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##INFO=<ID=HS,Number=0,Type=Flag,Description="Indicate it is at a hot spot">
##INFO=<ID=LEN,Number=A,Type=Integer,Description="allele length">
##INFO=<ID=MLLD,Number=A,Type=Float,Description="Mean log-likelihood delta per read.">
##INFO=<ID=NS,Number=1,Type=Integer,Description="Number of samples with data">
##INFO=<ID=QD,Number=1,Type=Float,Description="QualityByDepth as 4*QUAL/FDP (analogous to GATK)">
##INFO=<ID=RBI,Number=A,Type=Float,Description="Distance of bias parameters from zero.">
##INFO=<ID=REFB,Number=A,Type=Float,Description="Reference Hypothesis bias in prediction.">
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##INFO=<ID=RO,Number=1,Type=Integer,Description="Reference allele observations">
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##INFO=<ID=SRF,Number=1,Type=Integer,Description="Number of reference observations on the forward strand">
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##INFO=<ID=TYPE,Number=A,Type=String,Description="The type of allele, either snp, mnp, ins, del, or complex.">
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#CHROM	POS	ID	REF	ALT	QUAL	FILTER	INFO	FORMAT	L5T
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chr1	981931	.	A	G	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0193453;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.1245;QD=51.1831;RBI=0.0381846;REFB=0;REVB=-0.0329215;RO=0;SAF=4;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000420941;OID=.;OPOS=981931;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:16:4:0:0:16:4:0:0
chr1	982994	.	T	C	593.87	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0622385;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=55.1792;QD=60.9097;RBI=0.103;REFB=0;REVB=-0.0820692;RO=0;SAF=9;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.68708e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00236067;OID=.;OPOS=982994;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:30:9:0:0:30:9:0:0
chr1	984302	.	T	C	463.33	PASS	AF=0.443478;AO=51;DP=117;FAO=51;FDP=115;FR=.;FRO=64;FSAF=23;FSAR=28;FSRF=27;FSRR=37;FWDB=0.0119969;FXX=0.0170926;HRUN=1;LEN=1;MLLD=288.979;QD=16.1158;RBI=0.0120858;REFB=-0.0224653;REVB=0.00146348;RO=66;SAF=23;SAR=28;SRF=29;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0117993;STB=0.516401;STBP=0.767;TYPE=snp;VARB=0.0280238;OID=.;OPOS=984302;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:117:115:66:64:51:51:0.443478:28:23:29:37:28:23:27:37
chr1	986443	.	C	T	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00507018;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.576;QD=40.7629;RBI=0.0474004;REFB=0;REVB=0.0471284;RO=0;SAF=5;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00110636;OID=.;OPOS=986443;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:5:5:0:0:5:5:0:0
chr1	987200	.	C	T	990.64	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00558593;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.338;QD=59.1429;RBI=0.00707492;REFB=0;REVB=0.00434187;RO=0;SAF=26;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.88701e-05;OID=.;OPOS=987200;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:41:26:0:0:41:26:0:0
chr1	990280	.	C	T	580.25	PASS	AF=0.451852;AO=57;DP=135;FAO=61;FDP=135;FR=.;FRO=74;FSAF=30;FSAR=31;FSRF=37;FSRR=37;FWDB=0.0212689;FXX=0.0217376;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.1676;QD=17.1927;RBI=0.0254864;REFB=-0.0216307;REVB=-0.0140425;RO=74;SAF=27;SAR=30;SRF=37;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0266048;STB=0.504492;STBP=0.911;TYPE=snp;VARB=0.0293355;OID=.;OPOS=990280;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:135:135:74:74:57:61:0.451852:30:27:37:37:31:30:37:37
chr1	990806	.	G	A	606.53	PASS	AF=0.931818;AO=40;DP=45;FAO=41;FDP=44;FR=.;FRO=3;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0298027;FXX=0.0222173;HRUN=3;LEN=1;MLLD=242.607;QD=55.1389;RBI=0.0527781;REFB=-0.0184967;REVB=0.0435584;RO=2;SAF=21;SAR=19;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0425907;STB=0.533317;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.000953845;OID=.;OPOS=990806;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:45:44:2:3:40:41:0.931818:19:21:2:0:20:21:3:0
chr1	1007203	.	A	G	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0435481;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.2689;QD=33.4284;RBI=0.167391;REFB=0;REVB=0.161627;RO=0;SAF=5;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0143291;OID=.;OPOS=1007203;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:1:5:0:0:1:5:0:0
chr1	1021346	.	A	G	286.49	PASS	AF=0.553191;AO=26;DP=47;FAO=26;FDP=47;FR=.;FRO=21;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.00973065;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.765;QD=24.3817;RBI=0.0154257;REFB=-0.0262329;REVB=0.0119694;RO=21;SAF=12;SAR=14;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0500831;STB=0.527847;STBP=0.694;TYPE=snp;VARB=0.021177;OID=.;OPOS=1021346;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:21:21:26:26:0.553191:14:12:11:10:14:12:11:10
chr1	1026707	.	C	A	310.66	PASS	AF=0.447368;AO=34;DP=76;FAO=34;FDP=76;FR=.;FRO=42;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=27;FSRR=15;FWDB=-0.0141309;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=234.337;QD=16.3504;RBI=0.0181485;REFB=-0.0121362;REVB=0.0113879;RO=42;SAF=22;SAR=12;SRF=27;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00450998;STB=0.502537;STBP=0.982;TYPE=snp;VARB=0.0119641;OID=.;OPOS=1026707;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:42:42:34:34:0.447368:12:22:27:15:12:22:27:15
chr1	1139202	.	T	C	148.12	PASS	AF=0.484848;AO=16;DP=33;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.0346721;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.343;QD=17.9545;RBI=0.0375398;REFB=-0.0154287;REVB=0.0143902;RO=16;SAF=3;SAR=13;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.282245;STB=0.653051;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=0.0182303;OID=.;OPOS=1139202;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:16:17:16:16:0.484848:13:3:7:9:13:3:7:10
chr1	1147422	.	C	T	531.53	PASS	AF=1;AO=34;DP=35;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0157524;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.405;QD=59.0584;RBI=0.0269156;REFB=0;REVB=0.0218246;RO=0;SAF=27;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.32246e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.7208e-05;OID=.;OPOS=1147422;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:36:0:0:34:36:1:7:27:0:0:9:27:0:0
chr1	1156131	.	T	C	293.96	PASS	AF=1;AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00496688;FXX=0.0434594;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.779;QD=53.4472;RBI=0.0210255;REFB=0;REVB=-0.0204304;RO=0;SAF=13;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2029e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00015213;OID=.;OPOS=1156131;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:22:0:0:22:22:1:9:13:0:0:9:13:0:0
chr1	1158631	.	A	G	708.56	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0201081;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.643;QD=62.9827;RBI=0.0212882;REFB=0;REVB=0.00698952;RO=0;SAF=28;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.16179e-05;OID=.;OPOS=1158631;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:17:28:0:0:17:28:0:0
chr1	1226757	.	G	A	340.7	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000438711;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.089;QD=54.512;RBI=0.017501;REFB=0;REVB=0.0174955;RO=0;SAF=11;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.95206e-05;OID=.;OPOS=1226757;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:14:11:0:0:14:11:0:0
chr1	1226889	.	G	A	499.56	PASS	AF=0.945946;AO=35;DP=37;FAO=35;FDP=37;FR=.;FRO=2;FSAF=24;FSAR=11;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.000327661;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=108.306;QD=54.0063;RBI=0.0291103;REFB=0.000500653;REVB=-0.0291084;RO=2;SAF=24;SAR=11;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0374036;STB=0.519989;STBP=0.415;TYPE=snp;VARB=-0.000181291;OID=.;OPOS=1226889;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:37:37:2:2:35:35:0.945946:11:24:2:0:11:24:2:0
chr1	1231656	.	G	A	122.94	PASS	AF=0.923077;AO=11;DP=12;FAO=12;FDP=13;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0196154;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.7698;QD=37.8261;RBI=0.0901352;REFB=0.0472376;REVB=-0.087975;RO=1;SAF=6;SAR=5;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0690901;STB=0.533278;STBP=0.554;TYPE=snp;VARB=-0.0116082;OID=.;OPOS=1231656;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:12:13:1:1:11:12:0.923077:5:6:1:0:5:7:1:0
chr1	1234762	.	AG	A,GA	507.62	PASS	AF=0.977778,0;AO=33,2;DP=44;FAO=44,0;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=17,0;FSAR=27,0;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0575311,-0.00633876;FXX=0;HRUN=5,1;LEN=1,2;MLLD=15.89,138.085;QD=45.1214;RBI=0.153153,0.00676856;REFB=-0.0366078,-0.0128089;REVB=0.141936,0.0023735;RO=5;SAF=8,2;SAR=25,0;SRF=2;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0508728,0.64233;STB=0.509087,0.5;STBP=0.534,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.0130891,-0.00455965;OID=.,.;OPOS=1234763,1234762;OREF=G,AG;OALT=-,GA;OMAPALT=A,GA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:44:45:5:1:33,2:44,0:0.977778,0:25,0:8,2:2:3:27,0:17,0:0:1
chr1	1277533	.	T	C	1440.14	PASS	AF=0.970874;AO=88;DP=106;FAO=100;FDP=103;FR=.;FRO=3;FSAF=58;FSAR=42;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0320041;FXX=0.0373797;HRUN=3;LEN=1;MLLD=78.0238;QD=55.9277;RBI=0.0344973;REFB=-0.00661289;REVB=0.0128765;RO=0;SAF=47;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507354;STBP=0.409;TYPE=snp;VARB=0.000524255;OID=.;OPOS=1277533;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:106:103:0:3:88:100:0.970874:41:47:0:0:42:58:1:2
chr1	1322241	.	TTGAG	T	382.95	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0278262;FXX=0;HRUN=2;LEN=4;MLLD=268.949;QD=47.8691;RBI=0.0280139;REFB=0;REVB=0.0032374;RO=0;SAF=18;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000123193;OID=.;OPOS=1322242;OREF=TGAG;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:32:32:32:32:0:18:14:0:0:7:0:18:14:0:0
chr1	1334052	.	CTAGAG	C,CTAGAA	213.73	PASS	AF=0.477273,0;AO=21,2;DP=47;FAO=21,0;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=13,0;FSAR=8,0;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=-0.00584436,0.0284427;FXX=0.0434688;HRUN=1,1;LEN=5,1;MLLD=316.829,40.5188;QD=19.4297;RBI=0.0202442,0.0377171;REFB=0.00161389,0.0203625;REVB=0.0193823,-0.0247708;RO=21;SAF=13,0;SAR=8,2;SRF=12;SRR=9;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0441483,-0.535809;STB=0.552522,0.5;STBP=0.515,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.00157803,0;OID=.,.;OPOS=1334053,1334057;OREF=TAGAG,G;OALT=-,A;OMAPALT=C,CTAGAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.477273,0:21,2:47:21,0:44:23:13,0:8,0:12:11:99:21:13,0:8,2:12:9
chr1	1361555	.	T	C	35.38	PASS	AF=0.230769;AO=6;DP=26;FAO=6;FDP=26;FR=.;FRO=20;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=-0.0748119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.509;QD=5.44304;RBI=0.076558;REFB=-0.0189854;REVB=-0.0162572;RO=18;SAF=1;SAR=5;SRF=4;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102181;STB=0.647587;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=0.0417268;OID=.;OPOS=1361555;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:26:26:18:20:6:6:0.230769:5:1:4:14:5:1:6:14
chr1	1361594	.	C	T	159.87	PASS	AF=0.666667;AO=16;DP=24;FAO=16;FDP=24;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0109533;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=247.351;QD=26.6455;RBI=0.019192;REFB=-0.00805936;REVB=0.0157594;RO=7;SAF=3;SAR=13;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.274512;STB=0.640648;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=0.00337017;OID=.;OPOS=1361594;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:24:24:7:8:16:16:0.666667:13:3:4:3:13:3:4:4
chr1	1361633	.	G	A	126.58	PASS	AF=0.764706;AO=13;DP=16;FAO=13;FDP=17;FR=.;FRO=4;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.0169676;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=139.661;QD=29.783;RBI=0.0472848;REFB=-0.014844;REVB=0.0441356;RO=3;SAF=3;SAR=10;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.296967;STB=0.69967;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.00522579;OID=.;OPOS=1361633;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:16:17:3:4:13:13:0.764706:10:3:3:0:10:3:4:0
chr1	1361641	.	C	T	207.06	PASS	AF=1;AO=14;DP=16;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0951483;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=168.205;QD=48.7207;RBI=0.0968522;REFB=0;REVB=0.0180873;RO=0;SAF=5;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000385696;OID=.;OPOS=1361641;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:17:0:0:14:17:1:9:5:0:0:10:7:0:0
chr1	1375810	.	C	G	101.51	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0298439;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.065;QD=40.6045;RBI=0.0401786;REFB=0;REVB=0.0269009;RO=0;SAF=1;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.18628e-05;OID=.;OPOS=1375810;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:10:0:0:9:10:1:8:1:0:0:9:1:0:0
chr1	1375947	.	T	G	740.18	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0398584;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.9843;QD=56.9368;RBI=0.0449134;REFB=0;REVB=0.0207008;RO=0;SAF=37;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000255991;OID=.;OPOS=1375947;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:15:37:0:0:15:37:0:0
chr1	1376214	.	C	G	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0133594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.013;QD=51.1845;RBI=0.0460422;REFB=0;REVB=0.0440615;RO=0;SAF=15;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000274758;OID=.;OPOS=1376214;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:5:15:0:0:5:15:0:0
chr1	1377535	.	G	A	335.62	PASS	AF=0.607143;AO=32;DP=55;FAO=34;FDP=56;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=-0.0485179;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.6616;QD=23.9731;RBI=0.0603;REFB=-0.0283388;REVB=0.0358064;RO=23;SAF=11;SAR=21;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00342045;STB=0.515072;STBP=0.833;TYPE=snp;VARB=0.0241031;OID=.;OPOS=1377535;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:56:23:22:32:34:0.607143:21:11:8:15:22:12:7:15
chr1	1378173	.	G	A	72.64	PASS	AF=0.3125;AO=9;DP=31;FAO=10;FDP=32;FR=.;FRO=22;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.0740714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.729;QD=9.07992;RBI=0.0741129;REFB=-0.00334023;REVB=-0.00248203;RO=22;SAF=3;SAR=6;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195702;STB=0.56948;STBP=0.621;TYPE=snp;VARB=0.00801608;OID=.;OPOS=1378173;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:31:32:22:22:9:10:0.3125:6:3:11:11:6:4:11:11
chr1	1390875	.	C	T	724.09	PASS	AF=0.959184;AO=47;DP=49;FAO=47;FDP=49;FR=.;FRO=2;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.039446;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.216;QD=59.1096;RBI=0.0394709;REFB=-0.125229;REVB=0.00140076;RO=1;SAF=20;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0229327;STB=0.523799;STBP=0.165;TYPE=snp;VARB=0.00279236;OID=.;OPOS=1390875;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:49:49:1:2:47:47:0.959184:27:20:1:0:27:20:2:0
chr1	1403814	.	C	T	257.75	PASS	AF=0.545455;AO=24;DP=44;FAO=24;FDP=44;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.0118963;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.403;QD=23.4322;RBI=0.0132451;REFB=-0.0154976;REVB=-0.00582331;RO=20;SAF=9;SAR=15;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145592;STB=0.581326;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=0.017353;OID=.;OPOS=1403814;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:20:20:24:24:0.545455:15:9:11:9:15:9:11:9
chr1	1418004	.	T	C	171.99	PASS	AF=0.310811;AO=23;DP=74;FAO=23;FDP=74;FR=.;FRO=51;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=33;FSRR=18;FWDB=-0.00155039;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.637;QD=9.29696;RBI=0.0480212;REFB=0.00527375;REVB=-0.0479961;RO=51;SAF=10;SAR=13;SRF=33;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.244299;STB=0.643149;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=-0.0128595;OID=.;OPOS=1418004;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:51:51:23:23:0.310811:13:10:33:18:13:10:33:18
chr1	1420393	.	C	T	110.67	PASS	AF=0.705882;AO=12;DP=17;FAO=12;FDP=17;FR=.;FRO=5;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.00559528;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.883;QD=26.0409;RBI=0.115547;REFB=-0.0431402;REVB=-0.115411;RO=5;SAF=9;SAR=3;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0981189;STB=0.555458;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.0184803;OID=.;OPOS=1420393;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:17:17:5:5:12:12:0.705882:3:9:3:2:3:9:3:2
chr1	1421531	.	C	A	179.27	PASS	AF=0.413043;AO=19;DP=46;FAO=19;FDP=46;FR=.;FRO=27;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=9;FWDB=0.00424102;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.8157;QD=15.5887;RBI=0.00733768;REFB=-0.00206308;REVB=0.00598793;RO=27;SAF=7;SAR=12;SRF=18;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.298318;STB=0.670966;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.00335476;OID=.;OPOS=1421531;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:27:27:19:19:0.413043:12:7:18:9:12:7:18:9
chr1	1423267	.	A	G	228.38	PASS	AF=0.55;AO=21;DP=39;FAO=22;FDP=40;FR=.;FRO=18;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.0421575;FXX=0.0476077;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.4459;QD=22.8384;RBI=0.0421606;REFB=-0.0306944;REVB=-0.000506547;RO=17;SAF=13;SAR=8;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0743127;STB=0.541628;STBP=0.589;TYPE=snp;VARB=0.0246586;OID=.;OPOS=1423267;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:40:17:18:21:22:0.55:8:13:9:8:9:13:9:9
chr1	1425700	.	T	C	119.42	PASS	AF=0.296296;AO=16;DP=54;FAO=16;FDP=54;FR=.;FRO=38;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=24;FSRR=14;FWDB=-0.0120709;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.625;QD=8.84609;RBI=0.0121122;REFB=-0.0115374;REVB=0.000999305;RO=38;SAF=5;SAR=11;SRF=24;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.365088;STB=0.718204;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.027157;OID=.;OPOS=1425700;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:38:38:16:16:0.296296:11:5:24:14:11:5:24:14
chr1	1430985	.	C	T	124.88	PASS	AF=0.5;AO=14;DP=28;FAO=14;FDP=28;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.0377157;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.0915;QD=17.8401;RBI=0.0388301;REFB=-0.00738669;REVB=-0.00923588;RO=13;SAF=6;SAR=8;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0930297;STB=0.536031;STBP=0.667;TYPE=snp;VARB=0.0251465;OID=.;OPOS=1430985;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:28:13:14:14:14:0.5:8:6:7:6:8:6:7:7
chr1	1451380	.	T	C	147.62	PASS	AF=0.681818;AO=15;DP=22;FAO=15;FDP=22;FR=.;FRO=7;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.0290657;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.1727;QD=26.8392;RBI=0.124104;REFB=-0.0787164;REVB=-0.120653;RO=7;SAF=10;SAR=5;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.223168;STB=0.624829;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=0.0363843;OID=.;OPOS=1451380;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:22:22:7:7:15:15:0.681818:5:10:2:5:5:10:2:5
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chr1	1479333	.	A	G	139.61	PASS	AF=0.516129;AO=13;DP=29;FAO=16;FDP=31;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=-0.0470329;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.9713;QD=18.0143;RBI=0.0539454;REFB=-0.00848578;REVB=0.02642;RO=15;SAF=7;SAR=6;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188592;STB=0.551804;STBP=0.605;TYPE=snp;VARB=0.0176056;OID=.;OPOS=1479333;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:31:15:15:13:16:0.516129:6:7:5:10:9:7:5:10
chr1	1510801	.	C	T	71.65	PASS	AF=0.6;AO=9;DP=15;FAO=9;FDP=15;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.00763219;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.307;QD=19.1074;RBI=0.0126548;REFB=0.00482011;REVB=-0.0100943;RO=6;SAF=5;SAR=4;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0787225;STB=0.545355;STBP=0.695;TYPE=snp;VARB=-0.00595921;OID=.;OPOS=1510801;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:15:15:6:6:9:9:0.6:4:5:4:2:4:5:4:2
chr1	1511104	.	G	C	166.08	PASS	AF=0.566667;AO=17;DP=30;FAO=17;FDP=30;FR=.;FRO=13;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=11;FWDB=-0.00505675;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.7121;QD=22.1439;RBI=0.0490992;REFB=0.0494657;REVB=0.0488381;RO=13;SAF=12;SAR=5;SRF=2;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.414965;STB=0.732559;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=-0.0397254;OID=.;OPOS=1511104;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:13:13:17:17:0.566667:5:12:2:11:5:12:2:11
chr1	1551927	.	T	C	257.98	PASS	AF=0.5;AO=28;DP=56;FAO=28;FDP=56;FR=.;FRO=28;FSAF=20;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=0.000868977;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=248.588;QD=18.4269;RBI=0.0079158;REFB=-0.00731325;REVB=0.00786796;RO=28;SAF=20;SAR=8;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110525;STB=0.562084;STBP=0.4;TYPE=snp;VARB=0.00779285;OID=.;OPOS=1551927;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:28:28:28:28:0.5:8:20:17:11:8:20:17:11
chr1	1558792	.	T	C	170.53	PASS	AF=0.461538;AO=18;DP=39;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=-0.017959;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.743;QD=17.4903;RBI=0.0356228;REFB=-0.0297975;REVB=-0.0307646;RO=20;SAF=11;SAR=7;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104911;STB=0.57383;STBP=0.403;TYPE=snp;VARB=0.0301688;OID=.;OPOS=1558792;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:20:21:18:18:0.461538:7:11:10:10:7:11:10:11
chr1	1575785	.	G	A	127.87	PASS	AF=0.340909;AO=15;DP=42;FAO=15;FDP=44;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=20;FSRR=9;FWDB=-0.0437218;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.465;QD=11.6242;RBI=0.0437329;REFB=-0.00952115;REVB=-0.000984742;RO=27;SAF=12;SAR=3;SRF=19;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145055;STB=0.599854;STBP=0.388;TYPE=snp;VARB=0.0181213;OID=.;OPOS=1575785;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:44:27:29:15:15:0.340909:3:12:19:8:3:12:20:9
chr1	1588670	.	G	A	276.05	PASS	AF=0.264901;AO=40;DP=159;FAO=40;FDP=151;FR=.;FRO=111;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=51;FSRR=60;FWDB=-0.0654018;FXX=0.0503113;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.004;QD=7.31264;RBI=0.0701266;REFB=-0.00964771;REVB=-0.0253051;RO=100;SAF=22;SAR=18;SRF=48;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0847826;STB=0.566304;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.0287397;OID=.;OPOS=1588670;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:159:151:100:111:40:40:0.264901:18:22:48:52:18:22:51:60
chr1	1588717	.	G	A	370.08	PASS	AF=0.284153;AO=51;DP=182;FAO=52;FDP=183;FR=.;FRO=131;FSAF=25;FSAR=27;FSRF=62;FSRR=69;FWDB=-0.00495587;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.283;QD=8.08913;RBI=0.0195688;REFB=0.000283596;REVB=0.0189309;RO=131;SAF=24;SAR=27;SRF=62;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0033023;STB=0.505368;STBP=0.926;TYPE=snp;VARB=-0.000737225;OID=.;OPOS=1588717;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:182:183:131:131:51:52:0.284153:27:24:62:69:27:25:62:69
chr1	1588737	.	C	T	330.31	PASS	AF=0.289308;AO=46;DP=159;FAO=46;FDP=159;FR=.;FRO=113;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=56;FSRR=57;FWDB=0.00681771;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.271;QD=8.30973;RBI=0.00984743;REFB=0.0013396;REVB=0.00710567;RO=113;SAF=23;SAR=23;SRF=56;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00535316;STB=0.503143;STBP=0.961;TYPE=snp;VARB=-0.00119511;OID=.;OPOS=1588737;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:159:159:113:113:46:46:0.289308:23:23:56:57:23:23:56:57
chr1	1588743	.	A	T	269.13	PASS	AF=0.256757;AO=38;DP=146;FAO=38;FDP=148;FR=.;FRO=110;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=54;FSRR=56;FWDB=-0.000957972;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.122;QD=7.27366;RBI=0.0018411;REFB=-0.00773436;REVB=-0.00157224;RO=107;SAF=17;SAR=21;SRF=52;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0479131;STB=0.532483;STBP=0.673;TYPE=snp;VARB=0.026825;OID=.;OPOS=1588743;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:146:148:107:110:38:38:0.256757:21:17:52:55:21:17:54:56
chr1	1588744	.	AGCG	A	252.74	PASS	AF=0.257143;AO=36;DP=141;FAO=36;FDP=140;FR=.;FRO=104;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=52;FSRR=52;FWDB=-0.0143;FXX=0.0140835;HRUN=1;LEN=3;MLLD=285.853;QD=7.22109;RBI=0.0165001;REFB=-0.0026333;REVB=0.00823188;RO=101;SAF=17;SAR=19;SRF=50;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0281813;STB=0.52064;STBP=0.786;TYPE=del;VARB=0.0127806;OID=.;OPOS=1588745;OREF=GCG;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.257143:36:141:36:140:104:17:19:52:52:99:101:17:19:50:51
chr1	1599812	.	C	T	35.03	PASS	AF=0.214286;AO=6;DP=28;FAO=6;FDP=28;FR=.;FRO=22;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=6;FWDB=0.00235932;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.099;QD=5.00469;RBI=0.0023727;REFB=0.00624705;REVB=0.000251588;RO=22;SAF=1;SAR=5;SRF=16;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.599838;STB=0.884345;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=-0.0302359;OID=.;OPOS=1599812;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:28:28:22:22:6:6:0.214286:5:1:16:6:5:1:16:6
chr1	1599888	.	A	G	253.16	PASS	AF=0.509434;AO=27;DP=53;FAO=27;FDP=53;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=8;FWDB=0.00257093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.9752;QD=19.1063;RBI=0.025676;REFB=-0.0378585;REVB=0.025547;RO=25;SAF=14;SAR=13;SRF=17;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140432;STB=0.585854;STBP=0.208;TYPE=snp;VARB=0.0195746;OID=.;OPOS=1599888;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:25:26:27:27:0.509434:13:14:17:8:13:14:18:8
chr1	1601139	.	C	T	1140.57	PASS	AF=0.530806;AO=112;DP=212;FAO=112;FDP=211;FR=.;FRO=99;FSAF=64;FSAR=48;FSRF=38;FSRR=61;FWDB=0.00850058;FXX=0.00471676;HRUN=2;LEN=1;MLLD=303.294;QD=21.6223;RBI=0.00854075;REFB=-0.0199745;REVB=0.000827429;RO=99;SAF=64;SAR=48;SRF=38;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160381;STB=0.587586;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0176031;OID=.;OPOS=1601139;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:212:211:99:99:112:112:0.530806:48:64:38:61:48:64:38:61
chr1	1604499	.	G	A	83.87	PASS	AF=0.4;AO=10;DP=29;FAO=10;FDP=25;FR=.;FRO=15;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.0239069;FXX=0.166611;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.018;QD=13.4185;RBI=0.0240588;REFB=0.00555865;REVB=0.0027;RO=15;SAF=3;SAR=7;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11281;STB=0.567427;STBP=0.642;TYPE=snp;VARB=-0.0153596;OID=.;OPOS=1604499;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:29:25:15:15:10:10:0.4:7:3:6:9:7:3:6:9
chr1	1635004	.	T	C	1534.11	PASS	AF=0.963636;AO=105;DP=110;FAO=106;FDP=110;FR=.;FRO=4;FSAF=49;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0126463;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=207.904;QD=55.7859;RBI=0.0134666;REFB=-0.0163273;REVB=-0.00462809;RO=4;SAF=48;SAR=57;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.03214;STB=0.516946;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=0.000223357;OID=.;OPOS=1635004;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:110:110:4:4:105:106:0.963636:57:48:0:4:57:49:0:4
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chr1	1636044	.	G	A	834.41	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00708606;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.051;QD=57.5453;RBI=0.0214203;REFB=0;REVB=0.0202143;RO=0;SAF=24;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.31293e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.63872e-05;OID=.;OPOS=1636044;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:34:24:0:0:34:24:0:0
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chr1	1650832	.	A	G	219.2	PASS	AF=0.412698;AO=26;DP=63;FAO=26;FDP=63;FR=.;FRO=37;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=15;FWDB=-0.0251646;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.253;QD=13.9177;RBI=0.037508;REFB=-0.00419471;REVB=0.0278135;RO=33;SAF=12;SAR=14;SRF=22;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200827;STB=0.577611;STBP=0.325;TYPE=snp;VARB=0.00454539;OID=.;OPOS=1650832;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:33:37:26:26:0.412698:14:12:22:11:14:12:22:15
chr1	1650845	.	G	A	395.26	PASS	AF=0.573529;AO=37;DP=68;FAO=39;FDP=68;FR=.;FRO=29;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=0.0177291;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.518;QD=23.2504;RBI=0.0184661;REFB=-0.00957565;REVB=-0.00516491;RO=28;SAF=22;SAR=15;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103335;STB=0.57271;STBP=0.194;TYPE=snp;VARB=0.00672757;OID=.;OPOS=1650845;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:28:29:37:39:0.573529:15:22:13:15:15:24:13:16
chr1	1654038	.	G	A	95.34	PASS	AF=0.909091;AO=10;DP=11;FAO=10;FDP=11;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00779289;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.057;QD=34.669;RBI=0.028381;REFB=-0.0225585;REVB=0.0272901;RO=1;SAF=7;SAR=3;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126911;STB=0.57128;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=0.00113941;OID=.;OPOS=1654038;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:11:11:1:1:10:10:0.909091:3:7:0:1:3:7:0:1
chr1	1654058	.	C	T	177.46	PASS	AF=0.888889;AO=16;DP=18;FAO=16;FDP=18;FR=.;FRO=2;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0312036;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.147;QD=39.4353;RBI=0.0395038;REFB=0.0895728;REVB=0.0242257;RO=2;SAF=11;SAR=5;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151283;STB=0.583225;STBP=0.103;TYPE=snp;VARB=-0.0023874;OID=.;OPOS=1654058;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:18:18:2:2:16:16:0.888889:5:11:0:2:5:11:0:2
chr1	1654064	.	A	T	149.75	PASS	AF=0.714286;AO=15;DP=21;FAO=15;FDP=21;FR=.;FRO=6;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.00406246;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.994;QD=28.5245;RBI=0.0048753;REFB=-0.0342063;REVB=-0.00269535;RO=6;SAF=10;SAR=5;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00925336;OID=.;OPOS=1654064;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:21:21:6:6:15:15:0.714286:5:10:4:2:5:10:4:2
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chr1	1666175	.	C	T	30.1	PASS	AF=0.416667;AO=5;DP=12;FAO=5;FDP=12;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=0.0131725;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.261;QD=10.0339;RBI=0.0309855;REFB=0.00632744;REVB=-0.0280462;RO=7;SAF=2;SAR=3;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.413035;STB=0.749164;STBP=0.202;TYPE=snp;VARB=-0.0062564;OID=.;OPOS=1666175;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:12:12:7:7:5:5:0.416667:3:2:6:1:3:2:6:1
chr1	1683565	.	G	A	138.35	PASS	AF=0.326531;AO=16;DP=50;FAO=16;FDP=49;FR=.;FRO=33;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=0.0527174;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.424;QD=11.2942;RBI=0.0586343;REFB=-0.0157465;REVB=-0.0256682;RO=34;SAF=8;SAR=8;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.510191;STBP=0.947;TYPE=snp;VARB=0.0320471;OID=.;OPOS=1683565;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:49:34:33:16:16:0.326531:8:8:17:17:8:8:17:16
chr1	1684472	.	C	T	68.5	PASS	AF=0.6;AO=8;DP=15;FAO=9;FDP=15;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.0648473;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.0699;QD=18.268;RBI=0.0653342;REFB=-0.0189916;REVB=0.0079615;RO=6;SAF=4;SAR=4;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122361;STB=0.545355;STBP=0.729;TYPE=snp;VARB=0.00614518;OID=.;OPOS=1684472;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:15:15:6:6:8:9:0.6:4:4:2:4:5:4:2:4
chr1	1686040	.	G	T	286.69	PASS	AF=0.553191;AO=24;DP=45;FAO=26;FDP=47;FR=.;FRO=21;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=-0.0225828;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.778;QD=24.3995;RBI=0.0263157;REFB=0.00385166;REVB=0.0135104;RO=21;SAF=16;SAR=8;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0863188;STB=0.520532;STBP=0.752;TYPE=snp;VARB=-0.00656247;OID=.;OPOS=1686040;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:47:21:21:24:26:0.553191:8:16:12:9:10:16:12:9
chr1	1823922	.	A	G	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0301463;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.167;QD=51.9165;RBI=0.0342741;REFB=0;REVB=0.0163068;RO=0;SAF=3;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00018195;OID=.;OPOS=1823922;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:18:3:0:0:18:3:0:0
chr1	1846765	.	G	A	144.02	PASS	AF=0.421053;AO=16;DP=38;FAO=16;FDP=38;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=-0.00563264;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=284.674;QD=15.1604;RBI=0.0157871;REFB=-0.00286253;REVB=0.0147481;RO=22;SAF=6;SAR=10;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.300606;STB=0.672868;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.00508606;OID=.;OPOS=1846765;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:22:22:16:16:0.421053:10:6:15:7:10:6:15:7
chr1	1847979	.	T	C	163.83	PASS	AF=0.5;AO=17;DP=35;FAO=17;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=-0.00662243;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.4747;QD=19.2741;RBI=0.0125513;REFB=-0.0470826;REVB=0.010662;RO=15;SAF=5;SAR=12;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.266006;STB=0.680634;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.0203838;OID=.;OPOS=1847979;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:34:15:17:17:17:0.5:12:5:9:6:12:5:11:6
chr1	1849529	.	A	G	310.42	PASS	AF=0.551724;AO=32;DP=58;FAO=32;FDP=58;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.0337843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.433;QD=21.408;RBI=0.0354389;REFB=-0.0721662;REVB=0.0107023;RO=26;SAF=14;SAR=18;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0197117;STB=0.51091;STBP=0.874;TYPE=snp;VARB=0.0154177;OID=.;OPOS=1849529;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:26:26:32:32:0.551724:18:14:12:14:18:14:12:14
chr1	1849530	.	T	C	215.99	PASS	AF=0.438596;AO=25;DP=57;FAO=25;FDP=57;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=-0.0107434;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.221;QD=15.1571;RBI=0.0272427;REFB=-0.0109374;REVB=0.0250348;RO=31;SAF=11;SAR=14;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0205188;STB=0.501423;STBP=0.995;TYPE=snp;VARB=0.00352642;OID=.;OPOS=1849530;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:31:32:25:25:0.438596:14:11:13:18:14:11:14:18
chr1	1849744	.	G	A	35.95	PASS	AF=0.26087;AO=6;DP=23;FAO=6;FDP=23;FR=.;FRO=17;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=-0.0388903;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.03;QD=6.25134;RBI=0.0403389;REFB=0.0144601;REVB=0.0107132;RO=17;SAF=2;SAR=4;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.346032;STB=0.721525;STBP=0.225;TYPE=snp;VARB=-0.0152201;OID=.;OPOS=1849744;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:23:23:17:17:6:6:0.26087:4:2:11:6:4:2:11:6
chr1	1849812	.	G	A	221.27	PASS	AF=0.636364;AO=21;DP=33;FAO=21;FDP=33;FR=.;FRO=12;FSAF=16;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=0.00758797;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.22;QD=26.8204;RBI=0.0107298;REFB=0.0341713;REVB=0.00758631;RO=12;SAF=16;SAR=5;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0816628;STB=0.545409;STBP=0.544;TYPE=snp;VARB=-0.0162038;OID=.;OPOS=1849812;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:33:33:12:12:21:21:0.636364:5:16:8:4:5:16:8:4
chr1	1854109	.	A	G	801.32	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00212863;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.27;QD=57.2374;RBI=0.0285403;REFB=0;REVB=-0.0284608;RO=0;SAF=18;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.76069e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.52656e-05;OID=.;OPOS=1854109;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:38:18:0:0:38:18:0:0
chr1	1854546	.	C	T	156.41	PASS	AF=0.615385;AO=16;DP=26;FAO=16;FDP=26;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.0242676;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.0005;QD=24.063;RBI=0.0472088;REFB=0.0370074;REVB=0.0404939;RO=10;SAF=6;SAR=10;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.222788;STB=0.624844;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=-0.0179888;OID=.;OPOS=1854546;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:26:26:10:10:16:16:0.615385:10:6:7:3:10:6:7:3
chr1	1855319	.	C	T	206.25	PASS	AF=0.4375;AO=21;DP=48;FAO=21;FDP=48;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=8;FWDB=0.0170029;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.1874;QD=17.1874;RBI=0.0176707;REFB=-0.0252032;REVB=-0.00481177;RO=27;SAF=8;SAR=13;SRF=19;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.310507;STB=0.67614;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.0326344;OID=.;OPOS=1855319;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:27:27:21:21:0.4375:13:8:19:8:13:8:19:8
chr1	1859176	.	T	C	222.94	PASS	AF=0.462963;AO=25;DP=54;FAO=25;FDP=54;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=-0.00794963;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.9325;QD=16.5142;RBI=0.0127012;REFB=0.0198269;REVB=-0.00990572;RO=29;SAF=12;SAR=13;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.068086;STB=0.538431;STBP=0.609;TYPE=snp;VARB=-0.0353765;OID=.;OPOS=1859176;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:29:29:25:25:0.462963:13:12:16:13:13:12:16:13
chr1	1861582	.	C	T	220.77	PASS	AF=0.369863;AO=27;DP=73;FAO=27;FDP=73;FR=.;FRO=46;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=21;FSRR=25;FWDB=0.00364203;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=274.984;QD=12.0972;RBI=0.0105688;REFB=-0.0123393;REVB=-0.00992142;RO=45;SAF=14;SAR=13;SRF=21;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0562638;STB=0.538978;STBP=0.635;TYPE=snp;VARB=0.0166005;OID=.;OPOS=1861582;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:45:46:27:27:0.369863:13:14:21:24:13:14:21:25
chr1	1873514	.	A	G	187.33	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0102162;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.0982;QD=46.8323;RBI=0.0308381;REFB=0;REVB=-0.0290967;RO=0;SAF=9;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000254114;OID=.;OPOS=1873514;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:16:0:0:15:16:1:6:9:0:0:6:10:0:0
chr1	1873525	.	T	C	223.19	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0308066;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.4682;QD=49.5976;RBI=0.0424584;REFB=0;REVB=-0.0292176;RO=0;SAF=11;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00204585;OID=.;OPOS=1873525;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:7:11:0:0:7:11:0:0
chr1	1875858	.	CA	GG	142.69	PASS	AF=0.6;AO=15;DP=25;FAO=15;FDP=25;FR=.;FRO=10;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.0291872;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=184.987;QD=22.831;RBI=0.0328191;REFB=-0.0181928;REVB=-0.0150067;RO=10;SAF=8;SAR=7;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0237195;STB=0.513351;STBP=0.944;TYPE=mnp;VARB=0.0158706;OID=.;OPOS=1875858;OREF=CA;OALT=GG;OMAPALT=GG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:25:25:10:10:15:15:0.6:7:8:5:5:7:8:5:5
chr1	1886859	.	C	T	93.32	PASS	AF=0.578947;AO=11;DP=19;FAO=11;FDP=19;FR=.;FRO=8;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0863356;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.2486;QD=19.6459;RBI=0.0877478;REFB=-0.0348181;REVB=-0.0156795;RO=8;SAF=8;SAR=3;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188135;STB=0.608486;STBP=0.345;TYPE=snp;VARB=0.0298224;OID=.;OPOS=1886859;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:19:19:8:8:11:11:0.578947:3:8:4:4:3:8:4:4
chr1	1886863	.	T	C	45.02	PASS	AF=0.388889;AO=6;DP=16;FAO=7;FDP=18;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=0.0189363;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.962;QD=10.0048;RBI=0.0270166;REFB=-0.0175016;REVB=0.0192695;RO=10;SAF=3;SAR=3;SRF=8;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.309795;STB=0.599733;STBP=0.575;TYPE=snp;VARB=0.0265516;OID=.;OPOS=1886863;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:16:18:10:11:6:7:0.388889:3:3:8:2:3:4:8:3
chr1	1887018	.	TA	T,TG	143.55	PASS	AF=0.0769231,0.923077;AO=2,11;DP=13;FAO=1,12;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=1,9;FSAR=0,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00969838,0.0102763;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=280.183,294.578;QD=44.169;RBI=0.0144122,0.0109506;REFB=0,0;REVB=-0.0106608,-0.00378322;RO=0;SAF=2,8;SAR=0,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0386274,0.00443842;OID=.,.;OPOS=1887019,1887019;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=T,TG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0769231,0.923077:2,11:13:1,12:13:0:1,9:0,3:0:0:6:0:2,8:0,3:0:0
chr1	1887245	.	G	A	395.95	PASS	AF=0.512821;AO=40;DP=78;FAO=40;FDP=78;FR=.;FRO=38;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=16;FWDB=-0.00849481;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.3419;QD=20.3053;RBI=0.0167418;REFB=-0.00604487;REVB=0.0144266;RO=38;SAF=23;SAR=17;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0035508;STB=0.501967;STBP=0.992;TYPE=snp;VARB=0.00503268;OID=.;OPOS=1887245;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:38:38:40:40:0.512821:17:23:22:16:17:23:22:16
chr1	1888193	.	C	A	413.7	PASS	AF=0.427273;AO=47;DP=110;FAO=47;FDP=110;FR=.;FRO=63;FSAF=29;FSAR=18;FSRF=32;FSRR=31;FWDB=0.0182698;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.253;QD=15.0438;RBI=0.0182973;REFB=-0.00622588;REVB=0.00100377;RO=62;SAF=29;SAR=18;SRF=31;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121261;STB=0.564085;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.00801285;OID=.;OPOS=1888193;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:110:62:63:47:47:0.427273:18:29:31:31:18:29:32:31
chr1	1896440	.	G	A	380.48	PASS	AF=0.542857;AO=38;DP=70;FAO=38;FDP=70;FR=.;FRO=32;FSAF=25;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=0.0633515;FXX=0.0140825;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.704;QD=21.7419;RBI=0.0633525;REFB=-0.020723;REVB=0.000354288;RO=32;SAF=25;SAR=13;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0849029;STB=0.546976;STBP=0.426;TYPE=snp;VARB=0.0191619;OID=.;OPOS=1896440;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:32:32:38:38:0.542857:13:25:18:14:13:25:18:14
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chr1	1916890	.	C	T	344.78	PASS	AF=0.555556;AO=35;DP=63;FAO=35;FDP=63;FR=.;FRO=28;FSAF=25;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=-0.00763247;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.712;QD=21.8905;RBI=0.00779659;REFB=-0.0206631;REVB=-0.00159133;RO=28;SAF=25;SAR=10;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0679537;STB=0.537612;STBP=0.547;TYPE=snp;VARB=0.0205667;OID=.;OPOS=1916890;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:28:28:35:35:0.555556:10:25:18:10:10:25:18:10
chr1	1960674	.	C	T	283.09	PASS	AF=0.476923;AO=31;DP=65;FAO=31;FDP=65;FR=.;FRO=34;FSAF=9;FSAR=22;FSRF=11;FSRR=23;FWDB=-0.0175337;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.6823;QD=17.421;RBI=0.0234829;REFB=-0.0127759;REVB=0.0156211;RO=34;SAF=9;SAR=22;SRF=11;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0368777;STB=0.520696;STBP=0.784;TYPE=snp;VARB=0.0167563;OID=.;OPOS=1960674;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:34:34:31:31:0.476923:22:9:11:23:22:9:11:23
chr1	1987993	.	T	C	323.44	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0232478;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.5906;QD=53.9062;RBI=0.0335517;REFB=0;REVB=-0.0241921;RO=0;SAF=18;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.20537e-06;OID=.;OPOS=1987993;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:6:18:0:0:6:18:0:0
chr1	1991014	.	A	G	484.8	PASS	AF=0.51087;AO=47;DP=92;FAO=47;FDP=92;FR=.;FRO=45;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=22;FSRR=23;FWDB=0.00888579;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.49;QD=21.0783;RBI=0.0107228;REFB=-0.0151931;REVB=-0.00600185;RO=45;SAF=20;SAR=27;SRF=22;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0567338;STB=0.531383;STBP=0.569;TYPE=snp;VARB=0.0153746;OID=.;OPOS=1991014;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:45:45:47:47:0.51087:27:20:22:23:27:20:22:23
chr1	2005740	.	T	C	276.82	PASS	AF=1;AO=21;DP=22;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0418637;FXX=0.0454339;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.705;QD=52.7276;RBI=0.0920929;REFB=0;REVB=0.0820276;RO=0;SAF=11;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000604707;OID=.;OPOS=2005740;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:21:0:0:21:21:1:10:11:0:0:10:11:0:0
chr1	2113565	.	T	G	197.13	PASS	AF=0.347222;AO=25;DP=72;FAO=25;FDP=72;FR=.;FRO=47;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=26;FSRR=21;FWDB=0.00429998;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.423;QD=10.9517;RBI=0.0249171;REFB=-0.00982004;REVB=0.0245433;RO=47;SAF=16;SAR=9;SRF=26;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101923;STB=0.559392;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.0158845;OID=.;OPOS=2113565;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:47:47:25:25:0.347222:9:16:26:21:9:16:26:21
chr1	2117557	.	G	A	324.43	PASS	AF=0.454545;AO=35;DP=77;FAO=35;FDP=77;FR=.;FRO=42;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=0.0621021;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.6388;QD=16.8534;RBI=0.072211;REFB=-0.0101736;REVB=0.0368477;RO=42;SAF=22;SAR=13;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0820629;STB=0.546133;STBP=0.469;TYPE=snp;VARB=0.0152767;OID=.;OPOS=2117557;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:42:42:35:35:0.454545:13:22:23:19:13:22:23:19
chr1	2144982	.	G	T	1008.34	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.024842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.7089;QD=59.314;RBI=0.0543279;REFB=0;REVB=0.0483156;RO=0;SAF=41;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.6787e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000342249;OID=.;OPOS=2144982;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:27:41:0:0:27:41:0:0
chr1	2145524	.	G	A	205.09	PASS	AF=0.555556;AO=20;DP=36;FAO=20;FDP=36;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.0261623;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=235.338;QD=22.7876;RBI=0.0262294;REFB=-0.0101149;REVB=-0.00187491;RO=15;SAF=6;SAR=14;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0873407;STB=0.568679;STBP=0.378;TYPE=snp;VARB=0.00720266;OID=.;OPOS=2145524;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:15:16:20:20:0.555556:14:6:6:9:14:6:7:9
chr1	2399119	.	A	G	1158.54	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.018741;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.393;QD=60.9759;RBI=0.0190463;REFB=0;REVB=0.00339633;RO=0;SAF=35;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.31781e-05;OID=.;OPOS=2399119;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:76:0:0:77:76:1:42:35:0:0:42:34:0:0
chr1	2426333	.	C	T	268.47	PASS	AF=0.310345;AO=36;DP=117;FAO=36;FDP=116;FR=.;FRO=80;FSAF=10;FSAR=26;FSRF=26;FSRR=54;FWDB=-0.00771614;FXX=0.00854628;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.037;QD=9.25763;RBI=0.0116343;REFB=-0.00744296;REVB=0.00870736;RO=77;SAF=10;SAR=26;SRF=25;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0657401;STB=0.539148;STBP=0.611;TYPE=snp;VARB=0.0211458;OID=.;OPOS=2426333;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:117:116:77:80:36:36:0.310345:26:10:25:52:26:10:26:54
chr1	2430617	.	C	T	192.39	PASS	AF=0.363636;AO=24;DP=67;FAO=24;FDP=66;FR=.;FRO=42;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=28;FWDB=-0.00595749;FXX=0.0294074;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.06;QD=11.6598;RBI=0.00642936;REFB=-0.0132417;REVB=0.00241763;RO=41;SAF=14;SAR=10;SRF=14;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.259313;STB=0.655049;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.0203642;OID=.;OPOS=2430617;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:66:41:42:24:24:0.363636:10:14:14:27:10:14:14:28
chr1	2433900	.	C	T	239.58	PASS	AF=0.490566;AO=26;DP=53;FAO=26;FDP=53;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=7;FWDB=0.019967;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=146.791;QD=18.0818;RBI=0.0228404;REFB=-0.0188784;REVB=0.0110908;RO=26;SAF=13;SAR=13;SRF=19;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.206941;STB=0.622553;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.0185077;OID=.;OPOS=2433900;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:26:27:26:26:0.490566:13:13:19:7:13:13:20:7
chr1	2441358	.	T	C	75.62	PASS	AF=0.384615;AO=10;DP=26;FAO=10;FDP=26;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.0229163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.017;QD=11.6341;RBI=0.022976;REFB=-0.0299059;REVB=-0.00165466;RO=15;SAF=5;SAR=5;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101015;STB=0.538385;STBP=0.779;TYPE=snp;VARB=0.0341637;OID=.;OPOS=2441358;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:26:26:15:16:10:10:0.384615:5:5:6:9:5:5:7:9
chr1	2444414	.	G	A	717.07	PASS	AF=0.419355;AO=78;DP=188;FAO=78;FDP=186;FR=.;FRO=108;FSAF=50;FSAR=28;FSRF=54;FSRR=54;FWDB=0.00468214;FXX=0.0106377;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.671;QD=15.4208;RBI=0.0275109;REFB=-0.0348421;REVB=0.0271096;RO=106;SAF=50;SAR=28;SRF=54;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140525;STB=0.58469;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=0.0398408;OID=.;OPOS=2444414;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:188:186:106:108:78:78:0.419355:28:50:54:52:28:50:54:54
chr1	2452327	.	C	G	287.8	PASS	AF=0.484375;AO=31;DP=62;FAO=31;FDP=64;FR=.;FRO=33;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=0.0372112;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.331;QD=17.9873;RBI=0.0599258;REFB=-0.0330266;REVB=-0.0469726;RO=31;SAF=13;SAR=18;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0875058;STB=0.534266;STBP=0.625;TYPE=snp;VARB=0.0268192;OID=.;OPOS=2452327;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:64:31:33:31:31:0.484375:18:13:16:15:18:13:16:17
chr1	2452569	.	T	C	1494.7	PASS	AF=0.97;AO=97;DP=100;FAO=97;FDP=100;FR=.;FRO=3;FSAF=57;FSAR=40;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0401472;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.9383;QD=59.7881;RBI=0.0538502;REFB=-0.0154572;REVB=0.0358893;RO=2;SAF=57;SAR=40;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0163491;STB=0.512818;STBP=0.161;TYPE=snp;VARB=0.000501735;OID=.;OPOS=2452569;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:100:100:2:3:97:97:0.97:40:57:2:0:40:57:3:0
chr1	2488153	.	A	G	3477.86	PASS	AF=0.937255;AO=239;DP=256;FAO=239;FDP=255;FR=.;FRO=16;FSAF=109;FSAR=130;FSRF=3;FSRR=13;FWDB=-0.00213741;FXX=0.0039061;HRUN=4;LEN=1;MLLD=231.026;QD=54.5547;RBI=0.00430811;REFB=-0.031955;REVB=0.00374049;RO=15;SAF=109;SAR=130;SRF=3;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.029063;STB=0.517032;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.000369326;OID=.;OPOS=2488153;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:256:255:15:16:239:239:0.937255:130:109:3:12:130:109:3:13
chr1	2490898	.	C	A	340.74	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186103;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.19;QD=54.5176;RBI=0.0213913;REFB=0;REVB=0.0105471;RO=0;SAF=24;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.20334e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000163236;OID=.;OPOS=2490898;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:1:24:0:0:1:24:0:0
chr1	2490942	.	C	A	638.99	PASS	AF=0.976744;AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0782288;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.4015;QD=59.4405;RBI=0.0916339;REFB=-0.0833141;REVB=0.0477182;RO=1;SAF=28;SAR=14;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0323448;STB=0.517233;STBP=0.26;TYPE=snp;VARB=0.00257784;OID=.;OPOS=2490942;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:43:43:1:1:42:42:0.976744:14:28:0:1:14:28:0:1
chr1	2491205	.	C	T	1318.23	PASS	AF=1;AO=85;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00769149;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=112.381;QD=61.3129;RBI=0.0252818;REFB=0;REVB=0.0240835;RO=1;SAF=50;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00938119;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.27187e-05;OID=.;OPOS=2491205;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:86:1:0:85:86:1:35:50:1:0:35:51:0:0
chr1	2526746	.	A	G	323.4	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=3.6069e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.811;QD=53.8994;RBI=0.0477306;REFB=0;REVB=-0.0477305;RO=0;SAF=16;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00048521;OID=.;OPOS=2526746;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:8:16:0:0:8:16:0:0
chr1	2535613	.	C	A	1135.69	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0328894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.688;QD=60.5699;RBI=0.069443;REFB=0;REVB=0.0611605;RO=0;SAF=35;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.80413e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00028484;OID=.;OPOS=2535613;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:75:0:0:74:75:1:39:35:0:0:40:35:0:0
chr1	2541269	.	A	G	754.22	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0128356;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.2707;QD=56.9225;RBI=0.0217238;REFB=0;REVB=-0.0175262;RO=0;SAF=17;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.19417e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.38022e-05;OID=.;OPOS=2541269;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:36:17:0:0:36:17:0:0
chr1	2573199	.	A	G	1062.43	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00709636;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.351;QD=59.855;RBI=0.0221483;REFB=0;REVB=0.0209807;RO=0;SAF=27;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.87278e-05;OID=.;OPOS=2573199;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:44:27:0:0:44:27:0:0
chr1	2938265	.	C	T	54.74	PASS	AF=0.777778;AO=7;DP=9;FAO=7;FDP=9;FR=.;FRO=2;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0442323;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.747;QD=24.3281;RBI=0.0455306;REFB=-0.000217476;REVB=0.0107952;RO=2;SAF=3;SAR=4;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0278747;STB=0.516083;STBP=0.902;TYPE=snp;VARB=0.000874091;OID=.;OPOS=2938265;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:9:9:2:2:7:7:0.777778:4:3:1:1:4:3:1:1
chr1	2938407	.	CAGA	C	214.14	PASS	AF=0.46;AO=22;DP=51;FAO=23;FDP=50;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=19;FWDB=0.0179099;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=3;MLLD=210.938;QD=17.1313;RBI=0.0186516;REFB=0.00732944;REVB=-0.00520745;RO=27;SAF=11;SAR=11;SRF=8;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198569;STB=0.599215;STBP=0.221;TYPE=del;VARB=-0.0079364;OID=.;OPOS=2938408;OREF=AGA;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.46:22:51:23:50:27:11:12:8:19:99:27:11:11:8:19
chr1	2938697	.	T	G	249.53	PASS	AF=0.414286;AO=29;DP=70;FAO=29;FDP=70;FR=.;FRO=41;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=25;FWDB=-0.0130081;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.786;QD=14.2591;RBI=0.0222859;REFB=-0.0224712;REVB=-0.0180956;RO=40;SAF=13;SAR=16;SRF=16;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0501554;STB=0.53458;STBP=0.653;TYPE=snp;VARB=0.0276067;OID=.;OPOS=2938697;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:40:41:29:29:0.414286:16:13:16:24:16:13:16:25
chr1	2983963	.	G	A	770.42	PASS	AF=0.503185;AO=79;DP=157;FAO=79;FDP=157;FR=.;FRO=78;FSAF=56;FSAR=23;FSRF=50;FSRR=28;FWDB=0.0188627;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.6094;QD=19.6286;RBI=0.022321;REFB=-0.0423011;REVB=0.0119343;RO=77;SAF=56;SAR=23;SRF=49;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0758526;STB=0.539468;STBP=0.391;TYPE=snp;VARB=0.0414221;OID=.;OPOS=2983963;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:157:157:77:78:79:79:0.503185:23:56:49:28:23:56:50:28
chr1	2984087	.	C	A	307.0	PASS	AF=0.485294;AO=33;DP=68;FAO=33;FDP=68;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=12;FSRR=23;FWDB=0.0385748;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.35;QD=18.0589;RBI=0.0413208;REFB=-0.0353065;REVB=0.014812;RO=35;SAF=15;SAR=18;SRF=12;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105062;STB=0.558548;STBP=0.387;TYPE=snp;VARB=0.0339931;OID=.;OPOS=2984087;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:35:35:33:33:0.485294:18:15:12:23:18:15:12:23
chr1	2985885	.	C	G	209.59	PASS	AF=0.636364;AO=19;DP=31;FAO=21;FDP=33;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=11;FWDB=0.123265;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.8144;QD=25.4047;RBI=0.133618;REFB=-0.0127776;REVB=-0.0515709;RO=12;SAF=3;SAR=16;SRF=1;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106079;STB=0.584344;STBP=0.372;TYPE=snp;VARB=0.0096582;OID=.;OPOS=2985885;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:31:33:12:12:19:21:0.636364:16:3:1:11:16:5:1:11
chr1	3301721	.	C	T	218.99	PASS	AF=0.567568;AO=21;DP=37;FAO=21;FDP=37;FR=.;FRO=16;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=0.0113722;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.164;QD=23.6751;RBI=0.0163865;REFB=-0.00649108;REVB=0.0117979;RO=16;SAF=13;SAR=8;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.235885;STB=0.631589;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.00643606;OID=.;OPOS=3301721;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:16:16:21:21:0.567568:8:13:5:11:8:13:5:11
chr1	3312914	.	T	G	112.03	PASS	AF=0.433333;AO=11;DP=29;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.00617198;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=314.58;QD=14.9369;RBI=0.0165886;REFB=-0.00441189;REVB=0.0153977;RO=18;SAF=3;SAR=8;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.254975;STB=0.658418;STBP=0.163;TYPE=snp;VARB=0.00771335;OID=.;OPOS=3312914;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:30:18:17:11:13:0.433333:8:3:9:9:10:3:8:9
chr1	3328358	.	T	C	223.13	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.042247;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.2643;QD=49.5836;RBI=0.0441713;REFB=0;REVB=-0.0128954;RO=0;SAF=5;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000386789;OID=.;OPOS=3328358;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:13:5:0:0:13:5:0:0
chr1	3352009	.	G	A	282.17	PASS	AF=0.54717;AO=29;DP=53;FAO=29;FDP=53;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=24;FSRF=3;FSRR=21;FWDB=0.0184359;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=315.161;QD=21.2956;RBI=0.0203432;REFB=-0.00836928;REVB=-0.00860015;RO=24;SAF=5;SAR=24;SRF=3;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0716484;STB=0.539542;STBP=0.673;TYPE=snp;VARB=0.00665377;OID=.;OPOS=3352009;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:24:24:29:29:0.54717:24:5:3:21:24:5:3:21
chr1	3353890	.	A	G	1101.99	PASS	AF=1;AO=73;DP=74;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0349518;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.4158;QD=60.3832;RBI=0.0452554;REFB=0;REVB=-0.0287476;RO=0;SAF=31;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.98661e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.45745e-05;OID=.;OPOS=3353890;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:73:0:0:73:73:1:42:31:0:0:42:31:0:0
chr1	3353949	.	A	G	972.55	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0302995;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=123.259;QD=58.9426;RBI=0.0360163;REFB=0;REVB=-0.0194709;RO=0;SAF=19;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.91737e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.56117e-05;OID=.;OPOS=3353949;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:66:0:0:65:66:1:46:19:0:0:46:20:0:0
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chr1	3395039	.	G	A	375.01	PASS	AF=0.852941;AO=29;DP=34;FAO=29;FDP=34;FR=.;FRO=5;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0173499;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=293.976;QD=44.1189;RBI=0.0214743;REFB=-0.0263804;REVB=0.012654;RO=5;SAF=16;SAR=13;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0957549;STB=0.551688;STBP=0.184;TYPE=snp;VARB=0.00448498;OID=.;OPOS=3395039;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:26:34:34:5:5:29:29:0.852941:13:16:1:4:13:16:1:4
chr1	3407545	.	C	T	173.58	PASS	AF=0.319444;AO=23;DP=72;FAO=23;FDP=72;FR=.;FRO=49;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=36;FWDB=0.011376;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.576;QD=9.64339;RBI=0.0338978;REFB=-0.0125738;REVB=0.0319319;RO=49;SAF=8;SAR=15;SRF=13;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110144;STB=0.564262;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.0237314;OID=.;OPOS=3407545;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:49:49:23:23:0.319444:15:8:13:36:15:8:13:36
chr1	3414105	.	C	T	229.34	PASS	AF=0.448276;AO=25;DP=59;FAO=26;FDP=58;FR=.;FRO=32;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=0.00768744;FXX=0.0169463;HRUN=4;LEN=1;MLLD=93.3513;QD=15.8167;RBI=0.00909771;REFB=-0.0174524;REVB=-0.00486534;RO=27;SAF=15;SAR=10;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177543;STB=0.576864;STBP=0.291;TYPE=snp;VARB=0.012943;OID=.;OPOS=3414105;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:58:27:32:25:26:0.448276:10:15:11:16:11:15:14:18
chr1	3416449	.	C	A	334.45	PASS	AF=0.591837;AO=29;DP=49;FAO=29;FDP=49;FR=.;FRO=20;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=0.00185438;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.897;QD=27.3023;RBI=0.0158059;REFB=-0.0321984;REVB=0.0156967;RO=20;SAF=15;SAR=14;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0865344;STB=0.54772;STBP=0.423;TYPE=snp;VARB=0.0286491;OID=.;OPOS=3416449;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:20:20:29:29:0.591837:14:15:8:12:14:15:8:12
chr1	3418391	.	C	T	734.2	PASS	AF=0.410891;AO=82;DP=205;FAO=83;FDP=202;FR=.;FRO=119;FSAF=52;FSAR=31;FSRF=74;FSRR=45;FWDB=0.0322544;FXX=0.0194165;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.3378;QD=14.5386;RBI=0.0342823;REFB=-0.000322976;REVB=0.011616;RO=118;SAF=51;SAR=31;SRF=74;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00579434;STB=0.502926;STBP=0.956;TYPE=snp;VARB=0.000661534;OID=.;OPOS=3418391;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:205:202:118:119:82:83:0.410891:31:51:74:44:31:52:74:45
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chr1	3425183	.	G	A	795.94	PASS	AF=0.517007;AO=76;DP=147;FAO=76;FDP=147;FR=.;FRO=71;FSAF=36;FSAR=40;FSRF=31;FSRR=40;FWDB=-0.0299534;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.203;QD=21.6581;RBI=0.0345299;REFB=-0.030274;REVB=0.0171787;RO=71;SAF=36;SAR=40;SRF=31;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0327503;STB=0.517981;STBP=0.682;TYPE=snp;VARB=0.017055;OID=.;OPOS=3425183;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:147:147:71:71:76:76:0.517007:40:36:31:40:40:36:31:40
chr1	3428160	.	T	G	1080.45	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0067487;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.9279;QD=60.0247;RBI=0.00764585;REFB=0;REVB=0.00359362;RO=0;SAF=39;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.2023e-05;OID=.;OPOS=3428160;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:33:39:0:0:33:39:0:0
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chr1	3755675	.	T	C	380.42	PASS	AF=0.606557;AO=37;DP=59;FAO=37;FDP=61;FR=.;FRO=24;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.0310137;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.808;QD=24.9457;RBI=0.0310193;REFB=-0.0136848;REVB=-0.000591079;RO=22;SAF=23;SAR=14;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0543291;STB=0.515879;STBP=0.783;TYPE=snp;VARB=0.00931305;OID=.;OPOS=3755675;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:61:22:24:37:37:0.606557:14:23:12:10:14:23:14:10
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chr1	3809528	.	C	T	165.05	PASS	AF=0.548387;AO=16;DP=30;FAO=17;FDP=31;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.0225544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.749;QD=21.2967;RBI=0.0306446;REFB=0.0117676;REVB=-0.0207458;RO=14;SAF=7;SAR=9;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0679609;STB=0.551664;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=-0.00709052;OID=.;OPOS=3809528;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:31:14:14:16:17:0.548387:9:7:5:9:9:8:5:9
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chr1	6162407	.	A	G	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0353616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.117;QD=55.6561;RBI=0.0354291;REFB=0;REVB=0.00218624;RO=0;SAF=14;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000104186;OID=.;OPOS=6162407;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:13:14:0:0:13:14:0:0
chr1	6163065	.	G	A	232.96	PASS	AF=0.428571;AO=27;DP=64;FAO=27;FDP=63;FR=.;FRO=36;FSAF=6;FSAR=21;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=-0.0921184;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.808;QD=14.7911;RBI=0.092128;REFB=-0.0144941;REVB=0.00133259;RO=36;SAF=6;SAR=21;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.237534;STB=0.636253;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.0174008;OID=.;OPOS=6163065;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:63:36:36:27:27:0.428571:21:6:15:21:21:6:15:21
chr1	6165419	.	C	T	260.58	PASS	AF=0.571429;AO=24;DP=42;FAO=24;FDP=42;FR=.;FRO=18;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.0144141;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.984;QD=24.8167;RBI=0.0268949;REFB=-0.00967182;REVB=-0.0227061;RO=18;SAF=16;SAR=8;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179248;STB=0.599914;STBP=0.139;TYPE=snp;VARB=0.010364;OID=.;OPOS=6165419;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:18:18:24:24:0.571429:8:16:8:10:8:16:8:10
chr1	6184092	.	A	G	739.17	PASS	AF=0.981481;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0125526;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.228;QD=54.7535;RBI=0.0629862;REFB=-0.203679;REVB=-0.0617228;RO=1;SAF=32;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0144976;STB=0.507689;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=0.00120132;OID=.;OPOS=6184092;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:54:54:1:1:53:53:0.981481:21:32:1:0:21:32:1:0
chr1	6190315	.	C	T	283.25	PASS	AF=0.415584;AO=32;DP=78;FAO=32;FDP=77;FR=.;FRO=45;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=20;FSRR=25;FWDB=0.00237468;FXX=0.0128189;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.63;QD=14.7142;RBI=0.00401609;REFB=-0.0118025;REVB=-0.00323881;RO=45;SAF=15;SAR=17;SRF=20;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0251895;STB=0.514277;STBP=0.824;TYPE=snp;VARB=0.0167253;OID=.;OPOS=6190315;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:77:45:45:32:32:0.415584:17:15:20:25:17:15:20:25
chr1	6196869	.	A	G	817.69	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0245999;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.2619;QD=57.3817;RBI=0.035497;REFB=0;REVB=-0.0255907;RO=0;SAF=22;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000496432;OID=.;OPOS=6196869;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:35:22:0:0:35:22:0:0
chr1	6202245	.	G	A	647.3	PASS	AF=0.496183;AO=65;DP=131;FAO=65;FDP=131;FR=.;FRO=66;FSAF=32;FSAR=33;FSRF=37;FSRR=29;FWDB=-0.0116316;FXX=0.00757518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.535;QD=19.7649;RBI=0.0117532;REFB=-0.0094766;REVB=-0.00168623;RO=66;SAF=32;SAR=33;SRF=37;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0622986;STB=0.534371;STBP=0.464;TYPE=snp;VARB=0.0085093;OID=.;OPOS=6202245;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:131:131:66:66:65:65:0.496183:33:32:37:29:33:32:37:29
chr1	6209363	.	T	C	207.06	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.109661;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.6018;QD=48.7203;RBI=0.111176;REFB=0;REVB=0.0182869;RO=0;SAF=10;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00244732;OID=.;OPOS=6209363;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:7:10:0:0:7:10:0:0
chr1	6211183	.	G	A	726.39	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.04303;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.9214;QD=63.1646;RBI=0.0738756;REFB=0;REVB=0.0600502;RO=0;SAF=23;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000872483;OID=.;OPOS=6211183;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:46:0:0:44:46:1:21:23:0:0:23:23:0:0
chr1	6313938	.	C	T	885.43	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00943921;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.527;QD=58.061;RBI=0.0114645;REFB=0;REVB=0.00650667;RO=0;SAF=25;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.86364e-06;OID=.;OPOS=6313938;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:36:25:0:0:36:25:0:0
chr1	6314822	.	T	C	754.43	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0110651;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.4886;QD=56.9379;RBI=0.0339451;REFB=0;REVB=0.032091;RO=0;SAF=26;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000405596;OID=.;OPOS=6314822;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:27:26:0:0:27:26:0:0
chr1	6557009	.	A	C	995.47	PASS	AF=0.426357;AO=110;DP=258;FAO=110;FDP=258;FR=.;FRO=148;FSAF=52;FSAR=58;FSRF=87;FSRR=61;FWDB=0.00657825;FXX=0.00769201;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.493;QD=15.4337;RBI=0.0410195;REFB=-0.00922312;REVB=-0.0404885;RO=145;SAF=52;SAR=58;SRF=87;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1296;STB=0.565742;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=0.0165045;OID=.;OPOS=6557009;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:258:258:145:148:110:110:0.426357:58:52:87:58:58:52:87:61
chr1	6614230	.	G	A	464.17	PASS	AF=0.535714;AO=45;DP=84;FAO=45;FDP=84;FR=.;FRO=39;FSAF=31;FSAR=14;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=0.0284169;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.3689;QD=22.1035;RBI=0.0354582;REFB=-0.0280591;REVB=0.0212078;RO=38;SAF=31;SAR=14;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101757;STB=0.551578;STBP=0.335;TYPE=snp;VARB=0.041908;OID=.;OPOS=6614230;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:38:39:45:45:0.535714:14:31:22:16:14:31:23:16
chr1	6614535	.	G	A	139.92	PASS	AF=0.372093;AO=16;DP=43;FAO=16;FDP=43;FR=.;FRO=27;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=-0.00932105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.4913;QD=13.0157;RBI=0.083143;REFB=-0.00723363;REVB=0.0826188;RO=27;SAF=7;SAR=9;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126225;STB=0.573821;STBP=0.453;TYPE=snp;VARB=0.019392;OID=.;OPOS=6614535;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:27:27:16:16:0.372093:9:7:15:12:9:7:15:12
chr1	6635231	.	A	G	262.99	PASS	AF=0.954545;AO=21;DP=22;FAO=21;FDP=22;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0481462;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.3699;QD=47.8165;RBI=0.0555185;REFB=-0.0813962;REVB=-0.0276451;RO=1;SAF=13;SAR=8;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0341946;STB=0.518501;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.00589368;OID=.;OPOS=6635231;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:22:22:1:1:21:21:0.954545:8:13:1:0:8:13:1:0
chr1	6635306	.	G	A	178.94	PASS	AF=0.404255;AO=19;DP=47;FAO=19;FDP=47;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=0.00309294;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.916;QD=15.2287;RBI=0.0130201;REFB=-0.00502298;REVB=-0.0126474;RO=28;SAF=11;SAR=8;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0822525;STB=0.547461;STBP=0.601;TYPE=snp;VARB=0.00932444;OID=.;OPOS=6635306;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:28:28:19:19:0.404255:8:11:14:14:8:11:14:14
chr1	6646959	.	GCCTGCCTTC	G	89.73	PASS	AF=0.355556;AO=16;DP=45;FAO=16;FDP=45;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=-0.0272805;FXX=0;HRUN=2;LEN=9;MLLD=287.737;QD=7.97585;RBI=0.028623;REFB=-0.0172876;REVB=0.00866322;RO=25;SAF=9;SAR=7;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0836018;STB=0.515561;STBP=0.876;TYPE=del;VARB=0.0133035;OID=.;OPOS=6646960;OREF=CCTGCCTTC;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.355556:16:45:16:45:29:9:7:17:12:89:25:9:7:16:9
chr1	6695244	.	A	G	45.65	PASS	AF=0.333333;AO=7;DP=21;FAO=7;FDP=21;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.0201521;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.9324;QD=8.69451;RBI=0.0209258;REFB=-0.0286928;REVB=0.00563738;RO=14;SAF=4;SAR=3;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.226678;STB=0.639616;STBP=0.418;TYPE=snp;VARB=0.0596498;OID=.;OPOS=6695244;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:21:21:14:14:7:7:0.333333:3:4:5:9:3:4:5:9
chr1	6704635	.	A	G	154.11	PASS	AF=0.377778;AO=17;DP=46;FAO=17;FDP=45;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=19;FSRR=9;FWDB=0.013584;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.4034;QD=13.6989;RBI=0.0293026;REFB=-0.00453691;REVB=0.0259638;RO=28;SAF=11;SAR=6;SRF=19;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0373323;STB=0.521714;STBP=0.855;TYPE=snp;VARB=0.00366567;OID=.;OPOS=6704635;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:45:28:28:17:17:0.377778:6:11:19:9:6:11:19:9
chr1	6947717	.	C	T	203.52	PASS	AF=0.555556;AO=19;DP=35;FAO=20;FDP=36;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=0.0137086;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.688;QD=22.6137;RBI=0.0146789;REFB=-0.01564;REVB=0.00524828;RO=16;SAF=9;SAR=10;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122574;STB=0.555501;STBP=0.486;TYPE=snp;VARB=0.0186118;OID=.;OPOS=6947717;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:36:16:16:19:20:0.555556:10:9:10:6:10:10:10:6
chr1	7723534	.	G	A	340.74	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.029953;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=222.594;QD=54.5176;RBI=0.0442827;REFB=0;REVB=0.0326155;RO=0;SAF=9;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000395649;OID=.;OPOS=7723534;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:16:9:0:0:16:9:0:0
chr1	7723957	.	G	A	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00255296;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=229.562;QD=42.1826;RBI=0.0291855;REFB=0;REVB=0.0290736;RO=0;SAF=4;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00039995;OID=.;OPOS=7723957;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:7:4:0:0:7:4:0:0
chr1	7797503	.	C	G	158.99	PASS	AF=0.459459;AO=17;DP=35;FAO=17;FDP=37;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=-0.0204279;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=211.797;QD=17.1885;RBI=0.0295162;REFB=-0.012243;REVB=-0.0213051;RO=18;SAF=6;SAR=11;SRF=13;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.326321;STB=0.683021;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.0188439;OID=.;OPOS=7797503;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:37:18:20:17:17:0.459459:11:6:13:5:11:6:14:6
chr1	7811014	.	G	A	259.58	PASS	AF=0.315315;AO=33;DP=109;FAO=35;FDP=111;FR=.;FRO=76;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=31;FSRR=45;FWDB=0.0151301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.978;QD=9.3543;RBI=0.0165171;REFB=-0.010519;REVB=0.00662538;RO=76;SAF=18;SAR=15;SRF=31;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162267;STB=0.610625;STBP=0.131;TYPE=snp;VARB=0.0244149;OID=.;OPOS=7811014;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:111:76:76:33:35:0.315315:15:18:31:45:15:20:31:45
chr1	7887248	.	G	A	622.9	PASS	AF=1;AO=41;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0260316;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=213.56;QD=59.3234;RBI=0.0260368;REFB=-0.125103;REVB=0.000517315;RO=1;SAF=21;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0218198;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0010419;OID=.;OPOS=7887248;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:42:42:1:0:41:42:1:20:21:1:0:20:22:0:0
chr1	7887493	.	T	C	902.32	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0325446;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.4792;QD=58.2144;RBI=0.0738213;REFB=0;REVB=0.0662603;RO=0;SAF=19;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.31043e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000543732;OID=.;OPOS=7887493;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:62:0:0:60:62:1:41:19:0:0:43:19:0:0
chr1	7887605	.	G	A	293.77	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00307324;FXX=0.0434594;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.969;QD=53.4123;RBI=0.0154382;REFB=0;REVB=0.0151293;RO=0;SAF=9;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2029e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000865111;OID=.;OPOS=7887605;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:13:9:0:0:13:9:0:0
chr1	7890053	.	G	A	54.65	PASS	AF=0.333333;AO=8;DP=24;FAO=8;FDP=24;FR=.;FRO=16;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=-0.0231014;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.8632;QD=9.10812;RBI=0.0372452;REFB=-0.0507419;REVB=0.0292153;RO=16;SAF=2;SAR=6;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0847122;STB=0.552494;STBP=0.706;TYPE=snp;VARB=0.079763;OID=.;OPOS=7890053;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:24:24:16:16:8:8:0.333333:6:2:5:11:6:2:5:11
chr1	7890055	.	T	A	55.03	PASS	AF=0.347826;AO=8;DP=23;FAO=8;FDP=23;FR=.;FRO=15;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=-0.0186111;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.4613;QD=9.56962;RBI=0.0453411;REFB=0.00868281;REVB=-0.0413454;RO=15;SAF=2;SAR=6;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0232378;STB=0.514249;STBP=0.989;TYPE=snp;VARB=-0.0242196;OID=.;OPOS=7890055;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:23:23:15:15:8:8:0.347826:6:2:4:11:6:2:4:11
chr1	7906476	.	G	T	358.02	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00664098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.9772;QD=55.0794;RBI=0.00858426;REFB=0;REVB=0.00543938;RO=0;SAF=7;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.63811e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000215483;OID=.;OPOS=7906476;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:19:7:0:0:19:7:0:0
chr1	7909737	.	C	T	802.52	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0256947;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.8049;QD=64.2015;RBI=0.0498095;REFB=0;REVB=0.0426704;RO=0;SAF=19;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000212458;OID=.;OPOS=7909737;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:50:0:0:48:50:1:29:19:0:0:29:21:0:0
chr1	8031054	.	G	A	1374.72	PASS	AF=0.988889;AO=86;DP=87;FAO=89;FDP=90;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0148351;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.033;QD=61.0988;RBI=0.0894297;REFB=-0.0712123;REVB=0.0881907;RO=0;SAF=41;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505493;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=0.00101497;OID=.;OPOS=8031054;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:87:90:0:1:86:89:0.988889:45:41:0:0:45:44:0:1
chr1	8042970	.	G	T	340.73	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0287518;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.455;QD=54.5169;RBI=0.0414064;REFB=0;REVB=0.0297963;RO=0;SAF=11;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000524441;OID=.;OPOS=8042970;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:14:11:0:0:14:11:0:0
chr1	8073430	.	AAT	A,ATT	69.79	PASS	AF=0.255814,0;AO=11,3;DP=51;FAO=11,0;FDP=43;FR=.;FRO=32;FSAF=9,0;FSAR=2,0;FSRF=11;FSRR=21;FWDB=0.00650252,-0.048555;FXX=0.0652032;HRUN=6,6;LEN=2,1;MLLD=32.3253,27.4313;QD=6.49239;RBI=0.149684,0.0488305;REFB=-0.0266191,-0.00858997;REVB=-0.149543,-0.00517932;RO=35;SAF=9,3;SAR=2,0;SRF=11;SRR=24;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.571853,0.618058;STB=0.837471,0.5;STBP=0.025,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0886806,0;OID=.,.;OPOS=8073431,8073431;OREF=AT,A;OALT=-,T;OMAPALT=A,ATT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.255814,0:11,3:51:11,0:43:32:9,0:2,0:11:21:70:35:9,3:2,0:11:24
chr1	8390495	.	A	G	74.97	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0549042;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.274;QD=37.487;RBI=0.0576714;REFB=0;REVB=0.0176502;RO=0;SAF=1;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.78849e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000359831;OID=.;OPOS=8390495;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:7:1:0:0:7:1:0:0
chr1	8412935	.	C	T	1492.17	PASS	AF=1;AO=89;DP=89;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0185499;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.899;QD=62.8282;RBI=0.0233687;REFB=0;REVB=0.0142126;RO=0;SAF=44;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00108385;OID=.;OPOS=8412935;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:89:95:0:0:89:95:1:45:44:0:0:47:48:0:0
chr1	8412989	.	A	G	1008.49	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00443851;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=202.596;QD=59.323;RBI=0.00915674;REFB=0;REVB=0.00800909;RO=0;SAF=30;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.19419e-05;OID=.;OPOS=8412989;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:38:30:0:0:38:30:0:0
chr1	8414999	.	A	T	233.34	PASS	AF=0.472727;AO=25;DP=54;FAO=26;FDP=55;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=-0.0121873;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.318;QD=16.97;RBI=0.0270574;REFB=-0.00452397;REVB=0.0241572;RO=28;SAF=8;SAR=17;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.304178;STB=0.684364;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.0096291;OID=.;OPOS=8414999;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:55:28:29:25:26:0.472727:17:8:18:10:18:8:19:10
chr1	8418644	.	C	A	365.4	PASS	AF=0.964286;AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.032514;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=243.051;QD=52.2005;RBI=0.058673;REFB=-0.0797929;REVB=0.0488402;RO=0;SAF=16;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5146e-08;STB=0.521723;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.000597168;OID=.;OPOS=8418644;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:28:28:0:1:27:27:0.964286:11:16:0:0:11:16:0:1
chr1	8418650	.	T	C	392.04	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0474173;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.043;QD=56.0055;RBI=0.0494496;REFB=0;REVB=0.0140308;RO=0;SAF=15;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000291879;OID=.;OPOS=8418650;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:28:0:0:27:28:1:12:15:0:0:12:16:0:0
chr1	8928125	.	G	T	129.0	PASS	AF=0.538462;AO=14;DP=27;FAO=14;FDP=26;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=-0.00688709;FXX=0.0370233;HRUN=3;LEN=1;MLLD=155.379;QD=19.8455;RBI=0.0107847;REFB=-0.0242736;REVB=0.00829926;RO=12;SAF=5;SAR=9;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0515323;STB=0.529369;STBP=0.783;TYPE=snp;VARB=0.0211843;OID=.;OPOS=8928125;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:26:12:12:14:14:0.538462:9:5:5:7:9:5:5:7
chr1	9009406	.	C	T	102.36	PASS	AF=0.521739;AO=11;DP=22;FAO=12;FDP=23;FR=.;FRO=11;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=0.0242179;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.772;QD=17.801;RBI=0.0242645;REFB=-0.01653;REVB=-0.00150291;RO=11;SAF=6;SAR=5;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161818;STB=0.572403;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.0156976;OID=.;OPOS=9009406;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:22:23:11:11:11:12:0.521739:5:6:8:3:5:7:8:3
chr1	9009444	.	A	C	58.61	PASS	AF=0.5;AO=8;DP=16;FAO=8;FDP=16;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=-0.0260948;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.419;QD=14.6536;RBI=0.0353765;REFB=0.0124843;REVB=0.0238864;RO=8;SAF=6;SAR=2;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0162566;OID=.;OPOS=9009444;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:16:16:8:8:8:8:0.5:2:6:6:2:2:6:6:2
chr1	9011586	.	T	G	384.14	PASS	AF=0.506494;AO=38;DP=77;FAO=39;FDP=77;FR=.;FRO=38;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=13;FSRR=25;FWDB=0.000128567;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.1;QD=19.955;RBI=0.0292969;REFB=-0.0144039;REVB=0.0292966;RO=39;SAF=20;SAR=18;SRF=13;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174768;STB=0.5839;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=0.0155537;OID=.;OPOS=9011586;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:39:38:38:39:0.506494:18:20:13:26:19:20:13:25
chr1	9011722	.	G	T	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.031874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.622;QD=51.9163;RBI=0.0321698;REFB=0;REVB=-0.00435313;RO=0;SAF=12;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000173504;OID=.;OPOS=9011722;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:9:12:0:0:9:12:0:0
chr1	9017204	.	A	G	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0125537;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=288.891;QD=50.4135;RBI=0.0354885;REFB=0;REVB=-0.0331939;RO=0;SAF=14;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.41933e-05;OID=.;OPOS=9017204;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:5:14:0:0:5:14:0:0
chr1	9030964	.	C	T	510.33	PASS	AF=1;AO=33;DP=35;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0260869;FXX=0.105235;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.794;QD=60.0391;RBI=0.0285727;REFB=0;REVB=0.0116565;RO=0;SAF=20;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.82173e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00471362;OID=.;OPOS=9030964;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:35:34:0:0:33:34:1:13:20:0:0:14:20:0:0
chr1	9034421	.	G	A	474.93	PASS	AF=0.853659;AO=35;DP=41;FAO=35;FDP=41;FR=.;FRO=6;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0365331;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=228.433;QD=46.3344;RBI=0.0370354;REFB=-0.0318978;REVB=0.00607852;RO=4;SAF=19;SAR=16;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0888448;STB=0.518299;STBP=0.6;TYPE=snp;VARB=0.000532401;OID=.;OPOS=9034421;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:41:41:4:6:35:35:0.853659:16:19:4:0:16:19:4:2
chr1	9079365	.	G	A	576.22	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.122911;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.901;QD=60.6552;RBI=0.123249;REFB=0;REVB=-0.00911663;RO=0;SAF=5;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00013479;OID=.;OPOS=9079365;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:38:0:0:36:38:1:31:5:0:0:31:7:0:0
chr1	9165685	.	G	A	326.49	PASS	AF=0.423529;AO=36;DP=85;FAO=36;FDP=85;FR=.;FRO=49;FSAF=10;FSAR=26;FSRF=26;FSRR=23;FWDB=-0.024344;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.445;QD=15.3644;RBI=0.0542595;REFB=-0.0223825;REVB=0.0484919;RO=47;SAF=10;SAR=26;SRF=26;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.292568;STB=0.65629;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.0481692;OID=.;OPOS=9165685;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:47:49:36:36:0.423529:26:10:26:21:26:10:26:23
chr1	9171238	.	G	T	1021.76	PASS	AF=0.505102;AO=99;DP=197;FAO=99;FDP=196;FR=.;FRO=97;FSAF=52;FSAR=47;FSRF=51;FSRR=46;FWDB=0.00323604;FXX=0.00507588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.3645;QD=20.8522;RBI=0.00328338;REFB=-0.0179312;REVB=0.000555528;RO=96;SAF=52;SAR=47;SRF=50;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00397275;STB=0.500258;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.021726;OID=.;OPOS=9171238;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:197:196:96:97:99:99:0.505102:47:52:50:46:47:52:51:46
chr1	9188876	.	T	C	354.34	PASS	AF=0.545455;AO=36;DP=66;FAO=36;FDP=66;FR=.;FRO=30;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=-0.029131;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.4623;QD=21.4752;RBI=0.0296685;REFB=-0.000763592;REVB=-0.005622;RO=30;SAF=17;SAR=19;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0876478;STB=0.548361;STBP=0.424;TYPE=snp;VARB=-3.76521e-05;OID=.;OPOS=9188876;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:30:30:36:36:0.545455:19:17:11:19:19:17:11:19
chr1	9307033	.	G	A	612.87	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0460187;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.113;QD=61.2869;RBI=0.0735383;REFB=0;REVB=0.0573599;RO=0;SAF=23;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.4817e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000970577;OID=.;OPOS=9307033;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:17:23:0:0:17:23:0:0
chr1	9307138	.	T	C	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0588759;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.8541;QD=56.1913;RBI=0.0646674;REFB=0;REVB=-0.026749;RO=0;SAF=11;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.31638e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000487162;OID=.;OPOS=9307138;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:17:11:0:0:17:11:0:0
chr1	9323910	.	G	A	465.14	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.029989;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=206.065;QD=58.142;RBI=0.0415614;REFB=0;REVB=0.0287752;RO=0;SAF=2;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000288421;OID=.;OPOS=9323910;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:30:2:0:0:30:2:0:0
chr1	9416151	.	G	A	146.73	PASS	AF=0.470588;AO=15;DP=33;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.0020988;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.96;QD=17.2619;RBI=0.0188094;REFB=-0.0216808;REVB=0.0186919;RO=18;SAF=11;SAR=4;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.292343;STB=0.677184;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.0322563;OID=.;OPOS=9416151;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:34:18:18:15:16:0.470588:4:11:8:10:4:12:8:10
chr1	9427842	.	A	G	1277.94	PASS	AF=1;AO=82;DP=82;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0393753;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.16;QD=61.5877;RBI=0.0400337;REFB=0;REVB=0.00723076;RO=0;SAF=42;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000691343;OID=.;OPOS=9427842;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:83:0:0:82:83:1:40:42:0:0:40:43:0:0
chr1	9427869	.	G	A	816.76	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0346914;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.416;QD=57.3161;RBI=0.0353797;REFB=0;REVB=0.00694512;RO=0;SAF=27;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000105122;OID=.;OPOS=9427869;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:30:27:0:0:30:27:0:0
chr1	9670834	.	C	T	691.34	PASS	AF=0.485915;AO=69;DP=142;FAO=69;FDP=142;FR=.;FRO=73;FSAF=26;FSAR=43;FSRF=43;FSRR=30;FWDB=0.0403596;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.6484;QD=19.4743;RBI=0.0426137;REFB=-0.00696701;REVB=-0.0136759;RO=73;SAF=26;SAR=43;SRF=43;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198669;STB=0.609834;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.00568963;OID=.;OPOS=9670834;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:142:142:73:73:69:69:0.485915:43:26:43:30:43:26:43:30
chr1	9788894	.	AAGTT	A	102.58	PASS	AF=0.733333;AO=11;DP=16;FAO=11;FDP=15;FR=.;FRO=4;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-6.38224e-05;FXX=0.117578;HRUN=2;LEN=4;MLLD=298.329;QD=27.3553;RBI=0.0241091;REFB=-0.00540956;REVB=0.024109;RO=5;SAF=7;SAR=4;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0215005;STB=0.533274;STBP=0.742;TYPE=del;VARB=0.0019322;OID=.;OPOS=9788895;OREF=AGTT;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.733333:11:16:11:15:4:7:4:3:1:25:5:7:4:3:2
chr1	9888202	.	C	T	271.05	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00277492;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.017;QD=51.628;RBI=0.0415733;REFB=0;REVB=0.0414806;RO=0;SAF=13;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.851e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000199085;OID=.;OPOS=9888202;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:21:0:0:19:21:1:6:13:0:0:7:14:0:0
chr1	9910357	.	AT	TC	63.33	PASS	AF=0.310345;AO=9;DP=29;FAO=9;FDP=29;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=-0.0103425;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=211.108;QD=8.73562;RBI=0.0143661;REFB=-0.00580625;REVB=-0.00997093;RO=20;SAF=7;SAR=2;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.385455;STB=0.739278;STBP=0.115;TYPE=mnp;VARB=0.0125617;OID=.;OPOS=9910357;OREF=AT;OALT=TC;OMAPALT=TC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:29:29:20:20:9:9:0.310345:2:7:9:11:2:7:9:11
chr1	10001235	.	TTTCGTTCGTTCG	TTTCGTTCG,TTTCGTTCGTTCT,TTTCTTTCGTTCG	458.1	PASS	AF=0.783784,0.108108,0.108108;AO=15,7,3;DP=38;FAO=29,4,4;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=23,4,1;FSAR=6,0,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0129101,0.0245732,-0.126144;FXX=0.0512689;HRUN=2,1,1;LEN=4,1,1;MLLD=134.491,41.8751,54.0066;QD=49.5248;RBI=0.121699,0.17335,0.245164;REFB=-0.123669,-0.0127345,-0.0714971;REVB=0.121013,-0.1716,0.210221;RO=0;SAF=15,7,2;SAR=0,0,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,snp,snp;VARB=0.00174652,0.0532571,0.172881;OID=.,.,.;OPOS=10001236,10001247,10001239;OREF=TTCG,G,G;OALT=-,T,T;OMAPALT=TTTCGTTCG,TTTCGTTCGTTCT,TTTCTTTCGTTCG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.783784,0.108108,0.108108:15,7,3:38:29,4,4:37:0:23,4,1:6,0,3:0:0:27:0:15,7,2:0,0,1:0:0
chr1	10218439	.	T	C	234.38	PASS	AF=0.388889;AO=28;DP=72;FAO=28;FDP=72;FR=.;FRO=44;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=26;FWDB=-0.00276136;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.989;QD=13.0213;RBI=0.00340632;REFB=0.00216946;REVB=-0.00199447;RO=44;SAF=8;SAR=20;SRF=18;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148509;STB=0.585522;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=-0.00178911;OID=.;OPOS=10218439;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:44:44:28:28:0.388889:20:8:18:26:20:8:18:26
chr1	10318652	.	C	G	523.38	PASS	AF=0.491071;AO=55;DP=112;FAO=55;FDP=112;FR=.;FRO=57;FSAF=25;FSAR=30;FSRF=27;FSRR=30;FWDB=-0.0222413;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.8166;QD=18.692;RBI=0.0227724;REFB=-0.0226735;REVB=-0.0048893;RO=56;SAF=25;SAR=30;SRF=26;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00894716;STB=0.5098;STBP=0.835;TYPE=snp;VARB=0.024517;OID=.;OPOS=10318652;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:112:56:57:55:55:0.491071:30:25:26:30:30:25:27:30
chr1	10339209	.	CAT	C	200.73	PASS	AF=0.433962;AO=22;DP=53;FAO=23;FDP=53;FR=.;FRO=30;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=-0.00441847;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=2;MLLD=269.523;QD=15.1494;RBI=0.00886708;REFB=-0.0118034;REVB=0.00768779;RO=27;SAF=9;SAR=13;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0713905;STB=0.518256;STBP=0.839;TYPE=del;VARB=0.0143229;OID=.;OPOS=10339210;OREF=AT;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.433962:22:53:23:53:30:10:13:14:16:99:27:9:13:13:14
chr1	10366692	.	C	G	365.59	PASS	AF=0.487179;AO=36;DP=76;FAO=38;FDP=78;FR=.;FRO=40;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=-0.00845243;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.838;QD=18.7484;RBI=0.0137623;REFB=-0.00855872;REVB=0.0108608;RO=38;SAF=20;SAR=16;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.075564;STB=0.539063;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.00816636;OID=.;OPOS=10366692;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:78:38:40:36:38:0.487179:16:20:18:20:18:20:18:22
chr1	10435324	.	C	A	236.72	PASS	AF=0.45;AO=27;DP=60;FAO=27;FDP=60;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=-0.0117748;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.199;QD=15.781;RBI=0.0117778;REFB=-0.00611549;REVB=-0.000267445;RO=31;SAF=10;SAR=17;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111398;STB=0.565168;STBP=0.43;TYPE=snp;VARB=0.00763452;OID=.;OPOS=10435324;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:31:33:27:27:0.45:17:10:15:16:17:10:16:17
chr1	10460485	.	T	C	92.58	PASS	AF=0.3;AO=12;DP=40;FAO=12;FDP=40;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=20;FSRR=8;FWDB=0.0143886;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.718;QD=9.25815;RBI=0.014675;REFB=-0.00507862;REVB=0.00288521;RO=28;SAF=9;SAR=3;SRF=20;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0527218;STB=0.532203;STBP=0.805;TYPE=snp;VARB=0.0179652;OID=.;OPOS=10460485;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:40:40:28:28:12:12:0.3:3:9:20:8:3:9:20:8
chr1	10473196	.	C	T	180.66	PASS	AF=0.580645;AO=17;DP=31;FAO=18;FDP=31;FR=.;FRO=13;FSAF=15;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=0.0158108;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.711;QD=23.3103;RBI=0.0249949;REFB=0.00372054;REVB=0.0193588;RO=13;SAF=14;SAR=3;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152631;STB=0.593106;STBP=0.357;TYPE=snp;VARB=-0.00211523;OID=.;OPOS=10473196;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:13:13:17:18:0.580645:3:14:9:4:3:15:9:4
chr1	10511544	.	C	T	66.83	PASS	AF=0.428571;AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=11;FSRR=1;FWDB=-0.0254573;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=260.107;QD=12.73;RBI=0.0384389;REFB=-0.0206612;REVB=0.0288005;RO=12;SAF=7;SAR=2;SRF=11;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.227889;STB=0.63134;STBP=0.427;TYPE=snp;VARB=0.0221861;OID=.;OPOS=10511544;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:21:21:12:12:9:9:0.428571:2:7:11:1:2:7:11:1
chr1	10511589	.	T	C	358.44	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00162326;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.611;QD=55.1439;RBI=0.0108141;REFB=0;REVB=-0.0106916;RO=0;SAF=20;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.3455e-05;OID=.;OPOS=10511589;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:26:0:0:25:26:1:5:20:0:0:5:21:0:0
chr1	10713765	.	T	C	65.96	PASS	AF=0.391304;AO=9;DP=23;FAO=9;FDP=23;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=-0.0409804;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.1552;QD=11.4717;RBI=0.0580037;REFB=-0.00214657;REVB=-0.0410491;RO=14;SAF=8;SAR=1;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.62918;STB=0.879127;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=-0.00401554;OID=.;OPOS=10713765;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:23:23:14:14:9:9:0.391304:1:8:4:10:1:8:4:10
chr1	11008497	.	G	C	1400.77	PASS	AF=1;AO=74;DP=92;FAO=91;FDP=91;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=35;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.139876;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.348;QD=61.5723;RBI=0.141007;REFB=0;REVB=0.0178239;RO=0;SAF=18;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00443656;OID=.;OPOS=11008497;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:92:91:0:0:74:91:1:56:18:0:0:56:35:0:0
chr1	11008695	.	T	C	725.16	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0150038;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.15;QD=56.875;RBI=0.0177952;REFB=0;REVB=0.00956849;RO=0;SAF=19;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000145798;OID=.;OPOS=11008695;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:51:0:0:50:51:1:31:19:0:0:31:20:0:0
chr1	11014118	.	C	T	520.05	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0666238;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.8342;QD=59.4344;RBI=0.0791331;REFB=0;REVB=0.0427004;RO=0;SAF=19;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.1382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0017681;OID=.;OPOS=11014118;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:16:19:0:0:16:19:0:0
chr1	11015165	.	A	G	1572.49	PASS	AF=0.99;AO=99;DP=100;FAO=99;FDP=100;FR=.;FRO=1;FSAF=51;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0307117;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.917;QD=62.8995;RBI=0.0327452;REFB=-0.10288;REVB=-0.0113594;RO=1;SAF=51;SAR=48;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00977988;STB=0.505154;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=0.000448797;OID=.;OPOS=11015165;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:100:100:1:1:99:99:0.99:48:51:0:1:48:51:0:1
chr1	11087524	.	G	A	769.48	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0677878;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.036;QD=56.9988;RBI=0.0693165;REFB=0;REVB=0.0144773;RO=0;SAF=26;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000122543;OID=.;OPOS=11087524;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:54:0:0:52:54:1:26:26:0:0:26:28:0:0
chr1	11090916	.	C	A	446.08	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0239735;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.818;QD=57.559;RBI=0.0311896;REFB=0;REVB=-0.0199515;RO=0;SAF=10;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.90224e-05;OID=.;OPOS=11090916;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:31:0:0:30:31:1:20:10:0:0:21:10:0:0
chr1	11132217	.	G	A	958.21	PASS	AF=0.985075;AO=65;DP=66;FAO=66;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00530573;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.064;QD=57.2064;RBI=0.0064472;REFB=0.00508758;REVB=-0.00366272;RO=1;SAF=24;SAR=41;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0113841;STB=0.505881;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=-1.59882e-05;OID=.;OPOS=11132217;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:66:67:1:1:65:66:0.985075:41:24:0:1:42:24:0:1
chr1	11141187	.	C	G	123.14	PASS	AF=0.923077;AO=12;DP=13;FAO=12;FDP=13;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0187346;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.0464;QD=37.8888;RBI=0.0194576;REFB=-0.0112448;REVB=0.00525487;RO=1;SAF=8;SAR=4;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0531285;STB=0.529364;STBP=0.633;TYPE=snp;VARB=0.00707519;OID=.;OPOS=11141187;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:13:13:1:1:12:12:0.923077:4:8:1:0:4:8:1:0
chr1	11205058	.	C	T	365.02	PASS	AF=0.964286;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0557694;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.4485;QD=52.1456;RBI=0.063363;REFB=-0.0828401;REVB=-0.0300772;RO=0;SAF=12;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.519985;STBP=0.324;TYPE=snp;VARB=0.00325326;OID=.;OPOS=11205058;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:27:28:0:1:27:27:0.964286:15:12:0:0:15:12:1:0
chr1	11249902	.	A	T	212.7	PASS	AF=0.45283;AO=24;DP=54;FAO=24;FDP=53;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=-0.00941444;FXX=0.0185151;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.676;QD=16.053;RBI=0.0342335;REFB=-0.0139551;REVB=0.0329135;RO=29;SAF=12;SAR=12;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0499484;STB=0.528278;STBP=0.717;TYPE=snp;VARB=0.0194462;OID=.;OPOS=11249902;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:53:29:29:24:24:0.45283:12:12:13:16:12:12:13:16
chr1	11288758	.	G	A	594.54	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0310042;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.623;QD=60.9786;RBI=0.0370997;REFB=0;REVB=-0.0203746;RO=0;SAF=21;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.34792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000246636;OID=.;OPOS=11288758;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:18:21:0:0:18:21:0:0
chr1	11301714	.	A	G	816.67	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0497749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.856;QD=57.3103;RBI=0.0517192;REFB=0;REVB=-0.0140475;RO=0;SAF=24;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.25003e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000127006;OID=.;OPOS=11301714;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:33:24:0:0:33:24:0:0
chr1	11561593	.	G	A	41.14	PASS	AF=0.6;AO=6;DP=10;FAO=6;FDP=10;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.00127035;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.471;QD=16.4544;RBI=0.0130773;REFB=-0.022191;REVB=-0.0130155;RO=4;SAF=2;SAR=4;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.279564;STB=0.66611;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=0.0165737;OID=.;OPOS=11561593;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:10:10:4:4:6:6:0.6:4:2:3:1:4:2:3:1
chr1	11579470	.	G	A	289.49	PASS	AF=0.508197;AO=31;DP=61;FAO=31;FDP=61;FR=.;FRO=30;FSAF=9;FSAR=22;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=0.0406217;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.18;QD=18.9826;RBI=0.0415566;REFB=-0.022847;REVB=0.00876533;RO=29;SAF=9;SAR=22;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.242783;STB=0.629203;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.0182389;OID=.;OPOS=11579470;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:29:30:31:31:0.508197:22:9:16:13:22:9:16:14
chr1	11579504	.	G	C	304.76	PASS	AF=0.478261;AO=33;DP=69;FAO=33;FDP=69;FR=.;FRO=36;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=26;FWDB=-0.0219404;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.1462;QD=17.667;RBI=0.0271356;REFB=-0.0150899;REVB=0.0159674;RO=33;SAF=19;SAR=14;SRF=9;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.266848;STB=0.651713;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.00856328;OID=.;OPOS=11579504;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:33:36:33:33:0.478261:14:19:9:24:14:19:10:26
chr1	11589911	.	G	A	229.33	PASS	AF=0.415385;AO=27;DP=65;FAO=27;FDP=65;FR=.;FRO=38;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=23;FWDB=0.0119029;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.477;QD=14.1125;RBI=0.0121592;REFB=-0.00867999;REVB=0.00248333;RO=38;SAF=16;SAR=11;SRF=15;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.201611;STB=0.614605;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=0.0216419;OID=.;OPOS=11589911;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:38:38:27:27:0.415385:11:16:15:23:11:16:15:23
chr1	11710561	.	T	G	868.25	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0269724;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.333;QD=57.8836;RBI=0.0276592;REFB=0;REVB=-0.00612544;RO=0;SAF=26;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.79918e-05;OID=.;OPOS=11710561;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:34:26:0:0:34:26:0:0
chr1	11766424	.	C	T	107.86	PASS	AF=0.393939;AO=13;DP=33;FAO=13;FDP=33;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=0.0184694;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.5819;QD=13.0735;RBI=0.0394025;REFB=-0.0191226;REVB=0.0348058;RO=19;SAF=6;SAR=7;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0414547;STB=0.537678;STBP=0.78;TYPE=snp;VARB=0.0159754;OID=.;OPOS=11766424;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:19:20:13:13:0.393939:7:6:8:11:7:6:8:12
chr1	11810674	.	G	A	290.87	PASS	AF=0.508197;AO=31;DP=62;FAO=31;FDP=61;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=-0.00319302;FXX=0.0161264;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.6392;QD=19.0734;RBI=0.0313978;REFB=-0.00278317;REVB=0.031235;RO=30;SAF=13;SAR=18;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130226;STB=0.556467;STBP=0.381;TYPE=snp;VARB=0.00252238;OID=.;OPOS=11810674;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:61:30:30:31:31:0.508197:18:13:17:13:18:13:16:14
chr1	11810691	.	C	T	279.32	PASS	AF=0.508475;AO=30;DP=59;FAO=30;FDP=59;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=0.0013093;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=92.1091;QD=18.9366;RBI=0.0178347;REFB=-0.00539558;REVB=-0.0177866;RO=29;SAF=13;SAR=17;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133701;STB=0.507458;STBP=0.925;TYPE=snp;VARB=0.0053904;OID=.;OPOS=11810691;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:29:29:30:30:0.508475:17:13:13:16:17:13:13:16
chr1	11810765	.	T	A	1048.33	PASS	AF=1;AO=69;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0404097;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.485;QD=59.9045;RBI=0.0417025;REFB=0;REVB=0.0103029;RO=0;SAF=32;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000202689;OID=.;OPOS=11810765;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:69:70:1:37:32:0:0:37:33:0:0
chr1	11810844	.	A	G	262.12	PASS	AF=0.585366;AO=24;DP=41;FAO=24;FDP=41;FR=.;FRO=17;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=-0.0236156;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.197;QD=25.5725;RBI=0.0238854;REFB=-0.00632259;REVB=0.0035801;RO=17;SAF=10;SAR=14;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.049448;STB=0.527404;STBP=0.715;TYPE=snp;VARB=0.00626943;OID=.;OPOS=11810844;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:17:17:24:24:0.585366:14:10:6:11:14:10:6:11
chr1	11826630	.	C	T	276.53	PASS	AF=0.916667;AO=23;DP=25;FAO=22;FDP=24;FR=.;FRO=2;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00504493;FXX=0.039984;HRUN=6;LEN=1;MLLD=262.941;QD=46.0887;RBI=0.00531018;REFB=0.036249;REVB=0.00165732;RO=2;SAF=10;SAR=13;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0660323;STB=0.538427;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=-0.000220856;OID=.;OPOS=11826630;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:25:24:2:2:23:22:0.916667:13:10:0:2:12:10:0:2
chr1	11827304	.	A	G	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0126168;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.173;QD=33.4285;RBI=0.0201487;REFB=0;REVB=0.0157094;RO=0;SAF=5;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.5141e-05;OID=.;OPOS=11827304;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:1:5:0:0:1:5:0:0
chr1	11828238	.	G	A	296.26	PASS	AF=0.958333;AO=23;DP=24;FAO=23;FDP=24;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0290108;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.13;QD=49.3761;RBI=0.0652396;REFB=-0.0669223;REVB=-0.0584344;RO=0;SAF=14;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.84921e-08;STB=0.526293;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.000335952;OID=.;OPOS=11828238;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:24:24:0:1:23:23:0.958333:9:14:0:0:9:14:0:1
chr1	11828319	.	G	A	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0101812;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=282.063;QD=56.1916;RBI=0.0153709;REFB=0;REVB=0.0115156;RO=0;SAF=18;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.79561e-05;OID=.;OPOS=11828319;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:10:18:0:0:10:18:0:0
chr1	11831615	.	C	T	483.35	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0274968;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.167;QD=58.5877;RBI=0.0429885;REFB=0;REVB=0.0330445;RO=0;SAF=14;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.71297e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.36308e-05;OID=.;OPOS=11831615;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:19:14:0:0:19:14:0:0
chr1	11832311	.	G	C	582.05	PASS	AF=0.975;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0457858;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.6911;QD=58.2052;RBI=0.10808;REFB=-0.145128;REVB=0.0979023;RO=1;SAF=19;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0240334;STB=0.512814;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=0.00496934;OID=.;OPOS=11832311;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:40:40:1:1:39:39:0.975:20:19:1:0:20:19:1:0
chr1	11836628	.	T	C	708.56	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0107949;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.008;QD=62.9829;RBI=0.0258447;REFB=0;REVB=0.0234823;RO=0;SAF=17;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.9124e-05;OID=.;OPOS=11836628;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:28:17:0:0:28:17:0:0
chr1	11836682	.	C	T	446.99	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0372256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.212;QD=57.6759;RBI=0.041915;REFB=0;REVB=0.0192645;RO=0;SAF=14;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00025711;OID=.;OPOS=11836682;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:17:14:0:0:17:14:0:0
chr1	11838848	.	G	T	728.81	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0653976;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.471;QD=57.1618;RBI=0.0664297;REFB=0;REVB=0.0116645;RO=0;SAF=25;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94283e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000332181;OID=.;OPOS=11838848;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:26:25:0:0:26:25:0:0
chr1	11839966	.	G	A	804.73	PASS	AF=0.982759;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0410505;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.7178;QD=55.4987;RBI=0.0615652;REFB=-0.0912836;REVB=0.0458817;RO=1;SAF=27;SAR=30;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0154619;STB=0.508194;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.00169588;OID=.;OPOS=11839966;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:58:58:1:1:57:57:0.982759:30:27:0:1:30:27:0:1
chr1	11839998	.	T	C	785.21	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103292;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.985;QD=57.106;RBI=0.0224865;REFB=0;REVB=0.0199737;RO=0;SAF=30;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.30121e-05;OID=.;OPOS=11839998;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:25:30:0:0:25:30:0:0
chr1	11844330	.	C	T	1289.53	PASS	AF=1;AO=83;DP=84;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00194705;FXX=0.0119033;HRUN=2;LEN=1;MLLD=244.43;QD=62.146;RBI=0.00306693;REFB=0;REVB=0.00236962;RO=0;SAF=35;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.10069e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.21814e-06;OID=.;OPOS=11844330;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:83:0:0:83:83:1:48:35:0:0:48:35:0:0
chr1	11849447	.	A	G	708.56	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000282805;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.49;QD=62.9828;RBI=0.00935165;REFB=0;REVB=0.00934738;RO=0;SAF=33;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.05915e-05;OID=.;OPOS=11849447;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:12:33:0:0:12:33:0:0
chr1	11854457	.	G	A	575.76	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000857883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.388;QD=60.6062;RBI=0.0320298;REFB=0;REVB=-0.0320183;RO=0;SAF=18;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.51048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000140015;OID=.;OPOS=11854457;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:20:18:0:0:20:18:0:0
chr1	11884555	.	A	G	473.42	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00484899;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.164;QD=57.3837;RBI=0.050996;REFB=0;REVB=0.0507649;RO=0;SAF=19;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.47712e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000180549;OID=.;OPOS=11884555;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:33:0:0:31:33:1:12:19:0:0:13:20:0:0
chr1	11968216	.	G	A	99.24	PASS	AF=0.444444;AO=12;DP=27;FAO=12;FDP=27;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.00427021;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.557;QD=14.7015;RBI=0.00912828;REFB=0.000439334;REVB=0.00806788;RO=15;SAF=4;SAR=8;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134759;STB=0.578812;STBP=0.482;TYPE=snp;VARB=-0.00076687;OID=.;OPOS=11968216;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:15:15:12:12:0.444444:8:4:7:8:8:4:7:8
chr1	11968230	.	T	C	123.35	PASS	AF=0.419355;AO=12;DP=31;FAO=13;FDP=31;FR=.,HEALED;FRO=16;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=0.0100759;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.299;QD=15.9159;RBI=0.0143936;REFB=-0.00653021;REVB=0.0102787;RO=16;SAF=6;SAR=6;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.184269;STB=0.622855;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=0.0106595;OID=.;OPOS=11968230;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:16:16:12:13:0.419355:6:6:5:11:6:7:5:11
chr1	11968235	.	T	C	138.79	PASS	AF=0.5;AO=15;DP=31;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.00465277;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.8;QD=18.5054;RBI=0.00650322;REFB=-0.00799328;REVB=-0.00454352;RO=15;SAF=5;SAR=10;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124555;STB=0.571331;STBP=0.486;TYPE=snp;VARB=0.0125709;OID=.;OPOS=11968235;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:30:15:15:15:15:0.5:10:5:7:8:10:5:7:8
chr1	11968273	.	A	G	557.07	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0199057;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.8858;QD=60.2236;RBI=0.0489615;REFB=0;REVB=0.0447324;RO=0;SAF=15;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.82408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00120908;OID=.;OPOS=11968273;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:22:15:0:0:22:15:0:0
chr1	11968316	.	T	TA	62.39	PASS	AF=0.28125;AO=9;DP=32;FAO=9;FDP=32;FR=.;FRO=23;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=-0.0139951;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=289.942;QD=7.79849;RBI=0.0152936;REFB=-0.00355898;REVB=-0.00616699;RO=23;SAF=4;SAR=5;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0626681;STB=0.538922;STBP=0.787;TYPE=ins;VARB=0.0110972;OID=.;OPOS=11968317;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.28125:9:32:9:32:23:4:5:9:14:62:23:4:5:9:14
chr1	11969917	.	A	G	306.33	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0369267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.4747;QD=53.2754;RBI=0.0494295;REFB=0;REVB=0.0328586;RO=0;SAF=6;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.9951e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00120633;OID=.;OPOS=11969917;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:17:6:0:0:17:6:0:0
chr1	11983205	.	C	CG	113.68	PASS	AF=1;AO=3;DP=13;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.165799;FXX=0.076864;HRUN=0;LEN=1;MLLD=114.856;QD=37.8925;RBI=0.16581;REFB=-0.182916;REVB=-0.00193202;RO=9;SAF=0;SAR=3;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.670564;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00263468;OID=.;OPOS=11983206;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:3:13:12:12:0:5:7:0:0:3:9:0:3:5:4
chr1	11983206	.	A	G	84.37	PASS	AF=0.769231;AO=9;DP=12;FAO=10;FDP=13;FR=.;FRO=3;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0480414;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=151.656;QD=25.9606;RBI=0.0489435;REFB=-0.0283188;REVB=-0.00935357;RO=3;SAF=5;SAR=4;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.240503;STB=0.636096;STBP=0.111;TYPE=snp;VARB=0.000967921;OID=.;OPOS=11983206;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:12:13:3:3:9:10:0.769231:4:5:0:3:4:6:0:3
chr1	12009956	.	G	A	635.57	PASS	AF=1;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00913247;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.8963;QD=62.0072;RBI=0.0889703;REFB=0;REVB=0.0885004;RO=0;SAF=24;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.2194e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00221125;OID=.;OPOS=12009956;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:41:0:0:41:41:1:17:24:0:0:17:24:0:0
chr1	12010469	.	G	T	1268.48	PASS	AF=0.988095;AO=83;DP=84;FAO=83;FDP=84;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0109683;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.134;QD=60.404;RBI=0.0168538;REFB=-0.0383679;REVB=-0.0127964;RO=1;SAF=46;SAR=37;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0101856;STB=0.505375;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.000701271;OID=.;OPOS=12010469;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:84:84:1:1:83:83:0.988095:37:46:1:0:37:46:1:0
chr1	12026355	.	A	C	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00919248;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.025;QD=53.2771;RBI=0.0362601;REFB=0;REVB=0.0350756;RO=0;SAF=15;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000228126;OID=.;OPOS=12026355;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:8:15:0:0:8:15:0:0
chr1	12065841	.	C	T	1246.1	PASS	AF=1;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0345599;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=213.639;QD=61.5359;RBI=0.0346062;REFB=0;REVB=0.00179017;RO=0;SAF=31;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.35858e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.66966e-05;OID=.;OPOS=12065841;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:81:0:0:81:81:1:50:31:0:0:50:31:0:0
chr1	12082334	.	A	T	235.5	PASS	AF=0.578947;AO=22;DP=39;FAO=22;FDP=38;FR=.;FRO=16;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=0.0600618;FXX=0.0256345;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.3924;QD=24.7892;RBI=0.0646704;REFB=0.0169207;REVB=-0.0239759;RO=17;SAF=11;SAR=11;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161305;STB=0.578877;STBP=0.251;TYPE=snp;VARB=-0.0127124;OID=.;OPOS=12082334;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:38:17:16:22:22:0.578947:11:11:5:12:11:11:5:11
chr1	12082461	.	C	T	130.65	PASS	AF=0.394737;AO=15;DP=38;FAO=15;FDP=38;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=0.0210191;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=246.347;QD=13.7531;RBI=0.0216187;REFB=-0.00737395;REVB=0.00505615;RO=23;SAF=5;SAR=10;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0167764;STB=0.509791;STBP=0.959;TYPE=snp;VARB=0.0124842;OID=.;OPOS=12082461;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:23:23:15:15:0.394737:10:5:8:15:10:5:8:15
chr1	12082926	.	A	G	347.67	PASS	AF=0.962963;AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=27;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.000791132;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.439;QD=51.5074;RBI=0.00377569;REFB=-0.097923;REVB=-0.00369188;RO=1;SAF=9;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0488217;STB=0.526295;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.0048881;OID=.;OPOS=12082926;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:27:27:1:1:26:26:0.962963:17:9:1:0:17:9:1:0
chr1	12164437	.	C	T	788.06	PASS	AF=0.966102;AO=56;DP=59;FAO=57;FDP=59;FR=.;FRO=2;FSAF=29;FSAR=28;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0399615;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.455;QD=53.4281;RBI=0.0433928;REFB=-0.174593;REVB=0.016912;RO=2;SAF=28;SAR=28;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0324906;STB=0.516661;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=0.00389072;OID=.;OPOS=12164437;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:59:59:2:2:56:57:0.966102:28:28:2:0:28:29:2:0
chr1	12175729	.	C	T	754.67	PASS	AF=0.981818;AO=54;DP=55;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0245112;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=198.514;QD=54.885;RBI=0.0261875;REFB=-0.123247;REVB=0.00921876;RO=0;SAF=37;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.08382e-08;STB=0.51428;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=0.00041128;OID=.;OPOS=12175729;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:55:55:0:1:54:54:0.981818:17:37:0:0:17:37:0:1
chr1	12198297	.	T	C	3371.79	PASS	AF=1;AO=215;DP=218;FAO=216;FDP=216;FR=.;FRO=0;FSAF=101;FSAR=115;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0134281;FXX=0.00917389;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.99;QD=62.4405;RBI=0.0271391;REFB=0;REVB=0.0235842;RO=0;SAF=101;SAR=114;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.23018e-07;OID=.;OPOS=12198297;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:18:218:216:0:0:215:216:1:114:101:0:0:115:101:0:0
chr1	12248942	.	A	G	160.52	PASS	AF=0.485714;AO=17;DP=35;FAO=17;FDP=35;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=13;FWDB=0.0328054;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=160.774;QD=18.3451;RBI=0.032955;REFB=-0.00678883;REVB=0.00313649;RO=17;SAF=6;SAR=11;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0578869;STB=0.543347;STBP=0.686;TYPE=snp;VARB=0.00739368;OID=.;OPOS=12248942;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:17:18:17:17:0.485714:11:6:5:12:11:6:5:13
chr1	12251808	.	T	G	102.51	PASS	AF=0.521739;AO=12;DP=23;FAO=12;FDP=23;FR=.;FRO=11;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=0.00757577;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=228.368;QD=17.8275;RBI=0.0118873;REFB=-0.00903022;REVB=-0.00916052;RO=11;SAF=9;SAR=3;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.404385;STB=0.732936;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.00743632;OID=.;OPOS=12251808;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:23:23:11:11:12:12:0.521739:3:9:3:8:3:9:3:8
chr1	12252955	.	T	G	176.27	PASS	AF=0.529412;AO=18;DP=34;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=3;FSRR=13;FWDB=0.00224192;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.56;QD=20.7372;RBI=0.0179373;REFB=0.0106503;REVB=0.0177967;RO=16;SAF=6;SAR=12;SRF=3;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14541;STB=0.581312;STBP=0.402;TYPE=snp;VARB=-0.00760674;OID=.;OPOS=12252955;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:16:16:18:18:0.529412:12:6:3:13:12:6:3:13
chr1	12339619	.	A	T	143.96	PASS	AF=0.421053;AO=16;DP=38;FAO=16;FDP=38;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.00470554;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.83;QD=15.1538;RBI=0.00476475;REFB=-0.0092321;REVB=0.000748786;RO=22;SAF=10;SAR=6;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128177;STB=0.57423;STBP=0.472;TYPE=snp;VARB=0.0131197;OID=.;OPOS=12339619;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:22:22:16:16:0.421053:6:10:11:11:6:10:11:11
chr1	12401868	.	A	C	748.96	PASS	AF=1;AO=39;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.062398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.64;QD=63.7411;RBI=0.0786556;REFB=0;REVB=0.0478872;RO=0;SAF=20;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.3303e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000342571;OID=.;OPOS=12401868;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:39:47:1:19:20:0:0:21:26:0:0
chr1	12557635	.	G	A	96.22	PASS	AF=0.375;AO=12;DP=31;FAO=12;FDP=32;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.00494028;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.753;QD=12.0276;RBI=0.00619808;REFB=-0.0112283;REVB=-0.00374297;RO=18;SAF=10;SAR=2;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.35593;STB=0.723259;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=0.0258465;OID=.;OPOS=12557635;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:31:32:18:20:12:12:0.375:2:10:10:8:2:10:11:9
chr1	12628188	.	T	C	283.23	PASS	AF=0.577778;AO=26;DP=46;FAO=26;FDP=45;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=4;FWDB=-0.00849318;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.595;QD=25.1763;RBI=0.0420938;REFB=-0.0107617;REVB=0.0412281;RO=19;SAF=10;SAR=16;SRF=15;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.30161;STB=0.666543;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.0134591;OID=.;OPOS=12628188;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:45:19:19:26:26:0.577778:16:10:15:4:16:10:15:4
chr1	12638964	.	T	C	308.29	PASS	AF=0.613636;AO=27;DP=44;FAO=27;FDP=44;FR=.;FRO=17;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.00369005;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.72;QD=28.0261;RBI=0.00372674;REFB=-0.00999182;REVB=0.000521688;RO=17;SAF=13;SAR=14;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0746571;STB=0.541146;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=0.0211147;OID=.;OPOS=12638964;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:17:17:27:27:0.613636:14:13:10:7:14:13:10:7
chr1	12639289	.	C	T	238.24	PASS	AF=0.457627;AO=27;DP=59;FAO=27;FDP=59;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=20;FWDB=-0.00199846;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=118.915;QD=16.1522;RBI=0.0456603;REFB=-0.0259655;REVB=-0.0456166;RO=28;SAF=12;SAR=15;SRF=9;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115002;STB=0.538433;STBP=0.613;TYPE=snp;VARB=0.0232602;OID=.;OPOS=12639289;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:28:32:27:27:0.457627:15:12:9:19:15:12:12:20
chr1	12639389	.	T	C	321.63	PASS	AF=0.443038;AO=34;DP=78;FAO=35;FDP=79;FR=.;FRO=44;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=0.0146864;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=296.159;QD=16.2852;RBI=0.0148565;REFB=-0.00570491;REVB=0.00224209;RO=44;SAF=16;SAR=18;SRF=22;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0294578;STB=0.507955;STBP=0.883;TYPE=snp;VARB=0.00656684;OID=.;OPOS=12639389;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:79:44:44:34:35:0.443038:18:16:22:22:18:17:22:22
chr1	12776344	.	A	T	1382.49	PASS	AF=1;AO=87;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00870578;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.641;QD=62.8405;RBI=0.0369977;REFB=0;REVB=0.0359588;RO=0;SAF=44;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000125834;OID=.;OPOS=12776344;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:88:88:0:0:87:88:1:43:44:0:0:43:45:0:0
chr1	12779560	.	T	C	799.89	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00820646;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.061;QD=57.1351;RBI=0.0226062;REFB=0;REVB=0.021064;RO=0;SAF=34;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.66202e-05;OID=.;OPOS=12779560;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:56:0:0:55:56:1:21:34:0:0:22:34:0:0
chr1	12779618	.	T	C	920.76	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0336041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=297.332;QD=58.4608;RBI=0.0338285;REFB=0;REVB=0.00388962;RO=0;SAF=33;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.7886e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.97562e-05;OID=.;OPOS=12779618;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:63:0:0:60:63:1:27:33:0:0:27:36:0:0
chr1	12785493	.	TG	T,TT	386.28	PASS	AF=0.0357143,0.964286;AO=5,22;DP=27;FAO=1,27;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=0,13;FSAR=1,14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00071089,-0.000407489;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=214.332,218.912;QD=55.1834;RBI=0.0337928,0.0498238;REFB=0,0;REVB=0.0337853,0.0498221;RO=0;SAF=2,11;SAR=3,11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.000985788,0.00451169;OID=.,.;OPOS=12785494,12785494;OREF=G,G;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0357143,0.964286:5,22:27:1,27:28:0:0,13:1,14:0:0:6:0:2,11:3,11:0:0
chr1	12799736	.	C	T	1400.38	PASS	AF=0.989011;AO=89;DP=90;FAO=90;FDP=91;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=49;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0467534;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.058;QD=61.555;RBI=0.0468737;REFB=-0.0264807;REVB=0.00335622;RO=1;SAF=41;SAR=48;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0114189;STB=0.506023;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=0.000339752;OID=.;OPOS=12799736;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:90:91:1:1:89:90:0.989011:48:41:1:0:49:41:1:0
chr1	12820870	.	T	C	393.28	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0200502;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=174.872;QD=56.1831;RBI=0.0231744;REFB=0;REVB=0.0116208;RO=0;SAF=20;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.75204e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000102535;OID=.;OPOS=12820870;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:8:20:0:0:8:20:0:0
chr1	12835868	.	T	C	1190.44	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00281647;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.37;QD=61.048;RBI=0.0374299;REFB=0;REVB=0.0373238;RO=0;SAF=45;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.77202e-05;OID=.;OPOS=12835868;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:78:0:0:77:78:1:32:45:0:0:32:46:0:0
chr1	12837634	.	T	A	1641.51	PASS	AF=1;AO=109;DP=109;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0163503;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.4398;QD=60.2389;RBI=0.0523221;REFB=0;REVB=-0.0497018;RO=0;SAF=54;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000397113;OID=.;OPOS=12837634;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:109:109:0:0:109:109:1:55:54:0:0:55:54:0:0
chr1	12853403	.	A	C	34.71	PASS	AF=0.2;AO=6;DP=30;FAO=6;FDP=30;FR=.;FRO=24;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=17;FWDB=-0.0151663;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.9212;QD=4.62866;RBI=0.0469193;REFB=0.00228893;REVB=0.0444005;RO=24;SAF=4;SAR=2;SRF=7;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.422343;STB=0.774727;STBP=0.194;TYPE=snp;VARB=-0.004642;OID=.;OPOS=12853403;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:30:30:24:24:6:6:0.2:2:4:7:17:2:4:7:17
chr1	12854428	.	C	T	116.67	PASS	AF=0.35;AO=14;DP=40;FAO=14;FDP=40;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=-0.00267159;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=223.909;QD=11.6673;RBI=0.0121602;REFB=0.00530573;REVB=0.0118631;RO=26;SAF=6;SAR=8;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161655;STB=0.595609;STBP=0.405;TYPE=snp;VARB=-0.0100338;OID=.;OPOS=12854428;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:26:26:14:14:0.35:8:6:15:11:8:6:15:11
chr1	12854530	.	C	G	352.88	PASS	AF=0.62963;AO=33;DP=53;FAO=34;FDP=54;FR=.;FRO=20;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=20;FWDB=-0.00647978;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.7391;QD=26.1391;RBI=0.00753639;REFB=0.0445948;REVB=-0.00384832;RO=0;SAF=19;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.71297e-08;STB=0.699896;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=-0.0146119;OID=.;OPOS=12854530;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:54:0:20:33:34:0.62963:14:19:0:0:15:19:0:20
chr1	12854544	.	T	C	67.17	PASS	AF=0.196078;AO=9;DP=50;FAO=10;FDP=51;FR=.;FRO=41;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=25;FWDB=0.01824;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.145;QD=5.26788;RBI=0.0248282;REFB=-0.00617867;REVB=0.0168446;RO=41;SAF=3;SAR=6;SRF=16;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0751788;STB=0.580618;STBP=0.629;TYPE=snp;VARB=0.0232619;OID=.;OPOS=12854544;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:50:51:41:41:9:10:0.196078:6:3:16:25:7:3:16:25
chr1	12855724	.	T	C	64.07	PASS	AF=0.333333;AO=9;DP=27;FAO=9;FDP=27;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=14;FSRR=4;FWDB=0.003823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.418;QD=9.49157;RBI=0.0361555;REFB=-0.00904658;REVB=-0.0359528;RO=17;SAF=8;SAR=1;SRF=13;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.247444;STB=0.644779;STBP=0.437;TYPE=snp;VARB=0.0165063;OID=.;OPOS=12855724;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:27:27:17:18:9:9:0.333333:1:8:13:4:1:8:14:4
chr1	12855835	.	C	G	500.22	PASS	AF=1;AO=29;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.200041;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.4622;QD=55.5802;RBI=0.206639;REFB=0;REVB=0.0518008;RO=0;SAF=8;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.4007e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0199521;OID=.;OPOS=12855835;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:29:36:1:21:8:0:0:26:10:0:0
chr1	12855844	.	GG	AC,GC	489.04	PASS	AF=0.305556,0.666667;AO=11,23;DP=35;FAO=11,24;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=1,9;FSAR=10,15;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0198314,-0.0198303;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=2,1;MLLD=55.4997,74.0868;QD=54.3382;RBI=0.0205361,0.0285703;REFB=-0.107505,-0.131288;REVB=-0.00533358,-0.0205676;RO=0;SAF=1,8;SAR=10,15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.523767,0.516116;STBP=0.669,0.527;TYPE=mnp,snp;VARB=0.00853883,0.00191916;OID=.,.;OPOS=12855844,12855845;OREF=GG,G;OALT=AC,C;OMAPALT=AC,GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:83:35:36:0:1:11,23:11,24:0.305556,0.666667:10,15:1,8:0:0:10,15:1,9:0:1
chr1	12855878	.	A	C	179.28	PASS	AF=0.447368;AO=17;DP=38;FAO=17;FDP=38;FR=.,HEALED;FRO=19;FSAF=3;FSAR=14;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=0.000951607;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=203.545;QD=18.871;RBI=0.0136191;REFB=-0.0199613;REVB=0.0135858;RO=18;SAF=3;SAR=14;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.203581;STB=0.608554;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.0238469;OID=.;OPOS=12855878;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:18:19:17:17:0.447368:14:3:6:12:14:3:6:13
chr1	12856010	.	CA	AC,GA	191.19	PASS	AF=0,0.434783;AO=2,18;DP=47;FAO=0,20;FDP=46;FR=.;FRO=26;FSAF=0,12;FSAR=0,8;FSRF=18;FSRR=8;FWDB=-0.00407964,0.0132879;FXX=0.0212721;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=148.543,77.0715;QD=16.6248;RBI=0.0466501,0.0139849;REFB=-0.00659498,-0.00570194;REVB=-0.0464714,0.00435988;RO=25;SAF=2,10;SAR=0,8;SRF=17;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.415184,-0.129868;STB=0.5,0.555502;STBP=1,0.531;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0311111,-0.0329771;OID=.,.;OPOS=12856010,12856010;OREF=CA,C;OALT=AC,G;OMAPALT=AC,GA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:47:46:25:26:2,18:0,20:0,0.434783:0,8:2,10:17:8:0,8:0,12:18:8
chr1	12856106	.	A	G	32.59	PASS	AF=0.12766;AO=6;DP=47;FAO=6;FDP=47;FR=.;FRO=41;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=23;FSRR=18;FWDB=-0.0756921;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.361;QD=2.77365;RBI=0.0776764;REFB=-0.00373129;REVB=-0.017445;RO=41;SAF=2;SAR=4;SRF=23;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.263377;STB=0.693814;STBP=0.344;TYPE=snp;VARB=0.0144799;OID=.;OPOS=12856106;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:32:47:47:41:41:6:6:0.12766:4:2:23:18:4:2:23:18
chr1	12856111	.	C	T	59.16	PASS	AF=0.2;AO=9;DP=45;FAO=9;FDP=45;FR=.;FRO=36;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=-0.021161;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=245.881;QD=5.25878;RBI=0.024255;REFB=-0.00706202;REVB=-0.011854;RO=36;SAF=4;SAR=5;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134523;STB=0.588042;STBP=0.609;TYPE=snp;VARB=0.03401;OID=.;OPOS=12856111;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:59:45:45:36:36:9:9:0.2:5:4:20:16:5:4:20:16
chr1	12887549	.	T	C	990.55	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0131514;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.809;QD=59.1372;RBI=0.025366;REFB=0;REVB=-0.0216904;RO=0;SAF=31;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000355431;OID=.;OPOS=12887549;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:36:31:0:0:36:31:0:0
chr1	12888601	.	G	GC	116.99	PASS	AF=1;AO=10;DP=20;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.275431;FXX=0.111049;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.3754;QD=29.2476;RBI=0.275777;REFB=-0.0939235;REVB=0.0138046;RO=9;SAF=6;SAR=4;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0373874;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.0347736;OID=.;OPOS=12888602;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:1:10:20:16:16:0:10:6:0:0:5:9:6:4:5:4
chr1	12907379	.	T	C	111.06	PASS	AF=0.28;AO=13;DP=50;FAO=14;FDP=50;FR=.;FRO=36;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=24;FSRR=12;FWDB=-0.00992567;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.726;QD=8.88506;RBI=0.0226026;REFB=-0.0155521;REVB=0.0203066;RO=36;SAF=8;SAR=5;SRF=24;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0660885;STB=0.518841;STBP=0.889;TYPE=snp;VARB=0.0281407;OID=.;OPOS=12907379;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:36:36:13:14:0.28:5:8:24:12:5:9:24:12
chr1	12907449	.	C	G	157.81	PASS	AF=0.447368;AO=17;DP=38;FAO=17;FDP=38;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=-0.007348;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.868;QD=16.6119;RBI=0.00735869;REFB=-0.0135084;REVB=-0.000396517;RO=20;SAF=10;SAR=7;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0369472;STB=0.509543;STBP=0.921;TYPE=snp;VARB=0.0164339;OID=.;OPOS=12907449;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:20:21:17:17:0.447368:7:10:11:9:7:10:12:9
chr1	12907496	.	T	C	71.69	PASS	AF=0.277778;AO=10;DP=36;FAO=10;FDP=36;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=-0.0207213;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=215.053;QD=7.96581;RBI=0.0211248;REFB=-0.00916144;REVB=-0.00410911;RO=26;SAF=5;SAR=5;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0447464;STB=0.527722;STBP=0.867;TYPE=snp;VARB=0.0245794;OID=.;OPOS=12907496;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:71:36:36:26:26:10:10:0.277778:5:5:14:12:5:5:14:12
chr1	12907507	.	CT	TC	60.95	PASS	AF=0.25;AO=9;DP=36;FAO=9;FDP=36;FR=.;FRO=27;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=0.0139653;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=43.4624;QD=6.77245;RBI=0.0384061;REFB=0.00510394;REVB=0.0357771;RO=25;SAF=4;SAR=5;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0882612;STB=0.58264;STBP=0.596;TYPE=mnp;VARB=-0.0109269;OID=.;OPOS=12907507;OREF=CT;OALT=TC;OMAPALT=TC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:60:36:36:25:27:9:9:0.25:5:4:13:12:5:4:15:12
chr1	12907533	.	T	C	72.7	PASS	AF=0.30303;AO=10;DP=33;FAO=10;FDP=33;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=0.0182;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=185.67;QD=8.81175;RBI=0.0210667;REFB=-0.00282068;REVB=-0.0106096;RO=23;SAF=5;SAR=5;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174147;STB=0.605858;STBP=0.428;TYPE=snp;VARB=0.00777566;OID=.;OPOS=12907533;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:33:33:23:23:10:10:0.30303:5:5:15:8:5:5:15:8
chr1	12907633	.	G	A	196.39	PASS	AF=0.292135;AO=26;DP=89;FAO=26;FDP=89;FR=.;FRO=63;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=31;FSRR=32;FWDB=-0.0129949;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.085;QD=8.82657;RBI=0.0241636;REFB=-0.00420217;REVB=0.0203719;RO=63;SAF=9;SAR=17;SRF=31;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179046;STB=0.606517;STBP=0.204;TYPE=snp;VARB=0.0169021;OID=.;OPOS=12907633;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:63:63:26:26:0.292135:17:9:31:32:17:9:31:32
chr1	12907762	.	T	C	267.02	PASS	AF=0.224599;AO=42;DP=189;FAO=42;FDP=187;FR=.;FRO=145;FSAF=13;FSAR=29;FSRF=72;FSRR=73;FWDB=-0.00506332;FXX=0.0105815;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.194;QD=5.71162;RBI=0.00778646;REFB=-0.00742963;REVB=-0.00591539;RO=140;SAF=13;SAR=29;SRF=72;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.264634;STB=0.650151;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.028383;OID=.;OPOS=12907762;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:189:187:140:145:42:42:0.224599:29:13:72:68:29:13:72:73
chr1	12907777	.	T	C	1265.4	PASS	AF=0.618785;AO=112;DP=182;FAO=112;FDP=181;FR=.;FRO=69;FSAF=56;FSAR=56;FSRF=30;FSRR=39;FWDB=-0.0380081;FXX=0.0054942;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.5825;QD=27.9646;RBI=0.0569173;REFB=0.0255125;REVB=0.042367;RO=69;SAF=56;SAR=56;SRF=30;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0460165;STB=0.524857;STBP=0.376;TYPE=snp;VARB=-0.0169745;OID=.;OPOS=12907777;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:182:181:69:69:112:112:0.618785:56:56:30:39:56:56:30:39
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chr1	12907798	.	A	C	102.44	PASS	AF=0.126316;AO=24;DP=187;FAO=24;FDP=190;FR=.;FRO=166;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=82;FSRR=84;FWDB=-0.022518;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=217.56;QD=2.15659;RBI=0.022858;REFB=-0.00197834;REVB=-0.00392766;RO=163;SAF=16;SAR=8;SRF=80;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.222319;STB=0.652354;STBP=0.11;TYPE=snp;VARB=0.0124378;OID=.;OPOS=12907798;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:187:190:163:166:24:24:0.126316:8:16:80:83:8:16:82:84
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chr1	12907885	.	T	C	773.88	PASS	AF=0.445652;AO=82;DP=184;FAO=82;FDP=184;FR=.;FRO=102;FSAF=51;FSAR=31;FSRF=57;FSRR=45;FWDB=0.00951896;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.688;QD=16.8236;RBI=0.0102296;REFB=-0.00407906;REVB=0.00374611;RO=101;SAF=51;SAR=31;SRF=56;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0698314;STB=0.536536;STBP=0.375;TYPE=snp;VARB=0.00465219;OID=.;OPOS=12907885;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:184:184:101:102:82:82:0.445652:31:51:56:45:31:51:57:45
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chr1	12919111	.	G	A	80.37	PASS	AF=0.186667;AO=14;DP=75;FAO=14;FDP=75;FR=.;FRO=61;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=27;FSRR=34;FWDB=-0.00609438;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.8381;QD=4.28645;RBI=0.0132283;REFB=0.00140688;REVB=0.0117408;RO=60;SAF=7;SAR=7;SRF=27;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0625664;STB=0.546601;STBP=0.74;TYPE=snp;VARB=-0.00581377;OID=.;OPOS=12919111;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:80:75:75:60:61:14:14:0.186667:7:7:27:33:7:7:27:34
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chr1	12919891	.	G	T	360.61	PASS	AF=0.366667;AO=44;DP=120;FAO=44;FDP=120;FR=.;FRO=76;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=33;FSRR=43;FWDB=-0.00729306;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.03;QD=12.0202;RBI=0.0170033;REFB=-0.00332122;REVB=-0.0153598;RO=71;SAF=18;SAR=26;SRF=30;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0150437;STB=0.516348;STBP=0.835;TYPE=snp;VARB=0.00531824;OID=.;OPOS=12919891;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:120:71:76:44:44:0.366667:26:18:30:41:26:18:33:43
chr1	12919934	.	A	G	367.51	PASS	AF=0.354331;AO=45;DP=127;FAO=45;FDP=127;FR=.;FRO=82;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=33;FSRR=49;FWDB=0.0206272;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.8296;QD=11.5753;RBI=0.022062;REFB=0.00888059;REVB=0.00782631;RO=81;SAF=18;SAR=27;SRF=32;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00578292;STB=0.501639;STBP=0.99;TYPE=snp;VARB=-0.0186429;OID=.;OPOS=12919934;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:127:127:81:82:45:45:0.354331:27:18:32:49:27:18:33:49
chr1	12921127	.	A	G	187.61	PASS	AF=0.294118;AO=24;DP=85;FAO=25;FDP=85;FR=.;FRO=60;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=38;FSRR=22;FWDB=0.00871787;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.945;QD=8.82885;RBI=0.0143745;REFB=-0.00149455;REVB=0.0114291;RO=61;SAF=7;SAR=17;SRF=38;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.390214;STB=0.714642;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.00407877;OID=.;OPOS=12921127;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:61:60:24:25:0.294118:17:7:38:23:17:8:38:22
chr1	12921332	.	T	C	50.63	PASS	AF=0.2;AO=8;DP=40;FAO=8;FDP=40;FR=.;FRO=32;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=-0.0440823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.7699;QD=5.06333;RBI=0.0480397;REFB=-0.000487789;REVB=0.0190935;RO=32;SAF=2;SAR=6;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.31426;STB=0.709978;STBP=0.188;TYPE=snp;VARB=0.00257761;OID=.;OPOS=12921332;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:50:40:40:32:32:8:8:0.2:6:2:16:16:6:2:16:16
chr1	13001312	.	C	G	266.16	PASS	AF=0.5;AO=25;DP=50;FAO=25;FDP=50;FR=.;FRO=25;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.0219882;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.342;QD=21.2931;RBI=0.0227508;REFB=0.00434406;REVB=-0.00584076;RO=25;SAF=17;SAR=8;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152979;STB=0.586136;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=-0.00375093;OID=.;OPOS=13001312;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:25:25:25:25:0.5:8:17:13:12:8:17:13:12
chr1	13052789	.	G	A	1088.27	PASS	AF=0.661871;AO=92;DP=139;FAO=92;FDP=139;FR=.;FRO=47;FSAF=53;FSAR=39;FSRF=23;FSRR=24;FWDB=-0.00579288;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.5174;QD=31.317;RBI=0.0467033;REFB=-0.028561;REVB=-0.0463427;RO=47;SAF=53;SAR=39;SRF=23;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0551919;STB=0.529741;STBP=0.36;TYPE=snp;VARB=0.00607511;OID=.;OPOS=13052789;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:139:139:47:47:92:92:0.661871:39:53:23:24:39:53:23:24
chr1	13052871	.	C	T	1834.26	PASS	AF=0.647303;AO=155;DP=240;FAO=156;FDP=241;FR=.;FRO=85;FSAF=83;FSAR=73;FSRF=40;FSRR=45;FWDB=0.0124999;FXX=0.00413206;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.881;QD=30.4442;RBI=0.0166307;REFB=-0.0132008;REVB=-0.0109696;RO=85;SAF=82;SAR=73;SRF=40;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0385209;STB=0.521704;STBP=0.347;TYPE=snp;VARB=0.0069844;OID=.;OPOS=13052871;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:240:241:85:85:155:156:0.647303:73:82:40:45:73:83:40:45
chr1	13052907	.	T	C	1562.27	PASS	AF=0.620536;AO=137;DP=225;FAO=139;FDP=224;FR=.;FRO=85;FSAF=71;FSAR=68;FSRF=39;FSRR=46;FWDB=0.00394726;FXX=0.00884917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.124;QD=27.8977;RBI=0.00804897;REFB=-0.0101345;REVB=-0.00701463;RO=84;SAF=69;SAR=68;SRF=38;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0361047;STB=0.51971;STBP=0.419;TYPE=snp;VARB=0.00720239;OID=.;OPOS=13052907;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:225:224:84:85:137:139:0.620536:68:69:38:46:68:71:39:46
chr1	13183225	.	T	C	50.64	PASS	AF=0.2;AO=8;DP=40;FAO=8;FDP=40;FR=.;FRO=32;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=21;FSRR=11;FWDB=-0.0163401;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=218.539;QD=5.0644;RBI=0.0165569;REFB=0.000390984;REVB=-0.00267081;RO=32;SAF=7;SAR=1;SRF=21;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.359373;STB=0.749251;STBP=0.207;TYPE=snp;VARB=-0.000834236;OID=.;OPOS=13183225;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:50:40:40:32:32:8:8:0.2:1:7:21:11:1:7:21:11
chr1	13183237	.	CT	TC	60.51	PASS	AF=0.209302;AO=9;DP=44;FAO=9;FDP=43;FR=.;FRO=34;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=-0.0611871;FXX=0.0227221;HRUN=2;LEN=2;MLLD=57.2454;QD=5.62852;RBI=0.0871557;REFB=-0.0232921;REVB=-0.0620665;RO=33;SAF=8;SAR=1;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.514678;STB=0.838645;STBP=0.04;TYPE=mnp;VARB=0.0732479;OID=.;OPOS=13183237;OREF=CT;OALT=TC;OMAPALT=TC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:60:44:43:33:34:9:9:0.209302:1:8:17:16:1:8:18:16
chr1	13183243	.	T	C	60.27	PASS	AF=0.225;AO=9;DP=40;FAO=9;FDP=40;FR=.;FRO=31;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=-0.0134304;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=147.304;QD=6.02688;RBI=0.013822;REFB=-0.0119624;REVB=0.00326697;RO=31;SAF=8;SAR=1;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.538093;STB=0.854473;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.0191528;OID=.;OPOS=13183243;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:60:40:40:31:31:9:9:0.225:1:8:15:16:1:8:15:16
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chr1	13183439	.	T	C	2292.2	PASS	AF=1;AO=150;DP=151;FAO=150;FDP=150;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00599552;FXX=0.00662208;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.125;QD=61.1254;RBI=0.0147003;REFB=0;REVB=0.0134221;RO=0;SAF=79;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.75918e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.41466e-05;OID=.;OPOS=13183439;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:151:150:0:0:150:150:1:71:79:0:0:71:79:0:0
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chr1	13183573	.	G	T	77.96	PASS	AF=0.170732;AO=14;DP=82;FAO=14;FDP=82;FR=.;FRO=68;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=35;FSRR=33;FWDB=0.0179544;FXX=0.0120467;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.929;QD=3.80301;RBI=0.0183446;REFB=-0.00278872;REVB=-0.00376383;RO=68;SAF=7;SAR=7;SRF=35;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0184245;STB=0.512178;STBP=0.952;TYPE=snp;VARB=0.0160122;OID=.;OPOS=13183573;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:82:82:68:68:14:14:0.170732:7:7:35:33:7:7:35:33
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chr1	13183615	.	T	C	45.19	PASS	AF=0.142857;AO=8;DP=56;FAO=8;FDP=56;FR=.;FRO=48;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=30;FSRR=18;FWDB=0.00676842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.5049;QD=3.22774;RBI=0.0142074;REFB=-0.00210241;REVB=-0.0124915;RO=48;SAF=1;SAR=7;SRF=30;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.573801;STB=0.895788;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.00842505;OID=.;OPOS=13183615;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:56:56:48:48:8:8:0.142857:7:1:30:18:7:1:30:18
chr1	13219375	.	G	T	179.12	PASS	AF=0.3;AO=24;DP=80;FAO=24;FDP=80;FR=.;FRO=56;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=35;FSRR=21;FWDB=-0.017978;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.3712;QD=8.95622;RBI=0.0526999;REFB=0.0213447;REVB=0.0495386;RO=55;SAF=13;SAR=11;SRF=34;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0917774;STB=0.559274;STBP=0.493;TYPE=snp;VARB=-0.0524231;OID=.;OPOS=13219375;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:55:56:24:24:0.3:11:13:34:21:11:13:35:21
chr1	13448283	.	A	G	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0296065;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.3;QD=43.4856;RBI=0.034858;REFB=0;REVB=0.0183993;RO=0;SAF=7;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000209819;OID=.;OPOS=13448283;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:5:7:0:0:5:7:0:0
chr1	13448351	.	T	C	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0218735;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.474;QD=40.7629;RBI=0.0309449;REFB=0;REVB=0.0218892;RO=0;SAF=5;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.34376e-07;OID=.;OPOS=13448351;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:5:5:0:0:5:5:0:0
chr1	13474934	.	G	A	51.54	PASS	AF=0.636364;AO=7;DP=11;FAO=7;FDP=11;FR=.;FRO=4;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.00166392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.2302;QD=18.7427;RBI=0.0598077;REFB=0.00335242;REVB=0.0597846;RO=4;SAF=1;SAR=6;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.45752;STB=0.77329;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.00114421;OID=.;OPOS=13474934;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:11:11:4:4:7:7:0.636364:6:1:3:1:6:1:3:1
chr1	13474951	.	C	G	69.64	PASS	AF=0.529412;AO=9;DP=17;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.013878;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.695;QD=16.3859;RBI=0.0154813;REFB=-0.00702746;REVB=0.00686101;RO=8;SAF=1;SAR=8;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.349937;STB=0.710535;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.00666662;OID=.;OPOS=13474951;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:17:17:8:8:9:9:0.529412:8:1:3:5:8:1:3:5
chr1	13474974	.	G	A	100.75	PASS	AF=0.48;AO=12;DP=25;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=0.00898094;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.728;QD=16.1207;RBI=0.0394858;REFB=-0.0223269;REVB=0.0384509;RO=13;SAF=2;SAR=10;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190657;STB=0.612036;STBP=0.441;TYPE=snp;VARB=0.0196422;OID=.;OPOS=13474974;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:25:13:13:12:12:0.48:10:2:4:9:10:2:4:9
chr1	13695787	.	C	G	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0306186;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=275.034;QD=46.848;RBI=0.0358895;REFB=0;REVB=0.0187232;RO=0;SAF=7;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000333066;OID=.;OPOS=13695787;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:8:7:0:0:8:7:0:0
chr1	13695816	.	G	A	490.3	PASS	AF=0.971429;AO=29;DP=35;FAO=34;FDP=35;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0126614;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.625;QD=56.0341;RBI=0.0333252;REFB=-0.00300178;REVB=0.0308262;RO=1;SAF=16;SAR=13;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0344827;STB=0.513506;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=0.000642525;OID=.;OPOS=13695816;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:35:35:1:1:29:34:0.971429:13:16:0:1:18:16:0:1
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chr1	13910417	.	C	T	336.26	PASS	AF=0.604167;AO=29;DP=48;FAO=29;FDP=48;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=23;FSRF=3;FSRR=16;FWDB=0.0402238;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=217.604;QD=28.022;RBI=0.0412425;REFB=0.00320215;REVB=0.00911013;RO=19;SAF=6;SAR=23;SRF=3;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0557211;STB=0.530592;STBP=0.73;TYPE=snp;VARB=-0.00208529;OID=.;OPOS=13910417;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:19:19:29:29:0.604167:23:6:3:16:23:6:3:16
chr1	13940864	.	C	G	1578.31	PASS	AF=1;AO=105;DP=106;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0102096;FXX=0.0186898;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.015;QD=60.1261;RBI=0.0115865;REFB=0;REVB=0.00547825;RO=0;SAF=54;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.83539e-05;OID=.;OPOS=13940864;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:106:105:0:0:105:105:1:51:54:0:0:51:54:0:0
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chr1	13944293	.	CCTTT	C	46.04	PASS	AF=0.243902;AO=8;DP=45;FAO=10;FDP=41;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=-0.0105372;FXX=0.0888691;HRUN=2;LEN=4;MLLD=221.887;QD=4.49216;RBI=0.0190626;REFB=-0.00281567;REVB=0.0158855;RO=26;SAF=7;SAR=1;SRF=18;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.319762;STB=0.806145;STBP=0.08;TYPE=del;VARB=0.00730248;OID=.;OPOS=13944294;OREF=CTTT;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.243902:8:45:10:41:31:9:1:19:12:46:26:7:1:18:8
chr1	13944326	.	T	C	222.01	PASS	AF=0.6;AO=21;DP=35;FAO=21;FDP=35;FR=.;FRO=14;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=3;FWDB=0.0270047;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.405;QD=25.3726;RBI=0.0276919;REFB=-0.0189105;REVB=-0.00613099;RO=14;SAF=12;SAR=9;SRF=11;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16217;STB=0.589663;STBP=0.246;TYPE=snp;VARB=0.00523259;OID=.;OPOS=13944326;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:14:14:21:21:0.6:9:12:11:3:9:12:11:3
chr1	14105139	.	T	A	136.96	PASS	AF=0.454545;AO=15;DP=33;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=4;FSRR=14;FWDB=-0.0149452;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.067;QD=16.6006;RBI=0.0265503;REFB=-0.057944;REVB=0.0219444;RO=18;SAF=3;SAR=12;SRF=4;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0320536;STB=0.518493;STBP=0.913;TYPE=snp;VARB=0.0522656;OID=.;OPOS=14105139;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:18:18:15:15:0.454545:12:3:4:14:12:3:4:14
chr1	14105298	.	G	A	112.23	PASS	AF=0.481481;AO=13;DP=27;FAO=13;FDP=27;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=-0.0903378;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.3404;QD=16.6259;RBI=0.0959102;REFB=0.0358555;REVB=-0.0322158;RO=14;SAF=8;SAR=5;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.290292;STB=0.66642;STBP=0.124;TYPE=snp;VARB=-0.0469634;OID=.;OPOS=14105298;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:14:14:13:13:0.481481:5:8:4:10:5:8:4:10
chr1	14106394	.	A	ACTC	152.78	PASS	AF=0.377778;AO=17;DP=46;FAO=17;FDP=45;FR=.;FRO=28;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=-0.0355488;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=196.906;QD=13.5806;RBI=0.0379368;REFB=-0.00901028;REVB=0.0132473;RO=29;SAF=4;SAR=13;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.394189;STB=0.739546;STBP=0.017;TYPE=ins;VARB=0.016198;OID=.;OPOS=14106395;OREF=-;OALT=CTC;OMAPALT=ACTC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.377778:17:46:17:45:28:4:13:17:11:99:29:4:13:17:12
chr1	14109114	.	A	G	490.93	PASS	AF=0.5;AO=51;DP=102;FAO=51;FDP=102;FR=.;FRO=51;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=29;FSRR=22;FWDB=0.0163331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.2866;QD=19.252;RBI=0.0265252;REFB=-0.026574;REVB=-0.0209001;RO=51;SAF=25;SAR=26;SRF=29;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0708111;STB=0.539155;STBP=0.448;TYPE=snp;VARB=0.0265212;OID=.;OPOS=14109114;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:51:51:51:51:0.5:26:25:29:22:26:25:29:22
chr1	14143003	.	A	G	1333.42	PASS	AF=1;AO=85;DP=85;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0283893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.081;QD=62.0194;RBI=0.0311553;REFB=0;REVB=0.0128336;RO=0;SAF=35;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00070354;OID=.;OPOS=14143003;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:86:0:0:85:86:1:50:35:0:0:50:36:0:0
chr1	14149622	.	T	C	638.93	PASS	AF=0.976744;AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0209202;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.772;QD=59.4353;RBI=0.0376389;REFB=-0.0310705;REVB=0.0312896;RO=0;SAF=18;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.510199;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.000240853;OID=.;OPOS=14149622;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:43:43:0:1:42:42:0.976744:24:18:0:0:24:18:0:1
chr1	14150709	.	C	T	1774.21	PASS	AF=0.983333;AO=118;DP=120;FAO=118;FDP=120;FR=.;FRO=2;FSAF=60;FSAR=58;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00611421;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=227.274;QD=59.1403;RBI=0.0192619;REFB=-0.0887936;REVB=0.0182657;RO=2;SAF=60;SAR=58;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000268315;STB=0.500141;STBP=0.86;TYPE=snp;VARB=0.000501713;OID=.;OPOS=14150709;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:120:120:2:2:118:118:0.983333:58:60:1:1:58:60:1:1
chr1	14150714	.	G	A	1579.6	PASS	AF=0.972973;AO=108;DP=111;FAO=108;FDP=111;FR=.;FRO=3;FSAF=60;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0447561;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.229;QD=56.9227;RBI=0.0643414;REFB=-0.0654448;REVB=0.0462245;RO=3;SAF=60;SAR=48;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0287401;STB=0.515149;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=0.00363464;OID=.;OPOS=14150714;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:111:111:3:3:108:108:0.972973:48:60:0:3:48:60:0:3
chr1	14150740	.	G	T	1457.38	PASS	AF=0.989362;AO=93;DP=94;FAO=93;FDP=94;FR=.;FRO=1;FSAF=54;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00911662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.213;QD=62.0162;RBI=0.0248537;REFB=0.231502;REVB=0.0231213;RO=1;SAF=54;SAR=39;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00869954;STB=0.504586;STBP=0.493;TYPE=snp;VARB=-0.000459784;OID=.;OPOS=14150740;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:94:94:1:1:93:93:0.989362:39:54:1:0:39:54:1:0
chr1	14150992	.	T	C	1070.53	PASS	AF=1;AO=71;DP=72;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00806548;FXX=0.0273935;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.785;QD=60.3117;RBI=0.0479707;REFB=0;REVB=0.0472878;RO=0;SAF=37;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.12261e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000165598;OID=.;OPOS=14150992;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:71:0:0:71:71:1:34:37:0:0:34:37:0:0
chr1	14450771	.	G	A	659.43	PASS	AF=0.942308;AO=49;DP=52;FAO=49;FDP=52;FR=.;FRO=3;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0314298;FXX=0.0370302;HRUN=5;LEN=1;MLLD=184.943;QD=50.7251;RBI=0.0321434;REFB=-0.116803;REVB=-0.00673522;RO=3;SAF=20;SAR=29;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00840864;STB=0.504473;STBP=0.802;TYPE=snp;VARB=0.0017883;OID=.;OPOS=14450771;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:52:52:3:3:49:49:0.942308:29:20:1:2:29:20:1:2
chr1	15438990	.	G	A	322.26	PASS	AF=0.448718;AO=35;DP=78;FAO=35;FDP=78;FR=.;FRO=43;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=18;FSRR=25;FWDB=-0.0233514;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=77.1433;QD=16.5261;RBI=0.0236803;REFB=-0.0160217;REVB=-0.00393289;RO=43;SAF=17;SAR=18;SRF=18;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0660569;STB=0.537084;STBP=0.582;TYPE=snp;VARB=0.0291414;OID=.;OPOS=15438990;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:43:43:35:35:0.448718:18:17:18:25:18:17:18:25
chr1	15495110	.	A	G	958.66	PASS	AF=0.985075;AO=66;DP=67;FAO=66;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.013837;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.855;QD=57.2336;RBI=0.0141853;REFB=-0.066239;REVB=-0.00312441;RO=1;SAF=29;SAR=37;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0160134;STB=0.508472;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=-5.20848e-05;OID=.;OPOS=15495110;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:67:67:1:1:66:66:0.985075:37:29:1:0:37:29:1:0
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chr1	15541858	.	G	A	115.19	PASS	AF=0.325581;AO=14;DP=43;FAO=14;FDP=43;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=-0.0100476;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.522;QD=10.7149;RBI=0.0119673;REFB=-0.00799429;REVB=0.00650105;RO=29;SAF=8;SAR=6;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214125;STB=0.627274;STBP=0.237;TYPE=snp;VARB=0.0154127;OID=.;OPOS=15541858;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:29:29:14:14:0.325581:6:8:11:18:6:8:11:18
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chr1	15687059	.	A	G	116.31	PASS	AF=0.619048;AO=13;DP=21;FAO=13;FDP=21;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=-0.0230069;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.4456;QD=22.1541;RBI=0.0571804;REFB=-0.0116947;REVB=-0.0523477;RO=8;SAF=5;SAR=8;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0985854;STB=0.555473;STBP=0.604;TYPE=snp;VARB=0.00424413;OID=.;OPOS=15687059;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:21:21:8:8:13:13:0.619048:8:5:2:6:8:5:2:6
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chr1	15710411	.	G	C	141.27	PASS	AF=0.576923;AO=15;DP=26;FAO=15;FDP=26;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=2;FWDB=0.0361734;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.2247;QD=21.7336;RBI=0.036183;REFB=-0.0102612;REVB=0.000834087;RO=11;SAF=6;SAR=9;SRF=9;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.305574;STB=0.671425;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.00734527;OID=.;OPOS=15710411;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:26:26:11:11:15:15:0.576923:9:6:9:2:9:6:9:2
chr1	15714842	.	G	C	68.1	PASS	AF=0.473684;AO=9;DP=19;FAO=9;FDP=19;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.00455028;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=36.9415;QD=14.3372;RBI=0.0530723;REFB=-0.0299172;REVB=0.0528769;RO=10;SAF=3;SAR=6;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15627;STB=0.592381;STBP=0.477;TYPE=snp;VARB=0.0343706;OID=.;OPOS=15714842;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:19:19:10:10:9:9:0.473684:6:3:5:5:6:3:5:5
chr1	15754484	.	T	C	854.27	PASS	AF=0.983607;AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00560264;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=235.359;QD=56.0175;RBI=0.0169911;REFB=-0.0762809;REVB=0.0160408;RO=1;SAF=26;SAR=34;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0136794;STB=0.507244;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=0.000208452;OID=.;OPOS=15754484;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:61:61:1:1:60:60:0.983607:34:26:0:1:34:26:0:1
chr1	15788269	.	A	C	880.51	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.021948;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.5194;QD=57.7383;RBI=0.0401948;REFB=0;REVB=0.0336735;RO=0;SAF=25;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000100671;OID=.;OPOS=15788269;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:61:0:0:58:61:1:33:25:0:0:36:25:0:0
chr1	15808242	.	C	T	227.02	PASS	AF=0.402985;AO=27;DP=67;FAO=27;FDP=67;FR=.;FRO=40;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=24;FSRR=16;FWDB=0.00652618;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=295.428;QD=13.5535;RBI=0.0121665;REFB=-0.00731101;REVB=0.0102681;RO=40;SAF=18;SAR=9;SRF=24;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0758954;STB=0.543445;STBP=0.582;TYPE=snp;VARB=0.0117351;OID=.;OPOS=15808242;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:40:40:27:27:0.402985:9:18:24:16:9:18:24:16
chr1	15812432	.	A	G	1192.73	PASS	AF=1;AO=77;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00839957;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.963;QD=61.1656;RBI=0.00860538;REFB=0;REVB=0.00187079;RO=0;SAF=42;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.26068e-06;OID=.;OPOS=15812432;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:78:0:0:77:78:1:35:42:0:0:36:42:0:0
chr1	15832543	.	T	C	575.7	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00698007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.6522;QD=60.5999;RBI=0.00744329;REFB=0;REVB=0.00258478;RO=0;SAF=17;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.53998e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.72839e-05;OID=.;OPOS=15832543;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:21:17:0:0:21:17:0:0
chr1	15844615	.	A	G	1336.3	PASS	AF=1;AO=85;DP=85;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0288704;FXX=0.0113623;HRUN=3;LEN=1;MLLD=100.062;QD=61.4393;RBI=0.0472;REFB=0;REVB=0.0373409;RO=0;SAF=33;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000541993;OID=.;OPOS=15844615;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:87:0:0:85:87:1:52:33:0:0:52:35:0:0
chr1	15850603	.	G	A	226.01	PASS	AF=0.5;AO=22;DP=44;FAO=22;FDP=44;FR=.;FRO=22;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.00123846;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.179;QD=20.5464;RBI=0.0384076;REFB=0.00258294;REVB=0.0383877;RO=22;SAF=13;SAR=9;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0413286;STB=0.523284;STBP=0.77;TYPE=snp;VARB=-0.00136355;OID=.;OPOS=15850603;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:22:22:22:22:0.5:9:13:12:10:9:13:12:10
chr1	15850613	.	G	A	727.79	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0115239;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=164.29;QD=63.2862;RBI=0.0318133;REFB=0;REVB=0.0296528;RO=0;SAF=25;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.85991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.75869e-05;OID=.;OPOS=15850613;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:21:25:0:0:21:25:0:0
chr1	15892415	.	A	C	315.45	PASS	AF=0.492754;AO=33;DP=70;FAO=34;FDP=69;FR=.;FRO=35;FSAF=8;FSAR=26;FSRF=9;FSRR=26;FWDB=0.00619306;FXX=0.028165;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.2017;QD=18.2872;RBI=0.00982196;REFB=-0.0284734;REVB=0.00762345;RO=32;SAF=8;SAR=25;SRF=9;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0453857;STB=0.515142;STBP=0.851;TYPE=snp;VARB=0.0275161;OID=.;OPOS=15892415;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:69:32:35:33:34:0.492754:25:8:9:23:26:8:9:26
chr1	15904318	.	C	T	96.89	PASS	AF=0.545455;AO=11;DP=21;FAO=12;FDP=22;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.0686607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.1908;QD=17.6166;RBI=0.0695483;REFB=-0.0385457;REVB=-0.0110757;RO=10;SAF=4;SAR=7;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0320029;STB=0.5078;STBP=0.989;TYPE=snp;VARB=0.0572136;OID=.;OPOS=15904318;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:21:22:10:10:11:12:0.545455:7:4:4:6:7:5:4:6
chr1	15909744	.	C	T	283.65	PASS	AF=0.526316;AO=30;DP=57;FAO=30;FDP=57;FR=.;FRO=27;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=7;FWDB=-0.00464963;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.7232;QD=19.9053;RBI=0.0092708;REFB=0.00349967;REVB=-0.00802052;RO=27;SAF=14;SAR=16;SRF=20;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.231475;STB=0.628094;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=-0.00467614;OID=.;OPOS=15909744;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:27:27:30:30:0.526316:16:14:20:7:16:14:20:7
chr1	15909850	.	C	G	789.28	PASS	AF=1;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0228036;FXX=0.019996;HRUN=3;LEN=1;MLLD=97.3871;QD=64.4309;RBI=0.0237713;REFB=0;REVB=-0.0067133;RO=0;SAF=30;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.48867e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000225543;OID=.;OPOS=15909850;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:49:0:0:49:49:1:19:30:0:0:19:30:0:0
chr1	15987175	.	A	G	114.05	PASS	AF=0.52;AO=13;DP=25;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.0221087;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=282.534;QD=18.2478;RBI=0.0222065;REFB=-0.00491587;REVB=0.00208102;RO=12;SAF=4;SAR=9;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.240907;STB=0.638489;STBP=0.182;TYPE=snp;VARB=0.00450751;OID=.;OPOS=15987175;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:25:12:12:13:13:0.52:9:4:7:5:9:4:7:5
chr1	15987473	.	T	C	260.0	PASS	AF=0.69697;AO=23;DP=33;FAO=23;FDP=33;FR=.;FRO=10;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.0397926;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.7153;QD=31.5147;RBI=0.0706361;REFB=-0.00780564;REVB=-0.0583609;RO=10;SAF=13;SAR=10;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14571;STB=0.579983;STBP=0.18;TYPE=snp;VARB=0.00284242;OID=.;OPOS=15987473;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:33:33:10:10:23:23:0.69697:10:13:3:7:10:13:3:7
chr1	16096934	.	C	T	164.98	PASS	AF=0.9375;AO=12;DP=16;FAO=15;FDP=16;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0760062;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=36.5359;QD=41.2442;RBI=0.259143;REFB=-0.127889;REVB=0.247746;RO=1;SAF=8;SAR=4;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0531285;STB=0.529373;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=0.0276968;OID=.;OPOS=16096934;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:16:16:1:1:12:15:0.9375:4:8:1:0:7:8:1:0
chr1	16272250	.	A	G	73.06	PASS	AF=0.3125;AO=10;DP=32;FAO=10;FDP=32;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.0316631;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.3044;QD=9.13222;RBI=0.0319747;REFB=-0.0231884;REVB=-0.00445277;RO=22;SAF=5;SAR=5;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0415103;OID=.;OPOS=16272250;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:32:32:22:22:10:10:0.3125:5:5:11:11:5:5:11:11
chr1	16341649	.	C	T	1110.8	PASS	AF=0.974026;AO=75;DP=77;FAO=75;FDP=77;FR=.;FRO=2;FSAF=47;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0169984;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=283.731;QD=57.7038;RBI=0.0596402;REFB=-0.16825;REVB=0.0571665;RO=2;SAF=47;SAR=28;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0325964;STB=0.517237;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.00039579;OID=.;OPOS=16341649;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:77:77:2:2:75:75:0.974026:28:47:0:2:28:47:0:2
chr1	16341733	.	T	C	1052.2	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0110833;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.11;QD=59.2787;RBI=0.0228477;REFB=0;REVB=0.0199794;RO=0;SAF=31;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.81705e-05;OID=.;OPOS=16341733;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:71:0:0:69:71:1:38:31:0:0:38:33:0:0
chr1	16342237	.	A	G	538.55	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0134507;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.079;QD=59.8393;RBI=0.0165328;REFB=0;REVB=-0.00961307;RO=0;SAF=9;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.84725e-05;OID=.;OPOS=16342237;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:27:9:0:0:27:9:0:0
chr1	16344360	.	A	G	2245.34	PASS	AF=0.993103;AO=135;DP=137;FAO=144;FDP=145;FR=.;FRO=1;FSAF=79;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0233279;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.327;QD=61.9405;RBI=0.0605128;REFB=-0.0896778;REVB=0.0558356;RO=1;SAF=75;SAR=60;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00785684;STB=0.503816;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.00199167;OID=.;OPOS=16344360;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:137:145:1:1:135:144:0.993103:60:75:0:1:65:79:0:1
chr1	16344402	.	G	A	2315.14	PASS	AF=0.993197;AO=146;DP=147;FAO=146;FDP=147;FR=.;FRO=1;FSAF=79;FSAR=67;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0559598;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.0162;QD=62.9971;RBI=0.0620501;REFB=-0.0697295;REVB=0.0268088;RO=1;SAF=79;SAR=67;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00598224;STB=0.503144;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.000783651;OID=.;OPOS=16344402;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:147:147:1:1:146:146:0.993197:67:79:1:0:67:79:1:0
chr1	16344494	.	G	A	715.8	PASS	AF=0.981481;AO=52;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0214842;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.6213;QD=53.0219;RBI=0.160102;REFB=-0.0777643;REVB=0.158654;RO=2;SAF=31;SAR=21;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00695;STB=0.507934;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.00539668;OID=.;OPOS=16344494;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:54:54:2:1:52:53:0.981481:21:31:1:1:22:31:1:0
chr1	16344625	.	C	G	955.17	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000634418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.652;QD=58.7796;RBI=0.00635197;REFB=0;REVB=0.00632021;RO=0;SAF=31;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.90682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.99389e-05;OID=.;OPOS=16344625;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:34:31:0:0:34:31:0:0
chr1	16344664	.	G	A,C	1169.01	PASS	AF=0.961538,0.0384615;AO=75,3;DP=78;FAO=75,3;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=36,0;FSAR=39,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00281236,-2.77277e-05;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=130.947,119.972;QD=59.9491;RBI=0.0478535,0.0180608;REFB=0,0;REVB=0.0477708,0.0180608;RO=0;SAF=36,0;SAR=39,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.6999e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00504909,0.119207;OID=.,.;OPOS=16344664,16344664;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:7:78:78:0:0:75,3:75,3:0.961538,0.0384615:39,3:36,0:0:0:39,3:36,0:0:0
chr1	16351275	.	A	G	769.4	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0255219;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.621;QD=56.9928;RBI=0.0332429;REFB=0;REVB=0.0213009;RO=0;SAF=35;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.86274e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.377e-06;OID=.;OPOS=16351275;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:19:35:0:0:19:35:0:0
chr1	16356501	.	G	A	787.88	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.149961;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.3357;QD=57.3001;RBI=0.150275;REFB=0;REVB=0.00969678;RO=0;SAF=30;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00241284;OID=.;OPOS=16356501;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:25:30:0:0:25:30:0:0
chr1	16358932	.	T	C	323.65	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0212274;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.514;QD=53.9419;RBI=0.0413205;REFB=0;REVB=0.0354511;RO=0;SAF=8;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000116989;OID=.;OPOS=16358932;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:24:0:0:23:24:1:15:8:0:0:15:9:0:0
chr1	16361916	.	G	A	88.18	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00658464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.702;QD=39.1901;RBI=0.0287844;REFB=0;REVB=-0.0280212;RO=0;SAF=7;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000148746;OID=.;OPOS=16361916;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:2:7:0:0:2:7:0:0
chr1	16371067	.	G	T	236.02	PASS	AF=0.4;AO=28;DP=70;FAO=28;FDP=70;FR=.;FRO=42;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=26;FWDB=0.0328862;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.331;QD=13.4869;RBI=0.0333788;REFB=-0.0143307;REVB=-0.00571329;RO=41;SAF=14;SAR=14;SRF=15;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140187;STB=0.571379;STBP=0.351;TYPE=snp;VARB=0.0460663;OID=.;OPOS=16371067;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:41:42:28:28:0.4:14:14:15:26:14:14:16:26
chr1	16373124	.	A	G	728.7	PASS	AF=1;AO=42;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0796621;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.397;QD=57.1529;RBI=0.082695;REFB=0;REVB=0.0221903;RO=0;SAF=16;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000341184;OID=.;OPOS=16373124;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:42:51:1:26:16:0:0:26:25:0:0
chr1	16374533	.	G	C	862.23	PASS	AF=0.9;AO=63;DP=73;FAO=63;FDP=70;FR=.;FRO=7;FSAF=16;FSAR=47;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.00839723;FXX=0.0410903;HRUN=3;LEN=1;MLLD=257.922;QD=49.2702;RBI=0.00966412;REFB=0.0110871;REVB=-0.0047835;RO=6;SAF=16;SAR=47;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0849689;STB=0.540217;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=-7.72585e-05;OID=.;OPOS=16374533;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:73:70:6:7:63:63:0.9:47:16:4:2:47:16:4:3
chr1	16374534	.	A	C	30.46	PASS	AF=0.0972222;AO=6;DP=71;FAO=7;FDP=72;FR=.;FRO=65;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=16;FSRR=49;FWDB=-0.0605789;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=69.917;QD=1.69234;RBI=0.0641936;REFB=-0.0134935;REVB=0.0212372;RO=65;SAF=4;SAR=2;SRF=16;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.455706;STB=0.857868;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=0.0175575;OID=.;OPOS=16374534;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:71:72:65:65:6:7:0.0972222:2:4:16:49:2:5:16:49
chr1	16374994	.	C	T	167.5	PASS	AF=0.9375;AO=15;DP=16;FAO=15;FDP=16;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00574942;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=216.146;QD=41.8747;RBI=0.0113039;REFB=-0.0659893;REVB=-0.00973249;RO=1;SAF=11;SAR=4;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100822;STB=0.555478;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.000683476;OID=.;OPOS=16374994;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:16:16:1:1:15:15:0.9375:4:11:0:1:4:11:0:1
chr1	16375063	.	CA	GC	166.46	PASS	AF=0.941176;AO=16;DP=17;FAO=16;FDP=17;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.28291;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=84.0976;QD=39.1676;RBI=0.298974;REFB=-0.151676;REVB=0.096683;RO=1;SAF=6;SAR=10;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0701691;STB=0.538413;STBP=0.294;TYPE=mnp;VARB=0.0101058;OID=.;OPOS=16375063;OREF=CA;OALT=GC;OMAPALT=GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:17:17:1:1:16:16:0.941176:10:6:1:0:10:6:1:0
chr1	16376191	.	C	T	429.02	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0117339;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.6035;QD=57.2026;RBI=0.0215403;REFB=0;REVB=0.0180638;RO=0;SAF=26;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.9955e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.97371e-05;OID=.;OPOS=16376191;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:4:26:0:0:4:26:0:0
chr1	16376319	.	T	C	1208.69	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0296358;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.2286;QD=61.1996;RBI=0.0338723;REFB=0;REVB=0.016403;RO=0;SAF=40;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33478e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.14603e-05;OID=.;OPOS=16376319;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:39:40:0:0:39:40:0:0
chr1	16380196	.	T	C	955.2	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0138579;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.103;QD=58.7813;RBI=0.0215778;REFB=0;REVB=0.0165397;RO=0;SAF=33;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.818e-06;OID=.;OPOS=16380196;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:32:33:0:0:32:33:0:0
chr1	16380243	.	A	G	832.04	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000421938;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.882;QD=57.3821;RBI=0.0489663;REFB=0;REVB=-0.0489645;RO=0;SAF=32;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.09576e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000124302;OID=.;OPOS=16380243;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:26:32:0:0:26:32:0:0
chr1	16380252	.	C	T	779.29	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0693493;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=45.5447;QD=56.6756;RBI=0.0715093;REFB=0;REVB=-0.0174426;RO=0;SAF=29;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.40922e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000674478;OID=.;OPOS=16380252;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:26:29:0:0:26:29:0:0
chr1	16383682	.	G	C	458.48	PASS	AF=0.556962;AO=44;DP=80;FAO=44;FDP=79;FR=.;FRO=35;FSAF=17;FSAR=27;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=-0.0200016;FXX=0.0124984;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.297;QD=23.2143;RBI=0.05131;REFB=-0.00833333;REVB=0.0472509;RO=36;SAF=17;SAR=27;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0725806;STB=0.545434;STBP=0.393;TYPE=snp;VARB=0.00693027;OID=.;OPOS=16383682;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:79:36:35:44:44:0.556962:27:17:17:19:27:17:17:18
chr1	16383742	.	C	G	714.11	PASS	AF=0.514706;AO=68;DP=135;FAO=70;FDP=136;FR=.;FRO=66;FSAF=39;FSAR=31;FSRF=23;FSRR=43;FWDB=0.0394339;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.9053;QD=21.0032;RBI=0.0449659;REFB=-0.0210368;REVB=-0.0216079;RO=66;SAF=38;SAR=30;SRF=23;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18645;STB=0.600221;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.0223713;OID=.;OPOS=16383742;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:135:136:66:66:68:70:0.514706:30:38:23:43:31:39:23:43
chr1	16384998	.	GG	CA	57.15	PASS	AF=0.875;AO=6;DP=8;FAO=7;FDP=8;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00614349;FXX=0;HRUN=6;LEN=2;MLLD=343.133;QD=28.574;RBI=0.0113466;REFB=-0.0609417;REVB=0.00953949;RO=1;SAF=6;SAR=0;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.782178;STB=0.666107;STBP=0.137;TYPE=mnp;VARB=0.00691062;OID=.;OPOS=16384998;OREF=GG;OALT=CA;OMAPALT=CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:8:8:1:1:6:7:0.875:0:6:0:1:1:6:0:1
chr1	16385042	.	G	A	76.4	PASS	AF=0.75;AO=9;DP=12;FAO=9;FDP=12;FR=.;FRO=3;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0403783;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.608;QD=25.4677;RBI=0.145735;REFB=-0.0218701;REVB=0.14003;RO=3;SAF=8;SAR=1;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140735;STB=0.578792;STBP=0.67;TYPE=snp;VARB=0.00802285;OID=.;OPOS=16385042;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:12:12:3:3:9:9:0.75:1:8:3:0:1:8:3:0
chr1	16385175	.	G	A	557.13	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.018017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.993;QD=60.2302;RBI=0.0219062;REFB=0;REVB=-0.0124607;RO=0;SAF=20;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.71161e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.68855e-05;OID=.;OPOS=16385175;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:17:20:0:0:17:20:0:0
chr1	16385184	.	G	A	175.17	PASS	AF=0.514286;AO=18;DP=35;FAO=18;FDP=35;FR=.;FRO=17;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=0.0180613;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.031;QD=20.0196;RBI=0.0255122;REFB=-0.00787133;REVB=0.0180183;RO=17;SAF=11;SAR=7;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.220328;STB=0.624468;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.0181626;OID=.;OPOS=16385184;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:17:17:18:18:0.514286:7:11:6:11:7:11:6:11
chr1	16386008	.	T	C	411.67	PASS	AF=1;AO=21;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.038684;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.7441;QD=56.7826;RBI=0.235918;REFB=0;REVB=0.232724;RO=0;SAF=11;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00603911;OID=.;OPOS=16386008;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:21:29:1:10:11:0:0:17:12:0:0
chr1	16386416	.	G	A	429.01	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0312438;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.0278;QD=57.2016;RBI=0.0436538;REFB=0;REVB=-0.0304874;RO=0;SAF=19;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.20742e-05;OID=.;OPOS=16386416;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:11:19:0:0:11:19:0:0
chr1	16386447	.	G	C	336.21	PASS	AF=1;AO=22;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0251639;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.2059;QD=53.7942;RBI=0.103917;REFB=0;REVB=0.100824;RO=0;SAF=13;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2029e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00386431;OID=.;OPOS=16386447;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:22:25:1:9:13:0:0:11:14:0:0
chr1	16386495	.	C	T	167.02	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0983346;FXX=0.0666222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.323;QD=47.7197;RBI=0.0988682;REFB=0;REVB=-0.0102582;RO=0;SAF=7;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000935194;OID=.;OPOS=16386495;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:7:7:0:0:7:7:0:0
chr1	16388646	.	T	C	1346.45	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00293552;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.606;QD=61.9055;RBI=0.0234648;REFB=0;REVB=0.0232804;RO=0;SAF=41;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000676289;OID=.;OPOS=16388646;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:87:0:0:86:87:1:45:41:0:0:45:42:0:0
chr1	16461581	.	G	A	346.07	PASS	AF=0.507042;AO=36;DP=71;FAO=36;FDP=71;FR=.;FRO=35;FSAF=26;FSAR=10;FSRF=23;FSRR=12;FWDB=0.00875748;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.204;QD=19.4969;RBI=0.0411806;REFB=-0.0286333;REVB=0.0402386;RO=35;SAF=26;SAR=10;SRF=23;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0692293;STB=0.538584;STBP=0.559;TYPE=snp;VARB=0.0283188;OID=.;OPOS=16461581;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:35:35:36:36:0.507042:10:26:23:12:10:26:23:12
chr1	16533022	.	C	T	246.51	PASS	AF=0.952381;AO=20;DP=21;FAO=20;FDP=21;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.102701;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.2469;QD=46.9535;RBI=0.102854;REFB=-0.0708621;REVB=0.00560312;RO=1;SAF=1;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0236587;STB=0.512808;STBP=0.65;TYPE=snp;VARB=0.0524556;OID=.;OPOS=16533022;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:21:21:1:1:20:20:0.952381:19:1:0:1:19:1:0:1
chr1	16641899	.	C	T	411.12	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0527807;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=229.578;QD=56.7066;RBI=0.0538131;REFB=0;REVB=0.0104903;RO=0;SAF=8;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.4007e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00027529;OID=.;OPOS=16641899;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:21:8:0:0:21:8:0:0
chr1	16723084	.	G	A	857.93	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0527258;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.4167;QD=57.1954;RBI=0.0529525;REFB=0;REVB=0.00489397;RO=0;SAF=13;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.80722e-05;OID=.;OPOS=16723084;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:47:13:0:0:47:13:0:0
chr1	16840730	.	C	T	122.13	PASS	AF=0.684211;AO=13;DP=19;FAO=13;FDP=19;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.000931231;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=282.979;QD=25.711;RBI=0.00285353;REFB=-0.0202122;REVB=0.0026973;RO=6;SAF=5;SAR=8;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134616;STB=0.575112;STBP=0.423;TYPE=snp;VARB=0.0103567;OID=.;OPOS=16840730;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:19:19:6:6:13:13:0.684211:8:5:1:5:8:5:1:5
chr1	16858909	.	G	C	868.25	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00871473;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.56;QD=57.8833;RBI=0.00942755;REFB=0;REVB=-0.00359615;RO=0;SAF=19;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.31043e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.28999e-05;OID=.;OPOS=16858909;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:41:19:0:0:41:19:0:0
chr1	16860652	.	A	C	46.43	PASS	AF=0.0869565;AO=14;DP=162;FAO=14;FDP=161;FR=.;FRO=147;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=65;FSRR=82;FWDB=0.0197122;FXX=0.00617246;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.5753;QD=1.15354;RBI=0.0243589;REFB=-0.000546535;REVB=-0.0143104;RO=147;SAF=11;SAR=3;SRF=65;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.389348;STB=0.803537;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.0033471;OID=.;OPOS=16860652;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:162:161:147:147:14:14:0.0869565:3:11:65:82:3:11:65:82
chr1	16860695	.	G	T	88.03	PASS	AF=0.135714;AO=19;DP=140;FAO=19;FDP=140;FR=.;FRO=121;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=56;FSRR=65;FWDB=0.000795391;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.624;QD=2.51508;RBI=0.0219358;REFB=-0.00358616;REVB=-0.0219214;RO=121;SAF=12;SAR=7;SRF=56;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.210623;STB=0.644625;STBP=0.202;TYPE=snp;VARB=0.0190438;OID=.;OPOS=16860695;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:140:140:121:121:19:19:0.135714:7:12:56:65:7:12:56:65
chr1	16862282	.	G	A	367.52	PASS	AF=0.714286;AO=30;DP=42;FAO=30;FDP=42;FR=.;FRO=12;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=-5.42797e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.577;QD=35.0023;RBI=0.0242497;REFB=-0.0448409;REVB=0.0242496;RO=12;SAF=17;SAR=13;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122319;STB=0.566622;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=0.0096207;OID=.;OPOS=16862282;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:91:42:42:12:12:30:30:0.714286:13:17:4:8:13:17:4:8
chr1	16862454	.	T	G	306.67	PASS	AF=0.31746;AO=40;DP=126;FAO=40;FDP=126;FR=.;FRO=86;FSAF=27;FSAR=13;FSRF=43;FSRR=43;FWDB=-0.00234344;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.352;QD=9.73563;RBI=0.00315341;REFB=-0.00201798;REVB=0.00211004;RO=83;SAF=27;SAR=13;SRF=41;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.21787;STB=0.624214;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=0.0112022;OID=.;OPOS=16862454;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:126:126:83:86:40:40:0.31746:13:27:41:42:13:27:43:43
chr1	16862461	.	T	A	332.49	PASS	AF=0.325581;AO=42;DP=121;FAO=42;FDP=129;FR=.;FRO=87;FSAF=28;FSAR=14;FSRF=46;FSRR=41;FWDB=0.00270075;FXX=0.015266;HRUN=6;LEN=1;MLLD=229.393;QD=10.3099;RBI=0.0192313;REFB=-0.011214;REVB=-0.0190407;RO=78;SAF=28;SAR=14;SRF=41;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167291;STB=0.597778;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.00656347;OID=.;OPOS=16862461;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:121:129:78:87:42:42:0.325581:14:28:41:37:14:28:46:41
chr1	16862502	.	A	G	606.99	PASS	AF=0.360406;AO=71;DP=197;FAO=71;FDP=197;FR=.;FRO=126;FSAF=39;FSAR=32;FSRF=76;FSRR=50;FWDB=-0.0037881;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.4435;QD=12.3247;RBI=0.0110067;REFB=0.00924546;REVB=-0.0103343;RO=126;SAF=39;SAR=32;SRF=76;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0616867;STB=0.53503;STBP=0.473;TYPE=snp;VARB=-0.0173896;OID=.;OPOS=16862502;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:197:197:126:126:71:71:0.360406:32:39:76:50:32:39:76:50
chr1	16872426	.	G	A	165.83	PASS	AF=0.384615;AO=19;DP=53;FAO=20;FDP=52;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=0.00776117;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.329;QD=12.7564;RBI=0.00820698;REFB=-0.00146097;REVB=-0.00266809;RO=31;SAF=11;SAR=8;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169482;STB=0.581313;STBP=0.361;TYPE=snp;VARB=0.00282311;OID=.;OPOS=16872426;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:52:31:32:19:20:0.384615:8:11:13:18:8:12:15:17
chr1	16874150	.	C	CAAAACA	31.57	PASS	AF=0.206897;AO=3;DP=30;FAO=6;FDP=29;FR=.;FRO=23;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=-0.0187144;FXX=0.0937207;HRUN=4;LEN=6;MLLD=228.595;QD=4.35462;RBI=0.0188334;REFB=-0.00901375;REVB=-0.00211364;RO=24;SAF=2;SAR=1;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0482269;STB=0.54983;STBP=0.839;TYPE=ins;VARB=0.0388076;OID=.;OPOS=16874151;OREF=-;OALT=AAAACA;OMAPALT=CAAAACA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.206897:3:30:6:29:23:4:2:14:9:31:24:2:1:15:9
chr1	16874206	.	A	C	322.93	PASS	AF=0.559322;AO=33;DP=59;FAO=33;FDP=59;FR=.;FRO=26;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=8;FWDB=0.0202024;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.6738;QD=21.8939;RBI=0.0435746;REFB=0.0106374;REVB=0.0386084;RO=26;SAF=18;SAR=15;SRF=18;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119797;STB=0.565999;STBP=0.288;TYPE=snp;VARB=-0.00713222;OID=.;OPOS=16874206;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:26:26:33:33:0.559322:15:18:18:8:15:18:18:8
chr1	16874240	.	G	A	146.64	PASS	AF=0.339286;AO=19;DP=56;FAO=19;FDP=56;FR=.;FRO=37;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=-0.0255542;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.2287;QD=10.4739;RBI=0.0330418;REFB=-0.0140094;REVB=-0.0209463;RO=37;SAF=13;SAR=6;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.230281;STB=0.63586;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.0210602;OID=.;OPOS=16874240;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:37:37:19:19:0.339286:6:13:18:19:6:13:18:19
chr1	16890598	.	T	A	506.89	PASS	AF=0.329843;AO=63;DP=190;FAO=63;FDP=191;FR=.;FRO=128;FSAF=34;FSAR=29;FSRF=69;FSRR=59;FWDB=0.00506961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.323;QD=10.6155;RBI=0.00732629;REFB=-0.00180303;REVB=-0.005289;RO=126;SAF=34;SAR=29;SRF=68;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.500418;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00450476;OID=.;OPOS=16890598;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:190:191:126:128:63:63:0.329843:29:34:68:58:29:34:69:59
chr1	16890639	.	C	T	328.0	PASS	AF=0.373832;AO=40;DP=108;FAO=40;FDP=107;FR=.;FRO=67;FSAF=27;FSAR=13;FSRF=36;FSRR=31;FWDB=-0.0105085;FXX=0.0092584;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.343;QD=12.2615;RBI=0.0105093;REFB=-0.00678162;REVB=-0.000133865;RO=67;SAF=27;SAR=13;SRF=36;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160358;STB=0.591881;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.0104326;OID=.;OPOS=16890639;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:107:67:67:40:40:0.373832:13:27:36:31:13:27:36:31
chr1	16890644	.	C	T	97.08	PASS	AF=0.171717;AO=17;DP=99;FAO=17;FDP=99;FR=.;FRO=82;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=47;FSRR=35;FWDB=-0.00292558;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.526;QD=3.92231;RBI=0.0267158;REFB=-0.000133773;REVB=-0.0265551;RO=79;SAF=9;SAR=8;SRF=46;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0674837;STB=0.536484;STBP=0.722;TYPE=snp;VARB=0.000576593;OID=.;OPOS=16890644;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:99:99:79:82:17:17:0.171717:8:9:46:33:8:9:47:35
chr1	16890652	.	T	C	67.82	PASS	AF=0.151163;AO=13;DP=88;FAO=13;FDP=86;FR=.;FRO=73;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=41;FSRR=32;FWDB=0.010903;FXX=0.0227247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.837;QD=3.15453;RBI=0.0109356;REFB=0.00156756;REVB=-0.000843747;RO=75;SAF=6;SAR=7;SRF=43;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138695;STB=0.584242;STBP=0.553;TYPE=snp;VARB=-0.00902565;OID=.;OPOS=16890652;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:88:86:75:73:13:13:0.151163:7:6:43:32:7:6:41:32
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chr1	16893841	.	C	T	31.58	PASS	AF=0.065;AO=13;DP=199;FAO=13;FDP=200;FR=.;FRO=187;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=100;FSRR=87;FWDB=-0.0168463;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.968;QD=0.63154;RBI=0.0169719;REFB=-0.00136218;REVB=0.00206168;RO=184;SAF=8;SAR=5;SRF=97;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0950669;STB=0.576683;STBP=0.595;TYPE=snp;VARB=0.0190545;OID=.;OPOS=16893841;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:31:199:200:184:187:13:13:0.065:5:8:97:87:5:8:100:87
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chr1	16913584	.	A	C	92.17	PASS	AF=0.157895;AO=18;DP=114;FAO=18;FDP=114;FR=.;FRO=96;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=58;FSRR=38;FWDB=0.00309947;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.4365;QD=3.234;RBI=0.0240218;REFB=-0.00330401;REVB=0.023821;RO=96;SAF=6;SAR=12;SRF=58;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.333196;STB=0.718871;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=0.0264601;OID=.;OPOS=16913584;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:114:114:96:96:18:18:0.157895:12:6:58:38:12:6:58:38
chr1	16913612	.	G	A	83.14	PASS	AF=0.136364;AO=18;DP=132;FAO=18;FDP=132;FR=.;FRO=114;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=64;FSRR=50;FWDB=0.0207814;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.3164;QD=2.51936;RBI=0.0242451;REFB=-0.00155242;REVB=0.0124883;RO=114;SAF=6;SAR=12;SRF=64;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.281902;STB=0.69286;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.00649566;OID=.;OPOS=16913612;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:132:132:114:114:18:18:0.136364:12:6:64:50:12:6:64:50
chr1	16913633	.	G	T	83.54	PASS	AF=0.137405;AO=18;DP=130;FAO=18;FDP=131;FR=.;FRO=113;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=53;FSRR=60;FWDB=-0.00734985;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.43;QD=2.55096;RBI=0.00736931;REFB=0.000182042;REVB=-0.000535118;RO=112;SAF=14;SAR=4;SRF=53;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.386977;STB=0.769456;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=-0.000796168;OID=.;OPOS=16913633;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:130:131:112:113:18:18:0.137405:4:14:53:59:4:14:53:60
chr1	16918424	.	G	C	730.65	PASS	AF=0.24612;AO=111;DP=453;FAO=111;FDP=451;FR=.;FRO=340;FSAF=47;FSAR=64;FSRF=152;FSRR=188;FWDB=-0.0109688;FXX=0.00660778;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.016;QD=6.48027;RBI=0.0116801;REFB=-0.00617316;REVB=0.00401362;RO=333;SAF=47;SAR=64;SRF=149;SRR=184;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0308343;STB=0.518142;STBP=0.657;TYPE=snp;VARB=0.0134353;OID=.;OPOS=16918424;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:453:451:333:340:111:111:0.24612:64:47:149:184:64:47:152:188
chr1	16918502	.	A	G	134.55	PASS	AF=0.165563;AO=25;DP=151;FAO=25;FDP=151;FR=.;FRO=126;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=44;FSRR=82;FWDB=0.0111239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.288;QD=3.56421;RBI=0.0127231;REFB=-0.000607616;REVB=0.00617545;RO=126;SAF=10;SAR=15;SRF=44;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0691791;STB=0.544909;STBP=0.64;TYPE=snp;VARB=0.00531142;OID=.;OPOS=16918502;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:151:151:126:126:25:25:0.165563:15:10:44:82:15:10:44:82
chr1	17004785	.	A	C	600.9	PASS	AF=0.97561;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0537946;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.8166;QD=58.6246;RBI=0.0541089;REFB=-0.0799076;REVB=-0.00582389;RO=1;SAF=16;SAR=24;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0191432;STB=0.510199;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.0150388;OID=.;OPOS=17004785;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:41:41:1:1:40:40:0.97561:24:16:0:1:24:16:0:1
chr1	17017717	.	C	T	167.45	PASS	AF=0.333333;AO=22;DP=66;FAO=22;FDP=66;FR=.;FRO=44;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=24;FSRR=20;FWDB=0.0176873;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.133;QD=10.1486;RBI=0.0177398;REFB=-0.00649413;REVB=-0.00136349;RO=44;SAF=12;SAR=10;SRF=24;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.24014e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0125654;OID=.;OPOS=17017717;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:44:44:22:22:0.333333:10:12:24:20:10:12:24:20
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chr1	17023143	.	C	T	337.23	PASS	AF=0.352941;AO=42;DP=119;FAO=42;FDP=119;FR=.;FRO=77;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=43;FSRR=34;FWDB=0.00633687;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=273.26;QD=11.3354;RBI=0.00875621;REFB=-0.0118862;REVB=-0.0060428;RO=77;SAF=20;SAR=22;SRF=43;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0925219;STB=0.553047;STBP=0.393;TYPE=snp;VARB=0.0225849;OID=.;OPOS=17023143;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:119:77:77:42:42:0.352941:22:20:43:34:22:20:43:34
chr1	17023182	.	C	G	263.86	PASS	AF=0.378049;AO=31;DP=82;FAO=31;FDP=82;FR=.;FRO=51;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=32;FSRR=19;FWDB=-0.010613;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.2497;QD=12.8713;RBI=0.0510459;REFB=-0.00529876;REVB=-0.0499304;RO=50;SAF=15;SAR=16;SRF=31;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146579;STB=0.588824;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=0.00668979;OID=.;OPOS=17023182;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:50:51:31:31:0.378049:16:15:31:19:16:15:32:19
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chr1	17023403	.	G	A	305.78	PASS	AF=0.330508;AO=38;DP=121;FAO=39;FDP=118;FR=.;FRO=79;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=34;FSRR=45;FWDB=0.00139055;FXX=0.0406471;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.4629;QD=10.3653;RBI=0.0159641;REFB=-0.00811635;REVB=0.0159034;RO=75;SAF=16;SAR=22;SRF=33;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0222018;STB=0.513844;STBP=0.851;TYPE=snp;VARB=0.0425818;OID=.;OPOS=17023403;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:121:118:75:79:38:39:0.330508:22:16:33:42:23:16:34:45
chr1	17026043	.	G	A	54.65	PASS	AF=0.333333;AO=8;DP=24;FAO=8;FDP=24;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=15;FSRR=1;FWDB=-0.0181795;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.526;QD=9.10882;RBI=0.102982;REFB=-0.00755639;REVB=0.101364;RO=16;SAF=6;SAR=2;SRF=15;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.34403;STB=0.699648;STBP=0.429;TYPE=snp;VARB=0.0156051;OID=.;OPOS=17026043;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:24:24:16:16:8:8:0.333333:2:6:15:1:2:6:15:1
chr1	17026087	.	G	A	120.98	PASS	AF=0.257143;AO=18;DP=70;FAO=18;FDP=70;FR=.;FRO=52;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=39;FSRR=13;FWDB=0.014524;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.982;QD=6.91295;RBI=0.0591288;REFB=0.00417735;REVB=0.0573173;RO=52;SAF=11;SAR=7;SRF=39;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190079;STB=0.613921;STBP=0.355;TYPE=snp;VARB=-0.0109308;OID=.;OPOS=17026087;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:52:52:18:18:0.257143:7:11:39:13:7:11:39:13
chr1	17029462	.	A	G	216.95	PASS	AF=0.215116;AO=38;DP=167;FAO=37;FDP=172;FR=.;FRO=135;FSAF=25;FSAR=12;FSRF=59;FSRR=76;FWDB=-0.111465;FXX=0.00578001;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.2491;QD=5.04529;RBI=0.156697;REFB=-0.00481793;REVB=-0.110134;RO=129;SAF=26;SAR=12;SRF=57;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.306021;STB=0.685686;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0111006;OID=.;OPOS=17029462;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:167:172:129:135:38:37:0.215116:12:26:57:72:12:25:59:76
chr1	17030504	.	T	A	522.34	PASS	AF=0.239521;AO=80;DP=335;FAO=80;FDP=334;FR=.;FRO=254;FSAF=42;FSAR=38;FSRF=140;FSRR=114;FWDB=-0.00994485;FXX=0.00298499;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.9685;QD=6.25558;RBI=0.013498;REFB=-0.0164768;REVB=0.00912662;RO=253;SAF=42;SAR=38;SRF=140;SRR=113;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0361187;STB=0.519995;STBP=0.668;TYPE=snp;VARB=0.0281382;OID=.;OPOS=17030504;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:335:334:253:254:80:80:0.239521:38:42:140:113:38:42:140:114
chr1	17030515	.	G	A	499.41	PASS	AF=0.234234;AO=75;DP=329;FAO=78;FDP=333;FR=.;FRO=255;FSAF=39;FSAR=39;FSRF=137;FSRR=118;FWDB=-0.0185934;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.782;QD=5.99897;RBI=0.0194577;REFB=-0.00751428;REVB=-0.00573469;RO=254;SAF=37;SAR=38;SRF=136;SRR=118;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0537019;STB=0.528521;STBP=0.548;TYPE=snp;VARB=0.0337552;OID=.;OPOS=17030515;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:329:333:254:255:75:78:0.234234:38:37:136:118:39:39:137:118
chr1	17030518	.	CT	TG	426.59	PASS	AF=0.216463;AO=69;DP=333;FAO=71;FDP=328;FR=.;FRO=257;FSAF=35;FSAR=36;FSRF=139;FSRR=118;FWDB=-0.0408843;FXX=0.0208949;HRUN=1;LEN=2;MLLD=90.4671;QD=5.20235;RBI=0.0583376;REFB=-0.0025606;REVB=-0.0416143;RO=253;SAF=35;SAR=34;SRF=137;SRR=116;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0440511;STB=0.537487;STBP=0.464;TYPE=mnp;VARB=0.00900295;OID=.;OPOS=17030518;OREF=CT;OALT=TG;OMAPALT=TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:333:328:253:257:69:71:0.216463:34:35:137:116:36:35:139:118
chr1	17030590	.	G	A	295.68	PASS	AF=0.213043;AO=49;DP=230;FAO=49;FDP=230;FR=.;FRO=181;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=89;FSRR=92;FWDB=-0.0110813;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.0033;QD=5.14224;RBI=0.0133599;REFB=-0.00330292;REVB=0.00746269;RO=178;SAF=23;SAR=26;SRF=88;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0319763;STB=0.51759;STBP=0.79;TYPE=snp;VARB=0.0112509;OID=.;OPOS=17030590;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:230:230:178:181:49:49:0.213043:26:23:88:90:26:23:89:92
chr1	17033805	.	C	T	600.47	PASS	AF=0.355769;AO=74;DP=209;FAO=74;FDP=208;FR=.;FRO=134;FSAF=42;FSAR=32;FSRF=64;FSRR=70;FWDB=0.00111067;FXX=0.00478446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.435;QD=11.5474;RBI=0.0227122;REFB=-0.00843407;REVB=-0.022685;RO=133;SAF=42;SAR=32;SRF=63;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106177;STB=0.558087;STBP=0.216;TYPE=snp;VARB=0.0155646;OID=.;OPOS=17033805;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:209:208:133:134:74:74:0.355769:32:42:63:70:32:42:64:70
chr1	17033854	.	C	T	1392.42	PASS	AF=0.661111;AO=119;DP=180;FAO=119;FDP=180;FR=.;FRO=61;FSAF=55;FSAR=64;FSRF=20;FSRR=41;FWDB=0.0250415;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.63;QD=30.9427;RBI=0.0258101;REFB=-0.035161;REVB=-0.00625161;RO=60;SAF=55;SAR=64;SRF=20;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0814131;STB=0.546092;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=0.0168137;OID=.;OPOS=17033854;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:180:180:60:61:119:119:0.661111:64:55:20:40:64:55:20:41
chr1	17034125	.	C	CAGCT	87.61	PASS	AF=0.333333;AO=11;DP=35;FAO=11;FDP=33;FR=.;FRO=22;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.00154041;FXX=0.0571265;HRUN=1;LEN=4;MLLD=191.487;QD=10.6194;RBI=0.0132143;REFB=-0.0137269;REVB=-0.0131242;RO=22;SAF=4;SAR=7;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153944;STB=0.593048;STBP=0.463;TYPE=ins;VARB=0.0354264;OID=.;OPOS=17034126;OREF=-;OALT=AGCT;OMAPALT=CAGCT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.333333:11:35:11:33:22:4:7:11:11:87:22:4:7:11:11
chr1	17034455	.	CGCGCGCGT	C	426.34	PASS	AF=0.403361;AO=48;DP=125;FAO=48;FDP=119;FR=.;FRO=71;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=38;FSRR=33;FWDB=-0.0106305;FXX=0.0629872;HRUN=1;LEN=8;MLLD=266.754;QD=14.3308;RBI=0.0223285;REFB=-0.0163636;REVB=0.0196355;RO=67;SAF=23;SAR=25;SRF=35;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0447186;STB=0.533389;STBP=0.555;TYPE=del;VARB=0.0224845;OID=.;OPOS=17034456;OREF=GCGCGCGT;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.403361:48:125:48:119:71:23:25:38:33:99:67:23:25:35:32
chr1	17046456	.	T	C	225.12	PASS	AF=0.255814;AO=33;DP=130;FAO=33;FDP=129;FR=.;FRO=96;FSAF=23;FSAR=10;FSRF=48;FSRR=48;FWDB=0.00676048;FXX=0.00769172;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.76;QD=6.98042;RBI=0.0264393;REFB=-0.00454549;REVB=-0.0255604;RO=95;SAF=23;SAR=10;SRF=47;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.258271;STB=0.652547;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.0105925;OID=.;OPOS=17046456;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:130:129:95:96:33:33:0.255814:10:23:47:48:10:23:48:48
chr1	17052116	.	CG	GC	467.77	PASS	AF=0.18847;AO=85;DP=455;FAO=85;FDP=451;FR=.;FRO=366;FSAF=53;FSAR=32;FSRF=200;FSRR=166;FWDB=0.00468629;FXX=0.00879102;HRUN=1;LEN=2;MLLD=231.959;QD=4.14876;RBI=0.0344988;REFB=-0.00518427;REVB=-0.0341791;RO=360;SAF=53;SAR=32;SRF=196;SRR=164;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10534;STB=0.564482;STBP=0.212;TYPE=mnp;VARB=0.0231914;OID=.;OPOS=17052116;OREF=CG;OALT=GC;OMAPALT=GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:455:451:360:366:85:85:0.18847:32:53:196:164:32:53:200:166
chr1	17053766	.	G	A	1277.41	PASS	AF=0.674847;AO=110;DP=163;FAO=110;FDP=163;FR=.;FRO=53;FSAF=51;FSAR=59;FSRF=33;FSRR=20;FWDB=-0.0067402;FXX=0.0121205;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.583;QD=31.3475;RBI=0.0107239;REFB=-0.0344753;REVB=0.00834102;RO=53;SAF=51;SAR=59;SRF=33;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0960142;STB=0.551577;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.0143965;OID=.;OPOS=17053766;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:163:163:53:53:110:110:0.674847:59:51:33:20:59:51:33:20
chr1	17053782	.	C	G	485.21	PASS	AF=0.414062;AO=53;DP=179;FAO=53;FDP=128;FR=.;FRO=75;FSAF=16;FSAR=37;FSRF=40;FSRR=35;FWDB=-0.012163;FXX=0.2849;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.5733;QD=15.1627;RBI=0.0325051;REFB=0.000966142;REVB=-0.0301437;RO=75;SAF=16;SAR=37;SRF=40;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.252617;STB=0.642624;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=-0.0017464;OID=.;OPOS=17053782;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:179:128:75:75:53:53:0.414062:37:16:40:35:37:16:40:35
chr1	17053809	.	C	T	302.17	PASS	AF=0.251397;AO=45;DP=179;FAO=45;FDP=179;FR=.;FRO=134;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=54;FSRR=80;FWDB=-0.0229969;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.673;QD=6.75233;RBI=0.0636887;REFB=-0.00779332;REVB=-0.0593919;RO=134;SAF=23;SAR=22;SRF=54;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135107;STB=0.580658;STBP=0.236;TYPE=snp;VARB=0.0365398;OID=.;OPOS=17053809;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:179:179:134:134:45:45:0.251397:22:23:54:80:22:23:54:80
chr1	17053826	.	C	T	446.21	PASS	AF=0.347826;AO=56;DP=161;FAO=56;FDP=161;FR=.;FRO=105;FSAF=22;FSAR=34;FSRF=40;FSRR=65;FWDB=-0.00639061;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=225.16;QD=11.0858;RBI=0.0219654;REFB=-0.01751;REVB=-0.0210152;RO=105;SAF=22;SAR=34;SRF=40;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0142673;STB=0.508163;STBP=0.904;TYPE=snp;VARB=0.028554;OID=.;OPOS=17053826;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:161:161:105:105:56:56:0.347826:34:22:40:65:34:22:40:65
chr1	17053834	.	A	AC	248.33	PASS	AF=0.324675;AO=50;DP=157;FAO=50;FDP=154;FR=.;FRO=104;FSAF=13;FSAR=37;FSRF=45;FSRR=59;FWDB=-0.0121885;FXX=0.0191071;HRUN=0;LEN=1;MLLD=301.011;QD=6.45014;RBI=0.0153942;REFB=-0.00385173;REVB=-0.00940338;RO=107;SAF=13;SAR=37;SRF=47;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.235588;STB=0.632236;STBP=0.041;TYPE=ins;VARB=0.00581902;OID=.;OPOS=17053835;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.324675:50:157:50:154:104:13:37:45:59:99:107:13:37:47:60
chr1	17053861	.	C	T	337.57	PASS	AF=0.335938;AO=40;DP=126;FAO=43;FDP=128;FR=.;FRO=85;FSAF=15;FSAR=28;FSRF=38;FSRR=47;FWDB=-0.00923597;FXX=0.00775134;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.075;QD=10.5492;RBI=0.0247447;REFB=-0.000754305;REVB=0.0229564;RO=86;SAF=15;SAR=25;SRF=39;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0952806;STB=0.568768;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=0.00167558;OID=.;OPOS=17053861;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:126:128:86:85:40:43:0.335938:25:15:39:47:28:15:38:47
chr1	17083888	.	C	T	34.83	PASS	AF=0.833333;AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0186617;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=347.639;QD=23.2183;RBI=0.0191885;REFB=-0.0336429;REVB=-0.00446541;RO=1;SAF=4;SAR=1;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.277405;STB=0.66592;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=0.00464003;OID=.;OPOS=17083888;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:6:6:1:1:5:5:0.833333:1:4:0:1:1:4:0:1
chr1	17084510	.	G	A	594.05	PASS	AF=0.491935;AO=61;DP=124;FAO=61;FDP=124;FR=.;FRO=63;FSAF=28;FSAR=33;FSRF=32;FSRR=31;FWDB=0.0428826;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.7366;QD=19.163;RBI=0.0710487;REFB=0.00323537;REVB=0.056648;RO=63;SAF=28;SAR=33;SRF=32;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0450673;STB=0.524912;STBP=0.6;TYPE=snp;VARB=-0.00227923;OID=.;OPOS=17084510;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:124:124:63:63:61:61:0.491935:33:28:32:31:33:28:32:31
chr1	17084536	.	TGGAACA	T	231.12	PASS	AF=0.460526;AO=34;DP=77;FAO=35;FDP=76;FR=.;FRO=41;FSAF=11;FSAR=24;FSRF=24;FSRR=17;FWDB=0.00122293;FXX=0.0129853;HRUN=2;LEN=6;MLLD=315.807;QD=12.1644;RBI=0.00179765;REFB=-0.0104572;REVB=-0.00131757;RO=38;SAF=10;SAR=24;SRF=21;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0.20438;SSSB=-0.257318;STB=0.65057;STBP=0.02;TYPE=del;VARB=0.012705;OID=.;OPOS=17084537;OREF=GGAACA;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.460526:34:77:35:76:41:11:24:24:17:99:38:10:24:21:17
chr1	17084968	.	G	C	62.88	PASS	AF=0.174603;AO=10;DP=62;FAO=11;FDP=63;FR=.;FRO=52;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=25;FSRR=27;FWDB=-0.01729;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.865;QD=3.99211;RBI=0.0173339;REFB=-0.0106058;REVB=-0.00123355;RO=51;SAF=4;SAR=6;SRF=25;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111981;STB=0.5217;STBP=0.949;TYPE=snp;VARB=0.0489704;OID=.;OPOS=17084968;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:62:63:51:52:10:11:0.174603:6:4:25:26:6:5:25:27
chr1	17085006	.	C	T	78.7	PASS	AF=0.148515;AO=15;DP=101;FAO=15;FDP=101;FR=.;FRO=86;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=41;FSRR=45;FWDB=-0.00381186;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=300.828;QD=3.11692;RBI=0.00437492;REFB=-0.00420895;REVB=0.002147;RO=86;SAF=6;SAR=9;SRF=41;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.097199;STB=0.566176;STBP=0.625;TYPE=snp;VARB=0.0229274;OID=.;OPOS=17085006;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:101:101:86:86:15:15:0.148515:9:6:41:45:9:6:41:45
chr1	17085412	.	C	T	116.52	PASS	AF=0.152318;AO=23;DP=151;FAO=23;FDP=151;FR=.;FRO=128;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=45;FSRR=83;FWDB=0.0273037;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.083;QD=3.08666;RBI=0.0277472;REFB=-0.00733305;REVB=-0.00494082;RO=127;SAF=15;SAR=8;SRF=45;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.365592;STB=0.73965;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0672354;OID=.;OPOS=17085412;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:151:151:127:128:23:23:0.152318:8:15:45:82:8:15:45:83
chr1	17085427	.	T	C	124.12	PASS	AF=0.15528;AO=25;DP=161;FAO=25;FDP=161;FR=.;FRO=136;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=48;FSRR=88;FWDB=-0.00482132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.0668;QD=3.0837;RBI=0.00747499;REFB=0.00152177;REVB=0.0057123;RO=136;SAF=16;SAR=9;SRF=48;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.354215;STB=0.729157;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=-0.0087424;OID=.;OPOS=17085427;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:161:161:136:136:25:25:0.15528:9:16:48:88:9:16:48:88
chr1	17085502	.	T	C	733.55	PASS	AF=0.789474;AO=57;DP=73;FAO=60;FDP=76;FR=.;FRO=16;FSAF=25;FSAR=35;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=-0.0505691;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.584;QD=38.6077;RBI=0.050708;REFB=-0.0197582;REVB=-0.00375163;RO=16;SAF=23;SAR=34;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0921885;STB=0.54443;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.0026019;OID=.;OPOS=17085502;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:73:76:16:16:57:60:0.789474:34:23:10:6:35:25:10:6
chr1	17085516	.	C	A	45.88	PASS	AF=0.145455;AO=8;DP=55;FAO=8;FDP=55;FR=.;FRO=47;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=24;FSRR=23;FWDB=-0.00934964;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=342.294;QD=3.33642;RBI=0.0111624;REFB=-0.00753931;REVB=-0.00609779;RO=47;SAF=5;SAR=3;SRF=24;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139846;STB=0.598828;STBP=0.579;TYPE=snp;VARB=0.0424721;OID=.;OPOS=17085516;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:55:55:47:47:8:8:0.145455:3:5:24:23:3:5:24:23
chr1	17085834	.	G	T	434.87	PASS	AF=0.96875;AO=30;DP=31;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0328481;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=156.856;QD=54.3593;RBI=0.0448212;REFB=-0.0584409;REVB=0.0304949;RO=1;SAF=19;SAR=11;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0239088;STB=0.512812;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.000717025;OID=.;OPOS=17085834;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:31:32:1:1:30:31:0.96875:11:19:1:0:12:19:1:0
chr1	17087244	.	AC	A	237.78	PASS	AF=0.660714;AO=34;DP=57;FAO=37;FDP=56;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=26;FSRF=4;FSRR=15;FWDB=0.215429;FXX=0.0175408;HRUN=5;LEN=1;MLLD=14.7248;QD=16.984;RBI=0.25127;REFB=-0.00705321;REVB=0.129333;RO=21;SAF=9;SAR=25;SRF=5;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0.366667;SSSB=0.0241153;STB=0.536247;STBP=0.521;TYPE=del;VARB=0.0186623;OID=.;OPOS=17087245;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.660714:34:57:37:56:19:11:26:4:15:73:21:9:25:5:16
chr1	17087365	.	C	G	143.55	PASS	AF=0.384615;AO=15;DP=48;FAO=20;FDP=52;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=-0.00790628;FXX=0.0370302;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.97;QD=11.0423;RBI=0.0130721;REFB=-0.0200994;REVB=-0.0104101;RO=33;SAF=10;SAR=5;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.246276;STB=0.519212;STBP=0.844;TYPE=snp;VARB=0.0752822;OID=.;OPOS=17087365;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:52:33:32:15:20:0.384615:5:10:15:18:10:10:15:17
chr1	17087465	.	G	A	129.81	PASS	AF=0.263889;AO=19;DP=72;FAO=19;FDP=72;FR=.;FRO=53;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=34;FSRR=19;FWDB=-0.0194743;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=287.996;QD=7.21187;RBI=0.0252193;REFB=-0.00758441;REVB=-0.0160238;RO=53;SAF=6;SAR=13;SRF=34;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.382719;STB=0.730107;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.0221633;OID=.;OPOS=17087465;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:53:53:19:19:0.263889:13:6:34:19:13:6:34:19
chr1	17087582	.	G	A	32.62	PASS	AF=0.106061;AO=7;DP=66;FAO=7;FDP=66;FR=.;FRO=59;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=28;FSRR=31;FWDB=0.0187418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.778;QD=1.97727;RBI=0.0187418;REFB=0.000676975;REVB=-1.49966e-05;RO=59;SAF=1;SAR=6;SRF=28;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.409324;STB=0.823646;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=-0.00435703;OID=.;OPOS=17087582;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:32:66:66:59:59:7:7:0.106061:6:1:28:31:6:1:28:31
chr1	17090902	.	A	AT	51.52	PASS	AF=0.255319;AO=10;DP=47;FAO=12;FDP=47;FR=.;FRO=35;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=22;FSRR=13;FWDB=-0.0479605;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=24.6102;QD=4.38486;RBI=0.0560811;REFB=0.0321312;REVB=0.0290668;RO=35;SAF=6;SAR=4;SRF=22;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0364859;STB=0.531197;STBP=0.831;TYPE=ins;VARB=-0.104298;OID=.;OPOS=17090903;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.255319:10:47:12:47:35:8:4:22:13:51:35:6:4:22:13
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chr1	17186685	.	T	C	169.69	PASS	AF=0.25;AO=23;DP=95;FAO=24;FDP=96;FR=.;FRO=72;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=40;FSRR=32;FWDB=0.0198655;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.1918;QD=7.07051;RBI=0.0305283;REFB=-0.00966214;REVB=0.0231807;RO=72;SAF=11;SAR=12;SRF=40;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.095643;STB=0.572479;STBP=0.435;TYPE=snp;VARB=0.0337444;OID=.;OPOS=17186685;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:96:72:72:23:24:0.25:12:11:40:32:13:11:40:32
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chr1	17197563	.	G	T	191.76	PASS	AF=0.264151;AO=28;DP=107;FAO=28;FDP=106;FR=.;FRO=78;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=37;FSRR=41;FWDB=-0.0169485;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.855;QD=7.23603;RBI=0.0514464;REFB=-0.0189146;REVB=-0.0485745;RO=75;SAF=17;SAR=11;SRF=36;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155622;STB=0.598035;STBP=0.214;TYPE=snp;VARB=0.0569924;OID=.;OPOS=17197563;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:106:75:78:28:28:0.264151:11:17:36:39:11:17:37:41
chr1	17197615	.	C	A	41.25	PASS	AF=0.0940171;AO=11;DP=117;FAO=11;FDP=117;FR=.;FRO=106;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=55;FSRR=51;FWDB=0.00126908;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.833;QD=1.4101;RBI=0.00779199;REFB=-0.00184716;REVB=0.00768795;RO=105;SAF=3;SAR=8;SRF=54;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.282988;STB=0.723461;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.0114803;OID=.;OPOS=17197615;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:117:117:105:106:11:11:0.0940171:8:3:54:51:8:3:55:51
chr1	17197619	.	A	G	42.77	PASS	AF=0.0973451;AO=11;DP=113;FAO=11;FDP=113;FR=.;FRO=102;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=55;FSRR=47;FWDB=-0.000672787;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.136;QD=1.51404;RBI=0.0023285;REFB=-0.00199483;REVB=-0.00222919;RO=101;SAF=3;SAR=8;SRF=55;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.31583;STB=0.737253;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=0.0128523;OID=.;OPOS=17197619;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:42:113:113:101:102:11:11:0.0973451:8:3:55:46:8:3:55:47
chr1	17199074	.	T	C	87.61	PASS	AF=0.240741;AO=13;DP=54;FAO=13;FDP=54;FR=.;FRO=41;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=32;FSRR=9;FWDB=-0.00186256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.422;QD=6.48946;RBI=0.031718;REFB=-0.0109469;REVB=0.0316633;RO=41;SAF=11;SAR=2;SRF=32;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132572;STB=0.584398;STBP=0.621;TYPE=snp;VARB=0.0468922;OID=.;OPOS=17199074;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:54:54:41:41:13:13:0.240741:2:11:32:9:2:11:32:9
chr1	17199076	.	T	A	92.9	PASS	AF=0.245283;AO=13;DP=53;FAO=13;FDP=53;FR=.;FRO=40;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=31;FSRR=9;FWDB=0.00352533;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.381;QD=7.01134;RBI=0.0163078;REFB=-0.0137511;REVB=0.0159221;RO=36;SAF=11;SAR=2;SRF=27;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181016;STB=0.59009;STBP=0.561;TYPE=snp;VARB=0.0417851;OID=.;OPOS=17199076;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:53:53:36:40:13:13:0.245283:2:11:27:9:2:11:31:9
chr1	17200227	.	C	A	76.15	PASS	AF=0.0896057;AO=25;DP=279;FAO=25;FDP=279;FR=.;FRO=254;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=130;FSRR=124;FWDB=-0.00274617;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.5558;QD=1.09179;RBI=0.00294995;REFB=0.00281573;REVB=0.00107739;RO=254;SAF=8;SAR=17;SRF=130;SRR=124;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.227348;STB=0.675161;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=-0.0543761;OID=.;OPOS=17200227;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:279:279:254:254:25:25:0.0896057:17:8:130:124:17:8:130:124
chr1	17200270	.	T	G	553.53	PASS	AF=0.234501;AO=87;DP=372;FAO=87;FDP=371;FR=.;FRO=284;FSAF=42;FSAR=45;FSRF=148;FSRR=136;FWDB=0.00257007;FXX=0.0026881;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.6679;QD=5.968;RBI=0.0197741;REFB=-0.00988341;REVB=0.0196063;RO=283;SAF=42;SAR=45;SRF=148;SRR=135;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.051107;STB=0.529339;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.0373076;OID=.;OPOS=17200270;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:372:371:283:284:87:87:0.234501:45:42:148:135:45:42:148:136
chr1	17200289	.	C	T	712.29	PASS	AF=0.268041;AO=93;DP=372;FAO=104;FDP=388;FR=.;FRO=284;FSAF=50;FSAR=54;FSRF=144;FSRR=140;FWDB=-0.0359882;FXX=0.00257063;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.5268;QD=7.34323;RBI=0.0837614;REFB=-0.0365429;REVB=0.0756361;RO=279;SAF=50;SAR=43;SRF=139;SRR=140;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0497225;STB=0.519227;STBP=0.63;TYPE=snp;VARB=0.0994282;OID=.;OPOS=17200289;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:372:388:279:284:93:104:0.268041:43:50:139:140:54:50:144:140
chr1	17248500	.	A	G	30.97	PASS	AF=0.5;AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0566701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=46.7159;QD=12.386;RBI=0.0898876;REFB=-0.0462376;REVB=-0.0697731;RO=4;SAF=3;SAR=2;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118169;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.045449;OID=.;OPOS=17248500;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:27:10:10:4:5:5:5:0.5:2:3:3:1:2:3:3:2
chr1	17248532	.	A	G	79.49	PASS	AF=1;AO=6;DP=9;FAO=8;FDP=8;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0240965;FXX=0.110988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.076;QD=39.7473;RBI=0.152379;REFB=0;REVB=0.150462;RO=0;SAF=6;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000979097;OID=.;OPOS=17248532;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:8:0:0:6:8:1:0:6:0:0:2:6:0:0
chr1	17250836	.	A	G	190.69	PASS	AF=0.4;AO=20;DP=50;FAO=20;FDP=50;FR=.;FRO=30;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=-0.0270283;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.97;QD=15.2551;RBI=0.0318415;REFB=-0.0317594;REVB=-0.016833;RO=30;SAF=10;SAR=10;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10423;STB=0.559941;STBP=0.493;TYPE=snp;VARB=0.0473983;OID=.;OPOS=17250836;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:30:30:20:20:0.4:10:10:18:12:10:10:18:12
chr1	17264920	.	C	T	201.99	PASS	AF=0.373134;AO=25;DP=67;FAO=25;FDP=67;FR=.;FRO=42;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=24;FSRR=18;FWDB=0.0630781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.6552;QD=12.0591;RBI=0.064319;REFB=-0.00289515;REVB=0.0125729;RO=41;SAF=16;SAR=9;SRF=24;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0625074;STB=0.545418;STBP=0.6;TYPE=snp;VARB=0.00277502;OID=.;OPOS=17264920;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:41:42:25:25:0.373134:9:16:24:17:9:16:24:18
chr1	17264939	.	T	C	201.89	PASS	AF=0.367647;AO=25;DP=69;FAO=25;FDP=68;FR=.;FRO=43;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=26;FSRR=17;FWDB=-0.00611368;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=324.058;QD=11.8759;RBI=0.0199967;REFB=-0.0152124;REVB=-0.0190392;RO=43;SAF=16;SAR=9;SRF=26;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0413436;STB=0.52391;STBP=0.776;TYPE=snp;VARB=0.0239957;OID=.;OPOS=17264939;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:68:43:43:25:25:0.367647:9:16:26:17:9:16:26:17
chr1	17265560	.	C	T	135.76	PASS	AF=0.7;AO=14;DP=20;FAO=14;FDP=20;FR=.;FRO=6;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.00437907;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=223.547;QD=27.1523;RBI=0.00890569;REFB=-0.0401479;REVB=-0.00775468;RO=6;SAF=11;SAR=3;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.289706;STB=0.663536;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.0158152;OID=.;OPOS=17265560;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:20:20:6:6:14:14:0.7:3:11:2:4:3:11:2:4
chr1	17266536	.	G	C	152.36	PASS	AF=0.551724;AO=16;DP=29;FAO=16;FDP=29;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.00158907;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.079;QD=21.0155;RBI=0.0271745;REFB=-0.00974597;REVB=0.027128;RO=13;SAF=7;SAR=9;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0193001;STB=0.510903;STBP=0.934;TYPE=snp;VARB=0.008519;OID=.;OPOS=17266536;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:13:13:16:16:0.551724:9:7:6:7:9:7:6:7
chr1	17270751	.	G	A	35.21	PASS	AF=0.222222;AO=6;DP=27;FAO=6;FDP=27;FR=.;FRO=21;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=0.0130937;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.981;QD=5.21577;RBI=0.0903792;REFB=0.0143111;REVB=0.0894257;RO=21;SAF=1;SAR=5;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.310274;STB=0.71347;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=-0.0391626;OID=.;OPOS=17270751;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:27:27:21:21:6:6:0.222222:5:1:8:13:5:1:8:13
chr1	17273396	.	A	G	295.77	PASS	AF=0.566038;AO=30;DP=53;FAO=30;FDP=53;FR=.;FRO=23;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=-0.0133007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.849;QD=22.3221;RBI=0.0155929;REFB=-0.00954767;REVB=0.00813823;RO=23;SAF=17;SAR=13;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20354;STB=0.612349;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.00755154;OID=.;OPOS=17273396;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:23:23:30:30:0.566038:13:17:7:16:13:17:7:16
chr1	17273444	.	G	A	222.23	PASS	AF=0.617647;AO=21;DP=34;FAO=21;FDP=34;FR=.;FRO=13;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=-0.00302844;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.458;QD=26.1449;RBI=0.0495885;REFB=-0.0224829;REVB=0.0494959;RO=13;SAF=12;SAR=9;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180237;STB=0.599906;STBP=0.141;TYPE=snp;VARB=0.0123864;OID=.;OPOS=17273444;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:13:13:21:21:0.617647:9:12:4:9:9:12:4:9
chr1	17281912	.	C	T	121.52	PASS	AF=0.4375;AO=14;DP=32;FAO=14;FDP=32;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.0248668;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.378;QD=15.1901;RBI=0.0273527;REFB=-0.0268985;REVB=0.0113935;RO=18;SAF=7;SAR=7;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0539195;STB=0.531206;STBP=0.784;TYPE=snp;VARB=0.0369277;OID=.;OPOS=17281912;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:18:18:14:14:0.4375:7:7:8:10:7:7:8:10
chr1	17282573	.	G	A	251.92	PASS	AF=0.621622;AO=23;DP=37;FAO=23;FDP=37;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.0154568;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=282.035;QD=27.235;RBI=0.0169692;REFB=-0.0141121;REVB=-0.00700284;RO=14;SAF=7;SAR=16;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196324;STB=0.609038;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=0.00650424;OID=.;OPOS=17282573;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:14:14:23:23:0.621622:16:7:8:6:16:7:8:6
chr1	17295679	.	T	C	364.79	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0122947;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.272;QD=54.0433;RBI=0.0579839;REFB=0;REVB=0.0566654;RO=0;SAF=16;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.71087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000861188;OID=.;OPOS=17295679;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:27:0:0:26:27:1:10:16:0:0:11:16:0:0
chr1	17301448	.	C	T	51.55	PASS	AF=0.636364;AO=6;DP=10;FAO=7;FDP=11;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0139066;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.098;QD=18.7442;RBI=0.0152467;REFB=-0.00635275;REVB=0.00625046;RO=4;SAF=3;SAR=3;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168827;STB=0.615061;STBP=0.392;TYPE=snp;VARB=0.00113099;OID=.;OPOS=17301448;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:10:11:4:4:6:7:0.636364:3:3:1:3:3:4:1:3
chr1	17313454	.	G	A	95.99	PASS	AF=0.647059;AO=11;DP=17;FAO=11;FDP=17;FR=.;FRO=6;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.000880257;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=175.778;QD=22.5857;RBI=0.00410619;REFB=-0.0219966;REVB=0.00401073;RO=6;SAF=8;SAR=3;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0461225;STB=0.526267;STBP=0.819;TYPE=snp;VARB=0.00775001;OID=.;OPOS=17313454;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:17:17:6:6:11:11:0.647059:3:8:4:2:3:8:4:2
chr1	17314702	.	C	T	194.91	PASS	AF=0.444444;AO=20;DP=45;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.00142793;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.85;QD=17.3251;RBI=0.0230331;REFB=-0.00431932;REVB=0.0229888;RO=25;SAF=10;SAR=10;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0194604;STB=0.5111;STBP=0.927;TYPE=snp;VARB=0.00559424;OID=.;OPOS=17314702;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:25:25:20:20:0.444444:10:10:13:12:10:10:13:12
chr1	17380497	.	G	T	2341.17	PASS	AF=1;AO=146;DP=149;FAO=146;FDP=146;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0591595;FXX=0.0201329;HRUN=3;LEN=1;MLLD=205.39;QD=64.1416;RBI=0.0603539;REFB=0;REVB=0.0119476;RO=0;SAF=59;SAR=87;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.27456e-05;OID=.;OPOS=17380497;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:149:146:0:0:146:146:1:87:59:0:0:87:59:0:0
chr1	17394613	.	T	C	636.72	PASS	AF=1;AO=40;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0187908;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.22;QD=62.1188;RBI=0.0348187;REFB=0;REVB=0.0293129;RO=0;SAF=16;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.95416e-05;OID=.;OPOS=17394613;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:40:41:1:24:16:0:0:25:16:0:0
chr1	17394623	.	C	T	670.27	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0190882;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.6697;QD=62.3506;RBI=0.0199011;REFB=0;REVB=0.00562975;RO=0;SAF=17;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.75441e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000254022;OID=.;OPOS=17394623;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:26:17:0:0:26:17:0:0
chr1	17413121	.	A	C	633.74	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0194522;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.228;QD=61.8286;RBI=0.0261104;REFB=0;REVB=0.0174174;RO=0;SAF=15;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.00308e-05;OID=.;OPOS=17413121;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:41:0:0:38:41:1:23:15:0:0:23:18:0:0
chr1	17419024	.	G	A	571.86	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0708871;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.9259;QD=60.196;RBI=0.0769189;REFB=0;REVB=0.0298586;RO=0;SAF=20;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.71161e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00081621;OID=.;OPOS=17419024;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:38:0:0:37:38:1:17:20:0:0:18:20:0:0
chr1	17609448	.	G	T	1062.44	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0189719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.221;QD=59.8558;RBI=0.0239059;REFB=0;REVB=0.0145451;RO=0;SAF=33;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.53693e-05;OID=.;OPOS=17609448;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:38:33:0:0:38:33:0:0
chr1	17657534	.	G	A	591.79	PASS	AF=0.952381;AO=40;DP=42;FAO=40;FDP=42;FR=.;FRO=2;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0281887;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.0491;QD=56.3605;RBI=0.031475;REFB=-0.0308309;REVB=-0.0140025;RO=2;SAF=19;SAR=21;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.046837;STB=0.524987;STBP=0.256;TYPE=snp;VARB=0.00537195;OID=.;OPOS=17657534;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:42:42:2:2:40:40:0.952381:21:19:2:0:21:19:2:0
chr1	17657616	.	T	C	557.13	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00739712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.873;QD=60.2307;RBI=0.0133429;REFB=0;REVB=0.0111047;RO=0;SAF=20;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.71161e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.70879e-05;OID=.;OPOS=17657616;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:17:20:0:0:17:20:0:0
chr1	17660499	.	G	C	258.76	PASS	AF=0.814815;AO=22;DP=25;FAO=22;FDP=27;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=-0.0624979;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=252.427;QD=38.3355;RBI=0.0645323;REFB=0.0144257;REVB=-0.0160757;RO=0;SAF=2;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.80459e-08;STB=0.555509;STBP=0.633;TYPE=snp;VARB=-0.00426518;OID=.;OPOS=17660499;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:27:25:27:0:5:22:22:0.814815:20:2:0:0:20:2:0:5
chr1	17661128	.	A	C	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0506554;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.0088;QD=51.9159;RBI=0.0842151;REFB=0;REVB=0.0672771;RO=0;SAF=10;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00139581;OID=.;OPOS=17661128;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:11:10:0:0:11:10:0:0
chr1	17662639	.	T	C	631.38	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0191109;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.0889;QD=61.5983;RBI=0.0592156;REFB=0;REVB=-0.0560469;RO=0;SAF=10;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.09277e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0014788;OID=.;OPOS=17662639;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:31:10:0:0:31:10:0:0
chr1	17662662	.	T	C	690.84	PASS	AF=0.978261;AO=43;DP=44;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0302872;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.2031;QD=60.0734;RBI=0.0424188;REFB=0.00287841;REVB=-0.0296992;RO=1;SAF=5;SAR=38;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0850201;STB=0.545433;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=-0.000416514;OID=.;OPOS=17662662;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:44:46:1:1:43:45:0.978261:38:5:1:0:40:5:1:0
chr1	17674537	.	C	A	613.04	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0233952;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.9893;QD=61.3039;RBI=0.0372256;REFB=0;REVB=0.0289554;RO=0;SAF=28;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000439544;OID=.;OPOS=17674537;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:12:28:0:0:12:28:0:0
chr1	17718671	.	AG	A	472.4	PASS	AF=1;AO=40;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0885609;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=27.5899;QD=46.0881;RBI=0.131752;REFB=0;REVB=0.0975472;RO=0;SAF=19;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0.445205;SSEP=0;SSSB=3.17587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00570223;OID=.;OPOS=17718672;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:40:41:41:41:0:19:22:0:0:9:0:19:21:0:0
chr1	17733423	.	C	T	1484.55	PASS	AF=0.525547;AO=144;DP=275;FAO=144;FDP=274;FR=.;FRO=130;FSAF=76;FSAR=68;FSRF=65;FSRR=65;FWDB=-0.0057607;FXX=0.00724611;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.8231;QD=21.6723;RBI=0.0103674;REFB=-0.00549872;REVB=-0.00861955;RO=129;SAF=76;SAR=68;SRF=64;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0274347;STB=0.513199;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=0.0036493;OID=.;OPOS=17733423;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:275:274:129:130:144:144:0.525547:68:76:64:65:68:76:65:65
chr1	17914122	.	G	A	187.64	PASS	AF=0.415094;AO=22;DP=54;FAO=22;FDP=53;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=0.0432629;FXX=0.0185151;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.818;QD=14.1613;RBI=0.0532478;REFB=0.00095365;REVB=-0.0310427;RO=32;SAF=10;SAR=12;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111153;STB=0.573313;STBP=0.392;TYPE=snp;VARB=-0.000961923;OID=.;OPOS=17914122;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:53:32:31:22:22:0.415094:12:10:18:14:12:10:18:13
chr1	17991052	.	T	C	256.0	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0165545;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.851;QD=51.199;RBI=0.0362421;REFB=0;REVB=0.0322403;RO=0;SAF=9;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000168186;OID=.;OPOS=17991052;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:20:0:0:19:20:1:10:9:0:0:10:10:0:0
chr1	18023365	.	C	T	946.55	PASS	AF=1;AO=63;DP=66;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0231538;FXX=0.0441112;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.51;QD=58.249;RBI=0.0572135;REFB=0;REVB=0.0523191;RO=0;SAF=46;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.30331e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000285386;OID=.;OPOS=18023365;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:65:0:0:63:65:1:17:46:0:0:19:46:0:0
chr1	18023509	.	T	C	670.26	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0186631;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.121;QD=62.3496;RBI=0.0442478;REFB=0;REVB=-0.0401193;RO=0;SAF=29;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.13233e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000329119;OID=.;OPOS=18023509;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:14:29:0:0:14:29:0:0
chr1	18023690	.	A	G	763.25	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0298379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.807;QD=63.6041;RBI=0.0320814;REFB=0;REVB=0.0117864;RO=0;SAF=24;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0001063;OID=.;OPOS=18023690;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:48:0:0:47:48:1:23:24:0:0:23:25:0:0
chr1	18149510	.	G	T	54.66	PASS	AF=0.333333;AO=8;DP=24;FAO=8;FDP=24;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.0287367;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.654;QD=9.10959;RBI=0.0287965;REFB=-0.0312328;REVB=0.0018544;RO=16;SAF=6;SAR=2;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.405711;STB=0.749375;STBP=0.101;TYPE=snp;VARB=0.048832;OID=.;OPOS=18149510;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:24:24:16:16:8:8:0.333333:2:6:6:10:2:6:6:10
chr1	18149566	.	C	A	711.37	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0203084;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.054;QD=63.2327;RBI=0.021816;REFB=0;REVB=0.00796901;RO=0;SAF=25;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.90598e-05;OID=.;OPOS=18149566;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:45:0:0:44:45:1:19:25:0:0:20:25:0:0
chr1	18807897	.	C	G	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00961545;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=210.051;QD=40.7629;RBI=0.0135882;REFB=0;REVB=-0.00960122;RO=0;SAF=5;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.19674e-07;OID=.;OPOS=18807897;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:5:5:0:0:5:5:0:0
chr1	18807938	.	C	A	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0089754;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=310.234;QD=40.7629;RBI=0.00932614;REFB=0;REVB=-0.0025336;RO=0;SAF=4;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.28609e-05;OID=.;OPOS=18807938;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:6:4:0:0:6:4:0:0
chr1	18808292	.	C	A	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0437716;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.183;QD=51.1846;RBI=0.0439981;REFB=0;REVB=0.00445868;RO=0;SAF=10;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000362234;OID=.;OPOS=18808292;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:10:10:0:0:10:10:0:0
chr1	18808465	.	T	A	1208.83	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0100001;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.985;QD=61.2067;RBI=0.0302406;REFB=0;REVB=0.0285394;RO=0;SAF=53;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.77523e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.53437e-05;OID=.;OPOS=18808465;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:26:53:0:0:26:53:0:0
chr1	18808526	.	A	C	1339.77	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0119433;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.739;QD=62.3147;RBI=0.0211856;REFB=0;REVB=-0.0174982;RO=0;SAF=50;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.60262e-06;OID=.;OPOS=18808526;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:36:50:0:0:36:50:0:0
chr1	18808711	.	G	C	519.94	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0111917;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=210.898;QD=59.4221;RBI=0.0117172;REFB=0;REVB=0.00346972;RO=0;SAF=20;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.90225e-05;OID=.;OPOS=18808711;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:15:20:0:0:15:20:0:0
chr1	18809896	.	A	T	411.12	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0191838;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=242.202;QD=56.7062;RBI=0.019299;REFB=0;REVB=-0.00210525;RO=0;SAF=13;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.34391e-05;OID=.;OPOS=18809896;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:16:13:0:0:16:13:0:0
chr1	18810344	.	G	T	515.31	PASS	AF=0.947368;AO=36;DP=38;FAO=36;FDP=38;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0197283;FXX=0.0256345;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.884;QD=54.2435;RBI=0.0222461;REFB=-0.109171;REVB=0.0102804;RO=1;SAF=27;SAR=9;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0491764;STB=0.549971;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.00185271;OID=.;OPOS=18810344;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:38:38:1:2:36:36:0.947368:9:27:0:1:9:27:0:2
chr1	18810484	.	G	A	786.4	PASS	AF=1;AO=44;DP=50;FAO=49;FDP=49;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0780824;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.627;QD=64.1963;RBI=0.0800524;REFB=0;REVB=0.0176502;RO=0;SAF=23;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000298176;OID=.;OPOS=18810484;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:49:0:0:44:49:1:21:23:0:0:22:27:0:0
chr1	18810486	.	A	C	622.36	PASS	AF=0.921569;AO=47;DP=51;FAO=47;FDP=51;FR=.;FRO=4;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0152022;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=234.393;QD=48.8122;RBI=0.0168441;REFB=-0.0382361;REVB=-0.0072537;RO=2;SAF=27;SAR=20;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0335685;STB=0.50596;STBP=0.841;TYPE=snp;VARB=0.00217062;OID=.;OPOS=18810486;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:18:51:51:2:4:47:47:0.921569:20:27:2:0:20:27:2:2
chr1	19018405	.	G	A	408.07	PASS	AF=0.5125;AO=41;DP=80;FAO=41;FDP=80;FR=.;FRO=39;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=-0.0180853;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.9667;QD=20.4036;RBI=0.03433;REFB=0.000517692;REVB=0.02918;RO=39;SAF=17;SAR=24;SRF=23;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154034;STB=0.585324;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=-0.000331303;OID=.;OPOS=19018405;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:39:39:41:41:0.5125:24:17:23:16:24:17:23:16
chr1	19018432	.	A	C	295.68	PASS	AF=0.484848;AO=32;DP=66;FAO=32;FDP=66;FR=.;FRO=34;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=-0.0179143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.213;QD=17.9199;RBI=0.0272092;REFB=-0.0189866;REVB=-0.0204798;RO=34;SAF=14;SAR=18;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111718;STB=0.562461;STBP=0.347;TYPE=snp;VARB=0.016399;OID=.;OPOS=19018432;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:34:34:32:32:0.484848:18:14:19:15:18:14:19:15
chr1	19027239	.	A	G	231.71	PASS	AF=0.464286;AO=26;DP=55;FAO=26;FDP=56;FR=.;FRO=30;FSAF=4;FSAR=22;FSRF=8;FSRR=22;FWDB=0.0385556;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.1467;QD=16.5508;RBI=0.0385613;REFB=-0.0250479;REVB=-0.00066418;RO=28;SAF=4;SAR=22;SRF=7;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148618;STB=0.599914;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=0.0271126;OID=.;OPOS=19027239;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:56:28:30:26:26:0.464286:22:4:7:21:22:4:8:22
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chr1	19201956	.	A	G	224.59	PASS	AF=0.470588;AO=24;DP=51;FAO=24;FDP=51;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=-0.0371883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.7118;QD=17.615;RBI=0.0394544;REFB=-0.0197939;REVB=-0.0131789;RO=27;SAF=15;SAR=9;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.204813;STB=0.615667;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=0.0273591;OID=.;OPOS=19201956;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:27:27:24:24:0.470588:9:15:11:16:9:15:11:16
chr1	19202896	.	G	A	325.79	PASS	AF=0.603774;AO=32;DP=53;FAO=32;FDP=53;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=15;FSRR=6;FWDB=0.00386786;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=288.913;QD=24.588;RBI=0.00688312;REFB=-0.0200771;REVB=-0.00569359;RO=21;SAF=11;SAR=21;SRF=15;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.268323;STB=0.647594;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.00709073;OID=.;OPOS=19202896;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:21:21:32:32:0.603774:21:11:15:6:21:11:15:6
chr1	19202917	.	T	C	277.33	PASS	AF=0.595238;AO=25;DP=42;FAO=25;FDP=42;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.089155;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.76;QD=26.4119;RBI=0.0894413;REFB=-0.0238355;REVB=0.00715023;RO=17;SAF=9;SAR=16;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171012;STB=0.594835;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=0.009578;OID=.;OPOS=19202917;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:17:17:25:25:0.595238:16:9:10:7:16:9:10:7
chr1	19202926	.	T	C	236.84	PASS	AF=0.611111;AO=22;DP=36;FAO=22;FDP=36;FR=.;FRO=14;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=-0.00311396;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.041;QD=26.3157;RBI=0.0118387;REFB=-0.00758889;REVB=0.0114218;RO=14;SAF=9;SAR=13;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.211959;STB=0.617395;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=0.00352684;OID=.;OPOS=19202926;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:14:14:22:22:0.611111:13:9:10:4:13:9:10:4
chr1	19203997	.	C	G	930.8	PASS	AF=0.635659;AO=82;DP=129;FAO=82;FDP=129;FR=.;FRO=47;FSAF=55;FSAR=27;FSRF=25;FSRR=22;FWDB=0.00840006;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.592;QD=28.8619;RBI=0.0254438;REFB=-0.0329935;REVB=0.0240172;RO=47;SAF=55;SAR=27;SRF=25;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101694;STB=0.555084;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.0161722;OID=.;OPOS=19203997;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:129:129:47:47:82:82:0.635659:27:55:25:22:27:55:25:22
chr1	19401405	.	G	A	724.87	PASS	AF=0.959184;AO=47;DP=49;FAO=47;FDP=49;FR=.;FRO=2;FSAF=16;FSAR=31;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.005429;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=189.757;QD=59.1726;RBI=0.0231881;REFB=-0.13517;REVB=0.0225436;RO=1;SAF=16;SAR=31;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0284823;STB=0.529399;STBP=0.098;TYPE=snp;VARB=0.00125792;OID=.;OPOS=19401405;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:49:49:1:2:47:47:0.959184:31:16:1:0:31:16:2:0
chr1	19408294	.	G	C,GC	283.88	PASS	AF=0,1;AO=2,19;DP=30;FAO=0,29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=0,10;FSAR=0,19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.01459,0.189832;FXX=0;HRUN=2,4;LEN=1,1;MLLD=12.5102,13.4181;QD=39.1561;RBI=0.0504598,0.200443;REFB=0,0;REVB=-0.0483045,-0.0643525;RO=6;SAF=1,4;SAR=1,15;SRF=5;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.359974,-0.321315;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,ins;VARB=0,0.0069232;OID=.,.;OPOS=19408294,19408295;OREF=G,-;OALT=C,C;OMAPALT=C,GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	2/2:3:30:29:6:0:2,19:0,29:0,1:1,15:1,4:5:1:0,19:0,10:0:0
chr1	19411129	.	A	G	651.22	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0136684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.6985;QD=62.0212;RBI=0.0365033;REFB=0;REVB=-0.0338477;RO=0;SAF=23;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000191978;OID=.;OPOS=19411129;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:19:23:0:0:19:23:0:0
chr1	19413261	.	T	A	1066.94	PASS	AF=0.986301;AO=71;DP=72;FAO=72;FDP=73;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0214728;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.156;QD=58.4627;RBI=0.0313081;REFB=-0.00640853;REVB=-0.0227841;RO=0;SAF=31;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.18246e-08;STB=0.506171;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.000490826;OID=.;OPOS=19413261;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:72:73:0:1:71:72:0.986301:40:31:0:0:40:32:0:1
chr1	19415304	.	C	T	834.17	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.050906;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.64;QD=57.5289;RBI=0.051131;REFB=0;REVB=-0.00479235;RO=0;SAF=35;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000144615;OID=.;OPOS=19415304;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:56:58:0:0:56:58:1:21:35:0:0:21:37:0:0
chr1	19433449	.	A	G	710.28	PASS	AF=0.980769;AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.026285;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.565;QD=54.6366;RBI=0.0268321;REFB=-0.0570051;REVB=-0.00539085;RO=1;SAF=17;SAR=34;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0136506;STB=0.507244;STBP=0.608;TYPE=snp;VARB=0.0011623;OID=.;OPOS=19433449;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:52:52:1:1:51:51:0.980769:34:17:0:1:34:17:0:1
chr1	19447843	.	C	G	393.33	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0584683;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.4269;QD=56.1903;RBI=0.0687955;REFB=0;REVB=-0.0362529;RO=0;SAF=16;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00210868;OID=.;OPOS=19447843;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:12:16:0:0:12:16:0:0
chr1	19510394	.	A	G	675.24	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00665556;FXX=0.0227221;HRUN=3;LEN=1;MLLD=179.217;QD=62.8127;RBI=0.021335;REFB=0;REVB=-0.0202704;RO=0;SAF=19;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00044235;OID=.;OPOS=19510394;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:24:19:0:0:24:19:0:0
chr1	19565344	.	C	G	589.2	PASS	AF=1;AO=36;DP=38;FAO=39;FDP=39;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0560952;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.2435;QD=60.4311;RBI=0.0659413;REFB=0;REVB=0.0346638;RO=0;SAF=17;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00200537;OID=.;OPOS=19565344;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:39:0:0:36:39:1:19:17:0:0:19:20:0:0
chr1	19595137	.	C	T	834.37	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000666666;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.2025;QD=57.5427;RBI=0.0258378;REFB=0;REVB=0.0258292;RO=0;SAF=20;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.38905e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000147797;OID=.;OPOS=19595137;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:38:20:0:0:38:20:0:0
chr1	19596124	.	C	T	937.57	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0276297;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.5051;QD=58.5982;RBI=0.0483466;REFB=0;REVB=-0.0396736;RO=0;SAF=29;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.12086e-05;OID=.;OPOS=19596124;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:35:29:0:0:35:29:0:0
chr1	19596156	.	G	T	800.34	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0358831;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.5977;QD=57.1668;RBI=0.0469634;REFB=0;REVB=0.0302979;RO=0;SAF=22;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000795107;OID=.;OPOS=19596156;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:56:0:0:55:56:1:33:22:0:0:34:22:0:0
chr1	19609254	.	T	C	632.26	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00514105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.51;QD=61.684;RBI=0.0685056;REFB=0;REVB=0.0683125;RO=0;SAF=28;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000143946;OID=.;OPOS=19609254;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:13:28:0:0:13:28:0:0
chr1	19611241	.	T	C	805.15	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0210512;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.4883;QD=64.4123;RBI=0.0862737;REFB=0;REVB=-0.083666;RO=0;SAF=23;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00132807;OID=.;OPOS=19611241;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:27:23:0:0:27:23:0:0
chr1	19612477	.	C	T	704.21	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0292043;FXX=0.039208;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.7566;QD=57.4868;RBI=0.0336222;REFB=0;REVB=0.0166602;RO=0;SAF=28;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00216401;OID=.;OPOS=19612477;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:21:28:0:0:21:28:0:0
chr1	19726907	.	A	T	276.34	PASS	AF=0.557692;AO=27;DP=52;FAO=29;FDP=52;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=23;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=0.0152985;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.923;QD=21.257;RBI=0.0189799;REFB=-0.0112573;REVB=-0.0112337;RO=23;SAF=5;SAR=22;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.272181;STB=0.630038;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.0133654;OID=.;OPOS=19726907;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:23:23:27:29:0.557692:22:5:10:13:23:6:10:13
chr1	19750909	.	G	T	178.39	PASS	AF=0.395833;AO=19;DP=47;FAO=19;FDP=48;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=0.0169806;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.578;QD=14.8656;RBI=0.0178662;REFB=-0.0110451;REVB=0.00555525;RO=28;SAF=8;SAR=11;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0453538;STB=0.516761;STBP=0.855;TYPE=snp;VARB=0.0120811;OID=.;OPOS=19750909;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:48:28:29:19:19:0.395833:11:8:13:15:11:8:13:16
chr1	19950062	.	T	C	416.13	PASS	AF=0.539474;AO=41;DP=77;FAO=41;FDP=76;FR=.;FRO=35;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=11;FSRR=24;FWDB=0.0633651;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.3226;QD=21.9017;RBI=0.0648702;REFB=0.00559075;REVB=0.0138928;RO=35;SAF=17;SAR=24;SRF=11;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0878729;STB=0.548364;STBP=0.377;TYPE=snp;VARB=-0.00382953;OID=.;OPOS=19950062;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:76:35:35:41:41:0.539474:24:17:11:24:24:17:11:24
chr1	19953118	.	G	T	851.05	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0120607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.3333;QD=57.6983;RBI=0.0194869;REFB=0;REVB=-0.0153061;RO=0;SAF=32;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.96591e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.12995e-05;OID=.;OPOS=19953118;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:27:32:0:0:27:32:0:0
chr1	19953165	.	G	A	232.2	PASS	AF=0.479167;AO=22;DP=48;FAO=23;FDP=48;FR=.;FRO=25;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=-0.00996772;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.955;QD=19.3503;RBI=0.0206684;REFB=-0.0277586;REVB=0.018106;RO=26;SAF=15;SAR=7;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0707115;STB=0.556187;STBP=0.479;TYPE=snp;VARB=0.0231536;OID=.;OPOS=19953165;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:26:25:22:23:0.479167:7:15:16:10:7:16:15:10
chr1	20020993	.	AC	GT	183.36	PASS	AF=0.375;AO=18;DP=48;FAO=18;FDP=48;FR=.,HEALED;FRO=28;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=0.00792749;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=196.822;QD=15.2799;RBI=0.00894712;REFB=-0.00875186;REVB=0.00414799;RO=25;SAF=9;SAR=9;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0201776;STB=0.54343;STBP=0.646;TYPE=mnp;VARB=0.0107643;OID=.;OPOS=20020993;OREF=AC;OALT=GT;OMAPALT=GT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:25:28:18:18:0.375:9:9:13:12:9:9:16:12
chr1	20141528	.	C	T	195.89	PASS	AF=0.612903;AO=19;DP=31;FAO=19;FDP=31;FR=.;FRO=12;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=0.0348493;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.693;QD=25.2761;RBI=0.0364247;REFB=-0.0476476;REVB=0.0105965;RO=12;SAF=12;SAR=7;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0910107;STB=0.55051;STBP=0.537;TYPE=snp;VARB=0.011514;OID=.;OPOS=20141528;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:31:31:12:12:19:19:0.612903:7:12:9:3:7:12:9:3
chr1	20246876	.	C	T	480.8	PASS	AF=0.592105;AO=45;DP=77;FAO=45;FDP=76;FR=.;FRO=31;FSAF=29;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=0.0045647;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.681;QD=25.3055;RBI=0.00700104;REFB=-0.0335858;REVB=0.0053083;RO=29;SAF=29;SAR=16;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.096356;STB=0.5417;STBP=0.405;TYPE=snp;VARB=0.0193991;OID=.;OPOS=20246876;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:76:29:31:45:45:0.592105:16:29:15:14:16:29:17:14
chr1	20411332	.	C	T	621.84	PASS	AF=0.416667;AO=70;DP=165;FAO=70;FDP=168;FR=.;FRO=98;FSAF=31;FSAR=39;FSRF=49;FSRR=49;FWDB=-0.00169668;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.179;QD=14.8057;RBI=0.00169831;REFB=-0.00535276;REVB=-7.45458e-05;RO=95;SAF=31;SAR=39;SRF=49;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.075304;STB=0.533506;STBP=0.464;TYPE=snp;VARB=0.00753134;OID=.;OPOS=20411332;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:165:168:95:98:70:70:0.416667:39:31:49:46:39:31:49:49
chr1	20442054	.	T	C	889.44	PASS	AF=1;AO=60;DP=62;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00326996;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.709;QD=58.3238;RBI=0.0556598;REFB=0;REVB=0.0555637;RO=0;SAF=37;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.03034e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000105958;OID=.;OPOS=20442054;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:61:0:0:60:61:1:23:37:0:0:23:38:0:0
chr1	20490518	.	T	C	821.93	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0170063;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.251;QD=57.6791;RBI=0.0235731;REFB=0;REVB=0.0163242;RO=0;SAF=23;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000334175;OID=.;OPOS=20490518;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:34:23:0:0:34:23:0:0
chr1	20810216	.	CAAAAAAAG	CAAAAAA,CAAAAAAAA,CAAAAAAG	47.51	PASS	AF=0.289474,0,0;AO=7,3,8;DP=52;FAO=11,0,0;FDP=38;FR=.;FRO=27;FSAF=7,0,0;FSAR=4,0,0;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=-0.106958,0.0331195,-0.146502;FXX=0.0256345;HRUN=7,6,7;LEN=2,1,1;MLLD=14.7442,11.918,8.22778;QD=5.0007;RBI=0.15579,0.0867989,0.225394;REFB=-0.0445929,-0.0191545,-0.028554;REVB=-0.113272,0.0802319,-0.171288;RO=23;SAF=6,1,6;SAR=1,2,2;SRF=11;SRR=12;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.481938,-0.158088,0.329763;STB=0.532934,0.5,0.5;STBP=0.836,1,1;TYPE=del,snp,del;VARB=0.0875476,0,0.00463372;OID=.,.,.;OPOS=20810223,20810224,20810217;OREF=AG,G,A;OALT=-,A,-;OMAPALT=CAAAAAA,CAAAAAAAA,CAAAAAAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.289474,0,0:7,3,8:52:11,0,0:38:27:7,0,0:4,0,0:16:11:41:23:6,1,6:1,2,2:11:12
chr1	20880905	.	A	G	144.77	PASS	AF=0.432432;AO=16;DP=37;FAO=16;FDP=37;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=-0.0256119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.163;QD=15.6509;RBI=0.0262128;REFB=-0.00975295;REVB=0.0055806;RO=21;SAF=8;SAR=8;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.16468;STB=0.594481;STBP=0.334;TYPE=snp;VARB=0.011988;OID=.;OPOS=20880905;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:21:21:16:16:0.432432:8:8:7:14:8:8:7:14
chr1	20881309	.	T	A	155.94	PASS	AF=0.350877;AO=20;DP=57;FAO=20;FDP=57;FR=.;FRO=37;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=0.00932943;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.766;QD=10.9434;RBI=0.0148737;REFB=-0.00442789;REVB=0.011584;RO=37;SAF=7;SAR=13;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156781;STB=0.591891;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.0142776;OID=.;OPOS=20881309;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:37:37:20:20:0.350877:13:7:18:19:13:7:18:19
chr1	20945055	.	C	T	107.58	PASS	AF=0.351351;AO=13;DP=38;FAO=13;FDP=37;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=0.0181021;FXX=0.0263089;HRUN=3;LEN=1;MLLD=261.317;QD=11.6298;RBI=0.0353501;REFB=-0.00216092;REVB=0.0303636;RO=24;SAF=6;SAR=7;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0960675;STB=0.556876;STBP=0.603;TYPE=snp;VARB=0.0045196;OID=.;OPOS=20945055;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:37:24:24:13:13:0.351351:7:6:9:15:7:6:9:15
chr1	20972048	.	G	A	689.07	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00922887;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.4077;QD=62.6429;RBI=0.0120345;REFB=0;REVB=-0.00772376;RO=0;SAF=20;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.30465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000193036;OID=.;OPOS=20972048;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:24:20:0:0:24:20:0:0
chr1	20972130	.	T	A	72.73	PASS	AF=0.196721;AO=12;DP=61;FAO=12;FDP=61;FR=.;FRO=49;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=18;FSRR=31;FWDB=0.000560729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.9717;QD=4.76942;RBI=0.010794;REFB=-0.00910739;REVB=-0.0107794;RO=47;SAF=9;SAR=3;SRF=17;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.459776;STB=0.790246;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.0468504;OID=.;OPOS=20972130;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:61:61:47:49:12:12:0.196721:3:9:17:30:3:9:18:31
chr1	20977000	.	A	C	52.12	PASS	AF=0.242424;AO=8;DP=33;FAO=8;FDP=33;FR=.;FRO=25;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=19;FSRR=6;FWDB=-0.00547381;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.129;QD=6.31737;RBI=0.0171841;REFB=-0.0147713;REVB=0.016289;RO=24;SAF=4;SAR=4;SRF=19;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.356832;STB=0.696554;STBP=0.265;TYPE=snp;VARB=0.0381127;OID=.;OPOS=20977000;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:33:33:24:25:8:8:0.242424:4:4:19:5:4:4:19:6
chr1	20982631	.	G	A	747.05	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00338349;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.76;QD=63.579;RBI=0.0590868;REFB=0;REVB=-0.0589898;RO=0;SAF=25;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000315357;OID=.;OPOS=20982631;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:22:25:0:0:22:25:0:0
chr1	20987873	.	G	C	754.43	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0548918;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.595;QD=56.9377;RBI=0.0549591;REFB=0;REVB=0.00271885;RO=0;SAF=22;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.76368e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000228914;OID=.;OPOS=20987873;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:31:22:0:0:31:22:0:0
chr1	20990905	.	G	A	207.32	PASS	AF=0.588235;AO=20;DP=34;FAO=20;FDP=34;FR=.;FRO=14;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=0.00345323;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.929;QD=24.3902;RBI=0.0358657;REFB=-0.0453651;REVB=0.035699;RO=13;SAF=12;SAR=8;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0691896;STB=0.5185;STBP=0.798;TYPE=snp;VARB=0.0224483;OID=.;OPOS=20990905;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:13:14:20:20:0.588235:8:12:9:4:8:12:9:5
chr1	20992819	.	G	C	918.35	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0145086;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.2044;QD=58.3081;RBI=0.0994266;REFB=0;REVB=0.0983623;RO=0;SAF=34;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000883097;OID=.;OPOS=20992819;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:63:0:0:62:63:1:28:34:0:0:29:34:0:0
chr1	21024901	.	C	T	284.81	PASS	AF=0.657895;AO=25;DP=38;FAO=25;FDP=38;FR=.;FRO=13;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=0.00456138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.487;QD=29.9804;RBI=0.00713692;REFB=-0.0324454;REVB=-0.00548903;RO=12;SAF=14;SAR=11;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0848705;STB=0.559952;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.013826;OID=.;OPOS=21024901;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:12:13:25:25:0.657895:11:14:5:7:11:14:5:8
chr1	21031046	.	C	T	570.09	PASS	AF=0.53;AO=53;DP=100;FAO=53;FDP=100;FR=.;FRO=47;FSAF=23;FSAR=30;FSRF=26;FSRR=21;FWDB=-0.0211526;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.259;QD=22.8035;RBI=0.036578;REFB=-0.0182395;REVB=-0.0298415;RO=47;SAF=23;SAR=30;SRF=26;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102036;STB=0.556165;STBP=0.262;TYPE=snp;VARB=0.0210755;OID=.;OPOS=21031046;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:47:47:53:53:0.53:30:23:26:21:30:23:26:21
chr1	21042094	.	G	A	381.07	PASS	AF=0.415094;AO=44;DP=105;FAO=44;FDP=106;FR=.;FRO=62;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=26;FSRR=36;FWDB=-0.0124688;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.211;QD=14.3799;RBI=0.0127027;REFB=-0.0109146;REVB=0.00242679;RO=60;SAF=23;SAR=21;SRF=25;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108428;STB=0.560229;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=0.0163206;OID=.;OPOS=21042094;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:106:60:62:44:44:0.415094:21:23:25:35:21:23:26:36
chr1	21044161	.	ACG	GCG,GGC	187.66	PASS	AF=0.875,0.125;AO=14,2;DP=16;FAO=14,2;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=2,0;FSAR=12,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00706687,-0.00613622;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,3;MLLD=87.8925,57.0074;QD=46.9149;RBI=0.00968658,0.00744084;REFB=0,0;REVB=-0.0066249,0.00420867;RO=0;SAF=2,0;SAR=12,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=-0.0222502,0.011143;OID=.,.;OPOS=21044161,21044161;OREF=A,ACG;OALT=G,GGC;OMAPALT=GCG,GGC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:10:16:16:0:0:14,2:14,2:0.875,0.125:12,2:2,0:0:0:12,2:2,0:0:0
chr1	21050958	.	C	T	651.89	PASS	AF=1;AO=41;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0249985;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.316;QD=62.085;RBI=0.0664437;REFB=0;REVB=0.0615617;RO=0;SAF=22;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000319538;OID=.;OPOS=21050958;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:41:42:1:19:22:0:0:20:22:0:0
chr1	21167404	.	A	G	727.8	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0118579;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=319.702;QD=63.2868;RBI=0.0175156;REFB=0;REVB=0.0128914;RO=0;SAF=21;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.85991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.27981e-05;OID=.;OPOS=21167404;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:25:21:0:0:25:21:0:0
chr1	21325360	.	C	A	84.67	PASS	AF=0.366667;AO=10;DP=29;FAO=11;FDP=30;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.00845544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.614;QD=11.2895;RBI=0.0126208;REFB=-0.0039394;REVB=0.0093697;RO=16;SAF=5;SAR=5;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512173;STBP=0.956;TYPE=snp;VARB=0.00741345;OID=.;OPOS=21325360;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:29:30:16:19:10:11:0.366667:5:5:8:8:6:5:9:10
chr1	21808159	.	G	A	132.15	PASS	AF=0.636364;AO=14;DP=22;FAO=14;FDP=22;FR=.;FRO=8;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=0;FWDB=-0.0635373;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.8395;QD=24.0274;RBI=0.0715487;REFB=0.026624;REVB=-0.0328972;RO=8;SAF=10;SAR=4;SRF=8;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.259019;STB=0.642689;STBP=0.191;TYPE=snp;VARB=-0.0204814;OID=.;OPOS=21808159;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:22:22:8:8:14:14:0.636364:4:10:8:0:4:10:8:0
chr1	21808207	.	A	C	54.73	PASS	AF=0.777778;AO=7;DP=9;FAO=7;FDP=9;FR=.;FRO=2;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0237078;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.883;QD=24.3244;RBI=0.0318142;REFB=0.0170958;REVB=-0.0212151;RO=2;SAF=4;SAR=3;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174483;STB=0.599732;STBP=0.399;TYPE=snp;VARB=-0.00103701;OID=.;OPOS=21808207;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:9:9:2:2:7:7:0.777778:3:4:2:0:3:4:2:0
chr1	21808223	.	T	C	54.74	PASS	AF=0.777778;AO=7;DP=9;FAO=7;FDP=9;FR=.;FRO=2;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0334431;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.01;QD=24.3281;RBI=0.0673082;REFB=-0.032348;REVB=-0.0584119;RO=2;SAF=4;SAR=3;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174483;STB=0.599732;STBP=0.399;TYPE=snp;VARB=0.0091851;OID=.;OPOS=21808223;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:9:9:2:2:7:7:0.777778:3:4:2:0:3:4:2:0
chr1	21889635	.	T	C	670.22	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0533174;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.986;QD=62.3461;RBI=0.054962;REFB=0;REVB=-0.0133445;RO=0;SAF=19;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00043014;OID=.;OPOS=21889635;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:24:19:0:0:24:19:0:0
chr1	21904267	.	A	G	1556.19	PASS	AF=0.990566;AO=105;DP=106;FAO=105;FDP=106;FR=.;FRO=1;FSAF=64;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00218736;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.6329;QD=58.7242;RBI=0.0195892;REFB=-0.023615;REVB=-0.0194667;RO=1;SAF=64;SAR=41;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0114334;STB=0.506023;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=0.00470679;OID=.;OPOS=21904267;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:106:106:1:1:105:105:0.990566:41:64:0:1:41:64:0:1
chr1	21932625	.	G	A	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0251912;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=309.435;QD=59.4356;RBI=0.0779065;REFB=0;REVB=0.0737213;RO=0;SAF=15;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00020272;OID=.;OPOS=21932625;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:20:15:0:0:20:15:0:0
chr1	21935433	.	G	T	401.58	PASS	AF=0.9375;AO=29;DP=32;FAO=30;FDP=32;FR=.;FRO=2;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0156334;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.07;QD=50.197;RBI=0.0209228;REFB=-0.0269571;REVB=0.0139054;RO=2;SAF=14;SAR=15;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00207078;STB=0.502091;STBP=0.878;TYPE=snp;VARB=0.00155702;OID=.;OPOS=21935433;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:32:32:2:2:29:30:0.9375:15:14:1:1:16:14:1:1
chr1	21943820	.	G	A	671.78	PASS	AF=0.960784;AO=49;DP=51;FAO=49;FDP=51;FR=.;FRO=2;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00476365;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.5676;QD=52.6885;RBI=0.0836701;REFB=-0.139554;REVB=0.0835344;RO=1;SAF=21;SAR=28;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0165122;STB=0.502856;STBP=0.886;TYPE=snp;VARB=0.0147277;OID=.;OPOS=21943820;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:51:51:1:2:49:49:0.960784:28:21:0:1:28:21:1:1
chr1	22005681	.	C	T	76.14	PASS	AF=0.4;AO=10;DP=25;FAO=10;FDP=25;FR=.;FRO=15;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=15;FWDB=-0.0464242;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=257.382;QD=12.1827;RBI=0.0464489;REFB=-0.0033697;REVB=0.00151566;RO=15;SAF=1;SAR=9;SRF=0;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.409144;STB=0.727002;STBP=0.788;TYPE=snp;VARB=0.00361222;OID=.;OPOS=22005681;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:25:25:15:15:10:10:0.4:9:1:0:15:9:1:0:15
chr1	22050649	.	C	A	379.82	PASS	AF=1;AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0307347;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.559;QD=56.269;RBI=0.0349968;REFB=0;REVB=-0.0167377;RO=0;SAF=11;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.80421e-05;OID=.;OPOS=22050649;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:27:0:0:27:27:1:16:11:0:0:16:11:0:0
chr1	22109370	.	G	A	1632.01	PASS	AF=0.990991;AO=107;DP=112;FAO=110;FDP=111;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=62;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00809712;FXX=0.0176975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.423;QD=58.8111;RBI=0.0226842;REFB=-0.00826511;REVB=0.0211899;RO=1;SAF=47;SAR=60;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00999141;STB=0.505154;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=0.000528138;OID=.;OPOS=22109370;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:112:111:1:1:107:110:0.990991:60:47:1:0:62:48:1:0
chr1	22149935	.	T	C	336.78	PASS	AF=0.406593;AO=37;DP=91;FAO=37;FDP=91;FR=.;FRO=54;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=25;FSRR=29;FWDB=-0.00827405;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.563;QD=14.8035;RBI=0.0220567;REFB=-0.00625509;REVB=-0.020446;RO=54;SAF=19;SAR=18;SRF=25;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0528844;STB=0.529954;STBP=0.652;TYPE=snp;VARB=0.00878589;OID=.;OPOS=22149935;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:54:54:37:37:0.406593:18:19:25:29:18:19:25:29
chr1	22168534	.	TG	GT,T	269.47	PASS	AF=0,0.882353;AO=2,26;DP=51;FAO=0,45;FDP=51;FR=.;FRO=6;FSAF=0,13;FSAR=0,32;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0759647,0.258377;FXX=0;HRUN=1,5;LEN=2,1;MLLD=19.8404,9.32636;QD=21.1346;RBI=0.0776082,0.290616;REFB=-0.0510808,-0.176001;REVB=-0.0158868,0.133038;RO=19;SAF=0,3;SAR=2,23;SRF=10;SRR=9;SSEN=0,0;SSEP=0,0.5625;SSSB=-0.526746,-0.453625;STB=0.5,0.529459;STBP=1,0.324;TYPE=mnp,del;VARB=0,0.128982;OID=.,.;OPOS=22168534,22168535;OREF=TG,G;OALT=GT,-;OMAPALT=GT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:14:51:51:19:6:2,26:0,45:0,0.882353:2,23:0,3:10:9:0,32:0,13:3:3
chr1	22191454	.	G	A	600.96	PASS	AF=0.97561;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0324334;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.23;QD=58.6305;RBI=0.0836603;REFB=-0.0662826;REVB=0.0771176;RO=1;SAF=24;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0191432;STB=0.510199;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.00187067;OID=.;OPOS=22191454;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:41:41:1:1:40:40:0.97561:16:24:1:0:16:24:1:0
chr1	22206649	.	T	C	429.51	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0178192;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.3278;QD=57.2682;RBI=0.0395891;REFB=0;REVB=0.0353521;RO=0;SAF=18;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000236547;OID=.;OPOS=22206649;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:30:0:0:29:30:1:11:18:0:0:12:18:0:0
chr1	22206942	.	G	A	905.96	PASS	AF=0.984375;AO=63;DP=64;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.020424;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=285.975;QD=56.6222;RBI=0.0507683;REFB=0.00780152;REVB=0.0464788;RO=1;SAF=23;SAR=40;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0116608;STB=0.506171;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=2.48074e-05;OID=.;OPOS=22206942;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:64:64:1:1:63:63:0.984375:40:23:0:1:40:23:0:1
chr1	22207235	.	T	C	501.66	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0301429;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.393;QD=59.0183;RBI=0.0368223;REFB=0;REVB=-0.0211492;RO=0;SAF=15;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.40663e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000187976;OID=.;OPOS=22207235;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:19:15:0:0:19:15:0:0
chr1	22214127	.	A	G	1153.58	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.032113;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.216;QD=60.7146;RBI=0.122674;REFB=0;REVB=-0.118396;RO=0;SAF=40;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60877e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000266312;OID=.;OPOS=22214127;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:36:40:0:0:36:40:0:0
chr1	22217108	.	G	A	736.7	PASS	AF=0.981481;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0149086;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.9979;QD=54.5706;RBI=0.0150846;REFB=-0.158892;REVB=-0.00229775;RO=0;SAF=23;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.72004e-08;STB=0.508194;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.00318084;OID=.;OPOS=22217108;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:54:54:0:1:53:53:0.981481:30:23:0:0:30:23:0:1
chr1	22303524	.	G	A	54.75	PASS	AF=0.115044;AO=13;DP=113;FAO=13;FDP=113;FR=.;FRO=100;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=43;FSRR=57;FWDB=-0.0319533;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.5193;QD=1.93812;RBI=0.0319639;REFB=-0.00489546;REVB=0.000822217;RO=100;SAF=6;SAR=7;SRF=43;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0387803;STB=0.528155;STBP=0.838;TYPE=snp;VARB=0.0398013;OID=.;OPOS=22303524;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:113:113:100:100:13:13:0.115044:7:6:43:57:7:6:43:57
chr1	22307340	.	C	T	190.11	PASS	AF=1;AO=16;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0103566;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.3833;QD=44.7318;RBI=0.0828919;REFB=-0.0675415;REVB=0.0822424;RO=0;SAF=3;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.78418e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0124037;OID=.;OPOS=22307340;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:17:17:0:0:16:17:1:13:3:0:0:14:3:0:0
chr1	22307358	.	C	G	239.45	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.034605;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.6347;QD=50.4098;RBI=0.0353982;REFB=0;REVB=0.00745128;RO=0;SAF=5;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000872355;OID=.;OPOS=22307358;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:14:5:0:0:14:5:0:0
chr1	22307538	.	C	T	740.43	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0263103;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=225.405;QD=56.9565;RBI=0.0264683;REFB=0;REVB=0.00288716;RO=0;SAF=34;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.19096e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.2488e-05;OID=.;OPOS=22307538;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:18:34:0:0:18:34:0:0
chr1	22310190	.	T	C	183.65	PASS	AF=0.463415;AO=19;DP=41;FAO=19;FDP=41;FR=.;FRO=22;FSAF=15;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.0198524;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.3547;QD=17.9167;RBI=0.0568602;REFB=-0.0169058;REVB=-0.0532819;RO=22;SAF=15;SAR=4;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.318832;STB=0.683678;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.00782542;OID=.;OPOS=22310190;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:22:22:19:19:0.463415:4:15:11:11:4:15:11:11
chr1	22310262	.	G	C	722.98	PASS	AF=0.963636;AO=51;DP=54;FAO=53;FDP=55;FR=.;FRO=2;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0229947;FXX=0.017854;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.9154;QD=52.5804;RBI=0.0313277;REFB=0.0416055;REVB=-0.0212761;RO=2;SAF=26;SAR=25;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0361869;STB=0.519224;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=-0.00891123;OID=.;OPOS=22310262;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:54:55:2:2:51:53:0.963636:25:26:0:2:25:28:0:2
chr1	22310725	.	G	C	756.62	PASS	AF=0.98;AO=48;DP=49;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0518963;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.4814;QD=60.5295;RBI=0.128226;REFB=-0.128615;REVB=0.117255;RO=1;SAF=23;SAR=25;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.018447;STB=0.50943;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.0116421;OID=.;OPOS=22310725;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:49:50:1:1:48:49:0.98:25:23:0:1:26:23:0:1
chr1	22310824	.	T	C	874.03	PASS	AF=1;AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0209646;FXX=0.0322529;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.149;QD=58.2689;RBI=0.0250697;REFB=0;REVB=0.0137467;RO=0;SAF=26;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.57618e-05;OID=.;OPOS=22310824;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:60:0:0:60:60:1:34:26:0:0:34:26:0:0
chr1	22313161	.	T	C	267.13	PASS	AF=0.954545;AO=21;DP=23;FAO=21;FDP=22;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0403976;FXX=0.0434594;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.31;QD=48.5685;RBI=0.0450092;REFB=-0.0887009;REVB=0.0198458;RO=1;SAF=10;SAR=11;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0401224;STB=0.521719;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=0.00552041;OID=.;OPOS=22313161;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:23:22:1:1:21:21:0.954545:11:10:0:1:11:10:0:1
chr1	22324705	.	T	C	583.35	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00715977;FXX=0.0499875;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.065;QD=61.4054;RBI=0.0157945;REFB=0;REVB=0.0140784;RO=0;SAF=18;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.51048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000166546;OID=.;OPOS=22324705;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:20:18:0:0:20:18:0:0
chr1	22328228	.	C	G	460.84	PASS	AF=0.586667;AO=44;DP=75;FAO=44;FDP=75;FR=.;FRO=31;FSAF=14;FSAR=30;FSRF=11;FSRR=20;FWDB=-0.00947549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.7602;QD=24.5783;RBI=0.0095249;REFB=-0.0372498;REVB=-0.000968856;RO=30;SAF=14;SAR=30;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0128597;STB=0.517233;STBP=0.749;TYPE=snp;VARB=0.0542615;OID=.;OPOS=22328228;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:30:31:44:44:0.586667:30:14:10:20:30:14:11:20
chr1	22332008	.	T	C	52.23	PASS	AF=0.147059;AO=10;DP=68;FAO=10;FDP=68;FR=.;FRO=58;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=24;FSRR=34;FWDB=-0.0173023;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.791;QD=3.07259;RBI=0.020851;REFB=-0.00589951;REVB=0.0116359;RO=58;SAF=8;SAR=2;SRF=24;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.462809;STB=0.81757;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.0251762;OID=.;OPOS=22332008;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:68:68:58:58:10:10:0.147059:2:8:24:34:2:8:24:34
chr1	22336277	.	C	G	545.15	PASS	AF=0.973684;AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0833296;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.6381;QD=57.3839;RBI=0.0885911;REFB=-0.0227635;REVB=-0.0300758;RO=1;SAF=17;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0228411;STB=0.512189;STBP=0.492;TYPE=snp;VARB=0.0114305;OID=.;OPOS=22336277;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:38:38:1:1:37:37:0.973684:20:17:0:1:20:17:0:1
chr1	22443760	.	C	T	125.67	PASS	AF=0.466667;AO=14;DP=30;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=0.00295483;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.236;QD=16.7554;RBI=0.0148677;REFB=-0.00157508;REVB=-0.0145712;RO=16;SAF=9;SAR=5;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0457514;STB=0.526279;STBP=0.833;TYPE=snp;VARB=0.00190127;OID=.;OPOS=22443760;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:16:16:14:14:0.466667:5:9:11:5:5:9:11:5
chr1	22443887	.	G	T	159.7	PASS	AF=0.363636;AO=20;DP=55;FAO=20;FDP=55;FR=.;FRO=35;FSAF=16;FSAR=4;FSRF=23;FSRR=12;FWDB=0.00132205;FXX=0.017854;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.565;QD=11.6145;RBI=0.0188304;REFB=-0.00165836;REVB=-0.018784;RO=35;SAF=16;SAR=4;SRF=23;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.205389;STB=0.621225;STBP=0.215;TYPE=snp;VARB=0.00297794;OID=.;OPOS=22443887;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:35:35:20:20:0.363636:4:16:23:12:4:16:23:12
chr1	22445991	.	C	T	499.77	PASS	AF=0.486239;AO=53;DP=109;FAO=53;FDP=109;FR=.;FRO=56;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=29;FSRR=27;FWDB=-0.0142642;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.197;QD=18.3403;RBI=0.014278;REFB=0.000635352;REVB=0.000627657;RO=56;SAF=22;SAR=31;SRF=29;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0962136;STB=0.553357;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=-0.000649514;OID=.;OPOS=22445991;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:109:56:56:53:53:0.486239:31:22:29:27:31:22:29:27
chr1	22835677	.	A	G	1677.88	PASS	AF=0.99115;AO=111;DP=114;FAO=112;FDP=113;FR=.;FRO=1;FSAF=65;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0164551;FXX=0.00877116;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.933;QD=59.3941;RBI=0.0236899;REFB=0.0313464;REVB=0.0170423;RO=1;SAF=64;SAR=47;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00999396;STB=0.505262;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=0.000169928;OID=.;OPOS=22835677;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:114:113:1:1:111:112:0.99115:47:64:0:1:47:65:0:1
chr1	22846709	.	G	A	501.66	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0117966;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.993;QD=59.0186;RBI=0.024402;REFB=0;REVB=0.0213611;RO=0;SAF=19;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.40663e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000185853;OID=.;OPOS=22846709;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:15:19:0:0:15:19:0:0
chr1	22852715	.	G	C	482.8	PASS	AF=1;AO=33;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0475265;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.1056;QD=56.7997;RBI=0.099347;REFB=0;REVB=0.0872414;RO=1;SAF=19;SAR=14;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0322;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0034237;OID=.;OPOS=22852715;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:1:0:33:34:1:14:19:0:1:15:19:0:0
chr1	22853141	.	G	A	191.54	PASS	AF=0.558824;AO=19;DP=34;FAO=19;FDP=34;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=14;FWDB=-0.0143627;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.444;QD=22.5336;RBI=0.0173882;REFB=-0.0258151;REVB=0.00980108;RO=15;SAF=4;SAR=15;SRF=1;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194429;STB=0.607234;STBP=0.368;TYPE=snp;VARB=0.0299332;OID=.;OPOS=22853141;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:15:15:19:19:0.558824:15:4:1:14:15:4:1:14
chr1	23101688	.	T	G	424.14	PASS	AF=0.472527;AO=43;DP=91;FAO=43;FDP=91;FR=.;FRO=48;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=18;FSRR=30;FWDB=-0.00231119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.3545;QD=18.6436;RBI=0.0404742;REFB=0.0102874;REVB=0.0404081;RO=48;SAF=17;SAR=26;SRF=18;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0202402;STB=0.511273;STBP=0.852;TYPE=snp;VARB=-0.00812606;OID=.;OPOS=23101688;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:48:48:43:43:0.472527:26:17:18:30:26:17:18:30
chr1	23208925	.	G	A	271.89	PASS	AF=0.517857;AO=29;DP=56;FAO=29;FDP=56;FR=.;FRO=27;FSAF=22;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=20;FWDB=-0.0177254;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.881;QD=19.4203;RBI=0.0228979;REFB=-0.00621099;REVB=-0.0144957;RO=27;SAF=22;SAR=7;SRF=7;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.439046;STB=0.745123;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0145949;OID=.;OPOS=23208925;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:27:27:29:29:0.517857:7:22:7:20:7:22:7:20
chr1	23219493	.	T	C	785.82	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0652293;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.3958;QD=64.1483;RBI=0.0851314;REFB=0;REVB=0.0547037;RO=0;SAF=24;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.72898e-05;OID=.;OPOS=23219493;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:25:24:0:0:25:24:0:0
chr1	23222928	.	C	T	321.6	PASS	AF=0.607843;AO=29;DP=49;FAO=31;FDP=51;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=23;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.027612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.1541;QD=25.2233;RBI=0.0796239;REFB=-0.033968;REVB=0.074683;RO=20;SAF=7;SAR=22;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.225513;STB=0.610543;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=0.0248101;OID=.;OPOS=23222928;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:51:20:20:29:31:0.607843:22:7:10:10:23:8:10:10
chr1	23241193	.	C	T	170.33	PASS	AF=0.45;AO=18;DP=40;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=0.00984563;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=310.962;QD=17.0334;RBI=0.0113152;REFB=0.00279721;REVB=-0.00557659;RO=22;SAF=10;SAR=8;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00981228;STB=0.505612;STBP=0.956;TYPE=snp;VARB=-0.00362976;OID=.;OPOS=23241193;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:22:22:18:18:0.45:8:10:12:10:8:10:12:10
chr1	23280424	.	G	T	754.91	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00887022;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.153;QD=56.9747;RBI=0.0319909;REFB=0;REVB=0.0307365;RO=0;SAF=22;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000102046;OID=.;OPOS=23280424;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:53:0:0:52:53:1:30:22:0:0:31:22:0:0
chr1	23413027	.	T	C	114.72	PASS	AF=0.318182;AO=14;DP=44;FAO=14;FDP=44;FR=.;FRO=30;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=-0.00315377;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=308.597;QD=10.4293;RBI=0.0036344;REFB=-0.00426892;REVB=-0.00180626;RO=30;SAF=9;SAR=5;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.238185;STB=0.642653;STBP=0.217;TYPE=snp;VARB=0.00817709;OID=.;OPOS=23413027;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:30:30:14:14:0.318182:5:9:13:17:5:9:13:17
chr1	23418153	.	C	T	283.11	PASS	AF=0.476923;AO=31;DP=65;FAO=31;FDP=65;FR=.;FRO=34;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=0.0543962;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.6447;QD=17.4219;RBI=0.0863416;REFB=0.0310353;REVB=-0.0670517;RO=34;SAF=17;SAR=14;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0178344;STB=0.509994;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=-0.0314629;OID=.;OPOS=23418153;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:34:34:31:31:0.476923:14:17:18:16:14:17:18:16
chr1	23419261	.	G	A	72.7	PASS	AF=0.30303;AO=10;DP=33;FAO=10;FDP=33;FR=.;FRO=23;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=19;FWDB=0.00707817;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.9975;QD=8.81166;RBI=0.0301478;REFB=0.0215297;REVB=0.0293051;RO=23;SAF=1;SAR=9;SRF=4;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184034;STB=0.616167;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=-0.0467707;OID=.;OPOS=23419261;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:33:33:23:23:10:10:0.30303:9:1:4:19:9:1:4:19
chr1	23419374	.	G	T	177.74	PASS	AF=0.396226;AO=21;DP=52;FAO=21;FDP=53;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=-0.0340965;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.205;QD=13.4144;RBI=0.0371259;REFB=-0.000327117;REVB=-0.0146887;RO=31;SAF=11;SAR=10;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0592832;STB=0.542455;STBP=0.626;TYPE=snp;VARB=-0.00196549;OID=.;OPOS=23419374;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:53:31:32:21:21:0.396226:10:11:18:13:10:11:19:13
chr1	23419383	.	C	T	240.16	PASS	AF=0.465517;AO=27;DP=58;FAO=27;FDP=58;FR=.;FRO=31;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=0.00267493;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.103;QD=16.5625;RBI=0.0535944;REFB=-0.000222524;REVB=-0.0535276;RO=30;SAF=11;SAR=16;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149368;STB=0.592524;STBP=0.198;TYPE=snp;VARB=-8.43904e-05;OID=.;OPOS=23419383;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:30:31:27:27:0.465517:16:11:17:13:16:11:18:13
chr1	23419855	.	T	C	171.19	PASS	AF=0.461538;AO=18;DP=39;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=16;FWDB=0.0134895;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.064;QD=17.558;RBI=0.015507;REFB=-0.00614012;REVB=0.00764872;RO=21;SAF=10;SAR=8;SRF=5;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.294619;STB=0.666496;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.0203985;OID=.;OPOS=23419855;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:21:21:18:18:0.461538:8:10:5:16:8:10:5:16
chr1	23519633	.	A	G	160.52	PASS	AF=0.485714;AO=17;DP=35;FAO=17;FDP=35;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.0103238;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.474;QD=18.3452;RBI=0.0125757;REFB=0.00908339;REVB=-0.00718103;RO=18;SAF=7;SAR=10;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0807695;STB=0.54602;STBP=0.579;TYPE=snp;VARB=-0.0121093;OID=.;OPOS=23519633;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:18:18:17:17:0.485714:10:7:9:9:10:7:9:9
chr1	23687827	.	T	C	342.85	PASS	AF=0.546875;AO=35;DP=64;FAO=35;FDP=64;FR=.;FRO=29;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=-0.0189638;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.95;QD=21.428;RBI=0.0189952;REFB=-0.0180918;REVB=0.00109216;RO=29;SAF=17;SAR=18;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0540457;STB=0.529867;STBP=0.616;TYPE=snp;VARB=0.0169761;OID=.;OPOS=23687827;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:29:29:35:35:0.546875:18:17:16:13:18:17:16:13
chr1	23688933	.	A	G	159.32	PASS	AF=0.615385;AO=16;DP=27;FAO=16;FDP=26;FR=.;FRO=10;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=-0.00422173;FXX=0.0370233;HRUN=3;LEN=1;MLLD=155.57;QD=24.5099;RBI=0.013252;REFB=-0.00622968;REVB=0.0125615;RO=10;SAF=9;SAR=7;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0432421;STB=0.524241;STBP=0.778;TYPE=snp;VARB=0.00565385;OID=.;OPOS=23688933;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:27:26:10:10:16:16:0.615385:7:9:5:5:7:9:5:5
chr1	23696152	.	G	A	306.33	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0188324;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.605;QD=53.2741;RBI=0.0209729;REFB=0;REVB=0.00923069;RO=0;SAF=9;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.84921e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.10321e-05;OID=.;OPOS=23696152;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:14:9:0:0:14:9:0:0
chr1	23697574	.	C	G	134.48	PASS	AF=0.46875;AO=15;DP=32;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.0182366;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=207.352;QD=16.8093;RBI=0.0182914;REFB=-0.0225758;REVB=0.0014157;RO=15;SAF=6;SAR=9;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174999;STB=0.569527;STBP=0.454;TYPE=snp;VARB=0.0121422;OID=.;OPOS=23697574;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:15:17:15:15:0.46875:9:6:9:6:9:6:9:8
chr1	23710805	.	A	G	631.05	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00949557;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.893;QD=61.566;RBI=0.0205814;REFB=0;REVB=0.01826;RO=0;SAF=20;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.94815e-05;OID=.;OPOS=23710805;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:21:20:0:0:21:20:0:0
chr1	23743854	.	CT	CG,C	37.79	PASS	AF=0.0144928,0.188406;AO=3,24;DP=71;FAO=1,13;FDP=69;FR=.;FRO=55;FSAF=0,9;FSAR=1,4;FSRF=31;FSRR=24;FWDB=-0.0100636,-0.141428;FXX=0.0416609;HRUN=5,5;LEN=1,1;MLLD=83.7738,11.4424;QD=2.19094;RBI=0.0444646,0.175005;REFB=-0.00993592,-0.157778;REVB=-0.0433108,-0.103077;RO=38;SAF=0,16;SAR=3,8;SRF=21;SRR=17;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.536646,0.129345;STB=0.991218,0.611472;STBP=0.279,0.431;TYPE=snp,del;VARB=-0.0100451,0.15029;OID=.,.;OPOS=23743855,23743855;OREF=T,T;OALT=G,-;OMAPALT=CG,C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0.0144928,0.188406:3,24:71:1,13:69:55:0,9:1,4:31:24:35:38:0,16:3,8:21:17
chr1	23751140	.	G	T	92.58	PASS	AF=1;AO=9;DP=10;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.101914;FXX=0.0999001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.6506;QD=41.1448;RBI=0.103579;REFB=0;REVB=0.0184965;RO=0;SAF=4;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00662936;OID=.;OPOS=23751140;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:9:0:0:9:9:1:5:4:0:0:5:4:0:0
chr1	23763928	.	G	A	236.84	PASS	AF=0.611111;AO=22;DP=36;FAO=22;FDP=36;FR=.;FRO=14;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=0.00104996;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.1593;QD=26.3155;RBI=0.00265421;REFB=0.0165234;REVB=0.0024377;RO=14;SAF=13;SAR=9;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0379631;STB=0.521034;STBP=0.801;TYPE=snp;VARB=-0.00763306;OID=.;OPOS=23763928;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:14:14:22:22:0.611111:9:13:9:5:9:13:9:5
chr1	23833599	.	A	AT,T	337.3	PASS	AF=0.968254,0;AO=40,3;DP=67;FAO=61,0;FDP=63;FR=.;FRO=2;FSAF=41,0;FSAR=20,0;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0109879,0.00644211;FXX=0;HRUN=7,1;LEN=1,1;MLLD=8.48651,172.975;QD=21.4158;RBI=0.289063,0.0100477;REFB=-0.0988648,0.00595109;REVB=0.288854,0.00771068;RO=17;SAF=31,2;SAR=9,1;SRF=9;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.172533,0.153843;STB=0.511901,0.5;STBP=0.418,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.054324,0;OID=.,.;OPOS=23833600,23833599;OREF=-,A;OALT=T,T;OMAPALT=AT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:67:63:17:2:40,3:61,0:0.968254,0:9,1:31,2:9:8:20,0:41,0:2:0
chr1	23833611	.	G	T	918.41	PASS	AF=0.956522;AO=66;DP=70;FAO=66;FDP=69;FR=.;FRO=3;FSAF=45;FSAR=21;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0228095;FXX=0.0142837;HRUN=6;LEN=1;MLLD=206.82;QD=53.2409;RBI=0.022819;REFB=-0.146711;REVB=-0.000656499;RO=1;SAF=45;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0219643;STB=0.500758;STBP=0.944;TYPE=snp;VARB=0.000478691;OID=.;OPOS=23833611;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:70:69:1:3:66:66:0.956522:21:45:0:1:21:45:2:1
chr1	23835794	.	A	G	447.01	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=3.7705e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.498;QD=57.6786;RBI=0.0169024;REFB=0;REVB=0.0169024;RO=0;SAF=19;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.47712e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000163362;OID=.;OPOS=23835794;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:12:19:0:0:12:19:0:0
chr1	23836364	.	A	G	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0229808;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.374;QD=48.7368;RBI=0.0279158;REFB=0;REVB=0.0158485;RO=0;SAF=12;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000328307;OID=.;OPOS=23836364;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:5:12:0:0:5:12:0:0
chr1	23847464	.	C	A	594.54	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0102301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.622;QD=60.9786;RBI=0.0146634;REFB=0;REVB=-0.0105052;RO=0;SAF=19;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.95512e-07;OID=.;OPOS=23847464;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:39:0:0:38:39:1:19:19:0:0:20:19:0:0
chr1	23884780	.	T	C	101.47	PASS	AF=0.276596;AO=13;DP=47;FAO=13;FDP=47;FR=.;FRO=34;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=26;FWDB=0.00333222;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=244.322;QD=8.63528;RBI=0.0041741;REFB=-0.00833973;REVB=0.00251384;RO=33;SAF=4;SAR=9;SRF=8;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0948526;STB=0.564423;STBP=0.641;TYPE=snp;VARB=0.0258071;OID=.;OPOS=23884780;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:33:34:13:13:0.276596:9:4:8:25:9:4:8:26
chr1	23885498	.	T	C	1840.85	PASS	AF=1;AO=120;DP=120;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0249565;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.015;QD=61.3615;RBI=0.0267829;REFB=0;REVB=0.00972095;RO=0;SAF=55;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.70638e-05;OID=.;OPOS=23885498;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:120:120:0:0:120:120:1:65:55:0:0:65:55:0:0
chr1	23885599	.	T	C	196.39	PASS	AF=0.571429;AO=18;DP=33;FAO=20;FDP=35;FR=.;FRO=15;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.0332958;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.8842;QD=22.4444;RBI=0.0406661;REFB=-0.0167708;REVB=0.0233479;RO=15;SAF=8;SAR=10;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0719337;STB=0.514271;STBP=0.848;TYPE=snp;VARB=0.0161619;OID=.;OPOS=23885599;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:35:15:15:18:20:0.571429:10:8:8:7:10:10:8:7
chr1	23965704	.	A	C	346.27	PASS	AF=0.45122;AO=37;DP=82;FAO=37;FDP=82;FR=.;FRO=45;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=27;FSRR=18;FWDB=-0.00969312;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.805;QD=16.8914;RBI=0.0252095;REFB=0.00168017;REVB=-0.0232714;RO=45;SAF=22;SAR=15;SRF=27;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00548818;STB=0.503078;STBP=0.956;TYPE=snp;VARB=-0.0028728;OID=.;OPOS=23965704;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:45:45:37:37:0.45122:15:22:27:18:15:22:27:18
chr1	23966894	.	T	TAAG	74.92	PASS	AF=0.5;AO=9;DP=20;FAO=10;FDP=20;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=-0.0130861;FXX=0;HRUN=2;LEN=3;MLLD=207.167;QD=14.9833;RBI=0.02088;REFB=0.00121564;REVB=0.0162705;RO=10;SAF=4;SAR=5;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138165;STB=0.549901;STBP=0.705;TYPE=ins;VARB=-0.000825373;OID=.;OPOS=23966895;OREF=-;OALT=AAG;OMAPALT=TAAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.5:9:20:10:20:10:5:5:6:4:73:10:4:5:6:4
chr1	24018277	.	C	G	1381.56	PASS	AF=0.988889;AO=89;DP=90;FAO=89;FDP=90;FR=.;FRO=1;FSAF=50;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.019715;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.1126;QD=61.4028;RBI=0.0221018;REFB=-0.122631;REVB=0.00999025;RO=1;SAF=50;SAR=39;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0119967;STB=0.506328;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.00140549;OID=.;OPOS=24018277;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:90:90:1:1:89:89:0.988889:39:50:0:1:39:50:0:1
chr1	24083494	.	C	T	155.4	PASS	AF=0.404762;AO=16;DP=41;FAO=17;FDP=42;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=0.0871526;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.0462;QD=14.8001;RBI=0.0871774;REFB=-0.0100704;REVB=-0.0020778;RO=25;SAF=5;SAR=11;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101299;STB=0.530085;STBP=0.774;TYPE=snp;VARB=0.0179004;OID=.;OPOS=24083494;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:42:25:25:16:17:0.404762:11:5:10:15:11:6:10:15
chr1	24121601	.	C	T	165.98	PASS	AF=0.590909;AO=13;DP=21;FAO=13;FDP=22;FR=.,HEALED;FRO=6;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=-0.0531311;FXX=0.119952;HRUN=7;LEN=1;MLLD=253.966;QD=30.1787;RBI=0.0542904;REFB=-0.0194097;REVB=0.0111594;RO=4;SAF=2;SAR=11;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139462;STB=0.607004;STBP=0.384;TYPE=snp;VARB=0.0134515;OID=.;OPOS=24121601;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:39:21:22:4:6:13:13:0.590909:11:2:0:4:11:2:0:6
chr1	24134721	.	T	C	188.7	PASS	AF=0.415094;AO=22;DP=53;FAO=22;FDP=53;FR=.;FRO=31;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=-0.0210927;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.086;QD=14.2415;RBI=0.0252839;REFB=0.00154518;REVB=-0.0139419;RO=31;SAF=15;SAR=7;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.302717;STB=0.673416;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=-0.00425575;OID=.;OPOS=24134721;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:31:31:22:22:0.415094:7:15:12:19:7:15:12:19
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chr1	24201162	.	G	A	193.4	PASS	AF=0.425532;AO=19;DP=46;FAO=20;FDP=47;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=0.00810485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.483;QD=16.4594;RBI=0.00843846;REFB=-0.0390335;REVB=0.00234923;RO=27;SAF=10;SAR=9;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0456914;STB=0.539406;STBP=0.636;TYPE=snp;VARB=0.0364185;OID=.;OPOS=24201162;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:47:27:27:19:20:0.425532:9:10:13:14:9:11:13:14
chr1	24288404	.	A	G	465.54	PASS	AF=0.5625;AO=44;DP=79;FAO=45;FDP=80;FR=.;FRO=35;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=20;FSRR=15;FWDB=0.00919123;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.6694;QD=23.2769;RBI=0.0290195;REFB=0.00105444;REVB=0.0275255;RO=35;SAF=20;SAR=24;SRF=20;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0940574;STB=0.555531;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=0.00126441;OID=.;OPOS=24288404;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:80:35:35:44:45:0.5625:24:20:20:15:25:20:20:15
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chr1	24288476	.	T	C	354.4	PASS	AF=0.395349;AO=25;DP=86;FAO=34;FDP=86;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=38;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=14;FSRR=24;FWDB=0.0240568;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.588;QD=16.4838;RBI=0.0463697;REFB=-0.0165052;REVB=0.0396411;RO=28;SAF=13;SAR=12;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0854765;STB=0.554424;STBP=0.401;TYPE=snp;VARB=0.00710633;OID=.;OPOS=24288476;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:28:38:25:34:0.395349:12:13:12:16:18:16:14:24
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chr1	24418768	.	T	C	197.6	PASS	AF=0.512821;AO=19;DP=39;FAO=20;FDP=39;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.0753514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.5977;QD=20.2662;RBI=0.0827088;REFB=-0.0135756;REVB=0.0341016;RO=19;SAF=7;SAR=12;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143117;STB=0.562437;STBP=0.439;TYPE=snp;VARB=0.00770572;OID=.;OPOS=24418768;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:19:19:19:20:0.512821:12:7:10:9:12:8:10:9
chr1	24419496	.	A	G	387.93	PASS	AF=0.541667;AO=39;DP=72;FAO=39;FDP=72;FR=.;FRO=33;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=-0.00938219;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.916;QD=21.5516;RBI=0.0165453;REFB=0.00486196;REVB=-0.013628;RO=33;SAF=25;SAR=14;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183938;STB=0.601697;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=-0.00603469;OID=.;OPOS=24419496;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:33:33:39:39:0.541667:14:25:14:19:14:25:14:19
chr1	24421474	.	G	A	199.76	PASS	AF=0.5;AO=20;DP=40;FAO=20;FDP=40;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=0.00761487;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.036;QD=19.9757;RBI=0.0185577;REFB=-0.00999664;REVB=-0.0169234;RO=19;SAF=9;SAR=11;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155872;STB=0.598913;STBP=0.243;TYPE=snp;VARB=0.00864606;OID=.;OPOS=24421474;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:19:20:20:20:0.5:11:9:12:7:11:9:13:7
chr1	24421950	.	C	G	71.31	PASS	AF=0.27027;AO=10;DP=37;FAO=10;FDP=37;FR=.;FRO=27;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=0.00951617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.9501;QD=7.70934;RBI=0.0426626;REFB=-0.0191301;REVB=-0.0415878;RO=27;SAF=7;SAR=3;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181351;STB=0.613797;STBP=0.413;TYPE=snp;VARB=0.0678364;OID=.;OPOS=24421950;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:71:37:37:27:27:10:10:0.27027:3:7:15:12:3:7:15:12
chr1	24447468	.	G	C	456.24	PASS	AF=0.505618;AO=45;DP=89;FAO=45;FDP=89;FR=.;FRO=44;FSAF=14;FSAR=31;FSRF=25;FSRR=19;FWDB=0.0301806;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.4322;QD=20.5052;RBI=0.0680693;REFB=-0.00126298;REVB=0.0610128;RO=44;SAF=14;SAR=31;SRF=25;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.239895;STB=0.633255;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.00347318;OID=.;OPOS=24447468;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:44:44:45:45:0.505618:31:14:25:19:31:14:25:19
chr1	24448084	.	G	A	168.92	PASS	AF=0.4;AO=18;DP=44;FAO=18;FDP=45;FR=.;FRO=27;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=-0.0161687;FXX=0.0217344;HRUN=3;LEN=1;MLLD=141.577;QD=15.015;RBI=0.0162143;REFB=-0.0167505;REVB=0.00121497;RO=26;SAF=7;SAR=11;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115825;STB=0.578859;STBP=0.409;TYPE=snp;VARB=0.0336231;OID=.;OPOS=24448084;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:45:26:27:18:18:0.4:11:7:13:13:11:7:14:13
chr1	24460797	.	T	G	206.76	PASS	AF=0.4375;AO=21;DP=48;FAO=21;FDP=48;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=7;FWDB=0.00999094;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.9044;QD=17.2298;RBI=0.0145493;REFB=0.00873942;REVB=-0.0105765;RO=27;SAF=10;SAR=11;SRF=20;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.259962;STB=0.646929;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=-0.0195984;OID=.;OPOS=24460797;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:27:27:21:21:0.4375:11:10:20:7:11:10:20:7
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chr1	24706292	.	T	C	237.52	PASS	AF=0.490196;AO=24;DP=50;FAO=25;FDP=51;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=0.0148406;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.286;QD=18.6288;RBI=0.0149032;REFB=-0.0170588;REVB=0.00136499;RO=26;SAF=13;SAR=11;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144062;STB=0.588715;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=0.0194501;OID=.;OPOS=24706292;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:51:26:26:24:25:0.490196:11:13:10:16:11:14:10:16
chr1	24718075	.	T	C	255.47	PASS	AF=0.439394;AO=29;DP=66;FAO=29;FDP=66;FR=.;FRO=37;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=-0.0239597;FXX=0.0149231;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.1037;QD=15.4829;RBI=0.0336381;REFB=0.0212411;REVB=0.0236104;RO=37;SAF=14;SAR=15;SRF=22;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11065;STB=0.547413;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=-0.0289544;OID=.;OPOS=24718075;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:37:37:29:29:0.439394:15:14:22:15:15:14:21:16
chr1	24718079	.	C	A	340.97	PASS	AF=0.530303;AO=35;DP=67;FAO=35;FDP=66;FR=.;FRO=31;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.0123875;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.6224;QD=20.6651;RBI=0.0413306;REFB=-0.00924855;REVB=-0.0394306;RO=31;SAF=20;SAR=15;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0747984;STB=0.541461;STBP=0.539;TYPE=snp;VARB=0.00689128;OID=.;OPOS=24718079;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:66:31:31:35:35:0.530303:15:20:15:16:15:20:15:16
chr1	24785393	.	C	T	427.45	PASS	AF=0.488636;AO=43;DP=88;FAO=43;FDP=88;FR=.;FRO=45;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=26;FSRR=19;FWDB=-7.43403e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.3032;QD=19.4295;RBI=0.00747749;REFB=-0.0131792;REVB=0.00747712;RO=44;SAF=26;SAR=17;SRF=26;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0130436;STB=0.514279;STBP=0.832;TYPE=snp;VARB=0.0172167;OID=.;OPOS=24785393;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:44:45:43:43:0.488636:17:26:26:18:17:26:26:19
chr1	24859617	.	G	A	58.12	PASS	AF=0.444444;AO=7;DP=20;FAO=8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=-0.00557787;FXX=0.09995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.519;QD=12.9146;RBI=0.0073754;REFB=0.0103463;REVB=0.00482534;RO=10;SAF=5;SAR=2;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.310426;STB=0.705344;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=-0.0108941;OID=.;OPOS=24859617;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:58:20:18:10:10:7:8:0.444444:2:5:4:6:2:6:4:6
chr1	24859665	.	G	A	172.13	PASS	AF=0.473684;AO=18;DP=38;FAO=18;FDP=38;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.00406707;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=330.869;QD=18.1185;RBI=0.00998123;REFB=0.00354726;REVB=0.00911504;RO=20;SAF=10;SAR=8;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.05159;STB=0.529379;STBP=0.688;TYPE=snp;VARB=-0.00387314;OID=.;OPOS=24859665;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:20:20:18:18:0.473684:8:10:10:10:8:10:10:10
chr1	24861704	.	G	A	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00305236;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.4761;QD=45.8066;RBI=0.00408445;REFB=0;REVB=-0.00271402;RO=0;SAF=6;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.49224e-06;OID=.;OPOS=24861704;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:8:6:0:0:8:6:0:0
chr1	25291010	.	A	T	936.62	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00708042;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.6689;QD=58.5388;RBI=0.0114371;REFB=0;REVB=0.00898193;RO=0;SAF=28;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.35374e-06;OID=.;OPOS=25291010;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:36:28:0:0:36:28:0:0
chr1	25634143	.	T	C	157.85	PASS	AF=0.447368;AO=17;DP=38;FAO=17;FDP=38;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=0.0136765;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.973;QD=16.6157;RBI=0.0472747;REFB=-0.0258474;REVB=0.0452532;RO=21;SAF=6;SAR=11;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.020831;STB=0.511931;STBP=0.875;TYPE=snp;VARB=0.0339671;OID=.;OPOS=25634143;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:21:21:17:17:0.447368:11:6:7:14:11:6:7:14
chr1	25890189	.	A	G	149.85	PASS	AF=0.516129;AO=16;DP=31;FAO=16;FDP=31;FR=.;FRO=15;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.0525419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.442;QD=19.3353;RBI=0.0868126;REFB=-0.0545328;REVB=-0.069107;RO=15;SAF=10;SAR=6;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0811631;STB=0.54616;STBP=0.638;TYPE=snp;VARB=0.0390865;OID=.;OPOS=25890189;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:15:15:16:16:0.516129:6:10:8:7:6:10:8:7
chr1	26131654	.	G	A	769.5	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000501364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.873;QD=57;RBI=0.0198863;REFB=0;REVB=0.01988;RO=0;SAF=25;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.58851e-05;OID=.;OPOS=26131654;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:29:25:0:0:29:25:0:0
chr1	26138262	.	T	C	358.62	PASS	AF=1;AO=17;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.20572;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=35.5111;QD=55.1725;RBI=0.217462;REFB=0;REVB=0.0704913;RO=0;SAF=8;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00817444;OID=.;OPOS=26138262;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:17:26:1:9:8:0:0:10:16:0:0
chr1	26140573	.	C	A	752.7	PASS	AF=0.979592;AO=48;DP=49;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0268619;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.5941;QD=61.4453;RBI=0.0339589;REFB=-0.0713648;REVB=0.0207759;RO=1;SAF=27;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0171068;STB=0.509087;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.00296054;OID=.;OPOS=26140573;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:49:49:1:1:48:48:0.979592:21:27:1:0:21:27:1:0
chr1	26144674	.	G	A	506.07	PASS	AF=1;AO=33;DP=35;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0168051;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.83;QD=59.5372;RBI=0.0177249;REFB=0;REVB=0.00563552;RO=0;SAF=11;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000161819;OID=.;OPOS=26144674;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:34:0:0:33:34:1:22:11:0:0:22:12:0:0
chr1	26146884	.	C	G	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0257023;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.084;QD=55.6561;RBI=0.0284342;REFB=0;REVB=-0.0121612;RO=0;SAF=12;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000115302;OID=.;OPOS=26146884;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:15:12:0:0:15:12:0:0
chr1	26158962	.	A	G	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0147341;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.769;QD=53.2771;RBI=0.0347633;REFB=0;REVB=0.0314864;RO=0;SAF=13;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00029353;OID=.;OPOS=26158962;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:10:13:0:0:10:13:0:0
chr1	26290745	.	G	C	323.47	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.024784;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=287.822;QD=53.9112;RBI=0.0472613;REFB=0;REVB=0.0402416;RO=0;SAF=12;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000198465;OID=.;OPOS=26290745;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:12:12:0:0:12:12:0:0
chr1	26357656	.	C	A	437.6	PASS	AF=0.575342;AO=41;DP=74;FAO=42;FDP=73;FR=.;FRO=31;FSAF=26;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=-0.00600066;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.965;QD=23.978;RBI=0.00629569;REFB=-0.0149527;REVB=-0.00190468;RO=32;SAF=25;SAR=16;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.039147;STB=0.517139;STBP=0.762;TYPE=snp;VARB=0.00947456;OID=.;OPOS=26357656;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:73:32:31:41:42:0.575342:16:25:18:14:16:26:18:13
chr1	26357667	.	G	A	280.25	PASS	AF=0.462687;AO=31;DP=67;FAO=31;FDP=67;FR=.;FRO=36;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=12;FWDB=0.00664728;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.575;QD=16.7316;RBI=0.0159763;REFB=0.00275309;REVB=-0.0145277;RO=36;SAF=17;SAR=14;SRF=24;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115941;STB=0.56492;STBP=0.364;TYPE=snp;VARB=-0.00171092;OID=.;OPOS=26357667;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:36:36:31:31:0.462687:14:17:24:12:14:17:24:12
chr1	26358962	.	G	A	36.61	PASS	AF=0.3;AO=6;DP=20;FAO=6;FDP=20;FR=.;FRO=14;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=12;FWDB=0.00218737;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.914;QD=7.32158;RBI=0.0127526;REFB=-0.0170712;REVB=-0.0125636;RO=13;SAF=1;SAR=5;SRF=2;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0255261;STB=0.53115;STBP=0.918;TYPE=snp;VARB=0.0545701;OID=.;OPOS=26358962;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:20:20:13:14:6:6:0.3:5:1:2:11:5:1:2:12
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chr1	26378002	.	C	T	134.24	PASS	AF=0.454545;AO=15;DP=33;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=0.000628324;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.594;QD=16.2713;RBI=0.0098194;REFB=-0.00365536;REVB=0.00979928;RO=18;SAF=8;SAR=7;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0211742;STB=0.512179;STBP=0.926;TYPE=snp;VARB=0.00833424;OID=.;OPOS=26378002;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:18:18:15:15:0.454545:7:8:10:8:7:8:10:8
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chr1	26393974	.	C	T	199.61	PASS	AF=0.433962;AO=22;DP=52;FAO=23;FDP=53;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=-0.012316;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.518;QD=15.0652;RBI=0.0135578;REFB=-0.0137768;REVB=-0.00566816;RO=30;SAF=10;SAR=12;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0558771;STB=0.544516;STBP=0.591;TYPE=snp;VARB=0.0119009;OID=.;OPOS=26393974;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:53:30:30:22:23:0.433962:12:10:12:18:12:11:12:18
chr1	26449335	.	CAA	C	89.5	PASS	AF=0.355556;AO=16;DP=45;FAO=16;FDP=45;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=-0.00445903;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=139.12;QD=7.9552;RBI=0.0207225;REFB=-0.0127918;REVB=-0.0202371;RO=29;SAF=10;SAR=6;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.265355;STB=0.655547;STBP=0.142;TYPE=del;VARB=0.018331;OID=.;OPOS=26449336;OREF=AA;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.355556:16:45:16:45:29:10:6:11:18:89:29:10:6:11:18
chr1	26449510	.	C	T	202.02	PASS	AF=0.526316;AO=20;DP=38;FAO=20;FDP=38;FR=.;FRO=18;FSAF=16;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=-0.000409746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.401;QD=21.2647;RBI=0.0409531;REFB=-0.0129325;REVB=-0.040951;RO=18;SAF=16;SAR=4;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.39186;STB=0.722648;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.0113126;OID=.;OPOS=26449510;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:18:18:20:20:0.526316:4:16:7:11:4:16:7:11
chr1	26450714	.	A	G	109.94	PASS	AF=0.433333;AO=13;DP=30;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=13;FWDB=0.0390881;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.644;QD=14.658;RBI=0.0422301;REFB=-0.0165886;REVB=0.0159843;RO=16;SAF=2;SAR=11;SRF=3;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0581656;STB=0.578814;STBP=0.553;TYPE=snp;VARB=0.0181737;OID=.;OPOS=26450714;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:16:17:13:13:0.433333:11:2:3:13:11:2:4:13
chr1	26487940	.	A	G	132.15	PASS	AF=0.365854;AO=15;DP=41;FAO=15;FDP=41;FR=.;FRO=26;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=-0.00965079;FXX=0.0465008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.94;QD=12.893;RBI=0.0134667;REFB=-0.00604509;REVB=0.0093922;RO=26;SAF=3;SAR=12;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.291989;STB=0.67444;STBP=0.116;TYPE=snp;VARB=0.0251305;OID=.;OPOS=26487940;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:26:26:15:15:0.365854:12:3:11:15:12:3:11:15
chr1	26526539	.	C	A	96.72	PASS	AF=0.387097;AO=12;DP=31;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=15;FWDB=-0.0540049;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.0593;QD=12.4799;RBI=0.0599374;REFB=0.0258777;REVB=-0.0259992;RO=19;SAF=7;SAR=5;SRF=4;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.375971;STB=0.717631;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=-0.0445255;OID=.;OPOS=26526539;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:31:31:19:19:12:12:0.387097:5:7:4:15:5:7:4:15
chr1	26527951	.	G	A	357.88	PASS	AF=0.5;AO=37;DP=75;FAO=37;FDP=74;FR=.;FRO=37;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=-0.0561856;FXX=0.0133316;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.7154;QD=19.3451;RBI=0.0564784;REFB=0.02634;REVB=0.0057442;RO=38;SAF=17;SAR=20;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0369927;STB=0.527072;STBP=0.654;TYPE=snp;VARB=-0.0257353;OID=.;OPOS=26527951;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:74:38:37:37:37:0.5:20:17:19:19:20:17:19:18
chr1	26582091	.	G	A	263.71	PASS	AF=0.6;AO=24;DP=40;FAO=24;FDP=40;FR=.;FRO=16;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=0.00851116;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.338;QD=26.3711;RBI=0.0197985;REFB=-0.00834148;REVB=-0.0178757;RO=16;SAF=16;SAR=8;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.2172;STB=0.620587;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.00734242;OID=.;OPOS=26582091;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:16:16:24:24:0.6:8:16:6:10:8:16:6:10
chr1	26608782	.	C	T	62.26	PASS	AF=1;AO=5;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0114679;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.5734;QD=35.5756;RBI=0.0114679;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=5;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000920068;OID=.;OPOS=26608782;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:5:7:1:0:5:0:0:0:7:0:0
chr1	26608814	.	A	G	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0194346;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.5;QD=37.4885;RBI=0.0194346;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=8;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000144412;OID=.;OPOS=26608814;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:0:8:0:0:0:8:0:0
chr1	26608828	.	G	A	45.54	PASS	AF=0.666667;AO=3;DP=10;FAO=6;FDP=9;FR=.,HEALED;FRO=3;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0328191;FXX=0.0999001;HRUN=4;LEN=1;MLLD=172.012;QD=20.2388;RBI=0.0328191;REFB=-0.0734704;REVB=0;RO=4;SAF=3;SAR=0;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0298163;OID=.;OPOS=26608828;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:16:10:9:4:3:3:6:0.666667:0:3:4:0:0:6:3:0
chr1	26609259	.	C	T	94.56	PASS	AF=0.611111;AO=11;DP=18;FAO=11;FDP=18;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.0725742;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.8725;QD=21.013;RBI=0.0725743;REFB=0.00601727;REVB=-9.97883e-05;RO=7;SAF=5;SAR=6;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117729;STB=0.566892;STBP=0.492;TYPE=snp;VARB=0.000288257;OID=.;OPOS=26609259;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:18:18:7:7:11:11:0.611111:6:5:2:5:6:5:2:5
chr1	26610891	.	A	C	211.92	PASS	AF=0.488372;AO=20;DP=42;FAO=21;FDP=43;FR=.;FRO=22;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.00419308;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.09;QD=19.7134;RBI=0.0899766;REFB=-0.0379147;REVB=-0.0898788;RO=22;SAF=14;SAR=6;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156859;STB=0.596918;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=0.0316309;OID=.;OPOS=26610891;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:43:22:22:20:21:0.488372:6:14:12:10:6:15:12:10
chr1	26610910	.	G	A	212.78	PASS	AF=0.5;AO=21;DP=41;FAO=21;FDP=42;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=-0.100967;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.0889;QD=20.265;RBI=0.100987;REFB=-9.23066e-05;REVB=-0.00204834;RO=20;SAF=11;SAR=10;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110453;STB=0.572016;STBP=0.386;TYPE=snp;VARB=-0.00236264;OID=.;OPOS=26610910;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:42:20:21:21:21:0.5:10:11:13:7:10:11:14:7
chr1	26646726	.	A	G	199.36	PASS	AF=0.655172;AO=19;DP=29;FAO=19;FDP=29;FR=.;FRO=10;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=0.0328296;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.328;QD=27.4979;RBI=0.0340806;REFB=-0.00967321;REVB=0.00914907;RO=10;SAF=12;SAR=7;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0209336;STB=0.511616;STBP=0.892;TYPE=snp;VARB=0.00689328;OID=.;OPOS=26646726;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:29:29:10:10:19:19:0.655172:7:12:6:4:7:12:6:4
chr1	26646730	.	A	G	214.2	PASS	AF=0.666667;AO=20;DP=30;FAO=20;FDP=30;FR=.;FRO=10;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=-0.0125521;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=294.458;QD=28.5595;RBI=0.0321998;REFB=-0.0124484;REVB=0.0296525;RO=10;SAF=13;SAR=7;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0326949;STB=0.518098;STBP=0.806;TYPE=snp;VARB=0.00829188;OID=.;OPOS=26646730;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:30:30:10:10:20:20:0.666667:7:13:6:4:7:13:6:4
chr1	26648551	.	G	C	284.04	PASS	AF=0.634146;AO=25;DP=41;FAO=26;FDP=41;FR=.;FRO=15;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.00827575;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=239.826;QD=27.7109;RBI=0.00836379;REFB=-0.006615;REVB=0.00121034;RO=15;SAF=14;SAR=11;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108661;STB=0.564922;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.00379247;OID=.;OPOS=26648551;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:15:15:25:26:0.634146:11:14:6:9:11:15:6:9
chr1	26670444	.	G	T	428.0	PASS	AF=0.583333;AO=41;DP=72;FAO=42;FDP=72;FR=.;FRO=30;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=-0.0050184;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=193.013;QD=23.7776;RBI=0.013885;REFB=-0.009116;REVB=0.0129464;RO=31;SAF=25;SAR=16;SRF=10;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.22369;STB=0.608501;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.00497626;OID=.;OPOS=26670444;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:31:30:41:42:0.583333:16:25:10:21:17:25:10:20
chr1	26691174	.	C	A	96.52	PASS	AF=0.352941;AO=12;DP=35;FAO=12;FDP=34;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=0.0179357;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.116;QD=11.3551;RBI=0.0183013;REFB=-0.0190705;REVB=-0.00363957;RO=22;SAF=7;SAR=5;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0599784;STB=0.535656;STBP=0.799;TYPE=snp;VARB=0.0394655;OID=.;OPOS=26691174;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:35:34:22:22:12:12:0.352941:5:7:14:8:5:7:14:8
chr1	26694245	.	T	C	156.2	PASS	AF=0.414634;AO=16;DP=41;FAO=17;FDP=41;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=17;FWDB=-0.00977143;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.372;QD=15.2391;RBI=0.0130983;REFB=-0.0141114;REVB=-0.00872259;RO=24;SAF=8;SAR=8;SRF=7;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.216853;STB=0.606296;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=0.0219183;OID=.;OPOS=26694245;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:24:24:16:17:0.414634:8:8:7:17:9:8:7:17
chr1	26694260	.	T	C	144.77	PASS	AF=0.432432;AO=16;DP=37;FAO=16;FDP=37;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=-0.0574146;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.577;QD=15.6508;RBI=0.0604079;REFB=0.00301368;REVB=-0.0187796;RO=21;SAF=8;SAR=8;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0234155;STB=0.513497;STBP=0.918;TYPE=snp;VARB=-0.0043071;OID=.;OPOS=26694260;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:21:21:16:16:0.432432:8:8:10:11:8:8:10:11
chr1	26700795	.	T	C	898.45	PASS	AF=1;AO=47;DP=63;FAO=62;FDP=62;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=0;FSAF=35;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0582251;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.483;QD=57.9647;RBI=0.0603341;REFB=0;REVB=0.0158127;RO=0;SAF=22;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000333675;OID=.;OPOS=26700795;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:62:0:0:47:62:1:25:22:0:0:27:35:0:0
chr1	26755919	.	A	G	629.89	PASS	AF=0.954545;AO=42;DP=44;FAO=42;FDP=44;FR=.;FRO=2;FSAF=34;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.000378043;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=280.39;QD=57.2627;RBI=0.0112645;REFB=-0.216399;REVB=0.0112581;RO=1;SAF=34;SAR=8;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0136105;STB=0.522173;STBP=0.335;TYPE=snp;VARB=0.000653729;OID=.;OPOS=26755919;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:44:44:1:2:42:42:0.954545:8:34:1:0:8:34:1:1
chr1	26786627	.	G	A	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00454282;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.178;QD=53.2767;RBI=0.03913;REFB=0;REVB=0.0388654;RO=0;SAF=10;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00057358;OID=.;OPOS=26786627;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:13:10:0:0:13:10:0:0
chr1	26879376	.	T	C	453.51	PASS	AF=0.969697;AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=33;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0529263;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.2163;QD=54.9711;RBI=0.0571926;REFB=-0.00423693;REVB=0.0216747;RO=1;SAF=1;SAR=31;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.305177;STB=0.66653;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.00104548;OID=.;OPOS=26879376;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:33:33:1:1:32:32:0.969697:31:1:1:0:31:1:1:0
chr1	26879920	.	T	C	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00149036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.177;QD=51.1846;RBI=0.0259089;REFB=0;REVB=0.025866;RO=0;SAF=8;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.98241e-05;OID=.;OPOS=26879920;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:12:8:0:0:12:8:0:0
chr1	26887592	.	T	C	223.51	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0178909;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.24;QD=49.6698;RBI=0.0638559;REFB=0;REVB=0.0612984;RO=0;SAF=14;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.53656e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00061349;OID=.;OPOS=26887592;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:18:0:0:17:18:1:3:14:0:0:4:14:0:0
chr1	26900620	.	C	G	204.21	PASS	AF=0.384615;AO=25;DP=65;FAO=25;FDP=65;FR=.;FRO=40;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=23;FSRR=17;FWDB=-0.0425311;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=253.254;QD=12.5665;RBI=0.0425317;REFB=-0.0166565;REVB=-0.000238499;RO=40;SAF=9;SAR=16;SRF=23;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.230904;STB=0.632773;STBP=0.113;TYPE=snp;VARB=0.019986;OID=.;OPOS=26900620;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:40:40:25:25:0.384615:16:9:23:17:16:9:23:17
chr1	26900735	.	C	G	937.59	PASS	AF=1;AO=63;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0303172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.1503;QD=58.5995;RBI=0.0401697;REFB=0;REVB=0.026353;RO=0;SAF=35;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000344514;OID=.;OPOS=26900735;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:63:64:1:28:35:0:0:29:35:0:0
chr1	26901319	.	G	A	766.45	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0538146;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.9056;QD=63.8705;RBI=0.0747854;REFB=0;REVB=0.0519311;RO=0;SAF=20;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.56477e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0010755;OID=.;OPOS=26901319;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:28:20:0:0:28:20:0:0
chr1	27210721	.	T	C	630.45	PASS	AF=1;AO=40;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.027324;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.558;QD=61.5076;RBI=0.0275762;REFB=0;REVB=0.00372098;RO=1;SAF=18;SAR=22;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0253417;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.78118e-05;OID=.;OPOS=27210721;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:1:0:40:41:1:22:18:1:0:22:19:0:0
chr1	27223980	.	G	A	354.65	PASS	AF=0.647059;AO=33;DP=50;FAO=33;FDP=51;FR=.;FRO=18;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.00191798;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=174.966;QD=27.8154;RBI=0.0426334;REFB=-0.0288116;REVB=-0.0425902;RO=17;SAF=14;SAR=19;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102606;STB=0.546734;STBP=0.349;TYPE=snp;VARB=0.0185139;OID=.;OPOS=27223980;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:51:17:18:33:33:0.647059:19:14:10:7:19:14:10:8
chr1	27426796	.	T	C	689.28	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0154761;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.0462;QD=62.6622;RBI=0.0162373;REFB=0;REVB=-0.00491308;RO=0;SAF=15;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000290435;OID=.;OPOS=27426796;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:29:15:0:0:29:15:0:0
chr1	27427041	.	T	C	289.32	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0607703;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.2658;QD=52.604;RBI=0.0736181;REFB=0;REVB=-0.0415523;RO=0;SAF=6;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17051e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00299161;OID=.;OPOS=27427041;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:16:6:0:0:16:6:0:0
chr1	27676925	.	G	A	213.28	PASS	AF=0.382353;AO=26;DP=68;FAO=26;FDP=68;FR=.;FRO=42;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=20;FSRR=22;FWDB=-0.000597365;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.973;QD=12.546;RBI=0.0139035;REFB=0.00415589;REVB=-0.0138907;RO=41;SAF=9;SAR=17;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131233;STB=0.584057;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=-0.00636547;OID=.;OPOS=27676925;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:41:42:26:26:0.382353:17:9:19:22:17:9:20:22
chr1	27679797	.	A	G	371.48	PASS	AF=0.513514;AO=38;DP=74;FAO=38;FDP=74;FR=.;FRO=36;FSAF=32;FSAR=6;FSRF=26;FSRR=10;FWDB=0.0248052;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.9325;QD=20.0798;RBI=0.0329449;REFB=-0.00543219;REVB=-0.021681;RO=36;SAF=32;SAR=6;SRF=26;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170019;STB=0.595293;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=0.00563032;OID=.;OPOS=27679797;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:36:36:38:38:0.513514:6:32:26:10:6:32:26:10
chr1	27679954	.	G	A	133.54	PASS	AF=0.619048;AO=13;DP=21;FAO=13;FDP=21;FR=.,HEALED;FRO=6;FSAF=1;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.0144934;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=214.713;QD=25.4366;RBI=0.0173606;REFB=-0.0637433;REVB=-0.00955679;RO=3;SAF=1;SAR=12;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.231783;STB=0.585215;STBP=0.638;TYPE=snp;VARB=0.0256291;OID=.;OPOS=27679954;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:32:21:21:3:6:13:13:0.619048:12:1:1:2:12:1:1:5
chr1	27680292	.	A	G	212.78	PASS	AF=0.5;AO=21;DP=42;FAO=21;FDP=42;FR=.;FRO=21;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=0.0555096;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.7158;QD=20.2644;RBI=0.114114;REFB=-0.0206748;REVB=-0.0997024;RO=21;SAF=12;SAR=9;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0434181;STB=0.524452;STBP=0.783;TYPE=snp;VARB=0.020303;OID=.;OPOS=27680292;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:21:21:21:21:0.5:9:12:13:8:9:12:13:8
chr1	27687466	.	G	T	34.67	PASS	AF=0.206897;AO=6;DP=29;FAO=6;FDP=29;FR=.;FRO=23;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=0.0929206;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.989;QD=4.78266;RBI=0.0971949;REFB=-0.00761989;REVB=0.0285063;RO=22;SAF=3;SAR=3;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0533155;STB=0.551554;STBP=0.779;TYPE=snp;VARB=0.0386938;OID=.;OPOS=27687466;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:29:29:22:23:6:6:0.206897:3:3:12:10:3:3:13:10
chr1	27688633	.	G	A	192.85	PASS	AF=0.423077;AO=22;DP=52;FAO=22;FDP=52;FR=.;FRO=30;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=0.00524079;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=240.747;QD=14.8342;RBI=0.00600457;REFB=-0.0151441;REVB=-0.00293068;RO=28;SAF=14;SAR=8;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206241;STB=0.599908;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=0.0155662;OID=.;OPOS=27688633;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:28:30:22:22:0.423077:8:14:12:16:8:14:14:16
chr1	27875824	.	C	T	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0186721;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.8173;QD=42.1823;RBI=0.0206036;REFB=0;REVB=0.00870979;RO=0;SAF=7;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000536364;OID=.;OPOS=27875824;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:4:7:0:0:4:7:0:0
chr1	27876482	.	C	A	1346.52	PASS	AF=0.956989;AO=89;DP=93;FAO=89;FDP=93;FR=.;FRO=4;FSAF=21;FSAR=68;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0521344;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=97.1592;QD=57.9148;RBI=0.052149;REFB=-0.07215;REVB=0.00123505;RO=1;SAF=21;SAR=68;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00691977;STB=0.500837;STBP=0.976;TYPE=snp;VARB=0.000886545;OID=.;OPOS=27876482;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:93:93:1:4:89:89:0.956989:68:21:0:1:68:21:1:3
chr1	28020307	.	G	C	411.12	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0324306;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.885;QD=56.7064;RBI=0.0343945;REFB=0;REVB=0.011456;RO=0;SAF=12;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.0947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000319041;OID=.;OPOS=28020307;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:17:12:0:0:17:12:0:0
chr1	28268835	.	A	C	171.05	PASS	AF=0.473684;AO=17;DP=38;FAO=18;FDP=38;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.000137643;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.6433;QD=18.0048;RBI=0.0191184;REFB=-0.000517625;REVB=-0.0191179;RO=20;SAF=6;SAR=11;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190132;STB=0.618047;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=0.000158133;OID=.;OPOS=28268835;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:20:20:17:18:0.473684:11:6:11:9:12:6:11:9
chr1	28282292	.	T	C	487.67	PASS	AF=0.522222;AO=47;DP=90;FAO=47;FDP=90;FR=.;FRO=43;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=-0.00181932;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.008;QD=21.6741;RBI=0.00394187;REFB=-0.000924279;REVB=0.00349691;RO=43;SAF=24;SAR=23;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0192674;STB=0.510634;STBP=0.845;TYPE=snp;VARB=0.000986037;OID=.;OPOS=28282292;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:43:43:47:47:0.522222:23:24:21:22:23:24:21:22
chr1	28422847	.	C	T	304.45	PASS	AF=0.586957;AO=27;DP=46;FAO=27;FDP=46;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=0.0686942;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.9482;QD=26.4735;RBI=0.100576;REFB=-0.0185152;REVB=0.0734611;RO=19;SAF=9;SAR=18;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0291155;STB=0.516117;STBP=0.833;TYPE=snp;VARB=0.0173126;OID=.;OPOS=28422847;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:19:19:27:27:0.586957:18:9:7:12:18:9:7:12
chr1	28476862	.	G	T	148.03	PASS	AF=0.484848;AO=16;DP=33;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.00163945;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.213;QD=17.9429;RBI=0.0777066;REFB=-0.0238873;REVB=0.0776893;RO=17;SAF=6;SAR=10;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142198;STB=0.581292;STBP=0.359;TYPE=snp;VARB=0.038105;OID=.;OPOS=28476862;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:17:17:16:16:0.484848:10:6:9:8:10:6:9:8
chr1	28527011	.	A	G	115.67	PASS	AF=0.333333;AO=14;DP=42;FAO=14;FDP=42;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=0.00338923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.952;QD=11.0158;RBI=0.00964791;REFB=-0.0120771;REVB=-0.00903301;RO=28;SAF=12;SAR=2;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.498916;STB=0.802667;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.0252988;OID=.;OPOS=28527011;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:28:28:14:14:0.333333:2:12:13:15:2:12:13:15
chr1	28564252	.	A	G	210.28	PASS	AF=0.444444;AO=24;DP=54;FAO=24;FDP=54;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=-0.0180559;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.6347;QD=15.5764;RBI=0.0334769;REFB=0.00328491;REVB=-0.0281902;RO=30;SAF=12;SAR=12;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130802;STB=0.574014;STBP=0.356;TYPE=snp;VARB=-0.00499238;OID=.;OPOS=28564252;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:30:30:24:24:0.444444:12:12:11:19:12:12:11:19
chr1	28564279	.	A	G	219.21	PASS	AF=0.412698;AO=26;DP=63;FAO=26;FDP=63;FR=.;FRO=37;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=22;FWDB=0.0022125;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.493;QD=13.9183;RBI=0.00509845;REFB=0.000267667;REVB=0.00459337;RO=37;SAF=13;SAR=13;SRF=15;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0975262;STB=0.555513;STBP=0.491;TYPE=snp;VARB=-0.000338838;OID=.;OPOS=28564279;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:37:37:26:26:0.412698:13:13:15:22:13:13:15:22
chr1	28638859	.	A	T	2083.65	PASS	AF=1;AO=133;DP=133;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0279043;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.411;QD=62.6663;RBI=0.0376557;REFB=0;REVB=0.0252843;RO=0;SAF=63;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.77216e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.36017e-05;OID=.;OPOS=28638859;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:133:133:0:0:133:133:1:70:63:0:0:70:63:0:0
chr1	28793149	.	C	G	47.13	PASS	AF=0.411765;AO=7;DP=17;FAO=7;FDP=17;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.0211176;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=193.03;QD=11.0898;RBI=0.0229661;REFB=-0.00414044;REVB=0.00902708;RO=10;SAF=3;SAR=4;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0283636;STB=0.517192;STBP=0.919;TYPE=snp;VARB=0.0110563;OID=.;OPOS=28793149;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:17:17:10:10:7:7:0.411765:4:3:4:6:4:3:4:6
chr1	28975140	.	C	T	294.2	PASS	AF=0.477612;AO=31;DP=66;FAO=32;FDP=67;FR=.;FRO=35;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=13;FWDB=-0.00991808;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.409;QD=17.5642;RBI=0.0216068;REFB=0.00194823;REVB=0.019196;RO=35;SAF=17;SAR=14;SRF=22;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0772378;STB=0.535351;STBP=0.593;TYPE=snp;VARB=-0.00278011;OID=.;OPOS=28975140;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:67:35:35:31:32:0.477612:14:17:22:13:14:18:22:13
chr1	29138975	.	G	T	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0107093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=295.487;QD=40.763;RBI=0.0433267;REFB=0;REVB=0.0419823;RO=0;SAF=2;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000197355;OID=.;OPOS=29138975;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:8:2:0:0:8:2:0:0
chr1	29189597	.	C	T	1229.08	PASS	AF=1;AO=78;DP=79;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000549645;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.979;QD=61.454;RBI=0.00142206;REFB=0;REVB=0.00131155;RO=0;SAF=39;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00011511;OID=.;OPOS=29189597;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:79:80:0:0:78:80:1:39:39:0:0:40:40:0:0
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chr1	29446811	.	A	G	131.34	PASS	AF=0.405405;AO=15;DP=36;FAO=15;FDP=37;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.0116361;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.9984;QD=14.1984;RBI=0.011998;REFB=-0.0218317;REVB=0.00292473;RO=18;SAF=6;SAR=9;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198855;STB=0.612754;STBP=0.262;TYPE=snp;VARB=0.0550784;OID=.;OPOS=29446811;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:37:18:22:15:15:0.405405:9:6:11:7:9:6:13:9
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chr1	29475394	.	C	G	350.88	PASS	AF=0.529412;AO=36;DP=68;FAO=36;FDP=68;FR=.;FRO=32;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=0.0026791;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=224.705;QD=20.64;RBI=0.00528076;REFB=-0.0334281;REVB=-0.0045507;RO=28;SAF=19;SAR=17;SRF=9;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162888;STB=0.556972;STBP=0.33;TYPE=snp;VARB=0.0281118;OID=.;OPOS=29475394;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:28:32:36:36:0.529412:17:19:9:19:17:19:13:19
chr1	29475648	.	T	G	318.62	PASS	AF=0.692308;AO=27;DP=39;FAO=27;FDP=39;FR=.;FRO=12;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.00209537;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=253.394;QD=32.6793;RBI=0.00937627;REFB=-0.0121445;REVB=-0.00913914;RO=11;SAF=15;SAR=12;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0537951;STB=0.542825;STBP=0.453;TYPE=snp;VARB=0.00496818;OID=.;OPOS=29475648;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:39:39:11:12:27:27:0.692308:12:15:5:6:12:15:5:7
chr1	29529699	.	T	C	255.28	PASS	AF=0.510638;AO=24;DP=48;FAO=24;FDP=47;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=0.00134491;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.1468;QD=21.7257;RBI=0.0303266;REFB=-0.0130986;REVB=-0.0302968;RO=24;SAF=14;SAR=10;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509083;STBP=0.93;TYPE=snp;VARB=0.0226437;OID=.;OPOS=29529699;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:47:24:23:24:24:0.510638:10:14:14:10:10:14:13:10
chr1	29542637	.	A	G	242.1	PASS	AF=0.473684;AO=27;DP=57;FAO=27;FDP=57;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.0291846;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.0042;QD=16.9895;RBI=0.0676206;REFB=-0.00524185;REVB=-0.0609985;RO=30;SAF=11;SAR=16;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149368;STB=0.584031;STBP=0.25;TYPE=snp;VARB=0.00742879;OID=.;OPOS=29542637;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:30:30:27:27:0.473684:16:11:17:13:16:11:17:13
chr1	29606120	.	C	A	85.23	PASS	AF=0.354839;AO=10;DP=31;FAO=11;FDP=31;FR=.;FRO=20;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=19;FWDB=-0.00438907;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.595;QD=10.9978;RBI=0.0214371;REFB=-0.0146428;REVB=0.0209829;RO=19;SAF=2;SAR=8;SRF=0;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.488393;STB=0.674469;STBP=0.408;TYPE=snp;VARB=0.0274375;OID=.;OPOS=29606120;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:31:31:19:20:10:11:0.354839:8:2:0:19:9:2:1:19
chr1	29630455	.	C	T	546.33	PASS	AF=0.542553;AO=51;DP=94;FAO=51;FDP=94;FR=.;FRO=43;FSAF=24;FSAR=27;FSRF=16;FSRR=27;FWDB=-0.00182574;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.08;QD=23.248;RBI=0.0244096;REFB=-0.0187966;REVB=0.0243412;RO=43;SAF=24;SAR=27;SRF=16;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0827705;STB=0.545437;STBP=0.36;TYPE=snp;VARB=0.0175102;OID=.;OPOS=29630455;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:43:43:51:51:0.542553:27:24:16:27:27:24:16:27
chr1	29631909	.	A	G	708.49	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0435486;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.697;QD=62.9772;RBI=0.0435618;REFB=0;REVB=-0.00107433;RO=0;SAF=20;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.09779e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000133724;OID=.;OPOS=29631909;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:25:20:0:0:25:20:0:0
chr1	31188901	.	A	G	1156.49	PASS	AF=1;AO=76;DP=77;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00108813;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.227;QD=60.8679;RBI=0.00853703;REFB=0;REVB=-0.0084674;RO=0;SAF=43;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.66218e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.74547e-06;OID=.;OPOS=31188901;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:76:0:0:76:76:1:33:43:0:0:33:43:0:0
chr1	31215364	.	T	C	651.23	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00553643;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.271;QD=62.022;RBI=0.00584336;REFB=0;REVB=-0.00186889;RO=0;SAF=24;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.28648e-05;OID=.;OPOS=31215364;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:18:24:0:0:18:24:0:0
chr1	31346057	.	A	G	165.73	PASS	AF=0.391304;AO=18;DP=46;FAO=18;FDP=46;FR=.;FRO=28;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=0.00845599;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.025;QD=14.411;RBI=0.0277839;REFB=-0.0167441;REVB=-0.0264659;RO=28;SAF=8;SAR=10;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0585465;STB=0.533943;STBP=0.743;TYPE=snp;VARB=0.0225075;OID=.;OPOS=31346057;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:28:28:18:18:0.391304:10:8:14:14:10:8:14:14
chr1	31347320	.	G	A	308.75	PASS	AF=0.551724;AO=32;DP=59;FAO=32;FDP=58;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=0.0327262;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.4489;QD=21.2934;RBI=0.050935;REFB=-0.0299273;REVB=0.0390305;RO=26;SAF=13;SAR=19;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108351;STB=0.560006;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.0258025;OID=.;OPOS=31347320;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:58:26:26:32:32:0.551724:19:13:14:12:19:13:14:12
chr1	31445932	.	C	A,G	1220.14	PASS	AF=0.0493827,0.950617;AO=4,77;DP=81;FAO=4,77;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=1,43;FSAR=3,34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00715156,0.0079347;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=115.222,86.1983;QD=60.2539;RBI=0.014619,0.0141581;REFB=0,0;REVB=0.0127504,0.0117257;RO=0;SAF=1,43;SAR=3,34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.86674e-08,-7.11157e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0104831,0.00110106;OID=.,.;OPOS=31445932,31445932;OREF=C,C;OALT=A,G;OMAPALT=A,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:12:81:81:0:0:4,77:4,77:0.0493827,0.950617:3,34:1,43:0:0:3,34:1,43:0:0
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chr1	31732892	.	G	A	141.38	PASS	AF=0.369565;AO=14;DP=46;FAO=17;FDP=46;FR=.,HEALED;FRO=29;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=-0.133722;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.27;QD=12.294;RBI=0.135997;REFB=-0.0271514;REVB=-0.0247684;RO=24;SAF=6;SAR=8;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0323337;STB=0.550961;STBP=0.614;TYPE=snp;VARB=0.0505498;OID=.;OPOS=31732892;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:24:29:14:17:0.369565:8:6:11:13:9:8:16:13
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chr1	31973122	.	GTGGAGTCTGTC	G	276.55	PASS	AF=1;AO=21;DP=22;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159941;FXX=0.0454339;HRUN=1;LEN=11;MLLD=334.851;QD=52.6754;RBI=0.0171134;REFB=0;REVB=0.00608757;RO=0;SAF=4;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.45803e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=7.98059e-05;OID=.;OPOS=31973123;OREF=TGGAGTCTGTC;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:21:22:21:21:0:4:17:0:0:4:0:4:17:0:0
chr1	31973138	.	T	C	323.47	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0182139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.583;QD=53.9112;RBI=0.0556595;REFB=0;REVB=0.052595;RO=0;SAF=6;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000292276;OID=.;OPOS=31973138;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:18:6:0:0:18:6:0:0
chr1	31973348	.	A	C	594.53	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0319005;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=152.521;QD=60.9778;RBI=0.0559341;REFB=0;REVB=0.0459454;RO=0;SAF=12;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000432265;OID=.;OPOS=31973348;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:27:12:0:0:27:12:0:0
chr1	31973409	.	G	A	560.55	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.052951;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.365;QD=60.6002;RBI=0.0565432;REFB=0;REVB=0.0198326;RO=0;SAF=8;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000377464;OID=.;OPOS=31973409;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:29:8:0:0:29:8:0:0
chr1	31973440	.	G	A	501.66	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0147262;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.585;QD=59.0186;RBI=0.0163061;REFB=0;REVB=-0.00700187;RO=0;SAF=7;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.32246e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.53333e-05;OID=.;OPOS=31973440;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:27:7:0:0:27:7:0:0
chr1	32084904	.	C	T	606.93	PASS	AF=0.459854;AO=63;DP=137;FAO=63;FDP=137;FR=.;FRO=74;FSAF=23;FSAR=40;FSRF=31;FSRR=43;FWDB=-0.0189637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.9208;QD=17.7205;RBI=0.0191039;REFB=-0.0170639;REVB=-0.00231043;RO=74;SAF=23;SAR=40;SRF=31;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0554106;STB=0.530833;STBP=0.547;TYPE=snp;VARB=0.0191372;OID=.;OPOS=32084904;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:137:137:74:74:63:63:0.459854:40:23:31:43:40:23:31:43
chr1	32092525	.	A	G	188.7	PASS	AF=0.415094;AO=22;DP=53;FAO=22;FDP=53;FR=.;FRO=31;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=20;FWDB=-0.0063783;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.701;QD=14.2416;RBI=0.0158483;REFB=-0.0111368;REVB=-0.0145081;RO=31;SAF=11;SAR=11;SRF=11;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148746;STB=0.584831;STBP=0.351;TYPE=snp;VARB=0.0169007;OID=.;OPOS=32092525;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:31:31:22:22:0.415094:11:11:11:20:11:11:11:20
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chr1	32138107	.	G	A	57.32	PASS	AF=0.444444;AO=8;DP=18;FAO=8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=0.0908285;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.3096;QD=12.7388;RBI=0.0982377;REFB=0.00045942;REVB=0.0374278;RO=10;SAF=5;SAR=3;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.380216;STB=0.72318;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=0.00991248;OID=.;OPOS=32138107;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:18:18:10:10:8:8:0.444444:3:5:2:8:3:5:2:8
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chr1	32196647	.	C	G	98.92	PASS	AF=0.413793;AO=12;DP=30;FAO=12;FDP=29;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=0.113984;FXX=0.0333222;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.5704;QD=13.6444;RBI=0.114605;REFB=-0.0195223;REVB=0.0119118;RO=18;SAF=6;SAR=6;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113436;STB=0.586067;STBP=0.429;TYPE=snp;VARB=0.0306355;OID=.;OPOS=32196647;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:30:29:18:17:12:12:0.413793:6:6:11:7:6:6:11:6
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chr1	32256303	.	G	A	216.62	PASS	AF=0.4;AO=26;DP=65;FAO=26;FDP=65;FR=.;FRO=39;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=23;FWDB=0.0197345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.4776;QD=13.3305;RBI=0.0555487;REFB=-0.0180134;REVB=0.051925;RO=38;SAF=15;SAR=11;SRF=16;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161309;STB=0.599219;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=0.0153894;OID=.;OPOS=32256303;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:38:39:26:26:0.4:11:15:16:22:11:15:16:23
chr1	32258332	.	G	C	114.06	PASS	AF=0.52;AO=13;DP=25;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.0452265;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=229.241;QD=18.2489;RBI=0.0458846;REFB=-0.00901645;REVB=-0.00774346;RO=12;SAF=4;SAR=9;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.240907;STB=0.638489;STBP=0.182;TYPE=snp;VARB=0.00840857;OID=.;OPOS=32258332;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:25:12:12:13:13:0.52:9:4:7:5:9:4:7:5
chr1	32280610	.	T	C	520.38	PASS	AF=0.451613;AO=56;DP=124;FAO=56;FDP=124;FR=.;FRO=68;FSAF=40;FSAR=16;FSRF=33;FSRR=35;FWDB=-0.0189363;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.941;QD=16.7866;RBI=0.0331847;REFB=-0.0157447;REVB=-0.0272515;RO=68;SAF=40;SAR=16;SRF=33;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.242535;STB=0.635859;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.0167641;OID=.;OPOS=32280610;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:124:124:68:68:56:56:0.451613:16:40:33:35:16:40:33:35
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chr1	33231403	.	G	T	269.32	PASS	AF=0.793103;AO=23;DP=29;FAO=23;FDP=29;FR=.;FRO=6;FSAF=19;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0274527;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.686;QD=37.1473;RBI=0.0303785;REFB=-0.0566899;REVB=-0.0130076;RO=6;SAF=19;SAR=4;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0973676;STB=0.553349;STBP=0.399;TYPE=snp;VARB=0.00957095;OID=.;OPOS=33231403;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:29:29:6:6:23:23:0.793103:4:19:4:2:4:19:4:2
chr1	33235626	.	G	A	152.9	PASS	AF=0.352941;AO=18;DP=51;FAO=18;FDP=51;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=25;FSRR=8;FWDB=-0.00422933;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.548;QD=11.992;RBI=0.0205212;REFB=-0.0136946;REVB=0.0200806;RO=33;SAF=11;SAR=7;SRF=25;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180128;STB=0.604211;STBP=0.359;TYPE=snp;VARB=0.0384556;OID=.;OPOS=33235626;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:33:33:18:18:0.352941:7:11:25:8:7:11:25:8
chr1	33321887	.	TG	GT,TGT	61.47	PASS	AF=0.111111,0.166667;AO=7,8;DP=74;FAO=8,12;FDP=72;FR=.;FRO=52;FSAF=1,7;FSAR=7,5;FSRF=28;FSRR=24;FWDB=0.153231,0.157688;FXX=0.0270234;HRUN=9,7;LEN=2,1;MLLD=16.6605,8.38342;QD=3.41516;RBI=0.153521,0.192639;REFB=-0.0709217,-0.0261766;REVB=0.00943058,-0.110654;RO=36;SAF=1,3;SAR=6,5;SRF=22;SRR=14;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.544321,-0.280623;STB=0.866581,0.536975;STBP=0.037,0.831;TYPE=mnp,ins;VARB=0.0250899,-0.105722;OID=.,.;OPOS=33321887,33321889;OREF=TG,-;OALT=GT,T;OMAPALT=GT,TGT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:24:74:72:36:52:7,8:8,12:0.111111,0.166667:6,5:1,3:22:14:7,5:1,7:28:24
chr1	33324088	.	C	G	260.69	PASS	AF=0.509091;AO=27;DP=54;FAO=28;FDP=55;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=-0.00726998;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.441;QD=18.9589;RBI=0.00821431;REFB=0.00175401;REVB=-0.0038239;RO=27;SAF=10;SAR=17;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200064;STB=0.617329;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=-0.00237886;OID=.;OPOS=33324088;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:55:27:27:27:28:0.509091:17:10:16:11:18:10:16:11
chr1	33328165	.	G	A	269.2	PASS	AF=0.330189;AO=35;DP=105;FAO=35;FDP=106;FR=.;FRO=71;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=40;FSRR=31;FWDB=-0.0154906;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=195.438;QD=10.1583;RBI=0.0154918;REFB=-0.00023502;REVB=0.000191959;RO=70;SAF=19;SAR=16;SRF=40;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0332269;STB=0.513873;STBP=0.848;TYPE=snp;VARB=0.000378173;OID=.;OPOS=33328165;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:106:70:71:35:35:0.330189:16:19:40:30:16:19:40:31
chr1	33361228	.	A	G	79.38	PASS	AF=0.407407;AO=10;DP=26;FAO=11;FDP=27;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=3;FWDB=0.00244642;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.8466;QD=11.7595;RBI=0.00969586;REFB=-0.0287499;REVB=-0.00938215;RO=16;SAF=6;SAR=4;SRF=13;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.246387;STB=0.619962;STBP=0.394;TYPE=snp;VARB=0.0497055;OID=.;OPOS=33361228;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:79:26:27:16:16:10:11:0.407407:4:6:13:3:4:7:13:3
chr1	33409693	.	G	A	205.83	PASS	AF=0.571429;AO=20;DP=35;FAO=20;FDP=35;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=-0.00935199;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.5146;QD=23.5239;RBI=0.01281;REFB=-0.0450628;REVB=0.0087542;RO=15;SAF=9;SAR=11;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0388861;STB=0.521718;STBP=0.784;TYPE=snp;VARB=0.0322246;OID=.;OPOS=33409693;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:15:15:20:20:0.571429:11:9:6:9:11:9:6:9
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chr1	33646950	.	A	G	99.96	PASS	AF=0.461538;AO=12;DP=26;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.0278773;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.621;QD=15.3785;RBI=0.0396278;REFB=-0.00695407;REVB=-0.0281642;RO=14;SAF=6;SAR=6;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13274;STB=0.576798;STBP=0.479;TYPE=snp;VARB=0.00529008;OID=.;OPOS=33646950;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:26:14:14:12:12:0.461538:6:6:5:9:6:6:5:9
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chr1	33957130	.	C	A	89.54	PASS	AF=0.478261;AO=11;DP=23;FAO=11;FDP=23;FR=.;FRO=12;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=-0.0280429;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.706;QD=15.5714;RBI=0.0328478;REFB=-0.0100788;REVB=-0.0171048;RO=12;SAF=9;SAR=2;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.094561;STB=0.555448;STBP=0.664;TYPE=snp;VARB=0.0165262;OID=.;OPOS=33957130;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:23:23:12:12:11:11:0.478261:2:9:9:3:2:9:9:3
chr1	33957151	.	GT	G,GG	420.07	PASS	AF=0.0333333,0.966667;AO=3,26;DP=30;FAO=1,29;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=0,22;FSAR=1,7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00603086,-0.0271269;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=79.3864,92.7058;QD=56.0089;RBI=0.087592,0.0989878;REFB=0,0;REVB=0.0873841,0.0951983;RO=0;SAF=1,21;SAR=2,5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0703724,0.00778901;OID=.,.;OPOS=33957152,33957152;OREF=T,T;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0333333,0.966667:3,26:30:1,29:30:0:0,22:1,7:0:0:4:0:1,21:2,5:0:0
chr1	33960062	.	A	G	632.26	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0119934;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.625;QD=61.6834;RBI=0.01641;REFB=0;REVB=0.0112002;RO=0;SAF=12;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000127697;OID=.;OPOS=33960062;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:29:12:0:0:29:12:0:0
chr1	33961722	.	C	T	560.96	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00518739;FXX=0.0263089;HRUN=4;LEN=1;MLLD=49.8479;QD=60.6438;RBI=0.00983511;REFB=0;REVB=0.00835585;RO=0;SAF=18;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00045512;OID=.;OPOS=33961722;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:37:0:0:36:37:1:18:18:0:0:19:18:0:0
chr1	33981769	.	C	T	314.98	PASS	AF=0.52381;AO=33;DP=63;FAO=33;FDP=63;FR=.;FRO=30;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=0.00776198;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.251;QD=19.9989;RBI=0.0218747;REFB=0.00600566;REVB=0.0204513;RO=29;SAF=21;SAR=12;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104844;STB=0.551483;STBP=0.425;TYPE=snp;VARB=-0.00436695;OID=.;OPOS=33981769;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:29:30:33:33:0.52381:12:21:15:14:12:21:16:14
chr1	34024928	.	T	C	315.44	PASS	AF=0.571429;AO=32;DP=56;FAO=32;FDP=56;FR=.;FRO=24;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=0.00639217;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.189;QD=22.5315;RBI=0.0400309;REFB=0.0103609;REVB=-0.0395172;RO=23;SAF=20;SAR=12;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179451;STB=0.60804;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=-0.00679052;OID=.;OPOS=34024928;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:23:24:32:32:0.571429:12:20:9:14:12:20:9:15
chr1	34025030	.	A	G	470.27	PASS	AF=0.611111;AO=44;DP=72;FAO=44;FDP=72;FR=.;FRO=28;FSAF=27;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=0.00861169;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.83;QD=26.1259;RBI=0.01279;REFB=-0.00618448;REVB=-0.00945643;RO=28;SAF=27;SAR=17;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108939;STB=0.559558;STBP=0.231;TYPE=snp;VARB=0.00492781;OID=.;OPOS=34025030;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:28:28:44:44:0.611111:17:27:13:15:17:27:13:15
chr1	34038214	.	T	C	435.46	PASS	AF=0.575342;AO=42;DP=73;FAO=42;FDP=73;FR=.;FRO=31;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=0.0125813;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.7929;QD=23.861;RBI=0.0214518;REFB=-0.0265284;REVB=0.0173751;RO=31;SAF=21;SAR=21;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0873875;STB=0.547923;STBP=0.357;TYPE=snp;VARB=0.0177564;OID=.;OPOS=34038214;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:31:31:42:42:0.575342:21:21:12:19:21:21:12:19
chr1	34071524	.	TC	T,TT	269.33	PASS	AF=0.047619,0.952381;AO=6,15;DP=21;FAO=1,20;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=1,9;FSAR=0,11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0050374,-0.00474488;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=301.249,311.137;QD=51.3015;RBI=0.0487799,0.055477;REFB=0,0;REVB=0.0485191,0.0552737;RO=0;SAF=1,9;SAR=5,6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.18042e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.00515634,0.00269926;OID=.,.;OPOS=34071525,34071525;OREF=C,C;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.047619,0.952381:6,15:21:1,20:21:0:1,9:0,11:0:0:7:0:1,9:5,6:0:0
chr1	34166139	.	C	A	227.32	PASS	AF=0.488889;AO=22;DP=46;FAO=22;FDP=45;FR=.;FRO=23;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=-0.00573225;FXX=0.0217344;HRUN=3;LEN=1;MLLD=216.193;QD=20.2059;RBI=0.0131869;REFB=-0.0146491;REVB=0.0118759;RO=23;SAF=15;SAR=7;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0305004;STB=0.517226;STBP=0.85;TYPE=snp;VARB=0.0124716;OID=.;OPOS=34166139;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:45:23:23:22:22:0.488889:7:15:15:8:7:15:15:8
chr1	34238283	.	T	C	315.76	PASS	AF=0.478873;AO=34;DP=71;FAO=34;FDP=71;FR=.;FRO=37;FSAF=11;FSAR=23;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=-0.018439;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.7761;QD=17.7891;RBI=0.0256209;REFB=-0.0650563;REVB=-0.0177886;RO=36;SAF=11;SAR=23;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146777;STB=0.576498;STBP=0.245;TYPE=snp;VARB=0.0616024;OID=.;OPOS=34238283;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:36:37:34:34:0.478873:23:11:17:19:23:11:17:20
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chr1	34285342	.	G	A	315.69	PASS	AF=0.472222;AO=32;DP=70;FAO=34;FDP=72;FR=.;FRO=38;FSAF=23;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=0.0566415;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.9376;QD=17.5381;RBI=0.0630533;REFB=0.0052609;REVB=-0.0277031;RO=38;SAF=22;SAR=10;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192656;STB=0.598898;STBP=0.131;TYPE=snp;VARB=-0.00669736;OID=.;OPOS=34285342;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:72:38:38:32:34:0.472222:10:22:19:19:11:23:19:19
chr1	34285381	.	C	T	264.01	PASS	AF=0.434783;AO=30;DP=69;FAO=30;FDP=69;FR=.;FRO=39;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=-0.0130296;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.985;QD=15.3049;RBI=0.0137184;REFB=-0.00362751;REVB=0.00429232;RO=38;SAF=19;SAR=11;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10995;STB=0.570523;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=0.00625674;OID=.;OPOS=34285381;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:38:39:30:30:0.434783:11:19:20:18:11:19:20:19
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chr1	34330067	.	A	C	181.28	PASS	AF=0.431818;AO=19;DP=44;FAO=19;FDP=44;FR=.;FRO=25;FSAF=15;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=-0.00119351;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=243.212;QD=16.4803;RBI=0.00596535;REFB=-0.0136327;REVB=-0.00584473;RO=25;SAF=15;SAR=4;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.234782;STB=0.636206;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=0.0277362;OID=.;OPOS=34330067;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:25:25:19:19:0.431818:4:15:15:10:4:15:15:10
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chr1	35260768	.	A	AT	127.94	PASS	AF=0.485714;AO=4;DP=37;FAO=17;FDP=35;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=17;FWDB=0.0428928;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=342.061;QD=14.6222;RBI=0.0431469;REFB=-0.00485776;REVB=-0.00467553;RO=29;SAF=0;SAR=4;SRF=4;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.499172;STB=0.64851;STBP=0.287;TYPE=ins;VARB=0.011035;OID=.;OPOS=35260769;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.485714:4:37:17:35:18:4:13:1:17:99:29:0:4:4:25
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chr1	35260929	.	G	A	197.78	PASS	AF=0.425926;AO=23;DP=54;FAO=23;FDP=54;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=6;FSRR=25;FWDB=0.0168562;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=317.591;QD=14.6505;RBI=0.0170665;REFB=-0.00132444;REVB=-0.00267075;RO=31;SAF=9;SAR=14;SRF=6;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.223276;STB=0.625571;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=0.00204129;OID=.;OPOS=35260929;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:31:31:23:23:0.425926:14:9:6:25:14:9:6:25
chr1	35261166	.	G	A	236.11	PASS	AF=0.469388;AO=23;DP=49;FAO=23;FDP=49;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=0.0246077;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.7859;QD=19.274;RBI=0.0309982;REFB=-0.0363371;REVB=-0.0188508;RO=26;SAF=10;SAR=13;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0111896;STB=0.506324;STBP=0.948;TYPE=snp;VARB=0.0305331;OID=.;OPOS=35261166;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:26:26:23:23:0.469388:13:10:11:15:13:10:11:15
chr1	35321242	.	A	C	413.6	PASS	AF=0.477273;AO=42;DP=89;FAO=42;FDP=88;FR=.;FRO=46;FSAF=27;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=26;FWDB=-0.0694625;FXX=0.0112347;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.2801;QD=18.7999;RBI=0.0719651;REFB=-0.00505931;REVB=0.0188131;RO=47;SAF=27;SAR=15;SRF=20;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.208822;STB=0.610874;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.0080916;OID=.;OPOS=35321242;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:88:47:46:42:42:0.477273:15:27:20:27:15:27:20:26
chr1	35757843	.	A	T	316.75	PASS	AF=0.571429;AO=28;DP=49;FAO=28;FDP=49;FR=.;FRO=21;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0292691;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.6634;QD=25.8571;RBI=0.0427568;REFB=-0.0282331;REVB=0.0311682;RO=21;SAF=19;SAR=9;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129748;STB=0.572055;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=0.0184986;OID=.;OPOS=35757843;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:21:21:28:28:0.571429:9:19:11:10:9:19:11:10
chr1	35900615	.	A	G	128.55	PASS	AF=0.256757;AO=19;DP=74;FAO=19;FDP=74;FR=.;FRO=55;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=27;FSRR=28;FWDB=0.0433636;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.498;QD=6.94854;RBI=0.0440553;REFB=-0.00362149;REVB=-0.0077766;RO=55;SAF=11;SAR=8;SRF=27;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107705;STB=0.565645;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.0126025;OID=.;OPOS=35900615;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:55:55:19:19:0.256757:8:11:27:28:8:11:27:28
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chr1	36225948	.	T	C	1339.61	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00199686;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.9002;QD=62.3075;RBI=0.0314659;REFB=0;REVB=0.0314025;RO=0;SAF=43;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00014769;OID=.;OPOS=36225948;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:43:43:0:0:43:43:0:0
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chr1	36550658	.	C	T	43.62	PASS	AF=0.241379;AO=7;DP=29;FAO=7;FDP=29;FR=.;FRO=22;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.00238498;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.9723;QD=6.01647;RBI=0.00238502;REFB=-0.0121356;REVB=1.48413e-05;RO=22;SAF=4;SAR=3;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0307537;STB=0.519943;STBP=0.946;TYPE=snp;VARB=0.019976;OID=.;OPOS=36550658;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:29:29:22:22:7:7:0.241379:3:4:12:10:3:4:12:10
chr1	36553673	.	A	G	766.45	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0597505;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.884;QD=63.8707;RBI=0.0719606;REFB=0;REVB=0.0401024;RO=0;SAF=32;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000378955;OID=.;OPOS=36553673;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:16:32:0:0:16:32:0:0
chr1	36556867	.	C	T	74.48	PASS	AF=0.692308;AO=9;DP=13;FAO=9;FDP=13;FR=.;FRO=4;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0412765;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.998;QD=22.9154;RBI=0.0426107;REFB=0.0220152;REVB=0.0105791;RO=4;SAF=3;SAR=6;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0514675;STB=0.529348;STBP=0.794;TYPE=snp;VARB=-0.00970189;OID=.;OPOS=36556867;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:13:13:4:4:9:9:0.692308:6:3:1:3:6:3:1:3
chr1	36642420	.	T	C	689.38	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0585324;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.326;QD=62.6709;RBI=0.0585838;REFB=0;REVB=-0.00245413;RO=0;SAF=5;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000180842;OID=.;OPOS=36642420;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:39:5:0:0:39:5:0:0
chr1	36643700	.	GAGA	G,GAGG	54.06	PASS	AF=0.636364,0;AO=7,2;DP=15;FAO=7,0;FDP=11;FR=.;FRO=4;FSAF=5,0;FSAR=2,0;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0219487,-0.0480282;FXX=0.0832639;HRUN=1,2;LEN=3,1;MLLD=215.12,41.9464;QD=19.6581;RBI=0.0308691,0.0583474;REFB=-0.0197852,0.040137;REVB=-0.0217062,-0.0331318;RO=6;SAF=5,0;SAR=2,2;SRF=2;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.304739,-0.562437;STB=0.675156,0.5;STBP=0.186,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0205871,0;OID=.,.;OPOS=36643701,36643703;OREF=AGA,A;OALT=-,G;OMAPALT=G,GAGG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.636364,0:7,2:15:7,0:11:4:5,0:2,0:1:3:23:6:5,0:2,2:2:4
chr1	36752433	.	C	T	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0235857;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=266.274;QD=44.6898;RBI=0.073531;REFB=0;REVB=0.0696457;RO=0;SAF=8;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000682935;OID=.;OPOS=36752433;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:5:8:0:0:5:8:0:0
chr1	36773405	.	T	G	1184.9	PASS	AF=1;AO=73;DP=75;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0261658;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.149;QD=59.9949;RBI=0.0484925;REFB=0;REVB=0.0408273;RO=0;SAF=42;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.98661e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.88814e-05;OID=.;OPOS=36773405;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:79:0:0:73:79:1:31:42:0:0:35:44:0:0
chr1	36794192	.	C	T	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00856518;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.7548;QD=35.5759;RBI=0.0441911;REFB=0;REVB=0.0433531;RO=0;SAF=2;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.27427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00287967;OID=.;OPOS=36794192;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:5:2:0:0:5:2:0:0
chr1	36888462	.	A	G	127.67	PASS	AF=0.348837;AO=15;DP=43;FAO=15;FDP=43;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=0.00545541;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.4416;QD=11.8766;RBI=0.0058883;REFB=-0.0089742;REVB=-0.00221599;RO=28;SAF=6;SAR=9;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0723332;STB=0.542799;STBP=0.684;TYPE=snp;VARB=0.0238119;OID=.;OPOS=36888462;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:28:28:15:15:0.348837:9:6:13:15:9:6:13:15
chr1	36889005	.	G	A	386.76	PASS	AF=0.527027;AO=39;DP=74;FAO=39;FDP=74;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=25;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=-0.0196869;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=262.054;QD=20.9061;RBI=0.0199242;REFB=-0.00646868;REVB=0.00306593;RO=35;SAF=14;SAR=25;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0632453;STB=0.535037;STBP=0.546;TYPE=snp;VARB=0.00518175;OID=.;OPOS=36889005;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:35:35:39:39:0.527027:25:14:15:20:25:14:15:20
chr1	36893968	.	A	G	229.56	PASS	AF=0.536585;AO=22;DP=41;FAO=22;FDP=41;FR=.;FRO=19;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.0131353;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.899;QD=22.3958;RBI=0.0426096;REFB=-0.0149951;REVB=0.0405345;RO=19;SAF=12;SAR=10;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0159319;STB=0.50892;STBP=0.932;TYPE=snp;VARB=0.0110312;OID=.;OPOS=36893968;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:19:19:22:22:0.536585:10:12:10:9:10:12:10:9
chr1	36926853	.	G	A	38.57	PASS	AF=0.428571;AO=6;DP=14;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=-0.0330464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.968;QD=11.0197;RBI=0.0361236;REFB=-0.00665085;REVB=0.0145892;RO=8;SAF=2;SAR=4;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0912889;STB=0.555379;STBP=0.773;TYPE=snp;VARB=0.00881651;OID=.;OPOS=36926853;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:14:14:8:8:6:6:0.428571:4:2:2:6:4:2:2:6
chr1	36927733	.	G	A	711.44	PASS	AF=0.980769;AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0153221;FXX=0.0188644;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.4083;QD=54.7258;RBI=0.0314321;REFB=-0.16495;REVB=0.0274447;RO=1;SAF=34;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0268896;STB=0.51428;STBP=0.291;TYPE=snp;VARB=0.00365633;OID=.;OPOS=36927733;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:52:52:1:1:51:51:0.980769:17:34:0:1:17:34:0:1
chr1	37346428	.	A	G	151.48	PASS	AF=0.361702;AO=17;DP=47;FAO=17;FDP=47;FR=.;FRO=30;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.0145266;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.3182;QD=12.8918;RBI=0.0306125;REFB=-0.0276425;REVB=-0.0269463;RO=30;SAF=6;SAR=11;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.23397;STB=0.637117;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.0316993;OID=.;OPOS=37346428;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:30:30:17:17:0.361702:11:6:17:13:11:6:17:13
chr1	38006359	.	A	G	538.52	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.004911;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=83.2204;QD=59.835;RBI=0.0291137;REFB=0;REVB=-0.0286965;RO=0;SAF=18;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00036569;OID=.;OPOS=38006359;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:18:18:0:0:18:18:0:0
chr1	38023316	.	C	T	501.66	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000589584;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.907;QD=59.0183;RBI=0.00629882;REFB=0;REVB=0.00627116;RO=0;SAF=8;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.92223e-05;OID=.;OPOS=38023316;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:26:8:0:0:26:8:0:0
chr1	38077410	.	CCG	AAG,CTT	100.32	PASS	AF=0.2,0.8;AO=2,8;DP=10;FAO=2,8;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=2,8;FSAR=0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00679932,0.0111144;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=2,2;MLLD=126.683,126.183;QD=40.1276;RBI=0.00679932,0.0111144;REFB=0,0;REVB=0,0;RO=0;SAF=2,8;SAR=0,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,mnp;VARB=0.0148953,0.0109702;OID=.,.;OPOS=38077410,38077411;OREF=CC,CG;OALT=AA,TT;OMAPALT=AAG,CTT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:10:10:10:0:0:2,8:2,8:0.2,0.8:0,0:2,8:0:0:0,0:2,8:0:0
chr1	38077415	.	CGC	CTC,TAG	127.92	PASS	AF=0.333333,0.666667;AO=4,8;DP=12;FAO=4,8;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=4,8;FSAR=0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00714868,-0.00750472;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,3;MLLD=93.5189,238.103;QD=42.6402;RBI=0.00714868,0.00750472;REFB=0,0;REVB=0,0;RO=0;SAF=4,8;SAR=0,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=-0.00926235,0.00946202;OID=.,.;OPOS=38077416,38077415;OREF=G,CGC;OALT=T,TAG;OMAPALT=CTC,TAG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:21:12:12:0:0:4,8:4,8:0.333333,0.666667:0,0:4,8:0:0:0,0:4,8:0:0
chr1	38077419	.	TA	CC	41.78	PASS	AF=0.545455;AO=2;DP=19;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0181313;FXX=0.449775;HRUN=1;LEN=2;MLLD=162.874;QD=15.1943;RBI=0.0181313;REFB=-0.0481422;REVB=0;RO=0;SAF=2;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.128004;OID=.;OPOS=38077419;OREF=TA;OALT=CC;OMAPALT=CC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:19:11:0:5:2:6:0.545455:0:2:0:0:0:6:5:0
chr1	38148765	.	A	G	1593.74	PASS	AF=1;AO=105;DP=109;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0641299;FXX=0.0272702;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.9256;QD=59.5791;RBI=0.0643864;REFB=0;REVB=0.00574205;RO=0;SAF=55;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.80947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00249321;OID=.;OPOS=38148765;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:109:107:0:0:105:107:1:50:55:0:0:51:56:0:0
chr1	38173983	.	TTTC	T,TT	523.08	PASS	AF=0.977778,0.0222222;AO=32,9;DP=43;FAO=44,1;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=23,1;FSAR=21,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0210168,-0.0179671;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=3,2;MLLD=216.443,210.703;QD=46.4959;RBI=0.0274356,0.0251226;REFB=0,0;REVB=-0.0176354,-0.0175594;RO=0;SAF=18,4;SAR=14,5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=-0.000589502,-0.0405709;OID=.,.;OPOS=38173984,38173985;OREF=TTC,TC;OALT=-,-;OMAPALT=T,TT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.977778,0.0222222:32,9:43:44,1:45:0:23,1:21,0:0:0:5:0:18,4:14,5:0:0
chr1	38185169	.	G	A	345.79	PASS	AF=0.5;AO=34;DP=73;FAO=39;FDP=78;FR=.;FRO=39;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=27;FWDB=0.00421839;FXX=0.0126566;HRUN=3;LEN=1;MLLD=112.695;QD=17.7325;RBI=0.00943703;REFB=-0.0169093;REVB=0.00844173;RO=39;SAF=17;SAR=17;SRF=12;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18409;STB=0.626069;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=0.0237151;OID=.;OPOS=38185169;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:78:39:39:34:39:0.5:17:17:12:27:17:22:12:27
chr1	38187507	.	C	T	363.26	PASS	AF=0.475;AO=38;DP=80;FAO=38;FDP=80;FR=.;FRO=42;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=24;FSRR=18;FWDB=0.00352895;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=226.668;QD=18.1631;RBI=0.0220319;REFB=-0.0234539;REVB=0.0217474;RO=42;SAF=14;SAR=24;SRF=24;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.193164;STB=0.607943;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=0.0296766;OID=.;OPOS=38187507;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:42:42:38:38:0.475:24:14:24:18:24:14:24:18
chr1	38227086	.	A	T	375.6	PASS	AF=1;AO=26;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0590009;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.5621;QD=55.6439;RBI=0.0603216;REFB=0;REVB=-0.0125532;RO=0;SAF=2;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.21284e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000592589;OID=.;OPOS=38227086;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:26:27:1:24:2:0:0:25:2:0:0
chr1	38227268	.	G	T	393.33	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00432161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.263;QD=56.1896;RBI=0.0333778;REFB=0;REVB=0.0330969;RO=0;SAF=13;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.85509e-05;OID=.;OPOS=38227268;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:15:13:0:0:15:13:0:0
chr1	38411445	.	G	A	120.86	PASS	AF=0.424242;AO=14;DP=33;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.0239015;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.9426;QD=14.6497;RBI=0.0256107;REFB=-0.0168235;REVB=0.00919915;RO=19;SAF=6;SAR=8;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.045221;STB=0.526278;STBP=0.819;TYPE=snp;VARB=0.0442634;OID=.;OPOS=38411445;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:19:19:14:14:0.424242:8:6:9:10:8:6:9:10
chr1	38423853	.	G	C	1396.45	PASS	AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0299723;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.066;QD=62.7619;RBI=0.0301158;REFB=0;REVB=-0.002936;RO=0;SAF=46;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.24408e-05;OID=.;OPOS=38423853;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:43:46:0:0:43:46:0:0
chr1	38442547	.	G	A	382.5	PASS	AF=0.965517;AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0154282;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.5702;QD=52.7588;RBI=0.0219431;REFB=-0.109047;REVB=-0.0156035;RO=1;SAF=17;SAR=11;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0404293;STB=0.521723;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.00494036;OID=.;OPOS=38442547;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:29:29:1:1:28:28:0.965517:11:17:0:1:11:17:0:1
chr1	38449850	.	CT	C	78.65	PASS	AF=0.418605;AO=18;DP=44;FAO=18;FDP=43;FR=.;FRO=25;FSAF=16;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=-6.18554e-05;FXX=0.0227221;HRUN=2;LEN=1;MLLD=16.0578;QD=7.31639;RBI=0.0433734;REFB=-0.0694043;REVB=-0.0433734;RO=24;SAF=16;SAR=2;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.612918;STB=0.863198;STBP=0.001;TYPE=del;VARB=0.087286;OID=.;OPOS=38449851;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.418605:18:44:18:43:25:16:2:8:17:78:24:16:2:8:16
chr1	38450367	.	A	G	713.1	PASS	AF=1;AO=47;DP=49;FAO=50;FDP=50;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=30;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0645777;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.4606;QD=57.0484;RBI=0.0984096;REFB=0;REVB=0.0742575;RO=0;SAF=28;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00760324;OID=.;OPOS=38450367;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:50:0:0:47:50:1:19:28:0:0:20:30:0:0
chr1	38462898	.	T	A	45.55	PASS	AF=0.857143;AO=6;DP=7;FAO=6;FDP=7;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0221881;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=300.645;QD=26.0263;RBI=0.0221881;REFB=0.0450016;REVB=0;RO=1;SAF=6;SAR=0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000407651;OID=.;OPOS=38462898;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:7:7:1:1:6:6:0.857143:0:6:1:0:0:6:1:0
chr1	38462905	.	C	G	61.9	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.017753;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=38.2527;QD=35.3705;RBI=0.017753;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=7;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00178021;OID=.;OPOS=38462905;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:0:7:0:0:0:7:0:0
chr1	38463504	.	C	T	176.3	PASS	AF=0.37931;AO=22;DP=58;FAO=22;FDP=58;FR=.;FRO=36;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=22;FSRR=14;FWDB=-0.0206069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.4653;QD=12.1586;RBI=0.0355023;REFB=-0.0125666;REVB=-0.0289097;RO=36;SAF=11;SAR=11;SRF=22;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119598;STB=0.568904;STBP=0.426;TYPE=snp;VARB=0.0171776;OID=.;OPOS=38463504;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:36:36:22:22:0.37931:11:11:22:14:11:11:22:14
chr1	38862336	.	T	A	538.35	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0447665;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.3591;QD=59.8167;RBI=0.125806;REFB=0;REVB=-0.117572;RO=0;SAF=20;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.9376e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00286897;OID=.;OPOS=38862336;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:16:20:0:0:16:20:0:0
chr1	39549983	.	G	A	250.43	PASS	AF=0.48;AO=24;DP=48;FAO=24;FDP=50;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=0.000954707;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=238.768;QD=20.0343;RBI=0.017246;REFB=-0.00788157;REVB=0.0172195;RO=24;SAF=12;SAR=12;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00925403;OID=.;OPOS=39549983;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:50:24:26:24:24:0.48:12:12:12:12:12:12:13:13
chr1	39748921	.	G	A	141.25	PASS	AF=0.380952;AO=16;DP=42;FAO=16;FDP=42;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=0.0389025;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.7755;QD=13.452;RBI=0.0448549;REFB=-0.0123559;REVB=0.0223284;RO=26;SAF=7;SAR=9;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0574909;STB=0.533495;STBP=0.74;TYPE=snp;VARB=0.0240479;OID=.;OPOS=39748921;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:26:26:16:16:0.380952:9:7:10:16:9:7:10:16
chr1	39797055	.	A	G	113.75	PASS	AF=0.280702;AO=16;DP=57;FAO=16;FDP=57;FR=.;FRO=41;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=28;FWDB=-0.00853226;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.6013;QD=7.98271;RBI=0.0277247;REFB=-0.00422846;REVB=0.0263792;RO=40;SAF=10;SAR=6;SRF=13;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.343656;STB=0.711055;STBP=0.065;TYPE=snp;VARB=0.00660823;OID=.;OPOS=39797055;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:40:41:16:16:0.280702:6:10:13:27:6:10:13:28
chr1	39806610	.	C	T	296.42	PASS	AF=0.958333;AO=23;DP=24;FAO=23;FDP=24;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0393526;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.186;QD=49.4029;RBI=0.0404001;REFB=-0.058929;REVB=0.00914013;RO=1;SAF=15;SAR=8;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0543643;STB=0.529386;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=0.00173995;OID=.;OPOS=39806610;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:24:24:1:1:23:23:0.958333:8:15:0:1:8:15:0:1
chr1	39812822	.	C	A	613.24	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0366194;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.8629;QD=61.3242;RBI=0.0381991;REFB=0;REVB=0.0108718;RO=0;SAF=15;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000270155;OID=.;OPOS=39812822;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:25:15:0:0:25:15:0:0
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chr1	39878313	.	A	G	68.09	PASS	AF=0.473684;AO=9;DP=19;FAO=9;FDP=19;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=-0.00684032;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.363;QD=14.3343;RBI=0.021302;REFB=-0.0207021;REVB=0.0201739;RO=10;SAF=5;SAR=4;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.040409;STB=0.523757;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=0.0241033;OID=.;OPOS=39878313;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:19:19:10:10:9:9:0.473684:4:5:6:4:4:5:6:4
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chr1	40092464	.	C	T	158.4	PASS	AF=0.355932;AO=21;DP=58;FAO=21;FDP=59;FR=.;FRO=38;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=0.00369291;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=39.2015;QD=10.7392;RBI=0.0175269;REFB=-0.010414;REVB=-0.0171334;RO=37;SAF=5;SAR=16;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.274811;STB=0.671357;STBP=0.056;TYPE=snp;VARB=0.0164831;OID=.;OPOS=40092464;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:59:37:38:21:21:0.355932:16:5:17:20:16:5:18:20
chr1	40098328	.	T	C	411.12	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.110446;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.395;QD=56.7066;RBI=0.111049;REFB=0;REVB=-0.0115548;RO=0;SAF=1;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.55046e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000262725;OID=.;OPOS=40098328;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:28:1:0:0:28:1:0:0
chr1	40129066	.	G	A	244.26	PASS	AF=0.482143;AO=27;DP=56;FAO=27;FDP=56;FR=.;FRO=29;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=-0.0172504;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=67.0181;QD=17.4468;RBI=0.0253209;REFB=-0.00157497;REVB=-0.0185356;RO=29;SAF=14;SAR=13;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127124;STB=0.571187;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=0.00100909;OID=.;OPOS=40129066;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:29:29:27:27:0.482143:13:14:19:10:13:14:19:10
chr1	40145297	.	C	T	167.05	PASS	AF=0.382979;AO=18;DP=48;FAO=18;FDP=47;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=-0.0251201;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.866;QD=14.2171;RBI=0.0496145;REFB=-0.0123897;REVB=-0.0427853;RO=28;SAF=10;SAR=8;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20608;STB=0.60736;STBP=0.262;TYPE=snp;VARB=0.0287252;OID=.;OPOS=40145297;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:47:28:29:18:18:0.382979:8:10:10:18:8:10:11:18
chr1	40147817	.	C	A	81.24	PASS	AF=0.555556;AO=10;DP=18;FAO=10;FDP=18;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0296638;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=65.7684;QD=18.0536;RBI=0.0456434;REFB=0.00748309;REVB=-0.0346897;RO=8;SAF=3;SAR=7;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167675;STB=0.597357;STBP=0.436;TYPE=snp;VARB=-0.00665974;OID=.;OPOS=40147817;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:18:18:8:8:10:10:0.555556:7:3:4:4:7:3:4:4
chr1	40149642	.	G	T	1840.28	PASS	AF=1;AO=118;DP=118;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0111994;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.426;QD=61.3425;RBI=0.0384312;REFB=0;REVB=0.0367632;RO=0;SAF=76;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.28958e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.27587e-05;OID=.;OPOS=40149642;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:118:120:0:0:118:120:1:42:76:0:0:44:76:0:0
chr1	40150156	.	G	A	312.34	PASS	AF=0.453333;AO=34;DP=76;FAO=34;FDP=75;FR=.;FRO=41;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=23;FSRR=18;FWDB=0.0104785;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.4539;QD=16.658;RBI=0.0556722;REFB=-0.0265547;REVB=0.0546772;RO=40;SAF=17;SAR=17;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0481638;STB=0.533314;STBP=0.638;TYPE=snp;VARB=0.0452008;OID=.;OPOS=40150156;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:75:40:41:34:34:0.453333:17:17:22:18:17:17:23:18
chr1	40230336	.	C	G	61.53	PASS	AF=0.257143;AO=9;DP=35;FAO=9;FDP=35;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.0100792;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.518;QD=7.03219;RBI=0.0143637;REFB=0.00312097;REVB=0.0102335;RO=26;SAF=5;SAR=4;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110244;STB=0.569466;STBP=0.621;TYPE=snp;VARB=-0.00834551;OID=.;OPOS=40230336;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:35:35:26:26:9:9:0.257143:4:5:12:14:4:5:12:14
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chr1	40230531	.	C	T	122.13	PASS	AF=0.301887;AO=16;DP=53;FAO=16;FDP=53;FR=.;FRO=37;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=-0.0120171;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=228.289;QD=9.21742;RBI=0.0165682;REFB=-0.0199068;REVB=-0.0114059;RO=37;SAF=7;SAR=9;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150466;STB=0.590052;STBP=0.409;TYPE=snp;VARB=0.0422505;OID=.;OPOS=40230531;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:37:37:16:16:0.301887:9:7:21:16:9:7:21:16
chr1	40236074	.	A	C	61.81	PASS	AF=0.264706;AO=9;DP=34;FAO=9;FDP=34;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=-0.0246311;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.387;QD=7.27146;RBI=0.0247519;REFB=0.0021501;REVB=-0.00244207;RO=25;SAF=7;SAR=2;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.368007;STB=0.733717;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=-0.00632208;OID=.;OPOS=40236074;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:34:34:25:25:9:9:0.264706:2:7:12:13:2:7:12:13
chr1	40315888	.	A	T	805.1	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0117778;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=134.647;QD=64.4077;RBI=0.0143272;REFB=0;REVB=0.00815804;RO=0;SAF=20;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000115264;OID=.;OPOS=40315888;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:30:20:0:0:30:20:0:0
chr1	40349131	.	G	A	689.37	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0131102;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=179.381;QD=62.6697;RBI=0.0232907;REFB=0;REVB=0.0192504;RO=0;SAF=15;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.5381e-05;OID=.;OPOS=40349131;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:29:15:0:0:29:15:0:0
chr1	40363054	.	G	C	569.1	PASS	AF=1;AO=37;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0676064;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.5469;QD=59.9052;RBI=0.140813;REFB=0;REVB=0.123522;RO=0;SAF=22;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.82408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0028139;OID=.;OPOS=40363054;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:37:38:1:15:22:0:0:15:23:0:0
chr1	40421073	.	C	A	74.48	PASS	AF=0.692308;AO=9;DP=13;FAO=9;FDP=13;FR=.;FRO=4;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0163638;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=278.038;QD=22.9154;RBI=0.0163937;REFB=-0.00685129;REVB=-0.000989416;RO=4;SAF=7;SAR=2;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187655;STB=0.608433;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=0.00366518;OID=.;OPOS=40421073;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:13:13:4:4:9:9:0.692308:2:7:2:2:2:7:2:2
chr1	40533266	.	T	G	340.71	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00506461;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.525;QD=54.5137;RBI=0.015729;REFB=0;REVB=0.0148913;RO=0;SAF=3;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.65945e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000125963;OID=.;OPOS=40533266;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:22:3:0:0:22:3:0:0
chr1	40533287	.	T	G	283.01	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00386054;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.1447;QD=49.2196;RBI=0.0377381;REFB=0;REVB=0.0375401;RO=0;SAF=1;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.97126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00750011;OID=.;OPOS=40533287;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:23:0:0:20:23:1:19:1:0:0:22:1:0:0
chr1	40533315	.	T	G	272.55	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=105.654;QD=51.9144;RBI=0.0530989;REFB=0;REVB=-0.0530989;RO=0;SAF=0;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000632058;OID=.;OPOS=40533315;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:21:0:0:0:21:0:0:0
chr1	40533320	.	T	G	289.35	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0105351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.001;QD=52.6097;RBI=0.0114226;REFB=0;REVB=0.00441434;RO=0;SAF=1;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.62339e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.98353e-05;OID=.;OPOS=40533320;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:21:1:0:0:21:1:0:0
chr1	40533326	.	T	G	186.28	PASS	AF=1;AO=16;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0118979;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=46.9785;QD=43.8299;RBI=0.0247018;REFB=-0.124976;REVB=0.0216476;RO=0;SAF=1;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00981577;OID=.;OPOS=40533326;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:17:17:0:0:16:17:1:15:1:0:0:16:1:0:0
chr1	40533347	.	T	G	167.47	PASS	AF=0.9375;AO=15;DP=16;FAO=15;FDP=16;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0730213;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.114;QD=41.8669;RBI=0.0811132;REFB=-0.189269;REVB=0.0353163;RO=1;SAF=1;SAR=14;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0314901;STB=0.517219;STBP=0.66;TYPE=snp;VARB=0.00922453;OID=.;OPOS=40533347;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:16:16:1:1:15:15:0.9375:14:1:0:1:14:1:0:1
chr1	40703440	.	C	T	189.07	PASS	AF=0.527778;AO=19;DP=36;FAO=19;FDP=36;FR=.;FRO=17;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.00489881;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=254.366;QD=21.0076;RBI=0.0298136;REFB=-0.00100182;REVB=0.0294084;RO=17;SAF=11;SAR=8;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140036;STB=0.578864;STBP=0.335;TYPE=snp;VARB=0.000878344;OID=.;OPOS=40703440;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:17:17:19:19:0.527778:8:11:7:10:8:11:7:10
chr1	40705726	.	A	T	114.05	PASS	AF=0.52;AO=13;DP=25;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=-8.43631e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.874;QD=18.2485;RBI=0.0201357;REFB=-0.00734881;REVB=-0.0201355;RO=12;SAF=8;SAR=5;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123714;STB=0.570367;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.00558377;OID=.;OPOS=40705726;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:25:12:12:13:13:0.52:5:8:9:3:5:8:9:3
chr1	40769783	.	G	A	315.57	PASS	AF=0.56;AO=28;DP=50;FAO=28;FDP=50;FR=.;FRO=22;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=-0.00440685;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=132.397;QD=25.2457;RBI=0.0151046;REFB=-0.0389413;REVB=0.0144474;RO=22;SAF=16;SAR=12;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.16397;STB=0.590845;STBP=0.141;TYPE=snp;VARB=0.020454;OID=.;OPOS=40769783;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:22:22:28:28:0.56:12:16:8:14:12:16:8:14
chr1	40773149	.	T	C	1191.02	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0116418;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.995;QD=61.078;RBI=0.0318763;REFB=0;REVB=0.0296744;RO=0;SAF=38;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5078e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.35453e-05;OID=.;OPOS=40773149;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:78:0:0:77:78:1:39:38:0:0:40:38:0:0
chr1	40776752	.	C	A	96.17	PASS	AF=0.375;AO=12;DP=30;FAO=12;FDP=32;FR=.;FRO=20;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=-0.0420722;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=181.861;QD=12.0219;RBI=0.043153;REFB=-0.0212263;REVB=0.00959745;RO=18;SAF=3;SAR=9;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.330707;STB=0.725419;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.0479804;OID=.;OPOS=40776752;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:30:32:18:20:12:12:0.375:9:3:10:8:9:3:12:8
chr1	40777800	.	T	G	375.58	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103292;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.7715;QD=55.6419;RBI=0.0814021;REFB=0;REVB=-0.0807441;RO=0;SAF=11;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0017167;OID=.;OPOS=40777800;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:16:11:0:0:16:11:0:0
chr1	40777804	.	T	C	76.14	PASS	AF=0.4;AO=10;DP=25;FAO=10;FDP=25;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.0162189;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.58;QD=12.1822;RBI=0.0366914;REFB=-0.020706;REVB=-0.0329121;RO=14;SAF=4;SAR=6;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0998889;STB=0.540901;STBP=0.772;TYPE=snp;VARB=0.0303902;OID=.;OPOS=40777804;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:25:25:14:15:10:10:0.4:6:4:7:7:6:4:7:8
chr1	40840353	.	A	G	221.98	PASS	AF=0.42623;AO=26;DP=60;FAO=26;FDP=61;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=-0.0114869;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.0006;QD=14.5563;RBI=0.0459339;REFB=-0.00820081;REVB=-0.0444744;RO=33;SAF=13;SAR=13;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1048;STB=0.540952;STBP=0.588;TYPE=snp;VARB=0.0125555;OID=.;OPOS=40840353;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:61:33:35:26:26:0.42623:13:13:13:20:13:13:15:20
chr1	40881041	.	C	G	954.05	PASS	AF=0.886076;AO=71;DP=78;FAO=70;FDP=79;FR=.;FRO=9;FSAF=40;FSAR=30;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=0.0462362;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.8995;QD=48.3066;RBI=0.0470239;REFB=-0.063224;REVB=-0.00857114;RO=7;SAF=41;SAR=30;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0743605;STB=0.540134;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.0528098;OID=.;OPOS=40881041;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:40:78:79:7:9:71:70:0.886076:30:41:1:6:30:40:2:7
chr1	40923019	.	G	A	274.55	PASS	AF=0.527273;AO=29;DP=55;FAO=29;FDP=55;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=-0.0709762;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.075;QD=19.9669;RBI=0.0717687;REFB=0.00403918;REVB=-0.0106366;RO=24;SAF=13;SAR=16;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0424156;STB=0.542684;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=-0.00345451;OID=.;OPOS=40923019;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:24:26:29:29:0.527273:16:13:12:12:16:13:14:12
chr1	40980559	.	G	A	39.62	PASS	AF=0.5;AO=6;DP=12;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=-0.0283623;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.4217;QD=13.2051;RBI=0.0402564;REFB=0.0125826;REVB=0.0285685;RO=6;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.513504;STB=0.799197;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=-0.0152312;OID=.;OPOS=40980559;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:12:12:6:6:6:6:0.5:2:4:0:6:2:4:0:6
chr1	40980731	.	G	T	69.31	PASS	AF=0.888889;AO=8;DP=9;FAO=8;FDP=9;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00581444;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=326.301;QD=30.8034;RBI=0.00832999;REFB=-0.166253;REVB=-0.00596499;RO=1;SAF=5;SAR=3;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125393;STB=0.571246;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=0.00259212;OID=.;OPOS=40980731;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:9:9:1:1:8:8:0.888889:3:5:0:1:3:5:0:1
chr1	40998811	.	A	G	260.16	PASS	AF=0.467742;AO=29;DP=62;FAO=29;FDP=62;FR=.;FRO=33;FSAF=4;FSAR=25;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=0.012967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.257;QD=16.7848;RBI=0.0134043;REFB=-0.00963971;REVB=0.00339593;RO=33;SAF=4;SAR=25;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.352843;STB=0.702314;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.00727686;OID=.;OPOS=40998811;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:33:33:29:29:0.467742:25:4:13:20:25:4:13:20
chr1	41012752	.	A	C	58.07	PASS	AF=0.777778;AO=7;DP=10;FAO=7;FDP=9;FR=.;FRO=2;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0139747;FXX=0.0999001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=335.04;QD=25.8069;RBI=0.0148264;REFB=0.00187686;REVB=0.00495277;RO=3;SAF=2;SAR=5;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21311;STB=0.666171;STBP=0.128;TYPE=snp;VARB=-0.000209996;OID=.;OPOS=41012752;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:10:9:3:2:7:7:0.777778:5:2:2:1:5:2:2:0
chr1	41013015	.	C	T	107.26	PASS	AF=0.631579;AO=12;DP=19;FAO=12;FDP=19;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.0246396;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=202.734;QD=22.581;RBI=0.0267952;REFB=-0.00733743;REVB=-0.0105295;RO=7;SAF=5;SAR=7;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101303;STB=0.557426;STBP=0.596;TYPE=snp;VARB=0.0040319;OID=.;OPOS=41013015;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:19:19:7:7:12:12:0.631579:7:5:4:3:7:5:4:3
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chr1	41204569	.	C	T	297.81	PASS	AF=0.338235;AO=23;DP=67;FAO=23;FDP=68;FR=.,HEALED;FRO=30;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=24;FSRR=6;FWDB=-0.00525502;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.943;QD=17.5179;RBI=0.0264148;REFB=-0.00954269;REVB=-0.0258868;RO=28;SAF=13;SAR=10;SRF=23;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.265705;STB=0.64003;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=0.00358514;OID=.;OPOS=41204569;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:68:28:30:23:23:0.338235:10:13:23:5:10:13:24:6
chr1	41237278	.	T	G	246.68	PASS	AF=0.451613;AO=28;DP=62;FAO=28;FDP=62;FR=.;FRO=34;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=0.0306544;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=261.441;QD=15.9148;RBI=0.0314397;REFB=-0.00814481;REVB=-0.00698311;RO=33;SAF=15;SAR=13;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00940131;STB=0.512752;STBP=0.881;TYPE=snp;VARB=0.01045;OID=.;OPOS=41237278;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:33:34:28:28:0.451613:13:15:18:15:13:15:19:15
chr1	41285087	.	T	C	2338.22	PASS	AF=0.993243;AO=147;DP=148;FAO=147;FDP=148;FR=.;FRO=1;FSAF=71;FSAR=76;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.000449193;FXX=0.00671096;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.982;QD=63.195;RBI=0.0409994;REFB=-0.0507035;REVB=0.0409969;RO=1;SAF=71;SAR=76;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00665156;STB=0.503496;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.000150659;OID=.;OPOS=41285087;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:148:148:1:1:147:147:0.993243:76:71:1:0:76:71:1:0
chr1	41292377	.	G	A	549.24	PASS	AF=0.695652;AO=48;DP=70;FAO=48;FDP=69;FR=.;FRO=21;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0172728;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.3982;QD=31.8399;RBI=0.0173742;REFB=-0.0430483;REVB=-0.00187376;RO=21;SAF=22;SAR=26;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0369597;STB=0.519992;STBP=0.665;TYPE=snp;VARB=0.018995;OID=.;OPOS=41292377;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:69:21:21:48:48:0.695652:26:22:11:10:26:22:11:10
chr1	41296828	.	T	G	181.28	PASS	AF=0.431818;AO=19;DP=44;FAO=19;FDP=44;FR=.;FRO=25;FSAF=16;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=-0.016944;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.752;QD=16.4804;RBI=0.0171975;REFB=-0.020053;REVB=0.00294227;RO=25;SAF=16;SAR=3;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.464396;STB=0.770218;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0200492;OID=.;OPOS=41296828;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:25:25:19:19:0.431818:3:16:11:14:3:16:11:14
chr1	41326886	.	C	G	180.93	PASS	AF=0.431818;AO=18;DP=44;FAO=19;FDP=44;FR=.;FRO=25;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=-0.0956712;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.2531;QD=16.4477;RBI=0.0964343;REFB=-0.00435927;REVB=-0.0121077;RO=26;SAF=9;SAR=9;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158093;STB=0.56515;STBP=0.47;TYPE=snp;VARB=0.000896512;OID=.;OPOS=41326886;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:26:25:18:19:0.431818:9:9:17:9:9:10:16:9
chr1	41474400	.	C	G	289.87	PASS	AF=0.402439;AO=33;DP=82;FAO=33;FDP=82;FR=.;FRO=49;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=35;FSRR=14;FWDB=0.00532151;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.4127;QD=14.14;RBI=0.00939189;REFB=0.0236956;REVB=-0.0077388;RO=49;SAF=16;SAR=17;SRF=35;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.241237;STB=0.63602;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=-0.0201543;OID=.;OPOS=41474400;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:49:49:33:33:0.402439:17:16:35:14:17:16:35:14
chr1	41976017	.	C	T	259.94	PASS	AF=1;AO=20;DP=21;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.019935;FXX=0.0475964;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.733;QD=51.9883;RBI=0.0217839;REFB=0;REVB=-0.00878261;RO=0;SAF=8;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.86759e-05;OID=.;OPOS=41976017;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:20:0:0:20:20:1:12:8:0:0:12:8:0:0
chr1	41978566	.	T	G	2318.28	PASS	AF=1;AO=145;DP=146;FAO=155;FDP=155;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.115841;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=42.5076;QD=59.8266;RBI=0.127158;REFB=0;REVB=0.0524411;RO=0;SAF=65;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.05277e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00064163;OID=.;OPOS=41978566;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:146:155:0:0:145:155:1:80:65:0:0:81:74:0:0
chr1	41978825	.	C	G	1014.44	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0212059;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.227;QD=59.6729;RBI=0.0438388;REFB=0;REVB=0.0383686;RO=0;SAF=42;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.60567e-05;OID=.;OPOS=41978825;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:68:68:0:0:68:68:1:26:42:0:0:26:42:0:0
chr1	41979156	.	A	G	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0333284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.109;QD=35.5759;RBI=0.0333374;REFB=0;REVB=-0.000773613;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000759481;OID=.;OPOS=41979156;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:3:4:0:0:3:4:0:0
chr1	42048745	.	T	C	670.26	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.072075;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.8805;QD=62.3498;RBI=0.0755149;REFB=0;REVB=0.0225323;RO=0;SAF=17;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.75441e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00091442;OID=.;OPOS=42048745;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:26:17:0:0:26:17:0:0
chr1	42049032	.	G	A	2922.84	PASS	AF=1;AO=185;DP=185;FAO=185;FDP=185;FR=.;FRO=0;FSAF=101;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0271933;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.394;QD=63.1965;RBI=0.0348274;REFB=0;REVB=0.0217594;RO=0;SAF=101;SAR=84;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.15101e-05;OID=.;OPOS=42049032;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:16:185:185:0:0:185:185:1:84:101:0:0:84:101:0:0
chr1	42049140	.	C	G	1479.17	PASS	AF=1;AO=92;DP=95;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0436463;FXX=0.0210504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.585;QD=63.6203;RBI=0.050571;REFB=0;REVB=0.0255426;RO=0;SAF=55;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.18249e-05;OID=.;OPOS=42049140;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:93:0:0:92:93:1:37:55:0:0:38:55:0:0
chr1	42050366	.	C	T	243.77	PASS	AF=0.4375;AO=28;DP=64;FAO=28;FDP=64;FR=.;FRO=36;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=0.00602921;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.116;QD=15.2355;RBI=0.0545379;REFB=-0.0110408;REVB=-0.0542036;RO=36;SAF=10;SAR=18;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119353;STB=0.567708;STBP=0.383;TYPE=snp;VARB=0.0236643;OID=.;OPOS=42050366;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:36:36:28:28:0.4375:18:10:17:19:18:10:17:19
chr1	42619139	.	A	G	1453.48	PASS	AF=1;AO=92;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00724448;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.923;QD=63.1946;RBI=0.0225229;REFB=0;REVB=0.021326;RO=0;SAF=44;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.85155e-05;OID=.;OPOS=42619139;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:92:92:0:0:92:92:1:48:44:0:0:48:44:0:0
chr1	42693597	.	A	G	1625.83	PASS	AF=0.990909;AO=109;DP=110;FAO=109;FDP=110;FR=.;FRO=1;FSAF=56;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0139023;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.77;QD=59.121;RBI=0.0232312;REFB=0.0444326;REVB=-0.0186122;RO=1;SAF=56;SAR=53;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0088725;STB=0.504672;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=-1.28103e-05;OID=.;OPOS=42693597;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:110:110:1:1:109:109:0.990909:53:56:0:1:53:56:0:1
chr1	43119603	.	T	C	186.53	PASS	AF=0.5;AO=19;DP=38;FAO=19;FDP=38;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.0346668;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.4713;QD=19.6344;RBI=0.0364435;REFB=-0.0040855;REVB=-0.0112402;RO=19;SAF=9;SAR=10;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0467664;STB=0.526435;STBP=0.752;TYPE=snp;VARB=0.0027379;OID=.;OPOS=43119603;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:19:19:19:19:0.5:10:9:8:11:10:9:8:11
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chr1	43212431	.	A	G	2069.75	PASS	AF=0.992647;AO=111;DP=137;FAO=135;FDP=136;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=89;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0147521;FXX=0.0144917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.3963;QD=60.8751;RBI=0.014806;REFB=0;REVB=0.00126259;RO=0;SAF=75;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.88442e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0157451;OID=.;OPOS=43212431;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:137:136:0:0:111:135:0.992647:36:75:0:0:46:89:0:0
chr1	43212869	.	A	T	216.74	PASS	AF=0.4;AO=25;DP=65;FAO=26;FDP=65;FR=.;FRO=39;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=0.0103826;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=256.821;QD=13.3376;RBI=0.0177261;REFB=-0.0227301;REVB=-0.0143672;RO=39;SAF=12;SAR=13;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0470068;STB=0.538432;STBP=0.646;TYPE=snp;VARB=0.0338191;OID=.;OPOS=43212869;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:39:39:25:26:0.4:13:12:17:22:13:13:17:22
chr1	43215571	.	A	G	1465.93	PASS	AF=1;AO=90;DP=90;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00627055;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.606;QD=61.0805;RBI=0.0741349;REFB=0;REVB=0.0738692;RO=0;SAF=40;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.21981e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00356119;OID=.;OPOS=43215571;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:90:96:0:0:90:96:1:50:40:0:0:56:40:0:0
chr1	43309842	.	G	C	1190.44	PASS	AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0254612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.205;QD=61.0482;RBI=0.0265812;REFB=0;REVB=0.00763476;RO=0;SAF=37;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.4281e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.70718e-05;OID=.;OPOS=43309842;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:41:37:0:0:41:37:0:0
chr1	43392819	.	G	T	158.17	PASS	AF=0.459459;AO=17;DP=37;FAO=17;FDP=37;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=17;FWDB=0.00956765;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.927;QD=17.0997;RBI=0.0224408;REFB=-0.0069236;REVB=-0.020299;RO=20;SAF=10;SAR=7;SRF=3;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.399839;STB=0.724846;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.00613767;OID=.;OPOS=43392819;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:20:20:17:17:0.459459:7:10:3:17:7:10:3:17
chr1	43393384	.	G	A	236.26	PASS	AF=0.481481;AO=26;DP=54;FAO=26;FDP=54;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=-0.00747341;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.167;QD=17.5009;RBI=0.00764338;REFB=0.00665293;REVB=0.00160296;RO=28;SAF=11;SAR=15;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136733;STB=0.576864;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=-0.00581347;OID=.;OPOS=43393384;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:28:28:26:26:0.481481:15:11:16:12:15:11:16:12
chr1	43394612	.	T	C	115.63	PASS	AF=0.333333;AO=14;DP=42;FAO=14;FDP=42;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=-0.0589833;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.808;QD=11.012;RBI=0.0611045;REFB=-0.0035784;REVB=-0.0159602;RO=27;SAF=10;SAR=4;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.307102;STB=0.694162;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=0.0084376;OID=.;OPOS=43394612;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:27:28:14:14:0.333333:4:10:12:15:4:10:12:16
chr1	43408966	.	G	A	433.24	PASS	AF=0.458333;AO=43;DP=96;FAO=44;FDP=96;FR=.;FRO=52;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=21;FSRR=31;FWDB=-0.00660882;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=256.896;QD=18.0516;RBI=0.0170739;REFB=-0.0123961;REVB=0.0157429;RO=52;SAF=19;SAR=24;SRF=21;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0379031;STB=0.527819;STBP=0.641;TYPE=snp;VARB=0.0127916;OID=.;OPOS=43408966;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:96:52:52:43:44:0.458333:24:19:21:31:24:20:21:31
chr1	43457170	.	T	C	145.4	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00327302;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.566;QD=44.737;RBI=0.0193626;REFB=0;REVB=0.019084;RO=0;SAF=7;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000103235;OID=.;OPOS=43457170;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:13:0:0:12:13:1:5:7:0:0:6:7:0:0
chr1	43649336	.	T	C	420.52	PASS	AF=0.424779;AO=46;DP=111;FAO=48;FDP=113;FR=.;FRO=65;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=41;FSRR=24;FWDB=-0.0238916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.1915;QD=14.8856;RBI=0.0240867;REFB=0.000736295;REVB=-0.0030596;RO=65;SAF=24;SAR=22;SRF=41;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114401;STB=0.563658;STBP=0.277;TYPE=snp;VARB=-0.00139988;OID=.;OPOS=43649336;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:113:65:65:46:48:0.424779:22:24:41:24:23:25:41:24
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chr1	43784956	.	A	G	972.88	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0252476;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.434;QD=58.9624;RBI=0.0255719;REFB=0;REVB=0.00405977;RO=0;SAF=35;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.769e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.08951e-05;OID=.;OPOS=43784956;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:31:35:0:0:31:35:0:0
chr1	43825644	.	T	C	215.06	PASS	AF=0.525;AO=21;DP=40;FAO=21;FDP=40;FR=.;FRO=19;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.00869178;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.952;QD=21.5063;RBI=0.00871832;REFB=-0.0139469;REVB=-0.000679739;RO=18;SAF=14;SAR=7;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0987524;STB=0.54541;STBP=0.577;TYPE=snp;VARB=0.0149845;OID=.;OPOS=43825644;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:18:19:21:21:0.525:7:14:10:8:7:14:11:8
chr1	43886494	.	C	T	570.27	PASS	AF=0.522523;AO=58;DP=111;FAO=58;FDP=111;FR=.;FRO=53;FSAF=27;FSAR=31;FSRF=28;FSRR=25;FWDB=-0.00501296;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=242.065;QD=20.5502;RBI=0.0272476;REFB=-0.0206701;REVB=0.0267825;RO=53;SAF=27;SAR=31;SRF=28;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.054487;STB=0.529987;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=0.0195713;OID=.;OPOS=43886494;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:111:53:53:58:58:0.522523:31:27:28:25:31:27:28:25
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chr1	43909265	.	T	C	374.36	PASS	AF=0.659574;AO=31;DP=47;FAO=31;FDP=47;FR=.;FRO=16;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.00891812;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.365;QD=31.8601;RBI=0.00891817;REFB=0.000599729;REVB=3.16106e-05;RO=16;SAF=19;SAR=12;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0725976;STB=0.539747;STBP=0.468;TYPE=snp;VARB=-0.000374276;OID=.;OPOS=43909265;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:16:16:31:31:0.659574:12:19:8:8:12:19:8:8
chr1	43917601	.	C	T	120.16	PASS	AF=0.411765;AO=14;DP=34;FAO=14;FDP=34;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.0497016;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.1199;QD=14.1363;RBI=0.0528996;REFB=-0.00748482;REVB=0.0181139;RO=20;SAF=10;SAR=4;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.232219;STB=0.636159;STBP=0.215;TYPE=snp;VARB=0.00440025;OID=.;OPOS=43917601;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:20:20:14:14:0.411765:4:10:10:10:4:10:10:10
chr1	43917637	.	G	A	272.57	PASS	AF=0.555556;AO=25;DP=45;FAO=25;FDP=45;FR=.;FRO=20;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=0.00729029;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=96.0412;QD=24.2281;RBI=0.0223237;REFB=-0.041197;REVB=0.0210997;RO=17;SAF=11;SAR=14;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108298;STB=0.570865;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.0262483;OID=.;OPOS=43917637;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:17:20:25:25:0.555556:14:11:10:7:14:11:12:8
chr1	44058265	.	C	A	376.27	PASS	AF=0.62963;AO=34;DP=54;FAO=34;FDP=54;FR=.,HEALED;FRO=18;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.00523438;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=233.94;QD=27.8714;RBI=0.0213427;REFB=-0.0255806;REVB=0.0206909;RO=18;SAF=17;SAR=17;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.070413;STB=0.538439;STBP=0.456;TYPE=snp;VARB=0.014842;OID=.;OPOS=44058265;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:18:18:34:34:0.62963:17:17:11:7:17:17:11:7
chr1	44137257	.	C	A	144.67	PASS	AF=0.346154;AO=18;DP=53;FAO=18;FDP=52;FR=.;FRO=34;FSAF=15;FSAR=3;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=0.0112102;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.168;QD=11.1281;RBI=0.0122109;REFB=-0.00096701;REVB=-0.00484125;RO=34;SAF=15;SAR=3;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.455687;STB=0.771725;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.00434998;OID=.;OPOS=44137257;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:52:34:34:18:18:0.346154:3:15:16:18:3:15:16:18
chr1	44395786	.	C	T	267.51	PASS	AF=0.510204;AO=25;DP=49;FAO=25;FDP=49;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=0.0117749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.858;QD=21.8376;RBI=0.0491476;REFB=0.00373437;REVB=0.0477163;RO=23;SAF=13;SAR=12;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0764207;STB=0.551683;STBP=0.474;TYPE=snp;VARB=-0.00352617;OID=.;OPOS=44395786;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:23:24:25:25:0.510204:12:13:14:9:12:13:15:9
chr1	44396215	.	T	C	109.93	PASS	AF=0.433333;AO=13;DP=30;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=1;FWDB=0.00524605;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.995;QD=14.6577;RBI=0.0146289;REFB=-0.0124148;REVB=0.0136559;RO=17;SAF=8;SAR=5;SRF=16;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.381816;STB=0.71404;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=0.0260167;OID=.;OPOS=44396215;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:17:17:13:13:0.433333:5:8:16:1:5:8:16:1
chr1	44396790	.	G	A	487.73	PASS	AF=0.605263;AO=45;DP=77;FAO=46;FDP=76;FR=.;FRO=30;FSAF=27;FSAR=19;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=0.00466158;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.947;QD=25.67;RBI=0.015349;REFB=-0.0259019;REVB=0.014624;RO=30;SAF=26;SAR=19;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0577011;STB=0.53495;STBP=0.452;TYPE=snp;VARB=0.0182844;OID=.;OPOS=44396790;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:76:30:30:45:46:0.605263:19:26:15:15:19:27:15:15
chr1	44401384	.	A	G	520.33	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0494178;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.869;QD=59.4657;RBI=0.0605645;REFB=0;REVB=0.0350135;RO=0;SAF=21;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000518317;OID=.;OPOS=44401384;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:35:0:0:34:35:1:13:21:0:0:14:21:0:0
chr1	44415415	.	C	T	235.22	PASS	AF=0.594595;AO=22;DP=37;FAO=22;FDP=37;FR=.;FRO=15;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=-0.0209894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.296;QD=25.4287;RBI=0.034651;REFB=-0.0121649;REVB=-0.0275706;RO=15;SAF=12;SAR=10;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0900794;STB=0.549955;STBP=0.467;TYPE=snp;VARB=0.0130402;OID=.;OPOS=44415415;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:15:15:22:22:0.594595:10:12:10:5:10:12:10:5
chr1	44442930	.	A	G	520.83	PASS	AF=0.509434;AO=54;DP=106;FAO=54;FDP=106;FR=.;FRO=52;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=24;FSRR=28;FWDB=-0.0029322;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.1;QD=19.654;RBI=0.0192594;REFB=0.00757253;REVB=0.0190349;RO=52;SAF=28;SAR=26;SRF=24;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0505957;STB=0.527923;STBP=0.549;TYPE=snp;VARB=-0.0066403;OID=.;OPOS=44442930;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:106:52:52:54:54:0.509434:26:28:24:28:26:28:24:28
chr1	44451234	.	C	T	163.4	PASS	AF=0.472222;AO=17;DP=36;FAO=17;FDP=36;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=0.0151675;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.572;QD=18.1557;RBI=0.0202078;REFB=-0.016511;REVB=-0.013353;RO=19;SAF=10;SAR=7;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.201429;STB=0.614753;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=0.0156977;OID=.;OPOS=44451234;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:19:19:17:17:0.472222:7:10:7:12:7:10:7:12
chr1	44466606	.	G	A	108.03	PASS	AF=0.40625;AO=12;DP=32;FAO=13;FDP=32;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=0.0334929;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.4905;QD=13.504;RBI=0.0351429;REFB=-0.0269299;REVB=0.0106419;RO=20;SAF=6;SAR=6;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105621;STB=0.524235;STBP=0.835;TYPE=snp;VARB=0.042218;OID=.;OPOS=44466606;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:20:19:12:13:0.40625:6:6:8:12:7:6:8:11
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chr1	44595047	.	T	A	138.97	PASS	AF=0.347826;AO=16;DP=46;FAO=16;FDP=46;FR=.;FRO=30;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=-0.00266671;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.262;QD=12.084;RBI=0.0252985;REFB=-0.00797166;REVB=0.0251576;RO=30;SAF=9;SAR=7;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105899;STB=0.562422;STBP=0.554;TYPE=snp;VARB=0.0157466;OID=.;OPOS=44595047;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:30:30:16:16:0.347826:7:9:14:16:7:9:14:16
chr1	44595113	.	G	C	773.53	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0542818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.663;QD=56.2569;RBI=0.0552476;REFB=0;REVB=0.0102852;RO=0;SAF=24;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000448098;OID=.;OPOS=44595113;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:55:0:0:51:55:1:27:24:0:0:29:26:0:0
chr1	44595426	.	G	A	159.12	PASS	AF=0.435897;AO=18;DP=38;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.0119738;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.963;QD=16.3199;RBI=0.0786965;REFB=-0.0281651;REVB=-0.0777802;RO=20;SAF=4;SAR=14;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.417034;STB=0.714943;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.0533793;OID=.;OPOS=44595426;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:39:20:22:18:17:0.435897:14:4:13:7:13:4:13:9
chr1	44788397	.	CA	C,CT	418.24	PASS	AF=0.1,0.9;AO=4,26;DP=30;FAO=3,27;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=3,12;FSAR=0,15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.021496,0.0204064;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=125.954,145.653;QD=55.7659;RBI=0.0242816,0.0595343;REFB=0,0;REVB=-0.0112925,-0.0559278;RO=0;SAF=4,11;SAR=0,15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0646554,0.0148438;OID=.,.;OPOS=44788398,44788398;OREF=A,A;OALT=-,T;OMAPALT=C,CT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.1,0.9:4,26:30:3,27:30:0:3,12:0,15:0:0:12:0:4,11:0,15:0:0
chr1	45189820	.	G	T	495.56	PASS	AF=0.446281;AO=54;DP=121;FAO=54;FDP=121;FR=.;FRO=67;FSAF=27;FSAR=27;FSRF=38;FSRR=29;FWDB=-0.000133942;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.85;QD=16.3821;RBI=0.00391321;REFB=0.00278762;REVB=0.00391092;RO=67;SAF=27;SAR=27;SRF=38;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.066632;STB=0.537176;STBP=0.47;TYPE=snp;VARB=-0.00427337;OID=.;OPOS=45189820;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:121:121:67:67:54:54:0.446281:27:27:38:29:27:27:38:29
chr1	45285585	.	T	A	209.43	PASS	AF=0.446809;AO=21;DP=48;FAO=21;FDP=47;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=-0.00747893;FXX=0.020829;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.684;QD=17.8242;RBI=0.0144977;REFB=0.0132997;REVB=0.0124197;RO=26;SAF=13;SAR=8;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0428005;STB=0.524393;STBP=0.79;TYPE=snp;VARB=-0.0136591;OID=.;OPOS=45285585;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:47:26:26:21:21:0.446809:8:13:15:11:8:13:15:11
chr1	45285640	.	T	C	157.32	PASS	AF=0.485714;AO=17;DP=33;FAO=17;FDP=35;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=5;FWDB=-0.00869654;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=105.228;QD=17.979;RBI=0.0280672;REFB=-0.0285482;REVB=0.0266859;RO=16;SAF=7;SAR=10;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.232656;STB=0.655563;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.0209889;OID=.;OPOS=45285640;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:35:16:18:17:17:0.485714:10:7:11:5:10:7:13:5
chr1	45285664	.	G	A	306.33	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00366996;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.868;QD=53.274;RBI=0.0147156;REFB=0;REVB=0.0142506;RO=0;SAF=14;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.84921e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000146541;OID=.;OPOS=45285664;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:9:14:0:0:9:14:0:0
chr1	45504720	.	G	C	479.09	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00182109;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.334;QD=58.0709;RBI=0.0130982;REFB=0;REVB=0.012971;RO=0;SAF=1;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000386382;OID=.;OPOS=45504720;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:33:0:0:32:33:1:31:1:0:0:31:2:0:0
chr1	45793371	.	TGGGC	TGG,TGGC	1211.61	PASS	AF=0,0.993007;AO=29,83;DP=133;FAO=0,142;FDP=143;FR=.;FRO=1;FSAF=0,98;FSAR=0,44;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.042507,-0.152276;FXX=0.00694396;HRUN=3,3;LEN=2,1;MLLD=142.241,13.5868;QD=33.8913;RBI=0.10452,0.264307;REFB=0.0821431,-0.0123851;REVB=0.095486,0.216033;RO=13;SAF=20,72;SAR=9,11;SRF=2;SRR=11;SSEN=0,0;SSEP=0.336364,0.336364;SSSB=0.308586,0.299202;STB=0.5,0.502538;STBP=1,0.6;TYPE=del,del;VARB=0,0.00156494;OID=.,.;OPOS=45793374,45793372;OREF=GC,G;OALT=-,-;OMAPALT=TGG,TGGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	2/2:0,0.993007:29,83:133:0,142:143:1:0,98:0,44:1:0:16:13:20,72:9,11:2:11
chr1	45797505	.	C	G	389.35	PASS	AF=0.59375;AO=38;DP=64;FAO=38;FDP=64;FR=.;FRO=26;FSAF=25;FSAR=13;FSRF=6;FSRR=20;FWDB=2.44623e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.113;QD=24.3345;RBI=0.0282319;REFB=-0.0157392;REVB=-0.0282319;RO=26;SAF=25;SAR=13;SRF=6;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.313361;STB=0.671735;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0180716;OID=.;OPOS=45797505;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:26:26:38:38:0.59375:13:25:6:20:13:25:6:20
chr1	45805566	.	G	C	831.93	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0444925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.928;QD=57.3741;RBI=0.0473389;REFB=0;REVB=0.0161675;RO=0;SAF=13;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.60164e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.95047e-05;OID=.;OPOS=45805566;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:56:58:0:0:56:58:1:43:13:0:0:44:14:0:0
chr1	45810091	.	A	G	109.93	PASS	AF=0.433333;AO=13;DP=30;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.0206197;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.075;QD=14.6577;RBI=0.0264654;REFB=-0.00648315;REVB=0.0165905;RO=16;SAF=4;SAR=9;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0723649;STB=0.56561;STBP=0.554;TYPE=snp;VARB=0.0106408;OID=.;OPOS=45810091;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:16:17:13:13:0.433333:9:4:6:10:9:4:7:10
chr1	45962137	.	T	C	118.03	PASS	AF=0.5;AO=13;DP=28;FAO=14;FDP=28;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=-0.0172468;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.953;QD=16.8608;RBI=0.0225046;REFB=-0.0212984;REVB=0.0144571;RO=14;SAF=6;SAR=7;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0298971;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0234679;OID=.;OPOS=45962137;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:28:14:14:13:14:0.5:7:6:6:8:8:6:6:8
chr1	46073489	.	G	A	53.05	PASS	AF=0.275862;AO=8;DP=29;FAO=8;FDP=29;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=-0.0117617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.7025;QD=7.3172;RBI=0.0599547;REFB=-0.00852098;REVB=0.0587897;RO=21;SAF=5;SAR=3;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171993;STB=0.608422;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=0.0446289;OID=.;OPOS=46073489;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:29:29:21:21:8:8:0.275862:3:5:10:11:3:5:10:11
chr1	46078854	.	A	G	53.39	PASS	AF=0.285714;AO=8;DP=27;FAO=8;FDP=28;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.0153182;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.172;QD=7.62764;RBI=0.0247657;REFB=-0.00154302;REVB=-0.01946;RO=19;SAF=4;SAR=4;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0890944;STB=0.535625;STBP=0.853;TYPE=snp;VARB=0.00399132;OID=.;OPOS=46078854;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:27:28:19:20:8:8:0.285714:4:4:11:8:4:4:11:9
chr1	46078884	.	C	T	74.25	PASS	AF=0.344828;AO=10;DP=29;FAO=10;FDP=29;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.0203766;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.502;QD=10.241;RBI=0.0206395;REFB=-0.00891001;REVB=-0.00328363;RO=18;SAF=5;SAR=5;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.517207;STBP=0.937;TYPE=snp;VARB=0.0106207;OID=.;OPOS=46078884;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:29:29:18:19:10:10:0.344828:5:5:9:9:5:5:9:10
chr1	46087577	.	G	A	354.57	PASS	AF=0.422222;AO=38;DP=90;FAO=38;FDP=90;FR=.;FRO=52;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=26;FSRR=26;FWDB=0.0150506;FXX=0.0109878;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.149;QD=15.7589;RBI=0.0293604;REFB=-0.0317828;REVB=0.0252094;RO=51;SAF=18;SAR=20;SRF=26;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0367254;STB=0.515214;STBP=0.783;TYPE=snp;VARB=0.0407271;OID=.;OPOS=46087577;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:51:52:38:38:0.422222:20:18:26:25:20:18:26:26
chr1	46094027	.	A	G	214.11	PASS	AF=0.431034;AO=25;DP=58;FAO=25;FDP=58;FR=.;FRO=33;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=0.0761146;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.6856;QD=14.7663;RBI=0.0785068;REFB=0.00816765;REVB=-0.0192322;RO=33;SAF=12;SAR=13;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125812;STB=0.571372;STBP=0.37;TYPE=snp;VARB=-0.0180433;OID=.;OPOS=46094027;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:33:33:25:25:0.431034:13:12:20:13:13:12:20:13
chr1	46095272	.	T	C	160.75	PASS	AF=0.485714;AO=17;DP=35;FAO=17;FDP=35;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=5;FWDB=0.0263496;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.0772;QD=18.3711;RBI=0.0668189;REFB=-0.037416;REVB=-0.0614042;RO=18;SAF=9;SAR=8;SRF=13;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177796;STB=0.60057;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.0347351;OID=.;OPOS=46095272;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:18:18:17:17:0.485714:8:9:13:5:8:9:13:5
chr1	46379518	.	A	G	1116.8	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0214617;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.1869;QD=60.3673;RBI=0.0224214;REFB=0;REVB=-0.00648949;RO=0;SAF=29;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.16042e-05;OID=.;OPOS=46379518;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:74:0:0:73:74:1:44:29:0:0:45:29:0:0
chr1	46476587	.	T	G	411.11	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0612204;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.4929;QD=56.705;RBI=0.0618131;REFB=0;REVB=0.00853953;RO=0;SAF=4;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.10829e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00096954;OID=.;OPOS=46476587;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:25:4:0:0:25:4:0:0
chr1	46493460	.	T	G	1339.89	PASS	AF=0.91;AO=91;DP=98;FAO=91;FDP=100;FR=.;FRO=9;FSAF=49;FSAR=42;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.00254193;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.0157;QD=53.5954;RBI=0.0195712;REFB=-0.0343585;REVB=0.0194054;RO=7;SAF=49;SAR=42;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.053504;STB=0.518514;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=0.0231234;OID=.;OPOS=46493460;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:98:100:7:9:91:91:0.91:42:49:1:6:42:49:3:6
chr1	46496709	.	A	G	801.31	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0115829;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.246;QD=57.2365;RBI=0.0145296;REFB=0;REVB=0.00877186;RO=0;SAF=27;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.03144e-05;OID=.;OPOS=46496709;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:29:27:0:0:29:27:0:0
chr1	46498375	.	A	G	801.33	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0167659;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.54;QD=57.2377;RBI=0.0215286;REFB=0;REVB=-0.013505;RO=0;SAF=28;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000135038;OID=.;OPOS=46498375;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:28:28:0:0:28:28:0:0
chr1	46521517	.	G	A	651.19	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00340172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.252;QD=62.018;RBI=0.0153564;REFB=0;REVB=0.0149749;RO=0;SAF=19;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.16616e-05;OID=.;OPOS=46521517;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:23:19:0:0:23:19:0:0
chr1	46521559	.	A	T	573.11	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0117605;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.199;QD=60.3276;RBI=0.0127035;REFB=0;REVB=0.00480318;RO=0;SAF=14;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.76123e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.2744e-05;OID=.;OPOS=46521559;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:24:14:0:0:24:14:0:0
chr1	46655158	.	T	C	575.8	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0208452;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.736;QD=60.6102;RBI=0.0217061;REFB=0;REVB=0.00605244;RO=0;SAF=20;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.51048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.77822e-05;OID=.;OPOS=46655158;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:18:20:0:0:18:20:0:0
chr1	46660295	.	T	C	362.38	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0423074;FXX=0.0370233;HRUN=3;LEN=1;MLLD=94.2845;QD=55.7506;RBI=0.0431892;REFB=0;REVB=0.00868325;RO=0;SAF=7;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0004287;OID=.;OPOS=46660295;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:26:0:0:24:26:1:17:7:0:0:18:8:0:0
chr1	46807597	.	G	A	254.37	PASS	AF=0.439394;AO=29;DP=66;FAO=29;FDP=66;FR=.;FRO=37;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=-0.00343163;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.958;QD=15.4165;RBI=0.0133689;REFB=-0.00840984;REVB=-0.012921;RO=37;SAF=19;SAR=10;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0927119;STB=0.552536;STBP=0.46;TYPE=snp;VARB=0.0152383;OID=.;OPOS=46807597;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:37:37:29:29:0.439394:10:19:21:16:10:19:21:16
chr1	46807711	.	C	T	299.15	PASS	AF=0.576923;AO=30;DP=51;FAO=30;FDP=52;FR=.;FRO=22;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=0.00371647;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.5008;QD=23.0112;RBI=0.0351427;REFB=0.010105;REVB=0.0349457;RO=21;SAF=16;SAR=14;SRF=15;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137388;STB=0.563595;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=-0.0065269;OID=.;OPOS=46807711;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:52:21:22:30:30:0.576923:14:16:15:6:14:16:15:7
chr1	46808042	.	C	T	89.0	PASS	AF=0.769231;AO=10;DP=13;FAO=10;FDP=13;FR=.;FRO=3;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0675386;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=197.554;QD=27.3839;RBI=0.0696042;REFB=-0.0735066;REVB=0.0168308;RO=3;SAF=3;SAR=7;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163937;STB=0.593025;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=0.0199095;OID=.;OPOS=46808042;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:13:13:3:3:10:10:0.769231:7:3:2:1:7:3:2:1
chr1	46827456	.	A	G	333.96	PASS	AF=0.393617;AO=37;DP=94;FAO=37;FDP=94;FR=.;FRO=57;FSAF=12;FSAR=25;FSRF=28;FSRR=29;FWDB=0.00456531;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.946;QD=14.2109;RBI=0.00799781;REFB=-0.00551488;REVB=0.0065668;RO=57;SAF=12;SAR=25;SRF=28;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187072;STB=0.606737;STBP=0.113;TYPE=snp;VARB=0.00925589;OID=.;OPOS=46827456;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:57:57:37:37:0.393617:25:12:28:29:25:12:28:29
chr1	46828360	.	C	T	584.67	PASS	AF=0.433566;AO=60;DP=141;FAO=62;FDP=143;FR=.;FRO=81;FSAF=35;FSAR=27;FSRF=36;FSRR=45;FWDB=-0.00955203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.883;QD=16.3545;RBI=0.00995649;REFB=-0.00275877;REVB=-0.00280899;RO=73;SAF=34;SAR=26;SRF=36;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0729005;STB=0.567929;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.00291992;OID=.;OPOS=46828360;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:141:143:73:81:60:62:0.433566:26:34:36:37:27:35:36:45
chr1	46870761	.	C	A	122.33	PASS	AF=0.451613;AO=14;DP=31;FAO=14;FDP=31;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=-0.025638;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=226.545;QD=15.7844;RBI=0.025767;REFB=-0.00402698;REVB=0.00257563;RO=17;SAF=6;SAR=8;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.258764;STB=0.648446;STBP=0.175;TYPE=snp;VARB=0.00468654;OID=.;OPOS=46870761;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:17:17:14:14:0.451613:8:6:12:5:8:6:12:5
chr1	46871986	.	T	C	785.2	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00790936;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.2814;QD=57.1053;RBI=0.0200438;REFB=0;REVB=-0.0184173;RO=0;SAF=22;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000278438;OID=.;OPOS=46871986;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:33:22:0:0:33:22:0:0
chr1	46978497	.	C	T	2224.26	PASS	AF=0.986111;AO=142;DP=144;FAO=142;FDP=144;FR=.;FRO=2;FSAF=34;FSAR=108;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0121025;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=172.747;QD=61.7849;RBI=0.0146691;REFB=0.101967;REVB=-0.00828922;RO=2;SAF=34;SAR=108;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00939554;STB=0.504942;STBP=0.36;TYPE=snp;VARB=-0.000513249;OID=.;OPOS=46978497;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:144:144:2:2:142:142:0.986111:108:34:1:1:108:34:1:1
chr1	47013364	.	T	C	411.11	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0315437;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.17;QD=56.7053;RBI=0.0372835;REFB=0;REVB=-0.0198759;RO=0;SAF=16;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000263551;OID=.;OPOS=47013364;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:13:16:0:0:13:16:0:0
chr1	47059934	.	T	C	940.93	PASS	AF=0.984848;AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=66;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.010142;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.7762;QD=57.0262;RBI=0.013673;REFB=-0.0713402;REVB=0.00917008;RO=1;SAF=32;SAR=33;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.014534;STB=0.50769;STBP=0.551;TYPE=snp;VARB=0.00314554;OID=.;OPOS=47059934;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:66:66:1:1:65:65:0.984848:33:32:1:0:33:32:1:0
chr1	47078637	.	T	C	1644.02	PASS	AF=1;AO=109;DP=110;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0270571;FXX=0.00909008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.113;QD=60.3311;RBI=0.0280551;REFB=0;REVB=0.00741651;RO=0;SAF=49;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.56602e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.3178e-05;OID=.;OPOS=47078637;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:110:109:0:0:109:109:1:60:49:0:0:60:49:0:0
chr1	47080679	.	G	A	519.76	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0224849;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.9519;QD=59.4007;RBI=0.0230168;REFB=0;REVB=0.00491956;RO=0;SAF=21;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.27896e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000296569;OID=.;OPOS=47080679;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:14:21:0:0:14:21:0:0
chr1	47131319	.	A	T	1528.46	PASS	AF=1;AO=93;DP=93;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0263558;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.75;QD=63.6858;RBI=0.0263892;REFB=0;REVB=0.00132736;RO=0;SAF=51;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.8776e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.66321e-05;OID=.;OPOS=47131319;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:93:96:0:0:93:96:1:42:51:0:0:43:53:0:0
chr1	47138819	.	T	G	446.3	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0169334;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=129.921;QD=57.5866;RBI=0.0357861;REFB=0;REVB=0.0315263;RO=0;SAF=13;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.33668e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.86114e-05;OID=.;OPOS=47138819;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:18:13:0:0:18:13:0:0
chr1	47280746	.	GAT	G	71.08	PASS	AF=0.263158;AO=10;DP=38;FAO=10;FDP=38;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=22;FWDB=0.00379811;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=320.75;QD=7.48174;RBI=0.0130333;REFB=-0.00845764;REVB=0.0124676;RO=28;SAF=7;SAR=3;SRF=6;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.529106;STB=0.817249;STBP=0.045;TYPE=del;VARB=0.0351513;OID=.;OPOS=47280747;OREF=AT;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.263158:10:38:10:38:28:7:3:6:22:71:28:7:3:6:22
chr1	47280859	.	G	A	402.79	PASS	AF=0.398305;AO=47;DP=117;FAO=47;FDP=118;FR=.;FRO=71;FSAF=23;FSAR=24;FSRF=33;FSRR=38;FWDB=-0.0050265;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.788;QD=13.654;RBI=0.0238638;REFB=-0.00641405;REVB=-0.0233284;RO=70;SAF=23;SAR=24;SRF=32;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0341557;STB=0.514795;STBP=0.798;TYPE=snp;VARB=0.0101478;OID=.;OPOS=47280859;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:117:118:70:71:47:47:0.398305:24:23:32:38:24:23:33:38
chr1	47280884	.	C	T	422.63	PASS	AF=0.424779;AO=48;DP=113;FAO=48;FDP=113;FR=.;FRO=65;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=34;FSRR=31;FWDB=0.0138369;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.234;QD=14.9603;RBI=0.0192603;REFB=0.00217337;REVB=0.0133977;RO=65;SAF=23;SAR=25;SRF=34;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0449308;STB=0.525238;STBP=0.672;TYPE=snp;VARB=-0.00649816;OID=.;OPOS=47280884;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:113:65:65:48:48:0.424779:25:23:34:31:25:23:34:31
chr1	47282772	.	C	T	144.01	PASS	AF=0.421053;AO=16;DP=38;FAO=16;FDP=38;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=18;FWDB=-0.00937181;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=235.682;QD=15.159;RBI=0.026558;REFB=-0.00851011;REVB=-0.0248495;RO=20;SAF=9;SAR=7;SRF=3;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.389645;STB=0.711796;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.0120989;OID=.;OPOS=47282772;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:20:22:16:16:0.421053:7:9:3:17:7:9:4:18
chr1	47395973	.	G	A	288.83	PASS	AF=0.545455;AO=30;DP=55;FAO=30;FDP=55;FR=.;FRO=25;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=0.00132682;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.6499;QD=21.0061;RBI=0.00169952;REFB=0.00483665;REVB=-0.00106204;RO=25;SAF=18;SAR=12;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13238;STB=0.57348;STBP=0.253;TYPE=snp;VARB=-0.00412315;OID=.;OPOS=47395973;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:25:25:30:30:0.545455:12:18:11:14:12:18:11:14
chr1	47398496	.	A	G	343.07	PASS	AF=0.383838;AO=38;DP=99;FAO=38;FDP=99;FR=.;FRO=61;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=23;FSRR=38;FWDB=-0.05864;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.9521;QD=13.8612;RBI=0.0589026;REFB=0.0048231;REVB=-0.00555581;RO=61;SAF=23;SAR=15;SRF=23;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.243711;STB=0.638483;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=-0.0084449;OID=.;OPOS=47398496;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:61:61:38:38:0.383838:15:23:23:38:15:23:23:38
chr1	47399967	.	G	A	71.38	PASS	AF=0.27027;AO=10;DP=37;FAO=10;FDP=37;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=1.05198e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.3998;QD=7.71663;RBI=0.0344363;REFB=0.0110614;REVB=0.0344363;RO=27;SAF=6;SAR=4;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0967512;STB=0.560318;STBP=0.656;TYPE=snp;VARB=-0.0296364;OID=.;OPOS=47399967;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:71:37:37:27:27:10:10:0.27027:4:6:14:13:4:6:14:13
chr1	47571902	.	C	T	429.02	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0209628;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.739;QD=57.2026;RBI=0.0210912;REFB=0;REVB=0.00232321;RO=0;SAF=17;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.63861e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.47587e-05;OID=.;OPOS=47571902;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:13:17:0:0:13:17:0:0
chr1	47571905	.	C	T	400.14	PASS	AF=0.966667;AO=29;DP=30;FAO=29;FDP=30;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0294536;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.1372;QD=53.3522;RBI=0.0315896;REFB=-0.0429481;REVB=0.0114187;RO=1;SAF=16;SAR=13;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0282257;STB=0.515141;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=0.00211747;OID=.;OPOS=47571905;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:30:30:1:1:29:29:0.966667:13:16:1:0:13:16:1:0
chr1	47607281	.	C	T	1102.55	PASS	AF=0.986667;AO=74;DP=75;FAO=74;FDP=75;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0014957;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.216;QD=58.8027;RBI=0.00903273;REFB=-0.0705077;REVB=-0.00890804;RO=1;SAF=24;SAR=50;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00936911;STB=0.504949;STBP=0.611;TYPE=snp;VARB=0.000436748;OID=.;OPOS=47607281;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:75:75:1:1:74:74:0.986667:50:24:0:1:50:24:0:1
chr1	47607785	.	G	A	323.47	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00243556;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=278.37;QD=53.9111;RBI=0.0243668;REFB=0;REVB=0.0242448;RO=0;SAF=10;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.63589e-05;OID=.;OPOS=47607785;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:14:10:0:0:14:10:0:0
chr1	47607851	.	A	T	453.83	PASS	AF=0.969697;AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=33;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0152928;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.612;QD=55.0098;RBI=0.0341224;REFB=-0.0280642;REVB=-0.0305036;RO=0;SAF=16;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.515142;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.000238578;OID=.;OPOS=47607851;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:33:33:0:1:32:32:0.969697:16:16:0:0:16:16:1:0
chr1	47608983	.	G	T	526.72	PASS	AF=0.972973;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0664595;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.7711;QD=56.9425;RBI=0.0912651;REFB=0.0233589;REVB=-0.0625497;RO=0;SAF=18;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.513506;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=-0.0035255;OID=.;OPOS=47608983;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:37:37:0:1:36:36:0.972973:18:18:0:0:18:18:0:1
chr1	47609489	.	T	C	996.3	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0244786;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.467;QD=59.4807;RBI=0.0588632;REFB=0;REVB=-0.053532;RO=0;SAF=33;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.61397e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000261738;OID=.;OPOS=47609489;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:34:33:0:0:34:33:0:0
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chr1	47614434	.	C	T	123.56	PASS	AF=0.375;AO=13;DP=38;FAO=15;FDP=40;FR=.;FRO=25;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=18;FWDB=0.0461829;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.2004;QD=12.3556;RBI=0.0534758;REFB=-0.0205978;REVB=0.0269592;RO=25;SAF=3;SAR=10;SRF=7;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0723725;STB=0.510534;STBP=0.952;TYPE=snp;VARB=0.0404886;OID=.;OPOS=47614434;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:40:25:25:13:15:0.375:10:3:7:18:11:4:7:18
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chr1	47685455	.	T	C	677.13	PASS	AF=0.978261;AO=43;DP=44;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0142058;FXX=0.0212721;HRUN=3;LEN=1;MLLD=98.3044;QD=58.8806;RBI=0.0172858;REFB=-0.0229204;REVB=0.00984862;RO=0;SAF=20;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.51219;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.00143276;OID=.;OPOS=47685455;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:44:46:0:1:43:45:0.978261:23:20:0:0:25:20:1:0
chr1	47717189	.	A	G	97.91	PASS	AF=0.413793;AO=12;DP=29;FAO=12;FDP=29;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=0.010021;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=287.837;QD=13.5055;RBI=0.0141099;REFB=-0.00174112;REVB=-0.00993325;RO=17;SAF=6;SAR=6;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147429;STB=0.586067;STBP=0.429;TYPE=snp;VARB=0.0026011;OID=.;OPOS=47717189;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:29:29:17:17:12:12:0.413793:6:6:11:6:6:6:11:6
chr1	47746678	.	G	C	372.99	PASS	AF=0.464286;AO=39;DP=83;FAO=39;FDP=84;FR=.;FRO=45;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=19;FSRR=26;FWDB=-0.00142408;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.043;QD=17.7616;RBI=0.00158343;REFB=-0.0156746;REVB=-0.000692271;RO=44;SAF=19;SAR=20;SRF=19;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0526672;STB=0.534866;STBP=0.554;TYPE=snp;VARB=0.0180892;OID=.;OPOS=47746678;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:84:44:45:39:39:0.464286:20:19:19:25:20:19:19:26
chr1	47767914	.	G	A	306.06	PASS	AF=0.533333;AO=32;DP=60;FAO=32;FDP=60;FR=.;FRO=28;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=0.00327853;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.437;QD=20.4042;RBI=0.00480234;REFB=0.00255256;REVB=-0.00350909;RO=28;SAF=14;SAR=18;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142087;STB=0.578789;STBP=0.199;TYPE=snp;VARB=-0.0021797;OID=.;OPOS=47767914;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:28:28:32:32:0.533333:18:14:17:11:18:14:17:11
chr1	47799639	.	G	C	321.44	PASS	AF=0.397849;AO=33;DP=94;FAO=37;FDP=93;FR=.;FRO=56;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=29;FSRR=27;FWDB=-0.0425034;FXX=0.0210504;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.7685;QD=13.8253;RBI=0.0564856;REFB=-0.0828464;REVB=-0.0372034;RO=47;SAF=19;SAR=14;SRF=21;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133531;STB=0.547044;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.0989519;OID=.;OPOS=47799639;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:93:47:56:33:37:0.397849:14:19:21:26:15:22:29:27
chr1	47842431	.	G	A	764.77	PASS	AF=0.949153;AO=57;DP=59;FAO=56;FDP=59;FR=.;FRO=3;FSAF=26;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0149373;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.4844;QD=51.8487;RBI=0.0223631;REFB=-0.00633342;REVB=-0.016643;RO=2;SAF=26;SAR=31;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00282326;STB=0.506697;STBP=0.718;TYPE=snp;VARB=0.00464406;OID=.;OPOS=47842431;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:59:59:2:3:57:56:0.949153:31:26:1:1:30:26:1:2
chr1	47842666	.	A	T	984.78	PASS	AF=1;AO=45;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=0;FSAF=30;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.185203;FXX=0.0135117;HRUN=4;LEN=1;MLLD=25.1001;QD=53.9604;RBI=0.186941;REFB=0;REVB=-0.0254343;RO=0;SAF=13;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0219849;OID=.;OPOS=47842666;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:73:73:0:0:45:73:1:32:13:0:0:43:30:0:0
chr1	47883019	.	T	C	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0910874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.788;QD=55.6561;RBI=0.0936782;REFB=0;REVB=0.0218788;RO=0;SAF=2;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.18567e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000244293;OID=.;OPOS=47883019;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:25:2:0:0:25:2:0:0
chr1	47906338	.	G	A	2390.44	PASS	AF=1;AO=148;DP=148;FAO=149;FDP=149;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0234925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.39;QD=64.173;RBI=0.0235078;REFB=0;REVB=0.000849726;RO=0;SAF=66;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.79046e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.96042e-05;OID=.;OPOS=47906338;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:148:149:0:0:148:149:1:82:66:0:0:82:67:0:0
chr1	48694594	.	G	A	163.76	PASS	AF=0.367347;AO=18;DP=49;FAO=18;FDP=49;FR=.;FRO=31;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=-0.00182059;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=255.635;QD=13.368;RBI=0.0024107;REFB=-0.0157344;REVB=-0.00158016;RO=31;SAF=13;SAR=5;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.336108;STB=0.696746;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.0217108;OID=.;OPOS=48694594;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:31:31:18:18:0.367347:5:13:13:18:5:13:13:18
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chr1	48697781	.	C	T	208.24	PASS	AF=0.382353;AO=23;DP=65;FAO=26;FDP=68;FR=.;FRO=42;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=26;FSRR=16;FWDB=0.0294794;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.796;QD=12.2493;RBI=0.0336139;REFB=-0.00666813;REVB=-0.0161512;RO=41;SAF=12;SAR=11;SRF=26;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125499;STB=0.550421;STBP=0.556;TYPE=snp;VARB=0.0104709;OID=.;OPOS=48697781;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:68:41:42:23:26:0.382353:11:12:26:15:12:14:26:16
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chr1	48713394	.	C	T	133.45	PASS	AF=0.441176;AO=15;DP=34;FAO=15;FDP=34;FR=.;FRO=19;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.00998564;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=221.26;QD=15.7005;RBI=0.033361;REFB=-0.0058539;REVB=-0.0318315;RO=19;SAF=12;SAR=3;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.267316;STB=0.656484;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=0.0073577;OID=.;OPOS=48713394;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:19:19:15:15:0.441176:3:12:11:8:3:12:11:8
chr1	49224584	.	G	T	429.02	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0298939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.175;QD=57.2026;RBI=0.033166;REFB=0;REVB=0.0143646;RO=0;SAF=17;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.63861e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000189511;OID=.;OPOS=49224584;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:13:17:0:0:13:17:0:0
chr1	49511424	.	A	G	1026.37	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00664922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.8846;QD=59.4997;RBI=0.0097006;REFB=0;REVB=-0.00706325;RO=0;SAF=41;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.43236e-06;OID=.;OPOS=49511424;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:28:41:0:0:28:41:0:0
chr1	50661411	.	C	T	775.38	PASS	AF=0.95082;AO=57;DP=61;FAO=58;FDP=61;FR=.;FRO=3;FSAF=13;FSAR=45;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0573955;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=110.709;QD=50.8444;RBI=0.0578575;REFB=-0.0619472;REVB=0.00729702;RO=3;SAF=12;SAR=45;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104294;STB=0.530233;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.000680045;OID=.;OPOS=50661411;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:61:61:3:3:57:58:0.95082:45:12:3:0:45:13:2:1
chr1	50666515	.	C	T	1352.49	PASS	AF=0.957447;AO=88;DP=92;FAO=90;FDP=94;FR=.;FRO=4;FSAF=42;FSAR=48;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0499102;FXX=0.0105252;HRUN=6;LEN=1;MLLD=50.5461;QD=57.5527;RBI=0.0772806;REFB=-0.189914;REVB=0.0590023;RO=4;SAF=40;SAR=48;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00377014;STB=0.501424;STBP=0.898;TYPE=snp;VARB=0.00769139;OID=.;OPOS=50666515;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:92:94:4:4:88:90:0.957447:48:40:2:2:48:42:2:2
chr1	51180676	.	C	A	165.23	PASS	AF=0.477273;AO=16;DP=43;FAO=21;FDP=44;FR=.,HEALED;FRO=23;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=-0.074256;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=21.8623;QD=15.0211;RBI=0.0758504;REFB=-0.0180376;REVB=-0.0154704;RO=20;SAF=7;SAR=9;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0369908;STB=0.521719;STBP=0.799;TYPE=snp;VARB=0.0308823;OID=.;OPOS=51180676;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:44:20:23:16:21:0.477273:9:7:8:12:11:10:10:13
chr1	51737446	.	A	G	202.02	PASS	AF=0.526316;AO=20;DP=38;FAO=20;FDP=38;FR=.;FRO=18;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.0492241;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.624;QD=21.2647;RBI=0.0493938;REFB=-0.0162081;REVB=0.00409144;RO=17;SAF=15;SAR=5;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.21029;STB=0.636217;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=0.0274273;OID=.;OPOS=51737446;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:17:18:20:20:0.526316:5:15:9:8:5:15:9:9
chr1	51873951	.	G	A	1102.26	PASS	AF=1;AO=73;DP=74;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.01319;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.985;QD=60.3979;RBI=0.0146434;REFB=0;REVB=0.00636035;RO=0;SAF=33;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.93225e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.57878e-05;OID=.;OPOS=51873951;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:73:0:0:73:73:1:40:33:0:0:40:33:0:0
chr1	52266242	.	G	A	470.21	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00634002;FXX=0.0302939;HRUN=3;LEN=1;MLLD=231.09;QD=58.7759;RBI=0.00869514;REFB=0;REVB=-0.0059506;RO=0;SAF=8;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000645945;OID=.;OPOS=52266242;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:24:8:0:0:24:8:0:0
chr1	52290984	.	T	G	1037.07	PASS	AF=1;AO=69;DP=70;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0909437;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.4295;QD=58.4266;RBI=0.0978535;REFB=0;REVB=0.0361185;RO=1;SAF=27;SAR=42;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0171851;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00180435;OID=.;OPOS=52290984;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:70:71:1:0:69:71:1:42:27:1:0:41:30:0:0
chr1	52306063	.	ATCT	ATCA,A	81.97	PASS	AF=0.222222,0.777778;AO=2,6;DP=9;FAO=2,7;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=1,3;FSAR=1,4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0298575,-0.0138714;FXX=0;HRUN=2,1;LEN=1,3;MLLD=101.821,79.978;QD=36.4305;RBI=0.0304303,0.0652107;REFB=0,0;REVB=-0.00587678,0.0637183;RO=0;SAF=1,2;SAR=1,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,del;VARB=-0.0350522,0.0156731;OID=.,.;OPOS=52306066,52306064;OREF=T,TCT;OALT=A,-;OMAPALT=ATCA,A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.222222,0.777778:2,6:9:2,7:9:0:1,3:1,4:0:0:10:0:1,2:1,4:0:0
chr1	52439128	.	G	GT	1439.1	PASS	AF=1;AO=93;DP=100;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0380185;FXX=0.0396;HRUN=0;LEN=1;MLLD=192.808;QD=59.3442;RBI=0.0395997;REFB=0;REVB=0.0110785;RO=4;SAF=57;SAR=36;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0113134;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000108103;OID=.;OPOS=52439129;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:93:100:97:97:0:58:39:0:0:8:4:57:36:3:1
chr1	52498550	.	CCG	C	41.34	PASS	AF=0.206897;AO=8;DP=60;FAO=12;FDP=58;FR=.;FRO=46;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=31;FSRR=15;FWDB=-0.00459645;FXX=0;HRUN=4;LEN=2;MLLD=28.5966;QD=2.85091;RBI=0.1848;REFB=-0.0342892;REVB=0.184743;RO=48;SAF=2;SAR=6;SRF=31;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.454139;STB=0.86787;STBP=0.007;TYPE=del;VARB=0.136641;OID=.;OPOS=52498551;OREF=CG;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.206897:8:60:12:58:46:2:10:31:15:41:48:2:6:31:17
chr1	52889178	.	C	G	719.48	PASS	AF=0.47205;AO=76;DP=163;FAO=76;FDP=161;FR=.;FRO=85;FSAF=35;FSAR=41;FSRF=35;FSRR=50;FWDB=0.00314408;FXX=0.0122692;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.996;QD=17.8754;RBI=0.00875477;REFB=-0.0207597;REVB=-0.00817072;RO=85;SAF=35;SAR=41;SRF=35;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0470236;STB=0.526005;STBP=0.565;TYPE=snp;VARB=0.0185376;OID=.;OPOS=52889178;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:163:161:85:85:76:76:0.47205:41:35:35:50:41:35:35:50
chr1	52903935	.	CA	AT	36.7	PASS	AF=0.121622;AO=10;DP=76;FAO=9;FDP=74;FR=.;FRO=65;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=20;FSRR=45;FWDB=-0.0831373;FXX=0.0263123;HRUN=2;LEN=2;MLLD=186.955;QD=1.98374;RBI=0.0836184;REFB=-0.000958802;REVB=-0.00895676;RO=60;SAF=8;SAR=2;SRF=20;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.532344;STB=0.928539;STBP=0.027;TYPE=mnp;VARB=0.0626423;OID=.;OPOS=52903935;OREF=CA;OALT=AT;OMAPALT=AT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:76:74:60:65:10:9:0.121622:2:8:20:40:1:8:20:45
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chr1	53072454	.	T	C	1015.61	PASS	AF=0.985714;AO=68;DP=71;FAO=69;FDP=70;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00393691;FXX=0.0140825;HRUN=3;LEN=1;MLLD=203.01;QD=58.0349;RBI=0.00404861;REFB=-0.0803527;REVB=0.000944454;RO=1;SAF=36;SAR=32;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129488;STB=0.506665;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=9.66537e-05;OID=.;OPOS=53072454;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:71:70:1:1:68:69:0.985714:32:36:1:0:32:37:1:0
chr1	53250650	.	G	A	1163.13	PASS	AF=1;AO=77;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0677944;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.4881;QD=59.6477;RBI=0.0866118;REFB=-0.052289;REVB=0.053903;RO=1;SAF=44;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141253;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00356443;OID=.;OPOS=53250650;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:78:78:1:0:77:78:1:33:44:0:1:34:44:0:0
chr1	53535478	.	G	A	745.58	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0166972;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.626;QD=62.1317;RBI=0.0506106;REFB=0;REVB=0.047777;RO=0;SAF=15;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000460915;OID=.;OPOS=53535478;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:48:0:0:47:48:1:32:15:0:0:32:16:0:0
chr1	53537266	.	G	A	987.0	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0424127;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.177;QD=58.9256;RBI=0.0565841;REFB=0;REVB=0.0374556;RO=0;SAF=32;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.62221e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000417757;OID=.;OPOS=53537266;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:35:32:0:0:35:32:0:0
chr1	53544289	.	C	T	91.24	PASS	AF=0.52381;AO=11;DP=21;FAO=11;FDP=21;FR=.;FRO=10;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.00078172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.882;QD=17.3783;RBI=0.0547642;REFB=0.00824421;REVB=-0.0547586;RO=10;SAF=9;SAR=2;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144334;STB=0.584248;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=-0.0116678;OID=.;OPOS=53544289;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:21:21:10:10:11:11:0.52381:2:9:7:3:2:9:7:3
chr1	53544439	.	G	A	233.39	PASS	AF=0.472727;AO=19;DP=55;FAO=26;FDP=55;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=-0.00288716;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.951;QD=16.974;RBI=0.00936431;REFB=-0.01931;REVB=0.00890812;RO=29;SAF=5;SAR=14;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143006;STB=0.523791;STBP=0.76;TYPE=snp;VARB=0.0363999;OID=.;OPOS=53544439;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:29:29:19:26:0.472727:14:5:11:18:15:11:11:18
chr1	53544513	.	C	T	315.15	PASS	AF=0.571429;AO=32;DP=56;FAO=32;FDP=56;FR=.;FRO=24;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=0.0451254;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.2251;QD=22.5109;RBI=0.0485242;REFB=-0.00933912;REVB=0.0178409;RO=24;SAF=16;SAR=16;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00565544;OID=.;OPOS=53544513;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:24:24:32:32:0.571429:16:16:12:12:16:16:12:12
chr1	53544597	.	T	C	241.38	PASS	AF=0.482143;AO=26;DP=56;FAO=27;FDP=56;FR=.;FRO=29;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=0.00282567;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.528;QD=17.2411;RBI=0.00711688;REFB=-0.0442622;REVB=0.00653189;RO=29;SAF=13;SAR=13;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0484183;STB=0.517229;STBP=0.806;TYPE=snp;VARB=0.0260486;OID=.;OPOS=53544597;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:29:29:26:27:0.482143:13:13:16:13:13:14:16:13
chr1	53553702	.	A	G	1008.45	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0368474;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.373;QD=59.3208;RBI=0.0371225;REFB=0;REVB=0.00451114;RO=0;SAF=30;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000158032;OID=.;OPOS=53553702;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:38:30:0:0:38:30:0:0
chr1	53553754	.	T	C	349.03	PASS	AF=0.468354;AO=36;DP=79;FAO=37;FDP=79;FR=.;FRO=42;FSAF=26;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=26;FWDB=0.0227142;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.805;QD=17.6726;RBI=0.0228598;REFB=-0.0307616;REVB=0.0025753;RO=41;SAF=26;SAR=10;SRF=15;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.348083;STB=0.675465;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0328583;OID=.;OPOS=53553754;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:41:42:36:37:0.468354:10:26:15:26:11:26:16:26
chr1	53555783	.	A	C	43.7	PASS	AF=0.75;AO=6;DP=7;FAO=6;FDP=8;FR=.;FRO=2;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0383674;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=233.888;QD=21.8505;RBI=0.0796315;REFB=-0.0182408;REVB=-0.0697791;RO=1;SAF=5;SAR=1;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.281147;STB=0.749058;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.00593746;OID=.;OPOS=53555783;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:7:8:1:2:6:6:0.75:1:5:0:1:1:5:0:2
chr1	53558270	.	A	G	613.31	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0294433;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.5973;QD=61.3311;RBI=0.060792;REFB=0;REVB=0.0531861;RO=0;SAF=19;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000405808;OID=.;OPOS=53558270;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:21:19:0:0:21:19:0:0
chr1	53558366	.	T	C	95.68	PASS	AF=0.363636;AO=12;DP=33;FAO=12;FDP=33;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.00118402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.999;QD=11.5972;RBI=0.0183238;REFB=-0.0148878;REVB=-0.0182855;RO=21;SAF=5;SAR=7;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11507;STB=0.568413;STBP=0.596;TYPE=snp;VARB=0.0213388;OID=.;OPOS=53558366;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:33:33:21:21:12:12:0.363636:7:5:11:10:7:5:11:10
chr1	53600078	.	A	G	182.08	PASS	AF=0.44186;AO=19;DP=43;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=17;FWDB=-0.00905435;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.867;QD=16.9377;RBI=0.023341;REFB=0.00287456;REVB=-0.0215133;RO=23;SAF=6;SAR=13;SRF=6;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0627766;STB=0.515743;STBP=0.869;TYPE=snp;VARB=-0.00380299;OID=.;OPOS=53600078;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:23:24:19:19:0.44186:13:6:6:17:13:6:7:17
chr1	53676401	.	T	G	101.59	PASS	AF=0.5;AO=12;DP=24;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=0.00159425;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=254.657;QD=16.9323;RBI=0.00926179;REFB=0.0047301;REVB=0.00912355;RO=12;SAF=6;SAR=6;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144848;STB=0.583198;STBP=0.49;TYPE=snp;VARB=-0.00445743;OID=.;OPOS=53676401;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:24:24:12:12:12:12:0.5:6:6:8:4:6:6:8:4
chr1	53676448	.	G	A	249.36	PASS	AF=0.589744;AO=22;DP=38;FAO=23;FDP=39;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.0200208;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.385;QD=25.5758;RBI=0.0200902;REFB=-0.00149437;REVB=-0.00166835;RO=16;SAF=7;SAR=15;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195183;STB=0.613806;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=0.000626381;OID=.;OPOS=53676448;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:39:16:16:22:23:0.589744:15:7:9:7:16:7:9:7
chr1	53679878	.	T	C	127.73	PASS	AF=0.357143;AO=15;DP=42;FAO=15;FDP=42;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=18;FWDB=0.0473546;FXX=0.0232504;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.6255;QD=12.1643;RBI=0.0597195;REFB=-0.00523679;REVB=-0.0363863;RO=27;SAF=11;SAR=4;SRF=9;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.427894;STB=0.751225;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.00517681;OID=.;OPOS=53679878;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:27:27:15:15:0.357143:4:11:9:18:4:11:9:18
chr1	53684525	.	C	G	288.7	PASS	AF=1;AO=19;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.021199;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.123;QD=52.4904;RBI=0.0309482;REFB=0;REVB=0.0225476;RO=0;SAF=12;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000722992;OID=.;OPOS=53684525;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:19:22:1:7:12:0:0:9:13:0:0
chr1	53716416	.	G	A	972.87	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0136384;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.936;QD=58.9617;RBI=0.0622698;REFB=0;REVB=0.0607579;RO=0;SAF=34;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.75585e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000166069;OID=.;OPOS=53716416;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:32:34:0:0:32:34:0:0
chr1	53732315	.	G	T	1162.08	PASS	AF=1;AO=76;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0167777;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.068;QD=60.3677;RBI=0.0308964;REFB=0;REVB=0.0259441;RO=0;SAF=39;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.55481e-05;OID=.;OPOS=53732315;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:77:0:0:76:77:1:37:39:0:0:38:39:0:0
chr1	53792651	.	A	C	505.47	PASS	AF=0.49;AO=49;DP=100;FAO=49;FDP=100;FR=.;FRO=51;FSAF=13;FSAR=36;FSRF=23;FSRR=28;FWDB=-0.0103819;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.968;QD=20.2188;RBI=0.0239047;REFB=0.00231718;REVB=-0.0215325;RO=51;SAF=13;SAR=36;SRF=23;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19538;STB=0.608975;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=-0.00298626;OID=.;OPOS=53792651;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:51:51:49:49:0.49:36:13:23:28:36:13:23:28
chr1	53995512	.	GAAG	GAAA,GAA,GAG	443.5	PASS	AF=0.553571,0,0.25;AO=26,6,13;DP=57;FAO=31,0,14;FDP=56;FR=.;FRO=11;FSAF=19,0,1;FSAR=12,0,13;FSRF=9;FSRR=2;FWDB=-0.0949529,-0.284857,-0.0956128;FXX=0.0175408;HRUN=2,2,2;LEN=1,1,1;MLLD=34.5739,17.2358,17.1732;QD=31.6786;RBI=0.133367,0.284872,0.204238;REFB=0.019163,-0.115302,-0.149312;REVB=0.0936525,0.00284671,-0.180476;RO=7;SAF=17,3,1;SAR=9,3,12;SRF=5;SRR=2;SSEN=0,0,0.302273;SSEP=0,0.228917,0;SSSB=-0.026285,-0.191087,-0.579995;STB=0.558103,0.5,0.895895;STBP=0.263,1,0;TYPE=snp,del,del;VARB=0.0364024,0,0.154733;OID=.,.,.;OPOS=53995515,53995515,53995513;OREF=G,G,A;OALT=A,-,-;OMAPALT=GAAA,GAA,GAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/3:0.553571,0,0.25:26,6,13:57:31,0,14:56:11:19,0,1:12,0,13:9:2:95:7:17,3,1:9,3,12:5:2
chr1	54258880	.	C	T	69.64	PASS	AF=0.529412;AO=9;DP=17;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=-0.000748566;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.804;QD=16.3859;RBI=0.00676246;REFB=0.000931246;REVB=0.0067209;RO=8;SAF=1;SAR=8;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0275003;STB=0.516092;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000569221;OID=.;OPOS=54258880;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:17:17:8:8:9:9:0.529412:8:1:1:7:8:1:1:7
chr1	54354658	.	T	G	126.83	PASS	AF=0.538462;AO=13;DP=24;FAO=14;FDP=26;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.08784;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.5011;QD=19.513;RBI=0.0899737;REFB=0.00904316;REVB=-0.019478;RO=11;SAF=3;SAR=10;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.288616;STB=0.609591;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=-0.0118786;OID=.;OPOS=54354658;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:24:26:11:12:13:14:0.538462:10:3:6:5:10:4:6:6
chr1	54562444	.	A	G	283.12	PASS	AF=0.476923;AO=31;DP=65;FAO=31;FDP=65;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=14;FSRR=20;FWDB=-0.0153115;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.548;QD=17.4229;RBI=0.0153964;REFB=-0.00561952;REVB=-0.00161481;RO=34;SAF=10;SAR=21;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0914578;STB=0.551388;STBP=0.484;TYPE=snp;VARB=0.00614962;OID=.;OPOS=54562444;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:34:34:31:31:0.476923:21:10:14:20:21:10:14:20
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chr1	54571318	.	C	T	169.17	PASS	AF=0.708333;AO=20;DP=24;FAO=17;FDP=24;FR=.;FRO=7;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=-0.0178807;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.124;QD=28.1943;RBI=0.0219916;REFB=-0.0018732;REVB=0.0128027;RO=0;SAF=10;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.627872;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.00180122;OID=.;OPOS=54571318;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:24:24:0:7:20:17:0.708333:10:10:0:0:10:7:6:1
chr1	54606804	.	C	T	465.14	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0198792;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=247.862;QD=58.1419;RBI=0.0484723;REFB=0;REVB=0.0442084;RO=0;SAF=18;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000242643;OID=.;OPOS=54606804;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:14:18:0:0:14:18:0:0
chr1	54607051	.	A	G	130.45	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0194811;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.738;QD=43.4836;RBI=0.0410988;REFB=0;REVB=0.0361884;RO=0;SAF=4;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000273108;OID=.;OPOS=54607051;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:8:4:0:0:8:4:0:0
chr1	54637167	.	T	C	306.3	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00574899;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.6362;QD=53.2697;RBI=0.00747829;REFB=0;REVB=-0.00478266;RO=0;SAF=20;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000182077;OID=.;OPOS=54637167;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:3:20:0:0:3:20:0:0
chr1	54637417	.	G	A	937.58	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0122334;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=133.693;QD=58.5986;RBI=0.03746;REFB=0;REVB=0.0354061;RO=0;SAF=32;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.61746e-05;OID=.;OPOS=54637417;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:32:32:0:0:32:32:0:0
chr1	54637697	.	A	G	769.43	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000459738;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.74;QD=56.9951;RBI=0.0196932;REFB=0;REVB=0.0196879;RO=0;SAF=26;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.52846e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.73512e-05;OID=.;OPOS=54637697;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:28:26:0:0:28:26:0:0
chr1	54678305	.	C	G	267.47	PASS	AF=0.402597;AO=31;DP=77;FAO=31;FDP=77;FR=.;FRO=46;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=18;FSRR=28;FWDB=-0.0541819;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=113.277;QD=13.8944;RBI=0.0577668;REFB=-0.0196367;REVB=-0.0200331;RO=46;SAF=12;SAR=19;SRF=18;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00464489;STB=0.502644;STBP=0.986;TYPE=snp;VARB=0.0279351;OID=.;OPOS=54678305;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:46:46:31:31:0.402597:19:12:18:28:19:12:18:28
chr1	54681920	.	G	C	285.25	PASS	AF=0.432432;AO=32;DP=74;FAO=32;FDP=74;FR=.;FRO=42;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=22;FWDB=0.00765683;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.792;QD=15.419;RBI=0.0187584;REFB=-0.0116748;REVB=0.0171246;RO=42;SAF=18;SAR=14;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0869442;STB=0.549122;STBP=0.453;TYPE=snp;VARB=0.0113712;OID=.;OPOS=54681920;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:42:42:32:32:0.432432:14:18:20:22:14:18:20:22
chr1	54683856	.	C	G	474.3	PASS	AF=0.485437;AO=51;DP=102;FAO=50;FDP=103;FR=.;FRO=53;FSAF=29;FSAR=21;FSRF=28;FSRR=25;FWDB=0.0673356;FXX=0.00961446;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.9785;QD=18.4195;RBI=0.0687586;REFB=-0.0333188;REVB=0.0139165;RO=51;SAF=29;SAR=22;SRF=27;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0359004;STB=0.527054;STBP=0.601;TYPE=snp;VARB=0.0360862;OID=.;OPOS=54683856;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:103:51:53:51:50:0.485437:22:29:27:24:21:29:28:25
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chr1	54686374	.	T	C	200.94	PASS	AF=0.433962;AO=23;DP=53;FAO=23;FDP=53;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=0.0103633;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.3757;QD=15.1655;RBI=0.0252759;REFB=0.00535941;REVB=-0.0230537;RO=30;SAF=8;SAR=15;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0559092;STB=0.531887;STBP=0.709;TYPE=snp;VARB=-0.00991262;OID=.;OPOS=54686374;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:30:30:23:23:0.433962:15:8:12:18:15:8:12:18
chr1	54686464	.	C	T	157.73	PASS	AF=0.357143;AO=20;DP=56;FAO=20;FDP=56;FR=.;FRO=36;FSAF=4;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=0.00219521;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.9433;QD=11.2664;RBI=0.0356597;REFB=-0.00928847;REVB=-0.035592;RO=36;SAF=4;SAR=16;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.291041;STB=0.672375;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.0167627;OID=.;OPOS=54686464;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:36:36:20:20:0.357143:16:4:15:21:16:4:15:21
chr1	54704510	.	A	C	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0314948;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.066;QD=33.4284;RBI=0.0752267;REFB=0;REVB=0.0683164;RO=0;SAF=5;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000880199;OID=.;OPOS=54704510;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:1:5:0:0:1:5:0:0
chr1	54704567	.	A	G	223.14	PASS	AF=1;AO=15;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00981836;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.382;QD=49.5857;RBI=0.0763447;REFB=0;REVB=-0.0757107;RO=0;SAF=10;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000811882;OID=.;OPOS=54704567;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:15:18:1:5:10:0:0:5:13:0:0
chr1	54704629	.	C	T	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000117558;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=221.588;QD=53.2772;RBI=0.0212326;REFB=0;REVB=-0.0212323;RO=0;SAF=7;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.82475e-05;OID=.;OPOS=54704629;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:16:7:0:0:16:7:0:0
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chr1	55119144	.	A	G	107.43	PASS	AF=0.382353;AO=13;DP=33;FAO=13;FDP=34;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=-0.00720059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.961;QD=12.6393;RBI=0.0348525;REFB=-0.0134699;REVB=0.0341006;RO=17;SAF=6;SAR=7;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122807;STB=0.624816;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=0.0186605;OID=.;OPOS=55119144;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:34:17:21:13:13:0.382353:7:6:10:7:7:6:14:7
chr1	55119289	.	G	C	157.84	PASS	AF=0.447368;AO=16;DP=37;FAO=17;FDP=38;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=-0.0271178;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.5426;QD=16.6152;RBI=0.0294771;REFB=-0.0187654;REVB=0.0115552;RO=21;SAF=5;SAR=11;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.345274;STB=0.670534;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.0309101;OID=.;OPOS=55119289;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:38:21:21:16:17:0.447368:11:5:14:7:11:6:14:7
chr1	55119515	.	T	G	199.94	PASS	AF=0.362319;AO=25;DP=69;FAO=25;FDP=69;FR=.;FRO=44;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=27;FSRR=17;FWDB=-0.0228073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.328;QD=11.5908;RBI=0.0256915;REFB=-0.00970124;REVB=0.0118272;RO=44;SAF=10;SAR=15;SRF=27;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.232611;STB=0.63418;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.017724;OID=.;OPOS=55119515;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:44:44:25:25:0.362319:15:10:27:17:15:10:27:17
chr1	55119545	.	GA	G,GG	761.52	PASS	AF=0.0925926,0.907407;AO=17,35;DP=52;FAO=5,49;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=5,24;FSAR=0,25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0768595,0.0861966;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=204.198,219.109;QD=56.4085;RBI=0.0800548,0.090811;REFB=0,0;REVB=0.0223916,0.0285794;RO=0;SAF=14,13;SAR=3,22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.53656e-08,4.39865e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0440955,0.0128207;OID=.,.;OPOS=55119546,55119546;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0925926,0.907407:17,35:52:5,49:54:0:5,24:0,25:0:0:15:0:14,13:3,22:0:0
chr1	55136529	.	T	C	679.89	PASS	AF=0.421348;AO=75;DP=178;FAO=75;FDP=178;FR=.;FRO=103;FSAF=44;FSAR=31;FSRF=58;FSRR=45;FWDB=-0.026791;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.8522;QD=15.2783;RBI=0.0329202;REFB=-0.0119656;REVB=0.0191306;RO=103;SAF=44;SAR=31;SRF=58;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0249932;STB=0.513983;STBP=0.757;TYPE=snp;VARB=0.0131379;OID=.;OPOS=55136529;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:178:178:103:103:75:75:0.421348:31:44:58:45:31:44:58:45
chr1	55139741	.	A	G	947.01	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00612773;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.091;QD=58.2775;RBI=0.0149633;REFB=0;REVB=0.0136511;RO=0;SAF=43;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.72439e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.88818e-05;OID=.;OPOS=55139741;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:65:0:0:64:65:1:21:43:0:0:21:44:0:0
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chr1	55182300	.	T	A	1592.17	PASS	AF=1;AO=106;DP=107;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0223744;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.4025;QD=60.082;RBI=0.0231641;REFB=0;REVB=0.00599702;RO=0;SAF=66;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0001514;OID=.;OPOS=55182300;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:107:106:0:0:106:106:1:40:66:0:0:40:66:0:0
chr1	55224131	.	T	C	199.36	PASS	AF=0.655172;AO=19;DP=29;FAO=19;FDP=29;FR=.;FRO=10;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=-0.00536089;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.0308;QD=27.4982;RBI=0.0661561;REFB=-0.00123295;REVB=-0.0659386;RO=10;SAF=8;SAR=11;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172439;STB=0.595568;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=-0.000777828;OID=.;OPOS=55224131;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:29:29:10:10:19:19:0.655172:11:8:7:3:11:8:7:3
chr1	55224751	.	C	A	110.64	PASS	AF=0.448276;AO=13;DP=29;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=0.0409255;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.1376;QD=15.2604;RBI=0.041114;REFB=0.0225848;REVB=-0.00393169;RO=16;SAF=3;SAR=10;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170437;STB=0.599834;STBP=0.356;TYPE=snp;VARB=-0.0266822;OID=.;OPOS=55224751;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:16:16:13:13:0.448276:10:3:6:10:10:3:6:10
chr1	55251689	.	T	C	769.51	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00498604;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=301.046;QD=57.0007;RBI=0.0297259;REFB=0;REVB=0.0293047;RO=0;SAF=29;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.44926e-05;OID=.;OPOS=55251689;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:25:29:0:0:25:29:0:0
chr1	55277599	.	T	C	805.17	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0723157;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.476;QD=64.4139;RBI=0.139532;REFB=0;REVB=-0.119329;RO=0;SAF=22;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.15703e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00251572;OID=.;OPOS=55277599;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:28:22:0:0:28:22:0:0
chr1	55319902	.	A	G	820.18	PASS	AF=0.983051;AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0216875;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.023;QD=55.6057;RBI=0.027573;REFB=-0.0843471;REVB=0.017027;RO=1;SAF=24;SAR=34;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0136737;STB=0.507244;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.000390707;OID=.;OPOS=55319902;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:59:59:1:1:58:58:0.983051:34:24:0:1:34:24:0:1
chr1	55505587	.	CGG	CGC,CG	137.26	PASS	AF=0.0714286,0.357143;AO=3,23;DP=56;FAO=4,20;FDP=56;FR=.;FRO=32;FSAF=0,2;FSAR=4,18;FSRF=21;FSRR=11;FWDB=-0.0572366,-0.131725;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=202.745,15.5367;QD=9.80407;RBI=0.0961175,0.164901;REFB=-0.00229254,-0.0926142;REVB=-0.0772175,-0.0992006;RO=26;SAF=0,5;SAR=3,18;SRF=18;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0,0.364706;SSSB=-0.653592,-0.459685;STB=0.997922,0.876709;STBP=0.007,0;TYPE=snp,del;VARB=0.0598042,0.0135778;OID=.,.;OPOS=55505589,55505588;OREF=G,G;OALT=C,-;OMAPALT=CGC,CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0.0714286,0.357143:3,23:56:4,20:56:32:0,2:4,18:21:11:99:26:0,5:3,18:18:8
chr1	55523033	.	A	G	1590.71	PASS	AF=0.990741;AO=107;DP=108;FAO=107;FDP=108;FR=.;FRO=1;FSAF=62;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00764318;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.0756;QD=58.9153;RBI=0.0554018;REFB=-0.06271;REVB=-0.054872;RO=0;SAF=62;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.75633e-08;STB=0.503999;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.000322956;OID=.;OPOS=55523033;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:108:108:0:1:107:107:0.990741:45:62:0:0:45:62:1:0
chr1	55524197	.	A	G	1030.06	PASS	AF=0.985915;AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=71;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0155748;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.497;QD=58.0318;RBI=0.0422442;REFB=0.0714026;REVB=-0.0392682;RO=0;SAF=34;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506847;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=-0.000587282;OID=.;OPOS=55524197;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:71:71:0:1:70:70:0.985915:36:34:0:0:36:34:0:1
chr1	55524237	.	G	A	1358.62	PASS	AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00350406;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.459;QD=62.4653;RBI=0.0138254;REFB=0;REVB=0.013374;RO=0;SAF=45;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.519e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.31413e-05;OID=.;OPOS=55524237;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:42:45:0:0:42:45:0:0
chr1	55529187	.	G	A	1651.88	PASS	AF=0.966102;AO=113;DP=118;FAO=114;FDP=118;FR=.;FRO=4;FSAF=56;FSAR=58;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0275321;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=250.313;QD=55.9959;RBI=0.0281047;REFB=-0.0413796;REVB=0.00564466;RO=3;SAF=55;SAR=58;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00883556;STB=0.50877;STBP=0.339;TYPE=snp;VARB=0.000537482;OID=.;OPOS=55529187;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:118:118:3:4:113:114:0.966102:58:55:2:1:58:56:3:1
chr1	55541174	.	A	G	860.03	PASS	AF=0.968254;AO=61;DP=63;FAO=61;FDP=63;FR=.;FRO=2;FSAF=33;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0114449;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.136;QD=54.6053;RBI=0.0192143;REFB=-0.210334;REVB=0.0154339;RO=0;SAF=33;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.501309;STBP=0.877;TYPE=snp;VARB=0.00235438;OID=.;OPOS=55541174;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:63:63:0:2:61:61:0.968254:28:33:0:0:28:33:1:1
chr1	55638075	.	G	A	1482.21	PASS	AF=1;AO=90;DP=92;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.018599;FXX=0.0210504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.875;QD=63.751;RBI=0.051244;REFB=0;REVB=-0.0477496;RO=0;SAF=47;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.16558e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.39083e-05;OID=.;OPOS=55638075;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:92:93:0:0:90:93:1:43:47:0:0:43:50:0:0
chr1	55839117	.	G	T	316.87	PASS	AF=0.421687;AO=35;DP=83;FAO=35;FDP=83;FR=.;FRO=48;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=32;FWDB=-8.43963e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.37;QD=15.271;RBI=0.0180914;REFB=0.0018684;REVB=-0.0180912;RO=47;SAF=22;SAR=13;SRF=16;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.287801;STB=0.667023;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=-0.00305721;OID=.;OPOS=55839117;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:47:48:35:35:0.421687:13:22:16:31:13:22:16:32
chr1	55842312	.	G	C	219.09	PASS	AF=0.358974;AO=27;DP=77;FAO=28;FDP=78;FR=.;FRO=50;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=36;FSRR=14;FWDB=-0.00231449;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=207.939;QD=11.2354;RBI=0.0529728;REFB=0.00369122;REVB=0.0529222;RO=50;SAF=17;SAR=10;SRF=36;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11293;STB=0.57832;STBP=0.33;TYPE=snp;VARB=-0.00765234;OID=.;OPOS=55842312;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:78:50:50:27:28:0.358974:10:17:36:14:11:17:36:14
chr1	55864258	.	C	T	651.21	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0511138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.6762;QD=62.0205;RBI=0.0562224;REFB=0;REVB=-0.0234166;RO=0;SAF=15;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.13648e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000383077;OID=.;OPOS=55864258;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:27:15:0:0:27:15:0:0
chr1	56961756	.	A	G	870.54	PASS	AF=0.983871;AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.028268;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=84.4168;QD=56.1642;RBI=0.05288;REFB=-0.102028;REVB=0.0446902;RO=1;SAF=26;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0178082;STB=0.509431;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=0.00129003;OID=.;OPOS=56961756;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:62:62:1:1:61:61:0.983871:35:26:1:0:35:26:1:0
chr1	57002627	.	C	T	366.8	PASS	AF=0.6;AO=36;DP=60;FAO=36;FDP=60;FR=.;FRO=24;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=-0.00164318;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.601;QD=24.4534;RBI=0.0161989;REFB=-0.010622;REVB=0.0161153;RO=24;SAF=20;SAR=16;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160883;STB=0.588187;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=0.00515063;OID=.;OPOS=57002627;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:24:24:36:36:0.6:16:20:8:16:16:20:8:16
chr1	57180867	.	A	G	167.32	PASS	AF=0.368421;AO=21;DP=57;FAO=21;FDP=57;FR=.;FRO=36;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=0.00267593;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.5;QD=11.7419;RBI=0.00887601;REFB=-0.0181395;REVB=-0.00846304;RO=36;SAF=8;SAR=13;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102039;STB=0.559323;STBP=0.571;TYPE=snp;VARB=0.0265646;OID=.;OPOS=57180867;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:36:36:21:21:0.368421:13:8:17:19:13:8:17:19
chr1	57209695	.	T	C	257.96	PASS	AF=0.5;AO=28;DP=56;FAO=28;FDP=56;FR=.;FRO=28;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=0.0175692;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.9835;QD=18.4256;RBI=0.0344405;REFB=0.0208797;REVB=-0.0296222;RO=28;SAF=19;SAR=9;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.261313;STB=0.64649;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=-0.0167784;OID=.;OPOS=57209695;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:28:28:28:28:0.5:9:19:11:17:9:19:11:17
chr1	57221558	.	A	G	377.97	PASS	AF=0.642857;AO=35;DP=56;FAO=36;FDP=56;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=24;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=-0.0232003;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.727;QD=26.9978;RBI=0.0348023;REFB=-0.00018198;REVB=-0.0259413;RO=19;SAF=11;SAR=24;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.215541;STB=0.617217;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=2.36405e-06;OID=.;OPOS=57221558;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:19:20:35:36:0.642857:24:11:12:7:24:12:13:7
chr1	57422484	.	C	T	1283.44	PASS	AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00408573;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.037;QD=61.8524;RBI=0.0143877;REFB=0;REVB=0.0137954;RO=0;SAF=41;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.50454e-05;OID=.;OPOS=57422484;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:42:41:0:0:42:41:0:0
chr1	59004606	.	C	T	83.07	PASS	AF=0.314286;AO=11;DP=35;FAO=11;FDP=35;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=-0.0339467;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.9312;QD=9.49419;RBI=0.0365803;REFB=-0.000867047;REVB=0.0136288;RO=24;SAF=10;SAR=1;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.64008;STB=0.89309;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.000474657;OID=.;OPOS=59004606;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:35:35:24:24:11:11:0.314286:1:10:9:15:1:10:9:15
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chr1	59147926	.	T	C	1249.93	PASS	AF=0.987952;AO=82;DP=83;FAO=82;FDP=83;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0123685;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.7887;QD=60.2374;RBI=0.0917148;REFB=-0.0752436;REVB=0.090877;RO=0;SAF=46;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.14462e-08;STB=0.506848;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=0.000933244;OID=.;OPOS=59147926;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:83:83:0:1:82:82:0.987952:36:46:0:0:36:46:0:1
chr1	59248813	.	G	C	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.4927;QD=45.806;RBI=0.0247281;REFB=0;REVB=-0.0222159;RO=0;SAF=7;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000206056;OID=.;OPOS=59248813;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:7:7:0:0:7:7:0:0
chr1	59249031	.	T	G	3203.66	PASS	AF=1;AO=205;DP=205;FAO=207;FDP=207;FR=.;FRO=0;FSAF=120;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0287264;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.449;QD=61.9065;RBI=0.0527819;REFB=0;REVB=0.04428;RO=0;SAF=120;SAR=85;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.15097e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.32961e-05;OID=.;OPOS=59249031;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:18:205:207:0:0:205:207:1:85:120:0:0:87:120:0:0
chr1	59249347	.	G	C	3976.16	PASS	AF=1;AO=248;DP=249;FAO=248;FDP=248;FR=.;FRO=0;FSAF=116;FSAR=132;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0193033;FXX=0.0040159;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.712;QD=64.1316;RBI=0.0193133;REFB=0;REVB=-0.000621831;RO=0;SAF=116;SAR=132;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.98682e-06;OID=.;OPOS=59249347;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:21:249:248:0:0:248:248:1:132:116:0:0:132:116:0:0
chr1	59364918	.	G	A	172.53	PASS	AF=0.381818;AO=21;DP=55;FAO=21;FDP=55;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=0.0160529;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.698;QD=12.5476;RBI=0.0350278;REFB=-0.0294623;REVB=0.0311328;RO=34;SAF=10;SAR=11;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0568249;STB=0.532841;STBP=0.702;TYPE=snp;VARB=0.0295334;OID=.;OPOS=59364918;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:34:34:21:21:0.381818:11:10:18:16:11:10:18:16
chr1	59787350	.	T	G	285.75	PASS	AF=0.484375;AO=31;DP=65;FAO=31;FDP=64;FR=.;FRO=33;FSAF=22;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=0.00169766;FXX=0.0153822;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.218;QD=17.8595;RBI=0.0362031;REFB=-0.0047912;REVB=-0.0361633;RO=33;SAF=22;SAR=9;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196229;STB=0.610358;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=0.0046489;OID=.;OPOS=59787350;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:64:33:33:31:31:0.484375:9:22:17:16:9:22:17:16
chr1	59844471	.	G	A	1509.71	PASS	AF=1;AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130058;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.635;QD=63.5668;RBI=0.0130145;REFB=0;REVB=0.000477913;RO=0;SAF=39;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.64587e-05;OID=.;OPOS=59844471;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:95:0:0:95:95:1:56:39:0:0:56:39:0:0
chr1	60132965	.	G	A	319.36	PASS	AF=0.378947;AO=36;DP=95;FAO=36;FDP=95;FR=.;FRO=59;FSAF=23;FSAR=13;FSRF=35;FSRR=24;FWDB=-0.00838789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.838;QD=13.4469;RBI=0.00838887;REFB=-0.0180783;REVB=0.000128211;RO=57;SAF=23;SAR=13;SRF=35;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0286688;STB=0.530201;STBP=0.688;TYPE=snp;VARB=0.0230859;OID=.;OPOS=60132965;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:57:59:36:36:0.378947:13:23:35:22:13:23:35:24
chr1	60466814	.	T	C	609.52	PASS	AF=0.953488;AO=41;DP=43;FAO=41;FDP=43;FR=.;FRO=2;FSAF=10;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.102789;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.6694;QD=56.6994;RBI=0.10339;REFB=0.00304268;REVB=-0.0111336;RO=0;SAF=10;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.09277e-08;STB=0.515617;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=-0.00191674;OID=.;OPOS=60466814;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:43:43:0:2:41:41:0.953488:31:10:0:0:31:10:0:2
chr1	62232031	.	C	T	1545.2	PASS	AF=1;AO=102;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0340345;FXX=0.0190458;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.035;QD=60.0078;RBI=0.0374315;REFB=0;REVB=0.015581;RO=0;SAF=43;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.37889e-05;OID=.;OPOS=62232031;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:103:103:0:0:102:103:1:59:43:0:0:60:43:0:0
chr1	62261168	.	A	G	659.32	PASS	AF=0.421965;AO=73;DP=174;FAO=73;FDP=173;FR=.;FRO=100;FSAF=32;FSAR=41;FSRF=48;FSRR=52;FWDB=0.0403001;FXX=0.0057468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.1707;QD=15.2443;RBI=0.0417958;REFB=0.00222512;REVB=0.0110811;RO=100;SAF=32;SAR=41;SRF=48;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0434118;STB=0.52429;STBP=0.602;TYPE=snp;VARB=-0.00328462;OID=.;OPOS=62261168;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:174:173:100:100:73:73:0.421965:41:32:48:52:41:32:48:52
chr1	62318192	.	G	A	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0600059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.2083;QD=50.4129;RBI=0.0613503;REFB=0;REVB=-0.0127732;RO=0;SAF=13;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.851e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00164438;OID=.;OPOS=62318192;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:6:13:0:0:6:13:0:0
chr1	62318218	.	TCAG	T	103.78	PASS	AF=0.545455;AO=12;DP=22;FAO=12;FDP=22;FR=.;FRO=10;FSAF=11;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.0300825;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=186.227;QD=18.8682;RBI=0.0378302;REFB=-0.00455465;REVB=-0.0229382;RO=8;SAF=11;SAR=1;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.553187;STB=0.836256;STBP=0.006;TYPE=del;VARB=0.00360993;OID=.;OPOS=62318219;OREF=CAG;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.545455:12:22:12:22:10:11:1:4:6:75:8:11:1:3:5
chr1	62330080	.	T	G	708.56	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0365059;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=237.233;QD=62.9828;RBI=0.043919;REFB=0;REVB=0.0244171;RO=0;SAF=22;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000141766;OID=.;OPOS=62330080;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:23:22:0:0:23:22:0:0
chr1	62380270	.	C	T	429.02	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0694177;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.761;QD=57.2025;RBI=0.0703189;REFB=0;REVB=0.0112216;RO=0;SAF=3;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.84607e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000351184;OID=.;OPOS=62380270;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:27:3:0:0:27:3:0:0
chr1	62380298	.	G	A	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.017108;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=311.212;QD=51.1839;RBI=0.0171094;REFB=0;REVB=-0.000212739;RO=0;SAF=2;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.19193e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.26677e-05;OID=.;OPOS=62380298;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:18:2:0:0:18:2:0:0
chr1	62516683	.	G	C	400.26	PASS	AF=0.476744;AO=41;DP=86;FAO=41;FDP=86;FR=.;FRO=45;FSAF=16;FSAR=25;FSRF=20;FSRR=25;FWDB=0.000612143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.659;QD=18.6167;RBI=0.0274685;REFB=-0.0078593;REVB=0.0274617;RO=45;SAF=16;SAR=25;SRF=20;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0527005;STB=0.529397;STBP=0.621;TYPE=snp;VARB=0.0115705;OID=.;OPOS=62516683;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:45:45:41:41:0.476744:25:16:20:25:25:16:20:25
chr1	62538372	.	A	G	154.96	PASS	AF=0.592593;AO=16;DP=27;FAO=16;FDP=27;FR=.;FRO=11;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=0.0297402;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.601;QD=22.9575;RBI=0.0315495;REFB=-0.0199531;REVB=0.0105305;RO=11;SAF=9;SAR=7;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0548302;STB=0.530768;STBP=0.717;TYPE=snp;VARB=0.0115266;OID=.;OPOS=62538372;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:27:27:11:11:16:16:0.592593:7:9:7:4:7:9:7:4
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chr1	62579823	.	G	A	1511.49	PASS	AF=1;AO=97;DP=97;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108331;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.4299;QD=59.8611;RBI=0.0912126;REFB=0;REVB=0.090567;RO=0;SAF=54;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.50386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000701542;OID=.;OPOS=62579823;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:97:101:0:0:97:101:1:43:54:0:0:46:55:0:0
chr1	62579907	.	C	T	489.64	PASS	AF=0.582278;AO=46;DP=78;FAO=46;FDP=79;FR=.;FRO=33;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=-0.00174905;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.904;QD=24.7919;RBI=0.0117506;REFB=-0.023936;REVB=0.0116197;RO=32;SAF=21;SAR=25;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00922716;STB=0.500832;STBP=0.998;TYPE=snp;VARB=0.012643;OID=.;OPOS=62579907;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:79:32:33:46:46:0.582278:25:21:15:17:25:21:15:18
chr1	62594593	.	C	T	239.1	PASS	AF=0.457627;AO=27;DP=59;FAO=27;FDP=59;FR=.;FRO=32;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=0.0139806;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.8764;QD=16.2099;RBI=0.0148495;REFB=0.00842012;REVB=-0.00500519;RO=32;SAF=16;SAR=11;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00115183;STB=0.50065;STBP=0.99;TYPE=snp;VARB=-0.00924456;OID=.;OPOS=62594593;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:32:32:27:27:0.457627:11:16:19:13:11:16:19:13
chr1	62603421	.	C	T	781.69	PASS	AF=0.510204;AO=75;DP=147;FAO=75;FDP=147;FR=.;FRO=72;FSAF=40;FSAR=35;FSRF=32;FSRR=40;FWDB=0.0117914;FXX=0.0067563;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.254;QD=21.2704;RBI=0.0123707;REFB=0.00671826;REVB=-0.00374143;RO=72;SAF=40;SAR=35;SRF=32;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0790659;STB=0.543467;STBP=0.321;TYPE=snp;VARB=-0.0077581;OID=.;OPOS=62603421;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:147:147:72:72:75:75:0.510204:35:40:32:40:35:40:32:40
chr1	62603544	.	C	T	234.41	PASS	AF=0.469388;AO=23;DP=49;FAO=23;FDP=49;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=0.0896222;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.1327;QD=19.1359;RBI=0.0908602;REFB=0.0114321;REVB=-0.0149477;RO=26;SAF=13;SAR=10;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0111896;STB=0.506324;STBP=0.945;TYPE=snp;VARB=-0.00425518;OID=.;OPOS=62603544;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:26:26:23:23:0.469388:10:13:15:11:10:13:15:11
chr1	62644118	.	A	G	782.86	PASS	AF=1;AO=48;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0198161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.3325;QD=63.9073;RBI=0.0200107;REFB=0;REVB=0.00278376;RO=0;SAF=23;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.31501e-05;OID=.;OPOS=62644118;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:48:49:1:25:23:0:0:25:24:0:0
chr1	62672546	.	G	A	82.05	PASS	AF=0.9;AO=9;DP=10;FAO=9;FDP=10;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00763842;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=273.168;QD=32.8213;RBI=0.00889944;REFB=-0.0991441;REVB=0.00456668;RO=1;SAF=4;SAR=5;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0984833;STB=0.555432;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.000777684;OID=.;OPOS=62672546;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:10:10:1:1:9:9:0.9:5:4:1:0:5:4:1:0
chr1	62673037	.	T	C	142.62	PASS	AF=0.4;AO=16;DP=40;FAO=16;FDP=40;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.0146181;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.793;QD=14.262;RBI=0.0204285;REFB=-0.00945128;REVB=-0.0142701;RO=24;SAF=8;SAR=8;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0861018;STB=0.549938;STBP=0.621;TYPE=snp;VARB=0.0171285;OID=.;OPOS=62673037;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:24:24:16:16:0.4:8:8:10:14:8:8:10:14
chr1	62673225	.	G	A	300.47	PASS	AF=0.507937;AO=32;DP=63;FAO=32;FDP=63;FR=.;FRO=31;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=-0.0261861;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.9736;QD=19.0777;RBI=0.0278049;REFB=0.021059;REVB=-0.00934906;RO=31;SAF=18;SAR=14;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0163169;STB=0.509085;STBP=0.904;TYPE=snp;VARB=-0.02555;OID=.;OPOS=62673225;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:31:31:32:32:0.507937:14:18:18:13:14:18:18:13
chr1	62675619	.	C	T	535.1	PASS	AF=0.396226;AO=62;DP=159;FAO=63;FDP=159;FR=.;FRO=96;FSAF=35;FSAR=28;FSRF=39;FSRR=57;FWDB=0.0050084;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.5804;QD=13.4616;RBI=0.029308;REFB=-0.0130913;REVB=-0.0288769;RO=95;SAF=35;SAR=27;SRF=37;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186133;STB=0.589431;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.0225996;OID=.;OPOS=62675619;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:159:159:95:96:62:63:0.396226:27:35:37:58:28:35:39:57
chr1	62675892	.	A	G	98.55	PASS	AF=0.428571;AO=12;DP=28;FAO=12;FDP=28;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.0491942;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.4462;QD=14.0791;RBI=0.0587762;REFB=0.00260871;REVB=-0.0321648;RO=16;SAF=4;SAR=8;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0448575;STB=0.526271;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=-0.00590856;OID=.;OPOS=62675892;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:28:28:16:16:12:12:0.428571:8:4:6:10:8:4:6:10
chr1	62713224	.	C	G	2494.36	PASS	AF=0.993902;AO=163;DP=164;FAO=163;FDP=164;FR=.;FRO=1;FSAF=75;FSAR=88;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00307448;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.752;QD=60.838;RBI=0.0034989;REFB=-0.0483448;REVB=-0.0016703;RO=1;SAF=75;SAR=88;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00630254;STB=0.503311;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.000325323;OID=.;OPOS=62713224;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:164:164:1:1:163:163:0.993902:88:75:1:0:88:75:1:0
chr1	62728784	.	A	G	366.05	PASS	AF=0.428571;AO=39;DP=91;FAO=39;FDP=91;FR=.;FRO=52;FSAF=26;FSAR=13;FSRF=28;FSRR=24;FWDB=-0.00763687;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.9407;QD=16.0902;RBI=0.0653702;REFB=-0.010877;REVB=-0.0649225;RO=52;SAF=26;SAR=13;SRF=28;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138208;STB=0.578084;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=0.012057;OID=.;OPOS=62728784;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:52:52:39:39:0.428571:13:26:28:24:13:26:28:24
chr1	62728838	.	T	C	409.51	PASS	AF=0.387097;AO=48;DP=124;FAO=48;FDP=124;FR=.;FRO=76;FSAF=29;FSAR=19;FSRF=41;FSRR=35;FWDB=0.00262822;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.3657;QD=13.2099;RBI=0.0123999;REFB=-0.0205876;REVB=-0.0121182;RO=75;SAF=29;SAR=19;SRF=41;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0636257;STB=0.540729;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.0371767;OID=.;OPOS=62728838;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:124:124:75:76:48:48:0.387097:19:29:41:34:19:29:41:35
chr1	62728861	.	T	C	349.6	PASS	AF=0.346457;AO=43;DP=122;FAO=44;FDP=127;FR=.;FRO=83;FSAF=27;FSAR=17;FSRF=43;FSRR=40;FWDB=-0.010709;FXX=0.00781189;HRUN=3;LEN=1;MLLD=102.843;QD=11.0109;RBI=0.0536389;REFB=-0.00188242;REVB=-0.052559;RO=79;SAF=26;SAR=17;SRF=41;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0985374;STB=0.563913;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.00426633;OID=.;OPOS=62728861;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:122:127:79:83:43:44:0.346457:17:26:41:38:17:27:43:40
chr1	62728918	.	G	A	377.12	PASS	AF=0.351145;AO=46;DP=130;FAO=46;FDP=131;FR=.;FRO=85;FSAF=28;FSAR=18;FSRF=41;FSRR=44;FWDB=-0.000334129;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=147.765;QD=11.515;RBI=0.0137821;REFB=-0.00882823;REVB=0.013778;RO=84;SAF=28;SAR=18;SRF=40;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150759;STB=0.582905;STBP=0.182;TYPE=snp;VARB=0.0164432;OID=.;OPOS=62728918;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:130:131:84:85:46:46:0.351145:18:28:40:44:18:28:41:44
chr1	62732421	.	T	C	130.65	PASS	AF=0.394737;AO=15;DP=38;FAO=15;FDP=38;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=0.0350396;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.51;QD=13.7521;RBI=0.0383094;REFB=-0.012227;REVB=0.0154865;RO=23;SAF=5;SAR=10;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.285453;STB=0.666444;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=0.0119581;OID=.;OPOS=62732421;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:23:23:15:15:0.394737:10:5:14:9:10:5:14:9
chr1	62738904	.	T	C	453.07	PASS	AF=0.414634;AO=51;DP=123;FAO=51;FDP=123;FR=.;FRO=72;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=30;FSRR=42;FWDB=-0.015643;FXX=0.00806387;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.797;QD=14.7341;RBI=0.0211612;REFB=-0.0290738;REVB=0.014251;RO=72;SAF=25;SAR=26;SRF=30;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0767148;STB=0.543114;STBP=0.436;TYPE=snp;VARB=0.0411765;OID=.;OPOS=62738904;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:123:123:72:72:51:51:0.414634:26:25:30:42:26:25:30:42
chr1	62740446	.	T	C	218.58	PASS	AF=0.446429;AO=25;DP=60;FAO=25;FDP=56;FR=.;FRO=31;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=-0.0282223;FXX=0.0666556;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.1541;QD=15.6125;RBI=0.029734;REFB=-0.0043388;REVB=0.00936028;RO=30;SAF=11;SAR=14;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0901225;STB=0.559952;STBP=0.451;TYPE=snp;VARB=0.00771663;OID=.;OPOS=62740446;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:56:30:31:25:25:0.446429:14:11:16:14:14:11:17:14
chr1	62740449	.	T	C	236.57	PASS	AF=0.45;AO=27;DP=60;FAO=27;FDP=60;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=-0.0282424;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.236;QD=15.7716;RBI=0.0296554;REFB=-0.0360516;REVB=0.00904496;RO=33;SAF=11;SAR=16;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135051;STB=0.576341;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.0274417;OID=.;OPOS=62740449;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:33:33:27:27:0.45:16:11:18:15:16:11:18:15
chr1	63881552	.	C	T	465.14	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00622361;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.804;QD=58.1421;RBI=0.0260591;REFB=0;REVB=0.025305;RO=0;SAF=16;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.4313e-05;OID=.;OPOS=63881552;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:16:16:0:0:16:16:0:0
chr1	63991267	.	T	C	1066.16	PASS	AF=0.986301;AO=71;DP=72;FAO=72;FDP=73;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00404726;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.167;QD=58.4197;RBI=0.0293029;REFB=-0.0232598;REVB=0.0290221;RO=1;SAF=40;SAR=31;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0150093;STB=0.507934;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.000276725;OID=.;OPOS=63991267;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:72:73:1:1:71:72:0.986301:31:40:0:1:31:41:0:1
chr1	64015217	.	G	A	727.75	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0183893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.0075;QD=63.2822;RBI=0.0216574;REFB=0;REVB=-0.0114403;RO=0;SAF=24;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000273652;OID=.;OPOS=64015217;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:22:24:0:0:22:24:0:0
chr1	64097432	.	C	T	236.6	PASS	AF=0.45;AO=27;DP=60;FAO=27;FDP=60;FR=.;FRO=33;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=0.0232377;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.678;QD=15.773;RBI=0.0235003;REFB=-0.00190895;REVB=-0.00350332;RO=33;SAF=17;SAR=10;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.085427;STB=0.548351;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.00274079;OID=.;OPOS=64097432;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:33:33:27:27:0.45:10:17:18:15:10:17:18:15
chr1	64114301	.	T	C	191.62	PASS	AF=0.408163;AO=20;DP=49;FAO=20;FDP=49;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=21;FSRR=8;FWDB=-0.0325294;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.9914;QD=15.6428;RBI=0.0400939;REFB=-0.00170739;REVB=-0.0234384;RO=29;SAF=12;SAR=8;SRF=21;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13815;STB=0.578873;STBP=0.398;TYPE=snp;VARB=0.00362363;OID=.;OPOS=64114301;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:29:29:20:20:0.408163:8:12:21:8:8:12:21:8
chr1	64121441	.	G	A	84.79	PASS	AF=0.354839;AO=11;DP=31;FAO=11;FDP=31;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=-0.0251777;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.212;QD=10.9409;RBI=0.0387578;REFB=-0.00354105;REVB=0.0294661;RO=20;SAF=7;SAR=4;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159505;STB=0.509537;STBP=0.975;TYPE=snp;VARB=0.00693204;OID=.;OPOS=64121441;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:31:31:20:20:11:11:0.354839:4:7:13:7:4:7:13:7
chr1	64121569	.	A	C	184.83	PASS	AF=0.475;AO=19;DP=40;FAO=19;FDP=40;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.0219921;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.763;QD=18.4833;RBI=0.0234393;REFB=-0.010297;REVB=-0.00810843;RO=21;SAF=6;SAR=13;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159169;STB=0.59081;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.0152331;OID=.;OPOS=64121569;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:21:21:19:19:0.475:13:6:10:11:13:6:10:11
chr1	64121684	.	G	A	55.41	PASS	AF=0.363636;AO=8;DP=22;FAO=8;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=-0.0123053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.324;QD=10.0751;RBI=0.02776;REFB=-0.00516801;REVB=0.0248837;RO=14;SAF=3;SAR=5;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.274631;STB=0.666263;STBP=0.277;TYPE=snp;VARB=0.0131777;OID=.;OPOS=64121684;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:22:22:14:14:8:8:0.363636:5:3:9:5:5:3:9:5
chr1	64515379	.	C	T	464.46	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0416809;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.0375;QD=58.0579;RBI=0.0861375;REFB=0;REVB=0.0753815;RO=0;SAF=20;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00125422;OID=.;OPOS=64515379;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:32:0:0:31:32:1:11:20:0:0:11:21:0:0
chr1	64608329	.	G	T	463.56	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0398871;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.778;QD=57.9443;RBI=0.0415051;REFB=0;REVB=0.0114758;RO=0;SAF=12;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.47712e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00016507;OID=.;OPOS=64608329;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:32:0:0:31:32:1:19:12:0:0:19:13:0:0
chr1	65016349	.	A	T	642.18	PASS	AF=0.976744;AO=42;DP=44;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.036269;FXX=0.0227221;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.7821;QD=59.7374;RBI=0.0402035;REFB=-0.0213927;REVB=0.017346;RO=2;SAF=15;SAR=27;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0132029;STB=0.516121;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=0.00176555;OID=.;OPOS=65016349;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:44:43:2:1:42:42:0.976744:27:15:1:1:27:15:1:0
chr1	65113568	.	T	C	2310.44	PASS	AF=1;AO=144;DP=145;FAO=144;FDP=144;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.017455;FXX=0.0335548;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.3337;QD=64.1788;RBI=0.0286352;REFB=0;REVB=0.0227002;RO=0;SAF=67;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000692516;OID=.;OPOS=65113568;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:145:144:0:0:144:144:1:77:67:0:0:77:67:0:0
chr1	65158724	.	C	T	754.43	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000640905;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.69;QD=56.9383;RBI=0.00657376;REFB=0;REVB=-0.00654244;RO=0;SAF=28;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.31068e-05;OID=.;OPOS=65158724;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:25:28:0:0:25:28:0:0
chr1	65311262	.	G	A	1572.99	PASS	AF=1;AO=105;DP=105;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0310337;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.978;QD=59.9234;RBI=0.034763;REFB=0;REVB=0.0156645;RO=0;SAF=46;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.64392e-05;OID=.;OPOS=65311262;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:105:105:0:0:105:105:1:59:46:0:0:59:46:0:0
chr1	65523519	.	A	G	120.84	PASS	AF=0.424242;AO=14;DP=33;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.00723226;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.7607;QD=14.6466;RBI=0.0141776;REFB=-0.00978886;REVB=0.0121942;RO=19;SAF=6;SAR=8;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00761006;STB=0.504418;STBP=0.99;TYPE=snp;VARB=0.03395;OID=.;OPOS=65523519;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:19:19:14:14:0.424242:8:6:8:11:8:6:8:11
chr1	65591719	.	GC	G	95.55	PASS	AF=0.571429;AO=12;DP=21;FAO=12;FDP=21;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.00714536;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=25.1385;QD=18.1994;RBI=0.120681;REFB=0.0643357;REVB=-0.120469;RO=9;SAF=5;SAR=7;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0.374101;SSSB=-0.104918;STB=0.559899;STBP=0.589;TYPE=del;VARB=-0.0629606;OID=.;OPOS=65591720;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.571429:12:21:12:21:9:5:7:5:4:60:9:5:7:5:4
chr1	65614154	.	T	A	210.66	PASS	AF=0.477273;AO=21;DP=44;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.0593043;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.373;QD=19.1511;RBI=0.064877;REFB=-0.0105004;REVB=0.0263064;RO=23;SAF=8;SAR=13;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171704;STB=0.597281;STBP=0.249;TYPE=snp;VARB=0.00826774;OID=.;OPOS=65614154;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:23:23:21:21:0.477273:13:8:13:10:13:8:13:10
chr1	65690461	.	G	A	1543.05	PASS	AF=1;AO=94;DP=97;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0129795;FXX=0.0202;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.965;QD=63.631;RBI=0.0130209;REFB=0;REVB=-0.00103745;RO=0;SAF=57;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.95516e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.6364e-05;OID=.;OPOS=65690461;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:97:97:0:0:94:97:1:37:57:0:0:38:59:0:0
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chr1	65858145	.	G	A	197.74	PASS	AF=0.387097;AO=23;DP=62;FAO=24;FDP=62;FR=.;FRO=38;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=24;FSRR=14;FWDB=0.0125582;FXX=0.0158705;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.5932;QD=12.7575;RBI=0.0153665;REFB=-0.0175043;REVB=0.00885562;RO=38;SAF=11;SAR=12;SRF=24;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164888;STB=0.58058;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.0407727;OID=.;OPOS=65858145;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:38:38:23:24:0.387097:12:11:24:14:12:12:24:14
chr1	65858151	.	C	T	415.09	PASS	AF=0.597015;AO=40;DP=67;FAO=40;FDP=67;FR=.;FRO=27;FSAF=26;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=-0.0125186;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.501;QD=24.7813;RBI=0.0165716;REFB=0.0142628;REVB=-0.0108583;RO=27;SAF=26;SAR=14;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102444;STB=0.556231;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=-0.00925212;OID=.;OPOS=65858151;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:27:27:40:40:0.597015:14:26:14:13:14:26:14:13
chr1	65860660	.	T	C	523.26	PASS	AF=0.556818;AO=48;DP=88;FAO=49;FDP=88;FR=.;FRO=39;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=-0.00215139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.443;QD=23.7843;RBI=0.00477849;REFB=0.00200503;REVB=-0.00426679;RO=38;SAF=20;SAR=28;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0467594;STB=0.514845;STBP=0.777;TYPE=snp;VARB=-0.00164822;OID=.;OPOS=65860660;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:38:39:48:49:0.556818:28:20:18:20:28:21:18:21
chr1	65860687	.	A	C	1175.47	PASS	AF=0.987342;AO=78;DP=79;FAO=78;FDP=79;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00940161;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.1941;QD=59.5173;RBI=0.0157685;REFB=0.0116267;REVB=0.0126592;RO=1;SAF=35;SAR=43;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133317;STB=0.50704;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=-0.00103816;OID=.;OPOS=65860687;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:79:79:1:1:78:78:0.987342:43:35:1:0:43:35:1:0
chr1	65867519	.	G	A	491.36	PASS	AF=0.510638;AO=47;DP=94;FAO=48;FDP=94;FR=.;FRO=46;FSAF=19;FSAR=29;FSRF=10;FSRR=36;FWDB=0.0169758;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.699;QD=20.909;RBI=0.0252346;REFB=-0.02163;REVB=-0.0186709;RO=45;SAF=19;SAR=28;SRF=9;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196857;STB=0.594857;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=0.0148056;OID=.;OPOS=65867519;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:45:46:47:48:0.510638:28:19:9:36:29:19:10:36
chr1	65879252	.	A	G	465.01	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0710231;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.326;QD=58.1262;RBI=0.0946848;REFB=0;REVB=0.0626174;RO=0;SAF=7;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00269145;OID=.;OPOS=65879252;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:25:7:0:0:25:7:0:0
chr1	65886398	.	T	C	1659.22	PASS	AF=1;AO=110;DP=110;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0477181;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.362;QD=60.3353;RBI=0.0537277;REFB=0;REVB=0.0246909;RO=0;SAF=49;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.5544e-05;OID=.;OPOS=65886398;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:110:110:0:0:110:110:1:61:49:0:0:61:49:0:0
chr1	65886448	.	T	C	2863.45	PASS	AF=0.994565;AO=182;DP=183;FAO=183;FDP=184;FR=.;FRO=1;FSAF=76;FSAR=107;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00382411;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.8543;QD=62.249;RBI=0.0613176;REFB=-0.0740037;REVB=-0.0611983;RO=0;SAF=76;SAR=106;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.24841e-08;STB=0.502325;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=0.00230039;OID=.;OPOS=65886448;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:183:184:0:1:182:183:0.994565:106:76:0:0:107:76:0:1
chr1	66036441	.	A	G	123.99	PASS	AF=0.482759;AO=14;DP=29;FAO=14;FDP=29;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=-0.0206871;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=77.6338;QD=17.1022;RBI=0.0224319;REFB=-0.0170897;REVB=-0.00867369;RO=13;SAF=7;SAR=7;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.228752;STB=0.586087;STBP=0.366;TYPE=snp;VARB=0.017083;OID=.;OPOS=66036441;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:13:15:14:14:0.482759:7:7:10:3:7:7:10:5
chr1	66058513	.	A	G	754.43	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0171701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.142;QD=56.9383;RBI=0.0263539;REFB=0;REVB=-0.0199929;RO=0;SAF=20;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.88914e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.23453e-06;OID=.;OPOS=66058513;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:33:20:0:0:33:20:0:0
chr1	66102257	.	G	A	501.63	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100495;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.999;QD=59.0157;RBI=0.0486236;REFB=0;REVB=-0.0475737;RO=0;SAF=17;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000156065;OID=.;OPOS=66102257;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:17:17:0:0:17:17:0:0
chr1	67185083	.	A	C	480.93	PASS	AF=0.479592;AO=46;DP=98;FAO=47;FDP=98;FR=.;FRO=51;FSAF=19;FSAR=28;FSRF=23;FSRR=28;FWDB=0.098314;FXX=0.019998;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.7563;QD=19.6298;RBI=0.108036;REFB=0.0186425;REVB=0.0447898;RO=52;SAF=19;SAR=27;SRF=24;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0471513;STB=0.524989;STBP=0.648;TYPE=snp;VARB=-0.0173012;OID=.;OPOS=67185083;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:52:51:46:47:0.479592:27:19:24:28:28:19:23:28
chr1	67236097	.	A	T	220.55	PASS	AF=0.419355;AO=26;DP=62;FAO=26;FDP=62;FR=.;FRO=36;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=-0.00655322;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.018;QD=14.2289;RBI=0.00662323;REFB=-0.000652816;REVB=0.000960437;RO=36;SAF=15;SAR=11;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0791394;STB=0.545078;STBP=0.578;TYPE=snp;VARB=0.00180059;OID=.;OPOS=67236097;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:36:36:26:26:0.419355:11:15:18:18:11:15:18:18
chr1	67242087	.	G	A	322.88	PASS	AF=0.507463;AO=34;DP=67;FAO=34;FDP=67;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=24;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=-0.0213699;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.526;QD=19.2767;RBI=0.0217538;REFB=-0.00462105;REVB=-0.0040685;RO=32;SAF=10;SAR=24;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.248583;STB=0.632687;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.0054713;OID=.;OPOS=67242087;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:32:33:34:34:0.507463:24:10:18:14:24:10:18:15
chr1	67266756	.	T	A	962.0	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0122952;FXX=0.0298463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.864;QD=59.2002;RBI=0.0141707;REFB=0;REVB=-0.00704526;RO=0;SAF=39;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.10038e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.96705e-05;OID=.;OPOS=67266756;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:26:39:0:0:26:39:0:0
chr1	67288045	.	C	T	251.71	PASS	AF=0.474576;AO=28;DP=59;FAO=28;FDP=59;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=10;FWDB=-0.00860224;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=247.709;QD=17.0649;RBI=0.00950379;REFB=0.00144397;REVB=-0.00404023;RO=29;SAF=12;SAR=16;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.203557;STB=0.628482;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=-0.0019123;OID=.;OPOS=67288045;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:29:31:28:28:0.474576:16:12:19:10:16:12:21:10
chr1	67313249	.	G	A	848.14	PASS	AF=1;AO=58;DP=60;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0136752;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.096;QD=57.5011;RBI=0.0152659;REFB=0;REVB=-0.00678512;RO=0;SAF=19;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.47594e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000466134;OID=.;OPOS=67313249;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:59:0:0:58:59:1:39:19:0:0:39:20:0:0
chr1	67390416	.	G	C	1434.38	PASS	AF=1;AO=91;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0158508;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.31;QD=63.0495;RBI=0.0160266;REFB=0;REVB=-0.0023673;RO=0;SAF=47;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.04952e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.86224e-06;OID=.;OPOS=67390416;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:91:91:0:0:91:91:1:44:47:0:0:44:47:0:0
chr1	67390468	.	C	G	1324.96	PASS	AF=0.988506;AO=86;DP=87;FAO=86;FDP=87;FR=.;FRO=1;FSAF=49;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00320981;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=281.887;QD=60.9179;RBI=0.00330815;REFB=-0.0116282;REVB=0.000800609;RO=1;SAF=49;SAR=37;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00957159;STB=0.505049;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=6.16527e-06;OID=.;OPOS=67390468;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:87:87:1:1:86:86:0.988506:37:49:1:0:37:49:1:0
chr1	67558739	.	C	T	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0555813;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.7842;QD=51.9153;RBI=0.0571805;REFB=0;REVB=-0.0134285;RO=0;SAF=14;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00145401;OID=.;OPOS=67558739;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:7:14:0:0:7:14:0:0
chr1	67560956	.	C	T	2274.23	PASS	AF=1;AO=141;DP=141;FAO=143;FDP=143;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0384139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.832;QD=63.6147;RBI=0.0396479;REFB=0;REVB=-0.00981478;RO=0;SAF=68;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.2436e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.22633e-05;OID=.;OPOS=67560956;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:141:143:0:0:141:143:1:73:68:0:0:73:70:0:0
chr1	67568351	.	C	T	670.27	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148864;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.698;QD=62.3505;RBI=0.0193487;REFB=0;REVB=-0.0123599;RO=0;SAF=27;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.23661e-05;OID=.;OPOS=67568351;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:16:27:0:0:16:27:0:0
chr1	67579386	.	A	G	343.95	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.030442;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.2532;QD=52.9158;RBI=0.0595157;REFB=0;REVB=0.051141;RO=0;SAF=11;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00435334;OID=.;OPOS=67579386;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:26:0:0:25:26:1:14:11:0:0:14:12:0:0
chr1	67581127	.	T	C	133.45	PASS	AF=0.441176;AO=15;DP=34;FAO=15;FDP=34;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.000360284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.677;QD=15.7005;RBI=0.0220765;REFB=-0.0243131;REVB=0.0220735;RO=19;SAF=7;SAR=8;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0445112;STB=0.525658;STBP=0.817;TYPE=snp;VARB=0.0262832;OID=.;OPOS=67581127;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:19:19:15:15:0.441176:8:7:8:11:8:7:8:11
chr1	67633812	.	G	T	183.9	PASS	AF=0.463415;AO=19;DP=41;FAO=19;FDP=41;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=0.00832853;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.092;QD=17.9415;RBI=0.0110652;REFB=-0.0208582;REVB=0.00728515;RO=22;SAF=10;SAR=9;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110079;STB=0.562594;STBP=0.544;TYPE=snp;VARB=0.0215629;OID=.;OPOS=67633812;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:22:22:19:19:0.463415:9:10:9:13:9:10:9:13
chr1	67685387	.	T	C	330.44	PASS	AF=0.961538;AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0125865;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.235;QD=50.8371;RBI=0.0442425;REFB=-0.0229968;REVB=0.0424144;RO=1;SAF=17;SAR=8;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.026521;STB=0.514274;STBP=0.603;TYPE=snp;VARB=0.000263036;OID=.;OPOS=67685387;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:26:26:1:1:25:25:0.961538:8:17:1:0:8:17:1:0
chr1	67733321	.	G	A	315.55	PASS	AF=0.56;AO=28;DP=50;FAO=28;FDP=50;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.00716251;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.298;QD=25.2443;RBI=0.029636;REFB=-0.0132348;REVB=-0.0287575;RO=22;SAF=12;SAR=16;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0572719;STB=0.531769;STBP=0.661;TYPE=snp;VARB=0.0112812;OID=.;OPOS=67733321;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:22:22:28:28:0.56:16:12:11:11:16:12:11:11
chr1	67733346	.	G	A,T	800.88	PASS	AF=0.947368,0.0526316;AO=54,3;DP=57;FAO=54,3;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=25,1;FSAR=29,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00505823,0.00288149;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=182.877,54.512;QD=56.2021;RBI=0.00571353,0.00424013;REFB=0,0;REVB=-0.00265683,-0.00311058;RO=0;SAF=25,1;SAR=29,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.000573807,0.157306;OID=.,.;OPOS=67733346,67733346;OREF=G,G;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:10:57:57:0:0:54,3:54,3:0.947368,0.0526316:29,2:25,1:0:0:29,2:25,1:0:0
chr1	67795319	.	T	C	1538.67	PASS	AF=0.990476;AO=104;DP=105;FAO=104;FDP=105;FR=.;FRO=1;FSAF=49;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0192641;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.04;QD=58.6161;RBI=0.0311698;REFB=-0.0213104;REVB=0.0245041;RO=0;SAF=49;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504504;STBP=0.483;TYPE=snp;VARB=2.56267e-05;OID=.;OPOS=67795319;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:105:105:0:1:104:104:0.990476:55:49:0:0:55:49:0:1
chr1	67852335	.	G	A	632.26	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00457404;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.673;QD=61.684;RBI=0.0336379;REFB=0;REVB=0.0333254;RO=0;SAF=22;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000132871;OID=.;OPOS=67852335;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:19:22:0:0:19:22:0:0
chr1	67861520	.	C	A	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.061863;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=161.664;QD=37.4884;RBI=0.0756326;REFB=0;REVB=-0.0435115;RO=0;SAF=5;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00130061;OID=.;OPOS=67861520;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:3:5:0:0:3:5:0:0
chr1	68006815	.	T	C	230.29	PASS	AF=0.95;AO=19;DP=20;FAO=19;FDP=20;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0374768;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.077;QD=46.0582;RBI=0.0388889;REFB=-0.0522879;REVB=0.0103846;RO=1;SAF=10;SAR=9;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0483869;STB=0.526288;STBP=0.537;TYPE=snp;VARB=0.00697897;OID=.;OPOS=68006815;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:20:20:1:1:19:19:0.95:9:10:0:1:9:10:0:1
chr1	68462247	.	A	G	382.59	PASS	AF=0.965517;AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00640408;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.744;QD=52.7708;RBI=0.0314747;REFB=-0.0696307;REVB=0.0308163;RO=1;SAF=14;SAR=14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.032084;STB=0.517229;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.0010281;OID=.;OPOS=68462247;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:29:29:1:1:28:28:0.965517:14:14:1:0:14:14:1:0
chr1	68591253	.	C	T	149.64	PASS	AF=0.34;AO=17;DP=50;FAO=17;FDP=50;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=0.00735574;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=140.874;QD=11.9711;RBI=0.00905253;REFB=-0.0125239;REVB=0.0052765;RO=33;SAF=10;SAR=7;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149475;STB=0.588131;STBP=0.389;TYPE=snp;VARB=0.0144902;OID=.;OPOS=68591253;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:33:33:17:17:0.34:7:10:15:18:7:10:15:18
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chr1	70034372	.	G	A	610.13	PASS	AF=0.62069;AO=54;DP=87;FAO=54;FDP=87;FR=.;FRO=33;FSAF=18;FSAR=36;FSRF=5;FSRR=28;FWDB=0.0548;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.809;QD=28.0519;RBI=0.0548013;REFB=-0.0185744;REVB=0.000364803;RO=33;SAF=18;SAR=36;SRF=5;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151316;STB=0.58179;STBP=0.098;TYPE=snp;VARB=0.00162803;OID=.;OPOS=70034372;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:33:33:54:54:0.62069:36:18:5:28:36:18:5:28
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chr1	70904800	.	G	T	313.93	PASS	AF=0.426829;AO=34;DP=80;FAO=35;FDP=82;FR=.;FRO=47;FSAF=23;FSAR=12;FSRF=27;FSRR=20;FWDB=-0.00449507;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.7669;QD=15.3136;RBI=0.0135082;REFB=-0.0185097;REVB=-0.0127383;RO=46;SAF=22;SAR=12;SRF=26;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0882352;STB=0.550868;STBP=0.449;TYPE=snp;VARB=0.0313081;OID=.;OPOS=70904800;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:82:46:47:34:35:0.426829:12:22:26:20:12:23:27:20
chr1	71331497	.	GA	G,GG	537.6	PASS	AF=0.0277778,0.972222;AO=5,32;DP=37;FAO=1,35;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=0,21;FSAR=1,14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0308699,0.0255949;FXX=0.0270197;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=196.77,216.117;QD=59.7334;RBI=0.0827339,0.0881315;REFB=0,0;REVB=0.076759,0.0843331;RO=0;SAF=1,20;SAR=4,12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0302571,0.00119194;OID=.,.;OPOS=71331498,71331498;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0277778,0.972222:5,32:37:1,35:36:0:0,21:1,14:0:0:4:0:1,20:4,12:0:0
chr1	71419499	.	C	T	429.02	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0127845;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.819;QD=57.2021;RBI=0.0135038;REFB=0;REVB=0.00434845;RO=0;SAF=17;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.63861e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.99639e-05;OID=.;OPOS=71419499;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:13:17:0:0:13:17:0:0
chr1	72058552	.	G	A	1738.04	PASS	AF=1;AO=114;DP=114;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0295722;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.3917;QD=60.4536;RBI=0.0509492;REFB=0;REVB=-0.0414886;RO=0;SAF=73;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000725727;OID=.;OPOS=72058552;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:114:115:0:0:114:115:1:41:73:0:0:42:73:0:0
chr1	74507450	.	G	C	332.66	PASS	AF=0.492958;AO=35;DP=72;FAO=35;FDP=71;FR=.;FRO=36;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=-0.00298642;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.3695;QD=18.7413;RBI=0.0138934;REFB=-0.00567914;REVB=-0.0135686;RO=36;SAF=21;SAR=14;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167131;STB=0.593167;STBP=0.125;TYPE=snp;VARB=0.00561156;OID=.;OPOS=74507450;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:71:36:36:35:35:0.492958:14:21:15:21:14:21:15:21
chr1	74575182	.	C	T	1509.28	PASS	AF=1;AO=100;DP=100;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0301378;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.741;QD=59.7733;RBI=0.0314063;REFB=0;REVB=0.0088358;RO=0;SAF=41;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.3262e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.68349e-05;OID=.;OPOS=74575182;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:100:101:0:0:100:101:1:59:41:0:0:60:41:0:0
chr1	74665493	.	G	A	224.91	PASS	AF=0.488889;AO=22;DP=44;FAO=22;FDP=45;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.00456085;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.711;QD=19.9922;RBI=0.0214419;REFB=-0.0134143;REVB=0.0209512;RO=22;SAF=10;SAR=12;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0806656;STB=0.534382;STBP=0.67;TYPE=snp;VARB=0.0135935;OID=.;OPOS=74665493;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:45:22:23:22:22:0.488889:12:10:12:10:12:10:12:11
chr1	74670172	.	A	G	434.9	PASS	AF=0.511905;AO=43;DP=85;FAO=43;FDP=84;FR=.;FRO=41;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=0.0168446;FXX=0.0117633;HRUN=4;LEN=1;MLLD=125.5;QD=20.7095;RBI=0.0168466;REFB=-0.0132445;REVB=-0.00026512;RO=41;SAF=18;SAR=25;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0619108;STB=0.534292;STBP=0.553;TYPE=snp;VARB=0.022707;OID=.;OPOS=74670172;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:84:41:41:43:43:0.511905:25:18:20:21:25:18:20:21
chr1	74671519	.	A	G	267.98	PASS	AF=0.461538;AO=28;DP=63;FAO=30;FDP=65;FR=.;FRO=35;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=-0.0115678;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.813;QD=16.4911;RBI=0.0116312;REFB=0.000751237;REVB=-0.00121305;RO=34;SAF=14;SAR=14;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0285674;STB=0.52565;STBP=0.708;TYPE=snp;VARB=-0.000724778;OID=.;OPOS=74671519;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:65:34:35:28:30:0.461538:14:14:16:18:14:16:17:18
chr1	74941210	.	C	T	1151.8	PASS	AF=0.974684;AO=77;DP=81;FAO=77;FDP=79;FR=.;FRO=2;FSAF=30;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-1.85175e-05;FXX=0.0246883;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.414;QD=58.3192;RBI=0.004717;REFB=-0.0206948;REVB=-0.00471696;RO=2;SAF=30;SAR=47;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0197128;STB=0.510414;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=-4.17158e-05;OID=.;OPOS=74941210;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:81:79:2:2:77:77:0.974684:47:30:0:2:47:30:0:2
chr1	74941293	.	G	A	847.92	PASS	AF=0.983871;AO=59;DP=60;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0386584;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.282;QD=54.7043;RBI=0.0394265;REFB=-0.112402;REVB=-0.00774424;RO=1;SAF=30;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154685;STB=0.507934;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.000958895;OID=.;OPOS=74941293;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:60:62:1:1:59:61:0.983871:29:30:1:0:30:31:1:0
chr1	75035240	.	C	T	1044.38	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00291829;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.398;QD=59.6788;RBI=0.00978894;REFB=0;REVB=0.00934382;RO=0;SAF=41;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.317e-06;OID=.;OPOS=75035240;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:29:41:0:0:29:41:0:0
chr1	75036812	.	C	T	1159.42	PASS	AF=1;AO=76;DP=77;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000350052;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.229;QD=61.0222;RBI=0.0245707;REFB=0;REVB=0.0245682;RO=0;SAF=28;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.86654e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.50751e-05;OID=.;OPOS=75036812;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:76:0:0:76:76:1:48:28:0:0:48:28:0:0
chr1	75037845	.	A	G	410.96	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.034067;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.9117;QD=56.6844;RBI=0.059034;REFB=0;REVB=-0.0482126;RO=0;SAF=16;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00031123;OID=.;OPOS=75037845;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:13:16:0:0:13:16:0:0
chr1	75038228	.	A	C	989.92	PASS	AF=0.958333;AO=69;DP=72;FAO=69;FDP=72;FR=.;FRO=3;FSAF=37;FSAR=32;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0111758;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=175.566;QD=54.9958;RBI=0.0113522;REFB=-0.12445;REVB=-0.00199331;RO=3;SAF=37;SAR=32;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0367953;STB=0.519475;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=0.0041649;OID=.;OPOS=75038228;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:72:72:3:3:69:69:0.958333:32:37:3:0:32:37:3:0
chr1	75175886	.	T	A,C	822.26	PASS	AF=0.0344828,0.965517;AO=2,55;DP=57;FAO=2,56;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=0,30;FSAR=2,26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159886,0.0120151;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=119.009,154.568;QD=56.7076;RBI=0.0159889,0.0142701;REFB=0,0;REVB=8.6679e-05,0.00769889;RO=0;SAF=0,29;SAR=2,26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.40922e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0385808,-0.00418057;OID=.,.;OPOS=75175886,75175886;OREF=T,T;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:5:57:58:0:0:2,55:2,56:0.0344828,0.965517:2,26:0,29:0:0:2,26:0,30:0:0
chr1	75190452	.	C	T	542.65	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0151039;FXX=0.0270197;HRUN=3;LEN=1;MLLD=123.972;QD=60.2946;RBI=0.0386132;REFB=0;REVB=-0.0355366;RO=0;SAF=12;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.74277e-05;OID=.;OPOS=75190452;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:24:12:0:0:24:12:0:0
chr1	75214441	.	A	G	447.03	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00310662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.535;QD=57.6807;RBI=0.0333487;REFB=0;REVB=0.0332037;RO=0;SAF=21;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000228633;OID=.;OPOS=75214441;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:10:21:0:0:10:21:0:0
chr1	75672376	.	A	G	616.26	PASS	AF=0.484615;AO=63;DP=130;FAO=63;FDP=130;FR=.;FRO=67;FSAF=28;FSAR=35;FSRF=30;FSRR=37;FWDB=0.0186893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.576;QD=18.962;RBI=0.0218003;REFB=-0.0157072;REVB=-0.0112235;RO=67;SAF=28;SAR=35;SRF=30;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00312639;STB=0.50173;STBP=0.976;TYPE=snp;VARB=0.0102027;OID=.;OPOS=75672376;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:130:130:67:67:63:63:0.484615:35:28:30:37:35:28:30:37
chr1	75681511	.	T	C	411.19	PASS	AF=0.525641;AO=41;DP=78;FAO=41;FDP=78;FR=.;FRO=37;FSAF=16;FSAR=25;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=0.0123872;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.1451;QD=21.0868;RBI=0.0141335;REFB=-0.0244889;REVB=0.00680551;RO=37;SAF=16;SAR=25;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0376404;STB=0.520823;STBP=0.737;TYPE=snp;VARB=0.0198835;OID=.;OPOS=75681511;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:37:37:41:41:0.525641:25:16:16:21:25:16:16:21
chr1	75708668	.	AATTTTTC	AATTTTC,AATTTTCT,ATTTTC	175.35	PASS	AF=0,0,0.419355;AO=9,5,13;DP=65;FAO=0,0,26;FDP=62;FR=.;FRO=36;FSAF=0,0,16;FSAR=0,0,10;FSRF=10;FSRR=26;FWDB=-0.0881465,-0.176474,-0.100244;FXX=0.0605969;HRUN=5,5,5;LEN=1,2,2;MLLD=11.967,20.5449,21.7369;QD=11.3131;RBI=0.114516,0.178219,0.104686;REFB=-0.061356,-0.0200041,-0.0823461;REVB=-0.0731031,-0.0248741,-0.0301731;RO=33;SAF=2,5,7;SAR=7,0,6;SRF=10;SRR=23;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.126111,0.715683,0.275309;STB=0.5,0.5,0.688859;STBP=1,1,0.024;TYPE=del,mnp,del;VARB=0.040241,0,0.118377;OID=.,.,.;OPOS=75708670,75708674,75708669;OREF=T,TC,AT;OALT=-,CT,-;OMAPALT=AATTTTC,AATTTTCT,ATTTTC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/3:0,0,0.419355:9,5,13:65:0,0,26:62:36:0,0,16:0,0,10:10:26:99:33:2,5,7:7,0,6:10:23
chr1	75716925	.	C	T	1586.5	PASS	AF=1;AO=107;DP=108;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.178067;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.9428;QD=58.7594;RBI=0.178319;REFB=0;REVB=0.00946811;RO=0;SAF=52;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000487768;OID=.;OPOS=75716925;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:108:108:0:0:107:108:1:55:52:0:0:55:53:0:0
chr1	76257892	.	A	T	946.91	PASS	AF=0.970588;AO=66;DP=68;FAO=66;FDP=68;FR=.;FRO=2;FSAF=40;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00514243;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.713;QD=55.7006;RBI=0.0106076;REFB=0.0381633;REVB=0.0092777;RO=2;SAF=40;SAR=26;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0349599;STB=0.518513;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=8.34566e-06;OID=.;OPOS=76257892;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:68:68:2:2:66:66:0.970588:26:40:0:2:26:40:0:2
chr1	76344705	.	T	C	817.74	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0344608;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.92;QD=57.385;RBI=0.0349168;REFB=0;REVB=-0.00562491;RO=0;SAF=39;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.46126e-05;OID=.;OPOS=76344705;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:18:39:0:0:18:39:0:0
chr1	76344711	.	A	T	817.56	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0477517;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.709;QD=57.3728;RBI=0.0514174;REFB=0;REVB=-0.0190663;RO=0;SAF=39;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000122608;OID=.;OPOS=76344711;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:18:39:0:0:18:39:0:0
chr1	76775659	.	G	T	264.51	PASS	AF=0.510204;AO=24;DP=47;FAO=25;FDP=49;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=-0.0450392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.2901;QD=21.5924;RBI=0.0454186;REFB=-0.0326991;REVB=0.00585859;RO=23;SAF=11;SAR=13;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0592592;STB=0.511619;STBP=0.879;TYPE=snp;VARB=0.0180115;OID=.;OPOS=76775659;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:49:23:24:24:25:0.510204:13:11:9:14:14:11:10:14
chr1	77093180	.	C	A	388.55	PASS	AF=0.653061;AO=32;DP=49;FAO=32;FDP=49;FR=.;FRO=17;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=4;FWDB=-0.00638343;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.984;QD=31.7186;RBI=0.00954852;REFB=-0.0452516;REVB=-0.00710112;RO=17;SAF=18;SAR=14;SRF=13;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133031;STB=0.572516;STBP=0.198;TYPE=snp;VARB=0.0108527;OID=.;OPOS=77093180;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:17:17:32:32:0.653061:14:18:13:4:14:18:13:4
chr1	77634948	.	G	A,T	1229.22	PASS	AF=0.975309,0.0246914;AO=78,3;DP=81;FAO=79,2;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=48,0;FSAR=31,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0240831,-0.011944;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=166.917,41.2265;QD=60.7021;RBI=0.0240857,0.0124555;REFB=0,0;REVB=0.000356356,-0.00353263;RO=0;SAF=48,0;SAR=30,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00111856,0.0576986;OID=.,.;OPOS=77634948,77634948;OREF=G,G;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:3:81:81:0:0:78,3:79,2:0.975309,0.0246914:30,3:48,0:0:0:31,2:48,0:0:0
chr1	77763542	.	GC	AC,CA	1292.9	PASS	AF=0.964706,0.0352941;AO=72,3;DP=83;FAO=82,3;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=42,3;FSAR=40,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0146463,-0.0048932;FXX=0.0116266;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=193.42,160.181;QD=60.8424;RBI=0.0227374,0.016411;REFB=0,0;REVB=0.0173919,0.0156646;RO=0;SAF=35,3;SAR=37,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=-0.00156917,0.0207587;OID=.,.;OPOS=77763542,77763542;OREF=G,GC;OALT=A,CA;OMAPALT=AC,CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:7:83:85:0:0:72,3:82,3:0.964706,0.0352941:37,0:35,3:0:0:40,0:42,3:0:0
chr1	78111153	.	A	G	987.67	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0115014;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.415;QD=58.9652;RBI=0.0133753;REFB=0;REVB=-0.00682771;RO=0;SAF=28;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.99207e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.77059e-06;OID=.;OPOS=78111153;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:67:0:0:65:67:1:37:28:0:0:37:30:0:0
chr1	78184325	.	A	G	2506.49	PASS	AF=0.988095;AO=164;DP=168;FAO=166;FDP=168;FR=.;FRO=2;FSAF=90;FSAR=76;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0150059;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.3215;QD=59.6783;RBI=0.0155933;REFB=-0.0183549;REVB=0.00423956;RO=3;SAF=90;SAR=74;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00742792;STB=0.500506;STBP=0.87;TYPE=snp;VARB=0.000126597;OID=.;OPOS=78184325;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:168:168:3:2:164:166:0.988095:74:90:1:2:76:90:1:1
chr1	78201745	.	G	T	876.81	PASS	AF=0.96875;AO=62;DP=64;FAO=62;FDP=64;FR=.;FRO=2;FSAF=35;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0209712;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.9565;QD=54.8006;RBI=0.0412029;REFB=0.0206557;REVB=-0.0354667;RO=2;SAF=35;SAR=27;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.03369;STB=0.517851;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=-0.00549578;OID=.;OPOS=78201745;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:64:64:2:2:62:62:0.96875:27:35:0:2:27:35:0:2
chr1	78511960	.	C	T	273.88	PASS	AF=0.430556;AO=31;DP=72;FAO=31;FDP=72;FR=.;FRO=41;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=0.0340651;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.2736;QD=15.2156;RBI=0.0963727;REFB=0.0453185;REVB=0.0901514;RO=41;SAF=18;SAR=13;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0697776;STB=0.539484;STBP=0.619;TYPE=snp;VARB=-0.0528908;OID=.;OPOS=78511960;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:41:41:31:31:0.430556:13:18:21:20:13:18:21:20
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chr1	79094081	.	T	A	95.68	PASS	AF=0.363636;AO=12;DP=33;FAO=12;FDP=33;FR=.;FRO=21;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=-0.00244583;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=248.006;QD=11.5972;RBI=0.0439141;REFB=-0.0121551;REVB=-0.043846;RO=21;SAF=3;SAR=9;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.218581;STB=0.631344;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.035756;OID=.;OPOS=79094081;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:33:33:21:21:12:12:0.363636:9:3:9:12:9:3:9:12
chr1	79095581	.	T	C	404.25	PASS	AF=0.5;AO=40;DP=81;FAO=41;FDP=82;FR=.;FRO=41;FSAF=25;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=25;FWDB=0.00328586;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.69;QD=19.7196;RBI=0.0138694;REFB=-0.00239614;REVB=-0.0134746;RO=41;SAF=24;SAR=16;SRF=16;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190495;STB=0.609703;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.00328828;OID=.;OPOS=79095581;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:82:41:41:40:41:0.5:16:24:16:25:16:25:16:25
chr1	79392756	.	C	A	323.41	PASS	AF=1;AO=21;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0281733;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.331;QD=53.9009;RBI=0.0430621;REFB=0;REVB=0.0325669;RO=0;SAF=8;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000764795;OID=.;OPOS=79392756;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:21:24:1:13:8:0:0:16:8:0:0
chr1	82421596	.	C	T	418.03	PASS	AF=0.967742;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0376853;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=238.132;QD=53.9393;RBI=0.0509651;REFB=-0.191577;REVB=0.0343112;RO=0;SAF=14;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.56309e-08;STB=0.51723;STBP=0.336;TYPE=snp;VARB=0.00151887;OID=.;OPOS=82421596;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:31:31:0:1:30:30:0.967742:16:14:0:0:16:14:1:0
chr1	82457662	.	G	A	1283.41	PASS	AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0277789;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.408;QD=61.8512;RBI=0.0289501;REFB=0;REVB=-0.00815085;RO=0;SAF=46;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.12122e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.60517e-05;OID=.;OPOS=82457662;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:37:46:0:0:37:46:0:0
chr1	84376849	.	G	A	143.42	PASS	AF=0.294118;AO=20;DP=68;FAO=20;FDP=68;FR=.;FRO=48;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=23;FSRR=25;FWDB=-0.00201267;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=223.528;QD=8.43619;RBI=0.0246764;REFB=-0.00596162;REVB=-0.0245942;RO=48;SAF=9;SAR=11;SRF=23;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0346534;STB=0.520689;STBP=0.863;TYPE=snp;VARB=0.0147734;OID=.;OPOS=84376849;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:48:48:20:20:0.294118:11:9:23:25:11:9:23:25
chr1	84640691	.	T	G	382.62	PASS	AF=0.965517;AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00990374;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=210.712;QD=52.7748;RBI=0.0278087;REFB=-0.130943;REVB=0.0259853;RO=1;SAF=13;SAR=15;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0300185;STB=0.516118;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.000686918;OID=.;OPOS=84640691;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:29:29:1:1:28:28:0.965517:15:13:0:1:15:13:0:1
chr1	84810815	.	A	G	575.72	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0483427;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.998;QD=60.6017;RBI=0.0506216;REFB=0;REVB=0.0150176;RO=0;SAF=20;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.71161e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000178351;OID=.;OPOS=84810815;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:38:0:0:37:38:1:17:20:0:0:17:21:0:0
chr1	84853957	.	A	T	789.44	PASS	AF=0.935484;AO=58;DP=62;FAO=58;FDP=62;FR=.;FRO=4;FSAF=36;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0271172;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.2925;QD=50.9316;RBI=0.0366894;REFB=-0.0206331;REVB=0.0247137;RO=4;SAF=36;SAR=22;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0471996;STB=0.525079;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=0.0111274;OID=.;OPOS=84853957;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:62:62:4:4:58:58:0.935484:22:36:1:3:22:36:1:3
chr1	84944989	.	A	G	817.72	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00335251;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.867;QD=57.3836;RBI=0.0367155;REFB=0;REVB=0.0365621;RO=0;SAF=33;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.25003e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000125812;OID=.;OPOS=84944989;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:24:33:0:0:24:33:0:0
chr1	85028969	.	C	A	404.63	PASS	AF=0.438095;AO=45;DP=106;FAO=46;FDP=105;FR=.;FRO=59;FSAF=19;FSAR=27;FSRF=26;FSRR=33;FWDB=-0.00274903;FXX=0.0186898;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.1762;QD=15.4146;RBI=0.00323539;REFB=-0.0190726;REVB=0.00170605;RO=57;SAF=19;SAR=26;SRF=25;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0166758;STB=0.515917;STBP=0.809;TYPE=snp;VARB=0.0123174;OID=.;OPOS=85028969;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:105:57:59:45:46:0.438095:26:19:25:32:27:19:26:33
chr1	85113203	.	T	C	1171.26	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0401107;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.2992;QD=60.8447;RBI=0.0410783;REFB=0;REVB=0.00886321;RO=0;SAF=36;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.52206e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00035683;OID=.;OPOS=85113203;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:41:36:0:0:41:36:0:0
chr1	85113229	.	A	G	973.27	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0475957;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.0008;QD=58.9862;RBI=0.0492713;REFB=0;REVB=0.0127404;RO=0;SAF=28;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.99207e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000326292;OID=.;OPOS=85113229;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:66:0:0:65:66:1:37:28:0:0:37:29:0:0
chr1	85121255	.	A	G	1839.68	PASS	AF=1;AO=120;DP=120;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0222111;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.936;QD=61.3226;RBI=0.0242498;REFB=0;REVB=0.00973238;RO=0;SAF=51;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.63137e-05;OID=.;OPOS=85121255;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:120:120:0:0:120:120:1:69:51:0:0:69:51:0:0
chr1	85488030	.	G	A	758.88	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0138652;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.0891;QD=63.2399;RBI=0.0274963;REFB=0;REVB=-0.0237446;RO=0;SAF=25;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.85991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.22954e-05;OID=.;OPOS=85488030;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:48:0:0:46:48:1:21:25:0:0:22:26:0:0
chr1	85537706	.	T	C	386.82	PASS	AF=0.418367;AO=41;DP=98;FAO=41;FDP=98;FR=.;FRO=57;FSAF=26;FSAR=15;FSRF=27;FSRR=30;FWDB=0.0464286;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.018;QD=15.7887;RBI=0.0477543;REFB=-0.00329925;REVB=-0.0111742;RO=57;SAF=26;SAR=15;SRF=27;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168819;STB=0.595373;STBP=0.134;TYPE=snp;VARB=0.00549888;OID=.;OPOS=85537706;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:57:57:41:41:0.418367:15:26:27:30:15:26:27:30
chr1	85559452	.	A	G	488.82	PASS	AF=0.52809;AO=47;DP=89;FAO=47;FDP=89;FR=.;FRO=42;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=25;FSRR=17;FWDB=0.0366738;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.3628;QD=21.9696;RBI=0.0519289;REFB=-0.0148443;REVB=-0.0367647;RO=42;SAF=25;SAR=22;SRF=25;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0546385;STB=0.530108;STBP=0.57;TYPE=snp;VARB=0.0138796;OID=.;OPOS=85559452;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:42:42:47:47:0.52809:22:25:25:17:22:25:25:17
chr1	85589842	.	A	G	373.63	PASS	AF=0.464286;AO=38;DP=84;FAO=39;FDP=84;FR=.;FRO=45;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=29;FSRR=16;FWDB=-0.00672767;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.222;QD=17.7917;RBI=0.0103094;REFB=-0.00391033;REVB=0.00781161;RO=46;SAF=25;SAR=13;SRF=29;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0294392;STB=0.501991;STBP=0.983;TYPE=snp;VARB=0.00524775;OID=.;OPOS=85589842;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:46:45:38:39:0.464286:13:25:29:17:14:25:29:16
chr1	85594392	.	T	C	96.74	PASS	AF=0.387097;AO=12;DP=31;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=0.0153454;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.779;QD=12.4823;RBI=0.0155155;REFB=-0.007969;REVB=-0.00229136;RO=18;SAF=8;SAR=4;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.282827;STB=0.651918;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=0.0134968;OID=.;OPOS=85594392;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:31:31:18:19:12:12:0.387097:4:8:7:11:4:8:8:11
chr1	85624549	.	C	T	1171.97	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00795779;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.884;QD=60.8813;RBI=0.00835247;REFB=0;REVB=0.00253717;RO=0;SAF=42;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.31254e-05;OID=.;OPOS=85624549;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:35:42:0:0:35:42:0:0
chr1	85624864	.	G	A	727.8	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000234332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=290;QD=63.2868;RBI=0.00167297;REFB=0;REVB=0.00165647;RO=0;SAF=25;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.85991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.14659e-06;OID=.;OPOS=85624864;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:21:25:0:0:21:25:0:0
chr1	85648620	.	C	T	1080.55	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0140833;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.705;QD=60.0307;RBI=0.0140904;REFB=0;REVB=0.000448611;RO=0;SAF=35;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.43094e-05;OID=.;OPOS=85648620;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:37:35:0:0:37:35:0:0
chr1	85785751	.	T	C	1606.98	PASS	AF=1;AO=107;DP=107;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159673;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.27;QD=60.0739;RBI=0.0232181;REFB=0;REVB=0.016856;RO=0;SAF=46;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.73491e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000106888;OID=.;OPOS=85785751;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:107:107:0:0:107:107:1:61:46:0:0:61:46:0:0
chr1	85786977	.	G	A	247.3	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0114242;FXX=0.0951928;HRUN=5;LEN=1;MLLD=247.035;QD=52.0632;RBI=0.0514401;REFB=0;REVB=0.0501554;RO=0;SAF=18;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000155354;OID=.;OPOS=85786977;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:19:0:0:21:19:1:3:18:0:0:1:18:0:0
chr1	85816134	.	T	C	724.23	PASS	AF=0.981132;AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0156718;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.3929;QD=54.659;RBI=0.0234191;REFB=-0.0609527;REVB=-0.0174025;RO=0;SAF=25;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509087;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=0.000603231;OID=.;OPOS=85816134;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:53:53:0:1:52:52:0.981132:27:25:0:0:27:25:0:1
chr1	86202016	.	C	T	446.1	PASS	AF=0.459184;AO=45;DP=98;FAO=45;FDP=98;FR=.;FRO=53;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=33;FSRR=20;FWDB=-0.0101138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.528;QD=18.208;RBI=0.0119685;REFB=-0.0074009;REVB=0.00639969;RO=52;SAF=26;SAR=19;SRF=32;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0372965;STB=0.525048;STBP=0.671;TYPE=snp;VARB=0.00904224;OID=.;OPOS=86202016;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:52:53:45:45:0.459184:19:26:32:20:19:26:33:20
chr1	86375654	.	C	G	208.06	PASS	AF=0.403226;AO=24;DP=61;FAO=25;FDP=62;FR=.;FRO=37;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=0.0045583;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.37;QD=13.4232;RBI=0.00533782;REFB=-0.0123378;REVB=0.00277746;RO=36;SAF=12;SAR=12;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0290639;STB=0.51228;STBP=0.885;TYPE=snp;VARB=0.0139498;OID=.;OPOS=86375654;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:62:36:37:24:25:0.403226:12:12:19:17:12:13:20:17
chr1	86487981	.	G	A	1172.38	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0212291;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.131;QD=60.9029;RBI=0.0260573;REFB=0;REVB=0.0151099;RO=0;SAF=32;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.75449e-05;OID=.;OPOS=86487981;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:77:0:0:76:77:1:44:32:0:0:45:32:0:0
chr1	86487992	.	A	AACAG	602.09	PASS	AF=0.769231;AO=49;DP=70;FAO=50;FDP=65;FR=.;FRO=15;FSAF=16;FSAR=34;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=0.0187692;FXX=0.0298463;HRUN=2;LEN=4;MLLD=252.036;QD=37.0515;RBI=0.0193495;REFB=-0.00872807;REVB=0.00470319;RO=20;SAF=16;SAR=33;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.209421;STB=0.570441;STBP=0.053;TYPE=ins;VARB=0.00251603;OID=.;OPOS=86487993;OREF=-;OALT=ACAG;OMAPALT=AACAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.769231:49:70:50:65:15:16:34:9:6:96:20:16:33:14:6
chr1	86488232	.	G	A	277.39	PASS	AF=0.449275;AO=31;DP=69;FAO=31;FDP=69;FR=.;FRO=38;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=23;FWDB=0.0119911;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.0809;QD=16.0804;RBI=0.0338844;REFB=0.0153376;REVB=-0.0316918;RO=38;SAF=14;SAR=17;SRF=15;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0565148;STB=0.531794;STBP=0.676;TYPE=snp;VARB=-0.0122993;OID=.;OPOS=86488232;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:38:38:31:31:0.449275:17:14:15:23:17:14:15:23
chr1	86590915	.	G	A	651.21	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0163194;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.984;QD=62.0201;RBI=0.0227674;REFB=0;REVB=0.0158755;RO=0;SAF=30;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.52854e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.94303e-07;OID=.;OPOS=86590915;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:12:30:0:0:12:30:0:0
chr1	86591837	.	G	A	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000733086;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.898;QD=40.7629;RBI=0.0299197;REFB=0;REVB=-0.0299107;RO=0;SAF=5;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000647721;OID=.;OPOS=86591837;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:5:5:0:0:5:5:0:0
chr1	86818572	.	T	C	962.78	PASS	AF=0.944444;AO=68;DP=72;FAO=68;FDP=72;FR=.;FRO=4;FSAF=29;FSAR=39;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.00672592;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.191;QD=53.488;RBI=0.0297014;REFB=0.0726667;REVB=0.0289298;RO=4;SAF=29;SAR=39;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0608467;STB=0.532248;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=-0.000450685;OID=.;OPOS=86818572;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:72:72:4:4:68:68:0.944444:39:29:4:0:39:29:4:0
chr1	86820267	.	C	T	1556.51	PASS	AF=1;AO=104;DP=104;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.026747;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.105;QD=59.8657;RBI=0.0276607;REFB=0;REVB=-0.00705067;RO=0;SAF=63;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.05495e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.12379e-05;OID=.;OPOS=86820267;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:104:104:0:0:104:104:1:41:63:0:0:41:63:0:0
chr1	86822231	.	A	G	301.5	PASS	AF=0.458333;AO=33;DP=72;FAO=33;FDP=72;FR=.;FRO=39;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=16;FSRR=23;FWDB=-0.0703626;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.797;QD=16.7502;RBI=0.0800581;REFB=0.0196532;REVB=-0.0381891;RO=39;SAF=12;SAR=21;SRF=16;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0477864;STB=0.526865;STBP=0.695;TYPE=snp;VARB=-0.0262809;OID=.;OPOS=86822231;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:39:39:33:33:0.458333:21:12:16:23:21:12:16:23
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chr1	86952324	.	A	G	334.2	PASS	AF=0.344262;AO=42;DP=122;FAO=42;FDP=122;FR=.;FRO=80;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=30;FSRR=50;FWDB=0.0189366;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=67.3844;QD=10.9574;RBI=0.037114;REFB=-0.00238128;REVB=0.0319195;RO=76;SAF=23;SAR=19;SRF=29;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.184969;STB=0.611745;STBP=0.101;TYPE=snp;VARB=0.00744721;OID=.;OPOS=86952324;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:122:122:76:80:42:42:0.344262:19:23:29:47:19:23:30:50
chr1	86959173	.	T	C	653.23	PASS	AF=0.436364;AO=72;DP=165;FAO=72;FDP=165;FR=.;FRO=93;FSAF=44;FSAR=28;FSRF=44;FSRR=49;FWDB=0.0101527;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.608;QD=15.8359;RBI=0.015516;REFB=0.0063265;REVB=-0.0117332;RO=93;SAF=44;SAR=28;SRF=44;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141389;STB=0.578925;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=-0.00861521;OID=.;OPOS=86959173;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:165:165:93:93:72:72:0.436364:28:44:44:49:28:44:44:49
chr1	87031656	.	A	C	74.68	PASS	AF=0.357143;AO=10;DP=28;FAO=10;FDP=28;FR=.;FRO=18;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=17;FWDB=-0.0143935;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.847;QD=10.6681;RBI=0.0146014;REFB=-0.00371965;REVB=-0.0024552;RO=18;SAF=2;SAR=8;SRF=1;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.305967;STB=0.67542;STBP=0.42;TYPE=snp;VARB=0.00712562;OID=.;OPOS=87031656;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:28:28:18:18:10:10:0.357143:8:2:1:17:8:2:1:17
chr1	87101375	.	C	A,G	750.66	PASS	AF=0.0416667,0.958333;AO=2,46;DP=48;FAO=2,46;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=2,21;FSAR=0,25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00570148,0.0090079;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=151.091,153.786;QD=62.5546;RBI=0.0120178,0.02692;REFB=0,0;REVB=0.0105792,0.0253681;RO=0;SAF=2,21;SAR=0,25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-4.85991e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0731995,5.98263e-05;OID=.,.;OPOS=87101375,87101375;OREF=C,C;OALT=A,G;OMAPALT=A,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:48:48:0:0:2,46:2,46:0.0416667,0.958333:0,25:2,21:0:0:0,25:2,21:0:0
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chr1	89301119	.	A	AT	273.11	PASS	AF=1;AO=6;DP=58;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0756248;FXX=0.351787;HRUN=3;LEN=1;MLLD=19.9528;QD=31.213;RBI=0.152421;REFB=0;REVB=-0.132337;RO=52;SAF=3;SAR=3;SRF=26;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.0131427;OID=.;OPOS=89301120;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:6:58:35:35:0:8:27:0:0:6:52:3:3:26:26
chr1	89301123	.	C	T	757.04	PASS	AF=1;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0211939;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.5257;QD=57.135;RBI=0.0441773;REFB=0;REVB=-0.0387615;RO=0;SAF=24;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000353662;OID=.;OPOS=89301123;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:53:0:0:53:53:1:29:24:0:0:29:24:0:0
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chr1	89449434	.	T	C	135.07	PASS	AF=0.1875;AO=24;DP=128;FAO=24;FDP=128;FR=.;FRO=104;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=58;FSRR=46;FWDB=0.00736581;FXX=0.00775134;HRUN=3;LEN=1;MLLD=232.659;QD=4.22089;RBI=0.0134995;REFB=-0.000664079;REVB=-0.0113129;RO=104;SAF=14;SAR=10;SRF=58;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0333007;STB=0.521259;STBP=0.829;TYPE=snp;VARB=0.00270244;OID=.;OPOS=89449434;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:128:128:104:104:24:24:0.1875:10:14:58:46:10:14:58:46
chr1	89449483	.	C	G	133.51	PASS	AF=0.179104;AO=24;DP=134;FAO=24;FDP=134;FR=.;FRO=110;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=59;FSRR=51;FWDB=0.0118842;FXX=0.00740686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.098;QD=3.98548;RBI=0.0119079;REFB=-0.00642192;REVB=-0.000750152;RO=104;SAF=13;SAR=11;SRF=58;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0206033;STB=0.504377;STBP=0.972;TYPE=snp;VARB=0.0244746;OID=.;OPOS=89449483;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:134:134:104:110:24:24:0.179104:11:13:58:46:11:13:59:51
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chr1	89474818	.	A	G	165.57	PASS	AF=0.323529;AO=22;DP=68;FAO=22;FDP=68;FR=.;FRO=46;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=26;FWDB=0.0268197;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.688;QD=9.73929;RBI=0.0269006;REFB=0.00107791;REVB=0.002085;RO=45;SAF=11;SAR=11;SRF=19;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0890616;STB=0.544078;STBP=0.631;TYPE=snp;VARB=-0.0018836;OID=.;OPOS=89474818;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:45:46:22:22:0.323529:11:11:19:26:11:11:20:26
chr1	89479063	.	G	A	426.8	PASS	AF=0.432432;AO=48;DP=110;FAO=48;FDP=111;FR=.;FRO=63;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=40;FSRR=23;FWDB=0.00230065;FXX=0.00892777;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.553;QD=15.38;RBI=0.0116338;REFB=-0.00378026;REVB=0.011404;RO=61;SAF=23;SAR=25;SRF=39;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159558;STB=0.58787;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=0.00262297;OID=.;OPOS=89479063;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:111:61:63:48:48:0.432432:25:23:39:22:25:23:40:23
chr1	89479074	.	C	T	389.85	PASS	AF=0.422018;AO=43;DP=106;FAO=46;FDP=109;FR=.;FRO=63;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=39;FSRR=24;FWDB=0.00790973;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.355;QD=14.3063;RBI=0.011409;REFB=-0.0173535;REVB=-0.00822196;RO=59;SAF=21;SAR=22;SRF=36;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124948;STB=0.59308;STBP=0.107;TYPE=snp;VARB=0.0317059;OID=.;OPOS=89479074;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:109:59:63:43:46:0.422018:22:21:36:23:25:21:39:24
chr1	89479758	.	T	C	1080.56	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0188559;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.364;QD=60.031;RBI=0.0221738;REFB=0;REVB=0.0116676;RO=0;SAF=43;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.16073e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.0939e-05;OID=.;OPOS=89479758;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:29:43:0:0:29:43:0:0
chr1	89486037	.	C	T	613.21	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.085132;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.6053;QD=61.3213;RBI=0.087856;REFB=0;REVB=-0.0217076;RO=0;SAF=16;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0010514;OID=.;OPOS=89486037;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:24:16:0:0:24:16:0:0
chr1	89518623	.	C	T	1195.28	PASS	AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000260624;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.95;QD=61.2966;RBI=0.00658548;REFB=0;REVB=0.00658032;RO=0;SAF=34;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.47622e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000629672;OID=.;OPOS=89518623;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:44:34:0:0:44:34:0:0
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chr1	89652102	.	A	T	507.77	PASS	AF=0.477876;AO=50;DP=109;FAO=54;FDP=113;FR=.;FRO=59;FSAF=18;FSAR=36;FSRF=27;FSRR=32;FWDB=0.00920509;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.973;QD=17.974;RBI=0.0137018;REFB=-0.0083662;REVB=0.0101492;RO=59;SAF=15;SAR=35;SRF=27;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167701;STB=0.569594;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=0.0131541;OID=.;OPOS=89652102;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:113:59:59:50:54:0.477876:35:15:27:32:36:18:27:32
chr1	89655787	.	T	C	197.62	PASS	AF=0.421053;AO=23;DP=56;FAO=24;FDP=57;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=-0.0526464;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.0052;QD=13.8683;RBI=0.0916102;REFB=-0.005605;REVB=0.0749718;RO=33;SAF=11;SAR=12;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100107;STB=0.56763;STBP=0.391;TYPE=snp;VARB=0.0154443;OID=.;OPOS=89655787;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:57:33:33:23:24:0.421053:12:11:19:14:13:11:19:14
chr1	89655994	.	C	T	36.65	PASS	AF=0.230769;AO=5;DP=25;FAO=6;FDP=26;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=0.014868;FXX=0.0370233;HRUN=4;LEN=1;MLLD=46.827;QD=5.63918;RBI=0.0258451;REFB=-0.00931352;REVB=0.0211403;RO=20;SAF=3;SAR=2;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.284472;STB=0.730991;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=0.0383005;OID=.;OPOS=89655994;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:25:26:20:20:5:6:0.230769:2:3:7:13:2:4:7:13
chr1	89732237	.	G	A	282.67	PASS	AF=0.641026;AO=25;DP=39;FAO=25;FDP=39;FR=.;FRO=14;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.000417659;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=204.257;QD=28.9922;RBI=0.00875493;REFB=-0.0211504;REVB=-0.00874496;RO=14;SAF=16;SAR=9;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0476847;STB=0.526294;STBP=0.678;TYPE=snp;VARB=0.0144892;OID=.;OPOS=89732237;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:14:14:25:25:0.641026:9:16:8:6:9:16:8:6
chr1	89847372	.	G	T	237.14	PASS	AF=0.479167;AO=23;DP=48;FAO=23;FDP=48;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=5.53329e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.641;QD=19.7613;RBI=0.001109;REFB=-0.0109737;REVB=-0.00110762;RO=24;SAF=9;SAR=14;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174666;STB=0.608601;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=0.0107751;OID=.;OPOS=89847372;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:24:25:23:23:0.479167:14:9:14:10:14:9:15:10
chr1	89847411	.	C	T	265.8	PASS	AF=0.530612;AO=24;DP=47;FAO=26;FDP=49;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=0.0654935;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.8241;QD=21.6976;RBI=0.0866709;REFB=-0.00795751;REVB=0.0567666;RO=23;SAF=9;SAR=15;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.204803;STB=0.586788;STBP=0.208;TYPE=snp;VARB=0.0115079;OID=.;OPOS=89847411;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:49:23:23:24:26:0.530612:15:9:14:9:15:11:14:9
chr1	89847444	.	A	G	244.25	PASS	AF=0.547619;AO=23;DP=42;FAO=23;FDP=42;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.0140625;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.059;QD=23.2622;RBI=0.017236;REFB=-0.0179007;REVB=-0.00996631;RO=19;SAF=9;SAR=14;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111486;STB=0.562313;STBP=0.413;TYPE=snp;VARB=0.0163383;OID=.;OPOS=89847444;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:19:19:23:23:0.547619:14:9:10:9:14:9:10:9
chr1	89849742	.	A	T	244.52	PASS	AF=0.560976;AO=22;DP=41;FAO=23;FDP=41;FR=.;FRO=18;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=1;FWDB=0.0161603;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.274;QD=23.8553;RBI=0.033377;REFB=0.00189278;REVB=0.0292039;RO=18;SAF=16;SAR=6;SRF=17;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.252844;STB=0.643351;STBP=0.111;TYPE=snp;VARB=-0.00110057;OID=.;OPOS=89849742;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:18:18:22:23:0.560976:6:16:17:1:7:16:17:1
chr1	90171832	.	C	CT	496.18	PASS	AF=1;AO=9;DP=60;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0662398;FXX=0.133311;HRUN=2;LEN=1;MLLD=15.469;QD=38.1675;RBI=0.267344;REFB=0;REVB=-0.259008;RO=50;SAF=3;SAR=6;SRF=32;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.362021;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.0217392;OID=.;OPOS=90171833;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:9:60:52:52:0:30:22:0:0:10:50:3:6:32:18
chr1	90171835	.	C	T	884.55	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0187762;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.2873;QD=58.0031;RBI=0.0405377;REFB=0;REVB=-0.0359271;RO=0;SAF=37;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000242041;OID=.;OPOS=90171835;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:24:37:0:0:24:37:0:0
chr1	90178743	.	A	G	130.4	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00484517;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.4482;QD=43.4653;RBI=0.00541606;REFB=0;REVB=0.00242035;RO=0;SAF=8;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000239019;OID=.;OPOS=90178743;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:4:8:0:0:4:8:0:0
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chr1	92174260	.	A	G	212.4	PASS	AF=0.423729;AO=25;DP=59;FAO=25;FDP=59;FR=.;FRO=34;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=0.00190472;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.217;QD=14.3999;RBI=0.00626981;REFB=-0.00750861;REVB=-0.00597349;RO=33;SAF=16;SAR=9;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188838;STB=0.616137;STBP=0.134;TYPE=snp;VARB=0.0120216;OID=.;OPOS=92174260;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:33:34:25:25:0.423729:9:16:15:18:9:16:15:19
chr1	92185657	.	C	T	217.92	PASS	AF=0.40625;AO=24;DP=62;FAO=26;FDP=64;FR=.;FRO=38;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=-0.00443521;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=314.937;QD=13.6199;RBI=0.00449842;REFB=-0.0028695;REVB=0.000751427;RO=37;SAF=9;SAR=15;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120937;STB=0.579483;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.0050097;OID=.;OPOS=92185657;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:64:37:38:24:26:0.40625:15:9:18:19:17:9:18:20
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chr1	92457843	.	C	T	1419.67	PASS	AF=0.979798;AO=97;DP=100;FAO=97;FDP=99;FR=.;FRO=2;FSAF=42;FSAR=55;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0054027;FXX=0.0198;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.661;QD=57.3603;RBI=0.019904;REFB=-0.110311;REVB=0.0191567;RO=2;SAF=42;SAR=55;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00261287;STB=0.501378;STBP=0.871;TYPE=snp;VARB=2.95472e-05;OID=.;OPOS=92457843;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:100:99:2:2:97:97:0.979798:55:42:1:1:55:42:1:1
chr1	92646020	.	AG	A,AA	490.86	PASS	AF=0.0882353,0.911765;AO=6,28;DP=34;FAO=3,31;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=3,17;FSAR=0,14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.03591,0.0324505;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=277.341,286.497;QD=57.7487;RBI=0.0361397,0.0325248;REFB=0,0;REVB=0.00406824,0.00219819;RO=0;SAF=5,15;SAR=1,13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.18042e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0149333,0.00346239;OID=.,.;OPOS=92646021,92646021;OREF=G,G;OALT=-,A;OMAPALT=A,AA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0882353,0.911765:6,28:34:3,31:34:0:3,17:0,14:0:0:9:0:5,15:1,13:0:0
chr1	92647223	.	A	G	306.34	PASS	AF=1;AO=22;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00861272;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.627;QD=53.2763;RBI=0.010197;REFB=0;REVB=-0.00545892;RO=0;SAF=12;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.97156e-06;OID=.;OPOS=92647223;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:22:23:1:10:12:0:0:11:12:0:0
chr1	92647532	.	C	A,T	775.07	PASS	AF=0.979592,0.0204082;AO=47,2;DP=49;FAO=48,1;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=17,1;FSAR=31,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0187334,-0.0218771;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=78.3208,34.8997;QD=63.2713;RBI=0.0192428,0.0524261;REFB=0,0;REVB=-0.00439824,-0.0476433;RO=0;SAF=17,1;SAR=30,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000771224,0.0323098;OID=.,.;OPOS=92647532,92647532;OREF=C,C;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:5:49:49:0:0:47,2:48,1:0.979592,0.0204082:30,1:17,1:0:0:31,0:17,1:0:0
chr1	92889408	.	C	T	724.48	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0525974;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.575;QD=56.8222;RBI=0.0547166;REFB=0;REVB=-0.0150804;RO=0;SAF=24;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000190404;OID=.;OPOS=92889408;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:51:0:0:49:51:1:25:24:0:0:27:24:0:0
chr1	92946479	.	G	A	397.13	PASS	AF=1;AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0548905;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.8125;QD=56.7323;RBI=0.0752754;REFB=0;REVB=0.0515114;RO=0;SAF=24;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00200199;OID=.;OPOS=92946479;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:28:0:0:28:28:1:4:24:0:0:4:24:0:0
chr1	92974595	.	G	A	1632.11	PASS	AF=0.990909;AO=109;DP=110;FAO=109;FDP=110;FR=.;FRO=1;FSAF=54;FSAR=55;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0058364;FXX=0.0178555;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.453;QD=59.3495;RBI=0.012033;REFB=-0.0340034;REVB=-0.0105228;RO=1;SAF=54;SAR=55;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00870981;STB=0.504586;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=6.1594e-05;OID=.;OPOS=92974595;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:110:110:1:1:109:109:0.990909:55:54:1:0:55:54:1:0
chr1	92979124	.	G	A	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0272741;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.9232;QD=45.8065;RBI=0.0330288;REFB=0;REVB=-0.0186286;RO=0;SAF=7;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00216583;OID=.;OPOS=92979124;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:7:7:0:0:7:7:0:0
chr1	92979354	.	A	G	379.66	PASS	AF=1;AO=27;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0243088;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.091;QD=54.2368;RBI=0.0352126;REFB=0;REVB=0.0254757;RO=0;SAF=7;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.41836e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000470221;OID=.;OPOS=92979354;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:27:28:1:20:7:0:0:21:7:0:0
chr1	93089823	.	T	C	815.24	PASS	AF=0.951613;AO=59;DP=62;FAO=59;FDP=62;FR=.;FRO=3;FSAF=37;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0486132;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.4298;QD=52.596;RBI=0.0491651;REFB=-0.0920772;REVB=0.00734576;RO=3;SAF=37;SAR=22;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.028407;STB=0.515076;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.00506998;OID=.;OPOS=93089823;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:62:62:3:3:59:59:0.951613:22:37:1:2:22:37:1:2
chr1	93160902	.	T	C	612.79	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0854636;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.1134;QD=61.2786;RBI=0.0965438;REFB=0;REVB=0.0449075;RO=0;SAF=22;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000749481;OID=.;OPOS=93160902;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:40:0:0:39:40:1:17:22:0:0:17:23:0:0
chr1	93306317	.	G	A	1135.26	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00185267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.8339;QD=60.5471;RBI=0.052366;REFB=0;REVB=0.0523332;RO=0;SAF=40;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.93225e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000421464;OID=.;OPOS=93306317;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:75:0:0:73:75:1:33:40:0:0:35:40:0:0
chr1	93307908	.	T	A	766.32	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00575124;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.252;QD=63.86;RBI=0.0246716;REFB=0;REVB=-0.0239919;RO=0;SAF=19;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000106469;OID=.;OPOS=93307908;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:29:19:0:0:29:19:0:0
chr1	93311708	.	G	A	455.53	PASS	AF=0.48913;AO=45;DP=92;FAO=45;FDP=92;FR=.;FRO=47;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=26;FSRR=21;FWDB=-0.0679001;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.1048;QD=19.8056;RBI=0.0685153;REFB=-0.00486554;REVB=-0.00916058;RO=44;SAF=24;SAR=21;SRF=23;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00950061;STB=0.5102;STBP=0.849;TYPE=snp;VARB=0.005981;OID=.;OPOS=93311708;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:44:47:45:45:0.48913:21:24:23:21:21:24:26:21
chr1	93440474	.	T	C	133.22	PASS	AF=0.428571;AO=14;DP=34;FAO=15;FDP=35;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.0162456;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=288.53;QD=15.2256;RBI=0.0263931;REFB=-0.00831621;REVB=0.0208008;RO=20;SAF=8;SAR=6;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0726024;STB=0.519058;STBP=0.828;TYPE=snp;VARB=0.0107468;OID=.;OPOS=93440474;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:35:20:20:14:15:0.428571:6:8:10:10:7:8:10:10
chr1	93580581	.	G	C	1026.41	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00699912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.902;QD=59.5018;RBI=0.0331137;REFB=0;REVB=0.0323656;RO=0;SAF=33;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.36169e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.24289e-05;OID=.;OPOS=93580581;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:36:33:0:0:36:33:0:0
chr1	93581024	.	T	C	148.14	PASS	AF=0.484848;AO=16;DP=33;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.0083514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.705;QD=17.956;RBI=0.0177878;REFB=-0.0201422;REVB=0.0157054;RO=17;SAF=12;SAR=4;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.279432;STB=0.660802;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=0.00775999;OID=.;OPOS=93581024;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:17:17:16:16:0.484848:4:12:8:9:4:12:8:9
chr1	93603177	.	T	C	57.92	PASS	AF=0.214286;AO=9;DP=42;FAO=9;FDP=42;FR=.;FRO=33;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=21;FSRR=12;FWDB=0.00759267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.9;QD=5.51663;RBI=0.0378884;REFB=-0.0050757;REVB=0.0371198;RO=32;SAF=3;SAR=6;SRF=21;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.37524;STB=0.726801;STBP=0.137;TYPE=snp;VARB=0.0420425;OID=.;OPOS=93603177;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:42:42:32:33:9:9:0.214286:6:3:21:11:6:3:21:12
chr1	93603183	.	C	CAT,T	559.92	PASS	AF=0.657895,0.342105;AO=23,13;DP=44;FAO=25,13;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=18,5;FSAR=7,8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0210612,-0.013776;FXX=0.0952154;HRUN=0,1;LEN=2,1;MLLD=112.875,48.7465;QD=58.9391;RBI=0.0504116,0.0900653;REFB=0,0;REVB=-0.0458013,-0.0890055;RO=6;SAF=17,5;SAR=6,8;SRF=2;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.179796,0.0306968;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.0101434,-0.00569615;OID=.,.;OPOS=93603184,93603183;OREF=-,C;OALT=AT,T;OMAPALT=CAT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:44:38:6:0:23,13:25,13:0.657895,0.342105:6,8:17,5:2:4:7,8:18,5:0:0
chr1	93617546	.	T	C	740.3	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0535958;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.3263;QD=56.9461;RBI=0.0600031;REFB=0;REVB=0.0269789;RO=0;SAF=31;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.93989e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00104558;OID=.;OPOS=93617546;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:21:31:0:0:21:31:0:0
chr1	93620393	.	G	A	198.98	PASS	AF=0.575758;AO=19;DP=35;FAO=19;FDP=33;FR=.;FRO=14;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.00272369;FXX=0.0571265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.369;QD=24.1191;RBI=0.0136063;REFB=-0.0122139;REVB=0.0133309;RO=13;SAF=13;SAR=6;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.227534;STB=0.643409;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.00623082;OID=.;OPOS=93620393;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:33:13:14:19:19:0.575758:6:13:5:8:6:13:5:9
chr1	93672688	.	C	T	230.64	PASS	AF=0.589744;AO=21;DP=41;FAO=23;FDP=39;FR=.;FRO=16;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=3;FWDB=0.00155475;FXX=0.0487686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.535;QD=23.6551;RBI=0.00418809;REFB=-0.0103487;REVB=0.00388882;RO=14;SAF=12;SAR=9;SRF=12;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.218834;STB=0.62067;STBP=0.098;TYPE=snp;VARB=0.0081158;OID=.;OPOS=93672688;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:39:14:16:21:23:0.589744:9:12:12:2:11:12:13:3
chr1	93672723	.	A	C	714.09	PASS	AF=0.963636;AO=47;DP=55;FAO=53;FDP=55;FR=.;FRO=2;FSAF=31;FSAR=22;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0093639;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=112.992;QD=51.9334;RBI=0.0287109;REFB=-0.172433;REVB=0.027141;RO=0;SAF=28;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.515619;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.00083797;OID=.;OPOS=93672723;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:55:55:0:2:47:53:0.963636:19:28:0:0:22:31:2:0
chr1	93720070	.	C	G	246.21	PASS	AF=0.444444;AO=28;DP=64;FAO=28;FDP=63;FR=.;FRO=35;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=13;FWDB=-0.00189821;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.502;QD=15.6322;RBI=0.00259495;REFB=-0.0106787;REVB=0.00176934;RO=33;SAF=16;SAR=12;SRF=21;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0643713;STB=0.532687;STBP=0.654;TYPE=snp;VARB=0.0081758;OID=.;OPOS=93720070;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:63:33:35:28:28:0.444444:12:16:21:12:12:16:22:13
chr1	93826178	.	A	T	537.43	PASS	AF=0.51;AO=51;DP=100;FAO=51;FDP=100;FR=.;FRO=49;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=27;FSRR=22;FWDB=-0.0372682;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.867;QD=21.4972;RBI=0.0385479;REFB=-0.0117514;REVB=0.00984981;RO=49;SAF=25;SAR=26;SRF=27;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0539116;STB=0.529769;STBP=0.571;TYPE=snp;VARB=0.0136258;OID=.;OPOS=93826178;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:49:49:51:51:0.51:26:25:27:22:26:25:27:22
chr1	93851295	.	T	C	769.39	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00919266;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.412;QD=56.9916;RBI=0.0169479;REFB=0;REVB=0.0142382;RO=0;SAF=25;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000128616;OID=.;OPOS=93851295;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:29:25:0:0:29:25:0:0
chr1	94140375	.	G	A	226.0	PASS	AF=0.5;AO=22;DP=44;FAO=22;FDP=44;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.0216102;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.747;QD=20.545;RBI=0.025881;REFB=0.00128751;REVB=0.0142417;RO=22;SAF=10;SAR=12;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0404908;STB=0.522801;STBP=0.72;TYPE=snp;VARB=-0.00191384;OID=.;OPOS=94140375;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:22:22:22:22:0.5:12:10:11:11:12:10:11:11
chr1	94341267	.	A	G	734.36	PASS	AF=0.964286;AO=53;DP=55;FAO=54;FDP=56;FR=.;FRO=2;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0284639;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=197.693;QD=52.4542;RBI=0.0296958;REFB=0.0504377;REVB=0.00846458;RO=2;SAF=24;SAR=29;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00325731;STB=0.501329;STBP=0.877;TYPE=snp;VARB=-0.000202223;OID=.;OPOS=94341267;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:55:56:2:2:53:54:0.964286:29:24:1:1:29:25:1:1
chr1	94342564	.	C	A	772.55	PASS	AF=1;AO=54;DP=55;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0330138;FXX=0.0181785;HRUN=4;LEN=1;MLLD=162.511;QD=57.2261;RBI=0.0378957;REFB=0;REVB=0.0186056;RO=0;SAF=29;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000171176;OID=.;OPOS=94342564;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:54:0:0:54:54:1:25:29:0:0:25:29:0:0
chr1	94343023	.	A	G	868.27	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0220758;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.142;QD=57.8847;RBI=0.0221936;REFB=0;REVB=0.00228298;RO=0;SAF=28;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.69258e-05;OID=.;OPOS=94343023;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:32:28:0:0:32:28:0:0
chr1	94343233	.	T	C	1085.05	PASS	AF=0.986486;AO=73;DP=74;FAO=73;FDP=74;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0112883;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=226.374;QD=58.6513;RBI=0.0166909;REFB=-0.137317;REVB=0.0122947;RO=1;SAF=33;SAR=40;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0141179;STB=0.507461;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=-9.29716e-05;OID=.;OPOS=94343233;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:74:74:1:1:73:73:0.986486:40:33:1:0:40:33:1:0
chr1	94344716	.	C	T	724.17	PASS	AF=0.981132;AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.042324;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=283.354;QD=54.6541;RBI=0.046506;REFB=-0.125496;REVB=0.0192739;RO=0;SAF=19;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.0907e-08;STB=0.50746;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.000468928;OID=.;OPOS=94344716;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:53:53:0:1:52:52:0.981132:33:19:0:0:33:19:0:1
chr1	94471075	.	A	G	666.68	PASS	AF=0.960784;AO=48;DP=50;FAO=49;FDP=51;FR=.;FRO=2;FSAF=17;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0203096;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.5899;QD=52.2886;RBI=0.0203942;REFB=-0.0734511;REVB=-0.00185554;RO=2;SAF=17;SAR=31;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119379;STB=0.506594;STBP=0.79;TYPE=snp;VARB=0.00490691;OID=.;OPOS=94471075;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:50:51:2:2:48:49:0.960784:31:17:1:1:32:17:1:1
chr1	94476901	.	A	G	207.83	PASS	AF=0.446809;AO=21;DP=47;FAO=21;FDP=47;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=-0.0226038;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.985;QD=17.6876;RBI=0.0240892;REFB=-0.0365633;REVB=0.0083283;RO=25;SAF=10;SAR=11;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0418656;STB=0.53438;STBP=0.68;TYPE=snp;VARB=0.0333674;OID=.;OPOS=94476901;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:25:26:21:21:0.446809:11:10:13:12:11:10:14:12
chr1	94544234	.	T	C	307.01	PASS	AF=0.472222;AO=32;DP=70;FAO=34;FDP=72;FR=.;FRO=38;FSAF=6;FSAR=28;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=-0.0209553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.633;QD=17.0563;RBI=0.0212167;REFB=0.00695821;REVB=-0.00332057;RO=38;SAF=6;SAR=26;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.362538;STB=0.712689;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=-0.0029086;OID=.;OPOS=94544234;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:72:38:38:32:34:0.472222:26:6:19:19:28:6:19:19
chr1	94578548	.	T	C	731.76	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0683724;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.988;QD=63.631;RBI=0.0728701;REFB=0;REVB=0.0252045;RO=0;SAF=16;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.31553e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000457917;OID=.;OPOS=94578548;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:30:16:0:0:30:16:0:0
chr1	94639337	.	A	G	289.31	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0405275;FXX=0.0434594;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.969;QD=52.6025;RBI=0.0405902;REFB=0;REVB=0.00225411;RO=0;SAF=11;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000202532;OID=.;OPOS=94639337;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:22:0:0:21:22:1:10:11:0:0:11:11:0:0
chr1	94639447	.	C	T	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00926419;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.964;QD=47.8222;RBI=0.0306876;REFB=0;REVB=-0.0292558;RO=0;SAF=9;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00024612;OID=.;OPOS=94639447;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:7:9:0:0:7:9:0:0
chr1	94645418	.	CTTTTTTG	CTTTTTG,CTTTTTTGT	51.54	PASS	AF=0.207547,0.113208;AO=15,6;DP=56;FAO=11,6;FDP=53;FR=.;FRO=36;FSAF=1,6;FSAR=10,0;FSRF=11;FSRR=25;FWDB=0.0135458,-0.00793969;FXX=0.0185151;HRUN=6,1;LEN=1,1;MLLD=10.3789,22.8668;QD=3.88997;RBI=0.0917896,0.0723824;REFB=-0.0392941,0.000131111;REVB=-0.0907846,-0.0719456;RO=32;SAF=2,6;SAR=13,0;SRF=10;SRR=22;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.308905,0.739029;STB=0.773561,0.998652;STBP=0.084,0.001;TYPE=del,ins;VARB=0.120528,-0.0408069;OID=.,.;OPOS=94645419,94645426;OREF=T,-;OALT=-,T;OMAPALT=CTTTTTG,CTTTTTTGT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.207547,0.113208:15,6:56:11,6:53:36:1,6:10,0:11:25:28:32:2,6:13,0:10:22
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chr1	95001600	.	A	C	820.79	PASS	AF=1;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00252694;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.222;QD=57.5994;RBI=0.00427745;REFB=0;REVB=0.00345126;RO=0;SAF=31;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.19358e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000109963;OID=.;OPOS=95001600;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:57:0:0:57:57:1:26:31:0:0:26:31:0:0
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chr1	95330372	.	G	A	1083.73	PASS	AF=1;AO=72;DP=73;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00154227;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.223;QD=60.207;RBI=0.00196365;REFB=0;REVB=0.00121545;RO=0;SAF=42;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.1178e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.87162e-05;OID=.;OPOS=95330372;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:72:0:0:72:72:1:30:42:0:0:30:42:0:0
chr1	95709821	.	T	C	746.95	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0333832;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.3343;QD=63.5705;RBI=0.0439131;REFB=0;REVB=0.0285294;RO=0;SAF=25;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000629236;OID=.;OPOS=95709821;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:22:25:0:0:22:25:0:0
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chr1	97272456	.	A	G	1312.11	PASS	AF=1;AO=85;DP=86;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00754428;FXX=0.0229859;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.589;QD=61.7462;RBI=0.0192043;REFB=-0.125382;REVB=0.0176603;RO=0;SAF=46;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000174353;OID=.;OPOS=97272456;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:86:85:0:0:85:85:1:39:46:0:0:39:46:0:0
chr1	97915670	.	G	A	309.59	PASS	AF=0.380435;AO=35;DP=92;FAO=35;FDP=92;FR=.;FRO=57;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=30;FSRR=27;FWDB=-0.00161921;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.471;QD=13.4605;RBI=0.00649658;REFB=0.00641471;REVB=0.00629156;RO=54;SAF=16;SAR=19;SRF=28;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0654614;STB=0.542833;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=-0.00721262;OID=.;OPOS=97915670;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:54:57:35:35:0.380435:19:16:28:26:19:16:30:27
chr1	97981395	.	T	A,C	810.41	PASS	AF=0.0175439,0.982456;AO=2,55;DP=57;FAO=1,56;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=0,29;FSAR=1,27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00838053,-0.00782562;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=240.028,102.111;QD=56.8707;RBI=0.0087649,0.0593784;REFB=0,0;REVB=0.00256712,0.0588604;RO=0;SAF=0,29;SAR=2,26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.40922e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0939102,0.000393055;OID=.,.;OPOS=97981395,97981395;OREF=T,T;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:4:57:57:0:0:2,55:1,56:0.0175439,0.982456:2,26:0,29:0:0:1,27:0,29:0:0
chr1	98348885	.	G	A	1453.48	PASS	AF=1;AO=92;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00199798;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.499;QD=63.1948;RBI=0.0236374;REFB=0;REVB=0.0235528;RO=0;SAF=49;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.05234e-05;OID=.;OPOS=98348885;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:92:92:0:0:92:92:1:43:49:0:0:43:49:0:0
chr1	99127392	.	T	C	754.39	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0291495;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.1896;QD=56.9347;RBI=0.0516043;REFB=0;REVB=0.042583;RO=0;SAF=37;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.33586e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000159342;OID=.;OPOS=99127392;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:16:37:0:0:16:37:0:0
chr1	99156634	.	T	A	751.46	PASS	AF=0.563492;AO=71;DP=126;FAO=71;FDP=126;FR=.;FRO=55;FSAF=40;FSAR=31;FSRF=33;FSRR=22;FWDB=0.0165986;FXX=0.0078734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.393;QD=23.856;RBI=0.0199889;REFB=-0.0112385;REVB=0.0111373;RO=54;SAF=40;SAR=31;SRF=32;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0235856;STB=0.516308;STBP=0.702;TYPE=snp;VARB=0.0129076;OID=.;OPOS=99156634;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:126:126:54:55:71:71:0.563492:31:40:32:22:31:40:33:22
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chr1	100547994	.	T	C	1208.79	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00958412;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=213.323;QD=61.2045;RBI=0.0250122;REFB=0;REVB=0.0231031;RO=0;SAF=42;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.9934e-05;OID=.;OPOS=100547994;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:37:42:0:0:37:42:0:0
chr1	100575933	.	G	A	1658.05	PASS	AF=1;AO=110;DP=110;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0321709;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.3595;QD=60.2927;RBI=0.0347034;REFB=0;REVB=0.0130139;RO=0;SAF=54;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.46761e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000216141;OID=.;OPOS=100575933;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:110:110:0:0:110:110:1:56:54:0:0:56:54:0:0
chr1	100598866	.	GC	AT	854.42	PASS	AF=1;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00114031;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=2;MLLD=237.598;QD=57.9268;RBI=0.0190754;REFB=0;REVB=0.0190413;RO=0;SAF=17;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=-3.72395e-05;OID=.;OPOS=100598866;OREF=GC;OALT=AT;OMAPALT=AT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:59:0:0:59:59:1:42:17:0:0:42:17:0:0
chr1	100671865	.	TTAA	T,TAAA,TT	150.5	PASS	AF=1,0,0;AO=6,7,5;DP=33;FAO=16,0,0;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=9,0,0;FSAR=7,0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0926987,0.26498,0.00419482;FXX=0.333194;HRUN=6,6,13;LEN=3,1,2;MLLD=14.2711,6.14661,7.86902;QD=37.6258;RBI=0.211105,0.382053,0.2371;REFB=0,0,0;REVB=0.189663,-0.275227,0.237063;RO=8;SAF=3,5,4;SAR=3,2,1;SRF=1;SRR=7;SSEN=0,0,0;SSEP=0.431373,0,0;SSSB=0.361323,0.490947,0.598683;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,snp,del;VARB=0.0163234,0.0402761,0;OID=.,.,.;OPOS=100671866,100671866,100671867;OREF=TAA,T,AA;OALT=-,A,-;OMAPALT=T,TAAA,TT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:1,0,0:6,7,5:33:16,0,0:16:0:9,0,0:7,0,0:0:0:3:8:3,5,4:3,2,1:1:7
chr1	100672060	.	T	C	1822.52	PASS	AF=1;AO=119;DP=119;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0208011;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.461;QD=61.2612;RBI=0.0287397;REFB=0;REVB=0.0198314;RO=0;SAF=70;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.0618e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.69005e-05;OID=.;OPOS=100672060;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:119:119:0:0:119:119:1:49:70:0:0:49:70:0:0
chr1	101005855	.	T	C	726.89	PASS	AF=0.963636;AO=53;DP=55;FAO=53;FDP=55;FR=.;FRO=2;FSAF=30;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00630258;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=267.579;QD=52.8647;RBI=0.0112885;REFB=0.0155584;REVB=0.00936524;RO=2;SAF=30;SAR=23;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00459838;STB=0.502442;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=-0.000335033;OID=.;OPOS=101005855;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:55:55:2:2:53:53:0.963636:23:30:1:1:23:30:1:1
chr1	101006577	.	A	G	730.53	PASS	AF=1;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0468154;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.787;QD=63.5239;RBI=0.0501537;REFB=0;REVB=-0.017992;RO=0;SAF=19;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.56953e-05;OID=.;OPOS=101006577;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:46:0:0:46:46:1:27:19:0:0:27:19:0:0
chr1	101007036	.	T	C	233.7	PASS	AF=0.578947;AO=22;DP=38;FAO=22;FDP=38;FR=.;FRO=16;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=-0.00818972;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.082;QD=24.5996;RBI=0.00832702;REFB=0.00274777;REVB=-0.00150589;RO=16;SAF=13;SAR=9;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0268045;STB=0.514912;STBP=0.832;TYPE=snp;VARB=-0.00221169;OID=.;OPOS=101007036;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:16:16:22:22:0.578947:9:13:10:6:9:13:10:6
chr1	101007055	.	C	T	575.79	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0303629;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.716;QD=60.6096;RBI=0.0307186;REFB=0;REVB=-0.00466081;RO=0;SAF=23;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000283026;OID=.;OPOS=101007055;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:15:23:0:0:15:23:0:0
chr1	101203827	.	G	A	232.44	PASS	AF=0.378378;AO=28;DP=74;FAO=28;FDP=74;FR=.;FRO=46;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=-0.00379384;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.277;QD=12.5643;RBI=0.0136801;REFB=0.00369035;REVB=-0.0131435;RO=45;SAF=17;SAR=11;SRF=21;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152154;STB=0.580996;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=-0.0055101;OID=.;OPOS=101203827;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:45:46:28:28:0.378378:11:17:21:24:11:17:22:24
chr1	101440878	.	TTA	AAA,T,TTT	58.69	PASS	AF=0,0.321429,0;AO=2,6,8;DP=51;FAO=0,9,0;FDP=28;FR=.;FRO=19;FSAF=0,1,0;FSAR=0,8,0;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=0.013995,-0.117671,-0.0433715;FXX=0.263089;HRUN=8,8,7;LEN=2,2,1;MLLD=26.0194,15.9092,11.5319;QD=8.38357;RBI=0.0848195,0.118914,0.163223;REFB=0.0143775,-0.00985903,-0.0348739;REVB=0.0836569,0.0171513,-0.157355;RO=22;SAF=2,0,1;SAR=0,6,7;SRF=10;SRR=12;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.518239,-0.694908,-0.460837;STB=0.5,0.726653,0.5;STBP=1,0.205,1;TYPE=mnp,del,snp;VARB=0,-0.0347584,0;OID=.,.,.;OPOS=101440878,101440879,101440880;OREF=TT,TA,A;OALT=AA,-,T;OMAPALT=AAA,T,TTT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:60:51:28:22:19:2,6,8:0,9,0:0,0.321429,0:0,6,7:2,0,1:10:12:0,8,0:0,1,0:6:13
chr1	103352451	.	A	G	843.01	PASS	AF=0.983607;AO=58;DP=59;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0276911;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.9852;QD=55.2796;RBI=0.0315784;REFB=0.0238473;REVB=0.0151788;RO=1;SAF=29;SAR=29;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0159891;STB=0.508194;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.00042919;OID=.;OPOS=103352451;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:59:61:1:1:58:60:0.983607:29:29:0:1:30:30:0:1
chr1	103354138	.	A	G	1823.3	PASS	AF=1;AO=119;DP=121;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00906982;FXX=0.0165276;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.206;QD=61.2873;RBI=0.0124998;REFB=0;REVB=0.00860134;RO=0;SAF=54;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000133726;OID=.;OPOS=103354138;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:121:119:0:0:119:119:1:65:54:0:0:65:54:0:0
chr1	103354428	.	A	G	1135.08	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0124293;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=116.682;QD=60.5376;RBI=0.0166702;REFB=0;REVB=0.0111089;RO=0;SAF=36;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.6999e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.91249e-05;OID=.;OPOS=103354428;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:39:36:0:0:39:36:0:0
chr1	103379918	.	G	A	1243.47	PASS	AF=1;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0787695;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.4421;QD=61.4058;RBI=0.0797081;REFB=0;REVB=0.0121966;RO=0;SAF=39;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000540842;OID=.;OPOS=103379918;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:81:0:0:81:81:1:42:39:0:0:42:39:0:0
chr1	103444679	.	T	G	1030.66	PASS	AF=0.985915;AO=69;DP=70;FAO=70;FDP=71;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0643954;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=160.361;QD=58.0654;RBI=0.0645869;REFB=0.0817297;REVB=0.00497025;RO=1;SAF=33;SAR=36;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0129508;STB=0.506847;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=-0.000142038;OID=.;OPOS=103444679;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:70:71:1:1:69:70:0.985915:36:33:0:1:36:34:0:1
chr1	103471456	.	CCAT	C	661.18	PASS	AF=0.492611;AO=120;DP=232;FAO=100;FDP=203;FR=.;FRO=103;FSAF=3;FSAR=97;FSRF=27;FSRR=76;FWDB=-0.107245;FXX=0.408151;HRUN=2;LEN=3;MLLD=218.643;QD=13.0281;RBI=0.108144;REFB=-0.000396377;REVB=-0.0139124;RO=3;SAF=61;SAR=59;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.022785;STB=0.84854;STBP=0;TYPE=del;VARB=0.000406373;OID=.;OPOS=103471457;OREF=CAT;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.492611:120:232:100:203:103:3:97:27:76:99:3:61:59:3:0
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chr1	107600186	.	G	A	276.17	PASS	AF=0.410256;AO=31;DP=78;FAO=32;FDP=78;FR=.;FRO=46;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=24;FSRR=22;FWDB=0.0158689;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.054;QD=14.1626;RBI=0.0684271;REFB=-0.0190329;REVB=0.0665616;RO=44;SAF=11;SAR=20;SRF=23;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177833;STB=0.588179;STBP=0.203;TYPE=snp;VARB=0.0535825;OID=.;OPOS=107600186;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:44:46:31:32:0.410256:20:11:23:21:20:12:24:22
chr1	107600869	.	G	A	470.45	PASS	AF=0.505495;AO=46;DP=91;FAO=46;FDP=91;FR=.;FRO=45;FSAF=18;FSAR=28;FSRF=22;FSRR=23;FWDB=0.00272036;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=331.134;QD=20.679;RBI=0.0083976;REFB=-0.0127283;REVB=-0.00794477;RO=45;SAF=18;SAR=28;SRF=22;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0893891;STB=0.549537;STBP=0.36;TYPE=snp;VARB=0.0112767;OID=.;OPOS=107600869;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:45:45:46:46:0.505495:28:18:22:23:28:18:22:23
chr1	107979396	.	A	C	1901.11	PASS	AF=0.992;AO=123;DP=125;FAO=124;FDP=125;FR=.;FRO=1;FSAF=62;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00169378;FXX=0.0157468;HRUN=3;LEN=1;MLLD=196.293;QD=60.8354;RBI=0.0274752;REFB=-0.0750163;REVB=0.027423;RO=0;SAF=62;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.55703e-08;STB=0.503999;STBP=0.494;TYPE=snp;VARB=1.46713e-05;OID=.;OPOS=107979396;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:125:125:0:1:123:124:0.992:61:62:0:0:62:62:0:1
chr1	108023589	.	A	C	114.68	PASS	AF=0.318182;AO=14;DP=44;FAO=14;FDP=44;FR=.;FRO=30;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=-0.0169863;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.874;QD=10.4252;RBI=0.0238691;REFB=-0.0171906;REVB=-0.016769;RO=28;SAF=6;SAR=8;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.526278;STBP=0.814;TYPE=snp;VARB=0.0316641;OID=.;OPOS=108023589;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:28:30:14:14:0.318182:8:6:12:16:8:6:14:16
chr1	108113510	.	G	T	70.58	PASS	AF=0.5625;AO=9;DP=16;FAO=9;FDP=16;FR=.;FRO=7;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0401955;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.349;QD=17.6438;RBI=0.0412859;REFB=-0.0185749;REVB=0.00942585;RO=7;SAF=7;SAR=2;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.193732;STB=0.613759;STBP=0.385;TYPE=snp;VARB=0.0187438;OID=.;OPOS=108113510;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:16:16:7:7:9:9:0.5625:2:7:4:3:2:7:4:3
chr1	108113526	.	C	G	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00858735;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.3635;QD=47.8214;RBI=0.016735;REFB=0;REVB=0.0143637;RO=0;SAF=11;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.36667e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000485193;OID=.;OPOS=108113526;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:5:11:0:0:5:11:0:0
chr1	108115145	.	T	C	680.97	PASS	AF=0.962264;AO=49;DP=51;FAO=51;FDP=53;FR=.;FRO=2;FSAF=21;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0259786;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.6696;QD=51.3937;RBI=0.0458641;REFB=-0.0377632;REVB=0.0377972;RO=2;SAF=20;SAR=29;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00699852;STB=0.503431;STBP=0.869;TYPE=snp;VARB=0.0132825;OID=.;OPOS=108115145;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:51:53:2:2:49:51:0.962264:29:20:1:1:30:21:1:1
chr1	108185301	.	C	G	263.53	PASS	AF=0.483333;AO=29;DP=60;FAO=29;FDP=60;FR=.;FRO=31;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=10;FSRR=21;FWDB=-0.0192039;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.554;QD=17.5684;RBI=0.0215283;REFB=0.00310144;REVB=-0.0097303;RO=30;SAF=11;SAR=18;SRF=9;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0783104;STB=0.531577;STBP=0.697;TYPE=snp;VARB=-0.0126678;OID=.;OPOS=108185301;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:30:31:29:29:0.483333:18:11:9:21:18:11:10:21
chr1	108185309	.	G	A	259.1	PASS	AF=0.460317;AO=29;DP=63;FAO=29;FDP=63;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=0.00128974;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=306.947;QD=16.4505;RBI=0.0106583;REFB=0.00511988;REVB=-0.01058;RO=33;SAF=11;SAR=18;SRF=12;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0158265;STB=0.501741;STBP=0.988;TYPE=snp;VARB=-0.00478925;OID=.;OPOS=108185309;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:33:34:29:29:0.460317:18:11:12:21:18:11:13:21
chr1	108307727	.	T	A	1994.49	PASS	AF=0.992308;AO=128;DP=130;FAO=129;FDP=130;FR=.;FRO=1;FSAF=64;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00507281;FXX=0.0151504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.921;QD=61.369;RBI=0.00905116;REFB=-0.081683;REVB=0.00749601;RO=0;SAF=63;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.1359e-08;STB=0.503816;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.000278954;OID=.;OPOS=108307727;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:130:130:0:1:128:129:0.992308:65:63:0:0:65:64:0:1
chr1	108313258	.	C	T	602.49	PASS	AF=0.913043;AO=42;DP=46;FAO=42;FDP=46;FR=.;FRO=4;FSAF=30;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=-0.00477048;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.3694;QD=52.3901;RBI=0.0563471;REFB=-0.100113;REVB=-0.0561448;RO=4;SAF=30;SAR=12;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133299;STB=0.571393;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.00748486;OID=.;OPOS=108313258;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:17:46:46:4:4:42:42:0.913043:12:30:0:4:12:30:0:4
chr1	108771664	.	C	A	431.13	PASS	AF=0.345912;AO=50;DP=154;FAO=55;FDP=159;FR=.;FRO=104;FSAF=27;FSAR=28;FSRF=53;FSRR=51;FWDB=0.000830217;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.482;QD=10.8459;RBI=0.012152;REFB=-0.0213081;REVB=-0.0121236;RO=103;SAF=23;SAR=27;SRF=53;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0636109;STB=0.51223;STBP=0.835;TYPE=snp;VARB=0.0399463;OID=.;OPOS=108771664;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:154:159:103:104:50:55:0.345912:27:23:53:50:28:27:53:51
chr1	109173710	.	G	A	269.51	PASS	AF=0.508772;AO=30;DP=57;FAO=29;FDP=57;FR=.;FRO=28;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=0.0236555;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.0441;QD=18.913;RBI=0.0268209;REFB=-0.00981978;REVB=-0.0126402;RO=27;SAF=20;SAR=10;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0349622;STB=0.54567;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.00483637;OID=.;OPOS=109173710;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:27:28:30:29:0.508772:10:20:17:10:9:20:17:11
chr1	109256135	.	T	C	327.91	PASS	AF=0.53125;AO=34;DP=64;FAO=34;FDP=64;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=23;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=5.62842e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.417;QD=20.4946;RBI=0.0151983;REFB=-0.0178631;REVB=0.0151982;RO=30;SAF=11;SAR=23;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159203;STB=0.588529;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.0115804;OID=.;OPOS=109256135;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:30:30:34:34:0.53125:23:11:15:15:23:11:15:15
chr1	109265029	.	G	T	1590.6	PASS	AF=0.990741;AO=107;DP=108;FAO=107;FDP=108;FR=.;FRO=1;FSAF=54;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00943984;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=82.1731;QD=58.9111;RBI=0.0095628;REFB=-0.108906;REVB=-0.00152858;RO=1;SAF=54;SAR=53;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0088714;STB=0.504672;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=-4.59613e-05;OID=.;OPOS=109265029;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:108:108:1:1:107:107:0.990741:53:54:0:1:53:54:0:1
chr1	109351501	.	A	G	451.86	PASS	AF=1;AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00440887;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.657;QD=58.3043;RBI=0.0174678;REFB=0;REVB=0.0169023;RO=0;SAF=13;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.33668e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000288839;OID=.;OPOS=109351501;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:31:0:0:31:31:1:18:13:0:0:18:13:0:0
chr1	109363232	.	T	C	639.58	PASS	AF=0.934783;AO=43;DP=46;FAO=43;FDP=46;FR=.;FRO=3;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0291204;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=69.127;QD=55.616;RBI=0.0679506;REFB=0.0334319;REVB=0.0613945;RO=3;SAF=24;SAR=19;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0134713;STB=0.507183;STBP=0.715;TYPE=snp;VARB=-0.000752903;OID=.;OPOS=109363232;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:46:46:3:3:43:43:0.934783:19:24:2:1:19:24:2:1
chr1	109369915	.	G	T	302.53	PASS	AF=0.507692;AO=31;DP=63;FAO=33;FDP=65;FR=.;FRO=32;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=21;FWDB=-0.0203873;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.454;QD=18.6175;RBI=0.0245486;REFB=-0.00469981;REVB=0.0136745;RO=30;SAF=19;SAR=12;SRF=9;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.271629;STB=0.627809;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.00522881;OID=.;OPOS=109369915;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:65:30:32:31:33:0.507692:12:19:9:21:13:20:11:21
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chr1	109395105	.	C	T	170.33	PASS	AF=0.45;AO=18;DP=40;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=0.00565967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.248;QD=17.0332;RBI=0.00716566;REFB=-0.0044983;REVB=-0.00439487;RO=21;SAF=11;SAR=7;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0845838;STB=0.537314;STBP=0.693;TYPE=snp;VARB=0.00583217;OID=.;OPOS=109395105;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:21:22:18:18:0.45:7:11:11:10:7:11:12:10
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chr1	109472773	.	G	A	1507.19	PASS	AF=0.980952;AO=102;DP=104;FAO=103;FDP=105;FR=.;FRO=2;FSAF=42;FSAR=61;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0196359;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.1647;QD=57.4168;RBI=0.0561945;REFB=-0.0846298;REVB=0.0526522;RO=1;SAF=42;SAR=60;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0111623;STB=0.501817;STBP=0.85;TYPE=snp;VARB=0.00166135;OID=.;OPOS=109472773;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:104:105:1:2:102:103:0.980952:60:42:1:0:61:42:1:1
chr1	109479978	.	G	T	175.08	PASS	AF=0.514286;AO=18;DP=35;FAO=18;FDP=35;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.0498071;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.5937;QD=20.0093;RBI=0.0543838;REFB=-0.0153507;REVB=-0.0218369;RO=16;SAF=6;SAR=12;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0384389;STB=0.541619;STBP=0.656;TYPE=snp;VARB=0.0155173;OID=.;OPOS=109479978;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:16:17:18:18:0.514286:12:6:6:10:12:6:7:10
chr1	109486196	.	A	G	501.65	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0493086;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.807;QD=59.0173;RBI=0.0809995;REFB=0;REVB=0.0642618;RO=0;SAF=17;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000821474;OID=.;OPOS=109486196;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:17:17:0:0:17:17:0:0
chr1	109656946	.	T	C	1684.28	PASS	AF=1;AO=111;DP=113;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00647374;FXX=0.0176975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.522;QD=60.695;RBI=0.028339;REFB=0;REVB=0.0275896;RO=0;SAF=46;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.86979e-05;OID=.;OPOS=109656946;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:113:111:0:0:111:111:1:65:46:0:0:65:46:0:0
chr1	109704618	.	A	G	107.93	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.032574;FXX=0.0908265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.213;QD=43.1728;RBI=0.0770604;REFB=0;REVB=-0.0698373;RO=0;SAF=3;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000349844;OID=.;OPOS=109704618;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:7:3:0:0:7:3:0:0
chr1	109735298	.	T	C	727.8	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0161727;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=310.842;QD=63.2868;RBI=0.0179492;REFB=0;REVB=0.00778565;RO=0;SAF=26;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.16744e-05;OID=.;OPOS=109735298;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:20:26:0:0:20:26:0:0
chr1	109735416	.	A	C	675.57	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0262221;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.592;QD=62.8433;RBI=0.0297957;REFB=0;REVB=0.0141486;RO=0;SAF=23;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.4817e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.84202e-05;OID=.;OPOS=109735416;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:43:0:0:40:43:1:17:23:0:0:18:25:0:0
chr1	109737063	.	C	T	465.14	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00843618;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.386;QD=58.1421;RBI=0.0445446;REFB=0;REVB=0.0437385;RO=0;SAF=8;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000160832;OID=.;OPOS=109737063;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:24:8:0:0:24:8:0:0
chr1	109737090	.	G	A	538.48	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.111137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.4369;QD=59.8308;RBI=0.111259;REFB=0;REVB=0.00519611;RO=0;SAF=9;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00105517;OID=.;OPOS=109737090;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:27:9:0:0:27:9:0:0
chr1	109737132	.	T	C	587.72	PASS	AF=0.975;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-4.56909e-05;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.013;QD=58.7717;RBI=0.0101527;REFB=-0.0609835;REVB=0.0101526;RO=0;SAF=12;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509086;STBP=0.606;TYPE=snp;VARB=0.00167143;OID=.;OPOS=109737132;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:39:40:0:1:39:39:0.975:27:12:0:0:27:12:0:1
chr1	109737172	.	C	T	613.36	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0190723;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.051;QD=61.3361;RBI=0.0311009;REFB=0;REVB=0.0245666;RO=0;SAF=13;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.09012e-05;OID=.;OPOS=109737172;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:27:13:0:0:27:13:0:0
chr1	109742485	.	G	A	575.8	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00263303;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.279;QD=60.6103;RBI=0.0356058;REFB=0;REVB=0.0355083;RO=0;SAF=18;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.51048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000129216;OID=.;OPOS=109742485;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:20:18:0:0:20:18:0:0
chr1	109745618	.	T	C	974.61	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0363043;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.9084;QD=59.0674;RBI=0.0364013;REFB=0;REVB=0.00265655;RO=0;SAF=23;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000131408;OID=.;OPOS=109745618;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:66:0:0:61:66:1:38:23:0:0:39:27:0:0
chr1	109771063	.	T	C	940.77	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00158047;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.5;QD=58.7982;RBI=0.111184;REFB=0;REVB=0.111173;RO=0;SAF=26;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000237026;OID=.;OPOS=109771063;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:38:26:0:0:38:26:0:0
chr1	109792735	.	A	ACGC	60.07	PASS	AF=0.875;AO=6;DP=10;FAO=7;FDP=8;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00592924;FXX=0.110988;HRUN=1;LEN=3;MLLD=199.708;QD=30.0361;RBI=0.00592924;REFB=-0.103877;REVB=0;RO=3;SAF=6;SAR=0;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00890341;OID=.;OPOS=109792736;OREF=-;OALT=CGC;OMAPALT=ACGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.875:6:10:7:8:1:7:0:1:0:7:3:6:0:3:0
chr1	109794252	.	T	C	754.36	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0522998;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.3451;QD=56.9326;RBI=0.0556573;REFB=0;REVB=0.0190385;RO=0;SAF=30;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.72004e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000276305;OID=.;OPOS=109794252;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:23:30:0:0:23:30:0:0
chr1	109795608	.	T	C	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0245602;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.4995;QD=33.4253;RBI=0.0583893;REFB=0;REVB=-0.0529727;RO=0;SAF=3;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00727365;OID=.;OPOS=109795608;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:3:3:0:0:3:3:0:0
chr1	109806834	.	C	T	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.016134;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=168.755;QD=44.6891;RBI=0.0168536;REFB=0;REVB=-0.00487216;RO=0;SAF=5;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.3688e-05;OID=.;OPOS=109806834;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:8:5:0:0:8:5:0:0
chr1	109807099	.	G	A	1012.97	PASS	AF=0.958904;AO=70;DP=73;FAO=70;FDP=73;FR=.;FRO=3;FSAF=39;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0073202;FXX=0.0135117;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.196;QD=55.5051;RBI=0.0275254;REFB=-0.014062;REVB=0.0265341;RO=3;SAF=39;SAR=31;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0175625;STB=0.509297;STBP=0.462;TYPE=snp;VARB=0.00187061;OID=.;OPOS=109807099;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:73:73:3:3:70:70:0.958904:31:39:1:2:31:39:1:2
chr1	109816176	.	A	C	235.5	PASS	AF=1;AO=18;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0267584;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.942;QD=49.5783;RBI=0.0281378;REFB=0;REVB=-0.00870209;RO=0;SAF=4;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000110903;OID=.;OPOS=109816176;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:18:19:1:14:4:0:0:15:4:0:0
chr1	109818263	.	G	A	1587.79	PASS	AF=1;AO=99;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00623623;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=273.307;QD=64.1533;RBI=0.00778013;REFB=0;REVB=-0.00465187;RO=0;SAF=53;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.53256e-06;OID=.;OPOS=109818263;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:99:99:0:0:99:99:1:46:53:0:0:46:53:0:0
chr1	109825360	.	C	T	427.26	PASS	AF=0.939394;AO=31;DP=33;FAO=31;FDP=33;FR=.;FRO=2;FSAF=7;FSAR=24;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00361496;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.196;QD=51.7896;RBI=0.00897342;REFB=-0.0463792;REVB=0.00821306;RO=2;SAF=7;SAR=24;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115973;STB=0.562457;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.000786428;OID=.;OPOS=109825360;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:33:33:2:2:31:31:0.939394:24:7:2:0:24:7:2:0
chr1	109836842	.	C	G	501.65	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-4.55587e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.187;QD=59.018;RBI=0.0637673;REFB=0;REVB=-0.0637673;RO=0;SAF=26;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000304096;OID=.;OPOS=109836842;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:8:26:0:0:8:26:0:0
chr1	109838918	.	C	T	993.79	PASS	AF=1;AO=67;DP=68;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0116371;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.8539;QD=59.3309;RBI=0.0266131;REFB=0;REVB=0.0239339;RO=0;SAF=47;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000167196;OID=.;OPOS=109838918;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:67:0:0:67:67:1:20:47:0:0:20:47:0:0
chr1	109839433	.	A	G	1622.68	PASS	AF=1;AO=108;DP=108;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0150627;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.926;QD=60.0993;RBI=0.020696;REFB=0;REVB=0.0141929;RO=0;SAF=49;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.62579e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.16086e-06;OID=.;OPOS=109839433;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:108:108:0:0:108:108:1:59:49:0:0:59:49:0:0
chr1	109856306	.	G	A	394.6	PASS	AF=0.460674;AO=40;DP=89;FAO=41;FDP=89;FR=.;FRO=48;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=32;FWDB=-0.00472091;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.1041;QD=17.7347;RBI=0.033857;REFB=-0.0265704;REVB=0.0335263;RO=48;SAF=23;SAR=17;SRF=16;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.232128;STB=0.620893;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.0303571;OID=.;OPOS=109856306;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:48:48:40:41:0.460674:17:23:16:32:18:23:16:32
chr1	109856384	.	CAA	C	127.89	PASS	AF=0.44;AO=18;DP=47;FAO=22;FDP=50;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=0.0621629;FXX=0.019604;HRUN=6;LEN=2;MLLD=22.7636;QD=10.2315;RBI=0.0628802;REFB=0.00293354;REVB=-0.00947104;RO=22;SAF=9;SAR=9;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0436846;STB=0.509425;STBP=0.938;TYPE=del;VARB=0.00670904;OID=.;OPOS=109856385;OREF=AA;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.44:18:47:22:50:28:9:13:11:17:99:22:9:9:10:12
chr1	109884775	.	T	G	422.04	PASS	AF=0.506024;AO=42;DP=84;FAO=42;FDP=83;FR=.;FRO=41;FSAF=16;FSAR=26;FSRF=22;FSRR=19;FWDB=0.0402289;FXX=0.0235266;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.5619;QD=20.339;RBI=0.0422004;REFB=0.00214226;REVB=0.0127478;RO=42;SAF=16;SAR=26;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131484;STB=0.578416;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=-0.00392154;OID=.;OPOS=109884775;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:83:42:41:42:42:0.506024:26:16:22:20:26:16:22:19
chr1	109897100	.	T	C	444.43	PASS	AF=0.558442;AO=43;DP=77;FAO=43;FDP=77;FR=.;FRO=34;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=0.0143627;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.185;QD=23.0874;RBI=0.0161757;REFB=-0.00390603;REVB=-0.00744076;RO=34;SAF=18;SAR=25;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0185451;STB=0.510199;STBP=0.857;TYPE=snp;VARB=0.00279916;OID=.;OPOS=109897100;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:34:34:43:43:0.558442:25:18:15:19:25:18:15:19
chr1	109897103	.	A	G	309.48	PASS	AF=0.441558;AO=34;DP=77;FAO=34;FDP=77;FR=.;FRO=43;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=18;FSRR=25;FWDB=-0.0135178;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=126.853;QD=16.0769;RBI=0.0262934;REFB=-0.0123134;REVB=0.0225524;RO=43;SAF=15;SAR=19;SRF=18;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0227673;STB=0.512813;STBP=0.846;TYPE=snp;VARB=0.0245432;OID=.;OPOS=109897103;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:43:43:34:34:0.441558:19:15:18:25:19:15:18:25
chr1	110019439	.	A	G	292.83	PASS	AF=0.346939;AO=33;DP=97;FAO=34;FDP=98;FR=.;FRO=64;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=32;FSRR=32;FWDB=-0.00602707;FXX=0.0101;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.724;QD=11.9523;RBI=0.0068659;REFB=-0.0152337;REVB=-0.00328862;RO=64;SAF=19;SAR=14;SRF=32;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0869322;STB=0.558218;STBP=0.399;TYPE=snp;VARB=0.0260416;OID=.;OPOS=110019439;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:98:64:64:33:34:0.346939:14:19:32:32:14:20:32:32
chr1	110023432	.	G	A	517.94	PASS	AF=0.538462;AO=49;DP=91;FAO=49;FDP=91;FR=.;FRO=42;FSAF=12;FSAR=37;FSRF=15;FSRR=27;FWDB=-0.0101844;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=186.507;QD=22.7666;RBI=0.0129181;REFB=-0.0107617;REVB=-0.00794698;RO=42;SAF=12;SAR=37;SRF=15;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118167;STB=0.565337;STBP=0.227;TYPE=snp;VARB=0.00948534;OID=.;OPOS=110023432;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:42:42:49:49:0.538462:37:12:15:27:37:12:15:27
chr1	110051462	.	C	T	104.62	PASS	AF=0.571429;AO=12;DP=21;FAO=12;FDP=21;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=-0.0149867;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.424;QD=19.9276;RBI=0.0159137;REFB=-0.00564586;REVB=-0.00535199;RO=9;SAF=4;SAR=8;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00315142;OID=.;OPOS=110051462;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:21:21:9:9:12:12:0.571429:8:4:3:6:8:4:3:6
chr1	110087405	.	T	C	255.01	PASS	AF=0.521739;AO=24;DP=46;FAO=24;FDP=46;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=6;FSRR=16;FWDB=0.00442044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.6488;QD=22.1744;RBI=0.0246083;REFB=-0.0497191;REVB=0.024208;RO=22;SAF=7;SAR=17;SRF=6;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0197695;STB=0.511053;STBP=0.921;TYPE=snp;VARB=0.0203997;OID=.;OPOS=110087405;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:22:22:24:24:0.521739:17:7:6:16:17:7:6:16
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chr1	110170896	.	T	C	1081.1	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00771896;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.641;QD=60.0613;RBI=0.0258386;REFB=0;REVB=0.0246587;RO=0;SAF=22;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.03047e-05;OID=.;OPOS=110170896;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:72:0:0:70:72:1:48:22:0:0:50:22:0:0
chr1	110173775	.	G	T	100.75	PASS	AF=0.48;AO=12;DP=25;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.00912329;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.784;QD=16.1192;RBI=0.0108312;REFB=-0.0117597;REVB=-0.00583782;RO=13;SAF=5;SAR=7;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0410576;STB=0.52377;STBP=0.815;TYPE=snp;VARB=0.00993205;OID=.;OPOS=110173775;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:25:13:13:12:12:0.48:7:5:6:7:7:5:6:7
chr1	110201699	.	T	C	1416.78	PASS	AF=0.970297;AO=98;DP=101;FAO=98;FDP=101;FR=.;FRO=3;FSAF=55;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.00526452;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.6173;QD=56.1101;RBI=0.0862911;REFB=-0.058721;REVB=-0.0861303;RO=3;SAF=55;SAR=43;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0130031;STB=0.506859;STBP=0.467;TYPE=snp;VARB=0.000889183;OID=.;OPOS=110201699;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:101:101:3:3:98:98:0.970297:43:55:1:2:43:55:1:2
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chr1	110201812	.	A	G	400.63	PASS	AF=0.42;AO=42;DP=100;FAO=42;FDP=100;FR=.;FRO=58;FSAF=14;FSAR=28;FSRF=27;FSRR=31;FWDB=0.00393973;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.912;QD=16.0252;RBI=0.00864226;REFB=-0.0235013;REVB=-0.00769202;RO=57;SAF=14;SAR=28;SRF=27;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151681;STB=0.58152;STBP=0.188;TYPE=snp;VARB=0.0370999;OID=.;OPOS=110201812;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:57:58:42:42:0.42:28:14:27:30:28:14:27:31
chr1	110210780	.	C	G	323.47	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0431528;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.882;QD=53.9111;RBI=0.0473429;REFB=0;REVB=0.0194726;RO=0;SAF=11;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000340978;OID=.;OPOS=110210780;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:13:11:0:0:13:11:0:0
chr1	110233138	.	G	C	976.26	PASS	AF=0.985294;AO=67;DP=68;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0050919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.311;QD=57.427;RBI=0.0204659;REFB=-0.0385978;REVB=-0.0198224;RO=1;SAF=24;SAR=43;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.019281;STB=0.510201;STBP=0.261;TYPE=snp;VARB=0.000299898;OID=.;OPOS=110233138;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:68:68:1:1:67:67:0.985294:43:24:1:0:43:24:1:0
chr1	110257814	.	G	C	270.59	PASS	AF=0.413333;AO=31;DP=75;FAO=31;FDP=75;FR=.;FRO=44;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=12;FSRR=32;FWDB=-0.0302212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.5157;QD=14.4316;RBI=0.0489868;REFB=-0.00519205;REVB=0.0385536;RO=44;SAF=10;SAR=21;SRF=12;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0605472;STB=0.534253;STBP=0.659;TYPE=snp;VARB=0.00713493;OID=.;OPOS=110257814;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:44:44:31:31:0.413333:21:10:12:32:21:10:12:32
chr1	110282972	.	G	T	316.82	PASS	AF=0.532258;AO=33;DP=62;FAO=33;FDP=62;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=22;FSRF=8;FSRR=21;FWDB=0.0360121;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.757;QD=20.4401;RBI=0.0361386;REFB=-0.00395753;REVB=-0.00302136;RO=29;SAF=11;SAR=22;SRF=8;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0557564;STB=0.530846;STBP=0.627;TYPE=snp;VARB=0.00332424;OID=.;OPOS=110282972;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:29:29:33:33:0.532258:22:11:8:21:22:11:8:21
chr1	110295772	.	T	C	289.47	PASS	AF=0.577778;AO=26;DP=45;FAO=26;FDP=45;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=-0.00394932;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.582;QD=25.7308;RBI=0.0266004;REFB=-0.0423289;REVB=0.0263056;RO=19;SAF=11;SAR=15;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0850615;STB=0.547034;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.0289124;OID=.;OPOS=110295772;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:19:19:26:26:0.577778:15:11:6:13:15:11:6:13
chr1	110300504	.	A	G	1489.79	PASS	AF=1;AO=91;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0370509;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.8064;QD=63.3953;RBI=0.0480446;REFB=0;REVB=-0.0305862;RO=0;SAF=57;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000334513;OID=.;OPOS=110300504;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:94:94:0:0:91:94:1:34:57:0:0:36:58:0:0
chr1	110301709	.	C	T	727.57	PASS	AF=0.542636;AO=70;DP=128;FAO=70;FDP=129;FR=.;FRO=59;FSAF=27;FSAR=43;FSRF=24;FSRR=35;FWDB=-0.0173533;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.5016;QD=22.5603;RBI=0.0202317;REFB=-0.0106739;REVB=-0.0104011;RO=57;SAF=27;SAR=43;SRF=23;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0153401;STB=0.510116;STBP=0.824;TYPE=snp;VARB=0.00783063;OID=.;OPOS=110301709;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:128:129:57:59:70:70:0.542636:43:27:23:34:43:27:24:35
chr1	110466338	.	C	A	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0252666;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=294.873;QD=51.9167;RBI=0.0308365;REFB=0;REVB=-0.0176774;RO=0;SAF=5;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.78933e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000155616;OID=.;OPOS=110466338;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:16:5:0:0:16:5:0:0
chr1	110466466	.	T	C	170.48	PASS	AF=0.62963;AO=17;DP=27;FAO=17;FDP=27;FR=.;FRO=10;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=-0.0274256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.227;QD=25.2555;RBI=0.0686328;REFB=0.0287663;REVB=-0.062915;RO=10;SAF=14;SAR=3;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.287151;STB=0.662505;STBP=0.065;TYPE=snp;VARB=-0.0109182;OID=.;OPOS=110466466;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:27:27:10:10:17:17:0.62963:3:14:5:5:3:14:5:5
chr1	110466709	.	T	C	3365.61	PASS	AF=1;AO=216;DP=216;FAO=216;FDP=216;FR=.;FRO=0;FSAF=96;FSAR=120;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0312641;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.0002;QD=62.3261;RBI=0.031273;REFB=0;REVB=-0.000746505;RO=0;SAF=96;SAR=120;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000103194;OID=.;OPOS=110466709;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:18:216:216:0:0:216:216:1:120:96:0:0:120:96:0:0
chr1	110467745	.	A	G	941.22	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00283022;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.686;QD=58.8262;RBI=0.0274813;REFB=0;REVB=-0.0273352;RO=0;SAF=35;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.54099e-05;OID=.;OPOS=110467745;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:29:35:0:0:29:35:0:0
chr1	110766454	.	G	A	211.75	PASS	AF=0.488372;AO=21;DP=43;FAO=21;FDP=43;FR=.;FRO=22;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.000109295;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=267.345;QD=19.6972;RBI=0.00127373;REFB=-0.00890569;REVB=-0.00126903;RO=22;SAF=13;SAR=8;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0267774;STB=0.515137;STBP=0.874;TYPE=snp;VARB=0.00884942;OID=.;OPOS=110766454;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:22:22:21:21:0.488372:8:13:13:9:8:13:13:9
chr1	110882444	.	A	G	88.22	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00539041;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.469;QD=39.2068;RBI=0.0428993;REFB=0;REVB=0.0425593;RO=0;SAF=6;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000578515;OID=.;OPOS=110882444;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:3:6:0:0:3:6:0:0
chr1	110883569	.	A	T	171.15	PASS	AF=0.461538;AO=18;DP=39;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=-0.0418269;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.9119;QD=17.5539;RBI=0.0501821;REFB=-0.0184054;REVB=-0.0277265;RO=21;SAF=6;SAR=12;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.229785;STB=0.63143;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.0455097;OID=.;OPOS=110883569;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:21:21:18:18:0.461538:12:6:12:9:12:6:12:9
chr1	110884839	.	AAG	AA,A	583.33	PASS	AF=1,0;AO=41,6;DP=52;FAO=55,0;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=19,0;FSAR=36,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.209588,0.100123;FXX=0.017854;HRUN=2,2;LEN=1,2;MLLD=18.4383,6.39694;QD=42.4236;RBI=0.243897,0.149907;REFB=-0.0175039,-0.00763293;REVB=0.124734,-0.111569;RO=2;SAF=16,0;SAR=25,6;SRF=2;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0.285418,0;SSSB=-0.055096,-0.794076;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=0.00933095,0;OID=.,.;OPOS=110884841,110884840;OREF=G,AG;OALT=-,-;OMAPALT=AA,A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1,0:41,6:52:55,0:55:0:19,0:36,0:0:0:9:2:16,0:25,6:2:0
chr1	110921715	.	T	G	550.4	PASS	AF=0.402685;AO=60;DP=149;FAO=60;FDP=149;FR=.;FRO=89;FSAF=28;FSAR=32;FSRF=42;FSRR=47;FWDB=0.133166;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.9626;QD=14.7759;RBI=0.13605;REFB=-0.00038014;REVB=0.0278631;RO=89;SAF=28;SAR=32;SRF=42;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00558287;STB=0.503144;STBP=0.96;TYPE=snp;VARB=0.00208918;OID=.;OPOS=110921715;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:149:149:89:89:60:60:0.402685:32:28:42:47:32:28:42:47
chr1	110924353	.	G	A	204.42	PASS	AF=0.555556;AO=18;DP=35;FAO=20;FDP=36;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.00435486;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.833;QD=22.7129;RBI=0.0653616;REFB=-0.00273463;REVB=0.0652163;RO=16;SAF=9;SAR=9;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00226738;OID=.;OPOS=110924353;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:36:16:16:18:20:0.555556:9:9:8:8:10:10:8:8
chr1	110949720	.	C	T	207.49	PASS	AF=0.351351;AO=26;DP=74;FAO=26;FDP=74;FR=.;FRO=48;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=34;FWDB=0.00862547;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.286;QD=11.2156;RBI=0.0136873;REFB=-2.9767e-05;REVB=-0.0106274;RO=48;SAF=14;SAR=12;SRF=14;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.273736;STB=0.657031;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=6.11562e-05;OID=.;OPOS=110949720;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:48:48:26:26:0.351351:12:14:14:34:12:14:14:34
chr1	110950439	.	C	T	415.04	PASS	AF=0.5;AO=40;DP=82;FAO=43;FDP=86;FR=.;FRO=43;FSAF=31;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=23;FWDB=0.0313645;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.805;QD=19.3044;RBI=0.0336569;REFB=-0.0136743;REVB=-0.0122089;RO=41;SAF=29;SAR=11;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.237074;STB=0.639295;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0205836;OID=.;OPOS=110950439;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:86:41:43:40:43:0.5:11:29:20:21:12:31:20:23
chr1	110998854	.	G	A	267.69	PASS	AF=0.392405;AO=31;DP=80;FAO=31;FDP=79;FR=.;FRO=48;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=26;FSRR=22;FWDB=0.00743482;FXX=0.0124984;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.307;QD=13.5537;RBI=0.0111345;REFB=-0.00478742;REVB=-0.00828862;RO=47;SAF=14;SAR=17;SRF=25;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0848582;STB=0.554614;STBP=0.478;TYPE=snp;VARB=0.00886079;OID=.;OPOS=110998854;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:79:47:48:31:31:0.392405:17:14:25:22:17:14:26:22
chr1	111060669	.	T	C	186.37	PASS	AF=0.333333;AO=24;DP=72;FAO=24;FDP=72;FR=.;FRO=48;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=28;FWDB=-0.0154597;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=182.731;QD=10.3536;RBI=0.020106;REFB=-0.011201;REVB=0.0128549;RO=48;SAF=10;SAR=14;SRF=20;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0180264;OID=.;OPOS=111060669;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:48:48:24:24:0.333333:14:10:20:28:14:10:20:28
chr1	111061062	.	T	C	341.5	PASS	AF=0.392157;AO=40;DP=102;FAO=40;FDP=102;FR=.;FRO=62;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=41;FSRR=21;FWDB=-0.00393876;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=333.674;QD=13.3923;RBI=0.015264;REFB=-0.0047079;REVB=-0.014747;RO=60;SAF=24;SAR=16;SRF=41;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.094173;STB=0.5394;STBP=0.561;TYPE=snp;VARB=0.00723717;OID=.;OPOS=111061062;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:60:62:40:40:0.392157:16:24:41:19:16:24:41:21
chr1	111783996	.	A	C,G	1443.08	PASS	AF=0.0322581,0.967742;AO=4,89;DP=93;FAO=3,90;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=0,49;FSAR=3,41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0213441,0.00349941;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=9.53539,219.857;QD=62.068;RBI=0.0762936,0.0059724;REFB=0,0;REVB=-0.0732471,-0.0048398;RO=0;SAF=0,49;SAR=4,40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.190183,-0.000258106;OID=.,.;OPOS=111783996,111783996;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:6:93:93:0:0:4,89:3,90:0.0322581,0.967742:4,40:0,49:0:0:3,41:0,49:0:0
chr1	111833488	.	C	CCT	2195.16	PASS	AF=0.985915;AO=137;DP=146;FAO=140;FDP=142;FR=.;FRO=2;FSAF=64;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0281873;FXX=0.0206882;HRUN=2;LEN=2;MLLD=298.656;QD=61.8354;RBI=0.0322887;REFB=-0.0147108;REVB=0.0157492;RO=4;SAF=63;SAR=74;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00217737;STB=0.506493;STBP=0.232;TYPE=ins;VARB=3.57339e-05;OID=.;OPOS=111833489;OREF=-;OALT=CT;OMAPALT=CCT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:0.985915:137:146:140:142:2:64:76:0:2:4:4:63:74:2:2
chr1	111833517	.	G	A	2408.94	PASS	AF=1;AO=150;DP=150;FAO=150;FDP=150;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0215465;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.75;QD=64.2383;RBI=0.0342391;REFB=0;REVB=0.0266095;RO=0;SAF=69;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.05753e-05;OID=.;OPOS=111833517;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:150:150:0:0:150:150:1:81:69:0:0:81:69:0:0
chr1	111857154	.	T	C	412.79	PASS	AF=0.477273;AO=42;DP=88;FAO=42;FDP=88;FR=.;FRO=46;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=29;FSRR=17;FWDB=-0.00586685;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=208.235;QD=18.763;RBI=0.0249443;REFB=0.000952874;REVB=0.0242446;RO=46;SAF=25;SAR=17;SRF=29;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0345406;STB=0.519222;STBP=0.751;TYPE=snp;VARB=-0.000624297;OID=.;OPOS=111857154;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:46:46:42:42:0.477273:17:25:29:17:17:25:29:17
chr1	111858444	.	C	T	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0183807;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.154;QD=55.0984;RBI=0.0293107;REFB=0;REVB=-0.0228313;RO=0;SAF=11;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.45129e-05;OID=.;OPOS=111858444;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:15:11:0:0:15:11:0:0
chr1	111861841	.	A	G	463.82	PASS	AF=0.479167;AO=46;DP=96;FAO=46;FDP=96;FR=.;FRO=50;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=17;FSRR=33;FWDB=0.0277291;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.762;QD=19.326;RBI=0.0280566;REFB=-0.000935744;REVB=0.00427474;RO=50;SAF=21;SAR=25;SRF=17;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111406;STB=0.561782;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=0.00117518;OID=.;OPOS=111861841;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:96:50:50:46:46:0.479167:25:21:17:33:25:21:17:33
chr1	111861974	.	T	C	277.42	PASS	AF=0.5;AO=30;DP=60;FAO=30;FDP=60;FR=.;FRO=30;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=23;FWDB=0.00563482;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=261.725;QD=18.4948;RBI=0.0073035;REFB=-0.00614119;REVB=-0.0046465;RO=30;SAF=19;SAR=11;SRF=7;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.34749;STB=0.693011;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.00591433;OID=.;OPOS=111861974;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:30:30:30:30:0.5:11:19:7:23:11:19:7:23
chr1	111862952	.	T	G	266.63	PASS	AF=0.528302;AO=28;DP=55;FAO=28;FDP=53;FR=.;FRO=25;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.0508818;FXX=0.036357;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.0492;QD=20.1227;RBI=0.0610567;REFB=-0.0266162;REVB=-0.0337485;RO=25;SAF=8;SAR=20;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.216543;STB=0.621211;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=0.0195878;OID=.;OPOS=111862952;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:53:25:25:28:28:0.528302:20:8:13:12:20:8:13:12
chr1	111893958	.	A	G	245.18	PASS	AF=0.444444;AO=28;DP=63;FAO=28;FDP=63;FR=.;FRO=35;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=0.00233868;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.735;QD=15.5671;RBI=0.012646;REFB=0.00344811;REVB=0.0124279;RO=35;SAF=8;SAR=20;SRF=13;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0978253;STB=0.555514;STBP=0.491;TYPE=snp;VARB=-0.00454609;OID=.;OPOS=111893958;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:35:35:28:28:0.444444:20:8:13:22:20:8:13:22
chr1	111957097	.	C	G	837.44	PASS	AF=1;AO=57;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00678544;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.1765;QD=57.7543;RBI=0.00692969;REFB=0;REVB=-0.00140652;RO=0;SAF=32;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.5536e-05;OID=.;OPOS=111957097;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:57:58:1:25:32:0:0:25:33:0:0
chr1	111957245	.	G	A	334.32	PASS	AF=0.444444;AO=36;DP=82;FAO=36;FDP=81;FR=.;FRO=45;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=27;FWDB=-0.0101329;FXX=0.0121936;HRUN=4;LEN=1;MLLD=60.0895;QD=16.5096;RBI=0.0215069;REFB=0.0048047;REVB=-0.0189702;RO=45;SAF=20;SAR=16;SRF=18;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152805;STB=0.585784;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=-0.00648076;OID=.;OPOS=111957245;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:81:45:45:36:36:0.444444:16:20:18:27:16:20:18:27
chr1	111957311	.	G	C	216.92	PASS	AF=0.525;AO=14;DP=41;FAO=21;FDP=40;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=-0.0280533;FXX=0.0243843;HRUN=4;LEN=1;MLLD=111.903;QD=21.6924;RBI=0.0280533;REFB=-0.0070964;REVB=1.30227e-05;RO=17;SAF=10;SAR=4;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0748824;STB=0.576852;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=0.0123159;OID=.;OPOS=111957311;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:40:17:19:14:21:0.525:4:10:11:6:10:11:13:6
chr1	111957517	.	T	C	123.14	PASS	AF=0.319149;AO=13;DP=45;FAO=15;FDP=47;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=-0.0147634;FXX=0.059988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.888;QD=10.4805;RBI=0.0213625;REFB=-0.012939;REVB=-0.0154402;RO=32;SAF=9;SAR=4;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126123;STB=0.608966;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=0.0380059;OID=.;OPOS=111957517;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:47:32:32:13:15:0.319149:4:9:19:13:4:11:19:13
chr1	111957688	.	T	C	990.63	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00538387;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.661;QD=59.1423;RBI=0.0570741;REFB=0;REVB=0.0568196;RO=0;SAF=40;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000215627;OID=.;OPOS=111957688;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:27:40:0:0:27:40:0:0
chr1	111957693	.	A	G	1034.86	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0177007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.336;QD=59.135;RBI=0.0186511;REFB=0;REVB=0.00587794;RO=0;SAF=43;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.37932e-05;OID=.;OPOS=111957693;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:70:0:0:69:70:1:26:43:0:0:27:43:0:0
chr1	111962256	.	G	T	298.69	PASS	AF=0.553571;AO=30;DP=55;FAO=31;FDP=56;FR=.;FRO=25;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.0194679;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.218;QD=21.3349;RBI=0.0240219;REFB=-0.0147757;REVB=0.0140731;RO=25;SAF=16;SAR=14;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0109591;STB=0.512753;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=0.0122108;OID=.;OPOS=111962256;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:56:25:25:30:31:0.553571:14:16:13:12:14:17:13:12
chr1	111964262	.	G	A	211.87	PASS	AF=0.45098;AO=23;DP=51;FAO=23;FDP=51;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=0.0097039;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.845;QD=16.617;RBI=0.0127782;REFB=-0.0139819;REVB=0.00831371;RO=28;SAF=11;SAR=12;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0210389;STB=0.511935;STBP=0.833;TYPE=snp;VARB=0.0226659;OID=.;OPOS=111964262;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:28:28:23:23:0.45098:12:11:14:14:12:11:14:14
chr1	111968121	.	C	T	167.91	PASS	AF=0.418605;AO=18;DP=43;FAO=18;FDP=43;FR=.;FRO=25;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=0.00880408;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.474;QD=15.6197;RBI=0.0331899;REFB=-0.0235204;REVB=-0.0320009;RO=25;SAF=10;SAR=8;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0763977;STB=0.543992;STBP=0.624;TYPE=snp;VARB=0.0307977;OID=.;OPOS=111968121;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:25:25:18:18:0.418605:8:10:12:13:8:10:12:13
chr1	111969294	.	A	G	801.41	PASS	AF=0.95082;AO=59;DP=62;FAO=58;FDP=61;FR=.;FRO=3;FSAF=27;FSAR=31;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0169522;FXX=0.0161264;HRUN=5;LEN=1;MLLD=286.571;QD=52.5514;RBI=0.0169599;REFB=-0.0603788;REVB=0.000509059;RO=3;SAF=28;SAR=31;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0175426;STB=0.509923;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.00105777;OID=.;OPOS=111969294;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:62:61:3:3:59:58:0.95082:31:28:2:1:31:27:2:1
chr1	111969307	.	G	C	303.47	PASS	AF=0.574468;AO=27;DP=47;FAO=27;FDP=47;FR=.;FRO=20;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.0114017;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=255.427;QD=25.8272;RBI=0.0135567;REFB=-0.0165264;REVB=-0.00733391;RO=20;SAF=16;SAR=11;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0724507;STB=0.540163;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.0105876;OID=.;OPOS=111969307;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:20:20:27:27:0.574468:11:16:10:10:11:16:10:10
chr1	111969719	.	A	G	465.14	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0397045;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.859;QD=58.1421;RBI=0.0459602;REFB=0;REVB=0.0231495;RO=0;SAF=19;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000142915;OID=.;OPOS=111969719;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:13:19:0:0:13:19:0:0
chr1	111991768	.	G	A	184.84	PASS	AF=0.475;AO=11;DP=35;FAO=19;FDP=40;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=5;FWDB=-0.00984098;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=212.701;QD=18.4841;RBI=0.0127147;REFB=-0.00495237;REVB=0.00805098;RO=7;SAF=1;SAR=10;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.673428;STB=0.725661;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.00460955;OID=.;OPOS=111991768;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:40:7:21:11:19:0.475:10:1:7:0:13:6:16:5
chr1	111991845	.	C	A	2087.12	PASS	AF=1;AO=133;DP=134;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00972165;FXX=0.00746213;HRUN=2;LEN=1;MLLD=223.345;QD=62.7707;RBI=0.037524;REFB=0;REVB=0.0362428;RO=0;SAF=80;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.32046e-05;OID=.;OPOS=111991845;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:134:133:0:0:133:133:1:53:80:0:0:53:80:0:0
chr1	111992019	.	T	A	256.72	PASS	AF=0.414815;AO=32;DP=135;FAO=56;FDP=135;FR=.,HEALED;FRO=79;FSAF=25;FSAR=31;FSRF=37;FSRR=42;FWDB=-0.00940065;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=12.7341;QD=7.60659;RBI=0.0276045;REFB=0.0192165;REVB=-0.0259545;RO=44;SAF=10;SAR=22;SRF=22;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202779;STB=0.512939;STBP=0.809;TYPE=snp;VARB=0.0226636;OID=.;OPOS=111992019;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:135:135:44:79:32:56:0.414815:22:10:22:22:31:25:37:42
chr1	111992095	.	C	T	2459.04	PASS	AF=0.987805;AO=162;DP=164;FAO=162;FDP=164;FR=.;FRO=2;FSAF=62;FSAR=100;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0571065;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.603;QD=59.9767;RBI=0.0607615;REFB=-0.0177683;REVB=-0.0207559;RO=2;SAF=62;SAR=100;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0150993;STB=0.507936;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=0.00175654;OID=.;OPOS=111992095;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:164:164:2:2:162:162:0.987805:100:62:2:0:100:62:2:0
chr1	111992516	.	C	T	362.61	PASS	AF=0.521127;AO=37;DP=71;FAO=37;FDP=71;FR=.;FRO=34;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=0.0245519;FXX=0.013887;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.7635;QD=20.4289;RBI=0.0623192;REFB=-0.0276509;REVB=0.057279;RO=34;SAF=14;SAR=23;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133447;STB=0.574062;STBP=0.208;TYPE=snp;VARB=0.0261668;OID=.;OPOS=111992516;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:34:34:37:37:0.521127:23:14:18:16:23:14:18:16
chr1	112029193	.	A	G	216.34	PASS	AF=0.538462;AO=21;DP=39;FAO=21;FDP=39;FR=.;FRO=18;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.0135023;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.856;QD=22.1884;RBI=0.0138031;REFB=-0.0032728;REVB=-0.00286589;RO=18;SAF=13;SAR=8;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100864;STB=0.55662;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=0.00216924;OID=.;OPOS=112029193;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:18:18:21:21:0.538462:8:13:9:9:8:13:9:9
chr1	112042632	.	A	G	327.23	PASS	AF=0.472973;AO=35;DP=74;FAO=35;FDP=74;FR=.;FRO=39;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=16;FSRR=23;FWDB=0.0206165;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.381;QD=17.6878;RBI=0.0520011;REFB=-0.0223635;REVB=0.0477397;RO=38;SAF=15;SAR=20;SRF=16;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00715753;STB=0.509876;STBP=0.88;TYPE=snp;VARB=0.026469;OID=.;OPOS=112042632;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:38:39:35:35:0.472973:20:15:16:22:20:15:16:23
chr1	112269872	.	G	A	739.46	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0121413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.141;QD=62.933;RBI=0.0515269;REFB=0;REVB=0.0500761;RO=0;SAF=27;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000263545;OID=.;OPOS=112269872;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:47:0:0:45:47:1:18:27:0:0:18:29:0:0
chr1	112533649	.	C	G	505.13	PASS	AF=0.539326;AO=48;DP=89;FAO=48;FDP=89;FR=.;FRO=41;FSAF=18;FSAR=30;FSRF=14;FSRR=27;FWDB=-0.040368;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=53.9269;QD=22.7024;RBI=0.0486187;REFB=0.0214287;REVB=-0.0270963;RO=39;SAF=18;SAR=30;SRF=13;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.036652;STB=0.516609;STBP=0.763;TYPE=snp;VARB=-0.017609;OID=.;OPOS=112533649;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:39:41:48:48:0.539326:30:18:13:26:30:18:14:27
chr1	112533728	.	G	A	198.7	PASS	AF=0.487805;AO=20;DP=41;FAO=20;FDP=41;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=6;FSRR=15;FWDB=-0.00119415;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.333;QD=19.3858;RBI=0.00548581;REFB=-0.024613;REVB=-0.00535426;RO=21;SAF=6;SAR=14;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.015501;STB=0.508763;STBP=0.925;TYPE=snp;VARB=0.0295644;OID=.;OPOS=112533728;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:21:21:20:20:0.487805:14:6:6:15:14:6:6:15
chr1	112539061	.	A	G	50.45	PASS	AF=0.195122;AO=8;DP=41;FAO=8;FDP=41;FR=.;FRO=33;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=0.0113537;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.78;QD=4.92168;RBI=0.0199618;REFB=-0.00190968;REVB=0.0164185;RO=33;SAF=4;SAR=4;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0550114;STB=0.536494;STBP=0.829;TYPE=snp;VARB=0.0123325;OID=.;OPOS=112539061;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:50:41:41:33:33:8:8:0.195122:4:4:15:18:4:4:15:18
chr1	112991698	.	T	C	271.63	PASS	AF=1;AO=20;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0501003;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.68;QD=51.7394;RBI=0.0621355;REFB=0;REVB=0.036753;RO=0;SAF=10;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000405275;OID=.;OPOS=112991698;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:20:21:1:10:10:0:0:11:10:0:0
chr1	112999227	.	G	A	393.15	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00231054;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.0896;QD=56.1636;RBI=0.048;REFB=0;REVB=-0.0479443;RO=0;SAF=15;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000749397;OID=.;OPOS=112999227;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:13:15:0:0:13:15:0:0
chr1	113000946	.	GGTCA	G	483.4	PASS	AF=0.9;AO=43;DP=44;FAO=45;FDP=50;FR=.;FRO=5;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0408373;FXX=0;HRUN=2;LEN=4;MLLD=280.964;QD=38.6719;RBI=0.0408979;REFB=-0.0261122;REVB=-0.00222625;RO=0;SAF=20;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.555531;STBP=0.028;TYPE=del;VARB=0.00248687;OID=.;OPOS=113000947;OREF=GTCA;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.9:43:44:45:50:5:20:25:5:0:11:0:20:23:0:0
chr1	113063125	.	A	G	153.93	PASS	AF=0.358491;AO=19;DP=53;FAO=19;FDP=53;FR=.;FRO=34;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=-0.0207569;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=277.989;QD=11.6171;RBI=0.0244407;REFB=-0.0124843;REVB=-0.0129035;RO=34;SAF=9;SAR=10;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00340865;STB=0.50199;STBP=0.977;TYPE=snp;VARB=0.0194989;OID=.;OPOS=113063125;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:34:34:19:19:0.358491:10:9:16:18:10:9:16:18
chr1	113083439	.	C	T	102.44	PASS	AF=0.521739;AO=12;DP=23;FAO=12;FDP=23;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=-0.000440828;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.668;QD=17.8157;RBI=0.0345685;REFB=-0.0115631;REVB=-0.0345657;RO=11;SAF=3;SAR=9;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.273019;STB=0.658254;STBP=0.149;TYPE=snp;VARB=0.0153123;OID=.;OPOS=113083439;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:23:23:11:11:12:12:0.521739:9:3:6:5:9:3:6:5
chr1	113126707	.	G	A	232.76	PASS	AF=0.511628;AO=22;DP=45;FAO=22;FDP=43;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=-0.0183833;FXX=0.0444346;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.347;QD=21.6518;RBI=0.0249964;REFB=-0.00770591;REVB=-0.0169374;RO=19;SAF=13;SAR=9;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183289;STB=0.624106;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=0.0114805;OID=.;OPOS=113126707;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:43:19:21:22:22:0.511628:9:13:7:12:9:13:7:14
chr1	113213976	.	AGTTTTTT	AGTTTTT,AGTTTTTA,TAGTTTTT	65.97	PASS	AF=0.4,0.1,0.0333333;AO=8,5,2;DP=29;FAO=12,3,1;FDP=30;FR=.;FRO=14;FSAF=4,3,0;FSAR=8,0,1;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.0513227,-0.0118011,0.00103344;FXX=0;HRUN=6,6,1;LEN=1,1,3;MLLD=8.6523,12.9991,55.9882;QD=8.79613;RBI=0.0613551,0.152417,0.0327987;REFB=-0.16303,-0.139385,-0.0271935;REVB=0.033622,0.151959,-0.0327824;RO=10;SAF=3,5,0;SAR=5,0,2;SRF=4;SRR=6;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.0245631,0.745952,-0.542827;STB=0.514262,0.996871,0.986952;STBP=0.924,0.035,0.513;TYPE=del,snp,mnp;VARB=0.196087,-0.131014,0.0515046;OID=.,.,.;OPOS=113213978,113213983,113213976;OREF=T,T,AGT;OALT=-,A,TAG;OMAPALT=AGTTTTT,AGTTTTTA,TAGTTTTT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:29:30:10:14:8,5,2:12,3,1:0.4,0.1,0.0333333:5,0,2:3,5,0:4:6:8,0,1:4,3,0:5:9
chr1	113236681	.	C	T	378.06	PASS	AF=0.4875;AO=39;DP=80;FAO=39;FDP=80;FR=.;FRO=41;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=19;FWDB=-0.0169135;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.603;QD=18.9029;RBI=0.0169717;REFB=-0.0106342;REVB=-0.00140441;RO=41;SAF=25;SAR=14;SRF=22;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100886;STB=0.556275;STBP=0.351;TYPE=snp;VARB=0.0101174;OID=.;OPOS=113236681;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:41:41:39:39:0.4875:14:25:22:19:14:25:22:19
chr1	113237171	.	A	G	56.28	PASS	AF=0.4;AO=8;DP=20;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=-0.00571334;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.854;QD=11.2568;RBI=0.0163712;REFB=0.000175514;REVB=-0.0153419;RO=12;SAF=3;SAR=5;SRF=2;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.242422;STB=0.64255;STBP=0.406;TYPE=snp;VARB=-0.00147019;OID=.;OPOS=113237171;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:20:20:12:12:8:8:0.4:5:3:2:10:5:3:2:10
chr1	113239382	.	G	A	280.26	PASS	AF=0.462687;AO=30;DP=67;FAO=31;FDP=67;FR=.;FRO=36;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=-0.0127879;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.118;QD=16.7318;RBI=0.0130352;REFB=-0.0136771;REVB=-0.00252677;RO=37;SAF=17;SAR=13;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0525256;STB=0.511147;STBP=0.875;TYPE=snp;VARB=0.0113329;OID=.;OPOS=113239382;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:37:36:30:31:0.462687:13:17:19:18:14:17:19:17
chr1	113241052	.	T	C	363.71	PASS	AF=0.580645;AO=36;DP=63;FAO=36;FDP=62;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=-0.00897071;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.293;QD=23.4649;RBI=0.0108038;REFB=-0.00962945;REVB=0.00602073;RO=27;SAF=14;SAR=22;SRF=18;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.215401;STB=0.611049;STBP=0.056;TYPE=snp;VARB=0.00652991;OID=.;OPOS=113241052;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:62:27:26:36:36:0.580645:22:14:18:9:22:14:17:9
chr1	113243048	.	C	T	275.1	PASS	AF=0.43662;AO=31;DP=71;FAO=31;FDP=71;FR=.;FRO=40;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=0.0391976;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.738;QD=15.4984;RBI=0.0454918;REFB=-0.0204629;REVB=0.0230879;RO=40;SAF=20;SAR=11;SRF=18;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198285;STB=0.612171;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=0.0217439;OID=.;OPOS=113243048;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:40:40:31:31:0.43662:11:20:18:22:11:20:18:22
chr1	113255389	.	C	T	1321.32	PASS	AF=1;AO=84;DP=84;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00622843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.456;QD=62.1797;RBI=0.00651014;REFB=0;REVB=0.00189434;RO=0;SAF=43;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.2544e-06;OID=.;OPOS=113255389;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:85:0:0:84:85:1:41:43:0:0:42:43:0:0
chr1	113456546	.	A	T	788.81	PASS	AF=0.512821;AO=80;DP=156;FAO=80;FDP=156;FR=.;FRO=76;FSAF=46;FSAR=34;FSRF=41;FSRR=35;FWDB=0.00906241;FXX=0.00636902;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.474;QD=20.2259;RBI=0.0188683;REFB=-0.0208918;REVB=-0.0165494;RO=75;SAF=46;SAR=34;SRF=41;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0254256;STB=0.517608;STBP=0.676;TYPE=snp;VARB=0.0166673;OID=.;OPOS=113456546;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:156:156:75:76:80:80:0.512821:34:46:41:34:34:46:41:35
chr1	113657092	.	A	C	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00650477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=301.845;QD=45.8068;RBI=0.0403533;REFB=0;REVB=0.0398256;RO=0;SAF=8;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000166699;OID=.;OPOS=113657092;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:6:8:0:0:6:8:0:0
chr1	114240319	.	T	TA	486.59	PASS	AF=1;AO=40;DP=46;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0992947;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=20.7238;QD=43.2522;RBI=0.111352;REFB=0;REVB=-0.0503971;RO=2;SAF=21;SAR=19;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00223561;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00427141;OID=.;OPOS=114240320;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:40:46:45:45:0:22:23:0:0:9:2:21:19:1:1
chr1	114377568	.	A	G	368.18	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0332041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.089;QD=54.5446;RBI=0.0385576;REFB=0;REVB=0.0196005;RO=0;SAF=13;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000321094;OID=.;OPOS=114377568;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:27:0:0:26:27:1:13:13:0:0:14:13:0:0
chr1	114424601	.	C	T	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0458758;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.7972;QD=51.9162;RBI=0.0460268;REFB=0;REVB=0.00372432;RO=0;SAF=16;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.78933e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00174473;OID=.;OPOS=114424601;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:5:16:0:0:5:16:0:0
chr1	114438951	.	A	G	53.7	PASS	AF=0.296296;AO=8;DP=27;FAO=8;FDP=27;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.0158412;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=116.105;QD=7.95494;RBI=0.0377574;REFB=-0.0265743;REVB=-0.0342735;RO=19;SAF=4;SAR=4;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0890944;STB=0.555418;STBP=0.726;TYPE=snp;VARB=0.0413263;OID=.;OPOS=114438951;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:27:27:19:19:8:8:0.296296:4:4:8:11:4:4:8:11
chr1	114443899	.	G	A	519.04	PASS	AF=0.643836;AO=47;DP=73;FAO=47;FDP=73;FR=.;FRO=26;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=-0.0171479;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.188;QD=28.4404;RBI=0.0268003;REFB=-0.00241251;REVB=-0.0205963;RO=26;SAF=26;SAR=21;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0853225;STB=0.54639;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=0.000959294;OID=.;OPOS=114443899;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:26:26:47:47:0.643836:21:26:11:15:21:26:11:15
chr1	114444444	.	T	G	341.81	PASS	AF=0.486486;AO=36;DP=74;FAO=36;FDP=74;FR=.;FRO=38;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=26;FSRR=12;FWDB=-0.0196109;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.621;QD=18.4763;RBI=0.0212514;REFB=-0.00248523;REVB=0.00818756;RO=37;SAF=17;SAR=19;SRF=25;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184087;STB=0.607829;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=0.00215916;OID=.;OPOS=114444444;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:37:38:36:36:0.486486:19:17:25:12:19:17:26:12
chr1	114505000	.	G	A	378.07	PASS	AF=0.4875;AO=39;DP=80;FAO=39;FDP=80;FR=.;FRO=41;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=23;FSRR=18;FWDB=-0.0200252;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.3553;QD=18.9036;RBI=0.0323268;REFB=0.00525166;REVB=-0.0253775;RO=41;SAF=22;SAR=17;SRF=23;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00292397;STB=0.501628;STBP=0.984;TYPE=snp;VARB=-0.00517993;OID=.;OPOS=114505000;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:41:41:39:39:0.4875:17:22:23:18:17:22:23:18
chr1	114632115	.	TAAAAAA	AAAAAAT,AAAAATA,TAAAAA,TTAAAAA	269.53	PASS	AF=0.0136986,0.0547945,0.794521,0.0410959;AO=6,6,19,8;DP=63;FAO=1,4,58,3;FDP=73;FR=.;FRO=7;FSAF=1,4,28,0;FSAR=0,0,30,3;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=-0.148118,-0.124999,0.104815,0.130518;FXX=0.0266631;HRUN=6,6,7,7;LEN=7,6,1,1;MLLD=139.883,138.366,7.46728,6.65097;QD=14.7689;RBI=0.148157,0.125066,0.104815,0.132144;REFB=0.00963107,0.0105125,0.0484306,-0.0029792;REVB=-0.00338225,-0.00408605,0.000307636,-0.0206624;RO=12;SAF=6,6,2,0;SAR=0,0,17,8;SRF=4;SRR=8;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=0.774871,0.774871,-0.300245,-0.749985;STB=0.994993,0.997725,0.536729,0.993933;STBP=0.123,0.003,0.093,0.381;TYPE=mnp,mnp,del,snp;VARB=0.056773,0.232226,0.0333966,0.01809;OID=.,.,.,.;OPOS=114632115,114632115,114632116,114632116;OREF=TAAAAAA,TAAAAA,A,A;OALT=AAAAAAT,AAAAAT,-,T;OMAPALT=AAAAAAT,AAAAATA,TAAAAA,TTAAAAA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/3:20:63:73:12:7:6,6,19,8:1,4,58,3:0.0136986,0.0547945,0.794521,0.0410959:0,0,17,8:6,6,2,0:4:8:0,0,30,3:1,4,28,0:1:6
chr1	114948281	.	A	G	341.04	PASS	AF=0.538462;AO=35;DP=65;FAO=35;FDP=65;FR=.;FRO=30;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=0.0222831;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.488;QD=20.9873;RBI=0.0244341;REFB=-0.00220732;REVB=-0.0100245;RO=29;SAF=15;SAR=20;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0415065;STB=0.513506;STBP=0.828;TYPE=snp;VARB=0.00112365;OID=.;OPOS=114948281;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:29:30:35:35:0.538462:20:15:11:18:20:15:12:18
chr1	115119392	.	T	C	105.05	PASS	AF=0.541667;AO=12;DP=24;FAO=13;FDP=24;FR=.;FRO=11;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.000332097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.358;QD=17.509;RBI=0.00246248;REFB=-0.0170828;REVB=0.00243998;RO=12;SAF=7;SAR=5;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144308;STB=0.615207;STBP=0.265;TYPE=snp;VARB=0.00984804;OID=.;OPOS=115119392;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:90:24:24:12:11:12:13:0.541667:5:7:5:7:5:8:4:7
chr1	115537933	.	A	G	239.62	PASS	AF=0.490566;AO=25;DP=52;FAO=26;FDP=53;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=0.0483714;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.5949;QD=18.0845;RBI=0.0527711;REFB=-0.0176983;REVB=0.021095;RO=27;SAF=12;SAR=13;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0355086;STB=0.529047;STBP=0.714;TYPE=snp;VARB=0.0171166;OID=.;OPOS=115537933;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:53:27:27:25:26:0.490566:13:12:14:13:14:12:14:13
chr1	115576023	.	A	G	1155.3	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00445177;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.4297;QD=60.8052;RBI=0.0139215;REFB=0;REVB=0.0131905;RO=0;SAF=43;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.24419e-05;OID=.;OPOS=115576023;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:76:0:0:73:76:1:30:43:0:0:33:43:0:0
chr1	115590998	.	T	C	1350.45	PASS	AF=0.51938;AO=134;DP=256;FAO=134;FDP=258;FR=.;FRO=124;FSAF=66;FSAR=68;FSRF=57;FSRR=67;FWDB=0.035706;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.3684;QD=20.9372;RBI=0.0361731;REFB=-0.0240251;REVB=0.00579402;RO=122;SAF=66;SAR=68;SRF=57;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0220988;STB=0.515802;STBP=0.59;TYPE=snp;VARB=0.0242312;OID=.;OPOS=115590998;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:256:258:122:124:134:134:0.51938:68:66:57:65:68:66:57:67
chr1	115591058	.	T	C	1349.65	PASS	AF=0.464744;AO=136;DP=306;FAO=145;FDP=312;FR=.;FRO=167;FSAF=65;FSAR=80;FSRF=67;FSRR=100;FWDB=-0.00576841;FXX=0.0126578;HRUN=1;LEN=1;MLLD=304.925;QD=17.3032;RBI=0.0195837;REFB=-0.00866031;REVB=0.0187148;RO=167;SAF=63;SAR=73;SRF=67;SRR=100;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0624681;STB=0.525603;STBP=0.4;TYPE=snp;VARB=0.00900472;OID=.;OPOS=115591058;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:306:312:167:167:136:145:0.464744:73:63:67:100:80:65:67:100
chr1	115604798	.	C	T	156.81	PASS	AF=0.435897;AO=17;DP=39;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.00410462;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=114.83;QD=16.0828;RBI=0.0108675;REFB=-0.0143249;REVB=-0.0100626;RO=22;SAF=6;SAR=11;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104869;STB=0.560437;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.0142686;OID=.;OPOS=115604798;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:22:22:17:17:0.435897:11:6:10:12:11:6:10:12
chr1	116149152	.	G	A	1662.18	PASS	AF=1;AO=110;DP=111;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0181417;FXX=0.0090082;HRUN=3;LEN=1;MLLD=146.444;QD=60.4431;RBI=0.0302015;REFB=0;REVB=0.0241456;RO=0;SAF=55;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.10983e-05;OID=.;OPOS=116149152;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:111:110:0:0:110:110:1:55:55:0:0:55:55:0:0
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chr1	116234505	.	A	G	219.81	PASS	AF=0.364865;AO=27;DP=74;FAO=27;FDP=74;FR=.;FRO=47;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=33;FWDB=0.0151607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.805;QD=11.8815;RBI=0.0151929;REFB=-0.026586;REVB=0.00098896;RO=46;SAF=17;SAR=10;SRF=14;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.344966;STB=0.702069;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0360457;OID=.;OPOS=116234505;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:46:47:27:27:0.364865:10:17:14:32:10:17:14:33
chr1	116239633	.	T	G	501.49	PASS	AF=0.465517;AO=54;DP=115;FAO=54;FDP=116;FR=.;FRO=62;FSAF=17;FSAR=37;FSRF=31;FSRR=31;FWDB=0.0269879;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.2251;QD=17.2928;RBI=0.0298028;REFB=-0.0248507;REVB=0.0126436;RO=61;SAF=17;SAR=37;SRF=31;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195827;STB=0.605689;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.0369521;OID=.;OPOS=116239633;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:116:61:62:54:54:0.465517:37:17:31:30:37:17:31:31
chr1	116260532	.	A	T	322.4	PASS	AF=0.448718;AO=35;DP=78;FAO=35;FDP=78;FR=.;FRO=43;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=26;FWDB=0.0143667;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=267.416;QD=16.5331;RBI=0.017458;REFB=-0.00790639;REVB=0.00991855;RO=39;SAF=21;SAR=14;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15532;STB=0.612181;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=0.00937944;OID=.;OPOS=116260532;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:39:43:35:35:0.448718:14:21:17:22:14:21:17:26
chr1	116310967	.	T	C	404.68	PASS	AF=0.4375;AO=42;DP=97;FAO=42;FDP=96;FR=.;FRO=54;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=31;FSRR=23;FWDB=2.52574e-05;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.303;QD=16.8618;RBI=0.0166379;REFB=-0.00238779;REVB=0.0166379;RO=54;SAF=18;SAR=24;SRF=31;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145357;STB=0.581564;STBP=0.175;TYPE=snp;VARB=0.00412696;OID=.;OPOS=116310967;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:96:54:54:42:42:0.4375:24:18:31:23:24:18:31:23
chr1	116382318	.	A	G	1734.23	PASS	AF=1;AO=95;DP=115;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0145712;FXX=0.0086949;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.8031;QD=60.8501;RBI=0.0553894;REFB=0;REVB=-0.0534384;RO=0;SAF=40;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000343019;OID=.;OPOS=116382318;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:115:114:0:0:95:114:1:55:40:0:0:58:56:0:0
chr1	116382511	.	A	T	728.1	PASS	AF=1;AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0187248;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.3783;QD=57.1062;RBI=0.020941;REFB=0;REVB=-0.00937591;RO=0;SAF=25;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94283e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00163447;OID=.;OPOS=116382511;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:51:0:0:51:51:1:26:25:0:0:26:25:0:0
chr1	116382778	.	T	C	941.01	PASS	AF=0.984848;AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=66;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0541519;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.58;QD=57.0309;RBI=0.069095;REFB=-0.126556;REVB=0.042915;RO=0;SAF=41;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.25588e-08;STB=0.506022;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=0.00251083;OID=.;OPOS=116382778;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:66:66:0:1:65:65:0.984848:24:41:0:0:24:41:1:0
chr1	116383300	.	T	C	109.55	PASS	AF=0.916667;AO=11;DP=12;FAO=11;FDP=12;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0417008;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=44.587;QD=36.5174;RBI=0.0769731;REFB=-0.203458;REVB=-0.0646986;RO=0;SAF=6;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.545372;STBP=0.563;TYPE=snp;VARB=0.0198191;OID=.;OPOS=116383300;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:12:12:0:1:11:11:0.916667:5:6:0:0:5:6:0:1
chr1	116383333	.	C	A	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0603271;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.45;QD=33.4285;RBI=0.0603271;REFB=0;REVB=-9.97927e-06;RO=0;SAF=3;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00181624;OID=.;OPOS=116383333;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:3:3:0:0:3:3:0:0
chr1	116384090	.	G	A	950.88	PASS	AF=1;AO=51;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=29;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0539707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.189;QD=58.5159;RBI=0.0540519;REFB=0;REVB=0.00296124;RO=0;SAF=19;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.2152e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00604929;OID=.;OPOS=116384090;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:51:65:1:32:19:0:0:36:29:0:0
chr1	116384580	.	C	T	1490.93	PASS	AF=0.989583;AO=93;DP=94;FAO=95;FDP=96;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00494545;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.4875;QD=62.122;RBI=0.0739371;REFB=-0.130533;REVB=0.0737715;RO=1;SAF=44;SAR=49;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00957781;STB=0.504853;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.00320502;OID=.;OPOS=116384580;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:94:96:1:1:93:95:0.989583:49:44:0:1:51:44:0:1
chr1	116385122	.	T	C	167.49	PASS	AF=0.9375;AO=15;DP=16;FAO=15;FDP=16;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0154316;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.849;QD=41.8734;RBI=0.0186826;REFB=0.0790759;REVB=-0.0105311;RO=1;SAF=3;SAR=12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129286;STB=0.571326;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=-0.00120924;OID=.;OPOS=116385122;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:16:16:1:1:15:15:0.9375:12:3:1:0:12:3:1:0
chr1	116385288	.	C	T	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0175334;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.185;QD=40.7629;RBI=0.0961284;REFB=0;REVB=0.0945158;RO=0;SAF=7;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0013947;OID=.;OPOS=116385288;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:3:7:0:0:3:7:0:0
chr1	116385467	.	A	G	393.29	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0131094;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.599;QD=56.1843;RBI=0.0657137;REFB=0;REVB=0.0643928;RO=0;SAF=14;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000166676;OID=.;OPOS=116385467;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:14:14:0:0:14:14:0:0
chr1	116386105	.	G	A	1534.39	PASS	AF=1;AO=95;DP=97;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0204028;FXX=0.0204061;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.6496;QD=63.9327;RBI=0.0472456;REFB=0;REVB=-0.042613;RO=0;SAF=57;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.9692e-05;OID=.;OPOS=116386105;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:97:96:0:0:95:96:1:38:57:0:0:38:58:0:0
chr1	116386139	.	G	A	2288.02	PASS	AF=1;AO=141;DP=141;FAO=144;FDP=144;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00896858;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.7191;QD=63.556;RBI=0.00897313;REFB=0;REVB=-0.00028553;RO=0;SAF=82;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.35412e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.59422e-05;OID=.;OPOS=116386139;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:141:144:0:0:141:144:1:59:82:0:0:61:83:0:0
chr1	116386243	.	C	T	3454.0	PASS	AF=0.982609;AO=220;DP=225;FAO=226;FDP=230;FR=.;FRO=4;FSAF=114;FSAR=112;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.026532;FXX=0.00862032;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.0096;QD=60.0696;RBI=0.0266677;REFB=-0.0459965;REVB=-0.002687;RO=4;SAF=110;SAR=110;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0170069;STB=0.50862;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=0.00130633;OID=.;OPOS=116386243;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:225:230:4:4:220:226:0.982609:110:110:4:0:112:114:4:0
chr1	116534852	.	C	T	672.92	PASS	AF=0.430233;AO=74;DP=172;FAO=74;FDP=172;FR=.;FRO=98;FSAF=33;FSAR=41;FSRF=49;FSRR=49;FWDB=-0.0026068;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.383;QD=15.6494;RBI=0.0182089;REFB=-0.0188752;REVB=0.0180213;RO=98;SAF=33;SAR=41;SRF=49;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0554213;STB=0.530945;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.0205776;OID=.;OPOS=116534852;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:172:172:98:98:74:74:0.430233:41:33:49:49:41:33:49:49
chr1	116569530	.	G	C	2254.82	PASS	AF=1;AO=142;DP=142;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0277867;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.3375;QD=63.5161;RBI=0.0344944;REFB=0;REVB=0.0204392;RO=0;SAF=74;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.22206e-05;OID=.;OPOS=116569530;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:142:142:0:0:142:142:1:68:74:0:0:68:74:0:0
chr1	116610388	.	A	G	670.26	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0165415;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.4549;QD=62.35;RBI=0.018176;REFB=0;REVB=0.00753315;RO=0;SAF=14;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.13233e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000250802;OID=.;OPOS=116610388;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:29:14:0:0:29:14:0:0
chr1	116948712	.	G	A	271.38	PASS	AF=0.543478;AO=25;DP=46;FAO=25;FDP=46;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=4;FSRR=17;FWDB=0.0313895;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.499;QD=23.598;RBI=0.0324515;REFB=-0.00160567;REVB=0.00823391;RO=21;SAF=13;SAR=12;SRF=4;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.26911;STB=0.648771;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=0.00150218;OID=.;OPOS=116948712;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:21:21:25:25:0.543478:12:13:4:17:12:13:4:17
chr1	117102649	.	C	T	323.37	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0796042;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.5344;QD=53.8944;RBI=0.0964198;REFB=0;REVB=-0.0544055;RO=0;SAF=21;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.86584e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00359355;OID=.;OPOS=117102649;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:3:21:0:0:3:21:0:0
chr1	117122130	.	T	C,G	1270.97	PASS	AF=0.964706,0.0235294;AO=80,4;DP=85;FAO=82,2;FDP=85;FR=.;FRO=1;FSAF=36,0;FSAR=46,2;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00502557,-0.0571104;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=122.384,26.9839;QD=59.8102;RBI=0.00580895,0.0595418;REFB=-0.00742305,-0.0369921;REVB=0.00291334,-0.0168413;RO=1;SAF=34,2;SAR=46,2;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0137211,-0.166656;STB=0.506848,0.993266;STBP=0.316,0.232;TYPE=snp,snp;VARB=-0.000652332,0.048708;OID=.,.;OPOS=117122130,117122130;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:4:85:85:1:1:80,4:82,2:0.964706,0.0235294:46,2:34,2:1:0:46,2:36,0:1:0
chr1	117142613	.	C	T	70.55	PASS	AF=0.166667;AO=13;DP=78;FAO=13;FDP=78;FR=.;FRO=65;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=32;FSRR=33;FWDB=0.0222743;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.3143;QD=3.61808;RBI=0.0274016;REFB=0.0117275;REVB=0.0159595;RO=65;SAF=7;SAR=6;SRF=32;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0576266;STB=0.538402;STBP=0.792;TYPE=snp;VARB=-0.0535502;OID=.;OPOS=117142613;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:70:78:78:65:65:13:13:0.166667:6:7:32:33:6:7:32:33
chr1	117142641	.	G	A	126.4	PASS	AF=0.19469;AO=22;DP=113;FAO=22;FDP=113;FR=.;FRO=91;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=42;FSRR=49;FWDB=-0.000654828;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.477;QD=4.47434;RBI=0.0210402;REFB=-0.00203033;REVB=-0.02103;RO=91;SAF=9;SAR=13;SRF=42;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0675687;STB=0.542958;STBP=0.678;TYPE=snp;VARB=0.0100993;OID=.;OPOS=117142641;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:113:91:91:22:22:0.19469:13:9:42:49:13:9:42:49
chr1	117142700	.	C	A	397.67	PASS	AF=0.311765;AO=53;DP=171;FAO=53;FDP=170;FR=.;FRO=117;FSAF=20;FSAR=33;FSRF=61;FSRR=56;FWDB=-0.0131121;FXX=0.00584761;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.661;QD=9.35689;RBI=0.0281511;REFB=-0.00735208;REVB=0.024911;RO=116;SAF=20;SAR=33;SRF=60;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16744;STB=0.600231;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.0175116;OID=.;OPOS=117142700;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:171:170:116:117:53:53:0.311765:33:20:60:56:33:20:61:56
chr1	117142736	.	A	G	721.55	PASS	AF=0.477987;AO=76;DP=158;FAO=76;FDP=159;FR=.;FRO=83;FSAF=30;FSAR=46;FSRF=48;FSRR=35;FWDB=0.0150566;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.661;QD=18.1523;RBI=0.0205353;REFB=-0.0071268;REVB=-0.0139642;RO=82;SAF=30;SAR=46;SRF=47;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168395;STB=0.596186;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.00734951;OID=.;OPOS=117142736;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:158:159:82:83:76:76:0.477987:46:30:47:35:46:30:48:35
chr1	117142855	.	C	T	403.89	PASS	AF=0.462366;AO=40;DP=93;FAO=43;FDP=93;FR=.,HEALED;FRO=50;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=30;FSRR=20;FWDB=-0.0645464;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.0628;QD=17.3718;RBI=0.0727901;REFB=-0.0525027;REVB=-0.0336477;RO=29;SAF=21;SAR=19;SRF=9;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163528;STB=0.522925;STBP=0.715;TYPE=snp;VARB=0.0640571;OID=.;OPOS=117142855;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:29:50:40:43:0.462366:19:21:9:20:19:24:30:20
chr1	117142868	.	CA	TG	332.48	PASS	AF=0.413793;AO=36;DP=90;FAO=36;FDP=87;FR=.;FRO=51;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=29;FSRR=22;FWDB=0.0128675;FXX=0.0333296;HRUN=3;LEN=2;MLLD=159.484;QD=15.2866;RBI=0.0150607;REFB=-0.0207532;REVB=0.00782636;RO=50;SAF=21;SAR=15;SRF=28;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0245479;STB=0.508836;STBP=0.907;TYPE=mnp;VARB=0.0194202;OID=.;OPOS=117142868;OREF=CA;OALT=TG;OMAPALT=TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:87:50:51:36:36:0.413793:15:21:28:22:15:21:29:22
chr1	117146503	.	C	T	132.29	PASS	AF=0.32;AO=16;DP=51;FAO=16;FDP=50;FR=.;FRO=34;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=-0.0409621;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.5435;QD=10.5834;RBI=0.0413371;REFB=0.000447811;REVB=-0.00555524;RO=34;SAF=8;SAR=8;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100915;STB=0.559926;STBP=0.564;TYPE=snp;VARB=-0.00274008;OID=.;OPOS=117146503;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:50:34:34:16:16:0.32:8:8:20:14:8:8:20:14
chr1	117146504	.	G	A	39.74	PASS	AF=0.137255;AO=7;DP=51;FAO=7;FDP=51;FR=.;FRO=44;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=23;FSRR=21;FWDB=-0.0261325;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.541;QD=3.11679;RBI=0.0382884;REFB=-0.00347047;REVB=0.0279839;RO=44;SAF=5;SAR=2;SRF=23;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.236284;STB=0.672006;STBP=0.383;TYPE=snp;VARB=0.0202569;OID=.;OPOS=117146504;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:39:51:51:44:44:7:7:0.137255:2:5:23:21:2:5:23:21
chr1	117146563	.	G	A	33.12	PASS	AF=0.171429;AO=6;DP=35;FAO=6;FDP=35;FR=.;FRO=29;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=0.00159797;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.301;QD=3.78529;RBI=0.0255543;REFB=-0.00284382;REVB=0.0255043;RO=29;SAF=5;SAR=1;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.518765;STB=0.854744;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.0247571;OID=.;OPOS=117146563;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:35:35:29:29:6:6:0.171429:1:5:11:18:1:5:11:18
chr1	117146571	.	A	G	33.76	PASS	AF=0.162162;AO=6;DP=37;FAO=6;FDP=37;FR=.;FRO=31;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=-0.0318658;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.218;QD=3.64932;RBI=0.114617;REFB=-0.0105255;REVB=-0.110099;RO=31;SAF=5;SAR=1;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.511124;STB=0.853588;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=0.0243785;OID=.;OPOS=117146571;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:37:37:31:31:6:6:0.162162:1:5:12:19:1:5:12:19
chr1	117150928	.	C	T	260.47	PASS	AF=0.410959;AO=26;DP=68;FAO=30;FDP=73;FR=.;FRO=43;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=24;FWDB=0.0297696;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.966;QD=14.272;RBI=0.031898;REFB=-0.0250814;REVB=-0.0114565;RO=42;SAF=13;SAR=13;SRF=19;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.051181;STB=0.553698;STBP=0.493;TYPE=snp;VARB=0.0345362;OID=.;OPOS=117150928;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:73:42:43:26:30:0.410959:13:13:19:23:14:16:19:24
chr1	117150933	.	G	A	257.46	PASS	AF=0.422535;AO=30;DP=70;FAO=30;FDP=71;FR=.;FRO=41;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=0.0204738;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.543;QD=14.5048;RBI=0.0265472;REFB=-0.003154;REVB=-0.016899;RO=39;SAF=16;SAR=14;SRF=18;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.071675;STB=0.540311;STBP=0.572;TYPE=snp;VARB=0.00244137;OID=.;OPOS=117150933;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:71:39:41:30:30:0.422535:14:16:18:21:14:16:19:22
chr1	117156418	.	G	A	42.32	PASS	AF=0.194444;AO=7;DP=36;FAO=7;FDP=36;FR=.;FRO=29;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=-0.0227073;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.966;QD=4.70227;RBI=0.0413306;REFB=-0.00143426;REVB=-0.0345339;RO=29;SAF=5;SAR=2;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.353661;STB=0.735777;STBP=0.185;TYPE=snp;VARB=0.0081914;OID=.;OPOS=117156418;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:42:36:36:29:29:7:7:0.194444:2:5:12:17:2:5:12:17
chr1	117156459	.	C	T	148.06	PASS	AF=0.31746;AO=20;DP=63;FAO=20;FDP=63;FR=.;FRO=43;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=26;FWDB=0.0508332;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.7135;QD=9.40085;RBI=0.0530813;REFB=0.00108481;REVB=-0.0152845;RO=43;SAF=12;SAR=8;SRF=17;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.23318;STB=0.637366;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=-0.00169466;OID=.;OPOS=117156459;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:43:43:20:20:0.31746:8:12:17:26:8:12:17:26
chr1	117156490	.	T	C	188.66	PASS	AF=0.301205;AO=25;DP=82;FAO=25;FDP=83;FR=.;FRO=58;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=26;FSRR=32;FWDB=-0.0324534;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.4182;QD=9.09181;RBI=0.0440662;REFB=-0.00964687;REVB=-0.0298096;RO=57;SAF=15;SAR=10;SRF=26;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169286;STB=0.605685;STBP=0.214;TYPE=snp;VARB=0.0302561;OID=.;OPOS=117156490;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:83:57:58:25:25:0.301205:10:15:26:31:10:15:26:32
chr1	117156584	.	TG	CA	99.31	PASS	AF=0.219178;AO=16;DP=73;FAO=16;FDP=73;FR=.,HEALED;FRO=57;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=26;FSRR=31;FWDB=-0.0243224;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=201.812;QD=5.4417;RBI=0.057732;REFB=-0.00974894;REVB=-0.0523584;RO=40;SAF=8;SAR=8;SRF=23;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0887885;STB=0.534204;STBP=0.8;TYPE=mnp;VARB=0.0400112;OID=.;OPOS=117156584;OREF=TG;OALT=CA;OMAPALT=CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:40:57:16:16:0.219178:8:8:23:17:8:8:26:31
chr1	117156600	.	T	C	82.03	PASS	AF=0.194444;AO=14;DP=72;FAO=14;FDP=72;FR=.;FRO=58;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=33;FSRR=25;FWDB=-0.0132073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.303;QD=4.55722;RBI=0.0182279;REFB=-0.00327055;REVB=-0.0125628;RO=58;SAF=7;SAR=7;SRF=33;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0862832;STB=0.555477;STBP=0.669;TYPE=snp;VARB=0.013807;OID=.;OPOS=117156600;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:82:72:72:58:58:14:14:0.194444:7:7:33:25:7:7:33:25
chr1	117311147	.	C	A	714.89	PASS	AF=0.978723;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0588749;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.1879;QD=60.8414;RBI=0.0608496;REFB=-0.0580705;REVB=0.0153762;RO=1;SAF=21;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0218604;STB=0.511623;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.00262153;OID=.;OPOS=117311147;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:47:47:1:1:46:46:0.978723:25:21:1:0:25:21:1:0
chr1	117487710	.	AT	GA	120.19	PASS	AF=1;AO=11;DP=12;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0243671;FXX=0.0832639;HRUN=1;LEN=2;MLLD=208.311;QD=43.7065;RBI=0.0245463;REFB=0;REVB=-0.00296087;RO=0;SAF=4;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=-0.000362103;OID=.;OPOS=117487710;OREF=AT;OALT=GA;OMAPALT=GA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:11:0:0:11:11:1:7:4:0:0:7:4:0:0
chr1	117529458	.	G	A	1540.79	PASS	AF=1;AO=102;DP=102;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00399253;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.913;QD=59.8366;RBI=0.0106862;REFB=0;REVB=0.00991238;RO=0;SAF=59;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.2314e-06;OID=.;OPOS=117529458;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:102:103:0:0:102:103:1:43:59:0:0:43:60:0:0
chr1	117530273	.	A	G	651.21	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0162994;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.881;QD=62.0202;RBI=0.0371459;REFB=0;REVB=-0.0333789;RO=0;SAF=29;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.36943e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000124268;OID=.;OPOS=117530273;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:13:29:0:0:13:29:0:0
chr1	117532291	.	A	G	1935.17	PASS	AF=0.969697;AO=128;DP=132;FAO=128;FDP=132;FR=.;FRO=4;FSAF=73;FSAR=55;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0318925;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=207.275;QD=58.6414;RBI=0.03229;REFB=-0.00500998;REVB=-0.00505148;RO=4;SAF=73;SAR=55;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0187489;STB=0.509873;STBP=0.199;TYPE=snp;VARB=7.09557e-05;OID=.;OPOS=117532291;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:132:132:4:4:128:128:0.969697:55:73:1:3:55:73:1:3
chr1	117532790	.	C	T	584.12	PASS	AF=1;AO=38;DP=40;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00733253;FXX=0.0499875;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.999;QD=61.4867;RBI=0.01872;REFB=0;REVB=-0.0172242;RO=0;SAF=17;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.53998e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.27857e-05;OID=.;OPOS=117532790;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:38:0:0:38:38:1:21:17:0:0:21:17:0:0
chr1	117532798	.	C	G,T	611.95	PASS	AF=0.928571,0.0714286;AO=37,3;DP=41;FAO=39,3;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=18,0;FSAR=21,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00724221,0.00148896;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=140.1,86.5388;QD=58.2808;RBI=0.0252182,0.0228185;REFB=0,0;REVB=-0.0241559,-0.0227699;RO=0;SAF=16,0;SAR=21,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.7558e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000667545,0.0252713;OID=.,.;OPOS=117532798,117532798;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:14:41:42:0:0:37,3:39,3:0.928571,0.0714286:21,3:16,0:0:0:21,3:18,0:0:0
chr1	117559726	.	A	G	584.93	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0239686;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.218;QD=59.993;RBI=0.0285132;REFB=0;REVB=0.0154437;RO=0;SAF=20;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.51048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000710152;OID=.;OPOS=117559726;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:39:0:0:38:39:1:18:20:0:0:18:21:0:0
chr1	117560818	.	A	G	428.34	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00123609;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.498;QD=57.1116;RBI=0.0256904;REFB=0;REVB=-0.0256606;RO=0;SAF=9;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000571179;OID=.;OPOS=117560818;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:21:9:0:0:21:9:0:0
chr1	117560929	.	C	A	1175.8	PASS	AF=0.987342;AO=78;DP=79;FAO=78;FDP=79;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0286345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.722;QD=59.5341;RBI=0.0388492;REFB=-0.111256;REVB=0.0262551;RO=1;SAF=43;SAR=35;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0133317;STB=0.50704;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=0.000585355;OID=.;OPOS=117560929;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:79:79:1:1:78:78:0.987342:35:43:0:1:35:43:0:1
chr1	117602960	.	C	A	817.49	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0621977;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.2138;QD=57.3679;RBI=0.0742055;REFB=0;REVB=0.0404709;RO=0;SAF=36;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00105045;OID=.;OPOS=117602960;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:21:36:0:0:21:36:0:0
chr1	117617705	.	A	G	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.024745;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=63.6429;QD=53.2764;RBI=0.0303915;REFB=0;REVB=0.0176445;RO=0;SAF=17;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.9951e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000187325;OID=.;OPOS=117617705;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:6:17:0:0:6:17:0:0
chr1	117618067	.	C	T	272.55	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00326412;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.831;QD=51.915;RBI=0.00688801;REFB=0;REVB=0.0060655;RO=0;SAF=6;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5931e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.49908e-05;OID=.;OPOS=117618067;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:21:0:0:20:21:1:14:6:0:0:14:7:0:0
chr1	117654858	.	G	A	284.68	PASS	AF=0.484375;AO=31;DP=64;FAO=31;FDP=64;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=0.00488695;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.125;QD=17.7924;RBI=0.00749411;REFB=-0.00410707;REVB=0.0056815;RO=27;SAF=16;SAR=15;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0600255;STB=0.578264;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=0.00279484;OID=.;OPOS=117654858;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:27:33:31:31:0.484375:15:16:12:15:15:16:12:21
chr1	117656088	.	A	G	338.52	PASS	AF=0.627451;AO=32;DP=51;FAO=32;FDP=51;FR=.;FRO=19;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.0211397;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.533;QD=26.5503;RBI=0.0293426;REFB=-0.0342887;REVB=-0.0203495;RO=19;SAF=15;SAR=17;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00336249;STB=0.501844;STBP=0.961;TYPE=snp;VARB=0.0184513;OID=.;OPOS=117656088;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:19:19:32:32:0.627451:17:15:9:10:17:15:9:10
chr1	117715026	.	C	T	1030.27	PASS	AF=0.985915;AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=71;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00160143;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=190.92;QD=58.0432;RBI=0.00590783;REFB=-0.128838;REVB=-0.00568664;RO=1;SAF=42;SAR=28;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0111254;STB=0.505881;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=-9.093e-05;OID=.;OPOS=117715026;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:71:71:1:1:70:70:0.985915:28:42:1:0:28:42:1:0
chr1	117785931	.	G	A,T	547.77	PASS	AF=0.973684,0.0263158;AO=33,3;DP=36;FAO=37,1;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=22,1;FSAR=15,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00126747,-0.00362402;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=103.67,29.3039;QD=57.66;RBI=0.0548562,0.055657;REFB=0,0;REVB=0.0548415,-0.0555389;RO=0;SAF=19,2;SAR=14,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.71297e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00210791,0.0265262;OID=.,.;OPOS=117785931,117785931;OREF=G,G;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:5:36:38:0:0:33,3:37,1:0.973684,0.0263158:14,1:19,2:0:0:15,0:22,1:0:0
chr1	117785979	.	T	C	519.61	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0518358;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.5291;QD=59.3834;RBI=0.0526487;REFB=0;REVB=0.00921609;RO=0;SAF=20;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000694651;OID=.;OPOS=117785979;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:15:20:0:0:15:20:0:0
chr1	118065841	.	A	G	493.07	PASS	AF=0.435484;AO=54;DP=125;FAO=54;FDP=124;FR=.;FRO=70;FSAF=26;FSAR=28;FSRF=33;FSRR=37;FWDB=-0.0024984;FXX=0.00799936;HRUN=3;LEN=1;MLLD=220.941;QD=15.9054;RBI=0.013181;REFB=-0.00928139;REVB=-0.0129421;RO=70;SAF=26;SAR=28;SRF=33;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0101577;STB=0.505683;STBP=0.913;TYPE=snp;VARB=0.0131492;OID=.;OPOS=118065841;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:125:124:70:70:54:54:0.435484:28:26:33:37:28:26:33:37
chr1	118169462	.	C	T	322.72	PASS	AF=0.589286;AO=28;DP=53;FAO=33;FDP=56;FR=.;FRO=23;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.00360111;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.017;QD=23.0516;RBI=0.026609;REFB=-0.00810876;REVB=-0.0263642;RO=23;SAF=17;SAR=11;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106725;STB=0.553677;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=0.00775816;OID=.;OPOS=118169462;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:56:23:23:28:33:0.589286:11:17:11:12:13:20:11:12
chr1	118494625	.	C	T	386.9	PASS	AF=0.409091;AO=45;DP=110;FAO=45;FDP=110;FR=.;FRO=65;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=32;FSRR=33;FWDB=0.00270607;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.7784;QD=14.0692;RBI=0.0470404;REFB=0.00194755;REVB=-0.0469625;RO=65;SAF=23;SAR=22;SRF=32;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.01968;STB=0.511106;STBP=0.857;TYPE=snp;VARB=-0.00463791;OID=.;OPOS=118494625;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:110:65:65:45:45:0.409091:22:23:32:33:22:23:32:33
chr1	118693217	.	T	C	851.23	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.314;QD=57.7108;RBI=0.0220636;REFB=0;REVB=0.0192012;RO=0;SAF=29;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.19238e-05;OID=.;OPOS=118693217;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:30:29:0:0:30:29:0:0
chr1	118807059	.	T	C	854.1	PASS	AF=0.983607;AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0148891;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.895;QD=56.0067;RBI=0.0228033;REFB=0.0595087;REVB=0.0172714;RO=0;SAF=34;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507244;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=5.16924e-05;OID=.;OPOS=118807059;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:61:61:0:1:60:60:0.983607:26:34:0:0:26:34:1:0
chr1	119427454	.	G	A	317.1	PASS	AF=0.367925;AO=39;DP=106;FAO=39;FDP=106;FR=.;FRO=67;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=35;FSRR=32;FWDB=-0.000956312;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=187.999;QD=11.966;RBI=0.0150053;REFB=-0.0147604;REVB=-0.0149748;RO=67;SAF=17;SAR=22;SRF=35;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0957496;STB=0.554773;STBP=0.382;TYPE=snp;VARB=0.0230786;OID=.;OPOS=119427454;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:106:67:67:39:39:0.367925:22:17:35:32:22:17:35:32
chr1	119469188	.	G	T	309.96	PASS	AF=0.5;AO=33;DP=66;FAO=33;FDP=66;FR=.;FRO=33;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=23;FWDB=0.00928267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.915;QD=18.7852;RBI=0.0128803;REFB=-0.0200883;REVB=-0.00892934;RO=32;SAF=20;SAR=13;SRF=10;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.255896;STB=0.648561;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.0145675;OID=.;OPOS=119469188;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:32:33:33:33:0.5:13:20:10:22:13:20:10:23
chr1	119923724	.	T	C	510.58	PASS	AF=0.486486;AO=54;DP=111;FAO=54;FDP=111;FR=.;FRO=57;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=30;FSRR=27;FWDB=0.00553794;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=255.467;QD=18.3993;RBI=0.0055686;REFB=-0.0130518;REVB=0.00058351;RO=57;SAF=28;SAR=26;SRF=30;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00723656;STB=0.504009;STBP=0.948;TYPE=snp;VARB=0.0129608;OID=.;OPOS=119923724;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:111:57:57:54:54:0.486486:26:28:30:27:26:28:30:27
chr1	120057158	.	C	T	754.43	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00278119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.635;QD=56.9383;RBI=0.00775083;REFB=0;REVB=-0.00723466;RO=0;SAF=34;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.97342e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.02702e-05;OID=.;OPOS=120057158;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:19:34:0:0:19:34:0:0
chr1	120057246	.	C	A	500.94	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0274159;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.2096;QD=58.9336;RBI=0.0492718;REFB=0;REVB=-0.04094;RO=0;SAF=14;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.71297e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000274706;OID=.;OPOS=120057246;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:34:0:0:33:34:1:19:14:0:0:19:15:0:0
chr1	120164738	.	C	T	438.7	PASS	AF=0.483516;AO=44;DP=89;FAO=44;FDP=91;FR=.;FRO=47;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=20;FSRR=27;FWDB=-0.0346611;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=41.7914;QD=19.2837;RBI=0.0681479;REFB=-0.00353608;REVB=0.0586749;RO=45;SAF=21;SAR=23;SRF=18;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0708411;STB=0.526832;STBP=0.623;TYPE=snp;VARB=0.00385616;OID=.;OPOS=120164738;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:91:45:47:44:44:0.483516:23:21:18:27:23:21:20:27
chr1	120166681	.	G	A	58.62	PASS	AF=0.5;AO=8;DP=16;FAO=8;FDP=16;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0410105;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.298;QD=14.6539;RBI=0.0415964;REFB=-0.00097249;REVB=-0.0069575;RO=8;SAF=3;SAR=5;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108737;STB=0.564352;STBP=0.602;TYPE=snp;VARB=0.00186589;OID=.;OPOS=120166681;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:16:16:8:8:8:8:0.5:5:3:4:4:5:3:4:4
chr1	120267544	.	C	T	990.45	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00762607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.2715;QD=59.1314;RBI=0.0248994;REFB=0;REVB=-0.0237028;RO=0;SAF=25;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.93036e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000145781;OID=.;OPOS=120267544;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:42:25:0:0:42:25:0:0
chr1	120468425	.	G	A	185.1	PASS	AF=0.407407;AO=22;DP=56;FAO=22;FDP=54;FR=.;FRO=32;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=-0.00645971;FXX=0.0357079;HRUN=2;LEN=1;MLLD=260.81;QD=13.7108;RBI=0.00866839;REFB=-0.00434115;REVB=-0.00578041;RO=32;SAF=6;SAR=16;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191433;STB=0.610581;STBP=0.195;TYPE=snp;VARB=0.00460828;OID=.;OPOS=120468425;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:54:32:32:22:22:0.407407:16:6:14:18:16:6:14:18
chr1	120539331	.	C	T	699.11	PASS	AF=0.50365;AO=69;DP=137;FAO=69;FDP=137;FR=.;FRO=68;FSAF=38;FSAR=31;FSRF=35;FSRR=33;FWDB=-0.0129042;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=276.859;QD=20.4119;RBI=0.0196099;REFB=-0.0196374;REVB=0.0147658;RO=68;SAF=38;SAR=31;SRF=35;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0326547;STB=0.517993;STBP=0.676;TYPE=snp;VARB=0.0194038;OID=.;OPOS=120539331;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:137:137:68:68:69:69:0.50365:31:38:35:33:31:38:35:33
chr1	120611830	.	G	A	40.29	PASS	AF=0.545455;AO=6;DP=11;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0192289;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.5774;QD=14.6525;RBI=0.0413826;REFB=-0.0370081;REVB=0.0366438;RO=5;SAF=5;SAR=1;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.392076;STB=0.739831;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=0.0228201;OID=.;OPOS=120611830;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:11:11:5:5:6:6:0.545455:1:5:2:3:1:5:2:3
chr1	120611876	.	C	T	60.3	PASS	AF=0.571429;AO=8;DP=14;FAO=8;FDP=14;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0220749;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.0265;QD=17.2299;RBI=0.037102;REFB=-0.0417591;REVB=0.0298204;RO=6;SAF=5;SAR=3;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0946669;STB=0.555414;STBP=0.729;TYPE=snp;VARB=0.00980209;OID=.;OPOS=120611876;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:14:14:6:6:8:8:0.571429:3:5:3:3:3:5:3:3
chr1	120611964	.	G	C	85.05	PASS	AF=0.666667;AO=10;DP=15;FAO=10;FDP=15;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0380395;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.477;QD=22.6811;RBI=0.0462532;REFB=-0.0350526;REVB=0.0263126;RO=5;SAF=4;SAR=6;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0176199;OID=.;OPOS=120611964;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:15:15:5:5:10:10:0.666667:6:4:2:3:6:4:2:3
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chr1	121116704	.	G	A	32.2	PASS	AF=0.0941176;AO=8;DP=85;FAO=8;FDP=85;FR=.;FRO=77;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=27;FSRR=50;FWDB=-0.0276751;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.727;QD=1.51519;RBI=0.0282222;REFB=-0.00304646;REVB=0.00553001;RO=77;SAF=5;SAR=3;SRF=27;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.308692;STB=0.733555;STBP=0.22;TYPE=snp;VARB=0.0236485;OID=.;OPOS=121116704;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:32:85:85:77:77:8:8:0.0941176:3:5:27:50:3:5:27:50
chr1	121116733	.	A	G	128.96	PASS	AF=0.210526;AO=20;DP=95;FAO=20;FDP=95;FR=.,HEALED;FRO=75;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=26;FSRR=49;FWDB=0.0159103;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.892;QD=5.42974;RBI=0.0189253;REFB=-0.00491758;REVB=-0.0102483;RO=63;SAF=9;SAR=11;SRF=25;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0670723;STB=0.583704;STBP=0.442;TYPE=snp;VARB=0.0315713;OID=.;OPOS=121116733;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:63:75:20:20:0.210526:11:9:25:38:11:9:26:49
chr1	144014051	.	G	A	289.32	PASS	AF=0.343434;AO=34;DP=99;FAO=34;FDP=99;FR=.;FRO=65;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=26;FSRR=39;FWDB=0.00723977;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.156;QD=11.6897;RBI=0.00724044;REFB=0.00493027;REVB=-9.88389e-05;RO=65;SAF=16;SAR=18;SRF=26;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0810438;STB=0.546735;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=-0.00692696;OID=.;OPOS=144014051;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:65:65:34:34:0.343434:18:16:26:39:18:16:26:39
chr1	144014068	.	T	C	741.29	PASS	AF=0.709302;AO=61;DP=86;FAO=61;FDP=86;FR=.;FRO=25;FSAF=25;FSAR=36;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=-0.00864564;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.203;QD=34.4788;RBI=0.0183748;REFB=-0.0164234;REVB=0.0162138;RO=25;SAF=25;SAR=36;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0388252;STB=0.520916;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=0.00829773;OID=.;OPOS=144014068;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:25:25:61:61:0.709302:36:25:12:13:36:25:12:13
chr1	144534038	.	A	G	278.48	PASS	AF=0.234973;AO=43;DP=183;FAO=43;FDP=183;FR=.;FRO=140;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=82;FSRR=58;FWDB=-0.0130762;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.596;QD=6.08693;RBI=0.0247405;REFB=-0.00324788;REVB=-0.0210025;RO=138;SAF=23;SAR=20;SRF=81;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0664316;STB=0.539273;STBP=0.576;TYPE=snp;VARB=0.010796;OID=.;OPOS=144534038;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:183:183:138:140:43:43:0.234973:20:23:81:57:20:23:82:58
chr1	144534045	.	T	C	1741.57	PASS	AF=0.703518;AO=139;DP=198;FAO=140;FDP=199;FR=.;FRO=59;FSAF=79;FSAR=61;FSRF=37;FSRR=22;FWDB=-0.00177397;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.784;QD=35.0065;RBI=0.0323469;REFB=-0.0226897;REVB=0.0322983;RO=59;SAF=78;SAR=61;SRF=37;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0374766;STB=0.519032;STBP=0.445;TYPE=snp;VARB=0.00952501;OID=.;OPOS=144534045;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:198:199:59:59:139:140:0.703518:61:78:37:22:61:79:37:22
chr1	144534053	.	G	A	111.77	PASS	AF=0.12069;AO=28;DP=232;FAO=28;FDP=232;FR=.;FRO=204;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=113;FSRR=91;FWDB=0.00248823;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.9607;QD=1.92714;RBI=0.0826515;REFB=0.0003713;REVB=0.082614;RO=203;SAF=18;SAR=10;SRF=112;SRR=91;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117598;STB=0.581143;STBP=0.405;TYPE=snp;VARB=0.000149499;OID=.;OPOS=144534053;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:232:232:203:204:28:28:0.12069:10:18:112:91:10:18:113:91
chr1	144534076	.	G	A	531.34	PASS	AF=0.257525;AO=77;DP=301;FAO=77;FDP=299;FR=.;FRO=222;FSAF=42;FSAR=35;FSRF=120;FSRR=102;FWDB=0.00162334;FXX=0.0066443;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.915;QD=7.10821;RBI=0.00351329;REFB=0.00159901;REVB=0.00311576;RO=216;SAF=42;SAR=35;SRF=118;SRR=98;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0010574;STB=0.503676;STBP=0.939;TYPE=snp;VARB=-0.00507962;OID=.;OPOS=144534076;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:301:299:216:222:77:77:0.257525:35:42:118:98:35:42:120:102
chr1	144534082	.	TC	CT,TT	3667.08	PASS	AF=0.18328,0.710611;AO=57,209;DP=313;FAO=57,221;FDP=311;FR=.;FRO=33;FSAF=29,124;FSAR=28,97;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=0.0032414,-0.00862342;FXX=0.00955384;HRUN=4,2;LEN=2,1;MLLD=203.908,47.0852;QD=47.165;RBI=0.02095,0.0173371;REFB=-0.00740096,0.00761401;REVB=-0.0206977,-0.0150403;RO=32;SAF=29,122;SAR=28,87;SRF=12;SRR=20;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.088575,0.0534598;STB=0.553115,0.525875;STBP=0.201,0.034;TYPE=mnp,snp;VARB=0.00810507,0.0104153;OID=.,.;OPOS=144534082,144534083;OREF=TC,C;OALT=CT,T;OMAPALT=CT,TT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:313:311:32:33:57,209:57,221:0.18328,0.710611:28,87:29,122:12:20:28,97:29,124:12:21
chr1	144534084	.	C	G	69.59	PASS	AF=0.0841121;AO=25;DP=321;FAO=27;FDP=321;FR=.;FRO=294;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=160;FSRR=134;FWDB=0.00278119;FXX=0.0183481;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.813;QD=0.867118;RBI=0.0253087;REFB=-0.000814663;REVB=-0.0251555;RO=289;SAF=10;SAR=15;SRF=155;SRR=134;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155641;STB=0.689658;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.143949;OID=.;OPOS=144534084;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:69:321:321:289:294:25:27:0.0841121:15:10:155:134:18:9:160:134
chr1	144534092	.	G	A	3169.99	PASS	AF=0.728045;AO=257;DP=353;FAO=257;FDP=353;FR=.;FRO=96;FSAF=132;FSAR=125;FSRF=51;FSRR=45;FWDB=0.00438564;FXX=0.00563364;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.613;QD=35.9206;RBI=0.00764433;REFB=-0.00619236;REVB=0.00626115;RO=75;SAF=132;SAR=125;SRF=45;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0368241;STB=0.504799;STBP=0.765;TYPE=snp;VARB=0.00476031;OID=.;OPOS=144534092;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:353:353:75:96:257:257:0.728045:125:132:45:30:125:132:51:45
chr1	144534096	.	T	C	3120.72	PASS	AF=0.700272;AO=258;DP=370;FAO=257;FDP=367;FR=.;FRO=110;FSAF=132;FSAR=125;FSRF=56;FSRR=54;FWDB=0.00262635;FXX=0.00810789;HRUN=5;LEN=1;MLLD=233.501;QD=34.0133;RBI=0.00324001;REFB=-0.00740457;REVB=0.00189736;RO=99;SAF=132;SAR=126;SRF=52;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0070933;STB=0.501358;STBP=0.933;TYPE=snp;VARB=0.00353586;OID=.;OPOS=144534096;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:370:367:99:110:258:257:0.700272:126:132:52:47:125:132:56:54
chr1	144534186	.	TCG	T	443.13	PASS	AF=0.185022;AO=76;DP=459;FAO=84;FDP=454;FR=.;FRO=370;FSAF=39;FSAR=45;FSRF=170;FSRR=200;FWDB=-0.00204749;FXX=0.010893;HRUN=1;LEN=2;MLLD=186.887;QD=3.90422;RBI=0.0142393;REFB=-0.000602687;REVB=-0.0140913;RO=356;SAF=36;SAR=40;SRF=165;SRR=191;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0132987;STB=0.503955;STBP=0.937;TYPE=del;VARB=0.00278185;OID=.;OPOS=144534187;OREF=CG;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.185022:76:459:84:454:370:39:45:170:200:99:356:36:40:165:191
chr1	144615138	.	T	G	51.55	PASS	AF=0.636364;AO=7;DP=11;FAO=7;FDP=11;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.00721167;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.889;QD=18.7442;RBI=0.0246814;REFB=-0.020067;REVB=0.0236043;RO=4;SAF=2;SAR=5;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149414;STB=0.58797;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=0.00730899;OID=.;OPOS=144615138;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:11:11:4:4:7:7:0.636364:5:2:2:2:5:2:2:2
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chr1	144618123	.	C	T	213.34	PASS	AF=0.208092;AO=36;DP=173;FAO=36;FDP=173;FR=.;FRO=137;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=69;FSRR=68;FWDB=0.0198027;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.762;QD=4.93262;RBI=0.0378727;REFB=-0.0186755;REVB=-0.032283;RO=135;SAF=24;SAR=12;SRF=68;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.212319;STB=0.632336;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=0.0467527;OID=.;OPOS=144618123;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:173:173:135:137:36:36:0.208092:12:24:68:67:12:24:69:68
chr1	144618144	.	A	G	1923.21	PASS	AF=0.984375;AO=126;DP=128;FAO=126;FDP=128;FR=.;FRO=2;FSAF=66;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00113144;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.657;QD=60.1002;RBI=0.00942855;REFB=-0.0690839;REVB=0.00936041;RO=2;SAF=66;SAR=60;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0155732;STB=0.508195;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.000832929;OID=.;OPOS=144618144;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:128:128:2:2:126:126:0.984375:60:66:0:2:60:66:0:2
chr1	144619346	.	G	A	1420.97	PASS	AF=0.958763;AO=82;DP=97;FAO=93;FDP=97;FR=.,HEALED;FRO=4;FSAF=36;FSAR=57;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.00393433;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.308;QD=58.5968;RBI=0.071625;REFB=0.00295004;REVB=0.0715169;RO=4;SAF=34;SAR=48;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0302119;STB=0.515654;STBP=0.168;TYPE=snp;VARB=4.39215e-05;OID=.;OPOS=144619346;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:97:97:4:4:82:93:0.958763:48:34:3:1:57:36:3:1
chr1	144619354	.	C	T	466.02	PASS	AF=0.47619;AO=50;DP=106;FAO=50;FDP=105;FR=.;FRO=55;FSAF=17;FSAR=33;FSRF=23;FSRR=32;FWDB=-0.0185195;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.913;QD=17.7531;RBI=0.0204223;REFB=-0.024115;REVB=-0.00860786;RO=54;SAF=17;SAR=33;SRF=23;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0865441;STB=0.544312;STBP=0.429;TYPE=snp;VARB=0.0191489;OID=.;OPOS=144619354;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:105:54:55:50:50:0.47619:33:17:23:31:33:17:23:32
chr1	144621509	.	A	G	74.24	PASS	AF=0.3125;AO=10;DP=33;FAO=10;FDP=32;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=-0.022007;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.991;QD=9.28006;RBI=0.0273296;REFB=-0.0043294;REVB=-0.0162049;RO=23;SAF=9;SAR=1;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.614613;STB=0.87418;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.00373308;OID=.;OPOS=144621509;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:33:32:23:22:10:10:0.3125:1:9:9:14:1:9:9:13
chr1	144621522	.	A	C	75.77	PASS	AF=0.206897;AO=12;DP=58;FAO=12;FDP=58;FR=.;FRO=46;FSAF=11;FSAR=1;FSRF=19;FSRR=27;FWDB=0.0251365;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.407;QD=5.22579;RBI=0.0269537;REFB=0.00480409;REVB=-0.00972922;RO=46;SAF=11;SAR=1;SRF=19;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.635319;STB=0.910538;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=-0.0177103;OID=.;OPOS=144621522;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:58:58:46:46:12:12:0.206897:1:11:19:27:1:11:19:27
chr1	144621526	.	G	A	84.46	PASS	AF=0.205882;AO=14;DP=67;FAO=14;FDP=68;FR=.;FRO=54;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=25;FSRR=29;FWDB=-0.0154582;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.2119;QD=4.9685;RBI=0.0235617;REFB=-0.0137718;REVB=-0.017782;RO=52;SAF=11;SAR=3;SRF=24;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.413251;STB=0.764827;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=0.0283149;OID=.;OPOS=144621526;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:67:68:52:54:14:14:0.205882:3:11:24:28:3:11:25:29
chr1	144621555	.	A	G	46.43	PASS	AF=0.101695;AO=11;DP=122;FAO=12;FDP=118;FR=.,HEALED;FRO=106;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=56;FSRR=50;FWDB=0.0119805;FXX=0.0406471;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.806;QD=1.57402;RBI=0.049992;REFB=0.00046357;REVB=-0.0485353;RO=91;SAF=9;SAR=2;SRF=43;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.415986;STB=0.797016;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.000566976;OID=.;OPOS=144621555;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:122:118:91:106:11:12:0.101695:2:9:43:48:2:10:56:50
chr1	144811827	.	G	A	42.72	PASS	AF=0.123288;AO=9;DP=73;FAO=9;FDP=73;FR=.;FRO=64;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=28;FSRR=36;FWDB=-0.0188818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.697;QD=2.3409;RBI=0.0622036;REFB=-0.00213319;REVB=-0.0592686;RO=64;SAF=3;SAR=6;SRF=28;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130682;STB=0.595934;STBP=0.559;TYPE=snp;VARB=0.0232891;OID=.;OPOS=144811827;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:42:73:73:64:64:9:9:0.123288:6:3:28:36:6:3:28:36
chr1	144811836	.	G	A	140.83	PASS	AF=0.235955;AO=21;DP=89;FAO=21;FDP=89;FR=.;FRO=68;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=28;FSRR=40;FWDB=-0.0060526;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=224.022;QD=6.32931;RBI=0.0200473;REFB=-0.00201622;REVB=0.0191117;RO=68;SAF=9;SAR=12;SRF=28;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0213917;STB=0.513145;STBP=0.913;TYPE=snp;VARB=0.00413634;OID=.;OPOS=144811836;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:68:68:21:21:0.235955:12:9:28:40:12:9:28:40
chr1	144811924	.	T	G	2741.74	PASS	AF=1;AO=174;DP=174;FAO=176;FDP=176;FR=.;FRO=0;FSAF=98;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0117702;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.0672;QD=62.3124;RBI=0.0118293;REFB=0;REVB=-0.00118168;RO=0;SAF=96;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.15906e-05;OID=.;OPOS=144811924;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:15:174:176:0:0:174:176:1:78:96:0:0:78:98:0:0
chr1	144852390	.	C	T	50.21	PASS	AF=0.138889;AO=10;DP=72;FAO=10;FDP=72;FR=.;FRO=62;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=33;FSRR=29;FWDB=0.000444265;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=189.76;QD=2.78947;RBI=0.0127184;REFB=0.00115419;REVB=-0.0127106;RO=62;SAF=5;SAR=5;SRF=33;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0394956;STB=0.527722;STBP=0.871;TYPE=snp;VARB=-0.00745597;OID=.;OPOS=144852390;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:50:72:72:62:62:10:10:0.138889:5:5:33:29:5:5:33:29
chr1	144852450	.	G	A	72.74	PASS	AF=0.196721;AO=12;DP=61;FAO=12;FDP=61;FR=.;FRO=49;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=32;FWDB=0.0516674;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.6834;QD=4.7698;RBI=0.0749148;REFB=0.00309957;REVB=0.0542467;RO=49;SAF=1;SAR=11;SRF=17;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.467247;STB=0.8209;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=-0.00654097;OID=.;OPOS=144852450;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:61:61:49:49:12:12:0.196721:11:1:17:32:11:1:17:32
chr1	144852476	.	TG	CA,CG	236.76	PASS	AF=0.255319,0.255319;AO=12,12;DP=47;FAO=12,12;FDP=47;FR=.;FRO=23;FSAF=1,7;FSAR=11,5;FSRF=6;FSRR=17;FWDB=0.00845178,0.000309437;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=139.545,95.2509;QD=20.15;RBI=0.00886776,0.0196583;REFB=-0.0254278,-0.027477;REVB=0.00268411,0.0196558;RO=23;SAF=1,7;SAR=11,5;SRF=6;SRR=17;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.372289,0.345175;STB=0.732835,0.702893;STBP=0.137,0.102;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0259553,0.0164204;OID=.,.;OPOS=144852476,144852476;OREF=TG,T;OALT=CA,C;OMAPALT=CA,CG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:47:47:23:23:12,12:12,12:0.255319,0.255319:11,5:1,7:6:17:11,5:1,7:6:17
chr1	144852508	.	AAACAT	A	62.47	PASS	AF=0.324324;AO=8;DP=37;FAO=12;FDP=37;FR=.;FRO=25;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=0.00246401;FXX=0;HRUN=3;LEN=5;MLLD=301.001;QD=6.75382;RBI=0.00361564;REFB=0.00946908;REVB=-0.00264604;RO=22;SAF=1;SAR=7;SRF=6;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.273682;STB=0.802274;STBP=0.035;TYPE=del;VARB=-0.0199125;OID=.;OPOS=144852509;OREF=AACAT;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.324324:8:37:12:37:25:1:11:9:16:62:22:1:7:6:16
chr1	144852518	.	C	T	105.32	PASS	AF=0.342105;AO=13;DP=38;FAO=13;FDP=38;FR=.;FRO=25;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=0.0281521;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.4836;QD=11.0866;RBI=0.0308974;REFB=0.0374957;REVB=-0.0127323;RO=25;SAF=2;SAR=11;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.312603;STB=0.691086;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=-0.028449;OID=.;OPOS=144852518;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:25:25:13:13:0.342105:11:2:9:16:11:2:9:16
chr1	144852522	.	C	T	105.31	PASS	AF=0.342105;AO=13;DP=38;FAO=13;FDP=38;FR=.;FRO=25;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=-0.000759655;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.902;QD=11.085;RBI=0.0400619;REFB=-0.000394972;REVB=-0.0400547;RO=25;SAF=2;SAR=11;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.312603;STB=0.691086;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=0.000427965;OID=.;OPOS=144852522;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:25:25:13:13:0.342105:11:2:9:16:11:2:9:16
chr1	144854180	.	T	C	564.88	PASS	AF=0.261006;AO=83;DP=318;FAO=83;FDP=318;FR=.;FRO=235;FSAF=40;FSAR=43;FSRF=115;FSRR=120;FWDB=-0.00618124;FXX=0.0031347;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.324;QD=7.1054;RBI=0.00698476;REFB=-0.00987231;REVB=0.00325256;RO=235;SAF=40;SAR=43;SRF=115;SRR=120;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00928752;STB=0.505497;STBP=0.914;TYPE=snp;VARB=0.0252729;OID=.;OPOS=144854180;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:318:318:235:235:83:83:0.261006:43:40:115:120:43:40:115:120
chr1	144854528	.	A	G	295.81	PASS	AF=0.304688;AO=39;DP=128;FAO=39;FDP=128;FR=.;FRO=89;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=47;FSRR=42;FWDB=-0.00965215;FXX=0.0153834;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.767;QD=9.24416;RBI=0.021275;REFB=-0.00741968;REVB=0.0189595;RO=89;SAF=18;SAR=21;SRF=47;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0790173;STB=0.546195;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.0237386;OID=.;OPOS=144854528;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:128:128:89:89:39:39:0.304688:21:18:47:42:21:18:47:42
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chr1	144854597	.	T	C	1297.39	PASS	AF=0.75;AO=80;DP=206;FAO=150;FDP=200;FR=.,HEALED;FRO=49;FSAF=65;FSAR=85;FSRF=30;FSRR=19;FWDB=0.00151471;FXX=0.0566011;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.523;QD=25.9479;RBI=0.0258941;REFB=-0.0533383;REVB=0.0258498;RO=44;SAF=35;SAR=45;SRF=25;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0861498;STB=0.544315;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.0349545;OID=.;OPOS=144854597;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:206:200:44:49:80:150:0.75:45:35:25:19:85:65:30:19
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chr1	144855812	.	T	C	192.84	PASS	AF=0.423077;AO=22;DP=52;FAO=22;FDP=52;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=-0.040287;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.163;QD=14.8335;RBI=0.041179;REFB=-0.00648738;REVB=0.00852459;RO=30;SAF=8;SAR=14;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0390982;STB=0.522367;STBP=0.802;TYPE=snp;VARB=0.00833167;OID=.;OPOS=144855812;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:30:30:22:22:0.423077:14:8:12:18:14:8:12:18
chr1	144863320	.	T	C	50.27	PASS	AF=0.190476;AO=8;DP=42;FAO=8;FDP=42;FR=.;FRO=34;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=21;FSRR=13;FWDB=0.00172793;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=269.103;QD=4.78733;RBI=0.0205936;REFB=0.00136447;REVB=-0.020521;RO=34;SAF=4;SAR=4;SRF=21;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143711;STB=0.595009;STBP=0.593;TYPE=snp;VARB=-0.00582671;OID=.;OPOS=144863320;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:50:42:42:34:34:8:8:0.190476:4:4:21:13:4:4:21:13
chr1	144864143	.	G	A	137.22	PASS	AF=0.205128;AO=23;DP=116;FAO=24;FDP=117;FR=.;FRO=93;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=48;FSRR=45;FWDB=-0.00936157;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.2678;QD=4.69137;RBI=0.0166144;REFB=-0.0212031;REVB=0.0137259;RO=91;SAF=16;SAR=7;SRF=48;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.222141;STB=0.623424;STBP=0.195;TYPE=snp;VARB=0.0206441;OID=.;OPOS=144864143;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:116:117:91:93:23:24:0.205128:7:16:48:43:8:16:48:45
chr1	144865850	.	G	T	1144.93	PASS	AF=0.483193;AO=115;DP=239;FAO=115;FDP=238;FR=.;FRO=123;FSAF=61;FSAR=54;FSRF=63;FSRR=60;FWDB=-0.0207633;FXX=0.00418393;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.172;QD=19.2426;RBI=0.0216777;REFB=-0.00257925;REVB=0.00622982;RO=123;SAF=61;SAR=54;SRF=63;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0171628;STB=0.509449;STBP=0.756;TYPE=snp;VARB=0.00313117;OID=.;OPOS=144865850;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:239:238:123:123:115:115:0.483193:54:61:63:60:54:61:63:60
chr1	144866643	.	G	A	386.95	PASS	AF=0.409091;AO=45;DP=109;FAO=45;FDP=110;FR=.;FRO=65;FSAF=28;FSAR=17;FSRF=35;FSRR=30;FWDB=-0.013827;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.533;QD=14.0709;RBI=0.0178573;REFB=-0.0182035;REVB=0.0113003;RO=64;SAF=28;SAR=17;SRF=34;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0978206;STB=0.551296;STBP=0.403;TYPE=snp;VARB=0.0259895;OID=.;OPOS=144866643;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:110:64:65:45:45:0.409091:17:28:34:30:17:28:35:30
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chr1	144871782	.	A	G	99.36	PASS	AF=0.245902;AO=15;DP=62;FAO=15;FDP=61;FR=.;FRO=46;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=25;FWDB=-0.0152738;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.043;QD=6.51534;RBI=0.0152763;REFB=-0.022055;REVB=-0.000278473;RO=46;SAF=4;SAR=11;SRF=21;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.249762;STB=0.656105;STBP=0.209;TYPE=snp;VARB=0.0547458;OID=.;OPOS=144871782;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:61:46:46:15:15:0.245902:11:4:21:25:11:4:21:25
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chr1	144873887	.	C	T	814.07	PASS	AF=0.452128;AO=85;DP=188;FAO=85;FDP=188;FR=.;FRO=103;FSAF=65;FSAR=20;FSRF=73;FSRR=30;FWDB=0.000356203;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.8169;QD=17.3206;RBI=0.00263747;REFB=0.00643519;REVB=0.0026133;RO=101;SAF=65;SAR=20;SRF=72;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.067482;STB=0.540755;STBP=0.365;TYPE=snp;VARB=-0.0060507;OID=.;OPOS=144873887;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:188:188:101:103:85:85:0.452128:20:65:72:29:20:65:73:30
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chr1	144879090	.	T	C	78.67	PASS	AF=0.2;AO=12;DP=67;FAO=13;FDP=65;FR=.,HEALED;FRO=52;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=30;FSRR=22;FWDB=-0.031531;FXX=0.0298463;HRUN=6;LEN=1;MLLD=288.391;QD=4.84112;RBI=0.03196;REFB=-0.00610582;REVB=-0.00521871;RO=43;SAF=5;SAR=7;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144645;STB=0.591411;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.0204555;OID=.;OPOS=144879090;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:67:65:43:52:12:13:0.2:7:5:23:20:7:6:30:22
chr1	144879264	.	A	G	2409.78	PASS	AF=0.99375;AO=153;DP=155;FAO=159;FDP=160;FR=.;FRO=1;FSAF=85;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0214319;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.798;QD=60.2445;RBI=0.032493;REFB=-0.0380812;REVB=0.0244227;RO=1;SAF=80;SAR=73;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.006472;STB=0.503355;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.000128101;OID=.;OPOS=144879264;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:155:160:1:1:153:159:0.99375:73:80:0:1:74:85:0:1
chr1	144879375	.	T	C	625.99	PASS	AF=0.447368;AO=68;DP=152;FAO=68;FDP=152;FR=.;FRO=84;FSAF=26;FSAR=42;FSRF=53;FSRR=31;FWDB=-0.0748625;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.2734;QD=16.4733;RBI=0.0759916;REFB=0.0156757;REVB=0.0130507;RO=82;SAF=26;SAR=42;SRF=53;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.256671;STB=0.63608;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=-0.0196962;OID=.;OPOS=144879375;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:152:152:82:84:68:68:0.447368:42:26:53:29:42:26:53:31
chr1	144880832	.	T	C	79.91	PASS	AF=0.184211;AO=14;DP=76;FAO=14;FDP=76;FR=.;FRO=62;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=32;FSRR=30;FWDB=-0.0125151;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.547;QD=4.20589;RBI=0.0206814;REFB=-0.00710152;REVB=-0.0164649;RO=62;SAF=6;SAR=8;SRF=32;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109519;STB=0.571327;STBP=0.589;TYPE=snp;VARB=0.0353437;OID=.;OPOS=144880832;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:79:76:76:62:62:14:14:0.184211:8:6:32:30:8:6:32:30
chr1	144880864	.	T	A	217.47	PASS	AF=0.4;AO=26;DP=66;FAO=26;FDP=65;FR=.;FRO=39;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=-0.0244822;FXX=0.0151492;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.658;QD=13.3825;RBI=0.0350373;REFB=-0.0068014;REVB=-0.0250646;RO=37;SAF=13;SAR=13;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0139115;STB=0.507686;STBP=0.949;TYPE=snp;VARB=0.0145155;OID=.;OPOS=144880864;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:65:37:39:26:26:0.4:13:13:18:19:13:13:19:20
chr1	144882581	.	A	G	685.03	PASS	AF=0.476821;AO=72;DP=151;FAO=72;FDP=151;FR=.;FRO=79;FSAF=39;FSAR=33;FSRF=44;FSRR=35;FWDB=-0.0106036;FXX=0.00657851;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.2132;QD=18.1464;RBI=0.016204;REFB=-0.0138972;REVB=-0.0122529;RO=79;SAF=39;SAR=33;SRF=44;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0145847;STB=0.508067;STBP=0.845;TYPE=snp;VARB=0.0128265;OID=.;OPOS=144882581;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:151:151:79:79:72:72:0.476821:33:39:44:35:33:39:44:35
chr1	144882823	.	C	T	427.3	PASS	AF=0.408333;AO=49;DP=119;FAO=49;FDP=120;FR=.;FRO=71;FSAF=18;FSAR=31;FSRF=28;FSRR=43;FWDB=-0.0191566;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.191;QD=14.2432;RBI=0.0191837;REFB=-0.011949;REVB=-0.00101791;RO=69;SAF=18;SAR=31;SRF=26;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.010537;STB=0.517034;STBP=0.791;TYPE=snp;VARB=0.0181377;OID=.;OPOS=144882823;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:120:69:71:49:49:0.408333:31:18:26:43:31:18:28:43
chr1	144886197	.	A	T	437.87	PASS	AF=0.4375;AO=49;DP=112;FAO=49;FDP=112;FR=.;FRO=63;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=29;FSRR=34;FWDB=0.00625477;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=234.589;QD=15.6381;RBI=0.00673416;REFB=-0.0100439;REVB=0.00249534;RO=63;SAF=23;SAR=26;SRF=29;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00914752;STB=0.505122;STBP=0.949;TYPE=snp;VARB=0.0130068;OID=.;OPOS=144886197;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:112:63:63:49:49:0.4375:26:23:29:34:26:23:29:34
chr1	144892089	.	G	T	207.71	PASS	AF=0.403226;AO=25;DP=62;FAO=25;FDP=62;FR=.;FRO=37;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=0.00348898;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.8182;QD=13.4009;RBI=0.0110116;REFB=0.0130274;REVB=0.0104442;RO=37;SAF=10;SAR=15;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.091827;STB=0.552589;STBP=0.488;TYPE=snp;VARB=-0.0258939;OID=.;OPOS=144892089;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:37:37:25:25:0.403226:15:10:18:19:15:10:18:19
chr1	144892149	.	G	A	334.22	PASS	AF=0.4375;AO=35;DP=84;FAO=35;FDP=80;FR=.;FRO=45;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=21;FSRR=24;FWDB=-0.00738566;FXX=0.101112;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.065;QD=16.7111;RBI=0.0260924;REFB=-0.01425;REVB=-0.0250253;RO=44;SAF=22;SAR=13;SRF=21;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152949;STB=0.592809;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=0.0220913;OID=.;OPOS=144892149;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:80:44:45:35:35:0.4375:13:22:21:23:13:22:21:24
chr1	144912153	.	A	G	1525.1	PASS	AF=0.682796;AO=126;DP=185;FAO=127;FDP=186;FR=.;FRO=59;FSAF=56;FSAR=71;FSRF=34;FSRR=25;FWDB=-0.00546838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.378;QD=32.7978;RBI=0.0162188;REFB=-0.000929544;REVB=0.0152692;RO=59;SAF=55;SAR=71;SRF=34;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.083445;STB=0.543083;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=0.000481736;OID=.;OPOS=144912153;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:185:186:59:59:126:127:0.682796:71:55:34:25:71:56:34:25
chr1	144912233	.	C	T	566.13	PASS	AF=0.408805;AO=65;DP=159;FAO=65;FDP=159;FR=.;FRO=94;FSAF=29;FSAR=36;FSRF=41;FSRR=53;FWDB=0.00728063;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.146;QD=14.2424;RBI=0.00728212;REFB=0.00238711;REVB=-0.000147284;RO=94;SAF=29;SAR=36;SRF=41;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0106431;STB=0.505977;STBP=0.903;TYPE=snp;VARB=-0.0027039;OID=.;OPOS=144912233;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:159:159:94:94:65:65:0.408805:36:29:41:53:36:29:41:53
chr1	144915561	.	G	A	1074.53	PASS	AF=0.509434;AO=107;DP=212;FAO=108;FDP=212;FR=.;FRO=104;FSAF=58;FSAR=50;FSRF=49;FSRR=55;FWDB=0.00124817;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.212;QD=20.2742;RBI=0.00531537;REFB=-0.00260379;REVB=0.00516674;RO=104;SAF=57;SAR=50;SRF=49;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0553166;STB=0.532337;STBP=0.345;TYPE=snp;VARB=0.00194151;OID=.;OPOS=144915561;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:212:212:104:104:107:108:0.509434:50:57:49:55:50:58:49:55
chr1	144915623	.	AG	A,AA	651.62	PASS	AF=0.307692,0.188811;AO=44,27;DP=145;FAO=44,27;FDP=143;FR=.;FRO=72;FSAF=24,12;FSAR=20,15;FSRF=32;FSRR=40;FWDB=-0.0167741,0.0272999;FXX=0.0137922;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=122.368,129.67;QD=18.2271;RBI=0.0210495,0.0273854;REFB=-0.0200707,-0.0169732;REVB=-0.0127166,-0.00216121;RO=72;SAF=24,12;SAR=20,15;SRF=32;SRR=40;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.109868,0;STB=0.562472,0.5;STBP=0.291,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0268547,0.00906612;OID=.,.;OPOS=144915624,144915624;OREF=G,G;OALT=-,A;OMAPALT=A,AA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.307692,0.188811:44,27:145:44,27:143:72:24,12:20,15:32:40:99:72:24,12:20,15:32:40
chr1	144916748	.	C	G	632.62	PASS	AF=0.529412;AO=63;DP=120;FAO=63;FDP=119;FR=.;FRO=56;FSAF=31;FSAR=32;FSRF=31;FSRR=25;FWDB=0.0330054;FXX=0.00833264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.4525;QD=21.2644;RBI=0.0333279;REFB=-0.0201478;REVB=-0.00462524;RO=56;SAF=31;SAR=32;SRF=31;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0526619;STB=0.528916;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.0169708;OID=.;OPOS=144916748;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:119:56:56:63:63:0.529412:32:31:31:25:32:31:31:25
chr1	144917546	.	A	G	434.92	PASS	AF=0.45283;AO=48;DP=106;FAO=48;FDP=106;FR=.;FRO=58;FSAF=21;FSAR=27;FSRF=25;FSRR=33;FWDB=0.0250692;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.0462;QD=16.4121;RBI=0.0399874;REFB=0.0128425;REVB=-0.0311534;RO=58;SAF=21;SAR=27;SRF=25;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00643954;STB=0.503596;STBP=0.944;TYPE=snp;VARB=-0.0152541;OID=.;OPOS=144917546;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:106:58:58:48:48:0.45283:27:21:25:33:27:21:25:33
chr1	144917841	.	T	C	393.18	PASS	AF=0.4;AO=46;DP=115;FAO=46;FDP=115;FR=.;FRO=69;FSAF=28;FSAR=18;FSRF=31;FSRR=38;FWDB=0.0118356;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.447;QD=13.6759;RBI=0.0138946;REFB=-0.011368;REVB=0.00727868;RO=68;SAF=28;SAR=18;SRF=31;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162402;STB=0.596156;STBP=0.109;TYPE=snp;VARB=0.020579;OID=.;OPOS=144917841;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:115:68:69:46:46:0.4:18:28:31:37:18:28:31:38
chr1	144918957	.	T	A	231.73	PASS	AF=0.322222;AO=29;DP=90;FAO=29;FDP=90;FR=.;FRO=61;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=26;FSRR=35;FWDB=-0.0106335;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.601;QD=10.2989;RBI=0.016422;REFB=-0.00324639;REVB=0.0125144;RO=61;SAF=12;SAR=17;SRF=26;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0148127;STB=0.508655;STBP=0.913;TYPE=snp;VARB=0.00664795;OID=.;OPOS=144918957;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:61:61:29:29:0.322222:17:12:26:35:17:12:26:35
chr1	144921924	.	G	A	212.28	PASS	AF=0.215569;AO=35;DP=167;FAO=36;FDP=167;FR=.;FRO=131;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=43;FSRR=88;FWDB=-0.00850462;FXX=0.00595203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.4042;QD=5.08451;RBI=0.00952672;REFB=-0.00196272;REVB=-0.00429301;RO=129;SAF=22;SAR=13;SRF=43;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.363003;STB=0.711371;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.00764576;OID=.;OPOS=144921924;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:167:167:129:131:35:36:0.215569:13:22:43:86:14:22:43:88
chr1	144922583	.	G	A	722.06	PASS	AF=0.530303;AO=70;DP=132;FAO=70;FDP=132;FR=.;FRO=62;FSAF=32;FSAR=38;FSRF=33;FSRR=29;FWDB=0.0474019;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.3536;QD=21.8806;RBI=0.0583947;REFB=-0.00669495;REVB=-0.0341029;RO=61;SAF=32;SAR=38;SRF=32;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0573799;STB=0.535317;STBP=0.408;TYPE=snp;VARB=0.00834417;OID=.;OPOS=144922583;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:132:132:61:62:70:70:0.530303:38:32:32:29:38:32:33:29
chr1	144923728	.	GT	G	173.41	PASS	AF=0.212355;AO=56;DP=262;FAO=55;FDP=259;FR=.;FRO=204;FSAF=19;FSAR=36;FSRF=117;FSRR=87;FWDB=0.0825347;FXX=0.0114499;HRUN=2;LEN=1;MLLD=25.0071;QD=2.67817;RBI=0.100201;REFB=0.0104711;REVB=-0.0568183;RO=197;SAF=19;SAR=37;SRF=111;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.284111;STB=0.676834;STBP=0.007;TYPE=del;VARB=-0.0362511;OID=.;OPOS=144923729;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.212355:56:262:55:259:204:19:36:117:87:99:197:19:37:111:86
chr1	144923823	.	TAGGAAGAAACGGCA	T	616.29	PASS	AF=0.612903;AO=55;DP=140;FAO=57;FDP=93;FR=.;FRO=36;FSAF=26;FSAR=31;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=0.00862916;FXX=0.162148;HRUN=1;LEN=14;MLLD=355.443;QD=26.5069;RBI=0.00933423;REFB=0.000639041;REVB=0.00355885;RO=68;SAF=25;SAR=30;SRF=41;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146175;STB=0.515435;STBP=0.729;TYPE=del;VARB=-0.000134237;OID=.;OPOS=144923824;OREF=AGGAAGAAACGGCA;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.612903:55:140:57:93:36:26:31:15:21:99:68:25:30:41:27
chr1	144930596	.	C	A	416.19	PASS	AF=0.376923;AO=45;DP=130;FAO=49;FDP=130;FR=.,HEALED;FRO=81;FSAF=34;FSAR=15;FSRF=42;FSRR=39;FWDB=-0.0252267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.629;QD=12.806;RBI=0.0267211;REFB=-0.00915649;REVB=-0.00881097;RO=58;SAF=34;SAR=11;SRF=42;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0415631;STB=0.616886;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=0.0221429;OID=.;OPOS=144930596;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:130:130:58:81:45:49:0.376923:11:34:42:16:15:34:42:39
chr1	144930940	.	T	C	296.55	PASS	AF=0.492308;AO=31;DP=65;FAO=32;FDP=65;FR=.;FRO=33;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=-0.0490554;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.2183;QD=18.2489;RBI=0.0524349;REFB=-0.0191776;REVB=0.0185198;RO=33;SAF=18;SAR=13;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116669;STB=0.571245;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=0.0174755;OID=.;OPOS=144930940;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:33:33:31:32:0.492308:13:18:15:18:13:19:15:18
chr1	144931330	.	C	T	343.25	PASS	AF=0.34127;AO=43;DP=126;FAO=43;FDP=126;FR=.;FRO=83;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=36;FSRR=47;FWDB=-0.00420837;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.489;QD=10.8968;RBI=0.0236319;REFB=-0.00273348;REVB=0.0232541;RO=83;SAF=25;SAR=18;SRF=36;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168117;STB=0.596724;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=0.00433304;OID=.;OPOS=144931330;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:126:126:83:83:43:43:0.34127:18:25:36:47:18:25:36:47
chr1	144931392	.	G	A	570.91	PASS	AF=0.416667;AO=65;DP=156;FAO=65;FDP=156;FR=.;FRO=91;FSAF=42;FSAR=23;FSRF=40;FSRR=51;FWDB=-0.0194607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.7906;QD=14.6388;RBI=0.02611;REFB=-0.0104839;REVB=-0.0174073;RO=91;SAF=42;SAR=23;SRF=40;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.217857;STB=0.622309;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.00977846;OID=.;OPOS=144931392;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:156:156:91:91:65:65:0.416667:23:42:40:51:23:42:40:51
chr1	144931461	.	A	T	224.12	PASS	AF=0.292453;AO=31;DP=106;FAO=31;FDP=106;FR=.;FRO=75;FSAF=26;FSAR=5;FSRF=32;FSRR=43;FWDB=-0.0167889;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.3429;QD=8.45725;RBI=0.0233621;REFB=0.0010799;REVB=-0.0162456;RO=74;SAF=26;SAR=5;SRF=32;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.517203;STB=0.811231;STBP=0;TYPE=snp;VARB=-0.005071;OID=.;OPOS=144931461;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:106:74:75:31:31:0.292453:5:26:32:42:5:26:32:43
chr1	144952207	.	C	T	244.1	PASS	AF=0.290598;AO=34;DP=117;FAO=34;FDP=117;FR=.;FRO=83;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=51;FSRR=32;FWDB=0.0298213;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.568;QD=8.34514;RBI=0.065041;REFB=-0.00673804;REVB=-0.0578016;RO=82;SAF=19;SAR=15;SRF=50;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0626015;STB=0.540378;STBP=0.597;TYPE=snp;VARB=0.0177523;OID=.;OPOS=144952207;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:117:117:82:83:34:34:0.290598:15:19:50:32:15:19:51:32
chr1	144952220	.	C	T	372.23	PASS	AF=0.396396;AO=44;DP=111;FAO=44;FDP=111;FR=.;FRO=67;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=43;FSRR=24;FWDB=-0.00678656;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.022;QD=13.4138;RBI=0.0126646;REFB=-0.0136215;REVB=-0.0106928;RO=67;SAF=23;SAR=21;SRF=43;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128359;STB=0.572459;STBP=0.231;TYPE=snp;VARB=0.0191222;OID=.;OPOS=144952220;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:111:67:67:44:44:0.396396:21:23:43:24:21:23:43:24
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chr1	145074975	.	G	A	73.06	PASS	AF=0.0985915;AO=21;DP=214;FAO=21;FDP=213;FR=.;FRO=192;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=91;FSRR=101;FWDB=-0.00844023;FXX=0.00467268;HRUN=2;LEN=1;MLLD=259.225;QD=1.37203;RBI=0.0114451;REFB=-0.000514116;REVB=0.00772994;RO=192;SAF=5;SAR=16;SRF=91;SRR=101;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.294563;STB=0.723964;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.00530075;OID=.;OPOS=145074975;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:214:213:192:192:21:21:0.0985915:16:5:91:101:16:5:91:101
chr1	145075683	.	C	T	193.07	PASS	AF=0.423077;AO=22;DP=52;FAO=22;FDP=52;FR=.;FRO=30;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=-0.0141491;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=120.2;QD=14.8517;RBI=0.0283547;REFB=-0.040083;REVB=-0.0245722;RO=30;SAF=16;SAR=6;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.340839;STB=0.695469;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.0533214;OID=.;OPOS=145075683;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:30:30:22:22:0.423077:6:16:12:18:6:16:12:18
chr1	145075854	.	G	C	90.31	PASS	AF=0.3;AO=11;DP=39;FAO=12;FDP=40;FR=.;FRO=28;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=-0.0186992;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.041;QD=9.03062;RBI=0.0390326;REFB=-0.0116732;REVB=0.034262;RO=28;SAF=7;SAR=4;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00819703;STB=0.518487;STBP=0.878;TYPE=snp;VARB=0.0253875;OID=.;OPOS=145075854;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:90:39:40:28:28:11:12:0.3:4:7:18:10:4:8:18:10
chr1	145103928	.	G	A	83.11	PASS	AF=0.119048;AO=20;DP=169;FAO=20;FDP=168;FR=.;FRO=148;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=73;FSRR=75;FWDB=-0.0155444;FXX=0.00591681;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.582;QD=1.97885;RBI=0.0174599;REFB=-0.000365923;REVB=-0.00795116;RO=148;SAF=10;SAR=10;SRF=73;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00836812;STB=0.505946;STBP=0.946;TYPE=snp;VARB=0.00492335;OID=.;OPOS=145103928;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:169:168:148:148:20:20:0.119048:10:10:73:75:10:10:73:75
chr1	145103947	.	T	C	341.58	PASS	AF=0.260638;AO=49;DP=189;FAO=49;FDP=188;FR=.;FRO=139;FSAF=29;FSAR=20;FSRF=70;FSRR=69;FWDB=-0.0183922;FXX=0.00529073;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.785;QD=7.26758;RBI=0.0303555;REFB=-0.00808765;REVB=0.0241492;RO=139;SAF=29;SAR=20;SRF=70;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110504;STB=0.565858;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=0.0209509;OID=.;OPOS=145103947;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:189:188:139:139:49:49:0.260638:20:29:70:69:20:29:70:69
chr1	145109549	.	G	T	457.99	PASS	AF=0.189931;AO=82;DP=436;FAO=83;FDP=437;FR=.;FRO=354;FSAF=42;FSAR=41;FSRF=174;FSRR=180;FWDB=-0.0162021;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.794;QD=4.19211;RBI=0.0169701;REFB=0.00197456;REVB=0.00504754;RO=351;SAF=42;SAR=40;SRF=173;SRR=178;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0250506;STB=0.51174;STBP=0.806;TYPE=snp;VARB=-0.00867508;OID=.;OPOS=145109549;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:436:437:351:354:82:83:0.189931:40:42:173:178:41:42:174:180
chr1	145109583	.	C	A	1883.78	PASS	AF=0.438445;AO=201;DP=461;FAO=203;FDP=463;FR=.;FRO=260;FSAF=99;FSAR=104;FSRF=123;FSRR=137;FWDB=-0.0199106;FXX=0.00643763;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.2961;QD=16.2746;RBI=0.0634159;REFB=0.00776049;REVB=0.0602092;RO=257;SAF=99;SAR=102;SRF=123;SRR=134;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141289;STB=0.508211;STBP=0.747;TYPE=snp;VARB=-0.0102699;OID=.;OPOS=145109583;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:461:463:257:260:201:203:0.438445:102:99:123:134:104:99:123:137
chr1	145109661	.	G	A	368.46	PASS	AF=0.180157;AO=69;DP=380;FAO=69;FDP=383;FR=.;FRO=314;FSAF=24;FSAR=45;FSRF=142;FSRR=172;FWDB=-0.0207193;FXX=0.0026041;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.649;QD=3.84814;RBI=0.0214472;REFB=-0.00210744;REVB=0.00554029;RO=310;SAF=24;SAR=45;SRF=139;SRR=171;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135517;STB=0.589183;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=0.0114915;OID=.;OPOS=145109661;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:380:383:310:314:69:69:0.180157:45:24:139:171:45:24:142:172
chr1	145112414	.	T	C	179.85	PASS	AF=0.197452;AO=31;DP=157;FAO=31;FDP=157;FR=.;FRO=126;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=53;FSRR=73;FWDB=0.046081;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.821;QD=4.58205;RBI=0.0461953;REFB=-0.010206;REVB=-0.00324814;RO=126;SAF=14;SAR=17;SRF=53;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0402002;STB=0.525203;STBP=0.77;TYPE=snp;VARB=0.0327081;OID=.;OPOS=145112414;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:157:157:126:126:31:31:0.197452:17:14:53:73:17:14:53:73
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chr1	145112428	.	C	T	210.99	PASS	AF=0.219355;AO=34;DP=154;FAO=34;FDP=155;FR=.;FRO=121;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=47;FSRR=74;FWDB=-0.0409903;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.055;QD=5.44478;RBI=0.04105;REFB=-0.000414047;REVB=0.002214;RO=120;SAF=15;SAR=19;SRF=46;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0754016;STB=0.542144;STBP=0.579;TYPE=snp;VARB=0.00123172;OID=.;OPOS=145112428;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:154:155:120:121:34:34:0.219355:19:15:46:74:19:15:47:74
chr1	145112485	.	C	T	117.33	PASS	AF=0.171875;AO=22;DP=128;FAO=22;FDP=128;FR=.;FRO=106;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=45;FSRR=61;FWDB=-0.0219437;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.6873;QD=3.66655;RBI=0.0230812;REFB=0.00138248;REVB=0.00715649;RO=106;SAF=13;SAR=9;SRF=45;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.209414;STB=0.635355;STBP=0.182;TYPE=snp;VARB=-0.0113611;OID=.;OPOS=145112485;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:128:128:106:106:22:22:0.171875:9:13:45:61:9:13:45:61
chr1	145112501	.	C	T	53.93	PASS	AF=0.110169;AO=13;DP=118;FAO=13;FDP=118;FR=.;FRO=105;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=44;FSRR=61;FWDB=-0.0257272;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.424;QD=1.82808;RBI=0.0381966;REFB=0.00162709;REVB=-0.0282328;RO=102;SAF=11;SAR=2;SRF=44;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.492526;STB=0.862483;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=-0.0405831;OID=.;OPOS=145112501;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:118:118:102:105:13:13:0.110169:2:11:44:58:2:11:44:61
chr1	145115810	.	A	G	1503.07	PASS	AF=0.450867;AO=156;DP=346;FAO=156;FDP=346;FR=.;FRO=190;FSAF=87;FSAR=69;FSRF=104;FSRR=86;FWDB=0.00679591;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.71;QD=17.3765;RBI=0.00792949;REFB=-0.00370869;REVB=0.00408564;RO=190;SAF=87;SAR=69;SRF=104;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0103743;STB=0.505737;STBP=0.852;TYPE=snp;VARB=0.00366352;OID=.;OPOS=145115810;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:346:346:190:190:156:156:0.450867:69:87:104:86:69:87:104:86
chr1	145115820	.	T	C	346.01	PASS	AF=0.185294;AO=63;DP=340;FAO=63;FDP=340;FR=.;FRO=277;FSAF=37;FSAR=26;FSRF=152;FSRR=125;FWDB=-0.0128518;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.079;QD=4.07074;RBI=0.0192365;REFB=-7.7753e-05;REVB=0.0143134;RO=277;SAF=37;SAR=26;SRF=152;SRR=125;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.050856;STB=0.532034;STBP=0.595;TYPE=snp;VARB=0.000864195;OID=.;OPOS=145115820;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:340:340:277:277:63:63:0.185294:26:37:152:125:26:37:152:125
chr1	145116147	.	T	TA	159.16	PASS	AF=0.207843;AO=52;DP=258;FAO=53;FDP=255;FR=.;FRO=202;FSAF=35;FSAR=18;FSRF=106;FSRR=96;FWDB=0.0195888;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=22.7367;QD=2.49657;RBI=0.0640777;REFB=0.0141129;REVB=-0.0610101;RO=204;SAF=34;SAR=18;SRF=109;SRR=95;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158726;STB=0.61117;STBP=0.062;TYPE=ins;VARB=-0.0566126;OID=.;OPOS=145116148;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.207843:52:258:53:255:202:35:18:106:96:99:204:34:18:109:95
chr1	145116192	.	TG	T	153.26	PASS	AF=0.217228;AO=57;DP=268;FAO=58;FDP=267;FR=.;FRO=209;FSAF=28;FSAR=30;FSRF=114;FSRR=95;FWDB=-0.0204486;FXX=0.0037312;HRUN=4;LEN=1;MLLD=16.9303;QD=2.296;RBI=0.0486936;REFB=0.025321;REVB=-0.0441919;RO=202;SAF=27;SAR=30;SRF=109;SRR=93;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0840743;STB=0.548952;STBP=0.382;TYPE=del;VARB=-0.0888365;OID=.;OPOS=145116193;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.217228:57:268:58:267:209:28:30:114:95:99:202:27:30:109:93
chr1	145116311	.	G	T	319.62	PASS	AF=0.587302;AO=19;DP=50;FAO=37;FDP=63;FR=.,HEALED;FRO=23;FSAF=33;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=0.0323417;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.78;QD=20.293;RBI=0.0334635;REFB=-0.00961224;REVB=-0.00859203;RO=25;SAF=17;SAR=2;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.404552;STB=0.695171;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.0368796;OID=.;OPOS=145116311;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:63:25:23:19:37:0.587302:2:17:16:9:4:33:14:9
chr1	145116319	.	G	T	200.53	PASS	AF=0.470588;AO=11;DP=48;FAO=24;FDP=51;FR=.;FRO=27;FSAF=18;FSAR=6;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=0.0217585;FXX=0.120669;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.413;QD=15.7274;RBI=0.0260028;REFB=-0.0155999;REVB=0.0142377;RO=35;SAF=8;SAR=3;SRF=24;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.060557;STB=0.578244;STBP=0.35;TYPE=snp;VARB=0.014171;OID=.;OPOS=145116319;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:51:35:27:11:24:0.470588:3:8:24:11:6:18:17:10
chr1	145116326	.	TG	GT,TT	338.55	PASS	AF=0,0.66;AO=2,22;DP=42;FAO=0,33;FDP=50;FR=.;FRO=17;FSAF=0,19;FSAR=0,14;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=-0.038877,0.0169589;FXX=0.0384541;HRUN=7,1;LEN=2,1;MLLD=18.5972,146.04;QD=27.084;RBI=0.0502373,0.0206945;REFB=-0.111272,0.000208159;REVB=0.0318177,0.01186;RO=8;SAF=2,10;SAR=0,12;SRF=6;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.519945,-0.142857;STB=0.5,0.524985;STBP=1,0.652;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0779321,0.017091;OID=.,.;OPOS=145116326,145116327;OREF=TG,G;OALT=GT,T;OMAPALT=GT,TT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:42:50:8:17:2,22:0,33:0,0.66:0,12:2,10:6:2:0,14:0,19:11:6
chr1	145273302	.	A	G	320.51	PASS	AF=0.3;AO=42;DP=140;FAO=42;FDP=140;FR=.;FRO=98;FSAF=7;FSAR=35;FSRF=9;FSRR=89;FWDB=0.00277544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.958;QD=9.15737;RBI=0.0128093;REFB=-0.00879614;REVB=-0.012505;RO=96;SAF=7;SAR=35;SRF=9;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.182096;STB=0.6078;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=0.0143553;OID=.;OPOS=145273302;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:140:140:96:98:42:42:0.3:35:7:9:87:35:7:9:89
chr1	145273345	.	T	C	523.07	PASS	AF=0.32381;AO=68;DP=210;FAO=68;FDP=210;FR=.;FRO=142;FSAF=17;FSAR=51;FSRF=9;FSRR=133;FWDB=-0.00149156;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.857;QD=9.96332;RBI=0.0159307;REFB=0.00155092;REVB=0.0158607;RO=142;SAF=17;SAR=51;SRF=9;SRR=133;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.365796;STB=0.702249;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=-0.00199161;OID=.;OPOS=145273345;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:210:210:142:142:68:68:0.32381:51:17:9:133:51:17:9:133
chr1	145273431	.	A	G	324.4	PASS	AF=0.235023;AO=51;DP=217;FAO=51;FDP=217;FR=.;FRO=166;FSAF=9;FSAR=42;FSRF=52;FSRR=114;FWDB=-0.0422669;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.0036;QD=5.97975;RBI=0.0569548;REFB=0.00359892;REVB=-0.0381754;RO=165;SAF=9;SAR=42;SRF=52;SRR=113;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.238734;STB=0.645926;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=-0.0143409;OID=.;OPOS=145273431;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:217:217:165:166:51:51:0.235023:42:9:52:113:42:9:52:114
chr1	145277376	.	A	G	64.96	PASS	AF=0.111888;AO=16;DP=141;FAO=16;FDP=143;FR=.;FRO=127;FSAF=14;FSAR=2;FSRF=71;FSRR=56;FWDB=-0.0126581;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.918;QD=1.81699;RBI=0.0138344;REFB=0.000373984;REVB=-0.00558241;RO=125;SAF=14;SAR=2;SRF=71;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.425851;STB=0.826425;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=-0.00355161;OID=.;OPOS=145277376;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:141:143:125:127:16:16:0.111888:2:14:71:54:2:14:71:56
chr1	145277384	.	T	C	78.23	PASS	AF=0.122449;AO=17;DP=146;FAO=18;FDP=147;FR=.;FRO=129;FSAF=15;FSAR=3;FSRF=74;FSRR=55;FWDB=-0.0145175;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.322;QD=2.1286;RBI=0.0153941;REFB=0.000230155;REVB=-0.00512049;RO=129;SAF=15;SAR=2;SRF=74;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.436518;STB=0.764844;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=-0.00519609;OID=.;OPOS=145277384;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:146:147:129:129:17:18:0.122449:2:15:74:55:3:15:74:55
chr1	145277398	.	A	G	82.42	PASS	AF=0.134328;AO=18;DP=134;FAO=18;FDP=134;FR=.;FRO=116;FSAF=16;FSAR=2;FSRF=62;FSRR=54;FWDB=-0.00497107;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.99;QD=2.46024;RBI=0.00534833;REFB=-0.00257146;REVB=-0.00197307;RO=116;SAF=16;SAR=2;SRF=62;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.492594;STB=0.851276;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.00964261;OID=.;OPOS=145277398;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:82:134:134:116:116:18:18:0.134328:2:16:62:54:2:16:62:54
chr1	145277402	.	A	G	105.64	PASS	AF=0.154412;AO=21;DP=131;FAO=21;FDP=136;FR=.;FRO=115;FSAF=19;FSAR=2;FSRF=61;FSRR=54;FWDB=-0.0244618;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.205;QD=3.10715;RBI=0.0276703;REFB=-0.0113587;REVB=-0.0129332;RO=110;SAF=19;SAR=2;SRF=56;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.554582;STB=0.868884;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.037949;OID=.;OPOS=145277402;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:131:136:110:115:21:21:0.154412:2:19:56:54:2:19:61:54
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chr1	145281543	.	C	T	289.9	PASS	AF=0.259036;AO=43;DP=166;FAO=43;FDP=166;FR=.;FRO=123;FSAF=13;FSAR=30;FSRF=72;FSRR=51;FWDB=-0.0163171;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.211;QD=6.98561;RBI=0.0282597;REFB=-0.00473472;REVB=-0.023073;RO=123;SAF=13;SAR=30;SRF=72;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.348405;STB=0.707648;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.020504;OID=.;OPOS=145281543;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:166:166:123:123:43:43:0.259036:30:13:72:51:30:13:72:51
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chr1	145281633	.	C	A	181.46	PASS	AF=0.243478;AO=28;DP=115;FAO=28;FDP=115;FR=.;FRO=87;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=58;FSRR=29;FWDB=-0.0169109;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=169.665;QD=6.31155;RBI=0.0178519;REFB=-0.0124588;REVB=-0.00571927;RO=87;SAF=12;SAR=16;SRF=58;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.29132;STB=0.674583;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=0.0311349;OID=.;OPOS=145281633;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:115:87:87:28:28:0.243478:16:12:58:29:16:12:58:29
chr1	145281656	.	A	T	126.5	PASS	AF=0.19469;AO=22;DP=113;FAO=22;FDP=113;FR=.;FRO=91;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=57;FSRR=34;FWDB=-0.0207466;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.7455;QD=4.47784;RBI=0.0604172;REFB=-0.0055943;REVB=-0.0567434;RO=90;SAF=12;SAR=10;SRF=56;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0997734;STB=0.566444;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.0212075;OID=.;OPOS=145281656;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:113:90:91:22:22:0.19469:10:12:56:34:10:12:57:34
chr1	145290409	.	G	A	88.26	PASS	AF=0.122222;AO=21;DP=179;FAO=22;FDP=180;FR=.;FRO=158;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=74;FSRR=84;FWDB=-0.0327524;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.235;QD=1.96123;RBI=0.0334459;REFB=-0.00104313;REVB=0.0067756;RO=155;SAF=14;SAR=7;SRF=72;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.249471;STB=0.646454;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.0145117;OID=.;OPOS=145290409;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:179:180:155:158:21:22:0.122222:7:14:72:83:8:14:74:84
chr1	145290498	.	T	G	32.94	PASS	AF=0.08;AO=10;DP=127;FAO=10;FDP=125;FR=.;FRO=115;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=46;FSRR=69;FWDB=0.0435545;FXX=0.0157468;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.421;QD=1.05398;RBI=0.0436237;REFB=-0.00198928;REVB=-0.00245497;RO=115;SAF=5;SAR=5;SRF=46;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113047;STB=0.591822;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=0.022161;OID=.;OPOS=145290498;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:32:127:125:115:115:10:10:0.08:5:5:46:69:5:5:46:69
chr1	145293425	.	C	A	87.53	PASS	AF=0.109005;AO=23;DP=212;FAO=23;FDP=211;FR=.;FRO=188;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=100;FSRR=88;FWDB=0.00547849;FXX=0.00471676;HRUN=3;LEN=1;MLLD=151.848;QD=1.65934;RBI=0.0116234;REFB=-0.00111314;REVB=-0.0102513;RO=187;SAF=15;SAR=8;SRF=100;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147513;STB=0.610072;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=0.0124406;OID=.;OPOS=145293425;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:212:211:187:188:23:23:0.109005:8:15:100:87:8:15:100:88
chr1	145293490	.	G	C	243.27	PASS	AF=0.121442;AO=64;DP=527;FAO=64;FDP=527;FR=.;FRO=463;FSAF=38;FSAR=26;FSRF=238;FSRR=225;FWDB=-0.03159;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.8785;QD=1.84645;RBI=0.0419296;REFB=-0.00333912;REVB=-0.0275711;RO=458;SAF=38;SAR=26;SRF=235;SRR=223;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102988;STB=0.570637;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=0.0247099;OID=.;OPOS=145293490;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:527:527:458:463:64:64:0.121442:26:38:235:223:26:38:238:225
chr1	145293498	.	G	C	235.68	PASS	AF=0.120155;AO=62;DP=519;FAO=62;FDP=516;FR=.;FRO=454;FSAF=35;FSAR=27;FSRF=238;FSRR=216;FWDB=-0.00515396;FXX=0.00959674;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.006;QD=1.82695;RBI=0.00532375;REFB=-0.00451227;REVB=-0.00133381;RO=444;SAF=35;SAR=27;SRF=231;SRR=213;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.056406;STB=0.535703;STBP=0.566;TYPE=snp;VARB=0.0295914;OID=.;OPOS=145293498;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:519:516:444:454:62:62:0.120155:27:35:231:213:27:35:238:216
chr1	145293510	.	C	G	266.97	PASS	AF=0.129412;AO=65;DP=509;FAO=66;FDP=510;FR=.;FRO=444;FSAF=39;FSAR=27;FSRF=234;FSRR=210;FWDB=-0.0145485;FXX=0.00195691;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.674;QD=2.09391;RBI=0.0145796;REFB=-0.00518899;REVB=0.000950989;RO=440;SAF=38;SAR=27;SRF=232;SRR=208;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0738901;STB=0.556321;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.0393946;OID=.;OPOS=145293510;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:509:510:440:444:65:66:0.129412:27:38:232:208:27:39:234:210
chr1	145293515	.	A	G	285.51	PASS	AF=0.135354;AO=67;DP=497;FAO=67;FDP=495;FR=.;FRO=428;FSAF=31;FSAR=36;FSRF=233;FSRR=195;FWDB=-0.00888958;FXX=0.00402406;HRUN=3;LEN=1;MLLD=230.157;QD=2.30713;RBI=0.0136016;REFB=-0.00466845;REVB=-0.0102947;RO=426;SAF=31;SAR=36;SRF=233;SRR=193;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107843;STB=0.570276;STBP=0.243;TYPE=snp;VARB=0.0301236;OID=.;OPOS=145293515;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:497:495:426:428:67:67:0.135354:36:31:233:193:36:31:233:195
chr1	145293566	.	G	A	189.33	PASS	AF=0.128134;AO=46;DP=359;FAO=46;FDP=359;FR=.;FRO=313;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=180;FSRR=133;FWDB=-0.0109564;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.343;QD=2.1095;RBI=0.0269095;REFB=-0.00176722;REVB=0.024578;RO=313;SAF=26;SAR=20;SRF=180;SRR=133;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0127839;STB=0.508764;STBP=0.906;TYPE=snp;VARB=0.0130261;OID=.;OPOS=145293566;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:359:359:313:313:46:46:0.128134:20:26:180:133:20:26:180:133
chr1	145296372	.	A	G	82.22	PASS	AF=0.130435;AO=18;DP=139;FAO=18;FDP=138;FR=.;FRO=120;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=52;FSRR=68;FWDB=0.0394297;FXX=0.0142847;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.92;QD=2.38328;RBI=0.0399946;REFB=0.00102525;REVB=-0.00669826;RO=120;SAF=11;SAR=7;SRF=52;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.219253;STB=0.651495;STBP=0.194;TYPE=snp;VARB=-0.0067988;OID=.;OPOS=145296372;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:82:139:138:120:120:18:18:0.130435:7:11:52:68:7:11:52:68
chr1	145311083	.	A	C	1953.73	PASS	AF=0.615658;AO=157;DP=266;FAO=173;FDP=281;FR=.;FRO=108;FSAF=106;FSAR=67;FSRF=74;FSRR=34;FWDB=0.00833151;FXX=0.00354597;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.268;QD=27.8112;RBI=0.0366872;REFB=-0.0173991;REVB=0.0357287;RO=108;SAF=106;SAR=51;SRF=74;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00864006;STB=0.529734;STBP=0.217;TYPE=snp;VARB=0.0106196;OID=.;OPOS=145311083;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:266:281:108:108:157:173:0.615658:51:106:74:34:67:106:74:34
chr1	145311110	.	G	C	500.91	PASS	AF=0.260714;AO=73;DP=280;FAO=73;FDP=280;FR=.;FRO=207;FSAF=41;FSAR=32;FSRF=138;FSRR=69;FWDB=0.00092162;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.392;QD=7.15583;RBI=0.02104;REFB=-0.00731488;REVB=0.0210198;RO=206;SAF=41;SAR=32;SRF=137;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134316;STB=0.580382;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=0.0201081;OID=.;OPOS=145311110;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:280:280:206:207:73:73:0.260714:32:41:137:69:32:41:138:69
chr1	145311169	.	T	C	225.39	PASS	AF=0.164835;AO=45;DP=272;FAO=45;FDP=273;FR=.;FRO=228;FSAF=31;FSAR=14;FSRF=143;FSRR=85;FWDB=0.0321121;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.437;QD=3.3024;RBI=0.0363261;REFB=-0.00454188;REVB=-0.0169822;RO=227;SAF=31;SAR=14;SRF=142;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.090472;STB=0.557467;STBP=0.425;TYPE=snp;VARB=0.0297048;OID=.;OPOS=145311169;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:272:273:227:228:45:45:0.164835:14:31:142:85:14:31:143:85
chr1	145311828	.	C	G	167.85	PASS	AF=0.9375;AO=15;DP=16;FAO=15;FDP=16;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00736162;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.779;QD=41.9628;RBI=0.018677;REFB=-0.145069;REVB=-0.0171649;RO=0;SAF=8;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.533289;STBP=0.559;TYPE=snp;VARB=0.00292797;OID=.;OPOS=145311828;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:16:16:0:1:15:15:0.9375:7:8:0:0:7:8:0:1
chr1	145365316	.	G	A	39.05	PASS	AF=0.461538;AO=6;DP=13;FAO=6;FDP=13;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.00520972;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=253.804;QD=12.0157;RBI=0.0248911;REFB=0.000972897;REVB=0.0243398;RO=7;SAF=2;SAR=4;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.215036;STB=0.631131;STBP=0.474;TYPE=snp;VARB=-0.000995394;OID=.;OPOS=145365316;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:13:13:7:7:6:6:0.461538:4:2:4:3:4:2:4:3
chr1	145365372	.	C	G	38.57	PASS	AF=0.428571;AO=6;DP=14;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.019517;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.81;QD=11.0198;RBI=0.0207616;REFB=0.0259231;REVB=0.00708046;RO=8;SAF=2;SAR=4;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162008;STB=0.599657;STBP=0.548;TYPE=snp;VARB=-0.057071;OID=.;OPOS=145365372;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:14:14:8:8:6:6:0.428571:4:2:4:4:4:2:4:4
chr1	145368461	.	A	C	217.79	PASS	AF=0.234043;AO=33;DP=141;FAO=33;FDP=141;FR=.;FRO=108;FSAF=10;FSAR=23;FSRF=47;FSRR=61;FWDB=-0.00368842;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=238.487;QD=6.17831;RBI=0.0037979;REFB=-0.000756166;REVB=-0.000905325;RO=108;SAF=10;SAR=23;SRF=47;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.178295;STB=0.609415;STBP=0.165;TYPE=snp;VARB=0.0018121;OID=.;OPOS=145368461;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:141:141:108:108:33:33:0.234043:23:10:47:61:23:10:47:61
chr1	145368467	.	A	T	232.8	PASS	AF=0.233766;AO=36;DP=153;FAO=36;FDP=154;FR=.;FRO=118;FSAF=10;FSAR=26;FSRF=53;FSRR=65;FWDB=-0.0153607;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.794;QD=6.04667;RBI=0.0155136;REFB=-0.0062945;REVB=-0.00217316;RO=117;SAF=10;SAR=26;SRF=53;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.236995;STB=0.642774;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.0235163;OID=.;OPOS=145368467;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:153:154:117:118:36:36:0.233766:26:10:53:64:26:10:53:65
chr1	145379371	.	TCACCATTA	T	50.0	PASS	AO=52;DP=274;LEN=8;RO=222;SAF=25;SAR=40;SRF=97;SRR=112;TYPE=del;FR=.;OID=.;OPOS=145379372;OREF=CACCATTA;OALT=-;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:RO:AO:SAR:SAF:SRF:SRR	0/1:99:274:222:52:40:25:97:112
chr1	145397942	.	A	T	57.32	PASS	AF=0.444444;AO=8;DP=18;FAO=8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.000452813;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=258.751;QD=12.7389;RBI=0.00675417;REFB=-0.0154175;REVB=-0.00673897;RO=10;SAF=1;SAR=7;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.270467;STB=0.666171;STBP=0.371;TYPE=snp;VARB=0.0200432;OID=.;OPOS=145397942;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:18:18:10:10:8:8:0.444444:7:1:3:7:7:1:3:7
chr1	145397947	.	A	G	38.5	PASS	AF=0.428571;AO=6;DP=14;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.0330943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.0591;QD=11.0012;RBI=0.0720447;REFB=-0.0088268;REVB=-0.0639938;RO=8;SAF=1;SAR=5;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.264432;STB=0.66603;STBP=0.378;TYPE=snp;VARB=0.0305693;OID=.;OPOS=145397947;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:14:14:8:8:6:6:0.428571:5:1:3:5:5:1:3:5
chr1	145399229	.	C	T	172.12	PASS	AF=0.473684;AO=18;DP=38;FAO=18;FDP=38;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.000585123;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.28;QD=18.1178;RBI=0.0324141;REFB=-0.0217308;REVB=-0.0324088;RO=20;SAF=10;SAR=8;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0974848;STB=0.555494;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=0.0252328;OID=.;OPOS=145399229;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:20:20:18:18:0.473684:8:10:9:11:8:10:9:11
chr1	145442254	.	G	C	676.29	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0489759;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.3794;QD=61.481;RBI=0.0533265;REFB=0;REVB=0.0210967;RO=0;SAF=15;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000488963;OID=.;OPOS=145442254;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:44:0:0:40:44:1:25:15:0:0:26:18:0:0
chr1	145474219	.	C	T	169.19	PASS	AF=0.384615;AO=20;DP=52;FAO=20;FDP=52;FR=.;FRO=32;FSAF=18;FSAR=2;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=0.00734121;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=97.5848;QD=13.0148;RBI=0.0140562;REFB=-0.016457;REVB=0.0119868;RO=32;SAF=18;SAR=2;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.526356;STB=0.813448;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0151472;OID=.;OPOS=145474219;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:32:32:20:20:0.384615:2:18:17:15:2:18:17:15
chr1	145532549	.	T	C	927.65	PASS	AF=0.942857;AO=66;DP=70;FAO=66;FDP=70;FR=.;FRO=4;FSAF=32;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.0121584;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=221.452;QD=53.0086;RBI=0.0127862;REFB=-0.0904163;REVB=-0.00395723;RO=3;SAF=32;SAR=34;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0124495;STB=0.513439;STBP=0.402;TYPE=snp;VARB=0.000581467;OID=.;OPOS=145532549;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:70:70:3:4:66:66:0.942857:34:32:1:2:34:32:1:3
chr1	145536082	.	G	A	429.34	PASS	AF=0.494253;AO=43;DP=87;FAO=43;FDP=87;FR=.;FRO=44;FSAF=30;FSAR=13;FSRF=31;FSRR=13;FWDB=0.0119888;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.247;QD=19.7397;RBI=0.0222733;REFB=-0.0212879;REVB=0.0187714;RO=44;SAF=30;SAR=13;SRF=31;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00744263;STB=0.50413;STBP=0.946;TYPE=snp;VARB=0.0237549;OID=.;OPOS=145536082;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:44:44:43:43:0.494253:13:30:31:13:13:30:31:13
chr1	145542281	.	G	A	140.93	PASS	AF=0.535714;AO=15;DP=29;FAO=15;FDP=28;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.0300818;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.681;QD=20.1324;RBI=0.0349639;REFB=-0.050903;REVB=0.0178202;RO=13;SAF=8;SAR=7;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.058655;STB=0.533289;STBP=0.746;TYPE=snp;VARB=0.0401634;OID=.;OPOS=145542281;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:28:13:13:15:15:0.535714:7:8:6:7:7:8:6:7
chr1	145561594	.	C	T	505.84	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0203252;FXX=0.0285633;HRUN=4;LEN=1;MLLD=183.803;QD=59.5111;RBI=0.0253224;REFB=0;REVB=0.0151034;RO=0;SAF=25;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00013325;OID=.;OPOS=145561594;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:9:25:0:0:9:25:0:0
chr1	145562881	.	T	C	1381.45	PASS	AF=0.988889;AO=89;DP=90;FAO=89;FDP=90;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0168472;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.2351;QD=61.3979;RBI=0.0263434;REFB=0.0125152;REVB=0.020252;RO=1;SAF=40;SAR=49;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00957431;STB=0.505049;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=-0.00010798;OID=.;OPOS=145562881;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:90:90:1:1:89:89:0.988889:49:40:0:1:49:40:0:1
chr1	145586309	.	C	T	1472.52	PASS	AF=1;AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00350795;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.685;QD=63.3343;RBI=0.0251736;REFB=0;REVB=0.024928;RO=0;SAF=53;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.92821e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.83457e-05;OID=.;OPOS=145586309;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:93:93:0:0:93:93:1:40:53:0:0:40:53:0:0
chr1	145586403	.	G	T	1586.42	PASS	AF=1;AO=98;DP=98;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000728926;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=323.218;QD=64.0979;RBI=0.0171896;REFB=0;REVB=0.0171742;RO=0;SAF=40;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.05112e-05;OID=.;OPOS=145586403;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:99:0:0:98:99:1:58:40:0:0:58:41:0:0
chr1	146057292	.	T	C	182.34	PASS	AF=0.452381;AO=19;DP=42;FAO=19;FDP=42;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=-0.00513168;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.13;QD=17.3658;RBI=0.00941776;REFB=-0.00372689;REVB=0.00789683;RO=23;SAF=10;SAR=9;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129043;STB=0.57349;STBP=0.403;TYPE=snp;VARB=0.00387898;OID=.;OPOS=146057292;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:23:23:19:19:0.452381:9:10:9:14:9:10:9:14
chr1	146395447	.	A	G	305.11	PASS	AF=0.419753;AO=34;DP=81;FAO=34;FDP=81;FR=.;FRO=47;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=29;FSRR=18;FWDB=0.0073679;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.72;QD=15.0673;RBI=0.0140382;REFB=-0.0210786;REVB=-0.0119492;RO=47;SAF=20;SAR=14;SRF=29;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0306699;STB=0.517335;STBP=0.808;TYPE=snp;VARB=0.0237437;OID=.;OPOS=146395447;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:47:47:34:34:0.419753:14:20:29:18:14:20:29:18
chr1	146495752	.	C	T	35.21	PASS	AF=0.222222;AO=6;DP=27;FAO=6;FDP=27;FR=.;FRO=21;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.00793612;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.266;QD=5.21597;RBI=0.00830364;REFB=-0.00718594;REVB=0.00244303;RO=20;SAF=2;SAR=4;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.251436;STB=0.649495;STBP=0.446;TYPE=snp;VARB=0.0256978;OID=.;OPOS=146495752;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:27:27:20:21:6:6:0.222222:4:2:11:9:4:2:11:10
chr1	146496389	.	C	T	295.43	PASS	AF=0.428571;AO=32;DP=77;FAO=33;FDP=77;FR=.;FRO=44;FSAF=25;FSAR=8;FSRF=26;FSRR=18;FWDB=-0.0220261;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.796;QD=15.3472;RBI=0.03243;REFB=0.00124526;REVB=-0.0238024;RO=43;SAF=24;SAR=8;SRF=25;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.200133;STB=0.614292;STBP=0.114;TYPE=snp;VARB=-0.00211706;OID=.;OPOS=146496389;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:43:44:32:33:0.428571:8:24:25:18:8:25:26:18
chr1	146626922	.	T	C	205.08	PASS	AF=0.42;AO=21;DP=50;FAO=21;FDP=50;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=-0.0135561;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.0862;QD=16.4063;RBI=0.0387732;REFB=0.0043257;REVB=0.0363262;RO=29;SAF=12;SAR=9;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0153116;STB=0.508764;STBP=0.92;TYPE=snp;VARB=-0.00214347;OID=.;OPOS=146626922;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:29:29:21:21:0.42:9:12:17:12:9:12:17:12
chr1	146650058	.	T	C	284.65	PASS	AF=0.484375;AO=31;DP=64;FAO=31;FDP=64;FR=.;FRO=33;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=0.00441464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.9972;QD=17.7905;RBI=0.00603687;REFB=-0.00861331;REVB=-0.00411763;RO=33;SAF=15;SAR=16;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0288079;STB=0.516119;STBP=0.837;TYPE=snp;VARB=0.0117024;OID=.;OPOS=146650058;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:33:33:31:31:0.484375:16:15:17:16:16:15:17:16
chr1	146672906	.	C	T	1498.75	PASS	AF=1;AO=100;DP=101;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000934479;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.147;QD=59.9499;RBI=0.0297091;REFB=0;REVB=-0.0296944;RO=0;SAF=48;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.19274e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.73943e-05;OID=.;OPOS=146672906;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:101:100:0:0:100:100:1:52:48:0:0:52:48:0:0
chr1	146714392	.	G	C	212.4	PASS	AF=0.423729;AO=25;DP=59;FAO=25;FDP=59;FR=.;FRO=34;FSAF=18;FSAR=7;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=0.00215738;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.212;QD=14.3999;RBI=0.014639;REFB=-0.00750643;REVB=0.0144792;RO=34;SAF=18;SAR=7;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.212104;STB=0.621519;STBP=0.127;TYPE=snp;VARB=0.0125069;OID=.;OPOS=146714392;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:34:34:25:25:0.423729:7:18:18:16:7:18:18:16
chr1	146728162	.	T	TA	774.21	PASS	AF=1;AO=65;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0105683;FXX=0.043472;HRUN=1;LEN=1;MLLD=26.5526;QD=46.9218;RBI=0.106368;REFB=0;REVB=-0.105842;RO=1;SAF=35;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133067;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00214345;OID=.;OPOS=146728163;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:65:66:66:66:0:36:30:0:0:14:1:35:30:1:0
chr1	146751782	.	A	C	1153.61	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0113412;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.893;QD=60.7161;RBI=0.0229154;REFB=0;REVB=0.0199122;RO=0;SAF=40;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60877e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.64634e-05;OID=.;OPOS=146751782;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:36:40:0:0:36:40:0:0
chr1	146767149	.	G	T	1587.69	PASS	AF=1;AO=99;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0157027;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.121;QD=64.149;RBI=0.0174112;REFB=0;REVB=0.00752169;RO=0;SAF=47;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.28099e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.44296e-05;OID=.;OPOS=146767149;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:99:99:0:0:99:99:1:52:47:0:0:52:47:0:0
chr1	147119273	.	G	A	141.32	PASS	AF=0.380952;AO=16;DP=42;FAO=16;FDP=42;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=18;FWDB=-0.0253594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.364;QD=13.4591;RBI=0.0264693;REFB=-0.0153194;REVB=-0.00758475;RO=26;SAF=10;SAR=6;SRF=8;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.327081;STB=0.689431;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=0.0282944;OID=.;OPOS=147119273;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:26:26:16:16:0.380952:6:10:8:18:6:10:8:18
chr1	147121977	.	C	T	1415.48	PASS	AF=1;AO=89;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00433972;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.7622;QD=62.9102;RBI=0.0238186;REFB=0;REVB=0.0234199;RO=0;SAF=47;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.28712e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000126975;OID=.;OPOS=147121977;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:90:90:0:0:89:90:1:42:47:0:0:42:48:0:0
chr1	147124310	.	T	G	320.55	PASS	AF=0.443038;AO=35;DP=79;FAO=35;FDP=79;FR=.;FRO=44;FSAF=12;FSAR=23;FSRF=25;FSRR=19;FWDB=-0.0566554;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.6162;QD=16.2304;RBI=0.0587766;REFB=-0.0130715;REVB=0.0156478;RO=44;SAF=12;SAR=23;SRF=25;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.227086;STB=0.62797;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.0164322;OID=.;OPOS=147124310;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:44:44:35:35:0.443038:23:12:25:19:23:12:25:19
chr1	147735828	.	C	T	575.78	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0986187;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.8431;QD=60.6081;RBI=0.0988561;REFB=0;REVB=-0.00684707;RO=0;SAF=15;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00176121;OID=.;OPOS=147735828;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:23:15:0:0:23:15:0:0
chr1	147781062	.	A	G	566.27	PASS	AF=0.614458;AO=51;DP=83;FAO=51;FDP=83;FR=.;FRO=32;FSAF=17;FSAR=34;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=-0.0125819;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.422;QD=27.2899;RBI=0.012586;REFB=-0.00373165;REVB=0.000321835;RO=32;SAF=17;SAR=34;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170662;STB=0.593183;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.00210325;OID=.;OPOS=147781062;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:32:32:51:51:0.614458:34:17:18:14:34:17:18:14
chr1	147806880	.	T	C	955.19	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00935203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.2089;QD=58.7808;RBI=0.0145662;REFB=0;REVB=0.0111676;RO=0;SAF=34;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.90682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.71265e-05;OID=.;OPOS=147806880;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:31:34:0:0:31:34:0:0
chr1	147825732	.	C	G	564.91	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0065767;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.999;QD=59.4639;RBI=0.0353334;REFB=0;REVB=0.0347159;RO=0;SAF=18;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.68991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00152027;OID=.;OPOS=147825732;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:38:0:0:37:38:1:19:18:0:0:20:18:0:0
chr1	147825763	.	G	A	447.02	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0213008;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=235.603;QD=57.6805;RBI=0.027373;REFB=0;REVB=0.0171917;RO=0;SAF=15;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.43159e-05;OID=.;OPOS=147825763;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:16:15:0:0:16:15:0:0
chr1	147825765	.	G	A	446.91	PASS	AF=1;AO=30;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0329907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.0766;QD=57.6662;RBI=0.0442923;REFB=0;REVB=0.0295538;RO=0;SAF=15;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.08752e-05;OID=.;OPOS=147825765;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:30:31:1:15:15:0:0:16:15:0:0
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chr1	148000850	.	A	G	161.96	PASS	AF=0.5;AO=17;DP=34;FAO=17;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=16;FSAR=1;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=-0.0698385;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=45.1549;QD=19.0538;RBI=0.111345;REFB=-0.00191544;REVB=0.0867191;RO=17;SAF=16;SAR=1;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.462502;STB=0.773755;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.00242825;OID=.;OPOS=148000850;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:17:17:17:17:0.5:1:16:12:5:1:16:12:5
chr1	148009507	.	C	T	67.17	PASS	AF=0.196078;AO=10;DP=51;FAO=10;FDP=51;FR=.;FRO=41;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=23;FSRR=18;FWDB=0.00753912;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=247.179;QD=5.26796;RBI=0.0150849;REFB=-0.0079295;REVB=-0.0130658;RO=41;SAF=2;SAR=8;SRF=23;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.446546;STB=0.793057;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=0.025974;OID=.;OPOS=148009507;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:51:51:41:41:10:10:0.196078:8:2:23:18:8:2:23:18
chr1	148009510	.	G	A	101.16	PASS	AF=0.270833;AO=13;DP=48;FAO=13;FDP=48;FR=.;FRO=35;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=-0.0510731;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.1;QD=8.42994;RBI=0.052257;REFB=-0.00868031;REVB=-0.0110604;RO=35;SAF=4;SAR=9;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.282806;STB=0.673995;STBP=0.165;TYPE=snp;VARB=0.026568;OID=.;OPOS=148009510;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:35:35:13:13:0.270833:9:4:19:16:9:4:19:16
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chr1	148341920	.	C	A	108.61	PASS	AF=0.40625;AO=13;DP=32;FAO=13;FDP=32;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.00417494;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=321.396;QD=13.5766;RBI=0.0041763;REFB=-0.00128169;REVB=0.00010633;RO=19;SAF=7;SAR=6;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0414547;STB=0.524235;STBP=0.834;TYPE=snp;VARB=0.00200656;OID=.;OPOS=148341920;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:19:19:13:13:0.40625:6:7:11:8:6:7:11:8
chr1	148342488	.	T	C	285.92	PASS	AF=0.251462;AO=43;DP=171;FAO=43;FDP=171;FR=.;FRO=128;FSAF=27;FSAR=16;FSRF=76;FSRR=52;FWDB=0.00540866;FXX=0.00581362;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.479;QD=6.68816;RBI=0.0280869;REFB=-0.00327884;REVB=0.0275612;RO=128;SAF=27;SAR=16;SRF=77;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0347463;STB=0.526968;STBP=0.685;TYPE=snp;VARB=0.0068212;OID=.;OPOS=148342488;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:171:171:128:128:43:43:0.251462:16:27:77:51:16:27:76:52
chr1	149211967	.	G	A	186.22	PASS	AF=0.235772;AO=29;DP=123;FAO=29;FDP=123;FR=.;FRO=94;FSAF=3;FSAR=26;FSRF=52;FSRR=42;FWDB=-0.0338768;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.488;QD=6.05602;RBI=0.0350195;REFB=-0.00314952;REVB=-0.0088728;RO=94;SAF=3;SAR=26;SRF=52;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.605873;STB=0.874874;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00923617;OID=.;OPOS=149211967;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:123:123:94:94:29:29:0.235772:26:3:52:42:26:3:52:42
chr1	149211975	.	C	A	253.14	PASS	AF=0.264706;AO=36;DP=136;FAO=36;FDP=136;FR=.;FRO=100;FSAF=6;FSAR=30;FSRF=54;FSRR=46;FWDB=0.00755797;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.613;QD=7.44529;RBI=0.01474;REFB=0.00718091;REVB=-0.0126549;RO=100;SAF=6;SAR=30;SRF=54;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.493168;STB=0.797695;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=-0.0232241;OID=.;OPOS=149211975;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:136:136:100:100:36:36:0.264706:30:6:54:46:30:6:54:46
chr1	149211992	.	G	A	372.44	PASS	AF=0.293103;AO=50;DP=173;FAO=51;FDP=174;FR=.;FRO=123;FSAF=13;FSAR=38;FSRF=64;FSRR=59;FWDB=-0.0266313;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.772;QD=8.56186;RBI=0.0352959;REFB=0.000855546;REVB=-0.0231641;RO=119;SAF=13;SAR=37;SRF=63;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.338762;STB=0.698748;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=-0.0026614;OID=.;OPOS=149211992;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:173:174:119:123:50:51:0.293103:37:13:63:56:38:13:64:59
chr1	149211998	.	T	G	448.65	PASS	AF=0.313514;AO=58;DP=185;FAO=58;FDP=185;FR=.;FRO=127;FSAF=19;FSAR=39;FSRF=65;FSRR=62;FWDB=-0.00978899;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.169;QD=9.70043;RBI=0.0143181;REFB=-0.00737776;REVB=-0.0104491;RO=126;SAF=19;SAR=39;SRF=64;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.219936;STB=0.63056;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.0152086;OID=.;OPOS=149211998;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:185:185:126:127:58:58:0.313514:39:19:64:62:39:19:65:62
chr1	149224185	.	C	A	695.51	PASS	AF=0.366412;AO=47;DP=138;FAO=48;FDP=131;FR=.,HEALED;FRO=53;FSAF=30;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=38;FWDB=-0.00807386;FXX=0.050721;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.425;QD=21.2368;RBI=0.00810928;REFB=0.00319644;REVB=0.000757046;RO=48;SAF=29;SAR=18;SRF=12;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.325591;STB=0.674629;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=-0.0258495;OID=.;OPOS=149224185;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:138:131:48:53:47:48:0.366412:18:29:12:36:18:30:15:38
chr1	149286406	.	T	C	69.07	PASS	AF=0.116883;AO=16;DP=148;FAO=18;FDP=154;FR=.;FRO=136;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=48;FSRR=88;FWDB=-0.0652988;FXX=0.0064512;HRUN=2;LEN=1;MLLD=40.1791;QD=1.79411;RBI=0.0680092;REFB=-0.0139604;REVB=-0.0190085;RO=132;SAF=9;SAR=7;SRF=44;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.278276;STB=0.629736;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=0.0957574;OID=.;OPOS=149286406;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:69:148:154:132:136:16:18:0.116883:7:9:44:88:9:9:48:88
chr1	149286469	.	C	G	145.56	PASS	AF=0.444444;AO=16;DP=36;FAO=16;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=0.00150208;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=289.248;QD=16.1731;RBI=0.00151425;REFB=-0.00152499;REVB=0.000191613;RO=20;SAF=3;SAR=13;SRF=6;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156038;STB=0.590785;STBP=0.441;TYPE=snp;VARB=0.00158211;OID=.;OPOS=149286469;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:20:20:16:16:0.444444:13:3:6:14:13:3:6:14
chr1	149287392	.	T	G	732.54	PASS	AF=0.489796;AO=72;DP=147;FAO=72;FDP=147;FR=.;FRO=75;FSAF=30;FSAR=42;FSRF=42;FSRR=33;FWDB=-0.0168382;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.641;QD=19.9331;RBI=0.0176799;REFB=-0.00718712;REVB=0.0053902;RO=75;SAF=30;SAR=42;SRF=42;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132878;STB=0.573358;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=0.010515;OID=.;OPOS=149287392;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:147:147:75:75:72:72:0.489796:42:30:42:33:42:30:42:33
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chr1	149298554	.	C	A	154.8	PASS	AF=0.551724;AO=17;DP=30;FAO=16;FDP=29;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.0283722;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=45.5097;QD=21.3511;RBI=0.0311279;REFB=-0.0480649;REVB=-0.0128048;RO=13;SAF=6;SAR=11;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0886073;STB=0.540489;STBP=0.676;TYPE=snp;VARB=0.0415063;OID=.;OPOS=149298554;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:29:13:13:17:16:0.551724:11:6:6:7:10:6:6:7
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chr1	149298603	.	G	A	141.8	PASS	AF=0.339623;AO=18;DP=54;FAO=18;FDP=53;FR=.;FRO=35;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=25;FWDB=0.0281764;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.679;QD=10.7016;RBI=0.028249;REFB=-0.00340388;REVB=0.00202457;RO=35;SAF=9;SAR=9;SRF=10;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.243153;STB=0.641365;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.00920814;OID=.;OPOS=149298603;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:53:35:35:18:18:0.339623:9:9:10:25:9:9:10:25
chr1	149334339	.	G	C	1094.35	PASS	AF=0.41958;AO=120;DP=286;FAO=120;FDP=286;FR=.;FRO=166;FSAF=56;FSAR=64;FSRF=64;FSRR=102;FWDB=-0.0118788;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=169.347;QD=15.3056;RBI=0.0119049;REFB=-0.00373021;REVB=0.000786731;RO=162;SAF=56;SAR=64;SRF=64;SRR=98;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0747082;STB=0.547589;STBP=0.167;TYPE=snp;VARB=0.00589695;OID=.;OPOS=149334339;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:286:286:162:166:120:120:0.41958:64:56:64:98:64:56:64:102
chr1	149664423	.	A	G	487.34	PASS	AF=0.440945;AO=51;DP=123;FAO=56;FDP=127;FR=.;FRO=71;FSAF=26;FSAR=30;FSRF=27;FSRR=44;FWDB=0.0189496;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.16;QD=15.3493;RBI=0.0222983;REFB=-0.00944974;REVB=-0.0117528;RO=70;SAF=21;SAR=30;SRF=27;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0278551;STB=0.547507;STBP=0.37;TYPE=snp;VARB=0.0140219;OID=.;OPOS=149664423;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:123:127:70:71:51:56:0.440945:30:21:27:43:30:26:27:44
chr1	149676401	.	A	G	108.86	PASS	AF=0.272727;AO=15;DP=55;FAO=15;FDP=55;FR=.;FRO=40;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=24;FSRR=16;FWDB=-0.0471672;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.498;QD=7.91705;RBI=0.0472317;REFB=0.00717675;REVB=-0.00246642;RO=40;SAF=3;SAR=12;SRF=24;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.481231;STB=0.793721;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=-0.0143615;OID=.;OPOS=149676401;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:40:40:15:15:0.272727:12:3:24:16:12:3:24:16
chr1	149680227	.	A	G	791.8	PASS	AF=0.966102;AO=57;DP=59;FAO=57;FDP=59;FR=.;FRO=2;FSAF=20;FSAR=37;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0326234;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=208.308;QD=53.6817;RBI=0.0338845;REFB=-0.099343;REVB=-0.0091585;RO=2;SAF=20;SAR=37;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0448451;STB=0.523801;STBP=0.081;TYPE=snp;VARB=0.000471156;OID=.;OPOS=149680227;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:59:59:2:2:57:57:0.966102:37:20:2:0:37:20:2:0
chr1	149684084	.	C	A	48.07	PASS	AF=0.368421;AO=7;DP=19;FAO=7;FDP=19;FR=.;FRO=12;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=-0.0219182;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.4675;QD=10.1209;RBI=0.0245219;REFB=-0.000438118;REVB=0.0109963;RO=12;SAF=1;SAR=6;SRF=2;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0474209;STB=0.529324;STBP=0.905;TYPE=snp;VARB=0.00020598;OID=.;OPOS=149684084;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:48:19:19:12:12:7:7:0.368421:6:1:2:10:6:1:2:10
chr1	149684119	.	TA	T,TT	729.92	PASS	AF=0.9375,0.0625;AO=45,3;DP=48;FAO=45,3;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=15,1;FSAR=30,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00117084,0.0186453;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=238.892,220.217;QD=60.8264;RBI=0.0199769,0.0270615;REFB=0,0;REVB=-0.0199425,-0.0196131;RO=0;SAF=15,1;SAR=30,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-3.55188e-05,0.0123892;OID=.,.;OPOS=149684120,149684120;OREF=A,A;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.9375,0.0625:45,3:48:45,3:48:0:15,1:30,2:0:0:11:0:15,1:30,2:0:0
chr1	149684166	.	G	A	196.93	PASS	AF=0.393443;AO=24;DP=61;FAO=24;FDP=61;FR=.;FRO=37;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=24;FWDB=-0.00774993;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.7436;QD=12.9134;RBI=0.0251535;REFB=-0.00665054;REVB=-0.0239298;RO=37;SAF=10;SAR=14;SRF=13;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0720988;STB=0.541277;STBP=0.635;TYPE=snp;VARB=0.0113922;OID=.;OPOS=149684166;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:37:37:24:24:0.393443:14:10:13:24:14:10:13:24
chr1	149684169	.	G	A	380.25	PASS	AF=0.606557;AO=37;DP=61;FAO=37;FDP=61;FR=.;FRO=24;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=-0.0510072;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=226.933;QD=24.9346;RBI=0.0511401;REFB=-0.0157241;REVB=-0.00368513;RO=24;SAF=15;SAR=22;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0543085;STB=0.529724;STBP=0.583;TYPE=snp;VARB=0.0135751;OID=.;OPOS=149684169;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:24:24:37:37:0.606557:22:15:8:16:22:15:8:16
chr1	149684171	.	A	T	186.21	PASS	AF=0.383333;AO=23;DP=60;FAO=23;FDP=60;FR=.;FRO=37;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=24;FWDB=-0.00325603;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.431;QD=12.4138;RBI=0.0254518;REFB=-0.0171337;REVB=-0.0252427;RO=36;SAF=10;SAR=13;SRF=13;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.080605;STB=0.553019;STBP=0.563;TYPE=snp;VARB=0.0211252;OID=.;OPOS=149684171;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:36:37:23:23:0.383333:13:10:13:23:13:10:13:24
chr1	149711815	.	G	A	50.61	PASS	AF=0.122222;AO=11;DP=90;FAO=11;FDP=90;FR=.;FRO=79;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=19;FSRR=60;FWDB=-0.0060164;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.161;QD=2.24938;RBI=0.00670711;REFB=-0.00259601;REVB=-0.0029645;RO=73;SAF=4;SAR=7;SRF=16;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.216008;STB=0.62451;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=0.0258126;OID=.;OPOS=149711815;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:50:90:90:73:79:11:11:0.122222:7:4:16:57:7:4:19:60
chr1	149711845	.	C	A	43.3	PASS	AF=0.10989;AO=10;DP=91;FAO=10;FDP=91;FR=.;FRO=81;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=63;FWDB=0.0101177;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.527;QD=1.90343;RBI=0.0119128;REFB=0.00143518;REVB=0.00628864;RO=81;SAF=2;SAR=8;SRF=18;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0394409;STB=0.52974;STBP=0.907;TYPE=snp;VARB=-0.00572657;OID=.;OPOS=149711845;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:91:91:81:81:10:10:0.10989:8:2:18:63:8:2:18:63
chr1	149895759	.	CGGGGGGGC	CGGGGGGC,CGGGGGGCG	145.75	PASS	AF=0.761905,0;AO=20,3;DP=43;FAO=32,0;FDP=42;FR=.;FRO=10;FSAF=23,0;FSAR=9,0;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.0880062,-0.124159;FXX=0;HRUN=7,7;LEN=1,2;MLLD=8.09223,48.8776;QD=13.8813;RBI=0.245888,0.126447;REFB=-0.136768,-0.0172452;REVB=0.229599,0.0239445;RO=17;SAF=17,3;SAR=3,0;SRF=4;SRR=13;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.550212,0.719989;STB=0.611222,0.5;STBP=0.023,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.15979,0;OID=.,.;OPOS=149895760,149895766;OREF=G,GC;OALT=-,CG;OMAPALT=CGGGGGGC,CGGGGGGCG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.761905,0:20,3:43:32,0:42:10:23,0:9,0:3:7:27:17:17,3:3,0:4:13
chr1	149906393	.	T	C	373.24	PASS	AF=0.454545;AO=36;DP=85;FAO=40;FDP=88;FR=.;FRO=48;FSAF=26;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=24;FWDB=0.0177729;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.367;QD=16.9653;RBI=0.0207535;REFB=-0.0166767;REVB=-0.0107159;RO=48;SAF=22;SAR=14;SRF=24;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114793;STB=0.585264;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.0193593;OID=.;OPOS=149906393;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:88:48:48:36:40:0.454545:14:22:24:24:14:26:24:24
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chr1	150199123	.	G	T	115.58	PASS	AF=0.8;AO=12;DP=15;FAO=12;FDP=15;FR=.;FRO=3;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0855203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.28;QD=30.8207;RBI=0.087423;REFB=-0.0889383;REVB=-0.0181404;RO=3;SAF=4;SAR=8;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127365;STB=0.571306;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=0.0109954;OID=.;OPOS=150199123;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:15:15:3:3:12:12:0.8:8:4:2:1:8:4:2:1
chr1	150278741	.	G	C,GTC	171.96	PASS	AF=0.030303,0.515152;AO=2,14;DP=32;FAO=1,17;FDP=33;FR=.;FRO=15;FSAF=0,13;FSAR=1,4;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.0160677,0.0146278;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=164.408,246.254;QD=20.843;RBI=0.0219956,0.0227534;REFB=-0.0109553,-0.0165431;REVB=0.0150213,0.0174283;RO=14;SAF=1,10;SAR=1,4;SRF=7;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0.204512;STB=0.99016,0.62979;STBP=0.477,0.148;TYPE=snp,ins;VARB=0.00671325,0.0118073;OID=.,.;OPOS=150278741,150278742;OREF=G,-;OALT=C,TC;OMAPALT=C,GTC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:32:33:14:15:2,14:1,17:0.030303,0.515152:1,4:1,10:7:7:1,4:0,13:8:7
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chr1	150484987	.	G	A	286.48	PASS	AF=0.553191;AO=26;DP=47;FAO=26;FDP=47;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.0341865;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.278;QD=24.3814;RBI=0.0342186;REFB=-0.0107893;REVB=0.0014835;RO=21;SAF=13;SAR=13;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0573847;STB=0.53189;STBP=0.63;TYPE=snp;VARB=0.00838434;OID=.;OPOS=150484987;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:21:21:26:26:0.553191:13:13:9:12:13:13:9:12
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chr1	150531008	.	T	C	199.96	PASS	AF=0.431373;AO=21;DP=50;FAO=22;FDP=51;FR=.;FRO=29;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=-0.000244027;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.639;QD=15.6833;RBI=0.033143;REFB=-0.0112534;REVB=0.0331421;RO=29;SAF=13;SAR=8;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0348623;STB=0.530275;STBP=0.714;TYPE=snp;VARB=0.0157617;OID=.;OPOS=150531008;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:51:29:29:21:22:0.431373:8:13:17:12:8:14:17:12
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chr1	150547747	.	G	A	145.21	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0199739;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.4298;QD=44.6791;RBI=0.0401341;REFB=0;REVB=-0.0348108;RO=0;SAF=9;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000755186;OID=.;OPOS=150547747;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:4:9:0:0:4:9:0:0
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chr1	150597890	.	G	A	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00837731;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=118.738;QD=42.1825;RBI=0.0529667;REFB=0;REVB=-0.0523001;RO=0;SAF=7;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000749197;OID=.;OPOS=150597890;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:4:7:0:0:4:7:0:0
chr1	150771703	.	T	C	868.27	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0231442;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.669;QD=57.8847;RBI=0.0279432;REFB=0;REVB=-0.0156578;RO=0;SAF=32;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.89095e-06;OID=.;OPOS=150771703;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:28:32:0:0:28:32:0:0
chr1	150779755	.	C	T	1358.56	PASS	AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0167434;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.3916;QD=62.4624;RBI=0.0355622;REFB=0;REVB=-0.031374;RO=0;SAF=52;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000113493;OID=.;OPOS=150779755;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:35:52:0:0:35:52:0:0
chr1	150782797	.	C	T	144.01	PASS	AF=0.421053;AO=16;DP=38;FAO=16;FDP=38;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=17;FWDB=-0.0578039;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.4699;QD=15.1587;RBI=0.0716685;REFB=-0.0215172;REVB=0.0423685;RO=22;SAF=5;SAR=11;SRF=5;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104501;STB=0.559929;STBP=0.586;TYPE=snp;VARB=0.0288844;OID=.;OPOS=150782797;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:22:22:16:16:0.421053:11:5:5:17:11:5:5:17
chr1	150937771	.	T	A	2336.23	PASS	AF=1;AO=94;DP=168;FAO=167;FDP=167;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=92;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0560937;FXX=0.0118336;HRUN=5;LEN=1;MLLD=23.449;QD=55.9575;RBI=0.268035;REFB=0;REVB=0.2621;RO=0;SAF=62;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.26736e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00124078;OID=.;OPOS=150937771;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:168:167:0:0:94:167:1:32:62:0:0:75:92:0:0
chr1	150969567	.	A	G	723.6	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00809662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.828;QD=56.7529;RBI=0.0187002;REFB=0;REVB=0.0168565;RO=0;SAF=25;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.12197e-05;OID=.;OPOS=150969567;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:51:0:0:49:51:1:24:25:0:0:25:26:0:0
chr1	150969992	.	T	C	168.44	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0569981;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.116;QD=44.9164;RBI=0.104885;REFB=0;REVB=0.0880455;RO=0;SAF=7;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00335638;OID=.;OPOS=150969992;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:15:0:0:13:15:1:6:7:0:0:7:8:0:0
chr1	150970577	.	G	T	557.68	PASS	AF=1;AO=32;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.119103;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.691;QD=60.29;RBI=0.157515;REFB=0;REVB=0.10308;RO=0;SAF=17;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00366858;OID=.;OPOS=150970577;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:32:37:1:15:17:0:0:15:22:0:0
chr1	150975108	.	T	C	340.73	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0274042;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.697;QD=54.5163;RBI=0.0278263;REFB=0;REVB=0.00482868;RO=0;SAF=14;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000190823;OID=.;OPOS=150975108;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:11:14:0:0:11:14:0:0
chr1	150999737	.	A	G	60.71	PASS	AF=0.243243;AO=9;DP=37;FAO=9;FDP=37;FR=.;FRO=28;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=0.0387783;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=43.3525;QD=6.56286;RBI=0.0411062;REFB=-0.0146416;REVB=0.0136367;RO=28;SAF=5;SAR=4;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108157;STB=0.56871;STBP=0.661;TYPE=snp;VARB=0.056712;OID=.;OPOS=150999737;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:60:37:37:28:28:9:9:0.243243:4:5:13:15:4:5:13:15
chr1	151006539	.	C	A	85.29	PASS	AF=0.666667;AO=9;DP=14;FAO=10;FDP=15;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.0469648;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.9741;QD=22.7435;RBI=0.0530642;REFB=0.0232775;REVB=0.0247005;RO=5;SAF=5;SAR=4;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0964512;STB=0.533267;STBP=0.771;TYPE=snp;VARB=-0.0135405;OID=.;OPOS=151006539;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:14:15:5:5:9:10:0.666667:4:5:2:3:5:5:2:3
chr1	151019180	.	A	G	120.69	PASS	AF=0.424242;AO=14;DP=33;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=-0.00833699;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=38.5946;QD=14.6292;RBI=0.0309962;REFB=-0.0266881;REVB=0.0298539;RO=18;SAF=9;SAR=5;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0253924;STB=0.507032;STBP=0.974;TYPE=snp;VARB=0.0349477;OID=.;OPOS=151019180;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:18:19:14:14:0.424242:5:9:12:6:5:9:12:7
chr1	151025626	.	C	T	129.0	PASS	AF=0.538462;AO=14;DP=27;FAO=14;FDP=26;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.0152641;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.6;QD=19.8463;RBI=0.0371798;REFB=-0.0344188;REVB=0.033902;RO=13;SAF=8;SAR=6;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156693;STB=0.571326;STBP=0.46;TYPE=snp;VARB=0.0198904;OID=.;OPOS=151025626;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:26:13:12:14:14:0.538462:6:8:5:8:6:8:5:7
chr1	151040435	.	G	A	235.22	PASS	AF=0.444444;AO=26;DP=61;FAO=28;FDP=63;FR=.;FRO=35;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=0.00544838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.011;QD=14.9347;RBI=0.0063141;REFB=-0.0130934;REVB=-0.00319109;RO=29;SAF=7;SAR=19;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.222782;STB=0.628005;STBP=0.098;TYPE=snp;VARB=0.033172;OID=.;OPOS=151040435;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:63:29:35:26:28:0.444444:19:7:14:15:19:9:19:16
chr1	151104950	.	G	A	46.77	PASS	AF=0.388889;AO=7;DP=18;FAO=7;FDP=18;FR=.;FRO=11;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.0385597;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=196.599;QD=10.3925;RBI=0.0495129;REFB=-0.0199714;REVB=0.0310593;RO=10;SAF=1;SAR=6;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.341391;STB=0.749166;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.0330971;OID=.;OPOS=151104950;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:18:18:10:11:7:7:0.388889:6:1:4:6:6:1:5:6
chr1	151108137	.	T	G	182.8	PASS	AF=0.452381;AO=19;DP=42;FAO=19;FDP=42;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=0.02143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.0794;QD=17.4092;RBI=0.0722919;REFB=-0.011019;REVB=-0.0690425;RO=23;SAF=7;SAR=12;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.269215;STB=0.653306;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=0.0119402;OID=.;OPOS=151108137;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:23:23:19:19:0.452381:12:7:15:8:12:7:15:8
chr1	151137661	.	C	T	630.6	PASS	AF=0.445946;AO=56;DP=138;FAO=66;FDP=148;FR=.;FRO=82;FSAF=33;FSAR=33;FSRF=44;FSRR=38;FWDB=0.0882234;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.1338;QD=17.0433;RBI=0.162676;REFB=-0.0173276;REVB=0.136675;RO=82;SAF=28;SAR=28;SRF=43;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0257312;STB=0.520264;STBP=0.65;TYPE=snp;VARB=0.0230607;OID=.;OPOS=151137661;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:138:148:82:82:56:66:0.445946:28:28:43:39:33:33:44:38
chr1	151288391	.	A	G	805.17	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0036943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.218;QD=64.4138;RBI=0.0255811;REFB=0;REVB=0.0253129;RO=0;SAF=29;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.20481e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.25193e-05;OID=.;OPOS=151288391;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:21:29:0:0:21:29:0:0
chr1	151288698	.	A	C	172.12	PASS	AF=0.473684;AO=18;DP=38;FAO=18;FDP=38;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=-0.0304725;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.566;QD=18.1184;RBI=0.0325767;REFB=-0.0146091;REVB=-0.0115183;RO=20;SAF=9;SAR=9;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0924797;STB=0.552574;STBP=0.555;TYPE=snp;VARB=0.015113;OID=.;OPOS=151288698;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:20:20:18:18:0.473684:9:9:12:8:9:9:12:8
chr1	151316161	.	G	A	88.22	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0116711;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.491;QD=39.2068;RBI=0.0116857;REFB=0;REVB=0.000583299;RO=0;SAF=5;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.15222e-05;OID=.;OPOS=151316161;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:4:5:0:0:4:5:0:0
chr1	151372138	.	G	A	807.93	PASS	AF=0.982759;AO=57;DP=59;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0246997;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.232;QD=55.7192;RBI=0.0248077;REFB=-0.125104;REVB=0.00231236;RO=0;SAF=25;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50769;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.000762539;OID=.;OPOS=151372138;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:59:58:0:1:57:57:0.982759:32:25:0:0:32:25:0:1
chr1	151671355	.	T	C	340.73	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0202747;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.526;QD=54.5162;RBI=0.0254831;REFB=0;REVB=0.0154377;RO=0;SAF=12;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000342519;OID=.;OPOS=151671355;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:13:12:0:0:13:12:0:0
chr1	151675414	.	A	G	306.06	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00906432;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.8852;QD=53.2281;RBI=0.0318828;REFB=0;REVB=-0.0305672;RO=0;SAF=16;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00110749;OID=.;OPOS=151675414;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:7:16:0:0:7:16:0:0
chr1	151686983	.	T	A	62.93	PASS	AF=0.227273;AO=8;DP=43;FAO=10;FDP=44;FR=.;FRO=34;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=0.0272986;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.0004;QD=5.72071;RBI=0.0348478;REFB=-0.00593225;REVB=0.0216601;RO=34;SAF=3;SAR=5;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0827322;STB=0.617402;STBP=0.439;TYPE=snp;VARB=0.0356852;OID=.;OPOS=151686983;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:43:44:34:34:8:10:0.227273:5:3:15:19:7:3:15:19
chr1	151740666	.	T	C	923.86	PASS	AF=0.984615;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0746475;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.9074;QD=56.8527;RBI=0.0802896;REFB=-0.0948949;REVB=0.0295665;RO=0;SAF=30;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508194;STBP=0.334;TYPE=snp;VARB=0.00597643;OID=.;OPOS=151740666;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:64:65:0:1:64:64:0.984615:34:30:0:0:34:30:1:0
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chr1	151747558	.	C	T	234.95	PASS	AF=0.46;AO=23;DP=50;FAO=23;FDP=50;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=-0.00177217;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.442;QD=18.7957;RBI=0.0097017;REFB=-0.0241007;REVB=0.00953847;RO=27;SAF=8;SAR=15;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0611233;STB=0.534678;STBP=0.69;TYPE=snp;VARB=0.0197775;OID=.;OPOS=151747558;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:27:27:23:23:0.46:15:8:11:16:15:8:11:16
chr1	151747970	.	A	G	279.9	PASS	AF=0.405063;AO=32;DP=79;FAO=32;FDP=79;FR=.;FRO=47;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=25;FSRR=22;FWDB=-0.00803486;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.7159;QD=14.1723;RBI=0.0227758;REFB=-0.00185145;REVB=-0.0213114;RO=46;SAF=18;SAR=14;SRF=25;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0200002;STB=0.518388;STBP=0.807;TYPE=snp;VARB=0.00275849;OID=.;OPOS=151747970;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:46:47:32:32:0.405063:14:18:25:21:14:18:25:22
chr1	151803449	.	G	T	1038.56	PASS	AF=0.490741;AO=105;DP=218;FAO=106;FDP=216;FR=.;FRO=110;FSAF=40;FSAR=66;FSRF=52;FSRR=58;FWDB=-0.0267673;FXX=0.00917389;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.9527;QD=19.2327;RBI=0.0301283;REFB=-0.00774062;REVB=-0.0138285;RO=112;SAF=40;SAR=65;SRF=53;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0893705;STB=0.550389;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=0.00940722;OID=.;OPOS=151803449;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:218:216:112:110:105:106:0.490741:65:40:53:59:66:40:52:58
chr1	151814234	.	A	G	575.79	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0126671;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.2694;QD=60.6093;RBI=0.0203019;REFB=0;REVB=0.0158655;RO=0;SAF=23;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000253673;OID=.;OPOS=151814234;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:15:23:0:0:15:23:0:0
chr1	151820298	.	G	C	785.2	PASS	AF=1;AO=54;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.014122;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.0615;QD=57.1053;RBI=0.0352419;REFB=0;REVB=0.0322887;RO=0;SAF=36;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000536413;OID=.;OPOS=151820298;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:54:55:1:18:36:0:0:18:37:0:0
chr1	151820324	.	T	C	230.1	PASS	AF=0.489362;AO=21;DP=45;FAO=23;FDP=47;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=0.00383336;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.7376;QD=19.5827;RBI=0.00391632;REFB=-0.0411095;REVB=0.000801842;RO=24;SAF=12;SAR=9;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0114428;STB=0.509426;STBP=0.9;TYPE=snp;VARB=0.0399668;OID=.;OPOS=151820324;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:47:24:24:21:23:0.489362:9:12:14:10:10:13:14:10
chr1	151825991	.	G	T	352.18	PASS	AF=0.612245;AO=30;DP=49;FAO=30;FDP=49;FR=.;FRO=19;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=5;FSRR=14;FWDB=0.011968;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.037;QD=28.749;RBI=0.0138899;REFB=-0.00767234;REVB=0.00704955;RO=17;SAF=12;SAR=18;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0740099;STB=0.556485;STBP=0.344;TYPE=snp;VARB=0.00418685;OID=.;OPOS=151825991;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:17:19:30:30:0.612245:18:12:5:12:18:12:5:14
chr1	151845569	.	A	G	817.75	PASS	AF=1;AO=43;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0259069;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.653;QD=57.3857;RBI=0.0449403;REFB=0;REVB=0.0367214;RO=0;SAF=42;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.78486e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000240068;OID=.;OPOS=151845569;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:43:57:1:1:42:0:0:15:42:0:0
chr1	151845650	.	G	C	98.55	PASS	AF=0.428571;AO=12;DP=28;FAO=12;FDP=28;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=0.0666099;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.6777;QD=14.0782;RBI=0.0693627;REFB=0.00362357;REVB=-0.0193471;RO=16;SAF=6;SAR=6;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122388;STB=0.571312;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=-0.00624841;OID=.;OPOS=151845650;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:28:28:16:16:12:12:0.428571:6:6:10:6:6:6:10:6
chr1	151867560	.	G	A	801.26	PASS	AF=1;AO=55;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0113563;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.212;QD=57.2329;RBI=0.0130928;REFB=0;REVB=0.00651575;RO=0;SAF=34;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.25511e-05;OID=.;OPOS=151867560;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:55:56:1:21:34:0:0:22:34:0:0
chr1	152085505	.	A	C	871.23	PASS	AF=0.96875;AO=62;DP=64;FAO=62;FDP=64;FR=.;FRO=2;FSAF=31;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0369324;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.644;QD=54.4518;RBI=0.0414486;REFB=-0.119172;REVB=0.0188146;RO=2;SAF=31;SAR=31;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0294861;STB=0.51562;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=0.011872;OID=.;OPOS=152085505;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:64:64:2:2:62:62:0.96875:31:31:0:2:31:31:0:2
chr1	152185762	.	C	G	358.05	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00215944;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.7518;QD=55.0838;RBI=0.023761;REFB=0;REVB=-0.0236627;RO=0;SAF=15;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000596977;OID=.;OPOS=152185762;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:11:15:0:0:11:15:0:0
chr1	152185768	.	T	G	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0230979;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=305.256;QD=52.6132;RBI=0.0235464;REFB=0;REVB=0.004574;RO=0;SAF=13;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2029e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.9372e-05;OID=.;OPOS=152185768;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:9:13:0:0:9:13:0:0
chr1	152185774	.	A	G	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00888961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.152;QD=51.1846;RBI=0.00919285;REFB=0;REVB=-0.00234168;RO=0;SAF=12;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.21515e-05;OID=.;OPOS=152185774;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:8:12:0:0:8:12:0:0
chr1	152185780	.	G	A	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00272457;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=321.62;QD=49.5992;RBI=0.00949862;REFB=0;REVB=-0.00909947;RO=0;SAF=12;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.08148e-05;OID=.;OPOS=152185780;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:6:12:0:0:6:12:0:0
chr1	152185790	.	T	C	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0601315;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.536;QD=45.8064;RBI=0.075119;REFB=0;REVB=0.045023;RO=0;SAF=10;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.63386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000404675;OID=.;OPOS=152185790;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:4:10:0:0:4:10:0:0
chr1	152185792	.	G	A	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0624857;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.2656;QD=45.8064;RBI=0.0638004;REFB=0;REVB=-0.0128856;RO=0;SAF=10;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.63386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00179467;OID=.;OPOS=152185792;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:4:10:0:0:4:10:0:0
chr1	152185796	.	A	G	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0318683;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.1443;QD=45.8056;RBI=0.0538144;REFB=0;REVB=-0.0433635;RO=0;SAF=10;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.63386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000597719;OID=.;OPOS=152185796;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:4:10:0:0:4:10:0:0
chr1	152186141	.	C	T	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.175623;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.6988;QD=33.4275;RBI=0.177927;REFB=0;REVB=0.0285451;RO=0;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0191176;OID=.;OPOS=152186141;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:2:4:0:0:2:4:0:0
chr1	152187183	.	C	A	156.92	PASS	AF=0.435897;AO=17;DP=39;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=0.00510246;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.016;QD=16.0941;RBI=0.0109755;REFB=-0.00983796;REVB=0.00971733;RO=22;SAF=10;SAR=7;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0969551;STB=0.555492;STBP=0.551;TYPE=snp;VARB=0.0121324;OID=.;OPOS=152187183;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:22:22:17:17:0.435897:7:10:15:7:7:10:15:7
chr1	152188062	.	T	C	117.6	PASS	AF=0.2;AO=9;DP=94;FAO=19;FDP=95;FR=.;FRO=76;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=33;FSRR=43;FWDB=0.00398904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.0064;QD=4.95175;RBI=0.0384506;REFB=-0.0121676;REVB=0.0382432;RO=73;SAF=3;SAR=6;SRF=33;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145197;STB=0.531739;STBP=0.774;TYPE=snp;VARB=0.0468503;OID=.;OPOS=152188062;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:95:73:76:9:19:0.2:6:3:33:40:10:9:33:43
chr1	152188109	.	T	A	543.24	PASS	AF=0.365169;AO=65;DP=178;FAO=65;FDP=178;FR=.;FRO=113;FSAF=23;FSAR=42;FSRF=54;FSRR=59;FWDB=-0.00893958;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.4204;QD=12.2077;RBI=0.0262683;REFB=-0.00962641;REVB=-0.0247004;RO=113;SAF=23;SAR=42;SRF=54;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143793;STB=0.581943;STBP=0.118;TYPE=snp;VARB=0.0217077;OID=.;OPOS=152188109;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:178:178:113:113:65:65:0.365169:42:23:54:59:42:23:54:59
chr1	152188176	.	G	A	124.78	PASS	AF=0.131818;AO=29;DP=220;FAO=29;FDP=220;FR=.;FRO=191;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=98;FSRR=93;FWDB=-0.024828;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.3386;QD=2.26875;RBI=0.034448;REFB=-0.00716515;REVB=-0.0238796;RO=191;SAF=10;SAR=19;SRF=98;SRR=93;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.213675;STB=0.646809;STBP=0.103;TYPE=snp;VARB=0.023844;OID=.;OPOS=152188176;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:220:220:191:191:29:29:0.131818:19:10:98:93:19:10:98:93
chr1	152188463	.	G	A	177.85	PASS	AF=0.144981;AO=40;DP=269;FAO=39;FDP=269;FR=.;FRO=230;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=122;FSRR=108;FWDB=-0.0277859;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.3173;QD=2.6446;RBI=0.0426729;REFB=0.00147557;REVB=0.032387;RO=228;SAF=20;SAR=20;SRF=121;SRR=107;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0394499;STB=0.515074;STBP=0.87;TYPE=snp;VARB=-0.00935526;OID=.;OPOS=152188463;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:269:269:228:230:40:39:0.144981:20:20:121:107:19:20:122:108
chr1	152191709	.	C	G	801.32	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.033013;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.0076;QD=57.2368;RBI=0.0330247;REFB=0;REVB=0.000878246;RO=0;SAF=21;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000305434;OID=.;OPOS=152191709;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:35:21:0:0:35:21:0:0
chr1	152191809	.	C	T	362.66	PASS	AF=0.528571;AO=37;DP=70;FAO=37;FDP=70;FR=.;FRO=33;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=0.00141086;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.6196;QD=20.7232;RBI=0.00283783;REFB=-0.0131943;REVB=-0.00246226;RO=33;SAF=14;SAR=23;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0140194;STB=0.507764;STBP=0.916;TYPE=snp;VARB=0.0142526;OID=.;OPOS=152191809;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:33:33:37:37:0.528571:23:14:13:20:23:14:13:20
chr1	152191870	.	G	A	174.35	PASS	AF=0.366667;AO=22;DP=60;FAO=22;FDP=60;FR=.;FRO=38;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=0.0911342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.3813;QD=11.6231;RBI=0.0928754;REFB=0.0141168;REVB=0.0178995;RO=38;SAF=9;SAR=13;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100342;STB=0.558229;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=-0.0205085;OID=.;OPOS=152191870;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:38:38:22:22:0.366667:13:9:19:19:13:9:19:19
chr1	152191879	.	G	A	825.44	PASS	AF=1;AO=57;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0295788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.0445;QD=56.9267;RBI=0.0393363;REFB=0;REVB=0.0259315;RO=1;SAF=27;SAR=30;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0154619;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.21558e-06;OID=.;OPOS=152191879;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:1:0:57:58:1:30:27:0:1:31:27:0:0
chr1	152192098	.	AA	GG	168.44	PASS	AF=0.291139;AO=23;DP=78;FAO=23;FDP=79;FR=.;FRO=56;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=24;FSRR=32;FWDB=0.00226174;FXX=0;HRUN=4;LEN=2;MLLD=187.479;QD=8.52838;RBI=0.00631627;REFB=-0.0109712;REVB=-0.00589744;RO=55;SAF=10;SAR=13;SRF=24;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00190664;STB=0.50448;STBP=0.965;TYPE=mnp;VARB=0.018549;OID=.;OPOS=152192098;OREF=AA;OALT=GG;OMAPALT=GG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:79:55:56:23:23:0.291139:13:10:24:31:13:10:24:32
chr1	152192114	.	C	T	623.92	PASS	AF=0.467153;AO=64;DP=138;FAO=64;FDP=137;FR=.;FRO=73;FSAF=26;FSAR=38;FSRF=30;FSRR=43;FWDB=0.00211353;FXX=0.00724585;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.382;QD=18.2168;RBI=0.0183841;REFB=-0.00400961;REVB=-0.0182622;RO=72;SAF=26;SAR=38;SRF=30;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0102805;STB=0.502597;STBP=0.96;TYPE=snp;VARB=0.00495467;OID=.;OPOS=152192114;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:138:137:72:73:64:64:0.467153:38:26:30:42:38:26:30:43
chr1	152192163	.	G	T	987.77	PASS	AF=0.542857;AO=95;DP=175;FAO=95;FDP=175;FR=.;FRO=80;FSAF=50;FSAR=45;FSRF=40;FSRR=40;FWDB=0.0155637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.3269;QD=22.5776;RBI=0.0366717;REFB=-0.0177456;REVB=0.0332052;RO=80;SAF=50;SAR=45;SRF=40;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0220581;STB=0.512046;STBP=0.73;TYPE=snp;VARB=0.0225319;OID=.;OPOS=152192163;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:175:175:80:80:95:95:0.542857:45:50:40:40:45:50:40:40
chr1	152192219	.	G	C	959.65	PASS	AF=0.51087;AO=94;DP=184;FAO=94;FDP=184;FR=.;FRO=90;FSAF=49;FSAR=45;FSRF=48;FSRR=42;FWDB=-0.000835866;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.614;QD=20.8619;RBI=0.0048487;REFB=-0.0186505;REVB=0.00477611;RO=90;SAF=49;SAR=45;SRF=48;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0107705;STB=0.50591;STBP=0.889;TYPE=snp;VARB=0.0144231;OID=.;OPOS=152192219;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:184:184:90:90:94:94:0.51087:45:49:48:42:45:49:48:42
chr1	152192259	.	T	C	633.21	PASS	AF=0.368687;AO=73;DP=198;FAO=73;FDP=198;FR=.;FRO=125;FSAF=43;FSAR=30;FSRF=68;FSRR=57;FWDB=-0.00369177;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.604;QD=12.7921;RBI=0.00652741;REFB=-0.0086275;REVB=0.00538312;RO=125;SAF=43;SAR=30;SRF=68;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0511908;STB=0.529054;STBP=0.54;TYPE=snp;VARB=0.0125121;OID=.;OPOS=152192259;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:198:198:125:125:73:73:0.368687:30:43:68:57:30:43:68:57
chr1	152192293	.	C	T	2203.39	PASS	AF=1;AO=140;DP=141;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0491809;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=193.325;QD=62.5076;RBI=0.0551313;REFB=-0.112627;REVB=0.024914;RO=1;SAF=82;SAR=58;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00576343;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000337413;OID=.;OPOS=152192293;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:141:141:1:0:140:141:1:58:82:1:0:58:83:0:0
chr1	152192631	.	C	T	671.8	PASS	AF=0.960784;AO=49;DP=51;FAO=49;FDP=51;FR=.;FRO=2;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0154335;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.515;QD=52.6901;RBI=0.0209555;REFB=-0.0966799;REVB=-0.0141754;RO=0;SAF=25;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5004;STBP=0.886;TYPE=snp;VARB=-0.000227443;OID=.;OPOS=152192631;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:51:51:0:2:49:49:0.960784:24:25:0:0:24:25:1:1
chr1	152192687	.	T	C	785.89	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0150046;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.2;QD=64.1539;RBI=0.018602;REFB=0;REVB=0.0109953;RO=0;SAF=29;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.37695e-05;OID=.;OPOS=152192687;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:20:29:0:0:20:29:0:0
chr1	152192825	.	C	T	769.4	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00688218;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.067;QD=56.9923;RBI=0.0605965;REFB=0;REVB=0.0602044;RO=0;SAF=31;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.76368e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000415944;OID=.;OPOS=152192825;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:54:0:0:53:54:1:22:31:0:0:23:31:0:0
chr1	152192978	.	T	C	1321.74	PASS	AF=0.988506;AO=86;DP=87;FAO=86;FDP=87;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=49;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0201263;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.425;QD=60.7695;RBI=0.0386724;REFB=0.0162197;REVB=-0.0330225;RO=0;SAF=37;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506665;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=-0.000287964;OID=.;OPOS=152192978;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:87:87:0:1:86:86:0.988506:49:37:0:0:49:37:1:0
chr1	152193052	.	A	G	1008.44	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0151187;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.759;QD=59.3198;RBI=0.0151841;REFB=0;REVB=-0.00140735;RO=0;SAF=41;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.6787e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.54444e-05;OID=.;OPOS=152193052;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:27:41:0:0:27:41:0:0
chr1	152193121	.	G	T	783.24	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00726298;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.839;QD=56.9629;RBI=0.033981;REFB=0;REVB=0.0331958;RO=0;SAF=40;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.28425e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000135008;OID=.;OPOS=152193121;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:15:40:0:0:15:40:0:0
chr1	152193286	.	G	T	955.2	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0115662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.336;QD=58.7817;RBI=0.0137653;REFB=0;REVB=0.00746379;RO=0;SAF=24;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.25588e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.99124e-05;OID=.;OPOS=152193286;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:41:24:0:0:41:24:0:0
chr1	152193291	.	G	T	937.48	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0234545;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.064;QD=58.5925;RBI=0.0324592;REFB=0;REVB=0.0224384;RO=0;SAF=25;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.30166e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000135671;OID=.;OPOS=152193291;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:39:25:0:0:39:25:0:0
chr1	152193544	.	A	G	996.08	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142049;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.374;QD=58.5931;RBI=0.054319;REFB=0;REVB=0.0524287;RO=0;SAF=23;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.11549e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000316844;OID=.;OPOS=152193544;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:68:0:0:67:68:1:44:23:0:0:45:23:0:0
chr1	152193547	.	G	A	961.98	PASS	AF=0.985075;AO=66;DP=68;FAO=66;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0148586;FXX=0.0147037;HRUN=3;LEN=1;MLLD=253.248;QD=57.4315;RBI=0.022917;REFB=-0.0315248;REVB=0.0174473;RO=1;SAF=23;SAR=43;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0108628;STB=0.505745;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.000110922;OID=.;OPOS=152193547;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:68:67:1:1:66:66:0.985075:43:23:0:1:43:23:0:1
chr1	152193851	.	C	T	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0435727;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.197;QD=44.6896;RBI=0.0520366;REFB=0;REVB=-0.028447;RO=0;SAF=4;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000124042;OID=.;OPOS=152193851;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:9:4:0:0:9:4:0:0
chr1	152329369	.	C	G	160.2	PASS	AF=0.447368;AO=17;DP=38;FAO=17;FDP=38;FR=.;FRO=21;FSAF=3;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=3;FWDB=-0.0330031;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.7544;QD=16.8634;RBI=0.0333273;REFB=-0.0229092;REVB=0.00463735;RO=21;SAF=3;SAR=14;SRF=18;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.619464;STB=0.85179;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0297308;OID=.;OPOS=152329369;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:21:21:17:17:0.447368:14:3:18:3:14:3:18:3
chr1	152487910	.	G	T	209.85	PASS	AF=0.488372;AO=19;DP=41;FAO=21;FDP=43;FR=.;FRO=22;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.0695386;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.9828;QD=19.5205;RBI=0.0714041;REFB=-0.0425619;REVB=-0.0162152;RO=21;SAF=9;SAR=10;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00231994;STB=0.512183;STBP=0.837;TYPE=snp;VARB=0.0256888;OID=.;OPOS=152487910;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:43:21:22:19:21:0.488372:10:9:10:11:10:11:11:11
chr1	152552285	.	C	A	161.93	PASS	AF=0.5;AO=16;DP=33;FAO=17;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=16;FSAR=1;FSRF=14;FSRR=3;FWDB=0.00558885;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=76.2295;QD=19.0505;RBI=0.0515393;REFB=-0.00457718;REVB=0.0512354;RO=17;SAF=15;SAR=1;SRF=14;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.295089;STB=0.680578;STBP=0.198;TYPE=snp;VARB=0.00274511;OID=.;OPOS=152552285;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:34:17:17:16:17:0.5:1:15:14:3:1:16:14:3
chr1	152648659	.	TG	T	112.44	PASS	AF=0.609756;AO=24;DP=41;FAO=25;FDP=41;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=22;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=0.0628516;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=11.5002;QD=10.9697;RBI=0.211651;REFB=-0.158225;REVB=-0.202103;RO=17;SAF=0;SAR=24;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.844966;STB=0.60147;STBP=0.219;TYPE=del;VARB=0.151689;OID=.;OPOS=152648660;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.609756:24:41:25:41:16:3:22:4:12:67:17:0:24:7:10
chr1	152659471	.	T	G	236.67	PASS	AF=0.5;AO=25;DP=51;FAO=25;FDP=50;FR=.;FRO=25;FSAF=4;FSAR=21;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=-0.0313986;FXX=0.0384541;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.476;QD=18.9339;RBI=0.0337288;REFB=-0.019044;REVB=0.0123192;RO=25;SAF=4;SAR=21;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.37119;STB=0.711669;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.0230079;OID=.;OPOS=152659471;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:50:25:25:25:25:0.5:21:4:12:13:21:4:12:13
chr1	152692512	.	G	A	66.83	PASS	AF=0.428571;AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.0103238;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.8395;QD=12.7298;RBI=0.0145007;REFB=-0.0140516;REVB=-0.0101829;RO=12;SAF=4;SAR=5;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0535863;STB=0.531844;STBP=0.772;TYPE=snp;VARB=0.0126106;OID=.;OPOS=152692512;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:21:21:12:12:9:9:0.428571:5:4:6:6:5:4:6:6
chr1	152732174	.	T	C	72.7	PASS	AF=0.30303;AO=10;DP=33;FAO=10;FDP=33;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=6;FWDB=0.0113698;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=244.815;QD=8.81182;RBI=0.022378;REFB=-0.00436545;REVB=0.0192744;RO=23;SAF=5;SAR=5;SRF=17;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.277093;STB=0.66637;STBP=0.24;TYPE=snp;VARB=0.00675801;OID=.;OPOS=152732174;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:33:33:23:23:10:10:0.30303:5:5:17:6:5:5:17:6
chr1	152732436	.	G	C	206.86	PASS	AF=0.4375;AO=21;DP=48;FAO=21;FDP=48;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=-0.0349906;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.314;QD=17.2382;RBI=0.0352705;REFB=-0.0229438;REVB=-0.00443484;RO=27;SAF=13;SAR=8;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0274036;STB=0.515643;STBP=0.864;TYPE=snp;VARB=0.0388983;OID=.;OPOS=152732436;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:27:27:21:21:0.4375:8:13:16:11:8:13:16:11
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chr1	152760642	.	C	T	174.35	PASS	AF=0.366667;AO=22;DP=60;FAO=22;FDP=60;FR=.;FRO=38;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=0.0168954;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.759;QD=11.6231;RBI=0.0282595;REFB=-0.00578771;REVB=-0.0226527;RO=38;SAF=12;SAR=10;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0210136;STB=0.512184;STBP=0.878;TYPE=snp;VARB=0.00773927;OID=.;OPOS=152760642;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:38:38:22:22:0.366667:10:12:20:18:10:12:20:18
chr1	152760644	.	C	T	175.77	PASS	AF=0.372881;AO=22;DP=59;FAO=22;FDP=59;FR=.;FRO=37;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=0.00576187;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.273;QD=11.9168;RBI=0.016329;REFB=-0.0105419;REVB=-0.0152786;RO=37;SAF=12;SAR=10;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0053617;STB=0.503103;STBP=0.984;TYPE=snp;VARB=0.0093769;OID=.;OPOS=152760644;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:37:37:22:22:0.372881:10:12:20:17:10:12:20:17
chr1	152760647	.	C	A	175.75	PASS	AF=0.372881;AO=22;DP=59;FAO=22;FDP=59;FR=.;FRO=37;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=0.0115311;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=133.428;QD=11.9155;RBI=0.0140337;REFB=0.0312058;REVB=-0.00799877;RO=37;SAF=12;SAR=10;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0053617;STB=0.503103;STBP=0.984;TYPE=snp;VARB=-0.00989555;OID=.;OPOS=152760647;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:37:37:22:22:0.372881:10:12:20:17:10:12:20:17
chr1	152760651	.	C	T	155.94	PASS	AF=0.350877;AO=20;DP=57;FAO=20;FDP=57;FR=.;FRO=37;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=0.0141666;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.777;QD=10.9434;RBI=0.015771;REFB=0.00124825;REVB=-0.00693046;RO=37;SAF=12;SAR=8;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0675666;STB=0.539528;STBP=0.667;TYPE=snp;VARB=-0.00113832;OID=.;OPOS=152760651;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:37:37:20:20:0.350877:8:12:20:17:8:12:20:17
chr1	152770521	.	G	A	57.07	PASS	AF=0.875;AO=7;DP=8;FAO=7;FDP=8;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.000189524;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.5525;QD=28.5366;RBI=0.0628227;REFB=0.113127;REVB=0.0628224;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.571224;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=-0.00465069;OID=.;OPOS=152770521;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:8:8:0:1:7:7:0.875:3:4:0:0:3:4:0:1
chr1	152770589	.	A	G	174.09	PASS	AF=0.5;AO=18;DP=36;FAO=18;FDP=36;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=0.0231669;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.536;QD=19.3435;RBI=0.0238224;REFB=-0.0260046;REVB=0.00554972;RO=18;SAF=8;SAR=10;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194029;STB=0.609637;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=0.0154611;OID=.;OPOS=152770589;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:18:18:18:18:0.5:10:8:12:6:10:8:12:6
chr1	152771207	.	C	A	96.2	PASS	AF=0.375;AO=12;DP=32;FAO=12;FDP=32;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=5;FWDB=0.0591583;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.5978;QD=12.0251;RBI=0.0609879;REFB=0.0249798;REVB=-0.0148263;RO=20;SAF=4;SAR=8;SRF=15;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.419238;STB=0.744727;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=-0.0576359;OID=.;OPOS=152771207;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:32:32:20:20:12:12:0.375:8:4:15:5:8:4:15:5
chr1	152771293	.	A	G	244.29	PASS	AF=0.547619;AO=23;DP=42;FAO=23;FDP=42;FR=.;FRO=19;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.0405313;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.419;QD=23.2655;RBI=0.0420825;REFB=-0.0319142;REVB=0.0113203;RO=19;SAF=15;SAR=8;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150704;STB=0.58434;STBP=0.251;TYPE=snp;VARB=0.0261176;OID=.;OPOS=152771293;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:19:19:23:23:0.547619:8:15:9:10:8:15:9:10
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chr1	152777655	.	C	T	144.73	PASS	AF=0.31746;AO=20;DP=64;FAO=20;FDP=63;FR=.;FRO=43;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=23;FWDB=0.000519151;FXX=0.0156226;HRUN=6;LEN=1;MLLD=199.575;QD=9.18903;RBI=0.00534241;REFB=0.000791122;REVB=0.00531712;RO=42;SAF=10;SAR=10;SRF=19;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0546607;STB=0.523786;STBP=0.807;TYPE=snp;VARB=-0.00245601;OID=.;OPOS=152777655;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:63:42:43:20:20:0.31746:10:10:19:23:10:10:20:23
chr1	152882610	.	A	G	93.32	PASS	AF=0.578947;AO=11;DP=19;FAO=11;FDP=19;FR=.;FRO=8;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=0.000254538;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=181.549;QD=19.647;RBI=0.0461908;REFB=-0.0049272;REVB=-0.0461901;RO=8;SAF=10;SAR=1;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.651019;STB=0.878348;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.00369016;OID=.;OPOS=152882610;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:19:19:8:8:11:11:0.578947:1:10:1:7:1:10:1:7
chr1	152883680	.	A	G	74.48	PASS	AF=0.692308;AO=9;DP=13;FAO=9;FDP=13;FR=.;FRO=4;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0254193;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.362;QD=22.9158;RBI=0.0257264;REFB=-0.0587283;REVB=-0.00396334;RO=3;SAF=5;SAR=4;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.240503;STB=0.593016;STBP=0.349;TYPE=snp;VARB=0.019515;OID=.;OPOS=152883680;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:13:13:3:4:9:9:0.692308:4:5:0:3:4:5:1:3
chr1	152883711	.	G	C	30.99	PASS	AF=0.5;AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=-0.0659488;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.299;QD=12.395;RBI=0.0666416;REFB=-0.00455202;REVB=-0.00958439;RO=5;SAF=3;SAR=2;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.471002;STB=0.776909;STBP=0.18;TYPE=snp;VARB=0.0225551;OID=.;OPOS=152883711;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:27:10:10:5:5:5:5:0.5:2:3:0:5:2:3:0:5
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chr1	152958238	.	A	G	492.09	PASS	AF=0.54023;AO=47;DP=87;FAO=47;FDP=87;FR=.;FRO=40;FSAF=16;FSAR=31;FSRF=17;FSRR=23;FWDB=0.00828464;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.9329;QD=22.6247;RBI=0.0104195;REFB=0.00206485;REVB=0.00631909;RO=40;SAF=16;SAR=31;SRF=17;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0763629;STB=0.542112;STBP=0.439;TYPE=snp;VARB=-0.00596241;OID=.;OPOS=152958238;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:40:40:47:47:0.54023:31:16:17:23:31:16:17:23
chr1	152958267	.	T	C	281.32	PASS	AF=0.517241;AO=30;DP=58;FAO=30;FDP=58;FR=.;FRO=28;FSAF=8;FSAR=22;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=-0.0258137;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.1773;QD=19.4011;RBI=0.0525805;REFB=-0.0197786;REVB=-0.0458079;RO=28;SAF=8;SAR=22;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12961;STB=0.572552;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=0.0166874;OID=.;OPOS=152958267;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:28:28:30:30:0.517241:22:8:11:17:22:8:11:17
chr1	152975495	.	G	A	106.86	PASS	AF=0.371429;AO=13;DP=35;FAO=13;FDP=35;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=-0.00356445;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.193;QD=12.2127;RBI=0.0105102;REFB=-0.000757112;REVB=-0.00988732;RO=22;SAF=6;SAR=7;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0564458;STB=0.533283;STBP=0.776;TYPE=snp;VARB=0.00539126;OID=.;OPOS=152975495;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:22:22:13:13:0.371429:7:6:9:13:7:6:9:13
chr1	152975829	.	A	G	56.78	PASS	AF=0.421053;AO=8;DP=19;FAO=8;FDP=19;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=-0.0145192;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.654;QD=11.9536;RBI=0.0146335;REFB=0.00561511;REVB=0.00182516;RO=11;SAF=2;SAR=6;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0286032;STB=0.517197;STBP=0.962;TYPE=snp;VARB=-0.0047736;OID=.;OPOS=152975829;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:19:19:11:11:8:8:0.421053:6:2:3:8:6:2:3:8
chr1	152975941	.	C	G	308.0	PASS	AF=0.588235;AO=30;DP=51;FAO=30;FDP=51;FR=.;FRO=21;FSAF=21;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=-0.0129976;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.254;QD=24.1567;RBI=0.0131484;REFB=-0.00429576;REVB=-0.00198529;RO=21;SAF=21;SAR=9;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.283888;STB=0.657035;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.00363071;OID=.;OPOS=152975941;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:21:21:30:30:0.588235:9:21:7:14:9:21:7:14
chr1	152976108	.	C	T	196.73	PASS	AF=0.465116;AO=20;DP=43;FAO=20;FDP=43;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=-0.00860451;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.913;QD=18.3008;RBI=0.0349717;REFB=0.00637119;REVB=0.0338967;RO=23;SAF=12;SAR=8;SRF=16;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0961387;STB=0.554403;STBP=0.554;TYPE=snp;VARB=-0.00844391;OID=.;OPOS=152976108;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:23:23:20:20:0.465116:8:12:16:7:8:12:16:7
chr1	152976114	.	G	C	209.72	PASS	AF=0.466667;AO=21;DP=45;FAO=21;FDP=45;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=7;FWDB=-0.00109786;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.3586;QD=18.6421;RBI=0.0750012;REFB=-0.0610067;REVB=-0.0749932;RO=24;SAF=13;SAR=8;SRF=17;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0915012;STB=0.551677;STBP=0.576;TYPE=snp;VARB=0.0130267;OID=.;OPOS=152976114;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:24:24:21:21:0.466667:8:13:17:7:8:13:17:7
chr1	152976306	.	T	G	331.68	PASS	AF=0.548387;AO=34;DP=62;FAO=34;FDP=62;FR=.;FRO=28;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=0.00642751;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.374;QD=21.3985;RBI=0.026723;REFB=-0.0142206;REVB=0.0259385;RO=26;SAF=17;SAR=17;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0604223;STB=0.548359;STBP=0.426;TYPE=snp;VARB=0.0130032;OID=.;OPOS=152976306;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:26:28:34:34:0.548387:17:17:15:11:17:17:17:11
chr1	153004848	.	T	C	58.32	PASS	AF=0.5;AO=5;DP=14;FAO=7;FDP=14;FR=.,HEALED;FRO=6;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0621941;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=37.2284;QD=16.6616;RBI=0.0915989;REFB=-0.0306653;REVB=-0.0672477;RO=6;SAF=3;SAR=2;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0892949;STB=0.609426;STBP=0.546;TYPE=snp;VARB=0.0246885;OID=.;OPOS=153004848;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:40:14:14:6:6:5:7:0.5:2:3:3:3:2:5:3:3
chr1	153004853	.	C	T	48.24	PASS	AF=0.466667;AO=7;DP=15;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.00215197;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=174.177;QD=12.8634;RBI=0.041973;REFB=-0.0096021;REVB=0.0419178;RO=8;SAF=4;SAR=3;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0639024;STB=0.538351;STBP=0.748;TYPE=snp;VARB=0.00820689;OID=.;OPOS=153004853;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:15:15:8:8:7:7:0.466667:3:4:4:4:3:4:4:4
chr1	153005156	.	C	T	294.56	PASS	AF=0.619048;AO=26;DP=42;FAO=26;FDP=42;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=19;FSRF=3;FSRR=13;FWDB=0.0255404;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.4825;QD=28.0531;RBI=0.0327466;REFB=-0.0303439;REVB=0.0204946;RO=16;SAF=7;SAR=19;SRF=3;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0746985;STB=0.541032;STBP=0.606;TYPE=snp;VARB=0.0150473;OID=.;OPOS=153005156;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:16:16:26:26:0.619048:19:7:3:13:19:7:3:13
chr1	153066072	.	T	C	216.54	PASS	AF=0.294737;AO=28;DP=95;FAO=28;FDP=95;FR=.;FRO=67;FSAF=27;FSAR=1;FSRF=46;FSRR=21;FWDB=0.0324286;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=179.276;QD=9.11729;RBI=0.0336605;REFB=-0.00562909;REVB=0.0090229;RO=65;SAF=27;SAR=1;SRF=46;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.605566;STB=0.890159;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0242001;OID=.;OPOS=153066072;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:65:67:28:28:0.294737:1:27:46:19:1:27:46:21
chr1	153191512	.	T	A	349.86	PASS	AF=0.413043;AO=38;DP=91;FAO=38;FDP=92;FR=.;FRO=54;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=35;FWDB=0.0118269;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=119.703;QD=15.2112;RBI=0.0233747;REFB=-0.00810076;REVB=-0.0201619;RO=53;SAF=21;SAR=17;SRF=19;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198197;STB=0.616193;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.0101449;OID=.;OPOS=153191512;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:92:53:54:38:38:0.413043:17:21:19:34:17:21:19:35
chr1	153233488	.	C	CGGCGGT	32.34	PASS	AF=0.12;AO=6;DP=53;FAO=6;FDP=50;FR=.;FRO=44;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=16;FSRR=28;FWDB=-0.0128823;FXX=0.019604;HRUN=2;LEN=6;MLLD=252.848;QD=2.58699;RBI=0.0204306;REFB=-0.0126776;REVB=-0.0158573;RO=47;SAF=5;SAR=1;SRF=17;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.512396;STB=0.8724;STBP=0.095;TYPE=ins;VARB=0.0772084;OID=.;OPOS=153233489;OREF=-;OALT=GGCGGT;OMAPALT=CGGCGGT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.12:6:53:6:50:44:5:1:16:28:32:47:5:1:17:30
chr1	153233506	.	C	T	41.82	PASS	AF=0.179487;AO=7;DP=39;FAO=7;FDP=39;FR=.;FRO=32;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=-0.0512512;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.755;QD=4.28888;RBI=0.0533302;REFB=-0.00925844;REVB=-0.0147453;RO=32;SAF=4;SAR=3;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123038;STB=0.583703;STBP=0.669;TYPE=snp;VARB=0.0525752;OID=.;OPOS=153233506;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:39:39:32:32:7:7:0.179487:3:4:15:17:3:4:15:17
chr1	153234295	.	G	A	191.79	PASS	AF=0.558824;AO=19;DP=34;FAO=19;FDP=34;FR=.;FRO=15;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=0.0735758;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=61.6294;QD=22.564;RBI=0.123204;REFB=-0.0349051;REVB=0.0988223;RO=13;SAF=11;SAR=8;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0860085;STB=0.540151;STBP=0.619;TYPE=snp;VARB=0.01526;OID=.;OPOS=153234295;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:13:15:19:19:0.558824:8:11:9:4:8:11:10:5
chr1	153277423	.	C	T	294.48	PASS	AF=0.423077;AO=33;DP=78;FAO=33;FDP=78;FR=.;FRO=45;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=26;FSRR=19;FWDB=0.046578;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.9193;QD=15.1017;RBI=0.0557575;REFB=0.00949963;REVB=0.0306495;RO=45;SAF=12;SAR=21;SRF=26;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.219665;STB=0.624337;STBP=0.069;TYPE=snp;VARB=-0.0117737;OID=.;OPOS=153277423;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:45:45:33:33:0.423077:21:12:26:19:21:12:26:19
chr1	153304140	.	AG	A	208.68	PASS	AF=0.525;AO=20;DP=40;FAO=21;FDP=40;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.000702203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.216;QD=20.8675;RBI=0.0165328;REFB=0.0098016;REVB=0.0165178;RO=19;SAF=11;SAR=9;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0253371;STB=0.526291;STBP=0.748;TYPE=del;VARB=-0.00906025;OID=.;OPOS=153304141;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.525:20:40:21:40:19:11:10:11:8:99:19:11:9:11:8
chr1	153314153	.	C	A	906.13	PASS	AF=0.984375;AO=63;DP=64;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00170012;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=287.044;QD=56.6333;RBI=0.00947634;REFB=-0.154056;REVB=0.00932258;RO=1;SAF=31;SAR=32;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0145288;STB=0.50769;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.000345331;OID=.;OPOS=153314153;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:64:64:1:1:63:63:0.984375:32:31:0:1:32:31:0:1
chr1	153315579	.	A	G	1268.59	PASS	AF=0.988095;AO=83;DP=84;FAO=83;FDP=84;FR=.;FRO=1;FSAF=51;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0163345;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=132.825;QD=60.409;RBI=0.0465552;REFB=0.059762;REVB=-0.0435956;RO=1;SAF=51;SAR=32;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00919718;STB=0.504853;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=-0.000233764;OID=.;OPOS=153315579;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:84:84:1:1:83:83:0.988095:32:51:1:0:32:51:1:0
chr1	153320334	.	T	C	555.29	PASS	AF=1;AO=36;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000255024;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=298.743;QD=60.0316;RBI=0.0156085;REFB=0;REVB=0.0156064;RO=0;SAF=17;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.74047e-05;OID=.;OPOS=153320334;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:36:37:1:19:17:0:0:19:18:0:0
chr1	153320372	.	T	G	538.5	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=8.17737e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.4094;QD=59.8334;RBI=0.0392275;REFB=0;REVB=-0.0392274;RO=0;SAF=18;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000537481;OID=.;OPOS=153320372;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:18:18:0:0:18:18:0:0
chr1	153391729	.	G	A	253.12	PASS	AF=0.432836;AO=29;DP=67;FAO=29;FDP=67;FR=.;FRO=38;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=0.00461849;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.633;QD=15.1117;RBI=0.01131;REFB=-0.000993257;REVB=-0.0103241;RO=38;SAF=20;SAR=9;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20164;STB=0.614627;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.00093211;OID=.;OPOS=153391729;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:38:38:29:29:0.432836:9:20:19:19:9:20:19:19
chr1	153391786	.	T	C	163.67	PASS	AF=0.53125;AO=17;DP=32;FAO=17;FDP=32;FR=.;FRO=15;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=-0.00187634;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.876;QD=20.4589;RBI=0.00914011;REFB=-0.0163864;REVB=-0.00894544;RO=15;SAF=10;SAR=7;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.209241;STB=0.618045;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.0116837;OID=.;OPOS=153391786;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:15:15:17:17:0.53125:7:10:5:10:7:10:5:10
chr1	153410822	.	C	A	185.4	PASS	AF=0.407407;AO=22;DP=54;FAO=22;FDP=54;FR=.;FRO=32;FSAF=5;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=-0.0324673;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.383;QD=13.7335;RBI=0.0324674;REFB=-0.00740279;REVB=6.94503e-05;RO=32;SAF=5;SAR=17;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.373458;STB=0.715908;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.00970283;OID=.;OPOS=153410822;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:32:32:22:22:0.407407:17:5:18:14:17:5:18:14
chr1	153412392	.	T	G	428.97	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0187795;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.34;QD=57.1958;RBI=0.0537973;REFB=0;REVB=0.0504131;RO=0;SAF=15;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.95715e-05;OID=.;OPOS=153412392;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:15:15:0:0:15:15:0:0
chr1	153431406	.	C	G	939.18	PASS	AF=0.984848;AO=63;DP=64;FAO=65;FDP=66;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0231905;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.089;QD=56.9202;RBI=0.0449986;REFB=-0.141102;REVB=-0.0385626;RO=0;SAF=29;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50704;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.00127028;OID=.;OPOS=153431406;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:64:66:0:1:63:65:0.984848:34:29:0:0:35:30:0:1
chr1	153588279	.	G	A	284.95	PASS	AF=0.526316;AO=25;DP=52;FAO=30;FDP=57;FR=.;FRO=27;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=0.00263132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.383;QD=19.9964;RBI=0.0962197;REFB=-0.020311;REVB=0.0961837;RO=26;SAF=13;SAR=12;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0518425;STB=0.542028;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.0218108;OID=.;OPOS=153588279;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:57:26:27:25:30:0.526316:12:13:15:11:16:14:15:12
chr1	153588340	.	C	T	151.08	PASS	AF=0.351852;AO=19;DP=54;FAO=19;FDP=54;FR=.;FRO=35;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=0.00660516;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=307.527;QD=11.1912;RBI=0.0128381;REFB=-0.0151583;REVB=-0.0110086;RO=34;SAF=10;SAR=9;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125369;STB=0.563041;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.0328723;OID=.;OPOS=153588340;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:34:35:19:19:0.351852:9:10:14:20:9:10:15:20
chr1	153604029	.	C	T	433.58	PASS	AF=0.942857;AO=30;DP=33;FAO=33;FDP=35;FR=.;FRO=2;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00262221;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.603;QD=49.5518;RBI=0.0285909;REFB=-0.000613171;REVB=0.0284704;RO=2;SAF=12;SAR=18;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0715384;STB=0.531231;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.00300595;OID=.;OPOS=153604029;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:33:35:2:2:30:33:0.942857:18:12:2:0:18:15:2:0
chr1	153653757	.	G	C	127.52	PASS	AF=0.340909;AO=15;DP=42;FAO=15;FDP=44;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=-0.0579502;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.4488;QD=11.5929;RBI=0.0789257;REFB=0.00289984;REVB=0.0535821;RO=27;SAF=12;SAR=3;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.352383;STB=0.695363;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=-0.010669;OID=.;OPOS=153653757;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:44:27:29:15:15:0.340909:3:12:14:13:3:12:16:13
chr1	153676713	.	C	A	902.7	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00470833;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.193;QD=58.2389;RBI=0.028213;REFB=0;REVB=0.0278173;RO=0;SAF=29;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.22238e-05;OID=.;OPOS=153676713;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:33:29:0:0:33:29:0:0
chr1	153743234	.	T	C	417.99	PASS	AF=0.967742;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0684434;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=225.703;QD=53.9343;RBI=0.0758969;REFB=-0.133004;REVB=0.0328;RO=1;SAF=11;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0239088;STB=0.512812;STBP=0.539;TYPE=snp;VARB=0.000870174;OID=.;OPOS=153743234;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:31:31:1:1:30:30:0.967742:19:11:0:1:19:11:0:1
chr1	153907306	.	T	C	41.11	PASS	AF=0.6;AO=6;DP=9;FAO=6;FDP=10;FR=.;FRO=4;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0913062;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.744;QD=16.445;RBI=0.0935769;REFB=-0.12006;REVB=0.0204894;RO=3;SAF=3;SAR=3;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0941184;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0873739;OID=.;OPOS=153907306;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:9:10:3:4:6:6:0.6:3:3:1:2:3:3:2:2
chr1	153913770	.	A	G	803.19	PASS	AF=0.982759;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0370953;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.8965;QD=55.3926;RBI=0.0691158;REFB=0.00504014;REVB=0.0583175;RO=1;SAF=31;SAR=26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0177934;STB=0.509431;STBP=0.334;TYPE=snp;VARB=-2.48506e-05;OID=.;OPOS=153913770;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:58:58:1:1:57:57:0.982759:26:31:0:1:26:31:0:1
chr1	153931751	.	GT	GC,G	61.61	PASS	AF=0.15,0.175;AO=4,7;DP=40;FAO=6,7;FDP=40;FR=.;FRO=27;FSAF=0,1;FSAR=6,6;FSRF=18;FSRR=9;FWDB=-0.00242511,0.0388649;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=146.842,18.1743;QD=6.16149;RBI=0.00869527,0.0671112;REFB=-0.00423436,-0.0603909;REVB=-0.00835024,-0.0547123;RO=27;SAF=0,0;SAR=4,7;SRF=18;SRR=9;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.685329,-0.761454;STB=0.998487,0.882724;STBP=0.003,0.049;TYPE=snp,del;VARB=0.0652364,0.140721;OID=.,.;OPOS=153931752,153931752;OREF=T,T;OALT=C,-;OMAPALT=GC,G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0.15,0.175:4,7:40:6,7:40:27:0,1:6,6:18:9:27:27:0,0:4,7:18:9
chr1	154089438	.	T	C	238.88	PASS	AF=0.358025;AO=29;DP=81;FAO=29;FDP=81;FR=.;FRO=52;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=27;FSRR=25;FWDB=0.00164596;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.6709;QD=11.7966;RBI=0.017233;REFB=-0.00699811;REVB=0.0171542;RO=49;SAF=13;SAR=16;SRF=25;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0678144;STB=0.545578;STBP=0.545;TYPE=snp;VARB=0.0151926;OID=.;OPOS=154089438;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:49:52:29:29:0.358025:16:13:25:24:16:13:27:25
chr1	154108387	.	G	A	923.43	PASS	AF=0.984615;AO=63;DP=64;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.023259;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.917;QD=56.8267;RBI=0.029205;REFB=0.0466727;REVB=-0.017662;RO=1;SAF=23;SAR=40;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0116608;STB=0.506022;STBP=0.555;TYPE=snp;VARB=-0.00118594;OID=.;OPOS=154108387;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:64:65:1:1:63:64:0.984615:40:23:0:1:41:23:0:1
chr1	154140080	.	T	C	89.0	PASS	AF=0.769231;AO=5;DP=13;FAO=10;FDP=13;FR=.;FRO=3;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.00963461;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.797;QD=27.3834;RBI=0.0446882;REFB=0.0281732;REVB=0.0436372;RO=2;SAF=3;SAR=2;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.281149;STB=0.562373;STBP=0.464;TYPE=snp;VARB=-0.00117611;OID=.;OPOS=154140080;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:13:13:2:3:5:10:0.769231:2:3:0:2:4:6:1:2
chr1	154144681	.	A	T	118.04	PASS	AF=0.366667;AO=6;DP=30;FAO=11;FDP=30;FR=.,HEALED;FRO=10;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=-0.022661;FXX=0.0908816;HRUN=11;LEN=1;MLLD=281.588;QD=15.7388;RBI=0.0252151;REFB=-0.013782;REVB=0.0110581;RO=9;SAF=4;SAR=2;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.41225;STB=0.624791;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=0.0121963;OID=.;OPOS=154144681;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:60:30:30:9:10:6:11:0.366667:2:4:2:7:6:5:2:8
chr1	154310048	.	C	G	1208.96	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0331069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.165;QD=61.213;RBI=0.0335953;REFB=0;REVB=0.00570745;RO=0;SAF=36;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.03362e-05;OID=.;OPOS=154310048;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:43:36:0:0:43:36:0:0
chr1	154317153	.	C	T	727.76	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0327522;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.749;QD=63.2837;RBI=0.0481377;REFB=0;REVB=0.0352779;RO=0;SAF=26;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000236458;OID=.;OPOS=154317153;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:20:26:0:0:20:26:0:0
chr1	154437896	.	T	A,C	880.96	PASS	AF=0.0483871,0.951613;AO=3,57;DP=60;FAO=3,59;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=3,36;FSAR=0,23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0133869,0.00247581;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=113.811,243.398;QD=56.8358;RBI=0.0195442,0.0105478;REFB=0,0;REVB=0.0142395,0.0102531;RO=0;SAF=3,34;SAR=0,23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0330621,-0.0013698;OID=.,.;OPOS=154437896,154437896;OREF=T,T;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:10:60:62:0:0:3,57:3,59:0.0483871,0.951613:0,23:3,34:0:0:0,23:3,36:0:0
chr1	154438770	.	A	G	736.32	PASS	AF=0.569106;AO=69;DP=123;FAO=70;FDP=123;FR=.;FRO=53;FSAF=25;FSAR=45;FSRF=24;FSRR=29;FWDB=-0.0121139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.123;QD=23.9454;RBI=0.0121298;REFB=-0.00202992;REVB=0.000621;RO=53;SAF=24;SAR=45;SRF=24;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0891711;STB=0.54376;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=0.00172489;OID=.;OPOS=154438770;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:123:123:53:53:69:70:0.569106:45:24:24:29:45:25:24:29
chr1	154438880	.	T	C	937.54	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0176536;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.529;QD=58.596;RBI=0.0456097;REFB=0;REVB=0.0420547;RO=0;SAF=26;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000154931;OID=.;OPOS=154438880;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:38:26:0:0:38:26:0:0
chr1	154474131	.	C	G	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00981492;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=237.179;QD=50.4135;RBI=0.0101862;REFB=0;REVB=-0.00272513;RO=0;SAF=13;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.851e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.04831e-05;OID=.;OPOS=154474131;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:6:13:0:0:6:13:0:0
chr1	154516571	.	T	C	316.13	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0201162;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.153;QD=52.6884;RBI=0.0210037;REFB=0;REVB=0.00604114;RO=0;SAF=3;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000480685;OID=.;OPOS=154516571;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:24:0:0:23:24:1:20:3:0:0:21:3:0:0
chr1	154516578	.	G	A	144.18	PASS	AF=0.625;AO=15;DP=24;FAO=15;FDP=24;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=8;FWDB=-0.0155223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.471;QD=24.0302;RBI=0.0194077;REFB=-0.0022924;REVB=0.0116498;RO=9;SAF=2;SAR=13;SRF=1;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0330537;STB=0.518494;STBP=0.88;TYPE=snp;VARB=0.00114817;OID=.;OPOS=154516578;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:24:24:9:9:15:15:0.625:13:2:1:8:13:2:1:8
chr1	154556663	.	G	A	167.16	PASS	AF=0.409091;AO=18;DP=44;FAO=18;FDP=44;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=0.0322034;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=256.068;QD=15.1962;RBI=0.0340529;REFB=-0.00842602;REVB=0.0110697;RO=26;SAF=8;SAR=10;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0625797;STB=0.536043;STBP=0.689;TYPE=snp;VARB=0.0110232;OID=.;OPOS=154556663;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:26:26:18:18:0.409091:10:8:10:16:10:8:10:16
chr1	154573967	.	T	C	766.46	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0359215;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=210.499;QD=63.8717;RBI=0.0376658;REFB=0;REVB=-0.0113296;RO=0;SAF=18;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.73384e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.72258e-05;OID=.;OPOS=154573967;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:30:18:0:0:30:18:0:0
chr1	154574820	.	T	C	729.01	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00149949;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.498;QD=57.1773;RBI=0.00776877;REFB=0;REVB=0.00762268;RO=0;SAF=28;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.97956e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.90638e-05;OID=.;OPOS=154574820;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:23:28:0:0:23:28:0:0
chr1	154575040	.	C	T	806.09	PASS	AF=0.871429;AO=61;DP=70;FAO=61;FDP=70;FR=.;FRO=9;FSAF=15;FSAR=46;FSRF=8;FSRR=1;FWDB=-0.0177555;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.203;QD=46.0623;RBI=0.0232872;REFB=-0.177423;REVB=0.0150678;RO=7;SAF=15;SAR=46;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146293;STB=0.600078;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00932204;OID=.;OPOS=154575040;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:42:70:70:7:9:61:61:0.871429:46:15:6:1:46:15:8:1
chr1	154580458	.	C	A	530.51	PASS	AF=0.405594;AO=58;DP=145;FAO=58;FDP=143;FR=.;FRO=85;FSAF=34;FSAR=24;FSRF=61;FSRR=24;FWDB=-0.00917435;FXX=0.0137922;HRUN=3;LEN=1;MLLD=82.2707;QD=14.8394;RBI=0.0135622;REFB=0.00413881;REVB=-0.00998824;RO=85;SAF=34;SAR=24;SRF=61;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147993;STB=0.582795;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=-0.00581054;OID=.;OPOS=154580458;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:145:143:85:85:58:58:0.405594:24:34:61:24:24:34:61:24
chr1	154600372	.	A	G	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00869797;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.596;QD=47.8223;RBI=0.0206194;REFB=0;REVB=-0.018695;RO=0;SAF=5;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.36667e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000267038;OID=.;OPOS=154600372;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:11:5:0:0:11:5:0:0
chr1	154744807	.	C	G	117.23	PASS	AF=0.358974;AO=14;DP=39;FAO=14;FDP=39;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=0.000473303;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.076;QD=12.0232;RBI=0.0258656;REFB=-0.002378;REVB=-0.0258613;RO=25;SAF=5;SAR=9;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0496186;STB=0.529369;STBP=0.787;TYPE=snp;VARB=0.00652822;OID=.;OPOS=154744807;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:25:25:14:14:0.358974:9:5:10:15:9:5:10:15
chr1	154744852	.	A	G	239.18	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0939545;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.646;QD=50.3534;RBI=0.0939674;REFB=0;REVB=0.00156184;RO=0;SAF=9;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000958169;OID=.;OPOS=154744852;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:10:9:0:0:10:9:0:0
chr1	154917314	.	G	A	868.26	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00414178;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.95;QD=57.8837;RBI=0.0107848;REFB=0;REVB=-0.00995781;RO=0;SAF=30;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.90897e-05;OID=.;OPOS=154917314;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:30:30:0:0:30:30:0:0
chr1	154919080	.	C	T	466.5	PASS	AF=0.942857;AO=33;DP=35;FAO=33;FDP=35;FR=.;FRO=2;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0133594;FXX=0.0277701;HRUN=5;LEN=1;MLLD=117.053;QD=53.3143;RBI=0.0320883;REFB=-0.101291;REVB=0.029175;RO=2;SAF=18;SAR=15;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0491206;STB=0.5263;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=0.000936332;OID=.;OPOS=154919080;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:35:35:2:2:33:33:0.942857:15:18:2:0:15:18:2:0
chr1	154936660	.	ACC	AC,ACT	155.4	PASS	AF=0.431034,0.0344828;AO=20,2;DP=57;FAO=25,2;FDP=58;FR=.;FRO=31;FSAF=19,2;FSAR=6,0;FSRF=4;FSRR=27;FWDB=-0.0206518,-0.00471885;FXX=0.0169463;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=13.0927,203.715;QD=10.7174;RBI=0.0835372,0.0259416;REFB=-0.0674044,-0.00165564;REVB=0.0809443,-0.0255089;RO=31;SAF=16,2;SAR=4,0;SRF=4;SRR=27;SSEN=0,0;SSEP=0.438095,0;SSSB=0.638265,0.706634;STB=0.819381,0.998181;STBP=0.001,0.004;TYPE=del,snp;VARB=0.105304,0.0196882;OID=.,.;OPOS=154936661,154936662;OREF=C,C;OALT=-,T;OMAPALT=AC,ACT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.431034,0.0344828:20,2:57:25,2:58:31:19,2:6,0:4:27:99:31:16,2:4,0:4:27
chr1	154987526	.	C	T	465.06	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0742962;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.2001;QD=58.133;RBI=0.111656;REFB=0;REVB=0.0833489;RO=0;SAF=16;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00307897;OID=.;OPOS=154987526;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:16:16:0:0:16:16:0:0
chr1	154988957	.	A	G	195.36	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0554958;FXX=0.0587889;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.408;QD=48.8409;RBI=0.0558582;REFB=0;REVB=-0.00635277;RO=0;SAF=4;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.07465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000268636;OID=.;OPOS=154988957;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:12:4:0:0:12:4:0:0
chr1	155006091	.	A	G	714.9	PASS	AF=0.978723;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0128669;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=222.994;QD=60.8426;RBI=0.0197955;REFB=-0.116091;REVB=0.0150434;RO=0;SAF=23;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.510634;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.000367405;OID=.;OPOS=155006091;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:47:47:0:1:46:46:0.978723:23:23:0:0:23:23:0:1
chr1	155006999	.	C	T	371.58	PASS	AF=0.965517;AO=27;DP=29;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00565339;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=35.4992;QD=51.2523;RBI=0.0508861;REFB=-0.175431;REVB=0.0505711;RO=2;SAF=13;SAR=14;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0662949;STB=0.517229;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.030389;OID=.;OPOS=155006999;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:29:29:2:1:27:28:0.965517:14:13:2:0:14:14:1:0
chr1	155019710	.	A	C	927.87	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00996644;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.909;QD=57.9919;RBI=0.0116546;REFB=0;REVB=-0.00604142;RO=0;SAF=42;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00212244;OID=.;OPOS=155019710;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:64:0:0:63:64:1:21:42:0:0:22:42:0:0
chr1	155026942	.	A	C	483.35	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0218725;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.131;QD=58.5876;RBI=0.0336086;REFB=0;REVB=0.0255172;RO=0;SAF=12;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000301297;OID=.;OPOS=155026942;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:33:0:0:32:33:1:20:12:0:0:21:12:0:0
chr1	155033317	.	T	C	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0301493;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.888;QD=55.6561;RBI=0.0395764;REFB=0;REVB=-0.025638;RO=0;SAF=12;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.3826e-05;OID=.;OPOS=155033317;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:15:12:0:0:15:12:0:0
chr1	155059851	.	A	G	271.03	PASS	AF=1;AO=21;DP=22;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.038561;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.259;QD=47.1352;RBI=0.0463112;REFB=-0.0655897;REVB=-0.0256473;RO=1;SAF=11;SAR=10;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0439301;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000736616;OID=.;OPOS=155059851;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:22:23:1:0:21:23:1:10:11:0:1:11:12:0:0
chr1	155106054	.	A	G	186.88	PASS	AF=0.5;AO=19;DP=38;FAO=19;FDP=38;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=15;FWDB=0.0199407;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.363;QD=19.6717;RBI=0.0499934;REFB=-0.0232051;REVB=-0.0458444;RO=19;SAF=8;SAR=11;SRF=4;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.19931;STB=0.611657;STBP=0.225;TYPE=snp;VARB=0.0240044;OID=.;OPOS=155106054;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:19:19:19:19:0.5:11:8:4:15:11:8:4:15
chr1	155106227	.	A	T	262.86	PASS	AF=0.483333;AO=29;DP=60;FAO=29;FDP=60;FR=.;FRO=31;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=23;FSRR=8;FWDB=0.0460481;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.371;QD=17.524;RBI=0.0798841;REFB=-0.0231573;REVB=0.0652766;RO=31;SAF=18;SAR=11;SRF=23;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123213;STB=0.568681;STBP=0.377;TYPE=snp;VARB=0.0272036;OID=.;OPOS=155106227;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:31:31:29:29:0.483333:11:18:23:8:11:18:23:8
chr1	155106697	.	G	A	199.62	PASS	AF=0.5;AO=20;DP=40;FAO=20;FDP=40;FR=.;FRO=20;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=15;FWDB=-0.0058809;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.513;QD=19.9622;RBI=0.00695909;REFB=-0.0111241;REVB=0.00372074;RO=19;SAF=13;SAR=7;SRF=5;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.327634;STB=0.693988;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.0102829;OID=.;OPOS=155106697;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:19:20:20:20:0.5:7:13:5:14:7:13:5:15
chr1	155149718	.	G	A	230.88	PASS	AF=0.55;AO=22;DP=40;FAO=22;FDP=40;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.0220787;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.525;QD=23.0877;RBI=0.0222392;REFB=-0.0205102;REVB=0.00266702;RO=18;SAF=8;SAR=14;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0686566;STB=0.538426;STBP=0.597;TYPE=snp;VARB=0.0122903;OID=.;OPOS=155149718;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:18:18:22:22:0.55:14:8:8:10:14:8:8:10
chr1	155152205	.	C	T	647.69	PASS	AF=0.503876;AO=65;DP=129;FAO=65;FDP=129;FR=.;FRO=64;FSAF=28;FSAR=37;FSRF=22;FSRR=42;FWDB=-0.0291202;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.0492;QD=20.0835;RBI=0.0390211;REFB=-0.0340423;REVB=-0.0259742;RO=63;SAF=28;SAR=37;SRF=21;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0901451;STB=0.544546;STBP=0.325;TYPE=snp;VARB=0.0295332;OID=.;OPOS=155152205;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:129:129:63:64:65:65:0.503876:37:28:21:42:37:28:22:42
chr1	155162067	.	C	T	70.23	PASS	AF=0.75;AO=8;DP=12;FAO=9;FDP=12;FR=.;FRO=3;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0142024;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=196.832;QD=23.4105;RBI=0.0199166;REFB=-0.00613443;REVB=0.0139629;RO=3;SAF=2;SAR=6;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.370397;STB=0.713774;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.00445715;OID=.;OPOS=155162067;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:12:12:3:3:8:9:0.75:6:2:3:0:7:2:3:0
chr1	155178782	.	A	T	305.46	PASS	AF=0.478261;AO=33;DP=69;FAO=33;FDP=69;FR=.;FRO=36;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=-0.000953935;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.6115;QD=17.7075;RBI=0.0144375;REFB=-0.0143318;REVB=-0.014406;RO=36;SAF=12;SAR=21;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0524755;STB=0.529394;STBP=0.651;TYPE=snp;VARB=0.0208895;OID=.;OPOS=155178782;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:36:36:33:33:0.478261:21:12:15:21:21:12:15:21
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chr1	155230131	.	C	T	185.85	PASS	AF=0.487179;AO=19;DP=39;FAO=19;FDP=39;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.000184785;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=220.638;QD=19.0617;RBI=0.00115826;REFB=-0.015918;REVB=-0.00114343;RO=20;SAF=9;SAR=10;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0214966;STB=0.512182;STBP=0.891;TYPE=snp;VARB=0.0144168;OID=.;OPOS=155230131;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:20:20:19:19:0.487179:10:9:9:11:10:9:9:11
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chr1	155260383	.	G	T	50.64	PASS	AF=0.2;AO=8;DP=40;FAO=8;FDP=40;FR=.;FRO=32;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=24;FWDB=-0.00560581;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.337;QD=5.06427;RBI=0.0109186;REFB=-0.00464951;REVB=-0.00936964;RO=32;SAF=3;SAR=5;SRF=8;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174283;STB=0.612423;STBP=0.547;TYPE=snp;VARB=0.0215314;OID=.;OPOS=155260383;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:50:40:40:32:32:8:8:0.2:5:3:8:24:5:3:8:24
chr1	155260401	.	C	T	358.26	PASS	AF=0.763158;AO=29;DP=38;FAO=29;FDP=38;FR=.;FRO=9;FSAF=7;FSAR=22;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.0114317;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.14;QD=37.7118;RBI=0.0447532;REFB=-0.0133624;REVB=0.0432686;RO=9;SAF=7;SAR=22;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.052971;STB=0.528826;STBP=0.571;TYPE=snp;VARB=0.00413683;OID=.;OPOS=155260401;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:60:38:38:9:9:29:29:0.763158:22:7:3:6:22:7:3:6
chr1	155291273	.	G	T	345.93	PASS	AF=0.45122;AO=36;DP=81;FAO=37;FDP=82;FR=.;FRO=45;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=26;FWDB=0.0133042;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.732;QD=16.8745;RBI=0.0240408;REFB=-0.00596997;REVB=-0.0200239;RO=45;SAF=19;SAR=17;SRF=19;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104005;STB=0.56464;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=0.00433997;OID=.;OPOS=155291273;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:82:45:45:36:37:0.45122:17:19:19:26:17:20:19:26
chr1	155294273	.	T	TG	112.29	PASS	AF=1;AO=5;DP=28;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0302796;FXX=0.407257;HRUN=0;LEN=1;MLLD=43.5473;QD=28.0732;RBI=0.0360637;REFB=0;REVB=0.0195891;RO=23;SAF=4;SAR=1;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.535882;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.000586397;OID=.;OPOS=155294274;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:5:28:16:16:0:10:6:0:0:3:23:4:1:7:16
chr1	155294274	.	A	C,G	362.23	PASS	AF=0.185185,0.814815;AO=5,22;DP=27;FAO=5,22;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=4,6;FSAR=1,16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00134833,0.0175296;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=39.0145,73.9338;QD=53.6636;RBI=0.0290981,0.0186969;REFB=0,0;REVB=-0.0290668,0.00650287;RO=0;SAF=4,6;SAR=1,16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-3.17051e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0752918,0.000546911;OID=.,.;OPOS=155294274,155294274;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:25:27:27:0:0:5,22:5,22:0.185185,0.814815:1,16:4,6:0:0:1,16:4,6:0:0
chr1	155306151	.	T	C	50.45	PASS	AF=0.363636;AO=5;DP=18;FAO=4;FDP=11;FR=.,HEALED;FRO=4;FSAF=2;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0452434;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.8381;QD=18.3462;RBI=0.157162;REFB=-0.118974;REVB=-0.150509;RO=8;SAF=3;SAR=2;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0255761;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.044421;OID=.;OPOS=155306151;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:25:18:11:8:4:5:4:0.363636:2:3:5:3:2:2:2:2
chr1	155408635	.	T	C	688.95	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.063923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.1386;QD=62.6317;RBI=0.122888;REFB=0;REVB=0.104954;RO=0;SAF=29;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00255988;OID=.;OPOS=155408635;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:15:29:0:0:15:29:0:0
chr1	155581311	.	T	C	44.53	PASS	AF=0.28;AO=7;DP=25;FAO=7;FDP=25;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.00850241;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=295.053;QD=7.12521;RBI=0.0100797;REFB=0.00299933;REVB=-0.00541373;RO=18;SAF=4;SAR=3;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143116;STB=0.590651;STBP=0.582;TYPE=snp;VARB=-0.00765185;OID=.;OPOS=155581311;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:25:25:18:18:7:7:0.28:3:4:8:10:3:4:8:10
chr1	155630707	.	A	G	129.31	PASS	AF=0.375;AO=15;DP=40;FAO=15;FDP=40;FR=.;FRO=25;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=18;FWDB=-0.00266568;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.004;QD=12.9306;RBI=0.0143556;REFB=-0.00273581;REVB=-0.014106;RO=24;SAF=3;SAR=12;SRF=7;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134635;STB=0.571326;STBP=0.574;TYPE=snp;VARB=0.00424898;OID=.;OPOS=155630707;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:24:25:15:15:0.375:12:3:7:17:12:3:7:18
chr1	155658085	.	T	C	202.03	PASS	AF=0.526316;AO=20;DP=38;FAO=20;FDP=38;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=17;FSRF=4;FSRR=14;FWDB=-0.00993328;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=257.881;QD=21.2663;RBI=0.0110573;REFB=-0.0126777;REVB=-0.00485741;RO=17;SAF=3;SAR=17;SRF=4;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122345;STB=0.561255;STBP=0.578;TYPE=snp;VARB=0.010732;OID=.;OPOS=155658085;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:17:18:20:20:0.526316:17:3:4:13:17:3:4:14
chr1	155721856	.	G	C	197.68	PASS	AF=0.47619;AO=20;DP=42;FAO=20;FDP=42;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=0.0099994;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.0091;QD=18.8265;RBI=0.0461225;REFB=0.00841635;REVB=0.0450255;RO=22;SAF=9;SAR=11;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170758;STB=0.596603;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=-0.00547757;OID=.;OPOS=155721856;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:22:22:20:20:0.47619:11:9:14:8:11:9:14:8
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chr1	155755097	.	G	A	747.03	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00322881;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.885;QD=63.5771;RBI=0.00687578;REFB=0;REVB=-0.00607052;RO=0;SAF=29;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.65189e-05;OID=.;OPOS=155755097;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:18:29:0:0:18:29:0:0
chr1	155837865	.	G	C	538.4	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0808067;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.768;QD=59.8219;RBI=0.0810447;REFB=0;REVB=0.00620613;RO=0;SAF=17;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000999092;OID=.;OPOS=155837865;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:19:17:0:0:19:17:0:0
chr1	155838267	.	T	C	323.45	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0588363;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.189;QD=53.9079;RBI=0.0638221;REFB=0;REVB=0.0247293;RO=0;SAF=9;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000180527;OID=.;OPOS=155838267;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:15:9:0:0:15:9:0:0
chr1	155880573	.	C	G	708.08	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0288421;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.544;QD=62.9405;RBI=0.0447681;REFB=0;REVB=0.0342391;RO=0;SAF=26;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.82833e-05;OID=.;OPOS=155880573;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:45:0:0:44:45:1:18:26:0:0:19:26:0:0
chr1	155904177	.	T	C	1268.31	PASS	AF=1;AO=82;DP=83;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00529778;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.531;QD=61.8686;RBI=0.00581433;REFB=0;REVB=0.0023958;RO=0;SAF=46;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.14462e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000641648;OID=.;OPOS=155904177;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:82:0:0:82:82:1:36:46:0:0:36:46:0:0
chr1	155912486	.	T	C	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0264962;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.0598;QD=55.6559;RBI=0.0278269;REFB=0;REVB=-0.00850207;RO=0;SAF=13;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000505857;OID=.;OPOS=155912486;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:14:13:0:0:14:13:0:0
chr1	156107534	.	C	T	220.89	PASS	AF=0.44898;AO=22;DP=49;FAO=22;FDP=49;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=18;FWDB=-0.0170086;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.252;QD=18.032;RBI=0.0173541;REFB=-0.0122;REVB=0.00344551;RO=27;SAF=8;SAR=14;SRF=9;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.032077;STB=0.518202;STBP=0.808;TYPE=snp;VARB=0.0194396;OID=.;OPOS=156107534;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:27:27:22:22:0.44898:14:8:9:18:14:8:9:18
chr1	156215899	.	G	A	713.84	PASS	AF=0.47651;AO=71;DP=149;FAO=71;FDP=149;FR=.;FRO=78;FSAF=50;FSAR=21;FSRF=41;FSRR=37;FWDB=0.00657282;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.865;QD=19.1634;RBI=0.0174454;REFB=-0.0089459;REVB=-0.0161599;RO=78;SAF=50;SAR=21;SRF=41;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.184906;STB=0.602755;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.0125544;OID=.;OPOS=156215899;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:149:149:78:78:71:71:0.47651:21:50:41:37:21:50:41:37
chr1	156220056	.	T	C	74.24	PASS	AF=0.344828;AO=10;DP=29;FAO=10;FDP=29;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.0667709;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.494;QD=10.2403;RBI=0.0697143;REFB=0.00273968;REVB=-0.0200433;RO=19;SAF=5;SAR=5;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0856821;STB=0.551622;STBP=0.687;TYPE=snp;VARB=-0.0150296;OID=.;OPOS=156220056;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:29:29:19:19:10:10:0.344828:5:5:11:8:5:5:11:8
chr1	156233189	.	C	T	126.89	PASS	AF=0.538462;AO=14;DP=26;FAO=14;FDP=26;FR=.;FRO=12;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=2;FWDB=-0.0123706;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.322;QD=19.521;RBI=0.0127452;REFB=-0.0256699;REVB=0.00306747;RO=12;SAF=9;SAR=5;SRF=10;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179781;STB=0.601134;STBP=0.328;TYPE=snp;VARB=0.0236094;OID=.;OPOS=156233189;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:26:12:12:14:14:0.538462:5:9:10:2:5:9:10:2
chr1	156263940	.	T	C	177.46	PASS	AF=0.545455;AO=18;DP=33;FAO=18;FDP=33;FR=.;FRO=15;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.00726179;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.27;QD=21.5104;RBI=0.0074251;REFB=-0.00834627;REVB=0.00154872;RO=15;SAF=11;SAR=7;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171356;STB=0.596502;STBP=0.249;TYPE=snp;VARB=0.0108382;OID=.;OPOS=156263940;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:15:15:18:18:0.545455:7:11:6:9:7:11:6:9
chr1	156264000	.	G	A	122.14	PASS	AF=0.684211;AO=13;DP=19;FAO=13;FDP=19;FR=.;FRO=6;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.0204954;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.77;QD=25.7139;RBI=0.0275181;REFB=-0.0284324;REVB=-0.0183626;RO=6;SAF=8;SAR=5;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134616;STB=0.575112;STBP=0.426;TYPE=snp;VARB=0.00726017;OID=.;OPOS=156264000;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:19:19:6:6:13:13:0.684211:5:8:5:1:5:8:5:1
chr1	156280969	.	G	A	37.14	PASS	AF=0.333333;AO=6;DP=18;FAO=6;FDP=18;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.0257347;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.0361;QD=8.2527;RBI=0.0259544;REFB=0.0528682;REVB=0.00337039;RO=12;SAF=4;SAR=2;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181968;STB=0.61499;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=-0.103042;OID=.;OPOS=156280969;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:18:18:12:12:6:6:0.333333:2:4:6:6:2:4:6:6
chr1	156280971	.	G	A	37.12	PASS	AF=0.333333;AO=6;DP=17;FAO=6;FDP=18;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.0872648;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.9085;QD=8.24817;RBI=0.0904455;REFB=0.024877;REVB=0.0237749;RO=11;SAF=4;SAR=2;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.22268;STB=0.61499;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=-0.0544365;OID=.;OPOS=156280971;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:17:18:11:12:6:6:0.333333:2:4:5:6:2:4:6:6
chr1	156351699	.	G	A	590.72	PASS	AF=0.442857;AO=62;DP=131;FAO=62;FDP=140;FR=.;FRO=78;FSAF=31;FSAR=31;FSRF=43;FSRR=35;FWDB=-0.0189526;FXX=0.0070917;HRUN=3;LEN=1;MLLD=264.656;QD=16.8776;RBI=0.0221421;REFB=-0.0343215;REVB=0.0114487;RO=69;SAF=31;SAR=31;SRF=35;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00688215;STB=0.528562;STBP=0.569;TYPE=snp;VARB=0.0391127;OID=.;OPOS=156351699;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:131:140:69:78:62:62:0.442857:31:31:35:34:31:31:43:35
chr1	156354293	.	A	C,G	1205.13	PASS	AF=0.0375,0.9625;AO=3,77;DP=80;FAO=3,77;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=1,40;FSAR=2,37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00908368,0.00448409;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=105.864,119.744;QD=60.2563;RBI=0.0280313,0.00699848;REFB=0,0;REVB=-0.0265187,0.00537323;RO=0;SAF=1,40;SAR=2,37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0568194,0.000274518;OID=.,.;OPOS=156354293,156354293;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:7:80:80:0:0:3,77:3,77:0.0375,0.9625:2,37:1,40:0:0:2,37:1,40:0:0
chr1	156354367	.	A	G	817.41	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0864161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.6249;QD=57.3622;RBI=0.0873569;REFB=0;REVB=-0.0127861;RO=0;SAF=19;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000784488;OID=.;OPOS=156354367;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:38:19:0:0:38:19:0:0
chr1	156446903	.	T	C	96.74	PASS	AF=0.387097;AO=11;DP=30;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=4;FWDB=-0.0730552;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.9139;QD=12.4823;RBI=0.0861289;REFB=-0.0051594;REVB=-0.0456193;RO=19;SAF=6;SAR=5;SRF=15;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.274192;STB=0.677161;STBP=0.17;TYPE=snp;VARB=0.0053208;OID=.;OPOS=156446903;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:30:31:19:19:11:12:0.387097:5:6:15:4:6:6:15:4
chr1	156450719	.	G	A	117.78	PASS	AF=0.368421;AO=14;DP=38;FAO=14;FDP=38;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=-0.0156586;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=143.274;QD=12.3976;RBI=0.0241703;REFB=-0.0300039;REVB=0.0184122;RO=23;SAF=6;SAR=8;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0530878;STB=0.545389;STBP=0.672;TYPE=snp;VARB=0.045545;OID=.;OPOS=156450719;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:23:24:14:14:0.368421:8:6:11:12:8:6:12:12
chr1	156450740	.	G	A	192.9	PASS	AF=0.575758;AO=19;DP=33;FAO=19;FDP=33;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.0125846;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.87;QD=23.3816;RBI=0.0128092;REFB=0.00238322;REVB=0.0023886;RO=14;SAF=8;SAR=11;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00583414;STB=0.503265;STBP=0.998;TYPE=snp;VARB=-0.00124024;OID=.;OPOS=156450740;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:14:14:19:19:0.575758:11:8:6:8:11:8:6:8
chr1	156526387	.	C	G	1453.45	PASS	AF=1;AO=92;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0317049;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.4169;QD=63.1935;RBI=0.0977491;REFB=0;REVB=-0.0924645;RO=0;SAF=54;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.09023e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000879765;OID=.;OPOS=156526387;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:92:92:0:0:92:92:1:38:54:0:0:38:54:0:0
chr1	156526444	.	T	C	1026.41	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00378639;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.093;QD=59.5018;RBI=0.0258985;REFB=0;REVB=0.0256202;RO=0;SAF=38;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.02935e-05;OID=.;OPOS=156526444;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:31:38:0:0:31:38:0:0
chr1	156532977	.	T	C	313.49	PASS	AF=0.96;AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=25;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0330622;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.1089;QD=50.1591;RBI=0.0482881;REFB=-0.18929;REVB=-0.0351942;RO=1;SAF=14;SAR=10;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0440956;STB=0.52379;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=0.00952946;OID=.;OPOS=156532977;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:25:25:1:1:24:24:0.96:10:14:0:1:10:14:0:1
chr1	156536221	.	G	C	732.7	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00832543;FXX=0.0212721;HRUN=3;LEN=1;MLLD=183.885;QD=63.7135;RBI=0.0141617;REFB=0;REVB=-0.011456;RO=0;SAF=24;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000141576;OID=.;OPOS=156536221;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:22:24:0:0:22:24:0:0
chr1	156536251	.	T	C	860.89	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0107308;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.491;QD=57.3926;RBI=0.0150452;REFB=0;REVB=0.0105456;RO=0;SAF=28;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000243141;OID=.;OPOS=156536251;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:60:0:0:58:60:1:30:28:0:0:32:28:0:0
chr1	156556321	.	G	A	625.25	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00773796;FXX=0.0232504;HRUN=3;LEN=1;MLLD=106.029;QD=59.5479;RBI=0.0213457;REFB=-0.0474982;REVB=-0.0198938;RO=0;SAF=32;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.40541e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000523558;OID=.;OPOS=156556321;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:41:42:0:0:41:42:1:9:32:0:0:9:33:0:0
chr1	156563375	.	G	A	392.45	PASS	AF=0.935484;AO=29;DP=31;FAO=29;FDP=31;FR=.;FRO=2;FSAF=28;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0138363;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=307.298;QD=50.6386;RBI=0.0321715;REFB=-0.0777306;REVB=-0.0290442;RO=1;SAF=28;SAR=1;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0163549;STB=0.658682;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.000265604;OID=.;OPOS=156563375;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:31:31:1:2:29:29:0.935484:1:28:1:0:1:28:1:1
chr1	156563726	.	A	C	1695.23	PASS	AF=1;AO=112;DP=112;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00101951;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.8401;QD=60.5441;RBI=0.00758241;REFB=0;REVB=0.00751355;RO=0;SAF=59;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.35459e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.24995e-05;OID=.;OPOS=156563726;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:112:112:0:0:112:112:1:53:59:0:0:53:59:0:0
chr1	156563813	.	G	A	731.02	PASS	AF=1;AO=43;DP=50;FAO=46;FDP=46;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=32;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0768095;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.779;QD=63.5669;RBI=0.0830367;REFB=0;REVB=0.0315499;RO=0;SAF=27;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000369466;OID=.;OPOS=156563813;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:46:0:0:43:46:1:16:27:0:0:14:32:0:0
chr1	156563852	.	C	T	692.99	PASS	AF=1;AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00772784;FXX=0.0222173;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.0123;QD=62.9994;RBI=0.011106;REFB=0;REVB=-0.00797647;RO=0;SAF=24;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.30465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000111317;OID=.;OPOS=156563852;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:44:0:0:44:44:1:20:24:0:0:20:24:0:0
chr1	156564922	.	C	T	267.4	PASS	AF=0.5;AO=29;DP=58;FAO=29;FDP=58;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=-0.0103951;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.145;QD=18.4414;RBI=0.0204745;REFB=-0.0139279;REVB=-0.0176394;RO=29;SAF=13;SAR=16;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0628569;STB=0.535085;STBP=0.623;TYPE=snp;VARB=0.00992955;OID=.;OPOS=156564922;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:29:29:29:29:0.5:16:13:11:18:16:13:11:18
chr1	156565049	.	A	AAC	260.76	PASS	AF=1;AO=20;DP=24;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00637223;FXX=0.0475964;HRUN=4;LEN=2;MLLD=308.073;QD=52.1522;RBI=0.00903779;REFB=0;REVB=0.00640908;RO=3;SAF=9;SAR=11;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13106;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000154119;OID=.;OPOS=156565050;OREF=-;OALT=AC;OMAPALT=AAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:20:24:20:20:0:10:10:0:0:4:3:9:11:3:0
chr1	156565503	.	CTTTTTTTTG	CTTTTTTT,CTTTTTTTG	60.11	PASS	AF=0,0.8;AO=3,7;DP=21;FAO=0,16;FDP=20;FR=.;FRO=4;FSAF=0,8;FSAR=0,8;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0990428,0.179937;FXX=0;HRUN=8,8;LEN=2,1;MLLD=10.5806,6.94485;QD=12.0213;RBI=0.0992957,0.197769;REFB=0.153824,0.0413141;REVB=0.00708295,0.082068;RO=7;SAF=2,1;SAR=1,6;SRF=6;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.254889,-0.597519;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=-0.011756,0.0654053;OID=.,.;OPOS=156565511,156565504;OREF=TG,T;OALT=-,-;OMAPALT=CTTTTTTT,CTTTTTTTG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,0.8:3,7:21:0,16:20:4:0,8:0,8:2:2:12:7:2,1:1,6:6:1
chr1	156595447	.	G	A	1294.32	PASS	AF=0.916667;AO=88;DP=96;FAO=88;FDP=96;FR=.;FRO=8;FSAF=69;FSAR=19;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.00209065;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=215.974;QD=53.9299;RBI=0.00291937;REFB=-0.104326;REVB=0.00203762;RO=8;SAF=69;SAR=19;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0633913;STB=0.533617;STBP=0.069;TYPE=snp;VARB=0.000555654;OID=.;OPOS=156595447;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:96:96:8:8:88:88:0.916667:19:69:4:4:19:69:4:4
chr1	156622252	.	G	A	141.33	PASS	AF=0.576923;AO=15;DP=26;FAO=15;FDP=26;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=11;FWDB=0.116454;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.4446;QD=21.7427;RBI=0.122318;REFB=-0.00240437;REVB=0.0374181;RO=11;SAF=5;SAR=10;SRF=0;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.322042;STB=0.677234;STBP=0.118;TYPE=snp;VARB=0.00843805;OID=.;OPOS=156622252;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:26:26:11:11:15:15:0.576923:10:5:0:11:10:5:0:11
chr1	156627996	.	T	C	239.09	PASS	AF=0.457627;AO=27;DP=60;FAO=27;FDP=59;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=11;FWDB=-0.0188709;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.722;QD=16.2097;RBI=0.0191998;REFB=-0.0170706;REVB=0.00353883;RO=32;SAF=11;SAR=16;SRF=21;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.235997;STB=0.632784;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=0.0228141;OID=.;OPOS=156627996;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:59:32:32:27:27:0.457627:16:11:21:11:16:11:21:11
chr1	156639636	.	G	A	213.94	PASS	AF=0.512195;AO=21;DP=41;FAO=21;FDP=41;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=-0.0158981;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=257.084;QD=20.8719;RBI=0.0219534;REFB=-0.0235811;REVB=0.0151394;RO=20;SAF=9;SAR=12;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0703917;STB=0.539531;STBP=0.643;TYPE=snp;VARB=0.019361;OID=.;OPOS=156639636;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:20:20:21:21:0.512195:12:9:7:13:12:9:7:13
chr1	156639753	.	G	A	51.55	PASS	AF=0.636364;AO=7;DP=11;FAO=7;FDP=11;FR=.;FRO=4;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0322533;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.318;QD=18.744;RBI=0.0340093;REFB=0.00608748;REVB=-0.0107869;RO=4;SAF=1;SAR=6;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120201;STB=0.571204;STBP=0.724;TYPE=snp;VARB=-0.00709776;OID=.;OPOS=156639753;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:11:11:4:4:7:7:0.636364:6:1:1:3:6:1:1:3
chr1	156640308	.	C	T	80.91	PASS	AF=0.268293;AO=11;DP=41;FAO=11;FDP=41;FR=.;FRO=30;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=0.00601554;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.546;QD=7.89374;RBI=0.0378861;REFB=0.00159134;REVB=-0.0374055;RO=26;SAF=5;SAR=6;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0961329;STB=0.533273;STBP=0.808;TYPE=snp;VARB=-0.0138806;OID=.;OPOS=156640308;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:80:41:41:26:30:11:11:0.268293:6:5:14:12:6:5:15:15
chr1	156640503	.	C	T	556.29	PASS	AF=0.442029;AO=56;DP=134;FAO=61;FDP=138;FR=.;FRO=77;FSAF=30;FSAR=31;FSRF=25;FSRR=52;FWDB=0.070777;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.8532;QD=16.1242;RBI=0.0832869;REFB=-0.0306299;REVB=0.0439014;RO=78;SAF=25;SAR=31;SRF=26;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120714;STB=0.593534;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=0.0412075;OID=.;OPOS=156640503;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:134:138:78:77:56:61:0.442029:31:25:26:52:31:30:25:52
chr1	156640678	.	G	A	118.52	PASS	AF=0.482759;AO=12;DP=29;FAO=14;FDP=29;FR=.;FRO=15;FSAF=1;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=15;FWDB=-0.11809;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.417;QD=16.3469;RBI=0.121572;REFB=0.00302975;REVB=0.0288881;RO=15;SAF=1;SAR=11;SRF=0;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.367145;STB=0.68275;STBP=0.768;TYPE=snp;VARB=-0.00205554;OID=.;OPOS=156640678;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:15:15:12:14:0.482759:11:1:0:15:13:1:0:15
chr1	156705593	.	G	C	1190.35	PASS	AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.041651;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.004;QD=61.0437;RBI=0.0440894;REFB=0;REVB=0.0144593;RO=0;SAF=39;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.5601e-05;OID=.;OPOS=156705593;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:39:39:0:0:39:39:0:0
chr1	156712605	.	C	A	205.79	PASS	AF=0.588235;AO=19;DP=33;FAO=20;FDP=34;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=-0.0619711;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=37.4009;QD=24.2106;RBI=0.0717828;REFB=-0.0480435;REVB=0.0362265;RO=14;SAF=8;SAR=11;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167309;STB=0.5999;STBP=0.151;TYPE=snp;VARB=0.0346034;OID=.;OPOS=156712605;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:34:14:14:19:20:0.588235:11:8:9:5:12:8:9:5
chr1	156713512	.	C	T	403.11	PASS	AF=0.909091;AO=31;DP=33;FAO=30;FDP=33;FR=.;FRO=3;FSAF=23;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0119846;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.3739;QD=48.8622;RBI=0.0268767;REFB=-0.0329728;REVB=0.0240567;RO=1;SAF=24;SAR=7;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0190495;STB=0.530593;STBP=0.383;TYPE=snp;VARB=0.00258848;OID=.;OPOS=156713512;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:33:33:1:3:31:30:0.909091:7:24:1:0:7:23:3:0
chr1	156752048	.	C	G	392.27	PASS	AF=0.935484;AO=29;DP=31;FAO=29;FDP=31;FR=.;FRO=2;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0038707;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.1526;QD=50.6149;RBI=0.00828866;REFB=0.00872196;REVB=-0.00732937;RO=2;SAF=15;SAR=14;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0581366;STB=0.531229;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=-0.00439227;OID=.;OPOS=156752048;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:31:31:2:2:29:29:0.935484:14:15:2:0:14:15:2:0
chr1	156760887	.	C	A	1116.96	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00166772;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.256;QD=60.3764;RBI=0.0307772;REFB=0;REVB=0.0307319;RO=0;SAF=42;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.05797e-05;OID=.;OPOS=156760887;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:32:42:0:0:32:42:0:0
chr1	156784982	.	T	C	596.4	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0634216;FXX=0.0249938;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.437;QD=61.1693;RBI=0.0637898;REFB=0;REVB=-0.00684383;RO=0;SAF=17;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000295037;OID=.;OPOS=156784982;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:22:17:0:0:22:17:0:0
chr1	156785617	.	G	A	1088.57	PASS	AF=1;AO=73;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0560129;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=244.555;QD=58.8417;RBI=0.0594894;REFB=-0.0737382;REVB=0.0200387;RO=1;SAF=44;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0106301;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000323601;OID=.;OPOS=156785617;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:74:74:1:0:73:74:1:29:44:1:0:29:45:0:0
chr1	156877457	.	T	C	786.89	PASS	AF=0.982456;AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0266202;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.9373;QD=55.2205;RBI=0.026755;REFB=0.0721266;REVB=-0.00268229;RO=1;SAF=23;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0140753;STB=0.50746;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=-0.00222274;OID=.;OPOS=156877457;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:57:57:1:1:56:56:0.982456:33:23:0:1:33:23:0:1
chr1	156883546	.	A	G	307.77	PASS	AF=0.588235;AO=30;DP=51;FAO=30;FDP=51;FR=.;FRO=21;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.0098998;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.237;QD=24.1384;RBI=0.0266585;REFB=0.000804945;REVB=0.0247522;RO=21;SAF=18;SAR=12;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0583965;STB=0.532236;STBP=0.616;TYPE=snp;VARB=-0.000184436;OID=.;OPOS=156883546;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:21:21:30:30:0.588235:12:18:11:10:12:18:11:10
chr1	156902259	.	G	A	486.74	PASS	AF=0.616438;AO=45;DP=74;FAO=45;FDP=73;FR=.;FRO=28;FSAF=17;FSAR=28;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=0.0223895;FXX=0.0135117;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.414;QD=26.6706;RBI=0.0261829;REFB=-0.00905071;REVB=-0.013574;RO=28;SAF=17;SAR=28;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0634912;STB=0.534676;STBP=0.459;TYPE=snp;VARB=0.00622978;OID=.;OPOS=156902259;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:73:28:28:45:45:0.616438:28:17:13:15:28:17:13:15
chr1	156907081	.	T	C	135.07	PASS	AF=0.46875;AO=15;DP=32;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=-0.0117309;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.438;QD=16.884;RBI=0.0248836;REFB=-0.00333233;REVB=0.021945;RO=17;SAF=5;SAR=10;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0788801;STB=0.545393;STBP=0.657;TYPE=snp;VARB=0.00292805;OID=.;OPOS=156907081;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:17:17:15:15:0.46875:10:5:7:10:10:5:7:10
chr1	156907115	.	T	C	131.56	PASS	AF=0.428571;AO=14;DP=34;FAO=15;FDP=35;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=-0.054465;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.7914;QD=15.0358;RBI=0.0694364;REFB=-0.0136988;REVB=0.0430695;RO=19;SAF=6;SAR=8;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0615432;STB=0.530081;STBP=0.797;TYPE=snp;VARB=0.0277774;OID=.;OPOS=156907115;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:35:19:20:14:15:0.428571:8:6:7:12:9:6:7:13
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chr1	157069154	.	A	G	279.35	PASS	AF=0.508475;AO=30;DP=59;FAO=30;FDP=59;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=-0.0569999;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.4583;QD=18.9388;RBI=0.0662026;REFB=0.017102;REVB=-0.033672;RO=29;SAF=9;SAR=21;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.235136;STB=0.631678;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=-0.0276362;OID=.;OPOS=157069154;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:29:29:30:30:0.508475:21:9:16:13:21:9:16:13
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chr1	157508882	.	C	T	340.72	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0318833;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.9217;QD=54.5149;RBI=0.0838435;REFB=0;REVB=0.0775447;RO=0;SAF=13;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00168837;OID=.;OPOS=157508882;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:12:13:0:0:12:13:0:0
chr1	157509025	.	C	T	750.63	PASS	AF=1;AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=8.44508e-06;FXX=0.020829;HRUN=3;LEN=1;MLLD=159.652;QD=63.8838;RBI=0.030185;REFB=0;REVB=-0.030185;RO=0;SAF=21;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000102923;OID=.;OPOS=157509025;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:47:0:0:47:47:1:26:21:0:0:26:21:0:0
chr1	157514097	.	A	G	1374.78	PASS	AF=1;AO=87;DP=87;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0310361;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.384;QD=62.49;RBI=0.0310627;REFB=0;REVB=0.00128503;RO=0;SAF=50;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.42644e-05;OID=.;OPOS=157514097;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:88:0:0:87:88:1:37:50:0:0:38:50:0:0
chr1	157557701	.	G	A	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0169618;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.075;QD=55.0979;RBI=0.0196844;REFB=0;REVB=-0.00998859;RO=0;SAF=13;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.6465e-05;OID=.;OPOS=157557701;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:13:13:0:0:13:13:0:0
chr1	157567751	.	A	G	175.66	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0049414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.4467;QD=46.8432;RBI=0.0414128;REFB=0;REVB=0.041117;RO=0;SAF=11;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000809744;OID=.;OPOS=157567751;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:15:0:0:14:15:1:3:11:0:0:4:11:0:0
chr1	157768000	.	G	C	213.46	PASS	AF=0.382353;AO=25;DP=67;FAO=26;FDP=68;FR=.;FRO=42;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=0.0018597;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.325;QD=12.5564;RBI=0.0189342;REFB=-0.0159091;REVB=0.0188426;RO=42;SAF=14;SAR=11;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0396552;STB=0.509084;STBP=0.942;TYPE=snp;VARB=0.0283685;OID=.;OPOS=157768000;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:68:42:42:25:26:0.382353:11:14:22:20:12:14:22:20
chr1	157771880	.	C	T	211.87	PASS	AF=0.458333;AO=21;DP=47;FAO=22;FDP=48;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=19;FWDB=0.0207913;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.904;QD=17.6556;RBI=0.0211195;REFB=-0.0163145;REVB=0.00370886;RO=24;SAF=14;SAR=7;SRF=7;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.345766;STB=0.692141;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.0228523;OID=.;OPOS=157771880;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:48:24:26:21:22:0.458333:7:14:7:17:8:14:7:19
chr1	157802979	.	C	T	118.35	PASS	AF=0.411765;AO=13;DP=33;FAO=14;FDP=34;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=0.0276301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.174;QD=13.9237;RBI=0.0550059;REFB=0.00714747;REVB=0.0475628;RO=20;SAF=5;SAR=8;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.016668;STB=0.526988;STBP=0.824;TYPE=snp;VARB=-0.00801503;OID=.;OPOS=157802979;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:34:20:20:13:14:0.411765:8:5:8:12:9:5:8:12
chr1	157805650	.	A	T	310.6	PASS	AF=0.584906;AO=31;DP=53;FAO=31;FDP=53;FR=.;FRO=22;FSAF=22;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.0121855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.821;QD=23.4411;RBI=0.0121886;REFB=-0.0113844;REVB=-0.00027577;RO=22;SAF=22;SAR=9;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.209297;STB=0.615921;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.00844711;OID=.;OPOS=157805650;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:22:22:31:31:0.584906:9:22:10:12:9:22:10:12
chr1	158066834	.	A	G	323.47	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0288198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.5127;QD=53.9108;RBI=0.0293714;REFB=0;REVB=0.00566533;RO=0;SAF=11;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000910831;OID=.;OPOS=158066834;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:13:11:0:0:13:11:0:0
chr1	158436299	.	T	C	313.76	PASS	AF=0.402299;AO=35;DP=88;FAO=35;FDP=87;FR=.;FRO=52;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=33;FSRR=19;FWDB=-0.0090603;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.769;QD=14.4258;RBI=0.0976773;REFB=-0.00646147;REVB=0.0972562;RO=52;SAF=19;SAR=16;SRF=33;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0984481;STB=0.555747;STBP=0.423;TYPE=snp;VARB=0.0169313;OID=.;OPOS=158436299;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:87:52:52:35:35:0.402299:16:19:33:19:16:19:33:19
chr1	158450314	.	A	G	223.54	PASS	AF=0.617647;AO=21;DP=34;FAO=21;FDP=34;FR=.;FRO=13;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=0.0433128;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.4455;QD=26.2993;RBI=0.0558751;REFB=0.0178428;REVB=-0.0352991;RO=13;SAF=10;SAR=11;SRF=3;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171611;STB=0.594814;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=-0.0101484;OID=.;OPOS=158450314;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:13:13:21:21:0.617647:11:10:3:10:11:10:3:10
chr1	158450382	.	C	T	132.35	PASS	AF=0.441176;AO=14;DP=33;FAO=15;FDP=34;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=0.00840493;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.774;QD=15.5704;RBI=0.0148393;REFB=-0.0154964;REVB=-0.0122296;RO=18;SAF=4;SAR=10;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0548562;STB=0.511096;STBP=0.948;TYPE=snp;VARB=0.0193323;OID=.;OPOS=158450382;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:34:18:19:14:15:0.441176:10:4:6:12:10:5:6:13
chr1	158517142	.	C	T	395.94	PASS	AF=0.692308;AO=35;DP=49;FAO=36;FDP=52;FR=.;FRO=16;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=0.0093344;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.429;QD=30.4571;RBI=0.010778;REFB=-0.0194911;REVB=-0.00538833;RO=14;SAF=23;SAR=12;SRF=11;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0772103;STB=0.507242;STBP=0.901;TYPE=snp;VARB=0.00732585;OID=.;OPOS=158517142;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:52:14:16:35:36:0.692308:12:23:11:3:12:24:11:5
chr1	158517353	.	G	A	66.55	PASS	AF=0.36;AO=9;DP=26;FAO=9;FDP=25;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.0166923;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.86;QD=10.6485;RBI=0.0177248;REFB=-0.0114548;REVB=0.00596113;RO=15;SAF=4;SAR=5;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160115;STB=0.575055;STBP=0.599;TYPE=snp;VARB=0.0197684;OID=.;OPOS=158517353;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:26:25:15:16:9:9:0.36:5:4:9:6:5:4:9:7
chr1	158533140	.	A	G	256.35	PASS	AF=0.533333;AO=24;DP=45;FAO=24;FDP=45;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0050508;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.2898;QD=22.7867;RBI=0.0869996;REFB=0.0259548;REVB=-0.0868529;RO=21;SAF=6;SAR=18;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.258389;STB=0.64544;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=-0.0257915;OID=.;OPOS=158533140;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:21:21:24:24:0.533333:18:6:11:10:18:6:11:10
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chr1	158582646	.	T	C	964.64	PASS	AF=0.985075;AO=66;DP=68;FAO=66;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00976788;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.764;QD=57.5903;RBI=0.0204895;REFB=0.00869143;REVB=0.0180114;RO=1;SAF=31;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0149975;STB=0.50704;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.000946215;OID=.;OPOS=158582646;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:68:67:1:1:66:66:0.985075:35:31:1:0:35:31:0:1
chr1	158584091	.	A	G	650.83	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0183672;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.353;QD=61.9837;RBI=0.0208413;REFB=0;REVB=-0.00984911;RO=0;SAF=16;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.04748e-05;OID=.;OPOS=158584091;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:26:16:0:0:26:16:0:0
chr1	158587390	.	C	A,T	1018.36	PASS	AF=0.507042,0.492958;AO=34,35;DP=70;FAO=36,35;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=25,20;FSAR=11,15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0074111,0.000696116;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=37.0323,141.178;QD=57.3726;RBI=0.0435695,0.0417939;REFB=0,0;REVB=0.0429346,-0.0417881;RO=1;SAF=25,20;SAR=9,15;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0491205,0.0301623;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0217287,0.0160408;OID=.,.;OPOS=158587390,158587390;OREF=C,C;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:70:71:1:0:34,35:36,35:0.507042,0.492958:9,15:25,20:0:1:11,15:25,20:0:0
chr1	158587858	.	G	A	266.15	PASS	AF=0.5;AO=25;DP=50;FAO=25;FDP=50;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=7;FWDB=-0.0108685;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.7923;QD=21.2921;RBI=0.070314;REFB=0.0178089;REVB=-0.069469;RO=25;SAF=13;SAR=12;SRF=18;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18081;STB=0.600892;STBP=0.189;TYPE=snp;VARB=-0.020496;OID=.;OPOS=158587858;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:25:25:25:25:0.5:12:13:18:7:12:13:18:7
chr1	158592935	.	G	A	79.41	PASS	AF=0.5;AO=10;DP=20;FAO=10;FDP=20;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.010472;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=225.984;QD=15.8821;RBI=0.0266183;REFB=0.00131004;REVB=0.0244718;RO=10;SAF=3;SAR=7;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.342855;STB=0.6996;STBP=0.111;TYPE=snp;VARB=-0.00126479;OID=.;OPOS=158592935;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:20:20:10:10:10:10:0.5:7:3:7:3:7:3:7:3
chr1	158597507	.	G	C	255.91	PASS	AF=0.441176;AO=28;DP=66;FAO=30;FDP=68;FR=.;FRO=38;FSAF=8;FSAR=22;FSRF=22;FSRR=16;FWDB=0.0174519;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.561;QD=15.0538;RBI=0.0174797;REFB=-0.0220935;REVB=-0.000985001;RO=38;SAF=7;SAR=21;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.35293;STB=0.684519;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0146538;OID=.;OPOS=158597507;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:68:38:38:28:30:0.441176:21:7:22:16:22:8:22:16
chr1	158606449	.	G	T	394.46	PASS	AF=0.403509;AO=46;DP=114;FAO=46;FDP=114;FR=.;FRO=68;FSAF=31;FSAR=15;FSRF=37;FSRR=31;FWDB=0.00371187;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=220.071;QD=13.8408;RBI=0.0372446;REFB=-0.011739;REVB=-0.0370592;RO=68;SAF=31;SAR=15;SRF=37;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146306;STB=0.582955;STBP=0.195;TYPE=snp;VARB=0.0179947;OID=.;OPOS=158606449;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:114:114:68:68:46:46:0.403509:15:31:37:31:15:31:37:31
chr1	158607935	.	T	G	261.74	PASS	AF=0.47541;AO=29;DP=61;FAO=29;FDP=61;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=0.0429478;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2555;QD=17.1632;RBI=0.0439166;REFB=0.0376752;REVB=0.00917357;RO=32;SAF=14;SAR=15;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0161125;STB=0.509044;STBP=0.862;TYPE=snp;VARB=-0.041106;OID=.;OPOS=158607935;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:32:32:29:29:0.47541:15:14:16:16:15:14:16:16
chr1	158612236	.	A	G	3906.74	PASS	AF=1;AO=246;DP=249;FAO=246;FDP=246;FR=.;FRO=0;FSAF=113;FSAR=133;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0254423;FXX=0.0120477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.968;QD=63.5242;RBI=0.0364491;REFB=-0.0516041;REVB=0.0261004;RO=1;SAF=113;SAR=133;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00357051;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000165653;OID=.;OPOS=158612236;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:249:246:1:0:246:246:1:133:113:0:1:133:113:0:0
chr1	158619728	.	A	C	1797.1	PASS	AF=0.960317;AO=91;DP=127;FAO=121;FDP=126;FR=.;FRO=5;FSAF=57;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=-0.0283156;FXX=0.0078734;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.7;QD=57.0508;RBI=0.0302555;REFB=0.00406749;REVB=0.0106594;RO=0;SAF=54;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.518794;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=-0.000131338;OID=.;OPOS=158619728;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:127:126:0:5:91:121:0.960317:37:54:0:0:64:57:0:5
chr1	158626378	.	C	T	301.51	PASS	AF=0.458333;AO=33;DP=72;FAO=33;FDP=72;FR=.;FRO=39;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=17;FWDB=0.00589202;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.079;QD=16.7506;RBI=0.0252708;REFB=0.00538801;REVB=-0.0245743;RO=39;SAF=18;SAR=15;SRF=22;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0181677;STB=0.510198;STBP=0.903;TYPE=snp;VARB=-0.00698448;OID=.;OPOS=158626378;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:39:39:33:33:0.458333:15:18:22:17:15:18:22:17
chr1	158631171	.	A	C	288.34	PASS	AF=0.349515;AO=36;DP=103;FAO=36;FDP=103;FR=.;FRO=67;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=32;FSRR=35;FWDB=0.00331696;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.779;QD=11.1978;RBI=0.0175881;REFB=-0.00620943;REVB=-0.0172725;RO=67;SAF=17;SAR=19;SRF=32;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00609966;STB=0.503513;STBP=0.962;TYPE=snp;VARB=0.012027;OID=.;OPOS=158631171;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:103:67:67:36:36:0.349515:19:17:32:35:19:17:32:35
chr1	158647495	.	A	T	632.26	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00113723;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.732;QD=61.684;RBI=0.00445281;REFB=0;REVB=0.00430514;RO=0;SAF=32;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.40541e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.03469e-05;OID=.;OPOS=158647495;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:9:32:0:0:9:32:0:0
chr1	158647522	.	A	G	171.14	PASS	AF=0.381818;AO=21;DP=55;FAO=21;FDP=55;FR=.;FRO=34;FSAF=19;FSAR=2;FSRF=22;FSRR=12;FWDB=0.000940903;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.314;QD=12.4463;RBI=0.0109956;REFB=-0.00473304;REVB=-0.0109552;RO=33;SAF=19;SAR=2;SRF=21;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.449826;STB=0.76405;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.0181249;OID=.;OPOS=158647522;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:33:34:21:21:0.381818:2:19:21:12:2:19:22:12
chr1	158655036	.	G	A	751.36	PASS	AF=1;AO=48;DP=49;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0719549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.439;QD=54.6442;RBI=0.0732851;REFB=0;REVB=-0.0138997;RO=0;SAF=25;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0024418;OID=.;OPOS=158655036;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:55:0:0:48:55:1:23:25:0:0:23:32:0:0
chr1	158656281	.	T	C	1695.28	PASS	AF=1;AO=111;DP=111;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0125377;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.051;QD=60.5457;RBI=0.0130323;REFB=0;REVB=0.00355597;RO=0;SAF=64;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.26606e-06;OID=.;OPOS=158656281;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:111:112:0:0:111:112:1:47:64:0:0:47:65:0:0
chr1	158687163	.	G	A	977.96	PASS	AF=0.985294;AO=67;DP=68;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0130613;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=268.48;QD=57.5272;RBI=0.0170147;REFB=-0.134502;REVB=0.0109042;RO=1;SAF=32;SAR=35;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0133112;STB=0.50704;STBP=0.495;TYPE=snp;VARB=-5.39289e-05;OID=.;OPOS=158687163;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:68:68:1:1:67:67:0.985294:35:32:0:1:35:32:0:1
chr1	158687224	.	G	A	216.24	PASS	AF=1;AO=15;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0757389;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.923;QD=48.0523;RBI=0.078339;REFB=0;REVB=-0.0200157;RO=0;SAF=9;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00360158;OID=.;OPOS=158687224;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:15:18:1:6:9:0:0:7:11:0:0
chr1	158735595	.	C	T	1135.23	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00483995;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.349;QD=60.5454;RBI=0.012588;REFB=0;REVB=0.0116203;RO=0;SAF=39;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6999e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.67976e-05;OID=.;OPOS=158735595;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:36:39:0:0:36:39:0:0
chr1	158735691	.	T	C	1116.83	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.030902;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.0599;QD=60.3693;RBI=0.0312205;REFB=0;REVB=0.004448;RO=0;SAF=41;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000158966;OID=.;OPOS=158735691;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:33:41:0:0:33:41:0:0
chr1	158735740	.	A	G	1098.7	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0290579;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.1156;QD=60.2026;RBI=0.0887865;REFB=0;REVB=-0.0838969;RO=0;SAF=37;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.89682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00104447;OID=.;OPOS=158735740;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:36:37:0:0:36:37:0:0
chr1	158735892	.	A	G	708.52	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0712949;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.1063;QD=62.9797;RBI=0.0742771;REFB=0;REVB=-0.0208358;RO=0;SAF=27;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000304859;OID=.;OPOS=158735892;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:18:27:0:0:18:27:0:0
chr1	158736215	.	G	A	776.44	PASS	AF=1;AO=48;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.11486;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.7465;QD=63.3825;RBI=0.116053;REFB=0;REVB=0.0165978;RO=0;SAF=29;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00126431;OID=.;OPOS=158736215;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:48:49:1:19:29:0:0:19:30:0:0
chr1	158736445	.	C	T	260.54	PASS	AF=0.509091;AO=28;DP=55;FAO=28;FDP=55;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.00933345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.506;QD=18.9487;RBI=0.0267955;REFB=-0.00794908;REVB=-0.0251174;RO=27;SAF=12;SAR=16;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0190404;STB=0.510631;STBP=0.887;TYPE=snp;VARB=0.00754958;OID=.;OPOS=158736445;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:27:27:28:28:0.509091:16:12:11:16:16:12:11:16
chr1	158813819	.	A	G	692.21	PASS	AF=0.978261;AO=42;DP=44;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.029609;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.482;QD=60.192;RBI=0.0309737;REFB=-0.0967668;REVB=-0.00909251;RO=0;SAF=22;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5102;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.000206022;OID=.;OPOS=158813819;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:44:46:0:1:42:45:0.978261:20:22:0:0:21:24:1:0
chr1	158990247	.	A	G	929.32	PASS	AF=0.970149;AO=65;DP=67;FAO=65;FDP=67;FR=.;FRO=2;FSAF=29;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00570353;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=238.563;QD=55.4817;RBI=0.0228087;REFB=-0.0912351;REVB=0.022084;RO=2;SAF=29;SAR=36;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00306939;STB=0.501625;STBP=0.878;TYPE=snp;VARB=0.00102398;OID=.;OPOS=158990247;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:67:67:2:2:65:65:0.970149:36:29:1:1:36:29:1:1
chr1	159024668	.	A	T	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0306786;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=169.44;QD=49.5991;RBI=0.0363754;REFB=0;REVB=0.0195448;RO=0;SAF=3;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.32e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000289026;OID=.;OPOS=159024668;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:15:3:0:0:15:3:0:0
chr1	159169641	.	T	C	659.14	PASS	AF=1;AO=42;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0465319;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.62;QD=61.3157;RBI=0.0495834;REFB=0;REVB=0.0171261;RO=0;SAF=26;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00352667;OID=.;OPOS=159169641;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:42:43:1:16:26:0:0:17:26:0:0
chr1	159273892	.	A	G	388.32	PASS	AF=0.534247;AO=39;DP=73;FAO=39;FDP=73;FR=.;FRO=34;FSAF=26;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=24;FWDB=0.00269662;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=248;QD=21.2776;RBI=0.00958824;REFB=-0.00271118;REVB=0.00920123;RO=34;SAF=26;SAR=13;SRF=10;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.312556;STB=0.672639;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.00236391;OID=.;OPOS=159273892;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:34:34:39:39:0.534247:13:26:10:24:13:26:10:24
chr1	159283494	.	T	C	316.32	PASS	AF=0.532258;AO=33;DP=62;FAO=33;FDP=62;FR=.;FRO=29;FSAF=25;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=-0.040375;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.6036;QD=20.4075;RBI=0.0533408;REFB=-0.0105055;REVB=-0.0348584;RO=26;SAF=25;SAR=8;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105286;STB=0.561058;STBP=0.359;TYPE=snp;VARB=0.0148584;OID=.;OPOS=159283494;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:26:29:33:33:0.532258:8:25:17:9:8:25:19:10
chr1	159283746	.	T	C	146.37	PASS	AF=0.432432;AO=16;DP=38;FAO=16;FDP=37;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=-0.0222777;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.623;QD=15.8233;RBI=0.0223298;REFB=0.00170476;REVB=-0.00152549;RO=21;SAF=8;SAR=8;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117353;STB=0.567485;STBP=0.465;TYPE=snp;VARB=-0.00163879;OID=.;OPOS=159283746;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:37:21:21:16:16:0.432432:8:8:13:8:8:8:13:8
chr1	159409734	.	G	T	666.14	PASS	AF=0.977778;AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.053814;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.4511;QD=59.2128;RBI=0.0542335;REFB=-0.0689281;REVB=0.00673173;RO=1;SAF=21;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0199884;STB=0.510633;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.00182551;OID=.;OPOS=159409734;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:45:45:1:1:44:44:0.977778:23:21:0:1:23:21:0:1
chr1	159409857	.	A	G	121.57	PASS	AF=0.4375;AO=14;DP=32;FAO=14;FDP=32;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.00698277;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.045;QD=15.1967;RBI=0.0254734;REFB=-0.00684542;REVB=-0.0244977;RO=18;SAF=7;SAR=7;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0539195;STB=0.531206;STBP=0.784;TYPE=snp;VARB=0.0139489;OID=.;OPOS=159409857;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:18:18:14:14:0.4375:7:7:8:10:7:7:8:10
chr1	159505297	.	C	T	199.78	PASS	AF=0.431373;AO=22;DP=51;FAO=22;FDP=51;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=-0.006604;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.837;QD=15.6689;RBI=0.0246061;REFB=-0.00844505;REVB=-0.0237033;RO=28;SAF=11;SAR=11;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140847;STB=0.568566;STBP=0.415;TYPE=snp;VARB=0.00862996;OID=.;OPOS=159505297;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:28:29:22:22:0.431373:11:11:18:10:11:11:18:11
chr1	159558258	.	A	G	735.45	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00484442;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.346;QD=62.5912;RBI=0.00894795;REFB=0;REVB=-0.00752312;RO=0;SAF=25;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.85991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00199922;OID=.;OPOS=159558258;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:47:0:0:46:47:1:21:25:0:0:21:26:0:0
chr1	159683438	.	C	G	1014.15	PASS	AF=0.454936;AO=106;DP=234;FAO=106;FDP=233;FR=.;FRO=127;FSAF=59;FSAR=47;FSRF=45;FSRR=82;FWDB=0.00463111;FXX=0.00427332;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.579;QD=17.4102;RBI=0.0149226;REFB=-0.0226952;REVB=0.0141858;RO=127;SAF=59;SAR=47;SRF=45;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197132;STB=0.608909;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0201125;OID=.;OPOS=159683438;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:234:233:127:127:106:106:0.454936:47:59:45:82:47:59:45:82
chr1	159824967	.	G	C	1190.2	PASS	AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0319462;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.893;QD=61.036;RBI=0.0485652;REFB=0;REVB=0.0365789;RO=0;SAF=38;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.42134e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000222316;OID=.;OPOS=159824967;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:40:38:0:0:40:38:0:0
chr1	159898100	.	A	G	542.14	PASS	AF=1;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0185954;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.333;QD=60.2372;RBI=0.0217523;REFB=0;REVB=-0.011286;RO=0;SAF=22;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.36195e-05;OID=.;OPOS=159898100;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:36:0:0:36:36:1:14:22:0:0:14:22:0:0
chr1	159923111	.	T	G	1044.38	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0126876;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.397;QD=59.6786;RBI=0.0519139;REFB=0;REVB=0.0503396;RO=0;SAF=30;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000198047;OID=.;OPOS=159923111;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:40:30:0:0:40:30:0:0
chr1	160062472	.	C	T	208.62	PASS	AF=0.76;AO=19;DP=25;FAO=19;FDP=25;FR=.;FRO=6;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.0363988;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.2425;QD=33.379;RBI=0.042039;REFB=-0.0490839;REVB=0.0210333;RO=6;SAF=6;SAR=13;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0779026;STB=0.54267;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.025317;OID=.;OPOS=160062472;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:25:25:6:6:19:19:0.76:13:6:1:5:13:6:1:5
chr1	160062727	.	A	G	566.24	PASS	AF=0.513274;AO=58;DP=113;FAO=58;FDP=113;FR=.;FRO=55;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=28;FSRR=27;FWDB=0.00353131;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.076;QD=20.0439;RBI=0.0206424;REFB=-0.00968237;REVB=-0.0203381;RO=54;SAF=30;SAR=28;SRF=27;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0150984;STB=0.503969;STBP=0.957;TYPE=snp;VARB=0.00805168;OID=.;OPOS=160062727;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:113:54:55:58:58:0.513274:28:30:27:27:28:30:28:27
chr1	160134205	.	C	T	670.26	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0288012;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.478;QD=62.3497;RBI=0.0707465;REFB=0;REVB=-0.0646186;RO=0;SAF=17;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.75441e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00023014;OID=.;OPOS=160134205;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:26:17:0:0:26:17:0:0
chr1	160136350	.	G	A	291.39	PASS	AF=0.407407;AO=33;DP=81;FAO=33;FDP=81;FR=.;FRO=48;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=31;FSRR=17;FWDB=-0.0115514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.6256;QD=14.3896;RBI=0.0411274;REFB=-0.0174648;REVB=0.0394719;RO=48;SAF=13;SAR=20;SRF=31;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.25884;STB=0.646497;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.0279502;OID=.;OPOS=160136350;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:48:48:33:33:0.407407:20:13:31:17:20:13:31:17
chr1	160141196	.	C	T	1531.69	PASS	AF=1;AO=102;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0416198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.1083;QD=59.4832;RBI=0.0418487;REFB=0;REVB=0.0043706;RO=0;SAF=58;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000684223;OID=.;OPOS=160141196;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:103:103:0:0:102:103:1:44:58:0:0:45:58:0:0
chr1	160303416	.	G	A	264.83	PASS	AF=0.529412;AO=27;DP=50;FAO=27;FDP=51;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=0.000558268;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.7;QD=20.7713;RBI=0.0196062;REFB=-0.0150008;REVB=0.0195982;RO=22;SAF=13;SAR=14;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133133;STB=0.550328;STBP=0.46;TYPE=snp;VARB=0.016728;OID=.;OPOS=160303416;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:51:22:24:27:27:0.529412:14:13:7:15:14:13:9:15
chr1	160341142	.	T	C	30.99	PASS	AF=0.5;AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0241332;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.112;QD=12.3961;RBI=0.0249158;REFB=-0.0133454;REVB=-0.00619535;RO=4;SAF=3;SAR=2;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118169;STB=0.608297;STBP=0.611;TYPE=snp;VARB=0.00739013;OID=.;OPOS=160341142;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:27:10:10:4:5:5:5:0.5:2:3:3:1:2:3:4:1
chr1	160341245	.	TCA	T,TCT	274.18	PASS	AF=0.412698,0.0793651;AO=23,8;DP=63;FAO=26,5;FDP=63;FR=.;FRO=32;FSAF=13,1;FSAR=13,4;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=-0.0263178,-0.0424696;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=169.875,102.971;QD=17.4083;RBI=0.0335634,0.0430752;REFB=-0.0188876,-0.000133333;REVB=-0.0208296,-0.00719805;RO=31;SAF=13,1;SAR=10,7;SRF=12;SRR=19;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.177777,-0.402688;STB=0.551685,0.707943;STBP=0.478,0.412;TYPE=del,snp;VARB=0.0301831,0.0163917;OID=.,.;OPOS=160341246,160341247;OREF=CA,A;OALT=-,T;OMAPALT=T,TCT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.412698,0.0793651:23,8:63:26,5:63:32:13,1:13,4:13:19:99:31:13,1:10,7:12:19
chr1	160342015	.	T	G	344.66	PASS	AF=0.5;AO=36;DP=72;FAO=36;FDP=72;FR=.;FRO=36;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=-0.00333109;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.641;QD=19.1479;RBI=0.00719657;REFB=-0.0114792;REVB=-0.00637922;RO=36;SAF=22;SAR=14;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126956;STB=0.570715;STBP=0.262;TYPE=snp;VARB=0.0167429;OID=.;OPOS=160342015;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:36:36:36:36:0.5:14:22:17:19:14:22:17:19
chr1	160516542	.	A	T	278.84	PASS	AF=0.54902;AO=28;DP=50;FAO=28;FDP=51;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=-0.0370433;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.411;QD=21.8701;RBI=0.0389586;REFB=0.00068872;REVB=-0.0120651;RO=22;SAF=9;SAR=19;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.289578;STB=0.669835;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=-0.000688312;OID=.;OPOS=160516542;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:51:22:23:28:28:0.54902:19:9:15:7:19:9:16:7
chr1	160585554	.	C	G	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0346494;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.917;QD=55.0978;RBI=0.0757207;REFB=0;REVB=0.0673279;RO=0;SAF=17;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0001393;OID=.;OPOS=160585554;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:9:17:0:0:9:17:0:0
chr1	160650913	.	A	G	514.15	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0319698;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.29;QD=57.1277;RBI=0.0776152;REFB=0;REVB=0.0707252;RO=0;SAF=20;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.48532e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00190357;OID=.;OPOS=160650913;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:36:0:0:34:36:1:14:20:0:0:16:20:0:0
chr1	160654786	.	G	A	282.96	PASS	AF=0.421053;AO=32;DP=76;FAO=32;FDP=76;FR=.;FRO=44;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=23;FSRR=21;FWDB=-0.00661565;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.772;QD=14.8927;RBI=0.0233817;REFB=-0.0126008;REVB=-0.0224262;RO=44;SAF=15;SAR=17;SRF=23;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0551546;STB=0.53123;STBP=0.682;TYPE=snp;VARB=0.0263944;OID=.;OPOS=160654786;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:44:44:32:32:0.421053:17:15:23:21:17:15:23:21
chr1	160793442	.	A	G,T	1111.99	PASS	AF=0.96,0.04;AO=71,3;DP=74;FAO=72,3;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=44,2;FSAR=28,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0078237,0.00312256;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=79.7322,210.313;QD=59.3063;RBI=0.0127706,0.00313861;REFB=0,0;REVB=-0.0100934,-0.00031693;RO=0;SAF=44,2;SAR=27,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00353577,0.0277774;OID=.,.;OPOS=160793442,160793442;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:74:75:0:0:71,3:72,3:0.96,0.04:27,1:44,2:0:0:28,1:44,2:0:0
chr1	160793560	.	A	G	766.35	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0254335;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.57;QD=63.8628;RBI=0.0278734;REFB=0;REVB=0.0114046;RO=0;SAF=26;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000241227;OID=.;OPOS=160793560;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:22:26:0:0:22:26:0:0
chr1	160793962	.	G	C	1153.29	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000246507;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.943;QD=60.6993;RBI=0.0283513;REFB=0;REVB=0.0283502;RO=0;SAF=40;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60877e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.05056e-05;OID=.;OPOS=160793962;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:36:40:0:0:36:40:0:0
chr1	160971146	.	A	G	186.82	PASS	AF=0.5;AO=19;DP=38;FAO=19;FDP=38;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=5;FWDB=-0.0185343;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.279;QD=19.6648;RBI=0.0321467;REFB=-0.00209819;REVB=-0.0262658;RO=19;SAF=8;SAR=11;SRF=14;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.273635;STB=0.6539;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=0.00331786;OID=.;OPOS=160971146;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:19:19:19:19:0.5:11:8:14:5:11:8:14:5
chr1	160990875	.	TC	CA	107.42	PASS	AF=0.382353;AO=13;DP=34;FAO=13;FDP=34;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=-0.00356669;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=122.697;QD=12.6373;RBI=0.0267729;REFB=-0.00600472;REVB=0.0265343;RO=20;SAF=8;SAR=5;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0381561;STB=0.533929;STBP=0.765;TYPE=mnp;VARB=0.0115197;OID=.;OPOS=160990875;OREF=TC;OALT=CA;OMAPALT=CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:20:21:13:13:0.382353:5:8:13:7:5:8:14:7
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chr1	161166596	.	C	T	468.11	PASS	AF=0.54878;AO=45;DP=82;FAO=45;FDP=82;FR=.;FRO=37;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=0.00522132;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=161.699;QD=22.8346;RBI=0.0234572;REFB=-0.0076727;REVB=-0.0228687;RO=37;SAF=24;SAR=21;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0384642;STB=0.521163;STBP=0.718;TYPE=snp;VARB=0.00612878;OID=.;OPOS=161166596;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:37:37:45:45:0.54878:21:24:18:19:21:24:18:19
chr1	161183516	.	C	T	391.74	PASS	AF=0.493827;AO=40;DP=81;FAO=40;FDP=81;FR=.;FRO=41;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=22;FSRR=19;FWDB=-0.0133888;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=295.805;QD=19.345;RBI=0.0137117;REFB=-0.0136592;REVB=-0.00295819;RO=41;SAF=22;SAR=18;SRF=22;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0123146;STB=0.506846;STBP=0.902;TYPE=snp;VARB=0.0128395;OID=.;OPOS=161183516;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:41:41:40:40:0.493827:18:22:22:19:18:22:22:19
chr1	161202605	.	G	A	99.96	PASS	AF=0.461538;AO=12;DP=26;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=0.00790263;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=201.573;QD=15.3789;RBI=0.00799761;REFB=-0.0174621;REVB=0.00122891;RO=14;SAF=7;SAR=5;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0574537;STB=0.533279;STBP=0.774;TYPE=snp;VARB=0.0204546;OID=.;OPOS=161202605;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:26:14:14:12:12:0.461538:5:7:9:5:5:7:9:5
chr1	161254280	.	G	C	516.63	PASS	AF=0.532609;AO=49;DP=92;FAO=49;FDP=92;FR=.;FRO=43;FSAF=30;FSAR=19;FSRF=29;FSRR=14;FWDB=-0.0263918;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.0201;QD=22.4623;RBI=0.0525999;REFB=0.00880156;REVB=-0.0454997;RO=43;SAF=30;SAR=19;SRF=29;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0564095;STB=0.531016;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=-0.00860208;OID=.;OPOS=161254280;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:43:43:49:49:0.532609:19:30:29:14:19:30:29:14
chr1	161275943	.	C	T	221.93	PASS	AF=0.490566;AO=24;DP=50;FAO=26;FDP=53;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=8;FSRR=19;FWDB=0.0652634;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=35.8305;QD=16.7498;RBI=0.0931579;REFB=-0.0227492;REVB=0.0664762;RO=26;SAF=10;SAR=14;SRF=8;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105797;STB=0.548553;STBP=0.548;TYPE=snp;VARB=0.0258994;OID=.;OPOS=161275943;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:53:26:27:24:26:0.490566:14:10:8:18:16:10:8:19
chr1	161284224	.	A	AGT	171.21	PASS	AF=0.461538;AO=18;DP=39;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=7.72782e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=265.923;QD=17.56;RBI=0.0276173;REFB=-0.0123737;REVB=-0.0276172;RO=21;SAF=7;SAR=11;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00788839;STB=0.504499;STBP=0.973;TYPE=ins;VARB=0.0136115;OID=.;OPOS=161284225;OREF=-;OALT=GT;OMAPALT=AGT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.461538:18:39:18:39:21:7:11:8:13:99:21:7:11:8:13
chr1	161333191	.	A	G	41.14	PASS	AF=0.6;AO=6;DP=10;FAO=6;FDP=10;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0491664;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=270.147;QD=16.4544;RBI=0.0545051;REFB=-0.00224205;REVB=-0.0235261;RO=4;SAF=4;SAR=2;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.279564;STB=0.66611;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=0.00294031;OID=.;OPOS=161333191;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:10:10:4:4:6:6:0.6:2:4:1:3:2:4:1:3
chr1	161337604	.	G	A	152.36	PASS	AF=0.551724;AO=16;DP=29;FAO=16;FDP=29;FR=.;FRO=13;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.0241491;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.414;QD=21.0153;RBI=0.0241498;REFB=0.00742743;REVB=0.000188871;RO=13;SAF=12;SAR=4;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1969;STB=0.612095;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=-0.00915865;OID=.;OPOS=161337604;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:13:13:16:16:0.551724:4:12:7:6:4:12:7:6
chr1	161369479	.	G	A	143.18	PASS	AF=0.4;AO=16;DP=40;FAO=16;FDP=40;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=0.00371738;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=151.224;QD=14.3177;RBI=0.00916061;REFB=-0.00928715;REVB=0.00837245;RO=23;SAF=8;SAR=8;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110759;STB=0.574908;STBP=0.462;TYPE=snp;VARB=0.00821224;OID=.;OPOS=161369479;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:23:24:16:16:0.4:8:8:14:9:8:8:15:9
chr1	161390656	.	G	A	1536.69	PASS	AF=1;AO=96;DP=97;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.008462;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.6015;QD=63.3688;RBI=0.0143767;REFB=0;REVB=0.0116225;RO=0;SAF=47;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.53995e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000808778;OID=.;OPOS=161390656;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:97:97:0:0:96:97:1:49:47:0:0:49:48:0:0
chr1	161410044	.	G	A	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0165968;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=295.906;QD=44.6898;RBI=0.0186239;REFB=0;REVB=-0.00844978;RO=0;SAF=5;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.14664e-05;OID=.;OPOS=161410044;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:8:5:0:0:8:5:0:0
chr1	161479745	.	A	G	632.06	PASS	AF=0.448052;AO=69;DP=155;FAO=69;FDP=154;FR=.;FRO=85;FSAF=30;FSAR=39;FSRF=54;FSRR=31;FWDB=0.00598585;FXX=0.0064512;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.421;QD=16.4171;RBI=0.00886416;REFB=-0.0107601;REVB=0.0065378;RO=85;SAF=30;SAR=39;SRF=54;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196889;STB=0.609344;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.0159906;OID=.;OPOS=161479745;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:155:154:85:85:69:69:0.448052:39:30:54:31:39:30:54:31
chr1	161487863	.	C	A,T	697.0	PASS	AF=0.0384615,0.942308;AO=2,49;DP=52;FAO=2,49;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=2,26;FSAR=0,23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0391678,0.0267003;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=13.3742,153.719;QD=53.6151;RBI=0.0396208,0.0272208;REFB=-0.0552463,-0.103358;REVB=-0.00597409,-0.00529793;RO=1;SAF=2,26;SAR=0,23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.697199,0.0200211;STB=0.993266,0.510634;STBP=0.227,0.343;TYPE=snp,snp;VARB=0.16258,0.000532684;OID=.,.;OPOS=161487863,161487863;OREF=C,C;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:52:52:1:1:2,49:2,49:0.0384615,0.942308:0,23:2,26:0:1:0,23:2,26:0:1
chr1	161488016	.	A	AC	440.41	PASS	AF=1;AO=5;DP=35;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0764243;FXX=0.0285633;HRUN=0;LEN=1;MLLD=94.4536;QD=51.813;RBI=0.0765003;REFB=0;REVB=0.00341123;RO=30;SAF=3;SAR=2;SRF=8;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.385052;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000120566;OID=.;OPOS=161488017;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:5:35:34:34:0:11:23:0:0:4:30:3:2:8:22
chr1	161488017	.	T	C	394.62	PASS	AF=0.857143;AO=30;DP=35;FAO=30;FDP=35;FR=.;FRO=5;FSAF=8;FSAR=22;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0238794;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=140.599;QD=45.0991;RBI=0.0239068;REFB=-0.0398039;REVB=-0.00114391;RO=4;SAF=8;SAR=22;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0629363;STB=0.557564;STBP=0.139;TYPE=snp;VARB=0.000459676;OID=.;OPOS=161488017;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:35:35:4:5:30:30:0.857143:22:8:2:2:22:8:3:2
chr1	161493623	.	G	GA,GAA	217.1	PASS	AF=1,0;AO=25,5;DP=37;FAO=37,0;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=9,0;FSAR=28,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0566557,-0.0214823;FXX=0;HRUN=7,7;LEN=1,2;MLLD=9.71606,8.81794;QD=23.4699;RBI=0.0923079,0.0476857;REFB=-0.000900511,0.000143135;REVB=-0.0728758,-0.0425727;RO=7;SAF=4,2;SAR=21,3;SRF=3;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.173136,-0.0274957;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,ins;VARB=-0.00496263,0;OID=.,.;OPOS=161493624,161493624;OREF=-,-;OALT=A,AA;OMAPALT=GA,GAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:1,0:25,5:37:37,0:37:0:9,0:28,0:0:0:3:7:4,2:21,3:3:4
chr1	161495040	.	C	T	618.71	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00636956;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.725;QD=60.3619;RBI=0.0392765;REFB=0;REVB=0.0387566;RO=0;SAF=21;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.34792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000418461;OID=.;OPOS=161495040;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:41:0:0:39:41:1:18:21:0:0:19:22:0:0
chr1	161495477	.	A	T	734.97	PASS	AF=0.981481;AO=53;DP=56;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0169587;FXX=0.0357079;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.1439;QD=54.442;RBI=0.0181708;REFB=-0.20248;REVB=0.00652527;RO=1;SAF=32;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0144976;STB=0.507689;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=-0.000133507;OID=.;OPOS=161495477;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:56:54:1:1:53:53:0.981481:21:32:1:0:21:32:1:0
chr1	161495885	.	T	C	417.02	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.015361;FXX=0.0333222;HRUN=4;LEN=1;MLLD=50.6896;QD=57.5201;RBI=0.0400007;REFB=0;REVB=-0.0369336;RO=0;SAF=15;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00334199;OID=.;OPOS=161495885;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:14:15:0:0:14:15:0:0
chr1	161500130	.	A	G	483.23	PASS	AF=0.971429;AO=33;DP=36;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0755021;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.5391;QD=55.2261;RBI=0.0760176;REFB=-0.125395;REVB=0.00883781;RO=1;SAF=20;SAR=13;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0227903;STB=0.511621;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.00488555;OID=.;OPOS=161500130;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:36:35:1:1:33:34:0.971429:13:20:1:0:13:21:1:0
chr1	161500975	.	A	G	546.7	PASS	AF=0.926829;AO=38;DP=41;FAO=38;FDP=41;FR=.;FRO=3;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0769346;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.6925;QD=53.3361;RBI=0.099353;REFB=0.0331481;REVB=-0.0628655;RO=3;SAF=17;SAR=21;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0158032;STB=0.508448;STBP=0.714;TYPE=snp;VARB=-0.0081261;OID=.;OPOS=161500975;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:41:41:3:3:38:38:0.926829:21:17:1:2:21:17:1:2
chr1	161514542	.	A	C	1283.44	PASS	AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00583391;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=352.759;QD=61.8526;RBI=0.0233515;REFB=0;REVB=-0.022611;RO=0;SAF=38;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.04629e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.91102e-06;OID=.;OPOS=161514542;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:45:38:0:0:45:38:0:0
chr1	161518214	.	T	C	102.36	PASS	AF=0.171171;AO=19;DP=111;FAO=19;FDP=111;FR=.;FRO=92;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=43;FSRR=49;FWDB=-0.0281789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.0119;QD=3.68868;RBI=0.063362;REFB=-0.00485848;REVB=0.0567512;RO=92;SAF=10;SAR=9;SRF=43;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.074557;STB=0.548672;STBP=0.666;TYPE=snp;VARB=0.0235225;OID=.;OPOS=161518214;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:111:92:92:19:19:0.171171:9:10:43:49:9:10:43:49
chr1	161518336	.	C	T	479.88	PASS	AF=0.241611;AO=71;DP=297;FAO=72;FDP=298;FR=.;FRO=226;FSAF=33;FSAR=39;FSRF=108;FSRR=118;FWDB=-0.00251607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.775;QD=6.44131;RBI=0.0220112;REFB=-0.00710722;REVB=-0.0218669;RO=225;SAF=32;SAR=39;SRF=107;SRR=118;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0316334;STB=0.514884;STBP=0.765;TYPE=snp;VARB=0.0410444;OID=.;OPOS=161518336;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:297:298:225:226:71:72:0.241611:39:32:107:118:39:33:108:118
chr1	161565604	.	G	A	79.42	PASS	AF=0.23913;AO=11;DP=46;FAO=11;FDP=46;FR=.;FRO=35;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=-0.0105495;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.201;QD=6.90587;RBI=0.0272679;REFB=-0.00938414;REVB=-0.0251445;RO=35;SAF=6;SAR=5;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106166;STB=0.566808;STBP=0.638;TYPE=snp;VARB=0.0323608;OID=.;OPOS=161565604;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:79:46:46:35:35:11:11:0.23913:5:6:16:19:5:6:16:19
chr1	161565761	.	AT	A	174.97	PASS	AF=0.941176;AO=16;DP=17;FAO=16;FDP=17;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.149917;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=20.8841;QD=41.1691;RBI=0.171128;REFB=-0.0986417;REVB=-0.0825214;RO=1;SAF=12;SAR=4;SRF=0;SRR=1;SSEN=0.347639;SSEP=0;SSSB=0.101073;STB=0.555483;STBP=0.158;TYPE=del;VARB=0.0093659;OID=.;OPOS=161565762;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.941176:16:17:16:17:1:12:4:0:1:3:1:12:4:0:1
chr1	161574654	.	G	A	1488.42	PASS	AF=0.989474;AO=94;DP=95;FAO=94;FDP=95;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=62;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00994275;FXX=0.0206164;HRUN=4;LEN=1;MLLD=180.815;QD=62.6702;RBI=0.0121265;REFB=-0.0997277;REVB=0.00694216;RO=1;SAF=32;SAR=62;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0145851;STB=0.507691;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=0.000289137;OID=.;OPOS=161574654;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:95:95:1:1:94:94:0.989474:62:32:1:0:62:32:1:0
chr1	161591542	.	G	A	130.48	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00819034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.785;QD=43.493;RBI=0.0584607;REFB=0;REVB=0.0578842;RO=0;SAF=10;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000809918;OID=.;OPOS=161591542;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:12:0:0:11:12:1:1:10:0:0:2:10:0:0
chr1	161591548	.	C	T	130.61	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.011166;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.31;QD=43.535;RBI=0.151132;REFB=0;REVB=0.150719;RO=0;SAF=9;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000546711;OID=.;OPOS=161591548;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:12:0:0:11:12:1:2:9:0:0:2:10:0:0
chr1	161600995	.	C	T	741.35	PASS	AF=1;AO=46;DP=47;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.102925;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.205;QD=57.0266;RBI=0.103484;REFB=0;REVB=0.0107404;RO=1;SAF=15;SAR=31;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0303064;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000155782;OID=.;OPOS=161600995;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:52:1:0:46:52:1:31:15:1:0:31:21:0:0
chr1	161641291	.	C	T	472.52	PASS	AF=0.444444;AO=52;DP=117;FAO=52;FDP=117;FR=.;FRO=65;FSAF=30;FSAR=22;FSRF=40;FSRR=25;FWDB=-0.000850958;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=229.308;QD=16.1545;RBI=0.0060725;REFB=-0.0111112;REVB=0.00601258;RO=65;SAF=30;SAR=22;SRF=40;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0394554;STB=0.522025;STBP=0.7;TYPE=snp;VARB=0.016173;OID=.;OPOS=161641291;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:117:117:65:65:52:52:0.444444:22:30:40:25:22:30:40:25
chr1	161643269	.	C	T	102.34	PASS	AF=0.276596;AO=13;DP=48;FAO=13;FDP=47;FR=.;FRO=34;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=0.00699765;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.478;QD=8.70965;RBI=0.0298077;REFB=-0.00253955;REVB=-0.0289747;RO=34;SAF=9;SAR=4;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.202603;STB=0.624801;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.00311939;OID=.;OPOS=161643269;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:47:34:34:13:13:0.276596:4:9:18:16:4:9:18:16
chr1	161680258	.	G	A	479.97	PASS	AF=0.485714;AO=51;DP=104;FAO=51;FDP=105;FR=.;FRO=54;FSAF=32;FSAR=19;FSRF=38;FSRR=16;FWDB=0.00579699;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.3151;QD=18.2846;RBI=0.0101509;REFB=-0.015615;REVB=0.00833282;RO=53;SAF=32;SAR=19;SRF=37;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0710495;STB=0.542841;STBP=0.43;TYPE=snp;VARB=0.011715;OID=.;OPOS=161680258;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:105:53:54:51:51:0.485714:19:32:37:16:19:32:38:16
chr1	161681780	.	A	G	242.7	PASS	AF=0.430769;AO=28;DP=65;FAO=28;FDP=65;FR=.;FRO=37;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=26;FWDB=-0.00622074;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.2885;QD=14.9354;RBI=0.0321544;REFB=0.003451;REVB=-0.0315469;RO=36;SAF=12;SAR=16;SRF=10;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157806;STB=0.577928;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=-0.00783859;OID=.;OPOS=161681780;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:36:37:28:28:0.430769:16:12:10:26:16:12:11:26
chr1	161683136	.	G	A	266.9	PASS	AF=0.510204;AO=25;DP=49;FAO=25;FDP=49;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=-0.00804382;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.088;QD=21.7874;RBI=0.0218661;REFB=-0.00348144;REVB=0.0203328;RO=24;SAF=11;SAR=14;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0528002;STB=0.529581;STBP=0.725;TYPE=snp;VARB=0.00290979;OID=.;OPOS=161683136;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:24:24:25:25:0.510204:14:11:12:12:14:11:12:12
chr1	161695639	.	G	T	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0569154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.158;QD=42.1826;RBI=0.0768935;REFB=0;REVB=0.0517034;RO=0;SAF=6;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00267929;OID=.;OPOS=161695639;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:5:6:0:0:5:6:0:0
chr1	161696088	.	T	C	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0176104;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.579;QD=37.4885;RBI=0.0221616;REFB=0;REVB=0.013454;RO=0;SAF=3;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000274292;OID=.;OPOS=161696088;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:5:3:0:0:5:3:0:0
chr1	161697072	.	G	C	293.96	PASS	AF=0.365591;AO=33;DP=92;FAO=34;FDP=93;FR=.;FRO=59;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=33;FSRR=26;FWDB=-0.0269348;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.576;QD=12.6433;RBI=0.0275321;REFB=-0.00289234;REVB=-0.00570349;RO=59;SAF=22;SAR=11;SRF=33;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12745;STB=0.558788;STBP=0.414;TYPE=snp;VARB=0.00847165;OID=.;OPOS=161697072;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:93:59:59:33:34:0.365591:11:22:33:26:12:22:33:26
chr1	161697149	.	G	T	377.03	PASS	AF=0.411215;AO=42;DP=105;FAO=44;FDP=107;FR=.;FRO=63;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=37;FSRR=26;FWDB=0.00826274;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.275;QD=14.0946;RBI=0.00915272;REFB=-0.0136908;REVB=0.00393693;RO=63;SAF=23;SAR=19;SRF=37;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0426442;STB=0.524946;STBP=0.683;TYPE=snp;VARB=0.0227435;OID=.;OPOS=161697149;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:107:63:63:42:44:0.411215:19:23:37:26:20:24:37:26
chr1	161697375	.	AGGGG	ACGGG,AGGG,AGGGA	51.75	PASS	AF=0.0194175,0.126214,0.0485437;AO=4,19,4;DP=103;FAO=2,13,5;FDP=103;FR=.;FRO=83;FSAF=0,11,5;FSAR=2,2,0;FSRF=33;FSRR=50;FWDB=-0.0828625,-0.15634,0.0389166;FXX=0;HRUN=4,4,4;LEN=1,1,1;MLLD=51.0184,15.9892,30.5599;QD=2.00975;RBI=0.085066,0.176409,0.0480089;REFB=-0.0290251,-0.126993,-0.0794886;REVB=-0.0192361,0.0817189,0.0281131;RO=63;SAF=0,19,4;SAR=4,0,0;SRF=17;SRR=46;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.410407,0.82671,0.623685;STB=0.99395,0.866137,0.998277;STBP=0.22,0.009,0.001;TYPE=snp,del,snp;VARB=0.0617346,0.122772,0.092048;OID=.,.,.;OPOS=161697376,161697376,161697379;OREF=G,G,G;OALT=C,-,A;OMAPALT=ACGGG,AGGG,AGGGA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0.0194175,0.126214,0.0485437:4,19,4:103:2,13,5:103:83:0,11,5:2,2,0:33:50:22:63:0,19,4:4,0,0:17:46
chr1	161705871	.	C	G	94.56	PASS	AF=0.611111;AO=11;DP=18;FAO=11;FDP=18;FR=.;FRO=7;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.0267056;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.2711;QD=21.0136;RBI=0.0354135;REFB=0.0410094;REVB=-0.0232577;RO=7;SAF=6;SAR=5;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.270925;STB=0.653205;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=-0.0317444;OID=.;OPOS=161705871;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:18:18:7:7:11:11:0.611111:5:6:1:6:5:6:1:6
chr1	161722204	.	C	T	144.88	PASS	AF=0.410256;AO=16;DP=40;FAO=16;FDP=39;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=6;FWDB=-0.0160532;FXX=0.0249938;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.754;QD=14.8592;RBI=0.0189309;REFB=-0.00950582;REVB=-0.0100337;RO=23;SAF=8;SAR=8;SRF=17;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.245816;STB=0.640863;STBP=0.163;TYPE=snp;VARB=0.0193443;OID=.;OPOS=161722204;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:39:23:23:16:16:0.410256:8:8:17:6:8:8:17:6
chr1	161748056	.	C	T	233.78	PASS	AF=0.724138;AO=21;DP=27;FAO=21;FDP=29;FR=.;FRO=8;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.0724294;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.657;QD=32.2459;RBI=0.126996;REFB=0.00920879;REVB=-0.104317;RO=6;SAF=8;SAR=13;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0504888;STB=0.534214;STBP=0.616;TYPE=snp;VARB=-0.00976451;OID=.;OPOS=161748056;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:27:29:6:8:21:21:0.724138:13:8:3:3:13:8:4:4
chr1	161753802	.	T	C	56.24	PASS	AF=0.219512;AO=8;DP=40;FAO=9;FDP=41;FR=.;FRO=32;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=22;FSRR=10;FWDB=-0.0025157;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.573;QD=5.48667;RBI=0.0252569;REFB=-0.0140524;REVB=-0.0251313;RO=32;SAF=3;SAR=5;SRF=22;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.36544;STB=0.683842;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=0.0487697;OID=.;OPOS=161753802;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:40:41:32:32:8:9:0.219512:5:3:22:10:5:4:22:10
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chr1	161761312	.	C	T	161.48	PASS	AF=0.344262;AO=21;DP=59;FAO=21;FDP=61;FR=.;FRO=40;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=0.00328908;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.0885;QD=10.5889;RBI=0.0295771;REFB=-0.0025344;REVB=-0.0293937;RO=38;SAF=8;SAR=13;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133986;STB=0.595485;STBP=0.27;TYPE=snp;VARB=0.00561836;OID=.;OPOS=161761312;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:61:38:40:21:21:0.344262:13:8:19:19:13:8:21:19
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chr1	161953402	.	G	A	192.95	PASS	AF=0.410714;AO=23;DP=56;FAO=23;FDP=56;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=21;FSRR=12;FWDB=-0.018949;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.049;QD=13.7822;RBI=0.0278875;REFB=-0.00863596;REVB=-0.0204608;RO=32;SAF=11;SAR=12;SRF=21;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18061;STB=0.592514;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=0.015019;OID=.;OPOS=161953402;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:32:33:23:23:0.410714:12:11:21:11:12:11:21:12
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chr1	162346511	.	C	T	225.15	PASS	AF=0.325843;AO=28;DP=89;FAO=29;FDP=89;FR=.;FRO=60;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=30;FSRR=30;FWDB=0.02513;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.444;QD=10.1192;RBI=0.0292178;REFB=-0.00658985;REVB=0.0149052;RO=57;SAF=16;SAR=12;SRF=28;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0925962;STB=0.558645;STBP=0.459;TYPE=snp;VARB=0.0113491;OID=.;OPOS=162346511;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:57:60:28:29:0.325843:12:16:28:29:12:17:30:30
chr1	162467014	.	C	G	447.6	PASS	AF=0.517647;AO=44;DP=85;FAO=44;FDP=85;FR=.;FRO=41;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=29;FSRR=12;FWDB=0.0153423;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.683;QD=21.0636;RBI=0.0198321;REFB=-0.00645993;REVB=0.0125669;RO=40;SAF=25;SAR=19;SRF=29;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141214;STB=0.569653;STBP=0.207;TYPE=snp;VARB=0.00614209;OID=.;OPOS=162467014;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:40:41:44:44:0.517647:19:25:29:11:19:25:29:12
chr1	162493009	.	C	T	93.39	PASS	AF=0.315789;AO=12;DP=38;FAO=12;FDP=38;FR=.;FRO=26;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=19;FWDB=-0.0387254;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.69;QD=9.83029;RBI=0.0387952;REFB=-0.011398;REVB=-0.00232654;RO=26;SAF=4;SAR=8;SRF=7;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0849872;STB=0.550939;STBP=0.669;TYPE=snp;VARB=0.0211504;OID=.;OPOS=162493009;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:93:38:38:26:26:12:12:0.315789:8:4:7:19:8:4:7:19
chr1	162737116	.	C	G	381.64	PASS	AF=0.506494;AO=39;DP=77;FAO=39;FDP=77;FR=.;FRO=38;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=14;FSRR=24;FWDB=-0.0191013;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.7254;QD=19.8256;RBI=0.0270937;REFB=-0.0300153;REVB=-0.0192148;RO=38;SAF=19;SAR=20;SRF=14;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106123;STB=0.558794;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.030899;OID=.;OPOS=162737116;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:38:38:39:39:0.506494:20:19:14:24:20:19:14:24
chr1	162740327	.	T	C	1596.45	PASS	AF=1;AO=107;DP=110;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0237111;FXX=0.00909008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.5313;QD=58.5855;RBI=0.0476341;REFB=0;REVB=0.0413134;RO=1;SAF=49;SAR=58;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00811353;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00085887;OID=.;OPOS=162740327;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:110:109:1:0:107:109:1:58:49:0:1:59:50:0:0
chr1	162765475	.	G	C	115.84	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000997159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.534;QD=42.1231;RBI=0.0179854;REFB=0;REVB=-0.0179577;RO=0;SAF=7;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000228276;OID=.;OPOS=162765475;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:11:0:0:10:11:1:3:7:0:0:3:8:0:0
chr1	162775267	.	C	T	88.79	PASS	AF=0.458333;AO=11;DP=24;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.00654711;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.608;QD=14.7985;RBI=0.00781901;REFB=0.0101403;REVB=0.00427462;RO=13;SAF=5;SAR=6;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0777652;STB=0.545372;STBP=0.735;TYPE=snp;VARB=-0.00778141;OID=.;OPOS=162775267;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:24:24:13:13:11:11:0.458333:6:5:7:6:6:5:7:6
chr1	163309219	.	A	T	196.94	PASS	AF=0.393443;AO=24;DP=61;FAO=24;FDP=61;FR=.;FRO=37;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=0.00396182;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=264.968;QD=12.9138;RBI=0.0111285;REFB=-0.0116018;REVB=-0.0103994;RO=37;SAF=11;SAR=13;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0298407;STB=0.517132;STBP=0.839;TYPE=snp;VARB=0.0220425;OID=.;OPOS=163309219;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:37:37:24:24:0.393443:13:11:18:19:13:11:18:19
chr1	163479278	.	G	A	302.79	PASS	AF=0.464789;AO=33;DP=71;FAO=33;FDP=71;FR=.;FRO=38;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=-0.0133031;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.574;QD=17.0586;RBI=0.0179441;REFB=-0.0105972;REVB=0.0120424;RO=38;SAF=16;SAR=17;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0395393;STB=0.522171;STBP=0.757;TYPE=snp;VARB=0.0110047;OID=.;OPOS=163479278;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:38:38:33:33:0.464789:17:16:20:18:17:16:20:18
chr1	164529120	.	G	A	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0161958;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.555;QD=45.8066;RBI=0.0233307;REFB=0;REVB=-0.0167934;RO=0;SAF=7;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.12119e-06;OID=.;OPOS=164529120;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:7:7:0:0:7:7:0:0
chr1	164608825	.	G	A	902.71	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0133371;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.231;QD=58.2392;RBI=0.0150708;REFB=0;REVB=0.00701789;RO=0;SAF=19;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.65436e-05;OID=.;OPOS=164608825;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:62:0:0:61:62:1:42:19:0:0:43:19:0:0
chr1	165173216	.	A	G	1098.51	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0270281;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.8041;QD=60.1926;RBI=0.0458257;REFB=0;REVB=0.0370064;RO=0;SAF=54;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.93415e-05;OID=.;OPOS=165173216;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:19:54:0:0:19:54:0:0
chr1	165218792	.	G	A	305.5	PASS	AF=0.478261;AO=33;DP=69;FAO=33;FDP=69;FR=.;FRO=36;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=23;FSRR=13;FWDB=-0.00841761;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.4162;QD=17.71;RBI=0.036744;REFB=0.0338176;REVB=0.0357668;RO=36;SAF=18;SAR=15;SRF=23;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0887887;STB=0.549568;STBP=0.449;TYPE=snp;VARB=-0.0359574;OID=.;OPOS=165218792;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:36:36:33:33:0.478261:15:18:23:13:15:18:23:13
chr1	165377552	.	G	A	393.29	PASS	AF=0.557143;AO=39;DP=70;FAO=39;FDP=70;FR=.;FRO=31;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=-0.0289613;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.3403;QD=22.4738;RBI=0.040097;REFB=0.00023404;REVB=-0.027731;RO=31;SAF=20;SAR=19;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0286266;STB=0.515766;STBP=0.8;TYPE=snp;VARB=-0.00111099;OID=.;OPOS=165377552;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:31:31:39:39:0.557143:19:20:17:14:19:20:17:14
chr1	165533005	.	C	A	488.78	PASS	AF=1;AO=33;DP=34;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.029284;FXX=0.0294031;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.397;QD=59.2466;RBI=0.0405721;REFB=0;REVB=0.028081;RO=0;SAF=7;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.44409e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000451287;OID=.;OPOS=165533005;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:33:0:0:33:33:1:26:7:0:0:26:7:0:0
chr1	165601466	.	G	A	769.51	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00710346;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=312.767;QD=57.0008;RBI=0.00714655;REFB=0;REVB=0.000783587;RO=0;SAF=22;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.64875e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.97355e-06;OID=.;OPOS=165601466;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:32:22:0:0:32:22:0:0
chr1	165630698	.	A	G	501.65	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0413958;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.3862;QD=59.0173;RBI=0.0457835;REFB=0;REVB=-0.019558;RO=0;SAF=18;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000342674;OID=.;OPOS=165630698;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:16:18:0:0:16:18:0:0
chr1	165652273	.	A	G	651.18	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00268805;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.4351;QD=62.0171;RBI=0.104829;REFB=0;REVB=-0.104794;RO=0;SAF=22;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00157182;OID=.;OPOS=165652273;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:20:22:0:0:20:22:0:0
chr1	165737704	.	C	G	427.64	PASS	AF=0.939394;AO=31;DP=33;FAO=31;FDP=33;FR=.;FRO=2;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00773111;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=277.846;QD=51.8346;RBI=0.0184445;REFB=-0.0476676;REVB=0.016746;RO=1;SAF=18;SAR=13;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0345339;STB=0.505007;STBP=0.86;TYPE=snp;VARB=0.000791191;OID=.;OPOS=165737704;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:33:33:1:2:31:31:0.939394:13:18:0:1:13:18:1:1
chr1	166039898	.	C	G	660.35	PASS	AF=0.458904;AO=67;DP=145;FAO=67;FDP=146;FR=.;FRO=79;FSAF=36;FSAR=31;FSRF=47;FSRR=32;FWDB=-0.00566069;FXX=0.0135126;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.681;QD=18.0918;RBI=0.0203203;REFB=-0.0241758;REVB=-0.0195159;RO=76;SAF=36;SAR=31;SRF=46;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.065907;STB=0.531492;STBP=0.483;TYPE=snp;VARB=0.03097;OID=.;OPOS=166039898;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:145:146:76:79:67:67:0.458904:31:36:46:30:31:36:47:32
chr1	166818566	.	A	G	781.88	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00353913;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.241;QD=63.8271;RBI=0.0259476;REFB=0;REVB=0.0257052;RO=0;SAF=21;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.46654e-05;OID=.;OPOS=166818566;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:49:0:0:47:49:1:26:21:0:0:27:22:0:0
chr1	166825797	.	A	ACAGATCCAG	484.8	PASS	AF=0.666667;AO=43;DP=66;FAO=44;FDP=66;FR=.;FRO=22;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=-0.00380233;FXX=0;HRUN=1;LEN=9;MLLD=282.126;QD=29.3818;RBI=0.00389881;REFB=-0.00344299;REVB=-0.000861969;RO=22;SAF=19;SAR=24;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148668;STB=0.582953;STBP=0.064;TYPE=ins;VARB=0.00127294;OID=.;OPOS=166825798;OREF=-;OALT=CAGATCCAG;OMAPALT=ACAGATCCAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.666667:43:66:44:66:22:19:25:15:7:99:22:19:24:15:7
chr1	166927234	.	G	C	585.14	PASS	AF=0.504202;AO=60;DP=120;FAO=60;FDP=119;FR=.;FRO=59;FSAF=28;FSAR=32;FSRF=39;FSRR=20;FWDB=-0.0378514;FXX=0.00833264;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.042;QD=19.6686;RBI=0.0378556;REFB=-0.00708457;REVB=0.000564004;RO=60;SAF=28;SAR=32;SRF=39;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165041;STB=0.595524;STBP=0.056;TYPE=snp;VARB=0.00544831;OID=.;OPOS=166927234;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:119:60:59:60:60:0.504202:32:28:39:21:32:28:39:20
chr1	167095163	.	G	C	2043.21	PASS	AF=0.992481;AO=132;DP=133;FAO=132;FDP=133;FR=.;FRO=1;FSAF=66;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00723751;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.8843;QD=61.4498;RBI=0.0558213;REFB=-0.0161186;REVB=0.0553502;RO=1;SAF=66;SAR=66;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00714737;STB=0.503759;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.000296907;OID=.;OPOS=167095163;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:133:133:1:1:132:132:0.992481:66:66:0:1:66:66:0:1
chr1	167095691	.	G	A	322.25	PASS	AF=0.592593;AO=31;DP=53;FAO=32;FDP=54;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=24;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.00594836;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.228;QD=23.8702;RBI=0.0269016;REFB=-0.0356349;REVB=0.0262357;RO=22;SAF=8;SAR=23;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.27671;STB=0.656146;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.01818;OID=.;OPOS=167095691;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:54:22:22:31:32:0.592593:23:8:13:9:24:8:13:9
chr1	167095765	.	G	A	1050.69	PASS	AF=1;AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0168746;FXX=0.0277739;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.64;QD=60.0396;RBI=0.0196302;REFB=0;REVB=0.0100295;RO=0;SAF=37;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000162608;OID=.;OPOS=167095765;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:70:0:0:70:70:1:33:37:0:0:33:37:0:0
chr1	167095881	.	G	A	1192.98	PASS	AF=0.953488;AO=79;DP=86;FAO=82;FDP=86;FR=.;FRO=4;FSAF=30;FSAR=52;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0422356;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.248;QD=55.4874;RBI=0.0562939;REFB=-0.162376;REVB=0.0372176;RO=2;SAF=29;SAR=50;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00666958;STB=0.519052;STBP=0.149;TYPE=snp;VARB=0.00346305;OID=.;OPOS=167095881;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:86:86:2:4:79:82:0.953488:50:29:1:1:52:30:3:1
chr1	167097739	.	C	A	160.53	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00771348;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.037;QD=45.8669;RBI=0.0469361;REFB=0;REVB=0.0462979;RO=0;SAF=8;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00061637;OID=.;OPOS=167097739;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:14:0:0:13:14:1:5:8:0:0:6:8:0:0
chr1	167510996	.	G	A	632.18	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0425715;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.5707;QD=61.6758;RBI=0.0435683;REFB=0;REVB=-0.00926629;RO=0;SAF=19;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000504436;OID=.;OPOS=167510996;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:41:0:0:40:41:1:21:19:0:0:22:19:0:0
chr1	167793719	.	G	A	66.83	PASS	AF=0.428571;AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.0465344;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.23;QD=12.7297;RBI=0.0466214;REFB=-0.0313686;REVB=-0.00284675;RO=12;SAF=3;SAR=6;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16722;STB=0.599771;STBP=0.453;TYPE=snp;VARB=0.0359046;OID=.;OPOS=167793719;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:21:21:12:12:9:9:0.428571:6:3:6:6:6:3:6:6
chr1	167802253	.	G	T	190.92	PASS	AF=0.363636;AO=24;DP=66;FAO=24;FDP=66;FR=.;FRO=42;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=-0.00497234;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.603;QD=11.5708;RBI=0.0124138;REFB=-0.00785483;REVB=0.0113745;RO=42;SAF=10;SAR=14;SRF=21;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.092401;STB=0.553527;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.0119904;OID=.;OPOS=167802253;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:42:42:24:24:0.363636:14:10:21:21:14:10:21:21
chr1	167817639	.	A	G	958.47	PASS	AF=1;AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00571631;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.663;QD=58.9827;RBI=0.0100355;REFB=0;REVB=0.00824838;RO=0;SAF=39;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.10038e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.42331e-05;OID=.;OPOS=167817639;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:65:0:0:65:65:1:26:39:0:0:26:39:0:0
chr1	167906239	.	A	C	1931.47	PASS	AF=1;AO=122;DP=126;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00108285;FXX=0.00793588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.528;QD=61.8071;RBI=0.0254492;REFB=0;REVB=0.0254262;RO=0;SAF=68;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.72266e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000142266;OID=.;OPOS=167906239;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:126:125:0:0:122:125:1:54:68:0:0:54:71:0:0
chr1	168511284	.	T	C	90.76	PASS	AF=0.266667;AO=12;DP=45;FAO=12;FDP=45;FR=.;FRO=33;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=24;FSRR=9;FWDB=-0.00320267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.947;QD=8.06779;RBI=0.0146023;REFB=0.00226169;REVB=-0.0142467;RO=31;SAF=7;SAR=5;SRF=22;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159385;STB=0.612476;STBP=0.402;TYPE=snp;VARB=-0.0078853;OID=.;OPOS=168511284;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:90:45:45:31:33:12:12:0.266667:5:7:22:9:5:7:24:9
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chr1	168545949	.	G	A	564.0	PASS	AF=0.554455;AO=55;DP=100;FAO=56;FDP=101;FR=.;FRO=45;FSAF=33;FSAR=23;FSRF=18;FSRR=27;FWDB=0.00190317;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.364;QD=22.3368;RBI=0.0056933;REFB=-0.0158272;REVB=0.00536578;RO=45;SAF=32;SAR=23;SRF=18;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149112;STB=0.584454;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.0154235;OID=.;OPOS=168545949;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:101:45:45:55:56:0.554455:23:32:18:27:23:33:18:27
chr1	169101935	.	C	T	304.08	PASS	AF=0.516129;AO=32;DP=63;FAO=32;FDP=62;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=7;FSRR=23;FWDB=0.00710535;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.25;QD=19.6181;RBI=0.0140989;REFB=0.000877972;REVB=-0.0121775;RO=29;SAF=11;SAR=21;SRF=6;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136753;STB=0.561448;STBP=0.39;TYPE=snp;VARB=-0.000626513;OID=.;OPOS=169101935;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:62:29:30:32:32:0.516129:21:11:6:23:21:11:7:23
chr1	169272451	.	A	T	1511.08	PASS	AF=1;AO=102;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0297342;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=167.39;QD=58.6828;RBI=0.0297353;REFB=-0.0836078;REVB=-0.000253335;RO=0;SAF=40;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000154101;OID=.;OPOS=169272451;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:103:103:0:0:102:103:1:62:40:0:0:62:41:0:0
chr1	169272453	.	G	A	1532.41	PASS	AF=1;AO=102;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0315154;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.2597;QD=59.511;RBI=0.0316592;REFB=0;REVB=0.00301395;RO=0;SAF=41;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.18616e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.84556e-05;OID=.;OPOS=169272453;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:103:103:0:0:102:103:1:61:41:0:0:62:41:0:0
chr1	169345868	.	A	G	178.88	PASS	AF=0.404255;AO=19;DP=47;FAO=19;FDP=47;FR=.;FRO=28;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=19;FWDB=0.0141351;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.0713;QD=15.2239;RBI=0.0256523;REFB=-0.0015108;REVB=0.0214065;RO=28;SAF=8;SAR=11;SRF=9;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108024;STB=0.561998;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.00410098;OID=.;OPOS=169345868;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:28:28:19:19:0.404255:11:8:9:19:11:8:9:19
chr1	169366516	.	G	A	585.83	PASS	AF=0.349057;AO=63;DP=204;FAO=74;FDP=212;FR=.;FRO=138;FSAF=29;FSAR=45;FSRF=58;FSRR=80;FWDB=0.0286143;FXX=0.0139528;HRUN=1;LEN=1;MLLD=298.354;QD=11.0535;RBI=0.0336883;REFB=-0.00761549;REVB=0.01778;RO=137;SAF=22;SAR=41;SRF=59;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10197;STB=0.519226;STBP=0.68;TYPE=snp;VARB=0.0126653;OID=.;OPOS=169366516;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:204:212:137:138:63:74:0.349057:41:22:59:78:45:29:58:80
chr1	169391135	.	G	A	469.84	PASS	AF=0.542169;AO=45;DP=84;FAO=45;FDP=83;FR=.;FRO=38;FSAF=27;FSAR=18;FSRF=27;FSRR=11;FWDB=-0.00138734;FXX=0.0235266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.015;QD=22.6428;RBI=0.0102492;REFB=-0.00538827;REVB=-0.0101549;RO=37;SAF=27;SAR=18;SRF=26;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0896678;STB=0.553823;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=0.00281655;OID=.;OPOS=169391135;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:83:37:38:45:45:0.542169:18:27:26:11:18:27:27:11
chr1	169391154	.	A	G	1452.47	PASS	AF=0.971429;AO=100;DP=104;FAO=102;FDP=105;FR=.;FRO=3;FSAF=66;FSAR=36;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.000818314;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=192.945;QD=55.3323;RBI=0.00637721;REFB=0.00854953;REVB=-0.00632449;RO=4;SAF=64;SAR=36;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00872308;STB=0.500613;STBP=0.954;TYPE=snp;VARB=-4.24692e-05;OID=.;OPOS=169391154;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:104:105:4:3:100:102:0.971429:36:64:3:1:36:66:2:1
chr1	169435027	.	C	T	575.8	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00802321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.905;QD=60.6101;RBI=0.0315185;REFB=0;REVB=-0.0304802;RO=0;SAF=15;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000203131;OID=.;OPOS=169435027;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:23:15:0:0:23:15:0:0
chr1	169438025	.	A	G	244.0	PASS	AF=0.5;AO=26;DP=52;FAO=26;FDP=52;FR=.;FRO=26;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=0.0541983;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.3934;QD=18.7691;RBI=0.0559775;REFB=-0.00640935;REVB=-0.014001;RO=26;SAF=16;SAR=10;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17285;STB=0.59694;STBP=0.188;TYPE=snp;VARB=0.00712643;OID=.;OPOS=169438025;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:26:26:26:26:0.5:10:16:11:15:10:16:11:15
chr1	169510139	.	G	A	81.36	PASS	AF=0.255814;AO=11;DP=42;FAO=11;FDP=43;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=29;FSRR=3;FWDB=0.0142715;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.982;QD=7.56798;RBI=0.0166891;REFB=-0.00928537;REVB=-0.0086516;RO=31;SAF=10;SAR=1;SRF=28;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0205017;STB=0.506317;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0214392;OID=.;OPOS=169510139;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:81:42:43:31:32:11:11:0.255814:1:10:28:3:1:10:29:3
chr1	169510475	.	G	T	52.7	PASS	AF=0.258065;AO=8;DP=31;FAO=8;FDP=31;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=17;FWDB=0.00209586;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=155.143;QD=6.79996;RBI=0.0338558;REFB=-0.00819371;REVB=-0.0337908;RO=23;SAF=5;SAR=3;SRF=6;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.408334;STB=0.751342;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=0.0192032;OID=.;OPOS=169510475;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:31:31:23:23:8:8:0.258065:3:5:6:17:3:5:6:17
chr1	169519049	.	T	C	771.42	PASS	AF=1;AO=54;DP=55;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0121453;FXX=0.0181785;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.427;QD=57.1424;RBI=0.0252267;REFB=0;REVB=0.0221105;RO=0;SAF=24;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000101658;OID=.;OPOS=169519049;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:54:0:0:54:54:1:30:24:0:0:30:24:0:0
chr1	169519112	.	C	T	290.05	PASS	AF=0.444444;AO=32;DP=74;FAO=32;FDP=72;FR=.;FRO=40;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=-0.00816187;FXX=0.0270234;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.18;QD=16.1141;RBI=0.0155069;REFB=-0.00834691;REVB=0.0131851;RO=42;SAF=17;SAR=15;SRF=21;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0314327;STB=0.503482;STBP=0.976;TYPE=snp;VARB=0.0104609;OID=.;OPOS=169519112;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:72:42:40:32:32:0.444444:15:17:21:21:15:17:21:19
chr1	169521849	.	T	C	413.32	PASS	AF=0.454545;AO=44;DP=99;FAO=45;FDP=99;FR=.;FRO=54;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=31;FSRR=23;FWDB=0.0633663;FXX=0.0198;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.831;QD=16.7;RBI=0.0642617;REFB=0.00853374;REVB=0.01069;RO=55;SAF=20;SAR=24;SRF=32;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125701;STB=0.558363;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=-0.00947698;OID=.;OPOS=169521849;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:55:54:44:45:0.454545:24:20:32:23:24:21:31:23
chr1	169551682	.	T	C	257.99	PASS	AF=0.320755;AO=33;DP=105;FAO=34;FDP=106;FR=.;FRO=72;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=34;FSRR=38;FWDB=0.0211498;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.198;QD=9.7355;RBI=0.0289709;REFB=-0.00656583;REVB=0.019799;RO=71;SAF=19;SAR=14;SRF=34;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11356;STB=0.558789;STBP=0.418;TYPE=snp;VARB=0.0213522;OID=.;OPOS=169551682;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:106:71:72:33:34:0.320755:14:19:34:37:15:19:34:38
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chr1	169580885	.	C	T	106.58	PASS	AF=0.342105;AO=13;DP=38;FAO=13;FDP=38;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=-0.0058905;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.1666;QD=11.2189;RBI=0.0138593;REFB=-0.00376679;REVB=-0.0125452;RO=25;SAF=5;SAR=8;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.276413;STB=0.663788;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=0.00748018;OID=.;OPOS=169580885;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:25:25:13:13:0.342105:8:5:16:9:8:5:16:9
chr1	169702705	.	G	A	230.8	PASS	AF=0.480769;AO=25;DP=52;FAO=25;FDP=52;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=-0.0093008;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.4478;QD=17.7534;RBI=0.0488742;REFB=-0.0110974;REVB=-0.047981;RO=27;SAF=12;SAR=13;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.069568;STB=0.539139;STBP=0.626;TYPE=snp;VARB=0.0142109;OID=.;OPOS=169702705;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:27:27:25:25:0.480769:13:12:15:12:13:12:15:12
chr1	169762807	.	T	G	52.88	PASS	AF=0.266667;AO=8;DP=29;FAO=8;FDP=30;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.00604764;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.68;QD=7.05046;RBI=0.00810655;REFB=-0.0163384;REVB=-0.00539834;RO=21;SAF=6;SAR=2;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.229673;STB=0.666222;STBP=0.355;TYPE=snp;VARB=0.0592546;OID=.;OPOS=169762807;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:29:30:21:22:8:8:0.266667:2:6:12:9:2:6:12:10
chr1	169768033	.	T	C	375.64	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000795865;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.791;QD=55.6508;RBI=0.0727443;REFB=0;REVB=0.0727399;RO=0;SAF=17;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00103013;OID=.;OPOS=169768033;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:10:17:0:0:10:17:0:0
chr1	169768080	.	C	A	728.01	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0149912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=321.199;QD=63.3048;RBI=0.0250988;REFB=0;REVB=0.0201299;RO=0;SAF=24;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.30465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.81416e-06;OID=.;OPOS=169768080;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:46:0:0:44:46:1:20:24:0:0:22:24:0:0
chr1	169795276	.	A	C	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.055526;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=246.004;QD=37.4885;RBI=0.0607077;REFB=0;REVB=-0.0245415;RO=0;SAF=2;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.58669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000571824;OID=.;OPOS=169795276;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:6:2:0:0:6:2:0:0
chr1	169821135	.	C	T	132.43	PASS	AF=0.416667;AO=14;DP=35;FAO=15;FDP=36;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=-0.0191658;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.268;QD=14.7141;RBI=0.0191661;REFB=-0.00208971;REVB=-0.000107305;RO=20;SAF=6;SAR=8;SRF=6;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136269;STB=0.578846;STBP=0.458;TYPE=snp;VARB=0.00313503;OID=.;OPOS=169821135;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:36:20:21:14:15:0.416667:8:6:6:14:8:7:7:14
chr1	169823718	.	T	C	1371.85	PASS	AF=0.978261;AO=89;DP=93;FAO=90;FDP=92;FR=.;FRO=2;FSAF=45;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0145152;FXX=0.0107515;HRUN=4;LEN=1;MLLD=91.9025;QD=59.6455;RBI=0.0157515;REFB=0.0668039;REVB=0.00611726;RO=2;SAF=44;SAR=45;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000233955;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00028554;OID=.;OPOS=169823718;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:93:92:2:2:89:90:0.978261:45:44:1:1:45:45:1:1
chr1	169890923	.	CTAAAAAAGAA	ACTAAAAAGAG,CTAAAAAAGAG,GAACAAAAGAG	328.42	PASS	AF=0.08,0.92,0;AO=2,8,2;DP=24;FAO=2,23,0;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=0,14,0;FSAR=2,9,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0022369,0.0030864,-0.0163471;FXX=0;HRUN=1,8,1;LEN=11,1,11;MLLD=116.053,138.299,223.585;QD=52.5479;RBI=0.0769099,0.0821195,0.0619947;REFB=0,0,0;REVB=0.0768774,0.0820614,0.0598007;RO=0;SAF=0,6,0;SAR=2,2,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,5.58669e-08,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=mnp,snp,mnp;VARB=-0.00749142,0.00792711,0;OID=.,.,.;OPOS=169890923,169890933,169890923;OREF=CTAAAAAAGAA,A,CTAAAAAAGAA;OALT=ACTAAAAAGAG,G,GAACAAAAGAG;OMAPALT=ACTAAAAAGAG,CTAAAAAAGAG,GAACAAAAGAG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:10:24:25:0:0:2,8,2:2,23,0:0.08,0.92,0:2,2,2:0,6,0:0:0:2,9,0:0,14,0:0:0
chr1	169927228	.	T	TG	509.22	PASS	AF=1;AO=41;DP=51;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.090053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=23.6484;QD=45.2643;RBI=0.133344;REFB=0;REVB=0.0983413;RO=8;SAF=36;SAR=5;SRF=8;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0936425;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00663571;OID=.;OPOS=169927229;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:41:51:45:45:0:38:7:0:0:9:8:36:5:8:0
chr1	169951997	.	C	T	740.44	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0173357;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=327.211;QD=56.9569;RBI=0.0182431;REFB=0;REVB=0.0056817;RO=0;SAF=27;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.40625e-05;OID=.;OPOS=169951997;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:25:27:0:0:25:27:0:0
chr1	170501385	.	A	C	619.79	PASS	AF=1;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0304137;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.892;QD=61.9789;RBI=0.0409732;REFB=0;REVB=0.0274556;RO=0;SAF=10;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000143448;OID=.;OPOS=170501385;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:40:0:0:40:40:1:30:10:0:0:30:10:0:0
chr1	170521376	.	G	A	832.62	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0157318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.556;QD=57.4224;RBI=0.0164577;REFB=0;REVB=-0.00483397;RO=0;SAF=28;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.30787e-05;OID=.;OPOS=170521376;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:58:0:0:57:58:1:29:28:0:0:30:28:0:0
chr1	170916646	.	G	T	228.92	PASS	AF=0.45614;AO=26;DP=57;FAO=26;FDP=57;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=20;FWDB=0.0322939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.347;QD=16.0642;RBI=0.0328791;REFB=0.00742488;REVB=0.00617583;RO=30;SAF=12;SAR=14;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.091505;STB=0.55886;STBP=0.468;TYPE=snp;VARB=-0.0133425;OID=.;OPOS=170916646;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:30:31:26:26:0.45614:14:12:11:19:14:12:11:20
chr1	171461787	.	G	A	340.39	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0463818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.191;QD=54.4629;RBI=0.0511686;REFB=0;REVB=-0.0216091;RO=0;SAF=9;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000693856;OID=.;OPOS=171461787;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:25:0:0:24:25:1:15:9:0:0:15:10:0:0
chr1	171482616	.	A	C	327.4	PASS	AF=0.466667;AO=35;DP=76;FAO=35;FDP=75;FR=.;FRO=40;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=22;FSRR=18;FWDB=0.0154753;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.036;QD=17.4614;RBI=0.0167914;REFB=-0.00701971;REVB=0.00651668;RO=40;SAF=17;SAR=18;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0611477;STB=0.534227;STBP=0.625;TYPE=snp;VARB=0.00778237;OID=.;OPOS=171482616;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:75:40:40:35:35:0.466667:18:17:22:18:18:17:22:18
chr1	171486912	.	G	A	377.91	PASS	AF=0.542857;AO=38;DP=70;FAO=38;FDP=70;FR=.;FRO=32;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=-0.000153086;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=225.058;QD=21.5948;RBI=0.0102413;REFB=-0.00910844;REVB=0.0102401;RO=32;SAF=15;SAR=23;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0630822;STB=0.534865;STBP=0.551;TYPE=snp;VARB=0.00773083;OID=.;OPOS=171486912;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:32:32:38:38:0.542857:23:15:15:17:23:15:15:17
chr1	171509327	.	G	A	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0416444;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.6912;QD=44.6886;RBI=0.043178;REFB=0;REVB=-0.0114053;RO=0;SAF=8;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00280192;OID=.;OPOS=171509327;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:5:8:0:0:5:8:0:0
chr1	171511039	.	C	G	330.18	PASS	AF=0.961538;AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.07849;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.3007;QD=50.7968;RBI=0.0811262;REFB=-0.135622;REVB=-0.0205127;RO=1;SAF=10;SAR=15;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0299354;STB=0.516116;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.00247978;OID=.;OPOS=171511039;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:26:26:1:1:25:25:0.961538:15:10:0:1:15:10:0:1
chr1	171514731	.	C	G	688.36	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00742149;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.882;QD=62.5777;RBI=0.00790478;REFB=0;REVB=0.00272158;RO=0;SAF=22;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.07339e-06;OID=.;OPOS=171514731;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:22:22:0:0:22:22:0:0
chr1	171526570	.	G	A	375.67	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00341399;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.922;QD=55.6553;RBI=0.0264414;REFB=0;REVB=0.02622;RO=0;SAF=19;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.06954e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000164574;OID=.;OPOS=171526570;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:8:19:0:0:8:19:0:0
chr1	171556165	.	G	C	885.43	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00210822;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.034;QD=58.0611;RBI=0.0192048;REFB=0;REVB=0.0190887;RO=0;SAF=28;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.7978e-05;OID=.;OPOS=171556165;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:33:28:0:0:33:28:0:0
chr1	171558516	.	C	T	724.24	PASS	AF=0.981132;AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0160739;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=248.796;QD=54.6597;RBI=0.0229724;REFB=-0.114728;REVB=0.0164122;RO=1;SAF=30;SAR=22;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154433;STB=0.508194;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.000488822;OID=.;OPOS=171558516;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:53:53:1:1:52:52:0.981132:22:30:1:0:22:30:1:0
chr1	171562383	.	CT	C	31.04	PASS	AF=0.323529;AO=9;DP=35;FAO=11;FDP=34;FR=.;FRO=23;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=0.017113;FXX=0.0285633;HRUN=5;LEN=1;MLLD=14.1923;QD=3.65144;RBI=0.0493158;REFB=-0.0535778;REVB=0.0462514;RO=23;SAF=1;SAR=8;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.348312;STB=0.754129;STBP=0.104;TYPE=del;VARB=0.100358;OID=.;OPOS=171562384;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.323529:9:35:11:34:23:1:10:7:16:31:23:1:8:7:16
chr1	171751236	.	T	C	1155.91	PASS	AF=1;AO=76;DP=77;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0414231;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.406;QD=60.8376;RBI=0.0506481;REFB=0;REVB=0.0291438;RO=0;SAF=31;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.96428e-05;OID=.;OPOS=171751236;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:76:0:0:76:76:1:45:31:0:0:45:31:0:0
chr1	171753039	.	A	G	368.06	PASS	AF=0.62;AO=31;DP=50;FAO=31;FDP=50;FR=.;FRO=19;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=5;FWDB=0.0188602;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.195;QD=29.4446;RBI=0.0207872;REFB=-0.0221545;REVB=-0.0087408;RO=19;SAF=15;SAR=16;SRF=14;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174516;STB=0.595576;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=0.00983875;OID=.;OPOS=171753039;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:19:19:31:31:0.62:16:15:14:5:16:15:14:5
chr1	171755170	.	G	A	228.32	PASS	AF=0.52381;AO=22;DP=42;FAO=22;FDP=42;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=0.0135653;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.806;QD=21.7443;RBI=0.0236647;REFB=-0.0225378;REVB=-0.0193908;RO=20;SAF=9;SAR=13;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202833;STB=0.613632;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=0.0206574;OID=.;OPOS=171755170;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:20:20:22:22:0.52381:13:9:13:7:13:9:13:7
chr1	171755182	.	G	A	189.07	PASS	AF=0.527778;AO=19;DP=36;FAO=19;FDP=36;FR=.;FRO=17;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=-0.0165786;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.44;QD=21.0076;RBI=0.029842;REFB=-0.0148488;REVB=0.0248133;RO=17;SAF=11;SAR=8;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0915077;STB=0.551568;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.0116961;OID=.;OPOS=171755182;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:17:17:19:19:0.527778:8:11:8:9:8:11:8:9
chr1	171763549	.	C	T	458.96	PASS	AF=0.46;AO=46;DP=100;FAO=46;FDP=100;FR=.;FRO=54;FSAF=28;FSAR=18;FSRF=33;FSRR=21;FWDB=0.00220715;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.999;QD=18.3585;RBI=0.0400414;REFB=-0.00727558;REVB=-0.0399805;RO=54;SAF=28;SAR=18;SRF=33;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00245408;STB=0.501369;STBP=0.985;TYPE=snp;VARB=0.00824;OID=.;OPOS=171763549;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:54:54:46:46:0.46:18:28:33:21:18:28:33:21
chr1	171810960	.	A	G	1153.57	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0420188;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.347;QD=60.7144;RBI=0.044786;REFB=0;REVB=-0.0154985;RO=0;SAF=26;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.99741e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.5338e-05;OID=.;OPOS=171810960;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:50:26:0:0:50:26:0:0
chr1	171956803	.	C	T	107.76	PASS	AF=0.361111;AO=13;DP=37;FAO=13;FDP=36;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=0.00907556;FXX=0.0270197;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.276;QD=11.973;RBI=0.0149262;REFB=-0.00132173;REVB=0.0118502;RO=23;SAF=5;SAR=8;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.238875;STB=0.641136;STBP=0.243;TYPE=snp;VARB=0.00202366;OID=.;OPOS=171956803;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:36:23:23:13:13:0.361111:8:5:14:9:8:5:14:9
chr1	172157585	.	C	A	181.95	PASS	AF=0.411765;AO=18;DP=49;FAO=21;FDP=51;FR=.;FRO=30;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=0.0330532;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.179;QD=14.2704;RBI=0.0387108;REFB=-0.0418571;REVB=0.0201497;RO=30;SAF=5;SAR=13;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0711872;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0511595;OID=.;OPOS=172157585;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:51:30:30:18:21:0.411765:13:5:10:20:14:7:10:20
chr1	172356437	.	A	G	779.51	PASS	AF=1;AO=54;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00530959;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.973;QD=56.692;RBI=0.0181661;REFB=0;REVB=0.0173728;RO=0;SAF=29;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00028973;OID=.;OPOS=172356437;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:54:55:1:25:29:0:0:25:30:0:0
chr1	172378884	.	G	GT	244.41	PASS	AF=0.559633;AO=52;DP=110;FAO=61;FDP=109;FR=.;FRO=48;FSAF=39;FSAR=22;FSRF=26;FSRR=22;FWDB=0.0191535;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.0537;QD=8.96912;RBI=0.110589;REFB=0.0109021;REVB=0.108918;RO=48;SAF=35;SAR=17;SRF=29;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0662849;STB=0.545439;STBP=0.334;TYPE=ins;VARB=0.0124881;OID=.;OPOS=172378885;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.559633:52:110:61:109:48:39:22:26:22:99:48:35:17:29:19
chr1	172411496	.	A	G	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0201315;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=296.44;QD=35.5759;RBI=0.025464;REFB=0;REVB=-0.0155928;RO=0;SAF=2;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.27427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.22949e-05;OID=.;OPOS=172411496;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:5:2:0:0:5:2:0:0
chr1	172411768	.	T	C	208.29	PASS	AF=0.480769;AO=22;DP=50;FAO=25;FDP=52;FR=.;FRO=27;FSAF=19;FSAR=6;FSRF=19;FSRR=8;FWDB=-0.0415614;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.7669;QD=16.0222;RBI=0.0545923;REFB=-0.0414737;REVB=0.0353972;RO=28;SAF=17;SAR=5;SRF=20;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0774075;STB=0.53843;STBP=0.64;TYPE=snp;VARB=0.0306072;OID=.;OPOS=172411768;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:52:28:27:22:25:0.480769:5:17:20:8:6:19:19:8
chr1	172412845	.	C	A	315.03	PASS	AF=0.472222;AO=34;DP=72;FAO=34;FDP=72;FR=.;FRO=38;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=-0.00319195;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=162.491;QD=17.5014;RBI=0.0110711;REFB=-0.0187167;REVB=-0.010601;RO=38;SAF=21;SAR=13;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138206;STB=0.577454;STBP=0.244;TYPE=snp;VARB=0.0226738;OID=.;OPOS=172412845;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:38:38:34:34:0.472222:13:21:18:20:13:21:18:20
chr1	172412995	.	T	C	179.01	PASS	AF=0.385965;AO=22;DP=57;FAO=22;FDP=57;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=21;FSRR=14;FWDB=-0.0238555;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.5094;QD=12.5619;RBI=0.0582329;REFB=0.0169204;REVB=-0.0531223;RO=35;SAF=15;SAR=7;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0958943;STB=0.555504;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=-0.0440671;OID=.;OPOS=172412995;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:35:35:22:22:0.385965:7:15:21:14:7:15:21:14
chr1	172422209	.	C	T	419.5	PASS	AF=0.447917;AO=43;DP=97;FAO=43;FDP=96;FR=.;FRO=53;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=30;FSRR=23;FWDB=-0.0443997;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.9572;QD=17.4791;RBI=0.0451248;REFB=-0.00844324;REVB=0.00805734;RO=54;SAF=23;SAR=20;SRF=31;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0392422;STB=0.517317;STBP=0.795;TYPE=snp;VARB=0.0114094;OID=.;OPOS=172422209;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:96:54:53:43:43:0.447917:20:23:31:23:20:23:30:23
chr1	172434812	.	C	T	196.78	PASS	AF=0.59375;AO=19;DP=33;FAO=19;FDP=32;FR=.;FRO=13;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.0353141;FXX=0.0302939;HRUN=4;LEN=1;MLLD=221.977;QD=24.5975;RBI=0.0357776;REFB=-0.00682263;REVB=0.00574039;RO=13;SAF=10;SAR=9;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0470885;STB=0.526288;STBP=0.761;TYPE=snp;VARB=0.00293381;OID=.;OPOS=172434812;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:32:13:13:19:19:0.59375:9:10:6:7:9:10:6:7
chr1	172437592	.	G	A	1380.54	PASS	AF=0.988889;AO=88;DP=90;FAO=89;FDP=90;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0192438;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.842;QD=61.3575;RBI=0.0214318;REFB=0.0418211;REVB=-0.00943399;RO=1;SAF=42;SAR=46;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0111493;STB=0.505746;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=-0.000480383;OID=.;OPOS=172437592;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:90:90:1:1:88:89:0.988889:46:42:1:0:46:43:1:0
chr1	172501617	.	G	C	220.94	PASS	AF=0.44898;AO=22;DP=49;FAO=22;FDP=49;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=0.0169126;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.858;QD=18.0355;RBI=0.0186735;REFB=-0.0227611;REVB=0.00791592;RO=27;SAF=9;SAR=13;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177218;STB=0.600648;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=0.0208718;OID=.;OPOS=172501617;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:27:27:22:22:0.44898:13:9:16:11:13:9:16:11
chr1	172502479	.	T	C	2181.16	PASS	AF=0.992857;AO=139;DP=140;FAO=139;FDP=140;FR=.;FRO=1;FSAF=66;FSAR=73;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0332308;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.6186;QD=62.3188;RBI=0.0863318;REFB=0.0359895;REVB=-0.0796799;RO=1;SAF=66;SAR=73;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00714941;STB=0.503759;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=-0.00211646;OID=.;OPOS=172502479;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:140:140:1:1:139:139:0.992857:73:66:1:0:73:66:1:0
chr1	173429995	.	G	A	729.01	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0166878;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=277.136;QD=57.1775;RBI=0.0185998;REFB=0;REVB=-0.00821418;RO=0;SAF=30;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.20617e-05;OID=.;OPOS=173429995;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:21:30:0:0:21:30:0:0
chr1	173474429	.	T	C	955.19	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00107749;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.0196;QD=58.7806;RBI=0.00409418;REFB=0;REVB=0.00394986;RO=0;SAF=33;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.68573e-05;OID=.;OPOS=173474429;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:32:33:0:0:32:33:0:0
chr1	173516871	.	G	C	472.32	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0262835;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.312;QD=57.2507;RBI=0.0307448;REFB=0;REVB=0.0159505;RO=0;SAF=14;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0025082;OID=.;OPOS=173516871;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:33:0:0:31:33:1:17:14:0:0:18:15:0:0
chr1	173516903	.	A	G	464.96	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0595197;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.9351;QD=58.1201;RBI=0.061459;REFB=0;REVB=-0.0153173;RO=0;SAF=17;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000675711;OID=.;OPOS=173516903;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:15:17:0:0:15:17:0:0
chr1	174274224	.	G	A	209.59	PASS	AF=0.310345;AO=27;DP=87;FAO=27;FDP=87;FR=.;FRO=60;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=26;FSRR=34;FWDB=0.00221315;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.312;QD=9.63623;RBI=0.0023786;REFB=-0.000374651;REVB=-0.000871614;RO=59;SAF=17;SAR=10;SRF=26;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.220692;STB=0.634875;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=0.000973156;OID=.;OPOS=174274224;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:59:60:27:27:0.310345:10:17:26:33:10:17:26:34
chr1	175092674	.	C	T	211.66	PASS	AF=0.382353;AO=26;DP=69;FAO=26;FDP=68;FR=.;FRO=42;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=-0.000620389;FXX=0.0144907;HRUN=2;LEN=1;MLLD=254.501;QD=12.4506;RBI=0.0269362;REFB=-0.00269517;REVB=-0.0269291;RO=41;SAF=17;SAR=9;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157022;STB=0.584057;STBP=0.321;TYPE=snp;VARB=0.00449611;OID=.;OPOS=175092674;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:68:41:42:26:26:0.382353:9:17:21:20:9:17:22:20
chr1	175113578	.	T	C	1572.91	PASS	AF=1;AO=105;DP=105;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00618694;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.414;QD=59.9204;RBI=0.0216296;REFB=0;REVB=0.0207259;RO=0;SAF=52;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.53503e-05;OID=.;OPOS=175113578;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:105:105:0:0:105:105:1:53:52:0:0:53:52:0:0
chr1	175129924	.	C	CCTT	306.85	PASS	AF=0.627907;AO=21;DP=84;FAO=27;FDP=43;FR=.;FRO=16;FSAF=24;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=3;FWDB=0.00604346;FXX=0.0444346;HRUN=2;LEN=3;MLLD=127.745;QD=28.5444;RBI=0.059658;REFB=-0.139009;REVB=-0.0593511;RO=61;SAF=20;SAR=1;SRF=38;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.60983;STB=0.564653;STBP=0.458;TYPE=ins;VARB=0.074388;OID=.;OPOS=175129925;OREF=-;OALT=CTT;OMAPALT=CCTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.627907:21:84:27:43:16:24:3:13:3:99:61:20:1:38:23
chr1	175129955	.	G	C	31.97	PASS	AF=0.0941176;AO=8;DP=85;FAO=8;FDP=85;FR=.;FRO=77;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=32;FSRR=45;FWDB=-0.104104;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.4128;QD=1.50453;RBI=0.109179;REFB=-0.0147593;REVB=-0.0329001;RO=75;SAF=6;SAR=2;SRF=32;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.362767;STB=0.787035;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.0986954;OID=.;OPOS=175129955;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:31:85:85:75:77:8:8:0.0941176:2:6:32:43:2:6:32:45
chr1	175299301	.	T	C	616.97	PASS	AF=1;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0856679;FXX=0.0243843;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.0685;QD=61.6973;RBI=0.0892819;REFB=0;REVB=-0.025145;RO=0;SAF=17;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.4817e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00207441;OID=.;OPOS=175299301;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:40:0:0:40:40:1:23:17:0:0:23:17:0:0
chr1	175324651	.	A	G	756.82	PASS	AF=1;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0161524;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.531;QD=57.1188;RBI=0.0161653;REFB=0;REVB=0.000645691;RO=0;SAF=26;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000278321;OID=.;OPOS=175324651;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:53:0:0:53:53:1:27:26:0:0:27:26:0:0
chr1	175335234	.	C	T	2084.52	PASS	AF=0.992647;AO=133;DP=136;FAO=135;FDP=136;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=95;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0543511;FXX=0.0354585;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.705;QD=61.3095;RBI=0.0612521;REFB=-0.0878485;REVB=0.0282448;RO=1;SAF=39;SAR=94;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00503042;STB=0.506172;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=0.000194916;OID=.;OPOS=175335234;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:136:136:1:1:133:135:0.992647:94:39:0:1:95:40:1:0
chr1	176103053	.	TAC	T	901.57	PASS	AF=1;AO=60;DP=63;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00762225;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=2;MLLD=307.059;QD=58.1661;RBI=0.0085751;REFB=0;REVB=-0.00392855;RO=0;SAF=25;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.89445e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-2.76258e-05;OID=.;OPOS=176103054;OREF=AC;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:60:63:62:62:0:25:37:0:0:5:0:25:35:0:0
chr1	176118219	.	G	A	754.72	PASS	AF=1;AO=44;DP=54;FAO=53;FDP=53;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=12;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.051507;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.867;QD=56.96;RBI=0.0603658;REFB=0;REVB=0.0314812;RO=0;SAF=7;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.9155e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000659249;OID=.;OPOS=176118219;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:53:0:0:44:53:1:37:7:0:0:41:12:0:0
chr1	176863836	.	G	C	166.08	PASS	AF=0.409091;AO=18;DP=44;FAO=18;FDP=44;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=0.0037924;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.5716;QD=15.0977;RBI=0.0054578;REFB=-0.0188969;REVB=-0.00392495;RO=26;SAF=9;SAR=9;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0787827;STB=0.545404;STBP=0.62;TYPE=snp;VARB=0.0388325;OID=.;OPOS=176863836;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:26:26:18:18:0.409091:9:9:15:11:9:9:15:11
chr1	176863867	.	T	C	250.38	PASS	AF=0.48;AO=24;DP=50;FAO=24;FDP=50;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.0642068;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.1532;QD=20.0308;RBI=0.0645946;REFB=-0.0371089;REVB=0.00706717;RO=26;SAF=12;SAR=12;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0354698;STB=0.519983;STBP=0.81;TYPE=snp;VARB=0.0242012;OID=.;OPOS=176863867;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:26:26:24:24:0.48:12:12:12:14:12:12:12:14
chr1	176992553	.	A	G	1590.92	PASS	AF=1;AO=99;DP=100;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00423396;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.1629;QD=64.2796;RBI=0.0230978;REFB=0;REVB=0.0227064;RO=0;SAF=52;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.28099e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.38435e-05;OID=.;OPOS=176992553;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:100:99:0:0:99:99:1:47:52:0:0:47:52:0:0
chr1	177001896	.	C	G	288.22	PASS	AF=1;AO=19;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0174806;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.279;QD=52.4038;RBI=0.0306457;REFB=0;REVB=0.0251712;RO=0;SAF=10;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.77273e-06;OID=.;OPOS=177001896;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:19:22:1:9:10:0:0:11:11:0:0
chr1	177247912	.	C	G	196.74	PASS	AF=0.465116;AO=20;DP=43;FAO=20;FDP=43;FR=.;FRO=23;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.026057;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=222.901;QD=18.301;RBI=0.0263761;REFB=-0.0362208;REVB=-0.00409062;RO=22;SAF=13;SAR=7;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14424;STB=0.595083;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=0.0438872;OID=.;OPOS=177247912;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:22:23:20:20:0.465116:7:13:11:11:7:13:11:12
chr1	177908852	.	C	T	246.3	PASS	AF=0.39726;AO=29;DP=73;FAO=29;FDP=73;FR=.;FRO=44;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=25;FWDB=0.0006144;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.026;QD=13.4956;RBI=0.0142085;REFB=-0.00529591;REVB=0.0141952;RO=44;SAF=18;SAR=11;SRF=19;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199914;STB=0.614139;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=0.00836144;OID=.;OPOS=177908852;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:44:44:29:29:0.39726:11:18:19:25:11:18:19:25
chr1	177915474	.	A	C	341.12	PASS	AF=0.576271;AO=31;DP=59;FAO=34;FDP=59;FR=.,HEALED;FRO=25;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=5;FWDB=-0.0362044;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=86.7573;QD=23.1266;RBI=0.0496206;REFB=-0.00324311;REVB=0.033933;RO=19;SAF=19;SAR=12;SRF=15;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133537;STB=0.585025;STBP=0.176;TYPE=snp;VARB=-0.00124979;OID=.;OPOS=177915474;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:19:25:31:34:0.576271:12:19:15:4:13:21:20:5
chr1	177915498	.	G	A	309.48	PASS	AF=0.441558;AO=34;DP=77;FAO=34;FDP=77;FR=.;FRO=43;FSAF=23;FSAR=11;FSRF=26;FSRR=17;FWDB=-0.0114959;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=206.126;QD=16.0769;RBI=0.0142177;REFB=-0.00461229;REVB=0.00836582;RO=43;SAF=23;SAR=11;SRF=26;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0785634;STB=0.544352;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.00434585;OID=.;OPOS=177915498;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:43:43:34:34:0.441558:11:23:26:17:11:23:26:17
chr1	177929554	.	C	T	125.71	PASS	AF=0.307692;AO=16;DP=52;FAO=16;FDP=52;FR=.;FRO=36;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=-0.00400282;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.38;QD=9.66991;RBI=0.00686237;REFB=-0.00247449;REVB=0.00557401;RO=36;SAF=8;SAR=8;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0321224;STB=0.519207;STBP=0.883;TYPE=snp;VARB=0.00363601;OID=.;OPOS=177929554;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:36:36:16:16:0.307692:8:8:19:17:8:8:19:17
chr1	177929940	.	G	A	128.29	PASS	AF=0.405405;AO=14;DP=36;FAO=15;FDP=37;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=0.000747413;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.471;QD=13.8693;RBI=0.0339335;REFB=-0.0296481;REVB=0.0339252;RO=21;SAF=7;SAR=7;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.024428;STB=0.5467;STBP=0.655;TYPE=snp;VARB=0.0433581;OID=.;OPOS=177929940;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:37:21:22:14:15:0.405405:7:7:11:10:8:7:12:10
chr1	177929987	.	T	C	729.01	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00725762;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.806;QD=57.1769;RBI=0.0265394;REFB=0;REVB=0.0255278;RO=0;SAF=22;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000242167;OID=.;OPOS=177929987;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:29:22:0:0:29:22:0:0
chr1	178483231	.	G	A	383.67	PASS	AF=0.506494;AO=39;DP=78;FAO=39;FDP=77;FR=.;FRO=38;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=0.00817905;FXX=0.0128189;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.831;QD=19.9309;RBI=0.0468146;REFB=-0.0173561;REVB=0.0460946;RO=38;SAF=17;SAR=22;SRF=21;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103916;STB=0.557675;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=0.0187222;OID=.;OPOS=178483231;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:77:38:38:39:39:0.506494:22:17:21:17:22:17:21:17
chr1	178489978	.	T	G	219.45	PASS	AF=0.36;AO=26;DP=73;FAO=27;FDP=75;FR=.;FRO=48;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=35;FSRR=13;FWDB=-0.026057;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.311;QD=11.7037;RBI=0.0260895;REFB=-0.00154763;REVB=-0.00130174;RO=46;SAF=13;SAR=13;SRF=34;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.267507;STB=0.636271;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=0.00301595;OID=.;OPOS=178489978;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:75:46:48:26:27:0.36:13:13:34:12:13:14:35:13
chr1	178492447	.	T	A	132.66	PASS	AF=0.310345;AO=18;DP=58;FAO=18;FDP=58;FR=.;FRO=40;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=30;FWDB=0.00817821;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.877;QD=9.14892;RBI=0.0156319;REFB=-0.0182748;REVB=-0.0133219;RO=40;SAF=9;SAR=9;SRF=10;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.295159;STB=0.672245;STBP=0.107;TYPE=snp;VARB=0.0360125;OID=.;OPOS=178492447;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:40:40:18:18:0.310345:9:9:10:30:9:9:10:30
chr1	178514622	.	C	T	241.4	PASS	AF=0.522727;AO=22;DP=44;FAO=23;FDP=44;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.0868092;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.5392;QD=21.9451;RBI=0.0874215;REFB=-0.0116703;REVB=-0.0103287;RO=17;SAF=11;SAR=11;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0689408;STB=0.52172;STBP=0.781;TYPE=snp;VARB=0.0087371;OID=.;OPOS=178514622;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:17:21:22:23:0.522727:11:11:7:10:12:11:11:10
chr1	178820159	.	C	A	231.05	PASS	AF=0.464286;AO=26;DP=56;FAO=26;FDP=56;FR=.;FRO=30;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=-0.0211616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.4574;QD=16.5035;RBI=0.034543;REFB=-0.0157719;REVB=-0.0273022;RO=29;SAF=15;SAR=11;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0566037;STB=0.523725;STBP=0.754;TYPE=snp;VARB=0.0164507;OID=.;OPOS=178820159;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:29:30:26:26:0.464286:11:15:15:14:11:15:16:14
chr1	178858759	.	G	A	417.19	PASS	AF=0.443299;AO=43;DP=97;FAO=43;FDP=97;FR=.;FRO=54;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=29;FSRR=25;FWDB=-0.0283107;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.6012;QD=17.2035;RBI=0.0287954;REFB=0.0290164;REVB=-0.00526125;RO=53;SAF=22;SAR=21;SRF=29;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.035089;STB=0.514156;STBP=0.791;TYPE=snp;VARB=-0.0543325;OID=.;OPOS=178858759;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:53:54:43:43:0.443299:21:22:29:24:21:22:29:25
chr1	179312752	.	C	T	1138.57	PASS	AF=1;AO=75;DP=76;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00930948;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.614;QD=60.7236;RBI=0.0119666;REFB=0;REVB=0.00751886;RO=0;SAF=43;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.19021e-05;OID=.;OPOS=179312752;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:75:0:0:75:75:1:32:43:0:0:32:43:0:0
chr1	179319541	.	C	G	944.33	PASS	AF=0.984848;AO=65;DP=67;FAO=65;FDP=66;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0276589;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.843;QD=57.2319;RBI=0.028366;REFB=-0.0968752;REVB=-0.00629412;RO=0;SAF=34;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.90682e-08;STB=0.507244;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.000634684;OID=.;OPOS=179319541;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:67:66:0:1:65:65:0.984848:31:34:0:0:31:34:1:0
chr1	179320578	.	A	G	613.36	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159386;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.736;QD=61.3363;RBI=0.0166164;REFB=0;REVB=0.00469734;RO=0;SAF=17;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.4817e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000123063;OID=.;OPOS=179320578;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:23:17:0:0:23:17:0:0
chr1	179347832	.	T	C	1066.18	PASS	AF=0.986301;AO=72;DP=73;FAO=72;FDP=73;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0258578;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=247.535;QD=58.4211;RBI=0.0276765;REFB=-0.0726429;REVB=-0.00986719;RO=1;SAF=37;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0126112;STB=0.506665;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.000180033;OID=.;OPOS=179347832;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:73:73:1:1:72:72:0.986301:35:37:1:0:35:37:1:0
chr1	179452275	.	G	A	990.65	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0308142;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.671;QD=59.1431;RBI=0.0308149;REFB=0;REVB=-0.000208135;RO=0;SAF=41;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000139876;OID=.;OPOS=179452275;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:26:41:0:0:26:41:0:0
chr1	179520151	.	C	T	1048.29	PASS	AF=0.986111;AO=71;DP=72;FAO=71;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00322362;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.796;QD=58.2384;RBI=0.0135003;REFB=-0.149822;REVB=-0.0131098;RO=1;SAF=46;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0101703;STB=0.505375;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.000721717;OID=.;OPOS=179520151;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:72:72:1:1:71:71:0.986111:25:46:1:0:25:46:1:0
chr1	179604864	.	C	T	979.69	PASS	AF=1;AO=66;DP=68;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00572789;FXX=0.0294074;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.432;QD=59.3749;RBI=0.00831021;REFB=0;REVB=-0.00602088;RO=0;SAF=34;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.75585e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00012676;OID=.;OPOS=179604864;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:66:0:0:66:66:1:32:34:0:0:32:34:0:0
chr1	179609589	.	G	T	1262.99	PASS	AF=1;AO=80;DP=81;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0240481;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.884;QD=61.6092;RBI=0.0242201;REFB=0;REVB=0.00288138;RO=0;SAF=30;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.04036e-05;OID=.;OPOS=179609589;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:82:0:0:80:82:1:50:30:0:0:51:31:0:0
chr1	179815307	.	T	A	1186.58	PASS	AF=0.527273;AO=116;DP=219;FAO=116;FDP=220;FR=.;FRO=104;FSAF=57;FSAR=59;FSRF=42;FSRR=62;FWDB=-0.00567567;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.918;QD=21.5741;RBI=0.0179792;REFB=0.0150697;REVB=0.0170599;RO=103;SAF=57;SAR=59;SRF=42;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0721304;STB=0.541444;STBP=0.19;TYPE=snp;VARB=-0.0107514;OID=.;OPOS=179815307;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:219:220:103:104:116:116:0.527273:59:57:42:61:59:57:42:62
chr1	179852074	.	T	C	233.42	PASS	AF=0.472727;AO=26;DP=55;FAO=26;FDP=55;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=20;FWDB=-0.043321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.538;QD=16.9762;RBI=0.0433269;REFB=-0.0118733;REVB=-0.000712358;RO=29;SAF=11;SAR=15;SRF=9;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110533;STB=0.561998;STBP=0.418;TYPE=snp;VARB=0.0110226;OID=.;OPOS=179852074;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:29:29:26:26:0.472727:15:11:9:20:15:11:9:20
chr1	179858444	.	G	A	591.92	PASS	AF=0.521368;AO=59;DP=114;FAO=61;FDP=117;FR=.;FRO=56;FSAF=43;FSAR=18;FSRF=25;FSRR=31;FWDB=-0.0099679;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.868;QD=20.2364;RBI=0.0157082;REFB=-0.0077768;REVB=-0.0121403;RO=54;SAF=41;SAR=18;SRF=24;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.2302;STB=0.632497;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.00632435;OID=.;OPOS=179858444;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:114:117:54:56:59:61:0.521368:18:41:24:30:18:43:25:31
chr1	179876988	.	C	G	825.91	PASS	AF=0.458647;AO=61;DP=138;FAO=61;FDP=133;FR=.,HEALED;FRO=50;FSAF=22;FSAR=39;FSRF=21;FSRR=29;FWDB=0.00215132;FXX=0.0362293;HRUN=2;LEN=1;MLLD=213.12;QD=24.8394;RBI=0.0044362;REFB=0.00380308;REVB=0.00387964;RO=46;SAF=22;SAR=39;SRF=17;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00757949;STB=0.528512;STBP=0.491;TYPE=snp;VARB=-0.00578767;OID=.;OPOS=179876988;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:138:133:46:50:61:61:0.458647:39:22:17:29:39:22:21:29
chr1	179887125	.	G	A	289.72	PASS	AF=0.508197;AO=31;DP=61;FAO=31;FDP=61;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=23;FSRR=7;FWDB=-0.0059384;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.4857;QD=18.9978;RBI=0.0122681;REFB=0.00306553;REVB=-0.010735;RO=30;SAF=12;SAR=19;SRF=23;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.325744;STB=0.680545;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=-0.000811342;OID=.;OPOS=179887125;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:30:30:31:31:0.508197:19:12:23:7:19:12:23:7
chr1	179989584	.	G	C	109.77	PASS	AF=0.705882;AO=12;DP=17;FAO=12;FDP=17;FR=.;FRO=5;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0567021;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.6139;QD=25.8291;RBI=0.17682;REFB=-0.0412007;REVB=0.167481;RO=5;SAF=6;SAR=6;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0522328;STB=0.529363;STBP=0.745;TYPE=snp;VARB=0.0207785;OID=.;OPOS=179989584;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:17:17:5:5:12:12:0.705882:6:6:3:2:6:6:3:2
chr1	180003110	.	C	T	85.21	PASS	AF=0.366667;AO=11;DP=29;FAO=11;FDP=30;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=-0.0322044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.081;QD=11.3614;RBI=0.0332316;REFB=-0.00837218;REVB=0.00819838;RO=16;SAF=9;SAR=2;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.256532;STB=0.620445;STBP=0.408;TYPE=snp;VARB=0.0207138;OID=.;OPOS=180003110;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:29:30:16:19:11:11:0.366667:2:9:10:6:2:9:13:6
chr1	180010911	.	A	G	1039.35	PASS	AF=1;AO=70;DP=72;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0633378;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.467;QD=58.5552;RBI=0.0709492;REFB=-0.0546579;REVB=-0.0319704;RO=1;SAF=35;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133173;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00130695;OID=.;OPOS=180010911;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:72:71:1:0:70:71:1:35:35:1:0:35:36:0:0
chr1	180145088	.	A	G	891.49	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0140078;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.4787;QD=57.5156;RBI=0.0146519;REFB=0;REVB=-0.00429633;RO=0;SAF=34;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00120375;OID=.;OPOS=180145088;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:62:0:0:61:62:1:27:34:0:0:28:34:0:0
chr1	180243524	.	A	G	1105.79	PASS	AF=0.986667;AO=74;DP=76;FAO=74;FDP=75;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0253302;FXX=0.0131562;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.723;QD=58.9754;RBI=0.0259727;REFB=-0.0807374;REVB=-0.00574124;RO=0;SAF=38;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.79579e-08;STB=0.506848;STBP=0.324;TYPE=snp;VARB=0.000249619;OID=.;OPOS=180243524;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:76:75:0:1:74:74:0.986667:36:38:0:0:36:38:0:1
chr1	180854067	.	A	G	818.63	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0007344;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.492;QD=57.4474;RBI=0.0147656;REFB=0;REVB=0.0147473;RO=0;SAF=29;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.40922e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.90005e-05;OID=.;OPOS=180854067;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:55:57:0:0:55:57:1:26:29:0:0:28:29:0:0
chr1	180885430	.	T	C	736.51	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00715344;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.283;QD=62.6821;RBI=0.0178242;REFB=0;REVB=-0.0163257;RO=0;SAF=22;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.10359e-05;OID=.;OPOS=180885430;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:47:47:0:0:47:47:1:25:22:0:0:25:22:0:0
chr1	180897569	.	C	T	740.44	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00832052;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=245.315;QD=56.9568;RBI=0.0325526;REFB=0;REVB=0.0314713;RO=0;SAF=19;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.0907e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.43885e-05;OID=.;OPOS=180897569;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:33:19:0:0:33:19:0:0
chr1	180913597	.	A	G	619.9	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0574275;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=38.6147;QD=60.4777;RBI=0.0810579;REFB=0;REVB=-0.0572054;RO=0;SAF=17;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.53998e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.08074e-05;OID=.;OPOS=180913597;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:41:0:0:38:41:1:21:17:0:0:21:20:0:0
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chr1	182026813	.	G	C	46.36	PASS	AF=0.368421;AO=7;DP=19;FAO=7;FDP=19;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=-0.00885701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.051;QD=9.76073;RBI=0.00940593;REFB=-0.00254856;REVB=0.00316623;RO=12;SAF=3;SAR=4;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196632;STB=0.618737;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00432152;OID=.;OPOS=182026813;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:19:19:12:12:7:7:0.368421:4:3:3:9:4:3:3:9
chr1	182027022	.	C	T	364.22	PASS	AF=0.428571;AO=39;DP=88;FAO=39;FDP=91;FR=.;FRO=52;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=22;FSRR=30;FWDB=0.0358466;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=47.318;QD=16.0098;RBI=0.0459801;REFB=-0.04279;REVB=0.0287957;RO=49;SAF=21;SAR=18;SRF=19;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148616;STB=0.565623;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=0.0473911;OID=.;OPOS=182027022;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:91:49:52:39:39:0.428571:18:21:19:30:18:21:22:30
chr1	182356399	.	A	G	183.56	PASS	AF=0.324324;AO=24;DP=74;FAO=24;FDP=74;FR=.;FRO=50;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=32;FSRR=18;FWDB=0.00271763;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.3022;QD=9.92188;RBI=0.0116582;REFB=-0.00937733;REVB=0.011337;RO=50;SAF=14;SAR=10;SRF=32;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0681929;STB=0.539873;STBP=0.664;TYPE=snp;VARB=0.0252799;OID=.;OPOS=182356399;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:50:50:24:24:0.324324:10:14:32:18:10:14:32:18
chr1	182369078	.	G	A	154.79	PASS	AF=0.404762;AO=17;DP=42;FAO=17;FDP=42;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=0.00482778;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=263.467;QD=14.7422;RBI=0.00914796;REFB=-0.00638896;REVB=-0.00777031;RO=25;SAF=9;SAR=8;SRF=17;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157825;STB=0.590807;STBP=0.35;TYPE=snp;VARB=0.008652;OID=.;OPOS=182369078;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:25:25:17:17:0.404762:8:9:17:8:8:9:17:8
chr1	182369233	.	A	G	106.14	PASS	AF=0.371429;AO=12;DP=34;FAO=13;FDP=35;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.013423;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.0945;QD=12.1305;RBI=0.0191434;REFB=-0.0162865;REVB=-0.0136489;RO=22;SAF=7;SAR=5;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00846107;STB=0.516104;STBP=0.913;TYPE=snp;VARB=0.0358896;OID=.;OPOS=182369233;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:35:22:22:12:13:0.371429:5:7:13:9:5:8:13:9
chr1	182443462	.	T	C	244.25	PASS	AF=0.547619;AO=23;DP=42;FAO=23;FDP=42;FR=.;FRO=19;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=0.0114519;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.6073;QD=23.2623;RBI=0.0433979;REFB=-0.0197861;REVB=0.0418596;RO=19;SAF=12;SAR=11;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133041;STB=0.57405;STBP=0.327;TYPE=snp;VARB=0.0174579;OID=.;OPOS=182443462;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:19:19:23:23:0.547619:11:12:13:6:11:12:13:6
chr1	182496829	.	A	G	363.15	PASS	AF=0.475;AO=38;DP=80;FAO=38;FDP=80;FR=.;FRO=42;FSAF=27;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=23;FWDB=0.00088899;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.4398;QD=18.1577;RBI=0.00569333;REFB=-0.00482377;REVB=0.00562349;RO=42;SAF=27;SAR=11;SRF=19;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.257858;STB=0.644583;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.00493117;OID=.;OPOS=182496829;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:42:42:38:38:0.475:11:27:19:23:11:27:19:23
chr1	182568204	.	G	C	1192.67	PASS	AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00658232;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.542;QD=61.1625;RBI=0.0196154;REFB=0;REVB=0.018478;RO=0;SAF=36;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.43944e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.46865e-05;OID=.;OPOS=182568204;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:42:36:0:0:41:37:0:0
chr1	182569626	.	T	C,G	751.21	PASS	AF=0.958333,0.0416667;AO=46,2;DP=48;FAO=46,2;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=15,1;FSAR=31,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0104702,0.0139968;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=87.0758,142.407;QD=62.6005;RBI=0.0163788,0.0156791;REFB=0,0;REVB=0.0125953,0.00706575;RO=0;SAF=15,1;SAR=31,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00772701,0.0530998;OID=.,.;OPOS=182569626,182569626;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:48:48:0:0:46,2:46,2:0.958333,0.0416667:31,1:15,1:0:0:31,1:15,1:0:0
chr1	182775319	.	C	T	218.98	PASS	AF=0.567568;AO=21;DP=37;FAO=21;FDP=37;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.00982128;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.4186;QD=23.673;RBI=0.0127091;REFB=0.00561445;REVB=-0.00806626;RO=16;SAF=9;SAR=12;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00704467;STB=0.503933;STBP=0.979;TYPE=snp;VARB=-0.0101541;OID=.;OPOS=182775319;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:16:16:21:21:0.567568:12:9:7:9:12:9:7:9
chr1	182778367	.	G	A	520.03	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0180963;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=281.856;QD=59.4316;RBI=0.0209861;REFB=0;REVB=0.0106273;RO=0;SAF=16;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.1382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.67412e-05;OID=.;OPOS=182778367;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:19:16:0:0:19:16:0:0
chr1	182850727	.	T	C	1271.92	PASS	AF=0.955056;AO=83;DP=89;FAO=85;FDP=89;FR=.;FRO=4;FSAF=32;FSAR=53;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0551135;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.6546;QD=57.1648;RBI=0.0711072;REFB=-0.0149882;REVB=0.0449304;RO=5;SAF=31;SAR=52;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00303911;STB=0.505894;STBP=0.645;TYPE=snp;VARB=0.00508456;OID=.;OPOS=182850727;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:89:89:5:4:83:85:0.955056:52:31:2:3:53:32:2:2
chr1	182908602	.	AAATT	A	103.18	PASS	AF=0.404762;AO=16;DP=45;FAO=17;FDP=42;FR=.;FRO=25;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=18;FWDB=0.0281459;FXX=0.124974;HRUN=3;LEN=4;MLLD=251.88;QD=9.82633;RBI=0.0287743;REFB=-0.0062841;REVB=-0.00598031;RO=24;SAF=7;SAR=9;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111447;STB=0.615258;STBP=0.256;TYPE=del;VARB=0.0101981;OID=.;OPOS=182908603;OREF=AATT;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.404762:16:45:17:42:25:8:9:7:18:99:24:7:9:8:16
chr1	182993025	.	C	T	2260.22	PASS	AF=0.95092;AO=155;DP=163;FAO=155;FDP=163;FR=.;FRO=8;FSAF=81;FSAR=74;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.0237095;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.3768;QD=55.4656;RBI=0.0366489;REFB=0.0102849;REVB=0.0279464;RO=8;SAF=81;SAR=74;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00957087;STB=0.505039;STBP=0.601;TYPE=snp;VARB=-0.00117126;OID=.;OPOS=182993025;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:163:163:8:8:155:155:0.95092:74:81:5:3:74:81:5:3
chr1	183072590	.	T	C	1508.81	PASS	AF=1;AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0266482;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.165;QD=63.529;RBI=0.0334633;REFB=0;REVB=0.0202403;RO=0;SAF=55;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000175596;OID=.;OPOS=183072590;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:95:0:0:95:95:1:40:55:0:0:40:55:0:0
chr1	183083724	.	C	T	409.81	PASS	AF=0.518987;AO=41;DP=79;FAO=41;FDP=79;FR=.;FRO=38;FSAF=30;FSAR=11;FSRF=23;FSRR=15;FWDB=-0.00883518;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.4739;QD=20.7499;RBI=0.0249623;REFB=-0.00162758;REVB=0.0233464;RO=37;SAF=30;SAR=11;SRF=23;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11277;STB=0.57223;STBP=0.214;TYPE=snp;VARB=0.0021878;OID=.;OPOS=183083724;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:37:38:41:41:0.518987:11:30:23:14:11:30:23:15
chr1	183085755	.	A	G	1518.77	PASS	AF=0.990385;AO=103;DP=104;FAO=103;FDP=104;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00998054;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.189;QD=58.4141;RBI=0.0116912;REFB=0.00820572;REVB=0.00608884;RO=1;SAF=43;SAR=60;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00784321;STB=0.504131;STBP=0.476;TYPE=snp;VARB=2.57814e-05;OID=.;OPOS=183085755;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:104:104:1:1:103:103:0.990385:60:43:0:1:60:43:0:1
chr1	183086757	.	A	C	990.65	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103235;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.919;QD=59.1431;RBI=0.035456;REFB=0;REVB=-0.0339199;RO=0;SAF=37;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.63497e-05;OID=.;OPOS=183086757;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:30:37:0:0:30:37:0:0
chr1	183093875	.	T	C	1212.92	PASS	AF=0.987654;AO=80;DP=81;FAO=80;FDP=81;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00170032;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.843;QD=59.8971;RBI=0.00795363;REFB=-0.0732087;REVB=0.00776976;RO=1;SAF=32;SAR=48;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00976249;STB=0.505153;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=0.000241628;OID=.;OPOS=183093875;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:81:81:1:1:80:80:0.987654:48:32:0:1:48:32:0:1
chr1	183094547	.	T	C	955.2	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00616932;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.483;QD=58.7817;RBI=0.0160956;REFB=0;REVB=0.0148664;RO=0;SAF=34;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.90682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.30483e-05;OID=.;OPOS=183094547;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:31:34:0:0:31:34:0:0
chr1	183105534	.	T	C	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.021307;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.046;QD=45.8068;RBI=0.02687;REFB=0;REVB=0.0163709;RO=0;SAF=10;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.63386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000759827;OID=.;OPOS=183105534;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:4:10:0:0:4:10:0:0
chr1	183105705	.	G	A	785.86	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0101179;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.092;QD=64.152;RBI=0.015721;REFB=0;REVB=0.0120324;RO=0;SAF=25;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000110377;OID=.;OPOS=183105705;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:24:25:0:0:24:25:0:0
chr1	183112041	.	G	C	712.69	PASS	AF=1;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0192753;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.669;QD=63.3503;RBI=0.0356189;REFB=0;REVB=0.0299528;RO=0;SAF=25;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.09779e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000595171;OID=.;OPOS=183112041;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:45:0:0:45:45:1:20:25:0:0:20:25:0:0
chr1	183112412	.	A	G	657.18	PASS	AF=1;AO=40;DP=41;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0997831;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.4276;QD=59.7434;RBI=0.100983;REFB=0;REVB=0.0155217;RO=0;SAF=18;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.19993e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0112241;OID=.;OPOS=183112412;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:44:0:0:40:44:1:22:18:0:0:22:22:0:0
chr1	183112505	.	T	C	734.21	PASS	AF=0.888889;AO=56;DP=63;FAO=56;FDP=63;FR=.;FRO=7;FSAF=28;FSAR=28;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=0.0123303;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.6;QD=46.6166;RBI=0.0205436;REFB=-0.0846124;REVB=0.0164318;RO=7;SAF=28;SAR=28;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104362;STB=0.555536;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.00200401;OID=.;OPOS=183112505;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:63:63:7:7:56:56:0.888889:28:28:7:0:28:28:7:0
chr1	183112566	.	T	C	1008.49	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0101251;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=295.937;QD=59.323;RBI=0.0102127;REFB=0;REVB=0.00133528;RO=0;SAF=34;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.05819e-06;OID=.;OPOS=183112566;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:34:34:0:0:34:34:0:0
chr1	183112764	.	A	G	852.56	PASS	AF=0.953125;AO=61;DP=65;FAO=61;FDP=64;FR=.;FRO=3;FSAF=27;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.00218737;FXX=0.0153822;HRUN=4;LEN=1;MLLD=153.202;QD=53.2848;RBI=0.00222338;REFB=-0.0224865;REVB=-0.000398514;RO=2;SAF=27;SAR=34;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00348075;STB=0.505196;STBP=0.73;TYPE=snp;VARB=-1.28918e-05;OID=.;OPOS=183112764;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:65:64:2:3:61:61:0.953125:34:27:1:1:34:27:1:2
chr1	183114634	.	G	A	1194.14	PASS	AF=0.9875;AO=79;DP=80;FAO=79;FDP=80;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00884446;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=117.856;QD=59.707;RBI=0.0138406;REFB=-0.167861;REVB=-0.0106461;RO=1;SAF=28;SAR=51;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00919304;STB=0.504853;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=-7.63421e-05;OID=.;OPOS=183114634;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:80:80:1:1:79:79:0.9875:51:28:0:1:51:28:0:1
chr1	183155482	.	C	A	768.2	PASS	AF=0.982143;AO=54;DP=55;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.000883312;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=217.881;QD=54.8713;RBI=0.00593521;REFB=-0.0720085;REVB=0.00586911;RO=0;SAF=29;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508194;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.000234527;OID=.;OPOS=183155482;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:55:56:0:1:54:55:0.982143:25:29:0:0:25:30:1:0
chr1	183486859	.	G	A	1695.41	PASS	AF=1;AO=111;DP=111;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103092;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.924;QD=60.5502;RBI=0.0298833;REFB=0;REVB=0.0280487;RO=0;SAF=46;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.3433e-05;OID=.;OPOS=183486859;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:111:112:0:0:111:112:1:65:46:0:0:66:46:0:0
chr1	183532437	.	G	A	195.15	PASS	AF=0.418182;AO=23;DP=55;FAO=23;FDP=55;FR=.;FRO=32;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=-0.0181149;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.474;QD=14.1929;RBI=0.0282015;REFB=0.00582105;REVB=0.0216142;RO=32;SAF=16;SAR=7;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.211665;STB=0.621512;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=-0.00654829;OID=.;OPOS=183532437;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:32:32:23:23:0.418182:7:16:16:16:7:16:16:16
chr1	183542387	.	T	C	1175.84	PASS	AF=0.987342;AO=78;DP=79;FAO=78;FDP=79;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0340376;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.9303;QD=59.536;RBI=0.0342571;REFB=-0.0436357;REVB=0.00387183;RO=1;SAF=40;SAR=38;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0122936;STB=0.506492;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=0.000519973;OID=.;OPOS=183542387;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:79:79:1:1:78:78:0.987342:38:40:0:1:38:40:0:1
chr1	183616038	.	G	T	218.65	PASS	AF=0.470588;AO=23;DP=49;FAO=24;FDP=51;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=18;FWDB=-0.0283149;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.241;QD=17.1488;RBI=0.0313524;REFB=-0.0131902;REVB=-0.0134625;RO=26;SAF=8;SAR=15;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00172967;STB=0.52379;STBP=0.751;TYPE=snp;VARB=0.00993888;OID=.;OPOS=183616038;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:51:26:27:23:24:0.470588:15:8:9:17:15:9:9:18
chr1	183616926	.	T	C	204.61	PASS	AF=0.27619;AO=29;DP=105;FAO=29;FDP=105;FR=.;FRO=76;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=36;FSRR=40;FWDB=-0.00740804;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=262.163;QD=7.79458;RBI=0.00977283;REFB=-0.0057138;REVB=-0.0063741;RO=74;SAF=13;SAR=16;SRF=36;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.046373;STB=0.518506;STBP=0.807;TYPE=snp;VARB=0.014766;OID=.;OPOS=183616926;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:105:74:76:29:29:0.27619:16:13:36:38:16:13:36:40
chr1	183617105	.	A	G	169.49	PASS	AF=0.439024;AO=18;DP=41;FAO=18;FDP=41;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.0123333;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=339.898;QD=16.5359;RBI=0.0131733;REFB=0.0065171;REVB=0.0046288;RO=23;SAF=9;SAR=9;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0638092;STB=0.536545;STBP=0.697;TYPE=snp;VARB=-0.00797918;OID=.;OPOS=183617105;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:23:23:18:18:0.439024:9:9:13:10:9:9:13:10
chr1	183885657	.	ACCCC	ACCC,ACCCT	412.07	PASS	AF=0.890909,0.109091;AO=21,6;DP=55;FAO=49,6;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=20,6;FSAR=29,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.182752,-0.0100595;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=1,1;MLLD=9.26156,184.156;QD=29.9684;RBI=0.814548,0.0962139;REFB=0,0;REVB=0.793782,0.0956866;RO=25;SAF=16,6;SAR=5,0;SRF=4;SRR=21;SSEN=0,0;SSEP=0.650794,0;SSSB=0.543658,0.809412;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0372982,0.0936583;OID=.,.;OPOS=183885658,183885661;OREF=C,C;OALT=-,T;OMAPALT=ACCC,ACCCT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.890909,0.109091:21,6:55:49,6:55:0:20,6:29,0:0:0:25:25:16,6:5,0:4:21
chr1	184039735	.	T	A	336.72	PASS	AF=0.376147;AO=41;DP=109;FAO=41;FDP=109;FR=.;FRO=68;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=34;FSRR=34;FWDB=0.0188378;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.1733;QD=12.3567;RBI=0.0193;REFB=-0.0112229;REVB=0.00419858;RO=68;SAF=23;SAR=18;SRF=34;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0670436;STB=0.538235;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=0.015532;OID=.;OPOS=184039735;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:109:68:68:41:41:0.376147:18:23:34:34:18:23:34:34
chr1	184660205	.	T	A	522.49	PASS	AF=0.904762;AO=37;DP=42;FAO=38;FDP=42;FR=.;FRO=4;FSAF=13;FSAR=25;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.00323818;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=270.197;QD=49.7605;RBI=0.0052774;REFB=-0.109627;REVB=0.00416715;RO=4;SAF=13;SAR=24;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0293917;STB=0.51652;STBP=0.554;TYPE=snp;VARB=0.000492446;OID=.;OPOS=184660205;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:19:42:42:4:4:37:38:0.904762:24:13:2:2:25:13:2:2
chr1	184662181	.	C	T	738.67	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.011217;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.646;QD=62.8653;RBI=0.026513;REFB=0;REVB=0.0240234;RO=0;SAF=32;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000431109;OID=.;OPOS=184662181;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:47:0:0:46:47:1:14:32:0:0:15:32:0:0
chr1	184663537	.	A	C	670.04	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00313153;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=135.521;QD=62.3288;RBI=0.0269553;REFB=0;REVB=0.0267728;RO=0;SAF=28;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000121404;OID=.;OPOS=184663537;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:15:28:0:0:15:28:0:0
chr1	184663581	.	T	C	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00890678;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.309;QD=50.4134;RBI=0.00911495;REFB=0;REVB=0.00193693;RO=0;SAF=13;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.851e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000120608;OID=.;OPOS=184663581;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:6:13:0:0:6:13:0:0
chr1	184675814	.	G	A	1153.61	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00388242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.308;QD=60.7162;RBI=0.0118525;REFB=0;REVB=0.0111986;RO=0;SAF=40;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60877e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.57101e-05;OID=.;OPOS=184675814;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:36:40:0:0:36:40:0:0
chr1	184677464	.	G	A	762.88	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0177856;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.8808;QD=63.5735;RBI=0.0499509;REFB=0;REVB=-0.0466772;RO=0;SAF=27;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000847697;OID=.;OPOS=184677464;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:48:0:0:47:48:1:20:27:0:0:20:28:0:0
chr1	184706212	.	GT	G	396.41	PASS	AF=1;AO=33;DP=34;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0545026;FXX=0.0294031;HRUN=2;LEN=1;MLLD=27.2152;QD=48.0493;RBI=0.0619215;REFB=0;REVB=-0.0293895;RO=0;SAF=17;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.60901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.00302629;OID=.;OPOS=184706213;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:33:34:33:33:0:17:16:0:0:7:0:17:16:0:0
chr1	184764067	.	C	G	918.25	PASS	AF=0.860759;AO=68;DP=81;FAO=68;FDP=79;FR=.;FRO=11;FSAF=26;FSAR=42;FSRF=10;FSRR=1;FWDB=0.036247;FXX=0.0246883;HRUN=3;LEN=1;MLLD=180.272;QD=46.4938;RBI=0.037229;REFB=-0.0432124;REVB=0.00849421;RO=5;SAF=26;SAR=42;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.056265;STB=0.574883;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.00079724;OID=.;OPOS=184764067;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:51:81:79:5:11:68:68:0.860759:42:26:4:1:42:26:10:1
chr1	184777177	.	C	A	977.06	PASS	AF=0.985294;AO=60;DP=63;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0856472;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.386;QD=57.4741;RBI=0.0875472;REFB=-0.00486231;REVB=0.0181402;RO=1;SAF=30;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154718;STB=0.506847;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.000225354;OID=.;OPOS=184777177;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:63:68:1:1:60:67:0.985294:30:30:1:0:31:36:1:0
chr1	185069561	.	A	G	206.58	PASS	AF=0.396825;AO=25;DP=63;FAO=25;FDP=63;FR=.;FRO=38;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=0.00921487;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.963;QD=13.1164;RBI=0.00975934;REFB=-0.00860027;REVB=0.00321415;RO=37;SAF=13;SAR=12;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0630533;STB=0.543691;STBP=0.559;TYPE=snp;VARB=0.0121701;OID=.;OPOS=185069561;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:37:38:25:25:0.396825:12:13:17:20:12:13:17:21
chr1	185069843	.	T	A	111.05	PASS	AF=0.271186;AO=16;DP=59;FAO=16;FDP=59;FR=.;FRO=43;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=27;FSRR=16;FWDB=-0.00521748;FXX=0;HRUN=9;LEN=1;MLLD=283.064;QD=7.52885;RBI=0.00609254;REFB=0.00456522;REVB=0.00314593;RO=43;SAF=8;SAR=8;SRF=27;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154063;STB=0.593108;STBP=0.414;TYPE=snp;VARB=-0.0126819;OID=.;OPOS=185069843;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:43:43:16:16:0.271186:8:8:27:16:8:8:27:16
chr1	185135745	.	A	G	102.97	PASS	AF=0.545455;AO=11;DP=21;FAO=12;FDP=22;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=-0.0133411;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.654;QD=18.7224;RBI=0.0206003;REFB=-0.00416103;REVB=-0.0156967;RO=10;SAF=6;SAR=5;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13078;STB=0.555466;STBP=0.642;TYPE=snp;VARB=0.00272308;OID=.;OPOS=185135745;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:21:22:10:10:11:12:0.545455:5:6:7:3:5:7:7:3
chr1	185137461	.	A	T	185.64	PASS	AF=0.369231;AO=26;DP=66;FAO=24;FDP=65;FR=.;FRO=41;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=26;FSRR=15;FWDB=0.0175151;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.608;QD=11.4237;RBI=0.0330727;REFB=-0.0104576;REVB=0.0280539;RO=36;SAF=11;SAR=15;SRF=25;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.271561;STB=0.609544;STBP=0.2;TYPE=snp;VARB=0.0154063;OID=.;OPOS=185137461;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:65:36:41:26:24:0.369231:15:11:25:11:13:11:26:15
chr1	185137463	.	TT	AA,TTAA	173.9	PASS	AF=0.0909091,0.272727;AO=5,12;DP=67;FAO=6,18;FDP=66;FR=.;FRO=42;FSAF=2,9;FSAR=4,9;FSRF=27;FSRR=15;FWDB=0.00189059,-0.00851096;FXX=0.0149231;HRUN=3,1;LEN=2,2;MLLD=62.7573,39.084;QD=10.5394;RBI=0.056964,0.0371117;REFB=-0.00831267,0.00153676;REVB=-0.0569326,-0.0361226;RO=46;SAF=2,7;SAR=3,5;SRF=28;SRR=18;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.229677,-0.0324505;STB=0.752493,0.599893;STBP=0.238,0.329;TYPE=mnp,ins;VARB=0.106435,-0.0156232;OID=.,.;OPOS=185137463,185137465;OREF=TT,-;OALT=AA,AA;OMAPALT=AA,TTAA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:67:66:46:42:5,12:6,18:0.0909091,0.272727:3,5:2,7:28:18:4,9:2,9:27:15
chr1	185143721	.	A	G	96.19	PASS	AF=0.375;AO=12;DP=32;FAO=12;FDP=32;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=5;FWDB=-0.015926;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.25;QD=12.0241;RBI=0.0217499;REFB=0.000854379;REVB=0.0148128;RO=20;SAF=5;SAR=7;SRF=15;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.34254;STB=0.6997;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=-0.0104389;OID=.;OPOS=185143721;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:32:32:20:20:12:12:0.375:7:5:15:5:7:5:15:5
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chr1	185984517	.	T	C	727.69	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.022761;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.278;QD=63.277;RBI=0.0228713;REFB=0;REVB=0.00224357;RO=0;SAF=22;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000148715;OID=.;OPOS=185984517;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:24:22:0:0:24:22:0:0
chr1	186052064	.	C	A	50.13	PASS	AF=0.0909091;AO=23;DP=227;FAO=21;FDP=231;FR=.;FRO=210;FSAF=4;FSAR=17;FSRF=104;FSRR=106;FWDB=-0.109688;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.5467;QD=0.868127;RBI=0.117481;REFB=-0.00802114;REVB=-0.0420777;RO=184;SAF=4;SAR=19;SRF=103;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.467852;STB=0.788375;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.150022;OID=.;OPOS=186052064;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:50:227:231:184:210:23:21:0.0909091:19:4:103:81:17:4:104:106
chr1	186141181	.	C	G	339.18	PASS	AF=0.473684;AO=36;DP=76;FAO=36;FDP=76;FR=.;FRO=40;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=0.00425741;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.955;QD=17.8514;RBI=0.00674319;REFB=0.00110477;REVB=0.00522926;RO=40;SAF=20;SAR=16;SRF=18;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.09935;STB=0.555525;STBP=0.391;TYPE=snp;VARB=-0.00108917;OID=.;OPOS=186141181;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:40:40:36:36:0.473684:16:20:18:22:16:20:18:22
chr1	186277088	.	G	C	109.03	PASS	AF=0.916667;AO=11;DP=12;FAO=11;FDP=12;FR=.;FRO=1;FSAF=0;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.0927;QD=36.3435;RBI=0.0514436;REFB=-0.0877113;REVB=-0.0514436;RO=0;SAF=0;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0448026;OID=.;OPOS=186277088;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:12:12:0:1:11:11:0.916667:11:0:0:0:11:0:0:1
chr1	186326757	.	TAAAAAC	TAAAAC,TAAAACA	104.82	PASS	AF=0.5,0;AO=15,2;DP=38;FAO=18,0;FDP=36;FR=.;FRO=18;FSAF=10,0;FSAR=8,0;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.0505147,0.0480066;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=1,2;MLLD=15.1179,18.23;QD=11.6471;RBI=0.0640989,0.0515064;REFB=0.0589153,0.0510669;REVB=0.0394581,0.0186619;RO=16;SAF=9,1;SAR=6,1;SRF=8;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0917347,0;STB=0.555494,0.5;STBP=0.502,1;TYPE=del,mnp;VARB=-0.0530341,0;OID=.,.;OPOS=186326758,186326762;OREF=A,AC;OALT=-,CA;OMAPALT=TAAAAC,TAAAACA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.5,0:15,2:38:18,0:36:18:10,0:8,0:8:10:99:16:9,1:6,1:8:8
chr1	186648197	.	C	G	210.03	PASS	AF=0.444444;AO=24;DP=55;FAO=24;FDP=54;FR=.;FRO=30;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=-0.0031066;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.662;QD=15.5574;RBI=0.0466461;REFB=0.00589602;REVB=0.0465426;RO=30;SAF=10;SAR=14;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114795;STB=0.565163;STBP=0.402;TYPE=snp;VARB=-0.00671969;OID=.;OPOS=186648197;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:54:30:30:24:24:0.444444:14:10:16:14:14:10:16:14
chr1	186839879	.	AAGAGTGC	AAGAGTG,AAGTGC	675.94	PASS	AF=0.00645161,0.470968;AO=23,50;DP=158;FAO=1,73;FDP=155;FR=.;FRO=81;FSAF=0,23;FSAR=1,50;FSRF=37;FSRR=44;FWDB=-0.141857,0.00860221;FXX=0.0189861;HRUN=3,1;LEN=1,2;MLLD=18.1352,230.744;QD=17.4437;RBI=0.363875,0.0208152;REFB=-0.114538,-0.0349076;REVB=-0.335085,-0.0189545;RO=57;SAF=6,12;SAR=17,38;SRF=30;SRR=27;SSEN=0.39666,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.330798,-0.306117;STB=0.98925,0.581147;STBP=0.489,0.081;TYPE=del,del;VARB=0.0952405,0.0408302;OID=.,.;OPOS=186839886,186839880;OREF=C,AG;OALT=-,-;OMAPALT=AAGAGTG,AAGTGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0.00645161,0.470968:23,50:158:1,73:155:81:0,23:1,50:37:44:99:57:6,12:17,38:30:27
chr1	186946912	.	G	A	1533.32	PASS	AF=1;AO=103;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000733149;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.4912;QD=59.5464;RBI=0.0649099;REFB=0;REVB=-0.0649058;RO=0;SAF=56;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.97864e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000397007;OID=.;OPOS=186946912;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:103:103:0:0:103:103:1:47:56:0:0:47:56:0:0
chr1	187610537	.	AC	GG	234.49	PASS	AF=0.55;AO=22;DP=42;FAO=22;FDP=40;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.00695079;FXX=0.0476077;HRUN=2;LEN=2;MLLD=315.42;QD=23.449;RBI=0.00891804;REFB=-0.00793723;REVB=0.00558729;RO=18;SAF=11;SAR=11;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0447114;STB=0.524977;STBP=0.744;TYPE=mnp;VARB=0.0058559;OID=.;OPOS=187610537;OREF=AC;OALT=GG;OMAPALT=GG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:40:18:18:22:22:0.55:11:11:8:10:11:11:8:10
chr1	187610852	.	A	C	143.72	PASS	AF=0.444444;AO=15;DP=36;FAO=16;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.0501619;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.242;QD=15.9687;RBI=0.0504523;REFB=-0.00644211;REVB=-0.00540596;RO=20;SAF=6;SAR=9;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0507199;STB=0.507033;STBP=0.94;TYPE=snp;VARB=0.00907315;OID=.;OPOS=187610852;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:20:20:15:16:0.444444:9:6:9:11:9:7:9:11
chr1	192781172	.	C	G	900.63	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000708475;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.85;QD=58.1054;RBI=0.00664031;REFB=0;REVB=-0.00660241;RO=0;SAF=22;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.25018e-05;OID=.;OPOS=192781172;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:40:22:0:0:40:22:0:0
chr1	192844886	.	G	A	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0223547;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.896;QD=55.0986;RBI=0.0309398;REFB=0;REVB=0.0213901;RO=0;SAF=15;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000355708;OID=.;OPOS=192844886;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:11:15:0:0:11:15:0:0
chr1	193054154	.	G	A	1171.99	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0150431;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.85;QD=60.8825;RBI=0.0205752;REFB=0;REVB=-0.0140372;RO=0;SAF=38;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5078e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.68449e-05;OID=.;OPOS=193054154;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:39:38:0:0:39:38:0:0
chr1	193074651	.	T	A	1496.35	PASS	AF=1;AO=100;DP=102;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0195497;FXX=0.0196059;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.9949;QD=59.8539;RBI=0.0657352;REFB=0;REVB=0.0627609;RO=0;SAF=48;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.19274e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000485808;OID=.;OPOS=193074651;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:102:100:0:0:100:100:1:52:48:0:0:52:48:0:0
chr1	193701055	.	G	C	440.7	PASS	AF=0.488889;AO=44;DP=90;FAO=44;FDP=90;FR=.;FRO=46;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=25;FSRR=21;FWDB=-0.0440639;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.584;QD=19.5866;RBI=0.0443561;REFB=-0.0231725;REVB=-0.00508224;RO=46;SAF=21;SAR=23;SRF=25;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0608417;STB=0.533789;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=0.0123544;OID=.;OPOS=193701055;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:46:46:44:44:0.488889:23:21:25:21:23:21:25:21
chr1	193701480	.	G	A	253.48	PASS	AF=0.320388;AO=33;DP=103;FAO=33;FDP=103;FR=.;FRO=70;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=39;FSRR=31;FWDB=-0.0117062;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.995;QD=9.84401;RBI=0.0137272;REFB=-0.00779175;REVB=0.00716933;RO=70;SAF=18;SAR=15;SRF=39;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0137565;STB=0.508017;STBP=0.922;TYPE=snp;VARB=0.0144341;OID=.;OPOS=193701480;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:103:70:70:33:33:0.320388:15:18:39:31:15:18:39:31
chr1	193701489	.	C	T	236.32	PASS	AF=0.304762;AO=32;DP=104;FAO=32;FDP=105;FR=.;FRO=73;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=41;FSRR=32;FWDB=-0.0203708;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.0659;QD=9.0026;RBI=0.0217311;REFB=-0.00711371;REVB=-0.00756784;RO=72;SAF=17;SAR=15;SRF=40;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.028875;STB=0.521257;STBP=0.772;TYPE=snp;VARB=0.0158012;OID=.;OPOS=193701489;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:105:72:73:32:32:0.304762:15:17:40:32:15:17:41:32
chr1	194457292	.	T	C	961.67	PASS	AF=0.985075;AO=65;DP=67;FAO=66;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00551141;FXX=0.0147037;HRUN=4;LEN=1;MLLD=184.699;QD=57.4132;RBI=0.0269439;REFB=-0.123601;REVB=0.0263742;RO=1;SAF=32;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141005;STB=0.50746;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.000293062;OID=.;OPOS=194457292;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:67:67:1:1:65:66:0.985075:33:32:0:1:33:33:0:1
chr1	196227526	.	A	G	1415.43	PASS	AF=1;AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00572689;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=312.168;QD=62.9081;RBI=0.0242404;REFB=0;REVB=-0.0235542;RO=0;SAF=41;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.59742e-05;OID=.;OPOS=196227526;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:90:90:0:0:90:90:1:49:41:0:0:49:41:0:0
chr1	196642233	.	G	A	195.8	PASS	AF=0.454545;AO=20;DP=44;FAO=20;FDP=44;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=-0.0411708;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.4252;QD=17.7997;RBI=0.0416667;REFB=0.00640949;REVB=-0.00640991;RO=24;SAF=5;SAR=15;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188129;STB=0.607993;STBP=0.239;TYPE=snp;VARB=-0.00892695;OID=.;OPOS=196642233;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:24:24:20:20:0.454545:15:5:10:14:15:5:10:14
chr1	196654324	.	A	C	1967.78	PASS	AF=0.977444;AO=129;DP=133;FAO=130;FDP=133;FR=.;FRO=3;FSAF=66;FSAR=64;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.024357;FXX=0.0148137;HRUN=4;LEN=1;MLLD=51.7189;QD=59.1814;RBI=0.0248604;REFB=-0.133701;REVB=-0.00497766;RO=3;SAF=66;SAR=63;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00669839;STB=0.503587;STBP=0.724;TYPE=snp;VARB=0.00164768;OID=.;OPOS=196654324;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:133:133:3:3:129:130:0.977444:63:66:2:1:64:66:2:1
chr1	196659237	.	C	T	1208.07	PASS	AF=0.987654;AO=79;DP=80;FAO=80;FDP=81;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0193567;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.681;QD=59.6578;RBI=0.021869;REFB=-0.160623;REVB=0.0101769;RO=0;SAF=39;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33478e-08;STB=0.506171;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.00134886;OID=.;OPOS=196659237;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:80:81:0:1:79:80:0.987654:40:39:0:0:40:40:1:0
chr1	196682947	.	G	A	429.95	PASS	AF=0.5;AO=43;DP=86;FAO=43;FDP=86;FR=.;FRO=43;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=27;FWDB=-0.0140087;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.3837;QD=19.9977;RBI=0.0168275;REFB=-0.0204821;REVB=-0.00932305;RO=42;SAF=26;SAR=17;SRF=16;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198959;STB=0.615662;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.00893223;OID=.;OPOS=196682947;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:42:43:43:43:0.5:17:26:16:26:17:26:16:27
chr1	196695742	.	A	G	446.8	PASS	AF=0.401575;AO=51;DP=127;FAO=51;FDP=127;FR=.;FRO=76;FSAF=21;FSAR=30;FSRF=36;FSRR=40;FWDB=0.0026195;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.25;QD=14.0725;RBI=0.00311252;REFB=0.00575723;REVB=0.00168108;RO=76;SAF=21;SAR=30;SRF=36;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0667794;STB=0.537721;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=-0.00916214;OID=.;OPOS=196695742;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:127:127:76:76:51:51:0.401575:30:21:36:40:30:21:36:40
chr1	196709774	.	G	T	580.67	PASS	AF=0.569892;AO=53;DP=93;FAO=53;FDP=93;FR=.;FRO=40;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=24;FSRR=16;FWDB=-0.0494823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.2035;QD=24.9749;RBI=0.0526489;REFB=0.00780927;REVB=-0.0179833;RO=40;SAF=22;SAR=31;SRF=24;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145496;STB=0.579645;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=-0.007148;OID=.;OPOS=196709774;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:40:40:53:53:0.569892:31:22:24:16:31:22:24:16
chr1	196712586	.	C	T	416.8	PASS	AF=0.344828;AO=50;DP=145;FAO=50;FDP=145;FR=.;FRO=95;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=44;FSRR=51;FWDB=0.00189254;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.5977;QD=11.4979;RBI=0.00271494;REFB=0.0133591;REVB=-0.00194658;RO=95;SAF=24;SAR=26;SRF=44;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0192728;STB=0.511058;STBP=0.84;TYPE=snp;VARB=-0.022949;OID=.;OPOS=196712586;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:145:145:95:95:50:50:0.344828:26:24:44:51:26:24:44:51
chr1	196757392	.	C	T	1293.44	PASS	AF=1;AO=83;DP=85;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0239596;FXX=0.0117633;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.527;QD=61.5923;RBI=0.0262153;REFB=0;REVB=-0.0106384;RO=0;SAF=38;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.04629e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000178173;OID=.;OPOS=196757392;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:84:0:0:83:84:1:45:38:0:0:45:39:0:0
chr1	196757874	.	G	A	263.62	PASS	AF=0.434783;AO=30;DP=69;FAO=30;FDP=69;FR=.;FRO=39;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=27;FSRR=12;FWDB=-0.0142638;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.852;QD=15.2822;RBI=0.0650547;REFB=-0.0108718;REVB=-0.0634717;RO=39;SAF=14;SAR=16;SRF=27;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.223888;STB=0.625874;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=0.0100939;OID=.;OPOS=196757874;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:39:39:30:30:0.434783:16:14:27:12:16:14:27:12
chr1	196757881	.	G	T	261.57	PASS	AF=0.434783;AO=29;DP=68;FAO=30;FDP=69;FR=.;FRO=39;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=27;FSRR=12;FWDB=-0.00885625;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.044;QD=15.1635;RBI=0.0117039;REFB=-0.0116658;REVB=-0.0076516;RO=37;SAF=13;SAR=16;SRF=25;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.2229;STB=0.625874;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=0.0158691;OID=.;OPOS=196757881;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:69:37:39:29:30:0.434783:16:13:25:12:16:14:27:12
chr1	196797238	.	C	T	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0303331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.5566;QD=49.5991;RBI=0.0422623;REFB=0;REVB=-0.029428;RO=0;SAF=12;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.50189e-05;OID=.;OPOS=196797238;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:6:12:0:0:6:12:0:0
chr1	196797244	.	C	G	207.58	PASS	AF=1;AO=15;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0375528;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.3042;QD=48.8417;RBI=0.037584;REFB=0;REVB=-0.00153033;RO=0;SAF=10;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00176096;OID=.;OPOS=196797244;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:15:17:1:5:10:0:0:5:12:0:0
chr1	196799691	.	G	A	562.22	PASS	AF=0.5;AO=58;DP=117;FAO=58;FDP=116;FR=.;FRO=58;FSAF=22;FSAR=36;FSRF=28;FSRR=30;FWDB=0.00624967;FXX=0.00854628;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.0031;QD=19.3868;RBI=0.0194026;REFB=0.0100543;REVB=-0.0183685;RO=57;SAF=22;SAR=36;SRF=28;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1036;STB=0.553487;STBP=0.263;TYPE=snp;VARB=-0.0125816;OID=.;OPOS=196799691;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:117:116:57:58:58:58:0.5:36:22:28:29:36:22:28:30
chr1	196801042	.	G	T	2636.97	PASS	AF=0.977401;AO=172;DP=177;FAO=173;FDP=177;FR=.;FRO=4;FSAF=91;FSAR=82;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.00637655;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=279.326;QD=59.5925;RBI=0.00649962;REFB=0.0745006;REVB=0.00125884;RO=3;SAF=90;SAR=82;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0062071;STB=0.500589;STBP=0.899;TYPE=snp;VARB=-0.000153734;OID=.;OPOS=196801042;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:177:177:3:4:172:173:0.977401:82:90:1:2:82:91:2:2
chr1	196801078	.	A	T	2335.68	PASS	AF=1;AO=153;DP=153;FAO=153;FDP=153;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0037414;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.822;QD=61.0635;RBI=0.0291031;REFB=0;REVB=-0.0288616;RO=0;SAF=79;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60783e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.21356e-05;OID=.;OPOS=196801078;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:153:153:0:0:153:153:1:74:79:0:0:74:79:0:0
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chr1	196876458	.	A	G	490.64	PASS	AF=0.432;AO=54;DP=125;FAO=54;FDP=125;FR=.;FRO=71;FSAF=27;FSAR=27;FSRF=30;FSRR=41;FWDB=0.00378887;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=101.781;QD=15.7005;RBI=0.0478447;REFB=-0.0056435;REVB=0.0476944;RO=71;SAF=27;SAR=27;SRF=30;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0786155;STB=0.543984;STBP=0.416;TYPE=snp;VARB=0.00939872;OID=.;OPOS=196876458;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:125:125:71:71:54:54:0.432:27:27:30:41:27:27:30:41
chr1	196884258	.	A	T	78.86	PASS	AF=0.229167;AO=11;DP=48;FAO=11;FDP=48;FR=.;FRO=37;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=0.0456045;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.561;QD=6.57177;RBI=0.0486438;REFB=0.00297951;REVB=-0.0169249;RO=37;SAF=1;SAR=10;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.595396;STB=0.885307;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=-0.00670777;OID=.;OPOS=196884258;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:48:48:37:37:11:11:0.229167:10:1:20:17:10:1:20:17
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chr1	196920148	.	C	T	327.39	PASS	AF=0.472973;AO=35;DP=74;FAO=35;FDP=74;FR=.;FRO=39;FSAF=27;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=-0.004644;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.055;QD=17.6968;RBI=0.00731874;REFB=-0.0260155;REVB=-0.00565661;RO=39;SAF=27;SAR=8;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.282846;STB=0.659629;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.0233099;OID=.;OPOS=196920148;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:39:39:35:35:0.472973:8:27:20:19:8:27:20:19
chr1	197009798	.	A	G	358.23	PASS	AF=0.44186;AO=38;DP=85;FAO=38;FDP=86;FR=.;FRO=48;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=26;FSRR=22;FWDB=0.0525968;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.1874;QD=16.6619;RBI=0.0529351;REFB=0.0204216;REVB=-0.00597463;RO=47;SAF=18;SAR=20;SRF=26;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0781789;STB=0.537877;STBP=0.556;TYPE=snp;VARB=-0.0130439;OID=.;OPOS=197009798;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:86:47:48:38:38:0.44186:20:18:26:21:20:18:26:22
chr1	197030201	.	T	C	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0060911;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.322;QD=55.6556;RBI=0.0169218;REFB=0;REVB=0.0157876;RO=0;SAF=12;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000103465;OID=.;OPOS=197030201;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:15:12:0:0:15:12:0:0
chr1	197031021	.	C	T	1419.44	PASS	AF=0.98913;AO=91;DP=92;FAO=91;FDP=92;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=44;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00803037;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.354;QD=61.7147;RBI=0.00869742;REFB=-0.0176251;REVB=-0.0033404;RO=1;SAF=47;SAR=44;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0099791;STB=0.505262;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=4.02137e-05;OID=.;OPOS=197031021;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:92:92:1:1:91:91:0.98913:44:47:1:0:44:47:1:0
chr1	197070442	.	G	T	106.32	PASS	AF=0.361111;AO=13;DP=36;FAO=13;FDP=36;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=-0.0102782;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.815;QD=11.8134;RBI=0.0232671;REFB=-0.00205916;REVB=-0.0208739;RO=23;SAF=8;SAR=5;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.238875;STB=0.641136;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=0.00331153;OID=.;OPOS=197070442;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:23:23:13:13:0.361111:5:8:9:14:5:8:9:14
chr1	197070697	.	T	C	135.33	PASS	AF=0.46875;AO=14;DP=31;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=13;FWDB=0.100583;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.4406;QD=16.9166;RBI=0.116523;REFB=-0.0139992;REVB=0.0588269;RO=17;SAF=6;SAR=8;SRF=4;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.195189;STB=0.625378;STBP=0.225;TYPE=snp;VARB=0.0213723;OID=.;OPOS=197070697;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:32:17:17:14:15:0.46875:8:6:4:13:8:7:4:13
chr1	197070707	.	G	A	150.09	PASS	AF=0.516129;AO=16;DP=30;FAO=16;FDP=31;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=13;FWDB=-0.00138885;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.326;QD=19.3668;RBI=0.0138674;REFB=-0.00306027;REVB=-0.0137977;RO=14;SAF=7;SAR=9;SRF=1;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.326506;STB=0.65515;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=0.00256867;OID=.;OPOS=197070707;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:31:14:15:16:16:0.516129:9:7:1:13:9:7:2:13
chr1	197070776	.	C	T	116.21	PASS	AF=0.565217;AO=13;DP=23;FAO=13;FDP=23;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=-0.0116991;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.735;QD=20.2102;RBI=0.0356906;REFB=-0.0169891;REVB=-0.0337187;RO=10;SAF=4;SAR=9;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00691362;STB=0.503931;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0104648;OID=.;OPOS=197070776;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:23:23:10:10:13:13:0.565217:9:4:3:7:9:4:3:7
chr1	197070815	.	T	C	368.87	PASS	AF=1;AO=26;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00187455;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.195;QD=54.6479;RBI=0.0612954;REFB=0;REVB=0.0612668;RO=0;SAF=9;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00143409;OID=.;OPOS=197070815;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:26:27:1:17:9:0:0:18:9:0:0
chr1	197070901	.	A	G	594.48	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0224781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.0485;QD=60.9727;RBI=0.0244812;REFB=0;REVB=0.00969869;RO=0;SAF=25;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000435721;OID=.;OPOS=197070901;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:14:25:0:0:14:25:0:0
chr1	197072420	.	T	C	161.52	PASS	AF=0.344262;AO=21;DP=61;FAO=21;FDP=61;FR=.;FRO=40;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=20;FWDB=0.00964451;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=284.305;QD=10.5912;RBI=0.0190138;REFB=-0.000626692;REVB=-0.0163862;RO=40;SAF=13;SAR=8;SRF=20;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135812;STB=0.579541;STBP=0.372;TYPE=snp;VARB=0.0012157;OID=.;OPOS=197072420;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:40:40:21:21:0.344262:8:13:20:20:8:13:20:20
chr1	197073932	.	T	C	185.55	PASS	AF=0.407407;AO=22;DP=54;FAO=22;FDP=54;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=-0.00793778;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=71.564;QD=13.7444;RBI=0.0269704;REFB=-0.0104326;REVB=-0.0257758;RO=32;SAF=14;SAR=8;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0467638;STB=0.526857;STBP=0.751;TYPE=snp;VARB=0.017086;OID=.;OPOS=197073932;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:32:32:22:22:0.407407:8:14:19:13:8:14:19:13
chr1	197091537	.	A	T	538.54	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0718026;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.836;QD=59.8381;RBI=0.0718295;REFB=0;REVB=0.00196603;RO=0;SAF=19;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000344986;OID=.;OPOS=197091537;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:17:19:0:0:17:19:0:0
chr1	197112533	.	G	A	837.25	PASS	AF=0.983333;AO=58;DP=59;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0601067;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.8;QD=55.8168;RBI=0.0602044;REFB=-0.139772;REVB=0.00342895;RO=0;SAF=28;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507934;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.000439569;OID=.;OPOS=197112533;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:59:60:0:1:58:59:0.983333:30:28:0:0:31:28:0:1
chr1	197127041	.	CA	C	176.37	PASS	AF=1;AO=21;DP=25;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0698974;FXX=0.0370233;HRUN=7;LEN=1;MLLD=9.29431;QD=27.134;RBI=0.0817828;REFB=-0.00677834;REVB=0.0424592;RO=2;SAF=13;SAR=8;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0200927;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000834432;OID=.;OPOS=197127042;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:21:25:26:26:0:16:10:0:0:3:2:13:8:1:1
chr1	197127491	.	A	C	402.81	PASS	AF=0.398305;AO=47;DP=117;FAO=47;FDP=118;FR=.;FRO=71;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=31;FSRR=40;FWDB=-0.0364727;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.235;QD=13.6544;RBI=0.0365839;REFB=-0.00194043;REVB=0.00285019;RO=70;SAF=24;SAR=23;SRF=30;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0868;STB=0.544454;STBP=0.457;TYPE=snp;VARB=0.00260965;OID=.;OPOS=197127491;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:117:118:70:71:47:47:0.398305:23:24:30:40:23:24:31:40
chr1	197128726	.	G	A	165.16	PASS	AF=0.377358;AO=20;DP=53;FAO=20;FDP=53;FR=.;FRO=33;FSAF=4;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=-0.0243462;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=61.3234;QD=12.465;RBI=0.0546002;REFB=-0.00236035;REVB=0.0488716;RO=33;SAF=4;SAR=16;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.353449;STB=0.707735;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.00446166;OID=.;OPOS=197128726;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:33:33:20:20:0.377358:16:4:16:17:16:4:16:17
chr1	197390368	.	A	G	920.1	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186451;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.889;QD=58.4192;RBI=0.0243625;REFB=0;REVB=0.015681;RO=0;SAF=24;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51964e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000113394;OID=.;OPOS=197390368;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:39:24:0:0:39:24:0:0
chr1	197446702	.	G	T	443.2	PASS	AF=0.5;AO=44;DP=88;FAO=44;FDP=88;FR=.;FRO=44;FSAF=28;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=25;FWDB=-0.0164531;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.1226;QD=20.1456;RBI=0.0184095;REFB=-0.0174603;REVB=-0.00825871;RO=44;SAF=28;SAR=16;SRF=19;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18762;STB=0.604162;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.0156916;OID=.;OPOS=197446702;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:44:44:44:44:0.5:16:28:19:25:16:28:19:25
chr1	197684139	.	T	A	34.91	PASS	AF=0.583333;AO=6;DP=10;FAO=7;FDP=12;FR=.;FRO=5;FSAF=7;FSAR=0;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=-0.0229345;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=15.1425;QD=11.6369;RBI=0.0229345;REFB=-0.148013;REVB=0;RO=4;SAF=6;SAR=0;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.11986;OID=.;OPOS=197684139;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:10:12:4:5:6:7:0.583333:0:6:4:0:0:7:5:0
chr1	197742171	.	C	T	221.87	PASS	AF=0.458333;AO=22;DP=48;FAO=22;FDP=48;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=0.00134289;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.334;QD=18.4893;RBI=0.00663468;REFB=-0.0295962;REVB=-0.00649735;RO=26;SAF=14;SAR=8;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0214666;STB=0.512184;STBP=0.89;TYPE=snp;VARB=0.0258119;OID=.;OPOS=197742171;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:26:26:22:22:0.458333:8:14:16:10:8:14:16:10
chr1	197874949	.	T	C	235.64	PASS	AF=0.394366;AO=27;DP=70;FAO=28;FDP=71;FR=.;FRO=43;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=23;FSRR=20;FWDB=0.000195046;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.393;QD=13.2756;RBI=0.0171012;REFB=-0.000627891;REVB=-0.0171001;RO=43;SAF=9;SAR=18;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.221479;STB=0.609777;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=0.00112509;OID=.;OPOS=197874949;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:71:43:43:27:28:0.394366:18:9:23:20:18:10:23:20
chr1	199977636	.	C	A	1396.21	PASS	AF=1;AO=86;DP=87;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0402013;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.309;QD=62.7512;RBI=0.0431857;REFB=0;REVB=0.0157753;RO=0;SAF=44;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.51239e-05;OID=.;OPOS=199977636;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:89:0:0:86:89:1:42:44:0:0:43:46:0:0
chr1	199977724	.	G	T	920.91	PASS	AF=0.969697;AO=64;DP=68;FAO=64;FDP=66;FR=.;FRO=2;FSAF=32;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0657644;FXX=0.0294074;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.7074;QD=55.8128;RBI=0.0667681;REFB=-0.0145633;REVB=0.0115331;RO=2;SAF=32;SAR=32;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0286044;STB=0.515147;STBP=0.233;TYPE=snp;VARB=0.00320534;OID=.;OPOS=199977724;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:68:66:2:2:64:64:0.969697:32:32:0:2:32:32:0:2
chr1	200143281	.	C	T	284.46	PASS	AF=0.577778;AO=25;DP=47;FAO=26;FDP=45;FR=.;FRO=19;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=-0.00581648;FXX=0.0425441;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.561;QD=25.2851;RBI=0.0419457;REFB=-0.00168842;REVB=-0.0415405;RO=19;SAF=17;SAR=8;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0424168;STB=0.510311;STBP=0.902;TYPE=snp;VARB=0.00103791;OID=.;OPOS=200143281;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:45:19:19:25:26:0.577778:8:17:12:7:9:17:12:7
chr1	200146493	.	GAAT	GAA,GA,GAT	69.83	PASS	AF=0.0416667,0,0.416667;AO=4,3,7;DP=23;FAO=1,0,10;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=1,0,7;FSAR=0,0,3;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=0.0147425,0.015304,0.0144097;FXX=0;HRUN=10,2,2;LEN=1,2,1;MLLD=6.96958,24.9918,25.0011;QD=11.6385;RBI=0.390445,0.276651,0.105355;REFB=-0.0521049,-0.0344397,-0.0119067;REVB=-0.390166,-0.276228,-0.104365;RO=9;SAF=2,1,6;SAR=2,2,1;SRF=4;SRR=5;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.0579645,-0.123106,0.45597;STB=0.991536,0.5,0.681047;STBP=0.252,1,0.181;TYPE=del,del,del;VARB=0.0367811,0.0527868,0.0162584;OID=.,.,.;OPOS=200146496,200146495,200146494;OREF=T,AT,A;OALT=-,-,-;OMAPALT=GAA,GA,GAT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/3:0.0416667,0,0.416667:4,3,7:23:1,0,10:24:13:1,0,7:0,0,3:5:8:53:9:2,1,6:2,2,1:4:5
chr1	200182799	.	G	A	343.14	PASS	AF=0.493151;AO=36;DP=73;FAO=36;FDP=73;FR=.;FRO=37;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=-0.00849592;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.808;QD=18.8024;RBI=0.00914848;REFB=-0.00752747;REVB=-0.00339322;RO=36;SAF=15;SAR=21;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0758524;STB=0.549626;STBP=0.426;TYPE=snp;VARB=0.010961;OID=.;OPOS=200182799;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:36:37:36:36:0.493151:21:15:18:18:21:15:19:18
chr1	200182834	.	A	G	1206.1	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0221451;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.546;QD=61.0682;RBI=0.0298073;REFB=0;REVB=0.0199516;RO=0;SAF=34;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.11157e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000209372;OID=.;OPOS=200182834;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:79:0:0:77:79:1:43:34:0:0:43:36:0:0
chr1	200183398	.	C	A	798.72	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0196701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.507;QD=57.0515;RBI=0.0203886;REFB=0;REVB=-0.00536493;RO=0;SAF=24;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000138026;OID=.;OPOS=200183398;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:56:0:0:53:56:1:29:24:0:0:29:27:0:0
chr1	200311868	.	C	G	187.62	PASS	AF=0.415094;AO=22;DP=53;FAO=22;FDP=53;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=-0.000513389;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.174;QD=14.1602;RBI=0.0246016;REFB=-0.0306339;REVB=0.0245962;RO=31;SAF=12;SAR=10;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0300867;STB=0.517226;STBP=0.842;TYPE=snp;VARB=0.0413643;OID=.;OPOS=200311868;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:31:31:22:22:0.415094:10:12:16:15:10:12:16:15
chr1	200574959	.	T	C	473.89	PASS	AF=0.56962;AO=43;DP=78;FAO=45;FDP=79;FR=.;FRO=34;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=21;FSRR=13;FWDB=0.0338627;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.119;QD=23.9946;RBI=0.0351803;REFB=-0.0252884;REVB=0.0095381;RO=34;SAF=23;SAR=20;SRF=21;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0671681;STB=0.536611;STBP=0.486;TYPE=snp;VARB=0.0146559;OID=.;OPOS=200574959;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:79:34:34:43:45:0.56962:20:23:21:13:21:24:21:13
chr1	200586744	.	T	C	209.34	PASS	AF=0.409836;AO=25;DP=61;FAO=25;FDP=61;FR=.;FRO=36;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=25;FSRR=11;FWDB=-0.0125836;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.7747;QD=13.7269;RBI=0.0129157;REFB=0.0153473;REVB=-0.00291017;RO=35;SAF=11;SAR=14;SRF=25;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.275974;STB=0.646872;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=-0.0239448;OID=.;OPOS=200586744;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:35:36:25:25:0.409836:14:11:25:10:14:11:25:11
chr1	200618238	.	T	C	785.88	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0339284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.716;QD=64.1533;RBI=0.0493807;REFB=0;REVB=0.0358793;RO=0;SAF=19;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.48867e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000131649;OID=.;OPOS=200618238;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:30:19:0:0:30:19:0:0
chr1	200730170	.	A	G	57.47	PASS	AF=0.380952;AO=8;DP=22;FAO=8;FDP=21;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.0510064;FXX=0.0454339;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.5681;QD=10.9463;RBI=0.0514064;REFB=5.11529e-06;REVB=-0.00640006;RO=13;SAF=4;SAR=4;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0392276;STB=0.52375;STBP=0.906;TYPE=snp;VARB=-0.00494248;OID=.;OPOS=200730170;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:22:21:13:13:8:8:0.380952:4:4:7:6:4:4:7:6
chr1	200880978	.	C	T	110.85	PASS	AF=1;AO=10;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.169045;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.5629;QD=40.3085;RBI=0.19481;REFB=0;REVB=0.0968234;RO=1;SAF=5;SAR=5;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0811734;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0125779;OID=.;OPOS=200880978;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:1:0:10:11:1:5:5:1:0:5:6:0:0
chr1	200881172	.	C	A	49.33	PASS	AF=0.666667;AO=6;DP=10;FAO=6;FDP=9;FR=.;FRO=3;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0281465;FXX=0.181653;HRUN=5;LEN=1;MLLD=66.6048;QD=21.9261;RBI=0.167999;REFB=0.0125508;REVB=-0.165624;RO=3;SAF=4;SAR=2;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.236104;STB=0.635975;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=-0.00880156;OID=.;OPOS=200881172;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:17:10:9:3:3:6:6:0.666667:2:4:3:0:2:4:3:0
chr1	200940180	.	G	A	217.92	PASS	AF=0.40625;AO=26;DP=64;FAO=26;FDP=64;FR=.;FRO=38;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=23;FSRR=15;FWDB=-0.00538294;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=168.025;QD=13.6198;RBI=0.0198583;REFB=-0.00720748;REVB=-0.0191148;RO=38;SAF=13;SAR=13;SRF=23;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109595;STB=0.562453;STBP=0.439;TYPE=snp;VARB=0.0148713;OID=.;OPOS=200940180;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:38:38:26:26:0.40625:13:13:23:15:13:13:23:15
chr1	200956288	.	A	G	310.6	PASS	AF=0.584906;AO=31;DP=53;FAO=31;FDP=53;FR=.;FRO=22;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=-0.00274369;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.78;QD=23.4414;RBI=0.0524184;REFB=0.00238944;REVB=-0.0523465;RO=22;SAF=16;SAR=15;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0804192;STB=0.544321;STBP=0.485;TYPE=snp;VARB=-0.00205071;OID=.;OPOS=200956288;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:22:22:31:31:0.584906:15:16:9:13:15:16:9:13
chr1	200957691	.	G	C	55.87	PASS	AF=1;AO=6;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.021765;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=126.43;QD=31.9278;RBI=0.0359184;REFB=0;REVB=0.028573;RO=0;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0013669;OID=.;OPOS=200957691;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:6:7:1:5:1:0:0:5:2:0:0
chr1	200959302	.	G	A	430.53	PASS	AF=0.730769;AO=37;DP=51;FAO=38;FDP=52;FR=.;FRO=14;FSAF=25;FSAR=13;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.00749312;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.4325;QD=33.1173;RBI=0.00786013;REFB=-0.0253478;REVB=0.00237376;RO=13;SAF=24;SAR=13;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132874;STB=0.565697;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=0.0145974;OID=.;OPOS=200959302;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:52:13:14:37:38:0.730769:13:24:5:8:13:25:6:8
chr1	201030461	.	G	A	132.97	PASS	AF=0.310345;AO=17;DP=57;FAO=18;FDP=58;FR=.;FRO=40;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=-0.00568323;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.419;QD=9.17008;RBI=0.044076;REFB=-0.0080776;REVB=0.0437081;RO=40;SAF=8;SAR=9;SRF=21;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0636135;STB=0.555494;STBP=0.61;TYPE=snp;VARB=0.0187734;OID=.;OPOS=201030461;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:58:40:40:17:18:0.310345:9:8:21:19:10:8:21:19
chr1	201038651	.	G	A	386.52	PASS	AF=0.549296;AO=39;DP=71;FAO=39;FDP=71;FR=.;FRO=32;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=0.007452;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.119;QD=21.7757;RBI=0.0556528;REFB=-0.0296185;REVB=0.0551516;RO=32;SAF=23;SAR=16;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0488662;STB=0.526963;STBP=0.645;TYPE=snp;VARB=0.0235507;OID=.;OPOS=201038651;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:32:32:39:39:0.549296:16:23:17:15:16:23:17:15
chr1	201112981	.	A	G	465.13	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0554276;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.0245;QD=58.141;RBI=0.0628096;REFB=0;REVB=0.0295437;RO=0;SAF=21;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00143678;OID=.;OPOS=201112981;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:11:21:0:0:11:21:0:0
chr1	201115822	.	A	G	388.39	PASS	AF=0.481928;AO=39;DP=82;FAO=40;FDP=83;FR=.;FRO=43;FSAF=27;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=25;FWDB=-0.03837;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.4741;QD=18.7174;RBI=0.0612972;REFB=0.000694052;REVB=-0.0478026;RO=43;SAF=27;SAR=12;SRF=18;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.266365;STB=0.636801;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=-0.00226846;OID=.;OPOS=201115822;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:83:43:43:39:40:0.481928:12:27:18:25:13:27:18:25
chr1	201122947	.	T	G	632.17	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0545609;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.3316;QD=61.6751;RBI=0.0728649;REFB=0;REVB=0.0482949;RO=0;SAF=22;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.79682e-05;OID=.;OPOS=201122947;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:19:22:0:0:19:22:0:0
chr1	201166383	.	G	A	233.36	PASS	AF=0.435484;AO=27;DP=62;FAO=27;FDP=62;FR=.;FRO=35;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=14;FWDB=-0.0622931;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.0201;QD=15.0552;RBI=0.0642379;REFB=-0.0335217;REVB=0.0156869;RO=35;SAF=11;SAR=16;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190748;STB=0.607996;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=0.0416834;OID=.;OPOS=201166383;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:35:35:27:27:0.435484:16:11:21:14:16:11:21:14
chr1	201166435	.	T	C	167.5	PASS	AF=0.384615;AO=20;DP=53;FAO=20;FDP=52;FR=.;FRO=32;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=-0.0416986;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.161;QD=12.8848;RBI=0.044148;REFB=-0.0212632;REVB=-0.0145008;RO=32;SAF=7;SAR=13;SRF=20;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.289428;STB=0.64985;STBP=0.109;TYPE=snp;VARB=0.0335796;OID=.;OPOS=201166435;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:52:32:32:20:20:0.384615:13:7:20:12:13:7:19:13
chr1	201175227	.	C	A	1286.69	PASS	AF=0.988235;AO=84;DP=85;FAO=84;FDP=85;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0407207;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.7497;QD=60.55;RBI=0.0453739;REFB=-0.0676127;REVB=0.0200155;RO=1;SAF=41;SAR=43;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0108888;STB=0.505746;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=0.000857248;OID=.;OPOS=201175227;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:85:85:1:1:84:84:0.988235:43:41:0:1:43:41:0:1
chr1	201175274	.	A	G	315.2	PASS	AF=0.344538;AO=30;DP=107;FAO=41;FDP=119;FR=.;FRO=78;FSAF=11;FSAR=30;FSRF=37;FSRR=41;FWDB=-0.0124214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.894;QD=10.5951;RBI=0.0139863;REFB=-0.0195002;REVB=0.00642859;RO=76;SAF=7;SAR=23;SRF=36;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.319012;STB=0.64828;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.0426281;OID=.;OPOS=201175274;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:119:76:78:30:41:0.344538:23:7:36:40:30:11:37:41
chr1	201175715	.	G	T	786.55	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0210791;FXX=0.017854;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.288;QD=57.2033;RBI=0.0426796;REFB=0;REVB=0.0371109;RO=0;SAF=18;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.85968e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000242304;OID=.;OPOS=201175715;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:37:18:0:0:37:18:0:0
chr1	201176018	.	A	G	424.67	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0138005;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.217;QD=56.623;RBI=0.0140224;REFB=0;REVB=-0.00248473;RO=0;SAF=13;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.13493e-05;OID=.;OPOS=201176018;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:30:0:0:28:30:1:15:13:0:0:16:14:0:0
chr1	201176108	.	G	A	280.93	PASS	AF=0.625;AO=25;DP=40;FAO=25;FDP=40;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=18;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.0500579;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=188.289;QD=28.0931;RBI=0.0574243;REFB=-0.0470244;REVB=0.0281381;RO=15;SAF=7;SAR=18;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145385;STB=0.580577;STBP=0.209;TYPE=snp;VARB=0.0153452;OID=.;OPOS=201176108;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:15:15:25:25:0.625:18:7:7:8:18:7:7:8
chr1	201176690	.	T	C	56.29	PASS	AF=0.4;AO=8;DP=20;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=0.0225534;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.501;QD=11.257;RBI=0.0409159;REFB=-0.0230115;REVB=-0.0341388;RO=12;SAF=6;SAR=2;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0328321;OID=.;OPOS=201176690;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:20:20:12:12:8:8:0.4:2:6:9:3:2:6:9:3
chr1	201176968	.	A	G	160.52	PASS	AF=0.485714;AO=17;DP=35;FAO=17;FDP=35;FR=.;FRO=18;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=4;FWDB=-0.00552045;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=161.963;QD=18.345;RBI=0.0112514;REFB=-0.00462648;REVB=-0.00980401;RO=18;SAF=13;SAR=4;SRF=14;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0165745;STB=0.509423;STBP=0.935;TYPE=snp;VARB=0.00735693;OID=.;OPOS=201176968;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:18:18:17:17:0.485714:4:13:14:4:4:13:14:4
chr1	201177246	.	T	C	209.33	PASS	AF=0.409836;AO=25;DP=61;FAO=25;FDP=61;FR=.;FRO=36;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=23;FSRR=13;FWDB=0.00497031;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.9949;QD=13.7266;RBI=0.00677163;REFB=-0.0185634;REVB=0.00459902;RO=36;SAF=13;SAR=12;SRF=23;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124058;STB=0.570619;STBP=0.38;TYPE=snp;VARB=0.0194907;OID=.;OPOS=201177246;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:36:36:25:25:0.409836:12:13:23:13:12:13:23:13
chr1	201177278	.	C	T	224.9	PASS	AF=0.383562;AO=28;DP=73;FAO=28;FDP=73;FR=.;FRO=45;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=25;FSRR=20;FWDB=0.000502866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.432;QD=12.3233;RBI=0.0031255;REFB=-0.0256227;REVB=-0.00308478;RO=39;SAF=10;SAR=18;SRF=22;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.214275;STB=0.623673;STBP=0.103;TYPE=snp;VARB=0.022434;OID=.;OPOS=201177278;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:39:45:28:28:0.383562:18:10:22:17:18:10:25:20
chr1	201177538	.	G	T	88.1	PASS	AF=0.44;AO=11;DP=25;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.00626269;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.973;QD=14.0968;RBI=0.0116733;REFB=-0.00578301;REVB=0.00985109;RO=14;SAF=5;SAR=6;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0250796;STB=0.514679;STBP=0.907;TYPE=snp;VARB=0.00415795;OID=.;OPOS=201177538;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:25:25:14:14:11:11:0.44:6:5:6:8:6:5:6:8
chr1	201178819	.	G	A	75.71	PASS	AF=0.588235;AO=10;DP=17;FAO=10;FDP=17;FR=.;FRO=7;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.072881;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.8769;QD=17.815;RBI=0.0730062;REFB=-0.0360021;REVB=0.0042742;RO=5;SAF=6;SAR=4;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11821;STB=0.627655;STBP=0.249;TYPE=snp;VARB=0.0425719;OID=.;OPOS=201178819;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:48:17:17:5:7:10:10:0.588235:4:6:2:3:4:6:2:5
chr1	201181217	.	A	G	193.22	PASS	AF=0.425532;AO=20;DP=47;FAO=20;FDP=47;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=-0.00119494;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.9875;QD=16.4444;RBI=0.0285537;REFB=-0.0289403;REVB=0.0285287;RO=27;SAF=9;SAR=11;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105581;STB=0.560449;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=0.0280752;OID=.;OPOS=201181217;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:27:27:20:20:0.425532:11:9:15:12:11:9:15:12
chr1	201181223	.	A	G	708.56	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0385105;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=236.477;QD=62.9828;RBI=0.0427891;REFB=0;REVB=0.0186506;RO=0;SAF=24;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000107825;OID=.;OPOS=201181223;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:21:24:0:0:21:24:0:0
chr1	201181920	.	G	T	157.26	PASS	AF=0.4;AO=14;DP=35;FAO=14;FDP=35;FR=.,HEALED;FRO=17;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.102155;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=33.8472;QD=17.9723;RBI=0.114936;REFB=-0.0288313;REVB=0.0526744;RO=14;SAF=9;SAR=5;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129571;STB=0.597015;STBP=0.345;TYPE=snp;VARB=0.0509278;OID=.;OPOS=201181920;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:14:17:14:14:0.4:5:9:7:7:5:9:8:9
chr1	201183363	.	C	T	327.54	PASS	AF=0.373832;AO=40;DP=107;FAO=40;FDP=107;FR=.;FRO=67;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=46;FSRR=21;FWDB=-0.0142798;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.788;QD=12.2444;RBI=0.0192491;REFB=-0.00531709;REVB=-0.0129079;RO=67;SAF=24;SAR=16;SRF=46;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10163;STB=0.557741;STBP=0.374;TYPE=snp;VARB=0.012033;OID=.;OPOS=201183363;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:107:67:67:40:40:0.373832:16:24:46:21:16:24:46:21
chr1	201183402	.	T	C	454.94	PASS	AF=0.363014;AO=51;DP=145;FAO=53;FDP=146;FR=.;FRO=93;FSAF=29;FSAR=24;FSRF=58;FSRR=35;FWDB=-0.00243957;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.157;QD=12.464;RBI=0.0116908;REFB=-0.00165908;REVB=0.0114334;RO=89;SAF=28;SAR=23;SRF=55;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0784416;STB=0.5496;STBP=0.387;TYPE=snp;VARB=0.00312368;OID=.;OPOS=201183402;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:145:146:89:93:51:53:0.363014:23:28:55:34:24:29:58:35
chr1	201184275	.	C	T	239.65	PASS	AF=0.490566;AO=26;DP=53;FAO=26;FDP=53;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=0.00081642;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.905;QD=18.0872;RBI=0.0137477;REFB=0.00557102;REVB=0.0137235;RO=27;SAF=11;SAR=15;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.019775;STB=0.511103;STBP=0.884;TYPE=snp;VARB=-0.00603545;OID=.;OPOS=201184275;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:27:27:26:26:0.490566:15:11:12:15:15:11:12:15
chr1	201187764	.	T	C	937.92	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0116126;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.561;QD=58.6199;RBI=0.0342284;REFB=0;REVB=0.0321983;RO=0;SAF=29;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.11046e-05;OID=.;OPOS=201187764;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:64:0:0:63:64:1:34:29:0:0:35:29:0:0
chr1	201195119	.	C	T	1533.55	PASS	AF=0.963636;AO=106;DP=110;FAO=106;FDP=110;FR=.;FRO=4;FSAF=51;FSAR=55;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0530315;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.138;QD=55.7654;RBI=0.0568141;REFB=-0.0710433;REVB=0.0203839;RO=3;SAF=51;SAR=55;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0270967;STB=0.509782;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=0.00209958;OID=.;OPOS=201195119;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:110:110:3:4:106:106:0.963636:55:51:3:0:55:51:3:1
chr1	201197471	.	T	C	271.68	PASS	AF=0.538462;AO=28;DP=52;FAO=28;FDP=52;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=6;FSRR=18;FWDB=-0.0479455;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.33;QD=20.8987;RBI=0.0479755;REFB=0.0113309;REVB=0.00169644;RO=24;SAF=11;SAR=17;SRF=6;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128623;STB=0.571168;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=-0.0110917;OID=.;OPOS=201197471;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:24:24:28:28:0.538462:17:11:6:18:17:11:6:18
chr1	201285759	.	A	G	1227.51	PASS	AF=1;AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130493;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=187.362;QD=61.3754;RBI=0.0134444;REFB=0;REVB=0.00323508;RO=0;SAF=35;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.30416e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.1486e-05;OID=.;OPOS=201285759;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:80:80:0:0:80:80:1:45:35:0:0:45:35:0:0
chr1	201286771	.	C	T	1208.46	PASS	AF=1;AO=78;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0205191;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.2555;QD=61.1877;RBI=0.0296503;REFB=0;REVB=0.0214034;RO=0;SAF=31;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000152528;OID=.;OPOS=201286771;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:79:0:0:78:79:1:47:31:0:0:47:32:0:0
chr1	201288955	.	G	A	914.89	PASS	AF=0.969697;AO=64;DP=67;FAO=64;FDP=66;FR=.;FRO=2;FSAF=33;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0102894;FXX=0.0149231;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.542;QD=55.4477;RBI=0.128461;REFB=-0.0929297;REVB=0.128048;RO=1;SAF=33;SAR=31;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0149923;STB=0.51562;STBP=0.255;TYPE=snp;VARB=0.004604;OID=.;OPOS=201288955;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:67:66:1:2:64:64:0.969697:31:33:0:1:31:33:0:2
chr1	201299263	.	A	G	1434.36	PASS	AF=1;AO=91;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0304732;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.979;QD=63.0488;RBI=0.0304848;REFB=0;REVB=0.000841726;RO=0;SAF=49;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.37305e-05;OID=.;OPOS=201299263;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:91:91:0:0:91:91:1:42:49:0:0:42:49:0:0
chr1	201355522	.	T	C	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00422884;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=247.024;QD=59.4357;RBI=0.0155252;REFB=0;REVB=0.0149381;RO=0;SAF=26;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.72228e-05;OID=.;OPOS=201355522;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:9:26:0:0:9:26:0:0
chr1	201355943	.	C	T	1445.03	PASS	AF=1;AO=91;DP=91;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0160025;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.962;QD=62.8274;RBI=0.0273837;REFB=0;REVB=0.0222213;RO=0;SAF=47;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.04952e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.01457e-05;OID=.;OPOS=201355943;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:91:92:0:0:91:92:1:44:47:0:0:45:47:0:0
chr1	201360240	.	C	T	105.86	PASS	AF=0.48;AO=11;DP=25;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=2;FWDB=0.000520169;FXX=0.0740466;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.798;QD=16.938;RBI=0.0141587;REFB=-0.00229246;REVB=0.0141492;RO=13;SAF=6;SAR=5;SRF=11;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.29566;STB=0.647268;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.00350413;OID=.;OPOS=201360240;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:25:13:13:11:12:0.48:5:6:11:2:5:7:11:2
chr1	201383643	.	A	C	291.03	PASS	AF=0.590909;AO=26;DP=44;FAO=26;FDP=44;FR=.;FRO=18;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=-0.021448;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.532;QD=26.457;RBI=0.026454;REFB=-0.0129657;REVB=-0.0154853;RO=18;SAF=17;SAR=9;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.200988;STB=0.611423;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=0.0139545;OID=.;OPOS=201383643;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:18:18:26:26:0.590909:9:17:7:11:9:17:7:11
chr1	201386916	.	C	T	99.96	PASS	AF=0.4;AO=12;DP=31;FAO=12;FDP=30;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.000598365;FXX=0.0322477;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.588;QD=13.3277;RBI=0.00292443;REFB=-0.00323066;REVB=-0.00286256;RO=18;SAF=4;SAR=8;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.230768;STB=0.636132;STBP=0.239;TYPE=snp;VARB=0.00311577;OID=.;OPOS=201386916;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:30:18:18:12:12:0.4:8:4:10:8:8:4:10:8
chr1	201860626	.	A	G	372.83	PASS	AF=1;AO=27;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.159231;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.06;QD=53.2608;RBI=0.159561;REFB=0;REVB=0.0102476;RO=1;SAF=7;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.06184;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00212036;OID=.;OPOS=201860626;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:28:28:1:0:27:28:1:20:7:1:0:20:8:0:0
chr1	201861016	.	C	G	540.26	PASS	AF=0.926829;AO=38;DP=41;FAO=38;FDP=41;FR=.;FRO=3;FSAF=11;FSAR=27;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.00930072;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=237.348;QD=52.7081;RBI=0.010319;REFB=-0.0139071;REVB=0.00446983;RO=0;SAF=11;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.559967;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.000128315;OID=.;OPOS=201861016;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:41:41:0:3:38:38:0.926829:27:11:0:0:27:11:3:0
chr1	201865763	.	A	G	526.12	PASS	AF=1;AO=34;DP=35;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.135274;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=43.84;QD=58.4582;RBI=0.136598;REFB=0;REVB=-0.0189726;RO=0;SAF=8;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00200684;OID=.;OPOS=201865763;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:36:0:0:34:36:1:26:8:0:0:28:8:0:0
chr1	201952574	.	T	C	185.79	PASS	AF=0.487179;AO=19;DP=39;FAO=19;FDP=39;FR=.;FRO=20;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=0.00617376;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=288.759;QD=19.0555;RBI=0.034743;REFB=0.00573677;REVB=-0.0341901;RO=20;SAF=11;SAR=8;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161163;STB=0.591302;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=-0.00684689;OID=.;OPOS=201952574;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:20:20:19:19:0.487179:8:11:8:12:8:11:8:12
chr1	201969082	.	G	A	320.82	PASS	AF=0.55;AO=33;DP=60;FAO=33;FDP=60;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=0.0224768;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.931;QD=21.3877;RBI=0.0283297;REFB=-0.0216403;REVB=0.0172442;RO=27;SAF=15;SAR=18;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111944;STB=0.561896;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.016926;OID=.;OPOS=201969082;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:27:27:33:33:0.55:18:15:16:11:18:15:16:11
chr1	201970562	.	T	C	2239.27	PASS	AF=1;AO=140;DP=141;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000585872;FXX=0.00704176;HRUN=3;LEN=1;MLLD=150.93;QD=63.5254;RBI=0.00384558;REFB=0;REVB=-0.00380069;RO=0;SAF=55;SAR=85;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.29765e-06;OID=.;OPOS=201970562;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:141:141:0:0:140:141:1:85:55:0:0:85:56:0:0
chr1	201981862	.	T	C	147.03	PASS	AF=0.36;AO=16;DP=49;FAO=18;FDP=50;FR=.;FRO=32;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=20;FWDB=-0.0295951;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.278;QD=11.7623;RBI=0.0296071;REFB=-0.00859582;REVB=-0.000843151;RO=31;SAF=5;SAR=11;SRF=11;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0534507;STB=0.529379;STBP=0.762;TYPE=snp;VARB=0.0181654;OID=.;OPOS=201981862;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:50:31:32:16:18:0.36:11:5:11:20:12:6:12:20
chr1	202092332	.	C	G	134.27	PASS	AF=1;AO=12;DP=13;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.110071;FXX=0.076864;HRUN=3;LEN=1;MLLD=33.4704;QD=44.7558;RBI=0.121034;REFB=0;REVB=-0.0503351;RO=0;SAF=5;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0015398;OID=.;OPOS=202092332;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:12:0:0:12:12:1:7:5:0:0:7:5:0:0
chr1	202092360	.	G	A	175.07	PASS	AF=1;AO=12;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0500845;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.582;QD=46.6839;RBI=0.0502391;REFB=0;REVB=0.00393883;RO=0;SAF=4;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00109173;OID=.;OPOS=202092360;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:12:15:1:8:4:0:0:8:7:0:0
chr1	202092415	.	A	G	375.65	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0024704;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=304.725;QD=55.6513;RBI=0.0188848;REFB=0;REVB=0.0187226;RO=0;SAF=13;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.92705e-05;OID=.;OPOS=202092415;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:27:0:0:26:27:1:13:13:0:0:14:13:0:0
chr1	202092580	.	T	C	708.56	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.003482;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.112;QD=62.9828;RBI=0.0338676;REFB=0;REVB=0.0336882;RO=0;SAF=25;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.09779e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00012507;OID=.;OPOS=202092580;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:20:25:0:0:20:25:0:0
chr1	202104616	.	T	A	395.21	PASS	AF=0.565217;AO=39;DP=69;FAO=39;FDP=69;FR=.;FRO=30;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=11;FWDB=0.0185452;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.007;QD=22.9107;RBI=0.0188992;REFB=0.00897301;REVB=-0.00364085;RO=30;SAF=24;SAR=15;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0150351;STB=0.50827;STBP=0.892;TYPE=snp;VARB=-0.00437729;OID=.;OPOS=202104616;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:30:30:39:39:0.565217:15:24:19:11:15:24:19:11
chr1	202119546	.	C	G	223.94	PASS	AF=0.769231;AO=20;DP=26;FAO=20;FDP=26;FR=.;FRO=6;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.000394385;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=224.444;QD=34.4524;RBI=0.0161911;REFB=-0.0550264;REVB=-0.0161863;RO=6;SAF=12;SAR=8;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.182197;STB=0.5999;STBP=0.069;TYPE=snp;VARB=0.0129422;OID=.;OPOS=202119546;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:26:26:6:6:20:20:0.769231:8:12:1:5:8:12:1:5
chr1	202129826	.	T	C	679.98	PASS	AF=0.470588;AO=70;DP=150;FAO=72;FDP=153;FR=.;FRO=81;FSAF=45;FSAR=27;FSRF=37;FSRR=44;FWDB=-0.00716027;FXX=0.00649309;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.727;QD=17.7772;RBI=0.0173869;REFB=-0.0254226;REVB=-0.0158441;RO=80;SAF=43;SAR=27;SRF=37;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148082;STB=0.590657;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=0.0291127;OID=.;OPOS=202129826;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:150:153:80:81:70:72:0.470588:27:43:37:43:27:45:37:44
chr1	202155543	.	A	C	1713.04	PASS	AF=1;AO=101;DP=101;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0898648;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.095;QD=60.6386;RBI=0.100176;REFB=0;REVB=0.0442657;RO=0;SAF=40;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000116055;OID=.;OPOS=202155543;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:101:113:0:0:101:113:1:61:40:0:0:62:51:0:0
chr1	202156628	.	A	C	902.71	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0101534;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.295;QD=58.2395;RBI=0.010894;REFB=0;REVB=0.00394821;RO=0;SAF=14;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.84193e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.26363e-05;OID=.;OPOS=202156628;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:48:14:0:0:48:14:0:0
chr1	202172943	.	A	G	300.36	PASS	AF=0.666667;AO=26;DP=39;FAO=26;FDP=39;FR=.;FRO=13;FSAF=19;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=-0.00953905;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.5;QD=30.8063;RBI=0.00972833;REFB=0.00663645;REVB=-0.00190971;RO=13;SAF=19;SAR=7;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.278558;STB=0.653639;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=-0.00167601;OID=.;OPOS=202172943;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:13:13:26:26:0.666667:7:19:4:9:7:19:4:9
chr1	202200799	.	G	A	305.95	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00159536;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.666;QD=53.2084;RBI=0.00999759;REFB=0;REVB=-0.00986948;RO=0;SAF=2;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.63689e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.27042e-05;OID=.;OPOS=202200799;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:21:2:0:0:21:2:0:0
chr1	202276494	.	C	T	1329.62	PASS	AF=0.923077;AO=96;DP=104;FAO=96;FDP=104;FR=.;FRO=8;FSAF=55;FSAR=41;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=-0.0271506;FXX=0.0095229;HRUN=4;LEN=1;MLLD=149.676;QD=51.1392;RBI=0.0362595;REFB=-0.236218;REVB=0.0240332;RO=4;SAF=55;SAR=41;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00563992;STB=0.525188;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=0.00249531;OID=.;OPOS=202276494;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:25:104:104:4:8:96:96:0.923077:41:55:2:2:41:55:2:6
chr1	202287206	.	T	C	1103.24	PASS	AF=1;AO=55;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=29;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0163791;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.632;QD=59.6345;RBI=0.0244845;REFB=0;REVB=0.0181993;RO=0;SAF=22;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000149141;OID=.;OPOS=202287206;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:0:0:55:74:1:33:22:0:0:45:29:0:0
chr1	202287537	.	G	A	546.91	PASS	AF=1;AO=36;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00974125;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.673;QD=59.1256;RBI=0.110002;REFB=0;REVB=0.10957;RO=0;SAF=14;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00149742;OID=.;OPOS=202287537;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:36:37:1:22:14:0:0:23:14:0:0
chr1	202287813	.	T	C	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00107655;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=169.576;QD=33.4284;RBI=0.0430796;REFB=0;REVB=0.0430661;RO=0;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00115867;OID=.;OPOS=202287813;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:2:4:0:0:2:4:0:0
chr1	202531741	.	C	T	1231.41	PASS	AF=0.987805;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=82;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00432959;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.643;QD=60.0689;RBI=0.0501405;REFB=-0.108304;REVB=0.0499532;RO=0;SAF=35;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.46682e-08;STB=0.507041;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=0.000240498;OID=.;OPOS=202531741;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:81:82:0:1:81:81:0.987805:46:35:0:0:46:35:1:0
chr1	202574784	.	G	A	727.73	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.037002;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.602;QD=63.2812;RBI=0.0499816;REFB=0;REVB=0.0336009;RO=0;SAF=23;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000239382;OID=.;OPOS=202574784;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:23:23:0:0:23:23:0:0
chr1	202705455	.	G	C	353.81	PASS	AF=0.431818;AO=38;DP=88;FAO=38;FDP=88;FR=.;FRO=50;FSAF=25;FSAR=13;FSRF=25;FSRR=25;FWDB=0.0206387;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=68.6708;QD=16.0822;RBI=0.0242769;REFB=0.0213719;REVB=0.0127833;RO=50;SAF=25;SAR=13;SRF=25;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165957;STB=0.593699;STBP=0.137;TYPE=snp;VARB=-0.0146189;OID=.;OPOS=202705455;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:50:50:38:38:0.431818:13:25:25:25:13:25:25:25
chr1	202715284	.	G	A	145.57	PASS	AF=0.421053;AO=16;DP=38;FAO=16;FDP=38;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=0.0041178;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.979;QD=15.3236;RBI=0.0241534;REFB=-0.000304877;REVB=0.0237998;RO=22;SAF=12;SAR=4;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.357915;STB=0.708061;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.000673767;OID=.;OPOS=202715284;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:22:22:16:16:0.421053:4:12:9:13:4:12:9:13
chr1	202718202	.	G	A	132.7	PASS	AF=0.428571;AO=15;DP=34;FAO=15;FDP=35;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=-0.0171186;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.9623;QD=15.1651;RBI=0.0315412;REFB=-0.0369182;REVB=-0.0264915;RO=19;SAF=7;SAR=8;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0964265;STB=0.538411;STBP=0.722;TYPE=snp;VARB=0.0346848;OID=.;OPOS=202718202;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:35:19:20:15:15:0.428571:8:7:7:12:8:7:8:12
chr1	202733238	.	C	T	318.86	PASS	AF=0.583333;AO=28;DP=48;FAO=28;FDP=48;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=5;FWDB=-0.0264542;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.294;QD=26.5716;RBI=0.0264891;REFB=-0.0022503;REVB=-0.0013595;RO=20;SAF=12;SAR=16;SRF=15;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.238613;STB=0.631488;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.00112397;OID=.;OPOS=202733238;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:20:20:28:28:0.583333:16:12:15:5:16:12:15:5
chr1	202794787	.	T	C	266.57	PASS	AF=0.392405;AO=31;DP=79;FAO=31;FDP=79;FR=.;FRO=48;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=28;FSRR=20;FWDB=-0.0148605;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.018;QD=13.4974;RBI=0.0152041;REFB=-0.0144089;REVB=-0.00321399;RO=48;SAF=10;SAR=21;SRF=28;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.280854;STB=0.660491;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.0250057;OID=.;OPOS=202794787;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:48:48:31:31:0.392405:21:10:28:20:21:10:28:20
chr1	202795262	.	G	A	31.36	PASS	AF=0.555556;AO=5;DP=9;FAO=5;FDP=9;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.023797;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.861;QD=13.9367;RBI=0.0895523;REFB=-0.037347;REVB=0.0863326;RO=4;SAF=2;SAR=3;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0744193;STB=0.54527;STBP=0.922;TYPE=snp;VARB=0.0393198;OID=.;OPOS=202795262;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:9:9:4:4:5:5:0.555556:3:2:2:2:3:2:2:2
chr1	202795849	.	G	A	251.08	PASS	AF=0.509804;AO=26;DP=51;FAO=26;FDP=51;FR=.;FRO=25;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.0320735;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.647;QD=19.6924;RBI=0.0320947;REFB=-0.0161239;REVB=-0.00116555;RO=25;SAF=8;SAR=18;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198564;STB=0.611561;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=0.00912289;OID=.;OPOS=202795849;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:25:25:26:26:0.509804:18:8:13:12:18:8:13:12
chr1	202861342	.	A	G	140.64	PASS	AF=0.372093;AO=16;DP=43;FAO=16;FDP=43;FR=.;FRO=27;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=0.00671823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.106;QD=13.0826;RBI=0.0119561;REFB=0.00310431;REVB=0.00989011;RO=27;SAF=5;SAR=11;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.337406;STB=0.697162;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=-0.00321466;OID=.;OPOS=202861342;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:27:27:16:16:0.372093:11:5:17:10:11:5:17:10
chr1	202884063	.	C	T	160.52	PASS	AF=0.485714;AO=17;DP=35;FAO=17;FDP=35;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=-0.0257045;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.009;QD=18.3452;RBI=0.0279359;REFB=0.00165487;REVB=-0.0109404;RO=18;SAF=8;SAR=9;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.074462;STB=0.542324;STBP=0.662;TYPE=snp;VARB=-0.00236211;OID=.;OPOS=202884063;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:18:18:17:17:0.485714:9:8:7:11:9:8:7:11
chr1	202888947	.	T	C	226.52	PASS	AF=0.511628;AO=22;DP=43;FAO=22;FDP=43;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=-0.00413931;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.426;QD=21.0714;RBI=0.0365728;REFB=-0.00906886;REVB=0.0363378;RO=21;SAF=11;SAR=11;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0620553;STB=0.534852;STBP=0.658;TYPE=snp;VARB=0.00852248;OID=.;OPOS=202888947;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:21:21:22:22:0.511628:11:11:12:9:11:11:12:9
chr1	202932154	.	G	A	329.62	PASS	AF=0.38835;AO=39;DP=102;FAO=40;FDP=103;FR=.;FRO=63;FSAF=27;FSAR=13;FSRF=39;FSRR=24;FWDB=-0.00254185;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.781;QD=12.8007;RBI=0.0197734;REFB=-0.0139771;REVB=0.0196093;RO=61;SAF=26;SAR=13;SRF=38;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0516165;STB=0.537945;STBP=0.554;TYPE=snp;VARB=0.0211553;OID=.;OPOS=202932154;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:103:61:63:39:40:0.38835:13:26:38:23:13:27:39:24
chr1	202935911	.	T	C	197.79	PASS	AF=0.425926;AO=23;DP=54;FAO=23;FDP=54;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=-0.0409551;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.054;QD=14.6509;RBI=0.0412477;REFB=-0.00387761;REVB=0.00490465;RO=31;SAF=12;SAR=11;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00565179;STB=0.503223;STBP=0.957;TYPE=snp;VARB=0.00391169;OID=.;OPOS=202935911;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:31:31:23:23:0.425926:11:12:16:15:11:12:16:15
chr1	203003870	.	G	A	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00680438;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.2452;QD=51.9153;RBI=0.00732799;REFB=0;REVB=0.00272027;RO=0;SAF=14;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.22671e-05;OID=.;OPOS=203003870;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:7:14:0:0:7:14:0:0
chr1	203008174	.	G	C	782.09	PASS	AF=1;AO=42;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0193855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.593;QD=63.8439;RBI=0.0367913;REFB=0;REVB=0.0312699;RO=0;SAF=27;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.13648e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000290275;OID=.;OPOS=203008174;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:42:49:1:15:27:0:0:21:28:0:0
chr1	203008286	.	C	G	382.17	PASS	AF=0.506494;AO=39;DP=77;FAO=39;FDP=77;FR=.;FRO=38;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=25;FSRR=13;FWDB=-0.0954971;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.248;QD=19.8529;RBI=0.0956494;REFB=-0.0223236;REVB=-0.00539439;RO=38;SAF=19;SAR=20;SRF=25;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151547;STB=0.5839;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=0.017401;OID=.;OPOS=203008286;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:38:38:39:39:0.506494:20:19:25:13:20:19:25:13
chr1	203040816	.	G	C	123.79	PASS	AF=0.298246;AO=17;DP=57;FAO=17;FDP=57;FR=.;FRO=40;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=-0.0128581;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.789;QD=8.68722;RBI=0.0263662;REFB=-0.0117044;REVB=-0.0230183;RO=40;SAF=10;SAR=7;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132842;STB=0.579616;STBP=0.429;TYPE=snp;VARB=0.0269344;OID=.;OPOS=203040816;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:40:40:17:17:0.298246:7:10:19:21:7:10:19:21
chr1	203053768	.	T	C	1542.9	PASS	AF=0.981308;AO=105;DP=110;FAO=105;FDP=107;FR=.;FRO=2;FSAF=64;FSAR=41;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00722399;FXX=0.0272702;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.019;QD=57.6784;RBI=0.0118795;REFB=0.00715786;REVB=0.00943063;RO=1;SAF=64;SAR=41;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00735807;STB=0.507691;STBP=0.277;TYPE=snp;VARB=-0.000170782;OID=.;OPOS=203053768;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:110:107:1:2:105:105:0.981308:41:64:1:0:41:64:2:0
chr1	203054852	.	C	T	301.16	PASS	AF=0.445946;AO=33;DP=74;FAO=33;FDP=74;FR=.;FRO=41;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=16;FSRR=25;FWDB=0.0450036;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.9958;QD=16.279;RBI=0.0521732;REFB=-0.00931131;REVB=0.0263954;RO=39;SAF=12;SAR=21;SRF=14;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00486418;STB=0.51578;STBP=0.812;TYPE=snp;VARB=0.0133129;OID=.;OPOS=203054852;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:39:41:33:33:0.445946:21:12:14:25:21:12:16:25
chr1	203135840	.	CT	C	1086.24	PASS	AF=1;AO=90;DP=91;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0315942;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=24.7159;QD=46.7199;RBI=0.0786334;REFB=0;REVB=0.0720071;RO=1;SAF=58;SAR=32;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0081028;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.0017038;OID=.;OPOS=203135841;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:90:91:93:93:0:59:34:0:0:19:1:58:32:1:0
chr1	203137784	.	A	ACT	1066.15	PASS	AF=0.903614;AO=74;DP=86;FAO=75;FDP=83;FR=.;FRO=8;FSAF=44;FSAR=31;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=-0.00790568;FXX=0.0348797;HRUN=1;LEN=2;MLLD=277.044;QD=51.3806;RBI=0.0323021;REFB=-0.0247543;REVB=0.0313197;RO=10;SAF=44;SAR=30;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0675009;STB=0.533063;STBP=0.07;TYPE=ins;VARB=0.00222614;OID=.;OPOS=203137785;OREF=-;OALT=CT;OMAPALT=ACT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.903614:74:86:75:83:8:44:31:2:6:32:10:44:30:3:7
chr1	203143725	.	G	C	117.44	PASS	AF=0.590909;AO=13;DP=22;FAO=13;FDP=22;FR=.;FRO=9;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=1;FWDB=0.0301859;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.7163;QD=21.3524;RBI=0.0306002;REFB=-0.0252602;REVB=-0.00501876;RO=9;SAF=7;SAR=6;SRF=8;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.263102;STB=0.647279;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=0.0170621;OID=.;OPOS=203143725;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:22:22:9:9:13:13:0.590909:6:7:8:1:6:7:8:1
chr1	203148633	.	A	G	411.11	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0370533;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.266;QD=56.7046;RBI=0.0470305;REFB=0;REVB=0.0289641;RO=0;SAF=14;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000687086;OID=.;OPOS=203148633;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:15:14:0:0:15:14:0:0
chr1	203152801	.	T	C	305.18	PASS	AF=0.588235;AO=28;DP=49;FAO=30;FDP=51;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.0184921;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.436;QD=23.9356;RBI=0.0185033;REFB=-0.0185151;REVB=-0.00064471;RO=20;SAF=10;SAR=18;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0742461;STB=0.527028;STBP=0.668;TYPE=snp;VARB=0.0108909;OID=.;OPOS=203152801;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:51:20:21:28:30:0.588235:18:10:9:11:19:11:9:12
chr1	203155703	.	A	T	88.1	PASS	AF=0.44;AO=11;DP=25;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=2;FWDB=-0.0306471;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.029;QD=14.0964;RBI=0.0307888;REFB=-0.0122595;REVB=0.00295067;RO=14;SAF=5;SAR=6;SRF=12;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.38096;STB=0.717975;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=0.0414641;OID=.;OPOS=203155703;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:25:25:14:14:11:11:0.44:6:5:12:2:6:5:12:2
chr1	203309966	.	G	C	1534.24	PASS	AF=1;AO=95;DP=95;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0824159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.3594;QD=63.2676;RBI=0.0855476;REFB=0;REVB=-0.0229348;RO=0;SAF=35;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000513753;OID=.;OPOS=203309966;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:97:0:0:95:97:1:60:35:0:0:61:36:0:0
chr1	203652444	.	A	G	700.85	PASS	AF=0.945455;AO=51;DP=55;FAO=52;FDP=55;FR=.;FRO=3;FSAF=24;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.00174212;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.739;QD=50.971;RBI=0.0248562;REFB=0.0262057;REVB=-0.0247951;RO=3;SAF=23;SAR=28;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0124243;STB=0.50704;STBP=0.725;TYPE=snp;VARB=-0.00205659;OID=.;OPOS=203652444;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:55:55:3:3:51:52:0.945455:28:23:1:2:28:24:1:2
chr1	203667409	.	T	C	851.25	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0288553;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.795;QD=57.7118;RBI=0.0322792;REFB=0;REVB=0.0144679;RO=0;SAF=30;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000248497;OID=.;OPOS=203667409;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:29:30:0:0:29:30:0:0
chr1	203681085	.	T	C	708.51	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00302036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.993;QD=62.9784;RBI=0.0308261;REFB=0;REVB=0.0306778;RO=0;SAF=27;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000194552;OID=.;OPOS=203681085;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:18:27:0:0:18:27:0:0
chr1	203766964	.	A	G	152.34	PASS	AF=0.551724;AO=16;DP=29;FAO=16;FDP=29;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.00955984;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.853;QD=21.0124;RBI=0.00984993;REFB=-0.0107317;REVB=-0.00237285;RO=13;SAF=4;SAR=12;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1969;STB=0.612095;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=0.010913;OID=.;OPOS=203766964;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:13:13:16:16:0.551724:12:4:6:7:12:4:6:7
chr1	203768328	.	T	C	176.74	PASS	AF=0.366667;AO=22;DP=61;FAO=22;FDP=60;FR=.;FRO=38;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=23;FWDB=-0.0111583;FXX=0.0163908;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.11;QD=11.7827;RBI=0.0283264;REFB=-0.000543954;REVB=-0.0260361;RO=38;SAF=11;SAR=11;SRF=15;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115183;STB=0.566607;STBP=0.478;TYPE=snp;VARB=0.00396833;OID=.;OPOS=203768328;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:60:38:38:22:22:0.366667:11:11:15:23:11:11:15:23
chr1	203769532	.	G	A	101.59	PASS	AF=0.5;AO=12;DP=24;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.0138917;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.539;QD=16.9318;RBI=0.014;REFB=-0.0199859;REVB=0.00173851;RO=11;SAF=7;SAR=5;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107737;STB=0.542183;STBP=0.633;TYPE=snp;VARB=0.0138812;OID=.;OPOS=203769532;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:24:24:11:12:12:12:0.5:5:7:5:6:5:7:6:6
chr1	203787700	.	T	C	538.49	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0618584;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.381;QD=59.8327;RBI=0.0618843;REFB=0;REVB=0.00178751;RO=0;SAF=26;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000210352;OID=.;OPOS=203787700;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:10:26:0:0:10:26:0:0
chr1	204110334	.	A	G	769.31	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0491819;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.7387;QD=56.9862;RBI=0.0500228;REFB=0;REVB=-0.00913346;RO=0;SAF=31;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.6027e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000371348;OID=.;OPOS=204110334;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:23:31:0:0:23:31:0:0
chr1	204188371	.	A	G	283.91	PASS	AF=0.426667;AO=31;DP=72;FAO=32;FDP=75;FR=.;FRO=43;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=25;FSRR=18;FWDB=0.0307099;FXX=0.0259707;HRUN=1;LEN=1;MLLD=45.3533;QD=15.1417;RBI=0.0409281;REFB=-0.1015;REVB=0.0270557;RO=41;SAF=17;SAR=14;SRF=23;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.01281;STB=0.528949;STBP=0.66;TYPE=snp;VARB=0.157637;OID=.;OPOS=204188371;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:75:41:43:31:32:0.426667:14:17:23:18:15:17:25:18
chr1	204190412	.	C	G	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0261436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.645;QD=52.6131;RBI=0.0333461;REFB=0;REVB=0.0206996;RO=0;SAF=9;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2029e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.09226e-05;OID=.;OPOS=204190412;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:13:9:0:0:13:9:0:0
chr1	204198209	.	A	G	727.73	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00348997;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.012;QD=63.2804;RBI=0.0205603;REFB=0;REVB=-0.0202619;RO=0;SAF=18;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.06241e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.67367e-05;OID=.;OPOS=204198209;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:28:18:0:0:28:18:0:0
chr1	204199614	.	C	T	1062.24	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.118434;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.604;QD=59.8446;RBI=0.118864;REFB=0;REVB=0.0100979;RO=0;SAF=41;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.21646e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0012336;OID=.;OPOS=204199614;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:30:41:0:0:30:41:0:0
chr1	204225947	.	TG	T	41.0	PASS	AF=0.411765;AO=7;DP=17;FAO=7;FDP=17;FR=.;FRO=10;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=0;FWDB=0.0958351;FXX=0.0555247;HRUN=5;LEN=1;MLLD=21.5171;QD=9.64594;RBI=0.107086;REFB=-0.0278035;REVB=-0.0477813;RO=10;SAF=2;SAR=5;SRF=10;SRR=0;SSEN=0.402062;SSEP=0;SSSB=-0.619383;STB=0.856421;STBP=0.09;TYPE=del;VARB=0.0529766;OID=.;OPOS=204225948;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.411765:7:17:7:17:10:2:5:10:0:40:10:2:5:10:0
chr1	204230581	.	G	A	1457.39	PASS	AF=0.989362;AO=93;DP=94;FAO=93;FDP=94;FR=.;FRO=1;FSAF=55;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0199936;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=195.014;QD=62.0168;RBI=0.0246208;REFB=-0.0452176;REVB=0.014368;RO=1;SAF=55;SAR=38;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00854286;STB=0.504504;STBP=0.491;TYPE=snp;VARB=3.50874e-05;OID=.;OPOS=204230581;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:94:94:1:1:93:93:0.989362:38:55:1:0:38:55:1:0
chr1	204237416	.	C	T	1540.64	PASS	AF=1;AO=96;DP=98;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0141237;FXX=0.010203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.295;QD=63.5317;RBI=0.0227711;REFB=0;REVB=0.0178618;RO=0;SAF=40;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.40128e-05;OID=.;OPOS=204237416;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:97:0:0:96:97:1:56:40:0:0:57:40:0:0
chr1	204379617	.	T	C	1346.93	PASS	AF=0.988636;AO=87;DP=89;FAO=87;FDP=88;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00741885;FXX=0.0112347;HRUN=2;LEN=1;MLLD=235.622;QD=61.2239;RBI=0.0167386;REFB=-0.152476;REVB=0.0150048;RO=1;SAF=33;SAR=54;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00869482;STB=0.504586;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.000324522;OID=.;OPOS=204379617;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:89:88:1:1:87:87:0.988636:54:33:0:1:54:33:0:1
chr1	204403659	.	A	G	267.06	PASS	AF=0.528302;AO=28;DP=53;FAO=28;FDP=53;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=0.000670405;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.9738;QD=20.1554;RBI=0.00622537;REFB=0.0213313;REVB=0.00618916;RO=24;SAF=13;SAR=15;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0749746;STB=0.54976;STBP=0.466;TYPE=snp;VARB=-0.0196422;OID=.;OPOS=204403659;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:24:25:28:28:0.528302:15:13:9:15:15:13:9:16
chr1	204438334	.	C	T	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0157047;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=164.594;QD=44.6896;RBI=0.0317978;REFB=0;REVB=-0.027649;RO=0;SAF=3;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000395777;OID=.;OPOS=204438334;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:10:3:0:0:10:3:0:0
chr1	204438643	.	G	T	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0190595;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.35;QD=50.4134;RBI=0.0270019;REFB=0;REVB=0.019127;RO=0;SAF=9;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000282099;OID=.;OPOS=204438643;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:10:9:0:0:10:9:0:0
chr1	204476182	.	G	GA	112.72	PASS	AF=0.418605;AO=17;DP=45;FAO=18;FDP=43;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=0.00922228;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=304.709;QD=10.4851;RBI=0.0139181;REFB=-0.0118193;REVB=0.0104242;RO=28;SAF=10;SAR=7;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0610216;STB=0.506768;STBP=0.931;TYPE=ins;VARB=0.016393;OID=.;OPOS=204476183;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.418605:17:45:18:43:25:11:7:15:10:99:28:10:7:18:10
chr1	204531567	.	C	T	427.93	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0232851;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.5615;QD=57.0579;RBI=0.0405984;REFB=0;REVB=0.033257;RO=0;SAF=16;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.56309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000848813;OID=.;OPOS=204531567;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:14:16:0:0:14:16:0:0
chr1	204587240	.	G	A	276.07	PASS	AF=0.385542;AO=32;DP=83;FAO=32;FDP=83;FR=.;FRO=51;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=29;FSRR=22;FWDB=-0.0217254;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.603;QD=13.3044;RBI=0.0270912;REFB=-0.00841918;REVB=0.0161846;RO=51;SAF=15;SAR=17;SRF=29;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107065;STB=0.561102;STBP=0.403;TYPE=snp;VARB=0.0208739;OID=.;OPOS=204587240;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:51:51:32:32:0.385542:17:15:29:22:17:15:29:22
chr1	204590044	.	G	A	1034.61	PASS	AF=0.972603;AO=68;DP=70;FAO=71;FDP=73;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0247634;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.05;QD=56.6909;RBI=0.0470422;REFB=-0.101832;REVB=0.0399968;RO=1;SAF=26;SAR=42;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0111219;STB=0.511108;STBP=0.288;TYPE=snp;VARB=0.000835846;OID=.;OPOS=204590044;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:70:73:1:2:68:71:0.972603:42:26:0:1:44:27:0:2
chr1	204591237	.	A	G	465.14	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0152222;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.688;QD=58.1421;RBI=0.0188529;REFB=0;REVB=0.0111227;RO=0;SAF=16;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.90913e-05;OID=.;OPOS=204591237;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:16:16:0:0:16:16:0:0
chr1	204943947	.	C	A	202.81	PASS	AF=0.512821;AO=20;DP=40;FAO=20;FDP=39;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.00525027;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.675;QD=20.8011;RBI=0.0331975;REFB=0.00309279;REVB=-0.0327797;RO=19;SAF=7;SAR=13;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157965;STB=0.589242;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=-0.0017908;OID=.;OPOS=204943947;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:39:19:19:20:20:0.512821:13:7:10:9:13:7:10:9
chr1	204966428	.	C	G	145.19	PASS	AF=0.533333;AO=15;DP=29;FAO=16;FDP=30;FR=.;FRO=14;FSAF=2;FSAR=14;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=0.132085;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.2895;QD=19.358;RBI=0.132817;REFB=-0.0524301;REVB=0.0139198;RO=14;SAF=1;SAR=14;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.413127;STB=0.636165;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=0.0517218;OID=.;OPOS=204966428;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:30:14:14:15:16:0.533333:14:1:4:10:14:2:4:10
chr1	204966690	.	G	A	785.15	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0259055;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.29;QD=57.102;RBI=0.0367111;REFB=0;REVB=0.0260118;RO=0;SAF=29;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.40922e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.86222e-07;OID=.;OPOS=204966690;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:26:29:0:0:26:29:0:0
chr1	204966697	.	C	T	159.78	PASS	AF=0.363636;AO=20;DP=55;FAO=20;FDP=55;FR=.;FRO=35;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=15;FWDB=-0.0156159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.237;QD=11.6205;RBI=0.0297971;REFB=0.000132645;REVB=0.0253774;RO=35;SAF=9;SAR=11;SRF=20;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132094;STB=0.576777;STBP=0.412;TYPE=snp;VARB=-0.00029561;OID=.;OPOS=204966697;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:35:35:20:20:0.363636:11:9:20:15:11:9:20:15
chr1	204970302	.	T	C	392.75	PASS	AF=0.5;AO=36;DP=75;FAO=40;FDP=80;FR=.;FRO=40;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=24;FWDB=0.016934;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.118;QD=19.6373;RBI=0.0187604;REFB=-0.0145432;REVB=0.00807414;RO=39;SAF=21;SAR=15;SRF=15;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183934;STB=0.57459;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=0.0155686;OID=.;OPOS=204970302;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:80:39:40:36:40:0.5:15:21:15:24:18:22:16:24
chr1	204978533	.	A	G	240.76	PASS	AF=0.473684;AO=26;DP=56;FAO=27;FDP=57;FR=.;FRO=30;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=-0.007219;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.37;QD=16.8955;RBI=0.00831743;REFB=-0.0177351;REVB=-0.00413105;RO=30;SAF=10;SAR=16;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14335;STB=0.5877;STBP=0.233;TYPE=snp;VARB=0.0165603;OID=.;OPOS=204978533;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:57:30:30:26:27:0.473684:16:10:16:14:17:10:16:14
chr1	204991770	.	C	T	314.21	PASS	AF=0.465753;AO=33;DP=72;FAO=34;FDP=73;FR=.;FRO=39;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=25;FSRR=14;FWDB=-0.0141753;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.4122;QD=17.2172;RBI=0.0595184;REFB=-0.00806981;REVB=-0.0578057;RO=39;SAF=12;SAR=21;SRF=25;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.265679;STB=0.636792;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.0158055;OID=.;OPOS=204991770;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:73:39:39:33:34:0.465753:21:12:25:14:21:13:25:14
chr1	205027737	.	G	A	828.05	PASS	AF=0.512195;AO=82;DP=162;FAO=84;FDP=164;FR=.;FRO=80;FSAF=48;FSAR=36;FSRF=39;FSRR=41;FWDB=0.0181214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.515;QD=20.1964;RBI=0.0194307;REFB=-0.000685487;REVB=0.00701196;RO=79;SAF=47;SAR=35;SRF=38;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0829183;STB=0.541291;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=0.000566414;OID=.;OPOS=205027737;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:162:164:79:80:82:84:0.512195:35:47:38:41:36:48:39:41
chr1	205031116	.	C	T	2271.15	PASS	AF=1;AO=142;DP=143;FAO=143;FDP=143;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0594798;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.9268;QD=63.5288;RBI=0.0598284;REFB=0;REVB=0.00644906;RO=0;SAF=82;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.28203e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000243667;OID=.;OPOS=205031116;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:143:143:0:0:142:143:1:60:82:0:0:60:83:0:0
chr1	205041158	.	C	T	714.87	PASS	AF=0.442529;AO=76;DP=173;FAO=77;FDP=174;FR=.;FRO=97;FSAF=34;FSAR=43;FSRF=53;FSRR=44;FWDB=-0.00862085;FXX=0.00571396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.876;QD=16.4337;RBI=0.0094189;REFB=-0.0329143;REVB=0.00379427;RO=96;SAF=34;SAR=42;SRF=52;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0945224;STB=0.558426;STBP=0.196;TYPE=snp;VARB=0.0480668;OID=.;OPOS=205041158;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:173:174:96:97:76:77:0.442529:42:34:52:44:43:34:53:44
chr1	205052939	.	G	A	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00482191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.286;QD=56.1915;RBI=0.0182473;REFB=0;REVB=-0.0175987;RO=0;SAF=20;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.75204e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.415e-05;OID=.;OPOS=205052939;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:8:20:0:0:8:20:0:0
chr1	205053219	.	C	T	1030.3	PASS	AF=0.985915;AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=71;FR=.;FRO=1;FSAF=50;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0308058;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.442;QD=58.0451;RBI=0.0318062;REFB=-0.122168;REVB=0.00791437;RO=1;SAF=50;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.023049;STB=0.512192;STBP=0.194;TYPE=snp;VARB=0.00101651;OID=.;OPOS=205053219;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:71:71:1:1:70:70:0.985915:20:50:0:1:20:50:0:1
chr1	205056844	.	T	A,TTA	122.93	PASS	AF=0,0.923077;AO=3,10;DP=16;FAO=0,12;FDP=13;FR=.;FRO=1;FSAF=0,7;FSAR=0,5;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0159787,-0.0102932;FXX=0.133244;HRUN=5,5;LEN=1,2;MLLD=233.477,264.293;QD=37.8256;RBI=0.0208631,0.0226405;REFB=-0.00450019,-0.0636533;REVB=0.0134146,0.0201654;RO=2;SAF=3,6;SAR=0,4;SRF=2;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-0.127515;STB=0.5,0.533278;STBP=1,0.554;TYPE=snp,ins;VARB=0,0.00191344;OID=.,.;OPOS=205056844,205056845;OREF=T,-;OALT=A,TA;OMAPALT=A,TTA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:7:16:13:2:1:3,10:0,12:0,0.923077:0,4:3,6:2:0:0,5:0,7:1:0
chr1	205113595	.	AG	CA	322.25	PASS	AF=0.608696;AO=28;DP=46;FAO=28;FDP=46;FR=.;FRO=18;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=0.0104228;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=206.646;QD=28.0214;RBI=0.016655;REFB=-0.0254734;REVB=0.0129905;RO=18;SAF=19;SAR=9;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.252219;STB=0.639321;STBP=0.02;TYPE=mnp;VARB=0.0121443;OID=.;OPOS=205113595;OREF=AG;OALT=CA;OMAPALT=CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:18:18:28:28:0.608696:9:19:6:12:9:19:6:12
chr1	205129319	.	G	A	386.19	PASS	AF=0.64;AO=32;DP=50;FAO=32;FDP=50;FR=.;FRO=18;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.0566286;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.4346;QD=30.895;RBI=0.0667795;REFB=-0.0102291;REVB=0.0353935;RO=18;SAF=15;SAR=17;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0205801;STB=0.511271;STBP=0.856;TYPE=snp;VARB=0.00753527;OID=.;OPOS=205129319;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:18:18:32:32:0.64:17:15:9:9:17:15:9:9
chr1	205130413	.	A	G	817.65	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.025399;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.867;QD=57.3791;RBI=0.0307493;REFB=0;REVB=-0.0173324;RO=0;SAF=27;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.90203e-05;OID=.;OPOS=205130413;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:30:27:0:0:30:27:0:0
chr1	205272983	.	C	G	92.22	PASS	AF=0.55;AO=11;DP=20;FAO=11;FDP=20;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=0;FWDB=0.0163019;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.161;QD=18.4438;RBI=0.0214026;REFB=-0.0300469;REVB=0.0138679;RO=9;SAF=6;SAR=5;SRF=9;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.382976;STB=0.713979;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=0.0189104;OID=.;OPOS=205272983;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:20:20:9:9:11:11:0.55:5:6:9:0:5:6:9:0
chr1	205275421	.	A	G	766.45	PASS	AF=1;AO=47;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0233081;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.854;QD=63.8705;RBI=0.0368616;REFB=0;REVB=-0.0285571;RO=0;SAF=28;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.23275e-05;OID=.;OPOS=205275421;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:47:48:1:19:28:0:0:20:28:0:0
chr1	205306590	.	G	A	322.88	PASS	AF=0.507463;AO=34;DP=67;FAO=34;FDP=67;FR=.;FRO=33;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=0.0016263;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=259.386;QD=19.2764;RBI=0.0147058;REFB=-0.00847535;REVB=-0.0146156;RO=33;SAF=22;SAR=12;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0951489;STB=0.553041;STBP=0.418;TYPE=snp;VARB=0.00783703;OID=.;OPOS=205306590;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:33:33:34:34:0.507463:12:22:18:15:12:22:18:15
chr1	205492756	.	A	G	481.47	PASS	AF=0.944444;AO=33;DP=36;FAO=34;FDP=36;FR=.;FRO=2;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0212801;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.029;QD=53.4963;RBI=0.0251149;REFB=0.0043334;REVB=-0.0133384;RO=2;SAF=12;SAR=21;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0716814;STB=0.535693;STBP=0.124;TYPE=snp;VARB=-0.00103945;OID=.;OPOS=205492756;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:36:36:2:2:33:34:0.944444:21:12:2:0:21:13:2:0
chr1	205570406	.	T	A	352.86	PASS	AF=0.426966;AO=39;DP=89;FAO=38;FDP=89;FR=.;FRO=51;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=25;FSRR=26;FWDB=-0.016699;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.048;QD=15.8587;RBI=0.0391738;REFB=-0.00555644;REVB=-0.0354363;RO=50;SAF=14;SAR=25;SRF=25;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145675;STB=0.572088;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=0.006986;OID=.;OPOS=205570406;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:50:51:39:38:0.426966:25:14:25:25:24:14:25:26
chr1	205738166	.	T	C	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0254144;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.347;QD=56.1916;RBI=0.0254172;REFB=0;REVB=0.000377382;RO=0;SAF=13;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.98288e-05;OID=.;OPOS=205738166;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:15:13:0:0:15:13:0:0
chr1	205779231	.	G	A	727.8	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0218921;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.473;QD=63.2865;RBI=0.023548;REFB=0;REVB=0.00867427;RO=0;SAF=24;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.00563e-05;OID=.;OPOS=205779231;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:22:24:0:0:22:24:0:0
chr1	205814485	.	G	A	305.94	PASS	AF=0.583333;AO=20;DP=48;FAO=28;FDP=48;FR=.;FRO=20;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=0.0656253;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.9458;QD=25.4951;RBI=0.0687655;REFB=-0.0205641;REVB=0.0205428;RO=16;SAF=10;SAR=10;SRF=3;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.249843;STB=0.591651;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.0157955;OID=.;OPOS=205814485;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:16:20:20:28:0.583333:10:10:3:13:12:16:7:13
chr1	205814497	.	T	C	729.32	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00373463;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.588;QD=57.2017;RBI=0.0110069;REFB=0;REVB=0.0103539;RO=0;SAF=25;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.5059e-05;OID=.;OPOS=205814497;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:51:0:0:50:51:1:25:25:0:0:26:25:0:0
chr1	205819039	.	C	T	152.64	PASS	AF=0.338983;AO=20;DP=59;FAO=20;FDP=59;FR=.;FRO=39;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=-0.0137376;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.519;QD=10.3482;RBI=0.0329028;REFB=-0.0120245;REVB=-0.0298977;RO=39;SAF=12;SAR=8;SRF=18;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156355;STB=0.591745;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.0255408;OID=.;OPOS=205819039;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:39:39:20:20:0.338983:8:12:18:21:8:12:18:21
chr1	205819104	.	G	A	196.97	PASS	AF=0.393443;AO=23;DP=60;FAO=24;FDP=61;FR=.;FRO=37;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=-0.00478062;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.444;QD=12.9164;RBI=0.00767583;REFB=-0.0106413;REVB=0.00600533;RO=37;SAF=11;SAR=12;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0201661;STB=0.500687;STBP=0.999;TYPE=snp;VARB=0.015133;OID=.;OPOS=205819104;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:61:37:37:23:24:0.393443:12:11:17:20:13:11:17:20
chr1	206516261	.	C	T	348.61	PASS	AF=0.4625;AO=37;DP=80;FAO=37;FDP=80;FR=.;FRO=43;FSAF=11;FSAR=26;FSRF=12;FSRR=31;FWDB=0.00496171;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.7826;QD=17.4304;RBI=0.01639;REFB=-0.00310516;REVB=0.015621;RO=42;SAF=11;SAR=26;SRF=12;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0132603;STB=0.51183;STBP=0.888;TYPE=snp;VARB=0.00625104;OID=.;OPOS=206516261;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:42:43:37:37:0.4625:26:11:12:30:26:11:12:31
chr1	206566195	.	C	T	175.56	PASS	AF=0.243243;AO=27;DP=111;FAO=27;FDP=111;FR=.;FRO=84;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=23;FSRR=61;FWDB=-0.00444429;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.882;QD=6.32653;RBI=0.00873058;REFB=0.00645314;REVB=-0.00751473;RO=83;SAF=12;SAR=15;SRF=23;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.220272;STB=0.634566;STBP=0.151;TYPE=snp;VARB=-0.0339236;OID=.;OPOS=206566195;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:111:83:84:27:27:0.243243:15:12:23:60:15:12:23:61
chr1	206566903	.	GT	AC,GC	294.35	PASS	AF=0.0363636,0.318182;AO=4,35;DP=110;FAO=4,35;FDP=110;FR=.;FRO=71;FSAF=1,13;FSAR=3,22;FSRF=33;FSRR=38;FWDB=-0.0311367,-0.0270726;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=163.733,132.883;QD=10.7035;RBI=0.0415973,0.0275091;REFB=-0.0087292,-0.012366;REVB=-0.0275833,-0.00488108;RO=69;SAF=1,13;SAR=3,22;SRF=32;SRR=37;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.204746,-0.109323;STB=0.712183,0.564695;STBP=0.415,0.371;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0313754,0.0281864;OID=.,.;OPOS=206566903,206566904;OREF=GT,T;OALT=AC,C;OMAPALT=AC,GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:110:110:69:71:4,35:4,35:0.0363636,0.318182:3,22:1,13:32:37:3,22:1,13:33:38
chr1	206603535	.	G	A	211.89	PASS	AF=0.45098;AO=23;DP=51;FAO=23;FDP=51;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=-0.0394708;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.238;QD=16.6186;RBI=0.0427211;REFB=0.0164589;REVB=0.0163446;RO=28;SAF=10;SAR=13;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0978278;STB=0.555507;STBP=0.465;TYPE=snp;VARB=-0.0217945;OID=.;OPOS=206603535;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:28:28:23:23:0.45098:13:10:15:13:13:10:15:13
chr1	206626607	.	G	A	312.36	PASS	AF=0.459459;AO=34;DP=74;FAO=34;FDP=74;FR=.;FRO=40;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=18;FWDB=-0.00696534;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.3863;QD=16.8842;RBI=0.0153334;REFB=-0.00789711;REVB=0.01366;RO=39;SAF=19;SAR=15;SRF=22;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0051048;STB=0.504828;STBP=0.954;TYPE=snp;VARB=0.0156572;OID=.;OPOS=206626607;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:39:40:34:34:0.459459:15:19:22:17:15:19:22:18
chr1	206635570	.	C	T	486.71	PASS	AF=0.452991;AO=53;DP=117;FAO=53;FDP=117;FR=.;FRO=64;FSAF=32;FSAR=21;FSRF=41;FSRR=23;FWDB=-0.0208436;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=220.553;QD=16.6397;RBI=0.0222509;REFB=-0.00739716;REVB=-0.00778772;RO=64;SAF=32;SAR=21;SRF=41;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0381367;STB=0.521243;STBP=0.706;TYPE=snp;VARB=0.00868232;OID=.;OPOS=206635570;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:117:117:64:64:53:53:0.452991:21:32:41:23:21:32:41:23
chr1	206637395	.	C	T	282.66	PASS	AF=0.641026;AO=25;DP=39;FAO=25;FDP=39;FR=.;FRO=14;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=-0.0130476;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.017;QD=28.991;RBI=0.0362099;REFB=-0.0219851;REVB=-0.0337775;RO=14;SAF=17;SAR=8;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0274601;STB=0.515139;STBP=0.818;TYPE=snp;VARB=0.0133467;OID=.;OPOS=206637395;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:14:14:25:25:0.641026:8:17:9:5:8:17:9:5
chr1	206647742	.	A	G	740.36	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0423752;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.088;QD=56.9504;RBI=0.0811342;REFB=0;REVB=-0.0691889;RO=0;SAF=33;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.0907e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0015908;OID=.;OPOS=206647742;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:19:33:0:0:19:33:0:0
chr1	206647787	.	T	C	920.11	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00206081;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.658;QD=58.4195;RBI=0.0485086;REFB=0;REVB=0.0484648;RO=0;SAF=32;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000114274;OID=.;OPOS=206647787;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:63:0:0:61:63:1:29:32:0:0:30:33:0:0
chr1	206651107	.	G	A	287.88	PASS	AF=0.5;AO=31;DP=61;FAO=31;FDP=62;FR=.;FRO=31;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=0.00732418;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.757;QD=18.5726;RBI=0.00734748;REFB=-0.0128048;REVB=0.000584725;RO=29;SAF=18;SAR=13;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00496062;STB=0.516638;STBP=0.85;TYPE=snp;VARB=0.0137464;OID=.;OPOS=206651107;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:62:29:31:31:31:0.5:13:18:17:12:13:18:19:12
chr1	206661285	.	A	T	431.35	PASS	AF=0.478261;AO=43;DP=92;FAO=44;FDP=92;FR=.;FRO=48;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=28;FSRR=20;FWDB=-0.00570776;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.295;QD=18.7544;RBI=0.0182457;REFB=-0.0234036;REVB=-0.0173299;RO=48;SAF=22;SAR=21;SRF=28;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.06805;STB=0.531763;STBP=0.579;TYPE=snp;VARB=0.0197756;OID=.;OPOS=206661285;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:48:48:43:44:0.478261:21:22:28:20:21:23:28:20
chr1	206661287	.	C	T	470.15	PASS	AF=0.5;AO=44;DP=91;FAO=46;FDP=92;FR=.;FRO=46;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=28;FSRR=18;FWDB=-0.0017232;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.388;QD=20.4413;RBI=0.00851433;REFB=-0.0227909;REVB=-0.00833813;RO=45;SAF=23;SAR=21;SRF=26;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0503964;STB=0.554324;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=0.0376129;OID=.;OPOS=206661287;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:92:45:46:44:46:0.5:21:23:26:19:23:23:28:18
chr1	206665896	.	C	G	639.35	PASS	AF=0.960784;AO=47;DP=51;FAO=49;FDP=51;FR=.;FRO=2;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0344892;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.857;QD=50.145;RBI=0.0371756;REFB=-0.0499646;REVB=0.0138752;RO=3;SAF=22;SAR=25;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.053155;STB=0.518511;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=0.00273185;OID=.;OPOS=206665896;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:51:51:3:2:47:49:0.960784:25:22:0:3:26:23:0:2
chr1	206669465	.	C	T	885.37	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.029264;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.0591;QD=58.0572;RBI=0.0467848;REFB=0;REVB=-0.0365025;RO=0;SAF=33;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00052078;OID=.;OPOS=206669465;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:28:33:0:0:28:33:0:0
chr1	206758077	.	T	A	64.35	PASS	AF=0.727273;AO=8;DP=11;FAO=8;FDP=11;FR=.;FRO=3;FSAF=0;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.285;QD=23.3999;RBI=0.0368048;REFB=-0.0323249;REVB=0.0368048;RO=3;SAF=0;SAR=8;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0195914;OID=.;OPOS=206758077;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:11:11:3:3:8:8:0.727273:8:0:0:3:8:0:0:3
chr1	206773659	.	A	G	1231.0	PASS	AF=1;AO=70;DP=71;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0311811;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.376;QD=60.7901;RBI=0.118284;REFB=0;REVB=0.114101;RO=0;SAF=40;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000159061;OID=.;OPOS=206773659;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:71:81:0:0:70:81:1:30:40:0:0:39:42:0:0
chr1	207015957	.	T	C	430.86	PASS	AF=0.444444;AO=48;DP=108;FAO=48;FDP=108;FR=.;FRO=60;FSAF=15;FSAR=33;FSRF=33;FSRR=27;FWDB=0.0472259;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.1194;QD=15.9577;RBI=0.0475218;REFB=0.0173095;REVB=-0.00529436;RO=59;SAF=15;SAR=33;SRF=32;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.23671;STB=0.637622;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=-0.0186006;OID=.;OPOS=207015957;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:108:59:60:48:48:0.444444:33:15:32:27:33:15:33:27
chr1	207076321	.	T	G	368.49	PASS	AF=0.5;AO=38;DP=76;FAO=38;FDP=76;FR=.;FRO=38;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=0.0203764;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.6627;QD=19.3941;RBI=0.0624159;REFB=0.00416452;REVB=0.0589961;RO=38;SAF=22;SAR=16;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0953877;STB=0.553044;STBP=0.367;TYPE=snp;VARB=-0.00305384;OID=.;OPOS=207076321;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:38:38:38:38:0.5:16:22:18:20:16:22:18:20
chr1	207106444	.	A	G	296.54	PASS	AF=0.348624;AO=38;DP=102;FAO=38;FDP=109;FR=.;FRO=71;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=24;FSRR=47;FWDB=-0.0756052;FXX=0.00909008;HRUN=4;LEN=1;MLLD=44.8377;QD=10.8823;RBI=0.108722;REFB=-0.00252947;REVB=-0.07813;RO=64;SAF=14;SAR=24;SRF=22;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0293854;STB=0.5215;STBP=0.75;TYPE=snp;VARB=-0.000326791;OID=.;OPOS=207106444;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:109:64:71:38:38:0.348624:24:14:22:42:24:14:24:47
chr1	207106478	.	G	A	278.91	PASS	AF=0.395062;AO=32;DP=81;FAO=32;FDP=81;FR=.;FRO=49;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=17;FSRR=32;FWDB=0.0584986;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.445;QD=13.7731;RBI=0.0604674;REFB=0.00277996;REVB=-0.0153039;RO=49;SAF=12;SAR=20;SRF=17;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0320889;STB=0.518261;STBP=0.805;TYPE=snp;VARB=-0.00497614;OID=.;OPOS=207106478;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:49:49:32:32:0.395062:20:12:17:32:20:12:17:32
chr1	207107079	.	G	A	95.13	PASS	AF=0.352941;AO=12;DP=34;FAO=12;FDP=34;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=-0.015631;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.329;QD=11.1922;RBI=0.0369359;REFB=-0.00852819;REVB=0.0334654;RO=22;SAF=6;SAR=6;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148529;STB=0.588093;STBP=0.439;TYPE=snp;VARB=0.00889804;OID=.;OPOS=207107079;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:34:34:22:22:12:12:0.352941:6:6:8:14:6:6:8:14
chr1	207110936	.	T	C	734.34	PASS	AF=0.979167;AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=48;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00987528;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=152.228;QD=61.195;RBI=0.0125874;REFB=-0.133265;REVB=0.00780523;RO=0;SAF=28;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512815;STBP=0.291;TYPE=snp;VARB=0.000957822;OID=.;OPOS=207110936;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:48:48:0:1:47:47:0.979167:19:28:0:0:19:28:0:1
chr1	207132345	.	A	G	453.83	PASS	AF=0.969697;AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=33;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00947988;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=222.104;QD=55.0095;RBI=0.0342104;REFB=0.012003;REVB=-0.0328707;RO=1;SAF=22;SAR=10;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0444006;STB=0.523794;STBP=0.261;TYPE=snp;VARB=-4.7079e-05;OID=.;OPOS=207132345;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:33:33:1:1:32:32:0.969697:10:22:0:1:10:22:0:1
chr1	207140440	.	C	T	176.16	PASS	AF=0.333333;AO=23;DP=69;FAO=23;FDP=69;FR=.;FRO=46;FSAF=5;FSAR=18;FSRF=8;FSRR=38;FWDB=0.020263;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=196.208;QD=10.2124;RBI=0.0220741;REFB=-0.00181124;REVB=-0.00875664;RO=45;SAF=5;SAR=18;SRF=7;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111693;STB=0.54471;STBP=0.694;TYPE=snp;VARB=0.00516669;OID=.;OPOS=207140440;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:45:46:23:23:0.333333:18:5:7:38:18:5:8:38
chr1	207143422	.	A	G	755.84	PASS	AF=1;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0104837;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.822;QD=57.0444;RBI=0.0278687;REFB=0;REVB=-0.0258217;RO=0;SAF=26;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000239692;OID=.;OPOS=207143422;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:53:0:0:53:53:1:27:26:0:0:27:26:0:0
chr1	207195779	.	A	G	382.39	PASS	AF=0.965517;AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.110795;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.6922;QD=52.743;RBI=0.122827;REFB=0.0919981;REVB=0.0530192;RO=1;SAF=12;SAR=16;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0282029;STB=0.515141;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=-0.00664026;OID=.;OPOS=207195779;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:29:29:1:1:28:28:0.965517:16:12:0:1:16:12:0:1
chr1	207263829	.	A	G	766.46	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0174249;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=273.673;QD=63.8719;RBI=0.0184314;REFB=0;REVB=0.00600764;RO=0;SAF=24;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.27249e-05;OID=.;OPOS=207263829;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:24:24:0:0:24:24:0:0
chr1	207268779	.	A	G	71.83	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.141337;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.8312;QD=35.9159;RBI=0.143856;REFB=0;REVB=-0.0268043;RO=0;SAF=5;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.27427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00676941;OID=.;OPOS=207268779;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:8:0:0:7:8:1:2:5:0:0:2:6:0:0
chr1	207269919	.	C	T	208.82	PASS	AF=0.456522;AO=21;DP=45;FAO=21;FDP=46;FR=.;FRO=25;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=-0.00730506;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.5225;QD=18.1583;RBI=0.0175105;REFB=-0.00843186;REVB=0.015914;RO=24;SAF=14;SAR=7;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.23972;STB=0.646917;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=0.00528912;OID=.;OPOS=207269919;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:46:24:25:21:21:0.456522:7:14:10:14:7:14:10:15
chr1	207297680	.	T	C	248.54	PASS	AF=0.589744;AO=23;DP=39;FAO=23;FDP=39;FR=.;FRO=16;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.00796977;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=309.594;QD=25.4914;RBI=0.0083151;REFB=0.0111592;REVB=-0.00237145;RO=16;SAF=11;SAR=12;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0302011;STB=0.516764;STBP=0.82;TYPE=snp;VARB=-0.00874368;OID=.;OPOS=207297680;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:16:16:23:23:0.589744:12:11:7:9:12:11:7:9
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chr1	207646898	.	T	C	219.85	PASS	AF=0.44;AO=22;DP=50;FAO=22;FDP=50;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=-0.00928706;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.18;QD=17.5878;RBI=0.00933198;REFB=-0.0138614;REVB=-0.00091457;RO=28;SAF=11;SAR=11;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0702579;STB=0.539964;STBP=0.618;TYPE=snp;VARB=0.0163482;OID=.;OPOS=207646898;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:28:28:22:22:0.44:11:11:12:16:11:11:12:16
chr1	207646923	.	G	A	305.51	PASS	AF=0.478261;AO=33;DP=69;FAO=33;FDP=69;FR=.;FRO=36;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=-0.0245634;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.595;QD=17.7107;RBI=0.0245869;REFB=-0.0156315;REVB=-0.00107365;RO=33;SAF=17;SAR=16;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0814091;STB=0.53682;STBP=0.607;TYPE=snp;VARB=0.020384;OID=.;OPOS=207646923;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:33:36:33:33:0.478261:16:17:14:19:16:17:16:20
chr1	207653395	.	C	A	851.75	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00625883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.363;QD=57.7457;RBI=0.0189887;REFB=0;REVB=0.0179276;RO=0;SAF=24;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.25003e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.65182e-05;OID=.;OPOS=207653395;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:59:0:0:57:59:1:33:24:0:0:33:26:0:0
chr1	207679307	.	A	G	1073.2	PASS	AF=0.488789;AO=109;DP=223;FAO=109;FDP=223;FR=.;FRO=114;FSAF=57;FSAR=52;FSRF=49;FSRR=65;FWDB=0.00390597;FXX=0.00446409;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.546;QD=19.2502;RBI=0.00667113;REFB=-0.0087643;REVB=0.00540809;RO=109;SAF=57;SAR=52;SRF=46;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0916885;STB=0.547483;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=0.00750889;OID=.;OPOS=207679307;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:223:223:109:114:109:109:0.488789:52:57:46:63:52:57:49:65
chr1	207782916	.	A	T	1085.65	PASS	AF=1;AO=70;DP=72;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00207201;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.9108;QD=59.4875;RBI=0.0206685;REFB=0;REVB=0.0205644;RO=0;SAF=31;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000107122;OID=.;OPOS=207782916;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:73:0:0:70:73:1:39:31:0:0:40:33:0:0
chr1	207795320	.	A	G	649.39	PASS	AF=0.446541;AO=68;DP=156;FAO=71;FDP=159;FR=.;FRO=88;FSAF=41;FSAR=30;FSRF=42;FSRR=46;FWDB=0.0246447;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.7598;QD=16.3368;RBI=0.0252279;REFB=-0.00957809;REVB=-0.00539349;RO=87;SAF=39;SAR=29;SRF=42;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0919035;STB=0.555817;STBP=0.22;TYPE=snp;VARB=0.0122057;OID=.;OPOS=207795320;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:156:159:87:88:68:71:0.446541:29:39:42:45:30:41:42:46
chr1	207812791	.	A	G	284.97	PASS	AF=0.426667;AO=32;DP=76;FAO=32;FDP=75;FR=.;FRO=43;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=14;FSRR=29;FWDB=0.0087133;FXX=0.0131562;HRUN=2;LEN=1;MLLD=242.944;QD=15.1983;RBI=0.011933;REFB=-0.0103454;REVB=-0.00815326;RO=42;SAF=14;SAR=18;SRF=14;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108261;STB=0.566225;STBP=0.365;TYPE=snp;VARB=0.0114049;OID=.;OPOS=207812791;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:75:42:43:32:32:0.426667:18:14:14:28:18:14:14:29
chr1	207851611	.	A	G	805.65	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0623623;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.925;QD=64.4516;RBI=0.0772152;REFB=0;REVB=0.0455317;RO=0;SAF=30;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.48867e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000293903;OID=.;OPOS=207851611;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:50:0:0:49:50:1:19:30:0:0:20:30:0:0
chr1	207857254	.	A	G	411.55	PASS	AF=0.360294;AO=49;DP=136;FAO=49;FDP=136;FR=.;FRO=87;FSAF=30;FSAR=19;FSRF=38;FSRR=49;FWDB=0.043646;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.0545;QD=12.1044;RBI=0.0462453;REFB=-0.00998059;REVB=-0.0152856;RO=85;SAF=30;SAR=19;SRF=37;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196758;STB=0.612199;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.0128079;OID=.;OPOS=207857254;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:136:136:85:87:49:49:0.360294:19:30:37:48:19:30:38:49
chr1	207881557	.	A	G	1918.93	PASS	AF=1;AO=123;DP=123;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00242565;FXX=0.00799936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.519;QD=61.9008;RBI=0.00892617;REFB=0;REVB=0.00859027;RO=0;SAF=65;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000177915;OID=.;OPOS=207881557;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:123:124:0:0:123:124:1:58:65:0:0:59:65:0:0
chr1	207884105	.	C	A	1108.35	PASS	AF=0.986667;AO=74;DP=77;FAO=74;FDP=75;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0598116;FXX=0.0259707;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.6273;QD=59.112;RBI=0.0606612;REFB=0.0612389;REVB=0.0101169;RO=1;SAF=32;SAR=42;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0111316;STB=0.505881;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=-0.00786415;OID=.;OPOS=207884105;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:77:75:1:1:74:74:0.986667:42:32:0:1:42:32:0:1
chr1	207884107	.	G	A	1157.01	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0315782;FXX=0.0129853;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.417;QD=60.8952;RBI=0.0340689;REFB=0;REVB=0.012787;RO=0;SAF=34;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6391e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.4273e-05;OID=.;OPOS=207884107;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:42:34:0:0:42:34:0:0
chr1	207885881	.	C	T	1533.37	PASS	AF=1;AO=96;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00594941;FXX=0.0103082;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.769;QD=63.8904;RBI=0.0086808;REFB=0;REVB=-0.00632145;RO=0;SAF=48;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.16555e-06;OID=.;OPOS=207885881;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:96:96:0:0:96:96:1:48:48:0:0:48:48:0:0
chr1	207886150	.	C	T	2274.19	PASS	AF=1;AO=143;DP=143;FAO=143;FDP=143;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0210832;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.36;QD=63.6137;RBI=0.0210838;REFB=0;REVB=0.000158978;RO=0;SAF=67;SAR=76;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.13784e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.91424e-05;OID=.;OPOS=207886150;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:143:143:0:0:143:143:1:76:67:0:0:76:67:0:0
chr1	207888739	.	G	T	2053.79	PASS	AF=1;AO=129;DP=132;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0269649;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.455;QD=61.7682;RBI=0.0289191;REFB=0;REVB=-0.0104502;RO=0;SAF=69;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000100717;OID=.;OPOS=207888739;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:132:133:0:0:129:133:1:60:69:0:0:62:71:0:0
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chr1	208390155	.	C	T	105.82	PASS	AF=0.351351;AO=13;DP=37;FAO=13;FDP=37;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=0.00430523;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.18;QD=11.4395;RBI=0.00810036;REFB=-0.00752134;REVB=0.00686155;RO=24;SAF=7;SAR=6;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0872131;STB=0.551788;STBP=0.644;TYPE=snp;VARB=0.0091946;OID=.;OPOS=208390155;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:24:24:13:13:0.351351:6:7:11:13:6:7:11:13
chr1	208390162	.	T	C	104.82	PASS	AF=0.351351;AO=12;DP=36;FAO=13;FDP=37;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.0216466;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.89;QD=11.3323;RBI=0.0240013;REFB=-0.00471119;REVB=0.0103676;RO=22;SAF=8;SAR=4;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138903;STB=0.549279;STBP=0.663;TYPE=snp;VARB=0.00731839;OID=.;OPOS=208390162;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:37:22:24:12:13:0.351351:4:8:12:10:5:8:13:11
chr1	208391098	.	T	C	243.82	PASS	AF=0.381579;AO=29;DP=76;FAO=29;FDP=76;FR=.;FRO=47;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=28;FSRR=19;FWDB=-0.047288;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.2237;QD=12.8325;RBI=0.0487482;REFB=0.00599782;REVB=-0.011842;RO=45;SAF=12;SAR=17;SRF=27;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196467;STB=0.611435;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=-0.0165335;OID=.;OPOS=208391098;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:45:47:29:29:0.381579:17:12:27:18:17:12:28:19
chr1	209782343	.	A	G	1896.22	PASS	AF=1;AO=98;DP=123;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0252387;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.682;QD=61.6656;RBI=0.0270101;REFB=0;REVB=-0.00962049;RO=0;SAF=51;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.98828e-05;OID=.;OPOS=209782343;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:123:123:0:0:98:123:1:47:51:0:0:53:70:0:0
chr1	209788703	.	T	C	209.3	PASS	AF=0.409836;AO=25;DP=61;FAO=25;FDP=61;FR=.;FRO=36;FSAF=18;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=26;FWDB=-0.0368679;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.52;QD=13.7248;RBI=0.0444607;REFB=0.000937948;REVB=-0.0248498;RO=36;SAF=18;SAR=7;SRF=10;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.443053;STB=0.751706;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=-0.00253995;OID=.;OPOS=209788703;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:36:36:25:25:0.409836:7:18:10:26:7:18:10:26
chr1	209791929	.	G	T	739.66	PASS	AF=0.57377;AO=70;DP=122;FAO=70;FDP=122;FR=.;FRO=52;FSAF=35;FSAR=35;FSRF=24;FSRR=28;FWDB=-0.0100147;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.344;QD=24.251;RBI=0.0322126;REFB=-0.0107875;REVB=-0.0306163;RO=51;SAF=35;SAR=35;SRF=23;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0379087;STB=0.516389;STBP=0.683;TYPE=snp;VARB=0.0076047;OID=.;OPOS=209791929;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:122:122:51:52:70:70:0.57377:35:35:23:28:35:35:24:28
chr1	209797198	.	A	G	283.71	PASS	AF=0.526316;AO=30;DP=57;FAO=30;FDP=57;FR=.;FRO=27;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=0.0213984;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.87;QD=19.9095;RBI=0.0215951;REFB=-0.0241583;REVB=0.00290811;RO=27;SAF=20;SAR=10;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102083;STB=0.556923;STBP=0.372;TYPE=snp;VARB=0.0194478;OID=.;OPOS=209797198;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:27:27:30:30:0.526316:10:20:15:12:10:20:15:12
chr1	209797253	.	T	C	302.06	PASS	AF=0.516129;AO=32;DP=61;FAO=32;FDP=62;FR=.;FRO=30;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=0.00874052;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.356;QD=19.4877;RBI=0.0273856;REFB=-0.01436;REVB=-0.0259533;RO=29;SAF=20;SAR=12;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0955409;STB=0.56246;STBP=0.344;TYPE=snp;VARB=0.0133213;OID=.;OPOS=209797253;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:62:29:30:32:32:0.516129:12:20:15:14:12:20:15:15
chr1	209799205	.	A	G	116.16	PASS	AF=0.341463;AO=14;DP=41;FAO=14;FDP=41;FR=.;FRO=27;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=-0.0856177;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.631;QD=11.3324;RBI=0.0856266;REFB=-0.0214386;REVB=-0.00123279;RO=27;SAF=7;SAR=7;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144185;STB=0.585247;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.0328528;OID=.;OPOS=209799205;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:27:27:14:14:0.341463:7:7:10:17:7:7:10:17
chr1	209799253	.	A	G	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0301941;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.9006;QD=56.1912;RBI=0.0312006;REFB=0;REVB=-0.00786112;RO=0;SAF=15;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000303539;OID=.;OPOS=209799253;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:13:15:0:0:13:15:0:0
chr1	209800230	.	C	T	1526.42	PASS	AF=0.938596;AO=105;DP=113;FAO=107;FDP=114;FR=.;FRO=7;FSAF=67;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.00736062;FXX=0.0086949;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.22;QD=53.5586;RBI=0.0345861;REFB=-0.106632;REVB=0.0337938;RO=7;SAF=67;SAR=38;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0622493;STB=0.53119;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.00115261;OID=.;OPOS=209800230;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:17:113:114:7:7:105:107:0.938596:38:67:1:6:40:67:1:6
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chr1	209933528	.	G	A	154.78	PASS	AF=0.404762;AO=17;DP=42;FAO=17;FDP=42;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.017665;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.768;QD=14.7409;RBI=0.0177055;REFB=-0.00874883;REVB=0.001197;RO=25;SAF=6;SAR=11;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21537;STB=0.624851;STBP=0.2;TYPE=snp;VARB=0.0253434;OID=.;OPOS=209933528;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:25:25:17:17:0.404762:11:6:14:11:11:6:14:11
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chr1	209936914	.	C	T	234.31	PASS	AF=0.388889;AO=28;DP=72;FAO=28;FDP=72;FR=.;FRO=44;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=29;FSRR=15;FWDB=-0.00609083;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.1991;QD=13.0172;RBI=0.0442562;REFB=-0.0243095;REVB=-0.043835;RO=44;SAF=16;SAR=12;SRF=29;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.097327;STB=0.555517;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=0.0345525;OID=.;OPOS=209936914;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:44:44:28:28:0.388889:12:16:29:15:12:16:29:15
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chr1	209964080	.	C	T	237.05	PASS	AF=0.479167;AO=23;DP=48;FAO=23;FDP=48;FR=.;FRO=25;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=0.00691586;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.018;QD=19.7541;RBI=0.00777803;REFB=-0.010443;REVB=0.0035593;RO=25;SAF=8;SAR=15;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200335;STB=0.613282;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=0.0103268;OID=.;OPOS=209964080;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:25:25:23:23:0.479167:15:8:14:11:15:8:14:11
chr1	209968684	.	C	A	506.21	PASS	AF=0.504762;AO=53;DP=105;FAO=53;FDP=105;FR=.;FRO=52;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=25;FSRR=27;FWDB=-0.0179967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.794;QD=19.2843;RBI=0.0289968;REFB=-0.0103537;REVB=0.0227362;RO=52;SAF=28;SAR=25;SRF=25;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0426128;STB=0.523544;STBP=0.633;TYPE=snp;VARB=0.00913536;OID=.;OPOS=209968684;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:105:52:52:53:53:0.504762:25:28:25:27:25:28:25:27
chr1	210012437	.	G	A	371.97	PASS	AF=0.62069;AO=36;DP=58;FAO=36;FDP=58;FR=.;FRO=22;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=5;FSRR=17;FWDB=-0.0193456;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.057;QD=25.6529;RBI=0.0195524;REFB=-0.00806879;REVB=0.00283634;RO=22;SAF=15;SAR=21;SRF=5;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138877;STB=0.575717;STBP=0.161;TYPE=snp;VARB=0.00831335;OID=.;OPOS=210012437;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:22:22:36:36:0.62069:21:15:5:17:21:15:5:17
chr1	210337043	.	A	G	347.65	PASS	AF=0.962963;AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=27;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0652034;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.435;QD=51.5042;RBI=0.076572;REFB=-0.14537;REVB=0.040147;RO=0;SAF=10;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.71087e-08;STB=0.523791;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.0037562;OID=.;OPOS=210337043;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:27:27:0:1:26:26:0.962963:16:10:0:0:16:10:1:0
chr1	210407031	.	G	T	192.82	PASS	AF=0.423077;AO=22;DP=52;FAO=22;FDP=52;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=0.0116612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.489;QD=14.8319;RBI=0.0157633;REFB=-0.0344672;REVB=-0.0106065;RO=30;SAF=12;SAR=10;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.212034;STB=0.620584;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=0.0373871;OID=.;OPOS=210407031;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:30:30:22:22:0.423077:10:12:10:20:10:12:10:20
chr1	210547505	.	C	G	330.9	PASS	AF=0.433735;AO=36;DP=83;FAO=36;FDP=83;FR=.;FRO=47;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=18;FSRR=29;FWDB=0.000620053;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=302.257;QD=15.947;RBI=0.00410042;REFB=-0.00830253;REVB=-0.00405327;RO=47;SAF=13;SAR=23;SRF=18;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0236126;STB=0.513312;STBP=0.845;TYPE=snp;VARB=0.0105792;OID=.;OPOS=210547505;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:47:47:36:36:0.433735:23:13:18:29:23:13:18:29
chr1	210547517	.	C	T	407.93	PASS	AF=0.456522;AO=42;DP=92;FAO=42;FDP=92;FR=.;FRO=50;FSAF=16;FSAR=26;FSRF=20;FSRR=30;FWDB=-0.00968147;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.204;QD=17.736;RBI=0.0132361;REFB=0.00407539;REVB=0.00902572;RO=50;SAF=16;SAR=26;SRF=20;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0195047;STB=0.510912;STBP=0.842;TYPE=snp;VARB=-0.00535107;OID=.;OPOS=210547517;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:50:50:42:42:0.456522:26:16:20:30:26:16:20:30
chr1	210577873	.	G	C	362.08	PASS	AF=0.414894;AO=39;DP=94;FAO=39;FDP=94;FR=.;FRO=55;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=32;FSRR=23;FWDB=-0.00330409;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.652;QD=15.4077;RBI=0.0114935;REFB=-0.00953313;REVB=-0.0110084;RO=55;SAF=23;SAR=16;SRF=32;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00846193;STB=0.504781;STBP=0.952;TYPE=snp;VARB=0.0126425;OID=.;OPOS=210577873;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:55:55:39:39:0.414894:16:23:32:23:16:23:32:23
chr1	210577884	.	G	A	390.96	PASS	AF=0.43617;AO=41;DP=94;FAO=41;FDP=94;FR=.;FRO=53;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=30;FSRR=23;FWDB=0.0135677;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.75;QD=16.6364;RBI=0.0181765;REFB=-0.00171669;REVB=-0.0120956;RO=53;SAF=24;SAR=17;SRF=30;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0198899;STB=0.511177;STBP=0.874;TYPE=snp;VARB=0.00210842;OID=.;OPOS=210577884;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:53:53:41:41:0.43617:17:24:30:23:17:24:30:23
chr1	211447625	.	G	A	1416.51	PASS	AF=1;AO=90;DP=91;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0108459;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.4693;QD=62.9562;RBI=0.0454662;REFB=0;REVB=-0.0441537;RO=0;SAF=31;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.22242e-05;OID=.;OPOS=211447625;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:91:90:0:0:90:90:1:59:31:0:0:59:31:0:0
chr1	211846876	.	A	G	834.4	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0301159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.704;QD=57.5449;RBI=0.0330108;REFB=0;REVB=-0.0135184;RO=0;SAF=23;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.96471e-05;OID=.;OPOS=211846876;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:35:23:0:0:35:23:0:0
chr1	211922603	.	G	A	265.63	PASS	AF=0.3875;AO=31;DP=80;FAO=31;FDP=80;FR=.;FRO=49;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=25;FWDB=0.00215913;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.355;QD=13.2817;RBI=0.00333088;REFB=0.00203402;REVB=0.00253632;RO=48;SAF=14;SAR=17;SRF=23;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0294952;STB=0.523486;STBP=0.77;TYPE=snp;VARB=-0.00387162;OID=.;OPOS=211922603;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:48:49:31:31:0.3875:17:14:23:25:17:14:24:25
chr1	212273639	.	C	T	820.5	PASS	AF=1;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-6.06319e-05;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.445;QD=57.5787;RBI=0.000525979;REFB=0;REVB=0.000522473;RO=0;SAF=30;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.05482e-06;OID=.;OPOS=212273639;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:57:0:0:57:57:1:27:30:0:0:27:30:0:0
chr1	212274413	.	A	C	348.68	PASS	AF=1;AO=25;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0278957;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=238.234;QD=53.6425;RBI=0.0348369;REFB=0;REVB=-0.0208673;RO=0;SAF=10;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000141621;OID=.;OPOS=212274413;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:25:26:1:15:10:0:0:15:11:0:0
chr1	212515613	.	C	T	353.95	PASS	AF=0.625;AO=29;DP=47;FAO=30;FDP=48;FR=.;FRO=18;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=3;FSRR=15;FWDB=-0.0929831;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.019;QD=29.4956;RBI=0.0929838;REFB=0.00430526;REVB=0.000365673;RO=18;SAF=18;SAR=11;SRF=3;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.308946;STB=0.658435;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=-0.0031216;OID=.;OPOS=212515613;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:48:18:18:29:30:0.625:11:18:3:15:12:18:3:15
chr1	212526288	.	C	T	386.57	PASS	AF=0.470588;AO=40;DP=85;FAO=40;FDP=85;FR=.;FRO=45;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=20;FSRR=25;FWDB=-0.00303122;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.649;QD=18.1914;RBI=0.00337056;REFB=-0.00755227;REVB=-0.00147391;RO=45;SAF=17;SAR=23;SRF=20;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0187943;STB=0.510493;STBP=0.863;TYPE=snp;VARB=0.0102884;OID=.;OPOS=212526288;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:45:45:40:40:0.470588:23:17:20:25:23:17:20:25
chr1	212534377	.	T	A	224.29	PASS	AF=0.478261;AO=21;DP=45;FAO=22;FDP=46;FR=.;FRO=24;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.00501561;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.072;QD=19.5033;RBI=0.00967236;REFB=-0.0189166;REVB=-0.00827032;RO=23;SAF=14;SAR=7;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100971;STB=0.551819;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.0257223;OID=.;OPOS=212534377;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:46:23:24:21:22:0.478261:7:14:13:10:8:14:13:11
chr1	212560327	.	A	G	487.66	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0858746;FXX=0.0294031;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.8393;QD=59.1097;RBI=0.107824;REFB=0;REVB=-0.0652044;RO=0;SAF=17;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.60901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00319932;OID=.;OPOS=212560327;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:16:17:0:0:16:17:0:0
chr1	212619339	.	T	C	241.69	PASS	AF=0.522727;AO=23;DP=44;FAO=23;FDP=44;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=0.00579686;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.524;QD=21.9718;RBI=0.00599162;REFB=-0.0191228;REVB=0.00151521;RO=20;SAF=10;SAR=13;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.217751;STB=0.609282;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.01043;OID=.;OPOS=212619339;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:20:21:23:23:0.522727:13:10:14:6:13:10:14:7
chr1	212799870	.	A	G	867.64	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0607795;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.8231;QD=57.8427;RBI=0.0913784;REFB=0;REVB=-0.0682339;RO=0;SAF=24;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.31293e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.93965e-05;OID=.;OPOS=212799870;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:60:0:0:58:60:1:34:24:0:0:34:26:0:0
chr1	212799949	.	C	T	751.58	PASS	AF=1;AO=46;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000809597;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.694;QD=63.964;RBI=0.0436827;REFB=0;REVB=0.0436752;RO=0;SAF=17;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000111306;OID=.;OPOS=212799949;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:46:47:1:29:17:0:0:30:17:0:0
chr1	212900487	.	A	G	769.87	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0147018;FXX=0.020404;HRUN=3;LEN=1;MLLD=231.622;QD=64.1557;RBI=0.0155441;REFB=0;REVB=0.00504735;RO=0;SAF=25;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.48894e-05;OID=.;OPOS=212900487;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:23:25:0:0:23:25:0:0
chr1	212902901	.	G	A	332.74	PASS	AF=0.385417;AO=36;DP=95;FAO=37;FDP=96;FR=.;FRO=59;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=37;FSRR=22;FWDB=-0.0253859;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.695;QD=13.8643;RBI=0.0274893;REFB=-0.0263281;REVB=-0.0105459;RO=55;SAF=21;SAR=15;SRF=33;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0182905;STB=0.520883;STBP=0.74;TYPE=snp;VARB=0.0384985;OID=.;OPOS=212902901;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:96:55:59:36:37:0.385417:15:21:33:22:15:22:37:22
chr1	212911836	.	T	C	1208.91	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00325116;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.889;QD=61.2109;RBI=0.0175232;REFB=0;REVB=0.0172189;RO=0;SAF=23;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.03902e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.28816e-05;OID=.;OPOS=212911836;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:56:23:0:0:56:23:0:0
chr1	212965095	.	G	A	147.23	PASS	AF=0.470588;AO=16;DP=34;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.00174155;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.816;QD=17.3212;RBI=0.00498892;REFB=-0.00217057;REVB=-0.00467508;RO=18;SAF=7;SAR=9;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0581634;STB=0.533291;STBP=0.667;TYPE=snp;VARB=0.00280589;OID=.;OPOS=212965095;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:18:18:16:16:0.470588:9:7:9:9:9:7:9:9
chr1	212965284	.	C	G	794.76	PASS	AF=0.342857;AO=61;DP=210;FAO=72;FDP=210;FR=.,HEALED;FRO=118;FSAF=43;FSAR=29;FSRF=68;FSRR=50;FWDB=-0.00114794;FXX=0.00473911;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.958;QD=15.1383;RBI=0.00340171;REFB=-0.00802153;REVB=-0.00320217;RO=114;SAF=43;SAR=18;SRF=66;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15866;STB=0.513448;STBP=0.781;TYPE=snp;VARB=0.037574;OID=.;OPOS=212965284;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:210:210:114:118:61:72:0.342857:18:43:66:48:29:43:68:50
chr1	213009469	.	A	G	435.85	PASS	AF=0.96875;AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0300522;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.182;QD=54.4812;RBI=0.0475112;REFB=-0.12367;REVB=0.0367991;RO=1;SAF=12;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0239259;STB=0.512812;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.001547;OID=.;OPOS=213009469;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:32:32:1:1:31:31:0.96875:19:12:0:1:19:12:0:1
chr1	213031948	.	G	C	345.2	PASS	AF=0.870968;AO=26;DP=30;FAO=27;FDP=31;FR=.;FRO=4;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0100202;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=53.2478;QD=44.5415;RBI=0.0422725;REFB=-0.0880517;REVB=-0.0410678;RO=4;SAF=8;SAR=18;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18421;STB=0.599922;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.00418367;OID=.;OPOS=213031948;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:19:30:31:4:4:26:27:0.870968:18:8:4:0:19:8:4:0
chr1	213068595	.	C	T	290.16	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0240119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.443;QD=50.463;RBI=0.0269697;REFB=0;REVB=-0.0122798;RO=0;SAF=8;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.92882e-05;OID=.;OPOS=213068595;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:23:0:0:22:23:1:14:8:0:0:14:9:0:0
chr1	214492286	.	G	A	279.33	PASS	AF=0.508475;AO=30;DP=59;FAO=30;FDP=59;FR=.;FRO=29;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=-0.0154697;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.6396;QD=18.9374;RBI=0.0374933;REFB=0.0321272;REVB=0.0341531;RO=29;SAF=15;SAR=15;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0455696;STB=0.525407;STBP=0.732;TYPE=snp;VARB=-0.0303312;OID=.;OPOS=214492286;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:29:29:30:30:0.508475:15:15:13:16:15:15:13:16
chr1	214542819	.	T	C	120.17	PASS	AF=0.411765;AO=14;DP=34;FAO=14;FDP=34;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=-0.0456973;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.9627;QD=14.138;RBI=0.0458252;REFB=-0.00132607;REVB=0.00342202;RO=20;SAF=9;SAR=5;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.19746;STB=0.615217;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=-0.000332967;OID=.;OPOS=214542819;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:20:20:14:14:0.411765:5:9:9:11:5:9:9:11
chr1	214564340	.	T	C	196.94	PASS	AF=0.393443;AO=24;DP=61;FAO=24;FDP=61;FR=.;FRO=37;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=-0.0129841;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.732;QD=12.9141;RBI=0.0134597;REFB=-0.0112257;REVB=0.00354633;RO=36;SAF=6;SAR=18;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.288135;STB=0.660408;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.0155148;OID=.;OPOS=214564340;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:36:37:24:24:0.393443:18:6:18:18:18:6:18:19
chr1	214787130	.	G	A	219.84	PASS	AF=0.44;AO=22;DP=50;FAO=22;FDP=50;FR=.;FRO=28;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.0315535;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=77.138;QD=17.5873;RBI=0.0410078;REFB=0.00303887;REVB=-0.0261919;RO=28;SAF=13;SAR=9;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0554061;STB=0.53157;STBP=0.728;TYPE=snp;VARB=-0.00277554;OID=.;OPOS=214787130;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:28:28:22:22:0.44:9:13:15:13:9:13:15:13
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chr1	214826196	.	G	A	92.33	PASS	AF=0.5;AO=11;DP=23;FAO=11;FDP=22;FR=.;FRO=11;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=-0.031288;FXX=0.0434594;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.714;QD=16.7877;RBI=0.0316174;REFB=-0.00550256;REVB=0.00455189;RO=12;SAF=8;SAR=3;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0657668;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00490001;OID=.;OPOS=214826196;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:23:22:12:11:11:11:0.5:3:8:8:4:3:8:8:3
chr1	214828616	.	G	A	265.38	PASS	AF=0.491525;AO=29;DP=59;FAO=29;FDP=59;FR=.;FRO=30;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=0.000985994;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=323.196;QD=17.9916;RBI=0.0072294;REFB=-0.0110588;REVB=-0.00716185;RO=30;SAF=14;SAR=15;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0458938;STB=0.525683;STBP=0.728;TYPE=snp;VARB=0.0119764;OID=.;OPOS=214828616;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:30:30:29:29:0.491525:15:14:16:14:15:14:16:14
chr1	214830617	.	A	G	146.37	PASS	AF=0.457143;AO=16;DP=35;FAO=16;FDP=35;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=4;FWDB=0.0221088;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.089;QD=16.728;RBI=0.0309348;REFB=0.005748;REVB=0.0216371;RO=19;SAF=7;SAR=9;SRF=15;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.326378;STB=0.684912;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=-0.0106299;OID=.;OPOS=214830617;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:19:19:16:16:0.457143:9:7:15:4:9:7:15:4
chr1	214837110	.	C	G	286.5	PASS	AF=0.553191;AO=26;DP=47;FAO=26;FDP=47;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0170023;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.758;QD=24.3828;RBI=0.0358112;REFB=-0.0146208;REVB=-0.0315177;RO=21;SAF=13;SAR=13;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0191212;STB=0.51063;STBP=0.868;TYPE=snp;VARB=0.00940853;OID=.;OPOS=214837110;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:21:21:26:26:0.553191:13:13:11:10:13:13:11:10
chr1	215848062	.	C	T	367.9	PASS	AF=0.487179;AO=37;DP=76;FAO=38;FDP=78;FR=.;FRO=40;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=31;FSRR=9;FWDB=0.0278755;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.9264;QD=18.8668;RBI=0.0290564;REFB=-0.0299847;REVB=-0.0081996;RO=39;SAF=16;SAR=21;SRF=31;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.326088;STB=0.663952;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0381408;OID=.;OPOS=215848062;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:78:39:40:37:38:0.487179:21:16:31:8:21:17:31:9
chr1	215848641	.	T	C	279.78	PASS	AF=0.405063;AO=32;DP=79;FAO=32;FDP=79;FR=.;FRO=47;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=27;FSRR=20;FWDB=0.0297329;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.049;QD=14.1661;RBI=0.0306299;REFB=0.00950988;REVB=-0.00735839;RO=47;SAF=17;SAR=15;SRF=27;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0455662;STB=0.52588;STBP=0.737;TYPE=snp;VARB=-0.0083472;OID=.;OPOS=215848641;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:47:47:32:32:0.405063:15:17:27:20:15:17:27:20
chr1	215914826	.	T	C	344.8	PASS	AF=0.555556;AO=35;DP=63;FAO=35;FDP=63;FR=.;FRO=28;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=9;FSRR=19;FWDB=0.0244303;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.661;QD=21.8919;RBI=0.0246606;REFB=0.00310387;REVB=-0.00336171;RO=28;SAF=16;SAR=19;SRF=9;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111429;STB=0.561369;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=-0.00154401;OID=.;OPOS=215914826;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:28:28:35:35:0.555556:19:16:9:19:19:16:9:19
chr1	215916563	.	G	A	196.07	PASS	AF=0.416667;AO=20;DP=48;FAO=20;FDP=48;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=9;FWDB=-0.0010852;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.777;QD=16.3391;RBI=0.0090876;REFB=-0.0109097;REVB=0.00902257;RO=28;SAF=7;SAR=13;SRF=19;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.326833;STB=0.686811;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.024123;OID=.;OPOS=215916563;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:28:28:20:20:0.416667:13:7:19:9:13:7:19:9
chr1	215960167	.	T	G	416.1	PASS	AF=0.438776;AO=43;DP=98;FAO=43;FDP=98;FR=.;FRO=55;FSAF=14;FSAR=29;FSRF=24;FSRR=31;FWDB=0.00049617;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=215.841;QD=16.9838;RBI=0.00897632;REFB=-0.00657563;REVB=0.0089626;RO=55;SAF=14;SAR=29;SRF=24;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119797;STB=0.567424;STBP=0.265;TYPE=snp;VARB=0.00730026;OID=.;OPOS=215960167;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:55:55:43:43:0.438776:29:14:24:31:29:14:24:31
chr1	216172380	.	A	G,T	869.62	PASS	AF=0.934426,0.0655738;AO=57,4;DP=61;FAO=57,4;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=30,0;FSAR=27,4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000445526,-0.00304228;FXX=0.0161264;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=158.783,125.937;QD=57.0245;RBI=0.0127454,0.00447568;REFB=0,0;REVB=-0.0127376,-0.00328271;RO=0;SAF=30,0;SAR=27,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000213175,0.0322845;OID=.,.;OPOS=216172380,216172380;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:15:61:61:0:0:57,4:57,4:0.934426,0.0655738:27,4:30,0:0:0:27,4:30,0:0:0
chr1	216219781	.	A	G	389.04	PASS	AF=0.481928;AO=40;DP=83;FAO=40;FDP=83;FR=.;FRO=43;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=0.00900402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.9563;QD=18.7492;RBI=0.0260567;REFB=-0.0309938;REVB=0.0244516;RO=43;SAF=22;SAR=18;SRF=22;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0358805;STB=0.51999;STBP=0.739;TYPE=snp;VARB=0.0423238;OID=.;OPOS=216219781;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:43:43:40:40:0.481928:18:22:22:21:18:22:22:21
chr1	216348764	.	C	T	555.09	PASS	AF=0.513514;AO=57;DP=111;FAO=57;FDP=111;FR=.;FRO=54;FSAF=23;FSAR=34;FSRF=28;FSRR=26;FWDB=-0.0282148;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.389;QD=20.0032;RBI=0.0284363;REFB=0.0189968;REVB=-0.00354192;RO=54;SAF=23;SAR=34;SRF=28;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102996;STB=0.55682;STBP=0.226;TYPE=snp;VARB=-0.0236132;OID=.;OPOS=216348764;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:111:54:54:57:57:0.513514:34:23:28:26:34:23:28:26
chr1	216592003	.	T	C	501.9	PASS	AF=0.521277;AO=47;DP=93;FAO=49;FDP=94;FR=.;FRO=45;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=24;FSRR=21;FWDB=0.00154399;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.135;QD=21.3573;RBI=0.00534952;REFB=-0.0164919;REVB=0.00512187;RO=46;SAF=26;SAR=21;SRF=25;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00876801;STB=0.508538;STBP=0.871;TYPE=snp;VARB=0.0170485;OID=.;OPOS=216592003;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:94:46:45:47:49:0.521277:21:26:25:21:22:27:24:21
chr1	216595306	.	C	T	255.06	PASS	AF=0.379747;AO=30;DP=80;FAO=30;FDP=79;FR=.;FRO=49;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=31;FWDB=0.0205487;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.447;QD=12.9145;RBI=0.0358158;REFB=-0.00519335;REVB=-0.0293347;RO=49;SAF=15;SAR=15;SRF=18;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144013;STB=0.582225;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=0.00586339;OID=.;OPOS=216595306;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:79:49:49:30:30:0.379747:15:15:18:31:15:15:18:31
chr1	216678108	.	A	G	321.79	PASS	AF=0.592593;AO=32;DP=54;FAO=32;FDP=54;FR=.;FRO=22;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.0197666;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.6706;QD=23.8365;RBI=0.0275466;REFB=-0.0109584;REVB=0.0191859;RO=22;SAF=11;SAR=21;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156056;STB=0.58611;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=0.00678998;OID=.;OPOS=216678108;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:22:22:32:32:0.592593:21:11:12:10:21:11:12:10
chr1	216692669	.	C	T	1342.94	PASS	AF=1;AO=86;DP=87;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0352445;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.874;QD=62.4624;RBI=0.0359327;REFB=0;REVB=0.00699902;RO=0;SAF=44;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.98046e-05;OID=.;OPOS=216692669;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:86:0:0:86:86:1:42:44:0:0:42:44:0:0
chr1	217480756	.	G	A	365.77	PASS	AF=0.401869;AO=43;DP=107;FAO=43;FDP=107;FR=.;FRO=64;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=22;FSRR=42;FWDB=-0.00125633;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.975;QD=13.6735;RBI=0.00284975;REFB=0.00358198;REVB=-0.00255787;RO=64;SAF=21;SAR=22;SRF=22;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154145;STB=0.586861;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=-0.00618319;OID=.;OPOS=217480756;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:107:64:64:43:43:0.401869:22:21:22:42:22:21:22:42
chr1	217856622	.	A	G	556.81	PASS	AF=0.450382;AO=59;DP=132;FAO=59;FDP=131;FR=.;FRO=72;FSAF=30;FSAR=29;FSRF=41;FSRR=31;FWDB=0.0394829;FXX=0.00757518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.384;QD=17.0017;RBI=0.0396486;REFB=-0.015879;REVB=0.00362152;RO=72;SAF=30;SAR=29;SRF=41;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0602425;STB=0.533547;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.0141704;OID=.;OPOS=217856622;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:132:131:72:72:59:59:0.450382:29:30:41:31:29:30:41:31
chr1	217947738	.	G	A	529.04	PASS	AF=0.597561;AO=48;DP=81;FAO=49;FDP=82;FR=.;FRO=33;FSAF=29;FSAR=20;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=0.00296252;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.494;QD=25.8069;RBI=0.033792;REFB=-0.0137636;REVB=0.0336619;RO=30;SAF=29;SAR=19;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0274627;STB=0.531555;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=0.00965158;OID=.;OPOS=217947738;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:82:30:33:48:49:0.597561:19:29:17:13:20:29:17:16
chr1	218480973	.	A	G	112.41	PASS	AF=0.481481;AO=13;DP=26;FAO=13;FDP=27;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.0527322;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.852;QD=16.6533;RBI=0.0533506;REFB=-0.0169964;REVB=-0.00809906;RO=13;SAF=5;SAR=8;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135944;STB=0.561308;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.0150909;OID=.;OPOS=218480973;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:27:13:14:13:13:0.481481:8:5:7:6:8:5:7:7
chr1	218683528	.	A	G	266.2	PASS	AF=0.336842;AO=32;DP=95;FAO=32;FDP=95;FR=.;FRO=63;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=22;FSRR=41;FWDB=-0.00666487;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.7743;QD=11.2085;RBI=0.0128838;REFB=-0.0108355;REVB=0.011026;RO=63;SAF=11;SAR=21;SRF=22;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00689261;STB=0.503997;STBP=0.973;TYPE=snp;VARB=0.0221452;OID=.;OPOS=218683528;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:63:63:32:32:0.336842:21:11:22:41:21:11:22:41
chr1	219383866	.	G	C,GC	544.4	PASS	AF=0,1;AO=2,9;DP=38;FAO=0,37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=0,20;FSAR=0,17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0839624,0.0801411;FXX=0.0512689;HRUN=1,0;LEN=1,1;MLLD=81.6741,136.032;QD=58.8536;RBI=0.0851217,0.0905367;REFB=0,0;REVB=-0.0140004,0.0421224;RO=27;SAF=2,0;SAR=0,9;SRF=20;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.386095,-0.806893;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,ins;VARB=0,-0.00192526;OID=.,.;OPOS=219383866,219383867;OREF=G,-;OALT=C,C;OMAPALT=C,GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	2/2:4:38:37:27:0:2,9:0,37:0,1:0,9:2,0:20:7:0,17:0,20:0:0
chr1	219383867	.	T	C	339.15	PASS	AF=0.717949;AO=28;DP=39;FAO=28;FDP=39;FR=.;FRO=11;FSAF=20;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=9;FWDB=0.000849565;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=205.708;QD=34.7846;RBI=0.00980985;REFB=-0.214086;REVB=-0.00977299;RO=11;SAF=20;SAR=8;SRF=2;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.290191;STB=0.658796;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.00318025;OID=.;OPOS=219383867;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:59:39:39:11:11:28:28:0.717949:8:20:2:9:8:20:2:9
chr1	219383905	.	A	G	769.3	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000159772;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.894;QD=56.9849;RBI=0.00497267;REFB=0;REVB=0.0049701;RO=0;SAF=28;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.52846e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.97424e-06;OID=.;OPOS=219383905;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:26:28:0:0:26:28:0:0
chr1	220136115	.	A	G	370.53	PASS	AF=0.430108;AO=38;DP=92;FAO=40;FDP=93;FR=.;FRO=53;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=40;FWDB=0.0168554;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.1155;QD=15.9369;RBI=0.0262724;REFB=0.00337075;REVB=0.0201528;RO=53;SAF=21;SAR=17;SRF=13;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.31173;STB=0.669387;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.000909033;OID=.;OPOS=220136115;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:93:53:53:38:40:0.430108:17:21:13:40:18:22:13:40
chr1	220154768	.	C	T	208.37	PASS	AF=0.356164;AO=25;DP=72;FAO=26;FDP=73;FR=.;FRO=47;FSAF=6;FSAR=20;FSRF=23;FSRR=24;FWDB=-0.0210276;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.9156;QD=11.4177;RBI=0.0600025;REFB=0.0113745;REVB=-0.0561973;RO=45;SAF=6;SAR=19;SRF=23;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.327093;STB=0.687049;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=-0.0367653;OID=.;OPOS=220154768;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:73:45:47:25:26:0.356164:19:6:23:22:20:6:23:24
chr1	220197625	.	G	T	920.1	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0181358;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.3698;QD=58.4188;RBI=0.0427559;REFB=0;REVB=0.038719;RO=0;SAF=40;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000116844;OID=.;OPOS=220197625;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:23:40:0:0:23:40:0:0
chr1	220239447	.	G	C,GC	725.85	PASS	AF=0,1;AO=2,6;DP=56;FAO=0,54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=0,29;FSAR=0,25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0715754,0.100491;FXX=0.0357079;HRUN=1,0;LEN=1,1;MLLD=148.472,79.7727;QD=53.7666;RBI=0.0717496,0.100679;REFB=0,0;REVB=0.004997,0.00614746;RO=45;SAF=0,4;SAR=2,2;SRF=24;SRR=21;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.410704,0.1588;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,ins;VARB=0,0.00081399;OID=.,.;OPOS=220239447,220239448;OREF=G,-;OALT=C,C;OMAPALT=C,GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	2/2:4:56:54:45:0:2,6:0,54:0,1:2,2:0,4:24:21:0,25:0,29:0:0
chr1	220239448	.	T	C	563.63	PASS	AF=0.849057;AO=45;DP=53;FAO=45;FDP=53;FR=.;FRO=8;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0588354;FXX=0.0535619;HRUN=5;LEN=1;MLLD=102.811;QD=42.5381;RBI=0.060217;REFB=-0.108496;REVB=0.0128248;RO=8;SAF=24;SAR=21;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00942842;STB=0.505048;STBP=0.919;TYPE=snp;VARB=0.0140709;OID=.;OPOS=220239448;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:53:53:8:8:45:45:0.849057:21:24:4:4:21:24:4:4
chr1	220578893	.	AACACACACACACACACACACACACACAC	AACACACACACACACACACACACACA,AACACACACACACACACACACACACAC,AACACACACACACACACACACACAC	397.16	PASS	AF=0.333333,0.5,0.166667;AO=10,6,3;DP=27;FAO=10,15,5;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=10,4,4;FSAR=0,11,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00551158,-0.0031648,-0.0359021;FXX=0;HRUN=1,1,1;LEN=3,2,4;MLLD=109.506,114.22,59.6974;QD=52.955;RBI=0.077139,0.056935,0.0854803;REFB=0,0,0;REVB=0.0769418,0.056847,-0.0775752;RO=0;SAF=10,1,2;SAR=0,5,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,3.18042e-08,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,del,del;VARB=0.00322852,0.017785,0.100039;OID=.,.,.;OPOS=220578919,220578894,220578894;OREF=CAC,AC,ACAC;OALT=-,-,-;OMAPALT=AACACACACACACACACACACACACA,AACACACACACACACACACACACACAC,AACACACACACACACACACACACAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.333333,0.5,0.166667:10,6,3:27:10,15,5:30:0:10,4,4:0,11,1:0:0:39:0:10,1,2:0,5,1:0:0
chr1	220607685	.	G	A	212.37	PASS	AF=0.645161;AO=18;DP=31;FAO=20;FDP=31;FR=.;FRO=11;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.00131959;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.489;QD=27.4019;RBI=0.00180889;REFB=-0.0160496;REVB=-0.00123723;RO=11;SAF=9;SAR=9;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0308902;STB=0.565851;STBP=0.336;TYPE=snp;VARB=0.00188436;OID=.;OPOS=220607685;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:31:31:11:11:18:20:0.645161:9:9:6:5:9:11:4:7
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chr1	222803204	.	A	G	166.43	PASS	AF=0.4;AO=18;DP=44;FAO=18;FDP=45;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=-0.00924506;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=298.394;QD=14.7942;RBI=0.011424;REFB=-0.010263;REVB=-0.00671091;RO=26;SAF=9;SAR=9;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0393585;STB=0.511099;STBP=0.944;TYPE=snp;VARB=0.016678;OID=.;OPOS=222803204;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:45:26:27:18:18:0.4:9:9:14:12:9:9:14:13
chr1	222823529	.	A	C	229.86	PASS	AF=0.5;AO=20;DP=49;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.0608904;FXX=0.039992;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.8734;QD=19.1554;RBI=0.0783399;REFB=-0.0206163;REVB=0.04929;RO=20;SAF=14;SAR=6;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.191347;STB=0.543441;STBP=0.565;TYPE=snp;VARB=0.0138188;OID=.;OPOS=222823529;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:48:20:24:20:24:0.5:6:14:10:10:9:15:13:11
chr1	222825403	.	G	A	269.34	PASS	AF=0.531915;AO=25;DP=47;FAO=25;FDP=47;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=-0.0325453;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.3762;QD=22.9222;RBI=0.0388724;REFB=-0.00881965;REVB=-0.0212572;RO=22;SAF=12;SAR=13;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137054;STB=0.57627;STBP=0.245;TYPE=snp;VARB=0.0119474;OID=.;OPOS=222825403;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:22:22:25:25:0.531915:13:12:7:15:13:12:7:15
chr1	222833538	.	C	G	204.21	PASS	AF=0.384615;AO=25;DP=65;FAO=25;FDP=65;FR=.;FRO=40;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=0.00393242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=340.939;QD=12.5664;RBI=0.0118864;REFB=-0.0026959;REVB=-0.0112171;RO=39;SAF=14;SAR=11;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13128;STB=0.567514;STBP=0.418;TYPE=snp;VARB=0.00351166;OID=.;OPOS=222833538;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:39:40:25:25:0.384615:11:14:17:22:11:14:18:22
chr1	222833601	.	T	C	1136.89	PASS	AF=1;AO=73;DP=75;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0388498;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.876;QD=59.8362;RBI=0.0436293;REFB=0;REVB=0.0198545;RO=0;SAF=39;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.85493e-05;OID=.;OPOS=222833601;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:76:0:0:73:76:1:34:39:0:0:35:41:0:0
chr1	222838216	.	C	T	69.85	PASS	AF=0.344828;AO=7;DP=27;FAO=10;FDP=29;FR=.;FRO=19;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.0161866;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.916;QD=9.63383;RBI=0.0174538;REFB=-0.0082475;REVB=0.00652905;RO=18;SAF=1;SAR=6;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.579978;STB=0.713863;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=0.0243682;OID=.;OPOS=222838216;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:69:27:29:18:19:7:10:0.344828:6:1:12:6:7:3:12:7
chr1	222886119	.	A	G	1263.16	PASS	AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0390238;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.846;QD=61.6178;RBI=0.0820414;REFB=0;REVB=-0.072166;RO=0;SAF=41;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000786766;OID=.;OPOS=222886119;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:41:41:0:0:41:41:0:0
chr1	222919895	.	T	G	304.03	PASS	AF=0.414634;AO=34;DP=82;FAO=34;FDP=82;FR=.;FRO=48;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=29;FWDB=0.012106;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.736;QD=14.8305;RBI=0.0130594;REFB=0.00275449;REVB=0.00489807;RO=48;SAF=15;SAR=19;SRF=19;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0478485;STB=0.527071;STBP=0.712;TYPE=snp;VARB=-0.00442107;OID=.;OPOS=222919895;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:48:48:34:34:0.414634:19:15:19:29:19:15:19:29
chr1	222923351	.	A	G	296.58	PASS	AF=0.434211;AO=33;DP=76;FAO=33;FDP=76;FR=.;FRO=43;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=19;FSRR=24;FWDB=0.02164;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.3736;QD=15.6092;RBI=0.0223203;REFB=-0.00407201;REVB=0.00546882;RO=43;SAF=13;SAR=20;SRF=19;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0496384;STB=0.528036;STBP=0.685;TYPE=snp;VARB=0.00778811;OID=.;OPOS=222923351;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:43:43:33:33:0.434211:20:13:19:24:20:13:19:24
chr1	223116468	.	TCCCG	ATCCA,TCCCA	210.49	PASS	AF=0,0.419355;AO=3,18;DP=62;FAO=0,26;FDP=62;FR=.;FRO=36;FSAF=0,9;FSAR=0,17;FSRF=10;FSRR=26;FWDB=-0.204873,0.061678;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=5,1;MLLD=149.056,149.542;QD=13.5799;RBI=0.204942,0.0629824;REFB=-0.00755264,-0.00450276;REVB=-0.00529042,-0.012752;RO=28;SAF=3,2;SAR=0,16;SRF=2;SRR=26;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.80941,0.118287;STB=0.5,0.545037;STBP=1,0.618;TYPE=mnp,snp;VARB=0,0.00666005;OID=.,.;OPOS=223116468,223116472;OREF=TCCCG,G;OALT=ATCCA,A;OMAPALT=ATCCA,TCCCA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:62:62:28:36:3,18:0,26:0,0.419355:0,16:3,2:2:26:0,17:0,9:10:26
chr1	223116474	.	G	T	230.11	PASS	AF=0.415385;AO=27;DP=64;FAO=27;FDP=65;FR=.;FRO=38;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=26;FWDB=-0.0695366;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.193;QD=14.1606;RBI=0.0697592;REFB=0.00882582;REVB=-0.00556866;RO=36;SAF=10;SAR=17;SRF=10;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103435;STB=0.534801;STBP=0.671;TYPE=snp;VARB=-0.0156947;OID=.;OPOS=223116474;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:65:36:38:27:27:0.415385:17:10:10:26:17:10:12:26
chr1	223176849	.	ATTTTTTTC	ATTTTTT,ATTTTTTC	49.82	PASS	AF=0,0.592593;AO=3,12;DP=27;FAO=0,16;FDP=27;FR=.;FRO=11;FSAF=0,14;FSAR=0,2;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=-0.0115297,0.0858408;FXX=0;HRUN=7,7;LEN=2,1;MLLD=79.1513,6.75992;QD=7.38145;RBI=0.0317126,0.287782;REFB=0.00684709,0.0227701;REVB=-0.0295424,0.274681;RO=9;SAF=3,10;SAR=0,2;SRF=5;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.640421,0.286527;STB=0.5,0.666419;STBP=1,0.118;TYPE=del,del;VARB=0,0.0582837;OID=.,.;OPOS=223176856,223176850;OREF=TC,T;OALT=-,-;OMAPALT=ATTTTTT,ATTTTTTC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,0.592593:3,12:27:0,16:27:11:0,14:0,2:7:4:23:9:3,10:0,2:5:4
chr1	223178561	.	A	C	339.98	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0232972;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.215;QD=54.3961;RBI=0.0364376;REFB=0;REVB=0.0280169;RO=0;SAF=11;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.5567e-05;OID=.;OPOS=223178561;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:25:0:0:24:25:1:13:11:0:0:14:11:0:0
chr1	223283910	.	A	G	729.01	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00932316;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=164.728;QD=57.1775;RBI=0.011805;REFB=0;REVB=0.00724138;RO=0;SAF=32;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.2152e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.07501e-06;OID=.;OPOS=223283910;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:19:32:0:0:19:32:0:0
chr1	223284599	.	T	C	805.18	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.079624;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.051;QD=64.4143;RBI=0.0834671;REFB=0;REVB=0.0250353;RO=0;SAF=24;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.10374e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000522461;OID=.;OPOS=223284599;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:26:24:0:0:26:24:0:0
chr1	223566859	.	T	C	73.06	PASS	AF=0.3125;AO=10;DP=32;FAO=10;FDP=32;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=17;FSRR=5;FWDB=0.0196409;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.76;QD=9.13238;RBI=0.027126;REFB=-0.0105897;REVB=0.0187097;RO=22;SAF=6;SAR=4;SRF=17;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.217222;STB=0.629906;STBP=0.398;TYPE=snp;VARB=0.0121507;OID=.;OPOS=223566859;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:32:32:22:22:10:10:0.3125:4:6:17:5:4:6:17:5
chr1	223566876	.	G	A	63.65	PASS	AF=0.290323;AO=9;DP=32;FAO=9;FDP=31;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=-0.0283404;FXX=0.0312402;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.582;QD=8.21243;RBI=0.0349901;REFB=-0.013759;REVB=-0.0205215;RO=22;SAF=6;SAR=3;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0196504;STB=0.512168;STBP=0.967;TYPE=snp;VARB=0.0493115;OID=.;OPOS=223566876;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:32:31:22:22:9:9:0.290323:3:6:15:7:3:6:15:7
chr1	223567267	.	C	T	174.37	PASS	AF=0.366667;AO=22;DP=59;FAO=22;FDP=60;FR=.;FRO=38;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=0.0088406;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=206.702;QD=11.6248;RBI=0.0158433;REFB=-0.00165943;REVB=0.0131474;RO=35;SAF=11;SAR=11;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0456179;STB=0.533303;STBP=0.711;TYPE=snp;VARB=0.00333141;OID=.;OPOS=223567267;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:60:35:38:22:22:0.366667:11:11:16:19:11:11:17:21
chr1	223567401	.	T	C	391.86	PASS	AF=0.396552;AO=46;DP=116;FAO=46;FDP=116;FR=.;FRO=70;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=37;FSRR=33;FWDB=-0.106872;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.0884;QD=13.5125;RBI=0.108284;REFB=-0.0169025;REVB=0.0174323;RO=69;SAF=21;SAR=25;SRF=36;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0692233;STB=0.543459;STBP=0.467;TYPE=snp;VARB=0.0243607;OID=.;OPOS=223567401;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:116:116:69:70:46:46:0.396552:25:21:36:33:25:21:37:33
chr1	223567531	.	G	A	356.57	PASS	AF=0.5;AO=37;DP=74;FAO=37;FDP=74;FR=.;FRO=37;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=23;FWDB=-0.00240275;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.032;QD=19.274;RBI=0.0104155;REFB=-0.0360279;REVB=-0.0101345;RO=37;SAF=21;SAR=16;SRF=14;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168966;STB=0.593858;STBP=0.114;TYPE=snp;VARB=0.0284089;OID=.;OPOS=223567531;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:37:37:37:37:0.5:16:21:14:23:16:21:14:23
chr1	223567808	.	C	T	498.39	PASS	AF=0.527473;AO=48;DP=91;FAO=48;FDP=91;FR=.;FRO=43;FSAF=28;FSAR=20;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=0.0655817;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.3752;QD=21.9073;RBI=0.0693891;REFB=-0.0398108;REVB=-0.0226689;RO=43;SAF=28;SAR=20;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0823619;STB=0.545435;STBP=0.386;TYPE=snp;VARB=0.0497304;OID=.;OPOS=223567808;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:43:43:48:48:0.527473:20:28:21:22:20:28:21:22
chr1	223715248	.	GT	G	735.5	PASS	AF=0.984615;AO=62;DP=66;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0779981;FXX=0.0151492;HRUN=2;LEN=1;MLLD=26.7088;QD=45.2616;RBI=0.102314;REFB=-0.0360629;REVB=-0.0662153;RO=2;SAF=33;SAR=29;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0277544;STB=0.50704;STBP=0.543;TYPE=del;VARB=0.00196024;OID=.;OPOS=223715249;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:0.984615:62:66:64:65:1:35:29:1:0:9:2:33:29:2:0
chr1	223717484	.	G	A	708.49	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00605612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.6312;QD=62.9768;RBI=0.0233581;REFB=0;REVB=0.0225594;RO=0;SAF=23;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000181512;OID=.;OPOS=223717484;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:22:23:0:0:22:23:0:0
chr1	223718651	.	G	A	892.8	PASS	AF=1;AO=51;DP=63;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0286955;FXX=0.031741;HRUN=1;LEN=1;MLLD=297.755;QD=58.5446;RBI=0.0287652;REFB=0;REVB=-0.00200146;RO=0;SAF=22;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.15001e-05;OID=.;OPOS=223718651;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:61:0:0:51:61:1:29:22:0:0:30:31:0:0
chr1	223718670	.	G	A	868.27	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00590332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=295.314;QD=57.8849;RBI=0.0115665;REFB=0;REVB=0.00994655;RO=0;SAF=27;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.7886e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.88385e-05;OID=.;OPOS=223718670;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:33:27:0:0:33:27:0:0
chr1	223722780	.	G	A	801.32	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0212956;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.474;QD=57.2368;RBI=0.0217702;REFB=0;REVB=-0.00452088;RO=0;SAF=34;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.43892e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.15176e-05;OID=.;OPOS=223722780;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:22:34:0:0:22:34:0:0
chr1	223813586	.	G	T	670.27	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000645492;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.532;QD=62.3508;RBI=0.00511237;REFB=0;REVB=0.00507145;RO=0;SAF=14;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.13233e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.18645e-05;OID=.;OPOS=223813586;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:29:14:0:0:29:14:0:0
chr1	223877789	.	T	C	1439.36	PASS	AF=1;AO=90;DP=90;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.01657;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.0629;QD=62.5808;RBI=0.0200346;REFB=0;REVB=0.0112613;RO=0;SAF=28;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.01361e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000603306;OID=.;OPOS=223877789;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:90:92:0:0:90:92:1:62:28:0:0:63:29:0:0
chr1	223900408	.	C	G	1396.02	PASS	AF=1;AO=88;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00299431;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.0979;QD=62.7424;RBI=0.00305348;REFB=0;REVB=-0.000598212;RO=0;SAF=57;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.90485e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.32943e-05;OID=.;OPOS=223900408;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:89:89:0:0:88:89:1:31:57:0:0:31:58:0:0
chr1	223900544	.	A	G	523.14	PASS	AF=0.607595;AO=48;DP=79;FAO=48;FDP=79;FR=.;FRO=31;FSAF=15;FSAR=33;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=0.000146228;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.804;QD=26.4883;RBI=0.011246;REFB=-0.0144885;REVB=0.0112451;RO=31;SAF=15;SAR=33;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0860378;STB=0.547049;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.007384;OID=.;OPOS=223900544;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:31:31:48:48:0.607595:33:15:13:18:33:15:13:18
chr1	223905532	.	G	A	108.27	PASS	AF=0.6;AO=12;DP=21;FAO=12;FDP=20;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.00541683;FXX=0.0475964;HRUN=3;LEN=1;MLLD=98.3986;QD=21.6548;RBI=0.0240566;REFB=-0.0107809;REVB=-0.0234388;RO=8;SAF=4;SAR=8;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.211319;STB=0.620483;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=0.0071177;OID=.;OPOS=223905532;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:21:20:8:8:12:12:0.6:8:4:5:3:8:4:5:3
chr1	223934720	.	G	A	115.37	PASS	AF=0.285714;AO=16;DP=56;FAO=16;FDP=56;FR=.;FRO=40;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=26;FSRR=14;FWDB=-0.0114409;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.139;QD=8.24046;RBI=0.0208543;REFB=0.0033325;REVB=-0.0174358;RO=40;SAF=9;SAR=7;SRF=26;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107314;STB=0.564438;STBP=0.573;TYPE=snp;VARB=-0.0130837;OID=.;OPOS=223934720;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:40:40:16:16:0.285714:7:9:26:14:7:9:26:14
chr1	223947081	.	A	G	657.5	PASS	AF=0.977273;AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.072599;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.2873;QD=59.7725;RBI=0.0811405;REFB=-0.00495402;REVB=0.0362377;RO=1;SAF=21;SAR=22;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0218371;STB=0.511622;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.00214423;OID=.;OPOS=223947081;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:44:44:1:1:43:43:0.977273:22:21:1:0:22:21:1:0
chr1	223951841	.	T	C	526.81	PASS	AF=0.972973;AO=35;DP=36;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00206572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.069;QD=56.9525;RBI=0.0127875;REFB=-0.107432;REVB=-0.0126195;RO=0;SAF=15;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.515143;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=0.00121639;OID=.;OPOS=223951841;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:36:37:0:1:35:36:0.972973:20:15:0:0:20:16:1:0
chr1	223954080	.	A	C	834.4	PASS	AF=1;AO=57;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0107857;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.0926;QD=57.5447;RBI=0.0644792;REFB=0;REVB=0.0635707;RO=0;SAF=29;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00075898;OID=.;OPOS=223954080;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:57:58:1:28:29:0:0:28:30:0:0
chr1	223962817	.	C	A	393.26	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0159226;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.6849;QD=56.1798;RBI=0.0209707;REFB=0;REVB=0.0136469;RO=0;SAF=16;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.37289e-05;OID=.;OPOS=223962817;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:12:16:0:0:12:16:0:0
chr1	223967953	.	C	T	632.26	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00668282;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.779;QD=61.6837;RBI=0.0312305;REFB=0;REVB=-0.0305071;RO=0;SAF=26;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.13797e-05;OID=.;OPOS=223967953;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:15:26:0:0:15:26:0:0
chr1	223976846	.	G	A	641.84	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0118753;FXX=0.0465008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.704;QD=62.6184;RBI=0.0121965;REFB=0;REVB=-0.00278062;RO=0;SAF=19;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00209255;OID=.;OPOS=223976846;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:22:19:0:0:22:19:0:0
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chr1	224492746	.	C	T	428.85	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0391311;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.673;QD=57.1795;RBI=0.0680549;REFB=0;REVB=-0.0556796;RO=0;SAF=15;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000154666;OID=.;OPOS=224492746;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:15:15:0:0:15:15:0:0
chr1	224495852	.	C	T	1596.45	PASS	AF=1;AO=99;DP=99;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.035559;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.0271;QD=63.8582;RBI=0.0749544;REFB=0;REVB=-0.0659827;RO=0;SAF=47;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.28099e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00147392;OID=.;OPOS=224495852;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:99:100:0:0:99:100:1:52:47:0:0:53:47:0:0
chr1	224505570	.	T	TAA,TAAA	251.98	PASS	AF=1,0;AO=19,3;DP=27;FAO=22,0;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=11,0;FSAR=11,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.167263,-0.114493;FXX=0.119952;HRUN=2,2;LEN=2,3;MLLD=39.7441,25.6543;QD=45.8144;RBI=0.178701,0.121928;REFB=0,0;REVB=0.0629067,0.0419253;RO=5;SAF=8,3;SAR=11,0;SRF=2;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.00820712,0.698233;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,ins;VARB=-0.00158253,0;OID=.,.;OPOS=224505571,224505571;OREF=-,-;OALT=AA,AAA;OMAPALT=TAA,TAAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1,0:19,3:27:22,0:22:0:11,0:11,0:0:0:5:5:8,3:11,0:2:3
chr1	224517842	.	C	T	446.89	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0716388;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.6041;QD=57.6633;RBI=0.078405;REFB=0;REVB=-0.0318626;RO=0;SAF=15;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000881278;OID=.;OPOS=224517842;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:16:15:0:0:16:15:0:0
chr1	224575373	.	G	A	902.71	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00476033;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.222;QD=58.2394;RBI=0.0701075;REFB=0;REVB=0.0699457;RO=0;SAF=40;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000181719;OID=.;OPOS=224575373;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:22:40:0:0:22:40:0:0
chr1	225288534	.	A	C	546.91	PASS	AF=0.926829;AO=38;DP=41;FAO=38;FDP=41;FR=.;FRO=3;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.00772839;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=207.216;QD=53.3566;RBI=0.00821432;REFB=-0.0297352;REVB=-0.00278336;RO=3;SAF=19;SAR=19;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0684162;STB=0.536566;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=0.000309675;OID=.;OPOS=225288534;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:41:41:3:3:38:38:0.926829:19:19:3:0:19:19:3:0
chr1	225328432	.	G	T	179.0	PASS	AF=0.392857;AO=22;DP=56;FAO=22;FDP=56;FR=.;FRO=34;FSAF=19;FSAR=3;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=-0.0354335;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.103;QD=12.7859;RBI=0.1115;REFB=-0.0479496;REVB=-0.10572;RO=34;SAF=19;SAR=3;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.396743;STB=0.733839;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.0524669;OID=.;OPOS=225328432;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:34:34:22:22:0.392857:3:19:20:14:3:19:20:14
chr1	225490866	.	TAA	TA,TAT	234.86	PASS	AF=0.294964,0.0863309;AO=34,10;DP=141;FAO=41,12;FDP=139;FR=.;FRO=86;FSAF=11,0;FSAR=30,12;FSRF=76;FSRR=10;FWDB=0.185004,0.0320649;FXX=0.0279701;HRUN=5,5;LEN=1,1;MLLD=11.0065,212.188;QD=6.75865;RBI=0.196768,0.0638955;REFB=-0.0451225,-0.00571988;REVB=-0.0670166,-0.0552673;RO=78;SAF=8,0;SAR=26,10;SRF=69;SRR=9;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.671047,-0.828025;STB=0.85561,0.999626;STBP=0,0;TYPE=del,snp;VARB=0.038435,0.144556;OID=.,.;OPOS=225490867,225490868;OREF=A,A;OALT=-,T;OMAPALT=TA,TAT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.294964,0.0863309:34,10:141:41,12:139:86:11,0:30,12:76:10:99:78:8,0:26,10:69:9
chr1	225506294	.	A	G	1255.68	PASS	AF=0.976471;AO=83;DP=85;FAO=83;FDP=85;FR=.;FRO=2;FSAF=54;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00931828;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.3239;QD=59.0906;RBI=0.0239968;REFB=-0.0480432;REVB=0.0221138;RO=2;SAF=54;SAR=29;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00736069;STB=0.503887;STBP=0.73;TYPE=snp;VARB=0.0041813;OID=.;OPOS=225506294;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:85:85:2:2:83:83:0.976471:29:54:1:1:29:54:1:1
chr1	225533731	.	T	A	1293.22	PASS	AF=0.977011;AO=85;DP=87;FAO=85;FDP=87;FR=.;FRO=2;FSAF=51;FSAR=34;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0160636;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=275.253;QD=59.4585;RBI=0.0161837;REFB=-0.0111883;REVB=0.00196797;RO=1;SAF=51;SAR=34;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00919915;STB=0.509613;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=1.41887e-05;OID=.;OPOS=225533731;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:87:87:1:2:85:85:0.977011:34:51:1:0:34:51:2:0
chr1	225541899	.	C	T	1324.89	PASS	AF=0.988506;AO=86;DP=87;FAO=86;FDP=87;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0317394;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.681;QD=60.9144;RBI=0.0323015;REFB=0.0460618;REVB=0.00599961;RO=0;SAF=31;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504503;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=-0.000109685;OID=.;OPOS=225541899;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:87:87:0:1:86:86:0.988506:55:31:0:0:55:31:0:1
chr1	225565015	.	T	C	698.72	PASS	AF=0.980392;AO=49;DP=50;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0653497;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.9821;QD=54.8017;RBI=0.0654434;REFB=0.0388183;REVB=-0.00350089;RO=1;SAF=30;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0241219;STB=0.51219;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=-0.0100436;OID=.;OPOS=225565015;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:50:51:1:1:49:50:0.980392:19:30:0:1:20:30:0:1
chr1	225565073	.	C	T	785.17	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0123582;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.07;QD=57.1029;RBI=0.0185063;REFB=0;REVB=0.0137752;RO=0;SAF=32;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.49259e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.40299e-05;OID=.;OPOS=225565073;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:23:32:0:0:23:32:0:0
chr1	225569241	.	T	G	1136.18	PASS	AF=0.939759;AO=78;DP=84;FAO=78;FDP=83;FR=.;FRO=5;FSAF=48;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.00662652;FXX=0.0119033;HRUN=3;LEN=1;MLLD=211.804;QD=54.7557;RBI=0.0139227;REFB=-0.0868368;REVB=0.0122446;RO=2;SAF=48;SAR=30;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0305085;STB=0.538452;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.000808912;OID=.;OPOS=225569241;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:16:84:83:2:5:78:78:0.939759:30:48:0:2:30:48:0:5
chr1	225601647	.	C	T	358.51	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00948889;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.972;QD=55.1552;RBI=0.0652364;REFB=0;REVB=0.0645426;RO=0;SAF=17;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000690779;OID=.;OPOS=225601647;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:26:0:0:25:26:1:8:17:0:0:9:17:0:0
chr1	225607144	.	C	T	677.76	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0019143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.076;QD=61.6148;RBI=0.0120918;REFB=0;REVB=-0.0119393;RO=0;SAF=17;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.75441e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000103273;OID=.;OPOS=225607144;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:44:0:0:43:44:1:26:17:0:0:26:18:0:0
chr1	225609884	.	A	G	1656.97	PASS	AF=1;AO=106;DP=106;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0102929;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.978;QD=60.2534;RBI=0.0107477;REFB=0;REVB=0.00309328;RO=0;SAF=56;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.41959e-06;OID=.;OPOS=225609884;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:106:110:0:0:106:110:1:50:56:0:0:51:59:0:0
chr1	225611661	.	C	T	1571.28	PASS	AF=1;AO=97;DP=97;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.031798;FXX=0.0101;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.866;QD=64.1338;RBI=0.03224;REFB=0;REVB=0.00532022;RO=0;SAF=46;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.26759e-05;OID=.;OPOS=225611661;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:97:98:0:0:97:98:1:51:46:0:0:51:47:0:0
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chr1	226032928	.	G	A	611.23	PASS	AF=0.578947;AO=54;DP=94;FAO=55;FDP=95;FR=.;FRO=40;FSAF=24;FSAR=31;FSRF=16;FSRR=24;FWDB=0.0181529;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.2788;QD=25.7361;RBI=0.0361369;REFB=-0.0311413;REVB=0.0312466;RO=40;SAF=24;SAR=30;SRF=16;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0351697;STB=0.515619;STBP=0.734;TYPE=snp;VARB=0.0304202;OID=.;OPOS=226032928;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:95:40:40:54:55:0.578947:30:24:16:24:31:24:16:24
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chr1	226054333	.	G	A	308.34	PASS	AF=0.492537;AO=33;DP=67;FAO=33;FDP=67;FR=.;FRO=34;FSAF=8;FSAR=25;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=-0.0949607;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.4522;QD=18.4083;RBI=0.106063;REFB=-0.01555;REVB=0.0472418;RO=34;SAF=8;SAR=25;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156371;STB=0.587849;STBP=0.188;TYPE=snp;VARB=0.014874;OID=.;OPOS=226054333;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:34:34:33:33:0.492537:25:8:13:21:25:8:13:21
chr1	226055595	.	G	A	445.94	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00321575;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.0026;QD=57.5411;RBI=0.00893749;REFB=0;REVB=0.00833893;RO=0;SAF=19;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000143195;OID=.;OPOS=226055595;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:31:0:0:29:31:1:10:19:0:0:12:19:0:0
chr1	226074572	.	G	C	263.48	PASS	AF=0.483333;AO=29;DP=60;FAO=29;FDP=60;FR=.;FRO=31;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=10;FSRR=21;FWDB=-0.0161121;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.687;QD=17.5656;RBI=0.0169335;REFB=0.00550541;REVB=-0.00520997;RO=31;SAF=13;SAR=16;SRF=10;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119058;STB=0.566504;STBP=0.367;TYPE=snp;VARB=-0.00672976;OID=.;OPOS=226074572;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:31:31:29:29:0.483333:16:13:10:21:16:13:10:21
chr1	226352498	.	T	G	237.35	PASS	AF=0.442623;AO=28;DP=63;FAO=27;FDP=61;FR=.;FRO=34;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=0.0120967;FXX=0.031741;HRUN=9;LEN=1;MLLD=201.298;QD=15.5638;RBI=0.012212;REFB=-0.00168764;REVB=0.00167402;RO=29;SAF=16;SAR=12;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142756;STB=0.58459;STBP=0.262;TYPE=snp;VARB=0.00157647;OID=.;OPOS=226352498;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:61:29:34:28:27:0.442623:12:16:12:17:11:16:15:19
chr1	226474132	.	G	A	288.99	PASS	AF=0.457143;AO=31;DP=69;FAO=32;FDP=70;FR=.;FRO=38;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=-0.00723853;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=301.17;QD=16.5139;RBI=0.0128306;REFB=0.00552275;REVB=-0.0105938;RO=37;SAF=18;SAR=13;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143284;STB=0.593691;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=-0.00605542;OID=.;OPOS=226474132;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:70:37:38:31:32:0.457143:13:18:16:21:13:19:16:22
chr1	226555302	.	A	G	224.83	PASS	AF=0.391304;AO=27;DP=69;FAO=27;FDP=69;FR=.;FRO=42;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=26;FWDB=0.056796;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.7474;QD=13.0338;RBI=0.0599682;REFB=-0.00852141;REVB=-0.0192458;RO=42;SAF=10;SAR=17;SRF=16;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0120033;STB=0.506876;STBP=0.954;TYPE=snp;VARB=0.0228193;OID=.;OPOS=226555302;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:42:42:27:27:0.391304:17:10:16:26:17:10:16:26
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chr1	226589833	.	T	C	61.38	PASS	AF=0.615385;AO=8;DP=13;FAO=8;FDP=13;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0377488;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=225.275;QD=18.8866;RBI=0.0380712;REFB=-0.0295475;REVB=0.00494362;RO=5;SAF=5;SAR=3;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0175135;STB=0.510178;STBP=0.994;TYPE=snp;VARB=0.0256602;OID=.;OPOS=226589833;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:13:13:5:5:8:8:0.615385:3:5:3:2:3:5:3:2
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chr1	227153447	.	G	A	81.42	PASS	AF=0.5;AO=10;DP=21;FAO=10;FDP=20;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.0971523;FXX=0.0475964;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.8987;QD=16.2837;RBI=0.0984975;REFB=-0.00272903;REVB=0.0162234;RO=9;SAF=6;SAR=4;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0373874;STB=0.550917;STBP=0.598;TYPE=snp;VARB=0.0121876;OID=.;OPOS=227153447;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:21:20:9:10:10:10:0.5:4:6:5:4:4:6:5:5
chr1	227174210	.	T	C	268.86	PASS	AF=0.333333;AO=34;DP=102;FAO=34;FDP=102;FR=.;FRO=68;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=32;FSRR=36;FWDB=0.00149469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.515;QD=10.5435;RBI=0.00848847;REFB=-0.00151098;REVB=0.00835584;RO=68;SAF=22;SAR=12;SRF=32;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.205967;STB=0.619647;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=0.00290093;OID=.;OPOS=227174210;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:68:68:34:34:0.333333:12:22:32:36:12:22:32:36
chr1	227174267	.	T	C	630.19	PASS	AF=0.457746;AO=64;DP=140;FAO=65;FDP=142;FR=.;FRO=77;FSAF=40;FSAR=25;FSRF=31;FSRR=46;FWDB=-0.0374744;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.2414;QD=17.7518;RBI=0.103221;REFB=-0.0150151;REVB=-0.0961783;RO=71;SAF=39;SAR=25;SRF=28;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.203702;STB=0.615349;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.0153768;OID=.;OPOS=227174267;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:140:142:71:77:64:65:0.457746:25:39:28:43:25:40:31:46
chr1	227177731	.	A	T	253.97	PASS	AF=0.394737;AO=30;DP=76;FAO=30;FDP=76;FR=.;FRO=46;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=26;FSRR=20;FWDB=-0.00614148;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=264.372;QD=13.367;RBI=0.00670444;REFB=-0.00304259;REVB=0.00268919;RO=46;SAF=12;SAR=18;SRF=26;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175123;STB=0.599933;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=0.00508363;OID=.;OPOS=227177731;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:46:46:30:30:0.394737:18:12:26:20:18:12:26:20
chr1	227178127	.	A	G	55.03	PASS	AF=0.347826;AO=8;DP=23;FAO=8;FDP=23;FR=.;FRO=15;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=4;FWDB=0.00170584;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.803;QD=9.57027;RBI=0.0424084;REFB=-0.00596879;REVB=0.0423741;RO=14;SAF=2;SAR=6;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.467468;STB=0.795235;STBP=0.06;TYPE=snp;VARB=0.0106333;OID=.;OPOS=227178127;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:23:23:14:15:8:8:0.347826:6:2:10:4:6:2:11:4
chr1	227178948	.	G	A	799.41	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0111051;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.3722;QD=63.953;RBI=0.0147842;REFB=0;REVB=-0.00975961;RO=0;SAF=21;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.91199e-05;OID=.;OPOS=227178948;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:50:0:0:49:50:1:28:21:0:0:29:21:0:0
chr1	227182033	.	G	A	994.7	PASS	AF=0.985507;AO=57;DP=69;FAO=68;FDP=69;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=30;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00223641;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.405;QD=57.6639;RBI=0.0755356;REFB=0.0666364;REVB=0.0755024;RO=1;SAF=29;SAR=28;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.016546;STB=0.506492;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.000614917;OID=.;OPOS=227182033;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:69:69:1:1:57:68:0.985507:28:29:0:1:38:30:0:1
chr1	227182043	.	G	C	462.74	PASS	AF=0.578947;AO=43;DP=72;FAO=44;FDP=76;FR=.;FRO=32;FSAF=13;FSAR=31;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=0.0069542;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=200.096;QD=24.355;RBI=0.00708306;REFB=-0.0317399;REVB=-0.00134493;RO=14;SAF=12;SAR=31;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.219497;STB=0.595319;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.0178017;OID=.;OPOS=227182043;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:76:14:32:43:44:0.578947:31:12:10:4:31:13:16:16
chr1	227182575	.	A	G	747.09	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00807917;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.335;QD=63.5825;RBI=0.02582;REFB=0;REVB=-0.0245234;RO=0;SAF=30;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000176791;OID=.;OPOS=227182575;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:17:30:0:0:17:30:0:0
chr1	227182607	.	T	C	268.41	PASS	AF=0.6;AO=24;DP=41;FAO=24;FDP=40;FR=.;FRO=16;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.00138325;FXX=0.0476077;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.5501;QD=26.8414;RBI=0.0505808;REFB=-0.0114967;REVB=-0.0505619;RO=15;SAF=17;SAR=7;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137257;STB=0.566609;STBP=0.342;TYPE=snp;VARB=0.00759744;OID=.;OPOS=227182607;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:40:15:16:24:24:0.6:7:17:8:7:7:17:9:7
chr1	227182659	.	G	A	233.68	PASS	AF=0.578947;AO=22;DP=38;FAO=22;FDP=38;FR=.;FRO=16;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.0283049;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.5836;QD=24.598;RBI=0.042725;REFB=0.00754897;REVB=0.0320041;RO=16;SAF=14;SAR=8;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154432;STB=0.586127;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=-0.00544649;OID=.;OPOS=227182659;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:16:16:22:22:0.578947:8:14:7:9:8:14:7:9
chr1	227216662	.	T	C	276.65	PASS	AF=0.491803;AO=30;DP=62;FAO=30;FDP=61;FR=.;FRO=31;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=-0.0190688;FXX=0.0161264;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.0654;QD=18.1407;RBI=0.030218;REFB=0.0170491;REVB=0.0234415;RO=32;SAF=17;SAR=13;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00390477;STB=0.509428;STBP=0.896;TYPE=snp;VARB=-0.0162758;OID=.;OPOS=227216662;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:61:32:31:30:30:0.491803:13:17:18:14:13:17:17:14
chr1	227216775	.	C	T	245.21	PASS	AF=0.444444;AO=28;DP=63;FAO=28;FDP=63;FR=.;FRO=35;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=0.0110597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.076;QD=15.5688;RBI=0.0140797;REFB=-0.0013349;REVB=0.00871323;RO=35;SAF=18;SAR=10;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186326;STB=0.605492;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=0.00182558;OID=.;OPOS=227216775;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:35:35:28:28:0.444444:10:18:16:19:10:18:16:19
chr1	227504794	.	T	C	311.0	PASS	AF=0.393258;AO=35;DP=89;FAO=35;FDP=89;FR=.;FRO=54;FSAF=23;FSAR=12;FSRF=31;FSRR=23;FWDB=-0.00719801;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.413;QD=13.9773;RBI=0.0226503;REFB=0.0102226;REVB=-0.0214761;RO=54;SAF=23;SAR=12;SRF=31;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0946229;STB=0.553995;STBP=0.423;TYPE=snp;VARB=-0.0138338;OID=.;OPOS=227504794;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:54:54:35:35:0.393258:12:23:31:23:12:23:31:23
chr1	227681475	.	T	C	1613.42	PASS	AF=0.677725;AO=133;DP=202;FAO=143;FDP=211;FR=.;FRO=68;FSAF=75;FSAR=68;FSRF=40;FSRR=28;FWDB=0.0229145;FXX=0.00471676;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.785;QD=30.5861;RBI=0.0743918;REFB=-0.036061;REVB=0.0707748;RO=64;SAF=67;SAR=66;SRF=36;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0355703;STB=0.520636;STBP=0.368;TYPE=snp;VARB=0.0193047;OID=.;OPOS=227681475;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:202:211:64:68:133:143:0.677725:66:67:36:28:68:75:40:28
chr1	227920103	.	G	A	354.69	PASS	AF=0.521127;AO=37;DP=71;FAO=37;FDP=71;FR=.;FRO=34;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=0.0309697;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=46.7075;QD=19.9827;RBI=0.043657;REFB=-0.0438015;REVB=-0.0307703;RO=34;SAF=20;SAR=17;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.060475;STB=0.533518;STBP=0.576;TYPE=snp;VARB=0.0409961;OID=.;OPOS=227920103;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:34:34:37:37:0.521127:17:20:16:18:17:20:16:18
chr1	227922918	.	A	C	47.69	PASS	AF=0.4375;AO=7;DP=16;FAO=7;FDP=16;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=1;FWDB=0.0285876;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.061;QD=11.9219;RBI=0.0557321;REFB=-0.0199634;REVB=0.0478416;RO=8;SAF=5;SAR=2;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196457;STB=0.633826;STBP=0.471;TYPE=snp;VARB=0.0112054;OID=.;OPOS=227922918;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:16:16:8:9:7:7:0.4375:2:5:7:1:2:5:8:1
chr1	227935444	.	A	G	142.88	PASS	AF=0.339623;AO=18;DP=52;FAO=18;FDP=53;FR=.;FRO=35;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=23;FWDB=0.0398177;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.328;QD=10.7835;RBI=0.0490472;REFB=-0.0127706;REVB=-0.0286388;RO=30;SAF=6;SAR=12;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0395261;STB=0.532403;STBP=0.737;TYPE=snp;VARB=0.0170832;OID=.;OPOS=227935444;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:53:30:35:18:18:0.339623:12:6:11:19:11:7:12:23
chr1	227963491	.	G	T	251.62	PASS	AF=0.474576;AO=28;DP=59;FAO=28;FDP=59;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=0.00528918;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=234.145;QD=17.0586;RBI=0.015893;REFB=-0.018176;REVB=-0.0149871;RO=29;SAF=12;SAR=16;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0460263;STB=0.522372;STBP=0.779;TYPE=snp;VARB=0.0172763;OID=.;OPOS=227963491;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:29:31:28:28:0.474576:16:12:11:18:16:12:12:19
chr1	228003839	.	C	T	455.38	PASS	AF=0.55;AO=44;DP=80;FAO=44;FDP=80;FR=.;FRO=36;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=22;FSRR=14;FWDB=-0.00354646;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.408;QD=22.7688;RBI=0.00532375;REFB=-0.0329501;REVB=0.0039705;RO=36;SAF=24;SAR=20;SRF=22;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0544566;STB=0.52994;STBP=0.582;TYPE=snp;VARB=0.0253872;OID=.;OPOS=228003839;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:36:36:44:44:0.55:20:24:22:14:20:24:22:14
chr1	228033184	.	C	T	91.82	PASS	AF=0.285714;AO=12;DP=42;FAO=12;FDP=42;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=-0.00553902;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.894;QD=8.7452;RBI=0.0215826;REFB=-0.0160475;REVB=0.0208598;RO=30;SAF=8;SAR=4;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162398;STB=0.599829;STBP=0.436;TYPE=snp;VARB=0.0311517;OID=.;OPOS=228033184;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:91:42:42:30:30:12:12:0.285714:4:8:16:14:4:8:16:14
chr1	228033197	.	A	G	766.44	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0131882;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.472;QD=63.8699;RBI=0.0271323;REFB=0;REVB=0.0237115;RO=0;SAF=27;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00019889;OID=.;OPOS=228033197;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:21:27:0:0:21:27:0:0
chr1	228113163	.	A	G	1100.98	PASS	AF=1;AO=71;DP=73;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0503214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.2089;QD=59.5122;RBI=0.0515492;REFB=0;REVB=0.0111835;RO=0;SAF=30;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.21646e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000262188;OID=.;OPOS=228113163;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:74:0:0:71:74:1:41:30:0:0:42:32:0:0
chr1	228347352	.	A	G	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00631446;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=205.384;QD=40.7624;RBI=0.030558;REFB=0;REVB=-0.0298985;RO=0;SAF=6;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000511439;OID=.;OPOS=228347352;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:4:6:0:0:4:6:0:0
chr1	228352160	.	T	C	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0182194;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.584;QD=44.6885;RBI=0.0302972;REFB=0;REVB=0.0242069;RO=0;SAF=5;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00106917;OID=.;OPOS=228352160;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:8:5:0:0:8:5:0:0
chr1	228362682	.	G	A	174.09	PASS	AF=0.5;AO=18;DP=36;FAO=18;FDP=36;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.000195369;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=254.563;QD=19.3436;RBI=0.00466354;REFB=-0.00802735;REVB=0.00465945;RO=18;SAF=6;SAR=12;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154992;STB=0.588134;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.00654407;OID=.;OPOS=228362682;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:18:18:18:18:0.5:12:6:9:9:12:6:9:9
chr1	228399482	.	C	G	142.64	PASS	AF=0.339623;AO=18;DP=53;FAO=18;FDP=53;FR=.;FRO=35;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=0.00617371;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=125.868;QD=10.7656;RBI=0.0102514;REFB=-0.00547747;REVB=0.00818393;RO=34;SAF=10;SAR=8;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.062033;STB=0.527396;STBP=0.822;TYPE=snp;VARB=0.0190081;OID=.;OPOS=228399482;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:34:35:18:18:0.339623:8:10:17:17:8:10:18:17
chr1	228399766	.	T	C	290.86	PASS	AF=0.508197;AO=31;DP=62;FAO=31;FDP=61;FR=.;FRO=30;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=23;FWDB=0.00258391;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.449;QD=19.0726;RBI=0.00524118;REFB=-0.0202666;REVB=-0.00455997;RO=31;SAF=16;SAR=15;SRF=8;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.230798;STB=0.637902;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.0154249;OID=.;OPOS=228399766;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:61:31:30:31:31:0.508197:15:16:8:23:15:16:7:23
chr1	228402047	.	A	G	795.68	PASS	AF=0.488095;AO=82;DP=168;FAO=82;FDP=168;FR=.;FRO=86;FSAF=60;FSAR=22;FSRF=40;FSRR=46;FWDB=0.0103471;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.3344;QD=18.9447;RBI=0.0243043;REFB=0.0176002;REVB=-0.0219918;RO=85;SAF=60;SAR=22;SRF=39;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.274225;STB=0.649643;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=-0.015285;OID=.;OPOS=228402047;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:168:168:85:86:82:82:0.488095:22:60:39:46:22:60:40:46
chr1	228402121	.	A	G	561.2	PASS	AF=0.460938;AO=59;DP=128;FAO=59;FDP=128;FR=.;FRO=69;FSAF=41;FSAR=18;FSRF=38;FSRR=31;FWDB=-0.0513971;FXX=0.00775134;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.598;QD=17.5373;RBI=0.0526948;REFB=-0.00309406;REVB=-0.0116222;RO=69;SAF=41;SAR=18;SRF=38;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153176;STB=0.585513;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=0.00491266;OID=.;OPOS=228402121;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:128:128:69:69:59:59:0.460938:18:41:38:31:18:41:38:31
chr1	228402508	.	C	T	167.37	PASS	AF=0.586207;AO=17;DP=29;FAO=17;FDP=29;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=0.0315824;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=50.0604;QD=23.0856;RBI=0.0513006;REFB=-0.0200693;REVB=0.0404265;RO=10;SAF=4;SAR=13;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.057364;STB=0.553126;STBP=0.553;TYPE=snp;VARB=0.0176547;OID=.;OPOS=228402508;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:29:29:10:12:17:17:0.586207:13:4:3:7:13:4:4:8
chr1	228412227	.	TG	CA,CG	556.7	PASS	AF=0.473684,0.526316;AO=18,20;DP=38;FAO=18,20;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=13,5;FSAR=5,15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00539863,-0.0538968;FXX=0.0256345;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=133.902,59.0766;QD=58.5999;RBI=0.0215438,0.0538981;REFB=0,0;REVB=0.0208565,-0.000375045;RO=0;SAF=13,5;SAR=5,15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.00790193,0.00986945;OID=.,.;OPOS=228412227,228412227;OREF=TG,T;OALT=CA,C;OMAPALT=CA,CG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:38:38:0:0:18,20:18,20:0.473684,0.526316:5,15:13,5:0:0:5,15:13,5:0:0
chr1	228412308	.	G	A	913.57	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00549812;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.846;QD=58.0046;RBI=0.0185233;REFB=0;REVB=0.0176885;RO=0;SAF=25;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.77904e-05;OID=.;OPOS=228412308;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:63:0:0:61:63:1:36:25:0:0:38:25:0:0
chr1	228431095	.	A	G	1185.81	PASS	AF=0.9875;AO=78;DP=79;FAO=79;FDP=80;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0144539;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.053;QD=59.2904;RBI=0.0144616;REFB=0.0549989;REVB=0.000472748;RO=1;SAF=36;SAR=42;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0111373;STB=0.505746;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=-0.000288225;OID=.;OPOS=228431095;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:79:80:1:1:78:79:0.9875:42:36:0:1:43:36:0:1
chr1	228432055	.	G	A	229.0	PASS	AF=0.424242;AO=24;DP=64;FAO=28;FDP=66;FR=.;FRO=38;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=-0.0161443;FXX=0.0294074;HRUN=5;LEN=1;MLLD=151.997;QD=13.879;RBI=0.0271653;REFB=-0.0235744;REVB=-0.0218475;RO=27;SAF=13;SAR=11;SRF=9;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.193697;STB=0.607066;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.0293692;OID=.;OPOS=228432055;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:66:27:38:24:28:0.424242:11:13:9:18:11:17:16:22
chr1	228433217	.	A	G	762.22	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0435448;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.397;QD=63.5186;RBI=0.0461232;REFB=0;REVB=-0.0152052;RO=0;SAF=19;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.81498e-05;OID=.;OPOS=228433217;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:29:19:0:0:29:19:0:0
chr1	228433346	.	C	T	149.45	PASS	AF=0.421053;AO=16;DP=40;FAO=16;FDP=38;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=0.0326827;FXX=0.0499875;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.9057;QD=15.7313;RBI=0.0353554;REFB=0.00738415;REVB=0.013485;RO=22;SAF=6;SAR=10;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.258665;STB=0.649167;STBP=0.114;TYPE=snp;VARB=-0.00441013;OID=.;OPOS=228433346;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:38:22:22:16:16:0.421053:10:6:14:8:10:6:14:8
chr1	228434395	.	T	C	583.74	PASS	AF=1;AO=38;DP=40;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0193119;FXX=0.0499875;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.045;QD=61.4466;RBI=0.0214886;REFB=0;REVB=0.00942396;RO=1;SAF=16;SAR=22;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0283818;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000635849;OID=.;OPOS=228434395;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:38:1:0:38:38:1:22:16:1:0:22:16:0:0
chr1	228434467	.	T	C	707.22	PASS	AF=1;AO=43;DP=44;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0116415;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.045;QD=61.4975;RBI=0.0598946;REFB=0;REVB=0.0587524;RO=0;SAF=22;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000461562;OID=.;OPOS=228434467;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:46:0:0:43:46:1:21:22:0:0:24:22:0:0
chr1	228437772	.	G	A	207.91	PASS	AF=0.403226;AO=26;DP=62;FAO=25;FDP=62;FR=.;FRO=37;FSAF=7;FSAR=18;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=-0.00606401;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.0162;QD=13.4134;RBI=0.0853289;REFB=0.0186858;REVB=0.0851131;RO=36;SAF=7;SAR=19;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.256517;STB=0.634583;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=-0.0286995;OID=.;OPOS=228437772;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:36:37:26:25:0.403226:19:7:18:18:18:7:18:19
chr1	228437898	.	C	T	137.89	PASS	AF=0.517241;AO=15;DP=29;FAO=15;FDP=29;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.00873096;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.3848;QD=19.0187;RBI=0.0121569;REFB=-0.0322175;REVB=0.00845934;RO=14;SAF=5;SAR=10;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149262;STB=0.585249;STBP=0.438;TYPE=snp;VARB=0.0297334;OID=.;OPOS=228437898;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:14:14:15:15:0.517241:10:5:7:7:10:5:7:7
chr1	228444565	.	T	A	595.06	PASS	AF=0.97561;AO=38;DP=40;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.011985;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.387;QD=58.055;RBI=0.0378415;REFB=-0.123936;REVB=0.0358934;RO=0;SAF=24;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.76123e-08;STB=0.515144;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.000957398;OID=.;OPOS=228444565;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:40:41:0:1:38:40:0.97561:14:24:0:0:16:24:0:1
chr1	228451826	.	C	T	180.9	PASS	AF=0.431818;AO=19;DP=44;FAO=19;FDP=44;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=0.116491;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.0627;QD=16.4451;RBI=0.128587;REFB=-0.0435566;REVB=-0.0544459;RO=24;SAF=12;SAR=7;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17182;STB=0.610052;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.0602244;OID=.;OPOS=228451826;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:24:25:19:19:0.431818:7:12:11:13:7:12:11:14
chr1	228452032	.	G	A	192.9	PASS	AF=0.575758;AO=19;DP=33;FAO=19;FDP=33;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=16;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=0.0223136;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.102;QD=23.3812;RBI=0.035315;REFB=-0.0159633;REVB=0.0273725;RO=14;SAF=3;SAR=16;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158003;STB=0.58937;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.0171896;OID=.;OPOS=228452032;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:14:14:19:19:0.575758:16:3:4:10:16:3:4:10
chr1	228456147	.	T	C	738.96	PASS	AF=0.981481;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00395368;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.3971;QD=54.7376;RBI=0.00422239;REFB=-0.00763494;REVB=0.00148223;RO=1;SAF=29;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159704;STB=0.508471;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=4.03149e-05;OID=.;OPOS=228456147;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:54:54:1:1:53:53:0.981481:24:29:1:0:24:29:1:0
chr1	228461129	.	A	G	754.42	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00967775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.819;QD=56.9374;RBI=0.0210389;REFB=0;REVB=0.0186809;RO=0;SAF=24;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.81358e-05;OID=.;OPOS=228461129;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:29:24:0:0:29:24:0:0
chr1	228464248	.	T	G	740.44	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0269257;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.215;QD=56.9568;RBI=0.0407155;REFB=0;REVB=0.0305412;RO=0;SAF=28;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.85368e-05;OID=.;OPOS=228464248;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:24:28:0:0:24:28:0:0
chr1	228464276	.	T	C	727.77	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0012304;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.058;QD=63.284;RBI=0.00993089;REFB=0;REVB=0.00985437;RO=0;SAF=25;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.85991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.92101e-05;OID=.;OPOS=228464276;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:21:25:0:0:21:25:0:0
chr1	228467711	.	G	A	324.38	PASS	AF=0.366972;AO=39;DP=106;FAO=40;FDP=109;FR=.;FRO=69;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=36;FSRR=33;FWDB=-0.0276168;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.3;QD=11.9039;RBI=0.0415478;REFB=-0.0209365;REVB=-0.0310409;RO=67;SAF=17;SAR=22;SRF=35;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0957496;STB=0.545432;STBP=0.489;TYPE=snp;VARB=0.04043;OID=.;OPOS=228467711;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:109:67:69:39:40:0.366972:22:17:35:32:22:18:36:33
chr1	228468244	.	G	A	295.8	PASS	AF=0.566038;AO=30;DP=53;FAO=30;FDP=53;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=20;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=0.00146866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.562;QD=22.3246;RBI=0.00882595;REFB=-0.0286801;REVB=-0.0087029;RO=22;SAF=10;SAR=20;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.237606;STB=0.623292;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=0.0191029;OID=.;OPOS=228468244;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:22:23:30:30:0.566038:20:10:14:8:20:10:14:9
chr1	228469870	.	C	T	205.88	PASS	AF=0.317073;AO=26;DP=82;FAO=26;FDP=82;FR=.;FRO=56;FSAF=6;FSAR=20;FSRF=32;FSRR=24;FWDB=0.0285832;FXX=0.03529;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.171;QD=10.0429;RBI=0.0312033;REFB=-0.022418;REVB=0.0125157;RO=54;SAF=6;SAR=20;SRF=32;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.42713;STB=0.741995;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0376715;OID=.;OPOS=228469870;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:54:56:26:26:0.317073:20:6:32:22:20:6:32:24
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chr1	228471379	.	G	C	309.57	PASS	AF=0.416667;AO=34;DP=84;FAO=35;FDP=84;FR=.;FRO=49;FSAF=11;FSAR=24;FSRF=25;FSRR=24;FWDB=-0.00640143;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.076;QD=14.7413;RBI=0.070888;REFB=0.000169767;REVB=0.0705983;RO=48;SAF=11;SAR=23;SRF=23;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170407;STB=0.620618;STBP=0.069;TYPE=snp;VARB=0.00172329;OID=.;OPOS=228471379;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:48:49:34:35:0.416667:23:11:23:25:24:11:25:24
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chr1	228476414	.	G	A	158.67	PASS	AF=0.459459;AO=17;DP=37;FAO=17;FDP=37;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=-0.00536261;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.299;QD=17.1535;RBI=0.0140098;REFB=-0.0222732;REVB=0.0129429;RO=20;SAF=5;SAR=12;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.297664;STB=0.670846;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.0174591;OID=.;OPOS=228476414;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:20:20:17:17:0.459459:12:5:12:8:12:5:12:8
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chr1	228482028	.	G	C	461.28	PASS	AF=0.412698;AO=51;DP=125;FAO=52;FDP=126;FR=.;FRO=74;FSAF=16;FSAR=36;FSRF=34;FSRR=40;FWDB=0.007616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.187;QD=14.6438;RBI=0.022799;REFB=-0.0249048;REVB=0.0214893;RO=74;SAF=16;SAR=35;SRF=34;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164681;STB=0.596778;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=0.0359044;OID=.;OPOS=228482028;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:125:126:74:74:51:52:0.412698:35:16:34:40:36:16:34:40
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chr1	228505727	.	C	T	72.7	PASS	AF=0.30303;AO=10;DP=33;FAO=10;FDP=33;FR=.;FRO=23;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=0.0331055;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.321;QD=8.81179;RBI=0.0391832;REFB=-0.0197237;REVB=-0.0209606;RO=23;SAF=4;SAR=6;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0628691;STB=0.538386;STBP=0.749;TYPE=snp;VARB=0.0494745;OID=.;OPOS=228505727;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:33:33:23:23:10:10:0.30303:6:4:8:15:6:4:8:15
chr1	228509427	.	A	G	300.28	PASS	AF=0.507937;AO=32;DP=63;FAO=32;FDP=63;FR=.;FRO=31;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=-0.00466816;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.4471;QD=19.0655;RBI=0.0320164;REFB=-0.00271835;REVB=-0.0316743;RO=31;SAF=18;SAR=14;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154085;STB=0.585746;STBP=0.19;TYPE=snp;VARB=0.00334916;OID=.;OPOS=228509427;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:31:31:32:32:0.507937:14:18:12:19:14:18:12:19
chr1	228526665	.	T	C	1135.08	PASS	AF=0.513761;AO=112;DP=218;FAO=112;FDP=218;FR=.;FRO=106;FSAF=43;FSAR=69;FSRF=44;FSRR=62;FWDB=0.0258426;FXX=0.013574;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.924;QD=20.8272;RBI=0.0279762;REFB=-0.0192077;REVB=-0.0107157;RO=105;SAF=43;SAR=69;SRF=43;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0237451;STB=0.515896;STBP=0.633;TYPE=snp;VARB=0.0215172;OID=.;OPOS=228526665;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:218:218:105:106:112:112:0.513761:69:43:43:62:69:43:44:62
chr1	228528563	.	C	G	138.37	PASS	AF=0.340426;AO=16;DP=46;FAO=16;FDP=47;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=0.0131261;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.325;QD=11.776;RBI=0.0150021;REFB=-0.0118213;REVB=-0.00726412;RO=30;SAF=9;SAR=7;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14212;STB=0.572853;STBP=0.472;TYPE=snp;VARB=0.0259772;OID=.;OPOS=228528563;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:47:30:31:16:16:0.340426:7:9:13:17:7:9:14:17
chr1	228547901	.	C	T	258.54	PASS	AF=0.460317;AO=29;DP=63;FAO=29;FDP=63;FR=.;FRO=34;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=0.00602351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.735;QD=16.4151;RBI=0.00636353;REFB=-0.0015337;REVB=0.00205228;RO=34;SAF=13;SAR=16;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0644211;STB=0.536207;STBP=0.634;TYPE=snp;VARB=0.00160736;OID=.;OPOS=228547901;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:34:34:29:29:0.460317:16:13:13:21:16:13:13:21
chr1	228548197	.	G	A	112.42	PASS	AF=0.464286;AO=13;DP=28;FAO=13;FDP=28;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=0.000299005;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.75;QD=16.0599;RBI=0.00897531;REFB=-0.0120335;REVB=0.00897033;RO=14;SAF=9;SAR=4;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.361002;STB=0.692012;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=0.0145571;OID=.;OPOS=228548197;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:28:14:15:13:13:0.464286:4:9:4:10:4:9:5:10
chr1	228550426	.	C	T	732.45	PASS	AF=0.521739;AO=71;DP=133;FAO=72;FDP=138;FR=.;FRO=66;FSAF=36;FSAR=36;FSRF=23;FSRR=43;FWDB=-0.015209;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=83.1535;QD=21.2304;RBI=0.0248582;REFB=-0.031743;REVB=0.0196626;RO=62;SAF=35;SAR=36;SRF=22;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117854;STB=0.572444;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.0179356;OID=.;OPOS=228550426;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:133:138:62:66:71:72:0.521739:36:35:22:40:36:36:23:43
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chr1	228559994	.	C	T	1211.1	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0372407;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.496;QD=61.3216;RBI=0.0374316;REFB=0;REVB=0.00377583;RO=0;SAF=42;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000139113;OID=.;OPOS=228559994;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:37:42:0:0:37:42:0:0
chr1	228560139	.	A	G	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00288836;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.337;QD=51.9164;RBI=0.0312159;REFB=0;REVB=0.031082;RO=0;SAF=18;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000277474;OID=.;OPOS=228560139;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:3:18:0:0:3:18:0:0
chr1	228560700	.	T	C	3089.35	PASS	AF=1;AO=198;DP=198;FAO=200;FDP=200;FR=.;FRO=0;FSAF=92;FSAR=108;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0211158;FXX=0.0099005;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.9166;QD=61.787;RBI=0.0216657;REFB=0;REVB=-0.00485009;RO=0;SAF=92;SAR=106;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.33997e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.56312e-05;OID=.;OPOS=228560700;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:17:198:200:0:0:198:200:1:106:92:0:0:108:92:0:0
chr1	228564884	.	G	A	645.64	PASS	AF=0.643678;AO=56;DP=87;FAO=56;FDP=87;FR=.;FRO=31;FSAF=19;FSAR=37;FSRF=22;FSRR=9;FWDB=0.00893577;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.8013;QD=29.6846;RBI=0.0179685;REFB=-0.0219315;REVB=0.0155891;RO=31;SAF=19;SAR=37;SRF=22;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.247541;STB=0.634414;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0171436;OID=.;OPOS=228564884;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:31:31:56:56:0.643678:37:19:22:9:37:19:22:9
chr1	228602660	.	G	C	483.95	PASS	AF=0.445378;AO=53;DP=119;FAO=53;FDP=119;FR=.;FRO=66;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=24;FSRR=42;FWDB=0.025216;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.603;QD=16.2672;RBI=0.037965;REFB=-0.0205707;REVB=-0.0283812;RO=66;SAF=25;SAR=28;SRF=24;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108597;STB=0.560516;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=0.020616;OID=.;OPOS=228602660;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:119:66:66:53:53:0.445378:28:25:24:42:28:25:24:42
chr1	228612838	.	G	T	116.16	PASS	AF=0.341463;AO=14;DP=41;FAO=14;FDP=41;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.0250893;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.377;QD=11.3323;RBI=0.025638;REFB=-0.00134154;REVB=-0.00527575;RO=27;SAF=11;SAR=3;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.43447;STB=0.759614;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.0056808;OID=.;OPOS=228612838;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:27:27:14:14:0.341463:3:11:11:16:3:11:11:16
chr1	228699476	.	GT	AC,GC	324.48	PASS	AF=0.0833333,0.916667;AO=3,21;DP=26;FAO=2,22;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=0,11;FSAR=2,11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0421292,-0.0322823;FXX=0.0768935;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=96.8881,72.7834;QD=54.0795;RBI=0.0421852,0.0345954;REFB=0,0;REVB=0.00217416,0.0124376;RO=0;SAF=0,11;SAR=3,10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,5.51176e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0540942,0.00309783;OID=.,.;OPOS=228699476,228699477;OREF=GT,T;OALT=AC,C;OMAPALT=AC,GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:10:26:24:0:0:3,21:2,22:0.0833333,0.916667:3,10:0,11:0:0:2,11:0,11:0:0
chr1	228743499	.	C	A	1993.61	PASS	AF=0.992308;AO=127;DP=129;FAO=129;FDP=130;FR=.;FRO=1;FSAF=72;FSAR=57;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.049729;FXX=0.00763301;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.7471;QD=61.3418;RBI=0.0539021;REFB=-0.0617807;REVB=-0.0207959;RO=1;SAF=70;SAR=57;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00674044;STB=0.503448;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.000712486;OID=.;OPOS=228743499;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:129:130:1:1:127:129:0.992308:57:70:1:0:57:72:1:0
chr1	229460323	.	G	C	306.59	PASS	AF=0.37234;AO=35;DP=94;FAO=35;FDP=94;FR=.;FRO=59;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=39;FWDB=-0.00251634;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.509;QD=13.0463;RBI=0.0269584;REFB=-0.0168278;REVB=-0.0268407;RO=58;SAF=19;SAR=16;SRF=20;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214038;STB=0.626054;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.0327248;OID=.;OPOS=229460323;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:58:59:35:35:0.37234:16:19:20:38:16:19:20:39
chr1	229730452	.	G	A	120.35	PASS	AF=0.65;AO=13;DP=20;FAO=13;FDP=20;FR=.;FRO=7;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.0138272;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.5239;QD=24.07;RBI=0.0175657;REFB=-0.0472677;REVB=0.0108334;RO=7;SAF=6;SAR=7;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0681814;STB=0.538402;STBP=0.681;TYPE=snp;VARB=0.0138901;OID=.;OPOS=229730452;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:20:20:7:7:13:13:0.65:7:6:4:3:7:6:4:3
chr1	229737680	.	C	T	378.48	PASS	AF=0.434783;AO=40;DP=92;FAO=40;FDP=92;FR=.;FRO=52;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=23;FSRR=29;FWDB=0.0035778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.53;QD=16.4557;RBI=0.00445199;REFB=-0.00846633;REVB=0.00264945;RO=51;SAF=17;SAR=23;SRF=23;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0263841;STB=0.509973;STBP=0.867;TYPE=snp;VARB=0.0134262;OID=.;OPOS=229737680;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:51:52:40:40:0.434783:23:17:23:28:23:17:23:29
chr1	229738170	.	T	G	920.11	PASS	AF=1;AO=62;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00139642;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.327;QD=58.4195;RBI=0.00341416;REFB=0;REVB=0.00311553;RO=0;SAF=23;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.75648e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.32217e-06;OID=.;OPOS=229738170;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:62:63:1:39:23:0:0:40:23:0:0
chr1	229738235	.	C	CA	711.87	PASS	AF=1;AO=6;DP=54;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0822293;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=104.057;QD=55.8332;RBI=0.0831028;REFB=0;REVB=0.0120177;RO=48;SAF=1;SAR=5;SRF=23;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.380106;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=7.47826e-05;OID=.;OPOS=229738236;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:6:54:51:51:0:23:28:0:0:4:48:1:5:23:25
chr1	229738236	.	G	A	622.45	PASS	AF=0.875;AO=49;DP=56;FAO=49;FDP=56;FR=.;FRO=7;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.00577223;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=128.18;QD=44.4609;RBI=0.0243549;REFB=-0.156972;REVB=0.023661;RO=7;SAF=24;SAR=25;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.081417;STB=0.543445;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=0.00132021;OID=.;OPOS=229738236;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:56:56:7:7:49:49:0.875:25:24:1:6:25:24:1:6
chr1	229772693	.	T	G	447.0	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0506251;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.776;QD=57.6779;RBI=0.0652298;REFB=0;REVB=0.0411342;RO=0;SAF=13;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.33668e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000233171;OID=.;OPOS=229772693;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:18:13:0:0:18:13:0:0
chr1	229772932	.	A	G	411.55	PASS	AF=0.47191;AO=42;DP=89;FAO=42;FDP=89;FR=.;FRO=47;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=12;FSRR=35;FWDB=-0.00605121;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=306.045;QD=18.4965;RBI=0.0158144;REFB=-0.00929888;REVB=-0.0146108;RO=47;SAF=22;SAR=20;SRF=12;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.2531;STB=0.640149;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0122306;OID=.;OPOS=229772932;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:47:47:42:42:0.47191:20:22:12:35:20:22:12:35
chr1	229773441	.	C	T	526.67	PASS	AF=0.569767;AO=49;DP=86;FAO=49;FDP=86;FR=.;FRO=37;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=-0.0119037;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.7198;QD=24.4963;RBI=0.0119202;REFB=-0.00268553;REVB=-0.000628437;RO=36;SAF=26;SAR=23;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.045184;STB=0.519004;STBP=0.719;TYPE=snp;VARB=0.00237668;OID=.;OPOS=229773441;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:36:37:49:49:0.569767:23:26:17:19:23:26:18:19
chr1	229790048	.	A	G	621.01	PASS	AF=0.43125;AO=69;DP=159;FAO=69;FDP=160;FR=.;FRO=91;FSAF=22;FSAR=47;FSRF=40;FSRR=51;FWDB=0.0161639;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.7402;QD=15.5252;RBI=0.030191;REFB=0.0146337;REVB=-0.0254995;RO=89;SAF=22;SAR=47;SRF=39;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13089;STB=0.574731;STBP=0.131;TYPE=snp;VARB=-0.0237655;OID=.;OPOS=229790048;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:159:160:89:91:69:69:0.43125:47:22:39:50:47:22:40:51
chr1	230384937	.	T	C	97.33	PASS	AF=0.238095;AO=15;DP=63;FAO=15;FDP=63;FR=.;FRO=48;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=29;FWDB=-0.0114384;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.247;QD=6.17985;RBI=0.0204447;REFB=-0.0057489;REVB=0.0169455;RO=48;SAF=5;SAR=10;SRF=19;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0827267;STB=0.551654;STBP=0.654;TYPE=snp;VARB=0.0199973;OID=.;OPOS=230384937;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:63:63:48:48:15:15:0.238095:10:5:19:29:10:5:19:29
chr1	230384970	.	G	A	525.39	PASS	AF=0.762712;AO=45;DP=59;FAO=45;FDP=59;FR=.;FRO=14;FSAF=16;FSAR=29;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.00407736;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.975;QD=35.6198;RBI=0.0273152;REFB=-0.015485;REVB=0.0270092;RO=12;SAF=16;SAR=29;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0258829;STB=0.500411;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0032836;OID=.;OPOS=230384970;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:59:59:12:14:45:45:0.762712:29:16:5:7:29:16:5:9
chr1	230415148	.	G	A	888.52	PASS	AF=0.984127;AO=62;DP=63;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0186186;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.206;QD=56.4137;RBI=0.0405032;REFB=-0.0233519;REVB=0.0359702;RO=1;SAF=35;SAR=27;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0171646;STB=0.509088;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=0.000750844;OID=.;OPOS=230415148;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:63:63:1:1:62:62:0.984127:27:35:0:1:27:35:0:1
chr1	230416319	.	A	C	1895.13	PASS	AF=1;AO=122;DP=122;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0211661;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.322;QD=61.6304;RBI=0.0252443;REFB=0;REVB=0.0137576;RO=0;SAF=53;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.86958e-05;OID=.;OPOS=230416319;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:122:123:0:0:122:123:1:69:53:0:0:70:53:0:0
chr1	230417557	.	T	C	632.26	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00891312;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=285.7;QD=61.684;RBI=0.0250769;REFB=0;REVB=0.0234395;RO=0;SAF=27;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.80365e-05;OID=.;OPOS=230417557;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:14:27:0:0:14:27:0:0
chr1	230417560	.	A	G	601.22	PASS	AF=0.97561;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0448713;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.3476;QD=58.6552;RBI=0.0464682;REFB=-0.141897;REVB=0.012077;RO=0;SAF=26;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509429;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.00335614;OID=.;OPOS=230417560;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:41:41:0:1:40:40:0.97561:14:26:0:0:14:26:1:0
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chr1	230829139	.	A	G	223.58	PASS	AF=0.617647;AO=21;DP=34;FAO=21;FDP=34;FR=.;FRO=13;FSAF=1;FSAR=20;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.0132261;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.7183;QD=26.3039;RBI=0.0500281;REFB=0.00533319;REVB=0.0482482;RO=13;SAF=1;SAR=20;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.585782;STB=0.837872;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=-0.00233757;OID=.;OPOS=230829139;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:13:13:21:21:0.617647:20:1:6:7:20:1:6:7
chr1	230841687	.	T	C	1257.58	PASS	AF=1;AO=81;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00878824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.0306;QD=61.3456;RBI=0.0120418;REFB=0;REVB=0.00823244;RO=0;SAF=33;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.28649e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000104114;OID=.;OPOS=230841687;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:82:0:0:81:82:1:48:33:0:0:49:33:0:0
chr1	230845794	.	A	G	955.18	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00095802;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.361;QD=58.7805;RBI=0.0124321;REFB=0;REVB=-0.0123951;RO=0;SAF=36;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.741e-05;OID=.;OPOS=230845794;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:29:36:0:0:29:36:0:0
chr1	230898494	.	C	T	398.96	PASS	AF=0.471264;AO=41;DP=87;FAO=41;FDP=87;FR=.;FRO=46;FSAF=26;FSAR=15;FSRF=25;FSRR=21;FWDB=0.0415627;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.2767;QD=18.3432;RBI=0.0419305;REFB=-0.00546326;REVB=0.00554183;RO=46;SAF=26;SAR=15;SRF=25;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0899017;STB=0.55024;STBP=0.408;TYPE=snp;VARB=0.00618043;OID=.;OPOS=230898494;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:46:46:41:41:0.471264:15:26:25:21:15:26:25:21
chr1	230903350	.	T	C	276.61	PASS	AF=0.517857;AO=27;DP=58;FAO=29;FDP=56;FR=.;FRO=27;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=21;FSRR=6;FWDB=-0.0123656;FXX=0.0666556;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.89;QD=19.7581;RBI=0.0337887;REFB=0.000933725;REVB=0.0314447;RO=26;SAF=19;SAR=8;SRF=20;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0714174;STB=0.568138;STBP=0.349;TYPE=snp;VARB=-2.71421e-05;OID=.;OPOS=230903350;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:56:26:27:27:29:0.517857:8:19:20:6:10:19:21:6
chr1	230933898	.	C	T	116.9	PASS	AF=0.411765;AO=13;DP=33;FAO=14;FDP=34;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=0.021991;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.822;QD=13.7531;RBI=0.0228331;REFB=-0.0111336;REVB=-0.00614398;RO=20;SAF=9;SAR=4;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.349512;STB=0.713979;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.0254589;OID=.;OPOS=230933898;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:34:20:20:13:14:0.411765:4:9:7:13:4:10:7:13
chr1	231042732	.	T	A	782.04	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0181068;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=301.886;QD=56.8758;RBI=0.0503742;REFB=0;REVB=0.0470075;RO=0;SAF=35;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.5765e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.42488e-05;OID=.;OPOS=231042732;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:55:0:0:51:55:1:16:35:0:0:20:35:0:0
chr1	231047299	.	GAAAAAAAAG	GAAAAAAAA,GAAAAAAAG	121.11	PASS	AF=0.166667,0.0350877;AO=17,17;DP=114;FAO=19,4;FDP=114;FR=.;FRO=91;FSAF=3,1;FSAR=16,3;FSRF=39;FSRR=52;FWDB=-0.0142513,-0.139643;FXX=0;HRUN=1,8;LEN=1,1;MLLD=242.269,8.87445;QD=4.24936;RBI=0.0147535,0.153497;REFB=-0.000935585,-0.0190906;REVB=-0.00381644,-0.0637274;RO=73;SAF=3,6;SAR=14,11;SRF=33;SRR=40;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.389644,-0.129253;STB=0.766807,0.684736;STBP=0.022,0.533;TYPE=del,del;VARB=0.00363337,-0.0758141;OID=.,.;OPOS=231047308,231047300;OREF=G,A;OALT=-,-;OMAPALT=GAAAAAAAA,GAAAAAAAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.166667,0.0350877:17,17:114:19,4:114:91:3,1:16,3:39:52:99:73:3,6:14,11:33:40
chr1	231161773	.	C	T	384.38	PASS	AF=0.567164;AO=38;DP=69;FAO=38;FDP=67;FR=.;FRO=29;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=-0.025943;FXX=0.0289813;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.522;QD=22.9482;RBI=0.0262829;REFB=-0.0364274;REVB=-0.00421327;RO=30;SAF=21;SAR=17;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0689973;STB=0.545216;STBP=0.425;TYPE=snp;VARB=0.0237471;OID=.;OPOS=231161773;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:67:30:29:38:38:0.567164:17:21:14:16:17:21:13:16
chr1	231339713	.	C	T	1407.24	PASS	AF=0.459627;AO=147;DP=322;FAO=148;FDP=322;FR=.;FRO=174;FSAF=91;FSAR=57;FSRF=93;FSRR=81;FWDB=-0.00153889;FXX=0.00309588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.964;QD=17.4812;RBI=0.00962321;REFB=-0.00679387;REVB=-0.00949937;RO=171;SAF=90;SAR=57;SRF=92;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0746636;STB=0.544904;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=0.00789943;OID=.;OPOS=231339713;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:322:322:171:174:147:148:0.459627:57:90:92:79:57:91:93:81
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chr1	231355912	.	G	T	355.99	PASS	AF=0.447059;AO=38;DP=84;FAO=38;FDP=85;FR=.;FRO=47;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=34;FWDB=-0.00943975;FXX=0.0116266;HRUN=6;LEN=1;MLLD=40.7939;QD=16.7523;RBI=0.0128678;REFB=-0.0062568;REVB=-0.00874484;RO=45;SAF=23;SAR=15;SRF=12;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.319102;STB=0.675977;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.00608626;OID=.;OPOS=231355912;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:85:45:47:38:38:0.447059:15:23:12:33:15:23:13:34
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chr1	231357102	.	G	C	273.42	PASS	AF=0.372093;AO=32;DP=86;FAO=32;FDP=86;FR=.;FRO=54;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=31;FSRR=23;FWDB=0.00138943;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=319.784;QD=12.717;RBI=0.0111599;REFB=-0.0034637;REVB=-0.0110731;RO=54;SAF=17;SAR=15;SRF=31;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0472497;STB=0.52707;STBP=0.708;TYPE=snp;VARB=0.00428527;OID=.;OPOS=231357102;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:54:54:32:32:0.372093:15:17:31:23:15:17:31:23
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chr1	231480431	.	TTA	T,TTT	44.76	PASS	AF=0.135135,0;AO=16,10;DP=129;FAO=15,0;FDP=111;FR=.;FRO=96;FSAF=8,0;FSAR=7,0;FSRF=61;FSRR=35;FWDB=0.00162839,0.121046;FXX=0.0263135;HRUN=6,7;LEN=2,1;MLLD=21.6972,17.8439;QD=1.61304;RBI=0.248665,0.153548;REFB=-0.0143248,0.00250633;REVB=-0.24866,-0.0944715;RO=80;SAF=9,1;SAR=7,9;SRF=53;SRR=27;SSEN=0,0;SSEP=0.368071,0;SSSB=-0.132333,-0.61331;STB=0.589629,0.5;STBP=0.483,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0656306,0;OID=.,.;OPOS=231480432,231480433;OREF=TA,A;OALT=-,T;OMAPALT=T,TTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.135135,0:16,10:129:15,0:111:96:8,0:7,0:61:35:45:80:9,1:7,9:53:27
chr1	231830295	.	G	A	425.64	PASS	AF=0.472527;AO=43;DP=92;FAO=43;FDP=91;FR=.;FRO=48;FSAF=30;FSAR=13;FSRF=22;FSRR=26;FWDB=-0.0151435;FXX=0.0108684;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.069;QD=18.7095;RBI=0.0157012;REFB=-0.0368492;REVB=0.00414752;RO=48;SAF=30;SAR=13;SRF=22;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.239054;STB=0.633738;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0266913;OID=.;OPOS=231830295;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:91:48:48:43:43:0.472527:13:30:22:26:13:30:22:26
chr1	231906589	.	C	T	208.77	PASS	AF=0.456522;AO=21;DP=46;FAO=21;FDP=46;FR=.;FRO=25;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=0.0131881;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.102;QD=18.154;RBI=0.0166664;REFB=-0.0069903;REVB=0.0101904;RO=25;SAF=10;SAR=11;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0347428;STB=0.519732;STBP=0.827;TYPE=snp;VARB=0.00438816;OID=.;OPOS=231906589;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:25:25:21:21:0.456522:11:10:11:14:11:10:11:14
chr1	231931048	.	T	C	244.19	PASS	AF=0.386667;AO=28;DP=75;FAO=29;FDP=75;FR=.;FRO=46;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=23;FSRR=23;FWDB=-0.00414261;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.906;QD=13.0236;RBI=0.0133064;REFB=-0.00268858;REVB=0.0126452;RO=45;SAF=13;SAR=15;SRF=22;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0265118;STB=0.531834;STBP=0.675;TYPE=snp;VARB=0.00536335;OID=.;OPOS=231931048;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:45:46:28:29:0.386667:15:13:22:23:16:13:23:23
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chr1	232144887	.	A	G	120.99	PASS	AF=0.424242;AO=14;DP=33;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.029105;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.7895;QD=14.6659;RBI=0.0738023;REFB=-0.00422186;REVB=-0.067821;RO=19;SAF=7;SAR=7;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0260571;STB=0.51513;STBP=0.912;TYPE=snp;VARB=0.0028958;OID=.;OPOS=232144887;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:19:19:14:14:0.424242:7:7:10:9:7:7:10:9
chr1	232574921	.	T	C	1036.54	PASS	AF=1;AO=69;DP=71;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0255205;FXX=0.028165;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.1527;QD=60.0892;RBI=0.0257177;REFB=0;REVB=0.00317856;RO=0;SAF=26;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00162063;OID=.;OPOS=232574921;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:69:0:0:69:69:1:43:26:0:0:43:26:0:0
chr1	232581501	.	C	T	406.52	PASS	AF=0.442105;AO=42;DP=95;FAO=42;FDP=95;FR=.;FRO=53;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=28;FSRR=25;FWDB=-0.00389055;FXX=0.0104156;HRUN=2;LEN=1;MLLD=247.471;QD=17.1167;RBI=0.0068778;REFB=0.0017421;REVB=-0.00567166;RO=53;SAF=18;SAR=24;SRF=28;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0995788;STB=0.555865;STBP=0.358;TYPE=snp;VARB=-0.00255591;OID=.;OPOS=232581501;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:53:53:42:42:0.442105:24:18:28:25:24:18:28:25
chr1	232650750	.	A	G	228.19	PASS	AF=0.409091;AO=27;DP=66;FAO=27;FDP=66;FR=.;FRO=39;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=25;FWDB=0.000165674;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.607;QD=13.8299;RBI=0.00320252;REFB=-0.0204629;REVB=-0.00319824;RO=38;SAF=10;SAR=17;SRF=14;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00214642;STB=0.507241;STBP=0.928;TYPE=snp;VARB=0.026507;OID=.;OPOS=232650750;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:38:39:27:27:0.409091:17:10:14:24:17:10:14:25
chr1	232650867	.	C	T	204.79	PASS	AF=0.46;AO=21;DP=49;FAO=23;FDP=50;FR=.;FRO=27;FSAF=4;FSAR=19;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=0.00377553;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.727;QD=16.3831;RBI=0.0261676;REFB=-0.0240143;REVB=-0.0258938;RO=27;SAF=3;SAR=18;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.363138;STB=0.69072;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.0337139;OID=.;OPOS=232650867;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:50:27:27:21:23:0.46:18:3:11:16:19:4:12:15
chr1	232940863	.	G	A	683.45	PASS	AF=0.463087;AO=69;DP=149;FAO=69;FDP=149;FR=.;FRO=80;FSAF=41;FSAR=28;FSRF=37;FSRR=43;FWDB=-0.0159819;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.939;QD=18.3476;RBI=0.0176813;REFB=-0.00605504;REVB=-0.00756369;RO=80;SAF=41;SAR=28;SRF=37;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128465;STB=0.571324;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=0.0102289;OID=.;OPOS=232940863;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:149:149:80:80:69:69:0.463087:28:41:37:43:28:41:37:43
chr1	232940953	.	T	C	290.06	PASS	AF=0.457143;AO=32;DP=70;FAO=32;FDP=70;FR=.;FRO=38;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=-0.00767869;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.859;QD=16.5749;RBI=0.00792276;REFB=-0.0269432;REVB=-0.00195137;RO=38;SAF=17;SAR=15;SRF=21;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.020758;STB=0.511662;STBP=0.885;TYPE=snp;VARB=0.0366049;OID=.;OPOS=232940953;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:38:38:32:32:0.457143:15:17:21:17:15:17:21:17
chr1	232941677	.	G	T	267.59	PASS	AF=0.417722;AO=28;DP=74;FAO=33;FDP=79;FR=.;FRO=46;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=26;FSRR=20;FWDB=0.00423155;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=48.1306;QD=13.5489;RBI=0.103971;REFB=-0.0118047;REVB=0.103885;RO=45;SAF=17;SAR=11;SRF=26;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.032779;STB=0.511621;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=0.0158601;OID=.;OPOS=232941677;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:79:45:46:28:33:0.417722:11:17:26:19:15:18:26:20
chr1	232942251	.	A	G	130.79	PASS	AF=0.5;AO=12;DP=27;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=1;FWDB=0.000939387;FXX=0.0322477;HRUN=3;LEN=1;MLLD=146.364;QD=17.4381;RBI=0.00586187;REFB=-0.0319234;REVB=-0.00578611;RO=10;SAF=10;SAR=2;SRF=10;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.301146;STB=0.666488;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.0387583;OID=.;OPOS=232942251;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:30:10:15:12:15:0.5:2:10:10:0:5:10:14:1
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chr1	232967889	.	T	C	580.23	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.044243;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.283;QD=61.0772;RBI=0.0449154;REFB=0;REVB=0.00774257;RO=0;SAF=21;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.53998e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.92001e-05;OID=.;OPOS=232967889;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:17:21:0:0:17:21:0:0
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chr1	233515102	.	T	G	135.95	PASS	AF=0.483871;AO=15;DP=31;FAO=15;FDP=31;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=0.00305725;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.828;QD=17.5418;RBI=0.00618583;REFB=-0.0102282;REVB=0.00537752;RO=16;SAF=4;SAR=11;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116243;STB=0.566917;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.0135488;OID=.;OPOS=233515102;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:16:16:15:15:0.483871:11:4:6:10:11:4:6:10
chr1	233515413	.	G	A	91.24	PASS	AF=0.52381;AO=11;DP=21;FAO=11;FDP=21;FR=.;FRO=10;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=-0.0251308;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.684;QD=17.3782;RBI=0.029523;REFB=-0.0141737;REVB=-0.0154937;RO=10;SAF=8;SAR=3;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122798;STB=0.571292;STBP=0.58;TYPE=snp;VARB=0.00772989;OID=.;OPOS=233515413;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:21:21:10:10:11:11:0.52381:3:8:6:4:3:8:6:4
chr1	233518983	.	G	GT	251.22	PASS	AF=0.314917;AO=55;DP=191;FAO=57;FDP=181;FR=.;FRO=124;FSAF=29;FSAR=28;FSRF=62;FSRR=62;FWDB=-0.00234108;FXX=0.0473659;HRUN=1;LEN=1;MLLD=22.8906;QD=5.55171;RBI=0.0495995;REFB=-0.00964504;REVB=-0.0495442;RO=129;SAF=28;SAR=27;SRF=64;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0155807;STB=0.506008;STBP=0.915;TYPE=ins;VARB=0.0177592;OID=.;OPOS=233518984;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.314917:55:191:57:181:124:29:28:62:62:99:129:28:27:64:65
chr1	233518998	.	C	T	519.28	PASS	AF=0.333333;AO=64;DP=190;FAO=64;FDP=192;FR=.;FRO=128;FSAF=33;FSAR=31;FSRF=65;FSRR=63;FWDB=0.0014965;FXX=0.00518108;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.659;QD=10.8184;RBI=0.0693639;REFB=-0.00625765;REVB=-0.0693477;RO=124;SAF=33;SAR=31;SRF=64;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000580605;STB=0.50521;STBP=0.905;TYPE=snp;VARB=0.0136559;OID=.;OPOS=233518998;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:190:192:124:128:64:64:0.333333:31:33:64:60:31:33:65:63
chr1	233520845	.	T	C	303.19	PASS	AF=0.458333;AO=31;DP=70;FAO=33;FDP=72;FR=.;FRO=39;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=23;FWDB=0.00611732;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.148;QD=16.8439;RBI=0.0181328;REFB=0.00452993;REVB=0.0170697;RO=37;SAF=15;SAR=16;SRF=15;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0762307;STB=0.556641;STBP=0.405;TYPE=snp;VARB=-0.00410481;OID=.;OPOS=233520845;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:72:37:39:31:33:0.458333:16:15:15:22:16:17:16:23
chr1	233785716	.	T	G	640.24	PASS	AF=0.516129;AO=64;DP=124;FAO=64;FDP=124;FR=.;FRO=60;FSAF=38;FSAR=26;FSRF=33;FSRR=27;FWDB=0.0261794;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.742;QD=20.653;RBI=0.0263808;REFB=-0.0162521;REVB=-0.00325403;RO=60;SAF=38;SAR=26;SRF=33;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0395152;STB=0.521755;STBP=0.629;TYPE=snp;VARB=0.0152249;OID=.;OPOS=233785716;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:124:124:60:60:64:64:0.516129:26:38:33:27:26:38:33:27
chr1	234041422	.	G	C	596.78	PASS	AF=0.623529;AO=53;DP=85;FAO=53;FDP=85;FR=.;FRO=32;FSAF=39;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=11;FWDB=-0.0427957;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.8778;QD=28.0835;RBI=0.0539917;REFB=0.0320896;REVB=-0.0329186;RO=32;SAF=39;SAR=14;SRF=21;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0681845;STB=0.537176;STBP=0.468;TYPE=snp;VARB=-0.0134079;OID=.;OPOS=234041422;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:32:32:53:53:0.623529:14:39:21:11:14:39:21:11
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chr1	234527453	.	T	A	304.01	PASS	AF=0.563636;AO=31;DP=56;FAO=31;FDP=55;FR=.;FRO=24;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=-0.0204746;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.1963;QD=22.1097;RBI=0.0305092;REFB=-0.00055609;REVB=0.0226187;RO=24;SAF=15;SAR=16;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0127291;STB=0.507038;STBP=0.947;TYPE=snp;VARB=0.000670255;OID=.;OPOS=234527453;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:55:24:24:31:31:0.563636:16:15:12:12:16:15:12:12
chr1	234529552	.	C	T	169.19	PASS	AF=0.384615;AO=20;DP=52;FAO=20;FDP=52;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=-0.00734861;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.403;QD=13.0148;RBI=0.00981784;REFB=-0.0147882;REVB=-0.0065106;RO=31;SAF=10;SAR=10;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0169655;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0137667;OID=.;OPOS=234529552;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:31:32:20:20:0.384615:10:10:15:16:10:10:16:16
chr1	234529570	.	G	A	167.95	PASS	AF=0.428571;AO=18;DP=42;FAO=18;FDP=42;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=-0.0181182;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.186;QD=15.9953;RBI=0.0222775;REFB=-0.00936655;REVB=-0.0129622;RO=24;SAF=10;SAR=8;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0966124;STB=0.555494;STBP=0.561;TYPE=snp;VARB=0.0254527;OID=.;OPOS=234529570;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:24:24:18:18:0.428571:8:10:11:13:8:10:11:13
chr1	234546245	.	C	T	298.84	PASS	AF=0.576923;AO=30;DP=54;FAO=30;FDP=52;FR=.;FRO=22;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=-0.023191;FXX=0.0370302;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.5309;QD=22.9879;RBI=0.0256668;REFB=0.00938172;REVB=-0.0109983;RO=22;SAF=17;SAR=13;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0548156;STB=0.530243;STBP=0.657;TYPE=snp;VARB=-0.0173723;OID=.;OPOS=234546245;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:52:22:22:30:30:0.576923:13:17:14:8:13:17:14:8
chr1	234569192	.	T	C	670.27	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0161984;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.727;QD=62.3504;RBI=0.0265491;REFB=0;REVB=0.0210349;RO=0;SAF=26;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.75441e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.1604e-05;OID=.;OPOS=234569192;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:17:26:0:0:17:26:0:0
chr1	234573025	.	T	C	323.45	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.011105;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=87.5185;QD=53.9082;RBI=0.037008;REFB=0;REVB=0.0353025;RO=0;SAF=17;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000566496;OID=.;OPOS=234573025;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:7:17:0:0:7:17:0:0
chr1	234606998	.	A	G	37.78	PASS	AF=0.375;AO=6;DP=16;FAO=6;FDP=16;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.0650036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.056;QD=9.44475;RBI=0.0662147;REFB=-0.00151334;REVB=0.0126066;RO=10;SAF=5;SAR=1;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.467859;STB=0.794397;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=0.016495;OID=.;OPOS=234606998;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:16:16:10:10:6:6:0.375:1:5:4:6:1:5:4:6
chr1	235040004	.	G	A	501.64	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0196318;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=205.388;QD=59.0162;RBI=0.0411537;REFB=0;REVB=0.0361694;RO=0;SAF=18;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000163277;OID=.;OPOS=235040004;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:16:18:0:0:16:18:0:0
chr1	235040045	.	A	G	785.88	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0458224;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.1419;QD=64.1534;RBI=0.0524925;REFB=0;REVB=-0.0256081;RO=0;SAF=22;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.30731e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000270055;OID=.;OPOS=235040045;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:27:22:0:0:27:22:0:0
chr1	235652513	.	T	C	902.44	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0311572;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.8625;QD=58.2219;RBI=0.0316719;REFB=0;REVB=0.00568641;RO=0;SAF=27;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.46408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000390558;OID=.;OPOS=235652513;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:35:27:0:0:35:27:0:0
chr1	235705001	.	G	T	1098.18	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0217205;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.5195;QD=60.1742;RBI=0.0430622;REFB=0;REVB=-0.037183;RO=0;SAF=41;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000144335;OID=.;OPOS=235705001;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:32:41:0:0:32:41:0:0
chr1	235715523	.	A	G	233.45	PASS	AF=0.472727;AO=26;DP=55;FAO=26;FDP=55;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=0.0100203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.047;QD=16.9782;RBI=0.0105541;REFB=-0.0112381;REVB=-0.00331419;RO=29;SAF=12;SAR=14;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148148;STB=0.58327;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=0.0161031;OID=.;OPOS=235715523;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:29:29:26:26:0.472727:14:12:18:11:14:12:18:11
chr1	236141174	.	T	C	417.47	PASS	AF=0.488372;AO=42;DP=87;FAO=42;FDP=86;FR=.;FRO=44;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=23;FSRR=21;FWDB=0.0149488;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.396;QD=19.417;RBI=0.0152963;REFB=-0.0136006;REVB=-0.00324217;RO=43;SAF=24;SAR=18;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0337705;STB=0.52524;STBP=0.64;TYPE=snp;VARB=0.0125687;OID=.;OPOS=236141174;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:86:43:44:42:42:0.488372:18:24:23:20:18:24:23:21
chr1	236144951	.	A	G	312.0	PASS	AF=0.52459;AO=20;DP=62;FAO=32;FDP=61;FR=.,HEALED;FRO=29;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.265993;FXX=0.0161264;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.0771;QD=20.4588;RBI=0.268345;REFB=0.0151311;REVB=-0.0354515;RO=27;SAF=9;SAR=11;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0056272;STB=0.586411;STBP=0.19;TYPE=snp;VARB=-0.00878791;OID=.;OPOS=236144951;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:61:27:29:20:32:0.52459:11:9:12:15:11:21:14:15
chr1	236175339	.	T	C	902.7	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0172601;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.376;QD=58.2384;RBI=0.0207347;REFB=0;REVB=-0.0114899;RO=0;SAF=33;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.35777e-05;OID=.;OPOS=236175339;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:29:33:0:0:29:33:0:0
chr1	236208773	.	C	T	885.43	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0136642;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.255;QD=58.061;RBI=0.0136874;REFB=0;REVB=0.000795732;RO=0;SAF=37;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.59042e-05;OID=.;OPOS=236208773;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:24:37:0:0:24:37:0:0
chr1	236228288	.	C	A	269.3	PASS	AF=0.461538;AO=30;DP=65;FAO=30;FDP=65;FR=.;FRO=35;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=11;FSRR=24;FWDB=-0.00175212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=297.827;QD=16.5725;RBI=0.0100638;REFB=-0.00642954;REVB=0.00991015;RO=35;SAF=11;SAR=19;SRF=11;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0549779;STB=0.530844;STBP=0.702;TYPE=snp;VARB=0.00617541;OID=.;OPOS=236228288;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:35:35:30:30:0.461538:19:11:11:24:19:11:11:24
chr1	236381825	.	G	C	920.03	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00513132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.4492;QD=58.4146;RBI=0.0320936;REFB=0;REVB=0.0316808;RO=0;SAF=25;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00019473;OID=.;OPOS=236381825;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:38:25:0:0:38:25:0:0
chr1	236389999	.	C	T	326.06	PASS	AF=0.466667;AO=35;DP=75;FAO=35;FDP=75;FR=.;FRO=40;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=22;FSRR=18;FWDB=-0.0354681;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=225.069;QD=17.3898;RBI=0.0354683;REFB=0.00121864;REVB=-0.000100928;RO=39;SAF=14;SAR=21;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131721;STB=0.580599;STBP=0.188;TYPE=snp;VARB=-0.00222292;OID=.;OPOS=236389999;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:39:40:35:35:0.466667:21:14:21:18:21:14:22:18
chr1	236415347	.	T	C	91.82	PASS	AF=0.285714;AO=12;DP=42;FAO=12;FDP=42;FR=.;FRO=30;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=-0.0136565;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=274.431;QD=8.74515;RBI=0.0155391;REFB=0.00700858;REVB=0.00741385;RO=30;SAF=9;SAR=3;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.376737;STB=0.731313;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=-0.0157168;OID=.;OPOS=236415347;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:91:42:42:30:30:12:12:0.285714:3:9:13:17:3:9:13:17
chr1	236557771	.	G	A	206.98	PASS	AF=0.396825;AO=25;DP=62;FAO=25;FDP=63;FR=.;FRO=38;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=22;FSRR=16;FWDB=0.0113083;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=197.267;QD=13.1417;RBI=0.0248583;REFB=-0.00574575;REVB=-0.0221373;RO=37;SAF=17;SAR=8;SRF=22;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.097799;STB=0.566612;STBP=0.398;TYPE=snp;VARB=0.00628355;OID=.;OPOS=236557771;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:63:37:38:25:25:0.396825:8:17:22:15:8:17:22:16
chr1	236645670	.	C	T	215.89	PASS	AF=0.291667;AO=28;DP=96;FAO=28;FDP=96;FR=.;FRO=68;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=35;FSRR=33;FWDB=0.005617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.977;QD=8.99526;RBI=0.0275418;REFB=-0.0135569;REVB=-0.0269629;RO=67;SAF=15;SAR=13;SRF=35;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0159443;STB=0.514915;STBP=0.864;TYPE=snp;VARB=0.0239641;OID=.;OPOS=236645670;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:96:67:68:28:28:0.291667:13:15:35:32:13:15:35:33
chr1	236700807	.	T	A	529.29	PASS	AF=0.925;AO=36;DP=40;FAO=37;FDP=40;FR=.;FRO=3;FSAF=12;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.00417851;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=254.209;QD=52.9292;RBI=0.0273811;REFB=-0.0768634;REVB=0.0270604;RO=1;SAF=12;SAR=24;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0191068;STB=0.528287;STBP=0.246;TYPE=snp;VARB=0.000566029;OID=.;OPOS=236700807;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:40:40:1:3:36:37:0.925:24:12:0:1:25:12:0:3
chr1	236700823	.	T	C	706.98	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00984056;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.867;QD=62.8428;RBI=0.0154885;REFB=0;REVB=0.0119606;RO=0;SAF=14;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.13885e-05;OID=.;OPOS=236700823;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:45:0:0:44:45:1:30:14:0:0:31:14:0:0
chr1	236700857	.	C	T	785.87	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00687741;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.73;QD=64.1527;RBI=0.00867033;REFB=0;REVB=0.00527975;RO=0;SAF=16;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.55766e-05;OID=.;OPOS=236700857;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:33:16:0:0:33:16:0:0
chr1	236702209	.	CA	TG	785.21	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-7.35748e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=218.806;QD=57.1062;RBI=0.00170387;REFB=0;REVB=-0.00170228;RO=0;SAF=26;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.40922e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=-5.37821e-06;OID=.;OPOS=236702209;OREF=CA;OALT=TG;OMAPALT=TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:29:26:0:0:29:26:0:0
chr1	236702374	.	G	A	982.03	PASS	AF=0.971429;AO=66;DP=68;FAO=68;FDP=70;FR=.;FRO=2;FSAF=28;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0616086;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.1421;QD=56.116;RBI=0.0679859;REFB=-0.0417409;REVB=0.0287483;RO=0;SAF=28;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512192;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.00591463;OID=.;OPOS=236702374;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:68:70:0:2:66:68:0.971429:38:28:0:0:40:28:0:2
chr1	236706780	.	C	T	868.25	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00811358;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.192;QD=57.8831;RBI=0.0177874;REFB=0;REVB=-0.0158291;RO=0;SAF=35;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.89445e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.64985e-05;OID=.;OPOS=236706780;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:25:35:0:0:25:35:0:0
chr1	236706862	.	G	C	1171.8	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0316825;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.3113;QD=60.8728;RBI=0.0326707;REFB=0;REVB=0.00797467;RO=0;SAF=42;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000210996;OID=.;OPOS=236706862;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:35:42:0:0:35:42:0:0
chr1	236711323	.	T	C	724.01	PASS	AF=0.981132;AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00373918;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.009;QD=54.6424;RBI=0.048803;REFB=-0.0354314;REVB=0.0486596;RO=1;SAF=31;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0218994;STB=0.511623;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=0.00150157;OID=.;OPOS=236711323;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:53:53:1:1:52:52:0.981132:21:31:0:1:21:31:0:1
chr1	236714064	.	A	C	393.2	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0246166;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=93.6106;QD=56.1721;RBI=0.0847554;REFB=0;REVB=0.0811018;RO=0;SAF=18;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00116909;OID=.;OPOS=236714064;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:10:18:0:0:10:18:0:0
chr1	236716959	.	C	T	2255.09	PASS	AF=1;AO=142;DP=142;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0137841;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=291.149;QD=63.5238;RBI=0.030066;REFB=0;REVB=0.0267201;RO=0;SAF=75;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.56358e-05;OID=.;OPOS=236716959;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:142:142:0:0:142:142:1:67:75:0:0:67:75:0:0
chr1	236717926	.	T	C	753.25	PASS	AF=0.979592;AO=48;DP=49;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0386835;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.8652;QD=61.4896;RBI=0.0483726;REFB=0.128069;REVB=-0.029043;RO=1;SAF=18;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.025416;STB=0.513508;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=-0.0134503;OID=.;OPOS=236717926;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:49:49:1:1:48:48:0.979592:30:18:1:0:30:18:1:0
chr1	236718620	.	T	C	1171.5	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0284973;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.7795;QD=60.8573;RBI=0.0286137;REFB=0;REVB=0.00257796;RO=0;SAF=37;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000217894;OID=.;OPOS=236718620;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:40:37:0:0:40:37:0:0
chr1	236719135	.	T	C	393.2	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0225131;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.1286;QD=56.1708;RBI=0.0457847;REFB=0;REVB=-0.0398673;RO=0;SAF=16;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000750682;OID=.;OPOS=236719135;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:12:16:0:0:12:16:0:0
chr1	236719193	.	A	G	247.28	PASS	AF=1;AO=19;DP=21;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00627961;FXX=0.0951928;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.202;QD=52.0587;RBI=0.00979165;REFB=0;REVB=-0.00751285;RO=0;SAF=3;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000273441;OID=.;OPOS=236719193;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:19:0:0:19:19:1:16:3:0:0:16:3:0:0
chr1	236721610	.	G	A	730.61	PASS	AF=1;AO=51;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108696;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.0933;QD=56.2004;RBI=0.018295;REFB=0;REVB=-0.014716;RO=0;SAF=37;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0007034;OID=.;OPOS=236721610;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:51:52:1:14:37:0:0:14:38:0:0
chr1	236721660	.	T	C	1306.96	PASS	AF=0.988372;AO=84;DP=85;FAO=85;FDP=86;FR=.;FRO=1;FSAF=52;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0201219;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.679;QD=60.7887;RBI=0.0420205;REFB=-0.118156;REVB=0.0368894;RO=1;SAF=52;SAR=32;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0145713;STB=0.507461;STBP=0.278;TYPE=snp;VARB=0.000519791;OID=.;OPOS=236721660;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:85:86:1:1:84:85:0.988372:32:52:0:1:33:52:0:1
chr1	236721731	.	T	C	1590.69	PASS	AF=1;AO=99;DP=100;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0330391;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.1826;QD=64.2704;RBI=0.0729411;REFB=0;REVB=0.0650294;RO=0;SAF=50;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000255401;OID=.;OPOS=236721731;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:100:99:0:0:99:99:1:49:50:0:0:49:50:0:0
chr1	236724504	.	G	A	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0291539;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=286.908;QD=47.8224;RBI=0.0292292;REFB=0;REVB=0.00209763;RO=0;SAF=8;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.05236e-05;OID=.;OPOS=236724504;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:8:8:0:0:8:8:0:0
chr1	236744712	.	C	A	557.07	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0443665;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.959;QD=60.2238;RBI=0.053849;REFB=0;REVB=-0.0305176;RO=0;SAF=22;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.82408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000436348;OID=.;OPOS=236744712;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:15:22:0:0:15:22:0:0
chr1	236746443	.	C	T	1135.26	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0177124;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.403;QD=60.5472;RBI=0.0229018;REFB=0;REVB=-0.0145177;RO=0;SAF=34;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.65504e-06;OID=.;OPOS=236746443;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:41:34:0:0:41:34:0:0
chr1	236748505	.	T	C	598.86	PASS	AF=0.901961;AO=46;DP=51;FAO=46;FDP=51;FR=.;FRO=5;FSAF=14;FSAR=32;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0284446;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.219;QD=46.9693;RBI=0.0322481;REFB=-0.0103263;REVB=0.0151935;RO=4;SAF=14;SAR=32;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116923;STB=0.554889;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.00156899;OID=.;OPOS=236748505;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:24:51:51:4:5:46:46:0.901961:32:14:4:0:32:14:4:1
chr1	236749649	.	T	C	731.92	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0206536;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.263;QD=63.6454;RBI=0.0335554;REFB=0;REVB=0.026446;RO=0;SAF=20;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000674375;OID=.;OPOS=236749649;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:26:20:0:0:26:20:0:0
chr1	236755837	.	C	T	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00981622;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.104;QD=55.6559;RBI=0.0275659;REFB=0;REVB=0.0257589;RO=0;SAF=17;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.44252e-05;OID=.;OPOS=236755837;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:10:17:0:0:10:17:0:0
chr1	236758887	.	T	A,C	723.93	PASS	AF=0.0384615,0.961538;AO=2,50;DP=53;FAO=2,50;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=0,25;FSAR=2,25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0151822,-0.00245372;FXX=0.0188644;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=106.666,263.436;QD=55.6868;RBI=0.0436013,0.0413947;REFB=0,0;REVB=-0.0408727,0.0413219;RO=0;SAF=0,25;SAR=2,25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.229862,-0.000537406;OID=.,.;OPOS=236758887,236758887;OREF=T,T;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:7:53:52:0:0:2,50:2,50:0.0384615,0.961538:2,25:0,25:0:0:2,25:0,25:0:0
chr1	236767330	.	A	G	1171.99	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00109173;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.018;QD=60.8826;RBI=0.00590615;REFB=0;REVB=-0.00580438;RO=0;SAF=39;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.76526e-05;OID=.;OPOS=236767330;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:77:0:0:76:77:1:37:39:0:0:38:39:0:0
chr1	236882303	.	T	C	887.65	PASS	AF=1;AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0185063;FXX=0.0161264;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.788;QD=58.2063;RBI=0.0277447;REFB=0;REVB=0.0206708;RO=0;SAF=23;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.87044e-05;OID=.;OPOS=236882303;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:61:0:0:61:61:1:38:23:0:0:38:23:0:0
chr1	236883421	.	C	T	868.12	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.014799;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.359;QD=57.8743;RBI=0.0177992;REFB=0;REVB=-0.0098893;RO=0;SAF=27;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.7886e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.00199e-05;OID=.;OPOS=236883421;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:33:27:0:0:33:27:0:0
chr1	236899899	.	TC	T	199.32	PASS	AF=0.535714;AO=44;DP=85;FAO=45;FDP=84;FR=.;FRO=39;FSAF=31;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=15;FWDB=0.00189146;FXX=0.0117633;HRUN=5;LEN=1;MLLD=13.2752;QD=9.49144;RBI=0.0535234;REFB=0.0114935;REVB=-0.05349;RO=35;SAF=30;SAR=14;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0735541;STB=0.538628;STBP=0.476;TYPE=del;VARB=-0.0125022;OID=.;OPOS=236899900;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.535714:44:85:45:84:39:31:14:24:15:99:35:30:14:21:14
chr1	236926445	.	T	C	716.42	PASS	AF=0.946429;AO=53;DP=56;FAO=53;FDP=56;FR=.;FRO=3;FSAF=30;FSAR=23;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0195202;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=158.16;QD=51.1731;RBI=0.0315564;REFB=-0.0225486;REVB=0.0247945;RO=3;SAF=30;SAR=23;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0103374;STB=0.505492;STBP=0.791;TYPE=snp;VARB=0.000887497;OID=.;OPOS=236926445;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:56:56:3:3:53:53:0.946429:23:30:2:1:23:30:2:1
chr1	237054569	.	A	G	1624.42	PASS	AF=1;AO=108;DP=108;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00750344;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.742;QD=60.1635;RBI=0.0112582;REFB=0;REVB=-0.00839319;RO=0;SAF=47;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.63433e-05;OID=.;OPOS=237054569;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:108:108:0:0:108:108:1:61:47:0:0:61:47:0:0
chr1	237058744	.	C	A	1147.1	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0402798;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.962;QD=59.5899;RBI=0.072028;REFB=0;REVB=0.0597124;RO=0;SAF=29;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0010547;OID=.;OPOS=237058744;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:77:0:0:73:77:1:44:29:0:0:45:32:0:0
chr1	237058828	.	C	T	207.25	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.106217;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.061;QD=48.7638;RBI=0.106427;REFB=0;REVB=-0.0066838;RO=0;SAF=3;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.78418e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000960384;OID=.;OPOS=237058828;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:17:0:0:16:17:1:13:3:0:0:13:4:0:0
chr1	237061056	.	A	C	207.13	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00174274;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.44;QD=48.7369;RBI=0.0182034;REFB=0;REVB=0.0181198;RO=0;SAF=6;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000170619;OID=.;OPOS=237061056;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:17:0:0:16:17:1:10:6:0:0:11:6:0:0
chr1	237063504	.	A	G	770.61	PASS	AF=0.982143;AO=54;DP=55;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0337493;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.124;QD=55.0432;RBI=0.059087;REFB=-0.0157846;REVB=0.0485001;RO=1;SAF=30;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154512;STB=0.508194;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.000591538;OID=.;OPOS=237063504;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:55:56:1:1:54:55:0.982143:24:30:1:0:25:30:1:0
chr1	237433625	.	C	T	2456.79	PASS	AF=1;AO=160;DP=160;FAO=160;FDP=160;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=99;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0282929;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.361;QD=61.4198;RBI=0.0284167;REFB=0;REVB=-0.00264955;RO=0;SAF=61;SAR=99;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.49476e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.25934e-05;OID=.;OPOS=237433625;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:160:160:0:0:160:160:1:99:61:0:0:99:61:0:0
chr1	237617757	.	C	T	1080.37	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0127548;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.789;QD=60.0206;RBI=0.013758;REFB=0;REVB=0.00515738;RO=0;SAF=27;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.27032e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.94112e-05;OID=.;OPOS=237617757;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:45:27:0:0:45:27:0:0
chr1	237664108	.	G	T	444.48	PASS	AF=0.453704;AO=50;DP=109;FAO=49;FDP=108;FR=.;FRO=59;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=29;FSRR=30;FWDB=-0.0043002;FXX=0.00917347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.401;QD=16.4622;RBI=0.00450151;REFB=-0.0172541;REVB=-0.0013311;RO=59;SAF=26;SAR=24;SRF=29;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.027647;STB=0.521369;STBP=0.712;TYPE=snp;VARB=0.023817;OID=.;OPOS=237664108;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:108:59:59:50:49:0.453704:24:26:29:30:23:26:29:30
chr1	237711797	.	A	G	1044.34	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0312097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.2993;QD=59.6764;RBI=0.0451007;REFB=0;REVB=0.032558;RO=0;SAF=38;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000473614;OID=.;OPOS=237711797;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:32:38:0:0:32:38:0:0
chr1	237718431	.	C	A	237.23	PASS	AF=0.479167;AO=23;DP=48;FAO=23;FDP=48;FR=.;FRO=25;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=-0.0259578;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.084;QD=19.7692;RBI=0.0341767;REFB=-0.0143143;REVB=-0.0222316;RO=25;SAF=16;SAR=7;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0992073;STB=0.556187;STBP=0.479;TYPE=snp;VARB=0.0132327;OID=.;OPOS=237718431;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:25:25:23:23:0.479167:7:16:15:10:7:16:15:10
chr1	237801770	.	T	C	982.29	PASS	AF=0.971429;AO=68;DP=70;FAO=68;FDP=70;FR=.;FRO=2;FSAF=24;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0261451;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.276;QD=56.1306;RBI=0.0267779;REFB=-0.094344;REVB=0.00578705;RO=0;SAF=24;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.511108;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.00152522;OID=.;OPOS=237801770;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:70:70:0:2:68:68:0.971429:44:24:0:0:44:24:0:2
chr1	237814783	.	C	T	766.36	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00426811;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.9328;QD=63.8637;RBI=0.0285573;REFB=0;REVB=-0.0282366;RO=0;SAF=26;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0003118;OID=.;OPOS=237814783;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:22:26:0:0:22:26:0:0
chr1	237863718	.	T	G	500.59	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0145981;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.943;QD=58.8931;RBI=0.0147294;REFB=0;REVB=0.00196266;RO=0;SAF=12;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.31991e-05;OID=.;OPOS=237863718;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:34:0:0:33:34:1:21:12:0:0:21:13:0:0
chr1	237881770	.	C	T	2027.11	PASS	AF=1;AO=128;DP=128;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00253064;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.815;QD=62.3725;RBI=0.00938895;REFB=0;REVB=0.00904147;RO=0;SAF=74;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.60686e-06;OID=.;OPOS=237881770;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:128:130:0:0:128:130:1:54:74:0:0:56:74:0:0
chr1	237890437	.	C	T	1819.84	PASS	AF=0.975806;AO=121;DP=125;FAO=121;FDP=124;FR=.;FRO=3;FSAF=64;FSAR=57;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=4.42605e-05;FXX=0.00799936;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.896;QD=58.7046;RBI=0.00473004;REFB=-0.00133707;REVB=0.00472984;RO=3;SAF=64;SAR=57;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0217437;STB=0.511449;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=-1.91212e-05;OID=.;OPOS=237890437;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:125:124:3:3:121:121:0.975806:57:64:3:0:57:64:3:0
chr1	237997087	.	A	G	872.87	PASS	AF=1;AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0290514;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.246;QD=58.1916;RBI=0.0436257;REFB=0;REVB=0.0325456;RO=0;SAF=24;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.9695e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000384287;OID=.;OPOS=237997087;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:60:0:0:60:60:1:36:24:0:0:36:24:0:0
chr1	238107035	.	C	G	785.21	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00654483;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=315.81;QD=57.1062;RBI=0.00813146;REFB=0;REVB=-0.00482555;RO=0;SAF=26;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.40922e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.16162e-05;OID=.;OPOS=238107035;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:29:26:0:0:29:26:0:0
chr1	238114860	.	G	A	1084.31	PASS	AF=0.986486;AO=73;DP=74;FAO=73;FDP=74;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.000434166;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.686;QD=58.6116;RBI=0.0159934;REFB=-0.055578;REVB=0.0159875;RO=1;SAF=33;SAR=40;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0116794;STB=0.506171;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=0.000186767;OID=.;OPOS=238114860;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:74:74:1:1:73:73:0.986486:40:33:0:1:40:33:0:1
chr1	238114934	.	G	A	990.49	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0123481;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.5105;QD=59.1334;RBI=0.0234139;REFB=0;REVB=0.019893;RO=0;SAF=22;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.25462e-05;OID=.;OPOS=238114934;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:45:22:0:0:45:22:0:0
chr1	238114936	.	A	G	798.15	PASS	AF=0.895522;AO=67;DP=67;FAO=60;FDP=67;FR=.;FRO=7;FSAF=19;FSAR=41;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.0144929;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.568;QD=47.6506;RBI=0.0273889;REFB=0.0334328;REVB=0.0232403;RO=0;SAF=22;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.513371;STBP=0.563;TYPE=snp;VARB=-0.000521621;OID=.;OPOS=238114936;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:32:67:67:0:7:67:60:0.895522:45:22:0:0:41:19:3:4
chr1	240073226	.	C	T	1393.22	PASS	AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00279364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.133;QD=62.6165;RBI=0.0150965;REFB=0;REVB=0.0148358;RO=0;SAF=46;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.34013e-05;OID=.;OPOS=240073226;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:43:46:0:0:43:46:0:0
chr1	240073619	.	G	A	448.92	PASS	AF=1;AO=31;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0927414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.7991;QD=54.414;RBI=0.134836;REFB=0;REVB=0.0978764;RO=2;SAF=25;SAR=6;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0533429;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00362823;OID=.;OPOS=240073619;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:33:33:2:0:31:33:1:6:25:1:1:7:26:0:0
chr1	240074981	.	A	G	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.020871;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.033;QD=52.6131;RBI=0.056823;REFB=0;REVB=0.0528512;RO=0;SAF=14;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000442283;OID=.;OPOS=240074981;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:8:14:0:0:8:14:0:0
chr1	240076608	.	A	G	393.08	PASS	AF=0.680851;AO=32;DP=47;FAO=32;FDP=47;FR=.;FRO=15;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.0446003;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.003;QD=33.4533;RBI=0.0466101;REFB=-0.0371498;REVB=-0.0135396;RO=14;SAF=17;SAR=15;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0573296;STB=0.520626;STBP=0.734;TYPE=snp;VARB=0.0279526;OID=.;OPOS=240076608;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:14:15:32:32:0.680851:15:17:6:8:15:17:7:8
chr1	240076975	.	G	A	205.93	PASS	AF=0.526316;AO=20;DP=38;FAO=20;FDP=38;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=0.0108094;FXX=0.0256345;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.0757;QD=21.6769;RBI=0.0121617;REFB=-0.0304466;REVB=0.00557343;RO=18;SAF=10;SAR=10;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140643;STB=0.57887;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=0.0294157;OID=.;OPOS=240076975;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:18:18:20:20:0.526316:10:10:12:6:10:10:12:6
chr1	240077023	.	A	G	172.12	PASS	AF=0.473684;AO=18;DP=38;FAO=18;FDP=38;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=-0.00868968;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.949;QD=18.1174;RBI=0.0119405;REFB=-0.00481354;REVB=0.00818929;RO=20;SAF=10;SAR=8;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188164;STB=0.60682;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=0.00533746;OID=.;OPOS=240077023;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:20:20:18:18:0.473684:8:10:7:13:8:10:7:13
chr1	240077309	.	A	G	86.86	PASS	AF=0.407407;AO=11;DP=27;FAO=11;FDP=27;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=14;FWDB=0.0645393;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.577;QD=12.8688;RBI=0.0645908;REFB=-0.0014687;REVB=0.00257852;RO=16;SAF=4;SAR=7;SRF=2;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.290291;STB=0.666419;STBP=0.245;TYPE=snp;VARB=0.00272759;OID=.;OPOS=240077309;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:27:27:16:16:11:11:0.407407:7:4:2:14:7:4:2:14
chr1	240077669	.	A	G	327.33	PASS	AF=0.75;AO=27;DP=36;FAO=27;FDP=36;FR=.;FRO=9;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.0393408;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.1274;QD=36.37;RBI=0.0498062;REFB=-0.0801785;REVB=0.0305444;RO=9;SAF=13;SAR=14;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0848286;STB=0.546167;STBP=0.354;TYPE=snp;VARB=0.0251518;OID=.;OPOS=240077669;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:36:36:9:9:27:27:0.75:14:13:6:3:14:13:6:3
chr1	240256822	.	C	A	58.62	PASS	AF=0.5;AO=8;DP=16;FAO=8;FDP=16;FR=.;FRO=8;FSAF=0;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=316.529;QD=14.6539;RBI=0.0171553;REFB=-0.00147068;REVB=0.0171553;RO=8;SAF=0;SAR=8;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00159186;OID=.;OPOS=240256822;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:16:16:8:8:8:8:0.5:8:0:0:8:8:0:0:8
chr1	240341268	.	A	G	240.1	PASS	AF=0.465517;AO=27;DP=58;FAO=27;FDP=58;FR=.;FRO=31;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=11;FWDB=0.00959383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.6746;QD=16.5584;RBI=0.019002;REFB=-0.00236612;REVB=-0.0164023;RO=31;SAF=11;SAR=16;SRF=20;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.223039;STB=0.625382;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.00240091;OID=.;OPOS=240341268;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:31:31:27:27:0.465517:16:11:20:11:16:11:20:11
chr1	240492414	.	T	C	118.32	PASS	AF=0.378378;AO=14;DP=37;FAO=14;FDP=37;FR=.;FRO=23;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=-0.0455517;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.4001;QD=12.791;RBI=0.0473088;REFB=-0.0105274;REVB=0.0127736;RO=23;SAF=3;SAR=11;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.468977;STB=0.77607;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.0100514;OID=.;OPOS=240492414;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:23:23:14:14:0.378378:11:3:15:8:11:3:15:8
chr1	240497265	.	A	C	610.93	PASS	AF=0.470149;AO=63;DP=134;FAO=63;FDP=134;FR=.;FRO=71;FSAF=34;FSAR=29;FSRF=36;FSRR=35;FWDB=0.0122808;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.791;QD=18.2366;RBI=0.0178645;REFB=0.0106735;REVB=-0.0129739;RO=71;SAF=34;SAR=29;SRF=36;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0312782;STB=0.517351;STBP=0.723;TYPE=snp;VARB=-0.0115681;OID=.;OPOS=240497265;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:134:134:71:71:63:63:0.470149:29:34:36:35:29:34:36:35
chr1	241695792	.	T	C	471.98	PASS	AF=0.485437;AO=50;DP=103;FAO=50;FDP=103;FR=.;FRO=53;FSAF=19;FSAR=31;FSRF=31;FSRR=22;FWDB=0.0160827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.326;QD=18.3291;RBI=0.0308458;REFB=-0.025842;REVB=0.0263213;RO=53;SAF=19;SAR=31;SRF=31;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191218;STB=0.606136;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=0.0278664;OID=.;OPOS=241695792;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:103:53:53:50:50:0.485437:31:19:31:22:31:19:31:22
chr1	241712134	.	C	T	2285.74	PASS	AF=0.993421;AO=151;DP=152;FAO=151;FDP=152;FR=.;FRO=1;FSAF=96;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0153525;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.921;QD=60.1509;RBI=0.0153681;REFB=-0.0193648;REVB=0.000693923;RO=1;SAF=96;SAR=55;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00856947;STB=0.504504;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=0.000110329;OID=.;OPOS=241712134;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:152:152:1:1:151:151:0.993421:55:96:0:1:55:96:0:1
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chr1	241907817	.	T	C	258.38	PASS	AF=0.405405;AO=30;DP=74;FAO=30;FDP=74;FR=.;FRO=44;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=27;FSRR=17;FWDB=-0.00675108;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.785;QD=13.9662;RBI=0.0236066;REFB=-0.00660487;REVB=0.0226207;RO=44;SAF=19;SAR=11;SRF=27;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0219749;STB=0.512516;STBP=0.888;TYPE=snp;VARB=0.00936274;OID=.;OPOS=241907817;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:44:44:30:30:0.405405:11:19:27:17:11:19:27:17
chr1	242030151	.	A	G	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00286541;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.282;QD=56.1914;RBI=0.0457898;REFB=0;REVB=0.0457001;RO=0;SAF=14;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000208389;OID=.;OPOS=242030151;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:14:14:0:0:14:14:0:0
chr1	242035382	.	C	T	301.64	PASS	AF=0.452055;AO=33;DP=74;FAO=33;FDP=73;FR=.;FRO=40;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=26;FWDB=-0.0117272;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.47;QD=16.5282;RBI=0.0231693;REFB=-0.0024358;REVB=-0.0199823;RO=40;SAF=20;SAR=13;SRF=14;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.246384;STB=0.638216;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.00325761;OID=.;OPOS=242035382;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:73:40:40:33:33:0.452055:13:20:14:26:13:20:14:26
chr1	242042301	.	G	A	412.69	PASS	AF=0.477273;AO=42;DP=88;FAO=42;FDP=88;FR=.;FRO=46;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=21;FSRR=25;FWDB=0.0116684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.087;QD=18.7588;RBI=0.0163152;REFB=-0.0113648;REVB=-0.0114033;RO=46;SAF=19;SAR=23;SRF=21;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00391797;STB=0.502182;STBP=0.979;TYPE=snp;VARB=0.0184375;OID=.;OPOS=242042301;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:46:46:42:42:0.477273:23:19:21:25:23:19:21:25
chr1	242042545	.	A	G	236.33	PASS	AF=0.490196;AO=24;DP=50;FAO=25;FDP=51;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=-0.0139481;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.914;QD=18.5359;RBI=0.0193743;REFB=0.00214614;REVB=-0.0134466;RO=26;SAF=10;SAR=14;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0305958;STB=0.50819;STBP=0.915;TYPE=snp;VARB=-0.00208639;OID=.;OPOS=242042545;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:51:26:26:24:25:0.490196:14:10:10:16:15:10:10:16
chr1	242045275	.	C	T	2468.37	PASS	AF=1;AO=160;DP=161;FAO=161;FDP=161;FR=.;FRO=0;FSAF=89;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00364917;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.914;QD=61.3259;RBI=0.0190024;REFB=0;REVB=-0.0186488;RO=0;SAF=88;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33094e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.27195e-05;OID=.;OPOS=242045275;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:161:161:0:0:160:161:1:72:88:0:0:72:89:0:0
chr1	242048674	.	C	T	571.81	PASS	AF=0.445255;AO=61;DP=137;FAO=61;FDP=137;FR=.;FRO=76;FSAF=40;FSAR=21;FSRF=35;FSRR=41;FWDB=-0.00508121;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.1492;QD=16.6951;RBI=0.0316902;REFB=0.0171223;REVB=-0.0312802;RO=76;SAF=40;SAR=21;SRF=35;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199643;STB=0.611553;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=-0.0294875;OID=.;OPOS=242048674;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:137:137:76:76:61:61:0.445255:21:40:35:41:21:40:35:41
chr1	242053030	.	AT	A	232.67	PASS	AF=0.578947;AO=29;DP=57;FAO=33;FDP=57;FR=.;FRO=24;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.0218155;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=22.8305;QD=16.3279;RBI=0.0583557;REFB=0.0442644;REVB=0.0541246;RO=23;SAF=12;SAR=17;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0185603;STB=0.503266;STBP=0.971;TYPE=del;VARB=-0.0300372;OID=.;OPOS=242053031;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.578947:29:57:33:57:24:14:19:10:14:99:23:12:17:9:14
chr1	242053042	.	A	G	171.11	PASS	AF=0.381818;AO=21;DP=54;FAO=21;FDP=55;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=-0.000176711;FXX=0.017854;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.591;QD=12.4444;RBI=0.0277743;REFB=0.000376073;REVB=0.0277738;RO=33;SAF=10;SAR=11;SRF=12;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120585;STB=0.55841;STBP=0.493;TYPE=snp;VARB=-0.000299177;OID=.;OPOS=242053042;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:55:33:34:21:21:0.381818:11:10:12:21:11:10:13:21
chr1	242222754	.	A	G	549.5	PASS	AF=0.467742;AO=58;DP=124;FAO=58;FDP=124;FR=.;FRO=66;FSAF=33;FSAR=25;FSRF=33;FSRR=33;FWDB=-0.00474308;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.103;QD=17.7259;RBI=0.00826143;REFB=0.00585443;REVB=0.0067642;RO=66;SAF=33;SAR=25;SRF=33;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0666282;STB=0.537024;STBP=0.459;TYPE=snp;VARB=-0.00666525;OID=.;OPOS=242222754;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:124:124:66:66:58:58:0.467742:25:33:33:33:25:33:33:33
chr1	242687390	.	G	A	109.65	PASS	AF=0.433333;AO=13;DP=30;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=0.0107547;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.317;QD=14.6196;RBI=0.0120468;REFB=-0.0126693;REVB=-0.00542784;RO=17;SAF=10;SAR=3;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149999;STB=0.58809;STBP=0.475;TYPE=snp;VARB=0.017626;OID=.;OPOS=242687390;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:17:17:13:13:0.433333:3:10:11:6:3:10:11:6
chr1	243328887	.	G	T	73.6	PASS	AF=0.2;AO=12;DP=60;FAO=12;FDP=60;FR=.;FRO=48;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=32;FSRR=16;FWDB=-0.0069197;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.307;QD=4.90695;RBI=0.0159668;REFB=-0.00256972;REVB=0.0143895;RO=48;SAF=5;SAR=7;SRF=32;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.303721;STB=0.692221;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=0.0142572;OID=.;OPOS=243328887;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:60:60:48:48:12:12:0.2:7:5:32:16:7:5:32:16
chr1	243329049	.	G	A	342.53	PASS	AF=0.330769;AO=43;DP=130;FAO=43;FDP=130;FR=.;FRO=87;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=49;FSRR=38;FWDB=0.00501546;FXX=0.0151504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.567;QD=10.5393;RBI=0.0086822;REFB=-0.0118759;REVB=0.00708701;RO=85;SAF=20;SAR=23;SRF=48;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114219;STB=0.565342;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=0.017706;OID=.;OPOS=243329049;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:130:130:85:87:43:43:0.330769:23:20:48:37:23:20:49:38
chr1	243329075	.	T	C	222.5	PASS	AF=0.25;AO=32;DP=130;FAO=33;FDP=132;FR=.;FRO=99;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=54;FSRR=45;FWDB=-0.00393133;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=47.5079;QD=6.74252;RBI=0.00578047;REFB=-0.000721654;REVB=-0.00423775;RO=98;SAF=15;SAR=17;SRF=53;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0896065;STB=0.56786;STBP=0.356;TYPE=snp;VARB=0.00139087;OID=.;OPOS=243329075;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:130:132:98:99:32:33:0.25:17:15:53:45:18:15:54:45
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chr1	244219563	.	A	G	708.56	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00516191;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=260.807;QD=62.9829;RBI=0.0105126;REFB=0;REVB=0.00915806;RO=0;SAF=22;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.89532e-05;OID=.;OPOS=244219563;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:23:22:0:0:23:22:0:0
chr1	244724092	.	G	A	382.47	PASS	AF=0.425743;AO=42;DP=102;FAO=43;FDP=101;FR=.;FRO=58;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=24;FSRR=34;FWDB=0.00206271;FXX=0.00980296;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.822;QD=15.1475;RBI=0.00622729;REFB=-0.0117262;REVB=0.00587574;RO=58;SAF=23;SAR=19;SRF=24;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137039;STB=0.569171;STBP=0.253;TYPE=snp;VARB=0.0120502;OID=.;OPOS=244724092;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:101:58:58:42:43:0.425743:19:23:24:34:20:23:24:34
chr1	244735858	.	A	G	167.09	PASS	AF=0.409091;AO=18;DP=44;FAO=18;FDP=44;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=-0.00264047;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.04;QD=15.1897;RBI=0.0242428;REFB=-0.0103707;REVB=0.0240985;RO=26;SAF=11;SAR=7;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.046632;STB=0.526852;STBP=0.803;TYPE=snp;VARB=0.0068856;OID=.;OPOS=244735858;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:26:26:18:18:0.409091:7:11:17:9:7:11:17:9
chr1	244754961	.	C	A	124.86	PASS	AF=0.5;AO=14;DP=28;FAO=14;FDP=28;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=0.000784061;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.137;QD=17.8366;RBI=0.0172345;REFB=0.00494897;REVB=0.0172167;RO=14;SAF=6;SAR=8;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1854;STB=0.605911;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=-0.00629796;OID=.;OPOS=244754961;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:28:14:14:14:14:0.5:8:6:9:5:8:6:9:5
chr1	244773784	.	T	C	169.16	PASS	AF=0.375;AO=21;DP=56;FAO=21;FDP=56;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=0.0133309;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.886;QD=12.0829;RBI=0.0334911;REFB=-0.0122926;REVB=0.0307236;RO=35;SAF=15;SAR=6;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.316643;STB=0.68403;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.0203543;OID=.;OPOS=244773784;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:35:35:21:21:0.375:6:15:15:20:6:15:15:20
chr1	245027349	.	C	T	274.52	PASS	AF=0.527273;AO=29;DP=55;FAO=29;FDP=55;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=24;FSRF=2;FSRR=24;FWDB=0.0829663;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.4421;QD=19.9651;RBI=0.0871393;REFB=0.020328;REVB=0.0266431;RO=26;SAF=5;SAR=24;SRF=2;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160599;STB=0.588182;STBP=0.371;TYPE=snp;VARB=-0.0163863;OID=.;OPOS=245027349;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:26:26:29:29:0.527273:24:5:2:24:24:5:2:24
chr1	245133623	.	T	TCCTCC	95.33	PASS	AF=0.909091;AO=10;DP=11;FAO=10;FDP=11;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0469941;FXX=0;HRUN=2;LEN=5;MLLD=156.056;QD=34.6655;RBI=0.0751802;REFB=-0.0147999;REVB=0.0586823;RO=1;SAF=9;SAR=1;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0471711;STB=0.526264;STBP=0.652;TYPE=ins;VARB=0.00250059;OID=.;OPOS=245133624;OREF=-;OALT=CCTCC;OMAPALT=TCCTCC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.909091:10:11:10:11:1:9:1:1:0:6:1:9:1:1:0
chr1	245133662	.	G	C	207.02	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00949075;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.1123;QD=48.7105;RBI=0.0342785;REFB=0;REVB=0.0329384;RO=0;SAF=11;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00168375;OID=.;OPOS=245133662;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:6:11:0:0:6:11:0:0
chr1	245297243	.	G	A	136.89	PASS	AF=0.5;AO=15;DP=30;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=-0.00964629;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.8713;QD=18.2515;RBI=0.0125336;REFB=0.0276253;REVB=-0.00800244;RO=15;SAF=8;SAR=7;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0589223;STB=0.533588;STBP=0.776;TYPE=snp;VARB=-0.0289746;OID=.;OPOS=245297243;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:15:15:15:15:0.5:7:8:9:6:7:8:9:6
chr1	245297324	.	G	T	255.68	PASS	AF=0.491228;AO=28;DP=56;FAO=28;FDP=57;FR=.;FRO=29;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=0.030652;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.87;QD=17.9423;RBI=0.0365171;REFB=-0.0166463;REVB=-0.0198482;RO=28;SAF=15;SAR=13;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0955016;STB=0.544399;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=0.0225321;OID=.;OPOS=245297324;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:57:28:29:28:28:0.491228:13:15:12:16:13:15:13:16
chr1	245848798	.	C	T	436.63	PASS	AF=0.468085;AO=43;DP=94;FAO=44;FDP=94;FR=.;FRO=50;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=25;FSRR=25;FWDB=0.0282354;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.7886;QD=18.5798;RBI=0.0301283;REFB=-0.0277186;REVB=-0.0105107;RO=49;SAF=20;SAR=23;SRF=24;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0236234;STB=0.512095;STBP=0.789;TYPE=snp;VARB=0.0233813;OID=.;OPOS=245848798;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:49:50:43:44:0.468085:23:20:24:25:23:21:25:25
chr1	245849729	.	G	A	453.32	PASS	AF=0.45045;AO=50;DP=111;FAO=50;FDP=111;FR=.;FRO=61;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=23;FSRR=38;FWDB=-0.00124528;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=273.262;QD=16.3358;RBI=0.00532382;REFB=-0.0079654;REVB=-0.00517613;RO=61;SAF=27;SAR=23;SRF=23;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159348;STB=0.58881;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=0.00918872;OID=.;OPOS=245849729;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:111:61:61:50:50:0.45045:23:27:23:38:23:27:23:38
chr1	245850506	.	G	C	153.63	PASS	AF=0.571429;AO=16;DP=27;FAO=16;FDP=28;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=14;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=-0.122055;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.0093;QD=21.9472;RBI=0.122742;REFB=-0.0378273;REVB=-0.012968;RO=11;SAF=2;SAR=14;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.290291;STB=0.656019;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.0191693;OID=.;OPOS=245850506;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:27:28:11:12:16:16:0.571429:14:2:4:7:14:2:4:8
chr1	245851289	.	G	T	74.45	PASS	AF=0.692308;AO=9;DP=13;FAO=9;FDP=13;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.035182;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.6913;QD=22.9063;RBI=0.0438142;REFB=-0.00794591;REVB=0.0261134;RO=4;SAF=4;SAR=5;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162954;STB=0.593016;STBP=0.335;TYPE=snp;VARB=0.0214307;OID=.;OPOS=245851289;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:13:13:4:4:9:9:0.692308:5:4:3:1:5:4:3:1
chr1	245851304	.	A	G	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0190529;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.726;QD=43.4862;RBI=0.0399818;REFB=0;REVB=-0.0351502;RO=0;SAF=7;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000152561;OID=.;OPOS=245851304;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:5:7:0:0:5:7:0:0
chr1	245861571	.	C	T	215.07	PASS	AF=0.525;AO=21;DP=40;FAO=21;FDP=40;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=-0.00641653;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=304.189;QD=21.5074;RBI=0.00961155;REFB=0.00143237;REVB=0.00715611;RO=19;SAF=9;SAR=12;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17051;STB=0.595654;STBP=0.203;TYPE=snp;VARB=-0.00128497;OID=.;OPOS=245861571;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:19:19:21:21:0.525:12:9:12:7:12:9:12:7
chr1	245912889	.	G	A	225.7	PASS	AF=0.471698;AO=25;DP=54;FAO=25;FDP=53;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=3;FSRR=25;FWDB=0.0342754;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.3999;QD=17.0342;RBI=0.0359998;REFB=-0.00833783;REVB=-0.0110082;RO=28;SAF=12;SAR=13;SRF=3;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.362497;STB=0.700328;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.0110211;OID=.;OPOS=245912889;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:53:28:28:25:25:0.471698:13:12:3:25:13:12:3:25
chr1	246021941	.	T	C	469.27	PASS	AF=0.485149;AO=49;DP=101;FAO=49;FDP=101;FR=.;FRO=52;FSAF=14;FSAR=35;FSRF=32;FSRR=20;FWDB=-0.0378104;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.477;QD=18.5851;RBI=0.0400446;REFB=-0.0201515;REVB=0.0131888;RO=52;SAF=14;SAR=35;SRF=32;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.316901;STB=0.676396;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0150682;OID=.;OPOS=246021941;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:101:52:52:49:49:0.485149:35:14:32:20:35:14:32:20
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chr1	246720798	.	G	A	708.83	PASS	AF=1;AO=45;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0756374;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.1283;QD=61.6371;RBI=0.0935428;REFB=0;REVB=-0.0550385;RO=1;SAF=13;SAR=32;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0347745;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000840751;OID=.;OPOS=246720798;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:1:0:45:46:1:32:13:1:0:32:14:0:0
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chr1	246939513	.	G	A	471.7	PASS	AF=0.5625;AO=45;DP=81;FAO=45;FDP=80;FR=.;FRO=35;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=0.033568;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.6275;QD=23.585;RBI=0.0850735;REFB=-0.013685;REVB=0.0781709;RO=34;SAF=22;SAR=23;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0143627;STB=0.513898;STBP=0.79;TYPE=snp;VARB=0.0107139;OID=.;OPOS=246939513;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:80:34:35:45:45:0.5625:23:22:16:18:23:22:16:19
chr1	246942159	.	G	A	204.51	PASS	AF=0.555556;AO=20;DP=36;FAO=20;FDP=36;FR=.;FRO=16;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=-0.00668169;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.231;QD=22.7237;RBI=0.0221907;REFB=-0.00990346;REVB=-0.0211608;RO=16;SAF=12;SAR=8;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0736356;STB=0.541136;STBP=0.637;TYPE=snp;VARB=0.00879922;OID=.;OPOS=246942159;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:16:16:20:20:0.555556:8:12:11:5:8:12:11:5
chr1	247150740	.	T	C	920.53	PASS	AF=0.984848;AO=63;DP=65;FAO=65;FDP=66;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0252118;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=48.0804;QD=55.7899;RBI=0.0935612;REFB=-0.192485;REVB=0.0901003;RO=2;SAF=29;SAR=34;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0269675;STB=0.506847;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.00564596;OID=.;OPOS=247150740;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:65:66:2:1:63:65:0.984848:34:29:0:2:36:29:0:1
chr1	247162658	.	C	T	575.8	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0225489;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.087;QD=60.6103;RBI=0.0266031;REFB=0;REVB=-0.0141163;RO=0;SAF=18;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.51048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.49378e-05;OID=.;OPOS=247162658;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:20:18:0:0:20:18:0:0
chr1	247419509	.	T	C	464.86	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00296644;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.362;QD=58.107;RBI=0.00386556;REFB=0;REVB=0.00247846;RO=0;SAF=19;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.35071e-06;OID=.;OPOS=247419509;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:13:19:0:0:13:19:0:0
chr1	247419664	.	C	T	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00248487;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=227.649;QD=56.1916;RBI=0.0180144;REFB=0;REVB=-0.0178422;RO=0;SAF=16;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.11271e-05;OID=.;OPOS=247419664;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:12:16:0:0:12:16:0:0
chr1	247587477	.	G	A	220.94	PASS	AF=0.44898;AO=21;DP=48;FAO=22;FDP=49;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=19;FWDB=-0.0127182;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.125;QD=18.0356;RBI=0.0128633;REFB=-0.00656117;REVB=-0.00192667;RO=26;SAF=8;SAR=13;SRF=8;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0772372;STB=0.540947;STBP=0.635;TYPE=snp;VARB=0.0095018;OID=.;OPOS=247587477;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:49:26:27:21:22:0.44898:13:8:8:18:14:8:8:19
chr1	247587531	.	A	G	429.02	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0722945;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.673;QD=57.2026;RBI=0.0787556;REFB=0;REVB=0.0312401;RO=0;SAF=9;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000371283;OID=.;OPOS=247587531;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:21:9:0:0:21:9:0:0
chr1	247614617	.	C	T	128.49	PASS	AF=0.365854;AO=15;DP=41;FAO=15;FDP=41;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=21;FSRR=5;FWDB=-0.0368558;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.2859;QD=12.5359;RBI=0.0371947;REFB=-0.0272059;REVB=-0.00500991;RO=26;SAF=7;SAR=8;SRF=21;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.367258;STB=0.710873;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=0.0487409;OID=.;OPOS=247614617;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:26:26:15:15:0.365854:8:7:21:5:8:7:21:5
chr1	247614693	.	C	T	428.72	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00658048;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.391;QD=57.1632;RBI=0.0158395;REFB=0;REVB=0.0144079;RO=0;SAF=18;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.03968e-05;OID=.;OPOS=247614693;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:12:18:0:0:12:18:0:0
chr1	247614896	.	A	C	68.09	PASS	AF=0.473684;AO=9;DP=19;FAO=9;FDP=19;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=-0.0295692;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.733;QD=14.3342;RBI=0.0324332;REFB=-0.00754628;REVB=-0.0133257;RO=9;SAF=4;SAR=5;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187606;STB=0.581216;STBP=0.553;TYPE=snp;VARB=0.00491823;OID=.;OPOS=247614896;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:19:19:9:10:9:9:0.473684:5:4:6:3:5:4:6:4
chr1	247615261	.	GA	G	536.27	PASS	AF=0.49697;AO=80;DP=165;FAO=82;FDP=165;FR=.;FRO=83;FSAF=44;FSAR=38;FSRF=42;FSRR=41;FWDB=0.0623946;FXX=0.00602373;HRUN=2;LEN=1;MLLD=27.4789;QD=13.0005;RBI=0.146138;REFB=-0.0197019;REVB=-0.132148;RO=81;SAF=44;SAR=36;SRF=42;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.028945;STB=0.515417;STBP=0.68;TYPE=del;VARB=0.0171955;OID=.;OPOS=247615262;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.49697:80:165:82:165:83:44:38:42:41:99:81:44:36:42:39
chr1	247695612	.	G	A	689.38	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00642321;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=290.772;QD=62.6711;RBI=0.0117991;REFB=0;REVB=0.00989756;RO=0;SAF=22;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.50647e-05;OID=.;OPOS=247695612;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:22:22:0:0:22:22:0:0
chr1	247695756	.	T	C	428.95	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0182583;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.817;QD=57.1937;RBI=0.0718754;REFB=0;REVB=0.0695177;RO=0;SAF=17;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.63861e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000316272;OID=.;OPOS=247695756;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:13:17:0:0:13:17:0:0
chr1	247752019	.	G	C	1098.64	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00870808;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.2842;QD=60.1993;RBI=0.0127891;REFB=0;REVB=0.00936646;RO=0;SAF=37;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.89682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.53287e-06;OID=.;OPOS=247752019;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:36:37:0:0:36:37:0:0
chr1	247752367	.	A	G	452.18	PASS	AF=0.483871;AO=45;DP=93;FAO=45;FDP=93;FR=.;FRO=48;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=28;FSRR=20;FWDB=-0.0142941;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.86;QD=19.4488;RBI=0.0142943;REFB=-0.00103621;REVB=-7.96056e-05;RO=48;SAF=26;SAR=19;SRF=28;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0052906;STB=0.50294;STBP=0.962;TYPE=snp;VARB=0.00129726;OID=.;OPOS=247752367;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:48:48:45:45:0.483871:19:26:28:20:19:26:28:20
chr1	247769592	.	C	T	310.67	PASS	AF=0.522388;AO=30;DP=68;FAO=35;FDP=67;FR=.;FRO=32;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=-0.00766794;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.4073;QD=18.5474;RBI=0.0215522;REFB=-0.00785824;REVB=0.020142;RO=32;SAF=17;SAR=13;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00390477;STB=0.518508;STBP=0.752;TYPE=snp;VARB=0.0058857;OID=.;OPOS=247769592;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:67:32:32:30:35:0.522388:13:17:18:14:14:21:18:14
chr1	247769752	.	A	G	311.85	PASS	AF=0.453333;AO=31;DP=73;FAO=34;FDP=75;FR=.;FRO=41;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=28;FWDB=0.0464258;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.444;QD=16.6318;RBI=0.0464703;REFB=-0.0164018;REVB=0.00203294;RO=41;SAF=17;SAR=14;SRF=13;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.230271;STB=0.599944;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=0.0210599;OID=.;OPOS=247769752;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:75:41:41:31:34:0.453333:14:17:13:28:17:17:13:28
chr1	247835950	.	T	C	524.54	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00922115;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.482;QD=59.9479;RBI=0.0113224;REFB=0;REVB=0.00657015;RO=0;SAF=24;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00102779;OID=.;OPOS=247835950;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:11:24:0:0:11:24:0:0
chr1	247921100	.	T	G	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0167297;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.468;QD=55.6558;RBI=0.0167457;REFB=0;REVB=0.00073204;RO=0;SAF=13;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000111843;OID=.;OPOS=247921100;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:14:13:0:0:14:13:0:0
chr1	247921352	.	C	T	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0127936;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.662;QD=55.0982;RBI=0.0740954;REFB=0;REVB=0.0729826;RO=0;SAF=17;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000684348;OID=.;OPOS=247921352;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:9:17:0:0:9:17:0:0
chr1	247921717	.	C	A	974.68	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0254105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=353.841;QD=58.1896;RBI=0.0254113;REFB=0;REVB=0.000201373;RO=0;SAF=32;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.02126e-05;OID=.;OPOS=247921717;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:67:0:0:64:67:1:32:32:0:0:32:35:0:0
chr1	247921789	.	A	AGT	71.49	PASS	AF=0.642857;AO=7;DP=28;FAO=9;FDP=14;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.0227798;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=53.9695;QD=20.425;RBI=0.230957;REFB=-0.174813;REVB=0.229831;RO=19;SAF=5;SAR=2;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.282546;STB=0.555432;STBP=0.657;TYPE=ins;VARB=0.200945;OID=.;OPOS=247921790;OREF=-;OALT=GT;OMAPALT=AGT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.642857:7:28:9:14:5:5:4:2:3:26:19:5:2:9:10
chr1	247921888	.	C	T	591.74	PASS	AF=1;AO=38;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0563045;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.1502;QD=60.6917;RBI=0.0644652;REFB=0;REVB=-0.0313937;RO=0;SAF=15;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00051262;OID=.;OPOS=247921888;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:38:39:1:23:15:0:0:24:15:0:0
chr1	247978319	.	A	G	837.22	PASS	AF=0.983333;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00248557;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=207.284;QD=55.8143;RBI=0.0261702;REFB=-0.124407;REVB=0.0260519;RO=0;SAF=32;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.96591e-08;STB=0.50769;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=-3.96242e-05;OID=.;OPOS=247978319;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:60:60:0:1:59:59:0.983333:27:32:0:0:27:32:1:0
chr1	247978541	.	AAGG	A	195.35	PASS	AF=1;AO=16;DP=17;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0233827;FXX=0.0587889;HRUN=2;LEN=3;MLLD=251.13;QD=48.8379;RBI=0.0346008;REFB=0;REVB=0.0255042;RO=0;SAF=12;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.07465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000296777;OID=.;OPOS=247978542;OREF=AGG;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:16:17:16:16:0:12:4:0:0:4:0:12:4:0:0
chr1	248004614	.	G	A	438.13	PASS	AF=0.96875;AO=30;DP=31;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0291178;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.871;QD=54.7656;RBI=0.0414353;REFB=-0.152959;REVB=-0.0294794;RO=0;SAF=15;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.515142;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.00259904;OID=.;OPOS=248004614;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:31:32:0:1:30:31:0.96875:15:15:0:0:15:16:1:0
chr1	248004687	.	C	G	366.92	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0666052;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=301.122;QD=54.3586;RBI=0.0702218;REFB=0;REVB=0.0222452;RO=0;SAF=14;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000474346;OID=.;OPOS=248004687;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:27:0:0:26:27:1:12:14:0:0:12:15:0:0
chr1	248004775	.	C	T	101.81	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0284373;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.793;QD=40.7234;RBI=0.0372334;REFB=0;REVB=-0.0240344;RO=0;SAF=4;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.95834e-05;OID=.;OPOS=248004775;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:6:4:0:0:6:4:0:0
chr1	248004848	.	G	C	88.22	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00860008;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.1538;QD=39.2068;RBI=0.0812733;REFB=0;REVB=0.080817;RO=0;SAF=2;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00452209;OID=.;OPOS=248004848;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:7:2:0:0:7:2:0:0
chr1	248004877	.	C	T	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0175684;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.679;QD=43.4861;RBI=0.0534801;REFB=0;REVB=0.0505121;RO=0;SAF=5;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000730804;OID=.;OPOS=248004877;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:7:5:0:0:7:5:0:0
chr1	248004884	.	T	C	130.45	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0119363;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.656;QD=43.4835;RBI=0.0194843;REFB=0;REVB=0.0154;RO=0;SAF=5;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.12065e-05;OID=.;OPOS=248004884;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:7:5:0:0:7:5:0:0
chr1	248005213	.	G	C	322.96	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0404445;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.4827;QD=53.826;RBI=0.041463;REFB=0;REVB=-0.00913355;RO=0;SAF=16;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000259349;OID=.;OPOS=248005213;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:8:16:0:0:8:16:0:0
chr1	248020556	.	G	C	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00725214;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=157.786;QD=47.8224;RBI=0.0245871;REFB=0;REVB=0.0234932;RO=0;SAF=9;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000154688;OID=.;OPOS=248020556;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:7:9:0:0:7:9:0:0
chr1	248028218	.	C	CA	115.24	PASS	AF=1;AO=2;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0195527;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=209.351;QD=38.4142;RBI=0.0201647;REFB=0;REVB=-0.00493024;RO=9;SAF=2;SAR=0;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.602534;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00446343;OID=.;OPOS=248028219;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:2:12:12:12:0:7:5:0:0:4:9:2:0:4:5
chr1	248028219	.	G	A	76.4	PASS	AF=0.75;AO=9;DP=12;FAO=9;FDP=12;FR=.;FRO=3;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.000138274;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=224.702;QD=25.4672;RBI=0.000209817;REFB=0.0350041;REVB=-0.000157808;RO=2;SAF=4;SAR=5;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176689;STB=0.636074;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=-0.00110338;OID=.;OPOS=248028219;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:12:12:2:3:9:9:0.75:5:4:2:0:5:4:3:0
chr1	248039451	.	C	T	214.12	PASS	AF=0.431034;AO=25;DP=58;FAO=25;FDP=58;FR=.;FRO=33;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=-0.00508906;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.496;QD=14.7666;RBI=0.00524336;REFB=0.00950306;REVB=-0.00126264;RO=33;SAF=13;SAR=12;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0956162;STB=0.55429;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=-0.0110585;OID=.;OPOS=248039451;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:33:33:25:25:0.431034:12:13:14:19:12:13:14:19
chr1	248039713	.	A	G	322.66	PASS	AF=0.559322;AO=32;DP=58;FAO=33;FDP=59;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.0124189;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.2563;QD=21.8754;RBI=0.0241148;REFB=0.00508153;REVB=0.0206711;RO=26;SAF=12;SAR=20;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104649;STB=0.547916;STBP=0.42;TYPE=snp;VARB=-0.00330934;OID=.;OPOS=248039713;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:59:26:26:32:33:0.559322:20:12:13:13:20:13:13:13
chr1	248059423	.	C	T	1135.15	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00906831;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.014;QD=60.5413;RBI=0.018777;REFB=0;REVB=0.0164421;RO=0;SAF=39;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6999e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.87095e-05;OID=.;OPOS=248059423;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:36:39:0:0:36:39:0:0
chr1	248059456	.	G	A	1641.78	PASS	AF=1;AO=109;DP=109;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0121785;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.2458;QD=60.249;RBI=0.0129231;REFB=0;REVB=0.00432333;RO=0;SAF=53;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.66796e-05;OID=.;OPOS=248059456;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:109:109:0:0:109:109:1:56:53:0:0:56:53:0:0
chr1	248059476	.	A	C	1858.34	PASS	AF=1;AO=121;DP=121;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0124604;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.7154;QD=61.4327;RBI=0.0133147;REFB=0;REVB=0.00469241;RO=0;SAF=62;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.09109e-05;OID=.;OPOS=248059476;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:121:121:0:0:121:121:1:59:62:0:0:59:62:0:0
chr1	248059703	.	T	A	763.13	PASS	AF=1;AO=47;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0218295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.774;QD=63.5938;RBI=0.0254953;REFB=0;REVB=0.0131713;RO=0;SAF=31;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000118123;OID=.;OPOS=248059703;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:47:48:1:16:31:0:0:17:31:0:0
chr1	248059712	.	T	C	708.56	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0229603;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.709;QD=62.9827;RBI=0.0229671;REFB=0;REVB=0.000560204;RO=0;SAF=28;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000130212;OID=.;OPOS=248059712;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:17:28:0:0:17:28:0:0
chr1	248059856	.	T	C	1300.72	PASS	AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0377013;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.3186;QD=61.9391;RBI=0.0405997;REFB=0;REVB=0.0150647;RO=0;SAF=55;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000171561;OID=.;OPOS=248059856;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:29:55:0:0:29:55:0:0
chr1	248060029	.	A	G	472.32	PASS	AF=1;AO=31;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00761579;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.751;QD=57.2504;RBI=0.0121107;REFB=0;REVB=0.00941637;RO=0;SAF=13;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.33668e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000131114;OID=.;OPOS=248060029;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:31:33:1:18:13:0:0:20:13:0:0
chr1	248060230	.	C	T	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0157618;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=260.264;QD=35.5759;RBI=0.0208145;REFB=0;REVB=0.0135945;RO=0;SAF=2;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.27427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000289883;OID=.;OPOS=248060230;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:5:2:0:0:5:2:0:0
chr1	248060279	.	C	T	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0164783;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.4714;QD=44.6896;RBI=0.0164803;REFB=0;REVB=-0.000258202;RO=0;SAF=5;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000893795;OID=.;OPOS=248060279;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:8:5:0:0:8:5:0:0
chr1	248060380	.	C	G	740.79	PASS	AF=1;AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.025456;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.0367;QD=56.9841;RBI=0.0345835;REFB=0;REVB=0.0234096;RO=0;SAF=22;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000649116;OID=.;OPOS=248060380;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:52:0:0:52:52:1:30:22:0:0:30:22:0:0
chr1	248084434	.	G	A	1200.41	PASS	AF=0.97561;AO=80;DP=82;FAO=80;FDP=82;FR=.;FRO=2;FSAF=50;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-7.53368e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.041;QD=58.5566;RBI=0.00631303;REFB=-0.0251439;REVB=-0.00631258;RO=2;SAF=50;SAR=30;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00614456;STB=0.503246;STBP=0.767;TYPE=snp;VARB=0.00137855;OID=.;OPOS=248084434;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:82:82:2:2:80:80:0.97561:30:50:1:1:30:50:1:1
chr1	248084464	.	T	C	1022.48	PASS	AF=0.972222;AO=70;DP=72;FAO=70;FDP=72;FR=.;FRO=2;FSAF=50;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00480534;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.111;QD=56.8043;RBI=0.00480576;REFB=-0.0454424;REVB=-6.36631e-05;RO=2;SAF=50;SAR=20;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0136901;STB=0.507244;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=-1.08153e-05;OID=.;OPOS=248084464;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:72:72:2:2:70:70:0.972222:20:50:1:1:20:50:1:1
chr1	248084511	.	T	C	34.05	PASS	AF=0.171429;AO=6;DP=35;FAO=6;FDP=35;FR=.;FRO=29;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=-0.0225945;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=278.297;QD=3.89119;RBI=0.02723;REFB=-0.00318732;REVB=-0.0151975;RO=29;SAF=4;SAR=2;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0152112;STB=0.510603;STBP=0.964;TYPE=snp;VARB=0.0135382;OID=.;OPOS=248084511;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:35:35:29:29:6:6:0.171429:2:4:19:10:2:4:19:10
chr1	248085108	.	C	T	393.15	PASS	AF=1;AO=27;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00805304;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.392;QD=56.1641;RBI=0.0288391;REFB=0;REVB=-0.0276919;RO=0;SAF=14;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000203507;OID=.;OPOS=248085108;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:27:28:1:13:14:0:0:13:15:0:0
chr1	248112627	.	T	C	1625.66	PASS	AF=0.990909;AO=109;DP=110;FAO=109;FDP=110;FR=.;FRO=1;FSAF=52;FSAR=57;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00140501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.105;QD=59.1148;RBI=0.0290274;REFB=-0.0805392;REVB=0.0289934;RO=0;SAF=52;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.53715e-08;STB=0.504761;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.000511016;OID=.;OPOS=248112627;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:110:110:0:1:109:109:0.990909:57:52:0:0:57:52:1:0
chr1	248112745	.	G	T	411.12	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00699018;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=121.309;QD=56.7066;RBI=0.0130206;REFB=0;REVB=-0.0109851;RO=0;SAF=16;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000119088;OID=.;OPOS=248112745;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:13:16:0:0:13:16:0:0
chr1	248112762	.	TG	CA	465.14	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00204457;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=274.096;QD=58.1421;RBI=0.00298464;REFB=0;REVB=0.00217435;RO=0;SAF=19;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=5.68689e-06;OID=.;OPOS=248112762;OREF=TG;OALT=CA;OMAPALT=CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:13:19:0:0:13:19:0:0
chr1	248112771	.	C	T	553.43	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00583109;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=290.446;QD=59.8297;RBI=0.0374202;REFB=0;REVB=0.0369631;RO=0;SAF=21;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.27896e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00014692;OID=.;OPOS=248112771;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:37:0:0:35:37:1:14:21:0:0:15:22:0:0
chr1	248112809	.	A	G	689.23	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.025856;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.911;QD=62.6569;RBI=0.0263097;REFB=0;REVB=-0.00486485;RO=0;SAF=22;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00015466;OID=.;OPOS=248112809;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:22:22:0:0:22:22:0:0
chr1	248112836	.	A	G	651.16	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0602294;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.812;QD=62.0151;RBI=0.0627971;REFB=0;REVB=0.0177736;RO=0;SAF=18;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000638685;OID=.;OPOS=248112836;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:24:18:0:0:24:18:0:0
chr1	248113026	.	T	A	705.52	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0190608;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.199;QD=62.7127;RBI=0.0198196;REFB=0;REVB=-0.00543161;RO=0;SAF=15;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.02404e-05;OID=.;OPOS=248113026;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:45:0:0:44:45:1:29:15:0:0:30:15:0:0
chr1	248113040	.	A	G	704.85	PASS	AF=0.958333;AO=45;DP=47;FAO=46;FDP=48;FR=.;FRO=2;FSAF=12;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00116441;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.8543;QD=58.7377;RBI=0.0202687;REFB=-0.0204075;REVB=-0.0202352;RO=2;SAF=12;SAR=33;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0235387;STB=0.512755;STBP=0.544;TYPE=snp;VARB=0.00671974;OID=.;OPOS=248113040;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:47:48:2:2:45:46:0.958333:33:12:1:1:34:12:1:1
chr1	248129240	.	G	A	610.24	PASS	AF=0.97619;AO=40;DP=42;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0103999;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.6512;QD=58.118;RBI=0.0606606;REFB=0.0242039;REVB=0.0597624;RO=1;SAF=21;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0240441;STB=0.512189;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=-0.000608686;OID=.;OPOS=248129240;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:42:42:1:1:40:41:0.97619:19:21:0:1:20:21:0:1
chr1	248202344	.	G	C	206.1	PASS	AF=0.428571;AO=21;DP=49;FAO=21;FDP=49;FR=.;FRO=28;FSAF=3;FSAR=18;FSRF=6;FSRR=22;FWDB=-0.0772414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.515;QD=16.8248;RBI=0.0785477;REFB=-0.0065702;REVB=-0.0142659;RO=28;SAF=3;SAR=18;SRF=6;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128662;STB=0.57439;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.0143665;OID=.;OPOS=248202344;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:28:28:21:21:0.428571:18:3:6:22:18:3:6:22
chr1	248202474	.	A	G	57.59	PASS	AF=0.152778;AO=11;DP=72;FAO=11;FDP=72;FR=.;FRO=61;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=28;FSRR=33;FWDB=-0.00302479;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.448;QD=3.19957;RBI=0.0126484;REFB=-0.00684934;REVB=0.0122814;RO=61;SAF=7;SAR=4;SRF=28;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218059;STB=0.648854;STBP=0.337;TYPE=snp;VARB=0.0223028;OID=.;OPOS=248202474;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:72:72:61:61:11:11:0.152778:4:7:28:33:4:7:28:33
chr1	248224690	.	C	T	427.07	PASS	AF=0.594203;AO=41;DP=69;FAO=41;FDP=69;FR=.;FRO=28;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=0.014309;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212;QD=24.7575;RBI=0.0150426;REFB=-0.00696519;REVB=0.00464007;RO=28;SAF=20;SAR=21;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0439483;STB=0.524068;STBP=0.659;TYPE=snp;VARB=0.00426023;OID=.;OPOS=248224690;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:28:28:41:41:0.594203:21:20:12:16:21:20:12:16
chr1	248264018	.	C	T	1526.37	PASS	AF=0.981132;AO=104;DP=106;FAO=104;FDP=106;FR=.;FRO=2;FSAF=47;FSAR=57;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0487468;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.728;QD=57.599;RBI=0.0487531;REFB=-0.128984;REVB=0.000781572;RO=2;SAF=47;SAR=57;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0197617;STB=0.510415;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=0.00103147;OID=.;OPOS=248264018;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:106:106:2:2:104:104:0.981132:57:47:2:0:57:47:2:0
chr1	248308934	.	C	T	424.78	PASS	AF=0.267544;AO=61;DP=228;FAO=61;FDP=228;FR=.;FRO=167;FSAF=27;FSAR=34;FSRF=100;FSRR=67;FWDB=0.00387857;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.8881;QD=7.45233;RBI=0.0573471;REFB=-0.0131452;REVB=-0.0572158;RO=167;SAF=27;SAR=34;SRF=100;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191609;STB=0.612881;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.0337232;OID=.;OPOS=248308934;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:228:228:167:167:61:61:0.267544:34:27:100:67:34:27:100:67
chr1	248343543	.	C	T	647.97	PASS	AF=0.567568;AO=63;DP=111;FAO=63;FDP=111;FR=.;FRO=48;FSAF=28;FSAR=35;FSRF=26;FSRR=22;FWDB=0.0325364;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.5121;QD=23.3504;RBI=0.0365143;REFB=-0.0085444;REVB=0.0165733;RO=48;SAF=28;SAR=35;SRF=26;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0771469;STB=0.542155;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=0.00603674;OID=.;OPOS=248343543;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:111:48:48:63:63:0.567568:35:28:26:22:35:28:26:22
chr1	248343945	.	C	G	746.62	PASS	AF=0.461988;AO=79;DP=171;FAO=79;FDP=171;FR=.;FRO=92;FSAF=39;FSAR=40;FSRF=47;FSRR=45;FWDB=-0.00887129;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.4685;QD=17.4649;RBI=0.0236194;REFB=-0.0108888;REVB=0.0218901;RO=91;SAF=39;SAR=40;SRF=46;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0114227;STB=0.50925;STBP=0.818;TYPE=snp;VARB=0.0113988;OID=.;OPOS=248343945;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:171:171:91:92:79:79:0.461988:40:39:46:45:40:39:47:45
chr1	248343990	.	T	C	706.61	PASS	AF=0.449704;AO=76;DP=169;FAO=76;FDP=169;FR=.;FRO=93;FSAF=34;FSAR=42;FSRF=49;FSRR=44;FWDB=0.011243;FXX=0.00588201;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.478;QD=16.7246;RBI=0.0128486;REFB=-0.0116364;REVB=-0.00621945;RO=92;SAF=34;SAR=42;SRF=49;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0841091;STB=0.543826;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.0173877;OID=.;OPOS=248343990;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:169:169:92:93:76:76:0.449704:42:34:49:43:42:34:49:44
chr1	248366702	.	G	A	900.46	PASS	AF=0.523529;AO=89;DP=170;FAO=89;FDP=170;FR=.;FRO=81;FSAF=45;FSAR=44;FSRF=47;FSRR=34;FWDB=0.012174;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.451;QD=21.1874;RBI=0.0125709;REFB=-0.00648234;REVB=0.00313376;RO=81;SAF=45;SAR=44;SRF=47;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0649806;STB=0.535583;STBP=0.344;TYPE=snp;VARB=0.00672466;OID=.;OPOS=248366702;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:170:170:81:81:89:89:0.523529:44:45:47:34:44:45:47:34
chr1	248402758	.	C	T	337.11	PASS	AF=0.463415;AO=33;DP=78;FAO=38;FDP=82;FR=.;FRO=44;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=27;FWDB=0.00347461;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.003;QD=16.4445;RBI=0.0206389;REFB=-0.01323;REVB=0.0203443;RO=36;SAF=18;SAR=15;SRF=13;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170616;STB=0.574674;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=0.0168912;OID=.;OPOS=248402758;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:82:36:44:33:38:0.463415:15:18:13:23:18:20:17:27
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chr1	248436611	.	G	A	116.59	PASS	AF=0.341463;AO=13;DP=40;FAO=14;FDP=41;FR=.;FRO=27;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=-0.0310732;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.561;QD=11.3746;RBI=0.0347577;REFB=-0.0283873;REVB=0.0155741;RO=26;SAF=5;SAR=8;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0446188;STB=0.535265;STBP=0.781;TYPE=snp;VARB=0.0393878;OID=.;OPOS=248436611;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:41:26:27:13:14:0.341463:8:5:11:15:9:5:11:16
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chr1	248457979	.	C	A	317.93	PASS	AF=0.426829;AO=35;DP=82;FAO=35;FDP=82;FR=.;FRO=47;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=25;FSRR=22;FWDB=-0.00346119;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.344;QD=15.5086;RBI=0.00599646;REFB=-0.00285457;REVB=0.0048967;RO=46;SAF=17;SAR=18;SRF=25;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0581032;STB=0.526447;STBP=0.724;TYPE=snp;VARB=0.00523066;OID=.;OPOS=248457979;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:46:47:35:35:0.426829:18:17:25:21:18:17:25:22
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chr1	248458717	.	C	G	292.42	PASS	AF=0.357895;AO=34;DP=95;FAO=34;FDP=95;FR=.;FRO=61;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=29;FSRR=32;FWDB=0.0346878;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.687;QD=12.3125;RBI=0.0348061;REFB=-0.00610615;REVB=-0.00286725;RO=61;SAF=13;SAR=21;SRF=29;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106549;STB=0.561389;STBP=0.363;TYPE=snp;VARB=0.00917208;OID=.;OPOS=248458717;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:61:61:34:34:0.357895:21:13:29:32:21:13:29:32
chr1	248487300	.	C	T	696.8	PASS	AF=0.407407;AO=77;DP=189;FAO=77;FDP=189;FR=.;FRO=112;FSAF=50;FSAR=27;FSRF=63;FSRR=49;FWDB=-0.00476551;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.793;QD=14.747;RBI=0.0318981;REFB=-0.00591888;REVB=0.0315401;RO=112;SAF=50;SAR=27;SRF=63;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0971955;STB=0.554649;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=0.00751331;OID=.;OPOS=248487300;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:189:189:112:112:77:77:0.407407:27:50:63:49:27:50:63:49
chr1	248487338	.	C	A	846.94	PASS	AF=0.412281;AO=94;DP=230;FAO=94;FDP=228;FR=.;FRO=134;FSAF=59;FSAR=35;FSRF=71;FSRR=63;FWDB=-0.00684084;FXX=0.00869527;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.299;QD=14.8585;RBI=0.00825684;REFB=-0.0110315;REVB=0.00462367;RO=136;SAF=59;SAR=35;SRF=71;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115143;STB=0.559608;STBP=0.134;TYPE=snp;VARB=0.011039;OID=.;OPOS=248487338;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:230:228:136:134:94:94:0.412281:35:59:71:65:35:59:71:63
chr1	248487638	.	A	G	550.16	PASS	AF=0.467742;AO=58;DP=122;FAO=58;FDP=124;FR=.;FRO=66;FSAF=25;FSAR=33;FSRF=18;FSRR=48;FWDB=-0.00725966;FXX=0.00799936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.536;QD=17.747;RBI=0.0302916;REFB=-0.0293952;REVB=-0.0294089;RO=63;SAF=25;SAR=33;SRF=18;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142778;STB=0.58795;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=0.0399882;OID=.;OPOS=248487638;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:122:124:63:66:58:58:0.467742:33:25:18:45:33:25:18:48
chr1	248487768	.	A	G	255.2	PASS	AF=0.491228;AO=28;DP=57;FAO=28;FDP=57;FR=.;FRO=29;FSAF=22;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=-0.0399863;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=54.8404;QD=17.9087;RBI=0.0939723;REFB=0.0229887;REVB=-0.0850405;RO=29;SAF=22;SAR=6;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.259589;STB=0.646943;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=-0.0271826;OID=.;OPOS=248487768;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:29:29:28:28:0.491228:6:22:16:13:6:22:16:13
chr1	248512094	.	C	T	494.96	PASS	AF=0.473214;AO=52;DP=113;FAO=53;FDP=112;FR=.;FRO=59;FSAF=31;FSAR=22;FSRF=27;FSRR=32;FWDB=0.0170498;FXX=0.00884877;HRUN=2;LEN=1;MLLD=237.318;QD=17.677;RBI=0.0241735;REFB=-0.0269249;REVB=-0.0171365;RO=58;SAF=30;SAR=22;SRF=26;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122335;STB=0.567432;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.0230398;OID=.;OPOS=248512094;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:112:58:59:52:53:0.473214:22:30:26:32:22:31:27:32
chr1	248512637	.	C	T	259.74	PASS	AF=0.467742;AO=29;DP=62;FAO=29;FDP=62;FR=.;FRO=33;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=-0.0216487;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.079;QD=16.7572;RBI=0.0354121;REFB=-0.0167948;REVB=-0.0280242;RO=33;SAF=20;SAR=9;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.233067;STB=0.631485;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=0.0178432;OID=.;OPOS=248512637;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:33:33:29:29:0.467742:9:20:15:18:9:20:15:18
chr1	248512749	.	G	A	238.3	PASS	AF=0.457627;AO=27;DP=59;FAO=27;FDP=59;FR=.;FRO=32;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=-0.00901246;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=153.788;QD=16.156;RBI=0.0111519;REFB=-0.0155349;REVB=0.00656808;RO=32;SAF=18;SAR=9;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197387;STB=0.61168;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.015058;OID=.;OPOS=248512749;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:32:32:27:27:0.457627:9:18:15:17:9:18:15:17
chr1	248512767	.	G	T	238.15	PASS	AF=0.48;AO=22;DP=50;FAO=24;FDP=50;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=0.00645295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.5705;QD=19.0524;RBI=0.0325495;REFB=0.00679134;REVB=-0.0319035;RO=25;SAF=10;SAR=12;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0905328;STB=0.559951;STBP=0.443;TYPE=snp;VARB=-0.00534329;OID=.;OPOS=248512767;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:25:26:22:24:0.48:12:10:9:16:12:12:10:16
chr1	248525100	.	G	A	78.76	PASS	AF=0.144144;AO=16;DP=111;FAO=16;FDP=111;FR=.;FRO=95;FSAF=2;FSAR=14;FSRF=49;FSRR=46;FWDB=0.0871921;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.3145;QD=2.83828;RBI=0.0912431;REFB=0.00446987;REVB=0.0268856;RO=94;SAF=2;SAR=14;SRF=49;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.51825;STB=0.855645;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=-0.0233403;OID=.;OPOS=248525100;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:111:111:94:95:16:16:0.144144:14:2:49:45:14:2:49:46
chr1	248525135	.	G	A	107.57	PASS	AF=0.160305;AO=21;DP=131;FAO=21;FDP=131;FR=.;FRO=110;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=55;FSRR=55;FWDB=-0.0562956;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.256;QD=3.28453;RBI=0.0581013;REFB=-0.00328493;REVB=-0.0143722;RO=98;SAF=7;SAR=14;SRF=44;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15328;STB=0.642349;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=0.0312564;OID=.;OPOS=248525135;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:131:131:98:110:21:21:0.160305:14:7:44:54:14:7:55:55
chr1	248525138	.	C	T	108.0	PASS	AF=0.161538;AO=21;DP=130;FAO=21;FDP=130;FR=.;FRO=109;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=54;FSRR=55;FWDB=0.00414342;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=137.766;QD=3.32313;RBI=0.0326201;REFB=-0.00254937;REVB=-0.0323559;RO=109;SAF=7;SAR=14;SRF=54;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.209319;STB=0.638609;STBP=0.167;TYPE=snp;VARB=0.00806226;OID=.;OPOS=248525138;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:130:130:109:109:21:21:0.161538:14:7:54:55:14:7:54:55
chr1	248525638	.	CA	C	398.17	PASS	AF=0.519481;AO=40;DP=78;FAO=40;FDP=77;FR=.;FRO=37;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=-0.00096802;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.055;QD=20.6844;RBI=0.0228584;REFB=-0.020996;REVB=-0.0228379;RO=37;SAF=20;SAR=20;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0351786;STB=0.519471;STBP=0.717;TYPE=del;VARB=0.0156586;OID=.;OPOS=248525639;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.519481:40:78:40:77:37:20:20:17:20:99:37:20:20:17:20
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chr1	248569369	.	A	G	320.09	PASS	AF=0.4375;AO=35;DP=80;FAO=35;FDP=80;FR=.;FRO=45;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=29;FWDB=-0.00578897;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.244;QD=16.0045;RBI=0.00590059;REFB=0.000429356;REVB=-0.00114226;RO=45;SAF=16;SAR=19;SRF=16;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103448;STB=0.558107;STBP=0.38;TYPE=snp;VARB=-0.000463501;OID=.;OPOS=248569369;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:45:45:35:35:0.4375:19:16:16:29:19:16:16:29
chr1	248616401	.	G	A	2377.05	PASS	AF=0.728302;AO=190;DP=263;FAO=193;FDP=265;FR=.;FRO=72;FSAF=83;FSAR=110;FSRF=42;FSRR=30;FWDB=0.00788816;FXX=0.00375926;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.149;QD=35.88;RBI=0.00955357;REFB=-0.0117868;REVB=0.00538958;RO=72;SAF=80;SAR=110;SRF=42;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0844757;STB=0.541974;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.00396435;OID=.;OPOS=248616401;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:263:265:72:72:190:193:0.728302:110:80:42:30:110:83:42:30
chr1	248616408	.	C	T	2370.29	PASS	AF=0.722846;AO=193;DP=267;FAO=193;FDP=267;FR=.;FRO=74;FSAF=83;FSAR=110;FSRF=44;FSRR=30;FWDB=0.00867963;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.5117;QD=35.51;RBI=0.0301835;REFB=0.00369802;REVB=-0.0289086;RO=74;SAF=83;SAR=110;SRF=44;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0860312;STB=0.545912;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=-0.00195117;OID=.;OPOS=248616408;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:267:267:74:74:193:193:0.722846:110:83:44:30:110:83:44:30
chr1	248637046	.	G	A	158.05	PASS	AF=0.64;AO=16;DP=25;FAO=16;FDP=25;FR=.;FRO=9;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.00928343;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.881;QD=25.2872;RBI=0.00954796;REFB=-0.013692;REVB=0.00223189;RO=9;SAF=8;SAR=8;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0357466;STB=0.519975;STBP=0.805;TYPE=snp;VARB=0.00805507;OID=.;OPOS=248637046;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:25:25:9:9:16:16:0.64:8:8:4:5:8:8:4:5
chr1	248637065	.	A	G	61.38	PASS	AF=0.615385;AO=8;DP=13;FAO=8;FDP=13;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0497699;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.02;QD=18.8861;RBI=0.0733975;REFB=-0.0643671;REVB=-0.0539457;RO=4;SAF=5;SAR=3;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.348619;STB=0.659985;STBP=0.198;TYPE=snp;VARB=0.0427537;OID=.;OPOS=248637065;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:13:13:4:5:8:8:0.615385:3:5:0:4:3:5:1:4
chr1	248637362	.	C	T	502.44	PASS	AF=0.465517;AO=54;DP=116;FAO=54;FDP=116;FR=.;FRO=62;FSAF=29;FSAR=25;FSRF=43;FSRR=19;FWDB=0.0250773;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.7359;QD=17.3256;RBI=0.0251047;REFB=-0.0053971;REVB=0.00117335;RO=60;SAF=29;SAR=25;SRF=43;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174457;STB=0.585145;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=0.0054653;OID=.;OPOS=248637362;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:116:116:60:62:54:54:0.465517:25:29:43:17:25:29:43:19
chr1	248637480	.	A	G	127.5	PASS	AF=0.145946;AO=27;DP=185;FAO=27;FDP=185;FR=.;FRO=158;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=112;FSRR=46;FWDB=-0.021465;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.067;QD=2.75678;RBI=0.0393556;REFB=-0.00284742;REVB=0.0329866;RO=155;SAF=17;SAR=10;SRF=110;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115405;STB=0.575327;STBP=0.459;TYPE=snp;VARB=0.0236717;OID=.;OPOS=248637480;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:185:185:155:158:27:27:0.145946:10:17:110:45:10:17:112:46
chr1	248637543	.	C	T	1635.07	PASS	AF=0.553957;AO=154;DP=278;FAO=154;FDP=278;FR=.;FRO=124;FSAF=88;FSAR=66;FSRF=80;FSRR=44;FWDB=0.00585015;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.124;QD=23.5262;RBI=0.0213297;REFB=-0.015771;REVB=0.0205117;RO=124;SAF=88;SAR=66;SRF=80;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0624192;STB=0.533894;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=0.0115488;OID=.;OPOS=248637543;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:278:278:124:124:154:154:0.553957:66:88:80:44:66:88:80:44
chr1	248652011	.	A	T	173.14	PASS	AF=0.842105;AO=16;DP=19;FAO=16;FDP=19;FR=.;FRO=3;FSAF=2;FSAR=14;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0986367;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.3959;QD=36.45;RBI=0.105781;REFB=0.00242481;REVB=-0.0382155;RO=3;SAF=2;SAR=14;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.270216;STB=0.65094;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=-0.00316773;OID=.;OPOS=248652011;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:19:19:3:3:16:16:0.842105:14:2:2:1:14:2:2:1
chr1	248652023	.	G	A	143.71	PASS	AF=0.823529;AO=14;DP=17;FAO=14;FDP=17;FR=.;FRO=3;FSAF=2;FSAR=12;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0246394;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.886;QD=33.8141;RBI=0.0323775;REFB=0.0726433;REVB=-0.0210048;RO=3;SAF=2;SAR=12;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.26412;STB=0.648402;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=-0.0201405;OID=.;OPOS=248652023;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:17:17:3:3:14:14:0.823529:12:2:2:1:12:2:2:1
chr1	248652058	.	G	A	33.48	PASS	AF=0.714286;AO=5;DP=7;FAO=5;FDP=7;FR=.;FRO=2;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0619164;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.778;QD=19.1341;RBI=0.0767815;REFB=0.00207555;REVB=0.0454067;RO=2;SAF=2;SAR=3;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.281149;STB=0.666029;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=-0.00335711;OID=.;OPOS=248652058;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:7:7:2:2:5:5:0.714286:3:2:2:0:3:2:2:0
chr1	248652061	.	C	T	33.48	PASS	AF=0.714286;AO=5;DP=7;FAO=5;FDP=7;FR=.;FRO=2;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0126417;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=196.449;QD=19.134;RBI=0.0295616;REFB=-0.0334845;REVB=-0.0267222;RO=2;SAF=2;SAR=3;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.281149;STB=0.666029;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=0.00599869;OID=.;OPOS=248652061;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:7:7:2:2:5:5:0.714286:3:2:2:0:3:2:2:0
chr1	248685253	.	T	C	760.79	PASS	AF=0.981818;AO=54;DP=55;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0025181;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.915;QD=55.3303;RBI=0.0113752;REFB=-0.153449;REVB=0.011093;RO=1;SAF=29;SAR=25;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0184775;STB=0.5098;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=-0.000126853;OID=.;OPOS=248685253;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:55:55:1:1:54:54:0.981818:25:29:0:1:25:29:0:1
chr1	248685719	.	A	T	298.08	PASS	AF=0.428571;AO=33;DP=78;FAO=33;FDP=77;FR=.;FRO=44;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=28;FSRR=16;FWDB=0.00371777;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.377;QD=15.4845;RBI=0.00371824;REFB=-0.00636004;REVB=5.92102e-05;RO=44;SAF=14;SAR=19;SRF=28;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.212053;STB=0.619494;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=0.0120687;OID=.;OPOS=248685719;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:77:44:44:33:33:0.428571:19:14:28:16:19:14:28:16
chr1	248722611	.	C	G	62.07	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0115909;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.997;QD=35.4707;RBI=0.0686733;REFB=0;REVB=0.067688;RO=0;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00319742;OID=.;OPOS=248722611;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:7:0:0:6:7:1:4:2:0:0:4:3:0:0
chr1	248722621	.	G	A	57.08	PASS	AF=0.875;AO=7;DP=8;FAO=7;FDP=8;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00975878;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=204.34;QD=28.5398;RBI=0.0247603;REFB=-0.142376;REVB=-0.0227561;RO=1;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0971198;STB=0.5554;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.00546367;OID=.;OPOS=248722621;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:8:8:1:1:7:7:0.875:4:3:0:1:4:3:0:1
chr1	248722624	.	C	T	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0396568;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.973;QD=37.4885;RBI=0.0442333;REFB=0;REVB=0.019594;RO=0;SAF=3;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000268522;OID=.;OPOS=248722624;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:5:3:0:0:5:3:0:0
chr1	248722659	.	C	T	239.4	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00608961;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.2194;QD=50.399;RBI=0.0295359;REFB=0;REVB=-0.0289013;RO=0;SAF=9;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00073891;OID=.;OPOS=248722659;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:10:9:0:0:10:9:0:0
chr1	248722671	.	T	A	340.73	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000304203;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.383;QD=54.5173;RBI=0.0057397;REFB=0;REVB=-0.00573164;RO=0;SAF=11;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.263e-05;OID=.;OPOS=248722671;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:14:11:0:0:14:11:0:0
chr1	248722777	.	T	A	727.28	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0343499;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.971;QD=63.2414;RBI=0.0381975;REFB=0;REVB=0.0167073;RO=0;SAF=18;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.06241e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.67141e-05;OID=.;OPOS=248722777;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:28:18:0:0:28:18:0:0
chr1	248737319	.	G	A	63.69	PASS	AF=0.321429;AO=9;DP=28;FAO=9;FDP=28;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=-0.0154412;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.0816;QD=9.09846;RBI=0.0475517;REFB=-0.00223775;REVB=0.0449748;RO=19;SAF=4;SAR=5;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.262204;STB=0.658586;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.00669478;OID=.;OPOS=248737319;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:28:28:19:19:9:9:0.321429:5:4:13:6:5:4:13:6
chr1	248737343	.	C	T	314.14	PASS	AF=0.658537;AO=27;DP=41;FAO=27;FDP=41;FR=.;FRO=14;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.0138967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.832;QD=30.6479;RBI=0.0232573;REFB=-0.0241894;REVB=-0.0186489;RO=14;SAF=17;SAR=10;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17249;STB=0.594772;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=0.0191176;OID=.;OPOS=248737343;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:14:14:27:27:0.658537:10:17:5:9:10:17:5:9
chr1	248737348	.	G	A	670.24	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000138013;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.6731;QD=62.3477;RBI=0.0147309;REFB=0;REVB=-0.0147303;RO=0;SAF=23;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000167805;OID=.;OPOS=248737348;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:20:23:0:0:20:23:0:0
chr1	248737511	.	A	G	121.81	PASS	AF=0.263889;AO=16;DP=69;FAO=19;FDP=72;FR=.;FRO=53;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=31;FSRR=22;FWDB=0.0217396;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=42.0472;QD=6.76741;RBI=0.0240069;REFB=0.0113261;REVB=0.0101844;RO=53;SAF=7;SAR=9;SRF=31;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180223;STB=0.543401;STBP=0.66;TYPE=snp;VARB=-0.0124311;OID=.;OPOS=248737511;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:72:53:53:16:19:0.263889:9:7:31:22:9:10:31:22
chr1	248737595	.	A	G	149.86	PASS	AF=1;AO=13;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0154345;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=198.517;QD=42.8181;RBI=0.0220276;REFB=0;REVB=-0.0157159;RO=0;SAF=6;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000522667;OID=.;OPOS=248737595;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:13:14:1:7:6:0:0:7:7:0:0
chr1	248814052	.	T	A	88.79	PASS	AF=0.458333;AO=11;DP=24;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.0510003;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.962;QD=14.7983;RBI=0.0525604;REFB=-0.00556437;REVB=0.0127108;RO=13;SAF=6;SAR=5;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0777652;STB=0.545372;STBP=0.735;TYPE=snp;VARB=0.00830376;OID=.;OPOS=248814052;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:24:24:13:13:11:11:0.458333:5:6:6:7:5:6:6:7
chr1	248814080	.	A	C	267.5	PASS	AF=0.88;AO=22;DP=25;FAO=22;FDP=25;FR=.;FRO=3;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.00619009;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=291.357;QD=42.7992;RBI=0.0147746;REFB=-0.0625164;REVB=0.0134154;RO=2;SAF=12;SAR=10;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.083825;STB=0.565158;STBP=0.118;TYPE=snp;VARB=0.000622997;OID=.;OPOS=248814080;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:25:25:2:3:22:22:0.88:10:12:0:2:10:12:0:3
chr1	248814126	.	G	A	56.68	PASS	AF=0.421053;AO=8;DP=19;FAO=8;FDP=19;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.0125666;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.4213;QD=11.9316;RBI=0.0128914;REFB=-0.000906544;REVB=-0.00287545;RO=10;SAF=6;SAR=2;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1654;STB=0.635998;STBP=0.348;TYPE=snp;VARB=0.00286238;OID=.;OPOS=248814126;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:19:19:10:11:8:8:0.421053:2:6:6:4:2:6:6:5
chr1	248844959	.	T	C	727.8	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00211647;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.722;QD=63.2866;RBI=0.0241043;REFB=0;REVB=0.0240112;RO=0;SAF=30;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.31553e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.68542e-05;OID=.;OPOS=248844959;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:16:30:0:0:16:30:0:0
chr1	248845356	.	G	T	759.73	PASS	AF=0.982143;AO=53;DP=56;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0130254;FXX=0.0175408;HRUN=3;LEN=1;MLLD=142.67;QD=54.2665;RBI=0.0352371;REFB=-0.0698225;REVB=0.0327413;RO=1;SAF=32;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0144976;STB=0.507689;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.000563985;OID=.;OPOS=248845356;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:56:56:1:1:53:55:0.982143:21:32:1:0:23:32:1:0
chr1	248845471	.	T	C	888.71	PASS	AF=1;AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00447554;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.12;QD=58.2758;RBI=0.0304643;REFB=0;REVB=0.0301337;RO=0;SAF=25;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.22377e-05;OID=.;OPOS=248845471;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:61:0:0:61:61:1:36:25:0:0:36:25:0:0
chr1	248845499	.	A	G	707.64	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.039855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.426;QD=62.9008;RBI=0.0677283;REFB=0;REVB=0.0547604;RO=0;SAF=18;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000676275;OID=.;OPOS=248845499;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:27:18:0:0:27:18:0:0
chr1	249105163	.	T	C	399.75	PASS	AF=0.43299;AO=41;DP=97;FAO=42;FDP=97;FR=.;FRO=55;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=30;FSRR=25;FWDB=-0.0306555;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.5094;QD=16.4846;RBI=0.0338847;REFB=-0.00808233;REVB=0.0144365;RO=52;SAF=16;SAR=25;SRF=28;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149227;STB=0.580208;STBP=0.192;TYPE=snp;VARB=0.00830811;OID=.;OPOS=249105163;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:52:55:41:42:0.43299:25:16:28:24:25:17:30:25
chr1	249141782	.	A	T	409.61	PASS	AF=0.571429;AO=39;DP=69;FAO=40;FDP=70;FR=.;FRO=30;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=9;FSRR=21;FWDB=0.11085;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.328;QD=23.4062;RBI=0.110854;REFB=-0.0140085;REVB=-0.00101544;RO=30;SAF=19;SAR=20;SRF=9;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148964;STB=0.585673;STBP=0.116;TYPE=snp;VARB=0.0202402;OID=.;OPOS=249141782;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:70:30:30:39:40:0.571429:20:19:9:21:20:20:9:21
chr1	249143522	.	C	A	98.87	PASS	AF=0.428571;AO=12;DP=28;FAO=12;FDP=28;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=-0.00247826;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=231.822;QD=14.124;RBI=0.0210044;REFB=-0.0216364;REVB=0.0208577;RO=16;SAF=9;SAR=3;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147216;STB=0.586802;STBP=0.467;TYPE=snp;VARB=0.0227604;OID=.;OPOS=249143522;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:28:28:16:16:12:12:0.428571:3:9:10:6:3:9:10:6
chr1	249168107	.	G	C	125.69	PASS	AF=0.319149;AO=15;DP=47;FAO=15;FDP=47;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=20;FWDB=0.00250704;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.601;QD=10.6974;RBI=0.0203515;REFB=-0.000811368;REVB=0.0201965;RO=32;SAF=10;SAR=5;SRF=12;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.326627;STB=0.694192;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=0.00370881;OID=.;OPOS=249168107;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:32:32:15:15:0.319149:5:10:12:20:5:10:12:20
chr1	249168436	.	G	A	260.16	PASS	AF=0.467742;AO=29;DP=62;FAO=29;FDP=62;FR=.;FRO=33;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=28;FSRR=5;FWDB=-0.0212407;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.616;QD=16.7848;RBI=0.0322385;REFB=-0.00971582;REVB=-0.0242519;RO=32;SAF=20;SAR=9;SRF=27;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183302;STB=0.606676;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=0.00891627;OID=.;OPOS=249168436;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:32:33:29:29:0.467742:9:20:27:5:9:20:28:5
chr1	249168516	.	A	G	820.55	PASS	AF=0.983607;AO=56;DP=58;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0443666;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.7729;QD=53.8063;RBI=0.0708631;REFB=0.00199311;REVB=-0.0552556;RO=2;SAF=34;SAR=22;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0269297;STB=0.506491;STBP=0.496;TYPE=snp;VARB=0.00205296;OID=.;OPOS=249168516;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:58:61:2:1:56:60:0.983607:22:34:2:0:22:38:1:0
chr1	249208772	.	C	T	220.93	PASS	AF=0.44898;AO=22;DP=49;FAO=22;FDP=49;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=8;FWDB=0.00336915;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.791;QD=18.0354;RBI=0.024879;REFB=-0.010889;REVB=0.0246498;RO=27;SAF=9;SAR=13;SRF=19;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.27974;STB=0.65809;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=0.02329;OID=.;OPOS=249208772;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:27:27:22:22:0.44898:13:9:19:8:13:9:19:8
chr1	249211096	.	G	A	167.25	PASS	AF=0.529412;AO=16;DP=33;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.013359;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.905;QD=19.6765;RBI=0.0136776;REFB=-0.0212405;REVB=-0.00293495;RO=16;SAF=9;SAR=7;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.503308;STBP=0.997;TYPE=snp;VARB=0.0197197;OID=.;OPOS=249211096;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:34:16:16:16:18:0.529412:7:9:9:7:8:10:9:7
chr1	249211619	.	G	A	55.91	PASS	AF=0.333333;AO=8;DP=25;FAO=8;FDP=24;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.00642691;FXX=0.039984;HRUN=5;LEN=1;MLLD=102.417;QD=9.31836;RBI=0.0120987;REFB=-0.00965853;REVB=-0.0102505;RO=16;SAF=4;SAR=4;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0677072;STB=0.541563;STBP=0.812;TYPE=snp;VARB=0.0301503;OID=.;OPOS=249211619;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:25:24:16:16:8:8:0.333333:4:4:9:7:4:4:9:7
chr2	242800	.	T	C	140.59	PASS	AF=0.777778;AO=14;DP=18;FAO=14;FDP=18;FR=.;FRO=4;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0232123;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.159;QD=31.2417;RBI=0.043331;REFB=0.0482397;REVB=0.0365891;RO=4;SAF=10;SAR=4;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0995427;STB=0.555473;STBP=0.459;TYPE=snp;VARB=-0.0026642;OID=.;OPOS=242800;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:18:18:4:4:14:14:0.777778:4:10:2:2:4:10:2:2
chr2	243504	.	C	T	102.71	PASS	AF=0.48;AO=12;DP=26;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.0384804;FXX=0.0384468;HRUN=3;LEN=1;MLLD=127.191;QD=16.4339;RBI=0.0406873;REFB=-0.0327872;REVB=-0.0132181;RO=13;SAF=5;SAR=7;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0410576;STB=0.52377;STBP=0.815;TYPE=snp;VARB=0.0261462;OID=.;OPOS=243504;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:25:13:13:12:12:0.48:7:5:6:7:7:5:6:7
chr2	269352	.	G	A	248.32	PASS	AF=0.352941;AO=30;DP=85;FAO=30;FDP=85;FR=.;FRO=55;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=26;FSRR=29;FWDB=-0.0204662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.544;QD=11.6857;RBI=0.021495;REFB=-0.00167182;REVB=-0.00657038;RO=55;SAF=14;SAR=16;SRF=26;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00681243;STB=0.503934;STBP=0.964;TYPE=snp;VARB=0.0033499;OID=.;OPOS=269352;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:55:55:30:30:0.352941:16:14:26:29:16:14:26:29
chr2	676177	.	C	G	785.88	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0234142;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.951;QD=64.1536;RBI=0.0235073;REFB=0;REVB=-0.00209051;RO=0;SAF=21;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.26383e-05;OID=.;OPOS=676177;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:28:21:0:0:28:21:0:0
chr2	1079320	.	C	T	1227.5	PASS	AF=1;AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0141221;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.8972;QD=61.375;RBI=0.0215588;REFB=0;REVB=-0.0162895;RO=0;SAF=37;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.46403e-05;OID=.;OPOS=1079320;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:80:80:0:0:80:80:1:43:37:0:0:43:37:0:0
chr2	1099076	.	TA	TC,TT	1979.15	PASS	AF=0.630573,0.350318;AO=61,19;DP=139;FAO=99,55;FDP=157;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=0;FSAF=69,27;FSAR=30,28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00437186,0.00857637;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=44.3908,88.6596;QD=50.4242;RBI=0.0877823,0.0320359;REFB=0,0;REVB=0.0876734,0.0308666;RO=0;SAF=47,3;SAR=14,16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.92147e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000912052,0.0496298;OID=.,.;OPOS=1099077,1099077;OREF=A,A;OALT=C,T;OMAPALT=TC,TT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.630573,0.350318:61,19:139:99,55:157:0:69,27:30,28:0:0:99:0:47,3:14,16:0:0
chr2	1099079	.	T	C	74.39	PASS	AF=0.113208;AO=17;DP=159;FAO=18;FDP=159;FR=.;FRO=141;FSAF=2;FSAR=16;FSRF=94;FSRR=47;FWDB=0.00131778;FXX=0;HRUN=11;LEN=1;MLLD=155.556;QD=1.87143;RBI=0.00576296;REFB=5.34334e-05;REVB=0.00561027;RO=141;SAF=2;SAR=15;SRF=94;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.607389;STB=0.9238;STBP=0;TYPE=snp;VARB=-0.000274088;OID=.;OPOS=1099079;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:159:159:141:141:17:18:0.113208:15:2:94:47:16:2:94:47
chr2	1497803	.	C	T	747.1	PASS	AF=1;AO=46;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00291657;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.807;QD=63.583;RBI=0.0244341;REFB=0;REVB=0.0242594;RO=0;SAF=19;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.39711e-05;OID=.;OPOS=1497803;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:46:47:1:27:19:0:0:27:20:0:0
chr2	1499899	.	C	T	1251.4	PASS	AF=0.987952;AO=82;DP=83;FAO=82;FDP=83;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0263283;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=209.648;QD=60.3084;RBI=0.0269949;REFB=-0.158054;REVB=-0.00596225;RO=1;SAF=42;SAR=40;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0111424;STB=0.505881;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.000421308;OID=.;OPOS=1499899;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:83:83:1:1:82:82:0.987952:40:42:1:0:40:42:1:0
chr2	1499927	.	A	C	1044.39	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.016897;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.631;QD=59.6794;RBI=0.0257512;REFB=0;REVB=0.0194323;RO=0;SAF=37;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.49034e-06;OID=.;OPOS=1499927;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:33:37:0:0:33:37:0:0
chr2	1520676	.	T	C	708.49	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0344452;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.6916;QD=62.977;RBI=0.0519169;REFB=0;REVB=0.0388445;RO=0;SAF=24;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.30465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000615325;OID=.;OPOS=1520676;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:45:0:0:44:45:1:20:24:0:0:20:25:0:0
chr2	1544617	.	G	A	801.32	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0271292;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.601;QD=57.2374;RBI=0.0284899;REFB=0;REVB=0.00869948;RO=0;SAF=30;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.29784e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.97312e-05;OID=.;OPOS=1544617;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:26:30:0:0:26:30:0:0
chr2	1636904	.	C	T	211.89	PASS	AF=0.45098;AO=23;DP=51;FAO=23;FDP=51;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=0.00405208;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.987;QD=16.6185;RBI=0.0162478;REFB=-0.00625813;REVB=0.0157344;RO=28;SAF=7;SAR=16;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202251;STB=0.61528;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=0.00435756;OID=.;OPOS=1636904;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:28:28:23:23:0.45098:16:7:14:14:16:7:14:14
chr2	1647171	.	T	C	972.65	PASS	AF=1;AO=65;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000304051;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.553;QD=58.9482;RBI=0.00737794;REFB=0;REVB=0.00737167;RO=0;SAF=40;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.41518e-06;OID=.;OPOS=1647171;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:65:66:1:25:40:0:0:25:41:0:0
chr2	1652459	.	G	A	72.01	PASS	AF=0.285714;AO=10;DP=35;FAO=10;FDP=35;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=-0.0418714;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.402;QD=8.22986;RBI=0.0534539;REFB=-0.00604151;REVB=-0.0332281;RO=24;SAF=6;SAR=4;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115678;STB=0.586034;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.0295523;OID=.;OPOS=1652459;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:35:35:24:25:10:10:0.285714:4:6:12:12:4:6:12:13
chr2	1652822	.	T	G	1605.76	PASS	AF=1;AO=104;DP=106;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0171467;FXX=0.0092584;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.945;QD=60.0283;RBI=0.020813;REFB=0;REVB=0.0117972;RO=0;SAF=55;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.13234e-05;OID=.;OPOS=1652822;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:106:107:0:0:104:107:1:49:55:0:0:50:57:0:0
chr2	1652891	.	G	A	512.32	PASS	AF=0.514851;AO=52;DP=101;FAO=52;FDP=101;FR=.;FRO=49;FSAF=28;FSAR=24;FSRF=26;FSRR=23;FWDB=-0.0117612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.835;QD=20.29;RBI=0.0357274;REFB=-0.032385;REVB=0.0337361;RO=49;SAF=28;SAR=24;SRF=26;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00693593;STB=0.503827;STBP=0.969;TYPE=snp;VARB=0.0307686;OID=.;OPOS=1652891;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:101:49:49:52:52:0.514851:24:28:26:23:24:28:26:23
chr2	1664654	.	A	G	1232.65	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00125075;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.702;QD=61.6323;RBI=0.0422791;REFB=0;REVB=0.0422606;RO=0;SAF=54;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000756501;OID=.;OPOS=1664654;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:79:80:0:0:79:80:1:25:54:0:0:26:54:0:0
chr2	1842968	.	T	C	1306.89	PASS	AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00410919;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.799;QD=62.233;RBI=0.0368219;REFB=0;REVB=0.0365919;RO=0;SAF=28;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.16228e-05;OID=.;OPOS=1842968;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:56:28:0:0:56:28:0:0
chr2	1893133	.	C	T	1044.36	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0172538;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.624;QD=59.6777;RBI=0.0557506;REFB=0;REVB=0.0530135;RO=0;SAF=41;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.23815e-05;OID=.;OPOS=1893133;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:29:41:0:0:29:41:0:0
chr2	1926436	.	C	CT	483.16	PASS	AF=1;AO=5;DP=36;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0743569;FXX=0.0277701;HRUN=0;LEN=1;MLLD=224.127;QD=55.2178;RBI=0.0756296;REFB=0;REVB=0.0138162;RO=31;SAF=1;SAR=4;SRF=11;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.216665;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000198234;OID=.;OPOS=1926437;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:5:36:35:35:0:11:24:0:0:4:31:1:4:11:20
chr2	1926437	.	G	T	409.48	PASS	AF=0.861111;AO=30;DP=36;FAO=31;FDP=36;FR=.;FRO=5;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=-0.000316514;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=229.123;QD=45.4975;RBI=0.0092893;REFB=-0.0867043;REVB=0.00928391;RO=5;SAF=10;SAR=20;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0403345;STB=0.523794;STBP=0.568;TYPE=snp;VARB=0.00179153;OID=.;OPOS=1926437;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:26:36:36:5:5:30:31:0.861111:20:10:1:4:20:11:1:4
chr2	1946914	.	A	G	465.14	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00088063;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.584;QD=58.1421;RBI=0.0272122;REFB=0;REVB=0.0271979;RO=0;SAF=15;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00017308;OID=.;OPOS=1946914;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:17:15:0:0:17:15:0:0
chr2	3605468	.	A	G	598.25	PASS	AF=1;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0450767;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.157;QD=61.3594;RBI=0.0464953;REFB=0;REVB=-0.0113975;RO=0;SAF=19;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.3303e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000132013;OID=.;OPOS=3605468;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:39:0:0:39:39:1:20:19:0:0:20:19:0:0
chr2	3652616	.	G	C	2035.49	PASS	AF=1;AO=128;DP=129;FAO=132;FDP=132;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0102654;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.996;QD=61.6816;RBI=0.0361097;REFB=-0.0481454;REVB=0.0346198;RO=1;SAF=64;SAR=64;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00736761;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00045669;OID=.;OPOS=3652616;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:129:132:1:0:128:132:1:64:64:0:1:68:64:0:0
chr2	3653844	.	T	C	727.76	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0173356;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.093;QD=63.2836;RBI=0.0255116;REFB=0;REVB=0.0187168;RO=0;SAF=15;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000107182;OID=.;OPOS=3653844;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:46:0:0:45:46:1:30:15:0:0:31:15:0:0
chr2	3800383	.	C	T	1453.34	PASS	AF=1;AO=92;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142407;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.5531;QD=63.1887;RBI=0.0288523;REFB=0;REVB=-0.025093;RO=0;SAF=45;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.9386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.95847e-05;OID=.;OPOS=3800383;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:92:92:0:0:92:92:1:47:45:0:0:47:45:0:0
chr2	3826387	.	T	C	379.54	PASS	AF=1;AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0204245;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.4444;QD=56.2283;RBI=0.0614858;REFB=0;REVB=0.0579943;RO=0;SAF=14;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00178938;OID=.;OPOS=3826387;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:27:0:0:27:27:1:13:14:0:0:13:14:0:0
chr2	4874702	.	C	A	69.26	PASS	AF=0.375;AO=6;DP=19;FAO=9;FDP=24;FR=.,HEALED;FRO=15;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=0.0226753;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.683;QD=11.5434;RBI=0.0853976;REFB=-0.0130803;REVB=0.0823321;RO=6;SAF=2;SAR=4;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.275357;STB=0.77716;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.0474564;OID=.;OPOS=4874702;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:19:24:6:15:6:9:0.375:4:2:4:2:7:2:10:5
chr2	7018021	.	G	A	325.83	PASS	AF=0.603774;AO=32;DP=53;FAO=32;FDP=53;FR=.;FRO=21;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.0171864;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.745;QD=24.5908;RBI=0.0828209;REFB=-0.0120946;REVB=0.0810181;RO=21;SAF=21;SAR=11;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170657;STB=0.594036;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=0.0073188;OID=.;OPOS=7018021;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:21:21:32:32:0.603774:11:21:9:12:11:21:9:12
chr2	7137067	.	A	G	1822.91	PASS	AF=0.991736;AO=119;DP=121;FAO=120;FDP=121;FR=.;FRO=1;FSAF=61;FSAR=59;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0139128;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.835;QD=60.2613;RBI=0.0139439;REFB=-0.0830412;REVB=-0.000931587;RO=0;SAF=60;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504064;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=1.65384e-05;OID=.;OPOS=7137067;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:121:121:0:1:119:120:0.991736:59:60:0:0:59:61:1:0
chr2	7154632	.	T	C	1227.51	PASS	AF=1;AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0137647;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.217;QD=61.3754;RBI=0.0206818;REFB=0;REVB=0.015436;RO=0;SAF=24;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.87206e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.93871e-05;OID=.;OPOS=7154632;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:80:80:0:0:80:80:1:56:24:0:0:56:24:0:0
chr2	7164578	.	A	G	217.73	PASS	AF=0.435484;AO=26;DP=62;FAO=27;FDP=62;FR=.,HEALED;FRO=35;FSAF=19;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=0.0106837;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=39.7155;QD=14.0467;RBI=0.191687;REFB=-0.0549292;REVB=-0.191389;RO=27;SAF=19;SAR=7;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181629;STB=0.661568;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.0640705;OID=.;OPOS=7164578;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:27:35:26:27:0.435484:7:19:15:12:8:19:15:20
chr2	7181560	.	G	A	321.95	PASS	AF=0.448718;AO=35;DP=79;FAO=35;FDP=78;FR=.;FRO=43;FSAF=11;FSAR=24;FSRF=24;FSRR=19;FWDB=-0.088351;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.5374;QD=16.5101;RBI=0.0885064;REFB=-0.0257198;REVB=0.00524295;RO=43;SAF=11;SAR=24;SRF=24;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.247808;STB=0.639674;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.0289525;OID=.;OPOS=7181560;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:78:43:43:35:35:0.448718:24:11:24:19:24:11:24:19
chr2	7208422	.	T	C	834.37	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00315168;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.734;QD=57.5425;RBI=0.0298241;REFB=0;REVB=0.0296572;RO=0;SAF=23;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.67068e-05;OID=.;OPOS=7208422;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:35:23:0:0:35:23:0:0
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chr2	8822319	.	G	A	182.99	PASS	AF=0.452381;AO=19;DP=42;FAO=19;FDP=42;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.00752262;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.76;QD=17.4273;RBI=0.00981541;REFB=-0.0193404;REVB=-0.00630495;RO=23;SAF=11;SAR=8;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0972164;STB=0.555497;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.0195397;OID=.;OPOS=8822319;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:23:23:19:19:0.452381:8:11:11:12:8:11:11:12
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chr2	10045024	.	G	A	1929.79	PASS	AF=1;AO=123;DP=125;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112048;FXX=0.0157468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.429;QD=61.7531;RBI=0.0353455;REFB=0;REVB=0.0335225;RO=0;SAF=55;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.61944e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.76549e-05;OID=.;OPOS=10045024;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:125:125:0:0:123:125:1:68:55:0:0:68:57:0:0
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chr2	10908893	.	A	G	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00800757;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.8387;QD=52.6128;RBI=0.0209291;REFB=0;REVB=-0.0193367;RO=0;SAF=11;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000305581;OID=.;OPOS=10908893;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:11:11:0:0:11:11:0:0
chr2	10928906	.	T	C	35.56	PASS	AF=0.24;AO=6;DP=25;FAO=6;FDP=25;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=-0.0184454;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.826;QD=5.68925;RBI=0.0214493;REFB=0.00733345;REVB=0.010947;RO=19;SAF=4;SAR=2;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.335001;STB=0.717261;STBP=0.243;TYPE=snp;VARB=-0.013187;OID=.;OPOS=10928906;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:25:25:19:19:6:6:0.24:2:4:7:12:2:4:7:12
chr2	10930903	.	T	C	206.1	PASS	AF=0.428571;AO=21;DP=49;FAO=21;FDP=49;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.00387229;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=301.558;QD=16.8248;RBI=0.0156701;REFB=-0.013467;REVB=-0.0151841;RO=28;SAF=12;SAR=9;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0361869;STB=0.52069;STBP=0.823;TYPE=snp;VARB=0.0178934;OID=.;OPOS=10930903;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:28:28:21:21:0.428571:9:12:15:13:9:12:15:13
chr2	10933249	.	C	T	271.24	PASS	AF=0.543478;AO=25;DP=46;FAO=25;FDP=46;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=4;FWDB=0.00579483;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.3614;QD=23.5862;RBI=0.021199;REFB=-0.00309357;REVB=0.0203916;RO=21;SAF=13;SAR=12;SRF=17;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.24195;STB=0.633704;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.00365757;OID=.;OPOS=10933249;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:21:21:25:25:0.543478:12:13:17:4:12:13:17:4
chr2	10942687	.	C	T	393.05	PASS	AF=0.5;AO=40;DP=80;FAO=40;FDP=80;FR=.;FRO=40;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=23;FSRR=17;FWDB=-0.00907141;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.4242;QD=19.6525;RBI=0.0273952;REFB=0.00547401;REVB=-0.0258497;RO=40;SAF=18;SAR=22;SRF=23;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112254;STB=0.562313;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=-0.00956224;OID=.;OPOS=10942687;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:40:40:40:40:0.5:22:18:23:17:22:18:23:17
chr2	11053020	.	A	G	766.44	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00206232;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.757;QD=63.8701;RBI=0.0253278;REFB=0;REVB=-0.0252437;RO=0;SAF=32;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000146655;OID=.;OPOS=11053020;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:16:32:0:0:16:32:0:0
chr2	11264830	.	G	A	1509.14	PASS	AF=0.97;AO=97;DP=100;FAO=97;FDP=100;FR=.;FRO=3;FSAF=48;FSAR=49;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.026837;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.6313;QD=60.3655;RBI=0.0268966;REFB=-0.10235;REVB=0.00178954;RO=1;SAF=48;SAR=49;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00958098;STB=0.505154;STBP=0.601;TYPE=snp;VARB=0.00983489;OID=.;OPOS=11264830;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:100:100:1:3:97:97:0.97:49:48:0:1:49:48:2:1
chr2	11680759	.	A	G	195.66	PASS	AF=0.425532;AO=20;DP=46;FAO=20;FDP=47;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=-0.0128072;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=87.5182;QD=16.6521;RBI=0.0312375;REFB=-0.0226877;REVB=-0.0284913;RO=26;SAF=13;SAR=7;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190708;STB=0.599898;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=0.0260793;OID=.;OPOS=11680759;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:47:26:27:20:20:0.425532:7:13:12:14:7:13:13:14
chr2	11702661	.	A	C	550.62	PASS	AF=0.402685;AO=61;DP=148;FAO=60;FDP=149;FR=.;FRO=89;FSAF=31;FSAR=29;FSRF=35;FSRR=54;FWDB=-0.019483;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.2624;QD=14.7817;RBI=0.0414946;REFB=0.00208566;REVB=-0.0366363;RO=85;SAF=32;SAR=29;SRF=34;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128864;STB=0.57341;STBP=0.165;TYPE=snp;VARB=-0.00298942;OID=.;OPOS=11702661;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:148:149:85:89:61:60:0.402685:29:32:34:51:29:31:35:54
chr2	11725049	.	T	C	256.61	PASS	AF=0.533333;AO=25;DP=45;FAO=24;FDP=45;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=16;FWDB=0.0307669;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.7781;QD=22.8096;RBI=0.0323534;REFB=-0.0282831;REVB=-0.0100071;RO=20;SAF=13;SAR=12;SRF=5;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214852;STB=0.639235;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.0439462;OID=.;OPOS=11725049;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:20:21:25:24:0.533333:12:13:5:15:11:13:5:16
chr2	11727507	.	G	A	343.98	PASS	AF=0.440476;AO=37;DP=84;FAO=37;FDP=84;FR=.;FRO=47;FSAF=25;FSAR=12;FSRF=31;FSRR=16;FWDB=-0.00368701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.7918;QD=16.3802;RBI=0.0039246;REFB=-0.0228405;REVB=0.0013448;RO=46;SAF=25;SAR=12;SRF=31;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0019816;STB=0.510199;STBP=0.888;TYPE=snp;VARB=0.0229538;OID=.;OPOS=11727507;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:46:47:37:37:0.440476:12:25:31:15:12:25:31:16
chr2	11738091	.	T	C	754.41	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0299976;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.023;QD=56.9369;RBI=0.0680943;REFB=0;REVB=0.0611308;RO=0;SAF=27;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000387848;OID=.;OPOS=11738091;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:26:27:0:0:26:27:0:0
chr2	11752635	.	T	C	1465.29	PASS	AF=0.99;AO=99;DP=101;FAO=99;FDP=100;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0345685;FXX=0.00990001;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.9565;QD=58.6117;RBI=0.038418;REFB=-0.101772;REVB=0.0167618;RO=0;SAF=44;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504504;STBP=0.496;TYPE=snp;VARB=0.00132235;OID=.;OPOS=11752635;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:101:100:0:1:99:99:0.99:55:44:0:0:55:44:0:1
chr2	11817812	.	G	C	446.71	PASS	AF=0.457944;AO=49;DP=107;FAO=49;FDP=107;FR=.;FRO=58;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=31;FSRR=27;FWDB=-0.0172187;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.7998;QD=16.6993;RBI=0.017625;REFB=-0.0298835;REVB=0.00376253;RO=57;SAF=27;SAR=22;SRF=30;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0240106;STB=0.509038;STBP=0.876;TYPE=snp;VARB=0.0345012;OID=.;OPOS=11817812;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:107:57:58:49:49:0.457944:22:27:30:27:22:27:31:27
chr2	11853913	.	G	A	963.65	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0380967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.0251;QD=58.403;RBI=0.0471882;REFB=0;REVB=-0.0278454;RO=0;SAF=30;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000631961;OID=.;OPOS=11853913;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:66:0:0:64:66:1:34:30:0:0:34:32:0:0
chr2	11965541	.	A	G	408.09	PASS	AF=0.412281;AO=47;DP=114;FAO=47;FDP=114;FR=.;FRO=67;FSAF=23;FSAR=24;FSRF=28;FSRR=39;FWDB=0.00120712;FXX=0.0086949;HRUN=3;LEN=1;MLLD=108.273;QD=14.319;RBI=0.00961932;REFB=-0.00455029;REVB=-0.00954328;RO=56;SAF=23;SAR=24;SRF=24;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.05933;STB=0.54207;STBP=0.493;TYPE=snp;VARB=0.00593143;OID=.;OPOS=11965541;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:114:114:56:67:47:47:0.412281:24:23:24:32:24:23:28:39
chr2	12864766	.	C	T	442.74	PASS	AF=0.551282;AO=43;DP=78;FAO=43;FDP=78;FR=.;FRO=35;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=-0.0226789;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=260.86;QD=22.7046;RBI=0.025142;REFB=-0.030487;REVB=-0.010853;RO=35;SAF=25;SAR=18;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0320623;STB=0.517653;STBP=0.747;TYPE=snp;VARB=0.0254533;OID=.;OPOS=12864766;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:35:35:43:43:0.551282:18:25:19:16:18:25:19:16
chr2	12877501	.	G	GA	456.09	PASS	AF=0.46729;AO=47;DP=110;FAO=50;FDP=107;FR=.;FRO=57;FSAF=23;FSAR=27;FSRF=28;FSRR=29;FWDB=0.00584815;FXX=0.0183469;HRUN=0;LEN=1;MLLD=88.7772;QD=17.05;RBI=0.00702584;REFB=-0.00347447;REVB=0.00389377;RO=58;SAF=21;SAR=26;SRF=30;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0697426;STB=0.516691;STBP=0.746;TYPE=ins;VARB=0.00328005;OID=.;OPOS=12877502;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.46729:47:110:50:107:57:23:27:28:29:99:58:21:26:30:28
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chr2	14779829	.	A	G	260.29	PASS	AF=0.509091;AO=27;DP=54;FAO=28;FDP=55;FR=.;FRO=27;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=22;FSRR=5;FWDB=0.0156041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.808;QD=18.9304;RBI=0.0189801;REFB=-0.00864501;REVB=-0.0108054;RO=27;SAF=18;SAR=9;SRF=22;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158942;STB=0.581049;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=0.00703013;OID=.;OPOS=14779829;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:55:27:27:27:28:0.509091:9:18:22:5:9:19:22:5
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chr2	14780131	.	A	G	187.68	PASS	AF=0.389831;AO=23;DP=59;FAO=23;FDP=59;FR=.;FRO=36;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=24;FWDB=0.0208579;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.79;QD=12.724;RBI=0.0245048;REFB=-0.00650439;REVB=-0.0128622;RO=36;SAF=12;SAR=11;SRF=12;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199184;STB=0.61394;STBP=0.185;TYPE=snp;VARB=0.0137011;OID=.;OPOS=14780131;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:36:36:23:23:0.389831:11:12:12:24:11:12:12:24
chr2	15372562	.	C	T	180.48	PASS	AF=0.422222;AO=19;DP=45;FAO=19;FDP=45;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.00406003;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.455;QD=16.0426;RBI=0.0109409;REFB=0.00543509;REVB=0.0101597;RO=26;SAF=9;SAR=10;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0264839;STB=0.515206;STBP=0.834;TYPE=snp;VARB=-0.00558536;OID=.;OPOS=15372562;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:26:26:19:19:0.422222:10:9:13:13:10:9:13:13
chr2	15378808	.	C	G	209.29	PASS	AF=0.409836;AO=25;DP=61;FAO=25;FDP=61;FR=.;FRO=36;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=14;FWDB=0.000872737;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.0016;QD=13.7243;RBI=0.00524687;REFB=-0.00660603;REVB=0.00517378;RO=36;SAF=13;SAR=12;SRF=22;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0948336;STB=0.554047;STBP=0.493;TYPE=snp;VARB=0.0098016;OID=.;OPOS=15378808;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:36:36:25:25:0.409836:12:13:22:14:12:13:22:14
chr2	15542352	.	C	T	264.48	PASS	AF=0.428571;AO=28;DP=70;FAO=30;FDP=70;FR=.;FRO=40;FSAF=21;FSAR=9;FSRF=20;FSRR=20;FWDB=-0.0119282;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.583;QD=15.113;RBI=0.0138109;REFB=0.00374803;REVB=-0.00696131;RO=41;SAF=19;SAR=9;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183033;STB=0.622614;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=-0.00429629;OID=.;OPOS=15542352;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:41:40:28:30:0.428571:9:19:21:20:9:21:20:20
chr2	15735648	.	T	C	637.29	PASS	AF=0.57;AO=57;DP=100;FAO=57;FDP=100;FR=.;FRO=43;FSAF=19;FSAR=38;FSRF=24;FSRR=19;FWDB=-0.00451645;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=284.907;QD=25.4914;RBI=0.0103792;REFB=-0.0165899;REVB=0.009345;RO=43;SAF=19;SAR=38;SRF=24;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184924;STB=0.601362;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.0115819;OID=.;OPOS=15735648;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:43:43:57:57:0.57:38:19:24:19:38:19:24:19
chr2	15747393	.	C	T	838.14	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0141836;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.499;QD=57.8029;RBI=0.0159577;REFB=0;REVB=-0.00731243;RO=0;SAF=34;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.31293e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000284391;OID=.;OPOS=15747393;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:24:34:0:0:24:34:0:0
chr2	15760388	.	G	A	82.96	PASS	AF=0.168539;AO=15;DP=89;FAO=15;FDP=89;FR=.;FRO=74;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=33;FSRR=41;FWDB=0.00590313;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=294.052;QD=3.72871;RBI=0.00595843;REFB=0.00155332;REVB=-0.000809948;RO=74;SAF=8;SAR=7;SRF=33;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109514;STB=0.572185;STBP=0.587;TYPE=snp;VARB=-0.0076454;OID=.;OPOS=15760388;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:82:89:89:74:74:15:15:0.168539:7:8:33:41:7:8:33:41
chr2	15840522	.	G	T	124.16	PASS	AF=0.3;AO=15;DP=50;FAO=15;FDP=50;FR=.;FRO=35;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=26;FSRR=9;FWDB=0.0115702;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=224.215;QD=9.9325;RBI=0.0217505;REFB=0.00121733;REVB=-0.0184178;RO=35;SAF=7;SAR=8;SRF=26;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.320871;STB=0.689073;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=-0.00269233;OID=.;OPOS=15840522;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:35:35:15:15:0.3:8:7:26:9:8:7:26:9
chr2	15840645	.	T	C	321.69	PASS	AF=0.375;AO=39;DP=104;FAO=39;FDP=104;FR=.;FRO=65;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=39;FSRR=26;FWDB=-0.0190285;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.6598;QD=12.3726;RBI=0.0669431;REFB=0.00561792;REVB=0.0641817;RO=65;SAF=18;SAR=21;SRF=39;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150748;STB=0.58586;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=-0.00853908;OID=.;OPOS=15840645;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:104:65:65:39:39:0.375:21:18:39:26:21:18:39:26
chr2	16090820	.	T	C	68.05	PASS	AF=0.473684;AO=9;DP=19;FAO=9;FDP=19;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=9;FWDB=-0.0537157;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.4328;QD=14.3269;RBI=0.0655352;REFB=-0.0253213;REVB=-0.0375432;RO=10;SAF=5;SAR=4;SRF=1;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.400842;STB=0.729911;STBP=0.136;TYPE=snp;VARB=0.0205343;OID=.;OPOS=16090820;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:19:19:10:10:9:9:0.473684:4:5:1:9:4:5:1:9
chr2	17304295	.	A	G	1122.33	PASS	AF=1;AO=74;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0698402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.2875;QD=59.0698;RBI=0.0702223;REFB=0;REVB=-0.00731503;RO=2;SAF=32;SAR=42;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0286479;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000603656;OID=.;OPOS=17304295;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:2:0:74:76:1:42:32:2:0:42:34:0:0
chr2	17696573	.	C	T	3167.65	PASS	AF=1;AO=204;DP=204;FAO=205;FDP=205;FR=.;FRO=0;FSAF=97;FSAR=108;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00812829;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.996;QD=61.8078;RBI=0.0140144;REFB=0;REVB=-0.0114164;RO=0;SAF=97;SAR=107;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.07916e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.22677e-06;OID=.;OPOS=17696573;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:17:204:205:0:0:204:205:1:107:97:0:0:108:97:0:0
chr2	17698678	.	A	G	2071.45	PASS	AF=1;AO=132;DP=133;FAO=132;FDP=132;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000568441;FXX=0.0149243;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.644;QD=62.7713;RBI=0.0038294;REFB=0;REVB=-0.00378698;RO=0;SAF=63;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.79384e-06;OID=.;OPOS=17698678;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:133:132:0:0:132:132:1:69:63:0:0:69:63:0:0
chr2	17699668	.	C	T	38.56	PASS	AF=0.428571;AO=6;DP=14;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=-0.0487306;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.497;QD=11.0178;RBI=0.0518379;REFB=-0.0233511;REVB=0.0176775;RO=8;SAF=5;SAR=1;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.264432;STB=0.66603;STBP=0.405;TYPE=snp;VARB=0.0409909;OID=.;OPOS=17699668;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:14:14:8:8:6:6:0.428571:1:5:5:3:1:5:5:3
chr2	17942775	.	T	A	594.16	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0391445;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.8477;QD=60.9393;RBI=0.0395032;REFB=0;REVB=0.00531166;RO=0;SAF=8;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000499133;OID=.;OPOS=17942775;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:31:8:0:0:31:8:0:0
chr2	17954027	.	G	A	1080.32	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0237759;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.1719;QD=60.018;RBI=0.067202;REFB=0;REVB=-0.0628555;RO=0;SAF=33;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00066264;OID=.;OPOS=17954027;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:39:33:0:0:39:33:0:0
chr2	17954421	.	C	G	1510.07	PASS	AF=1;AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0620544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.2337;QD=63.582;RBI=0.0821725;REFB=0;REVB=0.0538663;RO=0;SAF=49;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000504707;OID=.;OPOS=17954421;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:95:0:0:95:95:1:46:49:0:0:46:49:0:0
chr2	17962450	.	A	G	769.75	PASS	AF=0.982143;AO=54;DP=55;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0144504;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.5499;QD=54.9818;RBI=0.0158282;REFB=-0.0115861;REVB=0.00645896;RO=1;SAF=26;SAR=28;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0177809;STB=0.509431;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.00129397;OID=.;OPOS=17962450;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:55:56:1:1:54:55:0.982143:28:26:1:0:29:26:1:0
chr2	17962518	.	C	T	613.36	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00843845;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.202;QD=61.3364;RBI=0.0112563;REFB=0;REVB=-0.00744966;RO=0;SAF=19;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.12212e-06;OID=.;OPOS=17962518;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:21:19:0:0:21:19:0:0
chr2	18112473	.	G	A	1623.46	PASS	AF=1;AO=107;DP=107;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00740631;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.4667;QD=60.128;RBI=0.106702;REFB=0;REVB=0.106444;RO=0;SAF=52;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000611997;OID=.;OPOS=18112473;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:107:108:0:0:107:108:1:55:52:0:0:56:52:0:0
chr2	18113508	.	G	A	851.25	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0175543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.658;QD=57.7121;RBI=0.0203767;REFB=0;REVB=0.0103468;RO=0;SAF=29;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.12025e-05;OID=.;OPOS=18113508;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:30:29:0:0:30:29:0:0
chr2	18113623	.	A	G	562.76	PASS	AF=1;AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00811616;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.622;QD=60.8384;RBI=0.0259765;REFB=0;REVB=0.024676;RO=0;SAF=15;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.82408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000193597;OID=.;OPOS=18113623;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:37:0:0:37:37:1:22:15:0:0:22:15:0:0
chr2	19551762	.	GTTC	G,GT	347.86	PASS	AF=0.369427,0.0254777;AO=37,22;DP=159;FAO=58,4;FDP=157;FR=.;FRO=95;FSAF=35,1;FSAR=23,3;FSRF=47;FSRR=48;FWDB=-0.00217988,-0.00263469;FXX=0.0187488;HRUN=2,2;LEN=3,2;MLLD=270.944,272.79;QD=8.86269;RBI=0.0143722,0.00768633;REFB=0.000608672,0.00133272;REVB=0.0142059,0.00722067;RO=80;SAF=24,11;SAR=13,11;SRF=41;SRR=39;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.164672,-0.015717;STB=0.568496,0.737257;STBP=0.207,0.402;TYPE=del,del;VARB=-0.00570303,0.0136789;OID=.,.;OPOS=19551763,19551764;OREF=TTC,TC;OALT=-,-;OMAPALT=G,GT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.369427,0.0254777:37,22:159:58,4:157:95:35,1:23,3:47:48:99:80:24,11:13,11:41:39
chr2	20101487	.	G	A	439.23	PASS	AF=0.573333;AO=42;DP=74;FAO=43;FDP=75;FR=.;FRO=32;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=0.0118832;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.717;QD=23.4256;RBI=0.012186;REFB=-0.0154112;REVB=-0.00269989;RO=32;SAF=22;SAR=20;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0305651;STB=0.511855;STBP=0.826;TYPE=snp;VARB=0.011345;OID=.;OPOS=20101487;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:75:32:32:42:43:0.573333:20:22:18:14:20:23:18:14
chr2	20135283	.	T	C	441.39	PASS	AF=0.462264;AO=48;DP=105;FAO=49;FDP=106;FR=.;FRO=57;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=34;FSRR=23;FWDB=-0.0233128;FXX=0.00934492;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.3881;QD=16.656;RBI=0.0260637;REFB=-0.00458339;REVB=-0.0116545;RO=57;SAF=23;SAR=25;SRF=34;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113827;STB=0.568006;STBP=0.191;TYPE=snp;VARB=0.00584302;OID=.;OPOS=20135283;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:106:57:57:48:49:0.462264:25:23:34:23:26:23:34:23
chr2	20205680	.	C	T	453.68	PASS	AF=0.597222;AO=43;DP=72;FAO=43;FDP=72;FR=.;FRO=29;FSAF=27;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=0.0514738;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.8317;QD=25.2044;RBI=0.0533297;REFB=-0.00758234;REVB=0.0139466;RO=29;SAF=27;SAR=16;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0589225;STB=0.532276;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.0102376;OID=.;OPOS=20205680;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:29:29:43:43:0.597222:16:27:16:13:16:27:16:13
chr2	20205848	.	G	A	113.84	PASS	AF=0.5;AO=13;DP=26;FAO=13;FDP=26;FR=.;FRO=13;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=0.0344252;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.796;QD=17.5131;RBI=0.0346559;REFB=-0.0149692;REVB=-0.00399212;RO=13;SAF=2;SAR=11;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20961;STB=0.622427;STBP=0.359;TYPE=snp;VARB=0.0123057;OID=.;OPOS=20205848;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:26:13:13:13:13:0.5:11:2:4:9:11:2:4:9
chr2	20206000	.	A	G	116.36	PASS	AF=0.325581;AO=14;DP=44;FAO=14;FDP=43;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=0.0120934;FXX=0.0227221;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.008;QD=10.8237;RBI=0.0178247;REFB=0.00722516;REVB=-0.0130946;RO=29;SAF=8;SAR=6;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214125;STB=0.627274;STBP=0.237;TYPE=snp;VARB=-0.0133193;OID=.;OPOS=20206000;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:43:29:29:14:14:0.325581:6:8:11:18:6:8:11:18
chr2	20240668	.	C	A	304.5	PASS	AF=0.409639;AO=33;DP=82;FAO=34;FDP=83;FR=.;FRO=49;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=26;FSRR=23;FWDB=-0.0011987;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.7321;QD=14.6748;RBI=0.0344351;REFB=-0.0128275;REVB=-0.0344142;RO=49;SAF=17;SAR=16;SRF=27;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0377857;STB=0.518062;STBP=0.807;TYPE=snp;VARB=0.0171429;OID=.;OPOS=20240668;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:83:49:49:33:34:0.409639:16:17:27:22:17:17:26:23
chr2	20402876	.	G	T	358.25	PASS	AF=0.486842;AO=37;DP=79;FAO=37;FDP=76;FR=.;FRO=39;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=24;FSRR=15;FWDB=-0.0294344;FXX=0.0379699;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.1772;QD=18.8551;RBI=0.031525;REFB=0.00537942;REVB=0.0112892;RO=36;SAF=16;SAR=21;SRF=22;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157794;STB=0.59317;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=-0.00714908;OID=.;OPOS=20402876;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:76:36:39:37:37:0.486842:21:16:22:14:21:16:24:15
chr2	20403794	.	A	T	978.85	PASS	AF=1;AO=47;DP=67;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00748494;FXX=0.0294074;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.5955;QD=59.3241;RBI=0.0272663;REFB=0;REVB=0.0262189;RO=0;SAF=42;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000213376;OID=.;OPOS=20403794;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:66:0:0:47:66:1:5:42:0:0:22:44:0:0
chr2	20453591	.	T	C	416.18	PASS	AF=0.539474;AO=41;DP=77;FAO=41;FDP=76;FR=.;FRO=35;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=23;FSRR=12;FWDB=0.0285645;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.5633;QD=21.9045;RBI=0.0315951;REFB=0.0149928;REVB=0.0135026;RO=35;SAF=23;SAR=18;SRF=23;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.082498;STB=0.545433;STBP=0.419;TYPE=snp;VARB=-0.0187262;OID=.;OPOS=20453591;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:76:35:35:41:41:0.539474:18:23:23:12:18:23:23:12
chr2	20601461	.	C	T	176.28	PASS	AF=0.529412;AO=18;DP=34;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=13;FWDB=-0.0391605;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=310.252;QD=20.7383;RBI=0.0394395;REFB=-0.0138665;REVB=-0.00468322;RO=16;SAF=9;SAR=9;SRF=3;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.263017;STB=0.646909;STBP=0.087;TYPE=snp;VARB=0.0163364;OID=.;OPOS=20601461;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:16:16:18:18:0.529412:9:9:3:13:9:9:3:13
chr2	20648211	.	G	T	306.06	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0211571;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.317;QD=53.2274;RBI=0.0223001;REFB=0;REVB=0.00704783;RO=0;SAF=11;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000179513;OID=.;OPOS=20648211;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:12:11:0:0:12:11:0:0
chr2	20680665	.	C	A	330.49	PASS	AF=0.961538;AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0230339;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=288.122;QD=50.8448;RBI=0.031756;REFB=-0.0805323;REVB=0.0218605;RO=1;SAF=17;SAR=8;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.054487;STB=0.529388;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=0.000422614;OID=.;OPOS=20680665;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:26:26:1:1:25:25:0.961538:8:17:0:1:8:17:0:1
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chr2	20818454	.	T	A	572.95	PASS	AF=0.95122;AO=39;DP=41;FAO=39;FDP=41;FR=.;FRO=2;FSAF=26;FSAR=13;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0119966;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=228.331;QD=55.8972;RBI=0.0270131;REFB=0.00970836;REVB=0.0242031;RO=2;SAF=26;SAR=13;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0347063;STB=0.518509;STBP=0.396;TYPE=snp;VARB=-0.000361505;OID=.;OPOS=20818454;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:41:41:2:2:39:39:0.95122:13:26:2:0:13:26:2:0
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chr2	20823724	.	T	C	305.46	PASS	AF=1;AO=20;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0105353;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.814;QD=53.1238;RBI=0.0325901;REFB=0;REVB=0.0308403;RO=0;SAF=7;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00315709;OID=.;OPOS=20823724;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:20:23:1:13:7:0:0:15:8:0:0
chr2	20824559	.	C	T	505.16	PASS	AF=0.527473;AO=42;DP=92;FAO=48;FDP=91;FR=.,HEALED;FRO=41;FSAF=28;FSAR=20;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=-0.0713769;FXX=0.0108684;HRUN=4;LEN=1;MLLD=36.3101;QD=22.2047;RBI=0.089783;REFB=-0.0516806;REVB=-0.054464;RO=34;SAF=23;SAR=19;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110113;STB=0.555742;STBP=0.262;TYPE=snp;VARB=0.0362889;OID=.;OPOS=20824559;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:91:34:41:42:48:0.527473:19:23:14:20:20:28:19:22
chr2	20838318	.	G	A	239.74	PASS	AF=0.352941;AO=29;DP=84;FAO=30;FDP=85;FR=.;FRO=55;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=25;FSRR=30;FWDB=0.00574738;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.273;QD=11.2819;RBI=0.0058588;REFB=-0.00184106;REVB=0.00113721;RO=48;SAF=18;SAR=11;SRF=24;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133709;STB=0.616707;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=0.004178;OID=.;OPOS=20838318;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:85:48:55:29:30:0.352941:11:18:24:24:11:19:25:30
chr2	21231524	.	G	A	725.44	PASS	AF=0.981132;AO=52;DP=54;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00545271;FXX=0.0185151;HRUN=2;LEN=1;MLLD=257.194;QD=54.7505;RBI=0.0195427;REFB=-0.0710257;REVB=0.0187666;RO=1;SAF=21;SAR=31;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0149535;STB=0.507933;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.000352062;OID=.;OPOS=21231524;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:54:53:1:1:52:52:0.981132:31:21:0:1:31:21:0:1
chr2	21232803	.	T	C	446.85	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0299327;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.762;QD=57.6579;RBI=0.0333344;REFB=0;REVB=0.0146701;RO=0;SAF=16;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000310387;OID=.;OPOS=21232803;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:15:16:0:0:15:16:0:0
chr2	21235475	.	T	C	2255.03	PASS	AF=1;AO=142;DP=142;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0238997;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.358;QD=63.5219;RBI=0.0446967;REFB=0;REVB=0.0377703;RO=0;SAF=65;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.2093e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.61763e-05;OID=.;OPOS=21235475;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:142:142:0:0:142:142:1:77:65:0:0:77:65:0:0
chr2	21250914	.	G	A	255.69	PASS	AF=0.491228;AO=28;DP=57;FAO=28;FDP=57;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=-0.0308806;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.792;QD=17.9428;RBI=0.0318169;REFB=-0.0218687;REVB=-0.00766188;RO=29;SAF=11;SAR=17;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0129314;STB=0.507241;STBP=0.921;TYPE=snp;VARB=0.0129221;OID=.;OPOS=21250914;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:29:29:28:28:0.491228:17:11:11:18:17:11:11:18
chr2	21360583	.	A	G	173.08	PASS	AF=0.486486;AO=18;DP=37;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.0127938;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.313;QD=18.7112;RBI=0.0131993;REFB=-0.00141485;REVB=0.00324683;RO=19;SAF=13;SAR=5;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.243516;STB=0.639181;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=0.00134255;OID=.;OPOS=21360583;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:19:19:18:18:0.486486:5:13:9:10:5:13:9:10
chr2	21366324	.	G	C	144.67	PASS	AF=0.432432;AO=15;DP=37;FAO=16;FDP=37;FR=.;FRO=21;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.0051057;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.7919;QD=15.6403;RBI=0.0496098;REFB=-0.00774417;REVB=0.0493463;RO=21;SAF=3;SAR=12;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.370286;STB=0.724787;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.0137;OID=.;OPOS=21366324;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:21:21:15:16:0.432432:12:3:11:10:13:3:11:10
chr2	23865260	.	T	C	3114.49	PASS	AF=0.990291;AO=204;DP=206;FAO=204;FDP=206;FR=.;FRO=2;FSAF=107;FSAR=97;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0298158;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.006;QD=60.4755;RBI=0.0333231;REFB=0.0333534;REVB=0.014881;RO=0;SAF=107;SAR=97;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.07916e-08;STB=0.505102;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=-0.000208905;OID=.;OPOS=23865260;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:206:206:0:2:204:204:0.990291:97:107:0:0:97:107:0:2
chr2	23865358	.	TGGGG	TGGG,TGGGC	611.59	PASS	AF=1,0;AO=36,5;DP=62;FAO=60,0;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=2,0;FSAR=58,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.083198,0.357379;FXX=0.0322529;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=15.3928,7.62062;QD=40.773;RBI=0.1526,0.357422;REFB=-0.0206554,-0.0451307;REVB=0.127925,-0.00554475;RO=14;SAF=0,0;SAR=36,5;SRF=0;SRR=14;SSEN=0.611111,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0084161,-0.0997837;OID=.,.;OPOS=23865359,23865362;OREF=G,G;OALT=-,C;OMAPALT=TGGG,TGGGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1,0:36,5:62:60,0:60:0:2,0:58,0:0:0:3:14:0,0:36,5:0:14
chr2	23865908	.	G	C	135.75	PASS	AF=0.7;AO=14;DP=20;FAO=14;FDP=20;FR=.;FRO=6;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.00594863;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.4373;QD=27.1497;RBI=0.0389375;REFB=-0.0220946;REVB=-0.0384804;RO=6;SAF=9;SAR=5;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170491;STB=0.595449;STBP=0.19;TYPE=snp;VARB=0.0175603;OID=.;OPOS=23865908;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:20:20:6:6:14:14:0.7:5:9:2:4:5:9:2:4
chr2	23926659	.	T	C	140.11	PASS	AF=0.363636;AO=16;DP=44;FAO=16;FDP=44;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=9;FWDB=-0.025827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.1897;QD=12.7371;RBI=0.0410719;REFB=-0.00732719;REVB=-0.0319354;RO=28;SAF=6;SAR=10;SRF=19;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.320514;STB=0.686592;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=0.00981146;OID=.;OPOS=23926659;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:28:28:16:16:0.363636:10:6:19:9:10:6:19:9
chr2	23973799	.	T	C	354.32	PASS	AF=0.545455;AO=36;DP=66;FAO=36;FDP=66;FR=.;FRO=30;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=0.00461628;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.319;QD=21.4742;RBI=0.00983433;REFB=-0.00729319;REVB=0.00868355;RO=30;SAF=17;SAR=19;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0598298;STB=0.533033;STBP=0.6;TYPE=snp;VARB=0.00615324;OID=.;OPOS=23973799;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:30:30:36:36:0.545455:19:17:12:18:19:17:12:18
chr2	24055058	.	G	C	429.0	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0399495;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.283;QD=57.2006;RBI=0.0487809;REFB=0;REVB=-0.0279931;RO=0;SAF=21;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000178372;OID=.;OPOS=24055058;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:9:21:0:0:9:21:0:0
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chr2	24262060	.	G	A	179.02	PASS	AF=0.385965;AO=22;DP=57;FAO=22;FDP=57;FR=.;FRO=35;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=22;FSRR=13;FWDB=-0.0273124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.74;QD=12.5627;RBI=0.06767;REFB=0.00131119;REVB=-0.0619133;RO=35;SAF=16;SAR=6;SRF=22;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122992;STB=0.571361;STBP=0.471;TYPE=snp;VARB=-0.00360218;OID=.;OPOS=24262060;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:35:35:22:22:0.385965:6:16:22:13:6:16:22:13
chr2	24300563	.	T	C	455.04	PASS	AF=0.454545;AO=50;DP=110;FAO=50;FDP=110;FR=.;FRO=60;FSAF=19;FSAR=31;FSRF=24;FSRR=36;FWDB=0.00446831;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.639;QD=16.5468;RBI=0.00609486;REFB=-0.00200894;REVB=0.00414505;RO=60;SAF=19;SAR=31;SRF=24;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.020615;STB=0.511507;STBP=0.841;TYPE=snp;VARB=0.00253528;OID=.;OPOS=24300563;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:110:60:60:50:50:0.454545:31:19:24:36:31:19:24:36
chr2	24338428	.	T	G	56.78	PASS	AF=0.421053;AO=8;DP=19;FAO=8;FDP=19;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=0.00471114;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.5491;QD=11.9534;RBI=0.00539667;REFB=0.00442609;REVB=0.00263234;RO=11;SAF=5;SAR=3;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.32983;STB=0.695742;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=-0.00467055;OID=.;OPOS=24338428;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:19:19:11:11:8:8:0.421053:3:5:3:8:3:5:3:8
chr2	24342505	.	T	C	405.42	PASS	AF=0.609375;AO=39;DP=64;FAO=39;FDP=64;FR=.;FRO=25;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=0.00673603;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.574;QD=25.339;RBI=0.00678045;REFB=-0.0109383;REVB=0.000774894;RO=25;SAF=17;SAR=22;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00297406;STB=0.501628;STBP=0.982;TYPE=snp;VARB=0.00652664;OID=.;OPOS=24342505;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:25:25:39:39:0.609375:22:17:11:14:22:17:11:14
chr2	24342532	.	G	A	349.22	PASS	AF=0.618182;AO=34;DP=55;FAO=34;FDP=55;FR=.;FRO=21;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.00741637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.724;QD=25.3976;RBI=0.00943679;REFB=-0.00540765;REVB=0.00583528;RO=21;SAF=17;SAR=17;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0165737;STB=0.509086;STBP=0.834;TYPE=snp;VARB=0.003471;OID=.;OPOS=24342532;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:21:21:34:34:0.618182:17:17:11:10:17:17:11:10
chr2	24369674	.	C	T	523.79	PASS	AF=1;AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.010437;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.516;QD=59.8621;RBI=0.0221656;REFB=0;REVB=-0.0195546;RO=0;SAF=22;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.39865e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.68827e-05;OID=.;OPOS=24369674;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:35:0:0:35:35:1:13:22:0:0:13:22:0:0
chr2	24384424	.	T	C	517.73	PASS	AF=0.947368;AO=36;DP=38;FAO=36;FDP=38;FR=.;FRO=2;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0712458;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.8263;QD=54.4977;RBI=0.0728251;REFB=-0.0256454;REVB=0.015084;RO=2;SAF=17;SAR=19;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00274091;STB=0.501465;STBP=0.863;TYPE=snp;VARB=0.00323929;OID=.;OPOS=24384424;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:38:38:2:2:36:36:0.947368:19:17:1:1:19:17:1:1
chr2	24387178	.	G	GC	320.03	PASS	AF=1;AO=28;DP=34;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0765507;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=33.2774;QD=45.7181;RBI=0.117378;REFB=0;REVB=0.088981;RO=6;SAF=14;SAR=14;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0543191;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00773573;OID=.;OPOS=24387179;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:28:34:28:28:0:14:14:0:0:6:6:14:14:4:2
chr2	24390517	.	G	A	464.98	PASS	AF=0.422764;AO=52;DP=123;FAO=52;FDP=123;FR=.;FRO=71;FSAF=16;FSAR=36;FSRF=29;FSRR=42;FWDB=-0.0256445;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=163.726;QD=15.1213;RBI=0.0267145;REFB=-0.00903778;REVB=0.0074849;RO=70;SAF=16;SAR=36;SRF=28;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105335;STB=0.564828;STBP=0.255;TYPE=snp;VARB=0.00813229;OID=.;OPOS=24390517;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:123:123:70:71:52:52:0.422764:36:16:28:42:36:16:29:42
chr2	24402127	.	C	CAA	286.42	PASS	AF=1;AO=19;DP=25;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00195472;FXX=0.159936;HRUN=0;LEN=2;MLLD=175.041;QD=54.5555;RBI=0.00422177;REFB=0;REVB=-0.00374198;RO=4;SAF=6;SAR=13;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122407;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-4.87512e-05;OID=.;OPOS=24402128;OREF=-;OALT=AA;OMAPALT=CAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:19:25:21:21:0:7:14:0:0:3:4:6:13:0:4
chr2	24413298	.	A	G	253.6	PASS	AF=0.482759;AO=28;DP=58;FAO=28;FDP=58;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=0.00898407;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.837;QD=17.4898;RBI=0.0157382;REFB=0.00719456;REVB=0.012922;RO=30;SAF=11;SAR=17;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131225;STB=0.573697;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=-0.00628299;OID=.;OPOS=24413298;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:30:30:28:28:0.482759:17:11:16:14:17:11:16:14
chr2	24587571	.	A	G	817.73	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0417758;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.011;QD=57.3848;RBI=0.0424399;REFB=0;REVB=-0.00747835;RO=0;SAF=16;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.92381e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000140781;OID=.;OPOS=24587571;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:41:16:0:0:41:16:0:0
chr2	24899185	.	C	G	489.11	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0113872;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.1231;QD=57.5428;RBI=0.011416;REFB=0;REVB=-0.000809896;RO=0;SAF=14;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.71297e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00704201;OID=.;OPOS=24899185;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:34:0:0:33:34:1:19:14:0:0:19:15:0:0
chr2	24899204	.	A	G	546.17	PASS	AF=1;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00353282;FXX=0.0769034;HRUN=4;LEN=1;MLLD=108.445;QD=60.6854;RBI=0.0242839;REFB=0;REVB=0.0240255;RO=0;SAF=18;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00159461;OID=.;OPOS=24899204;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:37:36:0:0:36:36:1:18:18:0:0:18:18:0:0
chr2	24905927	.	G	C	689.2	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0659541;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.764;QD=62.6546;RBI=0.0664463;REFB=0;REVB=0.00807224;RO=0;SAF=24;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.30465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000428165;OID=.;OPOS=24905927;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:20:24:0:0:20:24:0:0
chr2	24974945	.	T	G	801.26	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0356917;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.629;QD=57.2327;RBI=0.0409301;REFB=0;REVB=0.0200343;RO=0;SAF=15;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000251413;OID=.;OPOS=24974945;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:41:15:0:0:41:15:0:0
chr2	25046090	.	T	C	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0245675;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.626;QD=48.7373;RBI=0.0330396;REFB=0;REVB=-0.0220919;RO=0;SAF=12;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.39136e-05;OID=.;OPOS=25046090;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:5:12:0:0:5:12:0:0
chr2	25047408	.	A	G	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0404534;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.816;QD=52.6133;RBI=0.040682;REFB=0;REVB=0.00430676;RO=0;SAF=11;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000232581;OID=.;OPOS=25047408;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:11:11:0:0:11:11:0:0
chr2	25050977	.	T	C	501.66	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0107453;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=225.605;QD=59.0187;RBI=0.0125856;REFB=0;REVB=0.00655264;RO=0;SAF=26;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.24386e-05;OID=.;OPOS=25050977;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:8:26:0:0:8:26:0:0
chr2	25064193	.	G	A	1483.21	PASS	AF=0.962617;AO=103;DP=107;FAO=103;FDP=107;FR=.;FRO=4;FSAF=51;FSAR=52;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0323173;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=151.091;QD=55.4471;RBI=0.0591401;REFB=0.035023;REVB=0.0495293;RO=3;SAF=51;SAR=52;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0265856;STB=0.509165;STBP=0.397;TYPE=snp;VARB=-0.000255336;OID=.;OPOS=25064193;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:107:107:3:4:103:103:0.962617:52:51:0:3:52:51:1:3
chr2	25194741	.	G	A	2722.88	PASS	AF=0.988764;AO=174;DP=176;FAO=176;FDP=178;FR=.;FRO=2;FSAF=96;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00330973;FXX=0.00558628;HRUN=3;LEN=1;MLLD=166.869;QD=61.1882;RBI=0.0390125;REFB=-0.117225;REVB=0.0388718;RO=2;SAF=95;SAR=79;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0118965;STB=0.506172;STBP=0.161;TYPE=snp;VARB=0.000731137;OID=.;OPOS=25194741;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:176:178:2:2:174:176:0.988764:79:95:0:2:80:96:0:2
chr2	25314186	.	T	C	669.52	PASS	AF=0.943396;AO=50;DP=53;FAO=50;FDP=53;FR=.;FRO=3;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0158308;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.006;QD=50.5294;RBI=0.0817883;REFB=0.0109043;REVB=-0.0802416;RO=3;SAF=27;SAR=23;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0135786;STB=0.507221;STBP=0.728;TYPE=snp;VARB=-0.00117754;OID=.;OPOS=25314186;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:53:53:3:3:50:50:0.943396:23:27:2:1:23:27:2:1
chr2	25359422	.	G	A	122.33	PASS	AF=0.451613;AO=14;DP=31;FAO=14;FDP=31;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=-0.0258594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.4776;QD=15.7843;RBI=0.0336615;REFB=-0.0205296;REVB=0.0215496;RO=17;SAF=8;SAR=6;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133846;STB=0.576818;STBP=0.49;TYPE=snp;VARB=0.00821179;OID=.;OPOS=25359422;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:17:17:14:14:0.451613:6:8:12:5:6:8:12:5
chr2	25377176	.	T	C	432.64	PASS	AF=1;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0179116;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.442;QD=57.6853;RBI=0.0401573;REFB=0;REVB=0.0359414;RO=0;SAF=7;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000324923;OID=.;OPOS=25377176;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:30:0:0:30:30:1:23:7:0:0:23:7:0:0
chr2	25469502	.	C	T	958.67	PASS	AF=0.445415;AO=102;DP=229;FAO=102;FDP=229;FR=.;FRO=127;FSAF=64;FSAR=38;FSRF=69;FSRR=58;FWDB=-0.0198916;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.264;QD=16.7453;RBI=0.0206599;REFB=-0.0171344;REVB=0.00558192;RO=127;SAF=64;SAR=38;SRF=69;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0875491;STB=0.54866;STBP=0.206;TYPE=snp;VARB=0.0193357;OID=.;OPOS=25469502;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:229:229:127:127:102:102:0.445415:38:64:69:58:38:64:69:58
chr2	26149968	.	C	T	582.3	PASS	AF=0.975;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0196833;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.771;QD=58.2304;RBI=0.0430681;REFB=-0.00106046;REVB=-0.038307;RO=0;SAF=30;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.68708e-08;STB=0.526302;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=-0.000174839;OID=.;OPOS=26149968;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:39:40:0:1:39:39:0.975:9:30:0:0:9:30:0:1
chr2	26204640	.	G	A	182.12	PASS	AF=0.44186;AO=19;DP=43;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=0.0311547;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.016;QD=16.9415;RBI=0.0341307;REFB=-0.0230359;REVB=-0.0139388;RO=24;SAF=11;SAR=8;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118016;STB=0.567496;STBP=0.429;TYPE=snp;VARB=0.0273845;OID=.;OPOS=26204640;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:24:24:19:19:0.44186:8:11:11:13:8:11:11:13
chr2	26321526	.	T	C	613.36	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0507719;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.473;QD=61.3361;RBI=0.0541825;REFB=0;REVB=0.0189197;RO=0;SAF=22;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.19993e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.05305e-05;OID=.;OPOS=26321526;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:18:22:0:0:18:22:0:0
chr2	26358110	.	G	C	243.48	PASS	AF=1;AO=19;DP=20;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00560814;FXX=0.049975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.9301;QD=51.2585;RBI=0.0159857;REFB=0;REVB=0.0149697;RO=0;SAF=8;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.41338e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000322099;OID=.;OPOS=26358110;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:19:0:0:19:19:1:11:8:0:0:11:8:0:0
chr2	26399213	.	GG	CA,GA	1485.87	PASS	AF=0.0315789,0.968421;AO=6,79;DP=96;FAO=3,92;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=0,41;FSAR=3,51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00713758,0.023185;FXX=0.0104156;HRUN=4,4;LEN=2,1;MLLD=148.515,222.808;QD=62.5629;RBI=0.0513994,0.0552789;REFB=0,0;REVB=0.0509014,0.0501818;RO=0;SAF=0,41;SAR=6,38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0128757,0.00271416;OID=.,.;OPOS=26399213,26399214;OREF=GG,G;OALT=CA,A;OMAPALT=CA,GA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:6:96:95:0:0:6,79:3,92:0.0315789,0.968421:6,38:0,41:0:0:3,51:0,41:0:0
chr2	26507076	.	A	T	740.42	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00974208;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.429;QD=56.9553;RBI=0.00976482;REFB=0;REVB=-0.000666149;RO=0;SAF=22;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.703e-05;OID=.;OPOS=26507076;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:30:22:0:0:30:22:0:0
chr2	26533989	.	C	G	269.11	PASS	AF=0.648649;AO=24;DP=37;FAO=24;FDP=37;FR=.;FRO=13;FSAF=18;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.000264004;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.258;QD=29.0929;RBI=0.0257511;REFB=-0.0166596;REVB=-0.0257498;RO=13;SAF=18;SAR=6;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214465;STB=0.618941;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.00970124;OID=.;OPOS=26533989;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:13:13:24:24:0.648649:6:18:6:7:6:18:6:7
chr2	26534801	.	G	A	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0206622;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.767;QD=51.1845;RBI=0.0403092;REFB=0;REVB=0.0346108;RO=0;SAF=11;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000293362;OID=.;OPOS=26534801;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:9:11:0:0:9:11:0:0
chr2	26536694	.	C	T	400.42	PASS	AF=0.966667;AO=29;DP=30;FAO=29;FDP=30;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.012941;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.79;QD=53.3887;RBI=0.0131008;REFB=-0.102501;REVB=-0.00204015;RO=1;SAF=19;SAR=10;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0238907;STB=0.512812;STBP=0.624;TYPE=snp;VARB=0.00187292;OID=.;OPOS=26536694;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:30:30:1:1:29:29:0.966667:10:19:1:0:10:19:1:0
chr2	26606154	.	T	C	1443.35	PASS	AF=0.978947;AO=92;DP=95;FAO=93;FDP=95;FR=.;FRO=2;FSAF=44;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0071571;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.811;QD=60.7728;RBI=0.0163448;REFB=-0.123999;REVB=0.0146945;RO=2;SAF=43;SAR=49;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0189544;STB=0.509998;STBP=0.253;TYPE=snp;VARB=0.000435644;OID=.;OPOS=26606154;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:95:95:2:2:92:93:0.978947:49:43:0:2:49:44:0:2
chr2	26607992	.	T	C	1047.76	PASS	AF=0.986111;AO=71;DP=72;FAO=71;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.022739;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=51.3633;QD=58.2091;RBI=0.024922;REFB=-0.0219078;REVB=-0.0102002;RO=1;SAF=32;SAR=39;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0145478;STB=0.50769;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=-0.000131393;OID=.;OPOS=26607992;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:72:72:1:1:71:71:0.986111:39:32:1:0:39:32:1:0
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chr2	26614583	.	T	TA,TAA	464.95	PASS	AF=0.985915,0.0140845;AO=44,20;DP=76;FAO=70,1;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=26,0;FSAR=44,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.244275,-0.130541;FXX=0.013887;HRUN=6,6;LEN=1,2;MLLD=8.58249,8.65526;QD=26.1941;RBI=0.297359,0.156674;REFB=0,0;REVB=-0.169564,-0.0866364;RO=10;SAF=16,8;SAR=28,12;SRF=4;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0134912,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,ins;VARB=-0.0376371,-0.00639666;OID=.,.;OPOS=26614584,26614584;OREF=-,-;OALT=A,AA;OMAPALT=TA,TAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:0.985915,0.0140845:44,20:76:70,1:71:0:26,0:44,1:0:0:3:10:16,8:28,12:4:6
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chr2	26676322	.	A	G	631.12	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0402505;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.8374;QD=61.573;RBI=0.0405634;REFB=0;REVB=-0.00502883;RO=0;SAF=17;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.2194e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000783359;OID=.;OPOS=26676322;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:24:17:0:0:24:17:0:0
chr2	26676395	.	G	T	447.0	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0152093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.118;QD=57.678;RBI=0.0261464;REFB=0;REVB=0.0212676;RO=0;SAF=13;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.33668e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000217986;OID=.;OPOS=26676395;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:18:13:0:0:18:13:0:0
chr2	26693967	.	C	T	536.21	PASS	AF=0.948718;AO=37;DP=39;FAO=37;FDP=39;FR=.;FRO=2;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0430527;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=198.193;QD=54.996;RBI=0.0439536;REFB=-0.07778;REVB=0.00885353;RO=1;SAF=22;SAR=15;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0208135;STB=0.505019;STBP=0.855;TYPE=snp;VARB=0.00314463;OID=.;OPOS=26693967;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:39:39:1:2:37:37:0.948718:15:22:1:0:15:22:1:1
chr2	26699126	.	C	G	2438.57	PASS	AF=1;AO=159;DP=159;FAO=159;FDP=159;FR=.;FRO=0;FSAF=98;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00450219;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.378;QD=61.3477;RBI=0.0927309;REFB=0;REVB=0.0926215;RO=0;SAF=98;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.53011e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000158855;OID=.;OPOS=26699126;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:159:159:0:0:159:159:1:61:98:0:0:61:98:0:0
chr2	26699855	.	G	C	677.53	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143372;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.091;QD=61.5936;RBI=0.0150075;REFB=0;REVB=0.00443504;RO=0;SAF=34;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00136368;OID=.;OPOS=26699855;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:44:0:0:43:44:1:9:34:0:0:9:35:0:0
chr2	26700700	.	G	A	1583.01	PASS	AF=0.972973;AO=108;DP=111;FAO=108;FDP=111;FR=.;FRO=3;FSAF=47;FSAR=61;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.00175783;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=244.826;QD=57.0454;RBI=0.0168381;REFB=-0.0447556;REVB=0.0167461;RO=3;SAF=47;SAR=61;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0120507;STB=0.506352;STBP=0.476;TYPE=snp;VARB=0.000474148;OID=.;OPOS=26700700;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:111:111:3:3:108:108:0.972973:61:47:2:1:61:47:2:1
chr2	26739423	.	T	C	613.33	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0307225;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.658;QD=61.3332;RBI=0.0380295;REFB=0;REVB=-0.0224136;RO=0;SAF=23;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.4817e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.32468e-05;OID=.;OPOS=26739423;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:17:23:0:0:17:23:0:0
chr2	26798893	.	A	T	323.39	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00873147;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.969;QD=53.8977;RBI=0.0188351;REFB=0;REVB=-0.016689;RO=0;SAF=15;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000212995;OID=.;OPOS=26798893;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:9:15:0:0:9:15:0:0
chr2	26799031	.	G	A	101.64	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.02067;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.3275;QD=40.6566;RBI=0.0214553;REFB=0;REVB=-0.00575162;RO=0;SAF=4;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000959535;OID=.;OPOS=26799031;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:10:0:0:9:10:1:5:4:0:0:5:5:0:0
chr2	26804218	.	G	A	2231.59	PASS	AF=0.993377;AO=148;DP=150;FAO=150;FDP=151;FR=.;FRO=1;FSAF=80;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.012216;FXX=0.0194793;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.7435;QD=59.1149;RBI=0.017808;REFB=-0.0496619;REVB=0.0129574;RO=2;SAF=80;SAR=68;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0137812;STB=0.503546;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=0.00181312;OID=.;OPOS=26804218;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:150:151:2:1:148:150:0.993377:68:80:0:2:70:80:0:1
chr2	26804247	.	T	C	610.43	PASS	AF=0.484615;AO=63;DP=130;FAO=63;FDP=130;FR=.;FRO=67;FSAF=34;FSAR=29;FSRF=32;FSRR=35;FWDB=-0.00855885;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.5411;QD=18.7826;RBI=0.0124196;REFB=-0.0270444;REVB=-0.00899958;RO=65;SAF=34;SAR=29;SRF=32;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0436337;STB=0.532019;STBP=0.485;TYPE=snp;VARB=0.0209896;OID=.;OPOS=26804247;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:130:130:65:67:63:63:0.484615:29:34:32:33:29:34:32:35
chr2	26818042	.	A	G	113.11	PASS	AF=0.5;AO=12;DP=25;FAO=13;FDP=26;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.0135502;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.651;QD=17.4015;RBI=0.013737;REFB=-0.0345863;REVB=0.00225784;RO=12;SAF=4;SAR=8;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0302273;OID=.;OPOS=26818042;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:26:12:13:12:13:0.5:8:4:4:8:8:5:5:8
chr2	26951449	.	G	A	294.06	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00434669;FXX=0.0434594;HRUN=4;LEN=1;MLLD=165.472;QD=53.4653;RBI=0.11771;REFB=0;REVB=0.11763;RO=0;SAF=21;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.62339e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00142305;OID=.;OPOS=26951449;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:1:21:0:0:1:21:0:0
chr2	27169842	.	C	A	236.12	PASS	AF=0.481481;AO=26;DP=54;FAO=26;FDP=54;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=0.0984336;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.681;QD=17.49;RBI=0.0984369;REFB=0.024057;REVB=-0.000803512;RO=27;SAF=10;SAR=16;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0564088;STB=0.54274;STBP=0.558;TYPE=snp;VARB=-0.0132588;OID=.;OPOS=27169842;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:27:28:26:26:0.481481:16:10:12:15:16:10:13:15
chr2	27246285	.	C	T	754.43	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0246852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.42;QD=56.9383;RBI=0.0249061;REFB=0;REVB=0.00330956;RO=0;SAF=34;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.97342e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.08399e-05;OID=.;OPOS=27246285;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:19:34:0:0:19:34:0:0
chr2	27260469	.	G	A	105.43	PASS	AF=0.269231;AO=14;DP=52;FAO=14;FDP=52;FR=.;FRO=38;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=26;FWDB=0.000400362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.385;QD=8.11004;RBI=0.0207704;REFB=-0.00365663;REVB=-0.0207666;RO=38;SAF=6;SAR=8;SRF=12;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142034;STB=0.58609;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.00837568;OID=.;OPOS=27260469;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:38:38:14:14:0.269231:8:6:12:26:8:6:12:26
chr2	27261329	.	A	G	464.24	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0066625;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.877;QD=58.0304;RBI=0.0284424;REFB=0;REVB=0.0276511;RO=0;SAF=17;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.63861e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.32971e-05;OID=.;OPOS=27261329;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:32:0:0:30:32:1:13:17:0:0:14:18:0:0
chr2	27290525	.	A	G	254.28	PASS	AF=0.326923;AO=34;DP=105;FAO=34;FDP=104;FR=.;FRO=70;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=37;FSRR=33;FWDB=0.0167528;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.0177;QD=9.77988;RBI=0.0188515;REFB=-0.0154871;REVB=-0.00864427;RO=65;SAF=20;SAR=14;SRF=33;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0925345;STB=0.540827;STBP=0.551;TYPE=snp;VARB=0.0336547;OID=.;OPOS=27290525;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:104:65:70:34:34:0.326923:14:20:33:32:14:20:37:33
chr2	27303755	.	A	G	746.85	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0229599;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.887;QD=63.5617;RBI=0.0335402;REFB=0;REVB=0.0244497;RO=0;SAF=21;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.60133e-05;OID=.;OPOS=27303755;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:26:21:0:0:26:21:0:0
chr2	27305773	.	G	T	100.8	PASS	AF=0.265306;AO=13;DP=49;FAO=13;FDP=49;FR=.;FRO=36;FSAF=1;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=-0.0200622;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.937;QD=8.22868;RBI=0.021286;REFB=0.000109712;REVB=-0.00711359;RO=35;SAF=1;SAR=12;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.611606;STB=0.883029;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=-0.000440218;OID=.;OPOS=27305773;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:35:36:13:13:0.265306:12:1:18:17:12:1:18:18
chr2	27315252	.	G	A	171.53	PASS	AF=0.381818;AO=20;DP=54;FAO=21;FDP=55;FR=.;FRO=34;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=-0.0248573;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.76;QD=12.4752;RBI=0.0248815;REFB=-0.015307;REVB=-0.0010973;RO=33;SAF=7;SAR=13;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181891;STB=0.624878;STBP=0.161;TYPE=snp;VARB=0.0283315;OID=.;OPOS=27315252;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:55:33:34:20:21:0.381818:13:7:17:16:14:7:18:16
chr2	27323385	.	C	T	82.74	PASS	AF=0.282051;AO=11;DP=40;FAO=11;FDP=39;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.00930753;FXX=0.0249938;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.186;QD=8.48651;RBI=0.045696;REFB=-0.00791039;REVB=-0.0447381;RO=28;SAF=7;SAR=4;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161743;STB=0.599815;STBP=0.456;TYPE=snp;VARB=0.0227704;OID=.;OPOS=27323385;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:82:40:39:28:28:11:11:0.282051:4:7:14:14:4:7:14:14
chr2	27324036	.	G	A	205.13	PASS	AF=0.442308;AO=23;DP=51;FAO=23;FDP=52;FR=.;FRO=29;FSAF=20;FSAR=3;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=-0.00720036;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=237.289;QD=15.7793;RBI=0.0219349;REFB=-0.0108307;REVB=-0.0207194;RO=27;SAF=20;SAR=3;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.474507;STB=0.778936;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0081171;OID=.;OPOS=27324036;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:52:27:29:23:23:0.442308:3:20:13:14:3:20:14:15
chr2	27324702	.	GC	G	40.77	PASS	AF=0.411765;AO=7;DP=17;FAO=7;FDP=17;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=0.0422048;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=20.007;QD=9.59192;RBI=0.142617;REFB=-0.0385423;REVB=0.136229;RO=9;SAF=4;SAR=3;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0.534483;SSSB=0.318742;STB=0.709151;STBP=0.212;TYPE=del;VARB=0.0942874;OID=.;OPOS=27324703;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.411765:7:17:7:17:10:4:3:2:8:40:9:4:3:2:7
chr2	27324724	.	G	C	72.96	PASS	AF=0.642857;AO=9;DP=14;FAO=9;FDP=14;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.0439742;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=255.631;QD=20.8458;RBI=0.0535893;REFB=-0.00703462;REVB=-0.0306281;RO=5;SAF=5;SAR=4;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.338781;STB=0.691926;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.00471431;OID=.;OPOS=27324724;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:14:14:5:5:9:9:0.642857:4:5:0:5:4:5:0:5
chr2	27324751	.	G	T	54.22	PASS	AF=0.636364;AO=7;DP=12;FAO=7;FDP=11;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0514455;FXX=0.0832639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.4291;QD=19.717;RBI=0.0540241;REFB=0.0237277;REVB=-0.0164911;RO=4;SAF=4;SAR=3;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0448465;STB=0.52624;STBP=0.929;TYPE=snp;VARB=-0.00624056;OID=.;OPOS=27324751;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:23:12:11:4:4:7:7:0.636364:3:4:2:2:3:4:2:2
chr2	27325063	.	C	A	65.68	PASS	AF=0.375;AO=8;DP=23;FAO=9;FDP=24;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=-0.00449376;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.608;QD=10.9461;RBI=0.0333326;REFB=-0.0167018;REVB=0.0330283;RO=15;SAF=5;SAR=3;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0481223;STB=0.571275;STBP=0.632;TYPE=snp;VARB=0.038125;OID=.;OPOS=27325063;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:23:24:15:15:8:9:0.375:3:5:10:5:4:5:10:5
chr2	27327483	.	G	A	129.28	PASS	AF=0.583333;AO=14;DP=24;FAO=14;FDP=24;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=0.0254324;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=209.268;QD=21.5459;RBI=0.0295169;REFB=-0.0146142;REVB=0.0149814;RO=10;SAF=6;SAR=8;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12611;STB=0.571326;STBP=0.456;TYPE=snp;VARB=0.0157333;OID=.;OPOS=27327483;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:24:24:10:10:14:14:0.583333:8:6:6:4:8:6:6:4
chr2	27351948	.	T	G	557.04	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0299765;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.1211;QD=60.2208;RBI=0.0490576;REFB=0;REVB=0.0388338;RO=0;SAF=26;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000568143;OID=.;OPOS=27351948;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:11:26:0:0:11:26:0:0
chr2	27424636	.	G	A	376.17	PASS	AF=0.535211;AO=38;DP=71;FAO=38;FDP=71;FR=.;FRO=33;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=0.0958336;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.7638;QD=21.1929;RBI=0.111964;REFB=-0.035604;REVB=0.0578961;RO=33;SAF=17;SAR=21;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0197028;STB=0.510888;STBP=0.854;TYPE=snp;VARB=0.0359472;OID=.;OPOS=27424636;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:33:33:38:38:0.535211:21:17:14:19:21:17:14:19
chr2	27428295	.	A	G	925.67	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0237738;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.0859;QD=57.8545;RBI=0.024372;REFB=0;REVB=0.00536645;RO=0;SAF=25;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000467859;OID=.;OPOS=27428295;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:64:0:0:62:64:1:37:25:0:0:37:27:0:0
chr2	27429367	.	T	C	161.5	PASS	AF=0.5;AO=17;DP=34;FAO=17;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.030609;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.6838;QD=18.9999;RBI=0.0330673;REFB=-0.013489;REVB=-0.0125114;RO=17;SAF=13;SAR=4;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189116;STB=0.608373;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=0.0056286;OID=.;OPOS=27429367;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:17:17:17:17:0.5:4:13:10:7:4:13:10:7
chr2	27435250	.	A	G	1324.55	PASS	AF=1;AO=83;DP=83;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00420846;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.098;QD=61.6068;RBI=0.0519554;REFB=0;REVB=0.0517847;RO=0;SAF=56;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000177344;OID=.;OPOS=27435250;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:86:0:0:83:86:1:27:56:0:0:30:56:0:0
chr2	27440784	.	C	CT	440.39	PASS	AF=1;AO=13;DP=44;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00625089;FXX=0.0454442;HRUN=0;LEN=1;MLLD=108.682;QD=41.9414;RBI=0.0337856;REFB=0;REVB=-0.0332023;RO=31;SAF=0;SAR=13;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.779255;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00400684;OID=.;OPOS=27440785;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:13:44:42:42:0:13:29:0:0:3:31:0:13:15:16
chr2	27440785	.	C	T	394.33	PASS	AF=0.777778;AO=31;DP=45;FAO=35;FDP=45;FR=.;FRO=10;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=10;FWDB=0.00856616;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.27;QD=35.0518;RBI=0.0369897;REFB=-0.238246;REVB=0.0359841;RO=14;SAF=15;SAR=16;SRF=0;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.281201;STB=0.599947;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.0151653;OID=.;OPOS=27440785;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:45:45:14:10:31:35:0.777778:16:15:0:14:20:15:0:10
chr2	27460732	.	C	T	286.96	PASS	AF=0.444444;AO=32;DP=72;FAO=32;FDP=72;FR=.;FRO=40;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=24;FWDB=0.0307418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.95;QD=15.9421;RBI=0.0353088;REFB=-0.0301594;REVB=-0.0173683;RO=39;SAF=21;SAR=11;SRF=16;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.242895;STB=0.643517;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.0468146;OID=.;OPOS=27460732;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:39:40:32:32:0.444444:11:21:16:23:11:21:16:24
chr2	27460968	.	A	G	102.07	PASS	AF=0.785714;AO=11;DP=14;FAO=11;FDP=14;FR=.;FRO=3;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.00834698;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.35;QD=29.1641;RBI=0.0224565;REFB=-0.042199;REVB=0.0208476;RO=3;SAF=4;SAR=7;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119933;STB=0.567442;STBP=0.457;TYPE=snp;VARB=0.0177416;OID=.;OPOS=27460968;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:14:14:3:3:11:11:0.785714:7:4:2:1:7:4:2:1
chr2	27550967	.	A	G	213.22	PASS	AF=0.329268;AO=26;DP=81;FAO=27;FDP=82;FR=.;FRO=55;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=27;FSRR=28;FWDB=0.00476354;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.097;QD=10.4007;RBI=0.0540093;REFB=-0.0101978;REVB=-0.0537988;RO=52;SAF=12;SAR=14;SRF=25;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0220465;STB=0.506324;STBP=0.966;TYPE=snp;VARB=0.0223986;OID=.;OPOS=27550967;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:82:52:55:26:27:0.329268:14:12:25:27:14:13:27:28
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chr2	27599875	.	T	G	146.37	PASS	AF=0.457143;AO=16;DP=35;FAO=16;FDP=35;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=0.0271341;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.942;QD=16.7276;RBI=0.0294928;REFB=0.0051148;REVB=-0.011557;RO=19;SAF=4;SAR=12;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19014;STB=0.610022;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=-0.00558774;OID=.;OPOS=27599875;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:19:19:16:16:0.457143:12:4:8:11:12:4:8:11
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chr2	27789861	.	T	A	294.63	PASS	AF=0.619048;AO=26;DP=41;FAO=26;FDP=42;FR=.;FRO=16;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=0.00995482;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.361;QD=28.06;RBI=0.0107321;REFB=-0.0184681;REVB=-0.00401;RO=15;SAF=11;SAR=15;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0617496;STB=0.518854;STBP=0.757;TYPE=snp;VARB=0.0116345;OID=.;OPOS=27789861;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:42:15:16:26:26:0.619048:15:11:5:10:15:11:6:10
chr2	27801403	.	C	G	192.63	PASS	AF=0.575758;AO=19;DP=33;FAO=19;FDP=33;FR=.;FRO=14;FSAF=15;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=-0.00264707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.0661;QD=23.3489;RBI=0.087599;REFB=-0.080248;REVB=-0.087559;RO=14;SAF=15;SAR=4;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.415105;STB=0.734001;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0315303;OID=.;OPOS=27801403;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:14:14:19:19:0.575758:4:15:4:10:4:15:4:10
chr2	27801418	.	C	A	195.89	PASS	AF=0.612903;AO=19;DP=31;FAO=19;FDP=31;FR=.;FRO=12;FSAF=15;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=-0.00552623;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.883;QD=25.2766;RBI=0.00666997;REFB=-0.0200937;REVB=-0.00373488;RO=11;SAF=15;SAR=4;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.381817;STB=0.730076;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0073744;OID=.;OPOS=27801418;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:31:31:11:12:19:19:0.612903:4:15:3:8:4:15:3:9
chr2	27802805	.	A	G	58.61	PASS	AF=0.5;AO=8;DP=16;FAO=8;FDP=16;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=-0.0431233;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.386;QD=14.6533;RBI=0.0576496;REFB=-0.0152798;REVB=-0.0382603;RO=8;SAF=5;SAR=3;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.211205;STB=0.624687;STBP=0.419;TYPE=snp;VARB=0.0329525;OID=.;OPOS=27802805;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:16:16:8:8:8:8:0.5:3:5:3:5:3:5:3:5
chr2	27838058	.	C	A	132.31	PASS	AF=0.320755;AO=17;DP=52;FAO=17;FDP=53;FR=.;FRO=36;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=-0.00514437;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=166.617;QD=9.98583;RBI=0.0295586;REFB=-0.0131168;REVB=-0.0291075;RO=35;SAF=8;SAR=9;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0818899;STB=0.538757;STBP=0.714;TYPE=snp;VARB=0.0200995;OID=.;OPOS=27838058;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:53:35:36:17:17:0.320755:9:8:19:16:9:8:19:17
chr2	27873415	.	G	A	398.64	PASS	AF=0.573529;AO=39;DP=69;FAO=39;FDP=68;FR=.;FRO=29;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=-0.00770356;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.025;QD=23.4496;RBI=0.025222;REFB=0.0189752;REVB=-0.0240168;RO=30;SAF=23;SAR=16;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150207;STB=0.575397;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=-0.0101829;OID=.;OPOS=27873415;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:68:30:29:39:39:0.573529:16:23:12:18:16:23:12:17
chr2	27887034	.	C	A	561.43	PASS	AF=0.527778;AO=57;DP=108;FAO=57;FDP=108;FR=.;FRO=51;FSAF=24;FSAR=33;FSRF=17;FSRR=34;FWDB=-0.0037166;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=263.677;QD=20.7935;RBI=0.00701715;REFB=-0.000563838;REVB=0.00595208;RO=49;SAF=24;SAR=33;SRF=16;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0829022;STB=0.543045;STBP=0.377;TYPE=snp;VARB=0.000526612;OID=.;OPOS=27887034;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:108:49:51:57:57:0.527778:33:24:16:33:33:24:17:34
chr2	27930837	.	C	T	32.4	PASS	AF=0.625;AO=5;DP=8;FAO=5;FDP=8;FR=.;FRO=3;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0385817;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=182.259;QD=16.1991;RBI=0.0391926;REFB=-0.0270689;REVB=0.00689297;RO=3;SAF=2;SAR=3;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165639;STB=0.599599;STBP=0.601;TYPE=snp;VARB=0.017658;OID=.;OPOS=27930837;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:8:8:3:3:5:5:0.625:3:2:2:1:3:2:2:1
chr2	28634790	.	G	A	727.26	PASS	AF=0.542636;AO=70;DP=129;FAO=70;FDP=129;FR=.;FRO=59;FSAF=28;FSAR=42;FSRF=22;FSRR=37;FWDB=0.00572557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.323;QD=22.5507;RBI=0.0106164;REFB=-0.0241787;REVB=0.0089401;RO=58;SAF=28;SAR=42;SRF=22;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0179173;STB=0.512983;STBP=0.779;TYPE=snp;VARB=0.018745;OID=.;OPOS=28634790;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:129:129:58:59:70:70:0.542636:42:28:22:36:42:28:22:37
chr2	28635740	.	T	C	305.79	PASS	AF=0.425;AO=35;DP=80;FAO=34;FDP=80;FR=.;FRO=46;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=23;FSRR=23;FWDB=-0.0419592;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.684;QD=15.2896;RBI=0.0495875;REFB=-0.00829619;REVB=0.0264263;RO=45;SAF=12;SAR=23;SRF=23;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174342;STB=0.587734;STBP=0.196;TYPE=snp;VARB=0.0101238;OID=.;OPOS=28635740;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:45:46:35:34:0.425:23:12:23:22:22:12:23:23
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chr2	28814548	.	A	T	189.85	PASS	AF=0.358209;AO=25;DP=66;FAO=24;FDP=67;FR=.;FRO=43;FSAF=5;FSAR=19;FSRF=15;FSRR=28;FWDB=0.0250802;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.593;QD=11.3345;RBI=0.0260171;REFB=0.00078344;REVB=0.00691917;RO=40;SAF=5;SAR=20;SRF=13;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180417;STB=0.617779;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=-0.00130463;OID=.;OPOS=28814548;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:67:40:43:25:24:0.358209:20:5:13:27:19:5:15:28
chr2	28824793	.	C	G	88.21	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0564328;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.7442;QD=39.2065;RBI=0.0654935;REFB=0;REVB=0.0332376;RO=0;SAF=4;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0063382;OID=.;OPOS=28824793;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:5:4:0:0:5:4:0:0
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chr2	29092850	.	G	T	557.13	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0140731;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=244.442;QD=60.2307;RBI=0.0228027;REFB=0;REVB=0.0179419;RO=0;SAF=17;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.71161e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.58904e-05;OID=.;OPOS=29092850;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:20:17:0:0:20:17:0:0
chr2	29129418	.	A	G	651.11	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0277823;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.0893;QD=62.0107;RBI=0.0666993;REFB=0;REVB=0.0606378;RO=0;SAF=22;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00136554;OID=.;OPOS=29129418;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:20:22:0:0:20:22:0:0
chr2	29135468	.	C	G	729.01	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00278724;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=290.221;QD=57.1775;RBI=0.0029055;REFB=0;REVB=-0.000820511;RO=0;SAF=18;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=8.62909e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.36483e-06;OID=.;OPOS=29135468;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:33:18:0:0:33:18:0:0
chr2	29170623	.	G	T	1976.72	PASS	AF=1;AO=117;DP=117;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0547918;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.441;QD=61.7723;RBI=0.0579939;REFB=0;REVB=0.0190039;RO=0;SAF=52;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.10611e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.5675e-05;OID=.;OPOS=29170623;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:117:128:0:0:117:128:1:65:52:0:0:65:63:0:0
chr2	29222070	.	G	A	541.35	PASS	AF=1;AO=34;DP=35;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0307169;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.415;QD=60.1504;RBI=0.0380468;REFB=0;REVB=0.0224507;RO=0;SAF=27;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.32246e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000154369;OID=.;OPOS=29222070;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:36:0:0:34:36:1:7:27:0:0:8:28:0:0
chr2	29226498	.	G	A	323.47	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0965396;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.181;QD=53.9112;RBI=0.096976;REFB=0;REVB=0.00919003;RO=0;SAF=6;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00100063;OID=.;OPOS=29226498;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:18:6:0:0:18:6:0:0
chr2	29226512	.	A	G	269.82	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0613039;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.176;QD=51.3943;RBI=0.0648179;REFB=0;REVB=-0.0210522;RO=0;SAF=4;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000181973;OID=.;OPOS=29226512;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:21:0:0:20:21:1:16:4:0:0:16:5:0:0
chr2	29240060	.	A	G	488.07	PASS	AF=0.390071;AO=55;DP=141;FAO=55;FDP=141;FR=.;FRO=86;FSAF=19;FSAR=36;FSRF=40;FSRR=46;FWDB=-0.0136816;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.842;QD=13.8459;RBI=0.0138387;REFB=-0.0111271;REVB=0.00207932;RO=85;SAF=19;SAR=36;SRF=40;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140857;STB=0.576832;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=0.0202074;OID=.;OPOS=29240060;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:141:141:85:86:55:55:0.390071:36:19:40:45:36:19:40:46
chr2	29240673	.	G	A	791.71	PASS	AF=0.520833;AO=75;DP=143;FAO=75;FDP=144;FR=.;FRO=69;FSAF=11;FSAR=64;FSRF=23;FSRR=46;FWDB=-0.012087;FXX=0.0270252;HRUN=4;LEN=1;MLLD=191.807;QD=21.9919;RBI=0.0179654;REFB=-0.0173292;REVB=0.0132914;RO=67;SAF=11;SAR=64;SRF=21;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.231591;STB=0.642603;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0162395;OID=.;OPOS=29240673;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:143:144:67:69:75:75:0.520833:64:11:21:46:64:11:23:46
chr2	29240686	.	A	C	755.33	PASS	AF=0.514085;AO=73;DP=142;FAO=73;FDP=142;FR=.;FRO=69;FSAF=12;FSAR=61;FSRF=20;FSRR=49;FWDB=-0.0163709;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=293.717;QD=21.2768;RBI=0.0176353;REFB=-0.0143269;REVB=-0.00655712;RO=67;SAF=12;SAR=61;SRF=18;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146196;STB=0.596548;STBP=0.06;TYPE=snp;VARB=0.0114933;OID=.;OPOS=29240686;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:142:142:67:69:73:73:0.514085:61:12:18:49:61:12:20:49
chr2	29240783	.	A	G	187.92	PASS	AF=0.513514;AO=19;DP=37;FAO=19;FDP=37;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=-0.0230257;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.565;QD=20.3158;RBI=0.0245917;REFB=-0.00535662;REVB=0.00863509;RO=18;SAF=5;SAR=14;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129111;STB=0.573298;STBP=0.414;TYPE=snp;VARB=0.00448516;OID=.;OPOS=29240783;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:18:18:19:19:0.513514:14:5:7:11:14:5:7:11
chr2	29246044	.	T	C	186.98	PASS	AF=0.342857;AO=24;DP=70;FAO=24;FDP=70;FR=.;FRO=46;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=33;FWDB=-0.0865124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.572;QD=10.6847;RBI=0.0873794;REFB=-0.0096663;REVB=-0.0122785;RO=46;SAF=7;SAR=17;SRF=13;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.012439;STB=0.50724;STBP=0.938;TYPE=snp;VARB=0.0216441;OID=.;OPOS=29246044;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:46:46:24:24:0.342857:17:7:13:33:17:7:13:33
chr2	29268375	.	A	C	317.54	PASS	AF=0.36;AO=36;DP=100;FAO=36;FDP=100;FR=.;FRO=64;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=17;FSRR=47;FWDB=0.00191726;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=109.776;QD=12.7016;RBI=0.0146847;REFB=0.00167473;REVB=0.014559;RO=64;SAF=15;SAR=21;SRF=17;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180766;STB=0.602784;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=-0.00318322;OID=.;OPOS=29268375;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:64:64:36:36:0.36:21:15:17:47:21:15:17:47
chr2	29286509	.	T	C	413.62	PASS	AF=0.445545;AO=45;DP=101;FAO=45;FDP=101;FR=.;FRO=56;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=31;FSRR=25;FWDB=0.0469203;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.4449;QD=16.3811;RBI=0.0585014;REFB=0.0125192;REVB=-0.0349414;RO=56;SAF=21;SAR=24;SRF=31;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0858959;STB=0.548068;STBP=0.411;TYPE=snp;VARB=-0.0148987;OID=.;OPOS=29286509;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:101:56:56:45:45:0.445545:24:21:31:25:24:21:31:25
chr2	29287926	.	C	CGCT	189.33	PASS	AF=0.475;AO=18;DP=47;FAO=19;FDP=40;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=-0.0244843;FXX=0.0697512;HRUN=1;LEN=3;MLLD=219.874;QD=18.9326;RBI=0.0260759;REFB=-0.0431564;REVB=0.00897065;RO=29;SAF=8;SAR=10;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00411419;STB=0.549021;STBP=0.562;TYPE=ins;VARB=0.0396788;OID=.;OPOS=29287927;OREF=-;OALT=GCT;OMAPALT=CGCT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.475:18:47:19:40:21:9:10:8:13:99:29:8:10:13:16
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chr2	29444095	.	C	T	167.07	PASS	AF=0.409091;AO=18;DP=44;FAO=18;FDP=44;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=18;FWDB=0.00433218;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.021;QD=15.188;RBI=0.013682;REFB=-0.00327445;REVB=-0.012978;RO=26;SAF=7;SAR=11;SRF=8;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0897838;STB=0.551575;STBP=0.588;TYPE=snp;VARB=0.00979849;OID=.;OPOS=29444095;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:26:26:18:18:0.409091:11:7:8:18:11:7:8:18
chr2	29445458	.	G	T	160.68	PASS	AF=0.459459;AO=17;DP=38;FAO=17;FDP=37;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.00372229;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.314;QD=17.3706;RBI=0.0498648;REFB=-0.013416;REVB=0.0497257;RO=18;SAF=6;SAR=11;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18715;STB=0.582682;STBP=0.368;TYPE=snp;VARB=0.0236555;OID=.;OPOS=29445458;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:37:18:20:17:17:0.459459:11:6:10:8:11:6:10:10
chr2	29543663	.	T	C	1415.4	PASS	AF=1;AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0112422;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.224;QD=62.9065;RBI=0.0156192;REFB=0;REVB=-0.010843;RO=0;SAF=54;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.38686e-05;OID=.;OPOS=29543663;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:90:90:0:0:90:90:1:36:54:0:0:36:54:0:0
chr2	29903931	.	T	A	715.52	PASS	AF=1;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0065241;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.0945;QD=57.2418;RBI=0.118903;REFB=0;REVB=0.118724;RO=0;SAF=28;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.15703e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000989272;OID=.;OPOS=29903931;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:50:0:0:50:50:1:22:28:0:0:22:28:0:0
chr2	29940529	.	A	T	476.06	PASS	AF=0.970588;AO=33;DP=35;FAO=33;FDP=34;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0243223;FXX=0.0285633;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.624;QD=56.007;RBI=0.0247441;REFB=-0.0461103;REVB=-0.00454919;RO=0;SAF=8;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.529393;STBP=0.138;TYPE=snp;VARB=9.3923e-05;OID=.;OPOS=29940529;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:35:34:0:1:33:33:0.970588:25:8:0:0:25:8:1:0
chr2	30976058	.	C	T	335.76	PASS	AF=0.402174;AO=37;DP=92;FAO=37;FDP=92;FR=.;FRO=55;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=29;FSRR=26;FWDB=-0.0359765;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.145;QD=14.5981;RBI=0.0667287;REFB=-0.0182625;REVB=-0.0561998;RO=55;SAF=15;SAR=22;SRF=29;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129355;STB=0.57342;STBP=0.273;TYPE=snp;VARB=0.0274323;OID=.;OPOS=30976058;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:55:55:37:37:0.402174:22:15:29:26:22:15:29:26
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chr2	31135184	.	G	T	470.44	PASS	AF=0.505495;AO=46;DP=91;FAO=46;FDP=91;FR=.;FRO=45;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=23;FSRR=22;FWDB=-0.0168193;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.915;QD=20.6785;RBI=0.0172588;REFB=-0.000145931;REVB=0.00387029;RO=45;SAF=20;SAR=26;SRF=23;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0686243;STB=0.538001;STBP=0.482;TYPE=snp;VARB=0.000148636;OID=.;OPOS=31135184;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:45:45:46:46:0.505495:26:20:23:22:26:20:23:22
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chr2	31399988	.	C	T	830.42	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0487866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.5318;QD=57.2705;RBI=0.0494729;REFB=0;REVB=0.00821234;RO=0;SAF=24;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.25003e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00112164;OID=.;OPOS=31399988;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:58:0:0:57:58:1:33:24:0:0:33:25:0:0
chr2	31410653	.	C	T	650.7	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0493787;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.0398;QD=61.9718;RBI=0.0695498;REFB=0;REVB=0.0489787;RO=0;SAF=15;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.13648e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.2455e-06;OID=.;OPOS=31410653;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:27:15:0:0:27:15:0:0
chr2	31411184	.	C	A	306.27	PASS	AF=0.923077;AO=24;DP=26;FAO=24;FDP=26;FR=.;FRO=2;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0158149;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.56;QD=47.1178;RBI=0.0203694;REFB=-0.0626827;REVB=0.0128376;RO=2;SAF=10;SAR=14;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0617183;STB=0.533306;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.00512673;OID=.;OPOS=31411184;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:26:26:2:2:24:24:0.923077:14:10:0:2:14:10:0:2
chr2	31411242	.	C	A	337.8	PASS	AF=1;AO=22;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0230078;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.021;QD=54.0475;RBI=0.0231112;REFB=0;REVB=-0.00218378;RO=0;SAF=6;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17051e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00126709;OID=.;OPOS=31411242;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:22:25:1:16:6:0:0:17:8:0:0
chr2	31414223	.	G	A	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143537;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.42;QD=49.5992;RBI=0.0144802;REFB=0;REVB=-0.00191007;RO=0;SAF=8;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.58621e-05;OID=.;OPOS=31414223;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:10:8:0:0:10:8:0:0
chr2	31414807	.	C	G	972.86	PASS	AF=1;AO=65;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0258449;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.016;QD=58.9612;RBI=0.0272861;REFB=0;REVB=-0.00875056;RO=0;SAF=36;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.90451e-05;OID=.;OPOS=31414807;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:65:66:1:29:36:0:0:30:36:0:0
chr2	31414830	.	G	A	475.06	PASS	AF=0.576923;AO=45;DP=78;FAO=45;FDP=78;FR=.;FRO=33;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=0.0069922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.902;QD=24.362;RBI=0.0304333;REFB=-0.0136626;REVB=0.0296192;RO=33;SAF=21;SAR=24;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0374676;STB=0.520539;STBP=0.712;TYPE=snp;VARB=0.00966942;OID=.;OPOS=31414830;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:33:33:45:45:0.576923:24:21:17:16:24:21:17:16
chr2	31423443	.	G	A	1954.99	PASS	AF=0.992188;AO=127;DP=128;FAO=127;FDP=128;FR=.;FRO=1;FSAF=50;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0257563;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=269.83;QD=61.0934;RBI=0.0258144;REFB=-0.0317326;REVB=-0.00172995;RO=1;SAF=50;SAR=77;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00613176;STB=0.503225;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=0.000377069;OID=.;OPOS=31423443;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:128:128:1:1:127:127:0.992188:77:50:0:1:77:50:0:1
chr2	31424792	.	C	A	361.97	PASS	AF=0.469136;AO=38;DP=81;FAO=38;FDP=81;FR=.;FRO=43;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=23;FSRR=20;FWDB=-0.0375034;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.3256;QD=17.8751;RBI=0.0830435;REFB=0.00800517;REVB=-0.0740927;RO=43;SAF=15;SAR=23;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134693;STB=0.575338;STBP=0.2;TYPE=snp;VARB=-0.0101139;OID=.;OPOS=31424792;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:43:43:38:38:0.469136:23:15:23:20:23:15:23:20
chr2	31451224	.	G	C	703.39	PASS	AF=0.605505;AO=64;DP=108;FAO=66;FDP=109;FR=.;FRO=43;FSAF=21;FSAR=45;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=0.0689593;FXX=0.00909008;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.936;QD=25.8123;RBI=0.0706587;REFB=-0.0116836;REVB=0.0154035;RO=43;SAF=20;SAR=44;SRF=22;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159411;STB=0.58263;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.00730748;OID=.;OPOS=31451224;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:109:43:43:64:66:0.605505:44:20:22:21:45:21:22:21
chr2	31490716	.	C	G	800.38	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0742789;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.8566;QD=57.1697;RBI=0.0942941;REFB=0;REVB=-0.0580864;RO=0;SAF=32;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000209134;OID=.;OPOS=31490716;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:24:32:0:0:24:32:0:0
chr2	31571786	.	A	G	739.49	PASS	AF=0.979592;AO=46;DP=46;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00373821;FXX=0.019996;HRUN=3;LEN=1;MLLD=209.541;QD=60.3664;RBI=0.00881276;REFB=-0.168325;REVB=0.00798064;RO=0;SAF=24;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50943;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.00277989;OID=.;OPOS=31571786;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:46:49:0:1:46:48:0.979592:22:24:0:0:22:26:1:0
chr2	31589847	.	G	A	391.3	PASS	AF=0.43617;AO=40;DP=93;FAO=41;FDP=94;FR=.;FRO=53;FSAF=15;FSAR=26;FSRF=19;FSRR=34;FWDB=-0.00417691;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.777;QD=16.6509;RBI=0.00461311;REFB=-0.00142369;REVB=-0.00195812;RO=53;SAF=14;SAR=26;SRF=19;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00941165;STB=0.504482;STBP=0.953;TYPE=snp;VARB=0.00204738;OID=.;OPOS=31589847;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:94:53:53:40:41:0.43617:26:14:19:34:26:15:19:34
chr2	31805706	.	G	C	241.67	PASS	AF=0.666667;AO=22;DP=33;FAO=22;FDP=33;FR=.;FRO=11;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=0.00455666;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.668;QD=29.2928;RBI=0.0374538;REFB=-0.0587599;REVB=0.0371756;RO=11;SAF=8;SAR=14;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.221305;STB=0.62211;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.0146949;OID=.;OPOS=31805706;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:33:33:11:11:22:22:0.666667:14:8:8:3:14:8:8:3
chr2	31805880	.	A	AG	377.25	PASS	AF=0.954545;AO=38;DP=46;FAO=42;FDP=44;FR=.;FRO=2;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.116929;FXX=0.0222173;HRUN=2;LEN=1;MLLD=17.2707;QD=34.2953;RBI=0.125479;REFB=-0.0472137;REVB=-0.0455263;RO=6;SAF=18;SAR=20;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00670137;STB=0.523798;STBP=0.265;TYPE=ins;VARB=0.0175551;OID=.;OPOS=31805881;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.954545:38:46:42:44:2:22:20:0:2:3:6:18:20:3:3
chr2	32248852	.	C	T	117.44	PASS	AF=0.590909;AO=13;DP=22;FAO=13;FDP=22;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.00573193;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.58;QD=21.3527;RBI=0.0071495;REFB=-0.0175664;REVB=-0.00427321;RO=9;SAF=3;SAR=10;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.271516;STB=0.655477;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=0.0109017;OID=.;OPOS=32248852;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:22:22:9:9:13:13:0.590909:10:3:5:4:10:3:5:4
chr2	32342508	.	A	T	2405.02	PASS	AF=0.603878;AO=218;DP=360;FAO=218;FDP=361;FR=.;FRO=143;FSAF=113;FSAR=105;FSRF=88;FSRR=55;FWDB=-0.0256099;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.1033;QD=26.6484;RBI=0.0376853;REFB=-0.0195792;REVB=0.0276463;RO=142;SAF=113;SAR=105;SRF=87;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0693006;STB=0.538595;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.0127022;OID=.;OPOS=32342508;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:360:361:142:143:218:218:0.603878:105:113:87:55:105:113:88:55
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chr2	32476390	.	T	G	159.58	PASS	AF=0.472222;AO=17;DP=36;FAO=17;FDP=36;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.003437;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.521;QD=17.7311;RBI=0.0121598;REFB=-0.0244759;REVB=-0.0116639;RO=19;SAF=8;SAR=9;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00286962;STB=0.501637;STBP=0.976;TYPE=snp;VARB=0.0242596;OID=.;OPOS=32476390;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:19:19:17:17:0.472222:9:8:9:10:9:8:9:10
chr2	32481795	.	T	A	276.22	PASS	AF=0.5;AO=30;DP=60;FAO=30;FDP=60;FR=.;FRO=30;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.00374447;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=178.463;QD=18.4145;RBI=0.00976091;REFB=-0.00104867;REVB=-0.00901412;RO=30;SAF=14;SAR=16;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0893065;STB=0.549856;STBP=0.477;TYPE=snp;VARB=0.00760794;OID=.;OPOS=32481795;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:30:30:30:30:0.5:16:14:17:13:16:14:17:13
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chr2	32843292	.	TTTA	T,TTT,TTTT	450.46	PASS	AF=1,0,0;AO=6,6,17;DP=35;FAO=32,0,0;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=21,0,0;FSAR=11,0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.109917,-0.113528,-0.113085;FXX=0;HRUN=4,1,1;LEN=3,1,1;MLLD=180.646,176.23,174.207;QD=56.3081;RBI=0.165187,0.154744,0.147084;REFB=0,0,0;REVB=0.123309,0.105153,0.0940502;RO=3;SAF=2,6,11;SAR=4,0,6;SRF=0;SRR=3;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.236104,0.804025,0.181817;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,del,snp;VARB=-0.00368407,0,-0.0966053;OID=.,.,.;OPOS=32843293,32843295,32843295;OREF=TTA,A,A;OALT=-,-,T;OMAPALT=T,TTT,TTTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1,0,0:6,6,17:35:32,0,0:32:0:21,0,0:11,0,0:0:0:4:3:2,6,11:4,0,6:0:3
chr2	32855615	.	A	G	868.26	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0529025;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.0925;QD=57.8839;RBI=0.0568272;REFB=0;REVB=0.0207522;RO=0;SAF=23;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.03034e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000524525;OID=.;OPOS=32855615;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:37:23:0:0:37:23:0:0
chr2	32983480	.	G	A	437.5	PASS	AF=0.406504;AO=38;DP=123;FAO=50;FDP=123;FR=.;FRO=73;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=39;FSRR=34;FWDB=-0.00349525;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.601;QD=14.2277;RBI=0.0219402;REFB=-0.00243235;REVB=0.02166;RO=64;SAF=12;SAR=26;SRF=33;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.228381;STB=0.532151;STBP=0.559;TYPE=snp;VARB=0.00450215;OID=.;OPOS=32983480;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:123:123:64:73:38:50:0.406504:26:12:33:31:26:24:39:34
chr2	32983526	.	C	T	652.65	PASS	AF=0.597938;AO=57;DP=96;FAO=58;FDP=97;FR=.;FRO=39;FSAF=24;FSAR=34;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=0.00412814;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.9776;QD=26.9136;RBI=0.0187299;REFB=-0.0037407;REVB=-0.0182693;RO=38;SAF=23;SAR=34;SRF=16;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133342;STB=0.509128;STBP=0.833;TYPE=snp;VARB=0.0039828;OID=.;OPOS=32983526;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:97:38:39:57:58:0.597938:34:23:16:22:34:24:17:22
chr2	33412077	.	G	A	295.76	PASS	AF=0.534483;AO=31;DP=58;FAO=31;FDP=58;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=-0.00738008;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.226;QD=20.397;RBI=0.0100149;REFB=0.00313762;REVB=0.00676997;RO=27;SAF=12;SAR=19;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143261;STB=0.579609;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=-0.00316026;OID=.;OPOS=33412077;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:27:27:31:31:0.534483:19:12:15:12:19:12:15:12
chr2	33447202	.	C	T	99.54	PASS	AF=0.387097;AO=12;DP=32;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.00711229;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.698;QD=12.8433;RBI=0.0155744;REFB=-0.00280567;REVB=0.0138556;RO=19;SAF=6;SAR=6;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0819582;STB=0.548307;STBP=0.71;TYPE=snp;VARB=0.00380804;OID=.;OPOS=33447202;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:31:19:19:12:12:0.387097:6:6:11:8:6:6:11:8
chr2	33488419	.	G	A	1622.98	PASS	AF=1;AO=107;DP=107;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000870983;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.094;QD=60.1102;RBI=0.0248278;REFB=0;REVB=0.0248125;RO=0;SAF=56;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.66952e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.72435e-05;OID=.;OPOS=33488419;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:107:108:0:0:107:108:1:51:56:0:0:51:57:0:0
chr2	33510916	.	G	T	1472.54	PASS	AF=1;AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00212397;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.076;QD=63.3351;RBI=0.0339249;REFB=0;REVB=-0.0338583;RO=0;SAF=48;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000167858;OID=.;OPOS=33510916;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:93:93:0:0:93:93:1:45:48:0:0:45:48:0:0
chr2	33540248	.	G	A	1249.41	PASS	AF=1;AO=81;DP=82;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0042174;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.4557;QD=61.6992;RBI=0.0126615;REFB=0;REVB=0.0119385;RO=0;SAF=45;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.42691e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.2805e-05;OID=.;OPOS=33540248;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:81:0:0:81:81:1:36:45:0:0:36:45:0:0
chr2	33557974	.	A	G	368.01	PASS	AF=0.62;AO=31;DP=50;FAO=31;FDP=50;FR=.;FRO=19;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.00631447;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.833;QD=29.4411;RBI=0.0212988;REFB=-0.0193424;REVB=0.0203412;RO=19;SAF=14;SAR=17;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0880534;STB=0.548356;STBP=0.423;TYPE=snp;VARB=0.0242476;OID=.;OPOS=33557974;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:19:19:31:31:0.62:17:14:11:8:17:14:11:8
chr2	33585796	.	T	C	2099.47	PASS	AF=1;AO=133;DP=137;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0288307;FXX=0.0289834;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.3319;QD=62.6709;RBI=0.0605024;REFB=0;REVB=0.0531914;RO=0;SAF=72;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.79172e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00272527;OID=.;OPOS=33585796;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:137:134:0:0:133:134:1:61:72:0:0:61:73:0:0
chr2	33774761	.	T	C	429.14	PASS	AF=0.488636;AO=43;DP=89;FAO=43;FDP=88;FR=.;FRO=45;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=22;FSRR=23;FWDB=0.00179413;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.421;QD=19.5064;RBI=0.0385237;REFB=0.00573439;REVB=0.0384819;RO=45;SAF=21;SAR=22;SRF=22;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000475595;STB=0.500264;STBP=0.988;TYPE=snp;VARB=-0.00684003;OID=.;OPOS=33774761;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:88:45:45:43:43:0.488636:22:21:22:23:22:21:22:23
chr2	33952413	.	T	C	101.63	PASS	AF=0.5;AO=12;DP=24;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=0.00679674;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.852;QD=16.9376;RBI=0.0469266;REFB=-0.0189809;REVB=-0.0464318;RO=12;SAF=4;SAR=8;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0842475;STB=0.54831;STBP=0.733;TYPE=snp;VARB=0.0129473;OID=.;OPOS=33952413;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:24:24:12:12:12:12:0.5:8:4:3:9:8:4:3:9
chr2	33952456	.	C	G	199.16	PASS	AF=0.944444;AO=17;DP=18;FAO=17;FDP=18;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0345795;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=255.445;QD=44.2587;RBI=0.0413688;REFB=-0.032397;REVB=0.0227077;RO=0;SAF=6;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.538415;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=0.000703177;OID=.;OPOS=33952456;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:18:18:0:1:17:17:0.944444:11:6:0:0:11:6:1:0
chr2	36583461	.	G	T	85.04	PASS	AF=0.666667;AO=10;DP=15;FAO=10;FDP=15;FR=.;FRO=5;FSAF=10;FSAR=0;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0117809;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=287.401;QD=22.6785;RBI=0.0117809;REFB=0.0139702;REVB=0;RO=5;SAF=10;SAR=0;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00760159;OID=.;OPOS=36583461;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:15:15:5:5:10:10:0.666667:0:10:5:0:0:10:5:0
chr2	36704144	.	C	T	1590.93	PASS	AF=0.990741;AO=107;DP=108;FAO=107;FDP=108;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=65;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00788334;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.417;QD=58.9232;RBI=0.0335074;REFB=-0.0622978;REVB=-0.0325668;RO=1;SAF=42;SAR=65;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0111662;STB=0.505881;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=6.5171e-05;OID=.;OPOS=36704144;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:108:108:1:1:107:107:0.990741:65:42:1:0:65:42:1:0
chr2	36756288	.	T	C	1431.39	PASS	AF=0.96875;AO=93;DP=96;FAO=93;FDP=96;FR=.;FRO=3;FSAF=43;FSAR=50;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0435233;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=121.201;QD=59.6412;RBI=0.0467626;REFB=0.0652991;REVB=0.0171015;RO=1;SAF=43;SAR=50;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0093882;STB=0.506413;STBP=0.496;TYPE=snp;VARB=-0.000607448;OID=.;OPOS=36756288;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:96:96:1:3:93:93:0.96875:50:43:0:1:50:43:2:1
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chr2	36782886	.	G	A	698.27	PASS	AF=0.980392;AO=49;DP=50;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00946003;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.254;QD=54.7665;RBI=0.0176354;REFB=-0.065459;REVB=-0.0148834;RO=1;SAF=33;SAR=16;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0285;STB=0.515145;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=0.000483739;OID=.;OPOS=36782886;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:50:51:1:1:49:50:0.980392:16:33:0:1:16:34:0:1
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chr2	37094945	.	A	G	651.44	PASS	AF=0.960784;AO=47;DP=51;FAO=49;FDP=51;FR=.;FRO=2;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00960365;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=100.188;QD=51.0931;RBI=0.0111743;REFB=-0.0773992;REVB=0.00571275;RO=1;SAF=27;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0229327;STB=0.517234;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=0.0016285;OID=.;OPOS=37094945;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:51:51:1:2:47:49:0.960784:20:27:0:1:21:28:2:0
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chr2	37241050	.	G	A	1444.42	PASS	AF=0.978947;AO=93;DP=95;FAO=93;FDP=95;FR=.;FRO=2;FSAF=38;FSAR=55;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00144335;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=285.157;QD=60.8175;RBI=0.00920052;REFB=-0.0410236;REVB=0.0090866;RO=2;SAF=38;SAR=55;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00377038;STB=0.501989;STBP=0.854;TYPE=snp;VARB=6.35196e-06;OID=.;OPOS=37241050;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:95:95:2:2:93:93:0.978947:55:38:1:1:55:38:1:1
chr2	37306343	.	G	A	2599.39	PASS	AF=1;AO=166;DP=166;FAO=168;FDP=168;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00988667;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.965;QD=61.8903;RBI=0.0137028;REFB=0;REVB=0.00948791;RO=0;SAF=85;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.06689e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.7732e-08;OID=.;OPOS=37306343;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:166:168:0:0:166:168:1:81:85:0:0:82:86:0:0
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chr2	37365640	.	G	A	174.08	PASS	AF=0.5;AO=18;DP=36;FAO=18;FDP=36;FR=.;FRO=18;FSAF=15;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=5;FWDB=-0.0762373;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.897;QD=19.342;RBI=0.082658;REFB=-0.00734424;REVB=0.031941;RO=18;SAF=15;SAR=3;SRF=13;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153745;STB=0.588127;STBP=0.396;TYPE=snp;VARB=0.0118776;OID=.;OPOS=37365640;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:18:18:18:18:0.5:3:15:13:5:3:15:13:5
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chr2	37456032	.	C	T	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0451426;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.239;QD=45.8062;RBI=0.0452922;REFB=0;REVB=0.003678;RO=0;SAF=6;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000892493;OID=.;OPOS=37456032;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:8:6:0:0:8:6:0:0
chr2	37458711	.	G	A	755.36	PASS	AF=1;AO=53;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0113577;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.399;QD=55.9526;RBI=0.0348768;REFB=0;REVB=0.0329757;RO=0;SAF=31;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.76368e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000175316;OID=.;OPOS=37458711;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:53:54:1:22:31:0:0:23:31:0:0
chr2	37477794	.	C	A	441.43	PASS	AF=1;AO=29;DP=30;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0205597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.3822;QD=56.9581;RBI=0.0263165;REFB=0;REVB=-0.0164273;RO=0;SAF=12;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.0947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000246994;OID=.;OPOS=37477794;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:31:0:0:29:31:1:17:12:0:0:17:14:0:0
chr2	37518045	.	G	C	715.45	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0487999;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.969;QD=57.236;RBI=0.0491269;REFB=0;REVB=-0.00565932;RO=0;SAF=24;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.10374e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.79584e-05;OID=.;OPOS=37518045;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:26:24:0:0:26:24:0:0
chr2	37558980	.	A	C	2784.47	PASS	AF=1;AO=178;DP=178;FAO=178;FDP=178;FR=.;FRO=0;FSAF=93;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00845768;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.3572;QD=62.5724;RBI=0.0118064;REFB=0;REVB=-0.0082376;RO=0;SAF=93;SAR=85;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.42749e-07;OID=.;OPOS=37558980;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:15:178:178:0:0:178:178:1:85:93:0:0:85:93:0:0
chr2	37872508	.	G	A	1558.07	PASS	AF=1;AO=96;DP=98;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0410423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.86;QD=62.9524;RBI=0.0432274;REFB=-0.0628865;REVB=-0.01357;RO=1;SAF=45;SAR=51;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00920842;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000189698;OID=.;OPOS=37872508;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:98:99:1:0:96:99:1:51:45:0:1:54:45:0:0
chr2	38178406	.	A	G	421.71	PASS	AF=0.462366;AO=43;DP=93;FAO=43;FDP=93;FR=.;FRO=50;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=30;FSRR=20;FWDB=-0.00292829;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.008;QD=18.1379;RBI=0.00554627;REFB=-0.0125705;REVB=-0.00471022;RO=49;SAF=23;SAR=20;SRF=30;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0747252;STB=0.535337;STBP=0.576;TYPE=snp;VARB=0.0138188;OID=.;OPOS=38178406;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:49:50:43:43:0.462366:20:23:30:19:20:23:30:20
chr2	38179134	.	G	A	747.74	PASS	AF=0.964286;AO=54;DP=58;FAO=54;FDP=56;FR=.;FRO=2;FSAF=34;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0209901;FXX=0.0344768;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.175;QD=53.4099;RBI=0.0320925;REFB=-0.153597;REVB=-0.0242764;RO=1;SAF=34;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0229779;STB=0.504949;STBP=0.777;TYPE=snp;VARB=0.00233863;OID=.;OPOS=38179134;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:58:56:1:2:54:54:0.964286:20:34:0:1:20:34:1:1
chr2	38179414	.	CTG	C	164.82	PASS	AF=0.548387;AO=17;DP=31;FAO=17;FDP=31;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=-0.000159902;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=192.616;QD=21.2672;RBI=0.0154499;REFB=-0.0235633;REVB=-0.015449;RO=14;SAF=8;SAR=9;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0338267;STB=0.519062;STBP=0.833;TYPE=del;VARB=0.0223771;OID=.;OPOS=38179415;OREF=TG;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.548387:17:31:17:31:14:8:9:6:8:99:14:8:9:6:8
chr2	38298150	.	A	G	465.13	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.031034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.086;QD=58.1418;RBI=0.0323208;REFB=0;REVB=0.00902907;RO=0;SAF=22;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000265315;OID=.;OPOS=38298150;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:10:22:0:0:10:22:0:0
chr2	38298203	.	C	G	429.02	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148061;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.0461;QD=57.2021;RBI=0.026053;REFB=0;REVB=-0.0214369;RO=0;SAF=18;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.61473e-05;OID=.;OPOS=38298203;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:12:18:0:0:12:18:0:0
chr2	38709720	.	A	G	621.82	PASS	AF=0.416667;AO=69;DP=168;FAO=70;FDP=168;FR=.;FRO=98;FSAF=29;FSAR=41;FSRF=55;FSRR=43;FWDB=-0.00452202;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.03;QD=14.8053;RBI=0.0050968;REFB=-0.0169935;REVB=-0.00235131;RO=97;SAF=29;SAR=40;SRF=55;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152674;STB=0.58569;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.0200662;OID=.;OPOS=38709720;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:168:168:97:98:69:70:0.416667:40:29:55:42:41:29:55:43
chr2	39025555	.	G	A	972.46	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0136202;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.62;QD=58.9367;RBI=0.013753;REFB=0;REVB=0.00190654;RO=0;SAF=38;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.61451e-05;OID=.;OPOS=39025555;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:28:38:0:0:28:38:0:0
chr2	39050141	.	A	C	375.44	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00511556;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.979;QD=55.6211;RBI=0.0577088;REFB=0;REVB=0.0574816;RO=0;SAF=13;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000187736;OID=.;OPOS=39050141;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:14:13:0:0:14:13:0:0
chr2	39055580	.	TGGG	TGG,TGTA	876.41	PASS	AF=0.925,0.0375;AO=30,3;DP=77;FAO=74,3;FDP=80;FR=.;FRO=3;FSAF=39,0;FSAR=35,3;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.953009,0.0727689;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,2;MLLD=16.0042,231.636;QD=43.8206;RBI=0.964753,0.0959419;REFB=-0.0498031,0.0131785;REVB=-0.150072,-0.0625262;RO=42;SAF=0,0;SAR=30,3;SRF=39;SRR=3;SSEN=0.456938,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.88918,-0.798445;STB=0.520542,0.5;STBP=0.093,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.023746,0.0308992;OID=.,.;OPOS=39055581,39055582;OREF=G,GG;OALT=-,TA;OMAPALT=TGG,TGTA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.925,0.0375:30,3:77:74,3:80:3:39,0:35,3:0:3:8:42:0,0:30,3:39:3
chr2	39082344	.	T	C	801.32	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=9.77454e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.392;QD=57.2374;RBI=0.0121819;REFB=0;REVB=0.0121816;RO=0;SAF=28;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.71439e-05;OID=.;OPOS=39082344;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:28:28:0:0:28:28:0:0
chr2	39185298	.	G	A	212.56	PASS	AF=0.5;AO=21;DP=42;FAO=21;FDP=42;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=5;FSRR=16;FWDB=-0.00983819;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.774;QD=20.2435;RBI=0.00999445;REFB=-0.0187662;REVB=-0.00176043;RO=20;SAF=7;SAR=14;SRF=4;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13768;STB=0.555505;STBP=0.548;TYPE=snp;VARB=0.022323;OID=.;OPOS=39185298;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:20:21:21:21:0.5:14:7:4:16:14:7:5:16
chr2	39212566	.	T	G,TG	90.52	PASS	AF=0,0.52381;AO=2,4;DP=33;FAO=0,11;FDP=21;FR=.;FRO=10;FSAF=0,6;FSAR=0,5;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=-0.0158208,-0.0184158;FXX=0.124948;HRUN=11,0;LEN=1,1;MLLD=142.043,237.997;QD=17.2424;RBI=0.0737384,0.0706502;REFB=0.0606718,0.00770835;REVB=0.0720212,0.0682078;RO=27;SAF=2,3;SAR=0,1;SRF=14;SRR=13;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.463741,0.269908;STB=0.5,0.521699;STBP=1,0.937;TYPE=snp,ins;VARB=0,-0.000140238;OID=.,.;OPOS=39212566,39212567;OREF=T,-;OALT=G,G;OMAPALT=G,TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:83:33:21:27:10:2,4:0,11:0,0.52381:0,1:2,3:14:13:0,5:0,6:5:5
chr2	39212637	.	T	C	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00390565;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=257.494;QD=33.4285;RBI=0.00987268;REFB=0;REVB=0.00906729;RO=0;SAF=3;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000188001;OID=.;OPOS=39212637;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:3:3:0:0:3:3:0:0
chr2	39477170	.	T	C	411.12	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0302643;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=276.4;QD=56.7066;RBI=0.035041;REFB=0;REVB=0.0176619;RO=0;SAF=13;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000116741;OID=.;OPOS=39477170;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:16:13:0:0:16:13:0:0
chr2	39507417	.	T	A	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0567101;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.077;QD=51.1843;RBI=0.0585094;REFB=0;REVB=0.0143982;RO=0;SAF=10;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000762913;OID=.;OPOS=39507417;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:10:10:0:0:10:10:0:0
chr2	39583446	.	A	G	698.96	PASS	AF=0.980392;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00986154;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.7323;QD=54.8206;RBI=0.010219;REFB=-0.127473;REVB=-0.00267902;RO=1;SAF=27;SAR=23;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.017117;STB=0.509087;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.00249342;OID=.;OPOS=39583446;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:51:51:1:1:50:50:0.980392:23:27:1:0:23:27:1:0
chr2	39944278	.	G	T	923.5	PASS	AF=0.610294;AO=83;DP=136;FAO=83;FDP=136;FR=.;FRO=53;FSAF=44;FSAR=39;FSRF=18;FSRR=35;FWDB=0.0196048;FXX=0.0144917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.2299;QD=27.1619;RBI=0.0315449;REFB=-0.0144682;REVB=-0.0247131;RO=51;SAF=44;SAR=39;SRF=16;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151313;STB=0.573828;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.00591261;OID=.;OPOS=39944278;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:136:136:51:53:83:83:0.610294:39:44:16:35:39:44:18:35
chr2	40403104	.	A	G	314.33	PASS	AF=0.453333;AO=34;DP=77;FAO=34;FDP=75;FR=.;FRO=41;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=0.00978454;FXX=0.0259707;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.495;QD=16.7644;RBI=0.0282056;REFB=-0.00395221;REVB=0.026454;RO=41;SAF=20;SAR=14;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122204;STB=0.56868;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.00251162;OID=.;OPOS=40403104;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:75:41:41:34:34:0.453333:14:20:19:22:14:20:19:22
chr2	42165754	.	C	T	411.09	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0124248;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.74;QD=56.7019;RBI=0.0239345;REFB=0;REVB=0.020457;RO=0;SAF=19;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000148513;OID=.;OPOS=42165754;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:10:19:0:0:10:19:0:0
chr2	42510018	.	A	G	1413.23	PASS	AF=0.978947;AO=90;DP=93;FAO=93;FDP=95;FR=.;FRO=2;FSAF=52;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0704098;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=45.4266;QD=59.5046;RBI=0.105667;REFB=0.0289264;REVB=-0.0787913;RO=3;SAF=51;SAR=39;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.035067;STB=0.511902;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=-0.00130866;OID=.;OPOS=42510018;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:93:95:3:2:90:93:0.978947:39:51:0:3:41:52:0:2
chr2	42515388	.	A	G	309.67	PASS	AF=0.592593;AO=31;DP=53;FAO=32;FDP=54;FR=.;FRO=22;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=0.00787116;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.104;QD=22.9384;RBI=0.0183745;REFB=-0.0159069;REVB=0.0166033;RO=21;SAF=15;SAR=16;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133689;STB=0.555521;STBP=0.344;TYPE=snp;VARB=0.0108165;OID=.;OPOS=42515388;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:54:21:22:31:32:0.592593:16:15:14:7:16:16:14:8
chr2	42515437	.	A	G	308.3	PASS	AF=0.613636;AO=27;DP=44;FAO=27;FDP=44;FR=.;FRO=17;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=4;FWDB=-0.0183489;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.4914;QD=28.027;RBI=0.0376499;REFB=0.0361352;REVB=0.032876;RO=17;SAF=12;SAR=15;SRF=13;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.221613;STB=0.621803;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=-0.021797;OID=.;OPOS=42515437;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:17:17:27:27:0.613636:15:12:13:4:15:12:13:4
chr2	42560975	.	A	G	761.43	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0781788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.7937;QD=56.4023;RBI=0.0822286;REFB=0;REVB=0.0254876;RO=0;SAF=25;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000860604;OID=.;OPOS=42560975;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:54:0:0:52:54:1:27:25:0:0:28:26:0:0
chr2	42577803	.	T	TAAATACACAC	174.12	PASS	AF=0.68;AO=17;DP=25;FAO=17;FDP=25;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=-0.0132263;FXX=0;HRUN=2;LEN=10;MLLD=363.991;QD=27.859;RBI=0.0141363;REFB=0.0030017;REVB=-0.00498997;RO=8;SAF=5;SAR=12;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.206534;STB=0.615242;STBP=0.129;TYPE=ins;VARB=-0.00109286;OID=.;OPOS=42577804;OREF=-;OALT=AAATACACAC;OMAPALT=TAAATACACAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.68:17:25:17:25:8:5:12:5:3:54:8:5:12:5:3
chr2	42577806	.	T	A	54.19	PASS	AF=0.32;AO=8;DP=25;FAO=8;FDP=25;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=-0.017085;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.9683;QD=8.66995;RBI=0.0841854;REFB=-0.0033355;REVB=-0.0824335;RO=17;SAF=5;SAR=3;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.351886;STB=0.713796;STBP=0.191;TYPE=snp;VARB=-0.00137697;OID=.;OPOS=42577806;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:25:25:17:17:8:8:0.32:3:5:5:12:3:5:5:12
chr2	42588195	.	T	C	1552.36	PASS	AF=0.989899;AO=98;DP=99;FAO=98;FDP=99;FR=.;FRO=1;FSAF=53;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0668701;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.0902;QD=62.7217;RBI=0.109586;REFB=-0.104357;REVB=-0.0868193;RO=1;SAF=53;SAR=45;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00886572;STB=0.504672;STBP=0.485;TYPE=snp;VARB=0.000413303;OID=.;OPOS=42588195;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:99:99:1:1:98:98:0.989899:45:53:1:0:45:53:1:0
chr2	42990101	.	G	C	1190.46	PASS	AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00289869;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.922;QD=61.0492;RBI=0.0236262;REFB=0;REVB=0.0234477;RO=0;SAF=48;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.22352e-05;OID=.;OPOS=42990101;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:30:48:0:0:30:48:0:0
chr2	42990336	.	T	G	344.66	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0155088;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.176;QD=55.1456;RBI=0.0291188;REFB=0;REVB=0.024645;RO=0;SAF=10;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.32314e-05;OID=.;OPOS=42990336;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:15:10:0:0:15:10:0:0
chr2	42990522	.	C	T	1043.91	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.115238;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.413;QD=59.6519;RBI=0.118452;REFB=0;REVB=0.0274039;RO=0;SAF=41;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000611512;OID=.;OPOS=42990522;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:29:41:0:0:29:41:0:0
chr2	43015704	.	T	A	650.95	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0258037;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.327;QD=61.9956;RBI=0.0538409;REFB=0;REVB=0.0472547;RO=0;SAF=16;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00022827;OID=.;OPOS=43015704;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:26:16:0:0:26:16:0:0
chr2	43015719	.	T	C	557.08	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0379664;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.668;QD=60.2245;RBI=0.0382829;REFB=0;REVB=0.0049121;RO=0;SAF=15;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.7717e-05;OID=.;OPOS=43015719;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:37:0:0:36:37:1:21:15:0:0:22:15:0:0
chr2	43015757	.	G	A	393.28	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.028979;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.945;QD=56.1829;RBI=0.0293131;REFB=0;REVB=-0.00441298;RO=0;SAF=13;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.47975e-05;OID=.;OPOS=43015757;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:15:13:0:0:15:13:0:0
chr2	43793725	.	G	A	170.31	PASS	AF=0.45;AO=18;DP=40;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=-0.00636542;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.024;QD=17.0306;RBI=0.0226591;REFB=-0.00137457;REVB=-0.0217466;RO=21;SAF=11;SAR=7;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.258194;STB=0.657439;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=0.00114995;OID=.;OPOS=43793725;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:21:22:18:18:0.45:7:11:7:14:7:11:7:15
chr2	43797619	.	C	T	410.61	PASS	AF=0.419643;AO=47;DP=112;FAO=47;FDP=112;FR=.;FRO=65;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=43;FSRR=22;FWDB=-0.0172337;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=265.09;QD=14.6646;RBI=0.02306;REFB=-0.008121;REVB=-0.015322;RO=65;SAF=27;SAR=20;SRF=43;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0935313;STB=0.552464;STBP=0.388;TYPE=snp;VARB=0.0107931;OID=.;OPOS=43797619;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:112:65:65:47:47:0.419643:20:27:43:22:20:27:43:22
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chr2	43804229	.	T	C	116.72	PASS	AF=0.341463;AO=14;DP=41;FAO=14;FDP=41;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=20;FSRR=7;FWDB=-0.0288574;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.1653;QD=11.3869;RBI=0.0352491;REFB=-0.0297347;REVB=-0.0202423;RO=26;SAF=9;SAR=5;SRF=19;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109654;STB=0.573024;STBP=0.555;TYPE=snp;VARB=0.0752759;OID=.;OPOS=43804229;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:26:27:14:14:0.341463:5:9:19:7:5:9:20:7
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chr2	43903354	.	T	C	651.23	PASS	AF=0.511811;AO=64;DP=127;FAO=65;FDP=127;FR=.;FRO=62;FSAF=31;FSAR=34;FSRF=34;FSRR=28;FWDB=0.00577137;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=243.211;QD=20.5113;RBI=0.0146043;REFB=-0.00320424;REVB=-0.0134156;RO=62;SAF=30;SAR=34;SRF=34;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0710425;STB=0.534839;STBP=0.435;TYPE=snp;VARB=0.00297881;OID=.;OPOS=43903354;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:127:127:62:62:64:65:0.511811:34:30:34:28:34:31:34:28
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chr2	43931176	.	T	C	415.6	PASS	AF=0.482759;AO=42;DP=87;FAO=42;FDP=87;FR=.;FRO=45;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=24;FWDB=-0.0137128;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.853;QD=19.108;RBI=0.0157616;REFB=-0.00564035;REVB=0.0077709;RO=44;SAF=23;SAR=19;SRF=21;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0648449;STB=0.541898;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00567302;OID=.;OPOS=43931176;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:44:45:42:42:0.482759:19:23:21:23:19:23:21:24
chr2	43968167	.	G	A	984.33	PASS	AF=0.985507;AO=65;DP=66;FAO=68;FDP=69;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0399714;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.8259;QD=57.0626;RBI=0.0455914;REFB=-0.0157459;REVB=-0.0219285;RO=1;SAF=27;SAR=38;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0171739;STB=0.508194;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.00178962;OID=.;OPOS=43968167;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:66:69:1:1:65:68:0.985507:38:27:1:0:38:30:1:0
chr2	43992575	.	C	A	669.22	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0219444;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.026;QD=62.2529;RBI=0.0274987;REFB=0;REVB=-0.0165717;RO=0;SAF=23;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.65404e-05;OID=.;OPOS=43992575;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:20:23:0:0:20:23:0:0
chr2	43993448	.	G	C	923.68	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0381453;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.602;QD=58.6461;RBI=0.0428609;REFB=0;REVB=0.0195446;RO=0;SAF=36;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.31521e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000343329;OID=.;OPOS=43993448;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:27:36:0:0:27:36:0:0
chr2	43995001	.	C	T	729.01	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0132394;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.255;QD=57.1773;RBI=0.0155721;REFB=0;REVB=0.00819802;RO=0;SAF=27;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.66867e-05;OID=.;OPOS=43995001;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:24:27:0:0:24:27:0:0
chr2	44004010	.	T	C	770.68	PASS	AF=0.982143;AO=55;DP=56;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0148785;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=296.261;QD=55.0487;RBI=0.0175676;REFB=-0.118266;REVB=0.00934085;RO=0;SAF=25;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5098;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.000173359;OID=.;OPOS=44004010;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:56:56:0:1:55:55:0.982143:30:25:0:0:30:25:1:0
chr2	44021826	.	T	A	769.49	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000103518;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=267.725;QD=56.9992;RBI=0.00159244;REFB=0;REVB=0.00158907;RO=0;SAF=31;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.6027e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.24273e-06;OID=.;OPOS=44021826;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:23:31:0:0:23:31:0:0
chr2	44066174	.	T	G	270.88	PASS	AF=0.415584;AO=28;DP=73;FAO=32;FDP=77;FR=.;FRO=45;FSAF=25;FSAR=7;FSRF=29;FSRR=16;FWDB=0.0408302;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.2905;QD=14.0718;RBI=0.0602117;REFB=-0.0455942;REVB=0.0442531;RO=44;SAF=21;SAR=7;SRF=28;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146798;STB=0.603288;STBP=0.17;TYPE=snp;VARB=0.0666598;OID=.;OPOS=44066174;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:77:44:45:28:32:0.415584:7:21:28:16:7:25:29:16
chr2	44071743	.	A	G	594.46	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0124647;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.657;QD=60.9707;RBI=0.0194223;REFB=0;REVB=-0.0148949;RO=0;SAF=19;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.3303e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.28149e-05;OID=.;OPOS=44071743;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:20:19:0:0:20:19:0:0
chr2	44101538	.	C	T	1481.6	PASS	AF=1;AO=83;DP=104;FAO=104;FDP=104;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=54;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0513953;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=35.7445;QD=56.9846;RBI=0.0879612;REFB=0;REVB=-0.0713842;RO=0;SAF=41;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0216878;OID=.;OPOS=44101538;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:104:104:0:0:83:104:1:42:41:0:0:50:54:0:0
chr2	44104925	.	T	C	901.48	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0749325;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.763;QD=58.1599;RBI=0.108437;REFB=0;REVB=0.0783819;RO=0;SAF=22;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000537014;OID=.;OPOS=44104925;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:62:0:0:60:62:1:38:22:0:0:38:24:0:0
chr2	45149003	.	C	T	403.98	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00844462;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=325.64;QD=55.7208;RBI=0.0347776;REFB=0;REVB=0.0337368;RO=0;SAF=18;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000305799;OID=.;OPOS=45149003;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:29:0:0:28:29:1:10:18:0:0:11:18:0:0
chr2	45149373	.	G	T	101.89	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0298381;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.2431;QD=40.7571;RBI=0.0364242;REFB=0;REVB=-0.0208904;RO=0;SAF=4;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000263883;OID=.;OPOS=45149373;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:6:4:0:0:6:4:0:0
chr2	45171842	.	A	G	1286.69	PASS	AF=1;AO=83;DP=84;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00732794;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.254;QD=62.0092;RBI=0.0170744;REFB=0;REVB=0.0154219;RO=0;SAF=54;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.92539e-05;OID=.;OPOS=45171842;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:83:0:0:83:83:1:29:54:0:0:29:54:0:0
chr2	45640374	.	C	A	1475.43	PASS	AF=1;AO=91;DP=91;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0360836;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.174;QD=62.7843;RBI=0.0440842;REFB=0;REVB=0.0253256;RO=0;SAF=37;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00124275;OID=.;OPOS=45640374;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:91:94:0:0:91:94:1:54:37:0:0:55:39:0:0
chr2	45645512	.	C	T	1190.46	PASS	AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143779;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.808;QD=61.0492;RBI=0.023062;REFB=0;REVB=-0.0180314;RO=0;SAF=42;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.43944e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.63615e-06;OID=.;OPOS=45645512;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:36:42:0:0:36:42:0:0
chr2	45796468	.	C	G	340.74	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0118791;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=252.42;QD=54.5177;RBI=0.0161665;REFB=0;REVB=0.0109655;RO=0;SAF=15;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.26676e-05;OID=.;OPOS=45796468;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:10:15:0:0:10:15:0:0
chr2	45796479	.	C	T	116.21	PASS	AF=0.565217;AO=13;DP=23;FAO=13;FDP=23;FR=.;FRO=10;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=-0.0122275;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=283.073;QD=20.2097;RBI=0.0219062;REFB=-0.0126864;REVB=0.0181761;RO=10;SAF=9;SAR=4;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159391;STB=0.591095;STBP=0.364;TYPE=snp;VARB=0.00973553;OID=.;OPOS=45796479;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:23:23:10:10:13:13:0.565217:4:9:5:5:4:9:5:5
chr2	46313481	.	C	T	198.36	PASS	AF=0.4;AO=24;DP=60;FAO=24;FDP=60;FR=.;FRO=36;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=23;FSRR=13;FWDB=-0.0203997;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.935;QD=13.2238;RBI=0.0373375;REFB=-0.0111413;REVB=0.031272;RO=36;SAF=10;SAR=14;SRF=23;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.229439;STB=0.631041;STBP=0.115;TYPE=snp;VARB=0.0204602;OID=.;OPOS=46313481;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:36:36:24:24:0.4:14:10:23:13:14:10:23:13
chr2	46414446	.	G	A	308.86	PASS	AF=0.533333;AO=31;DP=61;FAO=32;FDP=60;FR=.;FRO=28;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=8;FSRR=20;FWDB=-0.0145971;FXX=0.0322529;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.423;QD=20.5908;RBI=0.0225408;REFB=-0.0149039;REVB=0.0171759;RO=30;SAF=15;SAR=16;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133907;STB=0.586629;STBP=0.199;TYPE=snp;VARB=0.0136587;OID=.;OPOS=46414446;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:60:30:28:31:32:0.533333:16:15:10:20:17:15:8:20
chr2	46987300	.	T	G	223.18	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.030657;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.8338;QD=49.5945;RBI=0.0308892;REFB=0;REVB=0.00378001;RO=0;SAF=9;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00123847;OID=.;OPOS=46987300;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:9:9:0:0:9:9:0:0
chr2	47045309	.	C	T	374.8	PASS	AF=0.933333;AO=28;DP=30;FAO=28;FDP=30;FR=.;FRO=2;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0118941;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.6508;QD=49.9736;RBI=0.0313945;REFB=-0.00568256;REVB=0.0290542;RO=2;SAF=17;SAR=11;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0516604;STB=0.527758;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=0.00457072;OID=.;OPOS=47045309;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:30:30:2:2:28:28:0.933333:11:17:2:0:11:17:2:0
chr2	47045321	.	A	G	198.01	PASS	AF=0.655172;AO=17;DP=28;FAO=19;FDP=29;FR=.;FRO=10;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=2;FWDB=0.0418636;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.557;QD=27.3121;RBI=0.0420675;REFB=-0.0254052;REVB=0.0041371;RO=11;SAF=9;SAR=8;SRF=9;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.207419;STB=0.595492;STBP=0.163;TYPE=snp;VARB=0.016563;OID=.;OPOS=47045321;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:28:29:11:10:17:19:0.655172:8:9:9:2:9:10:8:2
chr2	47168774	.	C	G	118.32	PASS	AF=0.378378;AO=14;DP=37;FAO=14;FDP=37;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=0.0497271;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.078;QD=12.7914;RBI=0.0547178;REFB=-0.0168185;REVB=-0.0228309;RO=23;SAF=12;SAR=2;SRF=16;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.263104;STB=0.658273;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=0.0256028;OID=.;OPOS=47168774;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:23:23:14:14:0.378378:2:12:16:7:2:12:16:7
chr2	47201797	.	A	T	1378.18	PASS	AF=0.925926;AO=98;DP=128;FAO=125;FDP=135;FR=.;FRO=10;FSAF=62;FSAR=63;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=0.219174;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=28.3691;QD=40.835;RBI=0.21967;REFB=-0.191892;REVB=0.0147579;RO=28;SAF=44;SAR=54;SRF=22;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139678;STB=0.507702;STBP=0.591;TYPE=snp;VARB=0.0156942;OID=.;OPOS=47201797;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:17:128:135:28:10:98:125:0.925926:54:44:22:6:63:62:6:4
chr2	47251510	.	G	C	251.78	PASS	AF=0.5;AO=24;DP=48;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=-0.0198805;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.337;QD=20.9818;RBI=0.0240196;REFB=-0.00290367;REVB=-0.0134798;RO=24;SAF=15;SAR=9;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114584;STB=0.564461;STBP=0.348;TYPE=snp;VARB=0.00311597;OID=.;OPOS=47251510;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:24:24:24:24:0.5:9:15:12:12:9:15:12:12
chr2	47301029	.	A	G	250.38	PASS	AF=0.48;AO=24;DP=50;FAO=24;FDP=50;FR=.;FRO=26;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=0.00579184;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.498;QD=20.0307;RBI=0.0181693;REFB=-0.00492081;REVB=-0.0172214;RO=26;SAF=16;SAR=8;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0132254;STB=0.507456;STBP=0.945;TYPE=snp;VARB=0.00400593;OID=.;OPOS=47301029;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:26:26:24:24:0.48:8:16:17:9:8:16:17:9
chr2	47301624	.	T	C,TTGGGGCCTC	87.46	PASS	AF=0.0793651,0.15873;AO=7,7;DP=64;FAO=5,10;FDP=63;FR=.;FRO=48;FSAF=5,6;FSAR=0,4;FSRF=29;FSRR=19;FWDB=-0.00542143,-0.0045091;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,9;MLLD=192.47,184.48;QD=5.55318;RBI=0.0141695,0.0114587;REFB=-0.00102741,-0.00216291;REVB=-0.0130913,-0.0105342;RO=48;SAF=6,5;SAR=1,2;SRF=28;SRR=20;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.374469,0.167223;STB=0.997444,0.50359;STBP=0.041,0.991;TYPE=snp,ins;VARB=0.00347042,0.00969936;OID=.,.;OPOS=47301624,47301625;OREF=T,-;OALT=C,TGGGGCCTC;OMAPALT=C,TTGGGGCCTC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:50:64:63:48:48:7,7:5,10:0.0793651,0.15873:1,2:6,5:28:20:0,4:5,6:29:19
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chr2	47604866	.	C	T	664.9	PASS	AF=0.413408;AO=74;DP=179;FAO=74;FDP=179;FR=.;FRO=105;FSAF=35;FSAR=39;FSRF=47;FSRR=58;FWDB=-0.0137574;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.1015;QD=14.8581;RBI=0.0268717;REFB=-0.0146407;REVB=-0.023083;RO=103;SAF=35;SAR=39;SRF=45;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0377116;STB=0.514936;STBP=0.711;TYPE=snp;VARB=0.0134347;OID=.;OPOS=47604866;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:179:179:103:105:74:74:0.413408:39:35:45:58:39:35:47:58
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chr2	48807796	.	A	C	50.46	PASS	AF=0.583333;AO=7;DP=12;FAO=7;FDP=12;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.00783376;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=84.8542;QD=16.8183;RBI=0.0336023;REFB=-0.0194807;REVB=0.0326764;RO=5;SAF=4;SAR=3;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121017;STB=0.571224;STBP=0.651;TYPE=snp;VARB=0.048779;OID=.;OPOS=48807796;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:12:12:5:5:7:7:0.583333:3:4:2:3:3:4:2:3
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chr2	48808152	.	G	C	94.56	PASS	AF=0.611111;AO=11;DP=18;FAO=11;FDP=18;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.0368335;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.3511;QD=21.0122;RBI=0.0595138;REFB=-0.0122412;REVB=-0.046746;RO=7;SAF=5;SAR=6;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0795615;STB=0.545372;STBP=0.688;TYPE=snp;VARB=0.0107776;OID=.;OPOS=48808152;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:18:18:7:7:11:11:0.611111:6:5:4:3:6:5:4:3
chr2	48808594	.	C	T	295.76	PASS	AF=0.534483;AO=31;DP=58;FAO=31;FDP=58;FR=.;FRO=27;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=0.00103165;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=282.487;QD=20.3971;RBI=0.00319133;REFB=-0.0155364;REVB=0.00301998;RO=27;SAF=14;SAR=17;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.025196;STB=0.513989;STBP=0.856;TYPE=snp;VARB=0.0133842;OID=.;OPOS=48808594;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:27:27:31:31:0.534483:17:14:13:14:17:14:13:14
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chr2	48808898	.	C	T	157.73	PASS	AF=0.357143;AO=20;DP=56;FAO=20;FDP=56;FR=.;FRO=36;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=0.00517576;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.486;QD=11.2665;RBI=0.0248914;REFB=-0.0097652;REVB=-0.0243474;RO=36;SAF=8;SAR=12;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141633;STB=0.582651;STBP=0.357;TYPE=snp;VARB=0.019628;OID=.;OPOS=48808898;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:36:36:20:20:0.357143:12:8:19:17:12:8:19:17
chr2	48809593	.	G	T	159.19	PASS	AF=0.333333;AO=21;DP=63;FAO=21;FDP=63;FR=.;FRO=42;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=25;FSRR=17;FWDB=0.0155033;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.639;QD=10.1074;RBI=0.0163871;REFB=-0.0074717;REVB=0.0053091;RO=42;SAF=12;SAR=9;SRF=25;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0277415;STB=0.516264;STBP=0.847;TYPE=snp;VARB=0.0124408;OID=.;OPOS=48809593;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:42:42:21:21:0.333333:9:12:25:17:9:12:25:17
chr2	48825650	.	C	G	142.71	PASS	AF=0.380952;AO=16;DP=42;FAO=16;FDP=42;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=0.00135362;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.0167;QD=13.5911;RBI=0.0150886;REFB=-0.0134488;REVB=0.0150278;RO=26;SAF=8;SAR=8;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0234675;OID=.;OPOS=48825650;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:26:26:16:16:0.380952:8:8:13:13:8:8:13:13
chr2	48898798	.	T	A	2197.34	PASS	AF=0.959732;AO=143;DP=149;FAO=143;FDP=149;FR=.;FRO=6;FSAF=49;FSAR=94;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0366286;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.0903;QD=58.9891;RBI=0.0907991;REFB=0.0274707;REVB=-0.0830832;RO=3;SAF=49;SAR=94;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0149326;STB=0.507;STBP=0.421;TYPE=snp;VARB=-0.00223145;OID=.;OPOS=48898798;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:149:149:3:6:143:143:0.959732:94:49:0:3:94:49:3:3
chr2	48915871	.	A	G	732.0	PASS	AF=1;AO=46;DP=49;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0344729;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.3307;QD=61.0001;RBI=0.0593654;REFB=-0.0941853;REVB=0.0483309;RO=2;SAF=14;SAR=32;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0179386;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00285656;OID=.;OPOS=48915871;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:49:48:2:0:46:48:1:32:14:1:1:33:15:0:0
chr2	48921375	.	T	C	1026.56	PASS	AF=1;AO=69;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0301463;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.535;QD=58.6608;RBI=0.0378677;REFB=0;REVB=0.0229164;RO=0;SAF=42;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.56939e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.70778e-05;OID=.;OPOS=48921375;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:70:70:0:0:69:70:1:27:42:0:0:27:43:0:0
chr2	48960032	.	G	A	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00897423;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.81;QD=53.2759;RBI=0.0495614;REFB=0;REVB=0.0487422;RO=0;SAF=11;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000520532;OID=.;OPOS=48960032;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:12:11:0:0:12:11:0:0
chr2	49189921	.	C	T	1044.62	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0117133;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.386;QD=59.6926;RBI=0.0233129;REFB=0;REVB=0.0201567;RO=0;SAF=41;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.34083e-05;OID=.;OPOS=49189921;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:70:0:0:69:70:1:28:41:0:0:29:41:0:0
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chr2	54035508	.	G	C	1974.22	PASS	AF=1;AO=127;DP=128;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0245787;FXX=0.00781189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.9238;QD=62.1803;RBI=0.0391604;REFB=0;REVB=-0.0304864;RO=0;SAF=64;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.21543e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000275079;OID=.;OPOS=54035508;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:128:127:0:0:127:127:1:63:64:0:0:63:64:0:0
chr2	54081923	.	T	G	854.54	PASS	AF=1;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00706188;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.017;QD=57.9351;RBI=0.0081676;REFB=0;REVB=-0.00410359;RO=0;SAF=27;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.96591e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.73153e-05;OID=.;OPOS=54081923;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:59:0:0:59:59:1:32:27:0:0:32:27:0:0
chr2	54120820	.	G	A	692.8	PASS	AF=1;AO=43;DP=45;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0230156;FXX=0.0222173;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.587;QD=62.9822;RBI=0.0230349;REFB=0;REVB=-0.000943363;RO=0;SAF=19;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000121724;OID=.;OPOS=54120820;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:44:0:0:43:44:1:24:19:0:0:25:19:0:0
chr2	54127041	.	C	T	2492.44	PASS	AF=1;AO=162;DP=162;FAO=162;FDP=162;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0275239;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.0615;QD=61.5417;RBI=0.0285368;REFB=0;REVB=-0.00753551;RO=0;SAF=81;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000111474;OID=.;OPOS=54127041;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:162:162:0:0:162:162:1:81:81:0:0:81:81:0:0
chr2	54150237	.	A	G	675.64	PASS	AF=1;AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000818225;FXX=0.0227221;HRUN=3;LEN=1;MLLD=280.721;QD=62.8503;RBI=0.00100113;REFB=0;REVB=-0.000576865;RO=0;SAF=25;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.65211e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.66011e-05;OID=.;OPOS=54150237;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:43:0:0:43:43:1:18:25:0:0:18:25:0:0
chr2	54362645	.	T	C,TC	307.75	PASS	AF=0.958333,0.0416667;AO=15,4;DP=24;FAO=23,1;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=12,1;FSAR=11,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.156634,0.150092;FXX=0;HRUN=8,2;LEN=1,1;MLLD=30.8657,23.6775;QD=51.2917;RBI=0.177582,0.154114;REFB=0,0;REVB=0.0836729,0.0349779;RO=0;SAF=9,3;SAR=6,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,4.86674e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,ins;VARB=0.034228,-0.0134627;OID=.,.;OPOS=54362645,54362646;OREF=T,-;OALT=C,C;OMAPALT=C,TC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:5:24:24:0:0:15,4:23,1:0.958333,0.0416667:6,1:9,3:0:0:11,0:12,1:0:0
chr2	54482675	.	AG	A	51.81	PASS	AF=0.6;AO=8;DP=15;FAO=9;FDP=15;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0939427;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=14.249;QD=13.8157;RBI=0.0948049;REFB=-0.00983597;REVB=0.0127572;RO=6;SAF=1;SAR=7;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.492481;STB=0.799198;STBP=0.024;TYPE=del;VARB=0.0345468;OID=.;OPOS=54482676;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.6:8:15:9:15:6:1:8:4:2:32:6:1:7:4:2
chr2	54482989	.	C	T	241.69	PASS	AF=0.522727;AO=23;DP=44;FAO=23;FDP=44;FR=.;FRO=21;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=-0.0341584;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.904;QD=21.972;RBI=0.0526939;REFB=-0.0297851;REVB=-0.0401229;RO=21;SAF=12;SAR=11;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0791788;STB=0.54434;STBP=0.559;TYPE=snp;VARB=0.0283374;OID=.;OPOS=54482989;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:21:21:23:23:0.522727:11:12:9:12:11:12:9:12
chr2	54494448	.	G	A	605.26	PASS	AF=0.521368;AO=61;DP=117;FAO=61;FDP=117;FR=.;FRO=56;FSAF=22;FSAR=39;FSRF=25;FSRR=31;FWDB=-0.00908801;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=222.254;QD=20.6925;RBI=0.0107583;REFB=-0.000625593;REVB=-0.00575758;RO=56;SAF=22;SAR=39;SRF=25;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0788088;STB=0.543419;STBP=0.36;TYPE=snp;VARB=0.000848926;OID=.;OPOS=54494448;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:117:117:56:56:61:61:0.521368:39:22:25:31:39:22:25:31
chr2	54587596	.	C	T	447.02	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0220857;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.486;QD=57.6802;RBI=0.0223963;REFB=0;REVB=-0.00371697;RO=0;SAF=18;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.33668e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000552047;OID=.;OPOS=54587596;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:13:18:0:0:13:18:0:0
chr2	54587659	.	G	C	211.74	PASS	AF=0.488372;AO=21;DP=42;FAO=21;FDP=43;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=5;FWDB=-0.0343686;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.58;QD=19.6971;RBI=0.0343858;REFB=-0.0104741;REVB=-0.00108599;RO=21;SAF=8;SAR=13;SRF=16;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.328401;STB=0.692791;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0111938;OID=.;OPOS=54587659;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:43:21:22:21:21:0.488372:13:8:16:5:13:8:17:5
chr2	54756740	.	C	T	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0234474;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=225.452;QD=51.9167;RBI=0.029823;REFB=0;REVB=0.018429;RO=0;SAF=9;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000160221;OID=.;OPOS=54756740;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:12:9:0:0:12:9:0:0
chr2	54844790	.	C	T	556.98	PASS	AF=0.513514;AO=57;DP=111;FAO=57;FDP=111;FR=.;FRO=54;FSAF=19;FSAR=38;FSRF=26;FSRR=28;FWDB=-0.0267455;FXX=0.00892777;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.846;QD=20.0712;RBI=0.0267505;REFB=0.00175701;REVB=-0.00051716;RO=54;SAF=19;SAR=38;SRF=26;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13913;STB=0.576895;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=-0.000641328;OID=.;OPOS=54844790;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:111:54:54:57:57:0.513514:38:19:26:28:38:19:26:28
chr2	54858511	.	C	T	66.84	PASS	AF=0.428571;AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=0.063538;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.709;QD=12.7311;RBI=0.0635652;REFB=-0.0257813;REVB=-0.00185678;RO=12;SAF=5;SAR=4;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.211189;STB=0.624732;STBP=0.35;TYPE=snp;VARB=0.0167634;OID=.;OPOS=54858511;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:21:21:12:12:9:9:0.428571:4:5:4:8:4:5:4:8
chr2	54886347	.	G	A	326.18	PASS	AF=0.523077;AO=34;DP=65;FAO=34;FDP=65;FR=.;FRO=31;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=-0.00414487;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.012;QD=20.0726;RBI=0.0190365;REFB=-0.00739116;REVB=-0.0185798;RO=31;SAF=15;SAR=19;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0190585;STB=0.510573;STBP=0.875;TYPE=snp;VARB=0.00747865;OID=.;OPOS=54886347;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:31:31:34:34:0.523077:19:15:13:18:19:15:13:18
chr2	55040426	.	A	G	1320.72	PASS	AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0271128;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.019;QD=62.1513;RBI=0.0298056;REFB=0;REVB=0.0123802;RO=0;SAF=34;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000131265;OID=.;OPOS=55040426;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:51:34:0:0:51:34:0:0
chr2	55185032	.	A	G	266.66	PASS	AF=0.447761;AO=30;DP=67;FAO=30;FDP=67;FR=.;FRO=37;FSAF=21;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=24;FWDB=-0.0284533;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.7323;QD=15.9198;RBI=0.0636989;REFB=-0.00810551;REVB=-0.0569908;RO=37;SAF=21;SAR=9;SRF=13;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.343101;STB=0.693564;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.00793343;OID=.;OPOS=55185032;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:37:37:30:30:0.447761:9:21:13:24:9:21:13:24
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chr2	55404794	.	G	A	348.93	PASS	AF=0.57377;AO=35;DP=61;FAO=35;FDP=61;FR=.;FRO=26;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=7;FSRR=19;FWDB=-0.0287143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.429;QD=22.8807;RBI=0.0508607;REFB=-0.00678873;REVB=-0.0419797;RO=26;SAF=19;SAR=16;SRF=7;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.209654;STB=0.615108;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.00311255;OID=.;OPOS=55404794;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:26:26:35:35:0.57377:16:19:7:19:16:19:7:19
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chr2	55407754	.	C	T	785.88	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0433942;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.368;QD=64.1537;RBI=0.0629499;REFB=0;REVB=0.045603;RO=0;SAF=27;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.30731e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000323893;OID=.;OPOS=55407754;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:22:27:0:0:22:27:0:0
chr2	55449464	.	T	C	238.31	PASS	AF=0.457627;AO=26;DP=58;FAO=27;FDP=59;FR=.;FRO=32;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=-0.0020332;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=200.33;QD=16.1567;RBI=0.00819321;REFB=-0.026515;REVB=0.00793693;RO=31;SAF=7;SAR=19;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.229249;STB=0.629368;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=0.026921;OID=.;OPOS=55449464;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:59:31:32:26:27:0.457627:19:7:15:16:20:7:15:17
chr2	55460017	.	C	T	391.73	PASS	AF=0.493827;AO=40;DP=81;FAO=40;FDP=81;FR=.;FRO=41;FSAF=10;FSAR=30;FSRF=17;FSRR=24;FWDB=0.00326161;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.183;QD=19.3446;RBI=0.00713689;REFB=-0.0277053;REVB=0.006348;RO=38;SAF=10;SAR=30;SRF=15;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154073;STB=0.599947;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=0.0215392;OID=.;OPOS=55460017;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:38:41:40:40:0.493827:30:10:15:23:30:10:17:24
chr2	55470115	.	C	T	238.3	PASS	AF=0.457627;AO=27;DP=59;FAO=27;FDP=59;FR=.;FRO=32;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=-6.42925e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.1302;QD=16.1558;RBI=0.00247198;REFB=-0.00613159;REVB=-0.00247115;RO=32;SAF=15;SAR=12;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0536612;STB=0.530281;STBP=0.658;TYPE=snp;VARB=0.0046103;OID=.;OPOS=55470115;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:32:32:27:27:0.457627:12:15:16:16:12:15:16:16
chr2	55490788	.	T	C	84.78	PASS	AF=0.354839;AO=11;DP=31;FAO=11;FDP=31;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.00732902;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.367;QD=10.94;RBI=0.00845809;REFB=0.000559666;REVB=0.00422194;RO=20;SAF=4;SAR=7;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202063;STB=0.621079;STBP=0.337;TYPE=snp;VARB=-0.00186544;OID=.;OPOS=55490788;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:31:31:20:20:11:11:0.354839:7:4:11:9:7:4:11:9
chr2	55490819	.	G	T	296.35	PASS	AF=0.634146;AO=26;DP=41;FAO=26;FDP=41;FR=.;FRO=15;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.0239512;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.5161;QD=28.912;RBI=0.0842001;REFB=-0.0192622;REVB=0.0807218;RO=15;SAF=15;SAR=11;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0739929;STB=0.540765;STBP=0.479;TYPE=snp;VARB=0.0126578;OID=.;OPOS=55490819;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:15:15:26:26:0.634146:11:15:7:8:11:15:7:8
chr2	55516723	.	C	T	632.25	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0248611;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.553;QD=61.6832;RBI=0.0252253;REFB=0;REVB=-0.00427125;RO=0;SAF=15;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.8699e-05;OID=.;OPOS=55516723;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:26:15:0:0:26:15:0:0
chr2	55522422	.	A	G	1344.5	PASS	AF=0.988636;AO=87;DP=88;FAO=87;FDP=88;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00652033;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.927;QD=61.1137;RBI=0.00665907;REFB=-0.128528;REVB=-0.00135222;RO=1;SAF=38;SAR=49;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00957246;STB=0.505049;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=-5.72775e-05;OID=.;OPOS=55522422;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:88:88:1:1:87:87:0.988636:49:38:0:1:49:38:0:1
chr2	55599655	.	G	A	1645.04	PASS	AF=1;AO=102;DP=102;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0236236;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.731;QD=59.8195;RBI=0.0271437;REFB=0;REVB=0.0133681;RO=0;SAF=54;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.03919e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.7531e-05;OID=.;OPOS=55599655;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:102:110:0:0:102:110:1:48:54:0:0:51:59:0:0
chr2	55727140	.	C	A	75.59	PASS	AF=0.416667;AO=9;DP=23;FAO=10;FDP=24;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.0194265;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.278;QD=12.5976;RBI=0.0196317;REFB=-0.00798784;REVB=0.00283126;RO=14;SAF=5;SAR=4;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.19924;STB=0.583171;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.032559;OID=.;OPOS=55727140;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:23:24:14:14:9:10:0.416667:4:5:5:9:5:5:5:9
chr2	55771161	.	A	G	277.99	PASS	AF=0.421053;AO=31;DP=75;FAO=32;FDP=76;FR=.;FRO=44;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=25;FWDB=0.0289466;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.0251;QD=14.6309;RBI=0.0299263;REFB=0.00266472;REVB=0.00759472;RO=44;SAF=17;SAR=14;SRF=19;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120014;STB=0.557341;STBP=0.405;TYPE=snp;VARB=-0.00449434;OID=.;OPOS=55771161;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:76:44:44:31:32:0.421053:14:17:19:25:15:17:19:25
chr2	55805440	.	T	C	750.07	PASS	AF=1;AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0318767;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.124;QD=63.8354;RBI=0.032695;REFB=0;REVB=0.00726885;RO=0;SAF=23;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000343035;OID=.;OPOS=55805440;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:47:0:0:47:47:1:24:23:0:0:24:23:0:0
chr2	55873385	.	C	G	600.25	PASS	AF=0.561905;AO=59;DP=105;FAO=59;FDP=105;FR=.;FRO=46;FSAF=32;FSAR=27;FSRF=21;FSRR=25;FWDB=0.0450587;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.9581;QD=22.8666;RBI=0.0450934;REFB=-0.0262666;REVB=-0.00176814;RO=46;SAF=32;SAR=27;SRF=21;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0687682;STB=0.537629;STBP=0.392;TYPE=snp;VARB=0.0227909;OID=.;OPOS=55873385;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:105:46:46:59:59:0.561905:27:32:21:25:27:32:21:25
chr2	55883317	.	G	T	136.74	PASS	AF=0.32;AO=16;DP=49;FAO=16;FDP=50;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=23;FWDB=-0.00284428;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=239.706;QD=10.9389;RBI=0.00481784;REFB=-0.00143586;REVB=0.00388865;RO=33;SAF=10;SAR=6;SRF=11;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.321785;STB=0.696885;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.00266665;OID=.;OPOS=55883317;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:50:33:34:16:16:0.32:6:10:11:22:6:10:11:23
chr2	55912120	.	T	C	138.16	PASS	AF=0.5;AO=14;DP=30;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.0133498;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.942;QD=18.4207;RBI=0.0373394;REFB=0.00142888;REVB=0.0348714;RO=16;SAF=5;SAR=9;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137003;STB=0.567477;STBP=0.488;TYPE=snp;VARB=-0.000873694;OID=.;OPOS=55912120;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:16:15:14:15:0.5:9:5:8:8:9:6:8:7
chr2	56411817	.	C	T	57.26	PASS	AF=0.875;AO=7;DP=8;FAO=7;FDP=8;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0160342;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=190.284;QD=28.6308;RBI=0.0161874;REFB=-0.0797933;REVB=-0.0022214;RO=1;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124421;STB=0.571224;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=0.00132541;OID=.;OPOS=56411817;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:8:8:1:1:7:7:0.875:3:4:0:1:3:4:0:1
chr2	58316814	.	A	G	241.12	PASS	AF=0.424242;AO=28;DP=66;FAO=28;FDP=66;FR=.;FRO=38;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=0.00863182;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.005;QD=14.6131;RBI=0.0140946;REFB=-0.00424075;REVB=-0.0111422;RO=38;SAF=9;SAR=19;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164402;STB=0.593681;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=0.00396369;OID=.;OPOS=58316814;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:38:38:28:28:0.424242:19:9:18:20:19:9:18:20
chr2	58388696	.	A	G	76.45	PASS	AF=0.4;AO=9;DP=24;FAO=10;FDP=25;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.0128766;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.406;QD=12.2312;RBI=0.0142411;REFB=-0.00442111;REVB=0.00608303;RO=15;SAF=6;SAR=3;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145524;STB=0.540901;STBP=0.781;TYPE=snp;VARB=0.00536403;OID=.;OPOS=58388696;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:24:25:15:15:9:10:0.4:3:6:8:7:4:6:8:7
chr2	60614572	.	G	A	689.38	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0325788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.999;QD=62.6704;RBI=0.0337742;REFB=0;REVB=0.00890628;RO=0;SAF=21;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000108678;OID=.;OPOS=60614572;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:23:21:0:0:23:21:0:0
chr2	60614577	.	A	G	594.53	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0303043;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.078;QD=60.9777;RBI=0.0304762;REFB=0;REVB=-0.00323234;RO=0;SAF=19;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.3303e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000129809;OID=.;OPOS=60614577;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:20:19:0:0:20:19:0:0
chr2	60687959	.	A	G	937.61	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0189216;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=193.68;QD=58.6004;RBI=0.018925;REFB=0;REVB=0.00035384;RO=0;SAF=31;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.74682e-05;OID=.;OPOS=60687959;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:33:31:0:0:33:31:0:0
chr2	60867976	.	C	T	300.25	PASS	AF=0.55102;AO=27;DP=49;FAO=27;FDP=49;FR=.;FRO=22;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.0246855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.258;QD=24.51;RBI=0.0357994;REFB=-0.0169263;REVB=0.0259272;RO=22;SAF=14;SAR=13;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0149647;STB=0.508315;STBP=0.953;TYPE=snp;VARB=0.0206343;OID=.;OPOS=60867976;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:22:22:27:27:0.55102:13:14:11:11:13:14:11:11
chr2	61009909	.	C	T	96.76	PASS	AF=0.387097;AO=12;DP=31;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=15;FWDB=0.0563839;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.165;QD=12.4847;RBI=0.0666205;REFB=-0.00165371;REVB=-0.0354843;RO=17;SAF=5;SAR=7;SRF=4;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.195748;STB=0.635637;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.00334516;OID=.;OPOS=61009909;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:31:31:17:19:12:12:0.387097:7:5:4:13:7:5:4:15
chr2	61175312	.	T	C	107.95	PASS	AF=0.258065;AO=16;DP=62;FAO=16;FDP=62;FR=.;FRO=46;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=28;FWDB=-0.0055979;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=245.063;QD=6.96431;RBI=0.0107165;REFB=0.00162194;REVB=0.00913819;RO=45;SAF=7;SAR=9;SRF=17;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.074254;STB=0.535081;STBP=0.764;TYPE=snp;VARB=-0.00547135;OID=.;OPOS=61175312;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:45:46:16:16:0.258065:9:7:17:28:9:7:18:28
chr2	61385100	.	G	A	195.17	PASS	AF=0.418182;AO=23;DP=55;FAO=23;FDP=55;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=0.0119826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.6992;QD=14.1943;RBI=0.0194475;REFB=0.00674354;REVB=0.0153175;RO=32;SAF=14;SAR=9;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0809336;STB=0.546301;STBP=0.569;TYPE=snp;VARB=-0.0117533;OID=.;OPOS=61385100;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:32:32:23:23:0.418182:9:14:17:15:9:14:17:15
chr2	61385105	.	G	C	197.78	PASS	AF=0.425926;AO=23;DP=54;FAO=23;FDP=54;FR=.;FRO=31;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=-0.00842931;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=318.029;QD=14.6506;RBI=0.0129102;REFB=-0.00658271;REVB=0.0097785;RO=31;SAF=14;SAR=9;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0952689;STB=0.554408;STBP=0.561;TYPE=snp;VARB=0.00896343;OID=.;OPOS=61385105;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:31:31:23:23:0.425926:9:14:16:15:9:14:16:15
chr2	61389737	.	T	G	173.7	PASS	AF=0.360656;AO=22;DP=61;FAO=22;FDP=61;FR=.;FRO=39;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=17;FWDB=0.0592662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.148;QD=11.3903;RBI=0.0678069;REFB=-0.00953466;REVB=0.0329438;RO=37;SAF=12;SAR=10;SRF=22;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0540267;STB=0.512037;STBP=0.898;TYPE=snp;VARB=0.0173796;OID=.;OPOS=61389737;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:37:39:22:22:0.360656:10:12:22:15:10:12:22:17
chr2	61415492	.	A	G	70.71	PASS	AF=0.25641;AO=10;DP=39;FAO=10;FDP=39;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=-0.0179057;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.572;QD=7.2519;RBI=0.0180963;REFB=-0.00121526;REVB=0.00261941;RO=29;SAF=7;SAR=3;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14712;STB=0.593026;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.0028154;OID=.;OPOS=61415492;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:70:39:39:29:29:10:10:0.25641:3:7:17:12:3:7:17:12
chr2	61450454	.	A	G	299.09	PASS	AF=0.390805;AO=34;DP=87;FAO=34;FDP=87;FR=.;FRO=53;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=24;FSRR=29;FWDB=0.0234706;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=81.4584;QD=13.7513;RBI=0.0332921;REFB=-0.00775884;REVB=0.0236114;RO=53;SAF=22;SAR=12;SRF=24;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.210773;STB=0.620286;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=0.00799913;OID=.;OPOS=61450454;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:53:53:34:34:0.390805:12:22:24:29:12:22:24:29
chr2	61522123	.	T	C	1116.89	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0129251;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.6949;QD=60.3726;RBI=0.0358132;REFB=0;REVB=0.0333995;RO=0;SAF=39;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.80413e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000440082;OID=.;OPOS=61522123;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:35:39:0:0:35:39:0:0
chr2	61575308	.	A	G	789.16	PASS	AF=1;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0531854;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.099;QD=64.4212;RBI=0.0583959;REFB=0;REVB=-0.024112;RO=0;SAF=28;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.07378e-05;OID=.;OPOS=61575308;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:49:0:0:49:49:1:21:28:0:0:21:28:0:0
chr2	61577435	.	T	C	332.7	PASS	AF=0.58;AO=29;DP=50;FAO=29;FDP=50;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=0.00632416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.588;QD=26.6163;RBI=0.0122136;REFB=-0.0125858;REVB=0.0104488;RO=21;SAF=13;SAR=16;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164754;STB=0.590909;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=0.0101829;OID=.;OPOS=61577435;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:21:21:29:29:0.58:16:13:14:7:16:13:14:7
chr2	62066927	.	A	G	972.82	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0130796;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.5568;QD=58.9585;RBI=0.0193572;REFB=0;REVB=-0.0142698;RO=0;SAF=25;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.04816e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000203277;OID=.;OPOS=62066927;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:41:25:0:0:41:25:0:0
chr2	62081012	.	A	C	1208.95	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00567878;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.587;QD=61.2125;RBI=0.00621415;REFB=0;REVB=-0.00252331;RO=0;SAF=37;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.76944e-05;OID=.;OPOS=62081012;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:42:37:0:0:42:37:0:0
chr2	62729674	.	T	C	1013.57	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0164893;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.052;QD=59.6218;RBI=0.0786116;REFB=0;REVB=0.0768628;RO=0;SAF=33;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000350358;OID=.;OPOS=62729674;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:35:33:0:0:35:33:0:0
chr2	62733189	.	C	T	2865.82	PASS	AF=0.540434;AO=274;DP=506;FAO=274;FDP=507;FR=.;FRO=233;FSAF=151;FSAR=123;FSRF=137;FSRR=96;FWDB=-0.00754778;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.927;QD=22.61;RBI=0.0175931;REFB=-0.0230809;REVB=-0.0158918;RO=230;SAF=151;SAR=123;SRF=135;SRR=95;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0305539;STB=0.51719;STBP=0.403;TYPE=snp;VARB=0.0197903;OID=.;OPOS=62733189;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:506:507:230:233:274:274:0.540434:123:151:135:95:123:151:137:96
chr2	62733253	.	C	T	4449.32	PASS	AF=0.972881;AO=287;DP=296;FAO=287;FDP=295;FR=.;FRO=8;FSAF=148;FSAR=139;FSRF=8;FSRR=0;FWDB=0.0766255;FXX=0.00337826;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.0941;QD=60.3298;RBI=0.0828237;REFB=-0.0416884;REVB=0.0314372;RO=8;SAF=148;SAR=139;SRF=8;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0250744;STB=0.513157;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.000555133;OID=.;OPOS=62733253;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:296:295:8:8:287:287:0.972881:139:148:8:0:139:148:8:0
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chr2	65311555	.	C	T	579.03	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0292981;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.714;QD=60.9509;RBI=0.030759;REFB=0;REVB=-0.00936673;RO=0;SAF=18;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000200011;OID=.;OPOS=65311555;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:38:0:0:36:38:1:18:18:0:0:19:19:0:0
chr2	65495887	.	G	A	2277.47	PASS	AF=1;AO=143;DP=144;FAO=143;FDP=143;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00562394;FXX=0.00694396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.638;QD=63.7054;RBI=0.0133328;REFB=0;REVB=0.0120887;RO=0;SAF=82;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.21229e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.27536e-06;OID=.;OPOS=65495887;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:144:143:0:0:143:143:1:61:82:0:0:61:82:0:0
chr2	65496018	.	C	G	830.78	PASS	AF=1;AO=58;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0150089;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.568;QD=55.385;RBI=0.0171765;REFB=-0.0629475;REVB=0.00835268;RO=0;SAF=34;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.31293e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000335716;OID=.;OPOS=65496018;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:60:60:0:0:58:60:1:24:34:0:0:24:36:0:0
chr2	65496144	.	A	G	1014.81	PASS	AF=1;AO=68;DP=70;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0260849;FXX=0.0285673;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.9645;QD=59.695;RBI=0.0266253;REFB=0;REVB=0.0053371;RO=0;SAF=28;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000728147;OID=.;OPOS=65496144;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:70:68:0:0:68:68:1:40:28:0:0:40:28:0:0
chr2	65496187	.	G	A	851.04	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0179205;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.322;QD=57.6979;RBI=0.0199662;REFB=0;REVB=-0.00880384;RO=0;SAF=26;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.00382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000155493;OID=.;OPOS=65496187;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:33:26:0:0:33:26:0:0
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chr2	65540905	.	C	G	763.13	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108373;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=304.475;QD=56.5278;RBI=0.0132141;REFB=0;REVB=-0.00756075;RO=0;SAF=25;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000123147;OID=.;OPOS=65540905;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:54:0:0:52:54:1:27:25:0:0:27:27:0:0
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chr2	65659060	.	AG	A	41.23	PASS	AF=0.4;AO=11;DP=25;FAO=10;FDP=25;FR=.;FRO=15;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=-0.0392477;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=12.6697;QD=6.59613;RBI=0.150357;REFB=-0.117059;REVB=-0.145144;RO=14;SAF=3;SAR=8;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0.422819;SSSB=-0.169053;STB=0.567427;STBP=0.642;TYPE=del;VARB=0.167464;OID=.;OPOS=65659061;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.4:11:25:10:25:15:3:7:6:9:41:14:3:8:6:8
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chr2	67631831	.	G	A	229.59	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0311029;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.063;QD=48.3354;RBI=0.0381565;REFB=0;REVB=0.0221026;RO=0;SAF=11;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000823749;OID=.;OPOS=67631831;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:19:0:0:17:19:1:6:11:0:0:8:11:0:0
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chr2	68511584	.	A	G	80.27	PASS	AF=0.526316;AO=10;DP=19;FAO=10;FDP=19;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=1;FWDB=0.00155099;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.985;QD=16.8984;RBI=0.05842;REFB=-0.0128431;REVB=0.0583995;RO=9;SAF=6;SAR=4;SRF=8;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.265517;STB=0.650903;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=0.0157598;OID=.;OPOS=68511584;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:19:19:9:9:10:10:0.526316:4:6:8:1:4:6:8:1
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chr2	68613710	.	G	A	610.25	PASS	AF=0.560748;AO=60;DP=107;FAO=60;FDP=107;FR=.;FRO=47;FSAF=29;FSAR=31;FSRF=23;FSRR=24;FWDB=-0.00315592;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.0427;QD=22.8131;RBI=0.00559838;REFB=-0.00239436;REVB=0.00462408;RO=47;SAF=29;SAR=31;SRF=23;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0048427;STB=0.50265;STBP=0.979;TYPE=snp;VARB=0.00185388;OID=.;OPOS=68613710;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:107:47:47:60:60:0.560748:31:29:23:24:31:29:23:24
chr2	68622914	.	G	A	353.54	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0546924;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.781;QD=54.3909;RBI=0.0552153;REFB=0;REVB=-0.00758116;RO=0;SAF=10;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000195776;OID=.;OPOS=68622914;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:26:0:0:25:26:1:15:10:0:0:15:11:0:0
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chr2	69204671	.	A	T	522.2	PASS	AF=0.419118;AO=57;DP=137;FAO=57;FDP=136;FR=.;FRO=79;FSAF=35;FSAR=22;FSRF=45;FSRR=34;FWDB=-0.023193;FXX=0.00729874;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.277;QD=15.3588;RBI=0.0245616;REFB=-0.0156566;REVB=-0.00808443;RO=79;SAF=35;SAR=22;SRF=45;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0478354;STB=0.526872;STBP=0.595;TYPE=snp;VARB=0.0273498;OID=.;OPOS=69204671;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:137:136:79:79:57:57:0.419118:22:35:45:34:22:35:45:34
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chr2	69330118	.	A	G	250.21	PASS	AF=0.48;AO=24;DP=50;FAO=24;FDP=50;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=0.00168933;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.8205;QD=20.0169;RBI=0.0184034;REFB=0.0246609;REVB=0.0183257;RO=26;SAF=12;SAR=12;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0354698;STB=0.519983;STBP=0.797;TYPE=snp;VARB=-0.0244336;OID=.;OPOS=69330118;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:26:26:24:24:0.48:12:12:14:12:12:12:14:12
chr2	69362161	.	C	T	1089.22	PASS	AF=0.533679;AO=103;DP=191;FAO=103;FDP=193;FR=.;FRO=90;FSAF=50;FSAR=53;FSRF=48;FSRR=42;FWDB=0.00247695;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.224;QD=22.5746;RBI=0.0114931;REFB=-0.00880346;REVB=-0.011223;RO=86;SAF=50;SAR=53;SRF=45;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0315319;STB=0.522321;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=0.00776708;OID=.;OPOS=69362161;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:191:193:86:90:103:103:0.533679:53:50:45:41:53:50:48:42
chr2	69659126	.	A	T	277.6	PASS	AF=0.537037;AO=29;DP=54;FAO=29;FDP=54;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=0.0264043;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.9945;QD=20.5626;RBI=0.0343332;REFB=-0.00509114;REVB=-0.021945;RO=25;SAF=9;SAR=20;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.083855;STB=0.546729;STBP=0.491;TYPE=snp;VARB=0.00476781;OID=.;OPOS=69659126;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:25:25:29:29:0.537037:20:9:10:15:20:9:10:15
chr2	69693006	.	C	T	236.47	PASS	AF=0.564103;AO=22;DP=39;FAO=22;FDP=39;FR=.,HEALED;FRO=17;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=-0.00592227;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=260.853;QD=24.2534;RBI=0.00717068;REFB=-0.0394927;REVB=-0.00404294;RO=11;SAF=12;SAR=10;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0550494;STB=0.53268;STBP=0.704;TYPE=snp;VARB=0.017739;OID=.;OPOS=69693006;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:11:17:22:22:0.564103:10:12:5:6:10:12:8:9
chr2	69698158	.	G	A	322.05	PASS	AF=0.55;AO=33;DP=60;FAO=33;FDP=60;FR=.;FRO=27;FSAF=22;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=-0.0214953;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.636;QD=21.47;RBI=0.022531;REFB=-0.000291557;REVB=0.00675245;RO=23;SAF=22;SAR=11;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.212482;STB=0.620615;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=4.95019e-05;OID=.;OPOS=69698158;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:23:27:33:33:0.55:11:22:9:14:11:22:11:16
chr2	69700684	.	A	G	247.19	PASS	AF=0.367089;AO=29;DP=81;FAO=29;FDP=79;FR=.;FRO=50;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=22;FSRR=28;FWDB=0.0281094;FXX=0.0365809;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.6836;QD=12.5159;RBI=0.0281095;REFB=-0.0246421;REVB=4.50809e-05;RO=46;SAF=10;SAR=19;SRF=19;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0783823;STB=0.563962;STBP=0.408;TYPE=snp;VARB=0.0338859;OID=.;OPOS=69700684;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:79:46:50:29:29:0.367089:19:10:19:27:19:10:22:28
chr2	69702628	.	C	T	277.59	PASS	AF=0.537037;AO=29;DP=54;FAO=29;FDP=54;FR=.;FRO=25;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=-0.0103166;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.355;QD=20.5625;RBI=0.0106285;REFB=3.2313e-05;REVB=-0.00255564;RO=25;SAF=14;SAR=15;SRF=17;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163816;STB=0.59079;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=-0.00011759;OID=.;OPOS=69702628;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:25:25:29:29:0.537037:15:14:17:8:15:14:17:8
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chr2	69746142	.	C	G	116.98	PASS	AF=0.318182;AO=14;DP=43;FAO=14;FDP=44;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=0.0142078;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.638;QD=10.635;RBI=0.0204445;REFB=-0.0283053;REVB=-0.0147008;RO=29;SAF=8;SAR=6;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214125;STB=0.615223;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.0684661;OID=.;OPOS=69746142;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:44:29:30:14:14:0.318182:6:8:11:18:6:8:12:18
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chr2	71004492	.	T	C	65.3	PASS	AF=0.36;AO=8;DP=25;FAO=9;FDP=25;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=13;FWDB=0.0782301;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=49.4826;QD=10.4481;RBI=0.0813053;REFB=-0.0106021;REVB=-0.0221495;RO=16;SAF=3;SAR=5;SRF=3;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.238253;STB=0.672571;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=0.0223684;OID=.;OPOS=71004492;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:25:25:16:16:8:9:0.36:5:3:3:13:5:4:3:13
chr2	71004494	.	A	T	59.55	PASS	AF=0.347826;AO=8;DP=25;FAO=8;FDP=23;FR=.;FRO=15;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=12;FWDB=-0.00660063;FXX=0.079968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.116;QD=10.3565;RBI=0.0075618;REFB=-0.00193863;REVB=-0.0036895;RO=15;SAF=3;SAR=5;SRF=3;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.216346;STB=0.629345;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.0040358;OID=.;OPOS=71004494;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:59:25:23:15:15:8:8:0.347826:5:3:3:12:5:3:3:12
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chr2	71012734	.	C	G	563.74	PASS	AF=0.974359;AO=37;DP=38;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0118393;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.4165;QD=57.8194;RBI=0.0171268;REFB=-0.113741;REVB=0.0123757;RO=1;SAF=11;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0406685;STB=0.519989;STBP=0.26;TYPE=snp;VARB=0.00378569;OID=.;OPOS=71012734;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:38:39:1:1:37:38:0.974359:26:11:1:0:26:12:1:0
chr2	71036482	.	T	C	817.02	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0367848;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.1868;QD=57.3345;RBI=0.0536797;REFB=0;REVB=0.0390946;RO=0;SAF=21;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.59427e-05;OID=.;OPOS=71036482;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:36:21:0:0:36:21:0:0
chr2	71062833	.	G	GC	457.63	PASS	AF=1;AO=39;DP=43;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00455366;FXX=0.0465008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=25.1645;QD=44.6466;RBI=0.0326635;REFB=0;REVB=0.0323445;RO=4;SAF=14;SAR=25;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116617;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00104391;OID=.;OPOS=71062834;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:39:43:41:41:0:16:25:0:0:9:4:14:25:4:0
chr2	71163086	.	T	C	209.35	PASS	AF=0.571429;AO=20;DP=37;FAO=20;FDP=35;FR=.;FRO=15;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=4;FWDB=0.00783921;FXX=0.0540395;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.5776;QD=23.9257;RBI=0.00787135;REFB=-0.0196797;REVB=-0.000710608;RO=15;SAF=11;SAR=9;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144798;STB=0.580568;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=0.0199745;OID=.;OPOS=71163086;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:35:15:15:20:20:0.571429:9:11:11:4:9:11:11:4
chr2	71190405	.	C	T	244.26	PASS	AF=0.547619;AO=23;DP=42;FAO=23;FDP=42;FR=.;FRO=19;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=0.0186484;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.701;QD=23.2629;RBI=0.019401;REFB=-0.0283105;REVB=-0.0053513;RO=19;SAF=12;SAR=11;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123796;STB=0.569013;STBP=0.351;TYPE=snp;VARB=0.0235605;OID=.;OPOS=71190405;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:19:19:23:23:0.547619:11:12:7:12:11:12:7:12
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chr2	71305456	.	C	T	738.27	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00741072;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.949;QD=56.7898;RBI=0.0197373;REFB=0;REVB=0.0182933;RO=0;SAF=28;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.97956e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.90992e-05;OID=.;OPOS=71305456;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:52:0:0:51:52:1:23:28:0:0:23:29:0:0
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chr2	71360282	.	G	A	135.95	PASS	AF=0.483871;AO=15;DP=31;FAO=15;FDP=31;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=-0.0425058;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.2222;QD=17.5413;RBI=0.0575113;REFB=-0.0179633;REVB=-0.0387403;RO=16;SAF=4;SAR=11;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0194179;STB=0.511096;STBP=0.906;TYPE=snp;VARB=0.0110688;OID=.;OPOS=71360282;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:16:16:15:15:0.483871:11:4:4:12:11:4:4:12
chr2	71365805	.	A	G	241.24	PASS	AF=0.411765;AO=28;DP=70;FAO=28;FDP=68;FR=.;FRO=40;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=26;FWDB=0.014299;FXX=0.0285673;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.0234;QD=14.1907;RBI=0.0146735;REFB=-0.00560853;REVB=-0.00329398;RO=39;SAF=14;SAR=14;SRF=13;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171355;STB=0.588174;STBP=0.238;TYPE=snp;VARB=0.0058226;OID=.;OPOS=71365805;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:68:39:40:28:28:0.411765:14:14:13:26:14:14:14:26
chr2	71366957	.	C	A	195.49	PASS	AF=0.612903;AO=19;DP=31;FAO=19;FDP=31;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=-0.023896;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.21;QD=25.2241;RBI=0.026059;REFB=-0.0330009;REVB=0.0103951;RO=12;SAF=8;SAR=11;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0031244;STB=0.50174;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0149358;OID=.;OPOS=71366957;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:31:31:12:12:19:19:0.612903:11:8:5:7:11:8:5:7
chr2	71415479	.	T	C	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0682657;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.7838;QD=44.6894;RBI=0.0682665;REFB=0;REVB=0.000340772;RO=0;SAF=3;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00348089;OID=.;OPOS=71415479;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:10:3:0:0:10:3:0:0
chr2	71417065	.	G	T	930.51	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00702277;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=132.941;QD=58.1566;RBI=0.00716464;REFB=0;REVB=0.00141876;RO=0;SAF=41;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00023583;OID=.;OPOS=71417065;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:64:0:0:63:64:1:22:41:0:0:23:41:0:0
chr2	71615571	.	C	T	728.11	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0714962;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.1975;QD=63.3141;RBI=0.0739203;REFB=0;REVB=0.0187752;RO=0;SAF=22;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000731405;OID=.;OPOS=71615571;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:46:0:0:45:46:1:23:22:0:0:23:23:0:0
chr2	71633275	.	T	C	651.31	PASS	AF=0.478261;AO=66;DP=138;FAO=66;FDP=138;FR=.;FRO=72;FSAF=30;FSAR=36;FSRF=40;FSRR=32;FWDB=0.00319524;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=211.654;QD=18.8786;RBI=0.0134425;REFB=-0.00398654;REVB=0.0130572;RO=72;SAF=30;SAR=36;SRF=40;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0950684;STB=0.552616;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=0.00415567;OID=.;OPOS=71633275;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:138:138:72:72:66:66:0.478261:36:30:40:32:36:30:40:32
chr2	71633389	.	C	T	378.51	PASS	AF=0.434783;AO=40;DP=92;FAO=40;FDP=92;FR=.;FRO=52;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=26;FSRR=26;FWDB=-0.00301664;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.444;QD=16.457;RBI=0.0580673;REFB=-0.0064467;REVB=-0.0579889;RO=52;SAF=15;SAR=25;SRF=26;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128909;STB=0.572589;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=0.0101981;OID=.;OPOS=71633389;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:52:52:40:40:0.434783:25:15:26:26:25:15:26:26
chr2	71654175	.	G	A	460.11	PASS	AF=0.35625;AO=57;DP=160;FAO=57;FDP=160;FR=.;FRO=103;FSAF=34;FSAR=23;FSRF=42;FSRR=61;FWDB=-0.0174319;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.799;QD=11.5027;RBI=0.0267011;REFB=-0.0102082;REVB=-0.0202257;RO=102;SAF=34;SAR=23;SRF=41;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.21673;STB=0.620288;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.0209113;OID=.;OPOS=71654175;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:160:160:102:103:57:57:0.35625:23:34:41:61:23:34:42:61
chr2	72356449	.	G	T	629.49	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0146721;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.054;QD=61.4136;RBI=0.0146905;REFB=0;REVB=0.00073668;RO=0;SAF=19;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.68991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.25393e-05;OID=.;OPOS=72356449;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:41:0:0:37:41:1:18:19:0:0:20:21:0:0
chr2	72356627	.	T	G	648.45	PASS	AF=0.960784;AO=47;DP=49;FAO=49;FDP=51;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0178522;FXX=0.0192271;HRUN=4;LEN=1;MLLD=94.2568;QD=50.8587;RBI=0.029009;REFB=-0.193802;REVB=0.0228652;RO=2;SAF=27;SAR=20;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0058354;STB=0.50202;STBP=0.885;TYPE=snp;VARB=0.00216636;OID=.;OPOS=72356627;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:49:51:2:2:47:49:0.960784:20:27:1:1:22:27:1:1
chr2	72356745	.	T	TG	662.15	PASS	AF=1;AO=22;DP=61;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0476056;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=17.8135;QD=44.1432;RBI=0.0623437;REFB=0;REVB=-0.0402547;RO=38;SAF=9;SAR=13;SRF=29;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.374516;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000367018;OID=.;OPOS=72356746;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:22:61:60:60:0:37:23:0:0:13:38:9:13:29:9
chr2	72356747	.	A	G	212.98	PASS	AF=0.46875;AO=30;DP=64;FAO=30;FDP=64;FR=.;FRO=34;FSAF=27;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=24;FWDB=0.0383773;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=28.4489;QD=13.311;RBI=0.0422291;REFB=-0.0438248;REVB=-0.0176204;RO=34;SAF=27;SAR=3;SRF=10;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.646506;STB=0.867584;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0687624;OID=.;OPOS=72356747;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:34:34:30:30:0.46875:3:27:10:24:3:27:10:24
chr2	72360160	.	C	T	317.83	PASS	AF=0.416667;AO=34;DP=84;FAO=35;FDP=84;FR=.;FRO=49;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=24;FSRR=25;FWDB=0.00501985;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.333;QD=15.1349;RBI=0.0133485;REFB=-0.0122544;REVB=-0.0123686;RO=49;SAF=17;SAR=17;SRF=24;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0106177;STB=0.502381;STBP=0.966;TYPE=snp;VARB=0.0193673;OID=.;OPOS=72360160;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:49:49:34:35:0.416667:17:17:24:25:18:17:24:25
chr2	72692272	.	A	AAG,G	786.05	PASS	AF=1,0;AO=54,2;DP=57;FAO=55,0;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=35,0;FSAR=20,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00278887,-0.00756755;FXX=0.017854;HRUN=2,2;LEN=2,1;MLLD=218.888,89.0963;QD=57.1672;RBI=0.0177791,0.0125535;REFB=0,0;REVB=0.017559,0.0100162;RO=1;SAF=34,2;SAR=20,0;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0229779,0.697199;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=5.11809e-05,0;OID=.,.;OPOS=72692273,72692272;OREF=-,A;OALT=AG,G;OMAPALT=AAG,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:57:55:1:0:54,2:55,0:1,0:20,0:34,2:0:1:20,0:35,0:0:0
chr2	73339708	.	G	A	1620.59	PASS	AF=0.973451;AO=110;DP=114;FAO=110;FDP=113;FR=.;FRO=3;FSAF=66;FSAR=44;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.00430019;FXX=0.00877116;HRUN=4;LEN=1;MLLD=99.8514;QD=57.3662;RBI=0.00772045;REFB=-0.104941;REVB=0.006412;RO=0;SAF=66;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.6109e-08;STB=0.511109;STBP=0.193;TYPE=snp;VARB=0.000346683;OID=.;OPOS=73339708;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:114:113:0:3:110:110:0.973451:44:66:0:0:44:66:3:0
chr2	73461483	.	C	A	454.66	PASS	AF=0.425;AO=51;DP=120;FAO=51;FDP=120;FR=.;FRO=69;FSAF=24;FSAR=27;FSRF=23;FSRR=46;FWDB=0.00606566;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.178;QD=15.1555;RBI=0.011258;REFB=-0.0115587;REVB=0.00948426;RO=69;SAF=24;SAR=27;SRF=23;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142922;STB=0.57991;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=0.0179519;OID=.;OPOS=73461483;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:120:69:69:51:51:0.425:27:24:23:46:27:24:23:46
chr2	73675227	.	T	TCTC	392.78	PASS	AF=0.436893;AO=43;DP=117;FAO=45;FDP=103;FR=.;FRO=58;FSAF=12;FSAR=33;FSRF=25;FSRR=33;FWDB=-0.0224292;FXX=0.0282992;HRUN=1;LEN=3;MLLD=288.539;QD=15.2537;RBI=0.0234835;REFB=-0.0161474;REVB=0.00695724;RO=68;SAF=11;SAR=32;SRF=31;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.242848;STB=0.606507;STBP=0.061;TYPE=ins;VARB=0.0225937;OID=.;OPOS=73675228;OREF=-;OALT=CTC;OMAPALT=TCTC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.436893:43:117:45:103:58:12:33:25:33:99:68:11:32:31:37
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chr2	73716810	.	G	A	358.14	PASS	AF=0.5;AO=37;DP=75;FAO=37;FDP=74;FR=.;FRO=37;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=-0.00855649;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.6401;QD=19.3587;RBI=0.00961115;REFB=-0.0244262;REVB=-0.00437731;RO=37;SAF=19;SAR=18;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0487071;STB=0.527072;STBP=0.68;TYPE=snp;VARB=0.0270509;OID=.;OPOS=73716810;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:74:37:37:37:37:0.5:18:19:21:16:18:19:21:16
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chr2	73828538	.	G	A	38.17	PASS	AF=0.428571;AO=6;DP=14;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0204209;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.9817;QD=10.9063;RBI=0.0562734;REFB=-0.0198113;REVB=0.0524375;RO=8;SAF=4;SAR=2;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162008;STB=0.599657;STBP=0.552;TYPE=snp;VARB=0.0369397;OID=.;OPOS=73828538;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:14:14:8:8:6:6:0.428571:2:4:4:4:2:4:4:4
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chr2	74135898	.	A	G	228.34	PASS	AF=0.52381;AO=22;DP=42;FAO=22;FDP=42;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=15;FWDB=0.00158067;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=246.753;QD=21.7465;RBI=0.02254;REFB=-0.0108776;REVB=-0.0224845;RO=20;SAF=12;SAR=10;SRF=5;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.247775;STB=0.638179;STBP=0.081;TYPE=snp;VARB=0.00785238;OID=.;OPOS=74135898;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:20:20:22:22:0.52381:10:12:5:15:10:12:5:15
chr2	74185876	.	A	T	281.26	PASS	AF=0.54717;AO=29;DP=53;FAO=29;FDP=53;FR=.;FRO=24;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=0.012779;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=282.837;QD=21.227;RBI=0.0140971;REFB=-0.0137916;REVB=-0.00595197;RO=24;SAF=15;SAR=14;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0883878;STB=0.548986;STBP=0.441;TYPE=snp;VARB=0.0100655;OID=.;OPOS=74185876;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:24:24:29:29:0.54717:14:15:15:9:14:15:15:9
chr2	74300717	.	T	C	146.61	PASS	AF=0.339286;AO=19;DP=56;FAO=19;FDP=56;FR=.;FRO=37;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=22;FWDB=0.0336725;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.3091;QD=10.4719;RBI=0.0423265;REFB=0.00538562;REVB=-0.0256455;RO=37;SAF=6;SAR=13;SRF=15;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110365;STB=0.565147;STBP=0.485;TYPE=snp;VARB=-0.00957369;OID=.;OPOS=74300717;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:37:37:19:19:0.339286:13:6:15:22:13:6:15:22
chr2	74334462	.	G	A	868.25	PASS	AF=0.551724;AO=80;DP=144;FAO=80;FDP=145;FR=.;FRO=65;FSAF=45;FSAR=35;FSRF=36;FSRR=29;FWDB=0.000279236;FXX=0.00684885;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.552;QD=23.9516;RBI=0.0203643;REFB=-0.0128037;REVB=-0.0203623;RO=64;SAF=45;SAR=35;SRF=35;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0128959;STB=0.503936;STBP=0.917;TYPE=snp;VARB=0.00933399;OID=.;OPOS=74334462;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:144:145:64:65:80:80:0.551724:35:45:35:29:35:45:36:29
chr2	74362090	.	A	G	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0138533;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.881;QD=50.4129;RBI=0.0171786;REFB=0;REVB=-0.0101583;RO=0;SAF=8;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.41338e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000258269;OID=.;OPOS=74362090;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:11:8:0:0:11:8:0:0
chr2	74362459	.	T	TAGC	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000802712;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=317.9;QD=53.2772;RBI=0.0495387;REFB=0;REVB=0.0495322;RO=0;SAF=14;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.84921e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000210402;OID=.;OPOS=74362460;OREF=-;OALT=AGC;OMAPALT=TAGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:23:23:23:23:0:14:9:0:0:4:0:14:9:0:0
chr2	74641624	.	G	C	851.13	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0135328;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=91.7416;QD=57.7034;RBI=0.0160481;REFB=0;REVB=-0.00862589;RO=0;SAF=25;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.03209e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000140508;OID=.;OPOS=74641624;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:34:25:0:0:34:25:0:0
chr2	74682512	.	C	T	801.32	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.031878;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.61;QD=57.2375;RBI=0.0331944;REFB=0;REVB=0.0092553;RO=0;SAF=28;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.79271e-05;OID=.;OPOS=74682512;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:28:28:0:0:28:28:0:0
chr2	74687549	.	CTCA	CCA,CCAC,CCCA	675.03	PASS	AF=0.590909,0,0.409091;AO=20,3,16;DP=43;FAO=26,0,18;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=12,0,6;FSAR=14,0,12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.115631,0.077973,0.111938;FXX=0;HRUN=1,1,1;LEN=1,3,1;MLLD=189.57,153.838,189.397;QD=61.3667;RBI=0.117163,0.0801509,0.113288;REFB=0,0,0;REVB=0.0188861,0.0185572,0.0174386;RO=0;SAF=6,3,4;SAR=14,0,12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-3.5931e-08,0,3.07465e-08;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,mnp,snp;VARB=-0.00938662,0,0.0119553;OID=.,.,.;OPOS=74687550,74687550,74687550;OREF=T,TCA,T;OALT=-,CAC,C;OMAPALT=CCA,CCAC,CCCA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/3:0.590909,0,0.409091:20,3,16:43:26,0,18:44:0:12,0,6:14,0,12:0:0:47:0:6,3,4:14,0,12:0:0
chr2	74690039	.	G	A	2304.16	PASS	AF=0.881081;AO=162;DP=186;FAO=163;FDP=185;FR=.;FRO=22;FSAF=84;FSAR=79;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=0.0321868;FXX=0.00537606;HRUN=7;LEN=1;MLLD=258.641;QD=49.8197;RBI=0.0328461;REFB=-0.107773;REVB=-0.00654785;RO=8;SAF=83;SAR=79;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0122825;STB=0.503585;STBP=0.808;TYPE=snp;VARB=0.000580333;OID=.;OPOS=74690039;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:82:186:185:8:22:162:163:0.881081:79:83:3:5:79:84:12:10
chr2	74690378	.	C	T	765.15	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0132751;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.291;QD=63.7625;RBI=0.0139874;REFB=0;REVB=-0.00440683;RO=0;SAF=28;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.56477e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000112941;OID=.;OPOS=74690378;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:20:28:0:0:20:28:0:0
chr2	74699778	.	C	A	805.15	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0695684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.571;QD=64.4116;RBI=0.0707789;REFB=0;REVB=-0.0130345;RO=0;SAF=28;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.15703e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000112513;OID=.;OPOS=74699778;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:22:28:0:0:22:28:0:0
chr2	74710491	.	C	T	282.4	PASS	AF=0.956522;AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00747761;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.578;QD=49.1137;RBI=0.0585311;REFB=-0.0887766;REVB=0.0580515;RO=1;SAF=9;SAR=13;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0486023;STB=0.526292;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.00145612;OID=.;OPOS=74710491;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:23:23:1:1:22:22:0.956522:13:9:1:0:13:9:1:0
chr2	74725144	.	T	C	793.88	PASS	AF=0.982759;AO=54;DP=55;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0080066;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.6772;QD=54.75;RBI=0.0873708;REFB=-0.0426985;REVB=0.0870032;RO=1;SAF=26;SAR=28;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0177809;STB=0.509431;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=0.00816703;OID=.;OPOS=74725144;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:55:58:1:1:54:57:0.982759:28:26:1:0:31:26:1:0
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chr2	74746322	.	A	T	650.2	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0229483;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.244;QD=61.9237;RBI=0.0238896;REFB=0;REVB=0.00663991;RO=0;SAF=14;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000105319;OID=.;OPOS=74746322;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:28:14:0:0:28:14:0:0
chr2	74756176	.	G	C	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00723618;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=323.498;QD=45.8068;RBI=0.00723695;REFB=0;REVB=-0.000105436;RO=0;SAF=8;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.21148e-05;OID=.;OPOS=74756176;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:6:8:0:0:6:8:0:0
chr2	74758666	.	G	A	380.51	PASS	AF=0.359375;AO=46;DP=129;FAO=46;FDP=128;FR=.;FRO=82;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=46;FSRR=36;FWDB=0.0180725;FXX=0.00775134;HRUN=3;LEN=1;MLLD=103.542;QD=11.891;RBI=0.0286696;REFB=-0.00800485;REVB=-0.022256;RO=81;SAF=22;SAR=24;SRF=46;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0998145;STB=0.552823;STBP=0.375;TYPE=snp;VARB=0.0144368;OID=.;OPOS=74758666;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:129:128:81:82:46:46:0.359375:24:22:46:35:24:22:46:36
chr2	74761539	.	T	A	463.37	PASS	AF=0.529412;AO=45;DP=85;FAO=45;FDP=85;FR=.;FRO=40;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=0.0168085;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.788;QD=21.8055;RBI=0.0457894;REFB=-0.0305661;REVB=0.0425928;RO=40;SAF=24;SAR=21;SRF=21;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00713296;STB=0.503935;STBP=0.947;TYPE=snp;VARB=0.0254479;OID=.;OPOS=74761539;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:40:40:45:45:0.529412:21:24:21:19:21:24:21:19
chr2	74763258	.	C	G	443.74	PASS	AF=0.45;AO=45;DP=100;FAO=45;FDP=100;FR=.;FRO=55;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=25;FSRR=30;FWDB=-0.0208383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.2711;QD=17.7494;RBI=0.0209702;REFB=-0.00374459;REVB=-0.00234904;RO=55;SAF=22;SAR=23;SRF=25;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0338121;STB=0.518906;STBP=0.742;TYPE=snp;VARB=0.00409482;OID=.;OPOS=74763258;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:55:55:45:45:0.45:23:22:25:30:23:22:25:30
chr2	75099477	.	A	T	311.01	PASS	AF=0.393258;AO=35;DP=89;FAO=35;FDP=89;FR=.;FRO=54;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=25;FSRR=29;FWDB=0.0184168;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=284.277;QD=13.9778;RBI=0.0212677;REFB=-0.0091387;REVB=0.0106366;RO=54;SAF=18;SAR=17;SRF=25;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0546535;STB=0.531092;STBP=0.678;TYPE=snp;VARB=0.0137019;OID=.;OPOS=75099477;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:54:54:35:35:0.393258:17:18:25:29:17:18:25:29
chr2	75101454	.	T	C	1044.39	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.017947;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=312.857;QD=59.6795;RBI=0.0599893;REFB=0;REVB=0.0572417;RO=0;SAF=38;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.91096e-05;OID=.;OPOS=75101454;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:32:38:0:0:32:38:0:0
chr2	75113657	.	C	T	164.83	PASS	AF=0.548387;AO=17;DP=31;FAO=17;FDP=31;FR=.;FRO=14;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=3;FWDB=0.00837421;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.475;QD=21.2679;RBI=0.0155744;REFB=-0.000502155;REVB=0.0131314;RO=12;SAF=13;SAR=4;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.014906;STB=0.513353;STBP=0.923;TYPE=snp;VARB=0.000922474;OID=.;OPOS=75113657;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:12:14:17:17:0.548387:4:13:9:3:4:13:11:3
chr2	75113789	.	C	G	290.18	PASS	AF=0.5;AO=32;DP=64;FAO=31;FDP=62;FR=.;FRO=31;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=-0.0313894;FXX=0.0312451;HRUN=4;LEN=1;MLLD=52.4961;QD=18.7213;RBI=0.0376982;REFB=0.0044515;REVB=-0.0208773;RO=32;SAF=11;SAR=21;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0899616;STB=0.551234;STBP=0.431;TYPE=snp;VARB=-0.00546522;OID=.;OPOS=75113789;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:62:32:31:32:31:0.5:21:11:14:18:20:11:14:17
chr2	75115108	.	A	G	337.63	PASS	AF=0.514706;AO=35;DP=69;FAO=35;FDP=68;FR=.;FRO=33;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=-0.00130195;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.37;QD=19.8609;RBI=0.00578893;REFB=-0.0193586;REVB=-0.00564062;RO=33;SAF=17;SAR=18;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000756791;STB=0.50042;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.015134;OID=.;OPOS=75115108;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:68:33:33:35:35:0.514706:18:17:16:17:18:17:16:17
chr2	75116527	.	G	A	531.53	PASS	AF=0.537634;AO=50;DP=93;FAO=50;FDP=93;FR=.;FRO=43;FSAF=22;FSAR=28;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=0.0448516;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.5904;QD=22.8615;RBI=0.0505211;REFB=0.0136917;REVB=0.0232533;RO=43;SAF=22;SAR=28;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0409943;STB=0.52256;STBP=0.681;TYPE=snp;VARB=-0.00914359;OID=.;OPOS=75116527;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:43:43:50:50:0.537634:28:22:21:22:28:22:21:22
chr2	75118737	.	C	T	654.23	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0258183;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.935;QD=60.8589;RBI=0.042398;REFB=0;REVB=-0.0336305;RO=0;SAF=28;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.4198e-05;OID=.;OPOS=75118737;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:43:0:0:42:43:1:14:28:0:0:14:29:0:0
chr2	75124037	.	C	T	1153.59	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0152705;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.667;QD=60.7154;RBI=0.0461561;REFB=0;REVB=-0.0435568;RO=0;SAF=32;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00015179;OID=.;OPOS=75124037;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:44:32:0:0:44:32:0:0
chr2	75185856	.	G	T	310.03	PASS	AF=0.485294;AO=32;DP=70;FAO=33;FDP=68;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=0.0231378;FXX=0.0285673;HRUN=3;LEN=1;MLLD=127.323;QD=18.2372;RBI=0.0249119;REFB=-0.0186206;REVB=-0.00923277;RO=35;SAF=14;SAR=18;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0719834;STB=0.546734;STBP=0.445;TYPE=snp;VARB=0.0179972;OID=.;OPOS=75185856;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:68:35:35:32:33:0.485294:18:14:18:17:19:14:18:17
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chr2	79864080	.	G	C	288.42	PASS	AF=0.577778;AO=26;DP=44;FAO=26;FDP=45;FR=.;FRO=19;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.00797828;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=90.75;QD=25.6369;RBI=0.0246239;REFB=-0.0518952;REVB=0.0232955;RO=18;SAF=13;SAR=13;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0410526;STB=0.533308;STBP=0.609;TYPE=snp;VARB=0.0456024;OID=.;OPOS=79864080;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:45:18:19:26:26:0.577778:13:13:10:8:13:13:11:8
chr2	79914689	.	G	A	598.75	PASS	AF=0.574468;AO=54;DP=95;FAO=54;FDP=94;FR=.;FRO=40;FSAF=22;FSAR=32;FSRF=25;FSRR=15;FWDB=-0.00693609;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.696;QD=25.4785;RBI=0.0105448;REFB=-0.000493451;REVB=-0.00794254;RO=40;SAF=22;SAR=32;SRF=25;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169252;STB=0.592558;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=0.000511652;OID=.;OPOS=79914689;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:94:40:40:54:54:0.574468:32:22:25:15:32:22:25:15
chr2	80101321	.	T	G	2240.59	PASS	AF=1;AO=141;DP=142;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=97;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0368993;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.5579;QD=63.1153;RBI=0.0456533;REFB=0;REVB=-0.0268825;RO=0;SAF=96;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000200283;OID=.;OPOS=80101321;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:142:142:0:0:141:142:1:45:96:0:0:45:97:0:0
chr2	80529738	.	C	A	92.21	PASS	AF=0.55;AO=11;DP=20;FAO=11;FDP=20;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=0.126322;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.157;QD=18.4414;RBI=0.126382;REFB=-0.0350202;REVB=-0.00389979;RO=9;SAF=4;SAR=7;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124999;STB=0.571306;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=0.0182769;OID=.;OPOS=80529738;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:20:20:9:9:11:11:0.55:7:4:2:7:7:4:2:7
chr2	80529956	.	T	C	253.19	PASS	AF=0.509434;AO=27;DP=53;FAO=27;FDP=53;FR=.;FRO=26;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=0.00369724;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.721;QD=19.1088;RBI=0.0191888;REFB=-0.0146345;REVB=-0.0188293;RO=26;SAF=15;SAR=12;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149116;STB=0.583272;STBP=0.251;TYPE=snp;VARB=0.0173489;OID=.;OPOS=80529956;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:26:26:27:27:0.509434:12:15:10:16:12:15:10:16
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chr2	80875725	.	TC	CT,TCT,TCTT,TT	369.82	PASS	AF=0.307692,0.666667,0,0.025641;AO=11,14,4,2;DP=40;FAO=12,26,0,1;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=3,13,0,0;FSAR=9,13,0,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.151213,0.15874,0.0833646,-0.0309426;FXX=0.0249938;HRUN=9,5,5,1;LEN=2,1,2,1;MLLD=23.2814,13.115,8.71894,169.695;QD=37.9298;RBI=0.151244,0.207879,0.110244,0.0309699;REFB=0,0,0,0;REVB=0.00307332,-0.134221,-0.0721389,-0.0012998;RO=3;SAF=4,8,0,0;SAR=7,6,4,2;SRF=2;SRR=1;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=-0.119933,-0.0311253,-0.74182,-0.666583;STB=0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1,1;TYPE=mnp,ins,ins,snp;VARB=0.00940143,-0.0368839,0.0219232,0.025386;OID=.,.,.,.;OPOS=80875725,80875727,80875727,80875726;OREF=TC,-,-,C;OALT=CT,T,TT,T;OMAPALT=CT,TCT,TCTT,TT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:21:40:39:3:0:11,14,4,2:12,26,0,1:0.307692,0.666667,0,0.025641:7,6,4,2:4,8,0,0:2:1:9,13,0,1:3,13,0,0:0:0
chr2	83042810	.	GGAAC	G	239.77	PASS	AF=0.523077;AO=32;DP=66;FAO=34;FDP=65;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=-0.00150814;FXX=0.0151492;HRUN=2;LEN=4;MLLD=316.306;QD=14.7551;RBI=0.00771611;REFB=0.00524224;REVB=-0.00756729;RO=28;SAF=10;SAR=22;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108068;STB=0.54997;STBP=0.442;TYPE=del;VARB=-0.00511286;OID=.;OPOS=83042811;OREF=GAAC;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.523077:32:66:34:65:31:12:22:14:17:99:28:10:22:12:16
chr2	84756049	.	G	A	2083.74	PASS	AF=1;AO=133;DP=133;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00328743;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.916;QD=62.6688;RBI=0.0183202;REFB=0;REVB=0.0180228;RO=0;SAF=72;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.79172e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.31963e-05;OID=.;OPOS=84756049;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:133:133:0:0:133:133:1:61:72:0:0:61:72:0:0
chr2	84771480	.	G	A	1044.38	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0297838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.532;QD=59.6791;RBI=0.0301311;REFB=0;REVB=0.00456148;RO=0;SAF=37;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00012724;OID=.;OPOS=84771480;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:33:37:0:0:33:37:0:0
chr2	84771567	.	C	T	740.44	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00794379;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=269.534;QD=56.9569;RBI=0.0107307;REFB=0;REVB=0.00721415;RO=0;SAF=26;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.43749e-06;OID=.;OPOS=84771567;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:26:26:0:0:26:26:0:0
chr2	84800605	.	C	A	754.43	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0279475;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.829;QD=56.9383;RBI=0.0332642;REFB=0;REVB=0.0180401;RO=0;SAF=29;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.4264e-05;OID=.;OPOS=84800605;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:24:29:0:0:24:29:0:0
chr2	84897517	.	A	G	397.18	PASS	AF=0.935484;AO=29;DP=31;FAO=29;FDP=31;FR=.;FRO=2;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00295652;FXX=0.0312402;HRUN=3;LEN=1;MLLD=149.448;QD=51.2491;RBI=0.00724635;REFB=0.0487659;REVB=0.00661578;RO=2;SAF=18;SAR=11;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0489889;STB=0.526298;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=-0.000241572;OID=.;OPOS=84897517;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:31:31:2:2:29:29:0.935484:11:18:2:0:11:18:2:0
chr2	85280873	.	A	C	282.57	PASS	AF=0.484375;AO=25;DP=64;FAO=31;FDP=64;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=0.0594973;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=45.0299;QD=17.6609;RBI=0.0666389;REFB=0.0126506;REVB=0.0300135;RO=28;SAF=10;SAR=15;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128423;STB=0.530819;STBP=0.642;TYPE=snp;VARB=-0.0136516;OID=.;OPOS=85280873;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:28:33:25:31:0.484375:15:10:15:13:15:16:19:14
chr2	85282879	.	A	G	292.41	PASS	AF=0.4125;AO=33;DP=80;FAO=33;FDP=80;FR=.;FRO=47;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=31;FWDB=0.0412234;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.124;QD=14.6206;RBI=0.043965;REFB=-0.00272351;REVB=0.0152826;RO=47;SAF=15;SAR=18;SRF=16;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121085;STB=0.568405;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=0.00687554;OID=.;OPOS=85282879;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:47:47:33:33:0.4125:18:15:16:31:18:15:16:31
chr2	85283329	.	CTT	C	151.59	PASS	AF=0.5;AO=22;DP=45;FAO=22;FDP=44;FR=.;FRO=22;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=0.0111488;FXX=0.0222173;HRUN=2;LEN=2;MLLD=243.314;QD=13.7812;RBI=0.0118399;REFB=-0.00922899;REVB=-0.0039859;RO=22;SAF=15;SAR=7;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00959371;OID=.;OPOS=85283330;OREF=TT;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.5:22:45:22:44:22:15:7:15:7:99:22:15:7:15:7
chr2	85283395	.	C	T	123.13	PASS	AF=0.466667;AO=14;DP=30;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=0.0115345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.2097;QD=16.4168;RBI=0.0176171;REFB=0.0206876;REVB=0.0133161;RO=16;SAF=11;SAR=3;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122806;STB=0.57132;STBP=0.568;TYPE=snp;VARB=-0.0701417;OID=.;OPOS=85283395;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:16:16:14:14:0.466667:3:11:11:5:3:11:11:5
chr2	85546615	.	C	T	697.11	PASS	AF=1;AO=41;DP=42;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00795212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.658;QD=61.9653;RBI=0.018751;REFB=0;REVB=0.0169813;RO=0;SAF=20;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.85084e-05;OID=.;OPOS=85546615;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:45:0:0:41:45:1:21:20:0:0:23:22:0:0
chr2	85549527	.	T	C	306.32	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0153388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.369;QD=53.2727;RBI=0.0588765;REFB=0;REVB=0.0568434;RO=0;SAF=8;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000365316;OID=.;OPOS=85549527;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:15:8:0:0:15:8:0:0
chr2	85549547	.	C	T	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148955;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=275.821;QD=55.0987;RBI=0.0164324;REFB=0;REVB=0.00693895;RO=0;SAF=12;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.14925e-05;OID=.;OPOS=85549547;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:14:12:0:0:14:12:0:0
chr2	85553784	.	C	T	918.68	PASS	AF=0.955882;AO=59;DP=62;FAO=65;FDP=68;FR=.;FRO=3;FSAF=29;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0264332;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.4413;QD=54.0398;RBI=0.188199;REFB=-0.151789;REVB=0.186333;RO=3;SAF=29;SAR=30;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0448734;STB=0.519994;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.00968387;OID=.;OPOS=85553784;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:62:68:3:3:59:65:0.955882:30:29:0:3:36:29:0:3
chr2	85554080	.	G	A	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0218649;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=301.931;QD=37.4885;RBI=0.0234409;REFB=0;REVB=0.00844996;RO=0;SAF=1;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.78849e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000229642;OID=.;OPOS=85554080;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:7:1:0:0:7:1:0:0
chr2	85570849	.	C	T	60.28	PASS	AF=0.164179;AO=11;DP=67;FAO=11;FDP=67;FR=.;FRO=56;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=32;FSRR=24;FWDB=0.0195188;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=120.377;QD=3.59883;RBI=0.0195205;REFB=-0.0107135;REVB=0.0002583;RO=55;SAF=7;SAR=4;SRF=31;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0934857;STB=0.556713;STBP=0.689;TYPE=snp;VARB=0.0544354;OID=.;OPOS=85570849;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:60:67:67:55:56:11:11:0.164179:4:7:31:24:4:7:32:24
chr2	85570857	.	G	A	61.61	PASS	AF=0.169231;AO=11;DP=65;FAO=11;FDP=65;FR=.;FRO=54;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=31;FSRR=23;FWDB=-0.00458278;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=224.062;QD=3.79114;RBI=0.00849427;REFB=0.00220574;REVB=0.00715197;RO=53;SAF=8;SAR=3;SRF=31;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192968;STB=0.639731;STBP=0.378;TYPE=snp;VARB=-0.00755708;OID=.;OPOS=85570857;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:65:65:53:54:11:11:0.169231:3:8:31:22:3:8:31:23
chr2	85571256	.	CAG	TGC	287.01	PASS	AF=0.476923;AO=31;DP=68;FAO=31;FDP=65;FR=.;FRO=34;FSAF=23;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=0.0251026;FXX=0.0441112;HRUN=1;LEN=3;MLLD=225.916;QD=17.6624;RBI=0.0336623;REFB=-0.0171668;REVB=-0.0224278;RO=34;SAF=23;SAR=8;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.352317;STB=0.698296;STBP=0.007;TYPE=mnp;VARB=0.0125205;OID=.;OPOS=85571256;OREF=CAG;OALT=TGC;OMAPALT=TGC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:65:34:34:31:31:0.476923:8:23:13:21:8:23:13:21
chr2	85573033	.	G	A	825.49	PASS	AF=0.967213;AO=59;DP=61;FAO=59;FDP=61;FR=.;FRO=2;FSAF=19;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.000737677;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.5459;QD=54.1308;RBI=0.0158617;REFB=0.0455364;REVB=0.0158445;RO=2;SAF=19;SAR=40;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0125364;STB=0.506648;STBP=0.557;TYPE=snp;VARB=-0.00906517;OID=.;OPOS=85573033;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:61:61:2:2:59:59:0.967213:40:19:1:1:40:19:1:1
chr2	85573049	.	G	A	739.1	PASS	AF=0.981481;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0188381;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=293.191;QD=54.7479;RBI=0.0202333;REFB=-0.0255218;REVB=0.00738327;RO=0;SAF=19;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.97342e-08;STB=0.507244;STBP=0.553;TYPE=snp;VARB=7.83588e-05;OID=.;OPOS=85573049;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:54:54:0:1:53:53:0.981481:34:19:0:0:34:19:0:1
chr2	85781318	.	T	G	272.77	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00810258;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.569;QD=51.9556;RBI=0.0439859;REFB=0;REVB=0.0432331;RO=0;SAF=12;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000167169;OID=.;OPOS=85781318;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:21:0:0:20:21:1:8:12:0:0:9:12:0:0
chr2	85893741	.	G	A	185.86	PASS	AF=0.513514;AO=17;DP=35;FAO=19;FDP=37;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.12316;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.683;QD=20.0927;RBI=0.125169;REFB=-0.0229457;REVB=0.0223401;RO=18;SAF=8;SAR=9;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.074462;STB=0.566503;STBP=0.432;TYPE=snp;VARB=0.0277443;OID=.;OPOS=85893741;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:37:18:18:17:19:0.513514:9:8:7:11:9:10:7:11
chr2	85894308	.	G	T	266.98	PASS	AF=0.528302;AO=28;DP=53;FAO=28;FDP=53;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.0186622;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=153.869;QD=20.1492;RBI=0.0242537;REFB=-0.0127897;REVB=-0.0154908;RO=25;SAF=9;SAR=19;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.178305;STB=0.599639;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=0.00924688;OID=.;OPOS=85894308;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:25:25:28:28:0.528302:19:9:13:12:19:9:13:12
chr2	85895338	.	T	G	1005.93	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0126609;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.729;QD=59.1725;RBI=0.0299751;REFB=0;REVB=0.02717;RO=0;SAF=33;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.61397e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.83547e-05;OID=.;OPOS=85895338;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:68:0:0:67:68:1:34:33:0:0:34:34:0:0
chr2	85924729	.	C	T	2115.04	PASS	AF=0.985507;AO=136;DP=140;FAO=136;FDP=138;FR=.;FRO=2;FSAF=68;FSAR=68;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0282827;FXX=0.0142847;HRUN=3;LEN=1;MLLD=231.39;QD=61.3055;RBI=0.030087;REFB=0.0236826;REVB=-0.0102622;RO=2;SAF=68;SAR=68;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.95539e-05;OID=.;OPOS=85924729;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:140:138:2:2:136:136:0.985507:68:68:1:1:68:68:1:1
chr2	85925529	.	A	G	496.15	PASS	AF=0.754386;AO=42;DP=56;FAO=43;FDP=57;FR=.;FRO=14;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=14;FSRR=0;FWDB=0.0614457;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.178;QD=34.8173;RBI=0.0615089;REFB=-0.0249278;REVB=-0.00278642;RO=0;SAF=20;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.629572;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.00306114;OID=.;OPOS=85925529;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:56:57:0:14:42:43:0.754386:22:20:0:0:23:20:14:0
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chr2	85925848	.	C	G	989.32	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0392859;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.293;QD=59.0636;RBI=0.0552099;REFB=0;REVB=0.0387911;RO=0;SAF=43;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00017552;OID=.;OPOS=85925848;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:67:0:0:66:67:1:23:43:0:0:23:44:0:0
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chr2	86272758	.	G	A	229.57	PASS	AF=0.536585;AO=22;DP=41;FAO=22;FDP=41;FR=.;FRO=19;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.0032736;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.644;QD=22.3973;RBI=0.0135872;REFB=-0.00464289;REVB=-0.013187;RO=19;SAF=16;SAR=6;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0945307;STB=0.553141;STBP=0.49;TYPE=snp;VARB=0.00775287;OID=.;OPOS=86272758;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:19:19:22:22:0.536585:6:16:12:7:6:16:12:7
chr2	86315741	.	C	T	368.75	PASS	AF=0.493506;AO=38;DP=77;FAO=38;FDP=77;FR=.;FRO=39;FSAF=11;FSAR=27;FSRF=25;FSRR=14;FWDB=-0.0162192;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.186;QD=19.1558;RBI=0.0181627;REFB=-0.0110607;REVB=-0.00817444;RO=36;SAF=11;SAR=27;SRF=22;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.294413;STB=0.682965;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.00625941;OID=.;OPOS=86315741;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:36:39:38:38:0.493506:27:11:22:14:27:11:25:14
chr2	86317037	.	G	C	385.35	PASS	AF=0.465116;AO=40;DP=86;FAO=40;FDP=86;FR=.;FRO=46;FSAF=12;FSAR=28;FSRF=16;FSRR=30;FWDB=0.00773449;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=320.553;QD=17.923;RBI=0.00832301;REFB=0.00138593;REVB=0.00307409;RO=46;SAF=12;SAR=28;SRF=16;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0530695;STB=0.529715;STBP=0.636;TYPE=snp;VARB=-0.00162599;OID=.;OPOS=86317037;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:46:46:40:40:0.465116:28:12:16:30:28:12:16:30
chr2	86344237	.	A	G	354.05	PASS	AF=0.625;AO=30;DP=48;FAO=30;FDP=48;FR=.;FRO=18;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=0.00580748;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.869;QD=29.5044;RBI=0.00937368;REFB=-0.0166883;REVB=-0.00735793;RO=18;SAF=14;SAR=16;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0983171;STB=0.553981;STBP=0.346;TYPE=snp;VARB=0.00566113;OID=.;OPOS=86344237;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:18:18:30:30:0.625:16:14:11:7:16:14:11:7
chr2	86363074	.	A	G	629.0	PASS	AF=0.589474;AO=56;DP=95;FAO=56;FDP=95;FR=.;FRO=39;FSAF=34;FSAR=22;FSRF=24;FSRR=15;FWDB=0.017808;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.0041;QD=26.4843;RBI=0.0330793;REFB=-0.0273848;REVB=-0.0278767;RO=39;SAF=34;SAR=22;SRF=24;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00650825;STB=0.50355;STBP=0.953;TYPE=snp;VARB=0.0222724;OID=.;OPOS=86363074;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:39:39:56:56:0.589474:22:34:24:15:22:34:24:15
chr2	86364653	.	A	G	110.65	PASS	AF=0.448276;AO=13;DP=29;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.0202071;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.999;QD=15.2623;RBI=0.0205075;REFB=-0.00944861;REVB=0.00349738;RO=16;SAF=5;SAR=8;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112115;STB=0.565116;STBP=0.553;TYPE=snp;VARB=0.0107064;OID=.;OPOS=86364653;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:16:16:13:13:0.448276:8:5:8:8:8:5:8:8
chr2	86400824	.	G	A	450.56	PASS	AF=0.52381;AO=44;DP=85;FAO=44;FDP=84;FR=.;FRO=40;FSAF=16;FSAR=28;FSRF=16;FSRR=24;FWDB=0.00658144;FXX=0.0117633;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.213;QD=21.4552;RBI=0.0084767;REFB=-0.0126319;REVB=0.0053422;RO=40;SAF=16;SAR=28;SRF=16;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0334846;STB=0.51851;STBP=0.751;TYPE=snp;VARB=0.0101819;OID=.;OPOS=86400824;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:84:40:40:44:44:0.52381:28:16:16:24:28:16:16:24
chr2	86406556	.	C	T	101.59	PASS	AF=0.5;AO=12;DP=24;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=-0.00498612;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=257.605;QD=16.9316;RBI=0.00994796;REFB=-0.00432923;REVB=0.00860817;RO=12;SAF=4;SAR=8;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.288616;STB=0.666389;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=0.00252023;OID=.;OPOS=86406556;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:24:24:12:12:12:12:0.5:8:4:8:4:8:4:8:4
chr2	86440718	.	T	C	241.18	PASS	AF=0.424242;AO=28;DP=66;FAO=28;FDP=66;FR=.;FRO=38;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=0.0544081;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.069;QD=14.6167;RBI=0.0548638;REFB=-0.00257652;REVB=0.00705617;RO=38;SAF=11;SAR=17;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136923;STB=0.577795;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.00272625;OID=.;OPOS=86440718;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:38:38:28:28:0.424242:17:11:20:18:17:11:20:18
chr2	86441334	.	C	CTGTT	219.89	PASS	AF=0.511628;AO=20;DP=43;FAO=22;FDP=43;FR=.;FRO=21;FSAF=17;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=16;FWDB=0.00577432;FXX=0;HRUN=1;LEN=4;MLLD=277.486;QD=20.4545;RBI=0.00584148;REFB=-0.00165365;REVB=0.000883271;RO=21;SAF=15;SAR=5;SRF=5;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.458036;STB=0.76421;STBP=0.002;TYPE=ins;VARB=0.00156366;OID=.;OPOS=86441335;OREF=-;OALT=TGTT;OMAPALT=CTGTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.511628:20:43:22:43:21:17:5:5:16:99:21:15:5:5:16
chr2	86481835	.	C	T	191.63	PASS	AF=0.408163;AO=20;DP=49;FAO=20;FDP=49;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=-0.0100043;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=304.652;QD=15.643;RBI=0.0125943;REFB=0.00818748;REVB=-0.00765041;RO=29;SAF=12;SAR=8;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0147169;STB=0.508466;STBP=0.944;TYPE=snp;VARB=-0.0134549;OID=.;OPOS=86481835;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:29:29:20:20:0.408163:8:12:17:12:8:12:17:12
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chr2	86691250	.	G	A	2521.11	PASS	AF=0.988024;AO=165;DP=167;FAO=165;FDP=167;FR=.;FRO=2;FSAF=76;FSAR=89;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00159439;FXX=0.00595203;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.647;QD=60.3859;RBI=0.0163198;REFB=-0.0933334;REVB=0.0162417;RO=2;SAF=76;SAR=89;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000903351;STB=0.500475;STBP=0.867;TYPE=snp;VARB=0.00134953;OID=.;OPOS=86691250;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:167:167:2:2:165:165:0.988024:89:76:1:1:89:76:1:1
chr2	86707313	.	G	A	225.53	PASS	AF=0.478261;AO=22;DP=47;FAO=22;FDP=46;FR=.;FRO=24;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.00153116;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.409;QD=19.6109;RBI=0.00267676;REFB=0.0171247;REVB=-0.00219559;RO=24;SAF=14;SAR=8;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0915131;STB=0.551819;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=-0.0104179;OID=.;OPOS=86707313;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:46:24:24:22:22:0.478261:8:14:13:11:8:14:13:11
chr2	86979093	.	G	A	1475.35	PASS	AF=1;AO=93;DP=94;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00890501;FXX=0.0106372;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.2272;QD=63.4559;RBI=0.0573814;REFB=0;REVB=0.0566862;RO=0;SAF=46;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000366645;OID=.;OPOS=86979093;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:94:93:0:0:93:93:1:47:46:0:0:47:46:0:0
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chr2	87069379	.	G	A	152.26	PASS	AF=0.933333;AO=14;DP=15;FAO=14;FDP=15;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0543272;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.2728;QD=40.6032;RBI=0.0709167;REFB=-0.0255302;REVB=-0.0455822;RO=0;SAF=10;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.63386e-08;STB=0.523776;STBP=0.622;TYPE=snp;VARB=-0.000999391;OID=.;OPOS=87069379;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:15:15:0:1:14:14:0.933333:4:10:0:0:4:10:1:0
chr2	87069431	.	C	T	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0823815;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.024;QD=33.4285;RBI=0.0948723;REFB=0;REVB=0.0470535;RO=0;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00730047;OID=.;OPOS=87069431;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:4:2:0:0:4:2:0:0
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chr2	88315954	.	C	A	267.5	PASS	AF=0.88;AO=22;DP=25;FAO=22;FDP=25;FR=.;FRO=3;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0119746;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=242.954;QD=42.8002;RBI=0.012272;REFB=-0.182907;REVB=-0.00268572;RO=1;SAF=12;SAR=10;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0369717;STB=0.514693;STBP=0.719;TYPE=snp;VARB=0.00172894;OID=.;OPOS=88315954;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:25:25:1:3:22:22:0.88:10:12:1:0:10:12:2:1
chr2	88315993	.	A	G	113.11	PASS	AF=0.5;AO=13;DP=26;FAO=13;FDP=26;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.0834097;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.6112;QD=17.4011;RBI=0.0858886;REFB=0.05763;REVB=-0.0204857;RO=13;SAF=5;SAR=8;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200611;STB=0.615207;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=-0.0529894;OID=.;OPOS=88315993;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:26:13:13:13:13:0.5:8:5:8:5:8:5:8:5
chr2	88387403	.	C	A	517.87	PASS	AF=0.947368;AO=30;DP=38;FAO=36;FDP=38;FR=.;FRO=2;FSAF=28;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0101259;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.541;QD=54.5131;RBI=0.111829;REFB=-0.0952253;REVB=0.11137;RO=0;SAF=28;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.56306e-08;STB=0.517232;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=0.00224492;OID=.;OPOS=88387403;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:38:38:0:2:30:36:0.947368:2:28:0:0:8:28:2:0
chr2	88396210	.	G	A	263.74	PASS	AF=0.378049;AO=31;DP=82;FAO=31;FDP=82;FR=.;FRO=51;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=25;FSRR=26;FWDB=-0.0285109;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.215;QD=12.8652;RBI=0.0311705;REFB=-0.0127503;REVB=-0.0125988;RO=51;SAF=20;SAR=11;SRF=25;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172633;STB=0.599125;STBP=0.183;TYPE=snp;VARB=0.0203979;OID=.;OPOS=88396210;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:51:51:31:31:0.378049:11:20:25:26:11:20:25:26
chr2	88407959	.	T	C	212.1	PASS	AF=0.376812;AO=26;DP=69;FAO=26;FDP=69;FR=.;FRO=43;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=24;FSRR=19;FWDB=-0.000940272;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.2289;QD=12.2958;RBI=0.00444441;REFB=-0.0242758;REVB=-0.0043438;RO=42;SAF=14;SAR=12;SRF=24;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.035763;STB=0.51235;STBP=0.883;TYPE=snp;VARB=0.0410033;OID=.;OPOS=88407959;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:42:43:26:26:0.376812:12:14:24:18:12:14:24:19
chr2	88411605	.	A	T	1188.96	PASS	AF=0.963855;AO=80;DP=83;FAO=80;FDP=83;FR=.;FRO=3;FSAF=42;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0537865;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.58;QD=57.2992;RBI=0.0584108;REFB=-0.108033;REVB=0.022778;RO=2;SAF=42;SAR=38;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00115689;STB=0.506939;STBP=0.495;TYPE=snp;VARB=0.0126823;OID=.;OPOS=88411605;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:83:83:2:3:80:80:0.963855:38:42:1:1:38:42:1:2
chr2	88472791	.	G	A	715.54	PASS	AF=1;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0214163;FXX=0.019604;HRUN=3;LEN=1;MLLD=295.342;QD=57.2433;RBI=0.0262728;REFB=0;REVB=-0.0152185;RO=0;SAF=33;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.56458e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.13441e-05;OID=.;OPOS=88472791;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:50:0:0:50:50:1:17:33:0:0:17:33:0:0
chr2	88874891	.	C	A	902.71	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00565917;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.7;QD=58.2396;RBI=0.0148724;REFB=0;REVB=0.0137537;RO=0;SAF=24;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.86722e-05;OID=.;OPOS=88874891;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:38:24:0:0:38:24:0:0
chr2	88879131	.	T	C	601.11	PASS	AF=0.97561;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00362544;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.224;QD=58.6451;RBI=0.0177454;REFB=0.0429339;REVB=0.0173711;RO=1;SAF=21;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0240441;STB=0.512814;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=5.61686e-05;OID=.;OPOS=88879131;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:41:41:1:1:40:40:0.97561:19:21:0:1:19:21:0:1
chr2	88895123	.	T	C	739.04	PASS	AF=0.981481;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00842703;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.499;QD=54.7435;RBI=0.0283959;REFB=-0.0235064;REVB=0.0271166;RO=1;SAF=30;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0200431;STB=0.510634;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.000718729;OID=.;OPOS=88895123;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:54:54:1:1:53:53:0.981481:23:30:0:1:23:30:0:1
chr2	88895351	.	T	C	885.43	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0342419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.0924;QD=58.0608;RBI=0.0345566;REFB=0;REVB=-0.00465366;RO=0;SAF=39;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.01474e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000254072;OID=.;OPOS=88895351;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:22:39:0:0:22:39:0:0
chr2	89292154	.	G	T	236.24	PASS	AF=0.481481;AO=26;DP=54;FAO=26;FDP=54;FR=.;FRO=28;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=-0.0225714;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.474;QD=17.4989;RBI=0.0273364;REFB=-0.0043838;REVB=0.0154212;RO=27;SAF=14;SAR=12;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0851628;STB=0.556775;STBP=0.455;TYPE=snp;VARB=0.00579028;OID=.;OPOS=89292154;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:27:28:26:26:0.481481:12:14:12:15:12:14:12:16
chr2	89339720	.	G	A	34.9	PASS	AF=0.153846;AO=6;DP=39;FAO=6;FDP=39;FR=.;FRO=33;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=24;FWDB=0.0636246;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.1876;QD=3.57996;RBI=0.123632;REFB=0.0116565;REVB=0.106004;RO=33;SAF=2;SAR=4;SRF=9;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0854257;STB=0.559811;STBP=0.794;TYPE=snp;VARB=-0.0449845;OID=.;OPOS=89339720;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:39:39:33:33:6:6:0.153846:4:2:9:24:4:2:9:24
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chr2	95542476	.	C	T	163.45	PASS	AF=0.264368;AO=23;DP=87;FAO=23;FDP=87;FR=.;FRO=64;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=38;FSRR=26;FWDB=0.0370826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.816;QD=7.515;RBI=0.0384426;REFB=-0.00993346;REVB=-0.010135;RO=64;SAF=13;SAR=10;SRF=38;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0356211;STB=0.521454;STBP=0.834;TYPE=snp;VARB=0.0269199;OID=.;OPOS=95542476;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:64:64:23:23:0.264368:10:13:38:26:10:13:38:26
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chr2	96593118	.	T	A	195.88	PASS	AF=0.216783;AO=31;DP=143;FAO=31;FDP=143;FR=.;FRO=112;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=54;FSRR=58;FWDB=0.0129643;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.4021;QD=5.47925;RBI=0.0176624;REFB=0.00349491;REVB=0.0119953;RO=111;SAF=11;SAR=20;SRF=54;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170331;STB=0.602342;STBP=0.214;TYPE=snp;VARB=-0.0163514;OID=.;OPOS=96593118;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:143:143:111:112:31:31:0.216783:20:11:54:57:20:11:54:58
chr2	96594958	.	G	A	45.06	PASS	AF=0.304348;AO=7;DP=23;FAO=7;FDP=23;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=-0.00915311;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.129;QD=7.83695;RBI=0.0465155;REFB=0.0100186;REVB=0.0456061;RO=16;SAF=4;SAR=3;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0613202;STB=0.538354;STBP=0.868;TYPE=snp;VARB=-0.0148528;OID=.;OPOS=96594958;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:23:23:16:16:7:7:0.304348:3:4:10:6:3:4:10:6
chr2	96594966	.	T	G	151.2	PASS	AF=0.533333;AO=16;DP=30;FAO=16;FDP=30;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=0.0226848;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.1047;QD=20.16;RBI=0.0631257;REFB=0.0248319;REVB=0.0589088;RO=14;SAF=10;SAR=6;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0157568;STB=0.508917;STBP=0.965;TYPE=snp;VARB=-0.00732218;OID=.;OPOS=96594966;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:14:14:16:16:0.533333:6:10:9:5:6:10:9:5
chr2	96595032	.	A	T	220.37	PASS	AF=0.55;AO=21;DP=39;FAO=22;FDP=40;FR=.;FRO=18;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=0.0113977;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.339;QD=22.0372;RBI=0.0120742;REFB=-0.0169673;REVB=-0.00398472;RO=18;SAF=13;SAR=8;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0420569;STB=0.535682;STBP=0.647;TYPE=snp;VARB=0.0148969;OID=.;OPOS=96595032;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:40:18:18:21:22:0.55:8:13:12:6:9:13:12:6
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chr2	96795608	.	T	G	148.58	PASS	AF=0.5;AO=16;DP=32;FAO=16;FDP=32;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=-0.108334;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.5205;QD=18.573;RBI=0.1133;REFB=-0.0424173;REVB=-0.0331753;RO=16;SAF=4;SAR=12;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.348803;STB=0.699737;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.0391173;OID=.;OPOS=96795608;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:16:16:16:16:0.5:12:4:10:6:12:4:10:6
chr2	96795714	.	G	A	298.07	PASS	AF=0.54386;AO=31;DP=57;FAO=31;FDP=57;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=0.00434115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.37;QD=20.9168;RBI=0.0164252;REFB=-0.03424;REVB=-0.0158411;RO=26;SAF=14;SAR=17;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0237552;STB=0.513165;STBP=0.85;TYPE=snp;VARB=0.0208404;OID=.;OPOS=96795714;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:26:26:31:31:0.54386:17:14:11:15:17:14:11:15
chr2	96795857	.	T	C	501.64	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00297037;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.847;QD=59.0162;RBI=0.0172282;REFB=0;REVB=0.0169702;RO=0;SAF=10;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.10051e-05;OID=.;OPOS=96795857;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:24:10:0:0:24:10:0:0
chr2	96809331	.	T	C	460.9	PASS	AF=0.571429;AO=44;DP=78;FAO=44;FDP=77;FR=.;FRO=33;FSAF=26;FSAR=18;FSRF=26;FSRR=7;FWDB=0.0130692;FXX=0.0128189;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.6262;QD=23.9429;RBI=0.0155996;REFB=-0.0367562;REVB=0.00851723;RO=33;SAF=26;SAR=18;SRF=26;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16518;STB=0.590126;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=0.0262663;OID=.;OPOS=96809331;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:77:33:33:44:44:0.571429:18:26:26:7:18:26:26:7
chr2	96917588	.	T	G	437.41	PASS	AF=0.583333;AO=42;DP=72;FAO=42;FDP=72;FR=.;FRO=30;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=-0.00363867;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=159.715;QD=24.3008;RBI=0.00376221;REFB=-0.0176459;REVB=-0.000956193;RO=29;SAF=18;SAR=24;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0112659;STB=0.502023;STBP=0.97;TYPE=snp;VARB=0.0121798;OID=.;OPOS=96917588;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:29:30:42:42:0.583333:24:18:12:17:24:18:13:17
chr2	96944553	.	G	A	30.9	PASS	AF=0.5;AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=-0.0191847;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.1969;QD=12.359;RBI=0.0374358;REFB=-0.0167692;REVB=0.0321463;RO=5;SAF=4;SAR=1;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0186001;OID=.;OPOS=96944553;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:27:10:10:5:5:5:5:0.5:1:4:4:1:1:4:4:1
chr2	97166204	.	A	G	199.48	PASS	AF=0.431373;AO=22;DP=51;FAO=22;FDP=51;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.0150559;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.22;QD=15.6454;RBI=0.0150969;REFB=0.00425091;REVB=0.00111192;RO=29;SAF=8;SAR=14;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122984;STB=0.570305;STBP=0.394;TYPE=snp;VARB=-0.00435737;OID=.;OPOS=97166204;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:29:29:22:22:0.431373:14:8:14:15:14:8:14:15
chr2	97351840	.	A	G	118.91	PASS	AF=0.388889;AO=14;DP=36;FAO=14;FDP=36;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=-0.00975572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.622;QD=13.2127;RBI=0.0174694;REFB=-0.00311235;REVB=-0.0144916;RO=22;SAF=7;SAR=7;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0948902;STB=0.555477;STBP=0.603;TYPE=snp;VARB=0.00367252;OID=.;OPOS=97351840;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:22:22:14:14:0.388889:7:7:13:9:7:7:13:9
chr2	97355026	.	T	C	586.71	PASS	AF=0.536364;AO=58;DP=111;FAO=59;FDP=110;FR=.;FRO=51;FSAF=29;FSAR=30;FSRF=19;FSRR=32;FWDB=0.00222139;FXX=0.0265463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.705;QD=21.3348;RBI=0.00842842;REFB=-0.010269;REVB=-0.00813042;RO=49;SAF=29;SAR=29;SRF=18;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110811;STB=0.555263;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=0.0137622;OID=.;OPOS=97355026;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:110:49:51:58:59:0.536364:29:29:18:31:30:29:19:32
chr2	97359364	.	A	G	195.37	PASS	AF=0.454545;AO=20;DP=44;FAO=20;FDP=44;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=-0.00603159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.7556;QD=17.7608;RBI=0.0107819;REFB=-0.0204191;REVB=-0.00893692;RO=24;SAF=9;SAR=11;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00804904;STB=0.504583;STBP=0.957;TYPE=snp;VARB=0.0451578;OID=.;OPOS=97359364;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:24:24:20:20:0.454545:11:9:11:13:11:9:11:13
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chr2	98795792	.	C	G	919.38	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0131582;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.943;QD=58.3735;RBI=0.0223421;REFB=0;REVB=0.0180564;RO=0;SAF=30;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000166793;OID=.;OPOS=98795792;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:33:30:0:0:33:30:0:0
chr2	98844674	.	C	G	557.13	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143415;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.4463;QD=60.2306;RBI=0.0373069;REFB=0;REVB=0.0344401;RO=0;SAF=15;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.82408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000778578;OID=.;OPOS=98844674;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:22:15:0:0:22:15:0:0
chr2	98853173	.	G	A	1643.81	PASS	AF=1;AO=108;DP=111;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0379536;FXX=0.0180164;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.7688;QD=60.3234;RBI=0.0407825;REFB=0;REVB=0.0149245;RO=0;SAF=50;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.61453e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000479351;OID=.;OPOS=98853173;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:111:109:0:0:108:109:1:58:50:0:0:59:50:0:0
chr2	98928494	.	G	A	618.13	PASS	AF=0.97619;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0291319;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.8717;QD=58.8694;RBI=0.0291432;REFB=-0.102257;REVB=-0.000811582;RO=1;SAF=32;SAR=9;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0144415;STB=0.507689;STBP=0.633;TYPE=snp;VARB=0.00230102;OID=.;OPOS=98928494;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:42:42:1:1:41:41:0.97619:9:32:1:0:9:32:1:0
chr2	99013259	.	C	T	170.07	PASS	AF=0.45;AO=18;DP=40;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=-0.00253412;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.3726;QD=17.0074;RBI=0.0175025;REFB=-0.0241283;REVB=-0.0173181;RO=22;SAF=7;SAR=11;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0730157;STB=0.541622;STBP=0.654;TYPE=snp;VARB=0.0287211;OID=.;OPOS=99013259;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:22:22:18:18:0.45:11:7:7:15:11:7:7:15
chr2	99149946	.	G	A	180.85	PASS	AF=0.403846;AO=21;DP=52;FAO=21;FDP=52;FR=.;FRO=31;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=0.00928958;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=223.119;QD=13.9118;RBI=0.0161677;REFB=-0.00392476;REVB=-0.0132325;RO=31;SAF=8;SAR=13;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0416544;STB=0.523969;STBP=0.788;TYPE=snp;VARB=0.00691438;OID=.;OPOS=99149946;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:31:31:21:21:0.403846:13:8:13:18:13:8:13:18
chr2	99172244	.	A	G	68.82	PASS	AF=0.5;AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=-0.0903059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.2736;QD=15.2928;RBI=0.0904283;REFB=-0.0386217;REVB=0.0047026;RO=9;SAF=2;SAR=7;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124428;STB=0.573595;STBP=0.625;TYPE=snp;VARB=0.0461052;OID=.;OPOS=99172244;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:18:18:9:9:9:9:0.5:7:2:3:6:7:2:3:6
chr2	99193496	.	C	T	731.83	PASS	AF=0.555556;AO=70;DP=126;FAO=70;FDP=126;FR=.;FRO=56;FSAF=35;FSAR=35;FSRF=24;FSRR=32;FWDB=0.0250661;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.962;QD=23.2326;RBI=0.0262299;REFB=-0.0181106;REVB=0.00772622;RO=55;SAF=35;SAR=35;SRF=23;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0659145;STB=0.531737;STBP=0.468;TYPE=snp;VARB=0.0181952;OID=.;OPOS=99193496;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:126:126:55:56:70:70:0.555556:35:35:23:32:35:35:24:32
chr2	99226173	.	T	A	286.7	PASS	AF=0.675676;AO=24;DP=37;FAO=25;FDP=37;FR=.;FRO=12;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.017754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.643;QD=30.9949;RBI=0.0418082;REFB=-0.005867;REVB=-0.0378513;RO=12;SAF=16;SAR=8;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0555234;STB=0.53508;STBP=0.563;TYPE=snp;VARB=0.00273131;OID=.;OPOS=99226173;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:93:37:37:12:12:24:25:0.675676:8:16:7:5:8:17:7:5
chr2	99279812	.	C	A	175.63	PASS	AF=0.392157;AO=20;DP=51;FAO=20;FDP=51;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=-0.000439454;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.0228;QD=13.7748;RBI=0.0457765;REFB=-0.0101364;REVB=-0.0457744;RO=31;SAF=9;SAR=11;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0327042;STB=0.518868;STBP=0.842;TYPE=snp;VARB=0.00857066;OID=.;OPOS=99279812;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:31:31:20:20:0.392157:11:9:13:18:11:9:13:18
chr2	99778985	.	T	C	136.73	PASS	AF=0.296875;AO=19;DP=65;FAO=19;FDP=64;FR=.;FRO=45;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=21;FSRR=24;FWDB=0.0745003;FXX=0.0153822;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.8899;QD=8.54568;RBI=0.0796783;REFB=0.000729367;REVB=-0.0282549;RO=46;SAF=9;SAR=10;SRF=22;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00542085;STB=0.504945;STBP=0.964;TYPE=snp;VARB=-0.00020729;OID=.;OPOS=99778985;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:64:46:45:19:19:0.296875:10:9:22:24:10:9:21:24
chr2	99779131	.	T	C	119.78	PASS	AF=0.294118;AO=15;DP=51;FAO=15;FDP=51;FR=.;FRO=36;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=21;FSRR=15;FWDB=-0.0248248;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.5178;QD=9.39454;RBI=0.0319029;REFB=-0.0113165;REVB=-0.0200381;RO=36;SAF=8;SAR=7;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0590853;STB=0.535573;STBP=0.749;TYPE=snp;VARB=0.0258219;OID=.;OPOS=99779131;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:36:36:15:15:0.294118:7:8:21:15:7:8:21:15
chr2	99804642	.	T	C	670.27	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000841744;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.43;QD=62.3502;RBI=0.0253614;REFB=0;REVB=0.0253475;RO=0;SAF=24;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.91517e-05;OID=.;OPOS=99804642;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:19:24:0:0:19:24:0:0
chr2	99812070	.	G	A	183.07	PASS	AF=0.4;AO=22;DP=54;FAO=22;FDP=55;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=23;FWDB=-0.0063502;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.6931;QD=13.3144;RBI=0.0707704;REFB=-0.0268549;REVB=-0.0704849;RO=32;SAF=10;SAR=12;SRF=10;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151068;STB=0.59314;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.0282532;OID=.;OPOS=99812070;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:55:32:33:22:22:0.4:12:10:10:22:12:10:10:23
chr2	100343557	.	C	T	863.8	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00339344;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.313;QD=57.5868;RBI=0.0193126;REFB=0;REVB=0.0190121;RO=0;SAF=27;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.96591e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.67347e-05;OID=.;OPOS=100343557;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:60:0:0:59:60:1:32:27:0:0:33:27:0:0
chr2	100623151	.	C	T	320.81	PASS	AF=0.55;AO=33;DP=60;FAO=33;FDP=60;FR=.;FRO=27;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=0.00229571;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.698;QD=21.3874;RBI=0.0221562;REFB=-0.00352429;REVB=0.0220369;RO=26;SAF=20;SAR=13;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0241734;STB=0.506325;STBP=0.929;TYPE=snp;VARB=0.002942;OID=.;OPOS=100623151;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:26:27:33:33:0.55:13:20:15:11:13:20:16:11
chr2	100897573	.	G	A	788.05	PASS	AF=1;AO=55;DP=56;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0215245;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.528;QD=57.3124;RBI=0.0215306;REFB=0;REVB=-0.00051122;RO=0;SAF=29;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.40922e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000475337;OID=.;OPOS=100897573;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:55:0:0:55:55:1:26:29:0:0:26:29:0:0
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chr2	100916306	.	A	G	871.8	PASS	AF=0.983871;AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00143712;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=173.761;QD=56.2453;RBI=0.0075683;REFB=-0.0937742;REVB=0.0074306;RO=1;SAF=33;SAR=28;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0165597;STB=0.508769;STBP=0.339;TYPE=snp;VARB=6.42395e-05;OID=.;OPOS=100916306;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:62:62:1:1:61:61:0.983871:28:33:0:1:28:33:0:1
chr2	100916315	.	A	G	225.22	PASS	AF=0.440678;AO=25;DP=59;FAO=26;FDP=59;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=0.00129313;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.034;QD=15.2689;RBI=0.0351383;REFB=-0.00384067;REVB=0.0351145;RO=33;SAF=15;SAR=10;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.204924;STB=0.623282;STBP=0.098;TYPE=snp;VARB=0.00464358;OID=.;OPOS=100916315;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:33:33:25:26:0.440678:10:15:13:20:10:16:13:20
chr2	100917109	.	C	T	746.73	PASS	AF=0.525547;AO=72;DP=137;FAO=72;FDP=137;FR=.;FRO=65;FSAF=39;FSAR=33;FSRF=34;FSRR=31;FWDB=0.00287161;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=272.272;QD=21.8024;RBI=0.00794902;REFB=-0.0107694;REVB=-0.00741221;RO=65;SAF=39;SAR=33;SRF=34;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0161549;STB=0.508866;STBP=0.839;TYPE=snp;VARB=0.0097362;OID=.;OPOS=100917109;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:137:137:65:65:72:72:0.525547:33:39:34:31:33:39:34:31
chr2	101010082	.	G	C	406.49	PASS	AF=0.408696;AO=47;DP=115;FAO=47;FDP=115;FR=.;FRO=68;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=36;FSRR=32;FWDB=-0.00731153;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=269.855;QD=14.1387;RBI=0.00745393;REFB=-0.00373954;REVB=-0.00145003;RO=68;SAF=20;SAR=27;SRF=36;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109242;STB=0.561638;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=0.00502508;OID=.;OPOS=101010082;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:115:68:68:47:47:0.408696:27:20:36:32:27:20:36:32
chr2	101031561	.	G	T	122.29	PASS	AF=0.293103;AO=17;DP=58;FAO=17;FDP=58;FR=.;FRO=41;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=25;FWDB=-0.0344602;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.5286;QD=8.43346;RBI=0.0345884;REFB=0.00739201;REVB=-0.00297573;RO=41;SAF=11;SAR=6;SRF=16;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.297234;STB=0.677728;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=-0.0234631;OID=.;OPOS=101031561;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:41:41:17:17:0.293103:6:11:16:25:6:11:16:25
chr2	101086951	.	A	G	420.9	PASS	AF=0.615385;AO=40;DP=66;FAO=40;FDP=65;FR=.;FRO=25;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=0.000107736;FXX=0.0151492;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.578;QD=25.9015;RBI=0.025275;REFB=-0.00756326;REVB=0.0252748;RO=25;SAF=16;SAR=24;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114169;STB=0.562468;STBP=0.2;TYPE=snp;VARB=0.00386849;OID=.;OPOS=101086951;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:65:25:25:40:40:0.615385:24:16:14:11:24:16:14:11
chr2	101086966	.	C	T	188.85	PASS	AF=0.352941;AO=23;DP=68;FAO=24;FDP=68;FR=.;FRO=44;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=25;FWDB=0.0451746;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=56.3975;QD=11.109;RBI=0.0485319;REFB=-0.0174696;REVB=0.0177371;RO=45;SAF=14;SAR=9;SRF=19;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.209932;STB=0.59748;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=0.0369121;OID=.;OPOS=101086966;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:45:44:23:24:0.352941:9:14:19:26:10:14:19:25
chr2	101096960	.	C	T	1375.11	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00536847;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.595;QD=62.5052;RBI=0.0567975;REFB=0;REVB=0.0565432;RO=0;SAF=48;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.28834e-05;OID=.;OPOS=101096960;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:88:0:0:86:88:1:38:48:0:0:39:49:0:0
chr2	101186088	.	C	T	1283.23	PASS	AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0232118;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.0096;QD=61.8424;RBI=0.0299866;REFB=0;REVB=0.0189844;RO=0;SAF=31;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.49569e-05;OID=.;OPOS=101186088;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:52:31:0:0:52:31:0:0
chr2	101192883	.	G	A	110.56	PASS	AF=0.202247;AO=18;DP=89;FAO=18;FDP=89;FR=.;FRO=71;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=35;FSRR=36;FWDB=-0.0246436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.207;QD=4.96912;RBI=0.0357645;REFB=-0.00466528;REVB=-0.0259189;RO=71;SAF=8;SAR=10;SRF=35;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.061155;STB=0.538804;STBP=0.751;TYPE=snp;VARB=0.0202312;OID=.;OPOS=101192883;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:71:71:18:18:0.202247:10:8:35:36:10:8:35:36
chr2	101437561	.	G	A	1264.71	PASS	AF=1;AO=81;DP=81;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0196149;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.117;QD=61.693;RBI=0.0218852;REFB=0;REVB=0.00970658;RO=0;SAF=40;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.1124e-05;OID=.;OPOS=101437561;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:82:0:0:81:82:1:41:40:0:0:41:41:0:0
chr2	101437601	.	C	G	1158.18	PASS	AF=0.987179;AO=77;DP=78;FAO=77;FDP=78;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=42;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0115466;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=209.874;QD=59.394;RBI=0.0181019;REFB=-0.0829819;REVB=0.0139411;RO=1;SAF=35;SAR=42;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133301;STB=0.50704;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=6.47529e-05;OID=.;OPOS=101437601;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:78:78:1:1:77:77:0.987179:42:35:1:0:42:35:1:0
chr2	101587455	.	C	T	404.14	PASS	AF=0.493976;AO=41;DP=82;FAO=41;FDP=83;FR=.;FRO=42;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=-5.53304e-06;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.04;QD=19.4767;RBI=0.00520567;REFB=-0.0157453;REVB=-0.00520567;RO=41;SAF=24;SAR=17;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0888902;STB=0.543807;STBP=0.427;TYPE=snp;VARB=0.0157049;OID=.;OPOS=101587455;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:83:41:42:41:41:0.493976:17:24:20:21:17:24:21:21
chr2	101591304	.	A	G	347.63	PASS	AF=0.514286;AO=36;DP=70;FAO=36;FDP=70;FR=.;FRO=34;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=0.023593;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.9639;QD=19.8646;RBI=0.041631;REFB=-0.0226113;REVB=-0.0343003;RO=34;SAF=16;SAR=20;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100032;STB=0.555525;STBP=0.379;TYPE=snp;VARB=0.0225572;OID=.;OPOS=101591304;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:34:34:36:36:0.514286:20:16:19:15:20:16:19:15
chr2	101612051	.	G	A	186.7	PASS	AF=0.666667;AO=18;DP=27;FAO=18;FDP=27;FR=.;FRO=9;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=8;FWDB=0.0173923;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.15;QD=27.6587;RBI=0.0218265;REFB=-0.0112625;REVB=-0.0131873;RO=9;SAF=7;SAR=11;SRF=1;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.184777;STB=0.601706;STBP=0.184;TYPE=snp;VARB=0.00385866;OID=.;OPOS=101612051;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:27:27:9:9:18:18:0.666667:11:7:1:8:11:7:1:8
chr2	101624471	.	T	C	47.54	PASS	AF=0.4375;AO=7;DP=16;FAO=7;FDP=16;FR=.;FRO=9;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.0266857;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.732;QD=11.8841;RBI=0.0781309;REFB=-0.0165217;REVB=-0.0734323;RO=9;SAF=1;SAR=6;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.371799;STB=0.730929;STBP=0.192;TYPE=snp;VARB=0.0358461;OID=.;OPOS=101624471;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:16:16:9:9:7:7:0.4375:6:1:4:5:6:1:4:5
chr2	101638888	.	A	G	480.08	PASS	AF=0.5;AO=49;DP=100;FAO=50;FDP=100;FR=.;FRO=50;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=30;FSRR=20;FWDB=-0.0119724;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.885;QD=19.2033;RBI=0.0202222;REFB=-0.00559958;REVB=-0.0162972;RO=50;SAF=25;SAR=24;SRF=30;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0820994;STB=0.540177;STBP=0.447;TYPE=snp;VARB=0.00273894;OID=.;OPOS=101638888;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:50:50:49:50:0.5:24:25:30:20:24:26:30:20
chr2	101646144	.	G	A	384.14	PASS	AF=0.45977;AO=40;DP=87;FAO=40;FDP=87;FR=.;FRO=47;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=32;FWDB=-0.00958508;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.416;QD=17.6614;RBI=0.0101454;REFB=-0.0237753;REVB=0.00332496;RO=47;SAF=25;SAR=15;SRF=15;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.290273;STB=0.661893;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.0359139;OID=.;OPOS=101646144;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:47:47:40:40:0.45977:15:25:15:32:15:25:15:32
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chr2	101898412	.	G	C	689.38	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0255926;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.215;QD=62.671;RBI=0.0257172;REFB=0;REVB=-0.00252791;RO=0;SAF=23;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.185e-05;OID=.;OPOS=101898412;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:21:23:0:0:21:23:0:0
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chr2	103001402	.	C	T	292.52	PASS	AF=0.604651;AO=25;DP=42;FAO=26;FDP=43;FR=.;FRO=17;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=-0.024228;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201;QD=27.2107;RBI=0.0271922;REFB=-0.0249596;REVB=0.0123459;RO=15;SAF=14;SAR=11;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108661;STB=0.549962;STBP=0.403;TYPE=snp;VARB=0.0177922;OID=.;OPOS=103001402;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:43:15:17:25:26:0.604651:11:14:6:9:12:14:7:10
chr2	103095404	.	G	A	220.68	PASS	AF=0.375;AO=28;DP=73;FAO=27;FDP=72;FR=.;FRO=45;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=23;FSRR=22;FWDB=0.00237545;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.0046;QD=12.2598;RBI=0.0039762;REFB=-0.0210322;REVB=0.00318863;RO=42;SAF=13;SAR=15;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0125549;STB=0.541765;STBP=0.615;TYPE=snp;VARB=0.038929;OID=.;OPOS=103095404;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:72:42:45:28:27:0.375:15:13:20:22:15:12:23:22
chr2	103149100	.	G	A	178.72	PASS	AF=0.5625;AO=18;DP=32;FAO=18;FDP=32;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=0.00661121;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.594;QD=22.3395;RBI=0.00920877;REFB=-0.0122242;REVB=0.00641041;RO=14;SAF=6;SAR=12;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109116;STB=0.560911;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.00573172;OID=.;OPOS=103149100;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:14:14:18:18:0.5625:12:6:3:11:12:6:3:11
chr2	103334969	.	G	A	629.64	PASS	AF=0.448276;AO=65;DP=146;FAO=65;FDP=145;FR=.;FRO=80;FSAF=36;FSAR=29;FSRF=50;FSRR=30;FWDB=-0.0291326;FXX=0.00684885;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.9442;QD=17.3693;RBI=0.0447303;REFB=-0.00850582;REVB=0.0339424;RO=78;SAF=36;SAR=29;SRF=49;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0745435;STB=0.540048;STBP=0.406;TYPE=snp;VARB=0.0176697;OID=.;OPOS=103334969;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:146:145:78:80:65:65:0.448276:29:36:49:29:29:36:50:30
chr2	103431404	.	T	C	1468.06	PASS	AF=0.990196;AO=99;DP=101;FAO=101;FDP=102;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=54;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.040663;FXX=0.0192289;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.206;QD=57.5711;RBI=0.0490842;REFB=-0.151421;REVB=0.0274914;RO=0;SAF=46;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505262;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=0.00158933;OID=.;OPOS=103431404;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:101:102:0:1:99:101:0.990196:53:46:0:0:54:47:1:0
chr2	104995800	.	C	T	469.01	PASS	AF=0.5;AO=46;DP=92;FAO=46;FDP=92;FR=.;FRO=46;FSAF=31;FSAR=15;FSRF=29;FSRR=17;FWDB=0.0212314;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.742;QD=20.3916;RBI=0.0213858;REFB=-0.00630823;REVB=0.00256471;RO=46;SAF=31;SAR=15;SRF=29;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0438017;STB=0.524302;STBP=0.656;TYPE=snp;VARB=0.00652771;OID=.;OPOS=104995800;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:46:46:46:46:0.5:15:31:29:17:15:31:29:17
chr2	105709023	.	T	C	635.7	PASS	AF=1;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000712861;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.63;QD=62.019;RBI=0.00754615;REFB=0;REVB=0.00751241;RO=0;SAF=20;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.3416e-06;OID=.;OPOS=105709023;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:41:0:0:41:41:1:21:20:0:0:21:20:0:0
chr2	105885961	.	T	C	450.56	PASS	AF=0.53012;AO=43;DP=83;FAO=44;FDP=83;FR=.;FRO=39;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=-0.0349034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.9895;QD=21.7139;RBI=0.0357903;REFB=-0.035424;REVB=-0.0079181;RO=38;SAF=25;SAR=18;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0700925;STB=0.538359;STBP=0.48;TYPE=snp;VARB=0.0273684;OID=.;OPOS=105885961;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:38:39:43:44:0.53012:18:25:19:19:19:25:19:20
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chr2	105953938	.	G	GC	357.86	PASS	AF=0.414894;AO=39;DP=96;FAO=39;FDP=94;FR=.;FRO=55;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=21;FSRR=34;FWDB=-0.023977;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=150.914;QD=15.2283;RBI=0.0406897;REFB=-0.0280214;REVB=-0.0328748;RO=57;SAF=19;SAR=20;SRF=23;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0881305;STB=0.561853;STBP=0.333;TYPE=ins;VARB=0.0506608;OID=.;OPOS=105953939;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.414894:39:96:39:94:55:19:20:21:34:99:57:19:20:23:34
chr2	105959592	.	G	A	174.09	PASS	AF=0.5;AO=18;DP=36;FAO=18;FDP=36;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.00283444;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.054;QD=19.3431;RBI=0.0149662;REFB=0.00150265;REVB=-0.0146954;RO=18;SAF=5;SAR=13;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166538;STB=0.594959;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=-0.00201875;OID=.;OPOS=105959592;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:18:18:18:18:0.5:13:5:8:10:13:5:8:10
chr2	105977761	.	G	A	309.49	PASS	AF=0.441558;AO=34;DP=76;FAO=34;FDP=77;FR=.;FRO=43;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=20;FSRR=23;FWDB=0.00330351;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=215.888;QD=16.0776;RBI=0.00781227;REFB=-0.00289037;REVB=0.00707943;RO=42;SAF=15;SAR=19;SRF=19;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0111409;STB=0.513506;STBP=0.848;TYPE=snp;VARB=0.00310426;OID=.;OPOS=105977761;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:77:42:43:34:34:0.441558:19:15:19:23:19:15:20:23
chr2	106510455	.	GCACACACACACACACACACACTA	GCACACACACACACACAC,GCACACACACACACACACACACACACTA,GCACACACACACACACACTA	628.77	PASS	AF=0.645833,0.333333,0;AO=25,13,6;DP=58;FAO=31,16,0;FDP=48;FR=.;FRO=1;FSAF=17,10,0;FSAR=14,6,0;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0329299,0.0171401,0.0177127;FXX=0.0943218;HRUN=1,0,1;LEN=6,4,4;MLLD=331.231,132.28,183.222;QD=52.3978;RBI=0.0585245,0.0188861,0.0344163;REFB=-0.0841891,-0.0543418,-0.0224518;REVB=0.0483812,0.00793103,0.0295083;RO=0;SAF=14,8,4;SAR=11,5,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=3.99383e-08,3.60098e-08,0;STB=0.51723,0.538413,0.5;STBP=0.314,0.27,1;TYPE=del,ins,del;VARB=0.0082676,0.096245,0;OID=.,.,.;OPOS=106510473,106510456,106510456;OREF=ACACTA,-,CACA;OALT=-,CACA,-;OMAPALT=GCACACACACACACACAC,GCACACACACACACACACACACACACTA,GCACACACACACACACACTA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.645833,0.333333,0:25,13,6:58:31,16,0:48:1:17,10,0:14,6,0:0:1:99:0:14,8,4:11,5,2:0:0
chr2	106710108	.	C	T	816.64	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0276337;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.789;QD=57.3083;RBI=0.0289732;REFB=0;REVB=0.00870782;RO=0;SAF=22;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.65803e-05;OID=.;OPOS=106710108;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:55:57:0:0:55:57:1:33:22:0:0:33:24:0:0
chr2	106742139	.	C	T	340.73	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0765221;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.9835;QD=54.5174;RBI=0.0885982;REFB=0;REVB=-0.0446543;RO=0;SAF=8;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000518295;OID=.;OPOS=106742139;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:17:8:0:0:17:8:0:0
chr2	107049604	.	T	C	67.43	PASS	AF=0.45;AO=9;DP=20;FAO=9;FDP=20;FR=.;FRO=11;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=0.0143407;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.948;QD=13.486;RBI=0.0718158;REFB=-0.0113118;REVB=0.0703694;RO=11;SAF=7;SAR=2;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166665;STB=0.59976;STBP=0.496;TYPE=snp;VARB=0.0114016;OID=.;OPOS=107049604;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:20:20:11:11:9:9:0.45:2:7:7:4:2:7:7:4
chr2	107073469	.	T	A	191.28	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0459859;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.4323;QD=47.8204;RBI=0.119513;REFB=0;REVB=0.110312;RO=0;SAF=12;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.07465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00565887;OID=.;OPOS=107073469;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:4:12:0:0:4:12:0:0
chr2	107073501	.	C	T	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00117503;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.4863;QD=44.6894;RBI=0.0557272;REFB=0;REVB=0.0557148;RO=0;SAF=9;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00240384;OID=.;OPOS=107073501;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:4:9:0:0:4:9:0:0
chr2	107084739	.	A	G	2026.8	PASS	AF=0.931507;AO=136;DP=146;FAO=136;FDP=146;FR=.;FRO=10;FSAF=73;FSAR=63;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.0234801;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.075;QD=55.5289;RBI=0.0403287;REFB=-0.0918518;REVB=0.0327886;RO=9;SAF=73;SAR=63;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.024033;STB=0.509404;STBP=0.413;TYPE=snp;VARB=0.00406007;OID=.;OPOS=107084739;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:27:146:146:9:10:136:136:0.931507:63:73:3:6:63:73:4:6
chr2	107107511	.	C	T	747.1	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00691001;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.394;QD=63.5828;RBI=0.00742479;REFB=0;REVB=0.00271649;RO=0;SAF=8;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.91363e-05;OID=.;OPOS=107107511;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:39:8:0:0:39:8:0:0
chr2	107107567	.	G	C	518.65	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.04324;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=62.6375;QD=59.2742;RBI=0.0597502;REFB=0;REVB=-0.0412358;RO=0;SAF=11;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00145301;OID=.;OPOS=107107567;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:24:11:0:0:24:11:0:0
chr2	107450525	.	T	C	595.82	PASS	AF=0.568627;AO=58;DP=102;FAO=58;FDP=102;FR=.;FRO=44;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=16;FSRR=28;FWDB=-0.00848239;FXX=0.0192289;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.128;QD=23.3655;RBI=0.0206238;REFB=0.000347965;REVB=0.0187987;RO=42;SAF=30;SAR=28;SRF=16;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104595;STB=0.566015;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=-0.000285777;OID=.;OPOS=107450525;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:42:44:58:58:0.568627:28:30:16:26:28:30:16:28
chr2	107450589	.	C	T	1607.08	PASS	AF=1;AO=100;DP=100;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00347248;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.958;QD=64.2834;RBI=0.00764372;REFB=0;REVB=0.00680943;RO=0;SAF=42;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.20942e-06;OID=.;OPOS=107450589;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:100:100:0:0:100:100:1:58:42:0:0:58:42:0:0
chr2	107459974	.	C	T	203.06	PASS	AF=0.378788;AO=25;DP=66;FAO=25;FDP=66;FR=.;FRO=41;FSAF=7;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=24;FWDB=0.00883716;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=98.8438;QD=12.3069;RBI=0.0621553;REFB=0.00566149;REVB=-0.0615239;RO=40;SAF=7;SAR=18;SRF=16;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146392;STB=0.594961;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=-0.00983263;OID=.;OPOS=107459974;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:40:41:25:25:0.378788:18:7:16:24:18:7:17:24
chr2	108443511	.	C	G	2843.76	PASS	AF=0.978723;AO=184;DP=188;FAO=184;FDP=188;FR=.;FRO=4;FSAF=95;FSAR=89;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.00321864;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.7457;QD=60.5055;RBI=0.0188523;REFB=-0.185602;REVB=0.0185755;RO=2;SAF=95;SAR=89;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00991714;STB=0.504979;STBP=0.399;TYPE=snp;VARB=0.00368924;OID=.;OPOS=108443511;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:188:188:2:4:184:184:0.978723:89:95:2:0:89:95:3:1
chr2	108475958	.	A	G	1515.56	PASS	AF=0.989691;AO=96;DP=97;FAO=96;FDP=97;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0740146;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.8758;QD=62.4972;RBI=0.0824459;REFB=-0.0841182;REVB=-0.0363204;RO=0;SAF=40;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504424;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.00125469;OID=.;OPOS=108475958;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:97:97:0:1:96:96:0.989691:56:40:0:0:56:40:0:1
chr2	108479432	.	G	A	48.86	PASS	AF=0.5;AO=7;DP=14;FAO=7;FDP=14;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=-0.0273595;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=125.323;QD=13.959;RBI=0.0275534;REFB=-0.0250213;REVB=0.00326356;RO=7;SAF=5;SAR=2;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161108;STB=0.594352;STBP=0.618;TYPE=snp;VARB=0.0151168;OID=.;OPOS=108479432;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:14:14:7:7:7:7:0.5:2:5:6:1:2:5:6:1
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chr2	108875471	.	G	T	2342.26	PASS	AF=1;AO=152;DP=152;FAO=154;FDP=154;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0619294;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.3261;QD=60.838;RBI=0.0654584;REFB=0;REVB=-0.0212029;RO=0;SAF=74;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.65373e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000381733;OID=.;OPOS=108875471;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:152:154:0:0:152:154:1:78:74:0:0:80:74:0:0
chr2	108877062	.	T	A	804.82	PASS	AF=0.982759;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00568918;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=310.499;QD=55.5051;RBI=0.00714074;REFB=-0.0684046;REVB=-0.00431548;RO=1;SAF=31;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0149715;STB=0.507934;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.000125914;OID=.;OPOS=108877062;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:58:58:1:1:57:57:0.982759:26:31:1:0:26:31:1:0
chr2	108922036	.	T	G	243.8	PASS	AF=0.4375;AO=28;DP=64;FAO=28;FDP=64;FR=.;FRO=36;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=-0.00194074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.273;QD=15.2374;RBI=0.0116418;REFB=-0.0070403;REVB=0.0114789;RO=36;SAF=15;SAR=13;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.019846;STB=0.511228;STBP=0.885;TYPE=snp;VARB=0.00907241;OID=.;OPOS=108922036;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:36:36:28:28:0.4375:13:15:20:16:13:15:20:16
chr2	109099572	.	C	G	520.42	PASS	AF=1;AO=34;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0241441;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.141;QD=59.4764;RBI=0.0255107;REFB=0;REVB=0.00823787;RO=0;SAF=18;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000361457;OID=.;OPOS=109099572;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:34:35:1:16:18:0:0:16:19:0:0
chr2	109106381	.	A	G	959.7	PASS	AF=0.985075;AO=65;DP=67;FAO=66;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0151514;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=191.324;QD=57.2955;RBI=0.015182;REFB=-0.141233;REVB=-0.000963025;RO=1;SAF=27;SAR=38;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0171739;STB=0.508769;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=0.000545111;OID=.;OPOS=109106381;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:67:67:1:1:65:66:0.985075:38:27:1:0:38:28:1:0
chr2	109389463	.	G	A	742.89	PASS	AF=1;AO=52;DP=53;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0274054;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.7845;QD=55.0287;RBI=0.0278328;REFB=-0.108897;REVB=-0.00485861;RO=1;SAF=31;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0149535;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00503309;OID=.;OPOS=109389463;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:53:54:1:0:52:54:1:21:31:1:0:21:33:0:0
chr2	109429146	.	T	A	651.17	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0226096;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.4348;QD=62.0157;RBI=0.0241572;REFB=0;REVB=0.00850738;RO=0;SAF=14;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00022476;OID=.;OPOS=109429146;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:28:14:0:0:28:14:0:0
chr2	109510937	.	G	A	2239.02	PASS	AF=1;AO=141;DP=142;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0160323;FXX=0.00704176;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.713;QD=63.5184;RBI=0.0193109;REFB=0;REVB=0.0107646;RO=0;SAF=49;SAR=92;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.67285e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.96945e-05;OID=.;OPOS=109510937;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:142:141:0:0:141:141:1:92:49:0:0:92:49:0:0
chr2	109512234	.	T	C	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000441195;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.42;QD=48.7373;RBI=0.0729014;REFB=0;REVB=-0.0729;RO=0;SAF=9;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000584905;OID=.;OPOS=109512234;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:8:9:0:0:8:9:0:0
chr2	109513601	.	A	G	537.53	PASS	AF=0.467213;AO=57;DP=122;FAO=57;FDP=122;FR=.;FRO=65;FSAF=22;FSAR=35;FSRF=30;FSRR=35;FWDB=-0.0373131;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.2;QD=17.6241;RBI=0.0383015;REFB=-0.00969687;REVB=0.00864497;RO=65;SAF=22;SAR=35;SRF=30;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0748763;STB=0.541652;STBP=0.424;TYPE=snp;VARB=0.0092153;OID=.;OPOS=109513601;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:122:122:65:65:57:57:0.467213:35:22:30:35:35:22:30:35
chr2	109513654	.	G	A	1553.15	PASS	AF=0.989899;AO=98;DP=99;FAO=98;FDP=99;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0181126;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.771;QD=62.7537;RBI=0.0453536;REFB=-0.0394221;REVB=0.0415798;RO=1;SAF=41;SAR=57;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00824921;STB=0.504347;STBP=0.48;TYPE=snp;VARB=0.000522603;OID=.;OPOS=109513654;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:99:99:1:1:98:98:0.989899:57:41:0:1:57:41:0:1
chr2	109526969	.	G	A	1048.84	PASS	AF=0.986111;AO=70;DP=71;FAO=71;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0291131;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.979;QD=58.2687;RBI=0.0471823;REFB=-0.0891452;REVB=0.0371295;RO=1;SAF=35;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133173;STB=0.50704;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=0.000527465;OID=.;OPOS=109526969;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:71:72:1:1:70:71:0.986111:35:35:1:0:36:35:1:0
chr2	109527373	.	A	G	670.25	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00882864;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.9536;QD=62.3485;RBI=0.061716;REFB=0;REVB=-0.0610812;RO=0;SAF=25;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.65211e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000656824;OID=.;OPOS=109527373;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:18:25:0:0:18:25:0:0
chr2	109745176	.	G	A	866.97	PASS	AF=0.953846;AO=62;DP=65;FAO=62;FDP=65;FR=.;FRO=3;FSAF=16;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0154478;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=130.758;QD=53.3521;RBI=0.0251708;REFB=-0.151553;REVB=0.019873;RO=3;SAF=16;SAR=46;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00851393;STB=0.504515;STBP=0.884;TYPE=snp;VARB=0.00244863;OID=.;OPOS=109745176;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:65:65:3:3:62:62:0.953846:46:16:1:2:46:16:1:2
chr2	110373197	.	G	A	234.78	PASS	AF=0.4;AO=27;DP=69;FAO=28;FDP=70;FR=.;FRO=42;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=25;FSRR=17;FWDB=-0.00158147;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.528;QD=13.4162;RBI=0.0308857;REFB=-0.0209759;REVB=-0.0308452;RO=42;SAF=13;SAR=14;SRF=25;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120607;STB=0.578038;STBP=0.324;TYPE=snp;VARB=0.0304679;OID=.;OPOS=110373197;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:70:42:42:27:28:0.4:14:13:25:17:15:13:25:17
chr2	110374215	.	T	C	179.69	PASS	AF=0.413043;AO=19;DP=46;FAO=19;FDP=46;FR=.;FRO=27;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=0.00814956;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.6667;QD=15.6255;RBI=0.0663196;REFB=-0.00382194;REVB=0.065817;RO=27;SAF=7;SAR=12;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.192674;STB=0.610993;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=0.00818968;OID=.;OPOS=110374215;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:27:27:19:19:0.413043:12:7:15:12:12:7:15:12
chr2	110375025	.	C	T	307.24	PASS	AF=0.43038;AO=34;DP=79;FAO=34;FDP=79;FR=.;FRO=45;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=23;FWDB=0.00778541;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.777;QD=15.5563;RBI=0.0458987;REFB=0.00578768;REVB=-0.0452336;RO=45;SAF=17;SAR=17;SRF=22;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0112084;STB=0.506325;STBP=0.952;TYPE=snp;VARB=-0.00557478;OID=.;OPOS=110375025;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:45:45:34:34:0.43038:17:17:22:23:17:17:22:23
chr2	110855123	.	G	T	487.44	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000830948;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.112;QD=59.0839;RBI=0.0410632;REFB=0;REVB=0.0410548;RO=0;SAF=22;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.12019e-05;OID=.;OPOS=110855123;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:11:22:0:0:11:22:0:0
chr2	111881475	.	AG	A	58.76	PASS	AF=0.423077;AO=17;DP=49;FAO=22;FDP=52;FR=.;FRO=30;FSAF=3;FSAR=19;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=0.00138564;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=10.7124;QD=4.51982;RBI=0.00381383;REFB=-0.0901674;REVB=-0.00355321;RO=30;SAF=2;SAR=15;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.399185;STB=0.699784;STBP=0.059;TYPE=del;VARB=0.0844793;OID=.;OPOS=111881476;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.423077:17:49:22:52:30:3:19:11:19:58:30:2:15:11:19
chr2	111907691	.	T	C	414.7	PASS	AF=0.442308;AO=46;DP=105;FAO=46;FDP=104;FR=.;FRO=58;FSAF=18;FSAR=28;FSRF=32;FSRR=26;FWDB=-0.0262093;FXX=0.0095229;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.4228;QD=15.9501;RBI=0.0320856;REFB=-0.0117798;REVB=-0.0185084;RO=58;SAF=18;SAR=28;SRF=32;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160925;STB=0.59018;STBP=0.116;TYPE=snp;VARB=0.0120922;OID=.;OPOS=111907691;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:104:58:58:46:46:0.442308:28:18:32:26:28:18:32:26
chr2	111908262	.	G	A	380.97	PASS	AF=0.465116;AO=39;DP=85;FAO=40;FDP=86;FR=.;FRO=46;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=25;FSRR=21;FWDB=-0.0130473;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.906;QD=17.7193;RBI=0.0142333;REFB=-0.00600269;REVB=-0.00568808;RO=46;SAF=14;SAR=25;SRF=25;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.182244;STB=0.591669;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=0.00764062;OID=.;OPOS=111908262;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:86:46:46:39:40:0.465116:25:14:25:21:25:15:25:21
chr2	111908388	.	C	T	167.84	PASS	AF=0.381818;AO=19;DP=54;FAO=21;FDP=55;FR=.;FRO=34;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=-0.0423377;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.488;QD=12.2067;RBI=0.0425408;REFB=-0.00210332;REVB=0.00415185;RO=34;SAF=12;SAR=7;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115884;STB=0.557088;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=0.00368929;OID=.;OPOS=111908388;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:55:34:34:19:21:0.381818:7:12:18:16:8:13:18:16
chr2	112605302	.	C	T	41.7	PASS	AF=0.175;AO=7;DP=40;FAO=7;FDP=40;FR=.;FRO=33;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=-0.014806;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.541;QD=4.16988;RBI=0.0153072;REFB=0.00372118;REVB=-0.00388492;RO=33;SAF=2;SAR=5;SRF=12;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106208;STB=0.573551;STBP=0.723;TYPE=snp;VARB=-0.0194729;OID=.;OPOS=112605302;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:40:40:33:33:7:7:0.175:5:2:12:21:5:2:12:21
chr2	112641256	.	G	A	55.79	PASS	AF=1;AO=4;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0274279;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.43;QD=31.8792;RBI=0.0280238;REFB=0;REVB=0.00574869;RO=0;SAF=2;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00748252;OID=.;OPOS=112641256;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:4:7:1:2:2:0:0:3:4:0:0
chr2	112705143	.	A	G	204.21	PASS	AF=0.384615;AO=25;DP=65;FAO=25;FDP=65;FR=.;FRO=40;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=18;FWDB=0.00690493;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.139;QD=12.5664;RBI=0.00881631;REFB=-0.00999573;REVB=0.00548172;RO=40;SAF=15;SAR=10;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0549565;STB=0.53162;STBP=0.711;TYPE=snp;VARB=0.0145657;OID=.;OPOS=112705143;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:40:40:25:25:0.384615:10:15:22:18:10:15:22:18
chr2	112751928	.	G	A	504.8	PASS	AF=0.521277;AO=47;DP=90;FAO=49;FDP=94;FR=.;FRO=45;FSAF=30;FSAR=19;FSRF=27;FSRR=18;FWDB=-0.0103496;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.937;QD=21.481;RBI=0.0178666;REFB=-0.00259879;REVB=0.0145636;RO=43;SAF=30;SAR=17;SRF=25;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0524001;STB=0.506153;STBP=0.913;TYPE=snp;VARB=0.00237406;OID=.;OPOS=112751928;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:94:43:45:47:49:0.521277:17:30:25:18:19:30:27:18
chr2	112754828	.	G	T	255.66	PASS	AF=0.453125;AO=28;DP=63;FAO=29;FDP=64;FR=.;FRO=35;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=0.00227721;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=287.892;QD=15.9785;RBI=0.00309847;REFB=-0.0029844;REVB=-0.00210116;RO=34;SAF=15;SAR=13;SRF=12;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176402;STB=0.597586;STBP=0.167;TYPE=snp;VARB=0.0042266;OID=.;OPOS=112754828;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:64:34:35:28:29:0.453125:13:15:12:22:13:16:13:22
chr2	112755001	.	A	G	177.01	PASS	AF=0.452381;AO=18;DP=43;FAO=19;FDP=42;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=0.0505545;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.455;QD=16.8577;RBI=0.0554816;REFB=-0.0392406;REVB=0.0228571;RO=17;SAF=8;SAR=10;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0731248;STB=0.507684;STBP=0.945;TYPE=snp;VARB=0.0261927;OID=.;OPOS=112755001;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:42:17:23:18:19:0.452381:10:8:9:8:11:8:10:13
chr2	112765973	.	A	G	303.39	PASS	AF=0.563636;AO=31;DP=55;FAO=31;FDP=55;FR=.;FRO=24;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=0.0121164;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.06;QD=22.0646;RBI=0.0141015;REFB=-0.0142088;REVB=0.00721418;RO=24;SAF=16;SAR=15;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119617;STB=0.565996;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=0.0173612;OID=.;OPOS=112765973;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:24:24:31:31:0.563636:15:16:16:8:15:16:16:8
chr2	112776979	.	C	A	344.56	PASS	AF=0.5;AO=36;DP=72;FAO=36;FDP=72;FR=.;FRO=36;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=14;FWDB=0.00156236;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.0687;QD=19.1424;RBI=0.00197488;REFB=-0.0213728;REVB=-0.00120796;RO=36;SAF=19;SAR=17;SRF=22;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0755242;STB=0.541968;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.0239824;OID=.;OPOS=112776979;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:36:36:36:36:0.5:17:19:22:14:17:19:22:14
chr2	112939548	.	T	C	115.98	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0260117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.8257;QD=42.1754;RBI=0.0406856;REFB=0;REVB=0.0312844;RO=0;SAF=4;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000136434;OID=.;OPOS=112939548;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:7:4:0:0:7:4:0:0
chr2	113089267	.	T	C	571.63	PASS	AF=0.548077;AO=57;DP=105;FAO=57;FDP=104;FR=.;FRO=47;FSAF=23;FSAR=34;FSRF=22;FSRR=25;FWDB=-0.000666668;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.0662;QD=21.9857;RBI=0.00117766;REFB=-0.00871358;REVB=-0.000970794;RO=47;SAF=23;SAR=34;SRF=22;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.054577;STB=0.529951;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.00727066;OID=.;OPOS=113089267;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:104:47:47:57:57:0.548077:34:23:22:25:34:23:22:25
chr2	113090047	.	T	C	506.17	PASS	AF=0.545455;AO=48;DP=88;FAO=48;FDP=88;FR=.;FRO=40;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=0.0179097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.4455;QD=23.0076;RBI=0.0218439;REFB=-0.000946231;REVB=0.0125058;RO=40;SAF=20;SAR=28;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0491035;STB=0.527016;STBP=0.59;TYPE=snp;VARB=0.000777762;OID=.;OPOS=113090047;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:40:40:48:48:0.545455:28:20:19:21:28:20:19:21
chr2	113091685	.	T	G	324.98	PASS	AF=0.460526;AO=35;DP=76;FAO=35;FDP=76;FR=.;FRO=41;FSAF=23;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=29;FWDB=0.036354;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.7715;QD=17.1044;RBI=0.0379282;REFB=0.00399301;REVB=-0.0108135;RO=40;SAF=23;SAR=12;SRF=12;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.333913;STB=0.69175;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=-0.00461535;OID=.;OPOS=113091685;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:40:41:35:35:0.460526:12:23:12:28:12:23:12:29
chr2	113277949	.	T	C	367.08	PASS	AF=0.487179;AO=38;DP=77;FAO=38;FDP=78;FR=.;FRO=40;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=0.00191194;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.674;QD=18.8248;RBI=0.0261695;REFB=-0.0209175;REVB=0.0260995;RO=38;SAF=22;SAR=16;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0718366;STB=0.528106;STBP=0.639;TYPE=snp;VARB=0.0188403;OID=.;OPOS=113277949;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:78:38:40:38:38:0.487179:16:22:19:19:16:22:21:19
chr2	113289032	.	A	G	727.79	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0260225;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.4986;QD=63.2857;RBI=0.0392394;REFB=0;REVB=-0.0293694;RO=0;SAF=15;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.15086e-05;OID=.;OPOS=113289032;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:46:0:0:45:46:1:30:15:0:0:31:15:0:0
chr2	113344047	.	T	C	157.89	PASS	AF=0.447368;AO=17;DP=38;FAO=17;FDP=38;FR=.;FRO=21;FSAF=2;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=-0.0893722;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.562;QD=16.6195;RBI=0.0923315;REFB=-0.0202961;REVB=-0.0231887;RO=20;SAF=2;SAR=15;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.548523;STB=0.829816;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0138439;OID=.;OPOS=113344047;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:20:21:17:17:0.447368:15:2:12:8:15:2:13:8
chr2	113346413	.	C	G	222.29	PASS	AF=0.375;AO=27;DP=73;FAO=27;FDP=72;FR=.;FRO=45;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=27;FSRR=18;FWDB=0.056231;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.747;QD=12.3495;RBI=0.0562402;REFB=-0.00254452;REVB=0.00101829;RO=44;SAF=16;SAR=11;SRF=27;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0236343;STB=0.504799;STBP=0.951;TYPE=snp;VARB=0.0047448;OID=.;OPOS=113346413;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:72:44:45:27:27:0.375:11:16:27:17:11:16:27:18
chr2	113404708	.	G	A	124.31	PASS	AF=0.384615;AO=15;DP=39;FAO=15;FDP=39;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=0.0160507;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.838;QD=12.7495;RBI=0.0302701;REFB=-0.00430781;REVB=0.0256643;RO=24;SAF=5;SAR=10;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139165;STB=0.581706;STBP=0.463;TYPE=snp;VARB=0.00960474;OID=.;OPOS=113404708;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:24:24:15:15:0.384615:10:5:11:13:10:5:11:13
chr2	113482779	.	A	C	501.63	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00127375;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.6334;QD=59.015;RBI=0.0129616;REFB=0;REVB=-0.0128988;RO=0;SAF=16;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000128201;OID=.;OPOS=113482779;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:18:16:0:0:18:16:0:0
chr2	113484319	.	G	A	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00945561;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=290.362;QD=55.6561;RBI=0.0101463;REFB=0;REVB=0.00367942;RO=0;SAF=13;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.68923e-05;OID=.;OPOS=113484319;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:14:13:0:0:14:13:0:0
chr2	113498566	.	A	G	1063.07	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.095897;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=105.26;QD=59.8915;RBI=0.096197;REFB=0;REVB=0.00759029;RO=0;SAF=40;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000424447;OID=.;OPOS=113498566;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:71:0:0:69:71:1:29:40:0:0:29:42:0:0
chr2	113513825	.	T	C	1375.4	PASS	AF=1;AO=88;DP=89;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000723901;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.7501;QD=62.5181;RBI=0.062872;REFB=0;REVB=0.0628678;RO=0;SAF=42;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.77683e-05;OID=.;OPOS=113513825;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:89:88:0:0:88:88:1:46:42:0:0:46:42:0:0
chr2	113671378	.	G	T	698.57	PASS	AF=0.980392;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0418718;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.0525;QD=54.7897;RBI=0.0419003;REFB=-0.0183241;REVB=0.00154655;RO=1;SAF=25;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0184579;STB=0.5098;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.00799038;OID=.;OPOS=113671378;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:51:51:1:1:50:50:0.980392:25:25:1:0:25:25:1:0
chr2	113671410	.	A	G	670.26	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0247559;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.763;QD=62.3499;RBI=0.0292763;REFB=0;REVB=-0.0156284;RO=0;SAF=19;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.81001e-05;OID=.;OPOS=113671410;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:24:19:0:0:24:19:0:0
chr2	113763463	.	A	C	339.19	PASS	AF=0.473684;AO=35;DP=75;FAO=36;FDP=76;FR=.;FRO=40;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=-0.0204793;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=64.7552;QD=17.8521;RBI=0.0467769;REFB=0.00909574;REVB=0.0420556;RO=40;SAF=17;SAR=18;SRF=18;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.034074;STB=0.526301;STBP=0.665;TYPE=snp;VARB=-0.0124597;OID=.;OPOS=113763463;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:76:40:40:35:36:0.473684:18:17:18:22:18:18:18:22
chr2	113763575	.	A	G	1434.65	PASS	AF=1;AO=72;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=42;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0501572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.277;QD=61.7054;RBI=0.067451;REFB=0;REVB=0.0450987;RO=0;SAF=38;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000701561;OID=.;OPOS=113763575;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:93:93:0:0:72:93:1:34:38:0:0:51:42:0:0
chr2	113789316	.	C	T	278.86	PASS	AF=0.54902;AO=28;DP=51;FAO=28;FDP=51;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=-0.0181408;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.114;QD=21.8716;RBI=0.034803;REFB=-0.0397444;REVB=-0.0297012;RO=23;SAF=9;SAR=19;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100926;STB=0.556199;STBP=0.412;TYPE=snp;VARB=0.0270941;OID=.;OPOS=113789316;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:23:23:28:28:0.54902:19:9:10:13:19:9:10:13
chr2	113818520	.	T	C	106.81	PASS	AF=0.342105;AO=13;DP=39;FAO=13;FDP=38;FR=.;FRO=25;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=-0.0515598;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.999;QD=11.2433;RBI=0.0525785;REFB=-0.0250646;REVB=-0.0102996;RO=25;SAF=8;SAR=5;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.235158;STB=0.639788;STBP=0.238;TYPE=snp;VARB=0.0412499;OID=.;OPOS=113818520;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:38:25:25:13:13:0.342105:5:8:10:15:5:8:10:15
chr2	113831945	.	T	C	747.56	PASS	AF=1;AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0173256;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.436;QD=63.6224;RBI=0.0709589;REFB=0;REVB=0.0688113;RO=0;SAF=20;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000585064;OID=.;OPOS=113831945;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:47:0:0:47:47:1:27:20:0:0:27:20:0:0
chr2	113832234	.	T	C	195.8	PASS	AF=0.454545;AO=20;DP=44;FAO=20;FDP=44;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=0.00255392;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=167.948;QD=17.8003;RBI=0.0110912;REFB=-0.0125096;REVB=-0.0107931;RO=24;SAF=7;SAR=13;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.22611;STB=0.628902;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.0208093;OID=.;OPOS=113832234;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:24:24:20:20:0.454545:13:7:14:10:13:7:14:10
chr2	113832333	.	C	A	1659.11	PASS	AF=1;AO=110;DP=110;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0298224;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=126.383;QD=60.3311;RBI=0.0316442;REFB=0;REVB=0.0105818;RO=0;SAF=70;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.74501e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.023e-05;OID=.;OPOS=113832333;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:110:110:0:0:110:110:1:40:70:0:0:40:70:0:0
chr2	113890304	.	T	C	1026.19	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00582288;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.209;QD=59.4894;RBI=0.00650706;REFB=0;REVB=-0.00290446;RO=0;SAF=43;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.21141e-06;OID=.;OPOS=113890304;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:26:43:0:0:26:43:0:0
chr2	113940681	.	T	C	46.0	PASS	AF=0.35;AO=7;DP=20;FAO=7;FDP=20;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.0352965;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.4685;QD=9.19968;RBI=0.0932861;REFB=-0.027508;REVB=-0.0863507;RO=13;SAF=5;SAR=2;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118161;STB=0.57355;STBP=0.673;TYPE=snp;VARB=0.032995;OID=.;OPOS=113940681;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:20:20:13:13:7:7:0.35:2:5:8:5:2:5:8:5
chr2	113940839	.	G	C	200.95	PASS	AF=0.367647;AO=25;DP=68;FAO=25;FDP=68;FR=.;FRO=43;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=24;FSRR=19;FWDB=0.00271293;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=318.815;QD=11.8203;RBI=0.00391144;REFB=-0.00276896;REVB=0.00281769;RO=43;SAF=10;SAR=15;SRF=24;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173035;STB=0.59992;STBP=0.231;TYPE=snp;VARB=0.00467446;OID=.;OPOS=113940839;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:43:43:25:25:0.367647:15:10:24:19:15:10:24:19
chr2	113943470	.	A	G	120.62	PASS	AF=0.411765;AO=15;DP=33;FAO=14;FDP=34;FR=.;FRO=20;FSAF=13;FSAR=1;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.0147565;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.3918;QD=14.1908;RBI=0.0526573;REFB=-0.0583554;REVB=-0.0505474;RO=18;SAF=13;SAR=2;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.354044;STB=0.843524;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.0380124;OID=.;OPOS=113943470;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:34:18:20:15:14:0.411765:2:13:11:7:1:13:11:9
chr2	113955074	.	G	A	769.51	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00455772;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.957;QD=57.0004;RBI=0.0294108;REFB=0;REVB=0.0290555;RO=0;SAF=36;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000131509;OID=.;OPOS=113955074;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:18:36:0:0:18:36:0:0
chr2	113956371	.	G	C	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00681138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.51;QD=59.4357;RBI=0.0270743;REFB=0;REVB=0.0262035;RO=0;SAF=23;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.96501e-05;OID=.;OPOS=113956371;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:12:23:0:0:12:23:0:0
chr2	114220055	.	T	C	1143.46	PASS	AF=0.440433;AO=120;DP=277;FAO=122;FDP=277;FR=.;FRO=155;FSAF=63;FSAR=59;FSRF=77;FSRR=78;FWDB=0.0142753;FXX=0.0107139;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.434;QD=16.5121;RBI=0.0269801;REFB=-0.0113807;REVB=0.0228942;RO=154;SAF=63;SAR=57;SRF=77;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0253291;STB=0.51098;STBP=0.756;TYPE=snp;VARB=0.0196094;OID=.;OPOS=114220055;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:277:277:154:155:120:122:0.440433:57:63:77:77:59:63:77:78
chr2	114256840	.	C	T	190.77	PASS	AF=0.72;AO=18;DP=25;FAO=18;FDP=25;FR=.;FRO=7;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0467521;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.4085;QD=30.5237;RBI=0.0544826;REFB=0.0671989;REVB=0.0279748;RO=7;SAF=10;SAR=8;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00814684;STB=0.504499;STBP=0.965;TYPE=snp;VARB=-0.0247025;OID=.;OPOS=114256840;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:25:25:7:7:18:18:0.72:8:10:4:3:8:10:4:3
chr2	114256859	.	C	T	79.36	PASS	AF=0.5;AO=10;DP=20;FAO=10;FDP=20;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.0529168;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.3856;QD=15.8711;RBI=0.0683734;REFB=-0.0356622;REVB=-0.0432982;RO=10;SAF=3;SAR=7;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.342855;STB=0.6996;STBP=0.111;TYPE=snp;VARB=0.0304387;OID=.;OPOS=114256859;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:20:20:10:10:10:10:0.5:7:3:7:3:7:3:7:3
chr2	114391721	.	T	C	236.6	PASS	AF=0.45;AO=27;DP=60;FAO=27;FDP=60;FR=.;FRO=33;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=11;FSRR=22;FWDB=-0.00484965;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.719;QD=15.773;RBI=0.00485616;REFB=0.000761285;REVB=-0.000251352;RO=33;SAF=9;SAR=18;SRF=11;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00100989;OID=.;OPOS=114391721;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:33:33:27:27:0.45:18:9:11:22:18:9:11:22
chr2	114392716	.	C	T	297.17	PASS	AF=0.492308;AO=32;DP=65;FAO=32;FDP=65;FR=.;FRO=33;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=-0.0169404;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.01;QD=18.2874;RBI=0.0178575;REFB=-0.0132527;REVB=-0.00564916;RO=33;SAF=17;SAR=15;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0146692;STB=0.508192;STBP=0.894;TYPE=snp;VARB=0.0129361;OID=.;OPOS=114392716;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:33:33:32:32:0.492308:15:17:17:16:15:17:17:16
chr2	114763169	.	C	G	240.9	PASS	AF=0.42029;AO=28;DP=69;FAO=29;FDP=69;FR=.;FRO=40;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=18;FWDB=0.0740037;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.14;QD=13.9652;RBI=0.074531;REFB=-0.011043;REVB=-0.00884968;RO=41;SAF=11;SAR=17;SRF=23;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175621;STB=0.579104;STBP=0.278;TYPE=snp;VARB=0.0134787;OID=.;OPOS=114763169;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:41:40:28:29:0.42029:17:11:23:18:17:12:22:18
chr2	116099725	.	A	T	594.48	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0448447;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.2108;QD=60.9724;RBI=0.04506;REFB=0;REVB=-0.00440003;RO=0;SAF=21;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.34792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00090356;OID=.;OPOS=116099725;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:18:21:0:0:18:21:0:0
chr2	116510817	.	G	C	3274.21	PASS	AF=1;AO=211;DP=211;FAO=211;FDP=211;FR=.;FRO=0;FSAF=110;FSAR=101;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00373678;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.287;QD=62.0703;RBI=0.00799346;REFB=0;REVB=-0.00706624;RO=0;SAF=110;SAR=101;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.76926e-06;OID=.;OPOS=116510817;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:18:211:211:0:0:211:211:1:101:110:0:0:101:110:0:0
chr2	116525960	.	G	A	1102.21	PASS	AF=1;AO=73;DP=74;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00730107;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.03;QD=60.3951;RBI=0.0140882;REFB=0;REVB=0.0120487;RO=0;SAF=38;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.90268e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.09609e-06;OID=.;OPOS=116525960;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:73:0:0:73:73:1:35:38:0:0:35:38:0:0
chr2	116600388	.	A	G	224.61	PASS	AF=0.470588;AO=24;DP=51;FAO=24;FDP=51;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=0.0648329;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.5312;QD=17.6161;RBI=0.0651015;REFB=-0.0372574;REVB=0.00590755;RO=27;SAF=9;SAR=15;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00463463;STB=0.502616;STBP=0.983;TYPE=snp;VARB=0.0357412;OID=.;OPOS=116600388;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:27:27:24:24:0.470588:15:9:10:17:15:9:10:17
chr2	118583940	.	C	T	1603.05	PASS	AF=0.990826;AO=106;DP=109;FAO=108;FDP=109;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=60;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.051678;FXX=0.00909008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.948;QD=58.8275;RBI=0.0519099;REFB=-0.00771393;REVB=0.00490154;RO=0;SAF=47;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505154;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=2.66574e-05;OID=.;OPOS=118583940;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:109:109:0:1:106:108:0.990826:59:47:0:0:60:48:1:0
chr2	118589808	.	C	T	106.12	PASS	AF=1;AO=10;DP=11;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000485689;FXX=0.0908265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.16;QD=42.4484;RBI=0.0202423;REFB=0;REVB=-0.0202365;RO=0;SAF=6;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000295995;OID=.;OPOS=118589808;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:10:0:0:10:10:1:4:6:0:0:4:6:0:0
chr2	118731573	.	G	A	805.19	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00937229;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.621;QD=64.4154;RBI=0.0302647;REFB=0;REVB=0.028777;RO=0;SAF=25;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000160747;OID=.;OPOS=118731573;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:25:25:0:0:25:25:0:0
chr2	118774082	.	T	C	670.25	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0246201;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.665;QD=62.3492;RBI=0.0273515;REFB=0;REVB=0.0119146;RO=0;SAF=9;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.08995e-05;OID=.;OPOS=118774082;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:34:9:0:0:34:9:0:0
chr2	118774178	.	G	C	537.47	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000445202;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.8122;QD=59.7185;RBI=0.0391345;REFB=0;REVB=0.0391319;RO=0;SAF=14;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00049844;OID=.;OPOS=118774178;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:22:14:0:0:22:14:0:0
chr2	118866000	.	G	C	141.96	PASS	AF=0.390244;AO=16;DP=41;FAO=16;FDP=41;FR=.;FRO=25;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=0.00680827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.457;QD=13.8493;RBI=0.00942623;REFB=0.000240148;REVB=0.0065193;RO=23;SAF=4;SAR=12;SRF=16;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.448168;STB=0.758716;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=-0.000667457;OID=.;OPOS=118866000;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:23:25:16:16:0.390244:12:4:16:7:12:4:17:8
chr2	118866033	.	G	GA	61.16	PASS	AF=0.65;AO=8;DP=23;FAO=13;FDP=20;FR=.;FRO=7;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.115653;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=11.9463;QD=12.2317;RBI=0.115997;REFB=-0.0219687;REVB=0.00893511;RO=14;SAF=5;SAR=3;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.204846;STB=0.615207;STBP=0.201;TYPE=ins;VARB=0.0629265;OID=.;OPOS=118866034;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.65:8:23:13:20:7:8:5:2:5:38:14:5:3:6:8
chr2	119591588	.	C	G	316.82	PASS	AF=0.532258;AO=33;DP=62;FAO=33;FDP=62;FR=.;FRO=29;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.0285493;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=203.252;QD=20.4403;RBI=0.0287127;REFB=-0.0299931;REVB=-0.00305829;RO=29;SAF=18;SAR=15;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0239195;STB=0.513266;STBP=0.862;TYPE=snp;VARB=0.027807;OID=.;OPOS=119591588;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:29:29:33:33:0.532258:15:18:15:14:15:18:15:14
chr2	119591683	.	C	A	275.86	PASS	AF=0.491803;AO=28;DP=60;FAO=30;FDP=61;FR=.;FRO=31;FSAF=21;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=0.0635724;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.6918;QD=18.0893;RBI=0.0785239;REFB=0.041476;REVB=0.0460928;RO=32;SAF=19;SAR=9;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119524;STB=0.585395;STBP=0.246;TYPE=snp;VARB=-0.0408613;OID=.;OPOS=119591683;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:61:32:31:28:30:0.491803:9:19:18:14:9:21:17:14
chr2	119748143	.	C	G	164.2	PASS	AF=0.372549;AO=19;DP=51;FAO=19;FDP=51;FR=.;FRO=32;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=-0.00263345;FXX=0;HRUN=10;LEN=1;MLLD=199.139;QD=12.8781;RBI=0.00492502;REFB=0.000189533;REVB=-0.00416182;RO=31;SAF=9;SAR=10;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0584315;STB=0.542575;STBP=0.662;TYPE=snp;VARB=-0.000275879;OID=.;OPOS=119748143;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:31:32:19:19:0.372549:10:9:13:18:10:9:13:19
chr2	119915249	.	T	C	219.93	PASS	AF=0.44;AO=22;DP=49;FAO=22;FDP=50;FR=.;FRO=28;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=0.00810146;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.394;QD=17.5942;RBI=0.00870233;REFB=-0.00210391;REVB=-0.00317757;RO=26;SAF=14;SAR=8;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.274221;STB=0.63624;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=0.00199193;OID=.;OPOS=119915249;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:50:26:28:22:22:0.44:8:14:9:17:8:14:11:17
chr2	119927405	.	G	C	31.83	PASS	AF=0.333333;AO=5;DP=17;FAO=5;FDP=15;FR=.;FRO=10;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=-0.00906505;FXX=0.117578;HRUN=1;LEN=1;MLLD=348.385;QD=8.48891;RBI=0.0194148;REFB=0.00770275;REVB=0.0171685;RO=12;SAF=2;SAR=3;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0772232;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0156279;OID=.;OPOS=119927405;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:31:17:15:12:10:5:5:0.333333:3:2:4:8:3:2:4:6
chr2	119927411	.	G	T	37.15	PASS	AF=0.333333;AO=6;DP=18;FAO=6;FDP=18;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=0.0163558;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.0327;QD=8.25458;RBI=0.0592232;REFB=0.0098888;REVB=0.0569199;RO=12;SAF=2;SAR=4;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0125093;OID=.;OPOS=119927411;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:18:18:12:12:6:6:0.333333:4:2:4:8:4:2:4:8
chr2	119988565	.	G	A	382.59	PASS	AF=0.39823;AO=45;DP=113;FAO=45;FDP=113;FR=.;FRO=68;FSAF=31;FSAR=14;FSRF=37;FSRR=31;FWDB=-0.00136506;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.309;QD=13.5429;RBI=0.0347434;REFB=-0.0178968;REVB=0.0347166;RO=68;SAF=31;SAR=14;SRF=37;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165965;STB=0.594332;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=0.0226108;OID=.;OPOS=119988565;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:113:68:68:45:45:0.39823:14:31:37:31:14:31:37:31
chr2	120005569	.	C	T	607.88	PASS	AF=0.56701;AO=55;DP=97;FAO=55;FDP=97;FR=.;FRO=42;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=17;FSRR=25;FWDB=0.037191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.731;QD=25.067;RBI=0.0384255;REFB=-0.0312862;REVB=0.00966157;RO=41;SAF=30;SAR=25;SRF=17;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10196;STB=0.560726;STBP=0.202;TYPE=snp;VARB=0.0245097;OID=.;OPOS=120005569;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:41:42:55:55:0.56701:25:30:17:24:25:30:17:25
chr2	120021785	.	T	C	1343.67	PASS	AF=1;AO=86;DP=87;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0161313;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.7161;QD=62.4964;RBI=0.0163184;REFB=0;REVB=0.0024639;RO=0;SAF=41;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000142321;OID=.;OPOS=120021785;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:86:0:0:86:86:1:45:41:0:0:45:41:0:0
chr2	120125029	.	A	G	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0342396;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.738;QD=45.8068;RBI=0.0433369;REFB=0;REVB=0.0265658;RO=0;SAF=12;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.05889e-05;OID=.;OPOS=120125029;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:2:12:0:0:2:12:0:0
chr2	120194651	.	A	AGTGTGC	971.05	PASS	AF=1;AO=60;DP=86;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0392211;FXX=0.121605;HRUN=0;LEN=6;MLLD=301.936;QD=59.7567;RBI=0.0396234;REFB=0;REVB=-0.0056317;RO=18;SAF=10;SAR=50;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.245689;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00104118;OID=.;OPOS=120194652;OREF=-;OALT=GTGTGC;OMAPALT=AGTGTGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:60:86:65:65:0:14:51:0:0:5:18:10:50:10:8
chr2	120199140	.	A	G	411.1	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0321648;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.738;QD=56.7031;RBI=0.0321876;REFB=0;REVB=0.00121164;RO=0;SAF=17;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.0947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00014033;OID=.;OPOS=120199140;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:12:17:0:0:12:17:0:0
chr2	120303820	.	A	T	205.26	PASS	AF=0.4375;AO=21;DP=48;FAO=21;FDP=48;FR=.;FRO=27;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=-0.00728253;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.556;QD=17.1047;RBI=0.00814337;REFB=-0.0114709;REVB=-0.00364407;RO=27;SAF=7;SAR=14;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.224607;STB=0.628446;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=0.00741714;OID=.;OPOS=120303820;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:27:27:21:21:0.4375:14:7:15:12:14:7:15:12
chr2	120369300	.	T	C	782.16	PASS	AF=1;AO=54;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00333144;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.423;QD=56.8843;RBI=0.00685372;REFB=0;REVB=0.00598957;RO=0;SAF=28;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.52846e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.46766e-05;OID=.;OPOS=120369300;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:54:55:1:26:28:0:0:26:29:0:0
chr2	120388412	.	G	A	1008.46	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0205826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.177;QD=59.3212;RBI=0.022633;REFB=0;REVB=-0.00941319;RO=0;SAF=26;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.61875e-05;OID=.;OPOS=120388412;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:42:26:0:0:42:26:0:0
chr2	120409616	.	G	T	342.23	PASS	AF=0.521739;AO=34;DP=67;FAO=36;FDP=69;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=0.014676;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=301.941;QD=19.8394;RBI=0.0213912;REFB=-0.00497314;REVB=0.0155627;RO=32;SAF=16;SAR=18;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0565566;STB=0.509798;STBP=0.901;TYPE=snp;VARB=0.00690095;OID=.;OPOS=120409616;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:69:32:33:34:36:0.521739:18:16:13:19:20:16:14:19
chr2	120438515	.	G	C	289.45	PASS	AF=0.39759;AO=33;DP=83;FAO=33;FDP=83;FR=.;FRO=50;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=25;FSRR=25;FWDB=-0.00805057;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.096;QD=13.9495;RBI=0.0128129;REFB=-0.0110934;REVB=-0.00996791;RO=50;SAF=16;SAR=17;SRF=25;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0160349;STB=0.509125;STBP=0.873;TYPE=snp;VARB=0.0196192;OID=.;OPOS=120438515;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:50:50:33:33:0.39759:17:16:25:25:17:16:25:25
chr2	120438523	.	A	G	564.24	PASS	AF=0.607143;AO=51;DP=84;FAO=51;FDP=84;FR=.;FRO=33;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=-0.0132322;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.195;QD=26.8687;RBI=0.0132323;REFB=-0.0103913;REVB=2.22479e-05;RO=33;SAF=25;SAR=26;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00385398;STB=0.502101;STBP=0.966;TYPE=snp;VARB=0.00569143;OID=.;OPOS=120438523;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:33:33:51:51:0.607143:26:25:16:17:26:25:16:17
chr2	120438696	.	A	G	1048.07	PASS	AF=0.986111;AO=71;DP=72;FAO=71;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0447047;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.953;QD=58.2262;RBI=0.0470008;REFB=-0.0532008;REVB=-0.0145111;RO=1;SAF=42;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0111269;STB=0.505881;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.000613725;OID=.;OPOS=120438696;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:72:72:1:1:71:71:0.986111:29:42:1:0:29:42:1:0
chr2	120439230	.	C	G	222.91	PASS	AF=0.462963;AO=25;DP=55;FAO=25;FDP=54;FR=.;FRO=29;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=0.00341565;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.0008;QD=16.512;RBI=0.0454151;REFB=-0.0161222;REVB=-0.0452865;RO=28;SAF=15;SAR=10;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0422594;STB=0.531225;STBP=0.681;TYPE=snp;VARB=0.00753746;OID=.;OPOS=120439230;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:54:28:29:25:25:0.462963:10:15:18:10:10:15:19:10
chr2	120439459	.	C	A	148.05	PASS	AF=0.484848;AO=16;DP=33;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=-0.023075;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.644;QD=17.945;RBI=0.0271418;REFB=0.000907293;REVB=0.0142906;RO=16;SAF=6;SAR=10;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121787;STB=0.545399;STBP=0.669;TYPE=snp;VARB=-0.00303261;OID=.;OPOS=120439459;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:16:17:16:16:0.484848:10:6:4:12:10:6:5:12
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chr2	120830815	.	A	G	102.5	PASS	AF=0.521739;AO=12;DP=23;FAO=12;FDP=23;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=0.0342918;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.3786;QD=17.8264;RBI=0.0342925;REFB=-0.042558;REVB=-0.00021798;RO=11;SAF=5;SAR=7;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181486;STB=0.604144;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.0142805;OID=.;OPOS=120830815;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:23:23:11:11:12:12:0.521739:7:5:7:4:7:5:7:4
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chr2	121223274	.	C	T	518.71	PASS	AF=0.504673;AO=54;DP=107;FAO=54;FDP=107;FR=.;FRO=53;FSAF=17;FSAR=37;FSRF=28;FSRR=25;FWDB=-0.00759785;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.841;QD=19.3911;RBI=0.00950193;REFB=-0.0116327;REVB=-0.00570608;RO=52;SAF=17;SAR=37;SRF=28;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.209779;STB=0.612314;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0253444;OID=.;OPOS=121223274;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:107:52:53:54:54:0.504673:37:17:28:24:37:17:28:25
chr2	121726447	.	G	A	620.08	PASS	AF=0.97619;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.078365;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.246;QD=59.055;RBI=0.0784984;REFB=-0.127745;REVB=-0.00457377;RO=1;SAF=21;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0228826;STB=0.512189;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=0.00113937;OID=.;OPOS=121726447;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:42:42:1:1:41:41:0.97619:20:21:0:1:20:21:0:1
chr2	121746956	.	G	T	581.11	PASS	AF=0.597701;AO=52;DP=90;FAO=52;FDP=87;FR=.;FRO=35;FSAF=24;FSAR=28;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=-0.00114423;FXX=0.0333296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.267;QD=26.7175;RBI=0.0432328;REFB=-0.00603632;REVB=0.0432176;RO=35;SAF=24;SAR=28;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0032601;STB=0.501779;STBP=0.976;TYPE=snp;VARB=0.00449005;OID=.;OPOS=121746956;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:87:35:35:52:52:0.597701:28:24:16:19:28:24:16:19
chr2	121747406	.	G	A	130.23	PASS	AF=0.56;AO=14;DP=26;FAO=14;FDP=25;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=-0.00401978;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.783;QD=20.8369;RBI=0.0355679;REFB=-0.0326935;REVB=-0.03534;RO=12;SAF=6;SAR=8;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0799787;STB=0.52937;STBP=0.779;TYPE=snp;VARB=0.0214784;OID=.;OPOS=121747406;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:26:25:12:11:14:14:0.56:8:6:4:8:8:6:4:7
chr2	121747429	.	A	G	199.82	PASS	AF=0.5;AO=19;DP=39;FAO=20;FDP=40;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=0.0024753;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.1668;QD=19.9824;RBI=0.0111696;REFB=-0.0183475;REVB=-0.0108919;RO=20;SAF=11;SAR=8;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161163;STB=0.5999;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=0.0111602;OID=.;OPOS=121747429;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:40:20:20:19:20:0.5:8:11:8:12:8:12:8:12
chr2	121749067	.	G	C	334.19	PASS	AF=0.440476;AO=36;DP=85;FAO=37;FDP=84;FR=.;FRO=47;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=33;FSRR=14;FWDB=0.00176324;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.989;QD=15.9136;RBI=0.0061747;REFB=-0.00144129;REVB=-0.00591759;RO=47;SAF=18;SAR=18;SRF=33;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.204281;STB=0.6199;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.000630529;OID=.;OPOS=121749067;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:84:47:47:36:37:0.440476:18:18:33:14:19:18:33:14
chr2	121948235	.	C	G	101.89	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0397832;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=185.975;QD=40.7541;RBI=0.0398621;REFB=0;REVB=-0.00250765;RO=0;SAF=3;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000484931;OID=.;OPOS=121948235;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:7:3:0:0:7:3:0:0
chr2	121948239	.	A	C	130.31	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103821;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=135.347;QD=43.4381;RBI=0.0739333;REFB=0;REVB=0.0732007;RO=0;SAF=5;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000295914;OID=.;OPOS=121948239;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:7:5:0:0:7:5:0:0
chr2	121948307	.	A	G	103.51	PASS	AF=0.545455;AO=12;DP=22;FAO=12;FDP=22;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=-0.0785518;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.3405;QD=18.8194;RBI=0.0788526;REFB=-0.0423915;REVB=0.00688051;RO=10;SAF=5;SAR=7;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.013628;STB=0.5078;STBP=0.989;TYPE=snp;VARB=0.0304894;OID=.;OPOS=121948307;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:22:22:10:10:12:12:0.545455:7:5:4:6:7:5:4:6
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chr2	125746817	.	A	G	448.9	PASS	AF=1;AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0117918;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.0463;QD=57.9231;RBI=0.0333629;REFB=0;REVB=0.0312095;RO=0;SAF=15;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000574203;OID=.;OPOS=125746817;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:31:0:0:31:31:1:16:15:0:0:16:15:0:0
chr2	127453664	.	A	C	469.67	PASS	AF=1;AO=14;DP=34;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0162949;FXX=0.0588062;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.1573;QD=58.7084;RBI=0.141387;REFB=0;REVB=0.140445;RO=0;SAF=13;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00239226;OID=.;OPOS=127453664;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:32:0:0:14:32:1:1:13:0:0:18:14:0:0
chr2	127809874	.	G	A	641.23	PASS	AF=0.512;AO=64;DP=126;FAO=64;FDP=125;FR=.;FRO=61;FSAF=42;FSAR=22;FSRF=35;FSRR=26;FWDB=-0.0047243;FXX=0.00793588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=318.308;QD=20.5193;RBI=0.0272481;REFB=-0.00742149;REVB=0.0268354;RO=60;SAF=42;SAR=22;SRF=35;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0692291;STB=0.543382;STBP=0.339;TYPE=snp;VARB=0.0073222;OID=.;OPOS=127809874;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:126:125:60:61:64:64:0.512:22:42:35:25:22:42:35:26
chr2	127816695	.	C	T	340.73	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.010387;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.6952;QD=54.516;RBI=0.0663114;REFB=0;REVB=0.0654928;RO=0;SAF=14;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00193173;OID=.;OPOS=127816695;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:11:14:0:0:11:14:0:0
chr2	127821207	.	G	A	769.51	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00162949;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.11;QD=57.0004;RBI=0.031749;REFB=0;REVB=0.0317072;RO=0;SAF=27;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000123001;OID=.;OPOS=127821207;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:27:27:0:0:27:27:0:0
chr2	127826533	.	A	G	575.31	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00059891;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.423;QD=60.5587;RBI=0.00936118;REFB=0;REVB=0.009342;RO=0;SAF=19;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.99192e-05;OID=.;OPOS=127826533;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:19:19:0:0:19:19:0:0
chr2	127839434	.	C	T	360.71	PASS	AF=0.401869;AO=43;DP=107;FAO=43;FDP=107;FR=.;FRO=64;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=19;FSRR=45;FWDB=0.0105213;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.126;QD=13.4846;RBI=0.0151302;REFB=-0.0123421;REVB=0.0108731;RO=64;SAF=17;SAR=26;SRF=19;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112253;STB=0.563201;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.0261783;OID=.;OPOS=127839434;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:107:64:64:43:43:0.401869:26:17:19:45:26:17:19:45
chr2	128065064	.	CTCT	CTC,C	417.89	PASS	AF=0.633333,0.366667;AO=28,10;DP=67;FAO=38,22;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=12,7;FSAR=26,15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0501992,0.0549781;FXX=0.11763;HRUN=7,1;LEN=1,3;MLLD=9.24447,163.1;QD=27.8596;RBI=0.141528,0.0553618;REFB=0.0630966,-0.00769714;REVB=0.132326,0.00650683;RO=6;SAF=9,0;SAR=19,10;SRF=1;SRR=5;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0592398,-0.783948;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=0.0908551,0.0365403;OID=.,.;OPOS=128065067,128065065;OREF=T,TCT;OALT=-,-;OMAPALT=CTC,C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.633333,0.366667:28,10:67:38,22:60:0:12,7:26,15:0:0:99:6:9,0:19,10:1:5
chr2	128065075	.	TAAAAAAG	TAAAAAG,TAAAAAGA,TAAAAATG	245.92	PASS	AF=0.62963,0,0.037037;AO=35,3,5;DP=81;FAO=51,0,3;FDP=81;FR=.;FRO=27;FSAF=16,0,3;FSAR=35,0,0;FSRF=5;FSRR=22;FWDB=-0.0978253,-0.111732,-0.0334623;FXX=0.0240935;HRUN=6,6,6;LEN=1,2,1;MLLD=10.0006,11.9237,110.193;QD=12.1443;RBI=0.117117,0.117458,0.0335693;REFB=-0.0814592,-0.0607095,-0.00670617;REVB=0.0643943,-0.0362266,0.00267817;RO=22;SAF=9,1,4;SAR=26,2,1;SRF=2;SRR=20;SSEN=0,0,0;SSEP=0.456311,0,0;SSSB=0.168372,0.420293,0.717688;STB=0.553714,0.5,0.998223;STBP=0.263,1,0.01;TYPE=del,mnp,snp;VARB=0.115756,0,0.044426;OID=.,.,.;OPOS=128065076,128065081,128065081;OREF=A,AG,A;OALT=-,GA,T;OMAPALT=TAAAAAG,TAAAAAGA,TAAAAATG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.62963,0,0.037037:35,3,5:81:51,0,3:81:27:16,0,3:35,0,0:5:22:99:22:9,1,4:26,2,1:2:20
chr2	128180872	.	G	T	595.41	PASS	AF=1;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0175479;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.586;QD=61.0673;RBI=0.059604;REFB=0;REVB=0.0569624;RO=0;SAF=32;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.64961e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00053467;OID=.;OPOS=128180872;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:39:0:0:39:39:1:7:32:0:0:7:32:0:0
chr2	128321770	.	G	A	1215.65	PASS	AF=0.987654;AO=80;DP=81;FAO=80;FDP=81;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.020904;FXX=0.0121936;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.907;QD=60.0323;RBI=0.0232261;REFB=-0.0394867;REVB=0.0101229;RO=1;SAF=34;SAR=46;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0101822;STB=0.505375;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.00018913;OID=.;OPOS=128321770;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:81:81:1:1:80:80:0.987654:46:34:0:1:46:34:0:1
chr2	128400608	.	C	T	836.63	PASS	AF=0.983333;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0107278;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.6389;QD=55.7751;RBI=0.0560522;REFB=0.129755;REVB=-0.055016;RO=1;SAF=27;SAR=32;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0145176;STB=0.50769;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=-0.00322002;OID=.;OPOS=128400608;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:60:60:1:1:59:59:0.983333:32:27:0:1:32:27:0:1
chr2	128408717	.	G	A	62.69	PASS	AF=0.666667;AO=8;DP=12;FAO=8;FDP=12;FR=.;FRO=4;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.0278598;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.1253;QD=20.8977;RBI=0.0543359;REFB=-0.013875;REVB=0.04665;RO=4;SAF=7;SAR=1;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196883;STB=0.61088;STBP=0.689;TYPE=snp;VARB=0.00545098;OID=.;OPOS=128408717;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:12:12:4:4:8:8:0.666667:1:7:4:0:1:7:4:0
chr2	128460956	.	G	A	536.17	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.02713;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.733;QD=59.5742;RBI=0.0331332;REFB=0;REVB=0.0190204;RO=0;SAF=18;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.73609e-05;OID=.;OPOS=128460956;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:36:0:0:35:36:1:17:18:0:0:17:19:0:0
chr2	128495645	.	G	A	222.85	PASS	AF=0.468085;AO=22;DP=47;FAO=22;FDP=47;FR=.;FRO=25;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=-0.0314616;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=289.341;QD=18.9662;RBI=0.0341029;REFB=-0.00351635;REVB=-0.0131595;RO=25;SAF=8;SAR=14;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113601;STB=0.564456;STBP=0.426;TYPE=snp;VARB=0.00377758;OID=.;OPOS=128495645;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:25:25:22:22:0.468085:14:8:12:13:14:8:12:13
chr2	128522203	.	A	T	224.91	PASS	AF=0.458333;AO=22;DP=50;FAO=22;FDP=48;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=19;FWDB=-0.00812182;FXX=0.039992;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.718;QD=18.7426;RBI=0.0116414;REFB=-0.0025205;REVB=0.00834021;RO=27;SAF=10;SAR=12;SRF=7;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196228;STB=0.603025;STBP=0.244;TYPE=snp;VARB=0.00316985;OID=.;OPOS=128522203;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:48:27:26:22:22:0.458333:12:10:7:20:12:10:7:19
chr2	128526579	.	T	TTAAA	179.65	PASS	AF=0.85;AO=13;DP=87;FAO=17;FDP=20;FR=.;FRO=3;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0121441;FXX=0.0475964;HRUN=2;LEN=4;MLLD=185.971;QD=35.9297;RBI=0.0248647;REFB=-0.0696022;REVB=0.0216973;RO=72;SAF=4;SAR=9;SRF=33;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195761;STB=0.565144;STBP=0.222;TYPE=ins;VARB=0.0169031;OID=.;OPOS=128526580;OREF=-;OALT=TAAA;OMAPALT=TTAAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.85:13:87:17:20:3:7:10:0:3:15:72:4:9:33:39
chr2	128608184	.	C	T	313.72	PASS	AF=0.961538;AO=24;DP=26;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.000250153;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.905;QD=48.2644;RBI=0.0233723;REFB=-0.136599;REVB=0.0233709;RO=1;SAF=13;SAR=11;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0343222;STB=0.518504;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.00230544;OID=.;OPOS=128608184;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:26:26:1:1:24:25:0.961538:11:13:1:0:12:13:1:0
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chr2	128934400	.	T	C	215.0	PASS	AF=0.525;AO=21;DP=40;FAO=21;FDP=40;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=0.0192946;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.438;QD=21.5003;RBI=0.025392;REFB=-0.0158408;REVB=0.0165068;RO=18;SAF=9;SAR=12;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0335303;STB=0.529384;STBP=0.705;TYPE=snp;VARB=0.014159;OID=.;OPOS=128934400;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:18:19:21:21:0.525:12:9:7:11:12:9:7:12
chr2	128939817	.	G	A	442.23	PASS	AF=0.459184;AO=45;DP=98;FAO=45;FDP=98;FR=.;FRO=53;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=28;FSRR=25;FWDB=-0.0133455;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.03;QD=18.0503;RBI=0.0215116;REFB=-0.0246662;REVB=0.0168714;RO=53;SAF=21;SAR=24;SRF=28;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0596826;STB=0.533319;STBP=0.557;TYPE=snp;VARB=0.029396;OID=.;OPOS=128939817;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:53:53:45:45:0.459184:24:21:28:25:24:21:28:25
chr2	129023282	.	G	C	555.28	PASS	AF=0.926829;AO=32;DP=43;FAO=38;FDP=41;FR=.;FRO=3;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0331174;FXX=0.0465008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.4877;QD=54.1736;RBI=0.0331195;REFB=-0.000482107;REVB=0.000375192;RO=3;SAF=11;SAR=21;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0621641;STB=0.531898;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=0.00173887;OID=.;OPOS=129023282;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:43:41:3:3:32:38:0.926829:21:11:0:3:22:16:0:3
chr2	129075961	.	T	C	152.4	PASS	AF=0.933333;AO=14;DP=15;FAO=14;FDP=15;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0167359;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.4151;QD=40.6404;RBI=0.0186991;REFB=-0.0820753;REVB=0.00834054;RO=0;SAF=9;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.545388;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.00281864;OID=.;OPOS=129075961;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:15:15:0:1:14:14:0.933333:5:9:0:0:5:9:0:1
chr2	130738163	.	G	A	255.08	PASS	AF=0.521739;AO=24;DP=46;FAO=24;FDP=46;FR=.;FRO=22;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.00822763;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.093;QD=22.1808;RBI=0.0190373;REFB=-0.00454098;REVB=-0.0171675;RO=21;SAF=15;SAR=9;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127528;STB=0.561745;STBP=0.429;TYPE=snp;VARB=0.00564562;OID=.;OPOS=130738163;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:21:22:24:24:0.521739:9:15:10:11:9:15:11:11
chr2	130739444	.	TGAAGACGGAAGACGGAAGA	TGAAGACGGAAGA,TGAAGACGGAAGACGGAAAC	89.38	PASS	AF=0.285714,0.0571429;AO=8,4;DP=36;FAO=10,2;FDP=35;FR=.;FRO=23;FSAF=6,1;FSAR=4,1;FSRF=5;FSRR=18;FWDB=0.0150697,0.0228108;FXX=0.0277701;HRUN=1,1;LEN=7,2;MLLD=247.741,418.996;QD=10.2149;RBI=0.0153454,0.0251099;REFB=-0.00510626,-0.00486471;REVB=0.00289548,-0.0104964;RO=19;SAF=4,3;SAR=4,1;SRF=3;SRR=16;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.403858,0.615875;STB=0.749583,0.758109;STBP=0.097,0.71;TYPE=del,mnp;VARB=0.0103943,0.00564915;OID=.,.;OPOS=130739445,130739462;OREF=GAAGACG,GA;OALT=-,AC;OMAPALT=TGAAGACGGAAGA,TGAAGACGGAAGACGGAAAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.285714,0.0571429:8,4:36:10,2:35:23:6,1:4,1:5:18:64:19:4,3:4,1:3:16
chr2	130739646	.	TTAAC	T	70.32	PASS	AF=0.277778;AO=15;DP=54;FAO=15;FDP=54;FR=.;FRO=39;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=23;FWDB=-0.00743632;FXX=0;HRUN=3;LEN=4;MLLD=302.505;QD=5.20922;RBI=0.0249024;REFB=-0.0101273;REVB=-0.0237662;RO=37;SAF=8;SAR=7;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118211;STB=0.58812;STBP=0.448;TYPE=del;VARB=0.0260937;OID=.;OPOS=130739647;OREF=TAAC;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.277778:15:54:15:54:39:8:7:16:23:70:37:8:7:16:21
chr2	130739891	.	T	A	379.54	PASS	AF=0.4875;AO=39;DP=81;FAO=39;FDP=80;FR=.;FRO=41;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=16;FSRR=25;FWDB=-0.0162049;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.596;QD=18.977;RBI=0.0225708;REFB=-0.0019952;REVB=0.0157113;RO=42;SAF=16;SAR=23;SRF=16;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.028338;STB=0.510633;STBP=0.873;TYPE=snp;VARB=0.00190667;OID=.;OPOS=130739891;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:80:42:41:39:39:0.4875:23:16:16:26:23:16:16:25
chr2	130951548	.	G	A	941.02	PASS	AF=0.984848;AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=66;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00820226;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.588;QD=57.0314;RBI=0.0537979;REFB=-0.0507329;REVB=0.0531689;RO=1;SAF=43;SAR=22;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.010861;STB=0.505745;STBP=0.623;TYPE=snp;VARB=0.000425532;OID=.;OPOS=130951548;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:66:66:1:1:65:65:0.984848:22:43:1:0:22:43:1:0
chr2	130951566	.	G	A	937.59	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0131377;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.2984;QD=58.5996;RBI=0.0411556;REFB=0;REVB=0.0390024;RO=0;SAF=42;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000147876;OID=.;OPOS=130951566;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:22:42:0:0:22:42:0:0
chr2	131266530	.	C	A	557.13	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0846772;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.602;QD=60.2307;RBI=0.0870196;REFB=0;REVB=0.0200548;RO=0;SAF=19;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.68991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000452713;OID=.;OPOS=131266530;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:18:19:0:0:18:19:0:0
chr2	131414176	.	C	T	150.86	PASS	AF=0.247191;AO=22;DP=90;FAO=22;FDP=89;FR=.;FRO=67;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=40;FSRR=27;FWDB=0.00409444;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.6229;QD=6.78003;RBI=0.0984894;REFB=-0.0061084;REVB=-0.0984043;RO=67;SAF=9;SAR=13;SRF=40;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.228764;STB=0.638794;STBP=0.141;TYPE=snp;VARB=0.0248824;OID=.;OPOS=131414176;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:89:67:67:22:22:0.247191:13:9:40:27:13:9:40:27
chr2	131487673	.	A	C	740.44	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0129148;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.616;QD=56.9569;RBI=0.0186106;REFB=0;REVB=-0.0134;RO=0;SAF=30;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.90181e-05;OID=.;OPOS=131487673;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:22:30:0:0:22:30:0:0
chr2	131520231	.	C	T	81.95	PASS	AF=0.268293;AO=11;DP=42;FAO=11;FDP=41;FR=.;FRO=30;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=0.028056;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.559;QD=7.9954;RBI=0.0282045;REFB=-0.00299154;REVB=0.00289107;RO=30;SAF=6;SAR=5;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0143814;STB=0.508912;STBP=0.967;TYPE=snp;VARB=0.0068556;OID=.;OPOS=131520231;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:81:42:41:30:30:11:11:0.268293:5:6:16:14:5:6:16:14
chr2	131520663	.	T	C	958.38	PASS	AF=1;AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00574554;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.474;QD=58.9769;RBI=0.0144283;REFB=0;REVB=0.013235;RO=0;SAF=40;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.76416e-05;OID=.;OPOS=131520663;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:65:0:0:65:65:1:25:40:0:0:25:40:0:0
chr2	131672950	.	A	G	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0756582;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=336.229;QD=42.1826;RBI=0.0832069;REFB=0;REVB=0.0346299;RO=0;SAF=4;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000521983;OID=.;OPOS=131672950;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:7:4:0:0:7:4:0:0
chr2	131673316	.	C	T	82.05	PASS	AF=0.9;AO=9;DP=10;FAO=9;FDP=10;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00258305;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=143.238;QD=32.8218;RBI=0.00283836;REFB=0.139976;REVB=-0.00117649;RO=1;SAF=4;SAR=5;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.080744;STB=0.545355;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=-0.00269412;OID=.;OPOS=131673316;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:10:10:1:1:9:9:0.9:5:4:0:1:5:4:0:1
chr2	131674285	.	A	G	1163.46	PASS	AF=0.975;AO=78;DP=80;FAO=78;FDP=80;FR=.;FRO=2;FSAF=35;FSAR=43;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0192773;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.846;QD=58.1728;RBI=0.040143;REFB=0.0233751;REVB=0.0352115;RO=2;SAF=35;SAR=43;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0262774;STB=0.513885;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=-0.000394322;OID=.;OPOS=131674285;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:80:80:2:2:78:78:0.975:43:35:2:0:43:35:2:0
chr2	132137239	.	C	T	1475.82	PASS	AF=1;AO=97;DP=99;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0119915;FXX=0.0291234;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.542;QD=59.033;RBI=0.0265708;REFB=0;REVB=0.023711;RO=0;SAF=41;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.55487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000115973;OID=.;OPOS=132137239;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:99:100:0:0:97:100:1:56:41:0:0:56:44:0:0
chr2	132140090	.	A	C	2363.79	PASS	AF=0.99375;AO=156;DP=160;FAO=159;FDP=160;FR=.;FRO=1;FSAF=97;FSAR=62;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00741414;FXX=0.00621079;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.7984;QD=59.0947;RBI=0.105009;REFB=-0.0412486;REVB=0.104747;RO=4;SAF=96;SAR=60;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0182605;STB=0.502564;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=0.00121266;OID=.;OPOS=132140090;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:160:160:4:1:156:159:0.99375:60:96:1:3:62:97:1:0
chr2	132140200	.	C	A	2370.51	PASS	AF=0.987421;AO=157;DP=159;FAO=157;FDP=159;FR=.;FRO=2;FSAF=73;FSAR=84;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.000429937;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=284.728;QD=59.6354;RBI=0.00112483;REFB=-0.00497749;REVB=-0.00103942;RO=2;SAF=73;SAR=84;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000842377;STB=0.500443;STBP=0.876;TYPE=snp;VARB=-1.45385e-07;OID=.;OPOS=132140200;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:159:159:2:2:157:157:0.987421:84:73:1:1:84:73:1:1
chr2	132141767	.	A	G,T	805.29	PASS	AF=0.964912,0.0350877;AO=54,2;DP=56;FAO=55,2;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=22,0;FSAR=33,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0259597,-0.00323652;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=165.686,24.3693;QD=56.5118;RBI=0.0346732,0.00555678;REFB=0,0;REVB=0.0229852,0.00451694;RO=0;SAF=22,0;SAR=32,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.64875e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00041211,0.0989592;OID=.,.;OPOS=132141767,132141767;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:7:56:57:0:0:54,2:55,2:0.964912,0.0350877:32,2:22,0:0:0:33,2:22,0:0:0
chr2	132200256	.	T	C	375.63	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00103156;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.858;QD=55.6495;RBI=0.042824;REFB=0;REVB=-0.0428115;RO=0;SAF=11;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000137515;OID=.;OPOS=132200256;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:16:11:0:0:16:11:0:0
chr2	132200307	.	G	A,C	720.64	PASS	AF=0.914894,0.0851064;AO=43,4;DP=47;FAO=43,4;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=24,0;FSAR=19,4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0091199,0.00601821;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=156.649,101.84;QD=61.3314;RBI=0.0373933,0.0306107;REFB=0,0;REVB=0.0362641,-0.0300133;RO=0;SAF=24,0;SAR=19,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.000231425,0.196282;OID=.,.;OPOS=132200307,132200307;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:15:47:47:0:0:43,4:43,4:0.914894,0.0851064:19,4:24,0:0:0:19,4:24,0:0:0
chr2	132200345	.	C	T	1175.86	PASS	AF=0.987342;AO=78;DP=79;FAO=78;FDP=79;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0393295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.059;QD=59.5371;RBI=0.0584643;REFB=-0.141385;REVB=0.0432581;RO=1;SAF=43;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0108815;STB=0.505746;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.00261171;OID=.;OPOS=132200345;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:79:79:1:1:78:78:0.987342:35:43:1:0:35:43:1:0
chr2	132200529	.	A	G	604.53	PASS	AF=0.976744;AO=40;DP=42;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0134877;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.6083;QD=56.235;RBI=0.0614356;REFB=-0.113978;REVB=-0.0599368;RO=2;SAF=20;SAR=20;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.511622;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.00692529;OID=.;OPOS=132200529;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:42:43:2:1:40:42:0.976744:20:20:1:1:21:21:0:1
chr2	132200935	.	C	T	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0647564;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.306;QD=42.1825;RBI=0.0661801;REFB=0;REVB=-0.0136533;RO=0;SAF=5;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000803986;OID=.;OPOS=132200935;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:6:5:0:0:6:5:0:0
chr2	132201288	.	A	G	520.05	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0173874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.413;QD=59.4344;RBI=0.021397;REFB=0;REVB=0.0124704;RO=0;SAF=18;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.82143e-05;OID=.;OPOS=132201288;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:17:18:0:0:17:18:0:0
chr2	132201468	.	G	A	1255.95	PASS	AF=0.976471;AO=83;DP=85;FAO=83;FDP=85;FR=.;FRO=2;FSAF=37;FSAR=46;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0162855;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=60.341;QD=59.1035;RBI=0.0163223;REFB=0.0337362;REVB=0.00109445;RO=2;SAF=37;SAR=46;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0249103;STB=0.513155;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=-0.000935876;OID=.;OPOS=132201468;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:85:85:2:2:83:83:0.976471:46:37:2:0:46:37:2:0
chr2	132201582	.	A	G	906.98	PASS	AF=1;AO=62;DP=63;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00846743;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.5551;QD=58.515;RBI=0.0200148;REFB=0;REVB=-0.0181354;RO=0;SAF=30;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000515131;OID=.;OPOS=132201582;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:62:0:0:62:62:1:32:30:0:0:32:30:0:0
chr2	132201663	.	T	C	747.09	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-7.93097e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.965;QD=63.5825;RBI=0.00185575;REFB=0;REVB=0.00185405;RO=0;SAF=28;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.68126e-06;OID=.;OPOS=132201663;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:19:28:0:0:19:28:0:0
chr2	132201718	.	T	C	594.53	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00260426;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.109;QD=60.9775;RBI=0.022362;REFB=0;REVB=0.0222099;RO=0;SAF=25;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.50922e-05;OID=.;OPOS=132201718;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:14:25:0:0:14:25:0:0
chr2	132201736	.	C	G	477.0	PASS	AF=0.875;AO=35;DP=40;FAO=35;FDP=40;FR=.;FRO=5;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0323462;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.1777;QD=47.6996;RBI=0.032372;REFB=-0.0367143;REVB=0.00129117;RO=4;SAF=20;SAR=15;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0350455;STB=0.529395;STBP=0.381;TYPE=snp;VARB=0.0343623;OID=.;OPOS=132201736;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:25:40:40:4:5:35:35:0.875:15:20:3:1:15:20:4:1
chr2	132201862	.	C	G	1510.71	PASS	AF=1;AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0333153;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=179.039;QD=63.6086;RBI=0.0343181;REFB=0;REVB=-0.00823534;RO=0;SAF=51;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.77676e-05;OID=.;OPOS=132201862;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:95:0:0:95:95:1:44:51:0:0:44:51:0:0
chr2	132201889	.	C	A	1521.58	PASS	AF=1;AO=95;DP=96;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0210709;FXX=0.0306091;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.723;QD=64.0664;RBI=0.0299706;REFB=0;REVB=0.0213132;RO=0;SAF=47;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000129228;OID=.;OPOS=132201889;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:96:95:0:0:95:95:1:48:47:0:0:48:47:0:0
chr2	132201930	.	T	C	871.23	PASS	AF=1;AO=52;DP=61;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0171185;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.567;QD=58.0823;RBI=0.0203486;REFB=0;REVB=0.0110011;RO=0;SAF=27;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.25979e-05;OID=.;OPOS=132201930;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:60:0:0:52:60:1:25:27:0:0:33:27:0:0
chr2	132229720	.	T	C	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0305126;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.338;QD=49.5992;RBI=0.0307447;REFB=0;REVB=-0.00377075;RO=0;SAF=13;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000355678;OID=.;OPOS=132229720;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:5:13:0:0:5:13:0:0
chr2	132237983	.	A	G	137.68	PASS	AF=0.928571;AO=12;DP=13;FAO=13;FDP=14;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0636502;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.443;QD=39.3372;RBI=0.0637524;REFB=-0.171384;REVB=0.00360978;RO=1;SAF=5;SAR=7;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0601692;STB=0.533282;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=0.0190733;OID=.;OPOS=132237983;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:13:14:1:1:12:13:0.928571:7:5:0:1:7:6:0:1
chr2	132248379	.	T	G	762.54	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0146734;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.7572;QD=63.5449;RBI=0.0166362;REFB=0;REVB=-0.00783922;RO=0;SAF=20;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.56477e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.9624e-05;OID=.;OPOS=132248379;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:28:20:0:0:28:20:0:0
chr2	132248584	.	T	C	383.51	PASS	AF=1;AO=24;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0293559;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.6471;QD=54.7865;RBI=0.0418008;REFB=0;REVB=0.029758;RO=0;SAF=8;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00337056;OID=.;OPOS=132248584;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:24:28:1:16:8:0:0:17:11:0:0
chr2	132266142	.	G	C	2140.09	PASS	AF=1;AO=134;DP=140;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0181221;FXX=0.0425502;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.159;QD=63.4102;RBI=0.0277023;REFB=0;REVB=0.0209526;RO=0;SAF=77;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.79559e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000189332;OID=.;OPOS=132266142;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:140:135:0:0:134:135:1:57:77:0:0:57:78:0:0
chr2	132274474	.	G	A	1609.15	PASS	AF=0.990826;AO=108;DP=109;FAO=108;FDP=109;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0442436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168;QD=59.0514;RBI=0.0514142;REFB=-0.0521564;REVB=0.02619;RO=0;SAF=46;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.67537e-08;STB=0.503999;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.000308349;OID=.;OPOS=132274474;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:109:109:0:1:108:108:0.990826:62:46:0:0:62:46:0:1
chr2	132275343	.	G	T	1108.51	PASS	AF=0.974026;AO=75;DP=77;FAO=75;FDP=77;FR=.;FRO=2;FSAF=38;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00777344;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.2022;QD=57.5847;RBI=0.0222699;REFB=-0.0553304;REVB=0.0208691;RO=2;SAF=38;SAR=37;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000327513;STB=0.500173;STBP=0.864;TYPE=snp;VARB=0.00428792;OID=.;OPOS=132275343;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:77:77:2:2:75:75:0.974026:37:38:1:1:37:38:1:1
chr2	132275396	.	T	C	1339.59	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0182114;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.048;QD=62.3065;RBI=0.0382519;REFB=0;REVB=0.0336386;RO=0;SAF=42;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.57388e-05;OID=.;OPOS=132275396;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:44:42:0:0:44:42:0:0
chr2	132277686	.	C	T	393.17	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00993494;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.4211;QD=56.1672;RBI=0.0147805;REFB=0;REVB=0.0109434;RO=0;SAF=17;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.31638e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000389972;OID=.;OPOS=132277686;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:11:17:0:0:11:17:0:0
chr2	132277962	.	T	C	817.71	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0728534;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.4328;QD=57.3829;RBI=0.0728746;REFB=0;REVB=-0.00175655;RO=0;SAF=23;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000814688;OID=.;OPOS=132277962;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:34:23:0:0:34:23:0:0
chr2	132277984	.	G	A	708.56	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0795285;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.398;QD=62.9829;RBI=0.0795369;REFB=0;REVB=0.00115489;RO=0;SAF=22;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000101775;OID=.;OPOS=132277984;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:23:22:0:0:23:22:0:0
chr2	132287824	.	C	T	998.09	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0221897;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.987;QD=58.7109;RBI=0.0475856;REFB=0;REVB=0.0420952;RO=0;SAF=36;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000119308;OID=.;OPOS=132287824;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:68:0:0:67:68:1:31:36:0:0:32:36:0:0
chr2	133010778	.	CG	C	33.87	PASS	AF=0.118644;AO=7;DP=59;FAO=7;FDP=59;FR=.;FRO=52;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=29;FSRR=23;FWDB=-0.0525284;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=35.5595;QD=2.29622;RBI=0.118104;REFB=0.00603513;REVB=-0.105779;RO=51;SAF=4;SAR=3;SRF=29;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00336936;STB=0.51228;STBP=0.971;TYPE=del;VARB=-0.0809004;OID=.;OPOS=133010779;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.118644:7:59:7:59:52:4:3:29:23:33:51:4:3:29:22
chr2	133010783	.	A	T	48.5	PASS	AF=0.145161;AO=9;DP=62;FAO=9;FDP=62;FR=.;FRO=53;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=31;FSRR=22;FWDB=-0.00847083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.524;QD=3.12904;RBI=0.0483173;REFB=-0.00374019;REVB=-0.0475689;RO=51;SAF=5;SAR=4;SRF=31;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0656369;STB=0.525491;STBP=0.882;TYPE=snp;VARB=0.0343631;OID=.;OPOS=133010783;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:48:62:62:51:53:9:9:0.145161:4:5:31:20:4:5:31:22
chr2	133010796	.	C	T	41.96	PASS	AF=0.129032;AO=7;DP=61;FAO=8;FDP=62;FR=.;FRO=54;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=30;FSRR=24;FWDB=-0.00213797;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.9657;QD=2.70712;RBI=0.0324371;REFB=-0.00677579;REVB=0.0323665;RO=54;SAF=3;SAR=4;SRF=30;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148005;STB=0.548267;STBP=0.821;TYPE=snp;VARB=0.0272029;OID=.;OPOS=133010796;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:61:62:54:54:7:8:0.129032:4:3:30:24:4:4:30:24
chr2	133010802	.	T	C	54.0	PASS	AF=0.153846;AO=10;DP=65;FAO=10;FDP=65;FR=.;FRO=55;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=30;FSRR=25;FWDB=0.0227779;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.6034;QD=3.32317;RBI=0.0259962;REFB=-0.00334531;REVB=0.0125287;RO=55;SAF=4;SAR=6;SRF=30;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17782;STB=0.62171;STBP=0.439;TYPE=snp;VARB=0.0192432;OID=.;OPOS=133010802;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:65:65:55:55:10:10:0.153846:6:4:30:25:6:4:30:25
chr2	133010834	.	TG	CA	44.6	PASS	AF=0.130435;AO=9;DP=69;FAO=9;FDP=69;FR=.;FRO=60;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=35;FSRR=25;FWDB=-0.0200923;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=279.63;QD=2.58572;RBI=0.0233165;REFB=-0.00200836;REVB=-0.0118305;RO=59;SAF=3;SAR=6;SRF=35;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.307606;STB=0.709834;STBP=0.182;TYPE=mnp;VARB=0.0170413;OID=.;OPOS=133010834;OREF=TG;OALT=CA;OMAPALT=CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:69:69:59:60:9:9:0.130435:6:3:35:24:6:3:35:25
chr2	133010838	.	G	C	45.62	PASS	AF=0.134328;AO=9;DP=67;FAO=9;FDP=67;FR=.;FRO=58;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=34;FSRR=24;FWDB=-0.0301223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.162;QD=2.72366;RBI=0.0302327;REFB=-0.000205115;REVB=0.00258181;RO=57;SAF=3;SAR=6;SRF=33;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.29268;STB=0.71109;STBP=0.194;TYPE=snp;VARB=0.00423275;OID=.;OPOS=133010838;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:67:67:57:58:9:9:0.134328:6:3:33:24:6:3:34:24
chr2	133010847	.	CA	TG	46.73	PASS	AF=0.138462;AO=9;DP=67;FAO=9;FDP=65;FR=.;FRO=56;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=34;FSRR=22;FWDB=-0.0277536;FXX=0.0298463;HRUN=1;LEN=2;MLLD=217.336;QD=2.87571;RBI=0.0365454;REFB=-0.00189493;REVB=-0.0237762;RO=56;SAF=3;SAR=6;SRF=34;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.324088;STB=0.725021;STBP=0.206;TYPE=mnp;VARB=0.0187248;OID=.;OPOS=133010847;OREF=CA;OALT=TG;OMAPALT=TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:67:65:56:56:9:9:0.138462:6:3:34:22:6:3:34:22
chr2	133011929	.	C	T	92.18	PASS	AF=0.292683;AO=12;DP=41;FAO=12;FDP=41;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.0840101;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.6165;QD=8.9935;RBI=0.086977;REFB=-0.0248366;REVB=-0.0225233;RO=28;SAF=7;SAR=5;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.096537;STB=0.571309;STBP=0.594;TYPE=snp;VARB=0.0565459;OID=.;OPOS=133011929;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:41:41:28:29:12:12:0.292683:5:7:14:14:5:7:14:15
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chr2	133011947	.	C	G	134.05	PASS	AF=0.326531;AO=16;DP=51;FAO=16;FDP=49;FR=.;FRO=33;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=-0.015225;FXX=0.039208;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.5254;QD=10.9426;RBI=0.0162332;REFB=0.00178253;REVB=0.00563167;RO=31;SAF=7;SAR=9;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0576865;STB=0.50908;STBP=0.95;TYPE=snp;VARB=-0.0110579;OID=.;OPOS=133011947;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:49:31:33:16:16:0.326531:9:7:12:19:9:7:14:19
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chr2	133012007	.	T	C	87.15	PASS	AF=0.232143;AO=13;DP=56;FAO=13;FDP=56;FR=.;FRO=43;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=20;FSRR=23;FWDB=-0.0361039;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.63;QD=6.22517;RBI=0.0427147;REFB=0.00405267;REVB=-0.0228266;RO=43;SAF=6;SAR=7;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00439357;STB=0.502758;STBP=0.966;TYPE=snp;VARB=-0.0351251;OID=.;OPOS=133012007;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:56:56:43:43:13:13:0.232143:7:6:20:23:7:6:20:23
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chr2	133012022	.	G	A	111.85	PASS	AF=0.28;AO=14;DP=49;FAO=14;FDP=50;FR=.;FRO=36;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=-0.0344955;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=165.588;QD=8.94778;RBI=0.036224;REFB=-0.0174039;REVB=-0.0110563;RO=35;SAF=4;SAR=10;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184037;STB=0.624813;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.0354899;OID=.;OPOS=133012022;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:50:35:36:14:14:0.28:10:4:15:20:10:4:16:20
chr2	133012026	.	T	C	66.16	PASS	AF=0.192308;AO=10;DP=52;FAO=10;FDP=52;FR=.;FRO=42;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=24;FWDB=-0.000239133;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.147;QD=5.0896;RBI=0.0100738;REFB=-0.00188978;REVB=-0.010071;RO=42;SAF=4;SAR=6;SRF=18;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0361151;STB=0.523762;STBP=0.891;TYPE=snp;VARB=0.0087245;OID=.;OPOS=133012026;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:52:52:42:42:10:10:0.192308:6:4:18:24:6:4:18:24
chr2	133012032	.	A	G	75.17	PASS	AF=0.22;AO=12;DP=50;FAO=11;FDP=50;FR=.;FRO=39;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=-0.0205916;FXX=0.0384541;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.312;QD=6.0134;RBI=0.0235814;REFB=0.000389792;REVB=-0.0114921;RO=31;SAF=6;SAR=6;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0568211;STB=0.505485;STBP=0.968;TYPE=snp;VARB=-0.00212808;OID=.;OPOS=133012032;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:50:50:31:39:12:11:0.22:6:6:14:17:6:5:18:21
chr2	133012034	.	C	CG,G	261.28	PASS	AF=0.454545,0.181818;AO=15,12;DP=48;FAO=20,8;FDP=44;FR=.;FRO=16;FSAF=6,4;FSAR=14,4;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.0712665,0.0251191;FXX=0.0434688;HRUN=3,1;LEN=1,1;MLLD=18.078,167.371;QD=23.7523;RBI=0.159433,0.0430158;REFB=-0.00547878,-0.0192822;REVB=0.142619,0.0349198;RO=18;SAF=5,4;SAR=10,8;SRF=10;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.216322,-0.230768;STB=0.62487,0.541563;STBP=0.109,0.812;TYPE=ins,snp;VARB=-0.0703251,0.190018;OID=.,.;OPOS=133012035,133012034;OREF=-,C;OALT=G,G;OMAPALT=CG,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:44:18:16:15,12:20,8:0.454545,0.181818:10,8:5,4:10:8:14,4:6,4:9:7
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chr2	133012061	.	C	T	77.27	PASS	AF=0.215686;AO=11;DP=51;FAO=11;FDP=51;FR=.;FRO=40;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=23;FSRR=17;FWDB=-0.00160331;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=249.733;QD=6.06072;RBI=0.0160871;REFB=-0.00163198;REVB=-0.016007;RO=40;SAF=3;SAR=8;SRF=23;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.366964;STB=0.734559;STBP=0.107;TYPE=snp;VARB=0.00619853;OID=.;OPOS=133012061;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:51:51:40:40:11:11:0.215686:8:3:23:17:8:3:23:17
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chr2	133012130	.	C	T	60.41	PASS	AF=0.236842;AO=9;DP=38;FAO=9;FDP=38;FR=.;FRO=29;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=22;FSRR=7;FWDB=0.00566052;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.311;QD=6.35903;RBI=0.0261742;REFB=-0.00616064;REVB=0.0255547;RO=28;SAF=5;SAR=4;SRF=21;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.248505;STB=0.662265;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=0.0222242;OID=.;OPOS=133012130;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:60:38:38:28:29:9:9:0.236842:4:5:21:7:4:5:22:7
chr2	133012147	.	A	G	51.81	PASS	AF=0.210526;AO=9;DP=39;FAO=8;FDP=38;FR=.;FRO=30;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=22;FSRR=8;FWDB=-0.00914299;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.985;QD=5.45392;RBI=0.0092442;REFB=-0.003486;REVB=0.00136423;RO=28;SAF=5;SAR=4;SRF=20;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199952;STB=0.595369;STBP=0.593;TYPE=snp;VARB=0.0076827;OID=.;OPOS=133012147;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:51:39:38:28:30:9:8:0.210526:4:5:20:8:3:5:22:8
chr2	133012170	.	CC	AA	62.09	PASS	AF=0.272727;AO=9;DP=33;FAO=9;FDP=33;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.0151011;FXX=0;HRUN=3;LEN=2;MLLD=159.615;QD=7.52632;RBI=0.01716;REFB=-0.00305689;REVB=-0.00814999;RO=24;SAF=6;SAR=3;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10346;STB=0.565068;STBP=0.67;TYPE=mnp;VARB=0.00860875;OID=.;OPOS=133012170;OREF=CC;OALT=AA;OMAPALT=AA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:33:33:24:24:9:9:0.272727:3:6:14:10:3:6:14:10
chr2	133012172	.	T	C	42.63	PASS	AF=0.2;AO=6;DP=34;FAO=7;FDP=35;FR=.;FRO=28;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=-0.0182237;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.59;QD=4.87195;RBI=0.01933;REFB=-0.0155381;REVB=0.00644539;RO=27;SAF=3;SAR=3;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110448;STB=0.639616;STBP=0.479;TYPE=snp;VARB=0.0353828;OID=.;OPOS=133012172;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:42:34:35:27:28:6:7:0.2:3:3:16:11:4:3:17:11
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chr2	133012250	.	T	C	46.7	PASS	AF=0.10084;AO=12;DP=118;FAO=12;FDP=119;FR=.;FRO=107;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=22;FSRR=85;FWDB=-0.0175171;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.583;QD=1.56982;RBI=0.0418151;REFB=-0.00491439;REVB=-0.0379691;RO=104;SAF=7;SAR=5;SRF=22;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.455456;STB=0.812549;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=0.0590367;OID=.;OPOS=133012250;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:118:119:104:107:12:12:0.10084:5:7:22:82:5:7:22:85
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chr2	133012274	.	T	C	858.64	PASS	AF=0.66087;AO=76;DP=115;FAO=76;FDP=115;FR=.;FRO=39;FSAF=10;FSAR=66;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=-0.00887267;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=207.387;QD=29.8656;RBI=0.0161928;REFB=-0.000678654;REVB=0.0135455;RO=39;SAF=10;SAR=66;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.347165;STB=0.689919;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.000515884;OID=.;OPOS=133012274;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:115:39:39:76:76:0.66087:66:10:19:20:66:10:19:20
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chr2	133012358	.	G	A	82.32	PASS	AF=0.297297;AO=10;DP=37;FAO=11;FDP=37;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=-0.0117943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.142;QD=8.89988;RBI=0.0131645;REFB=-0.00266285;REVB=-0.00584795;RO=26;SAF=4;SAR=6;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16099;STB=0.558717;STBP=0.629;TYPE=snp;VARB=0.00864655;OID=.;OPOS=133012358;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:82:37:37:26:26:10:11:0.297297:6:4:14:12:6:5:14:12
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chr2	133012426	.	A	G	31.5	PASS	AF=0.115385;AO=6;DP=52;FAO=6;FDP=52;FR=.;FRO=46;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=18;FSRR=28;FWDB=-0.0235723;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.5141;QD=2.42277;RBI=0.0668072;REFB=-0.00103713;REVB=0.0625104;RO=46;SAF=1;SAR=5;SRF=18;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.303538;STB=0.741277;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=0.0128512;OID=.;OPOS=133012426;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:31:52:52:46:46:6:6:0.115385:5:1:18:28:5:1:18:28
chr2	133012432	.	G	C	37.41	PASS	AF=0.125;AO=7;DP=56;FAO=7;FDP=56;FR=.;FRO=49;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=20;FSRR=29;FWDB=-0.025301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.831;QD=2.6721;RBI=0.0324462;REFB=-0.00131546;REVB=-0.0203129;RO=49;SAF=2;SAR=5;SRF=20;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157077;STB=0.617624;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.0110815;OID=.;OPOS=133012432;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:56:56:49:49:7:7:0.125:5:2:20:29:5:2:20:29
chr2	133012439	.	A	AGAAC,C	243.08	PASS	AF=0.25,0.119048;AO=21,10;DP=84;FAO=21,10;FDP=84;FR=.;FRO=53;FSAF=16,10;FSAR=5,0;FSRF=23;FSRR=30;FWDB=-0.00281999,-0.022815;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=4,1;MLLD=234.108,73.3269;QD=11.5752;RBI=0.0119484,0.0228235;REFB=-0.00180558,0.00632259;REVB=-0.0116109,-0.000622855;RO=53;SAF=16,10;SAR=5,0;SRF=23;SRR=30;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.401606,0.722463;STB=0.741486,0.998954;STBP=0.017,0.001;TYPE=ins,snp;VARB=0.00295307,-0.0466313;OID=.,.;OPOS=133012440,133012439;OREF=-,A;OALT=GAAC,C;OMAPALT=AGAAC,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:53:53:21,10:21,10:0.25,0.119048:5,0:16,10:23:30:5,0:16,10:23:30
chr2	133012457	.	C	T	51.38	PASS	AF=0.0743494;AO=20;DP=269;FAO=20;FDP=269;FR=.;FRO=249;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=105;FSRR=144;FWDB=0.0267447;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=151.818;QD=0.764047;RBI=0.0338798;REFB=-0.000300637;REVB=-0.0207981;RO=244;SAF=8;SAR=12;SRF=103;SRR=141;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0256806;STB=0.520716;STBP=0.865;TYPE=snp;VARB=0.00232472;OID=.;OPOS=133012457;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:51:269:269:244:249:20:20:0.0743494:12:8:103:141:12:8:105:144
chr2	133012458	.	GT	AC	2873.08	PASS	AF=0.806691;AO=217;DP=270;FAO=217;FDP=269;FR=.;FRO=52;FSAF=93;FSAR=124;FSRF=20;FSRR=32;FWDB=0.000310911;FXX=0.0146515;HRUN=1;LEN=2;MLLD=213.954;QD=42.7223;RBI=0.018088;REFB=-0.0167327;REVB=0.0180853;RO=52;SAF=93;SAR=124;SRF=20;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0164075;STB=0.508695;STBP=0.553;TYPE=mnp;VARB=0.0023831;OID=.;OPOS=133012458;OREF=GT;OALT=AC;OMAPALT=AC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:270:269:52:52:217:217:0.806691:124:93:20:32:124:93:20:32
chr2	133012465	.	C	T	34.23	PASS	AF=0.0555556;AO=20;DP=360;FAO=20;FDP=360;FR=.;FRO=340;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=139;FSRR=201;FWDB=0.0282089;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.209;QD=0.380338;RBI=0.0313658;REFB=5.80279e-06;REVB=-0.013714;RO=340;SAF=8;SAR=12;SRF=139;SRR=201;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00929152;STB=0.508642;STBP=0.93;TYPE=snp;VARB=-0.0212089;OID=.;OPOS=133012465;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:360:360:340:340:20:20:0.0555556:12:8:139:201:12:8:139:201
chr2	133012504	.	A	G	4977.04	PASS	AF=0.873171;AO=354;DP=408;FAO=358;FDP=410;FR=.;FRO=52;FSAF=164;FSAR=194;FSRF=22;FSRR=30;FWDB=-0.00389848;FXX=0.00485425;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.593;QD=48.5565;RBI=0.0089136;REFB=-0.00922985;REVB=-0.00801587;RO=52;SAF=162;SAR=192;SRF=22;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00846069;STB=0.504477;STBP=0.629;TYPE=snp;VARB=0.000976569;OID=.;OPOS=133012504;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:408:410:52:52:354:358:0.873171:192:162:22:30:194:164:22:30
chr2	133012508	.	TG	CA,CG	5274.25	PASS	AF=0.0445545,0.883663;AO=17,344;DP=397;FAO=18,357;FDP=404;FR=.;FRO=29;FSAF=6,166;FSAR=12,191;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=-0.00375336,-0.00376233;FXX=0.0217912;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=109.506,147.162;QD=52.2203;RBI=0.0107752,0.0520252;REFB=0.000737569,-0.0128497;REVB=0.0101004,0.051889;RO=30;SAF=6,164;SAR=11,180;SRF=14;SRR=16;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.129068,0.00154051;STB=0.596904,0.501342;STBP=0.322,0.855;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0324828,-1.96637e-05;OID=.,.;OPOS=133012508,133012508;OREF=TG,T;OALT=CA,C;OMAPALT=CA,CG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:72:397:404:30:29:17,344:18,357:0.0445545,0.883663:11,180:6,164:14:16:12,191:6,166:14:15
chr2	133012516	.	T	G	4837.73	PASS	AF=0.861905;AO=336;DP=393;FAO=362;FDP=420;FR=.;FRO=58;FSAF=176;FSAR=186;FSRF=25;FSRR=33;FWDB=-0.0150612;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=58.6116;QD=46.0736;RBI=0.0160564;REFB=-0.0492975;REVB=0.00556497;RO=57;SAF=176;SAR=160;SRF=25;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0234409;STB=0.507625;STBP=0.444;TYPE=snp;VARB=0.00814394;OID=.;OPOS=133012516;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:393:420:57:58:336:362:0.861905:160:176:25:32:186:176:25:33
chr2	133012523	.	A	G	5356.24	PASS	AF=0.897129;AO=374;DP=417;FAO=375;FDP=418;FR=.;FRO=43;FSAF=183;FSAR=192;FSRF=17;FSRR=26;FWDB=0.0180846;FXX=0.00238658;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.557;QD=51.2559;RBI=0.0220971;REFB=-0.0267772;REVB=0.0126977;RO=43;SAF=182;SAR=192;SRF=17;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0179026;STB=0.50954;STBP=0.248;TYPE=snp;VARB=0.00208706;OID=.;OPOS=133012523;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:417:418:43:43:374:375:0.897129:192:182:17:26:192:183:17:26
chr2	133012542	.	T	C	5398.04	PASS	AF=0.923077;AO=372;DP=403;FAO=372;FDP=403;FR=.;FRO=31;FSAF=185;FSAR=187;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=0.0102264;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=294.507;QD=53.5786;RBI=0.0205664;REFB=0.00234496;REVB=-0.0178437;RO=31;SAF=185;SAR=187;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0161286;STB=0.508479;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=-0.00013458;OID=.;OPOS=133012542;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:403:403:31:31:372:372:0.923077:187:185:12:19:187:185:12:19
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chr2	133013351	.	G	A	89.45	PASS	AF=0.244898;AO=12;DP=49;FAO=12;FDP=49;FR=.;FRO=37;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=0.00297241;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.309;QD=7.3023;RBI=0.00420836;REFB=0.00050097;REVB=0.00297911;RO=37;SAF=5;SAR=7;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180683;STB=0.612609;STBP=0.395;TYPE=snp;VARB=-0.000772814;OID=.;OPOS=133013351;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:49:49:37:37:12:12:0.244898:7:5:21:16:7:5:21:16
chr2	133013378	.	A	G	260.34	PASS	AF=0.571429;AO=18;DP=42;FAO=24;FDP=42;FR=.,HEALED;FRO=18;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.0273598;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.948;QD=24.7943;RBI=0.0283193;REFB=-0.0336477;REVB=0.00730927;RO=18;SAF=7;SAR=11;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.565163;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=0.0357027;OID=.;OPOS=133013378;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:18:18:18:24:0.571429:11:7:7:11:11:13:7:11
chr2	133013388	.	C	T	91.76	PASS	AF=0.285714;AO=12;DP=42;FAO=12;FDP=42;FR=.;FRO=30;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=-0.0149389;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.8951;QD=8.7391;RBI=0.0191541;REFB=-0.0140228;REVB=-0.0119878;RO=30;SAF=6;SAR=6;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0778683;STB=0.54754;STBP=0.733;TYPE=snp;VARB=0.0331806;OID=.;OPOS=133013388;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:91:42:42:30:30:12:12:0.285714:6:6:13:17:6:6:13:17
chr2	133013418	.	A	G	107.42	PASS	AF=0.382353;AO=13;DP=34;FAO=13;FDP=34;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.0137622;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.38;QD=12.6374;RBI=0.0176578;REFB=-0.0175858;REVB=0.0110634;RO=21;SAF=6;SAR=7;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0652316;STB=0.538402;STBP=0.769;TYPE=snp;VARB=0.0193039;OID=.;OPOS=133013418;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:21:21:13:13:0.382353:7:6:11:10:7:6:11:10
chr2	133013449	.	G	A	41.51	PASS	AF=0.170732;AO=7;DP=41;FAO=7;FDP=41;FR=.;FRO=34;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=-0.000154218;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.06;QD=4.04955;RBI=0.000717713;REFB=0.00150061;REVB=0.000700948;RO=34;SAF=2;SAR=5;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.356195;STB=0.742574;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=-0.00530488;OID=.;OPOS=133013449;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:41:41:34:34:7:7:0.170732:5:2:20:14:5:2:20:14
chr2	133013461	.	C	T	34.02	PASS	AF=0.171429;AO=6;DP=35;FAO=6;FDP=35;FR=.;FRO=29;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=0.0241231;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=151.462;QD=3.88751;RBI=0.0265805;REFB=0.00107287;REVB=-0.0111624;RO=28;SAF=2;SAR=4;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.317106;STB=0.726565;STBP=0.262;TYPE=snp;VARB=-0.00505333;OID=.;OPOS=133013461;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:35:35:28:29:6:6:0.171429:4:2:17:11:4:2:18:11
chr2	133013475	.	A	G	133.45	PASS	AF=0.441176;AO=15;DP=34;FAO=15;FDP=34;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.0304879;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.0031;QD=15.7003;RBI=0.0460436;REFB=0.00838518;REVB=0.0345036;RO=19;SAF=8;SAR=7;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0445112;STB=0.525658;STBP=0.799;TYPE=snp;VARB=-0.0106945;OID=.;OPOS=133013475;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:19:19:15:15:0.441176:7:8:11:8:7:8:11:8
chr2	133013489	.	C	T	42.81	PASS	AF=0.212121;AO=7;DP=33;FAO=7;FDP=33;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.00835922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.9153;QD=5.18958;RBI=0.0198661;REFB=-0.00534738;REVB=0.0180218;RO=26;SAF=5;SAR=2;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.262867;STB=0.675158;STBP=0.34;TYPE=snp;VARB=0.0394462;OID=.;OPOS=133013489;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:42:33:33:26:26:7:7:0.212121:2:5:13:13:2:5:13:13
chr2	133013492	.	C	T	52.1	PASS	AF=0.242424;AO=8;DP=33;FAO=8;FDP=33;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=0.0714264;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.449;QD=6.31493;RBI=0.0719119;REFB=0.00319363;REVB=-0.0083418;RO=25;SAF=6;SAR=2;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.330551;STB=0.71373;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=-0.0125996;OID=.;OPOS=133013492;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:33:33:25:25:8:8:0.242424:2:6:12:13:2:6:12:13
chr2	133013513	.	A	C	77.29	PASS	AF=0.434783;AO=10;DP=23;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.0570164;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.359;QD=13.4414;RBI=0.0572739;REFB=-0.0187223;REVB=-0.00542502;RO=13;SAF=4;SAR=6;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133539;STB=0.578788;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.0412604;OID=.;OPOS=133013513;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:23:23:13:13:10:10:0.434783:6:4:7:6:6:4:7:6
chr2	133013567	.	T	C	76.87	PASS	AF=0.529412;AO=9;DP=17;FAO=9;FDP=17;FR=.,HEALED;FRO=7;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.0406863;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.409;QD=18.0873;RBI=0.0484141;REFB=0.0224494;REVB=-0.0262403;RO=6;SAF=3;SAR=6;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.235001;STB=0.666296;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=-0.00616469;OID=.;OPOS=133013567;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:49:17:17:6:7:9:9:0.529412:6:3:4:2:6:3:5:2
chr2	133013590	.	A	G	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0516021;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.043;QD=51.1846;RBI=0.0527449;REFB=0;REVB=0.0109201;RO=0;SAF=11;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000374806;OID=.;OPOS=133013590;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:9:11:0:0:9:11:0:0
chr2	133013631	.	G	A	45.66	PASS	AF=0.333333;AO=7;DP=21;FAO=7;FDP=21;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.0435805;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.547;QD=8.69794;RBI=0.0574436;REFB=0.0244074;REVB=-0.0374233;RO=14;SAF=3;SAR=4;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.65795e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0654891;OID=.;OPOS=133013631;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:21:21:14:14:7:7:0.333333:4:3:6:8:4:3:6:8
chr2	133013644	.	G	A	44.29	PASS	AF=0.269231;AO=7;DP=26;FAO=7;FDP=26;FR=.;FRO=19;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.00347726;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.187;QD=6.81336;RBI=0.0246417;REFB=-0.00685794;REVB=-0.0243951;RO=19;SAF=3;SAR=4;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.008787;STB=0.505602;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0120973;OID=.;OPOS=133013644;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:26:26:19:19:7:7:0.269231:4:3:8:11:4:3:8:11
chr2	133013680	.	G	A	314.14	PASS	AF=0.658537;AO=27;DP=41;FAO=27;FDP=41;FR=.;FRO=14;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.0237361;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.49;QD=30.648;RBI=0.047023;REFB=0.0118226;REVB=-0.0405926;RO=14;SAF=13;SAR=14;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0329958;STB=0.518103;STBP=0.818;TYPE=snp;VARB=-0.00627949;OID=.;OPOS=133013680;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:14:14:27:27:0.658537:14:13:6:8:14:13:6:8
chr2	133013687	.	T	C	69.67	PASS	AF=0.232558;AO=10;DP=43;FAO=10;FDP=43;FR=.;FRO=33;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=0.00619164;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=208.406;QD=6.4809;RBI=0.00705647;REFB=-0.00254418;REVB=-0.00338487;RO=33;SAF=5;SAR=5;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0547878;STB=0.534814;STBP=0.815;TYPE=snp;VARB=0.0123281;OID=.;OPOS=133013687;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:69:43:43:33:33:10:10:0.232558:5:5:15:18:5:5:15:18
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chr2	133013704	.	G	A	177.51	PASS	AF=0.387755;AO=19;DP=49;FAO=19;FDP=49;FR=.;FRO=30;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=-0.00491732;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.029;QD=14.4906;RBI=0.0235895;REFB=-0.0211669;REVB=-0.0230713;RO=29;SAF=10;SAR=9;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0813853;STB=0.556686;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.0256998;OID=.;OPOS=133013704;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:29:30:19:19:0.387755:9:10:13:16:9:10:13:17
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chr2	133014612	.	A	C	252.64	PASS	AF=0.6875;AO=24;DP=34;FAO=22;FDP=32;FR=.;FRO=10;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.0128851;FXX=0.0588062;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.161;QD=31.5795;RBI=0.0128906;REFB=-0.0266123;REVB=0.000375245;RO=10;SAF=14;SAR=10;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0992169;STB=0.56029;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.019186;OID=.;OPOS=133014612;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:34:32:10:10:24:22:0.6875:10:14:4:6:9:13:4:6
chr2	133014651	.	A	AC	177.52	PASS	AF=0.648649;AO=22;DP=37;FAO=24;FDP=37;FR=.;FRO=13;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=-0.00617848;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=20.8896;QD=19.191;RBI=0.00763536;REFB=-0.0241437;REVB=0.0044861;RO=15;SAF=16;SAR=6;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.304554;STB=0.649035;STBP=0.013;TYPE=ins;VARB=0.0119446;OID=.;OPOS=133014652;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.648649:22:37:24:37:13:17:7:4:9:66:15:16:6:5:10
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chr2	133036257	.	TG	CA	90.1	PASS	AF=0.255319;AO=12;DP=47;FAO=12;FDP=47;FR=.;FRO=35;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=23;FSRR=12;FWDB=-0.00687455;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=308.726;QD=7.66788;RBI=0.00692856;REFB=-0.00294605;REVB=-0.000863383;RO=35;SAF=7;SAR=5;SRF=23;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.093196;STB=0.557528;STBP=0.699;TYPE=mnp;VARB=0.00992366;OID=.;OPOS=133036257;OREF=TG;OALT=CA;OMAPALT=CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:90:47:47:35:35:12:12:0.255319:5:7:23:12:5:7:23:12
chr2	133036263	.	A	G	89.46	PASS	AF=0.244898;AO=12;DP=49;FAO=12;FDP=49;FR=.;FRO=37;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=25;FSRR=12;FWDB=0.0235543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.57;QD=7.30256;RBI=0.0241443;REFB=-0.00164753;REVB=0.00530483;RO=37;SAF=7;SAR=5;SRF=25;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118446;STB=0.57336;STBP=0.584;TYPE=snp;VARB=0.00337635;OID=.;OPOS=133036263;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:49:49:37:37:12:12:0.244898:5:7:25:12:5:7:25:12
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chr2	133036720	.	T	C	175.25	PASS	AF=0.27907;AO=24;DP=85;FAO=24;FDP=86;FR=.;FRO=62;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=31;FSRR=31;FWDB=0.0176832;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.733;QD=8.15118;RBI=0.021757;REFB=-0.00273368;REVB=-0.0126756;RO=61;SAF=10;SAR=14;SRF=31;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110529;STB=0.560496;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.00353455;OID=.;OPOS=133036720;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:86:61:62:24:24:0.27907:14:10:31:30:14:10:31:31
chr2	133036742	.	T	C	154.33	PASS	AF=0.308824;AO=21;DP=68;FAO=21;FDP=68;FR=.;FRO=47;FSAF=18;FSAR=3;FSRF=19;FSRR=28;FWDB=0.00594528;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.0266;QD=9.07838;RBI=0.00886595;REFB=0.00190693;REVB=0.00657714;RO=47;SAF=18;SAR=3;SRF=19;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.558451;STB=0.833744;STBP=0;TYPE=snp;VARB=-0.00416059;OID=.;OPOS=133036742;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:47:47:21:21:0.308824:3:18:19:28:3:18:19:28
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chr2	133036787	.	C	A	103.24	PASS	AF=0.351351;AO=12;DP=37;FAO=13;FDP=37;FR=.;FRO=24;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=0.0198574;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=306.57;QD=11.1612;RBI=0.0298536;REFB=-0.0123272;REVB=-0.0222917;RO=25;SAF=2;SAR=10;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.478016;STB=0.738748;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.036323;OID=.;OPOS=133036787;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:25:24:12:13:0.351351:10:2:14:11:10:3:14:10
chr2	133036797	.	A	AAGC	63.63	PASS	AF=0.28125;AO=9;DP=35;FAO=9;FDP=32;FR=.;FRO=23;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.00537761;FXX=0.0302939;HRUN=6;LEN=3;MLLD=237.182;QD=7.95372;RBI=0.0127852;REFB=0.00769055;REVB=0.0115993;RO=25;SAF=2;SAR=7;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.368007;STB=0.7308;STBP=0.128;TYPE=ins;VARB=-0.0102858;OID=.;OPOS=133036798;OREF=-;OALT=AGC;OMAPALT=AAGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.28125:9:35:9:32:23:2:7:12:11:63:25:2:7:13:12
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chr2	133036851	.	T	TC	30.61	PASS	AF=0.24;AO=6;DP=25;FAO=6;FDP=25;FR=.;FRO=19;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.0152329;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=28.417;QD=4.89769;RBI=0.0153882;REFB=0.00533005;REVB=0.00218122;RO=17;SAF=1;SAR=5;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.443236;STB=0.820818;STBP=0.09;TYPE=ins;VARB=-0.010848;OID=.;OPOS=133036852;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.24:6:25:6:25:19:1:5:11:8:30:17:1:5:9:8
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chr2	133037140	.	G	A	61.91	PASS	AF=1;AO=6;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.02018;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.794;QD=35.3772;RBI=0.086297;REFB=0;REVB=0.0839043;RO=0;SAF=5;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00059261;OID=.;OPOS=133037140;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:6:7:1:1:5:0:0:1:6:0:0
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chr2	133037226	.	T	C	93.32	PASS	AF=0.578947;AO=11;DP=19;FAO=11;FDP=19;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=0.0425817;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.13;QD=19.646;RBI=0.042741;REFB=0.00125392;REVB=-0.00368628;RO=8;SAF=6;SAR=5;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.395763;STB=0.721883;STBP=0.056;TYPE=snp;VARB=-0.000196574;OID=.;OPOS=133037226;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:19:19:8:8:11:11:0.578947:5:6:0:8:5:6:0:8
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chr2	133037812	.	A	G	429.02	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0406342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.618;QD=57.2022;RBI=0.0644676;REFB=0;REVB=-0.0500493;RO=0;SAF=15;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.99893e-05;OID=.;OPOS=133037812;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:15:15:0:0:15:15:0:0
chr2	133038166	.	T	C	97.31	PASS	AF=0.4;AO=12;DP=30;FAO=12;FDP=30;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.00116876;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.351;QD=12.9748;RBI=0.0475217;REFB=0.00164127;REVB=0.0475073;RO=18;SAF=5;SAR=7;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0857139;STB=0.550477;STBP=0.656;TYPE=snp;VARB=-0.00178731;OID=.;OPOS=133038166;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:30:30:18:18:12:12:0.4:7:5:9:9:7:5:9:9
chr2	133038179	.	AG	CT	124.86	PASS	AF=0.4375;AO=14;DP=34;FAO=14;FDP=32;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.0180876;FXX=0.0588062;HRUN=1;LEN=2;MLLD=151.266;QD=15.6074;RBI=0.01812;REFB=0.0053849;REVB=-0.00108371;RO=18;SAF=6;SAR=8;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0698633;STB=0.540482;STBP=0.649;TYPE=mnp;VARB=-0.00828221;OID=.;OPOS=133038179;OREF=AG;OALT=CT;OMAPALT=CT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:32:18:18:14:14:0.4375:8:6:9:9:8:6:9:9
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chr2	133038228	.	C	T	204.2	PASS	AF=0.384615;AO=25;DP=65;FAO=25;FDP=65;FR=.;FRO=40;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=0.000310296;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.339;QD=12.5664;RBI=0.0384316;REFB=-0.00456962;REVB=-0.0384304;RO=40;SAF=12;SAR=13;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00535969;STB=0.50308;STBP=0.959;TYPE=snp;VARB=0.00791134;OID=.;OPOS=133038228;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:40:40:25:25:0.384615:13:12:19:21:13:12:19:21
chr2	133038234	.	C	T	211.21	PASS	AF=0.371429;AO=26;DP=70;FAO=26;FDP=70;FR=.;FRO=44;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=0.0146443;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.585;QD=12.069;RBI=0.0270837;REFB=-0.0024363;REVB=-0.0227831;RO=44;SAF=11;SAR=15;SRF=22;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0845258;STB=0.548743;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=0.0027896;OID=.;OPOS=133038234;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:44:44:26:26:0.371429:15:11:22:22:15:11:22:22
chr2	133038264	.	G	A	201.79	PASS	AF=0.367647;AO=25;DP=68;FAO=25;FDP=68;FR=.;FRO=43;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=19;FWDB=0.0104836;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.8856;QD=11.8703;RBI=0.0287408;REFB=-0.00449023;REVB=0.0267606;RO=43;SAF=11;SAR=14;SRF=24;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128889;STB=0.574384;STBP=0.376;TYPE=snp;VARB=0.00770296;OID=.;OPOS=133038264;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:43:43:25:25:0.367647:14:11:24:19:14:11:24:19
chr2	133038275	.	C	T	171.78	PASS	AF=0.354839;AO=22;DP=62;FAO=22;FDP=62;FR=.;FRO=40;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=23;FSRR=17;FWDB=0.012216;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=270.516;QD=11.0826;RBI=0.0145394;REFB=-0.000489659;REVB=-0.00788427;RO=40;SAF=9;SAR=13;SRF=23;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.182926;STB=0.606318;STBP=0.215;TYPE=snp;VARB=0.000998319;OID=.;OPOS=133038275;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:40:40:22:22:0.354839:13:9:23:17:13:9:23:17
chr2	133038280	.	A	C	155.92	PASS	AF=0.350877;AO=20;DP=57;FAO=20;FDP=57;FR=.;FRO=37;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=0.0173651;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.484;QD=10.9419;RBI=0.0477048;REFB=-0.02273;REVB=-0.044432;RO=36;SAF=9;SAR=11;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11593;STB=0.575841;STBP=0.402;TYPE=snp;VARB=0.0208913;OID=.;OPOS=133038280;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:36:37:20:20:0.350877:11:9:20:16:11:9:21:16
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chr2	133038366	.	C	T	255.67	PASS	AF=0.657143;AO=23;DP=35;FAO=23;FDP=35;FR=.;FRO=12;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.0134316;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.95;QD=29.2191;RBI=0.0242325;REFB=-0.0170928;REVB=-0.0201694;RO=12;SAF=12;SAR=11;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.013527;STB=0.507456;STBP=0.943;TYPE=snp;VARB=0.0150094;OID=.;OPOS=133038366;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:35:35:12:12:23:23:0.657143:11:12:6:6:11:12:6:6
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chr2	133038383	.	GC	AT	87.46	PASS	AF=0.423077;AO=11;DP=26;FAO=11;FDP=26;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=3;FWDB=-0.0152611;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=298.698;QD=13.4559;RBI=0.0162029;REFB=-0.00768596;REVB=0.00544375;RO=15;SAF=7;SAR=4;SRF=12;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186214;STB=0.607823;STBP=0.412;TYPE=mnp;VARB=0.012096;OID=.;OPOS=133038383;OREF=GC;OALT=AT;OMAPALT=AT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:26:26:15:15:11:11:0.423077:4:7:12:3:4:7:12:3
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chr2	133038998	.	A	G	89.78	PASS	AF=0.25;AO=12;DP=48;FAO=12;FDP=48;FR=.;FRO=36;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=0.0158466;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.4;QD=7.48137;RBI=0.0160369;REFB=-0.00017184;REVB=-0.00246301;RO=36;SAF=1;SAR=11;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.604744;STB=0.886369;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.000299327;OID=.;OPOS=133038998;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:48:48:36:36:12:12:0.25:11:1:19:17:11:1:19:17
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chr2	133039166	.	T	C	106.42	PASS	AF=0.275862;AO=15;DP=57;FAO=16;FDP=58;FR=.;FRO=42;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=30;FSRR=12;FWDB=-0.00686694;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.086;QD=7.33955;RBI=0.0414953;REFB=-0.00147134;REVB=-0.0409231;RO=41;SAF=11;SAR=4;SRF=30;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00248458;STB=0.53329;STBP=0.797;TYPE=snp;VARB=0.00542707;OID=.;OPOS=133039166;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:58:41:42:15:16:0.275862:4:11:30:11:4:12:30:12
chr2	133039171	.	C	G	94.72	PASS	AF=0.245614;AO=14;DP=57;FAO=14;FDP=57;FR=.;FRO=43;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=31;FSRR=12;FWDB=0.000853303;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=209.337;QD=6.64713;RBI=0.0222919;REFB=-0.0143994;REVB=0.0222756;RO=43;SAF=12;SAR=2;SRF=31;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.251808;STB=0.661149;STBP=0.264;TYPE=snp;VARB=0.0272067;OID=.;OPOS=133039171;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:57:57:43:43:14:14:0.245614:2:12:31:12:2:12:31:12
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chr2	133039221	.	C	T	222.83	PASS	AF=0.462963;AO=25;DP=54;FAO=25;FDP=54;FR=.;FRO=29;FSAF=20;FSAR=5;FSRF=20;FSRR=9;FWDB=-0.0210691;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.66;QD=16.5056;RBI=0.0286433;REFB=0.00297817;REVB=-0.0194044;RO=28;SAF=20;SAR=5;SRF=19;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157087;STB=0.583261;STBP=0.324;TYPE=snp;VARB=-0.0136773;OID=.;OPOS=133039221;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:28:29:25:25:0.462963:5:20:19:9:5:20:20:9
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chr2	133174999	.	A	G	1365.88	PASS	AF=0.988764;AO=88;DP=90;FAO=88;FDP=89;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0161982;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.131;QD=61.3876;RBI=0.0241524;REFB=-0.00119149;REVB=-0.0179153;RO=1;SAF=48;SAR=40;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0116996;STB=0.506171;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=-4.94613e-06;OID=.;OPOS=133174999;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:90:89:1:1:88:88:0.988764:40:48:0:1:40:48:0:1
chr2	133281214	.	A	G	769.89	PASS	AF=1;AO=48;DP=49;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0668694;FXX=0.020404;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.298;QD=64.1573;RBI=0.0674534;REFB=0;REVB=-0.00885682;RO=0;SAF=25;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000439741;OID=.;OPOS=133281214;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:48:0:0:48:48:1:23:25:0:0:23:25:0:0
chr2	133539566	.	G	A	2124.44	PASS	AF=0.992701;AO=134;DP=137;FAO=136;FDP=137;FR=.;FRO=1;FSAF=52;FSAR=84;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0186165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.265;QD=62.0275;RBI=0.0221272;REFB=0.0212507;REVB=0.0119598;RO=1;SAF=50;SAR=84;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00941156;STB=0.504761;STBP=0.288;TYPE=snp;VARB=3.93109e-05;OID=.;OPOS=133539566;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:137:137:1:1:134:136:0.992701:84:50:1:0:84:52:1:0
chr2	133541107	.	T	A	357.24	PASS	AF=0.447059;AO=37;DP=84;FAO=38;FDP=85;FR=.;FRO=47;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=36;FWDB=0.0174052;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.547;QD=16.8112;RBI=0.0268276;REFB=-0.0280797;REVB=-0.0204152;RO=44;SAF=22;SAR=15;SRF=11;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.324913;STB=0.696874;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0276524;OID=.;OPOS=133541107;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:85:44:47:37:38:0.447059:15:22:11:33:15:23:11:36
chr2	133541444	.	T	C	2316.21	PASS	AF=1;AO=145;DP=146;FAO=145;FDP=145;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00419702;FXX=0.00684885;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.343;QD=63.8953;RBI=0.0119723;REFB=0;REVB=0.0112125;RO=0;SAF=77;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.02491e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.25948e-06;OID=.;OPOS=133541444;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:146:145:0:0:145:145:1:68:77:0:0:68:77:0:0
chr2	133541454	.	A	G	2130.28	PASS	AF=0.992806;AO=136;DP=139;FAO=138;FDP=139;FR=.;FRO=1;FSAF=79;FSAR=59;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00965139;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=205.104;QD=61.3029;RBI=0.0303091;REFB=0.0613427;REVB=0.0287314;RO=2;SAF=78;SAR=58;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00206979;STB=0.503144;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.000191854;OID=.;OPOS=133541454;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:139:139:2:1:136:138:0.992806:58:78:1:1:59:79:1:0
chr2	133541575	.	C	T	280.51	PASS	AF=0.508475;AO=30;DP=59;FAO=30;FDP=59;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=0.0228276;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.259;QD=19.0175;RBI=0.0254347;REFB=-0.0214524;REVB=0.0112171;RO=26;SAF=12;SAR=18;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0852822;STB=0.524459;STBP=0.73;TYPE=snp;VARB=0.0202847;OID=.;OPOS=133541575;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:26:29:30:30:0.508475:18:12:13:13:18:12:13:16
chr2	133542014	.	T	C	859.63	PASS	AF=1;AO=42;DP=63;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0230553;FXX=0.0476115;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.1203;QD=57.3087;RBI=0.0838499;REFB=0;REVB=0.080618;RO=0;SAF=24;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000614772;OID=.;OPOS=133542014;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:60:0:0:42:60:1:18:24:0:0:34:26:0:0
chr2	133542545	.	G	A	103.51	PASS	AF=0.545455;AO=12;DP=22;FAO=12;FDP=22;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=-0.00450666;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.124;QD=18.8206;RBI=0.0098646;REFB=-0.00394461;REVB=-0.00877499;RO=10;SAF=7;SAR=5;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.221878;STB=0.626659;STBP=0.194;TYPE=snp;VARB=0.00410522;OID=.;OPOS=133542545;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:22:22:10:10:12:12:0.545455:5:7:3:7:5:7:3:7
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chr2	133554288	.	A	G	695.78	PASS	AF=0.978261;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0738873;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.5834;QD=60.5027;RBI=0.0740078;REFB=-0.111849;REVB=-0.00422276;RO=0;SAF=24;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5102;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.0130259;OID=.;OPOS=133554288;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:46:46:0:1:45:45:0.978261:21:24:0:0:21:24:1:0
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chr2	134884700	.	G	A	265.41	PASS	AF=0.615385;AO=24;DP=39;FAO=24;FDP=39;FR=.;FRO=15;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.0422059;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=213.548;QD=27.2213;RBI=0.0425517;REFB=0.0037272;REVB=-0.00541391;RO=15;SAF=11;SAR=13;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00582899;STB=0.503223;STBP=0.953;TYPE=snp;VARB=-0.00243992;OID=.;OPOS=134884700;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:15:15:24:24:0.615385:13:11:7:8:13:11:7:8
chr2	135710322	.	A	G	741.66	PASS	AF=0.981481;AO=53;DP=55;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.102277;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.0459;QD=54.9379;RBI=0.103489;REFB=-0.108602;REVB=0.0157893;RO=0;SAF=37;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.33586e-08;STB=0.515146;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=0.00400109;OID=.;OPOS=135710322;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:55:54:0:1:53:53:0.981481:16:37:0:0:16:37:0:1
chr2	135711516	.	C	T	120.33	PASS	AF=1;AO=11;DP=12;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0859733;FXX=0.0832639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.6351;QD=43.7564;RBI=0.0871794;REFB=0;REVB=0.0144511;RO=0;SAF=10;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00369196;OID=.;OPOS=135711516;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:11:0:0:11:11:1:1:10:0:0:1:10:0:0
chr2	135711657	.	G	A	601.15	PASS	AF=0.97561;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0116187;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=302.073;QD=58.6486;RBI=0.0152243;REFB=-0.0417004;REVB=0.00983796;RO=0;SAF=22;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.19993e-08;STB=0.513507;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=0.000988452;OID=.;OPOS=135711657;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:40:41:0:1:40:40:0.97561:18:22:0:0:18:22:0:1
chr2	135740863	.	C	A	275.09	PASS	AF=0.555556;AO=25;DP=46;FAO=25;FDP=45;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=19;FSRF=5;FSRR=15;FWDB=-0.0250245;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.101;QD=24.4526;RBI=0.0258662;REFB=-0.0216575;REVB=0.006545;RO=20;SAF=6;SAR=19;SRF=5;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0108647;STB=0.506048;STBP=0.977;TYPE=snp;VARB=0.0221772;OID=.;OPOS=135740863;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:45:20:20:25:25:0.555556:19:6:5:15:19:6:5:15
chr2	135740876	.	A	G	130.6	PASS	AF=0.394737;AO=15;DP=38;FAO=15;FDP=38;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=17;FWDB=0.013877;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.963;QD=13.7478;RBI=0.0162042;REFB=-0.00659839;REVB=-0.00836687;RO=23;SAF=5;SAR=10;SRF=6;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0879261;STB=0.550955;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=0.0145878;OID=.;OPOS=135740876;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:23:23:15:15:0.394737:10:5:6:17:10:5:6:17
chr2	135744416	.	C	G	100.59	PASS	AF=0.48;AO=12;DP=25;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.0348694;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.8637;QD=16.095;RBI=0.0386207;REFB=-0.0150254;REVB=0.0166037;RO=13;SAF=4;SAR=8;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191053;STB=0.610921;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.0129401;OID=.;OPOS=135744416;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:25:13:13:12:12:0.48:8:4:7:6:8:4:7:6
chr2	135745392	.	G	A	139.53	PASS	AF=0.355556;AO=16;DP=45;FAO=16;FDP=45;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=20;FSRR=9;FWDB=-0.00389036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.706;QD=12.4027;RBI=0.00618382;REFB=-0.0106304;REVB=0.00480674;RO=28;SAF=7;SAR=9;SRF=19;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.257493;STB=0.658351;STBP=0.127;TYPE=snp;VARB=0.0176234;OID=.;OPOS=135745392;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:28:29:16:16:0.355556:9:7:19:9:9:7:20:9
chr2	135745545	.	C	T	772.36	PASS	AF=0.98;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0371183;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.1603;QD=61.7891;RBI=0.0371613;REFB=-0.0300022;REVB=-0.00178826;RO=1;SAF=20;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0229468;STB=0.51219;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.000850818;OID=.;OPOS=135745545;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:50:50:1:1:49:49:0.98:29:20:1:0:29:20:1:0
chr2	135745722	.	A	G	167.55	PASS	AF=0.9375;AO=15;DP=16;FAO=15;FDP=16;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00358958;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.821;QD=41.8884;RBI=0.0478417;REFB=0.0722118;REVB=-0.0477069;RO=1;SAF=7;SAR=8;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0536101;STB=0.529373;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=-0.00203743;OID=.;OPOS=135745722;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:16:16:1:1:15:15:0.9375:8:7:0:1:8:7:0:1
chr2	135893372	.	A	G	215.1	PASS	AF=0.525;AO=20;DP=40;FAO=21;FDP=40;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=-0.0696342;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=117.806;QD=21.5098;RBI=0.0754527;REFB=-0.025753;REVB=-0.0290549;RO=19;SAF=7;SAR=13;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0173701;STB=0.518501;STBP=0.818;TYPE=snp;VARB=0.0225299;OID=.;OPOS=135893372;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:19:19:20:21:0.525:13:7:7:12:14:7:7:12
chr2	135893453	.	A	T	65.78	PASS	AF=0.391304;AO=9;DP=23;FAO=9;FDP=23;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=-0.00805323;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=274.918;QD=11.4398;RBI=0.0110123;REFB=-0.00651592;REVB=0.00751109;RO=14;SAF=3;SAR=6;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145537;STB=0.586031;STBP=0.572;TYPE=snp;VARB=0.0107407;OID=.;OPOS=135893453;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:23:23:14:14:9:9:0.391304:6:3:3:11:6:3:3:11
chr2	135911422	.	T	C	1036.64	PASS	AF=0.972603;AO=71;DP=73;FAO=71;FDP=73;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0461865;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=83.7364;QD=56.8021;RBI=0.0506389;REFB=-0.182005;REVB=0.0207631;RO=2;SAF=27;SAR=44;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0210088;STB=0.511108;STBP=0.288;TYPE=snp;VARB=0.00353625;OID=.;OPOS=135911422;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:73:73:2:2:71:71:0.972603:44:27:0:2:44:27:0:2
chr2	136393658	.	A	G	177.32	PASS	AF=0.37931;AO=22;DP=58;FAO=22;FDP=58;FR=.;FRO=36;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=0.0142995;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.253;QD=12.2291;RBI=0.0235267;REFB=-0.00675426;REVB=0.0186824;RO=36;SAF=12;SAR=10;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10817;STB=0.562443;STBP=0.455;TYPE=snp;VARB=0.0156286;OID=.;OPOS=136393658;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:36:36:22:22:0.37931:10:12:16:20:10:12:16:20
chr2	136396300	.	T	C	335.95	PASS	AF=0.514706;AO=35;DP=68;FAO=35;FDP=68;FR=.;FRO=33;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=0.0152617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.157;QD=19.762;RBI=0.0302305;REFB=0.00729841;REVB=0.0260952;RO=33;SAF=20;SAR=15;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0230658;STB=0.512813;STBP=0.879;TYPE=snp;VARB=-0.00612076;OID=.;OPOS=136396300;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:33:33:35:35:0.514706:15:20:18:15:15:20:18:15
chr2	136407479	.	A	G	1105.58	PASS	AF=1;AO=73;DP=74;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.021557;FXX=0.0266631;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.877;QD=60.5797;RBI=0.0224191;REFB=0;REVB=-0.00615708;RO=0;SAF=40;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.93225e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.64708e-06;OID=.;OPOS=136407479;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:73:0:0:73:73:1:33:40:0:0:33:40:0:0
chr2	136482180	.	T	C	315.48	PASS	AF=0.571429;AO=32;DP=56;FAO=32;FDP=56;FR=.;FRO=24;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.0014525;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.561;QD=22.5342;RBI=0.00228712;REFB=-0.00769517;REVB=-0.00176668;RO=24;SAF=14;SAR=18;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0811715;STB=0.544815;STBP=0.48;TYPE=snp;VARB=0.00662821;OID=.;OPOS=136482180;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:24:24:32:32:0.571429:18:14:13:11:18:14:13:11
chr2	136511842	.	C	A	267.5	PASS	AF=0.510204;AO=25;DP=49;FAO=25;FDP=49;FR=.;FRO=24;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=-0.0337543;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.599;QD=21.837;RBI=0.0344162;REFB=-0.0226614;REVB=-0.0067172;RO=24;SAF=15;SAR=10;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125218;STB=0.570191;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=0.0385799;OID=.;OPOS=136511842;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:24:24:25:25:0.510204:10:15:11:13:10:15:11:13
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chr2	139621319	.	A	ATCT	244.53	PASS	AF=0.391892;AO=27;DP=78;FAO=29;FDP=74;FR=.;FRO=45;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=28;FSRR=17;FWDB=-0.00644601;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=206.449;QD=13.2181;RBI=0.00896273;REFB=-0.0180435;REVB=-0.00622732;RO=49;SAF=11;SAR=16;SRF=28;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18192;STB=0.624915;STBP=0.105;TYPE=ins;VARB=0.0183557;OID=.;OPOS=139621320;OREF=-;OALT=TCT;OMAPALT=ATCT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.391892:27:78:29:74:45:12:17:28:17:99:49:11:16:28:21
chr2	139621326	.	G	A	266.55	PASS	AF=0.447761;AO=30;DP=67;FAO=30;FDP=67;FR=.;FRO=37;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=0.0180332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.149;QD=15.9136;RBI=0.0257167;REFB=0.000347365;REVB=-0.0183345;RO=37;SAF=12;SAR=18;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138701;STB=0.578261;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=-0.000420627;OID=.;OPOS=139621326;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:37:37:30:30:0.447761:18:12:20:17:18:12:20:17
chr2	140979107	.	C	T	803.65	PASS	AF=0.519231;AO=81;DP=156;FAO=81;FDP=156;FR=.;FRO=75;FSAF=41;FSAR=40;FSRF=40;FSRR=35;FWDB=0.00451017;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.874;QD=20.6064;RBI=0.0475749;REFB=-0.0161504;REVB=-0.0473606;RO=75;SAF=41;SAR=40;SRF=40;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0238064;STB=0.513061;STBP=0.751;TYPE=snp;VARB=0.0150823;OID=.;OPOS=140979107;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:156:156:75:75:81:81:0.519231:40:41:40:35:40:41:40:35
chr2	141032088	.	C	T	407.78	PASS	AF=0.412281;AO=47;DP=114;FAO=47;FDP=114;FR=.;FRO=67;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=30;FSRR=37;FWDB=0.00258748;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.051;QD=14.3081;RBI=0.00945556;REFB=-0.00552653;REVB=-0.00909464;RO=67;SAF=27;SAR=20;SRF=30;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132087;STB=0.574436;STBP=0.215;TYPE=snp;VARB=0.00891068;OID=.;OPOS=141032088;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:114:114:67:67:47:47:0.412281:20:27:30:37:20:27:30:37
chr2	141260668	.	A	G	383.54	PASS	AF=0.42268;AO=40;DP=96;FAO=41;FDP=97;FR=.;FRO=56;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=22;FSRR=34;FWDB=0.0776814;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.31;QD=15.816;RBI=0.0779173;REFB=0.00873094;REVB=0.00605921;RO=56;SAF=20;SAR=20;SRF=22;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11088;STB=0.554969;STBP=0.367;TYPE=snp;VARB=-0.0144898;OID=.;OPOS=141260668;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:97:56:56:40:41:0.42268:20:20:22:34:21:20:22:34
chr2	141274576	.	T	C	316.82	PASS	AF=0.532258;AO=33;DP=62;FAO=33;FDP=62;FR=.;FRO=29;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.00926646;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=233.316;QD=20.4403;RBI=0.017262;REFB=-0.0131653;REVB=-0.014564;RO=29;SAF=20;SAR=13;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106;STB=0.558846;STBP=0.356;TYPE=snp;VARB=0.012419;OID=.;OPOS=141274576;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:29:29:33:33:0.532258:13:20:14:15:13:20:14:15
chr2	141571329	.	T	C	1149.28	PASS	AF=1;AO=75;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0133754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.905;QD=60.4882;RBI=0.0187313;REFB=0;REVB=0.0131133;RO=0;SAF=43;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.98139e-05;OID=.;OPOS=141571329;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:75:76:1:32:43:0:0:32:44:0:0
chr2	141709419	.	T	G	1061.39	PASS	AF=0.883721;AO=76;DP=86;FAO=76;FDP=86;FR=.;FRO=10;FSAF=51;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=10;FWDB=0.0551267;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.0476;QD=49.367;RBI=0.0585472;REFB=-0.203376;REVB=0.0197188;RO=9;SAF=51;SAR=25;SRF=0;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143453;STB=0.583311;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0246377;OID=.;OPOS=141709419;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:86:86:9:10:76:76:0.883721:25:51:0:9:25:51:0:10
chr2	141750164	.	A	T	410.8	PASS	AF=0.44898;AO=42;DP=97;FAO=44;FDP=98;FR=.;FRO=54;FSAF=14;FSAR=30;FSRF=33;FSRR=21;FWDB=-0.0103885;FXX=0.0101;HRUN=3;LEN=1;MLLD=170.267;QD=16.7671;RBI=0.0186628;REFB=-0.00950407;REVB=-0.0155041;RO=54;SAF=14;SAR=28;SRF=33;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.279965;STB=0.663766;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0149397;OID=.;OPOS=141750164;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:98:54:54:42:44:0.44898:28:14:33:21:30:14:33:21
chr2	141751592	.	G	A	351.18	PASS	AF=0.583333;AO=35;DP=60;FAO=35;FDP=60;FR=.;FRO=25;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=-0.0308829;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.029;QD=23.412;RBI=0.0324425;REFB=-0.000198447;REVB=-0.00993797;RO=25;SAF=21;SAR=14;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.46378e-05;OID=.;OPOS=141751592;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:25:25:35:35:0.583333:14:21:15:10:14:21:15:10
chr2	141816621	.	A	G	670.27	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0308166;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.348;QD=62.3505;RBI=0.0524891;REFB=0;REVB=0.0424905;RO=0;SAF=22;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000183984;OID=.;OPOS=141816621;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:21:22:0:0:21:22:0:0
chr2	142888376	.	G	C	31.6	PASS	AF=0.555556;AO=5;DP=9;FAO=5;FDP=9;FR=.;FRO=4;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=-0.00945061;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=161.88;QD=14.0438;RBI=0.00997407;REFB=-0.032875;REVB=-0.00318873;RO=4;SAF=1;SAR=4;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.28673;STB=0.666163;STBP=0.725;TYPE=snp;VARB=0.026754;OID=.;OPOS=142888376;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:9:9:4:4:5:5:0.555556:4:1:0:4:4:1:0:4
chr2	143849094	.	G	A	278.8	PASS	AF=0.455882;AO=31;DP=68;FAO=31;FDP=68;FR=.;FRO=37;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=22;FSRR=15;FWDB=-0.0110239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.7827;QD=16.3997;RBI=0.011174;REFB=-0.0181251;REVB=0.00182547;RO=37;SAF=13;SAR=18;SRF=22;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168717;STB=0.59484;STBP=0.185;TYPE=snp;VARB=0.0241694;OID=.;OPOS=143849094;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:37:37:31:31:0.455882:18:13:22:15:18:13:22:15
chr2	144899559	.	C	A	288.82	PASS	AF=0.450704;AO=32;DP=71;FAO=32;FDP=71;FR=.;FRO=39;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=26;FWDB=0.0153329;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.6488;QD=16.2716;RBI=0.0180577;REFB=0.021892;REVB=0.0095386;RO=39;SAF=14;SAR=18;SRF=13;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105096;STB=0.558948;STBP=0.426;TYPE=snp;VARB=-0.0272344;OID=.;OPOS=144899559;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:39:39:32:32:0.450704:18:14:13:26:18:14:13:26
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chr2	151219274	.	G	A	300.3	PASS	AF=0.492308;AO=32;DP=66;FAO=32;FDP=65;FR=.;FRO=33;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=-0.00192409;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.1876;QD=18.4799;RBI=0.00292572;REFB=-0.00137847;REVB=0.00220402;RO=33;SAF=15;SAR=17;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0696401;STB=0.538881;STBP=0.565;TYPE=snp;VARB=0.00168666;OID=.;OPOS=151219274;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:65:33:33:32:32:0.492308:17:15:18:15:17:15:18:15
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chr2	152118271	.	G	A	644.2	PASS	AF=0.455172;AO=66;DP=146;FAO=66;FDP=145;FR=.;FRO=79;FSAF=29;FSAR=37;FSRF=28;FSRR=51;FWDB=-0.00178067;FXX=0.00684885;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.883;QD=17.771;RBI=0.00659339;REFB=-0.0158874;REVB=-0.00634838;RO=79;SAF=29;SAR=37;SRF=28;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0856292;STB=0.547508;STBP=0.353;TYPE=snp;VARB=0.0119772;OID=.;OPOS=152118271;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:146:145:79:79:66:66:0.455172:37:29:28:51:37:29:28:51
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chr2	152138522	.	T	C	376.6	PASS	AF=0.673913;AO=31;DP=46;FAO=31;FDP=46;FR=.;FRO=15;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=0.00324129;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.835;QD=32.7482;RBI=0.00328314;REFB=-0.0224231;REVB=0.000522567;RO=15;SAF=17;SAR=14;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0311993;STB=0.517034;STBP=0.745;TYPE=snp;VARB=0.0100983;OID=.;OPOS=152138522;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:15:15:31:31:0.673913:14:17:9:6:14:17:9:6
chr2	152139416	.	G	A	1632.74	PASS	AF=0.495441;AO=162;DP=328;FAO=163;FDP=329;FR=.;FRO=166;FSAF=96;FSAR=67;FSRF=85;FSRR=81;FWDB=0.011257;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.699;QD=19.851;RBI=0.0161918;REFB=-0.0160135;REVB=0.0116386;RO=164;SAF=95;SAR=67;SRF=84;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0692348;STB=0.539505;STBP=0.148;TYPE=snp;VARB=0.0139637;OID=.;OPOS=152139416;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:328:329:164:166:162:163:0.495441:67:95:84:80:67:96:85:81
chr2	152423951	.	C	T	226.28	PASS	AF=0.471698;AO=25;DP=53;FAO=25;FDP=53;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=0.0144906;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.9534;QD=17.0774;RBI=0.021179;REFB=-0.00591948;REVB=-0.0154458;RO=28;SAF=11;SAR=14;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188264;STB=0.605887;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=0.00473079;OID=.;OPOS=152423951;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:28:28:25:25:0.471698:14:11:18:10:14:11:18:10
chr2	152490458	.	A	G	2254.95	PASS	AF=1;AO=141;DP=141;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0028871;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.841;QD=63.5198;RBI=0.0240578;REFB=0;REVB=0.023884;RO=0;SAF=63;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.28678e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.95888e-05;OID=.;OPOS=152490458;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:141:142:0:0:141:142:1:78:63:0:0:79:63:0:0
chr2	152496526	.	A	G	412.71	PASS	AF=0.546667;AO=40;DP=74;FAO=41;FDP=75;FR=.;FRO=34;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=0.0297881;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.1497;QD=22.0113;RBI=0.0309303;REFB=-0.00763683;REVB=-0.00832768;RO=34;SAF=24;SAR=16;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0353928;STB=0.512336;STBP=0.853;TYPE=snp;VARB=0.00888063;OID=.;OPOS=152496526;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:75:34:34:40:41:0.546667:16:24:19:15:17:24:19:15
chr2	152500449	.	C	G	480.2	PASS	AF=0.338983;AO=59;DP=177;FAO=60;FDP=177;FR=.;FRO=117;FSAF=25;FSAR=35;FSRF=57;FSRR=60;FWDB=0.0216993;FXX=0.00561766;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.4685;QD=10.8519;RBI=0.0266756;REFB=0.000122675;REVB=-0.0155154;RO=116;SAF=25;SAR=34;SRF=56;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0688555;STB=0.547172;STBP=0.371;TYPE=snp;VARB=-7.95119e-05;OID=.;OPOS=152500449;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:177:177:116:117:59:60:0.338983:34:25:56:60:35:25:57:60
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chr2	152527608	.	C	T	613.68	PASS	AF=0.473684;AO=63;DP=132;FAO=63;FDP=133;FR=.;FRO=70;FSAF=22;FSAR=41;FSRF=36;FSRR=34;FWDB=-0.00457666;FXX=0.00746213;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.924;QD=18.4566;RBI=0.0284852;REFB=-0.0185756;REVB=-0.0281151;RO=66;SAF=22;SAR=41;SRF=35;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173265;STB=0.590338;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.0145305;OID=.;OPOS=152527608;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:132:133:66:70:63:63:0.473684:41:22:35:31:41:22:36:34
chr2	152531077	.	A	G	1358.62	PASS	AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000188291;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=333.881;QD=62.4655;RBI=0.00949333;REFB=0;REVB=0.00949146;RO=0;SAF=43;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.90007e-06;OID=.;OPOS=152531077;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:44:43:0:0:44:43:0:0
chr2	152536498	.	T	A	616.44	PASS	AF=0.428571;AO=67;DP=159;FAO=69;FDP=161;FR=.;FRO=92;FSAF=37;FSAR=32;FSRF=48;FSRR=44;FWDB=-0.0170513;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.5372;QD=15.3152;RBI=0.055923;REFB=0.000621195;REVB=0.05326;RO=92;SAF=37;SAR=30;SRF=48;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0317328;STB=0.508313;STBP=0.86;TYPE=snp;VARB=-0.000558576;OID=.;OPOS=152536498;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:159:161:92:92:67:69:0.428571:30:37:48:44:32:37:48:44
chr2	152544903	.	T	C	576.5	PASS	AF=0.537037;AO=58;DP=108;FAO=58;FDP=108;FR=.;FRO=50;FSAF=29;FSAR=29;FSRF=26;FSRR=24;FWDB=-0.00752566;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.222;QD=21.3519;RBI=0.00788331;REFB=-0.0166694;REVB=0.00234754;RO=47;SAF=29;SAR=29;SRF=26;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.043445;STB=0.509256;STBP=0.846;TYPE=snp;VARB=0.0160144;OID=.;OPOS=152544903;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:108:47:50:58:58:0.537037:29:29:26:21:29:29:26:24
chr2	152573981	.	A	G	1877.84	PASS	AF=1;AO=122;DP=122;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00635868;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.69;QD=61.5684;RBI=0.00674278;REFB=0;REVB=0.00224327;RO=0;SAF=76;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.0929e-06;OID=.;OPOS=152573981;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:122:122:0:0:122:122:1:46:76:0:0:46:76:0:0
chr2	152988610	.	C	CT	220.03	PASS	AF=0.555556;AO=29;DP=56;FAO=30;FDP=54;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=-0.0711312;FXX=0.0357079;HRUN=1;LEN=1;MLLD=22.6708;QD=16.2988;RBI=0.090439;REFB=-0.0289849;REVB=-0.0558531;RO=26;SAF=11;SAR=18;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.232135;STB=0.633244;STBP=0.035;TYPE=ins;VARB=0.0215673;OID=.;OPOS=152988611;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.555556:29:56:30:54:24:11:19:16:8:99:26:11:18:17:9
chr2	153378459	.	T	C	902.57	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.030614;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.754;QD=58.2302;RBI=0.030695;REFB=0;REVB=-0.00222853;RO=0;SAF=25;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.82203e-05;OID=.;OPOS=153378459;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:37:25:0:0:37:25:0:0
chr2	153399253	.	GA	AG,G	944.56	PASS	AF=0.0875,0.9125;AO=7,40;DP=77;FAO=7,73;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=0,24;FSAR=7,49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0600849,0.888337;FXX=0.0123442;HRUN=2,2;LEN=2,1;MLLD=147.441,17.6276;QD=47.2279;RBI=0.0815198,0.898997;REFB=0.0619683,-0.0122485;REVB=-0.0550934,0.138034;RO=29;SAF=0,0;SAR=7,40;SRF=24;SRR=5;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.812497,-0.886108;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,del;VARB=0.0728685,0.0606424;OID=.,.;OPOS=153399253,153399254;OREF=GA,A;OALT=AG,-;OMAPALT=AG,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:27:77:80:29:0:7,40:7,73:0.0875,0.9125:7,40:0,0:24:5:7,49:0,24:0:0
chr2	153476066	.	G	GCCA	145.07	PASS	AF=1;AO=6;DP=24;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=5;LEN=3;MLLD=250.017;QD=41.4478;RBI=0.041749;REFB=0;REVB=0.041749;RO=18;SAF=0;SAR=6;SRF=3;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.648382;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000340737;OID=.;OPOS=153476067;OREF=-;OALT=CCA;OMAPALT=GCCA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:6:24:14:14:0:0:14:0:0:4:18:0:6:3:15
chr2	153476069	.	C	A	93.32	PASS	AF=0.578947;AO=11;DP=19;FAO=11;FDP=19;FR=.;FRO=8;FSAF=0;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=0;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=153.952;QD=19.6465;RBI=0.0325203;REFB=-0.0126124;REVB=0.0325203;RO=8;SAF=0;SAR=11;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0104648;OID=.;OPOS=153476069;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:19:19:8:8:11:11:0.578947:11:0:0:8:11:0:0:8
chr2	153476072	.	T	C	48.0	PASS	AF=0.5;AO=7;DP=15;FAO=7;FDP=14;FR=.;FRO=7;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0;FXX=0.0666222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.086;QD=13.7146;RBI=0.0507135;REFB=-0.0423893;REVB=0.0507135;RO=8;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0836784;OID=.;OPOS=153476072;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:15:14:8:7:7:7:0.5:7:0:0:8:7:0:0:7
chr2	153511027	.	T	C	1560.26	PASS	AF=0.981481;AO=105;DP=106;FAO=106;FDP=108;FR=.;FRO=2;FSAF=51;FSAR=55;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.015131;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.082;QD=57.7875;RBI=0.0435241;REFB=-0.142525;REVB=0.0408093;RO=1;SAF=50;SAR=55;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0093969;STB=0.509614;STBP=0.17;TYPE=snp;VARB=0.000782447;OID=.;OPOS=153511027;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:106:108:1:2:105:106:0.981481:55:50:1:0:55:51:2:0
chr2	153577013	.	G	A	868.27	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0181019;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.652;QD=57.8848;RBI=0.0293475;REFB=0;REVB=0.0230997;RO=0;SAF=34;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.4461e-05;OID=.;OPOS=153577013;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:26:34:0:0:26:34:0:0
chr2	155265623	.	G	A	85.17	PASS	AF=0.202703;AO=14;DP=74;FAO=15;FDP=74;FR=.;FRO=59;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=31;FSRR=28;FWDB=-0.0476436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.331;QD=4.6039;RBI=0.0521886;REFB=-0.0119877;REVB=-0.0213012;RO=57;SAF=7;SAR=7;SRF=30;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0328166;STB=0.5467;STBP=0.735;TYPE=snp;VARB=0.0431958;OID=.;OPOS=155265623;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:74:74:57:59:14:15:0.202703:7:7:30:27:8:7:31:28
chr2	155307335	.	TG	CT,TC	1894.52	PASS	AF=0.032,0.968;AO=5,118;DP=125;FAO=4,121;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=0,59;FSAR=4,62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00312541,0.00196077;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=172.608,158.494;QD=60.6248;RBI=0.00328623,0.00411743;REFB=0,0;REVB=0.00101546,-0.00362058;RO=0;SAF=1,58;SAR=4,60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0654814,-7.7307e-05;OID=.,.;OPOS=155307335,155307336;OREF=TG,G;OALT=CT,C;OMAPALT=CT,TC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:6:125:125:0:0:5,118:4,121:0.032,0.968:4,60:1,58:0:0:4,62:0,59:0:0
chr2	157189011	.	G	C	557.1	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0375425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.56;QD=60.2274;RBI=0.0388668;REFB=0;REVB=-0.0100594;RO=0;SAF=21;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.7558e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000204953;OID=.;OPOS=157189011;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:16:21:0:0:16:21:0:0
chr2	157257361	.	G	A	1026.24	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00156492;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.5237;QD=59.4922;RBI=0.0657295;REFB=0;REVB=-0.0657109;RO=0;SAF=20;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000158501;OID=.;OPOS=157257361;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:68:69:0:0:68:69:1:48:20:0:0:48:21:0:0
chr2	157406249	.	G	A	412.83	PASS	AF=0.532468;AO=41;DP=77;FAO=41;FDP=77;FR=.;FRO=36;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=14;FSRR=22;FWDB=0.00382625;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.3317;QD=21.4456;RBI=0.00383435;REFB=-0.0134253;REVB=0.000249151;RO=36;SAF=23;SAR=18;SRF=14;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145012;STB=0.580037;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.0151016;OID=.;OPOS=157406249;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:36:36:41:41:0.532468:18:23:14:22:18:23:14:22
chr2	157441664	.	G	C	199.28	PASS	AF=0.302326;AO=26;DP=87;FAO=26;FDP=86;FR=.;FRO=60;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=41;FWDB=-0.0078316;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.5855;QD=9.26903;RBI=0.00881144;REFB=0.00898427;REVB=0.00403826;RO=58;SAF=9;SAR=17;SRF=19;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0242898;STB=0.523029;STBP=0.8;TYPE=snp;VARB=-0.0196042;OID=.;OPOS=157441664;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:86:58:60:26:26:0.302326:17:9:19:39:17:9:19:41
chr2	157442253	.	G	A	193.71	PASS	AF=0.328947;AO=25;DP=76;FAO=25;FDP=76;FR=.;FRO=51;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=29;FSRR=22;FWDB=-0.00493445;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.9362;QD=10.1953;RBI=0.0238474;REFB=-0.0116786;REVB=-0.0233313;RO=50;SAF=11;SAR=14;SRF=28;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136383;STB=0.585706;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=0.0257919;OID=.;OPOS=157442253;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:50:51:25:25:0.328947:14:11:28:22:14:11:29:22
chr2	158155446	.	ACGGAAGACCGGAAGACCGGAAGACCG	ACGGAAGACCGGAAGACCG,ACGGAAGACCGGAAGACCGGAAGACCA	727.02	PASS	AF=0.729167,0.270833;AO=31,11;DP=48;FAO=35,13;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=17,8;FSAR=18,5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0291507,0.0470833;FXX=0.039992;HRUN=2,2;LEN=8,1;MLLD=210.662,268.958;QD=60.5846;RBI=0.0293012,0.0481821;REFB=0,0;REVB=0.00296507,-0.010231;RO=0;SAF=16,6;SAR=15,5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.00590297,-0.00440403;OID=.,.;OPOS=158155447,158155472;OREF=CGGAAGAC,G;OALT=-,A;OMAPALT=ACGGAAGACCGGAAGACCG,ACGGAAGACCGGAAGACCGGAAGACCA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.729167,0.270833:31,11:48:35,13:48:0:17,8:18,5:0:0:99:0:16,6:15,5:0:0
chr2	158155480	.	A	G	73.61	PASS	AF=0.207547;AO=11;DP=53;FAO=11;FDP=53;FR=.;FRO=42;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=-0.0137078;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.917;QD=5.55552;RBI=0.0324124;REFB=-0.00440464;REVB=-0.029371;RO=42;SAF=8;SAR=3;SRF=21;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.289049;STB=0.687818;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=0.0147616;OID=.;OPOS=158155480;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:53:53:42:42:11:11:0.207547:3:8:21:21:3:8:21:21
chr2	158155576	.	G	A	537.75	PASS	AF=1;AO=35;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0121075;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=231.456;QD=59.7494;RBI=0.0124695;REFB=0;REVB=0.00298287;RO=0;SAF=19;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.1382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.71355e-05;OID=.;OPOS=158155576;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:35:36:1:16:19:0:0:17:19:0:0
chr2	158157361	.	C	T	2815.95	PASS	AF=1;AO=180;DP=180;FAO=179;FDP=179;FR=.;FRO=0;FSAF=89;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00177878;FXX=0.0110491;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.269;QD=62.9263;RBI=0.00515847;REFB=0;REVB=0.00484209;RO=0;SAF=89;SAR=91;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.41202e-05;OID=.;OPOS=158157361;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:15:180:179:0:0:180:179:1:91:89:0:0:90:89:0:0
chr2	158291188	.	A	C	347.74	PASS	AF=0.962963;AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=27;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00873704;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=261.18;QD=51.5177;RBI=0.0357733;REFB=-0.109414;REVB=0.03469;RO=1;SAF=9;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0265471;STB=0.514275;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=0.000377594;OID=.;OPOS=158291188;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:27:27:1:1:26:26:0.962963:17:9:0:1:17:9:0:1
chr2	158386938	.	C	T	281.48	PASS	AF=0.415584;AO=32;DP=77;FAO=32;FDP=77;FR=.;FRO=45;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=29;FWDB=0.00235572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.807;QD=14.6222;RBI=0.0379812;REFB=0.000200401;REVB=-0.0379081;RO=45;SAF=14;SAR=18;SRF=16;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0870365;STB=0.549219;STBP=0.473;TYPE=snp;VARB=-0.000324972;OID=.;OPOS=158386938;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:45:45:32:32:0.415584:18:14:16:29:18:14:16:29
chr2	158469405	.	A	G	273.89	PASS	AF=0.483871;AO=30;DP=62;FAO=30;FDP=62;FR=.;FRO=32;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=21;FWDB=0.0485781;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.2916;QD=17.6706;RBI=0.0489592;REFB=0.0172571;REVB=0.00609645;RO=30;SAF=17;SAR=13;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206525;STB=0.613514;STBP=0.103;TYPE=snp;VARB=-0.0265754;OID=.;OPOS=158469405;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:30:32:30:30:0.483871:13:17:10:20:13:17:11:21
chr2	158626980	.	C	T	929.54	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00507593;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=286.695;QD=58.0963;RBI=0.00607368;REFB=0;REVB=-0.00333535;RO=0;SAF=24;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000150409;OID=.;OPOS=158626980;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:64:0:0:61:64:1:37:24:0:0:40:24:0:0
chr2	158636910	.	G	A	1523.09	PASS	AF=0.990385;AO=103;DP=104;FAO=103;FDP=104;FR=.;FRO=1;FSAF=57;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00988703;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=222.713;QD=58.5805;RBI=0.0266957;REFB=-0.0831047;REVB=0.0247974;RO=1;SAF=57;SAR=46;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00825224;STB=0.504347;STBP=0.467;TYPE=snp;VARB=1.92988e-05;OID=.;OPOS=158636910;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:104:104:1:1:103:103:0.990385:46:57:1:0:46:57:1:0
chr2	159166069	.	T	C	727.25	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0240073;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.8744;QD=63.2388;RBI=0.0415836;REFB=0;REVB=0.0339536;RO=0;SAF=19;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000151037;OID=.;OPOS=159166069;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:27:19:0:0:27:19:0:0
chr2	159434727	.	T	G	593.33	PASS	AF=0.421384;AO=67;DP=159;FAO=67;FDP=159;FR=.;FRO=92;FSAF=29;FSAR=38;FSRF=46;FSRR=46;FWDB=0.0191179;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.301;QD=14.9264;RBI=0.0250715;REFB=-0.00563111;REVB=0.0162199;RO=92;SAF=29;SAR=38;SRF=46;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0698913;STB=0.539148;STBP=0.421;TYPE=snp;VARB=0.0081746;OID=.;OPOS=159434727;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:159:159:92:92:67:67:0.421384:38:29:46:46:38:29:46:46
chr2	159440713	.	T	G	1257.04	PASS	AF=0.479554;AO=128;DP=272;FAO=129;FDP=269;FR=.;FRO=140;FSAF=74;FSAR=55;FSRF=73;FSRR=67;FWDB=0.0281319;FXX=0.0146515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.508;QD=18.6921;RBI=0.0297518;REFB=-0.00370779;REVB=-0.00968315;RO=143;SAF=73;SAR=55;SRF=76;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0376915;STB=0.527548;STBP=0.369;TYPE=snp;VARB=0.00477049;OID=.;OPOS=159440713;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:272:269:143:140:128:129:0.479554:55:73:76:67:55:74:73:67
chr2	159514676	.	TA	T	32.37	PASS	AF=0.291667;AO=19;DP=72;FAO=21;FDP=72;FR=.;FRO=51;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=26;FSRR=25;FWDB=0.0295942;FXX=0.0136968;HRUN=5;LEN=1;MLLD=8.09167;QD=1.79813;RBI=0.251089;REFB=-0.0459607;REVB=-0.249339;RO=42;SAF=7;SAR=12;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.182143;STB=0.666502;STBP=0.076;TYPE=del;VARB=-0.0563418;OID=.;OPOS=159514677;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.291667:19:72:21:72:51:6:15:26:25:32:42:7:12:22:20
chr2	159537868	.	A	G	785.87	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0176072;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.794;QD=64.1528;RBI=0.0276413;REFB=0;REVB=0.021308;RO=0;SAF=27;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.30731e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000123914;OID=.;OPOS=159537868;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:22:27:0:0:22:27:0:0
chr2	159663599	.	T	C,G	773.56	PASS	AF=0.963636,0.0363636;AO=53,2;DP=55;FAO=53,2;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=26,1;FSAR=27,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00663672,0.00239247;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=175.727,126.053;QD=56.2589;RBI=0.0235602,0.02674;REFB=0,0;REVB=-0.0226062,-0.0266328;RO=0;SAF=26,1;SAR=27,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000779427,0.0112822;OID=.,.;OPOS=159663599,159663599;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:7:55:55:0:0:53,2:53,2:0.963636,0.0363636:27,1:26,1:0:0:27,1:26,1:0:0
chr2	160019863	.	A	G	646.1	PASS	AF=0.941176;AO=41;DP=51;FAO=48;FDP=51;FR=.;FRO=3;FSAF=18;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=1.45134e-05;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=85.0662;QD=50.6744;RBI=0.0344892;REFB=-0.008324;REVB=-0.0344892;RO=0;SAF=12;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.502617;STBP=0.957;TYPE=snp;VARB=-1.88828e-05;OID=.;OPOS=160019863;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:51:51:0:3:41:48:0.941176:29:12:0:0:30:18:1:2
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chr2	160035207	.	T	C	753.51	PASS	AF=0.979592;AO=48;DP=49;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0236818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.725;QD=61.5108;RBI=0.0247052;REFB=-0.00201518;REVB=-0.00703683;RO=1;SAF=22;SAR=26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0177516;STB=0.50943;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=3.82074e-05;OID=.;OPOS=160035207;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:49:49:1:1:48:48:0.979592:26:22:0:1:26:22:0:1
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chr2	160086468	.	G	A	266.58	PASS	AF=0.528302;AO=28;DP=53;FAO=28;FDP=53;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.00991786;FXX=0.0185151;HRUN=2;LEN=1;MLLD=223.516;QD=20.119;RBI=0.0142009;REFB=-1.63108e-06;REVB=0.0101638;RO=25;SAF=11;SAR=17;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109706;STB=0.561166;STBP=0.387;TYPE=snp;VARB=7.54143e-05;OID=.;OPOS=160086468;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:25:25:28:28:0.528302:17:11:13:12:17:11:13:12
chr2	160086653	.	CA	TG	528.13	PASS	AF=0.405594;AO=58;DP=143;FAO=58;FDP=143;FR=.;FRO=85;FSAF=36;FSAR=22;FSRF=47;FSRR=38;FWDB=0.00162273;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=160.563;QD=14.773;RBI=0.0165649;REFB=-0.0144429;REVB=-0.0164852;RO=84;SAF=36;SAR=22;SRF=46;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.079681;STB=0.541882;STBP=0.447;TYPE=mnp;VARB=0.0200743;OID=.;OPOS=160086653;OREF=CA;OALT=TG;OMAPALT=TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:143:143:84:85:58:58:0.405594:22:36:46:38:22:36:47:38
chr2	160086692	.	A	G	666.67	PASS	AF=0.445122;AO=71;DP=163;FAO=73;FDP=164;FR=.;FRO=91;FSAF=47;FSAR=26;FSRF=45;FSRR=46;FWDB=0.0214834;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.995;QD=16.2601;RBI=0.0239115;REFB=-7.82121e-05;REVB=0.0104986;RO=89;SAF=47;SAR=24;SRF=44;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174696;STB=0.585849;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.000133529;OID=.;OPOS=160086692;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:163:164:89:91:71:73:0.445122:24:47:44:45:26:47:45:46
chr2	160088607	.	A	G	225.4	PASS	AF=0.478261;AO=22;DP=46;FAO=22;FDP=46;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=0.0138625;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.5243;QD=19.6002;RBI=0.0302846;REFB=-0.0177103;REVB=0.0269256;RO=24;SAF=10;SAR=12;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00352189;STB=0.50199;STBP=0.981;TYPE=snp;VARB=0.0126087;OID=.;OPOS=160088607;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:24:24:22:22:0.478261:12:10:11:13:12:10:11:13
chr2	160105007	.	A	G	123.13	PASS	AF=0.466667;AO=14;DP=30;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.0436091;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.365;QD=16.4167;RBI=0.0525446;REFB=-0.028963;REVB=-0.0293117;RO=16;SAF=6;SAR=8;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0666664;STB=0.538406;STBP=0.682;TYPE=snp;VARB=0.0278292;OID=.;OPOS=160105007;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:16:16:14:14:0.466667:8:6:8:8:8:6:8:8
chr2	160112881	.	G	T	962.76	PASS	AF=1;AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0391095;FXX=0.0298463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.9843;QD=59.2469;RBI=0.0561561;REFB=0;REVB=0.0402984;RO=0;SAF=25;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0019021;OID=.;OPOS=160112881;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:65:0:0:65:65:1:40:25:0:0:40:25:0:0
chr2	160114315	.	G	A	93.38	PASS	AF=0.315789;AO=12;DP=38;FAO=12;FDP=38;FR=.;FRO=26;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=-0.0275064;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.794;QD=9.82998;RBI=0.0278995;REFB=-0.000759048;REVB=0.00466692;RO=26;SAF=4;SAR=8;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108659;STB=0.565925;STBP=0.608;TYPE=snp;VARB=0.00240696;OID=.;OPOS=160114315;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:93:38:38:26:26:12:12:0.315789:8:4:11:15:8:4:11:15
chr2	160114437	.	G	A	920.01	PASS	AF=0.970149;AO=63;DP=63;FAO=65;FDP=67;FR=.;FRO=2;FSAF=31;FSAR=34;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00495349;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.9488;QD=54.926;RBI=0.0123865;REFB=-0.0282493;REVB=0.0113529;RO=0;SAF=30;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.51562;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.00622269;OID=.;OPOS=160114437;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:63:67:0:2:63:65:0.970149:33:30:0:0:34:31:2:0
chr2	160116291	.	T	C	272.89	PASS	AF=0.413333;AO=31;DP=76;FAO=31;FDP=75;FR=.;FRO=44;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=27;FSRR=17;FWDB=-0.00674754;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.8818;QD=14.5542;RBI=0.0318328;REFB=-0.0201915;REVB=0.0311095;RO=43;SAF=18;SAR=13;SRF=26;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0253811;STB=0.519987;STBP=0.8;TYPE=snp;VARB=0.0375288;OID=.;OPOS=160116291;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:75:43:44:31:31:0.413333:13:18:26:17:13:18:27:17
chr2	160132089	.	T	G	431.9	PASS	AF=0.447619;AO=47;DP=105;FAO=47;FDP=105;FR=.,HEALED;FRO=57;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=27;FSRR=30;FWDB=-0.0391898;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=258.514;QD=16.4533;RBI=0.0393455;REFB=-0.0129547;REVB=0.00349655;RO=43;SAF=25;SAR=22;SRF=13;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197345;STB=0.531901;STBP=0.583;TYPE=snp;VARB=0.00854391;OID=.;OPOS=160132089;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:105:43:57:47:47:0.447619:22:25:13:30:22:25:27:30
chr2	160136337	.	G	A	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00445434;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.736;QD=48.7373;RBI=0.0191828;REFB=0;REVB=0.0186584;RO=0;SAF=9;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000266145;OID=.;OPOS=160136337;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:8:9:0:0:8:9:0:0
chr2	160676427	.	C	A	801.32	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0320251;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.977;QD=57.2371;RBI=0.032346;REFB=0;REVB=-0.00454495;RO=0;SAF=30;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.29784e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.58502e-05;OID=.;OPOS=160676427;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:26:30:0:0:26:30:0:0
chr2	160711045	.	G	C	1540.6	PASS	AF=1;AO=103;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0265032;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.376;QD=59.8291;RBI=0.0348349;REFB=0;REVB=0.0226064;RO=0;SAF=55;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.9167e-05;OID=.;OPOS=160711045;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:103:103:0:0:103:103:1:48:55:0:0:48:55:0:0
chr2	160737621	.	C	T	1324.76	PASS	AF=0.988506;AO=86;DP=87;FAO=86;FDP=87;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0068457;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.91;QD=60.9085;RBI=0.00943562;REFB=0.00852356;REVB=0.00649364;RO=1;SAF=48;SAR=38;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00976886;STB=0.505153;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=-1.36764e-05;OID=.;OPOS=160737621;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:87:87:1:1:86:86:0.988506:38:48:1:0:38:48:1:0
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chr2	160833188	.	A	G	2506.41	PASS	AF=1;AO=159;DP=161;FAO=163;FDP=163;FR=.;FRO=0;FSAF=90;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0138676;FXX=0.0239507;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.418;QD=61.5071;RBI=0.0263532;REFB=0;REVB=0.0224094;RO=0;SAF=87;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000232048;OID=.;OPOS=160833188;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:161:163:0:0:159:163:1:72:87:0:0:73:90:0:0
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chr2	161029218	.	G	A	203.23	PASS	AF=0.540541;AO=20;DP=37;FAO=20;FDP=37;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.0184705;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.579;QD=21.9706;RBI=0.0185065;REFB=-0.0061954;REVB=0.0011544;RO=17;SAF=4;SAR=16;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.324028;STB=0.684006;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.00340716;OID=.;OPOS=161029218;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:17:17:20:20:0.540541:16:4:9:8:16:4:9:8
chr2	161174693	.	C	T	136.7	PASS	AF=0.32;AO=16;DP=50;FAO=16;FDP=50;FR=.;FRO=34;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=0.0380245;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.275;QD=10.9362;RBI=0.0380856;REFB=-0.00268521;REVB=-0.00215701;RO=34;SAF=8;SAR=8;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100915;STB=0.559926;STBP=0.564;TYPE=snp;VARB=0.00430932;OID=.;OPOS=161174693;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:34:34:16:16:0.32:8:8:20:14:8:8:20:14
chr2	161253376	.	A	G	214.43	PASS	AF=0.40625;AO=25;DP=63;FAO=26;FDP=64;FR=.;FRO=38;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=16;FWDB=-0.00480261;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.562;QD=13.4018;RBI=0.00633729;REFB=-0.00375831;REVB=-0.00413476;RO=37;SAF=16;SAR=9;SRF=22;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0504486;STB=0.522596;STBP=0.791;TYPE=snp;VARB=0.00730339;OID=.;OPOS=161253376;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:64:37:38:25:26:0.40625:9:16:22:15:10:16:22:16
chr2	162092241	.	ACAAAAAAAAT	AAAAAAAAAAT,ACAAAAAAAAA,ACAAAAAAAAAAT,ACAAAAAAAAAT,CAAAAAAAAAT	336.8	PASS	AF=0.0306122,0,0,0.928571,0;AO=8,8,15,33,5;DP=99;FAO=3,0,0,91,0;FDP=98;FR=.;FRO=4;FSAF=2,0,0,54,0;FSAR=1,0,0,37,0;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.00701042,-0.0864218,0.0384799,0.0837062,0.0548852;FXX=0.0101;HRUN=1,2,8,8,5;LEN=1,1,2,1,2;MLLD=162.182,15.2106,7.86134,5.64918,12.2487;QD=13.7471;RBI=0.0377914,0.109454,0.12242,0.233219,0.141978;REFB=-0.00774399,-0.0601367,0.00184336,0.00291236,0.00390813;REVB=-0.0371355,-0.0671677,-0.116215,-0.217679,-0.13094;RO=15;SAF=6,8,4,12,3;SAR=2,0,11,21,2;SRF=14;SRR=1;SSEN=0,0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0,0;SSSB=-0.326161,0.697711,-0.541794,-0.320099,-0.485429;STB=0.748908,0.5,0.5,0.517853,0.5;STBP=0.766,1,1,0.12,1;TYPE=snp,snp,ins,ins,mnp;VARB=0.0470256,0.102354,-0.0289082,-0.0223623,0;OID=.,.,.,.,.;OPOS=162092242,162092251,162092243,162092243,162092241;OREF=C,T,-,-,AC;OALT=A,A,AA,A,CA;OMAPALT=AAAAAAAAAAT,ACAAAAAAAAA,ACAAAAAAAAAAT,ACAAAAAAAAAT,CAAAAAAAAAT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/4:6:99:98:15:4:8,8,15,33,5:3,0,0,91,0:0.0306122,0,0,0.928571,0:2,0,11,21,2:6,8,4,12,3:14:1:1,0,0,37,0:2,0,0,54,0:4:0
chr2	162881369	.	G	A	232.29	PASS	AF=0.411765;AO=27;DP=67;FAO=28;FDP=68;FR=.;FRO=40;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=23;FWDB=-0.021677;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.688;QD=13.6641;RBI=0.0222285;REFB=-0.00433554;REVB=-0.00492058;RO=40;SAF=11;SAR=16;SRF=17;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0189526;STB=0.519637;STBP=0.802;TYPE=snp;VARB=0.00457909;OID=.;OPOS=162881369;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:68:40:40:27:28:0.411765:16:11:17:23:17:11:17:23
chr2	164145582	.	C	A	112.38	PASS	AF=0.448276;AO=13;DP=30;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.00207294;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.437;QD=15.5;RBI=0.0181568;REFB=-0.0162305;REVB=-0.0180381;RO=17;SAF=6;SAR=7;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.048982;STB=0.548314;STBP=0.696;TYPE=snp;VARB=0.0184634;OID=.;OPOS=164145582;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:29:17:16:13:13:0.448276:7:6:7:10:7:6:6:10
chr2	164465716	.	G	A	149.09	PASS	AF=0.5;AO=16;DP=32;FAO=16;FDP=32;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.0128864;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.26;QD=18.6359;RBI=0.0161118;REFB=-0.00529729;REVB=0.00967126;RO=16;SAF=6;SAR=10;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00260429;OID=.;OPOS=164465716;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:16:16:16:16:0.5:10:6:6:10:10:6:6:10
chr2	165353712	.	C	T	1043.33	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00589086;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.9088;QD=59.6186;RBI=0.0247127;REFB=0;REVB=-0.0240003;RO=0;SAF=35;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000198023;OID=.;OPOS=165353712;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:70:0:0:69:70:1:34:35:0:0:35:35:0:0
chr2	165476253	.	A	T	787.32	PASS	AF=0.982456;AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0366275;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.0954;QD=55.2506;RBI=0.0559532;REFB=-0.0824119;REVB=0.0422988;RO=1;SAF=26;SAR=30;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0154585;STB=0.508194;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.00238173;OID=.;OPOS=165476253;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:57:57:1:1:56:56:0.982456:30:26:0:1:30:26:0:1
chr2	165586466	.	T	C	304.47	PASS	AF=0.358491;AO=38;DP=106;FAO=38;FDP=106;FR=.;FRO=68;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=39;FSRR=29;FWDB=0.0232316;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=129.731;QD=11.4895;RBI=0.0237458;REFB=-0.00868929;REVB=-0.00491447;RO=62;SAF=19;SAR=19;SRF=35;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0701708;STB=0.547145;STBP=0.479;TYPE=snp;VARB=0.00780176;OID=.;OPOS=165586466;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:106:62:68:38:38:0.358491:19:19:35:27:19:19:39:29
chr2	165996107	.	T	A	1381.09	PASS	AF=0.988889;AO=89;DP=90;FAO=89;FDP=90;FR=.;FRO=1;FSAF=52;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0491122;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.74;QD=61.3816;RBI=0.049472;REFB=-0.0869148;REVB=0.00595585;RO=1;SAF=52;SAR=37;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0126361;STB=0.506665;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=0.000601853;OID=.;OPOS=165996107;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:90:90:1:1:89:89:0.988889:37:52:0:1:37:52:0:1
chr2	166170127	.	T	C	2474.78	PASS	AF=1;AO=161;DP=161;FAO=161;FDP=161;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.017041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.9115;QD=61.4852;RBI=0.04971;REFB=0;REVB=0.0466979;RO=0;SAF=88;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000229154;OID=.;OPOS=166170127;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:161:161:0:0:161:161:1:73:88:0:0:73:88:0:0
chr2	166248047	.	G	A	990.43	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0160724;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.3425;QD=59.1301;RBI=0.0213122;REFB=0;REVB=0.0139961;RO=0;SAF=32;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.62221e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.46829e-05;OID=.;OPOS=166248047;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:35:32:0:0:35:32:0:0
chr2	166535918	.	C	T	403.8	PASS	AF=0.547945;AO=40;DP=73;FAO=40;FDP=73;FR=.;FRO=33;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=-0.00602529;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.732;QD=22.1259;RBI=0.0181309;REFB=-0.00738378;REVB=0.0171004;RO=33;SAF=17;SAR=23;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.049743;STB=0.527436;STBP=0.605;TYPE=snp;VARB=0.00544342;OID=.;OPOS=166535918;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:33:33:40:40:0.547945:23:17:16:17:23:17:16:17
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chr2	166618262	.	C	T	319.83	PASS	AF=0.492754;AO=34;DP=69;FAO=34;FDP=69;FR=.;FRO=35;FSAF=23;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=0.00623972;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.534;QD=18.5409;RBI=0.0206015;REFB=0.00358008;REVB=-0.0196339;RO=35;SAF=23;SAR=11;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.208355;STB=0.616551;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=-0.00472902;OID=.;OPOS=166618262;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:35:35:34:34:0.492754:11:23:16:19:11:23:16:19
chr2	166740341	.	G	C	35.21	PASS	AF=0.222222;AO=6;DP=27;FAO=6;FDP=27;FR=.;FRO=21;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=15;FWDB=-0.0222228;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.194;QD=5.21556;RBI=0.0300458;REFB=0.00998644;REVB=-0.0202212;RO=21;SAF=3;SAR=3;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.257094;STB=0.666173;STBP=0.401;TYPE=snp;VARB=-0.0310903;OID=.;OPOS=166740341;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:27:27:21:21:6:6:0.222222:3:3:6:15:3:3:6:15
chr2	166788336	.	T	C	1494.97	PASS	AF=1;AO=94;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00181264;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.286;QD=63.6159;RBI=0.01712;REFB=0;REVB=0.0170238;RO=0;SAF=49;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.63599e-05;OID=.;OPOS=166788336;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:94:94:0:0:94:94:1:45:49:0:0:45:49:0:0
chr2	166797646	.	C	T	1034.87	PASS	AF=1;AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00260878;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.643;QD=59.1355;RBI=0.0107242;REFB=-0.0316431;REVB=0.010402;RO=0;SAF=31;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.83944e-05;OID=.;OPOS=166797646;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:71:70:0:0:70:70:1:39:31:0:0:39:31:0:0
chr2	166810159	.	C	T	94.58	PASS	AF=0.611111;AO=11;DP=18;FAO=11;FDP=18;FR=.;FRO=7;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=-0.0278915;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=195.629;QD=21.0169;RBI=0.0605444;REFB=-0.04955;REVB=0.0537372;RO=7;SAF=9;SAR=2;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0462643;STB=0.526269;STBP=0.836;TYPE=snp;VARB=0.034488;OID=.;OPOS=166810159;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:18:18:7:7:11:11:0.611111:2:9:6:1:2:9:6:1
chr2	166846730	.	A	G	294.2	PASS	AF=0.484848;AO=32;DP=66;FAO=32;FDP=66;FR=.;FRO=34;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=22;FWDB=0.00436187;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.025;QD=17.8303;RBI=0.0155862;REFB=0.00187016;REVB=0.0149634;RO=32;SAF=17;SAR=15;SRF=12;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139402;STB=0.59111;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=-0.00155254;OID=.;OPOS=166846730;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:32:34:32:32:0.484848:15:17:12:20:15:17:12:22
chr2	166892788	.	C	T	1379.16	PASS	AF=1;AO=85;DP=85;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0890557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.574;QD=62.6889;RBI=0.089057;REFB=0;REVB=-0.000490568;RO=0;SAF=34;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000180307;OID=.;OPOS=166892788;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:88:0:0:85:88:1:51:34:0:0:51:37:0:0
chr2	166897864	.	A	G	1511.22	PASS	AF=0.990385;AO=102;DP=103;FAO=103;FDP=104;FR=.;FRO=1;FSAF=55;FSAR=48;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0211394;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.5669;QD=58.1237;RBI=0.0246384;REFB=-0.0130164;REVB=0.0126561;RO=1;SAF=54;SAR=48;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0087057;STB=0.504504;STBP=0.466;TYPE=snp;VARB=0.0011214;OID=.;OPOS=166897864;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:103:104:1:1:102:103:0.990385:48:54:1:0:48:55:1:0
chr2	166903445	.	T	C	1662.07	PASS	AF=1;AO=110;DP=110;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0273737;FXX=0.0090082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.3295;QD=60.439;RBI=0.0286253;REFB=0;REVB=0.0083716;RO=0;SAF=61;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.57975e-05;OID=.;OPOS=166903445;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:110:110:0:0:110:110:1:49:61:0:0:49:61:0:0
chr2	167099158	.	A	G	1514.75	PASS	AF=1;AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112362;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.688;QD=63.779;RBI=0.0113552;REFB=0;REVB=-0.00163945;RO=0;SAF=43;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.67486e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.51595e-05;OID=.;OPOS=167099158;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:95:0:0:95:95:1:52:43:0:0:52:43:0:0
chr2	167129256	.	C	A	306.96	PASS	AF=0.574074;AO=31;DP=54;FAO=31;FDP=54;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=-0.00635789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.632;QD=22.7375;RBI=0.0204075;REFB=-0.0254146;REVB=0.0193918;RO=22;SAF=12;SAR=19;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.087447;STB=0.558785;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.0203593;OID=.;OPOS=167129256;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:22:23:31:31:0.574074:19:12:11:11:19:12:12:11
chr2	167133540	.	T	G	558.11	PASS	AF=0.491525;AO=58;DP=118;FAO=58;FDP=118;FR=.;FRO=60;FSAF=37;FSAR=21;FSRF=41;FSRR=19;FWDB=-0.0106525;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.7245;QD=18.9188;RBI=0.0519743;REFB=-0.0101548;REVB=0.050871;RO=59;SAF=37;SAR=21;SRF=40;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0400603;STB=0.525328;STBP=0.61;TYPE=snp;VARB=0.0125274;OID=.;OPOS=167133540;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:118:118:59:60:58:58:0.491525:21:37:40:19:21:37:41:19
chr2	167134775	.	T	C	286.94	PASS	AF=0.361702;AO=33;DP=93;FAO=34;FDP=94;FR=.;FRO=60;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=44;FWDB=-0.0186194;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.872;QD=12.2104;RBI=0.0200651;REFB=-0.0112288;REVB=0.00747827;RO=57;SAF=17;SAR=16;SRF=14;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.298552;STB=0.664936;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.0251221;OID=.;OPOS=167134775;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:94:57:60:33:34:0.361702:16:17:14:43:16:18:16:44
chr2	167144974	.	A	T	1166.17	PASS	AF=0.941176;AO=79;DP=84;FAO=80;FDP=85;FR=.;FRO=5;FSAF=39;FSAR=41;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0618862;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.2719;QD=54.8784;RBI=0.0653083;REFB=-0.132755;REVB=-0.0208632;RO=5;SAF=38;SAR=41;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0583177;STB=0.530113;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.00322804;OID=.;OPOS=167144974;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:84:85:5:5:79:80:0.941176:41:38:5:0:41:39:5:0
chr2	167144995	.	T	C	423.12	PASS	AF=0.455446;AO=46;DP=101;FAO=46;FDP=101;FR=.;FRO=55;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=33;FSRR=22;FWDB=0.0172578;FXX=0.00980296;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.793;QD=16.7573;RBI=0.0200202;REFB=-0.0132183;REVB=0.0101477;RO=54;SAF=21;SAR=25;SRF=32;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131064;STB=0.57763;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=0.0116956;OID=.;OPOS=167144995;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:101:54:55:46:46:0.455446:25:21:32:22:25:21:33:22
chr2	167145142	.	A	G	157.73	PASS	AF=0.357143;AO=20;DP=56;FAO=20;FDP=56;FR=.;FRO=36;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=0.00786033;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.768;QD=11.2667;RBI=0.0159759;REFB=-0.014372;REVB=-0.0139085;RO=36;SAF=12;SAR=8;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0503323;STB=0.529382;STBP=0.753;TYPE=snp;VARB=0.0291082;OID=.;OPOS=167145142;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:36:36:20:20:0.357143:8:12:20:16:8:12:20:16
chr2	167163043	.	T	C	836.83	PASS	AF=1;AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0223206;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.6937;QD=57.7126;RBI=0.0332612;REFB=0;REVB=0.0246596;RO=0;SAF=26;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.09576e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000334292;OID=.;OPOS=167163043;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:58:0:0:58:58:1:32:26:0:0:32:26:0:0
chr2	167168093	.	C	T	411.67	PASS	AF=0.393443;AO=49;DP=121;FAO=48;FDP=122;FR=.;FRO=74;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=31;FSRR=43;FWDB=-0.00536933;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.639;QD=13.4973;RBI=0.0104426;REFB=0.00157353;REVB=-0.00895651;RO=72;SAF=25;SAR=24;SRF=30;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0985412;STB=0.561581;STBP=0.261;TYPE=snp;VARB=-0.00180613;OID=.;OPOS=167168093;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:121:122:72:74:49:48:0.393443:24:25:30:42:23:25:31:43
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chr2	167262353	.	C	G	399.57	PASS	AF=0.4375;AO=42;DP=96;FAO=42;FDP=96;FR=.;FRO=54;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=11;FSRR=43;FWDB=-0.00856181;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.9939;QD=16.6487;RBI=0.00872744;REFB=-0.0250714;REVB=0.00169222;RO=54;SAF=20;SAR=22;SRF=11;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.281007;STB=0.655837;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.0163271;OID=.;OPOS=167262353;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:96:54:54:42:42:0.4375:22:20:11:43:22:20:11:43
chr2	167266344	.	G	A	512.47	PASS	AF=0.490909;AO=54;DP=110;FAO=54;FDP=110;FR=.;FRO=56;FSAF=30;FSAR=24;FSRF=39;FSRR=17;FWDB=-0.00754719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.021;QD=18.6353;RBI=0.02141;REFB=-0.0116695;REVB=-0.0200357;RO=56;SAF=30;SAR=24;SRF=39;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133752;STB=0.573778;STBP=0.167;TYPE=snp;VARB=0.0141372;OID=.;OPOS=167266344;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:110:56:56:54:54:0.490909:24:30:39:17:24:30:39:17
chr2	167279922	.	C	A	817.17	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0310457;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.6329;QD=57.3453;RBI=0.0428426;REFB=0;REVB=-0.0295238;RO=0;SAF=18;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00068957;OID=.;OPOS=167279922;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:39:18:0:0:39:18:0:0
chr2	167289224	.	A	T	108.6	PASS	AF=0.40625;AO=13;DP=32;FAO=13;FDP=32;FR=.;FRO=19;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=-0.0110982;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.79;QD=13.5752;RBI=0.0127362;REFB=-0.00340307;REVB=0.00624827;RO=18;SAF=3;SAR=10;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.439832;STB=0.745878;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.0041113;OID=.;OPOS=167289224;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:18:19:13:13:0.40625:10:3:12:6:10:3:12:7
chr2	167334085	.	G	T	1593.28	PASS	AF=1;AO=106;DP=106;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00392708;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.036;QD=60.1237;RBI=0.0121656;REFB=0;REVB=0.0115144;RO=0;SAF=58;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.30409e-06;OID=.;OPOS=167334085;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:106:106:0:0:106:106:1:48:58:0:0:48:58:0:0
chr2	168099789	.	TG	T	47.02	PASS	AF=0.340909;AO=12;DP=44;FAO=15;FDP=44;FR=.;FRO=29;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=9;FWDB=0.0415626;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=13.4189;QD=4.27451;RBI=0.104914;REFB=-0.102713;REVB=-0.0963304;RO=27;SAF=3;SAR=9;SRF=20;SRR=7;SSEN=0.353933;SSEP=0;SSSB=-0.524135;STB=0.767103;STBP=0.026;TYPE=del;VARB=0.146659;OID=.;OPOS=168099790;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.340909:12:44:15:44:29:4:11:20:9:47:27:3:9:20:7
chr2	168726659	.	A	C	393.13	PASS	AF=0.4;AO=46;DP=115;FAO=46;FDP=115;FR=.;FRO=69;FSAF=17;FSAR=29;FSRF=31;FSRR=38;FWDB=-0.0126969;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.682;QD=13.6742;RBI=0.0148979;REFB=0.00404293;REVB=0.00779344;RO=69;SAF=17;SAR=29;SRF=31;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0881881;STB=0.549958;STBP=0.397;TYPE=snp;VARB=-0.00589548;OID=.;OPOS=168726659;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:115:69:69:46:46:0.4:29:17:31:38:29:17:31:38
chr2	168810754	.	A	G	406.51	PASS	AF=0.488095;AO=41;DP=84;FAO=41;FDP=84;FR=.;FRO=43;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=30;FSRR=13;FWDB=0.00938097;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.04;QD=19.3576;RBI=0.023904;REFB=-0.0199802;REVB=0.0219864;RO=42;SAF=17;SAR=24;SRF=29;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.24728;STB=0.641936;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0225821;OID=.;OPOS=168810754;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:42:43:41:41:0.488095:24:17:29:13:24:17:30:13
chr2	169707428	.	C	T	1008.43	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00184283;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.0135;QD=59.3196;RBI=0.0364519;REFB=0;REVB=-0.0364052;RO=0;SAF=29;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000292622;OID=.;OPOS=169707428;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:39:29:0:0:39:29:0:0
chr2	169721377	.	G	A	483.32	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0154551;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.9386;QD=58.5845;RBI=0.0578017;REFB=0;REVB=0.0556972;RO=0;SAF=16;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.60901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00146045;OID=.;OPOS=169721377;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:17:16:0:0:17:16:0:0
chr2	169789016	.	T	C	269.51	PASS	AF=0.508772;AO=29;DP=57;FAO=29;FDP=57;FR=.;FRO=28;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=-0.00146661;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.394;QD=18.913;RBI=0.00434802;REFB=-0.00419627;REVB=0.00409321;RO=28;SAF=13;SAR=16;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169906;STB=0.59466;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.0037723;OID=.;OPOS=169789016;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:28:28:29:29:0.508772:16:13:18:10:16:13:18:10
chr2	169826877	.	C	T	83.48	PASS	AF=0.323529;AO=11;DP=34;FAO=11;FDP=34;FR=.;FRO=23;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.00703365;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.448;QD=9.82159;RBI=0.00860897;REFB=0.0142209;REVB=-0.00496407;RO=23;SAF=2;SAR=9;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.38184;STB=0.735373;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=-0.0182793;OID=.;OPOS=169826877;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:34:34:23:23:11:11:0.323529:9:2:11:12:9:2:11:12
chr2	169830328	.	A	G	484.81	PASS	AF=0.51087;AO=47;DP=92;FAO=47;FDP=92;FR=.;FRO=45;FSAF=17;FSAR=30;FSRF=33;FSRR=12;FWDB=0.0169311;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.0352;QD=21.0787;RBI=0.0308524;REFB=-0.00968679;REVB=-0.0257916;RO=44;SAF=17;SAR=30;SRF=33;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.331836;STB=0.677434;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00860722;OID=.;OPOS=169830328;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:44:45:47:47:0.51087:30:17:33:11:30:17:33:12
chr2	169847412	.	A	G	125.85	PASS	AF=0.518519;AO=14;DP=27;FAO=14;FDP=27;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.0389438;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.175;QD=18.6449;RBI=0.0440306;REFB=-0.0135551;REVB=0.0205445;RO=13;SAF=5;SAR=9;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157376;STB=0.590032;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.0186166;OID=.;OPOS=169847412;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:13:13:14:14:0.518519:9:5:7:6:9:5:7:6
chr2	169870855	.	A	G	310.95	PASS	AF=0.627907;AO=26;DP=42;FAO=27;FDP=43;FR=.;FRO=16;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.0140195;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.996;QD=28.9257;RBI=0.023442;REFB=-0.0135898;REVB=0.0187878;RO=16;SAF=14;SAR=12;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0266401;STB=0.506891;STBP=0.944;TYPE=snp;VARB=0.00798594;OID=.;OPOS=169870855;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:43:16:16:26:27:0.627907:12:14:8:8:13:14:8:8
chr2	169997051	.	G	A	39.05	PASS	AF=0.461538;AO=6;DP=13;FAO=6;FDP=13;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.0675317;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.6206;QD=12.0151;RBI=0.0763381;REFB=-0.0111594;REVB=0.0355945;RO=7;SAF=4;SAR=2;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215036;STB=0.631131;STBP=0.442;TYPE=snp;VARB=0.0229561;OID=.;OPOS=169997051;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:13:13:7:7:6:6:0.461538:2:4:3:4:2:4:3:4
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chr2	170010985	.	T	C	145.0	PASS	AF=0.28169;AO=20;DP=70;FAO=20;FDP=71;FR=.;FRO=51;FSAF=3;FSAR=17;FSRF=31;FSRR=20;FWDB=-0.00913868;FXX=0.0533262;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.832;QD=8.16923;RBI=0.0195373;REFB=-0.000591772;REVB=0.0172682;RO=48;SAF=3;SAR=17;SRF=28;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.540661;STB=0.838548;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.00628478;OID=.;OPOS=170010985;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:71:48:51:20:20:0.28169:17:3:28:20:17:3:31:20
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chr2	170053505	.	C	T	77.29	PASS	AF=0.434783;AO=10;DP=23;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.0797791;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.167;QD=13.4417;RBI=0.0799361;REFB=-0.0186925;REVB=-0.00500735;RO=13;SAF=1;SAR=9;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.424961;STB=0.759911;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=0.0284274;OID=.;OPOS=170053505;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:23:23:13:13:10:10:0.434783:9:1:5:8:9:1:5:8
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chr2	170150671	.	G	A	209.97	PASS	AF=0.588235;AO=20;DP=35;FAO=20;FDP=34;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.0694769;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.859;QD=24.702;RBI=0.0734917;REFB=-0.0351224;REVB=0.0239581;RO=13;SAF=8;SAR=12;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0113643;STB=0.5185;STBP=0.807;TYPE=snp;VARB=0.0190225;OID=.;OPOS=170150671;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:34:13:14:20:20:0.588235:12:8:5:8:12:8:5:9
chr2	170218847	.	C	G	583.31	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0365613;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.8;QD=59.8264;RBI=0.0438122;REFB=0;REVB=0.0241408;RO=0;SAF=22;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.82408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000265279;OID=.;OPOS=170218847;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:39:0:0:37:39:1:15:22:0:0:17:22:0:0
chr2	170403030	.	T	C	430.93	PASS	AF=0.44898;AO=44;DP=97;FAO=44;FDP=98;FR=.;FRO=54;FSAF=30;FSAR=14;FSRF=26;FSRR=28;FWDB=-0.0206978;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.283;QD=17.5888;RBI=0.0274637;REFB=-0.0142111;REVB=0.0180514;RO=52;SAF=30;SAR=14;SRF=24;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.222959;STB=0.616384;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=0.0186445;OID=.;OPOS=170403030;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:98:52:54:44:44:0.44898:14:30:24:28:14:30:26:28
chr2	170411693	.	T	C	336.3	PASS	AF=0.604167;AO=29;DP=48;FAO=29;FDP=48;FR=.;FRO=19;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.00202272;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.535;QD=28.0248;RBI=0.0112902;REFB=0.00534177;REVB=-0.0111075;RO=19;SAF=17;SAR=12;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0439204;STB=0.524212;STBP=0.72;TYPE=snp;VARB=-0.00335902;OID=.;OPOS=170411693;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:19:19:29:29:0.604167:12:17:10:9:12:17:10:9
chr2	170441001	.	G	A	170.33	PASS	AF=0.45;AO=18;DP=40;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=0.000683296;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.42;QD=17.0331;RBI=0.00976589;REFB=-0.0128281;REVB=0.00974196;RO=22;SAF=9;SAR=9;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0874523;STB=0.549945;STBP=0.576;TYPE=snp;VARB=0.0143112;OID=.;OPOS=170441001;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:22:22:18:18:0.45:9:9:9:13:9:9:9:13
chr2	170493103	.	T	A	107.75	PASS	AF=0.258065;AO=16;DP=62;FAO=16;FDP=62;FR=.;FRO=46;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=21;FSRR=25;FWDB=-0.0059631;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.146;QD=6.9517;RBI=0.00690781;REFB=-0.00891219;REVB=0.00348702;RO=44;SAF=8;SAR=8;SRF=21;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0273146;STB=0.532218;STBP=0.754;TYPE=snp;VARB=0.0258324;OID=.;OPOS=170493103;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:44:46:16:16:0.258065:8:8:21:23:8:8:21:25
chr2	170605981	.	C	T	754.41	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0296075;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.1974;QD=56.9363;RBI=0.0466358;REFB=0;REVB=-0.0360318;RO=0;SAF=22;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.76368e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000871266;OID=.;OPOS=170605981;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:31:22:0:0:31:22:0:0
chr2	170667832	.	T	C	269.54	PASS	AF=0.508772;AO=29;DP=57;FAO=29;FDP=57;FR=.;FRO=28;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=-0.00597441;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.988;QD=18.915;RBI=0.0157426;REFB=0.000655094;REVB=0.0145649;RO=27;SAF=13;SAR=16;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124372;STB=0.560345;STBP=0.382;TYPE=snp;VARB=-0.00076167;OID=.;OPOS=170667832;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:27:28:29:29:0.508772:16:13:16:11:16:13:16:12
chr2	170672843	.	G	A	199.32	PASS	AF=0.944444;AO=17;DP=18;FAO=17;FDP=18;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00665761;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.1643;QD=44.2922;RBI=0.0791008;REFB=-0.141033;REVB=-0.0788202;RO=0;SAF=10;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.523782;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.00912381;OID=.;OPOS=170672843;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:18:18:0:1:17:17:0.944444:7:10:0:0:7:10:1:0
chr2	170762566	.	A	T	1065.44	PASS	AF=1;AO=71;DP=72;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0588653;FXX=0.013887;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.3309;QD=60.0248;RBI=0.0589766;REFB=0;REVB=-0.00362155;RO=0;SAF=45;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000833968;OID=.;OPOS=170762566;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:71:0:0:71:71:1:26:45:0:0:26:45:0:0
chr2	170917648	.	A	G	547.33	PASS	AF=0.97561;AO=38;DP=42;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0650523;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.1155;QD=53.3984;RBI=0.0651366;REFB=-0.168813;REVB=-0.00331372;RO=2;SAF=15;SAR=23;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0584497;STB=0.514279;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.0191568;OID=.;OPOS=170917648;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:42:41:2:1:38:40:0.97561:23:15:2:0:23:17:1:0
chr2	170938659	.	G	A	323.46	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0199339;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.758;QD=53.9107;RBI=0.0356733;REFB=0;REVB=0.0295841;RO=0;SAF=10;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000109611;OID=.;OPOS=170938659;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:14:10:0:0:14:10:0:0
chr2	170976590	.	A	G,T	316.91	PASS	AF=0.916667,0.0833333;AO=22,2;DP=24;FAO=22,2;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=4,1;FSAR=18,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0107061,0.0254782;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=193.929,160.494;QD=52.8176;RBI=0.011182,0.0271184;REFB=0,0;REVB=-0.00322775,-0.00928811;RO=0;SAF=4,1;SAR=18,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00226457,0.131766;OID=.,.;OPOS=170976590,170976590;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:24:24:0:0:22,2:22,2:0.916667,0.0833333:18,1:4,1:0:0:18,1:4,1:0:0
chr2	171073887	.	G	A	286.53	PASS	AF=0.375;AO=33;DP=88;FAO=33;FDP=88;FR=.;FRO=55;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=31;FWDB=-0.0442559;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.495;QD=13.0239;RBI=0.0449426;REFB=-0.0031848;REVB=-0.00782667;RO=54;SAF=19;SAR=14;SRF=24;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142231;STB=0.58677;STBP=0.238;TYPE=snp;VARB=0.00528959;OID=.;OPOS=171073887;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:54:55:33:33:0.375:14:19:24:30:14:19:24:31
chr2	171225841	.	A	G	658.05	PASS	AF=0.591837;AO=58;DP=98;FAO=58;FDP=98;FR=.;FRO=40;FSAF=25;FSAR=33;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=0.0307568;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.1642;QD=26.8593;RBI=0.0309623;REFB=0.0163151;REVB=-0.00356171;RO=40;SAF=25;SAR=33;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0333623;STB=0.518195;STBP=0.655;TYPE=snp;VARB=-0.0067846;OID=.;OPOS=171225841;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:40:40:58:58:0.591837:33:25:19:21:33:25:19:21
chr2	171260787	.	G	A	1044.38	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0167557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.623;QD=59.6786;RBI=0.029818;REFB=0;REVB=0.024665;RO=0;SAF=54;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.3218e-05;OID=.;OPOS=171260787;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:16:54:0:0:16:54:0:0
chr2	171260820	.	T	C	854.08	PASS	AF=0.983607;AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=49;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0399012;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.7966;QD=56.0054;RBI=0.0411342;REFB=-0.0832954;REVB=-0.00999571;RO=1;SAF=49;SAR=11;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0409724;STB=0.521732;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=0.00857117;OID=.;OPOS=171260820;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:61:61:1:1:60:60:0.983607:11:49:0:1:11:49:0:1
chr2	171355198	.	A	G	485.97	PASS	AF=1;AO=33;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0573119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.378;QD=55.5392;RBI=0.0588926;REFB=-0.0333419;REVB=-0.0135533;RO=0;SAF=9;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000665129;OID=.;OPOS=171355198;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:35:35:0:0:33:35:1:24:9:0:0:24:11:0:0
chr2	171356274	.	G	A	1117.31	PASS	AF=0.987179;AO=72;DP=73;FAO=77;FDP=78;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0394402;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=38.5938;QD=57.298;RBI=0.0413361;REFB=-0.104502;REVB=0.0123752;RO=1;SAF=33;SAR=39;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0119732;STB=0.506023;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.00238695;OID=.;OPOS=171356274;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:73:78:1:1:72:77:0.987179:39:33:0:1:41:36:0:1
chr2	171570488	.	C	G	88.22	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0224299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.192;QD=39.2068;RBI=0.0361122;REFB=0;REVB=0.0283018;RO=0;SAF=5;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000340282;OID=.;OPOS=171570488;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:4:5:0:0:4:5:0:0
chr2	171572940	.	G	A	689.26	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0672321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.21;QD=62.6598;RBI=0.0672323;REFB=0;REVB=0.000174299;RO=0;SAF=14;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000149277;OID=.;OPOS=171572940;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:30:14:0:0:30:14:0:0
chr2	171649402	.	C	T	1343.49	PASS	AF=1;AO=86;DP=87;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0232517;FXX=0.0114929;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.392;QD=62.488;RBI=0.0286879;REFB=0;REVB=-0.0168033;RO=0;SAF=33;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.98109e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.99549e-05;OID=.;OPOS=171649402;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:86:0:0:86:86:1:53:33:0:0:53:33:0:0
chr2	171822466	.	C	T	622.34	PASS	AF=0.933333;AO=42;DP=45;FAO=42;FDP=45;FR=.;FRO=3;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0129536;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=262.432;QD=55.3187;RBI=0.0203122;REFB=-0.15386;REVB=0.0156457;RO=2;SAF=21;SAR=21;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0426252;STB=0.533318;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=0.00129722;OID=.;OPOS=171822466;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:45:45:2:3:42:42:0.933333:21:21:0:2:21:21:0:3
chr2	172174150	.	AA	GC	465.14	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00592634;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=187.273;QD=58.1421;RBI=0.00943798;REFB=0;REVB=0.00734534;RO=0;SAF=15;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=6.2504e-05;OID=.;OPOS=172174150;OREF=AA;OALT=GC;OMAPALT=GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:17:15:0:0:17:15:0:0
chr2	172180771	.	A	G	2083.82	PASS	AF=1;AO=133;DP=133;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0105704;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.885;QD=62.6713;RBI=0.0151186;REFB=0;REVB=0.0108092;RO=0;SAF=64;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.11775e-05;OID=.;OPOS=172180771;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:133:133:0:0:133:133:1:69:64:0:0:69:64:0:0
chr2	172378818	.	A	G	418.05	PASS	AF=0.967742;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0493453;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.7936;QD=53.9421;RBI=0.0536245;REFB=-0.199733;REVB=0.0209912;RO=0;SAF=13;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.63861e-08;STB=0.518506;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.0046024;OID=.;OPOS=172378818;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:31:31:0:1:30:30:0.967742:17:13:0:0:17:13:1:0
chr2	172379781	.	G	A	538.55	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0126749;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.77;QD=59.8393;RBI=0.02221;REFB=0;REVB=0.0182382;RO=0;SAF=21;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.95071e-05;OID=.;OPOS=172379781;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:15:21:0:0:15:21:0:0
chr2	172693780	.	G	A	238.2	PASS	AF=0.489362;AO=23;DP=47;FAO=23;FDP=47;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=0.00187291;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.0009;QD=20.2726;RBI=0.00737816;REFB=-0.00292385;REVB=0.00713649;RO=24;SAF=11;SAR=12;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0181034;STB=0.510195;STBP=0.884;TYPE=snp;VARB=0.00321816;OID=.;OPOS=172693780;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:24:24:23:23:0.489362:12:11:11:13:12:11:11:13
chr2	172709215	.	G	C	262.07	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0340611;FXX=0.0475964;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.005;QD=52.4146;RBI=0.0346441;REFB=0;REVB=-0.00632865;RO=0;SAF=13;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00160918;OID=.;OPOS=172709215;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:20:0:0:21:20:1:8:13:0:0:8:12:0:0
chr2	172725301	.	A	G	1074.11	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0446178;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.8838;QD=59.6728;RBI=0.0466924;REFB=0;REVB=0.0137635;RO=0;SAF=22;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000230624;OID=.;OPOS=172725301;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:72:0:0:71:72:1:49:22:0:0:49:23:0:0
chr2	172822320	.	T	C	493.88	PASS	AF=0.546512;AO=47;DP=86;FAO=47;FDP=86;FR=.;FRO=39;FSAF=32;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=1.74157e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.944;QD=22.9713;RBI=0.00492825;REFB=-0.00745639;REVB=-0.00492822;RO=39;SAF=32;SAR=15;SRF=18;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.191473;STB=0.605632;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.00779276;OID=.;OPOS=172822320;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:39:39:47:47:0.546512:15:32:18:21:15:32:18:21
chr2	172822999	.	C	T	327.83	PASS	AF=0.53125;AO=34;DP=64;FAO=34;FDP=64;FR=.;FRO=30;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=21;FSRR=9;FWDB=-0.0388191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.8646;QD=20.4893;RBI=0.0417801;REFB=-0.00880625;REVB=-0.0154485;RO=30;SAF=16;SAR=18;SRF=21;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.192766;STB=0.606497;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=0.00425558;OID=.;OPOS=172822999;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:30:30:34:34:0.53125:18:16:21:9:18:16:21:9
chr2	172926226	.	G	T	214.82	PASS	AF=0.525;AO=21;DP=40;FAO=21;FDP=40;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.0296652;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.6176;QD=21.4815;RBI=0.0328655;REFB=-0.00770553;REVB=-0.0141463;RO=18;SAF=10;SAR=11;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0652267;STB=0.523787;STBP=0.767;TYPE=snp;VARB=0.00561342;OID=.;OPOS=172926226;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:18:19:21:21:0.525:11:10:10:8:11:10:10:9
chr2	172966250	.	T	C	592.7	PASS	AF=0.609195;AO=53;DP=87;FAO=53;FDP=87;FR=.;FRO=34;FSAF=30;FSAR=23;FSRF=14;FSRR=20;FWDB=-0.0042029;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.597;QD=27.2505;RBI=0.0109482;REFB=-0.0127666;REVB=0.0101093;RO=34;SAF=30;SAR=23;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110792;STB=0.560359;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=0.00804384;OID=.;OPOS=172966250;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:34:34:53:53:0.609195:23:30:14:20:23:30:14:20
chr2	173352157	.	A	T	150.1	PASS	AF=0.516129;AO=16;DP=31;FAO=16;FDP=31;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.0393739;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.066;QD=19.3673;RBI=0.0683107;REFB=-0.04157;REVB=0.0558215;RO=15;SAF=7;SAR=9;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0251235;STB=0.514268;STBP=0.911;TYPE=snp;VARB=0.0425185;OID=.;OPOS=173352157;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:15:15:16:16:0.516129:9:7:7:8:9:7:7:8
chr2	173686663	.	G	T	729.01	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00153442;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.901;QD=57.1774;RBI=0.0280205;REFB=0;REVB=-0.0279784;RO=0;SAF=46;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.57138e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.3458e-05;OID=.;OPOS=173686663;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:5:46:0:0:5:46:0:0
chr2	173917425	.	G	A	923.44	PASS	AF=0.984615;AO=64;DP=65;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00551175;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.475;QD=56.827;RBI=0.0298798;REFB=0.0232943;REVB=-0.0293671;RO=1;SAF=32;SAR=32;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0145314;STB=0.50769;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=-0.00196281;OID=.;OPOS=173917425;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:65:65:1:1:64:64:0.984615:32:32:1:0:32:32:1:0
chr2	174068513	.	G	C	1008.48	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0170203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.7231;QD=59.3226;RBI=0.0186587;REFB=0;REVB=-0.00764571;RO=0;SAF=37;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000162209;OID=.;OPOS=174068513;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:31:37:0:0:31:37:0:0
chr2	174091088	.	T	C	1320.89	PASS	AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0134227;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.6899;QD=62.1594;RBI=0.0408775;REFB=0;REVB=0.0386109;RO=0;SAF=52;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000108646;OID=.;OPOS=174091088;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:33:52:0:0:33:52:0:0
chr2	174097106	.	A	G	182.29	PASS	AF=0.5;AO=18;DP=37;FAO=19;FDP=38;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.00583536;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.651;QD=19.1884;RBI=0.0189008;REFB=-0.0057628;REVB=-0.0179774;RO=19;SAF=6;SAR=12;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181892;STB=0.611643;STBP=0.19;TYPE=snp;VARB=0.00755946;OID=.;OPOS=174097106;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:38:19:19:18:19:0.5:12:6:10:9:13:6:10:9
chr2	174103160	.	T	C	288.49	PASS	AF=0.392857;AO=33;DP=84;FAO=33;FDP=84;FR=.;FRO=51;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=25;FSRR=26;FWDB=0.0223416;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.8947;QD=13.7375;RBI=0.0256211;REFB=-0.012773;REVB=-0.0125417;RO=50;SAF=18;SAR=15;SRF=25;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0482352;STB=0.533602;STBP=0.634;TYPE=snp;VARB=0.0162444;OID=.;OPOS=174103160;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:50:51:33:33:0.392857:15:18:25:25:15:18:25:26
chr2	174128513	.	C	T	310.37	PASS	AF=0.584906;AO=31;DP=54;FAO=31;FDP=53;FR=.;FRO=22;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=0.00941932;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.9934;QD=23.4241;RBI=0.0306784;REFB=0.00235566;REVB=0.0291966;RO=23;SAF=18;SAR=13;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0572697;STB=0.523914;STBP=0.693;TYPE=snp;VARB=-0.00170822;OID=.;OPOS=174128513;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:53:23:22:31:31:0.584906:13:18:15:8:13:18:14:8
chr2	174232845	.	T	C	237.65	PASS	AF=0.490196;AO=25;DP=51;FAO=25;FDP=51;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=-0.0325088;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.8256;QD=18.6394;RBI=0.0440773;REFB=-0.00525711;REVB=-0.0297655;RO=26;SAF=5;SAR=20;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.388416;STB=0.720527;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.00444617;OID=.;OPOS=174232845;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:26:26:25:25:0.490196:20:5:15:11:20:5:15:11
chr2	175201299	.	C	G	3452.65	PASS	AF=1;AO=208;DP=212;FAO=225;FDP=225;FR=.;FRO=0;FSAF=119;FSAR=106;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0028094;FXX=0.00442458;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.091;QD=61.3804;RBI=0.0372037;REFB=0.0214981;REVB=0.0370975;RO=1;SAF=112;SAR=96;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0042345;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00168477;OID=.;OPOS=175201299;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:212:225:1:0:208:225:1:96:112:1:0:106:119:0:0
chr2	175424779	.	T	G	567.43	PASS	AF=0.974359;AO=38;DP=40;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00173577;FXX=0.0249938;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.245;QD=58.1978;RBI=0.0251118;REFB=0.0276661;REVB=0.0250517;RO=1;SAF=17;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0267628;STB=0.514278;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=5.64415e-05;OID=.;OPOS=175424779;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:40:39:1:1:38:38:0.974359:21:17:1:0:21:17:1:0
chr2	175425476	.	G	A	631.57	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0160966;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.047;QD=61.6161;RBI=0.0317324;REFB=0;REVB=0.0273467;RO=0;SAF=23;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.43889e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.79249e-05;OID=.;OPOS=175425476;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:41:0:0:39:41:1:16:23:0:0:18:23:0:0
chr2	175426274	.	C	G	854.44	PASS	AF=1;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0306996;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.4069;QD=57.9281;RBI=0.0384613;REFB=0;REVB=0.0231691;RO=0;SAF=31;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000223903;OID=.;OPOS=175426274;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:59:0:0:59:59:1:28:31:0:0:28:31:0:0
chr2	175436940	.	G	A	715.45	PASS	AF=0.94;AO=47;DP=50;FAO=47;FDP=50;FR=.;FRO=3;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0112629;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.254;QD=57.2357;RBI=0.0328724;REFB=-0.102855;REVB=0.0308827;RO=1;SAF=24;SAR=23;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.019193;STB=0.510634;STBP=0.607;TYPE=snp;VARB=0.00129266;OID=.;OPOS=175436940;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:50:50:1:3:47:47:0.94:23:24:1:0:23:24:1:2
chr2	175957917	.	C	T	44.47	PASS	AF=0.0733333;AO=11;DP=150;FAO=11;FDP=150;FR=.,HEALED;FRO=134;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=60;FSRR=74;FWDB=0.00479214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.2763;QD=1.18595;RBI=0.00480791;REFB=-0.00227333;REVB=-0.000389147;RO=127;SAF=8;SAR=3;SRF=53;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.337878;STB=0.750778;STBP=0.115;TYPE=snp;VARB=0.166166;OID=.;OPOS=175957917;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:150:150:127:134:11:11:0.0733333:3:8:53:74:3:8:60:74
chr2	176802124	.	A	T	178.82	PASS	AF=0.25;AO=25;DP=100;FAO=25;FDP=100;FR=.;FRO=75;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=44;FSRR=31;FWDB=-0.00242267;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.649;QD=7.15274;RBI=0.019255;REFB=-0.00401368;REVB=-0.019102;RO=75;SAF=13;SAR=12;SRF=44;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0830229;STB=0.550242;STBP=0.585;TYPE=snp;VARB=0.014659;OID=.;OPOS=176802124;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:75:75:25:25:0.25:12:13:44:31:12:13:44:31
chr2	176866967	.	C	T	191.6	PASS	AF=0.408163;AO=20;DP=49;FAO=20;FDP=49;FR=.;FRO=29;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.00330761;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.4315;QD=15.6405;RBI=0.0285179;REFB=-0.00703024;REVB=0.0283254;RO=28;SAF=5;SAR=15;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.280914;STB=0.673972;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=0.0117883;OID=.;OPOS=176866967;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:28:29:20:20:0.408163:15:5:14:14:15:5:15:14
chr2	176957822	.	G	A	85.04	PASS	AF=0.666667;AO=10;DP=15;FAO=10;FDP=15;FR=.;FRO=5;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=-0.00344847;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.46;QD=22.6785;RBI=0.103765;REFB=0.0136467;REVB=0.103708;RO=5;SAF=8;SAR=2;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21313;STB=0.618849;STBP=0.377;TYPE=snp;VARB=-0.00501323;OID=.;OPOS=176957822;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:15:15:5:5:10:10:0.666667:2:8:5:0:2:8:5:0
chr2	176984192	.	TAAA	T,TATA	688.25	PASS	AF=0.230769,0.769231;AO=11,32;DP=45;FAO=12,40;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=8,14;FSAR=4,26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0329143,0.0158306;FXX=0.133311;HRUN=5,5;LEN=3,1;MLLD=25.8692,92.8227;QD=52.9421;RBI=0.064689,0.0543699;REFB=0,0;REVB=-0.0556894,-0.0520142;RO=0;SAF=4,13;SAR=7,19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0679413,0.00953686;OID=.,.;OPOS=176984193,176984194;OREF=AAA,A;OALT=-,T;OMAPALT=T,TATA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.230769,0.769231:11,32:45:12,40:52:0:8,14:4,26:0:0:68:0:4,13:7,19:0:0
chr2	176984454	.	A	T	53.79	PASS	AF=0.333333;AO=8;DP=24;FAO=8;FDP=24;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=0.048415;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.3029;QD=8.96522;RBI=0.0526208;REFB=-0.00594628;REVB=-0.0206141;RO=15;SAF=5;SAR=3;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.368003;STB=0.699533;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=0.0502904;OID=.;OPOS=176984454;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:24:24:15:16:8:8:0.333333:3:5:4:11:3:5:5:11
chr2	176988290	.	C	CGCA	221.05	PASS	AF=0.44898;AO=22;DP=56;FAO=22;FDP=49;FR=.;FRO=27;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=0.00389377;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=268.914;QD=18.0447;RBI=0.0154318;REFB=-0.0204013;REVB=0.0149324;RO=34;SAF=16;SAR=6;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167192;STB=0.586124;STBP=0.311;TYPE=ins;VARB=0.0229496;OID=.;OPOS=176988291;OREF=-;OALT=GCA;OMAPALT=CGCA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.44898:22:56:22:49:27:16:6:16:11:99:34:16:6:20:14
chr2	177016728	.	T	C	357.43	PASS	AF=0.428571;AO=36;DP=88;FAO=39;FDP=91;FR=.;FRO=52;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=33;FSRR=19;FWDB=-0.0196713;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.706;QD=15.7111;RBI=0.0222902;REFB=-0.0141016;REVB=0.0104829;RO=50;SAF=21;SAR=15;SRF=32;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0607172;STB=0.54138;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=0.0185927;OID=.;OPOS=177016728;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:91:50:52:36:39:0.428571:15:21:32:18:17:22:33:19
chr2	177033879	.	C	A	469.14	PASS	AF=0.651515;AO=43;DP=67;FAO=43;FDP=66;FR=.;FRO=23;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=6;FSRR=17;FWDB=-0.0387744;FXX=0.0149231;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.437;QD=28.4328;RBI=0.038814;REFB=-0.0255091;REVB=-0.00175248;RO=22;SAF=24;SAR=19;SRF=6;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176306;STB=0.602464;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.0222925;OID=.;OPOS=177033879;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:66:22:23:43:43:0.651515:19:24:6:16:19:24:6:17
chr2	177034121	.	G	T	57.89	PASS	AF=0.470588;AO=8;DP=16;FAO=8;FDP=17;FR=.;FRO=9;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.000561527;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=101.604;QD=13.6203;RBI=0.107637;REFB=-0.0128552;REVB=-0.107636;RO=8;SAF=1;SAR=7;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.574942;STB=0.829585;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.0797331;OID=.;OPOS=177034121;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:16:17:8:9:8:8:0.470588:7:1:6:2:7:1:6:3
chr2	177036315	.	G	A	180.85	PASS	AF=0.257732;AO=25;DP=97;FAO=25;FDP=97;FR=.;FRO=72;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=40;FSRR=32;FWDB=0.000397087;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.097;QD=7.45789;RBI=0.0124962;REFB=-0.00723215;REVB=0.0124899;RO=72;SAF=10;SAR=15;SRF=40;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190095;STB=0.614663;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.0236999;OID=.;OPOS=177036315;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:72:72:25:25:0.257732:15:10:40:32:15:10:40:32
chr2	177036754	.	T	C	144.04	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0420102;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.5892;QD=44.3196;RBI=0.0420103;REFB=0;REVB=0.000115527;RO=0;SAF=3;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00230627;OID=.;OPOS=177036754;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:13:0:0:12:13:1:9:3:0:0:9:4:0:0
chr2	177054411	.	T	C	244.82	PASS	AF=0.444444;AO=28;DP=63;FAO=28;FDP=63;FR=.;FRO=35;FSAF=7;FSAR=21;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=0.00480742;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.104;QD=15.5439;RBI=0.0218552;REFB=0.00205516;REVB=0.0213199;RO=35;SAF=7;SAR=21;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.233307;STB=0.632926;STBP=0.101;TYPE=snp;VARB=-0.00329764;OID=.;OPOS=177054411;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:35:35:28:28:0.444444:21:7:16:19:21:7:16:19
chr2	177054769	.	G	A	303.3	PASS	AF=0.574468;AO=27;DP=47;FAO=27;FDP=47;FR=.;FRO=20;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.000868348;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.227;QD=25.8129;RBI=0.0186807;REFB=0.00250464;REVB=0.0186605;RO=20;SAF=14;SAR=13;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0525663;STB=0.529112;STBP=0.653;TYPE=snp;VARB=-0.00475042;OID=.;OPOS=177054769;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:20:20:27:27:0.574468:13:14:9:11:13:14:9:11
chr2	178085137	.	G	A	831.05	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0274531;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.044;QD=57.3137;RBI=0.0405977;REFB=0;REVB=0.0299082;RO=0;SAF=34;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.39502e-06;OID=.;OPOS=178085137;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:58:0:0:57:58:1:23:34:0:0:24:34:0:0
chr2	178417142	.	C	T	1048.23	PASS	AF=1;AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0596253;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.6533;QD=59.8991;RBI=0.0673816;REFB=0;REVB=0.0313865;RO=0;SAF=27;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000535197;OID=.;OPOS=178417142;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:70:0:0:70:70:1:43:27:0:0:43:27:0:0
chr2	178417225	.	C	T	785.67	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0241611;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.106;QD=64.1362;RBI=0.0299353;REFB=0;REVB=0.0176739;RO=0;SAF=20;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000137134;OID=.;OPOS=178417225;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:29:20:0:0:29:20:0:0
chr2	178481818	.	G	T	729.19	PASS	AF=0.963636;AO=53;DP=56;FAO=53;FDP=55;FR=.;FRO=2;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0130506;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.442;QD=53.0319;RBI=0.0189053;REFB=-0.138629;REVB=-0.0136781;RO=0;SAF=28;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.519224;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.000811004;OID=.;OPOS=178481818;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:56:55:0:2:53:53:0.963636:25:28:0:0:25:28:0:2
chr2	178482560	.	C	T	326.06	PASS	AF=0.466667;AO=35;DP=75;FAO=35;FDP=75;FR=.;FRO=40;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=26;FWDB=0.0162963;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.401;QD=17.3897;RBI=0.0262134;REFB=-0.0174156;REVB=-0.0205322;RO=40;SAF=22;SAR=13;SRF=14;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.26283;STB=0.646976;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.0195627;OID=.;OPOS=178482560;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:40:40:35:35:0.466667:13:22:14:26:13:22:14:26
chr2	178482698	.	A	G	199.88	PASS	AF=0.40678;AO=24;DP=59;FAO=24;FDP=59;FR=.;FRO=35;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=0.00391151;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.0186;QD=13.5511;RBI=0.008656;REFB=0.0111073;REVB=0.00772182;RO=35;SAF=12;SAR=12;SRF=14;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103791;STB=0.559273;STBP=0.446;TYPE=snp;VARB=-0.0164913;OID=.;OPOS=178482698;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:35:35:24:24:0.40678:12:12:14:21:12:12:14:21
chr2	178491217	.	G	A	871.07	PASS	AF=0.983871;AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00214837;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.253;QD=56.1983;RBI=0.0144644;REFB=0.0651349;REVB=0.0143039;RO=1;SAF=38;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0200789;STB=0.510635;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=-0.00181252;OID=.;OPOS=178491217;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:62:62:1:1:61:61:0.983871:23:38:0:1:23:38:0:1
chr2	178493301	.	G	T	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103508;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.798;QD=52.6132;RBI=0.0139625;REFB=0;REVB=0.00937091;RO=0;SAF=11;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.81847e-05;OID=.;OPOS=178493301;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:11:11:0:0:11:11:0:0
chr2	178494173	.	G	GGGA	474.72	PASS	AF=0.440678;AO=49;DP=121;FAO=52;FDP=118;FR=.;FRO=66;FSAF=21;FSAR=31;FSRF=42;FSRR=24;FWDB=0.0061272;FXX=0.0166653;HRUN=4;LEN=3;MLLD=304.082;QD=16.0922;RBI=0.00615002;REFB=-0.013903;REVB=-0.000529243;RO=68;SAF=20;SAR=29;SRF=42;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.214411;STB=0.62833;STBP=0.017;TYPE=ins;VARB=0.015495;OID=.;OPOS=178494174;OREF=-;OALT=GGA;OMAPALT=GGGA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.440678:49:121:52:118:66:21:31:42:24:99:68:20:29:42:26
chr2	178936372	.	GT	G,GG	423.04	PASS	AF=0.0333333,0.966667;AO=3,27;DP=30;FAO=1,29;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=0,12;FSAR=1,17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0170765,0.0226482;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=225.504,243.099;QD=56.4054;RBI=0.0179974,0.0227988;REFB=0,0;REVB=0.00568326,-0.00261656;RO=0;SAF=2,10;SAR=1,17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.00783464,0.00135794;OID=.,.;OPOS=178936373,178936373;OREF=T,T;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0333333,0.966667:3,27:30:1,29:30:0:0,12:1,17:0:0:6:0:2,10:1,17:0:0
chr2	178936561	.	G	A	112.26	PASS	AF=0.481481;AO=12;DP=27;FAO=13;FDP=27;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=-0.0151644;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.215;QD=16.6317;RBI=0.0178408;REFB=0.00742499;REVB=0.00939872;RO=14;SAF=7;SAR=5;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128654;STB=0.555473;STBP=0.633;TYPE=snp;VARB=-0.0104475;OID=.;OPOS=178936561;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:14:14:12:13:0.481481:5:7:10:4:5:8:10:4
chr2	178936614	.	C	T	187.31	PASS	AF=0.941176;AO=16;DP=18;FAO=16;FDP=17;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00698793;FXX=0.0555247;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.323;QD=44.0717;RBI=0.0195176;REFB=-0.0665832;REVB=0.0182237;RO=1;SAF=13;SAR=3;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0338952;STB=0.518496;STBP=0.638;TYPE=snp;VARB=0.00105174;OID=.;OPOS=178936614;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:18:17:1:1:16:16:0.941176:3:13:1:0:3:13:1:0
chr2	179188979	.	C	T	717.75	PASS	AF=0.518519;AO=70;DP=135;FAO=70;FDP=135;FR=.;FRO=65;FSAF=26;FSAR=44;FSRF=31;FSRR=34;FWDB=-0.00548448;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.244;QD=21.2667;RBI=0.0104675;REFB=0.00162034;REVB=-0.00891568;RO=65;SAF=26;SAR=44;SRF=31;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0961174;STB=0.552895;STBP=0.233;TYPE=snp;VARB=-0.00332823;OID=.;OPOS=179188979;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:135:135:65:65:70:70:0.518519:44:26:31:34:44:26:31:34
chr2	179188986	.	C	T	662.3	PASS	AF=0.507692;AO=66;DP=130;FAO=66;FDP=130;FR=.;FRO=64;FSAF=25;FSAR=41;FSRF=31;FSRR=33;FWDB=0.011255;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=304.757;QD=20.3783;RBI=0.0149975;REFB=-0.00153668;REVB=0.00991207;RO=64;SAF=25;SAR=41;SRF=31;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0974929;STB=0.55377;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=0.0018479;OID=.;OPOS=179188986;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:130:130:64:64:66:66:0.507692:41:25:31:33:41:25:31:33
chr2	179203797	.	G	A	429.01	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0210509;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.5253;QD=57.2014;RBI=0.0323743;REFB=0;REVB=-0.0245959;RO=0;SAF=11;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000867533;OID=.;OPOS=179203797;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:19:11:0:0:19:11:0:0
chr2	179260382	.	A	G	532.65	PASS	AF=0.486957;AO=56;DP=115;FAO=56;FDP=115;FR=.;FRO=59;FSAF=24;FSAR=32;FSRF=36;FSRR=23;FWDB=-0.0103202;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.647;QD=18.527;RBI=0.0395977;REFB=-0.00136687;REVB=0.0382292;RO=59;SAF=24;SAR=32;SRF=36;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167285;STB=0.59256;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.00174449;OID=.;OPOS=179260382;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:115:59:59:56:56:0.486957:32:24:36:23:32:24:36:23
chr2	179414162	.	T	C	511.52	PASS	AF=0.462185;AO=55;DP=119;FAO=55;FDP=119;FR=.;FRO=64;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=29;FSRR=35;FWDB=0.00343668;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.922;QD=17.1941;RBI=0.00367756;REFB=-0.00422882;REVB=-0.00130909;RO=64;SAF=30;SAR=25;SRF=29;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0891571;STB=0.5496;STBP=0.34;TYPE=snp;VARB=0.00511887;OID=.;OPOS=179414162;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:119:64:64:55:55:0.462185:25:30:29:35:25:30:29:35
chr2	179426979	.	T	A	99.24	PASS	AF=0.444444;AO=12;DP=27;FAO=12;FDP=27;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=12;FWDB=0.0106796;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=227.041;QD=14.7015;RBI=0.0108658;REFB=0.0127341;REVB=-0.00200316;RO=15;SAF=4;SAR=8;SRF=3;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153102;STB=0.5881;STBP=0.449;TYPE=snp;VARB=-0.018042;OID=.;OPOS=179426979;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:15:15:12:12:0.444444:8:4:3:12:8:4:3:12
chr2	179440479	.	C	T	429.89	PASS	AF=0.444444;AO=44;DP=99;FAO=44;FDP=99;FR=.;FRO=55;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=25;FSRR=30;FWDB=-0.000523784;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.91;QD=17.3694;RBI=0.0155202;REFB=-0.0112904;REVB=0.0155113;RO=55;SAF=20;SAR=24;SRF=25;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0129543;OID=.;OPOS=179440479;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:55:55:44:44:0.444444:24:20:25:30:24:20:25:30
chr2	179444768	.	C	G	1731.31	PASS	AF=1;AO=114;DP=114;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00760654;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.542;QD=60.7476;RBI=0.00763555;REFB=0;REVB=0.000664923;RO=0;SAF=55;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.71456e-06;OID=.;OPOS=179444768;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:114:114:0:0:114:114:1:59:55:0:0:59:55:0:0
chr2	179458002	.	G	A	194.91	PASS	AF=0.444444;AO=20;DP=45;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=21;FWDB=0.0085979;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=300.393;QD=17.3255;RBI=0.0148868;REFB=-0.00090854;REVB=-0.0121529;RO=25;SAF=9;SAR=11;SRF=4;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.299893;STB=0.668069;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.00100487;OID=.;OPOS=179458002;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:25:25:20:20:0.444444:11:9:4:21:11:9:4:21
chr2	179569400	.	C	T	581.68	PASS	AF=0.522124;AO=59;DP=113;FAO=59;FDP=113;FR=.;FRO=54;FSAF=32;FSAR=27;FSRF=22;FSRR=32;FWDB=-0.0637652;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.575;QD=20.5906;RBI=0.0637794;REFB=-0.0038087;REVB=0.00134521;RO=54;SAF=32;SAR=27;SRF=22;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1168;STB=0.564234;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=0.00399039;OID=.;OPOS=179569400;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:113:54:54:59:59:0.522124:27:32:22:32:27:32:22:32
chr2	179569436	.	A	G	408.07	PASS	AF=0.5125;AO=41;DP=80;FAO=41;FDP=80;FR=.;FRO=39;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=15;FSRR=24;FWDB=0.0131989;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.3929;QD=20.4035;RBI=0.0179617;REFB=0.00744695;REVB=0.0121824;RO=39;SAF=17;SAR=24;SRF=15;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0273556;STB=0.515144;STBP=0.804;TYPE=snp;VARB=-0.01382;OID=.;OPOS=179569436;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:39:39:41:41:0.5125:24:17:15:24:24:17:15:24
chr2	179574384	.	C	T	706.93	PASS	AF=0.471698;AO=75;DP=159;FAO=75;FDP=159;FR=.;FRO=84;FSAF=31;FSAR=44;FSRF=39;FSRR=45;FWDB=0.0309738;FXX=0.00624961;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.672;QD=17.7843;RBI=0.0603227;REFB=0.0289199;REVB=0.0517635;RO=84;SAF=30;SAR=45;SRF=39;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.062953;STB=0.52748;STBP=0.54;TYPE=snp;VARB=-0.0332545;OID=.;OPOS=179574384;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:159:159:84:84:75:75:0.471698:45:30:39:45:44:31:39:45
chr2	179578730	.	G	A	757.22	PASS	AF=0.45977;AO=80;DP=174;FAO=80;FDP=174;FR=.;FRO=94;FSAF=37;FSAR=43;FSRF=52;FSRR=42;FWDB=0.00825356;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.929;QD=17.4073;RBI=0.00945037;REFB=-0.0120825;REVB=-0.00460308;RO=94;SAF=37;SAR=43;SRF=52;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.088218;STB=0.548898;STBP=0.244;TYPE=snp;VARB=0.0126761;OID=.;OPOS=179578730;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:174:174:94:94:80:80:0.45977:43:37:52:42:43:37:52:42
chr2	179579212	.	T	C	539.9	PASS	AF=0.504505;AO=56;DP=111;FAO=56;FDP=111;FR=.;FRO=55;FSAF=24;FSAR=32;FSRF=17;FSRR=38;FWDB=0.00644053;FXX=0.00892777;HRUN=2;LEN=1;MLLD=229.921;QD=19.456;RBI=0.00644704;REFB=-0.016644;REVB=0.000289572;RO=55;SAF=24;SAR=32;SRF=17;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111686;STB=0.561476;STBP=0.214;TYPE=snp;VARB=0.0181065;OID=.;OPOS=179579212;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:111:55:55:56:56:0.504505:32:24:17:38:32:24:17:38
chr2	179579822	.	T	A	506.4	PASS	AF=0.447154;AO=55;DP=123;FAO=55;FDP=123;FR=.;FRO=68;FSAF=23;FSAR=32;FSRF=40;FSRR=28;FWDB=0.045486;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.6007;QD=16.4684;RBI=0.0615728;REFB=-0.00589315;REVB=0.0414999;RO=68;SAF=23;SAR=32;SRF=40;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167824;STB=0.593606;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.00885291;OID=.;OPOS=179579822;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:123:123:68:68:55:55:0.447154:32:23:40:28:32:23:40:28
chr2	179580434	.	A	G	307.24	PASS	AF=0.43038;AO=34;DP=79;FAO=34;FDP=79;FR=.;FRO=45;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=28;FWDB=0.0124097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.624;QD=15.5563;RBI=0.0125292;REFB=-0.00831237;REVB=-0.00172669;RO=45;SAF=18;SAR=16;SRF=17;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152281;STB=0.585749;STBP=0.206;TYPE=snp;VARB=0.0100988;OID=.;OPOS=179580434;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:45:45:34:34:0.43038:16:18:17:28:16:18:17:28
chr2	179581835	.	C	A	236.51	PASS	AF=0.4;AO=28;DP=70;FAO=28;FDP=70;FR=.;FRO=42;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=-0.0167366;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.293;QD=13.5147;RBI=0.0171562;REFB=-0.00786903;REVB=-0.00377142;RO=42;SAF=11;SAR=17;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163457;STB=0.593362;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=0.0105251;OID=.;OPOS=179581835;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:42:42:28:28:0.4:17:11:23:19:17:11:23:19
chr2	179582537	.	G	T	102.67	PASS	AF=0.258621;AO=15;DP=58;FAO=15;FDP=58;FR=.;FRO=43;FSAF=2;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=25;FWDB=-0.0531172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.2724;QD=7.08094;RBI=0.0587984;REFB=0.00151191;REVB=-0.0252153;RO=43;SAF=2;SAR=13;SRF=18;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.431831;STB=0.773383;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=-0.0102856;OID=.;OPOS=179582537;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:43:43:15:15:0.258621:13:2:18:25:13:2:18:25
chr2	179585266	.	C	T	1302.13	PASS	AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0330113;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.0571;QD=62.0062;RBI=0.0330121;REFB=0;REVB=0.000217805;RO=0;SAF=43;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000244349;OID=.;OPOS=179585266;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:41:43:0:0:41:43:0:0
chr2	179600563	.	G	A	1571.39	PASS	AF=0.99;AO=99;DP=100;FAO=99;FDP=100;FR=.;FRO=1;FSAF=50;FSAR=49;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00370278;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.194;QD=62.8554;RBI=0.00477643;REFB=-0.00508602;REVB=0.00301723;RO=1;SAF=50;SAR=49;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00939286;STB=0.50495;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000134386;OID=.;OPOS=179600563;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:100:100:1:1:99:99:0.99:49:50:1:0:49:50:1:0
chr2	179600648	.	C	T	679.17	PASS	AF=0.473684;AO=72;DP=155;FAO=72;FDP=152;FR=.;FRO=80;FSAF=42;FSAR=30;FSRF=40;FSRR=40;FWDB=-0.0033247;FXX=0.0193536;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.6414;QD=17.8729;RBI=0.0139198;REFB=-0.000371634;REVB=-0.0135169;RO=83;SAF=42;SAR=30;SRF=40;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0988052;STB=0.544432;STBP=0.345;TYPE=snp;VARB=0.000296667;OID=.;OPOS=179600648;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:155:152:83:80:72:72:0.473684:30:42:40:43:30:42:40:40
chr2	179604160	.	T	G	210.68	PASS	AF=0.416667;AO=25;DP=60;FAO=25;FDP=60;FR=.;FRO=35;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=0.0271257;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.8848;QD=14.0455;RBI=0.0398103;REFB=-0.0146333;REVB=0.0291385;RO=35;SAF=11;SAR=14;SRF=13;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0719728;STB=0.540951;STBP=0.637;TYPE=snp;VARB=0.0328592;OID=.;OPOS=179604160;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:35:35:25:25:0.416667:14:11:13:22:14:11:13:22
chr2	179604742	.	G	A	894.9	PASS	AF=0.819277;AO=68;DP=83;FAO=68;FDP=83;FR=.;FRO=15;FSAF=36;FSAR=32;FSRF=11;FSRR=4;FWDB=0.0149026;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.294;QD=43.1275;RBI=0.0182953;REFB=-0.00508104;REVB=0.0106127;RO=15;SAF=36;SAR=32;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0696399;STB=0.537132;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=0.00134704;OID=.;OPOS=179604742;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:83:83:15:15:68:68:0.819277:32:36:11:4:32:36:11:4
chr2	179605180	.	C	A	100.75	PASS	AF=0.48;AO=12;DP=25;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.00319043;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.635;QD=16.1192;RBI=0.0353383;REFB=-0.0157594;REVB=-0.035194;RO=13;SAF=7;SAR=5;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0297828;STB=0.517213;STBP=0.893;TYPE=snp;VARB=0.00923844;OID=.;OPOS=179605180;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:25:13:13:12:12:0.48:5:7:8:5:5:7:8:5
chr2	179605705	.	A	G	358.97	PASS	AF=0.452381;AO=37;DP=82;FAO=38;FDP=84;FR=.;FRO=46;FSAF=12;FSAR=26;FSRF=25;FSRR=21;FWDB=0.00281633;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.349;QD=17.094;RBI=0.035758;REFB=-0.0030285;REVB=0.0356469;RO=45;SAF=12;SAR=25;SRF=25;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.233447;STB=0.630336;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.00915867;OID=.;OPOS=179605705;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:84:45:46:37:38:0.452381:25:12:25:20:26:12:25:21
chr2	179606538	.	G	A	791.07	PASS	AF=0.569231;AO=74;DP=130;FAO=74;FDP=130;FR=.;FRO=56;FSAF=39;FSAR=35;FSRF=21;FSRR=35;FWDB=-0.00135186;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=345.172;QD=24.3408;RBI=0.00317965;REFB=-0.0071357;REVB=-0.00287795;RO=56;SAF=39;SAR=35;SRF=21;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11967;STB=0.5652;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=0.0056931;OID=.;OPOS=179606538;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:130:130:56:56:74:74:0.569231:35:39:21:35:35:39:21:35
chr2	179611711	.	C	A	173.32	PASS	AF=0.486486;AO=18;DP=37;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=15;FWDB=0.00990605;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=146.227;QD=18.7373;RBI=0.0158858;REFB=-0.00748808;REVB=-0.0124189;RO=17;SAF=14;SAR=4;SRF=2;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.544057;STB=0.786668;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.00681022;OID=.;OPOS=179611711;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:17:19:18:18:0.486486:4:14:2:15:4:14:4:15
chr2	179614952	.	A	G	1713.21	PASS	AF=1;AO=113;DP=113;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0185988;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.386;QD=60.6446;RBI=0.0198228;REFB=0;REVB=0.00685764;RO=0;SAF=65;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.02215e-05;OID=.;OPOS=179614952;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:113:113:0:0:113:113:1:48:65:0:0:48:65:0:0
chr2	179615887	.	T	C	146.24	PASS	AF=0.470588;AO=15;DP=33;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=0.0588152;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.2534;QD=17.2043;RBI=0.0593045;REFB=-0.0278646;REVB=0.0076028;RO=17;SAF=10;SAR=5;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.29008;STB=0.651987;STBP=0.114;TYPE=snp;VARB=0.0528406;OID=.;OPOS=179615887;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:34:17:18:15:16:0.470588:5:10:6:11:6:10:6:12
chr2	179615931	.	C	G	687.64	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=1.44154e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.344;QD=61.1237;RBI=0.0457019;REFB=0;REVB=0.0457019;RO=0;SAF=15;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00105876;OID=.;OPOS=179615931;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:45:0:0:43:45:1:28:15:0:0:30:15:0:0
chr2	179615994	.	T	C	795.73	PASS	AF=1;AO=55;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0279974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.322;QD=56.8375;RBI=0.028342;REFB=0;REVB=-0.00440584;RO=1;SAF=18;SAR=37;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0254644;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.67463e-05;OID=.;OPOS=179615994;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:1:0:55:56:1:37:18:1:0:37:19:0:0
chr2	179620951	.	C	T	179.7	PASS	AF=0.413043;AO=19;DP=46;FAO=19;FDP=46;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=0.0111267;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=243.861;QD=15.6262;RBI=0.0128499;REFB=-0.00835311;REVB=0.00642778;RO=27;SAF=10;SAR=9;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0456914;STB=0.526288;STBP=0.802;TYPE=snp;VARB=0.0116309;OID=.;OPOS=179620951;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:27:27:19:19:0.413043:9:10:13:14:9:10:13:14
chr2	179620974	.	C	T	157.12	PASS	AF=0.323077;AO=21;DP=65;FAO=21;FDP=65;FR=.;FRO=44;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=27;FSRR=17;FWDB=0.0252688;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.744;QD=9.66869;RBI=0.0371853;REFB=0.00151244;REVB=-0.0272807;RO=43;SAF=13;SAR=8;SRF=27;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0107616;STB=0.503872;STBP=0.988;TYPE=snp;VARB=-0.00387404;OID=.;OPOS=179620974;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:43:44:21:21:0.323077:8:13:27:16:8:13:27:17
chr2	179621477	.	C	T	1540.02	PASS	AF=1;AO=103;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00611184;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.919;QD=59.8068;RBI=0.014905;REFB=0;REVB=0.0135943;RO=0;SAF=42;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.08734e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.8891e-06;OID=.;OPOS=179621477;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:103:103:0:0:103:103:1:61:42:0:0:61:42:0:0
chr2	179623758	.	C	T	758.49	PASS	AF=0.503401;AO=73;DP=145;FAO=74;FDP=147;FR=.;FRO=73;FSAF=41;FSAR=33;FSRF=40;FSRR=33;FWDB=0.00631414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.198;QD=20.6393;RBI=0.00941421;REFB=-0.00954246;REVB=-0.00698277;RO=72;SAF=40;SAR=33;SRF=40;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00693088;STB=0.503067;STBP=0.962;TYPE=snp;VARB=0.0103559;OID=.;OPOS=179623758;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:145:147:72:73:73:74:0.503401:33:40:40:32:33:41:40:33
chr2	179629363	.	T	C	1147.25	PASS	AF=0.987342;AO=76;DP=79;FAO=78;FDP=79;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00638546;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.089;QD=58.0884;RBI=0.0120598;REFB=0.0554867;REVB=0.0102306;RO=1;SAF=34;SAR=42;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0111346;STB=0.505881;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=-0.000499395;OID=.;OPOS=179629363;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:79:79:1:1:76:78:0.987342:42:34:0:1:42:36:0:1
chr2	179629461	.	C	T	155.78	PASS	AF=0.365385;AO=19;DP=53;FAO=19;FDP=52;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=22;FSRR=11;FWDB=0.00213943;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.638;QD=11.9833;RBI=0.0081827;REFB=-0.00505437;REVB=-0.00789806;RO=33;SAF=10;SAR=9;SRF=22;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155521;STB=0.590073;STBP=0.363;TYPE=snp;VARB=0.00757428;OID=.;OPOS=179629461;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:52:33:33:19:19:0.365385:9:10:22:11:9:10:22:11
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chr2	179647546	.	A	G	317.01	PASS	AF=0.478873;AO=34;DP=71;FAO=34;FDP=71;FR=.;FRO=37;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=0.0134529;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.802;QD=17.8595;RBI=0.0291425;REFB=-0.00280505;REVB=-0.0258515;RO=37;SAF=17;SAR=17;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0125912;STB=0.507038;STBP=0.919;TYPE=snp;VARB=0.00306934;OID=.;OPOS=179647546;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:37:37:34:34:0.478873:17:17:19:18:17:17:19:18
chr2	179659912	.	G	A	378.06	PASS	AF=0.4875;AO=39;DP=80;FAO=39;FDP=80;FR=.;FRO=41;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=24;FSRR=17;FWDB=0.0131582;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.094;QD=18.9032;RBI=0.039653;REFB=-0.0172508;REVB=0.0374062;RO=40;SAF=17;SAR=22;SRF=24;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148707;STB=0.576319;STBP=0.196;TYPE=snp;VARB=0.0217577;OID=.;OPOS=179659912;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:40:41:39:39:0.4875:22:17:24:16:22:17:24:17
chr2	179702268	.	A	G	608.04	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00191398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.489;QD=60.8043;RBI=0.0308195;REFB=0;REVB=0.03076;RO=0;SAF=22;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.09171e-05;OID=.;OPOS=179702268;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:40:0:0:39:40:1:17:22:0:0:18:22:0:0
chr2	179839833	.	A	G	209.62	PASS	AF=0.466667;AO=21;DP=45;FAO=21;FDP=45;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=0.00675522;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.685;QD=18.6331;RBI=0.0312976;REFB=-0.0337248;REVB=-0.0305599;RO=23;SAF=11;SAR=10;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121916;STB=0.578873;STBP=0.37;TYPE=snp;VARB=0.05452;OID=.;OPOS=179839833;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:23:24:21:21:0.466667:10:11:9:14:10:11:9:15
chr2	179914640	.	G	A	240.14	PASS	AF=0.465517;AO=27;DP=58;FAO=27;FDP=58;FR=.;FRO=31;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=-0.0220118;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.4251;QD=16.5616;RBI=0.0259249;REFB=-0.00383848;REVB=-0.0136961;RO=30;SAF=16;SAR=11;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0879328;STB=0.541636;STBP=0.581;TYPE=snp;VARB=0.00352811;OID=.;OPOS=179914640;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:30:31:27:27:0.465517:11:16:15:15:11:16:16:15
chr2	179990353	.	C	G	430.21	PASS	AF=0.552632;AO=42;DP=76;FAO=42;FDP=76;FR=.;FRO=34;FSAF=14;FSAR=28;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=-0.020787;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.9221;QD=22.6424;RBI=0.022512;REFB=-0.00416883;REVB=0.00864244;RO=34;SAF=14;SAR=28;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.214099;STB=0.618124;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.00435714;OID=.;OPOS=179990353;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:34:34:42:42:0.552632:28:14:20:14:28:14:20:14
chr2	180047908	.	T	C	740.68	PASS	AF=0.981481;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0310168;FXX=0.0181785;HRUN=4;LEN=1;MLLD=47.0511;QD=54.8654;RBI=0.0392588;REFB=0.120011;REVB=-0.0240668;RO=1;SAF=23;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0200431;STB=0.510634;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=-0.00359139;OID=.;OPOS=180047908;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:54:54:1:1:53:53:0.981481:30:23:1:0:30:23:1:0
chr2	180308028	.	C	T	62.67	PASS	AF=0.290323;AO=9;DP=31;FAO=9;FDP=31;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=16;FWDB=0.0422228;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.5076;QD=8.08706;RBI=0.043189;REFB=-0.0270675;REVB=-0.00908452;RO=22;SAF=7;SAR=2;SRF=6;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.540368;STB=0.828294;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.0711275;OID=.;OPOS=180308028;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:31:31:22:22:9:9:0.290323:2:7:6:16:2:7:6:16
chr2	180810180	.	C	T	291.52	PASS	AF=0.402439;AO=33;DP=83;FAO=33;FDP=82;FR=.;FRO=49;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=22;FSRR=27;FWDB=-0.01979;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.435;QD=14.2207;RBI=0.0204231;REFB=-0.0119758;REVB=-0.00504537;RO=49;SAF=13;SAR=20;SRF=23;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0812682;STB=0.533923;STBP=0.63;TYPE=snp;VARB=0.01366;OID=.;OPOS=180810180;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:82:49:49:33:33:0.402439:20:13:23:26:20:13:22:27
chr2	180810264	.	A	T	841.86	PASS	AF=1;AO=58;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0106054;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.463;QD=57.0752;RBI=0.0114995;REFB=0;REVB=0.00444569;RO=0;SAF=24;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.31293e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000437361;OID=.;OPOS=180810264;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:58:59:1:34:24:0:0:35:24:0:0
chr2	180835792	.	T	A	1413.52	PASS	AF=1;AO=89;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0369251;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=287.926;QD=62.8231;RBI=0.041746;REFB=0;REVB=-0.0194747;RO=0;SAF=47;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.28712e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.38985e-05;OID=.;OPOS=180835792;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:90:90:0:0:89:90:1:42:47:0:0:43:47:0:0
chr2	182374534	.	A	G	1008.14	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0255094;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.978;QD=59.3023;RBI=0.0257621;REFB=0;REVB=-0.00359958;RO=0;SAF=30;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.58981e-06;OID=.;OPOS=182374534;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:38:30:0:0:38:30:0:0
chr2	182395345	.	G	A	1274.79	PASS	AF=0.976744;AO=84;DP=86;FAO=84;FDP=86;FR=.;FRO=2;FSAF=39;FSAR=45;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0113958;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=246.184;QD=59.2924;RBI=0.0142906;REFB=-0.111004;REVB=-0.0086231;RO=2;SAF=39;SAR=45;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0236689;STB=0.512497;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=0.000513406;OID=.;OPOS=182395345;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:86:86:2:2:84:84:0.976744:45:39:2:0:45:39:2:0
chr2	182399097	.	T	C	689.34	PASS	AF=1;AO=43;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0621903;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.576;QD=62.6675;RBI=0.0624404;REFB=0;REVB=-0.00558262;RO=0;SAF=23;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000346395;OID=.;OPOS=182399097;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:43:44:1:20:23:0:0:21:23:0:0
chr2	182399638	.	A	G	1999.31	PASS	AF=1;AO=128;DP=131;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0525184;FXX=0.022899;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.5285;QD=62.4784;RBI=0.0525295;REFB=0;REVB=-0.00107977;RO=0;SAF=56;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.21615e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000117848;OID=.;OPOS=182399638;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:131:128:0:0:128:128:1:72:56:0:0:72:56:0:0
chr2	182400905	.	T	G	1542.17	PASS	AF=0.981308;AO=105;DP=107;FAO=105;FDP=107;FR=.;FRO=2;FSAF=48;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0524334;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.113;QD=57.6512;RBI=0.0525363;REFB=-0.104948;REVB=-0.00328515;RO=2;SAF=48;SAR=57;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0163586;STB=0.508619;STBP=0.214;TYPE=snp;VARB=0.000351634;OID=.;OPOS=182400905;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:107:107:2:2:105:105:0.981308:57:48:0:2:57:48:0:2
chr2	182403851	.	G	A	1080.61	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0120139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.962;QD=60.0338;RBI=0.0224551;REFB=0;REVB=0.018971;RO=0;SAF=36;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.49594e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.39943e-05;OID=.;OPOS=182403851;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:68:72:0:0:68:72:1:32:36:0:0:36:36:0:0
chr2	182413259	.	A	G	442.96	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0420824;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.19;QD=57.1558;RBI=0.0532027;REFB=0;REVB=0.0325515;RO=0;SAF=10;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0016188;OID=.;OPOS=182413259;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:31:0:0:30:31:1:20:10:0:0:20:11:0:0
chr2	182521578	.	G	A	1571.1	PASS	AF=1;AO=102;DP=102;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0335939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.141;QD=59.8514;RBI=0.0367583;REFB=0;REVB=0.0149206;RO=0;SAF=53;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.03142e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.18431e-05;OID=.;OPOS=182521578;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:102:105:0:0:102:105:1:49:53:0:0:49:56:0:0
chr2	182542864	.	C	G	94.24	PASS	AF=0.333333;AO=12;DP=36;FAO=12;FDP=36;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=17;FWDB=-0.137793;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.183;QD=10.4707;RBI=0.142677;REFB=0.0103288;REVB=-0.0370086;RO=24;SAF=5;SAR=7;SRF=7;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148288;STB=0.588097;STBP=0.491;TYPE=snp;VARB=-0.0668451;OID=.;OPOS=182542864;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:36:36:24:24:12:12:0.333333:7:5:7:17:7:5:7:17
chr2	182543455	.	T	C	698.99	PASS	AF=0.980392;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.01241;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=155.917;QD=54.8225;RBI=0.0373957;REFB=-0.100304;REVB=-0.0352765;RO=1;SAF=30;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154349;STB=0.508193;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=-6.49386e-05;OID=.;OPOS=182543455;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:51:51:1:1:50:50:0.980392:20:30:1:0:20:30:1:0
chr2	183007502	.	A	G	322.14	PASS	AF=0.608696;AO=28;DP=46;FAO=28;FDP=46;FR=.;FRO=18;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.00522094;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.3734;QD=28.0119;RBI=0.0784314;REFB=0.0464088;REVB=0.0782574;RO=18;SAF=17;SAR=11;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1175;STB=0.564827;STBP=0.262;TYPE=snp;VARB=-0.0248882;OID=.;OPOS=183007502;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:18:18:28:28:0.608696:11:17:8:10:11:17:8:10
chr2	183593697	.	C	T	512.47	PASS	AF=0.515789;AO=49;DP=95;FAO=49;FDP=95;FR=.;FRO=46;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=16;FSRR=30;FWDB=-0.00264384;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.535;QD=21.5777;RBI=0.0132773;REFB=0.0140425;REVB=-0.0130114;RO=46;SAF=20;SAR=29;SRF=16;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0554343;STB=0.530563;STBP=0.579;TYPE=snp;VARB=-0.00658686;OID=.;OPOS=183593697;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:46:46:49:49:0.515789:29:20:16:30:29:20:16:30
chr2	183622547	.	T	G	628.17	PASS	AF=0.484848;AO=64;DP=132;FAO=64;FDP=132;FR=.;FRO=68;FSAF=26;FSAR=38;FSRF=26;FSRR=42;FWDB=0.0466335;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.057;QD=19.0356;RBI=0.0476082;REFB=-0.0248509;REVB=0.00958413;RO=68;SAF=26;SAR=38;SRF=26;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0231855;STB=0.512816;STBP=0.798;TYPE=snp;VARB=0.0212698;OID=.;OPOS=183622547;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:132:132:68:68:64:64:0.484848:38:26:26:42:38:26:26:42
chr2	183627504	.	A	G	36.38	PASS	AF=0.285714;AO=6;DP=21;FAO=6;FDP=21;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=14;FWDB=0.000802785;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=161.907;QD=6.92897;RBI=0.0229238;REFB=-0.00192445;REVB=-0.0229098;RO=15;SAF=4;SAR=2;SRF=1;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.620201;STB=0.864112;STBP=0.185;TYPE=snp;VARB=0.00558732;OID=.;OPOS=183627504;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:21:21:15:15:6:6:0.285714:2:4:1:14:2:4:1:14
chr2	183738620	.	T	C	40.29	PASS	AF=0.545455;AO=6;DP=11;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.0586165;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.5058;QD=14.6523;RBI=0.0740958;REFB=0.0104294;REVB=0.0453243;RO=5;SAF=5;SAR=1;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.601011;STB=0.856027;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.00114793;OID=.;OPOS=183738620;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:11:11:5:5:6:6:0.545455:1:5:0:5:1:5:0:5
chr2	183789649	.	C	A	603.81	PASS	AF=1;AO=38;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.001892;FXX=0.0487686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.143;QD=61.929;RBI=0.00483214;REFB=0;REVB=0.00444633;RO=0;SAF=15;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.29877e-05;OID=.;OPOS=183789649;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:38:39:1:23:15:0:0:24:15:0:0
chr2	183799558	.	G	C	2064.82	PASS	AF=1;AO=132;DP=132;FAO=132;FDP=132;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0421163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.591;QD=62.5702;RBI=0.0445299;REFB=0;REVB=0.0144612;RO=0;SAF=64;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000129287;OID=.;OPOS=183799558;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:132:132:0:0:132:132:1:68:64:0:0:68:64:0:0
chr2	183961650	.	A	C	1909.23	PASS	AF=0.976744;AO=126;DP=129;FAO=126;FDP=129;FR=.;FRO=3;FSAF=57;FSAR=69;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.027131;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=250.169;QD=59.2008;RBI=0.0312438;REFB=-0.0257747;REVB=0.0154947;RO=2;SAF=57;SAR=69;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0135724;STB=0.502795;STBP=0.714;TYPE=snp;VARB=0.000648471;OID=.;OPOS=183961650;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:129:129:2:3:126:126:0.976744:69:57:0:2:69:57:1:2
chr2	183961668	.	A	G,T	1599.23	PASS	AF=0.926606,0.0733945;AO=101,7;DP=109;FAO=101,8;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=40,6;FSAR=61,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00325469,0.0199767;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=180.143,99.2639;QD=58.6873;RBI=0.0196203,0.0361367;REFB=0,0;REVB=0.0193485,-0.030113;RO=0;SAF=40,5;SAR=61,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.27427e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00414024,0.0632188;OID=.,.;OPOS=183961668,183961668;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:25:109:109:0:0:101,7:101,8:0.926606,0.0733945:61,2:40,5:0:0:61,2:40,6:0:0
chr2	184814072	.	T	C	471.96	PASS	AF=0.970588;AO=32;DP=34;FAO=33;FDP=34;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0234161;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.686;QD=55.5247;RBI=0.025964;REFB=-0.115125;REVB=0.0112167;RO=1;SAF=22;SAR=10;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0444006;STB=0.521726;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=0.00174008;OID=.;OPOS=184814072;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:34:34:1:1:32:33:0.970588:10:22:0:1:11:22:0:1
chr2	185469503	.	C	T	990.63	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0276214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.035;QD=59.142;RBI=0.0400965;REFB=0;REVB=0.0290652;RO=0;SAF=34;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.61397e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000125402;OID=.;OPOS=185469503;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:33:34:0:0:33:34:0:0
chr2	185800905	.	A	T	255.91	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0214751;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.048;QD=51.1825;RBI=0.0321448;REFB=0;REVB=-0.0239188;RO=0;SAF=9;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.01131e-05;OID=.;OPOS=185800905;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:11:9:0:0:11:9:0:0
chr2	185801747	.	G	A	447.02	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0665124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.043;QD=57.6804;RBI=0.0690238;REFB=0;REVB=-0.0184494;RO=0;SAF=14;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000342705;OID=.;OPOS=185801747;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:17:14:0:0:17:14:0:0
chr2	185801755	.	A	G	463.91	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159184;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.668;QD=57.9889;RBI=0.0182513;REFB=0;REVB=0.00892816;RO=0;SAF=13;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.63861e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.97057e-05;OID=.;OPOS=185801755;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:32:0:0:30:32:1:17:13:0:0:18:14:0:0
chr2	185802211	.	C	CACA	194.0	PASS	AF=0.782609;AO=16;DP=23;FAO=18;FDP=23;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=-0.0434659;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=226.433;QD=33.7392;RBI=0.0434937;REFB=-0.00497532;REVB=-0.00155672;RO=6;SAF=4;SAR=12;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.313275;STB=0.666473;STBP=0.008;TYPE=ins;VARB=0.000593409;OID=.;OPOS=185802212;OREF=-;OALT=ACA;OMAPALT=CACA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.782609:16:23:18:23:5:5:13:5:0:27:6:4:12:5:1
chr2	185802243	.	C	A	206.78	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0384473;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.897;QD=48.6538;RBI=0.0427637;REFB=0;REVB=0.0187225;RO=0;SAF=6;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000243701;OID=.;OPOS=185802243;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:17:0:0:16:17:1:10:6:0:0:10:7:0:0
chr2	185802363	.	A	G	902.69	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0285975;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.408;QD=58.2382;RBI=0.0305055;REFB=0;REVB=0.0106194;RO=0;SAF=31;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.33236e-05;OID=.;OPOS=185802363;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:31:31:0:0:31:31:0:0
chr2	186526579	.	G	A	2042.85	PASS	AF=1;AO=131;DP=131;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0342349;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.7651;QD=62.3772;RBI=0.048868;REFB=0;REVB=-0.034872;RO=0;SAF=59;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.95289e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000309178;OID=.;OPOS=186526579;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:131:131:0:0:131:131:1:72:59:0:0:72:59:0:0
chr2	186653546	.	G	A	173.05	PASS	AF=0.381818;AO=21;DP=53;FAO=21;FDP=55;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=20;FWDB=-0.00516038;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.8457;QD=12.5857;RBI=0.0306434;REFB=-0.0195469;REVB=-0.0302058;RO=32;SAF=12;SAR=9;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171895;STB=0.597846;STBP=0.264;TYPE=snp;VARB=0.02162;OID=.;OPOS=186653546;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:55:32:34:21:21:0.381818:9:12:13:19:9:12:14:20
chr2	186655726	.	G	A	747.09	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0184885;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.083;QD=63.5823;RBI=0.0197194;REFB=0;REVB=-0.00685792;RO=0;SAF=15;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.39459e-05;OID=.;OPOS=186655726;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:32:15:0:0:32:15:0:0
chr2	186656657	.	C	T	248.3	PASS	AF=0.352941;AO=30;DP=85;FAO=30;FDP=85;FR=.;FRO=55;FSAF=10;FSAR=20;FSRF=17;FSRR=38;FWDB=-0.00689626;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.2738;QD=11.6847;RBI=0.0591987;REFB=0.0106555;REVB=-0.0587956;RO=55;SAF=10;SAR=20;SRF=17;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0309555;STB=0.517845;STBP=0.849;TYPE=snp;VARB=-0.0214732;OID=.;OPOS=186656657;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:55:55:30:30:0.352941:20:10:17:38:20:10:17:38
chr2	186667360	.	A	C	206.64	PASS	AF=0.4375;AO=20;DP=47;FAO=21;FDP=48;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=0.00423779;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.173;QD=17.2198;RBI=0.00426827;REFB=0.00585053;REVB=-0.00050921;RO=27;SAF=12;SAR=8;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0458562;STB=0.509082;STBP=0.921;TYPE=snp;VARB=-0.00766758;OID=.;OPOS=186667360;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:48:27:27:20:21:0.4375:8:12:15:12:9:12:15:12
chr2	186668935	.	A	G	313.19	PASS	AF=0.515625;AO=33;DP=64;FAO=33;FDP=64;FR=.;FRO=31;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=21;FSRR=10;FWDB=0.0566593;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.452;QD=19.5743;RBI=0.0568071;REFB=-0.0240501;REVB=-0.00409528;RO=30;SAF=18;SAR=15;SRF=21;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135884;STB=0.565179;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.0189538;OID=.;OPOS=186668935;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:30:31:33:33:0.515625:15:18:21:9:15:18:21:10
chr2	186670104	.	A	C	1101.97	PASS	AF=0.986667;AO=74;DP=75;FAO=74;FDP=75;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0118199;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.0271;QD=58.7716;RBI=0.043793;REFB=-0.0226712;REVB=0.0421677;RO=1;SAF=36;SAR=38;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129601;STB=0.506848;STBP=0.335;TYPE=snp;VARB=0.00280227;OID=.;OPOS=186670104;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:75:75:1:1:74:74:0.986667:38:36:1:0:38:36:1:0
chr2	186670979	.	T	C	125.9	PASS	AF=0.518519;AO=14;DP=27;FAO=14;FDP=27;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.0159524;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.836;QD=18.6513;RBI=0.0209716;REFB=-0.00877847;REVB=0.0136135;RO=13;SAF=8;SAR=6;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0380779;STB=0.521708;STBP=0.853;TYPE=snp;VARB=0.00542533;OID=.;OPOS=186670979;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:13:13:14:14:0.518519:6:8:8:5:6:8:8:5
chr2	186697876	.	A	G	958.48	PASS	AF=0.985075;AO=66;DP=67;FAO=66;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0152951;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.1627;QD=57.2225;RBI=0.028768;REFB=-0.0190572;REVB=0.0243651;RO=1;SAF=33;SAR=33;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0141028;STB=0.50746;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.000401931;OID=.;OPOS=186697876;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:67:67:1:1:66:66:0.985075:33:33:1:0:33:33:1:0
chr2	187487160	.	G	A	488.25	PASS	AF=0.425197;AO=54;DP=127;FAO=54;FDP=127;FR=.;FRO=73;FSAF=26;FSAR=28;FSRF=26;FSRR=47;FWDB=0.0244083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.58;QD=15.378;RBI=0.0244239;REFB=0.00428786;REVB=-0.000870666;RO=73;SAF=26;SAR=28;SRF=26;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129639;STB=0.572493;STBP=0.203;TYPE=snp;VARB=-0.00785132;OID=.;OPOS=187487160;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:127:127:73:73:54:54:0.425197:28:26:26:47:28:26:26:47
chr2	187498107	.	T	C	434.31	PASS	AF=0.396825;AO=50;DP=126;FAO=50;FDP=126;FR=.;FRO=76;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=41;FSRR=35;FWDB=0.00664999;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=265.126;QD=13.7875;RBI=0.00721733;REFB=0.00307604;REVB=-0.00280491;RO=76;SAF=24;SAR=26;SRF=41;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0633812;STB=0.535813;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=-0.00503355;OID=.;OPOS=187498107;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:126:126:76:76:50:50:0.396825:26:24:41:35:26:24:41:35
chr2	187532417	.	G	A	1026.34	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0182417;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.3992;QD=59.4978;RBI=0.03302;REFB=0;REVB=0.0275237;RO=0;SAF=49;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.28744e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000403902;OID=.;OPOS=187532417;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:20:49:0:0:20:49:0:0
chr2	187558960	.	G	A	121.43	PASS	AF=0.4375;AO=14;DP=32;FAO=14;FDP=32;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=3;FWDB=0.0438412;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.557;QD=15.1781;RBI=0.0536136;REFB=-0.028529;REVB=0.0308605;RO=18;SAF=10;SAR=4;SRF=15;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154271;STB=0.588122;STBP=0.488;TYPE=snp;VARB=0.0334846;OID=.;OPOS=187558960;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:18:18:14:14:0.4375:4:10:15:3:4:10:15:3
chr2	187559029	.	A	ACAG	263.3	PASS	AF=0.648649;AO=21;DP=70;FAO=24;FDP=37;FR=.;FRO=13;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=1;FWDB=-0.00092616;FXX=0.372818;HRUN=1;LEN=3;MLLD=158.724;QD=28.4647;RBI=0.0751589;REFB=-0.0794151;REVB=0.0751532;RO=47;SAF=14;SAR=7;SRF=34;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0771349;STB=0.627924;STBP=0.062;TYPE=ins;VARB=0.0398499;OID=.;OPOS=187559030;OREF=-;OALT=CAG;OMAPALT=ACAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.648649:21:70:24:37:13:14:10:12:1:99:47:14:7:34:13
chr2	187559047	.	G	A,GCAA	216.16	PASS	AF=0.0724638,0.318841;AO=8,18;DP=85;FAO=5,22;FDP=69;FR=.;FRO=42;FSAF=3,13;FSAR=2,9;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=-0.0345073,0.00938076;FXX=0.103883;HRUN=1,1;LEN=1,3;MLLD=94.4918,108.601;QD=12.531;RBI=0.0632462,0.0538571;REFB=-0.0202524,-0.0330625;REVB=-0.0530031,-0.0530339;RO=56;SAF=3,13;SAR=5,5;SRF=34;SRR=22;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.272318,0.159116;STB=0.589384,0.56029;STBP=0.725,0.474;TYPE=snp,ins;VARB=0.116947,0.0579799;OID=.,.;OPOS=187559047,187559048;OREF=G,-;OALT=A,CAA;OMAPALT=A,GCAA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:85:69:56:42:8,18:5,22:0.0724638,0.318841:5,5:3,13:34:22:2,9:3,13:21:21
chr2	187626338	.	C	T	103.55	PASS	AF=0.545455;AO=12;DP=22;FAO=12;FDP=22;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.0148151;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.126;QD=18.8265;RBI=0.023595;REFB=0.00705196;REVB=-0.018364;RO=10;SAF=4;SAR=8;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0579899;STB=0.533277;STBP=0.786;TYPE=snp;VARB=-0.00671019;OID=.;OPOS=187626338;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:22:22:10:10:12:12:0.545455:8:4:4:6:8:4:4:6
chr2	188250301	.	T	A	1521.51	PASS	AF=0.990385;AO=103;DP=104;FAO=103;FDP=104;FR=.;FRO=1;FSAF=54;FSAR=49;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0031661;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.372;QD=58.5198;RBI=0.00333468;REFB=0.000499675;REVB=0.00104684;RO=0;SAF=54;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.95759e-08;STB=0.504586;STBP=0.465;TYPE=snp;VARB=-1.25132e-05;OID=.;OPOS=188250301;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:104:104:0:1:103:103:0.990385:49:54:0:0:49:54:1:0
chr2	188343497	.	T	C	487.71	PASS	AF=0.522222;AO=47;DP=90;FAO=47;FDP=90;FR=.;FRO=43;FSAF=33;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=24;FWDB=0.00627452;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.477;QD=21.6762;RBI=0.0223836;REFB=-0.00147037;REVB=0.0214862;RO=43;SAF=33;SAR=14;SRF=19;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.239395;STB=0.632635;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.00101258;OID=.;OPOS=188343497;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:43:43:47:47:0.522222:14:33:19:24:14:33:19:24
chr2	189460553	.	T	C	1492.57	PASS	AF=0.990196;AO=101;DP=103;FAO=101;FDP=102;FR=.;FRO=1;FSAF=54;FSAR=47;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00116473;FXX=0.0097078;HRUN=3;LEN=1;MLLD=138.608;QD=58.5321;RBI=0.0114813;REFB=0.124549;REVB=-0.011422;RO=1;SAF=54;SAR=47;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0087051;STB=0.504586;STBP=0.475;TYPE=snp;VARB=-0.000327564;OID=.;OPOS=189460553;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:103:102:1:1:101:101:0.990196:47:54:1:0:47:54:1:0
chr2	189866199	.	T	A	2814.46	PASS	AF=0.989071;AO=181;DP=181;FAO=181;FDP=183;FR=.;FRO=2;FSAF=103;FSAR=78;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0084714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.636;QD=61.5182;RBI=0.0296184;REFB=-0.00606374;REVB=0.028381;RO=0;SAF=104;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.500769;STBP=0.869;TYPE=snp;VARB=8.99574e-05;OID=.;OPOS=189866199;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:181:183:0:2:181:181:0.989071:77:104:0:0:78:103:1:1
chr2	189875421	.	T	G	1044.37	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00410869;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.701;QD=59.6782;RBI=0.0250771;REFB=0;REVB=0.0247383;RO=0;SAF=44;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.87154e-05;OID=.;OPOS=189875421;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:26:44:0:0:26:44:0:0
chr2	189907937	.	A	G	1175.28	PASS	AF=1;AO=77;DP=78;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0650509;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.0814;QD=61.0537;RBI=0.0713462;REFB=0;REVB=0.0293029;RO=0;SAF=40;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000470215;OID=.;OPOS=189907937;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:77:0:0:77:77:1:37:40:0:0:37:40:0:0
chr2	189932831	.	T	C	1062.44	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0166422;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.221;QD=59.8559;RBI=0.017456;REFB=0;REVB=0.00526767;RO=0;SAF=35;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11607e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.69022e-05;OID=.;OPOS=189932831;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:36:35:0:0:36:35:0:0
chr2	189962072	.	A	T	1076.95	PASS	AF=0.511848;AO=107;DP=210;FAO=108;FDP=211;FR=.;FRO=103;FSAF=52;FSAR=56;FSRF=46;FSRR=57;FWDB=0.00412287;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.349;QD=20.4161;RBI=0.00433347;REFB=-0.00288509;REVB=-0.00133452;RO=103;SAF=51;SAR=56;SRF=46;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.026961;STB=0.517068;STBP=0.596;TYPE=snp;VARB=0.00286572;OID=.;OPOS=189962072;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:210:211:103:103:107:108:0.511848:56:51:46:57:56:52:46:57
chr2	189974958	.	G	T	157.91	PASS	AF=0.64;AO=16;DP=25;FAO=16;FDP=25;FR=.;FRO=9;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.0852698;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.236;QD=25.2657;RBI=0.0898028;REFB=-0.0304102;REVB=0.0281712;RO=9;SAF=8;SAR=8;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0357466;STB=0.519975;STBP=0.814;TYPE=snp;VARB=0.0141947;OID=.;OPOS=189974958;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:25:25:9:9:16:16:0.64:8:8:5:4:8:8:5:4
chr2	189997837	.	CG	C,CA	696.81	PASS	AF=0.132075,0.867925;AO=9,44;DP=53;FAO=7,46;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=0,42;FSAR=7,4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0278035,0.0174142;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=29.5794,42.0105;QD=52.5892;RBI=0.0594327,0.132994;REFB=0,0;REVB=0.0525282,0.131849;RO=0;SAF=0,42;SAR=9,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.78902e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.071358,0.00428016;OID=.,.;OPOS=189997838,189997838;OREF=G,G;OALT=-,A;OMAPALT=C,CA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.132075,0.867925:9,44:53:7,46:53:0:0,42:7,4:0:0:18:0:0,42:9,2:0:0
chr2	190323530	.	A	G	579.47	PASS	AF=0.611765;AO=52;DP=85;FAO=52;FDP=85;FR=.;FRO=33;FSAF=28;FSAR=24;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=0.00639842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.69;QD=27.2693;RBI=0.0136764;REFB=0.0154213;REVB=-0.0120873;RO=33;SAF=28;SAR=24;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00501414;STB=0.502731;STBP=0.943;TYPE=snp;VARB=-0.0111282;OID=.;OPOS=190323530;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:33:33:52:52:0.611765:24:28:18:15:24:28:18:15
chr2	190430177	.	A	G	1625.51	PASS	AF=0.990909;AO=109;DP=110;FAO=109;FDP=110;FR=.;FRO=1;FSAF=60;FSAR=49;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0215379;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.4822;QD=59.1095;RBI=0.0270577;REFB=-0.0211374;REVB=-0.016378;RO=1;SAF=60;SAR=49;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0078464;STB=0.504131;STBP=0.486;TYPE=snp;VARB=0.000298856;OID=.;OPOS=190430177;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:110:110:1:1:109:109:0.990909:49:60:1:0:49:60:1:0
chr2	190531426	.	G	A	1567.96	PASS	AF=1;AO=97;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0169022;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.342;QD=63.9982;RBI=0.0169242;REFB=0;REVB=-0.000862975;RO=0;SAF=43;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.50386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.37444e-05;OID=.;OPOS=190531426;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:98:0:0:97:98:1:54:43:0:0:54:44:0:0
chr2	190595258	.	G	T	1518.72	PASS	AF=1;AO=95;DP=96;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0365135;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.8033;QD=62.6277;RBI=0.0461625;REFB=0;REVB=0.0282442;RO=1;SAF=47;SAR=48;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00998257;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0177786;OID=.;OPOS=190595258;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:96:97:1:0:95:97:1:48:47:1:0:48:49:0:0
chr2	190602513	.	T	C	842.1	PASS	AF=0.967742;AO=60;DP=62;FAO=60;FDP=62;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00879466;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=80.6139;QD=54.329;RBI=0.0276751;REFB=-0.132263;REVB=0.0262405;RO=1;SAF=27;SAR=33;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0171579;STB=0.501628;STBP=0.877;TYPE=snp;VARB=0.00149264;OID=.;OPOS=190602513;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:62:62:1:2:60:60:0.967742:33:27:1:0:33:27:1:1
chr2	190617643	.	A	G,T	1073.54	PASS	AF=0.84,0.16;AO=59,15;DP=74;FAO=63,12;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=35,0;FSAR=28,12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00144501,-0.0533654;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=148.291,33.6369;QD=57.2553;RBI=0.0355231,0.0559469;REFB=0,0;REVB=0.0354937,-0.0167987;RO=0;SAF=31,3;SAR=28,12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00288762,0.232107;OID=.,.;OPOS=190617643,190617643;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:62:74:75:0:0:59,15:63,12:0.84,0.16:28,12:31,3:0:0:28,12:35,0:0:0
chr2	190618249	.	T	A	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100343;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.077;QD=56.1912;RBI=0.0105767;REFB=0;REVB=0.00334342;RO=0;SAF=21;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000110248;OID=.;OPOS=190618249;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:7:21:0:0:7:21:0:0
chr2	190636411	.	C	G	1153.53	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0178063;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.007;QD=60.7123;RBI=0.0182278;REFB=0;REVB=0.00389764;RO=0;SAF=42;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.6391e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.87782e-05;OID=.;OPOS=190636411;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:34:42:0:0:34:42:0:0
chr2	190788844	.	T	TC	243.13	PASS	AF=1;AO=9;DP=21;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00412823;FXX=0.0475964;HRUN=0;LEN=1;MLLD=80.6805;QD=48.6253;RBI=0.139488;REFB=0;REVB=0.139427;RO=10;SAF=7;SAR=2;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.50325;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00304336;OID=.;OPOS=190788845;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:9:21:20:20:0:8:12:0:0:4:10:7:2:2:8
chr2	190788845	.	G	C	96.24	PASS	AF=0.55;AO=9;DP=19;FAO=11;FDP=20;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=0.0253752;FXX=0.0475964;HRUN=6;LEN=1;MLLD=87.1169;QD=19.2479;RBI=0.130718;REFB=-0.0310242;REVB=0.128231;RO=9;SAF=1;SAR=8;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.614015;STB=0.785857;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.0127714;OID=.;OPOS=190788845;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:19:20:9:9:9:11:0.55:8:1:7:2:9:2:7:2
chr2	190815211	.	G	A	575.8	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0135676;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=261.121;QD=60.6102;RBI=0.0138186;REFB=0;REVB=-0.002622;RO=0;SAF=11;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.536e-05;OID=.;OPOS=190815211;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:27:11:0:0:27:11:0:0
chr2	191064753	.	C	T	189.05	PASS	AF=0.527778;AO=19;DP=36;FAO=19;FDP=36;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.038551;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.2657;QD=21.0055;RBI=0.0594281;REFB=0.0173427;REVB=0.0452274;RO=17;SAF=6;SAR=13;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.237147;STB=0.634001;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=-0.0218834;OID=.;OPOS=191064753;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:17:17:19:19:0.527778:13:6:10:7:13:6:10:7
chr2	191065236	.	TTTTG	T	134.66	PASS	AF=0.456522;AO=19;DP=44;FAO=21;FDP=46;FR=.;FRO=25;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=0.00556013;FXX=0;HRUN=5;LEN=4;MLLD=309.989;QD=11.7094;RBI=0.00556075;REFB=-0.0049205;REVB=-8.2868e-05;RO=24;SAF=8;SAR=11;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157769;STB=0.566947;STBP=0.432;TYPE=del;VARB=0.00612799;OID=.;OPOS=191065237;OREF=TTTG;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.456522:19:44:21:46:25:10:11:15:10:99:24:8:11:14:10
chr2	191065595	.	G	T	103.94	PASS	AF=0.317073;AO=13;DP=41;FAO=13;FDP=41;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.00438605;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=117.947;QD=10.1409;RBI=0.00460616;REFB=0.00531132;REVB=-0.00140689;RO=28;SAF=7;SAR=6;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00313347;STB=0.501884;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00559885;OID=.;OPOS=191065595;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:28:28:13:13:0.317073:6:7:15:13:6:7:15:13
chr2	191065782	.	A	AGAT	80.57	PASS	AF=0.333333;AO=10;DP=34;FAO=11;FDP=33;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=0.00501501;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=3;MLLD=262.315;QD=9.76601;RBI=0.00780329;REFB=-0.0156323;REVB=-0.00597837;RO=23;SAF=8;SAR=2;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215424;STB=0.627647;STBP=0.403;TYPE=ins;VARB=0.0296707;OID=.;OPOS=191065783;OREF=-;OALT=GAT;OMAPALT=AGAT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.333333:10:34:11:33:22:9:2:15:7:80:23:8:2:15:8
chr2	191066683	.	C	T	478.41	PASS	AF=0.522727;AO=46;DP=90;FAO=46;FDP=88;FR=.;FRO=42;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=19;FSRR=23;FWDB=-0.0182957;FXX=0.0222198;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.343;QD=21.7458;RBI=0.0228069;REFB=0.0033852;REVB=-0.013617;RO=43;SAF=21;SAR=25;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00756319;STB=0.501991;STBP=0.974;TYPE=snp;VARB=-0.00383744;OID=.;OPOS=191066683;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:88:43:42:46:46:0.522727:25:21:20:23:25:21:19:23
chr2	191066769	.	C	T	269.83	PASS	AF=1;AO=17;DP=23;FAO=21;FDP=21;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0422072;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.2496;QD=51.3968;RBI=0.0458042;REFB=0;REVB=0.0177927;RO=0;SAF=8;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0191977;OID=.;OPOS=191066769;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:21:0:0:17:21:1:9:8:0:0:11:10:0:0
chr2	191066913	.	T	C	44.92	PASS	AF=0.304348;AO=7;DP=23;FAO=7;FDP=23;FR=.,HEALED;FRO=16;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.086131;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=184.185;QD=7.81245;RBI=0.0913145;REFB=-0.0280705;REVB=0.0303279;RO=13;SAF=3;SAR=4;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0476186;STB=0.549857;STBP=0.772;TYPE=snp;VARB=0.0621307;OID=.;OPOS=191066913;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:23:23:13:16:7:7:0.304348:4:3:5:8:4:3:8:8
chr2	191066970	.	C	T	151.21	PASS	AF=0.447368;AO=16;DP=37;FAO=17;FDP=38;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0497485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.3777;QD=15.9168;RBI=0.0519525;REFB=-0.0159259;REVB=0.0149717;RO=21;SAF=7;SAR=9;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0851303;STB=0.529377;STBP=0.766;TYPE=snp;VARB=0.0410871;OID=.;OPOS=191066970;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:38:21:21:16:17:0.447368:9:7:11:10:9:8:11:10
chr2	191067233	.	T	C	160.92	PASS	AF=0.33871;AO=21;DP=62;FAO=21;FDP=62;FR=.;FRO=41;FSAF=16;FSAR=5;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=-0.00939911;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.468;QD=10.382;RBI=0.0490599;REFB=-0.00197773;REVB=0.0481512;RO=41;SAF=16;SAR=5;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.310223;STB=0.683573;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.00482796;OID=.;OPOS=191067233;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:41:41:21:21:0.33871:5:16:21:20:5:16:21:20
chr2	191067766	.	T	TTC	224.99	PASS	AF=0.48;AO=21;DP=53;FAO=24;FDP=50;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=0.0112949;FXX=0.019604;HRUN=3;LEN=2;MLLD=154.789;QD=17.999;RBI=0.0156364;REFB=-0.0143227;REVB=0.0108131;RO=30;SAF=9;SAR=12;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0300506;STB=0.517227;STBP=0.843;TYPE=ins;VARB=0.0171966;OID=.;OPOS=191067767;OREF=-;OALT=TC;OMAPALT=TTC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.48:21:53:24:50:26:10:14:10:16:99:30:9:12:12:18
chr2	191068061	.	A	T	67.53	PASS	AF=0.375;AO=9;DP=25;FAO=9;FDP=24;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=0.0274669;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.8753;QD=11.2558;RBI=0.029689;REFB=0.0162853;REVB=-0.0112697;RO=15;SAF=6;SAR=3;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0166209;OID=.;OPOS=191068061;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:25:24:15:15:9:9:0.375:3:6:10:5:3:6:10:5
chr2	191161622	.	T	C	392.92	PASS	AF=0.450549;AO=41;DP=91;FAO=41;FDP=91;FR=.;FRO=50;FSAF=27;FSAR=14;FSRF=28;FSRR=22;FWDB=0.035778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.8514;QD=17.2714;RBI=0.0368293;REFB=-0.000731921;REVB=-0.00873662;RO=49;SAF=27;SAR=14;SRF=27;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111356;STB=0.55795;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=0.00227394;OID=.;OPOS=191161622;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:49:50:41:41:0.450549:14:27:27:22:14:27:28:22
chr2	191224981	.	G	T	416.68	PASS	AF=0.494118;AO=42;DP=85;FAO=42;FDP=85;FR=.;FRO=43;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=13;FSRR=30;FWDB=0.0192778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.8739;QD=19.6084;RBI=0.0208988;REFB=0.00463638;REVB=0.0080701;RO=43;SAF=19;SAR=23;SRF=13;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140453;STB=0.577704;STBP=0.203;TYPE=snp;VARB=-0.00465777;OID=.;OPOS=191224981;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:43:43:42:42:0.494118:23:19:13:30:23:19:13:30
chr2	191227365	.	GA	G,GG	71.77	PASS	AF=0.325,0.075;AO=13,3;DP=40;FAO=13,3;FDP=40;FR=.;FRO=24;FSAF=8,0;FSAR=5,3;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.118264,0.0414942;FXX=0;HRUN=7,7;LEN=1,1;MLLD=9.1192,27.4235;QD=7.17658;RBI=0.124042,0.048348;REFB=-0.113104,-0.0739682;REVB=-0.0374187,0.0248146;RO=23;SAF=7,0;SAR=6,3;SRF=10;SRR=13;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.111318,-0.555009;STB=0.627903,0.995827;STBP=0.264,0.123;TYPE=del,snp;VARB=0.103838,0.184229;OID=.,.;OPOS=191227366,191227366;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.325,0.075:13,3:40:13,3:40:24:8,0:5,3:10:14:60:23:7,0:6,3:10:13
chr2	191231458	.	G	A	1406.44	PASS	AF=0.978495;AO=91;DP=92;FAO=91;FDP=93;FR=.;FRO=2;FSAF=48;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00697943;FXX=0.0106372;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.151;QD=60.492;RBI=0.0291909;REFB=0.000481568;REVB=0.0283443;RO=1;SAF=48;SAR=43;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0108962;STB=0.500592;STBP=0.86;TYPE=snp;VARB=0.000105912;OID=.;OPOS=191231458;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:92:93:1:2:91:91:0.978495:43:48:0:1:43:48:1:1
chr2	191231503	.	G	A	496.92	PASS	AF=0.477477;AO=53;DP=110;FAO=53;FDP=111;FR=.;FRO=58;FSAF=29;FSAR=24;FSRF=31;FSRR=27;FWDB=-0.0207721;FXX=0.00892777;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.2945;QD=17.907;RBI=0.0208582;REFB=-0.0190196;REVB=0.0018927;RO=57;SAF=29;SAR=24;SRF=30;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0196077;STB=0.506678;STBP=0.926;TYPE=snp;VARB=0.0162019;OID=.;OPOS=191231503;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:111:57:58:53:53:0.477477:24:29:30:27:24:29:31:27
chr2	191235901	.	A	C,G	1186.96	PASS	AF=0.962963,0.037037;AO=74,3;DP=77;FAO=78,3;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=42,3;FSAR=36,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0145001,0.00570111;FXX=0.0121936;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=76.6482,107.965;QD=58.6153;RBI=0.0856449,0.00578778;REFB=0,0;REVB=0.0844085,-0.000997861;RO=0;SAF=42,3;SAR=32,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00151191,0.0349942;OID=.,.;OPOS=191235901,191235901;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:6:77:81:0:0:74,3:78,3:0.962963,0.037037:32,0:42,3:0:0:36,0:42,3:0:0
chr2	191301368	.	A	G	95.43	PASS	AF=0.909091;AO=10;DP=11;FAO=10;FDP=11;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.120966;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.8759;QD=34.7027;RBI=0.124818;REFB=0.0771866;REVB=-0.0307724;RO=1;SAF=3;SAR=7;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126911;STB=0.57128;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=-0.0025198;OID=.;OPOS=191301368;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:11:11:1:1:10:10:0.909091:7:3:1:0:7:3:1:0
chr2	191354491	.	T	C	412.75	PASS	AF=0.639344;AO=39;DP=61;FAO=39;FDP=61;FR=.;FRO=22;FSAF=26;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.000751073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.529;QD=27.0656;RBI=0.00431188;REFB=-0.0226574;REVB=0.00424596;RO=22;SAF=26;SAR=13;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148754;STB=0.581352;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=0.00596427;OID=.;OPOS=191354491;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:22:22:39:39:0.639344:13:26:10:12:13:26:10:12
chr2	191379268	.	G	A	56.05	PASS	AF=0.296296;AO=8;DP=28;FAO=8;FDP=27;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.0621098;FXX=0.0689417;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.968;QD=8.30304;RBI=0.0621133;REFB=-0.00189172;REVB=-0.000657816;RO=19;SAF=5;SAR=3;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171661;STB=0.607206;STBP=0.484;TYPE=snp;VARB=0.00210039;OID=.;OPOS=191379268;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:28:27:19:19:8:8:0.296296:3:5:9:10:3:5:9:10
chr2	191402654	.	A	G	55.19	PASS	AF=0.307692;AO=8;DP=27;FAO=8;FDP=26;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=0.0248272;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.4787;QD=8.49002;RBI=0.0929121;REFB=0.0168579;REVB=-0.0895336;RO=17;SAF=4;SAR=4;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162757;STB=0.576735;STBP=0.65;TYPE=snp;VARB=-0.0408206;OID=.;OPOS=191402654;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:27:26:17:18:8:8:0.307692:4:4:11:6:4:4:11:7
chr2	191402680	.	A	G	70.61	PASS	AF=0.2;AO=11;DP=55;FAO=11;FDP=55;FR=.;FRO=44;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=34;FSRR=10;FWDB=0.000115001;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.53;QD=5.13539;RBI=0.0285635;REFB=0.00321931;REVB=0.0285632;RO=44;SAF=8;SAR=3;SRF=34;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0744448;STB=0.547743;STBP=0.826;TYPE=snp;VARB=-0.0279231;OID=.;OPOS=191402680;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:70:55:55:44:44:11:11:0.2:3:8:34:10:3:8:34:10
chr2	191402685	.	A	C	373.78	PASS	AF=0.631579;AO=36;DP=57;FAO=36;FDP=57;FR=.;FRO=21;FSAF=30;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=0.00212255;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.2092;QD=26.2303;RBI=0.0182854;REFB=0.0336622;REVB=0.0181618;RO=21;SAF=30;SAR=6;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.216102;STB=0.619394;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=-0.0161776;OID=.;OPOS=191402685;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:21:21:36:36:0.631579:6:30:13:8:6:30:13:8
chr2	191402698	.	A	C	429.1	PASS	AF=0.640625;AO=27;DP=63;FAO=41;FDP=64;FR=.;FRO=23;FSAF=34;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=0.0103918;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=39.9885;QD=26.8186;RBI=0.035097;REFB=0.0077622;REVB=0.0335232;RO=18;SAF=20;SAR=7;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.201182;STB=0.618117;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=-0.00590904;OID=.;OPOS=191402698;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:64:18:23:27:41:0.640625:7:20:9:9:7:34:14:9
chr2	191402702	.	T	C	509.01	PASS	AF=0.657143;AO=46;DP=70;FAO=46;FDP=70;FR=.;FRO=24;FSAF=39;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.0545036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.9813;QD=29.086;RBI=0.0658537;REFB=-0.000265015;REVB=-0.0369603;RO=24;SAF=39;SAR=7;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.256896;STB=0.641129;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=-0.000894567;OID=.;OPOS=191402702;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:24:24:46:46:0.657143:7:39:14:10:7:39:14:10
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chr2	191828203	.	A	T	330.59	PASS	AF=0.523077;AO=34;DP=65;FAO=34;FDP=65;FR=.;FRO=31;FSAF=24;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=0.01575;FXX=0.0298463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.5545;QD=20.3438;RBI=0.0341702;REFB=-0.00192356;REVB=-0.030324;RO=27;SAF=24;SAR=10;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0709851;STB=0.56786;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.00719227;OID=.;OPOS=191828203;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:27:31:34:34:0.523077:10:24:17:10:10:24:18:13
chr2	191828205	.	C	A	324.49	PASS	AF=0.515152;AO=34;DP=66;FAO=34;FDP=66;FR=.;FRO=32;FSAF=24;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=0.00646213;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=209.731;QD=19.6663;RBI=0.0089506;REFB=-0.0109305;REVB=0.00619307;RO=32;SAF=24;SAR=10;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111312;STB=0.56208;STBP=0.34;TYPE=snp;VARB=0.0103083;OID=.;OPOS=191828205;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:32:32:34:34:0.515152:10:24:19:13:10:24:19:13
chr2	192160839	.	A	T	1153.24	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0387681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.146;QD=60.6971;RBI=0.0404125;REFB=0;REVB=0.0114108;RO=0;SAF=37;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.61688e-05;OID=.;OPOS=192160839;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:39:37:0:0:39:37:0:0
chr2	192160875	.	C	T	1102.24	PASS	AF=0.986667;AO=74;DP=75;FAO=74;FDP=75;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0150113;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.267;QD=58.7864;RBI=0.0151536;REFB=0.0112751;REVB=0.00207119;RO=1;SAF=33;SAR=41;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0141198;STB=0.507461;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=1.92987e-05;OID=.;OPOS=192160875;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:75:75:1:1:74:74:0.986667:41:33:1:0:41:33:1:0
chr2	192250726	.	G	A	613.36	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0255838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.35;QD=61.3364;RBI=0.0368058;REFB=0;REVB=0.0264601;RO=0;SAF=20;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.70388e-05;OID=.;OPOS=192250726;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:20:20:0:0:20:20:0:0
chr2	192279327	.	T	C	1470.73	PASS	AF=0.989474;AO=93;DP=96;FAO=94;FDP=95;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=52;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00303743;FXX=0.0104156;HRUN=2;LEN=1;MLLD=285.689;QD=61.9255;RBI=0.023612;REFB=0.165162;REVB=0.0234158;RO=1;SAF=41;SAR=52;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.011423;STB=0.505881;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=3.5588e-05;OID=.;OPOS=192279327;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:96:95:1:1:93:94:0.989474:52:41:1:0:52:42:1:0
chr2	192699639	.	A	AG	330.93	PASS	AF=0.375758;AO=61;DP=172;FAO=62;FDP=165;FR=.;FRO=103;FSAF=23;FSAR=39;FSRF=57;FSRR=46;FWDB=0.0888879;FXX=0.00602373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=26.6052;QD=8.02249;RBI=0.0902919;REFB=0.0191969;REVB=0.0158612;RO=110;SAF=22;SAR=39;SRF=62;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.229902;STB=0.614741;STBP=0.022;TYPE=ins;VARB=-0.0281392;OID=.;OPOS=192699640;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.375758:61:172:62:165:103:23:39:57:46:99:110:22:39:62:48
chr2	192701393	.	A	G	362.07	PASS	AF=0.394495;AO=43;DP=109;FAO=43;FDP=109;FR=.;FRO=66;FSAF=15;FSAR=28;FSRF=31;FSRR=35;FWDB=-0.021406;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.186;QD=13.287;RBI=0.0297068;REFB=-0.0106342;REVB=-0.020598;RO=64;SAF=15;SAR=28;SRF=31;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149157;STB=0.576766;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=0.0362402;OID=.;OPOS=192701393;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:109:64:66:43:43:0.394495:28:15:31:33:28:15:31:35
chr2	195523141	.	G	T	989.05	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0627838;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.4286;QD=59.0477;RBI=0.0822271;REFB=0;REVB=0.0530988;RO=0;SAF=35;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.769e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.54603e-05;OID=.;OPOS=195523141;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:67:0:0:66:67:1:31:35:0:0:32:35:0:0
chr2	196602089	.	T	TATCA	63.22	PASS	AF=0.209302;AO=9;DP=55;FAO=9;FDP=43;FR=.;FRO=34;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=-0.0550902;FXX=0.104145;HRUN=1;LEN=4;MLLD=149.854;QD=5.88051;RBI=0.0562064;REFB=-0.00901346;REVB=0.0111462;RO=46;SAF=4;SAR=5;SRF=26;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147058;STB=0.589547;STBP=0.577;TYPE=ins;VARB=0.0792334;OID=.;OPOS=196602090;OREF=-;OALT=ATCA;OMAPALT=TATCA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.209302:9:55:9:43:34:4:5:19:15:63:46:4:5:26:20
chr2	196602132	.	GTGAT	G	235.87	PASS	AF=0.578947;AO=23;DP=39;FAO=22;FDP=38;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=-0.0288233;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=4;MLLD=262.785;QD=24.8288;RBI=0.0383817;REFB=-0.0209845;REVB=0.025345;RO=16;SAF=10;SAR=13;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140018;STB=0.590826;STBP=0.196;TYPE=del;VARB=0.0151022;OID=.;OPOS=196602133;OREF=TGAT;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.578947:23:39:22:38:16:9:13:10:6:99:16:10:13:10:6
chr2	196602206	.	A	AAGTC	190.87	PASS	AF=0.396552;AO=23;DP=60;FAO=23;FDP=58;FR=.;FRO=35;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=0.00343321;FXX=0.0491723;HRUN=2;LEN=4;MLLD=245.376;QD=13.1637;RBI=0.0162849;REFB=-0.00180194;REVB=-0.0159189;RO=37;SAF=10;SAR=13;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0557377;STB=0.530987;STBP=0.757;TYPE=ins;VARB=0.00278983;OID=.;OPOS=196602207;OREF=-;OALT=AGTC;OMAPALT=AAGTC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.396552:23:60:23:58:35:10:13:17:18:99:37:10:13:18:19
chr2	196673533	.	A	G	658.85	PASS	AF=0.93617;AO=45;DP=47;FAO=44;FDP=47;FR=.;FRO=3;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.00883339;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.1385;QD=56.0719;RBI=0.0850707;REFB=-0.213576;REVB=0.0846108;RO=2;SAF=19;SAR=26;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0347865;STB=0.528289;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=0.0167691;OID=.;OPOS=196673533;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:47:47:2:3:45:44:0.93617:26:19:0:2:25:19:0:3
chr2	196765098	.	G	A	311.56	PASS	AF=0.507692;AO=33;DP=65;FAO=33;FDP=65;FR=.;FRO=32;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=-0.0180247;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.166;QD=19.1728;RBI=0.0293415;REFB=0.000440609;REVB=0.0231524;RO=32;SAF=17;SAR=16;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0142511;STB=0.507932;STBP=0.911;TYPE=snp;VARB=-0.000605002;OID=.;OPOS=196765098;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:32:32:33:33:0.507692:16:17:17:15:16:17:17:15
chr2	196791276	.	T	G	119.42	PASS	AF=0.296296;AO=16;DP=54;FAO=16;FDP=54;FR=.;FRO=38;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=26;FWDB=0.0203579;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.6796;QD=8.84557;RBI=0.0575131;REFB=0.00943393;REVB=0.0537895;RO=38;SAF=10;SAR=6;SRF=12;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.350192;STB=0.707725;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=-0.0200308;OID=.;OPOS=196791276;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:38:38:16:16:0.296296:6:10:12:26:6:10:12:26
chr2	196825402	.	T	C	316.66	PASS	AF=0.483333;AO=26;DP=60;FAO=29;FDP=60;FR=.,HEALED;FRO=20;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=-0.11321;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=265.584;QD=21.1107;RBI=0.113656;REFB=-0.0139495;REVB=0.0100653;RO=12;SAF=9;SAR=17;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0625892;STB=0.563335;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=-0.000497929;OID=.;OPOS=196825402;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:60:60:12:20:26:29:0.483333:17:9:3:9:20:9:9:11
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chr2	196866420	.	C	T	486.69	PASS	AF=0.452991;AO=53;DP=117;FAO=53;FDP=117;FR=.;FRO=64;FSAF=23;FSAR=30;FSRF=45;FSRR=19;FWDB=-0.0087369;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=260.023;QD=16.6388;RBI=0.0124786;REFB=-0.00626218;REVB=-0.00890963;RO=63;SAF=23;SAR=30;SRF=44;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.253625;STB=0.644091;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.00806355;OID=.;OPOS=196866420;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:117:117:63:64:53:53:0.452991:30:23:44:19:30:23:45:19
chr2	196877557	.	T	C	332.0	PASS	AF=0.439024;AO=36;DP=82;FAO=36;FDP=82;FR=.;FRO=46;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=26;FSRR=20;FWDB=0.000607757;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.959;QD=16.195;RBI=0.00484097;REFB=-0.00378342;REVB=0.00480267;RO=46;SAF=24;SAR=12;SRF=26;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108737;STB=0.561368;STBP=0.344;TYPE=snp;VARB=0.00408718;OID=.;OPOS=196877557;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:46:46:36:36:0.439024:12:24:26:20:12:24:26:20
chr2	196912179	.	G	C	356.14	PASS	AF=0.44186;AO=38;DP=86;FAO=38;FDP=86;FR=.;FRO=48;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=30;FWDB=0.0020267;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=277.72;QD=16.5647;RBI=0.0114677;REFB=0.0104483;REVB=0.0112872;RO=48;SAF=22;SAR=16;SRF=18;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.200658;STB=0.612532;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=-0.0107411;OID=.;OPOS=196912179;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:48:48:38:38:0.44186:16:22:18:30:16:22:18:30
chr2	196915991	.	A	G	1498.19	PASS	AF=0.946429;AO=103;DP=109;FAO=106;FDP=112;FR=.;FRO=6;FSAF=45;FSAR=61;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.00279177;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.8643;QD=53.5068;RBI=0.0119845;REFB=0.0261752;REVB=-0.0116548;RO=6;SAF=45;SAR=58;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0109883;STB=0.505006;STBP=0.66;TYPE=snp;VARB=-0.0269915;OID=.;OPOS=196915991;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:109:112:6:6:103:106:0.946429:58:45:2:4:61:45:2:4
chr2	197004439	.	A	G	2015.89	PASS	AF=0.992366;AO=130;DP=132;FAO=130;FDP=131;FR=.;FRO=1;FSAF=71;FSAR=59;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0165608;FXX=0.00757518;HRUN=3;LEN=1;MLLD=282.259;QD=61.554;RBI=0.0204405;REFB=-0.111276;REVB=0.0119814;RO=1;SAF=71;SAR=59;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00664708;STB=0.503496;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.000100204;OID=.;OPOS=197004439;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:132:131:1:1:130:130:0.992366:59:71:1:0:59:71:1:0
chr2	197021276	.	T	C	332.9	PASS	AF=0.381443;AO=34;DP=94;FAO=37;FDP=97;FR=.;FRO=60;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=35;FSRR=25;FWDB=0.0173936;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=294.451;QD=13.7279;RBI=0.0180159;REFB=-0.00451316;REVB=-0.00469441;RO=59;SAF=14;SAR=20;SRF=34;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180919;STB=0.576137;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=0.00692513;OID=.;OPOS=197021276;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:97:59:60:34:37:0.381443:20:14:34:25:20:17:35:25
chr2	197021372	.	T	A	689.36	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00157979;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=235.188;QD=62.6689;RBI=0.00540443;REFB=0;REVB=0.00516838;RO=0;SAF=18;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.29395e-06;OID=.;OPOS=197021372;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:26:18:0:0:26:18:0:0
chr2	197065221	.	A	G	1181.95	PASS	AF=0.975309;AO=79;DP=81;FAO=79;FDP=81;FR=.;FRO=2;FSAF=41;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00666646;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.936;QD=58.3678;RBI=0.0441943;REFB=-0.019809;REVB=0.0436886;RO=2;SAF=41;SAR=38;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000888511;STB=0.500469;STBP=0.882;TYPE=snp;VARB=0.00038632;OID=.;OPOS=197065221;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:81:81:2:2:79:79:0.975309:38:41:1:1:38:41:1:1
chr2	197065415	.	T	C	305.55	PASS	AF=0.52459;AO=32;DP=61;FAO=32;FDP=61;FR=.;FRO=29;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=0.00856954;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.5719;QD=20.0358;RBI=0.0520777;REFB=-0.0211553;REVB=0.0513678;RO=28;SAF=16;SAR=16;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0600706;STB=0.540958;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.0335855;OID=.;OPOS=197065415;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:28:29:32:32:0.52459:16:16:16:12:16:16:17:12
chr2	197118729	.	C	T	789.22	PASS	AF=1;AO=48;DP=50;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00471392;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.111;QD=64.4257;RBI=0.0143187;REFB=0;REVB=0.0135205;RO=0;SAF=22;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.64415e-05;OID=.;OPOS=197118729;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:49:0:0:48:49:1:26:22:0:0:27:22:0:0
chr2	197154234	.	A	G	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.033805;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.615;QD=51.1846;RBI=0.0380759;REFB=0;REVB=0.0175212;RO=0;SAF=10;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000136007;OID=.;OPOS=197154234;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:10:10:0:0:10:10:0:0
chr2	197183367	.	A	G	403.87	PASS	AF=0.547945;AO=39;DP=72;FAO=40;FDP=73;FR=.;FRO=33;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=8;FSRR=25;FWDB=0.0151264;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.273;QD=22.1296;RBI=0.0205859;REFB=-0.0136159;REVB=-0.0139633;RO=33;SAF=16;SAR=23;SRF=8;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148912;STB=0.586587;STBP=0.138;TYPE=snp;VARB=0.0141031;OID=.;OPOS=197183367;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:73:33:33:39:40:0.547945:23:16:8:25:23:17:8:25
chr2	197184321	.	C	T	264.91	PASS	AF=0.529412;AO=27;DP=51;FAO=27;FDP=51;FR=.;FRO=24;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.0144603;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=189.562;QD=20.7771;RBI=0.0170457;REFB=0.00236824;REVB=0.00902535;RO=21;SAF=14;SAR=13;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108186;STB=0.547791;STBP=0.488;TYPE=snp;VARB=-0.00177492;OID=.;OPOS=197184321;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:21:24:27:27:0.529412:13:14:8:13:13:14:10:14
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chr2	197537115	.	T	G	86.86	PASS	AF=0.407407;AO=11;DP=27;FAO=11;FDP=27;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.00509322;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.4583;QD=12.8687;RBI=0.0119005;REFB=-0.00984471;REVB=-0.0107556;RO=15;SAF=9;SAR=2;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.277675;STB=0.691913;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.0130423;OID=.;OPOS=197537115;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:27:27:15:16:11:11:0.407407:2:9:9:6:2:9:9:7
chr2	197597283	.	G	A	402.15	PASS	AF=0.547945;AO=39;DP=72;FAO=40;FDP=73;FR=.;FRO=33;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=9;FSRR=24;FWDB=0.012248;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.337;QD=22.0355;RBI=0.0147496;REFB=-0.017854;REVB=0.00821819;RO=33;SAF=19;SAR=20;SRF=9;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179736;STB=0.592471;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=0.0192898;OID=.;OPOS=197597283;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:73:33:33:39:40:0.547945:20:19:9:24:21:19:9:24
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chr2	197639796	.	A	G	171.01	PASS	AF=0.349206;AO=22;DP=64;FAO=22;FDP=63;FR=.;FRO=41;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=29;FSRR=12;FWDB=0.0150551;FXX=0.0156226;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.3862;QD=10.8577;RBI=0.0336239;REFB=-0.00325883;REVB=0.0300651;RO=40;SAF=12;SAR=10;SRF=28;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177362;STB=0.608217;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=0.0146886;OID=.;OPOS=197639796;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:63:40:41:22:22:0.349206:10:12:28:12:10:12:29:12
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chr2	197697772	.	T	C	84.79	PASS	AF=0.354839;AO=11;DP=31;FAO=11;FDP=31;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=-0.00180163;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.099;QD=10.9408;RBI=0.00830211;REFB=-0.0149985;REVB=-0.00810427;RO=20;SAF=6;SAR=5;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172518;STB=0.602234;STBP=0.411;TYPE=snp;VARB=0.0281486;OID=.;OPOS=197697772;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:31:31:20:20:11:11:0.354839:5:6:14:6:5:6:14:6
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chr2	198572076	.	A	ATTC,C	239.06	PASS	AF=0.72,0.12;AO=17,3;DP=25;FAO=18,3;FDP=25;FR=.;FRO=4;FSAF=14,3;FSAR=4,0;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0315417,0.00602813;FXX=0;HRUN=2,1;LEN=3,1;MLLD=152.87,53.0467;QD=38.2492;RBI=0.0318563,0.0121241;REFB=-0.00567093,-0.0611286;REVB=-0.00446638,0.0105193;RO=4;SAF=13,3;SAR=4,0;SRF=0;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.300597,0.782218;STB=0.666464,0.997134;STBP=0.008,0.019;TYPE=ins,snp;VARB=0.00952176,-0.0125938;OID=.,.;OPOS=198572077,198572076;OREF=-,A;OALT=TTC,C;OMAPALT=ATTC,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:25:25:4:4:17,3:18,3:0.72,0.12:4,0:13,3:0:4:4,0:14,3:0:4
chr2	198572461	.	C	T	317.13	PASS	AF=0.353659;AO=26;DP=82;FAO=29;FDP=82;FR=.,HEALED;FRO=46;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=25;FWDB=0.00743272;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.135;QD=15.4699;RBI=0.0113837;REFB=-0.0142922;REVB=0.00862232;RO=46;SAF=18;SAR=8;SRF=21;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.268107;STB=0.601601;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.0353538;OID=.;OPOS=198572461;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:46:46:26:29:0.353659:8:18:21:25:11:18:21:25
chr2	198950029	.	A	G	182.08	PASS	AF=0.44186;AO=19;DP=43;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=7;FWDB=-0.0224721;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.874;QD=16.9373;RBI=0.028022;REFB=-0.00857954;REVB=-0.0167402;RO=24;SAF=12;SAR=7;SRF=17;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0827652;STB=0.547122;STBP=0.599;TYPE=snp;VARB=0.00998188;OID=.;OPOS=198950029;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:24:24:19:19:0.44186:7:12:17:7:7:12:17:7
chr2	200136583	.	T	A	769.38	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0239609;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.377;QD=56.9909;RBI=0.0324046;REFB=0;REVB=-0.021816;RO=0;SAF=29;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.27494e-06;OID=.;OPOS=200136583;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:25:29:0:0:25:29:0:0
chr2	200790050	.	A	G	220.92	PASS	AF=0.44898;AO=22;DP=49;FAO=22;FDP=49;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=0.0204654;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.784;QD=18.0342;RBI=0.0208801;REFB=-0.0112163;REVB=0.0041411;RO=25;SAF=9;SAR=13;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142154;STB=0.580932;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.00912394;OID=.;OPOS=200790050;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:25:27:22:22:0.44898:13:9:14:11:13:9:15:12
chr2	200792881	.	C	T	1212.83	PASS	AF=0.987654;AO=80;DP=81;FAO=80;FDP=81;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00325633;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.303;QD=59.8929;RBI=0.0255325;REFB=0.0417965;REVB=0.025324;RO=0;SAF=47;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.71057e-08;STB=0.505262;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=1.37409e-05;OID=.;OPOS=200792881;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:81:81:0:1:80:80:0.987654:33:47:0:0:33:47:1:0
chr2	201344434	.	A	G	73.43	PASS	AF=0.322581;AO=10;DP=31;FAO=10;FDP=31;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0131187;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.1487;QD=9.47542;RBI=0.0131195;REFB=0.00890215;REVB=-0.000143624;RO=21;SAF=6;SAR=4;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0861957;STB=0.552525;STBP=0.658;TYPE=snp;VARB=-0.00871892;OID=.;OPOS=201344434;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:31:31:21:21:10:10:0.322581:4:6:11:10:4:6:11:10
chr2	201344491	.	G	A	95.39	PASS	AF=0.324324;AO=12;DP=37;FAO=12;FDP=37;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.0133699;FXX=0.0263089;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.5096;QD=10.3129;RBI=0.0360916;REFB=-0.00427478;REVB=-0.0335238;RO=25;SAF=7;SAR=5;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0267325;STB=0.516102;STBP=0.915;TYPE=snp;VARB=0.00365947;OID=.;OPOS=201344491;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:37:37:25:25:12:12:0.324324:5:7:14:11:5:7:14:11
chr2	201344732	.	C	T	222.32	PASS	AF=0.397059;AO=26;DP=67;FAO=27;FDP=68;FR=.;FRO=41;FSAF=4;FSAR=23;FSRF=23;FSRR=18;FWDB=-0.00710172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.43;QD=13.0777;RBI=0.00732269;REFB=-0.0105693;REVB=0.00178531;RO=41;SAF=4;SAR=22;SRF=23;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.494236;STB=0.790841;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0105016;OID=.;OPOS=201344732;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:68:41:41:26:27:0.397059:22:4:23:18:23:4:23:18
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chr2	201468732	.	C	G,T	639.65	PASS	AF=0.930233,0.0697674;AO=38,3;DP=41;FAO=40,3;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=27,0;FSAR=13,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00572502,-0.007778;FXX=0.0227221;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=114.81,122.379;QD=59.5019;RBI=0.0290917,0.0174064;REFB=0,0;REVB=0.0285228,0.015572;RO=0;SAF=25,0;SAR=13,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.000132742,0.213005;OID=.,.;OPOS=201468732,201468732;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:11:41:43:0:0:38,3:40,3:0.930233,0.0697674:13,3:25,0:0:0:13,3:27,0:0:0
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chr2	202149696	.	G	A	369.19	PASS	AF=0.481481;AO=39;DP=80;FAO=39;FDP=81;FR=.;FRO=42;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=0.00634634;FXX=0.0121936;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.3132;QD=18.2316;RBI=0.0499191;REFB=-0.00402791;REVB=-0.049514;RO=41;SAF=20;SAR=19;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000575833;STB=0.506646;STBP=0.882;TYPE=snp;VARB=0.00371933;OID=.;OPOS=202149696;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:81:41:42:39:39:0.481481:19:20:21:20:19:20:21:21
chr2	202151781	.	T	C	269.33	PASS	AF=0.461538;AO=30;DP=65;FAO=30;FDP=65;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=-0.00618823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.181;QD=16.5741;RBI=0.0190212;REFB=-0.0279122;REVB=0.0179865;RO=34;SAF=13;SAR=17;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11865;STB=0.559056;STBP=0.421;TYPE=snp;VARB=0.0242352;OID=.;OPOS=202151781;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:34:35:30:30:0.461538:17:13:19:15:17:13:19:16
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chr2	202245244	.	A	G	104.39	PASS	AF=0.325;AO=13;DP=40;FAO=13;FDP=40;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=-0.000709895;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=229.186;QD=10.4387;RBI=0.0208754;REFB=0.0107604;REVB=0.0208634;RO=27;SAF=8;SAR=5;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.231713;STB=0.638573;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=-0.0221213;OID=.;OPOS=202245244;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:27:27:13:13:0.325:5:8:11:16:5:8:11:16
chr2	202260049	.	G	A	631.36	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0458373;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.606;QD=61.5959;RBI=0.0458374;REFB=0;REVB=-7.70113e-05;RO=0;SAF=24;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.2194e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000102016;OID=.;OPOS=202260049;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:17:24:0:0:17:24:0:0
chr2	202264156	.	C	T	615.56	PASS	AF=0.516667;AO=62;DP=120;FAO=62;FDP=120;FR=.;FRO=58;FSAF=30;FSAR=32;FSRF=24;FSRR=34;FWDB=0.0166484;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.411;QD=20.5186;RBI=0.0167524;REFB=-0.00223543;REVB=-0.0018643;RO=58;SAF=30;SAR=32;SRF=24;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0617593;STB=0.53397;STBP=0.447;TYPE=snp;VARB=0.00204446;OID=.;OPOS=202264156;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:120:58:58:62:62:0.516667:32:30:24:34:32:30:24:34
chr2	202337730	.	A	G	1204.8	PASS	AF=1;AO=78;DP=78;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00573336;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.587;QD=61.0024;RBI=0.0257784;REFB=0;REVB=0.0251327;RO=0;SAF=37;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.4281e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.0062e-05;OID=.;OPOS=202337730;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:79:0:0:78:79:1:41:37:0:0:41:38:0:0
chr2	202342402	.	G	T	528.48	PASS	AF=0.563218;AO=49;DP=89;FAO=49;FDP=87;FR=.;FRO=38;FSAF=30;FSAR=19;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=0.00991008;FXX=0.0224694;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.063;QD=24.298;RBI=0.0111026;REFB=-0.00893367;REVB=0.00500573;RO=40;SAF=30;SAR=19;SRF=20;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0943087;STB=0.538819;STBP=0.444;TYPE=snp;VARB=0.00670388;OID=.;OPOS=202342402;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:87:40:38:49:49:0.563218:19:30:20:20:19:30:20:18
chr2	202357949	.	A	C	483.33	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.029462;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=61.6481;QD=58.5852;RBI=0.033684;REFB=0;REVB=0.016328;RO=0;SAF=14;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.71297e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000873733;OID=.;OPOS=202357949;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:19:14:0:0:19:14:0:0
chr2	202410300	.	A	T	755.94	PASS	AF=1;AO=52;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00299914;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.117;QD=57.0523;RBI=0.00321052;REFB=0;REVB=0.0011457;RO=0;SAF=33;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.0907e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.87306e-06;OID=.;OPOS=202410300;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:52:53:1:19:33:0:0:20:33:0:0
chr2	202469361	.	C	T	801.32	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0387551;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.229;QD=57.237;RBI=0.0411065;REFB=0;REVB=0.0137034;RO=0;SAF=12;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.93598e-05;OID=.;OPOS=202469361;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:44:12:0:0:44:12:0:0
chr2	202557702	.	C	T	583.56	PASS	AF=0.975;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00641226;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.736;QD=58.3561;RBI=0.0166161;REFB=-0.0241646;REVB=0.015329;RO=1;SAF=12;SAR=27;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0170496;STB=0.509086;STBP=0.606;TYPE=snp;VARB=0.000824743;OID=.;OPOS=202557702;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:40:40:1:1:39:39:0.975:27:12:0:1:27:12:0:1
chr2	202575821	.	G	A	519.82	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0184444;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.0889;QD=59.4083;RBI=0.0293144;REFB=0;REVB=-0.0227846;RO=0;SAF=18;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.16455e-05;OID=.;OPOS=202575821;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:17:18:0:0:17:18:0:0
chr2	202593280	.	G	A	144.01	PASS	AF=0.421053;AO=16;DP=38;FAO=16;FDP=38;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.0170057;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=250.161;QD=15.159;RBI=0.0179608;REFB=-0.0147049;REVB=0.00577902;RO=22;SAF=7;SAR=9;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0629161;STB=0.536378;STBP=0.678;TYPE=snp;VARB=0.0242059;OID=.;OPOS=202593280;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:22:22:16:16:0.421053:9:7:11:11:9:7:11:11
chr2	202625615	.	C	T	1083.6	PASS	AF=0.986486;AO=72;DP=72;FAO=73;FDP=74;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00116619;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.423;QD=58.5731;RBI=0.0356282;REFB=0.0352314;REVB=-0.0356091;RO=0;SAF=42;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.1178e-08;STB=0.508195;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=-0.000298996;OID=.;OPOS=202625615;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:72:74:0:1:72:73:0.986486:30:42:0:0:30:43:0:1
chr2	202633582	.	A	G	96.63	PASS	AF=0.315789;AO=12;DP=38;FAO=12;FDP=38;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=0.0104063;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.64;QD=10.1715;RBI=0.0105406;REFB=0.00212741;REVB=0.001677;RO=26;SAF=5;SAR=7;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.222004;STB=0.633404;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=-0.000990618;OID=.;OPOS=202633582;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:38:38:26:26:12:12:0.315789:7:5:16:10:7:5:16:10
chr2	202741256	.	A	T	955.16	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0175903;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.7463;QD=58.779;RBI=0.0596354;REFB=0;REVB=-0.0569821;RO=0;SAF=24;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.25588e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000255601;OID=.;OPOS=202741256;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:41:24:0:0:41:24:0:0
chr2	202741269	.	G	A	940.94	PASS	AF=0.984848;AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=66;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0159534;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.838;QD=57.0269;RBI=0.01779;REFB=0.00382273;REVB=0.00787239;RO=1;SAF=24;SAR=41;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0113841;STB=0.506022;STBP=0.538;TYPE=snp;VARB=4.90928e-05;OID=.;OPOS=202741269;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:66:66:1:1:65:65:0.984848:41:24:0:1:41:24:0:1
chr2	202901910	.	G	A	299.95	PASS	AF=0.359223;AO=31;DP=97;FAO=37;FDP=103;FR=.;FRO=66;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=35;FSRR=31;FWDB=-0.0099749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.607;QD=11.6483;RBI=0.0288545;REFB=-0.0111805;REVB=0.0270755;RO=66;SAF=19;SAR=12;SRF=35;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0985462;STB=0.510767;STBP=0.905;TYPE=snp;VARB=0.0131688;OID=.;OPOS=202901910;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:103:66:66:31:37:0.359223:12:19:35:31:18:19:35:31
chr2	202939836	.	G	C	369.3	PASS	AF=0.610169;AO=36;DP=59;FAO=36;FDP=59;FR=.;FRO=23;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=0.00752938;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.68;QD=25.0371;RBI=0.0296896;REFB=-0.0119571;REVB=0.028719;RO=23;SAF=15;SAR=21;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16699;STB=0.591499;STBP=0.081;TYPE=snp;VARB=0.0065988;OID=.;OPOS=202939836;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:23:23:36:36:0.610169:21:15:15:8:21:15:15:8
chr2	202964380	.	G	A	282.84	PASS	AF=0.415584;AO=30;DP=76;FAO=32;FDP=77;FR=.;FRO=45;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=23;FSRR=22;FWDB=0.000635323;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.986;QD=14.693;RBI=0.000635617;REFB=-0.00534857;REVB=-1.93086e-05;RO=46;SAF=19;SAR=11;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145093;STB=0.549102;STBP=0.453;TYPE=snp;VARB=0.0079876;OID=.;OPOS=202964380;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:77:46:45:30:32:0.415584:11:19:23:23:13:19:23:22
chr2	203139844	.	T	C	82.3	PASS	AF=0.588235;AO=10;DP=17;FAO=10;FDP=17;FR=.;FRO=7;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.0457956;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.7;QD=19.3642;RBI=0.0472779;REFB=0.00340836;REVB=0.0117458;RO=7;SAF=9;SAR=1;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.559911;STB=0.829978;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=-0.00618165;OID=.;OPOS=203139844;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:17:17:7:7:10:10:0.588235:1:9:2:5:1:9:2:5
chr2	203155936	.	A	C	196.31	PASS	AF=0.465116;AO=20;DP=43;FAO=20;FDP=43;FR=.;FRO=23;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=0.00751972;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.9387;QD=18.2616;RBI=0.0437597;REFB=-0.00541894;REVB=0.0431088;RO=23;SAF=13;SAR=7;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166923;STB=0.595083;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=0.0117001;OID=.;OPOS=203155936;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:23:23:20:20:0.465116:7:13:11:12:7:13:11:12
chr2	203640713	.	T	C	323.14	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00360165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.378;QD=53.8563;RBI=0.0109447;REFB=0;REVB=0.0103351;RO=0;SAF=13;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.06882e-05;OID=.;OPOS=203640713;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:11:13:0:0:11:13:0:0
chr2	204062061	.	A	G	1767.6	PASS	AF=1;AO=116;DP=116;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-8.73748e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.212;QD=60.9518;RBI=0.00421017;REFB=0;REVB=0.00420926;RO=0;SAF=59;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.29569e-06;OID=.;OPOS=204062061;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:116:116:0:0:116:116:1:57:59:0:0:57:59:0:0
chr2	204090887	.	C	G	698.99	PASS	AF=0.980392;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00385795;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=209.796;QD=54.8231;RBI=0.0188975;REFB=-0.0213034;REVB=0.0184995;RO=1;SAF=24;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0192104;STB=0.5102;STBP=0.33;TYPE=snp;VARB=0.000479955;OID=.;OPOS=204090887;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:51:51:1:1:50:50:0.980392:26:24:1:0:26:24:1:0
chr2	204103779	.	C	T	275.12	PASS	AF=0.43662;AO=31;DP=71;FAO=31;FDP=71;FR=.;FRO=40;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=11;FSRR=29;FWDB=-0.00355007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.114;QD=15.4996;RBI=0.00394031;REFB=-0.0039067;REVB=-0.00170969;RO=40;SAF=12;SAR=19;SRF=11;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122099;STB=0.568566;STBP=0.366;TYPE=snp;VARB=0.00376349;OID=.;OPOS=204103779;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:40:40:31:31:0.43662:19:12:11:29:19:12:11:29
chr2	204116690	.	C	T	428.72	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00782682;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.5862;QD=57.1621;RBI=0.0305397;REFB=0;REVB=-0.0295197;RO=0;SAF=16;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.56309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000214138;OID=.;OPOS=204116690;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:14:16:0:0:14:16:0:0
chr2	204154552	.	C	T	363.22	PASS	AF=0.414894;AO=39;DP=94;FAO=39;FDP=94;FR=.;FRO=55;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=32;FSRR=23;FWDB=0.0323556;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.2039;QD=15.4562;RBI=0.0548118;REFB=-0.0061044;REVB=0.0442431;RO=52;SAF=18;SAR=21;SRF=30;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116627;STB=0.569997;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=0.00789854;OID=.;OPOS=204154552;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:52:55:39:39:0.414894:21:18:30:22:21:18:32:23
chr2	204206977	.	C	T	594.54	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0191821;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.808;QD=60.9785;RBI=0.0467728;REFB=0;REVB=-0.0426585;RO=0;SAF=19;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.3303e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000129203;OID=.;OPOS=204206977;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:20:19:0:0:20:19:0:0
chr2	204298783	.	A	C	330.22	PASS	AF=0.6;AO=29;DP=50;FAO=30;FDP=50;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=0.0791166;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=46.5925;QD=26.4174;RBI=0.108277;REFB=-0.111867;REVB=0.0739227;RO=19;SAF=12;SAR=17;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0338124;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0736009;OID=.;OPOS=204298783;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:19:20:29:30:0.6:17:12:7:12:18:12:8:12
chr2	204322298	.	T	C	190.0	PASS	AF=0.5;AO=17;DP=40;FAO=20;FDP=40;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=0.0259976;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=51.8059;QD=19;RBI=0.036164;REFB=-0.0720581;REVB=0.0251388;RO=13;SAF=4;SAR=13;SRF=2;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0925106;STB=0.532225;STBP=0.739;TYPE=snp;VARB=0.0466858;OID=.;OPOS=204322298;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:13:20:17:20:0.5:13:4:2:11:15:5:6:14
chr2	204602211	.	GAA	GA,G	110.29	PASS	AF=0.653846,0;AO=13,3;DP=27;FAO=17,0;FDP=26;FR=.;FRO=9;FSAF=9,0;FSAR=8,0;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.120451,-0.0626275;FXX=0.0370233;HRUN=5,5;LEN=1,2;MLLD=14.766,16.0132;QD=16.9671;RBI=0.125144,0.0654972;REFB=0.0691402,0.0365649;REVB=0.0339504,0.0191751;RO=9;SAF=6,2;SAR=7,1;SRF=4;SRR=5;SSEN=0,0;SSEP=0.354839,0.354839;SSSB=0.0124041,0.23456;STB=0.529377,0.5;STBP=0.717,1;TYPE=del,del;VARB=-0.0802775,0;OID=.,.;OPOS=204602212,204602212;OREF=A,AA;OALT=-,-;OMAPALT=GA,G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.653846,0:13,3:27:17,0:26:9:9,0:8,0:4:5:39:9:6,2:7,1:4:5
chr2	204732714	.	A	G	137.38	PASS	AF=0.326531;AO=16;DP=48;FAO=16;FDP=49;FR=.;FRO=33;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=-0.0105934;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.11;QD=11.2146;RBI=0.0330356;REFB=-0.011182;REVB=-0.0312911;RO=31;SAF=5;SAR=11;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.300992;STB=0.678438;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=0.021766;OID=.;OPOS=204732714;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:49:31:33:16:16:0.326531:11:5:18:13:11:5:19:14
chr2	204824283	.	T	G	286.32	PASS	AF=0.553191;AO=26;DP=47;FAO=26;FDP=47;FR=.;FRO=21;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.000454573;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.863;QD=24.3677;RBI=0.0131497;REFB=0.00402933;REVB=0.0131418;RO=21;SAF=15;SAR=11;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119491;STB=0.566451;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=-0.0107039;OID=.;OPOS=204824283;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:21:21:26:26:0.553191:11:15:9:12:11:15:9:12
chr2	204824313	.	G	A	231.05	PASS	AF=0.464286;AO=26;DP=56;FAO=26;FDP=56;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=-0.0173511;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.195;QD=16.5035;RBI=0.0231879;REFB=0.00663258;REVB=0.0153824;RO=30;SAF=12;SAR=14;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0366047;STB=0.520645;STBP=0.751;TYPE=snp;VARB=-0.00565691;OID=.;OPOS=204824313;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:30:30:26:26:0.464286:14:12:15:15:14:12:15:15
chr2	205829991	.	C	T	990.65	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0155635;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.919;QD=59.1432;RBI=0.0199733;REFB=0;REVB=0.0125184;RO=0;SAF=42;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.93036e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.71171e-05;OID=.;OPOS=205829991;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:25:42:0:0:25:42:0:0
chr2	205912403	.	T	C	335.85	PASS	AF=0.566667;AO=34;DP=60;FAO=34;FDP=60;FR=.;FRO=26;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=-0.0129273;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.813;QD=22.3901;RBI=0.0143016;REFB=0.0214325;REVB=0.00611726;RO=25;SAF=21;SAR=13;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0182846;STB=0.501037;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0116099;OID=.;OPOS=205912403;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:25:26:34:34:0.566667:13:21:16:9:13:21:16:10
chr2	205969220	.	G	A	812.93	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00924255;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=313.386;QD=57.048;RBI=0.0132276;REFB=0;REVB=-0.00946274;RO=0;SAF=23;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.86737e-06;OID=.;OPOS=205969220;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:34:23:0:0:34:23:0:0
chr2	205986321	.	A	G	167.16	PASS	AF=0.409091;AO=18;DP=44;FAO=18;FDP=44;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=7;FWDB=0.00826937;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.9325;QD=15.196;RBI=0.0113167;REFB=0.00883763;REVB=-0.00772569;RO=26;SAF=8;SAR=10;SRF=19;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.288615;STB=0.664855;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=-0.012195;OID=.;OPOS=205986321;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:26:26:18:18:0.409091:10:8:19:7:10:8:19:7
chr2	205990353	.	C	T	471.87	PASS	AF=0.511111;AO=46;DP=90;FAO=46;FDP=90;FR=.;FRO=44;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=26;FSRR=18;FWDB=-0.00537183;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=250.761;QD=20.9719;RBI=0.00550915;REFB=-0.01129;REVB=-0.00122234;RO=43;SAF=26;SAR=20;SRF=25;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.014418;STB=0.512815;STBP=0.802;TYPE=snp;VARB=0.0102001;OID=.;OPOS=205990353;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:43:44:46:46:0.511111:20:26:25:18:20:26:26:18
chr2	206364737	.	T	C	251.69	PASS	AF=0.474576;AO=28;DP=59;FAO=28;FDP=59;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.00666191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.553;QD=17.064;RBI=0.00865815;REFB=-0.00309735;REVB=0.00553014;RO=31;SAF=10;SAR=18;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123544;STB=0.569569;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=0.00283578;OID=.;OPOS=206364737;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:31:31:28:28:0.474576:18:10:15:16:18:10:15:16
chr2	206581033	.	G	A	1604.96	PASS	AF=0.964912;AO=110;DP=114;FAO=110;FDP=114;FR=.;FRO=4;FSAF=52;FSAR=58;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.00588347;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.146;QD=56.3145;RBI=0.0284679;REFB=-0.109328;REVB=-0.0278533;RO=4;SAF=52;SAR=58;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00182014;STB=0.50096;STBP=0.901;TYPE=snp;VARB=0.00669042;OID=.;OPOS=206581033;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:114:114:4:4:110:110:0.964912:58:52:2:2:58:52:2:2
chr2	206592695	.	T	C	638.15	PASS	AF=0.402235;AO=71;DP=178;FAO=72;FDP=179;FR=.;FRO=107;FSAF=38;FSAR=34;FSRF=60;FSRR=47;FWDB=-0.0148198;FXX=0.00555525;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.372;QD=14.2603;RBI=0.0167143;REFB=-0.00525667;REVB=0.00772928;RO=107;SAF=38;SAR=33;SRF=60;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0274835;STB=0.519807;STBP=0.679;TYPE=snp;VARB=0.00720096;OID=.;OPOS=206592695;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:178:179:107:107:71:72:0.402235:33:38:60:47:34:38:60:47
chr2	206608039	.	T	C	727.78	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00589793;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.4932;QD=63.2849;RBI=0.0226159;REFB=0;REVB=-0.0218333;RO=0;SAF=19;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000132545;OID=.;OPOS=206608039;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:27:19:0:0:27:19:0:0
chr2	206863874	.	C	T	375.67	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0434637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.1264;QD=55.6542;RBI=0.0467709;REFB=0;REVB=-0.0172751;RO=0;SAF=17;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0013913;OID=.;OPOS=206863874;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:10:17:0:0:10:17:0:0
chr2	206874339	.	G	A	2201.42	PASS	AF=1;AO=139;DP=139;FAO=139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00215634;FXX=0.00714235;HRUN=3;LEN=1;MLLD=151.279;QD=63.3503;RBI=0.0661419;REFB=0;REVB=0.0661067;RO=0;SAF=86;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.62054e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.54629e-05;OID=.;OPOS=206874339;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:139:139:0:0:139:139:1:53:86:0:0:53:86:0:0
chr2	206911228	.	G	A	575.79	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0125894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.012;QD=60.6096;RBI=0.012615;REFB=0;REVB=-0.000802825;RO=0;SAF=20;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.51048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000108311;OID=.;OPOS=206911228;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:18:20:0:0:18:20:0:0
chr2	206921451	.	G	A	785.89	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000285961;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=335.299;QD=64.1539;RBI=0.00677899;REFB=0;REVB=0.00677295;RO=0;SAF=23;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.75999e-06;OID=.;OPOS=206921451;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:26:23:0:0:26:23:0:0
chr2	207472683	.	C	CTA	656.31	PASS	AF=0.467105;AO=69;DP=155;FAO=71;FDP=152;FR=.;FRO=81;FSAF=28;FSAR=43;FSRF=46;FSRR=35;FWDB=-0.00973028;FXX=0.0256394;HRUN=1;LEN=2;MLLD=265.346;QD=17.2712;RBI=0.00973072;REFB=-0.00954102;REVB=-9.27891e-05;RO=82;SAF=27;SAR=42;SRF=47;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17844;STB=0.592967;STBP=0.04;TYPE=ins;VARB=0.0130447;OID=.;OPOS=207472684;OREF=-;OALT=TA;OMAPALT=CTA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.467105:69:155:71:152:81:28:43:46:35:99:82:27:42:47:35
chr2	207527840	.	G	T	326.17	PASS	AF=0.523077;AO=34;DP=65;FAO=34;FDP=65;FR=.;FRO=31;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=11;FWDB=-0.00295044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.373;QD=20.0721;RBI=0.00930018;REFB=-0.00646783;REVB=0.00881977;RO=31;SAF=20;SAR=14;SRF=20;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0510357;STB=0.528285;STBP=0.667;TYPE=snp;VARB=0.00521992;OID=.;OPOS=207527840;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:31:31:34:34:0.523077:14:20:20:11:14:20:20:11
chr2	207603234	.	T	G	594.54	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.050712;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.904;QD=60.9785;RBI=0.0510507;REFB=0;REVB=0.00587071;RO=0;SAF=19;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.3303e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000170724;OID=.;OPOS=207603234;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:20:19:0:0:20:19:0:0
chr2	207621759	.	A	G	1116.68	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0109151;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.3725;QD=60.3613;RBI=0.0273363;REFB=0;REVB=0.0250626;RO=0;SAF=27;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.09191e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.41994e-05;OID=.;OPOS=207621759;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:47:27:0:0:47:27:0:0
chr2	207647981	.	C	T	351.15	PASS	AF=0.9;AO=27;DP=30;FAO=27;FDP=30;FR=.;FRO=3;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0340316;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.924;QD=46.8203;RBI=0.0378036;REFB=-0.0435794;REVB=-0.0164609;RO=2;SAF=16;SAR=11;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0546421;STB=0.542826;STBP=0.21;TYPE=snp;VARB=0.00321954;OID=.;OPOS=207647981;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:30:30:2:3:27:27:0.9:11:16:2:0:11:16:3:0
chr2	207820276	.	G	A	318.48	PASS	AF=0.485714;AO=34;DP=70;FAO=34;FDP=70;FR=.;FRO=36;FSAF=9;FSAR=25;FSRF=11;FSRR=25;FWDB=-0.0597122;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.731;QD=18.1989;RBI=0.0597393;REFB=0.0078471;REVB=0.00179911;RO=36;SAF=9;SAR=25;SRF=11;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0469958;STB=0.5263;STBP=0.732;TYPE=snp;VARB=-0.00870671;OID=.;OPOS=207820276;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:36:36:34:34:0.485714:25:9:11:25:25:9:11:25
chr2	207824384	.	T	G	233.45	PASS	AF=0.383562;AO=28;DP=73;FAO=28;FDP=73;FR=.;FRO=45;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=30;FWDB=0.00248632;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.782;QD=12.7916;RBI=0.00818505;REFB=-0.00099796;REVB=0.00779829;RO=45;SAF=12;SAR=16;SRF=15;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106729;STB=0.560933;STBP=0.466;TYPE=snp;VARB=0.00178718;OID=.;OPOS=207824384;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:45:45:28:28:0.383562:16:12:15:30:16:12:15:30
chr2	207825656	.	A	T	383.67	PASS	AF=0.513158;AO=39;DP=76;FAO=39;FDP=76;FR=.;FRO=37;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=0.0422208;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.679;QD=20.1931;RBI=0.0440704;REFB=-0.00451961;REVB=0.0126335;RO=37;SAF=19;SAR=20;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0231151;STB=0.512814;STBP=0.843;TYPE=snp;VARB=0.00711596;OID=.;OPOS=207825656;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:37:37:39:39:0.513158:20:19:19:18:20:19:19:18
chr2	207945785	.	A	G	93.06	PASS	AF=0.611111;AO=11;DP=18;FAO=11;FDP=18;FR=.;FRO=7;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=0.0250179;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=43.7622;QD=20.6805;RBI=0.164839;REFB=-0.0955431;REVB=0.162929;RO=7;SAF=8;SAR=3;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119385;STB=0.567454;STBP=0.557;TYPE=snp;VARB=0.0660694;OID=.;OPOS=207945785;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:18:18:7:7:11:11:0.611111:3:8:6:1:3:8:6:1
chr2	207988613	.	C	T	2296.84	PASS	AF=0.98125;AO=155;DP=160;FAO=157;FDP=160;FR=.;FRO=3;FSAF=87;FSAR=70;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0288106;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=104.14;QD=57.4211;RBI=0.0301972;REFB=-0.0783128;REVB=0.00904553;RO=2;SAF=85;SAR=70;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.011061;STB=0.504185;STBP=0.471;TYPE=snp;VARB=0.00040599;OID=.;OPOS=207988613;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:160:160:2:3:155:157:0.98125:70:85:2:0:70:87:1:2
chr2	207998800	.	C	T	611.87	PASS	AF=0.953488;AO=41;DP=43;FAO=41;FDP=43;FR=.;FRO=2;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00597949;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.513;QD=56.9184;RBI=0.00895993;REFB=-0.0582608;REVB=0.00667278;RO=2;SAF=21;SAR=20;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0010638;STB=0.500567;STBP=0.863;TYPE=snp;VARB=0.000565702;OID=.;OPOS=207998800;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:43:43:2:2:41:41:0.953488:20:21:1:1:20:21:1:1
chr2	208477852	.	G	A	1202.78	PASS	AF=1;AO=78;DP=78;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00806107;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.094;QD=60.9003;RBI=0.0139436;REFB=0;REVB=0.0113773;RO=0;SAF=33;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.88169e-05;OID=.;OPOS=208477852;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:79:0:0:78:79:1:45:33:0:0:45:34:0:0
chr2	208477956	.	C	T	1008.49	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0251049;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.995;QD=59.3229;RBI=0.0271478;REFB=0;REVB=-0.0103318;RO=0;SAF=28;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.22596e-05;OID=.;OPOS=208477956;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:40:28:0:0:40:28:0:0
chr2	208478055	.	A	G	479.39	PASS	AF=0.484536;AO=47;DP=98;FAO=47;FDP=97;FR=.;FRO=50;FSAF=23;FSAR=24;FSRF=25;FSRR=25;FWDB=0.0818995;FXX=0.010203;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.2501;QD=19.7685;RBI=0.0832053;REFB=0.00225268;REVB=0.0146831;RO=51;SAF=23;SAR=24;SRF=25;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000781283;STB=0.505482;STBP=0.912;TYPE=snp;VARB=-0.00100579;OID=.;OPOS=208478055;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:97:51:50:47:47:0.484536:24:23:25:26:24:23:25:25
chr2	208632093	.	G	A	138.95	PASS	AF=0.535714;AO=15;DP=28;FAO=15;FDP=28;FR=.;FRO=13;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.014317;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.638;QD=19.8494;RBI=0.0172354;REFB=0.0113291;REVB=0.00959586;RO=13;SAF=10;SAR=5;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.046223;STB=0.52628;STBP=0.79;TYPE=snp;VARB=-0.00796394;OID=.;OPOS=208632093;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:28:13:13:15:15:0.535714:5:10:8:5:5:10:8:5
chr2	208633413	.	T	C	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0206167;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.7931;QD=37.4885;RBI=0.0761421;REFB=0;REVB=-0.0732978;RO=0;SAF=5;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00605102;OID=.;OPOS=208633413;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:3:5:0:0:3:5:0:0
chr2	208633627	.	C	T	2830.29	PASS	AF=1;AO=178;DP=181;FAO=180;FDP=180;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.014463;FXX=0.0163925;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.255;QD=62.8954;RBI=0.0211245;REFB=0;REVB=0.015397;RO=0;SAF=83;SAR=95;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.36075e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.06755e-05;OID=.;OPOS=208633627;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:15:181:180:0:0:178:180:1:95:83:0:0:95:85:0:0
chr2	208811097	.	C	T	534.85	PASS	AF=0.491228;AO=55;DP=114;FAO=56;FDP=114;FR=.;FRO=58;FSAF=31;FSAR=25;FSRF=36;FSRR=22;FWDB=-0.0140987;FXX=0.0086949;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.568;QD=18.7668;RBI=0.0327104;REFB=-0.0168455;REVB=0.0295161;RO=59;SAF=31;SAR=24;SRF=36;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0444612;STB=0.53479;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.015172;OID=.;OPOS=208811097;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:114:114:59:58:55:56:0.491228:24:31:36:23:25:31:36:22
chr2	208841964	.	A	G	237.15	PASS	AF=0.479167;AO=22;DP=47;FAO=23;FDP=48;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.0118925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.403;QD=19.7621;RBI=0.0221454;REFB=-0.00512808;REVB=-0.0186812;RO=25;SAF=11;SAR=11;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0187754;STB=0.500907;STBP=0.988;TYPE=snp;VARB=0.00634722;OID=.;OPOS=208841964;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:48:25:25:22:23:0.479167:11:11:13:12:11:12:13:12
chr2	208918917	.	C	T	329.92	PASS	AF=0.486111;AO=35;DP=71;FAO=35;FDP=72;FR=.;FRO=37;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=-0.0322671;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.5806;QD=18.3287;RBI=0.11302;REFB=0.00511334;REVB=-0.108316;RO=36;SAF=18;SAR=17;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.012284;STB=0.500397;STBP=0.99;TYPE=snp;VARB=-0.00830531;OID=.;OPOS=208918917;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:72:36:37:35:35:0.486111:17:18:19:17:17:18:19:18
chr2	208938866	.	G	T	143.85	PASS	AF=0.410256;AO=16;DP=39;FAO=16;FDP=39;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=6;FWDB=-0.00349725;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.114;QD=14.7541;RBI=0.0195499;REFB=-0.0166984;REVB=0.0192346;RO=22;SAF=7;SAR=9;SRF=16;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.285167;STB=0.672698;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=0.022659;OID=.;OPOS=208938866;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:22:23:16:16:0.410256:9:7:16:6:9:7:17:6
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chr2	208989037	.	A	G	1358.53	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0469705;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.131;QD=62.4613;RBI=0.0503071;REFB=0;REVB=-0.0180159;RO=0;SAF=50;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000177718;OID=.;OPOS=208989037;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:87:0:0:86:87:1:36:50:0:0:36:51:0:0
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chr2	209027988	.	G	A	158.61	PASS	AF=0.382979;AO=18;DP=53;FAO=18;FDP=47;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.00173903;FXX=0.113186;HRUN=4;LEN=1;MLLD=203.351;QD=13.4986;RBI=0.0188555;REFB=0.00621909;REVB=-0.0187752;RO=24;SAF=11;SAR=7;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0711626;STB=0.559255;STBP=0.494;TYPE=snp;VARB=-0.00832035;OID=.;OPOS=209027988;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:47:24:29:18:18:0.382979:7:11:13:11:7:11:15:14
chr2	209030050	.	T	A	217.8	PASS	AF=0.461538;AO=24;DP=52;FAO=24;FDP=52;FR=.;FRO=28;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=0.00138722;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.5411;QD=16.7536;RBI=0.0520327;REFB=-0.00215078;REVB=0.0520142;RO=28;SAF=13;SAR=11;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0736317;STB=0.541632;STBP=0.631;TYPE=snp;VARB=0.00219916;OID=.;OPOS=209030050;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:28:28:24:24:0.461538:11:13:13:15:11:13:13:15
chr2	209033173	.	A	G	669.79	PASS	AF=1;AO=42;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0209148;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.646;QD=62.3062;RBI=0.0234467;REFB=0;REVB=-0.0105982;RO=0;SAF=16;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.13547e-05;OID=.;OPOS=209033173;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:42:43:1:26:16:0:0:26:17:0:0
chr2	209036712	.	T	C	1245.15	PASS	AF=1;AO=80;DP=80;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00964846;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=340.855;QD=61.489;RBI=0.0187767;REFB=0;REVB=0.0161081;RO=0;SAF=47;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.71057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.22163e-06;OID=.;OPOS=209036712;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:80:81:0:0:80:81:1:33:47:0:0:34:47:0:0
chr2	209036778	.	A	G	1339.74	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0332336;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.972;QD=62.3136;RBI=0.0647992;REFB=0;REVB=0.0556279;RO=0;SAF=40;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000211076;OID=.;OPOS=209036778;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:46:40:0:0:46:40:0:0
chr2	209150500	.	C	T	695.14	PASS	AF=0.563025;AO=65;DP=117;FAO=67;FDP=119;FR=.;FRO=52;FSAF=38;FSAR=29;FSRF=25;FSRR=27;FWDB=-0.000287486;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.535;QD=23.3661;RBI=0.049295;REFB=-0.00900699;REVB=0.0492941;RO=52;SAF=38;SAR=27;SRF=25;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0854098;STB=0.538042;STBP=0.348;TYPE=snp;VARB=0.00750655;OID=.;OPOS=209150500;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:117:119:52:52:65:67:0.563025:27:38:25:27:29:38:25:27
chr2	209184980	.	G	A	883.84	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00759034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.966;QD=57.9568;RBI=0.00798685;REFB=0;REVB=0.00248528;RO=0;SAF=27;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.7886e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.84129e-05;OID=.;OPOS=209184980;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:61:0:0:60:61:1:33:27:0:0:34:27:0:0
chr2	209184999	.	C	T	773.72	PASS	AF=0.949153;AO=56;DP=61;FAO=56;FDP=59;FR=.;FRO=3;FSAF=26;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0197934;FXX=0.0327815;HRUN=4;LEN=1;MLLD=171.423;QD=52.4555;RBI=0.0207772;REFB=0.0379492;REVB=-0.00631789;RO=3;SAF=26;SAR=30;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0126145;STB=0.506697;STBP=0.718;TYPE=snp;VARB=-0.000170309;OID=.;OPOS=209184999;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:61:59:3:3:56:56:0.949153:30:26:1:2:30:26:1:2
chr2	209190330	.	T	C	726.69	PASS	AF=0.875;AO=56;DP=64;FAO=56;FDP=64;FR=.;FRO=8;FSAF=30;FSAR=26;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.104855;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.175;QD=45.4184;RBI=0.104855;REFB=-0.150425;REVB=-0.00039789;RO=6;SAF=30;SAR=26;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.097185;STB=0.535702;STBP=0.151;TYPE=snp;VARB=0.0293019;OID=.;OPOS=209190330;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:39:64:64:6:8:56:56:0.875:26:30:0:6:26:30:2:6
chr2	209190519	.	A	T	393.31	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00206937;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.738;QD=56.1872;RBI=0.0260771;REFB=0;REVB=0.0259948;RO=0;SAF=10;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000154068;OID=.;OPOS=209190519;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:18:10:0:0:18:10:0:0
chr2	209190528	.	C	G	487.38	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00781324;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.6598;QD=59.0762;RBI=0.00802972;REFB=0;REVB=0.00185196;RO=0;SAF=14;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.71297e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000454844;OID=.;OPOS=209190528;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:19:14:0:0:19:14:0:0
chr2	209191082	.	C	A	206.99	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0514342;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.8055;QD=48.7038;RBI=0.0518345;REFB=0;REVB=0.00642992;RO=0;SAF=7;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00250194;OID=.;OPOS=209191082;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:10:7:0:0:10:7:0:0
chr2	209191099	.	T	C	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.070734;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.7898;QD=42.1826;RBI=0.102502;REFB=0;REVB=0.0741853;RO=0;SAF=1;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00846814;OID=.;OPOS=209191099;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:10:1:0:0:10:1:0:0
chr2	209209827	.	G	A	447.03	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0102177;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.745;QD=57.6807;RBI=0.0365426;REFB=0;REVB=0.035085;RO=0;SAF=18;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.33668e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000142752;OID=.;OPOS=209209827;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:13:18:0:0:13:18:0:0
chr2	209212707	.	G	A	1369.62	PASS	AF=0.978022;AO=89;DP=91;FAO=89;FDP=91;FR=.;FRO=2;FSAF=53;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0180437;FXX=0.0108684;HRUN=3;LEN=1;MLLD=85.8434;QD=60.2029;RBI=0.0191398;REFB=-0.186925;REVB=0.00638423;RO=1;SAF=53;SAR=36;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.012982;STB=0.51351;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=0.0028286;OID=.;OPOS=209212707;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:91:91:1:2:89:89:0.978022:36:53:0:1:36:53:0:2
chr2	209214770	.	A	G	920.11	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0139981;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.857;QD=58.4196;RBI=0.0182757;REFB=0;REVB=0.0117496;RO=0;SAF=34;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.08625e-05;OID=.;OPOS=209214770;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:29:34:0:0:29:34:0:0
chr2	209215586	.	A	G	990.62	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0243742;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.7921;QD=59.1415;RBI=0.0277749;REFB=0;REVB=0.013317;RO=0;SAF=36;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000385074;OID=.;OPOS=209215586;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:31:36:0:0:31:36:0:0
chr2	209220157	.	G	T	3443.84	PASS	AF=1;AO=219;DP=221;FAO=220;FDP=220;FR=.;FRO=0;FSAF=100;FSAR=120;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00716774;FXX=0.00452468;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.251;QD=62.6154;RBI=0.0123564;REFB=0;REVB=-0.010065;RO=0;SAF=100;SAR=119;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.95429e-06;OID=.;OPOS=209220157;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:19:221:220:0:0:219:220:1:119:100:0:0:120:100:0:0
chr2	209220238	.	G	C	3179.9	PASS	AF=0.990476;AO=206;DP=208;FAO=208;FDP=210;FR=.;FRO=2;FSAF=84;FSAR=124;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0776036;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.1595;QD=60.5696;RBI=0.0877097;REFB=-0.0784271;REVB=0.0408738;RO=2;SAF=84;SAR=122;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00174835;STB=0.50095;STBP=0.832;TYPE=snp;VARB=0.000846821;OID=.;OPOS=209220238;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:208:210:2:2:206:208:0.990476:122:84:1:1:124:84:1:1
chr2	209223122	.	TG	GT,TGT,TT	123.04	PASS	AF=0,0.439024,0.243902;AO=2,7,10;DP=42;FAO=0,18,10;FDP=41;FR=.;FRO=13;FSAF=0,12,9;FSAR=0,6,1;FSRF=2;FSRR=11;FWDB=-0.0156199,-0.471777,0.0247968;FXX=0.0681663;HRUN=5,10,1;LEN=2,1,1;MLLD=26.4014,4.56778,137.324;QD=12.004;RBI=0.123838,0.627828,0.0446094;REFB=-0.174328,-0.220918,0.0218894;REVB=0.122849,0.414241,0.0370825;RO=7;SAF=2,1,9;SAR=0,6,1;SRF=1;SRR=6;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.732272,0,0.619789;STB=0.5,0.708111,0.906776;STBP=1,0.013,0.003;TYPE=mnp,ins,snp;VARB=-0.0612907,-0.135425,-0.00407956;OID=.,.,.;OPOS=209223122,209223124,209223123;OREF=TG,-,G;OALT=GT,T,T;OMAPALT=GT,TGT,TT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	2/3:71:42:41:7:13:2,7,10:0,18,10:0,0.439024,0.243902:0,6,1:2,1,9:1:6:0,6,1:0,12,9:2:11
chr2	209224874	.	CAA	CA,CAC	779.87	PASS	AF=0.982759,0.0172414;AO=54,3;DP=58;FAO=57,1;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=24,1;FSAR=33,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00661338,-0.034551;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=24.016,5.04677;QD=53.7841;RBI=0.0223537,0.0769861;REFB=0,0;REVB=-0.021353,-0.0687975;RO=0;SAF=22,3;SAR=32,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.64875e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.00532721,0.136768;OID=.,.;OPOS=209224875,209224876;OREF=A,A;OALT=-,C;OMAPALT=CA,CAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.982759,0.0172414:54,3:58:57,1:58:0:24,1:33,0:0:0:4:0:22,3:32,0:0:0
chr2	209358027	.	C	T	352.76	PASS	AF=0.537313;AO=36;DP=67;FAO=36;FDP=67;FR=.;FRO=31;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=-0.00505247;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.014;QD=21.0604;RBI=0.00662321;REFB=-0.0164873;REVB=-0.00428246;RO=30;SAF=19;SAR=17;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131968;STB=0.564787;STBP=0.264;TYPE=snp;VARB=0.019314;OID=.;OPOS=209358027;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:30:31:36:36:0.537313:17:19:11:19:17:19:12:19
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chr2	211296239	.	G	A	323.47	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00817649;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.79;QD=53.9111;RBI=0.0110396;REFB=0;REVB=0.00741746;RO=0;SAF=12;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.48991e-06;OID=.;OPOS=211296239;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:12:12:0:0:12:12:0:0
chr2	211342502	.	G	A	1076.33	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0225404;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.933;QD=59.7959;RBI=0.0243694;REFB=0;REVB=-0.00926258;RO=0;SAF=42;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.38541e-05;OID=.;OPOS=211342502;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:72:0:0:71:72:1:29:42:0:0:30:42:0:0
chr2	211421452	.	A	ATCT,T	327.36	PASS	AF=0.4,0.0352941;AO=33,3;DP=85;FAO=34,3;FDP=85;FR=.;FRO=48;FSAF=18,1;FSAR=16,2;FSRF=24;FSRR=24;FWDB=0.000557319,0.00592767;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=3,1;MLLD=220.681,104.359;QD=15.4053;RBI=0.000558211,0.0365523;REFB=-0.00704884,-0.00225665;REVB=3.15358e-05,0.0360685;RO=48;SAF=18,1;SAR=15,2;SRF=24;SRR=24;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0475687,-0.154408;STB=0.517231,0.656841;STBP=0.825,0.688;TYPE=ins,snp;VARB=0.00879872,-0.0281044;OID=.,.;OPOS=211421453,211421452;OREF=-,A;OALT=TCT,T;OMAPALT=ATCT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:48:48:33,3:34,3:0.4,0.0352941:15,2:18,1:24:24:16,2:18,1:24:24
chr2	211456637	.	A	G	873.48	PASS	AF=0.439815;AO=94;DP=215;FAO=95;FDP=216;FR=.;FRO=121;FSAF=43;FSAR=52;FSRF=44;FSRR=77;FWDB=-0.00941303;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.409;QD=16.1755;RBI=0.0161636;REFB=0.00186717;REVB=0.0131399;RO=116;SAF=43;SAR=51;SRF=43;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0878311;STB=0.550779;STBP=0.209;TYPE=snp;VARB=-0.00555117;OID=.;OPOS=211456637;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:215:216:116:121:94:95:0.439815:51:43:43:73:52:43:44:77
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chr2	213866714	.	G	A	1627.16	PASS	AF=1;AO=108;DP=109;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0037554;FXX=0.00917347;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.955;QD=60.265;RBI=0.0188461;REFB=0;REVB=0.0184682;RO=0;SAF=62;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.67537e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.94706e-05;OID=.;OPOS=213866714;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:109:108:0:0:108:108:1:46:62:0:0:46:62:0:0
chr2	213886454	.	A	T	1036.21	PASS	AF=0.972603;AO=71;DP=73;FAO=71;FDP=73;FR=.;FRO=2;FSAF=36;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00337038;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=207.728;QD=56.7788;RBI=0.0327937;REFB=-0.13607;REVB=0.03262;RO=2;SAF=36;SAR=35;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000364693;STB=0.500193;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=0.000487191;OID=.;OPOS=213886454;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:73:73:2:2:71:71:0.972603:35:36:1:1:35:36:1:1
chr2	214012405	.	AA	AC,CA	901.1	PASS	AF=0.1875,0.6875;AO=3,46;DP=77;FAO=15,55;FDP=80;FR=.;FRO=10;FSAF=11,16;FSAR=4,39;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=0.0083428,0.0126606;FXX=0;HRUN=9,9;LEN=1,1;MLLD=112.494,95.4674;QD=45.0549;RBI=0.0152188,0.0231537;REFB=-0.0397364,-0.0883276;REVB=-0.0127283,-0.0193856;RO=0;SAF=3,9;SAR=0,37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.83101e-08;STB=0.564013,0.55496;STBP=0.477,0.063;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00124249,0.0141839;OID=.,.;OPOS=214012406,214012405;OREF=A,A;OALT=C,C;OMAPALT=AC,CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:88:77:80:0:10:3,46:15,55:0.1875,0.6875:0,37:3,9:0:0:4,39:11,16:6:4
chr2	214637044	.	A	G	95.18	PASS	AF=0.352941;AO=12;DP=34;FAO=12;FDP=34;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=17;FWDB=-0.0295692;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.524;QD=11.1978;RBI=0.0418282;REFB=-0.000374258;REVB=-0.0295848;RO=22;SAF=5;SAR=7;SRF=5;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.224322;STB=0.631383;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.000268487;OID=.;OPOS=214637044;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:34:34:22:22:12:12:0.352941:7:5:5:17:7:5:5:17
chr2	214794743	.	A	C	1067.06	PASS	AF=0.986301;AO=71;DP=73;FAO=72;FDP=73;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0315736;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=238.843;QD=58.4688;RBI=0.0328588;REFB=-0.126954;REVB=0.0091002;RO=0;SAF=35;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11607e-08;STB=0.506847;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.00034157;OID=.;OPOS=214794743;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:73:73:0:1:71:72:0.986301:36:35:0:0:36:36:1:0
chr2	215102929	.	T	A	447.03	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0214206;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=382.418;QD=57.6807;RBI=0.0217194;REFB=0;REVB=-0.00359055;RO=0;SAF=9;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.15349e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.732e-05;OID=.;OPOS=215102929;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:22:9:0:0:22:9:0:0
chr2	215632256	.	A	G	1176.53	PASS	AF=0.987342;AO=78;DP=79;FAO=78;FDP=79;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00392457;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.835;QD=59.5711;RBI=0.0292629;REFB=-0.0996981;REVB=0.0289985;RO=0;SAF=41;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.4281e-08;STB=0.506023;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.00117384;OID=.;OPOS=215632256;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:79:79:0:1:78:78:0.987342:37:41:0:0:37:41:1:0
chr2	215645545	.	C	G	234.94	PASS	AF=0.46;AO=23;DP=50;FAO=23;FDP=50;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=19;FWDB=-0.0291076;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.1965;QD=18.7955;RBI=0.0291439;REFB=0.0405002;REVB=0.00145463;RO=27;SAF=10;SAR=13;SRF=8;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137658;STB=0.577553;STBP=0.348;TYPE=snp;VARB=-0.0211952;OID=.;OPOS=215645545;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:27:27:23:23:0.46:13:10:8:19:13:10:8:19
chr2	215865575	.	T	C	511.88	PASS	AF=0.564706;AO=48;DP=85;FAO=48;FDP=85;FR=.;FRO=37;FSAF=30;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=22;FWDB=0.00977548;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.4493;QD=24.0883;RBI=0.048443;REFB=-0.00273837;REVB=0.0474464;RO=37;SAF=30;SAR=18;SRF=15;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176638;STB=0.596974;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=0.00275247;OID=.;OPOS=215865575;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:37:37:48:48:0.564706:18:30:15:22:18:30:15:22
chr2	215876166	.	A	T	724.86	PASS	AF=0.963636;AO=52;DP=55;FAO=53;FDP=55;FR=.;FRO=2;FSAF=39;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00614819;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.525;QD=52.7172;RBI=0.0537143;REFB=-0.0366976;REVB=-0.0533612;RO=2;SAF=38;SAR=14;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0626402;STB=0.53332;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.00248551;OID=.;OPOS=215876166;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:55:55:2:2:52:53:0.963636:14:38:0:2:14:39:0:2
chr2	215901774	.	C	T	286.47	PASS	AF=0.553191;AO=26;DP=47;FAO=26;FDP=47;FR=.;FRO=21;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=-0.00320976;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.914;QD=24.3802;RBI=0.0205384;REFB=-0.0230941;REVB=0.020286;RO=21;SAF=12;SAR=14;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0267013;STB=0.51484;STBP=0.832;TYPE=snp;VARB=0.0139536;OID=.;OPOS=215901774;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:21:21:26:26:0.553191:14:12:9:12:14:12:9:12
chr2	215940242	.	T	C	271.69	PASS	AF=0.538462;AO=28;DP=52;FAO=28;FDP=52;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=0.00447004;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=299.181;QD=20.8996;RBI=0.0156118;REFB=-0.00862718;REVB=-0.0149582;RO=24;SAF=13;SAR=15;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11039;STB=0.561239;STBP=0.381;TYPE=snp;VARB=0.00753058;OID=.;OPOS=215940242;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:24:24:28:28:0.538462:15:13:8:16:15:13:8:16
chr2	216190020	.	C	G	955.13	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00552796;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.831;QD=58.7772;RBI=0.00663253;REFB=0;REVB=0.00366499;RO=0;SAF=27;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.04073e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.78506e-05;OID=.;OPOS=216190020;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:38:27:0:0:38:27:0:0
chr2	216212339	.	T	C	1153.49	PASS	AF=1;AO=75;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0245488;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.578;QD=60.7101;RBI=0.0260264;REFB=0;REVB=-0.00864449;RO=0;SAF=42;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.76545e-05;OID=.;OPOS=216212339;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:75:76:1:33:42:0:0:34:42:0:0
chr2	216229692	.	A	G	893.14	PASS	AF=1;AO=61;DP=63;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.153875;FXX=0.031741;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.687;QD=58.5668;RBI=0.154288;REFB=0;REVB=0.0112837;RO=0;SAF=28;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.9266e-05;OID=.;OPOS=216229692;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:61:0:0:61:61:1:33:28:0:0:33:28:0:0
chr2	216235089	.	C	T	1377.51	PASS	AF=1;AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0122703;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.423;QD=62.614;RBI=0.0257142;REFB=0;REVB=-0.0225978;RO=0;SAF=34;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.68294e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.17437e-05;OID=.;OPOS=216235089;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:88:88:0:0:88:88:1:54:34:0:0:54:34:0:0
chr2	216249587	.	C	T	995.79	PASS	AF=1;AO=61;DP=63;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0247448;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.659;QD=56.9024;RBI=0.102926;REFB=-0.152874;REVB=0.099907;RO=1;SAF=53;SAR=8;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0553976;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0026794;OID=.;OPOS=216249587;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:63:70:1:0:61:70:1:8:53:0:1:15:55:0:0
chr2	216272900	.	T	G	501.66	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0326769;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.092;QD=59.0187;RBI=0.0417475;REFB=0;REVB=0.0259821;RO=0;SAF=21;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00012316;OID=.;OPOS=216272900;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:13:21:0:0:13:21:0:0
chr2	216272907	.	A	T	434.03	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0333057;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.242;QD=57.8701;RBI=0.0333517;REFB=0;REVB=-0.00175082;RO=0;SAF=19;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000233236;OID=.;OPOS=216272907;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:11:19:0:0:11:19:0:0
chr2	216300482	.	T	A	986.34	PASS	AF=1;AO=65;DP=66;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0193114;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.1179;QD=58.8859;RBI=0.0356059;REFB=0;REVB=0.0299141;RO=0;SAF=27;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.04073e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.91803e-05;OID=.;OPOS=216300482;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:67:0:0:65:67:1:38:27:0:0:40:27:0:0
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chr2	217288388	.	G	C	205.36	PASS	AF=0.428571;AO=24;DP=56;FAO=24;FDP=56;FR=.;FRO=32;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=12;FWDB=0.0016025;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.677;QD=14.6688;RBI=0.00738382;REFB=-0.0161792;REVB=0.00720782;RO=32;SAF=16;SAR=8;SRF=20;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0461069;STB=0.526294;STBP=0.76;TYPE=snp;VARB=0.0230681;OID=.;OPOS=217288388;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:32:32:24:24:0.428571:8:16:20:12:8:16:20:12
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chr2	217363638	.	G	A	306.08	PASS	AF=0.425;AO=34;DP=80;FAO=34;FDP=80;FR=.;FRO=46;FSAF=7;FSAR=27;FSRF=24;FSRR=22;FWDB=0.0258827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.61;QD=15.3042;RBI=0.0265131;REFB=-0.00648444;REVB=0.00574717;RO=43;SAF=7;SAR=27;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.32974;STB=0.709187;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.00655766;OID=.;OPOS=217363638;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:43:46:34:34:0.425:27:7:21:22:27:7:24:22
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chr2	217537699	.	C	A	48.2	PASS	AF=0.466667;AO=7;DP=15;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.131297;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.394;QD=12.8531;RBI=0.131522;REFB=-0.0064515;REVB=-0.00768133;RO=8;SAF=6;SAR=1;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.561098;STB=0.838983;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.0307493;OID=.;OPOS=217537699;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:15:15:8:8:7:7:0.466667:1:6:2:6:1:6:2:6
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chr2	219144815	.	T	C	747.05	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0222155;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.751;QD=63.5791;RBI=0.0409161;REFB=0;REVB=0.0343598;RO=0;SAF=28;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000226208;OID=.;OPOS=219144815;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:19:28:0:0:19:28:0:0
chr2	219146803	.	G	A	59.39	PASS	AF=0.533333;AO=8;DP=15;FAO=8;FDP=15;FR=.;FRO=7;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=0.0458161;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.8523;QD=15.8384;RBI=0.0530044;REFB=-0.0957115;REVB=-0.0266524;RO=7;SAF=6;SAR=2;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122922;STB=0.571264;STBP=0.686;TYPE=snp;VARB=0.0204466;OID=.;OPOS=219146803;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:15:15:7:7:8:8:0.533333:2:6:6:1:2:6:6:1
chr2	219210382	.	C	CCT	175.5	PASS	AF=0.5625;AO=16;DP=33;FAO=18;FDP=32;FR=.;FRO=14;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.0109164;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=238.678;QD=21.937;RBI=0.0111334;REFB=0.00267345;REVB=0.00218743;RO=15;SAF=9;SAR=7;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0326017;STB=0.531215;STBP=0.739;TYPE=ins;VARB=-0.00289368;OID=.;OPOS=219210383;OREF=-;OALT=CT;OMAPALT=CCT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.5625:16:33:18:32:14:9:9:8:6:99:15:9:7:9:6
chr2	219231807	.	C	A,T	473.38	PASS	AF=0.0606061,0.939394;AO=2,31;DP=33;FAO=2,31;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=1,11;FSAR=1,20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0309538,0.00635808;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=19.6564,203.302;QD=57.3791;RBI=0.0340054,0.00745279;REFB=0,0;REVB=-0.0140795,-0.00388829;RO=0;SAF=1,11;SAR=1,20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0625853,-0.000627511;OID=.,.;OPOS=219231807,219231807;OREF=C,C;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:33:33:0:0:2,31:2,31:0.0606061,0.939394:1,20:1,11:0:0:1,20:1,11:0:0
chr2	219254622	.	A	G	1048.96	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00601618;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.012;QD=59.9404;RBI=0.0249513;REFB=0;REVB=0.0242151;RO=0;SAF=32;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00016607;OID=.;OPOS=219254622;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:38:32:0:0:38:32:0:0
chr2	219265094	.	T	C	631.05	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0666485;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.6936;QD=61.566;RBI=0.0675809;REFB=0;REVB=0.0111872;RO=0;SAF=12;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000919941;OID=.;OPOS=219265094;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:29:12:0:0:29:12:0:0
chr2	219267781	.	C	T	447.01	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0056589;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.4935;QD=57.6788;RBI=0.0297622;REFB=0;REVB=-0.0292193;RO=0;SAF=15;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000522409;OID=.;OPOS=219267781;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:16:15:0:0:16:15:0:0
chr2	219319657	.	A	G	709.86	PASS	AF=0.980769;AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0072864;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.693;QD=54.6049;RBI=0.00800928;REFB=0.00349472;REVB=-0.0033252;RO=1;SAF=25;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0184631;STB=0.5098;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=-0.000158195;OID=.;OPOS=219319657;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:52:52:1:1:51:51:0.980769:26:25:1:0:26:25:1:0
chr2	219492924	.	T	C	1008.05	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00339198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.0711;QD=59.2972;RBI=0.0287128;REFB=0;REVB=0.0285118;RO=0;SAF=32;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.49594e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000133859;OID=.;OPOS=219492924;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:36:32:0:0:36:32:0:0
chr2	219508988	.	T	C	885.23	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0384238;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.566;QD=58.048;RBI=0.039256;REFB=0;REVB=0.00804049;RO=0;SAF=26;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.65244e-05;OID=.;OPOS=219508988;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:61:0:0:60:61:1:34:26:0:0:34:27:0:0
chr2	219509618	.	C	A	698.58	PASS	AF=0.980392;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00498843;FXX=0.0192271;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.6549;QD=54.7905;RBI=0.0136842;REFB=-0.105359;REVB=0.0127426;RO=1;SAF=21;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0218873;STB=0.511623;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=0.002448;OID=.;OPOS=219509618;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:51:51:1:1:50:50:0.980392:29:21:1:0:29:21:1:0
chr2	219867669	.	T	C	77.26	PASS	AF=0.434783;AO=10;DP=23;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=-0.0853626;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.767;QD=13.4359;RBI=0.0857985;REFB=-0.0275876;REVB=0.00863781;RO=12;SAF=7;SAR=3;SRF=2;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.467985;STB=0.751595;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.0409481;OID=.;OPOS=219867669;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:23:23:12:13:10:10:0.434783:3:7:2:10:3:7:3:10
chr2	219888742	.	G	T	124.09	PASS	AF=0.722222;AO=13;DP=18;FAO=13;FDP=18;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0016518;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.5223;QD=27.5756;RBI=0.00936794;REFB=0.00387983;REVB=-0.00922116;RO=5;SAF=4;SAR=9;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0523783;STB=0.529366;STBP=0.714;TYPE=snp;VARB=-0.00376673;OID=.;OPOS=219888742;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:18:18:5:5:13:13:0.722222:9:4:2:3:9:4:2:3
chr2	219920037	.	A	G	378.7	PASS	AF=0.33758;AO=48;DP=152;FAO=53;FDP=157;FR=.;FRO=104;FSAF=27;FSAR=26;FSRF=52;FSRR=52;FWDB=0.00905378;FXX=0.00632871;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.414;QD=9.64838;RBI=0.00948353;REFB=-0.014123;REVB=0.00282247;RO=104;SAF=24;SAR=24;SRF=51;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.011334;STB=0.506248;STBP=0.915;TYPE=snp;VARB=0.0296577;OID=.;OPOS=219920037;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:152:157:104:104:48:53:0.33758:24:24:51:53:26:27:52:52
chr2	219940484	.	C	T	739.07	PASS	AF=0.981481;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0176642;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.071;QD=54.7462;RBI=0.0253769;REFB=-0.0244115;REVB=-0.0182198;RO=1;SAF=24;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0192259;STB=0.5102;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=4.5445e-05;OID=.;OPOS=219940484;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:54:54:1:1:53:53:0.981481:29:24:1:0:29:24:1:0
chr2	219967380	.	T	C	673.98	PASS	AF=1;AO=42;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0534798;FXX=0.0227221;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.7141;QD=62.6956;RBI=0.0687618;REFB=0;REVB=0.0432216;RO=0;SAF=24;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000482597;OID=.;OPOS=219967380;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:42:43:1:18:24:0:0:19:24:0:0
chr2	220037393	.	A	G	208.06	PASS	AF=0.947368;AO=17;DP=18;FAO=18;FDP=19;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0436696;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.079;QD=43.8028;RBI=0.0637441;REFB=0.0321703;REVB=0.0464357;RO=1;SAF=8;SAR=9;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0538535;STB=0.529379;STBP=0.331;TYPE=snp;VARB=0.000283118;OID=.;OPOS=220037393;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:18:19:1:1:17:18:0.947368:9:8:1:0:10:8:1:0
chr2	220045454	.	G	A	584.4	PASS	AF=0.430556;AO=62;DP=144;FAO=62;FDP=144;FR=.;FRO=82;FSAF=17;FSAR=45;FSRF=30;FSRR=52;FWDB=-0.0135746;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.1501;QD=16.2332;RBI=0.0361748;REFB=-0.00275767;REVB=0.0335313;RO=79;SAF=17;SAR=45;SRF=29;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110094;STB=0.561881;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=0.00417954;OID=.;OPOS=220045454;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:144:144:79:82:62:62:0.430556:45:17:29:50:45:17:30:52
chr2	220072766	.	G	T	660.32	PASS	AF=1;AO=42;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0267713;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.9794;QD=61.4251;RBI=0.0451367;REFB=0;REVB=-0.0363404;RO=0;SAF=17;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.98888e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000138065;OID=.;OPOS=220072766;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:42:43:1:25:17:0:0:26:17:0:0
chr2	220083279	.	C	T	1378.78	PASS	AF=0.988889;AO=89;DP=90;FAO=89;FDP=90;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0222937;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=148.982;QD=61.2791;RBI=0.0227614;REFB=0.165826;REVB=0.00459084;RO=0;SAF=46;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505746;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=4.38343e-05;OID=.;OPOS=220083279;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:90:90:0:1:89:89:0.988889:43:46:0:0:43:46:0:1
chr2	220084902	.	G	A	669.37	PASS	AF=1;AO=42;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0465605;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=148.262;QD=62.2669;RBI=0.0484532;REFB=0;REVB=0.0134101;RO=0;SAF=19;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.4142e-05;OID=.;OPOS=220084902;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:42:43:1:23:19:0:0:24:19:0:0
chr2	220085845	.	A	G	289.36	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0134824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.5214;QD=52.6104;RBI=0.0848549;REFB=0;REVB=-0.083777;RO=0;SAF=13;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2029e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00164604;OID=.;OPOS=220085845;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:9:13:0:0:9:13:0:0
chr2	220100201	.	C	G	446.11	PASS	AF=0.565789;AO=43;DP=76;FAO=43;FDP=76;FR=.;FRO=33;FSAF=32;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=-0.0110036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.2717;QD=23.4796;RBI=0.0194333;REFB=-0.0423308;REVB=-0.0160179;RO=33;SAF=32;SAR=11;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.233691;STB=0.629149;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.0415479;OID=.;OPOS=220100201;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:33:33:43:43:0.565789:11:32:16:17:11:32:16:17
chr2	220113242	.	T	G	3928.1	PASS	AF=1;AO=252;DP=262;FAO=254;FDP=254;FR=.;FRO=0;FSAF=151;FSAR=103;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00296864;FXX=0.0305332;HRUN=2;LEN=1;MLLD=252.359;QD=61.8598;RBI=0.0174165;REFB=-0.0392718;REVB=0.0171617;RO=2;SAF=150;SAR=102;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00148302;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.14291e-05;OID=.;OPOS=220113242;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:262:254:2:0:252:254:1:102:150:1:1:103:151:0:0
chr2	220118531	.	G	C	393.33	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00535145;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.494;QD=56.1906;RBI=0.0109759;REFB=0;REVB=0.00958292;RO=0;SAF=16;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.43187e-05;OID=.;OPOS=220118531;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:12:16:0:0:12:16:0:0
chr2	220136155	.	T	C	1008.91	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.037487;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.49;QD=59.3476;RBI=0.0395551;REFB=0;REVB=0.0126227;RO=0;SAF=37;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000104772;OID=.;OPOS=220136155;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:68:0:0:67:68:1:30:37:0:0:31:37:0:0
chr2	220136351	.	G	A	433.76	PASS	AF=0.449541;AO=43;DP=104;FAO=49;FDP=109;FR=.;FRO=60;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=23;FSRR=37;FWDB=0.0668453;FXX=0.00909008;HRUN=2;LEN=1;MLLD=38.98;QD=15.9179;RBI=0.0713564;REFB=0.00189366;REVB=0.0249688;RO=60;SAF=16;SAR=27;SRF=23;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0123759;STB=0.525596;STBP=0.638;TYPE=snp;VARB=-0.000414258;OID=.;OPOS=220136351;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:109:60:60:43:49:0.449541:27:16:23:37:28:21:23:37
chr2	220136371	.	T	C	1398.59	PASS	AF=0.978495;AO=90;DP=93;FAO=91;FDP=93;FR=.;FRO=2;FSAF=37;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0368166;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.643;QD=60.1543;RBI=0.0383135;REFB=-0.0573719;REVB=0.0106047;RO=2;SAF=37;SAR=53;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0175486;STB=0.509089;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=0.00107247;OID=.;OPOS=220136371;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:93:93:2:2:90:91:0.978495:53:37:0:2:54:37:0:2
chr2	220250147	.	A	G	785.72	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0140084;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.406;QD=64.1401;RBI=0.0430471;REFB=0;REVB=0.040704;RO=0;SAF=28;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000171828;OID=.;OPOS=220250147;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:21:28:0:0:21:28:0:0
chr2	220283259	.	A	G	501.66	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0162069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.5097;QD=59.0183;RBI=0.102312;REFB=0;REVB=-0.10102;RO=0;SAF=26;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00158894;OID=.;OPOS=220283259;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:8:26:0:0:8:26:0:0
chr2	220283277	.	T	C	520.0	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00744322;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.4531;QD=59.4287;RBI=0.0685228;REFB=0;REVB=0.0681174;RO=0;SAF=27;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000661954;OID=.;OPOS=220283277;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:8:27:0:0:8:27:0:0
chr2	220308805	.	G	GC	47.38	PASS	AF=0.482759;AO=12;DP=32;FAO=14;FDP=29;FR=.;FRO=15;FSAF=2;FSAR=12;FSRF=2;FSRR=13;FWDB=0.196605;FXX=0.0333222;HRUN=6;LEN=1;MLLD=9.9051;QD=6.53452;RBI=0.207173;REFB=-0.126204;REVB=0.0653229;RO=19;SAF=1;SAR=11;SRF=5;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.365445;STB=0.51019;STBP=0.946;TYPE=ins;VARB=0.185412;OID=.;OPOS=220308806;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.482759:12:32:14:29:15:2:12:2:13:47:19:1:11:5:14
chr2	220315970	.	G	A	149.81	PASS	AF=0.327869;AO=20;DP=61;FAO=20;FDP=61;FR=.;FRO=41;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=30;FWDB=0.0171519;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.672;QD=9.82328;RBI=0.0181289;REFB=0.00806082;REVB=-0.005871;RO=41;SAF=6;SAR=14;SRF=11;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0440915;STB=0.525871;STBP=0.839;TYPE=snp;VARB=-0.0271799;OID=.;OPOS=220315970;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:41:41:20:20:0.327869:14:6:11:30:14:6:11:30
chr2	220330804	.	T	C	99.96	PASS	AF=0.461538;AO=12;DP=26;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.0890069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.496;QD=15.379;RBI=0.0900802;REFB=-0.0178297;REVB=0.0138644;RO=14;SAF=4;SAR=8;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162033;STB=0.594432;STBP=0.388;TYPE=snp;VARB=0.0165794;OID=.;OPOS=220330804;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:26:14:14:12:12:0.461538:8:4:7:7:8:4:7:7
chr2	220333950	.	T	C	834.41	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00696993;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.168;QD=57.5452;RBI=0.0232216;REFB=0;REVB=0.0221509;RO=0;SAF=26;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.09576e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.32216e-05;OID=.;OPOS=220333950;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:32:26:0:0:32:26:0:0
chr2	220362899	.	C	G	508.96	PASS	AF=0.972222;AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.141712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.638;QD=56.5508;RBI=0.142688;REFB=-0.136356;REVB=-0.0166607;RO=1;SAF=13;SAR=22;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0346204;STB=0.518508;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=0.00743936;OID=.;OPOS=220362899;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:36:36:1:1:35:35:0.972222:22:13:1:0:22:13:1:0
chr2	220379560	.	C	G	1185.8	PASS	AF=0.964286;AO=81;DP=85;FAO=81;FDP=84;FR=.;FRO=3;FSAF=38;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0059412;FXX=0.0117633;HRUN=6;LEN=1;MLLD=193.118;QD=56.4665;RBI=0.00835222;REFB=-0.0229915;REVB=-0.00587041;RO=4;SAF=38;SAR=43;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0196011;STB=0.51685;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=0.000329285;OID=.;OPOS=220379560;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:85:84:4:3:81:81:0.964286:43:38:1:3:43:38:0:3
chr2	220402671	.	G	T	540.5	PASS	AF=1;AO=33;DP=35;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00376832;FXX=0.0526177;HRUN=4;LEN=1;MLLD=176.558;QD=60.0551;RBI=0.0288265;REFB=0;REVB=0.0285792;RO=0;SAF=20;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.82173e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.22229e-05;OID=.;OPOS=220402671;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:36:0:0:33:36:1:13:20:0:0:15:21:0:0
chr2	220402680	.	T	C	554.79	PASS	AF=1;AO=36;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000413526;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.5341;QD=59.9775;RBI=0.0133739;REFB=0;REVB=0.0133675;RO=0;SAF=21;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.73994e-05;OID=.;OPOS=220402680;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:36:37:1:15:21:0:0:15:22:0:0
chr2	220404381	.	A	G	514.43	PASS	AF=1;AO=34;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0988399;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.278;QD=58.7924;RBI=0.0994726;REFB=0;REVB=0.0112013;RO=0;SAF=4;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000701558;OID=.;OPOS=220404381;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:34:35:1:30:4:0:0:31:4:0:0
chr2	220405321	.	T	C	1611.96	PASS	AF=1;AO=107;DP=107;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0192975;FXX=0.0092584;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.078;QD=60.2602;RBI=0.0284447;REFB=0;REVB=-0.0208975;RO=0;SAF=44;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.78072e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.86849e-06;OID=.;OPOS=220405321;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:107:107:0:0:107:107:1:63:44:0:0:63:44:0:0
chr2	220406722	.	T	C	392.97	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0450477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.1302;QD=56.1383;RBI=0.0518648;REFB=0;REVB=0.0257033;RO=0;SAF=18;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00064271;OID=.;OPOS=220406722;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:10:18:0:0:10:18:0:0
chr2	220412256	.	T	C	753.93	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0519429;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.9874;QD=56.9003;RBI=0.0521292;REFB=0;REVB=-0.00440346;RO=0;SAF=33;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.88914e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000694614;OID=.;OPOS=220412256;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:20:33:0:0:20:33:0:0
chr2	220414016	.	C	T	198.43	PASS	AF=0.944444;AO=17;DP=18;FAO=17;FDP=18;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0079654;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=209.211;QD=44.0946;RBI=0.0159551;REFB=-0.139244;REVB=0.0138245;RO=0;SAF=5;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.519977;STBP=0.631;TYPE=snp;VARB=0.00224919;OID=.;OPOS=220414016;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:18:18:0:1:17:17:0.944444:12:5:0:0:12:5:0:1
chr2	220419236	.	T	C	1696.18	PASS	AF=0.991228;AO=113;DP=114;FAO=113;FDP=114;FR=.;FRO=1;FSAF=56;FSAR=57;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.016616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.297;QD=59.5152;RBI=0.0354606;REFB=-0.0578805;REVB=0.0313267;RO=1;SAF=56;SAR=57;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0084037;STB=0.504424;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.000316187;OID=.;OPOS=220419236;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:114:114:1:1:113:113:0.991228:57:56:1:0:57:56:1:0
chr2	220419339	.	T	C	2347.87	PASS	AF=1;AO=145;DP=146;FAO=147;FDP=147;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148889;FXX=0.0067563;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.805;QD=63.8876;RBI=0.0221676;REFB=0;REVB=-0.0164233;RO=0;SAF=66;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.04189e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000649509;OID=.;OPOS=220419339;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:146:147:0:0:145:147:1:79:66:0:0:80:67:0:0
chr2	220420956	.	A	G	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=3.46378e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.975;QD=48.7359;RBI=0.018987;REFB=0;REVB=0.018987;RO=0;SAF=5;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000353206;OID=.;OPOS=220420956;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:12:5:0:0:12:5:0:0
chr2	220421417	.	C	G	708.56	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00438035;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.945;QD=62.9828;RBI=0.0045381;REFB=0;REVB=0.00118611;RO=0;SAF=26;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.15971e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.21901e-05;OID=.;OPOS=220421417;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:19:26:0:0:19:26:0:0
chr2	220430203	.	C	T	1312.18	PASS	AF=0.977273;AO=86;DP=88;FAO=86;FDP=88;FR=.;FRO=2;FSAF=40;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0290606;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.0902;QD=59.6446;RBI=0.094187;REFB=-0.17352;REVB=0.0895917;RO=0;SAF=40;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.510636;STBP=0.216;TYPE=snp;VARB=0.00381723;OID=.;OPOS=220430203;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:88:88:0:2:86:86:0.977273:46:40:0:0:46:40:0:2
chr2	220435034	.	A	G	429.02	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00435812;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=238.71;QD=57.2026;RBI=0.0051593;REFB=0;REVB=-0.00276137;RO=0;SAF=14;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.56309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.67349e-06;OID=.;OPOS=220435034;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:16:14:0:0:16:14:0:0
chr2	220435375	.	G	A	678.35	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0432795;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.893;QD=61.6678;RBI=0.0460098;REFB=0;REVB=0.0156137;RO=0;SAF=27;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000555377;OID=.;OPOS=220435375;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:44:0:0:43:44:1:16:27:0:0:16:28:0:0
chr2	220462640	.	G	T	1903.49	PASS	AF=0.984252;AO=123;DP=126;FAO=125;FDP=127;FR=.;FRO=2;FSAF=60;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.018455;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=299.532;QD=59.9523;RBI=0.0195758;REFB=-0.0379261;REVB=-0.00652877;RO=2;SAF=59;SAR=64;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0146135;STB=0.507575;STBP=0.225;TYPE=snp;VARB=-1.53573e-06;OID=.;OPOS=220462640;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:126:127:2:2:123:125:0.984252:64:59:0:2:65:60:0:2
chr2	220466199	.	G	T	682.89	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0322694;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.627;QD=54.631;RBI=0.0486304;REFB=0;REVB=0.0363814;RO=0;SAF=35;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.61818e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00106812;OID=.;OPOS=220466199;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:50:0:0:48:50:1:13:35:0:0:15:35:0:0
chr2	220471116	.	C	G	1011.72	PASS	AF=1;AO=68;DP=69;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0341863;FXX=0.0144907;HRUN=3;LEN=1;MLLD=220.261;QD=59.5131;RBI=0.0349188;REFB=0;REVB=0.0071151;RO=0;SAF=30;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.76795e-05;OID=.;OPOS=220471116;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:69:68:0:0:68:68:1:38:30:0:0:38:30:0:0
chr2	220472832	.	G	T	205.9	PASS	AF=0.428571;AO=21;DP=49;FAO=21;FDP=49;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.00323129;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.154;QD=16.8081;RBI=0.00813261;REFB=-0.0104669;REVB=-0.00746311;RO=28;SAF=7;SAR=14;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.208654;STB=0.619601;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.0146155;OID=.;OPOS=220472832;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:28:28:21:21:0.428571:14:7:15:13:14:7:15:13
chr2	220473355	.	G	A	1493.67	PASS	AF=0.980769;AO=102;DP=105;FAO=102;FDP=104;FR=.;FRO=2;FSAF=65;FSAR=37;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0206406;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.816;QD=57.4487;RBI=0.0338484;REFB=-0.0776532;REVB=0.0268268;RO=2;SAF=65;SAR=37;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0143743;STB=0.507574;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=0.000625416;OID=.;OPOS=220473355;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:105:104:2:2:102:102:0.980769:37:65:2:0:37:65:2:0
chr2	220476443	.	C	T	754.1	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.048653;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.698;QD=56.913;RBI=0.0491509;REFB=0;REVB=0.00697817;RO=0;SAF=24;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000113698;OID=.;OPOS=220476443;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:53:0:0:52:53:1:28:24:0:0:28:25:0:0
chr2	220479312	.	T	C	688.58	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.027315;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.566;QD=62.5979;RBI=0.055473;REFB=0;REVB=0.048282;RO=0;SAF=18;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000174468;OID=.;OPOS=220479312;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:44:0:0:42:44:1:24:18:0:0:26:18:0:0
chr2	220494118	.	A	C	570.43	PASS	AF=1;AO=26;DP=37;FAO=38;FDP=38;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0386179;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.102;QD=60.0454;RBI=0.0459371;REFB=0;REVB=0.0248772;RO=0;SAF=11;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000758526;OID=.;OPOS=220494118;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:38:0:0:26:38:1:15:11:0:0:21:17:0:0
chr2	220500423	.	A	G	1572.86	PASS	AF=1;AO=103;DP=105;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0249405;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.5538;QD=59.9185;RBI=0.0260394;REFB=0;REVB=-0.00748474;RO=2;SAF=52;SAR=51;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0178979;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000160472;OID=.;OPOS=220500423;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:105:105:2:0:103:105:1:51:52:2:0:51:54:0:0
chr2	220500426	.	A	G	1473.34	PASS	AF=0.980583;AO=99;DP=101;FAO=101;FDP=103;FR=.;FRO=2;FSAF=51;FSAR=50;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00781799;FXX=0.0190458;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.561;QD=57.2171;RBI=0.0383942;REFB=-0.0341888;REVB=-0.0375898;RO=2;SAF=50;SAR=49;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0185937;STB=0.509613;STBP=0.226;TYPE=snp;VARB=0.000131911;OID=.;OPOS=220500426;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:101:103:2:2:99:101:0.980583:49:50:2:0:50:51:2:0
chr2	220502367	.	A	C	538.55	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00610888;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.585;QD=59.8386;RBI=0.00613646;REFB=0;REVB=-0.000581074;RO=0;SAF=19;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.06984e-05;OID=.;OPOS=220502367;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:17:19:0:0:17:19:0:0
chr2	220502523	.	TG	T	36.9	PASS	AF=0.363636;AO=8;DP=22;FAO=8;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.0901699;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=10.2992;QD=6.70966;RBI=0.125424;REFB=-0.0750234;REVB=-0.0871812;RO=11;SAF=1;SAR=7;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0.494118;SSSB=-0.491325;STB=0.799127;STBP=0.053;TYPE=del;VARB=0.0971683;OID=.;OPOS=220502524;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.363636:8:22:8:22:14:1:7:7:7:36:11:1:7:6:5
chr2	220505265	.	T	C	1069.31	PASS	AF=0.986301;AO=72;DP=74;FAO=72;FDP=73;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0107369;FXX=0.0135117;HRUN=3;LEN=1;MLLD=234.956;QD=58.5922;RBI=0.0137739;REFB=-0.00272275;REVB=0.00862784;RO=1;SAF=27;SAR=45;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0103952;STB=0.505493;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.000154248;OID=.;OPOS=220505265;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:74:73:1:1:72:72:0.986301:45:27:0:1:45:27:0:1
chr2	220771223	.	C	T	1758.67	PASS	AF=0.959677;AO=119;DP=124;FAO=119;FDP=124;FR=.;FRO=5;FSAF=69;FSAR=50;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0159867;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=236.862;QD=56.7313;RBI=0.019838;REFB=-0.148575;REVB=0.011746;RO=1;SAF=69;SAR=50;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0068347;STB=0.509135;STBP=0.343;TYPE=snp;VARB=0.000666485;OID=.;OPOS=220771223;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:124:124:1:5:119:119:0.959677:50:69:1:0:50:69:4:1
chr2	220771290	.	G	A	1764.57	PASS	AF=1;AO=116;DP=116;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00758612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.338;QD=60.8472;RBI=0.0131196;REFB=0;REVB=0.010704;RO=0;SAF=59;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.66467e-06;OID=.;OPOS=220771290;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:116:116:0:0:116:116:1:57:59:0:0:57:59:0:0
chr2	222282765	.	C	T	1040.34	PASS	AF=0.397993;AO=120;DP=302;FAO=119;FDP=299;FR=.;FRO=180;FSAF=65;FSAR=54;FSRF=82;FSRR=98;FWDB=0.00919178;FXX=0.0132009;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.798;QD=13.9176;RBI=0.0113156;REFB=-0.00525731;REVB=0.00659955;RO=179;SAF=66;SAR=54;SRF=82;SRR=97;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0981483;STB=0.554486;STBP=0.114;TYPE=snp;VARB=0.00920969;OID=.;OPOS=222282765;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:302:299:179:180:120:119:0.397993:54:66:82:97:54:65:82:98
chr2	222283000	.	A	T	244.13	PASS	AF=0.391892;AO=28;DP=73;FAO=29;FDP=74;FR=.;FRO=45;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=32;FWDB=0.0127749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.345;QD=13.1962;RBI=0.0128853;REFB=-0.0190443;REVB=0.00168279;RO=45;SAF=14;SAR=14;SRF=13;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.228847;STB=0.618926;STBP=0.138;TYPE=snp;VARB=0.0310781;OID=.;OPOS=222283000;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:74:45:45:28:29:0.391892:14:14:13:32:15:14:13:32
chr2	222290027	.	T	G	359.79	PASS	AF=0.40625;AO=39;DP=96;FAO=39;FDP=96;FR=.;FRO=57;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=32;FSRR=25;FWDB=0.00172644;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=216.389;QD=14.9911;RBI=0.00892394;REFB=-0.00958314;REVB=0.00875535;RO=57;SAF=18;SAR=21;SRF=32;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104424;STB=0.559075;STBP=0.358;TYPE=snp;VARB=0.0156495;OID=.;OPOS=222290027;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:96:57:57:39:39:0.40625:21:18:32:25:21:18:32:25
chr2	223161889	.	A	G	958.72	PASS	AF=0.985075;AO=66;DP=67;FAO=66;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0153013;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.5469;QD=57.2372;RBI=0.0154989;REFB=-0.101202;REVB=-0.00246673;RO=1;SAF=35;SAR=31;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0149975;STB=0.507934;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=-0.000660256;OID=.;OPOS=223161889;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:67:67:1:1:66:66:0.985075:31:35:0:1:31:35:0:1
chr2	223169150	.	G	T	282.24	PASS	AF=0.52;AO=26;DP=50;FAO=26;FDP=50;FR=.;FRO=24;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=-0.00631607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.1608;QD=22.5791;RBI=0.00699087;REFB=-0.0156909;REVB=-0.00299659;RO=24;SAF=15;SAR=11;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0308275;STB=0.517228;STBP=0.834;TYPE=snp;VARB=0.0099578;OID=.;OPOS=223169150;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:24:24:26:26:0.52:11:15:13:11:11:15:13:11
chr2	223423362	.	A	G	741.75	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0908971;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.944;QD=63.1277;RBI=0.100788;REFB=0;REVB=0.0435431;RO=0;SAF=25;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000997057;OID=.;OPOS=223423362;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:22:25:0:0:22:25:0:0
chr2	223436607	.	C	T	170.61	PASS	AF=0.349206;AO=22;DP=63;FAO=22;FDP=63;FR=.;FRO=41;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=0.0220943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.8816;QD=10.8324;RBI=0.0668967;REFB=-0.00692248;REVB=-0.0631428;RO=40;SAF=13;SAR=9;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129091;STB=0.583137;STBP=0.362;TYPE=snp;VARB=0.00974023;OID=.;OPOS=223436607;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:40:41:22:22:0.349206:9:13:19:21:9:13:19:22
chr2	223509221	.	T	G	169.24	PASS	AF=0.375;AO=21;DP=57;FAO=21;FDP=56;FR=.;FRO=35;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=23;FWDB=-0.0490093;FXX=0.0175408;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.787;QD=12.0884;RBI=0.0522163;REFB=-0.0214384;REVB=0.0180177;RO=35;SAF=5;SAR=16;SRF=12;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140967;STB=0.582357;STBP=0.379;TYPE=snp;VARB=0.0122277;OID=.;OPOS=223509221;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:56:35:35:21:21:0.375:16:5:12:23:16:5:12:23
chr2	223785740	.	A	G	741.33	PASS	AF=1;AO=51;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00757618;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.6;QD=57.025;RBI=0.0110241;REFB=0;REVB=0.00800832;RO=0;SAF=28;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.97956e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000144073;OID=.;OPOS=223785740;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:51:52:1:23:28:0:0:23:29:0:0
chr2	223807380	.	C	A	1575.36	PASS	AF=1;AO=98;DP=99;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00572873;FXX=0.019998;HRUN=2;LEN=1;MLLD=274.562;QD=64.3005;RBI=0.011053;REFB=0;REVB=0.00945251;RO=0;SAF=42;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.74281e-07;OID=.;OPOS=223807380;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:99:98:0:0:98:98:1:56:42:0:0:56:42:0:0
chr2	223917629	.	C	T	689.33	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0134002;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.8667;QD=62.6659;RBI=0.0194525;REFB=0;REVB=-0.0141009;RO=0;SAF=27;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.54734e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.7803e-06;OID=.;OPOS=223917629;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:17:27:0:0:17:27:0:0
chr2	223917812	.	T	C	1502.29	PASS	AF=1;AO=96;DP=96;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0157516;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.606;QD=59.4968;RBI=0.0489662;REFB=0;REVB=0.0463635;RO=0;SAF=45;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000103921;OID=.;OPOS=223917812;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:96:101:0:0:96:101:1:51:45:0:0:55:46:0:0
chr2	223917983	.	T	G	754.43	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00102719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.161;QD=56.9381;RBI=0.0177882;REFB=0;REVB=-0.0177585;RO=0;SAF=26;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.80343e-05;OID=.;OPOS=223917983;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:27:26:0:0:27:26:0:0
chr2	223918080	.	C	G	613.23	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00320008;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.6938;QD=61.3228;RBI=0.0414496;REFB=0;REVB=0.0413259;RO=0;SAF=24;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00031106;OID=.;OPOS=223918080;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:16:24:0:0:16:24:0:0
chr2	223918363	.	T	C	411.1	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0428014;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=92.4003;QD=56.7033;RBI=0.0431521;REFB=0;REVB=0.00549032;RO=0;SAF=12;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.0947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000323282;OID=.;OPOS=223918363;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:17:12:0:0:17:12:0:0
chr2	224620181	.	G	T	449.47	PASS	AF=0.683333;AO=41;DP=60;FAO=41;FDP=60;FR=.;FRO=19;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.00282052;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.107;QD=29.9647;RBI=0.0393735;REFB=-0.00963274;REVB=-0.0392724;RO=19;SAF=22;SAR=19;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0248902;STB=0.513507;STBP=0.779;TYPE=snp;VARB=0.00463847;OID=.;OPOS=224620181;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:19:19:41:41:0.683333:19:22:11:8:19:22:11:8
chr2	224743373	.	C	T	109.93	PASS	AF=0.433333;AO=13;DP=30;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.00367527;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.268;QD=14.6568;RBI=0.00801709;REFB=-0.0234979;REVB=0.00712504;RO=17;SAF=8;SAR=5;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198112;STB=0.615207;STBP=0.321;TYPE=snp;VARB=0.0256027;OID=.;OPOS=224743373;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:17:17:13:13:0.433333:5:8:7:10:5:8:7:10
chr2	224765956	.	C	T	159.59	PASS	AF=0.472222;AO=17;DP=36;FAO=17;FDP=36;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=0.040299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.6028;QD=17.7316;RBI=0.0750037;REFB=0.0184394;REVB=0.0632577;RO=19;SAF=10;SAR=7;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0935847;STB=0.553204;STBP=0.595;TYPE=snp;VARB=-0.0112271;OID=.;OPOS=224765956;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:19:19:17:17:0.472222:7:10:13:6:7:10:13:6
chr2	224856650	.	G	A	531.89	PASS	AF=0.534653;AO=53;DP=100;FAO=54;FDP=101;FR=.;FRO=47;FSAF=36;FSAR=18;FSRF=21;FSRR=26;FWDB=-0.00684733;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.87;QD=21.065;RBI=0.0102841;REFB=-0.0134542;REVB=-0.00767316;RO=47;SAF=35;SAR=18;SRF=21;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189189;STB=0.606856;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.0091957;OID=.;OPOS=224856650;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:101:47:47:53:54:0.534653:18:35:21:26:18:36:21:26
chr2	224866387	.	G	A	68.81	PASS	AF=0.5;AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.000142704;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.527;QD=15.2921;RBI=0.0124144;REFB=-0.026415;REVB=0.0124136;RO=9;SAF=4;SAR=5;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187606;STB=0.609518;STBP=0.431;TYPE=snp;VARB=0.0208134;OID=.;OPOS=224866387;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:18:18:9:9:9:9:0.5:5:4:6:3:5:4:6:3
chr2	224866576	.	C	A	309.45	PASS	AF=0.365385;AO=38;DP=104;FAO=38;FDP=104;FR=.;FRO=66;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=34;FSRR=32;FWDB=-0.0354091;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.986;QD=11.9019;RBI=0.0361953;REFB=-0.0170118;REVB=0.00750332;RO=66;SAF=18;SAR=20;SRF=34;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0459353;STB=0.526302;STBP=0.678;TYPE=snp;VARB=0.021105;OID=.;OPOS=224866576;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:104:66:66:38:38:0.365385:20:18:34:32:20:18:34:32
chr2	225434445	.	A	G	754.15	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0222406;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.293;QD=56.9168;RBI=0.0741615;REFB=0;REVB=0.070748;RO=0;SAF=31;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.76368e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00054218;OID=.;OPOS=225434445;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:22:31:0:0:22:31:0:0
chr2	225630233	.	C	T	163.64	PASS	AF=0.53125;AO=17;DP=32;FAO=17;FDP=32;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=-0.0459292;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.0926;QD=20.4545;RBI=0.057687;REFB=-0.00526057;REVB=-0.0349042;RO=15;SAF=8;SAR=9;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161694;STB=0.591136;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=0.00116406;OID=.;OPOS=225630233;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:15:15:17:17:0.53125:9:8:10:5:9:8:10:5
chr2	225630435	.	C	T	557.66	PASS	AF=0.536082;AO=51;DP=93;FAO=52;FDP=97;FR=.;FRO=45;FSAF=25;FSAR=27;FSRF=19;FSRR=26;FWDB=-0.0179248;FXX=0.029997;HRUN=3;LEN=1;MLLD=102.944;QD=22.9962;RBI=0.0324942;REFB=-0.00153356;REVB=-0.0271031;RO=41;SAF=24;SAR=27;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00584644;STB=0.527248;STBP=0.58;TYPE=snp;VARB=0.00138812;OID=.;OPOS=225630435;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:97:41:45:51:52:0.536082:27:24:19:22:27:25:19:26
chr2	225706613	.	C	T	298.25	PASS	AF=0.65;AO=26;DP=40;FAO=26;FDP=40;FR=.;FRO=14;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.025792;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.5378;QD=29.8253;RBI=0.0258701;REFB=-0.00832653;REVB=-0.00200876;RO=14;SAF=12;SAR=14;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0672566;STB=0.536937;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.00613826;OID=.;OPOS=225706613;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:14:14:26:26:0.65:14:12:5:9:14:12:5:9
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chr2	226447735	.	C	A,T	791.59	PASS	AF=0.0344828,0.948276;AO=3,54;DP=58;FAO=2,55;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=0,26;FSAR=2,29;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0390591,0.0100707;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=23.068,86.058;QD=54.5924;RBI=0.0459144,0.0186963;REFB=0.042697,-0.0441882;REVB=0.0241354,0.0157522;RO=1;SAF=1,25;SAR=2,29;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.163246,0.0159744;STB=0.5,0.508471;STBP=1,0.522;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00591995,0.00127501;OID=.,.;OPOS=226447735,226447735;OREF=C,C;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:7:58:58:1:1:3,54:2,55:0.0344828,0.948276:2,29:1,25:0:1:2,29:0,26:0:1
chr2	226491770	.	A	C	666.71	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.106241;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.5815;QD=62.0197;RBI=0.106341;REFB=0;REVB=-0.00461652;RO=0;SAF=20;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00136279;OID=.;OPOS=226491770;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:43:0:0:41:43:1:21:20:0:0:21:22:0:0
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chr2	227807202	.	G	T	33.08	PASS	AF=0.5;AO=5;DP=11;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.0155262;FXX=0.0908265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.336;QD=13.2327;RBI=0.0208424;REFB=-0.0212665;REVB=0.0139047;RO=5;SAF=1;SAR=4;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.331615;STB=0.691764;STBP=0.745;TYPE=snp;VARB=0.00966015;OID=.;OPOS=227807202;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:11:10:5:5:5:5:0.5:4:1:0:5:4:1:0:5
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chr2	227872995	.	T	C	237.58	PASS	AF=0.405797;AO=28;DP=69;FAO=28;FDP=69;FR=.;FRO=41;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=24;FSRR=17;FWDB=-0.0940444;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.7413;QD=13.7728;RBI=0.0983636;REFB=-0.0192381;REVB=0.0288278;RO=40;SAF=10;SAR=18;SRF=24;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.250816;STB=0.636077;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=0.0351596;OID=.;OPOS=227872995;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:40:41:28:28:0.405797:18:10:24:16:18:10:24:17
chr2	227886773	.	A	G	463.56	PASS	AF=0.555556;AO=42;DP=78;FAO=45;FDP=81;FR=.;FRO=36;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=0.00179513;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.941;QD=22.8917;RBI=0.0175047;REFB=-0.0196501;REVB=-0.0174124;RO=32;SAF=23;SAR=19;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0129772;STB=0.535023;STBP=0.464;TYPE=snp;VARB=0.0136363;OID=.;OPOS=227886773;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:81:32:36:42:45:0.555556:19:23:17:15:19:26:18:18
chr2	227892619	.	C	T	360.12	PASS	AF=0.571429;AO=36;DP=63;FAO=36;FDP=63;FR=.;FRO=27;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=9;FWDB=0.0017769;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=190.846;QD=22.8646;RBI=0.0227798;REFB=0.00292209;REVB=-0.0227104;RO=27;SAF=22;SAR=14;SRF=18;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.046032;STB=0.525314;STBP=0.646;TYPE=snp;VARB=-0.00248519;OID=.;OPOS=227892619;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:27:27:36:36:0.571429:14:22:18:9:14:22:18:9
chr2	227892720	.	C	T	167.91	PASS	AF=0.418605;AO=18;DP=43;FAO=18;FDP=43;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.022861;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.276;QD=15.6193;RBI=0.0238061;REFB=7.96718e-05;REVB=-0.00664106;RO=24;SAF=11;SAR=7;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0711626;STB=0.554315;STBP=0.592;TYPE=snp;VARB=-2.7023e-05;OID=.;OPOS=227892720;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:24:25:18:18:0.418605:7:11:13:11:7:11:13:12
chr2	227896886	.	C	T	751.65	PASS	AF=0.427861;AO=73;DP=189;FAO=86;FDP=201;FR=.;FRO=115;FSAF=29;FSAR=57;FSRF=55;FSRR=60;FWDB=-0.00425014;FXX=0.00495025;HRUN=1;LEN=1;MLLD=302.524;QD=14.9581;RBI=0.00536093;REFB=-0.00337754;REVB=0.00326739;RO=112;SAF=24;SAR=49;SRF=53;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164151;STB=0.585238;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=0.00408961;OID=.;OPOS=227896886;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:189:201:112:115:73:86:0.427861:49:24:53:59:57:29:55:60
chr2	227896976	.	C	T	654.15	PASS	AF=0.412429;AO=73;DP=176;FAO=73;FDP=177;FR=.;FRO=104;FSAF=23;FSAR=50;FSRF=38;FSRR=66;FWDB=-0.00278168;FXX=0.00561766;HRUN=4;LEN=1;MLLD=91.102;QD=14.783;RBI=0.00585881;REFB=0.00560661;REVB=-0.00515635;RO=103;SAF=23;SAR=50;SRF=37;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0521568;STB=0.533394;STBP=0.474;TYPE=snp;VARB=-0.00855487;OID=.;OPOS=227896976;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:176:177:103:104:73:73:0.412429:50:23:37:66:50:23:38:66
chr2	227915832	.	G	A	156.21	PASS	AF=0.425;AO=17;DP=40;FAO=17;FDP=40;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=-0.00208315;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.201;QD=15.6205;RBI=0.00229342;REFB=-0.00465947;REVB=-0.000959305;RO=23;SAF=11;SAR=6;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130319;STB=0.575294;STBP=0.411;TYPE=snp;VARB=0.00670936;OID=.;OPOS=227915832;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:23:23:17:17:0.425:6:11:12:11:6:11:12:11
chr2	227954599	.	G	A	253.11	PASS	AF=0.432836;AO=27;DP=64;FAO=29;FDP=67;FR=.;FRO=38;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=15;FSRR=23;FWDB=-0.018181;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=293.266;QD=15.1109;RBI=0.0192001;REFB=-0.00835703;REVB=0.0061723;RO=37;SAF=8;SAR=19;SRF=14;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0952154;STB=0.530705;STBP=0.674;TYPE=snp;VARB=0.0121042;OID=.;OPOS=227954599;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:67:37:38:27:29:0.432836:19:8:14:23:19:10:15:23
chr2	228102752	.	C	A	228.04	PASS	AF=0.465517;AO=27;DP=57;FAO=27;FDP=58;FR=.;FRO=31;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=-0.0424535;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=38.6021;QD=15.7265;RBI=0.058806;REFB=-0.026109;REVB=0.040692;RO=30;SAF=14;SAR=13;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0451952;STB=0.533309;STBP=0.653;TYPE=snp;VARB=0.0281986;OID=.;OPOS=228102752;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:58:30:31:27:27:0.465517:13:14:17:13:13:14:18:13
chr2	228111435	.	T	C	1053.66	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0318596;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.246;QD=59.361;RBI=0.0332145;REFB=0;REVB=-0.00939009;RO=0;SAF=23;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.79556e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000196844;OID=.;OPOS=228111435;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:71:0:0:70:71:1:47:23:0:0:48:23:0:0
chr2	228111600	.	G	T	727.35	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00500848;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.7372;QD=63.2478;RBI=0.0308577;REFB=0;REVB=0.0304486;RO=0;SAF=19;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000278255;OID=.;OPOS=228111600;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:46:0:0:44:46:1:25:19:0:0:25:21:0:0
chr2	228113175	.	A	G	1208.93	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.062155;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.6581;QD=61.2117;RBI=0.0709399;REFB=0;REVB=-0.0341939;RO=0;SAF=51;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000819137;OID=.;OPOS=228113175;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:28:51:0:0:28:51:0:0
chr2	228128540	.	C	T	3291.1	PASS	AF=1;AO=216;DP=220;FAO=222;FDP=222;FR=.;FRO=0;FSAF=113;FSAR=109;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0231554;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.0272;QD=59.2991;RBI=0.0366777;REFB=-0.114638;REVB=-0.0284444;RO=2;SAF=112;SAR=104;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00907303;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00255355;OID=.;OPOS=228128540;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:220:222:2:0:216:222:1:104:112:0:2:109:113:0:0
chr2	228128568	.	G	A	1386.45	PASS	AF=0.528226;AO=131;DP=249;FAO=131;FDP=248;FR=.;FRO=117;FSAF=55;FSAR=76;FSRF=62;FSRR=55;FWDB=0.0100726;FXX=0.0040159;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.65;QD=22.3621;RBI=0.0304316;REFB=-0.00375984;REVB=0.0287163;RO=113;SAF=55;SAR=76;SRF=60;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0951781;STB=0.552393;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.00573138;OID=.;OPOS=228128568;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:249:248:113:117:131:131:0.528226:76:55:60:53:76:55:62:55
chr2	228131169	.	A	G	468.13	PASS	AF=0.459459;AO=51;DP=112;FAO=51;FDP=111;FR=.;FRO=60;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=38;FSRR=22;FWDB=0.00271919;FXX=0.00892777;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.908;QD=16.8697;RBI=0.0382303;REFB=-0.0136381;REVB=-0.0381335;RO=58;SAF=27;SAR=24;SRF=37;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105047;STB=0.556723;STBP=0.291;TYPE=snp;VARB=0.0141295;OID=.;OPOS=228131169;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:111:58:60:51:51:0.459459:24:27:37:21:24:27:38:22
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chr2	228135631	.	C	T	152.78	PASS	AF=0.377778;AO=17;DP=45;FAO=17;FDP=45;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=19;FWDB=-0.00866412;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.785;QD=13.5805;RBI=0.0187388;REFB=-0.0110817;REVB=-0.0166155;RO=26;SAF=9;SAR=8;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189915;STB=0.627764;STBP=0.204;TYPE=snp;VARB=0.0190402;OID=.;OPOS=228135631;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:26:28:17:17:0.377778:8:9:9:17:8:9:9:19
chr2	228177479	.	C	T	306.7	PASS	AF=0.345133;AO=39;DP=113;FAO=39;FDP=113;FR=.;FRO=74;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=33;FSRR=41;FWDB=-0.0117982;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.889;QD=10.8566;RBI=0.0136322;REFB=-0.00166281;REVB=-0.00682918;RO=73;SAF=16;SAR=23;SRF=33;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0483648;STB=0.52393;STBP=0.689;TYPE=snp;VARB=0.00295787;OID=.;OPOS=228177479;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:113:73:74:39:39:0.345133:23:16:33:40:23:16:33:41
chr2	228177825	.	C	G	225.17	PASS	AF=0.385714;AO=27;DP=70;FAO=27;FDP=70;FR=.;FRO=43;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=-0.0130881;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.657;QD=12.8666;RBI=0.0613317;REFB=-0.017909;REVB=0.059919;RO=42;SAF=15;SAR=12;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0844311;STB=0.541371;STBP=0.599;TYPE=snp;VARB=0.0254784;OID=.;OPOS=228177825;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:42:43:27:27:0.385714:12:15:20:22:12:15:21:22
chr2	228179238	.	G	A	1310.04	PASS	AF=0.456081;AO=134;DP=295;FAO=135;FDP=296;FR=.;FRO=161;FSAF=61;FSAR=74;FSRF=74;FSRR=87;FWDB=-0.00971292;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.0729;QD=17.7032;RBI=0.0553387;REFB=-0.0201093;REVB=-0.0544796;RO=160;SAF=60;SAR=74;SRF=74;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0146398;STB=0.504265;STBP=0.884;TYPE=snp;VARB=0.0203317;OID=.;OPOS=228179238;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:295:296:160:161:134:135:0.456081:74:60:74:86:74:61:74:87
chr2	228194480	.	AG	TT	139.44	PASS	AF=0.311475;AO=19;DP=61;FAO=19;FDP=61;FR=.;FRO=42;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=20;FSRR=22;FWDB=0.0161146;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=276.219;QD=9.14345;RBI=0.0163156;REFB=-0.00339125;REVB=0.00255365;RO=42;SAF=10;SAR=9;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0580538;STB=0.534447;STBP=0.721;TYPE=mnp;VARB=0.00680829;OID=.;OPOS=228194480;OREF=AG;OALT=TT;OMAPALT=TT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:42:42:19:19:0.311475:9:10:20:22:9:10:20:22
chr2	228416712	.	A	G	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0641646;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.522;QD=50.4132;RBI=0.0721174;REFB=0;REVB=0.0329213;RO=0;SAF=7;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000844056;OID=.;OPOS=228416712;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:12:7:0:0:12:7:0:0
chr2	228476140	.	C	T	544.82	PASS	AF=0.636364;AO=48;DP=76;FAO=49;FDP=77;FR=.;FRO=28;FSAF=22;FSAR=27;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=0.00320176;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.8239;QD=28.3023;RBI=0.0517274;REFB=-0.00667075;REVB=0.0516282;RO=28;SAF=22;SAR=26;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0283187;STB=0.518669;STBP=0.684;TYPE=snp;VARB=0.00462013;OID=.;OPOS=228476140;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:77:28:28:48:49:0.636364:26:22:14:14:27:22:14:14
chr2	228476253	.	C	G	1026.38	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0283864;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.9877;QD=59.5;RBI=0.0415525;REFB=0;REVB=-0.030345;RO=0;SAF=36;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.36169e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000509494;OID=.;OPOS=228476253;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:33:36:0:0:33:36:0:0
chr2	228758580	.	G	C	450.08	PASS	AF=0.473684;AO=44;DP=94;FAO=45;FDP=95;FR=.;FRO=50;FSAF=15;FSAR=30;FSRF=27;FSRR=23;FWDB=-0.00140017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.348;QD=18.9509;RBI=0.0225975;REFB=-0.0215669;REVB=0.0225541;RO=50;SAF=14;SAR=30;SRF=27;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.221112;STB=0.613087;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.0239035;OID=.;OPOS=228758580;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:95:50:50:44:45:0.473684:30:14:27:23:30:15:27:23
chr2	228776996	.	T	C	454.44	PASS	AF=1;AO=31;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0168583;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.478;QD=56.8054;RBI=0.0170262;REFB=0;REVB=-0.00238507;RO=0;SAF=22;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.15349e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000203849;OID=.;OPOS=228776996;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:31:32:1:9:22:0:0:9:23:0:0
chr2	228882970	.	T	C	54.32	PASS	AF=0.32;AO=8;DP=25;FAO=8;FDP=25;FR=.;FRO=17;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=0.0116404;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.5111;QD=8.69146;RBI=0.028343;REFB=-0.024661;REVB=0.0258423;RO=17;SAF=1;SAR=7;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.35954;STB=0.730647;STBP=0.165;TYPE=snp;VARB=0.0347354;OID=.;OPOS=228882970;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:25:25:17:17:8:8:0.32:7:1:6:11:7:1:6:11
chr2	228883721	.	T	C	187.68	PASS	AF=0.389831;AO=23;DP=59;FAO=23;FDP=59;FR=.;FRO=36;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=-0.0210077;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.506;QD=12.724;RBI=0.0211932;REFB=0.00246764;REVB=0.00279773;RO=35;SAF=14;SAR=9;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101249;STB=0.550636;STBP=0.586;TYPE=snp;VARB=-0.00860755;OID=.;OPOS=228883721;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:35:36:23:23:0.389831:9:14:18:17:9:14:19:17
chr2	230045542	.	C	G	1134.88	PASS	AF=0.525822;AO=113;DP=213;FAO=112;FDP=213;FR=.;FRO=101;FSAF=82;FSAR=30;FSRF=43;FSRR=58;FWDB=0.0263646;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.3902;QD=21.3123;RBI=0.0278165;REFB=-0.00600227;REVB=-0.00886935;RO=100;SAF=82;SAR=31;SRF=43;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.2744;STB=0.658004;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00596505;OID=.;OPOS=230045542;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:213:213:100:101:113:112:0.525822:31:82:43:57:30:82:43:58
chr2	230045545	.	T	C	1207.49	PASS	AF=0.552381;AO=116;DP=210;FAO=116;FDP=210;FR=.;FRO=94;FSAF=86;FSAR=30;FSRF=40;FSRR=54;FWDB=8.66683e-05;FXX=0.00473911;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.007;QD=22.9998;RBI=0.00457069;REFB=-0.0255563;REVB=-0.00456987;RO=93;SAF=85;SAR=31;SRF=40;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.270912;STB=0.65646;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0136739;OID=.;OPOS=230045545;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:210:210:93:94:116:116:0.552381:31:85:40:53:30:86:40:54
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chr2	230045568	.	T	C	1435.16	PASS	AF=0.648936;AO=122;DP=191;FAO=122;FDP=188;FR=.;FRO=66;FSAF=95;FSAR=27;FSRF=29;FSRR=37;FWDB=-0.0141474;FXX=0.015706;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.504;QD=30.5352;RBI=0.0203541;REFB=-0.000306232;REVB=-0.0146335;RO=67;SAF=95;SAR=27;SRF=30;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.263862;STB=0.644862;STBP=0;TYPE=snp;VARB=-4.65647e-06;OID=.;OPOS=230045568;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:191:188:67:66:122:122:0.648936:27:95:30:37:27:95:29:37
chr2	230045615	.	G	A	1564.74	PASS	AF=0.857143;AO=114;DP=133;FAO=114;FDP=133;FR=.;FRO=19;FSAF=96;FSAR=18;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.000869646;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.193;QD=47.0597;RBI=0.0192738;REFB=-0.017349;REVB=0.0192542;RO=19;SAF=96;SAR=18;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.16348;STB=0.587139;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.000847957;OID=.;OPOS=230045615;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:90:133:133:19:19:114:114:0.857143:18:96:9:10:18:96:9:10
chr2	230092723	.	G	A	375.41	PASS	AF=0.421053;AO=40;DP=95;FAO=40;FDP=95;FR=.;FRO=55;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=31;FSRR=24;FWDB=-0.0142099;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.881;QD=15.8067;RBI=0.0152496;REFB=-0.00265273;REVB=-0.00553416;RO=55;SAF=22;SAR=18;SRF=31;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0141619;STB=0.507983;STBP=0.916;TYPE=snp;VARB=0.00457553;OID=.;OPOS=230092723;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:55:55:40:40:0.421053:18:22:31:24:18:22:31:24
chr2	230135711	.	G	C,GC	2574.15	PASS	AF=0,1;AO=11,143;DP=192;FAO=0,173;FDP=173;FR=.;FRO=0;FSAF=0,72;FSAR=0,101;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0800281,-0.151604;FXX=0.0335177;HRUN=2,1;LEN=1,1;MLLD=5.08977,26.0914;QD=59.518;RBI=0.131882,0.241345;REFB=0,0;REVB=0.104826,0.187786;RO=31;SAF=6,53;SAR=5,90;SRF=16;SRR=15;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0348921,-0.0515928;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,ins;VARB=0,0.000256602;OID=.,.;OPOS=230135711,230135712;OREF=G,-;OALT=C,C;OMAPALT=C,GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	2/2:14:192:173:31:0:11,143:0,173:0,1:5,90:6,53:16:15:0,101:0,72:0:0
chr2	230650536	.	C	T	205.36	PASS	AF=0.428571;AO=24;DP=56;FAO=24;FDP=56;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=21;FWDB=0.0321792;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.4;QD=14.6688;RBI=0.0331626;REFB=0.00123197;REVB=0.0080164;RO=32;SAF=11;SAR=13;SRF=11;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11743;STB=0.566613;STBP=0.385;TYPE=snp;VARB=-0.00134615;OID=.;OPOS=230650536;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:32:32:24:24:0.428571:13:11:11:21:13:11:11:21
chr2	231035359	.	C	T	265.35	PASS	AF=0.491525;AO=29;DP=59;FAO=29;FDP=59;FR=.;FRO=30;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=11;FWDB=-0.0422602;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.779;QD=17.9896;RBI=0.0428712;REFB=-0.0214196;REVB=0.00721253;RO=29;SAF=14;SAR=15;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12306;STB=0.5762;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=0.0216076;OID=.;OPOS=231035359;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:29:30:29:29:0.491525:15:14:18:11:15:14:19:11
chr2	231050715	.	A	G	1713.01	PASS	AF=1;AO=111;DP=111;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0342996;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.827;QD=60.6377;RBI=0.0343498;REFB=0;REVB=-0.00185671;RO=0;SAF=63;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.46823e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.7565e-05;OID=.;OPOS=231050715;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:111:113:0:0:111:113:1:48:63:0:0:48:65:0:0
chr2	231072709	.	C	T	1069.68	PASS	AF=0.948718;AO=74;DP=78;FAO=74;FDP=78;FR=.;FRO=4;FSAF=34;FSAR=40;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0342017;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.021;QD=54.8555;RBI=0.0367936;REFB=-0.0252058;REVB=-0.013565;RO=4;SAF=34;SAR=40;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00395152;STB=0.502092;STBP=0.911;TYPE=snp;VARB=0.0154202;OID=.;OPOS=231072709;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:78:78:4:4:74:74:0.948718:40:34:2:2:40:34:2:2
chr2	231077725	.	A	G	401.2	PASS	AF=1;AO=27;DP=28;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0121817;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.0172;QD=55.3377;RBI=0.0134845;REFB=0;REVB=-0.00578242;RO=0;SAF=9;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000647544;OID=.;OPOS=231077725;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:29:0:0:27:29:1:18:9:0:0:19:10:0:0
chr2	231149108	.	G	A	912.77	PASS	AF=1;AO=52;DP=65;FAO=64;FDP=64;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=26;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.031468;FXX=0.0153822;HRUN=2;LEN=1;MLLD=37.7851;QD=57.0479;RBI=0.11699;REFB=0;REVB=0.112678;RO=0;SAF=22;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00126103;OID=.;OPOS=231149108;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:64:0:0:52:64:1:30:22:0:0:38:26:0:0
chr2	231331896	.	G	A	275.08	PASS	AF=0.43662;AO=31;DP=71;FAO=31;FDP=71;FR=.;FRO=40;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=25;FSRR=15;FWDB=0.000552679;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.205;QD=15.4974;RBI=0.0343238;REFB=-0.00296317;REVB=-0.0343193;RO=40;SAF=15;SAR=16;SRF=25;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140464;STB=0.579135;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=0.00441424;OID=.;OPOS=231331896;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:40:40:31:31:0.43662:16:15:25:15:16:15:25:15
chr2	231406680	.	T	C	255.75	PASS	AF=0.446154;AO=29;DP=65;FAO=29;FDP=65;FR=.;FRO=36;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=-0.0197298;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.559;QD=15.7382;RBI=0.0258198;REFB=-0.018954;REVB=0.0166552;RO=36;SAF=10;SAR=19;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158542;STB=0.589737;STBP=0.22;TYPE=snp;VARB=0.0179848;OID=.;OPOS=231406680;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:36:36:29:29:0.446154:19:10:18:18:19:10:18:18
chr2	231407663	.	C	T	102.86	PASS	AF=0.317073;AO=13;DP=41;FAO=13;FDP=41;FR=.;FRO=28;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=0.000531081;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.761;QD=10.0353;RBI=0.0515256;REFB=-0.000393082;REVB=-0.0515229;RO=26;SAF=4;SAR=9;SRF=18;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.412508;STB=0.722296;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=-0.000149527;OID=.;OPOS=231407663;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:26:28:13:13:0.317073:9:4:18:8:9:4:18:10
chr2	231738168	.	G	A	282.87	PASS	AF=0.469697;AO=32;DP=67;FAO=31;FDP=66;FR=.;FRO=35;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=20;FSRR=15;FWDB=0.0259986;FXX=0.0149231;HRUN=7;LEN=1;MLLD=251.596;QD=17.1433;RBI=0.0288081;REFB=-0.00757575;REVB=0.0124088;RO=33;SAF=12;SAR=20;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.210686;STB=0.598361;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=0.0065387;OID=.;OPOS=231738168;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:66:33:35:32:31:0.469697:20:12:20:13:19:12:20:15
chr2	231738263	.	C	T	282.91	PASS	AF=0.476923;AO=31;DP=65;FAO=31;FDP=65;FR=.;FRO=34;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=0.0164179;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.5725;QD=17.4098;RBI=0.0352205;REFB=0.00422527;REVB=0.0311599;RO=34;SAF=14;SAR=17;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0453377;STB=0.525407;STBP=0.708;TYPE=snp;VARB=-0.00330278;OID=.;OPOS=231738263;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:34:34:31:31:0.476923:17:14:17:17:17:14:17:17
chr2	231738269	.	G	A	253.58	PASS	AF=0.482759;AO=28;DP=58;FAO=28;FDP=58;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=0.00348502;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.334;QD=17.4886;RBI=0.0480365;REFB=-0.010359;REVB=0.04791;RO=30;SAF=11;SAR=17;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131225;STB=0.573697;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.00870333;OID=.;OPOS=231738269;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:30:30:28:28:0.482759:17:11:16:14:17:11:16:14
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chr2	231861071	.	T	C	34.06	PASS	AF=0.153846;AO=6;DP=39;FAO=6;FDP=39;FR=.;FRO=33;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=-0.133051;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.78;QD=3.49285;RBI=0.152781;REFB=-0.0114098;REVB=-0.075096;RO=32;SAF=4;SAR=2;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0922961;STB=0.555366;STBP=0.799;TYPE=snp;VARB=0.0698266;OID=.;OPOS=231861071;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:39:39:32:33:6:6:0.153846:2:4:19:13:2:4:20:13
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chr2	232087474	.	AT	GA	769.25	PASS	AF=1;AO=65;DP=66;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0661848;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=242.432;QD=45.2502;RBI=0.128638;REFB=0;REVB=0.110305;RO=0;SAF=36;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.00879312;OID=.;OPOS=232087474;OREF=AT;OALT=GA;OMAPALT=GA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:68:0:0:65:68:1:29:36:0:0:30:38:0:0
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chr2	232196564	.	C	T	104.05	PASS	AF=0.5;AO=11;DP=24;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=0.0512394;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.66;QD=17.3415;RBI=0.0636723;REFB=-0.026079;REVB=0.0377981;RO=12;SAF=8;SAR=3;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.359136;STB=0.717016;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=0.0381332;OID=.;OPOS=232196564;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:24:24:12:12:11:12:0.5:3:8:4:8:3:9:4:8
chr2	232196597	.	G	A	37.78	PASS	AF=0.375;AO=6;DP=16;FAO=6;FDP=16;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=-0.0368242;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.52;QD=9.44471;RBI=0.0455169;REFB=-0.00347878;REVB=-0.0267539;RO=10;SAF=5;SAR=1;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.535511;STB=0.832222;STBP=0.065;TYPE=snp;VARB=0.0100616;OID=.;OPOS=232196597;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:16:16:10:10:6:6:0.375:1:5:3:7:1:5:3:7
chr2	232225533	.	CACGGGAC	ACGGGGAC,CACGGGGA,CACGGGGAC	1342.87	PASS	AF=0,0,1;AO=8,9,78;DP=128;FAO=0,0,113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0,50;FSAR=0,0,63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.118131,-0.0615699,0.236046;FXX=0.0173898;HRUN=5,1,3;LEN=3,2,1;MLLD=4.35724,5.83732,17.2116;QD=47.5354;RBI=0.119743,0.061652,0.244844;REFB=0,0,0;REVB=-0.0195769,-0.00318137,-0.065047;RO=2;SAF=7,5,22;SAR=1,4,56;SRF=2;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.110633,-0.147719,-0.0410959;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=mnp,mnp,ins;VARB=0,0,0.0026521;OID=.,.,.;OPOS=232225533,232225539,232225536;OREF=CAC,AC,-;OALT=ACG,GA,G;OMAPALT=ACGGGGAC,CACGGGGA,CACGGGGAC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	3/3:8:128:113:2:0:8,9,78:0,0,113:0,0,1:1,4,56:7,5,22:2:0:0,0,63:0,0,50:0:0
chr2	232263127	.	G	A	307.99	PASS	AF=0.507463;AO=32;DP=66;FAO=34;FDP=67;FR=.;FRO=33;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=0.00379785;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.113;QD=18.3875;RBI=0.00385041;REFB=-0.0132416;REVB=-0.000634028;RO=33;SAF=14;SAR=18;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0709409;STB=0.536607;STBP=0.567;TYPE=snp;VARB=0.00950966;OID=.;OPOS=232263127;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:67:33:33:32:34:0.507463:18:14:17:16:19:15:17:16
chr2	232317402	.	CA	C	106.48	PASS	AF=0.631579;AO=12;DP=19;FAO=12;FDP=19;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0141769;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=32.5542;QD=22.4157;RBI=0.0379557;REFB=-0.00910266;REVB=0.0352086;RO=7;SAF=4;SAR=8;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162618;STB=0.592433;STBP=0.324;TYPE=del;VARB=0.0102206;OID=.;OPOS=232317403;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.631579:12:19:12:19:7:4:8:4:3:45:7:4:8:4:3
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chr2	232326417	.	C	T	353.61	PASS	AF=0.486842;AO=37;DP=75;FAO=37;FDP=76;FR=.;FRO=39;FSAF=25;FSAR=12;FSRF=26;FSRR=13;FWDB=0.0290949;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.7101;QD=18.6112;RBI=0.0298777;REFB=-0.0399663;REVB=-0.00679436;RO=38;SAF=25;SAR=12;SRF=25;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0183079;STB=0.505252;STBP=0.912;TYPE=snp;VARB=0.0546287;OID=.;OPOS=232326417;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:76:38:39:37:37:0.486842:12:25:25:13:12:25:26:13
chr2	232378231	.	T	C	1135.49	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0111818;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.0432;QD=59.7629;RBI=0.0715823;REFB=0;REVB=0.0707035;RO=0;SAF=50;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000876637;OID=.;OPOS=232378231;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:76:0:0:74:76:1:24:50:0:0:25:51:0:0
chr2	232457880	.	T	C	110.82	PASS	AF=0.448276;AO=12;DP=28;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.00618285;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.5342;QD=15.2849;RBI=0.0167446;REFB=-0.0179847;REVB=-0.0155613;RO=16;SAF=7;SAR=5;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0822464;STB=0.521244;STBP=0.809;TYPE=snp;VARB=0.0333996;OID=.;OPOS=232457880;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:29:16:16:12:13:0.448276:5:7:8:8:6:7:8:8
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chr2	233723182	.	G	A	857.03	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00013698;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.5373;QD=57.135;RBI=0.0308674;REFB=0;REVB=0.0308671;RO=0;SAF=33;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.23134e-05;OID=.;OPOS=233723182;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:56:60:0:0:56:60:1:23:33:0:0:25:35:0:0
chr2	233740227	.	A	G	98.55	PASS	AF=0.428571;AO=12;DP=28;FAO=12;FDP=28;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=-0.0181231;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.256;QD=14.0792;RBI=0.0209653;REFB=-0.011515;REVB=-0.0105403;RO=16;SAF=7;SAR=5;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.317828;STB=0.683625;STBP=0.115;TYPE=snp;VARB=0.0208155;OID=.;OPOS=233740227;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:28:28:16:16:12:12:0.428571:5:7:4:12:5:7:4:12
chr2	233757697	.	A	G	1146.43	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0344051;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.817;QD=60.3383;RBI=0.0478293;REFB=0;REVB=-0.0332255;RO=0;SAF=25;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.1645e-05;OID=.;OPOS=233757697;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:76:0:0:75:76:1:50:25:0:0:50:26:0:0
chr2	233785015	.	G	A	621.15	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0227595;FXX=0.0476077;HRUN=3;LEN=1;MLLD=148.765;QD=62.1145;RBI=0.0633267;REFB=0;REVB=-0.0590955;RO=0;SAF=24;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000275114;OID=.;OPOS=233785015;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:16:24:0:0:16:24:0:0
chr2	233834975	.	A	G	1568.52	PASS	AF=1;AO=97;DP=97;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0160527;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.08;QD=64.0212;RBI=0.0176891;REFB=0;REVB=0.00743065;RO=0;SAF=40;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.58683e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.07389e-05;OID=.;OPOS=233834975;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:97:98:0:0:97:98:1:57:40:0:0:58:40:0:0
chr2	234055004	.	T	C	648.62	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0196619;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.835;QD=61.7733;RBI=0.0436861;REFB=0;REVB=0.0390114;RO=0;SAF=22;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.6372e-05;OID=.;OPOS=234055004;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:42:0:0:41:42:1:19:22:0:0:19:23:0:0
chr2	234066969	.	C	G	674.02	PASS	AF=1;AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00229676;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.9866;QD=62.6993;RBI=0.0117506;REFB=0;REVB=0.0115239;RO=0;SAF=21;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000789251;OID=.;OPOS=234066969;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:43:0:0:43:43:1:22:21:0:0:22:21:0:0
chr2	234113057	.	G	A	632.26	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0124336;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.325;QD=61.6838;RBI=0.0142863;REFB=0;REVB=0.00703594;RO=0;SAF=26;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.65384e-05;OID=.;OPOS=234113057;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:15:26:0:0:15:26:0:0
chr2	234113301	.	C	T	120.03	PASS	AF=1;AO=11;DP=12;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0680102;FXX=0.0832639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.2139;QD=43.6456;RBI=0.0689743;REFB=0;REVB=0.011492;RO=0;SAF=4;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0018725;OID=.;OPOS=234113301;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:11:0:0:11:11:1:7:4:0:0:7:4:0:0
chr2	234227523	.	A	G	209.31	PASS	AF=0.361111;AO=26;DP=72;FAO=26;FDP=72;FR=.;FRO=46;FSAF=7;FSAR=19;FSRF=25;FSRR=21;FWDB=-0.0412052;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.354;QD=11.6281;RBI=0.0412274;REFB=-0.00388268;REVB=0.00135304;RO=42;SAF=7;SAR=19;SRF=21;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.26799;STB=0.684537;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.00303181;OID=.;OPOS=234227523;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:42:46:26:26:0.361111:19:7:21:21:19:7:25:21
chr2	234449316	.	G	A	632.25	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.02457;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.1368;QD=61.6827;RBI=0.0293495;REFB=0;REVB=-0.0160533;RO=0;SAF=22;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.60606e-05;OID=.;OPOS=234449316;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:19:22:0:0:19:22:0:0
chr2	234469664	.	T	C	923.42	PASS	AF=0.984615;AO=64;DP=65;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00193301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.45;QD=56.8258;RBI=0.010899;REFB=-0.0103731;REVB=0.0107262;RO=0;SAF=31;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507934;STBP=0.335;TYPE=snp;VARB=0.000164548;OID=.;OPOS=234469664;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:65:65:0:1:64:64:0.984615:33:31:0:0:33:31:1:0
chr2	234526871	.	C	G	584.34	PASS	AF=0.526786;AO=59;DP=113;FAO=59;FDP=112;FR=.;FRO=53;FSAF=26;FSAR=33;FSRF=14;FSRR=39;FWDB=-0.0262125;FXX=0.00884877;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.7843;QD=20.8691;RBI=0.0297288;REFB=-0.00434863;REVB=0.0140252;RO=53;SAF=26;SAR=33;SRF=14;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157911;STB=0.586438;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.00385154;OID=.;OPOS=234526871;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:112:53:53:59:59:0.526786:33:26:14:39:33:26:14:39
chr2	234527118	.	A	G	199.76	PASS	AF=0.5;AO=20;DP=40;FAO=20;FDP=40;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.00470007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.264;QD=19.9764;RBI=0.00562876;REFB=-0.00485749;REVB=0.00309714;RO=20;SAF=8;SAR=12;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0901606;STB=0.550969;STBP=0.483;TYPE=snp;VARB=0.00525351;OID=.;OPOS=234527118;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:20:20:20:20:0.5:12:8:10:10:12:8:10:10
chr2	234545773	.	C	T	338.69	PASS	AF=0.396226;AO=37;DP=101;FAO=42;FDP=106;FR=.;FRO=64;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=28;FSRR=36;FWDB=-0.00605965;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.452;QD=12.7807;RBI=0.00815949;REFB=-0.0116306;REVB=0.00546424;RO=63;SAF=14;SAR=23;SRF=27;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0576872;STB=0.505492;STBP=0.929;TYPE=snp;VARB=0.0296098;OID=.;OPOS=234545773;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:106:63:64:37:42:0.396226:23:14:27:36:24:18:28:36
chr2	234545861	.	C	T	194.53	PASS	AF=0.333333;AO=25;DP=75;FAO=25;FDP=75;FR=.;FRO=50;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=23;FSRR=27;FWDB=0.0368673;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.4444;QD=10.3752;RBI=0.0613041;REFB=-0.0163023;REVB=-0.0489795;RO=49;SAF=14;SAR=11;SRF=23;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102844;STB=0.566507;STBP=0.422;TYPE=snp;VARB=0.0355395;OID=.;OPOS=234545861;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:49:50:25:25:0.333333:11:14:23:26:11:14:23:27
chr2	234590970	.	T	G	754.41	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00812208;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.138;QD=56.9369;RBI=0.026805;REFB=0;REVB=0.0255448;RO=0;SAF=28;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.00224e-05;OID=.;OPOS=234590970;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:53:0:0:52:53:1:24:28:0:0:24:29:0:0
chr2	234590974	.	CG	AA,CA	701.01	PASS	AF=0.941176,0.0588235;AO=48,3;DP=51;FAO=48,3;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=26,2;FSAR=22,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000961626,-0.00571797;FXX=0;HRUN=2,1;LEN=2,1;MLLD=146.45,116.274;QD=54.9814;RBI=0.0552596,0.0609829;REFB=0,0;REVB=0.0552513,0.0607142;RO=0;SAF=26,2;SAR=22,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.46901e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.00146498,-0.0259718;OID=.,.;OPOS=234590974,234590975;OREF=CG,G;OALT=AA,A;OMAPALT=AA,CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:13:51:51:0:0:48,3:48,3:0.941176,0.0588235:22,1:26,2:0:0:22,1:26,2:0:0
chr2	234591339	.	G	A	747.1	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00370872;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.489;QD=63.5829;RBI=0.00922599;REFB=0;REVB=0.00844773;RO=0;SAF=20;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.79355e-05;OID=.;OPOS=234591339;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:27:20:0:0:27:20:0:0
chr2	234621780	.	T	C	545.16	PASS	AF=0.973684;AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.016016;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.979;QD=57.3857;RBI=0.0266053;REFB=-0.0273841;REVB=-0.0212445;RO=0;SAF=12;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509799;STBP=0.596;TYPE=snp;VARB=0.00643321;OID=.;OPOS=234621780;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:38:38:0:1:37:37:0.973684:25:12:0:0:25:12:0:1
chr2	234621787	.	C	G	565.14	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0230669;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.18;QD=59.4889;RBI=0.0299268;REFB=0;REVB=0.0190665;RO=0;SAF=13;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000706311;OID=.;OPOS=234621787;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:38:0:0:37:38:1:24:13:0:0:25:13:0:0
chr2	234621825	.	T	C	769.51	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0390098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.05;QD=57.0007;RBI=0.0393188;REFB=0;REVB=-0.00491996;RO=0;SAF=21;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.70667e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.97447e-05;OID=.;OPOS=234621825;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:33:21:0:0:33:21:0:0
chr2	234622061	.	C	A	1606.2	PASS	AF=1;AO=106;DP=106;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0191892;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.608;QD=60.0448;RBI=0.0266365;REFB=0;REVB=0.0184737;RO=0;SAF=54;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.12064e-05;OID=.;OPOS=234622061;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:106:107:0:0:106:107:1:52:54:0:0:53:54:0:0
chr2	234622110	.	C	G	2268.33	PASS	AF=1;AO=140;DP=141;FAO=143;FDP=143;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0211799;FXX=0.00694396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.655;QD=63.4499;RBI=0.0247021;REFB=0;REVB=-0.0127123;RO=1;SAF=62;SAR=78;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00605708;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.25331e-05;OID=.;OPOS=234622110;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:141:143:1:0:140:143:1:78:62:0:1:79:64:0:0
chr2	234622282	.	C	T	964.15	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0170523;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.629;QD=58.4335;RBI=0.0284884;REFB=0;REVB=0.0228213;RO=0;SAF=31;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.90682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000485736;OID=.;OPOS=234622282;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:66:0:0:65:66:1:34:31:0:0:34:32:0:0
chr2	234622294	.	C	T	708.39	PASS	AF=0.958333;AO=46;DP=49;FAO=46;FDP=48;FR=.;FRO=2;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0174929;FXX=0.020404;HRUN=3;LEN=1;MLLD=278.574;QD=59.0321;RBI=0.0211561;REFB=-0.182864;REVB=0.0118986;RO=1;SAF=25;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0184352;STB=0.501824;STBP=0.869;TYPE=snp;VARB=0.000688779;OID=.;OPOS=234622294;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:49:48:1:2:46:46:0.958333:21:25:1:0:21:25:1:1
chr2	234622310	.	C	T	613.36	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00427625;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=255.615;QD=61.3363;RBI=0.0316014;REFB=0;REVB=0.0313107;RO=0;SAF=22;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.19993e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.15467e-05;OID=.;OPOS=234622310;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:18:22:0:0:18:22:0:0
chr2	234622379	.	C	A	101.89	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0829265;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.3802;QD=40.7551;RBI=0.0937603;REFB=0;REVB=0.0437514;RO=0;SAF=5;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00663689;OID=.;OPOS=234622379;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:5:5:0:0:5:5:0:0
chr2	234622382	.	G	C	101.87	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0551986;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.596;QD=40.7482;RBI=0.0575298;REFB=0;REVB=0.0162107;RO=0;SAF=6;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00111042;OID=.;OPOS=234622382;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:4:6:0:0:4:6:0:0
chr2	234622412	.	G	C	184.86	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00123198;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=161.809;QD=46.2145;RBI=0.0274828;REFB=0;REVB=0.0274551;RO=0;SAF=4;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33019e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000334012;OID=.;OPOS=234622412;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:16:0:0:15:16:1:11:4:0:0:12:4:0:0
chr2	234622420	.	T	C	191.28	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0186294;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=70.7398;QD=47.8204;RBI=0.0186331;REFB=0;REVB=-0.000375941;RO=0;SAF=4;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.07465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000594064;OID=.;OPOS=234622420;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:12:4:0:0:12:4:0:0
chr2	234622429	.	T	C	167.48	PASS	AF=0.9375;AO=15;DP=16;FAO=15;FDP=16;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0226483;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.045;QD=41.869;RBI=0.036327;REFB=-0.0424863;REVB=0.0284026;RO=0;SAF=4;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33019e-08;STB=0.521711;STBP=0.653;TYPE=snp;VARB=0.0015109;OID=.;OPOS=234622429;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:16:16:0:1:15:15:0.9375:11:4:0:0:11:4:0:1
chr2	234627608	.	T	G	868.27	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0133677;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.975;QD=57.8845;RBI=0.016023;REFB=0;REVB=-0.00883412;RO=0;SAF=20;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.50976e-05;OID=.;OPOS=234627608;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:40:20:0:0:40:20:0:0
chr2	234627914	.	T	C	2119.18	PASS	AF=0.985507;AO=136;DP=141;FAO=136;FDP=138;FR=.;FRO=2;FSAF=69;FSAR=67;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0122844;FXX=0.0212751;HRUN=4;LEN=1;MLLD=237.72;QD=61.4254;RBI=0.0124248;REFB=-0.0999601;REVB=0.0018625;RO=1;SAF=69;SAR=67;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00704267;STB=0.500107;STBP=0.877;TYPE=snp;VARB=4.27248e-05;OID=.;OPOS=234627914;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:141:138:1:2:136:136:0.985507:67:69:0:1:67:69:1:1
chr2	234627937	.	T	C,G	2414.23	PASS	AF=0.956522,0.0434783;AO=152,8;DP=160;FAO=154,7;FDP=161;FR=.;FRO=0;FSAF=73,4;FSAR=81,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0185357,-0.00977662;FXX=0.00617246;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=60.0807,186.916;QD=59.9809;RBI=0.0862636,0.0118595;REFB=0,0;REVB=0.0842487,-0.00671306;RO=0;SAF=72,5;SAR=80,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.66134e-08,4.46938e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00128733,0.172655;OID=.,.;OPOS=234627937,234627937;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:160:161:0:0:152,8:154,7:0.956522,0.0434783:80,3:72,5:0:0:81,3:73,4:0:0
chr2	234628270	.	G	A	1785.77	PASS	AF=1;AO=117;DP=117;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0392017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.94;QD=61.0518;RBI=0.0392072;REFB=0;REVB=-0.000656701;RO=0;SAF=56;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000122877;OID=.;OPOS=234628270;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:117:117:0:0:117:117:1:61:56:0:0:61:56:0:0
chr2	234637803	.	T	C	930.92	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00564349;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.636;QD=57.2875;RBI=0.0296537;REFB=0;REVB=0.0291117;RO=0;SAF=39;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.75648e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000973501;OID=.;OPOS=234637803;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:65:0:0:62:65:1:23:39:0:0:26:39:0:0
chr2	234637853	.	G	A	1209.0	PASS	AF=0.987654;AO=78;DP=79;FAO=80;FDP=81;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=44;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0215188;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.886;QD=59.7036;RBI=0.0619333;REFB=-0.0927272;REVB=0.0580748;RO=1;SAF=34;SAR=44;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0137178;STB=0.506848;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=0.000818338;OID=.;OPOS=234637853;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:79:81:1:1:78:80:0.987654:44:34:1:0:44:36:1:0
chr2	234638249	.	A	G	2473.76	PASS	AF=1;AO=161;DP=161;FAO=161;FDP=161;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0182661;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.056;QD=61.4598;RBI=0.0238923;REFB=0;REVB=-0.015401;RO=0;SAF=74;SAR=87;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.4645e-06;OID=.;OPOS=234638249;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:161:161:0:0:161:161:1:87:74:0:0:87:74:0:0
chr2	234652482	.	C	T	729.0	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0255684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.598;QD=57.1769;RBI=0.0281622;REFB=0;REVB=0.0118053;RO=0;SAF=18;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=8.62909e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.86132e-05;OID=.;OPOS=234652482;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:33:18:0:0:33:18:0:0
chr2	234688036	.	C	A	834.15	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0107069;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.1717;QD=57.5275;RBI=0.0466788;REFB=0;REVB=-0.0454343;RO=0;SAF=27;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.07727e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000478674;OID=.;OPOS=234688036;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:31:27:0:0:31:27:0:0
chr2	234702459	.	T	C	1896.42	PASS	AF=1;AO=123;DP=123;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00354112;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.897;QD=61.672;RBI=0.0363661;REFB=0;REVB=0.0361933;RO=0;SAF=51;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.7235e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.97984e-05;OID=.;OPOS=234702459;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:123:123:0:0:123:123:1:72:51:0:0:72:51:0:0
chr2	234703136	.	T	C	708.52	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0574106;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.6476;QD=62.9793;RBI=0.075004;REFB=0;REVB=0.0482661;RO=0;SAF=21;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00114467;OID=.;OPOS=234703136;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:24:21:0:0:24:21:0:0
chr2	234704318	.	A	G	714.41	PASS	AF=0.978723;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0380397;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.134;QD=60.8007;RBI=0.0807757;REFB=-0.133359;REVB=-0.0712579;RO=1;SAF=27;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0170959;STB=0.509087;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.00379525;OID=.;OPOS=234704318;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:47:47:1:1:46:46:0.978723:19:27:1:0:19:27:1:0
chr2	234704690	.	T	C	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00878082;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.994;QD=53.2771;RBI=0.0182898;REFB=0;REVB=0.0160441;RO=0;SAF=13;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000112553;OID=.;OPOS=234704690;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:10:13:0:0:10:13:0:0
chr2	234708428	.	G	A	267.07	PASS	AF=0.528302;AO=28;DP=53;FAO=28;FDP=53;FR=.;FRO=25;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=0.016698;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.604;QD=20.1559;RBI=0.0242488;REFB=-0.0140112;REVB=-0.0175834;RO=25;SAF=14;SAR=14;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0847192;STB=0.547136;STBP=0.478;TYPE=snp;VARB=0.00924884;OID=.;OPOS=234708428;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:25:25:28:28:0.528302:14:14:10:15:14:14:10:15
chr2	234710831	.	G	C	252.78	PASS	AF=0.5;AO=24;DP=48;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=0.0186747;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.729;QD=21.0649;RBI=0.018676;REFB=-0.0198643;REVB=0.000219344;RO=24;SAF=7;SAR=17;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0857857;STB=0.548345;STBP=0.555;TYPE=snp;VARB=0.0201454;OID=.;OPOS=234710831;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:24:24:24:24:0.5:17:7:9:15:17:7:9:15
chr2	234713706	.	T	C	552.97	PASS	AF=0.504425;AO=57;DP=114;FAO=57;FDP=113;FR=.;FRO=56;FSAF=27;FSAR=30;FSRF=25;FSRR=31;FWDB=-0.00528436;FXX=0.00877116;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.933;QD=19.5741;RBI=0.0227816;REFB=-0.0180599;REVB=0.0221603;RO=55;SAF=27;SAR=30;SRF=24;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0333809;STB=0.513559;STBP=0.784;TYPE=snp;VARB=0.0256887;OID=.;OPOS=234713706;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:114:113:55:56:57:57:0.504425:30:27:24:31:30:27:25:31
chr2	234716426	.	G	A	314.34	PASS	AF=0.465753;AO=34;DP=73;FAO=34;FDP=73;FR=.;FRO=39;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=15;FSRR=24;FWDB=0.0134957;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.912;QD=17.224;RBI=0.0146138;REFB=-0.00816986;REVB=0.00560603;RO=39;SAF=15;SAR=19;SRF=15;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0551158;STB=0.530846;STBP=0.631;TYPE=snp;VARB=0.0103187;OID=.;OPOS=234716426;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:39:39:34:34:0.465753:19:15:15:24:19:15:15:24
chr2	234725502	.	T	C	1083.46	PASS	AF=1;AO=71;DP=73;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0127106;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.8742;QD=60.1925;RBI=0.0142423;REFB=0;REVB=-0.00642533;RO=0;SAF=33;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.24211e-05;OID=.;OPOS=234725502;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:72:0:0:71:72:1:38:33:0:0:38:34:0:0
chr2	234727333	.	C	G	224.76	PASS	AF=0.440678;AO=25;DP=58;FAO=26;FDP=59;FR=.;FRO=33;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=-0.0119446;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.467;QD=15.2379;RBI=0.0413677;REFB=-0.0263409;REVB=0.0396057;RO=33;SAF=12;SAR=13;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125812;STB=0.58025;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=0.027962;OID=.;OPOS=234727333;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:59:33:33:25:26:0.440678:13:12:20:13:14:12:20:13
chr2	234728078	.	T	C	1090.37	PASS	AF=0.973684;AO=74;DP=76;FAO=74;FDP=76;FR=.;FRO=2;FSAF=41;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0358538;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.2106;QD=57.3879;RBI=0.0368855;REFB=-0.00832385;REVB=0.00866306;RO=1;SAF=41;SAR=33;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0113997;STB=0.501438;STBP=0.873;TYPE=snp;VARB=0.00183599;OID=.;OPOS=234728078;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:76:76:1:2:74:74:0.973684:33:41:1:0:33:41:1:1
chr2	234730807	.	G	A	727.1	PASS	AF=0.542636;AO=70;DP=129;FAO=70;FDP=129;FR=.;FRO=59;FSAF=37;FSAR=33;FSRF=29;FSRR=30;FWDB=0.0213962;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.2884;QD=22.5458;RBI=0.0271338;REFB=-0.00692347;REVB=0.0166867;RO=59;SAF=37;SAR=33;SRF=29;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0309746;STB=0.516961;STBP=0.706;TYPE=snp;VARB=0.00519549;OID=.;OPOS=234730807;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:129:129:59:59:70:70:0.542636:33:37:29:30:33:37:29:30
chr2	234732317	.	A	G	1095.86	PASS	AF=1;AO=72;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00922907;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=148.105;QD=60.0471;RBI=0.0142555;REFB=0;REVB=0.0108648;RO=0;SAF=37;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.52187e-06;OID=.;OPOS=234732317;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:72:73:1:35:37:0:0:36:37:0:0
chr2	234737275	.	G	C	535.56	PASS	AF=0.452381;AO=56;DP=126;FAO=57;FDP=126;FR=.;FRO=69;FSAF=15;FSAR=42;FSRF=31;FSRR=38;FWDB=-0.0253001;FXX=0.0156238;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.048;QD=17.0019;RBI=0.0316741;REFB=-0.0148279;REVB=-0.0190565;RO=68;SAF=14;SAR=42;SRF=30;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21834;STB=0.616815;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.0180438;OID=.;OPOS=234737275;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:126:126:68:69:56:57:0.452381:42:14:30:38:42:15:31:38
chr2	234737372	.	C	A	1402.84	PASS	AF=1;AO=89;DP=91;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0287155;FXX=0.0219756;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.18;QD=63.049;RBI=0.0411625;REFB=0;REVB=0.0294918;RO=0;SAF=40;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.34232e-05;OID=.;OPOS=234737372;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:91:89:0:0:89:89:1:49:40:0:0:49:40:0:0
chr2	234740136	.	G	A	747.07	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0250162;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.04;QD=63.5808;RBI=0.0262834;REFB=0;REVB=-0.00806243;RO=0;SAF=23;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000201937;OID=.;OPOS=234740136;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:24:23:0:0:24:23:0:0
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chr2	234761225	.	C	T	271.39	PASS	AF=0.402597;AO=31;DP=77;FAO=31;FDP=77;FR=.;FRO=46;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=22;FWDB=0.0134547;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.593;QD=14.0983;RBI=0.016538;REFB=-0.0042769;REVB=-0.0096165;RO=45;SAF=14;SAR=17;SRF=23;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0620871;STB=0.541919;STBP=0.546;TYPE=snp;VARB=0.00691857;OID=.;OPOS=234761225;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:45:46:31:31:0.402597:17:14:23:22:17:14:24:22
chr2	234762480	.	A	T	431.25	PASS	AF=0.444444;AO=44;DP=100;FAO=44;FDP=99;FR=.;FRO=55;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=35;FSRR=20;FWDB=-0.0274924;FXX=0.009999;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.797;QD=17.4244;RBI=0.0275468;REFB=-0.00167985;REVB=-0.00172927;RO=52;SAF=23;SAR=21;SRF=35;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147664;STB=0.5636;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=0.00162584;OID=.;OPOS=234762480;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:99:52:55:44:44:0.444444:21:23:35:17:21:23:35:20
chr2	234775675	.	G	T	719.38	PASS	AF=0.489655;AO=71;DP=145;FAO=71;FDP=145;FR=.;FRO=74;FSAF=29;FSAR=42;FSRF=39;FSRR=35;FWDB=-0.00781921;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.573;QD=19.845;RBI=0.00787281;REFB=-0.00325252;REVB=0.000917068;RO=74;SAF=29;SAR=42;SRF=39;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110776;STB=0.561193;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.00362275;OID=.;OPOS=234775675;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:145:145:74:74:71:71:0.489655:42:29:39:35:42:29:39:35
chr2	234854540	.	G	C	205.1	PASS	AF=0.42;AO=21;DP=50;FAO=21;FDP=50;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=-0.0670727;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.897;QD=16.4078;RBI=0.0767099;REFB=0.0241974;REVB=-0.0372245;RO=29;SAF=13;SAR=8;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.207726;STB=0.618934;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=-0.0421496;OID=.;OPOS=234854540;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:29:29:21:21:0.42:8:13:12:17:8:13:12:17
chr2	234854547	.	A	T	300.6	PASS	AF=0.576923;AO=30;DP=52;FAO=30;FDP=52;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=0.00258741;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.1965;QD=23.1234;RBI=0.0301098;REFB=-0.000594731;REVB=-0.0299984;RO=21;SAF=12;SAR=18;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164006;STB=0.599933;STBP=0.104;TYPE=snp;VARB=6.59478e-05;OID=.;OPOS=234854547;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:21:22:30:30:0.576923:18:12:13:8:18:12:14:8
chr2	234854552	.	A	G	199.41	PASS	AF=0.431373;AO=22;DP=51;FAO=22;FDP=51;FR=.;FRO=29;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=0.0328554;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.7501;QD=15.6398;RBI=0.0404426;REFB=-0.0240964;REVB=0.0235823;RO=29;SAF=14;SAR=8;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.222769;STB=0.627124;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=0.0336235;OID=.;OPOS=234854552;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:29:29:22:22:0.431373:8:14:12:17:8:14:12:17
chr2	234863788	.	G	A	817.53	PASS	AF=1;AO=56;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0314591;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.682;QD=57.3703;RBI=0.0319147;REFB=0;REVB=0.00537345;RO=0;SAF=35;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000148839;OID=.;OPOS=234863788;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:56:57:1:21:35:0:0:21:36:0:0
chr2	234967539	.	T	A	866.68	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00889772;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.749;QD=57.7785;RBI=0.00927764;REFB=0;REVB=0.00262777;RO=0;SAF=29;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.26776e-05;OID=.;OPOS=234967539;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:60:0:0:59:60:1:30:29:0:0:30:30:0:0
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chr2	235950187	.	T	C	1283.44	PASS	AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0147696;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.861;QD=61.8525;RBI=0.0208504;REFB=0;REVB=0.0147172;RO=0;SAF=44;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.03564e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.86484e-05;OID=.;OPOS=235950187;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:39:44:0:0:39:44:0:0
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chr2	235964277	.	T	C	169.81	PASS	AF=0.45;AO=18;DP=40;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=0.0216637;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=122.663;QD=16.9809;RBI=0.0321958;REFB=-0.0253974;REVB=0.0238171;RO=21;SAF=9;SAR=9;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.203361;STB=0.599893;STBP=0.251;TYPE=snp;VARB=0.0130899;OID=.;OPOS=235964277;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:21:22:18:18:0.45:9:9:6:15:9:9:7:15
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chr2	236761396	.	C	T	546.47	PASS	AF=0.973684;AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0099485;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=140.961;QD=57.5236;RBI=0.0155303;REFB=-0.176529;REVB=0.0119255;RO=1;SAF=16;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0283678;STB=0.515143;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.0020506;OID=.;OPOS=236761396;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:38:38:1:1:37:37:0.973684:21:16:1:0:21:16:1:0
chr2	236957822	.	G	A	1248.57	PASS	AF=1;AO=80;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0204428;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.009;QD=61.6578;RBI=0.0213854;REFB=0;REVB=0.00627923;RO=0;SAF=41;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.14996e-05;OID=.;OPOS=236957822;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:81:0:0:80:81:1:39:41:0:0:39:42:0:0
chr2	237149941	.	C	T	304.87	PASS	AF=0.563636;AO=31;DP=55;FAO=31;FDP=55;FR=.;FRO=24;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=0.00913056;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.546;QD=22.1723;RBI=0.00913338;REFB=-0.00492997;REVB=-0.000226816;RO=24;SAF=18;SAR=13;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0706651;STB=0.539;STBP=0.554;TYPE=snp;VARB=0.00373287;OID=.;OPOS=237149941;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:24:24:31:31:0.563636:13:18:16:8:13:18:16:8
chr2	237150166	.	A	C	769.17	PASS	AF=1;AO=53;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00845853;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.221;QD=56.9755;RBI=0.0248742;REFB=0;REVB=0.0233919;RO=0;SAF=18;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000157031;OID=.;OPOS=237150166;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:53:54:1:35:18:0:0:35:19:0:0
chr2	237247013	.	G	A	382.03	PASS	AF=0.550725;AO=38;DP=70;FAO=38;FDP=69;FR=.;FRO=31;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=0.0456164;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.01;QD=22.1464;RBI=0.0471649;REFB=-0.00538923;REVB=-0.0119863;RO=30;SAF=20;SAR=18;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10084;STB=0.54792;STBP=0.412;TYPE=snp;VARB=0.00563584;OID=.;OPOS=237247013;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:69:30:31:38:38:0.550725:18:20:12:18:18:20:13:18
chr2	237923851	.	AG	A,AA	769.87	PASS	AF=0.109091,0.890909;AO=10,45;DP=56;FAO=6,49;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=3,16;FSAR=3,33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00360484,0.00448824;FXX=0.017854;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=280.487,289.333;QD=55.9908;RBI=0.00802376,0.00908899;REFB=0,0;REVB=0.00716839,0.00790351;RO=1;SAF=4,15;SAR=6,30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0990155,-0.030296;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0160922,0.00296502;OID=.,.;OPOS=237923852,237923852;OREF=G,G;OALT=-,A;OMAPALT=A,AA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.109091,0.890909:10,45:56:6,49:55:0:3,16:3,33:0:0:17:1:4,15:6,30:1:0
chr2	238166147	.	G	A	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0394023;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=282.462;QD=45.8068;RBI=0.0394509;REFB=0;REVB=0.00195822;RO=0;SAF=2;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000205103;OID=.;OPOS=238166147;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:12:2:0:0:12:2:0:0
chr2	238280362	.	G	C,GC	37.85	PASS	AF=0.117647,0.411765;AO=2,4;DP=17;FAO=2,7;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=2,5;FSAR=0,2;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.00426459,-0.0248807;FXX=0;HRUN=1,5;LEN=1,1;MLLD=230.519,7.2865;QD=8.90512;RBI=0.0866151,0.24822;REFB=0.00960029,-0.132636;REVB=0.0865101,0.24697;RO=10;SAF=2,4;SAR=0,0;SRF=5;SRR=5;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.57573,0.694591;STB=0.993043,0.555391;STBP=0.333,0.764;TYPE=snp,ins;VARB=0.0980717,0.169974;OID=.,.;OPOS=238280362,238280363;OREF=G,-;OALT=C,C;OMAPALT=C,GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:22:17:17:10:8:2,4:2,7:0.117647,0.411765:0,0:2,4:5:5:0,2:2,5:5:3
chr2	238461773	.	G	A	208.89	PASS	AF=0.409836;AO=25;DP=61;FAO=25;FDP=61;FR=.;FRO=36;FSAF=5;FSAR=20;FSRF=10;FSRR=26;FWDB=-0.0453505;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=47.836;QD=13.6976;RBI=0.0496592;REFB=-0.0411894;REVB=-0.020233;RO=36;SAF=5;SAR=20;SRF=10;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114588;STB=0.565981;STBP=0.479;TYPE=snp;VARB=0.0573692;OID=.;OPOS=238461773;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:36:36:25:25:0.409836:20:5:10:26:20:5:10:26
chr2	238462324	.	A	G	305.95	PASS	AF=0.492537;AO=33;DP=67;FAO=33;FDP=67;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=23;FSRF=14;FSRR=20;FWDB=0.00324794;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.219;QD=18.2656;RBI=0.0127693;REFB=-0.0288431;REVB=0.0123493;RO=34;SAF=10;SAR=23;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110848;STB=0.562079;STBP=0.341;TYPE=snp;VARB=0.0250027;OID=.;OPOS=238462324;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:34:34:33:33:0.492537:23:10:14:20:23:10:14:20
chr2	238483164	.	T	C	77.28	PASS	AF=0.434783;AO=10;DP=23;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.0159044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.045;QD=13.4396;RBI=0.017283;REFB=-0.00190307;REVB=0.006764;RO=13;SAF=3;SAR=7;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.306446;STB=0.681047;STBP=0.195;TYPE=snp;VARB=0.0031936;OID=.;OPOS=238483164;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:23:23:13:13:10:10:0.434783:7:3:8:5:7:3:8:5
chr2	238483729	.	A	G	256.44	PASS	AF=0.533333;AO=24;DP=45;FAO=24;FDP=45;FR=.;FRO=21;FSAF=19;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.00580462;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.25;QD=22.7947;RBI=0.00859498;REFB=-0.017359;REVB=0.00633878;RO=19;SAF=19;SAR=5;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.302921;STB=0.697443;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0139935;OID=.;OPOS=238483729;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:19:21:24:24:0.533333:5:19:9:10:5:19:9:12
chr2	238499863	.	A	AAATTCTTCAGGAGACTCT,T	102.72	PASS	AF=0.186441,0.0847458;AO=9,5;DP=63;FAO=11,5;FDP=59;FR=.;FRO=43;FSAF=8,5;FSAR=3,0;FSRF=23;FSRR=20;FWDB=-0.00493574,-0.00146303;FXX=0.0166639;HRUN=2,2;LEN=18,1;MLLD=605.66,386.963;QD=6.9643;RBI=0.00514094,0.00328315;REFB=-0.000973469,-0.00263784;REVB=0.00143796,-0.00293915;RO=48;SAF=7,5;SAR=2,0;SRF=28;SRR=20;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.266127,0.55586;STB=0.663947,0.997674;STBP=0.258,0.025;TYPE=ins,snp;VARB=0.00283279,0.0110816;OID=.,.;OPOS=238499864,238499863;OREF=-,A;OALT=AATTCTTCAGGAGACTCT,T;OMAPALT=AAATTCTTCAGGAGACTCT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:68:63:59:48:43:9,5:11,5:0.186441,0.0847458:2,0:7,5:28:20:3,0:8,5:23:20
chr2	238499866	.	C	T	122.89	PASS	AF=0.276923;AO=17;DP=64;FAO=18;FDP=65;FR=.;FRO=47;FSAF=15;FSAR=3;FSRF=27;FSRR=20;FWDB=-0.00162991;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.63;QD=7.56244;RBI=0.0132429;REFB=-0.00471207;REVB=-0.0131422;RO=47;SAF=14;SAR=3;SRF=27;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.35894;STB=0.732191;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.00893156;OID=.;OPOS=238499866;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:65:47:47:17:18:0.276923:3:14:27:20:3:15:27:20
chr2	238499874	.	C	T	209.24	PASS	AF=0.361111;AO=26;DP=71;FAO=26;FDP=72;FR=.;FRO=46;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=26;FSRR=20;FWDB=-0.0109932;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.046;QD=11.6243;RBI=0.0260609;REFB=-0.00767607;REVB=0.0236288;RO=44;SAF=15;SAR=11;SRF=24;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0348927;STB=0.507636;STBP=0.927;TYPE=snp;VARB=0.00621934;OID=.;OPOS=238499874;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:72:44:46:26:26:0.361111:11:15:24:20:11:15:26:20
chr2	238643907	.	G	A	296.34	PASS	AF=0.634146;AO=26;DP=41;FAO=26;FDP=41;FR=.;FRO=15;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=-0.0139391;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.788;QD=28.9108;RBI=0.0544594;REFB=-0.0145964;REVB=0.0526453;RO=14;SAF=15;SAR=11;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139817;STB=0.564922;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.0127089;OID=.;OPOS=238643907;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:14:15:26:26:0.634146:11:15:5:9:11:15:6:9
chr2	238668802	.	A	G	647.81	PASS	AF=0.651163;AO=56;DP=86;FAO=56;FDP=86;FR=.;FRO=30;FSAF=29;FSAR=27;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=0.000730434;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=154.779;QD=30.1305;RBI=0.01312;REFB=-0.0150882;REVB=0.0130997;RO=30;SAF=29;SAR=27;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0757328;STB=0.54103;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=0.0041843;OID=.;OPOS=238668802;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:30:30:56:56:0.651163:27:29:12:18:27:29:12:18
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chr2	238672703	.	C	G	47.68	PASS	AF=0.4375;AO=7;DP=16;FAO=7;FDP=16;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=-0.00199642;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.924;QD=11.9195;RBI=0.0226079;REFB=-0.00693485;REVB=-0.0225196;RO=9;SAF=2;SAR=5;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.354212;STB=0.713673;STBP=0.206;TYPE=snp;VARB=0.0177117;OID=.;OPOS=238672703;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:16:16:9:9:7:7:0.4375:5:2:6:3:5:2:6:3
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chr2	239010719	.	T	C	1396.71	PASS	AF=1;AO=88;DP=88;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00354868;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.189;QD=62.7736;RBI=0.0121575;REFB=0;REVB=0.0116281;RO=0;SAF=42;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.23485e-05;OID=.;OPOS=239010719;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:88:89:0:0:88:89:1:46:42:0:0:47:42:0:0
chr2	239016539	.	C	G	1540.53	PASS	AF=1;AO=103;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00104777;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.7207;QD=59.8263;RBI=0.0205985;REFB=0;REVB=0.0205718;RO=0;SAF=57;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.99381e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000126404;OID=.;OPOS=239016539;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:103:103:0:0:103:103:1:46:57:0:0:46:57:0:0
chr2	239038912	.	T	C	622.89	PASS	AF=0.504;AO=63;DP=125;FAO=63;FDP=125;FR=.;FRO=62;FSAF=35;FSAR=28;FSRF=29;FSRR=33;FWDB=-0.0777581;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.5898;QD=19.9324;RBI=0.0798066;REFB=0.0237758;REVB=-0.0179656;RO=62;SAF=35;SAR=28;SRF=29;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0791637;STB=0.543658;STBP=0.344;TYPE=snp;VARB=-0.0275066;OID=.;OPOS=239038912;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:125:125:62:62:63:63:0.504:28:35:29:33:28:35:29:33
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chr2	239039075	.	G	T	558.36	PASS	AF=0.547368;AO=52;DP=95;FAO=52;FDP=95;FR=.;FRO=43;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=16;FSRR=27;FWDB=0.00935675;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.39;QD=23.5099;RBI=0.0291852;REFB=-0.0212041;REVB=0.0276446;RO=43;SAF=26;SAR=26;SRF=16;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105521;STB=0.557873;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=0.0150409;OID=.;OPOS=239039075;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:43:43:52:52:0.547368:26:26:16:27:26:26:16:27
chr2	239039896	.	G	C	1328.65	PASS	AF=0.967033;AO=87;DP=89;FAO=88;FDP=91;FR=.;FRO=3;FSAF=52;FSAR=36;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0279214;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.3871;QD=58.402;RBI=0.0642657;REFB=0.0716722;REVB=-0.0578833;RO=2;SAF=51;SAR=36;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00377938;STB=0.502585;STBP=0.779;TYPE=snp;VARB=-0.0170003;OID=.;OPOS=239039896;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:89:91:2:3:87:88:0.967033:36:51:1:1:36:52:2:1
chr2	239040187	.	T	C	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0614444;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.296;QD=53.2766;RBI=0.0853277;REFB=0;REVB=0.0592065;RO=0;SAF=11;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.53277e-05;OID=.;OPOS=239040187;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:12:11:0:0:12:11:0:0
chr2	239050033	.	C	T	82.05	PASS	AF=0.9;AO=9;DP=10;FAO=9;FDP=10;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0754228;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=80.5828;QD=32.82;RBI=0.0754287;REFB=0.080038;REVB=-0.000944587;RO=1;SAF=4;SAR=5;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.080744;STB=0.545355;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=-0.00374896;OID=.;OPOS=239050033;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:10:10:1:1:9:9:0.9:5:4:0:1:5:4:0:1
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chr2	240323661	.	C	A	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0488939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.873;QD=33.4285;RBI=0.0515376;REFB=0;REVB=0.0162944;RO=0;SAF=3;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000907343;OID=.;OPOS=240323661;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:3:3:0:0:3:3:0:0
chr2	240323905	.	T	TG	112.52	PASS	AF=0.333333;AO=23;DP=69;FAO=23;FDP=69;FR=.;FRO=46;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=27;FSRR=19;FWDB=-0.0028607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=25.8674;QD=6.52265;RBI=0.137105;REFB=-0.00238798;REVB=-0.137076;RO=44;SAF=14;SAR=9;SRF=25;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0472077;STB=0.515099;STBP=0.884;TYPE=ins;VARB=0.000910896;OID=.;OPOS=240323906;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.333333:23:69:23:69:46:14:9:27:19:99:44:14:9:25:19
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chr2	240900607	.	TGGGGG	TGGGG,TGGGGA	76.98	PASS	AF=0.267606,0.0422535;AO=18,3;DP=71;FAO=19,3;FDP=71;FR=.;FRO=49;FSAF=13,0;FSAR=6,3;FSRF=18;FSRR=31;FWDB=-0.0159512,0.135967;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=1,1;MLLD=12.39,17.705;QD=4.33684;RBI=0.021778,0.138233;REFB=-0.0519335,-0.0409475;REVB=-0.014827,-0.0249263;RO=37;SAF=10,0;SAR=8,3;SRF=12;SRR=25;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.259644,-0.450975;STB=0.720916,0.995673;STBP=0.024,0.146;TYPE=del,snp;VARB=0.0406022,-0.0152749;OID=.,.;OPOS=240900608,240900612;OREF=G,G;OALT=-,A;OMAPALT=TGGGG,TGGGGA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.267606,0.0422535:18,3:71:19,3:71:49:13,0:6,3:18:31:57:37:10,0:8,3:12:25
chr2	240923050	.	C	T	919.73	PASS	AF=0.535714;AO=90;DP=167;FAO=90;FDP=168;FR=.;FRO=78;FSAF=48;FSAR=42;FSRF=39;FSRR=39;FWDB=0.0165957;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.802;QD=21.8983;RBI=0.0177671;REFB=-0.0123517;REVB=0.0063444;RO=77;SAF=48;SAR=42;SRF=39;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0226971;STB=0.51551;STBP=0.677;TYPE=snp;VARB=0.0107817;OID=.;OPOS=240923050;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:167:168:77:78:90:90:0.535714:42:48:39:38:42:48:39:39
chr2	240946766	.	T	C	224.79	PASS	AF=0.391304;AO=27;DP=69;FAO=27;FDP=69;FR=.;FRO=42;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=27;FSRR=15;FWDB=0.0278513;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.9477;QD=13.0313;RBI=0.0407464;REFB=0.000364918;REVB=0.0297419;RO=42;SAF=12;SAR=15;SRF=27;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20859;STB=0.618962;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=6.27028e-05;OID=.;OPOS=240946766;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:42:42:27:27:0.391304:15:12:27:15:15:12:27:15
chr2	240961728	.	T	C	251.19	PASS	AF=0.465517;AO=26;DP=64;FAO=27;FDP=58;FR=.;FRO=31;FSAF=19;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=20;FWDB=0.02202;FXX=0.0937354;HRUN=3;LEN=1;MLLD=170.231;QD=17.3235;RBI=0.0690771;REFB=-0.0199416;REVB=-0.0654734;RO=29;SAF=19;SAR=7;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.369533;STB=0.688977;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.0216914;OID=.;OPOS=240961728;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:58:29:31:26:27:0.465517:7:19:10:19:8:19:11:20
chr2	240981262	.	A	C	83.48	PASS	AF=0.323529;AO=11;DP=34;FAO=11;FDP=34;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=0.00749295;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=194.888;QD=9.82172;RBI=0.00929638;REFB=-0.0127349;REVB=-0.00550258;RO=23;SAF=6;SAR=5;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123092;STB=0.574334;STBP=0.576;TYPE=snp;VARB=0.0281754;OID=.;OPOS=240981262;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:34:34:23:23:11:11:0.323529:5:6:10:13:5:6:10:13
chr2	240981375	.	T	A	688.06	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0206019;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.223;QD=62.551;RBI=0.033777;REFB=0;REVB=0.0267665;RO=0;SAF=20;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.30465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.22146e-05;OID=.;OPOS=240981375;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:24:20:0:0:24:20:0:0
chr2	240984789	.	C	T	295.62	PASS	AF=0.566038;AO=29;DP=52;FAO=30;FDP=53;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=20;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=0.015334;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.685;QD=22.3109;RBI=0.0160317;REFB=-0.00853048;REVB=-0.00467825;RO=23;SAF=10;SAR=19;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.002644;STB=0.507038;STBP=0.902;TYPE=snp;VARB=0.0126746;OID=.;OPOS=240984789;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:53:23:23:29:30:0.566038:19:10:8:15:20:10:8:15
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chr2	240985347	.	G	A	223.17	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0474158;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.906;QD=49.5925;RBI=0.0540526;REFB=0;REVB=-0.0259503;RO=0;SAF=4;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000230785;OID=.;OPOS=240985347;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:14:4:0:0:14:4:0:0
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chr2	241463453	.	C	A	181.29	PASS	AF=0.431818;AO=19;DP=44;FAO=19;FDP=44;FR=.;FRO=25;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=-0.00591927;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.062;QD=16.4804;RBI=0.0283656;REFB=-0.0082413;REVB=0.0277411;RO=24;SAF=8;SAR=11;SRF=17;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.274918;STB=0.643882;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=0.0125119;OID=.;OPOS=241463453;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:24:25:19:19:0.431818:11:8:17:7:11:8:17:8
chr2	241492255	.	G	T	579.96	PASS	AF=1;AO=37;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0171525;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.758;QD=61.0482;RBI=0.0214023;REFB=0;REVB=-0.0128004;RO=0;SAF=17;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.71161e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000506806;OID=.;OPOS=241492255;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:37:38:1:20:17:0:0:21:17:0:0
chr2	241492350	.	A	G	564.27	PASS	AF=0.472;AO=59;DP=126;FAO=59;FDP=125;FR=.;FRO=66;FSAF=26;FSAR=33;FSRF=36;FSRR=30;FWDB=-0.0167719;FXX=0.00793588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.078;QD=18.0567;RBI=0.0361363;REFB=-0.0379485;REVB=-0.0320084;RO=66;SAF=26;SAR=33;SRF=36;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0997555;STB=0.555356;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=0.0407291;OID=.;OPOS=241492350;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:126:125:66:66:59:59:0.472:33:26:36:30:33:26:36:30
chr2	241511974	.	C	T	558.06	PASS	AF=0.536082;AO=52;DP=97;FAO=52;FDP=97;FR=.;FRO=45;FSAF=23;FSAR=29;FSRF=26;FSRR=19;FWDB=0.0807452;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.886;QD=23.0128;RBI=0.0809128;REFB=-0.0322103;REVB=0.00520516;RO=45;SAF=23;SAR=29;SRF=26;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114104;STB=0.562748;STBP=0.2;TYPE=snp;VARB=0.0217001;OID=.;OPOS=241511974;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:45:45:52:52:0.536082:29:23:26:19:29:23:26:19
chr2	241537421	.	G	A	937.6	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0163633;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=186.959;QD=58.6;RBI=0.0182056;REFB=0;REVB=0.00798029;RO=0;SAF=29;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.20966e-05;OID=.;OPOS=241537421;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:35:29:0:0:35:29:0:0
chr2	241538074	.	A	G	955.2	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0104128;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.704;QD=58.7813;RBI=0.0355008;REFB=0;REVB=-0.0339393;RO=0;SAF=23;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.35381e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.97154e-05;OID=.;OPOS=241538074;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:42:23:0:0:42:23:0:0
chr2	241558397	.	G	A	801.27	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00548162;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.707;QD=57.2335;RBI=0.00685106;REFB=0;REVB=-0.00410961;RO=0;SAF=29;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.19049e-06;OID=.;OPOS=241558397;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:27:29:0:0:27:29:0:0
chr2	241570249	.	A	C	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0966746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.917;QD=48.7373;RBI=0.096786;REFB=0;REVB=0.00464137;RO=0;SAF=6;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000582312;OID=.;OPOS=241570249;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:11:6:0:0:11:6:0:0
chr2	241570391	.	A	G	538.56	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0226694;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.642;QD=59.8394;RBI=0.0238885;REFB=0;REVB=-0.00753376;RO=0;SAF=24;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.8234e-05;OID=.;OPOS=241570391;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:12:24:0:0:12:24:0:0
chr2	241621799	.	GC	G,GG	280.22	PASS	AF=1,0;AO=19,3;DP=23;FAO=22,0;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=9,0;FSAR=13,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0476347,0.0273973;FXX=0.0434594;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=62.0471,46.9753;QD=50.9492;RBI=0.106223,0.184012;REFB=0,0;REVB=-0.094943,-0.181961;RO=0;SAF=9,0;SAR=10,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.33753e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.00140896,0.030661;OID=.,.;OPOS=241621800,241621800;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1,0:19,3:23:22,0:22:0:9,0:13,0:0:0:4:0:9,0:10,3:0:0
chr2	241622195	.	T	C	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0445849;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.36;QD=53.2771;RBI=0.0450524;REFB=0;REVB=0.00647359;RO=0;SAF=16;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00034232;OID=.;OPOS=241622195;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:7:16:0:0:7:16:0:0
chr2	241622209	.	T	C	160.27	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0434638;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.9307;QD=45.79;RBI=0.0843456;REFB=0;REVB=0.0722847;RO=0;SAF=8;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00142289;OID=.;OPOS=241622209;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:6:8:0:0:6:8:0:0
chr2	241627928	.	A	G	400.03	PASS	AF=0.966667;AO=28;DP=29;FAO=29;FDP=30;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00345356;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.385;QD=53.3374;RBI=0.0138432;REFB=0.118731;REVB=0.0134055;RO=1;SAF=19;SAR=9;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0489106;STB=0.523793;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=-0.000838073;OID=.;OPOS=241627928;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:29:30:1:1:28:29:0.966667:9:19:0:1:10:19:0:1
chr2	241631476	.	C	G	582.08	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0435898;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.1762;QD=59.7001;RBI=0.0545128;REFB=0;REVB=-0.032735;RO=0;SAF=16;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.43889e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00115881;OID=.;OPOS=241631476;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:23:16:0:0:23:16:0:0
chr2	241664801	.	C	T	805.02	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0708519;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.2163;QD=64.4018;RBI=0.0845097;REFB=0;REVB=0.046064;RO=0;SAF=36;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00104376;OID=.;OPOS=241664801;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:14:36:0:0:14:36:0:0
chr2	241667783	.	C	T	501.66	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0334635;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.972;QD=59.0186;RBI=0.0414506;REFB=0;REVB=0.0244611;RO=0;SAF=12;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.75716e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000154968;OID=.;OPOS=241667783;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:22:12:0:0:22:12:0:0
chr2	241696840	.	ATCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTC	ATCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCT,ATCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTC,CTCATCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTC	748.82	PASS	AF=0.0344828,0.775862,0.189655;AO=9,21,12;DP=61;FAO=2,45,11;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=2,9,1;FSAR=0,36,10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0715445,0.0678922,0.0294036;FXX=0.0793525;HRUN=2,2,1;LEN=4,3,4;MLLD=92.3982,100.935,65.0131;QD=51.6428;RBI=0.086816,0.0926029,0.0694929;REFB=0,0,0;REVB=0.0491773,0.0629758,0.0629658;RO=0;SAF=7,1,1;SAR=2,20,11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,3.78928e-08,-3.23983e-08;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,del,mnp;VARB=-0.0119666,0.0305217,0.04074;OID=.,.,.;OPOS=241696869,241696841,241696840;OREF=CCTC,TCC,ATCC;OALT=-,-,CTCA;OMAPALT=ATCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCT,ATCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTC,CTCATCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	2/3:69:61:58:0:0:9,21,12:2,45,11:0.0344828,0.775862,0.189655:2,20,11:7,1,1:0:0:0,36,10:2,9,1:0:0
chr2	241713646	.	A	G	297.6	PASS	AF=0.533333;AO=17;DP=60;FAO=32;FDP=60;FR=.,HEALED;FRO=27;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=0.264225;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=36.1738;QD=19.8399;RBI=0.269109;REFB=-0.0225856;REVB=-0.0510399;RO=25;SAF=3;SAR=14;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.375988;STB=0.505841;STBP=0.941;TYPE=snp;VARB=0.0528743;OID=.;OPOS=241713646;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:25:27:17:32:0.533333:14:3:12:13:15:17:14:13
chr2	241722445	.	G	A	254.74	PASS	AF=0.510638;AO=23;DP=46;FAO=24;FDP=47;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=-0.0210052;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=70.5906;QD=21.6797;RBI=0.0589457;REFB=-0.0107405;REVB=0.0550762;RO=23;SAF=14;SAR=9;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0410084;STB=0.535027;STBP=0.685;TYPE=snp;VARB=0.0232261;OID=.;OPOS=241722445;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:47:23:23:23:24:0.510638:9:14:15:8:10:14:15:8
chr2	241816545	.	C	T	227.09	PASS	AF=0.5;AO=22;DP=45;FAO=22;FDP=44;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.0106001;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.2344;QD=20.6446;RBI=0.0237058;REFB=-0.0477411;REVB=0.0212038;RO=20;SAF=7;SAR=15;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165061;STB=0.619453;STBP=0.128;TYPE=snp;VARB=0.0389475;OID=.;OPOS=241816545;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:44:20:22:22:22:0.5:15:7:10:10:15:7:12:10
chr2	241826517	.	C	T	413.76	PASS	AF=0.518519;AO=39;DP=79;FAO=42;FDP=81;FR=.;FRO=39;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=15;FSRR=24;FWDB=0.00727762;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.902;QD=20.4328;RBI=0.0100183;REFB=0.000968893;REVB=0.00688501;RO=37;SAF=17;SAR=22;SRF=12;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101267;STB=0.533119;STBP=0.571;TYPE=snp;VARB=0.000492764;OID=.;OPOS=241826517;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:81:37:39:39:42:0.518519:22:17:12:25:23:19:15:24
chr2	241828012	.	T	C	322.25	PASS	AF=0.608696;AO=28;DP=46;FAO=28;FDP=46;FR=.;FRO=18;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.0197233;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.9;QD=28.0214;RBI=0.0233592;REFB=-0.029671;REVB=-0.0125156;RO=18;SAF=14;SAR=14;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0237855;OID=.;OPOS=241828012;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:18:18:28:28:0.608696:14:14:9:9:14:14:9:9
chr2	241828034	.	A	G	501.59	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00390951;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.95;QD=59.01;RBI=0.00481644;REFB=0;REVB=0.00281316;RO=0;SAF=14;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.48532e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.62023e-06;OID=.;OPOS=241828034;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:20:14:0:0:20:14:0:0
chr2	241830969	.	G	A	442.58	PASS	AF=0.551282;AO=43;DP=78;FAO=43;FDP=78;FR=.;FRO=35;FSAF=28;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=0.0135581;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.306;QD=22.6962;RBI=0.0883078;REFB=-0.00840921;REVB=0.0872608;RO=34;SAF=28;SAR=15;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174375;STB=0.603028;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=0.00705612;OID=.;OPOS=241830969;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:34:35:43:43:0.551282:15:28:15:19:15:28:15:20
chr2	241831005	.	C	T	668.04	PASS	AF=0.5;AO=66;DP=133;FAO=67;FDP=134;FR=.;FRO=67;FSAF=43;FSAR=24;FSRF=34;FSRR=33;FWDB=0.0604155;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.8493;QD=19.9414;RBI=0.0643651;REFB=2.30996e-05;REVB=0.0221999;RO=67;SAF=43;SAR=23;SRF=34;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137763;STB=0.570111;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=0.00108878;OID=.;OPOS=241831005;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:133:134:67:67:66:67:0.5:23:43:34:33:24:43:34:33
chr2	241831296	.	C	G	168.44	PASS	AF=0.529412;AO=15;DP=32;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=0.125369;FXX=0.0285633;HRUN=3;LEN=1;MLLD=38.7384;QD=19.8167;RBI=0.125546;REFB=-0.0364215;REVB=-0.00665754;RO=16;SAF=7;SAR=8;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141648;STB=0.56369;STBP=0.464;TYPE=snp;VARB=0.0402616;OID=.;OPOS=241831296;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:34:16:16:15:18:0.529412:8:7:5:11:10:8:5:11
chr2	241834944	.	T	C	464.19	PASS	AF=0.586667;AO=44;DP=75;FAO=44;FDP=75;FR=.;FRO=31;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=-0.000896284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.406;QD=24.757;RBI=0.0265846;REFB=0.011099;REVB=-0.0265695;RO=31;SAF=23;SAR=21;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0438956;STB=0.524031;STBP=0.671;TYPE=snp;VARB=-0.00884072;OID=.;OPOS=241834944;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:31:31:44:44:0.586667:21:23:18:13:21:23:18:13
chr2	241835379	.	G	A	99.96	PASS	AF=0.461538;AO=12;DP=26;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=-0.0824952;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.984;QD=15.3789;RBI=0.085586;REFB=-0.0161793;REVB=-0.022793;RO=14;SAF=7;SAR=5;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.270556;STB=0.656002;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=0.0231824;OID=.;OPOS=241835379;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:26:14:14:12:12:0.461538:5:7:4:10:5:7:4:10
chr2	241865156	.	T	C	761.26	PASS	AF=0.418367;AO=82;DP=196;FAO=82;FDP=196;FR=.;FRO=114;FSAF=46;FSAR=36;FSRF=62;FSRR=52;FWDB=-0.0122585;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.546;QD=15.5359;RBI=0.0198603;REFB=-0.00533809;REVB=-0.0156256;RO=113;SAF=46;SAR=36;SRF=62;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0129206;STB=0.510078;STBP=0.843;TYPE=snp;VARB=0.00619634;OID=.;OPOS=241865156;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:196:196:113:114:82:82:0.418367:36:46:62:51:36:46:62:52
chr2	241872722	.	G	A	183.88	PASS	AF=0.463415;AO=19;DP=41;FAO=19;FDP=41;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=0.0249982;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.961;QD=17.9398;RBI=0.0419032;REFB=-0.0277723;REVB=-0.0336299;RO=22;SAF=7;SAR=12;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169672;STB=0.596755;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.0336838;OID=.;OPOS=241872722;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:22:22:19:19:0.463415:12:7:12:10:12:7:12:10
chr2	241922430	.	T	C	353.79	PASS	AF=0.486842;AO=37;DP=76;FAO=37;FDP=76;FR=.;FRO=39;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=23;FWDB=-0.00153363;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.184;QD=18.6204;RBI=0.0208403;REFB=-0.00960392;REVB=-0.0207838;RO=39;SAF=18;SAR=19;SRF=16;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0704158;STB=0.539209;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.00754473;OID=.;OPOS=241922430;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:39:39:37:37:0.486842:19:18:16:23:19:18:16:23
chr2	241925343	.	T	C	314.33	PASS	AF=0.465753;AO=34;DP=73;FAO=34;FDP=73;FR=.;FRO=39;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=-0.0128162;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.185;QD=17.2233;RBI=0.0133638;REFB=-0.0114554;REVB=-0.00378619;RO=38;SAF=18;SAR=16;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0470234;STB=0.532449;STBP=0.642;TYPE=snp;VARB=0.0183594;OID=.;OPOS=241925343;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:38:39:34:34:0.465753:16:18:22:16:16:18:23:16
chr2	241929228	.	A	G	791.94	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00933842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.34;QD=56.567;RBI=0.0105229;REFB=0;REVB=0.00485037;RO=0;SAF=28;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.4002e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000170447;OID=.;OPOS=241929228;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:56:0:0:55:56:1:27:28:0:0:28:28:0:0
chr2	241973223	.	C	T	310.42	PASS	AF=0.5;AO=32;DP=65;FAO=33;FDP=66;FR=.;FRO=33;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=11;FWDB=0.0298856;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.1512;QD=18.8131;RBI=0.0480162;REFB=-0.0384591;REVB=0.0375819;RO=33;SAF=18;SAR=14;SRF=22;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0977216;STB=0.561761;STBP=0.362;TYPE=snp;VARB=0.0399692;OID=.;OPOS=241973223;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:66:33:33:32:33:0.5:14:18:22:11:15:18:22:11
chr2	241979550	.	T	C	788.09	PASS	AF=1;AO=54;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0410049;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.118;QD=57.3155;RBI=0.0632245;REFB=0;REVB=0.0481242;RO=0;SAF=29;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.77396e-06;OID=.;OPOS=241979550;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:54:55:1:25:29:0:0:26:29:0:0
chr2	241991875	.	G	A	639.65	PASS	AF=0.934783;AO=43;DP=46;FAO=43;FDP=46;FR=.;FRO=3;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0150867;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.473;QD=55.6219;RBI=0.0163903;REFB=-0.0610674;REVB=-0.00640573;RO=2;SAF=21;SAR=22;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000970065;STB=0.511622;STBP=0.593;TYPE=snp;VARB=0.00544967;OID=.;OPOS=241991875;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:46:46:2:3:43:43:0.934783:22:21:1:1:22:21:2:1
chr2	242002306	.	G	A	190.27	PASS	AF=0.542857;AO=19;DP=35;FAO=19;FDP=35;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.0151446;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.777;QD=21.7454;RBI=0.0262175;REFB=-0.0302412;REVB=0.0214009;RO=13;SAF=8;SAR=11;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0300096;STB=0.536547;STBP=0.663;TYPE=snp;VARB=0.0206047;OID=.;OPOS=242002306;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:13:16:19:19:0.542857:11:8:6:7:11:8:8:8
chr2	242003487	.	C	T	2861.74	PASS	AF=1;AO=179;DP=185;FAO=184;FDP=184;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=118;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0349126;FXX=0.0366473;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.6209;QD=62.2117;RBI=0.0382046;REFB=-0.0435627;REVB=0.0155146;RO=0;SAF=64;SAR=115;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.74355e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00399347;OID=.;OPOS=242003487;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:185:184:0:0:179:184:1:115:64:0:0:118:66:0:0
chr2	242004866	.	A	G	632.21	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0235471;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.878;QD=61.6792;RBI=0.0265842;REFB=0;REVB=0.0123391;RO=0;SAF=19;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.89449e-05;OID=.;OPOS=242004866;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:22:19:0:0:22:19:0:0
chr2	242011330	.	C	A	658.28	PASS	AF=0.96;AO=48;DP=51;FAO=48;FDP=50;FR=.;FRO=2;FSAF=19;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0513637;FXX=0.019604;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.0096;QD=52.662;RBI=0.0540685;REFB=-0.141256;REVB=0.0168869;RO=2;SAF=19;SAR=29;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00817205;STB=0.504346;STBP=0.858;TYPE=snp;VARB=0.00636897;OID=.;OPOS=242011330;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:51:50:2:2:48:48:0.96:29:19:1:1:29:19:1:1
chr2	242011531	.	G	A	137.7	PASS	AF=0.555556;AO=15;DP=27;FAO=15;FDP=27;FR=.;FRO=12;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.0170304;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.4563;QD=20.3993;RBI=0.0485878;REFB=-0.0105717;REVB=0.0455054;RO=10;SAF=12;SAR=3;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190814;STB=0.666419;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=0.00806155;OID=.;OPOS=242011531;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:27:27:10:12:15:15:0.555556:3:12:6:4:3:12:6:6
chr2	242021742	.	G	T	383.23	PASS	AF=0.419048;AO=44;DP=105;FAO=44;FDP=105;FR=.;FRO=61;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=35;FSRR=26;FWDB=0.00172421;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.761;QD=14.599;RBI=0.00958959;REFB=0.00280878;REVB=-0.00943331;RO=61;SAF=18;SAR=26;SRF=35;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169531;STB=0.595462;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=-0.00788344;OID=.;OPOS=242021742;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:105:61:61:44:44:0.419048:26:18:35:26:26:18:35:26
chr2	242029426	.	G	A	299.05	PASS	AF=0.445946;AO=33;DP=74;FAO=33;FDP=74;FR=.;FRO=41;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=24;FSRR=17;FWDB=-0.00514969;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.22;QD=16.1647;RBI=0.00664518;REFB=-0.0063272;REVB=-0.00419991;RO=41;SAF=15;SAR=18;SRF=24;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128182;STB=0.572084;STBP=0.271;TYPE=snp;VARB=0.00629819;OID=.;OPOS=242029426;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:41:41:33:33:0.445946:18:15:24:17:18:15:24:17
chr2	242036797	.	A	G	240.49	PASS	AF=0.511111;AO=23;DP=45;FAO=23;FDP=45;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=0.0117224;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.223;QD=21.3766;RBI=0.0243415;REFB=-0.0174915;REVB=-0.021333;RO=22;SAF=8;SAR=15;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0575055;STB=0.532331;STBP=0.682;TYPE=snp;VARB=0.0158445;OID=.;OPOS=242036797;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:22:22:23:23:0.511111:15:8:9:13:15:8:9:13
chr2	242046785	.	A	C	117.75	PASS	AF=0.368421;AO=14;DP=38;FAO=14;FDP=38;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=-0.0221131;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=298.021;QD=12.3948;RBI=0.0234319;REFB=-0.0171271;REVB=-0.00775013;RO=24;SAF=6;SAR=8;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0592718;STB=0.534835;STBP=0.77;TYPE=snp;VARB=0.0313048;OID=.;OPOS=242046785;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:24:24:14:14:0.368421:8:6:9:15:8:6:9:15
chr2	242051777	.	G	A	154.1	PASS	AF=0.395349;AO=17;DP=43;FAO=17;FDP=43;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=0.0321883;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=252.131;QD=14.3349;RBI=0.0341306;REFB=-0.0126067;REVB=-0.0113497;RO=26;SAF=11;SAR=6;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196745;STB=0.614388;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=0.0186736;OID=.;OPOS=242051777;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:26:26:17:17:0.395349:6:11:12:14:6:11:12:14
chr2	242054403	.	G	A	230.58	PASS	AF=0.368421;AO=28;DP=76;FAO=28;FDP=76;FR=.;FRO=48;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=31;FSRR=17;FWDB=-0.0224814;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=266.529;QD=12.1358;RBI=0.0236905;REFB=-0.00997221;REVB=0.00747185;RO=48;SAF=13;SAR=15;SRF=31;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.197746;STB=0.613305;STBP=0.161;TYPE=snp;VARB=0.0200631;OID=.;OPOS=242054403;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:48:48:28:28:0.368421:15:13:31:17:15:13:31:17
chr2	242062162	.	C	T	58.61	PASS	AF=0.5;AO=8;DP=16;FAO=8;FDP=16;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.0459788;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.992;QD=14.6532;RBI=0.0480594;REFB=0.0184347;REVB=0.0139876;RO=8;SAF=3;SAR=5;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108737;STB=0.564352;STBP=0.602;TYPE=snp;VARB=-0.0254681;OID=.;OPOS=242062162;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:16:16:8:8:8:8:0.5:5:3:4:4:5:3:4:4
chr2	242082262	.	T	C	579.48	PASS	AF=1;AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0191153;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.34;QD=60.9977;RBI=0.0399514;REFB=0;REVB=0.0350817;RO=0;SAF=26;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.05056e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000123175;OID=.;OPOS=242082262;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:38:0:0:38:38:1:12:26:0:0:12:26:0:0
chr2	242122391	.	T	C	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00756609;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.922;QD=56.1909;RBI=0.0105661;REFB=0;REVB=0.00737535;RO=0;SAF=16;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.36523e-05;OID=.;OPOS=242122391;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:12:16:0:0:12:16:0:0
chr2	242129515	.	G	A	2739.08	PASS	AF=0.983425;AO=176;DP=182;FAO=178;FDP=181;FR=.;FRO=3;FSAF=91;FSAR=87;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0258147;FXX=0.0109284;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.163;QD=60.5321;RBI=0.0294718;REFB=-0.0322012;REVB=0.0142193;RO=3;SAF=91;SAR=85;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00477886;STB=0.502577;STBP=0.719;TYPE=snp;VARB=0.000293203;OID=.;OPOS=242129515;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:182:181:3:3:176:178:0.983425:85:91:2:1:87:91:2:1
chr2	242157087	.	C	T	204.95	PASS	AF=0.470588;AO=19;DP=48;FAO=24;FDP=51;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=0.00289865;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=91.704;QD=16.0748;RBI=0.0343929;REFB=-0.0344302;REVB=-0.0342705;RO=22;SAF=9;SAR=10;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110079;STB=0.551344;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.036188;OID=.;OPOS=242157087;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:51:22:27:19:24:0.470588:10:9:13:9:13:11:15:12
chr2	242157241	.	G	A	361.26	PASS	AF=0.506849;AO=37;DP=75;FAO=37;FDP=73;FR=.;FRO=36;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=21;FSRR=15;FWDB=0.0362506;FXX=0.0266631;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.6465;QD=19.795;RBI=0.0373258;REFB=-0.0387233;REVB=-0.00889472;RO=36;SAF=22;SAR=15;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0103393;STB=0.505744;STBP=0.938;TYPE=snp;VARB=0.0308722;OID=.;OPOS=242157241;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:73:36:36:37:37:0.506849:15:22:21:15:15:22:21:15
chr2	242168518	.	G	A	186.83	PASS	AF=0.5;AO=19;DP=38;FAO=19;FDP=38;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=0.0169151;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.921;QD=19.6663;RBI=0.0300096;REFB=-0.015384;REVB=-0.0247882;RO=19;SAF=10;SAR=9;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0927571;STB=0.552431;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.0220634;OID=.;OPOS=242168518;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:19:19:19:19:0.5:9:10:8:11:9:10:8:11
chr2	242168976	.	T	C	334.85	PASS	AF=0.397849;AO=37;DP=93;FAO=37;FDP=93;FR=.;FRO=56;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=31;FSRR=25;FWDB=0.0174116;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=144.262;QD=14.4021;RBI=0.0254412;REFB=-0.00614252;REVB=-0.0185498;RO=53;SAF=15;SAR=22;SRF=28;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128801;STB=0.589352;STBP=0.176;TYPE=snp;VARB=0.0158779;OID=.;OPOS=242168976;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:53:56:37:37:0.397849:22:15:28:25:22:15:31:25
chr2	242203916	.	A	C	1402.34	PASS	AF=1;AO=89;DP=89;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00543501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.798;QD=62.3263;RBI=0.00547247;REFB=0;REVB=0.000639267;RO=0;SAF=57;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.91716e-05;OID=.;OPOS=242203916;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:89:90:0:0:89:90:1:32:57:0:0:33:57:0:0
chr2	242434602	.	A	G	143.31	PASS	AF=0.410256;AO=15;DP=38;FAO=16;FDP=39;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=0.0162483;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.446;QD=14.6982;RBI=0.0162862;REFB=0.00387581;REVB=0.00111077;RO=23;SAF=8;SAR=7;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0791205;STB=0.527834;STBP=0.779;TYPE=snp;VARB=-0.00747655;OID=.;OPOS=242434602;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:39:23:23:15:16:0.410256:7:8:14:9:7:9:14:9
chr2	242572846	.	A	G	727.8	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0291636;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.631;QD=63.2866;RBI=0.032019;REFB=0;REVB=0.0132174;RO=0;SAF=20;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000194255;OID=.;OPOS=242572846;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:26:20:0:0:26:20:0:0
chr2	242573211	.	T	C	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0448528;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.44;QD=48.7371;RBI=0.0627115;REFB=0;REVB=-0.0438287;RO=0;SAF=9;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.76436e-06;OID=.;OPOS=242573211;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:8:9:0:0:8:9:0:0
chr2	242610773	.	T	A	1677.39	PASS	AF=1;AO=111;DP=111;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.030676;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.41;QD=60.4464;RBI=0.0717965;REFB=0;REVB=0.0649132;RO=0;SAF=70;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.65433e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000257545;OID=.;OPOS=242610773;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:111:111:0:0:111:111:1:41:70:0:0:41:70:0:0
chr2	242611934	.	T	C	240.13	PASS	AF=0.465517;AO=27;DP=58;FAO=27;FDP=58;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=9;FSRR=22;FWDB=-0.0448989;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.925;QD=16.5604;RBI=0.0451677;REFB=-0.0167198;REVB=-0.00492103;RO=31;SAF=9;SAR=18;SRF=9;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0467927;STB=0.526297;STBP=0.739;TYPE=snp;VARB=0.0168543;OID=.;OPOS=242611934;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:31:31:27:27:0.465517:18:9:9:22:18:9:9:22
chr2	242613133	.	T	G	239.92	PASS	AF=0.405797;AO=28;DP=69;FAO=28;FDP=69;FR=.;FRO=41;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=0.000980721;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.866;QD=13.9083;RBI=0.00844186;REFB=-0.0165659;REVB=-0.0083847;RO=41;SAF=15;SAR=13;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0245738;STB=0.514009;STBP=0.884;TYPE=snp;VARB=0.020516;OID=.;OPOS=242613133;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:41:41:28:28:0.405797:13:15:21:20:13:15:21:20
chr2	242664433	.	GGAA	G	111.61	PASS	AF=0.298701;AO=23;DP=80;FAO=23;FDP=77;FR=.;FRO=54;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=31;FSRR=23;FWDB=-0.00518292;FXX=0.0833234;HRUN=2;LEN=3;MLLD=313.385;QD=5.79805;RBI=0.00745066;REFB=-0.00112387;REVB=0.00535254;RO=46;SAF=7;SAR=16;SRF=25;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.279166;STB=0.689959;STBP=0.027;TYPE=del;VARB=0.00239149;OID=.;OPOS=242664434;OREF=GAA;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.298701:23:80:23:77:54:7:16:31:23:99:46:7:16:25:21
chr2	242742875	.	C	T	662.16	PASS	AF=0.551724;AO=64;DP=106;FAO=64;FDP=116;FR=.;FRO=52;FSAF=38;FSAR=26;FSRF=33;FSRR=19;FWDB=0.00828584;FXX=0.00854628;HRUN=4;LEN=1;MLLD=44.4685;QD=22.8331;RBI=0.0192558;REFB=-0.0379643;REVB=-0.0173819;RO=42;SAF=38;SAR=26;SRF=29;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0742517;STB=0.519117;STBP=0.663;TYPE=snp;VARB=0.0245441;OID=.;OPOS=242742875;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:116:42:52:64:64:0.551724:26:38:29:13:26:38:33:19
chr2	242757411	.	C	T	910.96	PASS	AF=0.969697;AO=64;DP=66;FAO=64;FDP=66;FR=.;FRO=2;FSAF=39;FSAR=25;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0274028;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.2897;QD=55.2097;RBI=0.0435076;REFB=-0.116095;REVB=0.0337934;RO=2;SAF=39;SAR=25;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0236054;STB=0.512496;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.00186921;OID=.;OPOS=242757411;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:66:66:2:2:64:64:0.969697:25:39:2:0:25:39:2:0
chr2	242758203	.	T	C	1073.94	PASS	AF=1;AO=52;DP=70;FAO=71;FDP=71;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=41;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00569687;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.189;QD=60.5035;RBI=0.120523;REFB=0;REVB=0.120388;RO=0;SAF=41;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000133553;OID=.;OPOS=242758203;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:71:0:0:52:71:1:11:41:0:0:30:41:0:0
chr2	242758326	.	G	A	774.75	PASS	AF=1;AO=38;DP=50;FAO=49;FDP=49;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=0;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.247733;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.687;QD=63.2448;RBI=0.247788;REFB=0;REVB=0.00523151;RO=0;SAF=13;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00230491;OID=.;OPOS=242758326;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:49:0:0:38:49:1:25:13:0:0:24:25:0:0
chr2	242793273	.	A	G	263.79	PASS	AF=0.378049;AO=31;DP=82;FAO=31;FDP=82;FR=.;FRO=51;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=29;FWDB=-0.00444629;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.149;QD=12.8676;RBI=0.0362556;REFB=-0.00645112;REVB=-0.0359819;RO=50;SAF=19;SAR=12;SRF=22;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186913;STB=0.61283;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.0077457;OID=.;OPOS=242793273;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:50:51:31:31:0.378049:12:19:22:28:12:19:22:29
chr2	242813124	.	T	C	785.82	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0572668;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.6949;QD=64.1484;RBI=0.0966254;REFB=0;REVB=0.0778267;RO=0;SAF=29;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000188104;OID=.;OPOS=242813124;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:20:29:0:0:20:29:0:0
chr2	242814009	.	G	A	164.82	PASS	AF=0.548387;AO=17;DP=31;FAO=17;FDP=31;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=0.0300216;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=289.014;QD=21.2676;RBI=0.0300242;REFB=-0.0185139;REVB=-0.000395577;RO=14;SAF=7;SAR=10;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169878;STB=0.595037;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=0.0145157;OID=.;OPOS=242814009;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:14:14:17:17:0.548387:10:7:3:11:10:7:3:11
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chr2	242839363	.	G	C	283.13	PASS	AF=0.476923;AO=31;DP=65;FAO=31;FDP=65;FR=.;FRO=34;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=-0.0159198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.7449;QD=17.4231;RBI=0.0542254;REFB=-0.00187401;REVB=0.0518359;RO=33;SAF=19;SAR=12;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.201655;STB=0.620101;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=0.00251695;OID=.;OPOS=242839363;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:33:34:31:31:0.476923:12:19:13:20:12:19:13:21
chr3	391100	.	A	G	1720.87	PASS	AF=0.95935;AO=116;DP=122;FAO=118;FDP=123;FR=.;FRO=5;FSAF=53;FSAR=65;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0147944;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=164.986;QD=55.9631;RBI=0.0316837;REFB=-0.0363376;REVB=0.0280176;RO=3;SAF=52;SAR=64;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.026607;STB=0.522519;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.000551699;OID=.;OPOS=391100;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:122:123:3:5:116:118:0.95935:64:52:3:0:65:53:5:0
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chr3	440028	.	T	C	902.61	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00761331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.603;QD=58.2328;RBI=0.00806892;REFB=0;REVB=0.00267302;RO=0;SAF=22;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.01474e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.33697e-06;OID=.;OPOS=440028;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:62:0:0:61:62:1:39:22:0:0:40:22:0:0
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chr3	450534	.	T	C	1425.36	PASS	AF=0.978723;AO=92;DP=94;FAO=92;FDP=94;FR=.;FRO=2;FSAF=37;FSAR=55;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00232861;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.9222;QD=60.6536;RBI=0.018056;REFB=-0.00879885;REVB=0.0179052;RO=2;SAF=37;SAR=55;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00409819;STB=0.502162;STBP=0.847;TYPE=snp;VARB=0.00102574;OID=.;OPOS=450534;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:94:94:2:2:92:92:0.978723:55:37:1:1:55:37:1:1
chr3	1107455	.	T	C	754.05	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0178817;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.502;QD=56.9098;RBI=0.0186614;REFB=0;REVB=-0.00533795;RO=0;SAF=19;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.97342e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.45631e-05;OID=.;OPOS=1107455;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:34:19:0:0:34:19:0:0
chr3	1107550	.	A	T	610.49	PASS	AF=1;AO=40;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.171348;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.8405;QD=58.1421;RBI=0.172555;REFB=-0.0921384;REVB=-0.0203745;RO=1;SAF=11;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0407263;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00826746;OID=.;OPOS=1107550;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:42:42:1:0:40:42:1:29:11:1:0:29:13:0:0
chr3	1262474	.	T	C	62.71	PASS	AF=0.13;AO=13;DP=99;FAO=13;FDP=100;FR=.;FRO=87;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=41;FSRR=46;FWDB=0.0485215;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.175;QD=2.50823;RBI=0.0497017;REFB=-0.000190587;REVB=0.0107672;RO=86;SAF=8;SAR=5;SRF=41;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170724;STB=0.624618;STBP=0.363;TYPE=snp;VARB=0.00339727;OID=.;OPOS=1262474;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:99:100:86:87:13:13:0.13:5:8:41:45:5:8:41:46
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chr3	1424850	.	T	G	1507.49	PASS	AF=0.773333;AO=111;DP=144;FAO=116;FDP=150;FR=.;FRO=34;FSAF=53;FSAR=63;FSRF=9;FSRR=25;FWDB=0.00559413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.956;QD=40.1998;RBI=0.0273431;REFB=-0.0176607;REVB=0.0267647;RO=32;SAF=52;SAR=59;SRF=8;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0927612;STB=0.544217;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=0.00377516;OID=.;OPOS=1424850;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:144:150:32:34:111:116:0.773333:59:52:8:24:63:53:9:25
chr3	3067850	.	A	G	106.99	PASS	AF=0.157895;AO=21;DP=134;FAO=21;FDP=133;FR=.;FRO=112;FSAF=16;FSAR=5;FSRF=50;FSRR=62;FWDB=0.0017984;FXX=0.00746213;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.598;QD=3.21771;RBI=0.0131137;REFB=0.00334183;REVB=0.0129898;RO=111;SAF=16;SAR=5;SRF=50;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.395467;STB=0.764371;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=-0.0163518;OID=.;OPOS=3067850;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:134:133:111:112:21:21:0.157895:5:16:50:61:5:16:50:62
chr3	3067853	.	G	A	113.76	PASS	AF=0.161765;AO=22;DP=136;FAO=22;FDP=136;FR=.;FRO=114;FSAF=17;FSAR=5;FSRF=51;FSRR=63;FWDB=-0.0236657;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.635;QD=3.34597;RBI=0.0238768;REFB=-0.0013138;REVB=-0.00316812;RO=114;SAF=17;SAR=5;SRF=51;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.413831;STB=0.77248;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0219195;OID=.;OPOS=3067853;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:136:136:114:114:22:22:0.161765:5:17:51:63:5:17:51:63
chr3	3076443	.	A	G	101.83	PASS	AF=0.282609;AO=13;DP=46;FAO=13;FDP=46;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=0.0137815;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.95;QD=8.8545;RBI=0.0145685;REFB=0.00782578;REVB=-0.00472335;RO=33;SAF=10;SAR=3;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.22564;STB=0.639766;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=-0.0122021;OID=.;OPOS=3076443;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:33:33:13:13:0.282609:3:10:20:13:3:10:20:13
chr3	3081750	.	A	T	2113.57	PASS	AF=0.79397;AO=158;DP=199;FAO=158;FDP=199;FR=.;FRO=41;FSAF=77;FSAR=81;FSRF=27;FSRR=14;FWDB=0.0222206;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.3358;QD=42.4837;RBI=0.0233603;REFB=-0.0164425;REVB=-0.00720759;RO=41;SAF=77;SAR=81;SRF=27;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0663337;STB=0.535227;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.00513621;OID=.;OPOS=3081750;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:199:199:41:41:158:158:0.79397:81:77:27:14:81:77:27:14
chr3	3081825	.	T	C	2615.18	PASS	AF=1;AO=167;DP=168;FAO=169;FDP=169;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-5.46447e-05;FXX=0.00588201;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.632;QD=61.8978;RBI=0.0469955;REFB=0;REVB=0.0469955;RO=1;SAF=82;SAR=85;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00556626;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000329739;OID=.;OPOS=3081825;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:168:169:1:0:167:169:1:85:82:0:1:87:82:0:0
chr3	3098041	.	G	C	1208.86	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000411695;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.532;QD=61.2081;RBI=0.00960007;REFB=0;REVB=-0.00959124;RO=0;SAF=40;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33478e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.29078e-05;OID=.;OPOS=3098041;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:39:40:0:0:39:40:0:0
chr3	3099460	.	T	C	138.93	PASS	AF=0.27027;AO=20;DP=74;FAO=20;FDP=74;FR=.;FRO=54;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=26;FSRR=28;FWDB=0.0574353;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.7;QD=7.50997;RBI=0.0576342;REFB=-0.00241682;REVB=-0.0047847;RO=53;SAF=6;SAR=14;SRF=26;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.239831;STB=0.639855;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=0.00658009;OID=.;OPOS=3099460;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:53:54:20:20:0.27027:14:6:26:27:14:6:26:28
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chr3	3115482	.	T	A	615.08	PASS	AF=0.819672;AO=50;DP=61;FAO=50;FDP=61;FR=.;FRO=11;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.0117563;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.959;QD=40.3333;RBI=0.0131583;REFB=-0.00254838;REVB=0.0059103;RO=11;SAF=26;SAR=24;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00858485;STB=0.504597;STBP=0.924;TYPE=snp;VARB=0.000400276;OID=.;OPOS=3115482;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:61:61:11:11:50:50:0.819672:24:26:6:5:24:26:6:5
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chr3	3197918	.	A	G	728.95	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0629067;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.272;QD=57.1726;RBI=0.0700677;REFB=0;REVB=0.0308583;RO=0;SAF=32;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.2152e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000529783;OID=.;OPOS=3197918;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:19:32:0:0:19:32:0:0
chr3	3886580	.	A	G	754.43	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0127741;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=232.239;QD=56.9383;RBI=0.0145414;REFB=0;REVB=0.00694806;RO=0;SAF=30;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.72004e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.22557e-05;OID=.;OPOS=3886580;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:23:30:0:0:23:30:0:0
chr3	3886847	.	G	C	341.96	PASS	AF=0.644444;AO=28;DP=45;FAO=29;FDP=45;FR=.;FRO=16;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=-0.0206175;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.7317;QD=30.3962;RBI=0.0224247;REFB=-0.00229005;REVB=0.00881957;RO=14;SAF=17;SAR=11;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0228941;STB=0.514276;STBP=0.791;TYPE=snp;VARB=0.00161614;OID=.;OPOS=3886847;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:14:16:28:29:0.644444:11:17:9:5:12:17:10:6
chr3	3886919	.	C	T	798.28	PASS	AF=0.698925;AO=65;DP=93;FAO=65;FDP=93;FR=.;FRO=28;FSAF=37;FSAR=28;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=-0.0239246;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.499;QD=34.3347;RBI=0.024498;REFB=-0.0346045;REVB=-0.00526922;RO=28;SAF=37;SAR=28;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0592444;STB=0.531919;STBP=0.347;TYPE=snp;VARB=0.0202768;OID=.;OPOS=3886919;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:28:28:65:65:0.698925:28:37:13:15:28:37:13:15
chr3	3889101	.	C	G	51.54	PASS	AF=0.636364;AO=7;DP=11;FAO=7;FDP=11;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.040517;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.345;QD=18.7417;RBI=0.0520332;REFB=-0.0396683;REVB=0.032647;RO=4;SAF=4;SAR=3;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0448465;STB=0.52624;STBP=0.929;TYPE=snp;VARB=0.0138458;OID=.;OPOS=3889101;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:11:11:4:4:7:7:0.636364:3:4:2:2:3:4:2:2
chr3	3889222	.	G	T	206.38	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00414247;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.549;QD=48.5592;RBI=0.0203269;REFB=0;REVB=0.0199003;RO=0;SAF=12;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.07465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000108611;OID=.;OPOS=3889222;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:17:0:0:16:17:1:4:12:0:0:5:12:0:0
chr3	4712413	.	G	A	144.89	PASS	AF=0.333333;AO=19;DP=57;FAO=19;FDP=57;FR=.;FRO=38;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=-0.0064049;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=246.874;QD=10.1675;RBI=0.0103408;REFB=-0.0047524;REVB=-0.00811845;RO=37;SAF=11;SAR=8;SRF=15;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.19328;STB=0.604287;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=0.0113293;OID=.;OPOS=4712413;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:37:38:19:19:0.333333:8:11:15:22:8:11:16:22
chr3	4716811	.	A	C	128.49	PASS	AF=0.256757;AO=19;DP=74;FAO=19;FDP=74;FR=.;FRO=55;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=24;FSRR=31;FWDB=0.00751096;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.412;QD=6.94561;RBI=0.0142787;REFB=0.0032978;REVB=0.0121436;RO=55;SAF=9;SAR=10;SRF=24;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0458017;STB=0.527868;STBP=0.777;TYPE=snp;VARB=-0.00747421;OID=.;OPOS=4716811;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:55:55:19:19:0.256757:10:9:24:31:10:9:24:31
chr3	4767262	.	T	C	1153.6	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00647217;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.39;QD=60.7156;RBI=0.00850965;REFB=0;REVB=0.00552495;RO=0;SAF=42;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.6391e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.05413e-06;OID=.;OPOS=4767262;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:34:42:0:0:34:42:0:0
chr3	4817057	.	T	C	801.11	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0257322;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.642;QD=57.2221;RBI=0.0352337;REFB=0;REVB=0.024068;RO=0;SAF=33;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000178587;OID=.;OPOS=4817057;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:23:33:0:0:23:33:0:0
chr3	4842231	.	C	T	271.77	PASS	AF=0.273381;AO=37;DP=138;FAO=38;FDP=139;FR=.;FRO=101;FSAF=25;FSAR=13;FSRF=53;FSRR=48;FWDB=-0.00947082;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.791;QD=7.82082;RBI=0.0131086;REFB=-0.00204739;REVB=0.00906301;RO=101;SAF=24;SAR=13;SRF=53;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157081;STB=0.600576;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=0.00235356;OID=.;OPOS=4842231;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:138:139:101:101:37:38:0.273381:13:24:53:48:13:25:53:48
chr3	4856180	.	T	C	1283.42	PASS	AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0246583;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.4847;QD=61.8514;RBI=0.0275547;REFB=0;REVB=0.0122973;RO=0;SAF=46;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.12122e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000200753;OID=.;OPOS=4856180;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:37:46:0:0:37:46:0:0
chr3	4856234	.	G	A	679.37	PASS	AF=1;AO=38;DP=39;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00619244;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=313.706;QD=61.7613;RBI=0.00632018;REFB=0;REVB=0.00126427;RO=0;SAF=21;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.53998e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.96068e-05;OID=.;OPOS=4856234;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:44:0:0:38:44:1:17:21:0:0:18:26:0:0
chr3	4920353	.	A	AC	54.44	PASS	AF=0.25;AO=15;DP=64;FAO=16;FDP=64;FR=.;FRO=48;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=29;FSRR=19;FWDB=-0.060333;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=19.3982;QD=3.40221;RBI=0.0607356;REFB=-0.000553727;REVB=-0.00698195;RO=47;SAF=9;SAR=6;SRF=28;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00540493;STB=0.516508;STBP=0.906;TYPE=ins;VARB=-0.00685311;OID=.;OPOS=4920354;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.25:15:64:16:64:48:10:6:29:19:54:47:9:6:28:19
chr3	5021403	.	C	T	246.68	PASS	AF=0.84;AO=21;DP=25;FAO=21;FDP=25;FR=.;FRO=4;FSAF=16;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0394206;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.654;QD=39.4689;RBI=0.0710048;REFB=-0.0202313;REVB=0.0590568;RO=4;SAF=16;SAR=5;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00479868;STB=0.502615;STBP=0.992;TYPE=snp;VARB=0.00441454;OID=.;OPOS=5021403;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:20:25:25:4:4:21:21:0.84:5:16:3:1:5:16:3:1
chr3	5024771	.	T	C	354.27	PASS	AF=0.647059;AO=32;DP=51;FAO=33;FDP=51;FR=.;FRO=18;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=5;FSRR=13;FWDB=-0.00522888;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.823;QD=27.7859;RBI=0.0229024;REFB=-0.0156606;REVB=0.0222975;RO=18;SAF=18;SAR=14;SRF=5;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.185465;STB=0.604178;STBP=0.056;TYPE=snp;VARB=0.00994107;OID=.;OPOS=5024771;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:18:18:32:33:0.647059:14:18:5:13:14:19:5:13
chr3	5025645	.	G	C	809.29	PASS	AF=0.6875;AO=66;DP=96;FAO=66;FDP=96;FR=.;FRO=30;FSAF=39;FSAR=27;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=0.000352893;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=268.33;QD=33.7205;RBI=0.0127927;REFB=0.00350085;REVB=0.0127879;RO=30;SAF=39;SAR=27;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.053884;STB=0.529061;STBP=0.413;TYPE=snp;VARB=-0.00181463;OID=.;OPOS=5025645;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:96:30:30:66:66:0.6875:27:39:15:15:27:39:15:15
chr3	5025650	.	G	T	806.5	PASS	AF=0.680412;AO=66;DP=98;FAO=66;FDP=97;FR=.;FRO=31;FSAF=40;FSAR=26;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.00888895;FXX=0.010203;HRUN=7;LEN=1;MLLD=178.596;QD=33.2577;RBI=0.00966004;REFB=-0.00527574;REVB=-0.00378191;RO=31;SAF=40;SAR=26;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0744349;STB=0.540181;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=0.00672847;OID=.;OPOS=5025650;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:97:31:31:66:66:0.680412:26:40:15:16:26:40:15:16
chr3	5025654	.	G	A	833.18	PASS	AF=0.686869;AO=68;DP=99;FAO=68;FDP=99;FR=.;FRO=31;FSAF=41;FSAR=27;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=-0.0125494;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.3441;QD=33.6637;RBI=0.0128373;REFB=-0.00355959;REVB=0.00270325;RO=31;SAF=41;SAR=27;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0710366;STB=0.538309;STBP=0.25;TYPE=snp;VARB=0.00599881;OID=.;OPOS=5025654;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:31:31:68:68:0.686869:27:41:15:16:27:41:15:16
chr3	5241309	.	C	A	1044.39	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144057;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.669;QD=59.6793;RBI=0.0227116;REFB=0;REVB=0.0175582;RO=0;SAF=38;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.8213e-05;OID=.;OPOS=5241309;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:32:38:0:0:32:38:0:0
chr3	5294713	.	C	T	44.51	PASS	AF=0.140351;AO=8;DP=57;FAO=8;FDP=57;FR=.;FRO=49;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=25;FSRR=24;FWDB=0.0216177;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.9407;QD=3.12327;RBI=0.0542809;REFB=0.0163239;REVB=0.0497905;RO=49;SAF=4;SAR=4;SRF=25;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0123214;STB=0.50875;STBP=0.927;TYPE=snp;VARB=-0.0954533;OID=.;OPOS=5294713;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:57:57:49:49:8:8:0.140351:4:4:25:24:4:4:25:24
chr3	5294774	.	C	T	33.42	PASS	AF=0.130435;AO=6;DP=48;FAO=6;FDP=46;FR=.,HEALED;FRO=40;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=23;FSRR=17;FWDB=0.00624658;FXX=0.041658;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.054;QD=2.9057;RBI=0.00761414;REFB=-0.00328184;REVB=0.00435377;RO=33;SAF=5;SAR=1;SRF=23;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218671;STB=0.761738;STBP=0.226;TYPE=snp;VARB=0.0187916;OID=.;OPOS=5294774;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:48:46:33:40:6:6:0.130435:1:5:23:10:1:5:23:17
chr3	6828364	.	A	G	375.58	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0394379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.7141;QD=55.6421;RBI=0.0425944;REFB=0;REVB=0.0160916;RO=0;SAF=19;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.06954e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000736987;OID=.;OPOS=6828364;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:8:19:0:0:8:19:0:0
chr3	7494417	.	A	T	548.74	PASS	AF=0.758065;AO=46;DP=61;FAO=47;FDP=62;FR=.;FRO=15;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=-0.0158701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.677;QD=35.4025;RBI=0.0416714;REFB=-0.0204497;REVB=0.0385312;RO=15;SAF=24;SAR=22;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0858209;STB=0.547925;STBP=0.199;TYPE=snp;VARB=0.00573848;OID=.;OPOS=7494417;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:61:62:15:15:46:47:0.758065:22:24:5:10:22:25:5:10
chr3	7620789	.	T	C	805.07	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0210828;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.313;QD=64.4054;RBI=0.0454;REFB=0;REVB=0.0402079;RO=0;SAF=24;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.10374e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000428797;OID=.;OPOS=7620789;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:26:24:0:0:26:24:0:0
chr3	7782257	.	T	C	65.51	PASS	AF=0.142857;AO=13;DP=91;FAO=13;FDP=91;FR=.;FRO=78;FSAF=12;FSAR=1;FSRF=36;FSRR=42;FWDB=0.0123987;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.7286;QD=2.87961;RBI=0.0137247;REFB=-0.0063158;REVB=-0.00588551;RO=78;SAF=12;SAR=1;SRF=36;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.593613;STB=0.914227;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0127154;OID=.;OPOS=7782257;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:91:91:78:78:13:13:0.142857:1:12:36:42:1:12:36:42
chr3	8556671	.	T	G	186.84	PASS	AF=0.237705;AO=29;DP=122;FAO=29;FDP=122;FR=.;FRO=93;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=51;FSRR=42;FWDB=0.00570866;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=241.994;QD=6.12573;RBI=0.0130065;REFB=-0.000283738;REVB=-0.0116868;RO=93;SAF=9;SAR=20;SRF=51;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.299183;STB=0.682467;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=0.00115209;OID=.;OPOS=8556671;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:122:122:93:93:29:29:0.237705:20:9:51:42:20:9:51:42
chr3	8609277	.	G	A	153.49	PASS	AF=0.304348;AO=21;DP=69;FAO=21;FDP=69;FR=.;FRO=48;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=31;FWDB=0.00410913;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.982;QD=8.89781;RBI=0.00579476;REFB=-0.00767036;REVB=0.00408586;RO=48;SAF=9;SAR=12;SRF=17;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0907187;STB=0.553598;STBP=0.556;TYPE=snp;VARB=0.015628;OID=.;OPOS=8609277;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:48:48:21:21:0.304348:12:9:17:31:12:9:17:31
chr3	8675539	.	G	A	1087.29	PASS	AF=0.790909;AO=87;DP=109;FAO=87;FDP=110;FR=.;FRO=23;FSAF=56;FSAR=31;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=-0.000276244;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=108.071;QD=39.5379;RBI=0.0163425;REFB=-0.0356631;REVB=0.0163402;RO=22;SAF=56;SAR=31;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0216224;STB=0.507935;STBP=0.751;TYPE=snp;VARB=0.00898165;OID=.;OPOS=8675539;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:110:22:23:87:87:0.790909:31:56:13:9:31:56:14:9
chr3	8676204	.	A	G	1093.88	PASS	AF=1;AO=72;DP=74;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0141696;FXX=0.0399947;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.854;QD=60.7713;RBI=0.0383563;REFB=0;REVB=0.035643;RO=0;SAF=37;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000309371;OID=.;OPOS=8676204;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:72:0:0:72:72:1:35:37:0:0:35:37:0:0
chr3	8705555	.	T	C	49.73	PASS	AF=0.177778;AO=8;DP=45;FAO=8;FDP=45;FR=.;FRO=37;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=22;FSRR=15;FWDB=0.0196086;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.174;QD=4.42036;RBI=0.0344517;REFB=0.00185406;REVB=-0.0283271;RO=37;SAF=3;SAR=5;SRF=22;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.261983;STB=0.675254;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=-0.00725791;OID=.;OPOS=8705555;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:49:45:45:37:37:8:8:0.177778:5:3:22:15:5:3:22:15
chr3	8809703	.	G	A	1158.04	PASS	AF=0.987013;AO=75;DP=77;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0120985;FXX=0.0493766;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.57;QD=60.158;RBI=0.0325025;REFB=-0.0545671;REVB=0.0301668;RO=0;SAF=30;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505375;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=0.00112615;OID=.;OPOS=8809703;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:77:77:0:1:75:76:0.987013:45:30:0:0:46:30:0:1
chr3	8973283	.	C	G	145.19	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0687697;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.8917;QD=44.6725;RBI=0.0751257;REFB=0;REVB=-0.0302424;RO=0;SAF=11;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00223333;OID=.;OPOS=8973283;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:2:11:0:0:2:11:0:0
chr3	9005078	.	C	T	137.47	PASS	AF=0.163636;AO=27;DP=165;FAO=27;FDP=165;FR=.;FRO=138;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=45;FSRR=93;FWDB=0.00401121;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=269.021;QD=3.33258;RBI=0.0104678;REFB=-0.005228;REVB=-0.00966881;RO=138;SAF=14;SAR=13;SRF=45;SRR=93;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.248828;STB=0.659155;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=0.0269749;OID=.;OPOS=9005078;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:165:165:138:138:27:27:0.163636:13:14:45:93:13:14:45:93
chr3	9024017	.	A	G	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0739424;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.865;QD=43.4861;RBI=0.083063;REFB=0;REVB=0.0378415;RO=0;SAF=6;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000992303;OID=.;OPOS=9024017;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:6:6:0:0:6:6:0:0
chr3	9024146	.	C	A	990.6	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0253925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.4566;QD=59.1405;RBI=0.032291;REFB=0;REVB=0.0199482;RO=0;SAF=38;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.51713e-05;OID=.;OPOS=9024146;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:29:38:0:0:29:38:0:0
chr3	9091151	.	C	G	448.12	PASS	AF=0.75;AO=38;DP=51;FAO=39;FDP=52;FR=.;FRO=13;FSAF=28;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.0171767;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=241.817;QD=34.4708;RBI=0.0171797;REFB=0.00875397;REVB=-0.000322795;RO=13;SAF=27;SAR=11;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0940646;STB=0.552817;STBP=0.221;TYPE=snp;VARB=-0.00247529;OID=.;OPOS=9091151;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:51:52:13:13:38:39:0.75:11:27:7:6:11:28:7:6
chr3	9122948	.	A	G	811.14	PASS	AF=1;AO=54;DP=55;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0518147;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.35;QD=56.9218;RBI=0.0536332;REFB=0;REVB=0.0138476;RO=0;SAF=30;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000995518;OID=.;OPOS=9122948;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:55:57:0:0:54:57:1:24:30:0:0:25:32:0:0
chr3	9406836	.	T	C	1208.81	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0057146;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.3924;QD=61.2057;RBI=0.0125944;REFB=0;REVB=0.0112233;RO=0;SAF=43;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.96936e-05;OID=.;OPOS=9406836;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:36:43:0:0:36:43:0:0
chr3	9422210	.	T	C	1474.74	PASS	AF=0.989474;AO=94;DP=95;FAO=94;FDP=95;FR=.;FRO=1;FSAF=56;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00528236;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=113.558;QD=62.0944;RBI=0.0235155;REFB=-0.11996;REVB=0.0229146;RO=1;SAF=56;SAR=38;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00839243;STB=0.504424;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.00047316;OID=.;OPOS=9422210;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:95:95:1:1:94:94:0.989474:38:56:1:0:38:56:1:0
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chr3	9867625	.	C	T	422.21	PASS	AF=0.842105;AO=32;DP=38;FAO=32;FDP=38;FR=.;FRO=6;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.00811247;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.486;QD=44.443;RBI=0.0115983;REFB=-0.0433559;REVB=-0.00828911;RO=5;SAF=16;SAR=16;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.025092;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0053302;OID=.;OPOS=9867625;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:38:38:5:6:32:32:0.842105:16:16:3:2:16:16:3:3
chr3	9871030	.	T	G	208.47	PASS	AF=0.9;AO=18;DP=20;FAO=18;FDP=20;FR=.;FRO=2;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00560346;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.656;QD=41.6947;RBI=0.00908064;REFB=-0.0557405;REVB=-0.00714558;RO=2;SAF=4;SAR=14;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.070175;STB=0.538417;STBP=0.374;TYPE=snp;VARB=0.00254792;OID=.;OPOS=9871030;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:20:20:2:2:18:18:0.9:14:4:1:1:14:4:1:1
chr3	9876919	.	G	A	559.76	PASS	AF=0.738462;AO=48;DP=65;FAO=48;FDP=65;FR=.;FRO=17;FSAF=19;FSAR=29;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=-0.0250875;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=92.6331;QD=34.447;RBI=0.0252844;REFB=-0.0567859;REVB=-0.00314934;RO=17;SAF=19;SAR=29;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0375696;STB=0.520257;STBP=0.615;TYPE=snp;VARB=0.0109211;OID=.;OPOS=9876919;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:17:17:48:48:0.738462:29:19:8:9:29:19:8:9
chr3	9876987	.	G	A	462.9	PASS	AF=0.72;AO=36;DP=50;FAO=36;FDP=50;FR=.;FRO=14;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=-0.0454699;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.0913;QD=37.0321;RBI=0.0456647;REFB=-0.0112822;REVB=-0.00421322;RO=14;SAF=13;SAR=23;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0427497;STB=0.523158;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=0.00220868;OID=.;OPOS=9876987;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:14:14:36:36:0.72:23:13:4:10:23:13:4:10
chr3	9908749	.	G	C	699.76	PASS	AF=0.980392;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00893741;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.5935;QD=54.8829;RBI=0.0595139;REFB=-0.137091;REVB=0.058839;RO=1;SAF=35;SAR=15;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0303442;STB=0.516122;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.00512472;OID=.;OPOS=9908749;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:51:51:1:1:50:50:0.980392:15:35:0:1:15:35:0:1
chr3	9934605	.	T	C	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00998294;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.318;QD=48.7373;RBI=0.0609438;REFB=0;REVB=0.0601206;RO=0;SAF=8;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000348686;OID=.;OPOS=9934605;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:9:8:0:0:9:8:0:0
chr3	9970031	.	A	G	109.05	PASS	AF=0.916667;AO=11;DP=12;FAO=11;FDP=12;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0354386;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.8264;QD=36.3483;RBI=0.0530914;REFB=0.00850979;REVB=-0.0395322;RO=1;SAF=5;SAR=6;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0690901;STB=0.538392;STBP=0.547;TYPE=snp;VARB=-0.00184544;OID=.;OPOS=9970031;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:12:12:1:1:11:11:0.916667:6:5:0:1:6:5:0:1
chr3	9975247	.	C	G	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00955339;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.293;QD=35.5759;RBI=0.0109844;REFB=0;REVB=-0.00542121;RO=0;SAF=5;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.27427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.60776e-05;OID=.;OPOS=9975247;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:2:5:0:0:2:5:0:0
chr3	9976159	.	A	G	769.95	PASS	AF=1;AO=48;DP=49;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0299911;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.9542;QD=64.1626;RBI=0.0331771;REFB=0;REVB=-0.0141864;RO=0;SAF=34;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.40807e-05;OID=.;OPOS=9976159;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:48:0:0:48:48:1:14:34:0:0:14:34:0:0
chr3	9985656	.	C	T	1058.84	PASS	AF=0.79;AO=78;DP=100;FAO=79;FDP=100;FR=.;FRO=21;FSAF=38;FSAR=41;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=0.00144959;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.994;QD=42.3536;RBI=0.00221428;REFB=-0.0057073;REVB=0.00167383;RO=20;SAF=37;SAR=41;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0670923;STB=0.538918;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=0.00104246;OID=.;OPOS=9985656;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:20:21:78:79:0.79:41:37:13:7:41:38:14:7
chr3	9990800	.	G	C	294.16	PASS	AF=0.735294;AO=25;DP=34;FAO=25;FDP=34;FR=.;FRO=9;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.0102494;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.5087;QD=34.6073;RBI=0.0124746;REFB=-0.0411453;REVB=0.00711089;RO=9;SAF=9;SAR=16;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0140785;STB=0.507686;STBP=0.876;TYPE=snp;VARB=0.016993;OID=.;OPOS=9990800;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:34:34:9:9:25:25:0.735294:16:9:3:6:16:9:3:6
chr3	9991101	.	C	G	169.59	PASS	AF=0.8;AO=16;DP=20;FAO=16;FDP=20;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0172233;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.236;QD=33.9183;RBI=0.0204692;REFB=-0.0262049;REVB=0.011061;RO=4;SAF=4;SAR=12;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112675;STB=0.562418;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=0.00601618;OID=.;OPOS=9991101;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:20:20:20:4:4:16:16:0.8:12:4:2:2:12:4:2:2
chr3	9991163	.	A	G	132.97	PASS	AF=0.866667;AO=13;DP=15;FAO=13;FDP=15;FR=.;FRO=2;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0385824;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.5648;QD=35.458;RBI=0.0737889;REFB=0.0290776;REVB=-0.0628983;RO=2;SAF=8;SAR=5;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.029065;STB=0.516104;STBP=0.864;TYPE=snp;VARB=-0.0100306;OID=.;OPOS=9991163;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:15:15:2:2:13:13:0.866667:5:8:1:1:5:8:1:1
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chr3	10044457	.	C	T	208.42	PASS	AF=0.76;AO=18;DP=25;FAO=19;FDP=25;FR=.;FRO=6;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0.0582738;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.4578;QD=33.3464;RBI=0.0585031;REFB=-0.03922;REVB=-0.00517511;RO=7;SAF=13;SAR=5;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.308678;STB=0.687293;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0161985;OID=.;OPOS=10044457;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:25:25:7:6:18:19:0.76:5:13:1:6:5:14:0:6
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chr3	10088404	.	C	T	45.97	PASS	AF=0.266667;AO=8;DP=30;FAO=8;FDP=30;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.0352187;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.668;QD=6.12926;RBI=0.0364419;REFB=-0.0397737;REVB=0.00936229;RO=22;SAF=6;SAR=2;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.351349;STB=0.723561;STBP=0.163;TYPE=snp;VARB=0.0548413;OID=.;OPOS=10088404;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:30:30:22:22:8:8:0.266667:2:6:10:12:2:6:10:12
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chr3	10242070	.	A	G	478.28	PASS	AF=0.693548;AO=43;DP=62;FAO=43;FDP=62;FR=.;FRO=19;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=-0.012854;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=88.689;QD=30.8567;RBI=0.0245034;REFB=-0.0130755;REVB=-0.0208612;RO=19;SAF=25;SAR=18;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0293056;STB=0.515872;STBP=0.725;TYPE=snp;VARB=0.00369742;OID=.;OPOS=10242070;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:19:19:43:43:0.693548:18:25:12:7:18:25:12:7
chr3	10276163	.	T	A	1033.4	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0188314;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.952;QD=59.0514;RBI=0.0254049;REFB=0;REVB=0.0170525;RO=0;SAF=30;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00070866;OID=.;OPOS=10276163;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:68:70:0:0:68:70:1:38:30:0:0:38:32:0:0
chr3	10302056	.	A	G	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00125467;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.72;QD=42.1823;RBI=0.0293021;REFB=0;REVB=0.0292752;RO=0;SAF=3;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000880832;OID=.;OPOS=10302056;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:8:3:0:0:8:3:0:0
chr3	10302172	.	G	A	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00390818;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.886;QD=45.8043;RBI=0.0155913;REFB=0;REVB=0.0150935;RO=0;SAF=6;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.23043e-05;OID=.;OPOS=10302172;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:8:6:0:0:8:6:0:0
chr3	10320592	.	T	C	57.1	PASS	AF=0.150685;AO=11;DP=73;FAO=11;FDP=73;FR=.;FRO=62;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=31;FSRR=31;FWDB=-0.0181999;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.126;QD=3.12886;RBI=0.0182003;REFB=-0.00189767;REVB=-0.000124637;RO=62;SAF=7;SAR=4;SRF=31;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169927;STB=0.616914;STBP=0.425;TYPE=snp;VARB=0.0349906;OID=.;OPOS=10320592;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:73:73:62:62:11:11:0.150685:4:7:31:31:4:7:31:31
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chr3	10353626	.	C	T	1146.74	PASS	AF=0.854167;AO=82;DP=96;FAO=82;FDP=96;FR=.;FRO=14;FSAF=31;FSAR=51;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.0100466;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.105;QD=47.781;RBI=0.01829;REFB=-0.000396651;REVB=0.0152837;RO=14;SAF=31;SAR=51;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0352325;STB=0.518732;STBP=0.374;TYPE=snp;VARB=7.79935e-05;OID=.;OPOS=10353626;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:96:96:14:14:82:82:0.854167:51:31:7:7:51:31:7:7
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chr3	10379923	.	C	T	192.88	PASS	AF=0.206667;AO=31;DP=150;FAO=31;FDP=150;FR=.;FRO=119;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=64;FSRR=55;FWDB=-0.00754185;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=233.432;QD=5.14349;RBI=0.0122182;REFB=-0.00866795;REVB=0.00961271;RO=119;SAF=15;SAR=16;SRF=64;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0686212;STB=0.542695;STBP=0.593;TYPE=snp;VARB=0.0312995;OID=.;OPOS=10379923;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:150:150:119:119:31:31:0.206667:16:15:64:55:16:15:64:55
chr3	10413601	.	G	A	1196.08	PASS	AF=0.806723;AO=89;DP=114;FAO=96;FDP=119;FR=.;FRO=23;FSAF=39;FSAR=57;FSRF=6;FSRR=17;FWDB=0.0402908;FXX=0.0403193;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.5741;QD=40.2044;RBI=0.0562263;REFB=-0.0187858;REVB=0.039218;RO=14;SAF=38;SAR=51;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0190479;STB=0.529438;STBP=0.2;TYPE=snp;VARB=0.00840891;OID=.;OPOS=10413601;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:114:119:14:23:89:96:0.806723:51:38:7:7:57:39:6:17
chr3	10413715	.	G	A	306.58	PASS	AF=0.6;AO=27;DP=45;FAO=27;FDP=45;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.00108619;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=254.815;QD=27.2513;RBI=0.004392;REFB=0.00934159;REVB=0.00425557;RO=14;SAF=9;SAR=18;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.033762;STB=0.54835;STBP=0.444;TYPE=snp;VARB=-0.00649779;OID=.;OPOS=10413715;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:14:18:27:27:0.6:18:9:4:10:18:9:8:10
chr3	10420087	.	T	C	417.89	PASS	AF=0.820513;AO=32;DP=39;FAO=32;FDP=39;FR=.;FRO=7;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.00745727;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.394;QD=42.86;RBI=0.0339813;REFB=-0.0278881;REVB=0.033153;RO=7;SAF=14;SAR=18;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0030159;STB=0.501628;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00741507;OID=.;OPOS=10420087;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:39:39:7:7:32:32:0.820513:18:14:3:4:18:14:3:4
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chr3	11302933	.	A	G	521.52	PASS	AF=1;AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00249382;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.5953;QD=59.6022;RBI=0.025899;REFB=0;REVB=0.0257786;RO=0;SAF=20;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000220994;OID=.;OPOS=11302933;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:35:0:0:35:35:1:15:20:0:0:15:20:0:0
chr3	11303000	.	TG	T	33.36	PASS	AF=0.333333;AO=14;DP=33;FAO=11;FDP=33;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=-0.194038;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=7.98739;QD=4.04349;RBI=0.210344;REFB=-0.110623;REVB=0.0812035;RO=15;SAF=10;SAR=4;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0.334694;SSSB=0.239094;STB=0.530671;STBP=0.813;TYPE=del;VARB=0.111997;OID=.;OPOS=11303001;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.333333:14:33:11:33:22:6:5:13:9:33:15:10:4:7:8
chr3	11303874	.	T	C	990.51	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0185811;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.318;QD=59.1351;RBI=0.0186006;REFB=0;REVB=0.000851402;RO=0;SAF=39;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.74073e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.76132e-05;OID=.;OPOS=11303874;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:28:39:0:0:28:39:0:0
chr3	11596348	.	C	T	548.05	PASS	AF=0.734375;AO=38;DP=66;FAO=47;FDP=64;FR=.,HEALED;FRO=17;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.0318345;FXX=0.0153822;HRUN=4;LEN=1;MLLD=116.404;QD=34.2528;RBI=0.0362726;REFB=-0.0212451;REVB=0.0173858;RO=18;SAF=17;SAR=21;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00174733;STB=0.537676;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.00366939;OID=.;OPOS=11596348;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:64:18:17:38:47:0.734375:21:17:8:10:21:26:7:10
chr3	11606490	.	G	A	55.42	PASS	AF=0.363636;AO=8;DP=22;FAO=8;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=-0.00460745;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.707;QD=10.0755;RBI=0.024329;REFB=-0.00476943;REVB=-0.0238888;RO=14;SAF=6;SAR=2;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.522846;STB=0.811807;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.00177266;OID=.;OPOS=11606490;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:22:22:14:14:8:8:0.363636:2:6:3:11:2:6:3:11
chr3	11643465	.	T	C	405.96	PASS	AF=1;AO=28;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0108707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.832;QD=55.994;RBI=0.031863;REFB=0;REVB=0.0299513;RO=0;SAF=11;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.31638e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000903885;OID=.;OPOS=11643465;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:28:29:1:17:11:0:0:18:11:0:0
chr3	11880760	.	T	C	310.3	PASS	AF=0.742857;AO=26;DP=35;FAO=26;FDP=35;FR=.;FRO=9;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.00991976;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.737;QD=35.4631;RBI=0.0100666;REFB=0.0101759;REVB=0.00171308;RO=9;SAF=9;SAR=17;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0502359;STB=0.527425;STBP=0.627;TYPE=snp;VARB=-0.003079;OID=.;OPOS=11880760;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:35:35:9:9:26:26:0.742857:17:9:4:5:17:9:4:5
chr3	11887991	.	C	G	826.34	PASS	AF=0.70297;AO=71;DP=99;FAO=71;FDP=101;FR=.;FRO=30;FSAF=38;FSAR=33;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=0.024541;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.39;QD=32.7261;RBI=0.0247041;REFB=-0.0216426;REVB=0.00283365;RO=28;SAF=38;SAR=33;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.018596;STB=0.50056;STBP=0.986;TYPE=snp;VARB=0.0107105;OID=.;OPOS=11887991;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:101:28:30:71:71:0.70297:33:38:14:14:33:38:16:14
chr3	11994492	.	C	CT	253.4	PASS	AF=1;AO=3;DP=24;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.121709;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=226.706;QD=44.0692;RBI=0.122633;REFB=0;REVB=0.0150225;RO=21;SAF=0;SAR=3;SRF=18;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.763432;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00079382;OID=.;OPOS=11994493;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:3:24:23:23:0:17:6:0:0:4:21:0:3:18:3
chr3	11994493	.	C	T	235.39	PASS	AF=0.869565;AO=20;DP=23;FAO=20;FDP=23;FR=.;FRO=3;FSAF=17;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0330911;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=288.036;QD=40.9366;RBI=0.0401924;REFB=-0.0981299;REVB=0.0228125;RO=3;SAF=17;SAR=3;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.301656;STB=0.666473;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.00166952;OID=.;OPOS=11994493;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:23:23:3:3:20:20:0.869565:3:17:0:3:3:17:0:3
chr3	12046076	.	T	C	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.908;QD=48.736;RBI=0.000150111;REFB=0;REVB=0.000150111;RO=0;SAF=0;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.57949e-06;OID=.;OPOS=12046076;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:17:0:0:0:17:0:0:0
chr3	12229015	.	A	G	636.18	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0164685;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.578;QD=62.066;RBI=0.0191061;REFB=0;REVB=-0.00968673;RO=0;SAF=13;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00026829;OID=.;OPOS=12229015;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:28:13:0:0:28:13:0:0
chr3	12232074	.	A	G	804.97	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0189188;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.003;QD=64.3973;RBI=0.0214619;REFB=0;REVB=-0.0101337;RO=0;SAF=24;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.10374e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.31801e-05;OID=.;OPOS=12232074;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:26:24:0:0:26:24:0:0
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chr3	12856856	.	A	G	194.63	PASS	AF=0.645161;AO=18;DP=29;FAO=20;FDP=31;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=-0.0108377;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.351;QD=25.1132;RBI=0.0156341;REFB=-0.0148829;REVB=0.0112681;RO=10;SAF=6;SAR=12;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114781;STB=0.595645;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.0111823;OID=.;OPOS=12856856;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:29:31:10:11:18:20:0.645161:12:6:5:5:14:6:6:5
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chr3	13612020	.	T	C	553.09	PASS	AF=0.716418;AO=48;DP=67;FAO=48;FDP=67;FR=.;FRO=19;FSAF=31;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.0395102;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.616;QD=33.0201;RBI=0.0395295;REFB=-0.0543076;REVB=-0.00123422;RO=19;SAF=31;SAR=17;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0378959;STB=0.520475;STBP=0.618;TYPE=snp;VARB=0.0264992;OID=.;OPOS=13612020;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:19:19:48:48:0.716418:17:31:11:8:17:31:11:8
chr3	13612286	.	A	G	34.54	PASS	AF=0.176471;AO=6;DP=34;FAO=6;FDP=34;FR=.;FRO=28;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=19;FWDB=0.00466332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.76;QD=4.06352;RBI=0.0553024;REFB=-0.0177194;REVB=-0.0551054;RO=28;SAF=2;SAR=4;SRF=9;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0160416;STB=0.511074;STBP=0.959;TYPE=snp;VARB=0.0545313;OID=.;OPOS=13612286;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:34:34:28:28:6:6:0.176471:4:2:9:19:4:2:9:19
chr3	13612296	.	C	T	438.38	PASS	AF=0.914286;AO=32;DP=35;FAO=32;FDP=35;FR=.;FRO=3;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0290108;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.8669;QD=50.1001;RBI=0.0309562;REFB=0.000443498;REVB=0.010801;RO=3;SAF=12;SAR=20;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00710681;STB=0.503814;STBP=0.959;TYPE=snp;VARB=0.000666255;OID=.;OPOS=13612296;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:35:35:3:3:32:32:0.914286:20:12:1:2:20:12:1:2
chr3	13612936	.	A	G	634.26	PASS	AF=0.662651;AO=54;DP=82;FAO=55;FDP=83;FR=.;FRO=28;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=0.00210571;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.247;QD=30.5668;RBI=0.0112568;REFB=-0.038403;REVB=-0.0110581;RO=27;SAF=30;SAR=24;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0686557;STB=0.539459;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=0.0167716;OID=.;OPOS=13612936;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:83:27:28:54:55:0.662651:24:30:12:15:25:30:12:16
chr3	13670481	.	A	G	769.34	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0162475;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.7228;QD=56.9881;RBI=0.0276714;REFB=0;REVB=0.0223992;RO=0;SAF=25;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.57427e-05;OID=.;OPOS=13670481;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:29:25:0:0:29:25:0:0
chr3	13670536	.	A	G	827.65	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.10328;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=44.6942;QD=57.0793;RBI=0.110892;REFB=0;REVB=-0.0403769;RO=0;SAF=24;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.31293e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000586485;OID=.;OPOS=13670536;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:34:24:0:0:34:24:0:0
chr3	13670776	.	T	C	351.66	PASS	AF=1;AO=15;DP=25;FAO=27;FDP=27;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0156293;FXX=0.0357015;HRUN=3;LEN=1;MLLD=144.366;QD=52.0981;RBI=0.0457922;REFB=0;REVB=0.0430424;RO=0;SAF=8;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000375111;OID=.;OPOS=13670776;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:27:0:0:15:27:1:7:8:0:0:14:13:0:0
chr3	13679203	.	G	A	881.4	PASS	AF=0.984127;AO=61;DP=62;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.030491;FXX=0.0454477;HRUN=5;LEN=1;MLLD=166.023;QD=55.9621;RBI=0.0519048;REFB=-0.115788;REVB=0.0420049;RO=1;SAF=30;SAR=31;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.014984;STB=0.50769;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=0.00103249;OID=.;OPOS=13679203;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:62:63:1:1:61:62:0.984127:31:30:0:1:32:30:0:1
chr3	13679335	.	C	T	632.26	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0541447;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.218;QD=61.6836;RBI=0.0595206;REFB=0;REVB=0.0247195;RO=0;SAF=14;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000245742;OID=.;OPOS=13679335;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:27:14:0:0:27:14:0:0
chr3	13689452	.	C	T	614.07	PASS	AF=0.86;AO=43;DP=50;FAO=43;FDP=50;FR=.;FRO=7;FSAF=28;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.006812;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.0336;QD=49.1254;RBI=0.0325281;REFB=-0.0699271;REVB=0.0318068;RO=7;SAF=28;SAR=15;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139371;STB=0.574744;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0139389;OID=.;OPOS=13689452;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:40:50:50:7:7:43:43:0.86:15:28:1:6:15:28:1:6
chr3	13896140	.	A	G	91.44	PASS	AF=0.177778;AO=16;DP=90;FAO=16;FDP=90;FR=.;FRO=74;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=35;FSRR=39;FWDB=-0.0194586;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.631;QD=4.06422;RBI=0.0204353;REFB=-0.00466607;REVB=-0.00624229;RO=73;SAF=8;SAR=8;SRF=34;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0431321;STB=0.522195;STBP=0.865;TYPE=snp;VARB=0.0190922;OID=.;OPOS=13896140;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:91:90:90:73:74:16:16:0.177778:8:8:34:39:8:8:35:39
chr3	13896284	.	C	T	112.95	PASS	AF=0.175;AO=20;DP=119;FAO=21;FDP=120;FR=.;FRO=99;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=62;FSRR=37;FWDB=0.0182448;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.913;QD=3.76511;RBI=0.0215005;REFB=-0.0014521;REVB=-0.0113752;RO=99;SAF=9;SAR=11;SRF=62;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.222372;STB=0.62253;STBP=0.233;TYPE=snp;VARB=0.00746277;OID=.;OPOS=13896284;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:120:99:99:20:21:0.175:11:9:62:37:11:10:62:37
chr3	14106499	.	G	A	727.93	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0189628;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.664;QD=63.2978;RBI=0.0208648;REFB=0;REVB=0.00870364;RO=0;SAF=27;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000188712;OID=.;OPOS=14106499;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:19:27:0:0:19:27:0:0
chr3	14174427	.	A	T	471.92	PASS	AF=0.970588;AO=33;DP=34;FAO=33;FDP=34;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0130814;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=296.068;QD=55.5196;RBI=0.019428;REFB=0.188435;REVB=-0.014364;RO=0;SAF=18;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.64315e-08;STB=0.516119;STBP=0.324;TYPE=snp;VARB=-0.000580216;OID=.;OPOS=14174427;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:34:34:0:1:33:33:0.970588:15:18:0:0:15:18:0:1
chr3	14175262	.	T	C	472.57	PASS	AF=1;AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0160927;FXX=0.0588062;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.468;QD=59.071;RBI=0.0386516;REFB=0;REVB=0.0351422;RO=0;SAF=18;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.87096e-05;OID=.;OPOS=14175262;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:32:0:0:32:32:1:14:18:0:0:14:18:0:0
chr3	14184056	.	AAAAACAAAACA	AAAAAC,AAAAACA,AAAAACAA	534.06	PASS	AF=0.04,0.92,0;AO=11,25,6;DP=54;FAO=2,46,0;FDP=50;FR=.;FRO=2;FSAF=0,37,0;FSAR=2,9,0;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00484493,0.00491794,0.00476307;FXX=0.0740604;HRUN=4,4,4;LEN=6,5,4;MLLD=257.182,261.56,256.644;QD=42.725;RBI=0.00915159,0.0140386,0.016337;REFB=0.00193561,-0.00273696,-0.00635479;REVB=0.0077639,0.013149,0.0156272;RO=2;SAF=8,20,3;SAR=3,5,3;SRF=2;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.0998761,-0.0441872,-0.215133;STB=0.994977,0.513152,0.5;STBP=0.131,0.588,1;TYPE=del,del,del;VARB=0.00376651,0.00136075,-0.0172564;OID=.,.,.;OPOS=14184062,14184057,14184063;OREF=AAAACA,AAAAC,AAAC;OALT=-,-,-;OMAPALT=AAAAAC,AAAAACA,AAAAACAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0.04,0.92,0:11,25,6:54:2,46,0:50:2:0,37,0:2,9,0:2:0:4:2:8,20,3:3,5,3:2:0
chr3	14187449	.	G	T	735.07	PASS	AF=0.816901;AO=58;DP=71;FAO=58;FDP=71;FR=.;FRO=13;FSAF=33;FSAR=25;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=0.0144079;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.245;QD=41.4125;RBI=0.0159555;REFB=-0.0384943;REVB=0.00685498;RO=13;SAF=33;SAR=25;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0637186;STB=0.534074;STBP=0.27;TYPE=snp;VARB=0.00780008;OID=.;OPOS=14187449;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:71:71:13:13:58:58:0.816901:25:33:5:8:25:33:5:8
chr3	14197987	.	A	T	223.22	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0225794;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.188;QD=49.6042;RBI=0.0530752;REFB=0;REVB=0.0480328;RO=0;SAF=12;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000365798;OID=.;OPOS=14197987;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:18:0:0:17:18:1:5:12:0:0:6:12:0:0
chr3	14199887	.	G	A	303.56	PASS	AF=0.806452;AO=25;DP=31;FAO=25;FDP=31;FR=.;FRO=6;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.00204359;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.4018;QD=39.1695;RBI=0.0619966;REFB=-0.0520946;REVB=-0.0619629;RO=6;SAF=14;SAR=11;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0216022;STB=0.51174;STBP=0.81;TYPE=snp;VARB=0.0112983;OID=.;OPOS=14199887;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:31:31:6:6:25:25:0.806452:11:14:3:3:11:14:3:3
chr3	14436184	.	GT	G	1040.84	PASS	AF=1;AO=66;DP=67;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0351738;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.266;QD=57.8242;RBI=0.0421135;REFB=0;REVB=0.0231592;RO=0;SAF=34;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.75585e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00104068;OID=.;OPOS=14436185;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:66:67:72:72:0:40:32:0:0:6:0:34:32:0:0
chr3	14485484	.	C	A	240.3	PASS	AF=0.909091;AO=20;DP=22;FAO=20;FDP=22;FR=.;FRO=2;FSAF=2;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0302026;FXX=0;HRUN=9;LEN=1;MLLD=262.82;QD=43.6903;RBI=0.0302539;REFB=-0.0537933;REVB=0.00176129;RO=0;SAF=2;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.19193e-08;STB=0.52629;STBP=0.631;TYPE=snp;VARB=0.000138026;OID=.;OPOS=14485484;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:22:22:0:2:20:20:0.909091:18:2:0:0:18:2:0:2
chr3	14526538	.	G	A	343.88	PASS	AF=0.21673;AO=57;DP=262;FAO=57;FDP=263;FR=.;FRO=206;FSAF=28;FSAR=29;FSRF=103;FSRR=103;FWDB=0.0145942;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.919;QD=5.23014;RBI=0.0199548;REFB=0.00428493;REVB=0.013609;RO=205;SAF=28;SAR=29;SRF=102;SRR=103;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00810198;STB=0.506869;STBP=0.914;TYPE=snp;VARB=-0.0146152;OID=.;OPOS=14526538;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:262:263:205:206:57:57:0.21673:29:28:102:103:29:28:103:103
chr3	14526656	.	A	G	30.59	PASS	AF=0.416667;AO=5;DP=12;FAO=5;FDP=12;FR=.;FRO=7;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0330175;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.603;QD=10.1982;RBI=0.0468955;REFB=-0.0323253;REVB=0.0333021;RO=6;SAF=1;SAR=4;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.429493;STB=0.7397;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=0.017251;OID=.;OPOS=14526656;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:12:12:6:7:5:5:0.416667:4:1:4:2:4:1:4:3
chr3	14547198	.	G	A	86.86	PASS	AF=0.714286;AO=10;DP=14;FAO=10;FDP=14;FR=.;FRO=4;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.057184;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.033;QD=24.8164;RBI=0.0597256;REFB=-0.0758569;REVB=0.0172377;RO=3;SAF=3;SAR=7;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157689;STB=0.610916;STBP=0.34;TYPE=snp;VARB=0.0946622;OID=.;OPOS=14547198;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:14:14:3:4:10:10:0.714286:7:3:0:3:7:3:0:4
chr3	14551444	.	A	G	1116.44	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0123892;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.4579;QD=60.3481;RBI=0.0193412;REFB=0;REVB=0.0148523;RO=0;SAF=23;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.24442e-06;OID=.;OPOS=14551444;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:51:23:0:0:51:23:0:0
chr3	14552994	.	A	G	308.26	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0395501;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=59.7942;QD=51.3772;RBI=0.0395694;REFB=0;REVB=0.00123617;RO=0;SAF=13;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2029e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00896025;OID=.;OPOS=14552994;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:24:0:0:22:24:1:9:13:0:0:9:15:0:0
chr3	14555216	.	T	C	613.36	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0682411;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.5839;QD=61.3362;RBI=0.0682436;REFB=0;REVB=0.000585088;RO=0;SAF=23;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.4817e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000824289;OID=.;OPOS=14555216;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:17:23:0:0:17:23:0:0
chr3	14555811	.	A	G	281.6	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0510736;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.7294;QD=51.2008;RBI=0.0659949;REFB=0;REVB=0.0417948;RO=0;SAF=12;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000929379;OID=.;OPOS=14555811;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:22:0:0:21:22:1:9:12:0:0:9:13:0:0
chr3	14561627	.	A	AG	597.25	PASS	AF=1;AO=50;DP=54;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.276399;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=22.9589;QD=45.9426;RBI=0.277804;REFB=0;REVB=-0.0278967;RO=4;SAF=24;SAR=26;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00278596;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00617233;OID=.;OPOS=14561628;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:50:54:52:52:0:25:27:0:0:11:4:24:26:2:2
chr3	14563237	.	G	A	573.02	PASS	AF=0.836735;AO=41;DP=49;FAO=41;FDP=49;FR=.;FRO=8;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.00634608;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.851;QD=46.7775;RBI=0.00634633;REFB=-0.0344568;REVB=5.61819e-05;RO=8;SAF=17;SAR=24;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0521055;STB=0.527937;STBP=0.406;TYPE=snp;VARB=0.0110524;OID=.;OPOS=14563237;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:49:49:49:8:8:41:41:0.836735:24:17:2:6:24:17:2:6
chr3	14712473	.	G	A	826.33	PASS	AF=0.764706;AO=64;DP=86;FAO=65;FDP=85;FR=.;FRO=20;FSAF=33;FSAR=32;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=-0.00802885;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.403;QD=38.8863;RBI=0.0120431;REFB=0.026503;REVB=-0.00897624;RO=20;SAF=32;SAR=32;SRF=6;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0888711;STB=0.548792;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=-0.00525126;OID=.;OPOS=14712473;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:85:20:20:64:65:0.764706:32:32:6:14:32:33:6:14
chr3	14724413	.	G	A	544.09	PASS	AF=0.734375;AO=47;DP=64;FAO=47;FDP=64;FR=.;FRO=17;FSAF=21;FSAR=26;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.0381182;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.9478;QD=34.0053;RBI=0.0407141;REFB=-0.0539489;REVB=-0.0143052;RO=16;SAF=21;SAR=26;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0547774;STB=0.522079;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=0.0122279;OID=.;OPOS=14724413;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:16:17:47:47:0.734375:26:21:9:7:26:21:9:8
chr3	14768534	.	A	G	480.03	PASS	AF=0.875;AO=35;DP=40;FAO=35;FDP=40;FR=.;FRO=5;FSAF=11;FSAR=24;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0333232;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.561;QD=48.0034;RBI=0.0351662;REFB=-0.0168149;REVB=-0.0112351;RO=5;SAF=11;SAR=24;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171898;STB=0.592538;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.00218332;OID=.;OPOS=14768534;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:25:40:40:5:5:35:35:0.875:24:11:5:0:24:11:5:0
chr3	14798976	.	G	A	201.23	PASS	AF=0.180905;AO=36;DP=199;FAO=36;FDP=199;FR=.;FRO=163;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=74;FSRR=89;FWDB=-0.0412253;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.941;QD=4.04479;RBI=0.0413475;REFB=-0.00302805;REVB=0.00317693;RO=163;SAF=14;SAR=22;SRF=74;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.085681;STB=0.554697;STBP=0.491;TYPE=snp;VARB=0.0300049;OID=.;OPOS=14798976;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:199:199:163:163:36:36:0.180905:22:14:74:89:22:14:74:89
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chr3	15492786	.	T	A	67.81	PASS	AF=0.2;AO=10;DP=50;FAO=10;FDP=50;FR=.;FRO=40;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=25;FSRR=15;FWDB=-0.0237031;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.438;QD=5.42477;RBI=0.0313954;REFB=-0.00136188;REVB=-0.0205872;RO=40;SAF=3;SAR=7;SRF=25;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.385014;STB=0.747625;STBP=0.125;TYPE=snp;VARB=0.00648064;OID=.;OPOS=15492786;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:50:50:40:40:10:10:0.2:7:3:25:15:7:3:25:15
chr3	15492807	.	G	A	78.15	PASS	AF=0.22;AO=11;DP=50;FAO=11;FDP=50;FR=.;FRO=39;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=-0.0435789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.0196;QD=6.25206;RBI=0.0438694;REFB=-0.0138238;REVB=0.00504022;RO=39;SAF=4;SAR=7;SRF=23;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.271508;STB=0.672293;STBP=0.218;TYPE=snp;VARB=0.044261;OID=.;OPOS=15492807;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:50:50:39:39:11:11:0.22:7:4:23:16:7:4:23:16
chr3	15509327	.	C	G	1514.36	PASS	AF=0.990385;AO=102;DP=104;FAO=103;FDP=104;FR=.;FRO=1;FSAF=53;FSAR=50;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0120454;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.659;QD=58.2447;RBI=0.0423393;REFB=-0.141797;REVB=0.0405897;RO=1;SAF=53;SAR=49;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00886831;STB=0.504672;STBP=0.466;TYPE=snp;VARB=0.000566226;OID=.;OPOS=15509327;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:104:104:1:1:102:103:0.990385:49:53:1:0:50:53:1:0
chr3	15516481	.	T	C	49.26	PASS	AF=0.147541;AO=9;DP=61;FAO=9;FDP=61;FR=.;FRO=52;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=18;FSRR=34;FWDB=-0.00765198;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=69.6651;QD=3.23034;RBI=0.0102199;REFB=0.00177877;REVB=-0.00677443;RO=52;SAF=4;SAR=5;SRF=18;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125485;STB=0.586283;STBP=0.584;TYPE=snp;VARB=-0.0133473;OID=.;OPOS=15516481;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:49:61:61:52:52:9:9:0.147541:5:4:18:34:5:4:18:34
chr3	15548131	.	A	G	465.14	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0069193;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=194.692;QD=58.1421;RBI=0.0200252;REFB=0;REVB=-0.0187918;RO=0;SAF=15;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.63265e-05;OID=.;OPOS=15548131;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:17:15:0:0:17:15:0:0
chr3	15548227	.	G	A	59.99	PASS	AF=0.141176;AO=12;DP=86;FAO=12;FDP=85;FR=.;FRO=73;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=40;FSRR=33;FWDB=-0.0172732;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.637;QD=2.82308;RBI=0.0175491;REFB=0.00360579;REVB=0.00309984;RO=72;SAF=9;SAR=3;SRF=39;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.273401;STB=0.687567;STBP=0.195;TYPE=snp;VARB=-0.0163099;OID=.;OPOS=15548227;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:59:86:85:72:73:12:12:0.141176:3:9:39:33:3:9:40:33
chr3	15643043	.	A	G	393.33	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0310696;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=160.182;QD=56.19;RBI=0.0540149;REFB=0;REVB=0.0441847;RO=0;SAF=15;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000283178;OID=.;OPOS=15643043;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:13:15:0:0:13:15:0:0
chr3	15643175	.	G	A	98.43	PASS	AF=0.254902;AO=13;DP=51;FAO=13;FDP=51;FR=.;FRO=38;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=23;FSRR=15;FWDB=-0.0182425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.269;QD=7.72034;RBI=0.021765;REFB=-0.0123685;REVB=-0.0118712;RO=34;SAF=5;SAR=8;SRF=22;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.302576;STB=0.660527;STBP=0.206;TYPE=snp;VARB=0.0239168;OID=.;OPOS=15643175;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:51:51:34:38:13:13:0.254902:8:5:22:12:8:5:23:15
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chr3	15737689	.	G	A	271.98	PASS	AF=0.666667;AO=24;DP=36;FAO=24;FDP=36;FR=.;FRO=12;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=4.26198e-05;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.8925;QD=30.22;RBI=0.0053351;REFB=-0.0276813;REVB=-0.00533493;RO=12;SAF=12;SAR=12;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101036;STB=0.55551;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.00850542;OID=.;OPOS=15737689;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:36:36:12:12:24:24:0.666667:12:12:4:8:12:12:4:8
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chr3	16535229	.	C	T	426.99	PASS	AF=0.864865;AO=32;DP=37;FAO=32;FDP=37;FR=.;FRO=5;FSAF=9;FSAR=23;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0221858;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.028;QD=46.1611;RBI=0.0223037;REFB=0.0167649;REVB=-0.00228942;RO=5;SAF=9;SAR=23;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0361781;STB=0.519495;STBP=0.626;TYPE=snp;VARB=-0.00254312;OID=.;OPOS=16535229;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:26:37:37:5:5:32:32:0.864865:23:9:2:3:23:9:2:3
chr3	16646745	.	C	G	392.7	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0754828;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.2316;QD=56.0996;RBI=0.0776884;REFB=0;REVB=0.0183802;RO=0;SAF=8;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.06954e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0011772;OID=.;OPOS=16646745;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:28:0:0:27:28:1:19:8:0:0:19:9:0:0
chr3	16926666	.	T	G	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=3.07572e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.65;QD=33.4285;RBI=0.0382869;REFB=0;REVB=0.0382869;RO=0;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00158666;OID=.;OPOS=16926666;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:2:4:0:0:2:4:0:0
chr3	17051328	.	T	C	123.15	PASS	AF=0.923077;AO=12;DP=13;FAO=12;FDP=13;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0305929;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=252.782;QD=37.8929;RBI=0.0360685;REFB=-0.0189941;REVB=0.0191053;RO=1;SAF=4;SAR=8;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0531285;STB=0.529364;STBP=0.634;TYPE=snp;VARB=0.00187649;OID=.;OPOS=17051328;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:13:13:1:1:12:12:0.923077:8:4:0:1:8:4:0:1
chr3	17053499	.	A	G	434.45	PASS	AF=0.73913;AO=34;DP=46;FAO=34;FDP=46;FR=.;FRO=12;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=-0.0216836;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.7701;QD=37.7785;RBI=0.0765989;REFB=0.00956337;REVB=-0.0734657;RO=12;SAF=20;SAR=14;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0816973;STB=0.54421;STBP=0.351;TYPE=snp;VARB=-0.00721557;OID=.;OPOS=17053499;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:46:46:12:12:34:34:0.73913:14:20:9:3:14:20:9:3
chr3	17741409	.	C	G	920.04	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0242973;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.3281;QD=58.4154;RBI=0.029436;REFB=0;REVB=0.0166169;RO=0;SAF=37;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000243664;OID=.;OPOS=17741409;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:26:37:0:0:26:37:0:0
chr3	18055231	.	A	C	868.27	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0375094;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.023;QD=57.8848;RBI=0.0375335;REFB=0;REVB=0.00134614;RO=0;SAF=26;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.85358e-05;OID=.;OPOS=18055231;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:34:26:0:0:34:26:0:0
chr3	18427924	.	G	T	1441.63	PASS	AF=0.760274;AO=111;DP=146;FAO=111;FDP=146;FR=.;FRO=35;FSAF=61;FSAR=50;FSRF=22;FSRR=13;FWDB=0.00182466;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=211.312;QD=39.4968;RBI=0.0184377;REFB=-0.00602462;REVB=0.0183471;RO=35;SAF=61;SAR=50;SRF=22;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.036004;STB=0.519201;STBP=0.427;TYPE=snp;VARB=0.00156297;OID=.;OPOS=18427924;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:146:146:35:35:111:111:0.760274:50:61:22:13:50:61:22:13
chr3	18459188	.	A	G	915.93	PASS	AF=0.795455;AO=70;DP=88;FAO=70;FDP=88;FR=.;FRO=18;FSAF=34;FSAR=36;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=0.0210438;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.625;QD=41.6332;RBI=0.028925;REFB=-0.0404197;REVB=0.0198447;RO=18;SAF=34;SAR=36;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0585031;STB=0.531241;STBP=0.26;TYPE=snp;VARB=0.00756787;OID=.;OPOS=18459188;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:18:18:70:70:0.795455:36:34:6:12:36:34:6:12
chr3	19930130	.	A	T	58.61	PASS	AF=0.150685;AO=11;DP=72;FAO=11;FDP=73;FR=.;FRO=62;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=25;FSRR=37;FWDB=0.00428213;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.252;QD=3.21141;RBI=0.0128744;REFB=-0.00788499;REVB=-0.0121414;RO=59;SAF=5;SAR=6;SRF=24;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0602578;STB=0.544225;STBP=0.766;TYPE=snp;VARB=0.0328176;OID=.;OPOS=19930130;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:58:72:73:59:62:11:11:0.150685:6:5:24:35:6:5:25:37
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chr3	19961330	.	C	T	83.26	PASS	AF=0.220339;AO=13;DP=59;FAO=13;FDP=59;FR=.;FRO=46;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=26;FSRR=20;FWDB=-0.0230367;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.303;QD=5.64502;RBI=0.024416;REFB=-0.00169646;REVB=-0.00809024;RO=44;SAF=5;SAR=8;SRF=25;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.222741;STB=0.638964;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.011468;OID=.;OPOS=19961330;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:59:59:44:46:13:13:0.220339:8:5:25:19:8:5:26:20
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chr3	19992432	.	G	T	127.4	PASS	AF=0.208333;AO=20;DP=96;FAO=20;FDP=96;FR=.;FRO=76;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=48;FSRR=28;FWDB=-0.0060889;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=311.17;QD=5.30843;RBI=0.00640177;REFB=-0.00293746;REVB=0.00197688;RO=76;SAF=7;SAR=13;SRF=48;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.343746;STB=0.713373;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.0121223;OID=.;OPOS=19992432;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:96:76:76:20:20:0.208333:13:7:48:28:13:7:48:28
chr3	20042834	.	C	T	32.28	PASS	AF=0.125;AO=5;DP=48;FAO=6;FDP=48;FR=.;FRO=42;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=25;FWDB=-0.0440127;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.9877;QD=2.6896;RBI=0.0519597;REFB=0.00270333;REVB=-0.0276169;RO=42;SAF=1;SAR=4;SRF=17;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.258834;STB=0.749065;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=-0.024004;OID=.;OPOS=20042834;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:32:48:48:42:42:5:6:0.125:4:1:17:25:5:1:17:25
chr3	20053581	.	C	T	98.25	PASS	AF=0.241935;AO=15;DP=62;FAO=15;FDP=62;FR=.;FRO=47;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=30;FWDB=0.00834732;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.1874;QD=6.33846;RBI=0.0259948;REFB=0.015078;REVB=-0.0246182;RO=44;SAF=6;SAR=9;SRF=16;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0465005;STB=0.530572;STBP=0.823;TYPE=snp;VARB=-0.0471648;OID=.;OPOS=20053581;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:62:62:44:47:15:15:0.241935:9:6:16:28:9:6:17:30
chr3	20310556	.	C	T	58.43	PASS	AF=0.134831;AO=12;DP=89;FAO=12;FDP=89;FR=.;FRO=77;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=30;FSRR=47;FWDB=-0.0403855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.261;QD=2.62597;RBI=0.052136;REFB=-0.00539427;REVB=-0.0329722;RO=77;SAF=9;SAR=3;SRF=30;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.427052;STB=0.793197;STBP=0.056;TYPE=snp;VARB=0.0373985;OID=.;OPOS=20310556;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:58:89:89:77:77:12:12:0.134831:3:9:30:47:3:9:30:47
chr3	21462754	.	A	G	1189.98	PASS	AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00650343;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.522;QD=61.0248;RBI=0.0173964;REFB=0;REVB=0.016135;RO=0;SAF=36;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.43944e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.1171e-05;OID=.;OPOS=21462754;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:42:36:0:0:42:36:0:0
chr3	21462787	.	G	A	1539.99	PASS	AF=0.990476;AO=103;DP=104;FAO=104;FDP=105;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.000463482;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.015;QD=58.6663;RBI=0.0302641;REFB=-0.129837;REVB=0.0302606;RO=1;SAF=46;SAR=57;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00825224;STB=0.504347;STBP=0.483;TYPE=snp;VARB=0.000410351;OID=.;OPOS=21462787;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:104:105:1:1:103:104:0.990476:57:46:0:1:57:47:0:1
chr3	21462880	.	A	G	384.97	PASS	AF=0.7;AO=35;DP=50;FAO=35;FDP=50;FR=.;FRO=15;FSAF=12;FSAR=23;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=-0.00749396;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.059;QD=30.7975;RBI=0.024251;REFB=-0.0271899;REVB=0.0230641;RO=13;SAF=13;SAR=22;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125657;STB=0.600891;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.0115998;OID=.;OPOS=21462880;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:13:15:35:35:0.7:22:13:8:5:23:12:10:5
chr3	23258771	.	A	G	1115.37	PASS	AF=0.8;AO=88;DP=110;FAO=88;FDP=110;FR=.;FRO=22;FSAF=46;FSAR=42;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=0.0194415;FXX=0.0265463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.386;QD=40.5591;RBI=0.0195256;REFB=-0.028753;REVB=0.00181084;RO=22;SAF=46;SAR=42;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0600166;STB=0.53197;STBP=0.193;TYPE=snp;VARB=0.00749385;OID=.;OPOS=23258771;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:110:22:22:88:88:0.8:42:46:15:7:42:46:15:7
chr3	24006477	.	T	A	519.96	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0246941;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.7429;QD=59.4238;RBI=0.0249506;REFB=0;REVB=0.00356883;RO=0;SAF=16;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.1382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000351178;OID=.;OPOS=24006477;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:19:16:0:0:19:16:0:0
chr3	24562877	.	G	T	148.94	PASS	AF=0.17931;AO=26;DP=143;FAO=26;FDP=145;FR=.;FRO=119;FSAF=3;FSAR=23;FSRF=23;FSRR=96;FWDB=-0.0142143;FXX=0.00684885;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.09;QD=4.10868;RBI=0.0149502;REFB=-0.00728322;REVB=-0.00463271;RO=114;SAF=3;SAR=23;SRF=21;SRR=93;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172074;STB=0.626065;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.03284;OID=.;OPOS=24562877;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:143:145:114:119:26:26:0.17931:23:3:21:93:23:3:23:96
chr3	25646268	.	G	A	79.96	PASS	AF=0.181818;AO=14;DP=77;FAO=14;FDP=77;FR=.;FRO=63;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=39;FSRR=24;FWDB=-0.00922599;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.653;QD=4.15354;RBI=0.035284;REFB=-0.00253494;REVB=-0.0340564;RO=58;SAF=10;SAR=4;SRF=35;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15315;STB=0.588103;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.0087061;OID=.;OPOS=25646268;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:79:77:77:58:63:14:14:0.181818:4:10:35:23:4:10:39:24
chr3	25679738	.	T	C	72.75	PASS	AF=0.196721;AO=12;DP=61;FAO=12;FDP=61;FR=.;FRO=49;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=24;FSRR=25;FWDB=-0.0141499;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.284;QD=4.77046;RBI=0.0171026;REFB=-0.00022238;REVB=-0.00960636;RO=48;SAF=3;SAR=9;SRF=24;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.322274;STB=0.703992;STBP=0.138;TYPE=snp;VARB=0.000882623;OID=.;OPOS=25679738;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:61:61:48:49:12:12:0.196721:9:3:24:24:9:3:24:25
chr3	25904828	.	A	G	107.36	PASS	AF=0.223684;AO=17;DP=75;FAO=17;FDP=76;FR=.;FRO=59;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=27;FSRR=32;FWDB=-0.00738005;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.527;QD=5.6504;RBI=0.00878717;REFB=-0.00134978;REVB=0.00476962;RO=58;SAF=8;SAR=9;SRF=27;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00630997;STB=0.510097;STBP=0.947;TYPE=snp;VARB=0.00554164;OID=.;OPOS=25904828;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:76:58:59:17:17:0.223684:9:8:27:31:9:8:27:32
chr3	26751493	.	A	T	178.72	PASS	AF=0.5625;AO=18;DP=32;FAO=18;FDP=32;FR=.;FRO=14;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.0484986;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.5106;QD=22.3401;RBI=0.0484994;REFB=-0.0399064;REVB=-0.000271336;RO=14;SAF=12;SAR=6;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0806589;STB=0.545403;STBP=0.577;TYPE=snp;VARB=0.0292911;OID=.;OPOS=26751493;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:14:14:18:18:0.5625:6:12:8:6:6:12:8:6
chr3	26752237	.	A	G	1658.63	PASS	AF=0.80625;AO=128;DP=160;FAO=129;FDP=160;FR=.;FRO=31;FSAF=63;FSAR=66;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=0.0467475;FXX=0.00621079;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.8354;QD=41.4658;RBI=0.0510631;REFB=-0.0705952;REVB=0.0205455;RO=31;SAF=63;SAR=65;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0385951;STB=0.519648;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=0.0151369;OID=.;OPOS=26752237;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:160:160:31:31:128:129:0.80625:65:63:12:19:66:63:12:19
chr3	27424718	.	A	G	1044.3	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0691249;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.2164;QD=59.6744;RBI=0.0717316;REFB=0;REVB=0.0191618;RO=0;SAF=26;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000677205;OID=.;OPOS=27424718;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:44:26:0:0:44:26:0:0
chr3	28295275	.	ATTTTTTA	AATTTTTA,ATTTTT,ATTTTTA,ATTTTTT	94.26	PASS	AF=0,0.481481,0,0;AO=2,4,7,3;DP=30;FAO=0,13,0,0;FDP=27;FR=.;FRO=14;FSAF=0,12,0,0;FSAR=0,1,0,0;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=-0.0460918,-0.286037,-0.208429,-0.353856;FXX=0.0357015;HRUN=6,6,6,6;LEN=1,2,1,1;MLLD=16.7308,22.1518,11.2269,11.9295;QD=13.9638;RBI=0.0954685,0.287159,0.214352,0.36473;REFB=-0.0458369,-0.0846728,-0.107948,-0.0552494;REVB=0.0836049,-0.0253665,0.050038,-0.0883964;RO=10;SAF=2,3,7,2;SAR=0,1,0,1;SRF=2;SRR=8;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=0.703678,0.539296,0.813121,0.477992;STB=0.5,0.856462,0.5,0.5;STBP=1,0.006,1,1;TYPE=snp,del,del,del;VARB=0,0.0615138,0.0277132,0.0358766;OID=.,.,.,.;OPOS=28295276,28295281,28295276,28295282;OREF=T,TA,T,A;OALT=A,-,-,-;OMAPALT=AATTTTTA,ATTTTT,ATTTTTA,ATTTTTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,0.481481,0,0:2,4,7,3:30:0,13,0,0:27:14:0,12,0,0:0,1,0,0:6:8:88:10:2,3,7,2:0,1,0,1:2:8
chr3	28520417	.	T	A	2204.26	PASS	AF=0.986014;AO=141;DP=141;FAO=141;FDP=143;FR=.;FRO=2;FSAF=81;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00148823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.725;QD=61.6575;RBI=0.00972802;REFB=0.0062239;REVB=0.00961351;RO=0;SAF=81;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508196;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=-0.000528447;OID=.;OPOS=28520417;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:141:143:0:2:141:141:0.986014:60:81:0:0:60:81:0:2
chr3	28533657	.	AG	A,AA	385.67	PASS	AF=0.0714286,0.928571;AO=6,21;DP=27;FAO=2,26;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=1,13;FSAR=1,13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00970323,0.0124207;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=218.812,225.388;QD=55.0951;RBI=0.0340545,0.0292484;REFB=0,0;REVB=0.0326429,0.0264801;RO=0;SAF=4,9;SAR=2,12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0271991,0.000266387;OID=.,.;OPOS=28533658,28533658;OREF=G,G;OALT=-,A;OMAPALT=A,AA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0714286,0.928571:6,21:27:2,26:28:0:1,13:1,13:0:0:9:0:4,9:2,12:0:0
chr3	29628639	.	C	T	1314.11	PASS	AF=0.784615;AO=102;DP=130;FAO=102;FDP=130;FR=.;FRO=28;FSAF=51;FSAR=51;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.00249749;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.7934;QD=40.4341;RBI=0.0201963;REFB=0.0302783;REVB=-0.0200413;RO=28;SAF=51;SAR=51;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00787422;OID=.;OPOS=29628639;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:130:130:28:28:102:102:0.784615:51:51:14:14:51:51:14:14
chr3	29804487	.	A	T	71.08	PASS	AF=0.263158;AO=10;DP=38;FAO=10;FDP=38;FR=.;FRO=28;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=-0.0224612;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=286.157;QD=7.48174;RBI=0.0224616;REFB=-0.0044;REVB=0.000128993;RO=28;SAF=5;SAR=5;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0842904;STB=0.552528;STBP=0.696;TYPE=snp;VARB=0.0134618;OID=.;OPOS=29804487;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:71:38:38:28:28:10:10:0.263158:5:5:16:12:5:5:16:12
chr3	30827904	.	A	G	107.26	PASS	AF=0.631579;AO=12;DP=19;FAO=12;FDP=19;FR=.;FRO=7;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.0200802;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=239.975;QD=22.5807;RBI=0.0214813;REFB=-0.0111693;REVB=-0.00763091;RO=7;SAF=8;SAR=4;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0353093;STB=0.519967;STBP=0.862;TYPE=snp;VARB=0.00665545;OID=.;OPOS=30827904;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:19:19:7:7:12:12:0.631579:4:8:5:2:4:8:5:2
chr3	30875428	.	T	A	77.17	PASS	AF=0.210526;AO=12;DP=57;FAO=12;FDP=57;FR=.;FRO=45;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=24;FSRR=21;FWDB=-0.00582129;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.778;QD=5.41523;RBI=0.026239;REFB=-0.0198269;REVB=-0.0255851;RO=45;SAF=9;SAR=3;SRF=24;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.285884;STB=0.685387;STBP=0.195;TYPE=snp;VARB=0.0502347;OID=.;OPOS=30875428;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:57:57:45:45:12:12:0.210526:3:9:24:21:3:9:24:21
chr3	31705649	.	C	T	1830.2	PASS	AF=0.836364;AO=137;DP=165;FAO=138;FDP=165;FR=.;FRO=27;FSAF=72;FSAR=66;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=0.0125298;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.897;QD=44.3685;RBI=0.013122;REFB=-0.00555192;REVB=0.00389757;RO=24;SAF=72;SAR=65;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0306699;STB=0.524759;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=0.00124024;OID=.;OPOS=31705649;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:165:165:24:27:137:138:0.836364:65:72:10:14:66:72:10:17
chr3	31712393	.	C	T	1203.86	PASS	AF=1;AO=67;DP=81;FAO=79;FDP=79;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=43;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0099731;FXX=0.0365809;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.615;QD=60.955;RBI=0.0127444;REFB=0;REVB=0.00793447;RO=0;SAF=41;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.17723e-05;OID=.;OPOS=31712393;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:81:79:0:0:67:79:1:26:41:0:0:36:43:0:0
chr3	31725316	.	G	A	152.58	PASS	AF=0.178808;AO=27;DP=151;FAO=27;FDP=151;FR=.;FRO=124;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=57;FSRR=67;FWDB=-0.0246552;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.3479;QD=4.04178;RBI=0.0275183;REFB=-0.00763823;REVB=0.012222;RO=122;SAF=16;SAR=11;SRF=55;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18009;STB=0.608404;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=0.0466992;OID=.;OPOS=31725316;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:151:151:122:124:27:27:0.178808:11:16:55:67:11:16:57:67
chr3	31789582	.	T	C	1305.9	PASS	AF=0.988372;AO=84;DP=86;FAO=85;FDP=86;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=53;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0749798;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.135;QD=60.7393;RBI=0.0946671;REFB=0.00458538;REVB=0.0577918;RO=2;SAF=32;SAR=52;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0055495;STB=0.507691;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=-0.000208279;OID=.;OPOS=31789582;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:86:86:2:1:84:85:0.988372:52:32:1:1:53:32:1:0
chr3	31839242	.	T	C	785.89	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00248581;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.575;QD=64.1539;RBI=0.0101707;REFB=0;REVB=0.00986224;RO=0;SAF=24;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.26929e-05;OID=.;OPOS=31839242;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:25:24:0:0:25:24:0:0
chr3	32031962	.	A	G	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0206713;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.088;QD=51.9166;RBI=0.0275304;REFB=0;REVB=0.0181831;RO=0;SAF=11;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000661453;OID=.;OPOS=32031962;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:10:11:0:0:10:11:0:0
chr3	32208621	.	T	C	746.31	PASS	AF=1;AO=47;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0014548;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.073;QD=62.1923;RBI=0.0138271;REFB=0;REVB=0.0137503;RO=1;SAF=13;SAR=34;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0136345;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000108998;OID=.;OPOS=32208621;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:1:0:47:48:1:34:13:0:1:35:13:0:0
chr3	32209927	.	A	G	1080.54	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.028451;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.961;QD=60.0301;RBI=0.0297508;REFB=0;REVB=0.00869757;RO=0;SAF=41;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000167567;OID=.;OPOS=32209927;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:31:41:0:0:31:41:0:0
chr3	32214179	.	A	T	885.42	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0214927;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.5991;QD=58.0606;RBI=0.0285853;REFB=0;REVB=-0.0188464;RO=0;SAF=32;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.57458e-05;OID=.;OPOS=32214179;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:29:32:0:0:29:32:0:0
chr3	32214212	.	A	C	690.35	PASS	AF=1;AO=50;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0340125;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.816;QD=53.1037;RBI=0.0341538;REFB=-0.170065;REVB=0.00310334;RO=1;SAF=24;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0192104;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00281776;OID=.;OPOS=32214212;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:52:52:1:0:50:52:1:26:24:1:0:26:26:0:0
chr3	32524707	.	T	C	567.82	PASS	AF=0.649351;AO=50;DP=74;FAO=50;FDP=77;FR=.;FRO=27;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=-0.00906186;FXX=0.0253133;HRUN=7;LEN=1;MLLD=142.561;QD=29.4972;RBI=0.0112891;REFB=-0.0209374;REVB=-0.0067325;RO=24;SAF=24;SAR=26;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0883763;STB=0.538607;STBP=0.356;TYPE=snp;VARB=0.00927218;OID=.;OPOS=32524707;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:77:24:27:50:50:0.649351:26:24:8:16:26:24:10:17
chr3	32611671	.	G	A	47.68	PASS	AF=0.4375;AO=6;DP=14;FAO=7;FDP=16;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.0141908;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=143.878;QD=11.9209;RBI=0.0163755;REFB=-0.00383229;REVB=0.00817179;RO=5;SAF=3;SAR=3;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0757641;STB=0.631215;STBP=0.397;TYPE=snp;VARB=0.00182531;OID=.;OPOS=32611671;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:14:16:5:9:6:7:0.4375:3:3:2:3:4:3:6:3
chr3	32815230	.	CA	C,CT	535.54	PASS	AF=0.0540541,0.945946;AO=7,28;DP=38;FAO=2,35;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=2,14;FSAR=0,21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00387697,0.00898782;FXX=0.0263089;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=190.266,200.85;QD=57.896;RBI=0.0213118,0.0186573;REFB=0,0;REVB=0.0209562,0.0163497;RO=0;SAF=6,10;SAR=1,18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0631519,0.000582886;OID=.,.;OPOS=32815231,32815231;OREF=A,A;OALT=-,T;OMAPALT=C,CT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0540541,0.945946:7,28:38:2,35:37:0:2,14:0,21:0:0:9:0:6,10:1,18:0:0
chr3	32927509	.	G	T	699.02	PASS	AF=0.980392;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0511569;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=215.086;QD=54.8248;RBI=0.0825916;REFB=-0.0348812;REVB=0.064841;RO=1;SAF=22;SAR=28;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0209158;STB=0.511107;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=0.000504667;OID=.;OPOS=32927509;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:51:51:1:1:50:50:0.980392:28:22:1:0:28:22:1:0
chr3	32996423	.	C	T	313.36	PASS	AF=0.96;AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=25;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00100339;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.0632;QD=50.137;RBI=0.00309973;REFB=-0.0933807;REVB=0.00293284;RO=0;SAF=14;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.517227;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.00337897;OID=.;OPOS=32996423;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:25:25:0:1:24:24:0.96:10:14:0:0:10:14:1:0
chr3	33038747	.	C	G	594.45	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0573853;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.7247;QD=60.9691;RBI=0.063245;REFB=0;REVB=-0.0265867;RO=0;SAF=18;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.34792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00105778;OID=.;OPOS=33038747;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:21:18:0:0:21:18:0:0
chr3	33055721	.	A	G	1153.57	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00677646;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.789;QD=60.7142;RBI=0.00964411;REFB=0;REVB=0.00686211;RO=0;SAF=37;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.55075e-07;OID=.;OPOS=33055721;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:39:37:0:0:39:37:0:0
chr3	33118631	.	G	A	145.94	PASS	AF=0.201613;AO=25;DP=124;FAO=25;FDP=124;FR=.;FRO=99;FSAF=20;FSAR=5;FSRF=63;FSRR=36;FWDB=-0.0278796;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.623;QD=4.70775;RBI=0.0431924;REFB=-0.00691373;REVB=0.0329896;RO=98;SAF=20;SAR=5;SRF=62;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.259468;STB=0.663822;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=0.0323038;OID=.;OPOS=33118631;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:124:124:98:99:25:25:0.201613:5:20:62:36:5:20:63:36
chr3	33138544	.	A	G	1884.84	PASS	AF=0.984127;AO=124;DP=126;FAO=124;FDP=126;FR=.;FRO=2;FSAF=58;FSAR=66;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0326322;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.747;QD=59.8363;RBI=0.0392784;REFB=-0.0144733;REVB=0.0218617;RO=2;SAF=58;SAR=66;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0160991;STB=0.508473;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=4.87253e-05;OID=.;OPOS=33138544;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:126:126:2:2:124:124:0.984127:66:58:2:0:66:58:2:0
chr3	33138549	.	G	A	1207.44	PASS	AF=0.806723;AO=94;DP=112;FAO=96;FDP=119;FR=.;FRO=23;FSAF=45;FSAR=51;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=0.0146929;FXX=0.0165276;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.7592;QD=40.5861;RBI=0.0426182;REFB=-0.102019;REVB=-0.0400054;RO=18;SAF=45;SAR=49;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0400384;STB=0.501845;STBP=0.953;TYPE=snp;VARB=0.0256759;OID=.;OPOS=33138549;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:119:18:23:94:96:0.806723:49:45:11:7:51:45:11:12
chr3	33161898	.	C	T	135.77	PASS	AF=0.253165;AO=20;DP=79;FAO=20;FDP=79;FR=.;FRO=59;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=33;FSRR=26;FWDB=0.0140511;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.884;QD=6.8744;RBI=0.0418824;REFB=0.00124535;REVB=-0.039455;RO=59;SAF=12;SAR=8;SRF=33;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0511517;STB=0.531218;STBP=0.773;TYPE=snp;VARB=-0.00289189;OID=.;OPOS=33161898;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:59:59:20:20:0.253165:8:12:33:26:8:12:33:26
chr3	33194990	.	C	A	518.25	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0137203;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=76.3053;QD=59.2288;RBI=0.0153159;REFB=0;REVB=0.0068066;RO=0;SAF=18;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.16387e-05;OID=.;OPOS=33194990;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:17:18:0:0:17:18:0:0
chr3	33195284	.	G	A	349.26	PASS	AF=0.618182;AO=34;DP=54;FAO=34;FDP=55;FR=.;FRO=21;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=-0.0140762;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=71.1909;QD=25.4007;RBI=0.0275197;REFB=-0.0526125;REVB=0.0236473;RO=20;SAF=18;SAR=16;SRF=6;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154337;STB=0.574425;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=0.0264283;OID=.;OPOS=33195284;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:55:20:21:34:34:0.618182:16:18:6:14:16:18:7:14
chr3	33195309	.	A	G	402.65	PASS	AF=0.629032;AO=38;DP=62;FAO=39;FDP=62;FR=.;FRO=23;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=-0.0154233;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.7932;QD=25.9775;RBI=0.0421395;REFB=-0.0081714;REVB=-0.0392156;RO=22;SAF=20;SAR=18;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108851;STB=0.570335;STBP=0.151;TYPE=snp;VARB=0.00255125;OID=.;OPOS=33195309;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:22:23:38:39:0.629032:18:20:8:14:18:21:8:15
chr3	33255592	.	A	G	362.48	PASS	AF=1;AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0373726;FXX=0.0370233;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.933;QD=55.7661;RBI=0.0391214;REFB=0;REVB=0.0115658;RO=0;SAF=9;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000430187;OID=.;OPOS=33255592;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:26:0:0:26:26:1:17:9:0:0:17:9:0:0
chr3	33434831	.	G	A	1743.23	PASS	AF=0.975;AO=117;DP=120;FAO=117;FDP=120;FR=.;FRO=3;FSAF=67;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0073768;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=252.632;QD=58.1077;RBI=0.0204161;REFB=-0.0976681;REVB=0.0190368;RO=3;SAF=67;SAR=50;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0276403;STB=0.514561;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.00145845;OID=.;OPOS=33434831;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:120:120:3:3:117:117:0.975:50:67:0:3:50:67:0:3
chr3	33458266	.	T	C	714.98	PASS	AF=0.978723;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0440477;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.026;QD=60.8495;RBI=0.0474143;REFB=0.0464307;REVB=0.0175475;RO=1;SAF=18;SAR=28;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0253996;STB=0.513508;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=-5.89178e-05;OID=.;OPOS=33458266;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:47:47:1:1:46:46:0.978723:28:18:1:0:28:18:1:0
chr3	33877626	.	G	A	747.17	PASS	AF=0.808219;AO=58;DP=72;FAO=59;FDP=73;FR=.;FRO=14;FSAF=32;FSAR=27;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.0106423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.232;QD=40.9408;RBI=0.0106427;REFB=-0.0396448;REVB=8.13696e-05;RO=14;SAF=32;SAR=26;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0708926;STB=0.535553;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=0.013413;OID=.;OPOS=33877626;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:81:72:73:14:14:58:59:0.808219:26:32:5:9:27:32:5:9
chr3	33879770	.	G	A	42.94	PASS	AF=0.133333;AO=8;DP=60;FAO=8;FDP=60;FR=.;FRO=52;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=32;FSRR=20;FWDB=-0.0352197;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.073;QD=2.86248;RBI=0.036224;REFB=-0.000978646;REVB=0.00847068;RO=50;SAF=4;SAR=4;SRF=31;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146598;STB=0.59976;STBP=0.573;TYPE=snp;VARB=0.00119777;OID=.;OPOS=33879770;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:42:60:60:50:52:8:8:0.133333:4:4:31:19:4:4:32:20
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chr3	33905566	.	C	T	717.19	PASS	AF=0.802817;AO=55;DP=70;FAO=57;FDP=71;FR=.;FRO=14;FSAF=33;FSAR=24;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=0.0374359;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.118;QD=40.4052;RBI=0.0380718;REFB=0.0133874;REVB=-0.00692938;RO=14;SAF=31;SAR=24;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0306297;STB=0.512973;STBP=0.664;TYPE=snp;VARB=-0.00260496;OID=.;OPOS=33905566;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:82:70:71:14:14:55:57:0.802817:24:31:9:5:24:33:9:5
chr3	33907945	.	A	G	438.92	PASS	AF=0.745098;AO=38;DP=51;FAO=38;FDP=51;FR=.;FRO=13;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=-0.00416138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.412;QD=34.4249;RBI=0.0129139;REFB=-0.00384694;REVB=-0.0122251;RO=13;SAF=16;SAR=22;SRF=3;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0935974;STB=0.550512;STBP=0.264;TYPE=snp;VARB=0.00171484;OID=.;OPOS=33907945;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:51:51:13:13:38:38:0.745098:22:16:3:10:22:16:3:10
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chr3	37459334	.	TACACACACACACACAC	T	146.48	PASS	AF=0.736842;AO=14;DP=18;FAO=14;FDP=19;FR=.;FRO=5;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0552487;FXX=0.136302;HRUN=1;LEN=16;MLLD=298.476;QD=30.8387;RBI=0.0623497;REFB=-0.0376341;REVB=0.0288975;RO=1;SAF=8;SAR=6;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0698108;STB=0.596878;STBP=0.185;TYPE=del;VARB=0.0147975;OID=.;OPOS=37459335;OREF=ACACACACACACACAC;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.736842:14:18:14:19:5:8:6:1:4:31:1:8:6:0:1
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chr3	37535984	.	C	G	547.8	PASS	AF=0.976744;AO=30;DP=44;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0352095;FXX=0.0444346;HRUN=5;LEN=1;MLLD=170.979;QD=50.9579;RBI=0.035212;REFB=0.0308422;REVB=-0.000418084;RO=0;SAF=25;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.533317;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=0.00140656;OID=.;OPOS=37535984;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:44:43:0:1:30:42:0.976744:5:25:0:0:7:35:0:1
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chr3	38271881	.	C	T	97.0	PASS	AF=0.159664;AO=19;DP=119;FAO=19;FDP=119;FR=.;FRO=100;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=50;FSRR=50;FWDB=-0.00491072;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.8964;QD=3.2605;RBI=0.0270925;REFB=-0.00208937;REVB=0.0266438;RO=98;SAF=9;SAR=10;SRF=48;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0204292;STB=0.522101;STBP=0.852;TYPE=snp;VARB=0.0143602;OID=.;OPOS=38271881;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:119:119:98:100:19:19:0.159664:10:9:48:50:10:9:50:50
chr3	38296817	.	G	A	641.22	PASS	AF=0.85;AO=51;DP=60;FAO=51;FDP=60;FR=.;FRO=9;FSAF=20;FSAR=31;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.0206936;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.341;QD=42.7479;RBI=0.0207777;REFB=-0.0476355;REVB=0.0018672;RO=9;SAF=20;SAR=31;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0153291;STB=0.508193;STBP=0.778;TYPE=snp;VARB=0.00913622;OID=.;OPOS=38296817;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:49:60:60:9:9:51:51:0.85:31:20:4:5:31:20:4:5
chr3	38347633	.	G	A	699.18	PASS	AF=0.962264;AO=51;DP=53;FAO=51;FDP=53;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0180187;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.4954;QD=52.7681;RBI=0.023193;REFB=-0.175276;REVB=0.0146028;RO=2;SAF=27;SAR=24;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0336073;STB=0.51785;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=0.00367144;OID=.;OPOS=38347633;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:53:53:2:2:51:51:0.962264:24:27:2:0:24:27:2:0
chr3	38347851	.	A	G	804.69	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00362025;FXX=0.0175408;HRUN=3;LEN=1;MLLD=74.0832;QD=57.4776;RBI=0.0214246;REFB=0;REVB=-0.0211165;RO=0;SAF=29;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00221685;OID=.;OPOS=38347851;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:27:29:0:0:27:29:0:0
chr3	38355225	.	GT	AC,AT	775.94	PASS	AF=0.0363636,0.963636;AO=2,52;DP=56;FAO=2,53;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=2,21;FSAR=0,32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00162702,-0.0323516;FXX=0.017854;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=98.3015,69.6815;QD=56.4318;RBI=0.0176449,0.0326895;REFB=0,0;REVB=0.0175697,0.00468793;RO=0;SAF=2,21;SAR=0,31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.93989e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=-0.0183939,0.00321704;OID=.,.;OPOS=38355225,38355225;OREF=GT,G;OALT=AC,A;OMAPALT=AC,AT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:56:55:0:0:2,52:2,53:0.0363636,0.963636:0,31:2,21:0:0:0,32:2,21:0:0
chr3	38357817	.	C	T	1343.28	PASS	AF=1;AO=85;DP=87;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0474563;FXX=0.0337041;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.561;QD=62.478;RBI=0.0535846;REFB=0;REVB=0.0248839;RO=0;SAF=49;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000147787;OID=.;OPOS=38357817;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:86:0:0:85:86:1:36:49:0:0:36:50:0:0
chr3	38401839	.	T	C	729.01	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0127845;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.943;QD=57.1774;RBI=0.0296448;REFB=0;REVB=0.0267464;RO=0;SAF=20;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.13361e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.87375e-05;OID=.;OPOS=38401839;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:31:20:0:0:31:20:0:0
chr3	38404472	.	C	A	1396.39	PASS	AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00922018;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.217;QD=62.7591;RBI=0.0235906;REFB=0;REVB=0.0217141;RO=0;SAF=51;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.43419e-05;OID=.;OPOS=38404472;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:38:51:0:0:38:51:0:0
chr3	38406773	.	G	T	289.5	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0397768;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.654;QD=52.6354;RBI=0.0717497;REFB=0;REVB=0.0597145;RO=0;SAF=9;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000560204;OID=.;OPOS=38406773;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:22:0:0:21:22:1:12:9:0:0:13:9:0:0
chr3	38408361	.	G	A	1415.42	PASS	AF=1;AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00636165;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=221.725;QD=62.9075;RBI=0.0225011;REFB=0;REVB=0.0215831;RO=0;SAF=39;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.24868e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.20209e-05;OID=.;OPOS=38408361;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:90:90:0:0:90:90:1:51:39:0:0:51:39:0:0
chr3	38442490	.	G	A	594.8	PASS	AF=0.803279;AO=49;DP=61;FAO=49;FDP=61;FR=.;FRO=12;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=-0.0127197;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=229.533;QD=39.0034;RBI=0.0128544;REFB=-0.0058437;REVB=0.00185636;RO=12;SAF=25;SAR=24;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0953085;STB=0.551081;STBP=0.137;TYPE=snp;VARB=0.00157584;OID=.;OPOS=38442490;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:61:61:12:12:49:49:0.803279:24:25:3:9:24:25:3:9
chr3	38519424	.	A	G	920.63	PASS	AF=0.804598;AO=70;DP=87;FAO=70;FDP=87;FR=.;FRO=17;FSAF=40;FSAR=30;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.00388296;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=274.187;QD=42.328;RBI=0.00494519;REFB=-0.0196083;REVB=-0.00306227;RO=17;SAF=40;SAR=30;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0590815;STB=0.531552;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=0.00531807;OID=.;OPOS=38519424;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:17:17:70:70:0.804598:30:40:7:10:30:40:7:10
chr3	38524742	.	C	T	1793.1	PASS	AF=0.769231;AO=138;DP=182;FAO=140;FDP=182;FR=.;FRO=42;FSAF=72;FSAR=68;FSRF=18;FSRR=24;FWDB=0.00351707;FXX=0.010869;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.48;QD=39.4088;RBI=0.00689863;REFB=-0.0201744;REVB=-0.00593476;RO=42;SAF=72;SAR=66;SRF=18;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0408163;STB=0.519771;STBP=0.331;TYPE=snp;VARB=0.00478209;OID=.;OPOS=38524742;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:182:182:42:42:138:140:0.769231:66:72:18:24:68:72:18:24
chr3	38525567	.	T	C	744.84	PASS	AF=0.701149;AO=61;DP=89;FAO=61;FDP=87;FR=.;FRO=26;FSAF=33;FSAR=28;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=-0.0119293;FXX=0.0224694;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.416;QD=34.2456;RBI=0.0119812;REFB=-0.0311755;REVB=0.00111427;RO=25;SAF=33;SAR=28;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0974995;STB=0.558042;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=0.0167334;OID=.;OPOS=38525567;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:87:25:26:61:61:0.701149:28:33:9:16:28:33:9:17
chr3	38529818	.	C	T	197.56	PASS	AF=0.633333;AO=19;DP=30;FAO=19;FDP=30;FR=.;FRO=11;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.00708487;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.58;QD=26.3415;RBI=0.0145449;REFB=-0.0331914;REVB=-0.0127027;RO=11;SAF=8;SAR=11;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.039106;STB=0.521716;STBP=0.759;TYPE=snp;VARB=0.00990582;OID=.;OPOS=38529818;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:30:30:11:11:19:19:0.633333:11:8:4:7:11:8:4:7
chr3	38529825	.	C	T	168.89	PASS	AF=0.607143;AO=17;DP=28;FAO=17;FDP=28;FR=.;FRO=11;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=-0.0136874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.599;QD=24.127;RBI=0.0242453;REFB=-0.0124711;REVB=-0.0200122;RO=11;SAF=8;SAR=9;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0757294;STB=0.542324;STBP=0.602;TYPE=snp;VARB=0.00729567;OID=.;OPOS=38529825;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:28:28:11:11:17:17:0.607143:9:8:4:7:9:8:4:7
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chr3	38534133	.	TAAAAAAAAT	TAAAAAAAA,TAAAAAAAAA,TAAAAAAAT	82.85	PASS	AF=0.113636,0.113636,0;AO=15,15,16;DP=90;FAO=5,5,0;FDP=44;FR=.;FRO=34;FSAF=2,1,0;FSAR=3,4,0;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=0.0330273,0.090029,-0.59494;FXX=0.10202;HRUN=1,1,8;LEN=1,1,1;MLLD=171.648,174.334,4.91327;QD=7.53168;RBI=0.0351958,0.0910459,0.66312;REFB=0.0036029,0.00558297,-0.0821366;REVB=-0.012163,-0.0135695,0.292872;RO=21;SAF=2,3,13;SAR=13,12,3;SRF=10;SRR=11;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.444865,-0.327991,0.384374;STB=0.6118,0.790486,0.5;STBP=0.656,0.242,1;TYPE=del,snp,del;VARB=-0.0390772,0.000921419,0.227183;OID=.,.,.;OPOS=38534142,38534142,38534134;OREF=T,T,A;OALT=-,A,-;OMAPALT=TAAAAAAAA,TAAAAAAAAA,TAAAAAAAT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.113636,0.113636,0:15,15,16:90:5,5,0:44:34:2,1,0:3,4,0:18:16:19:21:2,3,13:13,12,3:10:11
chr3	38589666	.	T	TCCCTCCTTTTTCCTACTCTCTTCTC	162.42	PASS	AF=0.566667;AO=14;DP=33;FAO=17;FDP=30;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.00234917;FXX=0.0322477;HRUN=3;LEN=25;MLLD=537.502;QD=21.6564;RBI=0.00359532;REFB=-0.00721239;REVB=0.00272172;RO=15;SAF=6;SAR=8;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153613;STB=0.588131;STBP=0.32;TYPE=ins;VARB=0.00439322;OID=.;OPOS=38589667;OREF=-;OALT=CCCTCCTTTTTCCTACTCTCTTCTC;OMAPALT=TCCCTCCTTTTTCCTACTCTCTTCTC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.566667:14:33:17:30:13:7:10:8:5:99:15:6:8:9:6
chr3	38592406	.	A	G	203.62	PASS	AF=0.27551;AO=27;DP=99;FAO=27;FDP=98;FR=.;FRO=71;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=32;FSRR=39;FWDB=0.0441866;FXX=0.0101;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.9196;QD=8.3109;RBI=0.04755;REFB=0.00311355;REVB=-0.0175653;RO=70;SAF=11;SAR=16;SRF=32;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0613605;STB=0.532072;STBP=0.696;TYPE=snp;VARB=-0.00989619;OID=.;OPOS=38592406;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:98:70:71:27:27:0.27551:16:11:32:38:16:11:32:39
chr3	38622467	.	T	C	1245.77	PASS	AF=1;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00969642;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.5523;QD=61.5195;RBI=0.0257351;REFB=0;REVB=0.0238385;RO=0;SAF=49;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.32002e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000276518;OID=.;OPOS=38622467;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:81:0:0:81:81:1:32:49:0:0:32:49:0:0
chr3	38674712	.	T	C	3215.6	PASS	AF=1;AO=206;DP=207;FAO=207;FDP=207;FR=.;FRO=0;FSAF=116;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0142679;FXX=0.014285;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.59;QD=62.1372;RBI=0.0315567;REFB=0;REVB=0.028147;RO=0;SAF=116;SAR=90;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000333142;OID=.;OPOS=38674712;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:18:207:207:0:0:206:207:1:90:116:0:0:91:116:0:0
chr3	38739574	.	T	C,G	1267.42	PASS	AF=0.964286,0.0357143;AO=78,3;DP=82;FAO=81,3;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=36,1;FSAR=45,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0050839,-0.0222409;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=52.6292,54.8062;QD=60.3532;RBI=0.089192,0.0315949;REFB=0,0;REVB=0.089047,-0.0224407;RO=1;SAF=36,1;SAR=42,2;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0111373,0.163246;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.0069597,0.155805;OID=.,.;OPOS=38739574,38739574;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:6:82:84:1:0:78,3:81,3:0.964286,0.0357143:42,2:36,1:0:1:45,2:36,1:0:0
chr3	38739845	.	A	G	651.23	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0506424;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.4;QD=62.0214;RBI=0.061311;REFB=0;REVB=-0.0345599;RO=0;SAF=12;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.52854e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000142682;OID=.;OPOS=38739845;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:30:12:0:0:30:12:0:0
chr3	38763863	.	G	C	812.93	PASS	AF=0.818182;AO=63;DP=76;FAO=63;FDP=77;FR=.;FRO=14;FSAF=36;FSAR=27;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.00720091;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.646;QD=42.23;RBI=0.0172983;REFB=0.00950083;REVB=0.0157283;RO=13;SAF=36;SAR=27;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0357406;STB=0.513203;STBP=0.614;TYPE=snp;VARB=-0.0015339;OID=.;OPOS=38763863;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:80:76:77:13:14:63:63:0.818182:27:36:6:7:27:36:7:7
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chr3	38766675	.	A	G	438.74	PASS	AF=0.755556;AO=32;DP=43;FAO=34;FDP=45;FR=.;FRO=11;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.0468671;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.945;QD=38.9988;RBI=0.0473497;REFB=0.0147866;REVB=0.00674325;RO=11;SAF=12;SAR=20;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.039521;STB=0.510746;STBP=0.815;TYPE=snp;VARB=-0.00234681;OID=.;OPOS=38766675;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:79:43:45:11:11:32:34:0.755556:20:12:5:6:20:14:5:6
chr3	38768247	.	G	A	446.37	PASS	AF=0.672131;AO=41;DP=61;FAO=41;FDP=61;FR=.;FRO=20;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=-0.00504018;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=155.008;QD=29.2703;RBI=0.0171012;REFB=-0.0168571;REVB=0.0163416;RO=19;SAF=24;SAR=17;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.096866;STB=0.56126;STBP=0.183;TYPE=snp;VARB=0.0072611;OID=.;OPOS=38768247;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:19:20:41:41:0.672131:17:24:8:11:17:24:8:12
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chr3	39180099	.	T	C	1272.07	PASS	AF=0.988095;AO=83;DP=85;FAO=83;FDP=84;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0389939;FXX=0.0117633;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.7603;QD=60.575;RBI=0.0392436;REFB=0.0588035;REVB=-0.00442031;RO=1;SAF=42;SAR=41;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0111436;STB=0.505881;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=-0.00673332;OID=.;OPOS=39180099;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:85:84:1:1:83:83:0.988095:41:42:1:0:41:42:1:0
chr3	39180263	.	G	A	695.33	PASS	AF=0.978261;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0307171;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.4514;QD=60.4632;RBI=0.0443388;REFB=-0.0929601;REVB=0.0319748;RO=1;SAF=15;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.030296;STB=0.516122;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=0.00405488;OID=.;OPOS=39180263;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:46:46:1:1:45:45:0.978261:30:15:1:0:30:15:1:0
chr3	39184959	.	C	T	632.26	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00398087;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.921;QD=61.684;RBI=0.00675357;REFB=0;REVB=-0.00545559;RO=0;SAF=18;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.64354e-05;OID=.;OPOS=39184959;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:23:18:0:0:23:18:0:0
chr3	39185077	.	G	A	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0617802;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.634;QD=45.8054;RBI=0.0720469;REFB=0;REVB=0.0370671;RO=0;SAF=6;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00117221;OID=.;OPOS=39185077;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:8:6:0:0:8:6:0:0
chr3	39185248	.	A	G	340.66	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00423822;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.0542;QD=54.5053;RBI=0.0170322;REFB=0;REVB=-0.0164964;RO=0;SAF=13;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000182291;OID=.;OPOS=39185248;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:12:13:0:0:12:13:0:0
chr3	39186728	.	C	T	1038.02	PASS	AF=0.986111;AO=70;DP=71;FAO=71;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0186466;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=209.763;QD=57.6675;RBI=0.0352428;REFB=0.0263627;REVB=0.0299058;RO=1;SAF=44;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0106256;STB=0.505493;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=-0.000324169;OID=.;OPOS=39186728;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:71:72:1:1:70:71:0.986111:26:44:1:0:26:45:1:0
chr3	39227447	.	G	A	164.37	PASS	AF=0.375;AO=18;DP=46;FAO=18;FDP=48;FR=.;FRO=30;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.0255443;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=169.26;QD=13.6978;RBI=0.025579;REFB=-0.0207148;REVB=0.00133309;RO=28;SAF=7;SAR=11;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15538;STB=0.610988;STBP=0.265;TYPE=snp;VARB=0.0275044;OID=.;OPOS=39227447;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:48:28:30:18:18:0.375:11:7:15:13:11:7:17:13
chr3	39229900	.	T	C	1189.85	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00532622;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.292;QD=61.0178;RBI=0.0201984;REFB=0;REVB=0.0194835;RO=0;SAF=40;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.39314e-05;OID=.;OPOS=39229900;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:78:0:0:77:78:1:37:40:0:0:38:40:0:0
chr3	39323163	.	A	C	102.02	PASS	AF=0.231884;AO=16;DP=69;FAO=16;FDP=69;FR=.;FRO=53;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=30;FSRR=23;FWDB=-0.021198;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=117.048;QD=5.91429;RBI=0.0242249;REFB=-0.000169925;REVB=0.0117257;RO=53;SAF=4;SAR=12;SRF=30;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.391837;STB=0.744218;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.000444321;OID=.;OPOS=39323163;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:53:53:16:16:0.231884:12:4:30:23:12:4:30:23
chr3	39374873	.	G	A	105.14	PASS	AF=0.846154;AO=11;DP=13;FAO=11;FDP=13;FR=.;FRO=2;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0218265;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.465;QD=32.352;RBI=0.0235827;REFB=0.0373155;REVB=-0.00893022;RO=2;SAF=6;SAR=5;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128043;STB=0.571303;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=-0.00444984;OID=.;OPOS=39374873;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:13:13:2:2:11:11:0.846154:5:6:2:0:5:6:2:0
chr3	39431081	.	G	A	766.46	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00251001;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.43;QD=63.8718;RBI=0.00646569;REFB=0;REVB=0.00595861;RO=0;SAF=19;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.8412e-06;OID=.;OPOS=39431081;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:29:19:0:0:29:19:0:0
chr3	40231883	.	C	T	1527.73	PASS	AF=1;AO=96;DP=97;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.082735;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.8001;QD=57.6503;RBI=0.0958796;REFB=0;REVB=0.0484544;RO=0;SAF=46;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.54587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00169463;OID=.;OPOS=40231883;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:97:106:0:0:96:106:1:50:46:0:0:58:48:0:0
chr3	40251392	.	T	C	516.43	PASS	AF=0.785714;AO=41;DP=54;FAO=44;FDP=56;FR=.;FRO=12;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.0013922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.52;QD=36.8877;RBI=0.0028252;REFB=-0.024182;REVB=-0.00245836;RO=11;SAF=17;SAR=24;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0523922;STB=0.532772;STBP=0.398;TYPE=snp;VARB=0.0049121;OID=.;OPOS=40251392;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:54:56:11:12:41:44:0.785714:24:17:6:5:25:19:7:5
chr3	40286017	.	T	C	1790.99	PASS	AF=1;AO=112;DP=112;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130956;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.37;QD=60.2014;RBI=0.0140609;REFB=0;REVB=0.00512002;RO=0;SAF=57;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.34603e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000235515;OID=.;OPOS=40286017;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:112:119:0:0:112:119:1:55:57:0:0:55:64:0:0
chr3	40351484	.	C	T	34.57	PASS	AF=0.193548;AO=6;DP=30;FAO=6;FDP=31;FR=.;FRO=25;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=0.0991838;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.4007;QD=4.46085;RBI=0.102781;REFB=0.00274577;REVB=-0.0269541;RO=24;SAF=3;SAR=3;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0987067;STB=0.548228;STBP=0.841;TYPE=snp;VARB=-0.0211335;OID=.;OPOS=40351484;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:30:31:24:25:6:6:0.193548:3:3:14:10:3:3:14:11
chr3	40466308	.	C	T	438.94	PASS	AF=0.745098;AO=38;DP=51;FAO=38;FDP=51;FR=.;FRO=13;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.0286818;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.326;QD=34.4264;RBI=0.0289796;REFB=-0.00504024;REVB=-0.00414389;RO=13;SAF=20;SAR=18;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0667027;STB=0.536063;STBP=0.397;TYPE=snp;VARB=0.00170102;OID=.;OPOS=40466308;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:51:51:13:13:38:38:0.745098:18:20:5:8:18:20:5:8
chr3	40468896	.	C	T	101.56	PASS	AF=0.265306;AO=13;DP=49;FAO=13;FDP=49;FR=.;FRO=36;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=33;FWDB=0.0183989;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.375;QD=8.29041;RBI=0.0186184;REFB=-0.0037057;REVB=-0.00285043;RO=36;SAF=2;SAR=11;SRF=3;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.193939;STB=0.615239;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.0115946;OID=.;OPOS=40468896;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:36:36:13:13:0.265306:11:2:3:33:11:2:3:33
chr3	40519429	.	T	C	330.2	PASS	AF=0.961538;AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0100621;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=50.3362;QD=50.7999;RBI=0.0136178;REFB=-0.154998;REVB=-0.00917601;RO=0;SAF=9;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.515139;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.00944899;OID=.;OPOS=40519429;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:26:26:0:1:25:25:0.961538:16:9:0:0:16:9:0:1
chr3	40559078	.	G	C	118.33	PASS	AF=0.243243;AO=18;DP=74;FAO=18;FDP=74;FR=.;FRO=56;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=21;FSRR=35;FWDB=0.015581;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.963;QD=6.39603;RBI=0.0160456;REFB=0.00257115;REVB=-0.00383332;RO=56;SAF=12;SAR=6;SRF=21;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.348962;STB=0.712818;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=-0.0239686;OID=.;OPOS=40559078;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:56:56:18:18:0.243243:6:12:21:35:6:12:21:35
chr3	41266070	.	AGTCACTGGCAGCAACAGTCTTACCTGGACT	A	278.23	PASS	AF=0.568182;AO=25;DP=44;FAO=25;FDP=44;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=18;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.00497462;FXX=0.0434688;HRUN=1;LEN=30;MLLD=897.252;QD=25.2932;RBI=0.0155948;REFB=-0.00655183;REVB=0.0147801;RO=18;SAF=7;SAR=18;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142397;STB=0.570765;STBP=0.317;TYPE=del;VARB=0.00540489;OID=.;OPOS=41266071;OREF=GTCACTGGCAGCAACAGTCTTACCTGGACT;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.568182:25:44:25:44:19:7:18:8:11:99:18:7:18:8:10
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chr3	41756986	.	A	T	578.6	PASS	AF=0.753846;AO=49;DP=65;FAO=49;FDP=65;FR=.;FRO=16;FSAF=14;FSAR=35;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=0.0116076;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.974;QD=35.6059;RBI=0.0142562;REFB=-0.0387484;REVB=0.00827662;RO=16;SAF=14;SAR=35;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.203141;STB=0.609709;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.00487814;OID=.;OPOS=41756986;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:16:16:49:49:0.753846:35:14:11:5:35:14:11:5
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chr3	41877414	.	T	C	722.45	PASS	AF=0.783784;AO=57;DP=74;FAO=58;FDP=74;FR=.;FRO=16;FSAF=28;FSAR=30;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.013386;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=236.61;QD=39.0513;RBI=0.0135721;REFB=-0.0273468;REVB=0.00224023;RO=16;SAF=27;SAR=30;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0148459;STB=0.509801;STBP=0.754;TYPE=snp;VARB=0.00873394;OID=.;OPOS=41877414;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:74:74:16:16:57:58:0.783784:30:27:7:9:30:28:7:9
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chr3	41925398	.	C	T	217.11	PASS	AF=0.279279;AO=31;DP=111;FAO=31;FDP=111;FR=.;FRO=80;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=41;FSRR=39;FWDB=-0.00462648;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.621;QD=7.8238;RBI=0.0525066;REFB=-0.00663197;REVB=-0.0523024;RO=80;SAF=19;SAR=12;SRF=41;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123757;STB=0.573664;STBP=0.351;TYPE=snp;VARB=0.0126289;OID=.;OPOS=41925398;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:111:80:80:31:31:0.279279:12:19:41:39:12:19:41:39
chr3	41925423	.	T	C	1593.67	PASS	AF=0.990741;AO=107;DP=109;FAO=107;FDP=108;FR=.;FRO=1;FSAF=57;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.000716102;FXX=0.00917347;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.746;QD=59.0246;RBI=0.0299254;REFB=-0.119896;REVB=0.0299168;RO=1;SAF=57;SAR=50;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00939812;STB=0.50495;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.000323638;OID=.;OPOS=41925423;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:109:108:1:1:107:107:0.990741:50:57:0:1:50:57:0:1
chr3	41937000	.	C	T	135.77	PASS	AF=0.21;AO=21;DP=100;FAO=21;FDP=100;FR=.;FRO=79;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=32;FSRR=47;FWDB=-0.0236463;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=293.962;QD=5.43075;RBI=0.0238507;REFB=0.00166551;REVB=0.00311569;RO=79;SAF=7;SAR=14;SRF=32;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.096914;STB=0.561091;STBP=0.562;TYPE=snp;VARB=-0.00549457;OID=.;OPOS=41937000;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:79:79:21:21:0.21:14:7:32:47:14:7:32:47
chr3	41939990	.	GTTT	GTT,GTTA	547.82	PASS	AF=0.0769231,0.923077;AO=9,21;DP=39;FAO=3,36;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=1,10;FSAR=2,26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0598058,0.0913305;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=23.5401,26.6013;QD=56.1864;RBI=0.0703238,0.111517;REFB=0,0;REVB=0.036996,-0.0639908;RO=1;SAF=3,8;SAR=6,13;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0684198,0.0341946;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.00344986,0.0388277;OID=.,.;OPOS=41939991,41939993;OREF=T,T;OALT=-,A;OMAPALT=GTT,GTTA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0769231,0.923077:9,21:39:3,36:39:0:1,10:2,26:0:0:10:1:3,8:6,13:0:1
chr3	41952838	.	A	G	465.88	PASS	AF=0.813953;AO=35;DP=43;FAO=35;FDP=43;FR=.;FRO=8;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.119011;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.7;QD=43.3379;RBI=0.119179;REFB=0.0150468;REVB=-0.00633029;RO=7;SAF=17;SAR=18;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0265243;STB=0.525882;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=-0.00307941;OID=.;OPOS=41952838;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:50:43:43:7:8:35:35:0.813953:18:17:4:3:18:17:5:3
chr3	41957466	.	T	G	56.81	PASS	AF=0.163934;AO=10;DP=61;FAO=10;FDP=61;FR=.;FRO=51;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=31;FSRR=20;FWDB=-0.023616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.893;QD=3.72494;RBI=0.0538667;REFB=-0.00326264;REVB=0.0484139;RO=50;SAF=7;SAR=3;SRF=30;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134366;STB=0.585277;STBP=0.601;TYPE=snp;VARB=0.0149145;OID=.;OPOS=41957466;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:61:61:50:51:10:10:0.163934:3:7:30:20:3:7:31:20
chr3	41996136	.	T	C	78.95	PASS	AF=0.179487;AO=14;DP=78;FAO=14;FDP=78;FR=.;FRO=64;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=37;FSRR=27;FWDB=-0.000921353;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=273.827;QD=4.04865;RBI=0.000962351;REFB=-0.00632197;REVB=0.0002779;RO=64;SAF=7;SAR=7;SRF=37;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0981794;STB=0.564013;STBP=0.622;TYPE=snp;VARB=0.0327172;OID=.;OPOS=41996136;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:78:78:64:64:14:14:0.179487:7:7:37:27:7:7:37:27
chr3	42236415	.	A	G	747.05	PASS	AF=1;AO=46;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0463396;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.4242;QD=63.5788;RBI=0.0567237;REFB=0;REVB=-0.0327142;RO=0;SAF=14;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00112447;OID=.;OPOS=42236415;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:46:47:1:32:14:0:0:32:15:0:0
chr3	42244321	.	G	A	1379.52	PASS	AF=0.989011;AO=89;DP=91;FAO=90;FDP=91;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0130502;FXX=0.0215031;HRUN=4;LEN=1;MLLD=195.788;QD=60.6381;RBI=0.0511079;REFB=-0.257132;REVB=0.0494136;RO=1;SAF=39;SAR=50;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00938488;STB=0.504949;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.00102107;OID=.;OPOS=42244321;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:91:91:1:1:89:90:0.989011:50:39:0:1:50:40:0:1
chr3	42251263	.	C	T	223.06	PASS	AF=1;AO=17;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.044777;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.506;QD=49.5683;RBI=0.0461584;REFB=0;REVB=0.0112079;RO=0;SAF=8;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000461859;OID=.;OPOS=42251263;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:17:18:1:9:8:0:0:10:8:0:0
chr3	42251329	.	C	T	651.06	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00407568;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=231.022;QD=62.0053;RBI=0.0131767;REFB=0;REVB=0.0125306;RO=0;SAF=25;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.98888e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.48246e-05;OID=.;OPOS=42251329;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:17:25:0:0:17:25:0:0
chr3	42251868	.	CT	C	234.07	PASS	AF=1;AO=20;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0300801;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=24.2766;QD=44.5852;RBI=0.128149;REFB=0;REVB=0.124569;RO=0;SAF=16;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00587858;OID=.;OPOS=42251869;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:20:21:21:21:0:17:4:0:0:4:0:16:4:0:0
chr3	42263355	.	T	C	186.77	PASS	AF=0.254545;AO=28;DP=110;FAO=28;FDP=110;FR=.;FRO=82;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=36;FSRR=46;FWDB=-0.0167729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.507;QD=6.79161;RBI=0.0184779;REFB=-0.00546759;REVB=0.0077527;RO=81;SAF=17;SAR=11;SRF=36;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199558;STB=0.624268;STBP=0.151;TYPE=snp;VARB=0.0141789;OID=.;OPOS=42263355;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:110:81:82:28:28:0.254545:11:17:36:45:11:17:36:46
chr3	42304784	.	A	G	426.06	PASS	AF=0.693878;AO=34;DP=48;FAO=34;FDP=49;FR=.;FRO=15;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=12;FSRR=3;FWDB=-0.0468233;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.7818;QD=34.7804;RBI=0.0945848;REFB=0.0362362;REVB=-0.0821819;RO=14;SAF=14;SAR=20;SRF=11;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19925;STB=0.617509;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=-0.0185237;OID=.;OPOS=42304784;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:49:14:15:34:34:0.693878:20:14:11:3:20:14:12:3
chr3	42438754	.	T	C	785.79	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0106214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.4045;QD=64.1463;RBI=0.0139888;REFB=0;REVB=0.00910353;RO=0;SAF=20;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.48852e-05;OID=.;OPOS=42438754;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:29:20:0:0:29:20:0:0
chr3	42448471	.	G	A	1104.26	PASS	AF=1;AO=71;DP=72;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0272414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.417;QD=58.8939;RBI=0.037165;REFB=-0.0930294;REVB=0.0252813;RO=0;SAF=38;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00109288;OID=.;OPOS=42448471;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:72:75:0:0:71:75:1:33:38:0:0:35:40:0:0
chr3	42568929	.	T	C	62.7	PASS	AF=0.290323;AO=9;DP=31;FAO=9;FDP=31;FR=.;FRO=22;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.0682467;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.657;QD=8.08973;RBI=0.068917;REFB=0.00773905;REVB=0.00958856;RO=21;SAF=2;SAR=7;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.31818;STB=0.68807;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=-0.0133941;OID=.;OPOS=42568929;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:31:31:21:22:9:9:0.290323:7:2:10:11:7:2:10:12
chr3	42610374	.	A	G	41.51	PASS	AF=0.170732;AO=7;DP=41;FAO=7;FDP=41;FR=.;FRO=34;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=24;FSRR=10;FWDB=-0.00846547;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=264.535;QD=4.04955;RBI=0.0191195;REFB=-0.00614756;REVB=-0.0171432;RO=34;SAF=5;SAR=2;SRF=24;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0122646;STB=0.50845;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0278168;OID=.;OPOS=42610374;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:41:41:34:34:7:7:0.170732:2:5:24:10:2:5:24:10
chr3	42700456	.	C	T	154.11	PASS	AF=0.228571;AO=21;DP=104;FAO=24;FDP=105;FR=.,HEALED;FRO=81;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=40;FSRR=41;FWDB=0.0173601;FXX=0.00943307;HRUN=5;LEN=1;MLLD=224.548;QD=5.87077;RBI=0.0326896;REFB=-0.0199437;REVB=-0.027699;RO=60;SAF=7;SAR=14;SRF=36;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.320257;STB=0.66293;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.0458538;OID=.;OPOS=42700456;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:105:60:81:21:24:0.228571:14:7:36:24:17:7:40:41
chr3	42700630	.	A	G	130.46	PASS	AF=0.191667;AO=23;DP=120;FAO=23;FDP=120;FR=.;FRO=97;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=49;FSRR=48;FWDB=-0.0154748;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.047;QD=4.34878;RBI=0.0230889;REFB=-0.00468142;REVB=-0.0171355;RO=97;SAF=8;SAR=15;SRF=49;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202401;STB=0.629025;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=0.0184753;OID=.;OPOS=42700630;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:120:97:97:23:23:0.191667:15:8:49:48:15:8:49:48
chr3	42728144	.	A	C,G	774.75	PASS	AF=0.0204082,0.979592;AO=2,47;DP=49;FAO=1,48;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=0,24;FSAR=1,24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0541026,-0.0413964;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=7.87845,120.867;QD=63.2449;RBI=0.0711949,0.0467754;REFB=0,0;REVB=-0.0462776,0.0217778;RO=0;SAF=0,24;SAR=2,23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.083668,0.00115415;OID=.,.;OPOS=42728144,42728144;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:4:49:49:0:0:2,47:1,48:0.0204082,0.979592:2,23:0,24:0:0:1,24:0,24:0:0
chr3	42733468	.	T	C	635.81	PASS	AF=1;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0543531;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.7387;QD=62.0306;RBI=0.0745003;REFB=0;REVB=0.0509512;RO=0;SAF=28;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.41168e-05;OID=.;OPOS=42733468;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:41:0:0:41:41:1:13:28:0:0:13:28:0:0
chr3	42735150	.	T	C	175.66	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0185838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.098;QD=46.8436;RBI=0.0210126;REFB=0;REVB=-0.00980667;RO=0;SAF=6;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000155095;OID=.;OPOS=42735150;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:9:6:0:0:9:6:0:0
chr3	42735274	.	A	G	340.68	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00927105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.805;QD=54.5079;RBI=0.0198845;REFB=0;REVB=-0.0175909;RO=0;SAF=13;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000144894;OID=.;OPOS=42735274;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:12:13:0:0:12:13:0:0
chr3	42826168	.	A	G	110.18	PASS	AF=0.916667;AO=11;DP=12;FAO=11;FDP=12;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00575947;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=114.464;QD=36.7275;RBI=0.0114924;REFB=-0.0769533;REVB=-0.00994508;RO=1;SAF=10;SAR=1;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0428878;STB=0.523767;STBP=0.669;TYPE=snp;VARB=0.0014446;OID=.;OPOS=42826168;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:12:12:1:1:11:11:0.916667:1:10:1:0:1:10:1:0
chr3	42907112	.	A	C	44.53	PASS	AF=0.28;AO=7;DP=25;FAO=7;FDP=25;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.00553102;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.708;QD=7.1251;RBI=0.0123085;REFB=-0.00535771;REVB=0.0109957;RO=18;SAF=3;SAR=4;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.204458;STB=0.628856;STBP=0.418;TYPE=snp;VARB=0.0209262;OID=.;OPOS=42907112;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:25:25:18:18:7:7:0.28:4:3:11:7:4:3:11:7
chr3	42908775	.	A	C	55.95	PASS	AF=0.333333;AO=8;DP=25;FAO=8;FDP=24;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.0729704;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.685;QD=9.32564;RBI=0.0738182;REFB=0.00137919;REVB=0.0111556;RO=17;SAF=6;SAR=2;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.323425;STB=0.716828;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=-0.00231176;OID=.;OPOS=42908775;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:25:24:17:16:8:8:0.333333:2:6:8:9:2:6:7:9
chr3	42917047	.	A	G	1561.23	PASS	AF=1;AO=97;DP=97;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00210646;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=307.447;QD=59.4754;RBI=0.0372861;REFB=0;REVB=0.0372266;RO=0;SAF=50;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.44886e-05;OID=.;OPOS=42917047;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:97:105:0:0:97:105:1:47:50:0:0:55:50:0:0
chr3	42954792	.	C	T	511.35	PASS	AF=0.77551;AO=38;DP=50;FAO=38;FDP=49;FR=.;FRO=11;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=2;FSRR=9;FWDB=-0.000334806;FXX=0.019996;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.81;QD=41.7429;RBI=0.012165;REFB=-0.0151384;REVB=-0.0121604;RO=10;SAF=23;SAR=15;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157892;STB=0.595419;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.00335143;OID=.;OPOS=42954792;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:50:49:10:11:38:38:0.77551:15:23:2:8:15:23:2:9
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chr3	42956519	.	C	A	205.91	PASS	AF=0.730769;AO=19;DP=26;FAO=19;FDP=26;FR=.;FRO=7;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.001955;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=299.388;QD=31.6788;RBI=0.00195598;REFB=-0.00472451;REVB=-6.17615e-05;RO=7;SAF=12;SAR=7;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0312435;STB=0.517223;STBP=0.795;TYPE=snp;VARB=0.00250029;OID=.;OPOS=42956519;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:26:26:7:7:19:19:0.730769:7:12:4:3:7:12:4:3
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chr3	43074430	.	A	G	35.31	PASS	AF=0.193548;AO=7;DP=32;FAO=6;FDP=31;FR=.;FRO=25;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.00695281;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=293.09;QD=4.55557;RBI=0.00735058;REFB=-0.00383735;REVB=0.00238524;RO=24;SAF=2;SAR=5;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.305167;STB=0.651662;STBP=0.457;TYPE=snp;VARB=0.0120086;OID=.;OPOS=43074430;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:32:31:24:25:7:6:0.193548:5:2:13:11:4:2:13:12
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chr3	43390387	.	C	CT	656.95	PASS	AF=1;AO=63;DP=80;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0500722;FXX=0.0128189;HRUN=4;LEN=1;MLLD=14.0647;QD=34.1273;RBI=0.135128;REFB=-0.0210955;REVB=-0.125509;RO=13;SAF=39;SAR=24;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.052751;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00305798;OID=.;OPOS=43390388;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:63:80:77:77:0:44:33:0:0:11:13:39:24:6:7
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chr3	43414318	.	A	G	1555.78	PASS	AF=1;AO=96;DP=96;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.041403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=293.162;QD=63.5013;RBI=0.0416166;REFB=0;REVB=-0.00421057;RO=0;SAF=45;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.43507e-05;OID=.;OPOS=43414318;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:96:98:0:0:96:98:1:51:45:0:0:52:46:0:0
chr3	43602803	.	C	T	613.24	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0277095;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=96.5058;QD=61.3243;RBI=0.0278308;REFB=0;REVB=0.00259539;RO=0;SAF=16;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0002842;OID=.;OPOS=43602803;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:24:16:0:0:24:16:0:0
chr3	43607136	.	T	C	465.14	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.014456;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=287.326;QD=58.1421;RBI=0.0150287;REFB=0;REVB=0.00410924;RO=0;SAF=11;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.2333e-05;OID=.;OPOS=43607136;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:21:11:0:0:21:11:0:0
chr3	44283672	.	T	C	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0905135;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.2606;QD=37.4882;RBI=0.0905135;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=8;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00692887;OID=.;OPOS=44283672;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:0:8:0:0:0:8:0:0
chr3	44283808	.	C	A	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0139402;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=265.242;QD=59.4348;RBI=0.0451466;REFB=0;REVB=0.0429405;RO=0;SAF=20;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.22577e-05;OID=.;OPOS=44283808;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:15:20:0:0:15:20:0:0
chr3	44284584	.	G	A	766.46	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0207863;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=222.253;QD=63.8719;RBI=0.0353841;REFB=0;REVB=-0.028635;RO=0;SAF=22;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.56493e-05;OID=.;OPOS=44284584;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:26:22:0:0:26:22:0:0
chr3	44540791	.	TTC	T,TTT	1217.71	PASS	AF=0.964706,0;AO=74,3;DP=85;FAO=82,0;FDP=85;FR=.;FRO=3;FSAF=34,0;FSAR=48,0;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0206411,-0.0311181;FXX=0.0229859;HRUN=5,1;LEN=2,1;MLLD=289.555,265.22;QD=57.3039;RBI=0.0285901,0.034454;REFB=-0.0100986,-0.00865534;REVB=-0.0197823,-0.0147898;RO=0;SAF=31,0;SAR=43,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.509131,0.5;STBP=0.392,1;TYPE=del,snp;VARB=0.000183306,0;OID=.,.;OPOS=44540792,44540793;OREF=TC,C;OALT=-,T;OMAPALT=T,TTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.964706,0:74,3:85:82,0:85:3:34,0:48,0:2:1:7:0:31,0:43,3:0:0
chr3	44612050	.	C	T	368.77	PASS	AF=1;AO=26;DP=27;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0409932;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.063;QD=52.6818;RBI=0.0429549;REFB=-0.0955922;REVB=0.012833;RO=0;SAF=10;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.71087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00276071;OID=.;OPOS=44612050;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:27:28:0:0:26:28:1:16:10:0:0:17:11:0:0
chr3	44692564	.	C	G	1139.21	PASS	AF=0.987013;AO=74;DP=76;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0082869;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.0186;QD=59.1796;RBI=0.0207903;REFB=-0.135969;REVB=0.0190673;RO=1;SAF=37;SAR=37;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0126148;STB=0.506492;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.00219404;OID=.;OPOS=44692564;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:76:77:1:1:74:76:0.987013:37:37:0:1:38:38:0:1
chr3	44763037	.	A	C	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0196823;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=215.242;QD=52.6122;RBI=0.0197431;REFB=0;REVB=0.00154774;RO=0;SAF=8;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.50693e-05;OID=.;OPOS=44763037;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:14:8:0:0:14:8:0:0
chr3	44775962	.	A	G	640.54	PASS	AF=1;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0193189;FXX=0.0465008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.43;QD=62.4915;RBI=0.021437;REFB=0;REVB=0.0092912;RO=0;SAF=17;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.2194e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000417507;OID=.;OPOS=44775962;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:41:0:0:41:41:1:24:17:0:0:24:17:0:0
chr3	44777795	.	CT	TC	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00157334;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=270.88;QD=51.9167;RBI=0.0165255;REFB=0;REVB=0.0164505;RO=0;SAF=11;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=4.5217e-05;OID=.;OPOS=44777795;OREF=CT;OALT=TC;OMAPALT=TC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:10:11:0:0:10:11:0:0
chr3	44869026	.	A	T	2536.81	PASS	AF=0.960674;AO=170;DP=178;FAO=171;FDP=178;FR=.;FRO=7;FSAF=71;FSAR=100;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=-0.0219875;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=50.1543;QD=57.0069;RBI=0.0590505;REFB=-0.236074;REVB=0.0548043;RO=2;SAF=71;SAR=99;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00951738;STB=0.516906;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.00845162;OID=.;OPOS=44869026;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:178:178:2:7:170:171:0.960674:99:71:0:2:100:71:0:7
chr3	44884647	.	C	A	831.27	PASS	AF=1;AO=57;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0193337;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=238.124;QD=57.329;RBI=0.0282511;REFB=0;REVB=0.0205992;RO=0;SAF=20;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.46177e-05;OID=.;OPOS=44884647;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:57:58:1:37:20:0:0:37:21:0:0
chr3	44929287	.	G	C	619.78	PASS	AF=0.97619;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0260198;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.0253;QD=59.0265;RBI=0.0326087;REFB=0.0460425;REVB=0.0196544;RO=0;SAF=14;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.517233;STBP=0.277;TYPE=snp;VARB=-0.000680166;OID=.;OPOS=44929287;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:42:42:0:1:41:41:0.97619:27:14:0:0:27:14:1:0
chr3	44943069	.	C	T	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00114344;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.574;QD=56.1916;RBI=0.00533399;REFB=0;REVB=-0.00520999;RO=0;SAF=12;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.2913e-06;OID=.;OPOS=44943069;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:16:12:0:0:16:12:0:0
chr3	44943389	.	G	A	1172.29	PASS	AF=1;AO=75;DP=76;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0114229;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.206;QD=60.8984;RBI=0.0440419;REFB=0;REVB=0.0425348;RO=0;SAF=33;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.61818e-05;OID=.;OPOS=44943389;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:77:0:0:75:77:1:42:33:0:0:44:33:0:0
chr3	44948479	.	C	T	709.19	PASS	AF=0.980769;AO=50;DP=52;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.027257;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=236.278;QD=54.5534;RBI=0.0355262;REFB=-0.0450959;REVB=0.0227852;RO=0;SAF=23;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509087;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.000255036;OID=.;OPOS=44948479;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:52:52:0:1:50:51:0.980769:27:23:0:0:27:24:0:1
chr3	44948590	.	G	A	817.98	PASS	AF=1;AO=54;DP=56;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0209385;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.229;QD=57.4021;RBI=0.02617;REFB=0;REVB=0.0156986;RO=0;SAF=22;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.64875e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.8938e-05;OID=.;OPOS=44948590;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:56:57:0:0:54:57:1:32:22:0:0:34:23:0:0
chr3	44968319	.	CT	C	240.85	PASS	AF=0.741935;AO=30;DP=57;FAO=46;FDP=62;FR=.;FRO=16;FSAF=33;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=-0.0653376;FXX=0.0158705;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.1716;QD=15.5386;RBI=0.0777921;REFB=-0.105825;REVB=-0.042221;RO=22;SAF=26;SAR=4;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.327537;STB=0.528655;STBP=0.526;TYPE=del;VARB=0.076509;OID=.;OPOS=44968320;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.741935:30:57:46:62:16:33:13:10:6:44:22:26:4:13:9
chr3	45052775	.	G	C	1624.41	PASS	AF=1;AO=108;DP=108;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0182353;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.106;QD=60.1633;RBI=0.0491487;REFB=0;REVB=0.0456406;RO=0;SAF=57;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60583e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.16225e-05;OID=.;OPOS=45052775;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:108:108:0:0:108:108:1:51:57:0:0:51:57:0:0
chr3	45077123	.	G	A	710.52	PASS	AF=0.9;AO=54;DP=61;FAO=54;FDP=60;FR=.;FRO=6;FSAF=27;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.0339082;FXX=0.0163908;HRUN=3;LEN=1;MLLD=145.302;QD=47.3679;RBI=0.0339359;REFB=-0.119317;REVB=0.00137236;RO=5;SAF=27;SAR=27;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0796447;STB=0.533321;STBP=0.131;TYPE=snp;VARB=0.00165448;OID=.;OPOS=45077123;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:61:60:5:6:54:54:0.9:27:27:0:5:27:27:1:5
chr3	45127515	.	T	C	955.28	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0725245;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.362;QD=58.7866;RBI=0.0865251;REFB=0;REVB=0.0471887;RO=0;SAF=31;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00118057;OID=.;OPOS=45127515;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:65:0:0:64:65:1:33:31:0:0:33:32:0:0
chr3	45134822	.	T	C	1064.74	PASS	AF=0.986301;AO=71;DP=72;FAO=72;FDP=73;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00440749;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.363;QD=58.342;RBI=0.00503542;REFB=-0.150509;REVB=-0.00243506;RO=0;SAF=35;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11607e-08;STB=0.506847;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.00049483;OID=.;OPOS=45134822;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:72:73:0:1:71:72:0.986301:36:35:0:0:36:36:1:0
chr3	45153708	.	G	A	1570.69	PASS	AF=0.858209;AO=113;DP=132;FAO=115;FDP=134;FR=.;FRO=19;FSAF=56;FSAR=59;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.016399;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.539;QD=46.8863;RBI=0.0167678;REFB=-0.0474221;REVB=0.00349738;RO=19;SAF=54;SAR=59;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0131689;STB=0.505582;STBP=0.757;TYPE=snp;VARB=0.00492961;OID=.;OPOS=45153708;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:90:132:134:19:19:113:115:0.858209:59:54:10:9:59:56:10:9
chr3	45527218	.	T	C	958.41	PASS	AF=1;AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.010915;FXX=0.0151492;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.647;QD=58.9793;RBI=0.0231587;REFB=0;REVB=0.0204252;RO=0;SAF=25;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.70296e-05;OID=.;OPOS=45527218;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:65:0:0:65:65:1:40:25:0:0:40:25:0:0
chr3	45533224	.	G	A	1251.72	PASS	AF=1;AO=80;DP=80;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0193514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.245;QD=61.0595;RBI=0.0276133;REFB=0;REVB=0.0196982;RO=0;SAF=40;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000125671;OID=.;OPOS=45533224;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:80:82:0:0:80:82:1:40:40:0:0:42:40:0:0
chr3	45557707	.	G	A	556.78	PASS	AF=0.680556;AO=49;DP=72;FAO=49;FDP=72;FR=.;FRO=23;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=0.0032321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.496;QD=30.9321;RBI=0.0213248;REFB=0.00650763;REVB=0.0210785;RO=23;SAF=25;SAR=24;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0324882;STB=0.517586;STBP=0.677;TYPE=snp;VARB=-0.00214771;OID=.;OPOS=45557707;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:23:23:49:49:0.680556:24:25:13:10:24:25:13:10
chr3	45559519	.	T	C	1098.73	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0222783;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.129;QD=60.2042;RBI=0.0265965;REFB=0;REVB=0.0145276;RO=0;SAF=34;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.47261e-05;OID=.;OPOS=45559519;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:39:34:0:0:39:34:0:0
chr3	45565554	.	A	G	1781.19	PASS	AF=0.983471;AO=118;DP=120;FAO=119;FDP=121;FR=.;FRO=2;FSAF=57;FSAR=62;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0349656;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.725;QD=58.8824;RBI=0.0371956;REFB=-0.0119508;REVB=-0.0126855;RO=2;SAF=56;SAR=62;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000806768;STB=0.500348;STBP=0.87;TYPE=snp;VARB=0.000671303;OID=.;OPOS=45565554;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:120:121:2:2:118:119:0.983471:62:56:1:1:62:57:1:1
chr3	45637253	.	C	T	901.65	PASS	AF=0.955224;AO=63;DP=67;FAO=64;FDP=67;FR=.;FRO=3;FSAF=35;FSAR=29;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.00919029;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=246.717;QD=53.8299;RBI=0.0293469;REFB=-0.00846423;REVB=0.0278707;RO=3;SAF=35;SAR=28;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0387693;STB=0.520542;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=4.109e-05;OID=.;OPOS=45637253;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:67:67:3:3:63:64:0.955224:28:35:3:0:29:35:3:0
chr3	45637439	.	T	C	3526.39	PASS	AF=1;AO=181;DP=216;FAO=223;FDP=223;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=107;FSAR=116;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0581074;FXX=0.00446409;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.077;QD=63.2536;RBI=0.0911626;REFB=0;REVB=0.0702435;RO=0;SAF=106;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.32579e-05;OID=.;OPOS=45637439;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:19:216:223:0:0:181:223:1:75:106:0:0:116:107:0:0
chr3	45722654	.	C	G	53.23	PASS	AF=0.160714;AO=9;DP=56;FAO=9;FDP=56;FR=.;FRO=47;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=19;FSRR=28;FWDB=0.00679545;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.7024;QD=3.80186;RBI=0.0204134;REFB=-0.00491366;REVB=-0.0192492;RO=47;SAF=4;SAR=5;SRF=19;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0503406;STB=0.534338;STBP=0.854;TYPE=snp;VARB=0.0434817;OID=.;OPOS=45722654;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:56:56:47:47:9:9:0.160714:5:4:19:28:5:4:19:28
chr3	45730482	.	C	G	81.57	PASS	AF=0.222222;AO=11;DP=54;FAO=12;FDP=54;FR=.;FRO=42;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=24;FSRR=18;FWDB=-0.0350658;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.8101;QD=6.04247;RBI=0.0542284;REFB=-0.00494965;REVB=0.0413655;RO=42;SAF=6;SAR=5;SRF=24;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0322986;STB=0.555464;STBP=0.67;TYPE=snp;VARB=0.016537;OID=.;OPOS=45730482;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:81:54:54:42:42:11:12:0.222222:5:6:24:18:6:6:24:18
chr3	45779136	.	A	T	816.93	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0123207;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.069;QD=57.3283;RBI=0.051254;REFB=0;REVB=0.0497511;RO=0;SAF=36;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.75811e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.74822e-05;OID=.;OPOS=45779136;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:55:57:0:0:55:57:1:19:36:0:0:21:36:0:0
chr3	45817418	.	A	G	1121.18	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0285835;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.447;QD=60.6042;RBI=0.0285851;REFB=0;REVB=0.000304468;RO=0;SAF=37;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000847741;OID=.;OPOS=45817418;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:37:37:0:0:37:37:0:0
chr3	45942608	.	G	A	46.72	PASS	AF=0.138462;AO=9;DP=65;FAO=9;FDP=65;FR=.;FRO=56;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=34;FSRR=22;FWDB=0.0136617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.3498;QD=2.87525;RBI=0.0519235;REFB=-0.0020067;REVB=-0.050094;RO=56;SAF=6;SAR=3;SRF=34;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0777913;STB=0.555429;STBP=0.762;TYPE=snp;VARB=0.0134316;OID=.;OPOS=45942608;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:65:65:56:56:9:9:0.138462:3:6:34:22:3:6:34:22
chr3	45959515	.	A	T	650.92	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0217658;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.253;QD=61.9921;RBI=0.0307434;REFB=0;REVB=0.0217119;RO=0;SAF=21;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.75385e-07;OID=.;OPOS=45959515;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:21:21:0:0:21:21:0:0
chr3	45959758	.	CT	C,CC	1179.37	PASS	AF=0.0128205,0.987179;AO=25,45;DP=70;FAO=1,77;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=0,41;FSAR=1,36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.078,0.0787463;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=222.065,229.814;QD=60.4806;RBI=0.0784071,0.0790648;REFB=0,0;REVB=0.00797933,0.00708948;RO=0;SAF=21,12;SAR=4,33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.661e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.00423789,0.00333573;OID=.,.;OPOS=45959759,45959759;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0128205,0.987179:25,45:70:1,77:78:0:0,41:1,36:0:0:8:0:21,12:4,33:0:0
chr3	45989044	.	T	G	375.67	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0443594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.444;QD=55.6545;RBI=0.0465959;REFB=0;REVB=0.0142625;RO=0;SAF=18;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000385443;OID=.;OPOS=45989044;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:9:18:0:0:9:18:0:0
chr3	45996761	.	G	A	1859.32	PASS	AF=1;AO=121;DP=121;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00486261;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.478;QD=61.4653;RBI=0.0152577;REFB=0;REVB=0.0144621;RO=0;SAF=64;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.75944e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.96571e-06;OID=.;OPOS=45996761;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:121:121:0:0:121:121:1:57:64:0:0:57:64:0:0
chr3	46008790	.	G	A	2037.19	PASS	AF=1;AO=130;DP=132;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0961892;FXX=0.0225547;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.9567;QD=62.6828;RBI=0.097188;REFB=0;REVB=0.0138972;RO=0;SAF=56;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.07652e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000146661;OID=.;OPOS=46008790;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:132:130:0:0:130:130:1:74:56:0:0:74:56:0:0
chr3	46009864	.	C	G	819.8	PASS	AF=0.983051;AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.068792;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.9605;QD=55.5794;RBI=0.0708043;REFB=-0.0939925;REVB=-0.0167602;RO=1;SAF=31;SAR=27;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0171508;STB=0.509088;STBP=0.334;TYPE=snp;VARB=0.00331085;OID=.;OPOS=46009864;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:59:59:1:1:58:58:0.983051:27:31:0:1:27:31:0:1
chr3	46010077	.	C	T	1291.67	PASS	AF=0.977011;AO=85;DP=87;FAO=85;FDP=87;FR=.;FRO=2;FSAF=45;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0231637;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=227.785;QD=59.3873;RBI=0.0231873;REFB=-0.102897;REVB=-0.00104383;RO=0;SAF=45;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.79153e-08;STB=0.500678;STBP=0.857;TYPE=snp;VARB=-2.14886e-07;OID=.;OPOS=46010077;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:87:87:0:2:85:85:0.977011:40:45:0:0:40:45:1:1
chr3	46021218	.	G	T	902.71	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0105247;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.366;QD=58.2396;RBI=0.0195527;REFB=0;REVB=0.0164785;RO=0;SAF=35;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.46408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.71168e-05;OID=.;OPOS=46021218;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:27:35:0:0:27:35:0:0
chr3	46416470	.	G	T	1075.52	PASS	AF=0.961538;AO=74;DP=79;FAO=75;FDP=78;FR=.;FRO=3;FSAF=29;FSAR=46;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.034066;FXX=0.0126566;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.2373;QD=55.1549;RBI=0.0713465;REFB=-0.15465;REVB=0.0626884;RO=5;SAF=29;SAR=45;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00101599;STB=0.511291;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.0101027;OID=.;OPOS=46416470;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:79:78:5:3:74:75:0.961538:45:29:2:3:46:29:2:1
chr3	46417312	.	G	T	374.4	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00591857;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.779;QD=55.4667;RBI=0.0211628;REFB=0;REVB=0.0203183;RO=0;SAF=13;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.21735e-05;OID=.;OPOS=46417312;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:27:0:0:26:27:1:13:13:0:0:13:14:0:0
chr3	46449978	.	A	C	1122.46	PASS	AF=0.974684;AO=75;DP=79;FAO=77;FDP=79;FR=.;FRO=2;FSAF=44;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0152131;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=168.006;QD=56.8334;RBI=0.0258146;REFB=0.00539285;REVB=0.0208556;RO=1;SAF=42;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141217;STB=0.514702;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=1.11178e-05;OID=.;OPOS=46449978;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:79:79:1:2:75:77:0.974684:33:42:0:1:33:44:0:2
chr3	46450070	.	T	A	1047.25	PASS	AF=0.986111;AO=71;DP=72;FAO=71;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=50;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0271307;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.211;QD=58.1806;RBI=0.0429623;REFB=-0.0864959;REVB=0.0333119;RO=1;SAF=50;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0219816;STB=0.511625;STBP=0.173;TYPE=snp;VARB=0.00305397;OID=.;OPOS=46450070;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:72:72:1:1:71:71:0.986111:21:50:0:1:21:50:0:1
chr3	46480801	.	A	G	417.98	PASS	AF=0.967742;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0213357;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.504;QD=53.9323;RBI=0.0270689;REFB=-0.14905;REVB=0.0166587;RO=1;SAF=18;SAR=12;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0372625;STB=0.519987;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.0072856;OID=.;OPOS=46480801;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:31:31:1:1:30:30:0.967742:12:18:0:1:12:18:0:1
chr3	46484964	.	G	A	1326.26	PASS	AF=1;AO=66;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=50;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00935133;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.6268;QD=61.6867;RBI=0.0145669;REFB=0;REVB=0.011169;RO=0;SAF=30;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00486409;OID=.;OPOS=46484964;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:86:0:0:66:86:1:36:30:0:0:36:50:0:0
chr3	46501213	.	T	C	1018.13	PASS	AF=0.972222;AO=70;DP=72;FAO=70;FDP=72;FR=.;FRO=2;FSAF=46;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.000709915;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=216.663;QD=56.5628;RBI=0.0108257;REFB=0.0160075;REVB=0.0108024;RO=2;SAF=46;SAR=24;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00912438;STB=0.504827;STBP=0.772;TYPE=snp;VARB=-6.32168e-05;OID=.;OPOS=46501213;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:72:72:2:2:70:70:0.972222:24:46:1:1:24:46:1:1
chr3	46501268	.	C	T	958.74	PASS	AF=0.985075;AO=66;DP=67;FAO=66;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00962499;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.077;QD=57.2381;RBI=0.00987924;REFB=-0.049272;REVB=0.00222689;RO=1;SAF=43;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0200972;STB=0.510635;STBP=0.263;TYPE=snp;VARB=-4.38893e-05;OID=.;OPOS=46501268;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:67:67:1:1:66:66:0.985075:23:43:0:1:23:43:0:1
chr3	46501284	.	C	CCTT	766.57	PASS	AF=1;AO=53;DP=57;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.021299;FXX=0;HRUN=2;LEN=3;MLLD=248.125;QD=56.783;RBI=0.0313977;REFB=0;REVB=0.0230688;RO=3;SAF=30;SAR=23;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0103374;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000102213;OID=.;OPOS=46501285;OREF=-;OALT=CTT;OMAPALT=CCTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:53:57:54:54:0:31:23:0:0:4:3:30:23:2:1
chr3	46509712	.	A	G	81.28	PASS	AF=0.275;AO=11;DP=40;FAO=11;FDP=40;FR=.;FRO=29;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=-0.00683981;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=195.114;QD=8.12762;RBI=0.0400562;REFB=-4.69735e-05;REVB=-0.0394679;RO=29;SAF=4;SAR=7;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0619944;STB=0.538391;STBP=0.783;TYPE=snp;VARB=-0.000469181;OID=.;OPOS=46509712;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:81:40:40:29:29:11:11:0.275:7:4:12:17:7:4:12:17
chr3	46580591	.	G	T	469.09	PASS	AF=0.745455;AO=41;DP=55;FAO=41;FDP=55;FR=.;FRO=14;FSAF=27;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=-0.0314232;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.511;QD=34.1153;RBI=0.0367105;REFB=-0.0507694;REVB=-0.0189799;RO=13;SAF=27;SAR=14;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0168524;STB=0.515929;STBP=0.735;TYPE=snp;VARB=0.0171126;OID=.;OPOS=46580591;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:55:55:13:14:41:41:0.745455:14:27:9:4:14:27:10:4
chr3	46620614	.	T	C	1821.76	PASS	AF=1;AO=119;DP=119;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0382705;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.7362;QD=61.2356;RBI=0.0492249;REFB=0;REVB=0.030959;RO=0;SAF=49;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.0618e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000209783;OID=.;OPOS=46620614;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:119:119:0:0:119:119:1:70:49:0:0:70:49:0:0
chr3	46621299	.	T	G	426.64	PASS	AF=0.74;AO=37;DP=51;FAO=37;FDP=50;FR=.;FRO=13;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=0.0147726;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.575;QD=34.131;RBI=0.0154542;REFB=-0.0299272;REVB=0.00453888;RO=13;SAF=18;SAR=19;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0490361;STB=0.52653;STBP=0.586;TYPE=snp;VARB=0.0129818;OID=.;OPOS=46621299;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:50:13:13:37:37:0.74:19:18:5:8:19:18:5:8
chr3	46654132	.	G	A	806.99	PASS	AF=0.761905;AO=64;DP=84;FAO=64;FDP=84;FR=.;FRO=20;FSAF=43;FSAR=21;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.0122228;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.414;QD=38.4279;RBI=0.0124909;REFB=-0.0172397;REVB=-0.00257419;RO=19;SAF=43;SAR=21;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0686437;STB=0.544957;STBP=0.167;TYPE=snp;VARB=0.00517451;OID=.;OPOS=46654132;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:19:20:64:64:0.761905:21:43:10:9:21:43:10:10
chr3	46658737	.	A	G	923.99	PASS	AF=0.984615;AO=63;DP=64;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0353965;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.8519;QD=56.8607;RBI=0.0676773;REFB=-0.107053;REVB=0.0576828;RO=0;SAF=28;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50704;STBP=0.536;TYPE=snp;VARB=0.00192487;OID=.;OPOS=46658737;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:64:65:0:1:63:64:0.984615:35:28:0:0:35:29:0:1
chr3	46713457	.	C	G	49.32	PASS	AF=0.135135;AO=10;DP=74;FAO=10;FDP=74;FR=.;FRO=64;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=36;FSRR=28;FWDB=0.0663707;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.6086;QD=2.66601;RBI=0.0663814;REFB=-0.000543455;REVB=0.00118923;RO=62;SAF=4;SAR=6;SRF=35;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199289;STB=0.638028;STBP=0.379;TYPE=snp;VARB=0.00726191;OID=.;OPOS=46713457;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:49:74:74:62:64:10:10:0.135135:6:4:35:27:6:4:36:28
chr3	46722692	.	G	T	41.82	PASS	AF=0.179487;AO=7;DP=38;FAO=7;FDP=39;FR=.;FRO=32;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=-0.0184911;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.6471;QD=4.28886;RBI=0.0209172;REFB=-0.000303019;REVB=-0.00977812;RO=31;SAF=4;SAR=3;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0280466;STB=0.533238;STBP=0.955;TYPE=snp;VARB=0.00202881;OID=.;OPOS=46722692;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:38:39:31:32:7:7:0.179487:3:4:17:14:3:4:17:15
chr3	46933960	.	C	G	274.87	PASS	AF=0.821429;AO=23;DP=28;FAO=23;FDP=28;FR=.;FRO=5;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=-0.0259126;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.8332;QD=39.267;RBI=0.0448524;REFB=-0.0119352;REVB=0.0366097;RO=5;SAF=13;SAR=10;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0793262;STB=0.543094;STBP=0.386;TYPE=snp;VARB=0.00284771;OID=.;OPOS=46933960;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:27:28:28:5:5:23:23:0.821429:10:13:4:1:10:13:4:1
chr3	46944274	.	T	C	389.53	PASS	AF=0.679245;AO=36;DP=54;FAO=36;FDP=53;FR=.;FRO=17;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=4;FWDB=0.0072926;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.8583;QD=29.3984;RBI=0.0244361;REFB=-0.0229533;REVB=0.0233225;RO=16;SAF=24;SAR=12;SRF=13;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0963854;STB=0.536212;STBP=0.488;TYPE=snp;VARB=0.0117008;OID=.;OPOS=46944274;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:53:16:17:36:36:0.679245:12:24:13:3:12:24:13:4
chr3	47018214	.	T	C	1171.99	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0278938;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.456;QD=60.8825;RBI=0.0279882;REFB=0;REVB=-0.00229732;RO=0;SAF=40;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.71093e-05;OID=.;OPOS=47018214;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:37:40:0:0:37:40:0:0
chr3	47043538	.	C	T	1717.56	PASS	AF=0.982906;AO=115;DP=117;FAO=115;FDP=117;FR=.;FRO=2;FSAF=55;FSAR=60;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0180407;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.2524;QD=58.7199;RBI=0.0180792;REFB=-0.00347011;REVB=-0.00117903;RO=2;SAF=55;SAR=60;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0169528;STB=0.508927;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=0.000579498;OID=.;OPOS=47043538;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:117:117:2:2:115:115:0.982906:60:55:2:0:60:55:2:0
chr3	47045606	.	G	A	99.41	PASS	AF=0.219178;AO=16;DP=73;FAO=16;FDP=73;FR=.;FRO=57;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=38;FSRR=19;FWDB=-0.0157592;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.2423;QD=5.44717;RBI=0.0510068;REFB=-0.000829548;REVB=0.0485112;RO=57;SAF=8;SAR=8;SRF=38;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.209844;STB=0.629985;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=0.00687131;OID=.;OPOS=47045606;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:57:57:16:16:0.219178:8:8:38:19:8:8:38:19
chr3	47045739	.	C	CG,G	148.62	PASS	AF=0.25,0.75;AO=2,12;DP=17;FAO=4,12;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=4,5;FSAR=0,7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0977458,0.0859752;FXX=0;HRUN=0,3;LEN=1,1;MLLD=99.8082,119.253;QD=37.1547;RBI=0.103638,0.0961444;REFB=-0.0841258,-0.0223882;REVB=0.0344457,0.043035;RO=3;SAF=2,5;SAR=0,7;SRF=3;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-0.206702;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.152059,-0.00315097;OID=.,.;OPOS=47045740,47045739;OREF=-,C;OALT=G,G;OMAPALT=CG,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:14:17:16:3:0:2,12:4,12:0.25,0.75:0,7:2,5:3:0:0,7:4,5:0:0
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chr3	47161214	.	T	C	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0267134;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.094;QD=51.9167;RBI=0.0268231;REFB=0;REVB=0.00242416;RO=0;SAF=9;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000119529;OID=.;OPOS=47161214;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:12:9:0:0:12:9:0:0
chr3	47162661	.	A	G	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.052742;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.793;QD=45.8068;RBI=0.053947;REFB=0;REVB=-0.0113383;RO=0;SAF=6;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000399366;OID=.;OPOS=47162661;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:8:6:0:0:8:6:0:0
chr3	47282303	.	G	A	711.52	PASS	AF=0.962963;AO=52;DP=54;FAO=52;FDP=54;FR=.;FRO=2;FSAF=22;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00469139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.147;QD=52.7051;RBI=0.0198431;REFB=-0.132202;REVB=-0.0192806;RO=2;SAF=22;SAR=30;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00548722;STB=0.502914;STBP=0.869;TYPE=snp;VARB=-0.000199121;OID=.;OPOS=47282303;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:54:54:2:2:52:52:0.962963:30:22:1:1:30:22:1:1
chr3	47322496	.	C	T	435.78	PASS	AF=0.96875;AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0377132;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.03;QD=54.4722;RBI=0.0735969;REFB=0.115806;REVB=0.0631999;RO=1;SAF=9;SAR=22;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0490246;STB=0.526298;STBP=0.194;TYPE=snp;VARB=-0.00318946;OID=.;OPOS=47322496;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:32:32:1:1:31:31:0.96875:22:9:1:0:22:9:1:0
chr3	47385585	.	C	A	581.33	PASS	AF=0.931818;AO=40;DP=44;FAO=41;FDP=44;FR=.;FRO=3;FSAF=27;FSAR=14;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0149493;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=38.621;QD=52.8484;RBI=0.0387974;REFB=-0.189045;REVB=0.0358016;RO=0;SAF=27;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.500616;STBP=0.965;TYPE=snp;VARB=0.0195255;OID=.;OPOS=47385585;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:44:44:0:3:40:41:0.931818:13:27:0:0:14:27:2:1
chr3	47386059	.	TG	CC	351.57	PASS	AF=1;AO=2;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.194766;FXX=0;HRUN=4;LEN=2;MLLD=48.6265;QD=54.0879;RBI=0.211117;REFB=0;REVB=0.0814653;RO=0;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.0113176;OID=.;OPOS=47386059;OREF=TG;OALT=CC;OMAPALT=CC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:2:26:1:2:0:0:0:16:10:0:0
chr3	47386874	.	A	G	153.0	PASS	AF=0.308824;AO=20;DP=69;FAO=21;FDP=68;FR=.;FRO=47;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=31;FWDB=0.012139;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.425;QD=8.99993;RBI=0.0151355;REFB=-0.0111756;REVB=-0.00904029;RO=44;SAF=9;SAR=11;SRF=13;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187017;STB=0.594814;STBP=0.33;TYPE=snp;VARB=0.0200753;OID=.;OPOS=47386874;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:68:44:47:20:21:0.308824:11:9:13:31:11:10:16:31
chr3	47449058	.	T	C	123.17	PASS	AF=0.923077;AO=12;DP=13;FAO=12;FDP=13;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0540931;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.775;QD=37.8982;RBI=0.0549753;REFB=-0.0318099;REVB=0.00980923;RO=1;SAF=6;SAR=6;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.069361;STB=0.538398;STBP=0.538;TYPE=snp;VARB=0.000823855;OID=.;OPOS=47449058;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:13:13:1:1:12:12:0.923077:6:6:0:1:6:6:0:1
chr3	47452087	.	G	A	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0258815;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.191;QD=43.4861;RBI=0.0337375;REFB=0;REVB=-0.0216418;RO=0;SAF=2;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.44626e-05;OID=.;OPOS=47452087;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:10:2:0:0:10:2:0:0
chr3	47452786	.	G	A	483.35	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0314907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.505;QD=58.5878;RBI=0.0343115;REFB=0;REVB=0.0136241;RO=0;SAF=11;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.49265e-05;OID=.;OPOS=47452786;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:22:11:0:0:22:11:0:0
chr3	47454399	.	G	A	114.88	PASS	AF=1;AO=7;DP=11;FAO=12;FDP=12;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.135086;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.6835;QD=38.2929;RBI=0.157471;REFB=0;REVB=0.0809248;RO=0;SAF=2;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.27427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0264436;OID=.;OPOS=47454399;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:12:0:0:7:12:1:5:2:0:0:9:3:0:0
chr3	47459679	.	C	T	1358.26	PASS	AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0277715;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.604;QD=62.4487;RBI=0.0283501;REFB=0;REVB=-0.00569816;RO=0;SAF=39;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.57206e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.02544e-05;OID=.;OPOS=47459679;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:48:39:0:0:48:39:0:0
chr3	47462200	.	T	C	445.4	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0138717;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.723;QD=57.4715;RBI=0.031899;REFB=0;REVB=0.0287249;RO=0;SAF=17;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.63861e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.60413e-05;OID=.;OPOS=47462200;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:31:0:0:30:31:1:13:17:0:0:14:17:0:0
chr3	47539751	.	T	C	1065.76	PASS	AF=1;AO=71;DP=72;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00586417;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.864;QD=60.0426;RBI=0.00719836;REFB=0;REVB=0.00417467;RO=0;SAF=35;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11607e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.99953e-05;OID=.;OPOS=47539751;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:71:0:0:71:71:1:36:35:0:0:36:35:0:0
chr3	47618953	.	C	A	332.55	PASS	AF=0.666667;AO=28;DP=43;FAO=28;FDP=42;FR=.;FRO=14;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.00570045;FXX=0.0232504;HRUN=3;LEN=1;MLLD=197.171;QD=31.6711;RBI=0.0115831;REFB=-0.00519842;REVB=0.0100834;RO=14;SAF=18;SAR=10;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0917027;STB=0.550323;STBP=0.376;TYPE=snp;VARB=0.00172528;OID=.;OPOS=47618953;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:42:14:14:28:28:0.666667:10:18:7:7:10:18:7:7
chr3	47645933	.	A	T	912.15	PASS	AF=0.786517;AO=69;DP=88;FAO=70;FDP=89;FR=.;FRO=19;FSAF=36;FSAR=34;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.0279023;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.1668;QD=40.9955;RBI=0.0386437;REFB=-0.00612733;REVB=-0.0267358;RO=19;SAF=35;SAR=34;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0502521;STB=0.525089;STBP=0.368;TYPE=snp;VARB=0.00177089;OID=.;OPOS=47645933;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:89:19:19:69:70:0.786517:34:35:12:7:34:36:12:7
chr3	47956424	.	C	T	81.87	PASS	AF=0.16129;AO=15;DP=93;FAO=15;FDP=93;FR=.;FRO=78;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=37;FSRR=41;FWDB=0.0295989;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.871;QD=3.52139;RBI=0.0296444;REFB=-0.000574697;REVB=-0.00164218;RO=78;SAF=8;SAR=7;SRF=37;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0739536;STB=0.549291;STBP=0.683;TYPE=snp;VARB=0.00316652;OID=.;OPOS=47956424;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:81:93:93:78:78:15:15:0.16129:7:8:37:41:7:8:37:41
chr3	47958037	.	G	T	78.65	PASS	AF=0.203125;AO=13;DP=64;FAO=13;FDP=64;FR=.;FRO=51;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=25;FSRR=26;FWDB=-0.0495786;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=247.044;QD=4.91571;RBI=0.0502323;REFB=-0.00454477;REVB=-0.00807743;RO=50;SAF=3;SAR=10;SRF=25;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.350644;STB=0.72129;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=0.0185631;OID=.;OPOS=47958037;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:64:64:50:51:13:13:0.203125:10:3:25:25:10:3:25:26
chr3	48229344	.	C	T	45.01	PASS	AF=0.100917;AO=10;DP=108;FAO=11;FDP=109;FR=.;FRO=98;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=45;FSRR=53;FWDB=0.00159263;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.583;QD=1.65186;RBI=0.0072545;REFB=-0.000216394;REVB=-0.00707752;RO=94;SAF=5;SAR=5;SRF=42;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0620815;STB=0.576976;STBP=0.595;TYPE=snp;VARB=0.00417453;OID=.;OPOS=48229344;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:108:109:94:98:10:11:0.100917:5:5:42:52:5:6:45:53
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chr3	48419897	.	C	T	511.23	PASS	AF=0.785714;AO=43;DP=55;FAO=44;FDP=56;FR=.;FRO=12;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=0.0382811;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.8981;QD=36.5163;RBI=0.0419816;REFB=0.00228172;REVB=-0.0172339;RO=11;SAF=24;SAR=19;SRF=2;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141975;STB=0.585583;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.000937195;OID=.;OPOS=48419897;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:55:56:11:12:43:44:0.785714:19:24:2:9:19:25:2:10
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chr3	48620881	.	G	A	514.47	PASS	AF=0.823529;AO=42;DP=51;FAO=42;FDP=51;FR=.;FRO=9;FSAF=28;FSAR=14;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.0243385;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=256.728;QD=40.3505;RBI=0.0243543;REFB=-0.00491635;REVB=-0.000876449;RO=9;SAF=28;SAR=14;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0796736;STB=0.542836;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=0.000978859;OID=.;OPOS=48620881;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:51:51:9:9:42:42:0.823529:14:28:4:5:14:28:4:5
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chr3	48628014	.	G	A	271.16	PASS	AF=0.793103;AO=23;DP=29;FAO=23;FDP=29;FR=.;FRO=6;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0.0303932;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.38;QD=37.4017;RBI=0.031627;REFB=-0.0270176;REVB=-0.00874762;RO=6;SAF=10;SAR=13;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17268;STB=0.593673;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.0119143;OID=.;OPOS=48628014;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:29:29:6:6:23:23:0.793103:13:10:0:6:13:10:0:6
chr3	48669447	.	C	T	281.35	PASS	AF=1;AO=21;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00611182;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.5442;QD=51.1542;RBI=0.0198736;REFB=0;REVB=0.0189104;RO=0;SAF=8;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00361798;OID=.;OPOS=48669447;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:21:22:1:13:8:0:0:13:9:0:0
chr3	48681053	.	C	T	669.78	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0371409;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=73.472;QD=62.3049;RBI=0.0374279;REFB=0;REVB=0.00462596;RO=0;SAF=23;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000543186;OID=.;OPOS=48681053;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:43:0:0:42:43:1:19:23:0:0:19:24:0:0
chr3	48691316	.	T	C	1532.02	PASS	AF=0.989796;AO=86;DP=98;FAO=97;FDP=98;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=57;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.125469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.5077;QD=62.5313;RBI=0.142649;REFB=-0.0592195;REVB=0.0678686;RO=1;SAF=47;SAR=39;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00997443;STB=0.504347;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.00320737;OID=.;OPOS=48691316;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:98:98:1:1:86:97:0.989796:39:47:1:0:40:57:1:0
chr3	48697654	.	C	G	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00300495;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.727;QD=59.4356;RBI=0.00739163;REFB=0;REVB=-0.00675326;RO=0;SAF=20;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.76323e-05;OID=.;OPOS=48697654;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:15:20:0:0:15:20:0:0
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chr3	49053219	.	A	G,T	995.56	PASS	AF=0.956522,0.0434783;AO=63,3;DP=67;FAO=66,3;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=35,2;FSAR=31,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00454975,-0.00877198;FXX=0.0142837;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=122.017,127.306;QD=57.7135;RBI=0.00752124,0.00877382;REFB=0,0;REVB=0.00598905,0.000179668;RO=0;SAF=33,2;SAR=30,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00227021,0.0336099;OID=.,.;OPOS=49053219,49053219;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:10:67:69:0:0:63,3:66,3:0.956522,0.0434783:30,1:33,2:0:0:31,1:35,2:0:0
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chr3	49061790	.	A	C	30.81	PASS	AF=0.0877193;AO=4;DP=58;FAO=5;FDP=57;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=50;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=18;FSRR=32;FWDB=0.0243894;FXX=0.0172384;HRUN=9;LEN=1;MLLD=24.7301;QD=2.16243;RBI=0.0619651;REFB=-0.0196023;REVB=0.0569635;RO=33;SAF=3;SAR=1;SRF=10;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.465852;STB=0.707584;STBP=0.442;TYPE=snp;VARB=0.0480103;OID=.;OPOS=49061790;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:58:57:33:50:4:5:0.0877193:1:3:10:23:2:3:18:32
chr3	49067904	.	T	C	221.11	PASS	AF=0.6;AO=21;DP=35;FAO=21;FDP=35;FR=.;FRO=14;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.0199907;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.663;QD=25.2696;RBI=0.0232191;REFB=-0.0300483;REVB=-0.011811;RO=14;SAF=9;SAR=12;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=0.999;TYPE=snp;VARB=0.0265224;OID=.;OPOS=49067904;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:14:14:21:21:0.6:12:9:6:8:12:9:6:8
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chr3	49156473	.	C	G	685.88	PASS	AF=0.808824;AO=55;DP=68;FAO=55;FDP=68;FR=.;FRO=13;FSAF=25;FSAR=30;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=-0.0176399;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=215.811;QD=40.3458;RBI=0.0178889;REFB=-0.0112228;REVB=0.00297465;RO=13;SAF=25;SAR=30;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0848956;STB=0.545438;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=0.00227118;OID=.;OPOS=49156473;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:68:68:13:13:55:55:0.808824:30:25:9:4:30:25:9:4
chr3	49200627	.	A	G	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0359342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.721;QD=40.7628;RBI=0.0375076;REFB=0;REVB=0.0107495;RO=0;SAF=3;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000767286;OID=.;OPOS=49200627;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:7:3:0:0:7:3:0:0
chr3	49200692	.	T	A	300.12	PASS	AF=0.958333;AO=23;DP=24;FAO=23;FDP=24;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0487596;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.8936;QD=50.0191;RBI=0.120788;REFB=-0.0283252;REVB=0.110509;RO=1;SAF=19;SAR=4;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102305;STB=0.555504;STBP=0.11;TYPE=snp;VARB=0.00328486;OID=.;OPOS=49200692;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:24:24:1:1:23:23:0.958333:4:19:0:1:4:19:0:1
chr3	49273996	.	C	T	192.81	PASS	AF=0.894737;AO=16;DP=19;FAO=17;FDP=19;FR=.;FRO=2;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0100315;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.486;QD=40.5907;RBI=0.0112895;REFB=-0.0607503;REVB=0.00517895;RO=0;SAF=9;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.545402;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=0.0137901;OID=.;OPOS=49273996;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:19:19:0:2:16:17:0.894737:7:9:0:0:7:10:2:0
chr3	49298139	.	G	A	538.97	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0327085;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.8013;QD=59.8852;RBI=0.0389249;REFB=0;REVB=0.0211021;RO=0;SAF=17;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000131696;OID=.;OPOS=49298139;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:36:0:0:35:36:1:18:17:0:0:19:17:0:0
chr3	49298205	.	T	C	632.21	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0621173;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.968;QD=61.6787;RBI=0.0714201;REFB=0;REVB=0.0352458;RO=0;SAF=22;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.40643e-05;OID=.;OPOS=49298205;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:19:22:0:0:19:22:0:0
chr3	49548008	.	C	G	681.21	PASS	AF=0.962264;AO=50;DP=53;FAO=51;FDP=53;FR=.;FRO=2;FSAF=21;FSAR=30;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0228445;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.4275;QD=51.4118;RBI=0.0231141;REFB=-0.0709594;REVB=0.00351971;RO=2;SAF=20;SAR=30;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0447671;STB=0.522718;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=0.000903178;OID=.;OPOS=49548008;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:53:53:2:2:50:51:0.962264:30:20:2:0:30:21:2:0
chr3	49570882	.	T	C	1120.65	PASS	AF=0.986842;AO=75;DP=76;FAO=75;FDP=76;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0335074;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.341;QD=58.9814;RBI=0.0335802;REFB=-0.0322817;REVB=0.00220895;RO=1;SAF=39;SAR=36;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0129618;STB=0.506848;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.00175988;OID=.;OPOS=49570882;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:76:76:1:1:75:75:0.986842:36:39:0:1:36:39:0:1
chr3	49690199	.	G	A	1346.97	PASS	AF=0.988636;AO=87;DP=89;FAO=87;FDP=88;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0394634;FXX=0.0112347;HRUN=2;LEN=1;MLLD=227.686;QD=61.2257;RBI=0.0634007;REFB=-0.0542974;REVB=0.0496215;RO=1;SAF=46;SAR=41;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0101897;STB=0.505375;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.000179394;OID=.;OPOS=49690199;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:89:88:1:1:87:87:0.988636:41:46:1:0:41:46:1:0
chr3	49701298	.	G	A	1533.51	PASS	AF=0.989796;AO=97;DP=98;FAO=97;FDP=98;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=58;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0138882;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.453;QD=62.5924;RBI=0.0177909;REFB=-0.0670839;REVB=-0.0111191;RO=1;SAF=39;SAR=58;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.012005;STB=0.506328;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=0.000318971;OID=.;OPOS=49701298;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:98:98:1:1:97:97:0.989796:58:39:1:0:58:39:1:0
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chr3	49723784	.	C	A	82.06	PASS	AF=0.9;AO=9;DP=10;FAO=9;FDP=10;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00385204;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.954;QD=32.822;RBI=0.0669096;REFB=-0.0598271;REVB=0.0667986;RO=1;SAF=4;SAR=5;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.080744;STB=0.545355;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.00210452;OID=.;OPOS=49723784;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:10:10:1:1:9:9:0.9:5:4:0:1:5:4:0:1
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chr3	49736537	.	C	T	238.56	PASS	AF=0.869565;AO=20;DP=24;FAO=20;FDP=23;FR=.;FRO=3;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0442337;FXX=0.0416493;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.2325;QD=41.4894;RBI=0.0481858;REFB=0.00638045;REVB=-0.0191115;RO=3;SAF=8;SAR=12;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0166773;STB=0.509082;STBP=0.923;TYPE=snp;VARB=-0.000196969;OID=.;OPOS=49736537;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:24:23:3:3:20:20:0.869565:12:8:1:2:12:8:1:2
chr3	49739507	.	G	C	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0726804;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.7333;QD=40.7626;RBI=0.072787;REFB=0;REVB=0.00393812;RO=0;SAF=6;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00366662;OID=.;OPOS=49739507;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:4:6:0:0:4:6:0:0
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chr3	49928691	.	T	C	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.968;QD=46.8475;RBI=0.0731716;REFB=0;REVB=0.0716557;RO=0;SAF=8;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00143269;OID=.;OPOS=49928691;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:7:8:0:0:7:8:0:0
chr3	50114515	.	C	T	411.12	PASS	AF=1;AO=28;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00686065;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194;QD=56.7065;RBI=0.00780716;REFB=0;REVB=0.00372602;RO=0;SAF=18;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.51841e-05;OID=.;OPOS=50114515;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:28:29:1:10:18:0:0:10:19:0:0
chr3	50129399	.	C	T	538.51	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0107758;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.633;QD=59.834;RBI=0.051655;REFB=0;REVB=-0.0505185;RO=0;SAF=16;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.9376e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000224155;OID=.;OPOS=50129399;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:20:16:0:0:20:16:0:0
chr3	50144951	.	T	C	610.14	PASS	AF=0.953488;AO=41;DP=43;FAO=41;FDP=43;FR=.;FRO=2;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0231422;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.4157;QD=56.7567;RBI=0.0286163;REFB=-0.09167;REVB=-0.0168325;RO=2;SAF=20;SAR=21;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0426083;STB=0.522716;STBP=0.221;TYPE=snp;VARB=0.00410701;OID=.;OPOS=50144951;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:43:43:2:2:41:41:0.953488:21:20:0:2:21:20:0:2
chr3	50153356	.	T	C	817.72	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00666457;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.109;QD=57.3837;RBI=0.018796;REFB=0;REVB=0.0175747;RO=0;SAF=32;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.6035e-05;OID=.;OPOS=50153356;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:25:32:0:0:25:32:0:0
chr3	50197092	.	C	T	865.18	PASS	AF=0.96875;AO=60;DP=61;FAO=62;FDP=64;FR=.;FRO=2;FSAF=28;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0339677;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.1811;QD=54.0737;RBI=0.0485538;REFB=-0.0199179;REVB=0.0346939;RO=0;SAF=26;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.501525;STBP=0.89;TYPE=snp;VARB=0.00333564;OID=.;OPOS=50197092;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:61:64:0:2:60:62:0.96875:34:26:0:0:34:28:1:1
chr3	50222926	.	T	A	546.04	PASS	AF=0.973684;AO=36;DP=37;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0256828;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.336;QD=57.4779;RBI=0.0503011;REFB=-0.103928;REVB=0.0432503;RO=1;SAF=23;SAR=13;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0346393;STB=0.517232;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=0.000925048;OID=.;OPOS=50222926;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:37:38:1:1:36:37:0.973684:13:23:0:1:14:23:0:1
chr3	50251833	.	A	AG	320.77	PASS	AF=1;AO=29;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0467707;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=19.2981;QD=41.3894;RBI=0.160811;REFB=0;REVB=0.153859;RO=1;SAF=15;SAR=14;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.03211;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00947248;OID=.;OPOS=50251834;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:29:31:31:31:0:16:15:0:0:6:1:15:14:0:1
chr3	50311899	.	AC	A,AT	666.19	PASS	AF=0.159091,0.840909;AO=7,36;DP=44;FAO=7,37;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=4,16;FSAR=3,21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00905519,-0.00770677;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=248.678,268.051;QD=60.5628;RBI=0.0473695,0.0434926;REFB=0,0;REVB=0.046496,0.0428043;RO=0;SAF=5,15;SAR=2,21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.27427e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0181361,0.00314359;OID=.,.;OPOS=50311900,50311900;OREF=C,C;OALT=-,T;OMAPALT=A,AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.159091,0.840909:7,36:44:7,37:44:0:4,16:3,21:0:0:38:0:5,15:2,21:0:0
chr3	50326020	.	G	A	447.03	PASS	AF=1;AO=30;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00868081;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.116;QD=57.6807;RBI=0.0102567;REFB=0;REVB=0.005463;RO=0;SAF=14;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.56309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.66795e-05;OID=.;OPOS=50326020;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:30:31:1:16:14:0:0:17:14:0:0
chr3	50327429	.	A	G	191.26	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0227136;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.6816;QD=47.8148;RBI=0.0638121;REFB=0;REVB=-0.0596329;RO=0;SAF=9;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00356121;OID=.;OPOS=50327429;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:7:9:0:0:7:9:0:0
chr3	50329825	.	CA	CG,GG	350.81	PASS	AF=0.923077,0.0769231;AO=24,2;DP=26;FAO=24,2;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=12,2;FSAR=12,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.046892,0.046506;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=1,2;MLLD=163.307,125.776;QD=53.9711;RBI=0.0738732,0.0733112;REFB=0,0;REVB=0.0570824,0.0566721;RO=0;SAF=12,2;SAR=12,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=-0.00243366,0.114002;OID=.,.;OPOS=50329826,50329825;OREF=A,CA;OALT=G,GG;OMAPALT=CG,GG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:26:26:0:0:24,2:24,2:0.923077,0.0769231:12,0:12,2:0:0:12,0:12,2:0:0
chr3	50330383	.	T	C	716.15	PASS	AF=0.903226;AO=50;DP=56;FAO=56;FDP=62;FR=.;FRO=6;FSAF=19;FSAR=37;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0474009;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.611;QD=46.203;RBI=0.0554615;REFB=-0.0674746;REVB=0.0287946;RO=6;SAF=13;SAR=37;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0189411;STB=0.500642;STBP=0.958;TYPE=snp;VARB=0.00795686;OID=.;OPOS=50330383;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:56:62:6:6:50:56:0.903226:37:13:2:4:37:19:2:4
chr3	50334231	.	T	A	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0104333;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.449;QD=51.1846;RBI=0.0104333;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=20;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.09685e-05;OID=.;OPOS=50334231;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:0:20:0:0:0:20:0:0
chr3	50336661	.	T	C	766.21	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0144588;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.589;QD=63.8512;RBI=0.0166269;REFB=0;REVB=0.0082097;RO=0;SAF=23;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.14389e-05;OID=.;OPOS=50336661;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:25:23:0:0:25:23:0:0
chr3	50355730	.	T	G	594.5	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0193757;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.483;QD=60.9744;RBI=0.0207353;REFB=0;REVB=-0.0073847;RO=0;SAF=16;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.43889e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.77379e-05;OID=.;OPOS=50355730;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:23:16:0:0:23:16:0:0
chr3	50357869	.	A	C	651.21	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0174722;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.4897;QD=62.02;RBI=0.0383585;REFB=0;REVB=-0.0341482;RO=0;SAF=25;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.98888e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000135333;OID=.;OPOS=50357869;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:17:25:0:0:17:25:0:0
chr3	50367867	.	A	C	557.13	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00447738;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.653;QD=60.2303;RBI=0.00481089;REFB=0;REVB=0.00176004;RO=0;SAF=23;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.21415e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.81078e-05;OID=.;OPOS=50367867;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:37:0:0:36:37:1:13:23:0:0:14:23:0:0
chr3	50401841	.	G	A	722.94	PASS	AF=0.931034;AO=54;DP=58;FAO=54;FDP=58;FR=.;FRO=4;FSAF=16;FSAR=38;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.160734;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=44.0501;QD=49.8577;RBI=0.184359;REFB=-0.0698791;REVB=0.090292;RO=2;SAF=17;SAR=37;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0143499;STB=0.53639;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=0.00776224;OID=.;OPOS=50401841;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:16:58:58:2:4:54:54:0.931034:37:17:1:1:38:16:3:1
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chr3	50597092	.	G	A	287.38	PASS	AF=0.8;AO=24;DP=30;FAO=24;FDP=30;FR=.;FRO=6;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.0038473;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.996;QD=38.3172;RBI=0.0617021;REFB=-0.0657165;REVB=0.0615821;RO=6;SAF=9;SAR=15;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0482757;STB=0.526294;STBP=0.59;TYPE=snp;VARB=0.00869635;OID=.;OPOS=50597092;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:30:30:6:6:24:24:0.8:15:9:3:3:15:9:3:3
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chr3	51431981	.	C	CTTAT	261.89	PASS	AF=0.766667;AO=20;DP=33;FAO=23;FDP=30;FR=.;FRO=7;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.0226951;FXX=0.0322477;HRUN=2;LEN=4;MLLD=296.238;QD=34.918;RBI=0.0312374;REFB=-0.0218458;REVB=0.0214642;RO=9;SAF=11;SAR=9;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00315393;STB=0.526131;STBP=0.608;TYPE=ins;VARB=0.00874734;OID=.;OPOS=51431982;OREF=-;OALT=TTAT;OMAPALT=CTTAT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.766667:20:33:23:30:7:14:9:5:2:44:9:11:9:5:4
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chr3	51432895	.	T	C	554.85	PASS	AF=0.95;AO=38;DP=40;FAO=38;FDP=40;FR=.;FRO=2;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0230483;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.298;QD=55.4846;RBI=0.0316686;REFB=-0.12569;REVB=0.0217181;RO=2;SAF=22;SAR=16;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0550239;STB=0.529396;STBP=0.139;TYPE=snp;VARB=0.00327647;OID=.;OPOS=51432895;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:40:40:2:2:38:38:0.95:16:22:0:2:16:22:0:2
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chr3	52360318	.	T	C	187.95	PASS	AF=0.389831;AO=23;DP=57;FAO=23;FDP=59;FR=.;FRO=36;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=-0.00707137;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.877;QD=12.7426;RBI=0.0183807;REFB=-0.0196391;REVB=-0.016966;RO=34;SAF=17;SAR=6;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.212678;STB=0.627399;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=0.0229927;OID=.;OPOS=52360318;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:59:34:36:23:23:0.389831:6:17:19:15:6:17:20:16
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chr3	52385992	.	A	G	43.83	PASS	AF=0.25;AO=7;DP=28;FAO=7;FDP=28;FR=.;FRO=21;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=17;FWDB=-0.000698524;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.379;QD=6.26132;RBI=0.0128795;REFB=-0.00594861;REVB=-0.0128606;RO=21;SAF=2;SAR=5;SRF=4;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150025;STB=0.594353;STBP=0.699;TYPE=snp;VARB=0.0224271;OID=.;OPOS=52385992;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:28:28:21:21:7:7:0.25:5:2:4:17:5:2:4:17
chr3	52387181	.	G	A	396.59	PASS	AF=0.428571;AO=45;DP=105;FAO=45;FDP=105;FR=.;FRO=60;FSAF=25;FSAR=20;FSRF=27;FSRR=33;FWDB=0.0135223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.813;QD=15.1081;RBI=0.0337392;REFB=-0.0123268;REVB=0.0309108;RO=59;SAF=25;SAR=20;SRF=27;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0989324;STB=0.560227;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.021641;OID=.;OPOS=52387181;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:105:59:60:45:45:0.428571:20:25:27:32:20:25:27:33
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chr3	52453893	.	C	T	794.94	PASS	AF=1;AO=47;DP=48;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0138109;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.004;QD=63.595;RBI=0.0514885;REFB=0;REVB=0.0496017;RO=0;SAF=29;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000153099;OID=.;OPOS=52453893;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:50:0:0:47:50:1:18:29:0:0:20:30:0:0
chr3	52454214	.	A	G	162.19	PASS	AF=0.37037;AO=20;DP=54;FAO=20;FDP=54;FR=.;FRO=34;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=22;FSRR=12;FWDB=0.0167418;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.1461;QD=12.0143;RBI=0.0175503;REFB=0.000671768;REVB=0.0052654;RO=34;SAF=13;SAR=7;SRF=22;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00349563;STB=0.50203;STBP=0.981;TYPE=snp;VARB=-0.000462033;OID=.;OPOS=52454214;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:34:34:20:20:0.37037:7:13:22:12:7:13:22:12
chr3	52454268	.	A	G	295.76	PASS	AF=0.534483;AO=31;DP=58;FAO=31;FDP=58;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=0.0164838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.925;QD=20.3971;RBI=0.0165437;REFB=-0.0341988;REVB=0.00140729;RO=27;SAF=15;SAR=16;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0600255;STB=0.533312;STBP=0.622;TYPE=snp;VARB=0.0338199;OID=.;OPOS=52454268;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:27:27:31:31:0.534483:16:15:15:12:16:15:15:12
chr3	52456833	.	C	T	228.2	PASS	AF=0.409091;AO=27;DP=66;FAO=27;FDP=66;FR=.;FRO=39;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=0.00958055;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.428;QD=13.8304;RBI=0.027476;REFB=-0.00587204;REVB=0.0257516;RO=39;SAF=14;SAR=13;SRF=18;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0589723;STB=0.533607;STBP=0.663;TYPE=snp;VARB=0.00847361;OID=.;OPOS=52456833;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:39:39:27:27:0.409091:13:14:18:21:13:14:18:21
chr3	52457282	.	C	T	260.15	PASS	AF=0.467742;AO=29;DP=62;FAO=29;FDP=62;FR=.;FRO=33;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=0.0494716;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.5045;QD=16.7841;RBI=0.049888;REFB=0.00933573;REVB=0.00643253;RO=32;SAF=14;SAR=15;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0452709;STB=0.517229;STBP=0.838;TYPE=snp;VARB=-0.00955215;OID=.;OPOS=52457282;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:32:33:29:29:0.467742:15:14:17:15:15:14:17:16
chr3	52474480	.	A	G	622.67	PASS	AF=0.436709;AO=69;DP=158;FAO=69;FDP=158;FR=.;FRO=89;FSAF=42;FSAR=27;FSRF=52;FSRR=37;FWDB=-0.0123352;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=308.202;QD=15.7639;RBI=0.0132865;REFB=-0.000643151;REVB=-0.00493717;RO=89;SAF=42;SAR=27;SRF=52;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0257064;STB=0.514347;STBP=0.776;TYPE=snp;VARB=0.0007802;OID=.;OPOS=52474480;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:158:158:89:89:69:69:0.436709:27:42:52:37:27:42:52:37
chr3	52477080	.	T	C	169.49	PASS	AF=0.439024;AO=18;DP=41;FAO=18;FDP=41;FR=.;FRO=23;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=0.0144166;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.523;QD=16.5358;RBI=0.0193217;REFB=-0.00189501;REVB=0.0128642;RO=23;SAF=13;SAR=5;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.369579;STB=0.71209;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.0027959;OID=.;OPOS=52477080;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:23:23:18:18:0.439024:5:13:8:15:5:13:8:15
chr3	52492707	.	T	C	411.59	PASS	AF=0.525641;AO=39;DP=77;FAO=41;FDP=78;FR=.;FRO=37;FSAF=26;FSAR=15;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=0.0174604;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.448;QD=21.107;RBI=0.0200634;REFB=-0.0190092;REVB=0.00988303;RO=37;SAF=26;SAR=13;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0942115;STB=0.533405;STBP=0.548;TYPE=snp;VARB=0.0189813;OID=.;OPOS=52492707;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:78:37:37:39:41:0.525641:13:26:21:16:15:26:21:16
chr3	52510592	.	G	A	632.26	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0230274;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.243;QD=61.6835;RBI=0.0234738;REFB=0;REVB=0.0045561;RO=0;SAF=15;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000106788;OID=.;OPOS=52510592;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:26:15:0:0:26:15:0:0
chr3	52522591	.	C	T	467.56	PASS	AF=0.494624;AO=46;DP=93;FAO=46;FDP=93;FR=.;FRO=47;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=28;FSRR=19;FWDB=0.043052;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.0231;QD=20.1102;RBI=0.0606943;REFB=-0.00483588;REVB=0.0427823;RO=44;SAF=25;SAR=21;SRF=25;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0220476;STB=0.526728;STBP=0.625;TYPE=snp;VARB=0.00492637;OID=.;OPOS=52522591;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:44:47:46:46:0.494624:21:25:25:19:21:25:28:19
chr3	52523405	.	C	T	210.36	PASS	AF=0.477273;AO=21;DP=44;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=20;FSAR=1;FSRF=22;FSRR=1;FWDB=0.0933376;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.2678;QD=19.1239;RBI=0.0965531;REFB=-0.0496847;REVB=0.02471;RO=23;SAF=20;SAR=1;SRF=22;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0215825;STB=0.512184;STBP=0.88;TYPE=snp;VARB=0.0798937;OID=.;OPOS=52523405;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:23:23:21:21:0.477273:1:20:22:1:1:20:22:1
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chr3	52540809	.	G	A	408.53	PASS	AF=0.419643;AO=46;DP=111;FAO=47;FDP=112;FR=.;FRO=65;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=36;FSRR=29;FWDB=-0.0260971;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.737;QD=14.5902;RBI=0.0326931;REFB=-0.00865451;REVB=0.0196921;RO=64;SAF=23;SAR=23;SRF=35;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0484421;STB=0.525104;STBP=0.668;TYPE=snp;VARB=0.0103212;OID=.;OPOS=52540809;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:112:64:65:46:47:0.419643:23:23:35:29:23:24:36:29
chr3	52544470	.	A	G	770.14	PASS	AF=1;AO=48;DP=49;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00995353;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.3914;QD=61.6115;RBI=0.0258254;REFB=-0.0459035;REVB=-0.0238302;RO=0;SAF=10;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.36352e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00139016;OID=.;OPOS=52544470;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:49:50:0:0:48:50:1:38:10:0:0:39:11:0:0
chr3	52546872	.	G	A	128.83	PASS	AF=0.365854;AO=15;DP=41;FAO=15;FDP=41;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=0.00549524;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.867;QD=12.569;RBI=0.0622071;REFB=0.000611784;REVB=0.0619639;RO=24;SAF=6;SAR=9;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.274957;STB=0.634439;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=-0.000201824;OID=.;OPOS=52546872;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:24:26:15:15:0.365854:9:6:16:8:9:6:16:10
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chr3	52554304	.	G	C	572.21	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0324681;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.3846;QD=60.2329;RBI=0.0342256;REFB=0;REVB=0.0108265;RO=0;SAF=12;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.05056e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000375925;OID=.;OPOS=52554304;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:26:12:0:0:26:12:0:0
chr3	52555957	.	T	C	323.46	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00021535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.9126;QD=53.91;RBI=0.0431733;REFB=0;REVB=-0.0431727;RO=0;SAF=20;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.83186e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000690391;OID=.;OPOS=52555957;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:4:20:0:0:4:20:0:0
chr3	52556890	.	A	G	250.68	PASS	AF=0.414286;AO=27;DP=69;FAO=29;FDP=70;FR=.;FRO=41;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=24;FSRR=17;FWDB=-0.0212509;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.5493;QD=14.3246;RBI=0.0782048;REFB=-0.015956;REVB=-0.0752622;RO=41;SAF=11;SAR=16;SRF=24;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186669;STB=0.579769;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=0.025936;OID=.;OPOS=52556890;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:70:41:41:27:29:0.414286:16:11:24:17:16:13:24:17
chr3	52557038	.	C	T	387.22	PASS	AF=0.584615;AO=38;DP=65;FAO=38;FDP=65;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=28;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.0236427;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.9764;QD=23.829;RBI=0.0318535;REFB=-0.00587485;REVB=-0.0213464;RO=27;SAF=10;SAR=28;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130413;STB=0.571945;STBP=0.214;TYPE=snp;VARB=0.00567046;OID=.;OPOS=52557038;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:27:27:38:38:0.584615:28:10:11:16:28:10:11:16
chr3	52557069	.	C	T	291.19	PASS	AF=0.525424;AO=30;DP=58;FAO=31;FDP=59;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=0.0314207;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.763;QD=19.7414;RBI=0.0315549;REFB=-0.0114982;REVB=0.00290672;RO=28;SAF=9;SAR=21;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18804;STB=0.590104;STBP=0.176;TYPE=snp;VARB=0.00857122;OID=.;OPOS=52557069;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:59:28:28:30:31:0.525424:21:9:14:14:21:10:14:14
chr3	52558008	.	T	C	707.11	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00168119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.338;QD=62.8544;RBI=0.00695269;REFB=0;REVB=0.00674637;RO=0;SAF=23;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.02855e-05;OID=.;OPOS=52558008;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:45:0:0:44:45:1:21:23:0:0:22:23:0:0
chr3	52558133	.	T	C	1767.61	PASS	AF=1;AO=116;DP=116;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0173416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.15;QD=60.9522;RBI=0.0173956;REFB=0;REVB=0.0013696;RO=0;SAF=74;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.75479e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.35088e-05;OID=.;OPOS=52558133;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:116:116:0:0:116:116:1:42:74:0:0:42:74:0:0
chr3	52558904	.	A	T	133.25	PASS	AF=0.405405;AO=15;DP=37;FAO=15;FDP=37;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.0123869;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.575;QD=14.4057;RBI=0.0165557;REFB=0.0017366;REVB=-0.0109844;RO=22;SAF=5;SAR=10;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.221949;STB=0.629453;STBP=0.189;TYPE=snp;VARB=-0.00343939;OID=.;OPOS=52558904;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:22:22:15:15:0.405405:10:5:12:10:10:5:12:10
chr3	52559042	.	C	T	238.22	PASS	AF=0.489362;AO=23;DP=47;FAO=23;FDP=47;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=-0.00420209;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.4594;QD=20.2737;RBI=0.0697066;REFB=0.00248662;REVB=-0.0695798;RO=24;SAF=11;SAR=12;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0560942;STB=0.531571;STBP=0.672;TYPE=snp;VARB=-0.00637972;OID=.;OPOS=52559042;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:24:24:23:23:0.489362:12:11:10:14:12:11:10:14
chr3	52584787	.	T	C	1041.47	PASS	AF=1;AO=68;DP=70;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.13077;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.7231;QD=58.6745;RBI=0.133293;REFB=0;REVB=0.0258138;RO=0;SAF=34;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00146138;OID=.;OPOS=52584787;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:71:0:0:68:71:1:34:34:0:0:36:35:0:0
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chr3	52676063	.	TACA	T,TA,TATA	341.79	PASS	AF=0,0.0384615,0.961538;AO=6,5,15;DP=34;FAO=0,1,25;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0,10;FSAR=0,1,15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0824047,-0.0748635,0.113453;FXX=0;HRUN=1,1,1;LEN=3,2,1;MLLD=102.571,103.841,70.6999;QD=52.5837;RBI=0.0855372,0.0765863,0.117488;REFB=0,0,0;REVB=-0.0229362,-0.016153,-0.0305251;RO=0;SAF=6,2,5;SAR=0,3,10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,del,snp;VARB=0.183035,-0.0810459,0.0097142;OID=.,.,.;OPOS=52676064,52676064,52676065;OREF=ACA,AC,C;OALT=-,-,T;OMAPALT=T,TA,TATA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	2/3:0,0.0384615,0.961538:6,5,15:34:0,1,25:26:0:0,0,10:0,1,15:0:0:4:0:6,2,5:0,3,10:0:0
chr3	52720080	.	A	C	235.38	PASS	AF=0.95;AO=19;DP=21;FAO=19;FDP=20;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0286463;FXX=0.0475964;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.301;QD=47.0767;RBI=0.0302865;REFB=-0.00534452;REVB=-0.00983176;RO=0;SAF=9;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33753e-08;STB=0.523785;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.000185823;OID=.;OPOS=52720080;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:21:20:0:1:19:19:0.95:10:9:0:0:10:9:0:1
chr3	52721305	.	G	A	399.04	PASS	AF=0.471264;AO=40;DP=83;FAO=41;FDP=87;FR=.;FRO=46;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=29;FSRR=17;FWDB=-0.0227711;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=89.8791;QD=18.3465;RBI=0.0242383;REFB=0.00364387;REVB=-0.00830478;RO=43;SAF=21;SAR=19;SRF=26;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0746272;STB=0.562716;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=-0.00375961;OID=.;OPOS=52721305;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:87:43:46:40:41:0.471264:19:21:26:17:20:21:29:17
chr3	52727257	.	G	A	1380.84	PASS	AF=1;AO=88;DP=89;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00207386;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.363;QD=62.7652;RBI=0.00273955;REFB=0;REVB=-0.00179005;RO=0;SAF=50;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.49151e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.62779e-05;OID=.;OPOS=52727257;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:89:88:0:0:88:88:1:38:50:0:0:38:50:0:0
chr3	52728804	.	C	T	255.75	PASS	AF=0.446154;AO=29;DP=65;FAO=29;FDP=65;FR=.;FRO=36;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=0.00625523;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.268;QD=15.7382;RBI=0.00628422;REFB=-0.00411014;REVB=0.000602896;RO=36;SAF=18;SAR=11;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174591;STB=0.598644;STBP=0.182;TYPE=snp;VARB=0.0066053;OID=.;OPOS=52728804;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:36:36:29:29:0.446154:11:18:16:20:11:18:16:20
chr3	52740182	.	C	G	587.38	PASS	AF=0.884615;AO=46;DP=52;FAO=46;FDP=52;FR=.;FRO=6;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=0.00085066;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=88.9732;QD=45.1828;RBI=0.0153653;REFB=-0.115137;REVB=0.0153418;RO=6;SAF=21;SAR=25;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116996;STB=0.562473;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.00521492;OID=.;OPOS=52740182;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:52:52:6:6:46:46:0.884615:25:21:6:0:25:21:6:0
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chr3	52800284	.	T	C	2249.5	PASS	AF=0.993007;AO=140;DP=143;FAO=142;FDP=143;FR=.;FRO=1;FSAF=71;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0205125;FXX=0.0205465;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.556;QD=62.9231;RBI=0.0309961;REFB=-0.0709162;REVB=0.0232378;RO=0;SAF=71;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.29942e-08;STB=0.503496;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.0014007;OID=.;OPOS=52800284;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:143:143:0:1:140:142:0.993007:69:71:0:0:71:71:0:1
chr3	52802402	.	A	C	742.47	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0569969;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.155;QD=63.1889;RBI=0.0652114;REFB=0;REVB=-0.0316841;RO=0;SAF=28;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.06241e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000100526;OID=.;OPOS=52802402;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:47:0:0:46:47:1:18:28:0:0:18:29:0:0
chr3	52820981	.	A	T	318.51	PASS	AF=0.540984;AO=33;DP=61;FAO=33;FDP=61;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=7;FSRR=21;FWDB=0.00932289;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.3183;QD=20.8861;RBI=0.0136704;REFB=-0.0168181;REVB=-0.00999812;RO=28;SAF=12;SAR=21;SRF=7;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105364;STB=0.558106;STBP=0.364;TYPE=snp;VARB=0.03241;OID=.;OPOS=52820981;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:28:28:33:33:0.540984:21:12:7:21:21:12:7:21
chr3	52821011	.	A	G	366.04	PASS	AF=0.544118;AO=37;DP=68;FAO=37;FDP=68;FR=.;FRO=31;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=-0.0053589;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.483;QD=21.5316;RBI=0.0125662;REFB=-0.0231987;REVB=-0.0113663;RO=29;SAF=16;SAR=21;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0128331;STB=0.506079;STBP=0.924;TYPE=snp;VARB=0.0206461;OID=.;OPOS=52821011;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:29:31:37:37:0.544118:21:16:13:16:21:16:13:18
chr3	52821177	.	A	C	246.85	PASS	AF=0.490909;AO=27;DP=55;FAO=27;FDP=55;FR=.;FRO=28;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=0.00460262;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=233.346;QD=17.9524;RBI=0.00954452;REFB=0.00080869;REVB=0.00836144;RO=27;SAF=16;SAR=11;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0345038;STB=0.507687;STBP=0.923;TYPE=snp;VARB=-0.00100167;OID=.;OPOS=52821177;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:27:28:27:27:0.490909:11:16:17:10:11:16:17:11
chr3	52821992	.	CT	C,CC	170.79	PASS	AF=0.485714,0.0285714;AO=11,5;DP=33;FAO=17,1;FDP=35;FR=.;FRO=17;FSAF=8,1;FSAR=9,0;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.0123214,0.00933179;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=290.418,288.643;QD=19.5185;RBI=0.0383294,0.033427;REFB=0.00406648,0.00305096;REVB=-0.0362949,-0.032098;RO=17;SAF=5,2;SAR=6,3;SRF=10;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.136212,-0.21266;STB=0.558552,0.988027;STBP=0.519,0.446;TYPE=del,snp;VARB=-0.00981477,-0.0213293;OID=.,.;OPOS=52821993,52821993;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.485714,0.0285714:11,5:33:17,1:35:17:8,1:9,0:10:7:99:17:5,2:6,3:10:7
chr3	52825585	.	T	C	180.48	PASS	AF=0.422222;AO=19;DP=45;FAO=19;FDP=45;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=-0.00794332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.082;QD=16.0424;RBI=0.0354562;REFB=-0.00693891;REVB=-0.034555;RO=25;SAF=7;SAR=12;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.266345;STB=0.661902;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=0.0129633;OID=.;OPOS=52825585;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:25:26:19:19:0.422222:12:7:16:9:12:7:17:9
chr3	52833805	.	C	A	270.01	PASS	AF=0.517857;AO=28;DP=54;FAO=29;FDP=56;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.00252043;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.422;QD=19.2867;RBI=0.0105581;REFB=-0.0356711;REVB=-0.0102529;RO=26;SAF=13;SAR=15;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0358519;STB=0.501867;STBP=0.999;TYPE=snp;VARB=0.0259525;OID=.;OPOS=52833805;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:56:26:27:28:29:0.517857:15:13:11:15:16:13:12:15
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chr3	52852538	.	G	T	281.22	PASS	AF=0.517241;AO=30;DP=58;FAO=30;FDP=58;FR=.;FRO=28;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=0.0632421;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.6028;QD=19.3946;RBI=0.0694103;REFB=-0.015101;REVB=0.0286045;RO=28;SAF=17;SAR=13;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119625;STB=0.566622;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.017647;OID=.;OPOS=52852538;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:28:28:30:30:0.517241:13:17:12:16:13:17:12:16
chr3	52853747	.	C	G	120.19	PASS	AF=0.411765;AO=14;DP=34;FAO=14;FDP=34;FR=.;FRO=20;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.0144124;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=205.005;QD=14.1399;RBI=0.0267354;REFB=-0.0156938;REVB=-0.022518;RO=19;SAF=11;SAR=3;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.249445;STB=0.666405;STBP=0.148;TYPE=snp;VARB=0.0266722;OID=.;OPOS=52853747;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:19:20:14:14:0.411765:3:11:11:8:3:11:11:9
chr3	52860816	.	C	T	109.46	PASS	AF=0.433333;AO=13;DP=30;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.0198551;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.009;QD=14.5942;RBI=0.0949584;REFB=-0.00643895;REVB=0.0928595;RO=17;SAF=4;SAR=9;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.279278;STB=0.662901;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.0152549;OID=.;OPOS=52860816;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:17:17:13:13:0.433333:9:4:10:7:9:4:10:7
chr3	52860936	.	C	T	208.76	PASS	AF=0.456522;AO=21;DP=46;FAO=21;FDP=46;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=0.0479031;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.499;QD=18.1526;RBI=0.0481224;REFB=-0.00876516;REVB=0.00458914;RO=25;SAF=9;SAR=12;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0497351;STB=0.528275;STBP=0.728;TYPE=snp;VARB=0.0149479;OID=.;OPOS=52860936;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:25:25:21:21:0.456522:12:9:12:13:12:9:12:13
chr3	52861211	.	A	T	134.95	PASS	AF=0.7;AO=14;DP=20;FAO=14;FDP=20;FR=.;FRO=6;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.0378498;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.3205;QD=26.9902;RBI=0.0384923;REFB=-0.00554424;REVB=0.00700346;RO=6;SAF=7;SAR=7;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0894563;STB=0.549929;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.00255971;OID=.;OPOS=52861211;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:20:20:6:6:14:14:0.7:7:7:4:2:7:7:4:2
chr3	52864584	.	A	G	157.84	PASS	AF=0.447368;AO=17;DP=38;FAO=17;FDP=38;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=16;FWDB=-0.00683469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.7;QD=16.6152;RBI=0.00695666;REFB=-0.0169058;REVB=-0.00129699;RO=20;SAF=7;SAR=10;SRF=4;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218064;STB=0.602537;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=0.0248166;OID=.;OPOS=52864584;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:20:21:17:17:0.447368:10:7:4:16:10:7:5:16
chr3	52867715	.	G	C	1396.45	PASS	AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00568841;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.417;QD=62.7617;RBI=0.0372113;REFB=0;REVB=0.0367739;RO=0;SAF=35;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.25937e-05;OID=.;OPOS=52867715;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:54:35:0:0:54:35:0:0
chr3	52870618	.	T	A	144.9	PASS	AF=0.333333;AO=19;DP=57;FAO=19;FDP=57;FR=.;FRO=38;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=0.00234959;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=290.324;QD=10.1684;RBI=0.00659553;REFB=-0.0105728;REVB=-0.00616282;RO=38;SAF=8;SAR=11;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0603248;STB=0.535543;STBP=0.753;TYPE=snp;VARB=0.0196105;OID=.;OPOS=52870618;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:38:38:19:19:0.333333:11:8:18:20:11:8:18:20
chr3	52874288	.	T	C	157.04	PASS	AF=0.435897;AO=16;DP=39;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=5;FWDB=-0.0107814;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.575;QD=16.1064;RBI=0.0121227;REFB=-8.00867e-05;REVB=0.00554266;RO=23;SAF=9;SAR=7;SRF=18;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.238533;STB=0.61153;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=0.000154024;OID=.;OPOS=52874288;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:23:22:16:17:0.435897:7:9:18:5:7:10:17:5
chr3	52874296	.	G	A	159.08	PASS	AF=0.435897;AO=17;DP=39;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=5;FWDB=0.0360396;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=45.0059;QD=16.3156;RBI=0.0600773;REFB=-0.044524;REVB=0.048067;RO=22;SAF=10;SAR=7;SRF=17;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196259;STB=0.61153;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=0.060728;OID=.;OPOS=52874296;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:22:22:17:17:0.435897:7:10:17:5:7:10:17:5
chr3	52874446	.	C	T	209.77	PASS	AF=0.446809;AO=20;DP=48;FAO=21;FDP=47;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=-0.0100214;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.3794;QD=17.8524;RBI=0.0460986;REFB=-0.00927482;REVB=0.0449961;RO=26;SAF=10;SAR=10;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114232;STB=0.550973;STBP=0.538;TYPE=snp;VARB=0.0141071;OID=.;OPOS=52874446;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:47:26:26:20:21:0.446809:10:10:16:10:10:11:16:10
chr3	53125922	.	T	C	260.11	PASS	AF=0.533333;AO=24;DP=47;FAO=24;FDP=45;FR=.;FRO=21;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0320822;FXX=0.0425441;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.8281;QD=23.1208;RBI=0.0324159;REFB=-0.000760037;REVB=0.00463894;RO=21;SAF=17;SAR=7;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170618;STB=0.595793;STBP=0.215;TYPE=snp;VARB=0.000848507;OID=.;OPOS=53125922;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:45:21:21:24:24:0.533333:7:17:11:10:7:17:11:10
chr3	53215875	.	A	C	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0113241;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.942;QD=55.0985;RBI=0.0115831;REFB=0;REVB=0.00243591;RO=0;SAF=9;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.6105e-05;OID=.;OPOS=53215875;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:17:9:0:0:17:9:0:0
chr3	53222761	.	C	T	801.32	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00283372;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.007;QD=57.2372;RBI=0.0102759;REFB=0;REVB=-0.00987749;RO=0;SAF=28;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.98947e-05;OID=.;OPOS=53222761;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:28:28:0:0:28:28:0:0
chr3	53223927	.	C	G	594.91	PASS	AF=0.911111;AO=42;DP=45;FAO=41;FDP=45;FR=.;FRO=4;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.00517759;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.5325;QD=52.8805;RBI=0.0648194;REFB=-0.0331232;REVB=-0.0646123;RO=2;SAF=19;SAR=23;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0468749;STB=0.527855;STBP=0.265;TYPE=snp;VARB=0.00773791;OID=.;OPOS=53223927;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:18:45:45:2:4:42:41:0.911111:23:19:2:0:23:18:3:1
chr3	53224002	.	T	C	769.25	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0749913;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.4387;QD=56.9812;RBI=0.0759703;REFB=0;REVB=0.0121569;RO=0;SAF=23;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6027e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000727961;OID=.;OPOS=53224002;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:31:23:0:0:31:23:0:0
chr3	53324819	.	ATGGCAC	A	129.47	PASS	AF=0.8125;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=16;FR=.;FRO=3;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0126504;FXX=0;HRUN=1;LEN=6;MLLD=300.636;QD=32.3683;RBI=0.0196388;REFB=0.0342366;REVB=-0.0150217;RO=0;SAF=3;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.565125;STBP=0.432;TYPE=del;VARB=-0.0121299;OID=.;OPOS=53324820;OREF=TGGCAC;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.8125:13:13:13:16:3:3:10:0:3:14:0:3:10:0:0
chr3	53700550	.	T	C	554.78	PASS	AF=0.525253;AO=52;DP=99;FAO=52;FDP=99;FR=.;FRO=47;FSAF=25;FSAR=27;FSRF=17;FSRR=30;FWDB=-0.00239792;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.476;QD=22.4151;RBI=0.00240328;REFB=-0.0193639;REVB=0.000160519;RO=47;SAF=25;SAR=27;SRF=17;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103342;STB=0.556837;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=0.0163225;OID=.;OPOS=53700550;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:47:47:52:52:0.525253:27:25:17:30:27:25:17:30
chr3	53766026	.	T	C	728.95	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00100561;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.512;QD=57.1722;RBI=0.0550313;REFB=0;REVB=0.0550221;RO=0;SAF=28;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.97956e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000338234;OID=.;OPOS=53766026;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:23:28:0:0:23:28:0:0
chr3	53856653	.	C	T	834.41	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0137138;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.571;QD=57.5452;RBI=0.0327515;REFB=0;REVB=0.0297422;RO=0;SAF=29;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000194101;OID=.;OPOS=53856653;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:29:29:0:0:29:29:0:0
chr3	53857803	.	A	C	834.4	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0843448;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.025;QD=57.5451;RBI=0.0844219;REFB=0;REVB=0.00360876;RO=0;SAF=28;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000268403;OID=.;OPOS=53857803;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:30:28:0:0:30:28:0:0
chr3	53882663	.	G	A	974.87	PASS	AF=0.985294;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00881002;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.63;QD=57.3451;RBI=0.00925898;REFB=-0.0492865;REVB=0.00284818;RO=0;SAF=37;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506665;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=-1.02881e-05;OID=.;OPOS=53882663;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:67:68:0:1:67:67:0.985294:30:37:0:0:30:37:1:0
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chr3	53886912	.	C	T	198.34	PASS	AF=0.4;AO=24;DP=60;FAO=24;FDP=60;FR=.;FRO=36;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=-0.00128098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.514;QD=13.223;RBI=0.00230971;REFB=-0.0137002;REVB=-0.00192193;RO=36;SAF=11;SAR=13;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101478;STB=0.558123;STBP=0.48;TYPE=snp;VARB=0.0245685;OID=.;OPOS=53886912;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:36:36:24:24:0.4:13:11:20:16:13:11:20:16
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chr3	53906513	.	G	A	1530.45	PASS	AF=1;AO=94;DP=94;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00245131;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.636;QD=63.7687;RBI=0.0199205;REFB=0;REVB=0.0197691;RO=0;SAF=47;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.61505e-05;OID=.;OPOS=53906513;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:94:96:0:0:94:96:1:47:47:0:0:47:49:0:0
chr3	53916130	.	A	G	269.55	PASS	AF=0.461538;AO=30;DP=65;FAO=30;FDP=65;FR=.;FRO=35;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=0.0062307;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.045;QD=16.5876;RBI=0.0152814;REFB=2.02042e-05;REVB=-0.0139535;RO=35;SAF=11;SAR=19;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.090506;STB=0.550986;STBP=0.475;TYPE=snp;VARB=-2.88089e-05;OID=.;OPOS=53916130;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:35:35:30:30:0.461538:19:11:16:19:19:11:16:19
chr3	53919630	.	T	A	164.4	PASS	AF=0.375;AO=18;DP=48;FAO=18;FDP=48;FR=.;FRO=30;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=11;FWDB=-0.0115752;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=334.869;QD=13.6997;RBI=0.0204902;REFB=0.00339559;REVB=-0.0169075;RO=30;SAF=10;SAR=8;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0856491;STB=0.549709;STBP=0.59;TYPE=snp;VARB=-0.00559419;OID=.;OPOS=53919630;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:30:30:18:18:0.375:8:10:19:11:8:10:19:11
chr3	53925775	.	C	T	139.98	PASS	AF=0.363636;AO=16;DP=44;FAO=16;FDP=44;FR=.;FRO=28;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=-0.00336403;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.63;QD=12.7254;RBI=0.00430152;REFB=-0.0111172;REVB=0.00268074;RO=28;SAF=5;SAR=11;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0547586;STB=0.532217;STBP=0.762;TYPE=snp;VARB=0.0211234;OID=.;OPOS=53925775;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:28:28:16:16:0.363636:11:5:10:18:11:5:10:18
chr3	53925849	.	C	T	177.51	PASS	AF=0.387755;AO=19;DP=49;FAO=19;FDP=49;FR=.;FRO=30;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=-0.0154536;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.597;QD=14.4907;RBI=0.0186909;REFB=-0.00922765;REVB=-0.0105136;RO=30;SAF=6;SAR=13;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0212236;STB=0.512302;STBP=0.89;TYPE=snp;VARB=0.0141996;OID=.;OPOS=53925849;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:30:30:19:19:0.387755:13:6:10:20:13:6:10:20
chr3	54354510	.	T	C	990.53	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0542768;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.3595;QD=59.1362;RBI=0.0679559;REFB=0;REVB=0.0408905;RO=0;SAF=32;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.62221e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00012838;OID=.;OPOS=54354510;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:35:32:0:0:35:32:0:0
chr3	54401650	.	C	A	136.84	PASS	AF=0.5;AO=15;DP=30;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=0.0120412;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.425;QD=18.245;RBI=0.0142563;REFB=-0.000357676;REVB=-0.00763231;RO=15;SAF=8;SAR=7;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.231787;STB=0.631413;STBP=0.193;TYPE=snp;VARB=0.000145415;OID=.;OPOS=54401650;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:15:15:15:15:0.5:7:8:4:11:7:8:4:11
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chr3	56106226	.	C	T	563.6	PASS	AF=1;AO=37;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0429905;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.914;QD=59.3265;RBI=0.0771725;REFB=0;REVB=0.0640891;RO=0;SAF=18;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.68991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00359886;OID=.;OPOS=56106226;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:37:38:1:19:18:0:0:20:18:0:0
chr3	56219179	.	GAAGCT	G	121.72	PASS	AF=0.354839;AO=22;DP=65;FAO=22;FDP=62;FR=.;FRO=40;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=25;FSRR=15;FWDB=0.00501878;FXX=0.0312451;HRUN=2;LEN=5;MLLD=272.536;QD=7.85264;RBI=0.0165194;REFB=-0.0163127;REVB=-0.0157385;RO=36;SAF=14;SAR=8;SRF=23;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0029321;STB=0.507879;STBP=0.931;TYPE=del;VARB=0.0279568;OID=.;OPOS=56219180;OREF=AAGCT;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.354839:22:65:22:62:40:14:8:25:15:99:36:14:8:23:13
chr3	56219210	.	T	C	991.7	PASS	AF=0.958333;AO=69;DP=74;FAO=69;FDP=72;FR=.;FRO=3;FSAF=38;FSAR=31;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0140343;FXX=0.0270234;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.2649;QD=55.0946;RBI=0.0268845;REFB=0.0237273;REVB=0.0229306;RO=2;SAF=38;SAR=31;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0242294;STB=0.518982;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=-0.00101164;OID=.;OPOS=56219210;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:74:72:2:3:69:69:0.958333:31:38:2:0:31:38:3:0
chr3	56592879	.	G	C	257.33	PASS	AF=0.4;AO=30;DP=75;FAO=30;FDP=75;FR=.;FRO=45;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=26;FWDB=0.0188803;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=261.862;QD=13.7241;RBI=0.0230335;REFB=-0.00486317;REVB=-0.0131938;RO=43;SAF=15;SAR=15;SRF=18;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0843941;STB=0.546636;STBP=0.559;TYPE=snp;VARB=0.00548517;OID=.;OPOS=56592879;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:43:45:30:30:0.4:15:15:18:25:15:15:19:26
chr3	56627598	.	A	G	1339.62	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0498645;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.518;QD=62.3078;RBI=0.0514821;REFB=0;REVB=0.0128039;RO=0;SAF=40;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000183218;OID=.;OPOS=56627598;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:46:40:0:0:46:40:0:0
chr3	56650012	.	G	C	737.71	PASS	AF=0.979167;AO=47;DP=49;FAO=47;FDP=48;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.000675757;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.455;QD=61.4756;RBI=0.0293204;REFB=0.0123422;REVB=0.0293126;RO=1;SAF=28;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.016502;STB=0.508768;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=-1.30324e-05;OID=.;OPOS=56650012;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:49:48:1:1:47:47:0.979167:19:28:1:0:19:28:1:0
chr3	56650054	.	T	C,TCTC	837.35	PASS	AF=0.0491803,0.934426;AO=4,56;DP=63;FAO=3,57;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=3,31;FSAR=0,26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0313631,0.0120433;FXX=0.0161264;HRUN=2,1;LEN=1,3;MLLD=55.8296,181.179;QD=54.9085;RBI=0.0384757,0.044112;REFB=0.00961431,-0.0366961;REVB=-0.0222876,0.0424361;RO=2;SAF=4,30;SAR=0,26;SRF=2;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-0.0303982;STB=0.5,0.507934;STBP=1,0.528;TYPE=snp,ins;VARB=-0.0313119,0.000952787;OID=.,.;OPOS=56650054,56650055;OREF=T,-;OALT=C,CTC;OMAPALT=C,TCTC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:11:63:61:2:1:4,56:3,57:0.0491803,0.934426:0,26:4,30:2:0:0,26:3,31:1:0
chr3	56658871	.	T	C	1042.25	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.04146;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.764;QD=59.5569;RBI=0.0429576;REFB=0;REVB=0.011244;RO=0;SAF=38;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000107492;OID=.;OPOS=56658871;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:32:38:0:0:32:38:0:0
chr3	56667682	.	G	C	747.05	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0039853;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.0082;QD=63.5788;RBI=0.0308038;REFB=0;REVB=0.0305449;RO=0;SAF=22;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000432946;OID=.;OPOS=56667682;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:25:22:0:0:25:22:0:0
chr3	56716922	.	T	G	618.74	PASS	AF=0.97619;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00206952;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.5113;QD=58.9279;RBI=0.0370181;REFB=0.00185407;REVB=-0.0369602;RO=0;SAF=22;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.513507;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=-0.000749342;OID=.;OPOS=56716922;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:42:42:0:1:41:41:0.97619:19:22:0:0:18:23:0:1
chr3	56763228	.	T	C	104.63	PASS	AF=0.571429;AO=12;DP=21;FAO=12;FDP=21;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.0113101;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=254.78;QD=19.9285;RBI=0.0208591;REFB=0.0014183;REVB=0.0175267;RO=9;SAF=6;SAR=6;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0416756;STB=0.52377;STBP=0.818;TYPE=snp;VARB=-0.00047302;OID=.;OPOS=56763228;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:21:21:9:9:12:12:0.571429:6:6:5:4:6:6:5:4
chr3	56763316	.	G	A	447.03	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0150237;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.404;QD=57.6807;RBI=0.0173802;REFB=0;REVB=0.00873834;RO=0;SAF=14;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.3539e-05;OID=.;OPOS=56763316;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:17:14:0:0:17:14:0:0
chr3	56763328	.	T	C	429.0	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0187996;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=63.6945;QD=57.1998;RBI=0.0195745;REFB=0;REVB=-0.00545287;RO=0;SAF=14;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.56309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000232101;OID=.;OPOS=56763328;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:16:14:0:0:16:14:0:0
chr3	56763525	.	A	G	176.16	PASS	AF=0.333333;AO=23;DP=69;FAO=23;FDP=69;FR=.;FRO=46;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=25;FWDB=0.00202651;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=183.973;QD=10.2124;RBI=0.0109363;REFB=-0.0103654;REVB=0.0107469;RO=46;SAF=9;SAR=14;SRF=21;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0762707;STB=0.544708;STBP=0.62;TYPE=snp;VARB=0.026526;OID=.;OPOS=56763525;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:46:46:23:23:0.333333:14:9:21:25:14:9:21:25
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chr3	57109095	.	T	C	120.86	PASS	AF=0.424242;AO=14;DP=33;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=0.0129049;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.409;QD=14.6497;RBI=0.0129049;REFB=-0.00423526;REVB=2.66179e-05;RO=19;SAF=9;SAR=5;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.26973;STB=0.656431;STBP=0.138;TYPE=snp;VARB=0.00416836;OID=.;OPOS=57109095;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:19:19:14:14:0.424242:5:9:7:12:5:9:7:12
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chr3	57882601	.	C	T	195.16	PASS	AF=0.418182;AO=23;DP=55;FAO=23;FDP=55;FR=.;FRO=32;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=-0.00871225;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.118;QD=14.1932;RBI=0.0323362;REFB=-0.00351637;REVB=-0.0311404;RO=32;SAF=9;SAR=14;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0486882;STB=0.527844;STBP=0.755;TYPE=snp;VARB=0.00433992;OID=.;OPOS=57882601;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:32:32:23:23:0.418182:14:9:14:18:14:9:14:18
chr3	58081888	.	T	C	800.75	PASS	AF=1;AO=55;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.068544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.275;QD=57.1965;RBI=0.0698071;REFB=0;REVB=0.0132192;RO=0;SAF=31;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000270256;OID=.;OPOS=58081888;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:55:56:1:24:31:0:0:25:31:0:0
chr3	58109162	.	G	A	726.95	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0797206;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.7919;QD=57.0158;RBI=0.0817522;REFB=0;REVB=0.018112;RO=0;SAF=23;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00117813;OID=.;OPOS=58109162;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:51:0:0:50:51:1:27:23:0:0:27:24:0:0
chr3	58112440	.	A	G	560.4	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00306962;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.913;QD=60.5838;RBI=0.00352256;REFB=0;REVB=-0.00172796;RO=0;SAF=16;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.12847e-05;OID=.;OPOS=58112440;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:37:0:0:38:37:1:22:16:0:0:22:15:0:0
chr3	58112488	.	C	T	246.34	PASS	AF=1;AO=19;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.115735;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=72.187;QD=49.2676;RBI=0.115836;REFB=0;REVB=-0.0048336;RO=1;SAF=9;SAR=10;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0483869;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00213001;OID=.;OPOS=58112488;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:1:0:19:20:1:10:9:1:0:10:10:0:0
chr3	58117724	.	G	A	281.15	PASS	AF=0.462687;AO=31;DP=67;FAO=31;FDP=67;FR=.,HEALED;FRO=36;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=0.00484424;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.476;QD=16.7849;RBI=0.128206;REFB=-0.00502145;REVB=0.128114;RO=26;SAF=14;SAR=17;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16516;STB=0.511147;STBP=0.862;TYPE=snp;VARB=0.00713225;OID=.;OPOS=58117724;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:26:36:31:31:0.462687:17:14:17:9:17:14:17:19
chr3	58118555	.	G	A	884.8	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.015556;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.6875;QD=58.0194;RBI=0.0358141;REFB=0;REVB=0.0322592;RO=0;SAF=28;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000206797;OID=.;OPOS=58118555;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:33:28:0:0:33:28:0:0
chr3	58154327	.	C	T	972.84	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0116169;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.978;QD=58.9599;RBI=0.0188361;REFB=0;REVB=0.0148271;RO=0;SAF=26;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.70472e-05;OID=.;OPOS=58154327;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:40:26:0:0:40:26:0:0
chr3	58179028	.	T	C	306.73	PASS	AF=0.581818;AO=30;DP=52;FAO=32;FDP=55;FR=.;FRO=23;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=-0.0513521;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.0296;QD=22.3079;RBI=0.0590516;REFB=-0.049461;REVB=0.0291558;RO=22;SAF=16;SAR=14;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0444381;STB=0.519709;STBP=0.756;TYPE=snp;VARB=0.0351442;OID=.;OPOS=58179028;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:55:22:23:30:32:0.581818:14:16:13:9:14:18:14:9
chr3	58191266	.	C	T	688.48	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0244118;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.262;QD=62.5887;RBI=0.0317368;REFB=0;REVB=0.0202803;RO=0;SAF=23;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.72303e-05;OID=.;OPOS=58191266;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:21:23:0:0:21:23:0:0
chr3	58305033	.	A	C	805.19	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.015648;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.148;QD=64.4154;RBI=0.0177792;REFB=0;REVB=-0.00844041;RO=0;SAF=21;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.20481e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.11691e-05;OID=.;OPOS=58305033;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:29:21:0:0:29:21:0:0
chr3	58305079	.	T	C	817.75	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0140619;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.956;QD=57.3858;RBI=0.0387842;REFB=0;REVB=0.0361452;RO=0;SAF=22;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.43892e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000130649;OID=.;OPOS=58305079;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:56:57:0:0:56:57:1:34:22:0:0:35:22:0:0
chr3	58305235	.	G	T	480.16	PASS	AF=1;AO=27;DP=34;FAO=33;FDP=33;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0406768;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.388;QD=58.2012;RBI=0.0554269;REFB=0;REVB=0.0376502;RO=0;SAF=14;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00346632;OID=.;OPOS=58305235;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:33:0:0:27:33:1:13:14:0:0:18:15:0:0
chr3	58395891	.	C	G	139.53	PASS	AF=0.355556;AO=16;DP=45;FAO=16;FDP=45;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=-0.0753751;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.452;QD=12.4025;RBI=0.0762553;REFB=-0.00940315;REVB=-0.0115526;RO=29;SAF=7;SAR=9;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105114;STB=0.56153;STBP=0.556;TYPE=snp;VARB=0.0211628;OID=.;OPOS=58395891;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:29:29:16:16:0.355556:9:7:10:19:9:7:10:19
chr3	58409173	.	A	T	219.82	PASS	AF=0.44;AO=22;DP=50;FAO=22;FDP=50;FR=.;FRO=28;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=-0.0119312;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.403;QD=17.5859;RBI=0.0140312;REFB=-0.00622545;REVB=0.00738372;RO=28;SAF=15;SAR=7;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.287731;STB=0.664055;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.0071427;OID=.;OPOS=58409173;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:28:28:22:22:0.44:7:15:11:17:7:15:11:17
chr3	58416538	.	T	C	1331.58	PASS	AF=1;AO=83;DP=84;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0117827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.3;QD=61.934;RBI=0.0294062;REFB=0;REVB=0.0269424;RO=0;SAF=45;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.04629e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.30008e-05;OID=.;OPOS=58416538;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:86:0:0:83:86:1:38:45:0:0:39:47:0:0
chr3	58484521	.	T	C	1482.38	PASS	AF=0.979381;AO=95;DP=97;FAO=95;FDP=97;FR=.;FRO=2;FSAF=41;FSAR=54;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00468175;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.8088;QD=61.1291;RBI=0.0401241;REFB=-0.0235365;REVB=0.03985;RO=2;SAF=41;SAR=54;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00272441;STB=0.501437;STBP=0.87;TYPE=snp;VARB=0.00167924;OID=.;OPOS=58484521;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:97:97:2:2:95:95:0.979381:54:41:1:1:54:41:1:1
chr3	58512237	.	A	G	785.85	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00999812;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.926;QD=64.1509;RBI=0.0114712;REFB=0;REVB=0.00562375;RO=0;SAF=23;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.52592e-05;OID=.;OPOS=58512237;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:26:23:0:0:26:23:0:0
chr3	58516318	.	G	A	280.22	PASS	AF=0.462687;AO=31;DP=67;FAO=31;FDP=67;FR=.;FRO=36;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=-0.0159623;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.543;QD=16.7295;RBI=0.0164212;REFB=0.00989784;REVB=0.00385516;RO=35;SAF=13;SAR=18;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0635759;STB=0.528874;STBP=0.667;TYPE=snp;VARB=-0.0083232;OID=.;OPOS=58516318;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:35:36:31:31:0.462687:18:13:17:18:18:13:17:19
chr3	58520306	.	G	C	1041.18	PASS	AF=0.986111;AO=60;DP=73;FAO=71;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00285644;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.0117;QD=57.8431;RBI=0.024894;REFB=-0.0621287;REVB=0.0247296;RO=0;SAF=28;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507461;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.00464789;OID=.;OPOS=58520306;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:73:72:0:1:60:71:0.986111:32:28:0:0:33:38:0:1
chr3	58551247	.	TG	CA	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0594185;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=211.7;QD=43.4862;RBI=0.0696676;REFB=0;REVB=0.0363733;RO=0;SAF=6;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=-0.000376041;OID=.;OPOS=58551247;OREF=TG;OALT=CA;OMAPALT=CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:6:6:0:0:6:6:0:0
chr3	58572577	.	C	G	772.89	PASS	AF=0.98;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00526492;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=233.506;QD=61.8312;RBI=0.0135509;REFB=-0.133489;REVB=0.0124863;RO=1;SAF=31;SAR=18;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0254237;STB=0.513508;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=0.000474617;OID=.;OPOS=58572577;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:50:50:1:1:49:49:0.98:18:31:0:1:18:31:0:1
chr3	58572625	.	G	A	367.65	PASS	AF=0.964286;AO=27;DP=29;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0282319;FXX=0.0344709;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.485;QD=52.5215;RBI=0.0374571;REFB=0.0749135;REVB=0.0246169;RO=1;SAF=15;SAR=12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0299926;STB=0.516117;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=-0.000573618;OID=.;OPOS=58572625;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:29:28:1:1:27:27:0.964286:12:15:1:0:12:15:1:0
chr3	59908126	.	A	G	269.98	PASS	AF=0.531915;AO=25;DP=47;FAO=25;FDP=47;FR=.;FRO=22;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=0.00686352;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.671;QD=22.977;RBI=0.00704904;REFB=-0.00481577;REVB=-0.0016066;RO=22;SAF=16;SAR=9;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.232817;STB=0.630032;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=0.0106326;OID=.;OPOS=59908126;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:22:22:25:25:0.531915:9:16:8:14:9:16:8:14
chr3	60519224	.	G	A	465.11	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0512754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.294;QD=58.1386;RBI=0.0598851;REFB=0;REVB=0.0309363;RO=0;SAF=11;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000385048;OID=.;OPOS=60519224;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:21:11:0:0:21:11:0:0
chr3	62189189	.	G	A	108.86	PASS	AF=0.666667;AO=12;DP=18;FAO=12;FDP=18;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0184067;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.951;QD=24.1899;RBI=0.0256694;REFB=0.0291385;REVB=0.0178916;RO=6;SAF=5;SAR=7;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0500226;STB=0.528254;STBP=0.706;TYPE=snp;VARB=-0.0119073;OID=.;OPOS=62189189;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:18:18:6:6:12:12:0.666667:7:5:3:3:7:5:3:3
chr3	62189437	.	G	C	819.29	PASS	AF=0.522013;AO=81;DP=157;FAO=83;FDP=159;FR=.;FRO=76;FSAF=38;FSAR=45;FSRF=35;FSRR=41;FWDB=-0.00718332;FXX=0.0124216;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.0922;QD=20.611;RBI=0.0170871;REFB=-0.0213521;REVB=0.0155038;RO=75;SAF=37;SAR=44;SRF=36;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0204428;STB=0.501297;STBP=0.987;TYPE=snp;VARB=0.0203284;OID=.;OPOS=62189437;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:157:159:75:76:81:83:0.522013:44:37:36:39:45:38:35:41
chr3	62229553	.	C	T	568.71	PASS	AF=0.974359;AO=39;DP=39;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0479909;FXX=0.0249938;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.671;QD=58.3291;RBI=0.0529111;REFB=-0.0523347;REVB=0.0222812;RO=0;SAF=17;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.511622;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.00200355;OID=.;OPOS=62229553;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:39:39:0:1:39:38:0.974359:22:17:0:0:21:17:0:1
chr3	62384314	.	A	G	350.82	PASS	AF=1;AO=17;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0176044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.193;QD=53.9724;RBI=0.0356863;REFB=0;REVB=0.0310419;RO=0;SAF=8;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.28557e-06;OID=.;OPOS=62384314;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:17:26:1:9:8:0:0:14:12:0:0
chr3	62431415	.	T	C	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0427883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=305.988;QD=48.7373;RBI=0.0442385;REFB=0;REVB=-0.0112342;RO=0;SAF=9;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.80871e-05;OID=.;OPOS=62431415;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:8:9:0:0:8:9:0:0
chr3	62556622	.	A	G	696.62	PASS	AF=0.938776;AO=46;DP=49;FAO=46;FDP=49;FR=.;FRO=3;FSAF=29;FSAR=17;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.00691248;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=288.857;QD=56.8672;RBI=0.0137521;REFB=-0.0683234;REVB=0.0118886;RO=3;SAF=29;SAR=17;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0461894;STB=0.52458;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=0.000348375;OID=.;OPOS=62556622;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:49:49:3:3:46:46:0.938776:17:29:3:0:17:29:3:0
chr3	64133350	.	A	G	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0904985;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.218;QD=52.613;RBI=0.0939877;REFB=0;REVB=0.0253717;RO=0;SAF=12;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000921651;OID=.;OPOS=64133350;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:10:12:0:0:10:12:0:0
chr3	64502189	.	G	A	225.19	PASS	AF=0.440678;AO=26;DP=59;FAO=26;FDP=59;FR=.;FRO=33;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=0.00318583;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=253.534;QD=15.2673;RBI=0.0171776;REFB=-0.0101356;REVB=-0.0168795;RO=33;SAF=8;SAR=18;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.272503;STB=0.654864;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.0149762;OID=.;OPOS=64502189;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:33:33:26:26:0.440678:18:8:19:14:18:8:19:14
chr3	64601145	.	T	A	42.47	PASS	AF=0.106383;AO=10;DP=94;FAO=10;FDP=94;FR=.;FRO=84;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=46;FSRR=38;FWDB=-0.0228184;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.31;QD=1.80702;RBI=0.0387745;REFB=-0.00196135;REVB=0.0313493;RO=84;SAF=3;SAR=7;SRF=46;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.290303;STB=0.717147;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=0.0102575;OID=.;OPOS=64601145;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:42:94:94:84:84:10:10:0.106383:7:3:46:38:7:3:46:38
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chr3	69091716	.	T	C	165.86	PASS	AF=0.323529;AO=21;DP=67;FAO=22;FDP=68;FR=.;FRO=46;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=24;FSRR=22;FWDB=-0.0198797;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.188;QD=9.75668;RBI=0.0200342;REFB=-0.000770966;REVB=-0.00248309;RO=45;SAF=12;SAR=9;SRF=23;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0701901;STB=0.547511;STBP=0.595;TYPE=snp;VARB=0.00078577;OID=.;OPOS=69091716;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:68:45:46:21:22:0.323529:9:12:23:22:9:13:24:22
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chr3	69154386	.	T	A	1025.61	PASS	AF=0.959459;AO=70;DP=73;FAO=71;FDP=74;FR=.;FRO=3;FSAF=41;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.000637886;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=360.789;QD=55.4382;RBI=0.017135;REFB=-0.0137815;REVB=-0.0171231;RO=2;SAF=40;SAR=30;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00382552;STB=0.510106;STBP=0.477;TYPE=snp;VARB=0.000156405;OID=.;OPOS=69154386;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:73:74:2:3:70:71:0.959459:30:40:1:1:30:41:1:2
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chr3	69168864	.	C	T	339.63	PASS	AF=0.473684;AO=35;DP=74;FAO=36;FDP=76;FR=.;FRO=40;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=16;FSRR=24;FWDB=0.00513579;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.263;QD=17.8754;RBI=0.00539171;REFB=-0.00356975;REVB=-0.00164139;RO=39;SAF=14;SAR=21;SRF=16;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0100375;STB=0.509045;STBP=0.858;TYPE=snp;VARB=0.0026018;OID=.;OPOS=69168864;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:76:39:40:35:36:0.473684:21:14:16:23:21:15:16:24
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chr3	71876449	.	A	G	94.56	PASS	AF=0.611111;AO=11;DP=18;FAO=11;FDP=18;FR=.;FRO=7;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.0136508;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.937;QD=21.0137;RBI=0.0153499;REFB=-0.00759444;REVB=-0.00701962;RO=7;SAF=8;SAR=3;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0110704;STB=0.506317;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0090672;OID=.;OPOS=71876449;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:18:18:7:7:11:11:0.611111:3:8:5:2:3:8:5:2
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chr3	73290979	.	G	T	903.01	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0111059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.76;QD=58.2585;RBI=0.0283888;REFB=0;REVB=0.0261263;RO=0;SAF=29;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.24319e-05;OID=.;OPOS=73290979;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:62:0:0:61:62:1:32:29:0:0:32:30:0:0
chr3	73433494	.	T	C	47.27	PASS	AF=0.538462;AO=6;DP=12;FAO=7;FDP=13;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0162866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.471;QD=14.5459;RBI=0.0185848;REFB=-0.00400733;REVB=-0.00895215;RO=6;SAF=1;SAR=5;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202122;STB=0.526239;STBP=0.962;TYPE=snp;VARB=0.00633568;OID=.;OPOS=73433494;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:12:13:6:6:6:7:0.538462:5:1:2:4:5:2:2:4
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chr3	75713654	.	G	A	36.88	PASS	AF=0.122807;AO=7;DP=58;FAO=7;FDP=57;FR=.;FRO=50;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=23;FSRR=27;FWDB=0.00103329;FXX=0.0172384;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.0336;QD=2.58838;RBI=0.0241179;REFB=-0.000723847;REVB=0.0240957;RO=51;SAF=5;SAR=2;SRF=24;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.287419;STB=0.720766;STBP=0.27;TYPE=snp;VARB=0.00296023;OID=.;OPOS=75713654;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:58:57:51:50:7:7:0.122807:2:5:24:27:2:5:23:27
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chr3	75714853	.	G	A	976.15	PASS	AF=0.38676;AO=110;DP=288;FAO=111;FDP=287;FR=.;FRO=176;FSAF=48;FSAR=63;FSRF=80;FSRR=96;FWDB=-0.00295517;FXX=0.0103445;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.2743;QD=13.6048;RBI=0.00299857;REFB=-0.00959129;REVB=0.000508296;RO=173;SAF=48;SAR=62;SRF=77;SRR=96;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00962652;STB=0.513759;STBP=0.714;TYPE=snp;VARB=0.0163822;OID=.;OPOS=75714853;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:288:287:173:176:110:111:0.38676:62:48:77:96:63:48:80:96
chr3	75714898	.	G	A	564.72	PASS	AF=0.255319;AO=82;DP=326;FAO=84;FDP=329;FR=.;FRO=245;FSAF=33;FSAR=51;FSRF=121;FSRR=124;FWDB=-0.0144008;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.3338;QD=6.86584;RBI=0.0763277;REFB=-0.0113724;REVB=0.0749569;RO=244;SAF=33;SAR=49;SRF=120;SRR=124;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113555;STB=0.576253;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=0.0366962;OID=.;OPOS=75714898;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:326:329:244:245:82:84:0.255319:49:33:120:124:51:33:121:124
chr3	75714917	.	G	A	886.02	PASS	AF=0.335593;AO=97;DP=295;FAO=99;FDP=295;FR=.,HEALED;FRO=181;FSAF=42;FSAR=57;FSRF=91;FSRR=90;FWDB=-0.00885248;FXX=0.00673378;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.068;QD=12.0139;RBI=0.0104573;REFB=-0.00857067;REVB=-0.00556672;RO=144;SAF=40;SAR=57;SRF=84;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181381;STB=0.551135;STBP=0.199;TYPE=snp;VARB=0.0163097;OID=.;OPOS=75714917;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:295:295:144:181:97:99:0.335593:57:40:84:60:57:42:91:90
chr3	75714929	.	G	A	757.86	PASS	AF=0.33101;AO=95;DP=287;FAO=95;FDP=287;FR=.;FRO=192;FSAF=41;FSAR=54;FSRF=89;FSRR=103;FWDB=-0.0377954;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=96.6388;QD=10.5625;RBI=0.0433619;REFB=-0.0270205;REVB=-0.0212547;RO=190;SAF=41;SAR=54;SRF=89;SRR=101;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.043399;STB=0.521657;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=0.0536692;OID=.;OPOS=75714929;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:287:287:190:192:95:95:0.33101:54:41:89:101:54:41:89:103
chr3	75714950	.	C	A	612.08	PASS	AF=0.311538;AO=80;DP=259;FAO=81;FDP=260;FR=.;FRO=179;FSAF=32;FSAR=49;FSRF=79;FSRR=100;FWDB=-0.00199059;FXX=0.0076333;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.86;QD=9.41665;RBI=0.00565491;REFB=-0.00540302;REVB=-0.00529298;RO=178;SAF=32;SAR=48;SRF=78;SRR=100;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0468983;STB=0.532861;STBP=0.471;TYPE=snp;VARB=0.0121908;OID=.;OPOS=75714950;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:259:260:178:179:80:81:0.311538:48:32:78:100:49:32:79:100
chr3	75714976	.	C	T	402.7	PASS	AF=0.275362;AO=57;DP=209;FAO=57;FDP=207;FR=.;FRO=150;FSAF=21;FSAR=36;FSRF=68;FSRR=82;FWDB=0.0460155;FXX=0.0189564;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.225;QD=7.78155;RBI=0.0467413;REFB=-0.00423308;REVB=0.00820538;RO=151;SAF=21;SAR=36;SRF=69;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112603;STB=0.563863;STBP=0.255;TYPE=snp;VARB=0.0102976;OID=.;OPOS=75714976;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:209:207:151:150:57:57:0.275362:36:21:69:82:36:21:68:82
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chr3	75781243	.	T	C	99.97	PASS	AF=0.259259;AO=14;DP=54;FAO=14;FDP=54;FR=.;FRO=40;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=28;FWDB=-0.0322046;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.4393;QD=7.40551;RBI=0.0327179;REFB=-0.0106475;REVB=0.00577267;RO=40;SAF=7;SAR=7;SRF=12;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.244463;STB=0.647955;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=0.028185;OID=.;OPOS=75781243;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:40:40:14:14:0.259259:7:7:12:28:7:7:12:28
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chr3	75786071	.	C	A	75.14	PASS	AF=0.100962;AO=21;DP=208;FAO=21;FDP=208;FR=.;FRO=187;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=97;FSRR=90;FWDB=-0.00355358;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=259.086;QD=1.44509;RBI=0.0141493;REFB=-0.0011412;REVB=-0.0136958;RO=187;SAF=12;SAR=9;SRF=97;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0639874;STB=0.547672;STBP=0.66;TYPE=snp;VARB=0.0115951;OID=.;OPOS=75786071;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:208:208:187:187:21:21:0.100962:9:12:97:90:9:12:97:90
chr3	75786073	.	C	G	326.09	PASS	AF=0.242718;AO=50;DP=205;FAO=50;FDP=206;FR=.;FRO=156;FSAF=21;FSAR=29;FSRF=86;FSRR=70;FWDB=0.0230552;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.0335;QD=6.33179;RBI=0.0293815;REFB=0.00247529;REVB=-0.0182134;RO=155;SAF=21;SAR=29;SRF=86;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168601;STB=0.598764;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=-0.0106791;OID=.;OPOS=75786073;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:205:206:155:156:50:50:0.242718:29:21:86:69:29:21:86:70
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chr3	75786132	.	T	C	110.84	PASS	AF=0.117647;AO=28;DP=241;FAO=28;FDP=238;FR=.;FRO=210;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=98;FSRR=112;FWDB=-0.0160868;FXX=0.0124476;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.664;QD=1.86283;RBI=0.0181657;REFB=-0.00297671;REVB=-0.00843837;RO=211;SAF=14;SAR=14;SRF=100;SRR=111;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0324945;STB=0.529391;STBP=0.747;TYPE=snp;VARB=0.0213426;OID=.;OPOS=75786132;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:241:238:211:210:28:28:0.117647:14:14:100:111:14:14:98:112
chr3	75786163	.	C	T	85.27	PASS	AF=0.117318;AO=22;DP=179;FAO=21;FDP=179;FR=.;FRO=158;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=71;FSRR=87;FWDB=0.0062155;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.676;QD=1.90539;RBI=0.0228221;REFB=-0.00145135;REVB=-0.0219595;RO=157;SAF=12;SAR=10;SRF=71;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115861;STB=0.606535;STBP=0.328;TYPE=snp;VARB=0.0260928;OID=.;OPOS=75786163;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:179:179:157:158:22:21:0.117318:10:12:71:86:9:12:71:87
chr3	75786175	.	C	A	297.66	PASS	AF=0.276316;AO=42;DP=154;FAO=42;FDP=152;FR=.;FRO=110;FSAF=13;FSAR=29;FSRF=48;FSRR=62;FWDB=0.0152847;FXX=0.0129862;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.5637;QD=7.83313;RBI=0.018311;REFB=-0.00257487;REVB=0.0100832;RO=110;SAF=13;SAR=29;SRF=48;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166653;STB=0.599206;STBP=0.149;TYPE=snp;VARB=0.00957115;OID=.;OPOS=75786175;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:154:152:110:110:42:42:0.276316:29:13:48:62:29:13:48:62
chr3	75786202	.	TG	CA	296.87	PASS	AF=0.314516;AO=39;DP=125;FAO=39;FDP=124;FR=.;FRO=85;FSAF=12;FSAR=27;FSRF=34;FSRR=51;FWDB=0.00623939;FXX=0.00799936;HRUN=1;LEN=2;MLLD=313.605;QD=9.57629;RBI=0.0148808;REFB=-0.000572427;REVB=0.0135096;RO=85;SAF=12;SAR=27;SRF=34;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119938;STB=0.570211;STBP=0.325;TYPE=mnp;VARB=0.00116689;OID=.;OPOS=75786202;OREF=TG;OALT=CA;OMAPALT=CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:125:124:85:85:39:39:0.314516:27:12:34:51:27:12:34:51
chr3	75786211	.	A	G	66.61	PASS	AF=0.130841;AO=14;DP=107;FAO=14;FDP=107;FR=.;FRO=93;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=34;FSRR=59;FWDB=0.0313746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.608;QD=2.49015;RBI=0.0435736;REFB=-0.00181511;REVB=-0.0302373;RO=92;SAF=7;SAR=7;SRF=33;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.178;STB=0.616665;STBP=0.383;TYPE=snp;VARB=0.0210569;OID=.;OPOS=75786211;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:107:107:92:93:14:14:0.130841:7:7:33:59:7:7:34:59
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chr3	75786225	.	G	A	143.0	PASS	AF=0.27907;AO=15;DP=80;FAO=24;FDP=86;FR=.;FRO=62;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=23;FSRR=39;FWDB=0.035905;FXX=0.0227247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.9651;QD=6.65093;RBI=0.0379917;REFB=-0.00866351;REVB=0.0124177;RO=59;SAF=6;SAR=9;SRF=24;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00878764;STB=0.621318;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=0.15246;OID=.;OPOS=75786225;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:86:59:62:15:24:0.27907:9:6:24:35:11:13:23:39
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chr3	75786244	.	A	T	31.42	PASS	AF=0.101449;AO=7;DP=69;FAO=7;FDP=69;FR=.;FRO=62;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=26;FSRR=36;FWDB=-0.0130085;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.931;QD=1.82119;RBI=0.0220962;REFB=-0.00473376;REVB=-0.0178612;RO=61;SAF=2;SAR=5;SRF=26;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172248;STB=0.63024;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.0183432;OID=.;OPOS=75786244;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:31:69:69:61:62:7:7:0.101449:5:2:26:35:5:2:26:36
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chr3	75786251	.	GG	AT,GT	241.49	PASS	AF=0.339623,0.169811;AO=18,9;DP=54;FAO=18,9;FDP=53;FR=.;FRO=26;FSAF=7,3;FSAR=11,6;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.0138625,-0.00923418;FXX=0.0185151;HRUN=3,3;LEN=2,1;MLLD=188.285,206.898;QD=18.2254;RBI=0.0206697,0.0218302;REFB=0.00601242,0.00134773;REVB=-0.0153319,-0.019781;RO=26;SAF=7,3;SAR=11,6;SRF=13;SRR=13;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.115825,-0.200736;STB=0.566935,0.627162;STBP=0.498,0.421;TYPE=mnp,snp;VARB=-0.0102514,-0.0178842;OID=.,.;OPOS=75786251,75786252;OREF=GG,G;OALT=AT,T;OMAPALT=AT,GT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:53:26:26:18,9:18,9:0.339623,0.169811:11,6:7,3:13:13:11,6:7,3:13:13
chr3	75786256	.	T	A	57.65	PASS	AF=0.176471;AO=9;DP=51;FAO=9;FDP=51;FR=.;FRO=42;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=20;FSRR=22;FWDB=-0.0105786;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=277.372;QD=4.5216;RBI=0.018083;REFB=-0.000201863;REVB=-0.0146659;RO=42;SAF=3;SAR=6;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179581;STB=0.621345;STBP=0.436;TYPE=snp;VARB=0.000822691;OID=.;OPOS=75786256;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:51:51:42:42:9:9:0.176471:6:3:20:22:6:3:20:22
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chr3	75786449	.	C	T	107.11	PASS	AF=0.172414;AO=20;DP=116;FAO=20;FDP=116;FR=.;FRO=96;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=39;FSRR=57;FWDB=-0.0422646;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.775;QD=3.6933;RBI=0.0457769;REFB=-0.0100711;REVB=-0.0175849;RO=96;SAF=10;SAR=10;SRF=39;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11964;STB=0.577511;STBP=0.469;TYPE=snp;VARB=0.0127307;OID=.;OPOS=75786449;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:116:116:96:96:20:20:0.172414:10:10:39:57:10:10:39:57
chr3	75786450	.	G	A	54.92	PASS	AF=0.113043;AO=13;DP=115;FAO=13;FDP=115;FR=.;FRO=102;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=42;FSRR=60;FWDB=-0.0293096;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.568;QD=1.91042;RBI=0.0305036;REFB=-0.00207822;REVB=-0.00845086;RO=101;SAF=7;SAR=6;SRF=42;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148524;STB=0.610946;STBP=0.408;TYPE=snp;VARB=0.0256843;OID=.;OPOS=75786450;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:115:115:101:102:13:13:0.113043:6:7:42:59:6:7:42:60
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chr3	75786499	.	CA	CG,TG	180.35	PASS	AF=0.148515,0.118812;AO=15,12;DP=101;FAO=15,12;FDP=101;FR=.;FRO=74;FSAF=6,7;FSAR=9,5;FSRF=30;FSRR=44;FWDB=0.00395731,0.00213971;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=156.03,237.951;QD=7.14259;RBI=0.00541496,0.0132959;REFB=-0.00640485,-0.00294207;REVB=-0.00369615,-0.0131226;RO=73;SAF=6,7;SAR=9,5;SRF=30;SRR=43;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.014275,0.210815;STB=0.504667,0.649382;STBP=0.989,0.303;TYPE=snp,mnp;VARB=0.0109224,0.00682208;OID=.,.;OPOS=75786500,75786499;OREF=A,CA;OALT=G,TG;OMAPALT=CG,TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:101:101:73:74:15,12:15,12:0.148515,0.118812:9,5:6,7:30:43:9,5:6,7:30:44
chr3	75786506	.	T	C	57.74	PASS	AF=0.130435;AO=12;DP=92;FAO=12;FDP=92;FR=.;FRO=80;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=33;FSRR=47;FWDB=0.0127616;FXX=0.0212743;HRUN=5;LEN=1;MLLD=185.253;QD=2.51036;RBI=0.012828;REFB=-0.0017615;REVB=0.00130339;RO=79;SAF=5;SAR=7;SRF=33;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00133343;STB=0.503725;STBP=0.994;TYPE=snp;VARB=0.0074303;OID=.;OPOS=75786506;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:92:92:79:80:12:12:0.130435:7:5:33:46:7:5:33:47
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chr3	75786760	.	TCCCC	TCCCCT,TCCC	260.79	PASS	AF=0.247059,0.352941;AO=19,20;DP=82;FAO=21,30;FDP=85;FR=.;FRO=34;FSAF=8,17;FSAR=13,13;FSRF=12;FSRR=22;FWDB=-0.0419159,-0.105;FXX=0.0116266;HRUN=0,4;LEN=1,1;MLLD=131.486,14.9468;QD=12.2722;RBI=0.0431708,0.184115;REFB=0.00321536,0.0127979;REVB=0.0103331,0.151239;RO=33;SAF=7,12;SAR=12,8;SRF=12;SRR=21;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.00560478,0.249896;STB=0.518501,0.612067;STBP=0.833,0.096;TYPE=ins,del;VARB=-0.0149046,0.0399335;OID=.,.;OPOS=75786765,75786761;OREF=-,C;OALT=T,-;OMAPALT=TCCCCT,TCCC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0.247059,0.352941:19,20:82:21,30:85:34:8,17:13,13:12:22:99:33:7,12:12,8:12:21
chr3	75786784	.	T	C	135.78	PASS	AF=0.253165;AO=20;DP=79;FAO=20;FDP=79;FR=.;FRO=59;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=26;FSRR=33;FWDB=0.0110073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.126;QD=6.87486;RBI=0.0112267;REFB=-0.00489768;REVB=-0.00220834;RO=58;SAF=8;SAR=12;SRF=26;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0604112;STB=0.531218;STBP=0.761;TYPE=snp;VARB=0.00836548;OID=.;OPOS=75786784;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:58:59:20:20:0.253165:12:8:26:32:12:8:26:33
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chr3	75786866	.	G	T	481.31	PASS	AF=0.434426;AO=53;DP=123;FAO=53;FDP=122;FR=.;FRO=69;FSAF=15;FSAR=38;FSRF=26;FSRR=43;FWDB=-0.0242206;FXX=0.00812942;HRUN=3;LEN=1;MLLD=221.112;QD=15.7806;RBI=0.0259049;REFB=-0.0169687;REVB=-0.00918845;RO=69;SAF=15;SAR=38;SRF=26;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109963;STB=0.561822;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=0.0188998;OID=.;OPOS=75786866;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:123:122:69:69:53:53:0.434426:38:15:26:43:38:15:26:43
chr3	75786888	.	C	T	166.89	PASS	AF=0.198582;AO=28;DP=141;FAO=28;FDP=141;FR=.;FRO=113;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=40;FSRR=73;FWDB=0.00886501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.94;QD=4.73433;RBI=0.0207295;REFB=-0.00605451;REVB=-0.0187383;RO=111;SAF=11;SAR=17;SRF=39;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0564359;STB=0.533095;STBP=0.68;TYPE=snp;VARB=0.0129772;OID=.;OPOS=75786888;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:141:141:111:113:28:28:0.198582:17:11:39:72:17:11:40:73
chr3	75786892	.	A	C	755.41	PASS	AF=0.503448;AO=73;DP=147;FAO=73;FDP=145;FR=.;FRO=72;FSAF=25;FSAR=48;FSRF=28;FSRR=44;FWDB=0.00900586;FXX=0.0202689;HRUN=3;LEN=1;MLLD=184.745;QD=20.8388;RBI=0.0105297;REFB=-0.00558977;REVB=0.00545607;RO=69;SAF=25;SAR=48;SRF=28;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0607384;STB=0.525179;STBP=0.601;TYPE=snp;VARB=0.00590951;OID=.;OPOS=75786892;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:147:145:69:72:73:73:0.503448:48:25:28:41:48:25:28:44
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chr3	75786965	.	C	T	53.19	PASS	AF=0.0829493;AO=18;DP=216;FAO=18;FDP=217;FR=.;FRO=199;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=79;FSRR=120;FWDB=-0.00983296;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.299;QD=0.980477;RBI=0.0125526;REFB=0.00047708;REVB=-0.00780269;RO=196;SAF=4;SAR=14;SRF=76;SRR=120;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.215288;STB=0.684112;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=-0.00332182;OID=.;OPOS=75786965;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:216:217:196:199:18:18:0.0829493:14:4:76:120:14:4:79:120
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chr3	75787427	.	T	C	179.86	PASS	AF=0.303797;AO=24;DP=76;FAO=24;FDP=79;FR=.;FRO=55;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=23;FSRR=32;FWDB=-0.0123339;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=218.436;QD=9.10701;RBI=0.0123568;REFB=-0.00218799;REVB=0.000751757;RO=52;SAF=11;SAR=13;SRF=23;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0187943;STB=0.528258;STBP=0.774;TYPE=snp;VARB=0.00507048;OID=.;OPOS=75787427;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:79:52:55:24:24:0.303797:13:11:23:29:13:11:23:32
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chr3	75787464	.	C	T	379.55	PASS	AF=0.43956;AO=40;DP=91;FAO=40;FDP=91;FR=.;FRO=51;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=33;FWDB=-0.000955176;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.6404;QD=16.6835;RBI=0.00270432;REFB=0.0136776;REVB=0.00253002;RO=50;SAF=23;SAR=17;SRF=18;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.210495;STB=0.622571;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=-0.00896806;OID=.;OPOS=75787464;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:50:51:40:40:0.43956:17:23:18:32:17:23:18:33
chr3	75787476	.	C	T	82.44	PASS	AF=0.157895;AO=16;DP=100;FAO=15;FDP=95;FR=.;FRO=80;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=35;FSRR=45;FWDB=-0.00585361;FXX=0.049995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=298.516;QD=3.4712;RBI=0.0320045;REFB=-0.00271144;REVB=-0.0314646;RO=80;SAF=9;SAR=7;SRF=34;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171927;STB=0.58009;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.00949921;OID=.;OPOS=75787476;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:82:100:95:80:80:16:15:0.157895:7:9:34:46:7:8:35:45
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chr3	75787511	.	C	A	48.73	PASS	AF=0.102564;AO=12;DP=121;FAO=12;FDP=117;FR=.,HEALED;FRO=105;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=53;FSRR=52;FWDB=0.0070107;FXX=0.00847386;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.036;QD=1.66597;RBI=0.00701091;REFB=0.000752206;REVB=-5.43868e-05;RO=76;SAF=5;SAR=7;SRF=29;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0451533;STB=0.579041;STBP=0.593;TYPE=snp;VARB=-0.00553899;OID=.;OPOS=75787511;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:121:117:76:105:12:12:0.102564:7:5:29:47:7:5:53:52
chr3	75787516	.	C	G	496.35	PASS	AF=0.435484;AO=54;DP=121;FAO=54;FDP=124;FR=.;FRO=70;FSAF=30;FSAR=24;FSRF=35;FSRR=35;FWDB=-0.00968555;FXX=0.00799936;HRUN=4;LEN=1;MLLD=292.243;QD=16.0114;RBI=0.0129062;REFB=-0.0108409;REVB=-0.00852989;RO=66;SAF=30;SAR=24;SRF=32;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0699281;STB=0.53152;STBP=0.591;TYPE=snp;VARB=0.0145747;OID=.;OPOS=75787516;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:121:124:66:70:54:54:0.435484:24:30:32:34:24:30:35:35
chr3	75787519	.	CT	AG,CG	716.89	PASS	AF=0.434109,0.124031;AO=56,16;DP=129;FAO=56,16;FDP=129;FR=.;FRO=57;FSAF=30,8;FSAR=26,8;FSRF=30;FSRR=27;FWDB=0.00168296,-0.00926906;FXX=0;HRUN=4,1;LEN=2,1;MLLD=121.39,159.742;QD=22.2292;RBI=0.034641,0.0118183;REFB=-0.0040456,0.0037689;REVB=0.0346001,0.00733197;RO=57;SAF=30,8;SAR=26,8;SRF=30;SRR=27;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.00860865,-0.0326845;STB=0.50476,0.520522;STBP=0.92,0.847;TYPE=mnp,snp;VARB=0.00607784,0.00658804;OID=.,.;OPOS=75787519,75787520;OREF=CT,T;OALT=AG,G;OMAPALT=AG,CG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:129:129:57:57:56,16:56,16:0.434109,0.124031:26,8:30,8:30:27:26,8:30,8:30:27
chr3	75787540	.	T	C	124.38	PASS	AF=0.174242;AO=23;DP=131;FAO=23;FDP=132;FR=.;FRO=109;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=61;FSRR=48;FWDB=-0.0180335;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.465;QD=3.76906;RBI=0.0280168;REFB=-0.00888818;REVB=-0.0214415;RO=107;SAF=11;SAR=12;SRF=59;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0930481;STB=0.566872;STBP=0.485;TYPE=snp;VARB=0.0522712;OID=.;OPOS=75787540;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:131:132:107:109:23:23:0.174242:12:11:59:48:12:11:61:48
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chr3	75787583	.	AC	GA	176.98	PASS	AF=0.210145;AO=26;DP=135;FAO=29;FDP=138;FR=.;FRO=109;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=62;FSRR=47;FWDB=0.00580094;FXX=0.00719373;HRUN=1;LEN=2;MLLD=195.95;QD=5.1298;RBI=0.00850676;REFB=-0.0151316;REVB=0.00622207;RO=107;SAF=14;SAR=12;SRF=62;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0528529;STB=0.567683;STBP=0.419;TYPE=mnp;VARB=0.0402859;OID=.;OPOS=75787583;OREF=AC;OALT=GA;OMAPALT=GA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:135:138:107:109:26:29:0.210145:12:14:62:45:15:14:62:47
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chr3	75787726	.	G	A	1824.7	PASS	AF=0.795455;AO=140;DP=176;FAO=140;FDP=176;FR=.;FRO=36;FSAF=70;FSAR=70;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=0.000847378;FXX=0.0056494;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.482;QD=41.4704;RBI=0.0125329;REFB=-0.0043119;REVB=-0.0125043;RO=36;SAF=70;SAR=70;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0320731;STB=0.517043;STBP=0.379;TYPE=snp;VARB=0.00390297;OID=.;OPOS=75787726;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:176:176:36:36:140:140:0.795455:70:70:15:21:70:70:15:21
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chr3	75788230	.	C	T	86.99	PASS	AF=0.146341;AO=18;DP=123;FAO=18;FDP=123;FR=.;FRO=105;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=55;FSRR=50;FWDB=-0.0248216;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.4;QD=2.8291;RBI=0.0285064;REFB=-0.000209235;REVB=-0.014018;RO=105;SAF=9;SAR=9;SRF=55;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0299945;STB=0.520303;STBP=0.868;TYPE=snp;VARB=0.00045497;OID=.;OPOS=75788230;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:123:123:105:105:18:18:0.146341:9:9:55:50:9:9:55:50
chr3	75788245	.	C	T	284.93	PASS	AF=0.333333;AO=37;DP=111;FAO=37;FDP=111;FR=.;FRO=74;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=43;FSRR=31;FWDB=-0.0177304;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.555;QD=10.2676;RBI=0.0250176;REFB=-0.0119544;REVB=-0.0176498;RO=73;SAF=17;SAR=20;SRF=42;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132345;STB=0.580509;STBP=0.237;TYPE=snp;VARB=0.0268703;OID=.;OPOS=75788245;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:111:73:74:37:37:0.333333:20:17:42:31:20:17:43:31
chr3	75788258	.	C	A	542.53	PASS	AF=0.534653;AO=54;DP=101;FAO=54;FDP=101;FR=.;FRO=47;FSAF=22;FSAR=32;FSRF=29;FSRR=18;FWDB=0.00290657;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=267.279;QD=21.4862;RBI=0.0103295;REFB=-0.00548113;REVB=-0.00991209;RO=47;SAF=22;SAR=32;SRF=29;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177049;STB=0.597329;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.00524427;OID=.;OPOS=75788258;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:101:47:47:54:54:0.534653:32:22:29:18:32:22:29:18
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chr3	81810702	.	A	AG	602.55	PASS	AF=1;AO=48;DP=60;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0614512;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=21.7265;QD=45.4751;RBI=0.075555;REFB=0;REVB=0.0439581;RO=10;SAF=22;SAR=26;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0134842;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00285339;OID=.;OPOS=81810703;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:48:60:53:53:0:24:29:0:0:11:10:22:26:5:5
chr3	81810725	.	C	T	560.83	PASS	AF=1;AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0167374;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.462;QD=60.6304;RBI=0.0218239;REFB=0;REVB=-0.0140051;RO=0;SAF=15;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.82408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.08237e-06;OID=.;OPOS=81810725;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:37:0:0:37:37:1:22:15:0:0:22:15:0:0
chr3	86117224	.	G	T	288.52	PASS	AF=0.392857;AO=33;DP=84;FAO=33;FDP=84;FR=.;FRO=51;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=17;FSRR=34;FWDB=0.000236848;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.273;QD=13.7389;RBI=0.00717505;REFB=-0.0062496;REVB=-0.00717114;RO=51;SAF=13;SAR=20;SRF=17;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0688968;STB=0.539147;STBP=0.578;TYPE=snp;VARB=0.0117662;OID=.;OPOS=86117224;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:51:51:33:33:0.392857:20:13:17:34:20:13:17:34
chr3	86411414	.	G	A	430.31	PASS	AF=0.56;AO=42;DP=75;FAO=42;FDP=75;FR=.;FRO=33;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=-0.0113242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.641;QD=22.95;RBI=0.0189357;REFB=-0.00912714;REVB=-0.0151764;RO=33;SAF=23;SAR=19;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0017465;STB=0.50096;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.010681;OID=.;OPOS=86411414;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:33:33:42:42:0.56:19:23:18:15:19:23:18:15
chr3	86411527	.	G	A	398.48	PASS	AF=1;AO=27;DP=29;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.041735;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.412;QD=56.9262;RBI=0.0508164;REFB=0;REVB=-0.0289914;RO=0;SAF=12;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000292102;OID=.;OPOS=86411527;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:28:0:0:27:28:1:15:12:0:0:15:13:0:0
chr3	86995839	.	T	TC	73.88	PASS	AF=0.46875;AO=12;DP=34;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=0.0254896;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=22.1239;QD=9.23511;RBI=0.0662639;REFB=0.00795217;REVB=0.0611652;RO=22;SAF=4;SAR=8;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.279135;STB=0.70787;STBP=0.041;TYPE=ins;VARB=-0.00116726;OID=.;OPOS=86995840;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.46875:12:34:15:32:17:4:11:11:6:73:22:4:8:13:9
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chr3	87304561	.	G	A	345.19	PASS	AF=0.391753;AO=38;DP=97;FAO=38;FDP=97;FR=.;FRO=59;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=26;FSRR=33;FWDB=-0.00656012;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.715;QD=14.2346;RBI=0.00662732;REFB=-0.0142652;REVB=-0.000941427;RO=59;SAF=22;SAR=16;SRF=26;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147678;STB=0.583921;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=0.018189;OID=.;OPOS=87304561;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:59:59:38:38:0.391753:16:22:26:33:16:22:26:33
chr3	88041650	.	G	A	483.94	PASS	AF=0.445378;AO=53;DP=119;FAO=53;FDP=119;FR=.;FRO=66;FSAF=33;FSAR=20;FSRF=32;FSRR=34;FWDB=0.00821222;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.165;QD=16.267;RBI=0.0208681;REFB=0.000155277;REVB=-0.0191842;RO=65;SAF=33;SAR=20;SRF=32;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131683;STB=0.578166;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=-0.00026451;OID=.;OPOS=88041650;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:119:65:66:53:53:0.445378:20:33:32:33:20:33:32:34
chr3	88101694	.	G	T	2386.47	PASS	AF=0.993711;AO=158;DP=159;FAO=158;FDP=159;FR=.;FRO=1;FSAF=78;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.000230727;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.6973;QD=60.037;RBI=0.0194346;REFB=0.0295648;REVB=-0.0194332;RO=1;SAF=78;SAR=80;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0059103;STB=0.503105;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=-4.42177e-05;OID=.;OPOS=88101694;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:159:159:1:1:158:158:0.993711:80:78:0:1:80:78:0:1
chr3	88105264	.	A	C	2206.04	PASS	AF=0.980132;AO=148;DP=152;FAO=148;FDP=151;FR=.;FRO=3;FSAF=84;FSAR=64;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0247747;FXX=0.00657851;HRUN=3;LEN=1;MLLD=216.168;QD=58.4381;RBI=0.0274739;REFB=-0.184434;REVB=-0.0118754;RO=0;SAF=84;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.502006;STBP=0.76;TYPE=snp;VARB=0.000247079;OID=.;OPOS=88105264;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:152:151:0:3:148:148:0.980132:64:84:0:0:64:84:2:1
chr3	88105818	.	T	C	520.02	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0227657;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.8998;QD=59.4308;RBI=0.0749208;REFB=0;REVB=0.0713783;RO=0;SAF=15;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00101597;OID=.;OPOS=88105818;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:20:15:0:0:20:15:0:0
chr3	88105879	.	TACTTC	T,TACTTA	451.06	PASS	AF=0.84375,0.15625;AO=27,5;DP=32;FAO=27,5;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=10,4;FSAR=17,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00879282,0.0066149;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=5,1;MLLD=236.02,67.0341;QD=56.3821;RBI=0.0133889,0.0131715;REFB=0,0;REVB=0.010097,0.0113899;RO=0;SAF=10,4;SAR=17,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.00469441,-0.0170287;OID=.,.;OPOS=88105880,88105884;OREF=ACTTC,C;OALT=-,A;OMAPALT=T,TACTTA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.84375,0.15625:27,5:32:27,5:32:0:10,4:17,1:0:0:26:0:10,4:17,1:0:0
chr3	88189341	.	T	C	806.02	PASS	AF=1;AO=57;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0513549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.0694;QD=55.5878;RBI=0.073224;REFB=-0.114107;REVB=0.0521961;RO=0;SAF=31;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.19358e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00382696;OID=.;OPOS=88189341;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:58:58:0:0:57:58:1:26:31:0:0:27:31:0:0
chr3	88190768	.	C	A	709.12	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00510162;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.886;QD=63.0333;RBI=0.00575065;REFB=0;REVB=0.00265394;RO=0;SAF=26;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.43208e-05;OID=.;OPOS=88190768;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:45:0:0:44:45:1:18:26:0:0:19:26:0:0
chr3	88190809	.	C	T	1037.81	PASS	AF=1;AO=69;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00417771;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.13;QD=59.3037;RBI=0.00432303;REFB=0;REVB=-0.00111146;RO=0;SAF=40;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.33696e-05;OID=.;OPOS=88190809;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:69:70:1:29:40:0:0:29:41:0:0
chr3	88191170	.	TGGGGA	TGGG,TGGGA	620.52	PASS	AF=0,1;AO=17,37;DP=58;FAO=0,57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=0,32;FSAR=0,25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0122823,-0.0106914;FXX=0.0172384;HRUN=4,4;LEN=2,1;MLLD=200.601,20.8338;QD=43.545;RBI=0.0214849,0.132301;REFB=-0.0635026,-0.0447467;REVB=0.0176279,-0.131869;RO=1;SAF=4,28;SAR=13,9;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0339667,0.0492024;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=0,-0.0035683;OID=.,.;OPOS=88191174,88191171;OREF=GA,G;OALT=-,-;OMAPALT=TGGG,TGGGA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	2/2:0,1:17,37:58:0,57:57:0:0,32:0,25:0:0:8:1:4,28:13,9:0:1
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chr3	88192484	.	T	C	888.13	PASS	AF=1;AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0543716;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.5202;QD=58.2382;RBI=0.089015;REFB=0;REVB=0.0704798;RO=0;SAF=18;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000799937;OID=.;OPOS=88192484;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:61:0:0:61:61:1:43:18:0:0:43:18:0:0
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chr3	97660106	.	A	C	304.58	PASS	AF=0.588235;AO=30;DP=51;FAO=30;FDP=51;FR=.;FRO=21;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.0396993;FXX=0.0192271;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.651;QD=23.8887;RBI=0.0402968;REFB=-0.00860971;REVB=-0.00691339;RO=21;SAF=18;SAR=12;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0941234;STB=0.551965;STBP=0.382;TYPE=snp;VARB=0.00860296;OID=.;OPOS=97660106;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:21:21:30:30:0.588235:12:18:10:11:12:18:10:11
chr3	97663686	.	A	C	302.24	PASS	AF=0.516129;AO=32;DP=62;FAO=32;FDP=62;FR=.;FRO=30;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=11;FWDB=-0.0174181;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=245.79;QD=19.4996;RBI=0.0174217;REFB=-0.009388;REVB=0.000356461;RO=30;SAF=16;SAR=16;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116112;STB=0.564476;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=0.00984271;OID=.;OPOS=97663686;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:30:30:32:32:0.516129:16:16:19:11:16:16:19:11
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chr3	97673268	.	A	C	1587.71	PASS	AF=1;AO=99;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00557227;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.017;QD=64.1499;RBI=0.00958541;REFB=0;REVB=0.00779936;RO=0;SAF=54;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.83808e-05;OID=.;OPOS=97673268;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:99:99:0:0:99:99:1:45:54:0:0:45:54:0:0
chr3	97726747	.	T	A	339.74	PASS	AF=0.420455;AO=37;DP=88;FAO=37;FDP=88;FR=.;FRO=51;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=30;FSRR=21;FWDB=0.00382334;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.231;QD=15.4426;RBI=0.00768069;REFB=-0.00977685;REVB=0.00666146;RO=51;SAF=20;SAR=17;SRF=30;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0495133;STB=0.527935;STBP=0.669;TYPE=snp;VARB=0.0144822;OID=.;OPOS=97726747;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:51:51:37:37:0.420455:17:20:30:21:17:20:30:21
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chr3	98541012	.	G	A	613.32	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0249855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.478;QD=61.3322;RBI=0.0255349;REFB=0;REVB=-0.00526857;RO=0;SAF=21;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.75859e-05;OID=.;OPOS=98541012;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:19:21:0:0:19:21:0:0
chr3	98541116	.	G	A	197.59	PASS	AF=0.47619;AO=20;DP=42;FAO=20;FDP=42;FR=.;FRO=22;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.0171316;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=48.7256;QD=18.8181;RBI=0.0284673;REFB=-0.0029641;REVB=0.0227354;RO=21;SAF=15;SAR=5;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.275908;STB=0.648489;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=0.00492298;OID=.;OPOS=98541116;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:21:22:20:20:0.47619:5:15:10:11:5:15:11:11
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chr3	100468407	.	C	CAGTT	184.37	PASS	AF=0.324324;AO=24;DP=75;FAO=24;FDP=74;FR=.;FRO=50;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=25;FSRR=25;FWDB=-0.00120047;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=4;MLLD=250.133;QD=9.96615;RBI=0.0136306;REFB=-0.00525362;REVB=0.0135776;RO=50;SAF=11;SAR=13;SRF=25;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0480682;STB=0.528193;STBP=0.776;TYPE=ins;VARB=0.0101581;OID=.;OPOS=100468408;OREF=-;OALT=AGTT;OMAPALT=CAGTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.324324:24:75:24:74:50:11:13:25:25:99:50:11:13:25:25
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chr3	100617680	.	C	T	1080.53	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0096579;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.265;QD=60.0295;RBI=0.0297983;REFB=0;REVB=0.0281898;RO=0;SAF=36;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.80656e-05;OID=.;OPOS=100617680;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:36:36:0:0:36:36:0:0
chr3	100712249	.	T	C	429.06	PASS	AF=0.473118;AO=43;DP=94;FAO=44;FDP=93;FR=.;FRO=49;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=34;FWDB=0.00962369;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.5069;QD=18.454;RBI=0.0263999;REFB=-0.00391305;REVB=0.0245834;RO=47;SAF=23;SAR=20;SRF=15;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20081;STB=0.624223;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.00743953;OID=.;OPOS=100712249;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:93:47:49:43:44:0.473118:20:23:15:32:20:24:15:34
chr3	100949842	.	G	A	1084.19	PASS	AF=0.986486;AO=73;DP=74;FAO=73;FDP=74;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0176792;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.4928;QD=58.6047;RBI=0.0416948;REFB=-0.0408285;REVB=-0.0377611;RO=0;SAF=33;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.93225e-08;STB=0.507461;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=0.00461485;OID=.;OPOS=100949842;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:74:74:0:1:73:73:0.986486:40:33:0:0:40:33:1:0
chr3	100963154	.	G	A	845.19	PASS	AF=1;AO=58;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00745361;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.429;QD=57.3011;RBI=0.0139137;REFB=0;REVB=0.0117489;RO=0;SAF=24;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.31293e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000108771;OID=.;OPOS=100963154;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:58:59:1:34:24:0:0:34:25:0:0
chr3	101043906	.	G	A	1381.34	PASS	AF=0.988889;AO=89;DP=90;FAO=89;FDP=90;FR=.;FRO=1;FSAF=59;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0456212;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.4482;QD=61.3929;RBI=0.0462258;REFB=0.0471384;REVB=0.00745199;RO=1;SAF=59;SAR=30;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0155337;STB=0.508195;STBP=0.26;TYPE=snp;VARB=-0.000836782;OID=.;OPOS=101043906;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:90:90:1:1:89:89:0.988889:30:59:0:1:30:59:0:1
chr3	101044304	.	ATTTTTTTA	ATTTTTT,ATTTTTTA	52.75	PASS	AF=0.226667,0;AO=9,13;DP=77;FAO=17,0;FDP=75;FR=.;FRO=58;FSAF=7,0;FSAR=10,0;FSRF=38;FSRR=20;FWDB=-0.0340386,-0.0858488;FXX=0.0131562;HRUN=7,7;LEN=2,1;MLLD=19.4351,10.1522;QD=2.81317;RBI=0.200642,0.249433;REFB=-0.0106686,0.0242436;REVB=-0.197733,-0.234194;RO=38;SAF=4,10;SAR=5,3;SRF=24;SRR=14;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.226647,0.198462;STB=0.68162,0.5;STBP=0.102,1;TYPE=del,del;VARB=0.0362636,0.0452255;OID=.,.;OPOS=101044311,101044305;OREF=TA,T;OALT=-,-;OMAPALT=ATTTTTT,ATTTTTTA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.226667,0:9,13:77:17,0:75:58:7,0:10,0:38:20:45:38:4,10:5,3:24:14
chr3	101080694	.	T	C	955.19	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0252544;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.67;QD=58.7811;RBI=0.0259022;REFB=0;REVB=0.00575659;RO=0;SAF=26;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.10038e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.61808e-05;OID=.;OPOS=101080694;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:39:26:0:0:39:26:0:0
chr3	101085413	.	G	A	742.73	PASS	AF=0.964286;AO=54;DP=56;FAO=54;FDP=56;FR=.;FRO=2;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0189582;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=265.524;QD=53.0518;RBI=0.0225028;REFB=-0.0561155;REVB=0.0121229;RO=2;SAF=25;SAR=29;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0362146;STB=0.519224;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.00163822;OID=.;OPOS=101085413;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:56:56:2:2:54:54:0.964286:29:25:2:0:29:25:2:0
chr3	101219889	.	G	C	669.83	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00180847;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=231.347;QD=62.3096;RBI=0.0284956;REFB=0;REVB=0.0284382;RO=0;SAF=22;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.57807e-05;OID=.;OPOS=101219889;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:21:22:0:0:21:22:0:0
chr3	101221069	.	T	C	769.16	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0573701;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.1972;QD=56.9746;RBI=0.0908822;REFB=0;REVB=-0.0704857;RO=0;SAF=15;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000169042;OID=.;OPOS=101221069;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:54:0:0:53:54:1:38:15:0:0:38:16:0:0
chr3	101231921	.	T	C	1589.89	PASS	AF=1;AO=106;DP=106;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.026802;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.267;QD=59.9959;RBI=0.031399;REFB=0;REVB=0.016357;RO=0;SAF=42;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.79622e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.33137e-06;OID=.;OPOS=101231921;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:106:106:0:0:106:106:1:64:42:0:0:64:42:0:0
chr3	101285224	.	G	A	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0372825;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.833;QD=46.8478;RBI=0.0400502;REFB=0;REVB=-0.0146299;RO=0;SAF=5;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000467074;OID=.;OPOS=101285224;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:10:5:0:0:10:5:0:0
chr3	101334753	.	C	A	198.71	PASS	AF=0.487805;AO=20;DP=41;FAO=20;FDP=41;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=0.0128655;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=254.232;QD=19.386;RBI=0.0129203;REFB=-0.0106524;REVB=-0.00118915;RO=21;SAF=5;SAR=15;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.353382;STB=0.701087;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.00684611;OID=.;OPOS=101334753;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:21:21:20:20:0.487805:15:5:13:8:15:5:13:8
chr3	101366362	.	CA	C,CC	133.16	PASS	AF=0.520833,0.0833333;AO=18,5;DP=48;FAO=25,4;FDP=48;FR=.;FRO=19;FSAF=10,1;FSAR=15,3;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.157779,0.0995074;FXX=0;HRUN=8,8;LEN=1,1;MLLD=8.55806,16.9633;QD=11.097;RBI=0.157818,0.109693;REFB=-0.121348,-0.0505117;REVB=-0.00348091,0.0461611;RO=22;SAF=4,1;SAR=14,4;SRF=14;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.418738,-0.486379;STB=0.555511,0.732146;STBP=0.43,0.36;TYPE=del,snp;VARB=0.114064,0.0934377;OID=.,.;OPOS=101366363,101366363;OREF=A,A;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.520833,0.0833333:18,5:48:25,4:48:19:10,1:15,3:10:9:58:22:4,1:14,4:14:8
chr3	101395629	.	C	T	1468.02	PASS	AF=0.567227;AO=135;DP=238;FAO=135;FDP=238;FR=.;FRO=103;FSAF=90;FSAR=45;FSRF=46;FSRR=57;FWDB=0.0246293;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.4603;QD=24.6727;RBI=0.0514601;REFB=-0.0186354;REVB=0.0451834;RO=102;SAF=90;SAR=45;SRF=45;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187024;STB=0.599985;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0148976;OID=.;OPOS=101395629;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:238:238:102:103:135:135:0.567227:45:90:45:57:45:90:46:57
chr3	101484335	.	G	A	1592.36	PASS	AF=1;AO=105;DP=106;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0239176;FXX=0.0270246;HRUN=4;LEN=1;MLLD=55.3289;QD=58.9762;RBI=0.0310024;REFB=-0.123455;REVB=0.0197255;RO=1;SAF=53;SAR=52;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0088702;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0009188;OID=.;OPOS=101484335;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:106:108:1:0:105:108:1:52:53:1:0:53:55:0:0
chr3	101571550	.	A	G	246.72	PASS	AF=0.509804;AO=26;DP=51;FAO=26;FDP=51;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=0.00512892;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.08;QD=19.3507;RBI=0.0351544;REFB=-0.0077373;REVB=0.0347782;RO=25;SAF=11;SAR=15;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15448;STB=0.5864;STBP=0.216;TYPE=snp;VARB=0.00559218;OID=.;OPOS=101571550;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:25:25:26:26:0.509804:15:11:15:10:15:11:15:10
chr3	101576029	.	T	TACTTTTAGAAAGCTTTAATAACC	39.91	PASS	AF=0.162791;AO=5;DP=43;FAO=7;FDP=43;FR=.;FRO=36;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=22;FSRR=14;FWDB=-0.0053222;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=23;MLLD=570.583;QD=3.71253;RBI=0.00842557;REFB=0.00063106;REVB=-0.0065318;RO=36;SAF=0;SAR=5;SRF=22;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.670173;STB=0.872408;STBP=0.059;TYPE=ins;VARB=-0.00289859;OID=.;OPOS=101576030;OREF=-;OALT=ACTTTTAGAAAGCTTTAATAACC;OMAPALT=TACTTTTAGAAAGCTTTAATAACC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.162791:5:43:7:43:36:1:6:22:14:39:36:0:5:22:14
chr3	101576175	.	T	C	542.69	PASS	AF=0.515152;AO=51;DP=99;FAO=51;FDP=99;FR=.;FRO=48;FSAF=30;FSAR=21;FSRF=27;FSRR=21;FWDB=-0.000194158;FXX=0.009999;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.5346;QD=21.9268;RBI=0.0167546;REFB=-0.0136305;REVB=0.0167535;RO=48;SAF=30;SAR=21;SRF=27;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0232139;STB=0.512815;STBP=0.825;TYPE=snp;VARB=0.0109293;OID=.;OPOS=101576175;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:48:48:51:51:0.515152:21:30:27:21:21:30:27:21
chr3	101674012	.	G	A	156.28	PASS	AF=0.425;AO=17;DP=40;FAO=17;FDP=40;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=0.0102107;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.1291;QD=15.628;RBI=0.0249998;REFB=-0.0269039;REVB=-0.0228195;RO=23;SAF=7;SAR=10;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0211591;STB=0.512181;STBP=0.898;TYPE=snp;VARB=0.0366083;OID=.;OPOS=101674012;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:23:23:17:17:0.425:10:7:9:14:10:7:9:14
chr3	103879569	.	G	A	5542.95	PASS	AF=1;AO=342;DP=342;FAO=353;FDP=353;FR=.;FRO=0;FSAF=162;FSAR=191;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0617289;FXX=0.00282478;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.502;QD=62.8097;RBI=0.0634833;REFB=0;REVB=-0.0148214;RO=0;SAF=150;SAR=192;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.90659e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.73275e-05;OID=.;OPOS=103879569;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:30:342:353:0:0:342:353:1:192:150:0:0:191:162:0:0
chr3	103879598	.	AT	A,AA	2308.43	PASS	AF=0.384615,0.615385;AO=20,115;DP=149;FAO=60,96;FDP=156;FR=.;FRO=0;FSAF=27,37;FSAR=33,59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.100124,0.0989034;FXX=0.0249984;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=179.478,179.254;QD=59.1905;RBI=0.113545,0.117833;REFB=0,0;REVB=-0.053551,-0.064052;RO=14;SAF=3,34;SAR=17,81;SRF=13;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.596487,-0.145695;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.00234871,0.0142052;OID=.,.;OPOS=103879599,103879599;OREF=T,T;OALT=-,A;OMAPALT=A,AA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.384615,0.615385:20,115:149:60,96:156:0:27,37:33,59:0:0:65:14:3,34:17,81:13:1
chr3	105260596	.	T	C	937.61	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00883874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.151;QD=58.6005;RBI=0.0148377;REFB=0;REVB=0.0119178;RO=0;SAF=26;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.99951e-05;OID=.;OPOS=105260596;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:38:26:0:0:38:26:0:0
chr3	105421034	.	C	T	792.0	PASS	AF=0.506667;AO=76;DP=150;FAO=76;FDP=150;FR=.;FRO=74;FSAF=40;FSAR=36;FSRF=40;FSRR=34;FWDB=-0.0423038;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.631;QD=21.12;RBI=0.043713;REFB=-0.0136682;REVB=-0.0110096;RO=74;SAF=40;SAR=36;SRF=40;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0127999;STB=0.50704;STBP=0.879;TYPE=snp;VARB=0.0111147;OID=.;OPOS=105421034;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:150:150:74:74:76:76:0.506667:36:40:40:34:36:40:40:34
chr3	105422844	.	C	T	965.01	PASS	AF=1;AO=65;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00538875;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=112.43;QD=58.4855;RBI=0.00669812;REFB=0;REVB=0.00397822;RO=0;SAF=26;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.10038e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.6224e-05;OID=.;OPOS=105422844;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:65:66:1:39:26:0:0:40:26:0:0
chr3	106234757	.	G	C	93.32	PASS	AF=0.578947;AO=11;DP=19;FAO=11;FDP=19;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.0170987;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.828;QD=19.646;RBI=0.0449479;REFB=0.0181427;REVB=0.0415686;RO=8;SAF=3;SAR=8;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0212942;STB=0.512173;STBP=0.983;TYPE=snp;VARB=-0.0115867;OID=.;OPOS=106234757;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:19:19:8:8:11:11:0.578947:8:3:2:6:8:3:2:6
chr3	106617500	.	C	T	613.36	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0361707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.056;QD=61.3359;RBI=0.0362301;REFB=0;REVB=-0.0020745;RO=0;SAF=13;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.71168e-05;OID=.;OPOS=106617500;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:27:13:0:0:27:13:0:0
chr3	107096547	.	G	A	158.7	PASS	AF=0.459459;AO=17;DP=37;FAO=17;FDP=37;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.00467845;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=305.574;QD=17.1565;RBI=0.00726797;REFB=0.00364182;REVB=0.00556197;RO=20;SAF=8;SAR=9;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0278045;STB=0.515905;STBP=0.808;TYPE=snp;VARB=-0.0035832;OID=.;OPOS=107096547;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:20:20:17:17:0.459459:9:8:10:10:9:8:10:10
chr3	107097346	.	C	A	382.17	PASS	AF=0.368;AO=46;DP=125;FAO=46;FDP=125;FR=.;FRO=79;FSAF=33;FSAR=13;FSRF=41;FSRR=38;FWDB=0.079421;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.238;QD=12.2294;RBI=0.0829952;REFB=-0.0120721;REVB=-0.0240938;RO=79;SAF=33;SAR=13;SRF=41;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.237383;STB=0.636233;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.02431;OID=.;OPOS=107097346;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:125:125:79:79:46:46:0.368:13:33:41:38:13:33:41:38
chr3	107646728	.	G	A	517.75	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00823244;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=306.763;QD=59.1716;RBI=0.0344445;REFB=0;REVB=0.0334462;RO=0;SAF=20;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.48532e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.07713e-05;OID=.;OPOS=107646728;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:35:0:0:34:35:1:14:20:0:0:14:21:0:0
chr3	107646807	.	G	T	674.25	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0325137;FXX=0.0227221;HRUN=3;LEN=1;MLLD=133.829;QD=62.7206;RBI=0.0325137;REFB=0;REVB=7.36167e-06;RO=0;SAF=27;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000159841;OID=.;OPOS=107646807;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:16:27:0:0:16:27:0:0
chr3	107646895	.	T	C	586.78	PASS	AF=0.884615;AO=46;DP=52;FAO=46;FDP=52;FR=.;FRO=6;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.0299066;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.7676;QD=45.1371;RBI=0.0798337;REFB=0.0309773;REVB=-0.0740204;RO=6;SAF=26;SAR=20;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0505636;STB=0.527015;STBP=0.325;TYPE=snp;VARB=-0.02722;OID=.;OPOS=107646895;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:31:52:52:6:6:46:46:0.884615:20:26:2:4:20:26:2:4
chr3	107762143	.	A	G	860.2	PASS	AF=0.435185;AO=94;DP=216;FAO=94;FDP=216;FR=.;FRO=122;FSAF=48;FSAR=46;FSRF=78;FSRR=44;FWDB=0.0135749;FXX=0.00460808;HRUN=4;LEN=1;MLLD=302.044;QD=15.9296;RBI=0.0137073;REFB=-0.000966904;REVB=0.00190103;RO=122;SAF=48;SAR=46;SRF=78;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131399;STB=0.572939;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=0.00125687;OID=.;OPOS=107762143;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:216:216:122:122:94:94:0.435185:46:48:78:44:46:48:78:44
chr3	107765392	.	G	A	52.91	PASS	AF=0.275862;AO=8;DP=28;FAO=8;FDP=29;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.053364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=48.262;QD=7.29802;RBI=0.109968;REFB=-0.0154631;REVB=-0.0961521;RO=20;SAF=6;SAR=2;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.251243;STB=0.67877;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=0.0385729;OID=.;OPOS=107765392;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:28:29:20:21:8:8:0.275862:2:6:11:9:2:6:11:10
chr3	107884269	.	A	G	523.85	PASS	AF=0.514286;AO=54;DP=105;FAO=54;FDP=105;FR=.;FRO=51;FSAF=34;FSAR=20;FSRF=24;FSRR=27;FWDB=-0.00263747;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.803;QD=19.9561;RBI=0.00917562;REFB=-0.0030694;REVB=0.00878838;RO=51;SAF=34;SAR=20;SRF=24;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143701;STB=0.579375;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=0.00247535;OID=.;OPOS=107884269;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:105:51:51:54:54:0.514286:20:34:24:27:20:34:24:27
chr3	107937408	.	C	T	219.17	PASS	AF=0.458333;AO=21;DP=48;FAO=22;FDP=48;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=-0.00880025;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.964;QD=18.2639;RBI=0.0102167;REFB=-0.00440993;REVB=-0.00519008;RO=26;SAF=8;SAR=13;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0362158;STB=0.510279;STBP=0.906;TYPE=snp;VARB=0.00520373;OID=.;OPOS=107937408;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:26:26:21:22:0.458333:13:8:9:17:14:8:9:17
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chr3	108081217	.	C	A	339.74	PASS	AF=0.6;AO=26;DP=46;FAO=30;FDP=50;FR=.;FRO=20;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.00661152;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=295.217;QD=27.1792;RBI=0.0171613;REFB=-0.000242161;REVB=0.0158367;RO=20;SAF=13;SAR=13;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0391418;STB=0.533311;STBP=0.607;TYPE=snp;VARB=0.000724001;OID=.;OPOS=108081217;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:50:20:20:26:30:0.6:13:13:11:9:16:14:11:9
chr3	108096098	.	C	G	1200.98	PASS	AF=0.9875;AO=79;DP=82;FAO=79;FDP=80;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00582799;FXX=0.0243873;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.735;QD=60.0489;RBI=0.0083325;REFB=0.0088126;REVB=-0.00595525;RO=0;SAF=38;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506023;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=-2.56308e-05;OID=.;OPOS=108096098;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:82:80:0:1:79:79:0.9875:41:38:0:0:41:38:0:1
chr3	108135680	.	C	T	321.84	PASS	AF=0.472973;AO=34;DP=73;FAO=35;FDP=74;FR=.;FRO=39;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=-0.0016739;FXX=0.0133316;HRUN=3;LEN=1;MLLD=229.989;QD=17.3969;RBI=0.0055877;REFB=-0.0248605;REVB=-0.00533108;RO=39;SAF=18;SAR=16;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0402727;STB=0.514278;STBP=0.86;TYPE=snp;VARB=0.0284575;OID=.;OPOS=108135680;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:74:39:39:34:35:0.472973:16:18:19:20:17:18:19:20
chr3	108159977	.	G	A	319.95	PASS	AF=0.571429;AO=31;DP=57;FAO=32;FDP=56;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=-0.00802306;FXX=0.0344768;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.267;QD=22.8537;RBI=0.00802382;REFB=-0.0158299;REVB=-0.000111067;RO=25;SAF=12;SAR=19;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0231575;STB=0.532767;STBP=0.584;TYPE=snp;VARB=0.0182342;OID=.;OPOS=108159977;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:56:25:24:31:32:0.571429:19:12:9:16:19:13:8:16
chr3	108298260	.	C	T	158.7	PASS	AF=0.459459;AO=17;DP=37;FAO=17;FDP=37;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=-0.0313369;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.775;QD=17.1565;RBI=0.0313388;REFB=-0.0106386;REVB=0.000344326;RO=20;SAF=6;SAR=11;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00304274;STB=0.50174;STBP=0.971;TYPE=snp;VARB=0.00749357;OID=.;OPOS=108298260;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:20:20:17:17:0.459459:11:6:7:13:11:6:7:13
chr3	108351907	.	C	G	467.33	PASS	AF=0.429752;AO=52;DP=121;FAO=52;FDP=121;FR=.;FRO=69;FSAF=24;FSAR=28;FSRF=28;FSRR=41;FWDB=-0.0214323;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.5931;QD=15.4488;RBI=0.0214785;REFB=0.00166765;REVB=-0.00140789;RO=69;SAF=24;SAR=28;SRF=28;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0573646;STB=0.532121;STBP=0.558;TYPE=snp;VARB=-0.00278963;OID=.;OPOS=108351907;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:121:121:69:69:52:52:0.429752:28:24:28:41:28:24:28:41
chr3	108403086	.	T	C	1767.82	PASS	AF=1;AO=113;DP=113;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156747;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.428;QD=60.4382;RBI=0.0158883;REFB=0;REVB=0.00259664;RO=0;SAF=57;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.28685e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000132833;OID=.;OPOS=108403086;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:113:117:0:0:113:117:1:56:57:0:0:58:59:0:0
chr3	108557820	.	T	C	754.32	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00702155;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.075;QD=56.9299;RBI=0.00847061;REFB=0;REVB=0.00473806;RO=0;SAF=24;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.63358e-06;OID=.;OPOS=108557820;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:29:24:0:0:29:24:0:0
chr3	108703587	.	C	T	937.46	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0438086;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.1041;QD=58.5913;RBI=0.0451946;REFB=0;REVB=0.0111066;RO=0;SAF=30;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000186024;OID=.;OPOS=108703587;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:34:30:0:0:34:30:0:0
chr3	108754238	.	A	T	1376.05	PASS	AF=0.967742;AO=90;DP=93;FAO=90;FDP=93;FR=.;FRO=3;FSAF=43;FSAR=47;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0201282;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=298.09;QD=59.1848;RBI=0.0208088;REFB=0.0522902;REVB=0.00527841;RO=2;SAF=43;SAR=47;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0197398;STB=0.50467;STBP=0.703;TYPE=snp;VARB=-0.000474532;OID=.;OPOS=108754238;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:93:93:2:3:90:90:0.967742:47:43:0:2:47:43:1:2
chr3	108867128	.	A	G	808.63	PASS	AF=0.966667;AO=58;DP=60;FAO=58;FDP=60;FR=.;FRO=2;FSAF=28;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0011011;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.734;QD=53.9089;RBI=0.0322726;REFB=0.00894812;REVB=-0.0322538;RO=1;SAF=28;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0165496;STB=0.500575;STBP=0.87;TYPE=snp;VARB=-0.00145508;OID=.;OPOS=108867128;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:60:60:1:2:58:58:0.966667:30:28:1:0:30:28:1:1
chr3	109052732	.	T	C	1068.4	PASS	AF=1;AO=70;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0015659;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.908;QD=59.3557;RBI=0.0134774;REFB=0;REVB=0.0133862;RO=1;SAF=42;SAR=28;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0111254;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.27355e-05;OID=.;OPOS=109052732;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:72:1:0:70:72:1:28:42:1:0:28:44:0:0
chr3	109178707	.	C	G	298.75	PASS	AF=0.54;AO=27;DP=50;FAO=27;FDP=50;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.00518687;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=268.393;QD=23.8999;RBI=0.0107758;REFB=-0.0144339;REVB=-0.00944534;RO=23;SAF=14;SAR=13;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00266441;STB=0.501483;STBP=0.969;TYPE=snp;VARB=0.0124597;OID=.;OPOS=109178707;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:23:23:27:27:0.54:13:14:12:11:13:14:12:11
chr3	109178758	.	C	T	602.97	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0117786;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.7153;QD=60.2965;RBI=0.0660631;REFB=0;REVB=0.0650046;RO=0;SAF=18;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.34792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00188946;OID=.;OPOS=109178758;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:40:0:0:39:40:1:21:18:0:0:21:19:0:0
chr3	110611137	.	G	A	721.6	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00613867;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.1138;QD=62.7475;RBI=0.0225085;REFB=0;REVB=-0.0216553;RO=0;SAF=24;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000213803;OID=.;OPOS=110611137;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:22:24:0:0:22:24:0:0
chr3	110789199	.	G	A	165.8	PASS	AF=0.375;AO=18;DP=49;FAO=18;FDP=48;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=0.0129246;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.416;QD=13.8167;RBI=0.0461839;REFB=-0.0223123;REVB=0.0443386;RO=30;SAF=8;SAR=10;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.012088;STB=0.507034;STBP=0.964;TYPE=snp;VARB=0.0343562;OID=.;OPOS=110789199;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:48:30:30:18:18:0.375:10:8:13:17:10:8:13:17
chr3	110863855	.	A	C	303.81	PASS	AF=0.458333;AO=33;DP=68;FAO=33;FDP=72;FR=.;FRO=39;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=16;FSRR=23;FWDB=0.00151902;FXX=0.0270234;HRUN=8;LEN=1;MLLD=155.894;QD=16.8784;RBI=0.0206225;REFB=-0.00576016;REVB=0.0205665;RO=35;SAF=13;SAR=20;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0331034;STB=0.509213;STBP=0.919;TYPE=snp;VARB=0.00554449;OID=.;OPOS=110863855;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:72:35:39:33:33:0.458333:20:13:15:20:20:13:16:23
chr3	111298145	.	A	G	239.85	PASS	AF=0.41791;AO=28;DP=67;FAO=28;FDP=67;FR=.;FRO=39;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=-0.00840218;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.3399;QD=14.3194;RBI=0.0198701;REFB=0.00343895;REVB=-0.0180062;RO=39;SAF=15;SAR=13;SRF=23;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0558896;STB=0.531732;STBP=0.706;TYPE=snp;VARB=-0.00926495;OID=.;OPOS=111298145;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:39:39:28:28:0.41791:13:15:23:16:13:15:23:16
chr3	111313457	.	T	C	355.96	PASS	AF=0.44186;AO=38;DP=86;FAO=38;FDP=86;FR=.;FRO=48;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=25;FSRR=23;FWDB=0.0702341;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.3263;QD=16.5562;RBI=0.0703494;REFB=-0.00859988;REVB=-0.00402532;RO=47;SAF=18;SAR=20;SRF=24;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0364125;STB=0.526302;STBP=0.692;TYPE=snp;VARB=0.0131922;OID=.;OPOS=111313457;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:47:48:38:38:0.44186:20:18:24:23:20:18:25:23
chr3	111313854	.	C	T	48.86	PASS	AF=0.5;AO=7;DP=14;FAO=7;FDP=14;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=0.0258347;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.9876;QD=13.9593;RBI=0.0301264;REFB=0.00827983;REVB=0.0154973;RO=6;SAF=2;SAR=5;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.414385;STB=0.76852;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=-0.0148807;OID=.;OPOS=111313854;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:14:14:6:7:7:7:0.5:5:2:5:1:5:2:6:1
chr3	111356083	.	G	C	2503.48	PASS	AF=1;AO=136;DP=166;FAO=165;FDP=165;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=92;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0769142;FXX=0.00602373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.4479;QD=60.6904;RBI=0.0776895;REFB=0;REVB=0.0109485;RO=0;SAF=70;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0117383;OID=.;OPOS=111356083;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:166:165:0:0:136:165:1:66:70:0:0:73:92:0:0
chr3	111604541	.	G	C	772.68	PASS	AF=0.98;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.008936;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=176.149;QD=61.8143;RBI=0.0179225;REFB=-0.103714;REVB=-0.0155359;RO=1;SAF=23;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0200211;STB=0.510634;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=0.000525367;OID=.;OPOS=111604541;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:50:50:1:1:49:49:0.98:26:23:1:0:26:23:1:0
chr3	111677526	.	G	A	307.65	PASS	AF=0.485294;AO=31;DP=66;FAO=33;FDP=68;FR=.;FRO=35;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=13;FWDB=0.0140975;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.907;QD=18.0969;RBI=0.0158088;REFB=-0.0113278;REVB=0.00715408;RO=35;SAF=20;SAR=11;SRF=22;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.01701;STB=0.50432;STBP=0.962;TYPE=snp;VARB=0.00638729;OID=.;OPOS=111677526;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:68:35:35:31:33:0.485294:11:20:22:13:12:21:22:13
chr3	111688578	.	C	T	344.54	PASS	AF=0.45122;AO=36;DP=82;FAO=37;FDP=82;FR=.;FRO=45;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=26;FSRR=19;FWDB=-0.00998998;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.9136;QD=16.8067;RBI=0.0380665;REFB=0.00357893;REVB=-0.0367322;RO=44;SAF=19;SAR=17;SRF=24;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0173829;STB=0.520628;STBP=0.768;TYPE=snp;VARB=-0.00485517;OID=.;OPOS=111688578;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:44:45:36:37:0.45122:17:19:24:20:17:20:26:19
chr3	111694438	.	T	C	1422.77	PASS	AF=0.989691;AO=96;DP=100;FAO=96;FDP=97;FR=.;FRO=1;FSAF=53;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0164139;FXX=0.0490148;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.736;QD=58.6709;RBI=0.0417784;REFB=-0.105381;REVB=0.038419;RO=0;SAF=53;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505746;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.00133967;OID=.;OPOS=111694438;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:100:97:0:1:96:96:0.989691:43:53:0:0:43:53:0:1
chr3	111732608	.	G	A	411.93	PASS	AF=0.456522;AO=42;DP=94;FAO=42;FDP=92;FR=.;FRO=50;FSAF=16;FSAR=26;FSRF=24;FSRR=26;FWDB=-0.0336068;FXX=0.0416623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.141;QD=17.9099;RBI=0.0385041;REFB=-0.0139424;REVB=-0.0187923;RO=49;SAF=16;SAR=26;SRF=24;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107807;STB=0.555529;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=0.0169383;OID=.;OPOS=111732608;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:92:49:50:42:42:0.456522:26:16:24:25:26:16:24:26
chr3	111760771	.	A	G	349.89	PASS	AF=0.468354;AO=37;DP=79;FAO=37;FDP=79;FR=.;FRO=42;FSAF=13;FSAR=24;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=-0.0272947;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=195.411;QD=17.7159;RBI=0.0288623;REFB=-0.0162239;REVB=-0.00938262;RO=41;SAF=13;SAR=24;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134176;STB=0.582395;STBP=0.198;TYPE=snp;VARB=0.0181491;OID=.;OPOS=111760771;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:41:42:37:37:0.468354:24:13:20:21:24:13:21:21
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chr3	111805256	.	T	A	520.32	PASS	AF=0.519608;AO=52;DP=102;FAO=53;FDP=102;FR=.;FRO=49;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=34;FSRR=15;FWDB=-0.000309306;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.354;QD=20.4047;RBI=0.00220918;REFB=-0.0132135;REVB=0.00218742;RO=48;SAF=21;SAR=31;SRF=34;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.260704;STB=0.631684;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0119043;OID=.;OPOS=111805256;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:48:49:52:53:0.519608:31:21:34:14:31:22:34:15
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chr3	111918215	.	CA	CG,TG	1254.47	PASS	AF=0.505882,0.494118;AO=41,42;DP=88;FAO=43,42;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=28,19;FSAR=15,23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0135909,0.00842493;FXX=0.034087;HRUN=4,2;LEN=1,2;MLLD=132.373,204.216;QD=59.0339;RBI=0.0281287,0.0215429;REFB=0,0;REVB=-0.0246275,0.0198272;RO=0;SAF=28,19;SAR=13,23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=-0.00136276,0.00308159;OID=.,.;OPOS=111918216,111918215;OREF=A,CA;OALT=G,TG;OMAPALT=CG,TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:88:85:0:0:41,42:43,42:0.505882,0.494118:13,23:28,19:0:0:15,23:28,19:0:0
chr3	111921116	.	C	A	491.26	PASS	AF=0.546512;AO=46;DP=85;FAO=47;FDP=86;FR=.;FRO=39;FSAF=17;FSAR=30;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=-0.0389009;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.5336;QD=22.8495;RBI=0.0457351;REFB=-0.00688063;REVB=0.0240503;RO=39;SAF=17;SAR=29;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123305;STB=0.571251;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.00576985;OID=.;OPOS=111921116;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:86:39:39:46:47:0.546512:29:17:20:19:30:17:20:19
chr3	111921225	.	GC	TC,TT	491.29	PASS	AF=0.941176,0.0588235;AO=32,2;DP=34;FAO=32,2;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=20,1;FSAR=12,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00809528,-0.0170351;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=236.257,199.537;QD=57.7989;RBI=0.0102688,0.0173299;REFB=0,0;REVB=0.00631774,0.00318303;RO=0;SAF=20,1;SAR=12,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=-0.000561159,0.0143171;OID=.,.;OPOS=111921225,111921225;OREF=G,GC;OALT=T,TT;OMAPALT=TC,TT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:34:34:0:0:32,2:32,2:0.941176,0.0588235:12,1:20,1:0:0:12,1:20,1:0:0
chr3	111923123	.	G	A	868.26	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00422316;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.127;QD=57.8837;RBI=0.0190476;REFB=0;REVB=0.0185735;RO=0;SAF=32;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.87735e-05;OID=.;OPOS=111923123;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:28:32:0:0:28:32:0:0
chr3	111962851	.	T	C	526.48	PASS	AF=0.495495;AO=55;DP=112;FAO=55;FDP=111;FR=.;FRO=56;FSAF=33;FSAR=22;FSRF=24;FSRR=32;FWDB=0.0075242;FXX=0.00892777;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.092;QD=18.9721;RBI=0.00878025;REFB=-0.00837136;REVB=0.0045254;RO=56;SAF=33;SAR=22;SRF=24;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1571;STB=0.586925;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=0.00623322;OID=.;OPOS=111962851;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:111:56:56:55:55:0.495495:22:33:24:32:22:33:24:32
chr3	111981849	.	C	T	281.3	PASS	AF=0.517241;AO=30;DP=58;FAO=30;FDP=58;FR=.;FRO=28;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=0.0419958;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=51.5121;QD=19.4002;RBI=0.0503033;REFB=0.00839963;REVB=0.0276907;RO=28;SAF=15;SAR=15;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123993;STB=0.56892;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=-0.00677024;OID=.;OPOS=111981849;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:28:28:30:30:0.517241:15:15:18:10:15:15:18:10
chr3	111981878	.	T	C	301.55	PASS	AF=0.5625;AO=27;DP=48;FAO=27;FDP=48;FR=.;FRO=21;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=0.00133353;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.121;QD=25.1295;RBI=0.00172958;REFB=-0.0158732;REVB=0.00110143;RO=21;SAF=12;SAR=15;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137052;STB=0.575981;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=0.0140546;OID=.;OPOS=111981878;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:21:21:27:27:0.5625:15:12:13:8:15:12:13:8
chr3	111981924	.	T	C	197.56	PASS	AF=0.633333;AO=19;DP=30;FAO=19;FDP=30;FR=.;FRO=11;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=-0.00717152;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.678;QD=26.3417;RBI=0.0101984;REFB=0.016454;REVB=0.00725098;RO=11;SAF=7;SAR=12;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120689;STB=0.567201;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=-0.00188189;OID=.;OPOS=111981924;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:30:30:11:11:19:19:0.633333:12:7:6:5:12:7:6:5
chr3	111985107	.	T	C	763.91	PASS	AF=0.427083;AO=81;DP=189;FAO=82;FDP=192;FR=.;FRO=110;FSAF=43;FSAR=39;FSRF=60;FSRR=50;FWDB=-0.000549516;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.673;QD=15.9148;RBI=0.0179225;REFB=-0.00654803;REVB=0.017914;RO=108;SAF=42;SAR=39;SRF=60;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0380479;STB=0.512108;STBP=0.764;TYPE=snp;VARB=0.0134076;OID=.;OPOS=111985107;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:189:192:108:110:81:82:0.427083:39:42:60:48:39:43:60:50
chr3	112059768	.	C	G	164.47	PASS	AF=0.548387;AO=17;DP=31;FAO=17;FDP=31;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.0354941;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.029;QD=21.2212;RBI=0.0355661;REFB=-0.0288828;REVB=0.00226129;RO=13;SAF=6;SAR=11;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148243;STB=0.569637;STBP=0.411;TYPE=snp;VARB=0.0156773;OID=.;OPOS=112059768;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:13:14:17:17:0.548387:11:6:7:6:11:6:7:7
chr3	112081560	.	T	TTA	1347.88	PASS	AF=0.871795;AO=85;DP=142;FAO=102;FDP=117;FR=.;FRO=15;FSAF=51;FSAR=51;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.0516423;FXX=0.0249979;HRUN=3;LEN=2;MLLD=171.378;QD=46.0813;RBI=0.0869887;REFB=-0.149239;REVB=0.0700008;RO=41;SAF=47;SAR=38;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0396196;STB=0.504273;STBP=0.836;TYPE=ins;VARB=0.0200102;OID=.;OPOS=112081561;OREF=-;OALT=TA;OMAPALT=TTA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.871795:85:142:102:117:15:51:51:8:7:69:41:47:38:20:21
chr3	112185025	.	G	A	1434.44	PASS	AF=1;AO=91;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108662;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=227.47;QD=63.0525;RBI=0.0110822;REFB=0;REVB=-0.00217762;RO=0;SAF=49;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.06203e-05;OID=.;OPOS=112185025;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:91:91:0:0:91:91:1:42:49:0:0:42:49:0:0
chr3	112190137	.	G	T	1286.75	PASS	AF=1;AO=82;DP=84;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00116846;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.357;QD=62.0119;RBI=0.0240874;REFB=0;REVB=0.024059;RO=0;SAF=50;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.03122e-05;OID=.;OPOS=112190137;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:83:0:0:82:83:1:32:50:0:0:33:50:0:0
chr3	112546306	.	C	A	598.97	PASS	AF=0.508333;AO=61;DP=120;FAO=61;FDP=120;FR=.;FRO=59;FSAF=28;FSAR=33;FSRF=30;FSRR=29;FWDB=0.000615069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.9206;QD=19.9655;RBI=0.0187697;REFB=-0.00107933;REVB=0.0187596;RO=59;SAF=28;SAR=33;SRF=30;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0442159;STB=0.524376;STBP=0.613;TYPE=snp;VARB=0.00170156;OID=.;OPOS=112546306;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:120:59:59:61:61:0.508333:33:28:30:29:33:28:30:29
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chr3	112732840	.	C	T	366.15	PASS	AF=0.433333;AO=39;DP=90;FAO=39;FDP=90;FR=.;FRO=51;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=27;FSRR=24;FWDB=0.0175775;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.4105;QD=16.2732;RBI=0.0199479;REFB=0.0324108;REVB=0.00943133;RO=51;SAF=22;SAR=17;SRF=27;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0353157;STB=0.519875;STBP=0.744;TYPE=snp;VARB=-0.0423034;OID=.;OPOS=112732840;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:51:51:39:39:0.433333:17:22:27:24:17:22:27:24
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chr3	112935138	.	C	G	789.23	PASS	AF=1;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0204192;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.551;QD=64.4273;RBI=0.0334157;REFB=0;REVB=-0.0264512;RO=0;SAF=20;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.01361e-05;OID=.;OPOS=112935138;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:49:0:0:49:49:1:29:20:0:0:29:20:0:0
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chr3	112991959	.	C	T	645.74	PASS	AF=0.507812;AO=65;DP=127;FAO=65;FDP=128;FR=.;FRO=63;FSAF=33;FSAR=32;FSRF=36;FSRR=27;FWDB=-0.0126484;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=49.5566;QD=20.1794;RBI=0.0127212;REFB=-0.0188158;REVB=-0.00135968;RO=54;SAF=33;SAR=32;SRF=27;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00637207;STB=0.531398;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=0.0256268;OID=.;OPOS=112991959;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:127:128:54:63:65:65:0.507812:32:33:27:27:32:33:36:27
chr3	112993367	.	G	A	486.42	PASS	AF=0.5;AO=50;DP=100;FAO=50;FDP=100;FR=.;FRO=50;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=19;FSRR=31;FWDB=0.0169349;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.026;QD=19.4569;RBI=0.0252525;REFB=0.0027738;REVB=-0.0187323;RO=49;SAF=25;SAR=25;SRF=18;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1189;STB=0.559976;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=-0.00291207;OID=.;OPOS=112993367;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:49:50:50:50:0.5:25:25:18:31:25:25:19:31
chr3	112997554	.	A	G	851.19	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0348691;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.8282;QD=57.7076;RBI=0.0577237;REFB=0;REVB=-0.0460019;RO=0;SAF=27;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.96591e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000824214;OID=.;OPOS=112997554;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:32:27:0:0:32:27:0:0
chr3	112998265	.	A	G	393.92	PASS	AF=0.435644;AO=44;DP=102;FAO=44;FDP=101;FR=.;FRO=57;FSAF=15;FSAR=29;FSRF=21;FSRR=36;FWDB=-0.0129019;FXX=0.0194156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.792;QD=15.6008;RBI=0.0133947;REFB=0.00677614;REVB=-0.00359962;RO=55;SAF=15;SAR=29;SRF=19;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00500426;STB=0.51708;STBP=0.776;TYPE=snp;VARB=-0.0105697;OID=.;OPOS=112998265;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:101:55:57:44:44:0.435644:29:15:19:36:29:15:21:36
chr3	112998268	.	G	A	555.79	PASS	AF=0.525253;AO=52;DP=99;FAO=52;FDP=99;FR=.;FRO=47;FSAF=18;FSAR=34;FSRF=17;FSRR=30;FWDB=-0.00657653;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.855;QD=22.4563;RBI=0.00904678;REFB=0.00242634;REVB=0.00621237;RO=47;SAF=18;SAR=34;SRF=17;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0147152;STB=0.50811;STBP=0.882;TYPE=snp;VARB=-0.00265177;OID=.;OPOS=112998268;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:47:47:52:52:0.525253:34:18:17:30:34:18:17:30
chr3	113010466	.	T	C	785.58	PASS	AF=0.463277;AO=81;DP=178;FAO=82;FDP=177;FR=.;FRO=95;FSAF=34;FSAR=48;FSRF=40;FSRR=55;FWDB=-0.0184266;FXX=0.0111726;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.372;QD=17.7533;RBI=0.0188892;REFB=-0.0118393;REVB=0.00415491;RO=96;SAF=34;SAR=47;SRF=41;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00734613;STB=0.503543;STBP=0.929;TYPE=snp;VARB=0.0113223;OID=.;OPOS=113010466;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:178:177:96:95:81:82:0.463277:47:34:41:55:48:34:40:55
chr3	113015660	.	G	A	466.78	PASS	AF=0.485149;AO=48;DP=102;FAO=49;FDP=101;FR=.;FRO=52;FSAF=22;FSAR=27;FSRF=25;FSRR=27;FWDB=-0.0167565;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.483;QD=18.4863;RBI=0.0174446;REFB=-0.0199217;REVB=-0.00485102;RO=51;SAF=21;SAR=27;SRF=24;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0310374;STB=0.516477;STBP=0.762;TYPE=snp;VARB=0.02173;OID=.;OPOS=113015660;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:101:51:52:48:49:0.485149:27:21:24:27:27:22:25:27
chr3	113022870	.	T	C	1120.19	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0012431;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.378;QD=60.5508;RBI=0.0427161;REFB=0;REVB=0.042698;RO=0;SAF=42;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.98661e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000164109;OID=.;OPOS=113022870;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:74:0:0:73:74:1:31:42:0:0:31:43:0:0
chr3	113046640	.	A	G	119.42	PASS	AF=0.296296;AO=16;DP=54;FAO=16;FDP=54;FR=.;FRO=38;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=0.00169919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.315;QD=8.8457;RBI=0.0121243;REFB=-0.0020067;REVB=-0.0120046;RO=38;SAF=5;SAR=11;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.256219;STB=0.654564;STBP=0.167;TYPE=snp;VARB=0.00422207;OID=.;OPOS=113046640;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:38:38:16:16:0.296296:11:5:20:18:11:5:20:18
chr3	113052357	.	T	C	487.38	PASS	AF=0.522222;AO=47;DP=90;FAO=47;FDP=90;FR=.;FRO=43;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=20;FSRR=23;FWDB=0.00955336;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.7029;QD=21.6612;RBI=0.0616456;REFB=-0.00680593;REVB=0.0609008;RO=43;SAF=20;SAR=27;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0348156;STB=0.519223;STBP=0.712;TYPE=snp;VARB=0.00661154;OID=.;OPOS=113052357;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:43:43:47:47:0.522222:27:20:20:23:27:20:20:23
chr3	113145006	.	C	T	467.06	PASS	AF=0.529412;AO=45;DP=87;FAO=45;FDP=85;FR=.;FRO=40;FSAF=29;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=-0.00958286;FXX=0.0229859;HRUN=2;LEN=1;MLLD=222.248;QD=21.9792;RBI=0.0144085;REFB=-0.00557714;REVB=-0.0107599;RO=38;SAF=29;SAR=16;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125478;STB=0.582798;STBP=0.111;TYPE=snp;VARB=0.00640352;OID=.;OPOS=113145006;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:85:38:40:45:45:0.529412:16:29:19:19:16:29:19:21
chr3	113146130	.	T	C	520.99	PASS	AF=0.6;AO=48;DP=80;FAO=48;FDP=80;FR=.;FRO=32;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=0.0040477;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=110.134;QD=26.0493;RBI=0.0138712;REFB=-0.0224125;REVB=0.0132675;RO=32;SAF=20;SAR=28;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.015642;STB=0.508543;STBP=0.87;TYPE=snp;VARB=0.0146038;OID=.;OPOS=113146130;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:32:32:48:48:0.6:28:20:14:18:28:20:14:18
chr3	113164109	.	A	G	370.74	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0309593;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.1188;QD=54.924;RBI=0.121361;REFB=0;REVB=0.117345;RO=0;SAF=10;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00359884;OID=.;OPOS=113164109;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:27:0:0:25:27:1:15:10:0:0:16:11:0:0
chr3	113176122	.	G	A	509.53	PASS	AF=0.505155;AO=49;DP=97;FAO=49;FDP=97;FR=.;FRO=48;FSAF=39;FSAR=10;FSRF=31;FSRR=17;FWDB=-0.00360423;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=106.08;QD=21.0113;RBI=0.0107292;REFB=-0.00699042;REVB=0.0101057;RO=48;SAF=39;SAR=10;SRF=31;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18043;STB=0.60064;STBP=0.087;TYPE=snp;VARB=0.00753326;OID=.;OPOS=113176122;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:48:48:49:49:0.505155:10:39:31:17:10:39:31:17
chr3	113222036	.	G	A	407.7	PASS	AF=0.433962;AO=46;DP=106;FAO=46;FDP=106;FR=.;FRO=60;FSAF=33;FSAR=13;FSRF=41;FSRR=19;FWDB=0.00472148;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=190.105;QD=15.3848;RBI=0.007129;REFB=0.0100944;REVB=0.00534137;RO=60;SAF=33;SAR=13;SRF=41;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0414175;STB=0.52328;STBP=0.722;TYPE=snp;VARB=-0.0100444;OID=.;OPOS=113222036;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:106:60:60:46:46:0.433962:13:33:41:19:13:33:41:19
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chr3	113367340	.	T	C	244.13	PASS	AF=0.547619;AO=23;DP=42;FAO=23;FDP=42;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=0.0567897;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.096;QD=23.25;RBI=0.0804048;REFB=-0.0189928;REVB=-0.0569198;RO=19;SAF=9;SAR=14;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0195499;STB=0.510908;STBP=0.9;TYPE=snp;VARB=0.0156143;OID=.;OPOS=113367340;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:19:19:23:23:0.547619:14:9:7:12:14:9:7:12
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chr3	113373797	.	A	G	203.59	PASS	AF=0.421053;AO=21;DP=55;FAO=24;FDP=57;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=0.0319096;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.293;QD=14.2868;RBI=0.0340392;REFB=-0.0173031;REVB=0.0118509;RO=32;SAF=7;SAR=14;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.244156;STB=0.574718;STBP=0.344;TYPE=snp;VARB=0.0290844;OID=.;OPOS=113373797;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:57:32:33:21:24:0.421053:14:7:18:14:14:10:18:15
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chr3	113380232	.	G	A	230.78	PASS	AF=0.480769;AO=25;DP=52;FAO=25;FDP=52;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=0.0280436;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.4985;QD=17.752;RBI=0.0347411;REFB=0.0132013;REVB=-0.0205061;RO=26;SAF=11;SAR=14;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.192069;STB=0.597484;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=-0.0322391;OID=.;OPOS=113380232;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:26:27:25:25:0.480769:14:11:17:9:14:11:17:10
chr3	113383221	.	A	G	178.72	PASS	AF=0.5625;AO=18;DP=32;FAO=18;FDP=32;FR=.;FRO=14;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=2;FWDB=-0.000318045;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.0709;QD=22.3394;RBI=0.0129179;REFB=0.00747822;REVB=-0.012914;RO=14;SAF=13;SAR=5;SRF=12;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141394;STB=0.578624;STBP=0.437;TYPE=snp;VARB=-0.0130135;OID=.;OPOS=113383221;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:14:14:18:18:0.5625:5:13:12:2:5:13:12:2
chr3	113557787	.	AGCC	A	72.75	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00830558;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=332.507;QD=36.3767;RBI=0.0357472;REFB=0;REVB=0.0347689;RO=0;SAF=5;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.27427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00226194;OID=.;OPOS=113557788;OREF=GCC;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:7:7:8:8:0:5:3:0:0:4:0:5:2:0:0
chr3	113801826	.	C	T	241.38	PASS	AF=0.5;AO=25;DP=50;FAO=25;FDP=50;FR=.;FRO=25;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=-0.0125871;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.0208;QD=19.3107;RBI=0.0128716;REFB=-0.00155464;REVB=-0.00269146;RO=24;SAF=8;SAR=17;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0539084;STB=0.522586;STBP=0.773;TYPE=snp;VARB=0.00207236;OID=.;OPOS=113801826;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:24:25:25:25:0.5:17:8:9:15:17:8:9:16
chr3	113858350	.	C	T	1577.07	PASS	AF=1;AO=105;DP=105;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00342471;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.731;QD=60.0787;RBI=0.00984751;REFB=0;REVB=-0.00923282;RO=0;SAF=62;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.14836e-05;OID=.;OPOS=113858350;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:105:105:0:0:105:105:1:43:62:0:0:43:62:0:0
chr3	113890815	.	C	T	1030.02	PASS	AF=0.985915;AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=71;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00527748;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.142;QD=58.0295;RBI=0.0271381;REFB=0.0175614;REVB=-0.02662;RO=1;SAF=28;SAR=42;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0111254;STB=0.505881;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=-0.000617737;OID=.;OPOS=113890815;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:71:71:1:1:70:70:0.985915:42:28:0:1:42:28:0:1
chr3	113955164	.	T	G	81.62	PASS	AF=0.282051;AO=11;DP=39;FAO=11;FDP=39;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=0.00998854;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.104;QD=8.37126;RBI=0.0130057;REFB=0.00569409;REVB=-0.00832938;RO=28;SAF=7;SAR=4;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.240661;STB=0.647881;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=-0.012953;OID=.;OPOS=113955164;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:81:39:39:28:28:11:11:0.282051:4:7:12:16:4:7:12:16
chr3	113955265	.	G	A	445.96	PASS	AF=0.431034;AO=50;DP=116;FAO=50;FDP=116;FR=.;FRO=66;FSAF=31;FSAR=19;FSRF=33;FSRR=33;FWDB=-0.00950373;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.046;QD=15.3779;RBI=0.0105178;REFB=-0.00772661;REVB=0.00450589;RO=66;SAF=31;SAR=19;SRF=33;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124637;STB=0.569986;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=0.0133534;OID=.;OPOS=113955265;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:116:116:66:66:50:50:0.431034:19:31:33:33:19:31:33:33
chr3	113955320	.	C	T	376.92	PASS	AF=0.40367;AO=44;DP=109;FAO=44;FDP=109;FR=.;FRO=65;FSAF=26;FSAR=18;FSRF=37;FSRR=28;FWDB=-0.0133917;FXX=0.0180164;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.9753;QD=13.832;RBI=0.0137191;REFB=-0.00800888;REVB=-0.0029792;RO=61;SAF=26;SAR=18;SRF=37;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0167498;STB=0.513299;STBP=0.834;TYPE=snp;VARB=0.017193;OID=.;OPOS=113955320;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:109:61:65:44:44:0.40367:18:26:37:24:18:26:37:28
chr3	113955820	.	G	C	316.55	PASS	AF=0.372549;AO=38;DP=102;FAO=38;FDP=102;FR=.;FRO=64;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=26;FSRR=38;FWDB=-0.00349498;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=304.92;QD=12.4136;RBI=0.00351346;REFB=-0.000695883;REVB=0.000359902;RO=64;SAF=21;SAR=17;SRF=26;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15963;STB=0.591048;STBP=0.173;TYPE=snp;VARB=0.00115726;OID=.;OPOS=113955820;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:64:64:38:38:0.372549:17:21:26:38:17:21:26:38
chr3	115440007	.	T	G	402.51	PASS	AF=0.488095;AO=41;DP=84;FAO=41;FDP=84;FR=.;FRO=43;FSAF=16;FSAR=25;FSRF=26;FSRR=17;FWDB=0.00380649;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=52.6666;QD=19.1672;RBI=0.0147572;REFB=-0.0112061;REVB=-0.0142578;RO=40;SAF=16;SAR=25;SRF=24;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187178;STB=0.609703;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.0115103;OID=.;OPOS=115440007;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:40:43:41:41:0.488095:25:16:24:16:25:16:26:17
chr3	115440074	.	C	CCT	84.97	PASS	AF=0.333333;AO=6;DP=55;FAO=11;FDP=33;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.0335732;FXX=0.0571265;HRUN=2;LEN=2;MLLD=133.797;QD=10.2999;RBI=0.042679;REFB=-0.0578938;REVB=0.0263503;RO=43;SAF=5;SAR=1;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.41431;STB=0.56033;STBP=0.644;TYPE=ins;VARB=0.134435;OID=.;OPOS=115440075;OREF=-;OALT=CT;OMAPALT=CCT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.333333:6:55:11:33:22:5:6:12:10:84:43:5:1:21:22
chr3	116301660	.	C	T	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0411509;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.999;QD=40.7629;RBI=0.0592986;REFB=0;REVB=-0.0426957;RO=0;SAF=5;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.78348e-05;OID=.;OPOS=116301660;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:5:5:0:0:5:5:0:0
chr3	116683964	.	G	C	6250.57	PASS	AF=1;AO=390;DP=391;FAO=392;FDP=392;FR=.;FRO=0;FSAF=189;FSAR=203;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0128302;FXX=0.00507601;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.209;QD=63.7813;RBI=0.0255067;REFB=0.0163021;REVB=0.0220449;RO=1;SAF=189;SAR=201;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00236846;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.91826e-06;OID=.;OPOS=116683964;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:28:391:392:1:0:390:392:1:201:189:0:1:203:189:0:0
chr3	118381320	.	C	A	451.73	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0183529;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.647;QD=58.2883;RBI=0.0279263;REFB=0;REVB=0.0210487;RO=0;SAF=16;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000109073;OID=.;OPOS=118381320;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:15:16:0:0:15:16:0:0
chr3	118621103	.	G	A	237.58	PASS	AF=0.45;AO=27;DP=61;FAO=27;FDP=60;FR=.;FRO=33;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=-0.00588549;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.8935;QD=15.8388;RBI=0.00596793;REFB=0.00602114;REVB=-0.000988558;RO=33;SAF=12;SAR=15;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127345;STB=0.571903;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=-0.00680607;OID=.;OPOS=118621103;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:60:33:33:27:27:0.45:15:12:19:14:15:12:19:14
chr3	118649060	.	G	T	773.06	PASS	AF=0.982143;AO=55;DP=57;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0233275;FXX=0.0175408;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.347;QD=55.2188;RBI=0.0378324;REFB=0.00018762;REVB=0.0297845;RO=0;SAF=34;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.511624;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=9.63602e-05;OID=.;OPOS=118649060;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:57:56:0:1:55:55:0.982143:21:34:0:0:21:34:0:1
chr3	118865126	.	GGAA	G	166.99	PASS	AF=0.42623;AO=26;DP=58;FAO=26;FDP=61;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=-0.0210573;FXX=0;HRUN=2;LEN=3;MLLD=230.347;QD=10.9499;RBI=0.0317802;REFB=-0.00385606;REVB=0.0238027;RO=31;SAF=13;SAR=13;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0465727;STB=0.50819;STBP=0.956;TYPE=del;VARB=0.0061582;OID=.;OPOS=118865127;OREF=GAA;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.42623:26:58:26:61:35:13:13:18:17:99:31:13:13:17:14
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chr3	118867047	.	C	G	171.25	PASS	AF=0.392157;AO=20;DP=52;FAO=20;FDP=51;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=0.0216477;FXX=0.0192271;HRUN=2;LEN=1;MLLD=232.704;QD=13.431;RBI=0.0218134;REFB=-0.0123054;REVB=0.00268287;RO=31;SAF=12;SAR=8;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0898566;STB=0.551947;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.0142866;OID=.;OPOS=118867047;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:51:31:31:20:20:0.392157:8:12:16:15:8:12:16:15
chr3	118909159	.	A	G	594.39	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0557562;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.6923;QD=60.9627;RBI=0.0563453;REFB=0;REVB=-0.00812606;RO=0;SAF=21;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.34792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000690442;OID=.;OPOS=118909159;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:18:21:0:0:18:21:0:0
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chr3	118948716	.	G	A	568.55	PASS	AF=0.487603;AO=59;DP=121;FAO=59;FDP=121;FR=.;FRO=62;FSAF=19;FSAR=40;FSRF=38;FSRR=24;FWDB=0.00283782;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=169.376;QD=18.795;RBI=0.0233339;REFB=0.00391325;REVB=0.0231607;RO=60;SAF=19;SAR=40;SRF=37;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.274041;STB=0.652121;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=-0.00683371;OID=.;OPOS=118948716;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:121:121:60:62:59:59:0.487603:40:19:37:23:40:19:38:24
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chr3	119120777	.	A	G	551.02	PASS	AF=0.609756;AO=50;DP=82;FAO=50;FDP=82;FR=.;FRO=32;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=0.0103559;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.2094;QD=26.8791;RBI=0.03861;REFB=-0.00195838;REVB=-0.0371952;RO=32;SAF=24;SAR=26;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0305073;STB=0.516627;STBP=0.715;TYPE=snp;VARB=0.000811203;OID=.;OPOS=119120777;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:32:32:50:50:0.609756:26:24:14:18:26:24:14:18
chr3	119133183	.	G	A	671.71	PASS	AF=0.960784;AO=49;DP=51;FAO=49;FDP=51;FR=.;FRO=2;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0165082;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.249;QD=52.6832;RBI=0.0309446;REFB=0.062683;REVB=0.0261734;RO=2;SAF=25;SAR=24;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.03761;STB=0.519992;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=-0.000570494;OID=.;OPOS=119133183;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:51:51:2:2:49:49:0.960784:24:25:0:2:24:25:0:2
chr3	119196166	.	T	C	388.84	PASS	AF=0.427184;AO=43;DP=102;FAO=44;FDP=103;FR=.;FRO=59;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=25;FSRR=34;FWDB=-0.00588066;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.729;QD=15.1004;RBI=0.0360442;REFB=-0.0119596;REVB=0.0355612;RO=57;SAF=20;SAR=23;SRF=23;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0631374;STB=0.517849;STBP=0.755;TYPE=snp;VARB=0.020724;OID=.;OPOS=119196166;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:103:57:59:43:44:0.427184:23:20:23:34:24:20:25:34
chr3	119197285	.	A	G	1033.63	PASS	AF=0.985915;AO=70;DP=72;FAO=70;FDP=71;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0220287;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.1219;QD=58.2327;RBI=0.035128;REFB=-0.0409436;REVB=0.0273627;RO=0;SAF=33;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506665;STBP=0.539;TYPE=snp;VARB=0.000333716;OID=.;OPOS=119197285;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:72:71:0:1:70:70:0.985915:37:33:0:0:37:33:0:1
chr3	119248301	.	G	A	1046.96	PASS	AF=0.444898;AO=109;DP=246;FAO=109;FDP=245;FR=.;FRO=136;FSAF=58;FSAR=51;FSRF=72;FSRR=64;FWDB=-0.0308345;FXX=0.00809684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.6266;QD=17.0932;RBI=0.0377216;REFB=-0.00284644;REVB=-0.021729;RO=135;SAF=58;SAR=51;SRF=71;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00619159;STB=0.501503;STBP=0.974;TYPE=snp;VARB=0.00263659;OID=.;OPOS=119248301;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:246:245:135:136:109:109:0.444898:51:58:71:64:51:58:72:64
chr3	119248321	.	A	G	713.53	PASS	AF=0.392857;AO=48;DP=199;FAO=77;FDP=196;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=109;FSAF=53;FSAR=24;FSRF=56;FSRR=53;FWDB=-0.00425025;FXX=0.0344811;HRUN=9;LEN=1;MLLD=296.338;QD=14.5618;RBI=0.0364886;REFB=0.00803993;REVB=-0.0362402;RO=79;SAF=41;SAR=7;SRF=43;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.43108;STB=0.609348;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=-0.00344005;OID=.;OPOS=119248321;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:199:196:79:109:48:77:0.392857:7:41:43:36:24:53:56:53
chr3	119263680	.	C	T	250.37	PASS	AF=0.48;AO=24;DP=50;FAO=24;FDP=50;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=0.0087389;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.282;QD=20.0298;RBI=0.011557;REFB=-0.0146887;REVB=-0.00756283;RO=26;SAF=14;SAR=10;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0421909;STB=0.52379;STBP=0.751;TYPE=snp;VARB=0.015079;OID=.;OPOS=119263680;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:26:26:24:24:0.48:10:14:14:12:10:14:14:12
chr3	119301139	.	C	T	499.2	PASS	AF=0.613333;AO=46;DP=76;FAO=46;FDP=75;FR=.;FRO=29;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=7;FSRR=22;FWDB=0.022561;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.2707;QD=26.624;RBI=0.0355423;REFB=-0.0608927;REVB=-0.0274638;RO=29;SAF=22;SAR=24;SRF=7;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170077;STB=0.592467;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.0207974;OID=.;OPOS=119301139;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:75:29:29:46:46:0.613333:24:22:7:22:24:22:7:22
chr3	119305169	.	G	A	215.11	PASS	AF=0.525;AO=21;DP=40;FAO=21;FDP=40;FR=.;FRO=19;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.00979812;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=165.71;QD=21.5109;RBI=0.0648069;REFB=-0.0176356;REVB=-0.0640619;RO=19;SAF=15;SAR=6;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130599;STB=0.573697;STBP=0.359;TYPE=snp;VARB=0.0202002;OID=.;OPOS=119305169;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:19:19:21:21:0.525:6:15:11:8:6:15:11:8
chr3	119305379	.	T	A	308.33	PASS	AF=0.435897;AO=34;DP=78;FAO=34;FDP=78;FR=.;FRO=44;FSAF=9;FSAR=25;FSRF=18;FSRR=26;FWDB=-0.00264501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.692;QD=15.8117;RBI=0.0410662;REFB=-0.000832424;REVB=-0.0409809;RO=44;SAF=9;SAR=25;SRF=18;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167741;STB=0.595179;STBP=0.175;TYPE=snp;VARB=0.000559475;OID=.;OPOS=119305379;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:44:44:34:34:0.435897:25:9:18:26:25:9:18:26
chr3	119327653	.	T	C	1582.21	PASS	AF=0.990826;AO=107;DP=110;FAO=108;FDP=109;FR=.;FRO=1;FSAF=53;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00170747;FXX=0.00909008;HRUN=3;LEN=1;MLLD=162.336;QD=58.0627;RBI=0.0512456;REFB=-0.0707549;REVB=0.0512172;RO=2;SAF=53;SAR=54;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0172523;STB=0.504504;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.0004624;OID=.;OPOS=119327653;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:110:109:2:1:107:108:0.990826:54:53:0:2:55:53:0:1
chr3	119328329	.	G	A	335.98	PASS	AF=0.514706;AO=35;DP=68;FAO=35;FDP=68;FR=.;FRO=33;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=0.00605335;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=221.36;QD=19.7635;RBI=0.0119736;REFB=-0.017199;REVB=-0.0103307;RO=33;SAF=15;SAR=20;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154444;STB=0.585725;STBP=0.183;TYPE=snp;VARB=0.0158952;OID=.;OPOS=119328329;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:33:33:35:35:0.514706:20:15:20:13:20:15:20:13
chr3	119331874	.	C	T	598.17	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0265284;FXX=0.0249938;HRUN=4;LEN=1;MLLD=141.779;QD=61.3511;RBI=0.0549561;REFB=0;REVB=-0.0481292;RO=0;SAF=22;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000417376;OID=.;OPOS=119331874;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:17:22:0:0:17:22:0:0
chr3	119331892	.	C	G	766.45	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0226145;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.866;QD=63.8705;RBI=0.0282752;REFB=0;REVB=-0.0169726;RO=0;SAF=29;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.39901e-05;OID=.;OPOS=119331892;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:19:29:0:0:19:29:0:0
chr3	119338956	.	A	G	2008.45	PASS	AF=1;AO=129;DP=129;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00431972;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=331.135;QD=62.2776;RBI=0.00943834;REFB=0;REVB=0.0083918;RO=0;SAF=52;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.43316e-06;OID=.;OPOS=119338956;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:129:129:0:0:129:129:1:77:52:0:0:77:52:0:0
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chr3	119367390	.	T	C	740.44	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00321034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.978;QD=56.9569;RBI=0.0262103;REFB=0;REVB=0.026013;RO=0;SAF=26;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.37414e-05;OID=.;OPOS=119367390;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:26:26:0:0:26:26:0:0
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chr3	119379186	.	C	T	180.0	PASS	AF=0.580645;AO=18;DP=31;FAO=18;FDP=31;FR=.;FRO=13;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.0126086;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.617;QD=23.2259;RBI=0.0140673;REFB=-0.0267838;REVB=-0.00623795;RO=13;SAF=14;SAR=4;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.220761;STB=0.624849;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=0.0195052;OID=.;OPOS=119379186;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:13:13:18:18:0.580645:4:14:7:6:4:14:7:6
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chr3	119395799	.	A	C	548.52	PASS	AF=0.518519;AO=55;DP=107;FAO=56;FDP=108;FR=.;FRO=52;FSAF=39;FSAR=17;FSRF=28;FSRR=24;FWDB=0.0301841;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.726;QD=20.3154;RBI=0.0348946;REFB=-0.0174834;REVB=-0.0175088;RO=51;SAF=38;SAR=17;SRF=28;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136186;STB=0.583972;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.0124872;OID=.;OPOS=119395799;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:108:51:52:55:56:0.518519:17:38:28:23:17:39:28:24
chr3	119421963	.	C	T	265.56	PASS	AF=0.382716;AO=31;DP=81;FAO=31;FDP=81;FR=.;FRO=50;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=30;FWDB=0.00878891;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.837;QD=13.1141;RBI=0.031708;REFB=-0.0172491;REVB=0.0304656;RO=49;SAF=17;SAR=14;SRF=20;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149392;STB=0.59078;STBP=0.189;TYPE=snp;VARB=0.0259665;OID=.;OPOS=119421963;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:49:50:31:31:0.382716:14:17:20:29:14:17:20:30
chr3	119422106	.	C	A	43.23	PASS	AF=0.233333;AO=7;DP=29;FAO=7;FDP=30;FR=.;FRO=23;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=-0.028342;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.1083;QD=5.76391;RBI=0.0525408;REFB=-0.0195063;REVB=-0.0442411;RO=22;SAF=4;SAR=3;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.239723;STB=0.666222;STBP=0.374;TYPE=snp;VARB=0.0804572;OID=.;OPOS=119422106;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:29:30:22:23:7:7:0.233333:3:4:8:14:3:4:8:15
chr3	119426307	.	T	C	107.42	PASS	AF=0.382353;AO=13;DP=34;FAO=13;FDP=34;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=-0.0190225;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.865;QD=12.6373;RBI=0.0232666;REFB=-0.0106949;REVB=-0.0133971;RO=21;SAF=8;SAR=5;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.242909;STB=0.642641;STBP=0.21;TYPE=snp;VARB=0.0296758;OID=.;OPOS=119426307;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:21:21:13:13:0.382353:5:8:8:13:5:8:8:13
chr3	119434527	.	G	C	1512.05	PASS	AF=1;AO=100;DP=100;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00788299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.594;QD=59.8832;RBI=0.00789309;REFB=0;REVB=-0.000399139;RO=0;SAF=52;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.19274e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.58352e-06;OID=.;OPOS=119434527;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:100:101:0:0:100:101:1:48:52:0:0:49:52:0:0
chr3	119531621	.	G	A	546.27	PASS	AF=0.518519;AO=56;DP=108;FAO=56;FDP=108;FR=.;FRO=52;FSAF=35;FSAR=21;FSRF=22;FSRR=30;FWDB=-0.00619458;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=224.146;QD=20.2321;RBI=0.0102403;REFB=-0.0104414;REVB=-0.00815416;RO=52;SAF=35;SAR=21;SRF=22;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.178722;STB=0.598556;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.0105693;OID=.;OPOS=119531621;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:108:52:52:56:56:0.518519:21:35:22:30:21:35:22:30
chr3	119533910	.	T	C	1316.14	PASS	AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0339823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.562;QD=61.9361;RBI=0.0424017;REFB=0;REVB=0.0253595;RO=0;SAF=46;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000223758;OID=.;OPOS=119533910;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:39:46:0:0:39:46:0:0
chr3	119886548	.	G	C	702.12	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0331708;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.1881;QD=62.4108;RBI=0.0439146;REFB=0;REVB=0.0287783;RO=0;SAF=23;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000373027;OID=.;OPOS=119886548;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:45:0:0:44:45:1:21:23:0:0:22:23:0:0
chr3	119886776	.	T	A	1139.08	PASS	AF=0.987013;AO=76;DP=77;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00951253;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=238.645;QD=59.1731;RBI=0.0276071;REFB=0.0373751;REVB=0.0259164;RO=1;SAF=38;SAR=38;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0122906;STB=0.506492;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=2.47516e-05;OID=.;OPOS=119886776;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:77:77:1:1:76:76:0.987013:38:38:0:1:38:38:0:1
chr3	120389316	.	T	A	495.11	PASS	AF=0.5;AO=48;DP=96;FAO=48;FDP=96;FR=.;FRO=48;FSAF=29;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=32;FWDB=0.00507696;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=243.531;QD=20.6296;RBI=0.00953202;REFB=-0.0232798;REVB=0.00806746;RO=48;SAF=29;SAR=19;SRF=16;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.241728;STB=0.633621;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0182353;OID=.;OPOS=120389316;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:96:48:48:48:48:0.5:19:29:16:32:19:29:16:32
chr3	120924764	.	C	T	1631.46	PASS	AF=1;AO=73;DP=134;FAO=108;FDP=108;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=0;FSAF=70;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0201491;FXX=0.0924292;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.008;QD=60.4243;RBI=0.150873;REFB=0;REVB=0.149521;RO=0;SAF=52;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00148176;OID=.;OPOS=120924764;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:134:108:0:0:73:108:1:21:52:0:0:38:70:0:0
chr3	121043357	.	C	A	465.14	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00455461;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=278.465;QD=58.1421;RBI=0.00466715;REFB=0;REVB=-0.00101872;RO=0;SAF=19;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.1039e-05;OID=.;OPOS=121043357;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:13:19:0:0:13:19:0:0
chr3	121137976	.	C	T	885.39	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0120178;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.779;QD=58.0585;RBI=0.0123728;REFB=0;REVB=0.00294262;RO=0;SAF=41;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.14674e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.68661e-05;OID=.;OPOS=121137976;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:20:41:0:0:20:41:0:0
chr3	121138015	.	C	T	616.54	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00394497;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.2551;QD=60.1504;RBI=0.00604741;REFB=0;REVB=-0.00458349;RO=0;SAF=29;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.97233e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000268287;OID=.;OPOS=121138015;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:41:0:0:40:41:1:11:29:0:0:11:30:0:0
chr3	121154974	.	T	C	2101.38	PASS	AF=1;AO=134;DP=134;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0297949;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=149.01;QD=62.7276;RBI=0.030144;REFB=0;REVB=-0.0045746;RO=0;SAF=68;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.39706e-05;OID=.;OPOS=121154974;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:134:134:0:0:134:134:1:66:68:0:0:66:68:0:0
chr3	121208833	.	G	C	575.8	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0121989;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.991;QD=60.6102;RBI=0.0232474;REFB=0;REVB=0.0197896;RO=0;SAF=14;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.76123e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000174805;OID=.;OPOS=121208833;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:24:14:0:0:24:14:0:0
chr3	121238749	.	G	A	817.69	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0145817;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.7013;QD=57.3821;RBI=0.0562356;REFB=0;REVB=-0.0543122;RO=0;SAF=23;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000263368;OID=.;OPOS=121238749;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:34:23:0:0:34:23:0:0
chr3	121263720	.	C	A,T	1132.83	PASS	AF=0.960526,0.0394737;AO=73,3;DP=76;FAO=73,3;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=42,0;FSAR=31,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0274907,-0.00374172;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=70.4962,213.427;QD=59.6227;RBI=0.0382027,0.016986;REFB=0,0;REVB=0.0265275,-0.0165688;RO=0;SAF=42,0;SAR=31,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.98661e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00225704,0.145192;OID=.,.;OPOS=121263720,121263720;OREF=C,C;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:76:76:0:0:73,3:73,3:0.960526,0.0394737:31,3:42,0:0:0:31,3:42,0:0:0
chr3	121350966	.	C	G	340.74	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0499223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.55;QD=54.5176;RBI=0.0566839;REFB=0;REVB=0.0268484;RO=0;SAF=15;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000399188;OID=.;OPOS=121350966;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:10:15:0:0:10:15:0:0
chr3	121351315	.	G	A	126.47	PASS	AF=0.225;AO=9;DP=40;FAO=9;FDP=40;FR=.,HEALED;FRO=25;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=-0.0613537;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=157.464;QD=12.6474;RBI=0.0634405;REFB=-0.00980389;REVB=-0.0161379;RO=23;SAF=1;SAR=8;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.568915;STB=0.875839;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0141607;OID=.;OPOS=121351315;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:60:40:40:23:25:9:9:0.225:8:1:13:10:8:1:15:10
chr3	121353254	.	T	C	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.026723;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.184;QD=46.8478;RBI=0.0330413;REFB=0;REVB=0.0194322;RO=0;SAF=8;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.80658e-05;OID=.;OPOS=121353254;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:7:8:0:0:7:8:0:0
chr3	121354583	.	G	A	294.32	PASS	AF=0.555556;AO=30;DP=53;FAO=30;FDP=54;FR=.;FRO=24;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=-0.00141539;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=227.195;QD=21.8014;RBI=0.0070966;REFB=-0.00625907;REVB=0.00695403;RO=23;SAF=15;SAR=15;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0511513;STB=0.518506;STBP=0.789;TYPE=snp;VARB=0.00302247;OID=.;OPOS=121354583;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:54:23:24:30:30:0.555556:15:15:10:13:15:15:11:13
chr3	121361787	.	G	A	105.82	PASS	AF=0.351351;AO=13;DP=37;FAO=13;FDP=37;FR=.;FRO=24;FSAF=1;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=18;FWDB=0.0122254;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.526;QD=11.4397;RBI=0.0159533;REFB=0.00203208;REVB=-0.0102493;RO=24;SAF=1;SAR=12;SRF=6;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.380191;STB=0.73637;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=-0.00407339;OID=.;OPOS=121361787;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:24:24:13:13:0.351351:12:1:6:18:12:1:6:18
chr3	121372875	.	A	G	428.99	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0163239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.3129;QD=57.199;RBI=0.0326731;REFB=0;REVB=0.028303;RO=0;SAF=12;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000604998;OID=.;OPOS=121372875;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:18:12:0:0:18:12:0:0
chr3	121373058	.	T	C	194.79	PASS	AF=0.444444;AO=20;DP=45;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=16;FSAR=4;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=-0.048379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.6047;QD=17.3142;RBI=0.0587143;REFB=-0.0154507;REVB=-0.0332692;RO=25;SAF=16;SAR=4;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.205917;STB=0.618917;STBP=0.231;TYPE=snp;VARB=0.02989;OID=.;OPOS=121373058;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:25:25:20:20:0.444444:4:16:16:9:4:16:16:9
chr3	121373111	.	T	C	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00571547;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=231.978;QD=48.7372;RBI=0.0447183;REFB=0;REVB=0.0443515;RO=0;SAF=8;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000196193;OID=.;OPOS=121373111;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:9:8:0:0:9:8:0:0
chr3	121374361	.	G	A	163.65	PASS	AF=0.53125;AO=17;DP=32;FAO=17;FDP=32;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=-0.0441707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.263;QD=20.4559;RBI=0.0450642;REFB=-0.00879767;REVB=0.00892894;RO=15;SAF=7;SAR=10;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127899;STB=0.571903;STBP=0.444;TYPE=snp;VARB=0.00450594;OID=.;OPOS=121374361;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:15:15:17:17:0.53125:10:7:4:11:10:7:4:11
chr3	121414061	.	C	T	162.22	PASS	AF=0.305556;AO=22;DP=72;FAO=22;FDP=72;FR=.;FRO=50;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=24;FSRR=26;FWDB=-0.00258755;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=269.432;QD=9.01204;RBI=0.00409644;REFB=-0.00570758;REVB=0.00317575;RO=50;SAF=12;SAR=10;SRF=24;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0766906;STB=0.545413;STBP=0.616;TYPE=snp;VARB=0.014754;OID=.;OPOS=121414061;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:50:50:22:22:0.305556:10:12:24:26:10:12:24:26
chr3	121415720	.	T	C	429.9	PASS	AF=0.5;AO=43;DP=86;FAO=43;FDP=86;FR=.;FRO=43;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=-0.00462542;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.283;QD=19.9952;RBI=0.0248809;REFB=-0.00493467;REVB=0.0244472;RO=43;SAF=22;SAR=21;SRF=22;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00488273;OID=.;OPOS=121415720;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:43:43:43:43:0.5:21:22:22:21:21:22:22:21
chr3	121416623	.	G	C	406.92	PASS	AF=0.506173;AO=41;DP=81;FAO=41;FDP=81;FR=.;FRO=40;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=26;FSRR=14;FWDB=-0.0119307;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.462;QD=20.0948;RBI=0.0362278;REFB=-0.00459571;REVB=-0.0342069;RO=39;SAF=22;SAR=19;SRF=25;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0932266;STB=0.556749;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.00498798;OID=.;OPOS=121416623;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:39:40:41:41:0.506173:19:22:25:14:19:22:26:14
chr3	121435621	.	T	C	109.05	PASS	AF=0.916667;AO=11;DP=12;FAO=11;FDP=12;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0335534;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.1829;QD=36.3493;RBI=0.034255;REFB=-0.0881105;REVB=-0.00689728;RO=1;SAF=5;SAR=6;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0815441;STB=0.545372;STBP=0.563;TYPE=snp;VARB=0.0106146;OID=.;OPOS=121435621;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:12:12:1:1:11:11:0.916667:6:5:1:0:6:5:1:0
chr3	121435624	.	C	T	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00186529;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.095;QD=43.4862;RBI=0.0180042;REFB=0;REVB=0.0179073;RO=0;SAF=6;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000142255;OID=.;OPOS=121435624;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:6:6:0:0:6:6:0:0
chr3	121563355	.	T	C	624.63	PASS	AF=0.508065;AO=63;DP=124;FAO=63;FDP=124;FR=.;FRO=61;FSAF=30;FSAR=33;FSRF=25;FSRR=36;FWDB=0.027503;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.1441;QD=20.1492;RBI=0.0302961;REFB=-0.00205166;REVB=0.0127058;RO=59;SAF=30;SAR=33;SRF=23;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0764236;STB=0.532808;STBP=0.495;TYPE=snp;VARB=0.0023797;OID=.;OPOS=121563355;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:124:124:59:61:63:63:0.508065:33:30:23:36:33:30:25:36
chr3	121712051	.	A	C	105.3	PASS	AF=0.317073;AO=12;DP=41;FAO=13;FDP=41;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=-0.0420569;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.6314;QD=10.2734;RBI=0.0477479;REFB=-0.0235255;REVB=-0.022607;RO=28;SAF=6;SAR=6;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0410896;STB=0.550484;STBP=0.699;TYPE=snp;VARB=0.0282998;OID=.;OPOS=121712051;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:28:28:12:13:0.317073:6:6:13:15:6:7:13:15
chr3	121825197	.	G	A	1586.76	PASS	AF=1;AO=103;DP=106;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0056427;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.53;QD=59.8778;RBI=0.0106964;REFB=0;REVB=0.00908693;RO=0;SAF=58;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.70881e-05;OID=.;OPOS=121825197;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:106:106:0:0:103:106:1:45:58:0:0:46:60:0:0
chr3	121836966	.	TGA	T	502.89	PASS	AF=1;AO=29;DP=38;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0373501;FXX=0.0789266;HRUN=1;LEN=2;MLLD=110.691;QD=57.4736;RBI=0.0641248;REFB=0;REVB=0.0521245;RO=0;SAF=13;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.000175971;OID=.;OPOS=121836967;OREF=GA;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:29:38:35:35:0:13:22:0:0:3:0:13:16:0:0
chr3	121838319	.	G	A	488.62	PASS	AF=0.485981;AO=50;DP=105;FAO=52;FDP=107;FR=.;FRO=55;FSAF=22;FSAR=30;FSRF=29;FSRR=26;FWDB=-0.00914825;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.866;QD=18.2661;RBI=0.00974852;REFB=-0.00515163;REVB=0.00336795;RO=55;SAF=20;SAR=30;SRF=29;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121447;STB=0.553926;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=0.00632029;OID=.;OPOS=121838319;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:107:55:55:50:52:0.485981:30:20:29:26:30:22:29:26
chr3	121838791	.	T	C	526.27	PASS	AF=0.486726;AO=55;DP=110;FAO=55;FDP=113;FR=.;FRO=58;FSAF=28;FSAR=27;FSRF=29;FSRR=29;FWDB=0.000820455;FXX=0.0341851;HRUN=4;LEN=1;MLLD=197.957;QD=18.6291;RBI=0.00846606;REFB=-0.00792195;REVB=0.00842621;RO=55;SAF=28;SAR=27;SRF=26;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0328789;STB=0.504665;STBP=0.894;TYPE=snp;VARB=0.00489531;OID=.;OPOS=121838791;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:113:55:58:55:55:0.486726:27:28:26:29:27:28:29:29
chr3	122002576	.	A	G	344.52	PASS	AF=0.440476;AO=37;DP=84;FAO=37;FDP=84;FR=.;FRO=47;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=26;FSRR=21;FWDB=0.02151;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.974;QD=16.4056;RBI=0.0251251;REFB=-0.00779358;REVB=0.0129842;RO=45;SAF=21;SAR=16;SRF=25;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0119389;STB=0.508171;STBP=0.898;TYPE=snp;VARB=0.0100111;OID=.;OPOS=122002576;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:45:47:37:37:0.440476:16:21:25:20:16:21:26:21
chr3	122003045	.	G	C	1587.92	PASS	AF=0.990741;AO=95;DP=98;FAO=107;FDP=108;FR=.;FRO=1;FSAF=52;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0328731;FXX=0.00917347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.783;QD=58.8119;RBI=0.0396751;REFB=-0.17047;REVB=0.0222142;RO=1;SAF=52;SAR=43;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0109;STB=0.504504;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=0.000260391;OID=.;OPOS=122003045;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:98:108:1:1:95:107:0.990741:43:52:0:1:55:52:0:1
chr3	122003769	.	A	G	414.89	PASS	AF=0.594203;AO=40;DP=68;FAO=41;FDP=69;FR=.;FRO=28;FSAF=15;FSAR=26;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=0.0258173;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.435;QD=24.0518;RBI=0.0279009;REFB=-0.0121265;REVB=0.0105798;RO=27;SAF=14;SAR=26;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102444;STB=0.55684;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=0.00661638;OID=.;OPOS=122003769;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:69:27:28:40:41:0.594203:26:14:13:14:26:15:14:14
chr3	122003832	.	G	C	740.43	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000505803;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.0005;QD=56.9561;RBI=0.0171789;REFB=0;REVB=-0.0171714;RO=0;SAF=26;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000129681;OID=.;OPOS=122003832;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:26:26:0:0:26:26:0:0
chr3	122133830	.	T	G	150.38	PASS	AF=0.346939;AO=17;DP=49;FAO=17;FDP=49;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=23;FSRR=9;FWDB=-0.0158889;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.386;QD=12.2756;RBI=0.0251891;REFB=-0.0156964;REVB=-0.0195457;RO=32;SAF=10;SAR=7;SRF=23;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155642;STB=0.590693;STBP=0.423;TYPE=snp;VARB=0.0280545;OID=.;OPOS=122133830;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:32:32:17:17:0.346939:7:10:23:9:7:10:23:9
chr3	122145324	.	C	T	108.86	PASS	AF=0.666667;AO=12;DP=18;FAO=12;FDP=18;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.00657942;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=236.417;QD=24.1899;RBI=0.0154692;REFB=0.00457051;REVB=-0.0140002;RO=6;SAF=3;SAR=9;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0629385;STB=0.535653;STBP=0.768;TYPE=snp;VARB=-0.00247946;OID=.;OPOS=122145324;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:18:18:6:6:12:12:0.666667:9:3:2:4:9:3:2:4
chr3	122186188	.	C	T	698.98	PASS	AF=0.980392;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0398934;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.465;QD=54.8223;RBI=0.0410841;REFB=-0.0406466;REVB=0.00981941;RO=1;SAF=28;SAR=22;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0209158;STB=0.511107;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.00177568;OID=.;OPOS=122186188;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:51:51:1:1:50:50:0.980392:22:28:0:1:22:28:0:1
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chr3	122274757	.	G	C	300.64	PASS	AF=0.553571;AO=31;DP=56;FAO=31;FDP=56;FR=.;FRO=25;FSAF=21;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.0274333;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.37;QD=21.4739;RBI=0.0331747;REFB=-0.0130326;REVB=0.018654;RO=25;SAF=21;SAR=10;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136866;STB=0.576009;STBP=0.217;TYPE=snp;VARB=0.0203175;OID=.;OPOS=122274757;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:25:25:31:31:0.553571:10:21:13:12:10:21:13:12
chr3	122288210	.	G	A	349.52	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.108304;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.355;QD=53.772;RBI=0.128045;REFB=0;REVB=-0.0683069;RO=0;SAF=12;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00433579;OID=.;OPOS=122288210;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:26:0:0:25:26:1:13:12:0:0:14:12:0:0
chr3	122296638	.	G	A	4000.74	PASS	AF=1;AO=255;DP=258;FAO=259;FDP=259;FR=.;FRO=0;FSAF=112;FSAR=147;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0368851;FXX=0.00384601;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.4248;QD=61.7875;RBI=0.0395871;REFB=-0.0204384;REVB=0.0143745;RO=1;SAF=111;SAR=144;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00427532;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000551692;OID=.;OPOS=122296638;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:17:258:259:1:0:255:259:1:144:111:1:0:147:112:0:0
chr3	122354037	.	A	G	427.64	PASS	AF=0.939394;AO=31;DP=33;FAO=31;FDP=33;FR=.;FRO=2;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0251355;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=213.487;QD=51.8346;RBI=0.0375404;REFB=0.00997291;REVB=-0.0278835;RO=2;SAF=15;SAR=16;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0548082;STB=0.529393;STBP=0.227;TYPE=snp;VARB=-8.26507e-05;OID=.;OPOS=122354037;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:33:33:2:2:31:31:0.939394:16:15:0:2:16:15:0:2
chr3	122354792	.	G	A	1080.56	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0077747;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=254.78;QD=60.031;RBI=0.00792409;REFB=0;REVB=0.00153141;RO=0;SAF=37;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.16395e-06;OID=.;OPOS=122354792;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:35:37:0:0:35:37:0:0
chr3	122437321	.	T	C	850.08	PASS	AF=1;AO=58;DP=59;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0123002;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.292;QD=56.6717;RBI=0.0277902;REFB=0;REVB=0.0249198;RO=0;SAF=22;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00312483;OID=.;OPOS=122437321;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:60:0:0:58:60:1:36:22:0:0:36:24:0:0
chr3	122645493	.	C	T	63.7	PASS	AF=0.321429;AO=9;DP=28;FAO=9;FDP=28;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.0387162;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=78.8916;QD=9.10042;RBI=0.0591746;REFB=0.0061417;REVB=0.0447514;RO=19;SAF=4;SAR=5;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0905072;STB=0.555432;STBP=0.755;TYPE=snp;VARB=-0.0299546;OID=.;OPOS=122645493;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:28:28:19:19:9:9:0.321429:5:4:10:9:5:4:10:9
chr3	122680141	.	A	G	410.52	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148962;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.201;QD=56.6233;RBI=0.0157222;REFB=0;REVB=0.00502899;RO=0;SAF=12;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.0947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00011941;OID=.;OPOS=122680141;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:17:12:0:0:17:12:0:0
chr3	122694930	.	C	T	334.98	PASS	AF=0.514706;AO=35;DP=68;FAO=35;FDP=68;FR=.;FRO=33;FSAF=12;FSAR=23;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=-0.000223182;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.0877;QD=19.7048;RBI=0.0756487;REFB=-0.0362633;REVB=0.0756484;RO=32;SAF=12;SAR=23;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115091;STB=0.557918;STBP=0.363;TYPE=snp;VARB=0.0349381;OID=.;OPOS=122694930;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:32:33:35:35:0.514706:23:12:15:17:23:12:15:18
chr3	122843110	.	G	T	382.74	PASS	AF=0.377049;AO=45;DP=120;FAO=46;FDP=122;FR=.;FRO=76;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=38;FSRR=38;FWDB=0.00289334;FXX=0.0161277;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.9868;QD=12.5488;RBI=0.0190806;REFB=-0.0104392;REVB=0.0188599;RO=74;SAF=24;SAR=21;SRF=37;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0364767;STB=0.513546;STBP=0.81;TYPE=snp;VARB=0.0176709;OID=.;OPOS=122843110;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:122:74:76:45:46:0.377049:21:24:37:37:22:24:38:38
chr3	122864436	.	G	A	715.01	PASS	AF=0.978723;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00919025;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.582;QD=60.852;RBI=0.0252052;REFB=0.00773115;REVB=0.02347;RO=1;SAF=24;SAR=22;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.02089;STB=0.511106;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=0.000189267;OID=.;OPOS=122864436;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:47:47:1:1:46:46:0.978723:22:24:0:1:22:24:0:1
chr3	122869147	.	G	C	97.19	PASS	AF=0.4;AO=12;DP=29;FAO=12;FDP=30;FR=.;FRO=18;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=5;FWDB=0.0150673;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=72.2149;QD=12.9586;RBI=0.0544583;REFB=-0.00511514;REVB=-0.0523324;RO=17;SAF=2;SAR=10;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.549026;STB=0.832778;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0236538;OID=.;OPOS=122869147;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:29:30:17:18:12:12:0.4:10:2:12:5:10:2:13:5
chr3	122880191	.	T	C	308.33	PASS	AF=0.435897;AO=34;DP=78;FAO=34;FDP=78;FR=.;FRO=44;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=28;FSRR=16;FWDB=-0.0674594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.934;QD=15.8117;RBI=0.0677337;REFB=-0.0294976;REVB=0.00608973;RO=44;SAF=19;SAR=15;SRF=28;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.079636;STB=0.544796;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.0297505;OID=.;OPOS=122880191;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:44:44:34:34:0.435897:15:19:28:16:15:19:28:16
chr3	122991021	.	A	T	1265.44	PASS	AF=1;AO=81;DP=81;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0145335;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=302.675;QD=61.7289;RBI=0.0183012;REFB=0;REVB=-0.0111226;RO=0;SAF=40;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.17396e-06;OID=.;OPOS=122991021;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:82:0:0:81:82:1:41:40:0:0:41:41:0:0
chr3	122991038	.	C	T	1264.67	PASS	AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0115036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.028;QD=61.6913;RBI=0.0223235;REFB=0;REVB=0.0191312;RO=0;SAF=42;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.26554e-05;OID=.;OPOS=122991038;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:40:42:0:0:40:42:0:0
chr3	123331775	.	TA	T	181.82	PASS	AF=1;AO=21;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.11863;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=13.7057;QD=33.0583;RBI=0.121872;REFB=0;REVB=-0.0279231;RO=0;SAF=6;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00805239;OID=.;OPOS=123331776;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:21:22:22:22:0:6:16:0:0:4:0:6:15:0:0
chr3	123357037	.	A	G	1029.92	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0510981;FXX=0.028165;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.634;QD=59.7056;RBI=0.0520008;REFB=0;REVB=0.00964749;RO=0;SAF=22;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.53119e-05;OID=.;OPOS=123357037;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:68:69:0:0:68:69:1:46:22:0:0:47:22:0:0
chr3	123368012	.	CA	CG,TG	250.74	PASS	AF=0.9,0.1;AO=18,2;DP=20;FAO=18,2;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=4,0;FSAR=14,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0408285,-0.0128134;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=94.3061,98.0815;QD=50.1489;RBI=0.0490398,0.0509683;REFB=0,0;REVB=0.0271651,0.0493313;RO=0;SAF=4,0;SAR=14,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.0162891,-0.0754917;OID=.,.;OPOS=123368013,123368012;OREF=A,CA;OALT=G,TG;OMAPALT=CG,TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:20:20:0:0:18,2:18,2:0.9,0.1:14,2:4,0:0:0:14,2:4,0:0:0
chr3	123385126	.	C	G	399.05	PASS	AF=0.58209;AO=39;DP=67;FAO=39;FDP=67;FR=.;FRO=28;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=0.0462099;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.1933;QD=23.8237;RBI=0.0487507;REFB=-0.0235742;REVB=0.0155332;RO=28;SAF=21;SAR=18;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110438;STB=0.56061;STBP=0.27;TYPE=snp;VARB=0.0107057;OID=.;OPOS=123385126;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:28:28:39:39:0.58209:18:21:11:17:18:21:11:17
chr3	123418913	.	G	A	731.08	PASS	AF=1;AO=51;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000854239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.461;QD=56.2372;RBI=0.00275335;REFB=0;REVB=0.00261748;RO=0;SAF=27;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.13003e-06;OID=.;OPOS=123418913;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:51:52:1:24:27:0:0:24:28:0:0
chr3	123451773	.	G	C	902.71	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0270665;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.822;QD=58.2395;RBI=0.0311822;REFB=0;REVB=0.0154834;RO=0;SAF=32;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.93109e-05;OID=.;OPOS=123451773;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:30:32:0:0:30:32:0:0
chr3	123452838	.	G	A	1256.2	PASS	AF=0.976471;AO=83;DP=85;FAO=83;FDP=85;FR=.;FRO=2;FSAF=42;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0224837;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=268.738;QD=59.1151;RBI=0.0265756;REFB=0.0508533;REVB=0.0141685;RO=1;SAF=42;SAR=41;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.011412;STB=0.511902;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=-0.000104;OID=.;OPOS=123452838;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:85:85:1:2:83:83:0.976471:41:42:0:1:41:42:0:2
chr3	123457893	.	G	A	279.55	PASS	AF=0.956522;AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0470518;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.345;QD=48.617;RBI=0.0474591;REFB=-0.0165723;REVB=-0.00620421;RO=1;SAF=12;SAR=10;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0439896;STB=0.523788;STBP=0.329;TYPE=snp;VARB=0.00468659;OID=.;OPOS=123457893;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:23:23:1:1:22:22:0.956522:10:12:0:1:10:12:0:1
chr3	123634046	.	G	A	1549.07	PASS	AF=1;AO=97;DP=97;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0250562;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.2455;QD=63.8791;RBI=0.0250576;REFB=0;REVB=-0.000263928;RO=0;SAF=61;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.76228e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000108255;OID=.;OPOS=123634046;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:97:97:0:0:97:97:1:36:61:0:0:36:61:0:0
chr3	123946895	.	G	A	648.24	PASS	AF=0.503876;AO=62;DP=125;FAO=65;FDP=129;FR=.;FRO=64;FSAF=36;FSAR=29;FSRF=40;FSRR=24;FWDB=0.0502183;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.0909;QD=20.1005;RBI=0.0569427;REFB=-0.0114247;REVB=0.0268439;RO=62;SAF=34;SAR=28;SRF=38;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0594218;STB=0.535981;STBP=0.438;TYPE=snp;VARB=0.0111388;OID=.;OPOS=123946895;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:125:129:62:64:62:65:0.503876:28:34:38:24:29:36:40:24
chr3	123988039	.	T	C	937.6	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000389348;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.5619;QD=58.5999;RBI=0.0423329;REFB=0;REVB=0.0423311;RO=0;SAF=35;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000254304;OID=.;OPOS=123988039;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:64:0:0:63:64:1:28:35:0:0:29:35:0:0
chr3	124044949	.	C	T	2154.8	PASS	AF=1;AO=124;DP=126;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0834769;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.551;QD=62.4579;RBI=0.0856244;REFB=0;REVB=0.019056;RO=0;SAF=61;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000201061;OID=.;OPOS=124044949;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:126:138:0:0:124:138:1:63:61:0:0:63:75:0:0
chr3	124196094	.	A	T	224.8	PASS	AF=0.391304;AO=27;DP=69;FAO=27;FDP=69;FR=.;FRO=42;FSAF=19;FSAR=8;FSRF=30;FSRR=12;FWDB=-0.00250601;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.325;QD=13.0317;RBI=0.01099;REFB=-0.00600895;REVB=-0.0107005;RO=40;SAF=19;SAR=8;SRF=30;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.059854;STB=0.507766;STBP=0.943;TYPE=snp;VARB=0.00878231;OID=.;OPOS=124196094;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:40:42:27:27:0.391304:8:19:30:10:8:19:30:12
chr3	124351316	.	G	A	991.5	PASS	AF=1;AO=67;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00821289;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.369;QD=58.3233;RBI=0.0223693;REFB=0;REVB=0.0208071;RO=0;SAF=36;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00013718;OID=.;OPOS=124351316;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:67:68:1:31:36:0:0:32:36:0:0
chr3	124351424	.	T	C	1213.71	PASS	AF=0.987654;AO=79;DP=82;FAO=80;FDP=81;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=48;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0107112;FXX=0.0121936;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.403;QD=59.9362;RBI=0.0357562;REFB=0.126416;REVB=0.0341142;RO=1;SAF=31;SAR=48;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.015025;STB=0.50769;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=-0.000291675;OID=.;OPOS=124351424;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:82:81:1:1:79:80:0.987654:48:31:1:0:48:32:1:0
chr3	124376653	.	G	A	925.7	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0374532;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.094;QD=58.7749;RBI=0.0376298;REFB=0;REVB=-0.00364121;RO=0;SAF=33;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000392788;OID=.;OPOS=124376653;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:30:33:0:0:30:33:0:0
chr3	124379748	.	G	C	1529.42	PASS	AF=1;AO=96;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00532172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.178;QD=63.7258;RBI=0.0113277;REFB=0;REVB=0.00999985;RO=0;SAF=53;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.72904e-06;OID=.;OPOS=124379748;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:96:96:0:0:96:96:1:43:53:0:0:43:53:0:0
chr3	124379817	.	T	C	2067.51	PASS	AF=0.992537;AO=133;DP=134;FAO=133;FDP=134;FR=.;FRO=1;FSAF=65;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0395706;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.3954;QD=61.7168;RBI=0.0574863;REFB=-0.0982734;REVB=0.0416994;RO=1;SAF=65;SAR=68;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00693903;STB=0.503649;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.00350403;OID=.;OPOS=124379817;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:134:134:1:1:133:133:0.992537:68:65:0:1:68:65:0:1
chr3	124412634	.	G	C,T	497.51	PASS	AF=0.0555556,0.916667;AO=2,34;DP=36;FAO=2,33;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=2,18;FSAR=0,15;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0026731,0.00121693;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=104.692,203.651;QD=55.2785;RBI=0.0125114,0.00161292;REFB=-0.039314,0.0596045;REVB=-0.0122225,-0.00105859;RO=0;SAF=2,18;SAR=0,16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.993266,0.516119;STBP=0.227,0.324;TYPE=snp,snp;VARB=0.0166741,-0.00381418;OID=.,.;OPOS=124412634,124412634;OREF=G,G;OALT=C,T;OMAPALT=C,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:36:36:0:1:2,34:2,33:0.0555556,0.916667:0,16:2,18:0:0:0,15:2,18:0:1
chr3	124439127	.	T	A	139.47	PASS	AF=0.355556;AO=16;DP=45;FAO=16;FDP=45;FR=.;FRO=29;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=9;FWDB=-0.00662036;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.2636;QD=12.3977;RBI=0.0244953;REFB=0.00917707;REVB=0.0235837;RO=29;SAF=5;SAR=11;SRF=20;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.399445;STB=0.733057;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=-0.0169742;OID=.;OPOS=124439127;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:29:29:16:16:0.355556:11:5:20:9:11:5:20:9
chr3	124451284	.	T	C	252.51	PASS	AF=0.5;AO=24;DP=48;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=18;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=0.00517559;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.942;QD=21.0428;RBI=0.0222271;REFB=0.00110891;REVB=0.0216161;RO=24;SAF=18;SAR=6;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135997;STB=0.576855;STBP=0.329;TYPE=snp;VARB=-0.00101269;OID=.;OPOS=124451284;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:24:24:24:24:0.5:6:18:15:9:6:18:15:9
chr3	124458938	.	T	A	343.26	PASS	AF=0.493151;AO=36;DP=73;FAO=36;FDP=73;FR=.;FRO=37;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=22;FWDB=0.0218363;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.727;QD=18.8085;RBI=0.0341531;REFB=-0.0248589;REVB=0.0262604;RO=36;SAF=19;SAR=17;SRF=14;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124325;STB=0.561755;STBP=0.327;TYPE=snp;VARB=0.0137222;OID=.;OPOS=124458938;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:36:37:36:36:0.493151:17:19:14:22:17:19:15:22
chr3	124462824	.	A	G	482.87	PASS	AF=0.547619;AO=45;DP=83;FAO=46;FDP=84;FR=.;FRO=38;FSAF=17;FSAR=29;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=0.0244287;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.897;QD=22.9939;RBI=0.0276913;REFB=-0.0122196;REVB=-0.0130402;RO=37;SAF=16;SAR=29;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134942;STB=0.561263;STBP=0.236;TYPE=snp;VARB=0.00804869;OID=.;OPOS=124462824;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:84:37:38:45:46:0.547619:29:16:19:18:29:17:19:19
chr3	124515308	.	A	G	169.13	PASS	AF=0.278481;AO=22;DP=80;FAO=22;FDP=79;FR=.;FRO=57;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=30;FSRR=27;FWDB=-0.00604274;FXX=0.102261;HRUN=3;LEN=1;MLLD=163.864;QD=8.56363;RBI=0.011058;REFB=-0.0173354;REVB=0.00926094;RO=57;SAF=15;SAR=7;SRF=30;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.195904;STB=0.618071;STBP=0.213;TYPE=snp;VARB=0.029312;OID=.;OPOS=124515308;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:79:57:57:22:22:0.278481:7:15:30:27:7:15:30:27
chr3	124515309	.	A	G	36.56	PASS	AF=0.102273;AO=8;DP=87;FAO=9;FDP=88;FR=.;FRO=79;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=45;FSRR=34;FWDB=-0.033911;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=193.381;QD=1.66168;RBI=0.0342432;REFB=-0.00489244;REVB=0.00475852;RO=79;SAF=2;SAR=6;SRF=45;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.355699;STB=0.799847;STBP=0.087;TYPE=snp;VARB=0.114528;OID=.;OPOS=124515309;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:87:88:79:79:8:9:0.102273:6:2:45:34:7:2:45:34
chr3	124515498	.	T	C	127.68	PASS	AF=0.348837;AO=15;DP=43;FAO=15;FDP=43;FR=.;FRO=28;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=0.00138586;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.914;QD=11.877;RBI=0.0241764;REFB=-0.0138961;REVB=-0.0241367;RO=28;SAF=3;SAR=12;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.263944;STB=0.658588;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.0264363;OID=.;OPOS=124515498;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:28:28:15:15:0.348837:12:3:11:17:12:3:11:17
chr3	124515646	.	A	C	234.38	PASS	AF=0.388889;AO=28;DP=72;FAO=28;FDP=72;FR=.;FRO=44;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=23;FSRR=21;FWDB=-0.00277276;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.423;QD=13.0212;RBI=0.0185338;REFB=-0.0150945;REVB=-0.0183252;RO=44;SAF=10;SAR=18;SRF=23;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18056;STB=0.603583;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=0.0277322;OID=.;OPOS=124515646;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:44:44:28:28:0.388889:18:10:23:21:18:10:23:21
chr3	124646594	.	A	G	329.99	PASS	AF=0.486111;AO=35;DP=72;FAO=35;FDP=72;FR=.;FRO=37;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=23;FSRR=14;FWDB=-0.0185751;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.991;QD=18.3328;RBI=0.018603;REFB=-0.00231437;REVB=-0.00101795;RO=37;SAF=16;SAR=19;SRF=23;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150549;STB=0.583877;STBP=0.183;TYPE=snp;VARB=0.00189044;OID=.;OPOS=124646594;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:37:37:35:35:0.486111:19:16:23:14:19:16:23:14
chr3	124646705	.	A	AAAG,AAG	1056.08	PASS	AF=1,0;AO=44,17;DP=85;FAO=70,0;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=12,0;FSAR=58,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00915097,-0.00927721;FXX=0.11391;HRUN=3,3;LEN=3,2;MLLD=239.635,222.231;QD=60.3473;RBI=0.0656917,0.0662883;REFB=0,0;REVB=0.0650512,0.0656359;RO=18;SAF=11,1;SAR=33,16;SRF=3;SRR=15;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.061769,-0.295063;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,ins;VARB=0.000389165,0;OID=.,.;OPOS=124646706,124646706;OREF=-,-;OALT=AAG,AG;OMAPALT=AAAG,AAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1,0:44,17:85:70,0:70:0:12,0:58,0:0:0:6:18:11,1:33,16:3:15
chr3	124728626	.	A	G	941.65	PASS	AF=1;AO=64;DP=65;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0132325;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.4718;QD=58.8529;RBI=0.0216508;REFB=0;REVB=-0.0171365;RO=0;SAF=27;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.1743e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.35848e-05;OID=.;OPOS=124728626;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:64:0:0:64:64:1:37:27:0:0:37:27:0:0
chr3	124731485	.	C	G	955.16	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0107689;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.922;QD=58.7788;RBI=0.0319033;REFB=0;REVB=0.0300309;RO=0;SAF=35;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000114622;OID=.;OPOS=124731485;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:30:35:0:0:30:35:0:0
chr3	124731689	.	T	A	514.18	PASS	AF=0.490909;AO=54;DP=111;FAO=54;FDP=110;FR=.;FRO=56;FSAF=22;FSAR=32;FSRF=24;FSRR=32;FWDB=-0.00411661;FXX=0.0178555;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.32;QD=18.6974;RBI=0.01457;REFB=-0.00800884;REVB=-0.0139763;RO=56;SAF=22;SAR=32;SRF=24;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0200554;STB=0.511107;STBP=0.819;TYPE=snp;VARB=0.00822206;OID=.;OPOS=124731689;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:110:56:56:54:54:0.490909:32:22:24:32:32:22:24:32
chr3	124732618	.	A	G	88.61	PASS	AF=0.407407;AO=10;DP=28;FAO=11;FDP=27;FR=.,HEALED;FRO=16;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.00485497;FXX=0.0357015;HRUN=6;LEN=1;MLLD=240.006;QD=13.1274;RBI=0.0546325;REFB=0.00201338;REVB=-0.0544164;RO=11;SAF=8;SAR=2;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.355177;STB=0.725348;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=-0.00307681;OID=.;OPOS=124732618;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:28:27:11:16:10:11:0.407407:2:8:5:6:2:9:8:8
chr3	124733649	.	T	G	1572.55	PASS	AF=1;AO=104;DP=104;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00782401;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=302.849;QD=59.9068;RBI=0.0151501;REFB=0;REVB=0.0129734;RO=0;SAF=52;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.94852e-05;OID=.;OPOS=124733649;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:104:105:0:0:104:105:1:52:52:0:0:51:54:0:0
chr3	124738107	.	C	T	355.04	PASS	AF=0.436782;AO=38;DP=87;FAO=38;FDP=87;FR=.;FRO=49;FSAF=26;FSAR=12;FSRF=25;FSRR=24;FWDB=0.00772545;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.9;QD=16.3235;RBI=0.00772545;REFB=0.0132139;REVB=-3.09833e-06;RO=48;SAF=26;SAR=12;SRF=25;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173471;STB=0.604594;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=-0.0156948;OID=.;OPOS=124738107;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:48:49:38:38:0.436782:12:26:25:23:12:26:25:24
chr3	124739892	.	G	A	544.09	PASS	AF=0.513761;AO=56;DP=109;FAO=56;FDP=109;FR=.;FRO=53;FSAF=34;FSAR=22;FSRF=21;FSRR=32;FWDB=0.00027851;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.075;QD=19.9666;RBI=0.00807204;REFB=-0.00416043;REVB=0.00806724;RO=53;SAF=34;SAR=22;SRF=21;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186293;STB=0.602721;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.00550669;OID=.;OPOS=124739892;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:109:53:53:56:56:0.513761:22:34:21:32:22:34:21:32
chr3	124746049	.	A	G	188.7	PASS	AF=0.415094;AO=22;DP=53;FAO=22;FDP=53;FR=.;FRO=31;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=10;FWDB=-0.00899935;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.957;QD=14.2414;RBI=0.0339128;REFB=-0.00306951;REVB=0.0326969;RO=31;SAF=11;SAR=11;SRF=21;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.182132;STB=0.603683;STBP=0.225;TYPE=snp;VARB=0.00650044;OID=.;OPOS=124746049;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:31:31:22:22:0.415094:11:11:21:10:11:11:21:10
chr3	124746182	.	C	A	450.85	PASS	AF=0.458716;AO=49;DP=110;FAO=50;FDP=109;FR=.;FRO=59;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=33;FSRR=26;FWDB=0.0137223;FXX=0.0180164;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.092;QD=16.5448;RBI=0.0141131;REFB=-0.0249991;REVB=-0.00329847;RO=59;SAF=27;SAR=22;SRF=33;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00821587;STB=0.500372;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0244732;OID=.;OPOS=124746182;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:109:59:59:49:50:0.458716:22:27:33:26:22:28:33:26
chr3	124746347	.	T	C	1153.6	PASS	AF=1;AO=75;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.02516;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.508;QD=60.7156;RBI=0.025217;REFB=0;REVB=0.00169503;RO=0;SAF=39;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6999e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.74577e-05;OID=.;OPOS=124746347;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:75:76:1:36:39:0:0:37:39:0:0
chr3	124748226	.	G	A	245.79	PASS	AF=0.38961;AO=28;DP=75;FAO=30;FDP=77;FR=.;FRO=47;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=21;FSRR=26;FWDB=-0.00982958;FXX=0.0374953;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.99;QD=12.7684;RBI=0.0100107;REFB=-0.0175596;REVB=-0.00189561;RO=46;SAF=15;SAR=13;SRF=20;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108891;STB=0.572985;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.0344524;OID=.;OPOS=124748226;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:77:46:47:28:30:0.38961:13:15:20:26:13:17:21:26
chr3	124802881	.	A	G	589.51	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0288322;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.421;QD=60.462;RBI=0.0408443;REFB=0;REVB=0.0289302;RO=0;SAF=17;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.71161e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.99799e-05;OID=.;OPOS=124802881;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:39:0:0:37:39:1:20:17:0:0:21:18:0:0
chr3	124802888	.	C	T	560.9	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0209604;FXX=0.0263089;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.601;QD=60.6375;RBI=0.0215949;REFB=0;REVB=0.00519595;RO=0;SAF=16;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.7558e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.55958e-05;OID=.;OPOS=124802888;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:21:16:0:0:21:16:0:0
chr3	124837684	.	T	C	1611.33	PASS	AF=1;AO=107;DP=108;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0386286;FXX=0.0092584;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.7757;QD=60.2365;RBI=0.0558906;REFB=0;REVB=0.040393;RO=0;SAF=49;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000264305;OID=.;OPOS=124837684;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:108:107:0:0:107:107:1:58:49:0:0:58:49:0:0
chr3	124839470	.	G	A	1507.92	PASS	AF=0.963636;AO=103;DP=107;FAO=106;FDP=110;FR=.;FRO=4;FSAF=54;FSAR=52;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0163485;FXX=0.0178555;HRUN=5;LEN=1;MLLD=250.721;QD=54.8336;RBI=0.0242318;REFB=-0.0377681;REVB=0.0178859;RO=3;SAF=51;SAR=52;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00868611;STB=0.500343;STBP=0.9;TYPE=snp;VARB=0.000144841;OID=.;OPOS=124839470;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:107:110:3:4:103:106:0.963636:52:51:1:2:52:54:2:2
chr3	124946370	.	G	A	183.89	PASS	AF=0.463415;AO=19;DP=41;FAO=19;FDP=41;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=0.0127124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=297.86;QD=17.9407;RBI=0.0152999;REFB=-0.00513637;REVB=-0.00851375;RO=22;SAF=5;SAR=14;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160545;STB=0.592042;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.0063195;OID=.;OPOS=124946370;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:22:22:19:19:0.463415:14:5:9:13:14:5:9:13
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chr3	125725268	.	TAACA	T	191.74	PASS	AF=0.482759;AO=21;DP=60;FAO=28;FDP=58;FR=.;FRO=30;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=-0.00833435;FXX=0.0645057;HRUN=2;LEN=4;MLLD=224.36;QD=13.2235;RBI=0.0284607;REFB=-0.00315989;REVB=0.0272131;RO=23;SAF=11;SAR=10;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161807;STB=0.586736;STBP=0.233;TYPE=del;VARB=0.00290975;OID=.;OPOS=125725269;OREF=AACA;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.482759:21:60:28:58:30:15:13:11:19:99:23:11:10:8:15
chr3	125726048	.	G	C	747.84	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.079976;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.552;QD=63.6456;RBI=0.0806732;REFB=0;REVB=0.0105831;RO=0;SAF=17;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000303422;OID=.;OPOS=125726048;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:47:0:0:46:47:1:29:17:0:0:29:18:0:0
chr3	125775227	.	CT	C,CC	794.13	PASS	AF=0.0357143,0.964286;AO=18,37;DP=56;FAO=2,54;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=0,31;FSAR=2,23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0287907,-0.000125612;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=80.1577,100.722;QD=56.7237;RBI=0.132921,0.166647;REFB=0,0;REVB=0.129766,0.166647;RO=0;SAF=0,31;SAR=18,6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0263773,0.000323922;OID=.,.;OPOS=125775228,125775228;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0357143,0.964286:18,37:56:2,54:56:0:0,31:2,23:0:0:7:0:0,31:18,6:0:0
chr3	125775321	.	G	C	163.76	PASS	AF=0.367347;AO=18;DP=49;FAO=18;FDP=49;FR=.;FRO=31;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=23;FSRR=8;FWDB=-0.014489;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=279.32;QD=13.3679;RBI=0.0144894;REFB=-0.000176832;REVB=0.00010938;RO=31;SAF=4;SAR=14;SRF=23;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.537713;STB=0.810835;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.000146398;OID=.;OPOS=125775321;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:31:31:18:18:0.367347:14:4:23:8:14:4:23:8
chr3	125786852	.	C	T	122.33	PASS	AF=0.451613;AO=14;DP=31;FAO=14;FDP=31;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=0.0135829;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.078;QD=15.7843;RBI=0.0136227;REFB=-0.00282825;REVB=0.00104081;RO=15;SAF=8;SAR=6;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153524;STB=0.542797;STBP=0.689;TYPE=snp;VARB=0.00218942;OID=.;OPOS=125786852;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:15:17:14:14:0.451613:6:8:11:4:6:8:11:6
chr3	125786879	.	T	C	519.91	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0652909;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.7781;QD=59.4182;RBI=0.0662026;REFB=0;REVB=-0.0109488;RO=0;SAF=20;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00136745;OID=.;OPOS=125786879;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:15:20:0:0:15:20:0:0
chr3	125826059	.	T	C	442.36	PASS	AF=0.52381;AO=43;DP=83;FAO=44;FDP=84;FR=.;FRO=40;FSAF=31;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=25;FWDB=-0.0832799;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.7569;QD=21.0648;RBI=0.0836079;REFB=0.00861906;REVB=0.00739833;RO=39;SAF=31;SAR=12;SRF=15;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.304667;STB=0.663212;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=-0.0108965;OID=.;OPOS=125826059;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:84:39:40:43:44:0.52381:12:31:15:24:13:31:15:25
chr3	125854409	.	T	C	102.88	PASS	AF=0.270833;AO=13;DP=50;FAO=13;FDP=48;FR=.;FRO=35;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=-0.0250911;FXX=0.039992;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.694;QD=8.573;RBI=0.035938;REFB=-0.0150182;REVB=-0.0257288;RO=37;SAF=6;SAR=7;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0943789;STB=0.538402;STBP=0.791;TYPE=snp;VARB=0.0393559;OID=.;OPOS=125854409;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:48:37:35:13:13:0.270833:7:6:20:17:7:6:18:17
chr3	125856695	.	C	A	485.4	PASS	AF=0.534884;AO=41;DP=81;FAO=46;FDP=86;FR=.;FRO=40;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=0.0680195;FXX=0.0227247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.226;QD=22.5768;RBI=0.0706514;REFB=-0.013777;REVB=0.019104;RO=40;SAF=17;SAR=24;SRF=21;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0992239;STB=0.52173;STBP=0.657;TYPE=snp;VARB=0.0188093;OID=.;OPOS=125856695;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:86:40:40:41:46:0.534884:24:17:21:19:24:22:21:19
chr3	125865766	.	C	A	84.79	PASS	AF=0.354839;AO=11;DP=31;FAO=11;FDP=31;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=-0.001302;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=318.551;QD=10.9409;RBI=0.0206757;REFB=-0.00754446;REVB=-0.0206346;RO=20;SAF=6;SAR=5;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155624;STB=0.592857;STBP=0.455;TYPE=snp;VARB=0.0148402;OID=.;OPOS=125865766;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:31:31:20:20:11:11:0.354839:5:6:8:12:5:6:8:12
chr3	126169230	.	C	T	1110.81	PASS	AF=1;AO=73;DP=74;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0233059;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.301;QD=59.2431;RBI=0.0281469;REFB=-0.07127;REVB=0.0157822;RO=0;SAF=29;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000127265;OID=.;OPOS=126169230;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:74:75:0:0:73:75:1:44:29:0:0:46:29:0:0
chr3	126169472	.	T	C	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0180138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.891;QD=50.4135;RBI=0.0205447;REFB=0;REVB=-0.00987849;RO=0;SAF=12;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.01149e-05;OID=.;OPOS=126169472;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:7:12:0:0:7:12:0:0
chr3	126194076	.	T	C	885.42	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0226161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.224;QD=58.0604;RBI=0.0326353;REFB=0;REVB=0.0235281;RO=0;SAF=34;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.70732e-06;OID=.;OPOS=126194076;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:27:34:0:0:27:34:0:0
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chr3	126218167	.	G	A	334.54	PASS	AF=0.486111;AO=35;DP=73;FAO=35;FDP=72;FR=.;FRO=37;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=-0.0329228;FXX=0.0270234;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.3164;QD=18.5855;RBI=0.0416946;REFB=-0.0118456;REVB=-0.0255837;RO=34;SAF=14;SAR=21;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.037648;STB=0.53141;STBP=0.625;TYPE=snp;VARB=0.0111744;OID=.;OPOS=126218167;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:72:34:37:35:35:0.486111:21:14:15:19:21:14:17:20
chr3	126260608	.	G	T	489.93	PASS	AF=0.971429;AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0259541;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.4894;QD=55.9916;RBI=0.0400676;REFB=0.00288641;REVB=0.0305253;RO=1;SAF=21;SAR=13;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0346006;STB=0.518508;STBP=0.278;TYPE=snp;VARB=-0.000191171;OID=.;OPOS=126260608;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:35:35:1:1:34:34:0.971429:13:21:0:1:13:21:0:1
chr3	126268918	.	G	A	447.02	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.048287;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.742;QD=57.6804;RBI=0.0888244;REFB=0;REVB=0.0745529;RO=0;SAF=14;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.56309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000394263;OID=.;OPOS=126268918;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:31:0:0:30:31:1:16:14:0:0:17:14:0:0
chr3	126329910	.	A	G	218.58	PASS	AF=0.714286;AO=20;DP=28;FAO=20;FDP=28;FR=.;FRO=8;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0323064;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.284;QD=31.2249;RBI=0.0451744;REFB=0.0111854;REVB=0.0315757;RO=8;SAF=15;SAR=5;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156847;STB=0.586864;STBP=0.176;TYPE=snp;VARB=-0.00308699;OID=.;OPOS=126329910;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:28:28:8:8:20:20:0.714286:5:15:4:4:5:15:4:4
chr3	126451937	.	G	T	352.75	PASS	AF=0.493333;AO=36;DP=74;FAO=37;FDP=75;FR=.;FRO=38;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=24;FSRR=14;FWDB=0.00447123;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.304;QD=18.8136;RBI=0.0329763;REFB=-0.0215877;REVB=0.0326717;RO=37;SAF=22;SAR=14;SRF=23;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0100837;STB=0.519568;STBP=0.753;TYPE=snp;VARB=0.0191507;OID=.;OPOS=126451937;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:75:37:38:36:37:0.493333:14:22:23:14:15:22:24:14
chr3	126708453	.	T	C	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0176131;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.139;QD=55.656;RBI=0.0176139;REFB=0;REVB=0.0001645;RO=0;SAF=11;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.90652e-05;OID=.;OPOS=126708453;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:16:11:0:0:16:11:0:0
chr3	126708459	.	C	T	34.65	PASS	AF=0.222222;AO=5;DP=26;FAO=6;FDP=27;FR=.;FRO=21;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.0217966;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.1083;QD=5.13285;RBI=0.0328057;REFB=-0.0232642;REVB=0.0245178;RO=21;SAF=3;SAR=2;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197248;STB=0.555373;STBP=0.777;TYPE=snp;VARB=0.154254;OID=.;OPOS=126708459;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:26:27:21:21:5:6:0.222222:2:3:9:12:3:3:9:12
chr3	126722304	.	C	T	407.31	PASS	AF=0.673469;AO=33;DP=49;FAO=33;FDP=49;FR=.;FRO=16;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=3;FSRR=13;FWDB=0.0308571;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.804;QD=33.2502;RBI=0.035087;REFB=-0.0134794;REVB=0.0167014;RO=16;SAF=16;SAR=17;SRF=3;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179766;STB=0.597702;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.00840909;OID=.;OPOS=126722304;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:16:16:33:33:0.673469:17:16:3:13:17:16:3:13
chr3	126723549	.	C	T	218.99	PASS	AF=0.567568;AO=21;DP=37;FAO=21;FDP=37;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.0108204;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.213;QD=23.675;RBI=0.016589;REFB=-0.0223634;REVB=-0.0125744;RO=16;SAF=8;SAR=13;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0457773;STB=0.525582;STBP=0.732;TYPE=snp;VARB=0.0182534;OID=.;OPOS=126723549;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:16:16:21:21:0.567568:13:8:7:9:13:8:7:9
chr3	126726705	.	A	G	170.47	PASS	AF=0.62963;AO=16;DP=27;FAO=17;FDP=27;FR=.;FRO=10;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.0267146;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.438;QD=25.2547;RBI=0.0379509;REFB=-0.0313168;REVB=-0.0269555;RO=10;SAF=8;SAR=8;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137454;STB=0.584318;STBP=0.263;TYPE=snp;VARB=0.0126538;OID=.;OPOS=126726705;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:27:27:10:10:16:17:0.62963:8:8:3:7:8:9:3:7
chr3	126735453	.	C	T	377.94	PASS	AF=0.596774;AO=37;DP=62;FAO=37;FDP=62;FR=.;FRO=25;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=0.0334618;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.364;QD=24.3833;RBI=0.0334683;REFB=-0.0299341;REVB=-0.000659411;RO=25;SAF=16;SAR=21;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0940885;STB=0.551636;STBP=0.344;TYPE=snp;VARB=0.0163325;OID=.;OPOS=126735453;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:25:25:37:37:0.596774:21:16:14:11:21:16:14:11
chr3	126737268	.	C	A	289.52	PASS	AF=0.577778;AO=25;DP=44;FAO=26;FDP=45;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=0.0360279;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.0571;QD=25.7351;RBI=0.0389384;REFB=-0.0276362;REVB=-0.0147712;RO=19;SAF=10;SAR=15;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.219037;STB=0.609054;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=0.0233772;OID=.;OPOS=126737268;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:45:19:19:25:26:0.577778:15:10:13:6:15:11:13:6
chr3	126741011	.	G	A	351.09	PASS	AF=0.583333;AO=35;DP=60;FAO=35;FDP=60;FR=.;FRO=25;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.0171663;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.75;QD=23.4062;RBI=0.0637994;REFB=-0.0110224;REVB=0.0614466;RO=24;SAF=17;SAR=18;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0413829;STB=0.514278;STBP=0.8;TYPE=snp;VARB=0.00899775;OID=.;OPOS=126741011;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:24:25:35:35:0.583333:18:17:13:11:18:17:13:12
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chr3	126746731	.	T	G	53.55	PASS	AF=0.258065;AO=8;DP=32;FAO=8;FDP=31;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.00964561;FXX=0.0312402;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.8222;QD=6.91025;RBI=0.0213169;REFB=0.00504423;REVB=0.0190098;RO=21;SAF=5;SAR=3;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0640626;STB=0.578313;STBP=0.653;TYPE=snp;VARB=-0.0523959;OID=.;OPOS=126746731;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:32:31:21:23:8:8:0.258065:3:5:12:9:3:5:12:11
chr3	126754711	.	G	A	430.7	PASS	AF=0.505882;AO=42;DP=84;FAO=43;FDP=85;FR=.;FRO=42;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=0.0324885;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.5276;QD=20.2684;RBI=0.0347601;REFB=-0.00869847;REVB=-0.0123596;RO=42;SAF=20;SAR=22;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0642782;STB=0.529237;STBP=0.633;TYPE=snp;VARB=0.00595054;OID=.;OPOS=126754711;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:85:42:42:42:43:0.505882:22:20:23:19:22:21:23:19
chr3	126916371	.	T	C	276.89	PASS	AF=1;AO=20;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.08052;FXX=0.0454339;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.485;QD=52.7413;RBI=0.080637;REFB=0;REVB=0.0043434;RO=1;SAF=4;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101866;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00253529;OID=.;OPOS=126916371;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:1:0:20:21:1:16:4:1:0:16:5:0:0
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chr3	127641968	.	C	A	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0303695;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.581;QD=43.4862;RBI=0.03117;REFB=0;REVB=0.00701876;RO=0;SAF=5;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000357742;OID=.;OPOS=127641968;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:7:5:0:0:7:5:0:0
chr3	127642814	.	G	C	389.88	PASS	AF=0.431579;AO=41;DP=95;FAO=41;FDP=95;FR=.;FRO=54;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=29;FSRR=25;FWDB=-0.0397664;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.8307;QD=16.416;RBI=0.0459667;REFB=-0.0229314;REVB=-0.0230559;RO=54;SAF=22;SAR=19;SRF=29;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000458882;STB=0.500258;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0276923;OID=.;OPOS=127642814;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:54:54:41:41:0.431579:19:22:29:25:19:22:29:25
chr3	127682473	.	A	AGTGTGTT	142.79	PASS	AF=0.289855;AO=19;DP=74;FAO=20;FDP=69;FR=.;FRO=49;FSAF=16;FSAR=4;FSRF=27;FSRR=22;FWDB=0.00057707;FXX=0.0142837;HRUN=0;LEN=7;MLLD=346.496;QD=8.27794;RBI=0.000772062;REFB=0.0011751;REVB=0.000512903;RO=54;SAF=15;SAR=4;SRF=29;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.34296;STB=0.707254;STBP=0.034;TYPE=ins;VARB=-0.00351385;OID=.;OPOS=127682474;OREF=-;OALT=GTGTGTT;OMAPALT=AGTGTGTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.289855:19:74:20:69:49:16:4:27:22:99:54:15:4:29:25
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chr3	127983495	.	T	C	951.43	PASS	AF=1;AO=52;DP=67;FAO=65;FDP=65;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=33;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0819487;FXX=0.0298463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.159;QD=58.5497;RBI=0.0858148;REFB=0;REVB=0.0254677;RO=0;SAF=21;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.93989e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00221405;OID=.;OPOS=127983495;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:65:0:0:52:65:1:31:21:0:0:32:33:0:0
chr3	128181537	.	C	T	511.84	PASS	AF=0.55814;AO=48;DP=87;FAO=48;FDP=86;FR=.;FRO=38;FSAF=28;FSAR=20;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=0.0259658;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.177;QD=23.8065;RBI=0.0271781;REFB=-0.00992584;REVB=0.00802667;RO=37;SAF=28;SAR=20;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120377;STB=0.571954;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.00485133;OID=.;OPOS=128181537;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:86:37:38:48:48:0.55814:20:28:16:21:20:28:16:22
chr3	128182074	.	G	A	285.1	PASS	AF=0.541667;AO=26;DP=48;FAO=26;FDP=48;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.0480476;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.791;QD=23.7583;RBI=0.0505462;REFB=-0.00253463;REVB=0.0156955;RO=21;SAF=9;SAR=17;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110699;STB=0.574266;STBP=0.288;TYPE=snp;VARB=0.0011233;OID=.;OPOS=128182074;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:21:22:26:26:0.541667:17:9:10:11:17:9:11:11
chr3	128204951	.	C	T	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0281847;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.857;QD=35.5759;RBI=0.126598;REFB=0;REVB=0.123421;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00151998;OID=.;OPOS=128204951;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:3:4:0:0:3:4:0:0
chr3	128205860	.	G	C	160.23	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0724505;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=67.9478;QD=45.7786;RBI=0.0745772;REFB=0;REVB=-0.0176828;RO=0;SAF=1;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00167348;OID=.;OPOS=128205860;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:13:1:0:0:13:1:0:0
chr3	128292844	.	A	G	175.67	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0701389;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.0841;QD=46.8463;RBI=0.0799457;REFB=0;REVB=0.0383647;RO=0;SAF=12;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00146303;OID=.;OPOS=128292844;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:3:12:0:0:3:12:0:0
chr3	128580574	.	T	C	1422.37	PASS	AF=1;AO=90;DP=90;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0133456;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.154;QD=62.522;RBI=0.0180505;REFB=0;REVB=0.0121539;RO=0;SAF=46;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.15792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.26612e-06;OID=.;OPOS=128580574;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:90:91:0:0:90:91:1:44:46:0:0:45:46:0:0
chr3	128580585	.	C	A	294.88	PASS	AF=0.352381;AO=36;DP=103;FAO=37;FDP=105;FR=.;FRO=68;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=30;FSRR=38;FWDB=0.0146033;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.454;QD=11.2335;RBI=0.0151873;REFB=-0.0100728;REVB=-0.0041709;RO=67;SAF=21;SAR=15;SRF=30;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15281;STB=0.581495;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=0.0169576;OID=.;OPOS=128580585;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:105:67:68:36:37:0.352381:15:21:30:37:16:21:30:38
chr3	128580767	.	T	TG,TGG	220.65	PASS	AF=0.450704,0.183099;AO=30,9;DP=79;FAO=32,13;FDP=71;FR=.;FRO=26;FSAF=16,7;FSAR=16,6;FSRF=7;FSRR=19;FWDB=0.199317,0.104297;FXX=0.0273935;HRUN=5,5;LEN=1,2;MLLD=9.17431,13.5617;QD=12.4308;RBI=0.241295,0.126189;REFB=-0.075399,-0.0402171;REVB=0.136,0.071033;RO=38;SAF=19,2;SAR=11,7;SRF=14;SRR=24;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.260268,-0.211967;STB=0.603386,0.675432;STBP=0.103,0.16;TYPE=ins,ins;VARB=-0.0262834,0.123891;OID=.,.;OPOS=128580768,128580768;OREF=-,-;OALT=G,GG;OMAPALT=TG,TGG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.450704,0.183099:30,9:79:32,13:71:26:16,7:16,6:7:19:43:38:19,2:11,7:14:24
chr3	128614185	.	A	C	299.38	PASS	AF=0.958333;AO=23;DP=24;FAO=23;FDP=24;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.000673143;FXX=0.039984;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.2385;QD=49.8971;RBI=0.00374075;REFB=0.0167484;REVB=0.00367969;RO=1;SAF=13;SAR=10;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0440445;STB=0.523789;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=-0.000801811;OID=.;OPOS=128614185;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:24:24:1:1:23:23:0.958333:10:13:0:1:10:13:0:1
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chr3	128627933	.	C	T	141.91	PASS	AF=0.390244;AO=16;DP=41;FAO=16;FDP=41;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.00947702;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=193.805;QD=13.8453;RBI=0.0110922;REFB=-0.0115791;REVB=-0.00576398;RO=24;SAF=7;SAR=9;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149715;STB=0.574375;STBP=0.488;TYPE=snp;VARB=0.0138362;OID=.;OPOS=128627933;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:24:25:16:16:0.390244:9:7:14:10:9:7:14:11
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chr3	128651796	.	G	A	233.48	PASS	AF=0.435484;AO=27;DP=62;FAO=27;FDP=62;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=0.0204426;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.197;QD=15.063;RBI=0.0204485;REFB=-0.0068572;REVB=-0.000492609;RO=35;SAF=13;SAR=14;SRF=14;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0816209;STB=0.546185;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.0102952;OID=.;OPOS=128651796;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:35:35:27:27:0.435484:14:13:14:21:14:13:14:21
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chr3	128979256	.	C	G	97.91	PASS	AF=0.413793;AO=12;DP=29;FAO=12;FDP=29;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=14;FWDB=0.00939447;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.386;QD=13.5052;RBI=0.0109066;REFB=-0.00682832;REVB=0.00554047;RO=17;SAF=5;SAR=7;SRF=3;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.264459;STB=0.651955;STBP=0.243;TYPE=snp;VARB=0.00902778;OID=.;OPOS=128979256;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:29:29:17:17:12:12:0.413793:7:5:3:14:7:5:3:14
chr3	128984583	.	C	T	252.77	PASS	AF=0.5;AO=24;DP=48;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=0.00649267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.269;QD=21.0641;RBI=0.00729382;REFB=0.00804673;REVB=-0.00332339;RO=24;SAF=11;SAR=13;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113498;STB=0.563553;STBP=0.422;TYPE=snp;VARB=-0.0076615;OID=.;OPOS=128984583;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:24:24:24:24:0.5:13:11:8:16:13:11:8:16
chr3	129034578	.	G	A	92.95	PASS	AF=0.307692;AO=12;DP=39;FAO=12;FDP=39;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=-0.0351718;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.4078;QD=9.53304;RBI=0.0359931;REFB=0.0252772;REVB=0.00764493;RO=27;SAF=6;SAR=6;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0211317;STB=0.512799;STBP=0.951;TYPE=snp;VARB=-0.0526552;OID=.;OPOS=129034578;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:39:39:27:27:12:12:0.307692:6:6:13:14:6:6:13:14
chr3	129035021	.	T	C	257.75	PASS	AF=0.545455;AO=24;DP=44;FAO=24;FDP=44;FR=.;FRO=20;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=5;FWDB=-0.0227735;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.485;QD=23.4314;RBI=0.0227738;REFB=-0.0328595;REVB=-0.000120401;RO=20;SAF=11;SAR=13;SRF=15;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.235124;STB=0.630493;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=0.0107568;OID=.;OPOS=129035021;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:20:20:24:24:0.545455:13:11:15:5:13:11:15:5
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chr3	129134242	.	G	A	284.55	PASS	AF=0.484375;AO=31;DP=64;FAO=31;FDP=64;FR=.;FRO=33;FSAF=8;FSAR=23;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=-0.00953901;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.907;QD=17.7843;RBI=0.00987301;REFB=-0.00670897;REVB=-0.00254633;RO=33;SAF=8;SAR=23;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.28919;STB=0.66286;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.00604858;OID=.;OPOS=129134242;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:33:33:31:31:0.484375:23:8:18:15:23:8:18:15
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chr3	129279597	.	C	T	469.06	PASS	AF=1;AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0399507;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.304;QD=58.6327;RBI=0.0404804;REFB=0;REVB=0.00652724;RO=0;SAF=9;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02243e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.20889e-05;OID=.;OPOS=129279597;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:32:0:0:32:32:1:23:9:0:0:23:9:0:0
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chr3	129293183	.	T	C	1159.78	PASS	AF=1;AO=76;DP=77;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00511795;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.696;QD=61.0413;RBI=0.0409071;REFB=0;REVB=-0.0405857;RO=0;SAF=39;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000112203;OID=.;OPOS=129293183;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:76:0:0:76:76:1:37:39:0:0:37:39:0:0
chr3	129293256	.	T	C	638.67	PASS	AF=0.512;AO=64;DP=124;FAO=64;FDP=125;FR=.;FRO=61;FSAF=35;FSAR=29;FSRF=40;FSRR=21;FWDB=-0.0188468;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.1005;QD=20.4374;RBI=0.0202268;REFB=-0.0262158;REVB=-0.00734311;RO=60;SAF=35;SAR=29;SRF=39;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0925024;STB=0.554124;STBP=0.226;TYPE=snp;VARB=0.0174849;OID=.;OPOS=129293256;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:124:125:60:61:64:64:0.512:29:35:39:21:29:35:40:21
chr3	129302495	.	G	A	135.34	PASS	AF=0.292308;AO=19;DP=65;FAO=19;FDP=65;FR=.;FRO=46;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=21;FSRR=25;FWDB=-0.0113923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.541;QD=8.32871;RBI=0.0327936;REFB=-0.0100992;REVB=0.0307512;RO=46;SAF=11;SAR=8;SRF=21;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144375;STB=0.586339;STBP=0.397;TYPE=snp;VARB=0.0237633;OID=.;OPOS=129302495;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:46:46:19:19:0.292308:8:11:21:25:8:11:21:25
chr3	129305459	.	C	A	240.64	PASS	AF=0.358025;AO=29;DP=81;FAO=29;FDP=81;FR=.;FRO=52;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=29;FSRR=23;FWDB=0.0595258;FXX=0.0121936;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.259;QD=11.8835;RBI=0.0596678;REFB=0.0202602;REVB=-0.00411502;RO=52;SAF=11;SAR=18;SRF=29;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198843;STB=0.61478;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=-0.0318375;OID=.;OPOS=129305459;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:52:52:29:29:0.358025:18:11:29:23:18:11:29:23
chr3	129367024	.	T	A	1102.55	PASS	AF=0.986667;AO=74;DP=75;FAO=74;FDP=75;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=42;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0328739;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.851;QD=58.8027;RBI=0.0337112;REFB=-0.125821;REVB=-0.00746699;RO=0;SAF=32;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50769;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=0.000396257;OID=.;OPOS=129367024;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:75:75:0:1:74:74:0.986667:42:32:0:0:42:32:1:0
chr3	129538635	.	A	G	530.74	PASS	AF=0.972973;AO=36;DP=38;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0140312;FXX=0.0263089;HRUN=2;LEN=1;MLLD=221.257;QD=57.3772;RBI=0.0350483;REFB=-0.0445829;REVB=0.0321171;RO=1;SAF=20;SAR=16;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0283532;STB=0.515143;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.000172161;OID=.;OPOS=129538635;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:38:37:1:1:36:36:0.972973:16:20:0:1:16:20:0:1
chr3	129546729	.	T	C	802.61	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0260568;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.774;QD=64.209;RBI=0.0383982;REFB=0;REVB=0.0282041;RO=0;SAF=26;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000160245;OID=.;OPOS=129546729;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:50:0:0:49:50:1:23:26:0:0:24:26:0:0
chr3	129694681	.	C	G	1140.77	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00542289;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.408;QD=60.8412;RBI=0.0174475;REFB=0;REVB=0.0165833;RO=0;SAF=27;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.00823e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000133972;OID=.;OPOS=129694681;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:48:27:0:0:48:27:0:0
chr3	129695954	.	T	C	471.72	PASS	AF=0.970588;AO=33;DP=34;FAO=33;FDP=34;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00838389;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.1065;QD=55.4968;RBI=0.0475727;REFB=0.0846499;REVB=0.0468281;RO=1;SAF=21;SAR=12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0217319;STB=0.511621;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=-0.00791679;OID=.;OPOS=129695954;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:34:34:1:1:33:33:0.970588:12:21:1:0:12:21:1:0
chr3	129696041	.	A	G	728.13	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148808;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.784;QD=63.3154;RBI=0.0149666;REFB=0;REVB=0.00160006;RO=0;SAF=16;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.49331e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.78412e-05;OID=.;OPOS=129696041;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:46:0:0:45:46:1:29:16:0:0:29:17:0:0
chr3	129800888	.	G	A	181.44	PASS	AF=0.263158;AO=25;DP=95;FAO=25;FDP=95;FR=.;FRO=70;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=37;FSRR=33;FWDB=0.00772899;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=219.395;QD=7.63972;RBI=0.0185394;REFB=-0.00186117;REVB=-0.0168514;RO=70;SAF=11;SAR=14;SRF=37;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108194;STB=0.565129;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=0.00404996;OID=.;OPOS=129800888;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:70:70:25:25:0.263158:14:11:37:33:14:11:37:33
chr3	129800895	.	G	A	204.04	PASS	AF=0.28125;AO=27;DP=96;FAO=27;FDP=96;FR=.;FRO=69;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=37;FSRR=32;FWDB=-0.00560313;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=232.745;QD=8.5018;RBI=0.0064238;REFB=-0.00552135;REVB=0.00314168;RO=69;SAF=11;SAR=16;SRF=37;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155401;STB=0.592524;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=0.0254494;OID=.;OPOS=129800895;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:96:69:69:27:27:0.28125:16:11:37:32:16:11:37:32
chr3	130098349	.	G	A	465.71	PASS	AF=0.455357;AO=51;DP=112;FAO=51;FDP=112;FR=.;FRO=61;FSAF=18;FSAR=33;FSRF=37;FSRR=24;FWDB=-0.0250892;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.8794;QD=16.6324;RBI=0.036785;REFB=-0.00419079;REVB=0.026901;RO=58;SAF=18;SAR=33;SRF=34;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.22581;STB=0.638805;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.00762258;OID=.;OPOS=130098349;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:112:58:61:51:51:0.455357:33:18:34:24:33:18:37:24
chr3	130103709	.	G	A	223.58	PASS	AF=0.617647;AO=21;DP=34;FAO=21;FDP=34;FR=.;FRO=13;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.00614206;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.2243;QD=26.3036;RBI=0.00786773;REFB=0.019481;REVB=-0.00491695;RO=13;SAF=9;SAR=12;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12859;STB=0.57136;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=-0.0119025;OID=.;OPOS=130103709;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:13:13:21:21:0.617647:12:9:8:5:12:9:8:5
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chr3	130174334	.	G	A	350.87	PASS	AF=0.529412;AO=36;DP=68;FAO=36;FDP=68;FR=.;FRO=32;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=-0.000823071;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.842;QD=20.6396;RBI=0.0155943;REFB=-0.00716269;REVB=0.0155726;RO=32;SAF=22;SAR=14;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0429338;STB=0.523796;STBP=0.706;TYPE=snp;VARB=0.00796462;OID=.;OPOS=130174334;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:32:32:36:36:0.529412:14:22:18:14:14:22:18:14
chr3	130187817	.	T	C	1397.9	PASS	AF=1;AO=89;DP=90;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000768007;FXX=0.0111099;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.86;QD=62.8269;RBI=0.0349139;REFB=0;REVB=0.0349055;RO=0;SAF=46;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.21813e-06;OID=.;OPOS=130187817;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:90:89:0:0:89:89:1:43:46:0:0:43:46:0:0
chr3	130190630	.	G	A	229.63	PASS	AF=0.363636;AO=28;DP=77;FAO=28;FDP=77;FR=.;FRO=49;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=34;FSRR=15;FWDB=-0.00161976;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.9082;QD=11.9289;RBI=0.0264567;REFB=0.000354487;REVB=-0.0264071;RO=46;SAF=17;SAR=11;SRF=33;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129888;STB=0.559281;STBP=0.466;TYPE=snp;VARB=-0.00082299;OID=.;OPOS=130190630;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:46:49:28:28:0.363636:11:17:33:13:11:17:34:15
chr3	130190716	.	G	A	177.86	PASS	AF=0.6;AO=17;DP=29;FAO=18;FDP=30;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=-0.0120301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.068;QD=23.7149;RBI=0.0129718;REFB=-0.0182495;REVB=0.00485232;RO=12;SAF=8;SAR=9;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0399905;STB=0.511266;STBP=0.91;TYPE=snp;VARB=0.0148302;OID=.;OPOS=130190716;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:29:30:12:12:17:18:0.6:9:8:5:7:10:8:5:7
chr3	130190720	.	AT	A	51.77	PASS	AF=0.357143;AO=9;DP=29;FAO=10;FDP=28;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.0849836;FXX=0.0344709;HRUN=3;LEN=1;MLLD=21.1724;QD=7.39564;RBI=0.114943;REFB=0.0446219;REVB=0.0773932;RO=17;SAF=3;SAR=6;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154634;STB=0.565086;STBP=0.652;TYPE=del;VARB=-0.0273056;OID=.;OPOS=130190721;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.357143:9:29:10:28:18:4:6:9:9:51:17:3:6:8:9
chr3	130195917	.	T	G	424.18	PASS	AF=0.472527;AO=43;DP=91;FAO=43;FDP=91;FR=.;FRO=48;FSAF=29;FSAR=14;FSRF=27;FSRR=21;FWDB=-0.00851957;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.228;QD=18.6452;RBI=0.012483;REFB=0.0162962;REVB=-0.00912375;RO=48;SAF=29;SAR=14;SRF=27;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114806;STB=0.564172;STBP=0.271;TYPE=snp;VARB=-0.0155586;OID=.;OPOS=130195917;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:48:48:43:43:0.472527:14:29:27:21:14:29:27:21
chr3	130284284	.	G	A	140.09	PASS	AF=0.555556;AO=15;DP=27;FAO=15;FDP=27;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.0274696;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.0645;QD=20.7544;RBI=0.0278704;REFB=-0.0123293;REVB=0.00470927;RO=12;SAF=5;SAR=10;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202987;STB=0.615227;STBP=0.19;TYPE=snp;VARB=0.00867951;OID=.;OPOS=130284284;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:12:12:15:15:0.555556:10:5:7:5:10:5:7:5
chr3	130300650	.	T	C	274.86	PASS	AF=0.483871;AO=30;DP=63;FAO=30;FDP=62;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=-0.00095081;FXX=0.0158705;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.9728;QD=17.7329;RBI=0.0154455;REFB=-0.00677326;REVB=-0.0154162;RO=33;SAF=14;SAR=16;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0453053;STB=0.51723;STBP=0.789;TYPE=snp;VARB=0.00676692;OID=.;OPOS=130300650;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:62:33:32:30:30:0.483871:16:14:17:16:16:14:16:16
chr3	130311398	.	C	T	388.63	PASS	AF=0.414141;AO=41;DP=95;FAO=41;FDP=99;FR=.;FRO=58;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=34;FSRR=24;FWDB=-0.00283447;FXX=0.009999;HRUN=4;LEN=1;MLLD=241.922;QD=15.7022;RBI=0.00714218;REFB=-0.00112993;REVB=-0.00655565;RO=54;SAF=20;SAR=21;SRF=33;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124466;STB=0.557494;STBP=0.362;TYPE=snp;VARB=0.00135288;OID=.;OPOS=130311398;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:99:54:58:41:41:0.414141:21:20:33:21:21:20:34:24
chr3	130361856	.	G	A	588.54	PASS	AF=0.564356;AO=57;DP=101;FAO=57;FDP=101;FR=.;FRO=44;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=23;FSRR=21;FWDB=-0.00487108;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.142;QD=23.3085;RBI=0.00778293;REFB=0.00562041;REVB=-0.00607014;RO=43;SAF=32;SAR=25;SRF=22;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.039506;STB=0.517029;STBP=0.733;TYPE=snp;VARB=-0.00354025;OID=.;OPOS=130361856;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:101:43:44:57:57:0.564356:25:32:22:21:25:32:23:21
chr3	130368069	.	A	G	629.19	PASS	AF=0.954545;AO=42;DP=44;FAO=42;FDP=44;FR=.;FRO=2;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.010562;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.753;QD=57.1991;RBI=0.0342933;REFB=-0.0455459;REVB=0.0326263;RO=1;SAF=19;SAR=23;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.024064;STB=0.524988;STBP=0.165;TYPE=snp;VARB=0.00355401;OID=.;OPOS=130368069;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:44:44:1:2:42:42:0.954545:23:19:1:0:23:19:2:0
chr3	130395749	.	A	G	122.31	PASS	AF=0.293103;AO=17;DP=57;FAO=17;FDP=58;FR=.;FRO=41;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=-0.0146713;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.013;QD=8.43541;RBI=0.0274327;REFB=-0.0122911;REVB=0.0231798;RO=40;SAF=10;SAR=7;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132842;STB=0.571344;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.0288131;OID=.;OPOS=130395749;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:58:40:41:17:17:0.293103:7:10:19:21:7:10:20:21
chr3	130449222	.	A	G	157.56	PASS	AF=0.414634;AO=17;DP=42;FAO=17;FDP=41;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=-0.0224826;FXX=0.0238039;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.0942;QD=15.3718;RBI=0.031311;REFB=-0.00122771;REVB=0.0217925;RO=24;SAF=6;SAR=11;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0242255;STB=0.514002;STBP=0.901;TYPE=snp;VARB=0.00228514;OID=.;OPOS=130449222;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:41:24:24:17:17:0.414634:11:6:9:15:11:6:9:15
chr3	130449248	.	G	A	240.49	PASS	AF=0.511111;AO=23;DP=45;FAO=23;FDP=45;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=-0.0270302;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.8658;QD=21.3767;RBI=0.0389994;REFB=0.0146598;REVB=-0.0281126;RO=22;SAF=7;SAR=16;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102403;STB=0.557682;STBP=0.439;TYPE=snp;VARB=-0.0214186;OID=.;OPOS=130449248;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:22:22:23:23:0.511111:16:7:9:13:16:7:9:13
chr3	130718472	.	G	A	266.0	PASS	AF=0.367816;AO=31;DP=84;FAO=32;FDP=87;FR=.;FRO=55;FSAF=22;FSAR=10;FSRF=34;FSRR=21;FWDB=-0.0348345;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.5479;QD=12.2299;RBI=0.0406376;REFB=-0.00388919;REVB=0.0209279;RO=53;SAF=22;SAR=9;SRF=33;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109267;STB=0.549083;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.00973541;OID=.;OPOS=130718472;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:87:53:55:31:32:0.367816:9:22:33:20:10:22:34:21
chr3	130852185	.	TG	CA	323.47	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.01879;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=307.733;QD=53.9112;RBI=0.0193026;REFB=0;REVB=-0.00441866;RO=0;SAF=9;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=3.86682e-05;OID=.;OPOS=130852185;OREF=TG;OALT=CA;OMAPALT=CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:15:9:0:0:15:9:0:0
chr3	130947435	.	A	T	449.81	PASS	AF=0.581081;AO=43;DP=74;FAO=43;FDP=74;FR=.;FRO=31;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=8;FSRR=23;FWDB=0.0134056;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.178;QD=24.3142;RBI=0.0182735;REFB=-0.0235308;REVB=-0.0124182;RO=31;SAF=26;SAR=17;SRF=8;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.260827;STB=0.642704;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.0196457;OID=.;OPOS=130947435;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:31:31:43:43:0.581081:17:26:8:23:17:26:8:23
chr3	131136797	.	T	C	236.6	PASS	AF=0.45;AO=27;DP=60;FAO=27;FDP=60;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=-0.0155714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.194;QD=15.773;RBI=0.0156389;REFB=-0.015041;REVB=-0.00145178;RO=33;SAF=11;SAR=16;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0469799;STB=0.526562;STBP=0.752;TYPE=snp;VARB=0.0195722;OID=.;OPOS=131136797;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:33:33:27:27:0.45:16:11:15:18:16:11:15:18
chr3	131947937	.	A	G	298.82	PASS	AF=0.5;AO=32;DP=64;FAO=32;FDP=64;FR=.;FRO=32;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=21;FWDB=-0.0242385;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.1869;QD=18.6762;RBI=0.0479124;REFB=-0.00384751;REVB=-0.0413291;RO=32;SAF=20;SAR=12;SRF=11;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.250284;STB=0.639448;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.00223789;OID=.;OPOS=131947937;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:32:32:32:32:0.5:12:20:11:21:12:20:11:21
chr3	132218623	.	G	T	2375.25	PASS	AF=1;AO=148;DP=149;FAO=148;FDP=148;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00397214;FXX=0.00671096;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.632;QD=64.1959;RBI=0.0166287;REFB=0;REVB=0.0161473;RO=0;SAF=80;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.87518e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.2861e-05;OID=.;OPOS=132218623;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:149:148:0:0:148:148:1:68:80:0:0:68:80:0:0
chr3	132360883	.	C	T	1062.44	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00824996;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.217;QD=59.8558;RBI=0.0104602;REFB=0;REVB=-0.00643072;RO=0;SAF=37;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.12261e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.8268e-05;OID=.;OPOS=132360883;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:34:37:0:0:34:37:0:0
chr3	132401600	.	C	T	770.57	PASS	AF=0.982143;AO=55;DP=56;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0246357;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=69.4917;QD=55.0406;RBI=0.0260019;REFB=-0.115938;REVB=-0.00831741;RO=0;SAF=18;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.85968e-08;STB=0.513509;STBP=0.264;TYPE=snp;VARB=0.00203569;OID=.;OPOS=132401600;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:56:56:0:1:55:55:0.982143:37:18:0:0:37:18:1:0
chr3	132436967	.	A	G	52.6	PASS	AF=0.258065;AO=8;DP=31;FAO=8;FDP=31;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=0.00106005;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.797;QD=6.78755;RBI=0.0198451;REFB=-0.0156185;REVB=0.0198167;RO=23;SAF=6;SAR=2;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.412741;STB=0.761261;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.0262148;OID=.;OPOS=132436967;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:31:31:23:23:8:8:0.258065:2:6:9:14:2:6:9:14
chr3	133114893	.	C	T	729.0	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0160969;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.948;QD=57.1763;RBI=0.0202788;REFB=0;REVB=-0.0123338;RO=0;SAF=26;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94283e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.64952e-05;OID=.;OPOS=133114893;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:25:26:0:0:25:26:0:0
chr3	133119306	.	C	G	64.16	PASS	AF=0.3;AO=9;DP=31;FAO=9;FDP=30;FR=.;FRO=21;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=-0.0376487;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.3185;QD=8.5544;RBI=0.0427425;REFB=-0.00562737;REVB=-0.020236;RO=22;SAF=4;SAR=5;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0951184;STB=0.579982;STBP=0.592;TYPE=snp;VARB=0.00964978;OID=.;OPOS=133119306;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:31:30:22:21:9:9:0.3:5:4:8:14:5:4:7:14
chr3	133167363	.	G	A	340.69	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0105032;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.039;QD=54.5103;RBI=0.0113914;REFB=0;REVB=-0.00440992;RO=0;SAF=17;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000121681;OID=.;OPOS=133167363;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:8:17:0:0:8:17:0:0
chr3	133329943	.	G	A	1167.5	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000491518;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.871;QD=60.6494;RBI=0.0256084;REFB=0;REVB=0.0256037;RO=0;SAF=37;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.70493e-05;OID=.;OPOS=133329943;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:77:0:0:75:77:1:38:37:0:0:39:38:0:0
chr3	133368362	.	T	G	1377.52	PASS	AF=1;AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0171108;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.727;QD=62.6144;RBI=0.0360059;REFB=0;REVB=0.0316803;RO=0;SAF=38;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.49151e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.0116e-05;OID=.;OPOS=133368362;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:88:88:0:0:88:88:1:50:38:0:0:50:38:0:0
chr3	133465283	.	A	G	1843.34	PASS	AF=0.991803;AO=121;DP=122;FAO=121;FDP=122;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=76;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0397063;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.0381;QD=60.4375;RBI=0.0627181;REFB=-0.0239616;REVB=-0.0485486;RO=1;SAF=45;SAR=76;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0104389;STB=0.505494;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=0.000773776;OID=.;OPOS=133465283;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:122:122:1:1:121:121:0.991803:76:45:1:0:76:45:1:0
chr3	133474328	.	G	A	1036.15	PASS	AF=0.972603;AO=71;DP=73;FAO=71;FDP=73;FR=.;FRO=2;FSAF=29;FSAR=42;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0221545;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=201.901;QD=56.7752;RBI=0.0224752;REFB=-0.0336195;REVB=0.00378339;RO=2;SAF=29;SAR=42;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00490053;STB=0.502592;STBP=0.855;TYPE=snp;VARB=0.000671811;OID=.;OPOS=133474328;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:73:73:2:2:71:71:0.972603:42:29:1:1:42:29:1:1
chr3	133475722	.	C	T	390.2	PASS	AF=0.487805;AO=41;DP=82;FAO=40;FDP=82;FR=.;FRO=42;FSAF=26;FSAR=14;FSRF=25;FSRR=17;FWDB=-0.00425058;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.451;QD=19.0342;RBI=0.0133146;REFB=-0.00115609;REVB=-0.0126178;RO=41;SAF=27;SAR=14;SRF=24;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0712669;STB=0.530248;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=0.0012211;OID=.;OPOS=133475722;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:41:42:41:40:0.487805:14:27:24:17:14:26:25:17
chr3	133483696	.	T	C	291.43	PASS	AF=0.463768;AO=32;DP=69;FAO=32;FDP=69;FR=.;FRO=37;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=24;FWDB=-0.0121943;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=262.589;QD=16.8946;RBI=0.0186728;REFB=-0.0080381;REVB=-0.0141411;RO=36;SAF=20;SAR=12;SRF=13;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.247488;STB=0.645072;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.00806216;OID=.;OPOS=133483696;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:36:37:32:32:0.463768:12:20:13:23:12:20:13:24
chr3	133485133	.	A	G	920.03	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0252755;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.2181;QD=58.4145;RBI=0.0465473;REFB=0;REVB=0.0390871;RO=0;SAF=40;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000318681;OID=.;OPOS=133485133;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:23:40:0:0:23:40:0:0
chr3	133547245	.	G	A	46.38	PASS	AF=0.368421;AO=7;DP=19;FAO=7;FDP=19;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.0136424;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.2171;QD=9.76485;RBI=0.0150964;REFB=-0.00519441;REVB=0.0064642;RO=11;SAF=4;SAR=3;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0263346;STB=0.50767;STBP=0.995;TYPE=snp;VARB=0.0135281;OID=.;OPOS=133547245;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:19:19:11:12:7:7:0.368421:3:4:6:5:3:4:7:5
chr3	133547692	.	G	A	477.04	PASS	AF=0.534884;AO=45;DP=85;FAO=46;FDP=86;FR=.;FRO=40;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=23;FSRR=17;FWDB=0.0242534;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.108;QD=22.188;RBI=0.0309548;REFB=-0.0349499;REVB=0.0192345;RO=40;SAF=25;SAR=20;SRF=23;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0168247;STB=0.514805;STBP=0.782;TYPE=snp;VARB=0.0350573;OID=.;OPOS=133547692;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:86:40:40:45:46:0.534884:20:25:23:17:21:25:23:17
chr3	133666209	.	C	T	329.73	PASS	AF=0.428571;AO=35;DP=83;FAO=36;FDP=84;FR=.;FRO=48;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=27;FWDB=-0.0105999;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.08;QD=15.7015;RBI=0.011824;REFB=0.00426954;REVB=0.00523913;RO=46;SAF=20;SAR=15;SRF=20;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137344;STB=0.567245;STBP=0.288;TYPE=snp;VARB=-0.0063423;OID=.;OPOS=133666209;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:84:46:48:35:36:0.428571:15:20:20:26:16:20:21:27
chr3	133670073	.	T	C	270.01	PASS	AF=0.537037;AO=26;DP=52;FAO=29;FDP=54;FR=.;FRO=25;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=0.00783505;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.946;QD=20.0004;RBI=0.0418835;REFB=-0.0173793;REVB=0.0411441;RO=25;SAF=14;SAR=12;SRF=8;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189848;STB=0.575785;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=0.0114688;OID=.;OPOS=133670073;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:54:25:25:26:29:0.537037:12:14:8:17:15:14:8:17
chr3	133698349	.	C	T	729.0	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0262872;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=266.617;QD=57.1768;RBI=0.0326132;REFB=0;REVB=0.019303;RO=0;SAF=22;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.60024e-05;OID=.;OPOS=133698349;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:29:22:0:0:29:22:0:0
chr3	133941320	.	C	T	818.02	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0396053;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.0762;QD=57.4046;RBI=0.04438;REFB=0;REVB=0.0200249;RO=0;SAF=26;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.29784e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000353401;OID=.;OPOS=133941320;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:56:57:0:0:56:57:1:30:26:0:0:31:26:0:0
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chr3	134075522	.	A	G	1194.31	PASS	AF=0.9875;AO=79;DP=80;FAO=79;FDP=80;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0152933;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=178.926;QD=59.7154;RBI=0.0198226;REFB=0.0377352;REVB=-0.0126115;RO=1;SAF=43;SAR=36;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0129683;STB=0.506848;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=-0.000861089;OID=.;OPOS=134075522;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:80:80:1:1:79:79:0.9875:36:43:0:1:36:43:0:1
chr3	134077470	.	C	G	1834.01	PASS	AF=0.99187;AO=121;DP=123;FAO=122;FDP=123;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0283804;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=217.446;QD=59.6426;RBI=0.0292404;REFB=-0.0250231;REVB=0.00703932;RO=2;SAF=44;SAR=77;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00454385;STB=0.503225;STBP=0.491;TYPE=snp;VARB=0.000520062;OID=.;OPOS=134077470;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:123:123:2:1:121:122:0.99187:77:44:1:1:77:45:0:1
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chr3	134280395	.	T	A	1008.48	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00410918;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.596;QD=59.3226;RBI=0.00415067;REFB=0;REVB=-0.000585416;RO=0;SAF=40;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.10773e-06;OID=.;OPOS=134280395;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:28:40:0:0:28:40:0:0
chr3	134322163	.	C	A	290.66	PASS	AF=0.545455;AO=30;DP=57;FAO=30;FDP=55;FR=.;FRO=25;FSAF=21;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=7;FWDB=-0.00172755;FXX=0.0517152;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.428;QD=21.1386;RBI=0.0029827;REFB=0.0144482;REVB=0.00243147;RO=27;SAF=21;SAR=9;SRF=18;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0332289;STB=0.51091;STBP=0.907;TYPE=snp;VARB=-0.011445;OID=.;OPOS=134322163;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:55:27:25:30:30:0.545455:9:21:18:9:9:21:18:7
chr3	134322742	.	A	G	173.73	PASS	AF=0.388889;AO=21;DP=54;FAO=21;FDP=54;FR=.;FRO=33;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=-0.00825114;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.396;QD=12.869;RBI=0.0191266;REFB=0.00879861;REVB=0.0172553;RO=33;SAF=7;SAR=14;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199123;STB=0.615272;STBP=0.194;TYPE=snp;VARB=-0.0201464;OID=.;OPOS=134322742;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:33:33:21:21:0.388889:14:7:17:16:14:7:17:16
chr3	134322814	.	G	C	345.87	PASS	AF=0.756757;AO=28;DP=38;FAO=28;FDP=37;FR=.;FRO=9;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.0104047;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.882;QD=37.3909;RBI=0.0286847;REFB=0.00556108;REVB=0.0267312;RO=10;SAF=15;SAR=13;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0655393;STB=0.522228;STBP=0.654;TYPE=snp;VARB=-0.00143031;OID=.;OPOS=134322814;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:38:37:10:9:28:28:0.756757:13:15:4:6:13:15:4:5
chr3	134323156	.	A	G	850.97	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0066255;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=66.2926;QD=57.6931;RBI=0.00818979;REFB=0;REVB=-0.00481407;RO=0;SAF=34;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.03209e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.27346e-05;OID=.;OPOS=134323156;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:25:34:0:0:25:34:0:0
chr3	134499419	.	G	A	300.12	PASS	AF=0.55102;AO=27;DP=49;FAO=27;FDP=49;FR=.;FRO=22;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=-0.016598;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.3198;QD=24.4999;RBI=0.037559;REFB=0.0118446;REVB=-0.0336924;RO=21;SAF=15;SAR=12;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0898238;STB=0.558098;STBP=0.445;TYPE=snp;VARB=-0.0110174;OID=.;OPOS=134499419;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:21:22:27:27:0.55102:12:15:14:7:12:15:15:7
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chr3	136667405	.	T	C	324.84	PASS	AF=0.460526;AO=35;DP=77;FAO=35;FDP=76;FR=.;FRO=41;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=26;FWDB=-0.00315903;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.6395;QD=17.097;RBI=0.00441427;REFB=-0.0153195;REVB=0.00308322;RO=41;SAF=15;SAR=20;SRF=15;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0622938;STB=0.534864;STBP=0.592;TYPE=snp;VARB=0.0505086;OID=.;OPOS=136667405;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:76:41:41:35:35:0.460526:20:15:15:26:20:15:15:26
chr3	137786442	.	T	C	131.91	PASS	AF=0.416667;AO=14;DP=36;FAO=15;FDP=36;FR=.,HEALED;FRO=21;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=-0.0409738;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.029;QD=14.657;RBI=0.0411022;REFB=-0.0104171;REVB=0.00324726;RO=16;SAF=7;SAR=7;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.560805;STBP=0.559;TYPE=snp;VARB=0.0133088;OID=.;OPOS=137786442;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:16:21:14:15:0.416667:7:7:8:8:8:7:12:9
chr3	137787047	.	C	T	243.1	PASS	AF=0.534884;AO=23;DP=43;FAO=23;FDP=43;FR=.;FRO=20;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.010056;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.216;QD=22.6144;RBI=0.0101235;REFB=0.00485677;REVB=0.00116655;RO=19;SAF=16;SAR=7;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150556;STB=0.575213;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=-0.00365114;OID=.;OPOS=137787047;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:19:20:23:23:0.534884:7:16:10:9:7:16:11:9
chr3	137787192	.	T	C	276.22	PASS	AF=0.449275;AO=31;DP=70;FAO=31;FDP=69;FR=.;FRO=38;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=15;FSRR=23;FWDB=-0.0258819;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.2931;QD=16.0129;RBI=0.0262796;REFB=-0.0522527;REVB=0.00455476;RO=38;SAF=12;SAR=19;SRF=15;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00784954;STB=0.504422;STBP=0.946;TYPE=snp;VARB=0.0630639;OID=.;OPOS=137787192;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:69:38:38:31:31:0.449275:19:12:15:23:19:12:15:23
chr3	137787963	.	T	G	400.24	PASS	AF=0.435644;AO=44;DP=101;FAO=44;FDP=101;FR=.;FRO=57;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=35;FSRR=22;FWDB=0.00439384;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.318;QD=15.8509;RBI=0.0049013;REFB=-0.000185493;REVB=-0.00217184;RO=57;SAF=25;SAR=19;SRF=35;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0473605;STB=0.526547;STBP=0.653;TYPE=snp;VARB=0.000255845;OID=.;OPOS=137787963;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:101:57:57:44:44:0.435644:19:25:35:22:19:25:35:22
chr3	137807259	.	G	A	574.36	PASS	AF=0.535354;AO=53;DP=99;FAO=53;FDP=99;FR=.;FRO=46;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=29;FSRR=17;FWDB=-0.0295666;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.74;QD=23.2065;RBI=0.035875;REFB=-0.0257134;REVB=0.0203184;RO=46;SAF=24;SAR=29;SRF=29;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149176;STB=0.581946;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=0.0260536;OID=.;OPOS=137807259;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:46:46:53:53:0.535354:29:24:29:17:29:24:29:17
chr3	137843106	.	T	C	456.25	PASS	AF=0.916667;AO=33;DP=36;FAO=33;FDP=36;FR=.;FRO=3;FSAF=22;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.00701096;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=300.959;QD=50.6939;RBI=0.00789427;REFB=-0.0377683;REVB=0.00362849;RO=3;SAF=22;SAR=11;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111588;STB=0.559963;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=0.002104;OID=.;OPOS=137843106;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:36:36:3:3:33:33:0.916667:11:22:0:3:11:22:0:3
chr3	137843476	.	G	T	537.51	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00475354;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.0615;QD=59.7232;RBI=0.0230082;REFB=0;REVB=0.0225118;RO=0;SAF=20;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000106516;OID=.;OPOS=137843476;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:36:0:0:35:36:1:15:20:0:0:15:21:0:0
chr3	137850003	.	A	G	310.61	PASS	AF=0.584906;AO=31;DP=53;FAO=31;FDP=53;FR=.;FRO=22;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=-0.033302;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=132.275;QD=23.4423;RBI=0.0338618;REFB=-0.023362;REVB=0.00613181;RO=21;SAF=19;SAR=12;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171378;STB=0.603845;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.0175831;OID=.;OPOS=137850003;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:21:22:31:31:0.584906:12:19:8:13:12:19:8:14
chr3	137881265	.	T	A	82.32	PASS	AF=0.588235;AO=9;DP=17;FAO=10;FDP=17;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.00163237;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=290.182;QD=19.3688;RBI=0.00196775;REFB=-0.00129827;REVB=0.00109882;RO=7;SAF=2;SAR=7;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.193732;STB=0.559875;STBP=0.598;TYPE=snp;VARB=0.00083963;OID=.;OPOS=137881265;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:17:17:7:7:9:10:0.588235:7:2:3:4:7:3:3:4
chr3	138033181	.	C	T	613.31	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0920737;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.1551;QD=61.3305;RBI=0.0937172;REFB=0;REVB=-0.017474;RO=0;SAF=19;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00121072;OID=.;OPOS=138033181;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:21:19:0:0:21:19:0:0
chr3	138187568	.	C	T	3129.11	PASS	AF=0.990338;AO=205;DP=207;FAO=205;FDP=207;FR=.;FRO=2;FSAF=111;FSAR=94;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0279482;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.646;QD=60.4659;RBI=0.0289255;REFB=-0.0865294;REVB=-0.00745533;RO=2;SAF=111;SAR=94;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0100257;STB=0.505263;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=-0.000115762;OID=.;OPOS=138187568;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:207:207:2:2:205:205:0.990338:94:111:0:2:94:111:0:2
chr3	138191232	.	G	A	137.88	PASS	AF=0.517241;AO=15;DP=29;FAO=15;FDP=29;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=-0.00882283;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=269.622;QD=19.0179;RBI=0.0184493;REFB=-0.0210993;REVB=-0.0162029;RO=14;SAF=3;SAR=12;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.247399;STB=0.642646;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.0269414;OID=.;OPOS=138191232;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:14:14:15:15:0.517241:12:3:6:8:12:3:6:8
chr3	138191448	.	A	T	404.01	PASS	AF=0.482353;AO=40;DP=84;FAO=41;FDP=85;FR=.;FRO=44;FSAF=27;FSAR=14;FSRF=29;FSRR=15;FWDB=0.0584683;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.88;QD=19.0121;RBI=0.0604767;REFB=-0.0191526;REVB=-0.015456;RO=44;SAF=27;SAR=13;SRF=29;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0169006;STB=0.500319;STBP=0.987;TYPE=snp;VARB=0.0274549;OID=.;OPOS=138191448;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:85:44:44:40:41:0.482353:13:27:29:15:14:27:29:15
chr3	138218994	.	T	C	750.97	PASS	AF=0.503448;AO=73;DP=145;FAO=73;FDP=145;FR=.;FRO=72;FSAF=38;FSAR=35;FSRF=39;FSRR=33;FWDB=0.0124941;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.2565;QD=20.7164;RBI=0.0415633;REFB=-0.0286632;REVB=-0.039641;RO=72;SAF=38;SAR=35;SRF=39;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.019092;STB=0.510511;STBP=0.802;TYPE=snp;VARB=0.0258796;OID=.;OPOS=138218994;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:145:145:72:72:73:73:0.503448:35:38:39:33:35:38:39:33
chr3	138219315	.	C	T	441.61	PASS	AF=0.428571;AO=45;DP=113;FAO=51;FDP=119;FR=.;FRO=68;FSAF=28;FSAR=23;FSRF=35;FSRR=33;FWDB=-0.0124606;FXX=0.00833264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.097;QD=14.8439;RBI=0.0235873;REFB=-0.020097;REVB=0.0200273;RO=63;SAF=28;SAR=17;SRF=32;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121386;STB=0.519714;STBP=0.716;TYPE=snp;VARB=0.0219247;OID=.;OPOS=138219315;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:119:63:68:45:51:0.428571:17:28:32:31:23:28:35:33
chr3	138289163	.	T	C	187.5	PASS	AF=0.463415;AO=19;DP=43;FAO=19;FDP=41;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=5;FWDB=0.00450462;FXX=0.0465008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.341;QD=18.2924;RBI=0.0420972;REFB=-0.00423826;REVB=0.0418555;RO=22;SAF=9;SAR=10;SRF=17;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.280577;STB=0.658075;STBP=0.098;TYPE=snp;VARB=0.0108738;OID=.;OPOS=138289163;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:41:22:22:19:19:0.463415:10:9:17:5:10:9:17:5
chr3	138289221	.	C	T	1356.45	PASS	AF=1;AO=84;DP=84;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0154716;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.5702;QD=62.3655;RBI=0.0159113;REFB=0;REVB=-0.00371464;RO=0;SAF=51;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.09613e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.3292e-05;OID=.;OPOS=138289221;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:87:0:0:84:87:1:33:51:0:0:33:54:0:0
chr3	138329862	.	G	A	1026.4	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0226526;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.555;QD=59.5017;RBI=0.0337948;REFB=0;REVB=0.0250789;RO=0;SAF=38;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.83134e-06;OID=.;OPOS=138329862;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:31:38:0:0:31:38:0:0
chr3	138724757	.	C	G	207.18	PASS	AF=0.588235;AO=20;DP=34;FAO=20;FDP=34;FR=.;FRO=14;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.00174071;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.8745;QD=24.374;RBI=0.102547;REFB=-0.00795135;REVB=0.102533;RO=14;SAF=9;SAR=11;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0895656;STB=0.54995;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.00834426;OID=.;OPOS=138724757;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:14:14:20:20:0.588235:11:9:8:6:11:9:8:6
chr3	138739617	.	A	G	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0338322;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.157;QD=33.4279;RBI=0.0515003;REFB=0;REVB=0.0388287;RO=0;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000872911;OID=.;OPOS=138739617;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:4:2:0:0:4:2:0:0
chr3	138739686	.	C	T	47.68	PASS	AF=0.4375;AO=7;DP=16;FAO=7;FDP=16;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.00300965;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.9127;QD=11.9195;RBI=0.0229079;REFB=0.0231463;REVB=-0.0227093;RO=9;SAF=3;SAR=4;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118071;STB=0.571224;STBP=0.714;TYPE=snp;VARB=-0.0240976;OID=.;OPOS=138739686;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:16:16:9:9:7:7:0.4375:4:3:5:4:4:3:5:4
chr3	138762707	.	C	G	412.65	PASS	AF=0.477273;AO=41;DP=87;FAO=42;FDP=88;FR=.;FRO=46;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=28;FSRR=18;FWDB=-0.0098931;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.786;QD=18.757;RBI=0.00990772;REFB=-0.000867946;REVB=0.000538013;RO=43;SAF=22;SAR=19;SRF=26;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0633454;STB=0.544641;STBP=0.442;TYPE=snp;VARB=0.000662717;OID=.;OPOS=138762707;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:88:43:46:41:42:0.477273:19:22:26:17:20:22:28:18
chr3	138763627	.	GTGCTGCTGCT	GTGCTGCT,GTGCTGCTG	1445.5	PASS	AF=0.958333,0.0416667;AO=74,13;DP=97;FAO=92,4;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=51,0;FSAR=41,4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0146026,0.0113757;FXX=0.0103082;HRUN=1,1;LEN=3,2;MLLD=256.394,248.289;QD=60.2293;RBI=0.0641849,0.0622764;REFB=0,0;REVB=0.0625017,0.0612286;RO=0;SAF=40,5;SAR=34,8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-3.60098e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=-0.00101424,0.0046146;OID=.,.;OPOS=138763628,138763636;OREF=TGC,CT;OALT=-,-;OMAPALT=GTGCTGCT,GTGCTGCTG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.958333,0.0416667:74,13:97:92,4:96:0:51,0:41,4:0:0:6:0:40,5:34,8:0:0
chr3	139102120	.	C	A	805.3	PASS	AF=1;AO=55;DP=56;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.010416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.559;QD=56.5123;RBI=0.0290999;REFB=0;REVB=0.0271719;RO=0;SAF=32;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.49259e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000570358;OID=.;OPOS=139102120;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:57:0:0:55:57:1:23:32:0:0:25:32:0:0
chr3	139303248	.	G	A	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0147813;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.784;QD=52.6131;RBI=0.0178908;REFB=0;REVB=0.0100794;RO=0;SAF=12;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.68329e-05;OID=.;OPOS=139303248;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:10:12:0:0:10:12:0:0
chr3	139328739	.	C	T	263.0	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0280378;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.7124;QD=50.096;RBI=0.0417008;REFB=0;REVB=0.0308682;RO=0;SAF=13;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00552012;OID=.;OPOS=139328739;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:21:0:0:20:21:1:7:13:0:0:7:14:0:0
chr3	140167536	.	A	G	1229.59	PASS	AF=0.964706;AO=82;DP=85;FAO=82;FDP=85;FR=.;FRO=3;FSAF=37;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.00406886;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=287.814;QD=57.863;RBI=0.00583889;REFB=-0.227457;REVB=-0.00418773;RO=3;SAF=37;SAR=45;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0305258;STB=0.516125;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=0.000524956;OID=.;OPOS=140167536;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:85:85:3:3:82:82:0.964706:45:37:0:3:45:37:0:3
chr3	140185549	.	G	A	257.31	PASS	AF=0.344444;AO=31;DP=89;FAO=31;FDP=90;FR=.;FRO=59;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=28;FSRR=31;FWDB=0.0087878;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.04;QD=11.436;RBI=0.0109602;REFB=5.14171e-06;REVB=0.00654993;RO=58;SAF=13;SAR=18;SRF=27;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0528375;STB=0.536703;STBP=0.595;TYPE=snp;VARB=-6.18523e-06;OID=.;OPOS=140185549;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:90:58:59:31:31:0.344444:18:13:27:31:18:13:28:31
chr3	140401693	.	A	G	323.46	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0796568;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.6499;QD=53.9099;RBI=0.0801057;REFB=0;REVB=-0.00846855;RO=0;SAF=15;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00210197;OID=.;OPOS=140401693;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:24:0:0:23:24:1:8:15:0:0:9:15:0:0
chr3	140406947	.	G	A	501.66	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00396707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.549;QD=59.0186;RBI=0.0255905;REFB=0;REVB=0.0252811;RO=0;SAF=21;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.7196e-05;OID=.;OPOS=140406947;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:13:21:0:0:13:21:0:0
chr3	140407260	.	C	A	207.12	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.139525;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.283;QD=48.735;RBI=0.141213;REFB=0;REVB=0.021767;RO=0;SAF=9;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00219768;OID=.;OPOS=140407260;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:8:9:0:0:8:9:0:0
chr3	140695332	.	C	T	154.83	PASS	AF=0.386364;AO=17;DP=45;FAO=17;FDP=44;FR=.;FRO=27;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=0.00493626;FXX=0.0222173;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.381;QD=14.0756;RBI=0.0172893;REFB=0.00293858;REVB=0.0165696;RO=27;SAF=14;SAR=3;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.272859;STB=0.661602;STBP=0.137;TYPE=snp;VARB=-0.00508411;OID=.;OPOS=140695332;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:44:27:27:17:17:0.386364:3:14:17:10:3:14:17:10
chr3	140697301	.	T	C	123.79	PASS	AF=0.298246;AO=17;DP=57;FAO=17;FDP=57;FR=.;FRO=40;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=0.0402273;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.12;QD=8.68681;RBI=0.0402519;REFB=-0.0269287;REVB=-0.00140898;RO=40;SAF=12;SAR=5;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.278901;STB=0.667891;STBP=0.11;TYPE=snp;VARB=0.0468785;OID=.;OPOS=140697301;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:40:40:17:17:0.298246:5:12:19:21:5:12:19:21
chr3	140785175	.	C	A	82.07	PASS	AF=0.9;AO=9;DP=10;FAO=9;FDP=10;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0631264;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.869;QD=32.8295;RBI=0.0778184;REFB=-0.0931723;REVB=0.0455057;RO=1;SAF=6;SAR=3;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126211;STB=0.571265;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=0.0119452;OID=.;OPOS=140785175;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:10:10:1:1:9:9:0.9:3:6:0:1:3:6:0:1
chr3	141011630	.	C	T	199.92	PASS	AF=0.633333;AO=19;DP=29;FAO=19;FDP=30;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.0275631;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.8695;QD=26.6556;RBI=0.0288122;REFB=-0.00291925;REVB=0.00839141;RO=10;SAF=5;SAR=14;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171452;STB=0.583241;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=0.00111282;OID=.;OPOS=141011630;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:29:30:10:11:19:19:0.633333:14:5:5:5:14:5:5:6
chr3	142030227	.	GAA	G	81.7	PASS	AF=0.555556;AO=9;DP=19;FAO=10;FDP=18;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=-0.128525;FXX=0.0526039;HRUN=7;LEN=2;MLLD=28.5107;QD=18.1563;RBI=0.132228;REFB=0.063922;REVB=-0.0310731;RO=7;SAF=3;SAR=6;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0779006;STB=0.511605;STBP=0.967;TYPE=del;VARB=-0.0514984;OID=.;OPOS=142030228;OREF=AA;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.555556:9:19:10:18:8:4:6:3:5:57:7:3:6:3:4
chr3	142078759	.	C	T	179.7	PASS	AF=0.413043;AO=19;DP=46;FAO=19;FDP=46;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=20;FWDB=-0.0287109;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.2679;QD=15.6258;RBI=0.0398905;REFB=0.010602;REVB=-0.0276935;RO=27;SAF=12;SAR=7;SRF=7;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.366343;STB=0.708768;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=-0.0139353;OID=.;OPOS=142078759;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:27:27:19:19:0.413043:7:12:7:20:7:12:7:20
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chr3	142168331	.	C	T	1011.87	PASS	AF=0.985714;AO=69;DP=70;FAO=69;FDP=70;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0407291;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.3014;QD=57.8214;RBI=0.065348;REFB=0.0180514;REVB=0.0511028;RO=1;SAF=36;SAR=33;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129508;STB=0.506847;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=-0.000307334;OID=.;OPOS=142168331;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:70:70:1:1:69:69:0.985714:33:36:1:0:33:36:1:0
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chr3	142277575	.	A	T	493.88	PASS	AF=0.50495;AO=51;DP=102;FAO=51;FDP=101;FR=.;FRO=50;FSAF=20;FSAR=31;FSRF=27;FSRR=23;FWDB=0.00596659;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.343;QD=19.5596;RBI=0.0136998;REFB=-0.00993195;REVB=-0.0123322;RO=49;SAF=20;SAR=31;SRF=26;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124813;STB=0.574271;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=0.0111615;OID=.;OPOS=142277575;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:101:49:50:51:51:0.50495:31:20:26:23:31:20:27:23
chr3	142281612	.	A	G	158.05	PASS	AF=0.64;AO=16;DP=25;FAO=16;FDP=25;FR=.;FRO=9;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=0.0077919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.442;QD=25.2873;RBI=0.0143466;REFB=0.0393219;REVB=0.0120462;RO=9;SAF=7;SAR=9;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.216343;STB=0.620543;STBP=0.124;TYPE=snp;VARB=-0.00765454;OID=.;OPOS=142281612;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:25:25:9:9:16:16:0.64:9:7:7:2:9:7:7:2
chr3	142392596	.	T	TC	474.01	PASS	AF=1;AO=46;DP=53;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.111738;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=16.7787;QD=39.5005;RBI=0.150702;REFB=0;REVB=-0.101123;RO=7;SAF=25;SAR=21;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0426842;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.0049922;OID=.;OPOS=142392597;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:46:53:48:48:0:25:23:0:0:9:7:25:21:5:2
chr3	142408606	.	G	A	1284.13	PASS	AF=1;AO=82;DP=82;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000593452;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.536;QD=61.8857;RBI=0.0014181;REFB=0;REVB=0.00128795;RO=0;SAF=50;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.71312e-07;OID=.;OPOS=142408606;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:83:0:0:82:83:1:32:50:0:0:33:50:0:0
chr3	142503605	.	G	A	2773.56	PASS	AF=1;AO=177;DP=178;FAO=178;FDP=178;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=99;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0105951;FXX=0.00558628;HRUN=3;LEN=1;MLLD=189.197;QD=62.3272;RBI=0.0182547;REFB=-0.00322676;REVB=0.0148654;RO=1;SAF=79;SAR=98;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00483303;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.15915e-05;OID=.;OPOS=142503605;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:178:178:1:0:177:178:1:98:79:0:1:99:79:0:0
chr3	142523349	.	G	A	1357.61	PASS	AF=1;AO=85;DP=89;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00913015;FXX=0.0224694;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.109;QD=62.4187;RBI=0.00924884;REFB=0;REVB=0.00147696;RO=0;SAF=38;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.83693e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.29066e-05;OID=.;OPOS=142523349;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:89:87:0:0:85:87:1:47:38:0:0:49:38:0:0
chr3	142524858	.	G	A	1234.04	PASS	AF=0.893204;AO=93;DP=103;FAO=92;FDP=103;FR=.;FRO=11;FSAF=53;FSAR=39;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=0.00706309;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.5726;QD=47.924;RBI=0.00740069;REFB=0.00504481;REVB=-0.00220972;RO=10;SAF=54;SAR=39;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0225595;STB=0.516609;STBP=0.348;TYPE=snp;VARB=-0.00589468;OID=.;OPOS=142524858;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:103:103:10:11:93:92:0.893204:39:54:7:3:39:53:8:3
chr3	142670616	.	A	G	246.94	PASS	AF=0.509804;AO=26;DP=52;FAO=26;FDP=51;FR=.;FRO=25;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=0.0145538;FXX=0.0192271;HRUN=4;LEN=1;MLLD=217.791;QD=19.3678;RBI=0.014891;REFB=-0.00788886;REVB=0.00315097;RO=24;SAF=15;SAR=11;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172453;STB=0.605301;STBP=0.134;TYPE=snp;VARB=0.00879824;OID=.;OPOS=142670616;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:51:24:25:26:26:0.509804:11:15:9:15:11:15:9:16
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chr3	142681642	.	G	A	318.78	PASS	AF=0.432099;AO=35;DP=81;FAO=35;FDP=81;FR=.;FRO=46;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=21;FSRR=25;FWDB=-0.00172712;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.763;QD=15.7422;RBI=0.0276639;REFB=-0.0135149;REVB=0.02761;RO=43;SAF=13;SAR=22;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0954798;STB=0.550375;STBP=0.453;TYPE=snp;VARB=0.0167899;OID=.;OPOS=142681642;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:43:46:35:35:0.432099:22:13:20:23:22:13:21:25
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chr3	143692018	.	C	G	152.68	PASS	AF=0.361702;AO=17;DP=48;FAO=17;FDP=47;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=20;FSRR=10;FWDB=0.0295802;FXX=0.020829;HRUN=4;LEN=1;MLLD=49.8296;QD=12.9938;RBI=0.0542466;REFB=0.00478699;REVB=-0.045472;RO=30;SAF=11;SAR=6;SRF=20;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0235913;STB=0.513796;STBP=0.876;TYPE=snp;VARB=-0.00912391;OID=.;OPOS=143692018;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:47:30:30:17:17:0.361702:6:11:20:10:6:11:20:10
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chr3	145803142	.	T	A	76.15	PASS	AF=0.4;AO=10;DP=25;FAO=10;FDP=25;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=-0.0145847;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=262.733;QD=12.184;RBI=0.0384836;REFB=-0.00789934;REVB=-0.0356128;RO=15;SAF=7;SAR=3;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.03914;STB=0.523317;STBP=0.863;TYPE=snp;VARB=0.0109567;OID=.;OPOS=145803142;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:25:25:15:15:10:10:0.4:3:7:10:5:3:7:10:5
chr3	146177815	.	C	T	330.89	PASS	AF=0.433735;AO=36;DP=83;FAO=36;FDP=83;FR=.;FRO=47;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=23;FSRR=24;FWDB=0.00643812;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.3508;QD=15.9464;RBI=0.0558432;REFB=-0.00547541;REVB=-0.0554708;RO=47;SAF=15;SAR=21;SRF=23;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0740171;STB=0.541728;STBP=0.555;TYPE=snp;VARB=0.00597101;OID=.;OPOS=146177815;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:47:47:36:36:0.433735:21:15:23:24:21:15:23:24
chr3	146289323	.	T	C	431.92	PASS	AF=1;AO=26;DP=31;FAO=30;FDP=30;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0209007;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.0916;QD=57.5891;RBI=0.0468824;REFB=0;REVB=0.0419657;RO=0;SAF=12;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00456891;OID=.;OPOS=146289323;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:30:0:0:26:30:1:14:12:0:0:16:14:0:0
chr3	147131716	.	CTTA	CT,CTA	99.21	PASS	AF=0.619048,0.047619;AO=7,6;DP=22;FAO=13,1;FDP=21;FR=.;FRO=7;FSAF=12,1;FSAR=1,0;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=-0.153206,-0.128069;FXX=0.0454339;HRUN=2,2;LEN=2,1;MLLD=25.1775,12.0684;QD=18.8977;RBI=0.176697,0.191478;REFB=-0.0690067,-0.110453;REVB=0.0880322,0.142344;RO=6;SAF=7,6;SAR=0,0;SRF=0;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.831619,0.826071;STB=0.865292,0.994993;STBP=0.001,0.123;TYPE=del,del;VARB=0.0329852,0.0260046;OID=.,.;OPOS=147131718,147131717;OREF=TA,T;OALT=-,-;OMAPALT=CT,CTA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.619048,0.047619:7,6:22:13,1:21:7:12,1:1,0:1:6:42:6:7,6:0,0:0:6
chr3	148459395	.	C	T	284.91	PASS	AF=0.541667;AO=25;DP=47;FAO=26;FDP=48;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.0178207;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.9742;QD=23.7422;RBI=0.0622865;REFB=0.00531915;REVB=0.0596828;RO=22;SAF=9;SAR=16;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159844;STB=0.594925;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=-0.00365887;OID=.;OPOS=148459395;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:48:22:22:25:26:0.541667:16:9:12:10:17:9:12:10
chr3	148460467	.	C	A	2667.46	PASS	AF=1;AO=172;DP=173;FAO=173;FDP=173;FR=.;FRO=0;FSAF=101;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00101634;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.168;QD=61.6754;RBI=0.01631;REFB=0;REVB=0.0162783;RO=0;SAF=101;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.7627e-05;OID=.;OPOS=148460467;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:173:173:0:0:172:173:1:71:101:0:0:72:101:0:0
chr3	148562310	.	G	A	155.23	PASS	AF=0.313433;AO=21;DP=67;FAO=21;FDP=67;FR=.;FRO=46;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=28;FWDB=-0.00433677;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.179;QD=9.26725;RBI=0.0361632;REFB=-0.00187957;REVB=0.0359022;RO=46;SAF=12;SAR=9;SRF=18;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206756;STB=0.621736;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=0.00359477;OID=.;OPOS=148562310;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:46:46:21:21:0.313433:9:12:18:28:9:12:18:28
chr3	148597612	.	C	T	1208.95	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00908873;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.414;QD=61.2126;RBI=0.0131257;REFB=0;REVB=-0.00946992;RO=0;SAF=34;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.40017e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.76064e-05;OID=.;OPOS=148597612;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:45:34:0:0:45:34:0:0
chr3	148759325	.	T	C	171.26	PASS	AF=0.381818;AO=21;DP=55;FAO=21;FDP=55;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=20;FWDB=0.0355609;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.7688;QD=12.4555;RBI=0.0358173;REFB=-0.0101385;REVB=-0.00427824;RO=34;SAF=11;SAR=10;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119403;STB=0.568901;STBP=0.426;TYPE=snp;VARB=0.0186805;OID=.;OPOS=148759325;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:34:34:21:21:0.381818:10:11:14:20:10:11:14:20
chr3	148786108	.	C	T	754.43	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0174989;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.214;QD=56.9381;RBI=0.0231632;REFB=0;REVB=-0.0151764;RO=0;SAF=20;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.88914e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.57434e-06;OID=.;OPOS=148786108;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:33:20:0:0:33:20:0:0
chr3	148863151	.	A	G	355.96	PASS	AF=0.553846;AO=36;DP=65;FAO=36;FDP=65;FR=.;FRO=29;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=21;FSRR=8;FWDB=0.00676947;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.297;QD=21.9054;RBI=0.00724697;REFB=0.00204476;REVB=-0.00258705;RO=29;SAF=24;SAR=12;SRF=21;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0533769;STB=0.529396;STBP=0.643;TYPE=snp;VARB=-0.00147804;OID=.;OPOS=148863151;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:29:29:36:36:0.553846:12:24:21:8:12:24:21:8
chr3	148916235	.	T	A	734.22	PASS	AF=0.979167;AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=48;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00734632;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.88;QD=61.1852;RBI=0.0154304;REFB=0.05849;REVB=-0.0135694;RO=0;SAF=20;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.51219;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=-0.00240905;OID=.;OPOS=148916235;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:48:48:0:1:47:47:0.979167:27:20:0:0:27:20:1:0
chr3	149093238	.	A	G	611.43	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.045675;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.083;QD=61.1433;RBI=0.050123;REFB=0;REVB=0.0206424;RO=0;SAF=20;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.3303e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00021062;OID=.;OPOS=149093238;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:40:0:0:39:40:1:19:20:0:0:19:21:0:0
chr3	149216629	.	C	T	736.89	PASS	AF=0.496552;AO=72;DP=147;FAO=72;FDP=145;FR=.;FRO=73;FSAF=37;FSAR=35;FSRF=38;FSRR=35;FWDB=0.0148089;FXX=0.0136045;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.576;QD=20.328;RBI=0.0157339;REFB=-0.0161581;REVB=0.00531537;RO=73;SAF=37;SAR=35;SRF=38;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00608551;STB=0.503355;STBP=0.936;TYPE=snp;VARB=0.0179746;OID=.;OPOS=149216629;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:147:145:73:73:72:72:0.496552:35:37:38:35:35:37:38:35
chr3	149220517	.	C	T	430.21	PASS	AF=0.552632;AO=42;DP=76;FAO=42;FDP=76;FR=.;FRO=34;FSAF=9;FSAR=33;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=-0.0366838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.899;QD=22.6425;RBI=0.054829;REFB=-0.0068795;REVB=-0.0407494;RO=34;SAF=9;SAR=33;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.231435;STB=0.628504;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.00327359;OID=.;OPOS=149220517;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:34:34:42:42:0.552632:33:9:15:19:33:9:15:19
chr3	149459341	.	A	G	441.51	PASS	AF=0.454545;AO=44;DP=98;FAO=45;FDP=99;FR=.;FRO=54;FSAF=17;FSAR=28;FSRF=30;FSRR=24;FWDB=-0.0239911;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.744;QD=17.8389;RBI=0.0311789;REFB=-0.00317599;REVB=0.0199136;RO=53;SAF=17;SAR=27;SRF=29;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158796;STB=0.598138;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=0.00375484;OID=.;OPOS=149459341;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:99:53:54:44:45:0.454545:27:17:29:24:28:17:30:24
chr3	149678534	.	C	T	689.37	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0180287;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.29;QD=62.6696;RBI=0.0184082;REFB=0;REVB=-0.00371817;RO=0;SAF=29;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000119824;OID=.;OPOS=149678534;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:15:29:0:0:15:29:0:0
chr3	150128154	.	T	C	143.4	PASS	AF=0.380952;AO=13;DP=40;FAO=16;FDP=42;FR=.;FRO=26;FSAF=2;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=-0.0302751;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.938;QD=13.657;RBI=0.0303098;REFB=-0.0293241;REVB=0.00145118;RO=26;SAF=2;SAR=11;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.341244;STB=0.712643;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=0.0371334;OID=.;OPOS=150128154;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:42:26:26:13:16:0.380952:11:2:10:16:14:2:9:17
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chr3	150280445	.	C	G	785.87	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0707959;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.7817;QD=64.1527;RBI=0.0739562;REFB=0;REVB=0.0213883;RO=0;SAF=25;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000642528;OID=.;OPOS=150280445;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:24:25:0:0:24:25:0:0
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chr3	150905972	.	A	G	165.06	PASS	AF=0.382979;AO=18;DP=47;FAO=18;FDP=47;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=21;FWDB=0.0250197;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.862;QD=14.0472;RBI=0.0253789;REFB=0.00339309;REVB=0.00425478;RO=29;SAF=7;SAR=11;SRF=8;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131436;STB=0.575756;STBP=0.465;TYPE=snp;VARB=-0.00553959;OID=.;OPOS=150905972;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:29:29:18:18:0.382979:11:7:8:21:11:7:8:21
chr3	150911405	.	T	C	561.3	PASS	AF=0.5;AO=58;DP=116;FAO=58;FDP=116;FR=.;FRO=58;FSAF=21;FSAR=37;FSRF=27;FSRR=31;FWDB=-0.0170117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.443;QD=19.3551;RBI=0.0178352;REFB=0.0133074;REVB=0.00535668;RO=58;SAF=21;SAR=37;SRF=27;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0981244;STB=0.554288;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=-0.0115211;OID=.;OPOS=150911405;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:116:116:58:58:58:58:0.5:37:21:27:31:37:21:27:31
chr3	150916327	.	T	C	346.41	PASS	AF=0.445783;AO=37;DP=83;FAO=37;FDP=83;FR=.;FRO=46;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=0.0069177;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.015;QD=16.6944;RBI=0.0069616;REFB=0.000830295;REVB=0.000780595;RO=46;SAF=17;SAR=20;SRF=22;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0186323;STB=0.510466;STBP=0.895;TYPE=snp;VARB=-0.00116751;OID=.;OPOS=150916327;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:46:46:37:37:0.445783:20:17:22:24:20:17:22:24
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chr3	151012497	.	T	C	307.23	PASS	AF=0.43038;AO=34;DP=79;FAO=34;FDP=79;FR=.;FRO=45;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=24;FSRR=21;FWDB=-0.00819804;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.156;QD=15.5558;RBI=0.014263;REFB=0.00311928;REVB=-0.0116716;RO=45;SAF=16;SAR=18;SRF=24;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0632526;STB=0.535693;STBP=0.613;TYPE=snp;VARB=-0.00491476;OID=.;OPOS=151012497;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:45:45:34:34:0.43038:18:16:24:21:18:16:24:21
chr3	151046308	.	G	A	465.14	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00937427;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.366;QD=58.142;RBI=0.00946401;REFB=0;REVB=-0.00130025;RO=0;SAF=13;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.04655e-05;OID=.;OPOS=151046308;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:19:13:0:0:19:13:0:0
chr3	151046604	.	G	T	215.48	PASS	AF=0.38806;AO=26;DP=68;FAO=26;FDP=67;FR=.;FRO=41;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=-0.0136425;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.7205;QD=12.8642;RBI=0.0253752;REFB=-0.00236716;REVB=0.0213959;RO=41;SAF=15;SAR=11;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0697491;STB=0.540039;STBP=0.605;TYPE=snp;VARB=0.00242166;OID=.;OPOS=151046604;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:67:41:41:26:26:0.38806:11:15:21:20:11:15:21:20
chr3	151056598	.	A	C	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.054157;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.696;QD=35.5759;RBI=0.0858245;REFB=0;REVB=-0.0665797;RO=0;SAF=6;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000153142;OID=.;OPOS=151056598;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:1:6:0:0:1:6:0:0
chr3	151082923	.	T	C	104.07	PASS	AF=0.263158;AO=15;DP=57;FAO=15;FDP=57;FR=.;FRO=42;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=-0.0147844;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.549;QD=7.30278;RBI=0.0189012;REFB=0.00155516;REVB=0.011776;RO=42;SAF=5;SAR=10;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.2588;STB=0.658611;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=-0.00551939;OID=.;OPOS=151082923;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:42:42:15:15:0.263158:10:5:23:19:10:5:23:19
chr3	151131077	.	C	T	175.04	PASS	AF=0.383333;AO=21;DP=58;FAO=23;FDP=60;FR=.;FRO=37;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=23;FWDB=0.0283857;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.7232;QD=11.6696;RBI=0.0618376;REFB=-0.0165217;REVB=0.0549376;RO=37;SAF=11;SAR=10;SRF=14;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158976;STB=0.613637;STBP=0.187;TYPE=snp;VARB=0.034619;OID=.;OPOS=151131077;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:60:37:37:21:23:0.383333:10:11:14:23:10:13:14:23
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chr3	151154666	.	T	C	1377.4	PASS	AF=1;AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=5.04829e-06;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.428;QD=62.6092;RBI=0.00693516;REFB=0;REVB=0.00693516;RO=0;SAF=40;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.43431e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.60932e-05;OID=.;OPOS=151154666;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:88:88:0:0:88:88:1:48:40:0:0:48:40:0:0
chr3	151155248	.	A	C	218.06	PASS	AF=0.355263;AO=27;DP=76;FAO=27;FDP=76;FR=.;FRO=49;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=30;FWDB=-0.000755525;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=307.96;QD=11.477;RBI=0.0078925;REFB=-0.00289152;REVB=-0.00785626;RO=49;SAF=18;SAR=9;SRF=19;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.308314;STB=0.67813;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.00594285;OID=.;OPOS=151155248;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:49:49:27:27:0.355263:9:18:19:30:9:18:19:30
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chr3	151155758	.	A	C	164.89	PASS	AF=0.382979;AO=17;DP=46;FAO=18;FDP=47;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=-0.00235253;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=207.188;QD=14.0332;RBI=0.0350567;REFB=-0.00777801;REVB=0.0349776;RO=29;SAF=12;SAR=5;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.286762;STB=0.637525;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.00806626;OID=.;OPOS=151155758;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:47:29:29:17:18:0.382979:5:12:13:16:6:12:13:16
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chr3	151165686	.	C	A	75.14	PASS	AF=0.37037;AO=10;DP=27;FAO=10;FDP=27;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.0206031;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.225;QD=11.1312;RBI=0.0212129;REFB=-0.01756;REVB=-0.00505005;RO=17;SAF=5;SAR=5;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.030867;STB=0.518482;STBP=0.937;TYPE=snp;VARB=0.0216787;OID=.;OPOS=151165686;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:27:27:17:17:10:10:0.37037:5:5:9:8:5:5:9:8
chr3	151166422	.	C	T	729.01	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.013201;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.777;QD=57.1775;RBI=0.0155393;REFB=0;REVB=0.0081979;RO=0;SAF=29;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.97237e-05;OID=.;OPOS=151166422;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:22:29:0:0:22:29:0:0
chr3	151171439	.	A	C	1289.6	PASS	AF=0.9375;AO=86;DP=92;FAO=90;FDP=96;FR=.;FRO=6;FSAF=45;FSAR=45;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.00969283;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=190.817;QD=53.7333;RBI=0.0212392;REFB=-0.195421;REVB=0.0188984;RO=6;SAF=42;SAR=44;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0219799;STB=0.510414;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.00114885;OID=.;OPOS=151171439;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:17:92:96:6:6:86:90:0.9375:44:42:4:2:45:45:4:2
chr3	151171542	.	A	G	821.19	PASS	AF=1;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0101188;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.259;QD=57.6273;RBI=0.0114472;REFB=0;REVB=0.00535229;RO=0;SAF=31;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.19358e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000164526;OID=.;OPOS=151171542;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:57:0:0:57:57:1:26:31:0:0:26:31:0:0
chr3	151283691	.	C	A	1438.22	PASS	AF=0.989362;AO=91;DP=92;FAO=93;FDP=94;FR=.;FRO=1;FSAF=49;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0406413;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.327;QD=61.2008;RBI=0.0420781;REFB=-0.105113;REVB=0.0109021;RO=0;SAF=47;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.04952e-08;STB=0.505617;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=0.000517227;OID=.;OPOS=151283691;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:92:94:0:1:91:93:0.989362:44:47:0:0:44:49:0:1
chr3	151463421	.	G	T	1120.77	PASS	AF=0.986842;AO=75;DP=76;FAO=75;FDP=76;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0185509;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.295;QD=58.9879;RBI=0.0384978;REFB=-0.0163227;REVB=0.0337335;RO=0;SAF=32;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50769;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=0.00037368;OID=.;OPOS=151463421;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:76:76:0:1:75:75:0.986842:43:32:0:0:43:32:1:0
chr3	151545601	.	G	A	742.78	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0150974;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.607;QD=57.1371;RBI=0.0153784;REFB=0;REVB=-0.00292647;RO=0;SAF=24;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00011774;OID=.;OPOS=151545601;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:28:24:0:0:28:24:0:0
chr3	151986434	.	GCC	GC,GCG	950.46	PASS	AF=0.870588,0.105882;AO=19,10;DP=85;FAO=74,9;FDP=85;FR=.;FRO=2;FSAF=25,9;FSAR=49,0;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0812582,-0.0476743;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=16.5995,211.941;QD=44.7277;RBI=0.860605,0.0522855;REFB=0.0116229,-0.00253372;REVB=0.85676,0.0214695;RO=56;SAF=18,10;SAR=1,0;SRF=8;SRR=48;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.814283,0.828152;STB=0.519226,0.5;STBP=0.074,1;TYPE=del,snp;VARB=0.00948624,0.10168;OID=.,.;OPOS=151986435,151986436;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=GC,GCG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.870588,0.105882:19,10:85:74,9:85:2:25,9:49,0:2:0:32:56:18,10:1,0:8:48
chr3	152554357	.	A	G	423.66	PASS	AF=0.447619;AO=46;DP=104;FAO=47;FDP=105;FR=.;FRO=58;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=21;FSRR=37;FWDB=0.00346954;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=213.753;QD=16.1395;RBI=0.0034742;REFB=-0.00268578;REVB=0.000179924;RO=58;SAF=24;SAR=22;SRF=21;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158433;STB=0.593045;STBP=0.107;TYPE=snp;VARB=0.0036735;OID=.;OPOS=152554357;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:105:58:58:46:47:0.447619:22:24:21:37:22:25:21:37
chr3	152637565	.	C	T	269.85	PASS	AF=0.367816;AO=32;DP=87;FAO=32;FDP=87;FR=.;FRO=55;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=25;FSRR=30;FWDB=0.00432235;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=143.044;QD=12.407;RBI=0.0321252;REFB=-0.00403112;REVB=-0.0318331;RO=55;SAF=16;SAR=16;SRF=25;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0500453;STB=0.528718;STBP=0.713;TYPE=snp;VARB=0.00676921;OID=.;OPOS=152637565;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:55:55:32:32:0.367816:16:16:25:30:16:16:25:30
chr3	152852067	.	C	T	39.16	PASS	AF=0.21875;AO=5;DP=31;FAO=7;FDP=32;FR=.;FRO=25;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=20;FSRR=5;FWDB=0.0108895;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.386;QD=4.89467;RBI=0.0328502;REFB=-0.0152186;REVB=0.0309928;RO=25;SAF=3;SAR=2;SRF=20;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.277775;STB=0.691864;STBP=0.359;TYPE=snp;VARB=0.0462172;OID=.;OPOS=152852067;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:39:31:32:25:25:5:7:0.21875:2:3:20:5:3:4:20:5
chr3	152852070	.	T	C	38.96	PASS	AF=0.21875;AO=6;DP=31;FAO=7;FDP=32;FR=.;FRO=25;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=20;FSRR=5;FWDB=0.0253604;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.235;QD=4.86959;RBI=0.0362746;REFB=-0.0205111;REVB=0.0259364;RO=25;SAF=3;SAR=3;SRF=20;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.378166;STB=0.691864;STBP=0.359;TYPE=snp;VARB=0.057438;OID=.;OPOS=152852070;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:31:32:25:25:6:7:0.21875:3:3:20:5:3:4:20:5
chr3	152852188	.	T	C	109.69	PASS	AF=0.285714;AO=14;DP=49;FAO=14;FDP=49;FR=.;FRO=35;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=24;FSRR=11;FWDB=0.00169876;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.963;QD=8.95457;RBI=0.0327543;REFB=0.0011335;REVB=0.0327102;RO=35;SAF=6;SAR=8;SRF=24;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.296919;STB=0.677732;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=-0.00276661;OID=.;OPOS=152852188;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:35:35:14:14:0.285714:8:6:24:11:8:6:24:11
chr3	152883036	.	G	A	161.5	PASS	AF=0.5;AO=17;DP=34;FAO=17;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=0.0085393;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=253.147;QD=19.0004;RBI=0.00877207;REFB=0.00381071;REVB=-0.00200738;RO=16;SAF=7;SAR=10;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147905;STB=0.561973;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00726209;OID=.;OPOS=152883036;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:16:17:17:17:0.5:10:7:4:12:10:7:5:12
chr3	152885599	.	A	T	483.35	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0168389;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=288.148;QD=58.5878;RBI=0.0176258;REFB=0;REVB=0.00520747;RO=0;SAF=18;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.64315e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.95663e-05;OID=.;OPOS=152885599;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:15:18:0:0:15:18:0:0
chr3	152917590	.	C	T	233.23	PASS	AF=0.578947;AO=22;DP=38;FAO=22;FDP=38;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.0211256;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=246.802;QD=24.5508;RBI=0.0213627;REFB=-0.0208166;REVB=-0.00317346;RO=16;SAF=9;SAR=13;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.022094;STB=0.512304;STBP=0.892;TYPE=snp;VARB=0.0162893;OID=.;OPOS=152917590;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:16:16:22:22:0.578947:13:9:7:9:13:9:7:9
chr3	153725166	.	G	A	231.31	PASS	AF=0.318681;AO=29;DP=91;FAO=29;FDP=91;FR=.;FRO=62;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=30;FSRR=32;FWDB=-0.0559434;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=229.73;QD=10.1675;RBI=0.0580662;REFB=-0.00164308;REVB=-0.0155572;RO=62;SAF=14;SAR=15;SRF=30;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00129631;STB=0.500758;STBP=0.991;TYPE=snp;VARB=0.00255651;OID=.;OPOS=153725166;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:62:62:29:29:0.318681:15:14:30:32:15:14:30:32
chr3	153725172	.	C	T	242.95	PASS	AF=0.315789;AO=30;DP=96;FAO=30;FDP=95;FR=.;FRO=65;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=32;FSRR=33;FWDB=-0.00521707;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.5378;QD=10.2296;RBI=0.0187325;REFB=0.00459511;REVB=-0.0179914;RO=64;SAF=15;SAR=15;SRF=31;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0181949;STB=0.50526;STBP=0.955;TYPE=snp;VARB=-0.00912199;OID=.;OPOS=153725172;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:95:64:65:30:30:0.315789:15:15:31:33:15:15:32:33
chr3	153725251	.	T	C	435.02	PASS	AF=0.413223;AO=49;DP=120;FAO=50;FDP=121;FR=.;FRO=71;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=38;FSRR=33;FWDB=0.0251164;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.1139;QD=14.3807;RBI=0.0259932;REFB=-0.0125282;REVB=-0.00669422;RO=71;SAF=23;SAR=26;SRF=38;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0689963;STB=0.532352;STBP=0.544;TYPE=snp;VARB=0.0168792;OID=.;OPOS=153725251;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:121:71:71:49:50:0.413223:26:23:38:33:26:24:38:33
chr3	153839866	.	G	C	2111.32	PASS	AF=0.930818;AO=148;DP=159;FAO=148;FDP=159;FR=.;FRO=11;FSAF=72;FSAR=76;FSRF=9;FSRR=2;FWDB=0.0156188;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=215.852;QD=53.115;RBI=0.0191492;REFB=-0.0144237;REVB=0.011079;RO=11;SAF=72;SAR=76;SRF=9;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0435087;STB=0.522933;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.000532292;OID=.;OPOS=153839866;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:159:159:11:11:148:148:0.930818:76:72:9:2:76:72:9:2
chr3	153839959	.	CT	CC,TC	482.65	PASS	AF=0.647059,0.352941;AO=22,12;DP=34;FAO=22,12;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=5,5;FSAR=17,7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0323988,-0.0925677;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=1,2;MLLD=165.468,46.6533;QD=56.7827;RBI=0.0333518,0.0926704;REFB=0,0;REVB=-0.0079157,-0.00436296;RO=0;SAF=5,5;SAR=17,7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.58081e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.00312038,0.0296372;OID=.,.;OPOS=153839960,153839959;OREF=T,CT;OALT=C,TC;OMAPALT=CC,TC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:95:34:34:0:0:22,12:22,12:0.647059,0.352941:17,7:5,5:0:0:17,7:5,5:0:0
chr3	153840389	.	T	C	853.54	PASS	AF=0.552448;AO=79;DP=144;FAO=79;FDP=143;FR=.;FRO=64;FSAF=51;FSAR=28;FSRF=34;FSRR=30;FWDB=-0.00343013;FXX=0.00694396;HRUN=3;LEN=1;MLLD=247.911;QD=23.8753;RBI=0.00344258;REFB=-0.0129483;REVB=0.000292527;RO=64;SAF=51;SAR=28;SRF=34;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0989311;STB=0.554126;STBP=0.182;TYPE=snp;VARB=0.0115736;OID=.;OPOS=153840389;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:144:143:64:64:79:79:0.552448:28:51:34:30:28:51:34:30
chr3	154018887	.	G	C	677.65	PASS	AF=0.977778;AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0228962;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=146.95;QD=60.2352;RBI=0.0233828;REFB=-0.0876471;REVB=-0.00474534;RO=0;SAF=28;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508768;STBP=0.538;TYPE=snp;VARB=-6.79581e-05;OID=.;OPOS=154018887;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:45:45:0:1:44:44:0.977778:16:28:0:0:16:28:1:0
chr3	154878158	.	GA	G	403.93	PASS	AF=0.471264;AO=40;DP=90;FAO=41;FDP=87;FR=.;FRO=46;FSAF=27;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=28;FWDB=-0.00804225;FXX=0.0333296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.522;QD=18.5716;RBI=0.0109799;REFB=0.00111325;REVB=-0.00747525;RO=45;SAF=27;SAR=13;SRF=17;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.284977;STB=0.642787;STBP=0.011;TYPE=del;VARB=-0.00131949;OID=.;OPOS=154878159;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.471264:40:90:41:87:46:27:14:18:28:99:45:27:13:17:28
chr3	155241740	.	A	G	689.38	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.018348;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=329.147;QD=62.6711;RBI=0.0228434;REFB=0;REVB=-0.0136078;RO=0;SAF=26;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.25108e-06;OID=.;OPOS=155241740;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:18:26:0:0:18:26:0:0
chr3	155314034	.	A	G	368.76	PASS	AF=0.438202;AO=39;DP=90;FAO=39;FDP=89;FR=.;FRO=50;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=28;FWDB=0.000531107;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.905;QD=16.5734;RBI=0.0175601;REFB=-0.0180116;REVB=-0.0175521;RO=50;SAF=22;SAR=17;SRF=22;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123846;STB=0.569585;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=0.0218943;OID=.;OPOS=155314034;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:89:50:50:39:39:0.438202:17:22:22:28:17:22:22:28
chr3	155481609	.	G	A	118.47	PASS	AF=0.358974;AO=14;DP=40;FAO=14;FDP=39;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=-0.0198361;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.0753;QD=12.1509;RBI=0.0461591;REFB=-0.0171701;REVB=-0.0416796;RO=25;SAF=7;SAR=7;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152478;STB=0.589619;STBP=0.386;TYPE=snp;VARB=0.0285606;OID=.;OPOS=155481609;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:39:25:25:14:14:0.358974:7:7:16:9:7:7:16:9
chr3	155485302	.	C	T	323.25	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0437959;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.967;QD=53.8753;RBI=0.0476569;REFB=0;REVB=0.0187908;RO=0;SAF=13;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000505458;OID=.;OPOS=155485302;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:11:13:0:0:11:13:0:0
chr3	155571275	.	T	C	203.23	PASS	AF=0.540541;AO=20;DP=37;FAO=20;FDP=37;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.0134491;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.646;QD=21.9709;RBI=0.0167839;REFB=0.0131182;REVB=-0.010041;RO=17;SAF=9;SAR=11;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112803;STB=0.563279;STBP=0.428;TYPE=snp;VARB=-0.0323578;OID=.;OPOS=155571275;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:17:17:20:20:0.540541:11:9:10:7:11:9:10:7
chr3	155632314	.	A	G	335.86	PASS	AF=0.566667;AO=34;DP=60;FAO=34;FDP=60;FR=.;FRO=26;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=0.00594247;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.921;QD=22.3905;RBI=0.00925926;REFB=-0.021537;REVB=-0.00710077;RO=26;SAF=18;SAR=16;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143258;STB=0.578902;STBP=0.18;TYPE=snp;VARB=0.0134431;OID=.;OPOS=155632314;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:26:26:34:34:0.566667:16:18:9:17:16:18:9:17
chr3	156249214	.	T	C	817.65	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.025069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.5899;QD=57.3789;RBI=0.032375;REFB=0;REVB=0.0204862;RO=0;SAF=24;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.25003e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00034609;OID=.;OPOS=156249214;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:33:24:0:0:33:24:0:0
chr3	156266774	.	C	T	189.06	PASS	AF=0.527778;AO=19;DP=36;FAO=19;FDP=36;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.0137892;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.5837;QD=21.0062;RBI=0.0149669;REFB=-0.0136878;REVB=0.00581941;RO=17;SAF=7;SAR=12;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186606;STB=0.605229;STBP=0.197;TYPE=snp;VARB=0.0133136;OID=.;OPOS=156266774;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:17:17:19:19:0.527778:12:7:10:7:12:7:10:7
chr3	156544584	.	C	T	1600.31	PASS	AF=1;AO=106;DP=106;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0340496;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.6573;QD=59.8245;RBI=0.0394728;REFB=0;REVB=0.0199682;RO=0;SAF=61;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.81716e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000350872;OID=.;OPOS=156544584;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:106:107:0:0:106:107:1:45:61:0:0:46:61:0:0
chr3	156763279	.	C	T	423.45	PASS	AF=0.447619;AO=48;DP=105;FAO=47;FDP=105;FR=.;FRO=58;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=27;FSRR=31;FWDB=0.0370963;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.3046;QD=16.1316;RBI=0.065013;REFB=-0.0024847;REVB=0.0533905;RO=57;SAF=26;SAR=22;SRF=27;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0661641;STB=0.548458;STBP=0.406;TYPE=snp;VARB=0.00411644;OID=.;OPOS=156763279;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:105:57:58:48:47:0.447619:22:26:27:30:21:26:27:31
chr3	157155314	.	C	A	1573.01	PASS	AF=0.990654;AO=106;DP=107;FAO=106;FDP=107;FR=.;FRO=1;FSAF=52;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00943607;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.633;QD=58.8042;RBI=0.0167074;REFB=-0.0947946;REVB=0.0137876;RO=1;SAF=52;SAR=54;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00870811;STB=0.504586;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=0.000613266;OID=.;OPOS=157155314;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:107:107:1:1:106:106:0.990654:54:52:0:1:54:52:0:1
chr3	157161198	.	A	AT,T	747.52	PASS	AF=0.888889,0.111111;AO=36,14;DP=58;FAO=48,6;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=23,4;FSAR=25,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.015297,0.00688012;FXX=0.0357079;HRUN=0,8;LEN=1,1;MLLD=147.956,143.286;QD=55.3718;RBI=0.0168985,0.0113539;REFB=0,0;REVB=-0.00718077,-0.00903195;RO=3;SAF=16,9;SAR=20,5;SRF=2;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0321857,-0.00827827;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.00178891,-0.00679941;OID=.,.;OPOS=157161199,157161198;OREF=-,A;OALT=T,T;OMAPALT=AT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:15:58:54:3:0:36,14:48,6:0.888889,0.111111:20,5:16,9:2:1:25,2:23,4:0:0
chr3	157815088	.	G	A	1826.18	PASS	AF=1;AO=119;DP=120;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00204755;FXX=0.00833264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.236;QD=61.384;RBI=0.0232358;REFB=0;REVB=0.0231454;RO=0;SAF=65;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000617664;OID=.;OPOS=157815088;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:120:119:0:0:119:119:1:54:65:0:0:54:65:0:0
chr3	157815217	.	A	T	439.56	PASS	AF=0.942857;AO=32;DP=35;FAO=33;FDP=35;FR=.;FRO=2;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0398174;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=32.8697;QD=50.2354;RBI=0.0400756;REFB=-0.109548;REVB=-0.00454206;RO=3;SAF=16;SAR=16;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0265976;STB=0.500866;STBP=0.865;TYPE=snp;VARB=0.0144543;OID=.;OPOS=157815217;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:35:35:3:2:32:33:0.942857:16:16:1:2:17:16:1:1
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chr3	158388780	.	T	C	1062.27	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0132154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.446;QD=59.8463;RBI=0.0137574;REFB=0;REVB=0.00382353;RO=0;SAF=28;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.30751e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.75644e-05;OID=.;OPOS=158388780;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:43:28:0:0:43:28:0:0
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chr3	158537443	.	A	G	224.86	PASS	AF=0.488889;AO=22;DP=45;FAO=22;FDP=45;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=0.0251742;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.3384;QD=19.9873;RBI=0.0253804;REFB=0.00384649;REVB=0.0032288;RO=22;SAF=8;SAR=14;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0442443;STB=0.508764;STBP=0.903;TYPE=snp;VARB=-0.00196871;OID=.;OPOS=158537443;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:22:23:22:22:0.488889:14:8:7:15:14:8:8:15
chr3	159744438	.	C	T	99.96	PASS	AF=0.461538;AO=12;DP=26;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=0.0229693;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.259;QD=15.3786;RBI=0.0229807;REFB=-0.00810308;REVB=-0.00072329;RO=14;SAF=8;SAR=4;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0245398;STB=0.514262;STBP=0.928;TYPE=snp;VARB=0.00851739;OID=.;OPOS=159744438;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:26:14:14:12:12:0.461538:4:8:9:5:4:8:9:5
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chr3	164783165	.	T	C	2049.09	PASS	AF=0.992481;AO=131;DP=132;FAO=132;FDP=133;FR=.;FRO=1;FSAF=68;FSAR=64;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0188325;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.427;QD=61.6269;RBI=0.0204961;REFB=0.0548306;REVB=-0.00808883;RO=1;SAF=68;SAR=63;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00693842;STB=0.503649;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=1.56868e-05;OID=.;OPOS=164783165;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:132:133:1:1:131:132:0.992481:63:68:1:0:64:68:1:0
chr3	164905411	.	TAA	AAA,TA,TAT	56.64	PASS	AF=0.0392157,0.196078,0.0392157;AO=2,15,2;DP=52;FAO=2,10,2;FDP=51;FR=.;FRO=37;FSAF=2,5,0;FSAR=0,5,2;FSRF=28;FSRR=9;FWDB=0.0065481,0.0964452,0.0103222;FXX=0.0192271;HRUN=1,7,7;LEN=1,1,1;MLLD=215.192,10.5347,150.073;QD=4.44253;RBI=0.0103053,0.152359,0.043953;REFB=-0.00127694,-0.0944424,-0.00908724;REVB=0.00795748,-0.117947,-0.0427238;RO=30;SAF=2,7,0;SAR=0,8,2;SRF=24;SRR=6;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.354952,-0.374272,-0.641372;STB=0.992405,0.701789,0.997189;STBP=0.352,0.187,0.026;TYPE=snp,del,snp;VARB=-0.0318134,0.0882275,0.167157;OID=.,.,.;OPOS=164905411,164905412,164905413;OREF=T,A,A;OALT=A,-,T;OMAPALT=AAA,TA,TAT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:39:52:51:30:37:2,15,2:2,10,2:0.0392157,0.196078,0.0392157:0,8,2:2,7,0:24:6:0,5,2:2,5,0:28:9
chr3	165951073	.	C	A	920.09	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0396346;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.643;QD=58.4182;RBI=0.041452;REFB=0;REVB=0.0121395;RO=0;SAF=29;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000155303;OID=.;OPOS=165951073;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:34:29:0:0:34:29:0:0
chr3	166900401	.	C	G	65.78	PASS	AF=0.391304;AO=9;DP=23;FAO=9;FDP=23;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.008418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.5005;QD=11.44;RBI=0.00904752;REFB=-0.0391805;REVB=-0.00331584;RO=14;SAF=4;SAR=5;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0565464;STB=0.533905;STBP=0.77;TYPE=snp;VARB=0.0333133;OID=.;OPOS=166900401;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:23:23:14:14:9:9:0.391304:5:4:7:7:5:4:7:7
chr3	166966436	.	C	T	661.75	PASS	AF=0.372642;AO=78;DP=212;FAO=79;FDP=212;FR=.;FRO=133;FSAF=40;FSAR=39;FSRF=91;FSRR=42;FWDB=-0.0112197;FXX=0.0139528;HRUN=3;LEN=1;MLLD=158.708;QD=12.4859;RBI=0.0272449;REFB=-0.00694954;REVB=-0.0248274;RO=131;SAF=39;SAR=39;SRF=89;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199786;STB=0.611903;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.0161638;OID=.;OPOS=166966436;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:212:212:131:133:78:79:0.372642:39:39:89:42:39:40:91:42
chr3	167000256	.	G	C	217.32	PASS	AF=0.666667;AO=20;DP=31;FAO=20;FDP=30;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=-0.0047171;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.651;QD=28.9764;RBI=0.00892717;REFB=6.04213e-05;REVB=0.00757914;RO=10;SAF=5;SAR=15;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0391935;STB=0.521717;STBP=0.841;TYPE=snp;VARB=-9.90578e-06;OID=.;OPOS=167000256;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:31:30:10:10:20:20:0.666667:15:5:3:7:15:5:3:7
chr3	167034814	.	T	C	586.62	PASS	AF=0.504202;AO=60;DP=119;FAO=60;FDP=119;FR=.;FRO=59;FSAF=41;FSAR=19;FSRF=37;FSRR=22;FWDB=0.00739587;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=205.039;QD=19.7183;RBI=0.0155198;REFB=-0.018344;REVB=-0.0136442;RO=59;SAF=41;SAR=19;SRF=37;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0568981;STB=0.531447;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.0186073;OID=.;OPOS=167034814;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:119:59:59:60:60:0.504202:19:41:37:22:19:41:37:22
chr3	167051726	.	A	G	311.3	PASS	AF=0.507692;AO=33;DP=65;FAO=33;FDP=65;FR=.;FRO=32;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=10;FSRR=22;FWDB=-0.0244707;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=113.063;QD=19.1569;RBI=0.0246888;REFB=-0.00704391;REVB=0.0032745;RO=32;SAF=17;SAR=16;SRF=10;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.178832;STB=0.5992;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=0.0114624;OID=.;OPOS=167051726;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:32:32:33:33:0.507692:16:17:10:22:16:17:10:22
chr3	167051769	.	T	C	84.79	PASS	AF=0.354839;AO=11;DP=31;FAO=11;FDP=31;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.00695311;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=182.224;QD=10.941;RBI=0.0347554;REFB=-0.0102013;REVB=-0.0340528;RO=19;SAF=5;SAR=6;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0760866;STB=0.529358;STBP=0.803;TYPE=snp;VARB=0.0165456;OID=.;OPOS=167051769;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:31:31:19:20:11:11:0.354839:6:5:10:9:6:5:10:10
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chr3	167077691	.	T	A	1209.13	PASS	AF=1;AO=78;DP=78;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0228487;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.238;QD=61.2217;RBI=0.0239552;REFB=0;REVB=0.00719625;RO=0;SAF=47;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.52166e-05;OID=.;OPOS=167077691;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:79:0:0:78:79:1:31:47:0:0:31:48:0:0
chr3	167159976	.	A	AG	70.31	PASS	AF=0.52;AO=3;DP=27;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.115256;FXX=0.0384468;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.9052;QD=11.2497;RBI=0.115316;REFB=0.0779557;REVB=0.00371647;RO=23;SAF=1;SAR=2;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0666076;STB=0.59984;STBP=0.372;TYPE=ins;VARB=-0.0610844;OID=.;OPOS=167159977;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.52:3:27:13:25:12:4:9:6:6:66:23:1:2:9:14
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chr3	167506967	.	A	G	566.43	PASS	AF=0.504274;AO=57;DP=115;FAO=59;FDP=117;FR=.;FRO=58;FSAF=25;FSAR=34;FSRF=25;FSRR=33;FWDB=0.00156543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.7887;QD=19.3652;RBI=0.00704101;REFB=-0.0119372;REVB=0.00686478;RO=55;SAF=25;SAR=32;SRF=22;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0350614;STB=0.503702;STBP=0.953;TYPE=snp;VARB=0.0119718;OID=.;OPOS=167506967;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:117:55:58:57:59:0.504274:32:25:22:33:34:25:25:33
chr3	167510472	.	G	A	416.87	PASS	AF=0.439252;AO=46;DP=106;FAO=47;FDP=107;FR=.;FRO=60;FSAF=31;FSAR=16;FSRF=26;FSRR=34;FWDB=-0.0666735;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.7895;QD=15.5838;RBI=0.0780579;REFB=-0.0214966;REVB=-0.0405916;RO=57;SAF=30;SAR=16;SRF=25;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.21525;STB=0.629513;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.023776;OID=.;OPOS=167510472;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:107:57:60:46:47:0.439252:16:30:25:32:16:31:26:34
chr3	168538993	.	A	G	1584.24	PASS	AF=1;AO=97;DP=98;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00933092;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.159;QD=64.0099;RBI=0.0223602;REFB=0;REVB=0.0203202;RO=0;SAF=42;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.85606e-05;OID=.;OPOS=168538993;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:99:0:0:97:99:1:55:42:0:0:57:42:0:0
chr3	168546914	.	C	T	1456.15	PASS	AF=0.979167;AO=93;DP=97;FAO=94;FDP=96;FR=.;FRO=2;FSAF=41;FSAR=53;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0289775;FXX=0.0103082;HRUN=3;LEN=1;MLLD=114.583;QD=60.6731;RBI=0.0370269;REFB=-0.171742;REVB=0.02305;RO=2;SAF=40;SAR=53;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.023112;STB=0.511902;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.00100834;OID=.;OPOS=168546914;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:97:96:2:2:93:94:0.979167:53:40:2:0:53:41:2:0
chr3	169098992	.	G	A	74.48	PASS	AF=0.692308;AO=9;DP=13;FAO=9;FDP=13;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0529862;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=237.41;QD=22.9154;RBI=0.0530349;REFB=0.0111698;REVB=0.00227215;RO=4;SAF=4;SAR=5;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0300734;STB=0.517203;STBP=0.907;TYPE=snp;VARB=-0.00319117;OID=.;OPOS=169098992;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:13:13:4:4:9:9:0.692308:5:4:2:2:5:4:2:2
chr3	169492101	.	C	T	249.53	PASS	AF=0.460317;AO=27;DP=60;FAO=29;FDP=63;FR=.;FRO=34;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=-0.00212947;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.7;QD=15.8433;RBI=0.0225513;REFB=-0.0391526;REVB=-0.0224505;RO=32;SAF=16;SAR=11;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0902906;STB=0.543829;STBP=0.565;TYPE=snp;VARB=0.031317;OID=.;OPOS=169492101;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:63:32:34:27:29:0.460317:11:16:16:16:13:16:16:18
chr3	169514585	.	A	T	145.55	PASS	AF=0.444444;AO=16;DP=36;FAO=16;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=-0.00789241;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.5521;QD=16.1724;RBI=0.0433559;REFB=-0.00752209;REVB=0.0426315;RO=20;SAF=12;SAR=4;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11895;STB=0.568875;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.00848186;OID=.;OPOS=169514585;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:20:20:16:16:0.444444:4:12:13:7:4:12:13:7
chr3	169518455	.	T	C	192.76	PASS	AF=0.423077;AO=22;DP=52;FAO=22;FDP=52;FR=.;FRO=30;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=23;FSRR=7;FWDB=-0.00191691;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.637;QD=14.828;RBI=0.0102673;REFB=-0.020593;REVB=0.0100867;RO=30;SAF=7;SAR=15;SRF=23;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.432577;STB=0.744827;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0281918;OID=.;OPOS=169518455;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:30:30:22:22:0.423077:15:7:23:7:15:7:23:7
chr3	169558025	.	C	T	160.48	PASS	AF=0.485714;AO=17;DP=35;FAO=17;FDP=35;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=0.0197829;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=94.5143;QD=18.34;RBI=0.0203659;REFB=-0.00950906;REVB=0.0048381;RO=16;SAF=10;SAR=7;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0326819;STB=0.512181;STBP=0.906;TYPE=snp;VARB=0.0129112;OID=.;OPOS=169558025;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:16:18:17:17:0.485714:7:10:10:6:7:10:11:7
chr3	169806170	.	G	A	248.57	PASS	AF=0.589744;AO=23;DP=39;FAO=23;FDP=39;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.00291785;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.9756;QD=25.4943;RBI=0.022236;REFB=-0.00879237;REVB=-0.0220438;RO=16;SAF=9;SAR=14;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0126768;STB=0.507036;STBP=0.942;TYPE=snp;VARB=0.013392;OID=.;OPOS=169806170;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:16:16:23:23:0.589744:14:9:6:10:14:9:6:10
chr3	169894680	.	G	A	335.86	PASS	AF=0.566667;AO=33;DP=59;FAO=34;FDP=60;FR=.;FRO=26;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=-0.00479487;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=240.328;QD=22.3904;RBI=0.0118124;REFB=0.00352334;REVB=-0.0107955;RO=26;SAF=19;SAR=14;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0302652;STB=0.508923;STBP=0.879;TYPE=snp;VARB=-0.00219286;OID=.;OPOS=169894680;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:60:26:26:33:34:0.566667:14:19:14:12:15:19:14:12
chr3	169962665	.	CTAAA	CAATA,CTAA,CTACA,TCAAT	271.13	PASS	AF=0.0833333,0.472222,0.166667,0.166667;AO=3,12,3,6;DP=38;FAO=3,17,6,6;FDP=36;FR=.;FRO=4;FSAF=0,16,0,0;FSAR=3,1,6,6;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.00678436,-0.0198936,-0.0249125,-0.0131507;FXX=0.0526177;HRUN=1,6,6,2;LEN=3,1,1,5;MLLD=77.9282,11.4739,89.0441,96.1406;QD=30.1254;RBI=0.060145,0.221325,0.09988,0.0601379;REFB=-0.0197688,-0.045109,-0.0221874,-0.0250757;REVB=-0.0597612,-0.220429,-0.0967232,-0.0586824;RO=5;SAF=0,12,0,0;SAR=3,0,3,6;SRF=3;SRR=2;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=-0.698233,0.817351,-0.698233,-0.773282;STB=0.995228,0.726916,0.997317,0.997317;STBP=0.114,0.035,0.063,0.063;TYPE=mnp,del,snp,mnp;VARB=0.00165994,0.0516596,0.0575346,0.0159555;OID=.,.,.,.;OPOS=169962666,169962667,169962668,169962665;OREF=TAA,A,A,CTAAA;OALT=AAT,-,C,TCAAT;OMAPALT=CAATA,CTAA,CTACA,TCAAT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	2/4:45:38:36:5:4:3,12,3,6:3,17,6,6:0.0833333,0.472222,0.166667,0.166667:3,0,3,6:0,12,0,0:3:2:3,1,6,6:0,16,0,0:2:2
chr3	169988286	.	C	T	386.27	PASS	AF=0.64;AO=32;DP=50;FAO=32;FDP=50;FR=.;FRO=18;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.00889232;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.434;QD=30.9018;RBI=0.00964413;REFB=0.0162375;REVB=0.00373309;RO=18;SAF=14;SAR=18;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114057;STB=0.562461;STBP=0.25;TYPE=snp;VARB=-0.0095298;OID=.;OPOS=169988286;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:18:18:32:32:0.64:18:14:11:7:18:14:11:7
chr3	170078232	.	C	T	520.05	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0174599;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.342;QD=59.4345;RBI=0.0359997;REFB=0;REVB=-0.0314822;RO=0;SAF=10;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.03206e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.16602e-05;OID=.;OPOS=170078232;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:25:10:0:0:25:10:0:0
chr3	170198367	.	G	A	192.9	PASS	AF=0.575758;AO=19;DP=33;FAO=19;FDP=33;FR=.;FRO=14;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.00548518;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.207;QD=23.3817;RBI=0.0116649;REFB=-0.0273411;REVB=0.0102948;RO=14;SAF=9;SAR=10;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.089129;STB=0.549788;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=0.021813;OID=.;OPOS=170198367;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:14:14:19:19:0.575758:10:9:5:9:10:9:5:9
chr3	170198898	.	C	T	120.57	PASS	AF=1;AO=11;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0925344;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=221.278;QD=40.189;RBI=0.0925678;REFB=0;REVB=0.00248555;RO=0;SAF=3;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0010012;OID=.;OPOS=170198898;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:11:12:1:8:3:0:0:8:4:0:0
chr3	170825905	.	C	G	1320.76	PASS	AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0320255;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.215;QD=62.1533;RBI=0.0369026;REFB=0;REVB=0.018335;RO=0;SAF=32;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.07334e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.78128e-05;OID=.;OPOS=170825905;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:53:32:0:0:53:32:0:0
chr3	170825920	.	G	A	1146.28	PASS	AF=0.97561;AO=71;DP=85;FAO=80;FDP=82;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=28;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.162515;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=34.9264;QD=55.9161;RBI=0.194516;REFB=-0.102396;REVB=0.106889;RO=4;SAF=25;SAR=46;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0162306;STB=0.504761;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=0.00902568;OID=.;OPOS=170825920;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:85:82:4:1:71:80:0.97561:46:25:2:2:52:28:0:1
chr3	170893070	.	G	A	658.58	PASS	AF=0.93617;AO=44;DP=47;FAO=44;FDP=47;FR=.;FRO=3;FSAF=39;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0116809;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=265.651;QD=56.0494;RBI=0.0154278;REFB=-0.0525065;REVB=0.0100784;RO=3;SAF=39;SAR=5;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0347865;STB=0.51851;STBP=0.654;TYPE=snp;VARB=0.000209601;OID=.;OPOS=170893070;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:47:47:3:3:44:44:0.93617:5:39:3:0:5:39:3:0
chr3	170946002	.	A	G	766.44	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103174;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.974;QD=63.87;RBI=0.013651;REFB=0;REVB=0.00893881;RO=0;SAF=22;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.96683e-05;OID=.;OPOS=170946002;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:26:22:0:0:26:22:0:0
chr3	171065030	.	AG	AC,CA	322.04	PASS	AF=0.875,0.125;AO=18,3;DP=24;FAO=21,3;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=1,0;FSAR=20,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0329329,-0.0202676;FXX=0.039984;HRUN=1,4;LEN=1,2;MLLD=201.193,184.781;QD=53.6728;RBI=0.0343726,0.0227188;REFB=0,0;REVB=-0.00984373,-0.0102648;RO=0;SAF=1,0;SAR=17,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=-0.000386515,0.0159951;OID=.,.;OPOS=171065031,171065030;OREF=G,AG;OALT=C,CA;OMAPALT=AC,CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:13:24:24:0:0:18,3:21,3:0.875,0.125:17,3:1,0:0:0:20,3:1,0:0:0
chr3	171844787	.	A	T	301.98	PASS	AF=0.445946;AO=31;DP=71;FAO=33;FDP=74;FR=.;FRO=41;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=0.0161684;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.415;QD=16.3232;RBI=0.0258668;REFB=-0.0308967;REVB=0.020191;RO=40;SAF=17;SAR=14;SRF=18;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0979804;STB=0.542084;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=0.0470285;OID=.;OPOS=171844787;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:74:40:41:31:33:0.445946:14:17:18:22:16:17:18:23
chr3	171969077	.	C	G	651.07	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.02966;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.8033;QD=62.0067;RBI=0.0297665;REFB=0;REVB=0.00251596;RO=0;SAF=15;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.13648e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000255605;OID=.;OPOS=171969077;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:27:15:0:0:27:15:0:0
chr3	172046861	.	T	C	1116.88	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0277825;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.043;QD=60.3718;RBI=0.0430285;REFB=0;REVB=0.032857;RO=0;SAF=39;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.80413e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.11776e-05;OID=.;OPOS=172046861;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:35:39:0:0:35:39:0:0
chr3	172115455	.	ATTTTTTTTTTT	ATTTTTTTT,ATTTTTTTTTAA,ATTTTTTTTTTA	84.88	PASS	AF=0.181818,0.636364,0.181818;AO=2,3,2;DP=11;FAO=2,7,2;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=2,3,0;FSAR=0,4,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.332434,0.0746649,0.0648473;FXX=0;HRUN=11,11,11;LEN=3,2,1;MLLD=12.383,15.75,10.7558;QD=30.8642;RBI=0.332692,0.0771778,0.0695902;REFB=0,0,0;REVB=0.0130909,0.0195334,0.0252513;RO=0;SAF=2,0,0;SAR=0,3,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,mnp,snp;VARB=-0.0664457,0.0332334,-0.0228026;OID=.,.,.;OPOS=172115456,172115465,172115466;OREF=TTT,TT,T;OALT=-,AA,A;OMAPALT=ATTTTTTTT,ATTTTTTTTTAA,ATTTTTTTTTTA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.181818,0.636364,0.181818:2,3,2:11:2,7,2:11:0:2,3,0:0,4,2:0:0:10:0:2,0,0:0,3,2:0:0
chr3	172165727	.	C	T	104.63	PASS	AF=0.571429;AO=12;DP=21;FAO=12;FDP=21;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=-2.19711e-05;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=276.651;QD=19.9285;RBI=0.0266063;REFB=0.00582486;REVB=-0.0266063;RO=9;SAF=6;SAR=6;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.209806;STB=0.61886;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=-0.00350994;OID=.;OPOS=172165727;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:21:21:9:9:12:12:0.571429:6:6:2:7:6:6:2:7
chr3	172166033	.	G	A	128.04	PASS	AF=0.56;AO=14;DP=25;FAO=14;FDP=25;FR=.;FRO=11;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=-0.0803912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.5937;QD=20.4858;RBI=0.0804989;REFB=-0.00476352;REVB=0.00416217;RO=11;SAF=9;SAR=5;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218499;STB=0.624098;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=0.00172442;OID=.;OPOS=172166033;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:25:25:11:11:14:14:0.56:5:9:4:7:5:9:4:7
chr3	172224303	.	A	G	260.9	PASS	AF=0.545455;AO=24;DP=46;FAO=24;FDP=44;FR=.;FRO=20;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=-0.00261879;FXX=0.0434688;HRUN=7;LEN=1;MLLD=155.653;QD=23.7186;RBI=0.0236267;REFB=0.00992747;REVB=-0.0234811;RO=20;SAF=15;SAR=9;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0218623;STB=0.512185;STBP=0.905;TYPE=snp;VARB=-0.00558101;OID=.;OPOS=172224303;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:44:20:20:24:24:0.545455:9:15:13:7:9:15:13:7
chr3	172348906	.	A	ACCTC	104.07	PASS	AF=0.263158;AO=15;DP=57;FAO=15;FDP=57;FR=.;FRO=42;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=-0.00174208;FXX=0;HRUN=2;LEN=4;MLLD=318.664;QD=7.30284;RBI=0.0170674;REFB=-0.0058438;REVB=-0.0169783;RO=42;SAF=10;SAR=5;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150223;STB=0.592466;STBP=0.407;TYPE=ins;VARB=0.0130935;OID=.;OPOS=172348907;OREF=-;OALT=CCTC;OMAPALT=ACCTC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.263158:15:57:15:57:42:10:5:23:19:99:42:10:5:23:19
chr3	172428782	.	T	C	1105.83	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00168699;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.91;QD=59.7746;RBI=0.026527;REFB=0;REVB=0.0264734;RO=0;SAF=23;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000102939;OID=.;OPOS=172428782;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:74:0:0:72:74:1:49:23:0:0:50:24:0:0
chr3	172489076	.	C	T	489.38	PASS	AF=0.971429;AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00102073;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.629;QD=55.929;RBI=0.0310475;REFB=-0.107887;REVB=-0.0310307;RO=1;SAF=22;SAR=12;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0373615;STB=0.519988;STBP=0.265;TYPE=snp;VARB=0.000694442;OID=.;OPOS=172489076;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:35:35:1:1:34:34:0.971429:12:22:0:1:12:22:0:1
chr3	172514294	.	G	A,T	1084.22	PASS	AF=0.945946,0.0540541;AO=69,5;DP=74;FAO=70,4;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=39,4;FSAR=31,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0224876,-0.0532688;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=52.1805,13.7247;QD=58.6067;RBI=0.0676884,0.13323;REFB=0,0;REVB=0.0638437,0.122117;RO=0;SAF=38,5;SAR=31,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00518254,0.170655;OID=.,.;OPOS=172514294,172514294;OREF=G,G;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:74:74:0:0:69,5:70,4:0.945946,0.0540541:31,0:38,5:0:0:31,0:39,4:0:0
chr3	172766822	.	G	A	157.04	PASS	AF=0.435897;AO=17;DP=39;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.00455148;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.773;QD=16.1063;RBI=0.00580981;REFB=-0.0138775;REVB=-0.0036108;RO=21;SAF=7;SAR=10;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0166384;STB=0.524662;STBP=0.785;TYPE=snp;VARB=0.0226256;OID=.;OPOS=172766822;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:21:22:17:17:0.435897:10:7:9:12:10:7:10:12
chr3	174951756	.	T	C	505.72	PASS	AF=1;AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00776032;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.476;QD=59.497;RBI=0.0205127;REFB=0;REVB=0.0189881;RO=0;SAF=26;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.06407e-06;OID=.;OPOS=174951756;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:34:0:0:34:34:1:8:26:0:0:8:26:0:0
chr3	175165079	.	C	T	625.67	PASS	AF=0.90566;AO=48;DP=53;FAO=48;FDP=53;FR=.;FRO=5;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.026171;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=136.209;QD=47.2204;RBI=0.035214;REFB=-0.167065;REVB=0.0235608;RO=3;SAF=25;SAR=23;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0207305;STB=0.530231;STBP=0.209;TYPE=snp;VARB=0.00386813;OID=.;OPOS=175165079;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:18:53:53:3:5:48:48:0.90566:23:25:1:2:23:25:1:4
chr3	175327309	.	G	A	3136.04	PASS	AF=1;AO=202;DP=203;FAO=206;FDP=206;FR=.;FRO=0;FSAF=102;FSAR=104;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00148374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.139;QD=60.894;RBI=0.0238527;REFB=-0.0922619;REVB=-0.0238065;RO=0;SAF=99;SAR=103;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.15151e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000455818;OID=.;OPOS=175327309;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:203:206:0:0:202:206:1:103:99:0:0:104:102:0:0
chr3	175345143	.	C	G	1283.44	PASS	AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0053714;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=306.397;QD=61.8526;RBI=0.00554737;REFB=0;REVB=0.00138616;RO=0;SAF=45;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.04629e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.66466e-06;OID=.;OPOS=175345143;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:38:45:0:0:38:45:0:0
chr3	175473047	.	T	C	1607.75	PASS	AF=0.990991;AO=107;DP=111;FAO=110;FDP=111;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=65;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00195899;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.7503;QD=57.9368;RBI=0.00804605;REFB=-0.0566973;REVB=0.00780393;RO=1;SAF=45;SAR=62;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0104304;STB=0.505494;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=0.00123695;OID=.;OPOS=175473047;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:111:111:1:1:107:110:0.990991:62:45:1:0:65:45:1:0
chr3	176838514	.	C	G	547.09	PASS	AF=1;AO=29;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0424594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.24;QD=59.1453;RBI=0.0436879;REFB=0;REVB=0.0102876;RO=0;SAF=16;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00081184;OID=.;OPOS=176838514;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:29:37:1:13:16:0:0:19:18:0:0
chr3	178742675	.	C	T	288.12	PASS	AF=0.5;AO=31;DP=61;FAO=31;FDP=62;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=10;FSRR=21;FWDB=-0.0130001;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=259.968;QD=18.5884;RBI=0.0139955;REFB=-0.005839;REVB=0.00518379;RO=30;SAF=12;SAR=19;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0506803;STB=0.534499;STBP=0.619;TYPE=snp;VARB=0.00462663;OID=.;OPOS=178742675;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:62:30:31:31:31:0.5:19:12:10:20:19:12:10:21
chr3	178742690	.	T	C	1014.58	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0276414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.853;QD=58.8165;RBI=0.0329;REFB=0;REVB=0.0178427;RO=0;SAF=25;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.27283e-05;OID=.;OPOS=178742690;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:68:69:0:0:68:69:1:43:25:0:0:44:25:0:0
chr3	178815528	.	G	A	1627.89	PASS	AF=1;AO=107;DP=107;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00740921;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.534;QD=59.739;RBI=0.0214256;REFB=0;REVB=0.0201037;RO=0;SAF=52;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00103291;OID=.;OPOS=178815528;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:107:109:0:0:107:109:1:55:52:0:0:57:52:0:0
chr3	178976777	.	C	T	563.52	PASS	AF=0.974359;AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0617829;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.9261;QD=57.7967;RBI=0.0770053;REFB=-0.112977;REVB=0.045964;RO=1;SAF=15;SAR=23;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0302093;STB=0.51612;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=0.0119159;OID=.;OPOS=178976777;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:39:39:1:1:38:38:0.974359:23:15:1:0:23:15:1:0
chr3	179096508	.	C	G	1415.49	PASS	AF=0.943396;AO=100;DP=108;FAO=100;FDP=106;FR=.;FRO=6;FSAF=49;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0.00332944;FXX=0.0185168;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.5194;QD=53.4145;RBI=0.0192599;REFB=0.0364776;REVB=0.01897;RO=5;SAF=49;SAR=51;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0442645;STB=0.527772;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=-0.00146852;OID=.;OPOS=179096508;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:16:108:106:5:6:100:100:0.943396:51:49:0:5:51:49:0:6
chr3	179298999	.	C	T	1565.58	PASS	AF=1;AO=97;DP=99;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00184321;FXX=0.0101;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.817;QD=63.9011;RBI=0.0168774;REFB=0;REVB=-0.0167765;RO=0;SAF=39;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.05269e-05;OID=.;OPOS=179298999;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:99:98:0:0:97:98:1:58:39:0:0:59:39:0:0
chr3	179306775	.	C	T	152.59	PASS	AF=0.369565;AO=18;DP=46;FAO=17;FDP=46;FR=.;FRO=29;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=-0.0718282;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.183;QD=13.269;RBI=0.0718302;REFB=-0.0272891;REVB=-0.000539008;RO=28;SAF=6;SAR=12;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0682035;STB=0.584423;STBP=0.396;TYPE=snp;VARB=0.0198575;OID=.;OPOS=179306775;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:28:29:18:17:0.369565:12:6:11:17:12:5:12:17
chr3	179322385	.	A	C	270.39	PASS	AF=0.359551;AO=32;DP=89;FAO=32;FDP=89;FR=.;FRO=57;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=24;FSRR=33;FWDB=0.0484888;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.4668;QD=12.1524;RBI=0.0527777;REFB=0.003097;REVB=0.0208404;RO=57;SAF=14;SAR=18;SRF=24;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0186398;STB=0.510723;STBP=0.887;TYPE=snp;VARB=-0.00377261;OID=.;OPOS=179322385;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:57:57:32:32:0.359551:18:14:24:33:18:14:24:33
chr3	179325566	.	G	GCTGT	440.99	PASS	AF=0.494382;AO=43;DP=89;FAO=44;FDP=89;FR=.;FRO=45;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=21;FSRR=24;FWDB=-0.0133238;FXX=0;HRUN=1;LEN=4;MLLD=291.093;QD=19.8198;RBI=0.0158109;REFB=-0.005087;REVB=-0.00851242;RO=45;SAF=22;SAR=21;SRF=21;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0413396;STB=0.516846;STBP=0.764;TYPE=ins;VARB=0.00554428;OID=.;OPOS=179325567;OREF=-;OALT=CTGT;OMAPALT=GCTGT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.494382:43:89:44:89:45:22:22:21:24:99:45:22:21:21:24
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chr3	179502006	.	T	C	41.62	PASS	AF=0.538462;AO=6;DP=12;FAO=7;FDP=13;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.0357925;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.9284;QD=12.8049;RBI=0.0617983;REFB=-0.0407687;REVB=0.0503779;RO=5;SAF=3;SAR=3;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0757641;STB=0.533237;STBP=0.934;TYPE=snp;VARB=0.0360965;OID=.;OPOS=179502006;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:12:13:5:6:6:7:0.538462:3:3:2:3:3:4:3:3
chr3	182584117	.	A	G	114.7	PASS	AF=0.318182;AO=14;DP=44;FAO=14;FDP=44;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=20;FSRR=10;FWDB=0.0602283;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.8572;QD=10.4273;RBI=0.0724085;REFB=0.0219253;REVB=0.0401938;RO=30;SAF=8;SAR=6;SRF=20;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11335;STB=0.567475;STBP=0.59;TYPE=snp;VARB=-0.0461641;OID=.;OPOS=182584117;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:30:30:14:14:0.318182:6:8:20:10:6:8:20:10
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chr3	182755209	.	T	G	445.89	PASS	AF=0.511628;AO=42;DP=84;FAO=44;FDP=86;FR=.;FRO=42;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=0.00369711;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.461;QD=20.7392;RBI=0.0157217;REFB=-0.00343718;REVB=0.0152808;RO=42;SAF=21;SAR=21;SRF=21;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.511106;STBP=0.884;TYPE=snp;VARB=0.00315636;OID=.;OPOS=182755209;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:86:42:42:42:44:0.511628:21:21:21:21:23:21:21:21
chr3	182790249	.	G	A	1139.45	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143676;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.969;QD=60.7709;RBI=0.014732;REFB=0;REVB=0.00325639;RO=0;SAF=35;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.80413e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.14457e-05;OID=.;OPOS=182790249;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:75:0:0:74:75:1:39:35:0:0:40:35:0:0
chr3	182871962	.	C	T	410.68	PASS	AF=0.456522;AO=42;DP=93;FAO=42;FDP=92;FR=.;FRO=50;FSAF=10;FSAR=32;FSRF=12;FSRR=38;FWDB=-0.0689459;FXX=0.0212743;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.789;QD=17.8554;RBI=0.0689552;REFB=-0.013754;REVB=0.00113211;RO=51;SAF=10;SAR=32;SRF=13;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0223543;STB=0.501424;STBP=0.988;TYPE=snp;VARB=0.0180265;OID=.;OPOS=182871962;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:92:51:50:42:42:0.456522:32:10:13:38:32:10:12:38
chr3	182897920	.	A	G	152.72	PASS	AF=0.377778;AO=17;DP=45;FAO=17;FDP=45;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=-0.0274678;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.7954;QD=13.5746;RBI=0.0274811;REFB=-0.00503683;REVB=0.00085558;RO=28;SAF=12;SAR=5;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.19644;STB=0.615243;STBP=0.26;TYPE=snp;VARB=0.0062329;OID=.;OPOS=182897920;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:28:28:17:17:0.377778:5:12:15:13:5:12:15:13
chr3	182925404	.	T	C	806.27	PASS	AF=1;AO=55;DP=56;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0145884;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.357;QD=55.6047;RBI=0.0351087;REFB=0;REVB=0.0319344;RO=0;SAF=38;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.97918e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000765544;OID=.;OPOS=182925404;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:56:58:0:0:55:58:1:17:38:0:0:17:41:0:0
chr3	183027542	.	T	G	206.74	PASS	AF=0.4375;AO=14;DP=48;FAO=21;FDP=48;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=0.0390604;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.2868;QD=17.2282;RBI=0.0398897;REFB=0.0164764;REVB=0.00809144;RO=24;SAF=7;SAR=7;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134352;STB=0.638376;STBP=0.111;TYPE=snp;VARB=-0.00964239;OID=.;OPOS=183027542;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:24:27:14:21:0.4375:7:7:15:9:13:8:17:10
chr3	183211906	.	A	G	1422.03	PASS	AF=1;AO=89;DP=90;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0130228;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.842;QD=62.5069;RBI=0.0238882;REFB=0;REVB=-0.0200263;RO=0;SAF=47;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.28712e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00013709;OID=.;OPOS=183211906;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:90:91:0:0:89:91:1:42:47:0:0:43:48:0:0
chr3	183476685	.	G	A	348.49	PASS	AF=0.4625;AO=37;DP=80;FAO=37;FDP=80;FR=.;FRO=43;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=-0.0630825;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.7477;QD=17.4244;RBI=0.0655456;REFB=-0.0290806;REVB=-0.0177997;RO=43;SAF=15;SAR=22;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.081081;STB=0.54543;STBP=0.464;TYPE=snp;VARB=0.0264787;OID=.;OPOS=183476685;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:43:43:37:37:0.4625:22:15:21:22:22:15:21:22
chr3	183521133	.	A	G	383.28	PASS	AF=0.567164;AO=38;DP=67;FAO=38;FDP=67;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=29;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=-0.00433892;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.848;QD=22.8821;RBI=0.00462203;REFB=0.0121342;REVB=0.00159278;RO=29;SAF=9;SAR=29;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14131;STB=0.578221;STBP=0.184;TYPE=snp;VARB=-0.00893739;OID=.;OPOS=183521133;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:29:29:38:38:0.567164:29:9:11:18:29:9:11:18
chr3	183523984	.	A	G	727.71	PASS	AF=0.67033;AO=61;DP=91;FAO=61;FDP=91;FR=.;FRO=30;FSAF=27;FSAR=34;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=0.0227277;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.025;QD=31.9873;RBI=0.023718;REFB=-0.0281422;REVB=0.00678216;RO=29;SAF=27;SAR=34;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0448436;STB=0.530084;STBP=0.41;TYPE=snp;VARB=0.00936321;OID=.;OPOS=183523984;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:29:30:61:61:0.67033:34:27:15:14:34:27:16:14
chr3	183524193	.	T	C	185.6	PASS	AF=0.407407;AO=22;DP=53;FAO=22;FDP=54;FR=.;FRO=32;FSAF=17;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=0.00679933;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=80.315;QD=13.7482;RBI=0.0692905;REFB=-0.0211037;REVB=0.0689561;RO=31;SAF=17;SAR=5;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.358098;STB=0.700179;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.0150527;OID=.;OPOS=183524193;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:54:31:32:22:22:0.407407:5:17:14:17:5:17:15:17
chr3	183533964	.	T	C	59.41	PASS	AF=0.533333;AO=8;DP=15;FAO=8;FDP=15;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.102013;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.4592;QD=15.8415;RBI=0.105362;REFB=-0.0608614;REVB=-0.0263554;RO=6;SAF=3;SAR=5;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0946669;STB=0.592984;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=0.0440499;OID=.;OPOS=183533964;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:15:15:6:7:8:8:0.533333:5:3:3:3:5:3:4:3
chr3	183660585	.	G	A	352.48	PASS	AF=0.474359;AO=37;DP=79;FAO=37;FDP=78;FR=.;FRO=41;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=24;FWDB=0.0050433;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.2776;QD=18.0757;RBI=0.0293071;REFB=0.0036417;REVB=0.0288699;RO=42;SAF=22;SAR=15;SRF=17;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180018;STB=0.594543;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=-0.00884762;OID=.;OPOS=183660585;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:78:42:41:37:37:0.474359:15:22:17:25:15:22:17:24
chr3	183685534	.	A	G	570.28	PASS	AF=1;AO=36;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0826514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.4745;QD=60.0298;RBI=0.117461;REFB=0;REVB=0.0834621;RO=0;SAF=21;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.003126;OID=.;OPOS=183685534;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:36:38:1:15:21:0:0:17:21:0:0
chr3	183696402	.	A	G	713.04	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0557337;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.137;QD=63.3809;RBI=0.055766;REFB=0;REVB=-0.00189724;RO=0;SAF=20;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.30465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.91572e-05;OID=.;OPOS=183696402;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:45:0:0:44:45:1:24:20:0:0:24:21:0:0
chr3	183699516	.	T	C	68.09	PASS	AF=0.473684;AO=9;DP=19;FAO=9;FDP=19;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=-0.00600558;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=265.909;QD=14.334;RBI=0.00633562;REFB=-0.0130675;REVB=0.0020182;RO=10;SAF=3;SAR=6;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15627;STB=0.592381;STBP=0.477;TYPE=snp;VARB=0.0161286;OID=.;OPOS=183699516;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:19:19:10:10:9:9:0.473684:6:3:5:5:6:3:5:5
chr3	183753777	.	G	A	66.21	PASS	AF=0.409091;AO=9;DP=20;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.121102;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.6551;QD=12.0389;RBI=0.128055;REFB=-0.0273035;REVB=-0.0416239;RO=11;SAF=8;SAR=1;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.510886;STB=0.787955;STBP=0.056;TYPE=snp;VARB=0.0278836;OID=.;OPOS=183753777;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:20:22:11:13:9:9:0.409091:1:8:5:6:1:8:7:6
chr3	183754294	.	G	C	69.64	PASS	AF=0.232558;AO=10;DP=43;FAO=10;FDP=43;FR=.;FRO=33;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=-0.0316184;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.4022;QD=6.47794;RBI=0.0318067;REFB=0.00456876;REVB=-0.00345633;RO=32;SAF=7;SAR=3;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176942;STB=0.603844;STBP=0.537;TYPE=snp;VARB=-0.0278617;OID=.;OPOS=183754294;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:69:43:43:32:33:10:10:0.232558:3:7:18:14:3:7:19:14
chr3	183755822	.	G	A	785.82	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00964794;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.048;QD=64.1483;RBI=0.0747094;REFB=0;REVB=0.0740838;RO=0;SAF=23;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000453456;OID=.;OPOS=183755822;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:26:23:0:0:26:23:0:0
chr3	183756702	.	G	A	1272.64	PASS	AF=1;AO=82;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0200004;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.949;QD=61.3319;RBI=0.0884389;REFB=0;REVB=0.0861476;RO=0;SAF=48;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000273145;OID=.;OPOS=183756702;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:83:0:0:82:83:1:34:48:0:0:35:48:0:0
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chr3	183774762	.	C	A	404.95	PASS	AF=0.43;AO=41;DP=98;FAO=43;FDP=100;FR=.;FRO=57;FSAF=27;FSAR=16;FSRF=39;FSRR=18;FWDB=0.0566514;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.9547;QD=16.1978;RBI=0.061599;REFB=0.0145745;REVB=0.0241878;RO=57;SAF=26;SAR=15;SRF=39;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0566993;STB=0.534939;STBP=0.592;TYPE=snp;VARB=-0.0220082;OID=.;OPOS=183774762;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:100:57:57:41:43:0.43:15:26:39:18:16:27:39:18
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chr3	183818416	.	G	A	55.21	PASS	AF=0.363636;AO=8;DP=22;FAO=8;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=-0.0140826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.159;QD=10.039;RBI=0.0140935;REFB=-0.0253447;REVB=0.000554935;RO=14;SAF=4;SAR=4;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0746008;STB=0.545342;STBP=0.78;TYPE=snp;VARB=0.0532206;OID=.;OPOS=183818416;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:22:22:14:14:8:8:0.363636:4:4:6:8:4:4:6:8
chr3	183861243	.	A	G	161.51	PASS	AF=0.5;AO=17;DP=34;FAO=17;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.00359453;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.959;QD=19.0006;RBI=0.00631087;REFB=0.00599239;REVB=0.00518715;RO=16;SAF=7;SAR=10;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0225945;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00549722;OID=.;OPOS=183861243;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:16:17:17:17:0.5:10:7:7:9:10:7:7:10
chr3	183863084	.	AAG	A	53.7	PASS	AF=0.421053;AO=6;DP=18;FAO=8;FDP=19;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.0011229;FXX=0;HRUN=4;LEN=2;MLLD=250.408;QD=11.3045;RBI=0.0123561;REFB=-0.0128983;REVB=-0.012305;RO=8;SAF=4;SAR=2;SRF=4;SRR=4;SSEN=0.324176;SSEP=0;SSSB=0.162008;STB=0.547823;STBP=0.75;TYPE=del;VARB=0.0215908;OID=.;OPOS=183863085;OREF=AG;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.421053:6:18:8:19:11:5:3:6:5:53:8:4:2:4:4
chr3	183900680	.	G	C	746.84	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0218673;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.9718;QD=63.5612;RBI=0.0557905;REFB=0;REVB=0.0513265;RO=0;SAF=22;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000980618;OID=.;OPOS=183900680;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:25:22:0:0:25:22:0:0
chr3	183900729	.	T	C	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0074247;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=299.197;QD=55.0987;RBI=0.0139102;REFB=0;REVB=-0.011763;RO=0;SAF=12;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.42626e-05;OID=.;OPOS=183900729;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:14:12:0:0:14:12:0:0
chr3	183907032	.	G	C,T	1995.47	PASS	AF=0.961832,0.0381679;AO=125,5;DP=130;FAO=126,5;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=62,3;FSAR=64,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00398132,0.00502638;FXX=0.0150365;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=133.082,98.0794;QD=60.9303;RBI=0.0231351,0.00502907;REFB=0,0;REVB=0.0227899,-0.000164573;RO=0;SAF=62,3;SAR=63,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000867316,0.0583444;OID=.,.;OPOS=183907032,183907032;OREF=G,G;OALT=C,T;OMAPALT=C,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:7:130:131:0:0:125,5:126,5:0.961832,0.0381679:63,2:62,3:0:0:64,2:62,3:0:0
chr3	183975365	.	C	T	591.76	PASS	AF=0.952381;AO=40;DP=42;FAO=40;FDP=42;FR=.;FRO=2;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00928807;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.702;QD=56.3577;RBI=0.0494136;REFB=-0.0220324;REVB=0.0485328;RO=2;SAF=18;SAR=22;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0407438;STB=0.521728;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=0.000514412;OID=.;OPOS=183975365;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:42:42:2:2:40:40:0.952381:22:18:0:2:22:18:0:2
chr3	183976103	.	C	T	214.36	PASS	AF=0.38806;AO=26;DP=67;FAO=26;FDP=67;FR=.;FRO=41;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=26;FSRR=15;FWDB=0.00716725;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.366;QD=12.7978;RBI=0.0158784;REFB=-0.0111364;REVB=0.0141688;RO=41;SAF=15;SAR=11;SRF=26;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.06331;STB=0.536239;STBP=0.659;TYPE=snp;VARB=0.0137295;OID=.;OPOS=183976103;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:41:41:26:26:0.38806:11:15:26:15:11:15:26:15
chr3	183996068	.	C	T	353.93	PASS	AF=0.431818;AO=38;DP=88;FAO=38;FDP=88;FR=.;FRO=50;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=27;FSRR=23;FWDB=0.0144633;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.5575;QD=16.0878;RBI=0.0150706;REFB=-0.027432;REVB=0.00423502;RO=50;SAF=16;SAR=22;SRF=27;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120372;STB=0.567791;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.03134;OID=.;OPOS=183996068;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:50:50:38:38:0.431818:22:16:27:23:22:16:27:23
chr3	184037533	.	A	G	623.95	PASS	AF=1;AO=38;DP=42;FAO=40;FDP=40;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=12;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00650377;FXX=0.0697512;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.4449;QD=62.395;RBI=0.00681221;REFB=0;REVB=-0.00202661;RO=0;SAF=11;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.45412e-05;OID=.;OPOS=184037533;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:40:0:0:38:40:1:27:11:0:0:28:12:0:0
chr3	184039666	.	A	G	81.75	PASS	AF=0.289474;AO=11;DP=38;FAO=11;FDP=38;FR=.;FRO=27;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=0.0036617;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.7961;QD=8.60489;RBI=0.0388747;REFB=-0.0119801;REVB=0.0387019;RO=27;SAF=4;SAR=7;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.221959;STB=0.636116;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.0232658;OID=.;OPOS=184039666;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:81:38:38:27:27:11:11:0.289474:7:4:15:12:7:4:15:12
chr3	184056252	.	C	G	210.7	PASS	AF=0.477273;AO=21;DP=44;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.0123823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.292;QD=19.1544;RBI=0.0156588;REFB=-0.00976137;REVB=-0.00958509;RO=23;SAF=8;SAR=13;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171704;STB=0.597281;STBP=0.249;TYPE=snp;VARB=0.0153334;OID=.;OPOS=184056252;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:23:23:21:21:0.477273:13:8:13:10:13:8:13:10
chr3	184075047	.	A	G	171.22	PASS	AF=0.461538;AO=18;DP=39;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.00405443;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=215.233;QD=17.5607;RBI=0.0282104;REFB=-0.0301753;REVB=0.0279175;RO=21;SAF=10;SAR=8;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0301757;STB=0.517222;STBP=0.841;TYPE=snp;VARB=0.025818;OID=.;OPOS=184075047;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:21:21:18:18:0.461538:8:10:11:10:8:10:11:10
chr3	184102396	.	C	T	598.41	PASS	AF=0.580645;AO=49;DP=93;FAO=54;FDP=93;FR=.;FRO=39;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=14;FSRR=25;FWDB=0.0314542;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.7528;QD=25.7382;RBI=0.0341749;REFB=0.0133065;REVB=0.0133624;RO=32;SAF=28;SAR=21;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0974206;STB=0.566642;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=-0.00989163;OID=.;OPOS=184102396;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:32:39:49:54:0.580645:21:28:14:18:26:28:14:25
chr3	184103903	.	A	C	157.72	PASS	AF=0.357143;AO=20;DP=56;FAO=20;FDP=56;FR=.;FRO=36;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=26;FSRR=10;FWDB=-0.00582395;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.221;QD=11.2655;RBI=0.00827273;REFB=-0.00308057;REVB=-0.00587535;RO=36;SAF=8;SAR=12;SRF=26;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.344528;STB=0.698448;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.00551275;OID=.;OPOS=184103903;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:36:36:20:20:0.357143:12:8:26:10:12:8:26:10
chr3	184144585	.	A	G	208.24	PASS	AF=0.625;AO=20;DP=32;FAO=20;FDP=32;FR=.;FRO=12;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.0201795;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.8775;QD=26.0304;RBI=0.0746973;REFB=-0.0246725;REVB=-0.0719199;RO=12;SAF=10;SAR=10;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0562357;STB=0.531219;STBP=0.694;TYPE=snp;VARB=0.0194878;OID=.;OPOS=184144585;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:32:32:12:12:20:20:0.625:10:10:5:7:10:10:5:7
chr3	184289152	.	A	G	409.71	PASS	AF=0.445545;AO=45;DP=101;FAO=45;FDP=101;FR=.;FRO=56;FSAF=27;FSAR=18;FSRF=26;FSRR=30;FWDB=0.00147359;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.733;QD=16.2262;RBI=0.00998654;REFB=-0.0139723;REVB=-0.00987722;RO=56;SAF=27;SAR=18;SRF=26;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135598;STB=0.575966;STBP=0.199;TYPE=snp;VARB=0.018539;OID=.;OPOS=184289152;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:101:56:56:45:45:0.445545:18:27:26:30:18:27:26:30
chr3	184428903	.	T	G	220.58	PASS	AF=0.419355;AO=26;DP=62;FAO=26;FDP=62;FR=.;FRO=36;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=22;FSRR=14;FWDB=-0.0173603;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.769;QD=14.2309;RBI=0.0228055;REFB=0.0013554;REVB=-0.0147888;RO=36;SAF=15;SAR=11;SRF=22;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0359531;STB=0.520445;STBP=0.809;TYPE=snp;VARB=-0.00229336;OID=.;OPOS=184428903;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:36:36:26:26:0.419355:11:15:22:14:11:15:22:14
chr3	184429133	.	A	ATCC	63.33	PASS	AF=0.257143;AO=7;DP=44;FAO=9;FDP=35;FR=.;FRO=26;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=-0.0480963;FXX=0.0789266;HRUN=1;LEN=3;MLLD=249.235;QD=7.23793;RBI=0.0509649;REFB=-0.012523;REVB=0.0168574;RO=35;SAF=3;SAR=4;SRF=22;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.238247;STB=0.569466;STBP=0.674;TYPE=ins;VARB=0.0396039;OID=.;OPOS=184429134;OREF=-;OALT=TCC;OMAPALT=ATCC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.257143:7:44:9:35:26:4:5:14:12:63:35:3:4:22:13
chr3	184429414	.	C	A	50.47	PASS	AF=0.583333;AO=7;DP=12;FAO=7;FDP=12;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0471699;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.31;QD=16.8242;RBI=0.0503018;REFB=-0.0411772;REVB=0.017472;RO=5;SAF=1;SAR=6;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0763028;STB=0.545316;STBP=0.886;TYPE=snp;VARB=0.0157741;OID=.;OPOS=184429414;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:12:12:5:5:7:7:0.583333:6:1:1:4:6:1:1:4
chr3	184550501	.	A	G	712.14	PASS	AF=1;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0521208;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.8543;QD=63.3012;RBI=0.0586892;REFB=0;REVB=0.0269786;RO=0;SAF=24;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00105558;OID=.;OPOS=184550501;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:45:0:0:45:45:1:21:24:0:0:21:24:0:0
chr3	184573555	.	C	T	689.37	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000435771;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.682;QD=62.6697;RBI=0.0158865;REFB=0;REVB=-0.0158805;RO=0;SAF=16;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.61535e-05;OID=.;OPOS=184573555;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:28:16:0:0:28:16:0:0
chr3	184647413	.	T	C	703.67	PASS	AF=1;AO=44;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103163;FXX=0.0425441;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.511;QD=62.5487;RBI=0.0192303;REFB=0;REVB=-0.016229;RO=0;SAF=14;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000296586;OID=.;OPOS=184647413;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:44:45:1:30:14:0:0:30:15:0:0
chr3	184700356	.	A	C	174.12	PASS	AF=0.68;AO=17;DP=25;FAO=17;FDP=25;FR=.;FRO=8;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.0288379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.108;QD=27.859;RBI=0.0299962;REFB=-0.025653;REVB=0.00825524;RO=8;SAF=7;SAR=10;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123511;STB=0.568639;STBP=0.357;TYPE=snp;VARB=0.0122042;OID=.;OPOS=184700356;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:25:25:8:8:17:17:0.68:10:7:5:3:10:7:5:3
chr3	184700426	.	C	T	130.27	PASS	AF=0.56;AO=14;DP=26;FAO=14;FDP=25;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=-0.0715383;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.6865;QD=20.8425;RBI=0.07186;REFB=-0.0431545;REVB=-0.00679142;RO=11;SAF=3;SAR=11;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153108;STB=0.587651;STBP=0.405;TYPE=snp;VARB=0.0330849;OID=.;OPOS=184700426;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:26:25:11:11:14:14:0.56:11:3:4:7:11:3:4:7
chr3	184795895	.	A	G	689.38	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0196588;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=247.526;QD=62.6711;RBI=0.0268646;REFB=0;REVB=0.0183096;RO=0;SAF=23;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.76326e-05;OID=.;OPOS=184795895;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:21:23:0:0:21:23:0:0
chr3	184797765	.	C	T	228.34	PASS	AF=0.52381;AO=22;DP=42;FAO=22;FDP=42;FR=.;FRO=20;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=0.0092011;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.5554;QD=21.7462;RBI=0.00920275;REFB=0.00806565;REVB=-0.000173772;RO=20;SAF=11;SAR=11;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127519;STB=0.571365;STBP=0.354;TYPE=snp;VARB=-0.00699108;OID=.;OPOS=184797765;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:20:20:22:22:0.52381:11:11:7:13:11:11:7:13
chr3	184798067	.	T	C	219.83	PASS	AF=0.44;AO=22;DP=50;FAO=22;FDP=50;FR=.;FRO=28;FSAF=17;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=0.0112378;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=234.843;QD=17.5866;RBI=0.0179732;REFB=0.000967684;REVB=0.0140267;RO=28;SAF=17;SAR=5;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.237141;STB=0.636429;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=-0.00122508;OID=.;OPOS=184798067;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:28:28:22:22:0.44:5:17:16:12:5:17:16:12
chr3	184798097	.	G	A	190.26	PASS	AF=0.542857;AO=19;DP=35;FAO=19;FDP=35;FR=.;FRO=16;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=2;FWDB=-0.0117465;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.628;QD=21.7436;RBI=0.0291081;REFB=-0.000231791;REVB=-0.0266327;RO=16;SAF=13;SAR=6;SRF=14;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196388;STB=0.608921;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=-0.00033708;OID=.;OPOS=184798097;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:16:16:19:19:0.542857:6:13:14:2:6:13:14:2
chr3	184798149	.	A	C	237.6	PASS	AF=0.489362;AO=23;DP=47;FAO=23;FDP=47;FR=.;FRO=24;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.0200309;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.797;QD=20.2211;RBI=0.0596169;REFB=-0.0384539;REVB=-0.056151;RO=24;SAF=14;SAR=9;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.062672;STB=0.535342;STBP=0.654;TYPE=snp;VARB=0.0277522;OID=.;OPOS=184798149;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:24:24:23:23:0.489362:9:14:13:11:9:14:13:11
chr3	184922294	.	C	T	210.71	PASS	AF=0.477273;AO=21;DP=44;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=0.030647;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.836;QD=19.1551;RBI=0.0322645;REFB=-0.00969847;REVB=0.0100876;RO=23;SAF=13;SAR=8;SRF=16;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0767254;STB=0.543285;STBP=0.621;TYPE=snp;VARB=0.00942356;OID=.;OPOS=184922294;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:23:23:21:21:0.477273:8:13:16:7:8:13:16:7
chr3	185046975	.	T	C	1567.69	PASS	AF=1;AO=98;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00675783;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.297;QD=63.9873;RBI=0.0186589;REFB=0;REVB=0.0173921;RO=0;SAF=53;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.1576e-05;OID=.;OPOS=185046975;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:98:0:0:98:98:1:45:53:0:0:45:53:0:0
chr3	185146702	.	C	T	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0810844;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.8961;QD=47.8221;RBI=0.0815922;REFB=0;REVB=-0.00908867;RO=0;SAF=4;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.07465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00365387;OID=.;OPOS=185146702;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:12:4:0:0:12:4:0:0
chr3	185300589	.	T	C	109.26	PASS	AF=0.419355;AO=13;DP=31;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=5;FWDB=0.0145056;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.415;QD=14.0974;RBI=0.029491;REFB=-0.0178646;REVB=-0.025677;RO=18;SAF=8;SAR=5;SRF=13;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116459;STB=0.567469;STBP=0.544;TYPE=snp;VARB=0.0357271;OID=.;OPOS=185300589;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:18:18:13:13:0.419355:5:8:13:5:5:8:13:5
chr3	185331165	.	C	A	192.93	PASS	AF=0.410714;AO=23;DP=56;FAO=23;FDP=56;FR=.;FRO=33;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=22;FWDB=0.024392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.983;QD=13.7805;RBI=0.0280151;REFB=-0.0209402;REVB=-0.0137795;RO=33;SAF=17;SAR=6;SRF=11;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.417522;STB=0.738922;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.0427117;OID=.;OPOS=185331165;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:33:33:23:23:0.410714:6:17:11:22:6:17:11:22
chr3	185348402	.	C	T	272.08	PASS	AF=0.363636;AO=33;DP=88;FAO=32;FDP=88;FR=.;FRO=56;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=28;FSRR=28;FWDB=0.0826795;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=51.5361;QD=12.3671;RBI=0.0859242;REFB=0.0183336;REVB=-0.0233895;RO=52;SAF=15;SAR=18;SRF=26;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0488616;STB=0.519902;STBP=0.808;TYPE=snp;VARB=-0.0177989;OID=.;OPOS=185348402;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:52:56:33:32:0.363636:18:15:26:26:17:15:28:28
chr3	185765580	.	G	GT	123.2	PASS	AF=1;AO=12;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0272134;FXX=0.0454339;HRUN=6;LEN=1;MLLD=8.09993;QD=23.4658;RBI=0.248857;REFB=0;REVB=-0.247365;RO=8;SAF=3;SAR=9;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.277454;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00832901;OID=.;OPOS=185765581;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:1:12:21:21:21:0:4:17:0:0:3:8:3:9:0:8
chr3	185867550	.	G	C	149.1	PASS	AF=0.5;AO=16;DP=32;FAO=16;FDP=32;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=0.0062524;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=235.929;QD=18.6378;RBI=0.00750322;REFB=0.000503884;REVB=-0.00414798;RO=16;SAF=6;SAR=10;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000385028;OID=.;OPOS=185867550;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:16:16:16:16:0.5:10:6:6:10:10:6:6:10
chr3	185867637	.	C	T	176.08	PASS	AF=0.514286;AO=18;DP=34;FAO=18;FDP=35;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=13;FWDB=-0.0307616;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=167.263;QD=20.1238;RBI=0.0308563;REFB=-0.0229799;REVB=-0.00241578;RO=16;SAF=7;SAR=11;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126312;STB=0.58123;STBP=0.37;TYPE=snp;VARB=0.0127786;OID=.;OPOS=185867637;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:35:16:17:18:18:0.514286:11:7:4:12:11:7:4:13
chr3	185990096	.	C	T	1091.22	PASS	AF=1;AO=62;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=31;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000469562;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.914;QD=59.7929;RBI=0.0304287;REFB=0;REVB=0.030425;RO=0;SAF=30;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000583262;OID=.;OPOS=185990096;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:62:73:1:32:30:0:0:42:31:0:0
chr3	186006566	.	T	C	729.01	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0126259;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.41;QD=57.1775;RBI=0.0128137;REFB=0;REVB=-0.002186;RO=0;SAF=39;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.49855e-05;OID=.;OPOS=186006566;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:12:39:0:0:12:39:0:0
chr3	186006618	.	G	C	181.91	PASS	AF=0.44186;AO=19;DP=43;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=15;FSAR=4;FSRF=23;FSRR=1;FWDB=-0.0172484;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=167.874;QD=16.922;RBI=0.0303112;REFB=-0.0264455;REVB=0.0249252;RO=24;SAF=15;SAR=4;SRF=23;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.30643;STB=0.669471;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=0.0198871;OID=.;OPOS=186006618;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:24:24:19:19:0.44186:4:15:23:1:4:15:23:1
chr3	186015283	.	A	G	249.53	PASS	AF=0.414286;AO=29;DP=70;FAO=29;FDP=70;FR=.;FRO=41;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=0.00161343;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=281.855;QD=14.2592;RBI=0.00803658;REFB=0.00230255;REVB=0.00787295;RO=41;SAF=11;SAR=18;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13951;STB=0.579421;STBP=0.278;TYPE=snp;VARB=-0.00339288;OID=.;OPOS=186015283;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:41:41:29:29:0.414286:18:11:21:20:18:11:21:20
chr3	186337713	.	T	C	195.66	PASS	AF=0.612903;AO=19;DP=31;FAO=19;FDP=31;FR=.;FRO=12;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.0333937;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.7366;QD=25.2466;RBI=0.0337971;REFB=-0.00780468;REVB=-0.00520612;RO=12;SAF=9;SAR=10;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0182979;STB=0.510193;STBP=0.955;TYPE=snp;VARB=0.00370881;OID=.;OPOS=186337713;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:31:31:12:12:19:19:0.612903:10:9:6:6:10:9:6:6
chr3	186338382	.	G	C	482.52	PASS	AF=0.554217;AO=46;DP=83;FAO=46;FDP=83;FR=.;FRO=37;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=22;FSRR=15;FWDB=0.0134243;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.975;QD=23.2538;RBI=0.0146984;REFB=-0.0129687;REVB=-0.00598603;RO=37;SAF=24;SAR=22;SRF=22;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0593899;STB=0.532618;STBP=0.547;TYPE=snp;VARB=0.00876225;OID=.;OPOS=186338382;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:37:37:46:46:0.554217:22:24:22:15:22:24:22:15
chr3	186338425	.	A	C	391.96	PASS	AF=0.547945;AO=38;DP=72;FAO=40;FDP=73;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=0.0273955;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.77;QD=21.4774;RBI=0.0295161;REFB=-0.00884622;REVB=-0.0109858;RO=34;SAF=14;SAR=24;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141206;STB=0.553046;STBP=0.324;TYPE=snp;VARB=0.00729021;OID=.;OPOS=186338425;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:73:34:33:38:40:0.547945:24:14:18:16:24:16:17:16
chr3	186370333	.	G	T	632.22	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0322757;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.3059;QD=61.6795;RBI=0.0402092;REFB=0;REVB=0.0239804;RO=0;SAF=23;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000132985;OID=.;OPOS=186370333;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:18:23:0:0:18:23:0:0
chr3	186390627	.	C	T	262.82	PASS	AF=0.428571;AO=30;DP=70;FAO=30;FDP=70;FR=.;FRO=40;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=22;FSRR=18;FWDB=-0.0103919;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=227.808;QD=15.018;RBI=0.0181957;REFB=-0.0114734;REVB=0.0149362;RO=40;SAF=9;SAR=21;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.263219;STB=0.649597;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.0126332;OID=.;OPOS=186390627;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:40:40:30:30:0.428571:21:9:22:18:21:9:22:18
chr3	186395113	.	A	G	120.55	PASS	AF=0.4375;AO=14;DP=32;FAO=14;FDP=32;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=0.0310858;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.328;QD=15.0691;RBI=0.0311568;REFB=-0.00580505;REVB=0.00210177;RO=18;SAF=10;SAR=4;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0548562;STB=0.531868;STBP=0.772;TYPE=snp;VARB=0.0171034;OID=.;OPOS=186395113;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:18:18:14:14:0.4375:4:10:12:6:4:10:12:6
chr3	186395180	.	T	C	279.26	PASS	AF=1;AO=14;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=18;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.163737;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.7673;QD=50.7748;RBI=0.163755;REFB=0;REVB=-0.00238996;RO=0;SAF=11;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00171015;OID=.;OPOS=186395180;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:14:22:1:3:11:0:0:4:18:0:0
chr3	186395436	.	C	T	213.98	PASS	AF=0.666667;AO=20;DP=30;FAO=20;FDP=30;FR=.;FRO=10;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.00994274;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=152.801;QD=28.5306;RBI=0.0181764;REFB=-0.011288;REVB=0.0152159;RO=9;SAF=10;SAR=10;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0937307;STB=0.566601;STBP=0.337;TYPE=snp;VARB=0.00372659;OID=.;OPOS=186395436;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:30:30:9:10:20:20:0.666667:10:10:3:6:10:10:3:7
chr3	186395572	.	A	T	428.78	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0110047;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.9504;QD=57.1703;RBI=0.0344512;REFB=0;REVB=0.0326463;RO=0;SAF=17;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.63861e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00098084;OID=.;OPOS=186395572;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:13:17:0:0:13:17:0:0
chr3	186443018	.	T	C	137.37	PASS	AF=0.326531;AO=16;DP=49;FAO=16;FDP=49;FR=.;FRO=33;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=21;FSRR=12;FWDB=-0.00500071;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.594;QD=11.2137;RBI=0.0087146;REFB=-0.0112173;REVB=0.00713703;RO=32;SAF=3;SAR=13;SRF=20;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.502974;STB=0.805814;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0201131;OID=.;OPOS=186443018;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:32:33:16:16:0.326531:13:3:20:12:13:3:21:12
chr3	186489724	.	T	C	195.23	PASS	AF=0.454545;AO=20;DP=44;FAO=20;FDP=44;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.0880939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.8302;QD=17.748;RBI=0.0881792;REFB=0.00394725;REVB=0.0038773;RO=24;SAF=9;SAR=11;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0323679;STB=0.518415;STBP=0.857;TYPE=snp;VARB=-0.00168466;OID=.;OPOS=186489724;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:24:24:20:20:0.454545:11:9:10:14:11:9:10:14
chr3	186509517	.	G	A	410.83	PASS	AF=0.518987;AO=41;DP=76;FAO=41;FDP=79;FR=.;FRO=38;FSAF=31;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=0.0096666;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.611;QD=20.8017;RBI=0.0136039;REFB=-0.00663582;REVB=0.00957192;RO=35;SAF=31;SAR=10;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.281892;STB=0.642527;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.00768173;OID=.;OPOS=186509517;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:79:35:38:41:41:0.518987:10:31:16:19:10:31:19:19
chr3	186570892	.	T	G	180.3	PASS	AF=0.395833;AO=16;DP=45;FAO=19;FDP=48;FR=.,HEALED;FRO=29;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=21;FSRR=8;FWDB=-0.0127537;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.654;QD=15.0249;RBI=0.0377871;REFB=-0.0164374;REVB=-0.0355698;RO=21;SAF=9;SAR=7;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0570481;STB=0.561981;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.0316891;OID=.;OPOS=186570892;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:48:21:29:16:19:0.395833:7:9:13:8:7:12:21:8
chr3	186570997	.	TGGGG	ATGGG,TGGG,TGGGC	205.86	PASS	AF=0,0.684211,0.0263158;AO=2,17,2;DP=38;FAO=0,26,1;FDP=38;FR=.;FRO=11;FSAF=0,6,1;FSAR=0,20,0;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.0661073,0.0276458,0.0793708;FXX=0;HRUN=1,4,4;LEN=2,1,1;MLLD=12.6321,15.478,14.6885;QD=21.6695;RBI=0.0723212,0.0474877,0.0858191;REFB=-0.0621597,-0.00185275,-0.0193666;REVB=0.0293289,-0.0386107,0.0326372;RO=13;SAF=1,1,2;SAR=1,16,0;SRF=8;SRR=5;SSEN=0,0.472222,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.118967,-0.640622,0.513867;STB=0.5,0.615289,0.988542;STBP=1,0.057,0.53;TYPE=mnp,del,snp;VARB=0,0.0224752,-0.027225;OID=.,.,.;OPOS=186570997,186570998,186571001;OREF=TG,G,G;OALT=AT,-,C;OMAPALT=ATGGG,TGGG,TGGGC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:60:38:38:13:11:2,17,2:0,26,1:0,0.684211,0.0263158:1,16,0:1,1,2:8:5:0,20,0:0,6,1:6:5
chr3	186917751	.	C	G	1208.84	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00816136;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.6728;QD=61.207;RBI=0.0328136;REFB=0;REVB=0.0317824;RO=0;SAF=40;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33478e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0001065;OID=.;OPOS=186917751;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:39:40:0:0:39:40:0:0
chr3	186937568	.	A	G	312.17	PASS	AF=0.447368;AO=34;DP=76;FAO=34;FDP=76;FR=.;FRO=42;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=27;FWDB=-0.00387783;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.904;QD=16.4298;RBI=0.00393238;REFB=-0.000439517;REVB=-0.000652736;RO=42;SAF=16;SAR=18;SRF=15;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112935;STB=0.563344;STBP=0.334;TYPE=snp;VARB=0.000221748;OID=.;OPOS=186937568;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:42:42:34:34:0.447368:18:16:15:27:18:16:15:27
chr3	186953932	.	C	A	311.65	PASS	AF=0.6;AO=24;DP=45;FAO=27;FDP=45;FR=.,HEALED;FRO=17;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=-0.0104025;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.486;QD=27.7022;RBI=0.0287685;REFB=-0.0679684;REVB=-0.0268219;RO=12;SAF=13;SAR=11;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125659;STB=0.563712;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=0.0390819;OID=.;OPOS=186953932;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:12:17:24:27:0.6:11:13:4:8:13:14:6:11
chr3	186954285	.	A	G	740.24	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00575939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.156;QD=56.9417;RBI=0.0898972;REFB=0;REVB=0.0897125;RO=0;SAF=27;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000337748;OID=.;OPOS=186954285;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:52:0:0:51:52:1:24:27:0:0:25:27:0:0
chr3	187088656	.	C	T	346.95	PASS	AF=0.445783;AO=37;DP=84;FAO=37;FDP=83;FR=.;FRO=46;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=23;FSRR=23;FWDB=0.0190913;FXX=0.0235266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.7878;QD=16.7206;RBI=0.0217681;REFB=-0.00395468;REVB=0.0104581;RO=46;SAF=16;SAR=21;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0671556;STB=0.537734;STBP=0.563;TYPE=snp;VARB=0.012914;OID=.;OPOS=187088656;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:83:46:46:37:37:0.445783:21:16:23:23:21:16:23:23
chr3	187088812	.	C	T	205.36	PASS	AF=0.428571;AO=24;DP=56;FAO=24;FDP=56;FR=.;FRO=32;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=-0.00314924;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.815;QD=14.6688;RBI=0.0152569;REFB=-0.000712737;REVB=-0.0149284;RO=32;SAF=8;SAR=16;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112142;STB=0.564048;STBP=0.413;TYPE=snp;VARB=0.00126953;OID=.;OPOS=187088812;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:32:32:24:24:0.428571:16:8:14:18:16:8:14:18
chr3	187088903	.	C	A	63.34	PASS	AF=0.310345;AO=9;DP=29;FAO=9;FDP=29;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.0118277;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.9066;QD=8.73681;RBI=0.0130349;REFB=-0.0225542;REVB=-0.00547852;RO=20;SAF=4;SAR=5;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00628668;STB=0.503867;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0459692;OID=.;OPOS=187088903;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:29:29:20:20:9:9:0.310345:5:4:9:11:5:4:9:11
chr3	187088926	.	G	A	191.12	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0267174;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.328;QD=47.7811;RBI=0.0346434;REFB=0;REVB=0.0220532;RO=0;SAF=5;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.36667e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.75406e-05;OID=.;OPOS=187088926;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:11:5:0:0:11:5:0:0
chr3	187089031	.	C	A	268.75	PASS	AF=0.520833;AO=25;DP=47;FAO=25;FDP=48;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=-0.000265312;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.392;QD=22.3957;RBI=0.0381943;REFB=-0.027039;REVB=-0.0381934;RO=22;SAF=11;SAR=14;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0655864;STB=0.545264;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.0220951;OID=.;OPOS=187089031;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:48:22:23:25:25:0.520833:14:11:8:14:14:11:8:15
chr3	187416634	.	C	A	326.85	PASS	AF=0.428571;AO=36;DP=84;FAO=36;FDP=84;FR=.;FRO=48;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=29;FSRR=19;FWDB=0.0542451;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.0929;QD=15.5643;RBI=0.0601324;REFB=-0.00562797;REVB=-0.0259496;RO=48;SAF=13;SAR=23;SRF=29;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.246141;STB=0.638812;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.00772629;OID=.;OPOS=187416634;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:48:48:36:36:0.428571:23:13:29:19:23:13:29:19
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chr3	187446211	.	C	T	393.31	PASS	AF=0.47619;AO=40;DP=87;FAO=40;FDP=84;FR=.;FRO=44;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=31;FWDB=0.00301079;FXX=0.0454494;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.5752;QD=18.729;RBI=0.00517259;REFB=-0.0160745;REVB=-0.00420605;RO=44;SAF=25;SAR=15;SRF=13;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.303256;STB=0.668523;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0283744;OID=.;OPOS=187446211;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:84:44:44:40:40:0.47619:15:25:13:31:15:25:13:31
chr3	187447032	.	G	A	385.27	PASS	AF=0.627119;AO=37;DP=59;FAO=37;FDP=59;FR=.;FRO=22;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=0.0305854;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.392;QD=26.1198;RBI=0.044806;REFB=0.0103424;REVB=0.032743;RO=22;SAF=19;SAR=18;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0218029;STB=0.51192;STBP=0.818;TYPE=snp;VARB=-0.00558525;OID=.;OPOS=187447032;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:22:22:37:37:0.627119:18:19:12:10:18:19:12:10
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chr3	188868753	.	A	G	386.81	PASS	AF=0.418367;AO=41;DP=98;FAO=41;FDP=98;FR=.;FRO=57;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=31;FSRR=26;FWDB=-0.0073679;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.49;QD=15.7881;RBI=0.00746813;REFB=-0.00197433;REVB=-0.00121938;RO=56;SAF=23;SAR=18;SRF=31;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00768908;STB=0.510076;STBP=0.883;TYPE=snp;VARB=0.00248668;OID=.;OPOS=188868753;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:56:57:41:41:0.418367:18:23:31:25:18:23:31:26
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chr3	189713205	.	T	C	208.74	PASS	AF=0.444444;AO=24;DP=54;FAO=24;FDP=54;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=-0.0415453;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.0154;QD=15.4621;RBI=0.0415453;REFB=-0.0108115;REVB=-1.56946e-05;RO=30;SAF=13;SAR=11;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.202175;STB=0.614237;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.0130278;OID=.;OPOS=189713205;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:30:30:24:24:0.444444:11:13:10:20:11:13:10:20
chr3	190023552	.	T	C	88.22	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000317088;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.594;QD=39.2068;RBI=0.0330579;REFB=0;REVB=-0.0330564;RO=0;SAF=4;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000262969;OID=.;OPOS=190023552;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:5:4:0:0:5:4:0:0
chr3	190024457	.	A	G	851.16	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0151995;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.831;QD=57.7057;RBI=0.0284254;REFB=0;REVB=0.0240204;RO=0;SAF=32;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.96591e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.69309e-05;OID=.;OPOS=190024457;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:27:32:0:0:27:32:0:0
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chr3	190333162	.	TG	T,TT	1335.38	PASS	AF=1,0;AO=76,10;DP=86;FAO=87,0;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=30,0;FSAR=57,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0196439,-0.0219456;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=328.399,311.674;QD=61.3967;RBI=0.019805,0.0220001;REFB=0,0;REVB=0.00252131,0.00154759;RO=0;SAF=25,5;SAR=51,5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=1.15422e-05,0;OID=.,.;OPOS=190333163,190333163;OREF=G,G;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1,0:76,10:86:87,0:87:0:30,0:57,0:0:0:7:0:25,5:51,5:0:0
chr3	190360102	.	G	A	670.2	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0651371;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.473;QD=62.3444;RBI=0.0657246;REFB=0;REVB=-0.00876824;RO=0;SAF=16;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000431738;OID=.;OPOS=190360102;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:27:16:0:0:27:16:0:0
chr3	191047532	.	A	G	2436.56	PASS	AF=1;AO=155;DP=155;FAO=159;FDP=159;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0422418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.33;QD=61.2971;RBI=0.0634438;REFB=0;REVB=0.0473364;RO=0;SAF=73;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.52411e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.30674e-05;OID=.;OPOS=191047532;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:155:159:0:0:155:159:1:82:73:0:0:85:74:0:0
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chr3	191075902	.	C	T	177.32	PASS	AF=0.37931;AO=22;DP=58;FAO=22;FDP=58;FR=.;FRO=36;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=-0.0189629;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.224;QD=12.229;RBI=0.0263682;REFB=0.00188435;REVB=-0.0183218;RO=36;SAF=11;SAR=11;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0596837;STB=0.534452;STBP=0.709;TYPE=snp;VARB=-0.00256728;OID=.;OPOS=191075902;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:36:36:22:22:0.37931:11:11:20:16:11:11:20:16
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chr3	191810914	.	TA	CG	483.35	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0280169;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=172.467;QD=58.5878;RBI=0.0376469;REFB=0;REVB=0.0251464;RO=0;SAF=18;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.64315e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000429465;OID=.;OPOS=191810914;OREF=TA;OALT=CG;OMAPALT=CG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:15:18:0:0:15:18:0:0
chr3	192447403	.	G	A	808.57	PASS	AF=1;AO=57;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00715683;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.022;QD=55.7632;RBI=0.0203205;REFB=-0.0503679;REVB=-0.0190185;RO=1;SAF=30;SAR=27;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.017147;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000215739;OID=.;OPOS=192447403;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:58:58:1:0:57:58:1:27:30:0:1:28:30:0:0
chr3	192447418	.	A	G	829.28	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0133279;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.766;QD=57.1914;RBI=0.0225316;REFB=0;REVB=0.0181671;RO=0;SAF=25;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.35607e-05;OID=.;OPOS=192447418;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:53:58:0:0:53:58:1:28:25:0:0:30:28:0:0
chr3	192515557	.	G	A	868.15	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0184405;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.009;QD=57.8769;RBI=0.0709672;REFB=0;REVB=-0.0685295;RO=0;SAF=33;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.7886e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.898e-05;OID=.;OPOS=192515557;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:27:33:0:0:27:33:0:0
chr3	192994543	.	A	G	526.53	PASS	AF=0.519231;AO=54;DP=104;FAO=54;FDP=104;FR=.;FRO=50;FSAF=22;FSAR=32;FSRF=24;FSRR=26;FWDB=0.048158;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.1562;QD=20.2511;RBI=0.0614582;REFB=-0.0264454;REVB=0.0381827;RO=50;SAF=22;SAR=32;SRF=24;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0646391;STB=0.535649;STBP=0.471;TYPE=snp;VARB=0.0221139;OID=.;OPOS=192994543;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:104:50:50:54:54:0.519231:32:22:24:26:32:22:24:26
chr3	193031926	.	C	T	213.91	PASS	AF=0.512195;AO=21;DP=41;FAO=21;FDP=41;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.0358467;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.7895;QD=20.8694;RBI=0.0987729;REFB=-0.023403;REVB=-0.0920386;RO=20;SAF=9;SAR=12;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105504;STB=0.559384;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=0.0182178;OID=.;OPOS=193031926;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:20:20:21:21:0.512195:12:9:11:9:12:9:11:9
chr3	193036783	.	G	A	72.35	PASS	AF=0.294118;AO=10;DP=34;FAO=10;FDP=34;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.00230973;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.885;QD=8.5119;RBI=0.0148696;REFB=-0.0373558;REVB=-0.0146892;RO=23;SAF=6;SAR=4;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0902872;STB=0.542084;STBP=0.804;TYPE=snp;VARB=0.0194984;OID=.;OPOS=193036783;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:34:34:23:24:10:10:0.294118:4:6:12:11:4:6:13:11
chr3	193036794	.	G	C	594.54	PASS	AF=1;AO=38;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0239403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.569;QD=60.9785;RBI=0.0264466;REFB=0;REVB=-0.0112375;RO=0;SAF=24;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.76123e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.5372e-05;OID=.;OPOS=193036794;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:38:39:1:14:24:0:0:15:24:0:0
chr3	193042776	.	T	C	575.81	PASS	AF=1;AO=36;DP=37;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0391852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.4;QD=60.6119;RBI=0.0391914;REFB=0;REVB=0.000696179;RO=0;SAF=20;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.9376e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000130322;OID=.;OPOS=193042776;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:38:0:0:36:38:1:16:20:0:0:18:20:0:0
chr3	193080414	.	C	G	937.61	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00958202;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=260.664;QD=58.6006;RBI=0.0137172;REFB=0;REVB=0.00981567;RO=0;SAF=34;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.11053e-05;OID=.;OPOS=193080414;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:30:34:0:0:30:34:0:0
chr3	193096529	.	C	T	976.41	PASS	AF=0.985294;AO=67;DP=68;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00690219;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.443;QD=57.436;RBI=0.006903;REFB=0.0200791;REVB=0.000105171;RO=1;SAF=30;SAR=37;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154913;STB=0.508194;STBP=0.291;TYPE=snp;VARB=3.52114e-05;OID=.;OPOS=193096529;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:68:68:1:1:67:67:0.985294:37:30:1:0:37:30:1:0
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chr3	193183817	.	A	G	241.69	PASS	AF=0.522727;AO=23;DP=44;FAO=23;FDP=44;FR=.;FRO=21;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=0.0548486;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.394;QD=21.9719;RBI=0.0574276;REFB=-0.014086;REVB=0.0170166;RO=21;SAF=14;SAR=9;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0525437;STB=0.529387;STBP=0.767;TYPE=snp;VARB=0.00780759;OID=.;OPOS=193183817;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:21:21:23:23:0.522727:9:14:14:7:9:14:14:7
chr3	193209178	.	T	C	176.26	PASS	AF=0.529412;AO=18;DP=34;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.00875064;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.4416;QD=20.7368;RBI=0.0126069;REFB=0.0003308;REVB=-0.00907523;RO=16;SAF=10;SAR=8;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00586403;STB=0.503308;STBP=0.997;TYPE=snp;VARB=-0.000919822;OID=.;OPOS=193209178;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:16:16:18:18:0.529412:8:10:9:7:8:10:9:7
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chr3	193365939	.	T	G	651.93	PASS	AF=0.596154;AO=62;DP=104;FAO=62;FDP=104;FR=.;FRO=42;FSAF=29;FSAR=33;FSRF=25;FSRR=17;FWDB=0.00504276;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.683;QD=25.0743;RBI=0.0219611;REFB=-0.0248669;REVB=0.0213742;RO=40;SAF=29;SAR=33;SRF=24;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0951431;STB=0.551345;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=0.0179133;OID=.;OPOS=193365939;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:104:40:42:62:62:0.596154:33:29:24:16:33:29:25:17
chr3	193374964	.	T	C	504.3	PASS	AF=0.5875;AO=47;DP=80;FAO=47;FDP=80;FR=.;FRO=33;FSAF=14;FSAR=33;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=0.00613004;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.984;QD=25.2151;RBI=0.0175949;REFB=-0.0124984;REVB=0.0164925;RO=33;SAF=14;SAR=33;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.224557;STB=0.6233;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.0114141;OID=.;OPOS=193374964;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:33:33:47:47:0.5875:33:14:19:14:33:14:19:14
chr3	193386239	.	C	T	285.17	PASS	AF=0.388235;AO=33;DP=84;FAO=33;FDP=85;FR=.;FRO=52;FSAF=23;FSAR=10;FSRF=37;FSRR=15;FWDB=0.0103697;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.6399;QD=13.4196;RBI=0.0108197;REFB=-0.0209139;REVB=-0.00308795;RO=47;SAF=23;SAR=10;SRF=33;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00634247;STB=0.510632;STBP=0.89;TYPE=snp;VARB=0.023029;OID=.;OPOS=193386239;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:85:47:52:33:33:0.388235:10:23:33:14:10:23:37:15
chr3	193855648	.	G	C	38.69	PASS	AF=0.179487;AO=4;DP=33;FAO=7;FDP=39;FR=.;FRO=32;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=12;FSRR=20;FWDB=0.0323576;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.3091;QD=3.96771;RBI=0.0332492;REFB=-0.0926307;REVB=-0.00764807;RO=29;SAF=3;SAR=1;SRF=9;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.464173;STB=0.873991;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.145694;OID=.;OPOS=193855648;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:33:39:29:32:4:7:0.179487:1:3:9:20:1:6:12:20
chr3	193863706	.	A	G	72.16	PASS	AF=0.454545;AO=9;DP=22;FAO=10;FDP=22;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.0570522;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.3929;QD=13.12;RBI=0.0570533;REFB=-0.030752;REVB=0.000352525;RO=12;SAF=6;SAR=3;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0865477;STB=0.509415;STBP=0.949;TYPE=snp;VARB=0.0230864;OID=.;OPOS=193863706;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:22:22:12:12:9:10:0.454545:3:6:7:5:4:6:7:5
chr3	194061826	.	C	T	334.38	PASS	AF=0.6;AO=33;DP=56;FAO=33;FDP=55;FR=.;FRO=22;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=0.0398977;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.613;QD=24.3183;RBI=0.0443753;REFB=-0.0433522;REVB=0.0194253;RO=22;SAF=14;SAR=19;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185981;STB=0.602125;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=0.0200793;OID=.;OPOS=194061826;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:55:22:22:33:33:0.6:19:14:15:7:19:14:15:7
chr3	194061906	.	TG	CA,CG	886.3	PASS	AF=0.444444,0.555556;AO=27,35;DP=62;FAO=28,35;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=13,13;FSAR=15,22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148399,-0.0238814;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=196.211,65.5113;QD=56.2732;RBI=0.0201887,0.0242289;REFB=0,0;REVB=0.0136881,-0.00408854;RO=0;SAF=12,13;SAR=15,22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,4.39865e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0053466,-0.00856147;OID=.,.;OPOS=194061906,194061906;OREF=TG,T;OALT=CA,C;OMAPALT=CA,CG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:62:63:0:0:27,35:28,35:0.444444,0.555556:15,22:12,13:0:0:15,22:13,13:0:0
chr3	194062565	.	C	T	58.16	PASS	AF=1;AO=6;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0785201;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.4965;QD=33.2344;RBI=0.130848;REFB=0;REVB=0.104671;RO=0;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0247938;OID=.;OPOS=194062565;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:6:7:1:2:4:0:0:3:4:0:0
chr3	194063153	.	G	A	308.01	PASS	AF=0.588235;AO=23;DP=51;FAO=30;FDP=51;FR=.;FRO=21;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=0.0188494;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.648;QD=24.1575;RBI=0.0212196;REFB=-0.0182474;REVB=0.00974532;RO=17;SAF=11;SAR=12;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0838134;STB=0.508191;STBP=0.896;TYPE=snp;VARB=0.0119253;OID=.;OPOS=194063153;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:17:21:23:30:0.588235:12:11:10:7:12:18:13:8
chr3	194063300	.	T	C	1544.94	PASS	AF=1;AO=102;DP=105;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0160056;FXX=0.0188661;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.4942;QD=59.4207;RBI=0.0232665;REFB=0;REVB=0.0168864;RO=0;SAF=43;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00505686;OID=.;OPOS=194063300;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:105:104:0:0:102:104:1:59:43:0:0:61:43:0:0
chr3	194118874	.	T	C	804.64	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.025317;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.717;QD=64.3712;RBI=0.0319513;REFB=0;REVB=0.0194919;RO=0;SAF=21;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.20481e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.95854e-05;OID=.;OPOS=194118874;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:29:21:0:0:29:21:0:0
chr3	194124421	.	A	G	345.1	PASS	AF=0.445783;AO=37;DP=83;FAO=37;FDP=83;FR=.;FRO=46;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=23;FSRR=23;FWDB=0.0256722;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.156;QD=16.6312;RBI=0.0260472;REFB=-0.000743746;REVB=-0.00440415;RO=46;SAF=18;SAR=19;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133325;STB=0.507488;STBP=0.895;TYPE=snp;VARB=0.000770904;OID=.;OPOS=194124421;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:46:46:37:37:0.445783:19:18:23:23:19:18:23:23
chr3	194124427	.	C	T	437.92	PASS	AF=0.530864;AO=43;DP=81;FAO=43;FDP=81;FR=.;FRO=38;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=-0.0134552;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.932;QD=21.6256;RBI=0.0209344;REFB=-0.0243383;REVB=-0.0160377;RO=37;SAF=21;SAR=22;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.046996;STB=0.519255;STBP=0.738;TYPE=snp;VARB=0.0124246;OID=.;OPOS=194124427;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:37:38:43:43:0.530864:22:21:16:21:22:21:17:21
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chr3	194337901	.	T	C	1116.73	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0433009;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.641;QD=60.364;RBI=0.0446422;REFB=0;REVB=-0.0108607;RO=0;SAF=52;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.53902e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000143998;OID=.;OPOS=194337901;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:22:52:0:0:22:52:0:0
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chr3	194373832	.	TG	CA	2311.01	PASS	AF=1;AO=151;DP=155;FAO=151;FDP=151;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0218741;FXX=0.0258048;HRUN=2;LEN=2;MLLD=346.266;QD=61.2188;RBI=0.0242653;REFB=0;REVB=0.0105039;RO=0;SAF=87;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000137734;OID=.;OPOS=194373832;OREF=TG;OALT=CA;OMAPALT=CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:155:151:0:0:151:151:1:64:87:0:0:64:87:0:0
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chr3	195076877	.	C	G	251.64	PASS	AF=0.426471;AO=29;DP=68;FAO=29;FDP=68;FR=.;FRO=39;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=-0.0177248;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.94;QD=14.8022;RBI=0.0416138;REFB=-0.0223917;REVB=0.0376503;RO=36;SAF=12;SAR=17;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0583321;STB=0.54271;STBP=0.6;TYPE=snp;VARB=0.0289705;OID=.;OPOS=195076877;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:36:39:29:29:0.426471:17:12:17:19:17:12:19:20
chr3	195345828	.	AG	GA	310.22	PASS	AF=1;AO=23;DP=24;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.011142;FXX=0.0416493;HRUN=1;LEN=2;MLLD=131.444;QD=53.9513;RBI=0.0265057;REFB=0;REVB=-0.0240501;RO=0;SAF=15;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=-0.000104549;OID=.;OPOS=195345828;OREF=AG;OALT=GA;OMAPALT=GA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:23:0:0:23:23:1:8:15:0:0:8:15:0:0
chr3	195345953	.	C	T	115.28	PASS	AF=0.541667;AO=13;DP=24;FAO=13;FDP=24;FR=.;FRO=11;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=2;FWDB=0.0059026;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.6915;QD=19.2132;RBI=0.00734931;REFB=-0.0378564;REVB=-0.00437855;RO=11;SAF=7;SAR=6;SRF=9;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.232786;STB=0.631394;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=0.0142632;OID=.;OPOS=195345953;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:24:24:11:11:13:13:0.541667:6:7:9:2:6:7:9:2
chr3	195346477	.	C	T	264.63	PASS	AF=0.529412;AO=27;DP=51;FAO=27;FDP=51;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=0.0178405;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.2481;QD=20.7553;RBI=0.0302856;REFB=-0.0038452;REVB=-0.0244731;RO=22;SAF=11;SAR=16;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0761434;STB=0.544346;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.00546158;OID=.;OPOS=195346477;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:22:24:27:27:0.529412:16:11:11:11:16:11:12:12
chr3	195346906	.	C	T	69.71	PASS	AF=0.217391;AO=10;DP=47;FAO=10;FDP=46;FR=.;FRO=36;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=23;FWDB=-0.0336792;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.4172;QD=6.06204;RBI=0.0449255;REFB=-0.0154281;REVB=0.0297323;RO=36;SAF=4;SAR=6;SRF=13;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.050025;STB=0.532047;STBP=0.862;TYPE=snp;VARB=0.0314432;OID=.;OPOS=195346906;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:69:47:46:36:36:10:10:0.217391:6:4:13:23:6:4:13:23
chr3	195404649	.	A	G	55.41	PASS	AF=0.363636;AO=8;DP=22;FAO=8;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=-0.014943;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.1171;QD=10.0741;RBI=0.0193241;REFB=-0.0137359;REVB=-0.0122526;RO=14;SAF=2;SAR=6;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0515286;STB=0.531174;STBP=0.91;TYPE=snp;VARB=0.0130035;OID=.;OPOS=195404649;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:22:22:14:14:8:8:0.363636:6:2:3:11:6:2:3:11
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chr3	195451880	.	AG	GA	235.18	PASS	AF=0.594595;AO=22;DP=37;FAO=22;FDP=37;FR=.;FRO=15;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.0582853;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=102.795;QD=25.4248;RBI=0.0583041;REFB=-0.0123349;REVB=0.0014779;RO=14;SAF=14;SAR=8;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0999037;STB=0.544001;STBP=0.539;TYPE=mnp;VARB=0.00530928;OID=.;OPOS=195451880;OREF=AG;OALT=GA;OMAPALT=GA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:14:15:22:22:0.594595:8:14:7:7:8:14:8:7
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chr3	195477791	.	G	A	484.56	PASS	AF=0.567901;AO=43;DP=78;FAO=46;FDP=81;FR=.;FRO=35;FSAF=29;FSAR=17;FSRF=20;FSRR=15;FWDB=0.0303964;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.885;QD=23.9289;RBI=0.0317746;REFB=-0.0175856;REVB=0.00925655;RO=35;SAF=28;SAR=15;SRF=20;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0697379;STB=0.526961;STBP=0.599;TYPE=snp;VARB=0.0134855;OID=.;OPOS=195477791;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:81:35:35:43:46:0.567901:15:28:20:15:17:29:20:15
chr3	195479256	.	T	C	299.52	PASS	AF=0.54;AO=26;DP=49;FAO=27;FDP=50;FR=.;FRO=23;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=-0.068036;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.8051;QD=23.9616;RBI=0.0842254;REFB=-0.0123618;REVB=0.0496489;RO=23;SAF=13;SAR=13;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0548666;STB=0.521529;STBP=0.781;TYPE=snp;VARB=0.00998204;OID=.;OPOS=195479256;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:50:23:23:26:27:0.54:13:13:10:13:14:13:10:13
chr3	195489009	.	C	A	1250.93	PASS	AF=0.58209;AO=117;DP=202;FAO=117;FDP=201;FR=.;FRO=84;FSAF=62;FSAR=55;FSRF=50;FSRR=34;FWDB=0.00655966;FXX=0.00495025;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.553;QD=24.8942;RBI=0.0133853;REFB=-0.0324516;REVB=0.0116678;RO=83;SAF=62;SAR=55;SRF=49;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0465799;STB=0.527483;STBP=0.374;TYPE=snp;VARB=0.0229864;OID=.;OPOS=195489009;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:202:201:83:84:117:117:0.58209:55:62:49:34:55:62:50:34
chr3	195489067	.	C	G	1313.12	PASS	AF=0.541126;AO=125;DP=231;FAO=125;FDP=231;FR=.;FRO=106;FSAF=54;FSAR=71;FSRF=54;FSRR=52;FWDB=0.00900109;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.4189;QD=22.7381;RBI=0.072584;REFB=0.0369598;REVB=-0.0720238;RO=105;SAF=54;SAR=71;SRF=53;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0614967;STB=0.535843;STBP=0.236;TYPE=snp;VARB=-0.0325051;OID=.;OPOS=195489067;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:231:231:105:106:125:125:0.541126:71:54:53:52:71:54:54:52
chr3	195495916	.	G	C	278.9	PASS	AF=0.4;AO=31;DP=80;FAO=32;FDP=80;FR=.;FRO=48;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=31;FSRR=17;FWDB=0.00466879;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=163.932;QD=13.9447;RBI=0.0103996;REFB=-0.0156258;REVB=-0.00929271;RO=41;SAF=16;SAR=15;SRF=25;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0948203;STB=0.569578;STBP=0.348;TYPE=snp;VARB=0.022701;OID=.;OPOS=195495916;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:41:48:31:32:0.4:15:16:25:16:15:17:31:17
chr3	195497143	.	C	T	302.89	PASS	AF=0.384615;AO=34;DP=90;FAO=35;FDP=91;FR=.;FRO=56;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=31;FSRR=25;FWDB=0.0123522;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=234.565;QD=13.314;RBI=0.0124657;REFB=-0.00722984;REVB=0.00167858;RO=56;SAF=17;SAR=17;SRF=31;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0583002;STB=0.524215;STBP=0.73;TYPE=snp;VARB=0.0122274;OID=.;OPOS=195497143;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:91:56:56:34:35:0.384615:17:17:31:25:17:18:31:25
chr3	195497174	.	C	G	653.37	PASS	AF=0.612903;AO=57;DP=93;FAO=57;FDP=93;FR=.;FRO=36;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=0.0201373;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.8566;QD=28.1019;RBI=0.033178;REFB=-0.0102645;REVB=0.026368;RO=36;SAF=32;SAR=25;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0242014;STB=0.513168;STBP=0.726;TYPE=snp;VARB=0.00975236;OID=.;OPOS=195497174;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:36:36:57:57:0.612903:25:32:19:17:25:32:19:17
chr3	195497743	.	T	C	240.15	PASS	AF=0.465517;AO=27;DP=58;FAO=27;FDP=58;FR=.;FRO=31;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=0.0144999;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.809;QD=16.5617;RBI=0.0604744;REFB=-0.00624771;REVB=0.0587104;RO=31;SAF=14;SAR=13;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0938681;STB=0.552827;STBP=0.474;TYPE=snp;VARB=0.00677363;OID=.;OPOS=195497743;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:31:31:27:27:0.465517:13:14:13:18:13:14:13:18
chr3	195501149	.	C	T	242.95	PASS	AF=0.451613;AO=28;DP=60;FAO=28;FDP=62;FR=.;FRO=34;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=20;FWDB=-0.0186369;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.9762;QD=15.6744;RBI=0.0190335;REFB=-0.0384172;REVB=-0.00386539;RO=32;SAF=17;SAR=11;SRF=12;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218541;STB=0.607066;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=0.0468175;OID=.;OPOS=195501149;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:62:32:34:28:28:0.451613:11:17:12:20:11:17:14:20
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chr3	195516087	.	G	A	308.69	PASS	AF=0.627907;AO=27;DP=43;FAO=27;FDP=43;FR=.;FRO=16;FSAF=20;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=2;FWDB=0.0253762;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.2741;QD=28.7148;RBI=0.0353769;REFB=-0.0319108;REVB=0.024649;RO=16;SAF=20;SAR=7;SRF=14;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126886;STB=0.569331;STBP=0.341;TYPE=snp;VARB=0.0201711;OID=.;OPOS=195516087;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:16:16:27:27:0.627907:7:20:14:2:7:20:14:2
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chr3	195516878	.	T	C	159.08	PASS	AF=0.666667;AO=13;DP=26;FAO=16;FDP=24;FR=.,HEALED;FRO=8;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.109695;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.82;QD=26.5136;RBI=0.115661;REFB=-0.0026705;REVB=0.0366658;RO=10;SAF=4;SAR=9;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0795218;STB=0.52125;STBP=0.759;TYPE=snp;VARB=0.00399633;OID=.;OPOS=195516878;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:26:24:10:8:13:16:0.666667:9:4:4:6:9:7:3:5
chr3	195517258	.	G	A	252.78	PASS	AF=0.5;AO=24;DP=47;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.0129764;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.668;QD=21.0652;RBI=0.0170444;REFB=-0.00130282;REVB=0.011051;RO=20;SAF=13;SAR=11;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0340521;STB=0.521035;STBP=0.808;TYPE=snp;VARB=0.00083708;OID=.;OPOS=195517258;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:48:20:24:24:24:0.5:11:13:10:10:11:13:14:10
chr3	195517321	.	G	A	129.61	PASS	AF=0.314815;AO=17;DP=54;FAO=17;FDP=54;FR=.;FRO=37;FSAF=15;FSAR=2;FSRF=24;FSRR=13;FWDB=-0.0143367;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.849;QD=9.60053;RBI=0.0243686;REFB=-0.00405616;REVB=-0.019705;RO=37;SAF=15;SAR=2;SRF=24;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.393568;STB=0.742227;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.0105431;OID=.;OPOS=195517321;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:37:37:17:17:0.314815:2:15:24:13:2:15:24:13
chr3	195517553	.	A	C	118.79	PASS	AF=0.619048;AO=13;DP=21;FAO=13;FDP=21;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.0228721;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=129.834;QD=22.6272;RBI=0.0235816;REFB=-0.0187891;REVB=-0.00574097;RO=8;SAF=5;SAR=8;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0985854;STB=0.555473;STBP=0.604;TYPE=snp;VARB=0.0126776;OID=.;OPOS=195517553;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:21:21:8:8:13:13:0.619048:8:5:2:6:8:5:2:6
chr3	195518112	.	T	A,TGTCTCCTGCGTAACA	162.25	PASS	AF=0.0705882,0.211765;AO=6,18;DP=88;FAO=6,18;FDP=85;FR=.;FRO=61;FSAF=6,5;FSAR=0,13;FSRF=29;FSRR=32;FWDB=0.00966646,-0.00365123;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,15;MLLD=198.859,450.047;QD=7.63534;RBI=0.0113021,0.00371703;REFB=-0.00534004,-0.00347094;REVB=0.00585633,-0.000696324;RO=64;SAF=6,5;SAR=0,13;SRF=29;SRR=35;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.600759,-0.23419;STB=0.998263,0.66248;STBP=0.008,0.143;TYPE=snp,ins;VARB=-0.00991685,0.0124317;OID=.,.;OPOS=195518112,195518113;OREF=T,-;OALT=A,GTCTCCTGCGTAACA;OMAPALT=A,TGTCTCCTGCGTAACA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:88:85:64:61:6,18:6,18:0.0705882,0.211765:0,13:6,5:29:35:0,13:6,5:29:32
chr3	195606019	.	G	A	56.28	PASS	AF=0.4;AO=8;DP=20;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=-0.0344867;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.472;QD=11.257;RBI=0.0575366;REFB=4.42359e-05;REVB=0.0460558;RO=12;SAF=2;SAR=6;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.192383;STB=0.617332;STBP=0.454;TYPE=snp;VARB=0.000181968;OID=.;OPOS=195606019;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:20:20:12:12:8:8:0.4:6:2:5:7:6:2:5:7
chr3	195615376	.	A	G	321.2	PASS	AF=0.651163;AO=27;DP=43;FAO=28;FDP=43;FR=.;FRO=15;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.0400588;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.148;QD=29.8793;RBI=0.0402493;REFB=-0.0186583;REVB=-0.00391211;RO=15;SAF=9;SAR=18;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138303;STB=0.564413;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=0.00907097;OID=.;OPOS=195615376;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:15:15:27:28:0.651163:18:9:8:7:18:10:8:7
chr3	195668478	.	A	G	726.88	PASS	AF=0.963636;AO=53;DP=55;FAO=53;FDP=55;FR=.;FRO=2;FSAF=34;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0132385;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.0132;QD=52.864;RBI=0.0132495;REFB=-0.0139736;REVB=0.000540176;RO=2;SAF=34;SAR=19;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0104968;STB=0.505574;STBP=0.78;TYPE=snp;VARB=0.00205249;OID=.;OPOS=195668478;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:55:55:2:2:53:53:0.963636:19:34:1:1:19:34:1:1
chr3	195692347	.	G	A	35.22	PASS	AF=0.0673077;AO=14;DP=208;FAO=14;FDP=208;FR=.;FRO=194;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=94;FSRR=100;FWDB=-0.0188952;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.018;QD=0.677402;RBI=0.0189319;REFB=-0.00191052;REVB=-0.00117718;RO=194;SAF=6;SAR=8;SRF=94;SRR=100;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0604398;STB=0.552411;STBP=0.701;TYPE=snp;VARB=0.0276743;OID=.;OPOS=195692347;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:208:208:194:194:14:14:0.0673077:8:6:94:100:8:6:94:100
chr3	195701278	.	C	T	107.77	PASS	AF=0.173913;AO=20;DP=115;FAO=20;FDP=115;FR=.;FRO=95;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=51;FSRR=44;FWDB=0.0160578;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.553;QD=3.74859;RBI=0.016814;REFB=0.0012088;REVB=-0.00498589;RO=94;SAF=10;SAR=10;SRF=51;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0540522;STB=0.530405;STBP=0.803;TYPE=snp;VARB=-0.0150233;OID=.;OPOS=195701278;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:115:94:95:20:20:0.173913:10:10:51:43:10:10:51:44
chr3	195701285	.	G	T	110.53	PASS	AF=0.168;AO=21;DP=126;FAO=21;FDP=125;FR=.;FRO=104;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=53;FSRR=51;FWDB=0.00840773;FXX=0.00793588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.765;QD=3.53707;RBI=0.0251242;REFB=-0.00022539;REVB=-0.0236757;RO=105;SAF=11;SAR=10;SRF=54;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0121195;STB=0.511812;STBP=0.965;TYPE=snp;VARB=0.00094066;OID=.;OPOS=195701285;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:126:125:105:104:21:21:0.168:10:11:54:51:10:11:53:51
chr3	195701304	.	C	T	127.31	PASS	AF=0.163265;AO=24;DP=147;FAO=24;FDP=147;FR=.;FRO=123;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=64;FSRR=59;FWDB=0.0184657;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=228.239;QD=3.46433;RBI=0.0205995;REFB=0.000333414;REVB=0.00912985;RO=123;SAF=12;SAR=12;SRF=64;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0259237;STB=0.516993;STBP=0.886;TYPE=snp;VARB=-0.00367249;OID=.;OPOS=195701304;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:147:147:123:123:24:24:0.163265:12:12:64:59:12:12:64:59
chr3	195701310	.	C	CAA	62.46	PASS	AF=0.164474;AO=24;DP=153;FAO=25;FDP=152;FR=.;FRO=127;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=64;FSRR=63;FWDB=0.0169526;FXX=0.00653552;HRUN=1;LEN=2;MLLD=45.8442;QD=1.64369;RBI=0.0194642;REFB=0.00919894;REVB=-0.00956385;RO=127;SAF=12;SAR=12;SRF=65;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0150525;STB=0.513417;STBP=0.889;TYPE=ins;VARB=-0.047375;OID=.;OPOS=195701311;OREF=-;OALT=AA;OMAPALT=CAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.164474:24:153:25:152:127:13:12:64:63:62:127:12:12:65:62
chr3	195701331	.	G	A	187.47	PASS	AF=0.195266;AO=33;DP=169;FAO=33;FDP=169;FR=.;FRO=136;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=69;FSRR=67;FWDB=-0.0139882;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.329;QD=4.43725;RBI=0.0387396;REFB=0.00284901;REVB=0.036126;RO=136;SAF=16;SAR=17;SRF=69;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.028798;STB=0.518096;STBP=0.816;TYPE=snp;VARB=-0.0199083;OID=.;OPOS=195701331;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:169:169:136:136:33:33:0.195266:17:16:69:67:17:16:69:67
chr3	195701388	.	GC	AA	773.8	PASS	AF=0.516556;AO=78;DP=152;FAO=78;FDP=151;FR=.;FRO=73;FSAF=42;FSAR=36;FSRF=33;FSRR=40;FWDB=-0.000368082;FXX=0.013071;HRUN=2;LEN=2;MLLD=177.456;QD=20.498;RBI=0.0166363;REFB=-0.00540554;REVB=0.0166322;RO=73;SAF=42;SAR=36;SRF=33;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0760217;STB=0.541741;STBP=0.293;TYPE=mnp;VARB=0.00438333;OID=.;OPOS=195701388;OREF=GC;OALT=AA;OMAPALT=AA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:152:151:73:73:78:78:0.516556:36:42:33:40:36:42:33:40
chr3	195710989	.	G	A	277.74	PASS	AF=0.308333;AO=37;DP=122;FAO=37;FDP=120;FR=.;FRO=83;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=41;FSRR=42;FWDB=-0.0144133;FXX=0.0243883;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.359;QD=9.25791;RBI=0.0229553;REFB=-0.00725859;REVB=0.0178662;RO=82;SAF=16;SAR=21;SRF=40;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0658051;STB=0.542834;STBP=0.554;TYPE=snp;VARB=0.0405504;OID=.;OPOS=195710989;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:122:120:82:83:37:37:0.308333:21:16:40:42:21:16:41:42
chr3	195710993	.	A	G	374.51	PASS	AF=0.343284;AO=46;DP=133;FAO=46;FDP=134;FR=.;FRO=88;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=44;FSRR=44;FWDB=-0.0091615;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.951;QD=11.1793;RBI=0.0164397;REFB=0.00464192;REVB=-0.0136503;RO=87;SAF=22;SAR=24;SRF=43;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0182232;STB=0.51428;STBP=0.823;TYPE=snp;VARB=-0.00752258;OID=.;OPOS=195710993;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:133:134:87:88:46:46:0.343284:24:22:43:44:24:22:44:44
chr3	195711016	.	G	A	1122.72	PASS	AF=0.63125;AO=101;DP=161;FAO=101;FDP=160;FR=.;FRO=59;FSAF=48;FSAR=53;FSRF=29;FSRR=30;FWDB=-0.0025962;FXX=0.00621079;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.4753;QD=28.068;RBI=0.0173152;REFB=-0.0010532;REVB=-0.0171195;RO=59;SAF=48;SAR=53;SRF=29;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.011135;STB=0.506012;STBP=0.852;TYPE=snp;VARB=0.0006525;OID=.;OPOS=195711016;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:161:160:59:59:101:101:0.63125:53:48:29:30:53:48:29:30
chr3	195938177	.	A	G	194.9	PASS	AF=0.444444;AO=20;DP=45;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=-0.0815245;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.035;QD=17.3246;RBI=0.0845062;REFB=0.017;REVB=-0.0222498;RO=24;SAF=11;SAR=9;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.048064;STB=0.538936;STBP=0.661;TYPE=snp;VARB=-0.0201969;OID=.;OPOS=195938177;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:24:25:20:20:0.444444:9:11:12:12:9:11:12:13
chr3	195941216	.	C	G	1530.02	PASS	AF=1;AO=95;DP=95;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00280029;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.443;QD=63.7506;RBI=0.0228171;REFB=0;REVB=0.0226446;RO=0;SAF=49;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.71919e-05;OID=.;OPOS=195941216;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:96:0:0:95:96:1:46:49:0:0:47:49:0:0
chr3	195955762	.	G	A	1589.85	PASS	AF=1;AO=106;DP=106;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0172891;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.216;QD=59.9944;RBI=0.0173839;REFB=0;REVB=-0.00181318;RO=0;SAF=53;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.6127e-06;OID=.;OPOS=195955762;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:106:106:0:0:106:106:1:53:53:0:0:53:53:0:0
chr3	195956827	.	T	C	1008.41	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00104688;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.4155;QD=59.3183;RBI=0.00236363;REFB=0;REVB=-0.00211915;RO=0;SAF=43;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.28896e-06;OID=.;OPOS=195956827;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:25:43:0:0:25:43:0:0
chr3	196054439	.	T	G	538.56	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000469822;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.788;QD=59.8394;RBI=0.0112332;REFB=0;REVB=0.0112234;RO=0;SAF=8;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.79159e-05;OID=.;OPOS=196054439;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:28:8:0:0:28:8:0:0
chr3	196294104	.	C	G	740.44	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00436889;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=296.746;QD=56.9569;RBI=0.00542222;REFB=0;REVB=0.00321143;RO=0;SAF=28;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.22948e-06;OID=.;OPOS=196294104;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:24:28:0:0:24:28:0:0
chr3	196386964	.	C	G	669.3	PASS	AF=0.92;AO=45;DP=50;FAO=46;FDP=50;FR=.;FRO=4;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0131231;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=210.593;QD=53.5441;RBI=0.0135453;REFB=-0.0193327;REVB=0.00335542;RO=2;SAF=24;SAR=21;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0375629;STB=0.537021;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=0.000464679;OID=.;OPOS=196386964;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:19:50:50:2:4:45:46:0.92:21:24:2:0:21:25:4:0
chr3	196435534	.	T	C	766.46	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0620569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.176;QD=63.8713;RBI=0.0624211;REFB=0;REVB=0.00673306;RO=0;SAF=16;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000130405;OID=.;OPOS=196435534;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:32:16:0:0:32:16:0:0
chr3	196438826	.	G	T	519.79	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0269617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.7349;QD=59.4041;RBI=0.0373502;REFB=0;REVB=0.0258477;RO=0;SAF=21;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.27896e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00096682;OID=.;OPOS=196438826;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:14:21:0:0:14:21:0:0
chr3	196443803	.	T	C	1979.32	PASS	AF=0.489051;AO=194;DP=405;FAO=201;FDP=411;FR=.;FRO=210;FSAF=79;FSAR=122;FSRF=99;FSRR=111;FWDB=0.0391677;FXX=0.00242713;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.2232;QD=19.2635;RBI=0.043847;REFB=-0.0174395;REVB=0.0197091;RO=210;SAF=73;SAR=121;SRF=99;SRR=111;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0933118;STB=0.541232;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=0.0220768;OID=.;OPOS=196443803;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:405:411:210:210:194:201:0.489051:121:73:99:111:122:79:99:111
chr3	196448103	.	C	T	251.42	PASS	AF=0.489796;AO=24;DP=49;FAO=24;FDP=49;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=-0.0148281;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.347;QD=20.5237;RBI=0.0226003;REFB=-0.00406438;REVB=-0.0170559;RO=25;SAF=13;SAR=11;SRF=8;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199227;STB=0.611674;STBP=0.139;TYPE=snp;VARB=0.00338295;OID=.;OPOS=196448103;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:25:25:24:24:0.489796:11:13:8:17:11:13:8:17
chr3	196674749	.	C	T	200.84	PASS	AF=0.512821;AO=19;DP=38;FAO=20;FDP=39;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.0116929;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.0231;QD=20.5995;RBI=0.0385323;REFB=-0.00678933;REVB=0.0367153;RO=19;SAF=9;SAR=10;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138931;STB=0.564039;STBP=0.443;TYPE=snp;VARB=0.00532488;OID=.;OPOS=196674749;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:39:19:19:19:20:0.512821:10:9:12:7:10:10:12:7
chr3	196674879	.	A	G	834.4	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0099249;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.567;QD=57.5447;RBI=0.0526311;REFB=0;REVB=-0.0516869;RO=0;SAF=24;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.31293e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000693426;OID=.;OPOS=196674879;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:34:24:0:0:34:24:0:0
chr3	196674916	.	A	C	670.26	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0301293;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.963;QD=62.3494;RBI=0.0335869;REFB=0;REVB=0.0148426;RO=0;SAF=14;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.13233e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000160037;OID=.;OPOS=196674916;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:29:14:0:0:29:14:0:0
chr3	196674972	.	CT	TC	468.84	PASS	AF=1;AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0192742;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=2;MLLD=257.307;QD=58.6049;RBI=0.0207075;REFB=0;REVB=0.00757005;RO=0;SAF=11;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=-2.17827e-05;OID=.;OPOS=196674972;OREF=CT;OALT=TC;OMAPALT=TC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:32:0:0:32:32:1:21:11:0:0:21:11:0:0
chr3	196675533	.	C	T	128.09	PASS	AF=0.56;AO=13;DP=25;FAO=14;FDP=25;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=0.0692812;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.5419;QD=20.4938;RBI=0.0694627;REFB=-0.0474852;REVB=0.00501804;RO=9;SAF=6;SAR=7;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.225945;STB=0.59078;STBP=0.343;TYPE=snp;VARB=0.0372076;OID=.;OPOS=196675533;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:25:25:9:11:13:14:0.56:7:6:7:2:8:6:7:4
chr3	196742290	.	T	C	466.42	PASS	AF=0.489362;AO=46;DP=93;FAO=46;FDP=94;FR=.;FRO=48;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=18;FSRR=30;FWDB=0.00654081;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.342;QD=19.8478;RBI=0.00895655;REFB=-0.00865905;REVB=-0.00611862;RO=47;SAF=23;SAR=23;SRF=18;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106752;STB=0.563802;STBP=0.238;TYPE=snp;VARB=0.00900778;OID=.;OPOS=196742290;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:94:47:48:46:46:0.489362:23:23:18:29:23:23:18:30
chr3	196743130	.	T	C	251.65	PASS	AF=0.489796;AO=24;DP=49;FAO=24;FDP=49;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.00542415;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.863;QD=20.5426;RBI=0.00827515;REFB=-0.00633184;REVB=-0.00624953;RO=25;SAF=11;SAR=13;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0919975;STB=0.55174;STBP=0.49;TYPE=snp;VARB=0.00472856;OID=.;OPOS=196743130;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:25:25:24:24:0.489796:13:11:14:11:13:11:14:11
chr3	196743994	.	G	A	581.99	PASS	AF=0.458647;AO=61;DP=133;FAO=61;FDP=133;FR=.;FRO=72;FSAF=33;FSAR=28;FSRF=34;FSRR=38;FWDB=0.0593481;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.9057;QD=17.5035;RBI=0.0603256;REFB=-0.00999205;REVB=0.010816;RO=72;SAF=33;SAR=28;SRF=34;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0669591;STB=0.537235;STBP=0.43;TYPE=snp;VARB=0.0113735;OID=.;OPOS=196743994;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:133:133:72:72:61:61:0.458647:28:33:34:38:28:33:34:38
chr3	196746629	.	T	C	398.95	PASS	AF=0.526316;AO=40;DP=76;FAO=40;FDP=76;FR=.;FRO=36;FSAF=14;FSAR=26;FSRF=24;FSRR=12;FWDB=-0.0315959;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.2814;QD=20.9971;RBI=0.0355687;REFB=-0.0212341;REVB=-0.0163352;RO=36;SAF=14;SAR=26;SRF=24;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.271115;STB=0.649925;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.0183442;OID=.;OPOS=196746629;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:36:36:40:40:0.526316:26:14:24:12:26:14:24:12
chr3	196770355	.	TAAGG	T	2479.49	PASS	AF=1;AO=195;DP=207;FAO=200;FDP=200;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=126;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0247591;FXX=0.0338148;HRUN=2;LEN=4;MLLD=168.946;QD=49.5899;RBI=0.0250467;REFB=0;REVB=0.00378495;RO=0;SAF=73;SAR=122;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=7.5987e-05;OID=.;OPOS=196770356;OREF=AAGG;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:195:207:200:200:0:74:126:0:0:44:0:73:122:0:0
chr3	196771245	.	G	A	727.79	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0375352;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.691;QD=63.2865;RBI=0.0506008;REFB=0;REVB=-0.0339345;RO=0;SAF=23;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000138157;OID=.;OPOS=196771245;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:23:23:0:0:23:23:0:0
chr3	197020780	.	G	A,GA	622.47	PASS	AF=0.142857,0.844156;AO=9,43;DP=90;FAO=11,65;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=4,36;FSAR=7,29;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00434199,0.038877;FXX=0.0253133;HRUN=1,6;LEN=1,1;MLLD=240.616,11.2247;QD=32.3363;RBI=0.0646489,0.206937;REFB=-0.0298136,0.0814302;REVB=-0.0645029,-0.203253;RO=31;SAF=1,26;SAR=8,17;SRF=20;SRR=11;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.623315,-0.032625;STB=0.555452,0.506847;STBP=0.296,0.524;TYPE=snp,ins;VARB=0.0421464,-0.038812;OID=.,.;OPOS=197020780,197020781;OREF=G,-;OALT=A,A;OMAPALT=A,GA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:51:90:77:31:1:9,43:11,65:0.142857,0.844156:8,17:1,26:20:11:7,29:4,36:1:0
chr3	197495334	.	G	A	632.12	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0451001;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.4293;QD=61.6705;RBI=0.0526082;REFB=0;REVB=0.0270851;RO=0;SAF=18;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000971184;OID=.;OPOS=197495334;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:23:18:0:0:23:18:0:0
chr3	197602648	.	TAATA	T	342.25	PASS	AF=0.636364;AO=42;DP=70;FAO=42;FDP=66;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=31;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=0.000556287;FXX=0.0149231;HRUN=2;LEN=4;MLLD=306.886;QD=20.7422;RBI=0.0017825;REFB=0.00392986;REVB=0.00169347;RO=27;SAF=11;SAR=31;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125272;STB=0.532534;STBP=0.534;TYPE=del;VARB=-0.00198899;OID=.;OPOS=197602649;OREF=AATA;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.636364:42:70:42:66:24:11:31:8:16:99:27:11:31:11:16
chr3	197846850	.	G	A	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00583028;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.4464;QD=49.5991;RBI=0.0205202;REFB=0;REVB=0.0196746;RO=0;SAF=9;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000678624;OID=.;OPOS=197846850;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:9:9:0:0:9:9:0:0
chr3	197882505	.	CT	C	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0413504;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=305.263;QD=35.5759;RBI=0.0413504;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=7;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000457696;OID=.;OPOS=197882506;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:7:7:7:7:0:7:0:0:0:4:0:7:0:0:0
chr3	197884212	.	C	T	101.88	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00594969;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.9982;QD=40.7509;RBI=0.034416;REFB=0;REVB=0.0338979;RO=0;SAF=4;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00236793;OID=.;OPOS=197884212;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:6:4:0:0:6:4:0:0
chr4	53428	.	G	A	724.13	PASS	AF=0.981132;AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.035081;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.745;QD=54.6514;RBI=0.0599154;REFB=-0.0538862;REVB=0.0485714;RO=0;SAF=24;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508769;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=0.000418607;OID=.;OPOS=53428;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:53:53:0:1:52:52:0.981132:28:24:0:0:28:24:0:1
chr4	60303	.	G	A	126.37	PASS	AF=0.133641;AO=29;DP=217;FAO=29;FDP=217;FR=.;FRO=188;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=87;FSRR=101;FWDB=-0.0289812;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.633;QD=2.32948;RBI=0.0306779;REFB=-0.00713093;REVB=-0.0100609;RO=188;SAF=11;SAR=18;SRF=87;SRR=101;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107787;STB=0.57398;STBP=0.4;TYPE=snp;VARB=0.0469136;OID=.;OPOS=60303;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:217:217:188:188:29:29:0.133641:18:11:87:101:18:11:87:101
chr4	85995	.	C	CA	199.86	PASS	AF=1;AO=17;DP=20;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0105846;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=23.7496;QD=47.0263;RBI=0.0873716;REFB=0;REVB=-0.086728;RO=3;SAF=6;SAR=11;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181817;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00700836;OID=.;OPOS=85996;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:17:20:17:17:0:6:11:0:0:4:3:6:11:3:0
chr4	86022	.	CAG	ATA	74.63	PASS	AF=1;AO=7;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00438567;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=126.965;QD=37.3146;RBI=0.0213266;REFB=0;REVB=-0.0208708;RO=0;SAF=1;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=-0.000442653;OID=.;OPOS=86022;OREF=CAG;OALT=ATA;OMAPALT=ATA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:7:8:1:6:1:0:0:7:1:0:0
chr4	86040	.	G	T	54.75	PASS	AF=0.777778;AO=7;DP=9;FAO=7;FDP=9;FR=.;FRO=2;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00991694;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.245;QD=24.3323;RBI=0.0230564;REFB=0.0420569;REVB=-0.0208148;RO=1;SAF=1;SAR=6;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0674964;STB=0.571243;STBP=0.657;TYPE=snp;VARB=-0.0214214;OID=.;OPOS=86040;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:9:9:1:2:7:7:0.777778:6:1:0:1:6:1:0:2
chr4	86042	.	A	G	66.5	PASS	AF=0.8;AO=8;DP=10;FAO=8;FDP=10;FR=.;FRO=2;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.101985;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.3;QD=26.599;RBI=0.10255;REFB=-0.0507563;REVB=-0.010753;RO=2;SAF=1;SAR=7;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110633;STB=0.562356;STBP=0.667;TYPE=snp;VARB=0.0153761;OID=.;OPOS=86042;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:10:10:2:2:8:8:0.8:7:1:0:2:7:1:0:2
chr4	86044	.	G	A	54.74	PASS	AF=0.777778;AO=7;DP=9;FAO=7;FDP=9;FR=.;FRO=2;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00102606;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.483;QD=24.3281;RBI=0.00220564;REFB=0.0867365;REVB=0.00195244;RO=2;SAF=1;SAR=6;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125389;STB=0.571243;STBP=0.657;TYPE=snp;VARB=-0.00936551;OID=.;OPOS=86044;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:9:9:2:2:7:7:0.777778:6:1:0:2:6:1:0:2
chr4	86738	.	A	G	546.07	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0221653;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.544;QD=59.0351;RBI=0.0320826;REFB=0;REVB=0.0231947;RO=0;SAF=13;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000210619;OID=.;OPOS=86738;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:24:13:0:0:24:13:0:0
chr4	87277	.	G	C	554.89	PASS	AF=0.95;AO=38;DP=40;FAO=38;FDP=40;FR=.;FRO=2;FSAF=8;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0162248;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.1202;QD=55.4893;RBI=0.021368;REFB=0.0110844;REVB=-0.013905;RO=1;SAF=8;SAR=30;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0153672;STB=0.516121;STBP=0.599;TYPE=snp;VARB=-0.0019467;OID=.;OPOS=87277;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:40:40:1:2:38:38:0.95:30:8:0:1:30:8:0:2
chr4	87313	.	G	GA	601.42	PASS	AF=1;AO=49;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0422551;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=27.0441;QD=47.1698;RBI=0.0920634;REFB=0;REVB=0.0817935;RO=1;SAF=13;SAR=36;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.012896;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00104572;OID=.;OPOS=87314;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:49:51:51:51:0:14:37:0:0:11:1:13:36:0:1
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chr4	376888	.	C	A	86.23	PASS	AF=0.333333;AO=11;DP=33;FAO=11;FDP=33;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=6;FWDB=-0.00816815;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.191;QD=10.4522;RBI=0.011873;REFB=0.0072126;REVB=0.00861682;RO=21;SAF=5;SAR=6;SRF=15;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.280966;STB=0.677128;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=-0.00840296;OID=.;OPOS=376888;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:33:33:21:22:11:11:0.333333:6:5:15:6:6:5:16:6
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chr4	517461	.	T	C	146.38	PASS	AF=0.265823;AO=21;DP=79;FAO=21;FDP=79;FR=.;FRO=58;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=23;FSRR=35;FWDB=-0.0224563;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.143;QD=7.4114;RBI=0.0225101;REFB=-0.00221043;REVB=0.00155547;RO=58;SAF=7;SAR=14;SRF=23;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0830904;STB=0.550409;STBP=0.634;TYPE=snp;VARB=0.0067104;OID=.;OPOS=517461;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:58:58:21:21:0.265823:14:7:23:35:14:7:23:35
chr4	517622	.	C	T	389.87	PASS	AF=0.679245;AO=36;DP=53;FAO=36;FDP=53;FR=.;FRO=17;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=4;FSRR=13;FWDB=0.000750245;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.7321;QD=29.4243;RBI=0.0093419;REFB=-0.011219;REVB=0.00931172;RO=17;SAF=21;SAR=15;SRF=4;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.203294;STB=0.610531;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.00511711;OID=.;OPOS=517622;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:17:17:36:36:0.679245:15:21:4:13:15:21:4:13
chr4	520853	.	G	A	330.8	PASS	AF=0.466667;AO=35;DP=80;FAO=35;FDP=75;FR=.;FRO=40;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=23;FSRR=17;FWDB=-0.0142475;FXX=0.0624922;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.4244;QD=17.6427;RBI=0.0358773;REFB=-0.0110122;REVB=0.032927;RO=39;SAF=22;SAR=13;SRF=22;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0637322;STB=0.530103;STBP=0.644;TYPE=snp;VARB=0.0146415;OID=.;OPOS=520853;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:75:39:40:35:35:0.466667:13:22:22:17:13:22:23:17
chr4	527677	.	T	C	284.63	PASS	AF=0.450704;AO=29;DP=67;FAO=32;FDP=71;FR=.;FRO=39;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=25;FSRR=14;FWDB=-0.00085584;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.721;QD=16.0356;RBI=0.0131281;REFB=-0.00939984;REVB=-0.0131002;RO=37;SAF=17;SAR=12;SRF=23;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0364721;STB=0.544277;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0106383;OID=.;OPOS=527677;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:71:37:39:29:32:0.450704:12:17:23:14:14:18:25:14
chr4	533001	.	T	C	162.13	PASS	AF=0.586207;AO=17;DP=29;FAO=17;FDP=29;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.00749874;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=43.3905;QD=22.3634;RBI=0.0711592;REFB=-0.0161503;REVB=-0.070763;RO=11;SAF=6;SAR=11;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140571;STB=0.564025;STBP=0.433;TYPE=snp;VARB=0.00939513;OID=.;OPOS=533001;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:29:29:11:12:17:17:0.586207:11:6:6:5:11:6:6:6
chr4	648643	.	G	A	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0530904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.758;QD=59.4351;RBI=0.0558864;REFB=0;REVB=-0.0174557;RO=0;SAF=12;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0001917;OID=.;OPOS=648643;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:23:12:0:0:23:12:0:0
chr4	663908	.	A	G	222.86	PASS	AF=0.468085;AO=22;DP=47;FAO=22;FDP=47;FR=.;FRO=25;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=0.0120297;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.652;QD=18.9666;RBI=0.018768;REFB=0.00141851;REVB=0.0144057;RO=25;SAF=8;SAR=14;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187297;STB=0.606201;STBP=0.19;TYPE=snp;VARB=-0.00274675;OID=.;OPOS=663908;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:25:25:22:22:0.468085:14:8:14:11:14:8:14:11
chr4	677103	.	G	A	864.88	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00580388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.0262;QD=57.6586;RBI=0.0314757;REFB=0;REVB=0.030936;RO=0;SAF=28;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000102479;OID=.;OPOS=677103;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:60:0:0:58:60:1:30:28:0:0:32:28:0:0
chr4	759872	.	T	C	291.38	PASS	AF=0.463768;AO=32;DP=69;FAO=32;FDP=69;FR=.;FRO=37;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=0.0214962;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.953;QD=16.8917;RBI=0.0259003;REFB=-0.0273977;REVB=-0.0144479;RO=37;SAF=20;SAR=12;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109847;STB=0.561759;STBP=0.386;TYPE=snp;VARB=0.0333775;OID=.;OPOS=759872;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:37:37:32:32:0.463768:12:20:19:18:12:20:19:18
chr4	762963	.	A	G	101.91	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.092;QD=40.7629;RBI=0.00979481;REFB=0;REVB=0.00979481;RO=0;SAF=0;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.85962e-05;OID=.;OPOS=762963;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:10:0:0:9:10:1:9:0:0:0:10:0:0:0
chr4	780286	.	C	G	1029.93	PASS	AF=1;AO=62;DP=63;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0190074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.862;QD=58.853;RBI=0.0714692;REFB=0;REVB=0.0688953;RO=0;SAF=43;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.32015e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000129745;OID=.;OPOS=780286;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:63:70:0:0:62:70:1:19:43:0:0:26:44:0:0
chr4	843508	.	C	T	309.2	PASS	AF=0.581818;AO=31;DP=54;FAO=32;FDP=55;FR=.;FRO=23;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=-0.00432253;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.2286;QD=22.4872;RBI=0.0213546;REFB=-0.00496148;REVB=0.0209125;RO=22;SAF=16;SAR=15;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0221057;STB=0.509085;STBP=0.866;TYPE=snp;VARB=0.0107561;OID=.;OPOS=843508;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:55:22:23:31:32:0.581818:15:16:12:10:16:16:12:11
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chr4	858941	.	T	C	382.69	PASS	AF=0.965517;AO=27;DP=28;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0362964;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.982;QD=52.7851;RBI=0.0596139;REFB=-0.0275835;REVB=0.0472905;RO=1;SAF=15;SAR=12;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0371713;STB=0.519986;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.00121411;OID=.;OPOS=858941;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:28:29:1:1:27:28:0.965517:12:15:0:1:12:16:0:1
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chr4	960331	.	C	G	260.54	PASS	AF=0.509091;AO=28;DP=55;FAO=28;FDP=55;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=22;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=0.132972;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.114;QD=18.9486;RBI=0.133503;REFB=-0.000864351;REVB=-0.0118896;RO=27;SAF=6;SAR=22;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17855;STB=0.600605;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=0.000946299;OID=.;OPOS=960331;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:27:27:28:28:0.509091:22:6:10:17:22:6:10:17
chr4	961373	.	G	A	547.97	PASS	AF=0.409091;AO=63;DP=154;FAO=63;FDP=154;FR=.;FRO=91;FSAF=43;FSAR=20;FSRF=64;FSRR=27;FWDB=-0.000716355;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.227;QD=14.2329;RBI=0.00396667;REFB=-0.0113767;REVB=-0.00390145;RO=90;SAF=43;SAR=20;SRF=64;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0350801;STB=0.514295;STBP=0.814;TYPE=snp;VARB=0.0251042;OID=.;OPOS=961373;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:154:154:90:91:63:63:0.409091:20:43:64:26:20:43:64:27
chr4	982852	.	G	A	670.4	PASS	AF=0.445122;AO=72;DP=165;FAO=73;FDP=164;FR=.;FRO=91;FSAF=28;FSAR=45;FSRF=33;FSRR=58;FWDB=0.0264247;FXX=0.00606024;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.99;QD=16.3513;RBI=0.0324092;REFB=-0.0152653;REVB=0.0187642;RO=91;SAF=27;SAR=45;SRF=33;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0132682;STB=0.512343;STBP=0.802;TYPE=snp;VARB=0.0243711;OID=.;OPOS=982852;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:165:164:91:91:72:73:0.445122:45:27:33:58:45:28:33:58
chr4	983041	.	C	T	263.5	PASS	AF=0.518519;AO=28;DP=54;FAO=28;FDP=54;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=0.0573265;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=157.084;QD=19.5186;RBI=0.0577666;REFB=-0.0214506;REVB=0.00711705;RO=26;SAF=13;SAR=15;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0358519;STB=0.519986;STBP=0.801;TYPE=snp;VARB=0.0274763;OID=.;OPOS=983041;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:26:26:28:28:0.518519:15:13:11:15:15:13:11:15
chr4	983060	.	T	C	785.21	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0120565;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.022;QD=57.1062;RBI=0.0524541;REFB=0;REVB=0.0510497;RO=0;SAF=28;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.4002e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000186728;OID=.;OPOS=983060;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:27:28:0:0:27:28:0:0
chr4	983809	.	C	T	200.46	PASS	AF=0.40678;AO=24;DP=60;FAO=24;FDP=59;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=26;FSRR=9;FWDB=-0.0464567;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.065;QD=13.5904;RBI=0.0589584;REFB=-0.0327485;REVB=0.0363024;RO=35;SAF=14;SAR=10;SRF=26;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177308;STB=0.600523;STBP=0.263;TYPE=snp;VARB=0.0557453;OID=.;OPOS=983809;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:59:35:35:24:24:0.40678:10:14:26:9:10:14:26:9
chr4	985727	.	A	G	1726.49	PASS	AF=1;AO=114;DP=114;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00713394;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.834;QD=60.5785;RBI=0.0353315;REFB=0;REVB=0.0346038;RO=0;SAF=62;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.8149e-05;OID=.;OPOS=985727;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:114:114:0:0:114:114:1:52:62:0:0:52:62:0:0
chr4	994452	.	C	T	373.32	PASS	AF=0.371901;AO=45;DP=121;FAO=45;FDP=121;FR=.;FRO=76;FSAF=28;FSAR=17;FSRF=43;FSRR=33;FWDB=0.004121;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.5452;QD=12.3412;RBI=0.0307675;REFB=0.0316862;REVB=0.0304902;RO=75;SAF=28;SAR=17;SRF=42;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0710498;STB=0.536999;STBP=0.554;TYPE=snp;VARB=-0.0404775;OID=.;OPOS=994452;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:121:121:75:76:45:45:0.371901:17:28:42:33:17:28:43:33
chr4	1006333	.	G	A	145.23	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0942492;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.9416;QD=44.6866;RBI=0.0943532;REFB=0;REVB=-0.00442776;RO=0;SAF=7;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00145291;OID=.;OPOS=1006333;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:6:7:0:0:6:7:0:0
chr4	1018271	.	T	C	917.91	PASS	AF=0.484211;AO=92;DP=190;FAO=92;FDP=190;FR=.;FRO=98;FSAF=61;FSAR=31;FSRF=79;FSRR=19;FWDB=-0.0133885;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.389;QD=19.3245;RBI=0.0154438;REFB=0.000225004;REVB=0.00769807;RO=96;SAF=61;SAR=31;SRF=78;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165486;STB=0.587263;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=-0.000290373;OID=.;OPOS=1018271;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:190:190:96:98:92:92:0.484211:31:61:78:18:31:61:79:19
chr4	1050653	.	G	A	67.92	PASS	AF=0.45;AO=9;DP=20;FAO=9;FDP=20;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=-0.00465322;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=184.526;QD=13.5842;RBI=0.0122097;REFB=-0.0364152;REVB=-0.0112882;RO=11;SAF=5;SAR=4;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166393;STB=0.597497;STBP=0.473;TYPE=snp;VARB=0.0244031;OID=.;OPOS=1050653;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:20:20:11:11:9:9:0.45:4:5:8:3:4:5:8:3
chr4	1052125	.	T	C	63.28	PASS	AF=0.310345;AO=9;DP=29;FAO=9;FDP=29;FR=.;FRO=20;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=-0.0384645;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.8529;QD=8.72844;RBI=0.0637163;REFB=-0.0160544;REVB=0.0507962;RO=20;SAF=2;SAR=7;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.236225;STB=0.647789;STBP=0.386;TYPE=snp;VARB=0.0317964;OID=.;OPOS=1052125;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:29:29:20:20:9:9:0.310345:7:2:8:12:7:2:8:12
chr4	1052166	.	A	C	93.23	PASS	AF=0.387097;AO=12;DP=31;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=-0.0182845;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.774;QD=12.0302;RBI=0.0183562;REFB=-0.0199675;REVB=0.00162061;RO=18;SAF=3;SAR=9;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167999;STB=0.588079;STBP=0.481;TYPE=snp;VARB=0.0386744;OID=.;OPOS=1052166;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:93:31:31:18:19:12:12:0.387097:9:3:7:11:9:3:7:12
chr4	1075271	.	C	T	247.38	PASS	AF=0.444444;AO=28;DP=64;FAO=28;FDP=63;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=0.00171048;FXX=0.0307645;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.991;QD=15.7065;RBI=0.0307082;REFB=0.000559973;REVB=0.0306605;RO=34;SAF=13;SAR=15;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0632489;STB=0.527789;STBP=0.706;TYPE=snp;VARB=-0.00104354;OID=.;OPOS=1075271;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:63:34:35:28:28:0.444444:15:13:18:16:15:13:18:17
chr4	1087327	.	G	GCTGCCCAGGCTGGAGCCAGCC	41.69	PASS	AF=0.5;AO=6;DP=12;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.0157093;FXX=0.076864;HRUN=0;LEN=21;MLLD=636.772;QD=13.8979;RBI=0.0226977;REFB=-0.00472892;REVB=0.016383;RO=6;SAF=5;SAR=1;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.202122;STB=0.624529;STBP=0.485;TYPE=ins;VARB=0.00426575;OID=.;OPOS=1087328;OREF=-;OALT=CTGCCCAGGCTGGAGCCAGCC;OMAPALT=GCTGCCCAGGCTGGAGCCAGCC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.5:6:12:6:12:6:5:1:4:2:38:6:5:1:4:2
chr4	1087329	.	C	T	49.59	PASS	AF=0.538462;AO=7;DP=13;FAO=7;FDP=13;FR=.;FRO=6;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.00250904;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=245.454;QD=15.2589;RBI=0.0607161;REFB=-0.0157549;REVB=-0.0606642;RO=6;SAF=6;SAR=1;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.23478;STB=0.642384;STBP=0.41;TYPE=snp;VARB=0.0192829;OID=.;OPOS=1087329;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:13:13:6:6:7:7:0.538462:1:6:4:2:1:6:4:2
chr4	1087338	.	C	T	69.62	PASS	AF=0.529412;AO=9;DP=17;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0335221;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=127.404;QD=16.3815;RBI=0.0537035;REFB=-0.0424139;REVB=0.0419564;RO=8;SAF=6;SAR=3;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14199;STB=0.583142;STBP=0.564;TYPE=snp;VARB=0.00571;OID=.;OPOS=1087338;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:17:17:8:8:9:9:0.529412:3:6:4:4:3:6:4:4
chr4	1090625	.	G	A	117.75	PASS	AF=0.368421;AO=14;DP=38;FAO=14;FDP=38;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=-0.00685025;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.164;QD=12.3946;RBI=0.0368113;REFB=-0.0179103;REVB=-0.0361683;RO=24;SAF=8;SAR=6;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121095;STB=0.571326;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.0262685;OID=.;OPOS=1090625;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:24:24:14:14:0.368421:6:8:11:13:6:8:11:13
chr4	1164277	.	C	G	76.14	PASS	AF=0.4;AO=10;DP=25;FAO=10;FDP=25;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=3;FWDB=0.00223909;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.225;QD=12.182;RBI=0.00829373;REFB=-0.00751292;REVB=-0.00798576;RO=15;SAF=7;SAR=3;SRF=12;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128876;STB=0.575618;STBP=0.62;TYPE=snp;VARB=0.00812086;OID=.;OPOS=1164277;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:25:25:15:15:10:10:0.4:3:7:12:3:3:7:12:3
chr4	1164552	.	A	G	304.76	PASS	AF=1;AO=20;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=19;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0385775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.82;QD=53.0009;RBI=0.0568058;REFB=0;REVB=0.0416974;RO=0;SAF=16;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00253069;OID=.;OPOS=1164552;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:20:23:1:4:16:0:0:4:19:0:0
chr4	1165130	.	G	T	283.08	PASS	AF=0.625;AO=25;DP=41;FAO=25;FDP=40;FR=.;FRO=15;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.0049109;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.505;QD=28.3081;RBI=0.0523319;REFB=-0.0418027;REVB=0.052101;RO=14;SAF=13;SAR=12;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.013037;STB=0.519984;STBP=0.764;TYPE=snp;VARB=0.0235601;OID=.;OPOS=1165130;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:40:14:15:25:25:0.625:12:13:7:7:12:13:7:8
chr4	1165741	.	A	G	1127.92	PASS	AF=1;AO=72;DP=73;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000166785;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.848;QD=60.1559;RBI=0.0213884;REFB=0;REVB=0.0213877;RO=0;SAF=36;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.58874e-05;OID=.;OPOS=1165741;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:75:0:0:72:75:1:36:36:0:0:39:36:0:0
chr4	1165764	.	C	T	214.36	PASS	AF=0.38806;AO=25;DP=67;FAO=26;FDP=67;FR=.;FRO=41;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=27;FWDB=0.000725669;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.679;QD=12.7975;RBI=0.00481616;REFB=0.000548894;REVB=0.00476117;RO=42;SAF=16;SAR=9;SRF=14;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.325394;STB=0.663556;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=-0.000391659;OID=.;OPOS=1165764;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:42:41:25:26:0.38806:9:16:14:28:10:16:14:27
chr4	1194586	.	T	A	309.36	PASS	AF=0.627907;AO=27;DP=43;FAO=27;FDP=43;FR=.;FRO=16;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=0.038398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.9463;QD=28.778;RBI=0.0394517;REFB=-0.01371;REVB=-0.00905684;RO=16;SAF=11;SAR=16;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0227834;STB=0.512536;STBP=0.842;TYPE=snp;VARB=0.0115771;OID=.;OPOS=1194586;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:16:16:27:27:0.627907:16:11:6:10:16:11:6:10
chr4	1194594	.	A	T	140.11	PASS	AF=0.363636;AO=16;DP=44;FAO=16;FDP=44;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=0.00926963;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=254.028;QD=12.737;RBI=0.0174373;REFB=0.0021723;REVB=-0.0147694;RO=28;SAF=7;SAR=9;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00984449;STB=0.505773;STBP=0.968;TYPE=snp;VARB=-0.0045708;OID=.;OPOS=1194594;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:28:28:16:16:0.363636:9:7:12:16:9:7:12:16
chr4	1194630	.	T	C	109.93	PASS	AF=0.433333;AO=13;DP=30;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.0486187;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.44;QD=14.6579;RBI=0.0488175;REFB=0.00141409;REVB=-0.0044008;RO=17;SAF=5;SAR=8;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142857;STB=0.583204;STBP=0.445;TYPE=snp;VARB=-0.00182317;OID=.;OPOS=1194630;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:17:17:13:13:0.433333:8:5:9:8:8:5:9:8
chr4	1244416	.	A	G	594.54	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00553672;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.474;QD=60.9786;RBI=0.00724603;REFB=0;REVB=-0.00467436;RO=0;SAF=17;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.30852e-05;OID=.;OPOS=1244416;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:22:17:0:0:22:17:0:0
chr4	1244879	.	A	G	228.95	PASS	AF=0.415385;AO=26;DP=64;FAO=27;FDP=65;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=25;FSRR=13;FWDB=0.0320244;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.994;QD=14.0889;RBI=0.03205;REFB=-0.0199528;REVB=-0.0012815;RO=37;SAF=15;SAR=11;SRF=25;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106491;STB=0.561359;STBP=0.437;TYPE=snp;VARB=0.0340297;OID=.;OPOS=1244879;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:65:37:38:26:27:0.415385:11:15:25:12:12:15:25:13
chr4	1330759	.	T	C	107.26	PASS	AF=0.631579;AO=11;DP=19;FAO=12;FDP=19;FR=.;FRO=7;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.03776;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.1174;QD=22.5803;RBI=0.0383743;REFB=0.0250014;REVB=0.00683913;RO=7;SAF=7;SAR=4;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0585073;STB=0.519967;STBP=0.862;TYPE=snp;VARB=-0.0253866;OID=.;OPOS=1330759;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:19:19:7:7:11:12:0.631579:4:7:5:2:4:8:5:2
chr4	1343405	.	T	C	418.43	PASS	AF=0.447917;AO=43;DP=96;FAO=43;FDP=96;FR=.;FRO=53;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=32;FSRR=21;FWDB=-0.019404;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.2161;QD=17.4348;RBI=0.0217337;REFB=-0.0105863;REVB=0.00978959;RO=53;SAF=23;SAR=20;SRF=32;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0686758;STB=0.538406;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.00769881;OID=.;OPOS=1343405;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:96:53:53:43:43:0.447917:20:23:32:21:20:23:32:21
chr4	1349029	.	G	A	60.3	PASS	AF=0.571429;AO=8;DP=14;FAO=8;FDP=14;FR=.;FRO=6;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0125474;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.5693;QD=17.2284;RBI=0.112414;REFB=-0.0407287;REVB=0.111711;RO=6;SAF=6;SAR=2;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.21129;STB=0.624664;STBP=0.382;TYPE=snp;VARB=0.0405948;OID=.;OPOS=1349029;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:14:14:6:6:8:8:0.571429:2:6:3:3:2:6:3:3
chr4	1374695	.	C	A	1071.59	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00403051;FXX=0.0273935;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.089;QD=60.3713;RBI=0.0554183;REFB=0;REVB=0.0552716;RO=0;SAF=32;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000250508;OID=.;OPOS=1374695;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:39:32:0:0:39:32:0:0
chr4	1374774	.	C	T	583.69	PASS	AF=1;AO=31;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0375405;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=94.7894;QD=59.8658;RBI=0.039327;REFB=0;REVB=0.0117185;RO=0;SAF=16;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.16027e-05;OID=.;OPOS=1374774;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:31:39:1:15:16:0:0:23:16:0:0
chr4	1377615	.	A	G	428.97	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.043139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.76;QD=57.1959;RBI=0.0537281;REFB=0;REVB=0.0320271;RO=0;SAF=19;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000346171;OID=.;OPOS=1377615;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:30:0:0:29:30:1:10:19:0:0:11:19:0:0
chr4	1619865	.	T	C	447.03	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0124223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.816;QD=57.6807;RBI=0.0318466;REFB=0;REVB=0.0293239;RO=0;SAF=16;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000174436;OID=.;OPOS=1619865;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:15:16:0:0:15:16:0:0
chr4	1619868	.	T	C	74.67	PASS	AF=0.357143;AO=10;DP=28;FAO=10;FDP=28;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.0742815;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.5331;QD=10.6675;RBI=0.0746238;REFB=-0.021768;REVB=0.00714025;RO=18;SAF=5;SAR=5;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118978;STB=0.571289;STBP=0.559;TYPE=snp;VARB=0.0338163;OID=.;OPOS=1619868;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:28:28:18:18:10:10:0.357143:5:5:11:7:5:5:11:7
chr4	1646017	.	C	G	554.29	PASS	AF=0.593023;AO=50;DP=86;FAO=51;FDP=86;FR=.;FRO=35;FSAF=24;FSAR=27;FSRF=21;FSRR=14;FWDB=-0.00504878;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.195;QD=25.7811;RBI=0.0224409;REFB=-0.011029;REVB=-0.0218656;RO=36;SAF=23;SAR=27;SRF=22;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115232;STB=0.552503;STBP=0.263;TYPE=snp;VARB=0.0082436;OID=.;OPOS=1646017;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:36:35:50:51:0.593023:27:23:22:14:27:24:21:14
chr4	1659128	.	T	C	111.42	PASS	AF=0.464286;AO=13;DP=28;FAO=13;FDP=28;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=-0.036894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.757;QD=15.9167;RBI=0.037431;REFB=0.00953677;REVB=0.00631774;RO=15;SAF=7;SAR=6;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121144;STB=0.569728;STBP=0.493;TYPE=snp;VARB=-0.0124875;OID=.;OPOS=1659128;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:28:15:15:13:13:0.464286:6:7:10:5:6:7:10:5
chr4	1659162	.	C	T	135.95	PASS	AF=0.483871;AO=15;DP=31;FAO=15;FDP=31;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=-0.0201369;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=275.356;QD=17.542;RBI=0.0246603;REFB=-0.0120611;REVB=-0.0142349;RO=16;SAF=7;SAR=8;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14199;STB=0.58109;STBP=0.404;TYPE=snp;VARB=0.0113566;OID=.;OPOS=1659162;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:16:16:15:15:0.483871:8:7:10:6:8:7:10:6
chr4	1685211	.	T	C	340.74	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00878143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.207;QD=54.5176;RBI=0.0107284;REFB=0;REVB=-0.00616322;RO=0;SAF=13;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.53033e-05;OID=.;OPOS=1685211;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:12:13:0:0:12:13:0:0
chr4	1701317	.	G	A	1008.48	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00140105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.357;QD=59.3222;RBI=0.011826;REFB=0;REVB=0.0117427;RO=0;SAF=31;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.68344e-05;OID=.;OPOS=1701317;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:37:31:0:0:37:31:0:0
chr4	1737502	.	C	T	649.83	PASS	AF=0.942308;AO=48;DP=51;FAO=49;FDP=52;FR=.;FRO=3;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=4.10636e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.639;QD=49.9869;RBI=0.0155805;REFB=-0.034225;REVB=0.0155804;RO=3;SAF=27;SAR=21;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0625875;STB=0.531902;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=0.000874943;OID=.;OPOS=1737502;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:51:52:3:3:48:49:0.942308:21:27:0:3:22:27:0:3
chr4	1739518	.	CGCCATCCCTGCCATC	CGCCATC,CGCCATCCCTGCC,CGCCAT	695.39	PASS	AF=0.686275,0.137255,0.176471;AO=31,6,14;DP=55;FAO=35,7,9;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=9,0,9;FSAR=26,7,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00128902,-0.0127048,-0.00351789;FXX=0.105245;HRUN=3,1,3;LEN=9,3,10;MLLD=268.915,193.102,257.887;QD=54.5404;RBI=0.0260172,0.0127644,0.0240555;REFB=0,0,0;REVB=0.0259853,0.0012322,0.0237969;RO=0;SAF=4,0,14;SAR=27,6,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0.446729,0,0.446729;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,del,del;VARB=0.0033858,-0.0203097,0.00797038;OID=.,.,.;OPOS=1739519,1739530,1739524;OREF=GCCATCCCT,CAT,CCCTGCCATC;OALT=-,-,-;OMAPALT=CGCCATC,CGCCATCCCTGCC,CGCCAT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/3:0.686275,0.137255,0.176471:31,6,14:55:35,7,9:51:0:9,0,9:26,7,0:0:0:38:0:4,0,14:27,6,0:0:0
chr4	1739592	.	A	G	769.49	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00435144;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.187;QD=56.9989;RBI=0.0114169;REFB=0;REVB=-0.0105551;RO=0;SAF=29;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.90317e-05;OID=.;OPOS=1739592;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:25:29:0:0:25:29:0:0
chr4	1805478	.	C	T	231.52	PASS	AF=0.394366;AO=29;DP=71;FAO=28;FDP=71;FR=.;FRO=43;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=0.0400897;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.3394;QD=13.0435;RBI=0.0465932;REFB=0.0063279;REVB=0.0237434;RO=40;SAF=11;SAR=18;SRF=20;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12606;STB=0.559053;STBP=0.425;TYPE=snp;VARB=-0.00963653;OID=.;OPOS=1805478;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:40:43:29:28:0.394366:18:11:20:20:17:11:21:22
chr4	1807894	.	G	A	689.24	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0284883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.54;QD=62.6584;RBI=0.0292912;REFB=0;REVB=0.00681091;RO=0;SAF=18;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000524749;OID=.;OPOS=1807894;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:26:18:0:0:26:18:0:0
chr4	1809127	.	CGT	C,TGC	954.16	PASS	AF=0.808824,0.191176;AO=36,19;DP=67;FAO=55,13;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=10,9;FSAR=45,4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0371229,-0.0308637;FXX=0.0555478;HRUN=1,1;LEN=2,3;MLLD=83.1831,85.9293;QD=56.1269;RBI=0.0527708,0.0565767;REFB=0,0;REVB=0.0375052,-0.0474168;RO=0;SAF=5,9;SAR=31,10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.33753e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.0270604,0.00594322;OID=.,.;OPOS=1809128,1809127;OREF=GT,CGT;OALT=-,TGC;OMAPALT=C,TGC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:84:67:68:0:0:36,19:55,13:0.808824,0.191176:31,10:5,9:0:0:45,4:10,9:0:0
chr4	1815990	.	G	A	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0168524;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.825;QD=55.0984;RBI=0.0208355;REFB=0;REVB=-0.0122521;RO=0;SAF=11;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.45171e-05;OID=.;OPOS=1815990;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:15:11:0:0:15:11:0:0
chr4	1818594	.	C	T	1326.51	PASS	AF=0.988636;AO=84;DP=85;FAO=87;FDP=88;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0117731;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.3085;QD=60.2957;RBI=0.0234092;REFB=-0.0971048;REVB=0.0202333;RO=0;SAF=40;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505617;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.000474759;OID=.;OPOS=1818594;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:85:88:0:1:84:87:0.988636:44:40:0:0:44:43:0:1
chr4	1954945	.	A	G	1492.53	PASS	AF=1;AO=99;DP=99;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0105492;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.333;QD=59.7011;RBI=0.0123703;REFB=0;REVB=0.00646046;RO=0;SAF=56;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.34205e-05;OID=.;OPOS=1954945;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:99:100:0:0:99:100:1:43:56:0:0:44:56:0:0
chr4	1986542	.	C	T	370.29	PASS	AF=1;AO=20;DP=28;FAO=27;FDP=27;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00436826;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=48.4016;QD=54.8578;RBI=0.0151828;REFB=0;REVB=-0.0145408;RO=0;SAF=9;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000191965;OID=.;OPOS=1986542;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:27:0:0:20:27:1:11:9:0:0:14:13:0:0
chr4	2160894	.	C	T	220.57	PASS	AF=0.470588;AO=24;DP=52;FAO=24;FDP=51;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=-0.00345855;FXX=0.0192271;HRUN=2;LEN=1;MLLD=221.646;QD=17.2995;RBI=0.0130364;REFB=-0.00971557;REVB=-0.0125692;RO=27;SAF=15;SAR=9;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.067977;STB=0.538429;STBP=0.642;TYPE=snp;VARB=0.0128802;OID=.;OPOS=2160894;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:51:27:27:24:24:0.470588:9:15:15:12:9:15:15:12
chr4	2175733	.	A	G	476.32	PASS	AF=0.474747;AO=47;DP=99;FAO=47;FDP=99;FR=.;FRO=52;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=25;FSRR=27;FWDB=0.015377;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.4025;QD=19.2451;RBI=0.0198655;REFB=-0.00386213;REVB=-0.0125771;RO=51;SAF=22;SAR=25;SRF=25;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0207469;STB=0.506681;STBP=0.895;TYPE=snp;VARB=0.00235403;OID=.;OPOS=2175733;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:51:52:47:47:0.474747:25:22:25:26:25:22:25:27
chr4	2176454	.	G	A	262.13	PASS	AF=0.585366;AO=24;DP=41;FAO=24;FDP=41;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.00521608;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.447;QD=25.5731;RBI=0.00943926;REFB=-0.0207355;REVB=-0.00786716;RO=17;SAF=9;SAR=15;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118729;STB=0.565982;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.0199057;OID=.;OPOS=2176454;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:17:17:24:24:0.585366:15:9:9:8:15:9:9:8
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chr4	2194946	.	C	T	43.83	PASS	AF=0.25;AO=7;DP=28;FAO=7;FDP=28;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0326834;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.454;QD=6.26153;RBI=0.0427846;REFB=-0.0134428;REVB=-0.0276102;RO=21;SAF=6;SAR=1;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.443974;STB=0.794232;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=0.0135669;OID=.;OPOS=2194946;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:28:28:21:21:7:7:0.25:1:6:11:10:1:6:11:10
chr4	2194953	.	G	A	52.6	PASS	AF=0.258065;AO=8;DP=31;FAO=8;FDP=31;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.0238948;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.641;QD=6.78683;RBI=0.0442921;REFB=-0.00953338;REVB=-0.0372939;RO=23;SAF=7;SAR=1;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.480729;STB=0.814633;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.0177589;OID=.;OPOS=2194953;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:31:31:23:23:8:8:0.258065:1:7:12:11:1:7:12:11
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chr4	2306053	.	A	G	212.82	PASS	AF=0.5;AO=21;DP=41;FAO=21;FDP=42;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=5;FWDB=-0.0121139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.356;QD=20.2683;RBI=0.0152481;REFB=0.00251291;REVB=-0.00926062;RO=20;SAF=10;SAR=11;SRF=15;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.236234;STB=0.64113;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=-0.00346917;OID=.;OPOS=2306053;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:42:20:21:21:21:0.5:11:10:15:5:11:10:16:5
chr4	2341194	.	T	C	1697.9	PASS	AF=1;AO=111;DP=112;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0131902;FXX=0.00884877;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.801;QD=60.6391;RBI=0.0241976;REFB=0;REVB=-0.0202865;RO=0;SAF=68;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.58685e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00019762;OID=.;OPOS=2341194;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:112:112:0:0:111:112:1:43:68:0:0:44:68:0:0
chr4	2451694	.	T	C	411.12	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0104818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.142;QD=56.7056;RBI=0.014665;REFB=0;REVB=0.0102565;RO=0;SAF=17;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.0947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00011671;OID=.;OPOS=2451694;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:12:17:0:0:12:17:0:0
chr4	2460571	.	C	T	158.63	PASS	AF=0.435897;AO=18;DP=40;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.0771367;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.3268;QD=16.2693;RBI=0.0807743;REFB=-0.0169902;REVB=-0.0239671;RO=22;SAF=13;SAR=5;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.273901;STB=0.649499;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=0.0238829;OID=.;OPOS=2460571;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:39:22:22:18:17:0.435897:5:13:10:12:5:12:10:12
chr4	2461888	.	A	G	501.63	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00339221;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.46;QD=59.0153;RBI=0.0310314;REFB=0;REVB=0.0308454;RO=0;SAF=14;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.48532e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000215422;OID=.;OPOS=2461888;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:20:14:0:0:20:14:0:0
chr4	2664913	.	GC	G	42.39	PASS	AF=0.411765;AO=6;DP=17;FAO=7;FDP=17;FR=.;FRO=10;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=10;FWDB=-0.10144;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=18.8997;QD=9.97516;RBI=0.144117;REFB=-0.0407339;REVB=-0.10237;RO=9;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.749554;STBP=0.406;TYPE=del;VARB=0.0276525;OID=.;OPOS=2664914;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.411765:6:17:7:17:10:2:5:0:10:42:9:0:6:0:9
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chr4	2928413	.	T	C	317.22	PASS	AF=0.571429;AO=28;DP=49;FAO=28;FDP=49;FR=.;FRO=21;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=-0.0641158;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.428;QD=25.8951;RBI=0.0645264;REFB=-0.00788208;REVB=0.0072679;RO=21;SAF=12;SAR=16;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0378587;STB=0.520943;STBP=0.742;TYPE=snp;VARB=0.00566133;OID=.;OPOS=2928413;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:21:21:28:28:0.571429:16:12:8:13:16:12:8:13
chr4	3039150	.	T	C	267.75	PASS	AF=0.454545;AO=30;DP=66;FAO=30;FDP=66;FR=.;FRO=36;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=26;FWDB=0.0635652;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.164;QD=16.2271;RBI=0.0635939;REFB=-0.00703166;REVB=-0.00191184;RO=36;SAF=18;SAR=12;SRF=10;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.304552;STB=0.67048;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.0150398;OID=.;OPOS=3039150;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:36:36:30:30:0.454545:12:18:10:26:12:18:10:26
chr4	3219613	.	A	C	1011.75	PASS	AF=1;AO=68;DP=69;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00586367;FXX=0.0144907;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.157;QD=59.5148;RBI=0.0660183;REFB=0;REVB=0.0657573;RO=0;SAF=34;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000125698;OID=.;OPOS=3219613;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:69:68:0:0:68:68:1:34:34:0:0:34:34:0:0
chr4	3231661	.	G	A	201.18	PASS	AF=0.678571;AO=18;DP=27;FAO=19;FDP=28;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=15;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=-0.0110508;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.894;QD=28.7404;RBI=0.0188607;REFB=0.025081;REVB=-0.0152842;RO=9;SAF=3;SAR=15;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.380246;STB=0.675472;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=-0.00709275;OID=.;OPOS=3231661;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:27:28:9:9:18:19:0.678571:15:3:6:3:15:4:6:3
chr4	3318413	.	A	G	501.66	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.02319;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.758;QD=59.0186;RBI=0.0232579;REFB=0;REVB=0.00177669;RO=0;SAF=14;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.48532e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.32014e-05;OID=.;OPOS=3318413;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:20:14:0:0:20:14:0:0
chr4	3319553	.	C	T	451.74	PASS	AF=0.597222;AO=43;DP=72;FAO=43;FDP=72;FR=.;FRO=29;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=0.0518836;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.2946;QD=25.0967;RBI=0.0554007;REFB=-0.0530248;REVB=0.0194249;RO=29;SAF=24;SAR=19;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0303785;STB=0.516626;STBP=0.761;TYPE=snp;VARB=0.0548784;OID=.;OPOS=3319553;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:29:29:43:43:0.597222:19:24:15:14:19:24:15:14
chr4	3417845	.	G	C	59.92	PASS	AF=0.225;AO=9;DP=40;FAO=9;FDP=40;FR=.;FRO=31;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=-0.0157168;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.906;QD=5.99155;RBI=0.0261826;REFB=-0.011502;REVB=-0.0209407;RO=31;SAF=6;SAR=3;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.258426;STB=0.666297;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=0.0369241;OID=.;OPOS=3417845;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:59:40:40:31:31:9:9:0.225:3:6:14:17:3:6:14:17
chr4	3446091	.	G	T	66.82	PASS	AF=0.428571;AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=-0.0220229;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=99.9735;QD=12.7278;RBI=0.0221842;REFB=-0.00656595;REVB=0.00267018;RO=12;SAF=3;SAR=6;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.315875;STB=0.687091;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=0.0569888;OID=.;OPOS=3446091;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:21:21:12:12:9:9:0.428571:6:3:8:4:6:3:8:4
chr4	3446132	.	C	G	87.35	PASS	AF=0.44;AO=9;DP=23;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.0214403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.445;QD=13.9758;RBI=0.0323499;REFB=-0.0315376;REVB=-0.0242246;RO=12;SAF=2;SAR=7;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.303064;STB=0.578801;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.0399255;OID=.;OPOS=3446132;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:23:25:12:14:9:11:0.44:7:2:6:6:7:4:7:7
chr4	3446682	.	C	T	188.69	PASS	AF=0.415094;AO=22;DP=53;FAO=22;FDP=53;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=-0.037015;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.0999;QD=14.2408;RBI=0.0453766;REFB=-0.0165153;REVB=-0.0262475;RO=30;SAF=10;SAR=12;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0123128;STB=0.517226;STBP=0.848;TYPE=snp;VARB=0.0241535;OID=.;OPOS=3446682;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:30:31:22:22:0.415094:12:10:14:16:12:10:15:16
chr4	3449886	.	G	A	176.95	PASS	AF=0.289157;AO=24;DP=82;FAO=24;FDP=83;FR=.;FRO=59;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=35;FSRR=24;FWDB=0.00473717;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.717;QD=8.52762;RBI=0.0937238;REFB=0.00526071;REVB=0.093604;RO=58;SAF=12;SAR=12;SRF=34;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10281;STB=0.566211;STBP=0.475;TYPE=snp;VARB=-0.010213;OID=.;OPOS=3449886;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:83:58:59:24:24:0.289157:12:12:34:24:12:12:35:24
chr4	3475252	.	T	C	2567.9	PASS	AF=0.994048;AO=166;DP=167;FAO=167;FDP=168;FR=.;FRO=1;FSAF=98;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0310972;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.4186;QD=61.1405;RBI=0.0311009;REFB=0.0730041;REVB=0.000482632;RO=1;SAF=97;SAR=69;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.006847;STB=0.503597;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=-0.000768201;OID=.;OPOS=3475252;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:167:168:1:1:166:167:0.994048:69:97:0:1:69:98:0:1
chr4	3514695	.	A	G	958.83	PASS	AF=0.985294;AO=65;DP=68;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0149385;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.3528;QD=56.4017;RBI=0.0162629;REFB=0.0146919;REVB=0.0064283;RO=0;SAF=33;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507244;STBP=0.496;TYPE=snp;VARB=8.91822e-05;OID=.;OPOS=3514695;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:68:68:0:1:65:67:0.985294:32:33:0:0:34:33:0:1
chr4	3589689	.	C	A	299.62	PASS	AF=0.574074;AO=28;DP=51;FAO=31;FDP=54;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=0.0486852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.333;QD=22.1941;RBI=0.0654567;REFB=-0.0364766;REVB=0.0437531;RO=21;SAF=9;SAR=19;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0105078;STB=0.508935;STBP=0.899;TYPE=snp;VARB=0.0356742;OID=.;OPOS=3589689;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:54:21:23:28:31:0.574074:19:9:7:14:21:10:7:16
chr4	3589719	.	CA	C	202.06	PASS	AF=0.56;AO=27;DP=51;FAO=28;FDP=50;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=0.0345011;FXX=0.019604;HRUN=2;LEN=1;MLLD=24.676;QD=16.165;RBI=0.109285;REFB=0.010031;REVB=-0.103696;RO=22;SAF=7;SAR=20;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10317;STB=0.540511;STBP=0.593;TYPE=del;VARB=-0.00942915;OID=.;OPOS=3589720;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.56:27:51:28:50:22:8:20:8:14:99:22:7:20:8:14
chr4	3590683	.	T	G	447.92	PASS	AF=0.626866;AO=42;DP=67;FAO=42;FDP=67;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=29;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.00685863;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.607;QD=26.7414;RBI=0.0118639;REFB=0.0076461;REVB=-0.00968052;RO=24;SAF=13;SAR=29;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139518;STB=0.585816;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=-0.00315279;OID=.;OPOS=3590683;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:24:25:42:42:0.626866:29:13:12:12:29:13:13:12
chr4	3590711	.	G	T	469.73	PASS	AF=0.661538;AO=43;DP=65;FAO=43;FDP=65;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=31;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.0352369;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.9336;QD=28.9062;RBI=0.0430497;REFB=-0.0228349;REVB=0.0247314;RO=22;SAF=12;SAR=31;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157295;STB=0.585825;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=0.0120179;OID=.;OPOS=3590711;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:22:22:43:43:0.661538:31:12:11:11:31:12:11:11
chr4	3590730	.	G	A	492.96	PASS	AF=0.698413;AO=44;DP=63;FAO=44;FDP=63;FR=.;FRO=19;FSAF=13;FSAR=31;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.000500472;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.6;QD=31.2987;RBI=0.0360612;REFB=-0.0157255;REVB=0.0360577;RO=19;SAF=13;SAR=31;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112879;STB=0.561288;STBP=0.197;TYPE=snp;VARB=0.00422874;OID=.;OPOS=3590730;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:19:19:44:44:0.698413:31:13:9:10:31:13:9:10
chr4	3590817	.	T	C	216.28	PASS	AF=0.689655;AO=20;DP=29;FAO=20;FDP=29;FR=.;FRO=9;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.0415451;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.783;QD=29.8322;RBI=0.0416864;REFB=-0.0356872;REVB=-0.00342876;RO=9;SAF=12;SAR=8;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0258492;STB=0.514271;STBP=0.879;TYPE=snp;VARB=0.0283756;OID=.;OPOS=3590817;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:29:29:9:9:20:20:0.689655:8:12:5:4:8:12:5:4
chr4	3590823	.	GACAC	G,GAC	310.98	PASS	AF=0.782609,0.217391;AO=16,5;DP=27;FAO=18,5;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=11,3;FSAR=7,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0575003,0.0497915;FXX=0.148093;HRUN=1,1;LEN=4,2;MLLD=135.539,51.2834;QD=54.0842;RBI=0.104548,0.0552475;REFB=0,0;REVB=0.0873161,0.0239395;RO=0;SAF=10,3;SAR=6,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=0.0276126,0.0536522;OID=.,.;OPOS=3590824,3590824;OREF=ACAC,AC;OALT=-,-;OMAPALT=G,GAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.782609,0.217391:16,5:27:18,5:23:0:11,3:7,2:0:0:30:0:10,3:6,2:0:0
chr4	3590878	.	C	T	661.88	PASS	AF=0.604167;AO=58;DP=96;FAO=58;FDP=96;FR=.;FRO=38;FSAF=37;FSAR=21;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=0.0187309;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.518;QD=27.5782;RBI=0.052348;REFB=-0.0102641;REVB=0.0488821;RO=38;SAF=37;SAR=21;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0854269;STB=0.546575;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.00566553;OID=.;OPOS=3590878;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:96:38:38:58:58:0.604167:21:37:20:18:21:37:20:18
chr4	3590911	.	A	C	1066.06	PASS	AF=0.61745;AO=92;DP=149;FAO=92;FDP=149;FR=.;FRO=57;FSAF=54;FSAR=38;FSRF=25;FSRR=32;FWDB=0.00458798;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.0883;QD=28.619;RBI=0.016418;REFB=-0.00935795;REVB=0.015764;RO=57;SAF=54;SAR=38;SRF=25;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105918;STB=0.557345;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=0.00561442;OID=.;OPOS=3590911;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:149:149:57:57:92:92:0.61745:38:54:25:32:38:54:25:32
chr4	3591015	.	A	C	1188.61	PASS	AF=0.524887;AO=116;DP=224;FAO=116;FDP=221;FR=.;FRO=105;FSAF=63;FSAR=53;FSRF=48;FSRR=57;FWDB=-0.0442448;FXX=0.0133923;HRUN=3;LEN=1;MLLD=102.032;QD=21.5133;RBI=0.0458789;REFB=0.00369556;REVB=-0.0121357;RO=99;SAF=63;SAR=53;SRF=46;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.066282;STB=0.54085;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=-0.00446583;OID=.;OPOS=3591015;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:224:221:99:105:116:116:0.524887:53:63:46:53:53:63:48:57
chr4	3591049	.	C	T	933.21	PASS	AF=0.505376;AO=93;DP=184;FAO=94;FDP=186;FR=.;FRO=92;FSAF=47;FSAR=47;FSRF=41;FSRR=51;FWDB=0.00452915;FXX=0.00534731;HRUN=5;LEN=1;MLLD=47.3748;QD=20.0689;RBI=0.0661223;REFB=0.00212523;REVB=0.065967;RO=91;SAF=46;SAR=47;SRF=40;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0496212;STB=0.526876;STBP=0.443;TYPE=snp;VARB=-0.00159953;OID=.;OPOS=3591049;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:184:186:91:92:93:94:0.505376:47:46:40:51:47:47:41:51
chr4	3591069	.	C	T	727.04	PASS	AF=0.493421;AO=75;DP=152;FAO=75;FDP=152;FR=.;FRO=77;FSAF=38;FSAR=37;FSRF=37;FSRR=40;FWDB=-0.0111572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.305;QD=19.1326;RBI=0.0249038;REFB=-0.0110575;REVB=-0.0222647;RO=76;SAF=38;SAR=37;SRF=36;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0301107;STB=0.51324;STBP=0.774;TYPE=snp;VARB=0.0090785;OID=.;OPOS=3591069;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:152:152:76:77:75:75:0.493421:37:38:36:40:37:38:37:40
chr4	4199634	.	A	T	594.49	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0154844;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.006;QD=60.9728;RBI=0.0155913;REFB=0;REVB=-0.00182317;RO=0;SAF=21;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.34792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.40162e-05;OID=.;OPOS=4199634;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:18:21:0:0:18:21:0:0
chr4	4204299	.	T	C	408.32	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00376171;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.845;QD=56.3198;RBI=0.0197608;REFB=0;REVB=0.0193995;RO=0;SAF=18;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000360183;OID=.;OPOS=4204299;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:29:0:0:28:29:1:10:18:0:0:11:18:0:0
chr4	4228273	.	TCCACAGCAG	T	50.0	PASS	AO=30;DP=72;LEN=9;RO=42;SAF=13;SAR=21;SRF=16;SRR=22;TYPE=del;FR=.;OID=.;OPOS=4228274;OREF=CCACAGCAG;OALT=-;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:RO:AO:SAR:SAF:SRF:SRR	0/1:99:72:42:30:21:13:16:22
chr4	4239587	.	G	T	115.22	PASS	AF=0.261538;AO=17;DP=66;FAO=17;FDP=65;FR=.;FRO=48;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=24;FSRR=24;FWDB=0.0285956;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.5314;QD=7.0903;RBI=0.0287209;REFB=0.00219764;REVB=0.00268038;RO=47;SAF=10;SAR=7;SRF=24;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0944627;STB=0.565616;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=-0.00473068;OID=.;OPOS=4239587;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:65:47:48:17:17:0.261538:7:10:24:23:7:10:24:24
chr4	4249297	.	C	T	508.25	PASS	AF=1;AO=34;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0242166;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.997;QD=58.086;RBI=0.0331577;REFB=0;REVB=0.0226493;RO=0;SAF=18;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00147125;OID=.;OPOS=4249297;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:34:35:1:16:18:0:0:16:19:0:0
chr4	4249300	.	T	C	520.04	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0136912;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.9788;QD=59.433;RBI=0.0141525;REFB=0;REVB=-0.00358398;RO=0;SAF=19;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.1382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000341149;OID=.;OPOS=4249300;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:16:19:0:0:16:19:0:0
chr4	4249855	.	G	A	327.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0405551;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.411;QD=52.374;RBI=0.060239;REFB=0;REVB=0.0445423;RO=0;SAF=9;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.84921e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000743932;OID=.;OPOS=4249855;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:23:25:1:14:9:0:0:15:10:0:0
chr4	4249909	.	C	T	340.82	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.13649;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.8502;QD=54.5312;RBI=0.138036;REFB=0;REVB=0.020605;RO=0;SAF=14;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00401529;OID=.;OPOS=4249909;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:25:0:0:24:25:1:10:14:0:0:10:15:0:0
chr4	4276132	.	T	C	393.31	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0147364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.659;QD=56.1872;RBI=0.0465825;REFB=0;REVB=0.0441901;RO=0;SAF=15;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000459799;OID=.;OPOS=4276132;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:28:0:0:27:28:1:12:15:0:0:12:16:0:0
chr4	4864301	.	C	A	60.75	PASS	AF=0.236842;AO=9;DP=38;FAO=9;FDP=38;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=-0.054499;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=247.529;QD=6.39527;RBI=0.0544992;REFB=-0.00843035;REVB=0.000168519;RO=29;SAF=7;SAR=2;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.369704;STB=0.738573;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=0.032382;OID=.;OPOS=4864301;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:60:38:38:29:29:9:9:0.236842:2:7:14:15:2:7:14:15
chr4	4865685	.	CTTTTAT	C,CTTTAAT,CTTTTTAT	242.51	PASS	AF=0.214286,0,0;AO=36,10,24;DP=212;FAO=39,0,0;FDP=182;FR=.;FRO=143;FSAF=19,0,0;FSAR=20,0,0;FSRF=74;FSRR=69;FWDB=0.0106445,0.0514807,-0.105748;FXX=0.0714249;HRUN=4,4,4;LEN=6,1,1;MLLD=253.042,38.5547,12.9257;QD=5.32995;RBI=0.0481698,0.10404,0.19578;REFB=0.00105422,0.0111761,-0.0156466;REVB=0.046979,0.090411,-0.164764;RO=124;SAF=18,8,12;SAR=18,2,12;SRF=68;SRR=56;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.0613018,0.291487,-0.0617876;STB=0.523784,0.5,0.5;STBP=0.732,1,1;TYPE=del,snp,ins;VARB=0.00190197,0,0.0234317;OID=.,.,.;OPOS=4865686,4865689,4865686;OREF=TTTTAT,T,-;OALT=-,A,T;OMAPALT=C,CTTTAAT,CTTTTTAT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.214286,0,0:36,10,24:212:39,0,0:182:143:19,0,0:20,0,0:74:69:99:124:18,8,12:18,2,12:68:56
chr4	5448429	.	A	G	411.11	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0136162;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.882;QD=56.705;RBI=0.0138116;REFB=0;REVB=0.00231517;RO=0;SAF=16;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.82504e-05;OID=.;OPOS=5448429;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:13:16:0:0:13:16:0:0
chr4	5570221	.	G	A	1457.48	PASS	AF=1;AO=92;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0037217;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.875;QD=62.6875;RBI=0.00955713;REFB=0;REVB=0.00880271;RO=0;SAF=50;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.02762e-05;OID=.;OPOS=5570221;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:93:93:0:0:92:93:1:42:50:0:0:42:51:0:0
chr4	5690902	.	T	C	59.87	PASS	AF=0.2;AO=9;DP=46;FAO=9;FDP=45;FR=.;FRO=36;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=0.00120609;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.366;QD=5.32161;RBI=0.00512323;REFB=-0.00866101;REVB=-0.00497923;RO=33;SAF=5;SAR=4;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.04906;STB=0.566355;STBP=0.697;TYPE=snp;VARB=0.0215078;OID=.;OPOS=5690902;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:59:46:45:33:36:9:9:0.2:4:5:17:16:4:5:17:19
chr4	5721021	.	A	C	417.73	PASS	AF=0.733333;AO=33;DP=45;FAO=33;FDP=45;FR=.;FRO=12;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.0153812;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.5506;QD=37.1316;RBI=0.0169434;REFB=0.0138252;REVB=-0.00710609;RO=12;SAF=19;SAR=14;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0378259;STB=0.520535;STBP=0.71;TYPE=snp;VARB=-0.00448098;OID=.;OPOS=5721021;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:90:45:45:12:12:33:33:0.733333:14:19:6:6:14:19:6:6
chr4	5743509	.	C	T	710.41	PASS	AF=0.980769;AO=52;DP=53;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0278164;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.359;QD=54.6469;RBI=0.047441;REFB=0.0988437;REVB=0.0384305;RO=0;SAF=29;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.84538e-08;STB=0.511107;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=-0.000333228;OID=.;OPOS=5743509;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:53:52:0:1:52:51:0.980769:23:29:0:0:22:29:0:1
chr4	5743512	.	T	C	754.2	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0558141;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.458;QD=56.921;RBI=0.0614795;REFB=0;REVB=0.0257783;RO=0;SAF=30;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.72004e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000270469;OID=.;OPOS=5743512;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:23:30:0:0:23:30:0:0
chr4	5750003	.	A	G	115.58	PASS	AF=0.8;AO=12;DP=15;FAO=12;FDP=15;FR=.;FRO=3;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0611334;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.8352;QD=30.8208;RBI=0.0678893;REFB=0.0613336;REVB=0.0295242;RO=3;SAF=4;SAR=8;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0122451;OID=.;OPOS=5750003;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:15:15:3:3:12:12:0.8:8:4:1:2:8:4:1:2
chr4	5755542	.	C	A	918.04	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0115608;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.384;QD=58.2885;RBI=0.0117019;REFB=0;REVB=0.00181203;RO=0;SAF=27;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.46408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.73125e-05;OID=.;OPOS=5755542;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:63:0:0:62:63:1:35:27:0:0:36:27:0:0
chr4	5795412	.	C	T	187.98	PASS	AF=0.415094;AO=22;DP=53;FAO=22;FDP=53;FR=.;FRO=31;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=0.0374216;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.9416;QD=14.1872;RBI=0.0396722;REFB=-0.0200798;REVB=-0.0131723;RO=31;SAF=6;SAR=16;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.355423;STB=0.704035;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.0354692;OID=.;OPOS=5795412;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:31:31:22:22:0.415094:16:6:19:12:16:6:19:12
chr4	5838513	.	C	G	77.28	PASS	AF=0.215686;AO=11;DP=51;FAO=11;FDP=51;FR=.;FRO=40;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=0.0349363;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.6951;QD=6.0609;RBI=0.0387955;REFB=-0.000511324;REVB=0.0168685;RO=40;SAF=5;SAR=6;SRF=21;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0860077;STB=0.55506;STBP=0.698;TYPE=snp;VARB=0.00471347;OID=.;OPOS=5838513;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:51:51:40:40:11:11:0.215686:6:5:21:19:6:5:21:19
chr4	5975538	.	G	A	453.88	PASS	AF=0.969697;AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=33;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0123669;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.478;QD=55.0159;RBI=0.0124354;REFB=-0.0033621;REVB=-0.00130385;RO=1;SAF=11;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0405505;STB=0.521725;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=3.13967e-06;OID=.;OPOS=5975538;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:33:33:1:1:32:32:0.969697:21:11:1:0:21:11:1:0
chr4	5990110	.	C	A	727.77	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0104059;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=184.672;QD=63.2847;RBI=0.0180202;REFB=0;REVB=0.0147121;RO=0;SAF=25;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.85991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.90854e-05;OID=.;OPOS=5990110;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:21:25:0:0:21:25:0:0
chr4	5990339	.	G	A	865.14	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00983058;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.599;QD=57.6759;RBI=0.0106118;REFB=0;REVB=-0.00399636;RO=0;SAF=27;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.50506e-05;OID=.;OPOS=5990339;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:56:60:0:0:56:60:1:29:27:0:0:33:27:0:0
chr4	5990551	.	G	A	340.72	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0140069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.4072;QD=54.5157;RBI=0.0333831;REFB=0;REVB=-0.0303024;RO=0;SAF=13;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000661437;OID=.;OPOS=5990551;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:12:13:0:0:12:13:0:0
chr4	5990599	.	T	C	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0373846;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.801;QD=47.8221;RBI=0.0388312;REFB=0;REVB=0.0105;RO=0;SAF=10;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000977409;OID=.;OPOS=5990599;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:6:10:0:0:6:10:0:0
chr4	5990791	.	A	G	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0200622;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.271;QD=53.277;RBI=0.0259215;REFB=0;REVB=0.0164145;RO=0;SAF=11;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.08495e-05;OID=.;OPOS=5990791;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:12:11:0:0:12:11:0:0
chr4	5991384	.	T	C	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0429235;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.2033;QD=49.5988;RBI=0.0646512;REFB=0;REVB=-0.0483461;RO=0;SAF=6;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000104491;OID=.;OPOS=5991384;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:12:6:0:0:12:6:0:0
chr4	5991476	.	G	A	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0852824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.83;QD=33.4285;RBI=0.0940022;REFB=0;REVB=0.039539;RO=0;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00461946;OID=.;OPOS=5991476;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:2:4:0:0:2:4:0:0
chr4	6293696	.	C	G	212.03	PASS	AF=0.242424;AO=32;DP=132;FAO=32;FDP=132;FR=.;FRO=100;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=52;FSRR=48;FWDB=0.0145831;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.905;QD=6.4253;RBI=0.015178;REFB=-0.00442094;REVB=0.00420792;RO=99;SAF=16;SAR=16;SRF=51;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0189037;STB=0.515142;STBP=0.854;TYPE=snp;VARB=0.0124703;OID=.;OPOS=6293696;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:132:132:99:100:32:32:0.242424:16:16:51:48:16:16:52:48
chr4	6302519	.	G	A	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0590468;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.266;QD=55.0984;RBI=0.0611408;REFB=0;REVB=0.0158643;RO=0;SAF=12;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000909737;OID=.;OPOS=6302519;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:14:12:0:0:14:12:0:0
chr4	6302707	.	C	T	84.34	PASS	AF=0.34375;AO=11;DP=32;FAO=11;FDP=32;FR=.;FRO=21;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=0.0249443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.324;QD=10.5421;RBI=0.0298061;REFB=-0.0236696;REVB=0.0163152;RO=21;SAF=2;SAR=9;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.528836;STB=0.817603;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0124504;OID=.;OPOS=6302707;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:32:32:21:21:11:11:0.34375:9:2:14:7:9:2:14:7
chr4	6302831	.	G	A	144.18	PASS	AF=0.625;AO=15;DP=24;FAO=15;FDP=24;FR=.;FRO=9;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.0114932;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.3664;QD=24.0296;RBI=0.0245587;REFB=-0.00884339;REVB=0.0217034;RO=9;SAF=7;SAR=8;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0149138;STB=0.508369;STBP=0.946;TYPE=snp;VARB=0.0114761;OID=.;OPOS=6302831;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:24:24:9:9:15:15:0.625:8:7:4:5:8:7:4:5
chr4	6303022	.	C	T	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0239973;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.492;QD=47.8224;RBI=0.0271844;REFB=0;REVB=-0.0127719;RO=0;SAF=11;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.36667e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000109285;OID=.;OPOS=6303022;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:5:11:0:0:5:11:0:0
chr4	6303354	.	G	A	51.35	PASS	AF=0.204082;AO=10;DP=50;FAO=10;FDP=49;FR=.;FRO=39;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=0.0100603;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.8574;QD=4.19161;RBI=0.0165764;REFB=-0.034085;REVB=0.0131744;RO=39;SAF=3;SAR=7;SRF=23;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.34789;STB=0.724662;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.102942;OID=.;OPOS=6303354;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:51:50:49:39:39:10:10:0.204082:7:3:23:16:7:3:23:16
chr4	6303955	.	G	A	103.56	PASS	AF=0.5;AO=12;DP=25;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=0.0154477;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.829;QD=17.2595;RBI=0.0156421;REFB=0.00413528;REVB=0.00245788;RO=13;SAF=5;SAR=7;SRF=3;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179293;STB=0.634129;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=-0.00494595;OID=.;OPOS=6303955;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:24:13:12:12:12:0.5:7:5:3:10:7:5:2:10
chr4	6304087	.	A	G	72.35	PASS	AF=0.294118;AO=10;DP=34;FAO=10;FDP=34;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=17;FWDB=0.000210951;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.459;QD=8.51178;RBI=0.0353792;REFB=-0.0050003;REVB=-0.0353786;RO=23;SAF=5;SAR=5;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.225143;STB=0.64679;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.0100428;OID=.;OPOS=6304087;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:34:34:23:24:10:10:0.294118:5:5:7:16:5:5:7:17
chr4	6304242	.	T	C	223.15	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0834622;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.5317;QD=49.5878;RBI=0.0895866;REFB=0;REVB=-0.0325548;RO=0;SAF=8;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00387904;OID=.;OPOS=6304242;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:10:8:0:0:10:8:0:0
chr4	6304286	.	C	T	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0460183;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.116;QD=52.6121;RBI=0.0496358;REFB=0;REVB=-0.0186018;RO=0;SAF=11;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000264128;OID=.;OPOS=6304286;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:11:11:0:0:11:11:0:0
chr4	6304344	.	G	A	104.39	PASS	AF=0.325;AO=13;DP=40;FAO=13;FDP=40;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=18;FSRR=9;FWDB=-0.0189789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.375;QD=10.4387;RBI=0.024073;REFB=-0.014786;REVB=-0.014809;RO=26;SAF=10;SAR=3;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160115;STB=0.58809;STBP=0.49;TYPE=snp;VARB=0.0158579;OID=.;OPOS=6304344;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:26:27:13:13:0.325:3:10:17:9:3:10:18:9
chr4	6325086	.	G	A	885.5	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00383864;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.376;QD=58.0658;RBI=0.0273153;REFB=0;REVB=0.0270442;RO=0;SAF=36;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.9695e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.75625e-05;OID=.;OPOS=6325086;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:61:0:0:60:61:1:24:36:0:0:25:36:0:0
chr4	6382919	.	C	T	85.04	PASS	AF=0.666667;AO=10;DP=15;FAO=10;FDP=15;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.00825802;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=170.052;QD=22.6777;RBI=0.00922166;REFB=-0.0103958;REVB=0.00410417;RO=4;SAF=5;SAR=5;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.533267;STBP=0.771;TYPE=snp;VARB=0.00913394;OID=.;OPOS=6382919;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:15:15:4:5:10:10:0.666667:5:5:2:2:5:5:2:3
chr4	6415618	.	G	A	57.0	PASS	AF=0.243243;AO=7;DP=36;FAO=9;FDP=37;FR=.;FRO=28;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=-0.00669864;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.734;QD=6.16247;RBI=0.00975118;REFB=-0.0096487;REVB=-0.00708617;RO=27;SAF=3;SAR=4;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0192232;STB=0.56871;STBP=0.661;TYPE=snp;VARB=0.037795;OID=.;OPOS=6415618;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:36:37:27:28:7:9:0.243243:4:3:12:15:4:5:13:15
chr4	6536979	.	G	A	244.52	PASS	AF=0.6875;AO=22;DP=32;FAO=22;FDP=32;FR=.;FRO=10;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=-0.00741056;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.552;QD=30.5651;RBI=0.0370451;REFB=-0.0145647;REVB=0.0362963;RO=10;SAF=13;SAR=9;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0527389;STB=0.529043;STBP=0.64;TYPE=snp;VARB=0.0080693;OID=.;OPOS=6536979;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:32:32:10:10:22:22:0.6875:9:13:5:5:9:13:5:5
chr4	6596360	.	G	A	988.17	PASS	AF=0.958904;AO=69;DP=73;FAO=70;FDP=73;FR=.;FRO=3;FSAF=40;FSAR=30;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0362075;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.571;QD=54.1463;RBI=0.0395338;REFB=-0.0467496;REVB=0.0158725;RO=3;SAF=39;SAR=30;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0349818;STB=0.518067;STBP=0.151;TYPE=snp;VARB=0.00180576;OID=.;OPOS=6596360;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:73:73:3:3:69:70:0.958904:30:39:3:0:30:40:3:0
chr4	6619165	.	A	G	411.11	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0209848;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.895;QD=56.7051;RBI=0.0350723;REFB=0;REVB=0.0281017;RO=0;SAF=15;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000347645;OID=.;OPOS=6619165;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:14:15:0:0:14:15:0:0
chr4	6619204	.	G	A	370.79	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0221445;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.003;QD=54.9322;RBI=0.0298082;REFB=0;REVB=0.0199537;RO=0;SAF=13;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000540187;OID=.;OPOS=6619204;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:14:13:0:0:14:13:0:0
chr4	6698667	.	T	C	579.43	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0226751;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.328;QD=60.9921;RBI=0.0637737;REFB=0;REVB=0.0596064;RO=0;SAF=20;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.51048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000175132;OID=.;OPOS=6698667;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:18:20:0:0:18:20:0:0
chr4	6698706	.	A	C	651.2	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0208765;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.8528;QD=62.0193;RBI=0.0470491;REFB=0;REVB=-0.0421638;RO=0;SAF=22;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000684152;OID=.;OPOS=6698706;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:20:22:0:0:20:22:0:0
chr4	6718775	.	G	T	45.25	PASS	AF=0.163265;AO=7;DP=48;FAO=8;FDP=49;FR=.;FRO=41;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=26;FWDB=0.00671203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.975;QD=3.6939;RBI=0.0126911;REFB=-0.00496684;REVB=0.0107709;RO=39;SAF=2;SAR=5;SRF=14;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0998856;STB=0.508176;STBP=0.979;TYPE=snp;VARB=0.0728396;OID=.;OPOS=6718775;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:48:49:39:41:7:8:0.163265:5:2:14:25:5:3:15:26
chr4	6884329	.	T	C	414.79	PASS	AF=0.885714;AO=31;DP=35;FAO=31;FDP=35;FR=.;FRO=4;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.00733764;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=161.83;QD=47.4045;RBI=0.0398531;REFB=-0.0127339;REVB=0.0391718;RO=3;SAF=18;SAR=13;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0413623;STB=0.509428;STBP=0.757;TYPE=snp;VARB=0.000399613;OID=.;OPOS=6884329;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:19:35:35:3:4:31:31:0.885714:13:18:1:2:13:18:2:2
chr4	6884352	.	GGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	GGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT,GGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGC	80.45	PASS	AF=0.346154,0.0769231;AO=8,2;DP=28;FAO=9,2;FDP=26;FR=.;FRO=15;FSAF=5,1;FSAR=4,1;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=7.08449e-05,0.0564412;FXX=0.0370233;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=98.9542,92.2899;QD=12.3765;RBI=0.012152,0.0612178;REFB=-0.0516311,0.00309393;REVB=-0.0121518,-0.0237067;RO=14;SAF=5,1;SAR=3,1;SRF=4;SRR=10;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.343095,0.22986;STB=0.636074,0.645722;STBP=0.326,0.71;TYPE=del,snp;VARB=0.0807191,0.134058;OID=.,.;OPOS=6884353,6884374;OREF=GT,T;OALT=-,C;OMAPALT=GGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT,GGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.346154,0.0769231:8,2:28:9,2:26:15:5,1:4,1:5:10:69:14:5,1:3,1:4:10
chr4	7044600	.	G	A	1000.32	PASS	AF=0.971831;AO=68;DP=70;FAO=69;FDP=71;FR=.;FRO=2;FSAF=25;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0991809;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.628;QD=56.3561;RBI=0.109219;REFB=-0.0935247;REVB=0.0457386;RO=2;SAF=24;SAR=44;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0209994;STB=0.511108;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.0081573;OID=.;OPOS=7044600;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:70:71:2:2:68:69:0.971831:44:24:0:2:44:25:0:2
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chr4	7714490	.	T	C	632.25	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.095543;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.8037;QD=61.6832;RBI=0.0956387;REFB=0;REVB=0.00427885;RO=0;SAF=17;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.2194e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000821097;OID=.;OPOS=7714490;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:24:17:0:0:24:17:0:0
chr4	7716932	.	T	C	755.25	PASS	AF=1;AO=43;DP=45;FAO=48;FDP=48;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=17;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0288707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.769;QD=62.9376;RBI=0.0391496;REFB=0;REVB=0.0264419;RO=0;SAF=15;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000287978;OID=.;OPOS=7716932;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:48:0:0:43:48:1:28:15:0:0:31:17:0:0
chr4	7770723	.	G	T	1568.34	PASS	AF=1;AO=98;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0563394;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.394;QD=64.0138;RBI=0.0602586;REFB=0;REVB=0.0213768;RO=0;SAF=47;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000108903;OID=.;OPOS=7770723;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:98:0:0:98:98:1:51:47:0:0:51:47:0:0
chr4	7774667	.	C	A	148.82	PASS	AF=0.208333;AO=25;DP=120;FAO=25;FDP=120;FR=.;FRO=95;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=47;FSRR=48;FWDB=0.00513165;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.347;QD=4.96076;RBI=0.0281101;REFB=-0.0012934;REVB=0.0276377;RO=95;SAF=12;SAR=13;SRF=47;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0186665;STB=0.511665;STBP=0.88;TYPE=snp;VARB=0.00378716;OID=.;OPOS=7774667;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:120:95:95:25:25:0.208333:13:12:47:48:13:12:47:48
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chr4	8031471	.	A	G	651.23	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0145589;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.305;QD=62.0217;RBI=0.0422605;REFB=0;REVB=-0.0396735;RO=0;SAF=27;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.13648e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000269059;OID=.;OPOS=8031471;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:15:27:0:0:15:27:0:0
chr4	8062689	.	TG	CA	766.46	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0288046;FXX=0;HRUN=3;LEN=2;MLLD=206.008;QD=63.872;RBI=0.0338399;REFB=0;REVB=-0.0177604;RO=0;SAF=23;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=-0.000104646;OID=.;OPOS=8062689;OREF=TG;OALT=CA;OMAPALT=CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:25:23:0:0:25:23:0:0
chr4	8207083	.	A	G	51.24	PASS	AF=0.216216;AO=8;DP=37;FAO=8;FDP=37;FR=.;FRO=29;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=-0.0855713;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.296;QD=5.5396;RBI=0.103003;REFB=-0.00676041;REVB=-0.0573334;RO=29;SAF=4;SAR=4;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0620516;STB=0.54044;STBP=0.809;TYPE=snp;VARB=0.0235967;OID=.;OPOS=8207083;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:51:37:37:29:29:8:8:0.216216:4:4:13:16:4:4:13:16
chr4	8228731	.	T	C	954.85	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0695923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.512;QD=58.76;RBI=0.0701108;REFB=0;REVB=-0.00851061;RO=0;SAF=22;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000149771;OID=.;OPOS=8228731;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:43:22:0:0:43:22:0:0
chr4	8228894	.	T	C	926.77	PASS	AF=1;AO=63;DP=65;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0166817;FXX=0.0307645;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.489;QD=58.8428;RBI=0.0166831;REFB=0;REVB=0.000220319;RO=0;SAF=40;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000227539;OID=.;OPOS=8228894;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:63:0:0:63:63:1:23:40:0:0:23:40:0:0
chr4	8229218	.	A	G	1190.45	PASS	AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0106865;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.18;QD=61.0489;RBI=0.0213815;REFB=0;REVB=-0.0185194;RO=0;SAF=41;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.4281e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.54439e-05;OID=.;OPOS=8229218;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:37:41:0:0:37:41:0:0
chr4	8229326	.	T	C	294.71	PASS	AF=1;AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0378682;FXX=0.0434594;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.305;QD=53.5832;RBI=0.0381981;REFB=0;REVB=-0.0050089;RO=0;SAF=14;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.1602e-05;OID=.;OPOS=8229326;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:22:0:0:22:22:1:8:14:0:0:8:14:0:0
chr4	8229713	.	A	G	41.14	PASS	AF=0.6;AO=6;DP=10;FAO=6;FDP=10;FR=.;FRO=4;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=179.9;QD=16.4544;RBI=0.0203021;REFB=-0.02936;REVB=-0.0203021;RO=4;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0187964;OID=.;OPOS=8229713;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:10:10:4:4:6:6:0.6:6:0:0:4:6:0:0:4
chr4	8242466	.	A	G	1545.15	PASS	AF=1;AO=101;DP=102;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0258886;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.261;QD=58.8629;RBI=0.0284422;REFB=0;REVB=0.0117786;RO=0;SAF=53;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11453e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000215649;OID=.;OPOS=8242466;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:102:105:0:0:101:105:1:48:53:0:0:51:54:0:0
chr4	8391358	.	G	A	136.67	PASS	AF=0.32;AO=16;DP=50;FAO=16;FDP=50;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=0.0419805;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.8107;QD=10.9337;RBI=0.0426133;REFB=0.00289184;REVB=0.00731685;RO=34;SAF=10;SAR=6;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0784672;STB=0.546816;STBP=0.686;TYPE=snp;VARB=-0.00164938;OID=.;OPOS=8391358;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:34:34:16:16:0.32:6:10:19:15:6:10:19:15
chr4	8394124	.	C	T	288.34	PASS	AF=0.349515;AO=36;DP=103;FAO=36;FDP=103;FR=.;FRO=67;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=30;FSRR=37;FWDB=0.0111998;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.04;QD=11.1976;RBI=0.0124993;REFB=-0.00570359;REVB=-0.00554943;RO=67;SAF=16;SAR=20;SRF=30;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00378838;STB=0.502182;STBP=0.976;TYPE=snp;VARB=0.0103097;OID=.;OPOS=8394124;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:103:67:67:36:36:0.349515:20:16:30:37:20:16:30:37
chr4	8398837	.	G	A	249.36	PASS	AF=0.733333;AO=22;DP=30;FAO=22;FDP=30;FR=.;FRO=8;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=-0.0807287;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.368;QD=33.2485;RBI=0.0819223;REFB=-0.00837807;REVB=-0.0139335;RO=8;SAF=7;SAR=15;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160305;STB=0.588152;STBP=0.138;TYPE=snp;VARB=0.00160579;OID=.;OPOS=8398837;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:30:30:8:8:22:22:0.733333:15:7:5:3:15:7:5:3
chr4	8588917	.	G	A	451.5	PASS	AF=0.729167;AO=34;DP=47;FAO=35;FDP=48;FR=.;FRO=13;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.0433502;FXX=0.020404;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.415;QD=37.6248;RBI=0.0434388;REFB=-0.0152744;REVB=0.00277275;RO=13;SAF=19;SAR=15;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0499058;STB=0.530103;STBP=0.468;TYPE=snp;VARB=0.00522888;OID=.;OPOS=8588917;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:48:13:13:34:35:0.729167:15:19:6:7:15:20:6:7
chr4	8594574	.	T	C	88.22	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0681633;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.072;QD=39.2068;RBI=0.0773822;REFB=0;REVB=0.0366301;RO=0;SAF=4;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.003775;OID=.;OPOS=8594574;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:5:4:0:0:5:4:0:0
chr4	8602884	.	T	C	501.64	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0441587;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.8426;QD=59.0164;RBI=0.0480844;REFB=0;REVB=0.0190295;RO=0;SAF=14;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.48532e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000428498;OID=.;OPOS=8602884;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:20:14:0:0:20:14:0:0
chr4	8602935	.	AT	GC,GT	564.05	PASS	AF=0.0526316,0.947368;AO=2,23;DP=38;FAO=2,36;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=0,14;FSAR=2,22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00444108,0.0272782;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=119.556,120.054;QD=59.3737;RBI=0.00922321,0.0280709;REFB=0,0;REVB=-0.00808359,-0.00662379;RO=0;SAF=0,14;SAR=2,9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-4.84921e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0106244,0.000403554;OID=.,.;OPOS=8602935,8602935;OREF=AT,A;OALT=GC,G;OMAPALT=GC,GT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:38:38:0:0:2,23:2,36:0.0526316,0.947368:2,9:0,14:0:0:2,22:0,14:0:0
chr4	8616096	.	T	C	318.68	PASS	AF=0.692308;AO=27;DP=39;FAO=27;FDP=39;FR=.;FRO=12;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.0116746;FXX=0.0249938;HRUN=3;LEN=1;MLLD=88.3404;QD=32.6854;RBI=0.069263;REFB=-0.0642726;REVB=-0.068272;RO=12;SAF=16;SAR=11;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00538257;STB=0.502945;STBP=0.991;TYPE=snp;VARB=0.00682198;OID=.;OPOS=8616096;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:39:39:12:12:27:27:0.692308:11:16:7:5:11:16:7:5
chr4	8616179	.	T	C	805.01	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0101942;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.2996;QD=64.4011;RBI=0.0151598;REFB=0;REVB=0.0112205;RO=0;SAF=19;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.02794e-05;OID=.;OPOS=8616179;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:31:19:0:0:31:19:0:0
chr4	8621167	.	G	A	90.69	PASS	AF=0.266667;AO=12;DP=45;FAO=12;FDP=45;FR=.;FRO=33;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=0.00697433;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=151.214;QD=8.06155;RBI=0.034283;REFB=-0.0088067;REVB=-0.0335661;RO=32;SAF=6;SAR=6;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0738568;STB=0.533278;STBP=0.79;TYPE=snp;VARB=0.0156803;OID=.;OPOS=8621167;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:90:45:45:32:33:12:12:0.266667:6:6:18:14:6:6:18:15
chr4	8621194	.	A	G	501.35	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00926673;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.205;QD=58.9822;RBI=0.0146344;REFB=0;REVB=0.0113266;RO=0;SAF=17;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000102175;OID=.;OPOS=8621194;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:17:17:0:0:17:17:0:0
chr4	8951816	.	A	G	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0153006;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.882;QD=40.7625;RBI=0.0201354;REFB=0;REVB=0.0130891;RO=0;SAF=5;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000144473;OID=.;OPOS=8951816;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:5:5:0:0:5:5:0:0
chr4	9387462	.	C	T	801.33	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0154156;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=316.552;QD=57.2377;RBI=0.0154202;REFB=0;REVB=-0.00037609;RO=0;SAF=21;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.24675e-05;OID=.;OPOS=9387462;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:35:21:0:0:35:21:0:0
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chr4	9785134	.	T	C	376.43	PASS	AF=0.769231;AO=30;DP=38;FAO=30;FDP=39;FR=.;FRO=9;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=-0.00684815;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.906;QD=38.6079;RBI=0.0601409;REFB=-0.0166285;REVB=-0.0597497;RO=8;SAF=18;SAR=12;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0892157;STB=0.562458;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=0.00386794;OID=.;OPOS=9785134;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:60:38:39:8:9:30:30:0.769231:12:18:3:5:12:18:3:6
chr4	9909923	.	G	A	101.59	PASS	AF=0.5;AO=12;DP=24;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.00189654;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=223.99;QD=16.9316;RBI=0.00463756;REFB=-0.00723602;REVB=0.00423203;RO=12;SAF=5;SAR=7;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144308;STB=0.583194;STBP=0.473;TYPE=snp;VARB=0.00829423;OID=.;OPOS=9909923;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:24:24:12:12:12:12:0.5:7:5:7:5:7:5:7:5
chr4	9922129	.	GC	AT,GT	770.72	PASS	AF=0.0408163,0.959184;AO=2,47;DP=49;FAO=2,47;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=2,20;FSAR=0,27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0165099,0.037526;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=56.1092,89.6588;QD=62.9161;RBI=0.0187925,0.0467227;REFB=0,0;REVB=0.00897671,0.0278354;RO=0;SAF=2,20;SAR=0,27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=-0.0682753,0.00386384;OID=.,.;OPOS=9922129,9922130;OREF=GC,C;OALT=AT,T;OMAPALT=AT,GT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:49:49:0:0:2,47:2,47:0.0408163,0.959184:0,27:2,20:0:0:0,27:2,20:0:0
chr4	9982330	.	A	G	255.88	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142603;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.8811;QD=51.1766;RBI=0.0461184;REFB=0;REVB=-0.0438583;RO=0;SAF=9;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000592492;OID=.;OPOS=9982330;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:11:9:0:0:11:9:0:0
chr4	9987324	.	G	A	569.65	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.029203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.8972;QD=59.963;RBI=0.029816;REFB=0;REVB=0.00601465;RO=0;SAF=20;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.51048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00315429;OID=.;OPOS=9987324;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:18:20:0:0:18:20:0:0
chr4	9998493	.	A	G	769.51	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00162886;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=222.088;QD=57.0008;RBI=0.0171379;REFB=0;REVB=0.0170604;RO=0;SAF=17;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.08382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.99356e-05;OID=.;OPOS=9998493;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:37:17:0:0:37:17:0:0
chr4	10090178	.	T	C	708.56	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0261172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.874;QD=62.9829;RBI=0.0294148;REFB=0;REVB=0.0135324;RO=0;SAF=24;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.37864e-05;OID=.;OPOS=10090178;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:21:24:0:0:21:24:0:0
chr4	10099340	.	T	C	969.5	PASS	AF=1;AO=65;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0235247;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.129;QD=58.7575;RBI=0.0265421;REFB=0;REVB=0.0122912;RO=0;SAF=34;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.90682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.17153e-05;OID=.;OPOS=10099340;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:65:66:1:31:34:0:0:31:35:0:0
chr4	10442700	.	C	T	1062.39	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0207004;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.5473;QD=59.8527;RBI=0.0381033;REFB=0;REVB=-0.03199;RO=0;SAF=39;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000395142;OID=.;OPOS=10442700;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:32:39:0:0:32:39:0:0
chr4	10446385	.	C	T	483.35	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00705683;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.656;QD=58.5877;RBI=0.0165088;REFB=0;REVB=0.0149246;RO=0;SAF=16;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.60901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000145315;OID=.;OPOS=10446385;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:17:16:0:0:17:16:0:0
chr4	10446906	.	A	G	323.47	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100801;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.274;QD=53.9109;RBI=0.0206813;REFB=0;REVB=0.0180585;RO=0;SAF=11;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000160577;OID=.;OPOS=10446906;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:13:11:0:0:13:11:0:0
chr4	10447985	.	AT	AA,A	374.65	PASS	AF=0.0357143,0.964286;AO=3,25;DP=28;FAO=1,27;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=0,15;FSAR=1,12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.165072,-0.0620927;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=13.893,27.9276;QD=53.521;RBI=0.165138,0.0701254;REFB=0,0;REVB=-0.00467252,-0.0325894;RO=0;SAF=2,13;SAR=1,12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.94263e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,del;VARB=0.075665,-0.00895569;OID=.,.;OPOS=10447986,10447986;OREF=T,T;OALT=A,-;OMAPALT=AA,A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0357143,0.964286:3,25:28:1,27:28:0:0,15:1,12:0:0:5:0:2,13:1,12:0:0
chr4	10502937	.	T	G	1080.48	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0152569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.293;QD=60.0267;RBI=0.0218229;REFB=0;REVB=0.0156035;RO=0;SAF=49;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.04125e-06;OID=.;OPOS=10502937;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:23:49:0:0:23:49:0:0
chr4	13545792	.	G	T	511.82	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0120528;FXX=0.0555401;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.122;QD=60.2136;RBI=0.0619609;REFB=0;REVB=0.0607773;RO=0;SAF=16;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000886895;OID=.;OPOS=13545792;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:18:16:0:0:18:16:0:0
chr4	13548796	.	T	G	338.41	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00288857;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.215;QD=54.1447;RBI=0.0310959;REFB=0;REVB=-0.0309615;RO=0;SAF=17;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000272765;OID=.;OPOS=13548796;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:8:17:0:0:8:17:0:0
chr4	13601977	.	C	A	250.22	PASS	AF=0.605263;AO=23;DP=38;FAO=23;FDP=38;FR=.;FRO=15;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.000652927;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.727;QD=26.3391;RBI=0.0106122;REFB=-0.0173581;REVB=0.0105921;RO=15;SAF=13;SAR=10;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0705874;STB=0.539136;STBP=0.564;TYPE=snp;VARB=0.0106058;OID=.;OPOS=13601977;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:15:15:23:23:0.605263:10:13:7:8:10:13:7:8
chr4	13606576	.	A	T	1348.71	PASS	AF=0.977778;AO=88;DP=90;FAO=88;FDP=90;FR=.;FRO=2;FSAF=24;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00145119;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.4322;QD=59.9426;RBI=0.0026091;REFB=-0.0641012;REVB=-0.00216828;RO=2;SAF=24;SAR=64;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0145785;STB=0.507691;STBP=0.425;TYPE=snp;VARB=0.00530184;OID=.;OPOS=13606576;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:90:90:2:2:88:88:0.977778:64:24:0:2:64:24:0:2
chr4	15516389	.	C	T	1974.32	PASS	AF=1;AO=127;DP=128;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0704819;FXX=0.00781189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.8558;QD=62.1833;RBI=0.0743997;REFB=0;REVB=-0.0238249;RO=0;SAF=59;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000208489;OID=.;OPOS=15516389;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:128:127:0:0:127:127:1:68:59:0:0:68:59:0:0
chr4	15689928	.	G	A	516.91	PASS	AF=1;AO=29;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0454931;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.182;QD=59.0756;RBI=0.0545079;REFB=0;REVB=-0.0300249;RO=0;SAF=11;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000142415;OID=.;OPOS=15689928;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:29:35:1:18:11:0:0:19:16:0:0
chr4	15709252	.	G	A	328.59	PASS	AF=0.479452;AO=35;DP=73;FAO=35;FDP=73;FR=.;FRO=38;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=-0.00836498;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.154;QD=18.0047;RBI=0.01752;REFB=0.00429909;REVB=0.015394;RO=37;SAF=13;SAR=22;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158832;STB=0.59596;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=-0.00778545;OID=.;OPOS=15709252;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:37:38:35:35:0.479452:22:13:20:17:22:13:21:17
chr4	15713446	.	C	T	207.77	PASS	AF=0.436364;AO=24;DP=55;FAO=24;FDP=55;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=0.0174944;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.0878;QD=15.1103;RBI=0.0315634;REFB=-0.0261039;REVB=0.0262715;RO=31;SAF=10;SAR=14;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162079;STB=0.592068;STBP=0.249;TYPE=snp;VARB=0.0330986;OID=.;OPOS=15713446;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:31:31:24:24:0.436364:14:10:18:13:14:10:18:13
chr4	15724487	.	T	G	562.76	PASS	AF=0.5;AO=58;DP=117;FAO=58;FDP=116;FR=.;FRO=58;FSAF=31;FSAR=27;FSRF=39;FSRR=19;FWDB=0.00640051;FXX=0.00854628;HRUN=4;LEN=1;MLLD=232.83;QD=19.4056;RBI=0.0121241;REFB=-0.0027317;REVB=0.0102969;RO=58;SAF=31;SAR=27;SRF=39;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126988;STB=0.56994;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=0.00285171;OID=.;OPOS=15724487;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:117:116:58:58:58:58:0.5:27:31:39:19:27:31:39:19
chr4	15733454	.	A	C	459.33	PASS	AF=0.505618;AO=45;DP=90;FAO=45;FDP=89;FR=.;FRO=44;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=19;FSRR=25;FWDB=-0.0128857;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.05;QD=20.644;RBI=0.0148086;REFB=-0.00966509;REVB=-0.0072974;RO=44;SAF=23;SAR=22;SRF=19;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0707085;STB=0.539135;STBP=0.469;TYPE=snp;VARB=0.00875925;OID=.;OPOS=15733454;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:89:44:44:45:45:0.505618:22:23:19:25:22:23:19:25
chr4	15739390	.	T	G	284.67	PASS	AF=0.657895;AO=25;DP=38;FAO=25;FDP=38;FR=.;FRO=13;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.0290309;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.875;QD=29.9648;RBI=0.043195;REFB=0.0105155;REVB=0.0319846;RO=13;SAF=12;SAR=13;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0115015;STB=0.506324;STBP=0.961;TYPE=snp;VARB=-0.00394107;OID=.;OPOS=15739390;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:13:13:25:25:0.657895:13:12:6:7:13:12:6:7
chr4	15835844	.	A	C	747.1	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000676693;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=172.103;QD=63.5826;RBI=0.0369032;REFB=0;REVB=0.036897;RO=0;SAF=21;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.00971e-05;OID=.;OPOS=15835844;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:26:21:0:0:26:21:0:0
chr4	15937731	.	T	C	333.88	PASS	AF=0.404255;AO=36;DP=90;FAO=38;FDP=94;FR=.;FRO=56;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=29;FSRR=27;FWDB=0.00542697;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.4873;QD=14.2078;RBI=0.028072;REFB=-0.00524768;REVB=0.0275424;RO=54;SAF=20;SAR=16;SRF=27;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0589484;STB=0.53687;STBP=0.596;TYPE=snp;VARB=0.0107897;OID=.;OPOS=15937731;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:94:54:56:36:38:0.404255:16:20:27:27:16:22:29:27
chr4	15964485	.	G	A	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00473733;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.606;QD=51.9167;RBI=0.0212827;REFB=0;REVB=0.0207488;RO=0;SAF=7;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.3768e-05;OID=.;OPOS=15964485;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:14:7:0:0:14:7:0:0
chr4	15964494	.	C	G	55.41	PASS	AF=0.363636;AO=8;DP=22;FAO=8;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=0.043731;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.035;QD=10.0752;RBI=0.0438461;REFB=0.00231284;REVB=0.00317517;RO=14;SAF=4;SAR=4;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.226511;STB=0.636048;STBP=0.336;TYPE=snp;VARB=-0.00115965;OID=.;OPOS=15964494;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:22:22:14:14:8:8:0.363636:4:4:4:10:4:4:4:10
chr4	15964573	.	A	G	632.25	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0208756;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.7957;QD=61.6833;RBI=0.0208905;REFB=0;REVB=0.000789471;RO=0;SAF=17;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.2194e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000197538;OID=.;OPOS=15964573;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:24:17:0:0:24:17:0:0
chr4	15964820	.	CCT	C	56.71	PASS	AF=0.409091;AO=8;DP=27;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=3;FWDB=-0.0383304;FXX=0.0832986;HRUN=3;LEN=2;MLLD=33.981;QD=10.3107;RBI=0.187301;REFB=-0.0468479;REVB=-0.183337;RO=16;SAF=2;SAR=6;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.509185;STB=0.742365;STBP=0.071;TYPE=del;VARB=0.0543802;OID=.;OPOS=15964821;OREF=CT;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.409091:8:27:9:22:13:3:6:10:3:56:16:2:6:12:4
chr4	16164193	.	T	TTA	331.64	PASS	AF=0.423529;AO=35;DP=90;FAO=36;FDP=85;FR=.;FRO=49;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=33;FSRR=16;FWDB=0.00108921;FXX=0.034087;HRUN=3;LEN=2;MLLD=342.975;QD=15.6065;RBI=0.00399482;REFB=-0.00370994;REVB=-0.00384347;RO=54;SAF=17;SAR=18;SRF=35;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172965;STB=0.614825;STBP=0.083;TYPE=ins;VARB=0.00497913;OID=.;OPOS=16164194;OREF=-;OALT=TA;OMAPALT=TTA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.423529:35:90:36:85:49:17:19:33:16:99:54:17:18:35:19
chr4	16198378	.	A	G	294.37	PASS	AF=0.684211;AO=25;DP=37;FAO=26;FDP=38;FR=.;FRO=12;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.0010827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.644;QD=30.9861;RBI=0.00391059;REFB=-0.00602838;REVB=0.00375772;RO=12;SAF=13;SAR=12;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0609451;STB=0.538432;STBP=0.496;TYPE=snp;VARB=0.00294724;OID=.;OPOS=16198378;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:93:37:38:12:12:25:26:0.684211:12:13:5:7:12:14:5:7
chr4	16675898	.	C	A	120.86	PASS	AF=0.424242;AO=14;DP=33;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=0.0128052;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=265.411;QD=14.6498;RBI=0.0166292;REFB=-0.0138781;REVB=-0.0106092;RO=18;SAF=5;SAR=9;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0892394;STB=0.539114;STBP=0.71;TYPE=snp;VARB=0.0170846;OID=.;OPOS=16675898;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:18:19:14:14:0.424242:9:5:8:10:9:5:8:11
chr4	17513587	.	GA	G	69.37	PASS	AF=0.75;AO=8;DP=16;FAO=12;FDP=16;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0234912;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=14.1906;QD=17.3432;RBI=0.246963;REFB=-0.0957758;REVB=0.245843;RO=8;SAF=2;SAR=6;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128818;STB=0.694072;STBP=0.029;TYPE=del;VARB=0.0835784;OID=.;OPOS=17513588;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.75:8:16:12:16:4:2:10:3:1:22:8:2:6:3:5
chr4	17517099	.	A	G	289.24	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0230006;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.3762;QD=52.589;RBI=0.0819281;REFB=0;REVB=-0.0786332;RO=0;SAF=16;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17051e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00287696;OID=.;OPOS=17517099;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:6:16:0:0:6:16:0:0
chr4	17524570	.	C	G	154.15	PASS	AF=0.395349;AO=17;DP=43;FAO=17;FDP=43;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=0.0349779;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.2317;QD=14.3399;RBI=0.0350073;REFB=-0.0674704;REVB=0.00143385;RO=26;SAF=11;SAR=6;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196745;STB=0.614388;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=0.042077;OID=.;OPOS=17524570;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:26:26:17:17:0.395349:6:11:12:14:6:11:12:14
chr4	17586703	.	T	C	606.94	PASS	AF=1;AO=39;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00418528;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.25;QD=60.6939;RBI=0.00788916;REFB=0;REVB=-0.00668747;RO=0;SAF=20;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.3303e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.63565e-05;OID=.;OPOS=17586703;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:39:40:1:19:20:0:0:19:21:0:0
chr4	17627294	.	A	G	718.18	PASS	AF=0.981132;AO=51;DP=53;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00538599;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.35;QD=54.202;RBI=0.0214826;REFB=-0.128348;REVB=0.0207965;RO=1;SAF=31;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0149495;STB=0.507933;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=-0.000876425;OID=.;OPOS=17627294;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:53:53:1:1:51:52:0.981132:20:31:1:0:21:31:1:0
chr4	17627332	.	T	C	524.97	PASS	AF=0.902439;AO=37;DP=42;FAO=37;FDP=41;FR=.;FRO=4;FSAF=25;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.00266914;FXX=0.0238039;HRUN=5;LEN=1;MLLD=281.76;QD=51.2169;RBI=0.0112225;REFB=-0.0100685;REVB=-0.0109005;RO=4;SAF=25;SAR=12;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0854225;STB=0.545826;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.00033999;OID=.;OPOS=17627332;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:19:42:41:4:4:37:37:0.902439:12:25:1:3:12:25:1:3
chr4	17634213	.	A	G	1051.01	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0490726;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.2046;QD=59.2118;RBI=0.0577224;REFB=0;REVB=0.0303934;RO=0;SAF=37;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.12261e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000637312;OID=.;OPOS=17634213;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:34:37:0:0:34:37:0:0
chr4	17643848	.	G	A	160.2	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.113711;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.428;QD=45.7708;RBI=0.123009;REFB=0;REVB=0.046915;RO=0;SAF=6;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00306738;OID=.;OPOS=17643848;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:8:6:0:0:8:6:0:0
chr4	17660082	.	C	T	754.41	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000532038;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.3;QD=56.9366;RBI=0.0199277;REFB=0;REVB=0.0199206;RO=0;SAF=26;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000149554;OID=.;OPOS=17660082;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:27:26:0:0:27:26:0:0
chr4	17694943	.	A	G	990.51	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00182254;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.9752;QD=59.1352;RBI=0.0177011;REFB=0;REVB=-0.0176071;RO=0;SAF=42;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.93036e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000197742;OID=.;OPOS=17694943;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:25:42:0:0:25:42:0:0
chr4	17706665	.	G	T	248.08	PASS	AF=0.451613;AO=28;DP=62;FAO=28;FDP=62;FR=.;FRO=34;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=-0.00265471;FXX=0.0158705;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.756;QD=16.0051;RBI=0.0166028;REFB=-0.00904957;REVB=0.0163892;RO=34;SAF=15;SAR=13;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0632489;STB=0.535689;STBP=0.648;TYPE=snp;VARB=0.01046;OID=.;OPOS=17706665;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:34:34:28:28:0.451613:13:15:16:18:13:15:16:18
chr4	17710905	.	G	C	468.5	PASS	AF=0.433333;AO=52;DP=120;FAO=52;FDP=120;FR=.;FRO=68;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=33;FSRR=35;FWDB=0.00125996;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.287;QD=15.6167;RBI=0.00565482;REFB=-0.0143013;REVB=-0.00551266;RO=68;SAF=26;SAR=26;SRF=33;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.014874;STB=0.50833;STBP=0.901;TYPE=snp;VARB=0.0233721;OID=.;OPOS=17710905;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:120:68:68:52:52:0.433333:26:26:33:35:26:26:33:35
chr4	17711076	.	T	C	620.23	PASS	AF=0.409357;AO=70;DP=172;FAO=70;FDP=171;FR=.;FRO=101;FSAF=30;FSAR=40;FSRF=39;FSRR=62;FWDB=-0.0263218;FXX=0.00581362;HRUN=4;LEN=1;MLLD=238.08;QD=14.5083;RBI=0.0267765;REFB=-0.00794827;REVB=-0.00491379;RO=101;SAF=30;SAR=40;SRF=39;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.045962;STB=0.525766;STBP=0.584;TYPE=snp;VARB=0.0119044;OID=.;OPOS=17711076;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:172:171:101:101:70:70:0.409357:40:30:39:62:40:30:39:62
chr4	17802388	.	C	T	86.01	PASS	AF=0.37931;AO=11;DP=29;FAO=11;FDP=29;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.0105777;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.062;QD=11.8636;RBI=0.0184445;REFB=-0.00365222;REVB=0.01511;RO=18;SAF=5;SAR=6;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162248;STB=0.596102;STBP=0.456;TYPE=snp;VARB=0.00427199;OID=.;OPOS=17802388;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:29:29:18:18:11:11:0.37931:6:5:11:7:6:5:11:7
chr4	17805379	.	G	A	588.79	PASS	AF=0.595506;AO=53;DP=89;FAO=53;FDP=89;FR=.;FRO=36;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=12;FSRR=24;FWDB=0.0099153;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.5198;QD=26.4625;RBI=0.0151697;REFB=-0.007167;REVB=0.0114807;RO=36;SAF=26;SAR=27;SRF=12;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11703;STB=0.563752;STBP=0.167;TYPE=snp;VARB=0.00304827;OID=.;OPOS=17805379;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:36:36:53:53:0.595506:27:26:12:24:27:26:12:24
chr4	17812796	.	C	T	393.28	PASS	AF=0.431373;AO=44;DP=102;FAO=44;FDP=102;FR=.;FRO=58;FSAF=8;FSAR=36;FSRF=17;FSRR=41;FWDB=0.0036408;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.3465;QD=15.4229;RBI=0.00392915;REFB=0.0031181;REVB=0.00147743;RO=58;SAF=8;SAR=36;SRF=17;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164958;STB=0.593621;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=-0.00378047;OID=.;OPOS=17812796;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:58:58:44:44:0.431373:36:8:17:41:36:8:17:41
chr4	17819695	.	G	A	296.35	PASS	AF=0.634146;AO=26;DP=41;FAO=26;FDP=41;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=19;FSRF=3;FSRR=12;FWDB=0.0127942;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.367;QD=28.9122;RBI=0.0134458;REFB=0.00626525;REVB=0.00413495;RO=15;SAF=7;SAR=19;SRF=3;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0603825;STB=0.533145;STBP=0.638;TYPE=snp;VARB=-0.0034439;OID=.;OPOS=17819695;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:15:15:26:26:0.634146:19:7:3:12:19:7:3:12
chr4	19183454	.	A	G	429.02	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0106401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.649;QD=57.2026;RBI=0.0131986;REFB=0;REVB=-0.00780966;RO=0;SAF=7;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.81002e-06;OID=.;OPOS=19183454;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:23:7:0:0:23:7:0:0
chr4	20520993	.	T	C	669.88	PASS	AF=0.960784;AO=49;DP=51;FAO=49;FDP=51;FR=.;FRO=2;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.011283;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.375;QD=52.5392;RBI=0.0245003;REFB=0.0515134;REVB=0.0217476;RO=1;SAF=20;SAR=29;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.015953;STB=0.503721;STBP=0.873;TYPE=snp;VARB=-0.000498458;OID=.;OPOS=20520993;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:51:51:1:2:49:49:0.960784:29:20:0:1:29:20:1:1
chr4	20544184	.	C	T	761.38	PASS	AF=0.416244;AO=82;DP=195;FAO=82;FDP=197;FR=.;FRO=115;FSAF=38;FSAR=44;FSRF=51;FSRR=64;FWDB=-0.0270511;FXX=0.00505025;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.6591;QD=15.4595;RBI=0.0272282;REFB=-0.00385957;REVB=-0.00310075;RO=113;SAF=38;SAR=44;SRF=51;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0126114;STB=0.511718;STBP=0.788;TYPE=snp;VARB=0.00739913;OID=.;OPOS=20544184;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:195:197:113:115:82:82:0.416244:44:38:51:62:44:38:51:64
chr4	20568902	.	A	G	655.5	PASS	AF=0.455782;AO=67;DP=147;FAO=67;FDP=147;FR=.;FRO=80;FSAF=29;FSAR=38;FSRF=41;FSRR=39;FWDB=0.00745292;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.33;QD=17.8368;RBI=0.0208649;REFB=-0.007116;REVB=-0.0194884;RO=80;SAF=29;SAR=38;SRF=41;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0784513;STB=0.543621;STBP=0.381;TYPE=snp;VARB=0.0103924;OID=.;OPOS=20568902;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:147:147:80:80:67:67:0.455782:38:29:41:39:38:29:41:39
chr4	20621987	.	G	A	211.4	PASS	AF=0.366197;AO=26;DP=72;FAO=26;FDP=71;FR=.;FRO=45;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=30;FSRR=15;FWDB=-0.00402003;FXX=0.013887;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.968;QD=11.9101;RBI=0.0103108;REFB=-0.0129833;REVB=-0.00949483;RO=44;SAF=11;SAR=15;SRF=29;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.253115;STB=0.650683;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.0209693;OID=.;OPOS=20621987;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:71:44:45:26:26:0.366197:15:11:29:15:15:11:30:15
chr4	20622009	.	C	T	278.87	PASS	AF=0.395062;AO=33;DP=81;FAO=32;FDP=81;FR=.;FRO=49;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=31;FSRR=18;FWDB=-0.00559996;FXX=0.0121936;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.3952;QD=13.7711;RBI=0.00611394;REFB=-0.00740712;REVB=0.00245373;RO=48;SAF=16;SAR=17;SRF=31;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167745;STB=0.580198;STBP=0.238;TYPE=snp;VARB=0.0108807;OID=.;OPOS=20622009;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:48:49:33:32:0.395062:17:16:31:17:16:16:31:18
chr4	20733708	.	C	A,CA	430.32	PASS	AF=0,1;AO=2,31;DP=48;FAO=0,38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=0,12;FSAR=0,26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0133022,0.054947;FXX=0;HRUN=1,5;LEN=1,1;MLLD=217.806,14.8859;QD=45.2969;RBI=0.031078,0.226796;REFB=0,0;REVB=-0.0280873,-0.22004;RO=12;SAF=0,11;SAR=2,20;SRF=10;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.718987,-0.246866;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,ins;VARB=0,-0.00436171;OID=.,.;OPOS=20733708,20733709;OREF=C,-;OALT=A,A;OMAPALT=A,CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	2/2:4:48:38:12:0:2,31:0,38:0,1:2,20:0,11:10:2:0,26:0,12:0:0
chr4	20751278	.	A	G	689.29	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0215235;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=329.14;QD=62.663;RBI=0.0228087;REFB=0;REVB=-0.00754816;RO=0;SAF=23;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.0064e-05;OID=.;OPOS=20751278;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:44:0:0:43:44:1:20:23:0:0:21:23:0:0
chr4	20852166	.	A	G	617.45	PASS	AF=1;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0030611;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.85;QD=61.7448;RBI=0.0440631;REFB=0;REVB=0.0439566;RO=0;SAF=24;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000206421;OID=.;OPOS=20852166;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:40:0:0:40:40:1:16:24:0:0:16:24:0:0
chr4	20852244	.	A	G	1019.85	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103209;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.229;QD=59.1218;RBI=0.0103553;REFB=0;REVB=0.000842804;RO=0;SAF=37;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00015193;OID=.;OPOS=20852244;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:67:69:0:0:67:69:1:30:37:0:0:30:39:0:0
chr4	21950259	.	A	G	2863.42	PASS	AF=1;AO=177;DP=178;FAO=185;FDP=185;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=115;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00671628;FXX=0.00537606;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.288;QD=61.9118;RBI=0.0221946;REFB=-0.0495027;REVB=0.021154;RO=1;SAF=70;SAR=107;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00442847;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000543485;OID=.;OPOS=21950259;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:178:185:1:0:177:185:1:107:70:0:1:115:70:0:0
chr4	22394239	.	T	G	468.78	PASS	AF=0.401515;AO=53;DP=130;FAO=53;FDP=132;FR=.;FRO=79;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=41;FSRR=38;FWDB=0.010645;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.1239;QD=14.2054;RBI=0.0149587;REFB=0.00203256;REVB=-0.0105093;RO=77;SAF=22;SAR=31;SRF=39;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0970239;STB=0.562638;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=-0.00459461;OID=.;OPOS=22394239;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:130:132:77:79:53:53:0.401515:31:22:39:38:31:22:41:38
chr4	22404391	.	G	A	298.17	PASS	AF=0.458333;AO=33;DP=72;FAO=33;FDP=72;FR=.;FRO=39;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=0.000217778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.268;QD=16.5652;RBI=0.0123855;REFB=-0.00731681;REVB=0.0123836;RO=37;SAF=19;SAR=14;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110125;STB=0.575712;STBP=0.256;TYPE=snp;VARB=0.00655829;OID=.;OPOS=22404391;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:37:39:33:33:0.458333:14:19:17:20:14:19:17:22
chr4	22415234	.	G	A	213.83	PASS	AF=0.45283;AO=23;DP=52;FAO=24;FDP=53;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=0.0262354;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.655;QD=16.1379;RBI=0.0263062;REFB=-0.0189137;REVB=-0.00192895;RO=29;SAF=12;SAR=11;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00441764;STB=0.513417;STBP=0.857;TYPE=snp;VARB=0.0282713;OID=.;OPOS=22415234;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:53:29:29:23:24:0.45283:11:12:15:14:11:13:15:14
chr4	22444692	.	C	T	340.74	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0159504;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=264.803;QD=54.5177;RBI=0.019726;REFB=0;REVB=0.011606;RO=0;SAF=12;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.74072e-05;OID=.;OPOS=22444692;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:13:12:0:0:13:12:0:0
chr4	22820504	.	A	T	1163.79	PASS	AF=0.975;AO=78;DP=80;FAO=78;FDP=80;FR=.;FRO=2;FSAF=35;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0322921;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.592;QD=58.1894;RBI=0.0330854;REFB=-0.115767;REVB=-0.00720168;RO=2;SAF=35;SAR=43;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0215054;STB=0.511361;STBP=0.217;TYPE=snp;VARB=0.000504688;OID=.;OPOS=22820504;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:80:80:2:2:78:78:0.975:43:35:0:2:43:35:0:2
chr4	23815522	.	C	T	1142.35	PASS	AF=0.987013;AO=76;DP=78;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.029604;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.835;QD=59.3427;RBI=0.0317353;REFB=0.0174035;REVB=0.0114339;RO=1;SAF=35;SAR=41;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0114027;STB=0.506023;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=-0.000194115;OID=.;OPOS=23815522;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:78:77:1:1:76:76:0.987013:41:35:0:1:41:35:0:1
chr4	23815662	.	C	T	990.63	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0120576;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.638;QD=59.1423;RBI=0.0157823;REFB=0;REVB=0.010183;RO=0;SAF=26;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.24794e-05;OID=.;OPOS=23815662;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:41:26:0:0:41:26:0:0
chr4	23815924	.	T	C	1476.86	PASS	AF=1;AO=93;DP=94;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00492883;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.005;QD=63.5208;RBI=0.0138151;REFB=0;REVB=0.0129059;RO=0;SAF=54;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.96098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000184318;OID=.;OPOS=23815924;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:94:93:0:0:93:93:1:39:54:0:0:39:54:0:0
chr4	23886323	.	G	T	313.76	PASS	AF=0.459459;AO=34;DP=73;FAO=34;FDP=74;FR=.;FRO=40;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=25;FWDB=-0.0170783;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=236.873;QD=16.9598;RBI=0.0183903;REFB=-0.0120152;REVB=-0.00682159;RO=39;SAF=14;SAR=20;SRF=15;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0268618;STB=0.520649;STBP=0.743;TYPE=snp;VARB=0.0120467;OID=.;OPOS=23886323;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:74:39:40:34:34:0.459459:20:14:15:24:20:14:15:25
chr4	24534687	.	T	C	194.4	PASS	AF=0.380952;AO=24;DP=63;FAO=24;FDP=63;FR=.;FRO=39;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=25;FWDB=-0.0365537;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.895;QD=12.3426;RBI=0.0385581;REFB=-0.0046348;REVB=-0.0122702;RO=38;SAF=7;SAR=17;SRF=13;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0628312;STB=0.548345;STBP=0.589;TYPE=snp;VARB=0.00485065;OID=.;OPOS=24534687;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:38:39:24:24:0.380952:17:7:13:25:17:7:14:25
chr4	24802323	.	G	C	676.78	PASS	AF=0.977778;AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00395635;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=233.975;QD=60.1579;RBI=0.0271314;REFB=0.0537369;REVB=0.0268414;RO=0;SAF=14;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508193;STBP=0.608;TYPE=snp;VARB=-0.000160534;OID=.;OPOS=24802323;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:45:45:0:1:44:44:0.977778:30:14:0:0:30:14:0:1
chr4	25001439	.	T	C	416.77	PASS	AF=0.443299;AO=43;DP=97;FAO=43;FDP=97;FR=.;FRO=54;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=24;FSRR=30;FWDB=-0.0470675;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.1951;QD=17.1865;RBI=0.0578905;REFB=-0.0251508;REVB=-0.033704;RO=53;SAF=21;SAR=22;SRF=24;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.035089;STB=0.524484;STBP=0.681;TYPE=snp;VARB=0.0251746;OID=.;OPOS=25001439;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:53:54:43:43:0.443299:22:21:24:29:22:21:24:30
chr4	25005193	.	G	A	1693.89	PASS	AF=1;AO=109;DP=113;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000478426;FXX=0.00884877;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.645;QD=60.4961;RBI=0.00772558;REFB=0;REVB=0.00771075;RO=0;SAF=67;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.7257e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00020604;OID=.;OPOS=25005193;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:113:112:0:0:109:112:1:42:67:0:0:45:67:0:0
chr4	25032135	.	C	T	859.81	PASS	AF=0.968254;AO=61;DP=63;FAO=61;FDP=63;FR=.;FRO=2;FSAF=47;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00158079;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=242.785;QD=54.5908;RBI=0.0515851;REFB=-0.177671;REVB=0.0515609;RO=2;SAF=47;SAR=14;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0225901;STB=0.511979;STBP=0.369;TYPE=snp;VARB=0.00147581;OID=.;OPOS=25032135;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:63:63:2:2:61:61:0.968254:14:47:1:1:14:47:1:1
chr4	25253995	.	C	T	632.25	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000647157;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.339;QD=61.6831;RBI=0.0145602;REFB=0;REVB=0.0145458;RO=0;SAF=19;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.81837e-05;OID=.;OPOS=25253995;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:22:19:0:0:22:19:0:0
chr4	25278988	.	T	C	504.22	PASS	AF=0.527473;AO=48;DP=91;FAO=48;FDP=91;FR=.;FRO=43;FSAF=18;FSAR=30;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=0.0458329;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.8252;QD=22.1634;RBI=0.0459333;REFB=-0.00220435;REVB=-0.00303463;RO=43;SAF=18;SAR=30;SRF=22;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120524;STB=0.566544;STBP=0.2;TYPE=snp;VARB=0.00221143;OID=.;OPOS=25278988;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:43:43:48:48:0.527473:30:18:22:21:30:18:22:21
chr4	25334874	.	A	G	365.02	PASS	AF=0.463415;AO=38;DP=82;FAO=38;FDP=82;FR=.;FRO=44;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=16;FSRR=28;FWDB=0.0224736;FXX=0.0238067;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.179;QD=17.8059;RBI=0.0226914;REFB=-0.0178138;REVB=0.00313661;RO=42;SAF=18;SAR=20;SRF=16;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.088002;STB=0.559555;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.0208683;OID=.;OPOS=25334874;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:42:44:38:38:0.463415:20:18:16:26:20:18:16:28
chr4	25363901	.	T	A	1409.65	PASS	AF=1;AO=89;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0415783;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.0966;QD=62.6513;RBI=0.0565347;REFB=0;REVB=0.0383069;RO=0;SAF=36;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.47001e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00108745;OID=.;OPOS=25363901;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:90:90:0:0:89:90:1:53:36:0:0:54:36:0:0
chr4	25408516	.	T	A	180.48	PASS	AF=0.422222;AO=19;DP=45;FAO=19;FDP=45;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=8;FWDB=0.0415169;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.564;QD=16.0427;RBI=0.0439581;REFB=0.00590179;REVB=-0.0144451;RO=26;SAF=11;SAR=8;SRF=18;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120026;STB=0.568558;STBP=0.478;TYPE=snp;VARB=-0.00773211;OID=.;OPOS=25408516;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:26:26:19:19:0.422222:8:11:18:8:8:11:18:8
chr4	25419283	.	T	C	471.95	PASS	AF=0.505495;AO=46;DP=91;FAO=46;FDP=91;FR=.;FRO=45;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=27;FSRR=18;FWDB=0.00966377;FXX=0.0108684;HRUN=4;LEN=1;MLLD=127.427;QD=20.7451;RBI=0.00970918;REFB=-0.0226882;REVB=0.000937951;RO=44;SAF=20;SAR=26;SRF=26;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137605;STB=0.581316;STBP=0.131;TYPE=snp;VARB=0.014492;OID=.;OPOS=25419283;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:44:45:46:46:0.505495:26:20:26:18:26:20:27:18
chr4	25678199	.	A	G	725.64	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00471404;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.248;QD=55.8182;RBI=0.00973964;REFB=0;REVB=-0.00852281;RO=0;SAF=30;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00138728;OID=.;OPOS=25678199;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:52:0:0:51:52:1:21:30:0:0:21:31:0:0
chr4	25749303	.	C	A	431.98	PASS	AF=0.96875;AO=30;DP=32;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0148192;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=236.401;QD=53.9974;RBI=0.0162062;REFB=-0.12395;REVB=-0.0065601;RO=0;SAF=15;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.515142;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.000764509;OID=.;OPOS=25749303;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:32:32:0:1:30:31:0.96875:15:15:0:0:16:15:0:1
chr4	25915858	.	C	A	457.09	PASS	AF=0.469388;AO=45;DP=97;FAO=46;FDP=98;FR=.;FRO=52;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=25;FSRR=27;FWDB=0.0106952;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.571;QD=18.6567;RBI=0.0234829;REFB=-0.0162875;REVB=0.020906;RO=51;SAF=21;SAR=24;SRF=25;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0224817;STB=0.512929;STBP=0.825;TYPE=snp;VARB=0.0439991;OID=.;OPOS=25915858;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:98:51:52:45:46:0.469388:24:21:25:26:25:21:25:27
chr4	26274274	.	T	A	213.52	PASS	AF=0.45283;AO=24;DP=53;FAO=24;FDP=53;FR=.;FRO=29;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=-0.00531081;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.8121;QD=16.115;RBI=0.0516408;REFB=-0.000249724;REVB=-0.051367;RO=29;SAF=15;SAR=9;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0737458;STB=0.541837;STBP=0.612;TYPE=snp;VARB=-1.90943e-06;OID=.;OPOS=26274274;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:29:29:24:24:0.45283:9:15:16:13:9:15:16:13
chr4	26417136	.	T	C	291.16	PASS	AF=0.508197;AO=31;DP=62;FAO=31;FDP=61;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=0.0303181;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.5496;QD=19.0927;RBI=0.0528892;REFB=-0.0174308;REVB=0.0433368;RO=30;SAF=12;SAR=19;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0424692;STB=0.523689;STBP=0.728;TYPE=snp;VARB=0.0136427;OID=.;OPOS=26417136;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:61:30:30:31:31:0.508197:19:12:13:17:19:12:13:17
chr4	26586832	.	G	A	47.68	PASS	AF=0.4375;AO=7;DP=16;FAO=7;FDP=16;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=0.0200976;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.561;QD=11.9197;RBI=0.0233832;REFB=-0.0300208;REVB=-0.0119524;RO=8;SAF=5;SAR=2;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.402505;STB=0.76201;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.0286491;OID=.;OPOS=26586832;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:16:16:8:9:7:7:0.4375:2:5:2:6:2:5:2:7
chr4	26673761	.	T	A	520.69	PASS	AF=0.353261;AO=56;DP=180;FAO=65;FDP=184;FR=.;FRO=119;FSAF=34;FSAR=31;FSRF=69;FSRR=50;FWDB=-0.0224111;FXX=0;HRUN=9;LEN=1;MLLD=38.1704;QD=11.3193;RBI=0.0233002;REFB=-0.0171747;REVB=-0.00637526;RO=46;SAF=29;SAR=27;SRF=27;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0570294;STB=0.536898;STBP=0.447;TYPE=snp;VARB=0.0386614;OID=.;OPOS=26673761;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:180:184:46:119:56:65:0.353261:27:29:27:19:31:34:69:50
chr4	26673787	.	A	G	3385.96	PASS	AF=0.982222;AO=220;DP=226;FAO=221;FDP=225;FR=.;FRO=4;FSAF=109;FSAR=112;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0571504;FXX=0.00442458;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.335;QD=60.1948;RBI=0.057298;REFB=-0.0906486;REVB=0.00410916;RO=2;SAF=109;SAR=111;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.8026e-05;STB=0.504565;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.000226915;OID=.;OPOS=26673787;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:226:225:2:4:220:221:0.982222:111:109:1:1:112:109:3:1
chr4	27004011	.	G	A	523.51	PASS	AF=0.972973;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00730355;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.7291;QD=56.5954;RBI=0.00787981;REFB=0.0959252;REVB=-0.00295797;RO=1;SAF=19;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0267359;STB=0.514278;STBP=0.325;TYPE=snp;VARB=-0.0175468;OID=.;OPOS=27004011;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:37:37:1:1:36:36:0.972973:17:19:0:1:17:19:0:1
chr4	28712912	.	C	G	409.43	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.017883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.81;QD=56.4726;RBI=0.0373366;REFB=0;REVB=0.0327753;RO=0;SAF=14;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000305615;OID=.;OPOS=28712912;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:15:14:0:0:15:14:0:0
chr4	28712968	.	A	G	666.16	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0172975;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.3307;QD=61.9685;RBI=0.026159;REFB=0;REVB=0.0196237;RO=0;SAF=18;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.65211e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.00527e-05;OID=.;OPOS=28712968;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:25:18:0:0:25:18:0:0
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chr4	30725696	.	G	A	56.28	PASS	AF=0.4;AO=8;DP=20;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.0109735;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.638;QD=11.2569;RBI=0.0120021;REFB=0.000437504;REVB=-0.00486134;RO=12;SAF=4;SAR=4;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00158496;OID=.;OPOS=30725696;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:20:20:12:12:8:8:0.4:4:4:6:6:4:4:6:6
chr4	30725987	.	G	A	130.04	PASS	AF=0.3;AO=18;DP=60;FAO=18;FDP=60;FR=.;FRO=42;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=25;FSRR=17;FWDB=-0.0185812;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.735;QD=8.66908;RBI=0.019451;REFB=-0.00291607;REVB=-0.00575174;RO=41;SAF=9;SAR=9;SRF=24;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0996332;STB=0.566594;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.00700245;OID=.;OPOS=30725987;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:41:42:18:18:0.3:9:9:24:17:9:9:25:17
chr4	31146018	.	A	G	195.8	PASS	AF=0.454545;AO=20;DP=44;FAO=20;FDP=44;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=-0.000655872;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.889;QD=17.7996;RBI=0.0290788;REFB=-0.019217;REVB=0.0290714;RO=24;SAF=13;SAR=7;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109375;STB=0.562436;STBP=0.492;TYPE=snp;VARB=0.0158181;OID=.;OPOS=31146018;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:24:24:20:20:0.454545:7:13:13:11:7:13:13:11
chr4	31147272	.	A	C	541.94	PASS	AF=0.528846;AO=56;DP=105;FAO=55;FDP=104;FR=.;FRO=49;FSAF=28;FSAR=27;FSRF=31;FSRR=18;FWDB=-0.00333775;FXX=0.0095229;HRUN=5;LEN=1;MLLD=181.918;QD=20.8437;RBI=0.00556766;REFB=0.00605681;REVB=0.00445626;RO=49;SAF=29;SAR=27;SRF=31;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0980626;STB=0.558339;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=-0.00492637;OID=.;OPOS=31147272;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:104:49:49:56:55:0.528846:27:29:31:18:27:28:31:18
chr4	34967868	.	G	T	924.9	PASS	AF=1;AO=63;DP=64;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0136632;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.1141;QD=58.7236;RBI=0.0301517;REFB=0;REVB=-0.0268783;RO=0;SAF=35;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000100939;OID=.;OPOS=34967868;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:63:0:0:63:63:1:28:35:0:0:28:35:0:0
chr4	36068567	.	A	AT	429.27	PASS	AF=1;AO=10;DP=48;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.135482;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=15.8234;QD=37.3275;RBI=0.171641;REFB=0;REVB=-0.105383;RO=36;SAF=9;SAR=1;SRF=14;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.62083;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.0019019;OID=.;OPOS=36068568;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:10:48:46:46:0:23:23:0:0:7:36:9:1:14:22
chr4	36081878	.	C	T	796.91	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0193226;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.439;QD=56.9218;RBI=0.0199733;REFB=0;REVB=0.0050568;RO=0;SAF=26;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.52846e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000105924;OID=.;OPOS=36081878;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:56:0:0:54:56:1:28:26:0:0:29:27:0:0
chr4	36179497	.	AAT	A,AAA	37.08	PASS	AF=0.111111,0;AO=8,3;DP=72;FAO=7,0;FDP=63;FR=.;FRO=56;FSAF=2,0;FSAR=5,0;FSRF=36;FSRR=20;FWDB=0.00361615,-0.0281253;FXX=0.0156226;HRUN=5,5;LEN=2,1;MLLD=23.2478,20.0962;QD=2.35452;RBI=0.160655,0.124671;REFB=-0.00540975,-0.0051653;REVB=0.160614,-0.121457;RO=52;SAF=4,1;SAR=4,2;SRF=31;SRR=21;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.116638,-0.233857;STB=0.790935,0.5;STBP=0.134,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0603606,0;OID=.,.;OPOS=36179498,36179499;OREF=AT,T;OALT=-,A;OMAPALT=A,AAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.111111,0:8,3:72:7,0:63:56:2,0:5,0:36:20:37:52:4,1:4,2:31:21
chr4	36258197	.	T	C	3867.06	PASS	AF=0.992157;AO=252;DP=255;FAO=253;FDP=255;FR=.;FRO=2;FSAF=105;FSAR=148;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0285183;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.018;QD=60.6598;RBI=0.0371152;REFB=-0.0098374;REVB=0.0237538;RO=2;SAF=105;SAR=147;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00644104;STB=0.500686;STBP=0.848;TYPE=snp;VARB=0.000221345;OID=.;OPOS=36258197;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:255:255:2:2:252:253:0.992157:147:105:0:2:148:105:1:1
chr4	36292009	.	T	A	81.57	PASS	AF=0.222222;AO=12;DP=54;FAO=12;FDP=54;FR=.;FRO=42;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=-0.0102212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.709;QD=6.04242;RBI=0.0339164;REFB=-0.00714505;REVB=-0.0323396;RO=41;SAF=8;SAR=4;SRF=22;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165147;STB=0.615188;STBP=0.375;TYPE=snp;VARB=0.0203389;OID=.;OPOS=36292009;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:81:54:54:41:42:12:12:0.222222:4:8:22:19:4:8:22:20
chr4	36292018	.	T	A	758.76	PASS	AF=0.964912;AO=55;DP=57;FAO=55;FDP=57;FR=.;FRO=2;FSAF=31;FSAR=24;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00045885;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.7;QD=53.2464;RBI=0.0447246;REFB=-0.0376886;REVB=0.0447222;RO=2;SAF=31;SAR=24;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0294432;STB=0.515619;STBP=0.227;TYPE=snp;VARB=0.000494799;OID=.;OPOS=36292018;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:57:57:2:2:55:55:0.964912:24:31:2:0:24:31:2:0
chr4	36310049	.	C	T	578.15	PASS	AF=0.508621;AO=59;DP=116;FAO=59;FDP=116;FR=.;FRO=57;FSAF=28;FSAR=31;FSRF=28;FSRR=29;FWDB=0.00678054;FXX=0.00854628;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.357;QD=19.9363;RBI=0.00727033;REFB=0.00131961;REVB=-0.00262333;RO=56;SAF=28;SAR=31;SRF=28;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0224893;STB=0.508194;STBP=0.901;TYPE=snp;VARB=-0.000764648;OID=.;OPOS=36310049;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:116:116:56:57:59:59:0.508621:31:28:28:28:31:28:28:29
chr4	36317965	.	T	C	570.04	PASS	AF=0.53;AO=53;DP=100;FAO=53;FDP=100;FR=.;FRO=47;FSAF=29;FSAR=24;FSRF=21;FSRR=26;FWDB=0.0221672;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.209;QD=22.8017;RBI=0.0255632;REFB=-0.00466907;REVB=0.0127314;RO=47;SAF=29;SAR=24;SRF=21;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0856793;STB=0.547152;STBP=0.353;TYPE=snp;VARB=0.00429104;OID=.;OPOS=36317965;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:47:47:53:53:0.53:24:29:21:26:24:29:21:26
chr4	37592250	.	T	C	151.2	PASS	AF=0.533333;AO=16;DP=30;FAO=16;FDP=30;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.00650352;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.421;QD=20.1594;RBI=0.00690621;REFB=-0.00362693;REVB=-0.00232376;RO=14;SAF=6;SAR=10;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0157568;STB=0.508917;STBP=0.97;TYPE=snp;VARB=0.00238108;OID=.;OPOS=37592250;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:14:14:16:16:0.533333:10:6:5:9:10:6:5:9
chr4	37612486	.	T	A	661.94	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0215439;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.755;QD=61.5754;RBI=0.026758;REFB=0;REVB=0.0158697;RO=0;SAF=21;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00124914;OID=.;OPOS=37612486;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:43:0:0:42:43:1:21:21:0:0:21:22:0:0
chr4	37836302	.	T	C	722.35	PASS	AF=0.486486;AO=71;DP=144;FAO=72;FDP=148;FR=.;FRO=76;FSAF=34;FSAR=38;FSRF=40;FSRR=36;FWDB=0.0324802;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=53.7304;QD=19.5229;RBI=0.0355854;REFB=0.00881339;REVB=0.0145383;RO=73;SAF=34;SAR=37;SRF=38;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.038284;STB=0.52777;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=-0.0120243;OID=.;OPOS=37836302;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:144:148:73:76:71:72:0.486486:37:34:38:35:38:34:40:36
chr4	37857342	.	G	C	559.77	PASS	AF=0.541667;AO=52;DP=96;FAO=52;FDP=96;FR=.;FRO=44;FSAF=27;FSAR=25;FSRF=24;FSRR=20;FWDB=0.00323737;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.807;QD=23.3235;RBI=0.0426674;REFB=-0.0226494;REVB=0.0425444;RO=42;SAF=27;SAR=25;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0231693;STB=0.512044;STBP=0.829;TYPE=snp;VARB=0.0208557;OID=.;OPOS=37857342;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:96:42:44:52:52:0.541667:25:27:23:19:25:27:24:20
chr4	37903756	.	T	C	658.86	PASS	AF=1;AO=36;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0511149;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.9313;QD=59.8963;RBI=0.0740877;REFB=0;REVB=-0.0536308;RO=0;SAF=24;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00159791;OID=.;OPOS=37903756;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:36:44:1:12:24:0:0:19:25:0:0
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chr4	37904089	.	C	T	95.68	PASS	AF=0.363636;AO=12;DP=33;FAO=12;FDP=33;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=-0.00725055;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.708;QD=11.5971;RBI=0.0161128;REFB=-0.017217;REVB=0.0143893;RO=20;SAF=7;SAR=5;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.191599;STB=0.597828;STBP=0.433;TYPE=snp;VARB=0.0179505;OID=.;OPOS=37904089;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:33:33:20:21:12:12:0.363636:5:7:8:12:5:7:9:12
chr4	37962186	.	G	C	651.2	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0122024;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.019;QD=62.0194;RBI=0.0826022;REFB=0;REVB=0.0816959;RO=0;SAF=36;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000602119;OID=.;OPOS=37962186;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:6:36:0:0:6:36:0:0
chr4	38016372	.	G	A	232.25	PASS	AF=0.564103;AO=22;DP=39;FAO=22;FDP=39;FR=.;FRO=17;FSAF=2;FSAR=20;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=-0.0117005;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.755;QD=23.8206;RBI=0.0151184;REFB=-0.028852;REVB=0.00957412;RO=17;SAF=2;SAR=20;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.435604;STB=0.749711;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.014442;OID=.;OPOS=38016372;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:17:17:22:22:0.564103:20:2:7:10:20:2:7:10
chr4	38016395	.	T	G	236.12	PASS	AF=0.469388;AO=23;DP=49;FAO=23;FDP=49;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=-0.0285279;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.193;QD=19.2749;RBI=0.0294943;REFB=-0.0231238;REVB=0.0074881;RO=26;SAF=6;SAR=17;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.283473;STB=0.66133;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.0233877;OID=.;OPOS=38016395;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:26:26:23:23:0.469388:17:6:14:12:17:6:14:12
chr4	38053599	.	C	T	519.17	PASS	AF=0.592593;AO=48;DP=81;FAO=48;FDP=81;FR=.;FRO=33;FSAF=33;FSAR=15;FSRF=23;FSRR=10;FWDB=0.00740064;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=225.594;QD=25.6379;RBI=0.00813034;REFB=-0.0143929;REVB=0.00336645;RO=33;SAF=33;SAR=15;SRF=23;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00824077;STB=0.504503;STBP=0.944;TYPE=snp;VARB=0.00951468;OID=.;OPOS=38053599;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:33:33:48:48:0.592593:15:33:23:10:15:33:23:10
chr4	38258908	.	G	T	669.78	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0277808;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.313;QD=62.3047;RBI=0.0405886;REFB=0;REVB=0.0295916;RO=0;SAF=29;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.13233e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.91777e-05;OID=.;OPOS=38258908;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:14:29:0:0:14:29:0:0
chr4	38259004	.	C	CG,G	581.48	PASS	AF=1,0;AO=6,3;DP=44;FAO=43,0;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=25,0;FSAR=18,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0166939,0.00714864;FXX=0;HRUN=0,1;LEN=1,1;MLLD=89.7804,82.8667;QD=54.0912;RBI=0.0388425,0.0572899;REFB=0,0;REVB=-0.0350722,0.0568421;RO=32;SAF=4,0;SAR=2,3;SRF=21;SRR=11;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0137895,-0.612085;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.00290514,0;OID=.,.;OPOS=38259005,38259004;OREF=-,C;OALT=G,G;OMAPALT=CG,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:43:32:0:6,3:43,0:1,0:2,3:4,0:21:11:18,0:25,0:0:0
chr4	38259005	.	T	G	411.04	PASS	AF=0.744186;AO=32;DP=43;FAO=32;FDP=43;FR=.;FRO=11;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.00212516;FXX=0.0444346;HRUN=8;LEN=1;MLLD=110.693;QD=38.2362;RBI=0.0596883;REFB=-0.0762307;REVB=-0.0596504;RO=11;SAF=21;SAR=11;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101503;STB=0.555175;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=0.00119655;OID=.;OPOS=38259005;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:79:43:43:11:11:32:32:0.744186:11:21:5:6:11:21:5:6
chr4	38259310	.	T	C	366.71	PASS	AF=0.965517;AO=27;DP=29;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0413692;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=40.9659;QD=50.5813;RBI=0.0680692;REFB=-0.000522184;REVB=-0.0540556;RO=1;SAF=15;SAR=12;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0371713;STB=0.519986;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=-0.000562508;OID=.;OPOS=38259310;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:29:29:1:1:27:28:0.965517:12:15:0:1:12:16:0:1
chr4	38628725	.	C	T	196.35	PASS	AF=0.947368;AO=16;DP=19;FAO=18;FDP=19;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.231484;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.6454;QD=41.3378;RBI=0.234447;REFB=-0.18883;REVB=0.0371582;RO=2;SAF=6;SAR=10;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129916;STB=0.523783;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.0295598;OID=.;OPOS=38628725;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:19:19:2:1:16:18:0.947368:10:6:2:0:10:8:0:1
chr4	38702437	.	A	G,T	637.84	PASS	AF=0.952381,0.047619;AO=40,2;DP=42;FAO=40,2;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=20,1;FSAR=20,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0420874,0.00698532;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=105.596,104.392;QD=60.7463;RBI=0.0490328,0.020915;REFB=0,0;REVB=0.0251568,0.019714;RO=0;SAF=20,1;SAR=20,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00188608,0.109065;OID=.,.;OPOS=38702437,38702437;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:42:42:0:0:40,2:40,2:0.952381,0.047619:20,1:20,1:0:0:20,1:20,1:0:0
chr4	38776107	.	T	G	75.35	PASS	AF=0.384615;AO=9;DP=25;FAO=10;FDP=26;FR=.;FRO=16;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.00719352;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.43;QD=11.5917;RBI=0.00837592;REFB=-0.0109012;REVB=0.00429061;RO=16;SAF=1;SAR=8;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.461932;STB=0.678847;STBP=0.2;TYPE=snp;VARB=0.0688254;OID=.;OPOS=38776107;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:25:26:16:16:9:10:0.384615:8:1:7:9:8:2:7:9
chr4	38776303	.	T	C	86.46	PASS	AF=0.392857;AO=11;DP=28;FAO=11;FDP=28;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.00580545;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=103.154;QD=12.3519;RBI=0.00651515;REFB=-0.00277051;REVB=-0.00295702;RO=16;SAF=7;SAR=4;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0122544;STB=0.530977;STBP=0.803;TYPE=snp;VARB=0.00463996;OID=.;OPOS=38776303;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:28:28:16:17:11:11:0.392857:4:7:10:6:4:7:10:7
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chr4	38777236	.	T	G	274.2	PASS	AF=0.527273;AO=29;DP=55;FAO=29;FDP=55;FR=.;FRO=26;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=6;FWDB=0.00954302;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.406;QD=19.942;RBI=0.0209309;REFB=-0.0044711;REVB=0.0186289;RO=26;SAF=17;SAR=12;SRF=20;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166281;STB=0.591941;STBP=0.197;TYPE=snp;VARB=0.00165143;OID=.;OPOS=38777236;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:26:26:29:29:0.527273:12:17:20:6:12:17:20:6
chr4	38798648	.	C	A	542.6	PASS	AF=1;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112401;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.798;QD=60.2893;RBI=0.0173813;REFB=0;REVB=-0.0132578;RO=0;SAF=24;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000676311;OID=.;OPOS=38798648;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:36:0:0:36:36:1:12:24:0:0:12:24:0:0
chr4	38798935	.	C	T	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00057504;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.774;QD=47.8217;RBI=0.0156599;REFB=0;REVB=0.0156493;RO=0;SAF=9;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000180855;OID=.;OPOS=38798935;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:7:9:0:0:7:9:0:0
chr4	38799710	.	T	C	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.101266;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.2895;QD=51.9154;RBI=0.105706;REFB=0;REVB=0.0303163;RO=0;SAF=11;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00385058;OID=.;OPOS=38799710;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:10:11:0:0:10:11:0:0
chr4	38829832	.	T	C	68.82	PASS	AF=0.5;AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=-0.0301296;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.9069;QD=15.2927;RBI=0.0346061;REFB=0.0390221;REVB=-0.0170231;RO=9;SAF=2;SAR=7;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0492584;OID=.;OPOS=38829832;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:18:18:9:9:9:9:0.5:7:2:2:7:7:2:2:7
chr4	38830012	.	G	C	132.71	PASS	AF=0.428571;AO=15;DP=35;FAO=15;FDP=35;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=-0.00383915;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=290.396;QD=15.1663;RBI=0.00520477;REFB=-0.00726285;REVB=-0.00351433;RO=20;SAF=6;SAR=9;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00871575;OID=.;OPOS=38830012;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:20:20:15:15:0.428571:9:6:8:12:9:6:8:12
chr4	38830116	.	C	T	193.22	PASS	AF=0.425532;AO=20;DP=47;FAO=20;FDP=47;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=-0.0206836;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.063;QD=16.4444;RBI=0.0213729;REFB=-0.000433444;REVB=-0.00538448;RO=27;SAF=11;SAR=9;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142165;STB=0.581315;STBP=0.354;TYPE=snp;VARB=0.000556874;OID=.;OPOS=38830116;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:27:27:20:20:0.425532:9:11:11:16:9:11:11:16
chr4	38830350	.	A	G	670.17	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0846653;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.6872;QD=62.3417;RBI=0.0866492;REFB=0;REVB=-0.0184355;RO=0;SAF=21;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00117423;OID=.;OPOS=38830350;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:22:21:0:0:22:21:0:0
chr4	38830736	.	A	G	243.79	PASS	AF=0.4375;AO=28;DP=64;FAO=28;FDP=64;FR=.;FRO=36;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=-0.011409;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=215.531;QD=15.2367;RBI=0.0120869;REFB=-0.0113989;REVB=-0.00399105;RO=36;SAF=13;SAR=15;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0355488;STB=0.52012;STBP=0.785;TYPE=snp;VARB=0.015594;OID=.;OPOS=38830736;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:36:36:28:28:0.4375:15:13:18:18:15:13:18:18
chr4	38879949	.	G	A	149.1	PASS	AF=0.5;AO=16;DP=32;FAO=16;FDP=32;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.0454862;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.552;QD=18.6371;RBI=0.0461525;REFB=-0.0213681;REVB=0.00781391;RO=16;SAF=7;SAR=9;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0562335;STB=0.53196;STBP=0.755;TYPE=snp;VARB=0.0226195;OID=.;OPOS=38879949;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:16:16:16:16:0.5:9:7:6:10:9:7:6:10
chr4	38880046	.	T	C	166.26	PASS	AF=0.566667;AO=16;DP=29;FAO=17;FDP=30;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.0199214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.093;QD=22.1683;RBI=0.022674;REFB=-0.00246366;REVB=-0.0108282;RO=13;SAF=7;SAR=9;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140495;STB=0.562427;STBP=0.481;TYPE=snp;VARB=0.00222729;OID=.;OPOS=38880046;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:30:13:13:16:17:0.566667:9:7:8:5:9:8:8:5
chr4	38916631	.	T	C	290.18	PASS	AF=0.457143;AO=32;DP=70;FAO=32;FDP=70;FR=.;FRO=38;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=8;FSRR=30;FWDB=0.00443204;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.1678;QD=16.5818;RBI=0.0172895;REFB=-0.0220315;REVB=0.0167118;RO=33;SAF=12;SAR=20;SRF=8;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134089;STB=0.599943;STBP=0.168;TYPE=snp;VARB=0.024161;OID=.;OPOS=38916631;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:33:38:32:32:0.457143:20:12:8:25:20:12:8:30
chr4	38933859	.	G	A	131.95	PASS	AF=0.416667;AO=15;DP=36;FAO=15;FDP=36;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=-0.0120076;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.301;QD=14.6614;RBI=0.0485562;REFB=-0.00887052;REVB=0.047048;RO=21;SAF=5;SAR=10;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.286975;STB=0.666444;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=0.0121669;OID=.;OPOS=38933859;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:21:21:15:15:0.416667:10:5:13:8:10:5:13:8
chr4	38937372	.	T	C	483.34	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0174455;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=61.0074;QD=58.5869;RBI=0.0203021;REFB=0;REVB=0.0103841;RO=0;SAF=12;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000558111;OID=.;OPOS=38937372;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:21:12:0:0:21:12:0:0
chr4	38995374	.	T	C	1587.79	PASS	AF=1;AO=99;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0258156;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.745;QD=64.1533;RBI=0.0265428;REFB=0;REVB=0.00617054;RO=0;SAF=50;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.571e-05;OID=.;OPOS=38995374;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:99:99:0:0:99:99:1:49:50:0:0:49:50:0:0
chr4	39000305	.	A	G	215.27	PASS	AF=0.525;AO=20;DP=39;FAO=21;FDP=40;FR=.;FRO=19;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=5;FWDB=0.0165641;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.51;QD=21.5273;RBI=0.0165885;REFB=-0.0110458;REVB=0.000900592;RO=19;SAF=12;SAR=8;SRF=14;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127321;STB=0.560983;STBP=0.475;TYPE=snp;VARB=0.0149588;OID=.;OPOS=39000305;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:40:19:19:20:21:0.525:8:12:14:5:8:13:14:5
chr4	39064162	.	A	C,T	1153.85	PASS	AF=0.961039,0.038961;AO=74,3;DP=78;FAO=74,3;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=49,1;FSAR=25,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00149573,0.0021287;FXX=0.0374953;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=77.8174,170.32;QD=59.9401;RBI=0.00987162,0.0158972;REFB=0,0;REVB=-0.00975764,0.015754;RO=0;SAF=49,1;SAR=25,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00155168,0.0280914;OID=.,.;OPOS=39064162,39064162;OREF=A,A;OALT=C,T;OMAPALT=C,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:78:77:0:0:74,3:74,3:0.961039,0.038961:25,2:49,1:0:0:25,2:49,1:0:0
chr4	39094738	.	G	A	727.78	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00712243;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.181;QD=63.285;RBI=0.00969658;REFB=0;REVB=0.00657986;RO=0;SAF=19;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.75556e-05;OID=.;OPOS=39094738;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:27:19:0:0:27:19:0:0
chr4	39116911	.	T	C	241.0	PASS	AF=0.424242;AO=27;DP=65;FAO=28;FDP=66;FR=.;FRO=38;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=0.010192;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.935;QD=14.6058;RBI=0.0159928;REFB=-0.00523892;REVB=0.0123244;RO=38;SAF=13;SAR=14;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0459943;STB=0.535689;STBP=0.626;TYPE=snp;VARB=0.00596732;OID=.;OPOS=39116911;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:66:38:38:27:28:0.424242:14:13:20:18:15:13:20:18
chr4	39122697	.	C	T	212.21	PASS	AF=0.376812;AO=26;DP=69;FAO=26;FDP=69;FR=.;FRO=43;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=-0.0116514;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=137.171;QD=12.302;RBI=0.0117961;REFB=0.00277621;REVB=0.00184209;RO=42;SAF=16;SAR=10;SRF=21;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126325;STB=0.580436;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=-0.00386757;OID=.;OPOS=39122697;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:42:43:26:26:0.376812:10:16:21:21:10:16:21:22
chr4	39302029	.	T	C	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0508547;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.9331;QD=51.9165;RBI=0.0541315;REFB=0;REVB=-0.0185476;RO=0;SAF=14;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00208646;OID=.;OPOS=39302029;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:7:14:0:0:7:14:0:0
chr4	39448542	.	C	G	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0262969;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=234.516;QD=48.7371;RBI=0.0264637;REFB=0;REVB=-0.00296632;RO=0;SAF=8;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000137524;OID=.;OPOS=39448542;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:9:8:0:0:9:8:0:0
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chr4	39458051	.	A	G	363.5	PASS	AF=1;AO=25;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0223116;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.335;QD=55.9229;RBI=0.036256;REFB=0;REVB=0.0285778;RO=0;SAF=15;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00034579;OID=.;OPOS=39458051;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:25:26:1:10:15:0:0:10:16:0:0
chr4	39459724	.	T	C	1512.84	PASS	AF=1;AO=101;DP=103;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0106846;FXX=0.0194156;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.802;QD=59.9145;RBI=0.0111814;REFB=0;REVB=0.00329575;RO=0;SAF=65;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000115518;OID=.;OPOS=39459724;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:103:101:0:0:101:101:1:36:65:0:0:36:65:0:0
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chr4	39921942	.	A	G	158.7	PASS	AF=0.459459;AO=17;DP=37;FAO=17;FDP=37;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.00588113;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.635;QD=17.1564;RBI=0.00798166;REFB=-0.0174376;REVB=-0.00539621;RO=20;SAF=9;SAR=8;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0748639;STB=0.542807;STBP=0.625;TYPE=snp;VARB=0.0244535;OID=.;OPOS=39921942;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:20:20:17:17:0.459459:8:9:9:11:8:9:9:11
chr4	40045139	.	T	C	627.0	PASS	AF=0.583333;AO=56;DP=96;FAO=56;FDP=96;FR=.;FRO=40;FSAF=25;FSAR=31;FSRF=16;FSRR=24;FWDB=-0.0233069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.2448;QD=26.125;RBI=0.023689;REFB=0.000175222;REVB=0.00423775;RO=40;SAF=25;SAR=31;SRF=16;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0359973;STB=0.519645;STBP=0.666;TYPE=snp;VARB=-0.000182088;OID=.;OPOS=40045139;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:96:40:40:56:56:0.583333:31:25:16:24:31:25:16:24
chr4	40045340	.	G	C	481.33	PASS	AF=0.547619;AO=45;DP=83;FAO=46;FDP=84;FR=.;FRO=38;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=0.00228275;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.035;QD=22.9205;RBI=0.00817327;REFB=-0.0115452;REVB=-0.00784802;RO=38;SAF=21;SAR=24;SRF=16;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0381998;STB=0.525976;STBP=0.616;TYPE=snp;VARB=0.00800936;OID=.;OPOS=40045340;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:84:38:38:45:46:0.547619:24:21:16:22:24:22:16:22
chr4	40079556	.	C	T	183.89	PASS	AF=0.463415;AO=19;DP=41;FAO=19;FDP=41;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.00278156;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.256;QD=17.9408;RBI=0.00667418;REFB=-0.000334659;REVB=-0.00606693;RO=22;SAF=10;SAR=9;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0675074;STB=0.538421;STBP=0.687;TYPE=snp;VARB=0.000342803;OID=.;OPOS=40079556;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:22:22:19:19:0.463415:9:10:10:12:9:10:10:12
chr4	40121562	.	G	A	1011.04	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0438031;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.867;QD=59.4727;RBI=0.0650841;REFB=0;REVB=-0.0481376;RO=0;SAF=37;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.91765e-05;OID=.;OPOS=40121562;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:68:0:0:66:68:1:29:37:0:0:29:39:0:0
chr4	40138676	.	A	G	264.5	PASS	AF=0.483333;AO=29;DP=61;FAO=29;FDP=60;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=0.0164913;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.5332;QD=17.6336;RBI=0.0174406;REFB=-0.00285078;REVB=-0.00567557;RO=31;SAF=9;SAR=20;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.201538;STB=0.613416;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.00273444;OID=.;OPOS=40138676;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:60:31:31:29:29:0.483333:20:9:16:15:20:9:16:15
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chr4	40337908	.	T	C	1117.97	PASS	AF=1;AO=74;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0265351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.415;QD=59.6252;RBI=0.0375843;REFB=0;REVB=0.026617;RO=1;SAF=42;SAR=32;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0145539;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.07704e-05;OID=.;OPOS=40337908;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:75:1:0:74:75:1:32:42:0:1:33:42:0:0
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chr4	40778162	.	T	G	355.04	PASS	AF=0.436782;AO=38;DP=87;FAO=38;FDP=87;FR=.;FRO=49;FSAF=26;FSAR=12;FSRF=24;FSRR=25;FWDB=0.0241056;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=187.566;QD=16.3238;RBI=0.0262796;REFB=-0.0114394;REVB=-0.0104662;RO=48;SAF=26;SAR=12;SRF=23;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.213843;STB=0.615814;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.0144895;OID=.;OPOS=40778162;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:48:49:38:38:0.436782:12:26:23:25:12:26:24:25
chr4	40810747	.	A	G	766.97	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0137211;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.712;QD=63.9138;RBI=0.0393541;REFB=0;REVB=-0.0368847;RO=0;SAF=33;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000140687;OID=.;OPOS=40810747;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:48:0:0:47:48:1:14:33:0:0:14:34:0:0
chr4	40870972	.	C	T	160.42	PASS	AF=0.459459;AO=17;DP=38;FAO=17;FDP=37;FR=.;FRO=20;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.0104865;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.055;QD=17.3429;RBI=0.0329699;REFB=-0.00863776;REVB=-0.0312578;RO=20;SAF=13;SAR=4;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.283926;STB=0.664025;STBP=0.087;TYPE=snp;VARB=0.00839327;OID=.;OPOS=40870972;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:37:20:20:17:17:0.459459:4:13:10:10:4:13:10:10
chr4	41015823	.	G	A,T	1140.91	PASS	AF=0.564103,0.435897;AO=44,34;DP=78;FAO=44,34;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=18,13;FSAR=26,21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00544129,-0.00549056;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=52.9842,185.464;QD=58.5081;RBI=0.0323882,0.00743763;REFB=0,0;REVB=0.0319278,0.00501717;RO=0;SAF=18,13;SAR=26,21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.0126193,0.0175678;OID=.,.;OPOS=41015823,41015823;OREF=G,G;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:78:78:0:0:44,34:44,34:0.564103,0.435897:26,21:18,13:0:0:26,21:18,13:0:0
chr4	41015899	.	C	T	1030.15	PASS	AF=0.985915;AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=71;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0127385;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.951;QD=58.0368;RBI=0.0222;REFB=-0.126208;REVB=0.0181816;RO=1;SAF=23;SAR=47;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00995486;STB=0.505262;STBP=0.618;TYPE=snp;VARB=0.000451311;OID=.;OPOS=41015899;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:71:71:1:1:70:70:0.985915:47:23:0:1:47:23:0:1
chr4	41016484	.	T	C	179.16	PASS	AF=0.5625;AO=18;DP=31;FAO=18;FDP=32;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=0.0109025;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=256.245;QD=22.3955;RBI=0.0128231;REFB=-0.0151625;REVB=0.00675039;RO=12;SAF=10;SAR=8;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0813951;STB=0.538964;STBP=0.655;TYPE=snp;VARB=0.00962143;OID=.;OPOS=41016484;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:32:12:14:18:18:0.5625:8:10:8:4:8:10:9:5
chr4	41259633	.	C	A	907.94	PASS	AF=0.984615;AO=58;DP=60;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00354725;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=76.2112;QD=55.8733;RBI=0.144289;REFB=-0.0386246;REVB=0.144246;RO=2;SAF=37;SAR=21;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00935481;STB=0.506491;STBP=0.553;TYPE=snp;VARB=0.000973104;OID=.;OPOS=41259633;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:60:65:2:1:58:64:0.984615:21:37:1:1:26:38:1:0
chr4	41526503	.	C	T	535.29	PASS	AF=0.529412;AO=54;DP=102;FAO=54;FDP=102;FR=.;FRO=48;FSAF=20;FSAR=34;FSRF=20;FSRR=28;FWDB=-0.0160794;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.272;QD=20.9918;RBI=0.0311313;REFB=-0.00783433;REVB=-0.0266573;RO=48;SAF=20;SAR=34;SRF=20;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0418857;STB=0.523068;STBP=0.655;TYPE=snp;VARB=0.00541297;OID=.;OPOS=41526503;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:48:48:54:54:0.529412:34:20:20:28:34:20:20:28
chr4	41634859	.	C	T	785.18	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0689756;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.9133;QD=57.1039;RBI=0.0842932;REFB=0;REVB=0.0484531;RO=0;SAF=17;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.97918e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000959914;OID=.;OPOS=41634859;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:38:17:0:0:38:17:0:0
chr4	41701248	.	A	G	38.24	PASS	AF=0.315789;AO=6;DP=20;FAO=6;FDP=19;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.00675632;FXX=0.049975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.202;QD=8.05039;RBI=0.0368743;REFB=-0.000538167;REVB=-0.03625;RO=13;SAF=3;SAR=3;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125021;STB=0.578691;STBP=0.724;TYPE=snp;VARB=-0.00128951;OID=.;OPOS=41701248;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:20:19:13:13:6:6:0.315789:3:3:8:5:3:3:8:5
chr4	41984118	.	C	T	501.66	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0209052;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.754;QD=59.0187;RBI=0.0253261;REFB=0;REVB=-0.0142962;RO=0;SAF=15;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.40663e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.48483e-05;OID=.;OPOS=41984118;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:19:15:0:0:19:15:0:0
chr4	41985101	.	A	G	3137.17	PASS	AF=1;AO=195;DP=195;FAO=196;FDP=196;FR=.;FRO=0;FSAF=89;FSAR=107;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.047026;FXX=0.00507588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.067;QD=64.0239;RBI=0.0574736;REFB=0;REVB=0.033042;RO=0;SAF=89;SAR=106;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-8.97096e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000159451;OID=.;OPOS=41985101;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:17:195:196:0:0:195:196:1:106:89:0:0:107:89:0:0
chr4	41985478	.	A	G	520.03	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0052806;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.973;QD=59.4324;RBI=0.00773532;REFB=0;REVB=0.00565247;RO=0;SAF=20;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.41081e-05;OID=.;OPOS=41985478;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:15:20:0:0:15:20:0:0
chr4	41985689	.	C	T	1021.37	PASS	AF=1;AO=51;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=39;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.141108;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=39.2692;QD=58.3639;RBI=0.152482;REFB=0;REVB=-0.0577864;RO=0;SAF=21;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00332393;OID=.;OPOS=41985689;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:51:70:1:30:21:0:0:31:39:0:0
chr4	41986857	.	A	G	1245.82	PASS	AF=1;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0261993;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.3878;QD=61.5217;RBI=0.0555541;REFB=0;REVB=0.0489883;RO=0;SAF=35;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.46682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000360704;OID=.;OPOS=41986857;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:81:0:0:81:81:1:46:35:0:0:46:35:0:0
chr4	41987892	.	G	A	754.43	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00403081;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=264.258;QD=56.9383;RBI=0.0123633;REFB=0;REVB=0.0116877;RO=0;SAF=25;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.45558e-05;OID=.;OPOS=41987892;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:28:25:0:0:28:25:0:0
chr4	41988385	.	TACACAG	TACA,TACAG	494.32	PASS	AF=0,1;AO=4,27;DP=34;FAO=0,34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=0,22;FSAR=0,12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000703698,0.0248311;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=3,2;MLLD=112.177,167.961;QD=58.1553;RBI=0.00304044,0.02637;REFB=0,0;REVB=-0.00295788,0.0088763;RO=0;SAF=4,16;SAR=0,11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-3.5146e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=0,-8.477e-06;OID=.,.;OPOS=41988389,41988386;OREF=CAG,AC;OALT=-,-;OMAPALT=TACA,TACAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	2/2:0,1:4,27:34:0,34:34:0:0,22:0,12:0:0:4:0:4,16:0,11:0:0
chr4	41992677	.	C	G	3922.55	PASS	AF=0.980916;AO=257;DP=262;FAO=257;FDP=262;FR=.;FRO=5;FSAF=131;FSAR=126;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0676944;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.2282;QD=59.8863;RBI=0.0867522;REFB=-0.114453;REVB=0.0542531;RO=2;SAF=131;SAR=126;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00722194;STB=0.505542;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=0.0021223;OID=.;OPOS=41992677;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:262:262:2:5:257:257:0.980916:126:131:2:0:126:131:4:1
chr4	42003671	.	A	G	483.35	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0133576;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.351;QD=58.5878;RBI=0.0179993;REFB=0;REVB=0.0120643;RO=0;SAF=16;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.60901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.20865e-06;OID=.;OPOS=42003671;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:17:16:0:0:17:16:0:0
chr4	42020142	.	A	G	1653.08	PASS	AF=0.982301;AO=110;DP=114;FAO=111;FDP=113;FR=.;FRO=2;FSAF=56;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0186395;FXX=0.00877116;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.3056;QD=58.5162;RBI=0.0272972;REFB=-0.135122;REVB=0.0199426;RO=0;SAF=55;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508927;STBP=0.265;TYPE=snp;VARB=0.00204162;OID=.;OPOS=42020142;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:114:113:0:2:110:111:0.982301:55:55:0:0:55:56:0:2
chr4	42022464	.	C	A	769.51	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0425035;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.93;QD=57.0006;RBI=0.0487387;REFB=0;REVB=0.023852;RO=0;SAF=18;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.38224e-05;OID=.;OPOS=42022464;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:36:18:0:0:36:18:0:0
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chr4	44295839	.	G	A	182.01	PASS	AF=0.315789;AO=24;DP=76;FAO=24;FDP=76;FR=.;FRO=52;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=33;FWDB=-0.0147141;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.54;QD=9.57923;RBI=0.0380145;REFB=-0.0101305;REVB=-0.0350513;RO=52;SAF=8;SAR=16;SRF=19;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0411364;STB=0.524251;STBP=0.787;TYPE=snp;VARB=0.0233942;OID=.;OPOS=44295839;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:52:52:24:24:0.315789:16:8:19:33:16:8:19:33
chr4	44626641	.	A	G	242.45	PASS	AF=0.430769;AO=28;DP=65;FAO=28;FDP=65;FR=.;FRO=37;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=-0.0257847;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.466;QD=14.9203;RBI=0.0305768;REFB=-0.0188363;REVB=0.0164343;RO=37;SAF=10;SAR=18;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187853;STB=0.606664;STBP=0.163;TYPE=snp;VARB=0.0171847;OID=.;OPOS=44626641;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:37:37:28:28:0.430769:18:10:20:17:18:10:20:17
chr4	44652030	.	C	T	629.54	PASS	AF=0.445161;AO=69;DP=155;FAO=69;FDP=155;FR=.;FRO=86;FSAF=37;FSAR=32;FSRF=37;FSRR=49;FWDB=-0.00594191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.383;QD=16.2462;RBI=0.0403337;REFB=-0.00904803;REVB=-0.0398936;RO=85;SAF=37;SAR=32;SRF=36;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111406;STB=0.558604;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=0.0106324;OID=.;OPOS=44652030;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:155:155:85:86:69:69:0.445161:32:37:36:49:32:37:37:49
chr4	44682465	.	T	C	489.43	PASS	AF=0.543478;AO=47;DP=89;FAO=50;FDP=92;FR=.;FRO=42;FSAF=36;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=26;FWDB=0.0548367;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.5766;QD=21.2795;RBI=0.0571298;REFB=-0.043648;REVB=0.0160236;RO=40;SAF=33;SAR=14;SRF=15;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.284193;STB=0.664138;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0504076;OID=.;OPOS=44682465;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:92:40:42:47:50:0.543478:14:33:15:25:14:36:16:26
chr4	44699484	.	T	G	236.37	PASS	AF=0.4;AO=28;DP=70;FAO=28;FDP=70;FR=.;FRO=42;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=26;FWDB=0.00212006;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=213.942;QD=13.507;RBI=0.00217188;REFB=-0.0140977;REVB=-0.000471627;RO=41;SAF=15;SAR=13;SRF=15;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.175886;STB=0.592041;STBP=0.239;TYPE=snp;VARB=0.0273236;OID=.;OPOS=44699484;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:41:42:28:28:0.4:13:15:15:26:13:15:16:26
chr4	44704757	.	C	T	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.028947;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.354;QD=59.4356;RBI=0.0310038;REFB=0;REVB=-0.0111045;RO=0;SAF=15;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.59064e-05;OID=.;OPOS=44704757;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:20:15:0:0:20:15:0:0
chr4	46086060	.	T	C	157.73	PASS	AF=0.357143;AO=20;DP=56;FAO=20;FDP=56;FR=.;FRO=36;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=0.00234478;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.108;QD=11.2667;RBI=0.0233827;REFB=0.00425468;REVB=0.0232648;RO=36;SAF=7;SAR=13;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199623;STB=0.61667;STBP=0.191;TYPE=snp;VARB=-0.00632802;OID=.;OPOS=46086060;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:36:36:20:20:0.357143:13:7:19:17:13:7:19:17
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chr4	47887991	.	G	A	497.93	PASS	AF=0.510638;AO=48;DP=94;FAO=48;FDP=94;FR=.;FRO=46;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=26;FSRR=20;FWDB=-0.0130038;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.843;QD=21.1883;RBI=0.0206438;REFB=-0.0337323;REVB=-0.0160333;RO=46;SAF=23;SAR=25;SRF=26;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0760459;STB=0.542018;STBP=0.427;TYPE=snp;VARB=0.0216765;OID=.;OPOS=47887991;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:46:46:48:48:0.510638:25:23:26:20:25:23:26:20
chr4	47901476	.	G	A	346.81	PASS	AF=0.564516;AO=35;DP=62;FAO=35;FDP=62;FR=.;FRO=27;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=0.00283202;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.875;QD=22.375;RBI=0.00359713;REFB=0.00855169;REVB=-0.00221788;RO=27;SAF=22;SAR=13;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0605768;STB=0.533443;STBP=0.576;TYPE=snp;VARB=-0.00853109;OID=.;OPOS=47901476;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:27:27:35:35:0.564516:13:22:15:12:13:22:15:12
chr4	47945295	.	C	T	103.49	PASS	AF=0.545455;AO=12;DP=21;FAO=12;FDP=22;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=-0.0336946;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.527;QD=18.816;RBI=0.0396326;REFB=-0.015976;REVB=-0.0208666;RO=8;SAF=7;SAR=5;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0594792;STB=0.538397;STBP=0.762;TYPE=snp;VARB=0.0103789;OID=.;OPOS=47945295;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:21:22:8:10:12:12:0.545455:5:7:4:4:5:7:5:5
chr4	47945455	.	C	G	74.97	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0838563;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.8657;QD=37.4874;RBI=0.0840029;REFB=0;REVB=0.00496014;RO=0;SAF=1;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.78849e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00251995;OID=.;OPOS=47945455;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:7:1:0:0:7:1:0:0
chr4	48069696	.	G	C	325.64	PASS	AF=0.466667;AO=35;DP=74;FAO=35;FDP=75;FR=.;FRO=40;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=24;FSRR=16;FWDB=0.00915388;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.5219;QD=17.3675;RBI=0.037522;REFB=0.00298679;REVB=0.0363882;RO=39;SAF=20;SAR=15;SRF=23;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0176648;STB=0.515616;STBP=0.821;TYPE=snp;VARB=-0.00285392;OID=.;OPOS=48069696;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:75:39:40:35:35:0.466667:15:20:23:16:15:20:24:16
chr4	48069725	.	G	A	270.77	PASS	AF=0.46875;AO=29;DP=63;FAO=30;FDP=64;FR=.;FRO=34;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=23;FSRR=11;FWDB=0.000813971;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=237.566;QD=16.9232;RBI=0.0314024;REFB=0.00223701;REVB=0.0313918;RO=34;SAF=14;SAR=15;SRF=23;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185259;STB=0.610238;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=-0.00340682;OID=.;OPOS=48069725;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:64:34:34:29:30:0.46875:15:14:23:11:16:14:23:11
chr4	48170669	.	A	G	654.81	PASS	AF=1;AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00912322;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.717;QD=62.363;RBI=0.00927855;REFB=0;REVB=-0.00169066;RO=0;SAF=21;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.39403e-05;OID=.;OPOS=48170669;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:42:0:0:42:42:1:21:21:0:0:21:21:0:0
chr4	48172266	.	G	A	754.39	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00780327;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.931;QD=56.9351;RBI=0.0078889;REFB=0;REVB=0.00115926;RO=0;SAF=24;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.61548e-05;OID=.;OPOS=48172266;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:29:24:0:0:29:24:0:0
chr4	48426066	.	A	T	236.23	PASS	AF=0.481481;AO=26;DP=54;FAO=26;FDP=54;FR=.;FRO=28;FSAF=4;FSAR=22;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=0.0117483;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.7791;QD=17.4988;RBI=0.0146493;REFB=-0.00500623;REVB=-0.00875109;RO=28;SAF=4;SAR=22;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.312665;STB=0.678853;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.00556819;OID=.;OPOS=48426066;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:28:28:26:26:0.481481:22:4:11:17:22:4:11:17
chr4	48492434	.	G	C	101.9	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0268991;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.522;QD=40.7614;RBI=0.0440799;REFB=0;REVB=0.0349209;RO=0;SAF=1;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.8593e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000277048;OID=.;OPOS=48492434;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:9:1:0:0:9:1:0:0
chr4	48582909	.	G	A	308.02	PASS	AF=0.551724;AO=28;DP=55;FAO=32;FDP=58;FR=.;FRO=26;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=0.011085;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.041;QD=21.243;RBI=0.0111439;REFB=0.00178573;REVB=0.00114386;RO=26;SAF=16;SAR=12;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127983;STB=0.592047;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=-0.00154051;OID=.;OPOS=48582909;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:58:26:26:28:32:0.551724:12:16:11:15:12:20:11:15
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chr4	52714354	.	A	ATTTC	189.01	PASS	AF=0.4;AO=20;DP=61;FAO=24;FDP=60;FR=.;FRO=36;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=-0.00308055;FXX=0;HRUN=5;LEN=4;MLLD=267.713;QD=12.6006;RBI=0.0109532;REFB=0.00366374;REVB=-0.0105111;RO=34;SAF=13;SAR=7;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136228;STB=0.604562;STBP=0.205;TYPE=ins;VARB=-0.00466445;OID=.;OPOS=52714355;OREF=-;OALT=TTTC;OMAPALT=ATTTC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.4:20:61:24:60:36:16:8:18:18:99:34:13:7:18:16
chr4	52752812	.	A	T	443.38	PASS	AF=0.423729;AO=50;DP=118;FAO=50;FDP=118;FR=.;FRO=68;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=30;FSRR=38;FWDB=0.00946359;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=221.712;QD=15.0299;RBI=0.0115373;REFB=-0.00361315;REVB=0.00659916;RO=68;SAF=25;SAR=25;SRF=30;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0603719;STB=0.533885;STBP=0.555;TYPE=snp;VARB=0.0050979;OID=.;OPOS=52752812;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:118:118:68:68:50:50:0.423729:25:25:30:38:25:25:30:38
chr4	52780048	.	G	C	426.94	PASS	AF=0.37594;AO=50;DP=133;FAO=50;FDP=133;FR=.;FRO=83;FSAF=31;FSAR=19;FSRF=41;FSRR=42;FWDB=0.00154305;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.0234;QD=12.8402;RBI=0.00473994;REFB=0.000545955;REVB=-0.00448175;RO=82;SAF=31;SAR=19;SRF=40;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146994;STB=0.580207;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=-0.00192117;OID=.;OPOS=52780048;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:133:133:82:83:50:50:0.37594:19:31:40:42:19:31:41:42
chr4	52889602	.	T	A	49.59	PASS	AF=0.538462;AO=7;DP=13;FAO=7;FDP=13;FR=.;FRO=6;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.0187468;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=194.879;QD=15.2589;RBI=0.0821217;REFB=-0.0139311;REVB=-0.0799533;RO=6;SAF=6;SAR=1;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.477234;STB=0.788535;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=0.0106714;OID=.;OPOS=52889602;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:13:13:6:6:7:7:0.538462:1:6:2:4:1:6:2:4
chr4	52938243	.	T	C	722.18	PASS	AF=1;AO=50;DP=51;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00852798;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.9874;QD=54.5043;RBI=0.0101936;REFB=0;REVB=0.00558425;RO=0;SAF=25;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00351105;OID=.;OPOS=52938243;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:53:0:0:50:53:1:25:25:0:0:25:28:0:0
chr4	53361058	.	G	C	61.7	PASS	AF=0.533333;AO=8;DP=16;FAO=8;FDP=15;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0115559;FXX=0.062461;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.302;QD=16.4524;RBI=0.0180251;REFB=0.00478744;REVB=-0.0138335;RO=7;SAF=5;SAR=3;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0446316;STB=0.526249;STBP=0.909;TYPE=snp;VARB=-0.00478526;OID=.;OPOS=53361058;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:49:16:15:7:7:8:8:0.533333:3:5:4:3:3:5:4:3
chr4	53822307	.	A	G	311.52	PASS	AF=0.507692;AO=33;DP=64;FAO=33;FDP=65;FR=.;FRO=32;FSAF=24;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=-0.00145524;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=169.442;QD=19.1705;RBI=0.0216893;REFB=-0.016871;REVB=0.0216404;RO=31;SAF=24;SAR=9;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148045;STB=0.577;STBP=0.261;TYPE=snp;VARB=0.0197507;OID=.;OPOS=53822307;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:65:31:32:33:33:0.507692:9:24:18:13:9:24:19:13
chr4	54011526	.	A	G	1937.52	PASS	AF=1;AO=125;DP=125;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0138292;FXX=0.00793588;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.121;QD=62.0005;RBI=0.0261606;REFB=0;REVB=0.0222066;RO=0;SAF=59;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000152852;OID=.;OPOS=54011526;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:125:125:0:0:125:125:1:66:59:0:0:66:59:0:0
chr4	54310281	.	T	G	775.25	PASS	AF=0.965517;AO=56;DP=58;FAO=56;FDP=58;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0214273;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.407;QD=53.4652;RBI=0.0597114;REFB=-0.0762596;REVB=0.0557343;RO=1;SAF=27;SAR=29;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.015982;STB=0.516661;STBP=0.238;TYPE=snp;VARB=0.00218445;OID=.;OPOS=54310281;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:58:58:1:2:56:56:0.965517:29:27:0:1:29:27:0:2
chr4	54966667	.	C	T	842.66	PASS	AF=0.967742;AO=60;DP=62;FAO=60;FDP=62;FR=.;FRO=2;FSAF=21;FSAR=39;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0573912;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=222.354;QD=54.3649;RBI=0.0577387;REFB=-0.138502;REVB=0.00632544;RO=0;SAF=21;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.52272;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.00190201;OID=.;OPOS=54966667;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:62:62:0:2:60:60:0.967742:39:21:0:0:39:21:2:0
chr4	54966830	.	G	A	632.26	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0172426;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=297.426;QD=61.684;RBI=0.0258533;REFB=0;REVB=0.0192636;RO=0;SAF=15;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.55429e-05;OID=.;OPOS=54966830;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:26:15:0:0:26:15:0:0
chr4	54966919	.	T	C	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.798;QD=51.1846;RBI=0.00693696;REFB=0;REVB=0.00693696;RO=0;SAF=0;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.95679e-05;OID=.;OPOS=54966919;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:20:0:0:0:20:0:0:0
chr4	55141055	.	A	G	1995.11	PASS	AF=0.984848;AO=129;DP=130;FAO=130;FDP=132;FR=.;FRO=2;FSAF=46;FSAR=84;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0133503;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.11;QD=60.4579;RBI=0.0248577;REFB=0.0531837;REVB=0.0209684;RO=1;SAF=46;SAR=83;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00569182;STB=0.502418;STBP=0.772;TYPE=snp;VARB=4.77011e-06;OID=.;OPOS=55141055;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:130:132:1:2:129:130:0.984848:83:46:0:1:84:46:1:1
chr4	55161391	.	T	C	1751.69	PASS	AF=0.991453;AO=116;DP=117;FAO=116;FDP=117;FR=.;FRO=1;FSAF=67;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.000681927;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.517;QD=59.8869;RBI=0.00162058;REFB=-0.00362763;REVB=0.00147012;RO=1;SAF=67;SAR=49;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00959315;STB=0.50505;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=1.48565e-05;OID=.;OPOS=55161391;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:117:117:1:1:116:116:0.991453:49:67:0:1:49:67:0:1
chr4	55161517	.	A	G	2243.36	PASS	AF=0.986207;AO=143;DP=144;FAO=143;FDP=145;FR=.;FRO=2;FSAF=65;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.012448;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.335;QD=61.8857;RBI=0.0130651;REFB=-0.0686091;REVB=-0.00396796;RO=1;SAF=65;SAR=78;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00605782;STB=0.506328;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=0.00111407;OID=.;OPOS=55161517;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:144:145:1:2:143:143:0.986207:78:65:0:1:78:65:0:2
chr4	55930179	.	G	A	30.13	PASS	AF=0.416667;AO=5;DP=12;FAO=5;FDP=12;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.0202896;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.111;QD=10.0436;RBI=0.0214337;REFB=-0.00120552;REVB=0.00690896;RO=7;SAF=2;SAR=3;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.286688;STB=0.676751;STBP=0.431;TYPE=snp;VARB=0.000961887;OID=.;OPOS=55930179;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:12:12:7:7:5:5:0.416667:3:2:5:2:3:2:5:2
chr4	55946081	.	A	G	1421.79	PASS	AF=1;AO=90;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00131752;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.455;QD=62.4961;RBI=0.0130309;REFB=0;REVB=0.0129642;RO=0;SAF=45;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.40842e-05;OID=.;OPOS=55946081;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:91:91:0:0:90:91:1:45:45:0:0:46:45:0:0
chr4	55972974	.	T	A	96.96	PASS	AF=0.444444;AO=11;DP=26;FAO=12;FDP=27;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=2;FWDB=-0.0368756;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.147;QD=14.3641;RBI=0.0569814;REFB=-0.0089188;REVB=0.0434404;RO=15;SAF=5;SAR=6;SRF=13;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.40083;STB=0.70342;STBP=0.113;TYPE=snp;VARB=0.0169587;OID=.;OPOS=55972974;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:26:27:15:15:11:12:0.444444:6:5:13:2:6:6:13:2
chr4	56291620	.	CAA	C	1285.79	PASS	AF=1;AO=100;DP=104;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0106905;FXX=0.08035;HRUN=2;LEN=2;MLLD=98.6038;QD=49.9337;RBI=0.0158941;REFB=0;REVB=-0.0117615;RO=0;SAF=64;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00157633;OID=.;OPOS=56291621;OREF=AA;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:100:104:103:103:0:65:38:0:0:23:0:64:36:0:0
chr4	56300685	.	C	T	575.8	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00584345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.434;QD=60.6101;RBI=0.0102237;REFB=0;REVB=0.00838913;RO=0;SAF=10;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.20279e-05;OID=.;OPOS=56300685;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:28:10:0:0:28:10:0:0
chr4	56301049	.	G	GA	792.9	PASS	AF=1;AO=70;DP=76;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0215656;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=18.5845;QD=42.288;RBI=0.078254;REFB=0;REVB=-0.0752238;RO=5;SAF=36;SAR=34;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0143778;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.000410175;OID=.;OPOS=56301050;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:70:76:75:75:0:38:37:0:0:14:5:36:34:2:3
chr4	56306111	.	G	A	1353.79	PASS	AF=1;AO=87;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00152405;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.225;QD=61.5357;RBI=0.00849289;REFB=0;REVB=0.00835503;RO=1;SAF=38;SAR=49;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00957246;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.78588e-06;OID=.;OPOS=56306111;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:88:88:1:0:87:88:1:49:38:0:1:50:38:0:0
chr4	56309992	.	A	G,T	600.68	PASS	AF=0.95,0.05;AO=38,2;DP=40;FAO=38,2;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=20,1;FSAR=18,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0398676,-0.00901754;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=112.008,177.59;QD=60.0678;RBI=0.0400136,0.00980709;REFB=0,0;REVB=0.00341482,-0.00385527;RO=0;SAF=20,1;SAR=18,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.51048e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000369012,0.0563975;OID=.,.;OPOS=56309992,56309992;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:40:40:0:0:38,2:38,2:0.95,0.05:18,1:20,1:0:0:18,1:20,1:0:0
chr4	56318462	.	G	A	491.18	PASS	AF=0.921053;AO=35;DP=38;FAO=35;FDP=38;FR=.;FRO=3;FSAF=27;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0159448;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.2888;QD=51.7032;RBI=0.0267678;REFB=-0.0205912;REVB=-0.0215006;RO=3;SAF=27;SAR=8;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0866162;STB=0.546531;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=0.0062771;OID=.;OPOS=56318462;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:38:38:3:3:35:35:0.921053:8:27:1:2:8:27:1:2
chr4	56367796	.	T	G	356.42	PASS	AF=1;AO=21;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0568131;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.482;QD=54.8346;RBI=0.072059;REFB=0;REVB=0.0443257;RO=0;SAF=10;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00276279;OID=.;OPOS=56367796;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:21:26:1:11:10:0:0:15:11:0:0
chr4	56502307	.	G	T	62.46	PASS	AF=1;AO=5;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0674618;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.5901;QD=35.693;RBI=0.0681485;REFB=0;REVB=-0.00965006;RO=0;SAF=4;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00518183;OID=.;OPOS=56502307;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:5:7:1:1:4:0:0:3:4:0:0
chr4	56756531	.	T	C	216.68	PASS	AF=0.4;AO=26;DP=65;FAO=26;FDP=65;FR=.;FRO=39;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=-0.0288321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.772;QD=13.3343;RBI=0.0338796;REFB=-0.0115803;REVB=0.0177915;RO=39;SAF=9;SAR=17;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180221;STB=0.603346;STBP=0.206;TYPE=snp;VARB=0.018835;OID=.;OPOS=56756531;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:39:39:26:26:0.4:17:9:20:19:17:9:20:19
chr4	56771089	.	G	A	219.2	PASS	AF=0.412698;AO=26;DP=62;FAO=26;FDP=63;FR=.;FRO=37;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=0.0142737;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.247;QD=13.9176;RBI=0.0197676;REFB=-0.00183018;REVB=-0.0136755;RO=36;SAF=16;SAR=10;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147938;STB=0.592521;STBP=0.255;TYPE=snp;VARB=0.00263538;OID=.;OPOS=56771089;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:63:36:37:26:26:0.412698:10:16:17:19:10:16:17:20
chr4	56835309	.	T	C	801.28	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0154255;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.361;QD=57.2341;RBI=0.0276968;REFB=0;REVB=0.0230036;RO=0;SAF=29;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000164445;OID=.;OPOS=56835309;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:27:29:0:0:27:29:0:0
chr4	57154737	.	T	C	199.91	PASS	AF=0.362319;AO=25;DP=69;FAO=25;FDP=69;FR=.;FRO=44;FSAF=7;FSAR=18;FSRF=23;FSRR=21;FWDB=-0.000924852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.79;QD=11.5887;RBI=0.0111071;REFB=-0.0212785;REVB=0.0110685;RO=44;SAF=7;SAR=18;SRF=23;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.282041;STB=0.66407;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.0292539;OID=.;OPOS=57154737;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:44:44:25:25:0.362319:18:7:23:21:18:7:23:21
chr4	57154755	.	A	ACTCTTC	195.4	PASS	AF=0.380952;AO=23;DP=67;FAO=24;FDP=63;FR=.;FRO=39;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=-0.00661189;FXX=0.0307645;HRUN=1;LEN=6;MLLD=230.879;QD=12.4063;RBI=0.00690394;REFB=-0.0165156;REVB=0.00198678;RO=42;SAF=7;SAR=16;SRF=21;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.228589;STB=0.645443;STBP=0.087;TYPE=ins;VARB=0.0190247;OID=.;OPOS=57154756;OREF=-;OALT=CTCTTC;OMAPALT=ACTCTTC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.380952:23:67:24:63:39:7:17:20:19:99:42:7:16:21:21
chr4	57181632	.	G	C	2008.33	PASS	AF=1;AO=112;DP=130;FAO=130;FDP=130;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=48;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0204001;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.205;QD=61.7948;RBI=0.0290816;REFB=0;REVB=0.0207262;RO=0;SAF=43;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000320655;OID=.;OPOS=57181632;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:130:130:0:0:112:130:1:69:43:0:0:82:48:0:0
chr4	57194329	.	G	T	1439.24	PASS	AF=1;AO=87;DP=88;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00182511;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.022;QD=61.903;RBI=0.048148;REFB=0;REVB=-0.0481134;RO=0;SAF=34;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000824427;OID=.;OPOS=57194329;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:88:93:0:0:87:93:1:53:34:0:0:55:38:0:0
chr4	57196155	.	C	T	219.55	PASS	AF=0.44;AO=22;DP=50;FAO=22;FDP=50;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=-0.00177506;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.32;QD=17.5642;RBI=0.0308651;REFB=-0.005246;REVB=-0.030814;RO=28;SAF=12;SAR=10;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0616093;STB=0.535024;STBP=0.669;TYPE=snp;VARB=0.00614831;OID=.;OPOS=57196155;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:28:28:22:22:0.44:10:12:17:11:10:12:17:11
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chr4	57204960	.	A	G	163.65	PASS	AF=0.53125;AO=17;DP=32;FAO=17;FDP=32;FR=.;FRO=15;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=0.0386319;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.204;QD=20.4561;RBI=0.0400331;REFB=-0.0140993;REVB=0.0104991;RO=15;SAF=14;SAR=3;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.456992;STB=0.761168;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.0222779;OID=.;OPOS=57204960;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:15:15:17:17:0.53125:3:14:5:10:3:14:5:10
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chr4	57219592	.	G	A	708.74	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00132608;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.057;QD=62.9994;RBI=0.0119569;REFB=0;REVB=0.0118831;RO=0;SAF=26;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.25825e-05;OID=.;OPOS=57219592;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:45:0:0:44:45:1:18:26:0:0:19:26:0:0
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chr4	57333822	.	G	T	1286.15	PASS	AF=0.551402;AO=65;DP=215;FAO=118;FDP=214;FR=.,HEALED;FRO=66;FSAF=58;FSAR=60;FSRF=44;FSRR=22;FWDB=0.0225838;FXX=0.00465095;HRUN=7;LEN=1;MLLD=183.117;QD=24.0402;RBI=0.0539098;REFB=-0.0165194;REVB=0.0489514;RO=48;SAF=51;SAR=14;SRF=32;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124568;STB=0.562696;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.00918473;OID=.;OPOS=57333822;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:215:214:48:66:65:118:0.551402:14:51:32:16:60:58:44:22
chr4	57344779	.	A	G	775.38	PASS	AF=0.493827;AO=80;DP=161;FAO=80;FDP=162;FR=.;FRO=82;FSAF=34;FSAR=46;FSRF=27;FSRR=55;FWDB=-0.0104871;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.074;QD=19.1453;RBI=0.0109643;REFB=-0.00802663;REVB=-0.00319928;RO=81;SAF=34;SAR=46;SRF=27;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0870652;STB=0.550308;STBP=0.238;TYPE=snp;VARB=0.0114754;OID=.;OPOS=57344779;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:161:162:81:82:80:80:0.493827:46:34:27:54:46:34:27:55
chr4	57361553	.	A	G	557.78	PASS	AF=0.457364;AO=59;DP=129;FAO=59;FDP=129;FR=.;FRO=70;FSAF=15;FSAR=44;FSRF=32;FSRR=38;FWDB=-0.00728656;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=287.314;QD=17.2956;RBI=0.0122576;REFB=-0.00848566;REVB=-0.00985677;RO=70;SAF=15;SAR=44;SRF=32;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.226667;STB=0.627001;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.00842826;OID=.;OPOS=57361553;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:129:129:70:70:59:59:0.457364:44:15:32:38:44:15:32:38
chr4	57368807	.	C	T	632.26	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0154851;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=158.003;QD=61.6838;RBI=0.0159304;REFB=0;REVB=0.00374039;RO=0;SAF=22;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.20521e-05;OID=.;OPOS=57368807;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:19:22:0:0:19:22:0:0
chr4	57797253	.	G	A	53.13	PASS	AF=0.275862;AO=8;DP=29;FAO=8;FDP=29;FR=.;FRO=21;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.0366985;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.737;QD=7.3277;RBI=0.0368388;REFB=-0.021706;REVB=0.00321166;RO=21;SAF=4;SAR=4;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0273308;STB=0.517198;STBP=0.934;TYPE=snp;VARB=0.053885;OID=.;OPOS=57797253;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:29:29:21:21:8:8:0.275862:4:4:11:10:4:4:11:10
chr4	57876955	.	G	A	581.7	PASS	AF=0.522124;AO=59;DP=113;FAO=59;FDP=113;FR=.;FRO=54;FSAF=20;FSAR=39;FSRF=33;FSRR=21;FWDB=-0.00630418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.011;QD=20.591;RBI=0.0214518;REFB=-0.0103728;REVB=0.0205046;RO=54;SAF=20;SAR=39;SRF=33;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.240708;STB=0.632645;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.00886996;OID=.;OPOS=57876955;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:113:54:54:59:59:0.522124:39:20:33:21:39:20:33:21
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chr4	62598689	.	C	T	919.71	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0210894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.095;QD=58.394;RBI=0.0262062;REFB=0;REVB=-0.0155564;RO=0;SAF=30;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.53633e-05;OID=.;OPOS=62598689;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:33:30:0:0:33:30:0:0
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chr4	65473384	.	C	G	997.68	PASS	AF=0.539326;AO=95;DP=178;FAO=96;FDP=178;FR=.;FRO=82;FSAF=35;FSAR=61;FSRF=31;FSRR=51;FWDB=-0.0110637;FXX=0.0111105;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.67;QD=22.4198;RBI=0.0125613;REFB=-0.0114612;REVB=0.00594836;RO=82;SAF=35;SAR=60;SRF=31;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0087426;STB=0.506669;STBP=0.86;TYPE=snp;VARB=0.00957538;OID=.;OPOS=65473384;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:178:178:82:82:95:96:0.539326:60:35:31:51:61:35:31:51
chr4	66197804	.	C	T	242.15	PASS	AF=0.473684;AO=27;DP=57;FAO=27;FDP=57;FR=.;FRO=30;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=0.0062304;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=248.41;QD=16.993;RBI=0.00811168;REFB=-0.00725043;REVB=-0.00519437;RO=30;SAF=15;SAR=12;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0522405;STB=0.52939;STBP=0.63;TYPE=snp;VARB=0.00747667;OID=.;OPOS=66197804;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:30:30:27:27:0.473684:12:15:15:15:12:15:15:15
chr4	68374597	.	C	T	1153.57	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0184709;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.8024;QD=60.7141;RBI=0.0206002;REFB=0;REVB=-0.0091209;RO=0;SAF=34;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6391e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.2803e-05;OID=.;OPOS=68374597;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:42:34:0:0:42:34:0:0
chr4	68376708	.	T	C	801.42	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00882281;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.79;QD=57.2442;RBI=0.0200486;REFB=0;REVB=0.0180029;RO=0;SAF=30;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000100002;OID=.;OPOS=68376708;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:56:0:0:55:56:1:25:30:0:0:25:31:0:0
chr4	68380215	.	G	A	1323.38	PASS	AF=0.956522;AO=85;DP=90;FAO=88;FDP=92;FR=.;FRO=4;FSAF=32;FSAR=56;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0124058;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.0303;QD=57.5383;RBI=0.0574455;REFB=-0.0208909;REVB=0.0560899;RO=5;SAF=32;SAR=53;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00263063;STB=0.506382;STBP=0.584;TYPE=snp;VARB=0.0073858;OID=.;OPOS=68380215;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:90:92:5:4:85:88:0.956522:53:32:2:3:56:32:2:2
chr4	68384008	.	C	T	785.02	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00789712;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.904;QD=57.0924;RBI=0.00999093;REFB=0;REVB=0.00611999;RO=0;SAF=22;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.02553e-06;OID=.;OPOS=68384008;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:33:22:0:0:33:22:0:0
chr4	68409936	.	A	G	366.19	PASS	AF=0.433333;AO=38;DP=90;FAO=39;FDP=90;FR=.;FRO=51;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=23;FSRR=28;FWDB=0.0017268;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.024;QD=16.2752;RBI=0.00357911;REFB=-0.00493687;REVB=0.00313499;RO=49;SAF=19;SAR=19;SRF=22;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0510876;STB=0.534985;STBP=0.569;TYPE=snp;VARB=0.00517427;OID=.;OPOS=68409936;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:49:51:38:39:0.433333:19:19:22:27:19:20:23:28
chr4	68436883	.	T	C	337.52	PASS	AF=0.39;AO=26;DP=101;FAO=39;FDP=100;FR=.;FRO=61;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=25;FSRR=36;FWDB=0.0350528;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.6825;QD=13.5007;RBI=0.0376496;REFB=-0.00448363;REVB=0.0137402;RO=59;SAF=9;SAR=17;SRF=24;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0763753;STB=0.577942;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=0.00648073;OID=.;OPOS=68436883;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:100:59:61:26:39:0.39:17:9:24:35:18:21:25:36
chr4	68749618	.	G	A	1008.47	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0149473;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.028;QD=59.3216;RBI=0.0149876;REFB=0;REVB=-0.00109814;RO=0;SAF=40;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.29717e-05;OID=.;OPOS=68749618;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:68:0:0:67:68:1:27:40:0:0:28:40:0:0
chr4	68784774	.	T	C,G	1562.38	PASS	AF=0.962264,0.0377358;AO=101,5;DP=106;FAO=102,4;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=42,3;FSAR=60,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0219294,-0.024731;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=141.48,86.9989;QD=58.9576;RBI=0.0220097,0.0346009;REFB=0,0;REVB=-0.00187844,-0.0241992;RO=0;SAF=41,4;SAR=60,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=4.25502e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00365439,0.150385;OID=.,.;OPOS=68784774,68784774;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:4:106:106:0:0:101,5:102,4:0.962264,0.0377358:60,1:41,4:0:0:60,1:42,3:0:0
chr4	68812283	.	C	T	820.21	PASS	AF=0.983051;AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0226013;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=219.844;QD=55.6074;RBI=0.026518;REFB=-0.0139538;REVB=0.0138702;RO=1;SAF=33;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0140815;STB=0.50746;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.000112595;OID=.;OPOS=68812283;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:59:59:1:1:58:58:0.983051:25:33:1:0:25:33:1:0
chr4	68995529	.	C	T	654.27	PASS	AF=0.52;AO=65;DP=125;FAO=65;FDP=125;FR=.;FRO=60;FSAF=36;FSAR=29;FSRF=30;FSRR=30;FWDB=-0.0127009;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.6965;QD=20.9365;RBI=0.022853;REFB=-0.00497319;REVB=-0.0189986;RO=60;SAF=36;SAR=29;SRF=30;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.047268;STB=0.525995;STBP=0.579;TYPE=snp;VARB=0.00450058;OID=.;OPOS=68995529;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:125:125:60:60:65:65:0.52:29:36:30:30:29:36:30:30
chr4	69078113	.	T	C	747.1	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00455456;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.734;QD=63.583;RBI=0.0200319;REFB=0;REVB=0.0195073;RO=0;SAF=26;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.14747e-05;OID=.;OPOS=69078113;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:21:26:0:0:21:26:0:0
chr4	69094507	.	T	A	785.81	PASS	AF=1;AO=48;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0125832;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.746;QD=64.148;RBI=0.0241808;REFB=0;REVB=0.0206488;RO=1;SAF=24;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.019199;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.87717e-05;OID=.;OPOS=69094507;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:1:0:48:49:1:24:24:1:0:24:25:0:0
chr4	69094575	.	T	G	464.8	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.028614;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.41;QD=58.1002;RBI=0.0314124;REFB=0;REVB=-0.0129606;RO=0;SAF=17;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.4266e-05;OID=.;OPOS=69094575;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:15:17:0:0:15:17:0:0
chr4	69095197	.	T	C	755.25	PASS	AF=0.981818;AO=54;DP=55;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00779048;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.5691;QD=54.9276;RBI=0.0453474;REFB=-0.1176;REVB=0.0446732;RO=1;SAF=21;SAR=33;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0219106;STB=0.511624;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=0.00148344;OID=.;OPOS=69095197;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:55:55:1:1:54:54:0.981818:33:21:1:0:33:21:1:0
chr4	69203080	.	T	C	209.12	PASS	AF=0.468085;AO=20;DP=44;FAO=22;FDP=47;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=0.0106681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.133;QD=17.7976;RBI=0.025719;REFB=-0.0313448;REVB=-0.0234021;RO=23;SAF=11;SAR=9;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188537;STB=0.597614;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=0.0507525;OID=.;OPOS=69203080;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:47:23:25:20:22:0.468085:9:11:8:15:10:12:9:16
chr4	69203551	.	A	T	769.51	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0192758;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.584;QD=57.0007;RBI=0.0197326;REFB=0;REVB=0.00422131;RO=0;SAF=29;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.0515e-05;OID=.;OPOS=69203551;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:25:29:0:0:25:29:0:0
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chr4	70078385	.	C	T	234.86	PASS	AF=0.442623;AO=27;DP=61;FAO=27;FDP=61;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=-0.0201146;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.6444;QD=15.4005;RBI=0.0206344;REFB=-0.0297643;REVB=-0.00460248;RO=34;SAF=10;SAR=17;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18768;STB=0.606316;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.019899;OID=.;OPOS=70078385;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:34:34:27:27:0.442623:17:10:19:15:17:10:19:15
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chr4	70391454	.	G	A	245.64	PASS	AF=0.560976;AO=23;DP=41;FAO=23;FDP=41;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.0421531;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.833;QD=23.9644;RBI=0.0451059;REFB=0.0118484;REVB=0.0160518;RO=18;SAF=9;SAR=14;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173865;STB=0.59693;STBP=0.189;TYPE=snp;VARB=-0.00697442;OID=.;OPOS=70391454;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:18:18:23:23:0.560976:14:9:11:7:14:9:11:7
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chr4	70802285	.	A	C	151.44	PASS	AF=0.361702;AO=16;DP=46;FAO=17;FDP=47;FR=.;FRO=30;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=11;FWDB=-0.00480022;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.746;QD=12.8885;RBI=0.0106057;REFB=-0.0268673;REVB=-0.00945722;RO=30;SAF=7;SAR=9;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.214002;STB=0.638662;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=0.0632045;OID=.;OPOS=70802285;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:47:30:30:16:17:0.361702:9:7:19:11:10:7:19:11
chr4	70807771	.	C	T	279.26	PASS	AF=0.491803;AO=30;DP=61;FAO=30;FDP=61;FR=.;FRO=31;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=-0.000319727;FXX=0.0161264;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.112;QD=18.3119;RBI=0.0177758;REFB=-0.0408316;REVB=0.0177729;RO=31;SAF=20;SAR=10;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17406;STB=0.597634;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=0.0282661;OID=.;OPOS=70807771;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:31:31:30:30:0.491803:10:20:15:16:10:20:15:16
chr4	70824619	.	C	A	1805.34	PASS	AF=0.222453;AO=103;DP=447;FAO=107;FDP=481;FR=.,HEALED;FRO=273;FSAF=24;FSAR=83;FSRF=158;FSRR=115;FWDB=0.0389196;FXX=0.00619822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.672;QD=15.0132;RBI=0.0397101;REFB=-0.0295206;REVB=-0.00788365;RO=261;SAF=19;SAR=84;SRF=146;SRR=115;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.485165;STB=0.760651;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0578334;OID=.;OPOS=70824619;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:447:481:261:273:103:107:0.222453:84:19:146:115:83:24:158:115
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chr4	71062256	.	C	T	490.46	PASS	AF=0.398551;AO=53;DP=136;FAO=55;FDP=138;FR=.;FRO=83;FSAF=20;FSAR=35;FSRF=38;FSRR=45;FWDB=-0.0101756;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.048;QD=14.2161;RBI=0.0687971;REFB=-0.0249332;REVB=-0.0680404;RO=82;SAF=19;SAR=34;SRF=38;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11759;STB=0.559207;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.0453092;OID=.;OPOS=71062256;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:136:138:82:83:53:55:0.398551:34:19:38:44:35:20:38:45
chr4	71062426	.	C	T	285.67	PASS	AF=0.37931;AO=33;DP=87;FAO=33;FDP=87;FR=.;FRO=54;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=16;FSRR=38;FWDB=0.00867533;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.281;QD=13.1343;RBI=0.0105938;REFB=0.000618267;REVB=0.00608015;RO=53;SAF=13;SAR=20;SRF=16;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107163;STB=0.56518;STBP=0.407;TYPE=snp;VARB=-0.000766031;OID=.;OPOS=71062426;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:53:54:33:33:0.37931:20:13:16:37:20:13:16:38
chr4	71068489	.	T	C	145.34	PASS	AF=0.444444;AO=16;DP=36;FAO=16;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.00472426;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.105;QD=16.1493;RBI=0.00549504;REFB=0.00350609;REVB=-0.00280656;RO=20;SAF=7;SAR=9;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108559;STB=0.562422;STBP=0.536;TYPE=snp;VARB=-0.00561391;OID=.;OPOS=71068489;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:20:20:16:16:0.444444:9:7:11:9:9:7:11:9
chr4	71115060	.	G	A	116.16	PASS	AF=0.341463;AO=14;DP=41;FAO=14;FDP=41;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=0.017053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.0388;QD=11.3327;RBI=0.0308174;REFB=0.00906571;REVB=-0.0256692;RO=27;SAF=6;SAR=8;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180161;STB=0.606746;STBP=0.357;TYPE=snp;VARB=-0.0141504;OID=.;OPOS=71115060;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:27:27:14:14:0.341463:8:6:16:11:8:6:16:11
chr4	71115152	.	T	C	200.89	PASS	AF=0.512821;AO=20;DP=39;FAO=20;FDP=39;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=-0.0819833;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.2253;QD=20.604;RBI=0.0897365;REFB=0.00215766;REVB=0.0364881;RO=18;SAF=7;SAR=13;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.266477;STB=0.638104;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=-0.00318458;OID=.;OPOS=71115152;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:18:19:20:20:0.512821:13:7:12:6:13:7:12:7
chr4	71201388	.	C	T	483.35	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0176275;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.7126;QD=58.5875;RBI=0.028086;REFB=0;REVB=0.0218653;RO=0;SAF=22;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.7108e-05;OID=.;OPOS=71201388;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:11:22:0:0:11:22:0:0
chr4	71232388	.	G	A	1012.07	PASS	AF=0.985714;AO=69;DP=70;FAO=69;FDP=70;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0130863;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=301.716;QD=57.8327;RBI=0.0156573;REFB=-0.00862576;REVB=0.00859657;RO=0;SAF=37;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50769;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=1.449e-05;OID=.;OPOS=71232388;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:70:70:0:1:69:69:0.985714:32:37:0:0:32:37:0:1
chr4	71232430	.	T	C	715.38	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00780562;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.6243;QD=57.2307;RBI=0.0306245;REFB=0;REVB=-0.029613;RO=0;SAF=15;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.87758e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000224066;OID=.;OPOS=71232430;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:35:15:0:0:35:15:0:0
chr4	71275232	.	C	T	428.64	PASS	AF=0.460784;AO=45;DP=99;FAO=47;FDP=102;FR=.;FRO=55;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=29;FSRR=26;FWDB=0.00719447;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=290.34;QD=16.8095;RBI=0.00826611;REFB=-0.0233928;REVB=0.0040704;RO=54;SAF=22;SAR=23;SRF=29;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0469563;STB=0.502512;STBP=0.978;TYPE=snp;VARB=0.0263336;OID=.;OPOS=71275232;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:102:54:55:45:47:0.460784:23:22:29:25:22:25:29:26
chr4	71339723	.	G	A	118.88	PASS	AF=0.388889;AO=14;DP=36;FAO=14;FDP=36;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.0354294;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.3297;QD=13.2089;RBI=0.0800781;REFB=8.14702e-05;REVB=-0.0718141;RO=22;SAF=9;SAR=5;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0576655;STB=0.533849;STBP=0.728;TYPE=snp;VARB=-0.00209513;OID=.;OPOS=71339723;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:22:22:14:14:0.388889:5:9:13:9:5:9:13:9
chr4	71339728	.	C	T	118.83	PASS	AF=0.388889;AO=14;DP=36;FAO=14;FDP=36;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=-0.00359248;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.683;QD=13.2028;RBI=0.0556603;REFB=-0.00873243;REVB=-0.0555442;RO=22;SAF=9;SAR=5;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0576655;STB=0.533849;STBP=0.728;TYPE=snp;VARB=0.00846217;OID=.;OPOS=71339728;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:22:22:14:14:0.388889:5:9:13:9:5:9:13:9
chr4	71346701	.	C	G	80.18	PASS	AF=0.47619;AO=10;DP=21;FAO=10;FDP=21;FR=.;FRO=11;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.0108936;FXX=0.0454339;HRUN=7;LEN=1;MLLD=151.498;QD=15.273;RBI=0.0200389;REFB=-0.0531174;REVB=-0.0168193;RO=11;SAF=7;SAR=3;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.231477;STB=0.63608;STBP=0.27;TYPE=snp;VARB=0.0192687;OID=.;OPOS=71346701;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:79:21:21:11:11:10:10:0.47619:3:7:5:6:3:7:5:6
chr4	71384488	.	C	T	868.27	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00861907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.575;QD=57.8849;RBI=0.00957054;REFB=0;REVB=0.00416014;RO=0;SAF=25;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.89445e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.04789e-05;OID=.;OPOS=71384488;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:35:25:0:0:35:25:0:0
chr4	71384537	.	C	T	275.61	PASS	AF=0.491803;AO=30;DP=61;FAO=30;FDP=61;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=0.00218746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.165;QD=18.0731;RBI=0.0245571;REFB=0.00262835;REVB=-0.0244595;RO=29;SAF=12;SAR=18;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0438242;STB=0.510197;STBP=0.887;TYPE=snp;VARB=-0.00268463;OID=.;OPOS=71384537;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:29:31:30:30:0.491803:18:12:13:16:18:12:13:18
chr4	71467593	.	A	C	269.19	PASS	AF=0.461538;AO=30;DP=65;FAO=30;FDP=65;FR=.;FRO=35;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=21;FSRR=14;FWDB=0.0205322;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.451;QD=16.5652;RBI=0.0209569;REFB=0.00915886;REVB=0.0041977;RO=35;SAF=18;SAR=12;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00982297;OID=.;OPOS=71467593;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:35:35:30:30:0.461538:12:18:21:14:12:18:21:14
chr4	71503493	.	T	A	182.24	PASS	AF=0.289157;AO=24;DP=86;FAO=24;FDP=83;FR=.,HEALED;FRO=59;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=41;FWDB=-0.00108804;FXX=0.0348797;HRUN=5;LEN=1;MLLD=170.223;QD=8.78274;RBI=0.060483;REFB=-0.0121888;REVB=-0.0604732;RO=48;SAF=9;SAR=15;SRF=17;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0255453;STB=0.554412;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=0.0235219;OID=.;OPOS=71503493;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:83:48:59:24:24:0.289157:15:9:17:31:15:9:18:41
chr4	71509314	.	C	T	250.33	PASS	AF=0.48;AO=24;DP=50;FAO=24;FDP=50;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.0189087;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=180.135;QD=20.0266;RBI=0.0277381;REFB=-0.00389679;REVB=-0.0202943;RO=26;SAF=13;SAR=11;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0385395;STB=0.521721;STBP=0.737;TYPE=snp;VARB=0.00463003;OID=.;OPOS=71509314;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:26:26:24:24:0.48:11:13:13:13:11:13:13:13
chr4	71657772	.	G	A	1031.23	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0135026;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.638;QD=59.7813;RBI=0.0287379;REFB=0;REVB=0.0253682;RO=0;SAF=35;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000515595;OID=.;OPOS=71657772;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:34:35:0:0:34:35:0:0
chr4	71704965	.	C	T	310.12	PASS	AF=0.571429;AO=26;DP=47;FAO=28;FDP=49;FR=.;FRO=21;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=0.00990507;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.115;QD=25.3159;RBI=0.0926687;REFB=-0.0533907;REVB=0.0921378;RO=21;SAF=16;SAR=10;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0440506;STB=0.527029;STBP=0.671;TYPE=snp;VARB=0.0368517;OID=.;OPOS=71704965;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:49:21:21:26:28:0.571429:10:16:14:7:11:17:14:7
chr4	71849697	.	C	T	727.8	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0238976;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.319;QD=63.2867;RBI=0.023912;REFB=0;REVB=-0.000830944;RO=0;SAF=23;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.03653e-05;OID=.;OPOS=71849697;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:23:23:0:0:23:23:0:0
chr4	71849888	.	G	T	246.85	PASS	AF=0.490909;AO=26;DP=55;FAO=27;FDP=55;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=6.0014e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.36;QD=17.9529;RBI=0.0127192;REFB=-0.0364484;REVB=0.012719;RO=28;SAF=7;SAR=19;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.297324;STB=0.67238;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0284405;OID=.;OPOS=71849888;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:28:28:26:27:0.490909:19:7:16:12:20:7:16:12
chr4	72425863	.	C	T	165.18	PASS	AF=0.377358;AO=20;DP=53;FAO=20;FDP=53;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=0.00096464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.903;QD=12.4667;RBI=0.0222383;REFB=-0.0128461;REVB=-0.0222174;RO=32;SAF=11;SAR=9;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151883;STB=0.596167;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.025408;OID=.;OPOS=72425863;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:32:33:20:20:0.377358:9:11:13:19:9:11:13:20
chr4	72433642	.	TG	T,TT	278.96	PASS	AF=0.388235,0;AO=28,4;DP=86;FAO=33,0;FDP=85;FR=.;FRO=52;FSAF=18,0;FSAR=15,0;FSRF=26;FSRR=26;FWDB=0.004007,0.00288884;FXX=0.0116266;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=260.942,261.296;QD=13.1275;RBI=0.0149976,0.00953243;REFB=-0.00518534,-0.00633204;REVB=0.0144524,0.00908416;RO=51;SAF=15,2;SAR=13,2;SRF=27;SRR=24;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.00706406,-0.029928;STB=0.52788,0.5;STBP=0.715,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0082339,0;OID=.,.;OPOS=72433643,72433643;OREF=G,G;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.388235,0:28,4:86:33,0:85:52:18,0:15,0:26:26:99:51:15,2:13,2:27:24
chr4	72434406	.	G	C	474.74	PASS	AF=0.522727;AO=46;DP=88;FAO=46;FDP=88;FR=.;FRO=42;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=17;FSRR=25;FWDB=0.0342678;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.839;QD=21.579;RBI=0.0350309;REFB=-0.00401475;REVB=-0.00727196;RO=42;SAF=20;SAR=26;SRF=17;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0265049;STB=0.514625;STBP=0.794;TYPE=snp;VARB=0.0049048;OID=.;OPOS=72434406;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:42:42:46:46:0.522727:26:20:17:25:26:20:17:25
chr4	72436804	.	G	A	1903.85	PASS	AF=1;AO=123;DP=124;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.006021;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.061;QD=61.4144;RBI=0.00610757;REFB=0;REVB=0.0010247;RO=0;SAF=63;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.34281e-05;OID=.;OPOS=72436804;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:124:124:0:0:123:124:1:60:63:0:0:60:64:0:0
chr4	72618296	.	T	C	2186.96	PASS	AF=1;AO=139;DP=141;FAO=140;FDP=140;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112044;FXX=0.0070917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.687;QD=62.4845;RBI=0.0242466;REFB=-0.0786477;REVB=0.0215026;RO=1;SAF=59;SAR=80;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00799016;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.02481e-05;OID=.;OPOS=72618296;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:141:140:1:0:139:140:1:80:59:1:0:80:60:0:0
chr4	72649774	.	G	A	726.09	PASS	AF=0.981132;AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0439211;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.6131;QD=54.7989;RBI=0.0563912;REFB=-0.154986;REVB=0.0353681;RO=0;SAF=18;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.19096e-08;STB=0.507244;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.00362796;OID=.;OPOS=72649774;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:53:53:0:1:52:52:0.981132:34:18:0:0:34:18:0:1
chr4	73433122	.	GA	G	161.63	PASS	AF=0.451613;AO=27;DP=62;FAO=28;FDP=62;FR=.;FRO=34;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=-0.13621;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=23.5954;QD=10.428;RBI=0.147725;REFB=-0.0175399;REVB=-0.0571815;RO=34;SAF=13;SAR=14;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10489;STB=0.567613;STBP=0.363;TYPE=del;VARB=0.0118481;OID=.;OPOS=73433123;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.451613:27:62:28:62:34:13:15:20:14:99:34:13:14:20:14
chr4	73942678	.	C	T	275.92	PASS	AF=0.385542;AO=32;DP=83;FAO=32;FDP=83;FR=.;FRO=51;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=30;FSRR=21;FWDB=-0.00118749;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=229.714;QD=13.2973;RBI=0.00649356;REFB=-0.0107032;REVB=-0.00638406;RO=51;SAF=16;SAR=16;SRF=30;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0949934;STB=0.554183;STBP=0.455;TYPE=snp;VARB=0.0146183;OID=.;OPOS=73942678;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:51:51:32:32:0.385542:16:16:30:21:16:16:30:21
chr4	73991006	.	T	C	965.74	PASS	AF=1;AO=66;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0476229;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.542;QD=57.6563;RBI=0.0476352;REFB=0;REVB=-0.00108319;RO=0;SAF=23;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00040467;OID=.;OPOS=73991006;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:66:67:1:43:23:0:0:44:23:0:0
chr4	74285239	.	C	T	100.74	PASS	AF=0.48;AO=12;DP=25;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.0168938;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.665;QD=16.1177;RBI=0.0193711;REFB=-0.0203965;REVB=-0.00947829;RO=13;SAF=7;SAR=5;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0410576;STB=0.52377;STBP=0.826;TYPE=snp;VARB=0.0213205;OID=.;OPOS=74285239;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:25:13:13:12:12:0.48:5:7:7:6:5:7:7:6
chr4	74302071	.	T	A	166.05	PASS	AF=0.38;AO=19;DP=51;FAO=19;FDP=50;FR=.;FRO=31;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=-0.00439114;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=286.618;QD=13.2842;RBI=0.0101122;REFB=-0.00640172;REVB=-0.00910909;RO=32;SAF=11;SAR=8;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.018117;STB=0.501079;STBP=0.999;TYPE=snp;VARB=0.00856353;OID=.;OPOS=74302071;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:50:32:31:19:19:0.38:8:11:18:14:8:11:18:13
chr4	74302870	.	T	C	506.61	PASS	AF=0.494949;AO=49;DP=99;FAO=49;FDP=99;FR=.;FRO=50;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=26;FSRR=24;FWDB=-0.0437008;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.4036;QD=20.4692;RBI=0.0437881;REFB=-0.00465073;REVB=0.00276411;RO=50;SAF=26;SAR=23;SRF=26;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00970059;STB=0.505374;STBP=0.916;TYPE=snp;VARB=0.00411284;OID=.;OPOS=74302870;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:50:50:49:49:0.494949:23:26:26:24:23:26:26:24
chr4	74318330	.	A	G	523.78	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0471188;FXX=0.0277701;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.285;QD=59.8606;RBI=0.0482585;REFB=0;REVB=-0.010426;RO=0;SAF=17;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000167647;OID=.;OPOS=74318330;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:18:17:0:0:18:17:0:0
chr4	74347503	.	TA	T	464.96	PASS	AF=0.967213;AO=45;DP=61;FAO=59;FDP=61;FR=.;FRO=2;FSAF=29;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.093779;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=12.7252;QD=30.4892;RBI=0.0938;REFB=-0.000176698;REVB=0.00198285;RO=8;SAF=22;SAR=23;SRF=5;SRR=3;SSEN=0.328125;SSEP=0;SSSB=-0.0383416;STB=0.500278;STBP=0.877;TYPE=del;VARB=0.0144966;OID=.;OPOS=74347504;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:0.967213:45:61:59:61:2:29:30:1:1:4:8:22:23:5:3
chr4	74447510	.	A	C	1274.5	PASS	AF=0.888889;AO=88;DP=99;FAO=88;FDP=99;FR=.;FRO=11;FSAF=46;FSAR=42;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=-0.00880102;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=203.359;QD=51.4951;RBI=0.0102443;REFB=-0.0491331;REVB=0.00524288;RO=11;SAF=46;SAR=42;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0523708;STB=0.527759;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=0.00060969;OID=.;OPOS=74447510;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:99:99:11:11:88:88:0.888889:42:46:3:8:42:46:3:8
chr4	74714098	.	G	A	754.72	PASS	AF=0.537313;AO=72;DP=136;FAO=72;FDP=134;FR=.;FRO=62;FSAF=31;FSAR=41;FSRF=38;FSRR=24;FWDB=-0.0335123;FXX=0.0147048;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.607;QD=22.5289;RBI=0.0337242;REFB=-0.0123751;REVB=-0.00377399;RO=64;SAF=31;SAR=41;SRF=40;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165898;STB=0.583998;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.00903188;OID=.;OPOS=74714098;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:136:134:64:62:72:72:0.537313:41:31:40:24:41:31:38:24
chr4	74719617	.	C	T	209.16	PASS	AF=0.433333;AO=25;DP=59;FAO=26;FDP=60;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=0.00658384;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.4328;QD=13.9437;RBI=0.0154008;REFB=-0.0147121;REVB=-0.0139225;RO=34;SAF=11;SAR=14;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0610413;STB=0.521834;STBP=0.775;TYPE=snp;VARB=0.0239767;OID=.;OPOS=74719617;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:60:34:34:25:26:0.433333:14:11:17:17:14:12:17:17
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chr4	74904296	.	G	T	56.4	PASS	AF=0.421053;AO=8;DP=19;FAO=8;FDP=19;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.0140914;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.267;QD=11.8746;RBI=0.0141906;REFB=0.00189181;REVB=-0.00167494;RO=11;SAF=5;SAR=3;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166061;STB=0.599747;STBP=0.494;TYPE=snp;VARB=-0.00126532;OID=.;OPOS=74904296;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:19:19:11:11:8:8:0.421053:3:5:5:6:3:5:5:6
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chr4	75046465	.	C	G	704.58	PASS	AF=1;AO=48;DP=50;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0116714;FXX=0.039208;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.2819;QD=57.5165;RBI=0.0138213;REFB=0;REVB=0.00740317;RO=0;SAF=19;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000283621;OID=.;OPOS=75046465;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:49:0:0:48:49:1:29:19:0:0:29:20:0:0
chr4	75168785	.	A	G	384.51	PASS	AF=0.465116;AO=40;DP=86;FAO=40;FDP=86;FR=.;FRO=46;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=27;FSRR=19;FWDB=0.0408896;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.757;QD=17.884;RBI=0.0411888;REFB=-0.0193393;REVB=0.00495555;RO=46;SAF=16;SAR=24;SRF=27;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.178897;STB=0.59995;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=0.0198829;OID=.;OPOS=75168785;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:46:46:40:40:0.465116:24:16:27:19:24:16:27:19
chr4	75248434	.	A	G	401.09	PASS	AF=0.5125;AO=40;DP=81;FAO=41;FDP=80;FR=.;FRO=39;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=27;FSRR=12;FWDB=0.00246739;FXX=0.0123442;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.401;QD=20.0547;RBI=0.0040624;REFB=-0.00743214;REVB=-0.00322725;RO=38;SAF=22;SAR=18;SRF=26;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121088;STB=0.577149;STBP=0.196;TYPE=snp;VARB=0.00937965;OID=.;OPOS=75248434;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:80:38:39:40:41:0.5125:18:22:26:12:19:22:27:12
chr4	75254282	.	G	A	324.3	PASS	AF=0.366972;AO=40;DP=109;FAO=40;FDP=109;FR=.;FRO=69;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=40;FSRR=29;FWDB=-0.0080034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.384;QD=11.9009;RBI=0.00890815;REFB=-0.00704153;REVB=-0.00391163;RO=68;SAF=17;SAR=23;SRF=40;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.178598;STB=0.597218;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=0.0166161;OID=.;OPOS=75254282;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:109:68:69:40:40:0.366972:23:17:40:28:23:17:40:29
chr4	75675841	.	A	T	205.17	PASS	AF=0.442308;AO=23;DP=52;FAO=23;FDP=52;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.00800326;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=283.337;QD=15.7819;RBI=0.0124656;REFB=-0.016855;REVB=0.00955714;RO=29;SAF=13;SAR=10;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0812293;STB=0.546178;STBP=0.558;TYPE=snp;VARB=0.0181201;OID=.;OPOS=75675841;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:29:29:23:23:0.442308:10:13:14:15:10:13:14:15
chr4	76407217	.	A	ACT,T	1692.59	PASS	AF=0.878261,0.121739;AO=97,14;DP=116;FAO=101,14;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=59,10;FSAR=42,4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.024663,0.0394618;FXX=0.00861995;HRUN=0,1;LEN=2,1;MLLD=251.004,92.3651;QD=58.8728;RBI=0.0326747,0.0641661;REFB=0,0;REVB=-0.021433,0.050597;RO=0;SAF=56,10;SAR=41,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.55487e-08,3.63386e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=-0.000118383,-0.00612456;OID=.,.;OPOS=76407218,76407217;OREF=-,A;OALT=CT,T;OMAPALT=ACT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:61:116:115:0:0:97,14:101,14:0.878261,0.121739:41,4:56,10:0:0:42,4:59,10:0:0
chr4	76452558	.	T	A	625.86	PASS	AF=0.570093;AO=61;DP=107;FAO=61;FDP=107;FR=.;FRO=46;FSAF=24;FSAR=37;FSRF=19;FSRR=27;FWDB=0.0189326;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.574;QD=23.3965;RBI=0.0235103;REFB=-0.0130884;REVB=-0.0139387;RO=46;SAF=24;SAR=37;SRF=19;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0160867;STB=0.508792;STBP=0.849;TYPE=snp;VARB=0.00845037;OID=.;OPOS=76452558;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:107:46:46:61:61:0.570093:37:24:19:27:37:24:19:27
chr4	76489345	.	C	T	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0185853;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.5878;QD=51.9165;RBI=0.0224596;REFB=0;REVB=-0.0126103;RO=0;SAF=16;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.78933e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.96767e-05;OID=.;OPOS=76489345;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:5:16:0:0:5:16:0:0
chr4	76720885	.	T	C	786.7	PASS	AF=0.982456;AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00911257;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=175.515;QD=55.2071;RBI=0.00991916;REFB=0.00110044;REVB=-0.00391801;RO=0;SAF=17;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.87981e-08;STB=0.506327;STBP=0.607;TYPE=snp;VARB=-1.91214e-05;OID=.;OPOS=76720885;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:57:57:0:1:56:56:0.982456:39:17:0:0:39:17:0:1
chr4	76722353	.	G	A	162.37	PASS	AF=0.882353;AO=15;DP=17;FAO=15;FDP=17;FR=.;FRO=2;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00113202;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.5672;QD=38.2045;RBI=0.0834842;REFB=-0.0505461;REVB=-0.0834766;RO=2;SAF=6;SAR=9;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0221381;STB=0.512179;STBP=0.873;TYPE=snp;VARB=0.00594301;OID=.;OPOS=76722353;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:17:17:2:2:15:15:0.882353:9:6:1:1:9:6:1:1
chr4	76787673	.	T	C	786.82	PASS	AF=0.982456;AO=55;DP=56;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0363874;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.6181;QD=55.2157;RBI=0.0743141;REFB=-0.0806049;REVB=0.0647961;RO=1;SAF=24;SAR=31;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0149647;STB=0.50769;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.00224135;OID=.;OPOS=76787673;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:56:57:1:1:55:56:0.982456:31:24:0:1:32:24:0:1
chr4	76793228	.	A	G	1025.66	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00941957;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.46;QD=59.4584;RBI=0.114765;REFB=0;REVB=-0.114378;RO=0;SAF=36;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.36169e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000137049;OID=.;OPOS=76793228;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:33:36:0:0:33:36:0:0
chr4	76794345	.	T	G	1542.2	PASS	AF=0.989899;AO=96;DP=97;FAO=98;FDP=99;FR=.;FRO=1;FSAF=50;FSAR=48;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0131069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.089;QD=62.3112;RBI=0.0185376;REFB=-0.0273672;REVB=0.0131092;RO=0;SAF=49;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.53995e-08;STB=0.504949;STBP=0.482;TYPE=snp;VARB=0.000458498;OID=.;OPOS=76794345;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:97:99:0:1:96:98:0.989899:47:49:0:0:48:50:1:0
chr4	76805902	.	C	T	997.42	PASS	AF=1;AO=66;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0443476;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.711;QD=58.6719;RBI=0.0461381;REFB=0;REVB=-0.0127286;RO=0;SAF=30;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000225298;OID=.;OPOS=76805902;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:66:68:1:36:30:0:0:36:32:0:0
chr4	76807218	.	C	G	1070.66	PASS	AF=0.865169;AO=77;DP=90;FAO=77;FDP=89;FR=.;FRO=12;FSAF=18;FSAR=59;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=-0.0162181;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.7893;QD=48.1196;RBI=0.0230117;REFB=0.0201366;REVB=-0.0163252;RO=12;SAF=18;SAR=59;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0623472;STB=0.533193;STBP=0.168;TYPE=snp;VARB=-0.0074115;OID=.;OPOS=76807218;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:58:90:89:12:12:77:77:0.865169:59:18:5:7:59:18:5:7
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chr4	76807252	.	C	A	916.41	PASS	AF=0.795455;AO=70;DP=88;FAO=70;FDP=88;FR=.;FRO=18;FSAF=16;FSAR=54;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.0296385;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.0494;QD=41.655;RBI=0.0301679;REFB=-0.0121361;REVB=0.00562657;RO=18;SAF=16;SAR=54;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0826034;STB=0.544246;STBP=0.17;TYPE=snp;VARB=0.00333375;OID=.;OPOS=76807252;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:18:18:70:70:0.795455:54:16:7:11:54:16:7:11
chr4	76807270	.	C	T	898.37	PASS	AF=0.771739;AO=68;DP=91;FAO=71;FDP=92;FR=.;FRO=21;FSAF=16;FSAR=55;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=-0.000434477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.606;QD=39.0594;RBI=0.0292339;REFB=-0.0351464;REVB=0.0292307;RO=20;SAF=15;SAR=53;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103503;STB=0.548159;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=0.0124736;OID=.;OPOS=76807270;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:92:20:21:68:71:0.771739:53:15:8:12:55:16:8:13
chr4	76807288	.	A	G	919.03	PASS	AF=0.763441;AO=70;DP=92;FAO=71;FDP=93;FR=.;FRO=22;FSAF=16;FSAR=55;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=0.0112449;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=238.001;QD=39.5281;RBI=0.0243001;REFB=-0.0172363;REVB=0.0215418;RO=22;SAF=15;SAR=55;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0930333;STB=0.544541;STBP=0.183;TYPE=snp;VARB=0.00491258;OID=.;OPOS=76807288;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:93:22:22:70:71:0.763441:55:15:8:14:55:16:8:14
chr4	76807302	.	A	G	874.7	PASS	AF=0.736842;AO=70;DP=95;FAO=70;FDP=95;FR=.;FRO=25;FSAF=16;FSAR=54;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=0.000800658;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.8649;QD=36.8294;RBI=0.0541842;REFB=0.0163961;REVB=-0.0541783;RO=25;SAF=16;SAR=54;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134827;STB=0.572641;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=-0.0189738;OID=.;OPOS=76807302;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:25:25:70:70:0.736842:54:16:11:14:54:16:11:14
chr4	76807304	.	A	G	890.87	PASS	AF=0.736842;AO=70;DP=95;FAO=70;FDP=95;FR=.;FRO=25;FSAF=16;FSAR=54;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=-0.0100646;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=136.762;QD=37.5104;RBI=0.0105759;REFB=0.0258368;REVB=-0.00324842;RO=25;SAF=16;SAR=54;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134827;STB=0.572641;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=-0.00548933;OID=.;OPOS=76807304;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:25:25:70:70:0.736842:54:16:11:14:54:16:11:14
chr4	76807313	.	C	A	864.74	PASS	AF=0.71134;AO=69;DP=97;FAO=69;FDP=97;FR=.;FRO=28;FSAF=16;FSAR=53;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=-0.0228486;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=157.908;QD=35.6592;RBI=0.0230122;REFB=-0.0375908;REVB=-0.00273946;RO=28;SAF=16;SAR=53;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158251;STB=0.585497;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.00485123;OID=.;OPOS=76807313;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:28:28:69:69:0.71134:53:16:13:15:53:16:13:15
chr4	76807325	.	T	A	486.03	PASS	AF=0.567901;AO=46;DP=81;FAO=46;FDP=81;FR=.;FRO=35;FSAF=11;FSAR=35;FSRF=21;FSRR=14;FWDB=-0.0110847;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=309.041;QD=24.0013;RBI=0.012788;REFB=-0.0133133;REVB=0.00637686;RO=35;SAF=11;SAR=35;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.316994;STB=0.675024;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.00741575;OID=.;OPOS=76807325;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:35:35:46:46:0.567901:35:11:21:14:35:11:21:14
chr4	76807334	.	T	C	431.91	PASS	AF=0.56;AO=33;DP=74;FAO=42;FDP=75;FR=.;FRO=33;FSAF=13;FSAR=29;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=-0.00683398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.4;QD=23.0354;RBI=0.0147363;REFB=-0.00149927;REVB=0.0130559;RO=31;SAF=12;SAR=21;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191984;STB=0.624014;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.00317776;OID=.;OPOS=76807334;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:75:31:33:33:42:0.56:21:12:18:13:29:13:19:14
chr4	76809386	.	A	G	1525.65	PASS	AF=1;AO=102;DP=102;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0267506;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.3509;QD=59.8296;RBI=0.0318794;REFB=0;REVB=-0.0173407;RO=0;SAF=46;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.43573e-05;OID=.;OPOS=76809386;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:102:102:0:0:102:102:1:56:46:0:0:56:46:0:0
chr4	76836137	.	A	G	955.19	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0600892;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.3165;QD=58.7807;RBI=0.0638709;REFB=0;REVB=-0.0216514;RO=0;SAF=38;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.04073e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000809406;OID=.;OPOS=76836137;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:27:38:0:0:27:38:0:0
chr4	76857309	.	C	T	914.55	PASS	AF=1;AO=63;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0306796;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.2871;QD=57.1591;RBI=0.0316303;REFB=0;REVB=0.00769637;RO=1;SAF=37;SAR=26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.017815;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000699827;OID=.;OPOS=76857309;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:1:0:63:64:1:26:37:0:1:27:37:0:0
chr4	76857388	.	C	T	465.13	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0185684;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.951;QD=58.1408;RBI=0.05814;REFB=0;REVB=-0.0550952;RO=0;SAF=13;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000213705;OID=.;OPOS=76857388;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:19:13:0:0:19:13:0:0
chr4	76877172	.	G	A	31.1	PASS	AF=0.0898876;AO=8;DP=88;FAO=8;FDP=89;FR=.;FRO=81;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=37;FSRR=44;FWDB=-0.00892191;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.5988;QD=1.39786;RBI=0.0199488;REFB=0.000243198;REVB=-0.0178424;RO=80;SAF=3;SAR=5;SRF=37;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101105;STB=0.576175;STBP=0.689;TYPE=snp;VARB=-0.00335389;OID=.;OPOS=76877172;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:31:88:89:80:81:8:8:0.0898876:5:3:37:43:5:3:37:44
chr4	76878688	.	G	A	756.82	PASS	AF=0.979592;AO=47;DP=50;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0283298;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.966;QD=61.7814;RBI=0.0341264;REFB=-0.121443;REVB=0.0190272;RO=1;SAF=27;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0171015;STB=0.509087;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.00135623;OID=.;OPOS=76878688;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:50:49:1:1:47:48:0.979592:20:27:1:0:21:27:1:0
chr4	76942943	.	C	G	1101.69	PASS	AF=1;AO=72;DP=74;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0122342;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.7867;QD=60.3664;RBI=0.0295842;REFB=0;REVB=-0.026936;RO=0;SAF=34;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000336822;OID=.;OPOS=76942943;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:73:0:0:72:73:1:38:34:0:0:38:35:0:0
chr4	76943137	.	G	C	1441.0	PASS	AF=1;AO=91;DP=93;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0858094;FXX=0.0215031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.9374;QD=63.3406;RBI=0.090219;REFB=0;REVB=0.0278605;RO=0;SAF=40;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000756025;OID=.;OPOS=76943137;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:93:91:0:0:91:91:1:51:40:0:0:51:40:0:0
chr4	76955914	.	T	C	609.64	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0303151;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.775;QD=59.4774;RBI=0.0355363;REFB=0;REVB=0.0185424;RO=0;SAF=24;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.76123e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000288367;OID=.;OPOS=76955914;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:41:0:0:38:41:1:14:24:0:0:14:27:0:0
chr4	76956188	.	T	C	1000.23	PASS	AF=0.971831;AO=69;DP=71;FAO=69;FDP=71;FR=.;FRO=2;FSAF=39;FSAR=30;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00368412;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=288.903;QD=56.3512;RBI=0.0081168;REFB=-0.0723682;REVB=0.00723255;RO=1;SAF=39;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119679;STB=0.512496;STBP=0.24;TYPE=snp;VARB=0.0016113;OID=.;OPOS=76956188;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:71:71:1:2:69:69:0.971831:30:39:1:0:30:39:2:0
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chr4	77033590	.	C	T	505.64	PASS	AF=0.527473;AO=48;DP=92;FAO=48;FDP=91;FR=.;FRO=43;FSAF=21;FSAR=27;FSRF=16;FSRR=27;FWDB=-0.024032;FXX=0.0215031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.98;QD=22.226;RBI=0.024278;REFB=-0.00938425;REVB=0.00344747;RO=42;SAF=21;SAR=27;SRF=17;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0282872;STB=0.531633;STBP=0.55;TYPE=snp;VARB=0.00673536;OID=.;OPOS=77033590;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:91:42:43:48:48:0.527473:27:21:17:25:27:21:16:27
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chr4	77065580	.	T	C	263.53	PASS	AF=0.483333;AO=29;DP=60;FAO=29;FDP=60;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=-0.00333933;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.683;QD=17.5685;RBI=0.00337035;REFB=0.0031651;REVB=-0.000456227;RO=31;SAF=12;SAR=17;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0254873;STB=0.514276;STBP=0.86;TYPE=snp;VARB=-0.00420233;OID=.;OPOS=77065580;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:31:31:29:29:0.483333:17:12:12:19:17:12:12:19
chr4	77081814	.	G	C	308.36	PASS	AF=0.613636;AO=27;DP=44;FAO=27;FDP=44;FR=.;FRO=17;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=-0.00892164;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.65;QD=28.0323;RBI=0.00892768;REFB=-0.00285564;REVB=0.000328441;RO=17;SAF=10;SAR=17;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0307799;STB=0.516982;STBP=0.779;TYPE=snp;VARB=0.00200725;OID=.;OPOS=77081814;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:17:17:27:27:0.613636:17:10:7:10:17:10:7:10
chr4	77192868	.	G	A	263.68	PASS	AF=0.6;AO=24;DP=40;FAO=24;FDP=40;FR=.;FRO=16;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.0330491;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.6853;QD=26.3683;RBI=0.0337635;REFB=-0.0227054;REVB=-0.00690889;RO=16;SAF=11;SAR=13;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0151615;STB=0.508396;STBP=0.919;TYPE=snp;VARB=0.0160647;OID=.;OPOS=77192868;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:16:16:24:24:0.6:13:11:7:9:13:11:7:9
chr4	77201487	.	C	T	75.55	PASS	AF=0.384615;AO=10;DP=26;FAO=10;FDP=26;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-3.57046e-06;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.196;QD=11.6238;RBI=0.0372445;REFB=-0.00660557;REVB=-0.0372445;RO=15;SAF=5;SAR=5;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169053;STB=0.576773;STBP=0.573;TYPE=snp;VARB=0.0121146;OID=.;OPOS=77201487;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:26:26:15:16:10:10:0.384615:5:5:5:10:5:5:6:10
chr4	77631425	.	T	A	184.43	PASS	AF=0.475;AO=18;DP=39;FAO=19;FDP=40;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=-0.0392674;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=228.072;QD=18.4431;RBI=0.0397136;REFB=0.00428483;REVB=-0.00593637;RO=21;SAF=6;SAR=12;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.510563;STBP=0.878;TYPE=snp;VARB=-0.00467927;OID=.;OPOS=77631425;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:40:21:21:18:19:0.475:12:6:7:14:13:6:7:14
chr4	77637502	.	A	C	464.37	PASS	AF=0.535714;AO=44;DP=83;FAO=45;FDP=84;FR=.;FRO=39;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=0.00312053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.099;QD=22.113;RBI=0.00329094;REFB=-0.00742102;REVB=0.00104527;RO=39;SAF=20;SAR=24;SRF=18;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00599764;STB=0.502391;STBP=0.972;TYPE=snp;VARB=0.00755699;OID=.;OPOS=77637502;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:84:39:39:44:45:0.535714:24:20:18:21:24:21:18:21
chr4	77660162	.	G	C	237.8	PASS	AF=0.457627;AO=27;DP=59;FAO=27;FDP=59;FR=.;FRO=32;FSAF=23;FSAR=4;FSRF=21;FSRR=11;FWDB=-0.0593312;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.7695;QD=16.1221;RBI=0.0601629;REFB=-0.0535083;REVB=0.00996919;RO=32;SAF=23;SAR=4;SRF=21;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.282166;STB=0.662049;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=0.0786722;OID=.;OPOS=77660162;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:32:32:27:27:0.457627:4:23:21:11:4:23:21:11
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chr4	77817874	.	G	T	247.01	PASS	AF=0.509804;AO=26;DP=52;FAO=26;FDP=51;FR=.;FRO=25;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-2.58159e-05;FXX=0.0192271;HRUN=3;LEN=1;MLLD=270.735;QD=19.3731;RBI=0.0288555;REFB=-0.000342903;REVB=-0.0288554;RO=25;SAF=14;SAR=12;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.016234;STB=0.509084;STBP=0.929;TYPE=snp;VARB=0.000238715;OID=.;OPOS=77817874;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:51:25:25:26:26:0.509804:12:14:13:12:12:14:13:12
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chr4	78987157	.	A	G	1385.94	PASS	AF=1;AO=86;DP=87;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0199709;FXX=0.0222198;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.155;QD=62.9973;RBI=0.0338029;REFB=0;REVB=0.0272727;RO=0;SAF=35;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000280562;OID=.;OPOS=78987157;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:88:0:0:86:88:1:51:35:0:0:53:35:0:0
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chr4	79186171	.	G	A	838.73	PASS	AF=1;AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00310492;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.28;QD=57.8432;RBI=0.00938608;REFB=0;REVB=-0.00885764;RO=0;SAF=25;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000305864;OID=.;OPOS=79186171;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:58:0:0:58:58:1:33:25:0:0:33:25:0:0
chr4	79205699	.	T	A	382.8	PASS	AF=0.414141;AO=41;DP=99;FAO=41;FDP=99;FR=.;FRO=58;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=24;FSRR=34;FWDB=-0.00669555;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=234.216;QD=15.4668;RBI=0.0213659;REFB=-0.0192297;REVB=-0.0202897;RO=57;SAF=20;SAR=21;SRF=23;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0872777;STB=0.543457;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=0.0259048;OID=.;OPOS=79205699;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:57:58:41:41:0.414141:21:20:23:34:21:20:24:34
chr4	79238649	.	T	C	396.8	PASS	AF=0.40708;AO=45;DP=113;FAO=46;FDP=113;FR=.;FRO=67;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=27;FSRR=40;FWDB=-0.00546241;FXX=0.00877116;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.624;QD=14.0458;RBI=0.00548011;REFB=0.00384926;REVB=0.000440074;RO=67;SAF=23;SAR=22;SRF=27;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114272;STB=0.557497;STBP=0.331;TYPE=snp;VARB=-0.00582959;OID=.;OPOS=79238649;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:113:67:67:45:46:0.40708:22:23:27:40:23:23:27:40
chr4	79240063	.	A	G	439.83	PASS	AF=0.591549;AO=41;DP=70;FAO=42;FDP=71;FR=.;FRO=29;FSAF=27;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.0153258;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.6934;QD=24.779;RBI=0.0311663;REFB=-0.0202413;REVB=-0.0271378;RO=29;SAF=26;SAR=15;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118678;STB=0.568388;STBP=0.173;TYPE=snp;VARB=0.0131315;OID=.;OPOS=79240063;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:71:29:29:41:42:0.591549:15:26:14:15:15:27:14:15
chr4	79284694	.	C	T	297.86	PASS	AF=0.44;AO=33;DP=75;FAO=33;FDP=75;FR=.;FRO=42;FSAF=8;FSAR=25;FSRF=19;FSRR=23;FWDB=-0.0229601;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.922;QD=15.886;RBI=0.0264616;REFB=-0.0222482;REVB=0.0131548;RO=42;SAF=8;SAR=25;SRF=19;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.241553;STB=0.637304;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.0185402;OID=.;OPOS=79284694;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:42:42:33:33:0.44:25:8:19:23:25:8:19:23
chr4	79300993	.	G	A	464.17	PASS	AF=0.451327;AO=51;DP=112;FAO=51;FDP=113;FR=.;FRO=62;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=37;FSRR=25;FWDB=-0.00283668;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.265;QD=16.4308;RBI=0.0122847;REFB=-0.000261082;REVB=0.0119527;RO=50;SAF=25;SAR=26;SRF=37;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.223847;STB=0.558342;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=0.000363884;OID=.;OPOS=79300993;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:113:50:62:51:51:0.451327:26:25:37:13:26:25:37:25
chr4	79372930	.	C	T	785.9	PASS	AF=1;AO=54;DP=55;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00929562;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.727;QD=56.1354;RBI=0.0231589;REFB=0;REVB=-0.0212114;RO=1;SAF=32;SAR=22;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0145012;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.67594e-06;OID=.;OPOS=79372930;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:56:1:0:54:56:1:22:32:1:0:22:34:0:0
chr4	79385719	.	G	A	577.89	PASS	AF=0.442029;AO=61;DP=139;FAO=61;FDP=138;FR=.;FRO=77;FSAF=29;FSAR=32;FSRF=24;FSRR=53;FWDB=-0.0110892;FXX=0.00719373;HRUN=2;LEN=1;MLLD=249.332;QD=16.7504;RBI=0.0121346;REFB=-0.0147186;REVB=-0.00492722;RO=77;SAF=29;SAR=32;SRF=24;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166313;STB=0.592377;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=0.0185541;OID=.;OPOS=79385719;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:139:138:77:77:61:61:0.442029:32:29:24:53:32:29:24:53
chr4	79387442	.	C	T	536.42	PASS	AF=0.555556;AO=50;DP=90;FAO=50;FDP=90;FR=.;FRO=40;FSAF=20;FSAR=30;FSRF=29;FSRR=11;FWDB=0.0395917;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.043;QD=23.8408;RBI=0.0410264;REFB=-0.0140054;REVB=0.0107549;RO=40;SAF=20;SAR=30;SRF=29;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.259088;STB=0.641866;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.00882627;OID=.;OPOS=79387442;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:40:40:50:50:0.555556:30:20:29:11:30:20:29:11
chr4	79387464	.	A	G	1284.37	PASS	AF=1;AO=81;DP=82;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.022326;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.9354;QD=59.0514;RBI=0.0298631;REFB=-0.0569318;REVB=-0.0198333;RO=1;SAF=37;SAR=44;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0126256;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00410595;OID=.;OPOS=79387464;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:82:87:1:0:81:87:1:44:37:1:0:44:43:0:0
chr4	79400868	.	C	T	689.38	PASS	AF=1;AO=43;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0243961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.217;QD=62.6711;RBI=0.0287335;REFB=0;REVB=0.0151803;RO=0;SAF=23;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000149644;OID=.;OPOS=79400868;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:43:44:1:20:23:0:0:20:24:0:0
chr4	79455714	.	C	G	193.75	PASS	AF=0.328947;AO=25;DP=76;FAO=25;FDP=76;FR=.;FRO=51;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=21;FSRR=30;FWDB=-0.0188482;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=105.429;QD=10.1974;RBI=0.0189262;REFB=-0.00499027;REVB=0.00171582;RO=50;SAF=15;SAR=10;SRF=21;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.204017;STB=0.624901;STBP=0.136;TYPE=snp;VARB=0.020579;OID=.;OPOS=79455714;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:50:51:25:25:0.328947:10:15:21:29:10:15:21:30
chr4	79455733	.	C	T	251.59	PASS	AF=0.37037;AO=30;DP=80;FAO=30;FDP=81;FR=.;FRO=51;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=29;FWDB=-0.0301929;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.0689;QD=12.4241;RBI=0.0310925;REFB=-0.0226559;REVB=0.00742527;RO=50;SAF=18;SAR=12;SRF=22;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174193;STB=0.605841;STBP=0.131;TYPE=snp;VARB=0.0347674;OID=.;OPOS=79455733;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:81:50:51:30:30:0.37037:12:18:22:28:12:18:22:29
chr4	79458332	.	TA	T	31.96	PASS	AF=0.236364;AO=13;DP=58;FAO=13;FDP=55;FR=.;FRO=42;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=15;FSRR=27;FWDB=0.014097;FXX=0.0517152;HRUN=4;LEN=1;MLLD=14.037;QD=2.32428;RBI=0.023433;REFB=-0.0641452;REVB=-0.0187184;RO=40;SAF=12;SAR=1;SRF=14;SRR=26;SSEN=0.409091;SSEP=0;SSSB=0.68508;STB=0.859307;STBP=0.004;TYPE=del;VARB=0.105503;OID=.;OPOS=79458333;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.236364:13:58:13:55:42:11:2:15:27:31:40:12:1:14:26
chr4	79531202	.	C	T	266.56	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.079571;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.932;QD=50.7741;RBI=0.0827196;REFB=0;REVB=0.0226052;RO=0;SAF=8;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.41338e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000316937;OID=.;OPOS=79531202;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:21:0:0:19:21:1:11:8:0:0:12:9:0:0
chr4	79786856	.	G	A	288.87	PASS	AF=0.450704;AO=32;DP=71;FAO=32;FDP=71;FR=.;FRO=39;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=-0.000999126;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.408;QD=16.2746;RBI=0.00543627;REFB=-0.00186676;REVB=0.00534367;RO=39;SAF=11;SAR=21;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195529;STB=0.610284;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=0.00150468;OID=.;OPOS=79786856;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:39:39:32:32:0.450704:21:11:21:18:21:11:21:18
chr4	79800080	.	G	A	326.11	PASS	AF=0.466667;AO=34;DP=74;FAO=35;FDP=75;FR=.;FRO=40;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=23;FSRR=17;FWDB=0.00605374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.645;QD=17.3923;RBI=0.00608807;REFB=-0.00966197;REVB=-0.000645618;RO=40;SAF=15;SAR=19;SRF=23;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128514;STB=0.562607;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.0119627;OID=.;OPOS=79800080;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:75:40:40:34:35:0.466667:19:15:23:17:19:16:23:17
chr4	79832509	.	A	C	417.79	PASS	AF=0.435185;AO=46;DP=109;FAO=47;FDP=108;FR=.;FRO=61;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=39;FSRR=22;FWDB=0.0180116;FXX=0.0181802;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.918;QD=15.4739;RBI=0.0207037;REFB=0.000322001;REVB=-0.0102091;RO=61;SAF=21;SAR=25;SRF=39;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184122;STB=0.595896;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=-0.000403456;OID=.;OPOS=79832509;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:108:61:61:46:47:0.435185:25:21:39:22:25:22:39:22
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chr4	80329343	.	T	C	212.4	PASS	AF=0.423729;AO=25;DP=59;FAO=25;FDP=59;FR=.;FRO=34;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=-0.0339781;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=126.274;QD=14.4001;RBI=0.0346902;REFB=-0.00949537;REVB=-0.00699262;RO=32;SAF=13;SAR=12;SRF=20;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104705;STB=0.539478;STBP=0.621;TYPE=snp;VARB=0.0121357;OID=.;OPOS=80329343;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:32:34:25:25:0.423729:12:13:20:12:12:13:20:14
chr4	80827062	.	T	C	1346.75	PASS	AF=0.95;AO=95;DP=101;FAO=95;FDP=100;FR=.;FRO=5;FSAF=51;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.00902717;FXX=0.00990001;HRUN=5;LEN=1;MLLD=276.995;QD=53.8701;RBI=0.00902718;REFB=-0.196983;REVB=-1.32858e-05;RO=5;SAF=51;SAR=44;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0508905;STB=0.526876;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.00101333;OID=.;OPOS=80827062;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:101:100:5:5:95:95:0.95:44:51:0:5:44:51:0:5
chr4	80828555	.	G	A	460.52	PASS	AF=0.571429;AO=42;DP=77;FAO=44;FDP=77;FR=.;FRO=33;FSAF=28;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=11;FWDB=-0.00320035;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.733;QD=23.9232;RBI=0.00325786;REFB=-0.0200975;REVB=0.000609422;RO=33;SAF=28;SAR=14;SRF=22;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.514132;STBP=0.789;TYPE=snp;VARB=0.0161986;OID=.;OPOS=80828555;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:33:33:42:44:0.571429:14:28:22:11:16:28:22:11
chr4	80905990	.	C	G	498.76	PASS	AF=1;AO=27;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=31;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.055966;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.005;QD=58.6776;RBI=0.0857578;REFB=0;REVB=0.0649785;RO=0;SAF=25;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.18567e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00288854;OID=.;OPOS=80905990;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:27:34:1:2:25:0:0:3:31:0:0
chr4	80977078	.	T	G	975.81	PASS	AF=1;AO=65;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0472553;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.2461;QD=59.1397;RBI=0.050366;REFB=0;REVB=0.0174262;RO=0;SAF=35;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000176034;OID=.;OPOS=80977078;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:65:66:1:30:35:0:0:31:35:0:0
chr4	81124596	.	G	C	996.91	PASS	AF=0.468468;AO=103;DP=221;FAO=104;FDP=222;FR=.;FRO=118;FSAF=65;FSAR=39;FSRF=60;FSRR=58;FWDB=0.000820101;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.4762;QD=17.9623;RBI=0.0218899;REFB=-0.00693714;REVB=0.0218745;RO=118;SAF=64;SAR=39;SRF=60;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112214;STB=0.563941;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=0.00797201;OID=.;OPOS=81124596;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:221:222:118:118:103:104:0.468468:39:64:60:58:39:65:60:58
chr4	81529518	.	T	C	1062.43	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00312396;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.263;QD=59.8553;RBI=0.0532608;REFB=0;REVB=0.0531691;RO=0;SAF=35;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11607e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000125349;OID=.;OPOS=81529518;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:36:35:0:0:36:35:0:0
chr4	81791163	.	G	A	202.01	PASS	AF=0.526316;AO=20;DP=38;FAO=20;FDP=38;FR=.;FRO=18;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=4;FWDB=-0.0138706;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.07;QD=21.2639;RBI=0.0551586;REFB=0.00487284;REVB=0.0533861;RO=18;SAF=15;SAR=5;SRF=14;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0317902;STB=0.51784;STBP=0.858;TYPE=snp;VARB=-0.00623884;OID=.;OPOS=81791163;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:18:18:20:20:0.526316:5:15:14:4:5:15:14:4
chr4	81884722	.	G	A	1396.46	PASS	AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0173096;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.368;QD=62.7621;RBI=0.0214101;REFB=0;REVB=-0.0126003;RO=0;SAF=44;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.31172e-06;OID=.;OPOS=81884722;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:45:44:0:0:45:44:0:0
chr4	81967150	.	G	A	147.2	PASS	AF=0.444444;AO=16;DP=37;FAO=16;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.0575303;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.401;QD=16.3559;RBI=0.0628945;REFB=-0.000921725;REVB=0.0254162;RO=21;SAF=3;SAR=13;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.384374;STB=0.733548;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.0011113;OID=.;OPOS=81967150;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:36:21:20:16:16:0.444444:13:3:11:10:13:3:11:9
chr4	81967187	.	AC	A,AT	742.33	PASS	AF=0.104167,0.895833;AO=6,42;DP=48;FAO=5,43;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=5,19;FSAR=0,24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0582872,0.0550857;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=200.647,219.1;QD=61.8604;RBI=0.058291,0.0550946;REFB=0,0;REVB=0.000667105,0.000990421;RO=0;SAF=6,18;SAR=0,24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0597019,-0.00674679;OID=.,.;OPOS=81967188,81967188;OREF=C,C;OALT=-,T;OMAPALT=A,AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.104167,0.895833:6,42:48:5,43:48:0:5,19:0,24:0:0:18:0:6,18:0,24:0:0
chr4	81974809	.	T	C	242.13	PASS	AF=0.473684;AO=27;DP=57;FAO=27;FDP=57;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=-0.00216362;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=161.387;QD=16.9917;RBI=0.00863447;REFB=-0.0198995;REVB=0.00835899;RO=28;SAF=11;SAR=16;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0528073;STB=0.514046;STBP=0.857;TYPE=snp;VARB=0.0221462;OID=.;OPOS=81974809;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:28:30:27:27:0.473684:16:11:13:15:16:11:13:17
chr4	81975088	.	G	A	538.55	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0164139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.5;QD=59.8392;RBI=0.0292717;REFB=0;REVB=0.0242367;RO=0;SAF=21;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.33458e-05;OID=.;OPOS=81975088;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:15:21:0:0:15:21:0:0
chr4	81977690	.	C	T	135.89	PASS	AF=0.321429;AO=19;DP=56;FAO=18;FDP=56;FR=.;FRO=38;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=0.000331583;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.188;QD=9.70622;RBI=0.0134643;REFB=-0.0110985;REVB=-0.0134602;RO=35;SAF=10;SAR=9;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0133391;STB=0.517837;STBP=0.867;TYPE=snp;VARB=0.0214985;OID=.;OPOS=81977690;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:35:38:19:18:0.321429:9:10:18:17:9:9:20:18
chr4	81977730	.	A	T	1071.77	PASS	AF=0.973333;AO=73;DP=75;FAO=73;FDP=75;FR=.;FRO=2;FSAF=34;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0160006;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=169.719;QD=57.1608;RBI=0.0189024;REFB=-0.109363;REVB=-0.0100638;RO=1;SAF=34;SAR=39;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0119748;STB=0.500917;STBP=0.879;TYPE=snp;VARB=0.000673086;OID=.;OPOS=81977730;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:75:75:1:2:73:73:0.973333:39:34:0:1:39:34:1:1
chr4	82025509	.	G	T	2257.81	PASS	AF=1;AO=141;DP=144;FAO=143;FDP=143;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00158741;FXX=0.00694396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.032;QD=63.1556;RBI=0.00289936;REFB=0;REVB=0.00242619;RO=0;SAF=74;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.10505e-05;OID=.;OPOS=82025509;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:144:143:0:0:141:143:1:67:74:0:0:67:76:0:0
chr4	83274634	.	C	T	834.39	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0858631;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.0506;QD=57.5439;RBI=0.0860928;REFB=0;REVB=-0.00628468;RO=0;SAF=29;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000527151;OID=.;OPOS=83274634;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:29:29:0:0:29:29:0:0
chr4	83551007	.	G	A	794.27	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0320393;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.236;QD=56.7333;RBI=0.0339696;REFB=0;REVB=-0.0112878;RO=0;SAF=25;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.53434e-05;OID=.;OPOS=83551007;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:56:0:0:53:56:1:28:25:0:0:30:26:0:0
chr4	83551119	.	T	C	501.49	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.128703;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.286;QD=58.9992;RBI=0.134371;REFB=0;REVB=0.0386172;RO=0;SAF=12;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.75716e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00136999;OID=.;OPOS=83551119;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:22:12:0:0:22:12:0:0
chr4	83582064	.	G	T	174.09	PASS	AF=0.5;AO=18;DP=36;FAO=18;FDP=36;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=0.00541647;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.153;QD=19.3436;RBI=0.0141791;REFB=-0.0105562;REVB=-0.0131038;RO=18;SAF=10;SAR=8;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194029;STB=0.609637;STBP=0.207;TYPE=snp;VARB=0.0107046;OID=.;OPOS=83582064;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:18:18:18:18:0.5:8:10:6:12:8:10:6:12
chr4	83582211	.	C	G	419.85	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0126101;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.999;QD=55.9797;RBI=0.0149163;REFB=0;REVB=-0.0079676;RO=0;SAF=15;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000403871;OID=.;OPOS=83582211;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:30:0:0:29:30:1:14:15:0:0:15:15:0:0
chr4	83778839	.	T	C	213.35	PASS	AF=0.423729;AO=25;DP=60;FAO=25;FDP=59;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=22;FSRR=12;FWDB=-0.00707908;FXX=0.0166639;HRUN=2;LEN=1;MLLD=222.71;QD=14.4647;RBI=0.0143399;REFB=-0.0049851;REVB=0.0124707;RO=33;SAF=12;SAR=13;SRF=21;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156024;STB=0.595613;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.00702283;OID=.;OPOS=83778839;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:59:33:34:25:25:0.423729:13:12:21:12:13:12:22:12
chr4	83788344	.	A	T	1358.62	PASS	AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00604592;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.682;QD=62.4651;RBI=0.035768;REFB=0;REVB=0.0352533;RO=0;SAF=46;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.17087e-05;OID=.;OPOS=83788344;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:41:46:0:0:41:46:0:0
chr4	83792555	.	C	A	226.01	PASS	AF=0.5;AO=22;DP=44;FAO=22;FDP=44;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.057423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.0596;QD=20.5465;RBI=0.0574488;REFB=0.00370843;REVB=-0.00171978;RO=22;SAF=12;SAR=10;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0404908;STB=0.522801;STBP=0.724;TYPE=snp;VARB=-0.00545492;OID=.;OPOS=83792555;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:22:22:22:22:0.5:10:12:11:11:10:12:11:11
chr4	83838217	.	G	A	1529.86	PASS	AF=1;AO=96;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0139732;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.362;QD=63.7442;RBI=0.0153171;REFB=0;REVB=0.00627401;RO=0;SAF=44;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.58318e-05;OID=.;OPOS=83838217;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:96:96:0:0:96:96:1:52:44:0:0:52:44:0:0
chr4	83839799	.	A	G	594.51	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130351;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.511;QD=60.9758;RBI=0.0130372;REFB=0;REVB=-0.000232292;RO=0;SAF=16;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.43889e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.4319e-05;OID=.;OPOS=83839799;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:23:16:0:0:23:16:0:0
chr4	83849057	.	G	A	1026.93	PASS	AF=0.959459;AO=71;DP=74;FAO=71;FDP=74;FR=.;FRO=3;FSAF=34;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0265123;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=95.1485;QD=55.51;RBI=0.0286785;REFB=-0.100067;REVB=0.0109339;RO=1;SAF=34;SAR=37;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0137051;STB=0.505912;STBP=0.735;TYPE=snp;VARB=0.00114098;OID=.;OPOS=83849057;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:74:74:1:3:71:71:0.959459:37:34:1:0:37:34:1:2
chr4	83900043	.	A	G	1102.51	PASS	AF=0.986667;AO=74;DP=75;FAO=74;FDP=75;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0331678;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.576;QD=58.8005;RBI=0.0363897;REFB=-0.100074;REVB=-0.0149703;RO=1;SAF=31;SAR=43;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0108759;STB=0.505746;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=0.000556985;OID=.;OPOS=83900043;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:75:75:1:1:74:74:0.986667:43:31:0:1:43:31:0:1
chr4	84191031	.	A	G	463.48	PASS	AF=0.942857;AO=33;DP=35;FAO=33;FDP=35;FR=.;FRO=2;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0233411;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.482;QD=52.9694;RBI=0.025762;REFB=-0.0463491;REVB=0.0109029;RO=0;SAF=18;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.64315e-08;STB=0.5263;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=0.00175646;OID=.;OPOS=84191031;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:35:35:0:2:33:33:0.942857:15:18:0:0:15:18:2:0
chr4	84230619	.	T	C	296.34	PASS	AF=0.958333;AO=23;DP=24;FAO=23;FDP=24;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0216837;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.4909;QD=49.3901;RBI=0.0252558;REFB=-0.0731273;REVB=-0.0129489;RO=1;SAF=12;SAR=11;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0370176;STB=0.519983;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.00366621;OID=.;OPOS=84230619;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:24:24:1:1:23:23:0.958333:11:12:1:0:11:12:1:0
chr4	84364751	.	A	G	290.3	PASS	AF=0.457143;AO=32;DP=69;FAO=32;FDP=70;FR=.;FRO=38;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=-0.00777361;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.072;QD=16.5887;RBI=0.0210613;REFB=0.00753412;REVB=0.0195742;RO=37;SAF=19;SAR=13;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0780232;STB=0.551692;STBP=0.478;TYPE=snp;VARB=-0.0069504;OID=.;OPOS=84364751;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:70:37:38:32:32:0.457143:13:19:19:18:13:19:19:19
chr4	84370091	.	A	G	194.05	PASS	AF=0.434783;AO=20;DP=46;FAO=20;FDP=46;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=20;FWDB=0.00388313;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.412;QD=16.8737;RBI=0.00507702;REFB=-0.00857505;REVB=-0.00327069;RO=26;SAF=11;SAR=9;SRF=6;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.310943;STB=0.675688;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.00631421;OID=.;OPOS=84370091;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:26:26:20:20:0.434783:9:11:6:20:9:11:6:20
chr4	84374480	.	C	T	459.07	PASS	AF=0.505618;AO=45;DP=90;FAO=45;FDP=89;FR=.;FRO=44;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=-0.0205863;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.7876;QD=20.6324;RBI=0.0299063;REFB=-0.0451233;REVB=0.0216932;RO=45;SAF=22;SAR=23;SRF=22;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505492;STBP=0.963;TYPE=snp;VARB=0.0245744;OID=.;OPOS=84374480;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:89:45:44:45:45:0.505618:23:22:22:23:23:22:22:22
chr4	84376743	.	A	T	841.12	PASS	AF=1;AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0833636;FXX=0.0333278;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.1986;QD=58.0085;RBI=0.0833636;REFB=0;REVB=0.000100125;RO=0;SAF=23;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000516953;OID=.;OPOS=84376743;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:58:0:0:58:58:1:35:23:0:0:35:23:0:0
chr4	84380955	.	G	T	195.04	PASS	AF=0.40678;AO=23;DP=58;FAO=24;FDP=59;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=-0.0020402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.585;QD=13.2233;RBI=0.0186864;REFB=-0.000514188;REVB=-0.0185747;RO=34;SAF=13;SAR=10;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0376383;STB=0.500711;STBP=0.999;TYPE=snp;VARB=0.000817129;OID=.;OPOS=84380955;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:59:34:35:23:24:0.40678:10:13:18:16:11:13:19:16
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chr4	84383810	.	C	T	365.97	PASS	AF=0.346154;AO=45;DP=131;FAO=45;FDP=130;FR=.;FRO=85;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=51;FSRR=34;FWDB=-0.012179;FXX=0.00763301;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.474;QD=11.2606;RBI=0.0159801;REFB=-0.00991725;REVB=-0.0103458;RO=74;SAF=23;SAR=22;SRF=47;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136495;STB=0.558274;STBP=0.337;TYPE=snp;VARB=0.0203364;OID=.;OPOS=84383810;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:131:130:74:85:45:45:0.346154:22:23:47:27:22:23:51:34
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chr4	85569994	.	C	T	251.65	PASS	AF=0.474576;AO=28;DP=59;FAO=28;FDP=59;FR=.;FRO=31;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=-0.048357;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.874;QD=17.0606;RBI=0.0483701;REFB=-0.0142693;REVB=0.00112354;RO=31;SAF=16;SAR=12;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.052286;STB=0.529391;STBP=0.653;TYPE=snp;VARB=0.0186109;OID=.;OPOS=85569994;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:31:31:28:28:0.474576:12:16:16:15:12:16:16:15
chr4	85762385	.	T	C	683.55	PASS	AF=0.463087;AO=69;DP=149;FAO=69;FDP=149;FR=.;FRO=80;FSAF=34;FSAR=35;FSRF=44;FSRR=36;FWDB=-0.0101584;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.352;QD=18.3503;RBI=0.0132614;REFB=-0.0157992;REVB=0.00852467;RO=80;SAF=34;SAR=35;SRF=44;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0553595;STB=0.530707;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=0.0194669;OID=.;OPOS=85762385;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:149:149:80:80:69:69:0.463087:35:34:44:36:35:34:44:36
chr4	86021741	.	C	T	621.8	PASS	AF=1;AO=40;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0458693;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.713;QD=60.6638;RBI=0.0469685;REFB=0;REVB=-0.0101018;RO=0;SAF=14;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00016434;OID=.;OPOS=86021741;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:40:41:1:26:14:0:0:27:14:0:0
chr4	86021765	.	C	T	785.09	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0443153;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.8777;QD=57.0974;RBI=0.055291;REFB=0;REVB=0.0330643;RO=0;SAF=17;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.97918e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000855527;OID=.;OPOS=86021765;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:38:17:0:0:38:17:0:0
chr4	86021800	.	A	T	459.85	PASS	AF=0.586667;AO=42;DP=76;FAO=44;FDP=75;FR=.;FRO=31;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=10;FSRR=21;FWDB=0.038928;FXX=0.0259707;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.7951;QD=24.5253;RBI=0.051772;REFB=-0.0219045;REVB=0.0341313;RO=31;SAF=18;SAR=24;SRF=10;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0849554;STB=0.546571;STBP=0.375;TYPE=snp;VARB=0.0252255;OID=.;OPOS=86021800;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:75:31:31:42:44:0.586667:24:18:10:21:25:19:10:21
chr4	86021967	.	C	T	629.62	PASS	AF=0.954545;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=44;FR=.;FRO=2;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00616539;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.549;QD=57.2377;RBI=0.0223045;REFB=0.0186853;REVB=0.0214354;RO=0;SAF=21;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.522716;STBP=0.238;TYPE=snp;VARB=-0.000923614;OID=.;OPOS=86021967;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:42:44:0:2:42:42:0.954545:21:21:0:0:21:21:0:2
chr4	86021976	.	T	A	193.16	PASS	AF=0.488372;AO=22;DP=43;FAO=21;FDP=43;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.00705846;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=123.968;QD=17.968;RBI=0.0169598;REFB=-0.000960785;REVB=-0.0154212;RO=13;SAF=7;SAR=15;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0502005;STB=0.612793;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.00211531;OID=.;OPOS=86021976;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:13:22:22:21:0.488372:15:7:5:8:14:7:12:10
chr4	87024409	.	T	C	489.98	PASS	AF=0.971429;AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0468709;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.468;QD=55.998;RBI=0.0545421;REFB=-0.0134835;REVB=0.0278919;RO=0;SAF=15;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.40663e-08;STB=0.51612;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=0.000339591;OID=.;OPOS=87024409;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:35:35:0:1:34:34:0.971429:19:15:0:0:19:15:1:0
chr4	87809387	.	G	T	695.86	PASS	AF=0.978261;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.014566;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.434;QD=60.5097;RBI=0.0276513;REFB=0.103865;REVB=-0.0235038;RO=1;SAF=19;SAR=26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0177343;STB=0.50943;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=-0.00787141;OID=.;OPOS=87809387;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:46:46:1:1:45:45:0.978261:26:19:0:1:26:19:0:1
chr4	88056925	.	A	G	134.87	PASS	AF=1;AO=12;DP=13;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0313349;FXX=0.076864;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.17;QD=44.958;RBI=0.0339305;REFB=0;REVB=0.0130153;RO=0;SAF=8;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000683308;OID=.;OPOS=88056925;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:12:0:0:12:12:1:4:8:0:0:4:8:0:0
chr4	88057353	.	G	A	233.58	PASS	AF=0.472727;AO=26;DP=54;FAO=26;FDP=55;FR=.;FRO=29;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=-0.0166525;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.8316;QD=16.9878;RBI=0.0174219;REFB=-0.00249567;REVB=0.00512024;RO=28;SAF=15;SAR=11;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.200658;STB=0.620599;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=0.00220741;OID=.;OPOS=88057353;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:55:28:29:26:26:0.472727:11:15:10:18:11:15:10:19
chr4	88059415	.	G	A	266.24	PASS	AF=0.336842;AO=32;DP=95;FAO=32;FDP=95;FR=.;FRO=63;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=30;FSRR=33;FWDB=-0.0155449;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.4187;QD=11.2102;RBI=0.031043;REFB=-0.00377303;REVB=0.0268705;RO=63;SAF=20;SAR=12;SRF=30;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172121;STB=0.599937;STBP=0.167;TYPE=snp;VARB=0.00916354;OID=.;OPOS=88059415;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:63:63:32:32:0.336842:12:20:30:33:12:20:30:33
chr4	88061624	.	ATATAT	A	76.23	PASS	AF=0.357143;AO=10;DP=27;FAO=10;FDP=28;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=14;FSRR=4;FWDB=-0.0162733;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=5;MLLD=160.544;QD=10.8898;RBI=0.0170548;REFB=0.00713522;REVB=0.00510342;RO=8;SAF=9;SAR=1;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.240747;STB=0.661373;STBP=0.377;TYPE=del;VARB=-0.0156692;OID=.;OPOS=88061625;OREF=TATAT;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.357143:10:27:10:28:18:9:1:14:4:76:8:9:1:6:2
chr4	88084356	.	CAAAT	AATAG,CAAATAG,CAAT	255.46	PASS	AF=0.111111,0.277778,0.125;AO=6,17,10;DP=75;FAO=8,20,9;FDP=72;FR=.;FRO=35;FSAF=0,12,0;FSAR=8,8,9;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=0.00949032,0.0119013,0.035372;FXX=0.0649266;HRUN=2,1,3;LEN=5,2,1;MLLD=142.774,145.203,12.9416;QD=14.192;RBI=0.052587,0.0530857,0.0402424;REFB=-0.0857256,-0.0792137,-0.208026;REVB=-0.0517235,-0.0517345,0.0191905;RO=20;SAF=0,11,1;SAR=6,6,9;SRF=13;SRR=7;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.754307,-0.00304274,-0.632181;STB=0.998607,0.537276,0.998739;STBP=0.002,0.713,0.001;TYPE=mnp,ins,del;VARB=0.0947896,0.120259,0.233032;OID=.,.,.;OPOS=88084356,88084361,88084357;OREF=CAAAT,-,A;OALT=AATAG,AG,-;OMAPALT=AATAG,CAAATAG,CAAT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:75:72:20:35:6,17,10:8,20,9:0.111111,0.277778,0.125:6,6,9:0,11,1:13:7:8,8,9:0,12,0:19:16
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chr4	88258483	.	T	C	734.48	PASS	AF=0.932203;AO=46;DP=59;FAO=55;FDP=59;FR=.;FRO=4;FSAF=31;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.00805924;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=105.481;QD=49.7956;RBI=0.0122146;REFB=-0.00952463;REVB=0.00917851;RO=0;SAF=23;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.521487;STBP=0.27;TYPE=snp;VARB=7.22186e-05;OID=.;OPOS=88258483;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:16:59:59:0:4:46:55:0.932203:23:23:0:0:24:31:1:3
chr4	88293887	.	G	A	273.92	PASS	AF=0.483871;AO=30;DP=62;FAO=30;FDP=62;FR=.;FRO=32;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=23;FSRR=9;FWDB=-0.000984125;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=306.973;QD=17.6719;RBI=0.00890864;REFB=0.00354471;REVB=-0.00885411;RO=32;SAF=20;SAR=10;SRF=23;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0552221;STB=0.530844;STBP=0.655;TYPE=snp;VARB=-0.00339474;OID=.;OPOS=88293887;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:32:32:30:30:0.483871:10:20:23:9:10:20:23:9
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chr4	88333389	.	G	A	271.34	PASS	AF=0.543478;AO=25;DP=45;FAO=25;FDP=46;FR=.;FRO=21;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=-0.0364772;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.4765;QD=23.595;RBI=0.0490209;REFB=0.0072958;REVB=0.0327484;RO=20;SAF=14;SAR=11;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0880191;STB=0.538431;STBP=0.608;TYPE=snp;VARB=-0.00643149;OID=.;OPOS=88333389;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:46:20:21:25:25:0.543478:11:14:9:11:11:14:10:11
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chr4	88401616	.	A	G	1661.3	PASS	AF=0.991071;AO=111;DP=112;FAO=111;FDP=112;FR=.;FRO=1;FSAF=57;FSAR=54;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0422724;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.64;QD=59.3322;RBI=0.0515281;REFB=-0.00719779;REVB=0.0294649;RO=1;SAF=57;SAR=54;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00825659;STB=0.504347;STBP=0.479;TYPE=snp;VARB=0.000213159;OID=.;OPOS=88401616;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:112:112:1:1:111:111:0.991071:54:57:1:0:54:57:1:0
chr4	88415463	.	G	A	412.58	PASS	AF=0.45;AO=45;DP=102;FAO=45;FDP=100;FR=.;FRO=55;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=25;FSRR=30;FWDB=0.00504977;FXX=0.0196059;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.376;QD=16.5032;RBI=0.00840579;REFB=0.0119413;REVB=0.00671991;RO=53;SAF=23;SAR=22;SRF=23;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0746431;STB=0.53107;STBP=0.603;TYPE=snp;VARB=-0.0113134;OID=.;OPOS=88415463;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:100:53:55:45:45:0.45:22:23:23:30:22:23:25:30
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chr4	88416188	.	G	T	313.1	PASS	AF=0.397727;AO=35;DP=89;FAO=35;FDP=88;FR=.;FRO=53;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=29;FSRR=24;FWDB=-0.0325152;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.339;QD=14.2319;RBI=0.0340683;REFB=-0.00143958;REVB=-0.0101691;RO=53;SAF=18;SAR=17;SRF=29;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0349041;STB=0.519833;STBP=0.763;TYPE=snp;VARB=0.00179959;OID=.;OPOS=88416188;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:88:53:53:35:35:0.397727:17:18:29:24:17:18:29:24
chr4	88416223	.	A	G	1439.41	PASS	AF=1;AO=89;DP=89;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0282028;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.7053;QD=62.5829;RBI=0.028539;REFB=0;REVB=-0.00436742;RO=0;SAF=38;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000153275;OID=.;OPOS=88416223;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:89:92:0:0:89:92:1:51:38:0:0:52:40:0:0
chr4	88535156	.	G	A	144.77	PASS	AF=0.432432;AO=16;DP=37;FAO=16;FDP=37;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=-0.0210615;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.856;QD=15.6508;RBI=0.0611671;REFB=-0.0109729;REVB=-0.0574267;RO=21;SAF=8;SAR=8;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0234155;STB=0.513497;STBP=0.918;TYPE=snp;VARB=0.0126466;OID=.;OPOS=88535156;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:21:21:16:16:0.432432:8:8:10:11:8:8:10:11
chr4	88583135	.	A	T	168.69	PASS	AF=0.428571;AO=18;DP=42;FAO=18;FDP=42;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=0.00454874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.47;QD=16.0653;RBI=0.0181741;REFB=-0.0193249;REVB=0.0175956;RO=24;SAF=12;SAR=6;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173256;STB=0.599886;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=0.0228679;OID=.;OPOS=88583135;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:24:24:18:18:0.428571:6:12:12:12:6:12:12:12
chr4	88732531	.	T	A,C	316.79	PASS	AF=0.0833333,0.916667;AO=2,22;DP=24;FAO=2,22;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=2,12;FSAR=0,10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0184091,0.0119003;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=151.986,100.827;QD=52.7978;RBI=0.0187635,0.0397311;REFB=0,0;REVB=0.0036296,0.037907;RO=0;SAF=2,12;SAR=0,10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00241986,0.00565758;OID=.,.;OPOS=88732531,88732531;OREF=T,T;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:24:24:0:0:2,22:2,22:0.0833333,0.916667:0,10:2,12:0:0:0,10:2,12:0:0
chr4	88732692	.	G	A	240.23	PASS	AF=0.909091;AO=20;DP=22;FAO=20;FDP=22;FR=.;FRO=2;FSAF=16;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0332984;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.0441;QD=43.6772;RBI=0.0697492;REFB=-0.0125104;REVB=-0.0612876;RO=2;SAF=16;SAR=4;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18245;STB=0.599891;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.0101858;OID=.;OPOS=88732692;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:22:22:2:2:20:20:0.909091:4:16:0:2:4:16:0:2
chr4	88732746	.	A	G	490.81	PASS	AF=0.971429;AO=33;DP=34;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.025209;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.826;QD=56.0925;RBI=0.0590111;REFB=-0.0722153;REVB=0.0533555;RO=1;SAF=20;SAR=13;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0227903;STB=0.512188;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.00216598;OID=.;OPOS=88732746;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:34:35:1:1:33:34:0.971429:13:20:1:0:14:20:1:0
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chr4	88767008	.	G	A	256.35	PASS	AF=0.533333;AO=24;DP=45;FAO=24;FDP=45;FR=.;FRO=21;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=-0.0157098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.716;QD=22.7865;RBI=0.0329131;REFB=0.0270523;REVB=0.0289219;RO=20;SAF=15;SAR=9;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145592;STB=0.593142;STBP=0.202;TYPE=snp;VARB=-0.0197224;OID=.;OPOS=88767008;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:20:21:24:24:0.533333:9:15:9:11:9:15:9:12
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chr4	88813503	.	T	C	2437.35	PASS	AF=1;AO=158;DP=158;FAO=159;FDP=159;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0101686;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=305.164;QD=61.3171;RBI=0.0301947;REFB=0;REVB=0.028431;RO=0;SAF=76;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.38593e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.34646e-05;OID=.;OPOS=88813503;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:158:159:0:0:158:159:1:82:76:0:0:83:76:0:0
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chr4	88813659	.	C	G	209.48	PASS	AF=0.351351;AO=26;DP=74;FAO=26;FDP=74;FR=.;FRO=48;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=10;FSRR=38;FWDB=-0.0403174;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.448;QD=11.3232;RBI=0.0420928;REFB=-0.0215281;REVB=-0.0120959;RO=48;SAF=9;SAR=17;SRF=10;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183803;STB=0.605062;STBP=0.278;TYPE=snp;VARB=0.0416787;OID=.;OPOS=88813659;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:48:48:26:26:0.351351:17:9:10:38:17:9:10:38
chr4	88814048	.	A	C	517.79	PASS	AF=0.504673;AO=54;DP=107;FAO=54;FDP=107;FR=.;FRO=53;FSAF=22;FSAR=32;FSRF=39;FSRR=14;FWDB=-0.0162187;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.1068;QD=19.3567;RBI=0.0503047;REFB=-0.00431974;REVB=0.0476185;RO=51;SAF=22;SAR=32;SRF=37;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.274718;STB=0.658513;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.00500999;OID=.;OPOS=88814048;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:107:51:53:54:54:0.504673:32:22:37:14:32:22:39:14
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chr4	88814665	.	A	C	236.34	PASS	AF=0.4;AO=28;DP=68;FAO=28;FDP=70;FR=.;FRO=42;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=26;FWDB=-0.00355632;FXX=0.0140825;HRUN=4;LEN=1;MLLD=250.253;QD=13.5052;RBI=0.00359351;REFB=-0.0149661;REVB=-0.000515627;RO=39;SAF=12;SAR=16;SRF=13;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101496;STB=0.529391;STBP=0.717;TYPE=snp;VARB=0.0242123;OID=.;OPOS=88814665;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:70:39:42:28:28:0.4:16:12:13:26:16:12:16:26
chr4	88814683	.	G	T	284.12	PASS	AF=0.426667;AO=32;DP=75;FAO=32;FDP=75;FR=.;FRO=43;FSAF=9;FSAR=23;FSRF=16;FSRR=27;FWDB=-0.0107217;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.535;QD=15.1532;RBI=0.01281;REFB=-0.0227717;REVB=-0.00701005;RO=43;SAF=9;SAR=23;SRF=16;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107247;STB=0.560936;STBP=0.427;TYPE=snp;VARB=0.0237373;OID=.;OPOS=88814683;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:43:43:32:32:0.426667:23:9:16:27:23:9:16:27
chr4	88814989	.	C	T	361.34	PASS	AF=0.405941;AO=41;DP=100;FAO=41;FDP=101;FR=.;FRO=60;FSAF=28;FSAR=13;FSRF=27;FSRR=33;FWDB=0.0153968;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.471;QD=14.3106;RBI=0.0162417;REFB=-0.00972732;REVB=-0.00517022;RO=59;SAF=28;SAR=13;SRF=26;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.259735;STB=0.642964;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.016931;OID=.;OPOS=88814989;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:101:59:60:41:41:0.405941:13:28:26:33:13:28:27:33
chr4	88815148	.	G	A	646.29	PASS	AF=0.468085;AO=66;DP=141;FAO=66;FDP=141;FR=.;FRO=75;FSAF=27;FSAR=39;FSRF=36;FSRR=39;FWDB=-0.0260894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.877;QD=18.3345;RBI=0.0305198;REFB=-0.00638316;REVB=0.0158368;RO=72;SAF=27;SAR=39;SRF=33;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0474955;STB=0.53845;STBP=0.396;TYPE=snp;VARB=0.00753367;OID=.;OPOS=88815148;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:141:141:72:75:66:66:0.468085:39:27:33:39:39:27:36:39
chr4	88815163	.	A	ATTAGG	391.36	PASS	AF=0.367188;AO=45;DP=133;FAO=47;FDP=128;FR=.;FRO=81;FSAF=15;FSAR=32;FSRF=34;FSRR=47;FWDB=-0.0103301;FXX=0.0303007;HRUN=2;LEN=5;MLLD=273.338;QD=12.2301;RBI=0.0112449;REFB=-0.00836339;REVB=-0.00444278;RO=82;SAF=13;SAR=32;SRF=36;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186;STB=0.56953;STBP=0.278;TYPE=ins;VARB=0.0133548;OID=.;OPOS=88815164;OREF=-;OALT=TTAGG;OMAPALT=ATTAGG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.367188:45:133:47:128:81:15:32:34:47:99:82:13:32:36:46
chr4	88898941	.	C	T	210.28	PASS	AF=0.444444;AO=24;DP=54;FAO=24;FDP=54;FR=.;FRO=30;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=-0.00740945;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.5475;QD=15.5761;RBI=0.0428728;REFB=-0.00181913;REVB=-0.0422277;RO=30;SAF=17;SAR=7;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.250745;STB=0.642968;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.00491599;OID=.;OPOS=88898941;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:30:30:24:24:0.444444:7:17:14:16:7:17:14:16
chr4	88902692	.	T	C	708.5	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00132603;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.811;QD=62.9774;RBI=0.0233131;REFB=0;REVB=0.0232754;RO=0;SAF=28;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.47085e-05;OID=.;OPOS=88902692;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:17:28:0:0:17:28:0:0
chr4	88903853	.	C	T	961.86	PASS	AF=0.985075;AO=65;DP=67;FAO=66;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=49;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0118802;FXX=0.0147037;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.943;QD=57.4243;RBI=0.0133872;REFB=0.127653;REVB=0.00617081;RO=1;SAF=17;SAR=48;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0269723;STB=0.514281;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=-0.000815169;OID=.;OPOS=88903853;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:67:67:1:1:65:66:0.985075:48:17:1:0:49:17:1:0
chr4	88921446	.	G	C	362.87	PASS	AF=0.419355;AO=39;DP=93;FAO=39;FDP=93;FR=.;FRO=54;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=30;FSRR=24;FWDB=0.0162538;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.8295;QD=15.6072;RBI=0.0171134;REFB=0.00574915;REVB=0.00535546;RO=54;SAF=16;SAR=23;SRF=30;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149689;STB=0.584487;STBP=0.205;TYPE=snp;VARB=-0.00932103;OID=.;OPOS=88921446;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:54:54:39:39:0.419355:23:16:30:24:23:16:30:24
chr4	88921512	.	G	A	199.94	PASS	AF=0.362319;AO=25;DP=69;FAO=25;FDP=69;FR=.;FRO=44;FSAF=6;FSAR=19;FSRF=26;FSRR=18;FWDB=-0.022061;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.018;QD=11.5908;RBI=0.0264611;REFB=-1.58571e-05;REVB=-0.0146118;RO=41;SAF=6;SAR=19;SRF=24;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.388795;STB=0.732338;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=-0.000122545;OID=.;OPOS=88921512;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:41:44:25:25:0.362319:19:6:24:17:19:6:26:18
chr4	89052323	.	G	T	607.75	PASS	AF=0.593407;AO=54;DP=93;FAO=54;FDP=91;FR=.;FRO=37;FSAF=20;FSAR=34;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=-0.00232221;FXX=0.0319115;HRUN=1;LEN=1;MLLD=297.846;QD=26.7142;RBI=0.0150457;REFB=0.00901807;REVB=-0.0148655;RO=38;SAF=19;SAR=35;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117889;STB=0.538052;STBP=0.392;TYPE=snp;VARB=-0.00719931;OID=.;OPOS=89052323;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:91:38:37:54:54:0.593407:35:19:19:19:34:20:17:20
chr4	89061114	.	C	T	278.87	PASS	AF=0.54902;AO=28;DP=51;FAO=28;FDP=51;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=6;FWDB=-0.0103239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.086;QD=21.8718;RBI=0.0144167;REFB=-0.00124158;REVB=0.0100627;RO=23;SAF=12;SAR=16;SRF=17;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.248149;STB=0.637268;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=0.00147259;OID=.;OPOS=89061114;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:23:23:28:28:0.54902:16:12:17:6:16:12:17:6
chr4	89182518	.	T	C	473.44	PASS	AF=1;AO=32;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0331117;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.56;QD=57.3871;RBI=0.0454689;REFB=0;REVB=0.0311614;RO=0;SAF=13;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000440321;OID=.;OPOS=89182518;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:32:33:1:19:13:0:0:20:13:0:0
chr4	89311962	.	T	C	306.47	PASS	AF=0.414634;AO=34;DP=84;FAO=34;FDP=82;FR=.;FRO=48;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=26;FSRR=22;FWDB=0.00415878;FXX=0.0238067;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.313;QD=14.9496;RBI=0.0210019;REFB=-0.020344;REVB=-0.020586;RO=48;SAF=20;SAR=14;SRF=26;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0491209;STB=0.527843;STBP=0.728;TYPE=snp;VARB=0.0269341;OID=.;OPOS=89311962;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:82:48:48:34:34:0.414634:14:20:26:22:14:20:26:22
chr4	89319296	.	T	C	464.03	PASS	AF=1;AO=31;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0988564;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.0211;QD=58.0041;RBI=0.10792;REFB=0;REVB=0.043291;RO=0;SAF=22;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.15349e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000775185;OID=.;OPOS=89319296;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:31:32:1:9:22:0:0:10:22:0:0
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chr4	89415396	.	T	C	988.93	PASS	AF=0.933333;AO=70;DP=75;FAO=70;FDP=75;FR=.;FRO=5;FSAF=32;FSAR=38;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0204024;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.1919;QD=52.7427;RBI=0.0205854;REFB=0.00105689;REVB=-0.00273863;RO=5;SAF=32;SAR=38;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0432612;STB=0.522929;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=-0.000639916;OID=.;OPOS=89415396;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:18:75:75:5:5:70:70:0.933333:38:32:4:1:38:32:4:1
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chr4	89618567	.	A	G	669.38	PASS	AF=0.462585;AO=68;DP=147;FAO=68;FDP=147;FR=.;FRO=79;FSAF=33;FSAR=35;FSRF=36;FSRR=43;FWDB=0.0255308;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.0805;QD=18.2145;RBI=0.0266527;REFB=-0.0101376;REVB=0.00765147;RO=79;SAF=33;SAR=35;SRF=36;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0287105;STB=0.51593;STBP=0.751;TYPE=snp;VARB=0.0106323;OID=.;OPOS=89618567;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:147:147:79:79:68:68:0.462585:35:33:36:43:35:33:36:43
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chr4	89625427	.	G	C	747.1	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0161216;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=292.778;QD=63.583;RBI=0.0214817;REFB=0;REVB=0.0141972;RO=0;SAF=23;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.96641e-05;OID=.;OPOS=89625427;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:24:23:0:0:24:23:0:0
chr4	89629681	.	TAACTTA	TAACT,TAACTA,TACTTA	279.49	PASS	AF=0.0714286,0.404762,0.380952;AO=4,16,9;DP=39;FAO=3,17,16;FDP=42;FR=.;FRO=6;FSAF=3,17,1;FSAR=0,0,15;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=-0.176654,-0.286864,-0.0118136;FXX=0.0454442;HRUN=2,2,2;LEN=2,1,1;MLLD=23.021,19.5649,18.4073;QD=26.6182;RBI=0.177008,0.289697,0.0459145;REFB=0.0667624,0.0971957,-0.00261343;REVB=-0.0112005,-0.0404153,-0.0443686;RO=5;SAF=4,16,0;SAR=0,0,9;SRF=5;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,-0.836525;STB=0.5,0.5,0.874402;STBP=1,1,0.001;TYPE=del,del,del;VARB=0.0699324,-0.0656698,0.0359193;OID=.,.,.;OPOS=89629686,89629685,89629682;OREF=TA,T,A;OALT=-,-,-;OMAPALT=TAACT,TAACTA,TACTTA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	2/3:0.0714286,0.404762,0.380952:4,16,9:39:3,17,16:42:6:3,17,1:0,0,15:6:0:96:5:4,16,0:0,0,9:5:0
chr4	89647798	.	AAC	AAA,AA,A	501.44	PASS	AF=0,0,1;AO=8,12,16;DP=36;FAO=0,0,35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0,29;FSAR=0,0,6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00291958,0.000718888,0.00438659;FXX=0;HRUN=1,1,7;LEN=1,1,2;MLLD=270.645,278.964,285.639;QD=57.3072;RBI=0.00650846,0.0075977,0.0105255;REFB=0,0,0;REVB=-0.00581688,-0.00756361,-0.00956781;RO=0;SAF=5,10,14;SAR=3,2,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=4.46938e-08,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=snp,del,del;VARB=0,0,-0.00026133;OID=.,.,.;OPOS=89647800,89647800,89647799;OREF=C,C,AC;OALT=A,-,-;OMAPALT=AAA,AA,A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	3/3:0,0,1:8,12,16:36:0,0,35:35:0:0,0,29:0,0,6:0:0:4:0:5,10,14:3,2,2:0:0
chr4	89653257	.	G	A	1268.22	PASS	AF=0.988095;AO=83;DP=84;FAO=83;FDP=84;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=48;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0156476;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.441;QD=60.3916;RBI=0.0196006;REFB=-0.0384602;REVB=-0.011804;RO=1;SAF=35;SAR=48;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133394;STB=0.507041;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=-8.20591e-05;OID=.;OPOS=89653257;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:84:84:1:1:83:83:0.988095:48:35:1:0:48:35:1:0
chr4	89668859	.	C	T	1881.21	PASS	AF=1;AO=122;DP=123;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00401719;FXX=0.00812942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.7991;QD=61.6791;RBI=0.0237227;REFB=0;REVB=-0.0233801;RO=0;SAF=68;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.72266e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.61967e-05;OID=.;OPOS=89668859;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:123:122:0:0:122:122:1:54:68:0:0:54:68:0:0
chr4	89670155	.	C	T	1423.52	PASS	AF=0.978723;AO=92;DP=94;FAO=92;FDP=94;FR=.;FRO=2;FSAF=37;FSAR=55;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00920094;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=274.002;QD=60.5752;RBI=0.00923068;REFB=-0.0195859;REVB=0.000740324;RO=2;SAF=37;SAR=55;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00409819;STB=0.502162;STBP=0.847;TYPE=snp;VARB=0.000426262;OID=.;OPOS=89670155;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:94:94:2:2:92:92:0.978723:55:37:1:1:55:37:1:1
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chr4	90168415	.	A	T	340.59	PASS	AF=0.586207;AO=34;DP=58;FAO=34;FDP=58;FR=.;FRO=24;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.00704375;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.209;QD=23.4891;RBI=0.0413395;REFB=0.00123505;REVB=0.040735;RO=24;SAF=21;SAR=13;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0594593;STB=0.53275;STBP=0.599;TYPE=snp;VARB=-0.000752918;OID=.;OPOS=90168415;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:24:24:34:34:0.586207:13:21:13:11:13:21:13:11
chr4	90169925	.	A	G	300.6	PASS	AF=0.576923;AO=30;DP=52;FAO=30;FDP=52;FR=.;FRO=22;FSAF=22;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.0207964;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.171;QD=23.1233;RBI=0.0221391;REFB=-0.0241358;REVB=0.00759285;RO=22;SAF=22;SAR=8;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.203097;STB=0.612823;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=0.0180287;OID=.;OPOS=90169925;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:22:22:30:30:0.576923:8:22:11:11:8:22:11:11
chr4	90857479	.	G	A	297.21	PASS	AF=0.492308;AO=32;DP=65;FAO=32;FDP=65;FR=.;FRO=33;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=-0.031132;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=294.659;QD=18.2899;RBI=0.0319879;REFB=-8.03521e-05;REVB=0.0073504;RO=33;SAF=12;SAR=20;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10322;STB=0.557732;STBP=0.385;TYPE=snp;VARB=5.5617e-05;OID=.;OPOS=90857479;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:33:33:32:32:0.492308:20:12:16:17:20:12:16:17
chr4	90874879	.	T	C	428.91	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.086945;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.84;QD=57.1882;RBI=0.0871231;REFB=0;REVB=-0.00556803;RO=0;SAF=13;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.63861e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000296678;OID=.;OPOS=90874879;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:17:13:0:0:17:13:0:0
chr4	91291407	.	C	T	1510.85	PASS	AF=1;AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0275879;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.605;QD=63.6149;RBI=0.0303104;REFB=0;REVB=0.0125551;RO=0;SAF=40;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.50947e-05;OID=.;OPOS=91291407;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:95:0:0:95:95:1:55:40:0:0:55:40:0:0
chr4	92185835	.	C	A	309.39	PASS	AF=0.380435;AO=35;DP=92;FAO=35;FDP=92;FR=.;FRO=57;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=31;FSRR=26;FWDB=-0.0108855;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.844;QD=13.4518;RBI=0.0124604;REFB=-0.0105372;REVB=-0.0060637;RO=56;SAF=14;SAR=21;SRF=29;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128377;STB=0.589468;STBP=0.194;TYPE=snp;VARB=0.0241047;OID=.;OPOS=92185835;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:56:57:35:35:0.380435:21:14:29:27:21:14:31:26
chr4	92240276	.	TAA	TA,TAT	1627.13	PASS	AF=0.364407,0.635593;AO=53,57;DP=118;FAO=43,75;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=23,37;FSAR=20,38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0290052,-0.0138458;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=25.6248,27.5617;QD=55.157;RBI=0.0316455,0.0839439;REFB=0,0;REVB=-0.0126545,0.0827942;RO=0;SAF=26,34;SAR=27,23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0136383,0.0664946;OID=.,.;OPOS=92240277,92240278;OREF=A,A;OALT=-,T;OMAPALT=TA,TAT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.364407,0.635593:53,57:118:43,75:118:0:23,37:20,38:0:0:99:0:26,34:27,23:0:0
chr4	92240802	.	C	T	1238.31	PASS	AF=1;AO=80;DP=82;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112561;FXX=0.0361402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.619;QD=61.9155;RBI=0.0375931;REFB=0;REVB=-0.0358684;RO=0;SAF=43;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.69903e-05;OID=.;OPOS=92240802;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:80:0:0:80:80:1:37:43:0:0:37:43:0:0
chr4	92246344	.	G	A	1814.6	PASS	AF=1;AO=118;DP=120;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0336879;FXX=0.00833264;HRUN=2;LEN=1;MLLD=227.333;QD=60.9951;RBI=0.0390977;REFB=0;REVB=0.0198433;RO=0;SAF=76;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.28958e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000187267;OID=.;OPOS=92246344;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:120:119:0:0:118:119:1:42:76:0:0:43:76:0:0
chr4	94316763	.	T	G	1038.31	PASS	AF=0.986111;AO=69;DP=70;FAO=71;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0248257;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.0563;QD=57.6837;RBI=0.045127;REFB=0.00875536;REVB=0.0376846;RO=1;SAF=42;SAR=27;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0171851;STB=0.508769;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=-0.00054413;OID=.;OPOS=94316763;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:70:72:1:1:69:71:0.986111:27:42:0:1:28:43:0:1
chr4	95134165	.	C	G	926.73	PASS	AF=1;AO=41;DP=68;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00177488;FXX=0.043472;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.4995;QD=56.1656;RBI=0.119133;REFB=0;REVB=0.11912;RO=0;SAF=29;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00378578;OID=.;OPOS=95134165;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:66:0:0:41:66:1:12:29:0:0:27:39:0:0
chr4	95169682	.	G	T	1215.1	PASS	AF=0.932584;AO=83;DP=89;FAO=83;FDP=89;FR=.;FRO=6;FSAF=33;FSAR=50;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=-0.0134441;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.9741;QD=54.6112;RBI=0.0238816;REFB=-0.0830275;REVB=0.019738;RO=6;SAF=33;SAR=50;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.030922;STB=0.516355;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=0.0204874;OID=.;OPOS=95169682;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:20:89:89:6:6:83:83:0.932584:50:33:1:5:50:33:1:5
chr4	95170839	.	G	A	1568.07	PASS	AF=1;AO=98;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00780967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.398;QD=64.003;RBI=0.0223561;REFB=0;REVB=0.0209477;RO=0;SAF=50;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.35849e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.15894e-05;OID=.;OPOS=95170839;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:98:0:0:98:98:1:48:50:0:0:48:50:0:0
chr4	95173779	.	T	C	868.21	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0118461;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.2869;QD=57.8804;RBI=0.0266838;REFB=0;REVB=-0.0239101;RO=0;SAF=32;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.04133e-05;OID=.;OPOS=95173779;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:28:32:0:0:28:32:0:0
chr4	95186055	.	A	G	328.67	PASS	AF=0.479452;AO=35;DP=73;FAO=35;FDP=73;FR=.;FRO=38;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=0.00163363;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=277.679;QD=18.0095;RBI=0.0172781;REFB=0.00142769;REVB=-0.0172007;RO=38;SAF=13;SAR=22;SRF=21;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17155;STB=0.59596;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=-0.00144847;OID=.;OPOS=95186055;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:38:38:35:35:0.479452:22:13:21:17:22:13:21:17
chr4	95197520	.	C	T	1268.81	PASS	AF=0.988095;AO=83;DP=84;FAO=83;FDP=84;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0118601;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.189;QD=60.4194;RBI=0.0157302;REFB=-0.121334;REVB=0.0103333;RO=1;SAF=43;SAR=40;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0108876;STB=0.505746;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=-0.000123199;OID=.;OPOS=95197520;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:84:84:1:1:83:83:0.988095:40:43:1:0:40:43:1:0
chr4	95211610	.	T	C	483.27	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0140338;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=135.35;QD=58.5784;RBI=0.0203583;REFB=0;REVB=-0.0147484;RO=0;SAF=17;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.60901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.90594e-06;OID=.;OPOS=95211610;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:16:17:0:0:16:17:0:0
chr4	95503902	.	T	C	266.55	PASS	AF=0.447761;AO=29;DP=66;FAO=30;FDP=67;FR=.;FRO=37;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=25;FWDB=-0.0345905;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.3195;QD=15.9131;RBI=0.0346117;REFB=-0.0138016;REVB=0.00121142;RO=37;SAF=14;SAR=15;SRF=12;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158894;STB=0.596953;STBP=0.192;TYPE=snp;VARB=0.0152337;OID=.;OPOS=95503902;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:67:37:37:29:30:0.447761:15:14:12:25:15:15:12:25
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chr4	95539267	.	G	A	727.86	PASS	AF=0.963636;AO=53;DP=55;FAO=53;FDP=55;FR=.;FRO=2;FSAF=20;FSAR=33;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.000105785;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.195;QD=52.9354;RBI=0.00185174;REFB=-0.0623862;REVB=0.00184871;RO=2;SAF=20;SAR=33;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0448028;STB=0.5238;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=0.000729974;OID=.;OPOS=95539267;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:55:55:2:2:53:53:0.963636:33:20:2:0:33:20:2:0
chr4	95561459	.	A	G	82.3	PASS	AF=0.289474;AO=10;DP=37;FAO=11;FDP=38;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=0.0437822;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.7;QD=8.66281;RBI=0.0442141;REFB=-0.000624486;REVB=0.00616456;RO=27;SAF=5;SAR=5;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0651077;STB=0.5713;STBP=0.607;TYPE=snp;VARB=0.00185777;OID=.;OPOS=95561459;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:82:37:38:27:27:10:11:0.289474:5:5:12:15:5:6:12:15
chr4	95578588	.	G	A	1901.05	PASS	AF=1;AO=123;DP=123;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0104474;FXX=0.00806387;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.1936;QD=61.8228;RBI=0.0110292;REFB=0;REVB=-0.00353479;RO=0;SAF=67;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.60146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000975689;OID=.;OPOS=95578588;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:123:123:0:0:123:123:1:56:67:0:0:56:67:0:0
chr4	95587587	.	T	C	394.02	PASS	AF=0.424528;AO=45;DP=105;FAO=45;FDP=106;FR=.;FRO=61;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=29;FSRR=32;FWDB=0.0423772;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=81.0577;QD=14.8687;RBI=0.0508121;REFB=0.0170245;REVB=-0.0280365;RO=60;SAF=22;SAR=23;SRF=29;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00565188;STB=0.50776;STBP=0.887;TYPE=snp;VARB=-0.0153301;OID=.;OPOS=95587587;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:106:60:61:45:45:0.424528:23:22:29:31:23:22:29:32
chr4	95588075	.	G	A	226.09	PASS	AF=0.295238;AO=31;DP=105;FAO=31;FDP=105;FR=.;FRO=74;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=37;FSRR=37;FWDB=-0.0358514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.1119;QD=8.61296;RBI=0.0369339;REFB=-0.017439;REVB=-0.0088764;RO=73;SAF=14;SAR=17;SRF=37;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0658953;STB=0.534174;STBP=0.647;TYPE=snp;VARB=0.0362042;OID=.;OPOS=95588075;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:105:73:74:31:31:0.295238:17:14:37:36:17:14:37:37
chr4	96075965	.	C	T	328.66	PASS	AF=0.479452;AO=32;DP=70;FAO=35;FDP=73;FR=.;FRO=38;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=0.00417383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.793;QD=18.0087;RBI=0.0377064;REFB=-0.0084044;REVB=0.0374746;RO=37;SAF=16;SAR=16;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129037;STB=0.507435;STBP=0.889;TYPE=snp;VARB=0.00948318;OID=.;OPOS=96075965;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:73:37:38:32:35:0.479452:16:16:19:18:18:17:19:19
chr4	96106322	.	A	G	1609.66	PASS	AF=1;AO=106;DP=108;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0103449;FXX=0.0092584;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.209;QD=60.1741;RBI=0.0122312;REFB=0;REVB=0.00652583;RO=0;SAF=40;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.2347e-06;OID=.;OPOS=96106322;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:108:107:0:0:106:107:1:66:40:0:0:66:41:0:0
chr4	96169733	.	G	T	205.09	PASS	AF=0.42;AO=21;DP=50;FAO=21;FDP=50;FR=.;FRO=29;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=20;FSRR=9;FWDB=-0.00651843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.8938;QD=16.4071;RBI=0.0239842;REFB=-0.01748;REVB=-0.0230815;RO=29;SAF=14;SAR=7;SRF=20;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0264746;STB=0.515137;STBP=0.886;TYPE=snp;VARB=0.0143163;OID=.;OPOS=96169733;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:29:29:21:21:0.42:7:14:20:9:7:14:20:9
chr4	96256616	.	A	G	1339.61	PASS	AF=1;AO=85;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0341005;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.7834;QD=62.3076;RBI=0.0341598;REFB=0;REVB=-0.0020121;RO=0;SAF=47;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.83693e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00024437;OID=.;OPOS=96256616;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:86:0:0:85:86:1:38:47:0:0:38:48:0:0
chr4	96256673	.	G	A	1396.41	PASS	AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0010409;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=119.974;QD=62.7602;RBI=0.0121618;REFB=0;REVB=0.0121171;RO=0;SAF=52;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.9917e-05;OID=.;OPOS=96256673;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:37:52:0:0:37:52:0:0
chr4	97270063	.	C	A	731.77	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0308939;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.149;QD=63.6325;RBI=0.0512866;REFB=0;REVB=0.0409375;RO=0;SAF=15;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000214435;OID=.;OPOS=97270063;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:31:15:0:0:31:15:0:0
chr4	98902409	.	C	T	266.56	PASS	AF=0.392405;AO=31;DP=79;FAO=31;FDP=79;FR=.;FRO=48;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=25;FSRR=23;FWDB=-0.0463995;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.1485;QD=13.4967;RBI=0.0481491;REFB=-0.00631488;REVB=-0.0128618;RO=48;SAF=17;SAR=14;SRF=25;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0294952;STB=0.516834;STBP=0.821;TYPE=snp;VARB=0.00697236;OID=.;OPOS=98902409;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:48:48:31:31:0.392405:14:17:25:23:14:17:25:23
chr4	99218108	.	G	GA	194.59	PASS	AF=0.454545;AO=30;DP=71;FAO=30;FDP=66;FR=.;FRO=36;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=0.00171147;FXX=0.043472;HRUN=0;LEN=1;MLLD=150.453;QD=11.7936;RBI=0.0230035;REFB=-0.0139576;REVB=0.0229397;RO=41;SAF=13;SAR=17;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0310199;STB=0.521458;STBP=0.764;TYPE=ins;VARB=0.0154573;OID=.;OPOS=99218109;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.454545:30:71:30:66:36:13:17:17:19:99:41:13:17:19:22
chr4	99363485	.	G	A	348.78	PASS	AF=0.385321;AO=41;DP=106;FAO=42;FDP=109;FR=.;FRO=67;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=30;FSRR=37;FWDB=-0.0343823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.796;QD=12.7992;RBI=0.0344056;REFB=-0.00146755;REVB=-0.00126588;RO=65;SAF=19;SAR=22;SRF=28;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.035516;STB=0.517536;STBP=0.781;TYPE=snp;VARB=0.00231228;OID=.;OPOS=99363485;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:109:65:67:41:42:0.385321:22:19:28:37:22:20:30:37
chr4	99802070	.	A	C	38.15	PASS	AF=0.4;AO=6;DP=15;FAO=6;FDP=15;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=-0.017132;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=275.729;QD=10.1734;RBI=0.0173289;REFB=-0.00319504;REVB=-0.0026048;RO=9;SAF=4;SAR=2;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00619182;OID=.;OPOS=99802070;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:15:15:9:9:6:6:0.4:2:4:6:3:2:4:6:3
chr4	99850126	.	A	G	136.95	PASS	AF=0.326531;AO=16;DP=49;FAO=16;FDP=49;FR=.;FRO=33;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=0.000380186;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.913;QD=11.1798;RBI=0.0300094;REFB=-0.0331463;REVB=-0.030007;RO=29;SAF=7;SAR=9;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161739;STB=0.572429;STBP=0.485;TYPE=snp;VARB=0.0332406;OID=.;OPOS=99850126;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:29:33:16:16:0.326531:9:7:17:12:9:7:18:15
chr4	99926965	.	T	C	50.47	PASS	AF=0.583333;AO=7;DP=12;FAO=7;FDP=12;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.00986303;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.481;QD=16.8229;RBI=0.0172539;REFB=-0.00939997;REVB=-0.0141569;RO=5;SAF=2;SAR=5;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0775494;STB=0.54533;STBP=0.803;TYPE=snp;VARB=0.00596923;OID=.;OPOS=99926965;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:12:12:5:5:7:7:0.583333:5:2:1:4:5:2:1:4
chr4	99952710	.	A	G	309.45	PASS	AF=0.365385;AO=38;DP=104;FAO=38;FDP=104;FR=.;FRO=66;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=36;FSRR=30;FWDB=-0.00535318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.853;QD=11.902;RBI=0.00800603;REFB=-0.00689866;REVB=-0.00595315;RO=66;SAF=20;SAR=18;SRF=36;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0212922;STB=0.512189;STBP=0.856;TYPE=snp;VARB=0.0147536;OID=.;OPOS=99952710;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:104:66:66:38:38:0.365385:18:20:36:30:18:20:36:30
chr4	100045574	.	T	C	538.53	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00341484;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.761;QD=59.8363;RBI=0.0188499;REFB=0;REVB=0.018538;RO=0;SAF=20;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.9376e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.71085e-05;OID=.;OPOS=100045574;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:16:20:0:0:16:20:0:0
chr4	100045616	.	C	T	489.21	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00880827;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.425;QD=59.2976;RBI=0.00886034;REFB=0;REVB=-0.00095918;RO=0;SAF=17;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.60901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00277285;OID=.;OPOS=100045616;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:16:17:0:0:16:17:0:0
chr4	100045647	.	A	G	411.12	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.121;QD=56.7056;RBI=0.0168983;REFB=0;REVB=0.00912719;RO=0;SAF=13;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000119556;OID=.;OPOS=100045647;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:16:13:0:0:16:13:0:0
chr4	100048414	.	T	C	1196.87	PASS	AF=1;AO=78;DP=80;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0169129;FXX=0.0249969;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.119;QD=61.3778;RBI=0.0793139;REFB=0;REVB=0.0774897;RO=0;SAF=48;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000428981;OID=.;OPOS=100048414;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:80:78:0:0:78:78:1:30:48:0:0:30:48:0:0
chr4	100048472	.	G	A	246.72	PASS	AF=0.451613;AO=28;DP=62;FAO=28;FDP=62;FR=.;FRO=34;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=0.00166966;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=253.026;QD=15.9175;RBI=0.00324837;REFB=-0.0114005;REVB=-0.00278642;RO=34;SAF=15;SAR=13;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0226057;STB=0.512752;STBP=0.881;TYPE=snp;VARB=0.0155461;OID=.;OPOS=100048472;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:34:34:28:28:0.451613:13:15:19:15:13:15:19:15
chr4	100052733	.	C	A	524.01	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00661879;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.286;QD=59.887;RBI=0.0132348;REFB=0;REVB=0.0114609;RO=0;SAF=17;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000127645;OID=.;OPOS=100052733;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:18:17:0:0:18:17:0:0
chr4	100062819	.	A	G	670.27	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0154939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.896;QD=62.3509;RBI=0.0334588;REFB=0;REVB=0.0296552;RO=0;SAF=22;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000137185;OID=.;OPOS=100062819;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:21:22:0:0:21:22:0:0
chr4	100064247	.	G	T	260.5	PASS	AF=0.416667;AO=30;DP=72;FAO=30;FDP=72;FR=.;FRO=42;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=24;FWDB=-0.0349406;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.4184;QD=14.4721;RBI=0.0355217;REFB=0.0308653;REVB=0.00639838;RO=42;SAF=16;SAR=14;SRF=18;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107284;STB=0.560845;STBP=0.421;TYPE=snp;VARB=-0.0423304;OID=.;OPOS=100064247;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:42:42:30:30:0.416667:14:16:18:24:14:16:18:24
chr4	100064305	.	C	G	1135.25	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000804777;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.457;QD=60.5468;RBI=0.00573041;REFB=0;REVB=0.00567362;RO=0;SAF=44;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.33355e-05;OID=.;OPOS=100064305;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:31:44:0:0:31:44:0:0
chr4	100140306	.	A	T	902.62	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00587647;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.3116;QD=58.2336;RBI=0.0277728;REFB=0;REVB=0.0271439;RO=0;SAF=26;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51662e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000154554;OID=.;OPOS=100140306;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:36:26:0:0:36:26:0:0
chr4	100235053	.	A	G	473.75	PASS	AF=0.349112;AO=58;DP=164;FAO=59;FDP=169;FR=.;FRO=110;FSAF=38;FSAR=21;FSRF=64;FSRR=46;FWDB=0.00920738;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.1388;QD=11.213;RBI=0.0328224;REFB=0.0050079;REVB=-0.0315045;RO=106;SAF=37;SAR=21;SRF=64;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0412259;STB=0.543074;STBP=0.412;TYPE=snp;VARB=-0.0103471;OID=.;OPOS=100235053;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:164:169:106:110:58:59:0.349112:21:37:64:42:21:38:64:46
chr4	100239319	.	T	C	1785.56	PASS	AF=1;AO=117;DP=117;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0214251;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.7541;QD=61.0449;RBI=0.0260275;REFB=0;REVB=0.0147782;RO=0;SAF=52;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.10611e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000193299;OID=.;OPOS=100239319;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:117:117:0:0:117:117:1:65:52:0:0:65:52:0:0
chr4	100266133	.	T	C	2021.55	PASS	AF=1;AO=129;DP=129;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0346347;FXX=0.00763301;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.275;QD=62.2015;RBI=0.0386713;REFB=0;REVB=0.0172019;RO=0;SAF=72;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000137559;OID=.;OPOS=100266133;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:129:130:0:0:129:130:1:57:72:0:0:57:73:0:0
chr4	100268190	.	A	C	2547.5	PASS	AF=0.994048;AO=165;DP=166;FAO=167;FDP=168;FR=.;FRO=1;FSAF=78;FSAR=89;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0337688;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.7918;QD=60.6548;RBI=0.034043;REFB=-0.0563507;REVB=-0.00431233;RO=1;SAF=76;SAR=89;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00622056;STB=0.503184;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=0.00042231;OID=.;OPOS=100268190;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:166:168:1:1:165:167:0.994048:89:76:1:0:89:78:1:0
chr4	100443720	.	G	A	1320.77	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00550663;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=54.8395;QD=61.431;RBI=0.0789652;REFB=0;REVB=-0.0787729;RO=0;SAF=36;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000549923;OID=.;OPOS=100443720;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:50:36:0:0:50:36:0:0
chr4	100443782	.	T	C	974.44	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.14752;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.45;QD=57.3197;RBI=0.167667;REFB=0;REVB=0.0796855;RO=0;SAF=31;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00114929;OID=.;OPOS=100443782;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:68:0:0:61:68:1:30:31:0:0:30:38:0:0
chr4	100443784	.	C	G	794.86	PASS	AF=0.882353;AO=60;DP=68;FAO=60;FDP=68;FR=.;FRO=8;FSAF=35;FSAR=25;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.0501052;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.755;QD=46.7562;RBI=0.0501263;REFB=-0.0805069;REVB=0.00145602;RO=3;SAF=35;SAR=25;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0533243;STB=0.524992;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=0.00137408;OID=.;OPOS=100443784;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:68:68:3:8:60:60:0.882353:25:35:0:3:25:35:3:5
chr4	100443800	.	G	A	802.72	PASS	AF=0.982759;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0114904;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.3686;QD=55.3601;RBI=0.0190885;REFB=0.0088554;REVB=-0.0152427;RO=0;SAF=32;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50769;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=-0.00217716;OID=.;OPOS=100443800;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:58:58:0:1:57:57:0.982759:25:32:0:0:25:32:1:0
chr4	100457117	.	A	ACAGT,T	669.73	PASS	AF=0.909091,0.0909091;AO=40,3;DP=43;FAO=40,4;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=17,3;FSAR=23,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0085189,0.00787014;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=4,1;MLLD=237.511,95.6832;QD=60.8842;RBI=0.0150941,0.0108734;REFB=0,0;REVB=0.0124604,0.00750275;RO=0;SAF=17,2;SAR=23,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=6.4817e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.00345906,-0.0536449;OID=.,.;OPOS=100457118,100457117;OREF=-,A;OALT=CAGT,T;OMAPALT=ACAGT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:19:43:44:0:0:40,3:40,4:0.909091,0.0909091:23,1:17,2:0:0:23,1:17,3:0:0
chr4	100485255	.	G	A	101.9	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0067456;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181;QD=40.76;RBI=0.030149;REFB=0;REVB=0.0293847;RO=0;SAF=9;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.8593e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000261208;OID=.;OPOS=100485255;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:1:9:0:0:1:9:0:0
chr4	100504664	.	T	C	1118.85	PASS	AF=1;AO=55;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0163493;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.6235;QD=59.6718;RBI=0.0508722;REFB=0;REVB=0.0481734;RO=1;SAF=16;SAR=39;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.011936;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000424545;OID=.;OPOS=100504664;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:75:1:0:55:75:1:39:16:0:1:41:34:0:0
chr4	100784980	.	C	T	265.83	PASS	AF=0.5;AO=24;DP=49;FAO=25;FDP=50;FR=.;FRO=25;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=-0.0384862;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.17;QD=21.2662;RBI=0.0389124;REFB=-0.0137505;REVB=0.00574335;RO=25;SAF=16;SAR=8;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177053;STB=0.582714;STBP=0.261;TYPE=snp;VARB=0.0177001;OID=.;OPOS=100784980;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:50:25:25:24:25:0.5:8:16:12:13:9:16:12:13
chr4	100805207	.	C	A	490.55	PASS	AF=0.534091;AO=47;DP=87;FAO=47;FDP=88;FR=.;FRO=41;FSAF=23;FSAR=24;FSRF=10;FSRR=31;FWDB=-0.0446627;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.594;QD=22.2977;RBI=0.0447563;REFB=-0.00248984;REVB=-0.00289371;RO=40;SAF=23;SAR=24;SRF=10;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.201869;STB=0.614927;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.00250118;OID=.;OPOS=100805207;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:88:40:41:47:47:0.534091:24:23:10:30:24:23:10:31
chr4	101368661	.	A	G	241.53	PASS	AF=0.522727;AO=23;DP=44;FAO=23;FDP=44;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0287179;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.081;QD=21.9572;RBI=0.0295906;REFB=-0.0359314;REVB=-0.00713325;RO=21;SAF=11;SAR=12;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0387692;STB=0.52172;STBP=0.781;TYPE=snp;VARB=0.0262177;OID=.;OPOS=101368661;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:21:21:23:23:0.522727:12:11:11:10:12:11:11:10
chr4	101401161	.	TAAC	T	449.72	PASS	AF=0.478873;AO=65;DP=142;FAO=68;FDP=142;FR=.;FRO=74;FSAF=32;FSAR=36;FSRF=32;FSRR=42;FWDB=-0.00563125;FXX=0.0138879;HRUN=2;LEN=3;MLLD=228.333;QD=12.6681;RBI=0.0058866;REFB=0.00167352;REVB=-0.00171495;RO=67;SAF=31;SAR=34;SRF=28;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0545214;STB=0.519994;STBP=0.661;TYPE=del;VARB=-0.00171357;OID=.;OPOS=101401162;OREF=AAC;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.478873:65:142:68:142:74:32:36:32:42:99:67:31:34:28:39
chr4	102251501	.	T	C	2078.39	PASS	AF=1;AO=133;DP=133;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0285423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.9705;QD=62.5078;RBI=0.0717808;REFB=0;REVB=0.0658621;RO=0;SAF=73;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.80485e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000291915;OID=.;OPOS=102251501;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:133:133:0:0:133:133:1:60:73:0:0:60:73:0:0
chr4	102965043	.	T	C	769.49	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00204506;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.1;QD=56.9996;RBI=0.0367614;REFB=0;REVB=0.0367045;RO=0;SAF=21;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.70667e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000183025;OID=.;OPOS=102965043;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:33:21:0:0:33:21:0:0
chr4	103225513	.	T	C	456.21	PASS	AF=0.458716;AO=50;DP=107;FAO=50;FDP=109;FR=.;FRO=59;FSAF=30;FSAR=20;FSRF=31;FSRR=28;FWDB=-0.00483353;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.3176;QD=16.7416;RBI=0.00611942;REFB=-0.0182184;REVB=0.0037529;RO=57;SAF=30;SAR=20;SRF=29;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0890267;STB=0.541337;STBP=0.455;TYPE=snp;VARB=0.0258736;OID=.;OPOS=103225513;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:109:57:59:50:50:0.458716:20:30:29:28:20:30:31:28
chr4	103228734	.	C	T	265.19	PASS	AF=0.491525;AO=29;DP=59;FAO=29;FDP=59;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=11;FWDB=-0.00359259;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.3809;QD=17.9789;RBI=0.0235782;REFB=-0.005188;REVB=0.0233029;RO=30;SAF=13;SAR=16;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166835;STB=0.593216;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=0.00389607;OID=.;OPOS=103228734;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:30:30:29:29:0.491525:16:13:19:11:16:13:19:11
chr4	103514658	.	T	C	894.02	PASS	AF=0.984127;AO=63;DP=64;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=54;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00679035;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.814;QD=56.763;RBI=0.0199212;REFB=-0.148643;REVB=0.0187282;RO=1;SAF=54;SAR=9;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0086669;STB=0.504586;STBP=0.648;TYPE=snp;VARB=0.00232196;OID=.;OPOS=103514658;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:64:63:1:1:63:62:0.984127:9:54:1:0:8:54:1:0
chr4	103611845	.	C	T	312.08	PASS	AF=0.515625;AO=33;DP=64;FAO=33;FDP=64;FR=.;FRO=31;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=-0.00580581;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.8904;QD=19.5049;RBI=0.00588164;REFB=-0.0166008;REVB=0.000941437;RO=31;SAF=21;SAR=12;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218754;STB=0.621702;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.0247562;OID=.;OPOS=103611845;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:31:31:33:33:0.515625:12:21:12:19:12:21:12:19
chr4	103808862	.	T	C	33.76	PASS	AF=0.162162;AO=6;DP=37;FAO=6;FDP=37;FR=.;FRO=31;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=-0.00796642;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=200.268;QD=3.64932;RBI=0.00999694;REFB=-0.00326316;REVB=-0.00603945;RO=31;SAF=5;SAR=1;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.404516;STB=0.791031;STBP=0.165;TYPE=snp;VARB=0.0167339;OID=.;OPOS=103808862;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:37:37:31:31:6:6:0.162162:1:5:16:15:1:5:16:15
chr4	103832597	.	A	G	39.74	PASS	AF=0.137255;AO=7;DP=51;FAO=7;FDP=51;FR=.;FRO=44;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=21;FSRR=23;FWDB=-0.0137481;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.9652;QD=3.11669;RBI=0.045173;REFB=-0.00889628;REVB=0.0430301;RO=42;SAF=5;SAR=2;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.286813;STB=0.705622;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.0257327;OID=.;OPOS=103832597;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:39:51:51:42:44:7:7:0.137255:2:5:20:22:2:5:21:23
chr4	103832611	.	G	A	35.87	PASS	AF=0.118644;AO=7;DP=59;FAO=7;FDP=59;FR=.;FRO=52;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=27;FSRR=25;FWDB=0.00250316;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.486;QD=2.43216;RBI=0.0739369;REFB=-0.000156277;REVB=-0.0738945;RO=52;SAF=5;SAR=2;SRF=27;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.235859;STB=0.677868;STBP=0.376;TYPE=snp;VARB=0.00016137;OID=.;OPOS=103832611;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:59:59:52:52:7:7:0.118644:2:5:27:25:2:5:27:25
chr4	103832665	.	T	C	32.21	PASS	AF=0.104478;AO=7;DP=67;FAO=7;FDP=67;FR=.;FRO=60;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=31;FSRR=29;FWDB=-0.0168171;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.033;QD=1.92295;RBI=0.0299534;REFB=-0.00429295;REVB=0.0247869;RO=59;SAF=5;SAR=2;SRF=30;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.242801;STB=0.682284;STBP=0.386;TYPE=snp;VARB=0.043297;OID=.;OPOS=103832665;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:32:67:67:59:60:7:7:0.104478:2:5:30:29:2:5:31:29
chr4	103832687	.	T	C	32.21	PASS	AF=0.104478;AO=7;DP=67;FAO=7;FDP=67;FR=.;FRO=60;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=31;FSRR=29;FWDB=0.00994303;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.814;QD=1.92272;RBI=0.0102248;REFB=0.00107545;REVB=0.00238382;RO=58;SAF=5;SAR=2;SRF=29;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.252253;STB=0.682284;STBP=0.386;TYPE=snp;VARB=-0.0151852;OID=.;OPOS=103832687;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:32:67:67:58:60:7:7:0.104478:2:5:29:29:2:5:31:29
chr4	103866480	.	G	A	84.34	PASS	AF=0.34375;AO=11;DP=32;FAO=11;FDP=32;FR=.;FRO=21;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=6;FWDB=0.00670057;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.416;QD=10.5422;RBI=0.0124243;REFB=-0.00390237;REVB=-0.0104625;RO=21;SAF=3;SAR=8;SRF=15;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.461065;STB=0.773729;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.00887982;OID=.;OPOS=103866480;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:32:32:21:21:11:11:0.34375:8:3:15:6:8:3:15:6
chr4	103911069	.	C	A	450.87	PASS	AF=1;AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000557257;FXX=0.0312402;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.411;QD=58.177;RBI=0.0118647;REFB=0;REVB=0.0118516;RO=0;SAF=16;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.40911e-05;OID=.;OPOS=103911069;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:31:0:0:31:31:1:15:16:0:0:15:16:0:0
chr4	106155185	.	C	G	275.1	PASS	AF=0.483871;AO=30;DP=63;FAO=30;FDP=62;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=10;FWDB=0.0419292;FXX=0.0158705;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.3117;QD=17.7487;RBI=0.0716374;REFB=0.0163786;REVB=0.0580849;RO=32;SAF=14;SAR=16;SRF=22;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202033;STB=0.612693;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=-0.0141062;OID=.;OPOS=106155185;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:62:32:32:30:30:0.483871:16:14:22:10:16:14:22:10
chr4	106155751	.	G	A	241.67	PASS	AF=0.522727;AO=23;DP=44;FAO=23;FDP=44;FR=.;FRO=21;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=6;FWDB=0.0123931;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.926;QD=21.9698;RBI=0.0135282;REFB=-0.0306331;REVB=0.00542432;RO=21;SAF=17;SAR=6;SRF=15;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0269807;STB=0.515138;STBP=0.895;TYPE=snp;VARB=0.0201711;OID=.;OPOS=106155751;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:21:21:23:23:0.522727:6:17:15:6:6:17:15:6
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chr4	106159644	.	T	A	296.6	PASS	AF=0.958333;AO=23;DP=24;FAO=23;FDP=24;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0288226;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=293.665;QD=49.4331;RBI=0.0288797;REFB=-0.0576159;REVB=0.00181421;RO=1;SAF=16;SAR=7;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0280632;STB=0.515138;STBP=0.599;TYPE=snp;VARB=0.000194001;OID=.;OPOS=106159644;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:24:24:1:1:23:23:0.958333:7:16:1:0:7:16:1:0
chr4	106160224	.	G	T	65.12	PASS	AF=0.4;AO=5;DP=25;FAO=12;FDP=30;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=0.0172441;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.392;QD=8.68222;RBI=0.0433102;REFB=-0.0136042;REVB=0.0397293;RO=15;SAF=3;SAR=2;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.222219;STB=0.517017;STBP=0.924;TYPE=snp;VARB=0.0208801;OID=.;OPOS=106160224;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:25:30:15:18:5:12:0.4:2:3:6:9:5:7:10:8
chr4	106160231	.	G	T	74.68	PASS	AF=0.354839;AO=11;DP=33;FAO=11;FDP=31;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.028588;FXX=0.0605877;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.497;QD=9.63629;RBI=0.04297;REFB=-0.0177591;REVB=0.0320804;RO=19;SAF=8;SAR=3;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.232226;STB=0.657925;STBP=0.249;TYPE=snp;VARB=0.0266798;OID=.;OPOS=106160231;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:33:31:19:20:11:11:0.354839:3:8:10:9:3:8:10:10
chr4	106163434	.	G	GT	32.78	PASS	AF=0.296296;AO=17;DP=63;FAO=16;FDP=54;FR=.;FRO=38;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=-0.070499;FXX=0.0181785;HRUN=7;LEN=1;MLLD=7.39232;QD=2.42803;RBI=0.0809356;REFB=-0.0670745;REVB=0.039755;RO=42;SAF=7;SAR=10;SRF=16;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0379457;STB=0.583225;STBP=0.41;TYPE=ins;VARB=0.0590159;OID=.;OPOS=106163435;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.296296:17:63:16:54:38:5:11:16:22:32:42:7:10:16:26
chr4	106190862	.	T	C	163.37	PASS	AF=0.35;AO=21;DP=61;FAO=21;FDP=60;FR=.;FRO=39;FSAF=3;FSAR=18;FSRF=22;FSRR=17;FWDB=0.00190771;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.21;QD=10.8915;RBI=0.0213579;REFB=-0.00429827;REVB=0.0212725;RO=39;SAF=3;SAR=18;SRF=22;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.524362;STB=0.810484;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0200581;OID=.;OPOS=106190862;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:60:39:39:21:21:0.35:18:3:22:17:18:3:22:17
chr4	106328200	.	A	G	91.23	PASS	AF=0.52381;AO=11;DP=21;FAO=11;FDP=21;FR=.;FRO=10;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=-0.0176028;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.863;QD=17.3781;RBI=0.0250733;REFB=-0.0036623;REVB=-0.0178553;RO=10;SAF=8;SAR=3;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.286528;STB=0.666349;STBP=0.163;TYPE=snp;VARB=0.00245699;OID=.;OPOS=106328200;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:21:21:10:10:11:11:0.52381:3:8:4:6:3:8:4:6
chr4	106474096	.	T	C	524.16	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000375596;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.131;QD=59.9045;RBI=0.00514393;REFB=0;REVB=-0.0051302;RO=0;SAF=20;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000214287;OID=.;OPOS=106474096;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:15:20:0:0:15:20:0:0
chr4	106861730	.	A	G	1076.52	PASS	AF=1;AO=67;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0654552;FXX=0.0270234;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.413;QD=59.8068;RBI=0.0660084;REFB=0;REVB=-0.00852775;RO=0;SAF=24;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000235922;OID=.;OPOS=106861730;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:72:0:0:67:72:1:43:24:0:0:43:29:0:0
chr4	106924931	.	G	A	1121.71	PASS	AF=1;AO=72;DP=75;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0141692;FXX=0.0263123;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.514;QD=60.6331;RBI=0.0395587;REFB=0;REVB=0.0369341;RO=0;SAF=43;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.16073e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000552988;OID=.;OPOS=106924931;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:74:0:0:72:74:1:29:43:0:0:31:43:0:0
chr4	107133919	.	A	G	287.99	PASS	AF=0.568627;AO=29;DP=53;FAO=29;FDP=51;FR=.;FRO=22;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=4;FWDB=0.02056;FXX=0.0377287;HRUN=3;LEN=1;MLLD=296.06;QD=22.5876;RBI=0.0218257;REFB=-0.0108785;REVB=0.00732432;RO=22;SAF=20;SAR=9;SRF=18;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123798;STB=0.568062;STBP=0.329;TYPE=snp;VARB=0.00793468;OID=.;OPOS=107133919;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:51:22:22:29:29:0.568627:9:20:18:4:9:20:18:4
chr4	107156462	.	C	T	963.71	PASS	AF=0.469767;AO=101;DP=214;FAO=101;FDP=215;FR=.;FRO=114;FSAF=46;FSAR=55;FSRF=61;FSRR=53;FWDB=-0.00198718;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=294.295;QD=17.9294;RBI=0.00858264;REFB=-0.0122199;REVB=-0.00834943;RO=111;SAF=45;SAR=56;SRF=59;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0817509;STB=0.542238;STBP=0.239;TYPE=snp;VARB=0.0122727;OID=.;OPOS=107156462;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:214:215:111:114:101:101:0.469767:56:45:59:52:55:46:61:53
chr4	107168431	.	G	C	972.85	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0178804;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.1924;QD=58.9605;RBI=0.0489561;REFB=0;REVB=0.045574;RO=0;SAF=21;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000498525;OID=.;OPOS=107168431;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:66:0:0:65:66:1:44:21:0:0:45:21:0:0
chr4	107171637	.	TAAATA	T	541.61	PASS	AF=0.48503;AO=81;DP=177;FAO=81;FDP=167;FR=.;FRO=86;FSAF=40;FSAR=41;FSRF=31;FSRR=55;FWDB=-0.00294701;FXX=0.0118336;HRUN=3;LEN=5;MLLD=245.568;QD=12.9726;RBI=0.00864432;REFB=-0.0041856;REVB=0.00812646;RO=84;SAF=41;SAR=40;SRF=32;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115618;STB=0.568788;STBP=0.099;TYPE=del;VARB=0.00495667;OID=.;OPOS=107171638;OREF=AAATA;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.48503:81:177:81:167:86:40:41:31:55:99:84:41:40:32:52
chr4	107279450	.	C	T	536.17	PASS	AF=0.42963;AO=58;DP=135;FAO=58;FDP=135;FR=.;FRO=77;FSAF=29;FSAR=29;FSRF=33;FSRR=44;FWDB=0.000926773;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.45;QD=15.8865;RBI=0.0186278;REFB=0.0051847;REVB=-0.0186048;RO=76;SAF=29;SAR=29;SRF=32;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0800919;STB=0.540727;STBP=0.434;TYPE=snp;VARB=-0.00378111;OID=.;OPOS=107279450;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:135:135:76:77:58:58:0.42963:29:29:32:44:29:29:33:44
chr4	107279482	.	T	A	640.45	PASS	AF=0.44898;AO=66;DP=147;FAO=66;FDP=147;FR=.;FRO=81;FSAF=35;FSAR=31;FSRF=35;FSRR=46;FWDB=0.0147551;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=249.127;QD=17.4272;RBI=0.0167864;REFB=-0.00420747;REVB=-0.00800429;RO=81;SAF=35;SAR=31;SRF=35;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0969553;STB=0.553941;STBP=0.273;TYPE=snp;VARB=0.00596772;OID=.;OPOS=107279482;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:147:147:81:81:66:66:0.44898:31:35:35:46:31:35:35:46
chr4	107288334	.	A	T	772.83	PASS	AF=0.457627;AO=81;DP=180;FAO=81;FDP=177;FR=.;FRO=96;FSAF=45;FSAR=36;FSRF=59;FSRR=37;FWDB=-0.0352522;FXX=0.0220982;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.5271;QD=17.465;RBI=0.0378545;REFB=-0.0144132;REVB=0.013793;RO=97;SAF=45;SAR=36;SRF=61;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0736575;STB=0.532642;STBP=0.463;TYPE=snp;VARB=0.0169875;OID=.;OPOS=107288334;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:180:177:97:96:81:81:0.457627:36:45:61:36:36:45:59:37
chr4	107845794	.	C	T	525.41	PASS	AF=0.495495;AO=55;DP=112;FAO=55;FDP=111;FR=.;FRO=56;FSAF=27;FSAR=28;FSRF=28;FSRR=28;FWDB=-0.0142034;FXX=0.00892777;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.7561;QD=18.9335;RBI=0.0199374;REFB=0.00100676;REVB=-0.0139914;RO=55;SAF=27;SAR=28;SRF=27;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504586;STBP=0.888;TYPE=snp;VARB=-0.00138874;OID=.;OPOS=107845794;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:111:55:56:55:55:0.495495:28:27:27:28:28:27:28:28
chr4	108641300	.	T	C	1369.95	PASS	AF=0.957895;AO=89;DP=93;FAO=91;FDP=95;FR=.;FRO=4;FSAF=50;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0249489;FXX=0.0104156;HRUN=3;LEN=1;MLLD=106.267;QD=57.682;RBI=0.0372596;REFB=-0.0443104;REVB=-0.0276737;RO=4;SAF=49;SAR=40;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0246548;STB=0.512698;STBP=0.27;TYPE=snp;VARB=0.00146926;OID=.;OPOS=108641300;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:93:95:4:4:89:91:0.957895:40:49:1:3:41:50:1:3
chr4	108641317	.	G	A	467.49	PASS	AF=0.516854;AO=45;DP=88;FAO=46;FDP=89;FR=.;FRO=43;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=23;FSRR=20;FWDB=0.047623;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.5173;QD=21.0107;RBI=0.0488442;REFB=-0.0068488;REVB=-0.010854;RO=43;SAF=24;SAR=21;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00137514;STB=0.504179;STBP=0.946;TYPE=snp;VARB=0.00700183;OID=.;OPOS=108641317;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:89:43:43:45:46:0.516854:21:24:23:20:21:25:23:20
chr4	108931039	.	T	C	1261.29	PASS	AF=1;AO=81;DP=81;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0804102;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.7883;QD=61.5265;RBI=0.0804105;REFB=0;REVB=0.000182444;RO=0;SAF=26;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000693475;OID=.;OPOS=108931039;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:82:0:0:81:82:1:55:26:0:0:55:27:0:0
chr4	108969883	.	G	A	465.57	PASS	AF=0.433333;AO=51;DP=123;FAO=52;FDP=120;FR=.;FRO=68;FSAF=23;FSAR=29;FSRF=37;FSRR=31;FWDB=0.0408411;FXX=0.0322555;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.0144;QD=15.519;RBI=0.0421628;REFB=-0.016912;REVB=0.0104741;RO=67;SAF=22;SAR=29;SRF=36;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107534;STB=0.55767;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=0.0255445;OID=.;OPOS=108969883;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:123:120:67:68:51:52:0.433333:29:22:36:31:29:23:37:31
chr4	109674116	.	A	G	354.35	PASS	AF=0.545455;AO=36;DP=66;FAO=36;FDP=66;FR=.;FRO=30;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=0.00492868;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.981;QD=21.4756;RBI=0.00500781;REFB=-0.0108779;REVB=-0.000886702;RO=30;SAF=20;SAR=16;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0459741;STB=0.52541;STBP=0.688;TYPE=snp;VARB=0.0109711;OID=.;OPOS=109674116;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:30:30:36:36:0.545455:16:20:15:15:16:20:15:15
chr4	109735133	.	T	C	135.95	PASS	AF=0.483871;AO=15;DP=31;FAO=15;FDP=31;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.0353511;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.353;QD=17.5419;RBI=0.0459436;REFB=-0.0307797;REVB=0.0293448;RO=16;SAF=3;SAR=12;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.207948;STB=0.620512;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=0.0246108;OID=.;OPOS=109735133;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:16:16:15:15:0.483871:12:3:6:10:12:3:6:10
chr4	109745336	.	T	G	207.85	PASS	AF=0.446809;AO=21;DP=47;FAO=21;FDP=47;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=-0.0140463;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.952;QD=17.6896;RBI=0.0193941;REFB=0.0121563;REVB=-0.0133729;RO=25;SAF=11;SAR=10;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112262;STB=0.57253;STBP=0.4;TYPE=snp;VARB=-0.0176156;OID=.;OPOS=109745336;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:25:26:21:21:0.446809:10:11:16:9:10:11:17:9
chr4	109769899	.	C	T	366.72	PASS	AF=0.493506;AO=38;DP=77;FAO=38;FDP=77;FR=.;FRO=39;FSAF=26;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=-0.0153278;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.6146;QD=19.0504;RBI=0.0601361;REFB=-0.0183669;REVB=0.0581499;RO=39;SAF=26;SAR=12;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167376;STB=0.593469;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=0.0175722;OID=.;OPOS=109769899;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:39:39:38:38:0.493506:12:26:20:19:12:26:20:19
chr4	109969337	.	G	T	211.75	PASS	AF=0.488372;AO=21;DP=43;FAO=21;FDP=43;FR=.;FRO=22;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=0.0245506;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=196.622;QD=19.6973;RBI=0.035336;REFB=0.00676099;REVB=-0.0254146;RO=22;SAF=14;SAR=7;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0155251;STB=0.508764;STBP=0.934;TYPE=snp;VARB=-0.00684929;OID=.;OPOS=109969337;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:22:22:21:21:0.488372:7:14:15:7:7:14:15:7
chr4	110442602	.	A	G	295.75	PASS	AF=0.534483;AO=31;DP=58;FAO=31;FDP=58;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=-0.0075284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.841;QD=20.3963;RBI=0.00865404;REFB=-0.0126135;REVB=-0.00426798;RO=27;SAF=15;SAR=16;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0600255;STB=0.533312;STBP=0.622;TYPE=snp;VARB=0.00953057;OID=.;OPOS=110442602;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:27:27:31:31:0.534483:16:15:15:12:16:15:15:12
chr4	110581363	.	T	A	314.84	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0921498;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.0425;QD=52.4737;RBI=0.0921642;REFB=0;REVB=0.00162843;RO=0;SAF=12;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00287086;OID=.;OPOS=110581363;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:12:12:0:0:12:12:0:0
chr4	110661937	.	G	A	340.73	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0290613;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.788;QD=54.5166;RBI=0.0295537;REFB=0;REVB=-0.00537246;RO=0;SAF=8;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000249652;OID=.;OPOS=110661937;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:17:8:0:0:17:8:0:0
chr4	110667590	.	C	T	401.53	PASS	AF=0.482353;AO=41;DP=85;FAO=41;FDP=85;FR=.;FRO=44;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=21;FSRR=23;FWDB=-0.00245533;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.339;QD=18.8954;RBI=0.0134033;REFB=-0.0161271;REVB=-0.0131765;RO=44;SAF=17;SAR=24;SRF=21;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.059244;STB=0.533005;STBP=0.581;TYPE=snp;VARB=0.0169163;OID=.;OPOS=110667590;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:44:44:41:41:0.482353:24:17:21:23:24:17:21:23
chr4	110678925	.	T	C	686.03	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.163416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.9484;QD=62.3662;RBI=0.163428;REFB=0;REVB=0.00196459;RO=0;SAF=13;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00190719;OID=.;OPOS=110678925;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:44:0:0:40:44:1:27:13:0:0:28:16:0:0
chr4	110737389	.	T	C	767.92	PASS	AF=1;AO=48;DP=49;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0525697;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.477;QD=63.9935;RBI=0.0531699;REFB=0;REVB=0.00796709;RO=0;SAF=13;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.61818e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000264115;OID=.;OPOS=110737389;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:48:0:0:48:48:1:35:13:0:0:35:13:0:0
chr4	110757224	.	G	A	747.22	PASS	AF=0.583333;AO=70;DP=120;FAO=70;FDP=120;FR=.;FRO=50;FSAF=40;FSAR=30;FSRF=26;FSRR=24;FWDB=-0.000975288;FXX=0.0163921;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.135;QD=24.9072;RBI=0.00413768;REFB=-0.00934264;REVB=-0.0040211;RO=50;SAF=40;SAR=30;SRF=26;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0398905;STB=0.521733;STBP=0.602;TYPE=snp;VARB=0.00789591;OID=.;OPOS=110757224;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:120:50:50:70:70:0.583333:30:40:26:24:30:40:26:24
chr4	110757287	.	G	A	530.58	PASS	AF=0.524272;AO=54;DP=103;FAO=54;FDP=103;FR=.;FRO=49;FSAF=26;FSAR=28;FSRF=26;FSRR=23;FWDB=-0.0183413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.152;QD=20.6049;RBI=0.0216804;REFB=-0.0117348;REVB=0.0115602;RO=49;SAF=26;SAR=28;SRF=26;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0424156;STB=0.523356;STBP=0.642;TYPE=snp;VARB=0.0118589;OID=.;OPOS=110757287;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:103:49:49:54:54:0.524272:28:26:26:23:28:26:26:23
chr4	110773067	.	G	A	55.83	PASS	AF=0.380952;AO=8;DP=21;FAO=8;FDP=21;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.00752669;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.678;QD=10.6346;RBI=0.0089981;REFB=-0.0233843;REVB=0.004931;RO=13;SAF=5;SAR=3;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.242792;STB=0.646696;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=0.0437056;OID=.;OPOS=110773067;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:21:21:13:13:8:8:0.380952:3:5:5:8:3:5:5:8
chr4	110790911	.	A	T	466.07	PASS	AF=0.47619;AO=50;DP=107;FAO=50;FDP=105;FR=.;FRO=55;FSAF=33;FSAR=17;FSRF=21;FSRR=34;FWDB=-0.0147086;FXX=0.0186898;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.302;QD=17.7549;RBI=0.015136;REFB=-0.00585174;REVB=0.00357124;RO=57;SAF=33;SAR=17;SRF=21;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.279736;STB=0.646999;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.0099541;OID=.;OPOS=110790911;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:105:57:55:50:50:0.47619:17:33:21:36:17:33:21:34
chr4	110791361	.	G	A	141.32	PASS	AF=0.380952;AO=16;DP=42;FAO=16;FDP=42;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.0615954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.5094;QD=13.4586;RBI=0.0620853;REFB=-0.0172103;REVB=-0.00778403;RO=26;SAF=7;SAR=9;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0257591;STB=0.515041;STBP=0.888;TYPE=snp;VARB=0.0223918;OID=.;OPOS=110791361;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:26:26:16:16:0.380952:9:7:12:14:9:7:12:14
chr4	110791413	.	C	T	126.63	PASS	AF=0.333333;AO=15;DP=45;FAO=15;FDP=45;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=-0.0221853;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.169;QD=11.2561;RBI=0.0325984;REFB=-0.00825041;REVB=-0.0238845;RO=30;SAF=8;SAR=7;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0746519;STB=0.54432;STBP=0.697;TYPE=snp;VARB=0.0123272;OID=.;OPOS=110791413;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:30:30:15:15:0.333333:7:8:14:16:7:8:14:16
chr4	110791543	.	C	T	408.45	PASS	AF=0.5125;AO=41;DP=80;FAO=41;FDP=80;FR=.;FRO=39;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=14;FSRR=25;FWDB=-0.000707861;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=156.61;QD=20.4223;RBI=0.00213917;REFB=-0.000627162;REVB=0.00201866;RO=39;SAF=17;SAR=24;SRF=14;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0509801;STB=0.528205;STBP=0.638;TYPE=snp;VARB=0.000258697;OID=.;OPOS=110791543;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:39:39:41:41:0.5125:24:17:14:25:24:17:14:25
chr4	110901198	.	G	A	712.0	PASS	AF=0.503597;AO=69;DP=139;FAO=70;FDP=139;FR=.;FRO=69;FSAF=24;FSAR=46;FSRF=36;FSRR=33;FWDB=-0.0106189;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.608;QD=20.4892;RBI=0.0114361;REFB=-0.0141124;REVB=-0.00424535;RO=68;SAF=23;SAR=46;SRF=35;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171707;STB=0.592756;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.0157654;OID=.;OPOS=110901198;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:139:139:68:69:69:70:0.503597:46:23:35:33:46:24:36:33
chr4	110914427	.	A	T	1328.06	PASS	AF=1;AO=85;DP=86;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00640512;FXX=0.0229859;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.7386;QD=62.4971;RBI=0.00666928;REFB=0;REVB=-0.00185843;RO=0;SAF=44;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000260478;OID=.;OPOS=110914427;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:85:0:0:85:85:1:41:44:0:0:41:44:0:0
chr4	110971030	.	G	T	575.46	PASS	AF=0.590909;AO=52;DP=89;FAO=52;FDP=88;FR=.;FRO=36;FSAF=33;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=15;FWDB=-0.000411514;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.982;QD=26.1575;RBI=0.0917916;REFB=-0.00891407;REVB=-0.0917907;RO=36;SAF=33;SAR=19;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0408737;STB=0.522338;STBP=0.647;TYPE=snp;VARB=0.00509771;OID=.;OPOS=110971030;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:88:36:36:52:52:0.590909:19:33:21:15:19:33:21:15
chr4	111398208	.	A	G	739.24	PASS	AF=0.981481;AO=52;DP=53;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.037469;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.983;QD=54.7587;RBI=0.0377333;REFB=0.0319333;REVB=0.00445856;RO=1;SAF=31;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0218994;STB=0.511624;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=-0.00129029;OID=.;OPOS=111398208;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:53:54:1:1:52:53:0.981481:21:31:0:1:21:32:0:1
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chr4	111542124	.	G	A	1013.8	PASS	AF=0.564706;AO=96;DP=169;FAO=96;FDP=170;FR=.;FRO=74;FSAF=47;FSAR=49;FSRF=30;FSRR=44;FWDB=-0.00227439;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.271;QD=23.8541;RBI=0.0111528;REFB=0.0013715;REVB=0.0109184;RO=73;SAF=47;SAR=49;SRF=29;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0734732;STB=0.536707;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=-0.000909032;OID=.;OPOS=111542124;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:169:170:73:74:96:96:0.564706:49:47:29:44:49:47:30:44
chr4	112252643	.	G	T	90.33	PASS	AF=0.5;AO=11;DP=22;FAO=11;FDP=22;FR=.;FRO=11;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.0449733;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.0372;QD=16.4242;RBI=0.0456492;REFB=-0.0498992;REVB=-0.00782647;RO=11;SAF=7;SAR=4;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160306;STB=0.593048;STBP=0.406;TYPE=snp;VARB=0.0497146;OID=.;OPOS=112252643;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:22:22:11:11:11:11:0.5:4:7:5:6:4:7:5:6
chr4	113178893	.	AATTTGT	A,AA	744.35	PASS	AF=0,1;AO=7,52;DP=62;FAO=0,62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=0,35;FSAR=0,27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0141073,0.0147423;FXX=0;HRUN=2,3;LEN=6,5;MLLD=237.569,263.083;QD=48.0225;RBI=0.0409268,0.0526534;REFB=0,0;REVB=0.0384185,0.0505474;RO=0;SAF=0,35;SAR=7,17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,4.31071e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=0,0.000111304;OID=.,.;OPOS=113178894,113178895;OREF=ATTTGT,TTTGT;OALT=-,-;OMAPALT=A,AA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	2/2:0,1:7,52:62:0,62:62:0:0,35:0,27:0:0:13:0:0,35:7,17:0:0
chr4	113178894	.	ATTTGT	A	50.0	PASS	AO=36;DP=74;LEN=5;RO=38;SAF=35;SAR=19;SRF=5;SRR=15;TYPE=del;FR=.;OID=.;OPOS=113178895;OREF=TTTGT;OALT=-;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:RO:AO:SAR:SAF:SRF:SRR	0/1:99:74:38:36:19:35:5:15
chr4	113195245	.	T	TA	229.87	PASS	AF=0.507463;AO=34;DP=67;FAO=34;FDP=67;FR=.;FRO=33;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=0.0423006;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=25.3578;QD=13.7236;RBI=0.0607758;REFB=0.0134432;REVB=0.0436389;RO=33;SAF=14;SAR=20;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0163382;STB=0.509086;STBP=0.893;TYPE=ins;VARB=-0.00772518;OID=.;OPOS=113195246;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.507463:34:67:34:67:33:14:20:13:20:99:33:14:20:13:20
chr4	113198805	.	G	C,T	756.85	PASS	AF=0.959184,0.0408163;AO=45,2;DP=47;FAO=47,2;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=8,2;FSAR=39,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00706172,0.00133749;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=86.3001,35.7919;QD=61.7836;RBI=0.0170568,0.03991;REFB=0,0;REVB=0.0155263,-0.0398876;RO=0;SAF=7,1;SAR=38,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=4.79115e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00632574,-0.000519024;OID=.,.;OPOS=113198805,113198805;OREF=G,G;OALT=C,T;OMAPALT=C,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:47:49:0:0:45,2:47,2:0.959184,0.0408163:38,1:7,1:0:0:39,0:8,2:0:0
chr4	113198889	.	AC	TT	91.37	PASS	AF=0.303571;AO=23;DP=62;FAO=17;FDP=56;FR=.;FRO=39;FSAF=2;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=28;FWDB=0.00827472;FXX=0.13844;HRUN=1;LEN=2;MLLD=250.194;QD=6.52623;RBI=0.0744284;REFB=-0.0477423;REVB=0.073967;RO=38;SAF=9;SAR=14;SRF=10;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151855;STB=0.693674;STBP=0.139;TYPE=mnp;VARB=0.105599;OID=.;OPOS=113198889;OREF=AC;OALT=TT;OMAPALT=TT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:91:62:56:38:39:23:17:0.303571:14:9:10:28:15:2:11:28
chr4	113199075	.	A	G	937.1	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00201951;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.5571;QD=58.569;RBI=0.00300805;REFB=0;REVB=0.00222935;RO=0;SAF=41;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.70612e-06;OID=.;OPOS=113199075;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:23:41:0:0:23:41:0:0
chr4	113344925	.	C	T	801.52	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00494974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=306.155;QD=57.2513;RBI=0.0190725;REFB=0;REVB=0.018419;RO=0;SAF=21;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.42516e-05;OID=.;OPOS=113344925;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:56:0:0:51:56:1:30:21:0:0:33:23:0:0
chr4	113352397	.	G	A	766.39	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0161036;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.182;QD=63.8661;RBI=0.0224351;REFB=0;REVB=0.0156207;RO=0;SAF=18;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.73384e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.62174e-05;OID=.;OPOS=113352397;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:30:18:0:0:30:18:0:0
chr4	113352628	.	A	G	382.36	PASS	AF=1;AO=27;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0458031;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.573;QD=54.6223;RBI=0.0527231;REFB=0;REVB=0.0261113;RO=0;SAF=17;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000713501;OID=.;OPOS=113352628;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:27:28:1:10:17:0:0:10:18:0:0
chr4	113352899	.	G	A	1208.13	PASS	AF=0.987654;AO=78;DP=79;FAO=80;FDP=81;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00631413;FXX=0.0240935;HRUN=3;LEN=1;MLLD=161.451;QD=59.6608;RBI=0.00764266;REFB=-0.134886;REVB=0.00430606;RO=1;SAF=40;SAR=38;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0122936;STB=0.506492;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=0.000719288;OID=.;OPOS=113352899;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:79:81:1:1:78:80:0.987654:38:40:0:1:38:42:0:1
chr4	113353285	.	T	C	708.55	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0033798;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.831;QD=62.982;RBI=0.0443018;REFB=0;REVB=-0.0441727;RO=0;SAF=29;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.49331e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000190956;OID=.;OPOS=113353285;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:16:29:0:0:16:29:0:0
chr4	113359703	.	A	G	955.18	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0013764;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.731;QD=58.7805;RBI=0.0384917;REFB=0;REVB=0.0384671;RO=0;SAF=27;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.04073e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000112082;OID=.;OPOS=113359703;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:38:27:0:0:38:27:0:0
chr4	113360925	.	G	A	693.63	PASS	AF=0.54918;AO=67;DP=123;FAO=67;FDP=122;FR=.;FRO=55;FSAF=29;FSAR=38;FSRF=28;FSRR=27;FWDB=0.00261638;FXX=0.00812942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.769;QD=22.7421;RBI=0.00748995;REFB=0.0168082;REVB=0.00701811;RO=52;SAF=29;SAR=38;SRF=25;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0388001;STB=0.534672;STBP=0.406;TYPE=snp;VARB=-0.00863021;OID=.;OPOS=113360925;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:123:122:52:55:67:67:0.54918:38:29:25:27:38:29:28:27
chr4	113362316	.	A	G	278.87	PASS	AF=0.54902;AO=28;DP=51;FAO=28;FDP=51;FR=.;FRO=23;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=0.00477901;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=235.607;QD=21.8719;RBI=0.0147509;REFB=-0.001522;REVB=0.0139553;RO=23;SAF=18;SAR=10;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0670451;STB=0.537286;STBP=0.601;TYPE=snp;VARB=0.0012628;OID=.;OPOS=113362316;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:23:23:28:28:0.54902:10:18:13:10:10:18:13:10
chr4	113362622	.	C	G	920.1	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00339021;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.5844;QD=58.4192;RBI=0.0124101;REFB=0;REVB=0.0119381;RO=0;SAF=39;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51964e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000130087;OID=.;OPOS=113362622;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:24:39:0:0:24:39:0:0
chr4	113436044	.	T	G	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0171996;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.077;QD=33.4285;RBI=0.0389919;REFB=0;REVB=-0.0349934;RO=0;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000563838;OID=.;OPOS=113436044;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:5:1:0:0:5:1:0:0
chr4	113539969	.	T	C	203.61	PASS	AF=0.555556;AO=20;DP=36;FAO=20;FDP=36;FR=.;FRO=16;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=0.0280649;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.03;QD=22.6233;RBI=0.0283733;REFB=-0.0101535;REVB=0.00417204;RO=16;SAF=11;SAR=9;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186696;STB=0.604294;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=0.0235645;OID=.;OPOS=113539969;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:16:16:20:20:0.555556:9:11:5:11:9:11:5:11
chr4	113549989	.	G	A	66.28	PASS	AF=0.409091;AO=9;DP=22;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=0.00503167;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=303.501;QD=12.0517;RBI=0.00503507;REFB=-0.000963703;REVB=0.000185165;RO=13;SAF=5;SAR=4;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.242158;STB=0.643262;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=0.0015299;OID=.;OPOS=113549989;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:22:22:13:13:9:9:0.409091:4:5:4:9:4:5:4:9
chr4	114309839	.	C	T	571.37	PASS	AF=0.39759;AO=66;DP=167;FAO=66;FDP=166;FR=.;FRO=100;FSAF=37;FSAR=29;FSRF=55;FSRR=45;FWDB=-0.0109513;FXX=0.0119041;HRUN=2;LEN=1;MLLD=228.626;QD=13.768;RBI=0.0214715;REFB=-0.00380231;REVB=-0.0184688;RO=98;SAF=37;SAR=29;SRF=54;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0103159;STB=0.506472;STBP=0.891;TYPE=snp;VARB=0.00549233;OID=.;OPOS=114309839;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:167:166:98:100:66:66:0.39759:29:37:54:44:29:37:55:45
chr4	114341210	.	T	C	340.73	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0449644;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.313;QD=54.5173;RBI=0.0479588;REFB=0;REVB=0.0166808;RO=0;SAF=9;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000198319;OID=.;OPOS=114341210;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:16:9:0:0:16:9:0:0
chr4	114341631	.	T	C	490.07	PASS	AF=0.971429;AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.060208;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.843;QD=56.008;RBI=0.060582;REFB=-0.028292;REVB=-0.00672157;RO=1;SAF=18;SAR=16;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0283217;STB=0.515143;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.00195955;OID=.;OPOS=114341631;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:35:35:1:1:34:34:0.971429:16:18:0:1:16:18:0:1
chr4	114429407	.	C	T	134.23	PASS	AF=0.454545;AO=15;DP=33;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=5;FWDB=-0.0572803;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.5945;QD=16.2706;RBI=0.0611836;REFB=-0.00484979;REVB=0.0215034;RO=18;SAF=9;SAR=6;SRF=13;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124769;STB=0.571338;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=0.00436827;OID=.;OPOS=114429407;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:18:18:15:15:0.454545:6:9:13:5:6:9:13:5
chr4	114822485	.	G	A	868.27	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0190262;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=250.407;QD=57.8848;RBI=0.0199834;REFB=0;REVB=-0.0061104;RO=0;SAF=30;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.5822e-05;OID=.;OPOS=114822485;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:30:30:0:0:30:30:0:0
chr4	115544714	.	A	G	1208.84	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00454332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.653;QD=61.2073;RBI=0.00606375;REFB=0;REVB=-0.00401589;RO=0;SAF=48;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.72963e-06;OID=.;OPOS=115544714;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:31:48:0:0:31:48:0:0
chr4	115544777	.	A	G	261.19	PASS	AF=0.364706;AO=31;DP=85;FAO=31;FDP=85;FR=.;FRO=54;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=29;FSRR=25;FWDB=0.0212138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.7715;QD=12.2914;RBI=0.0214911;REFB=0.00568247;REVB=0.00344116;RO=54;SAF=20;SAR=11;SRF=29;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124574;STB=0.571835;STBP=0.358;TYPE=snp;VARB=-0.00763266;OID=.;OPOS=115544777;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:54:54:31:31:0.364706:11:20:29:25:11:20:29:25
chr4	115589302	.	A	G	990.62	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0251567;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.1433;QD=59.1412;RBI=0.0252859;REFB=0;REVB=0.00255292;RO=0;SAF=37;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000139749;OID=.;OPOS=115589302;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:30:37:0:0:30:37:0:0
chr4	117760488	.	G	A	447.9	PASS	AF=0.626866;AO=42;DP=67;FAO=42;FDP=67;FR=.;FRO=25;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=7;FSRR=18;FWDB=-0.0121131;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=294.436;QD=26.7403;RBI=0.0142738;REFB=-0.0122421;REVB=-0.00755084;RO=25;SAF=23;SAR=19;SRF=7;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181458;STB=0.598828;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.00589027;OID=.;OPOS=117760488;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:25:25:42:42:0.626866:19:23:7:18:19:23:7:18
chr4	119237348	.	T	C	387.72	PASS	AF=0.47619;AO=40;DP=84;FAO=40;FDP=84;FR=.;FRO=44;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=26;FSRR=18;FWDB=-0.0128368;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.604;QD=18.463;RBI=0.0129125;REFB=-0.0187499;REVB=-0.00139592;RO=44;SAF=23;SAR=17;SRF=26;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0153262;STB=0.508543;STBP=0.897;TYPE=snp;VARB=0.0149366;OID=.;OPOS=119237348;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:44:44:40:40:0.47619:17:23:26:18:17:23:26:18
chr4	119435061	.	C	T	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0516176;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.851;QD=42.1823;RBI=0.0732665;REFB=0;REVB=-0.0519961;RO=0;SAF=4;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.06632e-06;OID=.;OPOS=119435061;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:7:4:0:0:7:4:0:0
chr4	119944611	.	G	T	225.67	PASS	AF=0.435484;AO=27;DP=62;FAO=27;FDP=62;FR=.;FRO=35;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=-0.0152827;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.9652;QD=14.5593;RBI=0.0294909;REFB=-0.00188477;REVB=-0.0252221;RO=35;SAF=12;SAR=15;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0697573;STB=0.539539;STBP=0.59;TYPE=snp;VARB=0.00432205;OID=.;OPOS=119944611;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:35:35:27:27:0.435484:15:12:18:17:15:12:18:17
chr4	119947961	.	AAAG	A	197.15	PASS	AF=0.410256;AO=30;DP=78;FAO=32;FDP=78;FR=.;FRO=46;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=28;FWDB=-0.0137911;FXX=0.0370325;HRUN=3;LEN=3;MLLD=166.982;QD=10.1102;RBI=0.028248;REFB=0.0030357;REVB=-0.0246527;RO=41;SAF=14;SAR=16;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0283384;STB=0.546088;STBP=0.526;TYPE=del;VARB=-0.00567471;OID=.;OPOS=119947962;OREF=AAG;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.410256:30:78:32:78:46:15:17:18:28:99:41:14:16:18:23
chr4	119947985	.	G	C	351.05	PASS	AF=0.474359;AO=37;DP=78;FAO=37;FDP=78;FR=.;FRO=41;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=17;FSRR=24;FWDB=-0.00460849;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.5753;QD=18.0025;RBI=0.0463289;REFB=0.00349126;REVB=-0.0460991;RO=41;SAF=16;SAR=21;SRF=17;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0171021;STB=0.509549;STBP=0.881;TYPE=snp;VARB=-0.0044834;OID=.;OPOS=119947985;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:41:41:37:37:0.474359:21:16:17:24:21:16:17:24
chr4	119951647	.	A	G	192.08	PASS	AF=0.487805;AO=17;DP=38;FAO=20;FDP=41;FR=.;FRO=21;FSAF=18;FSAR=2;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0641257;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=42.716;QD=18.7391;RBI=0.0793397;REFB=-0.0191195;REVB=0.0467193;RO=20;SAF=16;SAR=1;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.596297;STB=0.787964;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0250501;OID=.;OPOS=119951647;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:41:20:21:17:20:0.487805:1:16:11:9:2:18:11:10
chr4	120158580	.	C	A	213.94	PASS	AF=0.512195;AO=21;DP=41;FAO=21;FDP=41;FR=.;FRO=20;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=-0.0180616;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=237.006;QD=20.8719;RBI=0.0267304;REFB=-0.00911147;REVB=0.0197051;RO=20;SAF=11;SAR=10;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0664426;STB=0.537348;STBP=0.646;TYPE=snp;VARB=0.00700781;OID=.;OPOS=120158580;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:20:20:21:21:0.512195:10:11:12:8:10:11:12:8
chr4	120158685	.	T	G	98.56	PASS	AF=0.428571;AO=12;DP=28;FAO=12;FDP=28;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.0117013;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.305;QD=14.0796;RBI=0.0351812;REFB=-0.00291701;REVB=0.0331782;RO=16;SAF=4;SAR=8;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109071;STB=0.563993;STBP=0.577;TYPE=snp;VARB=0.00237288;OID=.;OPOS=120158685;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:28:28:16:16:12:12:0.428571:8:4:7:9:8:4:7:9
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chr4	120215314	.	A	G	515.32	PASS	AF=0.470085;AO=55;DP=116;FAO=55;FDP=117;FR=.;FRO=62;FSAF=28;FSAR=27;FSRF=31;FSRR=31;FWDB=-0.000246284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.028;QD=17.6177;RBI=0.000701713;REFB=0.000287803;REVB=-0.000657073;RO=61;SAF=28;SAR=27;SRF=31;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000846971;STB=0.504816;STBP=0.902;TYPE=snp;VARB=-0.00028228;OID=.;OPOS=120215314;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:116:117:61:62:55:55:0.470085:27:28:31:30:27:28:31:31
chr4	120239831	.	A	G	59.81	PASS	AF=0.214286;AO=9;DP=42;FAO=9;FDP=42;FR=.;FRO=33;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=0.0557491;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.639;QD=5.69614;RBI=0.0558051;REFB=-0.00033927;REVB=0.002499;RO=33;SAF=5;SAR=4;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0854607;STB=0.555432;STBP=0.78;TYPE=snp;VARB=0.00317936;OID=.;OPOS=120239831;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:59:42:42:33:33:9:9:0.214286:4:5:16:17:4:5:16:17
chr4	120239878	.	G	A	68.18	PASS	AF=0.204082;AO=10;DP=49;FAO=10;FDP=49;FR=.;FRO=39;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=-0.00885016;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.83;QD=5.56588;RBI=0.00895276;REFB=0.00853835;REVB=-0.00135149;RO=39;SAF=5;SAR=5;SRF=18;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0470492;STB=0.530551;STBP=0.829;TYPE=snp;VARB=-0.0256967;OID=.;OPOS=120239878;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:68:49:49:39:39:10:10:0.204082:5:5:18:21:5:5:18:21
chr4	120240238	.	T	C	179.02	PASS	AF=0.385965;AO=22;DP=57;FAO=22;FDP=57;FR=.;FRO=35;FSAF=5;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=-0.000472295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.567;QD=12.5624;RBI=0.0199493;REFB=-0.00407859;REVB=-0.0199437;RO=34;SAF=5;SAR=17;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.233105;STB=0.647473;STBP=0.111;TYPE=snp;VARB=0.00828899;OID=.;OPOS=120240238;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:34:35:22:22:0.385965:17:5:14:20:17:5:15:20
chr4	120241849	.	A	G	120.17	PASS	AF=0.411765;AO=14;DP=34;FAO=14;FDP=34;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=0.00587599;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.23;QD=14.1375;RBI=0.0197541;REFB=0.0140668;REVB=0.0188599;RO=20;SAF=8;SAR=6;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136269;STB=0.57884;STBP=0.473;TYPE=snp;VARB=-0.0121006;OID=.;OPOS=120241849;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:20:20:14:14:0.411765:6:8:14:6:6:8:14:6
chr4	120241902	.	T	C	214.11	PASS	AF=0.431034;AO=25;DP=58;FAO=25;FDP=58;FR=.;FRO=33;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=0.00688006;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.145;QD=14.7663;RBI=0.0102586;REFB=-0.00517607;REVB=0.00760947;RO=33;SAF=15;SAR=10;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0251026;STB=0.514274;STBP=0.871;TYPE=snp;VARB=0.00711541;OID=.;OPOS=120241902;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:33:33:25:25:0.431034:10:15:19:14:10:15:19:14
chr4	120325594	.	G	A	129.48	PASS	AF=0.8125;AO=13;DP=16;FAO=13;FDP=16;FR=.;FRO=3;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0322046;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.305;QD=32.3697;RBI=0.0325101;REFB=-0.0592916;REVB=-0.00444586;RO=3;SAF=4;SAR=9;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133306;STB=0.574349;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.0170923;OID=.;OPOS=120325594;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:16:16:3:3:13:13:0.8125:9:4:2:1:9:4:2:1
chr4	120330137	.	T	G	80.63	PASS	AF=0.275;AO=11;DP=40;FAO=11;FDP=40;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.0158259;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.5504;QD=8.0632;RBI=0.0197249;REFB=-0.0282442;REVB=0.0117734;RO=28;SAF=6;SAR=5;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0530436;STB=0.545372;STBP=0.771;TYPE=snp;VARB=0.0865749;OID=.;OPOS=120330137;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:80:40:40:28:29:11:11:0.275:5:6:14:14:5:6:14:15
chr4	120330155	.	C	T	143.0	PASS	AF=0.339623;AO=18;DP=53;FAO=18;FDP=53;FR=.;FRO=35;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=0.0214747;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.2812;QD=10.7924;RBI=0.103769;REFB=0.00188392;REVB=-0.101523;RO=35;SAF=8;SAR=10;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0180657;STB=0.510626;STBP=0.936;TYPE=snp;VARB=-0.00573626;OID=.;OPOS=120330155;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:35:35:18:18:0.339623:10:8:15:20:10:8:15:20
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chr4	120528327	.	G	A	211.9	PASS	AF=0.45098;AO=23;DP=51;FAO=23;FDP=51;FR=.;FRO=28;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=0.0240201;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=216.619;QD=16.6197;RBI=0.0294186;REFB=-0.00658878;REVB=-0.016985;RO=28;SAF=14;SAR=9;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0374422;STB=0.521258;STBP=0.828;TYPE=snp;VARB=0.00761915;OID=.;OPOS=120528327;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:28:28:23:23:0.45098:9:14:16:12:9:14:16:12
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chr4	121738049	.	T	C	168.68	PASS	AF=0.428571;AO=17;DP=42;FAO=18;FDP=42;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=-0.00820845;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=117.37;QD=16.065;RBI=0.00995301;REFB=-0.0184203;REVB=-0.00562883;RO=24;SAF=4;SAR=13;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.441772;STB=0.721975;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.0236097;OID=.;OPOS=121738049;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:24:24:17:18:0.428571:13:4:16:8:13:5:16:8
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chr4	121957734	.	T	C	407.29	PASS	AF=0.56338;AO=40;DP=71;FAO=40;FDP=71;FR=.;FRO=31;FSAF=13;FSAR=27;FSRF=22;FSRR=9;FWDB=-0.0153815;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.399;QD=22.9458;RBI=0.041502;REFB=0.000872829;REVB=0.0385464;RO=31;SAF=13;SAR=27;SRF=22;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.306526;STB=0.668705;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=-0.000872385;OID=.;OPOS=121957734;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:31:31:40:40:0.56338:27:13:22:9:27:13:22:9
chr4	121958091	.	T	G	222.84	PASS	AF=0.468085;AO=22;DP=47;FAO=22;FDP=47;FR=.;FRO=25;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=0.0255084;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=199.981;QD=18.9648;RBI=0.0323382;REFB=-0.00325214;REVB=0.0198766;RO=24;SAF=14;SAR=8;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.204856;STB=0.626343;STBP=0.113;TYPE=snp;VARB=0.00462253;OID=.;OPOS=121958091;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:24:25:22:22:0.468085:8:14:10:14:8:14:10:15
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chr4	121958697	.	G	A	176.25	PASS	AF=0.529412;AO=18;DP=34;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.0108323;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.216;QD=20.7356;RBI=0.0124959;REFB=-0.00607278;REVB=-0.00622963;RO=16;SAF=10;SAR=8;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.046583;STB=0.526286;STBP=0.8;TYPE=snp;VARB=0.00706533;OID=.;OPOS=121958697;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:16:16:18:18:0.529412:8:10:8:8:8:10:8:8
chr4	121966807	.	C	T	368.06	PASS	AF=0.62;AO=31;DP=50;FAO=31;FDP=50;FR=.;FRO=19;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=0.0132006;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=333.577;QD=29.4446;RBI=0.013411;REFB=-0.00574989;REVB=-0.00236676;RO=19;SAF=15;SAR=16;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13823;STB=0.575787;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.00345887;OID=.;OPOS=121966807;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:19:19:31:31:0.62:16:15:13:6:16:15:13:6
chr4	121982556	.	C	T	42.56	PASS	AF=0.133333;AO=8;DP=60;FAO=8;FDP=60;FR=.;FRO=52;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=20;FSRR=32;FWDB=0.0639007;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.5405;QD=2.83745;RBI=0.0689168;REFB=0.000577521;REVB=0.0258115;RO=52;SAF=5;SAR=3;SRF=20;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.283333;STB=0.699534;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.00422364;OID=.;OPOS=121982556;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:42:60:60:52:52:8:8:0.133333:3:5:20:32:3:5:20:32
chr4	122137662	.	T	A,G	994.66	PASS	AF=0.140845,0.859155;AO=8,56;DP=66;FAO=10,61;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=5,21;FSAR=5,40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00804991,0.0518404;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=198.855,67.1432;QD=56.0371;RBI=0.0138472,0.0536001;REFB=0,0;REVB=0.0112669,0.0136215;RO=0;SAF=3,20;SAR=5,36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.46938e-08,3.57266e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0204507,0.00728416;OID=.,.;OPOS=122137662,122137662;OREF=T,T;OALT=A,G;OMAPALT=A,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:46:66:71:0:0:8,56:10,61:0.140845,0.859155:5,36:3,20:0:0:5,40:5,21:0:0
chr4	122250734	.	A	G	332.09	PASS	AF=0.393617;AO=37;DP=93;FAO=37;FDP=94;FR=.;FRO=57;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=36;FSRR=21;FWDB=0.0062501;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=67.5472;QD=14.1314;RBI=0.0505443;REFB=-0.0132743;REVB=0.0501563;RO=56;SAF=16;SAR=21;SRF=36;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.220315;STB=0.618985;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.0211341;OID=.;OPOS=122250734;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:94:56:57:37:37:0.393617:21:16:36:20:21:16:36:21
chr4	122254119	.	G	A	526.83	PASS	AF=0.524752;AO=53;DP=101;FAO=53;FDP=101;FR=.;FRO=48;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=31;FSRR=17;FWDB=0.0532351;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.2124;QD=20.8645;RBI=0.0765273;REFB=-0.00797892;REVB=-0.0549768;RO=46;SAF=28;SAR=25;SRF=29;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0871273;STB=0.556373;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=0.00797507;OID=.;OPOS=122254119;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:101:46:48:53:53:0.524752:25:28:29:17:25:28:31:17
chr4	122257950	.	A	G	603.63	PASS	AF=0.97561;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0182001;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.371;QD=58.8907;RBI=0.0284023;REFB=-0.109535;REVB=0.0218047;RO=1;SAF=24;SAR=16;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0284076;STB=0.515144;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.000158385;OID=.;OPOS=122257950;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:41:41:1:1:40:40:0.97561:16:24:0:1:16:24:0:1
chr4	122617718	.	G	C	183.78	PASS	AF=0.44186;AO=19;DP=44;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=0.00235049;FXX=0.0227221;HRUN=6;LEN=1;MLLD=175.986;QD=17.096;RBI=0.0137198;REFB=-0.0193897;REVB=-0.013517;RO=23;SAF=10;SAR=9;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0460803;STB=0.51469;STBP=0.829;TYPE=snp;VARB=0.0185948;OID=.;OPOS=122617718;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:43:23:24:19:19:0.44186:9:10:11:12:9:10:12:12
chr4	122617745	.	G	A	214.39	PASS	AF=0.46;AO=23;DP=51;FAO=23;FDP=50;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.0214674;FXX=0.019604;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.056;QD=17.1514;RBI=0.0230005;REFB=-0.0172813;REVB=-0.00825672;RO=27;SAF=11;SAR=12;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0679379;STB=0.538428;STBP=0.668;TYPE=snp;VARB=0.0176796;OID=.;OPOS=122617745;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:50:27:27:23:23:0.46:12:11:11:16:12:11:11:16
chr4	122683007	.	G	A	1283.73	PASS	AF=1;AO=82;DP=82;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00433025;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.859;QD=61.8666;RBI=0.0243387;REFB=0;REVB=-0.0239504;RO=0;SAF=33;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.22047e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.12345e-05;OID=.;OPOS=122683007;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:83:0:0:82:83:1:49:33:0:0:49:34:0:0
chr4	122687238	.	A	G	289.4	PASS	AF=0.39759;AO=33;DP=83;FAO=33;FDP=83;FR=.;FRO=50;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=23;FSRR=27;FWDB=0.00193268;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.576;QD=13.9469;RBI=0.0118097;REFB=-0.0125268;REVB=-0.0116505;RO=49;SAF=18;SAR=15;SRF=23;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0799237;STB=0.551391;STBP=0.477;TYPE=snp;VARB=0.0228093;OID=.;OPOS=122687238;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:49:50:33:33:0.39759:15:18:23:26:15:18:23:27
chr4	122687491	.	G	C	439.2	PASS	AF=0.591549;AO=42;DP=71;FAO=42;FDP=71;FR=.;FRO=29;FSAF=15;FSAR=27;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=-0.0296189;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.226;QD=24.7435;RBI=0.0388744;REFB=-0.0197844;REVB=-0.0251781;RO=29;SAF=15;SAR=27;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150202;STB=0.582423;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=0.0102969;OID=.;OPOS=122687491;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:29:29:42:42:0.591549:27:15:16:13:27:15:16:13
chr4	122742217	.	T	C	1116.88	PASS	AF=1;AO=74;DP=75;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0949178;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.674;QD=60.3721;RBI=0.10235;REFB=0;REVB=0.0382906;RO=0;SAF=39;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.80413e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000382715;OID=.;OPOS=122742217;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:74:0:0:74:74:1:35:39:0:0:35:39:0:0
chr4	122824052	.	C	T	1607.13	PASS	AF=1;AO=100;DP=100;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.011892;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=256.516;QD=64.285;RBI=0.0155876;REFB=0;REVB=0.0100774;RO=0;SAF=50;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.08643e-06;OID=.;OPOS=122824052;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:100:100:0:0:100:100:1:50:50:0:0:50:50:0:0
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chr4	123008808	.	C	T	1205.99	PASS	AF=1;AO=78;DP=78;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00438746;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.523;QD=61.063;RBI=0.00746813;REFB=0;REVB=-0.00604344;RO=0;SAF=51;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000518848;OID=.;OPOS=123008808;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:79:0:0:78:79:1:27:51:0:0:27:52:0:0
chr4	123145751	.	T	A	224.79	PASS	AF=0.391304;AO=27;DP=69;FAO=27;FDP=69;FR=.;FRO=42;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=25;FSRR=17;FWDB=-0.0140001;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=230.447;QD=13.0314;RBI=0.0182457;REFB=-0.00638494;REVB=-0.0117006;RO=42;SAF=9;SAR=18;SRF=25;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.279409;STB=0.660075;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.00926191;OID=.;OPOS=123145751;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:42:42:27:27:0.391304:18:9:25:17:18:9:25:17
chr4	123192383	.	T	C	223.56	PASS	AF=0.433333;AO=26;DP=60;FAO=26;FDP=60;FR=.;FRO=34;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=-0.00286211;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.8;QD=14.9039;RBI=0.0304988;REFB=-0.00298077;REVB=0.0303642;RO=33;SAF=14;SAR=12;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0675696;STB=0.528476;STBP=0.704;TYPE=snp;VARB=0.00381781;OID=.;OPOS=123192383;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:33:34:26:26:0.433333:12:14:20:13:12:14:20:14
chr4	123229132	.	C	T	635.34	PASS	AF=0.563636;AO=62;DP=110;FAO=62;FDP=110;FR=.;FRO=48;FSAF=29;FSAR=33;FSRF=24;FSRR=24;FWDB=0.00429811;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=238.655;QD=23.1034;RBI=0.00739909;REFB=0.00364704;REVB=0.00602269;RO=48;SAF=29;SAR=33;SRF=24;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0257975;STB=0.514105;STBP=0.743;TYPE=snp;VARB=-0.0022473;OID=.;OPOS=123229132;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:110:48:48:62:62:0.563636:33:29:24:24:33:29:24:24
chr4	123267860	.	T	C	373.83	PASS	AF=0.415842;AO=42;DP=101;FAO=42;FDP=101;FR=.;FRO=59;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=35;FSRR=24;FWDB=0.00859099;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.5413;QD=14.805;RBI=0.00885582;REFB=0.001987;REVB=0.00214952;RO=59;SAF=20;SAR=22;SRF=35;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120799;STB=0.568043;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=-0.00384089;OID=.;OPOS=123267860;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:101:59:59:42:42:0.415842:22:20:35:24:22:20:35:24
chr4	123377482	.	C	A	282.85	PASS	AF=0.469697;AO=31;DP=67;FAO=31;FDP=66;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=-0.0284639;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.473;QD=17.1423;RBI=0.0299001;REFB=0.00256315;REVB=-0.00915547;RO=36;SAF=14;SAR=17;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0338644;STB=0.512356;STBP=0.871;TYPE=snp;VARB=-0.00249064;OID=.;OPOS=123377482;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:66:36:35:31:31:0.469697:17:14:15:21:17:14:15:20
chr4	123536963	.	G	A	1179.18	PASS	AF=0.9875;AO=75;DP=75;FAO=79;FDP=80;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0282279;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.494;QD=58.959;RBI=0.032604;REFB=-0.023402;REVB=0.0163157;RO=0;SAF=32;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507245;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=0.000551;OID=.;OPOS=123536963;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:75:80:0:1:75:79:0.9875:43:32:0:0:45:34:1:0
chr4	123664445	.	C	T	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0631923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.0049;QD=51.1843;RBI=0.0731691;REFB=0;REVB=-0.0368843;RO=0;SAF=11;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000621375;OID=.;OPOS=123664445;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:9:11:0:0:9:11:0:0
chr4	123665428	.	G	A	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0420093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.248;QD=33.4285;RBI=0.0427001;REFB=0;REVB=0.00764977;RO=0;SAF=3;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00154701;OID=.;OPOS=123665428;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:3:3:0:0:3:3:0:0
chr4	123665991	.	C	G	821.36	PASS	AF=1;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0340072;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.681;QD=57.6394;RBI=0.0352759;REFB=0;REVB=-0.00937528;RO=0;SAF=26;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.19358e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.25338e-05;OID=.;OPOS=123665991;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:57:0:0:57:57:1:31:26:0:0:31:26:0:0
chr4	123747947	.	G	A	267.09	PASS	AF=0.766667;AO=23;DP=30;FAO=23;FDP=30;FR=.;FRO=7;FSAF=18;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=0.0296771;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=165.881;QD=35.6122;RBI=0.0350566;REFB=-0.0540881;REVB=0.018661;RO=7;SAF=18;SAR=5;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0482757;STB=0.526294;STBP=0.72;TYPE=snp;VARB=0.0113453;OID=.;OPOS=123747947;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:42:30:30:7:7:23:23:0.766667:5:18:6:1:5:18:6:1
chr4	123814308	.	C	T	540.18	PASS	AF=0.520408;AO=51;DP=98;FAO=51;FDP=98;FR=.;FRO=47;FSAF=30;FSAR=21;FSRF=29;FSRR=18;FWDB=0.00988844;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.467;QD=22.048;RBI=0.0098908;REFB=-0.00490867;REVB=-0.000216465;RO=47;SAF=30;SAR=21;SRF=29;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0259761;STB=0.514316;STBP=0.792;TYPE=snp;VARB=0.00503916;OID=.;OPOS=123814308;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:47:47:51:51:0.520408:21:30:29:18:21:30:29:18
chr4	123838758	.	A	G	394.07	PASS	AF=0.431373;AO=45;DP=102;FAO=44;FDP=102;FR=.;FRO=58;FSAF=16;FSAR=28;FSRF=32;FSRR=26;FWDB=-0.0496518;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.876;QD=15.4536;RBI=0.0510333;REFB=-0.0264329;REVB=0.0117937;RO=55;SAF=17;SAR=28;SRF=30;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167076;STB=0.608646;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.0262465;OID=.;OPOS=123838758;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:55:58:45:44:0.431373:28:17:30:25:28:16:32:26
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chr4	126239986	.	C	T	108.0	PASS	AF=0.393939;AO=13;DP=33;FAO=13;FDP=33;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=-0.0383929;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.009;QD=13.0911;RBI=0.0384113;REFB=-0.00831548;REVB=-0.001189;RO=20;SAF=7;SAR=6;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0910385;STB=0.553406;STBP=0.662;TYPE=snp;VARB=0.0115161;OID=.;OPOS=126239986;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:20:20:13:13:0.393939:6:7:9:11:6:7:9:11
chr4	126240510	.	T	C	216.65	PASS	AF=0.4;AO=26;DP=65;FAO=26;FDP=65;FR=.;FRO=39;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=0.0342985;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.1786;QD=13.3326;RBI=0.0454951;REFB=-0.000536615;REVB=0.0298901;RO=39;SAF=13;SAR=13;SRF=23;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0942287;STB=0.553805;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.00240129;OID=.;OPOS=126240510;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:39:39:26:26:0.4:13:13:23:16:13:13:23:16
chr4	126241871	.	C	T	79.28	PASS	AF=0.434783;AO=10;DP=22;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.0263653;FXX=0.0416493;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.998;QD=13.7887;RBI=0.0275092;REFB=-0.0128282;REVB=-0.0078503;RO=12;SAF=6;SAR=4;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0943118;STB=0.535642;STBP=0.78;TYPE=snp;VARB=0.0160703;OID=.;OPOS=126241871;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:79:22:23:12:13:10:10:0.434783:4:6:6:6:4:6:7:6
chr4	126329789	.	T	C	1590.79	PASS	AF=0.990741;AO=107;DP=108;FAO=107;FDP=108;FR=.;FRO=1;FSAF=54;FSAR=53;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00259956;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.353;QD=58.9181;RBI=0.0270474;REFB=-0.0942677;REVB=0.0269222;RO=0;SAF=54;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.66183e-08;STB=0.504586;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.000125392;OID=.;OPOS=126329789;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:108:108:0:1:107:107:0.990741:53:54:0:0:53:54:1:0
chr4	126369872	.	G	C	1194.33	PASS	AF=0.9875;AO=79;DP=80;FAO=79;FDP=80;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0201766;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.292;QD=59.7167;RBI=0.0210787;REFB=-0.0826037;REVB=0.00610033;RO=1;SAF=33;SAR=46;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.010181;STB=0.505375;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.00017556;OID=.;OPOS=126369872;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:80:80:1:1:79:79:0.9875:46:33:0:1:46:33:0:1
chr4	126370647	.	G	A	538.44	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0017213;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=54.834;QD=59.8271;RBI=0.0576427;REFB=0;REVB=-0.057617;RO=0;SAF=12;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00095743;OID=.;OPOS=126370647;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:24:12:0:0:24:12:0:0
chr4	126373789	.	G	A	803.67	PASS	AF=1;AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0270284;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.561;QD=57.4052;RBI=0.0373841;REFB=0;REVB=-0.0258272;RO=0;SAF=30;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.29784e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.03772e-07;OID=.;OPOS=126373789;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:57:56:0:0:56:56:1:26:30:0:0:26:30:0:0
chr4	126412575	.	A	G	657.72	PASS	AF=0.977273;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0337688;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.0195;QD=59.7925;RBI=0.0567059;REFB=0.0457333;REVB=-0.0455546;RO=0;SAF=19;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.510199;STBP=0.492;TYPE=snp;VARB=-0.00280419;OID=.;OPOS=126412575;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:43:44:0:1:43:43:0.977273:24:19:0:0:24:19:0:1
chr4	128565000	.	A	G	193.84	PASS	AF=0.434783;AO=20;DP=46;FAO=20;FDP=46;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=18;FSRR=8;FWDB=0.0110675;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.488;QD=16.8557;RBI=0.0123757;REFB=0.00533752;REVB=0.00553789;RO=26;SAF=13;SAR=7;SRF=18;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.046774;STB=0.526673;STBP=0.786;TYPE=snp;VARB=-0.00434297;OID=.;OPOS=128565000;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:26:26:20:20:0.434783:7:13:18:8:7:13:18:8
chr4	128584580	.	G	A	244.1	PASS	AF=0.5;AO=26;DP=52;FAO=26;FDP=52;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=-0.0314978;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.307;QD=18.7769;RBI=0.036988;REFB=0.00372236;REVB=-0.0193908;RO=26;SAF=14;SAR=12;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0694935;STB=0.538893;STBP=0.613;TYPE=snp;VARB=-0.00461946;OID=.;OPOS=128584580;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:26:26:26:26:0.5:12:14:16:10:12:14:16:10
chr4	128689936	.	A	G,T	936.35	PASS	AF=0.897059,0.0735294;AO=61,5;DP=68;FAO=61,5;FDP=68;FR=.;FRO=2;FSAF=26,1;FSAR=35,4;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00235977,-0.00751581;FXX=0.0422476;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=196.079,131.612;QD=55.0795;RBI=0.00438741,0.00877789;REFB=0.0187198,0.0869983;REVB=-0.00369876,-0.00453475;RO=2;SAF=26,1;SAR=35,4;SRF=2;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0349287,-0.413629;STB=0.518512,0.748924;STBP=0.158,0.099;TYPE=snp,snp;VARB=-0.000591212,0.0146801;OID=.,.;OPOS=128689936,128689936;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:19:68:68:2:2:61,5:61,5:0.897059,0.0735294:35,4:26,1:2:0:35,4:26,1:2:0
chr4	128723042	.	T	C	1231.35	PASS	AF=0.987805;AO=81;DP=82;FAO=81;FDP=82;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=50;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.017235;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.5071;QD=60.066;RBI=0.0410198;REFB=-0.0432873;REVB=0.0372233;RO=0;SAF=31;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.35858e-08;STB=0.507935;STBP=0.256;TYPE=snp;VARB=0.000623589;OID=.;OPOS=128723042;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:82:82:0:1:81:81:0.987805:50:31:0:0:50:31:1:0
chr4	128807219	.	T	A	393.34	PASS	AF=1;AO=27;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00791629;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.768;QD=56.1916;RBI=0.0260551;REFB=0;REVB=0.0248233;RO=0;SAF=17;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.43493e-05;OID=.;OPOS=128807219;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:27:28:1:10:17:0:0:11:17:0:0
chr4	128814964	.	G	T	902.71	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0102166;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.5388;QD=58.2396;RBI=0.0104471;REFB=0;REVB=0.00218212;RO=0;SAF=35;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.46408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000121419;OID=.;OPOS=128814964;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:27:35:0:0:27:35:0:0
chr4	128842876	.	C	G	444.75	PASS	AF=0.453704;AO=49;DP=108;FAO=49;FDP=108;FR=.;FRO=59;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=30;FSRR=29;FWDB=-0.00451414;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=223.768;QD=16.4722;RBI=0.0147181;REFB=0.00498793;REVB=-0.0140088;RO=59;SAF=26;SAR=23;SRF=30;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0217055;STB=0.512116;STBP=0.831;TYPE=snp;VARB=-0.00476487;OID=.;OPOS=128842876;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:108:59:59:49:49:0.453704:23:26:30:29:23:26:30:29
chr4	129012181	.	G	A	728.97	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0296088;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=233.622;QD=57.1738;RBI=0.0300988;REFB=0;REVB=-0.00540877;RO=0;SAF=18;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=8.62909e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.82932e-05;OID=.;OPOS=129012181;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:33:18:0:0:33:18:0:0
chr4	129012638	.	A	G	708.48	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0543921;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.9555;QD=62.9759;RBI=0.067623;REFB=0;REVB=-0.0401793;RO=0;SAF=33;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000215009;OID=.;OPOS=129012638;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:12:33:0:0:12:33:0:0
chr4	129029009	.	G	GA,GAA	287.83	PASS	AF=1,0;AO=31,5;DP=44;FAO=41,0;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=20,0;FSAR=21,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00409229,-0.00440367;FXX=0.0465008;HRUN=6,6;LEN=1,2;MLLD=9.95402,8.20232;QD=28.0811;RBI=0.0137354,0.0117971;REFB=0,0;REVB=-0.0131116,-0.0109443;RO=8;SAF=13,4;SAR=18,1;SRF=4;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0311942,0.332419;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,ins;VARB=0.00134017,0.0169059;OID=.,.;OPOS=129029010,129029010;OREF=-,-;OALT=A,AA;OMAPALT=GA,GAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1,0:31,5:44:41,0:41:0:20,0:21,0:0:0:5:8:13,4:18,1:4:4
chr4	129043204	.	C	G	789.06	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0943433;FXX=0.019996;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.134;QD=64.4127;RBI=0.0969264;REFB=0;REVB=0.0222279;RO=0;SAF=21;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00015473;OID=.;OPOS=129043204;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:28:21:0:0:28:21:0:0
chr4	129043286	.	C	T	1098.71	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.010306;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.021;QD=60.2032;RBI=0.0108242;REFB=0;REVB=0.00330891;RO=0;SAF=31;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.98661e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.38264e-05;OID=.;OPOS=129043286;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:42:31:0:0:42:31:0:0
chr4	129043614	.	G	T	101.37	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.11795;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.112;QD=40.5461;RBI=0.162218;REFB=0;REVB=0.111366;RO=0;SAF=4;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000688868;OID=.;OPOS=129043614;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:6:4:0:0:6:4:0:0
chr4	129043617	.	T	G	52.93	PASS	AF=0.7;AO=7;DP=10;FAO=7;FDP=10;FR=.;FRO=3;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.00654839;FXX=0;HRUN=9;LEN=1;MLLD=158.741;QD=21.1705;RBI=0.0131224;REFB=-0.0898971;REVB=0.0113717;RO=3;SAF=3;SAR=4;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0505826;STB=0.529328;STBP=0.794;TYPE=snp;VARB=0.00123567;OID=.;OPOS=129043617;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:10:10:3:3:7:7:0.7:4:3:1:2:4:3:1:2
chr4	129100643	.	G	A	1190.42	PASS	AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00480932;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.988;QD=61.0473;RBI=0.0139426;REFB=0;REVB=-0.0130869;RO=0;SAF=41;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.4281e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.25184e-05;OID=.;OPOS=129100643;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:37:41:0:0:37:41:0:0
chr4	129677239	.	T	C	219.31	PASS	AF=0.438596;AO=16;DP=57;FAO=25;FDP=57;FR=.,HEALED;FRO=32;FSAF=19;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=0.0566437;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.835;QD=15.3898;RBI=0.0577732;REFB=-0.0460505;REVB=0.0113682;RO=32;SAF=10;SAR=6;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143183;STB=0.665463;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.0520333;OID=.;OPOS=129677239;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:32:32:16:25:0.438596:6:10:16:16:6:19:16:16
chr4	129867280	.	T	A	344.78	PASS	AF=0.555556;AO=35;DP=63;FAO=35;FDP=63;FR=.;FRO=28;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=-0.0128379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.551;QD=21.891;RBI=0.0136406;REFB=-0.0362237;REVB=0.00461021;RO=28;SAF=15;SAR=20;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.029189;STB=0.51612;STBP=0.795;TYPE=snp;VARB=0.0435209;OID=.;OPOS=129867280;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:28:28:35:35:0.555556:20:15:13:15:20:15:13:15
chr4	129913345	.	G	A	199.88	PASS	AF=0.40678;AO=24;DP=59;FAO=24;FDP=59;FR=.;FRO=35;FSAF=19;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=-0.0512361;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.7888;QD=13.5513;RBI=0.0563915;REFB=-0.0114852;REVB=-0.0235556;RO=35;SAF=19;SAR=5;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.40919;STB=0.736223;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0112055;OID=.;OPOS=129913345;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:35:35:24:24:0.40678:5:19:15:20:5:19:15:20
chr4	129924977	.	C	A	380.61	PASS	AF=0.444444;AO=40;DP=90;FAO=40;FDP=90;FR=.;FRO=50;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=31;FSRR=19;FWDB=-0.049515;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.1974;QD=16.9162;RBI=0.0500597;REFB=-0.0151845;REVB=0.00736429;RO=50;SAF=21;SAR=19;SRF=31;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0949426;STB=0.553165;STBP=0.394;TYPE=snp;VARB=0.018789;OID=.;OPOS=129924977;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:50:50:40:40:0.444444:19:21:31:19:19:21:31:19
chr4	130023884	.	G	T	654.9	PASS	AF=0.524194;AO=63;DP=121;FAO=65;FDP=124;FR=.;FRO=59;FSAF=28;FSAR=37;FSRF=30;FSRR=29;FWDB=-0.00816256;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=148.105;QD=21.1257;RBI=0.00816468;REFB=-0.0184631;REVB=-0.000186175;RO=57;SAF=26;SAR=37;SRF=29;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.084177;STB=0.537294;STBP=0.432;TYPE=snp;VARB=0.0221878;OID=.;OPOS=130023884;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:121:124:57:59:63:65:0.524194:37:26:29:28:37:28:30:29
chr4	130030644	.	C	T	172.11	PASS	AF=0.473684;AO=18;DP=38;FAO=18;FDP=38;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.0147364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.11;QD=18.1169;RBI=0.0152454;REFB=0.0074475;REVB=-0.00390671;RO=20;SAF=12;SAR=6;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115484;STB=0.565962;STBP=0.474;TYPE=snp;VARB=-0.00954648;OID=.;OPOS=130030644;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:20:20:18:18:0.473684:6:12:11:9:6:12:11:9
chr4	130030652	.	A	G	602.8	PASS	AF=0.97561;AO=40;DP=42;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0451997;FXX=0.0238039;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.128;QD=58.8093;RBI=0.0750095;REFB=-0.115173;REVB=0.0598616;RO=0;SAF=24;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.510199;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.00267774;OID=.;OPOS=130030652;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:42:41:0:1:40:40:0.97561:16:24:0:0:16:24:1:0
chr4	132641498	.	T	A	346.38	PASS	AF=0.366667;AO=41;DP=111;FAO=44;FDP=120;FR=.;FRO=76;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=47;FSRR=29;FWDB=0.00463011;FXX=0.0243883;HRUN=7;LEN=1;MLLD=196.972;QD=11.5458;RBI=0.00519695;REFB=-3.69923e-05;REVB=0.00236015;RO=70;SAF=22;SAR=19;SRF=47;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152307;STB=0.546974;STBP=0.485;TYPE=snp;VARB=0.000213517;OID=.;OPOS=132641498;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:120:70:76:41:44:0.366667:19:22:47:23:20:24:47:29
chr4	133367588	.	T	C	1301.48	PASS	AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0240537;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.8151;QD=61.9754;RBI=0.035787;REFB=0;REVB=0.0264978;RO=0;SAF=39;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.93822e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.03044e-05;OID=.;OPOS=133367588;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:45:39:0:0:45:39:0:0
chr4	134082967	.	T	C	2946.96	PASS	AF=0.492386;AO=291;DP=597;FAO=291;FDP=591;FR=.;FRO=300;FSAF=147;FSAR=144;FSRF=131;FSRR=169;FWDB=-0.00730689;FXX=0.0133554;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.098;QD=19.9456;RBI=0.0566431;REFB=0.00709549;REVB=0.0561699;RO=284;SAF=146;SAR=145;SRF=125;SRR=159;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0556756;STB=0.534742;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=-0.00652496;OID=.;OPOS=134082967;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:597:591:284:300:291:291:0.492386:145:146:125:159:144:147:131:169
chr4	134710268	.	G	A	215.5	PASS	AF=0.393939;AO=26;DP=66;FAO=26;FDP=66;FR=.;FRO=40;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=0.000728518;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.088;QD=13.0606;RBI=0.0162426;REFB=-0.0010689;REVB=-0.0162263;RO=40;SAF=12;SAR=14;SRF=21;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0671044;STB=0.538432;STBP=0.628;TYPE=snp;VARB=0.00166843;OID=.;OPOS=134710268;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:40:40:26:26:0.393939:14:12:21:19:14:12:21:19
chr4	135121066	.	T	G	739.9	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0123591;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.944;QD=56.9156;RBI=0.0156834;REFB=0;REVB=-0.00965511;RO=0;SAF=22;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.14585e-06;OID=.;OPOS=135121066;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:52:0:0:51:52:1:29:22:0:0:30:22:0:0
chr4	135121368	.	G	T	715.04	PASS	AF=0.978723;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00261926;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.607;QD=60.8543;RBI=0.0262078;REFB=-0.0585191;REVB=0.0260766;RO=1;SAF=14;SAR=32;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0144681;STB=0.507689;STBP=0.6;TYPE=snp;VARB=0.000807769;OID=.;OPOS=135121368;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:47:47:1:1:46:46:0.978723:32:14:0:1:32:14:0:1
chr4	135121601	.	C	T	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00874539;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.637;QD=51.9166;RBI=0.0115928;REFB=0;REVB=0.00760989;RO=0;SAF=10;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.83038e-06;OID=.;OPOS=135121601;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:11:10:0:0:11:10:0:0
chr4	138449683	.	A	G	183.04	PASS	AF=0.4;AO=22;DP=55;FAO=22;FDP=55;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=0.00536482;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.798;QD=13.3119;RBI=0.0123135;REFB=-0.0206267;REVB=0.0110833;RO=33;SAF=11;SAR=11;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0158109;STB=0.509083;STBP=0.94;TYPE=snp;VARB=0.0504818;OID=.;OPOS=138449683;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:33:33:22:22:0.4:11:11:16:17:11:11:16:17
chr4	138453453	.	G	A	519.41	PASS	AF=0.509434;AO=53;DP=106;FAO=54;FDP=106;FR=.;FRO=52;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=27;FSRR=25;FWDB=0.00402271;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.232;QD=19.6005;RBI=0.018478;REFB=-0.00963023;REVB=0.0180348;RO=51;SAF=25;SAR=28;SRF=26;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.033871;STB=0.527631;STBP=0.559;TYPE=snp;VARB=0.0103036;OID=.;OPOS=138453453;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:106:51:52:53:54:0.509434:28:25:26:25:29:25:27:25
chr4	139086246	.	A	G	257.09	PASS	AF=0.453125;AO=29;DP=64;FAO=29;FDP=64;FR=.;FRO=35;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=-0.000443629;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.789;QD=16.0681;RBI=0.0222641;REFB=-0.00645158;REVB=0.0222597;RO=35;SAF=16;SAR=13;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0641952;STB=0.536191;STBP=0.615;TYPE=snp;VARB=0.00593554;OID=.;OPOS=139086246;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:35:35:29:29:0.453125:13:16:17:18:13:16:17:18
chr4	139100372	.	C	T	582.72	PASS	AF=1;AO=38;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00961035;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=228.978;QD=59.7656;RBI=0.00990582;REFB=0;REVB=0.00240135;RO=1;SAF=9;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.049227;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.99913e-05;OID=.;OPOS=139100372;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:1:0:38:39:1:29:9:1:0:29:10:0:0
chr4	139140494	.	G	C	328.79	PASS	AF=0.423529;AO=36;DP=85;FAO=36;FDP=85;FR=.;FRO=49;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=25;FSRR=24;FWDB=0.0100019;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.381;QD=15.4726;RBI=0.0106735;REFB=-0.00838683;REVB=-0.00372639;RO=49;SAF=20;SAR=16;SRF=25;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0465683;STB=0.526301;STBP=0.724;TYPE=snp;VARB=0.00870252;OID=.;OPOS=139140494;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:49:49:36:36:0.423529:16:20:25:24:16:20:25:24
chr4	140005294	.	A	G	1231.19	PASS	AF=0.987805;AO=81;DP=82;FAO=81;FDP=82;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.035783;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.2909;QD=60.058;RBI=0.0714219;REFB=-0.0151801;REVB=-0.0618116;RO=1;SAF=45;SAR=36;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0129713;STB=0.506848;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=0.000592009;OID=.;OPOS=140005294;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:82:82:1:1:81:81:0.987805:36:45:0:1:36:45:0:1
chr4	140417671	.	G	C	729.01	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00786646;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.927;QD=57.1775;RBI=0.0116528;REFB=0;REVB=-0.00859694;RO=0;SAF=18;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=8.62909e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.71216e-06;OID=.;OPOS=140417671;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:33:18:0:0:33:18:0:0
chr4	140651584	.	TCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGC	TCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTG,TCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGC	50.07	PASS	AF=0,1;AO=2,4;DP=6;FAO=0,6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=0,3;FSAR=0,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.043622,0.045116;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=4,3;MLLD=258.477,284.283;QD=33.3792;RBI=0.0452912,0.0470183;REFB=0,0;REVB=-0.0121827,-0.0132391;RO=0;SAF=2,1;SAR=0,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-4.86674e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=0,0.000300365;OID=.,.;OPOS=140651609,140651585;OREF=CTGC,CTG;OALT=-,-;OMAPALT=TCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTG,TCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	2/2:0,1:2,4:6:0,6:6:0:0,3:0,3:0:0:4:0:2,1:0,3:0:0
chr4	140812005	.	G	A	549.19	PASS	AF=0.495652;AO=57;DP=116;FAO=57;FDP=115;FR=.;FRO=58;FSAF=28;FSAR=29;FSRF=22;FSRR=36;FWDB=-0.0279457;FXX=0.00861995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.027;QD=19.1022;RBI=0.0311399;REFB=-0.000787805;REVB=0.0137379;RO=58;SAF=28;SAR=29;SRF=22;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102452;STB=0.556555;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=0.000601551;OID=.;OPOS=140812005;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:116:115:58:58:57:57:0.495652:29:28:22:36:29:28:22:36
chr4	141499166	.	G	A	769.51	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00370752;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=215.796;QD=57.0007;RBI=0.0151263;REFB=0;REVB=0.0146649;RO=0;SAF=23;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6027e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.3389e-05;OID=.;OPOS=141499166;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:31:23:0:0:31:23:0:0
chr4	141543997	.	G	A	346.13	PASS	AF=0.507042;AO=36;DP=71;FAO=36;FDP=71;FR=.;FRO=35;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=22;FSRR=13;FWDB=0.00512376;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.508;QD=19.5003;RBI=0.0368857;REFB=-0.0281803;REVB=0.0365281;RO=35;SAF=16;SAR=20;SRF=22;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162185;STB=0.590013;STBP=0.127;TYPE=snp;VARB=0.0289137;OID=.;OPOS=141543997;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:35:35:36:36:0.507042:20:16:22:13:20:16:22:13
chr4	141600320	.	A	G	99.23	PASS	AF=0.444444;AO=12;DP=27;FAO=12;FDP=27;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=-0.0176;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.156;QD=14.7011;RBI=0.0252535;REFB=-0.0077745;REVB=-0.0181103;RO=15;SAF=7;SAR=5;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173698;STB=0.601059;STBP=0.368;TYPE=snp;VARB=0.021774;OID=.;OPOS=141600320;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:15:15:12:12:0.444444:5:7:6:9:5:7:6:9
chr4	141974815	.	CA	C,CC	357.66	PASS	AF=0.0740741,0.925926;AO=3,23;DP=27;FAO=2,25;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=0,7;FSAR=2,18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00261175,-0.00164933;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=103.442,118.296;QD=52.9863;RBI=0.0207849,0.0869718;REFB=0,0;REVB=0.0206201,0.0869561;RO=0;SAF=0,7;SAR=3,16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0087231,0.00512402;OID=.,.;OPOS=141974816,141974816;OREF=A,A;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0740741,0.925926:3,23:27:2,25:27:0:0,7:2,18:0:0:7:0:0,7:3,16:0:0
chr4	142640637	.	A	G	515.0	PASS	AF=0.534091;AO=42;DP=91;FAO=47;FDP=88;FR=.,HEALED;FRO=35;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=-0.00986231;FXX=0.0329634;HRUN=8;LEN=1;MLLD=238.582;QD=23.4091;RBI=0.00998515;REFB=-0.0267411;REVB=0.00156147;RO=25;SAF=18;SAR=24;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0482534;STB=0.523774;STBP=0.632;TYPE=snp;VARB=0.0160372;OID=.;OPOS=142640637;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:88:25:35:42:47:0.534091:24:18:9:16:27:20:13:22
chr4	142654084	.	C	A	505.75	PASS	AF=0.49;AO=49;DP=100;FAO=49;FDP=100;FR=.;FRO=51;FSAF=22;FSAR=27;FSRF=12;FSRR=39;FWDB=-0.0033139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.537;QD=20.2299;RBI=0.0176302;REFB=0.00650973;REVB=-0.017316;RO=51;SAF=22;SAR=27;SRF=12;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.204564;STB=0.612616;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=-0.00671326;OID=.;OPOS=142654084;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:51:51:49:49:0.49:27:22:12:39:27:22:12:39
chr4	143043340	.	A	G	260.52	PASS	AF=0.416667;AO=30;DP=72;FAO=30;FDP=72;FR=.;FRO=42;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=0.000296492;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.571;QD=14.4733;RBI=0.0122724;REFB=-0.00656558;REVB=0.0122688;RO=42;SAF=16;SAR=14;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00981684;STB=0.505572;STBP=0.974;TYPE=snp;VARB=0.00655033;OID=.;OPOS=143043340;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:42:42:30:30:0.416667:14:16:22:20:14:16:22:20
chr4	143094911	.	C	G	527.47	PASS	AF=0.555556;AO=49;DP=90;FAO=50;FDP=90;FR=.;FRO=40;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=-0.0263714;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.701;QD=23.4429;RBI=0.028775;REFB=-0.00725677;REVB=-0.011513;RO=40;SAF=27;SAR=22;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0623739;STB=0.537965;STBP=0.448;TYPE=snp;VARB=0.00858886;OID=.;OPOS=143094911;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:40:40:49:50:0.555556:22:27:19:21:22:28:19:21
chr4	143324094	.	G	A	160.52	PASS	AF=0.33871;AO=21;DP=62;FAO=21;FDP=62;FR=.;FRO=41;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=-0.0481166;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.1117;QD=10.3562;RBI=0.0502726;REFB=-0.0090894;REVB=-0.0145648;RO=41;SAF=10;SAR=11;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0421495;STB=0.524668;STBP=0.803;TYPE=snp;VARB=0.0228569;OID=.;OPOS=143324094;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:41:41:21:21:0.33871:11:10:18:23:11:10:18:23
chr4	143344932	.	A	G	245.52	PASS	AF=0.547619;AO=23;DP=42;FAO=23;FDP=42;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.0939517;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.12;QD=23.3824;RBI=0.0939724;REFB=-0.0209674;REVB=0.00197045;RO=19;SAF=11;SAR=12;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123796;STB=0.569013;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=0.0115743;OID=.;OPOS=143344932;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:19:19:23:23:0.547619:12:11:12:7:12:11:12:7
chr4	144135718	.	G	A	643.65	PASS	AF=0.924528;AO=50;DP=53;FAO=49;FDP=53;FR=.;FRO=4;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0261363;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2623;QD=48.5776;RBI=0.0706486;REFB=-0.028725;REVB=-0.0656363;RO=3;SAF=26;SAR=24;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0552805;STB=0.519622;STBP=0.399;TYPE=snp;VARB=0.0184145;OID=.;OPOS=144135718;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:17:53:53:3:4:50:49:0.924528:24:26:0:3:24:25:1:3
chr4	144442611	.	T	C	49.59	PASS	AF=0.538462;AO=7;DP=13;FAO=7;FDP=13;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.00291873;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=161.084;QD=15.2589;RBI=0.0735113;REFB=0.00282789;REVB=0.0734533;RO=6;SAF=4;SAR=3;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183473;STB=0.60839;STBP=0.483;TYPE=snp;VARB=0.000454724;OID=.;OPOS=144442611;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:13:13:6:6:7:7:0.538462:3:4:2:4:3:4:2:4
chr4	144442735	.	C	T	393.27	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0583657;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.9212;QD=56.1816;RBI=0.0646737;REFB=0;REVB=0.0278593;RO=0;SAF=9;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.62669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000632506;OID=.;OPOS=144442735;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:19:9:0:0:19:9:0:0
chr4	144467104	.	T	C	740.82	PASS	AF=1;AO=51;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00756922;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.989;QD=56.9861;RBI=0.012302;REFB=0;REVB=0.00969769;RO=0;SAF=25;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94283e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.15615e-05;OID=.;OPOS=144467104;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:51:52:1:26:25:0:0:26:26:0:0
chr4	144618610	.	G	C	875.22	PASS	AF=0.983871;AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0239836;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.218;QD=56.4659;RBI=0.0337454;REFB=-0.0924348;REVB=-0.0237389;RO=1;SAF=40;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0116565;STB=0.506171;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.000354332;OID=.;OPOS=144618610;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:62:62:1:1:61:61:0.983871:21:40:1:0:21:40:1:0
chr4	144794616	.	C	T	528.54	PASS	AF=0.925;AO=37;DP=40;FAO=37;FDP=40;FR=.;FRO=3;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.000490117;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=260.019;QD=52.8537;RBI=0.0231061;REFB=-0.0265834;REVB=-0.0231009;RO=3;SAF=16;SAR=21;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0623306;STB=0.533316;STBP=0.198;TYPE=snp;VARB=0.00218659;OID=.;OPOS=144794616;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:40:40:3:3:37:37:0.925:21:16:0:3:21:16:0:3
chr4	144799840	.	G	A	716.92	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00515553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.479;QD=62.3407;RBI=0.00912006;REFB=0;REVB=0.00752304;RO=0;SAF=23;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000205971;OID=.;OPOS=144799840;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:46:0:0:45:46:1:22:23:0:0:22:24:0:0
chr4	144801662	.	C	G,T	1649.96	PASS	AF=0.307018,0.692982;AO=35,77;DP=113;FAO=35,79;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=16,35;FSAR=19,44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000293982,-0.0252098;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=120.352,37.2246;QD=57.8932;RBI=0.0295401,0.0474734;REFB=0,0;REVB=-0.0295386,-0.0402267;RO=0;SAF=16,35;SAR=19,42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=4.1382e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0100636,0.0199901;OID=.,.;OPOS=144801662,144801662;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:113:114:0:0:35,77:35,79:0.307018,0.692982:19,42:16,35:0:0:19,44:16,35:0:0
chr4	144918712	.	C	G	520.01	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.043122;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.4822;QD=59.4291;RBI=0.0530877;REFB=0;REVB=0.0309645;RO=0;SAF=18;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00148592;OID=.;OPOS=144918712;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:17:18:0:0:17:18:0:0
chr4	145041686	.	A	G	340.48	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0197916;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.2088;QD=54.4762;RBI=0.0290547;REFB=0;REVB=0.0212713;RO=0;SAF=14;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.3826e-05;OID=.;OPOS=145041686;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:11:14:0:0:11:14:0:0
chr4	145041741	.	T	G	313.59	PASS	AF=0.96;AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=25;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0334454;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=140.774;QD=50.175;RBI=0.0381107;REFB=-0.0449734;REVB=-0.018271;RO=1;SAF=8;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0544279;STB=0.529387;STBP=0.288;TYPE=snp;VARB=0.000506202;OID=.;OPOS=145041741;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:25:25:1:1:24:24:0.96:16:8:1:0:16:8:1:0
chr4	146054799	.	G	C	520.7	PASS	AF=0.578313;AO=48;DP=84;FAO=48;FDP=83;FR=.;FRO=35;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=20;FSRR=15;FWDB=-0.0100129;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.8848;QD=25.0937;RBI=0.0178149;REFB=-0.0245163;REVB=0.0147347;RO=34;SAF=26;SAR=22;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0356606;STB=0.512659;STBP=0.814;TYPE=snp;VARB=0.0201254;OID=.;OPOS=146054799;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:83:34:35:48:48:0.578313:22:26:20:14:22:26:20:15
chr4	146057637	.	A	AAC	53.58	PASS	AF=0.421053;AO=6;DP=21;FAO=8;FDP=19;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=2;FWDB=-0.0166603;FXX=0;HRUN=4;LEN=2;MLLD=259.098;QD=11.279;RBI=0.0315371;REFB=-0.00970189;REVB=-0.0267773;RO=12;SAF=5;SAR=1;SRF=10;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.2918e-08;STB=0.555425;STBP=0.8;TYPE=ins;VARB=0.0162232;OID=.;OPOS=146057638;OREF=-;OALT=AC;OMAPALT=AAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.421053:6:21:8:19:11:6:2:9:2:53:12:5:1:10:2
chr4	146101073	.	GGC	G,GG	69.64	PASS	AF=0.358974,0;AO=13,5;DP=39;FAO=14,0;FDP=39;FR=.;FRO=25;FSAF=8,0;FSAR=6,0;FSRF=6;FSRR=19;FWDB=-0.150932,-0.197521;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=2,1;MLLD=22.3265,11.4322;QD=7.143;RBI=0.184819,0.224394;REFB=-0.0980171,-0.118778;REVB=-0.106667,-0.106481;RO=21;SAF=8,2;SAR=5,3;SRF=4;SRR=17;SSEN=0.509542,0;SSEP=0,0.509542;SSSB=0.426183,0.289321;STB=0.703967,0.5;STBP=0.079,1;TYPE=del,del;VARB=0.166306,0.0281965;OID=.,.;OPOS=146101074,146101075;OREF=GC,C;OALT=-,-;OMAPALT=G,GG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.358974,0:13,5:39:14,0:39:25:8,0:6,0:6:19:68:21:8,2:5,3:4:17
chr4	146479247	.	C	A	135.59	PASS	AF=0.483871;AO=11;DP=27;FAO=15;FDP=31;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.0284613;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.802;QD=17.4957;RBI=0.0303207;REFB=-0.0127431;REVB=0.0104546;RO=16;SAF=3;SAR=8;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.246768;STB=0.687223;STBP=0.065;TYPE=snp;VARB=0.00937266;OID=.;OPOS=146479247;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:31:16:16:11:15:0.483871:8:3:8:8:12:3:8:8
chr4	146823565	.	A	G	80.27	PASS	AF=0.526316;AO=10;DP=19;FAO=10;FDP=19;FR=.;FRO=9;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.0429433;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.7491;QD=16.8979;RBI=0.0487233;REFB=-0.0045427;REVB=-0.0230181;RO=7;SAF=8;SAR=2;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.317856;STB=0.699557;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.00984227;OID=.;OPOS=146823565;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:19:19:7:9:10:10:0.526316:2:8:3:4:2:8:4:5
chr4	147788728	.	G	A	3195.03	PASS	AF=1;AO=167;DP=200;FAO=199;FDP=199;FR=.;FRO=0;FSAF=90;FSAR=109;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00884885;FXX=0.00499975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.508;QD=64.2218;RBI=0.0088933;REFB=0;REVB=-0.000888032;RO=0;SAF=67;SAR=100;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.15183e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.24821e-05;OID=.;OPOS=147788728;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:17:200:199:0:0:167:199:1:100:67:0:0:109:90:0:0
chr4	147824864	.	G	A	870.53	PASS	AF=1;AO=59;DP=61;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0342829;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.08;QD=58.0354;RBI=0.0357517;REFB=0;REVB=-0.0101426;RO=0;SAF=28;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000472144;OID=.;OPOS=147824864;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:60:0:0:59:60:1:31:28:0:0:32:28:0:0
chr4	149000024	.	C	T	457.72	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0105372;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.697;QD=57.2148;RBI=0.0303394;REFB=0;REVB=0.0284507;RO=0;SAF=12;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.72726e-05;OID=.;OPOS=149000024;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:32:0:0:30:32:1:18:12:0:0:20:12:0:0
chr4	149002016	.	AT	A	146.86	PASS	AF=1;AO=17;DP=25;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.061656;FXX=0.039984;HRUN=7;LEN=1;MLLD=8.27407;QD=24.4766;RBI=0.14097;REFB=0;REVB=0.126771;RO=5;SAF=6;SAR=11;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0707164;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00983832;OID=.;OPOS=149002017;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:17:25:24:24:0:7:17:0:0:3:5:6:11:1:4
chr4	149356516	.	A	G	1607.13	PASS	AF=1;AO=99;DP=100;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.025033;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.449;QD=64.2853;RBI=0.0316422;REFB=0;REVB=-0.0193541;RO=0;SAF=57;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.37041e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.89912e-06;OID=.;OPOS=149356516;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:100:100:0:0:99:100:1:42:57:0:0:42:58:0:0
chr4	149357475	.	C	T	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159063;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.06;QD=51.9165;RBI=0.0159287;REFB=0;REVB=0.000844932;RO=0;SAF=7;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.86398e-05;OID=.;OPOS=149357475;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:14:7:0:0:14:7:0:0
chr4	149358014	.	G	C	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00260224;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.138;QD=51.9167;RBI=0.00276729;REFB=0;REVB=0.000941377;RO=0;SAF=10;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.76323e-05;OID=.;OPOS=149358014;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:11:10:0:0:11:10:0:0
chr4	150769133	.	G	A	530.3	PASS	AF=0.583333;AO=49;DP=84;FAO=49;FDP=84;FR=.;FRO=35;FSAF=22;FSAR=27;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=0.00706133;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=280.691;QD=25.2526;RBI=0.00857794;REFB=-0.00428724;REVB=0.00487018;RO=35;SAF=22;SAR=27;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0062764;STB=0.503433;STBP=0.953;TYPE=snp;VARB=0.00311803;OID=.;OPOS=150769133;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:35:35:49:49:0.583333:27:22:16:19:27:22:16:19
chr4	151000419	.	G	A	206.63	PASS	AF=0.396825;AO=25;DP=63;FAO=25;FDP=63;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=0.000217696;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=260.581;QD=13.1196;RBI=0.00961352;REFB=-0.00781692;REVB=0.00961106;RO=38;SAF=15;SAR=10;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0791781;STB=0.545418;STBP=0.565;TYPE=snp;VARB=0.0123709;OID=.;OPOS=151000419;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:38:38:25:25:0.396825:10:15:20:18:10:15:20:18
chr4	151120242	.	C	T	516.61	PASS	AF=0.532609;AO=48;DP=91;FAO=49;FDP=92;FR=.;FRO=43;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=19;FSRR=24;FWDB=0.0085508;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.551;QD=22.4615;RBI=0.0103314;REFB=-0.000470167;REVB=-0.00579836;RO=43;SAF=23;SAR=25;SRF=19;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0320734;STB=0.51293;STBP=0.809;TYPE=snp;VARB=0.000536438;OID=.;OPOS=151120242;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:92:43:43:48:49:0.532609:25:23:19:24:26:23:19:24
chr4	151199080	.	G	A	390.43	PASS	AF=0.487805;AO=40;DP=82;FAO=40;FDP=82;FR=.;FRO=42;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=15;FSRR=27;FWDB=-0.00295928;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.835;QD=19.0451;RBI=0.00671458;REFB=0.00533825;REVB=0.0060273;RO=41;SAF=17;SAR=23;SRF=15;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0556563;STB=0.535922;STBP=0.566;TYPE=snp;VARB=-0.00410135;OID=.;OPOS=151199080;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:41:42:40:40:0.487805:23:17:15:26:23:17:15:27
chr4	151207127	.	C	T	117.2	PASS	AF=0.358974;AO=14;DP=39;FAO=14;FDP=39;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.0266695;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.638;QD=12.0206;RBI=0.0283659;REFB=-0.0012158;REVB=-0.00966259;RO=25;SAF=9;SAR=5;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137756;STB=0.58163;STBP=0.473;TYPE=snp;VARB=0.00318177;OID=.;OPOS=151207127;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:25:25:14:14:0.358974:5:9:13:12:5:9:13:12
chr4	151505322	.	T	A	340.73	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0897711;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.5758;QD=54.5174;RBI=0.0906922;REFB=0;REVB=0.0128928;RO=0;SAF=8;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00111601;OID=.;OPOS=151505322;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:17:8:0:0:17:8:0:0
chr4	151505505	.	A	G	115.5	PASS	AF=0.325581;AO=14;DP=42;FAO=14;FDP=43;FR=.;FRO=29;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.0136656;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=82.2465;QD=10.7442;RBI=0.013666;REFB=-0.00761366;REVB=0.000106464;RO=28;SAF=3;SAR=11;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.387014;STB=0.724929;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.0191212;OID=.;OPOS=151505505;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:43:28:29:14:14:0.325581:11:3:15:13:11:3:15:14
chr4	151719263	.	A	G	214.85	PASS	AF=0.46;AO=23;DP=50;FAO=23;FDP=50;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=0.0100976;FXX=0.019604;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.52;QD=17.1882;RBI=0.0171172;REFB=-0.00375136;REVB=0.0138216;RO=27;SAF=11;SAR=12;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.038358;STB=0.52172;STBP=0.812;TYPE=snp;VARB=0.00467362;OID=.;OPOS=151719263;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:27:27:23:23:0.46:12:11:14:13:12:11:14:13
chr4	152041502	.	C	G	323.47	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0239264;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.472;QD=53.9108;RBI=0.0376364;REFB=0;REVB=-0.0290521;RO=0;SAF=9;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.0849e-05;OID=.;OPOS=152041502;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:15:9:0:0:15:9:0:0
chr4	152070633	.	T	A	1432.79	PASS	AF=0.96875;AO=93;DP=96;FAO=93;FDP=96;FR=.;FRO=3;FSAF=53;FSAR=40;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.00916014;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=209.13;QD=59.6997;RBI=0.00932577;REFB=-0.0686646;REVB=0.00174981;RO=3;SAF=53;SAR=40;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0260785;STB=0.513758;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=0.000204836;OID=.;OPOS=152070633;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:96:96:3:3:93:93:0.96875:40:53:3:0:40:53:3:0
chr4	152201018	.	G	GCAGGT	206.59	PASS	AF=0.4375;AO=20;DP=49;FAO=21;FDP=48;FR=.;FRO=27;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=20;FSRR=7;FWDB=0.00183106;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=5;MLLD=193.773;QD=17.2155;RBI=0.0275272;REFB=-0.0285171;REVB=-0.0274662;RO=27;SAF=13;SAR=7;SRF=20;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104113;STB=0.548343;STBP=0.627;TYPE=ins;VARB=0.0350554;OID=.;OPOS=152201019;OREF=-;OALT=CAGGT;OMAPALT=GCAGGT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.4375:20:49:21:48:27:14:7:20:7:99:27:13:7:20:7
chr4	152201053	.	G	A	451.74	PASS	AF=0.589041;AO=43;DP=73;FAO=43;FDP=73;FR=.;FRO=30;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=19;FSRR=11;FWDB=-0.0203338;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.467;QD=24.7528;RBI=0.0241168;REFB=-0.000946087;REVB=0.0129676;RO=30;SAF=21;SAR=22;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108584;STB=0.559413;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=0.000474044;OID=.;OPOS=152201053;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:30:30:43:43:0.589041:22:21:19:11:22:21:19:11
chr4	152212486	.	C	T	168.43	PASS	AF=0.338462;AO=22;DP=65;FAO=22;FDP=65;FR=.;FRO=43;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=23;FSRR=20;FWDB=0.0344091;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.442;QD=10.365;RBI=0.0626972;REFB=-0.0224445;REVB=-0.0524114;RO=42;SAF=9;SAR=13;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129475;STB=0.583374;STBP=0.348;TYPE=snp;VARB=0.0283154;OID=.;OPOS=152212486;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:42:43:22:22:0.338462:13:9:22:20:13:9:23:20
chr4	152212603	.	T	G	575.76	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00711875;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.7355;QD=60.6059;RBI=0.0539472;REFB=0;REVB=0.0534754;RO=0;SAF=23;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000855715;OID=.;OPOS=152212603;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:15:23:0:0:15:23:0:0
chr4	152498625	.	C	T	502.43	PASS	AF=0.521739;AO=48;DP=93;FAO=48;FDP=92;FR=.;FRO=44;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=23;FSRR=21;FWDB=0.000276268;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.262;QD=21.8447;RBI=0.00665894;REFB=-0.0086718;REVB=0.00665321;RO=44;SAF=26;SAR=22;SRF=23;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0164971;STB=0.509104;STBP=0.869;TYPE=snp;VARB=0.00643428;OID=.;OPOS=152498625;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:92:44:44:48:48:0.521739:22:26:23:21:22:26:23:21
chr4	152624972	.	A	G	518.04	PASS	AF=0.478261;AO=55;DP=115;FAO=55;FDP=115;FR=.;FRO=60;FSAF=17;FSAR=38;FSRF=29;FSRR=31;FWDB=0.0449327;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.1775;QD=18.0188;RBI=0.048786;REFB=-0.0155798;REVB=0.0190033;RO=60;SAF=17;SAR=38;SRF=29;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176681;STB=0.598388;STBP=0.056;TYPE=snp;VARB=0.0163907;OID=.;OPOS=152624972;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:115:60:60:55:55:0.478261:38:17:29:31:38:17:29:31
chr4	152682046	.	G	T	483.46	PASS	AF=0.49505;AO=50;DP=101;FAO=50;FDP=101;FR=.;FRO=51;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=28;FSRR=23;FWDB=0.0257783;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.9653;QD=19.1469;RBI=0.0266622;REFB=-0.0199775;REVB=0.00680823;RO=50;SAF=28;SAR=22;SRF=27;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0182803;STB=0.505616;STBP=0.925;TYPE=snp;VARB=0.0161166;OID=.;OPOS=152682046;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:101:50:51:50:50:0.49505:22:28:27:23:22:28:28:23
chr4	153896358	.	C	T	928.91	PASS	AF=0.460465;AO=99;DP=216;FAO=99;FDP=215;FR=.;FRO=116;FSAF=46;FSAR=53;FSRF=50;FSRR=66;FWDB=0.0099204;FXX=0.00921617;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.8;QD=17.2821;RBI=0.0124903;REFB=-0.00824663;REVB=0.007589;RO=116;SAF=46;SAR=53;SRF=50;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0330264;STB=0.518269;STBP=0.635;TYPE=snp;VARB=0.00959071;OID=.;OPOS=153896358;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:216:215:116:116:99:99:0.460465:53:46:50:66:53:46:50:66
chr4	153897770	.	G	A	272.79	PASS	AF=0.424658;AO=31;DP=73;FAO=31;FDP=73;FR=.;FRO=42;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=24;FSRR=18;FWDB=9.67614e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.065;QD=14.9474;RBI=0.00166327;REFB=-0.0153357;REVB=0.00166045;RO=42;SAF=16;SAR=15;SRF=24;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.056375;STB=0.531894;STBP=0.673;TYPE=snp;VARB=0.0204882;OID=.;OPOS=153897770;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:42:42:31:31:0.424658:15:16:24:18:15:16:24:18
chr4	153898178	.	A	G	238.34	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0707662;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.2056;QD=50.1766;RBI=0.0952722;REFB=0;REVB=0.0637882;RO=0;SAF=4;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.00629e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000230022;OID=.;OPOS=153898178;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:15:4:0:0:15:4:0:0
chr4	154216710	.	G	A	37.15	PASS	AF=0.333333;AO=6;DP=18;FAO=6;FDP=18;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=0.0164661;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.907;QD=8.25463;RBI=0.113544;REFB=0.00949333;REVB=-0.112344;RO=12;SAF=5;SAR=1;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.528478;STB=0.832222;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=-0.00424081;OID=.;OPOS=154216710;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:18:18:12:12:6:6:0.333333:1:5:4:8:1:5:4:8
chr4	154258667	.	A	C	46.26	PASS	AF=0.145161;AO=10;DP=63;FAO=9;FDP=62;FR=.,HEALED;FRO=53;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=32;FSRR=21;FWDB=-0.0656016;FXX=0.0312451;HRUN=6;LEN=1;MLLD=33.4138;QD=2.98448;RBI=0.0669629;REFB=-0.0464593;REVB=0.0134332;RO=38;SAF=6;SAR=4;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.185096;STB=0.542033;STBP=0.799;TYPE=snp;VARB=0.187647;OID=.;OPOS=154258667;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:63:62:38:53:10:9:0.145161:4:6:17:21:4:5:32:21
chr4	154388403	.	A	G	217.92	PASS	AF=0.40625;AO=26;DP=64;FAO=26;FDP=64;FR=.;FRO=38;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=0.00127097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.057;QD=13.6197;RBI=0.0417707;REFB=-0.0145271;REVB=-0.0417513;RO=38;SAF=10;SAR=16;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122349;STB=0.56997;STBP=0.378;TYPE=snp;VARB=0.0174111;OID=.;OPOS=154388403;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:38:38:26:26:0.40625:16:10:19:19:16:10:19:19
chr4	154478222	.	C	T	884.48	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0235714;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.2927;QD=57.9984;RBI=0.0319928;REFB=0;REVB=-0.0216316;RO=0;SAF=24;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.9695e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000473877;OID=.;OPOS=154478222;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:61:0:0:60:61:1:36:24:0:0:36:25:0:0
chr4	154479430	.	T	C	520.05	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0144416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.949;QD=59.4338;RBI=0.0322126;REFB=0;REVB=-0.0287939;RO=0;SAF=23;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000317096;OID=.;OPOS=154479430;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:12:23:0:0:12:23:0:0
chr4	154525458	.	C	T	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143164;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=290.741;QD=52.6132;RBI=0.014488;REFB=0;REVB=0.00222372;RO=0;SAF=9;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2029e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.14682e-05;OID=.;OPOS=154525458;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:13:9:0:0:13:9:0:0
chr4	154624656	.	T	C	306.06	PASS	AF=0.533333;AO=32;DP=60;FAO=32;FDP=60;FR=.;FRO=28;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=0.00296984;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.681;QD=20.404;RBI=0.00716396;REFB=7.81653e-05;REVB=0.00651939;RO=28;SAF=19;SAR=13;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139654;STB=0.577519;STBP=0.215;TYPE=snp;VARB=-2.679e-05;OID=.;OPOS=154624656;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:28:28:32:32:0.533333:13:19:12:16:13:19:12:16
chr4	154625409	.	T	C	198.7	PASS	AF=0.487805;AO=20;DP=41;FAO=20;FDP=41;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.0079755;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.77;QD=19.3857;RBI=0.00798102;REFB=-0.00074573;REVB=0.000296676;RO=21;SAF=11;SAR=9;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0668974;STB=0.537859;STBP=0.673;TYPE=snp;VARB=0.000556289;OID=.;OPOS=154625409;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:21:21:20:20:0.487805:9:11:10:11:9:11:10:11
chr4	154626180	.	T	C	331.09	PASS	AF=0.428571;AO=36;DP=85;FAO=36;FDP=84;FR=.;FRO=48;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=21;FSRR=27;FWDB=-0.00746567;FXX=0.0117633;HRUN=3;LEN=1;MLLD=259.094;QD=15.7662;RBI=0.00939646;REFB=-0.000995617;REVB=0.00570589;RO=47;SAF=14;SAR=22;SRF=21;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0602163;STB=0.52883;STBP=0.66;TYPE=snp;VARB=0.00119985;OID=.;OPOS=154626180;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:84:47:48:36:36:0.428571:22:14:21:26:22:14:21:27
chr4	154631543	.	A	T	1264.39	PASS	AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.019499;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.501;QD=61.6775;RBI=0.0196592;REFB=0;REVB=0.00250458;RO=0;SAF=42;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.65394e-05;OID=.;OPOS=154631543;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:40:42:0:0:40:42:0:0
chr4	154702283	.	G	C	323.46	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00916615;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.003;QD=53.9107;RBI=0.0143468;REFB=0;REVB=-0.0110368;RO=0;SAF=13;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000154413;OID=.;OPOS=154702283;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:11:13:0:0:11:13:0:0
chr4	154709856	.	A	C	747.09	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0187163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.424;QD=63.5825;RBI=0.0305582;REFB=0;REVB=0.0241558;RO=0;SAF=19;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.22465e-05;OID=.;OPOS=154709856;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:28:19:0:0:28:19:0:0
chr4	155156207	.	G	A	708.56	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=7.84777e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.937;QD=62.9829;RBI=0.0165445;REFB=0;REVB=0.0165443;RO=0;SAF=26;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.15971e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.73306e-05;OID=.;OPOS=155156207;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:19:26:0:0:19:26:0:0
chr4	155219318	.	C	T	70.83	PASS	AF=0.30303;AO=9;DP=32;FAO=10;FDP=33;FR=.;FRO=23;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=0.00800146;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.804;QD=8.58494;RBI=0.0180331;REFB=-0.0109408;REVB=0.0161608;RO=21;SAF=2;SAR=7;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.269229;STB=0.695219;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.0377422;OID=.;OPOS=155219318;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:70:32:33:21:23:9:10:0.30303:7:2:9:12:8:2:10:13
chr4	155219361	.	A	G	142.62	PASS	AF=0.4;AO=16;DP=40;FAO=16;FDP=40;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=-0.0145958;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.273;QD=14.2619;RBI=0.014733;REFB=0.00697156;REVB=-0.00200545;RO=24;SAF=7;SAR=9;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0648571;STB=0.537688;STBP=0.711;TYPE=snp;VARB=-0.0135222;OID=.;OPOS=155219361;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:24:24:16:16:0.4:9:7:12:12:9:7:12:12
chr4	155219662	.	G	C	262.81	PASS	AF=0.428571;AO=30;DP=70;FAO=30;FDP=70;FR=.;FRO=40;FSAF=21;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=0.00816561;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.262;QD=15.0176;RBI=0.0195949;REFB=-0.00142303;REVB=-0.0178124;RO=39;SAF=21;SAR=9;SRF=18;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.250298;STB=0.636269;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.000727137;OID=.;OPOS=155219662;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:39:40:30:30:0.428571:9:21:18:21:9:21:19:21
chr4	155243573	.	C	T	1377.47	PASS	AF=1;AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0139523;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.059;QD=62.612;RBI=0.0334706;REFB=0;REVB=-0.030424;RO=0;SAF=41;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.19675e-05;OID=.;OPOS=155243573;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:88:88:0:0:88:88:1:47:41:0:0:47:41:0:0
chr4	155243604	.	T	C	1021.07	PASS	AF=1;AO=69;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0153308;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.3728;QD=58.3467;RBI=0.0200932;REFB=0;REVB=0.0129887;RO=1;SAF=26;SAR=43;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0178329;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000283031;OID=.;OPOS=155243604;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:70:70:1:0:69:70:1:43:26:1:0:43:27:0:0
chr4	155244401	.	TTTTGTTTGTTTG	TTTTGTTTG,TTTTGTTTGT	261.78	PASS	AF=0.8,0;AO=13,6;DP=32;FAO=28,0;FDP=35;FR=.;FRO=7;FSAF=13,0;FSAR=15,0;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-5.17216e-05,-0.00318267;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=4,3;MLLD=219.943,213.187;QD=29.9181;RBI=0.0147318,0.00439628;REFB=0.00297445,0.00705721;REVB=0.0147317,0.0030328;RO=0;SAF=8,1;SAR=5,5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.60098e-08,3.18042e-08;STB=0.507182,0.5;STBP=0.918,1;TYPE=del,del;VARB=-0.000501331,0;OID=.,.;OPOS=155244402,155244411;OREF=TTTG,TTG;OALT=-,-;OMAPALT=TTTTGTTTG,TTTTGTTTGT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.8,0:13,6:32:28,0:35:7:13,0:15,0:3:4:29:0:8,1:5,5:0:0
chr4	155244475	.	G	T	450.79	PASS	AF=1;AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00577763;FXX=0.0312402;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.146;QD=58.1669;RBI=0.0175508;REFB=0;REVB=-0.0165725;RO=0;SAF=15;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.2036e-05;OID=.;OPOS=155244475;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:31:0:0:31:31:1:16:15:0:0:16:15:0:0
chr4	155256177	.	A	G	141.86	PASS	AF=0.333333;AO=17;DP=51;FAO=17;FDP=51;FR=.;FRO=34;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=-0.00110412;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.677;QD=11.1265;RBI=0.0253077;REFB=-0.0198219;REVB=0.0252836;RO=32;SAF=8;SAR=9;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101664;STB=0.558552;STBP=0.562;TYPE=snp;VARB=0.0288334;OID=.;OPOS=155256177;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:32:34:17:17:0.333333:9:8:18:14:9:8:19:15
chr4	155256205	.	G	A	606.61	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0145509;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.426;QD=60.661;RBI=0.0286971;REFB=0;REVB=0.0247345;RO=0;SAF=21;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.53998e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000127258;OID=.;OPOS=155256205;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:40:0:0:38:40:1:17:21:0:0:19:21:0:0
chr4	155287535	.	T	C	320.79	PASS	AF=0.55;AO=33;DP=60;FAO=33;FDP=60;FR=.;FRO=27;FSAF=22;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=0.0251172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.733;QD=21.3863;RBI=0.0257028;REFB=0.013916;REVB=0.00545501;RO=27;SAF=22;SAR=11;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0659767;STB=0.536563;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=-0.011599;OID=.;OPOS=155287535;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:27:27:33:33:0.55:11:22:16:11:11:22:16:11
chr4	155295076	.	A	G	167.51	PASS	AF=0.514286;AO=17;DP=34;FAO=18;FDP=35;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.0764228;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.9168;QD=19.1443;RBI=0.0819663;REFB=-0.0213696;REVB=0.0296315;RO=17;SAF=8;SAR=9;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0521373;STB=0.516111;STBP=0.885;TYPE=snp;VARB=0.0194886;OID=.;OPOS=155295076;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:35:17:17:17:18:0.514286:9:8:7:10:10:8:7:10
chr4	155407680	.	A	G	557.06	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0485573;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=54.2735;QD=60.2223;RBI=0.0592649;REFB=0;REVB=0.0339782;RO=0;SAF=13;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000243956;OID=.;OPOS=155407680;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:24:13:0:0:24:13:0:0
chr4	155410650	.	T	C	557.38	PASS	AF=0.457364;AO=59;DP=129;FAO=59;FDP=129;FR=.;FRO=70;FSAF=20;FSAR=39;FSRF=32;FSRR=38;FWDB=-0.0393245;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.923;QD=17.2831;RBI=0.0413136;REFB=-0.034013;REVB=-0.0126647;RO=69;SAF=20;SAR=39;SRF=31;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114075;STB=0.568362;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.037723;OID=.;OPOS=155410650;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:129:129:69:70:59:59:0.457364:39:20:31:38:39:20:32:38
chr4	155410667	.	G	A	544.19	PASS	AF=0.453125;AO=58;DP=128;FAO=58;FDP=128;FR=.;FRO=70;FSAF=19;FSAR=39;FSRF=32;FSRR=38;FWDB=0.015198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.889;QD=17.0059;RBI=0.0154898;REFB=-0.0172576;REVB=-0.00299288;RO=70;SAF=19;SAR=39;SRF=32;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136305;STB=0.576161;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=0.0210312;OID=.;OPOS=155410667;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:128:128:70:70:58:58:0.453125:39:19:32:38:39:19:32:38
chr4	155410731	.	G	C	327.75	PASS	AF=0.418605;AO=36;DP=86;FAO=36;FDP=86;FR=.;FRO=50;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=31;FSRR=19;FWDB=-0.000866187;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.154;QD=15.2444;RBI=0.00135068;REFB=-0.00815075;REVB=-0.00103637;RO=50;SAF=20;SAR=16;SRF=31;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0677621;STB=0.538238;STBP=0.578;TYPE=snp;VARB=0.0104239;OID=.;OPOS=155410731;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:50:50:36:36:0.418605:16:20:31:19:16:20:31:19
chr4	155410822	.	G	A	502.18	PASS	AF=0.494949;AO=49;DP=99;FAO=49;FDP=99;FR=.;FRO=50;FSAF=29;FSAR=20;FSRF=31;FSRR=19;FWDB=-0.0152242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.4801;QD=20.2902;RBI=0.0254913;REFB=-0.0224813;REVB=-0.0204458;RO=50;SAF=29;SAR=20;SRF=31;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0267225;STB=0.514795;STBP=0.776;TYPE=snp;VARB=0.0270109;OID=.;OPOS=155410822;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:50:50:49:49:0.494949:20:29:31:19:20:29:31:19
chr4	155411065	.	T	C	1789.0	PASS	AF=1;AO=117;DP=118;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0196494;FXX=0.00847386;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.756;QD=61.1626;RBI=0.0198165;REFB=0;REVB=0.00256817;RO=0;SAF=62;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.07878e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.73375e-05;OID=.;OPOS=155411065;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:118:117:0:0:117:117:1:55:62:0:0:55:62:0:0
chr4	155411104	.	A	C	1696.07	PASS	AF=0.982759;AO=113;DP=116;FAO=114;FDP=116;FR=.;FRO=2;FSAF=75;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0131605;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.039;QD=58.4851;RBI=0.0216068;REFB=-0.0483326;REVB=-0.0171364;RO=2;SAF=75;SAR=38;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00604146;STB=0.503018;STBP=0.772;TYPE=snp;VARB=-0.000187892;OID=.;OPOS=155411104;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:116:116:2:2:113:114:0.982759:38:75:1:1:39:75:1:1
chr4	155411939	.	A	C	628.99	PASS	AF=0.445161;AO=69;DP=155;FAO=69;FDP=155;FR=.;FRO=86;FSAF=39;FSAR=30;FSRF=56;FSRR=30;FWDB=-0.0212572;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.5223;QD=16.232;RBI=0.0536401;REFB=-0.00499184;REVB=-0.0492483;RO=85;SAF=39;SAR=30;SRF=56;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.095979;STB=0.549119;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=0.00725787;OID=.;OPOS=155411939;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:155:155:85:86:69:69:0.445161:30:39:56:29:30:39:56:30
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chr4	155459194	.	A	T	305.76	PASS	AF=0.368421;AO=35;DP=95;FAO=35;FDP=95;FR=.;FRO=60;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=36;FSRR=24;FWDB=-0.02359;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.514;QD=12.874;RBI=0.0236471;REFB=-0.00503491;REVB=0.00164228;RO=60;SAF=14;SAR=21;SRF=36;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.218413;STB=0.624929;STBP=0.069;TYPE=snp;VARB=0.00813165;OID=.;OPOS=155459194;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:60:60:35:35:0.368421:21:14:36:24:21:14:36:24
chr4	155461113	.	T	C	92.91	PASS	AF=0.245283;AO=13;DP=53;FAO=13;FDP=53;FR=.;FRO=40;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=0.0134644;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=272.777;QD=7.01193;RBI=0.014163;REFB=0.00453644;REVB=-0.00439302;RO=39;SAF=9;SAR=4;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.195846;STB=0.632816;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=-0.0172053;OID=.;OPOS=155461113;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:53:53:39:40:13:13:0.245283:4:9:21:18:4:9:21:19
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chr4	155488821	.	C	T	244.06	PASS	AF=0.5;AO=26;DP=52;FAO=26;FDP=52;FR=.;FRO=26;FSAF=19;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.0170594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.191;QD=18.7736;RBI=0.0370009;REFB=-0.00697707;REVB=-0.0328336;RO=25;SAF=19;SAR=7;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.242283;STB=0.647607;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.00370745;OID=.;OPOS=155488821;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:25:26:26:26:0.5:7:19:12:13:7:19:12:14
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chr4	155507382	.	G	A	410.87	PASS	AF=0.482759;AO=38;DP=83;FAO=42;FDP=87;FR=.;FRO=45;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=18;FSRR=27;FWDB=0.0262002;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.634;QD=18.8907;RBI=0.0268418;REFB=-0.0137381;REVB=0.0058336;RO=45;SAF=20;SAR=18;SRF=18;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121843;STB=0.588194;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.0137149;OID=.;OPOS=155507382;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:87:45:45:38:42:0.482759:18:20:18:27:18:24:18:27
chr4	155511824	.	T	C	286.38	PASS	AF=0.565217;AO=24;DP=44;FAO=26;FDP=46;FR=.;FRO=20;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=0.00359157;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.237;QD=24.9022;RBI=0.0293245;REFB=-0.0295836;REVB=0.0291038;RO=20;SAF=12;SAR=12;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0815005;STB=0.543445;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.0316443;OID=.;OPOS=155511824;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:46:20:20:24:26:0.565217:12:12:12:8:13:13:12:8
chr4	155720274	.	T	C	121.58	PASS	AF=0.4375;AO=14;DP=32;FAO=14;FDP=32;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.00609584;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.226;QD=15.1969;RBI=0.0115092;REFB=-0.00610412;REVB=0.00976224;RO=18;SAF=10;SAR=4;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17127;STB=0.59985;STBP=0.338;TYPE=snp;VARB=0.0081958;OID=.;OPOS=155720274;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:18:18:14:14:0.4375:4:10:10:8:4:10:10:8
chr4	156135676	.	C	T	1380.51	PASS	AF=0.988889;AO=88;DP=89;FAO=89;FDP=90;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00987776;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.8877;QD=61.3562;RBI=0.0482645;REFB=-0.118027;REVB=0.0472429;RO=1;SAF=47;SAR=41;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0114177;STB=0.506023;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.000351167;OID=.;OPOS=156135676;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:89:90:1:1:88:89:0.988889:41:47:0:1:41:48:0:1
chr4	156136027	.	C	T	1302.06	PASS	AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00781288;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.227;QD=62.0028;RBI=0.0585583;REFB=0;REVB=0.0580347;RO=0;SAF=51;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.09613e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00014123;OID=.;OPOS=156136027;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:33:51:0:0:33:51:0:0
chr4	156273768	.	T	C	726.89	PASS	AF=0.963636;AO=52;DP=54;FAO=53;FDP=55;FR=.;FRO=2;FSAF=32;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0124211;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=278.335;QD=52.8645;RBI=0.0262386;REFB=-0.0500113;REVB=0.0231123;RO=1;SAF=31;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0149535;STB=0.503936;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=0.00188116;OID=.;OPOS=156273768;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:54:55:1:2:52:53:0.963636:21:31:1:0:21:32:1:1
chr4	156274377	.	T	C	734.0	PASS	AF=0.979167;AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=48;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0264882;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.3054;QD=61.1669;RBI=0.0385927;REFB=-0.0575752;REVB=0.0280674;RO=0;SAF=24;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5102;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.00131165;OID=.;OPOS=156274377;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:48:48:0:1:47:47:0.979167:23:24:0:0:23:24:1:0
chr4	156276289	.	C	T	972.86	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.023025;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.2786;QD=58.961;RBI=0.0477446;REFB=0;REVB=-0.0418257;RO=0;SAF=35;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.769e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.4027e-05;OID=.;OPOS=156276289;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:31:35:0:0:31:35:0:0
chr4	156276317	.	A	G	785.83	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00717671;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.977;QD=64.1494;RBI=0.013852;REFB=0;REVB=0.0118479;RO=0;SAF=22;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.30731e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.22598e-05;OID=.;OPOS=156276317;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:27:22:0:0:27:22:0:0
chr4	156281371	.	T	C	805.29	PASS	AF=0.542857;AO=76;DP=140;FAO=76;FDP=140;FR=.;FRO=64;FSAF=41;FSAR=35;FSRF=29;FSRR=35;FWDB=0.0120526;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.851;QD=23.0083;RBI=0.012922;REFB=-0.0194798;REVB=0.00465959;RO=64;SAF=41;SAR=35;SRF=29;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0721332;STB=0.539463;STBP=0.329;TYPE=snp;VARB=0.0205502;OID=.;OPOS=156281371;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:140:140:64:64:76:76:0.542857:35:41:29:35:35:41:29:35
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chr4	156632391	.	A	G	1008.25	PASS	AF=0.934211;AO=71;DP=76;FAO=71;FDP=76;FR=.;FRO=5;FSAF=22;FSAR=49;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.000663969;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=306.912;QD=53.0656;RBI=0.0135468;REFB=-0.164767;REVB=0.0135305;RO=3;SAF=22;SAR=49;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00209975;STB=0.506895;STBP=0.695;TYPE=snp;VARB=0.000914853;OID=.;OPOS=156632391;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:16:76:76:3:5:71:71:0.934211:49:22:1:2:49:22:2:3
chr4	156680340	.	G	T	947.49	PASS	AF=0.971014;AO=66;DP=69;FAO=67;FDP=69;FR=.;FRO=2;FSAF=29;FSAR=38;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0692979;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.569;QD=54.9268;RBI=0.0799387;REFB=0.0110032;REVB=0.0398497;RO=2;SAF=29;SAR=37;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0314702;STB=0.516662;STBP=0.139;TYPE=snp;VARB=0.000238054;OID=.;OPOS=156680340;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:69:69:2:2:66:67:0.971014:37:29:2:0:38:29:2:0
chr4	156787340	.	G	A	902.54	PASS	AF=1;AO=61;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0194903;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.854;QD=58.2286;RBI=0.0289658;REFB=0;REVB=-0.0214277;RO=0;SAF=29;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.58541e-05;OID=.;OPOS=156787340;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:61:62:1:32:29:0:0:32:30:0:0
chr4	156847230	.	A	G	649.47	PASS	AF=0.912281;AO=52;DP=59;FAO=52;FDP=57;FR=.,HEALED;FRO=5;FSAF=33;FSAR=19;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.0532078;FXX=0.0338926;HRUN=8;LEN=1;MLLD=27.4012;QD=45.5768;RBI=0.0538271;REFB=-0.287491;REVB=0.00814138;RO=3;SAF=33;SAR=19;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0329898;STB=0.503267;STBP=0.887;TYPE=snp;VARB=0.0280808;OID=.;OPOS=156847230;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:16:59:57:3:5:52:52:0.912281:19:33:1:2:19:33:3:2
chr4	156847236	.	AAGG	AAAG,AAG,AAGA,AG	572.08	PASS	AF=0,0,0,1;AO=8,32,4,9;DP=54;FAO=0,0,0,53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0,0,34;FSAR=0,0,0,19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.187133,0.0431839,0.0359627,-0.130854;FXX=0.036357;HRUN=2,2,2,8;LEN=1,1,1,2;MLLD=4.35143,11.3006,6.17733,16.5097;QD=43.1758;RBI=0.188025,0.115711,0.0649043,0.158118;REFB=0,0,0,0;REVB=-0.0182994,-0.107351,-0.0540301,-0.0887619;RO=0;SAF=5,21,1,8;SAR=3,11,3,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=4.46938e-08,0,-4.86674e-08,0;STB=0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1,1;TYPE=snp,del,snp,del;VARB=0,0.00330828,0,0.0290916;OID=.,.,.,.;OPOS=156847238,156847238,156847239,156847237;OREF=G,G,G,AG;OALT=A,-,A,-;OMAPALT=AAAG,AAG,AAGA,AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	4/4:0,0,0,1:8,32,4,9:54:0,0,0,53:53:0:0,0,0,34:0,0,0,19:0:0:4:0:5,21,1,8:3,11,3,1:0:0
chr4	157892014	.	GGC	CGC,G	93.53	PASS	AF=0,0.48;AO=2,10;DP=24;FAO=0,12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=0,2;FSAR=0,10;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=0.0484252,0.040169;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,2;MLLD=21.5381,32.0502;QD=14.9654;RBI=0.0559694,0.253663;REFB=-0.0629014,-0.0933872;REVB=0.0280637,-0.250463;RO=11;SAF=2,0;SAR=0,10;SRF=10;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.451439,-0.84768;STB=0.5,0.796571;STBP=1,0.012;TYPE=snp,del;VARB=0,0.0875135;OID=.,.;OPOS=157892014,157892015;OREF=G,GC;OALT=C,-;OMAPALT=CGC,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:93:24:25:11:13:2,10:0,12:0,0.48:0,10:2,0:10:1:0,10:0,2:9:4
chr4	158043559	.	C	T	455.78	PASS	AF=0.5;AO=45;DP=90;FAO=45;FDP=90;FR=.;FRO=45;FSAF=13;FSAR=32;FSRF=26;FSRR=19;FWDB=-0.0217821;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.8215;QD=20.2567;RBI=0.0346556;REFB=-0.0245797;REVB=-0.0269546;RO=43;SAF=13;SAR=32;SRF=25;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.272943;STB=0.65299;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.0170719;OID=.;OPOS=158043559;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:43:45:45:45:0.5:32:13:25:18:32:13:26:19
chr4	158065038	.	T	C	1420.78	PASS	AF=1;AO=88;DP=89;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0366867;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=298.019;QD=63.1457;RBI=0.0367224;REFB=0;REVB=0.00161877;RO=0;SAF=46;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000333528;OID=.;OPOS=158065038;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:89:90:0:0:88:90:1:42:46:0:0:42:48:0:0
chr4	158238830	.	T	C	5169.85	PASS	AF=1;AO=326;DP=327;FAO=327;FDP=327;FR=.;FRO=0;FSAF=145;FSAR=182;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0157192;FXX=0.00304869;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.232;QD=63.2397;RBI=0.0207195;REFB=0;REVB=0.0134983;RO=0;SAF=145;SAR=181;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.23975e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.58175e-05;OID=.;OPOS=158238830;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:28:327:327:0:0:326:327:1:181:145:0:0:182:145:0:0
chr4	159076826	.	C	T	1616.86	PASS	AF=1;AO=107;DP=109;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0116943;FXX=0.00917347;HRUN=3;LEN=1;MLLD=171.82;QD=59.8835;RBI=0.0137989;REFB=0;REVB=-0.00732475;RO=0;SAF=40;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.9105e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.27622e-05;OID=.;OPOS=159076826;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:109:108:0:0:107:108:1:67:40:0:0:67:41:0:0
chr4	159092633	.	A	G	1249.43	PASS	AF=0.987952;AO=82;DP=83;FAO=82;FDP=83;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00604986;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.9548;QD=60.2133;RBI=0.00646489;REFB=-0.0944871;REVB=-0.00227902;RO=0;SAF=48;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505153;STBP=0.494;TYPE=snp;VARB=-0.000211798;OID=.;OPOS=159092633;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:83:83:0:1:82:82:0.987952:34:48:0:0:34:48:1:0
chr4	159601676	.	C	T	1008.48	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00400889;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.946;QD=59.3226;RBI=0.0107495;REFB=0;REVB=-0.00997396;RO=0;SAF=40;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.7341e-05;OID=.;OPOS=159601676;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:28:40:0:0:28:40:0:0
chr4	159621997	.	G	A	182.99	PASS	AF=0.452381;AO=19;DP=42;FAO=19;FDP=42;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=0.0229556;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.118;QD=17.4274;RBI=0.027607;REFB=-0.000896249;REVB=-0.0153358;RO=23;SAF=11;SAR=8;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218988;STB=0.624563;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.00130793;OID=.;OPOS=159621997;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:23:23:19:19:0.452381:8:11:8:15:8:11:8:15
chr4	159789282	.	A	G	220.4	PASS	AF=0.454545;AO=25;DP=55;FAO=25;FDP=55;FR=.;FRO=30;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=0.00376232;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.671;QD=16.0289;RBI=0.0225663;REFB=-0.00565328;REVB=-0.0222504;RO=29;SAF=16;SAR=9;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.217006;STB=0.631473;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=0.00639312;OID=.;OPOS=159789282;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:29:30:25:25:0.454545:9:16:12:17:9:16:12:18
chr4	159826773	.	T	G	447.03	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0174079;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=331.88;QD=57.6807;RBI=0.0345315;REFB=0;REVB=0.0298227;RO=0;SAF=11;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.23832e-05;OID=.;OPOS=159826773;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:20:11:0:0:20:11:0:0
chr4	159894250	.	C	T	929.31	PASS	AF=0.970149;AO=65;DP=67;FAO=65;FDP=67;FR=.;FRO=2;FSAF=32;FSAR=33;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00569441;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=298.738;QD=55.4811;RBI=0.00840551;REFB=-0.0327579;REVB=-0.00618274;RO=2;SAF=32;SAR=33;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0286092;STB=0.515147;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=0.000130177;OID=.;OPOS=159894250;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:67:67:2:2:65:65:0.970149:33:32:2:0:33:32:2:0
chr4	159894305	.	T	C	1513.26	PASS	AF=1;AO=100;DP=100;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00179499;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.283;QD=59.9312;RBI=0.0296384;REFB=0;REVB=0.029584;RO=0;SAF=51;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.18771e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.75219e-05;OID=.;OPOS=159894305;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:100:101:0:0:100:101:1:49:51:0:0:50:51:0:0
chr4	160428588	.	G	A	483.26	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.014159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.249;QD=58.5775;RBI=0.0421999;REFB=0;REVB=0.0397537;RO=0;SAF=19;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.71297e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.86004e-05;OID=.;OPOS=160428588;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:14:19:0:0:14:19:0:0
chr4	162307060	.	G	T	535.24	PASS	AF=0.426471;AO=58;DP=136;FAO=58;FDP=136;FR=.;FRO=78;FSAF=31;FSAR=27;FSRF=32;FSRR=46;FWDB=-0.0139239;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=266.866;QD=15.7423;RBI=0.0164694;REFB=-0.00442905;REVB=-0.00879588;RO=78;SAF=31;SAR=27;SRF=32;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126655;STB=0.570864;STBP=0.176;TYPE=snp;VARB=0.00536742;OID=.;OPOS=162307060;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:136:136:78:78:58:58:0.426471:27:31:32:46:27:31:32:46
chr4	164048199	.	G	C	1458.43	PASS	AF=1;AO=92;DP=93;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00824708;FXX=0.0212743;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.3719;QD=63.4099;RBI=0.0276475;REFB=0;REVB=0.0263889;RO=0;SAF=43;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000891459;OID=.;OPOS=164048199;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:93:92:0:0:92:92:1:49:43:0:0:49:43:0:0
chr4	164085425	.	T	C	3035.35	PASS	AF=0.979798;AO=193;DP=197;FAO=194;FDP=198;FR=.;FRO=4;FSAF=95;FSAR=99;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0321957;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=127.155;QD=61.3203;RBI=0.0449282;REFB=-0.0508699;REVB=0.0313365;RO=4;SAF=94;SAR=99;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000501043;STB=0.500208;STBP=0.896;TYPE=snp;VARB=0.00118375;OID=.;OPOS=164085425;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:197:198:4:4:193:194:0.979798:99:94:2:2:99:95:2:2
chr4	164272703	.	G	A	386.57	PASS	AF=0.470588;AO=40;DP=85;FAO=40;FDP=85;FR=.;FRO=45;FSAF=26;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=24;FWDB=-0.00405767;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=230.695;QD=18.1915;RBI=0.0258555;REFB=-0.0225531;REVB=-0.0255351;RO=44;SAF=26;SAR=14;SRF=20;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188537;STB=0.600192;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.0237686;OID=.;OPOS=164272703;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:44:45:40:40:0.470588:14:26:20:24:14:26:21:24
chr4	164272857	.	T	C	381.18	PASS	AF=0.405405;AO=45;DP=111;FAO=45;FDP=111;FR=.;FRO=66;FSAF=32;FSAR=13;FSRF=32;FSRR=34;FWDB=0.00578346;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.816;QD=13.7363;RBI=0.00687505;REFB=-0.00846202;REVB=-0.00371725;RO=66;SAF=32;SAR=13;SRF=32;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.253248;STB=0.643769;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0104282;OID=.;OPOS=164272857;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:111:66:66:45:45:0.405405:13:32:32:34:13:32:32:34
chr4	164415930	.	C	T	287.95	PASS	AF=0.457143;AO=31;DP=69;FAO=32;FDP=70;FR=.;FRO=38;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=-0.0120844;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.789;QD=16.4543;RBI=0.0133797;REFB=-0.0216988;REVB=-0.00574308;RO=38;SAF=18;SAR=13;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0796798;STB=0.551692;STBP=0.478;TYPE=snp;VARB=0.0338339;OID=.;OPOS=164415930;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:70:38:38:31:32:0.457143:13:18:19:19:13:19:19:19
chr4	164433954	.	T	C	341.03	PASS	AF=0.538462;AO=34;DP=65;FAO=35;FDP=65;FR=.;FRO=30;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=-0.00260062;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.989;QD=20.9862;RBI=0.0154345;REFB=-0.00217671;REVB=0.0152139;RO=29;SAF=17;SAR=17;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0143281;STB=0.508798;STBP=0.852;TYPE=snp;VARB=0.00242158;OID=.;OPOS=164433954;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:29:30:34:35:0.538462:17:17:15:14:17:18:16:14
chr4	164533702	.	T	C	1396.43	PASS	AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00269;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.4086;QD=62.7611;RBI=0.0899629;REFB=0;REVB=0.0899226;RO=0;SAF=37;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000355945;OID=.;OPOS=164533702;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:52:37:0:0:52:37:0:0
chr4	165878335	.	A	G	705.17	PASS	AF=1;AO=37;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0131898;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.3286;QD=56.4136;RBI=0.0252345;REFB=0;REVB=0.021513;RO=0;SAF=18;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.68991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000276315;OID=.;OPOS=165878335;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:37:50:1:19:18:0:0:31:19:0:0
chr4	166000194	.	CA	C,CG	525.2	PASS	AF=0.111111,0.888889;AO=5,30;DP=36;FAO=4,32;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=0,19;FSAR=4,13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00182973,0.00469211;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=157.086,176.564;QD=58.3558;RBI=0.0302191,0.0434865;REFB=0,0;REVB=0.0301637,0.0432326;RO=0;SAF=0,19;SAR=5,11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0290549,-0.0028566;OID=.,.;OPOS=166000195,166000195;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=C,CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.111111,0.888889:5,30:36:4,32:36:0:0,19:4,13:0:0:15:0:0,19:5,11:0:0
chr4	166000263	.	C	T	902.52	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.02926;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.895;QD=58.2273;RBI=0.092934;REFB=0;REVB=-0.0882075;RO=0;SAF=25;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00123076;OID=.;OPOS=166000263;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:37:25:0:0:37:25:0:0
chr4	166021811	.	G	C	207.85	PASS	AF=0.446809;AO=21;DP=47;FAO=21;FDP=47;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=8;FWDB=0.0115389;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.011;QD=17.6895;RBI=0.0190197;REFB=-0.0231673;REVB=-0.0151196;RO=26;SAF=10;SAR=11;SRF=18;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20908;STB=0.618366;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=0.0291564;OID=.;OPOS=166021811;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:26:26:21:21:0.446809:11:10:18:8:11:10:18:8
chr4	166199250	.	A	T	352.83	PASS	AF=0.474359;AO=37;DP=79;FAO=37;FDP=78;FR=.;FRO=41;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=22;FSRR=19;FWDB=-0.0141098;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.8662;QD=18.0936;RBI=0.0175542;REFB=-0.0317407;REVB=-0.0104434;RO=41;SAF=19;SAR=18;SRF=22;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0217348;STB=0.512138;STBP=0.842;TYPE=snp;VARB=0.0301329;OID=.;OPOS=166199250;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:78:41:41:37:37:0.474359:18:19:22:19:18:19:22:19
chr4	166199390	.	C	T	515.21	PASS	AF=0.466102;AO=55;DP=119;FAO=55;FDP=118;FR=.;FRO=63;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=38;FSRR=25;FWDB=-0.00360369;FXX=0.00840265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.199;QD=17.4647;RBI=0.00489994;REFB=0.00568451;REVB=0.00332007;RO=64;SAF=30;SAR=25;SRF=39;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0627469;STB=0.531239;STBP=0.552;TYPE=snp;VARB=-0.00685804;OID=.;OPOS=166199390;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:118:64:63:55:55:0.466102:25:30:39:25:25:30:38:25
chr4	166199763	.	A	C	1001.91	PASS	AF=0.502488;AO=100;DP=200;FAO=101;FDP=201;FR=.;FRO=100;FSAF=51;FSAR=50;FSRF=50;FSRR=50;FWDB=-0.0177342;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.5287;QD=19.9386;RBI=0.0551401;REFB=0.0155439;REVB=0.0522104;RO=100;SAF=51;SAR=49;SRF=50;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00910012;STB=0.502463;STBP=0.974;TYPE=snp;VARB=-0.0199653;OID=.;OPOS=166199763;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:200:201:100:100:100:101:0.502488:49:51:50:50:50:51:50:50
chr4	166231868	.	A	G	315.48	PASS	AF=0.363636;AO=39;DP=110;FAO=40;FDP=110;FR=.;FRO=70;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=25;FSRR=45;FWDB=-0.029128;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.51;QD=11.472;RBI=0.0396713;REFB=-0.0012713;REVB=-0.0269328;RO=70;SAF=18;SAR=21;SRF=25;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119181;STB=0.575721;STBP=0.24;TYPE=snp;VARB=0.00425659;OID=.;OPOS=166231868;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:110:70:70:39:40:0.363636:21:18:25:45:21:19:25:45
chr4	166264119	.	A	G	943.56	PASS	AF=0.573248;AO=90;DP=157;FAO=90;FDP=157;FR=.;FRO=67;FSAF=49;FSAR=41;FSRF=37;FSRR=30;FWDB=0.0113309;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.861;QD=24.0397;RBI=0.0166244;REFB=-0.0155238;REVB=-0.0121648;RO=67;SAF=49;SAR=41;SRF=37;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00616508;STB=0.503354;STBP=0.929;TYPE=snp;VARB=0.0103641;OID=.;OPOS=166264119;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:157:157:67:67:90:90:0.573248:41:49:37:30:41:49:37:30
chr4	166405584	.	C	T	1978.6	PASS	AF=1;AO=128;DP=128;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0200113;FXX=0.0153834;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.087;QD=61.8313;RBI=0.0202409;REFB=0;REVB=-0.00303986;RO=0;SAF=58;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000148484;OID=.;OPOS=166405584;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:128:128:0:0:128:128:1:70:58:0:0:70:58:0:0
chr4	167012381	.	G	A	2569.1	PASS	AF=1;AO=166;DP=167;FAO=166;FDP=166;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0204985;FXX=0.00598767;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.9715;QD=61.906;RBI=0.0209144;REFB=0;REVB=-0.00415009;RO=0;SAF=81;SAR=85;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.06689e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000476497;OID=.;OPOS=167012381;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:167:166:0:0:166:166:1:85:81:0:0:85:81:0:0
chr4	167012480	.	T	C	1694.49	PASS	AF=1;AO=112;DP=112;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0632774;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.777;QD=60.5173;RBI=0.0683906;REFB=0;REVB=0.0259467;RO=0;SAF=55;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.34603e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000175603;OID=.;OPOS=167012480;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:112:112:0:0:112:112:1:57:55:0:0:57:55:0:0
chr4	167020644	.	A	G	550.72	PASS	AF=0.487395;AO=57;DP=119;FAO=58;FDP=119;FR=.;FRO=61;FSAF=27;FSAR=31;FSRF=24;FSRR=37;FWDB=-0.00924041;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.805;QD=18.5115;RBI=0.010078;REFB=-0.00612451;REVB=0.00402249;RO=60;SAF=27;SAR=30;SRF=23;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0844228;STB=0.537301;STBP=0.467;TYPE=snp;VARB=0.00684597;OID=.;OPOS=167020644;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:119:60:61:57:58:0.487395:30:27:23:37:31:27:24:37
chr4	167023255	.	A	G	485.93	PASS	AF=0.5;AO=50;DP=101;FAO=51;FDP=102;FR=.;FRO=51;FSAF=21;FSAR=30;FSRF=20;FSRR=31;FWDB=-0.00555302;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.8686;QD=19.0562;RBI=0.0258715;REFB=0.00311699;REVB=-0.0252685;RO=51;SAF=20;SAR=30;SRF=20;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00745976;STB=0.510151;STBP=0.85;TYPE=snp;VARB=-0.00307042;OID=.;OPOS=167023255;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:102:51:51:50:51:0.5:30:20:20:31:30:21:20:31
chr4	167063842	.	C	T	160.54	PASS	AF=0.363636;AO=19;DP=54;FAO=20;FDP=55;FR=.;FRO=35;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=-0.00320581;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.597;QD=11.676;RBI=0.00938649;REFB=-0.0085343;REVB=-0.00882208;RO=34;SAF=11;SAR=8;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0551477;STB=0.555499;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=0.0265439;OID=.;OPOS=167063842;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:55:34:35:19:20:0.363636:8:11:18:16:8:12:18:17
chr4	168004426	.	C	T	334.58	PASS	AF=0.627451;AO=32;DP=52;FAO=32;FDP=51;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=22;FSRF=3;FSRR=16;FWDB=0.00876762;FXX=0.0192271;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.775;QD=26.2415;RBI=0.00926868;REFB=-0.00169504;REVB=0.00300622;RO=19;SAF=10;SAR=22;SRF=3;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129411;STB=0.570529;STBP=0.25;TYPE=snp;VARB=0.000862382;OID=.;OPOS=168004426;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:51:19:19:32:32:0.627451:22:10:3:16:22:10:3:16
chr4	168584259	.	T	A	433.06	PASS	AF=1;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.019775;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.2686;QD=57.7411;RBI=0.0197909;REFB=0;REVB=0.000793139;RO=0;SAF=12;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000253358;OID=.;OPOS=168584259;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:30:0:0:30:30:1:18:12:0:0:18:12:0:0
chr4	169083694	.	A	C	743.46	PASS	AF=1;AO=52;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00615138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.941;QD=56.11;RBI=0.0229172;REFB=0;REVB=0.0220762;RO=0;SAF=29;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.84538e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000166867;OID=.;OPOS=169083694;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:52:53:1:23:29:0:0:24:29:0:0
chr4	169086441	.	A	G	376.07	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0317423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.938;QD=55.7144;RBI=0.0361749;REFB=0;REVB=0.0173508;RO=0;SAF=17;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000162071;OID=.;OPOS=169086441;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:27:0:0:26:27:1:9:17:0:0:9:18:0:0
chr4	169098914	.	A	G	277.6	PASS	AF=0.537037;AO=29;DP=54;FAO=29;FDP=54;FR=.;FRO=25;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=0.0189659;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.998;QD=20.563;RBI=0.0201124;REFB=0.00303419;REVB=-0.00669378;RO=24;SAF=15;SAR=14;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0140682;STB=0.517229;STBP=0.805;TYPE=snp;VARB=-0.00238665;OID=.;OPOS=169098914;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:24:25:29:29:0.537037:14:15:12:12:14:15:12:13
chr4	169282355	.	T	C	347.96	PASS	AF=0.39604;AO=40;DP=101;FAO=40;FDP=101;FR=.;FRO=61;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=33;FSRR=28;FWDB=-0.0017965;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.911;QD=13.7806;RBI=0.0107917;REFB=-0.00235202;REVB=-0.0106411;RO=59;SAF=22;SAR=18;SRF=32;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0080981;STB=0.505492;STBP=0.942;TYPE=snp;VARB=0.00311308;OID=.;OPOS=169282355;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:101:59:61:40:40:0.39604:18:22:32:27:18:22:33:28
chr4	169315760	.	C	A	1007.66	PASS	AF=1;AO=67;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00567776;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.398;QD=59.2743;RBI=0.0101148;REFB=0;REVB=-0.00837087;RO=0;SAF=28;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.74073e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.23397e-05;OID=.;OPOS=169315760;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:67:68:1:39:28:0:0:39:29:0:0
chr4	169317279	.	C	T	375.49	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.126843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.592;QD=55.6281;RBI=0.12862;REFB=0;REVB=-0.0213063;RO=0;SAF=6;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00150064;OID=.;OPOS=169317279;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:21:6:0:0:21:6:0:0
chr4	169336662	.	T	C	429.01	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0220372;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.5079;QD=57.2007;RBI=0.0239423;REFB=0;REVB=-0.00935929;RO=0;SAF=16;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.56309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000217313;OID=.;OPOS=169336662;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:14:16:0:0:14:16:0:0
chr4	169341435	.	A	G	2309.94	PASS	AF=0.993197;AO=145;DP=146;FAO=146;FDP=147;FR=.;FRO=1;FSAF=83;FSAR=63;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00536376;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.152;QD=62.8556;RBI=0.0288247;REFB=0.0425045;REVB=-0.0283212;RO=1;SAF=82;SAR=63;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00576456;STB=0.502994;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=-0.000113683;OID=.;OPOS=169341435;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:146:147:1:1:145:146:0.993197:63:82:1:0:63:83:1:0
chr4	169362557	.	C	G	972.98	PASS	AF=1;AO=65;DP=66;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00941566;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.7938;QD=58.0885;RBI=0.011075;REFB=0;REVB=-0.00583097;RO=0;SAF=31;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.90682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.02881e-05;OID=.;OPOS=169362557;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:67:0:0:65:67:1:34:31:0:0:35:32:0:0
chr4	169369820	.	T	A	538.55	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000616181;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.898;QD=59.8387;RBI=0.0242112;REFB=0;REVB=0.0242034;RO=0;SAF=19;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000172678;OID=.;OPOS=169369820;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:17:19:0:0:17:19:0:0
chr4	169369853	.	A	T	557.11	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0639389;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.461;QD=60.2285;RBI=0.0644054;REFB=0;REVB=0.00773778;RO=0;SAF=19;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.68991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000406384;OID=.;OPOS=169369853;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:18:19:0:0:18:19:0:0
chr4	169369920	.	C	T	375.67	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00588404;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.608;QD=55.6542;RBI=0.0138749;REFB=0;REVB=-0.0125654;RO=0;SAF=16;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000249659;OID=.;OPOS=169369920;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:11:16:0:0:11:16:0:0
chr4	169393595	.	A	G	923.2	PASS	AF=1;AO=62;DP=64;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0291162;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.6093;QD=58.6158;RBI=0.0305672;REFB=0;REVB=-0.00930581;RO=0;SAF=32;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000179076;OID=.;OPOS=169393595;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:63:0:0:62:63:1:30:32:0:0:30:33:0:0
chr4	169621191	.	G	A	210.25	PASS	AF=0.366197;AO=26;DP=71;FAO=26;FDP=71;FR=.;FRO=45;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=29;FWDB=-0.00732952;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.0643;QD=11.8448;RBI=0.0515921;REFB=0.0121322;REVB=-0.0510688;RO=45;SAF=13;SAR=13;SRF=16;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159227;STB=0.591481;STBP=0.261;TYPE=snp;VARB=-0.0234434;OID=.;OPOS=169621191;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:45:45:26:26:0.366197:13:13:16:29:13:13:16:29
chr4	169630204	.	T	G	183.54	PASS	AF=0.370968;AO=22;DP=61;FAO=23;FDP=62;FR=.;FRO=39;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=0.0165234;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.332;QD=11.8412;RBI=0.017866;REFB=-0.00596312;REVB=-0.00679492;RO=39;SAF=11;SAR=11;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141023;STB=0.505613;STBP=0.97;TYPE=snp;VARB=0.0117033;OID=.;OPOS=169630204;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:62:39:39:22:23:0.370968:11:11:19:20:12:11:19:20
chr4	169806527	.	A	G	512.37	PASS	AF=0.490909;AO=54;DP=110;FAO=54;FDP=110;FR=.;FRO=56;FSAF=29;FSAR=25;FSRF=25;FSRR=31;FWDB=-0.00677153;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.3057;QD=18.6316;RBI=0.0225625;REFB=-0.0171561;REVB=0.0215224;RO=55;SAF=29;SAR=25;SRF=25;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0751695;STB=0.546049;STBP=0.381;TYPE=snp;VARB=0.0118262;OID=.;OPOS=169806527;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:110:55:56:54:54:0.490909:25:29:25:30:25:29:25:31
chr4	169846359	.	GCT	G	612.61	PASS	AF=1;AO=35;DP=42;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.041595;FXX=0.0476077;HRUN=1;LEN=2;MLLD=219.665;QD=61.2613;RBI=0.0495063;REFB=0;REVB=0.0268465;RO=0;SAF=21;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.27896e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000161369;OID=.;OPOS=169846360;OREF=CT;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:35:42:40:40:0:23:17:0:0:4:0:21:14:0:0
chr4	169928842	.	G	T	4170.77	PASS	AF=1;AO=267;DP=269;FAO=267;FDP=267;FR=.;FRO=0;FSAF=137;FSAR=130;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000996193;FXX=0.00743467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.288;QD=62.4835;RBI=0.00468423;REFB=-0.0631506;REVB=0.00457707;RO=1;SAF=137;SAR=130;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00365346;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00102356;OID=.;OPOS=169928842;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:18:269:267:1:0:267:267:1:130:137:0:1:130:137:0:0
chr4	170017669	.	C	T	212.39	PASS	AF=0.423729;AO=25;DP=59;FAO=25;FDP=59;FR=.;FRO=34;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=-0.00526978;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.709;QD=14.3996;RBI=0.0630068;REFB=0.0297509;REVB=0.062786;RO=34;SAF=13;SAR=12;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0202444;STB=0.511524;STBP=0.868;TYPE=snp;VARB=-0.0360101;OID=.;OPOS=170017669;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:34:34:25:25:0.423729:12:13:17:17:12:13:17:17
chr4	170077789	.	A	G	397.1	PASS	AF=0.573529;AO=39;DP=68;FAO=39;FDP=68;FR=.;FRO=29;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=0.00217874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.258;QD=23.3588;RBI=0.00234476;REFB=-0.0109584;REVB=-0.000866591;RO=29;SAF=21;SAR=18;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149343;STB=0.581981;STBP=0.141;TYPE=snp;VARB=0.0119282;OID=.;OPOS=170077789;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:29:29:39:39:0.573529:18:21:10:19:18:21:10:19
chr4	170581570	.	G	A	1863.57	PASS	AF=1;AO=121;DP=122;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.028733;FXX=0.00819605;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.9827;QD=61.6057;RBI=0.0445051;REFB=0;REVB=-0.0339871;RO=0;SAF=56;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.25432e-05;OID=.;OPOS=170581570;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:122:121:0:0:121:121:1:65:56:0:0:65:56:0:0
chr4	170663235	.	C	T	795.29	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00349904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.707;QD=63.6234;RBI=0.00825808;REFB=0;REVB=-0.00748015;RO=0;SAF=22;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.30731e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.42757e-07;OID=.;OPOS=170663235;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:50:0:0:49:50:1:27:22:0:0:27:23:0:0
chr4	170678993	.	T	C	772.45	PASS	AF=0.98;AO=46;DP=47;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0803275;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=304.384;QD=61.7962;RBI=0.0843137;REFB=-0.0167121;REVB=0.0256182;RO=1;SAF=11;SAR=35;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0132465;STB=0.507039;STBP=0.61;TYPE=snp;VARB=0.000905596;OID=.;OPOS=170678993;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:47:50:1:1:46:49:0.98:35:11:0:1:35:14:0:1
chr4	170987636	.	A	G	976.55	PASS	AF=0.985294;AO=67;DP=68;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=6.52383e-06;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=314.297;QD=57.4441;RBI=0.00226422;REFB=-0.134426;REVB=-0.00226421;RO=1;SAF=33;SAR=34;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0141052;STB=0.50746;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.000174006;OID=.;OPOS=170987636;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:68:68:1:1:67:67:0.985294:34:33:1:0:34:33:1:0
chr4	172735897	.	C	G	1199.11	PASS	AF=1;AO=78;DP=78;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0196063;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.6412;QD=60.7146;RBI=0.0413281;REFB=0;REVB=-0.0363814;RO=0;SAF=38;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.42134e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000100464;OID=.;OPOS=172735897;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:79:0:0:78:79:1:40:38:0:0:41:38:0:0
chr4	174062875	.	A	G	306.32	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0328037;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.4518;QD=53.2728;RBI=0.0436444;REFB=0;REVB=-0.0287881;RO=0;SAF=9;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.84921e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.49375e-05;OID=.;OPOS=174062875;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:14:9:0:0:14:9:0:0
chr4	174090004	.	G	A	1254.26	PASS	AF=0.976471;AO=83;DP=85;FAO=83;FDP=85;FR=.;FRO=2;FSAF=53;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0156267;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=123.172;QD=59.024;RBI=0.0472612;REFB=-0.153037;REVB=0.044603;RO=1;SAF=53;SAR=30;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0155243;STB=0.503523;STBP=0.727;TYPE=snp;VARB=0.00153488;OID=.;OPOS=174090004;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:85:85:1:2:83:83:0.976471:30:53:0:1:30:53:1:1
chr4	174458022	.	T	A	475.51	PASS	AF=0.414062;AO=53;DP=130;FAO=53;FDP=128;FR=.;FRO=75;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=37;FSRR=38;FWDB=-0.0268714;FXX=0.0153834;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.772;QD=14.8597;RBI=0.0276798;REFB=-0.00216938;REVB=0.0066408;RO=75;SAF=22;SAR=31;SRF=37;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0825168;STB=0.546442;STBP=0.429;TYPE=snp;VARB=0.00326372;OID=.;OPOS=174458022;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:130:128:75:75:53:53:0.414062:31:22:37:38:31:22:37:38
chr4	175184131	.	A	C	315.2	PASS	AF=0.364486;AO=39;DP=107;FAO=39;FDP=107;FR=.;FRO=68;FSAF=14;FSAR=25;FSRF=28;FSRR=40;FWDB=-0.00887406;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=192.028;QD=11.7832;RBI=0.0200129;REFB=-0.010963;REVB=0.0179379;RO=66;SAF=14;SAR=25;SRF=27;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0586324;STB=0.535696;STBP=0.563;TYPE=snp;VARB=0.0186581;OID=.;OPOS=175184131;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:107:66:68:39:39:0.364486:25:14:27:39:25:14:28:40
chr4	175237408	.	T	C	480.96	PASS	AF=0.547619;AO=46;DP=84;FAO=46;FDP=84;FR=.;FRO=38;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=0.00433473;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.305;QD=22.9027;RBI=0.00634922;REFB=-0.00337942;REVB=0.00463925;RO=38;SAF=25;SAR=21;SRF=21;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00758805;STB=0.504174;STBP=0.94;TYPE=snp;VARB=0.00291088;OID=.;OPOS=175237408;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:38:38:46:46:0.547619:21:25:21:17:21:25:21:17
chr4	175443156	.	C	T	1135.25	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0318977;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.571;QD=60.5468;RBI=0.0340476;REFB=0;REVB=0.011907;RO=0;SAF=33;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000129696;OID=.;OPOS=175443156;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:42:33:0:0:42:33:0:0
chr4	175598334	.	T	C	2139.38	PASS	AF=1;AO=135;DP=135;FAO=136;FDP=136;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000799022;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.341;QD=62.923;RBI=0.00813108;REFB=0;REVB=-0.00809172;RO=0;SAF=60;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.67788e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.24974e-06;OID=.;OPOS=175598334;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:135:136:0:0:135:136:1:75:60:0:0:75:61:0:0
chr4	175688138	.	A	G	855.06	PASS	AF=0.983607;AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00284837;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=165.985;QD=56.0694;RBI=0.0261332;REFB=-0.0559558;REVB=0.0259775;RO=1;SAF=26;SAR=34;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0136794;STB=0.507244;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=-1.43524e-05;OID=.;OPOS=175688138;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:61:61:1:1:60:60:0.983607:34:26:0:1:34:26:0:1
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chr4	176555585	.	A	C	277.18	PASS	AF=0.333333;AO=36;DP=106;FAO=36;FDP=108;FR=.;FRO=72;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=38;FSRR=34;FWDB=-0.000673105;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.1824;QD=10.266;RBI=0.00077277;REFB=-0.00996431;REVB=0.000379609;RO=70;SAF=22;SAR=14;SRF=37;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0965375;STB=0.55693;STBP=0.386;TYPE=snp;VARB=0.02034;OID=.;OPOS=176555585;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:108:70:72:36:36:0.333333:14:22:37:33:14:22:38:34
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chr4	177073026	.	G	A	847.64	PASS	AF=1;AO=50;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=30;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0178492;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.971;QD=57.4673;RBI=0.0263189;REFB=0;REVB=0.0193414;RO=0;SAF=21;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.20481e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000131577;OID=.;OPOS=177073026;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:50:59:1:29:21:0:0:29:30:0:0
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chr4	177113779	.	T	C	175.91	PASS	AF=0.392857;AO=22;DP=56;FAO=22;FDP=56;FR=.;FRO=34;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=-0.000912124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.951;QD=12.5648;RBI=0.00148455;REFB=-0.000128906;REVB=-0.00117129;RO=33;SAF=8;SAR=14;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0667556;STB=0.549442;STBP=0.538;TYPE=snp;VARB=0.000139166;OID=.;OPOS=177113779;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:33:34:22:22:0.392857:14:8:14:19:14:8:15:19
chr4	177113836	.	C	T	559.64	PASS	AF=0.495726;AO=58;DP=117;FAO=58;FDP=117;FR=.;FRO=59;FSAF=28;FSAR=30;FSRF=18;FSRR=41;FWDB=-0.00948659;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.806;QD=19.1331;RBI=0.0387921;REFB=0.0010875;REVB=-0.0376143;RO=59;SAF=28;SAR=30;SRF=18;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163866;STB=0.590231;STBP=0.069;TYPE=snp;VARB=-0.000949727;OID=.;OPOS=177113836;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:117:117:59:59:58:58:0.495726:30:28:18:41:30:28:18:41
chr4	177113956	.	A	G	606.4	PASS	AF=0.516949;AO=61;DP=120;FAO=61;FDP=118;FR=.;FRO=57;FSAF=22;FSAR=39;FSRF=31;FSRR=26;FWDB=0.0679385;FXX=0.0166653;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.794;QD=20.5559;RBI=0.0680277;REFB=-0.0055168;REVB=-0.00348237;RO=57;SAF=22;SAR=39;SRF=31;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165124;STB=0.591048;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.00423658;OID=.;OPOS=177113956;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:118:57:57:61:61:0.516949:39:22:31:26:39:22:31:26
chr4	177137988	.	C	T	179.69	PASS	AF=0.303797;AO=24;DP=79;FAO=24;FDP=79;FR=.;FRO=55;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=32;FSRR=23;FWDB=0.000424264;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.7527;QD=9.09826;RBI=0.0130913;REFB=0.00709318;REVB=0.0130844;RO=54;SAF=13;SAR=11;SRF=32;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0605643;STB=0.528258;STBP=0.77;TYPE=snp;VARB=-0.0279142;OID=.;OPOS=177137988;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:54:55:24:24:0.303797:11:13:32:22:11:13:32:23
chr4	177605081	.	CTCA	C	533.59	PASS	AF=1;AO=36;DP=38;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00895788;FXX=0.0526177;HRUN=1;LEN=3;MLLD=285.087;QD=59.2872;RBI=0.0133375;REFB=-0.0877898;REVB=0.0098815;RO=0;SAF=19;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.0020458;OID=.;OPOS=177605082;OREF=TCA;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:1:36:38:36:36:0:19:17:0:0:3:0:19:17:0:0
chr4	178102691	.	C	G	600.25	PASS	AF=0.561905;AO=59;DP=105;FAO=59;FDP=105;FR=.;FRO=46;FSAF=23;FSAR=36;FSRF=25;FSRR=21;FWDB=0.0527075;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.5674;QD=22.8668;RBI=0.0532193;REFB=0.0305981;REVB=0.00736324;RO=46;SAF=23;SAR=36;SRF=25;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125223;STB=0.568585;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=-0.0217629;OID=.;OPOS=178102691;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:105:46:46:59:59:0.561905:36:23:25:21:36:23:25:21
chr4	178231152	.	C	A	642.59	PASS	AF=0.488722;AO=65;DP=133;FAO=65;FDP=133;FR=.;FRO=68;FSAF=32;FSAR=33;FSRF=32;FSRR=36;FWDB=0.00717677;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.113;QD=19.3261;RBI=0.0276926;REFB=-0.0116062;REVB=0.0267465;RO=68;SAF=32;SAR=33;SRF=32;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0201022;STB=0.511108;STBP=0.81;TYPE=snp;VARB=0.0124364;OID=.;OPOS=178231152;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:133:133:68:68:65:65:0.488722:33:32:32:36:33:32:32:36
chr4	178272700	.	A	G	475.5	PASS	AF=0.474747;AO=47;DP=99;FAO=47;FDP=99;FR=.;FRO=52;FSAF=19;FSAR=28;FSRF=20;FSRR=32;FWDB=0.034762;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.1072;QD=19.2122;RBI=0.0348301;REFB=-0.0182592;REVB=0.00217729;RO=52;SAF=19;SAR=28;SRF=20;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0193307;STB=0.510748;STBP=0.866;TYPE=snp;VARB=0.0224717;OID=.;OPOS=178272700;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:52:52:47:47:0.474747:28:19:20:32:28:19:20:32
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chr4	178281754	.	G	A	858.2	PASS	AF=0.939394;AO=62;DP=66;FAO=62;FDP=66;FR=.;FRO=4;FSAF=43;FSAR=19;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0130662;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=157.657;QD=52.0122;RBI=0.0804502;REFB=-0.0328428;REVB=0.079382;RO=4;SAF=43;SAR=19;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0257105;STB=0.513647;STBP=0.423;TYPE=snp;VARB=0.000758931;OID=.;OPOS=178281754;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:66:66:4:4:62:62:0.939394:19:43:2:2:19:43:2:2
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chr4	178881982	.	G	T	691.21	PASS	AF=0.978723;AO=45;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00119114;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=189.499;QD=58.8265;RBI=0.00575563;REFB=-0.123793;REVB=0.00563103;RO=1;SAF=33;SAR=12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0140319;STB=0.507243;STBP=0.591;TYPE=snp;VARB=0.000760872;OID=.;OPOS=178881982;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:47:47:1:1:45:46:0.978723:12:33:1:0:12:34:1:0
chr4	179037990	.	C	T	199.89	PASS	AF=0.425926;AO=23;DP=55;FAO=23;FDP=54;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=0.00112411;FXX=0.0357079;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.445;QD=14.807;RBI=0.0065359;REFB=-0.00293181;REVB=0.00643851;RO=31;SAF=10;SAR=13;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0171728;STB=0.509795;STBP=0.916;TYPE=snp;VARB=0.00416333;OID=.;OPOS=179037990;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:54:31:31:23:23:0.425926:13:10:14:17:13:10:14:17
chr4	179327856	.	G	A	1954.46	PASS	AF=1;AO=126;DP=127;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0416236;FXX=0.0078734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.0378;QD=62.0463;RBI=0.0512297;REFB=0;REVB=-0.0298657;RO=0;SAF=59;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.31893e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.78663e-05;OID=.;OPOS=179327856;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:127:126:0:0:126:126:1:67:59:0:0:67:59:0:0
chr4	183601847	.	T	C	534.18	PASS	AF=0.491228;AO=55;DP=113;FAO=56;FDP=114;FR=.;FRO=58;FSAF=29;FSAR=27;FSRF=22;FSRR=36;FWDB=0.0490315;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.4829;QD=18.7432;RBI=0.0688674;REFB=0.0218966;REVB=0.0483594;RO=58;SAF=28;SAR=27;SRF=22;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120149;STB=0.5702;STBP=0.18;TYPE=snp;VARB=-0.0211822;OID=.;OPOS=183601847;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:114:58:58:55:56:0.491228:27:28:22:36:27:29:22:36
chr4	183652175	.	T	C	2180.74	PASS	AF=1;AO=138;DP=139;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0136982;FXX=0.00719373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.178;QD=63.2097;RBI=0.0875128;REFB=0;REVB=0.0864341;RO=0;SAF=60;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.7021e-05;OID=.;OPOS=183652175;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:139:138:0:0:138:138:1:78:60:0:0:78:60:0:0
chr4	183713630	.	A	G	179.69	PASS	AF=0.413043;AO=19;DP=46;FAO=19;FDP=46;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=0.00428199;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.268;QD=15.6254;RBI=0.00520643;REFB=0.0151233;REVB=0.00296168;RO=27;SAF=8;SAR=11;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0243285;STB=0.514004;STBP=0.908;TYPE=snp;VARB=-0.00987791;OID=.;OPOS=183713630;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:27:27:19:19:0.413043:11:8:12:15:11:8:12:15
chr4	183720850	.	C	T	1044.38	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0711074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.751;QD=59.6788;RBI=0.0861813;REFB=0;REVB=0.0486924;RO=0;SAF=30;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000308566;OID=.;OPOS=183720850;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:40:30:0:0:40:30:0:0
chr4	183721852	.	G	A	884.96	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0259741;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.72;QD=58.0303;RBI=0.0265404;REFB=0;REVB=-0.00545338;RO=0;SAF=29;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.07537e-05;OID=.;OPOS=183721852;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:32:29:0:0:32:29:0:0
chr4	184367558	.	TCTG	T	37.15	PASS	AF=0.333333;AO=6;DP=18;FAO=6;FDP=18;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=0.00393267;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=316.322;QD=8.25459;RBI=0.009741;REFB=-0.00320506;REVB=-0.00891186;RO=12;SAF=3;SAR=3;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.270468;STB=0.666172;STBP=0.362;TYPE=del;VARB=0.00608319;OID=.;OPOS=184367559;OREF=CTG;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.333333:6:18:6:18:12:3:3:9:3:37:12:3:3:9:3
chr4	184426387	.	C	T	2358.27	PASS	AF=0.993289;AO=148;DP=150;FAO=148;FDP=149;FR=.;FRO=1;FSAF=75;FSAR=73;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00566746;FXX=0.00666622;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.492;QD=63.3093;RBI=0.0555844;REFB=-0.00314462;REVB=0.0552948;RO=1;SAF=75;SAR=73;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00629954;STB=0.503311;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.000102587;OID=.;OPOS=184426387;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:150:149:1:1:148:148:0.993289:73:75:1:0:73:75:1:0
chr4	184570715	.	T	G	166.08	PASS	AF=0.566667;AO=17;DP=30;FAO=17;FDP=30;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.0499853;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.866;QD=22.1437;RBI=0.060577;REFB=-0.00382932;REVB=0.0342205;RO=13;SAF=8;SAR=9;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0522387;STB=0.529377;STBP=0.768;TYPE=snp;VARB=0.00372718;OID=.;OPOS=184570715;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:13:13:17:17:0.566667:9:8:7:6:9:8:7:6
chr4	184618936	.	G	C	596.77	PASS	AF=0.568627;AO=58;DP=102;FAO=58;FDP=102;FR=.;FRO=44;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=19;FSRR=25;FWDB=-0.0147954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.046;QD=23.4026;RBI=0.0268671;REFB=0.00190624;REVB=-0.0224262;RO=44;SAF=30;SAR=28;SRF=19;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0672956;STB=0.536787;STBP=0.415;TYPE=snp;VARB=-0.00154644;OID=.;OPOS=184618936;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:44:44:58:58:0.568627:28:30:19:25:28:30:19:25
chr4	184931818	.	G	A	104.64	PASS	AF=0.571429;AO=12;DP=21;FAO=12;FDP=21;FR=.;FRO=9;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=0.0138729;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.497;QD=19.9315;RBI=0.0520412;REFB=-0.020525;REVB=0.0501581;RO=9;SAF=7;SAR=5;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155545;STB=0.588097;STBP=0.426;TYPE=snp;VARB=0.013066;OID=.;OPOS=184931818;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:21:21:9:9:12:12:0.571429:5:7:7:2:5:7:7:2
chr4	185012425	.	C	T	168.5	PASS	AF=0.418605;AO=17;DP=47;FAO=18;FDP=43;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=0.0246904;FXX=0.0850883;HRUN=3;LEN=1;MLLD=78.4596;QD=15.6742;RBI=0.0270673;REFB=-0.0247114;REVB=0.0110916;RO=20;SAF=12;SAR=5;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0066627;STB=0.529747;STBP=0.803;TYPE=snp;VARB=0.0368755;OID=.;OPOS=185012425;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:43:20:25:17:18:0.418605:5:12:14:6:5:13:17:8
chr4	185310218	.	C	T	715.04	PASS	AF=0.978723;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.045837;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=103.531;QD=60.8542;RBI=0.047634;REFB=-0.113858;REVB=0.0129602;RO=1;SAF=23;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0200022;STB=0.510634;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.0011008;OID=.;OPOS=185310218;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:47:47:1:1:46:46:0.978723:23:23:0:1:23:23:0:1
chr4	185587165	.	A	G	1172.01	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0411252;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.102;QD=60.8835;RBI=0.0411305;REFB=0;REVB=0.000662523;RO=0;SAF=35;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.42781e-05;OID=.;OPOS=185587165;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:42:35:0:0:42:35:0:0
chr4	185622046	.	C	T	220.93	PASS	AF=0.44898;AO=22;DP=49;FAO=22;FDP=49;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=19;FWDB=-0.00371048;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.4908;QD=18.035;RBI=0.0698733;REFB=-0.00630756;REVB=-0.0697748;RO=27;SAF=12;SAR=10;SRF=8;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.238866;STB=0.63492;STBP=0.104;TYPE=snp;VARB=0.00865171;OID=.;OPOS=185622046;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:27:27:22:22:0.44898:10:12:8:19:10:12:8:19
chr4	185652147	.	G	A	252.09	PASS	AF=0.489796;AO=23;DP=48;FAO=24;FDP=49;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=0.0215419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=311.223;QD=20.5788;RBI=0.0218448;REFB=0.0064017;REVB=-0.00362525;RO=23;SAF=8;SAR=15;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0432862;STB=0.530362;STBP=0.695;TYPE=snp;VARB=-0.00631801;OID=.;OPOS=185652147;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:49:23:25:23:24:0.489796:15:8:7:16:15:9:8:17
chr4	185655171	.	C	T	451.74	PASS	AF=0.589041;AO=43;DP=73;FAO=43;FDP=73;FR=.;FRO=30;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=0.0174899;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=183.222;QD=24.7529;RBI=0.0225691;REFB=-0.0334068;REVB=-0.0142642;RO=30;SAF=19;SAR=24;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0689135;STB=0.537754;STBP=0.456;TYPE=snp;VARB=0.0180607;OID=.;OPOS=185655171;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:30:30:43:43:0.589041:24:19:16:14:24:19:16:14
chr4	185655190	.	C	G	256.43	PASS	AF=0.519231;AO=24;DP=49;FAO=27;FDP=52;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.0189021;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.427;QD=19.7251;RBI=0.0247647;REFB=-0.0275863;REVB=0.0160001;RO=25;SAF=10;SAR=14;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0945389;STB=0.554872;STBP=0.468;TYPE=snp;VARB=0.0228003;OID=.;OPOS=185655190;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:52:25:25:24:27:0.519231:14:10:13:12:16:11:13:12
chr4	185678110	.	A	G	637.02	PASS	AF=0.568807;AO=62;DP=109;FAO=62;FDP=109;FR=.;FRO=47;FSAF=31;FSAR=31;FSRF=25;FSRR=22;FWDB=0.0145252;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.067;QD=23.377;RBI=0.0156411;REFB=-0.0120486;REVB=-0.00580202;RO=47;SAF=31;SAR=31;SRF=25;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0251822;STB=0.513757;STBP=0.757;TYPE=snp;VARB=0.0107279;OID=.;OPOS=185678110;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:109:47:47:62:62:0.568807:31:31:25:22:31:31:25:22
chr4	185678118	.	C	G	1490.19	PASS	AF=1;AO=99;DP=101;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0155494;FXX=0.0291234;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.386;QD=59.6075;RBI=0.0421252;REFB=0;REVB=0.0391504;RO=0;SAF=51;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000831312;OID=.;OPOS=185678118;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:101:100:0:0:99:100:1:48:51:0:0:48:52:0:0
chr4	185686032	.	C	T	754.3	PASS	AF=1;AO=52;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0220151;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.829;QD=56.9286;RBI=0.148871;REFB=0;REVB=0.147234;RO=0;SAF=30;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000780302;OID=.;OPOS=185686032;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:52:53:1:22:30:0:0:23:30:0:0
chr4	185687863	.	A	G	175.63	PASS	AF=0.354839;AO=22;DP=62;FAO=22;FDP=62;FR=.;FRO=40;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=22;FSRR=18;FWDB=-0.00813549;FXX=0.0312451;HRUN=3;LEN=1;MLLD=188.254;QD=11.331;RBI=0.0701817;REFB=-0.00591962;REVB=-0.0697086;RO=40;SAF=15;SAR=7;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156324;STB=0.591397;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.00855783;OID=.;OPOS=185687863;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:40:40:22:22:0.354839:7:15:22:18:7:15:22:18
chr4	185940952	.	C	G	417.96	PASS	AF=0.5;AO=41;DP=83;FAO=42;FDP=84;FR=.;FRO=42;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=24;FSRR=18;FWDB=0.0132037;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.52;QD=19.9027;RBI=0.0434471;REFB=-0.00868921;REVB=-0.0413922;RO=42;SAF=22;SAR=19;SRF=24;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0319847;STB=0.523907;STBP=0.694;TYPE=snp;VARB=0.0122926;OID=.;OPOS=185940952;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:84:42:42:41:42:0.5:19:22:24:18:20:22:24:18
chr4	186091487	.	G	A	199.01	PASS	AF=0.4;AO=24;DP=61;FAO=24;FDP=60;FR=.;FRO=36;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=-0.00498835;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.885;QD=13.2671;RBI=0.00557947;REFB=-0.0243721;REVB=-0.00249937;RO=37;SAF=15;SAR=9;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149034;STB=0.576858;STBP=0.347;TYPE=snp;VARB=0.0266558;OID=.;OPOS=186091487;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:60:37:36:24:24:0.4:9:15:18:19:9:15:18:18
chr4	186097045	.	C	T	315.83	PASS	AF=0.416667;AO=35;DP=84;FAO=35;FDP=84;FR=.;FRO=49;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=29;FSRR=20;FWDB=-0.0130556;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=200.203;QD=15.0396;RBI=0.0158041;REFB=-0.000953028;REVB=-0.00890614;RO=47;SAF=15;SAR=20;SRF=27;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147614;STB=0.594541;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=0.00103903;OID=.;OPOS=186097045;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:47:49:35:35:0.416667:20:15:27:20:20:15:29:20
chr4	186111639	.	T	C	298.96	PASS	AF=0.445946;AO=33;DP=74;FAO=33;FDP=74;FR=.;FRO=41;FSAF=10;FSAR=23;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=-0.0300488;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.708;QD=16.1599;RBI=0.0327246;REFB=-0.0127221;REVB=0.0129602;RO=41;SAF=10;SAR=23;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171665;STB=0.597074;STBP=0.149;TYPE=snp;VARB=0.0160762;OID=.;OPOS=186111639;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:41:41:33:33:0.445946:23:10:19:22:23:10:19:22
chr4	186112111	.	G	A	166.62	PASS	AF=0.391304;AO=18;DP=45;FAO=18;FDP=46;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.00554639;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=228.454;QD=14.489;RBI=0.0253493;REFB=-0.00209412;REVB=0.0247351;RO=27;SAF=10;SAR=8;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0386588;STB=0.512182;STBP=0.915;TYPE=snp;VARB=0.00266422;OID=.;OPOS=186112111;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:46:27:28:18:18:0.391304:8:10:14:13:8:10:15:13
chr4	186339584	.	A	G	557.13	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0168999;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.196;QD=60.2306;RBI=0.0175495;REFB=0;REVB=0.00473026;RO=0;SAF=21;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.7558e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.64765e-05;OID=.;OPOS=186339584;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:16:21:0:0:16:21:0:0
chr4	186347055	.	G	A	227.3	PASS	AF=1;AO=18;DP=19;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0153112;FXX=0.0526039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.841;QD=50.5105;RBI=0.085035;REFB=0;REVB=0.0836452;RO=0;SAF=14;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000570688;OID=.;OPOS=186347055;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:18:0:0:18:18:1:4:14:0:0:4:14:0:0
chr4	186357523	.	C	G	1062.0	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.014302;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.225;QD=59.8309;RBI=0.0143582;REFB=0;REVB=0.00126905;RO=0;SAF=47;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.57441e-05;OID=.;OPOS=186357523;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:24:47:0:0:24:47:0:0
chr4	186361876	.	A	G	594.54	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0168176;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.916;QD=60.9783;RBI=0.0168338;REFB=0;REVB=-0.000738811;RO=0;SAF=18;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.34792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.89578e-05;OID=.;OPOS=186361876;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:21:18:0:0:21:18:0:0
chr4	186379371	.	G	A	1302.02	PASS	AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0135571;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.0343;QD=62.0011;RBI=0.0136484;REFB=0;REVB=0.00157572;RO=0;SAF=40;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.55922e-05;OID=.;OPOS=186379371;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:44:40:0:0:44:40:0:0
chr4	186379899	.	G	C	59.4	PASS	AF=0.533333;AO=8;DP=15;FAO=8;FDP=15;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.0175988;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.886;QD=15.8391;RBI=0.0378436;REFB=-0.0151617;REVB=-0.0335026;RO=7;SAF=4;SAR=4;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170899;STB=0.59976;STBP=0.495;TYPE=snp;VARB=0.0161725;OID=.;OPOS=186379899;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:15:15:7:7:8:8:0.533333:4:4:2:5:4:4:2:5
chr4	186380243	.	A	C	238.95	PASS	AF=0.5;AO=23;DP=46;FAO=23;FDP=46;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=-0.0109765;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.2547;QD=20.778;RBI=0.0236798;REFB=-0.0217478;REVB=0.0209821;RO=23;SAF=12;SAR=11;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0229216;OID=.;OPOS=186380243;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:23:23:23:23:0.5:11:12:12:11:11:12:12:11
chr4	186380295	.	A	G	297.81	PASS	AF=0.54386;AO=31;DP=57;FAO=31;FDP=57;FR=.;FRO=26;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=0.037557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.2357;QD=20.8987;RBI=0.0402702;REFB=8.0848e-05;REVB=0.0145313;RO=26;SAF=19;SAR=12;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15783;STB=0.587572;STBP=0.168;TYPE=snp;VARB=0.000412588;OID=.;OPOS=186380295;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:26:26:31:31:0.54386:12:19:11:15:12:19:11:15
chr4	186380515	.	G	A	210.4	PASS	AF=0.456522;AO=21;DP=47;FAO=21;FDP=46;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.0161468;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.978;QD=18.2957;RBI=0.0189428;REFB=-0.00160664;REVB=0.00990508;RO=25;SAF=12;SAR=9;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0497351;STB=0.528275;STBP=0.715;TYPE=snp;VARB=0.00225981;OID=.;OPOS=186380515;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:46:25:25:21:21:0.456522:9:12:13:12:9:12:13:12
chr4	186380846	.	A	T	206.1	PASS	AF=0.428571;AO=21;DP=49;FAO=21;FDP=49;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=0.000274314;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.143;QD=16.8247;RBI=0.0193093;REFB=0.00691496;REVB=0.0193073;RO=28;SAF=12;SAR=9;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177121;STB=0.601061;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=-0.00678678;OID=.;OPOS=186380846;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:28:28:21:21:0.428571:9:12:11:17:9:12:11:17
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chr4	186391898	.	C	T	256.32	PASS	AF=0.394737;AO=30;DP=76;FAO=30;FDP=76;FR=.;FRO=46;FSAF=8;FSAR=22;FSRF=18;FSRR=28;FWDB=0.000787189;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=144.904;QD=13.4904;RBI=0.00104811;REFB=-0.00580921;REVB=0.000692009;RO=45;SAF=8;SAR=22;SRF=17;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137547;STB=0.588415;STBP=0.251;TYPE=snp;VARB=0.00852279;OID=.;OPOS=186391898;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:45:46:30:30:0.394737:22:8:17:28:22:8:18:28
chr4	186393372	.	T	C	242.06	PASS	AF=0.473684;AO=27;DP=57;FAO=27;FDP=57;FR=.;FRO=30;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=0.0210122;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=46.179;QD=16.9868;RBI=0.0221444;REFB=0.031937;REVB=-0.00699005;RO=30;SAF=14;SAR=13;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141671;STB=0.579502;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=-0.0345066;OID=.;OPOS=186393372;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:30:30:27:27:0.473684:13:14:11:19:13:14:11:19
chr4	186423637	.	G	A	766.46	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0111101;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.9524;QD=63.8717;RBI=0.011655;REFB=0;REVB=0.003522;RO=0;SAF=18;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.73384e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000134288;OID=.;OPOS=186423637;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:30:18:0:0:30:18:0:0
chr4	186507298	.	AAT	A	96.13	PASS	AF=0.466667;AO=14;DP=31;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=-0.0221237;FXX=0.0322477;HRUN=2;LEN=2;MLLD=193.089;QD=12.8172;RBI=0.0317874;REFB=-0.00850234;REVB=0.022825;RO=14;SAF=7;SAR=7;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0623504;STB=0.566573;STBP=0.525;TYPE=del;VARB=0.0108776;OID=.;OPOS=186507299;OREF=AT;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.466667:14:31:14:30:16:7:7:10:6:95:14:7:7:8:6
chr4	187004074	.	C	T	120.17	PASS	AF=0.411765;AO=14;DP=34;FAO=14;FDP=34;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=-0.0218357;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.249;QD=14.1374;RBI=0.02717;REFB=-0.00751974;REVB=0.0161682;RO=20;SAF=5;SAR=9;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.244948;STB=0.642653;STBP=0.185;TYPE=snp;VARB=0.0241315;OID=.;OPOS=187004074;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:20:20:14:14:0.411765:9:5:12:8:9:5:12:8
chr4	187074833	.	A	G	210.46	PASS	AF=0.320988;AO=26;DP=81;FAO=26;FDP=81;FR=.;FRO=55;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=28;FSRR=27;FWDB=0.00304456;FXX=0.0581328;HRUN=3;LEN=1;MLLD=194.745;QD=10.3932;RBI=0.0287472;REFB=-0.00154208;REVB=-0.0285855;RO=55;SAF=15;SAR=11;SRF=28;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0792382;STB=0.546465;STBP=0.599;TYPE=snp;VARB=0.00465256;OID=.;OPOS=187074833;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:55:55:26:26:0.320988:11:15:28:27:11:15:28:27
chr4	187077206	.	A	G	1248.89	PASS	AF=0.976471;AO=82;DP=84;FAO=83;FDP=85;FR=.;FRO=2;FSAF=38;FSAR=45;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0113041;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=149.584;QD=58.7715;RBI=0.0180306;REFB=-0.0666944;REVB=-0.014047;RO=2;SAF=37;SAR=45;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0249076;STB=0.512817;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=-4.96133e-09;OID=.;OPOS=187077206;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:84:85:2:2:82:83:0.976471:45:37:2:0:45:38:2:0
chr4	187078785	.	A	G	2725.02	PASS	AF=0.983333;AO=177;DP=180;FAO=177;FDP=180;FR=.;FRO=3;FSAF=77;FSAR=100;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0346908;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.589;QD=60.556;RBI=0.0447033;REFB=-0.0422222;REVB=0.0281946;RO=2;SAF=77;SAR=100;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00942492;STB=0.501725;STBP=0.715;TYPE=snp;VARB=0.000572386;OID=.;OPOS=187078785;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:180:180:2:3:177:177:0.983333:100:77:0:2:100:77:1:2
chr4	187078866	.	C	T	562.98	PASS	AF=0.55914;AO=51;DP=93;FAO=52;FDP=93;FR=.;FRO=41;FSAF=22;FSAR=30;FSRF=24;FSRR=17;FWDB=-0.0379997;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=100.081;QD=24.214;RBI=0.0390538;REFB=-0.0058324;REVB=0.00901207;RO=41;SAF=22;SAR=29;SRF=24;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125017;STB=0.571638;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=0.00589369;OID=.;OPOS=187078866;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:41:41:51:52:0.55914:29:22:24:17:30:22:24:17
chr4	187079047	.	A	G	483.27	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00451531;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.9129;QD=58.5787;RBI=0.0726448;REFB=0;REVB=-0.0725043;RO=0;SAF=21;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00105794;OID=.;OPOS=187079047;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:12:21:0:0:12:21:0:0
chr4	187113041	.	C	G	95.33	PASS	AF=0.909091;AO=9;DP=11;FAO=10;FDP=11;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0249795;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=192.291;QD=34.6652;RBI=0.036324;REFB=0.0915092;REVB=-0.0263715;RO=1;SAF=6;SAR=3;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126211;STB=0.57128;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=-0.00125575;OID=.;OPOS=187113041;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:11:11:1:1:9:10:0.909091:3:6:0:1:3:7:0:1
chr4	187120211	.	C	A	262.87	PASS	AF=0.511111;AO=22;DP=46;FAO=23;FDP=45;FR=.,HEALED;FRO=20;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=-0.0276854;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.102;QD=23.3664;RBI=0.0620832;REFB=-0.00828789;REVB=-0.0555684;RO=16;SAF=11;SAR=11;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0945677;STB=0.583603;STBP=0.243;TYPE=snp;VARB=0.00150521;OID=.;OPOS=187120211;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:45:16:20:22:23:0.511111:11:11:10:6:11:12:14:6
chr4	187122319	.	T	G	255.68	PASS	AF=0.491228;AO=28;DP=57;FAO=28;FDP=57;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=0.0209928;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.781;QD=17.9424;RBI=0.0272297;REFB=0.0189763;REVB=-0.0173424;RO=29;SAF=13;SAR=15;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110219;STB=0.561583;STBP=0.396;TYPE=snp;VARB=-0.00873715;OID=.;OPOS=187122319;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:29:29:28:28:0.491228:15:13:10:19:15:13:10:19
chr4	187133576	.	A	C	784.3	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0551699;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.631;QD=57.0399;RBI=0.0575788;REFB=0;REVB=0.0164804;RO=0;SAF=22;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.76368e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000161387;OID=.;OPOS=187133576;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:55:0:0:53:55:1:31:22:0:0:32:23:0:0
chr4	187173012	.	T	G	362.43	PASS	AF=0.528571;AO=37;DP=70;FAO=37;FDP=70;FR=.;FRO=33;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=0.017831;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.248;QD=20.7104;RBI=0.0182264;REFB=-0.0162385;REVB=0.00377575;RO=33;SAF=20;SAR=17;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0217071;STB=0.512018;STBP=0.873;TYPE=snp;VARB=0.0180597;OID=.;OPOS=187173012;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:33:33:37:37:0.528571:17:20:17:16:17:20:17:16
chr4	187179210	.	T	C	204.51	PASS	AF=0.555556;AO=20;DP=36;FAO=20;FDP=36;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=-0.009697;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.3315;QD=22.7233;RBI=0.0108078;REFB=0.00747661;REVB=0.00477244;RO=16;SAF=7;SAR=13;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0901357;STB=0.550266;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=-0.0138954;OID=.;OPOS=187179210;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:16:16:20:20:0.555556:13:7:4:12:13:7:4:12
chr4	187194319	.	C	T	552.97	PASS	AF=0.443609;AO=59;DP=133;FAO=59;FDP=133;FR=.;FRO=74;FSAF=22;FSAR=37;FSRF=26;FSRR=48;FWDB=0.0186368;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.5307;QD=16.6305;RBI=0.0383364;REFB=-0.0144099;REVB=-0.0335014;RO=74;SAF=22;SAR=37;SRF=26;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0231132;STB=0.512887;STBP=0.81;TYPE=snp;VARB=0.0182233;OID=.;OPOS=187194319;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:133:133:74:74:59:59:0.443609:37:22:26:48:37:22:26:48
chr4	187201211	.	A	G	267.35	PASS	AF=0.5;AO=29;DP=58;FAO=29;FDP=58;FR=.;FRO=29;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=0.0185528;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.967;QD=18.4376;RBI=0.0372636;REFB=0.00248236;REVB=0.0323168;RO=29;SAF=18;SAR=11;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00178516;OID=.;OPOS=187201211;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:29:29:29:29:0.5:11:18:18:11:11:18:18:11
chr4	187205301	.	T	C	321.79	PASS	AF=0.592593;AO=32;DP=54;FAO=32;FDP=54;FR=.;FRO=22;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=0.0159879;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.1055;QD=23.8363;RBI=0.0313833;REFB=-0.0067619;REVB=-0.0270055;RO=22;SAF=13;SAR=19;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.032912;STB=0.518105;STBP=0.785;TYPE=snp;VARB=0.00365364;OID=.;OPOS=187205301;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:22:22:32:32:0.592593:19:13:8:14:19:13:8:14
chr4	187516880	.	A	G	834.33	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00946053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.187;QD=57.5401;RBI=0.0317131;REFB=0;REVB=0.0302691;RO=0;SAF=39;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.79072e-05;OID=.;OPOS=187516880;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:58:0:0:57:58:1:18:39:0:0:19:39:0:0
chr4	187517758	.	G	A	161.51	PASS	AF=0.5;AO=17;DP=34;FAO=17;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.00993755;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=256.904;QD=19.0006;RBI=0.0332889;REFB=-0.0220449;REVB=-0.031771;RO=17;SAF=14;SAR=3;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.377521;STB=0.717659;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=0.0159149;OID=.;OPOS=187517758;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:17:17:17:17:0.5:3:14:8:9:3:14:8:9
chr4	187519206	.	C	G	1273.92	PASS	AF=1;AO=80;DP=81;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00253899;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.564;QD=61.3939;RBI=0.0682061;REFB=0;REVB=0.0681588;RO=0;SAF=49;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.85194e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000183737;OID=.;OPOS=187519206;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:83:0:0:80:83:1:31:49:0:0:34:49:0:0
chr4	187522528	.	C	T	482.89	PASS	AF=0.490385;AO=51;DP=104;FAO=51;FDP=104;FR=.;FRO=53;FSAF=35;FSAR=16;FSRF=32;FSRR=21;FWDB=-0.0120362;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.035;QD=18.5726;RBI=0.0159417;REFB=-0.0184426;REVB=-0.0104531;RO=53;SAF=35;SAR=16;SRF=32;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0847559;STB=0.547087;STBP=0.373;TYPE=snp;VARB=0.0180135;OID=.;OPOS=187522528;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:104:53:53:51:51:0.490385:16:35:32:21:16:35:32:21
chr4	187525020	.	A	C	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.063525;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.8025;QD=47.8221;RBI=0.0635259;REFB=0;REVB=-0.000351031;RO=0;SAF=13;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.78418e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00142315;OID=.;OPOS=187525020;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:3:13:0:0:3:13:0:0
chr4	187534363	.	G	A	301.47	PASS	AF=0.357143;AO=35;DP=97;FAO=35;FDP=98;FR=.;FRO=63;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=35;FSRR=28;FWDB=0.0201565;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.826;QD=12.3048;RBI=0.0203476;REFB=0.00485281;REVB=0.00278259;RO=61;SAF=15;SAR=20;SRF=34;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142245;STB=0.581349;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=-0.00886537;OID=.;OPOS=187534363;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:98:61:63:35:35:0.357143:20:15:34:27:20:15:35:28
chr4	187534375	.	A	G	304.37	PASS	AF=0.362745;AO=37;DP=102;FAO=37;FDP=102;FR=.;FRO=65;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=38;FSRR=27;FWDB=0.00828328;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.949;QD=11.9359;RBI=0.0255009;REFB=0.000317485;REVB=-0.0241182;RO=65;SAF=21;SAR=16;SRF=38;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0193577;STB=0.511093;STBP=0.884;TYPE=snp;VARB=-0.000654446;OID=.;OPOS=187534375;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:65:65:37:37:0.362745:16:21:38:27:16:21:38:27
chr4	187538330	.	G	A	356.43	PASS	AF=0.39;AO=39;DP=100;FAO=39;FDP=100;FR=.;FRO=61;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=31;FSRR=30;FWDB=-0.0221189;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.759;QD=14.2574;RBI=0.024313;REFB=-0.00645736;REVB=0.0100934;RO=61;SAF=19;SAR=20;SRF=31;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0225443;STB=0.512814;STBP=0.851;TYPE=snp;VARB=0.00938215;OID=.;OPOS=187538330;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:61:61:39:39:0.39:20:19:31:30:20:19:31:30
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chr4	187539217	.	G	A	343.37	PASS	AF=0.596491;AO=33;DP=56;FAO=34;FDP=57;FR=.;FRO=23;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=-0.0430535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.6721;QD=24.0963;RBI=0.0555503;REFB=-0.0331202;REVB=0.0351031;RO=23;SAF=20;SAR=13;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00205888;STB=0.503815;STBP=0.948;TYPE=snp;VARB=0.0342172;OID=.;OPOS=187539217;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:57:23:23:33:34:0.596491:13:20:14:9:13:21:14:9
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chr4	187540918	.	G	C	174.04	PASS	AF=0.5;AO=18;DP=36;FAO=18;FDP=36;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=0.00318489;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.7464;QD=19.3372;RBI=0.0175119;REFB=-0.0236301;REVB=0.0172198;RO=18;SAF=9;SAR=9;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147378;STB=0.583243;STBP=0.361;TYPE=snp;VARB=0.01214;OID=.;OPOS=187540918;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:18:18:18:18:0.5:9:9:12:6:9:9:12:6
chr4	187541761	.	G	A	296.89	PASS	AF=0.434211;AO=33;DP=76;FAO=33;FDP=76;FR=.;FRO=43;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=0.0054597;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.561;QD=15.6256;RBI=0.0163232;REFB=-0.00846628;REVB=-0.0153831;RO=43;SAF=16;SAR=17;SRF=22;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0268372;STB=0.515142;STBP=0.865;TYPE=snp;VARB=0.00975232;OID=.;OPOS=187541761;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:43:43:33:33:0.434211:17:16:22:21:17:16:22:21
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chr4	187549428	.	C	T	236.62	PASS	AF=0.490196;AO=25;DP=51;FAO=25;FDP=51;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=18;FWDB=0.0270732;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.652;QD=18.5587;RBI=0.0374742;REFB=-0.0191161;REVB=-0.0259105;RO=26;SAF=14;SAR=11;SRF=8;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.225906;STB=0.626445;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.0236521;OID=.;OPOS=187549428;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:26:26:25:25:0.490196:11:14:8:18:11:14:8:18
chr4	187557893	.	T	C	675.2	PASS	AF=0.450617;AO=73;DP=164;FAO=73;FDP=162;FR=.;FRO=89;FSAF=26;FSAR=47;FSRF=46;FSRR=43;FWDB=-0.00757207;FXX=0.0181807;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.5538;QD=16.6715;RBI=0.0569971;REFB=-0.0245096;REVB=0.0564919;RO=88;SAF=26;SAR=47;SRF=45;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157684;STB=0.591169;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.0293261;OID=.;OPOS=187557893;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:164:162:88:89:73:73:0.450617:47:26:45:43:47:26:46:43
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chr4	187628398	.	C	G	207.87	PASS	AF=0.436364;AO=24;DP=55;FAO=24;FDP=55;FR=.;FRO=31;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=-0.0173182;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.716;QD=15.1181;RBI=0.0266552;REFB=-0.00404483;REVB=0.0202628;RO=31;SAF=13;SAR=11;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0390688;STB=0.522187;STBP=0.789;TYPE=snp;VARB=0.00518778;OID=.;OPOS=187628398;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:31:31:24:24:0.436364:11:13:18:13:11:13:18:13
chr4	187629140	.	G	C	242.11	PASS	AF=0.457627;AO=27;DP=60;FAO=27;FDP=59;FR=.;FRO=32;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=12;FWDB=-0.00293387;FXX=0.0327815;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.807;QD=16.4145;RBI=0.0101129;REFB=0.00719609;REVB=0.00967798;RO=32;SAF=13;SAR=14;SRF=20;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137576;STB=0.577444;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=-0.0102137;OID=.;OPOS=187629140;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:59:32:32:27:27:0.457627:14:13:20:12:14:13:20:12
chr4	187630590	.	G	A	232.44	PASS	AF=0.378378;AO=28;DP=74;FAO=28;FDP=74;FR=.;FRO=46;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=23;FSRR=23;FWDB=-0.0156626;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.538;QD=12.5642;RBI=0.0159763;REFB=-0.00563939;REVB=-0.0031506;RO=45;SAF=13;SAR=15;SRF=23;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.050362;STB=0.522228;STBP=0.789;TYPE=snp;VARB=0.00818551;OID=.;OPOS=187630590;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:45:46:28:28:0.378378:15:13:23:22:15:13:23:23
chr4	188924979	.	C	T	236.06	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000764041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=346.746;QD=49.6959;RBI=0.00209336;REFB=0;REVB=-0.00194895;RO=0;SAF=9;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.71585e-06;OID=.;OPOS=188924979;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:19:0:0:18:19:1:9:9:0:0:10:9:0:0
chr4	188925176	.	T	TGAC	792.89	PASS	AF=1;AO=55;DP=59;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0131032;FXX=0.0350816;HRUN=0;LEN=3;MLLD=311.999;QD=57.6649;RBI=0.0167589;REFB=0;REVB=0.0104483;RO=2;SAF=24;SAR=31;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0376688;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000268934;OID=.;OPOS=188925177;OREF=-;OALT=GAC;OMAPALT=TGAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:55:59:55:55:0:25:30:0:0:4:2:24:31:2:0
chr4	189012728	.	G	C	1178.03	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000188355;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.959;QD=61.1963;RBI=0.00162078;REFB=0;REVB=0.0016098;RO=0;SAF=44;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.00425e-06;OID=.;OPOS=189012728;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:77:0:0:76:77:1:32:44:0:0:33:44:0:0
chr4	189012809	.	C	T	955.2	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0213742;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.959;QD=58.7812;RBI=0.0214514;REFB=0;REVB=0.00181746;RO=0;SAF=32;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.32581e-05;OID=.;OPOS=189012809;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:33:32:0:0:33:32:0:0
chr4	189022324	.	C	T	1312.77	PASS	AF=1;AO=84;DP=84;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00377668;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.614;QD=61.7775;RBI=0.0144575;REFB=0;REVB=-0.0139555;RO=0;SAF=56;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00042931;OID=.;OPOS=189022324;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:85:0:0:84:85:1:28:56:0:0:29:56:0:0
chr4	190630778	.	GC	AT	1162.53	PASS	AF=0.562814;AO=110;DP=204;FAO=112;FDP=199;FR=.;FRO=87;FSAF=59;FSAR=53;FSRF=46;FSRR=41;FWDB=0.0090084;FXX=0.0292669;HRUN=1;LEN=2;MLLD=156.915;QD=23.3674;RBI=0.0129495;REFB=-0.0315625;REVB=-0.00930261;RO=82;SAF=59;SAR=51;SRF=44;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000175188;STB=0.500855;STBP=0.978;TYPE=mnp;VARB=0.0301072;OID=.;OPOS=190630778;OREF=GC;OALT=AT;OMAPALT=AT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:204:199:82:87:110:112:0.562814:51:59:44:38:53:59:46:41
chr4	190630786	.	A	G	1404.52	PASS	AF=0.591743;AO=128;DP=217;FAO=129;FDP=218;FR=.;FRO=89;FSAF=69;FSAR=60;FSRF=47;FSRR=42;FWDB=0.0142146;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.274;QD=25.7711;RBI=0.0176193;REFB=-0.0168266;REVB=-0.0104108;RO=89;SAF=69;SAR=59;SRF=47;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00835195;STB=0.502786;STBP=0.924;TYPE=snp;VARB=0.0116959;OID=.;OPOS=190630786;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:217:218:89:89:128:129:0.591743:59:69:47:42:60:69:47:42
chr4	190630805	.	G	C	381.87	PASS	AF=0.254464;AO=55;DP=222;FAO=57;FDP=224;FR=.;FRO=167;FSAF=33;FSAR=24;FSRF=85;FSRR=82;FWDB=0.00605264;FXX=0.00444425;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.3551;QD=6.81913;RBI=0.0436001;REFB=0.000299799;REVB=0.043178;RO=167;SAF=32;SAR=23;SRF=85;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0921672;STB=0.552588;STBP=0.366;TYPE=snp;VARB=-0.00078804;OID=.;OPOS=190630805;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:222:224:167:167:55:57:0.254464:23:32:85:82:24:33:85:82
chr4	190630812	.	C	T	101.39	PASS	AF=0.116071;AO=26;DP=224;FAO=26;FDP=224;FR=.;FRO=198;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=101;FSRR=97;FWDB=0.00146693;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.846;QD=1.8106;RBI=0.0138289;REFB=-0.0013007;REVB=-0.0137508;RO=197;SAF=13;SAR=13;SRF=101;SRR=96;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0157767;STB=0.508922;STBP=0.936;TYPE=snp;VARB=0.012667;OID=.;OPOS=190630812;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:224:224:197:198:26:26:0.116071:13:13:101:96:13:13:101:97
chr4	190814990	.	T	C	40.51	PASS	AF=0.145833;AO=7;DP=48;FAO=7;FDP=48;FR=.;FRO=41;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=16;FSRR=25;FWDB=0.0423567;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.331;QD=3.37562;RBI=0.0497344;REFB=-0.00604838;REVB=-0.0260656;RO=41;SAF=3;SAR=4;SRF=16;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0475423;STB=0.533647;STBP=0.879;TYPE=snp;VARB=0.0485261;OID=.;OPOS=190814990;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:40:48:48:41:41:7:7:0.145833:4:3:16:25:4:3:16:25
chr4	190862154	.	T	C	223.56	PASS	AF=0.433333;AO=26;DP=60;FAO=26;FDP=60;FR=.;FRO=34;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=0.00278732;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=212.816;QD=14.9042;RBI=0.0164973;REFB=-0.0158753;REVB=-0.0162601;RO=34;SAF=15;SAR=11;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0115883;STB=0.506574;STBP=0.952;TYPE=snp;VARB=0.0138594;OID=.;OPOS=190862154;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:34:34:26:26:0.433333:11:15:20:14:11:15:20:14
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chr4	190862182	.	C	T	1231.67	PASS	AF=0.987805;AO=80;DP=81;FAO=81;FDP=82;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0120375;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.887;QD=60.0813;RBI=0.0188734;REFB=-0.0261999;REVB=-0.0145364;RO=1;SAF=42;SAR=38;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0111399;STB=0.505881;STBP=0.491;TYPE=snp;VARB=-2.11031e-06;OID=.;OPOS=190862182;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:81:82:1:1:80:81:0.987805:38:42:1:0:39:42:1:0
chr4	190874206	.	T	A	237.98	PASS	AF=0.245033;AO=36;DP=150;FAO=37;FDP=151;FR=.;FRO=114;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=64;FSRR=50;FWDB=-0.0048616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.744;QD=6.30397;RBI=0.0248732;REFB=0.00500168;REVB=-0.0243934;RO=113;SAF=16;SAR=20;SRF=63;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14096;STB=0.596539;STBP=0.176;TYPE=snp;VARB=-0.00856818;OID=.;OPOS=190874206;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:150:151:113:114:36:37:0.245033:20:16:63:50:21:16:64:50
chr4	190874234	.	C	T	276.44	PASS	AF=0.231183;AO=42;DP=185;FAO=43;FDP=186;FR=.;FRO=143;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=79;FSRR=64;FWDB=-0.00588135;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=251.994;QD=5.94502;RBI=0.010834;REFB=-0.00359658;REVB=0.00909866;RO=143;SAF=20;SAR=22;SRF=79;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0964753;STB=0.56681;STBP=0.34;TYPE=snp;VARB=0.011994;OID=.;OPOS=190874234;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:185:186:143:143:42:43:0.231183:22:20:79:64:23:20:79:64
chr4	190874255	.	A	T	131.32	PASS	AF=0.14359;AO=25;DP=192;FAO=28;FDP=195;FR=.;FRO=167;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=87;FSRR=80;FWDB=-0.0133327;FXX=0.00510178;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.506;QD=2.69371;RBI=0.0158592;REFB=-0.00509075;REVB=-0.00858785;RO=166;SAF=16;SAR=9;SRF=86;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155928;STB=0.606664;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=0.0368785;OID=.;OPOS=190874255;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:192:195:166:167:25:28:0.14359:9:16:86:80:10:18:87:80
chr4	190874256	.	C	T	59.56	PASS	AF=0.0913706;AO=18;DP=197;FAO=18;FDP=197;FR=.;FRO=179;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=96;FSRR=83;FWDB=0.00575101;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.876;QD=1.20939;RBI=0.0210254;REFB=0.0017013;REVB=-0.0202236;RO=178;SAF=10;SAR=8;SRF=95;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0259405;STB=0.517614;STBP=0.868;TYPE=snp;VARB=-0.0195386;OID=.;OPOS=190874256;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:59:197:197:178:179:18:18:0.0913706:8:10:95:83:8:10:96:83
chr4	190874290	.	T	A	232.75	PASS	AF=0.201031;AO=39;DP=195;FAO=39;FDP=194;FR=.;FRO=155;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=78;FSRR=77;FWDB=-0.0027468;FXX=0.00512794;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.828;QD=4.79905;RBI=0.0112203;REFB=0.00234457;REVB=0.0108789;RO=156;SAF=24;SAR=15;SRF=79;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141243;STB=0.590643;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=-0.00932268;OID=.;OPOS=190874290;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:195:194:156:155:39:39:0.201031:15:24:79:77:15:24:78:77
chr4	190876195	.	C	T	815.04	PASS	AF=0.590551;AO=75;DP=128;FAO=75;FDP=127;FR=.;FRO=52;FSAF=33;FSAR=42;FSRF=20;FSRR=32;FWDB=-0.0297992;FXX=0.00781189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.027;QD=25.6705;RBI=0.0303133;REFB=-0.0127669;REVB=-0.00555934;RO=51;SAF=33;SAR=42;SRF=20;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0363328;STB=0.52313;STBP=0.545;TYPE=snp;VARB=0.00725318;OID=.;OPOS=190876195;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:128:127:51:52:75:75:0.590551:42:33:20:31:42:33:20:32
chr4	190876196	.	G	A	62.91	PASS	AF=0.117188;AO=15;DP=128;FAO=15;FDP=128;FR=.;FRO=113;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=50;FSRR=63;FWDB=-0.00527905;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.838;QD=1.96593;RBI=0.0190857;REFB=-0.0010137;REVB=-0.0183411;RO=111;SAF=4;SAR=11;SRF=50;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.237996;STB=0.667181;STBP=0.21;TYPE=snp;VARB=0.0167192;OID=.;OPOS=190876196;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:128:128:111:113:15:15:0.117188:11:4:50:61:11:4:50:63
chr4	190876204	.	G	A	870.17	PASS	AF=0.628099;AO=73;DP=134;FAO=76;FDP=121;FR=.;FRO=45;FSAF=32;FSAR=44;FSRF=23;FSRR=22;FWDB=0.0258409;FXX=0.11678;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.0909;QD=28.766;RBI=0.0538427;REFB=-0.0205544;REVB=0.0472365;RO=45;SAF=32;SAR=41;SRF=23;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0515775;STB=0.533972;STBP=0.327;TYPE=snp;VARB=0.0188022;OID=.;OPOS=190876204;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:134:121:45:45:73:76:0.628099:41:32:23:22:44:32:23:22
chr4	190876242	.	G	A	1836.05	PASS	AF=0.775956;AO=142;DP=183;FAO=142;FDP=183;FR=.;FRO=41;FSAF=63;FSAR=79;FSRF=23;FSRR=18;FWDB=-0.00155309;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.6729;QD=40.1322;RBI=0.0707476;REFB=-0.0121059;REVB=-0.0707306;RO=40;SAF=63;SAR=79;SRF=23;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0545849;STB=0.526459;STBP=0.187;TYPE=snp;VARB=0.00283184;OID=.;OPOS=190876242;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:183:183:40:41:142:142:0.775956:79:63:23:17:79:63:23:18
chr4	190876256	.	C	T	223.65	PASS	AF=0.201058;AO=38;DP=189;FAO=38;FDP=189;FR=.;FRO=151;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=74;FSRR=77;FWDB=-0.0418954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.469;QD=4.73336;RBI=0.0420924;REFB=-8.66093e-05;REVB=0.00406711;RO=151;SAF=16;SAR=22;SRF=74;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0889652;STB=0.555526;STBP=0.437;TYPE=snp;VARB=0.000373392;OID=.;OPOS=190876256;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:189:189:151:151:38:38:0.201058:22:16:74:77:22:16:74:77
chr4	190876263	.	A	T	50.4	PASS	AF=0.0860215;AO=16;DP=186;FAO=16;FDP=186;FR=.;FRO=170;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=83;FSRR=87;FWDB=-0.008786;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.215;QD=1.08396;RBI=0.00970555;REFB=-0.000709533;REVB=-0.00412357;RO=170;SAF=6;SAR=10;SRF=83;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132031;STB=0.604488;STBP=0.374;TYPE=snp;VARB=0.0128308;OID=.;OPOS=190876263;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:50:186:186:170:170:16:16:0.0860215:10:6:83:87:10:6:83:87
chr4	190876269	.	T	C	50.4	PASS	AF=0.0860215;AO=16;DP=186;FAO=16;FDP=186;FR=.;FRO=170;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=81;FSRR=89;FWDB=0.003497;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.89;QD=1.08394;RBI=0.0215886;REFB=-0.000608616;REVB=0.0213035;RO=170;SAF=7;SAR=9;SRF=81;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0453398;STB=0.535814;STBP=0.755;TYPE=snp;VARB=0.0077266;OID=.;OPOS=190876269;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:50:186:186:170:170:16:16:0.0860215:9:7:81:89:9:7:81:89
chr4	190876278	.	G	A	139.07	PASS	AF=0.153005;AO=28;DP=186;FAO=28;FDP=183;FR=.;FRO=155;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=77;FSRR=78;FWDB=-0.0176594;FXX=0.0213892;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.144;QD=3.0398;RBI=0.0176602;REFB=-0.00252227;REVB=-0.000168913;RO=157;SAF=9;SAR=19;SRF=80;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.242713;STB=0.651665;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=0.0153857;OID=.;OPOS=190876278;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:186:183:157:155:28:28:0.153005:19:9:80:77:19:9:77:78
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chr4	190878597	.	C	T	346.23	PASS	AF=0.387755;AO=38;DP=97;FAO=38;FDP=98;FR=.;FRO=60;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=28;FSRR=32;FWDB=-0.00948299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.389;QD=14.1318;RBI=0.0698361;REFB=-0.0188169;REVB=-0.0691893;RO=58;SAF=17;SAR=21;SRF=27;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0194679;STB=0.511911;STBP=0.865;TYPE=snp;VARB=0.0227405;OID=.;OPOS=190878597;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:98:58:60:38:38:0.387755:21:17:27:31:21:17:28:32
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chr4	190878654	.	C	G	291.48	PASS	AF=0.336207;AO=36;DP=114;FAO=39;FDP=116;FR=.;FRO=77;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=33;FSRR=44;FWDB=-0.0124397;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.2226;QD=10.0509;RBI=0.0381077;REFB=-0.0188055;REVB=-0.0360201;RO=76;SAF=18;SAR=18;SRF=33;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0767918;STB=0.538987;STBP=0.537;TYPE=snp;VARB=0.0283146;OID=.;OPOS=190878654;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:114:116:76:77:36:39:0.336207:18:18:33:43:20:19:33:44
chr4	190881933	.	A	G	42.11	PASS	AF=0.189189;AO=7;DP=36;FAO=7;FDP=37;FR=.;FRO=30;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=-0.00995992;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=42.5604;QD=4.55294;RBI=0.01681;REFB=0.00846534;REVB=-0.0135417;RO=29;SAF=3;SAR=4;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.023941;STB=0.53116;STBP=0.955;TYPE=snp;VARB=-0.0389587;OID=.;OPOS=190881933;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:42:36:37:29:30:7:7:0.189189:4:3:13:16:4:3:14:16
chr4	190881969	.	G	A	47.81	PASS	AF=0.153846;AO=8;DP=52;FAO=8;FDP=52;FR=.;FRO=44;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=19;FSRR=25;FWDB=-0.00175365;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.913;QD=3.67733;RBI=0.00503034;REFB=0.000593966;REVB=-0.00471477;RO=44;SAF=3;SAR=5;SRF=19;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0713594;STB=0.549873;STBP=0.818;TYPE=snp;VARB=-0.0111549;OID=.;OPOS=190881969;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:52:52:44:44:8:8:0.153846:5:3:19:25:5:3:19:25
chr4	190881992	.	T	C	46.55	PASS	AF=0.148148;AO=8;DP=54;FAO=8;FDP=54;FR=.;FRO=46;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=19;FSRR=27;FWDB=0.00424432;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.908;QD=3.44831;RBI=0.0145815;REFB=-0.00305522;REVB=-0.0139501;RO=46;SAF=3;SAR=5;SRF=19;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0481352;STB=0.533895;STBP=0.858;TYPE=snp;VARB=0.0201905;OID=.;OPOS=190881992;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:54:54:46:46:8:8:0.148148:5:3:19:27:5:3:19:27
chr4	190881997	.	A	G	45.73	PASS	AF=0.145455;AO=8;DP=55;FAO=8;FDP=55;FR=.;FRO=47;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=19;FSRR=28;FWDB=0.0176696;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.844;QD=3.32568;RBI=0.0359107;REFB=-0.0060087;REVB=-0.0312629;RO=47;SAF=3;SAR=5;SRF=19;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.037147;STB=0.526249;STBP=0.935;TYPE=snp;VARB=0.0354275;OID=.;OPOS=190881997;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:55:55:47:47:8:8:0.145455:5:3:19:28:5:3:19:28
chr4	190884225	.	T	TTTC	338.21	PASS	AF=1;AO=24;DP=29;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0129441;FXX=0.142806;HRUN=4;LEN=3;MLLD=280.78;QD=56.3682;RBI=0.0136329;REFB=0;REVB=0.00427854;RO=5;SAF=14;SAR=10;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0717003;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=4.28163e-05;OID=.;OPOS=190884226;OREF=-;OALT=TTC;OMAPALT=TTTC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:24:29:24:24:0:14:10:0:0:3:5:14:10:4:1
chr4	190903938	.	C	T	167.09	PASS	AF=0.283951;AO=23;DP=81;FAO=23;FDP=81;FR=.;FRO=58;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=37;FWDB=-0.0112121;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.973;QD=8.25126;RBI=0.0121375;REFB=0.00187667;REVB=-0.00464847;RO=57;SAF=12;SAR=11;SRF=21;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.182838;STB=0.613324;STBP=0.221;TYPE=snp;VARB=-0.00322628;OID=.;OPOS=190903938;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:57:58:23:23:0.283951:11:12:21:36:11:12:21:37
chr4	190903950	.	A	G	157.26	PASS	AF=0.278481;AO=22;DP=79;FAO=22;FDP=79;FR=.;FRO=57;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=36;FWDB=-0.022136;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.604;QD=7.9623;RBI=0.0236308;REFB=0.00702072;REVB=0.00827113;RO=57;SAF=11;SAR=11;SRF=21;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159191;STB=0.594854;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=-0.0170535;OID=.;OPOS=190903950;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:57:57:22:22:0.278481:11:11:21:36:11:11:21:36
chr4	190904645	.	G	A	32.4	PASS	AF=0.625;AO=5;DP=8;FAO=5;FDP=8;FR=.;FRO=3;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0499467;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.825;QD=16.1989;RBI=0.0830217;REFB=-0.0182091;REVB=0.0663169;RO=3;SAF=1;SAR=4;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.335094;STB=0.704971;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=0.00398873;OID=.;OPOS=190904645;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:8:8:3:3:5:5:0.625:4:1:2:1:4:1:2:1
chr4	190906015	.	A	G	94.15	PASS	AF=0.223881;AO=15;DP=67;FAO=15;FDP=67;FR=.;FRO=52;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=35;FSRR=17;FWDB=-0.0132639;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.807;QD=5.62091;RBI=0.0208336;REFB=-0.00384655;REVB=-0.0160657;RO=52;SAF=7;SAR=8;SRF=35;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.254878;STB=0.657341;STBP=0.208;TYPE=snp;VARB=0.0230935;OID=.;OPOS=190906015;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:67:67:52:52:15:15:0.223881:8:7:35:17:8:7:35:17
chr4	190906025	.	G	A	552.97	PASS	AF=0.758065;AO=47;DP=62;FAO=47;FDP=62;FR=.;FRO=15;FSAF=30;FSAR=17;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.00511228;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.233;QD=35.6753;RBI=0.0288668;REFB=-0.0373293;REVB=0.0284105;RO=14;SAF=30;SAR=17;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0940375;STB=0.543853;STBP=0.244;TYPE=snp;VARB=0.00266841;OID=.;OPOS=190906025;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:93:62:62:14:15:47:47:0.758065:17:30:6:8:17:30:7:8
chr4	190906043	.	GGGCG	GG,GGGCA	74.31	PASS	AF=0.192982,0.0175439;AO=10,2;DP=57;FAO=11,1;FDP=57;FR=.;FRO=45;FSAF=3,1;FSAR=8,0;FSRF=26;FSRR=19;FWDB=-0.0121755,-0.0465587;FXX=0.0172384;HRUN=3,2;LEN=3,1;MLLD=225.143,119.885;QD=5.21448;RBI=0.0150692,0.0468698;REFB=-0.00799961,-0.00440628;REVB=-0.00887907,0.00539109;RO=40;SAF=2,2;SAR=8,0;SRF=23;SRR=17;SSEN=0,0;SSEP=0.318945,0;SSSB=-0.459059,0.383449;STB=0.740783,0.988515;STBP=0.087,0.481;TYPE=del,snp;VARB=0.0486215,0.0193859;OID=.,.;OPOS=190906044,190906047;OREF=GGC,G;OALT=-,A;OMAPALT=GG,GGGCA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.192982,0.0175439:10,2:57:11,1:57:45:3,1:8,0:26:19:67:40:2,2:8,0:23:17
chr4	190936397	.	G	C	323.89	PASS	AF=0.341667;AO=41;DP=119;FAO=41;FDP=120;FR=.;FRO=79;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=49;FSRR=30;FWDB=-0.021942;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.6046;QD=10.7963;RBI=0.0724813;REFB=-0.00218637;REVB=-0.0690804;RO=78;SAF=18;SAR=23;SRF=48;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198742;STB=0.617579;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=0.00198118;OID=.;OPOS=190936397;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:120:78:79:41:41:0.341667:23:18:48:30:23:18:49:30
chr5	140515	.	C	A	680.21	PASS	AF=0.482517;AO=67;DP=144;FAO=69;FDP=143;FR=.;FRO=74;FSAF=33;FSAR=36;FSRF=40;FSRR=34;FWDB=0.024431;FXX=0.00694396;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.3898;QD=19.0269;RBI=0.0253097;REFB=-0.0140168;REVB=0.00661117;RO=75;SAF=31;SAR=36;SRF=41;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0799529;STB=0.53219;STBP=0.486;TYPE=snp;VARB=0.0161499;OID=.;OPOS=140515;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:144:143:75:74:67:69:0.482517:36:31:41:34:36:33:40:34
chr5	163260	.	A	C	145.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0706884;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.554;QD=44.7582;RBI=0.0756133;REFB=0;REVB=-0.0268426;RO=0;SAF=6;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000444951;OID=.;OPOS=163260;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:13:0:0:12:13:1:6:6:0:0:6:7:0:0
chr5	174106	.	G	A	223.74	PASS	AF=0.385714;AO=27;DP=70;FAO=27;FDP=70;FR=.;FRO=43;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=24;FWDB=0.00101447;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.579;QD=12.7851;RBI=0.0261278;REFB=0.00133387;REVB=0.0261081;RO=43;SAF=14;SAR=13;SRF=19;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0819444;STB=0.546956;STBP=0.552;TYPE=snp;VARB=-0.0018689;OID=.;OPOS=174106;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:43:43:27:27:0.385714:13:14:19:24:13:14:19:24
chr5	181730	.	C	G	152.08	PASS	AF=0.369565;AO=17;DP=46;FAO=17;FDP=46;FR=.;FRO=29;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=0.00726703;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.0532;QD=13.2245;RBI=0.0508934;REFB=-0.00539309;REVB=-0.0503719;RO=27;SAF=14;SAR=3;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.312376;STB=0.713092;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.00470966;OID=.;OPOS=181730;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:27:29:17:17:0.369565:3:14:16:11:3:14:16:13
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chr5	231111	.	T	C	302.89	PASS	AF=0.464789;AO=32;DP=71;FAO=33;FDP=71;FR=.;FRO=38;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=27;FSRR=11;FWDB=-0.0440269;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.213;QD=17.0643;RBI=0.0529432;REFB=-0.0206409;REVB=0.0294044;RO=38;SAF=20;SAR=12;SRF=27;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0906593;STB=0.560002;STBP=0.402;TYPE=snp;VARB=0.020391;OID=.;OPOS=231111;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:38:38:32:33:0.464789:12:20:27:11:13:20:27:11
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chr5	1038666	.	G	A	129.22	PASS	AF=0.375;AO=15;DP=40;FAO=15;FDP=40;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=-0.0096707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.893;QD=12.9218;RBI=0.0106053;REFB=-0.0200877;REVB=-0.00435308;RO=25;SAF=6;SAR=9;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0438595;STB=0.525739;STBP=0.818;TYPE=snp;VARB=0.0262178;OID=.;OPOS=1038666;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:25:25:15:15:0.375:9:6:11:14:9:6:11:14
chr5	1052360	.	C	T	465.87	PASS	AF=0.605634;AO=42;DP=77;FAO=43;FDP=71;FR=.;FRO=28;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=0.00286297;FXX=0.077912;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.1988;QD=26.2462;RBI=0.00642765;REFB=-0.0392178;REVB=0.00575483;RO=24;SAF=21;SAR=21;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0555893;STB=0.551882;STBP=0.261;TYPE=snp;VARB=0.0275517;OID=.;OPOS=1052360;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:71:24:28:42:43:0.605634:21:21:10:14:22:21:10:18
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chr5	1057615	.	A	G	923.86	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0383171;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.808;QD=58.6575;RBI=0.0383197;REFB=0;REVB=-0.000442248;RO=0;SAF=33;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.09533e-05;OID=.;OPOS=1057615;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:30:33:0:0:30:33:0:0
chr5	1063998	.	G	A	895.86	PASS	AF=0.438914;AO=97;DP=221;FAO=97;FDP=221;FR=.;FRO=124;FSAF=59;FSAR=38;FSRF=64;FSRR=60;FWDB=0.0165205;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.528;QD=16.2147;RBI=0.024937;REFB=-0.00875657;REVB=0.0186795;RO=122;SAF=59;SAR=38;SRF=63;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0943298;STB=0.552973;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=0.0114045;OID=.;OPOS=1063998;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:221:221:122:124:97:97:0.438914:38:59:63:59:38:59:64:60
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chr5	5443269	.	C	CT,T	51.07	PASS	AF=0.341463,0;AO=6,10;DP=41;FAO=14,0;FDP=41;FR=.;FRO=27;FSAF=6,0;FSAR=8,0;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=-0.0474156,0.0124145;FXX=0.0465008;HRUN=7,1;LEN=1,1;MLLD=8.38491,215.974;QD=4.98288;RBI=0.278383,0.024036;REFB=-0.0767075,0.00177825;REVB=-0.274316,-0.0205818;RO=24;SAF=1,4;SAR=5,6;SRF=11;SRR=13;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.385824,-0.0682721;STB=0.539513,0.5;STBP=0.748,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.00702154,0;OID=.,.;OPOS=5443270,5443269;OREF=-,C;OALT=T,T;OMAPALT=CT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:41:41:24:27:6,10:14,0:0.341463,0:5,6:1,4:11:13:8,0:6,0:10:17
chr5	5457724	.	ATTTTTT	ATTTTTA,ATTTTT,TATTTTT	243.88	PASS	AF=0.130435,0.630435,0;AO=3,19,3;DP=48;FAO=6,29,0;FDP=46;FR=.;FRO=11;FSAF=6,3,0;FSAR=0,26,0;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.0273982,-0.0118861,0.00252472;FXX=0.041658;HRUN=7,7,1;LEN=1,1,2;MLLD=178.576,10.692,72.8398;QD=21.2073;RBI=0.0468927,0.0186475,0.154099;REFB=0.00590451,0.0186212,-0.00349532;REVB=-0.038056,-0.0143685,-0.154078;RO=13;SAF=3,1,0;SAR=0,18,3;SRF=5;SRR=8;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.671217,-0.526291,-0.597541;STB=0.997844,0.684055,0.5;STBP=0.012,0.009,1;TYPE=snp,del,mnp;VARB=0.129038,0.0227737,0;OID=.,.,.;OPOS=5457730,5457725,5457724;OREF=T,T,AT;OALT=A,-,TA;OMAPALT=ATTTTTA,ATTTTT,TATTTTT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:28:48:46:13:11:3,19,3:6,29,0:0.130435,0.630435,0:0,18,3:3,1,0:5:8:0,26,0:6,3,0:5:6
chr5	5460569	.	C	T	199.89	PASS	AF=0.40678;AO=24;DP=59;FAO=24;FDP=59;FR=.;FRO=35;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=-0.0349177;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.956;QD=13.5518;RBI=0.0376938;REFB=-0.0126653;REVB=-0.0141977;RO=34;SAF=9;SAR=15;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160874;STB=0.600773;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=0.0250025;OID=.;OPOS=5460569;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:34:35:24:24:0.40678:15:9:18:16:15:9:19:16
chr5	5460619	.	G	C	267.07	PASS	AF=0.528302;AO=28;DP=53;FAO=28;FDP=53;FR=.;FRO=25;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=0.0165056;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.2076;QD=20.156;RBI=0.0498812;REFB=-0.00363079;REVB=0.0470712;RO=25;SAF=8;SAR=20;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.249168;STB=0.63943;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.00531008;OID=.;OPOS=5460619;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:25:25:28:28:0.528302:20:8:14:11:20:8:14:11
chr5	5462148	.	G	A	35.94	PASS	AF=0.26087;AO=6;DP=23;FAO=6;FDP=23;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=0.0354937;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.495;QD=6.25122;RBI=0.0485262;REFB=-0.00985012;REVB=-0.0330907;RO=17;SAF=4;SAR=2;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.346032;STB=0.721525;STBP=0.248;TYPE=snp;VARB=0.0299235;OID=.;OPOS=5462148;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:23:23:17:17:6:6:0.26087:2:4:6:11:2:4:6:11
chr5	6602544	.	T	C	955.14	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0489301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.365;QD=58.7777;RBI=0.0627844;REFB=0;REVB=0.0393412;RO=0;SAF=26;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.10038e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.73903e-05;OID=.;OPOS=6602544;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:39:26:0:0:39:26:0:0
chr5	6604787	.	C	T	613.97	PASS	AF=0.913043;AO=42;DP=46;FAO=42;FDP=46;FR=.;FRO=4;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0256024;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=128.489;QD=53.389;RBI=0.0257136;REFB=-0.106846;REVB=0.00238841;RO=1;SAF=21;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0218287;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00398065;OID=.;OPOS=6604787;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:18:46:46:1:4:42:42:0.913043:21:21:1:0:21:21:2:2
chr5	7826853	.	G	A	281.95	PASS	AF=0.410256;AO=32;DP=78;FAO=32;FDP=78;FR=.;FRO=46;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=27;FSRR=19;FWDB=0.00647828;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.507;QD=14.4588;RBI=0.00892837;REFB=-0.0091605;REVB=-0.00614391;RO=45;SAF=16;SAR=16;SRF=26;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0802025;STB=0.55125;STBP=0.48;TYPE=snp;VARB=0.0134967;OID=.;OPOS=7826853;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:45:46:32:32:0.410256:16:16:26:19:16:16:27:19
chr5	7866821	.	T	C	273.79	PASS	AF=0.424658;AO=31;DP=74;FAO=31;FDP=73;FR=.;FRO=42;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=22;FWDB=0.0211369;FXX=0.0135117;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.7654;QD=15.002;RBI=0.0216798;REFB=-0.0214556;REVB=0.0048215;RO=43;SAF=11;SAR=20;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118239;STB=0.572965;STBP=0.347;TYPE=snp;VARB=0.0312463;OID=.;OPOS=7866821;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:73:43:42:31:31:0.424658:20:11:20:23:20:11:20:22
chr5	7866967	.	G	C	1008.13	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0141064;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.621;QD=59.3018;RBI=0.014149;REFB=0;REVB=0.00109714;RO=0;SAF=28;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.35737e-05;OID=.;OPOS=7866967;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:40:28:0:0:40:28:0:0
chr5	7868030	.	T	C	1339.77	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00254612;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=284.209;QD=62.3147;RBI=0.0160193;REFB=0;REVB=0.0158157;RO=0;SAF=52;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.02904e-05;OID=.;OPOS=7868030;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:34:52:0:0:34:52:0:0
chr5	7870973	.	A	G	410.04	PASS	AF=0.438095;AO=46;DP=105;FAO=46;FDP=105;FR=.;FRO=59;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=33;FSRR=26;FWDB=0.0138673;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.4947;QD=15.6205;RBI=0.0185445;REFB=-0.00637915;REVB=-0.0123125;RO=58;SAF=25;SAR=21;SRF=33;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0256389;STB=0.508981;STBP=0.891;TYPE=snp;VARB=0.00805619;OID=.;OPOS=7870973;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:105:58:59:46:46:0.438095:21:25:33:25:21:25:33:26
chr5	7889216	.	G	A	280.92	PASS	AF=0.410256;AO=32;DP=78;FAO=32;FDP=78;FR=.;FRO=46;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=26;FSRR=20;FWDB=-0.0133855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.018;QD=14.4059;RBI=0.0238098;REFB=0.00326123;REVB=0.019691;RO=46;SAF=14;SAR=18;SRF=26;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13224;STB=0.575033;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=-0.00915943;OID=.;OPOS=7889216;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:46:46:32:32:0.410256:18:14:26:20:18:14:26:20
chr5	7889304	.	C	T	265.56	PASS	AF=0.333333;AO=32;DP=96;FAO=32;FDP=96;FR=.;FRO=64;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=31;FSRR=33;FWDB=-0.00990089;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.467;QD=11.0648;RBI=0.0100755;REFB=-0.00684051;REVB=0.00186788;RO=63;SAF=18;SAR=14;SRF=30;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0987735;STB=0.552187;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=0.014623;OID=.;OPOS=7889304;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:96:63:64:32:32:0.333333:14:18:30:33:14:18:31:33
chr5	7891506	.	C	G	371.53	PASS	AF=0.513514;AO=38;DP=74;FAO=38;FDP=74;FR=.;FRO=36;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=14;FSRR=22;FWDB=-0.011399;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=240.754;QD=20.0828;RBI=0.0113996;REFB=-0.00456547;REVB=0.000114358;RO=36;SAF=17;SAR=21;SRF=14;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.052211;STB=0.528928;STBP=0.647;TYPE=snp;VARB=0.0034875;OID=.;OPOS=7891506;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:36:36:38:38:0.513514:21:17:14:22:21:17:14:22
chr5	8620513	.	G	A	151.03	PASS	AF=0.351852;AO=19;DP=53;FAO=19;FDP=54;FR=.;FRO=35;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=-0.0114185;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.144;QD=11.1874;RBI=0.0897117;REFB=-0.00461473;REVB=-0.088982;RO=34;SAF=10;SAR=9;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0289123;STB=0.507804;STBP=0.96;TYPE=snp;VARB=0.004452;OID=.;OPOS=8620513;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:54:34:35:19:19:0.351852:9:10:17:17:9:10:18:17
chr5	9041924	.	T	C	289.22	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0178358;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.62;QD=52.5859;RBI=0.018464;REFB=0;REVB=0.004775;RO=0;SAF=10;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000183693;OID=.;OPOS=9041924;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:12:10:0:0:12:10:0:0
chr5	9041935	.	G	A	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00264762;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.002;QD=50.4134;RBI=0.0236416;REFB=0;REVB=0.0234928;RO=0;SAF=9;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000114161;OID=.;OPOS=9041935;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:10:9:0:0:10:9:0:0
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chr5	9108333	.	C	T	431.25	PASS	AF=0.61194;AO=41;DP=67;FAO=41;FDP=67;FR=.;FRO=26;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=0.0358842;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.466;QD=25.7462;RBI=0.0358848;REFB=-0.00597543;REVB=-0.000208425;RO=26;SAF=20;SAR=21;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0631767;STB=0.534529;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=0.00446549;OID=.;OPOS=9108333;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:26:26:41:41:0.61194:21:20:15:11:21:20:15:11
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chr5	9190404	.	G	A	883.92	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00842613;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.469;QD=57.9619;RBI=0.0145851;REFB=0;REVB=-0.0119048;RO=0;SAF=27;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.96591e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.29376e-06;OID=.;OPOS=9190404;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:61:0:0:59:61:1:32:27:0:0:32:29:0:0
chr5	9265584	.	G	A	345.16	PASS	AF=0.391753;AO=38;DP=97;FAO=38;FDP=97;FR=.;FRO=59;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=40;FSRR=19;FWDB=-0.017741;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.474;QD=14.2334;RBI=0.0248244;REFB=-0.00479922;REVB=-0.017364;RO=55;SAF=17;SAR=21;SRF=37;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.232573;STB=0.637651;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.00969076;OID=.;OPOS=9265584;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:55:59:38:38:0.391753:21:17:37:18:21:17:40:19
chr5	9265602	.	C	T	1630.48	PASS	AF=0.982143;AO=110;DP=112;FAO=110;FDP=112;FR=.;FRO=2;FSAF=65;FSAR=45;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00491557;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.809;QD=58.2316;RBI=0.0103783;REFB=-0.0161316;REVB=-0.0091404;RO=2;SAF=65;SAR=45;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0143819;STB=0.507574;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=-0.000100873;OID=.;OPOS=9265602;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:112:112:2:2:110:110:0.982143:45:65:2:0:45:65:2:0
chr5	9280957	.	C	A	456.14	PASS	AF=1;AO=31;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0138374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.157;QD=57.0168;RBI=0.0170464;REFB=0;REVB=0.00995511;RO=0;SAF=16;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.43324e-05;OID=.;OPOS=9280957;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:31:32:1:15:16:0:0:16:16:0:0
chr5	9629529	.	G	A	108.0	PASS	AF=0.393939;AO=13;DP=33;FAO=13;FDP=33;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=-0.0214522;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=120.547;QD=13.0908;RBI=0.0231009;REFB=0.0162194;REVB=0.00857052;RO=20;SAF=8;SAR=5;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0950368;STB=0.555473;STBP=0.667;TYPE=snp;VARB=-0.0152803;OID=.;OPOS=9629529;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:20:20:13:13:0.393939:5:8:14:6:5:8:14:6
chr5	10237035	.	A	AG	391.06	PASS	AF=1;AO=3;DP=30;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0839427;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=203.837;QD=50.4587;RBI=0.0982626;REFB=0;REVB=-0.0510798;RO=27;SAF=2;SAR=1;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157893;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000195147;OID=.;OPOS=10237036;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:3:30:31:31:0:16:15:0:0:4:27:2:1:14:13
chr5	10237036	.	A	G	377.93	PASS	AF=0.933333;AO=28;DP=31;FAO=28;FDP=30;FR=.;FRO=2;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00766438;FXX=0.0322477;HRUN=4;LEN=1;MLLD=270.871;QD=50.3905;RBI=0.00942798;REFB=0.0525717;REVB=-0.00549036;RO=2;SAF=14;SAR=14;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00231383;OID=.;OPOS=10237036;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:31:30:2:2:28:28:0.933333:14:14:1:1:14:14:1:1
chr5	10239261	.	G	A	747.1	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.01279;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.935;QD=63.5829;RBI=0.0246665;REFB=0;REVB=-0.0210915;RO=0;SAF=26;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000117277;OID=.;OPOS=10239261;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:21:26:0:0:21:26:0:0
chr5	10239278	.	C	T	834.4	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00373399;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.285;QD=57.5446;RBI=0.0113825;REFB=0;REVB=-0.0107526;RO=0;SAF=37;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.3149e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.79873e-05;OID=.;OPOS=10239278;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:21:37:0:0:21:37:0:0
chr5	10250430	.	G	A,GA	1290.76	PASS	AF=0.988506,0.0114943;AO=75,11;DP=88;FAO=86,1;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=35,0;FSAR=51,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0733454,0.0949891;FXX=0.0113623;HRUN=6,2;LEN=1,1;MLLD=32.8153,23.1467;QD=59.3455;RBI=0.136536,0.16789;REFB=0,0;REVB=0.115163,0.138434;RO=2;SAF=30,5;SAR=45,6;SRF=1;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0051115,-0.012578;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,ins;VARB=0.0100558,0.0437234;OID=.,.;OPOS=10250430,10250431;OREF=G,-;OALT=A,A;OMAPALT=A,GA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:5:88:87:2:0:75,11:86,1:0.988506,0.0114943:45,6:30,5:1:1:51,1:35,0:0:0
chr5	10250443	.	T	C	1568.52	PASS	AF=1;AO=98;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0152416;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=293.576;QD=64.0213;RBI=0.0165617;REFB=0;REVB=-0.00647959;RO=0;SAF=40;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.60973e-05;OID=.;OPOS=10250443;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:98:0:0:98:98:1:58:40:0:0:58:40:0:0
chr5	10254817	.	A	G	918.47	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0144312;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.012;QD=58.3158;RBI=0.0225343;REFB=0;REVB=0.0173071;RO=0;SAF=19;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.32015e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.77649e-06;OID=.;OPOS=10254817;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:63:0:0:62:63:1:43:19:0:0:44:19:0:0
chr5	10256161	.	T	C	1339.71	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0183808;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.688;QD=62.3121;RBI=0.0196666;REFB=0;REVB=0.00699444;RO=0;SAF=33;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.98109e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.37614e-05;OID=.;OPOS=10256161;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:53:33:0:0:53:33:0:0
chr5	10261966	.	G	A	785.88	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0172435;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.8371;QD=64.1533;RBI=0.0175418;REFB=0;REVB=0.00322127;RO=0;SAF=21;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00010626;OID=.;OPOS=10261966;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:28:21:0:0:28:21:0:0
chr5	10564846	.	C	T	1711.92	PASS	AF=1;AO=112;DP=113;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0475385;FXX=0.00877116;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.7182;QD=60.5988;RBI=0.0602918;REFB=0;REVB=0.0370836;RO=0;SAF=40;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.64229e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000484841;OID=.;OPOS=10564846;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:113:113:0:0:112:113:1:72:40:0:0:72:41:0:0
chr5	10624866	.	T	G	185.66	PASS	AF=0.383333;AO=23;DP=60;FAO=23;FDP=60;FR=.;FRO=37;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=24;FSRR=13;FWDB=0.0257673;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=144.426;QD=12.3774;RBI=0.0264704;REFB=-0.00775643;REVB=0.00606052;RO=36;SAF=11;SAR=12;SRF=24;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199184;STB=0.604229;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=0.0140305;OID=.;OPOS=10624866;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:36:37:23:23:0.383333:12:11:24:12:12:11:24:13
chr5	10624887	.	T	C	873.89	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0069389;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.334;QD=58.2594;RBI=0.0117698;REFB=0;REVB=-0.00950686;RO=0;SAF=36;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.9695e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000715797;OID=.;OPOS=10624887;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:24:36:0:0:24:36:0:0
chr5	10638180	.	T	C	1151.07	PASS	AF=1;AO=75;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0148377;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.613;QD=60.5829;RBI=0.0158186;REFB=0;REVB=0.0054839;RO=0;SAF=42;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.37569e-06;OID=.;OPOS=10638180;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:75:76:1:33:42:0:0:34:42:0:0
chr5	10649784	.	G	A	117.44	PASS	AF=0.590909;AO=13;DP=22;FAO=13;FDP=22;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.0387441;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.995;QD=21.3528;RBI=0.0451424;REFB=-0.0326068;REVB=0.0231675;RO=9;SAF=4;SAR=9;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0214541;STB=0.512176;STBP=0.977;TYPE=snp;VARB=0.0135328;OID=.;OPOS=10649784;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:22:22:9:9:13:13:0.590909:9:4:3:6:9:4:3:6
chr5	10650150	.	A	G	33.48	PASS	AF=0.714286;AO=5;DP=7;FAO=5;FDP=7;FR=.;FRO=2;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00082221;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.815;QD=19.1341;RBI=0.0272073;REFB=-0.0693188;REVB=-0.0271948;RO=2;SAF=3;SAR=2;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.281149;STB=0.666029;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.0123032;OID=.;OPOS=10650150;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:7:7:2:2:5:5:0.714286:2:3:0:2:2:3:0:2
chr5	10761182	.	A	G	99.62	PASS	AF=0.733333;AO=11;DP=15;FAO=11;FDP=15;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.0473563;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.8532;QD=26.5658;RBI=0.0575846;REFB=-0.0442742;REVB=-0.0327622;RO=4;SAF=2;SAR=9;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.335749;STB=0.691912;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.0134072;OID=.;OPOS=10761182;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:15:15:4:4:11:11:0.733333:9:2:3:1:9:2:3:1
chr5	10973727	.	G	A	1055.52	PASS	AF=0.519802;AO=101;DP=198;FAO=105;FDP=202;FR=.;FRO=97;FSAF=49;FSAR=56;FSRF=48;FSRR=49;FWDB=-0.00372617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.989;QD=20.9014;RBI=0.028866;REFB=-0.0207705;REVB=0.0286245;RO=97;SAF=47;SAR=54;SRF=48;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0264132;STB=0.513565;STBP=0.705;TYPE=snp;VARB=0.0157302;OID=.;OPOS=10973727;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:198:202:97:97:101:105:0.519802:54:47:48:49:56:49:48:49
chr5	13701470	.	C	A	356.33	PASS	AF=0.469136;AO=34;DP=79;FAO=38;FDP=81;FR=.;FRO=43;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=27;FSRR=16;FWDB=0.0879745;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.5635;QD=17.5965;RBI=0.0894931;REFB=-0.00552785;REVB=0.0164166;RO=43;SAF=13;SAR=21;SRF=27;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.241493;STB=0.608695;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.00805046;OID=.;OPOS=13701470;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:81:43:43:34:38:0.469136:21:13:27:16:22:16:27:16
chr5	13701525	.	T	C	240.48	PASS	AF=0.511111;AO=23;DP=45;FAO=23;FDP=45;FR=.;FRO=22;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.0283553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.815;QD=21.3761;RBI=0.0289236;REFB=-0.00537613;REVB=0.00570495;RO=21;SAF=16;SAR=7;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159835;STB=0.581123;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.0109533;OID=.;OPOS=13701525;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:21:22:23:23:0.511111:7:16:11:10:7:16:12:10
chr5	13701536	.	T	C	157.84	PASS	AF=0.447368;AO=17;DP=37;FAO=17;FDP=38;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.00774301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.519;QD=16.6151;RBI=0.00924269;REFB=-0.0147734;REVB=0.00504709;RO=20;SAF=13;SAR=4;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.283926;STB=0.654479;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=0.0295488;OID=.;OPOS=13701536;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:38:20:21:17:17:0.447368:4:13:10:10:4:13:11:10
chr5	13708284	.	C	T	703.51	PASS	AF=0.548387;AO=68;DP=124;FAO=68;FDP=124;FR=.;FRO=56;FSAF=28;FSAR=40;FSRF=26;FSRR=30;FWDB=0.0206335;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.893;QD=22.694;RBI=0.0206437;REFB=-0.00848012;REVB=-0.000648766;RO=56;SAF=28;SAR=40;SRF=26;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0443135;STB=0.524265;STBP=0.579;TYPE=snp;VARB=0.00584564;OID=.;OPOS=13708284;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:124:124:56:56:68:68:0.548387:40:28:26:30:40:28:26:30
chr5	13717471	.	T	C	517.25	PASS	AF=0.495413;AO=54;DP=110;FAO=54;FDP=109;FR=.;FRO=55;FSAF=37;FSAR=17;FSRF=32;FSRR=23;FWDB=0.003717;FXX=0.0180164;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.42;QD=18.9815;RBI=0.00821986;REFB=-0.00118313;REVB=0.00733144;RO=55;SAF=37;SAR=17;SRF=32;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104242;STB=0.557837;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=0.00168763;OID=.;OPOS=13717471;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:109:55:55:54:54:0.495413:17:37:32:23:17:37:32:23
chr5	13719018	.	G	A	452.17	PASS	AF=0.483871;AO=45;DP=93;FAO=45;FDP=93;FR=.;FRO=48;FSAF=27;FSAR=18;FSRF=32;FSRR=16;FWDB=0.0124749;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.806;QD=19.4481;RBI=0.012539;REFB=0.00516889;REVB=-0.00126637;RO=48;SAF=27;SAR=18;SRF=32;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0655339;STB=0.536348;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=-0.0043774;OID=.;OPOS=13719018;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:48:48:45:45:0.483871:18:27:32:16:18:27:32:16
chr5	13719022	.	T	G	482.81	PASS	AF=0.505376;AO=47;DP=93;FAO=47;FDP=93;FR=.;FRO=46;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=31;FSRR=15;FWDB=0.0396896;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.2507;QD=20.7661;RBI=0.0414908;REFB=-0.0150988;REVB=0.0120925;RO=46;SAF=26;SAR=21;SRF=31;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110813;STB=0.561156;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=0.0417611;OID=.;OPOS=13719022;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:46:46:47:47:0.505376:21:26:31:15:21:26:31:15
chr5	13719089	.	G	A	511.64	PASS	AF=0.521277;AO=45;DP=90;FAO=49;FDP=94;FR=.;FRO=45;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=28;FSRR=17;FWDB=0.0147909;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.275;QD=21.7718;RBI=0.0181386;REFB=-0.0136681;REVB=0.0104995;RO=45;SAF=20;SAR=25;SRF=28;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159323;STB=0.563233;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.00913435;OID=.;OPOS=13719089;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:94:45:45:45:49:0.521277:25:20:28:17:25:24:28:17
chr5	13737444	.	G	A	448.75	PASS	AF=0.438596;AO=50;DP=114;FAO=50;FDP=114;FR=.;FRO=64;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=31;FSRR=33;FWDB=-0.0227385;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.8818;QD=15.7456;RBI=0.0244834;REFB=-0.00401598;REVB=0.00907729;RO=64;SAF=26;SAR=24;SRF=31;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0357173;STB=0.519992;STBP=0.738;TYPE=snp;VARB=0.00299873;OID=.;OPOS=13737444;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:114:114:64:64:50:50:0.438596:24:26:31:33:24:26:31:33
chr5	13788886	.	C	A	140.54	PASS	AF=0.316667;AO=19;DP=60;FAO=19;FDP=60;FR=.;FRO=41;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=0.00792679;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.5471;QD=9.36914;RBI=0.0414078;REFB=-0.00806503;REVB=-0.040642;RO=40;SAF=13;SAR=6;SRF=18;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.272797;STB=0.669446;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=0.0133617;OID=.;OPOS=13788886;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:40:41:19:19:0.316667:6:13:18:22:6:13:18:23
chr5	13811775	.	T	C	450.58	PASS	AF=0.53012;AO=44;DP=83;FAO=44;FDP=83;FR=.;FRO=39;FSAF=28;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=17;FWDB=-0.00251508;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.5708;QD=21.7146;RBI=0.0168618;REFB=0.00282327;REVB=0.0166732;RO=39;SAF=28;SAR=16;SRF=22;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0650524;STB=0.535946;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=-0.00463029;OID=.;OPOS=13811775;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:39:39:44:44:0.53012:16:28:22:17:16:28:22:17
chr5	13829799	.	G	A	484.27	PASS	AF=0.560976;AO=46;DP=82;FAO=46;FDP=82;FR=.;FRO=36;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=-0.0197384;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.847;QD=23.623;RBI=0.0200273;REFB=0.00627798;REVB=0.00338982;RO=36;SAF=26;SAR=20;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00784618;STB=0.504308;STBP=0.923;TYPE=snp;VARB=-0.00656304;OID=.;OPOS=13829799;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:36:36:46:46:0.560976:20:26:20:16:20:26:20:16
chr5	13845045	.	G	A	298.09	PASS	AF=0.54386;AO=31;DP=57;FAO=31;FDP=57;FR=.;FRO=26;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=-0.0107683;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=206.9;QD=20.9185;RBI=0.0241864;REFB=-0.0206328;REVB=-0.0216569;RO=26;SAF=19;SAR=12;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0309146;STB=0.517149;STBP=0.781;TYPE=snp;VARB=0.0149419;OID=.;OPOS=13845045;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:26:26:31:31:0.54386:12:19:15:11:12:19:15:11
chr5	13864728	.	C	A	186.79	PASS	AF=0.383333;AO=23;DP=61;FAO=23;FDP=60;FR=.;FRO=37;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=-0.0134088;FXX=0.0163908;HRUN=3;LEN=1;MLLD=290.155;QD=12.4527;RBI=0.0135025;REFB=-0.00812442;REVB=-0.00158745;RO=37;SAF=6;SAR=17;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.317333;STB=0.684042;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.0149911;OID=.;OPOS=13864728;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:60:37:37:23:23:0.383333:17:6:20:17:17:6:20:17
chr5	13865980	.	T	C	259.49	PASS	AF=0.467742;AO=28;DP=61;FAO=29;FDP=62;FR=.;FRO=33;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=10;FSRR=23;FWDB=0.0094839;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.022;QD=16.7415;RBI=0.0635024;REFB=-0.0314128;REVB=0.0627902;RO=33;SAF=12;SAR=16;SRF=10;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126008;STB=0.579376;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=0.0329773;OID=.;OPOS=13865980;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:62:33:33:28:29:0.467742:16:12:10:23:16:13:10:23
chr5	13894894	.	T	A	441.51	PASS	AF=0.453704;AO=49;DP=107;FAO=49;FDP=108;FR=.;FRO=59;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=27;FSRR=32;FWDB=0.0239541;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=45.1663;QD=16.3522;RBI=0.0265199;REFB=-0.043527;REVB=-0.01138;RO=57;SAF=25;SAR=24;SRF=27;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0352171;STB=0.528689;STBP=0.632;TYPE=snp;VARB=0.0435093;OID=.;OPOS=13894894;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:108:57:59:49:49:0.453704:24:25:27:30:24:25:27:32
chr5	13900345	.	A	G	1970.95	PASS	AF=1;AO=127;DP=127;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103216;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.331;QD=62.0772;RBI=0.0399345;REFB=0;REVB=0.0385776;RO=0;SAF=71;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.70096e-05;OID=.;OPOS=13900345;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:127:127:0:0:127:127:1:56:71:0:0:56:71:0:0
chr5	13902220	.	T	C	410.96	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0296951;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.582;QD=56.6845;RBI=0.0328534;REFB=0;REVB=-0.0140552;RO=0;SAF=14;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.93704e-05;OID=.;OPOS=13902220;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:15:14:0:0:15:14:0:0
chr5	13913885	.	A	G	1914.92	PASS	AF=1;AO=124;DP=124;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00252128;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.451;QD=61.7715;RBI=0.0119346;REFB=0;REVB=-0.0116653;RO=0;SAF=69;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.72449e-05;OID=.;OPOS=13913885;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:124:124:0:0:124:124:1:55:69:0:0:55:69:0:0
chr5	13931340	.	C	T	940.64	PASS	AF=1;AO=64;DP=65;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0315976;FXX=0.0153822;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.8602;QD=58.7901;RBI=0.0433286;REFB=0;REVB=0.0296473;RO=0;SAF=26;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000643388;OID=.;OPOS=13931340;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:64:0:0:64:64:1:38:26:0:0:38:26:0:0
chr5	13944512	.	A	C	651.17	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144292;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.3399;QD=62.0158;RBI=0.0289208;REFB=0;REVB=0.0250642;RO=0;SAF=27;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.13648e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000569378;OID=.;OPOS=13944512;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:15:27:0:0:15:27:0:0
chr5	14184022	.	G	A	885.7	PASS	AF=1;AO=59;DP=60;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100213;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.011;QD=56.235;RBI=0.0177426;REFB=0;REVB=-0.0146415;RO=0;SAF=34;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.03209e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00105563;OID=.;OPOS=14184022;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:63:0:0:59:63:1:25:34:0:0:25:38:0:0
chr5	14184079	.	G	A	769.5	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00949974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.797;QD=57;RBI=0.0120935;REFB=0;REVB=0.00748381;RO=0;SAF=30;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.43753e-05;OID=.;OPOS=14184079;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:24:30:0:0:24:30:0:0
chr5	14420027	.	A	C	770.14	PASS	AF=0.982143;AO=56;DP=56;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0325311;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.7109;QD=55.0096;RBI=0.0336476;REFB=-0.000239061;REVB=0.00859557;RO=0;SAF=33;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507689;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=-0.000262454;OID=.;OPOS=14420027;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:56:56:0:1:56:55:0.982143:23:33:0:0:23:32:1:0
chr5	14488160	.	C	G	78.88	PASS	AF=0.818182;AO=9;DP=11;FAO=9;FDP=11;FR=.;FRO=2;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0141545;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=321.011;QD=28.6827;RBI=0.0149667;REFB=-0.0370793;REVB=0.00486339;RO=2;SAF=5;SAR=4;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176689;STB=0.599781;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=0.00955817;OID=.;OPOS=14488160;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:11:11:2:2:9:9:0.818182:4:5:0:2:4:5:0:2
chr5	14498727	.	G	A	222.68	PASS	AF=0.468085;AO=22;DP=47;FAO=22;FDP=47;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=0.000931574;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.7559;QD=18.9511;RBI=0.0141793;REFB=-0.0079191;REVB=0.0141486;RO=24;SAF=11;SAR=11;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0384446;STB=0.510629;STBP=0.911;TYPE=snp;VARB=0.0127178;OID=.;OPOS=14498727;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:24:25:22:22:0.468085:11:11:11:13:11:11:12:13
chr5	14741984	.	T	C	547.46	PASS	AF=0.427536;AO=59;DP=138;FAO=59;FDP=138;FR=.;FRO=79;FSAF=37;FSAR=22;FSRF=42;FSRR=37;FWDB=-0.0138947;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.092;QD=15.8685;RBI=0.0139142;REFB=-0.00184701;REVB=0.000737851;RO=79;SAF=37;SAR=22;SRF=42;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10114;STB=0.556726;STBP=0.278;TYPE=snp;VARB=0.0027847;OID=.;OPOS=14741984;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:138:138:79:79:59:59:0.427536:22:37:42:37:22:37:42:37
chr5	15928163	.	C	T	98.59	PASS	AF=0.5;AO=12;DP=24;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=0.0323887;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.589;QD=16.4313;RBI=0.0339243;REFB=0.00275083;REVB=0.0100912;RO=12;SAF=7;SAR=5;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214087;STB=0.623086;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=5.85343e-05;OID=.;OPOS=15928163;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:24:24:12:12:12:12:0.5:5:7:4:8:5:7:4:8
chr5	16673975	.	C	G	258.66	PASS	AF=1;AO=20;DP=21;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.020573;FXX=0.0475964;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.887;QD=51.7314;RBI=0.0232135;REFB=0;REVB=0.0107524;RO=1;SAF=11;SAR=9;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0400637;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000795086;OID=.;OPOS=16673975;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:20:1:0:20:20:1:9:11:1:0:9:11:0:0
chr5	16766269	.	T	C	230.78	PASS	AF=0.368421;AO=28;DP=75;FAO=28;FDP=76;FR=.;FRO=48;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=26;FSRR=22;FWDB=0.000118655;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.34;QD=12.1464;RBI=0.0180278;REFB=-0.000797933;REVB=-0.0180275;RO=47;SAF=10;SAR=18;SRF=26;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.215747;STB=0.618235;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.00113081;OID=.;OPOS=16766269;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:76:47:48:28:28:0.368421:18:10:26:21:18:10:26:22
chr5	16794916	.	G	A	91.78	PASS	AF=0.833333;AO=10;DP=12;FAO=10;FDP=12;FR=.;FRO=2;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0778657;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.8696;QD=30.5927;RBI=0.0995362;REFB=0.0251314;REVB=0.0620031;RO=2;SAF=4;SAR=6;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0305955;STB=0.517207;STBP=0.881;TYPE=snp;VARB=-0.000226983;OID=.;OPOS=16794916;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:12:12:2:2:10:10:0.833333:6:4:1:1:6:4:1:1
chr5	17240819	.	A	G	331.58	PASS	AF=0.548387;AO=34;DP=62;FAO=34;FDP=62;FR=.;FRO=28;FSAF=25;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.0709879;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.6264;QD=21.3922;RBI=0.0711085;REFB=-0.00404386;REVB=0.00413849;RO=28;SAF=25;SAR=9;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1876;STB=0.60433;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.00521877;OID=.;OPOS=17240819;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:28:28:34:34:0.548387:9:25:15:13:9:25:15:13
chr5	17345804	.	C	A	221.62	PASS	AF=0.369863;AO=27;DP=74;FAO=27;FDP=73;FR=.;FRO=46;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=32;FWDB=0.00424908;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.653;QD=12.1438;RBI=0.00660919;REFB=-0.00545885;REVB=0.00506229;RO=44;SAF=10;SAR=17;SRF=14;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.061621;STB=0.545624;STBP=0.602;TYPE=snp;VARB=0.00995003;OID=.;OPOS=17345804;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:73:44:46:27:27:0.369863:17:10:14:30:17:10:14:32
chr5	19721490	.	T	C	2089.41	PASS	AF=0.960526;AO=141;DP=150;FAO=146;FDP=152;FR=.;FRO=6;FSAF=52;FSAR=94;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.00435591;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.8567;QD=54.9845;RBI=0.00918963;REFB=-0.0406163;REVB=-0.00809168;RO=6;SAF=48;SAR=93;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000612171;STB=0.500983;STBP=0.959;TYPE=snp;VARB=0.0159336;OID=.;OPOS=19721490;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:150:152:6:6:141:146:0.960526:93:48:2:4:94:52:2:4
chr5	24910721	.	C	G	613.25	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0420637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.5289;QD=61.3245;RBI=0.0512511;REFB=0;REVB=-0.0292799;RO=0;SAF=25;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000145464;OID=.;OPOS=24910721;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:15:25:0:0:15:25:0:0
chr5	26198575	.	G	T	1840.84	PASS	AF=1;AO=120;DP=120;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0155055;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.503;QD=61.3612;RBI=0.0162744;REFB=0;REVB=-0.0049431;RO=0;SAF=59;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.24253e-05;OID=.;OPOS=26198575;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:120:120:0:0:120:120:1:61:59:0:0:61:59:0:0
chr5	26198591	.	C	T	1877.06	PASS	AF=1;AO=121;DP=122;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0183881;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.699;QD=61.5429;RBI=0.0188198;REFB=0;REVB=-0.00400756;RO=0;SAF=57;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.75944e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.8169e-05;OID=.;OPOS=26198591;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:122:122:0:0:121:122:1:64:57:0:0:64:58:0:0
chr5	26903557	.	G	A	444.96	PASS	AF=0.478261;AO=44;DP=89;FAO=44;FDP=92;FR=.;FRO=48;FSAF=30;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=30;FWDB=0.00629372;FXX=0.0315756;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.456;QD=19.346;RBI=0.0938369;REFB=-0.000238107;REVB=-0.0936256;RO=36;SAF=30;SAR=14;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159763;STB=0.662576;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.000111461;OID=.;OPOS=26903557;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:92:36:48:44:44:0.478261:14:30:18:18:14:30:18:30
chr5	31302288	.	C	T	370.15	PASS	AF=0.453488;AO=39;DP=86;FAO=39;FDP=86;FR=.;FRO=47;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=28;FSRR=19;FWDB=0.0227105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.67;QD=17.2162;RBI=0.0336081;REFB=-0.0170982;REVB=-0.0247738;RO=47;SAF=22;SAR=17;SRF=28;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.03153;STB=0.517652;STBP=0.791;TYPE=snp;VARB=0.0242105;OID=.;OPOS=31302288;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:47:47:39:39:0.453488:17:22:28:19:17:22:28:19
chr5	31317494	.	C	T	437.76	PASS	AF=0.530864;AO=43;DP=81;FAO=43;FDP=81;FR=.;FRO=38;FSAF=29;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=25;FWDB=-0.0798738;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.0009;QD=21.6177;RBI=0.0854659;REFB=0.0236336;REVB=0.0304071;RO=37;SAF=29;SAR=14;SRF=12;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.295857;STB=0.657866;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=-0.0251629;OID=.;OPOS=31317494;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:37:38:43:43:0.530864:14:29:12:25:14:29:13:25
chr5	31317529	.	A	G	454.92	PASS	AF=0.505618;AO=44;DP=88;FAO=45;FDP=89;FR=.;FRO=44;FSAF=28;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=29;FWDB=0.00860398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.79;QD=20.446;RBI=0.0212403;REFB=0.000460213;REVB=0.0194196;RO=43;SAF=28;SAR=16;SRF=15;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.255734;STB=0.637879;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=-0.000203869;OID=.;OPOS=31317529;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:89:43:44:44:45:0.505618:16:28:15:28:17:28:15:29
chr5	31317887	.	A	G	136.14	PASS	AF=0.326923;AO=17;DP=52;FAO=17;FDP=52;FR=.;FRO=35;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=22;FSRR=13;FWDB=0.0146777;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.046;QD=10.4722;RBI=0.0175719;REFB=-0.0121335;REVB=-0.00966112;RO=35;SAF=6;SAR=11;SRF=22;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.307271;STB=0.681208;STBP=0.081;TYPE=snp;VARB=0.0167126;OID=.;OPOS=31317887;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:35:35:17:17:0.326923:11:6:22:13:11:6:22:13
chr5	31317952	.	T	C	457.05	PASS	AF=0.556962;AO=44;DP=79;FAO=44;FDP=79;FR=.;FRO=35;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=-0.0165508;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.808;QD=23.1418;RBI=0.0315566;REFB=-0.00106764;REVB=0.0268681;RO=35;SAF=25;SAR=19;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0669811;STB=0.536837;STBP=0.473;TYPE=snp;VARB=0.00109282;OID=.;OPOS=31317952;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:35:35:44:44:0.556962:19:25:17:18:19:25:17:18
chr5	31409252	.	A	G	228.13	PASS	AF=0.52381;AO=22;DP=42;FAO=22;FDP=42;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.0201473;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.675;QD=21.7268;RBI=0.0231104;REFB=-0.0047642;REVB=-0.0113214;RO=20;SAF=9;SAR=13;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0783987;STB=0.544012;STBP=0.602;TYPE=snp;VARB=0.00490398;OID=.;OPOS=31409252;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:20:20:22:22:0.52381:13:9:10:10:13:9:10:10
chr5	31423007	.	T	C	1711.86	PASS	AF=1;AO=112;DP=113;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00246065;FXX=0.00877116;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.328;QD=60.5968;RBI=0.0101299;REFB=0;REVB=0.00982653;RO=0;SAF=47;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.8673e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.35631e-06;OID=.;OPOS=31423007;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:113:113:0:0:112:113:1:65:47:0:0:65:48:0:0
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chr5	32087802	.	A	G	36.97	PASS	AF=0.26087;AO=7;DP=22;FAO=6;FDP=23;FR=.;FRO=17;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.00417901;FXX=0.0416493;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.62;QD=6.4292;RBI=0.00630397;REFB=-0.00357343;REVB=-0.00471974;RO=13;SAF=4;SAR=3;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194284;STB=0.521667;STBP=0.931;TYPE=snp;VARB=0.00376304;OID=.;OPOS=32087802;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:22:23:13:17:7:6:0.26087:3:4:5:8:3:3:8:9
chr5	32403346	.	C	T	2058.85	PASS	AF=1;AO=131;DP=131;FAO=132;FDP=132;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.067954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.3831;QD=62.3893;RBI=0.0715763;REFB=0;REVB=-0.0224814;RO=0;SAF=59;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.95289e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000351761;OID=.;OPOS=32403346;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:131:132:0:0:131:132:1:72:59:0:0:72:60:0:0
chr5	32594752	.	C	T	178.77	PASS	AF=0.5625;AO=17;DP=32;FAO=18;FDP=32;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=-0.050297;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=102.731;QD=22.3464;RBI=0.0569771;REFB=-0.0367646;REVB=-0.0267693;RO=14;SAF=5;SAR=12;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0801704;STB=0.560911;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.0179872;OID=.;OPOS=32594752;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:14:14:17:18:0.5625:12:5:3:11:12:6:3:11
chr5	32789852	.	T	C	483.35	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.049795;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.562;QD=58.5875;RBI=0.0531622;REFB=0;REVB=0.0186193;RO=0;SAF=17;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.60901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000371983;OID=.;OPOS=32789852;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:16:17:0:0:16:17:0:0
chr5	32790616	.	T	C	1549.26	PASS	AF=1;AO=97;DP=97;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00240577;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.579;QD=63.8872;RBI=0.00328534;REFB=0;REVB=-0.00223735;RO=0;SAF=45;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46922e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.43408e-06;OID=.;OPOS=32790616;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:97:97:0:0:97:97:1:52:45:0:0:52:45:0:0
chr5	33278049	.	T	C	766.43	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00574539;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.085;QD=63.8692;RBI=0.0159291;REFB=0;REVB=0.0148569;RO=0;SAF=31;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00010375;OID=.;OPOS=33278049;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:17:31:0:0:17:31:0:0
chr5	33534977	.	A	AT	45.65	PASS	AF=0.3;AO=14;DP=41;FAO=12;FDP=40;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=1;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=0.0293727;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=14.0483;QD=4.56462;RBI=0.0741285;REFB=-0.0741324;REVB=-0.0680608;RO=27;SAF=12;SAR=2;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.483313;STB=0.879271;STBP=0.006;TYPE=ins;VARB=0.103842;OID=.;OPOS=33534978;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.3:14:41:12:40:28:11:1:13:15:45:27:12:2:13:14
chr5	33535060	.	G	A	107.26	PASS	AF=0.631579;AO=12;DP=18;FAO=12;FDP=19;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.0368141;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.6577;QD=22.5813;RBI=0.056909;REFB=-0.0289764;REVB=-0.0433977;RO=6;SAF=2;SAR=10;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.274816;STB=0.697296;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.00819237;OID=.;OPOS=33535060;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:18:19:6:7:12:12:0.631579:10:2:3:3:10:2:4:3
chr5	33751454	.	A	T	155.1	PASS	AF=0.425;AO=17;DP=40;FAO=17;FDP=40;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=5;FWDB=-0.000468749;FXX=0.0243843;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.08;QD=15.5103;RBI=0.0123856;REFB=-0.00415761;REVB=-0.0123767;RO=23;SAF=11;SAR=6;SRF=18;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157452;STB=0.589733;STBP=0.394;TYPE=snp;VARB=0.0096971;OID=.;OPOS=33751454;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:23:23:17:17:0.425:6:11:18:5:6:11:18:5
chr5	33938447	.	G	A	613.36	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00391354;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=191.027;QD=61.3364;RBI=0.0678323;REFB=0;REVB=0.0677193;RO=0;SAF=26;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00021934;OID=.;OPOS=33938447;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:14:26:0:0:14:26:0:0
chr5	33954511	.	T	C	1190.45	PASS	AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0177304;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.738;QD=61.0489;RBI=0.0467669;REFB=0;REVB=0.0432755;RO=0;SAF=45;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.72131e-05;OID=.;OPOS=33954511;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:33:45:0:0:33:45:0:0
chr5	33989503	.	C	G	333.35	PASS	AF=0.557377;AO=34;DP=61;FAO=34;FDP=61;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=0.0206745;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.3056;QD=21.8593;RBI=0.0386084;REFB=-0.00463794;REVB=0.0326063;RO=27;SAF=15;SAR=19;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0917819;STB=0.550695;STBP=0.397;TYPE=snp;VARB=0.00583375;OID=.;OPOS=33989503;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:27:27:34:34:0.557377:19:15:15:12:19:15:15:12
chr5	33989518	.	C	T	845.08	PASS	AF=1;AO=55;DP=56;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0594412;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.088;QD=57.2936;RBI=0.0679083;REFB=0;REVB=0.0328372;RO=0;SAF=29;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.40922e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00029846;OID=.;OPOS=33989518;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:56:59:0:0:55:59:1:26:29:0:0:26:33:0:0
chr5	33998883	.	A	G	1125.25	PASS	AF=0.950617;AO=75;DP=80;FAO=77;FDP=81;FR=.;FRO=4;FSAF=35;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0612702;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.569;QD=55.5679;RBI=0.0617081;REFB=-0.00973266;REVB=-0.00733857;RO=4;SAF=34;SAR=41;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0439506;STB=0.522721;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=0.000593307;OID=.;OPOS=33998883;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:80:81:4:4:75:77:0.950617:41:34:0:4:42:35:0:4
chr5	34020277	.	C	T	538.55	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0262416;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.672;QD=59.8391;RBI=0.0273066;REFB=0;REVB=0.00755163;RO=0;SAF=16;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.9376e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000162086;OID=.;OPOS=34020277;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:20:16:0:0:20:16:0:0
chr5	34038537	.	A	G	804.94	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0166968;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.747;QD=64.395;RBI=0.0279802;REFB=0;REVB=-0.0224523;RO=0;SAF=31;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000123619;OID=.;OPOS=34038537;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:19:31:0:0:19:31:0:0
chr5	34802384	.	A	G	885.41	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0322682;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.554;QD=58.06;RBI=0.0327765;REFB=0;REVB=-0.00574998;RO=0;SAF=26;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.18755e-05;OID=.;OPOS=34802384;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:35:26:0:0:35:26:0:0
chr5	34807928	.	C	T	1153.77	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0115633;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.4;QD=60.7247;RBI=0.0120186;REFB=0;REVB=-0.00327662;RO=0;SAF=39;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6999e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.22691e-05;OID=.;OPOS=34807928;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:76:0:0:75:76:1:36:39:0:0:37:39:0:0
chr5	34811137	.	T	G	616.78	PASS	AF=1;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0151255;FXX=0.0243843;HRUN=2;LEN=1;MLLD=313.332;QD=61.678;RBI=0.0332533;REFB=0;REVB=0.0296143;RO=0;SAF=24;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.99872e-05;OID=.;OPOS=34811137;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:40:0:0:40:40:1:16:24:0:0:16:24:0:0
chr5	34824555	.	G	T	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0125401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.311;QD=33.4285;RBI=0.0129204;REFB=0;REVB=-0.00311176;RO=0;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000578075;OID=.;OPOS=34824555;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:2:4:0:0:2:4:0:0
chr5	34840841	.	A	G	66.83	PASS	AF=0.428571;AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.0176194;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.384;QD=12.73;RBI=0.0183171;REFB=-0.00882577;REVB=0.0050071;RO=12;SAF=3;SAR=6;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.243311;STB=0.644834;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=0.0117144;OID=.;OPOS=34840841;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:21:21:12:12:9:9:0.428571:6:3:7:5:6:3:7:5
chr5	34862125	.	C	T	1511.13	PASS	AF=1;AO=100;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.02048;FXX=0.00980296;HRUN=2;LEN=1;MLLD=274.849;QD=59.8467;RBI=0.0206738;REFB=0;REVB=0.00282398;RO=0;SAF=50;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.79251e-06;OID=.;OPOS=34862125;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:101:101:0:0:100:101:1:50:50:0:0:51:50:0:0
chr5	34998877	.	C	A	365.81	PASS	AF=0.487179;AO=38;DP=78;FAO=38;FDP=78;FR=.;FRO=40;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=24;FWDB=-0.0158995;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.257;QD=18.7595;RBI=0.0219071;REFB=-0.00452296;REVB=-0.0150708;RO=40;SAF=24;SAR=14;SRF=16;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214417;STB=0.619502;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.00395319;OID=.;OPOS=34998877;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:40:40:38:38:0.487179:14:24:16:24:14:24:16:24
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chr5	35643615	.	G	A	172.12	PASS	AF=0.473684;AO=18;DP=38;FAO=18;FDP=38;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=4;FSRR=16;FWDB=0.0264219;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=175.761;QD=18.1178;RBI=0.027714;REFB=0.00465671;REVB=-0.00836336;RO=20;SAF=5;SAR=13;SRF=4;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0944152;STB=0.553379;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=-0.00610217;OID=.;OPOS=35643615;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:20:20:18:18:0.473684:13:5:4:16:13:5:4:16
chr5	35644621	.	T	C	786.63	PASS	AF=0.982456;AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0436003;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.8141;QD=55.2018;RBI=0.0512581;REFB=0.04692;REVB=0.0269518;RO=0;SAF=33;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.510634;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=-0.00113649;OID=.;OPOS=35644621;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:57:57:0:1:56:56:0.982456:23:33:0:0:23:33:0:1
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chr5	35670303	.	G	A	64.87	PASS	AF=0.36;AO=9;DP=25;FAO=9;FDP=25;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=-0.0031879;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.134;QD=10.3792;RBI=0.0065623;REFB=0.0100754;REVB=-0.00573594;RO=16;SAF=4;SAR=5;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.189101;STB=0.613789;STBP=0.376;TYPE=snp;VARB=-0.00920059;OID=.;OPOS=35670303;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:25:25:16:16:9:9:0.36:5:4:10:6:5:4:10:6
chr5	35692775	.	T	A	694.72	PASS	AF=0.489655;AO=65;DP=138;FAO=71;FDP=145;FR=.;FRO=74;FSAF=30;FSAR=41;FSRF=40;FSRR=34;FWDB=0.0482864;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.588;QD=19.1647;RBI=0.0483077;REFB=-0.00442558;REVB=0.00143429;RO=73;SAF=28;SAR=37;SRF=40;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111984;STB=0.56053;STBP=0.173;TYPE=snp;VARB=0.00465745;OID=.;OPOS=35692775;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:138:145:73:74:65:71:0.489655:37:28:40:33:41:30:40:34
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chr5	35788565	.	A	G	108.61	PASS	AF=0.40625;AO=12;DP=32;FAO=13;FDP=32;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=-0.00926466;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.48;QD=13.5765;RBI=0.013659;REFB=-0.00458246;REVB=0.0100366;RO=19;SAF=5;SAR=7;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0520805;STB=0.556013;STBP=0.612;TYPE=snp;VARB=0.0101051;OID=.;OPOS=35788565;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:19:19:12:13:0.40625:7:5:7:12:7:6:7:12
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chr5	36269551	.	G	C	549.65	PASS	AF=0.554348;AO=51;DP=92;FAO=51;FDP=92;FR=.;FRO=41;FSAF=34;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=0.00181477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.313;QD=23.8978;RBI=0.00734746;REFB=-0.00587647;REVB=-0.00711982;RO=40;SAF=34;SAR=17;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162109;STB=0.595381;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.0034219;OID=.;OPOS=36269551;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:40:41:51:51:0.554348:17:34:19:21:17:34:19:22
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chr5	37294473	.	T	C	481.09	PASS	AF=0.4;AO=54;DP=136;FAO=54;FDP=135;FR=.;FRO=81;FSAF=30;FSAR=24;FSRF=44;FSRR=37;FWDB=0.00710583;FXX=0.0073524;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.795;QD=14.2545;RBI=0.0223335;REFB=-0.00629737;REVB=0.0211729;RO=80;SAF=30;SAR=24;SRF=43;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0193021;STB=0.507485;STBP=0.884;TYPE=snp;VARB=0.00990258;OID=.;OPOS=37294473;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:136:135:80:81:54:54:0.4:24:30:43:37:24:30:44:37
chr5	37309371	.	TAGAA	TA,TAGAG	174.22	PASS	AF=0.5,0.0294118;AO=15,3;DP=35;FAO=17,1;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=6,1;FSAR=11,0;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=0.0360748,0.0424721;FXX=0.0285633;HRUN=1,2;LEN=3,1;MLLD=233.473,36.9859;QD=20.4964;RBI=0.0371162,0.0881838;REFB=-0.0261798,0.00655717;REVB=0.00873039,-0.077282;RO=15;SAF=4,3;SAR=11,0;SRF=6;SRR=9;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.137254,0.656613;STB=0.511614,0.991868;STBP=0.932,0.249;TYPE=del,snp;VARB=0.0270799,-0.0456177;OID=.,.;OPOS=37309372,37309375;OREF=AGA,A;OALT=-,G;OMAPALT=TA,TAGAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.5,0.0294118:15,3:35:17,1:34:16:6,1:11,0:6:10:99:15:4,3:11,0:6:9
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chr5	38941426	.	TGT	TG,TGTT,TT,TTT	138.54	PASS	AF=0,0.0425532,0.319149,0;AO=6,8,12,3;DP=49;FAO=0,2,15,0;FDP=47;FR=.;FRO=30;FSAF=0,0,8,0;FSAR=0,2,7,0;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=-0.0538349,0.0597989,-0.00544597,-0.00502782;FXX=0.040808;HRUN=8,8,1,1;LEN=1,1,1,1;MLLD=6.65249,6.14442,190.851,193.568;QD=11.7908;RBI=0.144797,0.15222,0.0314309,0.0375219;REFB=0.070006,-0.0805675,0.000477336,-0.000317773;REVB=0.134417,-0.139982,-0.0309555,-0.0371835;RO=18;SAF=5,2,6,2;SAR=1,6,6,1;SRF=7;SRR=11;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=0.508956,-0.180179,0.113436,0.296195;STB=0.5,0.994427,0.54432,0.5;STBP=1,0.179,0.697,1;TYPE=del,ins,del,snp;VARB=0.106759,0.0905897,-0.00736522,-0.0218634;OID=.,.,.,.;OPOS=38941428,38941428,38941427,38941427;OREF=T,-,G,G;OALT=-,T,-,T;OMAPALT=TG,TGTT,TT,TTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/3:0,0.0425532,0.319149,0:6,8,12,3:49:0,2,15,0:47:30:0,0,8,0:0,2,7,0:14:16:99:18:5,2,6,2:1,6,6,1:7:11
chr5	38942090	.	T	C	1072.2	PASS	AF=0.973333;AO=73;DP=75;FAO=73;FDP=75;FR=.;FRO=2;FSAF=40;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00308295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.602;QD=57.1842;RBI=0.0340126;REFB=0.0565874;REVB=0.0338726;RO=2;SAF=40;SAR=33;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0278028;STB=0.514702;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=-0.000162388;OID=.;OPOS=38942090;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:75:75:2:2:73:73:0.973333:33:40:0:2:33:40:0:2
chr5	38950776	.	G	A	955.07	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0249586;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.019;QD=58.7735;RBI=0.0249885;REFB=0;REVB=-0.00122221;RO=0;SAF=34;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.90682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.17704e-05;OID=.;OPOS=38950776;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:31:34:0:0:31:34:0:0
chr5	38955796	.	G	A	483.31	PASS	AF=0.49505;AO=49;DP=101;FAO=50;FDP=101;FR=.;FRO=51;FSAF=16;FSAR=34;FSRF=20;FSRR=31;FWDB=0.0357636;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2666;QD=19.1411;RBI=0.0358031;REFB=0.0274688;REVB=-0.00168151;RO=52;SAF=16;SAR=33;SRF=20;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0597173;STB=0.540619;STBP=0.448;TYPE=snp;VARB=-0.0285194;OID=.;OPOS=38955796;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:101:52:51:49:50:0.49505:33:16:20:32:34:16:20:31
chr5	39107100	.	A	G	299.83	PASS	AF=0.395349;AO=34;DP=86;FAO=34;FDP=86;FR=.;FRO=52;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=29;FSRR=23;FWDB=0.0206264;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.617;QD=13.9455;RBI=0.0207515;REFB=0.00354928;REVB=-0.00227592;RO=52;SAF=18;SAR=16;SRF=29;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.030209;STB=0.517184;STBP=0.819;TYPE=snp;VARB=-0.00536157;OID=.;OPOS=39107100;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:52:52:34:34:0.395349:16:18:29:23:16:18:29:23
chr5	39108309	.	A	G	1028.35	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0127406;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.213;QD=58.7626;RBI=0.0351234;REFB=0;REVB=0.0327312;RO=0;SAF=30;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000574555;OID=.;OPOS=39108309;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:66:70:0:0:66:70:1:36:30:0:0:38:32:0:0
chr5	39108322	.	A	G	1048.69	PASS	AF=1;AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00235798;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.484;QD=59.9253;RBI=0.00912993;REFB=0;REVB=0.00882018;RO=0;SAF=32;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.69387e-05;OID=.;OPOS=39108322;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:70:0:0:70:70:1:38:32:0:0:38:32:0:0
chr5	39119723	.	C	A	458.11	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.019327;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=288.453;QD=57.2633;RBI=0.0193645;REFB=0;REVB=0.00120368;RO=0;SAF=15;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00108364;OID=.;OPOS=39119723;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:32:0:0:31:32:1:16:15:0:0:17:15:0:0
chr5	39376972	.	G	T	492.46	PASS	AF=0.5;AO=51;DP=102;FAO=51;FDP=102;FR=.;FRO=51;FSAF=32;FSAR=19;FSRF=26;FSRR=25;FWDB=0.000125767;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.921;QD=19.3122;RBI=0.00349527;REFB=-0.0183879;REVB=0.00349301;RO=51;SAF=32;SAR=19;SRF=26;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109968;STB=0.560932;STBP=0.243;TYPE=snp;VARB=0.0156714;OID=.;OPOS=39376972;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:51:51:51:51:0.5:19:32:26:25:19:32:26:25
chr5	40852451	.	C	G	1190.29	PASS	AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00147656;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.1673;QD=61.0405;RBI=0.0371675;REFB=0;REVB=-0.0371382;RO=0;SAF=32;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5329e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000319891;OID=.;OPOS=40852451;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:46:32:0:0:46:32:0:0
chr5	40955561	.	G	C	1610.03	PASS	AF=1;AO=107;DP=108;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0265758;FXX=0.0092584;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.662;QD=60.1881;RBI=0.0276657;REFB=0;REVB=-0.00768907;RO=0;SAF=54;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.66183e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000280245;OID=.;OPOS=40955561;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:108:107:0:0:107:107:1:53:54:0:0:53:54:0:0
chr5	40955653	.	A	C	156.26	PASS	AF=0.425;AO=17;DP=40;FAO=17;FDP=40;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=17;FSRR=6;FWDB=-0.00661586;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=291.308;QD=15.6261;RBI=0.0102781;REFB=0.00555028;REVB=0.00786571;RO=23;SAF=11;SAR=6;SRF=17;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104704;STB=0.559933;STBP=0.61;TYPE=snp;VARB=-0.00743792;OID=.;OPOS=40955653;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:23:23:17:17:0.425:6:11:17:6:6:11:17:6
chr5	40972111	.	C	T	4092.09	PASS	AF=1;AO=262;DP=262;FAO=262;FDP=262;FR=.;FRO=0;FSAF=125;FSAR=137;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148614;FXX=0.00757547;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.753;QD=62.4747;RBI=0.0154674;REFB=0;REVB=-0.00428737;RO=0;SAF=125;SAR=137;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.95666e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000121941;OID=.;OPOS=40972111;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:22:262:262:0:0:262:262:1:137:125:0:0:137:125:0:0
chr5	40998196	.	T	C	111.35	PASS	AF=0.433333;AO=13;DP=31;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.00817064;FXX=0.0322477;HRUN=3;LEN=1;MLLD=180.138;QD=14.8467;RBI=0.00927866;REFB=-0.0138736;REVB=-0.00439705;RO=17;SAF=4;SAR=9;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.226252;STB=0.632221;STBP=0.233;TYPE=snp;VARB=0.0334851;OID=.;OPOS=40998196;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:30:17:17:13:13:0.433333:9:4:9:8:9:4:9:8
chr5	40998235	.	C	T	96.55	PASS	AF=0.352941;AO=12;DP=35;FAO=12;FDP=34;FR=.;FRO=22;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=0.0301735;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.925;QD=11.3588;RBI=0.0321856;REFB=-0.0161652;REVB=0.0112016;RO=22;SAF=2;SAR=10;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.457925;STB=0.777269;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.0267356;OID=.;OPOS=40998235;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:35:34:22:22:12:12:0.352941:10:2:12:10:10:2:12:10
chr5	41000343	.	G	A	322.7	PASS	AF=0.5;AO=34;DP=68;FAO=34;FDP=68;FR=.;FRO=34;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=-0.00418088;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.623;QD=18.9825;RBI=0.011022;REFB=-0.0148286;REVB=-0.0101983;RO=34;SAF=14;SAR=20;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158329;STB=0.588183;STBP=0.17;TYPE=snp;VARB=0.00731665;OID=.;OPOS=41000343;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:34:34:34:34:0.5:20:14:20:14:20:14:20:14
chr5	41008780	.	A	G	1170.11	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00705091;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=290.803;QD=60.785;RBI=0.0199811;REFB=0;REVB=0.0186957;RO=0;SAF=35;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.5851e-05;OID=.;OPOS=41008780;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:77:0:0:76:77:1:41:35:0:0:42:35:0:0
chr5	41018452	.	A	T	332.71	PASS	AF=0.444444;AO=35;DP=80;FAO=36;FDP=81;FR=.;FRO=45;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=18;FSRR=27;FWDB=-0.00361745;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.426;QD=16.43;RBI=0.00481275;REFB=-0.00683942;REVB=0.00317437;RO=42;SAF=17;SAR=18;SRF=18;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0556858;STB=0.540406;STBP=0.545;TYPE=snp;VARB=0.0057905;OID=.;OPOS=41018452;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:81:42:45:35:36:0.444444:18:17:18:24:19:17:18:27
chr5	41042284	.	G	T	192.89	PASS	AF=0.410714;AO=23;DP=56;FAO=23;FDP=56;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=29;FSRR=4;FWDB=-0.038193;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.1404;QD=13.7775;RBI=0.0439434;REFB=-0.0218476;REVB=-0.0217329;RO=33;SAF=16;SAR=7;SRF=29;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.252658;STB=0.641446;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=0.0303057;OID=.;OPOS=41042284;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:33:33:23:23:0.410714:7:16:29:4:7:16:29:4
chr5	41049389	.	T	C	519.68	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.029124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.0191;QD=59.3917;RBI=0.0391772;REFB=0;REVB=-0.0262039;RO=0;SAF=11;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.41433e-05;OID=.;OPOS=41049389;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:24:11:0:0:24:11:0:0
chr5	41049397	.	C	T	557.13	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0370081;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.998;QD=60.2302;RBI=0.0375061;REFB=0;REVB=0.00609204;RO=0;SAF=15;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.82408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000221617;OID=.;OPOS=41049397;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:22:15:0:0:22:15:0:0
chr5	41061715	.	CA	CG,TG	1160.94	PASS	AF=0.506329,0.493671;AO=40,39;DP=80;FAO=40,39;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=28,25;FSAR=12,14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00955646,0.00226179;FXX=0.0124984;HRUN=1,2;LEN=1,2;MLLD=78.6767,205.55;QD=58.7818;RBI=0.0380746,0.0165634;REFB=0,0;REVB=-0.0368558,-0.0164082;RO=0;SAF=28,25;SAR=12,14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=-0.00545895,-0.0123481;OID=.,.;OPOS=41061716,41061715;OREF=A,CA;OALT=G,TG;OMAPALT=CG,TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:80:79:0:0:40,39:40,39:0.506329,0.493671:12,14:28,25:0:0:12,14:28,25:0:0
chr5	41061829	.	G	A	372.96	PASS	AF=0.520548;AO=38;DP=73;FAO=38;FDP=73;FR=.;FRO=35;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=0.00235835;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.475;QD=20.4364;RBI=0.0114679;REFB=-0.0211966;REVB=0.0112228;RO=35;SAF=20;SAR=18;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0843996;STB=0.546738;STBP=0.423;TYPE=snp;VARB=0.0115138;OID=.;OPOS=41061829;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:35:35:38:38:0.520548:18:20:15:20:18:20:15:20
chr5	41069852	.	T	C	151.53	PASS	AF=0.361702;AO=17;DP=47;FAO=17;FDP=47;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.0127491;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.444;QD=12.8961;RBI=0.0198063;REFB=-0.0081661;REVB=0.0151575;RO=30;SAF=8;SAR=9;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104339;STB=0.561026;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.0170397;OID=.;OPOS=41069852;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:30:30:17:17:0.361702:9:8:17:13:9:8:17:13
chr5	41142932	.	C	T	568.34	PASS	AF=0.621951;AO=50;DP=82;FAO=51;FDP=82;FR=.;FRO=31;FSAF=30;FSAR=21;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=-0.00591433;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.5118;QD=27.7237;RBI=0.0362206;REFB=0.0225377;REVB=-0.0357345;RO=31;SAF=30;SAR=20;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128372;STB=0.564374;STBP=0.127;TYPE=snp;VARB=-0.0169524;OID=.;OPOS=41142932;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:31:31:50:51:0.621951:20:30:13:18:21:30:13:18
chr5	41158863	.	G	A	1518.9	PASS	AF=1;AO=95;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0198985;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.195;QD=63.2876;RBI=0.0199202;REFB=0;REVB=-0.000928411;RO=0;SAF=51;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000198526;OID=.;OPOS=41158863;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:96:96:0:0:95:96:1:44:51:0:0:45:51:0:0
chr5	41159192	.	C	T	307.38	PASS	AF=0.425;AO=34;DP=81;FAO=34;FDP=80;FR=.;FRO=46;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=36;FSRR=10;FWDB=-0.0241181;FXX=0.0123442;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.339;QD=15.369;RBI=0.0254404;REFB=-0.0106572;REVB=-0.00809509;RO=46;SAF=18;SAR=16;SRF=36;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.266129;STB=0.64857;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=0.0170641;OID=.;OPOS=41159192;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:80:46:46:34:34:0.425:16:18:36:10:16:18:36:10
chr5	41159339	.	C	G	61.86	PASS	AF=0.25;AO=9;DP=37;FAO=9;FDP=36;FR=.;FRO=27;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.0757522;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.4471;QD=6.87381;RBI=0.076407;REFB=-0.0276139;REVB=-0.00998208;RO=27;SAF=5;SAR=4;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130762;STB=0.58264;STBP=0.606;TYPE=snp;VARB=0.0788976;OID=.;OPOS=41159339;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:37:36:27:27:9:9:0.25:4:5:12:15:4:5:12:15
chr5	41159345	.	G	A	42.83	PASS	AF=0.212121;AO=7;DP=33;FAO=7;FDP=33;FR=.;FRO=26;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.0475591;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.948;QD=5.19185;RBI=0.048279;REFB=0.00180285;REVB=0.00830622;RO=25;SAF=3;SAR=4;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0613722;STB=0.55636;STBP=0.786;TYPE=snp;VARB=-0.00546514;OID=.;OPOS=41159345;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:42:33:33:25:26:7:7:0.212121:4:3:12:13:4:3:13:13
chr5	41160311	.	A	G	509.01	PASS	AF=0.504762;AO=53;DP=104;FAO=53;FDP=105;FR=.;FRO=52;FSAF=27;FSAR=26;FSRF=34;FSRR=18;FWDB=0.0352022;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.8921;QD=19.3908;RBI=0.0451831;REFB=-0.0100549;REVB=0.0283251;RO=51;SAF=27;SAR=26;SRF=33;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122803;STB=0.571711;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=0.00841166;OID=.;OPOS=41160311;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:105:51:52:53:53:0.504762:26:27:33:18:26:27:34:18
chr5	41175273	.	T	C	330.69	PASS	AF=0.589286;AO=33;DP=56;FAO=33;FDP=56;FR=.;FRO=23;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=0.0109123;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.885;QD=23.6208;RBI=0.0124643;REFB=-0.0116618;REVB=-0.00602328;RO=22;SAF=19;SAR=14;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0454958;STB=0.513896;STBP=0.819;TYPE=snp;VARB=0.00637976;OID=.;OPOS=41175273;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:22:23:33:33:0.589286:14:19:14:8:14:19:14:9
chr5	41176812	.	A	G	257.76	PASS	AF=0.545455;AO=24;DP=44;FAO=24;FDP=44;FR=.;FRO=20;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=0.0058664;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.817;QD=23.433;RBI=0.00892551;REFB=-0.0263276;REVB=0.00672682;RO=20;SAF=13;SAR=11;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114994;STB=0.564098;STBP=0.374;TYPE=snp;VARB=0.0140202;OID=.;OPOS=41176812;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:20:20:24:24:0.545455:11:13:8:12:11:13:8:12
chr5	41199959	.	G	T	130.03	PASS	AF=0.384615;AO=15;DP=39;FAO=15;FDP=39;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.0182303;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.353;QD=13.3359;RBI=0.0314725;REFB=-0.0102962;REVB=-0.025655;RO=24;SAF=10;SAR=5;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139165;STB=0.581706;STBP=0.46;TYPE=snp;VARB=0.0118702;OID=.;OPOS=41199959;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:24:24:15:15:0.384615:5:10:13:11:5:10:13:11
chr5	41312206	.	TA	AT,TT	177.69	PASS	AF=0.292929,0.030303;AO=20,6;DP=100;FAO=29,3;FDP=99;FR=.;FRO=67;FSAF=2,2;FSAR=27,1;FSRF=40;FSRR=27;FWDB=-0.0267225,-0.00848047;FXX=0.0198;HRUN=12,1;LEN=2,1;MLLD=38.9336,178.604;QD=7.1792;RBI=0.0286539,0.00925573;REFB=-0.0244109,-0.000819406;REVB=0.0103418,0.00370813;RO=58;SAF=2,1;SAR=18,5;SRF=37;SRR=21;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.657001,-0.496021;STB=0.912729,0.570942;STBP=0,0.92;TYPE=mnp,snp;VARB=0.00586309,-0.00704409;OID=.,.;OPOS=41312206,41312207;OREF=TA,A;OALT=AT,T;OMAPALT=AT,TT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:99:58:67:20,6:29,3:0.292929,0.030303:18,5:2,1:37:21:27,1:2,2:40:27
chr5	42700044	.	A	G	702.69	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0479784;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.181;QD=62.4616;RBI=0.0495727;REFB=0;REVB=-0.012471;RO=0;SAF=24;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.30465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000153008;OID=.;OPOS=42700044;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:45:0:0:44:45:1:20:24:0:0:21:24:0:0
chr5	42719092	.	C	A	348.83	PASS	AF=0.514286;AO=36;DP=69;FAO=36;FDP=70;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=25;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=-0.0307704;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.007;QD=19.9329;RBI=0.0341187;REFB=0.000743849;REVB=-0.0147401;RO=33;SAF=11;SAR=25;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.219648;STB=0.630177;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=-0.00111875;OID=.;OPOS=42719092;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:70:33:34:36:36:0.514286:25:11:18:15:25:11:19:15
chr5	42719239	.	A	C	575.63	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00828522;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.477;QD=60.5921;RBI=0.0134581;REFB=0;REVB=0.0106054;RO=0;SAF=21;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.53998e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.89567e-05;OID=.;OPOS=42719239;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:17:21:0:0:17:21:0:0
chr5	42720068	.	T	TA	290.86	PASS	AF=0.931034;AO=27;DP=32;FAO=27;FDP=29;FR=.;FRO=2;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0105504;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=310.928;QD=40.1182;RBI=0.0129613;REFB=-0.0217924;REVB=-0.00752895;RO=5;SAF=11;SAR=16;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125202;STB=0.52939;STBP=0.308;TYPE=ins;VARB=0.000855685;OID=.;OPOS=42720069;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.931034:27:32:27:29:2:11:16:0:2:6:5:11:16:0:5
chr5	43120098	.	A	G	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0374041;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=101.769;QD=48.7364;RBI=0.0423764;REFB=0;REVB=-0.0199173;RO=0;SAF=10;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000244765;OID=.;OPOS=43120098;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:7:10:0:0:7:10:0:0
chr5	43175369	.	G	T	1674.26	PASS	AF=1;AO=109;DP=109;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00685588;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=326.305;QD=60.3338;RBI=0.0112332;REFB=0;REVB=0.00889845;RO=0;SAF=52;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.53715e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.92756e-06;OID=.;OPOS=43175369;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:109:111:0:0:109:111:1:57:52:0:0:58:53:0:0
chr5	43492357	.	C	T	239.57	PASS	AF=0.469388;AO=22;DP=48;FAO=23;FDP=49;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=0.00513725;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.899;QD=19.5563;RBI=0.0124738;REFB=-0.0195177;REVB=0.0113668;RO=26;SAF=13;SAR=9;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0879897;STB=0.558932;STBP=0.42;TYPE=snp;VARB=0.0198639;OID=.;OPOS=43492357;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:49:26:26:22:23:0.469388:9:13:13:13:9:14:13:13
chr5	43492978	.	G	A	323.46	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0089727;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.839;QD=53.9106;RBI=0.00898859;REFB=0;REVB=0.000534297;RO=0;SAF=12;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.8199e-05;OID=.;OPOS=43492978;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:12:12:0:0:12:12:0:0
chr5	43506449	.	T	C	62.69	PASS	AF=0.290323;AO=9;DP=31;FAO=9;FDP=31;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=-0.00912757;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.536;QD=8.08967;RBI=0.010032;REFB=-0.0123288;REVB=-0.00416273;RO=22;SAF=5;SAR=4;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.21707;STB=0.633518;STBP=0.37;TYPE=snp;VARB=0.0303936;OID=.;OPOS=43506449;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:31:31:22:22:9:9:0.290323:4:5:8:14:4:5:8:14
chr5	43509348	.	T	A	1489.77	PASS	AF=1;AO=94;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0154697;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.5124;QD=63.3943;RBI=0.0452525;REFB=0;REVB=0.0425262;RO=0;SAF=38;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000157015;OID=.;OPOS=43509348;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:94:94:0:0:94:94:1:56:38:0:0:56:38:0:0
chr5	43527135	.	A	C	1540.49	PASS	AF=1;AO=103;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0136679;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.532;QD=59.825;RBI=0.0449046;REFB=0;REVB=0.042774;RO=0;SAF=65;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.63167e-05;OID=.;OPOS=43527135;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:103:103:0:0:103:103:1:38:65:0:0:38:65:0:0
chr5	45259363	.	T	C	269.65	PASS	AF=0.631579;AO=24;DP=38;FAO=24;FDP=38;FR=.;FRO=14;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=-0.00481814;FXX=0.0256345;HRUN=6;LEN=1;MLLD=231.209;QD=28.3842;RBI=0.0122027;REFB=-0.0141959;REVB=0.0112112;RO=14;SAF=16;SAR=8;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0362552;STB=0.519984;STBP=0.786;TYPE=snp;VARB=0.00810085;OID=.;OPOS=45259363;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:14:14:24:24:0.631579:8:16:10:4:8:16:10:4
chr5	49698180	.	G	A	602.18	PASS	AF=0.593407;AO=54;DP=91;FAO=54;FDP=91;FR=.;FRO=37;FSAF=26;FSAR=28;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=-0.00436446;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.4812;QD=26.4695;RBI=0.0146758;REFB=-0.00184224;REVB=-0.0140118;RO=37;SAF=26;SAR=28;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00373297;STB=0.502037;STBP=0.957;TYPE=snp;VARB=0.00106951;OID=.;OPOS=49698180;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:37:37:54:54:0.593407:28:26:18:19:28:26:18:19
chr5	50045967	.	G	T	483.64	PASS	AF=0.412371;AO=41;DP=107;FAO=40;FDP=97;FR=.,HEALED;FRO=46;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=21;FSRR=25;FWDB=-0.00967589;FXX=0.0396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.484;QD=19.944;RBI=0.0102802;REFB=-0.0132919;REVB=-0.00347259;RO=47;SAF=21;SAR=20;SRF=26;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0392713;STB=0.549975;STBP=0.412;TYPE=snp;VARB=0.0232712;OID=.;OPOS=50045967;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:97:47:46:41:40:0.412371:20:21:26:21:18:22:21:25
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chr5	50057729	.	G	A,T	388.66	PASS	AF=0.181818,0.727273;AO=6,24;DP=33;FAO=6,24;FDP=33;FR=.;FRO=3;FSAF=2,10;FSAR=4,14;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0223008,-0.0080055;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=143.013,118.921;QD=47.1106;RBI=0.0287803,0.0308111;REFB=-0.123509,-0.0580305;REVB=-0.0181929,0.029753;RO=3;SAF=2,10;SAR=4,14;SRF=0;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.236104,0.0894972;STB=0.635975,0.548348;STBP=0.333,0.193;TYPE=snp,snp;VARB=0.00190532,0.0110748;OID=.,.;OPOS=50057729,50057729;OREF=G,G;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:36:33:33:3:3:6,24:6,24:0.181818,0.727273:4,14:2,10:0:3:4,14:2,10:0:3
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chr5	52193287	.	C	T	137.86	PASS	AF=0.517241;AO=15;DP=29;FAO=15;FDP=29;FR=.;FRO=14;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.00457065;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.2701;QD=19.0156;RBI=0.0501726;REFB=-0.0318306;REVB=-0.0499639;RO=14;SAF=9;SAR=6;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0250535;STB=0.514267;STBP=0.911;TYPE=snp;VARB=0.0214013;OID=.;OPOS=52193287;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:14:14:15:15:0.517241:6:9:8:6:6:9:8:6
chr5	52248291	.	T	C	300.64	PASS	AF=0.553571;AO=30;DP=56;FAO=31;FDP=56;FR=.;FRO=25;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=0.0051661;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.913;QD=21.4743;RBI=0.00634081;REFB=-0.00367462;REVB=0.00367659;RO=25;SAF=15;SAR=15;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0491545;STB=0.533925;STBP=0.616;TYPE=snp;VARB=0.00375465;OID=.;OPOS=52248291;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:25:25:30:31:0.553571:15:15:11:14:15:16:11:14
chr5	52347369	.	C	T	581.09	PASS	AF=1;AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00371124;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.1243;QD=61.1676;RBI=0.0280863;REFB=0;REVB=-0.02784;RO=0;SAF=25;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00119761;OID=.;OPOS=52347369;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:38:0:0:38:38:1:13:25:0:0:13:25:0:0
chr5	52351413	.	G	A	1675.95	PASS	AF=1;AO=106;DP=107;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0369803;FXX=0.0176975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.005;QD=60.3945;RBI=0.0554924;REFB=0;REVB=0.0413747;RO=0;SAF=48;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000112584;OID=.;OPOS=52351413;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:107:111:0:0:106:111:1:58:48:0:0:65:46:0:0
chr5	52379277	.	C	T	1375.57	PASS	AF=1;AO=86;DP=87;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0185235;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.35;QD=62.5261;RBI=0.0185361;REFB=0;REVB=-0.000685419;RO=0;SAF=38;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.05472e-05;OID=.;OPOS=52379277;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:88:0:0:86:88:1:48:38:0:0:49:39:0:0
chr5	52389428	.	A	G	87.32	PASS	AF=0.37931;AO=11;DP=30;FAO=11;FDP=29;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.0320313;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.122;QD=12.0437;RBI=0.0491474;REFB=-0.000525174;REVB=0.0372756;RO=17;SAF=3;SAR=8;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.332324;STB=0.712982;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.000523878;OID=.;OPOS=52389428;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:30:29:17:18:11:11:0.37931:8:3:10:7:8:3:11:7
chr5	52389455	.	A	G	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=4.18595e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.36;QD=56.1911;RBI=0.00244101;REFB=0;REVB=0.00244065;RO=0;SAF=12;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.27448e-06;OID=.;OPOS=52389455;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:16:12:0:0:16:12:0:0
chr5	52389811	.	T	TAAAG	226.7	PASS	AF=1;AO=16;DP=19;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0386382;FXX=0.0526039;HRUN=4;LEN=4;MLLD=219.685;QD=50.3777;RBI=0.0444331;REFB=0;REVB=0.0219408;RO=0;SAF=4;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.07465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-4.84691e-05;OID=.;OPOS=52389812;OREF=-;OALT=AAAG;OMAPALT=TAAAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:16:19:18:18:0:5:13:0:0:4:0:4:12:0:0
chr5	52390026	.	A	AATTATATAAACAACTTTGTAGGACT,T	324.37	PASS	AF=0.652174,0.347826;AO=10,9;DP=43;FAO=15,8;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=9,8;FSAR=6,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0227112,-0.01344;FXX=0.281162;HRUN=2,2;LEN=25,1;MLLD=639.818,248.494;QD=56.412;RBI=0.0232752,0.0152413;REFB=0,0;REVB=0.0050928,0.00718767;RO=22;SAF=5,9;SAR=5,0;SRF=13;SRR=9;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.102445,0.743302;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.00414962,-0.00839843;OID=.,.;OPOS=52390027,52390026;OREF=-,A;OALT=ATTATATAAACAACTTTGTAGGACT,T;OMAPALT=AATTATATAAACAACTTTGTAGGACT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:65:43:23:22:0:10,9:15,8:0.652174,0.347826:5,0:5,9:13:9:6,0:9,8:0:0
chr5	52394018	.	GC	G	38.39	PASS	AF=0.4;AO=6;DP=15;FAO=6;FDP=15;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=0.0138556;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.083;QD=10.2366;RBI=0.0454128;REFB=0.00717544;REVB=-0.0432474;RO=9;SAF=4;SAR=2;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129519;STB=0.578703;STBP=0.743;TYPE=del;VARB=-0.0169854;OID=.;OPOS=52394019;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.4:6:15:6:15:9:4:2:7:2:38:9:4:2:7:2
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chr5	52778877	.	GCC	GC,GCG	260.18	PASS	AF=0.596491,0.0526316;AO=28,3;DP=54;FAO=34,3;FDP=57;FR=.;FRO=20;FSAF=3,0;FSAR=31,3;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=0.0330588,-0.0378201;FXX=0.0172384;HRUN=5,5;LEN=1,1;MLLD=14.4839,199.982;QD=18.2583;RBI=0.0845152,0.0479812;REFB=-0.123057,-0.00883897;REVB=-0.0777814,-0.0295268;RO=17;SAF=2,0;SAR=26,3;SRF=6;SRR=11;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.419589,-0.562485;STB=0.673787,0.995102;STBP=0.027,0.18;TYPE=del,snp;VARB=0.0475736,0.0467876;OID=.,.;OPOS=52778878,52778879;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=GC,GCG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.596491,0.0526316:28,3:54:34,3:57:20:3,0:31,3:6:14:94:17:2,0:26,3:6:11
chr5	52942083	.	A	C	64.05	PASS	AF=0.391304;AO=9;DP=23;FAO=9;FDP=23;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.0204466;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.96;QD=11.1391;RBI=0.0324159;REFB=0.00492213;REVB=0.0251541;RO=14;SAF=5;SAR=4;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0565464;STB=0.533905;STBP=0.802;TYPE=snp;VARB=-0.00924155;OID=.;OPOS=52942083;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:23:23:14:14:9:9:0.391304:4:5:7:7:4:5:7:7
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chr5	53815918	.	A	C	174.0	PASS	AF=0.5;AO=18;DP=36;FAO=18;FDP=36;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.0173281;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=160.893;QD=19.3332;RBI=0.0183441;REFB=-0.00640586;REVB=-0.00602031;RO=18;SAF=9;SAR=9;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.048982;STB=0.527747;STBP=0.758;TYPE=snp;VARB=0.00732947;OID=.;OPOS=53815918;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:18:18:18:18:0.5:9:9:10:8:9:9:10:8
chr5	53816782	.	T	C	242.8	PASS	AF=0.365854;AO=29;DP=77;FAO=30;FDP=82;FR=.;FRO=52;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=33;FWDB=0.016385;FXX=0.0120467;HRUN=6;LEN=1;MLLD=131.332;QD=11.8441;RBI=0.0204686;REFB=-0.000503668;REVB=0.0122676;RO=48;SAF=14;SAR=15;SRF=19;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0950174;STB=0.585311;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=-0.000491877;OID=.;OPOS=53816782;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:82:48:52:29:30:0.365854:15:14:19:29:15:15:19:33
chr5	54252345	.	T	C	557.23	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0374595;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.547;QD=60.2414;RBI=0.0378008;REFB=0;REVB=0.00506818;RO=0;SAF=16;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.9376e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000151703;OID=.;OPOS=54252345;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:37:0:0:36:37:1:20:16:0:0:21:16:0:0
chr5	54253555	.	A	G	727.76	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.020179;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.7938;QD=63.2838;RBI=0.0245985;REFB=0;REVB=0.0140674;RO=0;SAF=20;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.05381e-05;OID=.;OPOS=54253555;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:26:20:0:0:26:20:0:0
chr5	54253581	.	A	G	715.02	PASS	AF=0.978723;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00229211;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.064;QD=60.8525;RBI=0.0200286;REFB=-0.0222237;REVB=0.019897;RO=1;SAF=19;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0240991;STB=0.512815;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.000423674;OID=.;OPOS=54253581;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:47:47:1:1:46:46:0.978723:27:19:1:0:27:19:1:0
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chr5	54403957	.	T	C	459.0	PASS	AF=1;AO=31;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00347479;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.5;QD=57.3746;RBI=0.0784482;REFB=0;REVB=0.0783712;RO=0;SAF=19;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.47712e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00265289;OID=.;OPOS=54403957;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:31:32:1:12:19:0:0:13:19:0:0
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chr5	54410120	.	A	C	670.21	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000744437;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.0442;QD=62.3449;RBI=0.0151387;REFB=0;REVB=-0.0151204;RO=0;SAF=17;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.75441e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000147414;OID=.;OPOS=54410120;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:26:17:0:0:26:17:0:0
chr5	54433393	.	G	A	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0280186;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=273.876;QD=50.4135;RBI=0.0323677;REFB=0;REVB=-0.0162057;RO=0;SAF=7;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.85922e-05;OID=.;OPOS=54433393;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:12:7:0:0:12:7:0:0
chr5	54439466	.	G	A	1085.04	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0202303;FXX=0.0136968;HRUN=3;LEN=1;MLLD=186.611;QD=60.2802;RBI=0.0246525;REFB=0;REVB=0.0140884;RO=0;SAF=37;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.12261e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.55497e-05;OID=.;OPOS=54439466;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:72:0:0:71:72:1:34:37:0:0:35:37:0:0
chr5	54459961	.	A	G	751.26	PASS	AF=1;AO=47;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00243473;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.9823;QD=62.6048;RBI=0.0862028;REFB=0;REVB=-0.0861684;RO=0;SAF=20;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00113303;OID=.;OPOS=54459961;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:47:48:1:27:20:0:0:28:20:0:0
chr5	54468124	.	A	T	420.19	PASS	AF=0.385827;AO=48;DP=126;FAO=49;FDP=127;FR=.;FRO=78;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=39;FSRR=39;FWDB=0.0029254;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.4176;QD=13.2344;RBI=0.00956437;REFB=0.00127457;REVB=-0.009106;RO=78;SAF=26;SAR=22;SRF=39;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0455112;STB=0.518821;STBP=0.745;TYPE=snp;VARB=-0.00164125;OID=.;OPOS=54468124;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:126:127:78:78:48:49:0.385827:22:26:39:39:23:26:39:39
chr5	54516521	.	G	A	704.46	PASS	AF=0.518797;AO=69;DP=133;FAO=69;FDP=133;FR=.;FRO=64;FSAF=34;FSAR=35;FSRF=29;FSRR=35;FWDB=-0.0119848;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.314;QD=21.1869;RBI=0.0290426;REFB=-0.0181391;REVB=0.0264545;RO=63;SAF=34;SAR=35;SRF=29;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0282007;STB=0.519078;STBP=0.675;TYPE=snp;VARB=0.0183334;OID=.;OPOS=54516521;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:133:133:63:64:69:69:0.518797:35:34:29:34:35:34:29:35
chr5	54830380	.	A	G	738.31	PASS	AF=1;AO=46;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=33;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0904335;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=38.0191;QD=54.6897;RBI=0.0991979;REFB=0;REVB=0.0407678;RO=0;SAF=26;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0019536;OID=.;OPOS=54830380;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:46:54:1:20:26:0:0:21:33:0:0
chr5	55058992	.	C	A	840.8	PASS	AF=0.939394;AO=59;DP=64;FAO=62;FDP=66;FR=.;FRO=4;FSAF=29;FSAR=33;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.131077;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.678;QD=50.9577;RBI=0.139241;REFB=-0.0236271;REVB=-0.046978;RO=5;SAF=26;SAR=33;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0825127;STB=0.532248;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.0026733;OID=.;OPOS=55058992;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:64:66:5:4:59:62:0.939394:33:26:5:0:33:29:4:0
chr5	55062756	.	G	A	753.95	PASS	AF=1;AO=48;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00140456;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.9339;QD=60.3156;RBI=0.058962;REFB=-0.138172;REVB=0.0589452;RO=2;SAF=23;SAR=25;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.036156;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00875799;OID=.;OPOS=55062756;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:50:50:2:0:48:50:1:25:23:0:2:27:23:0:0
chr5	55062764	.	T	C	729.0	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0249567;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.139;QD=57.1767;RBI=0.0302649;REFB=0;REVB=0.0171209;RO=0;SAF=25;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94283e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.46351e-05;OID=.;OPOS=55062764;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:26:25:0:0:26:25:0:0
chr5	55082474	.	C	T	1101.86	PASS	AF=1;AO=73;DP=74;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0120421;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.711;QD=60.3757;RBI=0.0168323;REFB=0;REVB=0.0117607;RO=0;SAF=42;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.98661e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.93959e-07;OID=.;OPOS=55082474;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:73:0:0:73:73:1:31:42:0:0:31:42:0:0
chr5	55212667	.	G	C	314.43	PASS	AF=0.642857;AO=27;DP=42;FAO=27;FDP=42;FR=.;FRO=15;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.00357561;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.47;QD=29.9458;RBI=0.00418346;REFB=0.000247036;REVB=0.00217171;RO=15;SAF=13;SAR=14;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00963704;STB=0.505296;STBP=0.968;TYPE=snp;VARB=-0.000186247;OID=.;OPOS=55212667;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:15:15:27:27:0.642857:14:13:7:8:14:13:7:8
chr5	55243417	.	G	A	264.14	PASS	AF=0.631579;AO=23;DP=37;FAO=24;FDP=38;FR=.;FRO=14;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.0211754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.483;QD=27.8038;RBI=0.0212324;REFB=0.00801469;REVB=-0.00155469;RO=14;SAF=11;SAR=12;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0636059;STB=0.541632;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=-0.00778644;OID=.;OPOS=55243417;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:38:14:14:23:24:0.631579:12:11:8:6:13:11:8:6
chr5	56161787	.	G	A	887.54	PASS	AF=1;AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0265609;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.807;QD=58.1992;RBI=0.0277354;REFB=0;REVB=0.00798569;RO=0;SAF=32;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.11237e-05;OID=.;OPOS=56161787;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:61:0:0:61:61:1:29:32:0:0:29:32:0:0
chr5	56177743	.	G	A	632.25	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0373682;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.8756;QD=61.6825;RBI=0.0375838;REFB=0;REVB=0.00401994;RO=0;SAF=21;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000445443;OID=.;OPOS=56177743;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:20:21:0:0:20:21:0:0
chr5	56177848	.	TCAA	T	195.38	PASS	AF=1;AO=16;DP=17;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00129816;FXX=0.0587889;HRUN=1;LEN=3;MLLD=283.647;QD=48.844;RBI=0.0309284;REFB=0;REVB=0.0309011;RO=0;SAF=13;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.78418e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000217113;OID=.;OPOS=56177849;OREF=CAA;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:16:17:16:16:0:13:3:0:0:4:0:13:3:0:0
chr5	56178217	.	A	C	181.32	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00423861;FXX=0.062461;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.444;QD=48.3516;RBI=0.0823787;REFB=0;REVB=0.0822695;RO=0;SAF=8;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00282118;OID=.;OPOS=56178217;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:7:8:0:0:7:8:0:0
chr5	56526565	.	G	T	717.8	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00218951;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.472;QD=57.4244;RBI=0.0170215;REFB=0;REVB=0.0168801;RO=0;SAF=30;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.48867e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.95753e-05;OID=.;OPOS=56526565;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:50:0:0:49:50:1:19:30:0:0:19:31:0:0
chr5	56526783	.	G	A	953.66	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00833108;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=146.061;QD=58.6868;RBI=0.021278;REFB=0;REVB=0.0195792;RO=0;SAF=29;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.70737e-05;OID=.;OPOS=56526783;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:36:29:0:0:36:29:0:0
chr5	57750267	.	A	C	1064.2	PASS	AF=0.986301;AO=71;DP=72;FAO=72;FDP=73;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00251158;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.2633;QD=58.3122;RBI=0.0213463;REFB=-0.0480958;REVB=0.0211981;RO=1;SAF=34;SAR=37;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0137051;STB=0.507244;STBP=0.324;TYPE=snp;VARB=0.00797107;OID=.;OPOS=57750267;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:72:73:1:1:71:72:0.986301:37:34:1:0:38:34:1:0
chr5	57750350	.	C	G	278.27	PASS	AF=0.476923;AO=29;DP=65;FAO=31;FDP=65;FR=.;FRO=34;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=10;FSRR=24;FWDB=-0.00174983;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.513;QD=17.1245;RBI=0.0140585;REFB=-0.0181786;REVB=0.0139492;RO=34;SAF=13;SAR=16;SRF=11;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123005;STB=0.584469;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=0.0161099;OID=.;OPOS=57750350;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:34:34:29:31:0.476923:16:13:11:23:17:14:10:24
chr5	57754004	.	C	T	325.94	PASS	AF=0.636364;AO=28;DP=44;FAO=28;FDP=44;FR=.;FRO=16;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.0118563;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.974;QD=29.6312;RBI=0.015093;REFB=-0.00719657;REVB=0.00933944;RO=16;SAF=19;SAR=9;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128146;STB=0.570619;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=0.00604978;OID=.;OPOS=57754004;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:16:16:28:28:0.636364:9:19:8:8:9:19:8:8
chr5	57754132	.	G	C	556.93	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00843058;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.6135;QD=60.2084;RBI=0.0468575;REFB=0;REVB=-0.0460928;RO=0;SAF=22;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.82408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000530172;OID=.;OPOS=57754132;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:15:22:0:0:15:22:0:0
chr5	57754808	.	G	A	632.26	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0385322;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.212;QD=61.684;RBI=0.038563;REFB=0;REVB=-0.00154056;RO=0;SAF=19;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00064172;OID=.;OPOS=57754808;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:22:19:0:0:22:19:0:0
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chr5	58267723	.	A	C	50.11	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.11437;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.885;QD=33.4079;RBI=0.123897;REFB=0;REVB=-0.0476445;RO=0;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00209181;OID=.;OPOS=58267723;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:2:4:0:0:2:4:0:0
chr5	58489384	.	G	A	675.84	PASS	AF=0.977778;AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0115403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.1115;QD=60.0744;RBI=0.0127159;REFB=-0.0431756;REVB=-0.00534001;RO=1;SAF=15;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0302851;STB=0.516122;STBP=0.277;TYPE=snp;VARB=0.0011625;OID=.;OPOS=58489384;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:45:45:1:1:44:44:0.977778:29:15:1:0:29:15:1:0
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chr5	60817237	.	A	G	313.5	PASS	AF=0.361111;AO=39;DP=108;FAO=39;FDP=108;FR=.;FRO=69;FSAF=12;FSAR=27;FSRF=31;FSRR=38;FWDB=0.0477992;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.951;QD=11.611;RBI=0.0480344;REFB=-0.0094564;REVB=0.00474771;RO=69;SAF=12;SAR=27;SRF=31;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170305;STB=0.598093;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=0.00725329;OID=.;OPOS=60817237;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:108:69:69:39:39:0.361111:27:12:31:38:27:12:31:38
chr5	60982841	.	G	A	576.61	PASS	AF=0.537037;AO=58;DP=108;FAO=58;FDP=108;FR=.;FRO=50;FSAF=34;FSAR=24;FSRF=22;FSRR=28;FWDB=-0.0100522;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.8447;QD=21.3558;RBI=0.0195097;REFB=-0.0265513;REVB=-0.0167207;RO=50;SAF=34;SAR=24;SRF=22;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123956;STB=0.5681;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=0.0211337;OID=.;OPOS=60982841;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:108:50:50:58:58:0.537037:24:34:22:28:24:34:22:28
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chr5	61694379	.	T	C	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0125601;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.171;QD=59.4356;RBI=0.0545542;REFB=0;REVB=0.0530887;RO=0;SAF=20;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000359156;OID=.;OPOS=61694379;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:15:20:0:0:15:20:0:0
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chr5	64553480	.	A	G	208.34	PASS	AF=0.356164;AO=26;DP=73;FAO=26;FDP=73;FR=.;FRO=47;FSAF=19;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=30;FWDB=0.00772432;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=248.357;QD=11.4157;RBI=0.01915;REFB=-0.000735222;REVB=-0.0175231;RO=47;SAF=19;SAR=7;SRF=17;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.407953;STB=0.735945;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.00177502;OID=.;OPOS=64553480;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:47:47:26:26:0.356164:7:19:17:30:7:19:17:30
chr5	64881936	.	A	G	306.54	PASS	AF=0.6;AO=27;DP=45;FAO=27;FDP=45;FR=.;FRO=18;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=5;FSRR=13;FWDB=0.0906528;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.176;QD=27.2477;RBI=0.0912632;REFB=-0.00156902;REVB=-0.0105377;RO=18;SAF=14;SAR=13;SRF=5;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173758;STB=0.595676;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.00226912;OID=.;OPOS=64881936;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:18:18:27:27:0.6:13:14:5:13:13:14:5:13
chr5	64926315	.	G	A	182.99	PASS	AF=0.452381;AO=19;DP=42;FAO=19;FDP=42;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=0.00392333;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.57;QD=17.4273;RBI=0.0166509;REFB=-0.00103825;REVB=0.0161821;RO=23;SAF=7;SAR=12;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190857;STB=0.609021;STBP=0.225;TYPE=snp;VARB=0.0021789;OID=.;OPOS=64926315;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:23:23:19:19:0.452381:12:7:13:10:12:7:13:10
chr5	64926553	.	G	C	254.44	PASS	AF=0.5;AO=24;DP=49;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=0.0525245;FXX=0.020404;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.3742;QD=21.2036;RBI=0.0610192;REFB=0.0251173;REVB=0.0310567;RO=25;SAF=16;SAR=8;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177053;STB=0.58816;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=-0.0217254;OID=.;OPOS=64926553;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:48:25:24:24:24:0.5:8:16:12:13:8:16:12:12
chr5	65108215	.	A	G	319.26	PASS	AF=0.378947;AO=36;DP=94;FAO=36;FDP=95;FR=.;FRO=59;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=26;FSRR=33;FWDB=-0.0077547;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.861;QD=13.4425;RBI=0.0146075;REFB=0.00173679;REVB=-0.0123791;RO=57;SAF=18;SAR=18;SRF=26;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0471801;STB=0.536822;STBP=0.606;TYPE=snp;VARB=-0.0020009;OID=.;OPOS=65108215;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:95:57:59:36:36:0.378947:18:18:26:31:18:18:26:33
chr5	65317181	.	C	T	216.34	PASS	AF=0.538462;AO=21;DP=39;FAO=21;FDP=39;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=0.00486326;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.689;QD=22.1884;RBI=0.0284372;REFB=-0.0109437;REVB=-0.0280183;RO=18;SAF=11;SAR=10;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0723453;STB=0.540502;STBP=0.633;TYPE=snp;VARB=0.00647322;OID=.;OPOS=65317181;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:18:18:21:21:0.538462:10:11:11:7:10:11:11:7
chr5	65350374	.	A	G	306.15	PASS	AF=0.425;AO=34;DP=80;FAO=34;FDP=80;FR=.;FRO=46;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=21;FSRR=25;FWDB=0.0352912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.787;QD=15.3072;RBI=0.0399526;REFB=0.0108789;REVB=-0.018728;RO=46;SAF=13;SAR=21;SRF=21;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0780735;STB=0.544181;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=-0.0131883;OID=.;OPOS=65350374;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:46:46:34:34:0.425:21:13:21:25:21:13:21:25
chr5	66084607	.	G	C	488.97	PASS	AF=0.481481;AO=52;DP=109;FAO=52;FDP=108;FR=.;FRO=56;FSAF=18;FSAR=34;FSRF=12;FSRR=44;FWDB=0.0435984;FXX=0.00917347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.846;QD=18.1099;RBI=0.0436025;REFB=-0.00244014;REVB=-0.000591335;RO=56;SAF=18;SAR=34;SRF=12;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143715;STB=0.57918;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=0.00327962;OID=.;OPOS=66084607;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:108:56:56:52:52:0.481481:34:18:12:44:34:18:12:44
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chr5	66459878	.	G	C	221.37	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0165558;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.3014;QD=49.193;RBI=0.126534;REFB=0;REVB=0.125447;RO=0;SAF=11;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00836665;OID=.;OPOS=66459878;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:18:0:0:17:18:1:6:11:0:0:7:11:0:0
chr5	66480004	.	T	C	650.99	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0587349;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.67;QD=61.9987;RBI=0.0613235;REFB=0;REVB=0.0176289;RO=0;SAF=11;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.72514e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000380491;OID=.;OPOS=66480004;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:31:11:0:0:31:11:0:0
chr5	67522722	.	C	T	197.78	PASS	AF=0.425926;AO=23;DP=54;FAO=23;FDP=54;FR=.;FRO=31;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=-0.0185012;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.885;QD=14.6505;RBI=0.0256664;REFB=0.00961342;REVB=0.0177896;RO=31;SAF=13;SAR=10;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0498307;STB=0.52843;STBP=0.735;TYPE=snp;VARB=-0.0153582;OID=.;OPOS=67522722;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:31:31:23:23:0.425926:10:13:16:15:10:13:16:15
chr5	68266553	.	A	T	120.36	PASS	AF=0.65;AO=13;DP=20;FAO=13;FDP=20;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.00386987;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.606;QD=24.072;RBI=0.0716629;REFB=0.0303183;REVB=0.0715583;RO=7;SAF=4;SAR=9;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176469;STB=0.59984;STBP=0.291;TYPE=snp;VARB=-0.0206289;OID=.;OPOS=68266553;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:20:20:7:7:13:13:0.65:9:4:4:3:9:4:4:3
chr5	68471247	.	G	A	209.33	PASS	AF=0.409836;AO=25;DP=61;FAO=25;FDP=61;FR=.;FRO=36;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=22;FSRR=14;FWDB=0.00106552;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.368;QD=13.7268;RBI=0.019825;REFB=-0.0155172;REVB=-0.0197963;RO=36;SAF=14;SAR=11;SRF=22;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0540223;STB=0.530807;STBP=0.714;TYPE=snp;VARB=0.0277936;OID=.;OPOS=68471247;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:36:36:25:25:0.409836:11:14:22:14:11:14:22:14
chr5	68471657	.	A	G	382.22	PASS	AF=0.506494;AO=39;DP=77;FAO=39;FDP=77;FR=.;FRO=38;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=0.0114078;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.446;QD=19.8557;RBI=0.0117338;REFB=-0.00619806;REVB=0.00274653;RO=38;SAF=19;SAR=20;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0347762;STB=0.519298;STBP=0.741;TYPE=snp;VARB=0.00745109;OID=.;OPOS=68471657;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:38:38:39:39:0.506494:20:19:20:18:20:19:20:18
chr5	68525027	.	C	T	260.8	PASS	AF=0.517857;AO=28;DP=56;FAO=29;FDP=56;FR=.;FRO=27;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=0.00680466;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.0461;QD=18.6286;RBI=0.0113462;REFB=-0.00877455;REVB=-0.00907921;RO=25;SAF=17;SAR=11;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109706;STB=0.568852;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.0273209;OID=.;OPOS=68525027;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:25:27:28:29:0.517857:11:17:12:13:11:18:13:14
chr5	68531253	.	C	T	941.03	PASS	AF=1;AO=64;DP=65;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00228734;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.012;QD=58.8147;RBI=0.0165652;REFB=0;REVB=-0.0164065;RO=0;SAF=30;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.31092e-05;OID=.;OPOS=68531253;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:64:0:0:64:64:1:34:30:0:0:34:30:0:0
chr5	68546706	.	A	G	224.45	PASS	AF=0.468085;AO=22;DP=47;FAO=22;FDP=47;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=0.0129968;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.398;QD=19.1021;RBI=0.0130343;REFB=-0.0301367;REVB=0.000987346;RO=25;SAF=11;SAR=11;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0187754;STB=0.510629;STBP=0.911;TYPE=snp;VARB=0.0236296;OID=.;OPOS=68546706;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:25:25:22:22:0.468085:11:11:12:13:11:11:12:13
chr5	68551507	.	T	G	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0347692;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.2246;QD=47.8223;RBI=0.0365206;REFB=0;REVB=0.0111742;RO=0;SAF=7;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00134115;OID=.;OPOS=68551507;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:9:7:0:0:9:7:0:0
chr5	68609885	.	G	T	137.71	PASS	AF=0.5;AO=15;DP=30;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.0143208;FXX=0.0322477;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.211;QD=18.3608;RBI=0.0171734;REFB=-0.00607782;REVB=-0.00947848;RO=15;SAF=7;SAR=8;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00688462;OID=.;OPOS=68609885;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:15:15:15:15:0.5:8:7:7:8:8:7:7:8
chr5	68616331	.	C	T	72.01	PASS	AF=0.285714;AO=10;DP=35;FAO=10;FDP=35;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=-0.0907257;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.791;QD=8.22969;RBI=0.0971898;REFB=-0.00965938;REVB=-0.0348525;RO=25;SAF=5;SAR=5;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162846;STB=0.599808;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=0.0195113;OID=.;OPOS=68616331;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:35:35:25:25:10:10:0.285714:5:5:9:16:5:5:9:16
chr5	68688608	.	T	C	80.27	PASS	AF=0.526316;AO=10;DP=19;FAO=10;FDP=19;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=-0.011176;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.6489;QD=16.8985;RBI=0.0553569;REFB=0.0276458;REVB=-0.054217;RO=9;SAF=6;SAR=4;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215579;STB=0.624753;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=-0.0422084;OID=.;OPOS=68688608;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:19:19:9:9:10:10:0.526316:4:6:3:6:4:6:3:6
chr5	68715310	.	C	T	54.25	PASS	AF=0.421053;AO=6;DP=18;FAO=8;FDP=19;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=0.11326;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.213;QD=11.4212;RBI=0.113872;REFB=0.000569395;REVB=-0.0117912;RO=11;SAF=0;SAR=6;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.705658;STB=0.517197;STBP=0.962;TYPE=snp;VARB=0.0033434;OID=.;OPOS=68715310;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:18:19:11:11:6:8:0.421053:6:0:3:8:6:2:3:8
chr5	68720419	.	T	G	172.13	PASS	AF=0.473684;AO=18;DP=38;FAO=18;FDP=38;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=0.0170961;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=249.719;QD=18.1185;RBI=0.0275826;REFB=-0.00661804;REVB=0.0216454;RO=19;SAF=9;SAR=9;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119094;STB=0.578862;STBP=0.355;TYPE=snp;VARB=0.00921661;OID=.;OPOS=68720419;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:19:20:18:18:0.473684:9:9:7:12:9:9:7:13
chr5	70308251	.	C	T	1030.21	PASS	AF=1;AO=69;DP=70;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0191637;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.782;QD=59.7223;RBI=0.021168;REFB=0;REVB=-0.00899086;RO=0;SAF=50;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.45441e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.82142e-05;OID=.;OPOS=70308251;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:69:0:0:69:69:1:19:50:0:0:19:50:0:0
chr5	70308603	.	G	C	66.28	PASS	AF=0.409091;AO=9;DP=22;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.00465433;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.84;QD=12.0517;RBI=0.0399195;REFB=-0.00927884;REVB=-0.0396472;RO=13;SAF=6;SAR=3;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.208265;STB=0.624716;STBP=0.348;TYPE=snp;VARB=0.0162107;OID=.;OPOS=70308603;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:22:22:13:13:9:9:0.409091:3:6:6:7:3:6:6:7
chr5	70751818	.	T	G	1287.26	PASS	AF=1;AO=83;DP=84;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00322923;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.7228;QD=62.0368;RBI=0.0177685;REFB=0;REVB=0.0174726;RO=0;SAF=44;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.03564e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000608311;OID=.;OPOS=70751818;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:83:0:0:83:83:1:39:44:0:0:39:44:0:0
chr5	70800475	.	C	T	256.82	PASS	AF=0.509091;AO=28;DP=55;FAO=28;FDP=55;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=-0.0294103;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.257;QD=18.6778;RBI=0.0418887;REFB=-0.00702706;REVB=-0.0298278;RO=27;SAF=10;SAR=18;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.240452;STB=0.634368;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.00630251;OID=.;OPOS=70800475;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:27:27:28:28:0.509091:18:10:17:10:18:10:17:10
chr5	70800538	.	G	A	308.35	PASS	AF=0.435897;AO=34;DP=78;FAO=34;FDP=78;FR=.;FRO=44;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=25;FWDB=-0.00361524;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.321;QD=15.8126;RBI=0.00390079;REFB=-0.00578077;REVB=0.00146498;RO=43;SAF=15;SAR=19;SRF=19;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000687487;STB=0.505357;STBP=0.961;TYPE=snp;VARB=0.00766699;OID=.;OPOS=70800538;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:43:44:34:34:0.435897:19:15:19:24:19:15:19:25
chr5	70806457	.	G	A	47.19	PASS	AF=0.411765;AO=7;DP=17;FAO=7;FDP=17;FR=.;FRO=10;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=-0.0373896;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=204.452;QD=11.1038;RBI=0.0504084;REFB=-0.0256653;REVB=-0.0338086;RO=10;SAF=2;SAR=5;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.22218;STB=0.635955;STBP=0.405;TYPE=snp;VARB=0.0279366;OID=.;OPOS=70806457;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:17:17:10:10:7:7:0.411765:5:2:5:5:5:2:5:5
chr5	70806649	.	T	A	60.31	PASS	AF=0.571429;AO=8;DP=14;FAO=8;FDP=14;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0375232;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.905;QD=17.2301;RBI=0.0459873;REFB=-0.00689643;REVB=0.0265864;RO=6;SAF=4;SAR=4;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122361;STB=0.571253;STBP=0.585;TYPE=snp;VARB=0.00265914;OID=.;OPOS=70806649;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:14:14:6:6:8:8:0.571429:4:4:4:2:4:4:4:2
chr5	70806711	.	C	G	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0423308;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.9544;QD=46.8473;RBI=0.0423548;REFB=0;REVB=0.00142554;RO=0;SAF=8;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00154237;OID=.;OPOS=70806711;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:7:8:0:0:7:8:0:0
chr5	70806958	.	G	A	447.02	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.087447;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.135;QD=57.6805;RBI=0.087447;REFB=0;REVB=7.20441e-05;RO=0;SAF=17;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000744113;OID=.;OPOS=70806958;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:14:17:0:0:14:17:0:0
chr5	70809169	.	A	G	341.05	PASS	AF=0.538462;AO=35;DP=65;FAO=35;FDP=65;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=0.00343545;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.793;QD=20.9874;RBI=0.00469303;REFB=0.000108565;REVB=0.00319722;RO=30;SAF=13;SAR=22;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1658;STB=0.591875;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=-0.000139583;OID=.;OPOS=70809169;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:30:30:35:35:0.538462:22:13:17:13:22:13:17:13
chr5	70834926	.	T	C	131.9	PASS	AF=0.394737;AO=15;DP=39;FAO=15;FDP=38;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=-0.0192881;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.746;QD=13.8838;RBI=0.0338507;REFB=-0.0112343;REVB=0.027818;RO=24;SAF=6;SAR=9;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0628468;STB=0.52171;STBP=0.846;TYPE=snp;VARB=0.0151456;OID=.;OPOS=70834926;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:38:24:23:15:15:0.394737:9:6:11:13:9:6:10:13
chr5	70837295	.	A	C	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.029953;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.2495;QD=53.2758;RBI=0.0495732;REFB=0;REVB=0.0395008;RO=0;SAF=14;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.84921e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0016437;OID=.;OPOS=70837295;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:9:14:0:0:9:14:0:0
chr5	70840233	.	C	T	309.11	PASS	AF=0.425;AO=35;DP=81;FAO=34;FDP=80;FR=.;FRO=46;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=28;FWDB=0.0224235;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.241;QD=15.4552;RBI=0.0407022;REFB=0.00498974;REVB=-0.0339684;RO=46;SAF=20;SAR=15;SRF=18;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179995;STB=0.595426;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=-0.0106306;OID=.;OPOS=70840233;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:80:46:46:35:34:0.425:15:20:18:28:15:19:18:28
chr5	70849021	.	G	T	223.74	PASS	AF=0.385714;AO=27;DP=70;FAO=27;FDP=70;FR=.;FRO=43;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=24;FSRR=19;FWDB=-0.0176687;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.746;QD=12.785;RBI=0.0241866;REFB=-0.00551959;REVB=-0.0165168;RO=43;SAF=12;SAR=15;SRF=24;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121386;STB=0.569569;STBP=0.373;TYPE=snp;VARB=0.00801591;OID=.;OPOS=70849021;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:43:43:27:27:0.385714:15:12:24:19:15:12:24:19
chr5	70858194	.	C	T	291.78	PASS	AF=0.508197;AO=30;DP=60;FAO=31;FDP=61;FR=.;FRO=30;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=0.0331471;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.1925;QD=19.1333;RBI=0.033629;REFB=-0.0027671;REVB=-0.00567253;RO=28;SAF=14;SAR=16;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0289383;STB=0.508469;STBP=0.909;TYPE=snp;VARB=0.00285874;OID=.;OPOS=70858194;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:61:28:30:30:31:0.508197:16:14:14:14:16:15:14:16
chr5	70932002	.	G	A	538.55	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0132134;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.843;QD=59.8391;RBI=0.0375805;REFB=0;REVB=-0.035181;RO=0;SAF=19;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000394994;OID=.;OPOS=70932002;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:17:19:0:0:17:19:0:0
chr5	70945075	.	A	G	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0362379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.123;QD=47.8223;RBI=0.0777022;REFB=0;REVB=0.0687346;RO=0;SAF=6;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00108095;OID=.;OPOS=70945075;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:10:6:0:0:10:6:0:0
chr5	71146741	.	T	G	34.83	PASS	AF=0.833333;AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00142583;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=306.076;QD=23.2183;RBI=0.00142583;REFB=-0.00271968;REVB=0;RO=1;SAF=5;SAR=0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000687804;OID=.;OPOS=71146741;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:6:6:1:1:5:5:0.833333:0:5:1:0:0:5:1:0
chr5	71146757	.	T	C	785.2	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00649618;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.7242;QD=57.1052;RBI=0.0147592;REFB=0;REVB=-0.0132526;RO=0;SAF=35;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.67221e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000158295;OID=.;OPOS=71146757;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:20:35:0:0:20:35:0:0
chr5	71146882	.	T	C	3798.6	PASS	AF=0.969231;AO=251;DP=262;FAO=252;FDP=260;FR=.;FRO=8;FSAF=148;FSAR=104;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=0.00768902;FXX=0.0076333;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.031;QD=58.4401;RBI=0.0170621;REFB=-0.0291231;REVB=0.0152313;RO=8;SAF=148;SAR=103;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00976511;STB=0.505172;STBP=0.361;TYPE=snp;VARB=0.000490263;OID=.;OPOS=71146882;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:262:260:8:8:251:252:0.969231:103:148:6:2:104:148:6:2
chr5	71146889	.	A	G	3775.41	PASS	AF=0.972;AO=242;DP=249;FAO=243;FDP=250;FR=.;FRO=7;FSAF=146;FSAR=97;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=-0.00218421;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.924;QD=60.4065;RBI=0.00382282;REFB=-0.0441262;REVB=0.00313739;RO=6;SAF=145;SAR=97;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0112607;STB=0.507503;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=0.00023735;OID=.;OPOS=71146889;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:249:250:6:7:242:243:0.972:97:145:5:1:97:146:6:1
chr5	71490962	.	A	G	542.26	PASS	AF=1;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0153102;FXX=0.0270197;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.8071;QD=60.2512;RBI=0.0384055;REFB=0;REVB=-0.0352219;RO=0;SAF=22;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000207238;OID=.;OPOS=71490962;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:36:0:0:36:36:1:14:22:0:0:14:22:0:0
chr5	71495041	.	T	C	933.15	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00232014;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.0585;QD=57.4249;RBI=0.022692;REFB=0;REVB=0.0225731;RO=0;SAF=36;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.31521e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00166966;OID=.;OPOS=71495041;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:65:0:0:63:65:1:27:36:0:0:29:36:0:0
chr5	71756102	.	G	A	1938.36	PASS	AF=0.984496;AO=126;DP=129;FAO=127;FDP=129;FR=.;FRO=2;FSAF=62;FSAR=65;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0257719;FXX=0.00769172;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.5627;QD=60.1041;RBI=0.0603321;REFB=-0.159923;REVB=0.0545506;RO=2;SAF=62;SAR=64;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000235644;STB=0.500183;STBP=0.867;TYPE=snp;VARB=0.00253549;OID=.;OPOS=71756102;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:129:129:2:2:126:127:0.984496:64:62:1:1:65:62:1:1
chr5	72174432	.	C	G	1358.23	PASS	AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0270104;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.2315;QD=62.4474;RBI=0.0433727;REFB=0;REVB=-0.0339357;RO=0;SAF=38;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.18679e-05;OID=.;OPOS=72174432;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:49:38:0:0:49:38:0:0
chr5	72184098	.	C	T	487.99	PASS	AF=1;AO=33;DP=34;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0180361;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.3096;QD=59.1507;RBI=0.0207464;REFB=0;REVB=0.0102523;RO=0;SAF=20;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.82173e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000798335;OID=.;OPOS=72184098;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:33:0:0:33:33:1:13:20:0:0:13:20:0:0
chr5	72347223	.	A	G	339.94	PASS	AF=0.630435;AO=29;DP=45;FAO=29;FDP=46;FR=.;FRO=17;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=-0.00718568;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=136.969;QD=29.5598;RBI=0.0161279;REFB=0.0055923;REVB=0.0144387;RO=16;SAF=11;SAR=18;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00296699;STB=0.512649;STBP=0.839;TYPE=snp;VARB=-0.00462014;OID=.;OPOS=72347223;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:46:16:17:29:29:0.630435:18:11:6:10:18:11:7:10
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chr5	72395915	.	G	A	481.03	PASS	AF=0.541176;AO=46;DP=86;FAO=46;FDP=85;FR=.;FRO=39;FSAF=28;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=0.00481932;FXX=0.0116266;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.521;QD=22.6366;RBI=0.0174732;REFB=-0.021491;REVB=-0.0167954;RO=39;SAF=28;SAR=18;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145683;STB=0.580276;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=0.0145104;OID=.;OPOS=72395915;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:85:39:39:46:46:0.541176:18:28:17:22:18:28:17:22
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chr5	72798845	.	A	G	99.64	PASS	AF=0.419355;AO=10;DP=30;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.0491436;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=85.7587;QD=12.8574;RBI=0.0531163;REFB=-0.0760168;REVB=-0.0201555;RO=16;SAF=3;SAR=7;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154872;STB=0.509985;STBP=0.935;TYPE=snp;VARB=0.0768193;OID=.;OPOS=72798845;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:31:16:18:10:13:0.419355:7:3:7:9:7:6:8:10
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chr5	73090261	.	T	C	271.68	PASS	AF=0.418919;AO=31;DP=74;FAO=31;FDP=74;FR=.;FRO=43;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=23;FWDB=-0.00725205;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.235;QD=14.6855;RBI=0.00754608;REFB=-0.0100494;REVB=-0.00208593;RO=42;SAF=13;SAR=18;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0585831;STB=0.527045;STBP=0.695;TYPE=snp;VARB=0.017642;OID=.;OPOS=73090261;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:42:43:31:31:0.418919:18:13:20:22:18:13:20:23
chr5	73091149	.	C	T	304.1	PASS	AF=0.52459;AO=32;DP=61;FAO=32;FDP=61;FR=.;FRO=29;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=7;FWDB=0.0100097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.996;QD=19.941;RBI=0.0100808;REFB=-0.0116763;REVB=0.00119502;RO=29;SAF=15;SAR=17;SRF=22;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.246091;STB=0.635916;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=0.0130314;OID=.;OPOS=73091149;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:29:29:32:32:0.52459:17:15:22:7:17:15:22:7
chr5	73144845	.	A	G	1075.02	PASS	AF=1;AO=70;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0078199;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.738;QD=59.7231;RBI=0.031824;REFB=0;REVB=0.0308483;RO=0;SAF=40;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000365405;OID=.;OPOS=73144845;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:72:0:0:70:72:1:30:40:0:0:31:41:0:0
chr5	73163831	.	C	T	318.4	PASS	AF=0.485714;AO=34;DP=70;FAO=34;FDP=70;FR=.;FRO=36;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=-0.0126434;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.21;QD=18.1942;RBI=0.0275346;REFB=-0.00126635;REVB=-0.0244602;RO=36;SAF=19;SAR=15;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00304939;STB=0.501703;STBP=0.984;TYPE=snp;VARB=0.00136573;OID=.;OPOS=73163831;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:36:36:34:34:0.485714:15:19:20:16:15:19:20:16
chr5	73163965	.	C	A	285.68	PASS	AF=0.508197;AO=29;DP=60;FAO=31;FDP=61;FR=.;FRO=30;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=0.153061;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.836;QD=18.7331;RBI=0.156112;REFB=-0.043965;REVB=-0.0307116;RO=29;SAF=14;SAR=15;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507931;STBP=0.959;TYPE=snp;VARB=0.0717002;OID=.;OPOS=73163965;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:61:29:30:29:31:0.508197:15:14:14:15:15:16:15:15
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chr5	73207372	.	T	A	1283.39	PASS	AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0146228;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.675;QD=61.8499;RBI=0.0160078;REFB=0;REVB=-0.00651346;RO=0;SAF=40;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.89313e-05;OID=.;OPOS=73207372;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:43:40:0:0:43:40:0:0
chr5	73471334	.	G	C	409.8	PASS	AF=0.518987;AO=41;DP=79;FAO=41;FDP=79;FR=.;FRO=38;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=-0.0124695;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.4044;QD=20.7495;RBI=0.0159356;REFB=-0.000219707;REVB=0.00992247;RO=37;SAF=24;SAR=17;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.085873;STB=0.55428;STBP=0.338;TYPE=snp;VARB=0.000148117;OID=.;OPOS=73471334;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:37:38:41:41:0.518987:17:24:18:19:17:24:18:20
chr5	73613858	.	A	G	447.03	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00182976;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.24;QD=57.6807;RBI=0.0223726;REFB=0;REVB=0.0222977;RO=0;SAF=11;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00012534;OID=.;OPOS=73613858;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:20:11:0:0:20:11:0:0
chr5	73613972	.	G	C	1053.3	PASS	AF=1;AO=69;DP=73;FAO=70;FDP=70;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=31;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0235873;FXX=0.0410903;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.57;QD=60.1883;RBI=0.0276477;REFB=0;REVB=-0.0144234;RO=0;SAF=31;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.31831e-05;OID=.;OPOS=73613972;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:70:0:0:69:70:1:38:31:0:0:39:31:0:0
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chr5	74063154	.	C	G	135.89	PASS	AF=0.428571;AO=15;DP=37;FAO=15;FDP=35;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.00159918;FXX=0.0540395;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.295;QD=15.5306;RBI=0.00545743;REFB=-0.00474841;REVB=-0.00521787;RO=22;SAF=10;SAR=5;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.083897;STB=0.571331;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=0.00552302;OID=.;OPOS=74063154;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:35:22:20:15:15:0.428571:5:10:13:9:5:10:11:9
chr5	74069863	.	A	G	461.8	PASS	AF=0.523256;AO=45;DP=86;FAO=45;FDP=86;FR=.;FRO=41;FSAF=16;FSAR=29;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=0.0100779;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.015;QD=21.479;RBI=0.0141557;REFB=-0.0211858;REVB=0.00994081;RO=41;SAF=16;SAR=29;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140568;STB=0.577778;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=0.0217972;OID=.;OPOS=74069863;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:41:41:45:45:0.523256:29:16:21:20:29:16:21:20
chr5	74178511	.	C	T	240.5	PASS	AF=0.489362;AO=23;DP=48;FAO=23;FDP=47;FR=.;FRO=24;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.00113701;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.462;QD=20.4677;RBI=0.00656232;REFB=-0.0149564;REVB=0.00646307;RO=23;SAF=15;SAR=8;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.234593;STB=0.622533;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.0160859;OID=.;OPOS=74178511;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:47:23:24:23:23:0.489362:8:15:9:14:8:15:10:14
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chr5	74324548	.	G	A	152.68	PASS	AF=0.3;AO=21;DP=70;FAO=21;FDP=70;FR=.;FRO=49;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=26;FSRR=23;FWDB=-0.01705;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=194.024;QD=8.72433;RBI=0.0170884;REFB=-0.00464166;REVB=0.00114574;RO=49;SAF=14;SAR=7;SRF=26;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167322;STB=0.599902;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=0.0085537;OID=.;OPOS=74324548;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:49:49:21:21:0.3:7:14:26:23:7:14:26:23
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chr5	75912401	.	A	G	238.04	PASS	AF=0.444444;AO=28;DP=63;FAO=28;FDP=63;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=0.00766413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.29;QD=15.1137;RBI=0.0147222;REFB=-0.0160502;REVB=-0.01257;RO=35;SAF=15;SAR=13;SRF=14;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132764;STB=0.574919;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.0331308;OID=.;OPOS=75912401;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:35:35:28:28:0.444444:13:15:14:21:13:15:14:21
chr5	75923285	.	C	T	243.42	PASS	AF=0.474576;AO=27;DP=59;FAO=28;FDP=59;FR=.;FRO=31;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=0.0490283;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.4523;QD=16.5027;RBI=0.0553796;REFB=0.0111286;REVB=-0.0257512;RO=31;SAF=13;SAR=14;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.028402;STB=0.506694;STBP=0.932;TYPE=snp;VARB=-0.00898515;OID=.;OPOS=75923285;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:31:31:27:28:0.474576:14:13:14:17:15:13:14:17
chr5	75923294	.	T	G	856.68	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0166965;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.774;QD=57.1123;RBI=0.0182125;REFB=0;REVB=-0.00727489;RO=0;SAF=27;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000167481;OID=.;OPOS=75923294;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:60:0:0:57:60:1:30:27:0:0:30:30:0:0
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chr5	75932869	.	C	T	236.5	PASS	AF=0.4;AO=28;DP=69;FAO=28;FDP=70;FR=.;FRO=42;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=25;FSRR=17;FWDB=0.00425824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.643;QD=13.5141;RBI=0.011287;REFB=-0.0212651;REVB=-0.010453;RO=41;SAF=16;SAR=12;SRF=25;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.041077;STB=0.514634;STBP=0.891;TYPE=snp;VARB=0.028997;OID=.;OPOS=75932869;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:70:41:42:28:28:0.4:12:16:25:16:12:16:25:17
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chr5	75948650	.	A	G	435.19	PASS	AF=0.4;AO=50;DP=125;FAO=50;FDP=125;FR=.;FRO=75;FSAF=21;FSAR=29;FSRF=33;FSRR=42;FWDB=0.0305727;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.1491;QD=13.9259;RBI=0.0327983;REFB=0.00816927;REVB=-0.0118758;RO=74;SAF=21;SAR=29;SRF=33;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0279941;STB=0.512262;STBP=0.83;TYPE=snp;VARB=-0.0160512;OID=.;OPOS=75948650;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:125:125:74:75:50:50:0.4:29:21:33:41:29:21:33:42
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chr5	76128521	.	G	A	468.25	PASS	AF=1;AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000230688;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.412;QD=58.5315;RBI=0.0308857;REFB=0;REVB=-0.0308848;RO=0;SAF=13;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000307324;OID=.;OPOS=76128521;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:32:0:0:32:32:1:19:13:0:0:19:13:0:0
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chr5	77318835	.	T	C	55.41	PASS	AF=0.363636;AO=8;DP=22;FAO=8;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.0202618;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.37;QD=10.0752;RBI=0.022037;REFB=-0.00152439;REVB=-0.00866542;RO=14;SAF=5;SAR=3;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0583904;STB=0.535624;STBP=0.869;TYPE=snp;VARB=0.00359634;OID=.;OPOS=77318835;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:22:22:14:14:8:8:0.363636:3:5:8:6:3:5:8:6
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chr5	78326750	.	G	C	719.18	PASS	AF=0.496503;AO=70;DP=142;FAO=71;FDP=143;FR=.;FRO=72;FSAF=32;FSAR=39;FSRF=36;FSRR=36;FWDB=0.0206402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=293.68;QD=20.1168;RBI=0.026874;REFB=-0.00878678;REVB=0.0172102;RO=72;SAF=32;SAR=38;SRF=36;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0395077;STB=0.524934;STBP=0.566;TYPE=snp;VARB=0.00888954;OID=.;OPOS=78326750;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:142:143:72:72:70:71:0.496503:38:32:36:36:39:32:36:36
chr5	78328560	.	G	A	735.4	PASS	AF=0.42328;AO=79;DP=189;FAO=80;FDP=189;FR=.;FRO=109;FSAF=45;FSAR=35;FSRF=50;FSRR=59;FWDB=0.00355576;FXX=0.00526288;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.0378;QD=15.5639;RBI=0.0122513;REFB=-0.00583386;REVB=-0.011724;RO=107;SAF=45;SAR=34;SRF=48;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124613;STB=0.559879;STBP=0.18;TYPE=snp;VARB=0.0141971;OID=.;OPOS=78328560;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:189:189:107:109:79:80:0.42328:34:45:48:59:35:45:50:59
chr5	78340257	.	C	G	404.01	PASS	AF=0.438095;AO=45;DP=105;FAO=46;FDP=105;FR=.;FRO=59;FSAF=30;FSAR=16;FSRF=34;FSRR=25;FWDB=0.00264242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.34;QD=15.3907;RBI=0.00739337;REFB=-0.00526106;REVB=0.00690504;RO=58;SAF=30;SAR=15;SRF=33;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105641;STB=0.545676;STBP=0.429;TYPE=snp;VARB=0.00781115;OID=.;OPOS=78340257;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:105:58:59:45:46:0.438095:15:30:33:25:16:30:34:25
chr5	78340286	.	A	G	463.11	PASS	AF=0.471698;AO=50;DP=106;FAO=50;FDP=106;FR=.;FRO=56;FSAF=35;FSAR=15;FSRF=32;FSRR=24;FWDB=-0.0125545;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.331;QD=17.4758;RBI=0.0213078;REFB=-0.0123197;REVB=-0.0172165;RO=56;SAF=35;SAR=15;SRF=32;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135972;STB=0.575918;STBP=0.165;TYPE=snp;VARB=0.0118714;OID=.;OPOS=78340286;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:106:56:56:50:50:0.471698:15:35:32:24:15:35:32:24
chr5	78351636	.	A	C	225.52	PASS	AF=0.333333;AO=18;DP=60;FAO=20;FDP=60;FR=.,HEALED;FRO=33;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=0.0163597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.1695;QD=15.0345;RBI=0.0505184;REFB=-0.0310113;REVB=-0.0477962;RO=33;SAF=5;SAR=13;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.277032;STB=0.605717;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=0.0257504;OID=.;OPOS=78351636;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:33:33:18:20:0.333333:13:5:17:16:13:7:17:16
chr5	78373431	.	C	T	190.27	PASS	AF=0.542857;AO=19;DP=35;FAO=19;FDP=35;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.00169756;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.458;QD=21.7457;RBI=0.0160051;REFB=0.00452784;REVB=-0.0159149;RO=16;SAF=7;SAR=12;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00573328;STB=0.503222;STBP=0.998;TYPE=snp;VARB=-0.00396228;OID=.;OPOS=78373431;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:16:16:19:19:0.542857:12:7:6:10:12:7:6:10
chr5	78421959	.	G	A	324.84	PASS	AF=0.439024;AO=35;DP=81;FAO=36;FDP=82;FR=.;FRO=46;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=-0.00817745;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.795;QD=15.8459;RBI=0.00830323;REFB=-0.0152737;REVB=-0.00143978;RO=45;SAF=15;SAR=20;SRF=22;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0608281;STB=0.519115;STBP=0.787;TYPE=snp;VARB=0.0167327;OID=.;OPOS=78421959;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:82:45:46:35:36:0.439024:20:15:22:23:20:16:22:24
chr5	78573790	.	A	T	1026.38	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00690085;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.1913;QD=59.5001;RBI=0.00808515;REFB=0;REVB=-0.00421282;RO=0;SAF=28;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.20576e-05;OID=.;OPOS=78573790;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:41:28:0:0:41:28:0:0
chr5	78596044	.	T	C	712.82	PASS	AF=0.539062;AO=69;DP=128;FAO=69;FDP=128;FR=.;FRO=59;FSAF=26;FSAR=43;FSRF=37;FSRR=22;FWDB=-0.0102386;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.094;QD=22.2756;RBI=0.0156222;REFB=-0.00296055;REVB=0.0117993;RO=59;SAF=26;SAR=43;SRF=37;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.211261;STB=0.615788;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.00283433;OID=.;OPOS=78596044;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:128:128:59:59:69:69:0.539062:43:26:37:22:43:26:37:22
chr5	78617534	.	T	G	274.22	PASS	AF=0.568182;AO=25;DP=44;FAO=25;FDP=44;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.000153478;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=325.398;QD=24.9293;RBI=0.0019236;REFB=-0.0109901;REVB=0.00191747;RO=19;SAF=9;SAR=16;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174218;STB=0.596936;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.00754224;OID=.;OPOS=78617534;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:19:19:25:25:0.568182:16:9:11:8:16:9:11:8
chr5	79028472	.	C	T	357.85	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00623896;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.196;QD=55.0542;RBI=0.0284701;REFB=0;REVB=0.0277781;RO=0;SAF=10;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000114467;OID=.;OPOS=79028472;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:26:0:0:25:26:1:15:10:0:0:15:11:0:0
chr5	79030045	.	A	G	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000338814;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=335.691;QD=56.1916;RBI=0.0160716;REFB=0;REVB=-0.016068;RO=0;SAF=15;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.30778e-05;OID=.;OPOS=79030045;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:13:15:0:0:13:15:0:0
chr5	79031558	.	G	A	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00970771;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=247.231;QD=40.7629;RBI=0.058437;REFB=0;REVB=0.057625;RO=0;SAF=8;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00062198;OID=.;OPOS=79031558;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:2:8:0:0:2:8:0:0
chr5	79033391	.	G	A	416.13	PASS	AF=0.438776;AO=43;DP=98;FAO=43;FDP=98;FR=.;FRO=55;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=34;FWDB=-0.00980662;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.807;QD=16.9851;RBI=0.0102822;REFB=-0.00626162;REVB=0.00309094;RO=55;SAF=24;SAR=19;SRF=21;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174967;STB=0.59798;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=0.010518;OID=.;OPOS=79033391;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:55:55:43:43:0.438776:19:24:21:34:19:24:21:34
chr5	79048562	.	C	T	234.92	PASS	AF=0.442623;AO=27;DP=61;FAO=27;FDP=61;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=-0.000134559;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.286;QD=15.4047;RBI=0.0556439;REFB=-0.0102076;REVB=-0.0556437;RO=33;SAF=10;SAR=17;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144324;STB=0.590503;STBP=0.214;TYPE=snp;VARB=0.0153271;OID=.;OPOS=79048562;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:33:34:27:27:0.442623:17:10:17:16:17:10:18:16
chr5	79277817	.	A	C	97.29	PASS	AF=0.4;AO=12;DP=30;FAO=12;FDP=30;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=0.0182318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.413;QD=12.9723;RBI=0.0257521;REFB=-0.00209491;REVB=0.0181871;RO=18;SAF=6;SAR=6;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0566036;STB=0.533278;STBP=0.788;TYPE=snp;VARB=0.00617172;OID=.;OPOS=79277817;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:30:30:18:18:12:12:0.4:6:6:10:8:6:6:10:8
chr5	79351852	.	A	T	73.06	PASS	AF=0.3125;AO=10;DP=32;FAO=10;FDP=32;FR=.;FRO=22;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.00639748;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.739;QD=9.13236;RBI=0.00658163;REFB=-0.00107781;REVB=-0.00154599;RO=22;SAF=4;SAR=6;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.212501;STB=0.629375;STBP=0.363;TYPE=snp;VARB=0.00531658;OID=.;OPOS=79351852;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:32:32:22:22:10:10:0.3125:6:4:13:9:6:4:13:9
chr5	79616083	.	G	C,T	764.03	PASS	AF=0.959184,0.0408163;AO=46,2;DP=48;FAO=47,2;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=16,0;FSAR=31,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0304508,0.0186664;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=164.392,123.35;QD=62.3696;RBI=0.049226,0.0362501;REFB=0,0;REVB=-0.0386776,-0.0310747;RO=0;SAF=15,0;SAR=31,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00370255,-0.0522934;OID=.,.;OPOS=79616083,79616083;OREF=G,G;OALT=C,T;OMAPALT=C,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:7:48:49:0:0:46,2:47,2:0.959184,0.0408163:31,2:15,0:0:0:31,2:16,0:0:0
chr5	79617628	.	A	T	411.11	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0205416;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=63.6989;QD=56.7053;RBI=0.0431007;REFB=0;REVB=-0.0378908;RO=0;SAF=10;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00126887;OID=.;OPOS=79617628;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:19:10:0:0:19:10:0:0
chr5	79733079	.	T	C	74.94	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0153961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.864;QD=37.4712;RBI=0.0179704;REFB=0;REVB=0.00926799;RO=0;SAF=7;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.78849e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00054478;OID=.;OPOS=79733079;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:1:7:0:0:1:7:0:0
chr5	79734297	.	T	C	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0178153;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.7657;QD=51.184;RBI=0.0560032;REFB=0;REVB=0.0530941;RO=0;SAF=10;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00169523;OID=.;OPOS=79734297;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:10:10:0:0:10:10:0:0
chr5	79734409	.	G	A	447.03	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000128447;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=247.872;QD=57.6807;RBI=0.0449994;REFB=0;REVB=0.0449992;RO=0;SAF=18;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.33668e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00019231;OID=.;OPOS=79734409;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:13:18:0:0:13:18:0:0
chr5	79735858	.	A	G	1263.46	PASS	AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.093006;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.362;QD=61.6322;RBI=0.0931969;REFB=0;REVB=0.00596124;RO=0;SAF=40;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000109222;OID=.;OPOS=79735858;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:42:40:0:0:42:40:0:0
chr5	79745469	.	A	G	1193.96	PASS	AF=0.9875;AO=79;DP=80;FAO=79;FDP=80;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00917674;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.5902;QD=59.6981;RBI=0.01732;REFB=-0.102525;REVB=-0.0146891;RO=0;SAF=33;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505375;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=-0.000388288;OID=.;OPOS=79745469;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:80:80:0:1:79:79:0.9875:46:33:0:0:46:33:0:1
chr5	79855372	.	A	G	222.43	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000569258;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.284;QD=49.4294;RBI=0.051575;REFB=0;REVB=-0.0515719;RO=0;SAF=8;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000360612;OID=.;OPOS=79855372;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:10:8:0:0:10:8:0:0
chr5	79950512	.	A	G	94.44	PASS	AF=0.52381;AO=11;DP=22;FAO=11;FDP=21;FR=.;FRO=10;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=2;FWDB=-0.000601408;FXX=0.0454339;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.5679;QD=17.9878;RBI=0.00407858;REFB=-0.0199124;REVB=0.004034;RO=10;SAF=8;SAR=3;SRF=8;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0791542;STB=0.545376;STBP=0.771;TYPE=snp;VARB=0.0343605;OID=.;OPOS=79950512;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:79:22:21:10:10:11:11:0.52381:3:8:8:2:3:8:8:2
chr5	79950736	.	C	G	64.35	PASS	AF=0.727273;AO=8;DP=11;FAO=8;FDP=11;FR=.;FRO=3;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0551957;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=283.92;QD=23.4;RBI=0.055395;REFB=0.0034369;REVB=-0.00469475;RO=2;SAF=1;SAR=7;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110633;STB=0.608384;STBP=0.402;TYPE=snp;VARB=-0.00139796;OID=.;OPOS=79950736;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:11:11:2:3:8:8:0.727273:7:1:0:2:7:1:1:2
chr5	80149981	.	A	G	518.85	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00158432;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.274;QD=59.2974;RBI=0.00330703;REFB=0;REVB=-0.00290282;RO=0;SAF=20;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.48532e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.11993e-06;OID=.;OPOS=80149981;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:35:0:0:34:35:1:14:20:0:0:14:21:0:0
chr5	80168937	.	G	A	256.43	PASS	AF=0.533333;AO=24;DP=45;FAO=24;FDP=45;FR=.;FRO=21;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=15;FWDB=0.000559334;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.3306;QD=22.7934;RBI=0.0303869;REFB=-0.0214805;REVB=-0.0303817;RO=20;SAF=14;SAR=10;SRF=6;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.227824;STB=0.636253;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.0148008;OID=.;OPOS=80168937;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:20:21:24:24:0.533333:10:14:6:14:10:14:6:15
chr5	80736444	.	A	G	109.8	PASS	AF=0.433333;AO=12;DP=29;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.00544681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.201;QD=14.6397;RBI=0.0429007;REFB=-0.0332145;REVB=0.0425536;RO=17;SAF=7;SAR=5;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170437;STB=0.615207;STBP=0.321;TYPE=snp;VARB=0.0306172;OID=.;OPOS=80736444;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:30:17:17:12:13:0.433333:5:7:7:10:5:8:7:10
chr5	80756848	.	TAAAAAAA	TAAAAAA,TAAAAAAT	1457.8	PASS	AF=0.39576,0.424028;AO=70,55;DP=292;FAO=112,120;FDP=283;FR=.;FRO=51;FSAF=53,77;FSAR=59,43;FSRF=13;FSRR=38;FWDB=-0.449139,-0.134804;FXX=0.0374137;HRUN=8,8;LEN=1,1;MLLD=6.26463,154.684;QD=20.605;RBI=0.449768,0.134869;REFB=-0.239966,-0.0359662;REVB=0.0237796,0.00418558;RO=56;SAF=28,35;SAR=42,20;SRF=7;SRR=49;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.247888,0.442302;STB=0.568997,0.617077;STBP=0.008,0;TYPE=del,snp;VARB=0.187582,0.0362538;OID=.,.;OPOS=80756849,80756855;OREF=A,A;OALT=-,T;OMAPALT=TAAAAAA,TAAAAAAT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.39576,0.424028:70,55:292:112,120:283:51:53,77:59,43:13:38:99:56:28,35:42,20:7:49
chr5	81549216	.	C	T	727.79	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0468868;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.072;QD=63.2864;RBI=0.0479001;REFB=0;REVB=0.00980029;RO=0;SAF=19;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000144188;OID=.;OPOS=81549216;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:27:19:0:0:27:19:0:0
chr5	81549240	.	C	A	557.13	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0242191;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=160.936;QD=60.2299;RBI=0.0243553;REFB=0;REVB=0.00257242;RO=0;SAF=11;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.66506e-05;OID=.;OPOS=81549240;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:26:11:0:0:26:11:0:0
chr5	81572184	.	G	C	1328.58	PASS	AF=1;AO=85;DP=85;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.037268;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.7611;QD=61.7946;RBI=0.0394547;REFB=0;REVB=-0.0129525;RO=0;SAF=43;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000284766;OID=.;OPOS=81572184;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:86:0:0:85:86:1:42:43:0:0:42:44:0:0
chr5	82648943	.	G	A	541.98	PASS	AF=1;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0152326;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.8048;QD=60.2194;RBI=0.0194958;REFB=0;REVB=-0.0121677;RO=0;SAF=17;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000196477;OID=.;OPOS=82648943;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:36:0:0:36:36:1:19:17:0:0:19:17:0:0
chr5	82648976	.	C	CG	330.17	PASS	AF=1;AO=8;DP=49;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.016175;FXX=0.346868;HRUN=0;LEN=1;MLLD=16.29;QD=41.2718;RBI=0.0344382;REFB=0;REVB=0.0304033;RO=38;SAF=1;SAR=7;SRF=13;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.354431;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00291789;OID=.;OPOS=82648977;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:1:8:49:32:32:0:0:32:0:0:3:38:1:7:13:25
chr5	82648977	.	T	A,G	731.24	PASS	AF=0.163265,0.836735;AO=8,38;DP=46;FAO=8,41;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=1,14;FSAR=7,27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00841988,-0.00953671;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=85.1534,110.522;QD=59.6932;RBI=0.0687785,0.0727397;REFB=0,0;REVB=0.0682612,0.0721119;RO=0;SAF=1,13;SAR=7,25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.78849e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0158507,0.00119034;OID=.,.;OPOS=82648977,82648977;OREF=T,T;OALT=A,G;OMAPALT=A,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:47:46:49:0:0:8,38:8,41:0.163265,0.836735:7,25:1,13:0:0:7,27:1,14:0:0
chr5	82652551	.	C	G	441.35	PASS	AF=0.478261;AO=44;DP=94;FAO=44;FDP=92;FR=.;FRO=48;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=32;FSRR=16;FWDB=-0.0112707;FXX=0.0212743;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.172;QD=19.1891;RBI=0.0183484;REFB=-0.0127593;REVB=0.0144788;RO=48;SAF=24;SAR=20;SRF=32;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116216;STB=0.564488;STBP=0.249;TYPE=snp;VARB=0.018086;OID=.;OPOS=82652551;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:92:48:48:44:44:0.478261:20:24:32:16:20:24:32:16
chr5	82808072	.	C	T	587.46	PASS	AF=0.557692;AO=58;DP=103;FAO=58;FDP=104;FR=.;FRO=46;FSAF=43;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=27;FWDB=-0.00322388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.6458;QD=22.5947;RBI=0.0584631;REFB=0.0033521;REVB=0.0583742;RO=45;SAF=43;SAR=15;SRF=19;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.281022;STB=0.660029;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=-0.00178795;OID=.;OPOS=82808072;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:104:45:46:58:58:0.557692:15:43:19:26:15:43:19:27
chr5	82833145	.	G	A	114.44	PASS	AF=0.30303;AO=10;DP=33;FAO=10;FDP=33;FR=.,HEALED;FRO=19;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=14;FWDB=-0.0159188;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.953;QD=13.871;RBI=0.0159512;REFB=-0.00829679;REVB=-0.00101577;RO=19;SAF=1;SAR=9;SRF=5;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.31976;STB=0.7008;STBP=0.208;TYPE=snp;VARB=0.0141627;OID=.;OPOS=82833145;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:33:33:19:19:10:10:0.30303:9:1:5:14:9:1:5:14
chr5	82875800	.	C	T	1548.91	PASS	AF=1;AO=97;DP=97;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0677466;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.04;QD=63.8726;RBI=0.0731369;REFB=0;REVB=-0.0275573;RO=0;SAF=42;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000172238;OID=.;OPOS=82875800;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:97:97:0:0:97:97:1:55:42:0:0:55:42:0:0
chr5	82999358	.	T	G	88.79	PASS	AF=0.458333;AO=11;DP=22;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.0221924;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=185.041;QD=14.7991;RBI=0.0270079;REFB=-0.0115769;REVB=-0.0153923;RO=11;SAF=6;SAR=5;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50381;STBP=0.955;TYPE=snp;VARB=0.016043;OID=.;OPOS=82999358;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:22:24:11:13:11:11:0.458333:5:6:6:5:5:6:7:6
chr5	83360520	.	C	T	230.12	PASS	AF=0.415385;AO=27;DP=66;FAO=27;FDP=65;FR=.;FRO=38;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=25;FSRR=13;FWDB=-0.00363569;FXX=0.0151492;HRUN=3;LEN=1;MLLD=169.511;QD=14.1612;RBI=0.0258276;REFB=-0.0126072;REVB=-0.0255704;RO=37;SAF=14;SAR=13;SRF=24;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133658;STB=0.582031;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.0187908;OID=.;OPOS=83360520;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:65:37:38:27:27:0.415385:13:14:24:13:13:14:25:13
chr5	85582712	.	T	C	254.02	PASS	AF=1;AO=18;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00246637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.263;QD=50.8048;RBI=0.0838283;REFB=0;REVB=0.083792;RO=0;SAF=9;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000807938;OID=.;OPOS=85582712;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:18:20:1:9:9:0:0:11:9:0:0
chr5	85583507	.	T	G	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.03253;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.686;QD=42.1826;RBI=0.121161;REFB=0;REVB=-0.116713;RO=0;SAF=8;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00122699;OID=.;OPOS=85583507;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:3:8:0:0:3:8:0:0
chr5	85583642	.	C	T	146.72	PASS	AF=0.457143;AO=15;DP=35;FAO=16;FDP=35;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.0104818;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.633;QD=16.7674;RBI=0.0154019;REFB=-0.0107521;REVB=-0.011285;RO=19;SAF=8;SAR=7;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0445112;STB=0.50908;STBP=0.942;TYPE=snp;VARB=0.013651;OID=.;OPOS=85583642;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:19:19:15:16:0.457143:7:8:11:8:7:9:11:8
chr5	85586831	.	C	T	617.31	PASS	AF=0.521008;AO=62;DP=119;FAO=62;FDP=119;FR=.;FRO=57;FSAF=38;FSAR=24;FSRF=26;FSRR=31;FWDB=0.0558015;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.206;QD=20.7499;RBI=0.0559122;REFB=-0.00224584;REVB=-0.00351637;RO=56;SAF=38;SAR=24;SRF=26;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130638;STB=0.576368;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.00254414;OID=.;OPOS=85586831;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:119:56:57:62:62:0.521008:24:38:26:30:24:38:26:31
chr5	86513974	.	A	G	953.06	PASS	AF=0.970588;AO=66;DP=69;FAO=66;FDP=68;FR=.;FRO=2;FSAF=24;FSAR=42;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0749589;FXX=0.0285673;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.8009;QD=56.0625;RBI=0.078927;REFB=-0.0252916;REVB=-0.0247111;RO=2;SAF=24;SAR=42;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0377507;STB=0.519994;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.000260977;OID=.;OPOS=86513974;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:69:68:2:2:66:66:0.970588:42:24:2:0:42:24:2:0
chr5	87497977	.	C	T	613.09	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00182298;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.611;QD=61.3089;RBI=0.046016;REFB=0;REVB=-0.0459799;RO=0;SAF=23;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.4817e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000273241;OID=.;OPOS=87497977;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:17:23:0:0:17:23:0:0
chr5	87498849	.	G	A	1491.7	PASS	AF=1;AO=94;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0309927;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.651;QD=63.4766;RBI=0.0469651;REFB=0;REVB=0.035287;RO=0;SAF=55;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.92748e-05;OID=.;OPOS=87498849;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:94:94:0:0:94:94:1:39:55:0:0:39:55:0:0
chr5	87968864	.	A	G	1247.1	PASS	AF=0.469091;AO=129;DP=276;FAO=129;FDP=275;FR=.;FRO=146;FSAF=78;FSAR=51;FSRF=69;FSRR=77;FWDB=-0.00913584;FXX=0.00362306;HRUN=3;LEN=1;MLLD=276.598;QD=18.1396;RBI=0.0115622;REFB=-0.0136878;REVB=0.00708672;RO=145;SAF=78;SAR=51;SRF=69;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12539;STB=0.571123;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.0161788;OID=.;OPOS=87968864;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:276:275:145:146:129:129:0.469091:51:78:69:76:51:78:69:77
chr5	89703641	.	C	G	289.36	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0399629;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.6345;QD=52.6101;RBI=0.0402755;REFB=0;REVB=0.00500768;RO=0;SAF=9;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2029e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000717514;OID=.;OPOS=89703641;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:13:9:0:0:13:9:0:0
chr5	89769728	.	T	C	305.98	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0254668;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.4295;QD=53.2132;RBI=0.0285963;REFB=0;REVB=0.0130073;RO=0;SAF=9;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.84921e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00107747;OID=.;OPOS=89769728;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:14:9:0:0:14:9:0:0
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chr5	89812725	.	CACTG	C	192.3	PASS	AF=0.542857;AO=19;DP=35;FAO=19;FDP=35;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=0.0521058;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=4;MLLD=276.484;QD=21.9768;RBI=0.0527559;REFB=-0.0114326;REVB=-0.00825698;RO=15;SAF=7;SAR=12;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0885021;STB=0.55994;STBP=0.524;TYPE=del;VARB=0.0129069;OID=.;OPOS=89812726;OREF=ACTG;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.542857:19:35:19:35:16:7:12:4:12:99:15:7:12:4:11
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chr5	89979750	.	G	T	243.79	PASS	AF=0.509804;AO=24;DP=50;FAO=26;FDP=51;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=0.0142949;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.894;QD=19.1204;RBI=0.0165941;REFB=-0.0133059;REVB=0.00842736;RO=25;SAF=10;SAR=14;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0155862;STB=0.511619;STBP=0.887;TYPE=snp;VARB=0.0132128;OID=.;OPOS=89979750;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:51:25:25:24:26:0.509804:14:10:10:15:15:11:10:15
chr5	89990324	.	A	G	89.39	PASS	AF=0.478261;AO=11;DP=23;FAO=11;FDP=23;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=0.00614907;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.703;QD=15.5464;RBI=0.0203493;REFB=-0.0161682;REVB=-0.0193981;RO=12;SAF=7;SAR=4;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.268832;STB=0.65597;STBP=0.18;TYPE=snp;VARB=0.0133753;OID=.;OPOS=89990324;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:23:23:12:12:11:11:0.478261:4:7:4:8:4:7:4:8
chr5	90001368	.	T	G	159.59	PASS	AF=0.472222;AO=17;DP=36;FAO=17;FDP=36;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=-0.00863316;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=237.884;QD=17.7318;RBI=0.00949942;REFB=-0.0256013;REVB=0.00396328;RO=19;SAF=9;SAR=8;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196355;STB=0.611524;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=0.0274196;OID=.;OPOS=90001368;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:19:19:17:17:0.472222:8:9:6:13:8:9:6:13
chr5	90016871	.	G	A	271.88	PASS	AF=0.517857;AO=28;DP=56;FAO=29;FDP=56;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=0.00801979;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.677;QD=19.4203;RBI=0.00927507;REFB=-0.0097404;REVB=0.00465939;RO=26;SAF=12;SAR=16;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0952675;STB=0.568726;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.00908367;OID=.;OPOS=90016871;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:26:27:28:29:0.517857:16:12:14:12:17:12:15:12
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chr5	93731985	.	A	G	1283.44	PASS	AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0367467;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.162;QD=61.8526;RBI=0.037094;REFB=0;REVB=-0.00506379;RO=0;SAF=39;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.03564e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.75033e-05;OID=.;OPOS=93731985;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:44:39:0:0:44:39:0:0
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chr5	95084131	.	G	A	1513.41	PASS	AF=1;AO=99;DP=99;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0223349;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.468;QD=59.9372;RBI=0.0252474;REFB=0;REVB=-0.0117721;RO=0;SAF=48;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.45506e-05;OID=.;OPOS=95084131;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:99:101:0:0:99:101:1:51:48:0:0:51:50:0:0
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chr5	95236459	.	C	T	212.82	PASS	AF=0.5;AO=21;DP=42;FAO=21;FDP=42;FR=.;FRO=21;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=6;FWDB=0.00701976;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.489;QD=20.2682;RBI=0.0181354;REFB=-0.0120313;REVB=-0.0167217;RO=21;SAF=15;SAR=6;SRF=15;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0121348;OID=.;OPOS=95236459;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:21:21:21:21:0.5:6:15:15:6:6:15:15:6
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chr5	96079402	.	C	T	767.32	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0131606;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.132;QD=63.9432;RBI=0.0160554;REFB=0;REVB=-0.00919638;RO=0;SAF=15;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.02642e-05;OID=.;OPOS=96079402;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:48:0:0:47:48:1:32:15:0:0:33:15:0:0
chr5	96093222	.	G	A	2300.98	PASS	AF=0.993464;AO=152;DP=153;FAO=152;FDP=153;FR=.;FRO=1;FSAF=77;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00814792;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.5733;QD=60.1564;RBI=0.0387722;REFB=-0.0635207;REVB=0.0379064;RO=1;SAF=77;SAR=75;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00630036;STB=0.503311;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=0.00034006;OID=.;OPOS=96093222;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:153:153:1:1:152:152:0.993464:75:77:0:1:75:77:0:1
chr5	96118852	.	G	C	851.13	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00592965;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.2169;QD=57.7036;RBI=0.00661959;REFB=0;REVB=-0.00294247;RO=0;SAF=46;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.67016e-05;OID=.;OPOS=96118852;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:13:46:0:0:13:46:0:0
chr5	96121524	.	C	T	1411.76	PASS	AF=0.978495;AO=90;DP=94;FAO=91;FDP=93;FR=.;FRO=2;FSAF=56;FSAR=35;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0278797;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.661;QD=60.721;RBI=0.0282626;REFB=-0.0190262;REVB=-0.00463665;RO=1;SAF=55;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00854059;STB=0.50877;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=0.00105281;OID=.;OPOS=96121524;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:94:93:1:2:90:91:0.978495:35:55:1:0:35:56:2:0
chr5	96122260	.	T	A,G	718.59	PASS	AF=0.0392157,0.960784;AO=3,48;DP=51;FAO=2,49;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=2,27;FSAR=0,22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00495629,0.0124092;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=176.412,99.0616;QD=56.3598;RBI=0.00648245,0.0317009;REFB=0,0;REVB=0.00417819,0.0291711;RO=0;SAF=2,27;SAR=1,21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.166655,5.26979e-05;OID=.,.;OPOS=96122260,96122260;OREF=T,T;OALT=A,G;OMAPALT=A,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:51:51:0:0:3,48:2,49:0.0392157,0.960784:1,21:2,27:0:0:0,22:2,27:0:0
chr5	96124330	.	T	C	2262.14	PASS	AF=0.986928;AO=144;DP=146;FAO=151;FDP=153;FR=.;FRO=2;FSAF=83;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.011837;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.7374;QD=59.1409;RBI=0.037974;REFB=-0.0337067;REVB=0.036082;RO=2;SAF=82;SAR=62;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0150905;STB=0.507245;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=0.0149995;OID=.;OPOS=96124330;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:146:153:2:2:144:151:0.986928:62:82:0:2:68:83:0:2
chr5	96126308	.	A	G	937.51	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.02851;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.1467;QD=58.5942;RBI=0.0776553;REFB=0;REVB=0.0722324;RO=0;SAF=37;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.1743e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000614007;OID=.;OPOS=96126308;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:27:37:0:0:27:37:0:0
chr5	96129512	.	A	G	1098.43	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0021221;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=302.098;QD=60.1882;RBI=0.0165929;REFB=0;REVB=0.0164566;RO=0;SAF=40;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.18246e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.70763e-05;OID=.;OPOS=96129512;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:73:0:0:71:73:1:31:40:0:0:31:42:0:0
chr5	96130836	.	T	C	701.76	PASS	AF=1;AO=50;DP=52;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0984856;FXX=0.0192271;HRUN=3;LEN=1;MLLD=102.173;QD=55.04;RBI=0.100147;REFB=-0.0871956;REVB=0.018168;RO=1;SAF=28;SAR=22;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0165169;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00343114;OID=.;OPOS=96130836;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:52:51:1:0:50:51:1:22:28:1:0:22:29:0:0
chr5	96139250	.	C	G	1177.11	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000472044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.521;QD=60.3644;RBI=0.0253703;REFB=0;REVB=0.0253659;RO=0;SAF=39;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.14686e-05;OID=.;OPOS=96139250;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:78:0:0:72:78:1:33:39:0:0:38:40:0:0
chr5	96364300	.	CT	C	89.74	PASS	AF=0.33913;AO=31;DP=115;FAO=39;FDP=115;FR=.;FRO=76;FSAF=6;FSAR=33;FSRF=41;FSRR=35;FWDB=0.0881612;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=11.7299;QD=3.12133;RBI=0.13083;REFB=-0.0424685;REVB=-0.0966644;RO=71;SAF=4;SAR=27;SRF=42;SRR=29;SSEN=0.306122;SSEP=0;SSSB=-0.584656;STB=0.791565;STBP=0;TYPE=del;VARB=0.0147296;OID=.;OPOS=96364301;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.33913:31:115:39:115:76:6:33:41:35:89:71:4:27:42:29
chr5	96364306	.	CA	C	65.18	PASS	AF=0.271028;AO=30;DP=107;FAO=29;FDP=107;FR=.;FRO=78;FSAF=4;FSAR=25;FSRF=41;FSRR=37;FWDB=-0.0732546;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=15.5614;QD=2.43648;RBI=0.088122;REFB=-0.0360363;REVB=-0.0489822;RO=71;SAF=4;SAR=26;SRF=40;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.558428;STB=0.819131;STBP=0;TYPE=del;VARB=0.00916401;OID=.;OPOS=96364307;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.271028:30:107:29:107:78:4:25:41:37:65:71:4:26:40:31
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chr5	96511780	.	C	CT	170.98	PASS	AF=0.469697;AO=29;DP=67;FAO=31;FDP=66;FR=.;FRO=35;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=25;FWDB=-0.0282857;FXX=0.0149231;HRUN=3;LEN=1;MLLD=18.137;QD=10.3624;RBI=0.0469981;REFB=-0.0426238;REVB=0.0375332;RO=36;SAF=14;SAR=15;SRF=11;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176082;STB=0.621285;STBP=0.085;TYPE=ins;VARB=0.0402198;OID=.;OPOS=96511781;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.469697:29:67:31:66:35:16:15:10:25:99:36:14:15:11:25
chr5	96512865	.	T	A	902.71	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0105826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=314.604;QD=58.2396;RBI=0.0401852;REFB=0;REVB=0.0387668;RO=0;SAF=30;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.14086e-05;OID=.;OPOS=96512865;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:32:30:0:0:32:30:0:0
chr5	96512871	.	T	A	955.2	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0131983;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.956;QD=58.7815;RBI=0.0345577;REFB=0;REVB=-0.031938;RO=0;SAF=33;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000161518;OID=.;OPOS=96512871;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:32:33:0:0:32:33:0:0
chr5	96513471	.	G	C	323.08	PASS	AF=0.607843;AO=31;DP=51;FAO=31;FDP=51;FR=.;FRO=20;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.0467566;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.472;QD=25.3399;RBI=0.0517125;REFB=-0.00982378;REVB=-0.0220909;RO=20;SAF=20;SAR=11;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108829;STB=0.55996;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.00427433;OID=.;OPOS=96513471;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:20:20:31:31:0.607843:11:20:10:10:11:20:10:10
chr5	96518792	.	T	G	182.16	PASS	AF=0.558824;AO=14;DP=34;FAO=19;FDP=34;FR=.,HEALED;FRO=14;FSAF=3;FSAR=16;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=-0.00266614;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=32.7664;QD=21.4304;RBI=0.0226727;REFB=-0.112152;REVB=0.0225154;RO=14;SAF=3;SAR=11;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.542326;STBP=0.681;TYPE=snp;VARB=0.144771;OID=.;OPOS=96518792;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:14:14:14:19:0.558824:11:3:3:11:16:3:3:11
chr5	96724999	.	C	T	274.96	PASS	AF=0.527273;AO=29;DP=56;FAO=29;FDP=55;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=-0.020284;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.101;QD=19.9971;RBI=0.0226737;REFB=0.013908;REVB=-0.0101319;RO=27;SAF=12;SAR=17;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0271562;STB=0.504513;STBP=0.96;TYPE=snp;VARB=-0.011343;OID=.;OPOS=96724999;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:55:27:26:29:29:0.527273:17:12:12:15:17:12:11:15
chr5	98115828	.	A	G	314.39	PASS	AF=0.459459;AO=34;DP=75;FAO=34;FDP=74;FR=.;FRO=40;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=20;FSRR=20;FWDB=0.00819127;FXX=0.0133316;HRUN=2;LEN=1;MLLD=224.558;QD=16.994;RBI=0.00992513;REFB=-0.0161706;REVB=-0.00560458;RO=39;SAF=12;SAR=22;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157708;STB=0.582732;STBP=0.19;TYPE=snp;VARB=0.0148163;OID=.;OPOS=98115828;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:74:39:40:34:34:0.459459:22:12:20:19:22:12:20:20
chr5	98131505	.	A	G	411.09	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0716032;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.413;QD=56.7019;RBI=0.0734164;REFB=0;REVB=-0.0162159;RO=0;SAF=15;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000302847;OID=.;OPOS=98131505;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:14:15:0:0:14:15:0:0
chr5	100068875	.	C	T	1060.43	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0177137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.8993;QD=59.7426;RBI=0.018254;REFB=0;REVB=0.00440817;RO=0;SAF=35;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.91177e-05;OID=.;OPOS=100068875;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:71:0:0:70:71:1:35:35:0:0:35:36:0:0
chr5	100143084	.	G	C	237.15	PASS	AF=0.479167;AO=23;DP=48;FAO=23;FDP=48;FR=.;FRO=25;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=0.00305615;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.01;QD=19.7623;RBI=0.00340203;REFB=-0.00673924;REVB=-0.00149457;RO=25;SAF=10;SAR=13;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115482;STB=0.565161;STBP=0.425;TYPE=snp;VARB=0.00832221;OID=.;OPOS=100143084;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:25:25:23:23:0.479167:13:10:14:11:13:10:14:11
chr5	100145388	.	A	C	150.45	PASS	AF=0.327869;AO=19;DP=60;FAO=20;FDP=61;FR=.;FRO=41;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=-0.00612298;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.7993;QD=9.86553;RBI=0.00977574;REFB=-0.00578211;REVB=-0.00762064;RO=41;SAF=10;SAR=9;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100382;STB=0.540943;STBP=0.652;TYPE=snp;VARB=0.0134672;OID=.;OPOS=100145388;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:61:41:41:19:20:0.327869:9:10:18:23:10:10:18:23
chr5	100145662	.	A	AACAC	38.16	PASS	AF=0.157895;AO=6;DP=58;FAO=6;FDP=38;FR=.;FRO=32;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=-0.0459783;FXX=0.155521;HRUN=2;LEN=4;MLLD=195.049;QD=4.01714;RBI=0.0479261;REFB=-0.0240992;REVB=-0.0135246;RO=47;SAF=1;SAR=5;SRF=22;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.371937;STB=0.832224;STBP=0.116;TYPE=ins;VARB=0.105479;OID=.;OPOS=100145663;OREF=-;OALT=ACAC;OMAPALT=AACAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.157895:6:58:6:38:32:1:5:18:14:38:47:1:5:22:25
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chr5	101816104	.	G	A	159.41	PASS	AF=0.447368;AO=17;DP=39;FAO=17;FDP=38;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=-0.0502277;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.0301;QD=16.7803;RBI=0.0653472;REFB=-0.0521886;REVB=-0.0418024;RO=21;SAF=10;SAR=7;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108793;STB=0.562426;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.0660493;OID=.;OPOS=101816104;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:38:21:21:17:17:0.447368:7:10:10:11:7:10:10:11
chr5	102365186	.	G	A	800.77	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0129958;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.4876;QD=57.1979;RBI=0.0208614;REFB=0;REVB=-0.016319;RO=0;SAF=25;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.47561e-05;OID=.;OPOS=102365186;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:31:25:0:0:31:25:0:0
chr5	102365426	.	C	CAG	678.93	PASS	AF=0.868852;AO=53;DP=62;FAO=53;FDP=61;FR=.;FRO=8;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0142921;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=251.797;QD=44.52;RBI=0.0227846;REFB=0.0115718;REVB=0.0177447;RO=9;SAF=22;SAR=31;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00819994;STB=0.511417;STBP=0.658;TYPE=ins;VARB=-0.000732697;OID=.;OPOS=102365427;OREF=-;OALT=AG;OMAPALT=CAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.868852:53:62:53:61:8:22:31:4:4:41:9:22:31:4:5
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chr5	108672946	.	C	T	441.15	PASS	AF=0.551282;AO=42;DP=78;FAO=43;FDP=78;FR=.;FRO=35;FSAF=29;FSAR=14;FSRF=25;FSRR=10;FWDB=0.0202418;FXX=0.0249969;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.537;QD=22.6228;RBI=0.0429176;REFB=-0.00911802;REVB=-0.0378442;RO=35;SAF=29;SAR=13;SRF=25;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0232102;STB=0.520652;STBP=0.74;TYPE=snp;VARB=0.00776494;OID=.;OPOS=108672946;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:35:35:42:43:0.551282:13:29:25:10:14:29:25:10
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chr5	108719151	.	G	A	306.74	PASS	AF=0.574074;AO=30;DP=53;FAO=31;FDP=54;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=-0.0278628;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.853;QD=22.7218;RBI=0.0337995;REFB=0.000895107;REVB=0.0191329;RO=23;SAF=12;SAR=18;SRF=16;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.229537;STB=0.630248;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=-0.000476712;OID=.;OPOS=108719151;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:54:23:23:30:31:0.574074:18:12:16:7:19:12:16:7
chr5	109035302	.	T	TAAAG	209.01	PASS	AF=0.396825;AO=24;DP=63;FAO=25;FDP=63;FR=.;FRO=38;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=0.0112193;FXX=0.0454477;HRUN=1;LEN=4;MLLD=283.44;QD=13.2702;RBI=0.0125301;REFB=-0.0067569;REVB=-0.00557953;RO=38;SAF=16;SAR=8;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.238156;STB=0.617665;STBP=0.151;TYPE=ins;VARB=0.0132694;OID=.;OPOS=109035303;OREF=-;OALT=AAAG;OMAPALT=TAAAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.396825:24:63:25:63:38:16:9:17:21:99:38:16:8:17:21
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chr5	110439509	.	A	G	525.55	PASS	AF=0.515464;AO=50;DP=97;FAO=50;FDP=97;FR=.;FRO=47;FSAF=17;FSAR=33;FSRF=19;FSRR=28;FWDB=-0.00194361;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.0477;QD=21.6723;RBI=0.0124719;REFB=-0.0253965;REVB=-0.0123195;RO=47;SAF=17;SAR=33;SRF=19;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.061348;STB=0.533919;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=0.0252434;OID=.;OPOS=110439509;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:47:47:50:50:0.515464:33:17:19:28:33:17:19:28
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chr5	111065764	.	C	T	143.81	PASS	AF=0.4;AO=16;DP=41;FAO=16;FDP=40;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=0.00473404;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.643;QD=14.3805;RBI=0.00624976;REFB=-0.0130547;REVB=0.00408024;RO=24;SAF=5;SAR=11;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.284119;STB=0.665395;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=0.0405135;OID=.;OPOS=111065764;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:40:24:24:16:16:0.4:11:5:14:10:11:5:14:10
chr5	111066697	.	T	C	378.21	PASS	AF=0.481481;AO=39;DP=82;FAO=39;FDP=81;FR=.;FRO=42;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=25;FSRR=17;FWDB=-0.0138364;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.969;QD=18.6771;RBI=0.0139013;REFB=-0.0190294;REVB=0.00134176;RO=43;SAF=16;SAR=23;SRF=26;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181934;STB=0.595655;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=0.0159171;OID=.;OPOS=111066697;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:81:43:42:39:39:0.481481:23:16:26:17:23:16:25:17
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chr5	111500222	.	TAAAAC	T	58.67	PASS	AF=0.344828;AO=9;DP=33;FAO=10;FDP=29;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=0.0255409;FXX=0.121175;HRUN=4;LEN=5;MLLD=257.802;QD=8.09182;RBI=0.0293349;REFB=0.00767163;REVB=-0.014429;RO=19;SAF=5;SAR=4;SRF=7;SRR=12;SSEN=0.333333;SSEP=0;SSSB=0.204999;STB=0.551622;STBP=0.667;TYPE=del;VARB=-0.015503;OID=.;OPOS=111500223;OREF=AAAAC;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.344828:9:33:10:29:19:5:5:8:11:58:19:5:4:7:12
chr5	111500816	.	C	CTAAAA	467.26	PASS	AF=0.440678;AO=50;DP=121;FAO=52;FDP=118;FR=.;FRO=66;FSAF=19;FSAR=33;FSRF=42;FSRR=24;FWDB=-0.0209057;FXX=0;HRUN=1;LEN=5;MLLD=254.528;QD=15.8394;RBI=0.0212192;REFB=-0.00953345;REVB=-0.00363405;RO=69;SAF=18;SAR=32;SRF=45;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.297083;STB=0.650137;STBP=0.007;TYPE=ins;VARB=0.0122888;OID=.;OPOS=111500817;OREF=-;OALT=TAAAA;OMAPALT=CTAAAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.440678:50:121:52:118:66:19:33:42:24:99:69:18:32:45:24
chr5	111504479	.	C	T	1724.91	PASS	AF=1;AO=112;DP=113;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0246252;FXX=0.0338954;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.725;QD=60.523;RBI=0.0274183;REFB=0;REVB=0.0120566;RO=0;SAF=60;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000511161;OID=.;OPOS=111504479;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:113:114:0:0:112:114:1:52:60:0:0:54:60:0:0
chr5	111506069	.	G	A	868.27	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0247917;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.887;QD=57.8849;RBI=0.0253346;REFB=0;REVB=0.00521685;RO=0;SAF=26;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.45781e-05;OID=.;OPOS=111506069;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:34:26:0:0:34:26:0:0
chr5	111519740	.	T	C	1969.39	PASS	AF=0.977612;AO=130;DP=134;FAO=131;FDP=134;FR=.;FRO=3;FSAF=75;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0240757;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.347;QD=58.7879;RBI=0.0410815;REFB=-0.0721253;REVB=0.0332874;RO=3;SAF=74;SAR=56;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0102899;STB=0.513041;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=0.000618091;OID=.;OPOS=111519740;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:134:134:3:3:130:131:0.977612:56:74:1:2:56:75:0:3
chr5	111530284	.	A	G	538.5	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0496516;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.5556;QD=59.8335;RBI=0.0549032;REFB=0;REVB=0.0234326;RO=0;SAF=12;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00146827;OID=.;OPOS=111530284;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:24:12:0:0:24:12:0:0
chr5	111545670	.	C	G	1533.66	PASS	AF=1;AO=101;DP=101;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00477016;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.225;QD=59.5598;RBI=0.0107636;REFB=0;REVB=-0.00964885;RO=0;SAF=37;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.59598e-05;OID=.;OPOS=111545670;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:101:103:0:0:101:103:1:64:37:0:0:64:39:0:0
chr5	112162854	.	T	C	586.6	PASS	AF=0.531532;AO=58;DP=111;FAO=59;FDP=111;FR=.;FRO=52;FSAF=21;FSAR=38;FSRF=25;FSRR=27;FWDB=-0.0126415;FXX=0.00892777;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.2521;QD=21.1387;RBI=0.0295539;REFB=-0.011718;REVB=0.0267138;RO=51;SAF=21;SAR=37;SRF=25;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113756;STB=0.561495;STBP=0.176;TYPE=snp;VARB=0.0188259;OID=.;OPOS=112162854;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:111:51:52:58:59:0.531532:37:21:25:26:38:21:25:27
chr5	112164561	.	G	A	1078.67	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0136644;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.9964;QD=59.9263;RBI=0.0137262;REFB=0;REVB=0.00130066;RO=0;SAF=37;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.12261e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.7428e-05;OID=.;OPOS=112164561;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:72:0:0:71:72:1:34:37:0:0:34:38:0:0
chr5	112175770	.	G	A	696.68	PASS	AF=0.962264;AO=51;DP=53;FAO=51;FDP=53;FR=.;FRO=2;FSAF=24;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0127688;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.563;QD=52.5798;RBI=0.0128901;REFB=0.0699795;REVB=0.00176419;RO=2;SAF=24;SAR=27;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0336073;STB=0.51785;STBP=0.248;TYPE=snp;VARB=-0.00296596;OID=.;OPOS=112175770;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:53:53:2:2:51:51:0.962264:27:24:0:2:27:24:0:2
chr5	112176325	.	G	A	594.54	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0315093;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=213.526;QD=60.9784;RBI=0.033875;REFB=0;REVB=0.012437;RO=0;SAF=15;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000104432;OID=.;OPOS=112176325;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:24:15:0:0:24:15:0:0
chr5	112176559	.	T	G	708.38	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0675911;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.341;QD=62.9669;RBI=0.0691886;REFB=0;REVB=0.0147818;RO=0;SAF=18;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000561249;OID=.;OPOS=112176559;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:27:18:0:0:27:18:0:0
chr5	112176756	.	T	A	740.7	PASS	AF=1;AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0136408;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.8967;QD=56.9766;RBI=0.0151424;REFB=0;REVB=0.00657421;RO=0;SAF=22;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.18867e-05;OID=.;OPOS=112176756;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:52:0:0:52:52:1:30:22:0:0:30:22:0:0
chr5	112177171	.	G	A	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.014389;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=300.9;QD=44.6898;RBI=0.0243529;REFB=0;REVB=-0.0196474;RO=0;SAF=9;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.49768e-05;OID=.;OPOS=112177171;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:4:9:0:0:4:9:0:0
chr5	112177583	.	AAT	A,ATT	40.72	PASS	AF=0.208333,0;AO=7,2;DP=50;FAO=10,0;FDP=48;FR=.;FRO=38;FSAF=9,0;FSAR=1,0;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=0.00458605,-0.0742319;FXX=0.039992;HRUN=4,4;LEN=2,1;MLLD=30.4339,29.0547;QD=3.39298;RBI=0.0435494,0.088467;REFB=-0.0570562,0.000404662;REVB=0.0433073,0.0481253;RO=40;SAF=7,2;SAR=0,0;SRF=17;SRR=23;SSEN=0.326923,0;SSEP=0,0;SSSB=0.700388,0.450043;STB=0.891432,0.5;STBP=0.011,1;TYPE=del,snp;VARB=0.187738,0;OID=.,.;OPOS=112177584,112177584;OREF=AT,A;OALT=-,T;OMAPALT=A,ATT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.208333,0:7,2:50:10,0:48:38:9,0:1,0:16:22:41:40:7,2:0,0:17:23
chr5	112179909	.	C	A	194.09	PASS	AF=0.526316;AO=20;DP=39;FAO=20;FDP=38;FR=.;FRO=18;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.052153;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.744;QD=20.4302;RBI=0.0521673;REFB=-0.0131877;REVB=-0.00121911;RO=19;SAF=12;SAR=8;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0652459;STB=0.548338;STBP=0.576;TYPE=snp;VARB=0.0135732;OID=.;OPOS=112179909;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:38:19:18:20:20:0.526316:8:12:10:9:8:12:9:9
chr5	112180257	.	C	T	61.38	PASS	AF=0.615385;AO=8;DP=13;FAO=8;FDP=13;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.0487022;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.97;QD=18.8867;RBI=0.0738904;REFB=0.00523449;REVB=-0.0555687;RO=5;SAF=3;SAR=5;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151251;STB=0.588011;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=-0.0104644;OID=.;OPOS=112180257;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:13:13:5:5:8:8:0.615385:5:3:3:2:5:3:3:2
chr5	112197082	.	C	T	222.27	PASS	AF=0.458333;AO=22;DP=48;FAO=22;FDP=48;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=0.0241158;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.491;QD=18.5225;RBI=0.0244904;REFB=-0.0353911;REVB=0.00426734;RO=26;SAF=10;SAR=12;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18863;STB=0.606647;STBP=0.202;TYPE=snp;VARB=0.037213;OID=.;OPOS=112197082;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:26:26:22:22:0.458333:12:10:17:9:12:10:17:9
chr5	112200098	.	A	G	287.74	PASS	AF=0.5;AO=31;DP=62;FAO=31;FDP=62;FR=.;FRO=31;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=9;FWDB=0.0410893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.5105;QD=18.5641;RBI=0.0456088;REFB=-0.00808586;REVB=0.0197948;RO=31;SAF=14;SAR=17;SRF=22;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.228501;STB=0.626971;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.00704647;OID=.;OPOS=112200098;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:31:31:31:31:0.5:17:14:22:9:17:14:22:9
chr5	112203564	.	T	A	171.26	PASS	AF=0.381818;AO=21;DP=55;FAO=21;FDP=55;FR=.;FRO=34;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=0.00961203;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=304.808;QD=12.4555;RBI=0.0097834;REFB=-0.00616217;REVB=0.00182308;RO=34;SAF=6;SAR=15;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.273895;STB=0.659183;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.00759693;OID=.;OPOS=112203564;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:34:34:21:21:0.381818:15:6:18:16:15:6:18:16
chr5	112228670	.	G	A	254.53	PASS	AF=0.414286;AO=14;DP=70;FAO=29;FDP=70;FR=.,HEALED;FRO=41;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=-0.0294244;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.0703;QD=14.5443;RBI=0.0346175;REFB=-0.0386932;REVB=0.0182367;RO=27;SAF=1;SAR=13;SRF=6;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.365796;STB=0.511345;STBP=0.883;TYPE=snp;VARB=0.0644176;OID=.;OPOS=112228670;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:27:41:14:29:0.414286:13:1:6:21:15:14:19:22
chr5	112228765	.	C	A	171.82	PASS	AF=0.392157;AO=20;DP=52;FAO=20;FDP=51;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=-0.0421652;FXX=0.0192271;HRUN=4;LEN=1;MLLD=53.9559;QD=13.4763;RBI=0.042175;REFB=-0.0367634;REVB=-0.000911845;RO=31;SAF=9;SAR=11;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0696766;STB=0.540235;STBP=0.615;TYPE=snp;VARB=0.0285766;OID=.;OPOS=112228765;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:51:31:31:20:20:0.392157:11:9:16:15:11:9:16:15
chr5	112257908	.	T	C	897.16	PASS	AF=0.561644;AO=82;DP=146;FAO=82;FDP=146;FR=.;FRO=64;FSAF=40;FSAR=42;FSRF=29;FSRR=35;FWDB=0.0158383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.249;QD=24.5798;RBI=0.0164717;REFB=-0.0185511;REVB=0.00452409;RO=62;SAF=40;SAR=42;SRF=27;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0414235;STB=0.515219;STBP=0.677;TYPE=snp;VARB=0.0131092;OID=.;OPOS=112257908;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:146:146:62:64:82:82:0.561644:42:40:27:35:42:40:29:35
chr5	112312528	.	T	C	612.97	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0301127;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.6154;QD=61.2965;RBI=0.0663704;REFB=0;REVB=0.0591461;RO=0;SAF=27;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00117369;OID=.;OPOS=112312528;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:13:27:0:0:13:27:0:0
chr5	112312676	.	T	C	1549.21	PASS	AF=1;AO=95;DP=99;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0181865;FXX=0.0202;HRUN=3;LEN=1;MLLD=263.215;QD=63.8849;RBI=0.0286322;REFB=0;REVB=0.0221145;RO=0;SAF=39;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000226675;OID=.;OPOS=112312676;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:99:97:0:0:95:97:1:56:39:0:0:56:41:0:0
chr5	112346432	.	G	T	65.69	PASS	AF=0.434783;AO=2;DP=15;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=0.00184777;FXX=0.0416493;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.721;QD=11.4238;RBI=0.0846517;REFB=0.00269872;REVB=0.0846315;RO=2;SAF=2;SAR=0;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.608488;STBP=0.39;TYPE=snp;VARB=-0.00218821;OID=.;OPOS=112346432;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:15:23:2:13:2:10:0.434783:0:2:2:0:5:5:9:4
chr5	112384725	.	GGTCACTGGGCA	G	293.54	PASS	AF=0.783784;AO=28;DP=33;FAO=29;FDP=37;FR=.;FRO=8;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.0266657;FXX=0.0512689;HRUN=2;LEN=11;MLLD=370.429;QD=31.7341;RBI=0.0277533;REFB=-0.0338456;REVB=0.00769305;RO=0;SAF=15;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.523348;STBP=0.616;TYPE=del;VARB=0.0086195;OID=.;OPOS=112384726;OREF=GTCACTGGGCA;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.783784:28:33:29:37:8:15:14:5:3:35:0:15:13:0:0
chr5	112384802	.	G	A	1062.42	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0519061;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.278;QD=59.8549;RBI=0.0588982;REFB=0;REVB=0.0278344;RO=0;SAF=23;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00056525;OID=.;OPOS=112384802;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:48:23:0:0:48:23:0:0
chr5	112406862	.	G	A,T	802.28	PASS	AF=0.947368,0.0526316;AO=54,3;DP=57;FAO=54,3;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=19,0;FSAR=35,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0386022,-0.0266825;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=198.884,166.819;QD=56.3005;RBI=0.0437352,0.0326336;REFB=0,0;REVB=0.0205582,0.0187881;RO=0;SAF=19,0;SAR=35,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.86274e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000392048,0.154347;OID=.,.;OPOS=112406862,112406862;OREF=G,G;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:11:57:57:0:0:54,3:54,3:0.947368,0.0526316:35,3:19,0:0:0:35,3:19,0:0:0
chr5	112439941	.	T	C	910.97	PASS	AF=1;AO=62;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0158873;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.7793;QD=57.8392;RBI=0.0224505;REFB=0;REVB=0.0158625;RO=0;SAF=39;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.75648e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000321262;OID=.;OPOS=112439941;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:62:63:1:23:39:0:0:23:40:0:0
chr5	112479004	.	T	C	867.81	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00658753;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.133;QD=57.8543;RBI=0.00663789;REFB=0;REVB=-0.000816157;RO=0;SAF=35;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.89445e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.70409e-05;OID=.;OPOS=112479004;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:25:35:0:0:25:35:0:0
chr5	112823998	.	C	T	2620.53	PASS	AF=1;AO=163;DP=163;FAO=169;FDP=169;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=102;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.051168;FXX=0.00588201;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.129;QD=62.0243;RBI=0.0534144;REFB=0;REVB=0.0153277;RO=0;SAF=62;SAR=101;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.5499e-05;OID=.;OPOS=112823998;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:163:169:0:0:163:169:1:101:62:0:0:102:67:0:0
chr5	112824039	.	T	C	526.71	PASS	AF=0.972973;AO=35;DP=37;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0674286;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.658;QD=56.942;RBI=0.0714436;REFB=-0.0510727;REVB=0.023613;RO=1;SAF=15;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.022817;STB=0.511621;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.00511149;OID=.;OPOS=112824039;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:37:37:1:1:35:36:0.972973:20:15:0:1:21:15:0:1
chr5	112871492	.	T	C	104.81	PASS	AF=0.333333;AO=13;DP=39;FAO=13;FDP=39;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=-0.0104682;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.842;QD=10.7497;RBI=0.0381158;REFB=-0.000585652;REVB=0.0366501;RO=26;SAF=5;SAR=8;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.293411;STB=0.674073;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=0.00168058;OID=.;OPOS=112871492;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:26:26:13:13:0.333333:8:5:17:9:8:5:17:9
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chr5	113698544	.	G	C	117.2	PASS	AF=0.358974;AO=14;DP=39;FAO=14;FDP=39;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=-0.000197365;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.999;QD=12.0203;RBI=0.0105679;REFB=-0.0165659;REVB=-0.0105661;RO=25;SAF=9;SAR=5;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0496186;STB=0.529369;STBP=0.795;TYPE=snp;VARB=0.0303116;OID=.;OPOS=113698544;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:25:25:14:14:0.358974:5:9:15:10:5:9:15:10
chr5	113698631	.	T	TGCC	60.61	PASS	AF=0.204545;AO=8;DP=52;FAO=9;FDP=44;FR=.;FRO=35;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=-0.0588312;FXX=0.0434688;HRUN=1;LEN=3;MLLD=174.501;QD=5.50959;RBI=0.0638899;REFB=-0.00929885;REVB=-0.0249159;RO=43;SAF=3;SAR=5;SRF=25;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.246785;STB=0.577718;STBP=0.663;TYPE=ins;VARB=0.0438998;OID=.;OPOS=113698632;OREF=-;OALT=GCC;OMAPALT=TGCC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.204545:8:52:9:44:35:4:5:19:16:60:43:3:5:25:18
chr5	113829121	.	A	G	739.07	PASS	AF=0.981481;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0118599;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.971;QD=54.7462;RBI=0.0184913;REFB=0.0546813;REVB=0.0141869;RO=1;SAF=18;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0254518;STB=0.513508;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=-0.000756921;OID=.;OPOS=113829121;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:54:54:1:1:53:53:0.981481:35:18:1:0:35:18:1:0
chr5	114460539	.	T	C	1453.49	PASS	AF=1;AO=92;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00495042;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.068;QD=63.1953;RBI=0.00726018;REFB=0;REVB=0.0053107;RO=0;SAF=54;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.09023e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.11521e-07;OID=.;OPOS=114460539;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:92:92:0:0:92:92:1:38:54:0:0:38:54:0:0
chr5	114460580	.	C	G	566.42	PASS	AF=0.513274;AO=58;DP=113;FAO=58;FDP=113;FR=.;FRO=55;FSAF=38;FSAR=20;FSRF=27;FSRR=28;FWDB=0.000987885;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.2675;QD=20.0503;RBI=0.00923444;REFB=0.00829488;REVB=-0.00918145;RO=55;SAF=38;SAR=20;SRF=27;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151772;STB=0.583837;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=-0.00903939;OID=.;OPOS=114460580;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:113:55:55:58:58:0.513274:20:38:27:28:20:38:27:28
chr5	114462355	.	C	T	937.61	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0313439;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.646;QD=58.6006;RBI=0.0317438;REFB=0;REVB=0.00502297;RO=0;SAF=41;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.04772e-05;OID=.;OPOS=114462355;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:23:41:0:0:23:41:0:0
chr5	114469724	.	T	C	1641.73	PASS	AF=1;AO=109;DP=109;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0483365;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.568;QD=60.2469;RBI=0.0486901;REFB=0;REVB=-0.00585712;RO=0;SAF=58;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000160787;OID=.;OPOS=114469724;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:109:109:0:0:109:109:1:51:58:0:0:51:58:0:0
chr5	114480364	.	C	T	807.43	PASS	AF=0.513333;AO=77;DP=150;FAO=77;FDP=150;FR=.;FRO=73;FSAF=36;FSAR=41;FSRF=29;FSRR=44;FWDB=0.00553507;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.468;QD=21.5315;RBI=0.0056583;REFB=0.0105271;REVB=0.00117448;RO=73;SAF=36;SAR=41;SRF=29;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0628238;STB=0.534489;STBP=0.391;TYPE=snp;VARB=-0.00819661;OID=.;OPOS=114480364;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:150:150:73:73:77:77:0.513333:41:36:29:44:41:36:29:44
chr5	114858437	.	G	T	880.1	PASS	AF=1;AO=51;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=32;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00865356;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.647;QD=57.7112;RBI=0.0392009;REFB=0;REVB=0.0382339;RO=0;SAF=29;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000251901;OID=.;OPOS=114858437;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:51:61:1:22:29:0:0:29:32:0:0
chr5	115176589	.	A	G	1453.32	PASS	AF=1;AO=92;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0189061;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.913;QD=63.188;RBI=0.0287019;REFB=0;REVB=-0.0215954;RO=0;SAF=49;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.24949e-06;OID=.;OPOS=115176589;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:92:92:0:0:92:92:1:43:49:0:0:43:49:0:0
chr5	115188660	.	A	G	754.4	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0216962;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.4236;QD=56.9359;RBI=0.0274823;REFB=0;REVB=0.0168686;RO=0;SAF=30;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.72004e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000271977;OID=.;OPOS=115188660;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:23:30:0:0:23:30:0:0
chr5	115249078	.	C	T	35.87	PASS	AF=0.118644;AO=7;DP=59;FAO=7;FDP=59;FR=.;FRO=52;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=24;FSRR=28;FWDB=-0.0133313;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=222.389;QD=2.43213;RBI=0.021022;REFB=-0.0019046;REVB=-0.0162543;RO=52;SAF=3;SAR=4;SRF=24;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0392121;STB=0.529327;STBP=0.961;TYPE=snp;VARB=0.0178594;OID=.;OPOS=115249078;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:59:59:52:52:7:7:0.118644:4:3:24:28:4:3:24:28
chr5	115249271	.	G	A	240.63	PASS	AF=0.23871;AO=37;DP=155;FAO=37;FDP=155;FR=.;FRO=118;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=71;FSRR=47;FWDB=0.00920155;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.9663;QD=6.20991;RBI=0.0239488;REFB=5.53289e-05;REVB=-0.0221106;RO=117;SAF=21;SAR=16;SRF=70;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0395715;STB=0.52664;STBP=0.715;TYPE=snp;VARB=-0.000625974;OID=.;OPOS=115249271;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:155:155:117:118:37:37:0.23871:16:21:70:47:16:21:71:47
chr5	115298232	.	G	C	818.17	PASS	AF=1;AO=55;DP=56;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0600299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.587;QD=57.4154;RBI=0.0613299;REFB=0;REVB=0.0125607;RO=0;SAF=29;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.40922e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.45787e-05;OID=.;OPOS=115298232;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:56:57:0:0:55:57:1:26:29:0:0:26:31:0:0
chr5	115298378	.	C	T	689.38	PASS	AF=1;AO=30;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.03681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.632;QD=62.6708;RBI=0.0436178;REFB=0;REVB=0.0233994;RO=0;SAF=19;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00012815;OID=.;OPOS=115298378;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:30:44:1:11:19:0:0:24:20:0:0
chr5	115298475	.	T	C	447.0	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00538568;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.841;QD=57.6771;RBI=0.0208326;REFB=0;REVB=0.0201245;RO=0;SAF=22;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.15349e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000116998;OID=.;OPOS=115298475;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:9:22:0:0:9:22:0:0
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chr5	115298518	.	A	G	392.21	PASS	AF=0.935484;AO=29;DP=31;FAO=29;FDP=31;FR=.;FRO=2;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00929263;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.49;QD=50.6075;RBI=0.0184863;REFB=-0.112812;REVB=0.015981;RO=2;SAF=18;SAR=11;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0489889;STB=0.526298;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.00581353;OID=.;OPOS=115298518;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:31:31:2:2:29:29:0.935484:11:18:2:0:11:18:2:0
chr5	115298977	.	C	T	3833.32	PASS	AF=0.988189;AO=247;DP=250;FAO=251;FDP=254;FR=.;FRO=3;FSAF=135;FSAR=116;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0500351;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.0057;QD=60.3673;RBI=0.0775113;REFB=-0.10818;REVB=0.0591988;RO=3;SAF=133;SAR=114;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00295046;STB=0.50153;STBP=0.705;TYPE=snp;VARB=0.0051902;OID=.;OPOS=115298977;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:250:254:3:3:247:251:0.988189:114:133:2:1:116:135:2:1
chr5	115341611	.	G	T	1785.86	PASS	AF=1;AO=117;DP=117;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0035664;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.884;QD=61.0549;RBI=0.0146157;REFB=0;REVB=0.0141739;RO=0;SAF=58;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.65113e-05;OID=.;OPOS=115341611;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:117:117:0:0:117:117:1:59:58:0:0:59:58:0:0
chr5	115341638	.	G	C	1641.94	PASS	AF=1;AO=109;DP=109;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0114603;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.8385;QD=60.2547;RBI=0.0115301;REFB=0;REVB=-0.00126633;RO=0;SAF=55;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.66846e-05;OID=.;OPOS=115341638;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:109:109:0:0:109:109:1:54:55:0:0:54:55:0:0
chr5	115362148	.	A	G	600.05	PASS	AF=0.574257;AO=58;DP=101;FAO=58;FDP=101;FR=.;FRO=43;FSAF=20;FSAR=38;FSRF=19;FSRR=24;FWDB=0.0103226;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=78.1749;QD=23.7642;RBI=0.0113853;REFB=-0.0101182;REVB=0.00480287;RO=42;SAF=20;SAR=38;SRF=18;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0694721;STB=0.544437;STBP=0.327;TYPE=snp;VARB=0.00473154;OID=.;OPOS=115362148;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:101:42:43:58:58:0.574257:38:20:18:24:38:20:19:24
chr5	115783320	.	C	T	327.66	PASS	AF=0.472973;AO=35;DP=75;FAO=35;FDP=74;FR=.;FRO=39;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=14;FSRR=25;FWDB=0.0324705;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.4694;QD=17.7115;RBI=0.0330882;REFB=-0.00465148;REVB=-0.0063635;RO=39;SAF=15;SAR=20;SRF=14;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0677561;STB=0.537827;STBP=0.538;TYPE=snp;VARB=0.00444178;OID=.;OPOS=115783320;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:74:39:39:35:35:0.472973:20:15:14:25:20:15:14:25
chr5	115811220	.	T	C	636.73	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0117344;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.706;QD=62.1201;RBI=0.0119828;REFB=0;REVB=0.00242754;RO=0;SAF=26;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000303014;OID=.;OPOS=115811220;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:41:0:0:40:41:1:14:26:0:0:14:27:0:0
chr5	115813726	.	A	G	861.95	PASS	AF=0.983871;AO=60;DP=63;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0935701;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.8884;QD=55.6097;RBI=0.0938794;REFB=-0.0583803;REVB=0.00761489;RO=1;SAF=27;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0140874;STB=0.50746;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.00213658;OID=.;OPOS=115813726;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:63:62:1:1:60:61:0.983871:33:27:0:1:33:28:0:1
chr5	118484804	.	G	A	689.38	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0363843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.71;QD=62.6711;RBI=0.037231;REFB=0;REVB=-0.00789499;RO=0;SAF=20;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.30465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.59849e-05;OID=.;OPOS=118484804;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:24:20:0:0:24:20:0:0
chr5	118503399	.	TAAAAAAG	TAAAAA,TAAAAAG	54.91	PASS	AF=0.025641,0.435897;AO=6,12;DP=39;FAO=1,17;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=0,6;FSAR=1,11;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=-0.034571,0.0309465;FXX=0.0249938;HRUN=6,6;LEN=2,1;MLLD=90.461,7.9048;QD=5.63155;RBI=0.0431518,0.126709;REFB=-0.00601805,-0.111895;REVB=-0.0258248,-0.122872;RO=17;SAF=1,5;SAR=5,7;SRF=6;SRR=11;SSEN=0,0;SSEP=0.302326,0.302326;SSSB=-0.276799,0.0664552;STB=0.986681,0.511931;STBP=0.482,0.875;TYPE=del,del;VARB=0.161434,0.0703448;OID=.,.;OPOS=118503405,118503400;OREF=AG,A;OALT=-,-;OMAPALT=TAAAAA,TAAAAAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0.025641,0.435897:6,12:39:1,17:39:21:0,6:1,11:7:14:49:17:1,5:5,7:6:11
chr5	118669336	.	A	G	164.01	PASS	AF=0.125984;AO=16;DP=126;FAO=16;FDP=127;FR=.,HEALED;FRO=98;FSAF=14;FSAR=2;FSRF=22;FSRR=76;FWDB=-0.0265622;FXX=0.00781189;HRUN=4;LEN=1;MLLD=187.368;QD=5.16573;RBI=0.0303411;REFB=-0.012313;REVB=0.014664;RO=96;SAF=14;SAR=2;SRF=20;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.711306;STB=0.937773;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0825986;OID=.;OPOS=118669336;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:126:127:96:98:16:16:0.125984:2:14:20:76:2:14:22:76
chr5	118691065	.	C	T	341.84	PASS	AF=0.430233;AO=37;DP=86;FAO=37;FDP=86;FR=.;FRO=49;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=19;FSRR=30;FWDB=0.00836793;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=239.548;QD=15.8995;RBI=0.0084601;REFB=-0.0157159;REVB=-0.00124539;RO=49;SAF=16;SAR=21;SRF=19;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0463686;STB=0.526098;STBP=0.68;TYPE=snp;VARB=0.0201162;OID=.;OPOS=118691065;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:49:49:37:37:0.430233:21:16:19:30:21:16:19:30
chr5	118811533	.	G	A	486.64	PASS	AF=0.560976;AO=45;DP=81;FAO=46;FDP=82;FR=.;FRO=36;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=0.00185408;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.919;QD=23.7385;RBI=0.0210629;REFB=-0.0177121;REVB=-0.0209811;RO=34;SAF=23;SAR=22;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0548015;STB=0.53657;STBP=0.486;TYPE=snp;VARB=0.0220626;OID=.;OPOS=118811533;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:82:34:36:45:46:0.560976:22:23:15:19:23:23:15:21
chr5	118827842	.	T	C	406.77	PASS	AF=0.434343;AO=42;DP=99;FAO=43;FDP=99;FR=.;FRO=56;FSAF=15;FSAR=28;FSRF=23;FSRR=33;FWDB=-0.0117074;FXX=0.009999;HRUN=3;LEN=1;MLLD=207.511;QD=16.4353;RBI=0.0129572;REFB=-0.0178027;REVB=-0.00555192;RO=56;SAF=15;SAR=27;SRF=23;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.058037;STB=0.537627;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=0.0265833;OID=.;OPOS=118827842;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:56:56:42:43:0.434343:27:15:23:33:28:15:23:33
chr5	118845139	.	G	A	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0270202;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.9711;QD=33.4284;RBI=0.103157;REFB=0;REVB=0.0995554;RO=0;SAF=3;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0140516;OID=.;OPOS=118845139;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:3:3:0:0:3:3:0:0
chr5	118861713	.	A	G	135.07	PASS	AF=0.46875;AO=15;DP=32;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.0108971;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.318;QD=16.8837;RBI=0.0399013;REFB=-0.00758065;REVB=0.0383845;RO=17;SAF=3;SAR=12;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.353611;STB=0.705579;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=0.0172807;OID=.;OPOS=118861713;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:17:17:15:15:0.46875:12:3:9:8:12:3:9:8
chr5	118969960	.	C	T	239.34	PASS	AF=0.5;AO=19;DP=44;FAO=23;FDP=46;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=0.0468777;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=229.612;QD=20.8117;RBI=0.0469611;REFB=0.00642077;REVB=0.00279835;RO=17;SAF=10;SAR=9;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.193596;STB=0.544709;STBP=0.565;TYPE=snp;VARB=-0.00599606;OID=.;OPOS=118969960;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:46:17:23:19:23:0.5:9:10:5:12:13:10:8:15
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chr5	121309893	.	T	C	190.51	PASS	AF=0.408163;AO=20;DP=49;FAO=20;FDP=49;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.0220278;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.122;QD=15.5515;RBI=0.0237627;REFB=0.00526791;REVB=0.00891294;RO=29;SAF=10;SAR=10;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0177286;STB=0.510194;STBP=0.934;TYPE=snp;VARB=-0.0117506;OID=.;OPOS=121309893;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:29:29:20:20:0.408163:10:10:14:15:10:10:14:15
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chr5	121518309	.	G	A	623.52	PASS	AF=0.394444;AO=70;DP=180;FAO=71;FDP=180;FR=.;FRO=109;FSAF=33;FSAR=38;FSRF=47;FSRR=62;FWDB=0.00251676;FXX=0.00552456;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.012;QD=13.856;RBI=0.0247053;REFB=-0.00391896;REVB=-0.0245768;RO=109;SAF=32;SAR=38;SRF=46;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0383723;STB=0.520499;STBP=0.672;TYPE=snp;VARB=0.00529128;OID=.;OPOS=121518309;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:180:180:109:109:70:71:0.394444:38:32:46:63:38:33:47:62
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chr5	122435627	.	G	A	729.0	PASS	AF=0.466667;AO=77;DP=165;FAO=77;FDP=165;FR=.;FRO=88;FSAF=22;FSAR=55;FSRF=31;FSRR=57;FWDB=0.00235233;FXX=0.00602373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.1696;QD=17.6729;RBI=0.0106497;REFB=-0.0160553;REVB=-0.0103867;RO=88;SAF=22;SAR=55;SRF=31;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0754502;STB=0.541911;STBP=0.371;TYPE=snp;VARB=0.0199383;OID=.;OPOS=122435627;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:165:165:88:88:77:77:0.466667:55:22:31:57:55:22:31:57
chr5	122681834	.	C	T	556.56	PASS	AF=0.487395;AO=58;DP=119;FAO=58;FDP=119;FR=.;FRO=61;FSAF=29;FSAR=29;FSRF=24;FSRR=37;FWDB=-0.040023;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.443;QD=18.7079;RBI=0.0474861;REFB=-0.011279;REVB=-0.0255556;RO=61;SAF=29;SAR=29;SRF=24;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0987724;STB=0.554603;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=0.0107891;OID=.;OPOS=122681834;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:119:61:61:58:58:0.487395:29:29:24:37:29:29:24:37
chr5	122682348	.	A	G	203.23	PASS	AF=0.540541;AO=20;DP=37;FAO=20;FDP=37;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=0.0183749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.592;QD=21.9706;RBI=0.0195064;REFB=-0.00612889;REVB=0.00654679;RO=17;SAF=9;SAR=11;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131193;STB=0.573336;STBP=0.365;TYPE=snp;VARB=0.00685968;OID=.;OPOS=122682348;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:17:17:20:20:0.540541:11:9:5:12:11:9:5:12
chr5	122718736	.	G	C	819.76	PASS	AF=0.399142;AO=92;DP=235;FAO=93;FDP=233;FR=.;FRO=140;FSAF=38;FSAR=55;FSRF=54;FSRR=86;FWDB=-0.00595062;FXX=0.00851028;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.2843;QD=14.0732;RBI=0.0191459;REFB=-0.0154752;REVB=0.0181976;RO=139;SAF=38;SAR=54;SRF=53;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0353578;STB=0.514299;STBP=0.751;TYPE=snp;VARB=0.028737;OID=.;OPOS=122718736;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:235:233:139:140:92:93:0.399142:54:38:53:86:55:38:54:86
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chr5	122758268	.	G	C	1152.36	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.063467;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.047;QD=60.6506;RBI=0.0639974;REFB=0;REVB=0.0082227;RO=0;SAF=30;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000108991;OID=.;OPOS=122758268;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:76:0:0:69:76:1:39:30:0:0:39:37:0:0
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chr5	122950330	.	G	C	205.16	PASS	AF=0.442308;AO=23;DP=52;FAO=23;FDP=52;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=-0.0522623;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.8268;QD=15.7817;RBI=0.0656219;REFB=0.00487194;REVB=0.0396849;RO=28;SAF=10;SAR=13;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131848;STB=0.583954;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=-0.00681923;OID=.;OPOS=122950330;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:28:29:23:23:0.442308:13:10:16:12:13:10:17:12
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chr5	122950911	.	G	A	375.66	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0182588;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.783;QD=55.6534;RBI=0.0209762;REFB=0;REVB=-0.0103255;RO=0;SAF=16;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000192781;OID=.;OPOS=122950911;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:11:16:0:0:11:16:0:0
chr5	122990902	.	A	T	85.77	PASS	AF=0.37931;AO=11;DP=29;FAO=11;FDP=29;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=-0.00920027;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.554;QD=11.8306;RBI=0.00929328;REFB=-0.0124397;REVB=0.00131148;RO=17;SAF=5;SAR=6;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0444202;STB=0.541327;STBP=0.755;TYPE=snp;VARB=0.0190116;OID=.;OPOS=122990902;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:29:29:17:18:11:11:0.37931:6:5:7:10:6:5:7:11
chr5	123972799	.	G	A	94.91	PASS	AF=0.27451;AO=10;DP=52;FAO=14;FDP=51;FR=.;FRO=37;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=30;FWDB=0.0999542;FXX=0.13557;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.19;QD=7.44413;RBI=0.0999543;REFB=-0.00150124;REVB=-7.52515e-05;RO=41;SAF=0;SAR=10;SRF=6;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.645191;STB=0.64339;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.00505528;OID=.;OPOS=123972799;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:52:51:41:37:10:14:0.27451:10:0:6:35:9:5:7:30
chr5	123973360	.	T	TTA	126.65	PASS	AF=0.928571;AO=8;DP=43;FAO=13;FDP=14;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0719962;FXX=0.0666222;HRUN=3;LEN=2;MLLD=128.403;QD=36.1843;RBI=0.0916475;REFB=-0.126866;REVB=0.0567081;RO=33;SAF=4;SAR=4;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0550114;STB=0.538402;STBP=0.559;TYPE=ins;VARB=0.00531354;OID=.;OPOS=123973361;OREF=-;OALT=TA;OMAPALT=TTA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.928571:8:43:13:14:1:6:7:1:0:6:33:4:4:18:15
chr5	123984763	.	C	T	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0476749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.713;QD=49.5991;RBI=0.0503228;REFB=0;REVB=0.0161087;RO=0;SAF=9;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000618409;OID=.;OPOS=123984763;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:9:9:0:0:9:9:0:0
chr5	124686757	.	G	A	604.54	PASS	AF=0.97561;AO=40;DP=42;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0116384;FXX=0.0238039;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.446;QD=58.9792;RBI=0.0185946;REFB=-0.010178;REVB=-0.014502;RO=1;SAF=22;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0208425;STB=0.511106;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000245912;OID=.;OPOS=124686757;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:42:41:1:1:40:40:0.97561:18:22:1:0:18:22:1:0
chr5	125696140	.	G	A	557.13	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0172276;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=290.695;QD=60.2307;RBI=0.0182085;REFB=0;REVB=0.00589577;RO=0;SAF=19;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.68991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.9075e-05;OID=.;OPOS=125696140;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:18:19:0:0:18:19:0:0
chr5	125828803	.	A	G	799.5	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0269776;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.16;QD=63.9597;RBI=0.0347904;REFB=0;REVB=0.0219678;RO=0;SAF=22;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.39757e-06;OID=.;OPOS=125828803;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:50:0:0:47:50:1:25:22:0:0:28:22:0:0
chr5	125911132	.	G	A	71.66	PASS	AF=0.6;AO=9;DP=15;FAO=9;FDP=15;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.0148639;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.286;QD=19.1085;RBI=0.0150306;REFB=-0.00914974;REVB=-0.00223257;RO=6;SAF=4;SAR=5;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.038662;STB=0.522338;STBP=0.939;TYPE=snp;VARB=0.0080159;OID=.;OPOS=125911132;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:15:15:6:6:9:9:0.6:5:4:3:3:5:4:3:3
chr5	126171999	.	T	C	313.97	PASS	AF=0.478873;AO=33;DP=71;FAO=34;FDP=71;FR=.;FRO=37;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=-0.0150879;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.5536;QD=17.6884;RBI=0.0255915;REFB=0.00425944;REVB=0.0206708;RO=37;SAF=13;SAR=20;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0636583;STB=0.541678;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=-0.00783671;OID=.;OPOS=126171999;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:37:37:33:34:0.478873:20:13:17:20:21:13:17:20
chr5	126383592	.	G	T	280.12	PASS	AF=0.517241;AO=29;DP=57;FAO=30;FDP=58;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=9;FSRR=19;FWDB=-0.000143904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.758;QD=19.3189;RBI=0.00331713;REFB=-0.00800063;REVB=-0.003314;RO=28;SAF=12;SAR=17;SRF=9;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0853269;STB=0.54012;STBP=0.572;TYPE=snp;VARB=0.00885413;OID=.;OPOS=126383592;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:58:28:28:29:30:0.517241:17:12:9:19:18:12:9:19
chr5	126746277	.	C	T	937.58	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00476167;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.0473;QD=58.5984;RBI=0.0262461;REFB=0;REVB=-0.0258106;RO=0;SAF=25;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.30166e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000211305;OID=.;OPOS=126746277;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:39:25:0:0:39:25:0:0
chr5	126792974	.	T	A	979.28	PASS	AF=1;AO=66;DP=68;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0140768;FXX=0.0294074;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.939;QD=59.35;RBI=0.0141342;REFB=0;REVB=0.00127308;RO=0;SAF=36;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.81115e-05;OID=.;OPOS=126792974;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:66:0:0:66:66:1:30:36:0:0:30:36:0:0
chr5	126993249	.	G	C	1025.14	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.01156;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.557;QD=59.4282;RBI=0.065322;REFB=0;REVB=-0.064291;RO=0;SAF=33;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.61397e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.19646e-05;OID=.;OPOS=126993249;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:67:69:0:0:67:69:1:34:33:0:0:34:35:0:0
chr5	126993263	.	A	T	1153.59	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0261071;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.657;QD=60.7154;RBI=0.026114;REFB=0;REVB=0.000599943;RO=0;SAF=37;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.62845e-05;OID=.;OPOS=126993263;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:39:37:0:0:39:37:0:0
chr5	126993282	.	G	A	331.28	PASS	AF=0.381443;AO=37;DP=97;FAO=37;FDP=97;FR=.;FRO=60;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=34;FSRR=26;FWDB=-0.0144226;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.5169;QD=13.6611;RBI=0.0154254;REFB=0.0022703;REVB=0.00547098;RO=59;SAF=16;SAR=21;SRF=33;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136502;STB=0.582641;STBP=0.194;TYPE=snp;VARB=-0.00278648;OID=.;OPOS=126993282;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:59:60:37:37:0.381443:21:16:33:26:21:16:34:26
chr5	126993958	.	C	T	887.74	PASS	AF=0.953846;AO=59;DP=65;FAO=62;FDP=65;FR=.,HEALED;FRO=2;FSAF=36;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0124183;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=232.274;QD=54.6302;RBI=0.0131958;REFB=-0.0207031;REVB=-0.00446264;RO=2;SAF=33;SAR=26;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0349148;STB=0.518513;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=-3.14258e-05;OID=.;OPOS=126993958;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:65:65:2:2:59:62:0.953846:26:33:0:2:26:36:0:2
chr5	127469859	.	A	G	149.08	PASS	AF=0.5;AO=16;DP=32;FAO=16;FDP=32;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.0153856;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.969;QD=18.6352;RBI=0.015675;REFB=-0.0116248;REVB=-0.00299833;RO=16;SAF=9;SAR=7;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0552398;STB=0.531457;STBP=0.66;TYPE=snp;VARB=0.0133105;OID=.;OPOS=127469859;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:16:16:16:16:0.5:7:9:8:8:7:9:8:8
chr5	127522543	.	C	T	571.37	PASS	AF=0.458015;AO=60;DP=132;FAO=60;FDP=131;FR=.;FRO=71;FSAF=32;FSAR=28;FSRF=33;FSRR=38;FWDB=-0.00210916;FXX=0.00757518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.565;QD=17.4463;RBI=0.0104884;REFB=-0.00626471;REVB=-0.0102741;RO=72;SAF=32;SAR=28;SRF=34;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0598666;STB=0.537119;STBP=0.46;TYPE=snp;VARB=0.00649896;OID=.;OPOS=127522543;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:132:131:72:71:60:60:0.458015:28:32:34:38:28:32:33:38
chr5	127614472	.	A	G	1160.66	PASS	AF=1;AO=76;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00855495;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.5969;QD=60.2941;RBI=0.013832;REFB=-0.0145618;REVB=-0.0108691;RO=0;SAF=34;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6391e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000275983;OID=.;OPOS=127614472;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:77:77:0:0:76:77:1:42:34:0:0:43:34:0:0
chr5	127622491	.	T	C	224.86	PASS	AF=0.391304;AO=26;DP=68;FAO=27;FDP=69;FR=.;FRO=42;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=25;FSRR=17;FWDB=-0.0104214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.669;QD=13.0354;RBI=0.0155225;REFB=0.00403047;REVB=-0.011504;RO=41;SAF=14;SAR=12;SRF=24;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.050574;STB=0.546891;STBP=0.562;TYPE=snp;VARB=-0.00739525;OID=.;OPOS=127622491;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:69:41:42:26:27:0.391304:12:14:24:17:13:14:25:17
chr5	127625559	.	T	C	332.49	PASS	AF=0.366071;AO=41;DP=112;FAO=41;FDP=112;FR=.;FRO=71;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=38;FSRR=33;FWDB=-0.00977066;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.6115;QD=11.8746;RBI=0.0573404;REFB=-0.00494236;REVB=0.0565018;RO=70;SAF=19;SAR=22;SRF=37;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0718643;STB=0.545432;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=0.0116436;OID=.;OPOS=127625559;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:112:70:71:41:41:0.366071:22:19:37:33:22:19:38:33
chr5	127685135	.	C	T	885.43	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0157898;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.527;QD=58.0607;RBI=0.0172829;REFB=0;REVB=-0.00702702;RO=0;SAF=24;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.15666e-05;OID=.;OPOS=127685135;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:37:24:0:0:37:24:0:0
chr5	128430757	.	T	C	1415.21	PASS	AF=1;AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0319697;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.839;QD=62.8984;RBI=0.0412127;REFB=0;REVB=0.0260081;RO=0;SAF=29;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.67238e-05;OID=.;OPOS=128430757;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:90:90:0:0:90:90:1:61:29:0:0:61:29:0:0
chr5	128797156	.	C	G	34.83	PASS	AF=0.833333;AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0354866;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=180.338;QD=23.2183;RBI=0.0420276;REFB=0.00549924;REVB=0.022517;RO=1;SAF=2;SAR=3;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169284;STB=0.599598;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=-0.00273113;OID=.;OPOS=128797156;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:6:6:1:1:5:5:0.833333:3:2:1:0:3:2:1:0
chr5	128797315	.	T	TCCCGGC	124.56	PASS	AF=0.208333;AO=19;DP=106;FAO=20;FDP=96;FR=.;FRO=76;FSAF=3;FSAR=17;FSRF=40;FSRR=36;FWDB=-0.0156722;FXX=0.0204061;HRUN=3;LEN=6;MLLD=257.799;QD=5.18983;RBI=0.0255249;REFB=-0.00713964;REVB=-0.020147;RO=84;SAF=2;SAR=17;SRF=46;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.584615;STB=0.821005;STBP=0.003;TYPE=ins;VARB=0.0241305;OID=.;OPOS=128797316;OREF=-;OALT=CCCGGC;OMAPALT=TCCCGGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.208333:19:106:20:96:76:3:17:40:36:99:84:2:17:46:38
chr5	128863471	.	A	G	884.63	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00893435;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.168;QD=58.0088;RBI=0.00917889;REFB=0;REVB=-0.00210462;RO=0;SAF=32;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.23609e-05;OID=.;OPOS=128863471;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:61:0:0:60:61:1:28:32:0:0:28:33:0:0
chr5	129072943	.	G	T	513.57	PASS	AF=1;AO=33;DP=34;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0763489;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.3979;QD=58.6941;RBI=0.0800688;REFB=0;REVB=-0.0241217;RO=1;SAF=15;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0301269;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00197931;OID=.;OPOS=129072943;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:35:1:0:33:35:1:18:15:1:0:19:16:0:0
chr5	129520679	.	G	A	116.21	PASS	AF=0.565217;AO=13;DP=23;FAO=13;FDP=23;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=-0.01876;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=294.252;QD=20.2097;RBI=0.0189633;REFB=-0.0178126;REVB=0.00276901;RO=10;SAF=4;SAR=9;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159391;STB=0.591095;STBP=0.376;TYPE=snp;VARB=0.00893267;OID=.;OPOS=129520679;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:23:23:10:10:13:13:0.565217:9:4:5:5:9:4:5:5
chr5	129521126	.	A	G	255.75	PASS	AF=0.446154;AO=29;DP=65;FAO=29;FDP=65;FR=.;FRO=36;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=23;FSRR=13;FWDB=-0.0130026;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.011;QD=15.7382;RBI=0.02147;REFB=0.00483299;REVB=-0.0170849;RO=36;SAF=8;SAR=21;SRF=23;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.362717;STB=0.705164;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=-0.00417133;OID=.;OPOS=129521126;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:36:36:29:29:0.446154:21:8:23:13:21:8:23:13
chr5	130500751	.	A	C	738.29	PASS	AF=0.569106;AO=66;DP=120;FAO=70;FDP=123;FR=.;FRO=53;FSAF=30;FSAR=40;FSRF=29;FSRR=24;FWDB=0.000431107;FXX=0.00806387;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.815;QD=24.0094;RBI=0.000484107;REFB=-0.0152071;REVB=-0.000220242;RO=54;SAF=28;SAR=38;SRF=29;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0933759;STB=0.551387;STBP=0.204;TYPE=snp;VARB=0.0102412;OID=.;OPOS=130500751;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:123:54:53:66:70:0.569106:38:28:29:25:40:30:29:24
chr5	130766662	.	T	C	779.55	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0140539;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.46;QD=63.6365;RBI=0.0167563;REFB=0;REVB=-0.00912479;RO=0;SAF=26;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000183646;OID=.;OPOS=130766662;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:49:0:0:48:49:1:22:26:0:0:22:27:0:0
chr5	130805475	.	C	T	784.39	PASS	AF=1;AO=49;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0175621;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.067;QD=62.7514;RBI=0.0383378;REFB=0;REVB=0.0340787;RO=0;SAF=20;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00067489;OID=.;OPOS=130805475;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:49:50:1:29:20:0:0:30:20:0:0
chr5	131066725	.	C	A	747.1	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0241338;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.834;QD=63.5829;RBI=0.024453;REFB=0;REVB=-0.0039381;RO=0;SAF=24;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000132402;OID=.;OPOS=131066725;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:23:24:0:0:23:24:0:0
chr5	131283376	.	C	T	729.0	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00871865;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.513;QD=57.1768;RBI=0.0153053;REFB=0;REVB=-0.0125792;RO=0;SAF=26;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94283e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.56701e-05;OID=.;OPOS=131283376;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:25:26:0:0:25:26:0:0
chr5	131396478	.	C	T	907.68	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0106336;FXX=0.0158705;HRUN=3;LEN=1;MLLD=128.182;QD=58.5603;RBI=0.0250341;REFB=0;REVB=-0.0226635;RO=0;SAF=35;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.24779e-05;OID=.;OPOS=131396478;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:62:0:0:61:62:1:26:35:0:0:26:36:0:0
chr5	131411460	.	T	C	1698.49	PASS	AF=1;AO=110;DP=111;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00567243;FXX=0.00884877;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.561;QD=60.6605;RBI=0.0502;REFB=0;REVB=0.0498785;RO=0;SAF=57;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.60224e-06;OID=.;OPOS=131411460;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:111:112:0:0:110:112:1:53:57:0:0:55:57:0:0
chr5	131553428	.	T	TA	440.5	PASS	AF=0.416667;AO=46;DP=123;FAO=50;FDP=120;FR=.;FRO=70;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=36;FSRR=34;FWDB=0.00539468;FXX=0.0322555;HRUN=0;LEN=1;MLLD=284.228;QD=14.6832;RBI=0.00611975;REFB=-0.002393;REVB=0.00288943;RO=76;SAF=24;SAR=22;SRF=39;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00940576;STB=0.503336;STBP=0.968;TYPE=ins;VARB=0.00342025;OID=.;OPOS=131553429;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.416667:46:123:50:120:70:26:24:36:34:99:76:24:22:39:37
chr5	131602166	.	T	C	146.62	PASS	AF=0.457143;AO=16;DP=35;FAO=16;FDP=35;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=4;FWDB=-0.018422;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.131;QD=16.7565;RBI=0.0251817;REFB=-0.0300009;REVB=-0.0171682;RO=17;SAF=10;SAR=6;SRF=13;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14083;STB=0.599886;STBP=0.372;TYPE=snp;VARB=0.0669162;OID=.;OPOS=131602166;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:17:19:16:16:0.457143:6:10:13:4:6:10:15:4
chr5	131607080	.	A	G	141.95	PASS	AF=0.390244;AO=16;DP=40;FAO=16;FDP=41;FR=.;FRO=25;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=-0.0444345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.7277;QD=13.8485;RBI=0.0519007;REFB=-0.0122204;REVB=-0.026819;RO=24;SAF=8;SAR=8;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0861018;STB=0.560901;STBP=0.551;TYPE=snp;VARB=0.0171784;OID=.;OPOS=131607080;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:41:24:25:16:16:0.390244:8:8:10:14:8:8:10:15
chr5	131607297	.	A	G	150.09	PASS	AF=0.516129;AO=16;DP=31;FAO=16;FDP=31;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.0367471;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.7745;QD=19.3658;RBI=0.0561144;REFB=-0.00134996;REVB=-0.0424084;RO=15;SAF=5;SAR=11;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142741;STB=0.581392;STBP=0.379;TYPE=snp;VARB=0.00190452;OID=.;OPOS=131607297;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:15:15:16:16:0.516129:11:5:7:8:11:5:7:8
chr5	131663062	.	T	C	359.52	PASS	AF=0.513889;AO=37;DP=72;FAO=37;FDP=72;FR=.;FRO=35;FSAF=11;FSAR=26;FSRF=12;FSRR=23;FWDB=-0.0211886;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.5027;QD=19.9732;RBI=0.0216;REFB=-0.0175016;REVB=-0.00419595;RO=34;SAF=11;SAR=26;SRF=12;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0559363;STB=0.525931;STBP=0.684;TYPE=snp;VARB=0.0151954;OID=.;OPOS=131663062;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:34:35:37:37:0.513889:26:11:12:22:26:11:12:23
chr5	131670546	.	C	G	345.14	PASS	AF=0.445783;AO=37;DP=83;FAO=37;FDP=83;FR=.;FRO=46;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=0.00332136;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=245.584;QD=16.633;RBI=0.00755288;REFB=-0.00369411;REVB=-0.0067834;RO=46;SAF=15;SAR=22;SRF=22;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0732905;STB=0.541201;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.00409424;OID=.;OPOS=131670546;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:46:46:37:37:0.445783:22:15:22:24:22:15:22:24
chr5	131701279	.	T	C	851.25	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0134601;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.338;QD=57.7117;RBI=0.0160279;REFB=0;REVB=-0.00870166;RO=0;SAF=37;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.01597e-05;OID=.;OPOS=131701279;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:22:37:0:0:22:37:0:0
chr5	131705949	.	T	C	160.45	PASS	AF=0.33871;AO=21;DP=62;FAO=21;FDP=62;FR=.;FRO=41;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=25;FSRR=16;FWDB=-0.0225086;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.8075;QD=10.3517;RBI=0.0555493;REFB=0.000721571;REVB=-0.0507847;RO=41;SAF=11;SAR=10;SRF=25;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0979699;STB=0.557222;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=-0.00456584;OID=.;OPOS=131705949;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:41:41:21:21:0.33871:10:11:25:16:10:11:25:16
chr5	131721174	.	A	G	367.01	PASS	AF=0.6;AO=36;DP=60;FAO=36;FDP=60;FR=.;FRO=24;FSAF=30;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=-0.0138133;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.6104;QD=24.4672;RBI=0.036661;REFB=-0.00333116;REVB=-0.0339591;RO=23;SAF=30;SAR=6;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.304851;STB=0.663958;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.00237408;OID=.;OPOS=131721174;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:23:24:36:36:0.6:6:30:12:11:6:30:13:11
chr5	131731304	.	A	T	323.46	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0820229;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.78;QD=53.9091;RBI=0.0823646;REFB=0;REVB=0.00749451;RO=0;SAF=9;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000137843;OID=.;OPOS=131731304;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:15:9:0:0:15:9:0:0
chr5	131796498	.	T	C	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0223241;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.891;QD=51.9167;RBI=0.0263038;REFB=0;REVB=0.0139114;RO=0;SAF=10;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.75336e-05;OID=.;OPOS=131796498;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:11:10:0:0:11:10:0:0
chr5	131819126	.	C	T	236.41	PASS	AF=0.45;AO=27;DP=60;FAO=27;FDP=60;FR=.;FRO=33;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=-0.0130059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.279;QD=15.7609;RBI=0.0186449;REFB=-0.0028167;REVB=0.0133596;RO=33;SAF=17;SAR=10;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.229287;STB=0.629534;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=0.00428874;OID=.;OPOS=131819126;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:33:33:27:27:0.45:10:17:13:20:10:17:13:20
chr5	131822055	.	T	C	99.23	PASS	AF=0.444444;AO=12;DP=27;FAO=12;FDP=27;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=13;FWDB=-0.006866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.335;QD=14.7005;RBI=0.00748733;REFB=-0.016763;REVB=-0.00298633;RO=15;SAF=8;SAR=4;SRF=2;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.477123;STB=0.772337;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.0149562;OID=.;OPOS=131822055;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:15:15:12:12:0.444444:4:8:2:13:4:8:2:13
chr5	131822072	.	A	G	67.36	PASS	AF=0.5625;AO=7;DP=16;FAO=9;FDP=16;FR=.,HEALED;FRO=7;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.0668177;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.5162;QD=16.8411;RBI=0.0806323;REFB=0.0311879;REVB=0.0451328;RO=7;SAF=5;SAR=2;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.252798;STB=0.676989;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=-0.0110156;OID=.;OPOS=131822072;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:16:16:7:7:7:9:0.5625:2:5:3:4:2:7:3:4
chr5	131822224	.	T	C	103.61	PASS	AF=0.448276;AO=12;DP=28;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=0.026397;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=297.361;QD=14.2912;RBI=0.0297129;REFB=-0.00536897;REVB=-0.0136403;RO=16;SAF=8;SAR=4;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.284721;STB=0.677143;STBP=0.128;TYPE=snp;VARB=0.00974553;OID=.;OPOS=131822224;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:29:16:16:12:13:0.448276:4:8:6:10:4:9:6:10
chr5	131892357	.	C	T	632.2	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0150463;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.942;QD=61.678;RBI=0.0284075;REFB=0;REVB=0.0240955;RO=0;SAF=32;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.40541e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000591069;OID=.;OPOS=131892357;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:9:32:0:0:9:32:0:0
chr5	131995964	.	A	G	636.52	PASS	AF=1;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0634871;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.232;QD=62.0999;RBI=0.0655592;REFB=0;REVB=0.0163523;RO=0;SAF=24;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.2194e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000581175;OID=.;OPOS=131995964;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:41:0:0:41:41:1:17:24:0:0:17:24:0:0
chr5	131996500	.	A	C	569.58	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00488474;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=311.681;QD=59.9556;RBI=0.033855;REFB=0;REVB=0.0335007;RO=0;SAF=27;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.67388e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.33477e-05;OID=.;OPOS=131996500;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:38:0:0:37:38:1:10:27:0:0:10:28:0:0
chr5	132030414	.	T	A	471.55	PASS	AF=0.970588;AO=33;DP=34;FAO=33;FDP=34;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.039993;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.2572;QD=55.4769;RBI=0.0514737;REFB=0.0223586;REVB=0.0324053;RO=1;SAF=21;SAR=12;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0373388;STB=0.519988;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=-0.00712597;OID=.;OPOS=132030414;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:34:34:1:1:33:33:0.970588:12:21:0:1:12:21:0:1
chr5	132031972	.	T	C	224.11	PASS	AF=0.95;AO=18;DP=20;FAO=19;FDP=20;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0289791;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=50.2354;QD=44.8225;RBI=0.196121;REFB=0.0344867;REVB=0.193968;RO=2;SAF=8;SAR=10;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0833329;STB=0.521716;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.00576728;OID=.;OPOS=132031972;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:20:20:2:1:18:19:0.95:10:8:0:2:11:8:0:1
chr5	132042146	.	C	T	1767.61	PASS	AF=1;AO=116;DP=116;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00556581;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.711;QD=60.9521;RBI=0.024275;REFB=0;REVB=0.0236283;RO=0;SAF=51;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.91129e-05;OID=.;OPOS=132042146;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:116:116:0:0:116:116:1:65:51:0:0:65:51:0:0
chr5	132098242	.	A	G	991.28	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0265742;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.328;QD=59.1806;RBI=0.0266355;REFB=0;REVB=0.00180653;RO=0;SAF=30;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000180275;OID=.;OPOS=132098242;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:67:0:0:66:67:1:36:30:0:0:36:31:0:0
chr5	132099999	.	A	G	1556.02	PASS	AF=1;AO=104;DP=104;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0131746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.122;QD=59.847;RBI=0.0217006;REFB=0;REVB=0.0172436;RO=0;SAF=49;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.1491e-05;OID=.;OPOS=132099999;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:104:104:0:0:104:104:1:55:49:0:0:55:49:0:0
chr5	132150948	.	T	G	1269.55	PASS	AF=0.988095;AO=82;DP=83;FAO=83;FDP=84;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0459967;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=145.015;QD=60.4548;RBI=0.0463414;REFB=-0.0706492;REVB=0.00564202;RO=0;SAF=36;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.14462e-08;STB=0.506665;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.000304122;OID=.;OPOS=132150948;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:83:84:0:1:82:83:0.988095:46:36:0:0:46:37:1:0
chr5	132151071	.	A	G	381.84	PASS	AF=0.449438;AO=40;DP=89;FAO=40;FDP=89;FR=.;FRO=49;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=25;FSRR=24;FWDB=0.000447832;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.074;QD=17.1613;RBI=0.0034679;REFB=-0.011052;REVB=0.00343886;RO=48;SAF=20;SAR=20;SRF=25;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0202889;STB=0.505615;STBP=0.947;TYPE=snp;VARB=0.00964701;OID=.;OPOS=132151071;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:48:49:40:40:0.449438:20:20:25:23:20:20:25:24
chr5	132151751	.	C	T	119.51	PASS	AF=0.4;AO=14;DP=35;FAO=14;FDP=35;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.00963747;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.986;QD=13.6581;RBI=0.0276162;REFB=-0.0101216;REVB=-0.02588;RO=21;SAF=7;SAR=7;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.024428;STB=0.514265;STBP=0.948;TYPE=snp;VARB=0.0228433;OID=.;OPOS=132151751;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:21:21:14:14:0.4:7:7:11:10:7:7:11:10
chr5	132159134	.	C	T	155.71	PASS	AF=0.435897;AO=17;DP=39;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.0558996;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.292;QD=15.9702;RBI=0.0560748;REFB=-0.0147904;REVB=-0.0044297;RO=22;SAF=11;SAR=6;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192683;STB=0.610978;STBP=0.246;TYPE=snp;VARB=0.0292044;OID=.;OPOS=132159134;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:22:22:17:17:0.435897:6:11:10:12:6:11:10:12
chr5	132232315	.	G	A	282.78	PASS	AF=0.415584;AO=31;DP=75;FAO=32;FDP=77;FR=.;FRO=45;FSAF=10;FSAR=22;FSRF=19;FSRR=26;FWDB=-0.0131547;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=154.899;QD=14.6898;RBI=0.0334351;REFB=-0.00435569;REVB=-0.0307386;RO=43;SAF=9;SAR=22;SRF=18;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14741;STB=0.570616;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=0.00887713;OID=.;OPOS=132232315;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:77:43:45:31:32:0.415584:22:9:18:25:22:10:19:26
chr5	132267859	.	A	T	60.57	PASS	AF=0.6;AO=2;DP=16;FAO=9;FDP=15;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=4;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0769349;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=15.1469;QD=16.1522;RBI=0.210069;REFB=0.0751441;REVB=-0.195473;RO=1;SAF=0;SAR=2;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.697199;STB=0.608433;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=-0.0441463;OID=.;OPOS=132267859;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:16:15:1:4:2:9:0.6:2:0:1:0:7:2:2:2
chr5	132437531	.	C	T	285.23	PASS	AF=0.432432;AO=32;DP=74;FAO=32;FDP=74;FR=.;FRO=42;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=-0.026175;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.8846;QD=15.4179;RBI=0.0616144;REFB=-0.0144623;REVB=-0.0557782;RO=42;SAF=19;SAR=13;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0716192;STB=0.540492;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=0.0182107;OID=.;OPOS=132437531;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:42:42:32:32:0.432432:13:19:22:20:13:19:22:20
chr5	132534059	.	T	G	341.39	PASS	AF=0.365217;AO=42;DP=115;FAO=42;FDP=115;FR=.;FRO=73;FSAF=16;FSAR=26;FSRF=41;FSRR=32;FWDB=-0.010584;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.569;QD=11.8743;RBI=0.0107219;REFB=-0.0095638;REVB=0.00171362;RO=73;SAF=16;SAR=26;SRF=41;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200919;STB=0.614883;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=0.0202176;OID=.;OPOS=132534059;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:115:73:73:42:42:0.365217:26:16:41:32:26:16:41:32
chr5	132535046	.	G	A	257.15	PASS	AF=0.453125;AO=29;DP=64;FAO=29;FDP=64;FR=.;FRO=35;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=21;FSRR=14;FWDB=0.0121816;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.296;QD=16.0717;RBI=0.0128391;REFB=-0.0113085;REVB=0.00405608;RO=35;SAF=16;SAR=13;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0476234;STB=0.526816;STBP=0.698;TYPE=snp;VARB=0.0109605;OID=.;OPOS=132535046;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:35:35:29:29:0.453125:13:16:21:14:13:16:21:14
chr5	132918994	.	G	A	106.12	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0429673;FXX=0.0908265;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.223;QD=42.4477;RBI=0.0561668;REFB=0;REVB=-0.0361735;RO=0;SAF=5;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000179976;OID=.;OPOS=132918994;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:5:5:0:0:5:5:0:0
chr5	133186592	.	G	A	54.56	PASS	AF=0.777778;AO=7;DP=9;FAO=7;FDP=9;FR=.;FRO=2;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0479836;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.1503;QD=24.2469;RBI=0.0915874;REFB=-0.0373979;REVB=0.0780116;RO=2;SAF=3;SAR=4;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0278747;STB=0.516083;STBP=0.902;TYPE=snp;VARB=0.015075;OID=.;OPOS=133186592;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:9:9:2:2:7:7:0.777778:4:3:1:1:4:3:1:1
chr5	133186603	.	A	C	88.21	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00956163;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.764;QD=39.2062;RBI=0.00966377;REFB=0;REVB=0.00140131;RO=0;SAF=4;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000176543;OID=.;OPOS=133186603;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:5:4:0:0:5:4:0:0
chr5	133477802	.	C	T	316.79	PASS	AF=0.367347;AO=36;DP=98;FAO=36;FDP=98;FR=.;FRO=62;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=29;FSRR=33;FWDB=0.00386568;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.258;QD=12.9302;RBI=0.0472475;REFB=-0.0113971;REVB=-0.0470891;RO=61;SAF=20;SAR=16;SRF=28;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105939;STB=0.555525;STBP=0.406;TYPE=snp;VARB=0.0191517;OID=.;OPOS=133477802;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:61:62:36:36:0.367347:16:20:28:33:16:20:29:33
chr5	133481467	.	G	A	279.03	PASS	AF=0.609756;AO=25;DP=41;FAO=25;FDP=41;FR=.;FRO=16;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.00683005;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.854;QD=27.2221;RBI=0.01859;REFB=-0.0277441;REVB=-0.0172899;RO=16;SAF=17;SAR=8;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137456;STB=0.576208;STBP=0.245;TYPE=snp;VARB=0.0123285;OID=.;OPOS=133481467;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:16:16:25:25:0.609756:8:17:8:8:8:17:8:8
chr5	133909475	.	G	A	237.23	PASS	AF=0.442623;AO=27;DP=62;FAO=27;FDP=61;FR=.;FRO=34;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=0.00138499;FXX=0.031741;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.856;QD=15.5559;RBI=0.0120591;REFB=-0.0289949;REVB=-0.0119793;RO=34;SAF=13;SAR=14;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0471589;STB=0.526679;STBP=0.732;TYPE=snp;VARB=0.0169378;OID=.;OPOS=133909475;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:61:34:34:27:27:0.442623:14:13:18:16:14:13:18:16
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chr5	133915761	.	G	A	119.51	PASS	AF=0.4;AO=14;DP=35;FAO=14;FDP=35;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=15;FWDB=0.00231436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.619;QD=13.6588;RBI=0.0365087;REFB=-0.0268449;REVB=0.0364353;RO=21;SAF=7;SAR=7;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.221956;STB=0.6284;STBP=0.252;TYPE=snp;VARB=0.0391209;OID=.;OPOS=133915761;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:21:21:14:14:0.4:7:7:6:15:7:7:6:15
chr5	133956668	.	G	A	157.74	PASS	AF=0.357143;AO=20;DP=56;FAO=20;FDP=56;FR=.;FRO=36;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=-0.00729061;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.687;QD=11.2669;RBI=0.0199921;REFB=-0.0145796;REVB=0.0186153;RO=36;SAF=15;SAR=5;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.326918;STB=0.692105;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.033681;OID=.;OPOS=133956668;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:36:36:20:20:0.357143:5:15:17:19:5:15:17:19
chr5	134002580	.	GC	G,GG	31.15	PASS	AF=0.2,0.15;AO=4,2;DP=19;FAO=4,3;FDP=20;FR=.;FRO=13;FSAF=2,0;FSAR=2,3;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.0917196,0.00521511;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=1,1;MLLD=14.9195,27.1047;QD=6.23094;RBI=0.116865,0.0142853;REFB=-0.0601952,-0.04935;REVB=-0.0724217,0.0132993;RO=13;SAF=1,0;SAR=3,2;SRF=7;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0.4,0;SSSB=-0.327008,-0.569211;STB=0.529265,0.996264;STBP=0.912,0.055;TYPE=del,snp;VARB=0.10716,-0.0637677;OID=.,.;OPOS=134002581,134002581;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.2,0.15:4,2:19:4,3:20:13:2,0:2,3:7:6:17:13:1,0:3,2:7:6
chr5	134076812	.	G	A	120.86	PASS	AF=0.424242;AO=14;DP=33;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.0212393;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.008;QD=14.6497;RBI=0.0476587;REFB=-0.00604665;REVB=-0.0426644;RO=19;SAF=10;SAR=4;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.253154;STB=0.647927;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=0.0165275;OID=.;OPOS=134076812;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:19:19:14:14:0.424242:4:10:9:10:4:10:9:10
chr5	134193187	.	T	A	282.67	PASS	AF=0.52;AO=25;DP=49;FAO=26;FDP=50;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=0.0166361;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.438;QD=22.6139;RBI=0.0207496;REFB=0.00348617;REVB=0.0124011;RO=24;SAF=13;SAR=12;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0538525;STB=0.519985;STBP=0.794;TYPE=snp;VARB=-0.00291034;OID=.;OPOS=134193187;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:50:24:24:25:26:0.52:12:13:11:13:13:13:11:13
chr5	134223593	.	A	G	246.97	PASS	AF=0.575;AO=24;DP=40;FAO=23;FDP=40;FR=.;FRO=17;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=-0.0610683;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=65.1242;QD=24.6972;RBI=0.0673336;REFB=0.00817795;REVB=-0.0283634;RO=16;SAF=12;SAR=12;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181102;STB=0.578881;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=-0.00612528;OID=.;OPOS=134223593;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:16:17:24:23:0.575:12:12:4:12:12:11:5:12
chr5	134259741	.	A	G	72.7	PASS	AF=0.30303;AO=10;DP=33;FAO=10;FDP=33;FR=.;FRO=23;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.025135;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.127;QD=8.81184;RBI=0.0262104;REFB=0.00696018;REVB=0.00743081;RO=22;SAF=1;SAR=9;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.574686;STB=0.868145;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=-0.0103825;OID=.;OPOS=134259741;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:33:33:22:23:10:10:0.30303:9:1:12:10:9:1:13:10
chr5	134262271	.	C	A	124.06	PASS	AF=0.272727;AO=18;DP=66;FAO=18;FDP=66;FR=.;FRO=48;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=23;FSRR=25;FWDB=-0.048844;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.6049;QD=7.51891;RBI=0.054051;REFB=-0.027694;REVB=-0.0231468;RO=48;SAF=9;SAR=9;SRF=23;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.02502;STB=0.515135;STBP=0.879;TYPE=snp;VARB=0.0571657;OID=.;OPOS=134262271;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:48:48:18:18:0.272727:9:9:23:25:9:9:23:25
chr5	134263809	.	T	C	545.36	PASS	AF=0.574713;AO=50;DP=87;FAO=50;FDP=87;FR=.;FRO=37;FSAF=20;FSAR=30;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=-0.00674936;FXX=0.0113623;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.449;QD=25.0741;RBI=0.0146676;REFB=-0.0127991;REVB=0.0130224;RO=35;SAF=20;SAR=30;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0222975;STB=0.51428;STBP=0.783;TYPE=snp;VARB=0.0125328;OID=.;OPOS=134263809;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:35:37:50:50:0.574713:30:20:15:20:30:20:16:21
chr5	134343799	.	A	G	927.21	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0172804;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.356;QD=57.9506;RBI=0.0185165;REFB=0;REVB=-0.00665215;RO=0;SAF=31;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.73709e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000585881;OID=.;OPOS=134343799;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:64:0:0:60:64:1:29:31:0:0:31:33:0:0
chr5	134364518	.	C	G	62.22	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0319341;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.7668;QD=35.5531;RBI=0.111976;REFB=0;REVB=0.107326;RO=0;SAF=6;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.012242;OID=.;OPOS=134364518;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:1:6:0:0:1:6:0:0
chr5	134670741	.	C	T	530.54	PASS	AF=0.524272;AO=54;DP=103;FAO=54;FDP=103;FR=.;FRO=49;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=26;FSRR=23;FWDB=0.0109922;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.973;QD=20.6033;RBI=0.0344621;REFB=-0.00611055;REVB=-0.0326621;RO=49;SAF=24;SAR=30;SRF=26;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0746391;STB=0.54111;STBP=0.396;TYPE=snp;VARB=0.00626194;OID=.;OPOS=134670741;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:103:49:49:54:54:0.524272:30:24:26:23:30:24:26:23
chr5	134670765	.	A	G	509.03	PASS	AF=0.504762;AO=53;DP=105;FAO=53;FDP=105;FR=.;FRO=52;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=24;FSRR=28;FWDB=-0.0130601;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.073;QD=19.3916;RBI=0.0337704;REFB=0.00343855;REVB=0.0311428;RO=52;SAF=24;SAR=29;SRF=24;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00786612;STB=0.504346;STBP=0.942;TYPE=snp;VARB=-0.00194957;OID=.;OPOS=134670765;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:105:52:52:53:53:0.504762:29:24:24:28:29:24:24:28
chr5	134782414	.	G	T	73.36	PASS	AF=0.322581;AO=10;DP=30;FAO=10;FDP=31;FR=.;FRO=21;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.018915;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=126.677;QD=9.46556;RBI=0.0197345;REFB=-0.021939;REVB=0.00562782;RO=20;SAF=4;SAR=6;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111111;STB=0.584246;STBP=0.558;TYPE=snp;VARB=0.0304161;OID=.;OPOS=134782414;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:30:31:20:21:10:10:0.322581:6:4:10:10:6:4:11:10
chr5	134782450	.	T	A	64.07	PASS	AF=0.333333;AO=9;DP=27;FAO=9;FDP=27;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=0.010279;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.669;QD=9.49156;RBI=0.0115568;REFB=-0.0105458;REVB=-0.00528233;RO=18;SAF=5;SAR=4;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.52951e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0224119;OID=.;OPOS=134782450;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:27:27:18:18:9:9:0.333333:4:5:10:8:4:5:10:8
chr5	134782510	.	T	C	278.82	PASS	AF=0.455882;AO=31;DP=68;FAO=31;FDP=68;FR=.;FRO=37;FSAF=21;FSAR=10;FSRF=24;FSRR=13;FWDB=0.0245063;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.77;QD=16.4011;RBI=0.0502369;REFB=-0.0102011;REVB=-0.0438541;RO=37;SAF=21;SAR=10;SRF=24;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0313809;STB=0.517673;STBP=0.845;TYPE=snp;VARB=0.0124128;OID=.;OPOS=134782510;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:37:37:31:31:0.455882:10:21:24:13:10:21:24:13
chr5	134782576	.	T	G	378.33	PASS	AF=0.454545;AO=40;DP=87;FAO=40;FDP=88;FR=.;FRO=48;FSAF=27;FSAR=13;FSRF=31;FSRR=17;FWDB=-0.0361454;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=47.384;QD=17.1967;RBI=0.0361732;REFB=0.000380267;REVB=-0.00141786;RO=47;SAF=27;SAR=13;SRF=31;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0168486;STB=0.517894;STBP=0.802;TYPE=snp;VARB=0.000284396;OID=.;OPOS=134782576;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:88:47:48:40:40:0.454545:13:27:31:16:13:27:31:17
chr5	134986196	.	C	T	53.4	PASS	AF=0.285714;AO=8;DP=28;FAO=8;FDP=28;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=0.0198634;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.017;QD=7.62921;RBI=0.0234484;REFB=3.46898e-05;REVB=-0.0124608;RO=20;SAF=4;SAR=4;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114205;STB=0.571254;STBP=0.675;TYPE=snp;VARB=3.41427e-05;OID=.;OPOS=134986196;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:28:28:20:20:8:8:0.285714:4:4:8:12:4:4:8:12
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chr5	135207187	.	G	A	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00282223;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.068;QD=46.848;RBI=0.0299596;REFB=0;REVB=0.0298263;RO=0;SAF=8;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000313333;OID=.;OPOS=135207187;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:7:8:0:0:7:8:0:0
chr5	135207382	.	C	T	340.73	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0236994;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.084;QD=54.5171;RBI=0.0420071;REFB=0;REVB=0.0346833;RO=0;SAF=12;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000207846;OID=.;OPOS=135207382;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:13:12:0:0:13:12:0:0
chr5	135276201	.	AGTTGT	AG,AGT	597.77	PASS	AF=0,1;AO=5,41;DP=50;FAO=0,50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=0,23;FSAR=0,27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0037053,-0.0053131;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=4,3;MLLD=231.408,245.815;QD=47.8212;RBI=0.00421852,0.0126534;REFB=0,0;REVB=-0.00201661,0.0114839;RO=0;SAF=1,20;SAR=4,21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.02085e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=0.0144489,0.000104141;OID=.,.;OPOS=135276203,135276202;OREF=TTGT,GTT;OALT=-,-;OMAPALT=AG,AGT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	2/2:0,1:5,41:50:0,50:50:0:0,23:0,27:0:0:11:0:1,20:4,21:0:0
chr5	135276314	.	C	A,T	1092.55	PASS	AF=0.0540541,0.945946;AO=4,70;DP=74;FAO=4,70;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=3,32;FSAR=1,38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0621892,-0.0283441;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=13.2143,149.544;QD=59.0569;RBI=0.0634039,0.0284631;REFB=0,0;REVB=-0.0123513,-0.00260059;RO=0;SAF=3,32;SAR=1,38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=4.86674e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.167244,-0.000589357;OID=.,.;OPOS=135276314,135276314;OREF=C,C;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:13:74:74:0:0:4,70:4,70:0.0540541,0.945946:1,38:3,32:0:0:1,38:3,32:0:0
chr5	135276814	.	G	A	644.13	PASS	AF=0.455172;AO=66;DP=146;FAO=66;FDP=145;FR=.;FRO=79;FSAF=40;FSAR=26;FSRF=35;FSRR=44;FWDB=0.0196957;FXX=0.00684885;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.606;QD=17.769;RBI=0.0198368;REFB=-0.0153709;REVB=0.00236128;RO=79;SAF=40;SAR=26;SRF=34;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172805;STB=0.589446;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.0179293;OID=.;OPOS=135276814;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:146:145:79:79:66:66:0.455172:26:40:34:45:26:40:35:44
chr5	135276847	.	T	C	1699.37	PASS	AF=1;AO=112;DP=113;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0125191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.703;QD=59.627;RBI=0.0140052;REFB=-0.0637815;REVB=0.00627824;RO=1;SAF=53;SAR=59;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0088742;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000273776;OID=.;OPOS=135276847;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:113:114:1:0:112:114:1:59:53:1:0:60:54:0:0
chr5	135282630	.	C	T	312.25	PASS	AF=0.472973;AO=32;DP=70;FAO=35;FDP=74;FR=.;FRO=39;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=24;FWDB=-0.00410361;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.029;QD=16.8783;RBI=0.0183152;REFB=-0.00272624;REVB=0.0178496;RO=38;SAF=18;SAR=14;SRF=15;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160997;STB=0.568091;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=0.0077299;OID=.;OPOS=135282630;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:74:38:39:32:35:0.472973:14:18:15:23:17:18:15:24
chr5	135287029	.	T	C	249.92	PASS	AF=0.466667;AO=28;DP=60;FAO=28;FDP=60;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=12;FWDB=-0.0289756;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.756;QD=16.6611;RBI=0.0311296;REFB=-0.00358862;REVB=0.0113784;RO=32;SAF=12;SAR=16;SRF=20;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1846;STB=0.6037;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=0.00405487;OID=.;OPOS=135287029;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:32:32:28:28:0.466667:16:12:20:12:16:12:20:12
chr5	135388663	.	A	G	1377.51	PASS	AF=1;AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0219276;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.673;QD=62.614;RBI=0.0230483;REFB=0;REVB=-0.00709972;RO=0;SAF=51;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.06491e-05;OID=.;OPOS=135388663;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:88:88:0:0:88:88:1:37:51:0:0:37:51:0:0
chr5	135391366	.	C	T	376.48	PASS	AF=0.465116;AO=39;DP=85;FAO=40;FDP=86;FR=.;FRO=46;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=26;FSRR=20;FWDB=-0.0167325;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.672;QD=17.5107;RBI=0.0552733;REFB=-0.00944218;REVB=-0.0526798;RO=46;SAF=18;SAR=21;SRF=26;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0999814;STB=0.561454;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.0151495;OID=.;OPOS=135391366;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:86:46:46:39:40:0.465116:21:18:26:20:22:18:26:20
chr5	135391374	.	C	T	476.37	PASS	AF=0.522727;AO=46;DP=89;FAO=46;FDP=88;FR=.;FRO=42;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=24;FWDB=-0.00177824;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.294;QD=21.6533;RBI=0.00909399;REFB=-0.0206036;REVB=-0.00891844;RO=43;SAF=26;SAR=20;SRF=18;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127977;STB=0.565189;STBP=0.227;TYPE=snp;VARB=0.0194415;OID=.;OPOS=135391374;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:88:43:42:46:46:0.522727:20:26:18:25:20:26:18:24
chr5	135392426	.	T	C	904.86	PASS	AF=0.984615;AO=55;DP=65;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0272823;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=171.316;QD=55.6837;RBI=0.0379946;REFB=-0.11956;REVB=0.0264436;RO=0;SAF=18;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.85968e-08;STB=0.506665;STBP=0.54;TYPE=snp;VARB=0.000416425;OID=.;OPOS=135392426;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:65:65:0:1:55:64:0.984615:37:18:0:0:37:27:0:1
chr5	135394903	.	G	A	361.1	PASS	AF=0.410526;AO=39;DP=95;FAO=39;FDP=95;FR=.;FRO=56;FSAF=12;FSAR=27;FSRF=19;FSRR=37;FWDB=0.00570979;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.498;QD=15.2044;RBI=0.0211538;REFB=-0.00548447;REVB=0.0203686;RO=56;SAF=12;SAR=27;SRF=19;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.037928;STB=0.521484;STBP=0.759;TYPE=snp;VARB=0.00330808;OID=.;OPOS=135394903;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:56:56:39:39:0.410526:27:12:19:37:27:12:19:37
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chr5	135513085	.	T	TC	909.82	PASS	AF=1;AO=62;DP=71;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0408085;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=98.7;QD=57.7664;RBI=0.0418218;REFB=0;REVB=-0.00915026;RO=8;SAF=32;SAR=30;SRF=8;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104497;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00017183;OID=.;OPOS=135513086;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:62:71:63:63:0:33:30:0:0:5:8:32:30:8:0
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chr5	136313330	.	A	AG	76.63	PASS	AF=0.313253;AO=21;DP=86;FAO=26;FDP=83;FR=.;FRO=57;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=39;FWDB=0.121767;FXX=0.0235266;HRUN=4;LEN=1;MLLD=12.9559;QD=3.69311;RBI=0.125637;REFB=-0.0142799;REVB=0.0309425;RO=60;SAF=12;SAR=9;SRF=20;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.285758;STB=0.626415;STBP=0.133;TYPE=ins;VARB=-0.025802;OID=.;OPOS=136313331;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.313253:21:86:26:83:57:13:13:18:39:76:60:12:9:20:40
chr5	136953577	.	T	C	172.75	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00767437;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.009;QD=43.1865;RBI=0.0237384;REFB=-0.112942;REVB=0.0224637;RO=0;SAF=11;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33019e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000906617;OID=.;OPOS=136953577;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:15:16:0:0:15:16:1:4:11:0:0:5:11:0:0
chr5	136954719	.	T	C	885.4	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-9.33135e-06;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.884;QD=58.0587;RBI=0.00234196;REFB=0;REVB=-0.00234194;RO=0;SAF=39;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.01474e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.55324e-06;OID=.;OPOS=136954719;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:22:39:0:0:22:39:0:0
chr5	136955383	.	G	T	364.75	PASS	AF=0.40625;AO=39;DP=97;FAO=39;FDP=96;FR=.;FRO=57;FSAF=12;FSAR=27;FSRF=23;FSRR=34;FWDB=0.027809;FXX=0.0303;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.021;QD=15.1979;RBI=0.0279329;REFB=-0.00446984;REVB=0.00262761;RO=53;SAF=12;SAR=27;SRF=22;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121443;STB=0.563473;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.00615264;OID=.;OPOS=136955383;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:96:53:57:39:39:0.40625:27:12:22:31:27:12:23:34
chr5	137028029	.	T	C	911.28	PASS	AF=0.969697;AO=64;DP=66;FAO=64;FDP=66;FR=.;FRO=2;FSAF=47;FSAR=17;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0196487;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.8162;QD=55.2291;RBI=0.0381466;REFB=-0.198705;REVB=0.032697;RO=2;SAF=47;SAR=17;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0196755;STB=0.510413;STBP=0.43;TYPE=snp;VARB=0.0056099;OID=.;OPOS=137028029;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:66:66:2:2:64:64:0.969697:17:47:2:0:17:47:2:0
chr5	137206560	.	A	C	279.22	PASS	AF=1;AO=20;DP=22;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.039098;FXX=0.0869187;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.9548;QD=53.1849;RBI=0.0747808;REFB=0;REVB=-0.0637457;RO=1;SAF=11;SAR=9;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0400637;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0032776;OID=.;OPOS=137206560;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:21:1:0:20:21:1:9:11:1:0:9:12:0:0
chr5	137244517	.	G	A	349.25	PASS	AF=0.521739;AO=36;DP=69;FAO=36;FDP=69;FR=.;FRO=33;FSAF=12;FSAR=24;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=-0.0499847;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.839;QD=20.2461;RBI=0.0501251;REFB=0.00684919;REVB=-0.00374778;RO=32;SAF=12;SAR=24;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149961;STB=0.577275;STBP=0.199;TYPE=snp;VARB=-0.00537536;OID=.;OPOS=137244517;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:32:33:36:36:0.521739:24:12:16:16:24:12:16:17
chr5	137259179	.	T	C	1950.62	PASS	AF=0.992188;AO=124;DP=128;FAO=127;FDP=128;FR=.;FRO=1;FSAF=61;FSAR=66;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0188187;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.9172;QD=60.957;RBI=0.0207515;REFB=-0.13433;REVB=0.00874546;RO=1;SAF=61;SAR=63;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00772532;STB=0.504064;STBP=0.331;TYPE=snp;VARB=0.000512403;OID=.;OPOS=137259179;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:128:128:1:1:124:127:0.992188:63:61:1:0:66:61:1:0
chr5	137347498	.	G	A	1116.96	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0342128;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.174;QD=60.3763;RBI=0.0427631;REFB=0;REVB=0.0256547;RO=0;SAF=39;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.80413e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.63694e-05;OID=.;OPOS=137347498;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:35:39:0:0:35:39:0:0
chr5	137372207	.	A	T	708.47	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0129738;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.928;QD=62.9756;RBI=0.0456643;REFB=0;REVB=0.0437825;RO=0;SAF=25;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.09779e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00016545;OID=.;OPOS=137372207;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:20:25:0:0:20:25:0:0
chr5	137426447	.	G	A	30.99	PASS	AF=0.5;AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.00676887;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.017;QD=12.3961;RBI=0.0254527;REFB=0.0128441;REVB=0.0245362;RO=5;SAF=3;SAR=2;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162496;STB=0.599599;STBP=0.681;TYPE=snp;VARB=-0.014487;OID=.;OPOS=137426447;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:27:10:10:5:5:5:5:0.5:2:3:2:3:2:3:2:3
chr5	137476416	.	T	C	785.85	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0519505;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.2785;QD=64.1508;RBI=0.0531934;REFB=0;REVB=-0.0114317;RO=0;SAF=21;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000538008;OID=.;OPOS=137476416;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:28:21:0:0:28:21:0:0
chr5	137521224	.	G	A	280.25	PASS	AF=0.462687;AO=31;DP=67;FAO=31;FDP=67;FR=.;FRO=36;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=-0.0138569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.05;QD=16.7316;RBI=0.0186312;REFB=-0.0135157;REVB=-0.0124543;RO=36;SAF=17;SAR=14;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00692295;STB=0.503889;STBP=0.969;TYPE=snp;VARB=0.0141864;OID=.;OPOS=137521224;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:36:36:31:31:0.462687:14:17:20:16:14:17:20:16
chr5	137665323	.	G	A	221.3	PASS	AF=0.478261;AO=22;DP=46;FAO=22;FDP=46;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=6;FSRR=18;FWDB=-0.0268924;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.393;QD=19.2431;RBI=0.0275469;REFB=0.0150582;REVB=0.00596917;RO=24;SAF=7;SAR=15;SRF=6;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0750266;STB=0.542216;STBP=0.603;TYPE=snp;VARB=-0.0159225;OID=.;OPOS=137665323;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:24:24:22:22:0.478261:15:7:6:18:15:7:6:18
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chr5	137717265	.	G	A	729.01	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0340884;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.039;QD=57.1774;RBI=0.0352306;REFB=0;REVB=-0.00889799;RO=0;SAF=21;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.77801e-05;OID=.;OPOS=137717265;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:30:21:0:0:30:21:0:0
chr5	137754695	.	T	C	675.72	PASS	AF=0.602041;AO=59;DP=98;FAO=59;FDP=98;FR=.;FRO=39;FSAF=21;FSAR=38;FSRF=14;FSRR=25;FWDB=-0.00467903;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.2616;QD=27.5803;RBI=0.0161621;REFB=-0.00518298;REVB=-0.01547;RO=38;SAF=21;SAR=38;SRF=14;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00977118;STB=0.501319;STBP=0.983;TYPE=snp;VARB=0.00385413;OID=.;OPOS=137754695;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:38:39:59:59:0.602041:38:21:14:24:38:21:14:25
chr5	137781792	.	G	A	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0293882;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.3022;QD=40.7621;RBI=0.102427;REFB=0;REVB=0.0981205;RO=0;SAF=1;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.8593e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00431531;OID=.;OPOS=137781792;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:9:1:0:0:9:1:0:0
chr5	137782335	.	G	A	240.41	PASS	AF=0.367089;AO=29;DP=79;FAO=29;FDP=79;FR=.;FRO=50;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=32;FSRR=18;FWDB=-0.00985899;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.913;QD=12.1724;RBI=0.010868;REFB=-0.00333361;REVB=0.00457308;RO=49;SAF=18;SAR=11;SRF=31;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0139389;STB=0.513051;STBP=0.879;TYPE=snp;VARB=0.00458604;OID=.;OPOS=137782335;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:49:50:29:29:0.367089:11:18:31:18:11:18:32:18
chr5	137892170	.	G	A	266.95	PASS	AF=0.483333;AO=29;DP=60;FAO=29;FDP=60;FR=.;FRO=31;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=10;FWDB=-0.0214294;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.377;QD=17.7969;RBI=0.0229801;REFB=-0.0183218;REVB=0.00829863;RO=31;SAF=13;SAR=16;SRF=21;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.208925;STB=0.616702;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.016499;OID=.;OPOS=137892170;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:31:31:29:29:0.483333:16:13:21:10:16:13:21:10
chr5	137902339	.	T	C	61.8	PASS	AF=0.264706;AO=9;DP=34;FAO=9;FDP=34;FR=.;FRO=25;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=8.76432e-05;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=181.604;QD=7.27079;RBI=0.00372405;REFB=0.00113398;REVB=-0.00372302;RO=25;SAF=3;SAR=6;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131596;STB=0.583143;STBP=0.639;TYPE=snp;VARB=-0.00326963;OID=.;OPOS=137902339;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:34:34:25:25:9:9:0.264706:6:3:11:14:6:3:11:14
chr5	138705188	.	C	CATT	697.45	PASS	AF=0.928571;AO=50;DP=57;FAO=52;FDP=56;FR=.;FRO=4;FSAF=31;FSAR=21;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0188104;FXX=0.0508388;HRUN=1;LEN=3;MLLD=296.371;QD=49.8175;RBI=0.0188735;REFB=-0.00943683;REVB=0.00154157;RO=4;SAF=31;SAR=19;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0176273;STB=0.50711;STBP=0.755;TYPE=ins;VARB=0.000527103;OID=.;OPOS=138705189;OREF=-;OALT=ATT;OMAPALT=CATT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.928571:50:57:52:56:4:31:21:2:2:17:4:31:19:2:2
chr5	138713959	.	A	C	579.32	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00747328;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.401;QD=60.9813;RBI=0.0486256;REFB=0;REVB=0.0480478;RO=0;SAF=15;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000460991;OID=.;OPOS=138713959;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:23:15:0:0:23:15:0:0
chr5	138720108	.	C	T	1136.21	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0125589;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.7699;QD=60.598;RBI=0.125976;REFB=0;REVB=0.125349;RO=0;SAF=49;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.41374e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00124311;OID=.;OPOS=138720108;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:75:0:0:73:75:1:24:49:0:0:26:49:0:0
chr5	138728483	.	A	G	575.95	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0169564;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.8284;QD=60.6267;RBI=0.0286422;REFB=0;REVB=0.0230837;RO=0;SAF=18;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.68991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000440372;OID=.;OPOS=138728483;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:38:0:0:37:38:1:19:18:0:0:20:18:0:0
chr5	138728533	.	C	T	563.35	PASS	AF=0.974359;AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.035751;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.6907;QD=57.7797;RBI=0.0569295;REFB=-0.0664751;REVB=0.0443039;RO=1;SAF=14;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0322882;STB=0.517232;STBP=0.273;TYPE=snp;VARB=0.00401665;OID=.;OPOS=138728533;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:39:39:1:1:38:38:0.974359:24:14:1:0:24:14:1:0
chr5	138730037	.	T	C	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0251038;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.831;QD=33.4258;RBI=0.0676371;REFB=0;REVB=0.0628059;RO=0;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00325113;OID=.;OPOS=138730037;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:5:1:0:0:5:1:0:0
chr5	138856982	.	C	T	60.22	PASS	AF=0.225;AO=9;DP=40;FAO=9;FDP=40;FR=.;FRO=31;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=0.0187665;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=269.456;QD=6.02223;RBI=0.0223314;REFB=-0.00482502;REVB=-0.0121041;RO=29;SAF=5;SAR=4;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00462376;STB=0.530658;STBP=0.801;TYPE=snp;VARB=0.0166526;OID=.;OPOS=138856982;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:60:40:40:29:31:9:9:0.225:4:5:16:13:4:5:16:15
chr5	138857919	.	T	C	1587.12	PASS	AF=1;AO=98;DP=98;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00999363;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.135;QD=64.1259;RBI=0.0327672;REFB=0;REVB=0.031206;RO=0;SAF=53;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.33446e-05;OID=.;OPOS=138857919;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:99:0:0:98:99:1:45:53:0:0:45:54:0:0
chr5	138857925	.	C	G	400.33	PASS	AF=0.424242;AO=42;DP=99;FAO=42;FDP=99;FR=.;FRO=57;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=30;FSRR=27;FWDB=0.0176546;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.044;QD=16.1749;RBI=0.0197359;REFB=0.00214665;REVB=-0.00882168;RO=57;SAF=25;SAR=17;SRF=30;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0719056;STB=0.540521;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=-0.00383614;OID=.;OPOS=138857925;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:57:57:42:42:0.424242:17:25:30:27:17:25:30:27
chr5	138861078	.	C	T	251.46	PASS	AF=0.489796;AO=24;DP=49;FAO=24;FDP=49;FR=.;FRO=25;FSAF=18;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=-0.0154182;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.549;QD=20.5275;RBI=0.0257265;REFB=-0.0165949;REVB=-0.0205944;RO=25;SAF=18;SAR=6;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163288;STB=0.59251;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=0.0219905;OID=.;OPOS=138861078;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:25:25:24:24:0.489796:6:18:15:10:6:18:15:10
chr5	139097627	.	A	C	197.69	PASS	AF=0.47619;AO=20;DP=42;FAO=20;FDP=42;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.0185153;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.6067;QD=18.8278;RBI=0.0195455;REFB=0.00361875;REVB=0.00626169;RO=21;SAF=5;SAR=15;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.275908;STB=0.648489;STBP=0.11;TYPE=snp;VARB=-0.00192548;OID=.;OPOS=139097627;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:21:22:20:20:0.47619:15:5:11:10:15:5:11:11
chr5	139217320	.	G	C	438.16	PASS	AF=0.478261;AO=44;DP=92;FAO=44;FDP=92;FR=.;FRO=48;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=20;FSRR=28;FWDB=0.0154394;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.627;QD=19.0504;RBI=0.0220637;REFB=-0.0117068;REVB=-0.0157618;RO=48;SAF=23;SAR=21;SRF=20;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0991735;STB=0.555148;STBP=0.345;TYPE=snp;VARB=0.0104479;OID=.;OPOS=139217320;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:48:48:44:44:0.478261:21:23:20:28:21:23:20:28
chr5	139239515	.	C	CG	68.45	PASS	AF=0.5625;AO=9;DP=17;FAO=9;FDP=16;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.114085;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=28.0925;QD=17.1116;RBI=0.11613;REFB=-0.00336937;REVB=0.0216957;RO=8;SAF=5;SAR=4;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0571344;STB=0.571275;STBP=0.577;TYPE=ins;VARB=-0.0116059;OID=.;OPOS=139239516;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.5625:9:17:9:16:7:5:4:5:2:45:8:5:4:5:3
chr5	139574050	.	G	A	253.14	PASS	AF=0.509434;AO=27;DP=52;FAO=27;FDP=53;FR=.;FRO=26;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=-0.0365403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.1006;QD=19.1052;RBI=0.088701;REFB=-0.0146414;REVB=-0.0808249;RO=25;SAF=15;SAR=12;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00387536;STB=0.51063;STBP=0.884;TYPE=snp;VARB=0.0147251;OID=.;OPOS=139574050;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:53:25:26:27:27:0.509434:12:15:14:11:12:15:15:11
chr5	139712548	.	TAA	TA,TAC	463.11	PASS	AF=0.121212,0.878788;AO=5,28;DP=33;FAO=4,29;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=4,10;FSAR=0,19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0271491,-0.0171088;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=30.7219,57.4405;QD=56.1345;RBI=0.0296668,0.0332565;REFB=0,0;REVB=0.0119602,0.0285182;RO=0;SAF=5,9;SAR=0,19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.62669e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0798906,0.0101941;OID=.,.;OPOS=139712549,139712550;OREF=A,A;OALT=-,C;OMAPALT=TA,TAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.121212,0.878788:5,28:33:4,29:33:0:4,10:0,19:0:0:14:0:5,9:0,19:0:0
chr5	139740454	.	C	T	83.57	PASS	AF=0.625;AO=10;DP=16;FAO=10;FDP=16;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0700112;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.532;QD=20.8913;RBI=0.0703993;REFB=-0.000964686;REVB=0.00738242;RO=6;SAF=3;SAR=7;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0256073;STB=0.514676;STBP=0.965;TYPE=snp;VARB=0.00080438;OID=.;OPOS=139740454;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:16:16:6:6:10:10:0.625:7:3:2:4:7:3:2:4
chr5	139745154	.	T	C	465.13	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0420164;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.991;QD=58.1417;RBI=0.0439452;REFB=0;REVB=0.0128764;RO=0;SAF=17;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000165212;OID=.;OPOS=139745154;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:15:17:0:0:15:17:0:0
chr5	139936760	.	G	T	630.54	PASS	AF=0.977778;AO=41;DP=45;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0532147;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.2081;QD=56.048;RBI=0.128931;REFB=-0.181705;REVB=0.117437;RO=0;SAF=14;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508193;STBP=0.608;TYPE=snp;VARB=0.0178708;OID=.;OPOS=139936760;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:45:45:0:1:41:44:0.977778:27:14:0:0:30:14:0:1
chr5	139936980	.	A	G	703.27	PASS	AF=0.980769;AO=50;DP=51;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0126338;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.561;QD=54.098;RBI=0.0192822;REFB=-0.0329776;REVB=-0.0145667;RO=1;SAF=24;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0192104;STB=0.5098;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=0.000122497;OID=.;OPOS=139936980;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:51:52:1:1:50:51:0.980769:26:24:1:0:26:25:1:0
chr5	139940233	.	G	A	1457.64	PASS	AF=0.989362;AO=93;DP=94;FAO=93;FDP=94;FR=.;FRO=1;FSAF=59;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0141216;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=132.126;QD=62.0271;RBI=0.0148004;REFB=-0.0472308;REVB=-0.00443091;RO=0;SAF=59;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.20828e-08;STB=0.507245;STBP=0.26;TYPE=snp;VARB=0.000117984;OID=.;OPOS=139940233;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:94:94:0:1:93:93:0.989362:34:59:0:0:34:59:0:1
chr5	139941228	.	A	G	404.04	PASS	AF=0.967742;AO=26;DP=32;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0554155;FXX=0.0312402;HRUN=4;LEN=1;MLLD=63.4178;QD=52.1348;RBI=0.0872369;REFB=0.0301041;REVB=0.0673751;RO=0;SAF=15;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.516118;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=0.00704263;OID=.;OPOS=139941228;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:32:31:0:1:26:30:0.967742:11:15:0:0:15:15:1:0
chr5	140021482	.	C	T	90.68	PASS	AF=0.478261;AO=11;DP=23;FAO=11;FDP=23;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=-0.0196242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.001;QD=15.7702;RBI=0.0213416;REFB=-0.00632668;REVB=-0.00838777;RO=12;SAF=5;SAR=6;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111229;STB=0.564402;STBP=0.556;TYPE=snp;VARB=0.0237476;OID=.;OPOS=140021482;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:23:23:12:12:11:11:0.478261:6:5:4:8:6:5:4:8
chr5	140023238	.	C	G	496.65	PASS	AF=0.5;AO=48;DP=96;FAO=48;FDP=96;FR=.;FRO=48;FSAF=15;FSAR=33;FSRF=13;FSRR=35;FWDB=-0.0328081;FXX=0.0103082;HRUN=2;LEN=1;MLLD=262.22;QD=20.6937;RBI=0.03286;REFB=-0.00368322;REVB=-0.00184728;RO=48;SAF=15;SAR=33;SRF=13;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0446665;STB=0.524681;STBP=0.672;TYPE=snp;VARB=0.00361548;OID=.;OPOS=140023238;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:96:48:48:48:48:0.5:33:15:13:35:33:15:13:35
chr5	140048209	.	T	C	228.15	PASS	AF=0.52381;AO=22;DP=42;FAO=22;FDP=42;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.00429364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.1002;QD=21.7288;RBI=0.0682879;REFB=-0.0391773;REVB=0.0681528;RO=20;SAF=8;SAR=14;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161987;STB=0.591027;STBP=0.239;TYPE=snp;VARB=0.0386135;OID=.;OPOS=140048209;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:20:20:22:22:0.52381:14:8:11:9:14:8:11:9
chr5	140048267	.	T	C	747.08	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.463;QD=63.5815;RBI=0.0432232;REFB=0;REVB=0.0420375;RO=0;SAF=24;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00010539;OID=.;OPOS=140048267;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:23:24:0:0:23:24:0:0
chr5	140048544	.	C	T	181.75	PASS	AF=0.44186;AO=18;DP=42;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=-0.000229514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.081;QD=16.9071;RBI=0.0272892;REFB=-0.00387401;REVB=0.0272883;RO=23;SAF=8;SAR=10;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0757583;STB=0.567496;STBP=0.427;TYPE=snp;VARB=0.0055238;OID=.;OPOS=140048544;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:43:23:24:18:19:0.44186:10:8:12:11:11:8:13:11
chr5	140052271	.	A	G	56.29	PASS	AF=0.4;AO=8;DP=20;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.0185618;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.348;QD=11.2585;RBI=0.0187411;REFB=0.00143561;REVB=-0.00258642;RO=12;SAF=6;SAR=2;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.272725;STB=0.666222;STBP=0.271;TYPE=snp;VARB=-0.00556631;OID=.;OPOS=140052271;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:20:20:12:12:8:8:0.4:2:6:6:6:2:6:6:6
chr5	140098596	.	T	G	296.36	PASS	AF=0.634146;AO=26;DP=41;FAO=26;FDP=41;FR=.;FRO=15;FSAF=22;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=0.00317788;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=264.421;QD=28.9132;RBI=0.024988;REFB=-0.0163543;REVB=-0.0247851;RO=15;SAF=22;SAR=4;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192678;STB=0.607269;STBP=0.163;TYPE=snp;VARB=0.00898714;OID=.;OPOS=140098596;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:15:15:26:26:0.634146:4:22:10:5:4:22:10:5
chr5	140111764	.	AT	A	218.34	PASS	AF=0.485714;AO=34;DP=71;FAO=34;FDP=70;FR=.;FRO=36;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=0.0041121;FXX=0.0140825;HRUN=2;LEN=1;MLLD=25.8188;QD=12.4765;RBI=0.0824671;REFB=0.0375289;REVB=0.0823645;RO=36;SAF=17;SAR=17;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0511624;STB=0.528555;STBP=0.692;TYPE=del;VARB=-0.0352071;OID=.;OPOS=140111765;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.485714:34:71:34:70:36:17:17:20:16:99:36:17:17:20:16
chr5	140167463	.	C	T	110.65	PASS	AF=0.448276;AO=13;DP=29;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.0266573;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.45;QD=15.2623;RBI=0.026778;REFB=-0.00758934;REVB=-0.0025395;RO=16;SAF=3;SAR=10;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.233108;STB=0.636714;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.00597539;OID=.;OPOS=140167463;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:16:16:13:13:0.448276:10:3:7:9:10:3:7:9
chr5	140168070	.	A	G	89.78	PASS	AF=0.25;AO=12;DP=48;FAO=12;FDP=48;FR=.;FRO=36;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=23;FWDB=-0.0421485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.6664;QD=7.48143;RBI=0.117684;REFB=-0.0129669;REVB=-0.109877;RO=36;SAF=8;SAR=4;SRF=13;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.356411;STB=0.719654;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=0.0180602;OID=.;OPOS=140168070;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:48:48:36:36:12:12:0.25:4:8:13:23:4:8:13:23
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chr5	140174865	.	G	C	443.34	PASS	AF=0.608696;AO=42;DP=68;FAO=42;FDP=69;FR=.;FRO=27;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=0.00584174;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.7861;QD=25.7008;RBI=0.00780817;REFB=0.00564567;REVB=0.00518089;RO=26;SAF=19;SAR=23;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0207438;STB=0.503134;STBP=0.962;TYPE=snp;VARB=-0.00425145;OID=.;OPOS=140174865;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:69:26:27:42:42:0.608696:23:19:11:15:23:19:12:15
chr5	140181734	.	A	G	195.52	PASS	AF=0.454545;AO=20;DP=44;FAO=20;FDP=44;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=-0.00364189;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=81.4916;QD=17.7749;RBI=0.00446837;REFB=-0.021094;REVB=0.00258902;RO=24;SAF=9;SAR=11;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.205404;STB=0.616479;STBP=0.187;TYPE=snp;VARB=0.0389585;OID=.;OPOS=140181734;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:24:24:20:20:0.454545:11:9:16:8:11:9:16:8
chr5	140181892	.	T	C	197.71	PASS	AF=0.393443;AO=23;DP=61;FAO=24;FDP=61;FR=.;FRO=37;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=23;FSRR=14;FWDB=0.00242594;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.382;QD=12.9643;RBI=0.0124995;REFB=-0.0133605;REVB=-0.0122619;RO=38;SAF=11;SAR=12;SRF=23;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136597;STB=0.598026;STBP=0.246;TYPE=snp;VARB=0.0226521;OID=.;OPOS=140181892;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:38:37:23:24:0.393443:12:11:23:15:13:11:23:14
chr5	140182101	.	G	T	242.63	PASS	AF=0.509804;AO=25;DP=51;FAO=26;FDP=51;FR=.;FRO=25;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.0730535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.412;QD=19.0296;RBI=0.0749936;REFB=-0.0199506;REVB=-0.0169474;RO=26;SAF=13;SAR=12;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0167788;STB=0.509084;STBP=0.929;TYPE=snp;VARB=0.0138793;OID=.;OPOS=140182101;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:26:25:25:26:0.509804:12:13:14:12:12:14:13:12
chr5	140183058	.	G	A	195.2	PASS	AF=0.558824;AO=19;DP=34;FAO=19;FDP=34;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=-0.0104375;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.4232;QD=22.9641;RBI=0.0357587;REFB=-0.00224127;REVB=0.0342015;RO=14;SAF=8;SAR=11;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0501505;STB=0.509544;STBP=0.946;TYPE=snp;VARB=0.00498022;OID=.;OPOS=140183058;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:14:15:19:19:0.558824:11:8:5:9:11:8:6:9
chr5	140187048	.	G	C	60.27	PASS	AF=0.225;AO=9;DP=40;FAO=9;FDP=40;FR=.;FRO=31;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=0.00519092;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=250.606;QD=6.02725;RBI=0.00668617;REFB=-0.0061305;REVB=0.00421417;RO=31;SAF=3;SAR=6;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148648;STB=0.596271;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.0272656;OID=.;OPOS=140187048;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:60:40:40:31:31:9:9:0.225:6:3:14:17:6:3:14:17
chr5	140187102	.	A	G	124.15	PASS	AF=0.3;AO=15;DP=50;FAO=15;FDP=50;FR=.;FRO=35;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=-0.0049338;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.45;QD=9.93221;RBI=0.0218657;REFB=-0.0018626;REVB=-0.0213018;RO=35;SAF=3;SAR=12;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.34322;STB=0.709972;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=0.00560034;OID=.;OPOS=140187102;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:35:35:15:15:0.3:12:3:16:19:12:3:16:19
chr5	140187322	.	C	T	355.7	PASS	AF=0.436782;AO=37;DP=86;FAO=38;FDP=87;FR=.;FRO=49;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=23;FSRR=26;FWDB=0.00136447;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.421;QD=16.3541;RBI=0.00272703;REFB=-0.000350355;REVB=0.00236112;RO=49;SAF=15;SAR=22;SRF=23;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0660536;STB=0.543172;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.000627957;OID=.;OPOS=140187322;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:87:49:49:37:38:0.436782:22:15:23:26:23:15:23:26
chr5	140188383	.	T	G	110.65	PASS	AF=0.448276;AO=13;DP=29;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=-0.0280427;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.623;QD=15.2624;RBI=0.0280451;REFB=0.0116765;REVB=-0.000367303;RO=16;SAF=4;SAR=9;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00534704;STB=0.503101;STBP=0.975;TYPE=snp;VARB=-0.0151669;OID=.;OPOS=140188383;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:16:16:13:13:0.448276:9:4:5:11:9:4:5:11
chr5	140188401	.	A	G	68.81	PASS	AF=0.5;AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.0212733;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.295;QD=15.2919;RBI=0.0455462;REFB=-0.0153464;REVB=-0.0402729;RO=9;SAF=5;SAR=4;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0369894;OID=.;OPOS=140188401;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:18:18:9:9:9:9:0.5:4:5:5:4:4:5:5:4
chr5	140188575	.	G	C	226.42	PASS	AF=0.471698;AO=25;DP=53;FAO=25;FDP=53;FR=.;FRO=28;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=0.00221673;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.1524;QD=17.0885;RBI=0.00523068;REFB=0.0145858;REVB=0.00473773;RO=28;SAF=16;SAR=9;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135822;STB=0.57674;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=-0.0172851;OID=.;OPOS=140188575;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:28:28:25:25:0.471698:9:16:14:14:9:16:14:14
chr5	140201420	.	T	C	238.73	PASS	AF=0.411765;AO=28;DP=68;FAO=28;FDP=68;FR=.;FRO=40;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=-0.0389408;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.504;QD=14.0427;RBI=0.0393715;REFB=-0.0148441;REVB=-0.00580757;RO=40;SAF=11;SAR=17;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0869051;STB=0.549533;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=0.0247569;OID=.;OPOS=140201420;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:40:40:28:28:0.411765:17:11:19:21:17:11:19:21
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chr5	140214381	.	G	A	103.95	PASS	AF=0.267857;AO=14;DP=55;FAO=15;FDP=56;FR=.;FRO=41;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=25;FSRR=16;FWDB=-0.0376112;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.4215;QD=7.42521;RBI=0.0440078;REFB=0.00610274;REVB=-0.0228492;RO=41;SAF=6;SAR=8;SRF=25;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21609;STB=0.603639;STBP=0.35;TYPE=snp;VARB=-0.0203588;OID=.;OPOS=140214381;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:56:41:41:14:15:0.267857:8:6:25:16:8:7:25:16
chr5	140221139	.	G	A	157.03	PASS	AF=0.435897;AO=17;DP=39;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=0.0150738;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.789;QD=16.1058;RBI=0.0157815;REFB=0.0163067;REVB=0.00467298;RO=22;SAF=8;SAR=9;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0733111;STB=0.542119;STBP=0.665;TYPE=snp;VARB=-0.0117363;OID=.;OPOS=140221139;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:22:22:17:17:0.435897:9:8:12:10:9:8:12:10
chr5	140228164	.	C	A	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000659574;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.17;QD=44.6898;RBI=0.0567806;REFB=0;REVB=0.0567768;RO=0;SAF=3;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000353751;OID=.;OPOS=140228164;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:10:3:0:0:10:3:0:0
chr5	140229086	.	C	G	740.37	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0350146;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.2695;QD=56.9518;RBI=0.0405207;REFB=0;REVB=-0.0203938;RO=0;SAF=31;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.13361e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000154447;OID=.;OPOS=140229086;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:52:0:0:51:52:1:20:31:0:0:21:31:0:0
chr5	140229368	.	G	C	330.56	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0250173;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=52.6411;QD=52.8888;RBI=0.0370663;REFB=0;REVB=0.0273503;RO=0;SAF=13;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00505541;OID=.;OPOS=140229368;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:25:0:0:24:25:1:11:13:0:0:12:13:0:0
chr5	140229526	.	T	G	689.38	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0294787;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.424;QD=62.671;RBI=0.0478961;REFB=0;REVB=0.0377497;RO=0;SAF=24;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.30465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.67095e-05;OID=.;OPOS=140229526;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:20:24:0:0:20:24:0:0
chr5	140230370	.	AA	CC	670.27	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000580871;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=146.912;QD=62.3509;RBI=0.0269488;REFB=0;REVB=-0.0269425;RO=0;SAF=24;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=-9.15389e-05;OID=.;OPOS=140230370;OREF=AA;OALT=CC;OMAPALT=CC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:19:24:0:0:19:24:0:0
chr5	140231237	.	T	C	575.74	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00108469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.8372;QD=60.6042;RBI=0.0854408;REFB=0;REVB=0.0854339;RO=0;SAF=19;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.68991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000824416;OID=.;OPOS=140231237;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:38:0:0:37:38:1:18:19:0:0:18:20:0:0
chr5	140232950	.	G	C	255.89	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000949608;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.5159;QD=51.1785;RBI=0.0542276;REFB=0;REVB=-0.0542193;RO=0;SAF=10;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000990428;OID=.;OPOS=140232950;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:10:10:0:0:10:10:0:0
chr5	140236950	.	C	G	632.26	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0131592;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.245;QD=61.684;RBI=0.0202725;REFB=0;REVB=0.0154211;RO=0;SAF=18;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.75025e-05;OID=.;OPOS=140236950;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:23:18:0:0:23:18:0:0
chr5	140237109	.	T	G	972.75	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0861745;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.1412;QD=58.9546;RBI=0.0864597;REFB=0;REVB=0.00701627;RO=0;SAF=35;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.769e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000642104;OID=.;OPOS=140237109;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:31:35:0:0:31:35:0:0
chr5	140237387	.	T	G	312.15	PASS	AF=0.96;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=25;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0415341;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.0947;QD=49.9435;RBI=0.0643548;REFB=-0.004692;REVB=0.0491575;RO=0;SAF=11;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.52379;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=0.00368845;OID=.;OPOS=140237387;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:24:25:0:1:24:24:0.96:13:11:0:0:14:10:1:0
chr5	140237548	.	A	G	483.34	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.024391;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.644;QD=58.5863;RBI=0.0281578;REFB=0;REVB=0.0140693;RO=0;SAF=23;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000166216;OID=.;OPOS=140237548;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:10:23:0:0:10:23:0:0
chr5	140242451	.	GC	G	474.45	PASS	AF=1;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00662507;FXX=0.0238039;HRUN=2;LEN=1;MLLD=27.7011;QD=46.2878;RBI=0.00714278;REFB=0;REVB=-0.00266979;RO=0;SAF=24;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.2194e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.000796456;OID=.;OPOS=140242452;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:41:42:41:41:0:24:17:0:0:9:0:24:17:0:0
chr5	140242479	.	T	A	724.25	PASS	AF=0.981132;AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0026366;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=198.722;QD=54.6606;RBI=0.0204931;REFB=-0.00599683;REVB=0.0203228;RO=0;SAF=28;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508769;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=1.93787e-05;OID=.;OPOS=140242479;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:53:53:0:1:52:52:0.981132:24:28:0:0:24:28:1:0
chr5	140250252	.	T	C	320.81	PASS	AF=0.55;AO=33;DP=60;FAO=33;FDP=60;FR=.;FRO=27;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=0.0116499;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.562;QD=21.3876;RBI=0.0212495;REFB=-0.021012;REVB=0.0177713;RO=27;SAF=14;SAR=19;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.07739;STB=0.542831;STBP=0.495;TYPE=snp;VARB=0.0205551;OID=.;OPOS=140250252;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:27:27:33:33:0.55:19:14:14:13:19:14:14:13
chr5	140255792	.	C	A	212.95	PASS	AF=0.606061;AO=17;DP=34;FAO=20;FDP=33;FR=.,HEALED;FRO=13;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=-0.00544778;FXX=0.0294031;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.6818;QD=25.8122;RBI=0.202699;REFB=-0.0673213;REVB=-0.202626;RO=9;SAF=7;SAR=10;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0208503;STB=0.5185;STBP=0.822;TYPE=snp;VARB=0.036262;OID=.;OPOS=140255792;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:33:9:13:17:20:0.606061:10:7:4:5:13:7:4:9
chr5	140263290	.	T	G	854.9	PASS	AF=0.983607;AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0214379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.24;QD=56.0591;RBI=0.0214383;REFB=-0.165592;REVB=0.000133134;RO=0;SAF=35;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.89445e-08;STB=0.50704;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=0.000355552;OID=.;OPOS=140263290;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:61:61:0:1:60:60:0.983607:25:35:0:0:25:35:1:0
chr5	140307284	.	G	A	396.6	PASS	AF=0.460674;AO=41;DP=89;FAO=41;FDP=89;FR=.;FRO=48;FSAF=13;FSAR=28;FSRF=25;FSRR=23;FWDB=-0.0210365;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.885;QD=17.8245;RBI=0.0216939;REFB=0.000182855;REVB=0.00529974;RO=48;SAF=13;SAR=28;SRF=25;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.206866;STB=0.616039;STBP=0.06;TYPE=snp;VARB=-0.000196953;OID=.;OPOS=140307284;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:48:48:41:41:0.460674:28:13:25:23:28:13:25:23
chr5	140307969	.	C	G	250.32	PASS	AF=0.5;AO=27;DP=54;FAO=27;FDP=54;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=0.0448644;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.0964;QD=18.5425;RBI=0.0878651;REFB=-0.0243015;REVB=-0.0755477;RO=27;SAF=15;SAR=12;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0336267;STB=0.518815;STBP=0.825;TYPE=snp;VARB=0.0203087;OID=.;OPOS=140307969;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:27:27:27:27:0.5:12:15:16:11:12:15:16:11
chr5	140309016	.	C	T	386.56	PASS	AF=0.470588;AO=40;DP=85;FAO=40;FDP=85;FR=.;FRO=45;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=18;FSRR=27;FWDB=0.00760169;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.238;QD=18.1913;RBI=0.0215337;REFB=-0.0125718;REVB=-0.0201473;RO=45;SAF=16;SAR=24;SRF=18;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0106724;OID=.;OPOS=140309016;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:45:45:40:40:0.470588:24:16:18:27:24:16:18:27
chr5	140346468	.	T	A	356.73	PASS	AF=0.436782;AO=38;DP=88;FAO=38;FDP=87;FR=.;FRO=49;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=27;FWDB=-0.00750652;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.71;QD=16.4012;RBI=0.00948657;REFB=-0.0151461;REVB=-0.00580063;RO=49;SAF=24;SAR=14;SRF=22;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.185331;STB=0.604367;STBP=0.103;TYPE=snp;VARB=0.0324952;OID=.;OPOS=140346468;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:87:49:49:38:38:0.436782:14:24:22:27:14:24:22:27
chr5	140347398	.	C	T	303.47	PASS	AF=0.563636;AO=30;DP=54;FAO=31;FDP=55;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=0.00637229;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.761;QD=22.0706;RBI=0.00747769;REFB=-0.00188004;REVB=0.00391278;RO=24;SAF=11;SAR=19;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.240572;STB=0.621417;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.00187036;OID=.;OPOS=140347398;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:55:24:24:30:31:0.563636:19:11:16:8:19:12:16:8
chr5	140389536	.	A	G	62.59	PASS	AF=0.290323;AO=9;DP=31;FAO=9;FDP=31;FR=.;FRO=22;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.106245;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.9635;QD=8.07582;RBI=0.106339;REFB=-0.0314931;REVB=0.00447504;RO=22;SAF=3;SAR=6;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145403;STB=0.590701;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.0668988;OID=.;OPOS=140389536;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:31:31:22:22:9:9:0.290323:6:3:10:12:6:3:10:12
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chr5	140476653	.	GC	AA	105.32	PASS	AF=0.342105;AO=13;DP=38;FAO=13;FDP=38;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=21;FWDB=-0.0105459;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=254.739;QD=11.086;RBI=0.036584;REFB=-0.013823;REVB=-0.0350311;RO=24;SAF=5;SAR=8;SRF=4;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.276828;STB=0.66799;STBP=0.208;TYPE=mnp;VARB=0.0229104;OID=.;OPOS=140476653;OREF=GC;OALT=AA;OMAPALT=AA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:24:25:13:13:0.342105:8:5:4:20:8:5:4:21
chr5	140476805	.	T	G	621.73	PASS	AF=0.36019;AO=76;DP=211;FAO=76;FDP=211;FR=.;FRO=135;FSAF=28;FSAR=48;FSRF=62;FSRR=73;FWDB=0.00467477;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=265.449;QD=11.7863;RBI=0.0094101;REFB=-0.00172657;REVB=-0.00816679;RO=134;SAF=28;SAR=48;SRF=62;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109763;STB=0.56044;STBP=0.206;TYPE=snp;VARB=0.00321965;OID=.;OPOS=140476805;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:211:211:134:135:76:76:0.36019:48:28:62:72:48:28:62:73
chr5	140480852	.	G	A	55.03	PASS	AF=0.347826;AO=8;DP=23;FAO=8;FDP=23;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=4;FWDB=0.0149768;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.1894;QD=9.56963;RBI=0.0682923;REFB=0.000946234;REVB=0.0666298;RO=15;SAF=4;SAR=4;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.252475;STB=0.651828;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.00285248;OID=.;OPOS=140480852;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:23:23:15:15:8:8:0.347826:4:4:11:4:4:4:11:4
chr5	140481475	.	A	T	143.31	PASS	AF=0.410256;AO=16;DP=39;FAO=16;FDP=39;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=-0.00550624;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.033;QD=14.6983;RBI=0.00860405;REFB=-0.0122555;REVB=-0.00661143;RO=23;SAF=5;SAR=11;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00969069;STB=0.505611;STBP=0.971;TYPE=snp;VARB=0.0204099;OID=.;OPOS=140481475;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:23:23:16:16:0.410256:11:5:7:16:11:5:7:16
chr5	140482483	.	G	A	88.21	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.043334;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.34;QD=39.2026;RBI=0.0767047;REFB=0;REVB=-0.0632912;RO=0;SAF=7;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00249975;OID=.;OPOS=140482483;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:2:7:0:0:2:7:0:0
chr5	140502343	.	CC	TT	180.85	PASS	AF=0.403846;AO=21;DP=52;FAO=21;FDP=52;FR=.;FRO=31;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=-0.00942388;FXX=0;HRUN=5;LEN=2;MLLD=250.878;QD=13.9118;RBI=0.00942388;REFB=-0.00493007;REVB=7.72133e-06;RO=31;SAF=7;SAR=14;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19633;STB=0.613223;STBP=0.193;TYPE=mnp;VARB=0.00710211;OID=.;OPOS=140502343;OREF=CC;OALT=TT;OMAPALT=TT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:31:31:21:21:0.403846:14:7:16:15:14:7:16:15
chr5	140503237	.	A	G	112.23	PASS	AF=0.481481;AO=13;DP=27;FAO=13;FDP=27;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.000158124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.766;QD=16.627;RBI=0.0203053;REFB=0.00510284;REVB=0.0203047;RO=14;SAF=4;SAR=9;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185092;STB=0.60719;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=-0.00907483;OID=.;OPOS=140503237;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:14:14:13:13:0.481481:9:4:7:7:9:4:7:7
chr5	140517174	.	T	C	54.66	PASS	AF=0.333333;AO=8;DP=24;FAO=8;FDP=24;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=0.0126446;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.696;QD=9.1104;RBI=0.0129683;REFB=0.0011706;REVB=-0.00287916;RO=16;SAF=4;SAR=4;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.276263;STB=0.666296;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=-0.00297552;OID=.;OPOS=140517174;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:24:24:16:16:8:8:0.333333:4:4:4:12:4:4:4:12
chr5	140530852	.	G	C	417.8	PASS	AF=0.554054;AO=41;DP=74;FAO=41;FDP=74;FR=.;FRO=33;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=0.0193701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.31;QD=22.584;RBI=0.0228913;REFB=-0.0142894;REVB=0.0121988;RO=33;SAF=18;SAR=23;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13483;STB=0.574208;STBP=0.173;TYPE=snp;VARB=0.0116688;OID=.;OPOS=140530852;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:33:33:41:41:0.554054:23:18:20:13:23:18:20:13
chr5	140531175	.	T	C	409.87	PASS	AF=1;AO=22;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0896945;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.0804;QD=56.5331;RBI=0.0959344;REFB=0;REVB=-0.0340341;RO=0;SAF=5;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.58081e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00140846;OID=.;OPOS=140531175;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:22:29:1:17:5:0:0:18:11:0:0
chr5	140531374	.	T	C	82.98	PASS	AF=0.407407;AO=11;DP=27;FAO=11;FDP=27;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.030341;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=154.199;QD=12.2939;RBI=0.0444922;REFB=-0.0199768;REVB=-0.0325419;RO=16;SAF=7;SAR=4;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140607;STB=0.583179;STBP=0.478;TYPE=snp;VARB=0.0400981;OID=.;OPOS=140531374;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:82:27:27:16:16:11:11:0.407407:4:7:8:8:4:7:8:8
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chr5	140553856	.	G	A	45.61	PASS	AF=0.333333;AO=7;DP=19;FAO=7;FDP=21;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=0.0027534;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=68.4882;QD=8.6873;RBI=0.0651504;REFB=-0.0190466;REVB=-0.0650921;RO=12;SAF=4;SAR=3;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.240999;STB=0.68373;STBP=0.291;TYPE=snp;VARB=0.0145849;OID=.;OPOS=140553856;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:19:21:12:14:7:7:0.333333:3:4:4:8:3:4:4:10
chr5	140553917	.	G	A	35.54	PASS	AF=0.24;AO=6;DP=25;FAO=6;FDP=25;FR=.;FRO=19;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=16;FWDB=0.00300697;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.751;QD=5.68569;RBI=0.0164589;REFB=-0.0209266;REVB=-0.0161819;RO=19;SAF=2;SAR=4;SRF=3;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.265763;STB=0.666221;STBP=0.478;TYPE=snp;VARB=0.08099;OID=.;OPOS=140553917;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:25:25:19:19:6:6:0.24:4:2:3:16:4:2:3:16
chr5	140553919	.	C	A	35.55	PASS	AF=0.24;AO=6;DP=25;FAO=6;FDP=25;FR=.;FRO=19;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=16;FWDB=0.06517;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.657;QD=5.68855;RBI=0.0671133;REFB=-0.0149233;REVB=-0.0160332;RO=19;SAF=2;SAR=4;SRF=3;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.265763;STB=0.666221;STBP=0.478;TYPE=snp;VARB=0.0271028;OID=.;OPOS=140553919;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:25:25:19:19:6:6:0.24:4:2:3:16:4:2:3:16
chr5	140554006	.	C	G	46.0	PASS	AF=0.35;AO=7;DP=20;FAO=7;FDP=20;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=11;FWDB=0.0154618;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=287.984;QD=9.19977;RBI=0.0155782;REFB=-0.0192016;REVB=0.00190048;RO=13;SAF=3;SAR=4;SRF=2;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.322577;STB=0.691863;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.0363674;OID=.;OPOS=140554006;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:20:20:13:13:7:7:0.35:4:3:2:11:4:3:2:11
chr5	140554808	.	T	A	442.81	PASS	AF=0.271552;AO=61;DP=229;FAO=63;FDP=232;FR=.;FRO=169;FSAF=33;FSAR=30;FSRF=88;FSRR=81;FWDB=-0.00183803;FXX=0.00429166;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.0188;QD=7.63472;RBI=0.0147587;REFB=-0.00242622;REVB=-0.0146438;RO=160;SAF=33;SAR=28;SRF=81;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0427901;STB=0.502262;STBP=0.977;TYPE=snp;VARB=0.00391336;OID=.;OPOS=140554808;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:229:232:160:169:61:63:0.271552:28:33:81:79:30:33:88:81
chr5	140558326	.	T	C	312.64	PASS	AF=0.228311;AO=50;DP=219;FAO=50;FDP=219;FR=.;FRO=169;FSAF=31;FSAR=19;FSRF=87;FSRR=82;FWDB=0.0375715;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.905;QD=5.71023;RBI=0.0384478;REFB=0.000906773;REVB=-0.00816206;RO=167;SAF=31;SAR=19;SRF=85;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142866;STB=0.582695;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=-0.00272736;OID=.;OPOS=140558326;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:219:219:167:169:50:50:0.228311:19:31:85:82:19:31:87:82
chr5	140558528	.	A	G	113.59	PASS	AF=0.160584;AO=22;DP=137;FAO=22;FDP=137;FR=.;FRO=115;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=54;FSRR=61;FWDB=0.00181307;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=229.625;QD=3.3166;RBI=0.0039728;REFB=-0.00285543;REVB=-0.00353496;RO=115;SAF=13;SAR=9;SRF=54;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153869;STB=0.601362;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=0.0144244;OID=.;OPOS=140558528;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:137:137:115:115:22:22:0.160584:9:13:54:61:9:13:54:61
chr5	140559596	.	T	G	538.55	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0106625;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.249;QD=59.8393;RBI=0.0110734;REFB=0;REVB=0.00298879;RO=0;SAF=17;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.7982e-05;OID=.;OPOS=140559596;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:19:17:0:0:19:17:0:0
chr5	140559679	.	C	G	194.0	PASS	AF=0.444444;AO=20;DP=45;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=0.0398801;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.0766;QD=17.2448;RBI=0.0449877;REFB=0.0133275;REVB=-0.0208199;RO=24;SAF=10;SAR=10;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119924;STB=0.555501;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=-0.0150995;OID=.;OPOS=140559679;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:24:25:20:20:0.444444:10:10:9:15:10:10:10:15
chr5	140559849	.	G	A	453.1	PASS	AF=0.5;AO=43;DP=90;FAO=46;FDP=92;FR=.;FRO=46;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=23;FSRR=23;FWDB=0.0155058;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.146;QD=19.6998;RBI=0.0162469;REFB=-0.0229536;REVB=0.00485071;RO=45;SAF=20;SAR=23;SRF=22;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0219341;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0207952;OID=.;OPOS=140559849;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:92:45:46:43:46:0.5:23:20:22:23:23:23:23:23
chr5	140559914	.	T	C	363.26	PASS	AF=0.475;AO=38;DP=80;FAO=38;FDP=80;FR=.;FRO=42;FSAF=9;FSAR=29;FSRF=11;FSRR=31;FWDB=0.00243771;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=251.76;QD=18.1628;RBI=0.0110748;REFB=-0.00996412;REVB=0.0108032;RO=42;SAF=9;SAR=29;SRF=11;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0319149;STB=0.517848;STBP=0.791;TYPE=snp;VARB=0.0094092;OID=.;OPOS=140559914;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:42:42:38:38:0.475:29:9:11:31:29:9:11:31
chr5	140563173	.	G	T	397.7	PASS	AF=0.565217;AO=39;DP=71;FAO=39;FDP=69;FR=.;FRO=30;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=-0.00491197;FXX=0.028165;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.2307;QD=23.0548;RBI=0.0197202;REFB=-0.0176399;REVB=0.0190986;RO=29;SAF=17;SAR=22;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00974507;STB=0.513547;STBP=0.832;TYPE=snp;VARB=0.0185215;OID=.;OPOS=140563173;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:69:29:30:39:39:0.565217:22:17:13:16:22:17:14:16
chr5	140564214	.	T	C	100.43	PASS	AF=0.428571;AO=12;DP=28;FAO=12;FDP=28;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.00800283;FXX=0.0344709;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.63;QD=14.3475;RBI=0.0163739;REFB=0.00776469;REVB=-0.0142849;RO=16;SAF=3;SAR=9;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.270626;STB=0.659715;STBP=0.173;TYPE=snp;VARB=-0.0078688;OID=.;OPOS=140564214;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:28:16:16:12:12:0.428571:9:3:8:8:9:3:8:8
chr5	140564594	.	C	T	69.64	PASS	AF=0.529412;AO=9;DP=17;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=0.0529041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.04;QD=16.3856;RBI=0.0538583;REFB=-0.00978598;REVB=-0.0100933;RO=8;SAF=3;SAR=6;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.355513;STB=0.699669;STBP=0.163;TYPE=snp;VARB=0.00935979;OID=.;OPOS=140564594;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:17:17:8:8:9:9:0.529412:6:3:0:8:6:3:0:8
chr5	140564661	.	T	C	127.54	PASS	AF=0.416667;AO=16;DP=36;FAO=15;FDP=36;FR=.;FRO=21;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=16;FWDB=-0.0153664;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=43.4469;QD=14.1715;RBI=0.0174654;REFB=0.0101189;REVB=-0.00830145;RO=20;SAF=4;SAR=12;SRF=5;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.521711;STBP=0.867;TYPE=snp;VARB=-0.0240818;OID=.;OPOS=140564661;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:20:21:16:15:0.416667:12:4:5:15:11:4:5:16
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chr5	140567608	.	C	T	210.07	PASS	AF=0.5;AO=17;DP=44;FAO=22;FDP=44;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.0561264;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=46.9031;QD=19.0968;RBI=0.0811507;REFB=-0.109926;REVB=-0.0586111;RO=17;SAF=4;SAR=13;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.292682;STB=0.546176;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0518018;OID=.;OPOS=140567608;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:17:22:17:22:0.5:13:4:9:8:13:9:11:11
chr5	140568034	.	C	CA	650.11	PASS	AF=1;AO=51;DP=57;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0600598;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=24.1054;QD=47.2807;RBI=0.200518;REFB=0;REVB=-0.191312;RO=4;SAF=24;SAR=27;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.030303;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00341564;OID=.;OPOS=140568035;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:51:57:55:55:0:24:31:0:0:12:4:24:27:1:3
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chr5	140568167	.	T	A	124.15	PASS	AF=0.3;AO=15;DP=50;FAO=15;FDP=50;FR=.;FRO=35;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=-0.00879453;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.329;QD=9.93223;RBI=0.0339596;REFB=-0.0110897;REVB=-0.032801;RO=35;SAF=5;SAR=10;SRF=14;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0838656;STB=0.550655;STBP=0.65;TYPE=snp;VARB=0.00653758;OID=.;OPOS=140568167;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:35:35:15:15:0.3:10:5:14:21:10:5:14:21
chr5	140568379	.	A	G	36.4	PASS	AF=0.545455;AO=5;DP=11;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0299278;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.5824;QD=13.2353;RBI=0.0465499;REFB=-0.0330573;REVB=0.0356542;RO=5;SAF=3;SAR=2;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.545304;STBP=0.816;TYPE=snp;VARB=0.0184827;OID=.;OPOS=140568379;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:11:11:5:5:5:6:0.545455:2:3:3:2:3:3:3:2
chr5	140568869	.	G	T	41.36	PASS	AF=0.166667;AO=7;DP=42;FAO=7;FDP=42;FR=.;FRO=35;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=-0.0136253;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.33;QD=3.93896;RBI=0.0149962;REFB=-0.00745586;REVB=-0.00626398;RO=35;SAF=3;SAR=4;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103079;STB=0.571225;STBP=0.748;TYPE=snp;VARB=0.0313611;OID=.;OPOS=140568869;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:42:42:35:35:7:7:0.166667:4:3:18:17:4:3:18:17
chr5	140572668	.	C	T	253.93	PASS	AF=0.510638;AO=24;DP=47;FAO=24;FDP=47;FR=.;FRO=23;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=-0.00387398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.6479;QD=21.6112;RBI=0.0333356;REFB=-0.0162891;REVB=0.0331097;RO=23;SAF=15;SAR=9;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0150974;STB=0.508467;STBP=0.933;TYPE=snp;VARB=0.0169407;OID=.;OPOS=140572668;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:23:23:24:24:0.510638:9:15:14:9:9:15:14:9
chr5	140573439	.	G	C	200.85	PASS	AF=0.512821;AO=20;DP=39;FAO=20;FDP=39;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=-0.0205303;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.8362;QD=20.6001;RBI=0.0206441;REFB=0.0139233;REVB=-0.00216495;RO=19;SAF=6;SAR=14;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0679889;STB=0.538422;STBP=0.699;TYPE=snp;VARB=-0.0227224;OID=.;OPOS=140573439;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:19:19:20:20:0.512821:14:6:7:12:14:6:7:12
chr5	140573442	.	C	G	200.86	PASS	AF=0.512821;AO=20;DP=39;FAO=20;FDP=39;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=0.0139091;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=242.394;QD=20.6011;RBI=0.01953;REFB=-0.00413676;REVB=0.0137097;RO=19;SAF=6;SAR=14;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0679889;STB=0.538422;STBP=0.699;TYPE=snp;VARB=0.00399514;OID=.;OPOS=140573442;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:19:19:20:20:0.512821:14:6:7:12:14:6:7:12
chr5	140575211	.	G	T	201.9	PASS	AF=0.655172;AO=19;DP=30;FAO=19;FDP=29;FR=.;FRO=10;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=-0.00738053;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.056;QD=27.8475;RBI=0.0112918;REFB=-0.0087926;REVB=0.00854586;RO=11;SAF=9;SAR=10;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0126582;STB=0.525521;STBP=0.755;TYPE=snp;VARB=0.00720584;OID=.;OPOS=140575211;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:30:29:11:10:19:19:0.655172:10:9:5:6:10:9:4:6
chr5	140579358	.	A	G	244.25	PASS	AF=0.547619;AO=23;DP=42;FAO=23;FDP=42;FR=.;FRO=19;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.0206519;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.197;QD=23.2618;RBI=0.0369727;REFB=0.00645744;REVB=-0.0306672;RO=19;SAF=12;SAR=11;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00371334;STB=0.502073;STBP=0.969;TYPE=snp;VARB=-0.00322396;OID=.;OPOS=140579358;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:19:19:23:23:0.547619:11:12:10:9:11:12:10:9
chr5	140580772	.	T	C	118.82	PASS	AF=0.619048;AO=13;DP=21;FAO=13;FDP=21;FR=.;FRO=8;FSAF=1;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=-0.0516621;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.6692;QD=22.6327;RBI=0.0519599;REFB=0.0298522;REVB=0.00555545;RO=7;SAF=1;SAR=12;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124998;STB=0.558041;STBP=0.787;TYPE=snp;VARB=-0.0142613;OID=.;OPOS=140580772;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:21:21:7:8:13:13:0.619048:12:1:1:6:12:1:1:7
chr5	140580931	.	C	G	207.26	PASS	AF=0.588235;AO=20;DP=34;FAO=20;FDP=34;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=-0.0155487;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.488;QD=24.3839;RBI=0.0155488;REFB=-0.012682;REVB=4.81044e-05;RO=14;SAF=7;SAR=13;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0531482;STB=0.529576;STBP=0.718;TYPE=snp;VARB=0.0172454;OID=.;OPOS=140580931;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:14:14:20:20:0.588235:13:7:4:10:13:7:4:10
chr5	140590766	.	A	G	164.13	PASS	AF=0.372549;AO=19;DP=51;FAO=19;FDP=51;FR=.;FRO=32;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=21;FWDB=-0.0284781;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.246;QD=12.8731;RBI=0.0287953;REFB=0.00333592;REVB=-0.00426175;RO=32;SAF=5;SAR=14;SRF=11;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104827;STB=0.561336;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=-0.00282482;OID=.;OPOS=140590766;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:32:32:19:19:0.372549:14:5:11:21:14:5:11:21
chr5	140595001	.	A	G	400.49	PASS	AF=0.533333;AO=40;DP=75;FAO=40;FDP=75;FR=.;FRO=35;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=0.0032916;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.7079;QD=21.3596;RBI=0.00909669;REFB=-0.00297662;REVB=0.00848028;RO=35;SAF=17;SAR=23;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00308319;STB=0.501703;STBP=0.992;TYPE=snp;VARB=0.0031311;OID=.;OPOS=140595001;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:35:35:40:40:0.533333:23:17:15:20:23:17:15:20
chr5	140595106	.	C	G	65.91	PASS	AF=0.409091;AO=9;DP=22;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=11;FWDB=-0.0430678;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.9441;QD=11.9831;RBI=0.0600342;REFB=-0.0130944;REVB=0.0418243;RO=13;SAF=1;SAR=8;SRF=2;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0958989;STB=0.557999;STBP=0.851;TYPE=snp;VARB=0.0243491;OID=.;OPOS=140595106;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:22:22:13:13:9:9:0.409091:8:1:2:11:8:1:2:11
chr5	140595756	.	C	T	71.66	PASS	AF=0.6;AO=9;DP=15;FAO=9;FDP=15;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.0454113;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.791;QD=19.1085;RBI=0.0483204;REFB=-0.00182532;REVB=0.0165128;RO=6;SAF=4;SAR=5;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.265094;STB=0.651856;STBP=0.208;TYPE=snp;VARB=0.00175313;OID=.;OPOS=140595756;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:15:15:6:6:9:9:0.6:5:4:5:1:5:4:5:1
chr5	140595802	.	T	C	85.22	PASS	AF=0.666667;AO=9;DP=14;FAO=10;FDP=15;FR=.;FRO=5;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0429994;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=46.5503;QD=22.7262;RBI=0.0723456;REFB=-0.102502;REVB=-0.0581802;RO=4;SAF=5;SAR=4;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162954;STB=0.63132;STBP=0.233;TYPE=snp;VARB=0.0467233;OID=.;OPOS=140595802;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:14:15:4:5:9:10:0.666667:4:5:1:3:4:6:1:4
chr5	140596704	.	A	G	344.76	PASS	AF=0.45122;AO=37;DP=82;FAO=37;FDP=82;FR=.;FRO=45;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=25;FSRR=20;FWDB=0.0196283;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.119;QD=16.8175;RBI=0.077241;REFB=-0.0212327;REVB=0.0747054;RO=42;SAF=22;SAR=15;SRF=24;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0227123;STB=0.522022;STBP=0.742;TYPE=snp;VARB=0.042286;OID=.;OPOS=140596704;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:42:45:37:37:0.45122:15:22:24:18:15:22:25:20
chr5	140604721	.	C	A	30.52	PASS	AF=0.454545;AO=5;DP=11;FAO=5;FDP=11;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0360909;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.0315;QD=11.0975;RBI=0.0369594;REFB=-0.0183099;REVB=-0.00796545;RO=6;SAF=2;SAR=3;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0892949;STB=0.555331;STBP=0.742;TYPE=snp;VARB=0.0347362;OID=.;OPOS=140604721;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:11:11:6:6:5:5:0.454545:3:2:3:3:3:2:3:3
chr5	140605601	.	A	G	374.34	PASS	AF=0.4;AO=44;DP=111;FAO=44;FDP=110;FR=.;FRO=66;FSAF=17;FSAR=27;FSRF=29;FSRR=37;FWDB=0.00462929;FXX=0.0090082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.818;QD=13.6125;RBI=0.0252998;REFB=-0.00748306;REVB=0.0248726;RO=66;SAF=17;SAR=27;SRF=29;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0583078;STB=0.533032;STBP=0.575;TYPE=snp;VARB=0.0109121;OID=.;OPOS=140605601;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:110:66:66:44:44:0.4:27:17:29:37:27:17:29:37
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chr5	140620221	.	GCCAC	G	84.6	PASS	AF=0.5;AO=12;DP=24;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=0.0201041;FXX=0.0768935;HRUN=2;LEN=4;MLLD=214.198;QD=14.0992;RBI=0.021361;REFB=-0.0191769;REVB=-0.00721913;RO=11;SAF=4;SAR=8;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0581219;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.0166417;OID=.;OPOS=140620222;OREF=CCAC;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.5:12:24:12:24:12:4:8:4:8:81:11:4:8:3:8
chr5	140626626	.	C	CA	37.32	PASS	AF=0.333333;AO=3;DP=27;FAO=8;FDP=24;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.0107366;FXX=0.11107;HRUN=0;LEN=1;MLLD=132.532;QD=6.22047;RBI=0.0115945;REFB=-0.0236311;REVB=0.00437697;RO=22;SAF=0;SAR=3;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.621044;STB=0.541563;STBP=0.812;TYPE=ins;VARB=0.108648;OID=.;OPOS=140626627;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.333333:3:27:8:24:16:4:4:9:7:37:22:0:3:13:9
chr5	140626627	.	G	A	48.79	PASS	AF=0.307692;AO=7;DP=26;FAO=8;FDP=26;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.00733386;FXX=0.0370233;HRUN=3;LEN=1;MLLD=127.328;QD=7.50669;RBI=0.00741038;REFB=-0.0249973;REVB=0.00106224;RO=16;SAF=4;SAR=3;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0100525;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0631101;OID=.;OPOS=140626627;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:48:26:26:16:18:7:8:0.307692:3:4:9:7:4:4:9:9
chr5	140626724	.	T	G	256.44	PASS	AF=0.55102;AO=25;DP=47;FAO=27;FDP=49;FR=.;FRO=22;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.00903995;FXX=0.039208;HRUN=3;LEN=1;MLLD=146.348;QD=20.9339;RBI=0.0113172;REFB=-0.022037;REVB=-0.00680869;RO=22;SAF=14;SAR=11;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0885669;STB=0.562644;STBP=0.345;TYPE=snp;VARB=0.0248629;OID=.;OPOS=140626724;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:49:22:22:25:27:0.55102:11:14:10:12:11:16:10:12
chr5	140683265	.	G	A	300.61	PASS	AF=0.576923;AO=30;DP=52;FAO=30;FDP=52;FR=.;FRO=22;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.00614946;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=275.372;QD=23.1237;RBI=0.00861281;REFB=-0.0146144;REVB=-0.00603031;RO=22;SAF=14;SAR=16;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0603097;STB=0.533311;STBP=0.63;TYPE=snp;VARB=0.011335;OID=.;OPOS=140683265;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:22:22:30:30:0.576923:16:14:12:10:16:14:12:10
chr5	140710705	.	G	A	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0430807;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.653;QD=53.2772;RBI=0.0432052;REFB=0;REVB=0.00327737;RO=0;SAF=10;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00014917;OID=.;OPOS=140710705;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:13:10:0:0:13:10:0:0
chr5	140712210	.	G	T	39.05	PASS	AF=0.461538;AO=6;DP=13;FAO=6;FDP=13;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.0276932;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.783;QD=12.0157;RBI=0.0921336;REFB=-0.0257192;REVB=0.0878731;RO=7;SAF=5;SAR=1;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.585813;STB=0.852542;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.0148525;OID=.;OPOS=140712210;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:13:13:7:7:6:6:0.461538:1:5:1:6:1:5:1:6
chr5	140718683	.	G	A	462.56	PASS	AF=0.474227;AO=46;DP=97;FAO=46;FDP=97;FR=.;FRO=51;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=30;FSRR=21;FWDB=-0.00090069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.308;QD=19.0747;RBI=0.00101079;REFB=-0.00590728;REVB=0.00045875;RO=51;SAF=21;SAR=25;SRF=30;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123921;STB=0.568913;STBP=0.209;TYPE=snp;VARB=0.0080309;OID=.;OPOS=140718683;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:51:51:46:46:0.474227:25:21:30:21:25:21:30:21
chr5	140720516	.	C	G	65.78	PASS	AF=0.391304;AO=9;DP=23;FAO=9;FDP=23;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.0198029;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.85;QD=11.4396;RBI=0.0431083;REFB=-0.00765973;REVB=-0.0382906;RO=14;SAF=6;SAR=3;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.244315;STB=0.646728;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=0.0083162;OID=.;OPOS=140720516;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:23:23:14:14:9:9:0.391304:3:6:6:8:3:6:6:8
chr5	140720543	.	C	T	102.51	PASS	AF=0.521739;AO=12;DP=23;FAO=12;FDP=23;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=0.0124726;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=182.638;QD=17.8275;RBI=0.0193069;REFB=-0.0074685;REVB=0.0147374;RO=11;SAF=4;SAR=8;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.323399;STB=0.685409;STBP=0.081;TYPE=snp;VARB=0.00820825;OID=.;OPOS=140720543;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:23:23:11:11:12:12:0.521739:8:4:8:3:8:4:8:3
chr5	140725828	.	C	T	314.67	PASS	AF=0.411765;AO=35;DP=85;FAO=35;FDP=85;FR=.;FRO=50;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=22;FSRR=28;FWDB=0.0868122;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.0219;QD=14.8079;RBI=0.0906901;REFB=-0.0339078;REVB=0.0262362;RO=50;SAF=14;SAR=21;SRF=22;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0427886;STB=0.524258;STBP=0.731;TYPE=snp;VARB=0.0516996;OID=.;OPOS=140725828;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:50:50:35:35:0.411765:21:14:22:28:21:14:22:28
chr5	140735119	.	C	A	64.87	PASS	AF=0.36;AO=9;DP=25;FAO=9;FDP=25;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=14;FWDB=-0.0655747;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.01;QD=10.3794;RBI=0.0707556;REFB=-0.0139891;REVB=-0.0265766;RO=15;SAF=4;SAR=5;SRF=2;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.353734;STB=0.716607;STBP=0.165;TYPE=snp;VARB=0.0444467;OID=.;OPOS=140735119;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:25:25:15:16:9:9:0.36:5:4:2:13:5:4:2:14
chr5	140750044	.	T	C	3429.75	PASS	AF=1;AO=220;DP=223;FAO=222;FDP=222;FR=.;FRO=0;FSAF=115;FSAR=107;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0386934;FXX=0.0044841;HRUN=2;LEN=1;MLLD=254.047;QD=61.7973;RBI=0.0417693;REFB=-0.0772344;REVB=0.0157321;RO=2;SAF=113;SAR=107;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000234231;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000117663;OID=.;OPOS=140750044;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:223:222:2:0:220:222:1:107:113:1:1:107:115:0:0
chr5	140751128	.	C	G	95.42	PASS	AF=0.444444;AO=11;DP=27;FAO=12;FDP=27;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=2;FWDB=0.0474671;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.7874;QD=14.1367;RBI=0.0522566;REFB=-0.00699484;REVB=0.0218546;RO=15;SAF=6;SAR=5;SRF=13;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.337592;STB=0.670902;STBP=0.208;TYPE=snp;VARB=0.0412138;OID=.;OPOS=140751128;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:27:27:15:15:11:12:0.444444:5:6:13:2:5:7:13:2
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chr5	140772427	.	T	G	64.88	PASS	AF=0.36;AO=9;DP=25;FAO=9;FDP=25;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=-0.00258753;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.58;QD=10.3807;RBI=0.0116007;REFB=-0.0132814;REVB=0.0113085;RO=15;SAF=4;SAR=5;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.227806;STB=0.613789;STBP=0.376;TYPE=snp;VARB=0.0303053;OID=.;OPOS=140772427;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:25:25:15:16:9:9:0.36:5:4:10:5:5:4:10:6
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chr5	140870516	.	A	G	265.58	PASS	AF=0.483333;AO=29;DP=62;FAO=29;FDP=60;FR=.;FRO=31;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=11;FWDB=-0.00933988;FXX=0.0322529;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.662;QD=17.7053;RBI=0.0138925;REFB=0.000459912;REVB=-0.0102843;RO=31;SAF=16;SAR=13;SRF=20;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0880828;STB=0.549262;STBP=0.485;TYPE=snp;VARB=-0.000775439;OID=.;OPOS=140870516;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:60:31:31:29:29:0.483333:13:16:20:11:13:16:20:11
chr5	140870949	.	G	T	54.99	PASS	AF=0.347826;AO=8;DP=23;FAO=8;FDP=23;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=-0.00423826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.077;QD=9.56311;RBI=0.0129774;REFB=-0.00602815;REVB=0.0122658;RO=14;SAF=5;SAR=3;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.343095;STB=0.683772;STBP=0.249;TYPE=snp;VARB=0.00700742;OID=.;OPOS=140870949;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:23:23:14:15:8:8:0.347826:3:5:4:10:3:5:5:10
chr5	140871425	.	A	G	572.31	PASS	AF=0.41875;AO=64;DP=153;FAO=67;FDP=160;FR=.;FRO=93;FSAF=31;FSAR=36;FSRF=44;FSRR=49;FWDB=0.00631209;FXX=0.0303012;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.9172;QD=14.3077;RBI=0.0203723;REFB=-0.0231389;REVB=-0.0193698;RO=89;SAF=31;SAR=33;SRF=45;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0220421;STB=0.50609;STBP=0.905;TYPE=snp;VARB=0.0269624;OID=.;OPOS=140871425;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:153:160:89:93:64:67:0.41875:33:31:45:44:36:31:44:49
chr5	140966709	.	G	A	259.99	PASS	AF=0.447761;AO=29;DP=66;FAO=30;FDP=67;FR=.;FRO=37;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=23;FWDB=0.0268982;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.943;QD=15.5219;RBI=0.0270218;REFB=-0.00487003;REVB=0.00258217;RO=37;SAF=16;SAR=13;SRF=14;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170563;STB=0.602888;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.00690355;OID=.;OPOS=140966709;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:67:37:37:29:30:0.447761:13:16:14:23:13:17:14:23
chr5	141014494	.	T	C	363.04	PASS	AF=0.41;AO=41;DP=101;FAO=41;FDP=100;FR=.;FRO=59;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=25;FSRR=34;FWDB=0.00964765;FXX=0.00990001;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.394;QD=14.5217;RBI=0.0185038;REFB=-0.00441781;REVB=-0.0157896;RO=59;SAF=23;SAR=18;SRF=25;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142647;STB=0.580543;STBP=0.2;TYPE=snp;VARB=0.0052987;OID=.;OPOS=141014494;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:100:59:59:41:41:0.41:18:23:25:34:18:23:25:34
chr5	141016288	.	T	G	564.02	PASS	AF=0.468254;AO=59;DP=126;FAO=59;FDP=126;FR=.;FRO=67;FSAF=36;FSAR=23;FSRF=30;FSRR=37;FWDB=-0.00453403;FXX=0.0078734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.593;QD=17.9055;RBI=0.00485393;REFB=-0.0237752;REVB=0.00173298;RO=66;SAF=36;SAR=23;SRF=30;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14975;STB=0.587246;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.023031;OID=.;OPOS=141016288;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:126:126:66:67:59:59:0.468254:23:36:30:36:23:36:30:37
chr5	141026182	.	G	T	88.02	PASS	AF=0.44;AO=11;DP=25;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.00523329;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.4788;QD=14.0834;RBI=0.108251;REFB=-0.0483121;REVB=-0.108124;RO=14;SAF=4;SAR=7;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0067129;STB=0.50393;STBP=0.971;TYPE=snp;VARB=0.0285834;OID=.;OPOS=141026182;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:25:25:14:14:11:11:0.44:7:4:5:9:7:4:5:9
chr5	141036337	.	A	G	159.47	PASS	AF=0.447368;AO=17;DP=39;FAO=17;FDP=38;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.0394448;FXX=0.0256345;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.0462;QD=16.7867;RBI=0.0589171;REFB=0.000219748;REVB=-0.0437645;RO=22;SAF=8;SAR=9;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0288764;STB=0.529377;STBP=0.766;TYPE=snp;VARB=-0.00379863;OID=.;OPOS=141036337;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:38:22:21:17:17:0.447368:9:8:11:11:9:8:11:10
chr5	141051236	.	C	T	173.96	PASS	AF=0.486486;AO=18;DP=37;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=-0.0623927;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.0758;QD=18.8066;RBI=0.0660629;REFB=-0.0187539;REVB=-0.0217132;RO=19;SAF=4;SAR=14;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112659;STB=0.56444;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.0167117;OID=.;OPOS=141051236;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:19:19:18:18:0.486486:14:4:6:13:14:4:6:13
chr5	141059158	.	CGGGG	CGGG,CGGGT,GCGGG	53.4	PASS	AF=0.32,0.04,0.04;AO=17,2,6;DP=50;FAO=16,2,2;FDP=50;FR=.;FRO=30;FSAF=2,2,0;FSAR=14,0,2;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=-0.00171976,0.00611007,0.00334962;FXX=0;HRUN=5,5,1;LEN=1,1,2;MLLD=9.77896,226.626,122.973;QD=4.27175;RBI=0.188588,0.0743068,0.212072;REFB=-0.132627,-0.0219502,-0.0104405;REVB=-0.18858,-0.0740552,-0.212045;RO=22;SAF=3,2,0;SAR=14,0,6;SRF=16;SRR=6;SSEN=0,0,0;SSEP=0.340909,0,0;SSSB=-0.547968,0.417635,-0.773579;STB=0.842906,0.993814,0.995655;STBP=0.005,0.193,0.093;TYPE=del,snp,mnp;VARB=0.160809,0.0205222,0.085045;OID=.,.,.;OPOS=141059159,141059162,141059158;OREF=G,G,CG;OALT=-,T,GC;OMAPALT=CGGG,CGGGT,GCGGG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:50:50:22:30:17,2,6:16,2,2:0.32,0.04,0.04:14,0,6:3,2,0:16:6:14,0,2:2,2,0:18:12
chr5	141059868	.	T	C	218.86	PASS	AF=0.567568;AO=21;DP=36;FAO=21;FDP=37;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.0237424;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.7174;QD=23.6601;RBI=0.0968528;REFB=-0.0123962;REVB=0.0938976;RO=15;SAF=8;SAR=13;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0381435;STB=0.50273;STBP=0.998;TYPE=snp;VARB=0.0115159;OID=.;OPOS=141059868;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:37:15:16:21:21:0.567568:13:8:5:10:13:8:6:10
chr5	141243646	.	A	G	2254.14	PASS	AF=1;AO=141;DP=141;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0113959;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.402;QD=63.4969;RBI=0.0115301;REFB=0;REVB=0.00175451;RO=0;SAF=57;SAR=84;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.13501e-05;OID=.;OPOS=141243646;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:141:142:0:0:141:142:1:84:57:0:0:85:57:0:0
chr5	141244356	.	C	T	920.0	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0224364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.9205;QD=58.4127;RBI=0.0226862;REFB=0;REVB=-0.00335733;RO=0;SAF=31;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000223772;OID=.;OPOS=141244356;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:32:31:0:0:32:31:0:0
chr5	141248533	.	G	A	323.18	PASS	AF=0.454545;AO=34;DP=76;FAO=35;FDP=77;FR=.;FRO=42;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=27;FWDB=0.00382612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.818;QD=16.7886;RBI=0.0332721;REFB=-0.00714642;REVB=0.0330514;RO=42;SAF=14;SAR=20;SRF=15;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0560804;STB=0.540207;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.00781237;OID=.;OPOS=141248533;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:77:42:42:34:35:0.454545:20:14:15:27:20:15:15:27
chr5	141324954	.	AC	ACCTGCTGCTG,TG	529.24	PASS	AF=0.843373,0.0843373;AO=38,7;DP=86;FAO=70,7;FDP=83;FR=.;FRO=6;FSAF=53,7;FSAR=17,0;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.0149972,0.00462993;FXX=0.0568117;HRUN=2,1;LEN=9,2;MLLD=133.822,167.925;QD=25.5058;RBI=0.0364956,0.00548365;REFB=-0.0471333,-0.0214274;REVB=0.0332718,-0.0029384;RO=27;SAF=24,7;SAR=14,0;SRF=27;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.333754,0;STB=0.509613,0.997566;STBP=0.596,0.067;TYPE=ins,mnp;VARB=0.004706,0.0386292;OID=.,.;OPOS=141324956,141324954;OREF=-,AC;OALT=CTGCTGCTG,TG;OMAPALT=ACCTGCTGCTG,TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:30:86:83:27:6:38,7:70,7:0.843373,0.0843373:14,0:24,7:27:0:17,0:53,7:4:2
chr5	141325249	.	T	C	1534.63	PASS	AF=0.990291;AO=96;DP=103;FAO=102;FDP=103;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=43;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00649515;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.387;QD=59.5972;RBI=0.0207933;REFB=0;REVB=0.0197529;RO=0;SAF=37;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.78952e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000180346;OID=.;OPOS=141325249;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:103:103:0:0:96:102:0.990291:59:37:0:0:59:43:0:0
chr5	141335241	.	A	G	483.35	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.003568;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.262;QD=58.5878;RBI=0.00806906;REFB=0;REVB=0.00723735;RO=0;SAF=15;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.64315e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.69294e-06;OID=.;OPOS=141335241;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:18:15:0:0:18:15:0:0
chr5	141335284	.	G	A	731.92	PASS	AF=0.947368;AO=54;DP=57;FAO=54;FDP=57;FR=.;FRO=3;FSAF=29;FSAR=25;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0413003;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.6665;QD=51.3628;RBI=0.099841;REFB=-0.0508598;REVB=0.0908983;RO=3;SAF=29;SAR=25;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0462903;STB=0.524581;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=0.0166485;OID=.;OPOS=141335284;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:57:57:3:3:54:54:0.947368:25:29:3:0:25:29:3:0
chr5	141336264	.	G	T	703.23	PASS	AF=0.978723;AO=43;DP=43;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0295544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=305.177;QD=59.8494;RBI=0.0312134;REFB=-0.027861;REVB=0.0100407;RO=0;SAF=21;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5098;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.000712499;OID=.;OPOS=141336264;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:43:47:0:1:43:46:0.978723:22:21:0:0:25:21:0:1
chr5	141337126	.	C	T	900.2	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0466818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.587;QD=57.1556;RBI=0.0469182;REFB=0;REVB=0.00470381;RO=0;SAF=23;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.75648e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000460955;OID=.;OPOS=141337126;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:63:0:0:62:63:1:39:23:0:0:40:23:0:0
chr5	141337225	.	A	G	632.26	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00716379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.674;QD=61.6839;RBI=0.0123565;REFB=0;REVB=-0.0100679;RO=0;SAF=16;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.1719e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.40253e-05;OID=.;OPOS=141337225;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:25:16:0:0:25:16:0:0
chr5	141391532	.	G	A	462.47	PASS	AF=0.474227;AO=46;DP=97;FAO=46;FDP=97;FR=.;FRO=51;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=23;FSRR=28;FWDB=-0.0381679;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.1749;QD=19.0709;RBI=0.0545179;REFB=0.00712399;REVB=0.0389284;RO=51;SAF=26;SAR=20;SRF=23;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108014;STB=0.560117;STBP=0.288;TYPE=snp;VARB=-0.00815888;OID=.;OPOS=141391532;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:51:51:46:46:0.474227:20:26:23:28:20:26:23:28
chr5	141531735	.	C	T	727.8	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000950496;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.719;QD=63.2868;RBI=0.0223457;REFB=0;REVB=0.0223255;RO=0;SAF=16;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.31553e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.89804e-05;OID=.;OPOS=141531735;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:30:16:0:0:30:16:0:0
chr5	141973349	.	C	G	1326.28	PASS	AF=1;AO=85;DP=87;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.012699;FXX=0.0229859;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.6379;QD=62.4133;RBI=0.015328;REFB=0;REVB=0.00858383;RO=0;SAF=33;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000448529;OID=.;OPOS=141973349;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:85:0:0:85:85:1:52:33:0:0:52:33:0:0
chr5	141973501	.	T	C	1267.96	PASS	AF=1;AO=82;DP=83;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0200837;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.082;QD=61.8515;RBI=0.0231611;REFB=0;REVB=0.0115363;RO=0;SAF=32;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.22164e-05;OID=.;OPOS=141973501;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:82:0:0:82:82:1:50:32:0:0:50:32:0:0
chr5	142254679	.	A	G	868.21	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00145157;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.382;QD=57.8803;RBI=0.00706706;REFB=0;REVB=-0.00691638;RO=0;SAF=32;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.05639e-05;OID=.;OPOS=142254679;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:28:32:0:0:28:32:0:0
chr5	142593652	.	C	T	939.93	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0207634;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.4;QD=58.7455;RBI=0.0250837;REFB=0;REVB=0.014074;RO=0;SAF=50;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000138322;OID=.;OPOS=142593652;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:14:50:0:0:14:50:0:0
chr5	143059433	.	T	C	248.15	PASS	AF=0.575;AO=23;DP=41;FAO=23;FDP=40;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.00672627;FXX=0.0243843;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.5622;QD=24.8146;RBI=0.00821986;REFB=-0.0438636;REVB=-0.00472477;RO=18;SAF=9;SAR=14;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00199679;STB=0.509083;STBP=0.923;TYPE=snp;VARB=0.0388632;OID=.;OPOS=143059433;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:40:18:17:23:23:0.575:14:9:7:11:14:9:7:10
chr5	143200053	.	C	T	205.1	PASS	AF=0.42;AO=21;DP=50;FAO=21;FDP=50;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=-0.0429924;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.411;QD=16.4081;RBI=0.0536325;REFB=0.00725305;REVB=-0.032064;RO=29;SAF=11;SAR=10;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0283682;STB=0.516237;STBP=0.829;TYPE=snp;VARB=-0.00983653;OID=.;OPOS=143200053;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:29:29:21:21:0.42:10:11:16:13:10:11:16:13
chr5	145199583	.	TA	CT,T	72.62	PASS	AF=0.0078125,0.28125;AO=5,38;DP=130;FAO=1,36;FDP=128;FR=.;FRO=91;FSAF=1,25;FSAR=0,11;FSRF=28;FSRR=63;FWDB=-0.00284683,-0.147907;FXX=0.0153834;HRUN=1,6;LEN=2,1;MLLD=27.9615,8.23665;QD=2.26941;RBI=0.0926642,0.20785;REFB=-0.0825872,-0.139023;REVB=0.0926204,0.146031;RO=72;SAF=5,31;SAR=0,7;SRF=16;SRR=56;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.680319,0.62583;STB=0.993768,0.760246;STBP=0.156,0.001;TYPE=mnp,del;VARB=0.0511155,0.172765;OID=.,.;OPOS=145199583,145199584;OREF=TA,A;OALT=CT,-;OMAPALT=CT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:72:130:128:72:91:5,38:1,36:0.0078125,0.28125:0,7:5,31:16:56:0,11:1,25:28:63
chr5	145246085	.	T	G	2827.3	PASS	AF=1;AO=178;DP=179;FAO=182;FDP=182;FR=.;FRO=0;FSAF=98;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00839735;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.979;QD=62.1384;RBI=0.00858325;REFB=0;REVB=0.00177672;RO=0;SAF=96;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.14438e-06;OID=.;OPOS=145246085;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:15:179:182:0:0:178:182:1:82:96:0:0:84:98:0:0
chr5	145393364	.	C	T	223.87	PASS	AF=0.478261;AO=22;DP=46;FAO=22;FDP=46;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=0.0139605;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=136.008;QD=19.467;RBI=0.0139675;REFB=-0.00283046;REVB=-0.000443173;RO=22;SAF=12;SAR=10;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120584;STB=0.545413;STBP=0.593;TYPE=snp;VARB=0.00466723;OID=.;OPOS=145393364;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:22:24:22:22:0.478261:10:12:9:13:10:12:11:13
chr5	145439647	.	T	C	766.11	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0253614;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.088;QD=63.8428;RBI=0.0254219;REFB=0;REVB=-0.00175282;RO=0;SAF=25;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.33249e-05;OID=.;OPOS=145439647;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:23:25:0:0:23:25:0:0
chr5	145442133	.	G	A	60.58	PASS	AF=0.444444;AO=8;DP=19;FAO=8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=-0.00280644;FXX=0.09995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.867;QD=13.4612;RBI=0.00606903;REFB=-0.0237754;REVB=-0.00538117;RO=10;SAF=6;SAR=2;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.258322;STB=0.655832;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=0.0203067;OID=.;OPOS=145442133;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:60:19:18:10:10:8:8:0.444444:2:6:5:5:2:6:5:5
chr5	145442203	.	G	C	501.59	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00718089;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.6178;QD=59.0109;RBI=0.0193461;REFB=0;REVB=0.017964;RO=0;SAF=21;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000388837;OID=.;OPOS=145442203;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:13:21:0:0:13:21:0:0
chr5	145890028	.	A	G	851.26	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0227853;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.609;QD=57.7124;RBI=0.0341793;REFB=0;REVB=0.0254766;RO=0;SAF=30;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.37214e-05;OID=.;OPOS=145890028;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:29:30:0:0:29:30:0:0
chr5	145894896	.	G	C	501.66	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0228702;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.644;QD=59.0184;RBI=0.0428272;REFB=0;REVB=0.0362094;RO=0;SAF=19;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.40663e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.06754e-05;OID=.;OPOS=145894896;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:15:19:0:0:15:19:0:0
chr5	146092291	.	C	G	466.17	PASS	AF=0.7;AO=42;DP=60;FAO=42;FDP=60;FR=.;FRO=18;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=0.0119376;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=167.199;QD=31.0783;RBI=0.0120646;REFB=-0.00721529;REVB=0.00174542;RO=18;SAF=23;SAR=19;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0044352;STB=0.502403;STBP=0.978;TYPE=snp;VARB=0.00373532;OID=.;OPOS=146092291;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:18:18:42:42:0.7:19:23:10:8:19:23:10:8
chr5	146619206	.	G	C	542.61	PASS	AF=1;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0120455;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.478;QD=60.2898;RBI=0.0149072;REFB=0;REVB=-0.00878242;RO=0;SAF=21;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000523449;OID=.;OPOS=146619206;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:36:0:0:36:36:1:15:21:0:0:15:21:0:0
chr5	146971253	.	C	T	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00321351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.797;QD=40.7629;RBI=0.00391462;REFB=0;REVB=-0.00223553;RO=0;SAF=4;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.29108e-05;OID=.;OPOS=146971253;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:6:4:0:0:6:4:0:0
chr5	146971279	.	A	G	42.23	PASS	AF=0.666667;AO=6;DP=9;FAO=6;FDP=9;FR=.;FRO=3;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0215153;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.588;QD=18.767;RBI=0.0294619;REFB=-0.00679531;REVB=0.0201269;RO=3;SAF=2;SAR=4;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00389126;OID=.;OPOS=146971279;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:9:9:3:3:6:6:0.666667:4:2:1:2:4:2:1:2
chr5	147012291	.	G	A	435.02	PASS	AF=0.45283;AO=48;DP=106;FAO=48;FDP=106;FR=.;FRO=58;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=31;FSRR=27;FWDB=-0.0107899;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.6973;QD=16.4158;RBI=0.0251813;REFB=-0.0072226;REVB=-0.0227525;RO=58;SAF=26;SAR=22;SRF=31;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00708032;STB=0.503954;STBP=0.958;TYPE=snp;VARB=0.00596958;OID=.;OPOS=147012291;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:106:58:58:48:48:0.45283:22:26:31:27:22:26:31:27
chr5	147024476	.	C	A	565.69	PASS	AF=0.54902;AO=56;DP=102;FAO=56;FDP=102;FR=.;FRO=46;FSAF=18;FSAR=38;FSRF=23;FSRR=23;FWDB=-0.018507;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.943;QD=22.1837;RBI=0.0192998;REFB=-0.00371533;REVB=0.00547478;RO=46;SAF=18;SAR=38;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157363;STB=0.586564;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.00304997;OID=.;OPOS=147024476;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:46:46:56:56:0.54902:38:18:23:23:38:18:23:23
chr5	147024509	.	C	T	487.72	PASS	AF=0.522222;AO=48;DP=90;FAO=47;FDP=90;FR=.;FRO=43;FSAF=15;FSAR=32;FSRF=23;FSRR=20;FWDB=-0.0143943;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.5728;QD=21.6762;RBI=0.0438773;REFB=0.0212852;REVB=-0.041449;RO=42;SAF=15;SAR=33;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.210741;STB=0.60917;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=-0.0448647;OID=.;OPOS=147024509;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:42:43:48:47:0.522222:33:15:23:19:32:15:23:20
chr5	147281308	.	C	T	1378.8	PASS	AF=0.460568;AO=143;DP=314;FAO=146;FDP=317;FR=.;FRO=171;FSAF=80;FSAR=66;FSRF=82;FSRR=89;FWDB=-0.0188587;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.0394;QD=17.3981;RBI=0.0306297;REFB=-0.0147292;REVB=0.0241356;RO=170;SAF=80;SAR=63;SRF=82;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0760606;STB=0.536977;STBP=0.213;TYPE=snp;VARB=0.0152606;OID=.;OPOS=147281308;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:314:317:170:171:143:146:0.460568:63:80:82:88:66:80:82:89
chr5	147286013	.	A	T	198.73	PASS	AF=0.4;AO=24;DP=60;FAO=24;FDP=60;FR=.;FRO=36;FSAF=19;FSAR=5;FSRF=21;FSRR=15;FWDB=0.00316125;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.8082;QD=13.2489;RBI=0.00339385;REFB=-0.01904;REVB=0.00123481;RO=35;SAF=19;SAR=5;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.247408;STB=0.65503;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.0254522;OID=.;OPOS=147286013;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:35:36:24:24:0.4:5:19:21:14:5:19:21:15
chr5	147286054	.	G	A	531.58	PASS	AF=0.537634;AO=50;DP=93;FAO=50;FDP=93;FR=.;FRO=43;FSAF=16;FSAR=34;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=-0.0148058;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.55;QD=22.8636;RBI=0.0312525;REFB=-0.016223;REVB=0.0275228;RO=43;SAF=16;SAR=34;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152198;STB=0.583995;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=0.0141741;OID=.;OPOS=147286054;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:43:43:50:50:0.537634:34:16:21:22:34:16:21:22
chr5	147468614	.	A	G	1113.48	PASS	AF=0.962025;AO=76;DP=79;FAO=76;FDP=79;FR=.;FRO=3;FSAF=37;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0181479;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.8628;QD=56.3786;RBI=0.0181857;REFB=-0.0410311;REVB=0.00117225;RO=3;SAF=37;SAR=39;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0350152;STB=0.518514;STBP=0.116;TYPE=snp;VARB=0.00801675;OID=.;OPOS=147468614;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:79:79:3:3:76:76:0.962025:39:37:0:3:39:37:0:3
chr5	147475386	.	A	G	1134.58	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0102673;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.933;QD=60.5111;RBI=0.0433836;REFB=0;REVB=0.0421511;RO=0;SAF=40;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.71047e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.3827e-05;OID=.;OPOS=147475386;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:35:40:0:0:35:40:0:0
chr5	147477551	.	C	T	902.71	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00540274;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=278.453;QD=58.2392;RBI=0.00576104;REFB=0;REVB=0.00200002;RO=0;SAF=29;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.264e-05;OID=.;OPOS=147477551;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:33:29:0:0:33:29:0:0
chr5	147480027	.	G	A	594.54	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0169989;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.291;QD=60.9779;RBI=0.0331278;REFB=0;REVB=0.0284339;RO=0;SAF=19;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.3303e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.18527e-05;OID=.;OPOS=147480027;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:20:19:0:0:20:19:0:0
chr5	147480112	.	T	C	787.51	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00457783;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.305;QD=57.2731;RBI=0.0091346;REFB=0;REVB=0.00790471;RO=0;SAF=24;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.8504e-07;OID=.;OPOS=147480112;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:31:24:0:0:31:24:0:0
chr5	147480955	.	A	G	251.47	PASS	AF=0.875;AO=21;DP=24;FAO=21;FDP=24;FR=.;FRO=3;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0167133;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=82.7168;QD=41.9116;RBI=0.0854038;REFB=-0.152373;REVB=0.0837525;RO=1;SAF=11;SAR=10;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0401224;STB=0.559944;STBP=0.131;TYPE=snp;VARB=0.00918889;OID=.;OPOS=147480955;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:24:24:1:3:21:21:0.875:10:11:1:0:10:11:3:0
chr5	147481430	.	A	G	1572.83	PASS	AF=0.990991;AO=103;DP=106;FAO=110;FDP=111;FR=.;FRO=1;FSAF=57;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0127261;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=42.4712;QD=56.6786;RBI=0.103215;REFB=-0.00367284;REVB=0.102428;RO=2;SAF=53;SAR=50;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0185991;STB=0.504672;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.00224729;OID=.;OPOS=147481430;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:106:111:2:1:103:110:0.990991:50:53:0:2:53:57:0:1
chr5	147486677	.	C	A	1556.17	PASS	AF=1;AO=97;DP=97;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0544048;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.5549;QD=63.5172;RBI=0.123478;REFB=0;REVB=-0.110846;RO=0;SAF=52;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46922e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000394423;OID=.;OPOS=147486677;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:97:98:0:0:97:98:1:45:52:0:0:46:52:0:0
chr5	147488367	.	C	A,T	994.46	PASS	AF=0.0289855,0.971014;AO=4,65;DP=69;FAO=2,67;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=2,37;FSAR=0,30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0294957,-0.0581741;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=28.0925,58.4668;QD=57.6497;RBI=0.0363432,0.0597581;REFB=0,0;REVB=-0.0212328,0.0136679;RO=0;SAF=2,37;SAR=2,28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-4.99207e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.000550388,0.00087503;OID=.,.;OPOS=147488367,147488367;OREF=C,C;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:6:69:69:0:0:4,65:2,67:0.0289855,0.971014:2,28:2,37:0:0:0,30:2,37:0:0
chr5	147498019	.	G	A	1829.11	PASS	AF=1;AO=120;DP=121;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00360211;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=256.165;QD=60.4665;RBI=0.00520319;REFB=-0.0545432;REVB=-0.00375473;RO=1;SAF=56;SAR=64;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00840699;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.43052e-05;OID=.;OPOS=147498019;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:121:121:1:0:120:121:1:64:56:1:0:64:57:0:0
chr5	147499616	.	C	A,T	781.2	PASS	AF=0.04,0.96;AO=2,47;DP=50;FAO=2,48;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=2,25;FSAR=0,23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0380566,-0.0423524;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=98.8311,145.187;QD=62.4959;RBI=0.0427292,0.0430844;REFB=0,0;REVB=-0.0194289,-0.00790865;RO=0;SAF=2,25;SAR=0,22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.150623,-0.000340519;OID=.,.;OPOS=147499616,147499616;OREF=C,C;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:50:50:0:0:2,47:2,48:0.04,0.96:0,22:2,25:0:0:0,23:2,25:0:0
chr5	147499670	.	C	T	613.36	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000443674;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.744;QD=61.3356;RBI=0.0186803;REFB=0;REVB=-0.018675;RO=0;SAF=19;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000105945;OID=.;OPOS=147499670;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:21:19:0:0:21:19:0:0
chr5	147505116	.	G	A	501.65	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0245042;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.3477;QD=59.0179;RBI=0.0432915;REFB=0;REVB=0.0356888;RO=0;SAF=29;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000182471;OID=.;OPOS=147505116;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:5:29:0:0:5:29:0:0
chr5	147510866	.	T	C	1511.75	PASS	AF=1;AO=93;DP=93;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00997087;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.825;QD=63.6527;RBI=0.0659624;REFB=0;REVB=0.0652044;RO=0;SAF=42;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.8776e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000104547;OID=.;OPOS=147510866;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:93:95:0:0:93:95:1:51:42:0:0:53:42:0:0
chr5	147593497	.	C	A	424.89	PASS	AF=0.367647;AO=50;DP=136;FAO=50;FDP=136;FR=.;FRO=86;FSAF=31;FSAR=19;FSRF=40;FSRR=46;FWDB=0.00150955;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=276.015;QD=12.4966;RBI=0.0127233;REFB=0.00334466;REVB=-0.0126334;RO=86;SAF=31;SAR=19;SRF=40;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173487;STB=0.598949;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=-0.00533443;OID=.;OPOS=147593497;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:136:136:86:86:50:50:0.367647:19:31:40:46:19:31:40:46
chr5	147665537	.	ATCTTCT	ATCTTC,ATCT	277.74	PASS	AF=0,0.432692;AO=11,31;DP=105;FAO=0,45;FDP=104;FR=.;FRO=59;FSAF=0,23;FSAR=0,22;FSRF=29;FSRR=30;FWDB=0.0316615,-0.0021678;FXX=0.0095229;HRUN=7,2;LEN=1,3;MLLD=7.77964,253.583;QD=10.6824;RBI=0.171737,0.0208593;REFB=-0.030912,-0.00090163;REVB=-0.168793,-0.0207463;RO=42;SAF=2,18;SAR=9,13;SRF=23;SRR=19;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.462072,0.0342014;STB=0.5,0.511106;STBP=1,0.852;TYPE=del,del;VARB=0.0442736,0.00110221;OID=.,.;OPOS=147665543,147665538;OREF=T,TCT;OALT=-,-;OMAPALT=ATCTTC,ATCT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,0.432692:11,31:105:0,45:104:59:0,23:0,22:29:30:99:42:2,18:9,13:23:19
chr5	147665620	.	A	G	278.92	PASS	AF=0.4;AO=32;DP=80;FAO=32;FDP=80;FR=.;FRO=48;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=24;FSRR=24;FWDB=-0.0295114;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.263;QD=13.9457;RBI=0.0328645;REFB=8.23291e-06;REVB=-0.0144621;RO=48;SAF=14;SAR=18;SRF=24;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0662373;STB=0.537712;STBP=0.607;TYPE=snp;VARB=-0.000150025;OID=.;OPOS=147665620;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:48:48:32:32:0.4:18:14:24:24:18:14:24:24
chr5	147703416	.	C	T	358.12	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100348;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=209.418;QD=55.0949;RBI=0.0412645;REFB=0;REVB=-0.0400258;RO=0;SAF=5;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000152663;OID=.;OPOS=147703416;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:21:5:0:0:21:5:0:0
chr5	147805120	.	T	C	416.69	PASS	AF=0.494118;AO=42;DP=85;FAO=42;FDP=85;FR=.;FRO=43;FSAF=14;FSAR=28;FSRF=26;FSRR=17;FWDB=-0.00234659;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=287.505;QD=19.6088;RBI=0.00306814;REFB=-0.00577175;REVB=-0.0019766;RO=43;SAF=14;SAR=28;SRF=26;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.251552;STB=0.639932;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.00419353;OID=.;OPOS=147805120;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:43:43:42:42:0.494118:28:14:26:17:28:14:26:17
chr5	147822069	.	A	T	446.1	PASS	AF=0.459184;AO=45;DP=98;FAO=45;FDP=98;FR=.;FRO=53;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=28;FSRR=25;FWDB=-0.0218679;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=288.153;QD=18.2082;RBI=0.021908;REFB=-0.0015355;REVB=0.00132469;RO=53;SAF=24;SAR=21;SRF=28;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00489182;STB=0.502731;STBP=0.973;TYPE=snp;VARB=0.00191323;OID=.;OPOS=147822069;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:53:53:45:45:0.459184:21:24:28:25:21:24:28:25
chr5	147856333	.	G	A	263.51	PASS	AF=0.483333;AO=29;DP=58;FAO=29;FDP=60;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=-0.0136924;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.967;QD=17.5674;RBI=0.0158922;REFB=0.00717173;REVB=0.00806721;RO=29;SAF=9;SAR=20;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166585;STB=0.596945;STBP=0.204;TYPE=snp;VARB=-0.00621156;OID=.;OPOS=147856333;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:60:29:31:29:29:0.483333:20:9:14:15:20:9:15:16
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chr5	148206440	.	G	A	225.98	PASS	AF=0.5;AO=22;DP=44;FAO=22;FDP=44;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.00193095;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.396;QD=20.5437;RBI=0.00735983;REFB=-0.0155212;REVB=-0.00710201;RO=22;SAF=6;SAR=16;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.299425;STB=0.669442;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.0114246;OID=.;OPOS=148206440;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:22:22:22:22:0.5:16:6:13:9:16:6:13:9
chr5	148206473	.	G	C	638.23	PASS	AF=0.907407;AO=49;DP=54;FAO=49;FDP=54;FR=.;FRO=5;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.00461178;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.753;QD=47.2765;RBI=0.0487052;REFB=-0.0380948;REVB=0.0484863;RO=5;SAF=24;SAR=25;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0504126;STB=0.526863;STBP=0.213;TYPE=snp;VARB=0.00223127;OID=.;OPOS=148206473;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:54:54:5:5:49:49:0.907407:25:24:1:4:25:24:1:4
chr5	148206646	.	G	A	445.82	PASS	AF=0.470588;AO=48;DP=104;FAO=48;FDP=102;FR=.;FRO=54;FSAF=29;FSAR=19;FSRF=36;FSRR=18;FWDB=0.0288629;FXX=0.0192289;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.077;QD=17.4833;RBI=0.0329248;REFB=-0.020234;REVB=0.0158423;RO=54;SAF=29;SAR=19;SRF=36;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0631597;STB=0.535081;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.0227314;OID=.;OPOS=148206646;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:102:54:54:48:48:0.470588:19:29:36:18:19:29:36:18
chr5	148206917	.	C	A	286.24	PASS	AF=0.492063;AO=31;DP=63;FAO=31;FDP=63;FR=.;FRO=32;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=-0.00273481;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=223.602;QD=18.1741;RBI=0.0101385;REFB=-0.00435398;REVB=0.00976271;RO=30;SAF=17;SAR=14;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0163053;STB=0.507242;STBP=0.915;TYPE=snp;VARB=0.00428875;OID=.;OPOS=148206917;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:30:32:31:31:0.492063:14:17:17:13:14:17:18:14
chr5	148207447	.	G	C	1523.18	PASS	AF=0.990385;AO=103;DP=104;FAO=103;FDP=104;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0290522;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=302.442;QD=58.5837;RBI=0.0292396;REFB=-0.0639112;REVB=0.00330519;RO=0;SAF=46;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.99381e-08;STB=0.504347;STBP=0.471;TYPE=snp;VARB=8.25439e-05;OID=.;OPOS=148207447;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:104:104:0:1:103:103:0.990385:57:46:0:0:57:46:0:1
chr5	148207573	.	T	C	124.16	PASS	AF=0.722222;AO=13;DP=18;FAO=13;FDP=18;FR=.;FRO=5;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0264969;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.844;QD=27.5905;RBI=0.0276164;REFB=-0.00185564;REVB=0.00778335;RO=5;SAF=7;SAR=6;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.030782;STB=0.517215;STBP=0.812;TYPE=snp;VARB=0.00088714;OID=.;OPOS=148207573;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:18:18:5:5:13:13:0.722222:6:7:3:2:6:7:3:2
chr5	148207633	.	G	A	355.91	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0173171;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.2672;QD=54.756;RBI=0.0175105;REFB=0;REVB=0.00259566;RO=0;SAF=18;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.28381e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000166479;OID=.;OPOS=148207633;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:8:18:0:0:8:18:0:0
chr5	148407708	.	A	C	483.33	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0330589;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.9321;QD=58.5854;RBI=0.035424;REFB=0;REVB=-0.0127268;RO=0;SAF=17;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.60901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000526881;OID=.;OPOS=148407708;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:16:17:0:0:16:17:0:0
chr5	148578636	.	T	C	1338.65	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00270806;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.701;QD=62.2627;RBI=0.00559125;REFB=0;REVB=-0.00489167;RO=0;SAF=53;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.98109e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.02652e-06;OID=.;OPOS=148578636;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:33:53:0:0:33:53:0:0
chr5	148610276	.	C	A	1368.82	PASS	AF=0.577273;AO=125;DP=218;FAO=127;FDP=220;FR=.;FRO=93;FSAF=47;FSAR=80;FSRF=31;FSRR=62;FWDB=0.0013973;FXX=0.00452468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.301;QD=24.8876;RBI=0.00421681;REFB=-0.0230911;REVB=-0.00397857;RO=91;SAF=47;SAR=78;SRF=30;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0387693;STB=0.516801;STBP=0.567;TYPE=snp;VARB=0.0183964;OID=.;OPOS=148610276;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:218:220:91:93:125:127:0.577273:78:47:30:61:80:47:31:62
chr5	148627252	.	G	A	261.77	PASS	AF=0.47541;AO=29;DP=60;FAO=29;FDP=61;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=10;FSRR=22;FWDB=-0.0138913;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.529;QD=17.1651;RBI=0.0293339;REFB=-0.0105564;REVB=0.0258362;RO=31;SAF=10;SAR=19;SRF=10;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0228802;STB=0.518974;STBP=0.796;TYPE=snp;VARB=0.0105701;OID=.;OPOS=148627252;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:61:31:32:29:29:0.47541:19:10:10:21:19:10:10:22
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chr5	148986244	.	G	C	1244.53	PASS	AF=0.987952;AO=81;DP=82;FAO=82;FDP=83;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0368141;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.4745;QD=59.9774;RBI=0.0428736;REFB=-0.129283;REVB=-0.0219743;RO=1;SAF=34;SAR=47;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00996906;STB=0.505153;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.003051;OID=.;OPOS=148986244;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:82:83:1:1:81:82:0.987952:47:34:0:1:48:34:0:1
chr5	149006640	.	C	T	123.15	PASS	AF=0.923077;AO=12;DP=13;FAO=12;FDP=13;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0466534;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.1285;QD=37.8916;RBI=0.0564445;REFB=-0.0397717;REVB=0.0317718;RO=1;SAF=8;SAR=4;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0531285;STB=0.529364;STBP=0.633;TYPE=snp;VARB=0.00838233;OID=.;OPOS=149006640;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:13:13:1:1:12:12:0.923077:4:8:1:0:4:8:1:0
chr5	149006837	.	A	G	276.44	PASS	AF=1;AO=21;DP=22;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00247619;FXX=0.0454339;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.717;QD=52.6553;RBI=0.0329137;REFB=0;REVB=-0.0328205;RO=0;SAF=4;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.45803e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000162296;OID=.;OPOS=149006837;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:21:0:0:21:21:1:17:4:0:0:17:4:0:0
chr5	149008403	.	A	G	1217.22	PASS	AF=1;AO=79;DP=81;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0150837;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.469;QD=60.8611;RBI=0.0173099;REFB=0;REVB=-0.00849207;RO=0;SAF=35;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.37809e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.17461e-05;OID=.;OPOS=149008403;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:80:0:0:79:80:1:44:35:0:0:45:35:0:0
chr5	149008521	.	A	G	954.95	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.042864;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.142;QD=58.7659;RBI=0.0434645;REFB=0;REVB=0.00719971;RO=0;SAF=30;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000166448;OID=.;OPOS=149008521;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:35:30:0:0:35:30:0:0
chr5	149212462	.	G	A	403.91	PASS	AF=0.547945;AO=40;DP=73;FAO=40;FDP=73;FR=.;FRO=33;FSAF=14;FSAR=26;FSRF=11;FSRR=22;FWDB=0.0156148;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.58;QD=22.1322;RBI=0.0158953;REFB=-0.00824933;REVB=-0.00297267;RO=33;SAF=14;SAR=26;SRF=11;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0150933;STB=0.508317;STBP=0.91;TYPE=snp;VARB=0.00789385;OID=.;OPOS=149212462;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:33:33:40:40:0.547945:26:14:11:22:26:14:11:22
chr5	149247738	.	C	A	279.82	PASS	AF=0.625;AO=23;DP=37;FAO=25;FDP=40;FR=.;FRO=15;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.0618285;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.6688;QD=27.9821;RBI=0.0773355;REFB=0.00605131;REVB=-0.0464543;RO=14;SAF=9;SAR=14;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0764437;STB=0.535183;STBP=0.584;TYPE=snp;VARB=-0.00440138;OID=.;OPOS=149247738;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:40:14:15:23:25:0.625:14:9:7:7:14:11:8:7
chr5	149323906	.	T	G	248.26	PASS	AF=0.459016;AO=28;DP=61;FAO=28;FDP=61;FR=.;FRO=33;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=0.0173421;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.162;QD=16.279;RBI=0.0205025;REFB=-0.000585828;REVB=-0.0109365;RO=33;SAF=9;SAR=19;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195485;STB=0.610549;STBP=0.139;TYPE=snp;VARB=0.000812683;OID=.;OPOS=149323906;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:33:33:28:28:0.459016:19:9:17:16:19:9:17:16
chr5	149360877	.	T	C	851.5	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000796986;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.4702;QD=57.7286;RBI=0.0199494;REFB=0;REVB=0.0199335;RO=0;SAF=25;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00018634;OID=.;OPOS=149360877;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:59:0:0:58:59:1:33:25:0:0:34:25:0:0
chr5	149406271	.	C	T	340.72	PASS	AF=0.530303;AO=35;DP=67;FAO=35;FDP=66;FR=.;FRO=31;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=-0.0106395;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.939;QD=20.6497;RBI=0.0167076;REFB=-0.025175;REVB=0.0128819;RO=32;SAF=18;SAR=17;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0928441;STB=0.544486;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.0157534;OID=.;OPOS=149406271;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:66:32:31:35:35:0.530303:17:18:13:19:17:18:13:18
chr5	149493472	.	C	T	911.12	PASS	AF=1;AO=61;DP=62;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0026183;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.497;QD=57.8489;RBI=0.0388032;REFB=0;REVB=0.0387148;RO=0;SAF=35;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000540343;OID=.;OPOS=149493472;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:63:0:0:61:63:1:26:35:0:0:28:35:0:0
chr5	149495050	.	T	C	3035.84	PASS	AF=0.99005;AO=199;DP=201;FAO=199;FDP=201;FR=.;FRO=2;FSAF=108;FSAR=91;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00431701;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=318.712;QD=60.4147;RBI=0.0108902;REFB=0.0367688;REVB=0.00999802;RO=1;SAF=108;SAR=91;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0043898;STB=0.500428;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=1.3782e-06;OID=.;OPOS=149495050;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:201:201:1:2:199:199:0.99005:91:108:1:0:91:108:1:1
chr5	149563715	.	T	C	464.9	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0895125;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.5885;QD=58.1128;RBI=0.0995045;REFB=0;REVB=-0.0434588;RO=0;SAF=17;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00293833;OID=.;OPOS=149563715;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:15:17:0:0:15:17:0:0
chr5	149582191	.	G	A	132.7	PASS	AF=0.428571;AO=15;DP=35;FAO=15;FDP=35;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=0.0170524;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.771;QD=15.166;RBI=0.0173756;REFB=-0.0162461;REVB=0.00333587;RO=20;SAF=7;SAR=8;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0665023;STB=0.538411;STBP=0.722;TYPE=snp;VARB=0.0270074;OID=.;OPOS=149582191;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:20:20:15:15:0.428571:8:7:8:12:8:7:8:12
chr5	149583300	.	T	C	428.99	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0821729;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.3377;QD=57.1988;RBI=0.0846335;REFB=0;REVB=0.0202592;RO=0;SAF=18;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00143235;OID=.;OPOS=149583300;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:12:18:0:0:12:18:0:0
chr5	149583336	.	T	C	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00758563;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.9825;QD=50.4126;RBI=0.027314;REFB=0;REVB=0.0262396;RO=0;SAF=13;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.851e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000473174;OID=.;OPOS=149583336;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:6:13:0:0:6:13:0:0
chr5	149584197	.	G	A	274.56	PASS	AF=0.47619;AO=30;DP=63;FAO=30;FDP=63;FR=.;FRO=33;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=-0.0123524;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.755;QD=17.4323;RBI=0.0320946;REFB=-0.0201936;REVB=0.0296223;RO=32;SAF=15;SAR=15;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0575933;STB=0.523794;STBP=0.77;TYPE=snp;VARB=0.0175904;OID=.;OPOS=149584197;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:32:33:30:30:0.47619:15:15:18:14:15:15:18:15
chr5	149585025	.	A	C	868.27	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0144071;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.418;QD=57.8848;RBI=0.0147632;REFB=0;REVB=0.00322294;RO=0;SAF=32;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.84682e-05;OID=.;OPOS=149585025;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:28:32:0:0:28:32:0:0
chr5	149597160	.	A	G	228.66	PASS	AF=0.469388;AO=22;DP=48;FAO=23;FDP=49;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=0.0411014;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.1237;QD=18.6659;RBI=0.0412367;REFB=-0.000210998;REVB=0.00333772;RO=26;SAF=14;SAR=8;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170364;STB=0.579067;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.00460927;OID=.;OPOS=149597160;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:49:26:26:22:23:0.469388:8:14:12:14:9:14:12:14
chr5	149602608	.	A	G	74.68	PASS	AF=0.357143;AO=10;DP=28;FAO=10;FDP=28;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=-0.0229195;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.485;QD=10.6682;RBI=0.0234745;REFB=-0.0141394;REVB=0.00507438;RO=17;SAF=3;SAR=7;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0638208;STB=0.524949;STBP=0.87;TYPE=snp;VARB=0.0196561;OID=.;OPOS=149602608;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:28:28:17:18:10:10:0.357143:7:3:6:11:7:3:6:12
chr5	149644597	.	T	G	2045.97	PASS	AF=1;AO=131;DP=131;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0179979;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.126;QD=62.4722;RBI=0.0287015;REFB=0;REVB=0.0223574;RO=0;SAF=64;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.78847e-06;OID=.;OPOS=149644597;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:131:131:0:0:131:131:1:67:64:0:0:67:64:0:0
chr5	149677851	.	A	G	1050.0	PASS	AF=1;AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00476917;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.436;QD=59.9999;RBI=0.0158276;REFB=0;REVB=0.0150919;RO=0;SAF=32;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.001247;OID=.;OPOS=149677851;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:70:0:0:70:70:1:38:32:0:0:38:32:0:0
chr5	149824223	.	T	C	109.93	PASS	AF=0.433333;AO=13;DP=30;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=0.000603319;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=333.849;QD=14.6577;RBI=0.0099577;REFB=-0.000937902;REVB=0.00993941;RO=17;SAF=7;SAR=6;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179374;STB=0.603905;STBP=0.383;TYPE=snp;VARB=0.00189117;OID=.;OPOS=149824223;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:17:17:13:13:0.433333:6:7:6:11:6:7:6:11
chr5	149826526	.	C	T	85.77	PASS	AF=0.37931;AO=11;DP=29;FAO=11;FDP=29;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=-0.00675129;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=234.4;QD=11.8306;RBI=0.0232778;REFB=-0.00154239;REVB=-0.0222773;RO=18;SAF=6;SAR=5;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162248;STB=0.596102;STBP=0.443;TYPE=snp;VARB=0.00188529;OID=.;OPOS=149826526;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:29:29:18:18:11:11:0.37931:5:6:7:11:5:6:7:11
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chr5	149912527	.	C	T	240.49	PASS	AF=0.511111;AO=22;DP=45;FAO=23;FDP=45;FR=.;FRO=22;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.0273777;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.853;QD=21.3766;RBI=0.0556029;REFB=-0.0385322;REVB=-0.0483956;RO=22;SAF=16;SAR=6;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140653;STB=0.586128;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.030385;OID=.;OPOS=149912527;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:22:22:22:23:0.511111:6:16:13:9:6:17:13:9
chr5	149919739	.	G	C	771.51	PASS	AF=1;AO=54;DP=55;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0071561;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.748;QD=57.1487;RBI=0.0149082;REFB=0;REVB=-0.0130784;RO=0;SAF=35;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.86274e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.46079e-05;OID=.;OPOS=149919739;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:54:0:0:54:54:1:19:35:0:0:19:35:0:0
chr5	149923178	.	A	G	344.35	PASS	AF=0.390476;AO=41;DP=105;FAO=41;FDP=105;FR=.;FRO=64;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=25;FSRR=39;FWDB=0.00142612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.822;QD=13.118;RBI=0.0199811;REFB=-0.0181247;REVB=-0.0199302;RO=62;SAF=23;SAR=18;SRF=25;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166346;STB=0.602709;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=0.0155089;OID=.;OPOS=149923178;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:105:62:64:41:41:0.390476:18:23:25:37:18:23:25:39
chr5	149932934	.	G	A	570.14	PASS	AF=0.53;AO=53;DP=100;FAO=53;FDP=100;FR=.;FRO=47;FSAF=21;FSAR=32;FSRF=27;FSRR=20;FWDB=0.00856993;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=93.7542;QD=22.8054;RBI=0.00868722;REFB=-0.00237795;REVB=-0.00142274;RO=47;SAF=21;SAR=32;SRF=27;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153345;STB=0.584443;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=0.00231623;OID=.;OPOS=149932934;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:47:47:53:53:0.53:32:21:27:20:32:21:27:20
chr5	149932996	.	G	A	242.13	PASS	AF=0.473684;AO=27;DP=57;FAO=27;FDP=57;FR=.;FRO=30;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=0.0102897;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.266;QD=16.9916;RBI=0.019365;REFB=-0.0157198;REVB=-0.0164051;RO=30;SAF=9;SAR=18;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.22422;STB=0.62641;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.027578;OID=.;OPOS=149932996;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:30:30:27:27:0.473684:18:9:17:13:18:9:17:13
chr5	149933222	.	C	G	353.42	PASS	AF=0.469136;AO=37;DP=81;FAO=38;FDP=81;FR=.;FRO=43;FSAF=25;FSAR=13;FSRF=28;FSRR=15;FWDB=0.0409119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.8198;QD=17.453;RBI=0.0497174;REFB=-0.0141106;REVB=0.0282496;RO=43;SAF=25;SAR=12;SRF=28;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0265306;STB=0.503958;STBP=0.96;TYPE=snp;VARB=0.0112098;OID=.;OPOS=149933222;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:43:43:37:38:0.469136:12:25:28:15:13:25:28:15
chr5	149998128	.	G	A	120.85	PASS	AF=0.424242;AO=14;DP=33;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.0351108;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206;QD=14.6487;RBI=0.0367854;REFB=0.0056992;REVB=-0.0109724;RO=19;SAF=5;SAR=9;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171518;STB=0.599854;STBP=0.359;TYPE=snp;VARB=-0.00653693;OID=.;OPOS=149998128;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:19:19:14:14:0.424242:9:5:10:9:9:5:10:9
chr5	150030596	.	T	C	90.34	PASS	AF=0.5;AO=11;DP=22;FAO=11;FDP=22;FR=.;FRO=11;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=0.0134542;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=288.839;QD=16.4263;RBI=0.0206406;REFB=-0.00199474;REVB=-0.0156531;RO=11;SAF=7;SAR=4;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.307182;STB=0.677107;STBP=0.11;TYPE=snp;VARB=0.00305978;OID=.;OPOS=150030596;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:22:22:11:11:11:11:0.5:4:7:3:8:4:7:3:8
chr5	150030853	.	G	C	61.38	PASS	AF=0.409091;AO=8;DP=22;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=-0.0113414;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=247.716;QD=11.1608;RBI=0.0236443;REFB=0.000929193;REVB=0.0207467;RO=14;SAF=7;SAR=1;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.354271;STB=0.567408;STBP=0.709;TYPE=snp;VARB=-0.00108833;OID=.;OPOS=150030853;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:22:22:14:13:8:9:0.409091:1:7:9:5:2:7:9:4
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chr5	150088545	.	G	A	219.77	PASS	AF=0.44898;AO=19;DP=46;FAO=22;FDP=49;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.0288481;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.058;QD=17.9402;RBI=0.0304391;REFB=-0.0292249;REVB=0.00971218;RO=26;SAF=9;SAR=10;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0512182;STB=0.500959;STBP=0.996;TYPE=snp;VARB=0.027024;OID=.;OPOS=150088545;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:49:26:27:19:22:0.44898:10:9:11:15:13:9:11:16
chr5	150089766	.	G	A	105.86	PASS	AF=0.6;AO=12;DP=19;FAO=12;FDP=20;FR=.;FRO=8;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.00700821;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.522;QD=21.1723;RBI=0.0351276;REFB=0.0100209;REVB=-0.0344214;RO=7;SAF=10;SAR=2;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.424721;STB=0.728732;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=-0.00540778;OID=.;OPOS=150089766;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:19:20:7:8:12:12:0.6:2:10:2:5:2:10:3:5
chr5	150090781	.	C	T	395.23	PASS	AF=0.450549;AO=40;DP=91;FAO=41;FDP=91;FR=.;FRO=50;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=23;FSRR=27;FWDB=0.00585396;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.111;QD=17.3726;RBI=0.00768435;REFB=-0.00675697;REVB=0.00497799;RO=51;SAF=20;SAR=20;SRF=23;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0489143;STB=0.528642;STBP=0.627;TYPE=snp;VARB=0.00746109;OID=.;OPOS=150090781;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:51:50:40:41:0.450549:20:20:23:28:20:21:23:27
chr5	150097883	.	G	C	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0460612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.757;QD=56.1915;RBI=0.0497903;REFB=0;REVB=0.0189062;RO=0;SAF=10;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000237626;OID=.;OPOS=150097883;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:18:10:0:0:18:10:0:0
chr5	150158164	.	C	G	799.67	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0151865;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.465;QD=57.1194;RBI=0.0301034;REFB=0;REVB=0.025992;RO=0;SAF=29;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.75422e-05;OID=.;OPOS=150158164;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:27:29:0:0:27:29:0:0
chr5	150158199	.	C	T	772.97	PASS	AF=0.98;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.107035;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.0588;QD=61.8379;RBI=0.11992;REFB=-0.129634;REVB=0.0540764;RO=1;SAF=22;SAR=27;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0171119;STB=0.509087;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.00494997;OID=.;OPOS=150158199;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:50:50:1:1:49:49:0.98:27:22:0:1:27:22:0:1
chr5	150158226	.	A	C	638.81	PASS	AF=0.976744;AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0210079;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=257.54;QD=59.4243;RBI=0.0225353;REFB=-0.0548683;REVB=0.00815538;RO=1;SAF=19;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0199732;STB=0.510633;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=5.11343e-05;OID=.;OPOS=150158226;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:43:43:1:1:42:42:0.976744:23:19:0:1:23:19:0:1
chr5	150227966	.	C	A	398.62	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0215213;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=307.388;QD=56.9452;RBI=0.0311645;REFB=0;REVB=0.0225402;RO=0;SAF=18;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000269587;OID=.;OPOS=150227966;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:10:18:0:0:10:18:0:0
chr5	150275787	.	C	T	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00288053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.541;QD=50.4133;RBI=0.00418435;REFB=0;REVB=-0.00303502;RO=0;SAF=11;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.41338e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.10219e-06;OID=.;OPOS=150275787;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:8:11:0:0:8:11:0:0
chr5	150407456	.	T	C	2889.83	PASS	AF=0.994595;AO=183;DP=186;FAO=184;FDP=185;FR=.;FRO=1;FSAF=113;FSAR=71;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0174063;FXX=0.00537606;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.337;QD=62.4828;RBI=0.0478787;REFB=-0.0356388;REVB=0.0446026;RO=1;SAF=112;SAR=71;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0042323;STB=0.502202;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.000269449;OID=.;OPOS=150407456;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:186:185:1:1:183:184:0.994595:71:112:1:0:71:113:1:0
chr5	150409477	.	T	C	312.89	PASS	AF=0.453333;AO=34;DP=75;FAO=34;FDP=75;FR=.;FRO=41;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=28;FWDB=0.00332794;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.731;QD=16.6872;RBI=0.0144835;REFB=2.65064e-06;REVB=0.014096;RO=39;SAF=19;SAR=15;SRF=12;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.236149;STB=0.629842;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.000313257;OID=.;OPOS=150409477;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:39:41:34:34:0.453333:15:19:12:27:15:19:13:28
chr5	150415196	.	G	A	273.51	PASS	AF=0.537037;AO=28;DP=53;FAO=29;FDP=54;FR=.;FRO=25;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=0.0211521;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.46;QD=20.2601;RBI=0.024717;REFB=-0.0232363;REVB=0.0127876;RO=25;SAF=13;SAR=15;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147968;STB=0.57247;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=0.0300242;OID=.;OPOS=150415196;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:54:25:25:28:29:0.537037:15:13:16:9:15:14:16:9
chr5	150429444	.	G	A	227.86	PASS	AF=0.5;AO=22;DP=45;FAO=22;FDP=44;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=-0.00219217;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.489;QD=20.7145;RBI=0.0240493;REFB=0.00576752;REVB=0.0239491;RO=20;SAF=12;SAR=10;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0469145;STB=0.546177;STBP=0.586;TYPE=snp;VARB=-0.0045287;OID=.;OPOS=150429444;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:44:20:22:22:22:0.5:10:12:12:8:10:12:14:8
chr5	150429452	.	G	A	270.01	PASS	AF=0.531915;AO=25;DP=47;FAO=25;FDP=47;FR=.;FRO=22;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=-0.0465161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.2801;QD=22.9796;RBI=0.0485988;REFB=0.0161583;REVB=0.0140746;RO=22;SAF=14;SAR=11;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0655864;STB=0.536557;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=-0.0156439;OID=.;OPOS=150429452;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:22:22:25:25:0.531915:11:14:14:8:11:14:14:8
chr5	150480520	.	C	T	405.4	PASS	AF=0.5;AO=41;DP=82;FAO=41;FDP=82;FR=.;FRO=41;FSAF=13;FSAR=28;FSRF=25;FSRR=16;FWDB=-0.0166712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.6407;QD=19.7756;RBI=0.0168896;REFB=-0.0455968;REVB=0.00270774;RO=41;SAF=13;SAR=28;SRF=25;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.270185;STB=0.650292;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.0349851;OID=.;OPOS=150480520;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:41:41:41:41:0.5:28:13:25:16:28:13:25:16
chr5	150489390	.	A	G	180.85	PASS	AF=0.403846;AO=21;DP=52;FAO=21;FDP=52;FR=.;FRO=31;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=0.0116798;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.533;QD=13.9118;RBI=0.015105;REFB=-0.00127539;REVB=0.00957829;RO=30;SAF=7;SAR=14;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.243302;STB=0.649207;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=0.00210457;OID=.;OPOS=150489390;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:30:31:21:21:0.403846:14:7:17:13:14:7:18:13
chr5	150518988	.	G	A	241.66	PASS	AF=0.376623;AO=29;DP=77;FAO=29;FDP=77;FR=.;FRO=48;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=23;FSRR=25;FWDB=0.00635675;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.0262;QD=12.5536;RBI=0.0136727;REFB=0.00214681;REVB=0.0121051;RO=48;SAF=14;SAR=15;SRF=23;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00390446;STB=0.502241;STBP=0.974;TYPE=snp;VARB=-0.00228606;OID=.;OPOS=150518988;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:48:48:29:29:0.376623:15:14:23:25:15:14:23:25
chr5	150639409	.	A	G	433.82	PASS	AF=0.567568;AO=41;DP=73;FAO=42;FDP=74;FR=.;FRO=32;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=0.0297794;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.254;QD=23.4495;RBI=0.0307805;REFB=-0.00972011;REVB=-0.00778643;RO=32;SAF=18;SAR=23;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0239534;STB=0.50713;STBP=0.907;TYPE=snp;VARB=0.00794945;OID=.;OPOS=150639409;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:74:32:32:41:42:0.567568:23:18:15:17:23:19:15:17
chr5	150639439	.	A	G	769.48	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0168154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.911;QD=56.9989;RBI=0.0293495;REFB=0;REVB=-0.0240549;RO=0;SAF=24;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.6243e-05;OID=.;OPOS=150639439;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:30:24:0:0:30:24:0:0
chr5	150647156	.	T	C	196.95	PASS	AF=0.4;AO=24;DP=60;FAO=24;FDP=60;FR=.;FRO=36;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=21;FSRR=15;FWDB=-0.00500241;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=247.745;QD=13.1299;RBI=0.00748472;REFB=-0.0028201;REVB=-0.00556749;RO=36;SAF=11;SAR=13;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130213;STB=0.574524;STBP=0.38;TYPE=snp;VARB=0.00485222;OID=.;OPOS=150647156;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:36:36:24:24:0.4:13:11:21:15:13:11:21:15
chr5	150666843	.	A	C	245.15	PASS	AF=0.5;AO=25;DP=50;FAO=26;FDP=52;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=-0.0378217;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.2538;QD=18.8579;RBI=0.0633276;REFB=0.00670172;REVB=0.0507928;RO=24;SAF=12;SAR=13;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129489;STB=0.558515;STBP=0.438;TYPE=snp;VARB=-0.00690684;OID=.;OPOS=150666843;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:52:24:26:25:26:0.5:13:12:8:16:14:12:9:17
chr5	150666962	.	G	A	367.13	PASS	AF=0.411765;AO=42;DP=102;FAO=42;FDP=102;FR=.;FRO=60;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=31;FSRR=29;FWDB=0.0216815;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=270.244;QD=14.3973;RBI=0.0283109;REFB=-0.00797135;REVB=0.018205;RO=58;SAF=18;SAR=24;SRF=29;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0740774;STB=0.552088;STBP=0.389;TYPE=snp;VARB=0.0119417;OID=.;OPOS=150666962;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:58:60:42:42:0.411765:24:18:29:29:24:18:31:29
chr5	150667016	.	T	C	1529.1	PASS	AF=0.972222;AO=105;DP=108;FAO=105;FDP=108;FR=.;FRO=3;FSAF=42;FSAR=63;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0166055;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=251.119;QD=56.6333;RBI=0.016691;REFB=-0.060498;REVB=-0.00168753;RO=3;SAF=42;SAR=63;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.032691;STB=0.517238;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=-3.09109e-05;OID=.;OPOS=150667016;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:108:108:3:3:105:105:0.972222:63:42:3:0:63:42:3:0
chr5	150696447	.	C	T	1179.3	PASS	AF=0.975309;AO=78;DP=79;FAO=79;FDP=81;FR=.;FRO=2;FSAF=31;FSAR=48;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0526428;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.5361;QD=58.237;RBI=0.107486;REFB=0.0552932;REVB=-0.0937126;RO=1;SAF=31;SAR=47;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0150232;STB=0.515621;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=-0.00383889;OID=.;OPOS=150696447;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:79:81:1:2:78:79:0.975309:47:31:1:0:48:31:2:0
chr5	150696498	.	G	A	1135.25	PASS	AF=1;AO=74;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000817191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.014;QD=60.5467;RBI=0.0281798;REFB=0;REVB=0.0281679;RO=0;SAF=35;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.80413e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.9859e-05;OID=.;OPOS=150696498;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:75:0:0:74:75:1:39:35:0:0:39:36:0:0
chr5	150696540	.	C	T	902.67	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0204007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.505;QD=58.2369;RBI=0.0221492;REFB=0;REVB=0.00862547;RO=0;SAF=30;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.93868e-05;OID=.;OPOS=150696540;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:32:30:0:0:32:30:0:0
chr5	150723806	.	G	A	1323.61	PASS	AF=0.956989;AO=88;DP=93;FAO=89;FDP=93;FR=.;FRO=4;FSAF=26;FSAR=63;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.00891466;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.9102;QD=56.9296;RBI=0.019696;REFB=0.011716;REVB=0.0175631;RO=5;SAF=26;SAR=62;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0365812;STB=0.52334;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=-0.00180593;OID=.;OPOS=150723806;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:93:93:5:4:88:89:0.956989:62:26:3:2:63:26:3:1
chr5	150886725	.	G	A	773.63	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0272352;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.4523;QD=63.1531;RBI=0.105296;REFB=0;REVB=-0.101712;RO=0;SAF=21;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000518495;OID=.;OPOS=150886725;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:49:0:0:48:49:1:27:21:0:0:27:22:0:0
chr5	150886882	.	G	A	2272.9	PASS	AF=0.980645;AO=152;DP=156;FAO=152;FDP=155;FR=.;FRO=3;FSAF=69;FSAR=83;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.00269799;FXX=0.00640985;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.711;QD=58.6554;RBI=0.0133887;REFB=-0.0296918;REVB=0.013114;RO=2;SAF=69;SAR=83;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0135863;STB=0.504149;STBP=0.457;TYPE=snp;VARB=0.000408191;OID=.;OPOS=150886882;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:156:155:2:3:152:152:0.980645:83:69:2:0:83:69:2:1
chr5	150891733	.	A	G	670.24	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0482023;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.434;QD=62.3483;RBI=0.0576351;REFB=0;REVB=-0.0315965;RO=0;SAF=23;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.34847e-05;OID=.;OPOS=150891733;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:20:23:0:0:20:23:0:0
chr5	150901111	.	A	G	1216.88	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0476299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.562;QD=60.8439;RBI=0.0501059;REFB=0;REVB=-0.0155561;RO=0;SAF=28;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000276665;OID=.;OPOS=150901111;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:79:80:0:0:79:80:1:51:28:0:0:51:29:0:0
chr5	150901261	.	C	T	323.03	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0364362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.643;QD=53.8376;RBI=0.0371351;REFB=0;REVB=0.00717087;RO=0;SAF=12;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000348101;OID=.;OPOS=150901261;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:12:12:0:0:12:12:0:0
chr5	150901300	.	G	A	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0159534;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.403;QD=56.1912;RBI=0.0269011;REFB=0;REVB=0.02166;RO=0;SAF=18;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.95844e-05;OID=.;OPOS=150901300;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:10:18:0:0:10:18:0:0
chr5	150901613	.	A	G	255.06	PASS	AF=0.956522;AO=20;DP=22;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0375802;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.3482;QD=44.3579;RBI=0.0704388;REFB=-0.0217818;REVB=0.0595764;RO=1;SAF=13;SAR=7;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0341449;STB=0.517226;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.00331016;OID=.;OPOS=150901613;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:22:23:1:1:20:22:0.956522:7:13:1:0:8:14:1:0
chr5	150914184	.	A	T	139.55	PASS	AF=0.355556;AO=16;DP=45;FAO=16;FDP=45;FR=.;FRO=29;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=-0.0278026;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.944;QD=12.4042;RBI=0.0512377;REFB=-0.0225605;REVB=-0.0430385;RO=29;SAF=4;SAR=12;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.347302;STB=0.705613;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.0564513;OID=.;OPOS=150914184;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:29:29:16:16:0.355556:12:4:16:13:12:4:16:13
chr5	150923405	.	A	G	832.57	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0679201;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.7106;QD=57.4189;RBI=0.121172;REFB=0;REVB=-0.100347;RO=0;SAF=33;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00199278;OID=.;OPOS=150923405;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:25:33:0:0:25:33:0:0
chr5	150925144	.	A	G	129.58	PASS	AF=0.5;AO=14;DP=29;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.00352438;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.329;QD=17.2775;RBI=0.0116623;REFB=-0.0251207;REVB=0.011117;RO=14;SAF=8;SAR=6;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5342;STBP=0.731;TYPE=snp;VARB=0.0435483;OID=.;OPOS=150925144;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:30:14:15:14:15:0.5:6:8:8:6:6:9:8:7
chr5	150942919	.	A	G	483.35	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00773712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.884;QD=58.5876;RBI=0.0077868;REFB=0;REVB=-0.000878141;RO=0;SAF=19;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.71297e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.5296e-05;OID=.;OPOS=150942919;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:14:19:0:0:14:19:0:0
chr5	150946966	.	G	A	2065.77	PASS	AF=0.992701;AO=125;DP=126;FAO=136;FDP=137;FR=.;FRO=1;FSAF=81;FSAR=55;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00647227;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=69.2489;QD=60.3144;RBI=0.0447098;REFB=-0.0344899;REVB=0.0442389;RO=1;SAF=81;SAR=44;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00583038;STB=0.503067;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.00220177;OID=.;OPOS=150946966;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:126:137:1:1:125:136:0.992701:44:81:1:0:55:81:1:0
chr5	151043103	.	G	C	194.9	PASS	AF=0.444444;AO=20;DP=45;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=4;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=0.0556777;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.91;QD=17.3243;RBI=0.0563686;REFB=-0.0234991;REVB=0.00879867;RO=25;SAF=4;SAR=16;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.325155;STB=0.687963;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=0.0158854;OID=.;OPOS=151043103;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:25:25:20:20:0.444444:16:4:12:13:16:4:12:13
chr5	151083909	.	T	C	272.52	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00207776;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=212.061;QD=51.9085;RBI=0.051316;REFB=0;REVB=0.051274;RO=0;SAF=11;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00024772;OID=.;OPOS=151083909;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:10:11:0:0:10:11:0:0
chr5	151084026	.	G	A	244.0	PASS	AF=0.5;AO=26;DP=52;FAO=26;FDP=52;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=0.0212936;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.672;QD=18.7695;RBI=0.0216333;REFB=0.00246921;REVB=0.00381883;RO=26;SAF=10;SAR=16;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13946;STB=0.578252;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=-0.00285005;OID=.;OPOS=151084026;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:26:26:26:26:0.5:16:10:14:12:16:10:14:12
chr5	151084036	.	T	C	752.14	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0213034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.366;QD=56.7652;RBI=0.0410757;REFB=0;REVB=0.0351195;RO=0;SAF=24;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000328038;OID=.;OPOS=151084036;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:29:24:0:0:29:24:0:0
chr5	151255217	.	C	T	1157.72	PASS	AF=1;AO=74;DP=75;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0104528;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.068;QD=60.9325;RBI=0.020464;REFB=0;REVB=0.0175931;RO=0;SAF=35;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.80413e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.4099e-05;OID=.;OPOS=151255217;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:76:0:0:74:76:1:39:35:0:0:40:36:0:0
chr5	151771817	.	C	T	2216.81	PASS	AF=1;AO=140;DP=140;FAO=140;FDP=140;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0135163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.092;QD=63.3374;RBI=0.0369346;REFB=0;REVB=0.0343726;RO=0;SAF=64;SAR=76;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.33035e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.15105e-05;OID=.;OPOS=151771817;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:140:140:0:0:140:140:1:76:64:0:0:76:64:0:0
chr5	151784183	.	G	A	226.89	PASS	AF=0.536585;AO=21;DP=39;FAO=22;FDP=41;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=5;FWDB=0.00140056;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.495;QD=22.1353;RBI=0.0154389;REFB=-0.0420003;REVB=0.0153752;RO=18;SAF=11;SAR=10;SRF=14;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.213337;STB=0.609661;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=0.0226086;OID=.;OPOS=151784183;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:41:18:19:21:22:0.536585:10:11:14:4:11:11:14:5
chr5	153413390	.	C	T	990.65	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00176508;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=233.885;QD=59.143;RBI=0.0299077;REFB=0;REVB=-0.0298555;RO=0;SAF=42;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.93036e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.17882e-05;OID=.;OPOS=153413390;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:25:42:0:0:25:42:0:0
chr5	153429459	.	T	C	1019.73	PASS	AF=1;AO=67;DP=68;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0207513;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.2794;QD=59.1147;RBI=0.0328935;REFB=0;REVB=0.0255218;RO=0;SAF=24;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00178666;OID=.;OPOS=153429459;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:68:69:0:0:67:69:1:43:24:0:0:45:24:0:0
chr5	153432733	.	T	C	429.01	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0140445;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.087;QD=57.2013;RBI=0.0510622;REFB=0;REVB=0.0490928;RO=0;SAF=19;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000381581;OID=.;OPOS=153432733;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:11:19:0:0:11:19:0:0
chr5	153432970	.	C	T	1190.43	PASS	AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0193133;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.4738;QD=61.0476;RBI=0.0199631;REFB=0;REVB=0.00505216;RO=0;SAF=45;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.48174e-05;OID=.;OPOS=153432970;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:33:45:0:0:33:45:0:0
chr5	153735709	.	A	G	561.9	PASS	AF=0.535354;AO=53;DP=99;FAO=53;FDP=99;FR=.;FRO=46;FSAF=37;FSAR=16;FSRF=32;FSRR=14;FWDB=0.0183628;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.839;QD=22.7031;RBI=0.0281948;REFB=-0.052183;REVB=0.0213952;RO=46;SAF=37;SAR=16;SRF=32;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00246292;STB=0.501354;STBP=0.995;TYPE=snp;VARB=0.0323897;OID=.;OPOS=153735709;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:46:46:53:53:0.535354:16:37:32:14:16:37:32:14
chr5	153788991	.	G	C	606.64	PASS	AF=0.521368;AO=61;DP=118;FAO=61;FDP=117;FR=.;FRO=56;FSAF=38;FSAR=23;FSRF=28;FSRR=28;FWDB=-0.00369241;FXX=0.00847386;HRUN=2;LEN=1;MLLD=262.32;QD=20.7397;RBI=0.0119504;REFB=0.00135171;REVB=-0.0113656;RO=55;SAF=38;SAR=23;SRF=27;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117169;STB=0.560744;STBP=0.197;TYPE=snp;VARB=-0.0011263;OID=.;OPOS=153788991;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:118:117:55:56:61:61:0.521368:23:38:27:28:23:38:28:28
chr5	154065369	.	ATTTTTTTTTTTTTA	ATTTTTTTTTTTTA,ATTTTTTTTTTTTT,ATTTTTTTTTTTTTT	142.65	PASS	AF=0.448276,0.362069,0;AO=7,10,2;DP=53;FAO=26,21,0;FDP=58;FR=.;FRO=11;FSAF=18,18,0;FSAR=8,3,0;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=0.543115,-0.0166206,-0.286422;FXX=0;HRUN=13,3,3;LEN=1,1,1;MLLD=2.68731,11.9071,12.2713;QD=9.83818;RBI=1.52527,0.0710535,0.765143;REFB=0.0383678,4.12108e-07,-0.0205248;REVB=-1.4253,-0.0690822,0.709511;RO=8;SAF=5,10,2;SAR=2,0,0;SRF=7;SRR=1;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.196457,0.771358,0.490468;STB=0.512306,0.58056,0.5;STBP=0.871,0.341,1;TYPE=del,del,snp;VARB=0.169734,0.0558463,-0.45411;OID=.,.,.;OPOS=154065370,154065383,154065383;OREF=T,A,A;OALT=-,-,T;OMAPALT=ATTTTTTTTTTTTA,ATTTTTTTTTTTTT,ATTTTTTTTTTTTTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.448276,0.362069,0:7,10,2:53:26,21,0:58:11:18,18,0:8,3,0:8:3:69:8:5,10,2:2,0,0:7:1
chr5	154166084	.	A	AG	345.26	PASS	AF=0.462687;AO=55;DP=137;FAO=62;FDP=134;FR=.;FRO=72;FSAF=27;FSAR=35;FSRF=27;FSRR=45;FWDB=0.02919;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=19.6918;QD=10.3064;RBI=0.0683756;REFB=0.0246192;REVB=-0.0618318;RO=75;SAF=26;SAR=29;SRF=28;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103364;STB=0.533323;STBP=0.5;TYPE=ins;VARB=-0.0355056;OID=.;OPOS=154166085;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.462687:55:137:62:134:72:27:35:27:45:99:75:26:29:28:47
chr5	154268902	.	C	T	1160.25	PASS	AF=0.987179;AO=77;DP=78;FAO=77;FDP=78;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00371095;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.7393;QD=59.5;RBI=0.070999;REFB=-0.0494046;REVB=0.070902;RO=0;SAF=37;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506171;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.0032554;OID=.;OPOS=154268902;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:78:78:0:1:77:77:0.987179:40:37:0:0:40:37:0:1
chr5	154271948	.	G	A	483.89	PASS	AF=0.944444;AO=34;DP=36;FAO=34;FDP=36;FR=.;FRO=2;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00357766;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.1324;QD=53.7653;RBI=0.00431325;REFB=-0.221936;REVB=0.00240925;RO=1;SAF=14;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.022804;STB=0.523796;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.00696038;OID=.;OPOS=154271948;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:36:36:1:2:34:34:0.944444:20:14:0:1:20:14:0:2
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chr5	154300940	.	A	C	871.32	PASS	AF=0.983871;AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0326557;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=62.3663;QD=56.2143;RBI=0.065458;REFB=-0.11071;REVB=0.0567305;RO=0;SAF=25;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506847;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.00231676;OID=.;OPOS=154300940;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:62:62:0:1:61:61:0.983871:36:25:0:0:36:25:0:1
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chr5	154395158	.	G	T	129.42	PASS	AF=0.375;AO=15;DP=40;FAO=15;FDP=40;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.0424256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.025;QD=12.942;RBI=0.0441812;REFB=0.00118751;REVB=-0.0123308;RO=25;SAF=11;SAR=4;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.207063;STB=0.622468;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=-0.00328421;OID=.;OPOS=154395158;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:25:25:15:15:0.375:4:11:14:11:4:11:14:11
chr5	154395458	.	G	A	152.36	PASS	AF=0.551724;AO=16;DP=29;FAO=16;FDP=29;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.00697522;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.61;QD=21.0158;RBI=0.024342;REFB=-0.012885;REVB=0.0233212;RO=12;SAF=8;SAR=8;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126935;STB=0.55166;STBP=0.548;TYPE=snp;VARB=0.0115321;OID=.;OPOS=154395458;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:12:13:16:16:0.551724:8:8:8:4:8:8:8:5
chr5	154395682	.	G	A	231.28	PASS	AF=0.318681;AO=29;DP=91;FAO=29;FDP=91;FR=.;FRO=62;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=28;FSRR=34;FWDB=-0.0120027;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.998;QD=10.1661;RBI=0.0174287;REFB=-0.018539;REVB=-0.012637;RO=62;SAF=11;SAR=18;SRF=28;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0869869;STB=0.550985;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=0.0434272;OID=.;OPOS=154395682;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:62:62:29:29:0.318681:18:11:28:34:18:11:28:34
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chr5	155771579	.	T	C	1420.15	PASS	AF=1;AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0162259;FXX=0.0217368;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.078;QD=63.1178;RBI=0.0223977;REFB=0;REVB=0.0154395;RO=0;SAF=42;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.84626e-05;OID=.;OPOS=155771579;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:90:90:0:0:90:90:1:48:42:0:0:48:42:0:0
chr5	156376703	.	A	G	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.048737;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.049;QD=44.6898;RBI=0.0491333;REFB=0;REVB=-0.00622832;RO=0;SAF=5;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000718943;OID=.;OPOS=156376703;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:8:5:0:0:8:5:0:0
chr5	156479424	.	A	C	1626.51	PASS	AF=1;AO=107;DP=107;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00160302;FXX=0.00917347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.677;QD=60.2411;RBI=0.0366384;REFB=0;REVB=0.0366033;RO=0;SAF=46;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.73491e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000333291;OID=.;OPOS=156479424;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:107:108:0:0:107:108:1:61:46:0:0:62:46:0:0
chr5	156479509	.	A	G	1864.34	PASS	AF=1;AO=120;DP=120;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00881622;FXX=0.00819605;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.447;QD=61.6311;RBI=0.0178454;REFB=0;REVB=0.0155155;RO=0;SAF=51;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.28409e-05;OID=.;OPOS=156479509;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:120:121:0:0:120:121:1:69:51:0:0:69:52:0:0
chr5	156479556	.	C	T	53.69	PASS	AF=0.125;AO=11;DP=95;FAO=12;FDP=96;FR=.;FRO=84;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=35;FSRR=49;FWDB=-7.21405e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.598;QD=2.23694;RBI=0.00109725;REFB=-0.00737426;REVB=0.00109487;RO=84;SAF=0;SAR=11;SRF=35;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.62933;STB=0.867695;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.0450097;OID=.;OPOS=156479556;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:95:96:84:84:11:12:0.125:11:0:35:49:11:1:35:49
chr5	156479557	.	GTTGGAACAGTCGTCA	G,GTTGGAACAGTCGTTG,GTTGGAACAGTTGTCG	972.73	PASS	AF=0.636364,0.0757576,0.287879;AO=44,7,15;DP=85;FAO=42,5,19;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=20,0,0;FSAR=22,5,19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0468069,0.0221926,0.0140938;FXX=0.21426;HRUN=2,1,1;LEN=15,2,5;MLLD=191.793,228.148,113.301;QD=58.9533;RBI=0.0499147,0.0332911,0.0162362;REFB=0,0,0;REVB=-0.0173377,-0.024815,-0.00806102;RO=0;SAF=20,0,0;SAR=24,7,15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-5.30465e-08,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,mnp,mnp;VARB=0.000125067,0.0114601,0.000662237;OID=.,.,.;OPOS=156479558,156479571,156479568;OREF=TTGGAACAGTCGTCA,CA,CGTCA;OALT=-,TG,TGTCG;OMAPALT=G,GTTGGAACAGTCGTTG,GTTGGAACAGTTGTCG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/3:0.636364,0.0757576,0.287879:44,7,15:85:42,5,19:66:0:20,0,0:22,5,19:0:0:99:0:20,0,0:24,7,15:0:0
chr5	156479596	.	A	ATGCTCATTGTTGTTGGAACAGTTGTCGTTGGAACAGTCGTTGTCGTTGGAA	50.0	PASS	AO=41;DP=139;LEN=51;RO=98;SAF=20;SAR=28;SRF=47;SRR=44;TYPE=ins;FR=.;OID=.;OPOS=156479596;OREF=-;OALT=ATGCTCATTGTTGTTGGAACAGTTGTCGTTGGAACAGTCGTTGTCGTTGGA;OMAPALT=ATGCTCATTGTTGTTGGAACAGTTGTCGTTGGAACAGTCGTTGTCGTTGGAA	GT:GQ:DP:RO:AO:SAR:SAF:SRF:SRR	0/1:99:139:98:41:28:20:47:44
chr5	156482459	.	G	T	1190.33	PASS	AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0623246;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.3392;QD=61.0426;RBI=0.0636104;REFB=0;REVB=-0.012725;RO=0;SAF=36;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.43944e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000623517;OID=.;OPOS=156482459;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:42:36:0:0:42:36:0:0
chr5	156531736	.	C	A	772.11	PASS	AF=1;AO=54;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0124272;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.885;QD=56.1536;RBI=0.0278759;REFB=0;REVB=0.0249526;RO=0;SAF=28;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.52846e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000194994;OID=.;OPOS=156531736;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:54:55:1:26:28:0:0:26:29:0:0
chr5	156589481	.	C	T	152.9	PASS	AF=0.352941;AO=18;DP=51;FAO=18;FDP=51;FR=.;FRO=33;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=12;FWDB=0.00663287;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.314;QD=11.9919;RBI=0.0110877;REFB=-0.0100996;REVB=0.00888488;RO=33;SAF=4;SAR=14;SRF=21;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.461164;STB=0.770621;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0339927;OID=.;OPOS=156589481;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:33:33:18:18:0.352941:14:4:21:12:14:4:21:12
chr5	156721863	.	T	C,TC	1279.26	PASS	AF=0,1;AO=5,81;DP=96;FAO=0,91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=0,46;FSAR=0,45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.02743,-0.00237918;FXX=0.0108684;HRUN=2,3;LEN=1,1;MLLD=7.31852,23.1723;QD=56.2311;RBI=0.0274503,0.0803367;REFB=0.00265565,-0.0260229;REVB=-0.00105339,0.0803014;RO=9;SAF=0,42;SAR=5,39;SRF=6;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.761805,-0.0280115;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,ins;VARB=0,0.00147645;OID=.,.;OPOS=156721863,156721864;OREF=T,-;OALT=C,C;OMAPALT=C,TC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	2/2:5:96:91:9:0:5,81:0,91:0,1:5,39:0,42:6:3:0,45:0,46:0:0
chr5	156898690	.	A	G	1573.51	PASS	AF=1;AO=91;DP=91;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0086959;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.366;QD=63.5762;RBI=0.0225279;REFB=0;REVB=0.0207819;RO=0;SAF=56;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.454e-07;OID=.;OPOS=156898690;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:91:99:0:0:91:99:1:35:56:0:0:41:58:0:0
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chr5	157078475	.	C	G	851.77	PASS	AF=0.524691;AO=85;DP=162;FAO=85;FDP=162;FR=.;FRO=77;FSAF=32;FSAR=53;FSRF=40;FSRR=37;FWDB=0.0226378;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.3126;QD=21.0313;RBI=0.0547385;REFB=0.0187567;REVB=0.0498381;RO=70;SAF=32;SAR=53;SRF=38;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140752;STB=0.569876;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=-0.0201848;OID=.;OPOS=157078475;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:162:162:70:77:85:85:0.524691:53:32:38:32:53:32:40:37
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chr5	157183770	.	C	T	131.3	PASS	AF=0.405405;AO=15;DP=37;FAO=15;FDP=37;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.041184;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.2486;QD=14.1944;RBI=0.0440478;REFB=0.00903182;REVB=-0.0156233;RO=22;SAF=7;SAR=8;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.012446;STB=0.507237;STBP=0.942;TYPE=snp;VARB=-0.0171282;OID=.;OPOS=157183770;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:22:22:15:15:0.405405:8:7:10:12:8:7:10:12
chr5	157213497	.	A	G	650.84	PASS	AF=0.405556;AO=73;DP=181;FAO=73;FDP=180;FR=.;FRO=107;FSAF=42;FSAR=31;FSRF=51;FSRR=56;FWDB=0.0458182;FXX=0.00552456;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.121;QD=14.463;RBI=0.0469876;REFB=-0.00708688;REVB=0.010418;RO=107;SAF=42;SAR=31;SRF=51;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104954;STB=0.558956;STBP=0.194;TYPE=snp;VARB=0.0119478;OID=.;OPOS=157213497;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:181:180:107:107:73:73:0.405556:31:42:51:56:31:42:51:56
chr5	157403931	.	A	G	43.62	PASS	AF=0.241379;AO=7;DP=29;FAO=7;FDP=29;FR=.;FRO=22;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.0111637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.585;QD=6.016;RBI=0.0149247;REFB=0.00419544;REVB=0.00990552;RO=22;SAF=3;SAR=4;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187877;STB=0.621021;STBP=0.477;TYPE=snp;VARB=-0.0139348;OID=.;OPOS=157403931;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:29:29:22:22:7:7:0.241379:4:3:13:9:4:3:13:9
chr5	158122989	.	ATTTTTGC	AATTTTTG,ATTTTGC,ATTTTTG,ATTTTTGA	91.49	PASS	AF=0.0508475,0.237288,0.118644,0.0847458;AO=3,9,7,4;DP=62;FAO=3,14,7,5;FDP=59;FR=.;FRO=30;FSAF=0,13,0,0;FSAR=3,1,7,5;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=0.00414264,-0.064072,0.00459841,0.00501685;FXX=0.0483793;HRUN=5,5,1,1;LEN=7,1,1,1;MLLD=100.797,11.8502,90.6256,90.6412;QD=6.20246;RBI=0.0267215,0.0664742,0.0287795,0.0536615;REFB=-0.00798389,0.0218036,-0.00832449,-0.0076894;REVB=0.0263984,-0.017709,0.0284098,0.0534264;RO=24;SAF=0,8,0,0;SAR=3,1,7,4;SRF=16;SRR=8;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=-0.647813,0.381282,-0.767614,-0.694909;STB=0.996982,0.844368,0.998535,0.998061;STBP=0.041,0.012,0,0.003;TYPE=mnp,del,del,snp;VARB=0.155171,-0.165633,0.203744,0.217836;OID=.,.,.,.;OPOS=158122990,158122990,158122996,158122996;OREF=TTTTTGC,T,C,C;OALT=ATTTTTG,-,-,A;OMAPALT=AATTTTTG,ATTTTGC,ATTTTTG,ATTTTTGA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0.0508475,0.237288,0.118644,0.0847458:3,9,7,4:62:3,14,7,5:59:30:0,13,0,0:3,1,7,5:18:12:31:24:0,8,0,0:3,1,7,4:16:8
chr5	158204425	.	A	G	1050.67	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000766626;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.04;QD=59.1926;RBI=0.00304729;REFB=0;REVB=-0.00294928;RO=0;SAF=40;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000669954;OID=.;OPOS=158204425;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:71:0:0:70:71:1:30:40:0:0:31:40:0:0
chr5	159344461	.	G	A	1408.58	PASS	AF=0.989247;AO=90;DP=93;FAO=92;FDP=93;FR=.;FRO=1;FSAF=52;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0133525;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=206.834;QD=60.5842;RBI=0.0196891;REFB=-0.0971866;REVB=0.0144696;RO=1;SAF=50;SAR=40;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0117017;STB=0.506171;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=0.000291029;OID=.;OPOS=159344461;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:93:93:1:1:90:92:0.989247:40:50:0:1:40:52:0:1
chr5	159505208	.	C	A	447.01	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00809509;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.286;QD=57.6791;RBI=0.0119901;REFB=0;REVB=-0.00884494;RO=0;SAF=16;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.32758e-06;OID=.;OPOS=159505208;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:15:16:0:0:15:16:0:0
chr5	159659273	.	C	T	222.8	PASS	AF=0.468085;AO=22;DP=47;FAO=22;FDP=47;FR=.;FRO=25;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=0.0258073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.4588;QD=18.9619;RBI=0.0260733;REFB=0.0216394;REVB=0.00371469;RO=25;SAF=8;SAR=14;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.25812;STB=0.646022;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=-0.00967109;OID=.;OPOS=159659273;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:25:25:22:22:0.468085:14:8:16:9:14:8:16:9
chr5	159665599	.	G	A	817.73	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0115488;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.846;QD=57.3847;RBI=0.0192009;REFB=0;REVB=0.0153395;RO=0;SAF=32;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00015573;OID=.;OPOS=159665599;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:25:32:0:0:25:32:0:0
chr5	159775741	.	G	A	1605.82	PASS	AF=1;AO=107;DP=107;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0259969;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.4225;QD=60.0308;RBI=0.0260813;REFB=0;REVB=0.00209591;RO=0;SAF=44;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.78072e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.3007e-05;OID=.;OPOS=159775741;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:107:107:0:0:107:107:1:63:44:0:0:63:44:0:0
chr5	159776047	.	A	G	556.23	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0166571;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.072;QD=60.1334;RBI=0.024824;REFB=0;REVB=0.0184059;RO=0;SAF=11;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.46502e-05;OID=.;OPOS=159776047;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:26:11:0:0:26:11:0:0
chr5	159776637	.	C	T	746.88	PASS	AF=1;AO=46;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0891858;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=49.3582;QD=63.5639;RBI=0.0904417;REFB=0;REVB=-0.0150198;RO=1;SAF=20;SAR=26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0177403;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00101758;OID=.;OPOS=159776637;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:1:0:46:47:1:26:20:0:1:27:20:0:0
chr5	159835658	.	A	G	2326.5	PASS	AF=1;AO=142;DP=144;FAO=146;FDP=146;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0499732;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.215;QD=63.7398;RBI=0.055006;REFB=0;REVB=0.0229858;RO=0;SAF=66;SAR=76;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.20007e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.21459e-05;OID=.;OPOS=159835658;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:144:146:0:0:142:146:1:76:66:0:0:76:70:0:0
chr5	159901408	.	C	A	1091.48	PASS	AF=0.866667;AO=78;DP=90;FAO=78;FDP=90;FR=.;FRO=12;FSAF=39;FSAR=39;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.00955865;FXX=0.0217368;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.381;QD=48.5101;RBI=0.0120705;REFB=-0.0853195;REVB=0.00737081;RO=12;SAF=39;SAR=39;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0209091;STB=0.511108;STBP=0.589;TYPE=snp;VARB=0.0121074;OID=.;OPOS=159901408;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:58:90:90:12:12:78:78:0.866667:39:39:7:5:39:39:7:5
chr5	159912418	.	C	G	162.2	PASS	AF=0.37037;AO=20;DP=54;FAO=20;FDP=54;FR=.;FRO=34;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=21;FSRR=13;FWDB=-0.0254183;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.4875;QD=12.0147;RBI=0.0322833;REFB=-0.0118562;REVB=-0.0199028;RO=34;SAF=8;SAR=12;SRF=21;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.232932;STB=0.634904;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=0.0167625;OID=.;OPOS=159912418;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:34:34:20:20:0.37037:12:8:21:13:12:8:21:13
chr5	160097496	.	A	G	873.13	PASS	AF=1;AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0165375;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.1538;QD=58.2086;RBI=0.0249506;REFB=0;REVB=0.0186827;RO=0;SAF=32;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00105494;OID=.;OPOS=160097496;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:60:0:0:60:60:1:28:32:0:0:28:32:0:0
chr5	160097632	.	G	A	594.53	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0287748;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.799;QD=60.9776;RBI=0.0326992;REFB=0;REVB=-0.0155322;RO=0;SAF=16;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.43889e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.71569e-05;OID=.;OPOS=160097632;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:23:16:0:0:23:16:0:0
chr5	161113004	.	G	A	635.59	PASS	AF=0.453333;AO=68;DP=150;FAO=68;FDP=150;FR=.;FRO=82;FSAF=38;FSAR=30;FSRF=43;FSRR=39;FWDB=0.00805582;FXX=0.00662208;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.4941;QD=16.949;RBI=0.0321527;REFB=-0.00639591;REVB=0.0311271;RO=81;SAF=38;SAR=30;SRF=43;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0276229;STB=0.518997;STBP=0.669;TYPE=snp;VARB=0.0111967;OID=.;OPOS=161113004;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:150:150:81:82:68:68:0.453333:30:38:43:38:30:38:43:39
chr5	161114522	.	T	C	902.71	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00193116;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=287.8;QD=58.2395;RBI=0.00999489;REFB=0;REVB=0.00980655;RO=0;SAF=36;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51662e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.0974e-06;OID=.;OPOS=161114522;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:26:36:0:0:26:36:0:0
chr5	161119071	.	G	T	1268.52	PASS	AF=0.988095;AO=83;DP=84;FAO=83;FDP=84;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0189677;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.3492;QD=60.4058;RBI=0.0297519;REFB=-0.0892334;REVB=-0.0229217;RO=1;SAF=45;SAR=38;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0123005;STB=0.506492;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.000836143;OID=.;OPOS=161119071;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:84:84:1:1:83:83:0.988095:38:45:0:1:38:45:0:1
chr5	161119125	.	C	G	1286.27	PASS	AF=0.923077;AO=83;DP=91;FAO=84;FDP=91;FR=.,HEALED;FRO=4;FSAF=50;FSAR=34;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0121549;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.674;QD=56.5395;RBI=0.0270213;REFB=0.00045534;REVB=-0.0241332;RO=3;SAF=49;SAR=34;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0174791;STB=0.504483;STBP=0.752;TYPE=snp;VARB=-0.000118155;OID=.;OPOS=161119125;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:91:91:3:4:83:84:0.923077:34:49:1:2:34:50:2:2
chr5	161128761	.	C	G	1062.39	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0218811;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.0654;QD=59.8528;RBI=0.0300715;REFB=0;REVB=-0.020628;RO=0;SAF=26;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000380777;OID=.;OPOS=161128761;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:45:26:0:0:45:26:0:0
chr5	161128914	.	C	T	715.04	PASS	AF=0.978723;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00240558;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=260.232;QD=60.8545;RBI=0.0166166;REFB=-0.0866027;REVB=-0.0164415;RO=1;SAF=27;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0170959;STB=0.509087;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.000360761;OID=.;OPOS=161128914;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:47:47:1:1:46:46:0.978723:19:27:1:0:19:27:1:0
chr5	161325934	.	A	C	937.59	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0192102;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.998;QD=58.5993;RBI=0.0269675;REFB=0;REVB=0.0189266;RO=0;SAF=32;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.4601e-05;OID=.;OPOS=161325934;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:32:32:0:0:32:32:0:0
chr5	161528280	.	C	T	1079.16	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0038461;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.324;QD=59.9534;RBI=0.0281123;REFB=0;REVB=0.0278479;RO=0;SAF=31;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.18246e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.95158e-05;OID=.;OPOS=161528280;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:72:0:0:71:72:1:40:31:0:0:41:31:0:0
chr5	161582493	.	CAT	C	364.31	PASS	AF=0.449438;AO=37;DP=87;FAO=40;FDP=89;FR=.;FRO=49;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=23;FSRR=26;FWDB=-0.00789136;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=255.963;QD=16.3735;RBI=0.00794707;REFB=-0.00468122;REVB=-0.000939323;RO=49;SAF=18;SAR=19;SRF=23;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0173044;STB=0.503097;STBP=0.963;TYPE=del;VARB=0.00627658;OID=.;OPOS=161582494;OREF=AT;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.449438:37:87:40:89:49:19:21:23:26:99:49:18:19:23:26
chr5	162210532	.	A	G	575.65	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0223422;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.974;QD=60.5947;RBI=0.0416139;REFB=0;REVB=0.0351076;RO=0;SAF=18;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.51048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.90481e-05;OID=.;OPOS=162210532;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:20:18:0:0:20:18:0:0
chr5	162890953	.	G	A	1008.49	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0261405;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.636;QD=59.3228;RBI=0.0262296;REFB=0;REVB=-0.00216099;RO=0;SAF=32;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.49594e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.2239e-05;OID=.;OPOS=162890953;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:36:32:0:0:36:32:0:0
chr5	167489093	.	A	T	287.89	PASS	AF=0.545455;AO=29;DP=54;FAO=30;FDP=55;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.0109563;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.93;QD=20.9376;RBI=0.0109833;REFB=-0.0328718;REVB=0.000769931;RO=25;SAF=11;SAR=18;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120173;STB=0.572097;STBP=0.256;TYPE=snp;VARB=0.0232492;OID=.;OPOS=167489093;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:55:25:25:29:30:0.545455:18:11:13:12:19:11:13:12
chr5	167674370	.	C	T	389.44	PASS	AF=0.573529;AO=38;DP=67;FAO=39;FDP=68;FR=.;FRO=29;FSAF=14;FSAR=25;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.00807782;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126;QD=22.908;RBI=0.0588939;REFB=-0.00646621;REVB=0.0583373;RO=29;SAF=14;SAR=24;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121064;STB=0.57038;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=0.00639757;OID=.;OPOS=167674370;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:68:29:29:38:39:0.573529:24:14:15:14:25:14:15:14
chr5	167850748	.	A	G	2281.48	PASS	AF=0.986395;AO=145;DP=147;FAO=145;FDP=147;FR=.;FRO=2;FSAF=73;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0353279;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.519;QD=62.0812;RBI=0.0391582;REFB=-0.0874421;REVB=0.0168909;RO=2;SAF=73;SAR=72;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0130251;STB=0.506848;STBP=0.253;TYPE=snp;VARB=0.000272152;OID=.;OPOS=167850748;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:147:147:2:2:145:145:0.986395:72:73:0:2:72:73:0:2
chr5	167868741	.	C	T	420.87	PASS	AF=0.44;AO=43;DP=99;FAO=44;FDP=100;FR=.;FRO=56;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=25;FSRR=31;FWDB=0.00185509;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.393;QD=16.8348;RBI=0.0197608;REFB=-0.00261905;REVB=-0.0196735;RO=56;SAF=18;SAR=25;SRF=25;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0286155;STB=0.508314;STBP=0.884;TYPE=snp;VARB=0.0036331;OID=.;OPOS=167868741;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:100:56:56:43:44:0.44:25:18:25:31:25:19:25:31
chr5	167868779	.	A	G	335.46	PASS	AF=0.455696;AO=36;DP=79;FAO=36;FDP=79;FR=.;FRO=43;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=-0.0463686;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=198.125;QD=16.9851;RBI=0.046376;REFB=-0.00663276;REVB=0.000830033;RO=43;SAF=15;SAR=21;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0705484;STB=0.539592;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=0.00649098;OID=.;OPOS=167868779;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:43:43:36:36:0.455696:21:15:21:22:21:15:21:22
chr5	167868809	.	C	T	242.43	PASS	AF=0.430769;AO=28;DP=65;FAO=28;FDP=65;FR=.;FRO=37;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=0.0740916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.753;QD=14.9185;RBI=0.0741358;REFB=0.00487627;REVB=0.00255952;RO=37;SAF=12;SAR=16;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.085779;STB=0.548638;STBP=0.539;TYPE=snp;VARB=-0.00590615;OID=.;OPOS=167868809;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:37:37:28:28:0.430769:16:12:19:18:16:12:19:18
chr5	167891830	.	T	C	342.83	PASS	AF=0.546875;AO=35;DP=64;FAO=35;FDP=64;FR=.;FRO=29;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=0.00153419;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.276;QD=21.4269;RBI=0.0148935;REFB=-0.0109202;REVB=-0.0148142;RO=29;SAF=20;SAR=15;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0164345;STB=0.509086;STBP=0.877;TYPE=snp;VARB=0.00602268;OID=.;OPOS=167891830;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:29:29:35:35:0.546875:15:20:16:13:15:20:16:13
chr5	167913510	.	G	A	206.91	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0254877;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.766;QD=48.684;RBI=0.0608194;REFB=0;REVB=0.0552211;RO=0;SAF=6;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000557398;OID=.;OPOS=167913510;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:11:6:0:0:11:6:0:0
chr5	167915643	.	C	T	107.41	PASS	AF=0.382353;AO=13;DP=34;FAO=13;FDP=34;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=-0.000158729;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.179;QD=12.637;RBI=0.0704786;REFB=-0.000810144;REVB=-0.0704785;RO=21;SAF=6;SAR=7;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.213434;STB=0.624816;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=0.00140122;OID=.;OPOS=167915643;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:21:21:13:13:0.382353:7:6:14:7:7:6:14:7
chr5	167943827	.	G	A	1000.58	PASS	AF=0.985714;AO=68;DP=70;FAO=69;FDP=70;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0150412;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.876;QD=57.1762;RBI=0.015831;REFB=-0.103437;REVB=0.00493774;RO=0;SAF=30;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506327;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=0.000136954;OID=.;OPOS=167943827;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:70:70:0:1:68:69:0.985714:38:30:0:0:39:30:0:1
chr5	167957055	.	G	A	670.27	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156701;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=167.614;QD=62.3508;RBI=0.0216914;REFB=0;REVB=0.0149988;RO=0;SAF=8;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.54187e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000128902;OID=.;OPOS=167957055;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:35:8:0:0:35:8:0:0
chr5	168093522	.	G	A	61.8	PASS	AF=0.264706;AO=9;DP=33;FAO=9;FDP=34;FR=.;FRO=25;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.00503977;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.477;QD=7.2706;RBI=0.00551614;REFB=-0.0102091;REVB=-0.00224243;RO=24;SAF=4;SAR=5;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0646411;STB=0.555432;STBP=0.75;TYPE=snp;VARB=0.0222176;OID=.;OPOS=168093522;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:33:34:24:25:9:9:0.264706:5:4:12:12:5:4:13:12
chr5	168098463	.	A	G	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108969;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.817;QD=55.0986;RBI=0.022977;REFB=0;REVB=-0.0202288;RO=0;SAF=8;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.28381e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.79225e-05;OID=.;OPOS=168098463;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:18:8:0:0:18:8:0:0
chr5	168212951	.	A	G	377.86	PASS	AF=0.965517;AO=26;DP=27;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.1356;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.6295;QD=52.119;RBI=0.136001;REFB=-0.105257;REVB=0.0104416;RO=1;SAF=19;SAR=7;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0617811;STB=0.533309;STBP=0.161;TYPE=snp;VARB=0.00312809;OID=.;OPOS=168212951;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:27:29:1:1:26:28:0.965517:7:19:0:1:7:21:0:1
chr5	168233474	.	G	A	239.82	PASS	AF=0.490566;AO=26;DP=52;FAO=26;FDP=53;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.00121064;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.333;QD=18.0997;RBI=0.00510001;REFB=-0.0164443;REVB=-0.00495424;RO=25;SAF=12;SAR=14;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0902886;STB=0.527838;STBP=0.676;TYPE=snp;VARB=0.0128578;OID=.;OPOS=168233474;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:53:25:27:26:26:0.490566:14:12:9:16:14:12:11:16
chr5	168250350	.	C	G	249.37	PASS	AF=1;AO=19;DP=20;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0801798;FXX=0.0951928;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.378;QD=52.4978;RBI=0.0861656;REFB=0;REVB=0.0315549;RO=0;SAF=12;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.77769e-05;OID=.;OPOS=168250350;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:19:0:0:19:19:1:7:12:0:0:7:12:0:0
chr5	168671698	.	A	T	2220.61	PASS	AF=1;AO=140;DP=141;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00406359;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.125;QD=62.9961;RBI=0.0235105;REFB=0;REVB=-0.0231566;RO=0;SAF=76;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.33035e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.90837e-05;OID=.;OPOS=168671698;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:141:141:0:0:140:141:1:64:76:0:0:64:77:0:0
chr5	168690612	.	A	G	3634.74	PASS	AF=1;AO=229;DP=229;FAO=230;FDP=230;FR=.;FRO=0;FSAF=124;FSAR=106;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0045588;FXX=0.00862032;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.256;QD=63.2129;RBI=0.0185394;REFB=0;REVB=-0.0179701;RO=0;SAF=123;SAR=106;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.50233e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000542565;OID=.;OPOS=168690612;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:20:229:230:0:0:229:230:1:106:123:0:0:106:124:0:0
chr5	169021610	.	C	T	208.86	PASS	AF=0.45098;AO=23;DP=51;FAO=23;FDP=51;FR=.;FRO=28;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.00745809;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.727;QD=16.381;RBI=0.0140194;REFB=-0.0218241;REVB=-0.011871;RO=28;SAF=13;SAR=10;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.063522;STB=0.536051;STBP=0.641;TYPE=snp;VARB=0.0313727;OID=.;OPOS=169021610;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:28:28:23:23:0.45098:10:13:14:14:10:13:14:14
chr5	169028481	.	T	C	269.87	PASS	AF=0.531915;AO=25;DP=47;FAO=25;FDP=47;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=20;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=0.001034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.814;QD=22.9679;RBI=0.0443074;REFB=0.00459669;REVB=0.0442953;RO=22;SAF=5;SAR=20;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.22879;STB=0.629099;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=-0.00417583;OID=.;OPOS=169028481;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:22:22:25:25:0.531915:20:5:9:13:20:5:9:13
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chr5	170215670	.	G	A	161.65	PASS	AF=0.38;AO=19;DP=52;FAO=19;FDP=50;FR=.;FRO=31;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=20;FWDB=0.00358722;FXX=0.0384541;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.849;QD=12.9319;RBI=0.00386388;REFB=-0.0154488;REVB=0.00143575;RO=33;SAF=8;SAR=11;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0304564;STB=0.542626;STBP=0.676;TYPE=snp;VARB=0.0242758;OID=.;OPOS=170215670;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:50:33:31:19:19:0.38:11:8:13:20:11:8:11:20
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chr5	171481606	.	A	G	198.71	PASS	AF=0.487805;AO=20;DP=41;FAO=20;FDP=41;FR=.;FRO=21;FSAF=18;FSAR=2;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=-0.00206268;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.337;QD=19.3862;RBI=0.0208929;REFB=-0.0226548;REVB=-0.0207908;RO=20;SAF=18;SAR=2;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.429905;STB=0.767108;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.0189392;OID=.;OPOS=171481606;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:20:21:20:20:0.487805:2:18:12:8:2:18:12:9
chr5	171533629	.	A	G	221.99	PASS	AF=0.468085;AO=21;DP=46;FAO=22;FDP=47;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=7;FWDB=0.0125052;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.187;QD=18.8923;RBI=0.0125078;REFB=-0.0158094;REVB=-0.000254092;RO=22;SAF=13;SAR=8;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0613533;STB=0.572832;STBP=0.379;TYPE=snp;VARB=0.0193029;OID=.;OPOS=171533629;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:47:22:25:21:22:0.468085:8:13:15:7:9:13:18:7
chr5	171533656	.	C	T	343.15	PASS	AF=0.486486;AO=36;DP=75;FAO=36;FDP=74;FR=.;FRO=38;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=26;FSRR=12;FWDB=0.000714817;FXX=0.0133316;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.071;QD=18.5487;RBI=0.0153677;REFB=-0.00966847;REVB=0.0153511;RO=38;SAF=19;SAR=17;SRF=26;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146266;STB=0.581263;STBP=0.198;TYPE=snp;VARB=0.0126792;OID=.;OPOS=171533656;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:74:38:38:36:36:0.486486:17:19:26:12:17:19:26:12
chr5	171533782	.	T	C	493.28	PASS	AF=0.534091;AO=47;DP=88;FAO=47;FDP=88;FR=.;FRO=41;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=16;FSRR=25;FWDB=-0.0198013;FXX=0.0112347;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.862;QD=22.4219;RBI=0.0313189;REFB=0.0221107;REVB=0.0242649;RO=41;SAF=25;SAR=22;SRF=16;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119337;STB=0.565692;STBP=0.209;TYPE=snp;VARB=-0.0208545;OID=.;OPOS=171533782;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:41:41:47:47:0.534091:22:25:16:25:22:25:16:25
chr5	171636926	.	C	T	69.68	PASS	AF=0.232558;AO=10;DP=43;FAO=10;FDP=43;FR=.;FRO=33;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=0.0054588;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.539;QD=6.48146;RBI=0.0150089;REFB=0.00010925;REVB=-0.013981;RO=33;SAF=6;SAR=4;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0076195;STB=0.504845;STBP=0.994;TYPE=snp;VARB=-0.000500033;OID=.;OPOS=171636926;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:69:43:43:33:33:10:10:0.232558:4:6:20:13:4:6:20:13
chr5	171760569	.	A	G	170.02	PASS	AF=0.439024;AO=18;DP=40;FAO=18;FDP=41;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=0.0415537;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=183.574;QD=16.5874;RBI=0.0442682;REFB=-0.00124315;REVB=-0.0152632;RO=22;SAF=10;SAR=8;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.182845;STB=0.614849;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=0.00492467;OID=.;OPOS=171760569;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:41:22:23:18:18:0.439024:8:10:8:14:8:10:8:15
chr5	171849471	.	G	A	516.12	PASS	AF=1;AO=34;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0294481;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.223;QD=58.9852;RBI=0.0298554;REFB=0;REVB=-0.00491453;RO=0;SAF=22;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.75716e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000262512;OID=.;OPOS=171849471;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:34:35:1:12:22:0:0:12:23:0:0
chr5	172196711	.	G	T	520.03	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0181188;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.765;QD=59.4321;RBI=0.0613053;REFB=0;REVB=0.0585666;RO=0;SAF=11;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000294015;OID=.;OPOS=172196711;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:24:11:0:0:24:11:0:0
chr5	172294193	.	C	T	171.12	PASS	AF=0.439024;AO=18;DP=42;FAO=18;FDP=41;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=6;FWDB=0.024668;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.951;QD=16.6944;RBI=0.036328;REFB=0.0119429;REVB=0.0266687;RO=22;SAF=10;SAR=8;SRF=17;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.219509;STB=0.606631;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=-0.00515332;OID=.;OPOS=172294193;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:41:22:23:18:18:0.439024:8:10:17:5:8:10:17:6
chr5	172294513	.	G	A	50.47	PASS	AF=0.583333;AO=7;DP=12;FAO=7;FDP=12;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.0173731;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.8395;QD=16.8226;RBI=0.0557049;REFB=0.000969865;REVB=-0.0529264;RO=5;SAF=4;SAR=3;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121017;STB=0.571224;STBP=0.651;TYPE=snp;VARB=-0.00708659;OID=.;OPOS=172294513;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:12:12:5:5:7:7:0.583333:3:4:2:3:3:4:2:3
chr5	172381973	.	A	AGGT,T	697.78	PASS	AF=0.87931,0.0517241;AO=50,2;DP=57;FAO=51,3;FDP=58;FR=.;FRO=4;FSAF=23,3;FSAR=28,0;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.000759212,-0.00796147;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=3,1;MLLD=246.925,59.3266;QD=48.1229;RBI=0.0147574,0.0229906;REFB=-0.0390872,0.00119566;REVB=0.0147378,-0.0215681;RO=4;SAF=23,2;SAR=27,0;SRF=4;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0751116,0;STB=0.539984,0.5;STBP=0.05,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.000894013,0.0247374;OID=.,.;OPOS=172381974,172381973;OREF=-,A;OALT=GGT,T;OMAPALT=AGGT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:17:57:58:4:4:50,2:51,3:0.87931,0.0517241:27,0:23,2:4:0:28,0:23,3:4:0
chr5	172447762	.	G	A	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0177405;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.525;QD=55.0987;RBI=0.0412646;REFB=0;REVB=-0.0372565;RO=0;SAF=12;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000434326;OID=.;OPOS=172447762;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:14:12:0:0:14:12:0:0
chr5	172631051	.	T	G	179.73	PASS	AF=0.580645;AO=18;DP=31;FAO=18;FDP=31;FR=.;FRO=13;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=0.0674914;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.6105;QD=23.1912;RBI=0.0800709;REFB=-0.0342077;REVB=-0.0430843;RO=13;SAF=10;SAR=8;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10519;STB=0.55876;STBP=0.449;TYPE=snp;VARB=0.025323;OID=.;OPOS=172631051;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:13:13:18:18:0.580645:8:10:9:4:8:10:9:4
chr5	172662024	.	T	C	149.75	PASS	AF=0.714286;AO=15;DP=21;FAO=15;FDP=21;FR=.;FRO=6;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.00494049;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.565;QD=28.5246;RBI=0.0125381;REFB=-0.00352056;REVB=-0.0115237;RO=6;SAF=12;SAR=3;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0991174;STB=0.555477;STBP=0.537;TYPE=snp;VARB=0.00111128;OID=.;OPOS=172662024;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:21:21:6:6:15:15:0.714286:3:12:4:2:3:12:4:2
chr5	172681229	.	G	A	104.31	PASS	AF=0.317073;AO=12;DP=40;FAO=13;FDP=41;FR=.;FRO=28;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=24;FWDB=0.0536158;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.8301;QD=10.1768;RBI=0.0556032;REFB=0.00192908;REVB=-0.0147331;RO=28;SAF=2;SAR=10;SRF=4;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0517432;STB=0.514684;STBP=0.945;TYPE=snp;VARB=-0.00218617;OID=.;OPOS=172681229;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:41:28:28:12:13:0.317073:10:2:4:24:11:2:4:24
chr5	172750436	.	G	A	244.6	PASS	AF=0.482143;AO=26;DP=56;FAO=27;FDP=56;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.00107733;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.352;QD=17.4712;RBI=0.00453802;REFB=-0.0216033;REVB=0.00440829;RO=29;SAF=11;SAR=15;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0566037;STB=0.519985;STBP=0.767;TYPE=snp;VARB=0.00646513;OID=.;OPOS=172750436;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:29:29:26:27:0.482143:15:11:14:15:15:12:14:15
chr5	172789203	.	T	C	416.59	PASS	AF=0.494118;AO=41;DP=85;FAO=42;FDP=85;FR=.;FRO=43;FSAF=28;FSAR=14;FSRF=28;FSRR=15;FWDB=0.00184373;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.937;QD=19.6043;RBI=0.0159421;REFB=-0.012644;REVB=0.0158351;RO=42;SAF=28;SAR=13;SRF=28;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0169602;STB=0.508768;STBP=0.893;TYPE=snp;VARB=0.0137014;OID=.;OPOS=172789203;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:42:43:41:42:0.494118:13:28:28:14:14:28:28:15
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chr5	173376506	.	A	G	273.91	PASS	AF=0.47619;AO=29;DP=64;FAO=30;FDP=63;FR=.;FRO=33;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=0.0182394;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.2889;QD=17.3914;RBI=0.0200669;REFB=-0.0170733;REVB=0.00836693;RO=31;SAF=14;SAR=15;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0586526;STB=0.523794;STBP=0.75;TYPE=snp;VARB=0.0162582;OID=.;OPOS=173376506;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:63:31:33:29:30:0.47619:15:14:13:18:15:15:15:18
chr5	174156168	.	T	C	594.51	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0166487;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.347;QD=60.9753;RBI=0.0195781;REFB=0;REVB=0.0103015;RO=0;SAF=22;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000114828;OID=.;OPOS=174156168;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:17:22:0:0:17:22:0:0
chr5	174422374	.	C	T	295.32	PASS	AF=0.492308;AO=31;DP=64;FAO=32;FDP=65;FR=.;FRO=33;FSAF=23;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=0.0425816;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.495;QD=18.1734;RBI=0.0452155;REFB=-0.00666433;REVB=-0.0152069;RO=33;SAF=22;SAR=9;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.301654;STB=0.672945;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.0108352;OID=.;OPOS=174422374;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:65:33:33:31:32:0.492308:9:22:13:20:9:23:13:20
chr5	174868840	.	T	C	805.17	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00191543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.533;QD=64.4134;RBI=0.0121141;REFB=0;REVB=0.0119617;RO=0;SAF=23;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.97509e-05;OID=.;OPOS=174868840;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:27:23:0:0:27:23:0:0
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chr5	174937193	.	C	T	83.08	PASS	AF=0.314286;AO=11;DP=35;FAO=11;FDP=35;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=-0.00397243;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.725;QD=9.49433;RBI=0.00469982;REFB=-0.0105205;REVB=0.00251159;RO=24;SAF=6;SAR=5;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00430506;STB=0.502613;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0279432;OID=.;OPOS=174937193;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:35:35:24:24:11:11:0.314286:5:6:13:11:5:6:13:11
chr5	175110779	.	G	A	287.6	PASS	AF=0.444444;AO=32;DP=72;FAO=32;FDP=72;FR=.;FRO=40;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=26;FSRR=14;FWDB=-0.0364837;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.117;QD=15.9777;RBI=0.0364883;REFB=-0.0129215;REVB=-0.000580277;RO=39;SAF=19;SAR=13;SRF=25;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0483619;STB=0.532767;STBP=0.684;TYPE=snp;VARB=0.0157182;OID=.;OPOS=175110779;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:39:40:32:32:0.444444:13:19:25:14:13:19:26:14
chr5	175130907	.	A	T	279.32	PASS	AF=0.508475;AO=30;DP=59;FAO=30;FDP=59;FR=.;FRO=29;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=0.00881859;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.1019;QD=18.9367;RBI=0.0129155;REFB=0.00503267;REVB=-0.00943628;RO=29;SAF=20;SAR=10;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.284919;STB=0.658984;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=-0.00482497;OID=.;OPOS=175130907;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:29:29:30:30:0.508475:10:20:10:19:10:20:10:19
chr5	175307256	.	TT	CC,CT	203.15	PASS	AF=0.117647,0.882353;AO=2,15;DP=17;FAO=2,15;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=2,5;FSAR=0,10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0443582,-0.0937726;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=2,1;MLLD=134.451,54.6917;QD=47.7989;RBI=0.05393,0.0943272;REFB=0,0;REVB=-0.0306724,0.0102132;RO=0;SAF=2,5;SAR=0,10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0331546,-0.0136328;OID=.,.;OPOS=175307256,175307256;OREF=TT,T;OALT=CC,C;OMAPALT=CC,CT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:10:17:17:0:0:2,15:2,15:0.117647,0.882353:0,10:2,5:0:0:0,10:2,5:0:0
chr5	175307373	.	G	A	391.6	PASS	AF=0.549296;AO=39;DP=71;FAO=39;FDP=71;FR=.;FRO=32;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=0.00784059;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.0004;QD=22.0618;RBI=0.0325687;REFB=0.00233578;REVB=0.0316109;RO=32;SAF=20;SAR=19;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0104771;STB=0.505777;STBP=0.957;TYPE=snp;VARB=-0.00193062;OID=.;OPOS=175307373;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:32:32:39:39:0.549296:19:20:16:16:19:20:16:16
chr5	175307969	.	G	A	38.57	PASS	AF=0.428571;AO=6;DP=14;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.0139911;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.306;QD=11.0203;RBI=0.020183;REFB=-0.00114029;REVB=0.0145466;RO=8;SAF=1;SAR=5;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.264432;STB=0.66603;STBP=0.378;TYPE=snp;VARB=0.00155579;OID=.;OPOS=175307969;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:14:14:8:8:6:6:0.428571:5:1:3:5:5:1:3:5
chr5	175308022	.	A	G	224.22	PASS	AF=0.904762;AO=19;DP=21;FAO=19;FDP=21;FR=.;FRO=2;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0274239;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.111;QD=42.7089;RBI=0.028612;REFB=0.0264613;REVB=-0.00815951;RO=2;SAF=9;SAR=10;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00460898;STB=0.50251;STBP=0.871;TYPE=snp;VARB=-0.00268392;OID=.;OPOS=175308022;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:21:21:2:2:19:19:0.904762:10:9:1:1:10:9:1:1
chr5	175308768	.	G	A	191.54	PASS	AF=0.558824;AO=19;DP=34;FAO=19;FDP=34;FR=.;FRO=15;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=0.0104027;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.523;QD=22.5346;RBI=0.024381;REFB=-0.00744225;REVB=-0.0220503;RO=15;SAF=12;SAR=7;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.283014;STB=0.658373;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.00467845;OID=.;OPOS=175308768;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:15:15:19:19:0.558824:7:12:4:11:7:12:4:11
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chr5	175309601	.	G	A	142.84	PASS	AF=0.346939;AO=13;DP=54;FAO=17;FDP=49;FR=.;FRO=32;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=26;FSRR=6;FWDB=-0.00114398;FXX=0.155146;HRUN=4;LEN=1;MLLD=113.297;QD=11.6604;RBI=0.013763;REFB=-0.00986621;REVB=0.0137153;RO=28;SAF=4;SAR=9;SRF=23;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.537424;STB=0.775061;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.0433346;OID=.;OPOS=175309601;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:49:28:32:13:17:0.346939:9:4:23:5:11:6:26:6
chr5	175511992	.	C	T	164.39	PASS	AF=0.375;AO=18;DP=48;FAO=18;FDP=48;FR=.;FRO=30;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=-0.00512205;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.885;QD=13.699;RBI=0.0093021;REFB=-0.00830966;REVB=0.0077649;RO=30;SAF=7;SAR=11;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.063912;STB=0.537088;STBP=0.748;TYPE=snp;VARB=0.0137975;OID=.;OPOS=175511992;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:30:30:18:18:0.375:11:7:10:20:11:7:10:20
chr5	175530790	.	A	G	100.21	PASS	AF=0.186813;AO=17;DP=91;FAO=17;FDP=91;FR=.;FRO=74;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=40;FSRR=34;FWDB=0.0269727;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.9202;QD=4.4048;RBI=0.0404508;REFB=0.00366078;REVB=-0.0301453;RO=74;SAF=10;SAR=7;SRF=40;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0610457;STB=0.539427;STBP=0.734;TYPE=snp;VARB=-0.0163302;OID=.;OPOS=175530790;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:74:74:17:17:0.186813:7:10:40:34:7:10:40:34
chr5	175811094	.	C	CGT	232.57	PASS	AF=0.52381;AO=22;DP=50;FAO=22;FDP=42;FR=.;FRO=20;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.0207306;FXX=0.0454442;HRUN=1;LEN=2;MLLD=200.914;QD=22.1492;RBI=0.0328005;REFB=-0.0244319;REVB=0.0254188;RO=26;SAF=11;SAR=11;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0734584;STB=0.523788;STBP=0.745;TYPE=ins;VARB=0.0194347;OID=.;OPOS=175811095;OREF=-;OALT=GT;OMAPALT=CGT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.52381:22:50:22:42:20:11:11:11:9:99:26:11:11:15:11
chr5	175955814	.	A	G	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00434257;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.361;QD=37.4885;RBI=0.00434257;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=8;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.46359e-05;OID=.;OPOS=175955814;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:0:8:0:0:0:8:0:0
chr5	175956271	.	A	C	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0114309;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.138;QD=59.4356;RBI=0.019286;REFB=0;REVB=-0.0155333;RO=0;SAF=17;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.58055e-06;OID=.;OPOS=175956271;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:18:17:0:0:18:17:0:0
chr5	175998246	.	T	C	246.84	PASS	AF=0.490909;AO=27;DP=55;FAO=27;FDP=55;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=-0.00472939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.535;QD=17.9522;RBI=0.0050159;REFB=-0.0154991;REVB=0.00167097;RO=27;SAF=7;SAR=20;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156499;STB=0.601186;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=0.0152295;OID=.;OPOS=175998246;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:27:28:27:27:0.490909:20:7:11:16:20:7:12:16
chr5	176002144	.	A	C	538.42	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0170383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.147;QD=59.8242;RBI=0.0287367;REFB=0;REVB=-0.0231407;RO=0;SAF=31;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.57482e-05;OID=.;OPOS=176002144;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:5:31:0:0:5:31:0:0
chr5	176004476	.	T	C	144.19	PASS	AF=1;AO=12;DP=14;FAO=13;FDP=13;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0377814;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.4169;QD=44.3668;RBI=0.113146;REFB=0;REVB=0.106652;RO=0;SAF=7;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00327519;OID=.;OPOS=176004476;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:13:0:0:12:13:1:5:7:0:0:6:7:0:0
chr5	176004703	.	C	T	212.81	PASS	AF=0.5;AO=21;DP=42;FAO=21;FDP=42;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.0246418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.4039;QD=20.2679;RBI=0.0611485;REFB=-0.0136342;REVB=0.0559636;RO=21;SAF=11;SAR=10;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0421918;STB=0.523787;STBP=0.777;TYPE=snp;VARB=0.0192558;OID=.;OPOS=176004703;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:21:21:21:21:0.5:10:11:10:11:10:11:10:11
chr5	176005477	.	C	T	144.78	PASS	AF=0.410256;AO=16;DP=40;FAO=16;FDP=39;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=0.0265867;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.02;QD=14.8493;RBI=0.0265869;REFB=-0.000947825;REVB=8.84874e-05;RO=23;SAF=9;SAR=7;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0942034;STB=0.554389;STBP=0.635;TYPE=snp;VARB=0.000990594;OID=.;OPOS=176005477;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:39:23:23:16:16:0.410256:7:9:15:8:7:9:15:8
chr5	176011264	.	T	C	244.35	PASS	AF=0.547619;AO=23;DP=42;FAO=23;FDP=42;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=0.00236032;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.927;QD=23.2716;RBI=0.0108176;REFB=-0.0237708;REVB=-0.010557;RO=18;SAF=9;SAR=14;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00199679;STB=0.514027;STBP=0.845;TYPE=snp;VARB=0.0247033;OID=.;OPOS=176011264;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:18:19:23:23:0.547619:14:9:7:11:14:9:8:11
chr5	176017455	.	C	T	178.44	PASS	AF=0.387755;AO=19;DP=49;FAO=19;FDP=49;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=-0.0102883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.823;QD=14.5663;RBI=0.0102902;REFB=0.00419773;REVB=-0.000197431;RO=29;SAF=11;SAR=8;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.24096;STB=0.627776;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=-0.00897897;OID=.;OPOS=176017455;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:29:30:19:19:0.387755:8:11:10:19:8:11:11:19
chr5	176017639	.	C	A	436.39	PASS	AF=0.433628;AO=49;DP=113;FAO=49;FDP=113;FR=.;FRO=64;FSAF=29;FSAR=20;FSRF=34;FSRR=30;FWDB=0.00114989;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.687;QD=15.4473;RBI=0.00974633;REFB=-0.017009;REVB=0.00967826;RO=63;SAF=29;SAR=20;SRF=33;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0696093;STB=0.535041;STBP=0.54;TYPE=snp;VARB=0.0247435;OID=.;OPOS=176017639;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:113:63:64:49:49:0.433628:20:29:33:30:20:29:34:30
chr5	176024880	.	C	T	760.77	PASS	AF=0.964912;AO=55;DP=57;FAO=55;FDP=57;FR=.;FRO=2;FSAF=14;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0182611;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=288.983;QD=53.3876;RBI=0.0193404;REFB=-0.0959839;REVB=0.00637023;RO=2;SAF=14;SAR=41;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0211271;STB=0.511218;STBP=0.548;TYPE=snp;VARB=0.000353041;OID=.;OPOS=176024880;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:57:57:2:2:55:55:0.964912:41:14:1:1:41:14:1:1
chr5	176025938	.	T	C	575.74	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0033711;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.577;QD=60.6044;RBI=0.0186515;REFB=0;REVB=-0.0183444;RO=0;SAF=24;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.76123e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.56336e-05;OID=.;OPOS=176025938;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:14:24:0:0:14:24:0:0
chr5	176026138	.	T	A	33.65	PASS	AF=0.1875;AO=6;DP=29;FAO=6;FDP=32;FR=.;FRO=26;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=-0.0653109;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.837;QD=4.20607;RBI=0.0755129;REFB=-0.0130587;REVB=-0.0379037;RO=23;SAF=1;SAR=5;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.3641;STB=0.749064;STBP=0.24;TYPE=snp;VARB=0.118833;OID=.;OPOS=176026138;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:29:32:23:26:6:6:0.1875:5:1:10:13:5:1:11:15
chr5	176026143	.	C	T	45.88	PASS	AF=0.233333;AO=6;DP=29;FAO=7;FDP=30;FR=.;FRO=23;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=0.0794601;FXX=0.0624805;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.0598;QD=6.11798;RBI=0.0935237;REFB=-0.0100362;REVB=0.0493232;RO=23;SAF=1;SAR=5;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.3641;STB=0.775565;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=0.0258481;OID=.;OPOS=176026143;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:29:30:23:23:6:7:0.233333:5:1:10:13:6:1:10:13
chr5	176026146	.	C	T	46.99	PASS	AF=0.266667;AO=9;DP=31;FAO=8;FDP=30;FR=.;FRO=22;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.0264057;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.655;QD=6.26537;RBI=0.026543;REFB=-0.0224132;REVB=-0.00269547;RO=22;SAF=2;SAR=7;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.298292;STB=0.666222;STBP=0.343;TYPE=snp;VARB=0.052877;OID=.;OPOS=176026146;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:31:30:22:22:9:8:0.266667:7:2:10:12:6:2:10:12
chr5	176047761	.	G	A	69.28	PASS	AF=0.888889;AO=8;DP=9;FAO=8;FDP=9;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0203133;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=204.222;QD=30.7904;RBI=0.0260798;REFB=-0.0218148;REVB=0.0163562;RO=1;SAF=4;SAR=4;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0978599;STB=0.555418;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.00375571;OID=.;OPOS=176047761;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:9:9:1:1:8:8:0.888889:4:4:1:0:4:4:1:0
chr5	176053622	.	G	A	40.29	PASS	AF=0.545455;AO=6;DP=11;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.101084;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.8758;QD=14.6523;RBI=0.106316;REFB=0.00489157;REVB=0.0329416;RO=5;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.333798;STB=0.691819;STBP=0.354;TYPE=snp;VARB=0.00756306;OID=.;OPOS=176053622;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:11:11:5:5:6:6:0.545455:4:2:0:5:4:2:0:5
chr5	176069831	.	G	A	1553.89	PASS	AF=1;AO=94;DP=94;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.069306;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.0863;QD=63.4243;RBI=0.069306;REFB=0;REVB=-3.94976e-05;RO=0;SAF=26;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.91088e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000126403;OID=.;OPOS=176069831;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:94:98:0:0:94:98:1:68:26:0:0:68:30:0:0
chr5	176081907	.	C	T	195.37	PASS	AF=0.337838;AO=25;DP=74;FAO=25;FDP=74;FR=.;FRO=49;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=27;FSRR=22;FWDB=0.0330171;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.9851;QD=10.5606;RBI=0.0330193;REFB=0.00468568;REVB=-0.000380486;RO=49;SAF=13;SAR=12;SRF=27;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0353395;STB=0.520591;STBP=0.792;TYPE=snp;VARB=-0.00805536;OID=.;OPOS=176081907;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:49:49:25:25:0.337838:12:13:27:22:12:13:27:22
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chr5	176314459	.	G	A	54.32	PASS	AF=0.32;AO=8;DP=25;FAO=8;FDP=25;FR=.;FRO=17;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=0.0114944;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.578;QD=8.69148;RBI=0.0430815;REFB=-0.00479656;REVB=0.0415198;RO=17;SAF=3;SAR=5;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.351886;STB=0.713796;STBP=0.18;TYPE=snp;VARB=0.0162133;OID=.;OPOS=176314459;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:25:25:17:17:8:8:0.32:5:3:12:5:5:3:12:5
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chr5	176402401	.	G	A	268.26	PASS	AF=0.430556;AO=29;DP=69;FAO=31;FDP=72;FR=.;FRO=41;FSAF=23;FSAR=8;FSRF=22;FSRR=19;FWDB=0.00758137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.362;QD=14.9033;RBI=0.0995935;REFB=-0.0174934;REVB=-0.0993045;RO=40;SAF=21;SAR=8;SRF=21;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.223716;STB=0.632936;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=0.0156903;OID=.;OPOS=176402401;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:72:40:41:29:31:0.430556:8:21:21:19:8:23:22:19
chr5	176516631	.	G	A	278.47	PASS	AF=0.449275;AO=31;DP=69;FAO=31;FDP=69;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=25;FWDB=-0.00506301;FXX=0.0142837;HRUN=5;LEN=1;MLLD=190.355;QD=16.143;RBI=0.0139618;REFB=-0.0259831;REVB=0.0130115;RO=38;SAF=15;SAR=16;SRF=13;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139847;STB=0.578502;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=0.0272888;OID=.;OPOS=176516631;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:38:38:31:31:0.449275:16:15:13:25:16:15:13:25
chr5	176517170	.	G	A	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0164288;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.943;QD=45.8068;RBI=0.0359306;REFB=0;REVB=-0.0319547;RO=0;SAF=5;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000187577;OID=.;OPOS=176517170;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:9:5:0:0:9:5:0:0
chr5	176517292	.	A	G	592.06	PASS	AF=0.97561;AO=39;DP=40;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0257225;FXX=0.0238039;HRUN=3;LEN=1;MLLD=103.693;QD=57.7615;RBI=0.0630553;REFB=0.00433645;REVB=-0.0575702;RO=1;SAF=18;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0218009;STB=0.511622;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.00010171;OID=.;OPOS=176517292;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:40:41:1:1:39:40:0.97561:21:18:0:1:21:19:0:1
chr5	176517326	.	T	C	632.26	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0150291;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=264.049;QD=61.684;RBI=0.0205037;REFB=0;REVB=0.0139473;RO=0;SAF=20;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.6143e-06;OID=.;OPOS=176517326;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:21:20:0:0:21:20:0:0
chr5	176517461	.	T	G	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00500475;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.63;QD=53.2771;RBI=0.0444973;REFB=0;REVB=0.044215;RO=0;SAF=17;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.9951e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000208596;OID=.;OPOS=176517461;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:6:17:0:0:6:17:0:0
chr5	176517797	.	C	T	772.78	PASS	AF=0.98;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00543678;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=247.487;QD=61.8223;RBI=0.0055034;REFB=-0.0554545;REVB=-0.000853704;RO=0;SAF=31;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.58521e-08;STB=0.513508;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=0.000153794;OID=.;OPOS=176517797;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:50:50:0:1:49:49:0.98:18:31:0:0:18:31:0:1
chr5	176518784	.	C	T	785.89	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0213009;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.165;QD=64.1539;RBI=0.0223212;REFB=0;REVB=0.00667134;RO=0;SAF=26;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.25022e-05;OID=.;OPOS=176518784;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:23:26:0:0:23:26:0:0
chr5	176520243	.	G	A	67.42	PASS	AF=0.45;AO=9;DP=20;FAO=9;FDP=20;FR=.;FRO=11;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.0219424;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=142.954;QD=13.4839;RBI=0.0243968;REFB=-0.0198206;REVB=-0.0106646;RO=11;SAF=1;SAR=8;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.447363;STB=0.77345;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.0385224;OID=.;OPOS=176520243;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:20:20:11:11:9:9:0.45:8:1:5:6:8:1:5:6
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chr5	176831826	.	C	G	1563.08	PASS	AF=0.990654;AO=102;DP=105;FAO=106;FDP=107;FR=.;FRO=1;FSAF=60;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0105612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.235;QD=58.433;RBI=0.0225789;REFB=0.0104317;REVB=0.0199567;RO=0;SAF=59;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504131;STBP=0.494;TYPE=snp;VARB=-1.46046e-05;OID=.;OPOS=176831826;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:105:107:0:1:102:106:0.990654:43:59:0:0:46:60:1:0
chr5	176863519	.	G	C	394.29	PASS	AF=0.5125;AO=38;DP=76;FAO=41;FDP=80;FR=.;FRO=39;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=24;FSRR=15;FWDB=0.001442;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.621;QD=19.7144;RBI=0.013183;REFB=-0.0215331;REVB=-0.0131039;RO=38;SAF=21;SAR=17;SRF=23;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0481651;STB=0.52709;STBP=0.665;TYPE=snp;VARB=0.0197267;OID=.;OPOS=176863519;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:80:38:39:38:41:0.5125:17:21:23:15:18:23:24:15
chr5	176867943	.	A	G	127.2	PASS	AF=0.340909;AO=15;DP=44;FAO=15;FDP=44;FR=.;FRO=29;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=0.00431744;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.2404;QD=11.5633;RBI=0.0269764;REFB=-0.00386183;REVB=-0.0266286;RO=29;SAF=5;SAR=10;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.245901;STB=0.645956;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.00355988;OID=.;OPOS=176867943;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:29:29:15:15:0.340909:10:5:16:13:10:5:16:13
chr5	176884511	.	C	G	76.92	PASS	AF=0.37037;AO=9;DP=27;FAO=10;FDP=27;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.0136392;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=297.113;QD=11.3962;RBI=0.0168184;REFB=0.000357063;REVB=0.00984033;RO=17;SAF=4;SAR=5;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0912882;STB=0.581924;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=-0.000653427;OID=.;OPOS=176884511;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:27:27:17:17:9:10:0.37037:5:4:9:8:6:4:9:8
chr5	176885178	.	A	G	340.7	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0177314;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.6174;QD=54.5116;RBI=0.0196279;REFB=0;REVB=-0.00841731;RO=0;SAF=12;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000445311;OID=.;OPOS=176885178;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:13:12:0:0:13:12:0:0
chr5	176885499	.	T	C	385.6	PASS	AF=0.527027;AO=37;DP=73;FAO=39;FDP=74;FR=.;FRO=35;FSAF=26;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=23;FWDB=-0.0252854;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.224;QD=20.8432;RBI=0.0273198;REFB=-0.00982681;REVB=-0.0103452;RO=35;SAF=26;SAR=11;SRF=12;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.321738;STB=0.654465;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.00454094;OID=.;OPOS=176885499;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:74:35:35:37:39:0.527027:11:26:12:23:13:26:12:23
chr5	176894756	.	C	T	88.11	PASS	AF=0.44;AO=11;DP=25;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=0.055449;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.615;QD=14.0972;RBI=0.0557622;REFB=-0.0219777;REVB=0.00590178;RO=14;SAF=1;SAR=10;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.257402;STB=0.655393;STBP=0.34;TYPE=snp;VARB=0.0176585;OID=.;OPOS=176894756;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:25:25:14:14:11:11:0.44:10:1:3:11:10:1:3:11
chr5	176916516	.	C	T	375.64	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0379181;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.59;QD=55.6502;RBI=0.0478273;REFB=0;REVB=0.0291491;RO=0;SAF=19;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.06954e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000610541;OID=.;OPOS=176916516;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:8:19:0:0:8:19:0:0
chr5	176917078	.	T	C	575.8	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0187003;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.07;QD=60.6103;RBI=0.0214299;REFB=0;REVB=0.0104662;RO=0;SAF=25;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.63257e-05;OID=.;OPOS=176917078;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:13:25:0:0:13:25:0:0
chr5	176930135	.	G	A	598.16	PASS	AF=1;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00539027;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.468;QD=61.3492;RBI=0.0235689;REFB=0;REVB=0.0229442;RO=0;SAF=24;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.63777e-05;OID=.;OPOS=176930135;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:39:0:0:39:39:1:15:24:0:0:15:24:0:0
chr5	176930171	.	AGAG	A	723.05	PASS	AF=1;AO=44;DP=48;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0549801;FXX=0.041658;HRUN=1;LEN=3;MLLD=229.691;QD=62.8738;RBI=0.0660761;REFB=0;REVB=0.0366503;RO=0;SAF=24;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.30465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000168275;OID=.;OPOS=176930172;OREF=GAG;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:44:48:46:46:0:26:20:0:0:4:0:24:20:0:0
chr5	176931146	.	C	T	537.54	PASS	AF=0.467213;AO=57;DP=122;FAO=57;FDP=122;FR=.;FRO=65;FSAF=22;FSAR=35;FSRF=29;FSRR=36;FWDB=-0.00019549;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.2;QD=17.6242;RBI=0.00675672;REFB=-0.0225052;REVB=0.00675389;RO=65;SAF=22;SAR=35;SRF=29;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0598735;STB=0.533302;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.0287897;OID=.;OPOS=176931146;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:122:122:65:65:57:57:0.467213:35:22:29:36:35:22:29:36
chr5	176936590	.	T	C	834.4	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0319712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.366;QD=57.5451;RBI=0.0328462;REFB=0;REVB=-0.00753094;RO=0;SAF=32;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.09576e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.10073e-05;OID=.;OPOS=176936590;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:26:32:0:0:26:32:0:0
chr5	176936650	.	T	C	651.17	PASS	AF=1;AO=41;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0375011;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.423;QD=62.016;RBI=0.047583;REFB=0;REVB=0.0292884;RO=0;SAF=23;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.35462e-05;OID=.;OPOS=176936650;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:41:42:1:18:23:0:0:19:23:0:0
chr5	176936819	.	C	G	88.21	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00405746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.641;QD=39.2042;RBI=0.092356;REFB=0;REVB=0.0922668;RO=0;SAF=3;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00308184;OID=.;OPOS=176936819;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:6:3:0:0:6:3:0:0
chr5	176951276	.	A	G	804.37	PASS	AF=1;AO=47;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=32;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0293879;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.318;QD=57.4547;RBI=0.0689685;REFB=0;REVB=0.062394;RO=0;SAF=25;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000325174;OID=.;OPOS=176951276;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:47:56:1:22:25:0:0:24:32:0:0
chr5	177022652	.	A	G	160.29	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.175265;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.458;QD=45.7962;RBI=0.201815;REFB=0;REVB=0.100057;RO=0;SAF=12;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0125274;OID=.;OPOS=177022652;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:2:12:0:0:2:12:0:0
chr5	177022722	.	G	C	101.83	PASS	AF=0.5;AO=11;DP=24;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=12;FSRR=0;FWDB=0.0129588;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.569;QD=16.9718;RBI=0.0333173;REFB=-0.00587974;REVB=0.0306938;RO=12;SAF=9;SAR=2;SRF=12;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.360272;STB=0.687283;STBP=0.356;TYPE=snp;VARB=0.00769318;OID=.;OPOS=177022722;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:24:24:12:12:11:12:0.5:2:9:12:0:2:10:12:0
chr5	177023096	.	A	AT	194.17	PASS	AF=0.69697;AO=5;DP=42;FAO=23;FDP=33;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=18;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=-0.0898635;FXX=0.195074;HRUN=1;LEN=1;MLLD=24.5734;QD=23.5354;RBI=0.102089;REFB=0.0305135;REVB=-0.0484438;RO=36;SAF=0;SAR=5;SRF=9;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.546779;STB=0.507806;STBP=0.923;TYPE=ins;VARB=-0.026232;OID=.;OPOS=177023097;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.69697:5:42:23:33:10:5:18:2:8:52:36:0:5:9:27
chr5	177031348	.	T	C	293.32	PASS	AF=1;AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0885907;FXX=0.0434594;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.011;QD=53.3311;RBI=0.0914213;REFB=0;REVB=0.022573;RO=0;SAF=6;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17051e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000318826;OID=.;OPOS=177031348;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:22:0:0:22:22:1:16:6:0:0:16:6:0:0
chr5	177032050	.	C	G	59.34	PASS	AF=0.533333;AO=8;DP=15;FAO=8;FDP=15;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.0574356;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.9642;QD=15.8242;RBI=0.0602329;REFB=-0.0683174;REVB=0.0181425;RO=7;SAF=3;SAR=5;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0446316;STB=0.526249;STBP=0.917;TYPE=snp;VARB=0.0991934;OID=.;OPOS=177032050;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:15:15:7:7:8:8:0.533333:5:3:3:4:5:3:3:4
chr5	177035964	.	T	C	1358.6	PASS	AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0372177;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.643;QD=62.4644;RBI=0.0433896;REFB=0;REVB=0.0223047;RO=0;SAF=53;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.9001e-05;OID=.;OPOS=177035964;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:34:53:0:0:34:53:0:0
chr5	177158620	.	TA	CA,CG	114.11	PASS	AF=0.818182,0.181818;AO=9,2;DP=11;FAO=9,2;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=5,0;FSAR=4,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.03661,0.0358813;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=236.027,205.006;QD=41.4948;RBI=0.0370745,0.0359091;REFB=0,0;REVB=-0.00585037,-0.00141456;RO=0;SAF=5,0;SAR=4,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.00481796,-0.0150194;OID=.,.;OPOS=177158620,177158620;OREF=T,TA;OALT=C,CG;OMAPALT=CA,CG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:10:11:11:0:0:9,2:9,2:0.818182,0.181818:4,2:5,0:0:0:4,2:5,0:0:0
chr5	177180236	.	G	A	823.21	PASS	AF=0.983051;AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.003906;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.939;QD=55.811;RBI=0.0557049;REFB=-0.147055;REVB=-0.0555678;RO=1;SAF=44;SAR=14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0106029;STB=0.505616;STBP=0.651;TYPE=snp;VARB=0.000312531;OID=.;OPOS=177180236;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:59:59:1:1:58:58:0.983051:14:44:1:0:14:44:1:0
chr5	177310717	.	A	G	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0251402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.418;QD=33.4275;RBI=0.0252148;REFB=0;REVB=0.00193867;RO=0;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0010752;OID=.;OPOS=177310717;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:2:4:0:0:2:4:0:0
chr5	177422823	.	C	T	401.52	PASS	AF=0.56338;AO=38;DP=70;FAO=40;FDP=71;FR=.;FRO=31;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=0.0143285;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.171;QD=22.6206;RBI=0.0197484;REFB=-0.00124205;REVB=0.0135902;RO=31;SAF=21;SAR=17;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108354;STB=0.556934;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=0.000758581;OID=.;OPOS=177422823;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:71:31:31:38:40:0.56338:17:21:13:18:18:22:13:18
chr5	177422876	.	T	C	1293.36	PASS	AF=0.977011;AO=85;DP=87;FAO=85;FDP=87;FR=.;FRO=2;FSAF=47;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0123069;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.821;QD=59.465;RBI=0.0217293;REFB=-0.00435337;REVB=0.0179082;RO=2;SAF=47;SAR=38;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0242775;STB=0.512818;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=7.90964e-05;OID=.;OPOS=177422876;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:87:87:2:2:85:85:0.977011:38:47:0:2:38:47:0:2
chr5	177422908	.	A	G	300.16	PASS	AF=0.395349;AO=34;DP=86;FAO=34;FDP=86;FR=.;FRO=52;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=28;FWDB=-0.0376013;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.875;QD=13.961;RBI=0.0399448;REFB=-0.0186753;REVB=-0.0134808;RO=48;SAF=20;SAR=14;SRF=20;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176561;STB=0.576878;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=0.0236987;OID=.;OPOS=177422908;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:48:52:34:34:0.395349:14:20:20:28:14:20:24:28
chr5	177457621	.	GA	G,GTA	143.94	PASS	AF=0.475,0.05;AO=16,4;DP=39;FAO=19,2;FDP=40;FR=.;FRO=19;FSAF=1,2;FSAR=18,0;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.132639,-0.0507482;FXX=0;HRUN=2,0;LEN=1,1;MLLD=19.0524,45.8597;QD=14.3938;RBI=0.222084,0.0733507;REFB=-0.0713817,-0.00904605;REVB=0.178124,-0.0529618;RO=18;SAF=0,4;SAR=16,0;SRF=9;SRR=9;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.823618,0.657455;STB=0.892029,0.993866;STBP=0.001,0.2;TYPE=del,ins;VARB=0.0942933,0.155695;OID=.,.;OPOS=177457622,177457622;OREF=A,-;OALT=-,T;OMAPALT=G,GTA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.475,0.05:16,4:39:19,2:40:19:1,2:18,0:11:8:99:18:0,4:16,0:9:9
chr5	177547247	.	T	C	876.92	PASS	AF=1;AO=59;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0739321;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.142;QD=56.5752;RBI=0.0742042;REFB=0;REVB=-0.00634834;RO=0;SAF=7;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.54021e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.41329e-05;OID=.;OPOS=177547247;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:59:62:1:52:7:0:0:53:9:0:0
chr5	177551154	.	C	T	289.14	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0959446;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.6248;QD=52.5701;RBI=0.0959648;REFB=0;REVB=0.0019679;RO=0;SAF=14;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000971133;OID=.;OPOS=177551154;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:8:14:0:0:8:14:0:0
chr5	177551169	.	T	C	306.33	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0276601;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.728;QD=53.2739;RBI=0.0307242;REFB=0;REVB=0.0133753;RO=0;SAF=14;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.84921e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000348575;OID=.;OPOS=177551169;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:9:14:0:0:9:14:0:0
chr5	177551176	.	T	C	368.64	PASS	AF=0.964286;AO=27;DP=29;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0537308;FXX=0.0344709;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.452;QD=52.6634;RBI=0.0541234;REFB=0.128574;REVB=-0.00650667;RO=1;SAF=18;SAR=9;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0251379;STB=0.513504;STBP=0.63;TYPE=snp;VARB=-0.00786214;OID=.;OPOS=177551176;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:29:28:1:1:27:27:0.964286:9:18:1:0:9:18:1:0
chr5	177612734	.	T	C	1688.87	PASS	AF=0.974359;AO=114;DP=117;FAO=114;FDP=117;FR=.;FRO=3;FSAF=55;FSAR=59;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.00182615;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=244.889;QD=57.7391;RBI=0.00982608;REFB=-0.110342;REVB=0.0096549;RO=3;SAF=55;SAR=59;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00897247;STB=0.504727;STBP=0.46;TYPE=snp;VARB=0.000338085;OID=.;OPOS=177612734;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:117:117:3:3:114:114:0.974359:59:55:2:1:59:55:2:1
chr5	177612739	.	G	T	400.45	PASS	AF=0.398305;AO=47;DP=118;FAO=47;FDP=118;FR=.;FRO=71;FSAF=23;FSAR=24;FSRF=35;FSRR=36;FWDB=-0.00232322;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.1112;QD=13.5744;RBI=0.0139141;REFB=0.00816127;REVB=-0.0137188;RO=71;SAF=23;SAR=24;SRF=35;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00382605;STB=0.502164;STBP=0.969;TYPE=snp;VARB=-0.0123144;OID=.;OPOS=177612739;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:118:118:71:71:47:47:0.398305:24:23:35:36:24:23:35:36
chr5	177612744	.	A	G	1803.88	PASS	AF=1;AO=118;DP=118;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.034213;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.894;QD=61.1486;RBI=0.0383922;REFB=0;REVB=-0.0174195;RO=0;SAF=59;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.2653e-05;OID=.;OPOS=177612744;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:118:118:0:0:118:118:1:59:59:0:0:59:59:0:0
chr5	177612983	.	G	A	207.64	PASS	AF=0.436364;AO=24;DP=55;FAO=24;FDP=55;FR=.;FRO=31;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=21;FWDB=0.00200457;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.906;QD=15.1009;RBI=0.0249318;REFB=-0.01157;REVB=0.0248511;RO=31;SAF=15;SAR=9;SRF=10;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.294117;STB=0.666532;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.0111237;OID=.;OPOS=177612983;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:31:31:24:24:0.436364:9:15:10:21:9:15:10:21
chr5	177613123	.	T	C	665.73	PASS	AF=0.956522;AO=43;DP=45;FAO=44;FDP=46;FR=.;FRO=2;FSAF=14;FSAR=30;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0219516;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=95.702;QD=57.8891;RBI=0.0308659;REFB=-0.0217843;REVB=0.0216987;RO=2;SAF=14;SAR=29;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.062462;STB=0.533318;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.00069235;OID=.;OPOS=177613123;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:45:46:2:2:43:44:0.956522:29:14:2:0:30:14:2:0
chr5	177613168	.	C	T	169.17	PASS	AF=0.375;AO=21;DP=56;FAO=21;FDP=56;FR=.;FRO=35;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=-0.0131397;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.9975;QD=12.0833;RBI=0.0301457;REFB=0.00424264;REVB=0.0271314;RO=35;SAF=12;SAR=9;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0312681;STB=0.518117;STBP=0.838;TYPE=snp;VARB=-0.00308301;OID=.;OPOS=177613168;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:35:35:21:21:0.375:9:12:19:16:9:12:19:16
chr5	177613296	.	C	T	180.91	PASS	AF=0.392857;AO=22;DP=56;FAO=22;FDP=56;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=-0.00200029;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.92;QD=12.9224;RBI=0.00988542;REFB=-0.00205098;REVB=0.00968092;RO=34;SAF=11;SAR=11;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.062041;STB=0.535682;STBP=0.698;TYPE=snp;VARB=0.00244867;OID=.;OPOS=177613296;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:34:34:22:22:0.392857:11:11:19:15:11:11:19:15
chr5	177614001	.	T	C	264.81	PASS	AF=0.529412;AO=27;DP=50;FAO=27;FDP=51;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=21;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=-0.0126933;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.574;QD=20.7697;RBI=0.0181109;REFB=0.0105019;REVB=0.0129185;RO=23;SAF=6;SAR=21;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.217532;STB=0.636253;STBP=0.065;TYPE=snp;VARB=-0.0119286;OID=.;OPOS=177614001;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:51:23:24:27:27:0.529412:21:6:10:13:21:6:11:13
chr5	177614090	.	G	C	77.17	PASS	AF=0.4;AO=11;DP=25;FAO=10;FDP=25;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=-0.0234759;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.803;QD=12.3471;RBI=0.0238635;REFB=-0.0154841;REVB=0.00428316;RO=14;SAF=7;SAR=4;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.264132;STB=0.71611;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=0.0243512;OID=.;OPOS=177614090;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:25:25:14:15:11:10:0.4:4:7:5:9:3:7:5:10
chr5	177614094	.	C	G	92.23	PASS	AF=0.55;AO=11;DP=20;FAO=11;FDP=20;FR=.;FRO=9;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.0328088;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.274;QD=18.446;RBI=0.0391033;REFB=-0.0115557;REVB=-0.0212755;RO=9;SAF=7;SAR=4;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0666662;STB=0.53839;STBP=0.755;TYPE=snp;VARB=0.00639016;OID=.;OPOS=177614094;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:20:20:9:9:11:11:0.55:4:7:5:4:4:7:5:4
chr5	177614137	.	C	T	70.58	PASS	AF=0.5625;AO=9;DP=16;FAO=9;FDP=16;FR=.;FRO=7;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.0247338;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.169;QD=17.644;RBI=0.032817;REFB=-0.0175365;REVB=-0.0215684;RO=7;SAF=6;SAR=3;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.286547;STB=0.666296;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=0.0105058;OID=.;OPOS=177614137;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:16:16:7:7:9:9:0.5625:3:6:2:5:3:6:2:5
chr5	177614183	.	T	C	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0585719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.469;QD=42.1826;RBI=0.0594773;REFB=0;REVB=0.0103383;RO=0;SAF=2;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000807406;OID=.;OPOS=177614183;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:9:2:0:0:9:2:0:0
chr5	177669413	.	T	G	237.62	PASS	AF=0.405797;AO=28;DP=69;FAO=28;FDP=69;FR=.;FRO=41;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=-0.00972701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.327;QD=13.775;RBI=0.00982361;REFB=-0.0112226;REVB=-0.00137422;RO=38;SAF=14;SAR=14;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0266812;STB=0.507241;STBP=0.943;TYPE=snp;VARB=0.0173161;OID=.;OPOS=177669413;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:38:41:28:28:0.405797:14:14:18:20:14:14:20:21
chr5	177675217	.	C	T	810.18	PASS	AF=0.550725;AO=76;DP=138;FAO=76;FDP=138;FR=.;FRO=62;FSAF=34;FSAR=42;FSRF=12;FSRR=50;FWDB=0.00759201;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.8771;QD=23.4835;RBI=0.021686;REFB=-0.0171566;REVB=0.0203136;RO=61;SAF=34;SAR=42;SRF=12;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.212961;STB=0.618153;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.00971323;OID=.;OPOS=177675217;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:138:138:61:62:76:76:0.550725:42:34:12:49:42:34:12:50
chr5	177683377	.	T	C	96.72	PASS	AF=0.387097;AO=12;DP=31;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=5;FWDB=-0.0501344;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.0745;QD=12.4804;RBI=0.0795213;REFB=-0.021902;REVB=0.0617267;RO=19;SAF=4;SAR=8;SRF=14;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.401643;STB=0.734332;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.0316523;OID=.;OPOS=177683377;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:31:31:19:19:12:12:0.387097:8:4:14:5:8:4:14:5
chr5	177688772	.	G	A	109.25	PASS	AF=0.419355;AO=13;DP=31;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=2;FWDB=0.0146378;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.7256;QD=14.0968;RBI=0.0287559;REFB=0.0199042;REVB=-0.0247515;RO=18;SAF=7;SAR=6;SRF=16;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.372735;STB=0.711081;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=-0.0114931;OID=.;OPOS=177688772;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:18:18:13:13:0.419355:6:7:16:2:6:7:16:2
chr5	177715291	.	G	A	75.14	PASS	AF=0.37037;AO=10;DP=27;FAO=10;FDP=27;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.01463;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=266.634;QD=11.1312;RBI=0.0367501;REFB=0.00100658;REVB=-0.0337125;RO=17;SAF=9;SAR=1;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.466808;STB=0.790488;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=-0.0029648;OID=.;OPOS=177715291;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:27:27:17:17:10:10:0.37037:1:9:10:7:1:9:10:7
chr5	177715580	.	CT	C,CC	826.58	PASS	AF=0.0517241,0.948276;AO=10,33;DP=59;FAO=3,55;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=2,28;FSAR=1,27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0575331,0.0593267;FXX=0.0169463;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=167.705,177.548;QD=57.0053;RBI=0.0706882,0.0869993;REFB=0,0;REVB=0.0410703,0.0636335;RO=0;SAF=6,22;SAR=4,11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0247405,0.00875946;OID=.,.;OPOS=177715581,177715581;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0517241,0.948276:10,33:59:3,55:58:0:2,28:1,27:0:0:7:0:6,22:4,11:0:0
chr5	178030591	.	T	G	117.3	PASS	AF=0.590909;AO=13;DP=22;FAO=13;FDP=22;FR=.;FRO=9;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.0208326;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.514;QD=21.3265;RBI=0.024696;REFB=-0.00282191;REVB=0.0132625;RO=9;SAF=10;SAR=3;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0972524;STB=0.555466;STBP=0.571;TYPE=snp;VARB=0.00241089;OID=.;OPOS=178030591;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:22:22:9:9:13:13:0.590909:3:10:6:3:3:10:6:3
chr5	178359136	.	A	G	159.83	PASS	AF=0.666667;AO=16;DP=24;FAO=16;FDP=24;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.00536426;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.746;QD=26.6374;RBI=0.0235496;REFB=0.00979337;REVB=0.0229305;RO=8;SAF=6;SAR=10;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152268;STB=0.584998;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=-0.00410674;OID=.;OPOS=178359136;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:24:24:8:8:16:16:0.666667:10:6:5:3:10:6:5:3
chr5	178391860	.	G	A	990.5	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0412731;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.1492;QD=59.1341;RBI=0.0453542;REFB=0;REVB=-0.0188025;RO=0;SAF=43;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000620016;OID=.;OPOS=178391860;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:24:43:0:0:24:43:0:0
chr5	178412273	.	T	C	483.35	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00797471;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.752;QD=58.5878;RBI=0.0284726;REFB=0;REVB=0.027333;RO=0;SAF=25;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000104851;OID=.;OPOS=178412273;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:8:25:0:0:8:25:0:0
chr5	178412716	.	C	A	88.0	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.133457;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.059;QD=39.1097;RBI=0.133793;REFB=0;REVB=0.00947538;RO=0;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.38236e-05;OID=.;OPOS=178412716;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:9:0:0:7:9:1:7:0:0:0:8:1:0:0
chr5	178413816	.	T	C	1465.78	PASS	AF=1;AO=89;DP=92;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0211911;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.59;QD=61.0741;RBI=0.0616368;REFB=0;REVB=0.0578794;RO=0;SAF=55;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.58117e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0025919;OID=.;OPOS=178413816;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:92:96:0:0:89:96:1:34:55:0:0:38:58:0:0
chr5	178413947	.	T	C	892.21	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00260564;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.532;QD=57.5619;RBI=0.0077239;REFB=0;REVB=0.00727112;RO=0;SAF=30;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000240871;OID=.;OPOS=178413947;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:62:0:0:61:62:1:31:30:0:0:32:30:0:0
chr5	178415937	.	A	G	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00399925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.166;QD=51.9153;RBI=0.00405717;REFB=0;REVB=-0.000683118;RO=0;SAF=12;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.49975e-05;OID=.;OPOS=178415937;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:9:12:0:0:9:12:0:0
chr5	178415982	.	A	G	575.8	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00498331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.45;QD=60.6102;RBI=0.00668017;REFB=0;REVB=-0.00444874;RO=0;SAF=20;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.51048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.75268e-07;OID=.;OPOS=178415982;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:18:20:0:0:18:20:0:0
chr5	178416063	.	G	A	692.94	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0169095;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.542;QD=62.9948;RBI=0.0308661;REFB=0;REVB=0.0258222;RO=0;SAF=23;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.63954e-05;OID=.;OPOS=178416063;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:44:0:0:45:44:1:22:23:0:0:21:23:0:0
chr5	178416288	.	G	A	1492.57	PASS	AF=0.990196;AO=101;DP=102;FAO=101;FDP=102;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0100419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.899;QD=58.532;RBI=0.0459264;REFB=-0.0871808;REVB=0.0448151;RO=1;SAF=48;SAR=53;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00886767;STB=0.504672;STBP=0.486;TYPE=snp;VARB=0.000245669;OID=.;OPOS=178416288;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:102:102:1:1:101:101:0.990196:53:48:0:1:53:48:0:1
chr5	178419278	.	TGG	TGGGCAAGGTC,TGGGCAAGGTCTG,TG	142.03	PASS	AF=0.692308,0.153846,0.153846;AO=2,8,2;DP=14;FAO=9,2,2;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=7,2,2;FSAR=2,0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00310255,0.0029954,-0.0542927;FXX=0.0713776;HRUN=2,2,2;LEN=8,10,1;MLLD=328.525,319.307,17.243;QD=43.7025;RBI=0.0864491,0.0460605,0.10251;REFB=0,0,0;REVB=0.0863934,0.045963,0.0869519;RO=0;SAF=0,8,2;SAR=2,0,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=ins,ins,del;VARB=0.00552646,0.00791328,0.120467;OID=.,.,.;OPOS=178419281,178419280,178419279;OREF=-,-,G;OALT=GCAAGGTC,GGCAAGGTCT,-;OMAPALT=TGGGCAAGGTC,TGGGCAAGGTCTG,TG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/3:0.692308,0.153846,0.153846:2,8,2:14:9,2,2:13:0:7,2,2:2,0,0:0:0:14:0:0,8,2:2,0,0:0:0
chr5	178419288	.	C	T	145.16	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0398558;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.5788;QD=44.6636;RBI=0.102155;REFB=0;REVB=0.0940595;RO=0;SAF=11;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.006979;OID=.;OPOS=178419288;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:2:11:0:0:2:11:0:0
chr5	178459283	.	A	G	510.71	PASS	AF=0.510417;AO=49;DP=96;FAO=49;FDP=96;FR=.;FRO=47;FSAF=15;FSAR=34;FSRF=15;FSRR=32;FWDB=-0.0019241;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.814;QD=21.2795;RBI=0.00579581;REFB=-0.0252766;REVB=0.0054671;RO=47;SAF=15;SAR=34;SRF=15;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0134925;STB=0.50746;STBP=0.897;TYPE=snp;VARB=0.0271449;OID=.;OPOS=178459283;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:96:47:47:49:49:0.510417:34:15:15:32:34:15:15:32
chr5	178459426	.	A	C	446.35	PASS	AF=0.470588;AO=48;DP=103;FAO=48;FDP=102;FR=.;FRO=54;FSAF=28;FSAR=20;FSRF=24;FSRR=30;FWDB=0.000211516;FXX=0.0097078;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.16;QD=17.5039;RBI=0.00783086;REFB=-0.0124374;REVB=-0.007828;RO=54;SAF=28;SAR=20;SRF=24;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132462;STB=0.57374;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=0.0161591;OID=.;OPOS=178459426;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:102:54:54:48:48:0.470588:20:28:24:30:20:28:24:30
chr5	178507069	.	T	C	192.85	PASS	AF=0.423077;AO=22;DP=52;FAO=22;FDP=52;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=-0.00715031;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=216.17;QD=14.8342;RBI=0.00755235;REFB=-0.00527699;REVB=-0.00243125;RO=29;SAF=12;SAR=10;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198153;STB=0.601986;STBP=0.237;TYPE=snp;VARB=0.00641507;OID=.;OPOS=178507069;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:29:30:22:22:0.423077:10:12:10:19:10:12:11:19
chr5	178507090	.	G	A	185.8	PASS	AF=0.487179;AO=19;DP=39;FAO=19;FDP=39;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=-0.00441923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.128;QD=19.0565;RBI=0.00484008;REFB=-0.00273582;REVB=0.00197403;RO=20;SAF=10;SAR=9;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158713;STB=0.58972;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=0.00455504;OID=.;OPOS=178507090;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:20:20:19:19:0.487179:9:10:7:13:9:10:7:13
chr5	178555045	.	G	A	210.7	PASS	AF=0.477273;AO=21;DP=44;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.0256824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.545;QD=19.1549;RBI=0.0477817;REFB=-0.0212145;REVB=0.0402927;RO=23;SAF=9;SAR=12;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126084;STB=0.571361;STBP=0.402;TYPE=snp;VARB=0.018839;OID=.;OPOS=178555045;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:23:23:21:21:0.477273:12:9:13:10:12:9:13:10
chr5	178562967	.	G	A	452.04	PASS	AF=0.536585;AO=44;DP=82;FAO=44;FDP=82;FR=.;FRO=38;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=-0.0046843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.247;QD=22.0508;RBI=0.00966529;REFB=-0.0316417;REVB=0.00845429;RO=38;SAF=21;SAR=23;SRF=21;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0632576;STB=0.534868;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.0209925;OID=.;OPOS=178562967;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:38:38:44:44:0.536585:23:21:21:17:23:21:21:17
chr5	178634619	.	C	T	817.74	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0285726;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.617;QD=57.3855;RBI=0.0617628;REFB=0;REVB=0.0547563;RO=0;SAF=39;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000317128;OID=.;OPOS=178634619;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:18:39:0:0:18:39:0:0
chr5	178634672	.	C	T	766.45	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0493125;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.826;QD=63.8706;RBI=0.0602133;REFB=0;REVB=0.0345531;RO=0;SAF=30;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.73384e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000300331;OID=.;OPOS=178634672;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:18:30:0:0:18:30:0:0
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chr5	179071958	.	C	G	41.07	PASS	AF=0.159091;AO=7;DP=44;FAO=7;FDP=44;FR=.;FRO=37;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=23;FSRR=14;FWDB=-0.00380423;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.904;QD=3.73333;RBI=0.00387807;REFB=-0.00394785;REVB=0.000753149;RO=37;SAF=2;SAR=5;SRF=23;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.389578;STB=0.766165;STBP=0.17;TYPE=snp;VARB=0.0191236;OID=.;OPOS=179071958;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:44:44:37:37:7:7:0.159091:5:2:23:14:5:2:23:14
chr5	179078940	.	T	C	648.31	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00734925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.299;QD=61.7433;RBI=0.0177659;REFB=0;REVB=0.0161745;RO=0;SAF=15;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000156351;OID=.;OPOS=179078940;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:42:0:0:41:42:1:26:15:0:0:26:16:0:0
chr5	179126090	.	C	T	485.57	PASS	AF=0.897436;AO=35;DP=39;FAO=35;FDP=39;FR=.;FRO=4;FSAF=23;FSAR=12;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0311121;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=232.638;QD=49.802;RBI=0.035706;REFB=-0.0582681;REVB=0.0175201;RO=2;SAF=23;SAR=12;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0174978;STB=0.510632;STBP=0.75;TYPE=snp;VARB=0.00337533;OID=.;OPOS=179126090;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:19:39:39:2:4:35:35:0.897436:12:23:1:1:12:23:3:1
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chr5	179260153	.	C	T	252.87	PASS	AF=0.530612;AO=23;DP=46;FAO=26;FDP=49;FR=.;FRO=23;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=0.0324327;FXX=0.019996;HRUN=4;LEN=1;MLLD=69.7613;QD=20.6424;RBI=0.0331443;REFB=-0.0254347;REVB=-0.00683115;RO=23;SAF=13;SAR=10;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0776697;STB=0.510196;STBP=0.854;TYPE=snp;VARB=0.023913;OID=.;OPOS=179260153;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:49:23:23:23:26:0.530612:10:13:11:12:13:13:11:12
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chr5	179264731	.	T	C	436.85	PASS	AF=0.478261;AO=44;DP=92;FAO=44;FDP=92;FR=.;FRO=48;FSAF=27;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=33;FWDB=0.00447881;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.345;QD=18.9933;RBI=0.00576773;REFB=-0.00830746;REVB=-0.00363414;RO=47;SAF=27;SAR=17;SRF=14;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.287682;STB=0.654002;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0089451;OID=.;OPOS=179264731;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:47:48:44:44:0.478261:17:27:14:33:17:27:15:33
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chr5	179287585	.	GC	CT	113.11	PASS	AF=0.5;AO=13;DP=26;FAO=13;FDP=26;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=-0.00336748;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=136.639;QD=17.4015;RBI=0.0276949;REFB=-0.0185117;REVB=-0.0274894;RO=13;SAF=3;SAR=10;SRF=3;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.01434;OID=.;OPOS=179287585;OREF=GC;OALT=CT;OMAPALT=CT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:26:13:13:13:13:0.5:10:3:3:10:10:3:3:10
chr5	179287622	.	G	GTA	99.96	PASS	AF=0.461538;AO=12;DP=26;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.0090808;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=262.477;QD=15.3789;RBI=0.0110502;REFB=-0.0184892;REVB=0.00629646;RO=14;SAF=3;SAR=9;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121912;STB=0.571303;STBP=0.557;TYPE=ins;VARB=0.0201394;OID=.;OPOS=179287623;OREF=-;OALT=TA;OMAPALT=GTA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.461538:12:26:12:26:14:3:9:5:9:99:14:3:9:5:9
chr5	179290845	.	T	G	288.86	PASS	AF=0.545455;AO=30;DP=55;FAO=30;FDP=55;FR=.;FRO=25;FSAF=22;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=0.00610005;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=234.564;QD=21.0082;RBI=0.0181756;REFB=-0.0174946;REVB=-0.0171214;RO=25;SAF=22;SAR=8;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164958;STB=0.592003;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=0.0154306;OID=.;OPOS=179290845;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:25:25:30:30:0.545455:8:22:14:11:8:22:14:11
chr5	179393927	.	G	A	491.55	PASS	AF=0.25;AO=30;DP=121;FAO=30;FDP=120;FR=.,HEALED;FRO=63;FSAF=28;FSAR=2;FSRF=33;FSRR=30;FWDB=-0.00502566;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.668;QD=16.3851;RBI=0.0200297;REFB=-0.00571104;REVB=0.0193889;RO=63;SAF=28;SAR=2;SRF=32;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.638847;STB=0.879844;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.00630324;OID=.;OPOS=179393927;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:121:120:63:63:30:30:0.25:2:28:32:31:2:28:33:30
chr5	179529124	.	G	A	501.19	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0351115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.164;QD=58.9638;RBI=0.0437304;REFB=0;REVB=0.0260678;RO=0;SAF=10;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.72437e-05;OID=.;OPOS=179529124;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:24:10:0:0:24:10:0:0
chr5	179554602	.	C	T	94.06	PASS	AF=0.363636;AO=12;DP=33;FAO=12;FDP=33;FR=.;FRO=21;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.00749417;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.3213;QD=11.4008;RBI=0.0454483;REFB=-0.0278346;REVB=0.0448262;RO=21;SAF=4;SAR=8;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160135;STB=0.59558;STBP=0.433;TYPE=snp;VARB=0.0619668;OID=.;OPOS=179554602;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:33:33:21:21:12:12:0.363636:8:4:10:11:8:4:10:11
chr5	179555407	.	T	C	364.55	PASS	AF=0.481013;AO=38;DP=79;FAO=38;FDP=79;FR=.;FRO=41;FSAF=27;FSAR=11;FSRF=36;FSRR=5;FWDB=-0.0107755;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=259.048;QD=18.4582;RBI=0.0111362;REFB=-0.0106214;REVB=0.00281124;RO=39;SAF=27;SAR=11;SRF=34;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.197163;STB=0.615947;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=0.00941944;OID=.;OPOS=179555407;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:39:41:38:38:0.481013:11:27:34:5:11:27:36:5
chr5	179563435	.	T	C	1080.54	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0301487;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.3283;QD=60.0299;RBI=0.0417898;REFB=0;REVB=-0.0289385;RO=0;SAF=32;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.05346e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000537089;OID=.;OPOS=179563435;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:40:32:0:0:40:32:0:0
chr5	179727681	.	A	G	154.29	PASS	AF=0.395349;AO=17;DP=43;FAO=17;FDP=43;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=0.00893833;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=288.06;QD=14.3521;RBI=0.00908037;REFB=0.000953599;REVB=0.00159978;RO=25;SAF=10;SAR=7;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0556242;STB=0.541499;STBP=0.737;TYPE=snp;VARB=-0.00147041;OID=.;OPOS=179727681;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:25:26:17:17:0.395349:7:10:16:9:7:10:17:9
chr5	179729519	.	A	G	902.4	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0476959;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.4198;QD=58.2196;RBI=0.0487261;REFB=0;REVB=0.00996667;RO=0;SAF=27;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.46408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000347371;OID=.;OPOS=179729519;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:35:27:0:0:35:27:0:0
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chr5	179996111	.	C	T	575.8	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0037839;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.661;QD=60.61;RBI=0.00501786;REFB=0;REVB=0.00329561;RO=0;SAF=20;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.51048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.80963e-05;OID=.;OPOS=179996111;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:18:20:0:0:18:20:0:0
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chr5	180052946	.	G	A	171.99	PASS	AF=0.529412;AO=17;DP=33;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=15;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=0.0393878;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.605;QD=20.2336;RBI=0.0397963;REFB=0.00200945;REVB=-0.00568685;RO=15;SAF=14;SAR=3;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.456992;STB=0.755495;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=-0.00315847;OID=.;OPOS=180052946;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:34:15:16:17:18:0.529412:3:14:5:10:3:15:6:10
chr5	180057231	.	C	A	74.45	PASS	AF=0.692308;AO=8;DP=13;FAO=9;FDP=13;FR=.,HEALED;FRO=4;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0056144;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.112;QD=22.9084;RBI=0.00871351;REFB=-0.0427418;REVB=-0.00666362;RO=3;SAF=8;SAR=0;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.78436;STB=0.705321;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=0.00954487;OID=.;OPOS=180057231;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:13:13:3:4:8:9:0.692308:0:8:2:1:1:8:2:2
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chr5	180166369	.	C	T	51.24	PASS	AF=0.216216;AO=8;DP=37;FAO=8;FDP=37;FR=.;FRO=29;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=21;FWDB=0.0337302;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.627;QD=5.53973;RBI=0.0339769;REFB=0.00433931;REVB=0.00408706;RO=29;SAF=5;SAR=3;SRF=8;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.403689;STB=0.754177;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=-0.00679068;OID=.;OPOS=180166369;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:51:37:37:29:29:8:8:0.216216:3:5:8:21:3:5:8:21
chr5	180166461	.	C	G	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0226998;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.992;QD=55.0983;RBI=0.0291011;REFB=0;REVB=0.0182096;RO=0;SAF=11;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00026986;OID=.;OPOS=180166461;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:15:11:0:0:15:11:0:0
chr5	180218668	.	A	G	162.2	PASS	AF=0.37037;AO=20;DP=54;FAO=20;FDP=54;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=0.0063084;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.331;QD=12.015;RBI=0.010384;REFB=0.00016467;REVB=0.00824816;RO=33;SAF=10;SAR=10;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0813988;STB=0.555501;STBP=0.536;TYPE=snp;VARB=-0.000256446;OID=.;OPOS=180218668;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:33:34:20:20:0.37037:10:10:19:14:10:10:20:14
chr5	180218820	.	C	A	356.43	PASS	AF=0.452381;AO=37;DP=83;FAO=38;FDP=84;FR=.;FRO=46;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=22;FWDB=0.0103128;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.262;QD=16.973;RBI=0.01351;REFB=-0.0108649;REVB=0.00872739;RO=46;SAF=21;SAR=16;SRF=24;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0457001;STB=0.517036;STBP=0.799;TYPE=snp;VARB=0.0102623;OID=.;OPOS=180218820;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:84:46:46:37:38:0.452381:16:21:24:22:17:21:24:22
chr5	180218831	.	G	A	319.54	PASS	AF=0.4375;AO=34;DP=79;FAO=35;FDP=80;FR=.;FRO=45;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=23;FSRR=22;FWDB=0.00727966;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.256;QD=15.9771;RBI=0.00737248;REFB=-0.00102573;REVB=0.00116617;RO=45;SAF=19;SAR=15;SRF=23;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.048471;STB=0.534276;STBP=0.629;TYPE=snp;VARB=0.00140513;OID=.;OPOS=180218831;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:80:45:45:34:35:0.4375:15:19:23:22:15:20:23:22
chr5	180219304	.	C	T	556.61	PASS	AF=0.530612;AO=52;DP=98;FAO=52;FDP=98;FR=.;FRO=46;FSAF=39;FSAR=13;FSRF=35;FSRR=11;FWDB=0.00431765;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=144.052;QD=22.7186;RBI=0.0273172;REFB=-0.0100347;REVB=0.0269739;RO=46;SAF=39;SAR=13;SRF=35;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.012447;STB=0.506847;STBP=0.899;TYPE=snp;VARB=0.0110249;OID=.;OPOS=180219304;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:46:46:52:52:0.530612:13:39:35:11:13:39:35:11
chr5	180276402	.	C	T	972.51	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0206372;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.8089;QD=58.94;RBI=0.0231322;REFB=0;REVB=0.0104502;RO=0;SAF=28;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000109288;OID=.;OPOS=180276402;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:38:28:0:0:38:28:0:0
chr5	180277343	.	T	C	242.95	PASS	AF=0.534884;AO=23;DP=43;FAO=23;FDP=43;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=2;FWDB=-0.00384034;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=221.203;QD=22.6;RBI=0.0132084;REFB=-0.00533437;REVB=0.0126378;RO=20;SAF=7;SAR=16;SRF=18;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.469575;STB=0.760249;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.00390342;OID=.;OPOS=180277343;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:20:20:23:23:0.534884:16:7:18:2:16:7:18:2
chr5	180278393	.	C	G	207.08	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0191036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.4757;QD=48.7255;RBI=0.0941354;REFB=0;REVB=0.0921766;RO=0;SAF=13;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.78418e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00328728;OID=.;OPOS=180278393;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:17:0:0:16:17:1:3:13:0:0:3:14:0:0
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chr5	180376972	.	C	G	64.87	PASS	AF=0.36;AO=9;DP=25;FAO=9;FDP=25;FR=.;FRO=16;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=0.000160438;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=297.574;QD=10.3792;RBI=0.0138584;REFB=-0.0154324;REVB=0.0138575;RO=15;SAF=1;SAR=8;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.284865;STB=0.715828;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=0.0271628;OID=.;OPOS=180376972;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:25:25:15:16:9:9:0.36:8:1:4:11:8:1:5:11
chr5	180376974	.	T	G	64.85	PASS	AF=0.36;AO=9;DP=25;FAO=9;FDP=25;FR=.;FRO=16;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=0.00347264;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.9696;QD=10.376;RBI=0.00347289;REFB=-0.010614;REVB=4.23789e-05;RO=15;SAF=1;SAR=8;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.362611;STB=0.715828;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=0.0294828;OID=.;OPOS=180376974;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:25:25:15:16:9:9:0.36:8:1:5:10:8:1:5:11
chr5	180377331	.	T	C	435.36	PASS	AF=0.468085;AO=44;DP=94;FAO=44;FDP=94;FR=.;FRO=50;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=25;FSRR=25;FWDB=0.000596145;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.852;QD=18.5258;RBI=0.00978109;REFB=-0.00691644;REVB=0.00976291;RO=50;SAF=21;SAR=23;SRF=25;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0216937;STB=0.512095;STBP=0.789;TYPE=snp;VARB=0.00771152;OID=.;OPOS=180377331;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:50:50:44:44:0.468085:23:21:25:25:23:21:25:25
chr5	180377470	.	G	A	90.34	PASS	AF=0.5;AO=11;DP=22;FAO=11;FDP=22;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=-0.0435264;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.434;QD=16.4256;RBI=0.0612457;REFB=-0.00807329;REVB=0.043087;RO=11;SAF=2;SAR=9;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.373023;STB=0.719552;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.00903136;OID=.;OPOS=180377470;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:22:22:11:11:11:11:0.5:9:2:6:5:9:2:6:5
chr5	180430895	.	G	A	472.25	PASS	AF=0.505495;AO=46;DP=91;FAO=46;FDP=91;FR=.;FRO=45;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=28;FSRR=17;FWDB=0.00848483;FXX=0.0215031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.8847;QD=20.7583;RBI=0.0107768;REFB=-0.0120372;REVB=0.00664434;RO=45;SAF=24;SAR=22;SRF=28;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0904159;STB=0.560414;STBP=0.263;TYPE=snp;VARB=0.0143468;OID=.;OPOS=180430895;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:45:45:46:46:0.505495:22:24:28:17:23:23:28:17
chr5	180432416	.	C	T	125.85	PASS	AF=0.518519;AO=14;DP=27;FAO=14;FDP=27;FR=.;FRO=13;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.00546617;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=282.512;QD=18.6449;RBI=0.00571043;REFB=-0.000124056;REVB=-0.00165226;RO=13;SAF=11;SAR=3;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.316854;STB=0.682943;STBP=0.069;TYPE=snp;VARB=0.000170113;OID=.;OPOS=180432416;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:13:13:14:14:0.518519:3:11:6:7:3:11:6:7
chr5	180472498	.	C	T	259.14	PASS	AF=0.55814;AO=24;DP=42;FAO=24;FDP=43;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.0141193;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.389;QD=24.1059;RBI=0.0210656;REFB=0.00198927;REVB=-0.0156334;RO=18;SAF=8;SAR=16;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.260587;STB=0.634806;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=-0.001945;OID=.;OPOS=180472498;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:43:18:19:24:24:0.55814:16:8:12:6:16:8:12:7
chr5	180472513	.	A	G	207.66	PASS	AF=0.444444;AO=23;DP=54;FAO=24;FDP=54;FR=.;FRO=30;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=10;FWDB=-0.00507999;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.587;QD=15.3823;RBI=0.0222851;REFB=0.00422321;REVB=-0.0216984;RO=30;SAF=9;SAR=14;SRF=20;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.269023;STB=0.658961;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=-0.00335502;OID=.;OPOS=180472513;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:30:30:23:24:0.444444:14:9:20:10:15:9:20:10
chr5	180486247	.	G	C,T	726.44	PASS	AF=0.0769231,0.923077;AO=4,47;DP=53;FAO=4,48;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=0,22;FSAR=4,26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0144893,0.0261601;FXX=0.0188644;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=97.9007,112.169;QD=55.8801;RBI=0.0374219,0.0289368;REFB=0,0;REVB=-0.034503,-0.0123688;RO=0;SAF=0,21;SAR=4,26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.175815,0.0046603;OID=.,.;OPOS=180486247,180486247;OREF=G,G;OALT=C,T;OMAPALT=C,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:19:53:52:0:0:4,47:4,48:0.0769231,0.923077:4,26:0,21:0:0:4,26:0,22:0:0
chr5	180486306	.	C	T	112.49	PASS	AF=0.48;AO=9;DP=26;FAO=12;FDP=25;FR=.,HEALED;FRO=12;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=-0.0365969;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.364;QD=17.9988;RBI=0.0880712;REFB=-0.033837;REVB=0.0801074;RO=13;SAF=1;SAR=8;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.325655;STB=0.687108;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=0.0391781;OID=.;OPOS=180486306;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:26:25:13:12:9:12:0.48:8:1:4:9:11:1:3:9
chr5	180486785	.	G	C	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0861774;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=303.515;QD=42.1826;RBI=0.0862122;REFB=0;REVB=-0.00245079;RO=0;SAF=2;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000453453;OID=.;OPOS=180486785;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:9:2:0:0:9:2:0:0
chr5	180600638	.	T	C	225.2	PASS	AF=0.440678;AO=26;DP=59;FAO=26;FDP=59;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=-0.0046822;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.592;QD=15.2675;RBI=0.0374773;REFB=0.000405997;REVB=0.0371836;RO=32;SAF=11;SAR=15;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105935;STB=0.568575;STBP=0.367;TYPE=snp;VARB=-0.000735253;OID=.;OPOS=180600638;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:32:33:26:26:0.440678:15:11:17:15:15:11:18:15
chr5	180600702	.	G	C	277.73	PASS	AF=0.5;AO=30;DP=60;FAO=30;FDP=60;FR=.;FRO=30;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=-0.015346;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.094;QD=18.5155;RBI=0.0177923;REFB=0.00384877;REVB=0.00900379;RO=30;SAF=9;SAR=21;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.193622;STB=0.60862;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=-0.00292657;OID=.;OPOS=180600702;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:30:30:30:30:0.5:21:9:15:15:21:9:15:15
chr5	180615403	.	A	C	110.71	PASS	AF=0.705882;AO=12;DP=17;FAO=12;FDP=17;FR=.;FRO=5;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.00412827;FXX=0;HRUN=14;LEN=1;MLLD=250.835;QD=26.0488;RBI=0.0123221;REFB=-0.0147373;REVB=-0.0116099;RO=5;SAF=7;SAR=5;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00896755;STB=0.505042;STBP=0.998;TYPE=snp;VARB=0.00704693;OID=.;OPOS=180615403;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:17:17:5:5:12:12:0.705882:5:7:3:2:5:7:3:2
chr5	180615933	.	T	C	834.41	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0250351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.046;QD=57.5452;RBI=0.0250525;REFB=0;REVB=-0.000932647;RO=0;SAF=32;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.09576e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.6254e-05;OID=.;OPOS=180615933;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:26:32:0:0:26:32:0:0
chr5	180618713	.	A	AC	838.97	PASS	AF=1;AO=72;DP=80;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0304278;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=18.4411;QD=43.0241;RBI=0.119331;REFB=-0.0196659;REVB=-0.115386;RO=7;SAF=42;SAR=30;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0474601;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00325551;OID=.;OPOS=180618714;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:72:80:78:78:0:46:32:0:0:14:7:42:30:6:1
chr5	180622615	.	C	T	133.85	PASS	AF=0.666667;AO=14;DP=21;FAO=14;FDP=21;FR=.;FRO=7;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.0167122;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=256.341;QD=25.4947;RBI=0.0176762;REFB=-0.0102249;REVB=0.00575768;RO=7;SAF=11;SAR=3;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.259242;STB=0.646828;STBP=0.087;TYPE=snp;VARB=0.00587179;OID=.;OPOS=180622615;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:21:21:7:7:14:14:0.666667:3:11:3:4:3:11:3:4
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chr6	1507808	.	G	T	1958.84	PASS	AF=1;AO=126;DP=128;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0165364;FXX=0.0156238;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.927;QD=62.1855;RBI=0.0271703;REFB=0;REVB=-0.0215586;RO=0;SAF=57;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.06696e-05;OID=.;OPOS=1507808;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:128:126:0:0:126:126:1:69:57:0:0:69:57:0:0
chr6	1523145	.	C	G	689.22	PASS	AF=0.857143;AO=54;DP=63;FAO=54;FDP=63;FR=.;FRO=9;FSAF=35;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=9;FWDB=-0.0158572;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.4444;QD=43.7602;RBI=0.0870923;REFB=0.00507616;REVB=-0.0856366;RO=2;SAF=35;SAR=19;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0470484;STB=0.595708;STBP=0;TYPE=snp;VARB=-0.00501728;OID=.;OPOS=1523145;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:63:63:2:9:54:54:0.857143:19:35:0:2:19:35:0:9
chr6	1742794	.	A	G	214.35	PASS	AF=0.5;AO=20;DP=41;FAO=21;FDP=42;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0412387;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.012;QD=20.4145;RBI=0.0438784;REFB=0.01114;REVB=0.0149896;RO=21;SAF=9;SAR=11;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0668974;STB=0.523787;STBP=0.777;TYPE=snp;VARB=-0.00605092;OID=.;OPOS=1742794;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:42:21:21:20:21:0.5:11:9:11:10:11:10:11:10
chr6	2623820	.	G	A	229.54	PASS	AF=0.536585;AO=22;DP=41;FAO=22;FDP=41;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.0123372;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.7179;QD=22.3938;RBI=0.0742355;REFB=-0.0121317;REVB=0.0732031;RO=19;SAF=10;SAR=12;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0594771;STB=0.533303;STBP=0.713;TYPE=snp;VARB=0.0183557;OID=.;OPOS=2623820;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:19:19:22:22:0.536585:12:10:10:9:12:10:10:9
chr6	2624053	.	T	A	289.72	PASS	AF=0.508197;AO=31;DP=61;FAO=31;FDP=61;FR=.;FRO=30;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=-0.018595;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.388;QD=18.9979;RBI=0.020175;REFB=-0.0241018;REVB=0.00782659;RO=30;SAF=10;SAR=21;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166583;STB=0.593158;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.0170624;OID=.;OPOS=2624053;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:30:30:31:31:0.508197:21:10:15:15:21:10:15:15
chr6	2664375	.	C	A	77.29	PASS	AF=0.384615;AO=10;DP=27;FAO=10;FDP=26;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.0176388;FXX=0.0370233;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.421;QD=11.8909;RBI=0.0226485;REFB=-0.00869782;REVB=-0.0142065;RO=16;SAF=5;SAR=5;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129195;STB=0.576773;STBP=0.573;TYPE=snp;VARB=0.0192507;OID=.;OPOS=2664375;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:27:26:16:16:10:10:0.384615:5:5:6:10:5:5:6:10
chr6	2667031	.	A	G	216.28	PASS	AF=0.689655;AO=20;DP=29;FAO=20;FDP=29;FR=.;FRO=9;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=-0.0215929;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.447;QD=29.8322;RBI=0.0226566;REFB=0.00117806;REVB=-0.00686041;RO=9;SAF=12;SAR=8;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.210948;STB=0.616323;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=-0.0007851;OID=.;OPOS=2667031;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:29:29:9:9:20:20:0.689655:8:12:2:7:8:12:2:7
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chr6	3255327	.	G	A	418.32	PASS	AF=0.661017;AO=39;DP=59;FAO=39;FDP=59;FR=.;FRO=20;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.0206417;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.1068;QD=28.3609;RBI=0.0233111;REFB=0.00206528;REVB=-0.0108316;RO=20;SAF=23;SAR=16;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0254229;STB=0.513844;STBP=0.778;TYPE=snp;VARB=-0.00101657;OID=.;OPOS=3255327;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:20:20:39:39:0.661017:16:23:11:9:16:23:11:9
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chr6	3264502	.	G	C	421.46	PASS	AF=0.672414;AO=39;DP=58;FAO=39;FDP=58;FR=.;FRO=19;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=0.0260909;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.421;QD=29.0661;RBI=0.026549;REFB=0.00233914;REVB=-0.00491055;RO=19;SAF=20;SAR=19;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0868352;STB=0.547196;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=-0.00199459;OID=.;OPOS=3264502;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:19:19:39:39:0.672414:19:20:7:12:19:20:7:12
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chr6	4735035	.	T	C	171.15	PASS	AF=0.461538;AO=18;DP=39;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=-0.0290014;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.551;QD=17.5539;RBI=0.0335958;REFB=-0.0637618;REVB=0.0169587;RO=20;SAF=5;SAR=13;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130549;STB=0.592725;STBP=0.34;TYPE=snp;VARB=0.0706567;OID=.;OPOS=4735035;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:20:21:18:18:0.461538:13:5:8:12:13:5:9:12
chr6	4735071	.	C	G	145.54	PASS	AF=0.444444;AO=15;DP=35;FAO=16;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=0.0149749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.982;QD=16.1705;RBI=0.0159046;REFB=-0.0142959;REVB=0.00535791;RO=18;SAF=4;SAR=11;SRF=5;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133398;STB=0.50812;STBP=0.957;TYPE=snp;VARB=0.0184274;OID=.;OPOS=4735071;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:36:18:20:15:16:0.444444:11:4:5:13:11:5:6:14
chr6	4773438	.	C	T	72.34	PASS	AF=0.147368;AO=14;DP=95;FAO=14;FDP=95;FR=.;FRO=81;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=34;FSRR=47;FWDB=-0.00832175;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.648;QD=3.04573;RBI=0.00891611;REFB=0.00146768;REVB=0.00320085;RO=81;SAF=6;SAR=8;SRF=34;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0112668;STB=0.507681;STBP=0.954;TYPE=snp;VARB=-0.00671941;OID=.;OPOS=4773438;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:95:95:81:81:14:14:0.147368:8:6:34:47:8:6:34:47
chr6	5086211	.	G	C	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0339566;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.88;QD=35.5759;RBI=0.0605711;REFB=0;REVB=0.0501579;RO=0;SAF=5;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.27427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00111966;OID=.;OPOS=5086211;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:2:5:0:0:2:5:0:0
chr6	5086558	.	C	A	769.5	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0105233;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.99;QD=56.9997;RBI=0.0538294;REFB=0;REVB=0.0527907;RO=0;SAF=31;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.6027e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000137677;OID=.;OPOS=5086558;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:23:31:0:0:23:31:0:0
chr6	5139012	.	C	A	88.2	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0346678;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.7388;QD=39.2009;RBI=0.0353753;REFB=0;REVB=0.00703977;RO=0;SAF=5;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00295449;OID=.;OPOS=5139012;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:4:5:0:0:4:5:0:0
chr6	6145726	.	A	G	380.74	PASS	AF=0.373016;AO=42;DP=121;FAO=47;FDP=126;FR=.;FRO=79;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=47;FSRR=32;FWDB=-0.0108094;FXX=0.0078734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=299.243;QD=12.0868;RBI=0.0118291;REFB=-0.00975622;REVB=0.00480452;RO=79;SAF=24;SAR=18;SRF=47;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0273828;STB=0.539861;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.0190362;OID=.;OPOS=6145726;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:121:126:79:79:42:47:0.373016:18:24:47:32:22:25:47:32
chr6	6152137	.	C	G	152.89	PASS	AF=0.361702;AO=17;DP=47;FAO=17;FDP=47;FR=.;FRO=30;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=-0.0272358;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.055;QD=13.0119;RBI=0.0354571;REFB=-0.00496441;REVB=0.0227028;RO=30;SAF=6;SAR=11;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.267588;STB=0.656533;STBP=0.128;TYPE=snp;VARB=0.0170162;OID=.;OPOS=6152137;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:30:30:17:17:0.361702:11:6:18:12:11:6:18:12
chr6	6152140	.	C	T	152.08	PASS	AF=0.369565;AO=17;DP=46;FAO=17;FDP=46;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=0.0133754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.548;QD=13.224;RBI=0.0307546;REFB=-0.00756902;REVB=0.0276938;RO=29;SAF=6;SAR=11;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.285559;STB=0.666473;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.014161;OID=.;OPOS=6152140;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:29:29:17:17:0.369565:11:6:18:11:11:6:18:11
chr6	6320808	.	T	G	1890.09	PASS	AF=1;AO=121;DP=122;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0794334;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.0938;QD=61.4663;RBI=0.102469;REFB=0;REVB=-0.0647314;RO=0;SAF=52;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000645747;OID=.;OPOS=6320808;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:122:123:0:0:121:123:1:69:52:0:0:70:53:0:0
chr6	7211818	.	G	A	1053.71	PASS	AF=1;AO=70;DP=72;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00792426;FXX=0.0410903;HRUN=3;LEN=1;MLLD=209.888;QD=60.2119;RBI=0.0254969;REFB=0;REVB=0.0242342;RO=0;SAF=43;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.74349e-05;OID=.;OPOS=7211818;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:70:0:0:70:70:1:27:43:0:0:27:43:0:0
chr6	7230680	.	G	T	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0331025;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=114.783;QD=44.6884;RBI=0.0336445;REFB=0;REVB=0.00601419;RO=0;SAF=7;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000222974;OID=.;OPOS=7230680;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:6:7:0:0:6:7:0:0
chr6	7246998	.	G	A	259.14	PASS	AF=0.446154;AO=29;DP=60;FAO=29;FDP=65;FR=.;FRO=36;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=22;FSRR=14;FWDB=0.00405871;FXX=0.0151492;HRUN=5;LEN=1;MLLD=146.334;QD=15.9473;RBI=0.0525003;REFB=-0.0351208;REVB=0.0523432;RO=30;SAF=20;SAR=9;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154234;STB=0.548891;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=0.0382966;OID=.;OPOS=7246998;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:65:30:36:29:29:0.446154:9:20:16:14:9:20:22:14
chr6	7247247	.	CT	C,CC	202.03	PASS	AF=0.0588235,0.941176;AO=2,15;DP=17;FAO=1,16;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=0,10;FSAR=1,6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00420893,0.0129349;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=124.227,143.175;QD=47.5365;RBI=0.0572805,0.062665;REFB=0,0;REVB=0.0571256,0.0613155;RO=0;SAF=1,9;SAR=1,6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0110022,0.00545082;OID=.,.;OPOS=7247248,7247248;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0588235,0.941176:2,15:17:1,16:17:0:0,10:1,6:0:0:5:0:1,9:1,6:0:0
chr6	7248925	.	C	T	156.26	PASS	AF=0.425;AO=17;DP=40;FAO=17;FDP=40;FR=.;FRO=23;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=0.0280267;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=227.415;QD=15.626;RBI=0.0280269;REFB=-0.00204417;REVB=-0.000103066;RO=23;SAF=4;SAR=13;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.233898;STB=0.63619;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.00188548;OID=.;OPOS=7248925;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:23:23:17:17:0.425:13:4:10:13:13:4:10:13
chr6	7288544	.	A	C	161.19	PASS	AF=0.473684;AO=17;DP=37;FAO=18;FDP=38;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=0.01361;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.4253;QD=16.9678;RBI=0.0521817;REFB=-0.00508809;REVB=0.0503756;RO=20;SAF=8;SAR=9;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0672545;STB=0.523783;STBP=0.749;TYPE=snp;VARB=0.00830913;OID=.;OPOS=7288544;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:38:20:20:17:18:0.473684:9:8:8:12:10:8:8:12
chr6	7289957	.	CCA	C	65.35	PASS	AF=0.366667;AO=11;DP=32;FAO=11;FDP=30;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.004995;FXX=0.0624805;HRUN=2;LEN=2;MLLD=227.308;QD=8.71284;RBI=0.024816;REFB=-0.0185019;REVB=-0.0243081;RO=19;SAF=7;SAR=4;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.175257;STB=0.604745;STBP=0.379;TYPE=del;VARB=0.0277672;OID=.;OPOS=7289958;OREF=CA;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.366667:11:32:11:30:19:7:4:9:10:65:19:7:4:9:10
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chr6	7295300	.	TAAAAAAA	TAAAAAA,TAAAAAAT	100.03	PASS	AF=0.53125,0.09375;AO=15,3;DP=32;FAO=17,3;FDP=32;FR=.;FRO=12;FSAF=8,3;FSAR=9,0;FSRF=10;FSRR=2;FWDB=0.0710267,0.0723657;FXX=0;HRUN=7,7;LEN=1,1;MLLD=8.05847,22.5259;QD=12.5037;RBI=0.178023,0.120848;REFB=-0.0696331,-0.0337559;REVB=0.16324,0.0967858;RO=13;SAF=6,3;SAR=9,0;SRF=12;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.410723,0.5212;STB=0.647838,0.994222;STBP=0.07,0.336;TYPE=del,snp;VARB=0.0904986,0.00420243;OID=.,.;OPOS=7295301,7295307;OREF=A,A;OALT=-,T;OMAPALT=TAAAAAA,TAAAAAAT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.53125,0.09375:15,3:32:17,3:32:12:8,3:9,0:10:2:32:13:6,3:9,0:12:1
chr6	7393452	.	C	T	575.02	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0323428;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.8745;QD=60.5286;RBI=0.0581101;REFB=0;REVB=0.0482776;RO=0;SAF=17;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.71161e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000336829;OID=.;OPOS=7393452;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:38:0:0:37:38:1:20:17:0:0:21:17:0:0
chr6	7563983	.	T	G	1825.49	PASS	AF=1;AO=119;DP=120;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0118193;FXX=0.00833264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.8652;QD=61.3609;RBI=0.0132072;REFB=0;REVB=-0.00589366;RO=0;SAF=51;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.19807e-05;OID=.;OPOS=7563983;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:120:119:0:0:119:119:1:68:51:0:0:68:51:0:0
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chr6	7576527	.	G	A	302.61	PASS	AF=0.684211;AO=26;DP=38;FAO=26;FDP=38;FR=.;FRO=12;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=0.00272526;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.802;QD=31.8541;RBI=0.00669488;REFB=-0.0116562;REVB=-0.00611509;RO=12;SAF=10;SAR=16;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.210408;STB=0.615296;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.00469048;OID=.;OPOS=7576527;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:93:38:38:12:12:26:26:0.684211:16:10:9:3:16:10:9:3
chr6	7577260	.	C	T	278.85	PASS	AF=0.54902;AO=28;DP=51;FAO=28;FDP=51;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.0186692;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.2543;QD=21.8709;RBI=0.022215;REFB=0.0147299;REVB=-0.0120402;RO=22;SAF=10;SAR=18;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154327;STB=0.596471;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=-0.0165423;OID=.;OPOS=7577260;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:22:23:28:28:0.54902:18:10:12:10:18:10:13:10
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chr6	7585967	.	G	C	98.55	PASS	AF=0.428571;AO=12;DP=28;FAO=12;FDP=28;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.0441429;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=171.893;QD=14.079;RBI=0.045683;REFB=0.0015478;REVB=0.0117617;RO=16;SAF=3;SAR=9;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.325913;STB=0.691969;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=-0.00314771;OID=.;OPOS=7585967;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:28:28:16:16:12:12:0.428571:9:3:9:7:9:3:9:7
chr6	7601720	.	C	T	330.93	PASS	AF=0.433735;AO=36;DP=83;FAO=36;FDP=83;FR=.;FRO=47;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=25;FSRR=22;FWDB=-0.0191954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.042;QD=15.9485;RBI=0.0219723;REFB=0.0153742;REVB=-0.0106921;RO=45;SAF=22;SAR=14;SRF=25;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0568481;STB=0.546181;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=-0.0236608;OID=.;OPOS=7601720;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:45:47:36:36:0.433735:14:22:25:20:14:22:25:22
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chr6	7987883	.	G	C	284.57	PASS	AF=0.484375;AO=31;DP=64;FAO=31;FDP=64;FR=.;FRO=33;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=11;FWDB=0.0176833;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=283.457;QD=17.7853;RBI=0.0244402;REFB=-0.00541317;REVB=-0.0168707;RO=32;SAF=14;SAR=17;SRF=21;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184364;STB=0.609493;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=0.00746202;OID=.;OPOS=7987883;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:32:33:31:31:0.484375:17:14:21:11:17:14:22:11
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chr6	10587038	.	C	G	428.89	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00796212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.3112;QD=57.1859;RBI=0.0358556;REFB=0;REVB=0.0349604;RO=0;SAF=20;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000690455;OID=.;OPOS=10587038;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:30:0:0:29:30:1:9:20:0:0:9:21:0:0
chr6	10634214	.	T	C	118.32	PASS	AF=0.243243;AO=18;DP=74;FAO=18;FDP=74;FR=.;FRO=56;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=25;FSRR=31;FWDB=-0.00118522;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.956;QD=6.3958;RBI=0.00235073;REFB=-0.00875542;REVB=0.00203007;RO=56;SAF=7;SAR=11;SRF=25;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0727288;STB=0.544841;STBP=0.674;TYPE=snp;VARB=0.0520253;OID=.;OPOS=10634214;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:56:56:18:18:0.243243:11:7:25:31:11:7:25:31
chr6	10647272	.	C	T	297.85	PASS	AF=0.65;AO=26;DP=40;FAO=26;FDP=40;FR=.;FRO=14;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=-0.0159623;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.5982;QD=29.7845;RBI=0.0198315;REFB=-0.0320616;REVB=-0.0117684;RO=13;SAF=16;SAR=10;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0960925;STB=0.566877;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=0.0292055;OID=.;OPOS=10647272;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:13:14:26:26:0.65:10:16:6:7:10:16:6:8
chr6	10671764	.	G	A	346.24	PASS	AF=0.674419;AO=29;DP=43;FAO=29;FDP=43;FR=.;FRO=14;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=-0.029346;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.998;QD=32.2081;RBI=0.0324602;REFB=0.00326942;REVB=-0.0138738;RO=14;SAF=16;SAR=13;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0734172;STB=0.540165;STBP=0.49;TYPE=snp;VARB=-0.00193532;OID=.;OPOS=10671764;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:14:14:29:29:0.674419:13:16:6:8:13:16:6:8
chr6	10687746	.	G	T	449.45	PASS	AF=0.683333;AO=41;DP=60;FAO=41;FDP=60;FR=.;FRO=19;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.00836733;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.501;QD=29.9631;RBI=0.0109654;REFB=-0.0205778;REVB=0.00708718;RO=19;SAF=18;SAR=23;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0204572;STB=0.511106;STBP=0.831;TYPE=snp;VARB=0.0105014;OID=.;OPOS=10687746;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:19:19:41:41:0.683333:23:18:9:10:23:18:9:10
chr6	10729020	.	C	T	805.13	PASS	AF=1;AO=49;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0194203;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.6123;QD=64.41;RBI=0.022332;REFB=0;REVB=-0.0110258;RO=0;SAF=23;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000203421;OID=.;OPOS=10729020;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:49:50:1:26:23:0:0:26:24:0:0
chr6	10753107	.	T	A	236.78	PASS	AF=0.611111;AO=22;DP=36;FAO=22;FDP=36;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.0184942;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=84.49;QD=26.3083;RBI=0.0433142;REFB=-0.0411086;REVB=0.0391674;RO=12;SAF=8;SAR=14;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144616;STB=0.555504;STBP=0.43;TYPE=snp;VARB=0.0311377;OID=.;OPOS=10753107;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:12:14:22:22:0.611111:14:8:7:5:14:8:7:7
chr6	10763312	.	G	A	107.53	PASS	AF=0.541667;AO=13;DP=23;FAO=13;FDP=24;FR=.;FRO=11;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.00446292;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.522;QD=17.9223;RBI=0.00677483;REFB=0.00626506;REVB=0.00509711;RO=10;SAF=7;SAR=6;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0294478;STB=0.575046;STBP=0.473;TYPE=snp;VARB=-0.00509664;OID=.;OPOS=10763312;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:23:24:10:11:13:13:0.541667:6:7:5:5:5:8:5:6
chr6	10764727	.	A	G	370.46	PASS	AF=0.666667;AO=34;DP=51;FAO=34;FDP=51;FR=.;FRO=17;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.00542886;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.021;QD=29.0555;RBI=0.0171149;REFB=-0.0245552;REVB=-0.016231;RO=17;SAF=19;SAR=15;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0181682;STB=0.509912;STBP=0.848;TYPE=snp;VARB=0.00796841;OID=.;OPOS=10764727;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:17:17:34:34:0.666667:15:19:9:8:15:19:9:8
chr6	10891781	.	C	T	727.77	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00441274;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.601;QD=63.2845;RBI=0.00593505;REFB=0;REVB=-0.00396895;RO=0;SAF=26;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.36314e-05;OID=.;OPOS=10891781;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:20:26:0:0:20:26:0:0
chr6	10906256	.	A	G	510.75	PASS	AF=0.714286;AO=45;DP=63;FAO=45;FDP=63;FR=.;FRO=18;FSAF=19;FSAR=26;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.00800883;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.031;QD=32.4283;RBI=0.0265796;REFB=-0.0100803;REVB=0.0253443;RO=17;SAF=19;SAR=26;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114656;STB=0.554347;STBP=0.205;TYPE=snp;VARB=0.00348531;OID=.;OPOS=10906256;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:17:18:45:45:0.714286:26:19:11:6:26:19:11:7
chr6	10955408	.	C	T	763.83	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0449784;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.7986;QD=63.6528;RBI=0.0450084;REFB=0;REVB=-0.00164263;RO=0;SAF=26;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000608372;OID=.;OPOS=10955408;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:48:0:0:47:48:1:21:26:0:0:22:26:0:0
chr6	10981053	.	G	A	122.33	PASS	AF=0.451613;AO=15;DP=31;FAO=14;FDP=31;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.00453206;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.118;QD=15.7844;RBI=0.0120037;REFB=-0.00158923;REVB=-0.0111153;RO=16;SAF=7;SAR=8;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0861724;STB=0.516106;STBP=0.917;TYPE=snp;VARB=0.00168389;OID=.;OPOS=10981053;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:16:17:15:14:0.451613:8:7:9:7:7:7:9:8
chr6	11079286	.	G	A	474.93	PASS	AF=0.576923;AO=45;DP=78;FAO=45;FDP=78;FR=.;FRO=33;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=11;FSRR=22;FWDB=-0.0441124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.559;QD=24.3553;RBI=0.0442658;REFB=-0.016069;REVB=0.00368143;RO=33;SAF=22;SAR=23;SRF=11;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120642;STB=0.566009;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=0.0161589;OID=.;OPOS=11079286;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:33:33:45:45:0.576923:23:22:11:22:23:22:11:22
chr6	11105763	.	C	T	172.14	PASS	AF=0.653846;AO=17;DP=26;FAO=17;FDP=26;FR=.;FRO=9;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.0077092;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.079;QD=26.4831;RBI=0.00942776;REFB=0.00918599;REVB=-0.00542687;RO=9;SAF=10;SAR=7;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0208503;STB=0.511614;STBP=0.894;TYPE=snp;VARB=-0.00377304;OID=.;OPOS=11105763;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:26:26:9:9:17:17:0.653846:7:10:5:4:7:10:5:4
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chr6	11185509	.	G	T	306.91	PASS	AF=0.485294;AO=33;DP=68;FAO=33;FDP=68;FR=.;FRO=35;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=0.0225766;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.791;QD=18.0533;RBI=0.0263172;REFB=-0.00133127;REVB=-0.0135238;RO=35;SAF=19;SAR=14;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0573308;STB=0.532049;STBP=0.611;TYPE=snp;VARB=0.00242762;OID=.;OPOS=11185509;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:35:35:33:33:0.485294:14:19:18:17:14:19:18:17
chr6	11185533	.	G	A	360.78	PASS	AF=0.463415;AO=38;DP=81;FAO=38;FDP=82;FR=.;FRO=44;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=30;FSRR=14;FWDB=-0.0207132;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.381;QD=17.5988;RBI=0.0335561;REFB=0.00144875;REVB=0.0264003;RO=43;SAF=19;SAR=19;SRF=29;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166218;STB=0.597512;STBP=0.103;TYPE=snp;VARB=-0.00256057;OID=.;OPOS=11185533;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:82:43:44:38:38:0.463415:19:19:29:14:19:19:30:14
chr6	11190626	.	A	G	1011.7	PASS	AF=1;AO=68;DP=69;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00179254;FXX=0.0144907;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.876;QD=59.5116;RBI=0.00193752;REFB=0;REVB=0.000735379;RO=0;SAF=33;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.286e-06;OID=.;OPOS=11190626;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:69:68:0:0:68:68:1:35:33:0:0:35:33:0:0
chr6	11192575	.	C	T	988.31	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00862565;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.1581;QD=59.0036;RBI=0.0247146;REFB=0;REVB=0.0231605;RO=0;SAF=29;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000234749;OID=.;OPOS=11192575;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:67:0:0:66:67:1:37:29:0:0:38:29:0:0
chr6	11193860	.	G	A	1510.78	PASS	AF=1;AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00442398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.809;QD=63.6119;RBI=0.0227194;REFB=0;REVB=0.0222846;RO=0;SAF=63;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.18502e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.68295e-05;OID=.;OPOS=11193860;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:95:0:0:95:95:1:32:63:0:0:32:63:0:0
chr6	11213832	.	T	C	575.79	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0191822;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.365;QD=60.6099;RBI=0.0205341;REFB=0;REVB=0.00732747;RO=0;SAF=18;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.51048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.73303e-05;OID=.;OPOS=11213832;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:20:18:0:0:20:18:0:0
chr6	11538534	.	C	T	376.05	PASS	AF=0.381356;AO=44;DP=117;FAO=45;FDP=118;FR=.;FRO=73;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=35;FSRR=38;FWDB=-0.00212842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.487;QD=12.7476;RBI=0.0282223;REFB=-0.0109945;REVB=0.0281419;RO=70;SAF=24;SAR=20;SRF=35;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.049273;STB=0.533319;STBP=0.585;TYPE=snp;VARB=0.0135874;OID=.;OPOS=11538534;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:117:118:70:73:44:45:0.381356:20:24:35:35:21:24:35:38
chr6	11576130	.	T	C	1189.96	PASS	AF=0.94186;AO=80;DP=86;FAO=81;FDP=86;FR=.;FRO=5;FSAF=38;FSAR=43;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0252365;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=59.1441;QD=55.347;RBI=0.0661441;REFB=-0.136343;REVB=0.0611405;RO=1;SAF=38;SAR=42;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0122965;STB=0.507628;STBP=0.564;TYPE=snp;VARB=0.0068034;OID=.;OPOS=11576130;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:86:86:1:5:80:81:0.94186:42:38:1:0:43:38:3:2
chr6	11644302	.	T	C	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0315245;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.3044;QD=37.4878;RBI=0.0546426;REFB=0;REVB=0.0446321;RO=0;SAF=4;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00612143;OID=.;OPOS=11644302;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:4:4:0:0:4:4:0:0
chr6	11644518	.	C	T	482.91	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0584277;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.9895;QD=58.534;RBI=0.060809;REFB=0;REVB=-0.0168507;RO=0;SAF=19;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.71297e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0005634;OID=.;OPOS=11644518;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:14:19:0:0:14:19:0:0
chr6	12122645	.	A	G	1014.94	PASS	AF=1;AO=69;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00447496;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.186;QD=57.9966;RBI=0.00464696;REFB=-0.0129333;REVB=-0.00125258;RO=1;SAF=40;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0116725;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.77566e-05;OID=.;OPOS=12122645;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:70:70:1:0:69:70:1:29:40:1:0:29:41:0:0
chr6	12122773	.	T	C	236.12	PASS	AF=0.469388;AO=23;DP=49;FAO=23;FDP=49;FR=.;FRO=26;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.00591054;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.006;QD=19.2749;RBI=0.00864745;REFB=0.0074624;REVB=-0.0063122;RO=26;SAF=16;SAR=7;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196773;STB=0.611753;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=-0.00954887;OID=.;OPOS=12122773;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:26:26:23:23:0.469388:7:16:13:13:7:16:13:13
chr6	12124587	.	C	G	344.48	PASS	AF=0.674419;AO=28;DP=42;FAO=29;FDP=43;FR=.;FRO=14;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=0.0320931;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.243;QD=32.0445;RBI=0.039046;REFB=-0.0146823;REVB=0.0222401;RO=14;SAF=17;SAR=11;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0228941;STB=0.507687;STBP=0.904;TYPE=snp;VARB=0.00518361;OID=.;OPOS=12124587;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:43:14:14:28:29:0.674419:11:17:9:5:11:18:9:5
chr6	12294258	.	A	G	1244.97	PASS	AF=0.965116;AO=82;DP=85;FAO=83;FDP=86;FR=.;FRO=3;FSAF=43;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.00299248;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=262.757;QD=57.9055;RBI=0.00589391;REFB=-0.0359931;REVB=-0.00507772;RO=3;SAF=42;SAR=40;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0341967;STB=0.518068;STBP=0.134;TYPE=snp;VARB=-8.78634e-06;OID=.;OPOS=12294258;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:85:86:3:3:82:83:0.965116:40:42:0:3:40:43:0:3
chr6	12296255	.	G	T	334.87	PASS	AF=0.397849;AO=37;DP=92;FAO=37;FDP=93;FR=.;FRO=56;FSAF=25;FSAR=12;FSRF=24;FSRR=32;FWDB=0.00613957;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.969;QD=14.4032;RBI=0.0425507;REFB=0.005719;REVB=-0.0421055;RO=53;SAF=25;SAR=12;SRF=22;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.274863;STB=0.651575;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=-0.00516446;OID=.;OPOS=12296255;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:93:53:56:37:37:0.397849:12:25:22:31:12:25:24:32
chr6	13470113	.	A	T	990.6	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00946916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.1835;QD=59.1405;RBI=0.0276909;REFB=0;REVB=0.0260216;RO=0;SAF=31;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.85407e-05;OID=.;OPOS=13470113;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:36:31:0:0:36:31:0:0
chr6	13548165	.	A	G	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00834412;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.103;QD=53.2768;RBI=0.00871606;REFB=0;REVB=-0.00251901;RO=0;SAF=9;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.84921e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.86372e-05;OID=.;OPOS=13548165;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:14:9:0:0:14:9:0:0
chr6	13622132	.	T	TC	80.02	PASS	AF=0.526316;AO=10;DP=19;FAO=10;FDP=19;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.00179069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=36.547;QD=16.8461;RBI=0.00673251;REFB=-0.00711401;REVB=0.00649001;RO=9;SAF=2;SAR=8;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.252049;STB=0.648318;STBP=0.234;TYPE=ins;VARB=0.00698578;OID=.;OPOS=13622133;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.526316:10:19:10:19:9:2:8:4:5:67:9:2:8:4:5
chr6	13794147	.	C	T	175.6	PASS	AF=0.392157;AO=20;DP=51;FAO=20;FDP=51;FR=.;FRO=31;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=-0.0126425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.783;QD=13.7724;RBI=0.0393708;REFB=-0.0056784;REVB=-0.0372858;RO=30;SAF=7;SAR=13;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12709;STB=0.565151;STBP=0.479;TYPE=snp;VARB=0.00461613;OID=.;OPOS=13794147;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:30:31:20:20:0.392157:13:7:14:16:13:7:14:17
chr6	13978207	.	CA	C	274.83	PASS	AF=0.449541;AO=45;DP=110;FAO=49;FDP=109;FR=.;FRO=60;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=34;FSRR=26;FWDB=0.06152;FXX=0.00909008;HRUN=4;LEN=1;MLLD=18.4955;QD=10.0854;RBI=0.104303;REFB=0.0112041;REVB=-0.084228;RO=56;SAF=20;SAR=25;SRF=30;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0904511;STB=0.542242;STBP=0.46;TYPE=del;VARB=-0.00680463;OID=.;OPOS=13978208;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.449541:45:110:49:109:60:24:25:34:26:99:56:20:25:30:26
chr6	13978275	.	A	C	789.24	PASS	AF=0.564885;AO=74;DP=131;FAO=74;FDP=131;FR=.;FRO=57;FSAF=42;FSAR=32;FSRF=22;FSRR=35;FWDB=0.0111473;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.641;QD=24.0989;RBI=0.0389227;REFB=0.00365628;REVB=0.0372923;RO=57;SAF=42;SAR=32;SRF=22;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144387;STB=0.578753;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=-0.00156126;OID=.;OPOS=13978275;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:131:131:57:57:74:74:0.564885:32:42:22:35:32:42:22:35
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chr6	13978618	.	C	G	303.75	PASS	AF=0.5625;AO=27;DP=48;FAO=27;FDP=48;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0242702;FXX=0.020404;HRUN=3;LEN=1;MLLD=229.782;QD=25.3121;RBI=0.0256175;REFB=-0.0247087;REVB=-0.00819854;RO=21;SAF=13;SAR=14;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0333577;STB=0.518505;STBP=0.799;TYPE=snp;VARB=0.014815;OID=.;OPOS=13978618;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:21:21:27:27:0.5625:14:13:11:10:14:13:11:10
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chr6	13978910	.	G	T	144.54	PASS	AF=0.421053;AO=21;DP=39;FAO=16;FDP=38;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=0.00328784;FXX=0.0256345;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.2734;QD=15.2148;RBI=0.00586001;REFB=-0.00959648;REVB=0.00485076;RO=15;SAF=10;SAR=11;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0572686;STB=0.624844;STBP=0.204;TYPE=snp;VARB=0.0107822;OID=.;OPOS=13978910;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:38:15:22:21:16:0.421053:11:10:6:9:6:10:9:13
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chr6	13980157	.	A	T	141.87	PASS	AF=0.410256;AO=16;DP=39;FAO=16;FDP=39;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.0830656;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.1328;QD=14.5505;RBI=0.0962645;REFB=-0.0506031;REVB=-0.0486514;RO=22;SAF=8;SAR=8;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0910968;STB=0.538414;STBP=0.707;TYPE=snp;VARB=0.0718275;OID=.;OPOS=13980157;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:22:23:16:16:0.410256:8:8:13:9:8:8:13:10
chr6	14131804	.	G	A	385.35	PASS	AF=0.465116;AO=40;DP=86;FAO=40;FDP=86;FR=.;FRO=46;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=27;FSRR=19;FWDB=-0.0055326;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=147.169;QD=17.9232;RBI=0.0545714;REFB=-0.0178368;REVB=0.0542902;RO=46;SAF=16;SAR=24;SRF=27;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.178897;STB=0.59995;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=0.024635;OID=.;OPOS=14131804;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:46:46:40:40:0.465116:24:16:27:19:24:16:27:19
chr6	14646772	.	A	G	557.13	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00483902;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.3426;QD=60.2299;RBI=0.0402067;REFB=0;REVB=-0.0399144;RO=0;SAF=19;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.68991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00063892;OID=.;OPOS=14646772;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:18:19:0:0:18:19:0:0
chr6	15513482	.	G	A	45.66	PASS	AF=0.333333;AO=7;DP=21;FAO=7;FDP=21;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.00328494;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.469;QD=8.69783;RBI=0.0223337;REFB=0.0116426;REVB=0.0220908;RO=14;SAF=4;SAR=3;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0769493;STB=0.547808;STBP=0.75;TYPE=snp;VARB=-0.0189276;OID=.;OPOS=15513482;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:21:21:14:14:7:7:0.333333:3:4:7:7:3:4:7:7
chr6	15586009	.	G	T	871.98	PASS	AF=1;AO=61;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0241171;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.434;QD=54.499;RBI=0.0249252;REFB=-0.157693;REVB=-0.00629548;RO=2;SAF=28;SAR=33;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0325244;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000204033;OID=.;OPOS=15586009;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:64:64:2:0:61:64:1:33:28:2:0:33:31:0:0
chr6	16145325	.	A	G	976.32	PASS	AF=0.985294;AO=67;DP=68;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0132043;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=246.38;QD=57.4307;RBI=0.0216206;REFB=-0.0244818;REVB=0.01712;RO=1;SAF=30;SAR=37;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154913;STB=0.508194;STBP=0.291;TYPE=snp;VARB=4.49784e-06;OID=.;OPOS=16145325;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:68:68:1:1:67:67:0.985294:37:30:1:0:37:30:1:0
chr6	16290761	.	T	A	1121.96	PASS	AF=0.962025;AO=76;DP=80;FAO=76;FDP=79;FR=.;FRO=3;FSAF=33;FSAR=43;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0224412;FXX=0.0246883;HRUN=3;LEN=1;MLLD=202.287;QD=56.8081;RBI=0.025976;REFB=-0.171151;REVB=0.0130824;RO=3;SAF=33;SAR=43;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.016941;STB=0.508959;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=0.00117049;OID=.;OPOS=16290761;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:80:79:3:3:76:76:0.962025:43:33:2:1:43:33:2:1
chr6	16300444	.	G	GTCCTT	204.87	PASS	AF=0.4375;AO=19;DP=49;FAO=21;FDP=48;FR=.;FRO=27;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=0.0065086;FXX=0;HRUN=1;LEN=5;MLLD=320.952;QD=17.0726;RBI=0.00753519;REFB=-0.00475188;REVB=0.00379701;RO=28;SAF=6;SAR=13;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200255;STB=0.588149;STBP=0.284;TYPE=ins;VARB=0.00585843;OID=.;OPOS=16300445;OREF=-;OALT=TCCTT;OMAPALT=GTCCTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.4375:19:49:21:48:27:7:14:13:14:99:28:6:13:14:14
chr6	16327330	.	T	C	323.44	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0509924;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.7407;QD=53.907;RBI=0.053652;REFB=0;REVB=0.0166825;RO=0;SAF=10;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000914074;OID=.;OPOS=16327330;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:14:10:0:0:14:10:0:0
chr6	16327615	.	A	G	411.12	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-7.5727e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.044;QD=56.7065;RBI=0.0641858;REFB=0;REVB=0.0641858;RO=0;SAF=20;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000257317;OID=.;OPOS=16327615;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:9:20:0:0:9:20:0:0
chr6	17293058	.	A	G	136.88	PASS	AF=0.5;AO=15;DP=30;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=0.0161354;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=263.106;QD=18.2512;RBI=0.0166624;REFB=-0.00510236;REVB=-0.00415746;RO=15;SAF=7;SAR=8;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118644;STB=0.56748;STBP=0.537;TYPE=snp;VARB=0.00576559;OID=.;OPOS=17293058;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:15:15:15:15:0.5:8:7:5:10:8:7:5:10
chr6	17543302	.	A	G	332.0	PASS	AF=0.439024;AO=36;DP=82;FAO=36;FDP=82;FR=.;FRO=46;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=27;FWDB=0.00421791;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=323.036;QD=16.1951;RBI=0.00462481;REFB=0.000675466;REVB=0.00189685;RO=46;SAF=19;SAR=17;SRF=19;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113979;STB=0.564067;STBP=0.343;TYPE=snp;VARB=-0.000828593;OID=.;OPOS=17543302;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:46:46:36:36:0.439024:17:19:19:27:17:19:19:27
chr6	17629616	.	G	A	638.82	PASS	AF=0.976744;AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0207134;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.445;QD=59.425;RBI=0.0225875;REFB=-0.0266133;REVB=-0.00900832;RO=1;SAF=17;SAR=25;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0184086;STB=0.509799;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.00153807;OID=.;OPOS=17629616;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:43:43:1:1:42:42:0.976744:25:17:0:1:25:17:0:1
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chr6	17665479	.	G	C	197.79	PASS	AF=0.47619;AO=20;DP=42;FAO=20;FDP=42;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.0507447;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.435;QD=18.837;RBI=0.050889;REFB=0.000987901;REVB=0.00382939;RO=22;SAF=7;SAR=13;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10207;STB=0.558021;STBP=0.495;TYPE=snp;VARB=-0.00114973;OID=.;OPOS=17665479;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:22:22:20:20:0.47619:13:7:10:12:13:7:10:12
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chr6	18273431	.	G	A	274.53	PASS	AF=0.527273;AO=29;DP=55;FAO=29;FDP=55;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=-0.0421987;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.6439;QD=19.966;RBI=0.0634082;REFB=-0.0192446;REVB=-0.0473273;RO=26;SAF=14;SAR=15;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144898;STB=0.58047;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.0141169;OID=.;OPOS=18273431;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:26:26:29:29:0.527273:15:14:17:9:15:14:17:9
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chr6	25106783	.	G	A	173.04	PASS	AF=0.486486;AO=18;DP=37;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.0967744;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.0833;QD=18.707;RBI=0.0969767;REFB=0.0114852;REVB=0.00625992;RO=18;SAF=11;SAR=7;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100257;STB=0.544841;STBP=0.592;TYPE=snp;VARB=-0.00498115;OID=.;OPOS=25106783;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:18:19:18:18:0.486486:7:11:9:9:7:11:10:9
chr6	25287726	.	C	T	147.22	PASS	AF=0.470588;AO=16;DP=34;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=2;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.0901827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.3782;QD=17.3201;RBI=0.0907824;REFB=0.0153398;REVB=-0.0104179;RO=18;SAF=2;SAR=14;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.416489;STB=0.744313;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=-0.0182103;OID=.;OPOS=25287726;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:18:18:16:16:0.470588:14:2:8:10:14:2:8:10
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chr6	25426768	.	G	A	283.65	PASS	AF=0.609756;AO=24;DP=41;FAO=25;FDP=41;FR=.;FRO=16;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.00154892;FXX=0.0465008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.049;QD=27.6727;RBI=0.016073;REFB=0.0116139;REVB=0.0159982;RO=15;SAF=15;SAR=9;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0184311;STB=0.515139;STBP=0.825;TYPE=snp;VARB=-0.00632482;OID=.;OPOS=25426768;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:15:16:24:25:0.609756:9:15:9:6:10:15:9:7
chr6	25435758	.	A	C,G	660.09	PASS	AF=0.0930233,0.906977;AO=4,38;DP=42;FAO=4,39;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=4,21;FSAR=0,18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0272139,0.0457084;FXX=0.0444346;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=135.837,59.5689;QD=61.4035;RBI=0.031666,0.0934007;REFB=0,0;REVB=0.0161906,0.0814521;RO=0;SAF=4,21;SAR=0,17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-3.53998e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.028544,0.00233391;OID=.,.;OPOS=25435758,25435758;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:18:42:43:0:0:4,38:4,39:0.0930233,0.906977:0,17:4,21:0:0:0,18:4,21:0:0
chr6	25511008	.	C	CAT	143.11	PASS	AF=0.377778;AO=13;DP=50;FAO=17;FDP=45;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.0415066;FXX=0;HRUN=0;LEN=2;MLLD=162.421;QD=12.7205;RBI=0.0431586;REFB=-0.00222233;REVB=0.0118267;RO=33;SAF=9;SAR=4;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.21761;STB=0.533294;STBP=0.708;TYPE=ins;VARB=0.00511324;OID=.;OPOS=25511009;OREF=-;OALT=AT;OMAPALT=CAT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.377778:13:50:17:45:28:10:7:15:13:99:33:9:4:17:16
chr6	25600968	.	G	A	306.33	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00800941;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.874;QD=53.2755;RBI=0.0816017;REFB=0;REVB=0.0812076;RO=0;SAF=8;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0010361;OID=.;OPOS=25600968;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:15:8:0:0:15:8:0:0
chr6	25605091	.	G	A	785.72	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000819436;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.1103;QD=64.1405;RBI=0.0178865;REFB=0;REVB=-0.0178677;RO=0;SAF=25;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000152611;OID=.;OPOS=25605091;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:24:25:0:0:24:25:0:0
chr6	25726675	.	G	A	272.3	PASS	AF=0.47619;AO=30;DP=63;FAO=30;FDP=63;FR=.;FRO=33;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=-0.0145488;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=317.398;QD=17.289;RBI=0.0146218;REFB=-0.0200372;REVB=0.00145985;RO=33;SAF=15;SAR=15;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141446;STB=0.507931;STBP=0.931;TYPE=snp;VARB=0.025319;OID=.;OPOS=25726675;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:33:33:30:30:0.47619:15:15:16:17:15:15:16:17
chr6	25727196	.	C	T	181.51	PASS	AF=0.6;AO=17;DP=30;FAO=18;FDP=30;FR=.;FRO=12;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.0107088;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.625;QD=24.201;RBI=0.0187107;REFB=-0.0174024;REVB=0.0153431;RO=12;SAF=10;SAR=7;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127109;STB=0.578859;STBP=0.337;TYPE=snp;VARB=0.0237594;OID=.;OPOS=25727196;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:30:30:12:12:17:18:0.6:7:10:5:7:7:11:5:7
chr6	25727265	.	C	T	219.1	PASS	AF=0.36;AO=26;DP=74;FAO=27;FDP=75;FR=.;FRO=48;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=27;FSRR=21;FWDB=-0.0027318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.54;QD=11.6855;RBI=0.00476643;REFB=-0.014229;REVB=-0.00390591;RO=48;SAF=12;SAR=14;SRF=27;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112515;STB=0.575166;STBP=0.341;TYPE=snp;VARB=0.0267854;OID=.;OPOS=25727265;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:75:48:48:26:27:0.36:14:12:27:21:15:12:27:21
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chr6	25769349	.	T	C	587.54	PASS	AF=0.97561;AO=39;DP=40;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0500867;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.3077;QD=57.321;RBI=0.0512615;REFB=0.0216187;REVB=-0.010912;RO=1;SAF=13;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0346908;STB=0.518509;STBP=0.262;TYPE=snp;VARB=-0.00821531;OID=.;OPOS=25769349;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:40:41:1:1:39:40:0.97561:26:13:1:0:27:13:1:0
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chr6	25813150	.	G	A	220.38	PASS	AF=0.419355;AO=25;DP=62;FAO=26;FDP=62;FR=.;FRO=36;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=24;FWDB=0.00742719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.934;QD=14.2183;RBI=0.0136701;REFB=-0.000553961;REVB=0.0114765;RO=35;SAF=8;SAR=17;SRF=12;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0265211;STB=0.508258;STBP=0.912;TYPE=snp;VARB=0.00104068;OID=.;OPOS=25813150;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:35:36:25:26:0.419355:17:8:12:23:17:9:12:24
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chr6	26033506	.	G	A	277.26	PASS	AF=0.54902;AO=27;DP=50;FAO=28;FDP=51;FR=.;FRO=23;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=-0.00503002;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.307;QD=21.7457;RBI=0.00548187;REFB=0.00314454;REVB=-0.00217938;RO=23;SAF=14;SAR=13;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00266441;STB=0.506325;STBP=0.949;TYPE=snp;VARB=-0.00230743;OID=.;OPOS=26033506;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:51:23:23:27:28:0.54902:13:14:12:11:13:15:12:11
chr6	26044369	.	A	G	229.26	PASS	AF=0.409091;AO=27;DP=67;FAO=27;FDP=66;FR=.;FRO=39;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=-0.016665;FXX=0.0149231;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.547;QD=13.8944;RBI=0.0198388;REFB=-0.0195357;REVB=0.0107637;RO=39;SAF=15;SAR=12;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.044551;STB=0.525405;STBP=0.771;TYPE=snp;VARB=0.0228272;OID=.;OPOS=26044369;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:66:39:39:27:27:0.409091:12:15:20:19:12:15:20:19
chr6	26045929	.	T	C	192.84	PASS	AF=0.423077;AO=22;DP=52;FAO=22;FDP=52;FR=.;FRO=30;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=-0.0378654;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.7983;QD=14.8339;RBI=0.0441182;REFB=0.0209479;REVB=-0.0226412;RO=29;SAF=9;SAR=13;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.208917;STB=0.609276;STBP=0.203;TYPE=snp;VARB=-0.0308169;OID=.;OPOS=26045929;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:29:30:22:22:0.423077:13:9:18:11:13:9:18:12
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chr6	26423317	.	G	A	441.12	PASS	AF=0.465347;AO=47;DP=101;FAO=47;FDP=101;FR=.;FRO=54;FSAF=6;FSAR=41;FSRF=18;FSRR=36;FWDB=0.0143669;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=164.389;QD=17.4702;RBI=0.0206896;REFB=-0.0332873;REVB=-0.014888;RO=53;SAF=6;SAR=41;SRF=17;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.301614;STB=0.680406;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.0381575;OID=.;OPOS=26423317;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:101:53:54:47:47:0.465347:41:6:17:36:41:6:18:36
chr6	26426487	.	G	A	122.46	PASS	AF=0.424242;AO=14;DP=34;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.0195862;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.631;QD=14.8437;RBI=0.0217907;REFB=-0.00465228;REVB=-0.00955072;RO=19;SAF=8;SAR=6;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00761006;STB=0.504418;STBP=0.989;TYPE=snp;VARB=0.00799095;OID=.;OPOS=26426487;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:33:19:19:14:14:0.424242:6:8:11:8:6:8:11:8
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chr6	26431340	.	A	G	289.41	PASS	AF=0.438356;AO=32;DP=73;FAO=32;FDP=73;FR=.;FRO=41;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=-0.0112821;FXX=0.0266631;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.869;QD=15.858;RBI=0.0179429;REFB=-0.00204358;REVB=-0.013952;RO=41;SAF=14;SAR=18;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0260904;STB=0.514722;STBP=0.842;TYPE=snp;VARB=0.00165774;OID=.;OPOS=26431340;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:41:41:32:32:0.438356:18:14:19:22:18:14:19:22
chr6	26443853	.	C	A	244.1	PASS	AF=0.5;AO=26;DP=52;FAO=26;FDP=52;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=-0.000414619;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=209.319;QD=18.7769;RBI=0.0181064;REFB=-0.015794;REVB=-0.0181017;RO=26;SAF=6;SAR=20;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.341518;STB=0.69291;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.0150413;OID=.;OPOS=26443853;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:26:26:26:26:0.5:20:6:15:11:20:6:15:11
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chr6	27271634	.	T	C	662.5	PASS	AF=0.465278;AO=67;DP=144;FAO=67;FDP=144;FR=.;FRO=77;FSAF=27;FSAR=40;FSRF=39;FSRR=38;FWDB=0.00455932;FXX=0.00689608;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.629;QD=18.4028;RBI=0.00948187;REFB=-0.0165832;REVB=0.00831375;RO=77;SAF=27;SAR=40;SRF=39;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101283;STB=0.556241;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=0.0194036;OID=.;OPOS=27271634;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:144:144:77:77:67:67:0.465278:40:27:39:38:40:27:39:38
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chr6	27277402	.	C	T	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.004191;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=231.102;QD=55.6561;RBI=0.0756539;REFB=0;REVB=-0.0755377;RO=0;SAF=19;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.06954e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000331425;OID=.;OPOS=27277402;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:8:19:0:0:8:19:0:0
chr6	27279774	.	C	T	304.91	PASS	AF=0.586957;AO=27;DP=46;FAO=27;FDP=46;FR=.;FRO=19;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.00188759;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.582;QD=26.5136;RBI=0.0139166;REFB=-0.000193143;REVB=0.0137879;RO=19;SAF=18;SAR=9;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.071558;STB=0.539653;STBP=0.538;TYPE=snp;VARB=0.000271122;OID=.;OPOS=27279774;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:19:19:27:27:0.586957:9:18:11:8:9:18:11:8
chr6	27279852	.	T	C	257.74	PASS	AF=0.519231;AO=27;DP=52;FAO=27;FDP=52;FR=.;FRO=25;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=-0.0100471;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.781;QD=19.8262;RBI=0.0179391;REFB=-0.00586308;REVB=-0.0148616;RO=25;SAF=18;SAR=9;SRF=17;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129802;STB=0.507241;STBP=0.933;TYPE=snp;VARB=0.00636755;OID=.;OPOS=27279852;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:25:25:27:27:0.519231:9:18:17:8:9:18:17:8
chr6	27300755	.	T	TA	689.6	PASS	AF=1;AO=62;DP=82;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.082992;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=13.7232;QD=34.48;RBI=0.157585;REFB=-0.00774079;REVB=0.13396;RO=18;SAF=24;SAR=38;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0239361;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.0047594;OID=.;OPOS=27300756;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:62:82:80:80:0:30:50:0:0:10:18:24:38:6:12
chr6	27327349	.	C	G	1048.88	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.035323;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.881;QD=59.936;RBI=0.0563063;REFB=0;REVB=0.0438484;RO=0;SAF=39;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000630839;OID=.;OPOS=27327349;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:70:0:0:69:70:1:30:39:0:0:30:40:0:0
chr6	27356867	.	A	G	1153.61	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00543668;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.969;QD=60.7162;RBI=0.005534;REFB=0;REVB=-0.00103328;RO=0;SAF=35;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.6145e-06;OID=.;OPOS=27356867;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:41:35:0:0:41:35:0:0
chr6	27473602	.	C	G	164.89	PASS	AF=0.377358;AO=20;DP=54;FAO=20;FDP=53;FR=.;FRO=33;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=22;FWDB=0.0137772;FXX=0.0185151;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.8485;QD=12.4443;RBI=0.0169902;REFB=-0.0022804;REVB=-0.00994263;RO=33;SAF=13;SAR=7;SRF=11;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.332136;STB=0.691558;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.00347504;OID=.;OPOS=27473602;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:53:33:33:20:20:0.377358:7:13:11:22:7:13:11:22
chr6	27551316	.	C	G	424.17	PASS	AF=0.377953;AO=46;DP=142;FAO=48;FDP=127;FR=.;FRO=79;FSAF=21;FSAR=27;FSRF=37;FSRR=42;FWDB=-0.00291312;FXX=0.136045;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.972;QD=13.3596;RBI=0.00871856;REFB=0.00323687;REVB=0.00821748;RO=55;SAF=21;SAR=25;SRF=26;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0158882;STB=0.519395;STBP=0.736;TYPE=snp;VARB=-0.00459815;OID=.;OPOS=27551316;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:142:127:55:79:46:48:0.377953:25:21:26:29:27:21:37:42
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chr6	27648908	.	C	G	292.01	PASS	AF=0.555556;AO=30;DP=54;FAO=30;FDP=54;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=0.0153583;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=354.519;QD=21.6305;RBI=0.0170488;REFB=0.00716233;REVB=0.00740178;RO=24;SAF=11;SAR=19;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0772067;STB=0.542828;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=-0.006168;OID=.;OPOS=27648908;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:24:24:30:30:0.555556:19:11:11:13:19:11:11:13
chr6	27650521	.	C	T	437.89	PASS	AF=0.530864;AO=43;DP=81;FAO=43;FDP=81;FR=.;FRO=38;FSAF=29;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=23;FWDB=-0.0193735;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.706;QD=21.6243;RBI=0.0250426;REFB=0.0244137;REVB=-0.0158682;RO=38;SAF=29;SAR=14;SRF=15;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.244451;STB=0.635223;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=-0.0163061;OID=.;OPOS=27650521;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:38:38:43:43:0.530864:14:29:15:23:14:29:15:23
chr6	27655994	.	T	G	448.16	PASS	AF=0.470588;AO=48;DP=102;FAO=48;FDP=102;FR=.;FRO=54;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=35;FSRR=19;FWDB=-0.0175373;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.029;QD=17.5749;RBI=0.0178579;REFB=-0.00597172;REVB=0.00336856;RO=54;SAF=22;SAR=26;SRF=35;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179168;STB=0.599474;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.00876944;OID=.;OPOS=27655994;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:54:54:48:48:0.470588:26:22:35:19:26:22:35:19
chr6	27694460	.	A	G	170.61	PASS	AF=0.349206;AO=22;DP=63;FAO=22;FDP=63;FR=.;FRO=41;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=27;FSRR=14;FWDB=0.0045057;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.827;QD=10.8325;RBI=0.00452392;REFB=-0.0174252;REVB=0.000405651;RO=41;SAF=8;SAR=14;SRF=27;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.321224;STB=0.686112;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.0184245;OID=.;OPOS=27694460;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:41:41:22:22:0.349206:14:8:27:14:14:8:27:14
chr6	27792221	.	C	T	575.26	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0306045;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.1291;QD=60.5538;RBI=0.0369154;REFB=0;REVB=0.0206425;RO=0;SAF=15;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000881916;OID=.;OPOS=27792221;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:23:15:0:0:23:15:0:0
chr6	27792228	.	T	C	575.79	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00095164;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.117;QD=60.6092;RBI=0.0142332;REFB=0;REVB=0.0142013;RO=0;SAF=15;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.32723e-05;OID=.;OPOS=27792228;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:23:15:0:0:23:15:0:0
chr6	28180818	.	G	C	602.44	PASS	AF=0.417178;AO=68;DP=163;FAO=68;FDP=163;FR=.;FRO=95;FSAF=32;FSAR=36;FSRF=53;FSRR=42;FWDB=0.0167467;FXX=0.00609719;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.4672;QD=14.7837;RBI=0.0978744;REFB=0.0148211;REVB=0.096431;RO=95;SAF=32;SAR=36;SRF=53;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0905993;STB=0.550741;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=-0.0166822;OID=.;OPOS=28180818;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:163:163:95:95:68:68:0.417178:36:32:53:42:36:32:53:42
chr6	28180870	.	A	C	481.42	PASS	AF=0.394161;AO=54;DP=140;FAO=54;FDP=137;FR=.;FRO=83;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=41;FSRR=42;FWDB=0.0336026;FXX=0.021427;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.602;QD=14.056;RBI=0.0717143;REFB=-0.00833911;REVB=-0.0633546;RO=85;SAF=24;SAR=30;SRF=43;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0666167;STB=0.530168;STBP=0.588;TYPE=snp;VARB=0.013835;OID=.;OPOS=28180870;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:140:137:85:83:54:54:0.394161:30:24:43:42:30:24:41:42
chr6	28180904	.	A	G	287.85	PASS	AF=0.33945;AO=37;DP=109;FAO=37;FDP=109;FR=.;FRO=72;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=33;FSRR=39;FWDB=-0.00964464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.511;QD=10.5631;RBI=0.028572;REFB=-0.00674617;REVB=-0.0268949;RO=72;SAF=15;SAR=22;SRF=33;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0618189;STB=0.535749;STBP=0.603;TYPE=snp;VARB=0.013466;OID=.;OPOS=28180904;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:109:72:72:37:37:0.33945:22:15:33:39:22:15:33:39
chr6	28213239	.	T	C	159.49	PASS	AF=0.472222;AO=17;DP=36;FAO=17;FDP=36;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.00491135;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.992;QD=17.7209;RBI=0.0507213;REFB=-0.00597695;REVB=0.0504829;RO=19;SAF=9;SAR=8;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00286962;STB=0.501637;STBP=0.981;TYPE=snp;VARB=0.009663;OID=.;OPOS=28213239;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:19:19:17:17:0.472222:8:9:10:9:8:9:10:9
chr6	28219270	.	G	A	859.91	PASS	AF=0.631148;AO=77;DP=122;FAO=77;FDP=122;FR=.;FRO=45;FSAF=45;FSAR=32;FSRF=22;FSRR=23;FWDB=-0.0295671;FXX=0.00812942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.3613;QD=28.1937;RBI=0.0384507;REFB=0.00997057;REVB=-0.0245814;RO=43;SAF=45;SAR=32;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0647083;STB=0.535821;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=-0.00617421;OID=.;OPOS=28219270;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:122:122:43:45:77:77:0.631148:32:45:21:22:32:45:22:23
chr6	28219496	.	C	T	87.46	PASS	AF=0.423077;AO=11;DP=26;FAO=11;FDP=26;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=0.0164428;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.243;QD=13.4558;RBI=0.0314549;REFB=-0.00458896;REVB=-0.026815;RO=15;SAF=8;SAR=3;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.385972;STB=0.726859;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.00648132;OID=.;OPOS=28219496;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:26:26:15:15:11:11:0.423077:3:8:5:10:3:8:5:10
chr6	28227436	.	A	G	451.38	PASS	AF=0.442478;AO=50;DP=112;FAO=50;FDP=113;FR=.;FRO=63;FSAF=32;FSAR=18;FSRF=32;FSRR=31;FWDB=1.1662e-05;FXX=0.00877116;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.931;QD=15.9782;RBI=0.00720075;REFB=-0.00979703;REVB=-0.00720074;RO=60;SAF=32;SAR=18;SRF=30;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141579;STB=0.576439;STBP=0.182;TYPE=snp;VARB=0.00962659;OID=.;OPOS=28227436;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:113:60:63:50:50:0.442478:18:32:30:30:18:32:32:31
chr6	28227604	.	C	A	163.68	PASS	AF=0.53125;AO=17;DP=32;FAO=17;FDP=32;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=0.0698965;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=54.9005;QD=20.4597;RBI=0.0720646;REFB=0.0352487;REVB=-0.0175439;RO=15;SAF=9;SAR=8;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161694;STB=0.591136;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=-0.0290209;OID=.;OPOS=28227604;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:15:15:17:17:0.53125:8:9:5:10:8:9:5:10
chr6	28228342	.	A	G	740.72	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00859746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.005;QD=56.9783;RBI=0.0157807;REFB=0;REVB=0.0132331;RO=0;SAF=30;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.1681e-05;OID=.;OPOS=28228342;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:52:0:0:51:52:1:21:30:0:0:21:31:0:0
chr6	28239873	.	A	G	349.24	PASS	AF=0.618182;AO=34;DP=55;FAO=34;FDP=55;FR=.;FRO=21;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.0172743;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.534;QD=25.3995;RBI=0.0184875;REFB=-0.0172187;REVB=-0.00658688;RO=21;SAF=21;SAR=13;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134328;STB=0.573726;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=0.017161;OID=.;OPOS=28239873;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:21:21:34:34:0.618182:13:21:9:12:13:21:9:12
chr6	28239932	.	T	TG	361.54	PASS	AF=1;AO=30;DP=33;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0294467;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=23.6749;QD=45.1922;RBI=0.0783312;REFB=0;REVB=0.0725856;RO=2;SAF=17;SAR=13;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00788608;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=4.42593e-05;OID=.;OPOS=28239933;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:30:33:32:32:0:19:13:0:0:7:2:17:13:1:1
chr6	28264681	.	G	A	198.36	PASS	AF=0.4;AO=24;DP=60;FAO=24;FDP=60;FR=.;FRO=36;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=14;FWDB=-0.00159859;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=277.616;QD=13.224;RBI=0.0115084;REFB=-0.0189016;REVB=-0.0113968;RO=36;SAF=9;SAR=15;SRF=22;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.245261;STB=0.64038;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=0.0269124;OID=.;OPOS=28264681;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:36:36:24:24:0.4:15:9:22:14:15:9:22:14
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chr6	28359186	.	C	T	224.61	PASS	AF=0.470588;AO=24;DP=51;FAO=24;FDP=51;FR=.;FRO=27;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=0.0292066;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.9066;QD=17.6164;RBI=0.0293587;REFB=-0.00183032;REVB=-0.0029843;RO=27;SAF=14;SAR=10;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0266285;STB=0.515038;STBP=0.854;TYPE=snp;VARB=0.00244917;OID=.;OPOS=28359186;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:27:27:24:24:0.470588:10:14:15:12:10:14:15:12
chr6	28483482	.	A	C	350.52	PASS	AF=0.445783;AO=37;DP=84;FAO=37;FDP=83;FR=.,HEALED;FRO=44;FSAF=24;FSAR=13;FSRF=25;FSRR=19;FWDB=-0.0177182;FXX=0.0119033;HRUN=5;LEN=1;MLLD=279.906;QD=16.8927;RBI=0.0318672;REFB=-0.0177377;REVB=-0.0264874;RO=36;SAF=24;SAR=13;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113;STB=0.546594;STBP=0.481;TYPE=snp;VARB=0.0122601;OID=.;OPOS=28483482;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:83:36:44:37:37:0.445783:13:24:19:17:13:24:25:19
chr6	28542424	.	G	A	122.31	PASS	AF=0.293103;AO=17;DP=57;FAO=17;FDP=58;FR=.;FRO=41;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=24;FSRR=17;FWDB=-0.0247218;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.3996;QD=8.43522;RBI=0.0404182;REFB=-0.00663849;REVB=-0.0319761;RO=40;SAF=11;SAR=6;SRF=24;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0588626;STB=0.546381;STBP=0.661;TYPE=snp;VARB=0.0157528;OID=.;OPOS=28542424;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:58:40:41:17:17:0.293103:6:11:24:16:6:11:24:17
chr6	28542520	.	C	T	328.65	PASS	AF=0.486111;AO=34;DP=72;FAO=35;FDP=72;FR=.;FRO=37;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=27;FSRR=10;FWDB=-0.00976374;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.376;QD=18.2582;RBI=0.0128332;REFB=-0.0193724;REVB=0.0083283;RO=37;SAF=16;SAR=18;SRF=26;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.214963;STB=0.637708;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.0187615;OID=.;OPOS=28542520;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:37:37:34:35:0.486111:18:16:26:11:19:16:27:10
chr6	28601934	.	A	T	613.29	PASS	AF=1;AO=39;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0725406;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.653;QD=61.3293;RBI=0.0725417;REFB=0;REVB=-0.000395422;RO=0;SAF=19;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.3303e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000535755;OID=.;OPOS=28601934;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:39:40:1:20:19:0:0:20:20:0:0
chr6	28616066	.	T	A	1245.92	PASS	AF=1;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00791124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.475;QD=61.527;RBI=0.052343;REFB=0;REVB=0.0517417;RO=0;SAF=37;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.61006e-05;OID=.;OPOS=28616066;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:81:0:0:81:81:1:44:37:0:0:44:37:0:0
chr6	28626098	.	G	A	624.46	PASS	AF=1;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0015569;FXX=0.0697512;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.806;QD=62.4463;RBI=0.0128414;REFB=0;REVB=-0.0127466;RO=0;SAF=21;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.89309e-05;OID=.;OPOS=28626098;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:40:0:0:40:40:1:19:21:0:0:19:21:0:0
chr6	28641689	.	A	G	320.48	PASS	AF=0.595745;AO=28;DP=47;FAO=28;FDP=47;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=0.010837;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.5203;QD=27.2748;RBI=0.0196541;REFB=0.00871601;REVB=0.0163964;RO=19;SAF=8;SAR=20;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0714414;STB=0.539539;STBP=0.555;TYPE=snp;VARB=-0.0113207;OID=.;OPOS=28641689;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:19:19:28:28:0.595745:20:8:7:12:20:8:7:12
chr6	28641695	.	C	G	178.95	PASS	AF=0.404255;AO=19;DP=47;FAO=19;FDP=47;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=20;FWDB=0.00290857;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.912;QD=15.2296;RBI=0.00353011;REFB=0.000810608;REVB=-0.00200047;RO=27;SAF=7;SAR=12;SRF=8;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0812567;STB=0.5544;STBP=0.573;TYPE=snp;VARB=-0.000679032;OID=.;OPOS=28641695;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:27:28:19:19:0.404255:12:7:8:19:12:7:8:20
chr6	28663703	.	G	A,GA	75.19	PASS	AF=0.04,0.34;AO=2,18;DP=51;FAO=2,17;FDP=50;FR=.;FRO=31;FSAF=2,13;FSAR=0,4;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=0.0714741,0.151904;FXX=0;HRUN=2,5;LEN=1,1;MLLD=33.0046,10.1337;QD=6.01495;RBI=0.0796924,0.170329;REFB=-0.0132935,-0.0318253;REVB=-0.0352467,-0.0770528;RO=28;SAF=2,12;SAR=0,6;SRF=18;SRR=10;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.411757,0.0277631;STB=0.993703,0.618896;STBP=0.217,0.272;TYPE=snp,ins;VARB=0.0881908,-0.012938;OID=.,.;OPOS=28663703,28663704;OREF=G,-;OALT=A,A;OMAPALT=A,GA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:66:51:50:28:31:2,18:2,17:0.04,0.34:0,6:2,12:18:10:0,4:2,13:19:12
chr6	28663716	.	A	G	834.41	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.005316;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.931;QD=57.5451;RBI=0.00601857;REFB=0;REVB=0.00282193;RO=0;SAF=33;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.30609e-05;OID=.;OPOS=28663716;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:25:33:0:0:25:33:0:0
chr6	28663754	.	T	C	1283.43	PASS	AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00488412;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.403;QD=61.852;RBI=0.0290295;REFB=0;REVB=0.0286156;RO=0;SAF=39;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.03564e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.67754e-05;OID=.;OPOS=28663754;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:44:39:0:0:44:39:0:0
chr6	28678357	.	T	C	556.8	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00126712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.54;QD=60.1944;RBI=0.0652982;REFB=0;REVB=0.0652859;RO=0;SAF=21;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.7558e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000455351;OID=.;OPOS=28678357;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:16:21:0:0:16:21:0:0
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chr6	29796376	.	C	A	583.37	PASS	AF=0.569892;AO=53;DP=94;FAO=53;FDP=93;FR=.;FRO=40;FSAF=27;FSAR=26;FSRF=24;FSRR=16;FWDB=-0.0179126;FXX=0.0106372;HRUN=2;LEN=1;MLLD=261.67;QD=25.0913;RBI=0.0179236;REFB=-0.0161191;REVB=-0.000625929;RO=39;SAF=27;SAR=26;SRF=24;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.082333;STB=0.53901;STBP=0.42;TYPE=snp;VARB=0.0123041;OID=.;OPOS=29796376;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:93:39:40:53:53:0.569892:26:27:24:15:26:27:24:16
chr6	29797696	.	A	G	660.82	PASS	AF=0.597938;AO=58;DP=96;FAO=58;FDP=97;FR=.;FRO=39;FSAF=24;FSAR=34;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=0.033889;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.6162;QD=27.2504;RBI=0.0908274;REFB=0.00568435;REVB=-0.0842684;RO=38;SAF=24;SAR=34;SRF=23;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13963;STB=0.571098;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=-0.0271628;OID=.;OPOS=29797696;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:97:38:39:58:58:0.597938:34:24:23:15:34:24:23:16
chr6	29798140	.	A	G	360.48	PASS	AF=0.486842;AO=37;DP=77;FAO=37;FDP=76;FR=.;FRO=39;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=0.0133301;FXX=0.0256377;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.724;QD=18.9726;RBI=0.0134631;REFB=0.00502739;REVB=0.0018872;RO=39;SAF=20;SAR=17;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0492065;STB=0.527426;STBP=0.665;TYPE=snp;VARB=-0.00311786;OID=.;OPOS=29798140;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:76:39:39:37:37:0.486842:17:20:19:20:17:20:19:20
chr6	29855580	.	GCCCTGACCCT	GCCCT,GCCCTGACCCA	411.28	PASS	AF=0.793103,0.206897;AO=23,6;DP=32;FAO=23,6;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=3,5;FSAR=20,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00873351,0.0602555;FXX=0.121175;HRUN=1,1;LEN=6,1;MLLD=291.138,79.5314;QD=56.7275;RBI=0.00874852,0.0602597;REFB=0,0;REVB=0.000512286,0.000709945;RO=0;SAF=3,5;SAR=20,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-3.18042e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.00182634,0.0558182;OID=.,.;OPOS=29855581,29855590;OREF=CCCTGA,T;OALT=-,A;OMAPALT=GCCCT,GCCCTGACCCA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.793103,0.206897:23,6:32:23,6:29:0:3,5:20,1:0:0:37:0:3,5:20,1:0:0
chr6	29855849	.	A	C	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0184128;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.0426;QD=44.6898;RBI=0.031403;REFB=0;REVB=-0.0254385;RO=0;SAF=7;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000211298;OID=.;OPOS=29855849;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:6:7:0:0:6:7:0:0
chr6	29855856	.	T	C	132.99	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.215842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=48.6871;QD=40.9207;RBI=0.222218;REFB=0;REVB=0.0528491;RO=0;SAF=7;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0577913;OID=.;OPOS=29855856;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:6:7:0:0:6:7:0:0
chr6	29855858	.	C	A	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00191388;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.074;QD=40.7629;RBI=0.0259168;REFB=0;REVB=0.0258461;RO=0;SAF=7;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000415089;OID=.;OPOS=29855858;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:3:7:0:0:3:7:0:0
chr6	29855862	.	AGA	GAT	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0218176;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=247.495;QD=40.7629;RBI=0.0280808;REFB=0;REVB=-0.0176783;RO=0;SAF=7;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=5.26755e-05;OID=.;OPOS=29855862;OREF=AGA;OALT=GAT;OMAPALT=GAT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:3:7:0:0:3:7:0:0
chr6	29855901	.	A	G	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0044078;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.888;QD=49.5988;RBI=0.0153585;REFB=0;REVB=-0.0147124;RO=0;SAF=12;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.81858e-05;OID=.;OPOS=29855901;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:6:12:0:0:6:12:0:0
chr6	29856330	.	G	A	743.09	PASS	AF=0.96;AO=48;DP=50;FAO=48;FDP=50;FR=.;FRO=2;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0248288;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.82;QD=59.4471;RBI=0.0255563;REFB=-0.0303917;REVB=0.00605442;RO=2;SAF=22;SAR=26;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00315391;STB=0.501677;STBP=0.874;TYPE=snp;VARB=0.000851639;OID=.;OPOS=29856330;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:50:50:2:2:48:48:0.96:26:22:1:1:26:22:1:1
chr6	29856347	.	C	T	676.78	PASS	AF=0.977778;AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0124318;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=258.589;QD=60.1583;RBI=0.0163836;REFB=-0.0578401;REVB=0.0106711;RO=1;SAF=19;SAR=25;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0184224;STB=0.509799;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.000784443;OID=.;OPOS=29856347;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:45:45:1:1:44:44:0.977778:25:19:0:1:25:19:0:1
chr6	29856427	.	G	A	499.61	PASS	AF=0.945946;AO=35;DP=37;FAO=35;FDP=37;FR=.;FRO=2;FSAF=11;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0280033;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=123.19;QD=54.0117;RBI=0.0432787;REFB=0.0732074;REVB=0.032998;RO=2;SAF=11;SAR=24;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0215572;STB=0.511539;STBP=0.557;TYPE=snp;VARB=-0.00118343;OID=.;OPOS=29856427;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:37:37:2:2:35:35:0.945946:24:11:1:1:24:11:1:1
chr6	29856550	.	C	G	435.41	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0167666;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.29;QD=58.0552;RBI=0.021814;REFB=0;REVB=-0.0139547;RO=0;SAF=15;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000429811;OID=.;OPOS=29856550;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:15:15:0:0:15:15:0:0
chr6	29856633	.	T	C	435.64	PASS	AF=0.96875;AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0266931;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.8961;QD=54.4551;RBI=0.039511;REFB=-0.107077;REVB=-0.0291307;RO=1;SAF=20;SAR=11;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0405228;STB=0.521725;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=0.00213853;OID=.;OPOS=29856633;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:32:32:1:1:31:31:0.96875:11:20:0:1:11:20:0:1
chr6	29856686	.	C	G	465.08	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.042055;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=140.527;QD=58.1347;RBI=0.0420837;REFB=0;REVB=-0.00155506;RO=0;SAF=21;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000263175;OID=.;OPOS=29856686;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:11:21:0:0:11:21:0:0
chr6	29856693	.	C	T	483.85	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0114184;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.693;QD=58.648;RBI=0.0241568;REFB=0;REVB=0.0212878;RO=0;SAF=21;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.03707e-05;OID=.;OPOS=29856693;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:33:0:0:32:33:1:11:21:0:0:12:21:0:0
chr6	29856718	.	G	C	543.71	PASS	AF=1;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0076388;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.3492;QD=60.412;RBI=0.0292319;REFB=0;REVB=0.0282162;RO=0;SAF=21;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00136473;OID=.;OPOS=29856718;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:36:0:0:36:36:1:15:21:0:0:15:21:0:0
chr6	29910358	.	C	G	740.39	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00219826;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.6977;QD=56.9527;RBI=0.0304691;REFB=0;REVB=0.0303897;RO=0;SAF=25;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000423874;OID=.;OPOS=29910358;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:27:25:0:0:27:25:0:0
chr6	29910378	.	C	T	187.25	PASS	AF=0.485714;AO=17;DP=35;FAO=17;FDP=35;FR=.,HEALED;FRO=15;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.0197801;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=267.01;QD=21.4001;RBI=0.0203287;REFB=-0.00826008;REVB=0.00469081;RO=13;SAF=5;SAR=12;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144048;STB=0.590053;STBP=0.34;TYPE=snp;VARB=0.00783494;OID=.;OPOS=29910378;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:13:15:17:17:0.485714:12:5:6:7:12:5:7:8
chr6	29910402	.	G	A	100.24	PASS	AF=0.428571;AO=12;DP=29;FAO=12;FDP=28;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=0.0533572;FXX=0.0344709;HRUN=3;LEN=1;MLLD=151.386;QD=14.3199;RBI=0.0593065;REFB=-0.00661494;REVB=0.0258897;RO=16;SAF=7;SAR=5;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.259872;STB=0.650922;STBP=0.188;TYPE=snp;VARB=0.00563495;OID=.;OPOS=29910402;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:28:16:16:12:12:0.428571:5:7:5:11:5:7:5:11
chr6	29910538	.	C	T	49.59	PASS	AF=0.538462;AO=7;DP=13;FAO=7;FDP=13;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=-0.013503;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=266.695;QD=15.2589;RBI=0.0222397;REFB=-0.00754448;REVB=-0.0176712;RO=6;SAF=2;SAR=5;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.329175;STB=0.6871;STBP=0.357;TYPE=snp;VARB=0.0121405;OID=.;OPOS=29910538;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:13:13:6:6:7:7:0.538462:5:2:0:6:5:2:0:6
chr6	29910604	.	C	A	115.91	PASS	AF=0.565217;AO=13;DP=23;FAO=13;FDP=23;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=0.0108684;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.473;QD=20.1574;RBI=0.0199031;REFB=-0.036902;REVB=-0.0166736;RO=10;SAF=5;SAR=8;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156207;STB=0.588109;STBP=0.422;TYPE=snp;VARB=0.0207755;OID=.;OPOS=29910604;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:23:23:10:10:13:13:0.565217:8:5:2:8:8:5:2:8
chr6	29910700	.	G	T	92.22	PASS	AF=0.55;AO=11;DP=20;FAO=11;FDP=20;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.0152288;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=151.86;QD=18.4431;RBI=0.0160182;REFB=-0.0157051;REVB=0.00496644;RO=9;SAF=2;SAR=9;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.270831;STB=0.658211;STBP=0.18;TYPE=snp;VARB=0.00446754;OID=.;OPOS=29910700;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:20:20:9:9:11:11:0.55:9:2:4:5:9:2:4:5
chr6	29910716	.	CA	GA,GG	146.12	PASS	AF=0.461538,0.538462;AO=6,7;DP=14;FAO=6,7;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=2,2;FSAR=4,5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0111005,0.00857602;FXX=0.0713776;HRUN=2,2;LEN=1,2;MLLD=92.885,139.943;QD=44.9593;RBI=0.0232362,0.00881367;REFB=0,0;REVB=-0.0204132,-0.0020329;RO=0;SAF=2,2;SAR=4,5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-3.27427e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=-0.00632667,0.0173293;OID=.,.;OPOS=29910716,29910716;OREF=C,CA;OALT=G,GG;OMAPALT=GA,GG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:40:14:13:0:0:6,7:6,7:0.461538,0.538462:4,5:2,2:0:0:4,5:2,2:0:0
chr6	29910730	.	T	A	145.22	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0530706;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.974;QD=44.6843;RBI=0.053194;REFB=0;REVB=-0.00362214;RO=0;SAF=5;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000599839;OID=.;OPOS=29910730;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:8:5:0:0:8:5:0:0
chr6	29910742	.	G	C	145.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.143186;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.4837;QD=44.7565;RBI=0.144735;REFB=0;REVB=-0.021116;RO=0;SAF=4;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00568774;OID=.;OPOS=29910742;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:13:0:0:12:13:1:8:4:0:0:8:5:0:0
chr6	29910752	.	G	C	50.47	PASS	AF=0.583333;AO=7;DP=12;FAO=7;FDP=12;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0408895;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.597;QD=16.8228;RBI=0.0434865;REFB=-0.0134835;REVB=-0.0148027;RO=5;SAF=3;SAR=4;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0206743;STB=0.51216;STBP=0.999;TYPE=snp;VARB=0.0136099;OID=.;OPOS=29910752;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:12:12:5:5:7:7:0.583333:4:3:2:3:4:3:2:3
chr6	29911056	.	A	C,G	193.43	PASS	AF=0.722222,0.222222;AO=13,4;DP=18;FAO=13,4;FDP=18;FR=.;FRO=1;FSAF=11,1;FSAR=2,3;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0078565,-0.0430396;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=118.237,47.0229;QD=42.9841;RBI=0.0153696,0.0440048;REFB=-0.0897667,-0.12282;REVB=-0.0132099,-0.00916611;RO=0;SAF=11,1;SAR=2,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-4.86674e-08;STB=0.599828,0.571096;STBP=0.113,0.672;TYPE=snp,snp;VARB=0.00428256,0.0189063;OID=.,.;OPOS=29911056,29911056;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:22:18:18:0:1:13,4:13,4:0.722222,0.222222:2,3:11,1:0:0:2,3:11,1:0:1
chr6	29911063	.	TA	GG,TG	281.55	PASS	AF=0.227273,0.772727;AO=5,17;DP=22;FAO=5,17;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=1,12;FSAR=4,5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000717483,-0.00786904;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=2,1;MLLD=91.2385,120.286;QD=51.1909;RBI=0.0373875,0.10414;REFB=0,0;REVB=-0.0373806,-0.103842;RO=0;SAF=1,12;SAR=4,5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0184119,-0.00411725;OID=.,.;OPOS=29911063,29911064;OREF=TA,A;OALT=GG,G;OMAPALT=GG,TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:27:22:22:0:0:5,17:5,17:0.227273,0.772727:4,5:1,12:0:0:4,5:1,12:0:0
chr6	29911069	.	A	T	176.25	PASS	AF=0.708333;AO=17;DP=24;FAO=17;FDP=24;FR=.;FRO=7;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=-0.00216216;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.46;QD=29.3742;RBI=0.00912464;REFB=-0.00146346;REVB=0.00886477;RO=7;SAF=12;SAR=5;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.305719;STB=0.669845;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.000466129;OID=.;OPOS=29911069;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:24:24:7:7:17:17:0.708333:5:12:1:6:5:12:1:6
chr6	29911114	.	GG	AC	383.92	PASS	AF=1;AO=22;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0123025;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=103.562;QD=54.8451;RBI=0.0164958;REFB=0;REVB=-0.0109892;RO=0;SAF=9;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2029e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.00204567;OID=.;OPOS=29911114;OREF=GG;OALT=AC;OMAPALT=AC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:22:28:1:13:9:0:0:15:13:0:0
chr6	29911119	.	G	T	429.01	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0374744;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.73;QD=57.2015;RBI=0.0375294;REFB=0;REVB=0.00203144;RO=0;SAF=13;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.63861e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000332219;OID=.;OPOS=29911119;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:17:13:0:0:17:13:0:0
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chr6	29912398	.	A	G	86.63	PASS	AF=0.34375;AO=11;DP=32;FAO=11;FDP=32;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.0231564;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=300.431;QD=10.8284;RBI=0.0320193;REFB=-0.00951577;REVB=0.0221138;RO=20;SAF=8;SAR=3;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.21057;STB=0.645683;STBP=0.278;TYPE=snp;VARB=0.018767;OID=.;OPOS=29912398;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:32:32:20:21:11:11:0.34375:3:8:11:9:3:8:11:10
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chr6	29912830	.	T	C	902.71	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.036149;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.185;QD=58.2396;RBI=0.0361701;REFB=0;REVB=0.00123734;RO=0;SAF=35;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.46408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.05878e-05;OID=.;OPOS=29912830;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:27:35:0:0:27:35:0:0
chr6	29912852	.	T	C	937.61	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0187899;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.607;QD=58.6005;RBI=0.0407465;REFB=0;REVB=0.0361554;RO=0;SAF=37;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.1743e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000180953;OID=.;OPOS=29912852;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:27:37:0:0:27:37:0:0
chr6	29912856	.	A	T	841.01	PASS	AF=1;AO=59;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0353325;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.8796;QD=56.0671;RBI=0.0353405;REFB=-0.0442369;REVB=0.000752197;RO=1;SAF=34;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0136765;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00133243;OID=.;OPOS=29912856;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:60:60:1:0:59:60:1:25:34:1:0:25:35:0:0
chr6	29913042	.	C	T	1172.01	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00763846;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=268.67;QD=60.8835;RBI=0.017791;REFB=0;REVB=0.0160678;RO=0;SAF=38;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.71802e-05;OID=.;OPOS=29913042;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:77:0:0:76:77:1:38:38:0:0:39:38:0:0
chr6	29913067	.	T	C	212.36	PASS	AF=0.423729;AO=25;DP=59;FAO=25;FDP=59;FR=.;FRO=34;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=-0.0141034;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.1821;QD=14.3973;RBI=0.0845364;REFB=-0.00544931;REVB=0.0833516;RO=34;SAF=15;SAR=10;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.012358;STB=0.507037;STBP=0.955;TYPE=snp;VARB=0.00902249;OID=.;OPOS=29913067;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:34:34:25:25:0.423729:10:15:20:14:10:15:20:14
chr6	29913074	.	A	G	804.4	PASS	AF=1;AO=52;DP=53;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0208035;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.623;QD=56.449;RBI=0.0430581;REFB=0;REVB=0.0376991;RO=0;SAF=33;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.0907e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00662538;OID=.;OPOS=29913074;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:57:0:0:52:57:1:19:33:0:0:23:34:0:0
chr6	29913078	.	A	G	786.84	PASS	AF=0.982456;AO=55;DP=56;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0148136;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=238.718;QD=55.2168;RBI=0.0149885;REFB=-0.0650321;REVB=0.00228286;RO=1;SAF=32;SAR=23;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0145046;STB=0.50746;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.00125048;OID=.;OPOS=29913078;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:56:57:1:1:55:56:0.982456:23:32:1:0:23:33:1:0
chr6	29913211	.	AATA	AATAT,AA,AAT,AATT	362.84	PASS	AF=0.0655738,0,0.557377,0.0327869;AO=7,9,17,5;DP=59;FAO=4,0,34,2;FDP=61;FR=.;FRO=21;FSAF=3,0,20,2;FSAR=1,0,14,0;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=0.126275,-0.019374,-0.0176769,-0.0160222;FXX=0;HRUN=7,1,1,1;LEN=1,2,1,1;MLLD=4.49733,210.043,213.821,212.775;QD=23.7925;RBI=0.412579,0.0344866,0.0622059,0.0765539;REFB=-0.245403,0.0235107,0.0196274,0.0168927;REVB=0.39278,0.0285302,0.0596415,0.0748585;RO=13;SAF=6,2,12,4;SAR=1,7,5,1;SRF=8;SRR=5;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=0.343745,-0.406226,0.0804595,0.247161;STB=0.66578,0.5,0.506604,0.993969;STBP=0.538,1,0.912,0.197;TYPE=ins,del,del,snp;VARB=0.288486,0,-0.0043492,-0.0335084;OID=.,.,.,.;OPOS=29913215,29913212,29913214,29913214;OREF=-,AT,A,A;OALT=T,-,-,T;OMAPALT=AATAT,AA,AAT,AATT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/3:0.0655738,0,0.557377,0.0327869:7,9,17,5:59:4,0,34,2:61:21:3,0,20,2:1,0,14,0:12:9:99:13:6,2,12,4:1,7,5,1:8:5
chr6	29976838	.	A	G	1153.56	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0226171;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.9398;QD=60.7139;RBI=0.0418394;REFB=0;REVB=-0.0351995;RO=0;SAF=34;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6391e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.80761e-05;OID=.;OPOS=29976838;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:42:34:0:0:42:34:0:0
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chr6	30115542	.	G	A	212.8	PASS	AF=0.5;AO=21;DP=42;FAO=21;FDP=42;FR=.;FRO=21;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=-0.0558587;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.7545;QD=20.2663;RBI=0.0722958;REFB=0.0159801;REVB=0.0458964;RO=21;SAF=14;SAR=7;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17663;STB=0.599902;STBP=0.2;TYPE=snp;VARB=-0.0156802;OID=.;OPOS=30115542;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:21:21:21:21:0.5:7:14:10:11:7:14:10:11
chr6	30121460	.	C	T	135.87	PASS	AF=0.321429;AO=18;DP=56;FAO=18;FDP=56;FR=.;FRO=38;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=28;FSRR=10;FWDB=-0.02132;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=294.795;QD=9.70529;RBI=0.0260443;REFB=0.00530631;REVB=0.0149587;RO=38;SAF=13;SAR=5;SRF=28;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0211197;STB=0.512486;STBP=0.924;TYPE=snp;VARB=-0.0104111;OID=.;OPOS=30121460;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:38:38:18:18:0.321429:5:13:28:10:5:13:28:10
chr6	30122154	.	T	C	758.69	PASS	AF=0.964912;AO=55;DP=57;FAO=55;FDP=57;FR=.;FRO=2;FSAF=31;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.000109556;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.727;QD=53.2412;RBI=0.0172426;REFB=-0.0222356;REVB=-0.0172422;RO=2;SAF=31;SAR=24;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00427299;STB=0.502267;STBP=0.883;TYPE=snp;VARB=0.000898119;OID=.;OPOS=30122154;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:57:57:2:2:55:55:0.964912:24:31:1:1:24:31:1:1
chr6	30131515	.	C	A	533.31	PASS	AF=0.535354;AO=53;DP=101;FAO=53;FDP=99;FR=.;FRO=46;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=25;FSRR=21;FWDB=-0.0153437;FXX=0.0198;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.4358;QD=21.5479;RBI=0.0717215;REFB=-0.0176173;REVB=0.070061;RO=46;SAF=22;SAR=31;SRF=25;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109316;STB=0.560146;STBP=0.216;TYPE=snp;VARB=0.0106463;OID=.;OPOS=30131515;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:99:46:46:53:53:0.535354:31:22:25:21:31:22:25:21
chr6	30139699	.	G	A	394.9	PASS	AF=0.403509;AO=44;DP=112;FAO=46;FDP=114;FR=.;FRO=68;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=31;FSRR=37;FWDB=0.00479305;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.908;QD=13.8562;RBI=0.00497505;REFB=-0.0102574;REVB=0.00133336;RO=67;SAF=22;SAR=22;SRF=31;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0397615;STB=0.526304;STBP=0.665;TYPE=snp;VARB=0.016945;OID=.;OPOS=30139699;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:114:67:68:44:46:0.403509:22:22:31:36:23:23:31:37
chr6	30140342	.	T	C	1135.25	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00564507;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.346;QD=60.5467;RBI=0.00599739;REFB=0;REVB=0.0020253;RO=0;SAF=41;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.35516e-05;OID=.;OPOS=30140342;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:34:41:0:0:34:41:0:0
chr6	30154199	.	T	C	505.73	PASS	AF=1;AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0205725;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.992;QD=59.4973;RBI=0.0225551;REFB=0;REVB=0.00924681;RO=0;SAF=21;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.64576e-05;OID=.;OPOS=30154199;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:34:0:0:34:34:1:13:21:0:0:13:21:0:0
chr6	30166266	.	C	T	197.7	PASS	AF=0.47619;AO=20;DP=42;FAO=20;FDP=42;FR=.;FRO=22;FSAF=19;FSAR=1;FSRF=19;FSRR=3;FWDB=-0.00974556;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=282.729;QD=18.8287;RBI=0.0154166;REFB=-0.0234545;REVB=-0.0119455;RO=22;SAF=19;SAR=1;SRF=19;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.284532;STB=0.666454;STBP=0.248;TYPE=snp;VARB=0.0256945;OID=.;OPOS=30166266;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:22:22:20:20:0.47619:1:19:19:3:1:19:19:3
chr6	30227583	.	C	G	123.79	PASS	AF=0.518519;AO=13;DP=27;FAO=14;FDP=27;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.00572454;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.7531;QD=18.3386;RBI=0.0423046;REFB=-0.0193374;REVB=0.0419155;RO=13;SAF=4;SAR=9;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146024;STB=0.595095;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.0240807;OID=.;OPOS=30227583;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:13:13:13:14:0.518519:9:4:6:7:10:4:6:7
chr6	30228230	.	A	C	758.75	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0322592;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.867;QD=57.2641;RBI=0.0737847;REFB=0;REVB=0.0663591;RO=0;SAF=24;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000210238;OID=.;OPOS=30228230;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:53:0:0:52:53:1:28:24:0:0:29:24:0:0
chr6	30228379	.	A	G	465.07	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0268868;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.013;QD=58.134;RBI=0.0330521;REFB=0;REVB=0.0192235;RO=0;SAF=17;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000224007;OID=.;OPOS=30228379;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:15:17:0:0:15:17:0:0
chr6	30228398	.	CG	C	226.94	PASS	AF=1;AO=23;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0140249;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=13.0259;QD=31.3018;RBI=0.0794242;REFB=-0.0293404;REVB=0.0781761;RO=5;SAF=10;SAR=13;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0546704;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00874245;OID=.;OPOS=30228399;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:23:29:29:29:0:14:15:0:0:3:5:10:13:3:2
chr6	30229013	.	A	G	471.22	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0512394;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.177;QD=58.9023;RBI=0.0545838;REFB=0;REVB=0.0188127;RO=0;SAF=18;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000436983;OID=.;OPOS=30229013;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:14:18:0:0:14:18:0:0
chr6	30229034	.	C	CT	320.98	PASS	AF=1;AO=26;DP=30;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00936125;FXX=0.0666445;HRUN=1;LEN=1;MLLD=30.3292;QD=45.8547;RBI=0.0501584;REFB=0;REVB=0.0492771;RO=1;SAF=16;SAR=10;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0441872;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00303031;OID=.;OPOS=30229035;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:26:30:28:28:0:17:11:0:0:6:1:16:10:0:1
chr6	30229457	.	C	T	1145.8	PASS	AF=1;AO=75;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0120513;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.0007;QD=60.3053;RBI=0.0235478;REFB=0;REVB=0.0202303;RO=0;SAF=43;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00278761;OID=.;OPOS=30229457;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:75:76:1:32:43:0:0:32:44:0:0
chr6	30229463	.	G	A	1120.95	PASS	AF=0.986842;AO=75;DP=76;FAO=75;FDP=76;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0143799;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=221.067;QD=58.9976;RBI=0.0223158;REFB=-0.116954;REVB=0.017065;RO=1;SAF=44;SAR=31;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.010633;STB=0.505616;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.000268866;OID=.;OPOS=30229463;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:76:76:1:1:75:75:0.986842:31:44:1:0:31:44:1:0
chr6	30230085	.	T	C	584.12	PASS	AF=1;AO=26;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.202933;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.706;QD=61.4864;RBI=0.203388;REFB=0;REVB=0.0135868;RO=0;SAF=6;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.14057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000863874;OID=.;OPOS=30230085;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:26:38:1:20:6:0:0:20:18:0:0
chr6	30231071	.	G	A	894.36	PASS	AF=0.984375;AO=61;DP=64;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0139569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.5937;QD=55.8977;RBI=0.0520368;REFB=-0.137777;REVB=0.0501301;RO=0;SAF=31;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508194;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=0.00306879;OID=.;OPOS=30231071;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:64:64:0:1:61:63:0.984375:30:31:0:0:30:33:0:1
chr6	30231108	.	G	T	1036.01	PASS	AF=0.972603;AO=71;DP=73;FAO=71;FDP=73;FR=.;FRO=2;FSAF=37;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0289321;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.8265;QD=56.7675;RBI=0.0451711;REFB=-0.103983;REVB=0.0346895;RO=2;SAF=37;SAR=34;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0270022;STB=0.514282;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.00348528;OID=.;OPOS=30231108;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:73:73:2:2:71:71:0.972603:34:37:0:2:34:37:0:2
chr6	30297529	.	T	C	885.43	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00137029;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.192;QD=58.061;RBI=0.00820497;REFB=0;REVB=0.00808973;RO=0;SAF=29;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.04556e-05;OID=.;OPOS=30297529;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:32:29:0:0:32:29:0:0
chr6	30309508	.	T	C	1070.69	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0258008;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.793;QD=59.4825;RBI=0.050032;REFB=0;REVB=0.0428663;RO=0;SAF=45;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000128691;OID=.;OPOS=30309508;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:67:72:0:0:67:72:1:22:45:0:0:23:49:0:0
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chr6	30671760	.	C	T	685.31	PASS	AF=0.564103;AO=66;DP=118;FAO=66;FDP=117;FR=.;FRO=51;FSAF=23;FSAR=43;FSRF=18;FSRR=33;FWDB=-0.00263919;FXX=0.00847386;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.8715;QD=23.4294;RBI=0.00371878;REFB=-0.0404366;REVB=-0.00261993;RO=51;SAF=23;SAR=43;SRF=18;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00390866;STB=0.502136;STBP=0.974;TYPE=snp;VARB=0.0310232;OID=.;OPOS=30671760;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:118:117:51:51:66:66:0.564103:43:23:18:33:43:23:18:33
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chr6	30711805	.	C	G	786.46	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00822765;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.614;QD=64.201;RBI=0.026642;REFB=0;REVB=0.0253397;RO=0;SAF=20;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.12549e-05;OID=.;OPOS=30711805;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:49:0:0:47:49:1:27:20:0:0:27:22:0:0
chr6	30712327	.	G	A	200.07	PASS	AF=0.442308;AO=23;DP=52;FAO=23;FDP=52;FR=.;FRO=29;FSAF=19;FSAR=4;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=0.0263513;FXX=0.0188644;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.0237;QD=15.3899;RBI=0.0698363;REFB=-0.00579032;REVB=0.064674;RO=29;SAF=19;SAR=4;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.23617;STB=0.63623;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=0.00814573;OID=.;OPOS=30712327;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:29:29:23:23:0.442308:4:19:19:10:4:19:19:10
chr6	30782105	.	T	C	1162.66	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0288043;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.532;QD=60.3979;RBI=0.0370706;REFB=0;REVB=-0.0233354;RO=0;SAF=38;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.26695e-05;OID=.;OPOS=30782105;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:77:0:0:76:77:1:38:38:0:0:39:38:0:0
chr6	30782218	.	C	CTGTT	325.35	PASS	AF=0.418605;AO=35;DP=86;FAO=36;FDP=86;FR=.;FRO=50;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=31;FWDB=-0.0113303;FXX=0;HRUN=1;LEN=4;MLLD=260.939;QD=15.1324;RBI=0.0164623;REFB=-0.00965647;REVB=-0.0119429;RO=50;SAF=19;SAR=16;SRF=19;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167907;STB=0.585319;STBP=0.198;TYPE=ins;VARB=0.0120123;OID=.;OPOS=30782219;OREF=-;OALT=TGTT;OMAPALT=CTGTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.418605:35:86:36:86:50:19:17:19:31:99:50:19:16:19:31
chr6	30782235	.	G	A	1208.86	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0240302;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.517;QD=61.2081;RBI=0.0245487;REFB=0;REVB=0.005019;RO=0;SAF=32;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.45895e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.48249e-05;OID=.;OPOS=30782235;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:47:32:0:0:47:32:0:0
chr6	30782303	.	C	T	728.74	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186084;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.204;QD=57.1557;RBI=0.0193386;REFB=0;REVB=0.00526412;RO=0;SAF=27;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.29386e-05;OID=.;OPOS=30782303;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:51:0:0:50:51:1:23:27:0:0:24:27:0:0
chr6	30782323	.	T	C	175.15	PASS	AF=0.514286;AO=18;DP=35;FAO=18;FDP=35;FR=.;FRO=17;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=14;FWDB=0.0273831;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.152;QD=20.0174;RBI=0.0307258;REFB=-0.021485;REVB=0.0139371;RO=16;SAF=10;SAR=8;SRF=3;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.301636;STB=0.678832;STBP=0.06;TYPE=snp;VARB=0.0194704;OID=.;OPOS=30782323;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:16:17:18:18:0.514286:8:10:3:13:8:10:3:14
chr6	30782361	.	G	A	77.93	PASS	AF=0.4;AO=10;DP=25;FAO=10;FDP=25;FR=.;FRO=15;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.000502846;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.613;QD=12.4687;RBI=0.00197336;REFB=-0.0111255;REVB=0.00190822;RO=14;SAF=1;SAR=9;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.467302;STB=0.808233;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.0143982;OID=.;OPOS=30782361;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:25:25:14:15:10:10:0.4:9:1:6:8:9:1:7:8
chr6	30782407	.	A	G	557.13	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186193;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=200.165;QD=60.2306;RBI=0.0236171;REFB=0;REVB=0.0145289;RO=0;SAF=19;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.68991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000133537;OID=.;OPOS=30782407;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:18:19:0:0:18:19:0:0
chr6	30832063	.	C	T	496.46	PASS	AF=0.505263;AO=48;DP=95;FAO=48;FDP=95;FR=.;FRO=47;FSAF=17;FSAR=31;FSRF=19;FSRR=28;FWDB=0.0205738;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=248.668;QD=20.9037;RBI=0.0208995;REFB=-0.000875017;REVB=0.00367539;RO=47;SAF=17;SAR=31;SRF=19;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0481188;STB=0.526652;STBP=0.633;TYPE=snp;VARB=0.00085096;OID=.;OPOS=30832063;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:47:47:48:48:0.505263:31:17:19:28:31:17:19:28
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chr6	30858857	.	C	T	687.47	PASS	AF=0.540323;AO=67;DP=124;FAO=67;FDP=124;FR=.;FRO=57;FSAF=36;FSAR=31;FSRF=29;FSRR=28;FWDB=-0.0155917;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.4506;QD=22.1764;RBI=0.0173355;REFB=-0.0331918;REVB=-0.00757754;RO=57;SAF=36;SAR=31;SRF=29;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0240193;STB=0.513164;STBP=0.765;TYPE=snp;VARB=0.0186859;OID=.;OPOS=30858857;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:124:124:57:57:67:67:0.540323:31:36:29:28:31:36:29:28
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chr6	30887972	.	C	T	610.32	PASS	AF=0.560748;AO=60;DP=107;FAO=60;FDP=107;FR=.;FRO=47;FSAF=37;FSAR=23;FSRF=18;FSRR=29;FWDB=0.0182529;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=223.359;QD=22.8155;RBI=0.0201714;REFB=-0.0306185;REVB=-0.00858602;RO=46;SAF=37;SAR=23;SRF=18;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18029;STB=0.603289;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.021445;OID=.;OPOS=30887972;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:107:46:47:60:60:0.560748:23:37:18:28:23:37:18:29
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chr6	30889389	.	T	C	215.05	PASS	AF=0.488372;AO=21;DP=45;FAO=21;FDP=43;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=6;FWDB=0.0284293;FXX=0.0444346;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.7077;QD=20.0042;RBI=0.0294223;REFB=-0.00686423;REVB=0.00757913;RO=22;SAF=12;SAR=9;SRF=16;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148248;STB=0.583258;STBP=0.321;TYPE=snp;VARB=0.0115467;OID=.;OPOS=30889389;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:43:22:22:21:21:0.488372:9:12:16:6:9:12:16:6
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chr6	30900427	.	T	G	786.37	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.012665;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.727;QD=64.1933;RBI=0.0261305;REFB=0;REVB=0.0228561;RO=0;SAF=32;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000106513;OID=.;OPOS=30900427;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:49:0:0:47:49:1:15:32:0:0:16:33:0:0
chr6	30900435	.	G	T	266.11	PASS	AF=0.5;AO=25;DP=50;FAO=25;FDP=50;FR=.;FRO=25;FSAF=19;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=-0.00304683;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.8848;QD=21.2887;RBI=0.028294;REFB=-0.0396175;REVB=0.0281295;RO=25;SAF=19;SAR=6;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173971;STB=0.598341;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=0.0429621;OID=.;OPOS=30900435;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:25:25:25:25:0.5:6:19:15:10:6:19:15:10
chr6	30920890	.	G	A	237.68	PASS	AF=0.490196;AO=25;DP=51;FAO=25;FDP=51;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=0.00962575;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.473;QD=18.6417;RBI=0.00988568;REFB=-0.00240158;REVB=-0.00225201;RO=26;SAF=12;SAR=13;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0529666;STB=0.529757;STBP=0.695;TYPE=snp;VARB=0.00158789;OID=.;OPOS=30920890;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:26:26:25:25:0.490196:13:12:14:12:13:12:14:12
chr6	30993377	.	T	A	557.08	PASS	AF=1;AO=36;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0298008;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.3915;QD=60.2249;RBI=0.03062;REFB=0;REVB=0.0070353;RO=0;SAF=25;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.58193e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000262851;OID=.;OPOS=30993377;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:36:37:1:11:25:0:0:12:25:0:0
chr6	30993440	.	G	A	262.16	PASS	AF=0.585366;AO=22;DP=39;FAO=24;FDP=41;FR=.;FRO=17;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.0416911;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.6168;QD=25.5762;RBI=0.041755;REFB=-0.0256995;REVB=-0.00230886;RO=17;SAF=15;SAR=7;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.081208;STB=0.557327;STBP=0.414;TYPE=snp;VARB=0.0506815;OID=.;OPOS=30993440;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:41:17:17:22:24:0.585366:7:15:10:7:7:17:10:7
chr6	30993499	.	C	T	147.46	PASS	AF=0.444444;AO=16;DP=37;FAO=16;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=2;FWDB=0.0477408;FXX=0.0270197;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.8525;QD=16.3841;RBI=0.0515591;REFB=-0.0223586;REVB=0.0194719;RO=20;SAF=10;SAR=6;SRF=18;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.316371;STB=0.677241;STBP=0.151;TYPE=snp;VARB=0.00719121;OID=.;OPOS=30993499;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:36:20:20:16:16:0.444444:6:10:18:2:6:10:18:2
chr6	30993532	.	TA	T,TG	353.07	PASS	AF=0.0384615,0.961538;AO=5,21;DP=26;FAO=1,25;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=1,15;FSAR=0,10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0146564,0.018983;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=234.222,253.871;QD=54.3188;RBI=0.0674013,0.0833759;REFB=0,0;REVB=0.0657884,0.0811861;RO=0;SAF=3,13;SAR=2,8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0220302,0.000456298;OID=.,.;OPOS=30993533,30993533;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=T,TG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0384615,0.961538:5,21:26:1,25:26:0:1,15:0,10:0:0:6:0:3,13:2,8:0:0
chr6	30993590	.	A	G	139.92	PASS	AF=0.425;AO=16;DP=40;FAO=17;FDP=40;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=6;FWDB=-0.0107807;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.2477;QD=13.9921;RBI=0.0454864;REFB=-0.0370397;REVB=0.0441903;RO=24;SAF=7;SAR=9;SRF=17;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.275068;STB=0.68162;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.0733396;OID=.;OPOS=30993590;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:24:23:16:17:0.425:9:7:17:7:10:7:17:6
chr6	30993958	.	A	G	769.45	PASS	AF=1;AO=47;DP=49;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00098955;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.3607;QD=64.121;RBI=0.00332339;REFB=0;REVB=0.00317265;RO=0;SAF=32;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.5454e-05;OID=.;OPOS=30993958;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:48:0:0:47:48:1:15:32:0:0:15:33:0:0
chr6	30994327	.	C	T	38.57	PASS	AF=0.428571;AO=5;DP=14;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=-0.0388791;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.518;QD=11.0198;RBI=0.0432693;REFB=-0.00233033;REVB=-0.0189908;RO=9;SAF=2;SAR=3;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157037;STB=0.666111;STBP=0.364;TYPE=snp;VARB=0.00176623;OID=.;OPOS=30994327;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:14:14:9:8:5:6:0.428571:3:2:5:4:4:2:5:3
chr6	30994759	.	A	C	308.16	PASS	AF=0.542373;AO=32;DP=59;FAO=32;FDP=59;FR=.;FRO=27;FSAF=25;FSAR=7;FSRF=19;FSRR=8;FWDB=0.0113117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.711;QD=20.8921;RBI=0.0127353;REFB=-0.00246454;REVB=0.00585088;RO=27;SAF=25;SAR=7;SRF=19;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0880492;STB=0.549016;STBP=0.478;TYPE=snp;VARB=0.00245014;OID=.;OPOS=30994759;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:27:27:32:32:0.542373:7:25:19:8:7:25:19:8
chr6	30997692	.	G	C	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.034507;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.075;QD=52.6132;RBI=0.0431095;REFB=0;REVB=-0.0258399;RO=0;SAF=19;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.44668e-05;OID=.;OPOS=30997692;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:3:19:0:0:3:19:0:0
chr6	30999997	.	T	C	384.76	PASS	AF=0.45977;AO=39;DP=86;FAO=40;FDP=87;FR=.;FRO=47;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=17;FSRR=30;FWDB=-0.00221743;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=288.607;QD=17.6902;RBI=0.0175364;REFB=-0.00918161;REVB=-0.0173956;RO=46;SAF=15;SAR=24;SRF=17;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0154332;STB=0.521728;STBP=0.748;TYPE=snp;VARB=0.0109479;OID=.;OPOS=30999997;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:87:46:47:39:40:0.45977:24:15:17:29:24:16:17:30
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chr6	31079889	.	C	G	68.83	PASS	AF=0.5;AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.012331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.14;QD=15.2949;RBI=0.0874223;REFB=-0.0243047;REVB=-0.0865483;RO=9;SAF=7;SAR=2;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.22915;STB=0.636033;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.0397603;OID=.;OPOS=31079889;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:18:18:9:9:9:9:0.5:2:7:5:4:2:7:5:4
chr6	31080016	.	C	G	352.57	PASS	AF=0.537313;AO=36;DP=67;FAO=36;FDP=67;FR=.;FRO=31;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=-0.0155499;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=318.815;QD=21.0486;RBI=0.0156531;REFB=-0.00913915;REVB=0.00179427;RO=31;SAF=22;SAR=14;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0543689;STB=0.530104;STBP=0.612;TYPE=snp;VARB=0.00609267;OID=.;OPOS=31080016;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:31:31:36:36:0.537313:14:22:17:14:14:22:17:14
chr6	31084163	.	A	G	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.050434;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=148.428;QD=51.1845;RBI=0.0507364;REFB=0;REVB=-0.00553167;RO=0;SAF=12;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000510752;OID=.;OPOS=31084163;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:8:12:0:0:8:12:0:0
chr6	31084170	.	A	C	65.78	PASS	AF=0.391304;AO=9;DP=23;FAO=9;FDP=23;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.0179364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.763;QD=11.4396;RBI=0.0189114;REFB=-0.00311474;REVB=0.00599363;RO=14;SAF=7;SAR=2;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.31575;STB=0.691844;STBP=0.19;TYPE=snp;VARB=0.00620235;OID=.;OPOS=31084170;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:23:23:14:14:9:9:0.391304:2:7:7:7:2:7:7:7
chr6	31084288	.	T	C	88.22	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0496633;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=312.148;QD=39.2068;RBI=0.0498272;REFB=0;REVB=-0.00403762;RO=0;SAF=3;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000325332;OID=.;OPOS=31084288;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:6:3:0:0:6:3:0:0
chr6	31084684	.	G	A	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0352772;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.164;QD=33.4285;RBI=0.0783904;REFB=0;REVB=0.0700041;RO=0;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00121804;OID=.;OPOS=31084684;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:2:4:0:0:2:4:0:0
chr6	31084787	.	A	G	99.96	PASS	AF=0.461538;AO=12;DP=26;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=0.00621294;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=250.796;QD=15.3789;RBI=0.0355032;REFB=-0.00268337;REVB=-0.0349553;RO=14;SAF=2;SAR=10;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.531007;STB=0.810268;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.00571217;OID=.;OPOS=31084787;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:26:14:14:12:12:0.461538:10:2:10:4:10:2:10:4
chr6	31084792	.	C	T	356.52	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00980472;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.755;QD=54.8489;RBI=0.0669758;REFB=0;REVB=0.0662543;RO=0;SAF=12;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000150863;OID=.;OPOS=31084792;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:26:0:0:25:26:1:13:12:0:0:14:12:0:0
chr6	31088202	.	A	G	282.82	PASS	AF=0.421053;AO=32;DP=76;FAO=32;FDP=76;FR=.;FRO=44;FSAF=6;FSAR=26;FSRF=10;FSRR=34;FWDB=0.0160519;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.7922;QD=14.885;RBI=0.0206049;REFB=-0.00794815;REVB=-0.0129189;RO=44;SAF=6;SAR=26;SRF=10;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0633725;STB=0.536059;STBP=0.667;TYPE=snp;VARB=0.0113298;OID=.;OPOS=31088202;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:44:44:32:32:0.421053:26:6:10:34:26:6:10:34
chr6	31097453	.	T	G	1290.7	PASS	AF=0.988235;AO=84;DP=85;FAO=84;FDP=85;FR=.;FRO=1;FSAF=51;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0408968;FXX=0.0116266;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.2114;QD=60.7388;RBI=0.0412395;REFB=-0.0725975;REVB=0.00530586;RO=1;SAF=51;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141366;STB=0.507461;STBP=0.271;TYPE=snp;VARB=0.000803963;OID=.;OPOS=31097453;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:85:85:1:1:84:84:0.988235:33:51:0:1:33:51:0:1
chr6	31105891	.	A	G	160.12	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00566532;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.523;QD=45.7482;RBI=0.0341245;REFB=0;REVB=0.0336509;RO=0;SAF=8;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000187269;OID=.;OPOS=31105891;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:14:0:0:13:14:1:5:8:0:0:6:8:0:0
chr6	31106177	.	T	C	96.74	PASS	AF=0.387097;AO=12;DP=31;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=-0.0238263;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.7257;QD=12.4824;RBI=0.0238547;REFB=-0.00669181;REVB=0.00116236;RO=19;SAF=4;SAR=8;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0206538;STB=0.512175;STBP=0.96;TYPE=snp;VARB=0.0123217;OID=.;OPOS=31106177;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:31:31:19:19:12:12:0.387097:8:4:6:13:8:4:6:13
chr6	31165897	.	CT	C	121.25	PASS	AF=0.655738;AO=29;DP=63;FAO=40;FDP=61;FR=.;FRO=21;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=-0.0280257;FXX=0.031741;HRUN=8;LEN=1;MLLD=6.87987;QD=7.95087;RBI=0.184828;REFB=-0.117014;REVB=0.182691;RO=23;SAF=16;SAR=13;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127518;STB=0.525523;STBP=0.553;TYPE=del;VARB=0.119985;OID=.;OPOS=31165898;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.655738:29:63:40:61:21:22:18:10:11:33:23:16:13:9:14
chr6	31170228	.	G	C	443.62	PASS	AF=0.66129;AO=41;DP=62;FAO=41;FDP=62;FR=.;FRO=21;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=0.0398477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.63;QD=28.6203;RBI=0.040161;REFB=-0.0125902;REVB=-0.00500683;RO=21;SAF=23;SAR=18;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112055;STB=0.560946;STBP=0.18;TYPE=snp;VARB=0.00630488;OID=.;OPOS=31170228;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:21:21:41:41:0.66129:18:23:8:13:18:23:8:13
chr6	31238925	.	C	T	30.94	PASS	AF=0.111111;AO=5;DP=45;FAO=5;FDP=45;FR=.,HEALED;FRO=39;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=0.0130453;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.662;QD=2.75064;RBI=0.0159227;REFB=-0.0051553;REVB=0.00912988;RO=34;SAF=2;SAR=3;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115698;STB=0.621142;STBP=0.657;TYPE=snp;VARB=0.0498995;OID=.;OPOS=31238925;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:26:45:45:34:39:5:5:0.111111:3:2:17:17:3:2:21:18
chr6	31238942	.	G	A	49.06	PASS	AF=0.163265;AO=8;DP=49;FAO=8;FDP=49;FR=.;FRO=41;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=-0.0041425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.416;QD=4.00457;RBI=0.00624209;REFB=-0.00512429;REVB=0.00466941;RO=41;SAF=4;SAR=4;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0444749;STB=0.530536;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=0.0557604;OID=.;OPOS=31238942;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:49:49:49:41:41:8:8:0.163265:4:4:19:22:4:4:19:22
chr6	31238957	.	A	C	47.2	PASS	AF=0.150943;AO=8;DP=53;FAO=8;FDP=53;FR=.;FRO=45;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=20;FSRR=25;FWDB=-0.0139337;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.4697;QD=3.56216;RBI=0.027737;REFB=0.0110539;REVB=-0.0239831;RO=45;SAF=4;SAR=4;SRF=20;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0675084;STB=0.547053;STBP=0.805;TYPE=snp;VARB=-0.0875702;OID=.;OPOS=31238957;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:53:53:45:45:8:8:0.150943:4:4:20:25:4:4:20:25
chr6	31322303	.	C	G	32.4	PASS	AF=0.625;AO=5;DP=8;FAO=5;FDP=8;FR=.;FRO=3;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0258975;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.5076;QD=16.1994;RBI=0.194433;REFB=-0.0379187;REVB=-0.1927;RO=3;SAF=4;SAR=1;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116878;STB=0.57112;STBP=0.776;TYPE=snp;VARB=-0.000544905;OID=.;OPOS=31322303;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:8:8:3:3:5:5:0.625:1:4:2:1:1:4:2:1
chr6	31322470	.	C	G	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0389538;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.982;QD=47.8224;RBI=0.0496361;REFB=0;REVB=0.0307627;RO=0;SAF=12;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.07465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.65737e-05;OID=.;OPOS=31322470;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:4:12:0:0:4:12:0:0
chr6	31322888	.	A	G	180.35	PASS	AF=0.6;AO=18;DP=30;FAO=18;FDP=30;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=11;FWDB=0.0230431;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.2806;QD=24.0462;RBI=0.0349984;REFB=-0.036608;REVB=-0.0263421;RO=12;SAF=4;SAR=14;SRF=1;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159695;STB=0.588148;STBP=0.42;TYPE=snp;VARB=0.0336603;OID=.;OPOS=31322888;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:30:30:12:12:18:18:0.6:14:4:1:11:14:4:1:11
chr6	31322996	.	C	T	726.94	PASS	AF=1;AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0123886;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.479;QD=57.0146;RBI=0.0225246;REFB=0;REVB=0.0188117;RO=0;SAF=24;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.19332e-05;OID=.;OPOS=31322996;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:51:0:0:51:51:1:27:24:0:0:27:24:0:0
chr6	31323203	.	A	G	119.52	PASS	AF=0.4;AO=14;DP=35;FAO=14;FDP=35;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=-0.0262642;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.775;QD=13.6597;RBI=0.0280753;REFB=-0.00421671;REVB=-0.00992026;RO=20;SAF=9;SAR=5;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.244948;STB=0.65565;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=0.0111718;OID=.;OPOS=31323203;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:20:21:14:14:0.4:5:9:8:12:5:9:8:13
chr6	31323233	.	A	G	109.92	PASS	AF=0.433333;AO=13;DP=30;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=-0.0260448;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.321;QD=14.6564;RBI=0.063769;REFB=-0.0127828;REVB=-0.0582079;RO=16;SAF=9;SAR=4;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194659;STB=0.632221;STBP=0.244;TYPE=snp;VARB=0.0154682;OID=.;OPOS=31323233;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:16:17:13:13:0.433333:4:9:8:8:4:9:8:9
chr6	31323296	.	A	G	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0257363;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=251.841;QD=50.4134;RBI=0.0258956;REFB=0;REVB=0.00286805;RO=0;SAF=11;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.41338e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.47516e-05;OID=.;OPOS=31323296;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:8:11:0:0:8:11:0:0
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chr6	31323875	.	C	T	39.05	PASS	AF=0.461538;AO=6;DP=13;FAO=6;FDP=13;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.0970853;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.6892;QD=12.0151;RBI=0.106965;REFB=-0.000746815;REVB=0.0448983;RO=7;SAF=3;SAR=3;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0631528;STB=0.538334;STBP=0.829;TYPE=snp;VARB=0.0170464;OID=.;OPOS=31323875;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:13:13:7:7:6:6:0.461538:3:3:3:4:3:3:3:4
chr6	31323885	.	G	T	39.05	PASS	AF=0.461538;AO=6;DP=13;FAO=6;FDP=13;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.0783241;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=65.6111;QD=12.0147;RBI=0.0798522;REFB=-0.0316477;REVB=0.0155468;RO=7;SAF=3;SAR=3;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0631528;STB=0.538334;STBP=0.829;TYPE=snp;VARB=0.0274172;OID=.;OPOS=31323885;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:13:13:7:7:6:6:0.461538:3:3:3:4:3:3:3:4
chr6	31323945	.	A	C	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000115304;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.666;QD=44.6889;RBI=0.0387729;REFB=0;REVB=-0.0387727;RO=0;SAF=6;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000708234;OID=.;OPOS=31323945;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:7:6:0:0:7:6:0:0
chr6	31323953	.	C	G	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.102875;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.358;QD=44.6891;RBI=0.112765;REFB=0;REVB=-0.0461804;RO=0;SAF=6;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00157101;OID=.;OPOS=31323953;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:7:6:0:0:7:6:0:0
chr6	31323958	.	T	G	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0467213;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.285;QD=43.4861;RBI=0.0547047;REFB=0;REVB=0.0284557;RO=0;SAF=6;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00139421;OID=.;OPOS=31323958;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:6:6:0:0:6:6:0:0
chr6	31323960	.	G	C	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0645832;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.023;QD=43.486;RBI=0.0783882;REFB=0;REVB=-0.0444266;RO=0;SAF=6;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000327635;OID=.;OPOS=31323960;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:6:6:0:0:6:6:0:0
chr6	31324024	.	C	A	45.55	PASS	AF=0.857143;AO=6;DP=7;FAO=6;FDP=7;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0403338;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.571;QD=26.0262;RBI=0.0444713;REFB=-0.0858631;REVB=0.0187319;RO=1;SAF=1;SAR=5;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.281147;STB=0.666027;STBP=0.127;TYPE=snp;VARB=0.00542216;OID=.;OPOS=31324024;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:7:7:1:1:6:6:0.857143:5:1:1:0:5:1:1:0
chr6	31324036	.	T	A	45.55	PASS	AF=0.857143;AO=6;DP=7;FAO=6;FDP=7;FR=.;FRO=1;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0211261;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.908;QD=26.0257;RBI=0.0211306;REFB=0.021863;REVB=-0.000435761;RO=1;SAF=2;SAR=4;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171372;STB=0.599655;STBP=0.252;TYPE=snp;VARB=-0.0028112;OID=.;OPOS=31324036;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:7:7:1:1:6:6:0.857143:4:2:1:0:4:2:1:0
chr6	31324077	.	C	G	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0173327;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.251;QD=42.1811;RBI=0.0701741;REFB=0;REVB=-0.0679999;RO=0;SAF=5;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00341987;OID=.;OPOS=31324077;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:6:5:0:0:6:5:0:0
chr6	31324086	.	G	C	129.85	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0536747;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.0156;QD=43.282;RBI=0.0619805;REFB=0;REVB=0.0309935;RO=0;SAF=6;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00134181;OID=.;OPOS=31324086;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:6:6:0:0:6:6:0:0
chr6	31324100	.	G	T	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144653;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.743;QD=44.6893;RBI=0.016403;REFB=0;REVB=0.00773387;RO=0;SAF=6;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000307637;OID=.;OPOS=31324100;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:7:6:0:0:7:6:0:0
chr6	31324143	.	GT	GA,TA	149.58	PASS	AF=0.8,0.133333;AO=11,2;DP=15;FAO=12,2;FDP=15;FR=.;FRO=1;FSAF=5,1;FSAR=7,1;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0385866,-0.0252938;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=140.073,108.194;QD=39.8873;RBI=0.0580456,0.0270842;REFB=-0.0584328,-0.0778217;REVB=0.0433632,0.00968383;RO=1;SAF=5,1;SAR=6,1;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0815441,-0.25849;STB=0.545378,0.665164;STBP=0.307,0.662;TYPE=snp,mnp;VARB=0.012926,0.0308341;OID=.,.;OPOS=31324144,31324143;OREF=T,GT;OALT=A,TA;OMAPALT=GA,TA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:10:15:15:1:1:11,2:12,2:0.8,0.133333:6,1:5,1:1:0:7,1:5,1:1:0
chr6	31324151	.	C	T	152.39	PASS	AF=0.933333;AO=14;DP=15;FAO=14;FDP=15;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0189026;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.717;QD=40.6381;RBI=0.0198245;REFB=-0.013681;REVB=0.0059752;RO=1;SAF=6;SAR=8;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0698108;STB=0.538406;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=0.000177367;OID=.;OPOS=31324151;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:15:15:1:1:14:14:0.933333:8:6:1:0:8:6:1:0
chr6	31324200	.	G	C	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00544457;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.986;QD=43.4861;RBI=0.0449505;REFB=0;REVB=0.0446196;RO=0;SAF=5;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000968064;OID=.;OPOS=31324200;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:7:5:0:0:7:5:0:0
chr6	31324562	.	C	T	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00216696;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.464;QD=33.4285;RBI=0.0094311;REFB=0;REVB=0.00917878;RO=0;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000174183;OID=.;OPOS=31324562;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:2:4:0:0:2:4:0:0
chr6	31324643	.	G	C	102.07	PASS	AF=0.785714;AO=11;DP=14;FAO=11;FDP=14;FR=.;FRO=3;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0344042;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=220.891;QD=29.1641;RBI=0.0386989;REFB=-0.00302521;REVB=0.0177186;RO=3;SAF=5;SAR=6;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0808542;STB=0.545372;STBP=0.589;TYPE=snp;VARB=0.000518408;OID=.;OPOS=31324643;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:14:14:3:3:11:11:0.785714:6:5:2:1:6:5:2:1
chr6	31370027	.	C	CTAAT	149.45	PASS	AF=0.375;AO=15;DP=48;FAO=18;FDP=48;FR=.;FRO=30;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=-0.00737175;FXX=0;HRUN=1;LEN=4;MLLD=306.211;QD=12.4542;RBI=0.036288;REFB=-0.00276451;REVB=-0.0355314;RO=30;SAF=7;SAR=8;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114115;STB=0.51469;STBP=0.912;TYPE=ins;VARB=0.00424159;OID=.;OPOS=31370028;OREF=-;OALT=TAAT;OMAPALT=CTAAT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.375:15:48:18:48:30:7:11:11:19:99:30:7:8:11:19
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chr6	31378387	.	T	C	766.46	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0542985;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.3641;QD=63.8716;RBI=0.0612391;REFB=0;REVB=0.0283177;RO=0;SAF=18;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.73384e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000225908;OID=.;OPOS=31378387;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:30:18:0:0:30:18:0:0
chr6	31378425	.	A	G	651.07	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0233489;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.74;QD=62.0071;RBI=0.0270672;REFB=0;REVB=0.0136917;RO=0;SAF=11;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.72514e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00017282;OID=.;OPOS=31378425;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:31:11:0:0:31:11:0:0
chr6	31378977	.	G	A	593.6	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00175945;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.544;QD=60.882;RBI=0.0185093;REFB=0;REVB=0.0184254;RO=0;SAF=24;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.31613e-05;OID=.;OPOS=31378977;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:15:24:0:0:15:24:0:0
chr6	31379109	.	G	A	689.38	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00414206;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=302.078;QD=62.6711;RBI=0.0273493;REFB=0;REVB=0.0270338;RO=0;SAF=31;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.22787e-05;OID=.;OPOS=31379109;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:13:31:0:0:13:31:0:0
chr6	31379752	.	C	T	260.12	PASS	AF=0.467742;AO=29;DP=62;FAO=29;FDP=62;FR=.;FRO=33;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=0.0705666;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.1101;QD=16.7819;RBI=0.0708804;REFB=0.0112424;REVB=-0.00666246;RO=33;SAF=18;SAR=11;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0146362;STB=0.50823;STBP=0.919;TYPE=snp;VARB=-0.0109067;OID=.;OPOS=31379752;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:33:33:29:29:0.467742:11:18:20:13:11:18:20:13
chr6	31379773	.	C	T	859.46	PASS	AF=0.983607;AO=59;DP=61;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.012579;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.133;QD=56.3582;RBI=0.0333757;REFB=-0.0581414;REVB=0.0309145;RO=0;SAF=36;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506664;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00188432;OID=.;OPOS=31379773;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:61:61:0:1:59:60:0.983607:23:36:0:0:23:37:1:0
chr6	31379794	.	CA	TG	811.04	PASS	AF=1;AO=56;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00406646;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=166.189;QD=56.9151;RBI=0.00582528;REFB=0;REVB=-0.00417107;RO=0;SAF=34;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.43892e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=-2.93378e-07;OID=.;OPOS=31379794;OREF=CA;OALT=TG;OMAPALT=TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:56:57:1:22:34:0:0:22:35:0:0
chr6	31379807	.	C	T	696.73	PASS	AF=0.962264;AO=51;DP=53;FAO=51;FDP=53;FR=.;FRO=2;FSAF=33;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0216082;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=232.832;QD=52.5831;RBI=0.0249518;REFB=-0.0834147;REVB=-0.0124771;RO=1;SAF=33;SAR=18;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0254383;STB=0.506051;STBP=0.78;TYPE=snp;VARB=0.000425652;OID=.;OPOS=31379807;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:53:53:1:2:51:51:0.962264:18:33:0:1:18:33:1:1
chr6	31379817	.	T	C	738.2	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0123796;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.247;QD=56.7842;RBI=0.0252086;REFB=0;REVB=0.0219595;RO=0;SAF=34;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.19096e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00012124;OID=.;OPOS=31379817;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:18:34:0:0:18:34:0:0
chr6	31379823	.	C	G	769.44	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0381681;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.9244;QD=56.9953;RBI=0.0424356;REFB=0;REVB=-0.0185466;RO=0;SAF=35;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.86274e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000150731;OID=.;OPOS=31379823;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:19:35:0:0:19:35:0:0
chr6	31379930	.	CG	CA,GA	478.01	PASS	AF=0.351351,0.594595;AO=13,22;DP=37;FAO=13,22;FDP=37;FR=.;FRO=2;FSAF=6,13;FSAR=7,9;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0317026,0.0630923;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=1,2;MLLD=174.049,45.6309;QD=51.6766;RBI=0.0332609,0.0634013;REFB=-0.00390976,-0.0396575;REVB=-0.0100614,0.0062525;RO=1;SAF=6,13;SAR=7,9;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0603742,0.0486023;STB=0.562406,0.549954;STBP=0.281,0.127;TYPE=snp,mnp;VARB=0.0444272,-0.00891774;OID=.,.;OPOS=31379931,31379930;OREF=G,CG;OALT=A,GA;OMAPALT=CA,GA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:37:37:1:2:13,22:13,22:0.351351,0.594595:7,9:6,13:0:1:7,9:6,13:0:2
chr6	31380157	.	TGCTG	T,TGCT,TGCTGCTGCTGCTGCT	377.65	PASS	AF=0.586207,0.137931,0.275862;AO=14,9,4;DP=30;FAO=17,4,8;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=8,4,2;FSAR=9,0,6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0125633,0.00963871,-0.0233159;FXX=0.0333222;HRUN=1,2,1;LEN=4,1,11;MLLD=248.623,25.9485,135.831;QD=52.0891;RBI=0.0158422,0.0486633,0.0251986;REFB=0,0,0;REVB=0.00965074,-0.0476991,-0.00955701;RO=0;SAF=6,6,1;SAR=8,3,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,-4.86674e-08;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,del,ins;VARB=0.0107503,0.00612729,0.0314423;OID=.,.,.;OPOS=31380158,31380161,31380162;OREF=GCTG,G,-;OALT=-,-,CTGCTGCTGCT;OMAPALT=T,TGCT,TGCTGCTGCTGCTGCT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/3:0.586207,0.137931,0.275862:14,9,4:30:17,4,8:29:0:8,4,2:9,0,6:0:0:59:0:6,6,1:8,3,3:0:0
chr6	31380194	.	T	C	37.14	PASS	AF=0.333333;AO=6;DP=18;FAO=6;FDP=18;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.0209235;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.742;QD=8.25406;RBI=0.0309848;REFB=-0.00560876;REVB=0.0228531;RO=12;SAF=2;SAR=4;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0946031;STB=0.559795;STBP=0.755;TYPE=snp;VARB=0.0134078;OID=.;OPOS=31380194;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:18:18:12:12:6:6:0.333333:4:2:5:7:4:2:5:7
chr6	31380198	.	C	T	37.15	PASS	AF=0.333333;AO=6;DP=18;FAO=6;FDP=18;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=-0.0465966;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.881;QD=8.25462;RBI=0.0466419;REFB=-0.0123749;REVB=-0.00205466;RO=12;SAF=2;SAR=4;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0946031;STB=0.559795;STBP=0.755;TYPE=snp;VARB=0.0177024;OID=.;OPOS=31380198;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:18:18:12:12:6:6:0.333333:4:2:5:7:4:2:5:7
chr6	31382882	.	C	A	1362.52	PASS	AF=0.988764;AO=88;DP=89;FAO=88;FDP=89;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=50;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0156182;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.869;QD=61.2366;RBI=0.0402282;REFB=-0.036416;REVB=0.0370726;RO=1;SAF=38;SAR=50;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0123069;STB=0.506492;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=9.31225e-05;OID=.;OPOS=31382882;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:89:89:1:1:88:88:0.988764:50:38:1:0:50:38:1:0
chr6	31382911	.	A	G	902.85	PASS	AF=1;AO=62;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0699345;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.2942;QD=56.428;RBI=0.0770419;REFB=-0.0427129;REVB=-0.0323206;RO=1;SAF=27;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0171646;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00293187;OID=.;OPOS=31382911;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:64:64:1:0:62:64:1:35:27:1:0:35:29:0:0
chr6	31473546	.	A	G	702.21	PASS	AF=1;AO=44;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0206225;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=253.834;QD=62.4185;RBI=0.0215347;REFB=0;REVB=0.00620146;RO=0;SAF=22;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.13845e-05;OID=.;OPOS=31473546;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:44:45:1:22:22:0:0:23:22:0:0
chr6	31474884	.	G	A	277.73	PASS	AF=0.395062;AO=32;DP=81;FAO=32;FDP=81;FR=.;FRO=49;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=28;FWDB=-0.0300632;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.629;QD=13.7151;RBI=0.0353363;REFB=0.0151842;REVB=0.0185704;RO=47;SAF=16;SAR=16;SRF=20;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0779734;STB=0.543183;STBP=0.557;TYPE=snp;VARB=-0.022637;OID=.;OPOS=31474884;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:47:49:32:32:0.395062:16:16:20:27:16:16:21:28
chr6	31477681	.	A	G	901.16	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.137676;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.6221;QD=58.1391;RBI=0.142385;REFB=0;REVB=-0.0363154;RO=0;SAF=30;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00102927;OID=.;OPOS=31477681;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:32:30:0:0:32:30:0:0
chr6	31496791	.	C	G	145.55	PASS	AF=0.444444;AO=16;DP=36;FAO=16;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.0204206;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.061;QD=16.1718;RBI=0.0674288;REFB=-0.00845681;REVB=0.0642623;RO=19;SAF=8;SAR=8;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.024879;STB=0.527743;STBP=0.803;TYPE=snp;VARB=0.00669588;OID=.;OPOS=31496791;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:19:20:16:16:0.444444:8:8:10:9:8:8:11:9
chr6	31496915	.	G	A	429.02	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.038429;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.773;QD=57.2026;RBI=0.0392541;REFB=0;REVB=-0.008006;RO=0;SAF=11;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.57962e-05;OID=.;OPOS=31496915;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:19:11:0:0:19:11:0:0
chr6	31496925	.	G	A	340.73	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0240017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.157;QD=54.517;RBI=0.0273904;REFB=0;REVB=0.0131966;RO=0;SAF=8;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.57871e-05;OID=.;OPOS=31496925;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:17:8:0:0:17:8:0:0
chr6	31497706	.	C	T	1480.35	PASS	AF=0.990099;AO=100;DP=101;FAO=100;FDP=101;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=64;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0836503;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.342;QD=58.6277;RBI=0.0838324;REFB=-0.0886324;REVB=-0.00552235;RO=1;SAF=36;SAR=64;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.012994;STB=0.506848;STBP=0.256;TYPE=snp;VARB=0.000235154;OID=.;OPOS=31497706;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:101:101:1:1:100:100:0.990099:64:36:1:0:64:36:1:0
chr6	31506624	.	T	C	766.42	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00139235;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.674;QD=63.8686;RBI=0.0081318;REFB=0;REVB=0.00801171;RO=0;SAF=23;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.41285e-05;OID=.;OPOS=31506624;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:25:23:0:0:25:23:0:0
chr6	31506648	.	G	T	769.96	PASS	AF=1;AO=48;DP=49;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0244951;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.1402;QD=64.1631;RBI=0.0535048;REFB=0;REVB=-0.0475684;RO=0;SAF=23;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000304281;OID=.;OPOS=31506648;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:48:0:0:48:48:1:25:23:0:0:25:23:0:0
chr6	31506801	.	G	A	644.31	PASS	AF=1;AO=41;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0153642;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.49;QD=61.3632;RBI=0.025669;REFB=0;REVB=-0.020563;RO=0;SAF=30;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000203302;OID=.;OPOS=31506801;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:41:42:1:11:30:0:0:12:30:0:0
chr6	31509432	.	G	A	785.88	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00199937;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.693;QD=64.1536;RBI=0.00878198;REFB=0;REVB=0.00855135;RO=0;SAF=30;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.48867e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.40578e-05;OID=.;OPOS=31509432;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:19:30:0:0:19:30:0:0
chr6	31510105	.	A	G	873.74	PASS	AF=1;AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0213677;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.2295;QD=58.2493;RBI=0.024065;REFB=0;REVB=0.0110701;RO=0;SAF=37;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.03034e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000307845;OID=.;OPOS=31510105;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:60:0:0:60:60:1:23:37:0:0:23:37:0:0
chr6	31525448	.	C	T	166.43	PASS	AF=0.4;AO=18;DP=45;FAO=18;FDP=45;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=0.0201935;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.01;QD=14.7938;RBI=0.0250206;REFB=-0.013512;REVB=0.0147733;RO=26;SAF=10;SAR=8;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0176619;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0152765;OID=.;OPOS=31525448;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:26:27:18:18:0.4:8:10:14:12:8:10:15:12
chr6	31525912	.	C	T	751.95	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.005903;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=172.495;QD=56.7512;RBI=0.00951608;REFB=0;REVB=0.00746394;RO=0;SAF=31;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.76368e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.20951e-05;OID=.;OPOS=31525912;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:22:31:0:0:22:31:0:0
chr6	31528326	.	G	C	562.69	PASS	AF=0.974359;AO=36;DP=38;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0491144;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.322;QD=57.7118;RBI=0.0498723;REFB=0.0138897;REVB=-0.00866173;RO=1;SAF=15;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.021769;STB=0.511105;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=-0.000133255;OID=.;OPOS=31528326;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:38:39:1:1:36:38:0.974359:21:15:0:1:22:16:0:1
chr6	31540556	.	T	C	207.13	PASS	AF=1;AO=16;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0671902;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.897;QD=48.7369;RBI=0.0828877;REFB=0;REVB=0.0485371;RO=0;SAF=7;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00088802;OID=.;OPOS=31540556;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:16:17:1:9:7:0:0:9:8:0:0
chr6	31555130	.	A	G	1084.97	PASS	AF=0.986486;AO=72;DP=73;FAO=73;FDP=74;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00447825;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.716;QD=58.6468;RBI=0.0582952;REFB=-0.153701;REVB=0.0581229;RO=1;SAF=31;SAR=41;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0113966;STB=0.505881;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000813751;OID=.;OPOS=31555130;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:73:74:1:1:72:73:0.986486:41:31:0:1:42:31:0:1
chr6	31555657	.	A	G	356.12	PASS	AF=1;AO=16;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=19;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0302432;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.228;QD=54.788;RBI=0.108398;REFB=0;REVB=0.104093;RO=0;SAF=15;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00681319;OID=.;OPOS=31555657;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:16:26:1:1:15:0:0:7:19:0:0
chr6	31556580	.	AT	AA,A	459.34	PASS	AF=0.911765,0.0882353;AO=27,4;DP=34;FAO=31,3;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=15,1;FSAR=16,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.146794,0.101967;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=40.2059,24.1089;QD=54.0398;RBI=0.152167,0.102957;REFB=-0.0280117,-0.056393;REVB=-0.0400809,-0.0142379;RO=1;SAF=11,2;SAR=16,2;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.040394,-0.166656;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,del;VARB=-0.00256237,0.110393;OID=.,.;OPOS=31556581,31556581;OREF=T,T;OALT=A,-;OMAPALT=AA,A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.911765,0.0882353:27,4:34:31,3:34:0:15,1:16,2:0:0:12:1:11,2:16,2:1:0
chr6	31557791	.	G	A	157.86	PASS	AF=0.365385;AO=19;DP=52;FAO=19;FDP=52;FR=.;FRO=33;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=22;FWDB=-0.0328248;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.919;QD=12.1431;RBI=0.0329961;REFB=-0.0165385;REVB=0.00335852;RO=33;SAF=6;SAR=13;SRF=11;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0218529;STB=0.512747;STBP=0.889;TYPE=snp;VARB=0.0276837;OID=.;OPOS=31557791;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:33:33:19:19:0.365385:13:6:11:22:13:6:11:22
chr6	31583166	.	G	A	158.06	PASS	AF=0.64;AO=16;DP=25;FAO=16;FDP=25;FR=.;FRO=9;FSAF=16;FSAR=0;FSRF=9;FSRR=0;FWDB=0.0255148;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.37;QD=25.2899;RBI=0.0255148;REFB=-0.017943;REVB=0;RO=9;SAF=16;SAR=0;SRF=9;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0104116;OID=.;OPOS=31583166;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:25:25:9:9:16:16:0.64:0:16:9:0:0:16:9:0
chr6	31583312	.	G	A	122.33	PASS	AF=0.451613;AO=14;DP=31;FAO=14;FDP=31;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.00610132;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.785;QD=15.7842;RBI=0.0114634;REFB=-0.0197025;REVB=-0.00970481;RO=17;SAF=7;SAR=7;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0837908;STB=0.548319;STBP=0.64;TYPE=snp;VARB=0.030317;OID=.;OPOS=31583312;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:17:17:14:14:0.451613:7:7:7:10:7:7:7:10
chr6	31583931	.	C	T	361.7	PASS	AF=0.580645;AO=35;DP=63;FAO=36;FDP=62;FR=.;FRO=26;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=0.00477872;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.737;QD=23.3353;RBI=0.00480017;REFB=-0.00889112;REVB=-0.000453289;RO=25;SAF=19;SAR=16;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0437828;STB=0.509086;STBP=0.868;TYPE=snp;VARB=0.00644812;OID=.;OPOS=31583931;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:62:25:26:35:36:0.580645:16:19:15:10:16:20:15:11
chr6	31594628	.	T	A	1043.67	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0239543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.9954;QD=59.6381;RBI=0.0319904;REFB=0;REVB=0.0212033;RO=0;SAF=33;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000216138;OID=.;OPOS=31594628;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:37:33:0:0:37:33:0:0
chr6	31595772	.	GCCTGCTGCCCCA	G	33.32	PASS	AF=0.18;AO=9;DP=54;FAO=9;FDP=50;FR=.;FRO=41;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=28;FSRR=13;FWDB=-0.00880911;FXX=0.0740604;HRUN=2;LEN=12;MLLD=290.78;QD=2.66556;RBI=0.00881087;REFB=-0.00908924;REVB=-0.000176204;RO=38;SAF=5;SAR=4;SRF=25;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13029;STB=0.608071;STBP=0.512;TYPE=del;VARB=0.0319671;OID=.;OPOS=31595773;OREF=CCTGCTGCCCCA;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.18:9:54:9:50:41:5:4:28:13:33:38:5:4:25:13
chr6	31595882	.	C	A	507.68	PASS	AF=1;AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0429513;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.337;QD=59.7271;RBI=0.0476333;REFB=0;REVB=0.0205942;RO=0;SAF=11;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000453962;OID=.;OPOS=31595882;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:34:0:0:34:34:1:23:11:0:0:23:11:0:0
chr6	31600304	.	G	C	190.95	PASS	AF=0.72;AO=18;DP=25;FAO=18;FDP=25;FR=.;FRO=7;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.00831058;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=278.474;QD=30.5522;RBI=0.0418776;REFB=-0.0178862;REVB=0.0410447;RO=7;SAF=8;SAR=10;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00814684;STB=0.504499;STBP=0.967;TYPE=snp;VARB=0.0071344;OID=.;OPOS=31600304;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:25:25:7:7:18:18:0.72:10:8:3:4:10:8:3:4
chr6	31601344	.	T	C	438.38	PASS	AF=0.914286;AO=32;DP=35;FAO=32;FDP=35;FR=.;FRO=3;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0559887;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.6301;QD=50.1;RBI=0.0560174;REFB=-0.00278466;REVB=-0.00179375;RO=3;SAF=16;SAR=16;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0265976;STB=0.514277;STBP=0.701;TYPE=snp;VARB=0.0071828;OID=.;OPOS=31601344;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:35:35:3:3:32:32:0.914286:16:16:2:1:16:16:2:1
chr6	31602967	.	G	A	978.21	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00329511;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.28;QD=59.2854;RBI=0.0314886;REFB=0;REVB=0.0313157;RO=0;SAF=31;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.769e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000236;OID=.;OPOS=31602967;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:35:31:0:0:35:31:0:0
chr6	31604044	.	T	G	620.91	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.106227;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=40.1912;QD=60.5763;RBI=0.106437;REFB=0;REVB=-0.00668513;RO=0;SAF=5;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00171628;OID=.;OPOS=31604044;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:41:0:0:39:41:1:34:5:0:0:35:6:0:0
chr6	31605278	.	C	T	719.73	PASS	AF=0.591304;AO=68;DP=115;FAO=68;FDP=115;FR=.;FRO=47;FSAF=35;FSAR=33;FSRF=27;FSRR=20;FWDB=-0.00396186;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.591;QD=25.0341;RBI=0.0193844;REFB=-0.0362238;REVB=0.0189752;RO=47;SAF=35;SAR=33;SRF=27;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0449812;STB=0.524474;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=0.0271145;OID=.;OPOS=31605278;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:115:47:47:68:68:0.591304:33:35:27:20:33:35:27:20
chr6	31617063	.	TCCCCCA	CCCTCCA,TCCCCA,TCCCCAC	148.06	PASS	AF=0.0294118,0.529412,0.176471;AO=2,11,5;DP=36;FAO=1,18,6;FDP=34;FR=.;FRO=9;FSAF=1,9,6;FSAR=0,9,0;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=-0.0506903,-0.133955,-0.0711981;FXX=0.0555401;HRUN=1,5,5;LEN=4,1,2;MLLD=147.908,10.0778,13.9904;QD=17.4182;RBI=0.0586278,0.138946,0.180853;REFB=-0.00877584,-0.089011,-0.103557;REVB=-0.0294569,0.0369053,0.166249;RO=9;SAF=2,5,5;SAR=0,6,0;SRF=3;SRR=6;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0.381818,0;SSSB=0.64528,0.0967735,0.761805;STB=0.992077,0.555495,0.998;STBP=0.261,0.456,0.003;TYPE=mnp,del,mnp;VARB=0.196734,0.077414,0.0889815;OID=.,.,.;OPOS=31617063,31617064,31617068;OREF=TCCC,C,CA;OALT=CCCT,-,AC;OMAPALT=CCCTCCA,TCCCCA,TCCCCAC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:31:36:34:9:9:2,11,5:1,18,6:0.0294118,0.529412,0.176471:0,6,0:2,5,5:3:6:0,9,0:1,9,6:3:6
chr6	31625507	.	G	T	453.38	PASS	AF=0.45045;AO=50;DP=111;FAO=50;FDP=111;FR=.;FRO=61;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=32;FSRR=29;FWDB=0.00241216;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=282.635;QD=16.3379;RBI=0.00311597;REFB=-0.00602937;REVB=-0.0019725;RO=61;SAF=24;SAR=26;SRF=32;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0438551;STB=0.524486;STBP=0.673;TYPE=snp;VARB=0.00747472;OID=.;OPOS=31625507;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:111:61:61:50:50:0.45045:26:24:32:29:26:24:32:29
chr6	31625541	.	C	A	400.15	PASS	AF=0.418182;AO=46;DP=110;FAO=46;FDP=110;FR=.;FRO=64;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=36;FSRR=28;FWDB=0.00581308;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.2333;QD=14.5509;RBI=0.0706041;REFB=0.0257254;REVB=-0.0703644;RO=63;SAF=25;SAR=21;SRF=35;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0125174;STB=0.511168;STBP=0.855;TYPE=snp;VARB=-0.0349069;OID=.;OPOS=31625541;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:110:63:64:46:46:0.418182:21:25:35:28:21:25:36:28
chr6	31627449	.	C	G	763.63	PASS	AF=0.506494;AO=78;DP=155;FAO=78;FDP=154;FR=.;FRO=76;FSAF=46;FSAR=32;FSRF=41;FSRR=35;FWDB=6.62593e-05;FXX=0.0064512;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.272;QD=19.8344;RBI=0.00296972;REFB=-0.00366243;REVB=0.00296898;RO=74;SAF=46;SAR=32;SRF=39;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0567316;STB=0.525394;STBP=0.545;TYPE=snp;VARB=0.0045816;OID=.;OPOS=31627449;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:155:154:74:76:78:78:0.506494:32:46:39:35:32:46:41:35
chr6	31627523	.	C	T	2406.24	PASS	AF=0.987578;AO=159;DP=161;FAO=159;FDP=161;FR=.;FRO=2;FSAF=95;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00800812;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=77.1591;QD=59.7825;RBI=0.00861413;REFB=-0.142169;REVB=0.00317384;RO=0;SAF=95;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.47089e-08;STB=0.507691;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.00090361;OID=.;OPOS=31627523;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:161:161:0:2:159:159:0.987578:64:95:0:0:64:95:0:2
chr6	31628113	.	A	C	357.94	PASS	AF=0.506849;AO=37;DP=73;FAO=37;FDP=73;FR=.;FRO=36;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=9;FSRR=27;FWDB=-0.00283959;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=251.124;QD=19.6131;RBI=0.00754676;REFB=0.0162899;REVB=-0.00699216;RO=36;SAF=14;SAR=23;SRF=9;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125832;STB=0.569533;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=-0.0210325;OID=.;OPOS=31628113;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:36:36:37:37:0.506849:23:14:9:27:23:14:9:27
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chr6	31634758	.	G	A	1550.53	PASS	AF=1;AO=96;DP=96;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00923325;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.065;QD=63.2871;RBI=0.0253739;REFB=0;REVB=0.0236343;RO=0;SAF=54;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00017413;OID=.;OPOS=31634758;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:96:98:0:0:96:98:1:42:54:0:0:44:54:0:0
chr6	31635710	.	T	C	740.32	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0243916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.224;QD=56.9475;RBI=0.025178;REFB=0;REVB=-0.00624329;RO=0;SAF=20;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.00761e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000160956;OID=.;OPOS=31635710;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:32:20:0:0:32:20:0:0
chr6	31639757	.	G	A	337.36	PASS	AF=0.48;AO=35;DP=74;FAO=36;FDP=75;FR=.;FRO=39;FSAF=12;FSAR=24;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=-0.00148381;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.6497;QD=17.9925;RBI=0.0506491;REFB=0.0108045;REVB=-0.0506274;RO=39;SAF=12;SAR=23;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142832;STB=0.584857;STBP=0.194;TYPE=snp;VARB=-0.0110338;OID=.;OPOS=31639757;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:75:39:39:35:36:0.48:23:12:19:20:24:12:19:20
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chr6	31657924	.	G	A	372.69	PASS	AF=0.413462;AO=43;DP=104;FAO=43;FDP=104;FR=.;FRO=61;FSAF=27;FSAR=16;FSRF=39;FSRR=22;FWDB=-0.00861376;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.1491;QD=14.3343;RBI=0.0524703;REFB=-0.0134368;REVB=-0.0517584;RO=61;SAF=27;SAR=16;SRF=39;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0127704;STB=0.507201;STBP=0.91;TYPE=snp;VARB=0.0223702;OID=.;OPOS=31657924;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:104:61:61:43:43:0.413462:16:27:39:22:16:27:39:22
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chr6	31675765	.	G	A	283.45	PASS	AF=0.526316;AO=29;DP=54;FAO=30;FDP=57;FR=.;FRO=27;FSAF=28;FSAR=2;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=-0.0147182;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=46.0284;QD=19.8915;RBI=0.0151545;REFB=-0.0437652;REVB=-0.00360989;RO=25;SAF=27;SAR=2;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.59078;STB=0.833041;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0417307;OID=.;OPOS=31675765;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:57:25:27:29:30:0.526316:2:27:12:13:2:28:14:13
chr6	31679874	.	G	T	236.6	PASS	AF=0.45;AO=27;DP=58;FAO=27;FDP=60;FR=.;FRO=33;FSAF=20;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=0.0114555;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=245.746;QD=15.773;RBI=0.021762;REFB=-0.00342868;REVB=0.0185028;RO=21;SAF=20;SAR=7;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197624;STB=0.671007;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.00298335;OID=.;OPOS=31679874;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:60:21:33:27:27:0.45:7:20:11:10:7:20:15:18
chr6	31683157	.	T	G	493.23	PASS	AF=0.546512;AO=47;DP=86;FAO=47;FDP=86;FR=.;FRO=39;FSAF=31;FSAR=16;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=0.0222945;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.514;QD=22.941;RBI=0.0223781;REFB=-0.0167426;REVB=-0.00193281;RO=39;SAF=31;SAR=16;SRF=23;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0625729;STB=0.534468;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.0107679;OID=.;OPOS=31683157;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:39:39:47:47:0.546512:16:31:23:16:16:31:23:16
chr6	31687008	.	G	A	372.67	PASS	AF=0.544118;AO=37;DP=69;FAO=37;FDP=68;FR=.;FRO=31;FSAF=26;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=0.0149734;FXX=0.0555478;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.983;QD=21.9217;RBI=0.0163231;REFB=-0.0129243;REVB=0.00649917;RO=31;SAF=26;SAR=11;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113914;STB=0.563141;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.0157099;OID=.;OPOS=31687008;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:68:31:31:37:37:0.544118:11:26:18:13:11:26:18:13
chr6	31708328	.	C	T	469.25	PASS	AF=0.485149;AO=49;DP=101;FAO=49;FDP=101;FR=.;FRO=52;FSAF=15;FSAR=34;FSRF=21;FSRR=31;FWDB=0.00306191;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=268.002;QD=18.5842;RBI=0.00328124;REFB=-0.013997;REVB=0.00117952;RO=52;SAF=15;SAR=34;SRF=21;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10166;STB=0.556593;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.0139028;OID=.;OPOS=31708328;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:101:52:52:49:49:0.485149:34:15:21:31:34:15:21:31
chr6	31729359	.	A	G	990.64	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00101793;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.465;QD=59.1426;RBI=0.0748098;REFB=0;REVB=-0.0748029;RO=0;SAF=30;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000326999;OID=.;OPOS=31729359;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:37:30:0:0:37:30:0:0
chr6	31731881	.	C	T	255.65	PASS	AF=0.491228;AO=28;DP=57;FAO=28;FDP=57;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=-0.00304651;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=183.687;QD=17.9406;RBI=0.00604984;REFB=0.00178876;REVB=0.00522679;RO=25;SAF=13;SAR=15;SRF=8;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12433;STB=0.525898;STBP=0.725;TYPE=snp;VARB=-0.00227121;OID=.;OPOS=31731881;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:25:29:28:28:0.491228:15:13:8:17:15:13:12:17
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chr6	31860337	.	T	C	766.41	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0111206;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.487;QD=63.8672;RBI=0.0121413;REFB=0;REVB=0.00487267;RO=0;SAF=34;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.59011e-05;OID=.;OPOS=31860337;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:14:34:0:0:14:34:0:0
chr6	31864547	.	G	T	76.29	PASS	AF=0.407407;AO=9;DP=27;FAO=11;FDP=27;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=16;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=0.130792;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=28.6523;QD=11.3017;RBI=0.157213;REFB=-0.0412022;REVB=-0.0872323;RO=10;SAF=3;SAR=6;SRF=9;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.475274;STB=0.68595;STBP=0.115;TYPE=snp;VARB=0.0682415;OID=.;OPOS=31864547;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:27:27:10:16:9:11:0.407407:6:3:9:1:7:4:11:5
chr6	31867835	.	G	A	144.77	PASS	AF=0.432432;AO=16;DP=37;FAO=16;FDP=37;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0304645;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.608;QD=15.6508;RBI=0.0321909;REFB=-0.00798113;REVB=0.0104002;RO=21;SAF=7;SAR=9;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0851303;STB=0.549091;STBP=0.602;TYPE=snp;VARB=0.0100367;OID=.;OPOS=31867835;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:21:21:16:16:0.432432:9:7:11:10:9:7:11:10
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chr6	31914935	.	A	G	1226.39	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0260179;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.221;QD=61.3196;RBI=0.0268377;REFB=0;REVB=-0.00658284;RO=0;SAF=31;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.24948e-05;OID=.;OPOS=31914935;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:79:80:0:0:79:80:1:48:31:0:0:48:32:0:0
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chr6	31978746	.	G	A	78.33	PASS	AF=0.142857;AO=16;DP=113;FAO=16;FDP=112;FR=.;FRO=96;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=59;FSRR=37;FWDB=-0.0355961;FXX=0.0344798;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.563;QD=2.79757;RBI=0.0406577;REFB=-0.0107133;REVB=-0.0196461;RO=87;SAF=7;SAR=9;SRF=52;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199832;STB=0.648296;STBP=0.244;TYPE=snp;VARB=0.0391814;OID=.;OPOS=31978746;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:113:112:87:96:16:16:0.142857:9:7:52:35:9:7:59:37
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chr6	32006317	.	C	T	393.32	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00886858;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.302;QD=56.1881;RBI=0.0201421;REFB=0;REVB=-0.0180846;RO=0;SAF=8;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.75204e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000421137;OID=.;OPOS=32006317;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:20:8:0:0:20:8:0:0
chr6	32006337	.	C	A	263.06	PASS	AF=0.954545;AO=20;DP=22;FAO=21;FDP=22;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0397866;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=52.1035;QD=47.8284;RBI=0.0511458;REFB=-0.106164;REVB=0.0321391;RO=2;SAF=2;SAR=18;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.301147;STB=0.571354;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.00813673;OID=.;OPOS=32006337;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:22:22:2:1:20:21:0.954545:18:2:2:0:18:3:1:0
chr6	32013037	.	C	T	92.24	PASS	AF=0.179775;AO=16;DP=89;FAO=16;FDP=89;FR=.;FRO=73;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=24;FSRR=49;FWDB=0.0164975;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.96;QD=4.14565;RBI=0.0318906;REFB=-0.00201699;REVB=-0.0272919;RO=69;SAF=6;SAR=10;SRF=23;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0571744;STB=0.541234;STBP=0.772;TYPE=snp;VARB=0.007827;OID=.;OPOS=32013037;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:89:89:69:73:16:16:0.179775:10:6:23:46:10:6:24:49
chr6	32017105	.	A	G	240.14	PASS	AF=0.465517;AO=27;DP=58;FAO=27;FDP=58;FR=.;FRO=31;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=-0.00374708;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.133;QD=16.5612;RBI=0.0464803;REFB=0.0155561;REVB=-0.046329;RO=30;SAF=11;SAR=16;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00718503;STB=0.51128;STBP=0.9;TYPE=snp;VARB=-0.0154714;OID=.;OPOS=32017105;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:30:31:27:27:0.465517:16:11:12:18:16:11:12:19
chr6	32025863	.	C	T	98.76	PASS	AF=0.413793;AO=12;DP=30;FAO=12;FDP=29;FR=.;FRO=17;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.00887537;FXX=0.0333222;HRUN=3;LEN=1;MLLD=116.131;QD=13.6223;RBI=0.0555297;REFB=-0.0288792;REVB=-0.0548158;RO=17;SAF=3;SAR=9;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.24777;STB=0.646796;STBP=0.22;TYPE=snp;VARB=0.0561791;OID=.;OPOS=32025863;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:30:29:17:17:12:12:0.413793:9:3:8:9:9:3:8:9
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chr6	32151994	.	A	T	483.95	PASS	AF=1;AO=33;DP=34;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143153;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.9;QD=58.6608;RBI=0.0253595;REFB=0;REVB=-0.0209327;RO=0;SAF=24;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000198049;OID=.;OPOS=32151994;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:33:0:0:33:33:1:9:24:0:0:9:24:0:0
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chr6	32261952	.	G	A	127.7	PASS	AF=0.348837;AO=15;DP=42;FAO=15;FDP=43;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=-0.0197123;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.694;QD=11.8793;RBI=0.0338826;REFB=-0.00986027;REVB=-0.0275582;RO=27;SAF=6;SAR=9;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.049783;STB=0.542799;STBP=0.684;TYPE=snp;VARB=0.0176872;OID=.;OPOS=32261952;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:43:27:28:15:15:0.348837:9:6:12:15:9:6:13:15
chr6	32270363	.	A	T	142.0	PASS	AF=0.372093;AO=16;DP=44;FAO=16;FDP=43;FR=.;FRO=27;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=21;FWDB=-0.000351709;FXX=0.0227221;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.4249;QD=13.2096;RBI=0.0217844;REFB=-0.00201421;REVB=-0.0217815;RO=26;SAF=7;SAR=9;SRF=6;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.233382;STB=0.642044;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=0.0026686;OID=.;OPOS=32270363;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:43:26:27:16:16:0.372093:9:7:6:20:9:7:6:21
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chr6	32724258	.	C	G,T	513.08	PASS	AF=0.0285714,0.971429;AO=2,33;DP=35;FAO=1,34;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=1,20;FSAR=0,14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000286351,0.0208192;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=15.8911,153.79;QD=58.6377;RBI=0.0810184,0.0331426;REFB=0,0;REVB=-0.0810179,0.0257874;RO=0;SAF=1,20;SAR=1,13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,4.82173e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.106617,9.0671e-05;OID=.,.;OPOS=32724258,32724258;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:5:35:35:0:0:2,33:1,34:0.0285714,0.971429:1,13:1,20:0:0:0,14:1,20:0:0
chr6	32725062	.	T	A	925.52	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0297453;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.329;QD=58.7631;RBI=0.0788347;REFB=0;REVB=0.0730077;RO=0;SAF=36;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51662e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000261338;OID=.;OPOS=32725062;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:63:0:0:62:63:1:26:36:0:0:27:36:0:0
chr6	32725619	.	TG	CA	966.53	PASS	AF=1;AO=65;DP=67;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0258312;FXX=0.0298463;HRUN=1;LEN=2;MLLD=130.581;QD=59.4785;RBI=0.0297039;REFB=0;REVB=-0.0146654;RO=0;SAF=29;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000509805;OID=.;OPOS=32725619;OREF=TG;OALT=CA;OMAPALT=CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:65:0:0:65:65:1:36:29:0:0:36:29:0:0
chr6	32725625	.	T	C	1044.39	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0185288;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.292;QD=59.6795;RBI=0.019969;REFB=0;REVB=0.00744612;RO=0;SAF=30;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.28098e-05;OID=.;OPOS=32725625;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:40:30:0:0:40:30:0:0
chr6	32726803	.	C	T	1549.54	PASS	AF=0.981651;AO=106;DP=109;FAO=107;FDP=109;FR=.;FRO=2;FSAF=46;FSAR=61;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0241223;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.22;QD=56.864;RBI=0.0253871;REFB=-0.121535;REVB=0.00791335;RO=1;SAF=46;SAR=60;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00784487;STB=0.510636;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.000914532;OID=.;OPOS=32726803;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:109:109:1:2:106:107:0.981651:60:46:0:1:61:46:2:0
chr6	32726838	.	C	T	1558.39	PASS	AF=1;AO=102;DP=103;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0304234;FXX=0.0095229;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.84;QD=59.9381;RBI=0.0378259;REFB=0;REVB=0.0224769;RO=0;SAF=48;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.03919e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000111893;OID=.;OPOS=32726838;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:103:104:0:0:102:104:1:54:48:0:0:55:49:0:0
chr6	32729459	.	C	T	1008.44	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0397942;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.618;QD=59.3199;RBI=0.0398231;REFB=0;REVB=-0.00151701;RO=0;SAF=37;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000251716;OID=.;OPOS=32729459;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:68:0:0:67:68:1:30:37:0:0:31:37:0:0
chr6	32729642	.	G	C	1175.22	PASS	AF=0.987342;AO=77;DP=78;FAO=78;FDP=79;FR=.;FRO=1;FSAF=51;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00663564;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.246;QD=59.5047;RBI=0.00917216;REFB=0.0347627;REVB=0.0063322;RO=1;SAF=51;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0091908;STB=0.504853;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=-0.000347844;OID=.;OPOS=32729642;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:78:79:1:1:77:78:0.987342:26:51:1:0:27:51:1:0
chr6	32797809	.	C	T	207.59	PASS	AF=0.45098;AO=23;DP=52;FAO=23;FDP=51;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=0.0274344;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.975;QD=16.2813;RBI=0.0339089;REFB=-0.00322191;REVB=-0.019929;RO=27;SAF=10;SAR=13;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0631228;STB=0.543822;STBP=0.627;TYPE=snp;VARB=0.00398249;OID=.;OPOS=32797809;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:51:27:28:23:23:0.45098:13:10:10:17:13:10:10:18
chr6	32800412	.	C	T	457.64	PASS	AF=0.556962;AO=44;DP=79;FAO=44;FDP=79;FR=.;FRO=35;FSAF=29;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=0.0228636;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.856;QD=23.1718;RBI=0.0239603;REFB=-0.0192128;REVB=0.00716591;RO=35;SAF=29;SAR=15;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169817;STB=0.593575;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.0147383;OID=.;OPOS=32800412;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:35:35:44:44:0.556962:15:29:16:19:15:29:16:19
chr6	32818774	.	T	C	468.71	PASS	AF=0.542169;AO=44;DP=82;FAO=45;FDP=83;FR=.;FRO=38;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=-0.0124704;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.933;QD=22.5884;RBI=0.032219;REFB=-0.0256145;REVB=-0.0297078;RO=37;SAF=22;SAR=22;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0560322;STB=0.529147;STBP=0.589;TYPE=snp;VARB=0.0260166;OID=.;OPOS=32818774;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:83:37:38:44:45:0.542169:22:22:21:16:23:22:21:17
chr6	32825090	.	G	A	277.57	PASS	AF=0.537037;AO=29;DP=54;FAO=29;FDP=54;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.00145705;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.3249;QD=20.5607;RBI=0.00181572;REFB=-0.0355543;REVB=0.00108343;RO=25;SAF=12;SAR=17;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0894955;STB=0.549771;STBP=0.477;TYPE=snp;VARB=0.0265016;OID=.;OPOS=32825090;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:25:25:29:29:0.537037:17:12:13:12:17:12:13:12
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chr6	32917544	.	C	T	501.65	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0144592;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.78;QD=59.0176;RBI=0.0284982;REFB=0;REVB=0.0245576;RO=0;SAF=22;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.75716e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.87004e-05;OID=.;OPOS=32917544;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:12:22:0:0:12:22:0:0
chr6	32939894	.	G	T	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.324;QD=47.8221;RBI=0.00535019;REFB=0;REVB=-0.00535019;RO=0;SAF=0;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.86307e-05;OID=.;OPOS=32939894;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:16:0:0:0:16:0:0:0
chr6	32948462	.	G	A	817.54	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0559824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.2065;QD=57.371;RBI=0.0559828;REFB=0;REVB=-0.000213765;RO=0;SAF=38;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000542985;OID=.;OPOS=32948462;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:19:38:0:0:19:38:0:0
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chr6	32948804	.	C	T	834.38	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00915204;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.0285;QD=57.5432;RBI=0.00924635;REFB=0;REVB=-0.00131725;RO=0;SAF=32;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.09576e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.5908e-05;OID=.;OPOS=32948804;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:26:32:0:0:26:32:0:0
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chr6	32975869	.	G	A	946.35	PASS	AF=1;AO=48;DP=63;FAO=65;FDP=65;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=28;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0754742;FXX=0.0298463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.5487;QD=58.2367;RBI=0.107098;REFB=0;REVB=0.0759847;RO=0;SAF=12;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0028942;OID=.;OPOS=32975869;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:65:0:0:48:65:1:36:12:0:0:37:28:0:0
chr6	32975870	.	C	A	103.54	PASS	AF=0.238806;AO=16;DP=67;FAO=16;FDP=67;FR=.;FRO=51;FSAF=15;FSAR=1;FSRF=15;FSRR=36;FWDB=-0.00921796;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=99.3678;QD=6.18168;RBI=0.021602;REFB=-0.0253346;REVB=0.0195365;RO=51;SAF=15;SAR=1;SRF=15;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.73677;STB=0.94821;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00571068;OID=.;OPOS=32975870;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:51:51:16:16:0.238806:1:15:15:36:1:15:15:36
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chr6	33036505	.	G	C	648.7	PASS	AF=1;AO=41;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0245079;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.312;QD=61.7811;RBI=0.0285198;REFB=0;REVB=0.0145856;RO=0;SAF=23;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000108951;OID=.;OPOS=33036505;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:41:42:1:18:23:0:0:19:23:0:0
chr6	33036549	.	T	C	169.5	PASS	AF=0.439024;AO=18;DP=40;FAO=18;FDP=41;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=-0.00737961;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=231.556;QD=16.5366;RBI=0.0259908;REFB=-0.0060432;REVB=-0.0249212;RO=21;SAF=12;SAR=6;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0969551;STB=0.586108;STBP=0.331;TYPE=snp;VARB=0.0075369;OID=.;OPOS=33036549;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:41:21:23:18:18:0.439024:6:12:12:9:6:12:12:11
chr6	33036853	.	A	C	1230.22	PASS	AF=1;AO=80;DP=82;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00452688;FXX=0.0121936;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.947;QD=60.7518;RBI=0.00452995;REFB=0;REVB=0.000166757;RO=1;SAF=46;SAR=34;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0137211;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.43634e-05;OID=.;OPOS=33036853;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:82:81:1:0:80:81:1:34:46:0:1:35:46:0:0
chr6	33036950	.	CA	CG,TG	1123.7	PASS	AF=0.571429,0.428571;AO=44,33;DP=77;FAO=44,33;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=29,15;FSAR=15,18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0183907,0.0364032;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=1,2;MLLD=78.0332,90.9553;QD=58.3742;RBI=0.0396192,0.0437905;REFB=0,0;REVB=0.0350922,0.0243396;RO=0;SAF=29,15;SAR=15,18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-4.64315e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.0191753,-0.0393117;OID=.,.;OPOS=33036951,33036950;OREF=A,CA;OALT=G,TG;OMAPALT=CG,TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:77:77:0:0:44,33:44,33:0.571429,0.428571:15,18:29,15:0:0:15,18:29,15:0:0
chr6	33036959	.	G	A	1087.4	PASS	AF=0.986486;AO=73;DP=75;FAO=73;FDP=74;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0213852;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.558;QD=58.7783;RBI=0.0259089;REFB=-0.0574374;REVB=-0.0146269;RO=1;SAF=39;SAR=34;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119748;STB=0.506327;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.000667747;OID=.;OPOS=33036959;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:75:74:1:1:73:73:0.986486:34:39:1:0:34:39:1:0
chr6	33036971	.	C	T	1338.64	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0503154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.741;QD=62.2625;RBI=0.0519168;REFB=0;REVB=-0.0127953;RO=0;SAF=46;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.78626e-05;OID=.;OPOS=33036971;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:40:46:0:0:40:46:0:0
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chr6	33037061	.	G	C	226.99	PASS	AF=0.448276;AO=26;DP=57;FAO=26;FDP=58;FR=.;FRO=32;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=-0.0922407;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.2472;QD=15.6547;RBI=0.096876;REFB=0.0297968;REVB=0.0296074;RO=31;SAF=17;SAR=9;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.16951;STB=0.605397;STBP=0.167;TYPE=snp;VARB=-0.0377615;OID=.;OPOS=33037061;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:58:31:32:26:26:0.448276:9:17:15:16:9:17:15:17
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chr6	33052958	.	C	T	885.39	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0243264;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.179;QD=58.0583;RBI=0.0281438;REFB=0;REVB=0.0141527;RO=0;SAF=25;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000168848;OID=.;OPOS=33052958;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:36:25:0:0:36:25:0:0
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chr6	33053609	.	G	A	450.73	PASS	AF=0.466667;AO=47;DP=105;FAO=49;FDP=105;FR=.;FRO=56;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=31;FSRR=25;FWDB=0.00823043;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.396;QD=17.1705;RBI=0.0088095;REFB=-0.0130409;REVB=0.00314121;RO=53;SAF=26;SAR=21;SRF=28;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0238816;STB=0.509691;STBP=0.869;TYPE=snp;VARB=0.0111504;OID=.;OPOS=33053609;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:105:53:56:47:49:0.466667:21:26:28:25:21:28:31:25
chr6	33053682	.	G	A	1245.67	PASS	AF=1;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00746563;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.0134;QD=61.5145;RBI=0.0692298;REFB=0;REVB=0.0688261;RO=0;SAF=45;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.42691e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000453299;OID=.;OPOS=33053682;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:81:0:0:81:81:1:36:45:0:0:36:45:0:0
chr6	33053968	.	T	A	535.91	PASS	AF=1;AO=36;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0339561;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.6743;QD=57.9358;RBI=0.204673;REFB=0;REVB=0.201837;RO=1;SAF=27;SAR=9;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0491764;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00433452;OID=.;OPOS=33053968;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:37:37:1:0:36:37:1:9:27:0:1:10:27:0:0
chr6	33053971	.	T	C	557.12	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0027813;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.848;QD=60.2293;RBI=0.0630234;REFB=0;REVB=0.062962;RO=0;SAF=27;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.67388e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00031856;OID=.;OPOS=33053971;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:10:27:0:0:10:27:0:0
chr6	33053982	.	G	C	557.09	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0376449;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.985;QD=60.2256;RBI=0.0403838;REFB=0;REVB=0.014619;RO=0;SAF=27;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.67388e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000114836;OID=.;OPOS=33053982;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:10:27:0:0:10:27:0:0
chr6	33054013	.	TA	T	107.85	PASS	AF=0.422222;AO=18;DP=45;FAO=19;FDP=45;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=18;FSRR=8;FWDB=0.00679239;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=21.6926;QD=9.58621;RBI=0.0211057;REFB=0.0281611;REVB=0.0199828;RO=25;SAF=13;SAR=5;SRF=17;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0515131;STB=0.532129;STBP=0.76;TYPE=del;VARB=-0.0297602;OID=.;OPOS=33054014;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.422222:18:45:19:45:26:14:5:18:8:99:25:13:5:17:8
chr6	33054046	.	T	G	676.4	PASS	AF=1;AO=31;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=34;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0163057;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.903;QD=62.9204;RBI=0.0753151;REFB=0;REVB=0.0735288;RO=0;SAF=26;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000538881;OID=.;OPOS=33054046;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:31:43:1:5:26:0:0:9:34:0:0
chr6	33054057	.	G	A	785.71	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0166287;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.169;QD=64.1394;RBI=0.0173979;REFB=0;REVB=0.00511592;RO=0;SAF=33;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.94486e-05;OID=.;OPOS=33054057;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:16:33:0:0:16:33:0:0
chr6	33080359	.	CT	TG	193.99	PASS	AF=0.416667;AO=20;DP=49;FAO=20;FDP=48;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=-0.00512627;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=2;MLLD=206.855;QD=16.166;RBI=0.00726994;REFB=-0.0128752;REVB=0.00515494;RO=28;SAF=11;SAR=9;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0870393;STB=0.54995;STBP=0.603;TYPE=mnp;VARB=0.0146282;OID=.;OPOS=33080359;OREF=CT;OALT=TG;OMAPALT=TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:48:28:28:20:20:0.416667:9:11:13:15:9:11:13:15
chr6	33134278	.	G	A	171.02	PASS	AF=0.473684;AO=17;DP=37;FAO=18;FDP=38;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.0316937;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.2599;QD=18.002;RBI=0.0492955;REFB=0.00683302;REVB=0.0377565;RO=20;SAF=11;SAR=6;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0967593;STB=0.565962;STBP=0.474;TYPE=snp;VARB=-0.00678711;OID=.;OPOS=33134278;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:38:20:20:17:18:0.473684:6:11:11:9:6:12:11:9
chr6	33136310	.	G	T	160.51	PASS	AF=0.485714;AO=17;DP=35;FAO=17;FDP=35;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.0269143;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.585;QD=18.3435;RBI=0.0271834;REFB=-0.00839066;REVB=-0.00381525;RO=18;SAF=8;SAR=9;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.074462;STB=0.542324;STBP=0.662;TYPE=snp;VARB=0.00663469;OID=.;OPOS=33136310;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:18:18:17:17:0.485714:9:8:7:11:9:8:7:11
chr6	33138955	.	G	A	178.5	PASS	AF=0.403846;AO=16;DP=49;FAO=21;FDP=52;FR=.;FRO=31;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=27;FSRR=4;FWDB=-0.00724631;FXX=0.0370302;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.962;QD=13.7306;RBI=0.0451646;REFB=-0.00742659;REVB=0.0445795;RO=32;SAF=14;SAR=2;SRF=27;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0742067;STB=0.650675;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=0.0105692;OID=.;OPOS=33138955;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:52:32:31:16:21:0.403846:2:14:27:5:7:14:27:4
chr6	33141161	.	A	G	635.41	PASS	AF=1;AO=36;DP=42;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0235415;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.921;QD=61.9912;RBI=0.024136;REFB=0;REVB=0.00532401;RO=0;SAF=14;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.46742e-06;OID=.;OPOS=33141161;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:41:0:0:36:41:1:22:14:0:0:22:19:0:0
chr6	33141797	.	C	T	303.22	PASS	AF=0.409639;AO=34;DP=82;FAO=34;FDP=83;FR=.;FRO=49;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=33;FWDB=-0.0167367;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=242.362;QD=14.6128;RBI=0.0167427;REFB=-0.0101488;REVB=-0.000445181;RO=47;SAF=17;SAR=17;SRF=14;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.208543;STB=0.602352;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=0.0174396;OID=.;OPOS=33141797;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:83:47:49:34:34:0.409639:17:17:14:33:17:17:16:33
chr6	33141920	.	G	C	239.74	PASS	AF=1;AO=17;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=4;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00889979;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.194;QD=50.4709;RBI=0.0135686;REFB=0;REVB=0.0102421;RO=0;SAF=3;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.53656e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000278426;OID=.;OPOS=33141920;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:17:19:1:14:3:0:0:15:4:0:0
chr6	33144243	.	T	A	885.41	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0191842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.356;QD=58.0598;RBI=0.0274216;REFB=0;REVB=0.0195936;RO=0;SAF=19;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000142771;OID=.;OPOS=33144243;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:42:19:0:0:42:19:0:0
chr6	33145018	.	G	A	192.73	PASS	AF=0.434783;AO=18;DP=45;FAO=20;FDP=46;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=0.0303797;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.71;QD=16.7595;RBI=0.0306389;REFB=-0.0237642;REVB=0.00397653;RO=26;SAF=10;SAR=8;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0625797;STB=0.537574;STBP=0.658;TYPE=snp;VARB=0.0205513;OID=.;OPOS=33145018;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:46:26:26:18:20:0.434783:8:10:16:10:9:11:16:10
chr6	33145418	.	G	A	148.77	PASS	AF=0.5;AO=15;DP=32;FAO=16;FDP=32;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.0592189;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.2693;QD=18.596;RBI=0.115205;REFB=-0.00401629;REVB=0.0988191;RO=15;SAF=6;SAR=9;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0598629;STB=0.532745;STBP=0.722;TYPE=snp;VARB=0.00870438;OID=.;OPOS=33145418;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:15:16:15:16:0.5:9:6:7:8:10:6:7:9
chr6	33163451	.	G	A	955.62	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.020893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.004;QD=58.8073;RBI=0.0528186;REFB=0;REVB=0.0485107;RO=0;SAF=33;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.87477e-05;OID=.;OPOS=33163451;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:65:0:0:63:65:1:30:33:0:0:32:33:0:0
chr6	33168574	.	G	A	339.92	PASS	AF=0.48;AO=36;DP=75;FAO=36;FDP=75;FR=.;FRO=39;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=16;FSRR=23;FWDB=0.0241958;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.7198;QD=18.1289;RBI=0.0640783;REFB=0.0145663;REVB=0.0593346;RO=39;SAF=15;SAR=21;SRF=16;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00614608;STB=0.503431;STBP=0.961;TYPE=snp;VARB=-0.0154201;OID=.;OPOS=33168574;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:39:39:36:36:0.48:21:15:16:23:21:15:16:23
chr6	33172479	.	G	T	324.95	PASS	AF=0.466667;AO=35;DP=76;FAO=35;FDP=75;FR=.;FRO=40;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=13;FSRR=27;FWDB=0.0410138;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.066;QD=17.3307;RBI=0.059702;REFB=-0.0304192;REVB=0.0433844;RO=40;SAF=15;SAR=20;SRF=13;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102622;STB=0.55728;STBP=0.374;TYPE=snp;VARB=0.040263;OID=.;OPOS=33172479;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:75:40:40:35:35:0.466667:20:15:13:27:20:15:13:27
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chr6	33422976	.	T	G	651.13	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00300256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.7847;QD=62.0124;RBI=0.0796455;REFB=0;REVB=0.0795889;RO=0;SAF=28;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00118871;OID=.;OPOS=33422976;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:14:28:0:0:14:28:0:0
chr6	33541507	.	A	G	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0653588;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=259.058;QD=43.4862;RBI=0.0667907;REFB=0;REVB=-0.0137559;RO=0;SAF=7;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000326774;OID=.;OPOS=33541507;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:5:7:0:0:5:7:0:0
chr6	33560896	.	A	G	102.5	PASS	AF=0.521739;AO=12;DP=23;FAO=12;FDP=23;FR=.;FRO=11;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=9;FWDB=-0.0102935;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.025;QD=17.8252;RBI=0.0325535;REFB=0.00867088;REVB=-0.0308832;RO=11;SAF=7;SAR=5;SRF=2;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.325459;STB=0.68503;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=-0.018267;OID=.;OPOS=33560896;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:23:23:11:11:12:12:0.521739:5:7:2:9:5:7:2:9
chr6	33636907	.	C	T	259.98	PASS	AF=1;AO=20;DP=21;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00943176;FXX=0.0475964;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.52;QD=51.9966;RBI=0.0254128;REFB=0;REVB=0.0235977;RO=0;SAF=4;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000275502;OID=.;OPOS=33636907;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:20:0:0:20:20:1:16:4:0:0:16:4:0:0
chr6	33638180	.	C	T	1098.57	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0690744;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.02;QD=60.1958;RBI=0.0780156;REFB=0;REVB=0.0362652;RO=0;SAF=37;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.89682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000304296;OID=.;OPOS=33638180;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:36:37:0:0:36:37:0:0
chr6	33641379	.	T	C	766.45	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0077684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.811;QD=63.8712;RBI=0.0107385;REFB=0;REVB=0.00741402;RO=0;SAF=25;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.27224e-06;OID=.;OPOS=33641379;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:23:25:0:0:23:25:0:0
chr6	33648228	.	C	T	1185.5	PASS	AF=0.987654;AO=79;DP=81;FAO=80;FDP=81;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00536636;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=313.318;QD=58.543;RBI=0.0192929;REFB=-0.0212603;REVB=0.0185315;RO=2;SAF=42;SAR=37;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00148455;STB=0.506665;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=6.45258e-05;OID=.;OPOS=33648228;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:81:81:2:1:79:80:0.987654:37:42:1:1:37:43:0:1
chr6	33653448	.	CT	TC,TT	734.62	PASS	AF=0.0425532,0.957447;AO=2,41;DP=43;FAO=2,45;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=2,25;FSAR=0,20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143442,0.00956721;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=183.689,226.853;QD=62.5205;RBI=0.0482068,0.0728367;REFB=0,0;REVB=0.0460233,0.0722057;RO=0;SAF=2,25;SAR=0,16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.1719e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0464922,-0.002008;OID=.,.;OPOS=33653448,33653448;OREF=CT,C;OALT=TC,T;OMAPALT=TC,TT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:43:47:0:0:2,41:2,45:0.0425532,0.957447:0,16:2,25:0:0:0,20:2,25:0:0
chr6	33659472	.	C	G	607.42	PASS	AF=0.953488;AO=41;DP=43;FAO=41;FDP=43;FR=.;FRO=2;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00599754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.1803;QD=56.5041;RBI=0.0147505;REFB=0.0661016;REVB=-0.0134762;RO=2;SAF=20;SAR=21;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0446315;STB=0.523798;STBP=0.264;TYPE=snp;VARB=-0.00266725;OID=.;OPOS=33659472;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:43:43:2:2:41:41:0.953488:21:20:2:0:21:20:2:0
chr6	33690796	.	CA	TG	725.18	PASS	AF=1;AO=50;DP=52;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00668243;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=2;MLLD=205.79;QD=56.8767;RBI=0.0148427;REFB=0;REVB=0.0132533;RO=0;SAF=23;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=6.12687e-06;OID=.;OPOS=33690796;OREF=CA;OALT=TG;OMAPALT=TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:51:0:0:50:51:1:27:23:0:0:28:23:0:0
chr6	33739960	.	A	G	831.82	PASS	AF=0.924242;AO=61;DP=66;FAO=61;FDP=66;FR=.;FRO=5;FSAF=42;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0303957;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.9962;QD=50.4132;RBI=0.0356827;REFB=-0.0358078;REVB=-0.018691;RO=4;SAF=42;SAR=19;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0578253;STB=0.541769;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.020246;OID=.;OPOS=33739960;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:20:66:66:4:5:61:61:0.924242:19:42:1:3:19:42:1:4
chr6	33740025	.	C	T	198.38	PASS	AF=0.944444;AO=17;DP=18;FAO=17;FDP=18;FR=.;FRO=1;FSAF=0;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.9677;QD=44.0849;RBI=0.0797069;REFB=-0.0791007;REVB=0.0797069;RO=1;SAF=0;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0115193;OID=.;OPOS=33740025;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:18:18:1:1:17:17:0.944444:17:0:0:1:17:0:0:1
chr6	33768897	.	A	G	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00612501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.251;QD=49.5992;RBI=0.0201236;REFB=0;REVB=0.0191688;RO=0;SAF=9;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000105123;OID=.;OPOS=33768897;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:9:9:0:0:9:9:0:0
chr6	34212743	.	A	G	294.51	PASS	AF=1;AO=14;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.6704;QD=51.2199;RBI=0.047772;REFB=0;REVB=-0.047772;RO=0;SAF=0;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00279786;OID=.;OPOS=34212743;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:14:23:1:14:0:0:0:23:0:0:0
chr6	34213296	.	T	C	465.13	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000355659;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.69;QD=58.141;RBI=0.0129248;REFB=0;REVB=0.0129199;RO=0;SAF=15;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.79294e-05;OID=.;OPOS=34213296;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:17:15:0:0:17:15:0:0
chr6	34213868	.	A	G	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0290832;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=135.892;QD=44.6878;RBI=0.0290985;REFB=0;REVB=-0.000945476;RO=0;SAF=6;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000162945;OID=.;OPOS=34213868;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:7:6:0:0:7:6:0:0
chr6	34214322	.	C	G	418.2	PASS	AF=0.967742;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00629352;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=140.071;QD=53.9606;RBI=0.00867125;REFB=-0.193942;REVB=0.00596507;RO=0;SAF=16;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.56309e-08;STB=0.515141;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=0.00126227;OID=.;OPOS=34214322;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:31:31:0:1:30:30:0.967742:14:16:0:0:14:16:1:0
chr6	34502687	.	T	C	1522.68	PASS	AF=1;AO=95;DP=95;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00410691;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.637;QD=63.4451;RBI=0.0178905;REFB=0;REVB=0.0174128;RO=0;SAF=43;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.67486e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.23436e-05;OID=.;OPOS=34502687;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:96:0:0:95:96:1:52:43:0:0:53:43:0:0
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chr6	34557374	.	A	G	203.65	PASS	AF=0.857143;AO=18;DP=21;FAO=18;FDP=21;FR=.;FRO=3;FSAF=15;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.00421151;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=242.545;QD=38.7913;RBI=0.0117896;REFB=-0.00383523;REVB=-0.0110117;RO=3;SAF=15;SAR=3;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.300597;STB=0.666454;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=1.71869e-06;OID=.;OPOS=34557374;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:21:21:3:3:18:18:0.857143:3:15:0:3:3:15:0:3
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chr6	34949607	.	C	T	248.34	PASS	AF=0.490909;AO=27;DP=55;FAO=27;FDP=55;FR=.;FRO=28;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=-5.96666e-05;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.057;QD=18.0614;RBI=0.0102324;REFB=-0.0163603;REVB=-0.0102323;RO=27;SAF=13;SAR=14;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0330534;STB=0.52757;STBP=0.728;TYPE=snp;VARB=0.0167933;OID=.;OPOS=34949607;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:27:28:27:27:0.490909:14:13:14:13:14:13:15:13
chr6	34977663	.	C	A	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0223403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.345;QD=35.5759;RBI=0.0342373;REFB=0;REVB=-0.0259443;RO=0;SAF=6;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000193989;OID=.;OPOS=34977663;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:1:6:0:0:1:6:0:0
chr6	35027927	.	T	C	1500.19	PASS	AF=1;AO=100;DP=101;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0118229;FXX=0.00990001;HRUN=3;LEN=1;MLLD=169.307;QD=60.0077;RBI=0.038177;REFB=0;REVB=-0.0363002;RO=0;SAF=52;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.19274e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.95898e-05;OID=.;OPOS=35027927;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:101:100:0:0:100:100:1:48:52:0:0:48:52:0:0
chr6	35050506	.	G	A	750.22	PASS	AF=1;AO=51;DP=52;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00348557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.3932;QD=56.6205;RBI=0.0257067;REFB=0;REVB=0.0254693;RO=0;SAF=28;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.97956e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000204883;OID=.;OPOS=35050506;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:53:0:0:51:53:1:23:28:0:0:23:30:0:0
chr6	35203203	.	T	G	605.13	PASS	AF=0.977273;AO=40;DP=43;FAO=43;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00840971;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=217.816;QD=55.0118;RBI=0.0266677;REFB=-0.184043;REVB=0.025307;RO=3;SAF=25;SAR=15;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0401613;STB=0.509799;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.000585302;OID=.;OPOS=35203203;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:43:44:3:1:40:43:0.977273:15:25:1:2:18:25:1:0
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chr6	35260530	.	C	T	393.33	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0414079;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.3392;QD=56.1899;RBI=0.0486864;REFB=0;REVB=0.0256076;RO=0;SAF=9;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.62669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00157677;OID=.;OPOS=35260530;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:19:9:0:0:19:9:0:0
chr6	35263555	.	A	G	508.37	PASS	AF=0.972222;AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.045654;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.3744;QD=56.4854;RBI=0.053671;REFB=-0.0254814;REVB=-0.0282186;RO=1;SAF=13;SAR=22;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0207916;STB=0.511105;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=0.0064417;OID=.;OPOS=35263555;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:36:36:1:1:35:35:0.972222:22:13:0:1:22:13:0:1
chr6	35285720	.	A	C	465.13	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0495256;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.5157;QD=58.1416;RBI=0.065161;REFB=0;REVB=-0.0423458;RO=0;SAF=16;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000115618;OID=.;OPOS=35285720;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:16:16:0:0:16:16:0:0
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chr6	35395010	.	C	T	972.86	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0386714;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=254.546;QD=58.9613;RBI=0.0448064;REFB=0;REVB=0.0226304;RO=0;SAF=38;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.74361e-05;OID=.;OPOS=35395010;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:28:38:0:0:28:38:0:0
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chr6	35477025	.	C	G	306.34	PASS	AF=1;AO=22;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0210495;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.879;QD=53.2761;RBI=0.0699108;REFB=0;REVB=0.0666666;RO=0;SAF=8;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000943195;OID=.;OPOS=35477025;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:22:23:1:14:8:0:0:15:8:0:0
chr6	35479574	.	G	C	205.42	PASS	AF=1;AO=16;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.02417;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.352;QD=48.3333;RBI=0.0322754;REFB=0;REVB=0.0213895;RO=0;SAF=9;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000204383;OID=.;OPOS=35479574;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:16:17:1:7:9:0:0:8:9:0:0
chr6	35705892	.	T	C	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00970101;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.911;QD=55.6558;RBI=0.0114377;REFB=0;REVB=0.00605893;RO=0;SAF=13;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.10729e-05;OID=.;OPOS=35705892;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:14:13:0:0:14:13:0:0
chr6	35745655	.	C	T	195.48	PASS	AF=0.418182;AO=23;DP=55;FAO=23;FDP=55;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=0.0450026;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.4561;QD=14.2165;RBI=0.0452899;REFB=0.0067013;REVB=-0.00509317;RO=32;SAF=10;SAR=13;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.098376;STB=0.556211;STBP=0.471;TYPE=snp;VARB=-0.00960721;OID=.;OPOS=35745655;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:32:32:23:23:0.418182:13:10:17:15:13:10:17:15
chr6	35748931	.	T	C	396.91	PASS	AF=0.573529;AO=39;DP=68;FAO=39;FDP=68;FR=.;FRO=29;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=0.0116861;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.0758;QD=23.3477;RBI=0.0555131;REFB=-0.0028306;REVB=-0.0542691;RO=29;SAF=17;SAR=22;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0635359;STB=0.534936;STBP=0.544;TYPE=snp;VARB=0.00207492;OID=.;OPOS=35748931;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:29:29:39:39:0.573529:22:17:15:14:22:17:15:14
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chr6	35995950	.	C	G	63.56	PASS	AF=0.321429;AO=9;DP=27;FAO=9;FDP=28;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.024926;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.0451;QD=9.08;RBI=0.0662516;REFB=0.00999569;REVB=-0.0613837;RO=18;SAF=4;SAR=5;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.52951e-08;STB=0.519955;STBP=0.949;TYPE=snp;VARB=-0.0220451;OID=.;OPOS=35995950;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:27:28:18:19:9:9:0.321429:5:4:8:10:5:4:9:10
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chr6	36922684	.	A	C	1540.12	PASS	AF=1;AO=103;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00892427;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.6498;QD=59.8105;RBI=0.0456125;REFB=0;REVB=-0.044731;RO=0;SAF=51;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000221771;OID=.;OPOS=36922684;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:103:103:0:0:103:103:1:52:51:0:0:52:51:0:0
chr6	36931162	.	A	G	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0424496;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.221;QD=51.9163;RBI=0.0424723;REFB=0;REVB=-0.00138794;RO=0;SAF=6;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000333372;OID=.;OPOS=36931162;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:15:6:0:0:15:6:0:0
chr6	36976637	.	G	C	379.9	PASS	AF=0.506494;AO=39;DP=77;FAO=39;FDP=77;FR=.;FRO=38;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=0.0409834;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.635;QD=19.7348;RBI=0.0453477;REFB=-0.0183316;REVB=0.0194107;RO=38;SAF=18;SAR=21;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0126853;STB=0.507039;STBP=0.905;TYPE=snp;VARB=0.0188282;OID=.;OPOS=36976637;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:38:38:39:39:0.506494:21:18:17:21:21:18:17:21
chr6	36978834	.	A	G	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000831121;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.474;QD=51.9155;RBI=0.0348534;REFB=0;REVB=0.0348435;RO=0;SAF=9;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000142436;OID=.;OPOS=36978834;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:12:9:0:0:12:9:0:0
chr6	36995222	.	G	A	270.77	PASS	AF=0.46875;AO=30;DP=64;FAO=30;FDP=64;FR=.;FRO=34;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=13;FWDB=-0.00477372;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.716;QD=16.9228;RBI=0.0233083;REFB=-0.0133081;REVB=-0.0228142;RO=33;SAF=16;SAR=14;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0686269;STB=0.545233;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=0.0155858;OID=.;OPOS=36995222;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:33:34:30:30:0.46875:14:16:20:13:14:16:21:13
chr6	37138220	.	C	G	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0475191;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.059;QD=48.7368;RBI=0.149691;REFB=0;REVB=0.141948;RO=0;SAF=14;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.53656e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00188505;OID=.;OPOS=37138220;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:3:14:0:0:3:14:0:0
chr6	37180237	.	G	A	834.33	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0259187;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.9184;QD=57.5401;RBI=0.0259195;REFB=0;REVB=0.000205158;RO=0;SAF=37;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.3149e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000196985;OID=.;OPOS=37180237;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:21:37:0:0:21:37:0:0
chr6	37180355	.	G	A	727.8	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0123504;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.824;QD=63.2868;RBI=0.0203944;REFB=0;REVB=0.0162296;RO=0;SAF=25;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.85991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.19144e-05;OID=.;OPOS=37180355;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:21:25:0:0:21:25:0:0
chr6	37180523	.	A	G	726.31	PASS	AF=0.963636;AO=53;DP=55;FAO=53;FDP=55;FR=.;FRO=2;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0445836;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=46.6686;QD=52.8224;RBI=0.079135;REFB=-0.184959;REVB=-0.0653808;RO=0;SAF=26;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.500343;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=0.0048812;OID=.;OPOS=37180523;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:55:55:0:2:53:53:0.963636:27:26:0:0:27:26:1:1
chr6	37250112	.	A	G	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0502044;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.8073;QD=40.7625;RBI=0.0555013;REFB=0;REVB=0.0236624;RO=0;SAF=5;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00129258;OID=.;OPOS=37250112;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:5:5:0:0:5:5:0:0
chr6	37252210	.	C	T	951.89	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0587053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.885;QD=58.578;RBI=0.0621627;REFB=0;REVB=0.0204424;RO=0;SAF=34;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.90682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000151816;OID=.;OPOS=37252210;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:31:34:0:0:31:34:0:0
chr6	37288036	.	A	G	575.8	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0463276;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.188;QD=60.6103;RBI=0.0523069;REFB=0;REVB=0.0242853;RO=0;SAF=16;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.92108e-05;OID=.;OPOS=37288036;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:22:16:0:0:22:16:0:0
chr6	37349033	.	G	A	1491.69	PASS	AF=1;AO=94;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.013857;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.444;QD=63.4764;RBI=0.0199726;REFB=0;REVB=-0.0143837;RO=0;SAF=42;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.90593e-05;OID=.;OPOS=37349033;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:94:94:0:0:94:94:1:52:42:0:0:52:42:0:0
chr6	37450914	.	T	C	198.36	PASS	AF=0.4;AO=24;DP=60;FAO=24;FDP=60;FR=.;FRO=36;FSAF=18;FSAR=6;FSRF=23;FSRR=13;FWDB=-0.00378193;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.475;QD=13.224;RBI=0.0169206;REFB=0.00497875;REVB=-0.0164925;RO=36;SAF=18;SAR=6;SRF=23;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14125;STB=0.581561;STBP=0.348;TYPE=snp;VARB=-0.0052514;OID=.;OPOS=37450914;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:36:36:24:24:0.4:6:18:23:13:6:18:23:13
chr6	37502110	.	C	G	367.86	PASS	AF=0.428571;AO=39;DP=93;FAO=39;FDP=91;FR=.;FRO=52;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=26;FSRR=26;FWDB=0.00259551;FXX=0.0215031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.739;QD=16.1697;RBI=0.00400498;REFB=-0.00501919;REVB=-0.00305012;RO=52;SAF=23;SAR=16;SRF=26;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0922107;STB=0.551973;STBP=0.393;TYPE=snp;VARB=0.00654621;OID=.;OPOS=37502110;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:91:52:52:39:39:0.428571:16:23:26:26:16:23:26:26
chr6	37603102	.	TG	CA,CG	641.69	PASS	AF=0.534884,0.465116;AO=22,21;DP=43;FAO=23,20;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=17,11;FSAR=6,9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0471871,0.0238674;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=122.743,51.3174;QD=59.6925;RBI=0.0485004,0.0496395;REFB=0,0;REVB=0.0112101,0.043525;RO=0;SAF=16,12;SAR=6,9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.17051e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.01415,0.0313847;OID=.,.;OPOS=37603102,37603102;OREF=TG,T;OALT=CA,C;OMAPALT=CA,CG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:43:43:0:0:22,21:23,20:0.534884,0.465116:6,9:16,12:0:0:6,9:17,11:0:0
chr6	37604885	.	A	G	230.8	PASS	AF=0.480769;AO=25;DP=51;FAO=25;FDP=52;FR=.;FRO=27;FSAF=3;FSAR=22;FSRF=6;FSRR=21;FWDB=-0.0134526;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.941;QD=17.7539;RBI=0.026854;REFB=0.00833758;REVB=-0.0232415;RO=26;SAF=3;SAR=22;SRF=6;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194493;STB=0.605408;STBP=0.27;TYPE=snp;VARB=-0.00851832;OID=.;OPOS=37604885;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:52:26:27:25:25:0.480769:22:3:6:20:22:3:6:21
chr6	37623566	.	C	T	130.65	PASS	AF=0.394737;AO=15;DP=38;FAO=15;FDP=38;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=5;FWDB=0.00854758;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.2225;QD=13.7529;RBI=0.0181075;REFB=-0.0292707;REVB=0.0159632;RO=22;SAF=9;SAR=6;SRF=17;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194421;STB=0.620545;STBP=0.245;TYPE=snp;VARB=0.0267072;OID=.;OPOS=37623566;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:22:23:15:15:0.394737:6:9:17:5:6:9:18:5
chr6	37623626	.	C	T	292.74	PASS	AF=0.604651;AO=26;DP=43;FAO=26;FDP=43;FR=.;FRO=17;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=-0.0117114;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.806;QD=27.2319;RBI=0.0117864;REFB=0.00188601;REVB=-0.00132737;RO=17;SAF=17;SAR=9;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137637;STB=0.576211;STBP=0.221;TYPE=snp;VARB=-0.00129387;OID=.;OPOS=37623626;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:17:17:26:26:0.604651:9:17:8:9:9:17:8:9
chr6	37626142	.	C	T	277.6	PASS	AF=0.537037;AO=29;DP=54;FAO=29;FDP=54;FR=.;FRO=25;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=-0.0115615;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.824;QD=20.563;RBI=0.0122049;REFB=-0.00819799;REVB=0.00391042;RO=25;SAF=16;SAR=13;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0930115;STB=0.551688;STBP=0.452;TYPE=snp;VARB=0.00709541;OID=.;OPOS=37626142;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:25:25:29:29:0.537037:13:16:11:14:13:16:11:14
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chr6	39855288	.	C	A	131.99	PASS	AF=0.416667;AO=15;DP=36;FAO=15;FDP=36;FR=.;FRO=21;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=-0.0209299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.44;QD=14.6656;RBI=0.0280217;REFB=-0.00226487;REVB=-0.0186322;RO=21;SAF=12;SAR=3;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180257;STB=0.605906;STBP=0.366;TYPE=snp;VARB=0.00590621;OID=.;OPOS=39855288;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:21:21:15:15:0.416667:3:12:14:7:3:12:14:7
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chr6	41037778	.	C	T	178.72	PASS	AF=0.5625;AO=17;DP=32;FAO=18;FDP=32;FR=.;FRO=14;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.0178578;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.5234;QD=22.3398;RBI=0.0435138;REFB=0.0117474;REVB=0.0396805;RO=14;SAF=8;SAR=9;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0235764;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00764557;OID=.;OPOS=41037778;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:14:14:17:18:0.5625:9:8:7:7:9:9:7:7
chr6	41037876	.	A	G	79.41	PASS	AF=0.5;AO=10;DP=20;FAO=10;FDP=20;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=9;FWDB=0.0126046;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.93;QD=15.882;RBI=0.0137384;REFB=-0.0107181;REVB=-0.00546499;RO=10;SAF=3;SAR=7;SRF=1;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.230767;STB=0.631356;STBP=0.411;TYPE=snp;VARB=0.0103791;OID=.;OPOS=41037876;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:20:20:10:10:10:10:0.5:7:3:1:9:7:3:1:9
chr6	41038845	.	C	T	393.33	PASS	AF=0.5;AO=40;DP=79;FAO=40;FDP=80;FR=.;FRO=40;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=0.0109347;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.619;QD=19.6666;RBI=0.0112206;REFB=-0.00681435;REVB=0.00251644;RO=39;SAF=19;SAR=21;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.010854;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.006069;OID=.;OPOS=41038845;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:80:39:40:40:40:0.5:21:19:19:20:21:19:19:21
chr6	41162518	.	T	C	1509.45	PASS	AF=1;AO=97;DP=97;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.028353;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=286.713;QD=59.7802;RBI=0.0352246;REFB=0;REVB=0.0209017;RO=0;SAF=44;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.9339e-05;OID=.;OPOS=41162518;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:97:101:0:0:97:101:1:53:44:0:0:54:47:0:0
chr6	41196156	.	C	T	547.29	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000943188;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.907;QD=59.1668;RBI=0.0229316;REFB=0;REVB=0.0229121;RO=0;SAF=23;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.21415e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000791037;OID=.;OPOS=41196156;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:37:0:0:36:37:1:13:23:0:0:14:23:0:0
chr6	41196492	.	C	A	215.02	PASS	AF=0.538462;AO=20;DP=38;FAO=21;FDP=39;FR=.;FRO=18;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.0176378;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.1661;QD=22.0534;RBI=0.0469939;REFB=-0.00872838;REVB=-0.0435584;RO=18;SAF=11;SAR=9;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0422861;STB=0.533301;STBP=0.727;TYPE=snp;VARB=0.00676987;OID=.;OPOS=41196492;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:39:18:18:20:21:0.538462:9:11:9:9:9:12:9:9
chr6	41196605	.	T	C	716.21	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0207827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.578;QD=56.1731;RBI=0.0234415;REFB=0;REVB=0.0108436;RO=0;SAF=27;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000316649;OID=.;OPOS=41196605;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:51:0:0:48:51:1:21:27:0:0:21:30:0:0
chr6	41196727	.	C	T	691.47	PASS	AF=1;AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0231387;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.7792;QD=62.8612;RBI=0.0287709;REFB=0;REVB=-0.0170987;RO=0;SAF=29;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000431;OID=.;OPOS=41196727;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:44:0:0:44:44:1:15:29:0:0:15:29:0:0
chr6	41197785	.	T	C	766.46	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108312;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=236.819;QD=63.872;RBI=0.0535841;REFB=0;REVB=0.052478;RO=0;SAF=23;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000140888;OID=.;OPOS=41197785;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:25:23:0:0:25:23:0:0
chr6	41197857	.	C	T	684.44	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0149122;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.907;QD=62.222;RBI=0.0377454;REFB=0;REVB=0.0346748;RO=0;SAF=21;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000194653;OID=.;OPOS=41197857;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:44:0:0:43:44:1:22:21:0:0:22:22:0:0
chr6	41270223	.	C	T	429.02	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0364418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.2411;QD=57.2026;RBI=0.0388853;REFB=0;REVB=-0.0135669;RO=0;SAF=18;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00102648;OID=.;OPOS=41270223;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:12:18:0:0:12:18:0:0
chr6	41303592	.	T	C	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.029469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.77;QD=51.1843;RBI=0.0307183;REFB=0;REVB=-0.0086713;RO=0;SAF=7;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000322351;OID=.;OPOS=41303592;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:13:7:0:0:13:7:0:0
chr6	41309552	.	T	C	592.53	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00488492;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.971;QD=60.7718;RBI=0.00885964;REFB=0;REVB=0.00739126;RO=0;SAF=21;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.53998e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.66564e-05;OID=.;OPOS=41309552;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:39:0:0:38:39:1:17:21:0:0:17:22:0:0
chr6	41318438	.	A	G	757.54	PASS	AF=1;AO=48;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.023076;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.796;QD=61.8396;RBI=0.0249607;REFB=-0.137997;REVB=0.00951494;RO=1;SAF=22;SAR=26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0177516;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000561299;OID=.;OPOS=41318438;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:49:49:1:0:48:49:1:26:22:0:1:27:22:0:0
chr6	41533579	.	C	A	1406.83	PASS	AF=0.978495;AO=91;DP=93;FAO=91;FDP=93;FR=.;FRO=2;FSAF=49;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0453081;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=253.557;QD=60.5089;RBI=0.0495916;REFB=-0.0710619;REVB=0.020162;RO=0;SAF=49;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.511625;STBP=0.165;TYPE=snp;VARB=0.000237823;OID=.;OPOS=41533579;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:93:93:0:2:91:91:0.978495:42:49:0:0:42:49:0:2
chr6	41568064	.	G	A	180.85	PASS	AF=0.403846;AO=21;DP=52;FAO=21;FDP=52;FR=.;FRO=31;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=-0.0170959;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.098;QD=13.9118;RBI=0.0188459;REFB=-0.00383186;REVB=0.00793087;RO=31;SAF=11;SAR=10;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0255701;STB=0.514692;STBP=0.858;TYPE=snp;VARB=0.00567206;OID=.;OPOS=41568064;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:31:31:21:21:0.403846:10:11:17:14:10:11:17:14
chr6	41621618	.	A	G	221.91	PASS	AF=1;AO=16;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=18;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0233068;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.757;QD=49.3144;RBI=0.0233068;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=16;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000395992;OID=.;OPOS=41621618;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:16:18:1:0:16:0:0:0:18:0:0
chr6	41621625	.	G	A	173.14	PASS	AF=0.842105;AO=16;DP=19;FAO=16;FDP=19;FR=.;FRO=3;FSAF=16;FSAR=0;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0275104;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=220.106;QD=36.4505;RBI=0.0275104;REFB=0.0735818;REVB=0;RO=0;SAF=16;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00581904;OID=.;OPOS=41621625;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:19:19:0:3:16:16:0.842105:0:16:0:0:0:16:3:0
chr6	41652514	.	C	T	45.07	PASS	AF=0.304348;AO=7;DP=23;FAO=7;FDP=23;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=-0.00339965;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.858;QD=7.8382;RBI=0.0278131;REFB=-0.000864239;REVB=-0.0276046;RO=16;SAF=4;SAR=3;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0613202;STB=0.538354;STBP=0.868;TYPE=snp;VARB=0.000792115;OID=.;OPOS=41652514;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:23:23:16:16:7:7:0.304348:3:4:10:6:3:4:10:6
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chr6	41754573	.	C	CCTT	228.3	PASS	AF=1;AO=16;DP=28;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0586097;FXX=0.428418;HRUN=2;LEN=3;MLLD=134.554;QD=57.0741;RBI=0.0607345;REFB=0;REVB=0.0159242;RO=11;SAF=8;SAR=8;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0329238;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000861486;OID=.;OPOS=41754574;OREF=-;OALT=CTT;OMAPALT=CCTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:1:16:28:16:16:0:8:8:0:0:3:11:8:8:6:5
chr6	41754576	.	C	T	85.24	PASS	AF=0.354839;AO=10;DP=30;FAO=11;FDP=31;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.064942;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.08;QD=10.9993;RBI=0.0650075;REFB=-0.00179389;REVB=0.00291776;RO=20;SAF=5;SAR=5;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0549448;STB=0.502953;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00273764;OID=.;OPOS=41754576;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:30:31:20:20:10:11:0.354839:5:5:11:9:5:6:11:9
chr6	41800629	.	T	C	324.78	PASS	AF=0.603774;AO=31;DP=52;FAO=32;FDP=53;FR=.;FRO=21;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.0119728;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.159;QD=24.5114;RBI=0.0192878;REFB=-0.00552821;REVB=0.015122;RO=21;SAF=15;SAR=16;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0406445;STB=0.516004;STBP=0.787;TYPE=snp;VARB=0.00362871;OID=.;OPOS=41800629;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:53:21:21:31:32:0.603774:16:15:9:12:17:15:9:12
chr6	41903782	.	A	C	86.3	PASS	AF=0.392857;AO=11;DP=28;FAO=11;FDP=28;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=4;FWDB=0.00192365;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.119;QD=12.3284;RBI=0.0115156;REFB=0.000846869;REVB=0.0113538;RO=17;SAF=7;SAR=4;SRF=13;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15055;STB=0.588087;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=-0.00113805;OID=.;OPOS=41903782;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:28:28:17:17:11:11:0.392857:4:7:13:4:4:7:13:4
chr6	42044945	.	G	A	709.79	PASS	AF=0.980769;AO=50;DP=52;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.039154;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.9601;QD=54.5989;RBI=0.0463759;REFB=0.0246797;REVB=0.0248535;RO=1;SAF=25;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0184579;STB=0.5098;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=-0.00030622;OID=.;OPOS=42044945;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:52:52:1:1:50:51:0.980769:25:25:1:0:26:25:1:0
chr6	42072989	.	G	A	316.34	PASS	AF=0.411765;AO=35;DP=86;FAO=35;FDP=85;FR=.;FRO=50;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=32;FWDB=-0.00338699;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.322;QD=14.8866;RBI=0.0151895;REFB=-0.00709846;REVB=0.0148071;RO=47;SAF=21;SAR=14;SRF=17;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.238883;STB=0.638811;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.00970669;OID=.;OPOS=42072989;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:85:47:50:35:35:0.411765:14:21:17:30:14:21:18:32
chr6	42073958	.	C	T	128.99	PASS	AF=0.357143;AO=15;DP=41;FAO=15;FDP=42;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=18;FWDB=-0.0436645;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.5873;QD=12.2852;RBI=0.0483492;REFB=-0.0238173;REVB=-0.0207621;RO=26;SAF=6;SAR=9;SRF=8;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106839;STB=0.545395;STBP=0.704;TYPE=snp;VARB=0.0467282;OID=.;OPOS=42073958;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:42:26:27:15:15:0.357143:9:6:8:18:9:6:9:18
chr6	42074106	.	A	G	128.04	PASS	AF=0.56;AO=14;DP=25;FAO=14;FDP=25;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=-0.0075085;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.899;QD=20.4857;RBI=0.0179982;REFB=-0.019482;REVB=-0.0163572;RO=11;SAF=5;SAR=9;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.283868;STB=0.66079;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=0.0173596;OID=.;OPOS=42074106;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:25:25:11:11:14:14:0.56:9:5:8:3:9:5:8:3
chr6	42123317	.	A	C	1624.25	PASS	AF=1;AO=106;DP=107;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.016784;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.298;QD=60.1573;RBI=0.0279842;REFB=0;REVB=0.0223923;RO=1;SAF=66;SAR=40;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0117165;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.16806e-05;OID=.;OPOS=42123317;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:107:108:1:0:106:108:1:40:66:0:1:41:67:0:0
chr6	42162388	.	A	G	1453.69	PASS	AF=1;AO=91;DP=91;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0365188;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.53;QD=63.2039;RBI=0.038832;REFB=0;REVB=0.0132022;RO=0;SAF=46;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.96609e-05;OID=.;OPOS=42162388;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:91:92:0:0:91:92:1:45:46:0:0:45:47:0:0
chr6	42224546	.	A	T	172.13	PASS	AF=0.473684;AO=18;DP=38;FAO=18;FDP=38;FR=.;FRO=20;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=0.0366076;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.293;QD=18.1185;RBI=0.0366172;REFB=-0.00808555;REVB=0.000837103;RO=20;SAF=11;SAR=7;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0381998;STB=0.521715;STBP=0.813;TYPE=snp;VARB=0.00953359;OID=.;OPOS=42224546;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:20:20:18:18:0.473684:7:11:13:7:7:11:13:7
chr6	42236821	.	A	C	252.86	PASS	AF=0.5;AO=24;DP=48;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.0127768;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.8125;QD=21.0714;RBI=0.0289992;REFB=-0.00354741;REVB=-0.0260328;RO=24;SAF=13;SAR=11;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11088;STB=0.562232;STBP=0.423;TYPE=snp;VARB=0.00347232;OID=.;OPOS=42236821;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:24:24:24:24:0.5:11:13:10:14:11:13:10:14
chr6	42532102	.	C	T	211.74	PASS	AF=0.45098;AO=21;DP=49;FAO=23;FDP=51;FR=.;FRO=28;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=-0.00496781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.774;QD=16.6069;RBI=0.0124864;REFB=-0.00587334;REVB=0.0114556;RO=27;SAF=16;SAR=5;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.307322;STB=0.634113;STBP=0.104;TYPE=snp;VARB=0.00541753;OID=.;OPOS=42532102;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:51:27:28:21:23:0.45098:5:16:13:14:7:16:13:15
chr6	42600319	.	A	G	1307.43	PASS	AF=1;AO=83;DP=83;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0189589;FXX=0.0117633;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.089;QD=62.2588;RBI=0.0224824;REFB=0;REVB=-0.0120838;RO=0;SAF=39;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.03564e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000925899;OID=.;OPOS=42600319;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:84:0:0:83:84:1:44:39:0:0:45:39:0:0
chr6	42627430	.	C	T	116.15	PASS	AF=0.341463;AO=14;DP=40;FAO=14;FDP=41;FR=.;FRO=27;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=-0.0123196;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=69.4425;QD=11.3318;RBI=0.0128879;REFB=-0.0175035;REVB=0.00378508;RO=26;SAF=7;SAR=7;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169652;STB=0.585247;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.0301168;OID=.;OPOS=42627430;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:41:26:27:14:14:0.341463:7:7:17:9:7:7:17:10
chr6	42627434	.	G	A	116.16	PASS	AF=0.341463;AO=14;DP=41;FAO=14;FDP=41;FR=.;FRO=27;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=-0.0192461;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.648;QD=11.3328;RBI=0.0223823;REFB=0.00800249;REVB=-0.0114262;RO=27;SAF=7;SAR=7;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144185;STB=0.585247;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=-0.0211239;OID=.;OPOS=42627434;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:27:27:14:14:0.341463:7:7:17:10:7:7:17:10
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chr6	42666145	.	C	T	787.04	PASS	AF=0.982456;AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0650129;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.9972;QD=55.2307;RBI=0.0907405;REFB=-0.165744;REVB=0.0633022;RO=0;SAF=26;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.29784e-08;STB=0.509431;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.00567774;OID=.;OPOS=42666145;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:57:57:0:1:56:56:0.982456:30:26:0:0:30:26:1:0
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chr6	42689755	.	A	G	260.15	PASS	AF=0.467742;AO=29;DP=62;FAO=29;FDP=62;FR=.;FRO=33;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=-0.010894;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.0606;QD=16.7837;RBI=0.0314947;REFB=0.00642145;REVB=-0.0295506;RO=33;SAF=17;SAR=12;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0683278;STB=0.538435;STBP=0.592;TYPE=snp;VARB=-0.00835495;OID=.;OPOS=42689755;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:33:33:29:29:0.467742:12:17:17:16:12:17:17:16
chr6	42713618	.	A	G	1434.44	PASS	AF=1;AO=91;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0146684;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=235.223;QD=63.0523;RBI=0.020806;REFB=0;REVB=0.0147556;RO=0;SAF=56;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.46674e-05;OID=.;OPOS=42713618;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:91:91:0:0:91:91:1:35:56:0:0:35:56:0:0
chr6	42933526	.	C	T	136.53	PASS	AF=1;AO=12;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0381248;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.013;QD=42.01;RBI=0.044824;REFB=0;REVB=-0.0235731;RO=0;SAF=9;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00117057;OID=.;OPOS=42933526;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:12:13:1:3:9:0:0:3:10:0:0
chr6	42989057	.	T	C	616.91	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0447168;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.8677;QD=61.6907;RBI=0.0552875;REFB=0;REVB=0.0325133;RO=0;SAF=15;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000312145;OID=.;OPOS=42989057;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:40:0:0:39:40:1:24:15:0:0:25:15:0:0
chr6	42992808	.	T	C	268.97	PASS	AF=0.454545;AO=30;DP=67;FAO=30;FDP=66;FR=.;FRO=36;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=0.002113;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.6553;QD=16.3012;RBI=0.0174087;REFB=-0.0391878;REVB=0.01728;RO=36;SAF=12;SAR=18;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0715795;STB=0.540345;STBP=0.59;TYPE=snp;VARB=0.0463293;OID=.;OPOS=42992808;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:66:36:36:30:30:0.454545:18:12:17:19:18:12:17:19
chr6	42992825	.	C	G	294.2	PASS	AF=0.477612;AO=32;DP=67;FAO=32;FDP=67;FR=.;FRO=35;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=-0.0101727;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.084;QD=17.5643;RBI=0.0103576;REFB=-0.000521086;REVB=-0.00194866;RO=35;SAF=12;SAR=20;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106653;STB=0.559808;STBP=0.37;TYPE=snp;VARB=0.00040547;OID=.;OPOS=42992825;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:35:35:32:32:0.477612:20:12:17:18:20:12:17:18
chr6	43008298	.	C	T	68.82	PASS	AF=0.5;AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.0226175;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.331;QD=15.293;RBI=0.024427;REFB=-0.0029398;REVB=-0.00922648;RO=9;SAF=5;SAR=4;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00463931;OID=.;OPOS=43008298;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:18:18:9:9:9:9:0.5:4:5:5:4:4:5:5:4
chr6	43014298	.	TT	CC	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0300758;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=104.727;QD=44.6898;RBI=0.0655438;REFB=0;REVB=0.0582361;RO=0;SAF=5;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000308774;OID=.;OPOS=43014298;OREF=TT;OALT=CC;OMAPALT=CC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:8:5:0:0:8:5:0:0
chr6	43020188	.	G	A	59.4	PASS	AF=0.533333;AO=8;DP=15;FAO=8;FDP=15;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.017027;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.2;QD=15.8391;RBI=0.0172452;REFB=-0.00348422;REVB=0.00273471;RO=7;SAF=5;SAR=3;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158056;STB=0.592984;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.00411761;OID=.;OPOS=43020188;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:15:15:7:7:8:8:0.533333:3:5:3:4:3:5:3:4
chr6	43148987	.	G	C	553.65	PASS	AF=0.52;AO=52;DP=100;FAO=52;FDP=100;FR=.;FRO=48;FSAF=15;FSAR=37;FSRF=12;FSRR=36;FWDB=0.0231791;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=207.038;QD=22.1459;RBI=0.0254853;REFB=-0.0192005;REVB=0.0105938;RO=48;SAF=15;SAR=37;SRF=12;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0416453;STB=0.522914;STBP=0.671;TYPE=snp;VARB=0.0176268;OID=.;OPOS=43148987;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:48:48:52:52:0.52:37:15:12:36:37:15:12:36
chr6	43152573	.	A	G	36.87	PASS	AF=0.315789;AO=6;DP=19;FAO=6;FDP=19;FR=.;FRO=13;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.0111116;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.107;QD=7.76202;RBI=0.0461257;REFB=-0.00508755;REVB=-0.0447673;RO=13;SAF=2;SAR=4;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.30002;STB=0.689036;STBP=0.335;TYPE=snp;VARB=0.0141455;OID=.;OPOS=43152573;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:19:19:13:13:6:6:0.315789:4:2:8:5:4:2:8:5
chr6	43154091	.	C	G	375.68	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000762622;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=274.487;QD=55.6561;RBI=0.0280858;REFB=0;REVB=0.0280755;RO=0;SAF=10;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.71087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.82679e-05;OID=.;OPOS=43154091;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:27:0:0:26:27:1:16:10:0:0:16:11:0:0
chr6	43184132	.	A	C	153.43	PASS	AF=0.571429;AO=15;DP=28;FAO=16;FDP=28;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.0208107;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.896;QD=21.9182;RBI=0.0213907;REFB=-0.00692043;REVB=0.00494772;RO=13;SAF=5;SAR=10;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112427;STB=0.518844;STBP=0.876;TYPE=snp;VARB=0.0110466;OID=.;OPOS=43184132;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:28:13:12:15:16:0.571429:10:5:6:7:10:6:5:7
chr6	43251486	.	G	A	31.2	PASS	AF=0.285714;AO=3;DP=17;FAO=4;FDP=14;FR=.,HEALED;FRO=8;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=-0.068899;FXX=0.176367;HRUN=3;LEN=1;MLLD=189.656;QD=8.91554;RBI=0.0700111;REFB=-0.0184166;REVB=-0.0124293;RO=3;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.599466;STBP=0.716;TYPE=snp;VARB=0.0172984;OID=.;OPOS=43251486;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:26:17:14:3:8:3:4:0.285714:3:0:0:3:3:1:3:5
chr6	43270097	.	T	C,G	855.27	PASS	AF=0.966667,0.0333333;AO=57,3;DP=60;FAO=58,2;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=28,2;FSAR=30,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0133346,-0.0123904;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=108.815,63.9035;QD=57.0177;RBI=0.018977,0.0129624;REFB=0,0;REVB=0.0135024,-0.00380801;RO=0;SAF=28,2;SAR=29,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.000211624,0.130501;OID=.,.;OPOS=43270097,43270097;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:6:60:60:0:0:57,3:58,2:0.966667,0.0333333:29,1:28,2:0:0:30,0:28,2:0:0
chr6	43270151	.	C	T	169.52	PASS	AF=0.439024;AO=18;DP=41;FAO=18;FDP=41;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=-0.0231768;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.924;QD=16.5381;RBI=0.0253637;REFB=-0.0232276;REVB=0.0103032;RO=23;SAF=10;SAR=8;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0971332;STB=0.555495;STBP=0.584;TYPE=snp;VARB=0.0318407;OID=.;OPOS=43270151;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:23:23:18:18:0.439024:8:10:15:8:8:10:15:8
chr6	43273604	.	A	G	221.85	PASS	AF=0.458333;AO=21;DP=48;FAO=22;FDP=48;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=0.00300121;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.691;QD=18.4875;RBI=0.0054495;REFB=-0.00328834;REVB=-0.0045486;RO=26;SAF=12;SAR=9;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0699397;STB=0.524692;STBP=0.754;TYPE=snp;VARB=0.00349424;OID=.;OPOS=43273604;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:26:26:21:22:0.458333:9:12:13:13:10:12:13:13
chr6	43306346	.	A	G	1062.44	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0262479;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.083;QD=59.8557;RBI=0.0273539;REFB=0;REVB=0.00769952;RO=0;SAF=30;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.21646e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.4796e-05;OID=.;OPOS=43306346;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:41:30:0:0:41:30:0:0
chr6	43492578	.	G	A	465.14	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0082135;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.574;QD=58.1421;RBI=0.0146675;REFB=0;REVB=0.0121522;RO=0;SAF=15;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.32226e-05;OID=.;OPOS=43492578;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:17:15:0:0:17:15:0:0
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chr6	43753325	.	G	A	467.82	PASS	AF=0.942857;AO=33;DP=36;FAO=33;FDP=35;FR=.;FRO=2;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00398743;FXX=0.0277701;HRUN=4;LEN=1;MLLD=230.264;QD=53.4646;RBI=0.0118221;REFB=-0.134531;REVB=0.0111294;RO=0;SAF=18;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.64315e-08;STB=0.502616;STBP=0.865;TYPE=snp;VARB=0.000916361;OID=.;OPOS=43753325;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:36:35:0:2:33:33:0.942857:15:18:0:0:15:18:1:1
chr6	44081718	.	G	A	1028.87	PASS	AF=1;AO=66;DP=68;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0032755;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.5613;QD=57.9643;RBI=0.190513;REFB=-0.0810692;REVB=0.190484;RO=0;SAF=38;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00187184;OID=.;OPOS=44081718;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:68:71:0:0:66:71:1:28:38:0:0:32:39:0:0
chr6	44108848	.	C	T	445.42	PASS	AF=0.608696;AO=41;DP=68;FAO=42;FDP=69;FR=.;FRO=27;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=6;FSRR=21;FWDB=0.0632849;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.0623;QD=25.8212;RBI=0.0709133;REFB=-0.0382499;REVB=-0.0319956;RO=23;SAF=18;SAR=23;SRF=6;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121442;STB=0.584377;STBP=0.107;TYPE=snp;VARB=0.0166973;OID=.;OPOS=44108848;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:69:23:27:41:42:0.608696:23:18:6:17:24:18:6:21
chr6	44137663	.	A	G	99.24	PASS	AF=0.444444;AO=12;DP=27;FAO=12;FDP=27;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.0217914;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.155;QD=14.7015;RBI=0.0231312;REFB=0.00792287;REVB=0.007758;RO=15;SAF=6;SAR=6;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0953953;STB=0.555464;STBP=0.597;TYPE=snp;VARB=-0.00928604;OID=.;OPOS=44137663;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:15:15:12:12:0.444444:6:6:6:9:6:6:6:9
chr6	44140774	.	AG	A	70.12	PASS	AF=0.333333;AO=13;DP=39;FAO=13;FDP=39;FR=.;FRO=26;FSAF=1;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=0.029715;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.8219;QD=7.19212;RBI=0.0299154;REFB=-0.0345021;REVB=0.00345708;RO=25;SAF=1;SAR=12;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.652309;STB=0.901971;STBP=0.002;TYPE=del;VARB=0.161137;OID=.;OPOS=44140775;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.333333:13:39:13:39:26:1:12:16:10:70:25:1:12:15:10
chr6	44218120	.	A	G	43.68	PASS	AF=0.75;AO=6;DP=8;FAO=6;FDP=8;FR=.;FRO=2;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00849084;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=140.7;QD=21.8397;RBI=0.0108931;REFB=0.0600048;REVB=0.00682383;RO=2;SAF=1;SAR=5;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.209294;STB=0.624528;STBP=0.369;TYPE=snp;VARB=-0.00304522;OID=.;OPOS=44218120;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:8:8:2:2:6:6:0.75:5:1:1:1:5:1:1:1
chr6	44222047	.	G	A	891.74	PASS	AF=0.526946;AO=88;DP=167;FAO=88;FDP=167;FR=.;FRO=79;FSAF=40;FSAR=48;FSRF=37;FSRR=42;FWDB=-0.0135201;FXX=0.00595203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.105;QD=21.359;RBI=0.0162486;REFB=-0.00466828;REVB=-0.00901245;RO=79;SAF=40;SAR=48;SRF=37;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0120092;STB=0.506577;STBP=0.862;TYPE=snp;VARB=0.00512538;OID=.;OPOS=44222047;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:167:167:79:79:88:88:0.526946:48:40:37:42:48:40:37:42
chr6	44223010	.	G	T	129.28	PASS	AF=0.583333;AO=14;DP=24;FAO=14;FDP=24;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.000395519;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=272.788;QD=21.5459;RBI=0.00542725;REFB=0.00361954;REVB=0.00541282;RO=10;SAF=3;SAR=11;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0877621;STB=0.549925;STBP=0.639;TYPE=snp;VARB=-0.00266622;OID=.;OPOS=44223010;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:24:24:10:10:14:14:0.583333:11:3:3:7:11:3:3:7
chr6	44247951	.	T	G	817.75	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00743901;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=245.005;QD=57.3858;RBI=0.0218234;REFB=0;REVB=-0.0205164;RO=0;SAF=32;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.52528e-05;OID=.;OPOS=44247951;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:25:32:0:0:25:32:0:0
chr6	44253749	.	A	G	499.88	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.018776;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.062;QD=58.8093;RBI=0.0222944;REFB=0;REVB=0.0120209;RO=0;SAF=22;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.75716e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00045162;OID=.;OPOS=44253749;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:12:22:0:0:12:22:0:0
chr6	44253765	.	A	G	538.24	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0312125;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.3167;QD=59.804;RBI=0.100654;REFB=0;REVB=-0.0956926;RO=0;SAF=21;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0026932;OID=.;OPOS=44253765;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:15:21:0:0:15:21:0:0
chr6	44268135	.	C	T	837.04	PASS	AF=0.983333;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0354482;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.8;QD=55.8028;RBI=0.0382124;REFB=-0.171162;REVB=-0.0142695;RO=0;SAF=27;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.96591e-08;STB=0.509088;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.00189396;OID=.;OPOS=44268135;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:60:60:0:1:59:59:0.983333:32:27:0:0:32:27:1:0
chr6	44268371	.	T	C	714.7	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0379677;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.175;QD=57.1758;RBI=0.0441477;REFB=0;REVB=0.0225271;RO=0;SAF=14;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000181271;OID=.;OPOS=44268371;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:36:14:0:0:36:14:0:0
chr6	44275011	.	T	C	868.26	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00416421;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.998;QD=57.8843;RBI=0.00637823;REFB=0;REVB=-0.00483127;RO=0;SAF=25;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.35748e-06;OID=.;OPOS=44275011;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:60:0:0:58:60:1:33:25:0:0:33:27:0:0
chr6	44310854	.	G	A	1090.3	PASS	AF=0.973684;AO=73;DP=76;FAO=74;FDP=76;FR=.;FRO=2;FSAF=38;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00132278;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=286.233;QD=57.3841;RBI=0.035567;REFB=-0.0395357;REVB=0.0355424;RO=2;SAF=37;SAR=36;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000345377;STB=0.500356;STBP=0.873;TYPE=snp;VARB=4.87397e-05;OID=.;OPOS=44310854;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:76:76:2:2:73:74:0.973684:36:37:1:1:36:38:1:1
chr6	44320548	.	T	A	263.5	PASS	AF=0.518519;AO=28;DP=54;FAO=28;FDP=54;FR=.;FRO=26;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=0.00164756;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.8193;QD=19.5184;RBI=0.00645188;REFB=-0.00418262;REVB=0.00623797;RO=26;SAF=18;SAR=10;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128406;STB=0.571771;STBP=0.33;TYPE=snp;VARB=0.0051035;OID=.;OPOS=44320548;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:26:26:28:28:0.518519:10:18:13:13:10:18:13:13
chr6	44371714	.	C	T	801.32	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0109676;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.113;QD=57.237;RBI=0.0185215;REFB=0;REVB=-0.0149251;RO=0;SAF=24;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.69978e-05;OID=.;OPOS=44371714;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:32:24:0:0:32:24:0:0
chr6	44403438	.	A	G	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0294005;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.169;QD=48.7373;RBI=0.0368378;REFB=0;REVB=-0.0221953;RO=0;SAF=6;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000311824;OID=.;OPOS=44403438;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:11:6:0:0:11:6:0:0
chr6	44982593	.	G	A	492.16	PASS	AF=0.54023;AO=47;DP=87;FAO=47;FDP=87;FR=.;FRO=40;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=13;FSRR=27;FWDB=-0.0611488;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.3277;QD=22.628;RBI=0.0620507;REFB=0.00984436;REVB=-0.0105408;RO=40;SAF=20;SAR=27;SRF=13;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.087251;STB=0.547925;STBP=0.387;TYPE=snp;VARB=-0.00944441;OID=.;OPOS=44982593;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:40:40:47:47:0.54023:27:20:13:27:27:20:13:27
chr6	46047458	.	C	T	183.1	PASS	AF=0.62069;AO=18;DP=29;FAO=18;FDP=29;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=-0.00380968;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=317.206;QD=25.2545;RBI=0.00413994;REFB=-0.0114651;REVB=0.00162031;RO=11;SAF=6;SAR=12;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0229477;STB=0.512806;STBP=0.902;TYPE=snp;VARB=0.00564748;OID=.;OPOS=46047458;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:29:29:11:11:18:18:0.62069:12:6:4:7:12:6:4:7
chr6	46107752	.	C	G	867.12	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0168476;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.434;QD=57.8081;RBI=0.0169184;REFB=0;REVB=0.00154552;RO=0;SAF=33;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.00382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000133978;OID=.;OPOS=46107752;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:60:0:0:59:60:1:26:33:0:0:27:33:0:0
chr6	46108083	.	A	G	163.65	PASS	AF=0.53125;AO=17;DP=32;FAO=17;FDP=32;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.00895427;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.252;QD=20.4561;RBI=0.014251;REFB=-2.54124e-05;REVB=-0.0110865;RO=15;SAF=7;SAR=10;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101757;STB=0.557553;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=-0.00018225;OID=.;OPOS=46108083;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:15:15:17:17:0.53125:10:7:8:7:10:7:8:7
chr6	46128688	.	G	C	548.96	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00172698;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.442;QD=59.3468;RBI=0.0163047;REFB=0;REVB=0.016213;RO=0;SAF=20;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.9376e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00116929;OID=.;OPOS=46128688;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:37:0:0:36:37:1:16:20:0:0:16:21:0:0
chr6	46128745	.	C	T	414.91	PASS	AF=1;AO=29;DP=30;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0299476;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.8288;QD=57.2292;RBI=0.0723761;REFB=0;REVB=-0.0658897;RO=0;SAF=14;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000856455;OID=.;OPOS=46128745;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:29:0:0:29:29:1:15:14:0:0:15:14:0:0
chr6	46129345	.	G	A	740.42	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0341766;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.88;QD=56.9553;RBI=0.0374301;REFB=0;REVB=0.0152633;RO=0;SAF=21;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.93989e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000138134;OID=.;OPOS=46129345;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:31:21:0:0:31:21:0:0
chr6	46135489	.	T	C	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0246879;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.111;QD=33.4285;RBI=0.0246879;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=6;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000266804;OID=.;OPOS=46135489;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:0:6:0:0:0:6:0:0
chr6	46135984	.	G	A,T	744.7	PASS	AF=0.0833333,0.916667;AO=4,44;DP=48;FAO=4,44;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=2,15;FSAR=2,29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00374582,0.0233341;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=196.51,84.9365;QD=62.0581;RBI=0.0042868,0.0239153;REFB=0,0;REVB=0.00208458,-0.00524026;RO=0;SAF=2,15;SAR=2,29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0418731,-0.00674384;OID=.,.;OPOS=46135984,46135984;OREF=G,G;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:18:48:48:0:0:4,44:4,44:0.0833333,0.916667:2,29:2,15:0:0:2,29:2,15:0:0
chr6	46563817	.	A	T	182.99	PASS	AF=0.411765;AO=21;DP=52;FAO=21;FDP=51;FR=.;FRO=30;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=0.0128059;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.49;QD=14.352;RBI=0.0129092;REFB=0.00866996;REVB=0.00163023;RO=31;SAF=9;SAR=12;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0579029;STB=0.542332;STBP=0.63;TYPE=snp;VARB=-0.0120941;OID=.;OPOS=46563817;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:51:31:30:21:21:0.411765:12:9:15:16:12:9:15:15
chr6	46623698	.	T	C	309.7	PASS	AF=0.397727;AO=33;DP=88;FAO=35;FDP=88;FR=.;FRO=53;FSAF=9;FSAR=26;FSRF=24;FSRR=29;FWDB=-0.00470762;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.06;QD=14.0772;RBI=0.0300075;REFB=-0.0277031;REVB=0.0296359;RO=53;SAF=8;SAR=25;SRF=24;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.25886;STB=0.634065;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.0493711;OID=.;OPOS=46623698;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:53:53:33:35:0.397727:25:8:24:29:26:9:24:29
chr6	46657057	.	A	G	368.32	PASS	AF=0.527778;AO=36;DP=71;FAO=38;FDP=72;FR=.;FRO=34;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=10;FSRR=24;FWDB=0.0131042;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.9;QD=20.4623;RBI=0.015414;REFB=-0.0300909;REVB=-0.00811607;RO=35;SAF=14;SAR=22;SRF=11;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0709622;STB=0.550755;STBP=0.388;TYPE=snp;VARB=0.0217945;OID=.;OPOS=46657057;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:72:35:34:36:38:0.527778:22:14:11:24:23:15:10:24
chr6	46658904	.	AC	AG,GA	260.24	PASS	AF=0.509091,0;AO=28,2;DP=57;FAO=28,0;FDP=55;FR=.;FRO=27;FSAF=17,0;FSAR=11,0;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=-0.000600143,-0.0180474;FXX=0.0350816;HRUN=1,2;LEN=1,2;MLLD=85.0023,86.5757;QD=18.9268;RBI=0.00185528,0.0217898;REFB=0.0103428,0.00811752;REVB=-0.00175554,-0.0122102;RO=27;SAF=17,2;SAR=11,0;SRF=14;SRR=13;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0799255,0.463741;STB=0.544694,0.5;STBP=0.53,1;TYPE=snp,mnp;VARB=-0.00871946,0;OID=.,.;OPOS=46658905,46658904;OREF=C,AC;OALT=G,GA;OMAPALT=AG,GA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:55:27:27:28,2:28,0:0.509091,0:11,0:17,2:14:13:11,0:17,0:14:13
chr6	46672943	.	A	G	604.37	PASS	AF=0.435065;AO=67;DP=154;FAO=67;FDP=154;FR=.;FRO=87;FSAF=27;FSAR=40;FSRF=50;FSRR=37;FWDB=0.00530352;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.354;QD=15.698;RBI=0.0126738;REFB=-0.000562954;REVB=-0.0115107;RO=86;SAF=27;SAR=40;SRF=50;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179517;STB=0.596986;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.000925369;OID=.;OPOS=46672943;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:154:154:86:87:67:67:0.435065:40:27:50:36:40:27:50:37
chr6	46677098	.	C	A	536.92	PASS	AF=0.53125;AO=49;DP=95;FAO=51;FDP=96;FR=.;FRO=45;FSAF=30;FSAR=21;FSRF=27;FSRR=18;FWDB=0.0204095;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.4174;QD=22.3716;RBI=0.0787501;REFB=0.0102399;REVB=-0.0760594;RO=45;SAF=29;SAR=20;SRF=27;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00734042;STB=0.505701;STBP=0.937;TYPE=snp;VARB=-0.00846981;OID=.;OPOS=46677098;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:96:45:45:49:51:0.53125:20:29:27:18:21:30:27:18
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chr6	46802370	.	G	A	674.34	PASS	AF=0.472222;AO=68;DP=144;FAO=68;FDP=144;FR=.;FRO=76;FSAF=44;FSAR=24;FSRF=46;FSRR=30;FWDB=-0.0122296;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.36;QD=18.7316;RBI=0.012302;REFB=-0.00948516;REVB=0.00133299;RO=76;SAF=44;SAR=24;SRF=46;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0429176;STB=0.523802;STBP=0.571;TYPE=snp;VARB=0.00852189;OID=.;OPOS=46802370;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:144:144:76:76:68:68:0.472222:24:44:46:30:24:44:46:30
chr6	46803018	.	A	T	207.07	PASS	AF=0.526316;AO=20;DP=41;FAO=20;FDP=38;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=0.00274178;FXX=0.0731529;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.1688;QD=21.7966;RBI=0.0164556;REFB=-0.00543194;REVB=0.0162256;RO=18;SAF=9;SAR=11;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134987;STB=0.575841;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=0.00914602;OID=.;OPOS=46803018;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:38:18:18:20:20:0.526316:11:9:11:7:11:9:11:7
chr6	46803102	.	A	G	169.49	PASS	AF=0.439024;AO=18;DP=41;FAO=18;FDP=41;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=0.0321858;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.54;QD=16.5357;RBI=0.0338973;REFB=-0.000269247;REVB=0.0106347;RO=23;SAF=5;SAR=13;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.215693;STB=0.624479;STBP=0.196;TYPE=snp;VARB=0.00148914;OID=.;OPOS=46803102;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:23:23:18:18:0.439024:13:5:11:12:13:5:11:12
chr6	46824448	.	A	G	702.55	PASS	AF=0.978723;AO=45;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0454059;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=56.3057;QD=59.7912;RBI=0.0532597;REFB=-0.114519;REVB=0.027837;RO=1;SAF=33;SAR=12;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.03755;STB=0.519991;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=0.00448497;OID=.;OPOS=46824448;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:47:47:1:1:45:46:0.978723:12:33:0:1:12:34:0:1
chr6	46826508	.	G	A	483.35	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0232951;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.634;QD=58.5876;RBI=0.0267146;REFB=0;REVB=-0.0130771;RO=0;SAF=21;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000129189;OID=.;OPOS=46826508;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:12:21:0:0:12:21:0:0
chr6	46826715	.	T	A	1194.33	PASS	AF=0.9875;AO=80;DP=80;FAO=79;FDP=80;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00137964;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.151;QD=59.7164;RBI=0.00471735;REFB=0.148532;REVB=-0.0045111;RO=0;SAF=42;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.26068e-08;STB=0.506023;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=-0.000495621;OID=.;OPOS=46826715;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:80:80:0:1:80:79:0.9875:38:42:0:0:38:41:1:0
chr6	46826844	.	T	C	1457.46	PASS	AF=0.989362;AO=93;DP=94;FAO=93;FDP=94;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0316774;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=266.337;QD=62.0196;RBI=0.0341182;REFB=0.038812;REVB=0.0126727;RO=1;SAF=47;SAR=46;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00998082;STB=0.505262;STBP=0.494;TYPE=snp;VARB=-3.79807e-05;OID=.;OPOS=46826844;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:94:94:1:1:93:93:0.989362:46:47:1:0:46:47:1:0
chr6	46826910	.	G	A	1358.62	PASS	AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00831531;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=212.794;QD=62.4654;RBI=0.00840417;REFB=0;REVB=0.00121886;RO=0;SAF=42;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.519e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.30685e-05;OID=.;OPOS=46826910;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:45:42:0:0:45:42:0:0
chr6	46826979	.	A	G	499.99	PASS	AF=0.377358;AO=60;DP=158;FAO=60;FDP=159;FR=.;FRO=99;FSAF=31;FSAR=29;FSRF=37;FSRR=62;FWDB=0.0051285;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=298.137;QD=12.5784;RBI=0.00582785;REFB=-0.00609897;REVB=-0.0027681;RO=98;SAF=31;SAR=29;SRF=37;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151998;STB=0.588538;STBP=0.104;TYPE=snp;VARB=0.0102104;OID=.;OPOS=46826979;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:158:159:98:99:60:60:0.377358:29:31:37:61:29:31:37:62
chr6	46827073	.	A	G	996.2	PASS	AF=0.596154;AO=93;DP=156;FAO=93;FDP=156;FR=.;FRO=63;FSAF=44;FSAR=49;FSRF=41;FSRR=22;FWDB=0.00684392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.925;QD=25.5436;RBI=0.0092547;REFB=-0.0117683;REVB=0.00622979;RO=61;SAF=44;SAR=49;SRF=39;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121064;STB=0.571394;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.00619326;OID=.;OPOS=46827073;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:156:156:61:63:93:93:0.596154:49:44:39:22:49:44:41:22
chr6	46827126	.	C	T	1377.49	PASS	AF=1;AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00849373;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=112.073;QD=62.6132;RBI=0.0122077;REFB=0;REVB=0.00876845;RO=0;SAF=58;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.51712e-05;OID=.;OPOS=46827126;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:88:88:0:0:88:88:1:30:58:0:0:30:58:0:0
chr6	46832813	.	G	A	447.34	PASS	AF=0.517647;AO=43;DP=85;FAO=44;FDP=85;FR=.;FRO=41;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=26;FWDB=-0.0034315;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.32;QD=21.0512;RBI=0.0194632;REFB=-0.0246418;REVB=0.0191583;RO=41;SAF=23;SAR=20;SRF=15;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148216;STB=0.585949;STBP=0.116;TYPE=snp;VARB=0.0207076;OID=.;OPOS=46832813;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:41:41:43:44:0.517647:20:23:15:26:20:24:15:26
chr6	46834685	.	G	A	1573.01	PASS	AF=1;AO=105;DP=105;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00158379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.171;QD=59.924;RBI=0.00595976;REFB=0;REVB=0.00574546;RO=0;SAF=59;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.50572e-06;OID=.;OPOS=46834685;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:105:105:0:0:105:105:1:46:59:0:0:46:59:0:0
chr6	46856100	.	G	A	1160.87	PASS	AF=0.987179;AO=77;DP=79;FAO=77;FDP=78;FR=.;FRO=1;FSAF=52;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00842642;FXX=0.0126566;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.771;QD=59.5318;RBI=0.00903156;REFB=-0.0145529;REVB=0.0032503;RO=0;SAF=52;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504761;STBP=0.608;TYPE=snp;VARB=5.46445e-05;OID=.;OPOS=46856100;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:79:78:0:1:77:77:0.987179:25:52:0:0:25:52:1:0
chr6	47563692	.	C	T	1526.67	PASS	AF=1;AO=100;DP=100;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0291687;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.3362;QD=58.7182;RBI=0.0310336;REFB=0;REVB=0.0105957;RO=0;SAF=29;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.0826e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00163852;OID=.;OPOS=47563692;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:100:104:0:0:100:104:1:71:29:0:0:71:33:0:0
chr6	47591983	.	C	G	491.09	PASS	AF=0.464912;AO=52;DP=114;FAO=53;FDP=114;FR=.;FRO=61;FSAF=18;FSAR=35;FSRF=26;FSRR=35;FWDB=-0.0177277;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.2145;QD=17.2312;RBI=0.0221607;REFB=0.00116052;REVB=-0.0132975;RO=60;SAF=18;SAR=34;SRF=26;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0896078;STB=0.549981;STBP=0.359;TYPE=snp;VARB=-0.00200022;OID=.;OPOS=47591983;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:114:114:60:61:52:53:0.464912:34:18:26:34:35:18:26:35
chr6	47594302	.	T	C	1320.95	PASS	AF=1;AO=84;DP=84;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00558704;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.404;QD=62.1623;RBI=0.00610015;REFB=0;REVB=0.00244884;RO=0;SAF=43;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.90576e-06;OID=.;OPOS=47594302;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:85:0:0:84:85:1:41:43:0:0:42:43:0:0
chr6	47594722	.	G	A	1396.39	PASS	AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0115272;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.126;QD=62.759;RBI=0.0174843;REFB=0;REVB=0.0131462;RO=0;SAF=48;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.30324e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.70148e-05;OID=.;OPOS=47594722;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:41:48:0:0:41:48:0:0
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chr6	47682604	.	A	C	1803.23	PASS	AF=1;AO=118;DP=118;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0269117;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=131.018;QD=61.1264;RBI=0.0274893;REFB=0;REVB=0.00560582;RO=0;SAF=65;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.27396e-05;OID=.;OPOS=47682604;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:118:118:0:0:118:118:1:53:65:0:0:53:65:0:0
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chr6	49489397	.	C	A	406.78	PASS	AF=0.451613;AO=42;DP=93;FAO=42;FDP=93;FR=.;FRO=51;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=28;FSRR=23;FWDB=0.00599381;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.6287;QD=17.496;RBI=0.0267833;REFB=0.00246626;REVB=-0.026104;RO=51;SAF=18;SAR=24;SRF=28;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118119;STB=0.566122;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=-0.00281389;OID=.;OPOS=49489397;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:51:51:42:42:0.451613:24:18:28:23:24:18:28:23
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chr6	51924774	.	A	G	789.65	PASS	AF=0.982456;AO=56;DP=58;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0135339;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.7477;QD=55.4143;RBI=0.0417213;REFB=-0.0242126;REVB=0.0394652;RO=1;SAF=33;SAR=23;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0140753;STB=0.50746;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.000701053;OID=.;OPOS=51924774;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:58:57:1:1:56:56:0.982456:23:33:1:0:23:33:1:0
chr6	52051274	.	G	A	306.05	PASS	AF=0.533333;AO=32;DP=60;FAO=32;FDP=60;FR=.;FRO=28;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=-0.038642;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.487;QD=20.4034;RBI=0.0449551;REFB=-0.00175554;REVB=0.022973;RO=28;SAF=20;SAR=12;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138352;STB=0.576874;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=0.00170012;OID=.;OPOS=52051274;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:28:28:32:32:0.533333:12:20:13:15:12:20:13:15
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chr6	52701143	.	C	T	177.46	PASS	AF=0.545455;AO=18;DP=33;FAO=18;FDP=33;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=-0.0166242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.087;QD=21.5106;RBI=0.0235903;REFB=0.0183739;REVB=-0.0167374;RO=15;SAF=5;SAR=13;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0112405;STB=0.506322;STBP=0.977;TYPE=snp;VARB=-0.0104024;OID=.;OPOS=52701143;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:15:15:18:18:0.545455:13:5:4:11:13:5:4:11
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chr6	52843131	.	G	T	602.56	PASS	AF=0.566038;AO=56;DP=102;FAO=60;FDP=106;FR=.;FRO=46;FSAF=33;FSAR=27;FSRF=28;FSRR=18;FWDB=-0.0156176;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.8001;QD=22.7382;RBI=0.0569301;REFB=-0.053347;REVB=0.054746;RO=46;SAF=32;SAR=24;SRF=28;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0314423;STB=0.525854;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=0.0322516;OID=.;OPOS=52843131;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:106:46:46:56:60:0.566038:24:32:28:18:27:33:28:18
chr6	52844040	.	C	G	366.55	PASS	AF=0.6;AO=36;DP=60;FAO=36;FDP=60;FR=.;FRO=24;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=0.00109945;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.05;QD=24.4368;RBI=0.016788;REFB=-0.0075581;REVB=-0.016752;RO=24;SAF=15;SAR=21;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0314233;STB=0.517232;STBP=0.756;TYPE=snp;VARB=0.0035143;OID=.;OPOS=52844040;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:24:24:36:36:0.6:21:15:9:15:21:15:9:15
chr6	52844045	.	G	A	174.35	PASS	AF=0.366667;AO=22;DP=60;FAO=22;FDP=60;FR=.;FRO=38;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=-0.0136129;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=229.832;QD=11.6231;RBI=0.0181639;REFB=-0.00902151;REVB=-0.0120257;RO=38;SAF=9;SAR=13;SRF=16;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.01346;STB=0.507805;STBP=0.942;TYPE=snp;VARB=0.0149597;OID=.;OPOS=52844045;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:38:38:22:22:0.366667:13:9:16:22:13:9:16:22
chr6	52963071	.	A	G	557.13	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00145456;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.768;QD=60.2302;RBI=0.0116148;REFB=0;REVB=0.0115234;RO=0;SAF=17;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.71161e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.18845e-05;OID=.;OPOS=52963071;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:20:17:0:0:20:17:0:0
chr6	53084208	.	C	A	113.11	PASS	AF=0.5;AO=13;DP=26;FAO=13;FDP=26;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=-0.00393452;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.768;QD=17.4015;RBI=0.00757125;REFB=-0.00885509;REVB=0.00646865;RO=13;SAF=6;SAR=7;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136804;STB=0.578197;STBP=0.465;TYPE=snp;VARB=0.0110808;OID=.;OPOS=53084208;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:26:13:13:13:13:0.5:7:6:4:9:7:6:4:9
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chr6	53989526	.	G	A	834.2	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0229671;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.235;QD=57.5311;RBI=0.072158;REFB=0;REVB=0.0684053;RO=0;SAF=28;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000416164;OID=.;OPOS=53989526;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:30:28:0:0:30:28:0:0
chr6	54054686	.	T	A	1098.49	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0303408;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.351;QD=60.1912;RBI=0.0345516;REFB=0;REVB=0.0165302;RO=0;SAF=40;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.05346e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000103655;OID=.;OPOS=54054686;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:73:0:0:72:73:1:32:40:0:0:32:41:0:0
chr6	54079968	.	G	A	1816.61	PASS	AF=0.975806;AO=120;DP=123;FAO=121;FDP=124;FR=.;FRO=3;FSAF=57;FSAR=64;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0285047;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.053;QD=58.6004;RBI=0.0287473;REFB=-0.00144112;REVB=0.00372664;RO=3;SAF=56;SAR=64;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00929675;STB=0.504745;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=-4.50982e-05;OID=.;OPOS=54079968;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:123:124:3:3:120:121:0.975806:64:56:2:1:64:57:2:1
chr6	54186147	.	T	C	1142.03	PASS	AF=0.987013;AO=77;DP=78;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=49;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0207506;FXX=0.0128189;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.6883;QD=59.3261;RBI=0.0211163;REFB=-0.0398391;REVB=0.00391304;RO=0;SAF=28;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509089;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=0.000608242;OID=.;OPOS=54186147;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:78:77:0:1:77:76:0.987013:49:28:0:0:49:27:1:0
chr6	54191970	.	T	A	613.36	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0564755;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.7863;QD=61.3362;RBI=0.059017;REFB=0;REVB=-0.0171325;RO=0;SAF=18;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.19993e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00115542;OID=.;OPOS=54191970;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:22:18:0:0:22:18:0:0
chr6	55142337	.	A	G	1513.98	PASS	AF=1;AO=94;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00761137;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.688;QD=63.7467;RBI=0.0077648;REFB=0;REVB=0.00153595;RO=0;SAF=37;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.95516e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.53471e-05;OID=.;OPOS=55142337;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:95:0:0:94:95:1:57:37:0:0:57:38:0:0
chr6	55196587	.	C	T	388.53	PASS	AF=0.653061;AO=32;DP=49;FAO=32;FDP=49;FR=.;FRO=17;FSAF=23;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=-0.0125673;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.7421;QD=31.7166;RBI=0.034021;REFB=0.00148675;REVB=-0.0316148;RO=17;SAF=23;SAR=9;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.21483;STB=0.618027;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=-0.00119099;OID=.;OPOS=55196587;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:17:17:32:32:0.653061:9:23:7:10:9:23:7:10
chr6	55266625	.	T	C	612.73	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0322016;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.506;QD=61.273;RBI=0.037445;REFB=0;REVB=0.0191097;RO=0;SAF=26;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000103403;OID=.;OPOS=55266625;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:14:26:0:0:14:26:0:0
chr6	55428650	.	T	C	156.7	PASS	AF=0.447368;AO=16;DP=37;FAO=17;FDP=38;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=-0.0035248;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.859;QD=16.4948;RBI=0.0225697;REFB=-0.0087298;REVB=-0.0222927;RO=20;SAF=13;SAR=3;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.475765;STB=0.724313;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.0112223;OID=.;OPOS=55428650;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:38:20:21:16:17:0.447368:3:13:7:13:4:13:8:13
chr6	55428658	.	A	C	93.46	PASS	AF=0.333333;AO=11;DP=37;FAO=11;FDP=33;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=-0.0236885;FXX=0.131544;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.307;QD=11.3289;RBI=0.028046;REFB=-0.0147664;REVB=0.0150144;RO=21;SAF=6;SAR=5;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0819168;STB=0.561688;STBP=0.659;TYPE=snp;VARB=0.0204423;OID=.;OPOS=55428658;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:93:37:33:21:22:11:11:0.333333:5:6:13:8:5:6:14:8
chr6	55428724	.	A	C	146.33	PASS	AF=0.432432;AO=15;DP=37;FAO=16;FDP=37;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=0.00570462;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.7731;QD=15.8193;RBI=0.00575144;REFB=-0.0381999;REVB=-0.000732383;RO=20;SAF=6;SAR=9;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196363;STB=0.637413;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.036015;OID=.;OPOS=55428724;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:20:21:15:16:0.432432:9:6:12:8:10:6:13:8
chr6	55739553	.	A	G	1573.62	PASS	AF=0.973214;AO=108;DP=112;FAO=109;FDP=112;FR=.;FRO=3;FSAF=51;FSAR=58;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0450918;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=122.527;QD=56.2008;RBI=0.0455211;REFB=-0.134442;REVB=0.00623663;RO=0;SAF=50;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.61453e-08;STB=0.50362;STBP=0.673;TYPE=snp;VARB=0.000796114;OID=.;OPOS=55739553;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:112:112:0:3:108:109:0.973214:58:50:0:0:58:51:1:2
chr6	55925801	.	G	T	164.81	PASS	AF=0.280488;AO=22;DP=82;FAO=23;FDP=82;FR=.;FRO=59;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=38;FWDB=-0.0501992;FXX=0.0120467;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.562;QD=8.03926;RBI=0.0503566;REFB=-0.00345241;REVB=-0.00397835;RO=58;SAF=11;SAR=11;SRF=20;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188791;STB=0.618198;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=0.00929309;OID=.;OPOS=55925801;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:58:59:22:23:0.280488:11:11:20:38:11:12:21:38
chr6	56044578	.	T	C	379.43	PASS	AF=0.493671;AO=39;DP=78;FAO=39;FDP=79;FR=.;FRO=40;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=14;FSRR=26;FWDB=-0.0104098;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=162.749;QD=19.2118;RBI=0.01852;REFB=0.000999072;REVB=0.0153175;RO=39;SAF=19;SAR=20;SRF=13;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139427;STB=0.569717;STBP=0.256;TYPE=snp;VARB=-0.0013846;OID=.;OPOS=56044578;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:79:39:40:39:39:0.493671:20:19:13:26:20:19:14:26
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chr6	56417282	.	C	T	1062.44	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0145416;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.066;QD=59.8559;RBI=0.0147303;REFB=0;REVB=-0.00235069;RO=0;SAF=33;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.53623e-05;OID=.;OPOS=56417282;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:38:33:0:0:38:33:0:0
chr6	56417545	.	T	C	545.97	PASS	AF=0.973684;AO=36;DP=37;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00498977;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.324;QD=57.4704;RBI=0.0291505;REFB=0.016703;REVB=0.0287202;RO=1;SAF=19;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0267359;STB=0.513506;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=7.91938e-05;OID=.;OPOS=56417545;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:37:38:1:1:36:37:0.973684:17:19:0:1:18:19:0:1
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chr6	58141935	.	T	C	58.88	PASS	AF=0.136364;AO=12;DP=88;FAO=12;FDP=88;FR=.;FRO=76;FSAF=11;FSAR=1;FSRF=43;FSRR=33;FWDB=-0.0173809;FXX=0.0112347;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.4599;QD=2.67649;RBI=0.0473841;REFB=0.00395261;REVB=-0.0440813;RO=76;SAF=11;SAR=1;SRF=44;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.499674;STB=0.873104;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=-0.0276657;OID=.;OPOS=58141935;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:58:88:88:76:76:12:12:0.136364:1:11:44:32:1:11:43:33
chr6	58141946	.	C	T	932.84	PASS	AF=0.876543;AO=68;DP=80;FAO=71;FDP=81;FR=.;FRO=10;FSAF=40;FSAR=31;FSRF=9;FSRR=1;FWDB=0.0548036;FXX=0.0121936;HRUN=4;LEN=1;MLLD=38.8069;QD=46.0662;RBI=0.105355;REFB=-0.101235;REVB=0.0899795;RO=11;SAF=40;SAR=28;SRF=9;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0628723;STB=0.542682;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.0215701;OID=.;OPOS=58141946;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:80:81:11:10:68:71:0.876543:28:40:9:2:31:40:9:1
chr6	58142634	.	G	A	41.06	PASS	AF=0.0742574;AO=15;DP=200;FAO=15;FDP=202;FR=.;FRO=187;FSAF=13;FSAR=2;FSRF=88;FSRR=99;FWDB=-0.00384417;FXX=0.00492587;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.3983;QD=0.813098;RBI=0.0268507;REFB=-0.00387111;REVB=-0.026574;RO=185;SAF=13;SAR=2;SRF=88;SRR=97;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.437519;STB=0.866179;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0459938;OID=.;OPOS=58142634;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:200:202:185:187:15:15:0.0742574:2:13:88:97:2:13:88:99
chr6	62282965	.	C	T	1540.3	PASS	AF=1;AO=102;DP=102;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0656151;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.6629;QD=59.8177;RBI=0.0684232;REFB=0;REVB=0.019401;RO=0;SAF=58;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000294248;OID=.;OPOS=62282965;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:102:103:0:0:102:103:1:44:58:0:0:45:58:0:0
chr6	62283016	.	T	G	710.59	PASS	AF=0.980769;AO=49;DP=51;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.023965;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.546;QD=54.6607;RBI=0.0242008;REFB=0.0263643;REVB=-0.00337028;RO=1;SAF=30;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154304;STB=0.507689;STBP=0.539;TYPE=snp;VARB=9.28995e-05;OID=.;OPOS=62283016;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:51:52:1:1:49:51:0.980769:19:30:1:0:19:32:1:0
chr6	62284247	.	T	G	1516.8	PASS	AF=0.989796;AO=93;DP=94;FAO=97;FDP=98;FR=.;FRO=1;FSAF=57;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0254456;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.2221;QD=61.9102;RBI=0.0563037;REFB=-0.10915;REVB=0.0502258;RO=1;SAF=55;SAR=38;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00854286;STB=0.504347;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.00687114;OID=.;OPOS=62284247;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:94:98:1:1:93:97:0.989796:38:55:1:0:40:57:1:0
chr6	62284487	.	C	T	1510.81	PASS	AF=1;AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0109757;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.028;QD=63.6129;RBI=0.0202183;REFB=0;REVB=0.0169798;RO=0;SAF=55;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.90784e-05;OID=.;OPOS=62284487;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:95:0:0:95:95:1:40:55:0:0:40:55:0:0
chr6	62284512	.	T	C	1384.84	PASS	AF=1;AO=88;DP=89;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-7.02008e-05;FXX=0.0222198;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.11;QD=62.9471;RBI=0.00090774;REFB=0;REVB=-0.000905022;RO=0;SAF=52;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.57365e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.29081e-05;OID=.;OPOS=62284512;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:89:88:0:0:88:88:1:36:52:0:0:36:52:0:0
chr6	62390916	.	T	C	1922.08	PASS	AF=0.984375;AO=126;DP=128;FAO=126;FDP=128;FR=.;FRO=2;FSAF=52;FSAR=74;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0021939;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=303.663;QD=60.0651;RBI=0.0161655;REFB=-0.0440827;REVB=0.0160159;RO=1;SAF=52;SAR=74;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00904992;STB=0.509432;STBP=0.141;TYPE=snp;VARB=0.000441072;OID=.;OPOS=62390916;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:128:128:1:2:126:126:0.984375:74:52:1:0:74:52:2:0
chr6	62887099	.	C	T	449.48	PASS	AF=0.473684;AO=45;DP=95;FAO=45;FDP=95;FR=.;FRO=50;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=27;FSRR=23;FWDB=-0.0389754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.3657;QD=18.9253;RBI=0.0538362;REFB=-0.00518288;REVB=-0.0371383;RO=50;SAF=20;SAR=25;SRF=27;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0903891;STB=0.550329;STBP=0.362;TYPE=snp;VARB=0.00628705;OID=.;OPOS=62887099;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:50:50:45:45:0.473684:25:20:27:23:25:20:27:23
chr6	63921853	.	A	G	1019.15	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0343316;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.008;QD=59.0811;RBI=0.0379221;REFB=0;REVB=-0.0161067;RO=0;SAF=39;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.25942e-05;OID=.;OPOS=63921853;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:68:69:0:0:68:69:1:29:39:0:0:30:39:0:0
chr6	63921873	.	A	T	851.49	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0278799;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.602;QD=57.7283;RBI=0.0279968;REFB=0;REVB=-0.00255635;RO=0;SAF=34;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.31293e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.56232e-05;OID=.;OPOS=63921873;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:59:0:0:58:59:1:24:34:0:0:24:35:0:0
chr6	63921924	.	A	G	729.0	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0711688;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.036;QD=57.1766;RBI=0.0711995;REFB=0;REVB=0.00208844;RO=0;SAF=20;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.13361e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000197693;OID=.;OPOS=63921924;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:31:20:0:0:31:20:0:0
chr6	63922023	.	C	T	871.09	PASS	AF=1;AO=59;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0471657;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.257;QD=58.0725;RBI=0.0472155;REFB=0;REVB=0.00216953;RO=0;SAF=20;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.04828e-05;OID=.;OPOS=63922023;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:59:60:1:39:20:0:0:40:20:0:0
chr6	63922916	.	T	C	447.46	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0291712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.6014;QD=57.7362;RBI=0.044863;REFB=0;REVB=0.0340841;RO=0;SAF=6;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000469187;OID=.;OPOS=63922916;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:31:0:0:30:31:1:24:6:0:0:25:6:0:0
chr6	64498055	.	T	A	135.07	PASS	AF=0.46875;AO=15;DP=32;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=13;FWDB=-0.0119135;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.6459;QD=16.8839;RBI=0.0119673;REFB=-0.0158307;REVB=-0.00113347;RO=17;SAF=5;SAR=10;SRF=4;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106867;STB=0.560899;STBP=0.584;TYPE=snp;VARB=0.0174704;OID=.;OPOS=64498055;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:17:17:15:15:0.46875:10:5:4:13:10:5:4:13
chr6	65016977	.	TGA	T	114.08	PASS	AF=0.371429;AO=12;DP=38;FAO=13;FDP=35;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=-0.0504979;FXX=0.146306;HRUN=1;LEN=2;MLLD=108.437;QD=13.0378;RBI=0.0808159;REFB=-0.0869765;REVB=-0.0630964;RO=18;SAF=4;SAR=8;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.333332;STB=0.628624;STBP=0.289;TYPE=del;VARB=0.144996;OID=.;OPOS=65016978;OREF=GA;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.371429:12:38:13:35:22:5:8:13:9:99:18:4:8:12:6
chr6	65149185	.	T	A	305.19	PASS	AF=0.414634;AO=34;DP=83;FAO=34;FDP=82;FR=.;FRO=48;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=22;FSRR=26;FWDB=-0.0494702;FXX=0.0120467;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.3082;QD=14.8872;RBI=0.049556;REFB=0.00969945;REVB=0.00291498;RO=48;SAF=16;SAR=18;SRF=22;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0127147;STB=0.5072;STBP=0.915;TYPE=snp;VARB=-0.0147248;OID=.;OPOS=65149185;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:82:48:48:34:34:0.414634:18:16:22:26:18:16:22:26
chr6	65300239	.	C	A	208.44	PASS	AF=0.256198;AO=31;DP=120;FAO=31;FDP=121;FR=.;FRO=90;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=49;FSRR=41;FWDB=-0.0168254;FXX=0.00819605;HRUN=3;LEN=1;MLLD=188.451;QD=6.89069;RBI=0.0224243;REFB=-0.00716982;REVB=-0.0148241;RO=88;SAF=17;SAR=14;SRF=47;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0177341;STB=0.502957;STBP=0.982;TYPE=snp;VARB=0.0213121;OID=.;OPOS=65300239;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:121:88:90:31:31:0.256198:14:17:47:41:14:17:49:41
chr6	65301504	.	A	G	1396.44	PASS	AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0158497;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=209.841;QD=62.7614;RBI=0.0389817;REFB=0;REVB=0.0356141;RO=0;SAF=45;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.20994e-05;OID=.;OPOS=65301504;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:44:45:0:0:44:45:0:0
chr6	65301834	.	C	T	377.56	PASS	AF=0.430108;AO=40;DP=92;FAO=40;FDP=93;FR=.;FRO=53;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=33;FWDB=0.015004;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.331;QD=16.2392;RBI=0.0177368;REFB=-0.00330626;REVB=-0.00945913;RO=52;SAF=22;SAR=18;SRF=20;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165074;STB=0.597396;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=0.0106599;OID=.;OPOS=65301834;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:93:52:53:40:40:0.430108:18:22:20:32:18:22:20:33
chr6	66005794	.	C	A	403.9	PASS	AF=0.401709;AO=47;DP=117;FAO=47;FDP=117;FR=.;FRO=70;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=31;FSRR=39;FWDB=0.0130158;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=85.741;QD=13.8086;RBI=0.024683;REFB=-0.00872047;REVB=0.0209724;RO=67;SAF=22;SAR=25;SRF=29;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.037013;STB=0.515178;STBP=0.789;TYPE=snp;VARB=0.0271477;OID=.;OPOS=66005794;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:117:117:67:70:47:47:0.401709:25:22:29:38:25:22:31:39
chr6	66005888	.	C	T	2300.98	PASS	AF=0.993464;AO=152;DP=153;FAO=152;FDP=153;FR=.;FRO=1;FSAF=75;FSAR=77;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00544798;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.543;QD=60.1562;RBI=0.0177594;REFB=-0.0380805;REVB=-0.0169031;RO=1;SAF=75;SAR=77;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00630036;STB=0.503311;STBP=0.33;TYPE=snp;VARB=0.000254492;OID=.;OPOS=66005888;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:153:153:1:1:152:152:0.993464:77:75:1:0:77:75:1:0
chr6	66005970	.	G	A	1227.42	PASS	AF=1;AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0200115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.18;QD=61.3708;RBI=0.0239984;REFB=0;REVB=-0.0132462;RO=0;SAF=45;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.30416e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.01831e-05;OID=.;OPOS=66005970;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:80:80:0:0:80:80:1:35:45:0:0:35:45:0:0
chr6	66013945	.	A	G	30.99	PASS	AF=0.5;AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.0227078;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.8587;QD=12.3961;RBI=0.0390276;REFB=-0.00469307;REVB=-0.0317414;RO=5;SAF=2;SAR=3;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162496;STB=0.599599;STBP=0.681;TYPE=snp;VARB=-0.000137776;OID=.;OPOS=66013945;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:27:10:10:5:5:5:5:0.5:3:2:3:2:3:2:3:2
chr6	66204756	.	C	T	116.9	PASS	AF=0.195876;AO=19;DP=97;FAO=19;FDP=97;FR=.;FRO=78;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=39;FSRR=39;FWDB=-0.00336492;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.287;QD=4.8207;RBI=0.0177575;REFB=-0.00351483;REVB=0.0174357;RO=75;SAF=8;SAR=11;SRF=37;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0915155;STB=0.563728;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.0126544;OID=.;OPOS=66204756;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:75:78:19:19:0.195876:11:8:37:38:11:8:39:39
chr6	68599166	.	A	G	1785.84	PASS	AF=1;AO=117;DP=117;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00770701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.296;QD=61.0544;RBI=0.021563;REFB=0;REVB=-0.0201387;RO=0;SAF=51;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.11903e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.97584e-05;OID=.;OPOS=68599166;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:117:117:0:0:117:117:1:66:51:0:0:66:51:0:0
chr6	68599169	.	A	T	514.68	PASS	AF=0.470085;AO=53;DP=115;FAO=55;FDP=117;FR=.;FRO=62;FSAF=19;FSAR=36;FSRF=32;FSRR=30;FWDB=0.00616986;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.041;QD=17.596;RBI=0.0138509;REFB=-0.0210903;REVB=0.0124008;RO=62;SAF=19;SAR=34;SRF=32;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157308;STB=0.59414;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=0.0218078;OID=.;OPOS=68599169;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:117:62:62:53:55:0.470085:34:19:32:30:36:19:32:30
chr6	69666684	.	A	G	1080.51	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0094965;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.3721;QD=60.0281;RBI=0.0131556;REFB=0;REVB=-0.00910416;RO=0;SAF=27;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.1951e-06;OID=.;OPOS=69666684;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:72:0:0:71:72:1:44:27:0:0:44:28:0:0
chr6	70071173	.	G	A	411.11	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00735781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.806;QD=56.7046;RBI=0.0484826;REFB=0;REVB=0.047921;RO=0;SAF=15;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000536227;OID=.;OPOS=70071173;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:14:15:0:0:14:15:0:0
chr6	70407465	.	A	T	1139.08	PASS	AF=0.987013;AO=76;DP=77;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0244115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.106;QD=59.173;RBI=0.0271724;REFB=-0.0756759;REVB=0.0119339;RO=0;SAF=36;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.60877e-08;STB=0.506848;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.000416626;OID=.;OPOS=70407465;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:77:77:0:1:76:76:0.987013:40:36:0:0:40:36:1:0
chr6	70733547	.	C	G	541.35	PASS	AF=0.636364;AO=47;DP=75;FAO=49;FDP=77;FR=.;FRO=28;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=0.0107529;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.207;QD=28.1218;RBI=0.0180924;REFB=-0.000793136;REVB=-0.0145502;RO=28;SAF=20;SAR=27;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0229904;STB=0.513303;STBP=0.764;TYPE=snp;VARB=0.000289543;OID=.;OPOS=70733547;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:77:28:28:47:49:0.636364:27:20:11:17:28:21:11:17
chr6	70778378	.	GC	CT	177.76	PASS	AF=0.62963;AO=16;DP=29;FAO=17;FDP=27;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.0043919;FXX=0.0999667;HRUN=1;LEN=2;MLLD=108.333;QD=26.3347;RBI=0.0613474;REFB=-0.020943;REVB=0.06119;RO=10;SAF=7;SAR=9;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0432421;STB=0.533294;STBP=0.645;TYPE=mnp;VARB=0.0166554;OID=.;OPOS=70778378;OREF=GC;OALT=CT;OMAPALT=CT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:29:27:10:10:16:17:0.62963:9:7:5:5:10:7:5:5
chr6	70812123	.	A	G	156.05	PASS	AF=0.350877;AO=19;DP=56;FAO=20;FDP=57;FR=.;FRO=37;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=24;FWDB=-0.0255105;FXX=0.0172384;HRUN=3;LEN=1;MLLD=208.622;QD=10.9509;RBI=0.027917;REFB=-0.00793442;REVB=0.011339;RO=37;SAF=9;SAR=10;SRF=13;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13975;STB=0.596398;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=0.0160342;OID=.;OPOS=70812123;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:57:37:37:19:20:0.350877:10:9:13:24:10:10:13:24
chr6	70916888	.	A	C	898.92	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.034643;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=309.676;QD=57.9951;RBI=0.034654;REFB=0;REVB=0.000872509;RO=0;SAF=23;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.63876e-05;OID=.;OPOS=70916888;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:56:62:0:0:56:62:1:33:23:0:0:34:28:0:0
chr6	70917550	.	T	C	289.49	PASS	AF=0.577778;AO=26;DP=45;FAO=26;FDP=45;FR=.;FRO=19;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.00395789;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=288.12;QD=25.7324;RBI=0.0114044;REFB=-0.0253324;REVB=-0.0106956;RO=19;SAF=13;SAR=13;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0601284;STB=0.533308;STBP=0.609;TYPE=snp;VARB=0.0180031;OID=.;OPOS=70917550;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:19:19:26:26:0.577778:13:13:11:8:13:13:11:8
chr6	70917559	.	A	AT,T	470.84	PASS	AF=1,0;AO=31,2;DP=39;FAO=33,0;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=16,0;FSAR=17,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00428137,0.00277399;FXX=0.0833102;HRUN=0,1;LEN=1,1;MLLD=100.252,182.661;QD=57.0714;RBI=0.0404198,0.00575675;REFB=0.0172176,-0.0156335;REVB=-0.0401924,-0.00504431;RO=6;SAF=14,2;SAR=17,0;SRF=5;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.114395,0.524163;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=-0.000321528,0;OID=.,.;OPOS=70917560,70917559;OREF=-,A;OALT=T,T;OMAPALT=AT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:39:33:6:0:31,2:33,0:1,0:17,0:14,2:5:1:17,0:16,0:0:0
chr6	70972931	.	TTA	T,TAA,TTT	63.77	PASS	AF=0.434783,0,0;AO=4,3,3;DP=28;FAO=10,0,0;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=8,0,0;FSAR=2,0,0;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.204066,-0.117563,0.110383;FXX=0;HRUN=6,6,6;LEN=2,1,1;MLLD=19.5453,14.1526,11.7261;QD=11.09;RBI=0.204901,0.128226,0.122273;REFB=-0.0959943,0.0695771,-0.0681538;REVB=0.018486,-0.0511921,0.0525956;RO=16;SAF=4,3,0;SAR=0,0,3;SRF=10;SRR=6;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.631565,0.575361,-0.661837;STB=0.719518,0.5,0.5;STBP=0.104,1,1;TYPE=del,snp,snp;VARB=0.0661981,0,0;OID=.,.,.;OPOS=70972932,70972932,70972933;OREF=TA,T,A;OALT=-,A,T;OMAPALT=T,TAA,TTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.434783,0,0:4,3,3:28:10,0,0:23:13:8,0,0:2,0,0:6:7:64:16:4,3,0:0,0,3:10:6
chr6	71236216	.	C	T	594.51	PASS	AF=0.491935;AO=61;DP=124;FAO=61;FDP=124;FR=.;FRO=63;FSAF=36;FSAR=25;FSRF=38;FSRR=25;FWDB=-0.00315544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.4016;QD=19.1776;RBI=0.0372279;REFB=-0.00908884;REVB=-0.037094;RO=63;SAF=36;SAR=25;SRF=38;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0123916;STB=0.506847;STBP=0.868;TYPE=snp;VARB=0.00809808;OID=.;OPOS=71236216;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:124:124:63:63:61:61:0.491935:25:36:38:25:25:36:38:25
chr6	71238105	.	A	G	386.11	PASS	AF=0.64;AO=32;DP=50;FAO=32;FDP=50;FR=.;FRO=18;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=0.0159524;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.138;QD=30.8885;RBI=0.0296025;REFB=-0.00249702;REVB=0.0249365;RO=18;SAF=16;SAR=16;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109633;STB=0.559963;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=0.00136407;OID=.;OPOS=71238105;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:18:18:32:32:0.64:16:16:6:12:16:16:6:12
chr6	71269459	.	C	T	197.75	PASS	AF=0.425926;AO=23;DP=54;FAO=23;FDP=54;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=0.0140447;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=174.263;QD=14.6485;RBI=0.0141031;REFB=-0.00208592;REVB=-0.00128227;RO=29;SAF=12;SAR=11;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105614;STB=0.540158;STBP=0.628;TYPE=snp;VARB=0.00302526;OID=.;OPOS=71269459;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:29:31:23:23:0.425926:11:12:12:17:11:12:14:17
chr6	71269632	.	G	A	86.27	PASS	AF=0.478261;AO=9;DP=21;FAO=11;FDP=23;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.0136422;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.55;QD=15.0039;RBI=0.0172309;REFB=-0.0120527;REVB=0.010526;RO=12;SAF=2;SAR=7;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.225785;STB=0.586989;STBP=0.486;TYPE=snp;VARB=0.0120373;OID=.;OPOS=71269632;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:21:23:12:12:9:11:0.478261:7:2:5:7:8:3:5:7
chr6	71289189	.	A	G	319.44	PASS	AF=0.583333;AO=27;DP=47;FAO=28;FDP=48;FR=.;FRO=20;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.0353358;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.734;QD=26.6196;RBI=0.0354716;REFB=-0.00402072;REVB=0.00310109;RO=20;SAF=13;SAR=14;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0242295;STB=0.505984;STBP=0.955;TYPE=snp;VARB=0.00311514;OID=.;OPOS=71289189;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:48:20:20:27:28:0.583333:14:13:9:11:15:13:9:11
chr6	71546702	.	C	T	958.36	PASS	AF=1;AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0310986;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.8616;QD=58.9761;RBI=0.0391567;REFB=0;REVB=-0.0237934;RO=0;SAF=28;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.99207e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000556744;OID=.;OPOS=71546702;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:65:0:0:65:65:1:37:28:0:0:37:28:0:0
chr6	71547572	.	A	T	1354.41	PASS	AF=0.96;AO=95;DP=99;FAO=96;FDP=100;FR=.;FRO=4;FSAF=46;FSAR=50;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.0583128;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.199;QD=54.1764;RBI=0.0600481;REFB=-0.0798446;REVB=-0.0143313;RO=1;SAF=46;SAR=49;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0101972;STB=0.520829;STBP=0.087;TYPE=snp;VARB=0.00105201;OID=.;OPOS=71547572;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:99:100:1:4:95:96:0.96:49:46:1:0:50:46:4:0
chr6	71665986	.	G	A	303.69	PASS	AF=1;AO=19;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0303328;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.079;QD=52.8163;RBI=0.0902924;REFB=0;REVB=0.0850449;RO=0;SAF=8;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.41338e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00179518;OID=.;OPOS=71665986;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:19:23:1:11:8:0:0:13:10:0:0
chr6	72892257	.	A	G	289.33	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00265814;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.2024;QD=52.6057;RBI=0.0156926;REFB=0;REVB=0.0154658;RO=0;SAF=10;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000180642;OID=.;OPOS=72892257;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:12:10:0:0:12:10:0:0
chr6	74019376	.	T	C	272.3	PASS	AF=0.47619;AO=30;DP=63;FAO=30;FDP=63;FR=.;FRO=33;FSAF=22;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=-0.0211451;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.834;QD=17.2888;RBI=0.0264275;REFB=-0.0063979;REVB=0.0158523;RO=33;SAF=22;SAR=8;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17012;STB=0.595991;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=0.0103065;OID=.;OPOS=74019376;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:33:33:30:30:0.47619:8:22:19:14:8:22:19:14
chr6	74073531	.	C	G	132.4	PASS	AF=0.320755;AO=17;DP=53;FAO=17;FDP=53;FR=.;FRO=36;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=0.010065;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.021;QD=9.99253;RBI=0.0258369;REFB=-0.0117155;REVB=0.0237958;RO=36;SAF=9;SAR=8;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0653002;STB=0.538757;STBP=0.726;TYPE=snp;VARB=0.0203654;OID=.;OPOS=74073531;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:36:36:17:17:0.320755:8:9:17:19:8:9:17:19
chr6	74079024	.	A	G	311.07	PASS	AF=0.453333;AO=33;DP=75;FAO=34;FDP=75;FR=.;FRO=41;FSAF=7;FSAR=27;FSRF=22;FSRR=19;FWDB=-0.0139538;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.965;QD=16.5905;RBI=0.0207206;REFB=-0.000570947;REVB=0.0153177;RO=41;SAF=7;SAR=26;SRF=22;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.360994;STB=0.708463;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.00169802;OID=.;OPOS=74079024;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:41:41:33:34:0.453333:26:7:22:19:27:7:22:19
chr6	74079041	.	A	C	1152.46	PASS	AF=1;AO=75;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.026533;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2958;QD=60.6557;RBI=0.0512831;REFB=0;REVB=0.0438857;RO=0;SAF=28;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94731e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000613586;OID=.;OPOS=74079041;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:75:76:1:47:28:0:0:48:28:0:0
chr6	74125875	.	A	G	162.2	PASS	AF=0.37037;AO=20;DP=54;FAO=20;FDP=54;FR=.;FRO=34;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=27;FWDB=-0.0397234;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.053;QD=12.0149;RBI=0.0408801;REFB=-0.00204058;REVB=0.00965596;RO=34;SAF=6;SAR=14;SRF=7;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130018;STB=0.574697;STBP=0.479;TYPE=snp;VARB=0.00246486;OID=.;OPOS=74125875;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:34:34:20:20:0.37037:14:6:7:27:14:6:7:27
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chr6	74135016	.	C	T	181.54	PASS	AF=0.6;AO=19;DP=30;FAO=18;FDP=30;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.0222784;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.0482;QD=24.2049;RBI=0.0484246;REFB=0.0202814;REVB=0.0429955;RO=11;SAF=8;SAR=11;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.039106;STB=0.511615;STBP=0.919;TYPE=snp;VARB=-0.0113125;OID=.;OPOS=74135016;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:30:30:11:12:19:18:0.6:11:8:4:7:11:7:5:7
chr6	74161503	.	A	G	175.11	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0233876;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=300.697;QD=46.6964;RBI=0.0330017;REFB=0;REVB=0.0232837;RO=0;SAF=5;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000165594;OID=.;OPOS=74161503;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:15:0:0:14:15:1:9:5:0:0:10:5:0:0
chr6	74161801	.	G	T	427.95	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.037471;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.0988;QD=57.0605;RBI=0.0454718;REFB=0;REVB=0.0257607;RO=0;SAF=10;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00131314;OID=.;OPOS=74161801;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:20:10:0:0:20:10:0:0
chr6	74331619	.	C	T	427.94	PASS	AF=0.583333;AO=41;DP=71;FAO=42;FDP=72;FR=.;FRO=30;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=-0.0134389;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.3426;QD=23.7743;RBI=0.0134516;REFB=-0.00119709;REVB=0.0005841;RO=30;SAF=20;SAR=21;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0677633;STB=0.541647;STBP=0.422;TYPE=snp;VARB=0.00148373;OID=.;OPOS=74331619;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:72:30:30:41:42:0.583333:21:20:12:18:21:21:12:18
chr6	74354175	.	C	T	447.84	PASS	AF=0.626866;AO=42;DP=67;FAO=42;FDP=67;FR=.;FRO=25;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=-0.013549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.8083;QD=26.7367;RBI=0.0304547;REFB=-0.00978365;REVB=-0.0272747;RO=25;SAF=18;SAR=24;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0079647;STB=0.504346;STBP=0.939;TYPE=snp;VARB=0.00409101;OID=.;OPOS=74354175;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:25:25:42:42:0.626866:24:18:11:14:24:18:11:14
chr6	74466377	.	C	T	785.88	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0257298;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.643;QD=64.1536;RBI=0.0279421;REFB=0;REVB=-0.0108966;RO=0;SAF=31;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.58521e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.58067e-05;OID=.;OPOS=74466377;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:18:31:0:0:18:31:0:0
chr6	74521947	.	C	T	163.75	PASS	AF=0.367347;AO=18;DP=49;FAO=18;FDP=49;FR=.;FRO=31;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=24;FWDB=-0.00464322;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.627;QD=13.3676;RBI=0.0271515;REFB=-0.00224996;REVB=-0.0267516;RO=31;SAF=13;SAR=5;SRF=7;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.504928;STB=0.790068;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.00133458;OID=.;OPOS=74521947;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:31:31:18:18:0.367347:5:13:7:24:5:13:7:24
chr6	74533192	.	T	G	575.75	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00402045;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.697;QD=60.605;RBI=0.00491803;REFB=0;REVB=-0.00283249;RO=0;SAF=26;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.05056e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.75287e-05;OID=.;OPOS=74533192;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:12:26:0:0:12:26:0:0
chr6	75797302	.	C	T	937.48	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0197109;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.7357;QD=58.5926;RBI=0.068068;REFB=0;REVB=0.0651517;RO=0;SAF=39;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.30166e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000564946;OID=.;OPOS=75797302;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:25:39:0:0:25:39:0:0
chr6	75841722	.	A	T	1358.34	PASS	AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00735996;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.541;QD=62.4524;RBI=0.00820737;REFB=0;REVB=-0.00363206;RO=0;SAF=51;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.39335e-05;OID=.;OPOS=75841722;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:36:51:0:0:36:51:0:0
chr6	75848181	.	A	G	396.46	PASS	AF=0.428571;AO=45;DP=105;FAO=45;FDP=105;FR=.;FRO=60;FSAF=16;FSAR=29;FSRF=33;FSRR=27;FWDB=-0.0132683;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.245;QD=15.1033;RBI=0.0196207;REFB=-0.00664022;REVB=-0.0144542;RO=60;SAF=16;SAR=29;SRF=33;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.201233;STB=0.613242;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.00835835;OID=.;OPOS=75848181;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:105:60:60:45:45:0.428571:29:16:33:27:29:16:33:27
chr6	76138146	.	C	CAG	233.41	PASS	AF=0.383562;AO=28;DP=73;FAO=28;FDP=73;FR=.;FRO=45;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=25;FSRR=20;FWDB=0.0224242;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=309.506;QD=12.7897;RBI=0.023793;REFB=-0.0130963;REVB=-0.00795368;RO=45;SAF=10;SAR=18;SRF=25;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.215463;STB=0.623673;STBP=0.103;TYPE=ins;VARB=0.02056;OID=.;OPOS=76138147;OREF=-;OALT=AG;OMAPALT=CAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.383562:28:73:28:73:45:10:18:25:20:99:45:10:18:25:20
chr6	76312315	.	C	T	205.58	PASS	AF=0.575758;AO=19;DP=35;FAO=19;FDP=33;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.00997947;FXX=0.108079;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.324;QD=24.919;RBI=0.0173865;REFB=-0.0220571;REVB=0.0142373;RO=13;SAF=6;SAR=13;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00683169;STB=0.519979;STBP=0.807;TYPE=snp;VARB=0.0118748;OID=.;OPOS=76312315;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:33:13:14:19:19:0.575758:13:6:4:9:13:6:5:9
chr6	76369054	.	A	G	283.02	PASS	AF=0.421053;AO=32;DP=76;FAO=32;FDP=76;FR=.;FRO=44;FSAF=22;FSAR=10;FSRF=27;FSRR=17;FWDB=-0.00301144;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.871;QD=14.8956;RBI=0.00904586;REFB=-0.00599726;REVB=0.00852988;RO=44;SAF=22;SAR=10;SRF=27;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0843899;STB=0.54794;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.0066741;OID=.;OPOS=76369054;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:44:44:32:32:0.421053:10:22:27:17:10:22:27:17
chr6	76425594	.	A	C	731.07	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.019941;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.934;QD=63.571;RBI=0.0362706;REFB=0;REVB=0.030297;RO=0;SAF=24;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.28506e-05;OID=.;OPOS=76425594;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:46:0:0:45:46:1:21:24:0:0:21:25:0:0
chr6	76540178	.	A	T	353.11	PASS	AF=0.583333;AO=35;DP=61;FAO=35;FDP=60;FR=.;FRO=25;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.025295;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.627;QD=23.5406;RBI=0.0269933;REFB=-0.0233081;REVB=-0.00942363;RO=24;SAF=15;SAR=20;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0842572;STB=0.538439;STBP=0.479;TYPE=snp;VARB=0.015921;OID=.;OPOS=76540178;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:60:24:25:35:35:0.583333:20:15:13:11:20:15:13:12
chr6	76564953	.	A	G	497.86	PASS	AF=0.510638;AO=48;DP=94;FAO=48;FDP=94;FR=.;FRO=46;FSAF=33;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=0.00619782;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.188;QD=21.1854;RBI=0.0144756;REFB=-0.0134356;REVB=0.0130816;RO=46;SAF=33;SAR=15;SRF=22;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197099;STB=0.609328;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.0113441;OID=.;OPOS=76564953;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:46:46:48:48:0.510638:15:33:22:24:15:33:22:24
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chr6	76660397	.	T	C	463.99	PASS	AF=0.942857;AO=32;DP=35;FAO=33;FDP=35;FR=.;FRO=2;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0766957;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.4067;QD=53.0273;RBI=0.0771049;REFB=0.00459319;REVB=0.00793314;RO=2;SAF=20;SAR=12;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0716363;STB=0.538438;STBP=0.124;TYPE=snp;VARB=-0.00388346;OID=.;OPOS=76660397;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:35:35:2:2:32:33:0.942857:12:20:0:2:12:21:0:2
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chr6	79612800	.	G	A	876.85	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0374359;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.277;QD=57.4981;RBI=0.038323;REFB=0;REVB=-0.00819782;RO=0;SAF=31;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.19358e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.26159e-05;OID=.;OPOS=79612800;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:61:0:0:57:61:1:26:31:0:0:26:35:0:0
chr6	79657391	.	G	A	1208.95	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00264802;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.944;QD=61.2129;RBI=0.0442534;REFB=0;REVB=-0.0441741;RO=0;SAF=46;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.43115e-05;OID=.;OPOS=79657391;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:33:46:0:0:33:46:0:0
chr6	79679577	.	A	G	993.9	PASS	AF=1;AO=67;DP=68;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.037849;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.901;QD=59.3373;RBI=0.0384248;REFB=0;REVB=0.0066272;RO=0;SAF=35;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.62221e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.10671e-05;OID=.;OPOS=79679577;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:67:0:0:67:67:1:32:35:0:0:32:35:0:0
chr6	79708000	.	A	C	1396.2	PASS	AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00781438;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.7176;QD=62.7507;RBI=0.0079827;REFB=0;REVB=0.00163061;RO=0;SAF=52;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.18281e-05;OID=.;OPOS=79708000;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:37:52:0:0:37:52:0:0
chr6	79918309	.	G	A	745.47	PASS	AF=1;AO=46;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.172694;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.8817;QD=56.2619;RBI=0.172741;REFB=0;REVB=-0.00404067;RO=0;SAF=20;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0053409;OID=.;OPOS=79918309;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:46:53:1:26:20:0:0:28:25:0:0
chr6	80196498	.	T	C	398.63	PASS	AF=0.633333;AO=38;DP=60;FAO=38;FDP=60;FR=.;FRO=22;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=-0.000739334;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.3458;QD=26.5751;RBI=0.0638879;REFB=-0.0332678;REVB=0.0638837;RO=22;SAF=23;SAR=15;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.054498;STB=0.529724;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=0.0208045;OID=.;OPOS=80196498;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:22:22:38:38:0.633333:15:23:15:7:15:23:15:7
chr6	80228541	.	A	G	2428.53	PASS	AF=1;AO=158;DP=159;FAO=160;FDP=160;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0210653;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.739;QD=60.7133;RBI=0.0248759;REFB=0;REVB=0.0132311;RO=1;SAF=73;SAR=85;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00647294;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000132314;OID=.;OPOS=80228541;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:159:160:1:0:158:160:1:85:73:1:0:85:75:0:0
chr6	80410956	.	A	G	518.61	PASS	AF=0.474138;AO=55;DP=115;FAO=55;FDP=116;FR=.;FRO=61;FSAF=25;FSAR=30;FSRF=33;FSRR=28;FWDB=-0.00180356;FXX=0.00854628;HRUN=1;LEN=1;MLLD=316.058;QD=17.883;RBI=0.00211645;REFB=-0.00354444;REVB=-0.0011075;RO=59;SAF=25;SAR=30;SRF=32;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0819735;STB=0.545438;STBP=0.368;TYPE=snp;VARB=0.00354232;OID=.;OPOS=80410956;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:116:59:61:55:55:0.474138:30:25:32:27:30:25:33:28
chr6	80580038	.	T	G	1347.08	PASS	AF=0.988636;AO=87;DP=88;FAO=87;FDP=88;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0418966;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.563;QD=61.231;RBI=0.0429005;REFB=-0.113956;REVB=0.00922678;RO=1;SAF=47;SAR=40;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00997538;STB=0.505262;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.000483402;OID=.;OPOS=80580038;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:88:88:1:1:87:87:0.988636:40:47:1:0:40:47:1:0
chr6	80715838	.	T	G	368.34	PASS	AF=0.443182;AO=39;DP=88;FAO=39;FDP=88;FR=.;FRO=49;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=18;FSRR=31;FWDB=0.00218125;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.274;QD=16.7426;RBI=0.0371726;REFB=-0.00583088;REVB=0.0371086;RO=49;SAF=16;SAR=23;SRF=18;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0444036;STB=0.524896;STBP=0.683;TYPE=snp;VARB=0.0058656;OID=.;OPOS=80715838;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:49:49:39:39:0.443182:23:16:18:31:23:16:18:31
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chr6	82461520	.	A	G	72.92	PASS	AF=0.642857;AO=9;DP=14;FAO=9;FDP=14;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.0246455;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.2594;QD=20.8348;RBI=0.0390284;REFB=-0.0130083;REVB=-0.0302625;RO=5;SAF=5;SAR=4;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0964512;STB=0.555432;STBP=0.657;TYPE=snp;VARB=0.0153403;OID=.;OPOS=82461520;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:14:14:5:5:9:9:0.642857:4:5:2:3:4:5:2:3
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chr6	83075914	.	G	A	619.71	PASS	AF=1;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.005942;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.0778;QD=61.9706;RBI=0.0185749;REFB=0;REVB=0.0175989;RO=0;SAF=21;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000285336;OID=.;OPOS=83075914;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:40:0:0:40:40:1:19:21:0:0:19:21:0:0
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chr6	84108219	.	C	T	450.21	PASS	AF=0.536585;AO=43;DP=81;FAO=44;FDP=82;FR=.;FRO=38;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=-0.0262242;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.9404;QD=21.9616;RBI=0.0492359;REFB=0.00570674;REVB=0.0416709;RO=38;SAF=25;SAR=18;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0923808;STB=0.544065;STBP=0.415;TYPE=snp;VARB=-0.00513786;OID=.;OPOS=84108219;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:82:38:38:43:44:0.536585:18:25:18:20:19:25:18:20
chr6	84234144	.	C	T	144.02	PASS	AF=0.421053;AO=16;DP=38;FAO=16;FDP=38;FR=.;FRO=22;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.00947513;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=245.236;QD=15.1604;RBI=0.0181421;REFB=-0.00812724;REVB=-0.0154711;RO=22;SAF=4;SAR=12;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.233392;STB=0.636181;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=0.0128152;OID=.;OPOS=84234144;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:22:22:16:16:0.421053:12:4:10:12:12:4:10:12
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chr6	84303342	.	T	C	670.81	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0122366;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.34;QD=62.4005;RBI=0.0415815;REFB=0;REVB=0.0397402;RO=0;SAF=17;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.98888e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.68376e-05;OID=.;OPOS=84303342;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:43:0:0:42:43:1:25:17:0:0:26:17:0:0
chr6	84563410	.	G	A	514.63	PASS	AF=0.38125;AO=61;DP=165;FAO=61;FDP=160;FR=.;FRO=99;FSAF=23;FSAR=38;FSRF=39;FSRR=60;FWDB=-0.0448013;FXX=0.0361424;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.332;QD=12.8657;RBI=0.0456423;REFB=-0.0269661;REVB=-0.00872111;RO=88;SAF=23;SAR=38;SRF=30;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0409256;STB=0.511059;STBP=0.83;TYPE=snp;VARB=0.0500313;OID=.;OPOS=84563410;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:165:160:88:99:61:61:0.38125:38:23:30:58:38:23:39:60
chr6	85473758	.	C	T	977.15	PASS	AF=0.985294;AO=67;DP=68;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0205435;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=230.311;QD=57.4792;RBI=0.0399193;REFB=-0.133159;REVB=0.0342274;RO=0;SAF=34;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.61397e-08;STB=0.50746;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.000282213;OID=.;OPOS=85473758;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:68:68:0:1:67:67:0.985294:33:34:0:0:33:34:0:1
chr6	86199233	.	A	G	1547.05	PASS	AF=1;AO=97;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00350572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.805;QD=63.145;RBI=0.0484888;REFB=0;REVB=0.0483619;RO=1;SAF=46;SAR=51;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0092091;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000325421;OID=.;OPOS=86199233;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:98:1:0:97:98:1:51:46:0:1:52:46:0:0
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chr6	87796233	.	G	A	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0104333;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.91;QD=42.1826;RBI=0.0131522;REFB=0;REVB=-0.00800785;RO=0;SAF=1;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000514075;OID=.;OPOS=87796233;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:10:1:0:0:10:1:0:0
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chr6	88125542	.	G	A	53.7	PASS	AF=0.296296;AO=8;DP=27;FAO=8;FDP=27;FR=.;FRO=19;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=0.0428836;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.913;QD=7.9554;RBI=0.0471337;REFB=-0.0176103;REVB=-0.0195595;RO=19;SAF=2;SAR=6;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.469121;STB=0.788797;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=0.0212575;OID=.;OPOS=88125542;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:27:27:19:19:8:8:0.296296:6:2:13:6:6:2:13:6
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chr6	88221892	.	T	G	310.4	PASS	AF=0.551724;AO=32;DP=58;FAO=32;FDP=58;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=0.0150653;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=184.975;QD=21.4065;RBI=0.0156296;REFB=-0.00949287;REVB=0.00416177;RO=25;SAF=11;SAR=21;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114729;STB=0.556415;STBP=0.364;TYPE=snp;VARB=0.00757351;OID=.;OPOS=88221892;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:25:26:32:32:0.551724:21:11:12:13:21:11:12:14
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chr6	89793894	.	G	C	689.09	PASS	AF=1;AO=42;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0249101;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=320.945;QD=62.6444;RBI=0.0264899;REFB=0;REVB=0.00901115;RO=0;SAF=16;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.69307e-05;OID=.;OPOS=89793894;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:44:0:0:42:44:1:26:16:0:0:27:17:0:0
chr6	89806689	.	T	C	769.5	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0475288;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.837;QD=56.9996;RBI=0.0549393;REFB=0;REVB=0.027556;RO=0;SAF=26;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.52846e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000347969;OID=.;OPOS=89806689;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:28:26:0:0:28:26:0:0
chr6	89806992	.	A	C	817.74	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0123487;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.122;QD=57.3854;RBI=0.0349942;REFB=0;REVB=0.032743;RO=0;SAF=28;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000212132;OID=.;OPOS=89806992;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:29:28:0:0:29:28:0:0
chr6	89888744	.	C	T	738.66	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0208965;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.2137;QD=56.8199;RBI=0.0246523;REFB=0;REVB=-0.0130793;RO=0;SAF=26;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000350118;OID=.;OPOS=89888744;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:26:26:0:0:26:26:0:0
chr6	89907873	.	G	A	1495.52	PASS	AF=1;AO=94;DP=95;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0269656;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.032;QD=63.6391;RBI=0.0323866;REFB=0;REVB=-0.0179373;RO=0;SAF=68;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.91088e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000118518;OID=.;OPOS=89907873;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:94:0:0:94:94:1:26:68:0:0:26:68:0:0
chr6	89913209	.	C	T	1064.28	PASS	AF=1;AO=71;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0314672;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.251;QD=59.1264;RBI=0.0324409;REFB=0;REVB=0.00788816;RO=1;SAF=38;SAR=33;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0122822;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.37773e-05;OID=.;OPOS=89913209;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:72:1:0:71:72:1:33:38:1:0:33:39:0:0
chr6	89913218	.	T	A	858.01	PASS	AF=0.926471;AO=63;DP=68;FAO=63;FDP=68;FR=.;FRO=5;FSAF=33;FSAR=30;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.000977653;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.71;QD=50.4714;RBI=0.0368404;REFB=0.00132596;REVB=0.0368275;RO=4;SAF=33;SAR=30;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0255461;STB=0.505616;STBP=0.782;TYPE=snp;VARB=-0.00043073;OID=.;OPOS=89913218;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:19:68:68:4:5:63:63:0.926471:30:33:3:1:30:33:3:2
chr6	89926966	.	T	C	248.26	PASS	AF=0.459016;AO=28;DP=61;FAO=28;FDP=61;FR=.;FRO=33;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=-0.0160478;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.997;QD=16.279;RBI=0.0186018;REFB=0.00372882;REVB=0.00940708;RO=32;SAF=14;SAR=14;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0592334;STB=0.524573;STBP=0.72;TYPE=snp;VARB=-0.00593846;OID=.;OPOS=89926966;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:32:33:28:28:0.459016:14:14:18:14:14:14:18:15
chr6	89981413	.	T	C	349.57	PASS	AF=0.507042;AO=36;DP=72;FAO=36;FDP=71;FR=.;FRO=35;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=-0.0098714;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.556;QD=19.6942;RBI=0.0155399;REFB=-0.00767922;REVB=-0.0120018;RO=35;SAF=21;SAR=15;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137503;STB=0.576428;STBP=0.21;TYPE=snp;VARB=0.00876189;OID=.;OPOS=89981413;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:71:35:35:36:36:0.507042:15:21:15:20:15:21:15:20
chr6	90039670	.	G	C	632.26	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0129378;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.542;QD=61.684;RBI=0.0312069;REFB=0;REVB=0.0283987;RO=0;SAF=21;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000148048;OID=.;OPOS=90039670;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:20:21:0:0:20:21:0:0
chr6	90315789	.	A	G	501.66	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0561958;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.445;QD=59.0184;RBI=0.0566486;REFB=0;REVB=-0.00714845;RO=0;SAF=20;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.48532e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000520523;OID=.;OPOS=90315789;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:14:20:0:0:14:20:0:0
chr6	90327873	.	G	A	827.82	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.024048;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.6594;QD=57.091;RBI=0.050153;REFB=0;REVB=0.0440115;RO=0;SAF=28;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00100923;OID=.;OPOS=90327873;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:56:58:0:0:56:58:1:28:28:0:0:29:29:0:0
chr6	90333599	.	A	G	769.42	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0178427;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.471;QD=56.9943;RBI=0.0275581;REFB=0;REVB=0.0210021;RO=0;SAF=28;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.52846e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000176279;OID=.;OPOS=90333599;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:26:28:0:0:26:28:0:0
chr6	90340276	.	G	A	538.52	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00305138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.528;QD=59.836;RBI=0.0144943;REFB=0;REVB=-0.0141695;RO=0;SAF=26;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000123942;OID=.;OPOS=90340276;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:10:26:0:0:10:26:0:0
chr6	90362783	.	A	C	1984.87	PASS	AF=1;AO=126;DP=129;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00222332;FXX=0.0303007;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.024;QD=62.0271;RBI=0.0109174;REFB=0;REVB=0.0106886;RO=0;SAF=75;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.38094e-05;OID=.;OPOS=90362783;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:129:128:0:0:126:128:1:51:75:0:0:51:77:0:0
chr6	90371202	.	G	A	1587.34	PASS	AF=1;AO=99;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00795826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.873;QD=64.1351;RBI=0.00795897;REFB=0;REVB=0.000106238;RO=0;SAF=48;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.12135e-05;OID=.;OPOS=90371202;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:99:99:0:0:99:99:1:51:48:0:0:51:48:0:0
chr6	90383870	.	G	A	43.42	PASS	AF=0.233333;AO=7;DP=30;FAO=7;FDP=30;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=0.000695943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.3127;QD=5.78922;RBI=0.0171483;REFB=-0.000262541;REVB=0.0171341;RO=21;SAF=5;SAR=2;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.233142;STB=0.68573;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=0.00263061;OID=.;OPOS=90383870;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:30:30:21:23:7:7:0.233333:2:5:11:10:2:5:11:12
chr6	90384231	.	T	G,TG	82.74	PASS	AF=0.02,0.34;AO=4,9;DP=56;FAO=1,17;FDP=50;FR=.;FRO=32;FSAF=0,8;FSAR=1,9;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=0.0142627,0.116928;FXX=0.122785;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=142.59,16.2715;QD=6.61926;RBI=0.0318134,0.129056;REFB=-0.00872618,-0.0619675;REVB=-0.0284372,-0.0546196;RO=43;SAF=0,2;SAR=4,7;SRF=24;SRR=19;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.582268,-0.41111;STB=0.989887,0.519208;STBP=0.465,0.821;TYPE=snp,ins;VARB=0.0615527,0.124477;OID=.,.;OPOS=90384231,90384232;OREF=T,-;OALT=G,G;OMAPALT=G,TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:77:56:50:43:32:4,9:1,17:0.02,0.34:4,7:0,2:24:19:1,9:0,8:16:16
chr6	90384233	.	AG	GA,GG	31.32	PASS	AF=0.105263,0;AO=3,3;DP=56;FAO=6,0;FDP=57;FR=.;FRO=51;FSAF=1,0;FSAR=5,0;FSRF=24;FSRR=27;FWDB=0.0169873,0.00791464;FXX=0.0172384;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=35.1278,173.197;QD=2.19758;RBI=0.0598254,0.0220897;REFB=0.0171666,0.00196718;REVB=0.057363,-0.0206231;RO=43;SAF=2,3;SAR=1,0;SRF=20;SRR=23;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.190823,0.509687;STB=0.795122,0.5;STBP=0.17,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.00815666,0;OID=.,.;OPOS=90384233,90384233;OREF=AG,A;OALT=GA,G;OMAPALT=GA,GG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:56:57:43:51:3,3:6,0:0.105263,0:1,0:2,3:20:23:5,0:1,0:24:27
chr6	90390443	.	C	A	432.93	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00310586;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.534;QD=57.7244;RBI=0.00860868;REFB=0;REVB=0.00802888;RO=0;SAF=11;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000132567;OID=.;OPOS=90390443;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:19:11:0:0:19:11:0:0
chr6	90402482	.	G	A	689.38	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00381282;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=272.378;QD=62.6711;RBI=0.0349538;REFB=0;REVB=0.0347453;RO=0;SAF=17;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.54734e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.58922e-05;OID=.;OPOS=90402482;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:27:17:0:0:27:17:0:0
chr6	90402840	.	C	G	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0215861;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.316;QD=45.8068;RBI=0.0236921;REFB=0;REVB=0.00976496;RO=0;SAF=7;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000458866;OID=.;OPOS=90402840;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:7:7:0:0:7:7:0:0
chr6	90418262	.	C	T	1659.61	PASS	AF=1;AO=110;DP=110;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00673768;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=245.58;QD=60.3496;RBI=0.0258102;REFB=0;REVB=0.0249153;RO=0;SAF=59;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.21569e-05;OID=.;OPOS=90418262;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:110:110:0:0:110:110:1:51:59:0:0:51:59:0:0
chr6	90448092	.	C	T	1109.35	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00228497;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.854;QD=59.1651;RBI=0.0378686;REFB=0;REVB=0.0377996;RO=0;SAF=35;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.90268e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00179077;OID=.;OPOS=90448092;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:75:0:0:73:75:1:38:35:0:0:38:37:0:0
chr6	90455084	.	A	G	727.7	PASS	AF=1;AO=45;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0531096;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.501;QD=63.2781;RBI=0.0531219;REFB=0;REVB=0.00114124;RO=0;SAF=18;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000270718;OID=.;OPOS=90455084;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:45:46:1:27:18:0:0:27:19:0:0
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chr6	96652371	.	T	C	567.43	PASS	AF=1;AO=35;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00485553;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=170.534;QD=52.7839;RBI=0.0148141;REFB=0;REVB=0.0139958;RO=0;SAF=21;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.27896e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00141565;OID=.;OPOS=96652371;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:42:43:0:0:35:43:1:14:21:0:0:20:23:0:0
chr6	96652582	.	G	T	632.26	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00898603;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.461;QD=61.684;RBI=0.00919277;REFB=0;REVB=0.00193865;RO=0;SAF=15;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.70845e-05;OID=.;OPOS=96652582;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:26:15:0:0:26:15:0:0
chr6	96652706	.	G	A	676.78	PASS	AF=0.977778;AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0187097;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=280.435;QD=60.1581;RBI=0.0191193;REFB=0.00309825;REVB=0.00393611;RO=1;SAF=21;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0199884;STB=0.510633;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=-9.24192e-06;OID=.;OPOS=96652706;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:45:45:1:1:44:44:0.977778:23:21:0:1:23:21:0:1
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chr6	96653325	.	T	A	95.2	PASS	AF=0.223881;AO=14;DP=66;FAO=15;FDP=67;FR=.;FRO=52;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=32;FWDB=0.00107566;FXX=0.0147037;HRUN=4;LEN=1;MLLD=194.406;QD=5.68341;RBI=0.0249463;REFB=-0.00816921;REVB=-0.0249231;RO=52;SAF=7;SAR=7;SRF=20;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143986;STB=0.564432;STBP=0.577;TYPE=snp;VARB=0.0425014;OID=.;OPOS=96653325;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:66:67:52:52:14:15:0.223881:7:7:20:32:8:7:20:32
chr6	96661315	.	T	C	74.97	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0070101;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.13;QD=37.4854;RBI=0.0365357;REFB=0;REVB=0.0358569;RO=0;SAF=5;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000754288;OID=.;OPOS=96661315;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:3:5:0:0:3:5:0:0
chr6	96661410	.	A	G	356.95	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00155773;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.826;QD=54.9157;RBI=0.00644915;REFB=0;REVB=-0.0062582;RO=0;SAF=14;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.07699e-05;OID=.;OPOS=96661410;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:26:0:0:25:26:1:11:14:0:0:11:15:0:0
chr6	96730731	.	G	C	289.65	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00342473;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.042;QD=52.6631;RBI=0.0134976;REFB=0;REVB=0.0130559;RO=0;SAF=12;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.57669e-05;OID=.;OPOS=96730731;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:22:0:0:21:22:1:9:12:0:0:10:12:0:0
chr6	97339078	.	A	G	1139.03	PASS	AF=0.987013;AO=76;DP=77;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=44;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0407221;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.689;QD=59.1706;RBI=0.044299;REFB=0.0659287;REVB=0.0174388;RO=0;SAF=32;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50769;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=-0.000283354;OID=.;OPOS=97339078;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:77:77:0:1:76:76:0.987013:44:32:0:0:44:32:1:0
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chr6	97694582	.	A	ATAG,G	187.15	PASS	AF=0.409091,0.0454545;AO=18,2;DP=44;FAO=18,2;FDP=44;FR=.;FRO=24;FSAF=10,2;FSAR=8,0;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.0183815,-0.0407171;FXX=0;HRUN=1,4;LEN=3,1;MLLD=195.916,78.0433;QD=17.0135;RBI=0.0189465,0.0491557;REFB=-0.00166256,0.0141927;REVB=0.00459227,0.027539;RO=24;SAF=10,2;SAR=8,0;SRF=14;SRR=10;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0280656,0.453997;STB=0.516111,0.993906;STBP=0.879,0.195;TYPE=ins,snp;VARB=0.00456234,0.0563653;OID=.,.;OPOS=97694583,97694582;OREF=-,A;OALT=TAG,G;OMAPALT=ATAG,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:24:24:18,2:18,2:0.409091,0.0454545:8,0:10,2:14:10:8,0:10,2:14:10
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chr6	100868721	.	G	A	563.85	PASS	AF=0.450382;AO=59;DP=136;FAO=59;FDP=131;FR=.;FRO=72;FSAF=26;FSAR=33;FSRF=32;FSRR=40;FWDB=-0.0115889;FXX=0.0437924;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.5266;QD=17.2167;RBI=0.01159;REFB=0.00592727;REVB=0.000154244;RO=61;SAF=26;SAR=33;SRF=28;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0170527;STB=0.502098;STBP=0.975;TYPE=snp;VARB=-0.00554757;OID=.;OPOS=100868721;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:136:131:61:72:59:59:0.450382:33:26:28:33:33:26:32:40
chr6	100868779	.	G	T	487.4	PASS	AF=0.473214;AO=53;DP=112;FAO=53;FDP=112;FR=.;FRO=59;FSAF=20;FSAR=33;FSRF=26;FSRR=33;FWDB=0.0229892;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.7615;QD=17.4072;RBI=0.0310175;REFB=-0.00527511;REVB=0.0208226;RO=53;SAF=20;SAR=33;SRF=23;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.053593;STB=0.53487;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.00715461;OID=.;OPOS=100868779;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:112:53:59:53:53:0.473214:33:20:23:30:33:20:26:33
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chr6	101094554	.	A	G	1439.21	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0138797;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.736;QD=62.5745;RBI=0.0553648;REFB=0;REVB=0.0535968;RO=0;SAF=44;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000196564;OID=.;OPOS=101094554;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:86:92:0:0:86:92:1:42:44:0:0:47:45:0:0
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chr6	104031012	.	G	A	445.27	PASS	AF=0.494382;AO=44;DP=89;FAO=44;FDP=89;FR=.;FRO=45;FSAF=31;FSAR=13;FSRF=25;FSRR=20;FWDB=-0.00512153;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.691;QD=20.0123;RBI=0.0126537;REFB=-0.009097;REVB=-0.0115709;RO=44;SAF=31;SAR=13;SRF=25;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137795;STB=0.584198;STBP=0.131;TYPE=snp;VARB=0.0128488;OID=.;OPOS=104031012;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:44:45:44:44:0.494382:13:31:25:19:13:31:25:20
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chr6	107565060	.	T	C	393.79	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.104789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.049;QD=56.2557;RBI=0.105822;REFB=0;REVB=0.0147449;RO=0;SAF=8;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.06954e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000699196;OID=.;OPOS=107565060;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:28:0:0:27:28:1:19:8:0:0:19:9:0:0
chr6	108026146	.	C	T	183.54	PASS	AF=0.370968;AO=23;DP=62;FAO=23;FDP=62;FR=.;FRO=39;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=0.00142045;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=223.353;QD=11.8416;RBI=0.0111104;REFB=-0.0092445;REVB=0.0110192;RO=39;SAF=15;SAR=8;SRF=23;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0726772;STB=0.542131;STBP=0.635;TYPE=snp;VARB=0.0144085;OID=.;OPOS=108026146;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:39:39:23:23:0.370968:8:15:23:16:8:15:23:16
chr6	108026317	.	G	T	2062.88	PASS	AF=1;AO=131;DP=131;FAO=132;FDP=132;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00545903;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.914;QD=62.5114;RBI=0.0377529;REFB=0;REVB=0.0373562;RO=0;SAF=52;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.173e-05;OID=.;OPOS=108026317;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:131:132:0:0:131:132:1:79:52:0:0:80:52:0:0
chr6	108026402	.	A	C	639.54	PASS	AF=0.512;AO=64;DP=127;FAO=64;FDP=125;FR=.;FRO=61;FSAF=26;FSAR=38;FSRF=30;FSRR=31;FWDB=0.002912;FXX=0.0157468;HRUN=6;LEN=1;MLLD=239.555;QD=20.4653;RBI=0.00313949;REFB=0.00111778;REVB=-0.00117331;RO=55;SAF=26;SAR=38;SRF=27;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0727564;STB=0.542567;STBP=0.367;TYPE=snp;VARB=-0.000776166;OID=.;OPOS=108026402;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:127:125:55:61:64:64:0.512:38:26:27:28:38:26:30:31
chr6	108026455	.	A	G	1541.29	PASS	AF=1;AO=94;DP=94;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0149599;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.243;QD=63.5585;RBI=0.0181564;REFB=0;REVB=0.0102886;RO=0;SAF=39;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.62192e-05;OID=.;OPOS=108026455;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:94:97:0:0:94:97:1:55:39:0:0:58:39:0:0
chr6	108029091	.	G	A	185.82	PASS	AF=0.487179;AO=19;DP=39;FAO=19;FDP=39;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=0.0178645;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.505;QD=19.058;RBI=0.0264806;REFB=-0.000747594;REVB=0.019547;RO=19;SAF=6;SAR=13;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102566;STB=0.548141;STBP=0.611;TYPE=snp;VARB=0.000742812;OID=.;OPOS=108029091;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:19:20:19:19:0.487179:13:6:8:11:13:6:8:12
chr6	108029109	.	T	C	185.82	PASS	AF=0.487179;AO=19;DP=39;FAO=19;FDP=39;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.013499;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.976;QD=19.0583;RBI=0.0184378;REFB=-0.00541734;REVB=-0.012559;RO=20;SAF=6;SAR=13;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177504;STB=0.601046;STBP=0.239;TYPE=snp;VARB=0.00376561;OID=.;OPOS=108029109;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:20:20:19:19:0.487179:13:6:10:10:13:6:10:10
chr6	108233929	.	G	A	71.99	PASS	AF=0.243902;AO=10;DP=43;FAO=10;FDP=41;FR=.;FRO=31;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=-0.0166106;FXX=0.0465008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.237;QD=7.023;RBI=0.0329338;REFB=-0.00485233;REVB=-0.028438;RO=27;SAF=4;SAR=6;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0365322;STB=0.515121;STBP=0.912;TYPE=snp;VARB=0.0142564;OID=.;OPOS=108233929;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:71:43:41:27:31:10:10:0.243902:6:4:10:17:6:4:13:18
chr6	108277287	.	C	A	2065.68	PASS	AF=1;AO=131;DP=131;FAO=132;FDP=132;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00902487;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.831;QD=62.5965;RBI=0.00960004;REFB=0;REVB=-0.003273;RO=0;SAF=50;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.19503e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.7102e-05;OID=.;OPOS=108277287;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:131:132:0:0:131:132:1:81:50:0:0:82:50:0:0
chr6	108364582	.	T	C	220.94	PASS	AF=0.488889;AO=21;DP=45;FAO=22;FDP=45;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=-0.00745121;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=253.986;QD=19.6388;RBI=0.0106347;REFB=-0.0192773;REVB=0.00758787;RO=23;SAF=10;SAR=11;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121916;STB=0.555506;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=0.0187498;OID=.;OPOS=108364582;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:23:23:21:22:0.488889:11:10:14:9:11:11:14:9
chr6	109576672	.	A	G	463.12	PASS	AF=0.471698;AO=50;DP=106;FAO=50;FDP=106;FR=.;FRO=56;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=20;FSRR=36;FWDB=0.00540616;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=260.263;QD=17.4762;RBI=0.0158873;REFB=-0.0186641;REVB=-0.0149392;RO=55;SAF=24;SAR=26;SRF=20;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110592;STB=0.565324;STBP=0.204;TYPE=snp;VARB=0.025112;OID=.;OPOS=109576672;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:106:55:56:50:50:0.471698:26:24:20:35:26:24:20:36
chr6	109583186	.	A	G	257.77	PASS	AF=0.348315;AO=31;DP=89;FAO=31;FDP=89;FR=.;FRO=58;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=33;FSRR=25;FWDB=-0.00398222;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.038;QD=11.585;RBI=0.0116077;REFB=0.00387429;REVB=-0.0109033;RO=58;SAF=15;SAR=16;SRF=33;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.095761;STB=0.555279;STBP=0.455;TYPE=snp;VARB=-0.00891865;OID=.;OPOS=109583186;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:58:58:31:31:0.348315:16:15:33:25:16:15:33:25
chr6	109615603	.	G	T	741.48	PASS	AF=0.514286;AO=72;DP=139;FAO=72;FDP=140;FR=.;FRO=68;FSAF=36;FSAR=36;FSRF=43;FSRR=25;FWDB=-0.0153127;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.966;QD=21.185;RBI=0.0178589;REFB=-0.00737359;REVB=-0.00919025;RO=66;SAF=36;SAR=36;SRF=41;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105678;STB=0.564268;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=0.00962144;OID=.;OPOS=109615603;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:139:140:66:68:72:72:0.514286:36:36:41:25:36:36:43:25
chr6	109616762	.	A	G	732.38	PASS	AF=0.555556;AO=70;DP=126;FAO=70;FDP=126;FR=.;FRO=56;FSAF=35;FSAR=35;FSRF=33;FSRR=23;FWDB=0.0174653;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.631;QD=23.2503;RBI=0.0183126;REFB=-0.0266765;REVB=0.00550577;RO=56;SAF=35;SAR=35;SRF=33;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0726209;STB=0.539671;STBP=0.364;TYPE=snp;VARB=0.019767;OID=.;OPOS=109616762;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:126:126:56:56:70:70:0.555556:35:35:33:23:35:35:33:23
chr6	109621493	.	AT	A,AC	220.95	PASS	AF=0.197531,0.160494;AO=14,14;DP=82;FAO=16,13;FDP=81;FR=.;FRO=52;FSAF=14,0;FSAR=2,13;FSRF=25;FSRR=27;FWDB=-0.00493373,-0.0037581;FXX=0.0121936;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=151.928,160.92;QD=10.9111;RBI=0.0058547,0.0466554;REFB=-0.0278814,-0.0226507;REVB=0.00315211,-0.0465038;RO=51;SAF=14,0;SAR=0,14;SRF=25;SRR=26;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.756338,-0.751642;STB=0.838377,0.999054;STBP=0.003,0;TYPE=del,snp;VARB=0.0460115,0.00116077;OID=.,.;OPOS=109621494,109621494;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=A,AC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.197531,0.160494:14,14:82:16,13:81:52:14,0:2,13:25:27:79:51:14,0:0,14:25:26
chr6	109621572	.	G	A	182.98	PASS	AF=0.452381;AO=19;DP=42;FAO=19;FDP=42;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=-0.00567233;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=252.136;QD=17.4265;RBI=0.0145405;REFB=-0.00762121;REVB=0.0133885;RO=23;SAF=9;SAR=10;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.03751;STB=0.521388;STBP=0.808;TYPE=snp;VARB=0.00785305;OID=.;OPOS=109621572;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:23:23:19:19:0.452381:10:9:10:13:10:9:10:13
chr6	109627262	.	AT	A	33.85	PASS	AF=0.304348;AO=6;DP=24;FAO=7;FDP=23;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=0.0188169;FXX=0.079968;HRUN=5;LEN=1;MLLD=16.3236;QD=5.88635;RBI=0.0511665;REFB=0.000862493;REVB=0.0475809;RO=16;SAF=3;SAR=3;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.2144;STB=0.584187;STBP=0.645;TYPE=del;VARB=0.0265167;OID=.;OPOS=109627263;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.304348:6:24:7:23:16:4:3:11:5:33:16:3:3:11:5
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chr6	109674055	.	C	T	605.82	PASS	AF=1;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.018473;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.518;QD=60.5818;RBI=0.0217826;REFB=-0.0218589;REVB=-0.0115425;RO=0;SAF=25;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.66789e-05;OID=.;OPOS=109674055;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:41:40:0:0:40:40:1:15:25:0:0:15:25:0:0
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chr6	109768295	.	G	A	604.09	PASS	AF=1;AO=39;DP=41;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0200302;FXX=0.0487686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.1215;QD=61.9578;RBI=0.0463236;REFB=0;REVB=0.0417692;RO=0;SAF=21;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.34792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00154314;OID=.;OPOS=109768295;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:39:0:0:39:39:1:18:21:0:0:18:21:0:0
chr6	109775436	.	T	C	175.9	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0477556;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.265;QD=46.9055;RBI=0.0775641;REFB=0;REVB=0.0611195;RO=0;SAF=5;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00112388;OID=.;OPOS=109775436;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:15:0:0:14:15:1:9:5:0:0:10:5:0:0
chr6	109827716	.	C	T	1230.78	PASS	AF=1;AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0474829;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.404;QD=61.5392;RBI=0.0475446;REFB=0;REVB=0.00242195;RO=0;SAF=19;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.49012e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000227078;OID=.;OPOS=109827716;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:80:80:0:0:80:80:1:61:19:0:0:61:19:0:0
chr6	109906329	.	GCTTCTTCTTCTTCT	GCTTCTTCTTC,GCTTCTTCTTCT,GCTTCTTCTTCTT,GCTTCTTCTTCTTTT	1600.23	PASS	AF=0,1,0,0;AO=21,42,21,6;DP=116;FAO=0,111,0,0;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=0,62,0,0;FSAR=0,49,0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00385345,0.00264841,0.00223519,0.000509251;FXX=0.0430997;HRUN=2,2,1,1;LEN=4,3,2,1;MLLD=217.917,220.715,215.782,202.254;QD=57.6658;RBI=0.0247771,0.0257979,0.015346,0.00599158;REFB=0,0,0,0;REVB=0.0244756,0.0256616,0.0151824,0.0059699;RO=0;SAF=10,26,15,4;SAR=11,16,6,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=-5.51176e-08,0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1,1;TYPE=del,del,del,snp;VARB=0.0361025,-0.000275186,0,0;OID=.,.,.,.;OPOS=109906340,109906330,109906341,109906342;OREF=TTCT,CTT,TC,C;OALT=-,-,-,T;OMAPALT=GCTTCTTCTTC,GCTTCTTCTTCT,GCTTCTTCTTCTT,GCTTCTTCTTCTTTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	2/2:0,1,0,0:21,42,21,6:116:0,111,0,0:111:0:0,62,0,0:0,49,0,0:0:0:9:0:10,26,15,4:11,16,6,2:0:0
chr6	109954252	.	C	T	910.2	PASS	AF=1;AO=61;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0193774;FXX=0.0454477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.743;QD=57.7907;RBI=0.029252;REFB=0;REVB=-0.0219134;RO=0;SAF=29;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00619809;OID=.;OPOS=109954252;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:61:63:1:32:29:0:0:33:30:0:0
chr6	110064928	.	A	T	1153.52	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.033088;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.029;QD=60.7114;RBI=0.0404093;REFB=0;REVB=0.023197;RO=0;SAF=40;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60877e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.99914e-05;OID=.;OPOS=110064928;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:36:40:0:0:36:40:0:0
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chr6	110777818	.	C	G	157.84	PASS	AF=0.447368;AO=17;DP=38;FAO=17;FDP=38;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=0.0228983;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.9867;QD=16.6152;RBI=0.0278173;REFB=0.0148768;REVB=0.0157947;RO=21;SAF=5;SAR=12;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.318969;STB=0.683324;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=-0.0175356;OID=.;OPOS=110777818;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:21:21:17:17:0.447368:12:5:13:8:12:5:13:8
chr6	110797702	.	GCCG	GCG,GCGC	647.65	PASS	AF=0.0357143,0.964286;AO=13,6;DP=56;FAO=2,54;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=1,22;FSAR=1,32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0819745,-0.0347625;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,2;MLLD=13.9656,21.5982;QD=46.2609;RBI=0.254268,0.283622;REFB=0,0;REVB=0.240692,-0.281484;RO=4;SAF=10,3;SAR=3,3;SRF=1;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.257639,0.168827;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.0702004,0.00611498;OID=.,.;OPOS=110797703,110797704;OREF=C,CG;OALT=-,GC;OMAPALT=GCG,GCGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0357143,0.964286:13,6:56:2,54:56:0:1,22:1,32:0:0:9:4:10,3:3,3:1:3
chr6	110797707	.	GGGG	CACC,CCCA	757.09	PASS	AF=0.678571,0.232143;AO=34,12;DP=54;FAO=38,13;FDP=56;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=12,6;FSAR=26,7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.053894,0.0469988;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=4,4;MLLD=146.233,121.142;QD=54.078;RBI=0.0540877,0.0472492;REFB=0,0;REVB=0.004573,-0.00485792;RO=0;SAF=9,5;SAR=25,7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,mnp;VARB=0.00785683,0.0122983;OID=.,.;OPOS=110797707,110797707;OREF=GGGG,GGGG;OALT=CACC,CCCA;OMAPALT=CACC,CCCA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:94:54:56:0:0:34,12:38,13:0.678571,0.232143:25,7:9,5:0:0:26,7:12,6:0:0
chr6	110797713	.	C	T	452.63	PASS	AF=0.694915;AO=41;DP=59;FAO=41;FDP=59;FR=.;FRO=18;FSAF=15;FSAR=26;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=0.00177803;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=249.315;QD=30.6866;RBI=0.0105625;REFB=-0.0168824;REVB=0.0104117;RO=14;SAF=15;SAR=26;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134942;STB=0.577246;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=0.00432229;OID=.;OPOS=110797713;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:14:18:41:41:0.694915:26:15:9:5:26:15:11:7
chr6	110964409	.	G	A	411.12	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.02126;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.527;QD=56.7057;RBI=0.0266463;REFB=0;REVB=-0.0160636;RO=0;SAF=14;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000219705;OID=.;OPOS=110964409;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:15:14:0:0:15:14:0:0
chr6	111280038	.	C	T	355.13	PASS	AF=1;AO=25;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.144913;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.405;QD=54.6358;RBI=0.145185;REFB=0;REVB=0.00888324;RO=1;SAF=10;SAR=15;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.044143;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000972631;OID=.;OPOS=111280038;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:1:0:25:26:1:15:10:1:0:15:11:0:0
chr6	111283592	.	C	T	239.44	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0154936;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.0603;QD=50.4083;RBI=0.0337577;REFB=0;REVB=-0.0299922;RO=0;SAF=9;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00123516;OID=.;OPOS=111283592;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:10:9:0:0:10:9:0:0
chr6	111587266	.	T	C	610.33	PASS	AF=0.560748;AO=60;DP=107;FAO=60;FDP=107;FR=.;FRO=47;FSAF=36;FSAR=24;FSRF=27;FSRR=20;FWDB=-0.00697643;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.062;QD=22.816;RBI=0.0100033;REFB=-0.00630335;REVB=0.00716902;RO=47;SAF=36;SAR=24;SRF=27;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0212383;STB=0.511624;STBP=0.798;TYPE=snp;VARB=0.00619182;OID=.;OPOS=111587266;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:107:47:47:60:60:0.560748:24:36:27:20:24:36:27:20
chr6	111589293	.	A	C	97.0	PASS	AF=0.387097;AO=12;DP=30;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=0.00898963;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=55.2461;QD=12.5158;RBI=0.100981;REFB=-0.000673775;REVB=0.10058;RO=18;SAF=6;SAR=6;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170731;STB=0.612725;STBP=0.363;TYPE=snp;VARB=0.0056275;OID=.;OPOS=111589293;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:30:31:18:19:12:12:0.387097:6:6:12:6:6:6:13:6
chr6	111620758	.	G	A	557.13	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0235695;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.32;QD=60.2304;RBI=0.0291461;REFB=0;REVB=0.0171456;RO=0;SAF=17;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.71161e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.28239e-05;OID=.;OPOS=111620758;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:20:17:0:0:20:17:0:0
chr6	111695073	.	C	T	215.11	PASS	AF=0.525;AO=21;DP=40;FAO=21;FDP=40;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.00165453;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.567;QD=21.511;RBI=0.0581732;REFB=-0.00663842;REVB=-0.0581497;RO=19;SAF=10;SAR=11;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0423572;STB=0.523787;STBP=0.767;TYPE=snp;VARB=0.0083703;OID=.;OPOS=111695073;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:19:19:21:21:0.525:11:10:10:9:11:10:10:9
chr6	111695268	.	C	T	441.09	PASS	AF=0.544304;AO=43;DP=79;FAO=43;FDP=79;FR=.;FRO=36;FSAF=28;FSAR=15;FSRF=21;FSRR=15;FWDB=0.0155725;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=288.279;QD=22.3339;RBI=0.0177612;REFB=-0.0285474;REVB=-0.00854156;RO=35;SAF=28;SAR=15;SRF=20;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0697379;STB=0.533318;STBP=0.554;TYPE=snp;VARB=0.0213429;OID=.;OPOS=111695268;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:35:36:43:43:0.544304:15:28:20:15:15:28:21:15
chr6	111695887	.	G	A	56.78	PASS	AF=0.421053;AO=8;DP=19;FAO=8;FDP=19;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=-0.0676163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.6534;QD=11.9536;RBI=0.0679062;REFB=-0.028266;REVB=-0.00626725;RO=11;SAF=5;SAR=3;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109376;STB=0.565062;STBP=0.696;TYPE=snp;VARB=0.028315;OID=.;OPOS=111695887;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:19:19:11:11:8:8:0.421053:3:5:8:3:3:5:8:3
chr6	111696257	.	G	A	583.48	PASS	AF=0.526786;AO=59;DP=112;FAO=59;FDP=112;FR=.;FRO=53;FSAF=24;FSAR=35;FSRF=26;FSRR=27;FWDB=-0.0140458;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.7991;QD=20.8385;RBI=0.014238;REFB=0.0191413;REVB=0.00233194;RO=53;SAF=24;SAR=35;SRF=26;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0734956;STB=0.540443;STBP=0.392;TYPE=snp;VARB=-0.0284353;OID=.;OPOS=111696257;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:112:53:53:59:59:0.526786:35:24:26:27:35:24:26:27
chr6	111696852	.	T	C	165.72	PASS	AF=0.391304;AO=18;DP=46;FAO=18;FDP=46;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=0.0612266;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.7389;QD=14.4104;RBI=0.0882943;REFB=-0.00917444;REVB=-0.0636176;RO=28;SAF=7;SAR=11;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.227155;STB=0.631434;STBP=0.161;TYPE=snp;VARB=0.0147009;OID=.;OPOS=111696852;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:28:28:18:18:0.391304:11:7:17:11:11:7:17:11
chr6	111726698	.	G	C	431.3	PASS	AF=0.387597;AO=50;DP=129;FAO=50;FDP=129;FR=.;FRO=79;FSAF=36;FSAR=14;FSRF=40;FSRR=39;FWDB=0.00437109;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.406;QD=13.3736;RBI=0.00455182;REFB=0.00284293;REVB=-0.00126988;RO=79;SAF=36;SAR=14;SRF=40;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.249035;STB=0.641932;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=-0.00306733;OID=.;OPOS=111726698;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:129:129:79:79:50:50:0.387597:14:36:40:39:14:36:40:39
chr6	111901453	.	G	T	1116.92	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00589509;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.472;QD=60.3742;RBI=0.00696944;REFB=0;REVB=-0.00371766;RO=0;SAF=43;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.6447e-06;OID=.;OPOS=111901453;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:31:43:0:0:31:43:0:0
chr6	112457390	.	C	T	1607.03	PASS	AF=1;AO=107;DP=107;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00140581;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.503;QD=60.076;RBI=0.0159082;REFB=0;REVB=-0.015846;RO=0;SAF=40;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.9105e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.02107e-05;OID=.;OPOS=112457390;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:107:107:0:0:107:107:1:67:40:0:0:67:40:0:0
chr6	112493872	.	A	G	1592.24	PASS	AF=1;AO=106;DP=107;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0148641;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.607;QD=60.0846;RBI=0.0173418;REFB=0;REVB=0.00893281;RO=0;SAF=54;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.82802e-06;OID=.;OPOS=112493872;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:107:106:0:0:106:106:1:52:54:0:0:52:54:0:0
chr6	112508769	.	TG	GT	271.1	PASS	AF=1;AO=48;DP=49;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0921021;FXX=0.039992;HRUN=1;LEN=2;MLLD=187.415;QD=22.5919;RBI=0.128132;REFB=0;REVB=0.0890788;RO=0;SAF=16;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.0121142;OID=.;OPOS=112508769;OREF=TG;OALT=GT;OMAPALT=GT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:49:48:0:0:48:48:1:32:16:0:0:32:16:0:0
chr6	112512905	.	G	A	283.65	PASS	AF=0.526316;AO=30;DP=57;FAO=30;FDP=57;FR=.;FRO=27;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=-0.0153696;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.413;QD=19.9054;RBI=0.0155106;REFB=0.00311656;REVB=0.00208666;RO=27;SAF=20;SAR=10;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134368;STB=0.574949;STBP=0.25;TYPE=snp;VARB=-0.00248081;OID=.;OPOS=112512905;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:27:27:30:30:0.526316:10:20:14:13:10:20:14:13
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chr6	116263181	.	T	C	483.35	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.020027;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.318;QD=58.5878;RBI=0.0535018;REFB=0;REVB=0.0496122;RO=0;SAF=14;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.71297e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000224216;OID=.;OPOS=116263181;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:19:14:0:0:19:14:0:0
chr6	116325142	.	C	T	1008.49	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00485725;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=284.639;QD=59.3229;RBI=0.00485727;REFB=0;REVB=1.27192e-05;RO=0;SAF=35;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.73864e-06;OID=.;OPOS=116325142;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:33:35:0:0:33:35:0:0
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chr6	116446576	.	A	G	768.54	PASS	AF=0.473988;AO=79;DP=175;FAO=82;FDP=173;FR=.;FRO=91;FSAF=35;FSAR=47;FSRF=45;FSRR=46;FWDB=-0.0164704;FXX=0.0280883;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.544;QD=17.7697;RBI=0.0389346;REFB=-0.0134507;REVB=-0.0352793;RO=91;SAF=32;SAR=47;SRF=45;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0879029;STB=0.535985;STBP=0.414;TYPE=snp;VARB=0.0118524;OID=.;OPOS=116446576;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:175:173:91:91:79:82:0.473988:47:32:45:46:47:35:45:46
chr6	116571255	.	G	A	157.67	PASS	AF=0.414634;AO=17;DP=41;FAO=17;FDP=41;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=17;FWDB=-0.0288352;FXX=0.0238039;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.339;QD=15.3822;RBI=0.0575193;REFB=-0.00304046;REVB=-0.0497694;RO=24;SAF=10;SAR=7;SRF=7;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.293802;STB=0.668337;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=0.00287825;OID=.;OPOS=116571255;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:24:24:17:17:0.414634:7:10:7:17:7:10:7:17
chr6	116574455	.	G	A	55.4	PASS	AF=0.363636;AO=8;DP=22;FAO=8;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.0305642;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.582;QD=10.0734;RBI=0.0344839;REFB=0.00376112;REVB=0.0159678;RO=14;SAF=6;SAR=2;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.34871;STB=0.713729;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=-0.00314658;OID=.;OPOS=116574455;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:22:22:14:14:8:8:0.363636:2:6:6:8:2:6:6:8
chr6	116575083	.	C	A	1010.31	PASS	AF=1;AO=68;DP=69;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0693457;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.501;QD=59.4297;RBI=0.0695332;REFB=0;REVB=0.00510309;RO=0;SAF=29;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000209155;OID=.;OPOS=116575083;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:69:68:0:0:68:68:1:39:29:0:0:39:29:0:0
chr6	116599665	.	T	C	193.97	PASS	AF=0.434783;AO=20;DP=46;FAO=20;FDP=46;FR=.;FRO=26;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.0692704;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.6907;QD=16.867;RBI=0.0787462;REFB=0.00907546;REVB=-0.037451;RO=26;SAF=15;SAR=5;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.309681;STB=0.678382;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=-0.0152771;OID=.;OPOS=116599665;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:26:26:20:20:0.434783:5:15:12:14:5:15:12:14
chr6	116600465	.	T	TCAC	152.98	PASS	AF=0.681818;AO=15;DP=24;FAO=15;FDP=22;FR=.;FRO=7;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.000270437;FXX=0.0832986;HRUN=1;LEN=3;MLLD=230.957;QD=27.8143;RBI=0.0103748;REFB=-0.0157693;REVB=0.0103713;RO=8;SAF=9;SAR=6;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0995014;STB=0.538411;STBP=0.61;TYPE=ins;VARB=0.0051718;OID=.;OPOS=116600466;OREF=-;OALT=CAC;OMAPALT=TCAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.681818:15:24:15:22:7:9:6:5:2:47:8:9:6:6:2
chr6	116600774	.	C	G	57.33	PASS	AF=0.444444;AO=8;DP=18;FAO=8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.00870085;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.724;QD=12.7393;RBI=0.0129864;REFB=-0.0181156;REVB=-0.00964057;RO=10;SAF=6;SAR=2;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.341689;STB=0.705344;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=0.0192289;OID=.;OPOS=116600774;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:18:18:10:10:8:8:0.444444:2:6:4:6:2:6:4:6
chr6	116600810	.	G	A	66.19	PASS	AF=0.409091;AO=9;DP=22;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.0397689;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.6185;QD=12.0342;RBI=0.103838;REFB=-0.00994817;REVB=0.0959209;RO=13;SAF=6;SAR=3;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.208265;STB=0.624716;STBP=0.348;TYPE=snp;VARB=0.0239255;OID=.;OPOS=116600810;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:22:22:13:13:9:9:0.409091:3:6:6:7:3:6:6:7
chr6	116757557	.	T	C	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0308808;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.8544;QD=40.7623;RBI=0.0745471;REFB=0;REVB=0.0678502;RO=0;SAF=7;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00589427;OID=.;OPOS=116757557;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:3:7:0:0:3:7:0:0
chr6	116783330	.	G	A	147.23	PASS	AF=0.470588;AO=16;DP=34;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.00963649;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=233.266;QD=17.3208;RBI=0.0324948;REFB=-0.0231441;REVB=0.031033;RO=18;SAF=10;SAR=6;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169121;STB=0.596892;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.0300251;OID=.;OPOS=116783330;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:18:18:16:16:0.470588:6:10:8:10:6:10:8:10
chr6	116783390	.	A	G	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0461793;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.044;QD=35.5756;RBI=0.0530395;REFB=0;REVB=-0.0260894;RO=0;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000681949;OID=.;OPOS=116783390;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:4:3:0:0:4:3:0:0
chr6	116875427	.	G	A	1641.91	PASS	AF=1;AO=108;DP=108;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0351112;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.573;QD=60.2537;RBI=0.037592;REFB=0;REVB=0.0134299;RO=0;SAF=34;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-8.33239e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.08919e-05;OID=.;OPOS=116875427;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:108:109:0:0:108:109:1:74:34:0:0:75:34:0:0
chr6	116875493	.	T	C	325.78	PASS	AF=0.603774;AO=32;DP=53;FAO=32;FDP=53;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=25;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.00901835;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.4548;QD=24.5871;RBI=0.0161139;REFB=-0.0031108;REVB=0.0133539;RO=21;SAF=7;SAR=25;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.192974;STB=0.606908;STBP=0.081;TYPE=snp;VARB=0.0023427;OID=.;OPOS=116875493;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:21:21:32:32:0.603774:25:7:9:12:25:7:9:12
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chr6	116950833	.	T	C	231.91	PASS	AF=0.428571;AO=27;DP=63;FAO=27;FDP=63;FR=.;FRO=36;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=-0.0146207;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.4703;QD=14.7247;RBI=0.0148862;REFB=0.00289876;REVB=0.00279869;RO=36;SAF=12;SAR=15;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11163;STB=0.563333;STBP=0.435;TYPE=snp;VARB=-0.00429735;OID=.;OPOS=116950833;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:36:36:27:27:0.428571:15:12:20:16:15:12:20:16
chr6	116973182	.	T	C	541.57	PASS	AF=0.574713;AO=50;DP=87;FAO=50;FDP=87;FR=.;FRO=37;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=0.000125182;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.9564;QD=24.8996;RBI=0.0191074;REFB=0.00760292;REVB=0.019107;RO=36;SAF=27;SAR=23;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119907;STB=0.511817;STBP=0.817;TYPE=snp;VARB=-0.00670369;OID=.;OPOS=116973182;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:36:37:50:50:0.574713:23:27:20:16:23:27:21:16
chr6	117113653	.	T	C	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00433664;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.062;QD=55.0986;RBI=0.0641429;REFB=0;REVB=0.0639961;RO=0;SAF=13;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000430728;OID=.;OPOS=117113653;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:13:13:0:0:13:13:0:0
chr6	117114025	.	G	A	243.12	PASS	AF=0.952381;AO=19;DP=20;FAO=20;FDP=21;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0358572;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.9982;QD=46.3093;RBI=0.0383773;REFB=-0.00433359;REVB=-0.0136777;RO=1;SAF=7;SAR=12;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0368096;STB=0.5185;STBP=0.625;TYPE=snp;VARB=0.00156487;OID=.;OPOS=117114025;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:20:21:1:1:19:20:0.952381:12:7:0:1:13:7:0:1
chr6	117114223	.	T	A	651.21	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.015654;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.1716;QD=62.0204;RBI=0.0168055;REFB=0;REVB=0.00611364;RO=0;SAF=26;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000121307;OID=.;OPOS=117114223;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:16:26:0:0:16:26:0:0
chr6	117114403	.	G	A	712.86	PASS	AF=0.978723;AO=45;DP=45;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.03611;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.6479;QD=60.6687;RBI=0.0361224;REFB=-0.0781005;REVB=0.000945108;RO=0;SAF=15;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508193;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.0100727;OID=.;OPOS=117114403;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:45:47:0:1:45:46:0.978723:30:15:0:0:30:16:0:1
chr6	117121894	.	G	A	804.39	PASS	AF=0.982759;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00721036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.42;QD=55.475;RBI=0.00750561;REFB=-0.00717786;REVB=0.00208444;RO=0;SAF=31;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.19358e-08;STB=0.509431;STBP=0.334;TYPE=snp;VARB=0.000357932;OID=.;OPOS=117121894;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:58:58:0:1:57:57:0.982759:26:31:0:0:26:31:0:1
chr6	117130704	.	G	A	937.46	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0176667;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.3641;QD=58.5914;RBI=0.0191413;REFB=0;REVB=0.00736724;RO=0;SAF=32;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.56469e-05;OID=.;OPOS=117130704;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:32:32:0:0:32:32:0:0
chr6	117591781	.	C	A	195.74	PASS	AF=0.444444;AO=20;DP=46;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=4;FSAR=16;FSRF=6;FSRR=19;FWDB=-0.0430417;FXX=0.0217344;HRUN=5;LEN=1;MLLD=227.783;QD=17.3993;RBI=0.0432299;REFB=-0.00753323;REVB=-0.00402972;RO=24;SAF=4;SAR=16;SRF=7;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12426;STB=0.533299;STBP=0.77;TYPE=snp;VARB=0.00772733;OID=.;OPOS=117591781;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:45:24:25:20:20:0.444444:16:4:7:17:16:4:6:19
chr6	117710661	.	T	C	275.15	PASS	AF=0.380952;AO=32;DP=84;FAO=32;FDP=84;FR=.;FRO=52;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=26;FSRR=26;FWDB=0.0137256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.379;QD=13.1026;RBI=0.0159711;REFB=-0.00561441;REVB=0.008166;RO=51;SAF=13;SAR=19;SRF=26;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112484;STB=0.558786;STBP=0.403;TYPE=snp;VARB=0.00844919;OID=.;OPOS=117710661;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:51:52:32:32:0.380952:19:13:26:25:19:13:26:26
chr6	117725448	.	T	G	467.42	PASS	AF=0.494624;AO=46;DP=93;FAO=46;FDP=93;FR=.;FRO=47;FSAF=13;FSAR=33;FSRF=21;FSRR=26;FWDB=0.0157947;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.554;QD=20.104;RBI=0.0235555;REFB=-0.00095028;REVB=-0.0174754;RO=46;SAF=13;SAR=33;SRF=21;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176075;STB=0.593922;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=0.00115645;OID=.;OPOS=117725448;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:46:47:46:46:0.494624:33:13:21:25:33:13:21:26
chr6	117725578	.	T	A	225.15	PASS	AF=0.409091;AO=26;DP=66;FAO=27;FDP=66;FR=.;FRO=39;FSAF=5;FSAR=22;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=-0.00367297;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.949;QD=13.6455;RBI=0.00851963;REFB=0.00162413;REVB=0.00768722;RO=39;SAF=5;SAR=21;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.408964;STB=0.740736;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=-0.0029721;OID=.;OPOS=117725578;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:39:39:26:27:0.409091:21:5:21:18:22:5:21:18
chr6	117842698	.	A	G	397.76	PASS	AF=0.465909;AO=41;DP=87;FAO=41;FDP=88;FR=.;FRO=47;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=28;FSRR=19;FWDB=0.00814161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.753;QD=18.0798;RBI=0.0097643;REFB=-0.00452271;REVB=-0.00539035;RO=44;SAF=19;SAR=22;SRF=26;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118075;STB=0.570291;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=0.00416935;OID=.;OPOS=117842698;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:88:44:47:41:41:0.465909:22:19:26:18:22:19:28:19
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chr6	119149149	.	C	G	826.89	PASS	AF=1;AO=55;DP=56;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00935441;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.163;QD=57.0271;RBI=0.0102013;REFB=0;REVB=-0.00406967;RO=0;SAF=24;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.83788e-06;OID=.;OPOS=119149149;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:56:58:0:0:55:58:1:31:24:0:0:33:25:0:0
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chr6	120583501	.	T	G	106.33	PASS	AF=0.361111;AO=13;DP=36;FAO=13;FDP=36;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=-0.0198446;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=288.196;QD=11.8143;RBI=0.0198735;REFB=0.00303261;REVB=0.00107165;RO=23;SAF=6;SAR=7;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0648377;STB=0.538402;STBP=0.77;TYPE=snp;VARB=-0.00587572;OID=.;OPOS=120583501;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:23:23:13:13:0.361111:7:6:12:11:7:6:12:11
chr6	120583509	.	A	G	106.86	PASS	AF=0.371429;AO=13;DP=35;FAO=13;FDP=35;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.00203007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.786;QD=12.213;RBI=0.00204394;REFB=-0.00802439;REVB=0.000237677;RO=22;SAF=6;SAR=7;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0409598;STB=0.524192;STBP=0.81;TYPE=snp;VARB=0.0158073;OID=.;OPOS=120583509;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:22:22:13:13:0.371429:7:6:11:11:7:6:11:11
chr6	120583521	.	A	T	96.65	PASS	AF=0.387097;AO=12;DP=31;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.0191409;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.29;QD=12.4704;RBI=0.0358918;REFB=-0.00822322;REVB=-0.0303619;RO=19;SAF=5;SAR=7;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0600117;STB=0.535459;STBP=0.782;TYPE=snp;VARB=0.0769649;OID=.;OPOS=120583521;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:31:31:19:19:12:12:0.387097:7:5:9:10:7:5:9:10
chr6	120583526	.	C	G	64.07	PASS	AF=0.333333;AO=9;DP=27;FAO=9;FDP=27;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.0141774;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.611;QD=9.49176;RBI=0.0152181;REFB=-0.00750679;REVB=0.00553093;RO=18;SAF=4;SAR=5;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.52951e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00418601;OID=.;OPOS=120583526;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:27:27:18:18:9:9:0.333333:5:4:8:10:5:4:8:10
chr6	120583533	.	A	G	54.66	PASS	AF=0.333333;AO=8;DP=24;FAO=8;FDP=24;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.00193888;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.629;QD=9.11032;RBI=0.0164595;REFB=0.0072702;REVB=-0.0163449;RO=16;SAF=3;SAR=5;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0703661;STB=0.543368;STBP=0.765;TYPE=snp;VARB=-0.0125961;OID=.;OPOS=120583533;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:24:24:16:16:8:8:0.333333:5:3:7:9:5:3:7:9
chr6	120847506	.	C	T	110.7	PASS	AF=0.448276;AO=13;DP=29;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.010873;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.677;QD=15.2686;RBI=0.0312666;REFB=-0.0351461;REVB=-0.0293151;RO=16;SAF=8;SAR=5;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.226907;STB=0.631378;STBP=0.225;TYPE=snp;VARB=0.0236656;OID=.;OPOS=120847506;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:16:16:13:13:0.448276:5:8:6:10:5:8:6:10
chr6	120847544	.	C	A	75.62	PASS	AF=0.384615;AO=10;DP=26;FAO=10;FDP=26;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.0174464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.656;QD=11.6341;RBI=0.0273377;REFB=-0.00771488;REVB=-0.0210469;RO=16;SAF=7;SAR=3;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.334607;STB=0.6996;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.0123797;OID=.;OPOS=120847544;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:26:26:16:16:10:10:0.384615:3:7:6:10:3:7:6:10
chr6	121007775	.	C	G	62.75	PASS	AF=0.290323;AO=8;DP=28;FAO=9;FDP=31;FR=.;FRO=22;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.0189879;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.0753;QD=8.09628;RBI=0.0241827;REFB=-0.00743567;REVB=-0.0149753;RO=20;SAF=2;SAR=6;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196171;STB=0.590701;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.0186548;OID=.;OPOS=121007775;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:28:31:20:22:8:9:0.290323:6:2:8:12:6:3:10:12
chr6	121620608	.	G	T	827.4	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0355298;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.658;QD=57.0623;RBI=0.0415199;REFB=0;REVB=0.0214834;RO=0;SAF=38;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.97918e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000139836;OID=.;OPOS=121620608;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:55:58:0:0:55:58:1:17:38:0:0:19:39:0:0
chr6	121629167	.	G	A	1695.18	PASS	AF=1;AO=112;DP=112;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0363431;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.4182;QD=60.5422;RBI=0.05808;REFB=0;REVB=-0.0453041;RO=0;SAF=62;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000455683;OID=.;OPOS=121629167;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:112:112:0:0:112:112:1:50:62:0:0:50:62:0:0
chr6	121632008	.	T	A	1168.29	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0343875;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=46.5471;QD=59.9121;RBI=0.0955673;REFB=0;REVB=0.0891662;RO=0;SAF=39;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5078e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00196277;OID=.;OPOS=121632008;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:78:0:0:77:78:1:38:39:0:0:38:40:0:0
chr6	121901599	.	A	G	366.64	PASS	AF=0.481481;AO=35;DP=79;FAO=39;FDP=81;FR=.;FRO=42;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=15;FSRR=27;FWDB=0.143184;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.4196;QD=18.1055;RBI=0.144019;REFB=-0.0297769;REVB=0.0154836;RO=43;SAF=16;SAR=19;SRF=16;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0848637;STB=0.580401;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=0.0352798;OID=.;OPOS=121901599;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:81:43:42:35:39:0.481481:19:16:16:27:19:20:15:27
chr6	123066514	.	T	C	955.2	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00440625;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.481;QD=58.7817;RBI=0.0127739;REFB=0;REVB=0.0119899;RO=0;SAF=29;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.425e-05;OID=.;OPOS=123066514;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:36:29:0:0:36:29:0:0
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chr6	123758492	.	C	T	1080.32	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00295779;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.263;QD=60.018;RBI=0.0165192;REFB=0;REVB=0.0162522;RO=0;SAF=37;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.12261e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.8535e-05;OID=.;OPOS=123758492;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:72:0:0:71:72:1:34:37:0:0:35:37:0:0
chr6	123833457	.	G	C	2641.91	PASS	AF=1;AO=167;DP=173;FAO=169;FDP=169;FR=.;FRO=0;FSAF=114;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0300009;FXX=0.028734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.338;QD=62.5304;RBI=0.0351439;REFB=0;REVB=0.0183041;RO=0;SAF=112;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.42812e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000162616;OID=.;OPOS=123833457;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:173:169:0:0:167:169:1:55:112:0:0:55:114:0:0
chr6	124603378	.	A	G	215.5	PASS	AF=0.393939;AO=26;DP=66;FAO=26;FDP=66;FR=.;FRO=40;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=23;FWDB=-0.0137738;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.465;QD=13.0607;RBI=0.0138297;REFB=-0.0151605;REVB=-0.00124304;RO=40;SAF=10;SAR=16;SRF=17;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0445202;STB=0.525528;STBP=0.754;TYPE=snp;VARB=0.0217066;OID=.;OPOS=124603378;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:40:40:26:26:0.393939:16:10:17:23:16:10:17:23
chr6	124603390	.	A	G	206.55	PASS	AF=0.396825;AO=25;DP=63;FAO=25;FDP=63;FR=.;FRO=38;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=-0.0432812;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=53.0494;QD=13.1144;RBI=0.0432812;REFB=0.00229964;REVB=5.84338e-05;RO=36;SAF=11;SAR=14;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0622994;STB=0.536369;STBP=0.657;TYPE=snp;VARB=-0.00497542;OID=.;OPOS=124603390;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:36:38:25:25:0.396825:14:11:18:18:14:11:19:19
chr6	125144352	.	T	G	228.34	PASS	AF=0.52381;AO=21;DP=42;FAO=22;FDP=42;FR=.;FRO=20;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=0.0161969;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=199.757;QD=21.7472;RBI=0.016259;REFB=-0.00938057;REVB=0.00141961;RO=14;SAF=12;SAR=9;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.252561;STB=0.63605;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=0.00549549;OID=.;OPOS=125144352;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:14:20:21:22:0.52381:9:12:3:11:9:13:6:14
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chr6	127476516	.	G	A	106.86	PASS	AF=0.371429;AO=13;DP=35;FAO=13;FDP=35;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=-0.0284557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.4467;QD=12.2126;RBI=0.0440759;REFB=-0.0212288;REVB=-0.0336594;RO=22;SAF=6;SAR=7;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0564458;STB=0.533283;STBP=0.776;TYPE=snp;VARB=0.0342625;OID=.;OPOS=127476516;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:22:22:13:13:0.371429:7:6:9:13:7:6:9:13
chr6	127609691	.	C	T	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00401012;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.467;QD=35.5759;RBI=0.0174582;REFB=0;REVB=-0.0169914;RO=0;SAF=1;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000503877;OID=.;OPOS=127609691;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:6:1:0:0:6:1:0:0
chr6	127768472	.	G	A	727.26	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00389543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.8891;QD=63.2401;RBI=0.020219;REFB=0;REVB=0.0198402;RO=0;SAF=26;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.55238e-05;OID=.;OPOS=127768472;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:20:26:0:0:20:26:0:0
chr6	127797179	.	G	A	651.21	PASS	AF=1;AO=41;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0233051;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.681;QD=62.0203;RBI=0.0263821;REFB=0;REVB=-0.0123648;RO=0;SAF=16;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.1719e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.34957e-05;OID=.;OPOS=127797179;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:41:42:1:25:16:0:0:25:17:0:0
chr6	127797374	.	G	A	1304.34	PASS	AF=0.988372;AO=85;DP=86;FAO=85;FDP=86;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0238427;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.1929;QD=60.6669;RBI=0.0245769;REFB=-0.0794587;REVB=-0.00596222;RO=1;SAF=45;SAR=40;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0104115;STB=0.505493;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=0.000695576;OID=.;OPOS=127797374;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:86:86:1:1:85:85:0.988372:40:45:1:0:40:45:1:0
chr6	128134798	.	T	C	625.78	PASS	AF=0.586538;AO=60;DP=102;FAO=61;FDP=104;FR=.;FRO=43;FSAF=32;FSAR=29;FSRF=20;FSRR=23;FWDB=0.00918182;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=54.4642;QD=24.0685;RBI=0.0114999;REFB=-0.0340476;REVB=-0.00692397;RO=42;SAF=31;SAR=29;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0305584;STB=0.524582;STBP=0.565;TYPE=snp;VARB=0.0336409;OID=.;OPOS=128134798;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:104:42:43:60:61:0.586538:29:31:20:22:29:32:20:23
chr6	128312033	.	A	G	267.55	PASS	AF=0.397436;AO=31;DP=78;FAO=31;FDP=78;FR=.;FRO=47;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=23;FSRR=24;FWDB=-0.0245436;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.254;QD=13.7203;RBI=0.0258515;REFB=0.0120056;REVB=0.00811851;RO=47;SAF=11;SAR=20;SRF=23;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14726;STB=0.584137;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=-0.0156126;OID=.;OPOS=128312033;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:47:47:31:31:0.397436:20:11:23:24:20:11:23:24
chr6	128403745	.	A	G	477.63	PASS	AF=0.452991;AO=52;DP=115;FAO=53;FDP=117;FR=.;FRO=64;FSAF=17;FSAR=36;FSRF=35;FSRR=29;FWDB=-0.0262867;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.4221;QD=16.3293;RBI=0.0492207;REFB=-0.0156198;REVB=-0.0416136;RO=63;SAF=17;SAR=35;SRF=35;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.231518;STB=0.628771;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0179611;OID=.;OPOS=128403745;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:117:63:64:52:53:0.452991:35:17:35:28:36:17:35:29
chr6	129371106	.	C	T	674.36	PASS	AF=0.503759;AO=65;DP=132;FAO=67;FDP=133;FR=.;FRO=66;FSAF=46;FSAR=21;FSRF=31;FSRR=35;FWDB=-0.00441231;FXX=0.00746213;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.544;QD=20.2815;RBI=0.0192662;REFB=-0.00147764;REVB=0.0187541;RO=66;SAF=45;SAR=20;SRF=31;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215721;STB=0.614322;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.000914958;OID=.;OPOS=129371106;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:132:133:66:66:65:67:0.503759:20:45:31:35:21:46:31:35
chr6	129381026	.	C	A	1000.22	PASS	AF=0.971831;AO=69;DP=71;FAO=69;FDP=71;FR=.;FRO=2;FSAF=25;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00659479;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=299.519;QD=56.3507;RBI=0.00676825;REFB=-0.00167019;REVB=0.00152248;RO=2;SAF=25;SAR=44;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0210027;STB=0.511108;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=3.43735e-05;OID=.;OPOS=129381026;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:71:71:2:2:69:69:0.971831:44:25:0:2:44:25:0:2
chr6	129511373	.	T	C	454.58	PASS	AF=0.428571;AO=51;DP=119;FAO=51;FDP=119;FR=.;FRO=68;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=38;FSRR=30;FWDB=-0.00513597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.865;QD=15.2801;RBI=0.00955182;REFB=-0.0130245;REVB=-0.00805352;RO=68;SAF=26;SAR=25;SRF=38;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0500271;STB=0.528042;STBP=0.6;TYPE=snp;VARB=0.0149886;OID=.;OPOS=129511373;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:119:68:68:51:51:0.428571:25:26:38:30:25:26:38:30
chr6	129635800	.	G	A	285.33	PASS	AF=0.432432;AO=32;DP=74;FAO=32;FDP=74;FR=.;FRO=42;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=-0.000512953;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.3823;QD=15.4233;RBI=0.0199685;REFB=-0.0071533;REVB=-0.0199619;RO=42;SAF=12;SAR=20;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15229;STB=0.586152;STBP=0.21;TYPE=snp;VARB=0.011432;OID=.;OPOS=129635800;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:42:42:32:32:0.432432:20:12:22:20:20:12:22:20
chr6	129722389	.	A	G	152.15	PASS	AF=0.369565;AO=17;DP=46;FAO=17;FDP=46;FR=.;FRO=29;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=22;FWDB=0.00996323;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=292.131;QD=13.2308;RBI=0.0104393;REFB=-0.00882804;REVB=0.00311671;RO=29;SAF=5;SAR=12;SRF=7;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0711949;STB=0.541354;STBP=0.691;TYPE=snp;VARB=0.0171039;OID=.;OPOS=129722389;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:29:29:17:17:0.369565:12:5:7:22:12:5:7:22
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chr6	129807629	.	C	T	244.24	PASS	AF=0.547619;AO=23;DP=42;FAO=23;FDP=42;FR=.;FRO=19;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.00447174;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.027;QD=23.261;RBI=0.0393753;REFB=-0.0236321;REVB=-0.0391205;RO=19;SAF=12;SAR=11;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0896243;STB=0.549957;STBP=0.474;TYPE=snp;VARB=0.0164481;OID=.;OPOS=129807629;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:19:19:23:23:0.547619:11:12:12:7:11:12:12:7
chr6	129807699	.	G	C	285.98	PASS	AF=0.557692;AO=29;DP=52;FAO=29;FDP=52;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=-0.0094381;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.488;QD=21.9981;RBI=0.00955709;REFB=0.0117461;REVB=-0.00150342;RO=23;SAF=14;SAR=15;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134825;STB=0.574586;STBP=0.246;TYPE=snp;VARB=-0.00913839;OID=.;OPOS=129807699;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:23:23:29:29:0.557692:15:14:15:8:15:14:15:8
chr6	129807714	.	G	A	187.39	PASS	AF=0.411765;AO=21;DP=51;FAO=21;FDP=51;FR=.;FRO=30;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=-0.00651861;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.3738;QD=14.6971;RBI=0.00845786;REFB=-0.00206783;REVB=-0.00538917;RO=30;SAF=14;SAR=7;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144581;STB=0.583252;STBP=0.366;TYPE=snp;VARB=0.00256767;OID=.;OPOS=129807714;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:30:30:21:21:0.411765:7:14:16:14:7:14:16:14
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chr6	130374102	.	C	A	210.75	PASS	AF=0.477273;AO=21;DP=44;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=0.0082095;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.4954;QD=19.1587;RBI=0.107404;REFB=0.00222243;REVB=-0.10709;RO=23;SAF=11;SAR=10;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20174;STB=0.61363;STBP=0.184;TYPE=snp;VARB=-0.00650546;OID=.;OPOS=130374102;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:23:23:21:21:0.477273:10:11:7:16:10:11:7:16
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chr6	131148737	.	G	A	1749.87	PASS	AF=1;AO=114;DP=114;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0262683;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.179;QD=60.8652;RBI=0.0279705;REFB=0;REVB=-0.00960857;RO=0;SAF=56;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.23074e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.31207e-05;OID=.;OPOS=131148737;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:114:115:0:0:114:115:1:58:56:0:0:58:57:0:0
chr6	131156102	.	G	T	1153.61	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00191184;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=331.54;QD=60.7162;RBI=0.00521133;REFB=0;REVB=-0.00484798;RO=0;SAF=35;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.0388e-06;OID=.;OPOS=131156102;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:41:35:0:0:41:35:0:0
chr6	131160876	.	G	T	1009.26	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00398151;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.807;QD=59.3685;RBI=0.0543654;REFB=0;REVB=0.0542195;RO=0;SAF=40;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.26911e-05;OID=.;OPOS=131160876;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:68:0:0:66:68:1:26:40:0:0:28:40:0:0
chr6	131603366	.	AGT	A	263.59	PASS	AF=0.384615;AO=30;DP=85;FAO=30;FDP=78;FR=.;FRO=48;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=20;FSRR=28;FWDB=-0.0225992;FXX=0.0930124;HRUN=1;LEN=2;MLLD=238.549;QD=13.5173;RBI=0.0259297;REFB=-0.0157729;REVB=0.0127133;RO=46;SAF=9;SAR=21;SRF=20;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15698;STB=0.579944;STBP=0.306;TYPE=del;VARB=0.0276534;OID=.;OPOS=131603367;OREF=GT;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.384615:30:85:30:78:48:9:21:20:28:99:46:9:21:20:26
chr6	131919862	.	A	G	40.35	PASS	AF=0.0857143;AO=6;DP=70;FAO=6;FDP=70;FR=.,HEALED;FRO=61;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=17;FSRR=44;FWDB=-0.0153122;FXX=0.0140825;HRUN=4;LEN=1;MLLD=204.367;QD=2.30546;RBI=0.0161462;REFB=-0.00541889;REVB=0.00512192;RO=61;SAF=5;SAR=1;SRF=17;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.562671;STB=0.909949;STBP=0.136;TYPE=snp;VARB=0.0476899;OID=.;OPOS=131919862;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:20:70:70:61:61:6:6:0.0857143:1:5:17:44:1:5:17:44
chr6	131995313	.	A	G	753.34	PASS	AF=0.493671;AO=78;DP=158;FAO=78;FDP=158;FR=.;FRO=80;FSAF=33;FSAR=45;FSRF=42;FSRR=38;FWDB=0.00521192;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.925;QD=19.072;RBI=0.00535913;REFB=-0.00401558;REVB=0.00124748;RO=80;SAF=33;SAR=45;SRF=42;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0943019;STB=0.551998;STBP=0.213;TYPE=snp;VARB=0.00400121;OID=.;OPOS=131995313;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:158:158:80:80:78:78:0.493671:45:33:42:38:45:33:42:38
chr6	132022419	.	G	A	190.9	PASS	AF=0.666667;AO=18;DP=28;FAO=18;FDP=27;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=-0.0335984;FXX=0.0689417;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.22;QD=28.2812;RBI=0.034108;REFB=-0.0785039;REVB=-0.00587425;RO=9;SAF=6;SAR=12;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.269678;STB=0.649831;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.0115125;OID=.;OPOS=132022419;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:28:27:9:9:18:18:0.666667:12:6:7:2:12:6:7:2
chr6	132168910	.	C	T	180.41	PASS	AF=0.44186;AO=19;DP=43;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=16;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=0.0213444;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.9343;QD=16.7827;RBI=0.0336019;REFB=0.0026639;REVB=-0.025952;RO=24;SAF=16;SAR=3;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.413057;STB=0.74045;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=-0.0021506;OID=.;OPOS=132168910;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:24:24:19:19:0.44186:3:16:12:12:3:16:12:12
chr6	132271952	.	G	C	736.03	PASS	AF=0.979167;AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=48;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0048533;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.2542;QD=61.3359;RBI=0.0526572;REFB=-0.113352;REVB=0.052433;RO=1;SAF=29;SAR=18;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.025408;STB=0.513508;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=0.00180475;OID=.;OPOS=132271952;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:48:48:1:1:47:47:0.979167:18:29:0:1:18:29:0:1
chr6	132271959	.	T	G	718.23	PASS	AF=0.978723;AO=46;DP=48;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0874686;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.7647;QD=61.1259;RBI=0.0875857;REFB=-0.084468;REVB=0.00452701;RO=0;SAF=26;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50943;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.00138044;OID=.;OPOS=132271959;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:48:47:0:1:46:46:0.978723:20:26:0:0:20:26:1:0
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chr6	132859609	.	T	A	2148.57	PASS	AF=0.992754;AO=137;DP=139;FAO=137;FDP=138;FR=.;FRO=1;FSAF=72;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0344169;FXX=0.00719373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.086;QD=62.2775;RBI=0.0406921;REFB=0.00223081;REVB=0.0217099;RO=1;SAF=72;SAR=65;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00725792;STB=0.503816;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=4.75171e-05;OID=.;OPOS=132859609;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:139:138:1:1:137:137:0.992754:65:72:0:1:65:72:0:1
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chr6	135375762	.	G	A	575.69	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0186949;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.809;QD=60.5994;RBI=0.0191363;REFB=0;REVB=0.00408638;RO=0;SAF=20;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.51048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.90519e-05;OID=.;OPOS=135375762;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:18:20:0:0:18:20:0:0
chr6	135523774	.	A	G	318.62	PASS	AF=0.692308;AO=27;DP=39;FAO=27;FDP=39;FR=.;FRO=12;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=1;FWDB=-0.00506343;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.922;QD=32.6792;RBI=0.00999729;REFB=0.00782831;REVB=0.00862018;RO=12;SAF=11;SAR=16;SRF=11;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.280543;STB=0.652952;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=-0.00352198;OID=.;OPOS=135523774;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:39:39:12:12:27:27:0.692308:16:11:11:1:16:11:11:1
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chr6	136599822	.	C	G	90.3	PASS	AF=0.172043;AO=16;DP=93;FAO=16;FDP=93;FR=.;FRO=77;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=33;FSRR=44;FWDB=-0.0121568;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.922;QD=3.8837;RBI=0.0155724;REFB=-0.00564738;REVB=-0.00973199;RO=77;SAF=9;SAR=7;SRF=33;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167501;STB=0.609428;STBP=0.343;TYPE=snp;VARB=0.0361952;OID=.;OPOS=136599822;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:90:93:93:77:77:16:16:0.172043:7:9:33:44:7:9:33:44
chr6	136599836	.	G	A	99.43	PASS	AF=0.182796;AO=17;DP=93;FAO=17;FDP=93;FR=.;FRO=76;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=37;FSRR=39;FWDB=-0.0735392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.604;QD=4.2765;RBI=0.0746107;REFB=0.00143134;REVB=-0.0125995;RO=76;SAF=9;SAR=8;SRF=37;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0536462;STB=0.534725;STBP=0.774;TYPE=snp;VARB=-0.0109594;OID=.;OPOS=136599836;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:76:76:17:17:0.182796:8:9:37:39:8:9:37:39
chr6	136599842	.	G	A	92.31	PASS	AF=0.183908;AO=16;DP=87;FAO=16;FDP=87;FR=.;FRO=71;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=36;FSRR=35;FWDB=-0.0705849;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.321;QD=4.2443;RBI=0.0715403;REFB=-0.0115609;REVB=-0.0116522;RO=71;SAF=8;SAR=8;SRF=36;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00885733;STB=0.50574;STBP=0.95;TYPE=snp;VARB=0.0434828;OID=.;OPOS=136599842;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:87:87:71:71:16:16:0.183908:8:8:36:35:8:8:36:35
chr6	136664997	.	T	A	307.02	PASS	AF=0.485294;AO=33;DP=68;FAO=33;FDP=68;FR=.;FRO=35;FSAF=10;FSAR=23;FSRF=27;FSRR=8;FWDB=-0.0240366;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=253.925;QD=18.0598;RBI=0.0241649;REFB=-0.0112429;REVB=0.00248666;RO=34;SAF=10;SAR=23;SRF=26;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.409079;STB=0.732853;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00466026;OID=.;OPOS=136664997;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:34:35:33:33:0.485294:23:10:26:8:23:10:27:8
chr6	136682172	.	G	A	750.28	PASS	AF=1;AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0230424;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.5793;QD=63.8535;RBI=0.0546874;REFB=0;REVB=0.0495959;RO=0;SAF=33;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000421437;OID=.;OPOS=136682172;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:47:0:0:47:47:1:14:33:0:0:14:33:0:0
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chr6	138753337	.	C	T	161.51	PASS	AF=0.5;AO=17;DP=34;FAO=17;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=-0.0135988;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.637;QD=19.0005;RBI=0.0143692;REFB=-0.0107002;REVB=0.00464194;RO=17;SAF=12;SAR=5;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0111835;OID=.;OPOS=138753337;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:17:17:17:17:0.5:5:12:12:5:5:12:12:5
chr6	138754323	.	A	G	467.97	PASS	AF=0.480769;AO=50;DP=104;FAO=50;FDP=104;FR=.;FRO=54;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=35;FSRR=19;FWDB=-0.0136733;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.807;QD=17.9989;RBI=0.0163713;REFB=-0.00683639;REVB=-0.00900335;RO=53;SAF=24;SAR=26;SRF=34;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149315;STB=0.586806;STBP=0.11;TYPE=snp;VARB=0.0102056;OID=.;OPOS=138754323;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:104:53:54:50:50:0.480769:26:24:34:19:26:24:35:19
chr6	139013188	.	C	T	354.51	PASS	AF=0.452381;AO=36;DP=82;FAO=38;FDP=84;FR=.;FRO=46;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=27;FSRR=19;FWDB=-0.00492401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=312.243;QD=16.8815;RBI=0.0131032;REFB=-0.00427954;REVB=0.0121428;RO=46;SAF=17;SAR=19;SRF=27;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113979;STB=0.57602;STBP=0.213;TYPE=snp;VARB=0.00575944;OID=.;OPOS=139013188;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:84:46:46:36:38:0.452381:19:17:27:19:21:17:27:19
chr6	139017780	.	G	A	280.8	PASS	AF=0.354839;AO=33;DP=93;FAO=33;FDP=93;FR=.;FRO=60;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=28;FSRR=32;FWDB=0.00226859;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.033;QD=12.0775;RBI=0.0136693;REFB=0.0180207;REVB=0.0134797;RO=60;SAF=19;SAR=14;SRF=28;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122294;STB=0.570453;STBP=0.334;TYPE=snp;VARB=-0.0285096;OID=.;OPOS=139017780;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:60:60:33:33:0.354839:14:19:28:32:14:19:28:32
chr6	139017815	.	A	G	1310.65	PASS	AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0334185;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.006;QD=61.6774;RBI=0.0580221;REFB=0;REVB=-0.0474318;RO=0;SAF=36;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.85325e-05;OID=.;OPOS=139017815;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:49:36:0:0:49:36:0:0
chr6	139094629	.	C	CG,CGG	36.25	PASS	AF=0.125,0.166667;AO=6,9;DP=49;FAO=6,8;FDP=48;FR=.;FRO=34;FSAF=3,7;FSAR=3,1;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=-0.305352,-0.157836;FXX=0;HRUN=8,8;LEN=1,2;MLLD=6.52649,12.1265;QD=3.02081;RBI=0.462489,0.24153;REFB=-0.0689395,-0.0355744;REVB=0.347356,0.182824;RO=32;SAF=3,8;SAR=3,1;SRF=18;SRR=14;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0744072,0.478346;STB=0.524917,0.825473;STBP=0.925,0.069;TYPE=ins,ins;VARB=-0.176216,0.0944549;OID=.,.;OPOS=139094630,139094630;OREF=-,-;OALT=G,GG;OMAPALT=CG,CGG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0.125,0.166667:6,9:49:6,8:48:34:3,7:3,1:18:16:12:32:3,8:3,1:18:14
chr6	139097232	.	C	T	209.73	PASS	AF=0.466667;AO=21;DP=45;FAO=21;FDP=45;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.00347759;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=277.493;QD=18.6423;RBI=0.0127589;REFB=-0.00772527;REVB=-0.0122759;RO=24;SAF=9;SAR=12;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0114428;STB=0.506487;STBP=0.946;TYPE=snp;VARB=0.00988823;OID=.;OPOS=139097232;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:24:24:21:21:0.466667:12:9:10:14:12:9:10:14
chr6	139487836	.	T	C	212.94	PASS	AF=0.488372;AO=21;DP=43;FAO=21;FDP=43;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.0422047;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.2739;QD=19.8087;RBI=0.0473847;REFB=-0.0265911;REVB=-0.0215423;RO=22;SAF=10;SAR=11;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0196547;STB=0.511101;STBP=0.898;TYPE=snp;VARB=0.0266425;OID=.;OPOS=139487836;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:22:22:21:21:0.488372:11:10:10:12:11:10:10:12
chr6	139498628	.	A	G	350.03	PASS	AF=0.398058;AO=41;DP=103;FAO=41;FDP=103;FR=.;FRO=62;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=30;FSRR=32;FWDB=-0.00139351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.227;QD=13.5934;RBI=0.00788853;REFB=0.00841247;REVB=0.00776447;RO=62;SAF=19;SAR=22;SRF=30;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0217914;STB=0.512351;STBP=0.838;TYPE=snp;VARB=-0.0116491;OID=.;OPOS=139498628;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:103:62:62:41:41:0.398058:22:19:30:32:22:19:30:32
chr6	141004964	.	G	GT,T	2246.34	PASS	AF=0.9125,0.0875;AO=128,16;DP=176;FAO=146,14;FDP=160;FR=.;FRO=0;FSAF=54,14;FSAR=92,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0371147,-0.0643103;FXX=0.0123449;HRUN=0,2;LEN=1,1;MLLD=43.9052,26.7061;QD=56.1586;RBI=0.0371187,0.0651621;REFB=0,0;REVB=0.000541959,0.0105018;RO=18;SAF=39,16;SAR=89,0;SRF=7;SRR=11;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0229216,0.835406;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=-0.000196246,0.0343991;OID=.,.;OPOS=141004965,141004964;OREF=-,G;OALT=T,T;OMAPALT=GT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:20:176:160:18:0:128,16:146,14:0.9125,0.0875:89,0:39,16:7:11:92,0:54,14:0:0
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chr6	142688811	.	C	T	583.22	PASS	AF=0.417722;AO=66;DP=159;FAO=66;FDP=158;FR=.;FRO=92;FSAF=39;FSAR=27;FSRF=44;FSRR=48;FWDB=-0.0214208;FXX=0.00628891;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.224;QD=14.7652;RBI=0.022249;REFB=-0.0155665;REVB=0.00601392;RO=92;SAF=39;SAR=27;SRF=44;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118007;STB=0.566182;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.0147268;OID=.;OPOS=142688811;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:159:158:92:92:66:66:0.417722:27:39:44:48:27:39:44:48
chr6	142688827	.	C	T	574.48	PASS	AF=0.432624;AO=60;DP=142;FAO=61;FDP=141;FR=.;FRO=80;FSAF=40;FSAR=21;FSRF=35;FSRR=45;FWDB=0.0211979;FXX=0.013985;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.36;QD=16.2972;RBI=0.022006;REFB=-0.00378209;REVB=-0.00590901;RO=80;SAF=39;SAR=21;SRF=35;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.220354;STB=0.626292;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.00913589;OID=.;OPOS=142688827;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:142:141:80:80:60:61:0.432624:21:39:35:45:21:40:35:45
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chr6	142718802	.	G	A	30.54	PASS	AF=0.101266;AO=3;DP=76;FAO=8;FDP=79;FR=.;FRO=71;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=34;FSRR=37;FWDB=-0.000553207;FXX=0.0124984;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.851;QD=1.54647;RBI=0.00134019;REFB=-0.000956169;REVB=0.00122068;RO=73;SAF=3;SAR=0;SRF=34;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.419607;STB=0.51894;STBP=0.943;TYPE=snp;VARB=0.0575115;OID=.;OPOS=142718802;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:76:79:73:71:3:8:0.101266:0:3:34:39:4:4:34:37
chr6	142758631	.	A	G	803.7	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0154831;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.7277;QD=64.2959;RBI=0.0644102;REFB=0;REVB=-0.0625216;RO=0;SAF=29;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.20481e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000390374;OID=.;OPOS=142758631;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:21:29:0:0:21:29:0:0
chr6	143074700	.	T	C	329.02	PASS	AF=0.523077;AO=34;DP=67;FAO=34;FDP=65;FR=.;FRO=31;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=-0.0101211;FXX=0.0298463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.1413;QD=20.2475;RBI=0.0146446;REFB=-0.00567838;REVB=0.0105844;RO=31;SAF=16;SAR=18;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0667685;STB=0.537049;STBP=0.547;TYPE=snp;VARB=0.00266374;OID=.;OPOS=143074700;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:65:31:31:34:34:0.523077:18:16:17:14:18:16:17:14
chr6	143090734	.	T	C	362.57	PASS	AF=0.475;AO=38;DP=80;FAO=38;FDP=80;FR=.;FRO=42;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=22;FWDB=0.0273201;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.526;QD=18.1287;RBI=0.0371817;REFB=-0.0120073;REVB=-0.0252208;RO=41;SAF=22;SAR=16;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0855908;STB=0.554348;STBP=0.373;TYPE=snp;VARB=0.0101789;OID=.;OPOS=143090734;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:41:42:38:38:0.475:16:22:20:21:16:22:20:22
chr6	143091263	.	A	G	689.38	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00458779;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.257;QD=62.6711;RBI=0.0245809;REFB=0;REVB=0.024149;RO=0;SAF=19;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.95416e-05;OID=.;OPOS=143091263;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:25:19:0:0:25:19:0:0
chr6	143091769	.	G	A	207.93	PASS	AF=0.403226;AO=25;DP=61;FAO=25;FDP=62;FR=.;FRO=37;FSAF=19;FSAR=6;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=0.0339907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.392;QD=13.4148;RBI=0.0562186;REFB=-0.00438786;REVB=-0.0447791;RO=36;SAF=19;SAR=6;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.325173;STB=0.695608;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.00648915;OID=.;OPOS=143091769;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:62:36:37:25:25:0.403226:6:19:17:19:6:19:17:20
chr6	143092442	.	G	A	365.8	PASS	AF=0.475;AO=38;DP=76;FAO=38;FDP=80;FR=.;FRO=42;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=27;FWDB=-0.016425;FXX=0.0123442;HRUN=5;LEN=1;MLLD=218.151;QD=18.2899;RBI=0.0255746;REFB=-0.0175718;REVB=0.0196031;RO=38;SAF=23;SAR=15;SRF=11;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.278703;STB=0.628839;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.0240787;OID=.;OPOS=143092442;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:80:38:42:38:38:0.475:15:23:11:27:15:23:15:27
chr6	143382110	.	T	C	1588.12	PASS	AF=0.527778;AO=152;DP=286;FAO=152;FDP=288;FR=.;FRO=136;FSAF=78;FSAR=74;FSRF=73;FSRR=63;FWDB=-0.0446777;FXX=0.00346009;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.2105;QD=22.0572;RBI=0.0665863;REFB=-0.0190622;REVB=-0.0493724;RO=133;SAF=78;SAR=74;SRF=72;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0241653;STB=0.51116;STBP=0.678;TYPE=snp;VARB=0.0169238;OID=.;OPOS=143382110;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:286:288:133:136:152:152:0.527778:74:78:72:61:74:78:73:63
chr6	143745915	.	A	G	1320.75	PASS	AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0127562;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.1532;QD=62.153;RBI=0.0128241;REFB=0;REVB=-0.00131823;RO=0;SAF=25;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.47492e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000110003;OID=.;OPOS=143745915;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:60:25:0:0:60:25:0:0
chr6	143792675	.	T	C	71.08	PASS	AF=0.263158;AO=10;DP=38;FAO=10;FDP=38;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=19;FWDB=0.00584846;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=163.109;QD=7.48208;RBI=0.0274635;REFB=-0.000533061;REVB=-0.0268335;RO=28;SAF=6;SAR=4;SRF=9;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.320084;STB=0.696608;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=0.00234484;OID=.;OPOS=143792675;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:71:38:38:28:28:10:10:0.263158:4:6:9:19:4:6:9:19
chr6	143816859	.	C	T	952.92	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0135807;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.374;QD=58.6411;RBI=0.0138527;REFB=0;REVB=0.00273169;RO=0;SAF=31;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.90682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.49737e-05;OID=.;OPOS=143816859;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:34:31:0:0:34:31:0:0
chr6	143823112	.	G	A	382.31	PASS	AF=0.425743;AO=43;DP=101;FAO=43;FDP=101;FR=.;FRO=58;FSAF=27;FSAR=16;FSRF=30;FSRR=28;FWDB=0.00711543;FXX=0.00980296;HRUN=3;LEN=1;MLLD=189.847;QD=15.1408;RBI=0.0113919;REFB=-0.000287443;REVB=0.00889642;RO=58;SAF=27;SAR=16;SRF=30;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116538;STB=0.565683;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=0.000312681;OID=.;OPOS=143823112;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:101:58:58:43:43:0.425743:16:27:30:28:16:27:30:28
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chr6	144537771	.	T	C	261.99	PASS	AF=0.422535;AO=30;DP=71;FAO=30;FDP=71;FR=.;FRO=41;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=13;FSRR=28;FWDB=0.00457418;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=147.53;QD=14.7598;RBI=0.0059447;REFB=-0.00115052;REVB=0.00379688;RO=41;SAF=9;SAR=21;SRF=13;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0204784;STB=0.51162;STBP=0.91;TYPE=snp;VARB=0.0014033;OID=.;OPOS=144537771;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:41:41:30:30:0.422535:21:9:13:28:21:9:13:28
chr6	144758799	.	A	G	226.4	PASS	AF=0.471698;AO=25;DP=53;FAO=25;FDP=53;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=8;FWDB=0.00991288;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2728;QD=17.0868;RBI=0.0264148;REFB=-0.00849173;REVB=-0.0244842;RO=28;SAF=10;SAR=15;SRF=20;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.288134;STB=0.661641;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=0.00925476;OID=.;OPOS=144758799;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:28:28:25:25:0.471698:15:10:20:8:15:10:20:8
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chr6	146125793	.	A	T	98.54	PASS	AF=0.428571;AO=12;DP=28;FAO=12;FDP=28;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.00673495;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.1345;QD=14.0778;RBI=0.0218304;REFB=0.0388464;REVB=0.0207655;RO=16;SAF=9;SAR=3;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.270626;STB=0.659715;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=-0.0495059;OID=.;OPOS=146125793;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:28:28:16:16:12:12:0.428571:3:9:8:8:3:9:8:8
chr6	146126419	.	C	T	77.29	PASS	AF=0.434783;AO=10;DP=23;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=-0.018565;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=298.319;QD=13.4417;RBI=0.0200676;REFB=0.00066561;REVB=0.00761898;RO=12;SAF=3;SAR=7;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.340037;STB=0.717521;STBP=0.107;TYPE=snp;VARB=-0.00117329;OID=.;OPOS=146126419;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:23:23:12:13:10:10:0.434783:7:3:8:4:7:3:9:4
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chr6	146234644	.	G	A	165.66	PASS	AF=0.362069;AO=21;DP=58;FAO=21;FDP=58;FR=.;FRO=37;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=24;FWDB=-0.0208739;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.0686;QD=11.4247;RBI=0.0220326;REFB=-0.0263934;REVB=-0.00705076;RO=37;SAF=12;SAR=9;SRF=13;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.237897;STB=0.637555;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=0.0437639;OID=.;OPOS=146234644;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:37:37:21:21:0.362069:9:12:13:24:9:12:13:24
chr6	146264480	.	C	T	180.02	PASS	AF=0.5625;AO=17;DP=30;FAO=18;FDP=32;FR=.;FRO=14;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=-0.00219481;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.307;QD=22.5029;RBI=0.11285;REFB=-0.00195155;REVB=0.112829;RO=12;SAF=11;SAR=6;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0857078;STB=0.51469;STBP=0.857;TYPE=snp;VARB=0.00234101;OID=.;OPOS=146264480;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:32:12:14:17:18:0.5625:6:11:9:3:7:11:9:5
chr6	147049868	.	G	A	404.3	PASS	AF=1;AO=28;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0348273;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.99;QD=55.766;RBI=0.0736523;REFB=0;REVB=-0.0648978;RO=0;SAF=11;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.31638e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.77742e-05;OID=.;OPOS=147049868;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:28:29:1:17:11:0:0:17:12:0:0
chr6	147136212	.	A	T	1387.92	PASS	AF=0.968421;AO=91;DP=95;FAO=92;FDP=95;FR=.;FRO=3;FSAF=37;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0179046;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.601;QD=58.4387;RBI=0.0179483;REFB=0.0225459;REVB=-0.00125251;RO=4;SAF=36;SAR=55;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0121707;STB=0.513271;STBP=0.207;TYPE=snp;VARB=-0.00173296;OID=.;OPOS=147136212;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:95:95:4:3:91:92:0.968421:55:36:1:3:55:37:0:3
chr6	147136244	.	A	G	1099.3	PASS	AF=1;AO=73;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0842336;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.4716;QD=59.4215;RBI=0.0864674;REFB=0;REVB=-0.0195269;RO=1;SAF=24;SAR=49;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0192984;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000666162;OID=.;OPOS=147136244;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:1:0:73:74:1:49:24:1:0:49:25:0:0
chr6	147635385	.	C	G	957.99	PASS	AF=1;AO=64;DP=66;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0107978;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.455;QD=58.9535;RBI=0.0180257;REFB=0;REVB=-0.0144337;RO=0;SAF=30;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.70659e-06;OID=.;OPOS=147635385;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:65:0:0:64:65:1:34:30:0:0:34:31:0:0
chr6	147635413	.	A	G	1062.42	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00828452;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.337;QD=59.8548;RBI=0.0128406;REFB=0;REVB=0.00981063;RO=0;SAF=38;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.68841e-05;OID=.;OPOS=147635413;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:33:38:0:0:33:38:0:0
chr6	147680359	.	A	G	1339.74	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0249153;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.2246;QD=62.3134;RBI=0.0249402;REFB=0;REVB=-0.00111441;RO=0;SAF=42;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00014504;OID=.;OPOS=147680359;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:44:42:0:0:44:42:0:0
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chr6	147886107	.	C	G	414.82	PASS	AF=0.434343;AO=43;DP=99;FAO=43;FDP=99;FR=.;FRO=56;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=28;FSRR=28;FWDB=0.0119771;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.3469;QD=16.7602;RBI=0.0238488;REFB=-0.0365911;REVB=-0.0206232;RO=56;SAF=21;SAR=22;SRF=28;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0117111;STB=0.506576;STBP=0.876;TYPE=snp;VARB=0.0407124;OID=.;OPOS=147886107;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:56:56:43:43:0.434343:22:21:28:28:22:21:28:28
chr6	148854984	.	G	A	302.7	PASS	AF=0.452055;AO=33;DP=73;FAO=33;FDP=73;FR=.;FRO=40;FSAF=22;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=28;FWDB=-0.00436856;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.432;QD=16.5861;RBI=0.0103851;REFB=0.00591148;REVB=0.00942159;RO=40;SAF=22;SAR=11;SRF=12;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.350257;STB=0.696313;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=-0.00448124;OID=.;OPOS=148854984;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:40:40:33:33:0.452055:11:22:12:28:11:22:12:28
chr6	148865257	.	A	G	109.26	PASS	AF=0.419355;AO=13;DP=31;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.0103195;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.133;QD=14.0974;RBI=0.0110652;REFB=-0.00958317;REVB=0.00399339;RO=18;SAF=8;SAR=5;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117074;STB=0.568421;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=0.0272663;OID=.;OPOS=148865257;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:18:18:13:13:0.419355:5:8:9:9:5:8:9:9
chr6	149700491	.	G	A	245.68	PASS	AF=0.482143;AO=27;DP=56;FAO=27;FDP=56;FR=.;FRO=29;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=-0.0680163;FXX=0.0175408;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.04;QD=17.5484;RBI=0.0680294;REFB=-0.00671389;REVB=-0.00133548;RO=29;SAF=15;SAR=12;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00357308;STB=0.502007;STBP=0.978;TYPE=snp;VARB=0.01485;OID=.;OPOS=149700491;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:29:29:27:27:0.482143:12:15:16:13:12:15:16:13
chr6	149721690	.	G	A	150.11	PASS	AF=0.516129;AO=16;DP=31;FAO=16;FDP=31;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=-0.00437714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.853;QD=19.3684;RBI=0.0250548;REFB=0.00817834;REVB=-0.0246695;RO=15;SAF=9;SAR=7;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.193237;STB=0.609428;STBP=0.215;TYPE=snp;VARB=-0.00905178;OID=.;OPOS=149721690;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:15:15:16:16:0.516129:7:9:5:10:7:9:5:10
chr6	149721965	.	T	C	261.21	PASS	AF=0.518519;AO=28;DP=54;FAO=28;FDP=54;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=0.0516217;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=45.9116;QD=19.3492;RBI=0.058942;REFB=-0.00666616;REVB=0.0284493;RO=26;SAF=9;SAR=19;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0963598;STB=0.553896;STBP=0.456;TYPE=snp;VARB=0.00837177;OID=.;OPOS=149721965;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:26:26:28:28:0.518519:19:9:11:15:19:9:11:15
chr6	149722040	.	A	G	435.7	PASS	AF=0.96875;AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0635776;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.298;QD=54.4631;RBI=0.0693624;REFB=-0.014307;REVB=-0.0277315;RO=1;SAF=15;SAR=16;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0282674;STB=0.515142;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.000376437;OID=.;OPOS=149722040;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:32:32:1:1:31:31:0.96875:16:15:0:1:16:15:0:1
chr6	149730846	.	G	A	321.15	PASS	AF=0.5;AO=34;DP=68;FAO=34;FDP=68;FR=.;FRO=34;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=24;FWDB=-0.0103812;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.2046;QD=18.8913;RBI=0.0103812;REFB=-0.0130577;REVB=-6.15352e-07;RO=34;SAF=21;SAR=13;SRF=10;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.285185;STB=0.658384;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0220201;OID=.;OPOS=149730846;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:34:34:34:34:0.5:13:21:10:24:13:21:10:24
chr6	149953981	.	C	T	1227.51	PASS	AF=1;AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00930794;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=270.483;QD=61.3756;RBI=0.0119738;REFB=0;REVB=0.00753217;RO=0;SAF=41;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.47644e-06;OID=.;OPOS=149953981;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:80:80:0:0:80:80:1:39:41:0:0:39:41:0:0
chr6	149983216	.	G	A	464.74	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0288159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.536;QD=58.0927;RBI=0.0292507;REFB=0;REVB=-0.00502488;RO=0;SAF=19;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000302134;OID=.;OPOS=149983216;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:13:19:0:0:13:19:0:0
chr6	150004779	.	A	G	670.26	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0146982;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.02;QD=62.3501;RBI=0.0150357;REFB=0;REVB=-0.00316779;RO=0;SAF=17;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.75441e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.59758e-05;OID=.;OPOS=150004779;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:26:17:0:0:26:17:0:0
chr6	150067675	.	A	G	632.23	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00631859;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.756;QD=61.6805;RBI=0.00681187;REFB=0;REVB=-0.002545;RO=0;SAF=21;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.68792e-05;OID=.;OPOS=150067675;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:20:21:0:0:20:21:0:0
chr6	150093678	.	C	T	499.3	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00168752;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=304.538;QD=58.7409;RBI=0.00370037;REFB=0;REVB=-0.00329318;RO=0;SAF=13;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.22806e-06;OID=.;OPOS=150093678;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:34:0:0:32:34:1:19:13:0:0:21:13:0:0
chr6	150093682	.	C	T	538.44	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00351195;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.7521;QD=59.8264;RBI=0.0378345;REFB=0;REVB=-0.0376712;RO=0;SAF=15;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000367439;OID=.;OPOS=150093682;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:21:15:0:0:21:15:0:0
chr6	150114745	.	G	A	766.45	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0373364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.277;QD=63.8707;RBI=0.0405216;REFB=0;REVB=0.0157477;RO=0;SAF=17;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000241001;OID=.;OPOS=150114745;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:31:17:0:0:31:17:0:0
chr6	150209717	.	C	G	754.41	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000623064;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.1194;QD=56.9367;RBI=0.00393019;REFB=0;REVB=-0.00388049;RO=0;SAF=31;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.76368e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.6047e-05;OID=.;OPOS=150209717;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:22:31:0:0:22:31:0:0
chr6	150210681	.	G	A	1302.06	PASS	AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000234109;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.533;QD=62.003;RBI=0.00105801;REFB=0;REVB=-0.00103178;RO=0;SAF=42;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.51605e-06;OID=.;OPOS=150210681;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:42:42:0:0:42:42:0:0
chr6	150210685	.	C	T	1302.12	PASS	AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0206565;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.207;QD=62.0057;RBI=0.0397722;REFB=0;REVB=0.0339873;RO=0;SAF=42;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000111494;OID=.;OPOS=150210685;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:42:42:0:0:42:42:0:0
chr6	150211123	.	A	T	1194.22	PASS	AF=1;AO=77;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0218401;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.61;QD=61.2421;RBI=0.0304249;REFB=0;REVB=0.0211821;RO=0;SAF=35;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.42414e-05;OID=.;OPOS=150211123;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:78:0:0:77:78:1:42:35:0:0:43:35:0:0
chr6	150212003	.	C	T	769.82	PASS	AF=1;AO=52;DP=53;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000239969;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.6462;QD=57.0234;RBI=0.00814639;REFB=0;REVB=0.00814285;RO=0;SAF=27;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.06587e-05;OID=.;OPOS=150212003;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:54:0:0:52:54:1:25:27:0:0:26:28:0:0
chr6	150239330	.	C	T	224.41	PASS	AF=0.488889;AO=22;DP=44;FAO=22;FDP=45;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=-0.00773921;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.7802;QD=19.948;RBI=0.0139078;REFB=0.0209972;REVB=-0.0115556;RO=22;SAF=11;SAR=11;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0807409;STB=0.555506;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=-0.0241936;OID=.;OPOS=150239330;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:45:22:23:22:22:0.488889:11:11:13:9:11:11:14:9
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chr6	150290371	.	A	T	719.55	PASS	AF=0.556452;AO=69;DP=124;FAO=69;FDP=124;FR=.;FRO=55;FSAF=34;FSAR=35;FSRF=23;FSRR=32;FWDB=0.0231347;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.6406;QD=23.2114;RBI=0.026715;REFB=-0.0147461;REVB=0.0133595;RO=55;SAF=34;SAR=35;SRF=23;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.060595;STB=0.533105;STBP=0.453;TYPE=snp;VARB=0.00943396;OID=.;OPOS=150290371;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:124:124:55:55:69:69:0.556452:35:34:23:32:35:34:23:32
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chr6	150346532	.	T	C	261.66	PASS	AF=0.418605;AO=18;DP=43;FAO=18;FDP=43;FR=.,HEALED;FRO=18;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.0131791;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.297;QD=24.3401;RBI=0.0132062;REFB=-0.0313514;REVB=0.000846296;RO=18;SAF=7;SAR=11;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0507894;STB=0.528814;STBP=0.751;TYPE=snp;VARB=0.043906;OID=.;OPOS=150346532;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:18:18:18:18:0.418605:11:7:8:10:11:7:8:10
chr6	150385730	.	T	G	1412.13	PASS	AF=1;AO=89;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0178098;FXX=0.0217368;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.275;QD=62.7612;RBI=0.0580175;REFB=0;REVB=0.0552163;RO=0;SAF=50;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000291521;OID=.;OPOS=150385730;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:90:90:0:0:89:90:1:39:50:0:0:40:50:0:0
chr6	150665278	.	A	G	242.95	PASS	AF=0.534884;AO=23;DP=43;FAO=23;FDP=43;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=0.00628131;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=276.674;QD=22.6;RBI=0.00724546;REFB=0.00514066;REVB=-0.00361135;RO=20;SAF=6;SAR=17;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0909417;STB=0.551076;STBP=0.536;TYPE=snp;VARB=-0.00407661;OID=.;OPOS=150665278;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:20:20:23:23:0.534884:17:6:7:13:17:6:7:13
chr6	150716696	.	T	C	632.26	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0165791;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.852;QD=61.6839;RBI=0.0298621;REFB=0;REVB=0.0248371;RO=0;SAF=26;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.17485e-05;OID=.;OPOS=150716696;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:15:26:0:0:15:26:0:0
chr6	150722187	.	T	C	1425.94	PASS	AF=0.98913;AO=91;DP=94;FAO=91;FDP=92;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0225155;FXX=0.0212743;HRUN=3;LEN=1;MLLD=209.141;QD=61.9976;RBI=0.0433123;REFB=0.0216004;REVB=0.0370002;RO=1;SAF=39;SAR=52;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00902916;STB=0.504761;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=1.704e-05;OID=.;OPOS=150722187;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:94:92:1:1:91:91:0.98913:52:39:0:1:52:39:0:1
chr6	151121915	.	G	A	1246.34	PASS	AF=1;AO=80;DP=80;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156405;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.206;QD=61.5476;RBI=0.0243091;REFB=0;REVB=0.0186094;RO=0;SAF=46;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.3274e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.64924e-05;OID=.;OPOS=151121915;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:80:81:0:0:80:81:1:34:46:0:0:34:47:0:0
chr6	151152257	.	A	G	336.63	PASS	AF=0.557377;AO=34;DP=63;FAO=34;FDP=61;FR=.;FRO=27;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=7;FSRR=20;FWDB=-0.0118842;FXX=0.031741;HRUN=4;LEN=1;MLLD=306.014;QD=22.0742;RBI=0.0139018;REFB=-0.00325131;REVB=-0.00721292;RO=27;SAF=14;SAR=20;SRF=7;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129814;STB=0.571388;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=0.00236541;OID=.;OPOS=151152257;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:61:27:27:34:34:0.557377:20:14:7:20:20:14:7:20
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chr6	151669875	.	A	G	162.34	PASS	AF=0.4;AO=17;DP=44;FAO=18;FDP=45;FR=.;FRO=27;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=0.0125303;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=139.574;QD=14.4302;RBI=0.0342851;REFB=0.00220792;REVB=0.0319134;RO=27;SAF=7;SAR=10;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0746002;STB=0.556898;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=-0.00684233;OID=.;OPOS=151669875;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:45:27:27:17:18:0.4:10:7:13:14:11:7:13:14
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chr6	151766552	.	G	A	2338.46	PASS	AF=1;AO=145;DP=148;FAO=146;FDP=146;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=98;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00838739;FXX=0.0201329;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.722;QD=64.0673;RBI=0.0194156;REFB=0;REVB=0.0175105;RO=0;SAF=47;SAR=98;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.14233e-05;OID=.;OPOS=151766552;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:148:146:0:0:145:146:1:98:47:0:0:98:48:0:0
chr6	151859314	.	A	G	121.58	PASS	AF=0.4375;AO=14;DP=32;FAO=14;FDP=32;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.0226806;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.402;QD=15.1969;RBI=0.0307702;REFB=-0.00981229;REVB=0.0207941;RO=17;SAF=7;SAR=7;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0837908;STB=0.531206;STBP=0.785;TYPE=snp;VARB=0.0124739;OID=.;OPOS=151859314;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:17:18:14:14:0.4375:7:7:10:7:7:7:10:8
chr6	151894340	.	C	T	230.88	PASS	AF=0.55;AO=22;DP=40;FAO=22;FDP=40;FR=.;FRO=18;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.000950213;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=290.003;QD=23.0884;RBI=0.00340782;REFB=-0.00717182;REVB=0.00327266;RO=18;SAF=12;SAR=10;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00820253;STB=0.504583;STBP=0.964;TYPE=snp;VARB=0.00436453;OID=.;OPOS=151894340;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:18:18:22:22:0.55:10:12:10:8:10:12:10:8
chr6	151894505	.	T	C	556.14	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00719774;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.9675;QD=60.1228;RBI=0.0919414;REFB=0;REVB=-0.0916592;RO=0;SAF=28;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00197323;OID=.;OPOS=151894505;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:9:28:0:0:9:28:0:0
chr6	151936677	.	G	A	266.56	PASS	AF=0.447761;AO=30;DP=67;FAO=30;FDP=67;FR=.;FRO=37;FSAF=8;FSAR=22;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=-0.0143986;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.475;QD=15.9139;RBI=0.0174317;REFB=0.00194942;REVB=-0.00982568;RO=37;SAF=8;SAR=22;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.238628;STB=0.63546;STBP=0.06;TYPE=snp;VARB=-0.00249974;OID=.;OPOS=151936677;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:37:37:30:30:0.447761:22:8:18:19:22:8:18:19
chr6	151939181	.	G	A	143.3	PASS	AF=0.410256;AO=16;DP=39;FAO=16;FDP=39;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.0279159;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.837;QD=14.6977;RBI=0.0323396;REFB=-0.00604742;REVB=-0.0163264;RO=23;SAF=8;SAR=8;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0221035;STB=0.512805;STBP=0.939;TYPE=snp;VARB=0.00857418;OID=.;OPOS=151939181;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:23:23:16:16:0.410256:8:8:12:11:8:8:12:11
chr6	152129077	.	T	C	966.52	PASS	AF=0.539773;AO=92;DP=174;FAO=95;FDP=176;FR=.;FRO=81;FSAF=48;FSAR=47;FSRF=41;FSRR=40;FWDB=-0.00338892;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.044;QD=21.9665;RBI=0.0203467;REFB=-0.00803225;REVB=-0.0200625;RO=74;SAF=47;SAR=45;SRF=40;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0242773;STB=0.500419;STBP=0.97;TYPE=snp;VARB=0.00794791;OID=.;OPOS=152129077;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:174:176:74:81:92:95:0.539773:45:47:40:34:47:48:41:40
chr6	152201875	.	T	C	1328.75	PASS	AF=1;AO=84;DP=84;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0175766;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.728;QD=61.0918;RBI=0.0175951;REFB=0;REVB=0.000805853;RO=0;SAF=33;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.09613e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000324196;OID=.;OPOS=152201875;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:87:0:0:84:87:1:51:33:0:0:51:36:0:0
chr6	152422335	.	C	T	1197.98	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00280057;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.455;QD=60.6574;RBI=0.0308588;REFB=0;REVB=0.0307314;RO=0;SAF=39;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5078e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.73628e-05;OID=.;OPOS=152422335;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:79:0:0:77:79:1:38:39:0:0:38:41:0:0
chr6	152423905	.	T	A	339.2	PASS	AF=0.413793;AO=36;DP=92;FAO=36;FDP=87;FR=.;FRO=51;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=35;FSRR=16;FWDB=-0.00752087;FXX=0.0842017;HRUN=8;LEN=1;MLLD=259.574;QD=15.5953;RBI=0.0141895;REFB=-0.00520728;REVB=0.0120324;RO=40;SAF=19;SAR=17;SRF=28;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165019;STB=0.594125;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=0.0109046;OID=.;OPOS=152423905;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:87:40:51:36:36:0.413793:17:19:28:12:17:19:35:16
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chr6	152469188	.	C	G	834.4	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0149447;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.2007;QD=57.5447;RBI=0.0374819;REFB=0;REVB=-0.0343737;RO=0;SAF=35;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00058469;OID=.;OPOS=152469188;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:23:35:0:0:23:35:0:0
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chr6	153741613	.	G	C	459.15	PASS	AF=0.55;AO=44;DP=81;FAO=44;FDP=80;FR=.;FRO=36;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=0.0434267;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.9226;QD=22.9576;RBI=0.0520393;REFB=-0.00753845;REVB=0.0286741;RO=36;SAF=23;SAR=21;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0639285;STB=0.535171;STBP=0.495;TYPE=snp;VARB=0.00911962;OID=.;OPOS=153741613;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:80:36:36:44:44:0.55:21:23:16:20:21:23:16:20
chr6	154360797	.	A	G	2053.8	PASS	AF=0.992537;AO=130;DP=132;FAO=133;FDP=134;FR=.;FRO=1;FSAF=66;FSAR=67;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.000994026;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.097;QD=61.3074;RBI=0.0225582;REFB=0.0484955;REVB=-0.0225363;RO=1;SAF=64;SAR=66;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00736821;STB=0.503759;STBP=0.553;TYPE=snp;VARB=5.64734e-07;OID=.;OPOS=154360797;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:132:134:1:1:130:133:0.992537:66:64:1:0:67:66:1:0
chr6	154414446	.	A	T	2585.83	PASS	AF=0.994083;AO=168;DP=169;FAO=168;FDP=169;FR=.;FRO=1;FSAF=87;FSAR=81;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0047623;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.262;QD=61.203;RBI=0.055534;REFB=0.0950245;REVB=-0.0553294;RO=0;SAF=87;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.99687e-08;STB=0.502857;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=-6.77019e-05;OID=.;OPOS=154414446;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:169:169:0:1:168:168:0.994083:81:87:0:0:81:87:1:0
chr6	154414563	.	A	G	816.99	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0271214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.213;QD=57.3326;RBI=0.032018;REFB=0;REVB=0.017017;RO=0;SAF=27;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.87253e-05;OID=.;OPOS=154414563;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:56:57:0:0:56:57:1:29:27:0:0:29:28:0:0
chr6	154414573	.	C	T	682.94	PASS	AF=0.961538;AO=50;DP=52;FAO=50;FDP=52;FR=.;FRO=2;FSAF=23;FSAR=27;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0786671;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.1159;QD=52.534;RBI=0.0786849;REFB=0.0290742;REVB=0.00167037;RO=2;SAF=23;SAR=27;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0391845;STB=0.520825;STBP=0.182;TYPE=snp;VARB=-0.00132753;OID=.;OPOS=154414573;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:52:52:2:2:50:50:0.961538:27:23:2:0:27:23:2:0
chr6	154727408	.	T	C	333.04	PASS	AF=0.548387;AO=34;DP=63;FAO=34;FDP=62;FR=.;FRO=28;FSAF=26;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.00288936;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.859;QD=21.4863;RBI=0.0143861;REFB=-0.0225659;REVB=-0.0140929;RO=28;SAF=26;SAR=8;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.223688;STB=0.624635;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=0.0124353;OID=.;OPOS=154727408;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:62:28:28:34:34:0.548387:8:26:15:13:8:26:15:13
chr6	154771277	.	A	G	871.45	PASS	AF=0.983871;AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0142647;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.7276;QD=56.2225;RBI=0.0200071;REFB=-0.0979932;REVB=0.0140286;RO=1;SAF=32;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0145233;STB=0.50769;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=0.00148351;OID=.;OPOS=154771277;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:62:62:1:1:61:61:0.983871:29:32:1:0:29:32:1:0
chr6	155451352	.	G	A	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00297187;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.717;QD=42.1822;RBI=0.00297939;REFB=0;REVB=0.000211541;RO=0;SAF=7;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.84296e-05;OID=.;OPOS=155451352;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:4:7:0:0:4:7:0:0
chr6	155458565	.	C	T	66.86	PASS	AF=0.428571;AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=0.0250624;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.187;QD=12.7348;RBI=0.0322242;REFB=-0.0158553;REVB=0.0202552;RO=11;SAF=4;SAR=5;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176743;STB=0.624732;STBP=0.38;TYPE=snp;VARB=0.00878604;OID=.;OPOS=155458565;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:21:21:11:12:9:9:0.428571:5:4:7:4:5:4:8:4
chr6	155485554	.	G	A	977.45	PASS	AF=1;AO=66;DP=67;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00466315;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.8413;QD=59.2394;RBI=0.0928319;REFB=0;REVB=-0.0927147;RO=0;SAF=38;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000224637;OID=.;OPOS=155485554;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:66:0:0:66:66:1:28:38:0:0:28:38:0:0
chr6	155561760	.	T	C	1008.46	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0122142;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.083;QD=59.3209;RBI=0.0388037;REFB=0;REVB=0.0368312;RO=0;SAF=29;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.55008e-05;OID=.;OPOS=155561760;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:39:29:0:0:39:29:0:0
chr6	155577823	.	C	T	472.18	PASS	AF=0.970588;AO=33;DP=34;FAO=33;FDP=34;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0148817;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.824;QD=55.5508;RBI=0.0231098;REFB=-0.116214;REVB=0.0176804;RO=1;SAF=10;SAR=23;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0444293;STB=0.523795;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=0.00110358;OID=.;OPOS=155577823;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:34:34:1:1:33:33:0.970588:23:10:1:0:23:10:1:0
chr6	155578599	.	A	T	938.74	PASS	AF=0.985714;AO=63;DP=65;FAO=69;FDP=70;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0282841;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=36.9006;QD=53.6423;RBI=0.0489747;REFB=-0.0770463;REVB=0.0399817;RO=2;SAF=37;SAR=26;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00522397;STB=0.508769;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.00260858;OID=.;OPOS=155578599;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:65:70:2:1:63:69:0.985714:26:37:1:1:28:41:0:1
chr6	155578756	.	A	T	727.03	PASS	AF=0.963636;AO=53;DP=55;FAO=53;FDP=55;FR=.;FRO=2;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00383985;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.261;QD=52.8751;RBI=0.014113;REFB=-0.120902;REVB=-0.0135806;RO=2;SAF=22;SAR=31;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0409165;STB=0.521731;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.00248936;OID=.;OPOS=155578756;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:55:55:2:2:53:53:0.963636:31:22:2:0:31:22:2:0
chr6	155596901	.	T	C,G	730.44	PASS	AF=0.961538,0.0384615;AO=50,2;DP=52;FAO=50,2;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=30,2;FSAR=20,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0236396,-0.0215879;FXX=0.0188644;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=273.393,222.287;QD=56.1878;RBI=0.0246033,0.0238668;REFB=0,0;REVB=0.00681872,0.0101778;RO=0;SAF=30,2;SAR=20,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00144466,0.0440003;OID=.,.;OPOS=155596901,155596901;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:7:52:52:0:0:50,2:50,2:0.961538,0.0384615:20,0:30,2:0:0:20,0:30,2:0:0
chr6	155597147	.	C	T	1396.35	PASS	AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0174363;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.28;QD=62.7575;RBI=0.0174369;REFB=0;REVB=-0.000148501;RO=0;SAF=44;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.21078e-05;OID=.;OPOS=155597147;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:45:44:0:0:45:44:0:0
chr6	155606325	.	C	T	868.27	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0583095;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.217;QD=57.8846;RBI=0.058466;REFB=0;REVB=0.00427492;RO=0;SAF=27;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.7886e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.25279e-05;OID=.;OPOS=155606325;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:33:27:0:0:33:27:0:0
chr6	155750035	.	C	T	742.58	PASS	AF=0.96;AO=48;DP=50;FAO=48;FDP=50;FR=.;FRO=2;FSAF=28;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.040369;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.7174;QD=59.4061;RBI=0.0447209;REFB=-0.0398809;REVB=0.0192431;RO=2;SAF=28;SAR=20;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0064371;STB=0.503423;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=0.0277915;OID=.;OPOS=155750035;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:50:50:2:2:48:48:0.96:20:28:1:1:20:28:1:1
chr6	155761246	.	G	T	97.39	PASS	AF=0.444444;AO=11;DP=26;FAO=12;FDP=27;FR=.;FRO=15;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=-0.00215853;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.77;QD=14.4281;RBI=0.0116166;REFB=-0.0133203;REVB=0.0114142;RO=15;SAF=3;SAR=8;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.330769;STB=0.705523;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.0174319;OID=.;OPOS=155761246;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:26:27:15:15:11:12:0.444444:8:3:9:6:9:3:9:6
chr6	157801040	.	T	A	501.65	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0668559;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.127;QD=59.0176;RBI=0.0676338;REFB=0;REVB=-0.0102284;RO=0;SAF=4;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.59855e-05;OID=.;OPOS=157801040;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:30:4:0:0:30:4:0:0
chr6	157801186	.	G	A	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0115269;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=222.515;QD=49.5992;RBI=0.0222949;REFB=0;REVB=0.0190839;RO=0;SAF=4;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000163741;OID=.;OPOS=157801186;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:14:4:0:0:14:4:0:0
chr6	157801516	.	A	G	1415.43	PASS	AF=1;AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00566443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=313.005;QD=62.9081;RBI=0.0126171;REFB=0;REVB=0.0112741;RO=0;SAF=42;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.29958e-05;OID=.;OPOS=157801516;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:90:90:0:0:90:90:1:48:42:0:0:48:42:0:0
chr6	157963743	.	G	A	362.23	PASS	AF=0.580645;AO=36;DP=62;FAO=36;FDP=62;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=25;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=0.0160685;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.531;QD=23.3695;RBI=0.0162049;REFB=-0.0249192;REVB=0.00209792;RO=26;SAF=11;SAR=25;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131676;STB=0.572667;STBP=0.203;TYPE=snp;VARB=0.0171008;OID=.;OPOS=157963743;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:26:26:36:36:0.580645:25:11:12:14:25:11:12:14
chr6	158497717	.	T	C	175.62	PASS	AF=0.392157;AO=20;DP=51;FAO=20;FDP=51;FR=.;FRO=31;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=-0.00204933;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.8185;QD=13.7738;RBI=0.0124019;REFB=0.0160758;REVB=-0.0122314;RO=31;SAF=11;SAR=9;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0674753;STB=0.538884;STBP=0.659;TYPE=snp;VARB=-0.0318267;OID=.;OPOS=158497717;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:31:31:20:20:0.392157:9:11:19:12:9:11:19:12
chr6	158499302	.	G	T	305.52	PASS	AF=0.414634;AO=34;DP=82;FAO=34;FDP=82;FR=.;FRO=48;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=29;FSRR=19;FWDB=-0.00660669;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.987;QD=14.9032;RBI=0.0223454;REFB=-0.00602478;REVB=0.0213464;RO=47;SAF=20;SAR=14;SRF=28;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00795962;STB=0.509653;STBP=0.906;TYPE=snp;VARB=0.011065;OID=.;OPOS=158499302;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:47:48:34:34:0.414634:14:20:28:19:14:20:29:19
chr6	158505088	.	A	G	275.02	PASS	AF=0.483871;AO=30;DP=63;FAO=30;FDP=62;FR=.;FRO=32;FSAF=7;FSAR=23;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=0.00263269;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.05;QD=17.7431;RBI=0.0129157;REFB=0.00337884;REVB=-0.0126446;RO=33;SAF=7;SAR=23;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.271805;STB=0.659486;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=-0.00373643;OID=.;OPOS=158505088;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:62:33:32:30:30:0.483871:23:7:16:17:23:7:16:16
chr6	158507981	.	G	A	180.95	PASS	AF=0.431818;AO=19;DP=43;FAO=19;FDP=44;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=-0.0513299;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.118;QD=16.4497;RBI=0.05134;REFB=-0.0110029;REVB=0.00101752;RO=22;SAF=7;SAR=12;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.210695;STB=0.652324;STBP=0.103;TYPE=snp;VARB=0.0308256;OID=.;OPOS=158507981;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:44:22:25:19:19:0.431818:12:7:13:9:12:7:16:9
chr6	158509750	.	A	G	200.01	PASS	AF=0.384615;AO=23;DP=63;FAO=25;FDP=65;FR=.;FRO=40;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=24;FWDB=0.0610487;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.7464;QD=12.3083;RBI=0.0669306;REFB=-0.0378191;REVB=-0.0274366;RO=40;SAF=9;SAR=14;SRF=16;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00996773;STB=0.525106;STBP=0.767;TYPE=snp;VARB=0.0813126;OID=.;OPOS=158509750;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:65:40:40:23:25:0.384615:14:9:16:24:14:11:16:24
chr6	158517308	.	A	G	50.47	PASS	AF=0.583333;AO=7;DP=12;FAO=7;FDP=12;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0359788;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.7953;QD=16.8227;RBI=0.0362385;REFB=0.0315618;REVB=-0.00433031;RO=5;SAF=1;SAR=6;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.518377;STB=0.809829;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=-0.019997;OID=.;OPOS=158517308;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:12:12:5:5:7:7:0.583333:6:1:4:1:6:1:4:1
chr6	158571501	.	G	A	231.82	PASS	AF=0.428571;AO=27;DP=63;FAO=27;FDP=63;FR=.;FRO=36;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=21;FSRR=15;FWDB=0.00242157;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.832;QD=14.7186;RBI=0.0133846;REFB=-0.0229478;REVB=-0.0131637;RO=36;SAF=14;SAR=13;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0655511;STB=0.537163;STBP=0.64;TYPE=snp;VARB=0.0110661;OID=.;OPOS=158571501;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:36:36:27:27:0.428571:13:14:21:15:13:14:21:15
chr6	158735087	.	C	T	141.86	PASS	AF=0.333333;AO=17;DP=51;FAO=17;FDP=51;FR=.;FRO=34;FSAF=3;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=22;FWDB=-0.0502698;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.8305;QD=11.1266;RBI=0.0522204;REFB=0.00266301;REVB=-0.0141394;RO=34;SAF=3;SAR=14;SRF=12;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.265631;STB=0.660164;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=-0.00780408;OID=.;OPOS=158735087;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:34:34:17:17:0.333333:14:3:12:22:14:3:12:22
chr6	158735090	.	T	C	137.38	PASS	AF=0.326531;AO=16;DP=49;FAO=16;FDP=49;FR=.;FRO=33;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=-0.0113414;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.737;QD=11.2143;RBI=0.0184732;REFB=-0.00822294;REVB=-0.0145819;RO=33;SAF=3;SAR=13;SRF=12;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.258367;STB=0.656346;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=0.018977;OID=.;OPOS=158735090;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:33:33:16:16:0.326531:13:3:12:21:13:3:12:21
chr6	158870081	.	A	G	769.39	PASS	AF=1;AO=53;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0473674;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.7882;QD=56.9917;RBI=0.0669287;REFB=0;REVB=-0.0472841;RO=1;SAF=30;SAR=23;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154473;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00124503;OID=.;OPOS=158870081;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:1:0:53:54:1:23:30:1:0:23:31:0:0
chr6	158923434	.	G	C	1056.82	PASS	AF=1;AO=70;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0117258;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.6839;QD=59.539;RBI=0.021878;REFB=0;REVB=-0.0184704;RO=0;SAF=34;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.26138e-05;OID=.;OPOS=158923434;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:70:71:1:36:34:0:0:37:34:0:0
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chr6	158927651	.	A	G	669.87	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186585;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.7965;QD=62.3134;RBI=0.0186805;REFB=0;REVB=0.000905995;RO=0;SAF=20;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000133146;OID=.;OPOS=158927651;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:23:20:0:0:23:20:0:0
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chr6	159399348	.	A	G	268.96	PASS	AF=0.648649;AO=24;DP=37;FAO=24;FDP=37;FR=.;FRO=13;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.0402802;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.317;QD=29.0772;RBI=0.0421454;REFB=0.00631046;REVB=-0.0123991;RO=13;SAF=10;SAR=14;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0292365;STB=0.516116;STBP=0.814;TYPE=snp;VARB=-0.0034077;OID=.;OPOS=159399348;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:13:13:24:24:0.648649:14:10:6:7:14:10:6:7
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chr6	159414899	.	T	C	211.22	PASS	AF=0.371429;AO=26;DP=69;FAO=26;FDP=70;FR=.;FRO=44;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=25;FSRR=19;FWDB=-0.0065893;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.877;QD=12.0696;RBI=0.00687989;REFB=-0.0091841;REVB=-0.00197839;RO=43;SAF=9;SAR=17;SRF=25;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.255599;STB=0.640689;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=0.0137363;OID=.;OPOS=159414899;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:70:43:44:26:26:0.371429:17:9:25:18:17:9:25:19
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chr6	159655084	.	C	G	1128.46	PASS	AF=0.415842;AO=125;DP=302;FAO=126;FDP=303;FR=.;FRO=177;FSAF=60;FSAR=66;FSRF=108;FSRR=69;FWDB=-0.0291599;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.7108;QD=14.8972;RBI=0.03339;REFB=-0.0126716;REVB=-0.0162664;RO=173;SAF=60;SAR=65;SRF=105;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131838;STB=0.577849;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0169126;OID=.;OPOS=159655084;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:302:303:173:177:125:126:0.415842:65:60:105:68:66:60:108:69
chr6	159655102	.	A	G	1140.85	PASS	AF=0.413374;AO=112;DP=307;FAO=136;FDP=329;FR=.;FRO=193;FSAF=63;FSAR=73;FSRF=122;FSRR=71;FWDB=-0.00228635;FXX=0.00903587;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.875;QD=13.8706;RBI=0.0225738;REFB=-0.00408244;REVB=0.0224577;RO=163;SAF=51;SAR=61;SRF=99;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160021;STB=0.598161;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.00682879;OID=.;OPOS=159655102;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:307:329:163:193:112:136:0.413374:61:51:99:64:73:63:122:71
chr6	159655383	.	A	G	65.49	PASS	AF=0.666667;AO=8;DP=13;FAO=8;FDP=12;FR=.;FRO=4;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.064127;FXX=0.076864;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.431;QD=21.8287;RBI=0.0930299;REFB=-0.0198515;REVB=-0.0673965;RO=5;SAF=7;SAR=1;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.608654;STB=0.832405;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.0176374;OID=.;OPOS=159655383;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:23:13:12:5:4:8:8:0.666667:1:7:0:5:1:7:0:4
chr6	159655402	.	A	G	81.23	PASS	AF=0.555556;AO=10;DP=18;FAO=10;FDP=18;FR=.;FRO=8;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.00934106;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.869;QD=18.0521;RBI=0.0499656;REFB=-0.0137023;REVB=-0.0490847;RO=7;SAF=9;SAR=1;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.559911;STB=0.850538;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.00294358;OID=.;OPOS=159655402;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:18:18:7:8:10:10:0.555556:1:9:2:5:1:9:2:6
chr6	159660804	.	CC	GG	48.32	PASS	AF=0.388889;AO=7;DP=19;FAO=7;FDP=18;FR=.;FRO=11;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=11;FWDB=0;FXX=0.0526039;HRUN=3;LEN=2;MLLD=242.797;QD=10.7385;RBI=0.00683248;REFB=0.00129122;REVB=-0.00683248;RO=11;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=-0.0020565;OID=.;OPOS=159660804;OREF=CC;OALT=GG;OMAPALT=GG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:48:19:18:11:11:7:7:0.388889:7:0:0:11:7:0:0:11
chr6	159660808	.	C	T	30.23	PASS	AF=0.3125;AO=5;DP=16;FAO=5;FDP=16;FR=.;FRO=11;FSAF=0;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=11;FWDB=0;FXX=0.0587889;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.609;QD=7.55628;RBI=0.0227085;REFB=-0.00831759;REVB=-0.0227085;RO=11;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.01111;OID=.;OPOS=159660808;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:16:16:11:11:5:5:0.3125:5:0:0:11:5:0:0:11
chr6	159670100	.	A	G	72.18	PASS	AF=0.243902;AO=10;DP=43;FAO=10;FDP=41;FR=.;FRO=31;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=-0.02589;FXX=0.0465008;HRUN=2;LEN=1;MLLD=255.277;QD=7.0419;RBI=0.0322659;REFB=-0.0120514;REVB=-0.019256;RO=21;SAF=6;SAR=4;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.290067;STB=0.588058;STBP=0.559;TYPE=snp;VARB=0.0370377;OID=.;OPOS=159670100;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:43:41:21:31:10:10:0.243902:4:6:7:14:4:6:15:16
chr6	159672419	.	G	C	538.35	PASS	AF=0.52381;AO=54;DP=104;FAO=55;FDP=105;FR=.;FRO=50;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=27;FSRR=23;FWDB=0.0369066;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.489;QD=20.5084;RBI=0.0406608;REFB=-0.0229266;REVB=-0.0170645;RO=50;SAF=30;SAR=24;SRF=27;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0137103;STB=0.502617;STBP=0.96;TYPE=snp;VARB=0.0236881;OID=.;OPOS=159672419;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:105:50:50:54:55:0.52381:24:30:27:23:25:30:27:23
chr6	159672542	.	C	T	207.32	PASS	AF=0.588235;AO=20;DP=34;FAO=20;FDP=34;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=13;FWDB=0.0252522;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.369;QD=24.3901;RBI=0.0257521;REFB=-0.0104261;REVB=0.00504906;RO=14;SAF=3;SAR=17;SRF=1;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126112;STB=0.569558;STBP=0.552;TYPE=snp;VARB=0.00972841;OID=.;OPOS=159672542;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:14:14:20:20:0.588235:17:3:1:13:17:3:1:13
chr6	159692405	.	C	T	660.13	PASS	AF=0.4;AO=74;DP=185;FAO=74;FDP=185;FR=.;FRO=111;FSAF=42;FSAR=32;FSRF=64;FSRR=47;FWDB=-0.00506008;FXX=0.00537606;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.491;QD=14.273;RBI=0.00891127;REFB=-0.0101633;REVB=-0.00733528;RO=109;SAF=42;SAR=32;SRF=64;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0212337;STB=0.505513;STBP=0.906;TYPE=snp;VARB=0.0147272;OID=.;OPOS=159692405;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:185:185:109:111:74:74:0.4:32:42:64:45:32:42:64:47
chr6	160114168	.	T	C	207.61	PASS	AF=0.436364;AO=24;DP=55;FAO=24;FDP=55;FR=.;FRO=31;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=-0.0801046;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.2758;QD=15.0992;RBI=0.0874829;REFB=-0.0108402;REVB=-0.0351641;RO=31;SAF=14;SAR=10;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0353606;STB=0.520107;STBP=0.814;TYPE=snp;VARB=0.0105539;OID=.;OPOS=160114168;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:31:31:24:24:0.436364:10:14:17:14:10:14:17:14
chr6	160169258	.	G	T	573.63	PASS	AF=0.577778;AO=52;DP=91;FAO=52;FDP=90;FR=.;FRO=38;FSAF=27;FSAR=25;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=0.0102394;FXX=0.0217368;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.256;QD=25.4947;RBI=0.0152268;REFB=-0.00679657;REVB=-0.0112699;RO=38;SAF=27;SAR=25;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00547708;STB=0.502995;STBP=0.961;TYPE=snp;VARB=0.00552569;OID=.;OPOS=160169258;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:90:38:38:52:52:0.577778:25:27:20:18:25:27:20:18
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chr6	160198359	.	C	T	564.18	PASS	AF=0.607143;AO=51;DP=84;FAO=51;FDP=84;FR=.;FRO=33;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=-0.0457623;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.2903;QD=26.8657;RBI=0.0457777;REFB=0.00873617;REVB=0.0011882;RO=33;SAF=26;SAR=25;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00385398;STB=0.502101;STBP=0.967;TYPE=snp;VARB=-0.0063968;OID=.;OPOS=160198359;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:33:33:51:51:0.607143:25:26:17:16:25:26:17:16
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chr6	160206716	.	T	C	130.03	PASS	AF=0.384615;AO=15;DP=39;FAO=15;FDP=39;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.0082425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.9739;QD=13.3359;RBI=0.0746605;REFB=-0.00183029;REVB=0.0742041;RO=23;SAF=8;SAR=7;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146586;STB=0.571334;STBP=0.478;TYPE=snp;VARB=0.0045304;OID=.;OPOS=160206716;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:23:24:15:15:0.384615:7:8:9:14:7:8:10:14
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chr6	160494409	.	A	G	344.74	PASS	AF=0.5;AO=36;DP=72;FAO=36;FDP=72;FR=.;FRO=36;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=0.0160608;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.483;QD=19.152;RBI=0.0300531;REFB=-0.023554;REVB=0.0254016;RO=36;SAF=19;SAR=17;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0249874;STB=0.513903;STBP=0.79;TYPE=snp;VARB=0.0166438;OID=.;OPOS=160494409;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:36:36:36:36:0.5:17:19:18:18:17:19:18:18
chr6	160505199	.	C	G	613.29	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0480555;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.117;QD=61.3294;RBI=0.0480555;REFB=0;REVB=6.08812e-05;RO=0;SAF=18;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.19993e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000219263;OID=.;OPOS=160505199;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:22:18:0:0:22:18:0:0
chr6	160524773	.	T	A	211.4	PASS	AF=0.65625;AO=18;DP=32;FAO=21;FDP=32;FR=.;FRO=11;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=-0.0461768;FXX=0;HRUN=9;LEN=1;MLLD=29.5323;QD=26.4256;RBI=0.0738919;REFB=0.00161404;REVB=0.0576864;RO=6;SAF=11;SAR=7;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.201418;STB=0.54541;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.00409765;OID=.;OPOS=160524773;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:32:32:6:11:18:21:0.65625:7:11:1:5:7:14:6:5
chr6	160526904	.	TCAAA	T,TCAAC	162.99	PASS	AF=0.355556,0.0444444;AO=16,2;DP=48;FAO=16,2;FDP=45;FR=.;FRO=27;FSAF=6,1;FSAR=10,1;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=-0.00842452,-0.0733196;FXX=0.062487;HRUN=1,3;LEN=4,1;MLLD=230.499,34.8696;QD=14.488;RBI=0.00883013,0.0978065;REFB=-0.00591956,0.0143912;REVB=-0.00264549,0.0647329;RO=26;SAF=6,1;SAR=10,1;SRF=13;SRR=13;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.135342,0;STB=0.5916,0.517071;STBP=0.363,0.872;TYPE=del,snp;VARB=0.0045224,0.0410163;OID=.,.;OPOS=160526905,160526908;OREF=CAAA,A;OALT=-,C;OMAPALT=T,TCAAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.355556,0.0444444:16,2:48:16,2:45:27:6,1:10,1:14:13:99:26:6,1:10,1:13:13
chr6	160543122	.	GTC	G,GC,GCC	379.72	PASS	AF=0,0.392857,0.303571;AO=9,17,16;DP=58;FAO=0,22,17;FDP=56;FR=.;FRO=17;FSAF=0,18,9;FSAR=0,4,8;FSRF=4;FSRR=13;FWDB=-0.217897,-0.0462332,0.171054;FXX=0;HRUN=1,1,1;LEN=2,1,1;MLLD=29.6713,33.591,40.6602;QD=27.1226;RBI=0.222913,0.0586492,0.171077;REFB=-0.0288066,-0.0342838,-0.0075667;REVB=-0.047026,-0.0360862,-0.00285912;RO=16;SAF=9,13,6;SAR=0,4,10;SRF=3;SRR=13;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.830981,0.48661,0.186817;STB=0.5,0.77638,0.644892;STBP=1,0.001,0.121;TYPE=del,del,snp;VARB=0.0553875,0.0571943,0.0207487;OID=.,.,.;OPOS=160543123,160543123,160543123;OREF=TC,T,T;OALT=-,-,C;OMAPALT=G,GC,GCC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,0.392857,0.303571:9,17,16:58:0,22,17:56:17:0,18,9:0,4,8:4:13:99:16:9,13,6:0,4,10:3:13
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chr6	161139480	.	C	T	158.96	PASS	AF=0.297297;AO=21;DP=73;FAO=22;FDP=74;FR=.;FRO=52;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=25;FSRR=27;FWDB=0.0470977;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=45.9647;QD=8.59217;RBI=0.0577341;REFB=-0.00412415;REVB=0.033392;RO=52;SAF=10;SAR=11;SRF=25;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00546276;STB=0.513501;STBP=0.878;TYPE=snp;VARB=0.0132431;OID=.;OPOS=161139480;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:74:52:52:21:22:0.297297:11:10:25:27:11:11:25:27
chr6	161173946	.	T	G	2284.59	PASS	AF=1;AO=146;DP=147;FAO=151;FDP=151;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00376554;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.65;QD=60.5188;RBI=0.00887621;REFB=0;REVB=0.0080379;RO=0;SAF=81;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.00316e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.40199e-05;OID=.;OPOS=161173946;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:147:151:0:0:146:151:1:65:81:0:0:68:83:0:0
chr6	161469774	.	G	A	579.46	PASS	AF=1;AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0104422;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.404;QD=60.9956;RBI=0.0107918;REFB=0;REVB=0.00272446;RO=0;SAF=21;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.53998e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.39426e-05;OID=.;OPOS=161469774;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:38:0:0:38:38:1:17:21:0:0:17:21:0:0
chr6	161538250	.	G	A	2403.2	PASS	AF=1;AO=157;DP=157;FAO=157;FDP=157;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00746572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.618;QD=61.228;RBI=0.0364279;REFB=0;REVB=0.0356546;RO=0;SAF=70;SAR=87;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.30895e-05;OID=.;OPOS=161538250;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:157:157:0:0:157:157:1:87:70:0:0:87:70:0:0
chr6	161790964	.	C	T	439.4	PASS	AF=0.483516;AO=43;DP=90;FAO=44;FDP=91;FR=.;FRO=47;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=16;FSRR=31;FWDB=0.00327438;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.707;QD=19.3143;RBI=0.00890909;REFB=-0.0116863;REVB=-0.00828555;RO=47;SAF=21;SAR=22;SRF=16;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139682;STB=0.582381;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=0.0119975;OID=.;OPOS=161790964;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:91:47:47:43:44:0.483516:22:21:16:31:22:22:16:31
chr6	161807855	.	C	G	716.28	PASS	AF=0.493056;AO=65;DP=139;FAO=71;FDP=144;FR=.;FRO=73;FSAF=45;FSAR=26;FSRF=46;FSRR=27;FWDB=-0.00393596;FXX=0.00689608;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.111;QD=19.8967;RBI=0.0155504;REFB=-0.0193637;REVB=0.015044;RO=72;SAF=45;SAR=20;SRF=45;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0724153;STB=0.501999;STBP=0.962;TYPE=snp;VARB=0.0204993;OID=.;OPOS=161807855;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:139:144:72:73:65:71:0.493056:20:45:45:27:26:45:46:27
chr6	162622197	.	C	T	125.45	PASS	AF=0.303571;AO=17;DP=56;FAO=17;FDP=56;FR=.;FRO=39;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=23;FWDB=-0.0362837;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.967;QD=8.96062;RBI=0.0373579;REFB=-0.0131444;REVB=-0.00889395;RO=39;SAF=10;SAR=7;SRF=16;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.205143;STB=0.622265;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=0.0334073;OID=.;OPOS=162622197;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:39:39:17:17:0.303571:7:10:16:23:7:10:16:23
chr6	163587146	.	C	G	1814.62	PASS	AF=1;AO=118;DP=118;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00153245;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.592;QD=60.9956;RBI=0.0436396;REFB=0;REVB=0.0436127;RO=0;SAF=71;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.14664e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.46775e-05;OID=.;OPOS=163587146;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:118:119:0:0:118:119:1:47:71:0:0:48:71:0:0
chr6	163612783	.	C	A	157.86	PASS	AF=0.5;AO=17;DP=34;FAO=17;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=0.113235;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=46.8825;QD=18.5717;RBI=0.113682;REFB=-0.0336056;REVB=0.0100732;RO=16;SAF=11;SAR=6;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.331936;STB=0.673269;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.0658666;OID=.;OPOS=163612783;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:16:17:17:17:0.5:6:11:4:12:6:11:5:12
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chr6	166307718	.	T	C	591.43	PASS	AF=0.556701;AO=54;DP=97;FAO=54;FDP=97;FR=.;FRO=43;FSAF=32;FSAR=22;FSRF=27;FSRR=16;FWDB=0.00913478;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.315;QD=24.3889;RBI=0.0126031;REFB=-0.00360697;REVB=0.00868292;RO=43;SAF=32;SAR=22;SRF=27;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0297606;STB=0.516303;STBP=0.757;TYPE=snp;VARB=0.00312052;OID=.;OPOS=166307718;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:43:43:54:54:0.556701:22:32:27:16:22:32:27:16
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chr6	166571157	.	G	A	293.03	PASS	AF=0.58;AO=28;DP=52;FAO=29;FDP=50;FR=.;FRO=21;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.0166129;FXX=0.0384541;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.181;QD=23.4426;RBI=0.0188949;REFB=-0.0241671;REVB=0.0090016;RO=21;SAF=14;SAR=14;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0552766;STB=0.502761;STBP=0.965;TYPE=snp;VARB=0.0111922;OID=.;OPOS=166571157;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:50:21:21:28:29:0.58:14:14:12:9:14:15:11:10
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chr6	166572005	.	T	C	121.07	PASS	AF=0.4;AO=14;DP=35;FAO=14;FDP=35;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=-0.00850905;FXX=0.0277701;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.789;QD=13.8369;RBI=0.0456964;REFB=-0.0262847;REVB=-0.0448972;RO=21;SAF=7;SAR=7;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122488;STB=0.571329;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.0249134;OID=.;OPOS=166572005;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:21:21:14:14:0.4:7:7:8:13:7:7:8:13
chr6	166572045	.	C	T	181.5	PASS	AF=0.6;AO=18;DP=30;FAO=18;FDP=30;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.00838978;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.448;QD=24.2006;RBI=0.0137352;REFB=-0.0421669;REVB=-0.0108751;RO=12;SAF=5;SAR=13;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179199;STB=0.600722;STBP=0.231;TYPE=snp;VARB=0.0285169;OID=.;OPOS=166572045;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:30:30:12:12:18:18:0.6:13:5:6:6:13:5:6:6
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chr6	166739684	.	G	A,T	184.99	PASS	AF=0.875,0.125;AO=13,2;DP=15;FAO=14,2;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=7,1;FSAR=7,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0692845,0.095033;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=134.396,86.8829;QD=46.2467;RBI=0.0775574,0.101072;REFB=0,0;REVB=0.0348543,0.0344125;RO=0;SAF=7,1;SAR=6,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00735693,0.0501022;OID=.,.;OPOS=166739684,166739684;OREF=G,G;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:15:16:0:0:13,2:14,2:0.875,0.125:6,1:7,1:0:0:7,1:7,1:0:0
chr6	166755975	.	T	C	784.26	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0341945;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.165;QD=57.0368;RBI=0.0341953;REFB=0;REVB=-0.000229976;RO=0;SAF=32;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.64875e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.22593e-05;OID=.;OPOS=166755975;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:55:0:0:54:55:1:22:32:0:0:22:33:0:0
chr6	166755979	.	A	C	753.99	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0111188;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.023;QD=56.905;RBI=0.0115052;REFB=0;REVB=0.00295663;RO=0;SAF=32;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.81969e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.16281e-05;OID=.;OPOS=166755979;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:21:32:0:0:21:32:0:0
chr6	166778679	.	T	G	885.33	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0184078;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.2303;QD=58.0542;RBI=0.0493674;REFB=0;REVB=0.0458071;RO=0;SAF=32;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000296027;OID=.;OPOS=166778679;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:29:32:0:0:29:32:0:0
chr6	166826255	.	G	A	68.82	PASS	AF=0.5;AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.0176365;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.809;QD=15.293;RBI=0.0335885;REFB=-0.0114151;REVB=-0.0285856;RO=9;SAF=7;SAR=2;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.319819;STB=0.689682;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=0.00902135;OID=.;OPOS=166826255;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:18:18:9:9:9:9:0.5:2:7:4:5:2:7:4:5
chr6	166826304	.	T	C	77.25	PASS	AF=0.434783;AO=10;DP=23;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.0204955;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.301;QD=13.4353;RBI=0.0299319;REFB=-0.0312774;REVB=-0.021814;RO=12;SAF=8;SAR=2;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.252837;STB=0.636061;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=0.0328364;OID=.;OPOS=166826304;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:23:23:12:13:10:10:0.434783:2:8:7:5:2:8:8:5
chr6	166864693	.	G	A	180.48	PASS	AF=0.404255;AO=19;DP=48;FAO=19;FDP=47;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=0.0455388;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.656;QD=15.3597;RBI=0.0455998;REFB=-0.00960531;REVB=-0.00235733;RO=27;SAF=6;SAR=13;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.216105;STB=0.615987;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=0.0150043;OID=.;OPOS=166864693;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:47:27:28:19:19:0.404255:13:6:14:13:13:6:14:14
chr6	166873010	.	C	T	270.44	PASS	AF=0.461538;AO=30;DP=66;FAO=30;FDP=65;FR=.;FRO=35;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=-0.00272953;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.6041;QD=16.6427;RBI=0.0129275;REFB=-0.00905054;REVB=-0.012636;RO=34;SAF=12;SAR=18;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0962479;STB=0.547138;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.0126311;OID=.;OPOS=166873010;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:65:34:35:30:30:0.461538:18:12:17:17:18:12:17:18
chr6	166952264	.	G	A	779.26	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00588661;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.4761;QD=56.6736;RBI=0.0168793;REFB=0;REVB=0.0158196;RO=0;SAF=38;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.97918e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.39597e-05;OID=.;OPOS=166952264;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:17:38:0:0:17:38:0:0
chr6	167271711	.	T	C	1132.35	PASS	AF=1;AO=74;DP=75;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0438511;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.0115;QD=59.5972;RBI=0.0523945;REFB=0;REVB=0.0286751;RO=0;SAF=28;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000832001;OID=.;OPOS=167271711;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:76:0:0:74:76:1:46:28:0:0:47:29:0:0
chr6	167271716	.	T	C	1037.59	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0403579;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.509;QD=59.2909;RBI=0.0490862;REFB=0;REVB=0.0279409;RO=0;SAF=24;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.36476e-05;OID=.;OPOS=167271716;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:68:70:0:0:68:70:1:44:24:0:0:45:25:0:0
chr6	167352104	.	C	A	330.81	PASS	AF=0.615385;AO=32;DP=52;FAO=32;FDP=52;FR=.;FRO=20;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=5;FWDB=0.0233359;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.568;QD=25.4471;RBI=0.0397985;REFB=-0.00426844;REVB=0.0322391;RO=20;SAF=15;SAR=17;SRF=15;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195595;STB=0.607078;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=0.00140609;OID=.;OPOS=167352104;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:20:20:32:32:0.615385:17:15:15:5:17:15:15:5
chr6	167411298	.	T	C	37.78	PASS	AF=0.375;AO=6;DP=16;FAO=6;FDP=16;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=-0.0295804;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.694;QD=9.44487;RBI=0.0320368;REFB=-0.0337071;REVB=-0.0123029;RO=10;SAF=3;SAR=3;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100718;STB=0.562295;STBP=0.758;TYPE=snp;VARB=0.0335216;OID=.;OPOS=167411298;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:16:16:10:10:6:6:0.375:3:3:4:6:3:3:4:6
chr6	167413539	.	T	C	268.46	PASS	AF=0.310345;AO=37;DP=117;FAO=36;FDP=116;FR=.;FRO=80;FSAF=28;FSAR=8;FSRF=40;FSRR=40;FWDB=-0.00248899;FXX=0.00854628;HRUN=8;LEN=1;MLLD=302.253;QD=9.25735;RBI=0.00706268;REFB=0.000267343;REVB=-0.00660956;RO=79;SAF=29;SAR=8;SRF=40;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.359595;STB=0.711738;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=-0.000466203;OID=.;OPOS=167413539;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:117:116:79:80:37:36:0.310345:8:29:40:39:8:28:40:40
chr6	167424293	.	T	C	56.78	PASS	AF=0.421053;AO=8;DP=19;FAO=8;FDP=19;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=3.12428e-06;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.915;QD=11.9534;RBI=0.0868174;REFB=-0.0285366;REVB=0.0868174;RO=11;SAF=4;SAR=4;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131886;STB=0.578755;STBP=0.613;TYPE=snp;VARB=0.0364331;OID=.;OPOS=167424293;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:19:19:11:11:8:8:0.421053:4:4:7:4:4:4:7:4
chr6	167571048	.	T	C	923.68	PASS	AF=1;AO=63;DP=64;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00928028;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.6897;QD=58.6464;RBI=0.0202834;REFB=0;REVB=0.0180359;RO=0;SAF=39;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51964e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000189505;OID=.;OPOS=167571048;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:63:0:0:63:63:1:24:39:0:0:24:39:0:0
chr6	167571430	.	A	T	1749.35	PASS	AF=1;AO=113;DP=113;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00922117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.813;QD=60.8469;RBI=0.0144885;REFB=0;REVB=0.0111752;RO=0;SAF=67;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.40416e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.56742e-05;OID=.;OPOS=167571430;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:113:115:0:0:113:115:1:46:67:0:0:48:67:0:0
chr6	167590541	.	G	A	85.65	PASS	AF=0.230769;AO=12;DP=52;FAO=12;FDP=52;FR=.;FRO=40;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=-0.0209633;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.3183;QD=6.58811;RBI=0.0222308;REFB=-0.00558462;REVB=-0.00739914;RO=39;SAF=4;SAR=8;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131511;STB=0.594432;STBP=0.478;TYPE=snp;VARB=0.0174356;OID=.;OPOS=167590541;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:52:52:39:40:12:12:0.230769:8:4:17:22:8:4:18:22
chr6	167590574	.	G	C	483.5	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00970467;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.503;QD=58.6058;RBI=0.0462496;REFB=0;REVB=0.04522;RO=0;SAF=12;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.47712e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000325208;OID=.;OPOS=167590574;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:33:0:0:31:33:1:19:12:0:0:21:12:0:0
chr6	167591954	.	G	A	286.67	PASS	AF=0.336364;AO=37;DP=110;FAO=37;FDP=110;FR=.;FRO=73;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=18;FSRR=55;FWDB=-0.0128974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.049;QD=10.4243;RBI=0.0254471;REFB=-0.0188397;REVB=-0.0219366;RO=72;SAF=14;SAR=23;SRF=18;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164839;STB=0.597326;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=0.0329532;OID=.;OPOS=167591954;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:110:72:73:37:37:0.336364:23:14:18:54:23:14:18:55
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chr6	167796309	.	C	T	538.66	PASS	AF=0.515152;AO=51;DP=99;FAO=51;FDP=99;FR=.;FRO=48;FSAF=28;FSAR=23;FSRF=25;FSRR=23;FWDB=0.0275068;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=290.015;QD=21.764;RBI=0.0325184;REFB=0.00062995;REVB=0.0173441;RO=47;SAF=28;SAR=23;SRF=24;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0335636;STB=0.513756;STBP=0.783;TYPE=snp;VARB=-0.000577296;OID=.;OPOS=167796309;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:47:48:51:51:0.515152:23:28:24:23:23:28:25:23
chr6	167796319	.	T	C	559.54	PASS	AF=0.530612;AO=52;DP=99;FAO=52;FDP=98;FR=.;FRO=46;FSAF=30;FSAR=22;FSRF=23;FSRR=23;FWDB=-0.032891;FXX=0.0101;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.051;QD=22.8382;RBI=0.0331472;REFB=-0.00289963;REVB=-0.004113;RO=46;SAF=30;SAR=22;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0663706;STB=0.536552;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=0.00632388;OID=.;OPOS=167796319;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:98:46:46:52:52:0.530612:22:30:23:23:22:30:23:23
chr6	167797844	.	C	T	929.4	PASS	AF=0.970149;AO=65;DP=67;FAO=65;FDP=67;FR=.;FRO=2;FSAF=32;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00603256;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=220.575;QD=55.4865;RBI=0.00605907;REFB=-0.0615449;REVB=0.000566147;RO=1;SAF=32;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141005;STB=0.514701;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=0.000248367;OID=.;OPOS=167797844;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:67:67:1:2:65:65:0.970149:33:32:0:1:33:32:0:2
chr6	168069834	.	A	G	257.67	PASS	AF=0.519231;AO=27;DP=52;FAO=27;FDP=52;FR=.;FRO=25;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=-3.19885e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.128;QD=19.8205;RBI=0.0164057;REFB=0.00483971;REVB=0.0164056;RO=25;SAF=16;SAR=11;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.16577;STB=0.592524;STBP=0.196;TYPE=snp;VARB=-0.00498887;OID=.;OPOS=168069834;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:25:25:27:27:0.519231:11:16:10:15:11:16:10:15
chr6	168070084	.	G	A	48.86	PASS	AF=0.5;AO=7;DP=14;FAO=7;FDP=14;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=-0.0147045;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.557;QD=13.961;RBI=0.0147075;REFB=-0.0116553;REVB=0.000293067;RO=7;SAF=3;SAR=4;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125462;STB=0.574264;STBP=0.688;TYPE=snp;VARB=0.0055414;OID=.;OPOS=168070084;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:14:14:7:7:7:7:0.5:4:3:2:5:4:3:2:5
chr6	168070293	.	G	A	191.94	PASS	AF=0.5;AO=19;DP=39;FAO=20;FDP=40;FR=.;FRO=20;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.0229574;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.624;QD=19.1941;RBI=0.022958;REFB=-0.00423197;REVB=0.000171642;RO=20;SAF=13;SAR=6;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177504;STB=0.608582;STBP=0.194;TYPE=snp;VARB=0.0028788;OID=.;OPOS=168070293;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:40:20:20:19:20:0.5:6:13:10:10:6:14:10:10
chr6	168315978	.	G	C	561.89	PASS	AF=0.434783;AO=59;DP=137;FAO=60;FDP=138;FR=.;FRO=78;FSAF=35;FSAR=25;FSRF=48;FSRR=30;FWDB=-0.00292054;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.188;QD=16.2867;RBI=0.0255456;REFB=-0.00761765;REVB=0.0253781;RO=78;SAF=35;SAR=24;SRF=48;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.023487;STB=0.518744;STBP=0.718;TYPE=snp;VARB=0.0129295;OID=.;OPOS=168315978;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:137:138:78:78:59:60:0.434783:24:35:48:30:25:35:48:30
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chr6	168323664	.	A	G	190.69	PASS	AF=0.4;AO=20;DP=50;FAO=20;FDP=50;FR=.;FRO=30;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=21;FWDB=-0.0315966;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.2995;QD=15.2551;RBI=0.0404349;REFB=-0.00518451;REVB=-0.0252317;RO=30;SAF=6;SAR=14;SRF=9;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00629495;OID=.;OPOS=168323664;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:30:30:20:20:0.4:14:6:9:21:14:6:9:21
chr6	168343838	.	T	C	1346.24	PASS	AF=1;AO=86;DP=88;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0294388;FXX=0.0227247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.5349;QD=62.6158;RBI=0.0478348;REFB=0;REVB=0.0377031;RO=0;SAF=49;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000325261;OID=.;OPOS=168343838;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:88:86:0:0:86:86:1:37:49:0:0:37:49:0:0
chr6	168349011	.	C	T	315.34	PASS	AF=0.56;AO=28;DP=49;FAO=28;FDP=50;FR=.;FRO=22;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.0572494;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=46.5537;QD=25.2273;RBI=0.0684328;REFB=0.000269591;REVB=-0.0374907;RO=21;SAF=13;SAR=15;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0278396;STB=0.504307;STBP=0.96;TYPE=snp;VARB=-0.000597055;OID=.;OPOS=168349011;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:50:21:22:28:28:0.56:15:13:9:12:15:13:10:12
chr6	168376866	.	T	C	46.76	PASS	AF=0.666667;AO=6;DP=9;FAO=6;FDP=9;FR=.;FRO=3;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0129269;FXX=0.0999001;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.0475;QD=20.7834;RBI=0.0129269;REFB=-0.00300039;REVB=1.65079e-05;RO=3;SAF=3;SAR=3;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0941184;STB=0.555372;STBP=0.703;TYPE=snp;VARB=0.0186715;OID=.;OPOS=168376866;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:9:9:3:3:6:6:0.666667:3:3:2:1:3:3:2:1
chr6	168457801	.	A	G	738.66	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00226041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.089;QD=62.8646;RBI=0.0274978;REFB=0;REVB=0.0274048;RO=0;SAF=26;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.15971e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000381239;OID=.;OPOS=168457801;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:47:0:0:45:47:1:19:26:0:0:20:27:0:0
chr6	168457966	.	G	A	465.13	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00872018;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.77;QD=58.1415;RBI=0.0128003;REFB=0;REVB=0.00937055;RO=0;SAF=13;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000126254;OID=.;OPOS=168457966;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:19:13:0:0:19:13:0:0
chr6	168459790	.	G	T	1211.9	PASS	AF=0.932584;AO=82;DP=88;FAO=83;FDP=89;FR=.;FRO=6;FSAF=43;FSAR=40;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.0104061;FXX=0.0111099;HRUN=7;LEN=1;MLLD=60.528;QD=54.4675;RBI=0.0633273;REFB=-0.0662358;REVB=0.0624665;RO=6;SAF=42;SAR=40;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.041441;STB=0.521309;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=0.0245598;OID=.;OPOS=168459790;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:19:88:89:6:6:82:83:0.932584:40:42:5:1:40:43:5:1
chr6	168459792	.	G	A	1301.91	PASS	AF=0.926316;AO=88;DP=95;FAO=88;FDP=95;FR=.;FRO=7;FSAF=48;FSAR=40;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.00654375;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=266.88;QD=54.8173;RBI=0.0209129;REFB=-0.00404017;REVB=0.0198628;RO=7;SAF=48;SAR=40;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.023764;STB=0.51257;STBP=0.385;TYPE=snp;VARB=4.28471e-05;OID=.;OPOS=168459792;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:23:95:95:7:7:88:88:0.926316:40:48:5:2:40:48:5:2
chr6	168459845	.	G	C	2105.97	PASS	AF=1;AO=134;DP=134;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0260976;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=139.292;QD=62.3991;RBI=0.0499846;REFB=0;REVB=0.0426306;RO=0;SAF=71;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.87953e-05;OID=.;OPOS=168459845;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:134:135:0:0:134:135:1:63:71:0:0:64:71:0:0
chr6	168479604	.	G	A	1396.46	PASS	AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0242894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.997;QD=62.7621;RBI=0.0501941;REFB=0;REVB=0.0439257;RO=0;SAF=40;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.10555e-05;OID=.;OPOS=168479604;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:49:40:0:0:49:40:0:0
chr6	168482110	.	C	T	955.05	PASS	AF=1;AO=64;DP=68;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0408368;FXX=0.0985777;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.067;QD=59.6909;RBI=0.0728105;REFB=0;REVB=0.0602804;RO=0;SAF=31;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000653478;OID=.;OPOS=168482110;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:64:0:0:64:64:1:33:31:0:0:33:31:0:0
chr6	168694594	.	C	T	1801.24	PASS	AF=1;AO=118;DP=118;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0596364;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.9167;QD=61.059;RBI=0.0604213;REFB=0;REVB=0.00970756;RO=0;SAF=55;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000305105;OID=.;OPOS=168694594;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:118:118:0:0:118:118:1:63:55:0:0:63:55:0:0
chr6	168695309	.	C	T	590.14	PASS	AF=0.446043;AO=61;DP=139;FAO=62;FDP=139;FR=.;FRO=77;FSAF=44;FSAR=18;FSRF=50;FSRR=27;FWDB=0.0154832;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.7385;QD=16.9823;RBI=0.0415008;REFB=-0.00648899;REVB=-0.0385044;RO=78;SAF=44;SAR=17;SRF=50;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0952097;STB=0.539203;STBP=0.442;TYPE=snp;VARB=0.00641862;OID=.;OPOS=168695309;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:139:139:78:77:61:62:0.446043:17:44:50:28:18:44:50:27
chr6	168695345	.	G	A	772.41	PASS	AF=0.465517;AO=79;DP=171;FAO=81;FDP=174;FR=.;FRO=93;FSAF=46;FSAR=35;FSRF=51;FSRR=42;FWDB=-0.0261026;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.1144;QD=17.7566;RBI=0.0276483;REFB=-0.0401948;REVB=0.00911481;RO=92;SAF=46;SAR=33;SRF=51;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0277088;STB=0.510593;STBP=0.823;TYPE=snp;VARB=0.0431191;OID=.;OPOS=168695345;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:171:174:92:93:79:81:0.465517:33:46:51:41:35:46:51:42
chr6	169617726	.	A	C	268.94	PASS	AF=0.508772;AO=29;DP=57;FAO=29;FDP=57;FR=.;FRO=28;FSAF=21;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=-0.0048279;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.8056;QD=18.8729;RBI=0.0144587;REFB=-0.0300586;REVB=0.0136288;RO=28;SAF=21;SAR=8;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154216;STB=0.586529;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=0.0276633;OID=.;OPOS=169617726;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:28:28:29:29:0.508772:8:21:16:12:8:21:16:12
chr6	169619933	.	T	TTTCCTTCC	149.76	PASS	AF=0.714286;AO=15;DP=28;FAO=15;FDP=21;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=14;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.0686343;FXX=0;HRUN=3;LEN=8;MLLD=267.289;QD=28.5259;RBI=0.0689882;REFB=-0.0442639;REVB=-0.00697816;RO=13;SAF=1;SAR=14;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.661812;STB=0.813396;STBP=0.005;TYPE=ins;VARB=0.0103261;OID=.;OPOS=169619934;OREF=-;OALT=TTCCTTCC;OMAPALT=TTTCCTTCC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.714286:15:28:15:21:6:1:14:4:2:36:13:1:14:9:4
chr6	170062481	.	C	T	334.57	PASS	AF=0.467532;AO=36;DP=77;FAO=36;FDP=77;FR=.;FRO=41;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=0.00819374;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.1244;QD=17.3801;RBI=0.0127463;REFB=0.0109043;REVB=-0.00976378;RO=41;SAF=15;SAR=21;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0217757;STB=0.512188;STBP=0.873;TYPE=snp;VARB=-0.012223;OID=.;OPOS=170062481;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:41:41:36:36:0.467532:21:15:18:23:21:15:18:23
chr6	170068086	.	C	T	667.09	PASS	AF=0.977778;AO=43;DP=44;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0112001;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.1116;QD=59.2965;RBI=0.0986391;REFB=-0.146769;REVB=0.0980012;RO=1;SAF=29;SAR=14;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0323574;STB=0.516122;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=0.00985757;OID=.;OPOS=170068086;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:44:45:1:1:43:44:0.977778:14:29:0:1:15:29:0:1
chr6	170070723	.	A	G	483.63	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0544733;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.959;QD=58.6217;RBI=0.0717402;REFB=0;REVB=0.0466831;RO=0;SAF=20;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000342928;OID=.;OPOS=170070723;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:33:0:0:31:33:1:11:20:0:0:11:22:0:0
chr6	170102267	.	A	G	289.29	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0225931;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=65.3279;QD=52.5975;RBI=0.03041;REFB=0;REVB=0.0203549;RO=0;SAF=15;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.79751e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.00756e-05;OID=.;OPOS=170102267;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:7:15:0:0:7:15:0:0
chr6	170151766	.	C	T	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0217945;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.169;QD=45.8048;RBI=0.0222176;REFB=0;REVB=-0.00431529;RO=0;SAF=11;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000133191;OID=.;OPOS=170151766;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:3:11:0:0:3:11:0:0
chr6	170162537	.	C	T	1510.64	PASS	AF=1;AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00788812;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.4317;QD=63.6061;RBI=0.00816476;REFB=0;REVB=0.00210731;RO=0;SAF=48;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.61194e-05;OID=.;OPOS=170162537;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:95:0:0:95:95:1:47:48:0:0:47:48:0:0
chr6	170176146	.	G	A	117.12	PASS	AF=0.236842;AO=18;DP=75;FAO=18;FDP=76;FR=.;FRO=58;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=44;FSRR=14;FWDB=-0.0253061;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.958;QD=6.16437;RBI=0.0281148;REFB=-0.0164058;REVB=-0.0122492;RO=55;SAF=9;SAR=9;SRF=41;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.308786;STB=0.697183;STBP=0.095;TYPE=snp;VARB=0.0431715;OID=.;OPOS=170176146;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:76:55:58:18:18:0.236842:9:9:41:14:9:9:44:14
chr6	170176467	.	A	G	876.94	PASS	AF=0.96875;AO=60;DP=62;FAO=62;FDP=64;FR=.;FRO=2;FSAF=39;FSAR=23;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.027484;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=277.744;QD=54.809;RBI=0.0276391;REFB=-0.0540888;REVB=0.00292363;RO=2;SAF=39;SAR=21;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0235879;STB=0.512496;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.000264183;OID=.;OPOS=170176467;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:62:64:2:2:60:62:0.96875:21:39:2:0:23:39:2:0
chr6	170176647	.	CA	GG,TG	771.07	PASS	AF=0.0408163,0.959184;AO=2,47;DP=49;FAO=2,47;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=2,26;FSAR=0,21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00512867,0.00496788;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,2;MLLD=244.443,289.813;QD=62.9443;RBI=0.00734309,0.00909113;REFB=0,0;REVB=-0.00525525,-0.00761372;RO=0;SAF=2,26;SAR=0,21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,mnp;VARB=0.0419656,-0.00136246;OID=.,.;OPOS=170176647,170176647;OREF=CA,CA;OALT=GG,TG;OMAPALT=GG,TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:49:49:0:0:2,47:2,47:0.0408163,0.959184:0,21:2,26:0:0:0,21:2,26:0:0
chr6	170190200	.	G	A	1596.12	PASS	AF=1;AO=98;DP=98;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0255839;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.1704;QD=63.8447;RBI=0.0688344;REFB=0;REVB=0.0639034;RO=0;SAF=43;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.423e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000341316;OID=.;OPOS=170190200;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:100:0:0:98:100:1:55:43:0:0:57:43:0:0
chr6	170190418	.	T	G	447.02	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000449524;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.287;QD=57.6795;RBI=0.0253373;REFB=0;REVB=0.0253334;RO=0;SAF=13;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.63861e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.22191e-05;OID=.;OPOS=170190418;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:31:0:0:30:31:1:17:13:0:0:17:14:0:0
chr6	170190659	.	G	T	57.32	PASS	AF=0.444444;AO=8;DP=18;FAO=8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.0662862;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.9;QD=12.7388;RBI=0.0684963;REFB=-0.0116523;REVB=0.0172594;RO=10;SAF=3;SAR=5;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0763832;STB=0.545344;STBP=0.797;TYPE=snp;VARB=0.0137645;OID=.;OPOS=170190659;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:18:18:10:10:8:8:0.444444:5:3:3:7:5:3:3:7
chr6	170591923	.	T	G	319.26	PASS	AF=0.4;AO=36;DP=90;FAO=36;FDP=90;FR=.;FRO=54;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=27;FSRR=27;FWDB=0.0138549;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=182.236;QD=14.1891;RBI=0.0227359;REFB=-0.00306456;REVB=0.0180268;RO=54;SAF=22;SAR=14;SRF=27;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119548;STB=0.567972;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=0.00369628;OID=.;OPOS=170591923;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:54:54:36:36:0.4:14:22:27:27:14:22:27:27
chr6	170592945	.	C	T	557.13	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.022846;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=245.551;QD=60.23;RBI=0.0230518;REFB=0;REVB=0.00307356;RO=0;SAF=19;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.68991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.92486e-05;OID=.;OPOS=170592945;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:18:19:0:0:18:19:0:0
chr6	170597305	.	C	T	692.35	PASS	AF=0.978723;AO=44;DP=45;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.01032;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.2059;QD=58.9232;RBI=0.0148768;REFB=-0.16887;REVB=0.0107152;RO=1;SAF=24;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0191734;STB=0.5102;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.00310549;OID=.;OPOS=170597305;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:45:47:1:1:44:46:0.978723:20:24:1:0:22:24:1:0
chr6	170845354	.	A	G	613.24	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0554842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.841;QD=61.3244;RBI=0.0781664;REFB=0;REVB=0.055059;RO=0;SAF=21;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000938946;OID=.;OPOS=170845354;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:19:21:0:0:19:21:0:0
chr6	170862300	.	G	C	1358.62	PASS	AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0450646;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=249.166;QD=62.4654;RBI=0.046698;REFB=0;REVB=0.0122428;RO=0;SAF=33;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.42877e-05;OID=.;OPOS=170862300;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:54:33:0:0:54:33:0:0
chr6	170878793	.	T	C	1970.85	PASS	AF=1;AO=126;DP=127;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108956;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.264;QD=62.0741;RBI=0.0399138;REFB=0;REVB=0.0383978;RO=0;SAF=57;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00011222;OID=.;OPOS=170878793;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:127:127:0:0:126:127:1:69:57:0:0:70:57:0:0
chr6	170887693	.	G	C	207.08	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0359259;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.876;QD=48.724;RBI=0.04235;REFB=0;REVB=-0.0224244;RO=0;SAF=8;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00025756;OID=.;OPOS=170887693;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:9:8:0:0:9:8:0:0
chr7	228527	.	TGG	AGT,GTG,TG	317.2	PASS	AF=0,0.351351,0.648649;AO=2,11,16;DP=39;FAO=0,13,24;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0,4;FSAR=0,13,20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0264852,-0.0363465,0.305813;FXX=0.0512689;HRUN=1,1,5;LEN=3,2,1;MLLD=36.2602,21.6395,11.5738;QD=34.2916;RBI=0.030729,0.0391355,0.305841;REFB=0.03987,0.100983,-0.0265718;REVB=0.0155822,0.0145092,0.00416945;RO=5;SAF=0,0,0;SAR=2,11,16;SRF=3;SRR=2;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0.516484;SSSB=-0.64233,-0.821629,-0.84475;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=mnp,mnp,del;VARB=0,0.0840911,0.192297;OID=.,.,.;OPOS=228527,228527,228528;OREF=TGG,TG,G;OALT=AGT,GT,-;OMAPALT=AGT,GTG,TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	2/3:73:39:37:5:0:2,11,16:0,13,24:0,0.351351,0.648649:2,11,16:0,0,0:3:2:0,13,20:0,0,4:0:0
chr7	228780	.	C	T	212.27	PASS	AF=0.645161;AO=20;DP=31;FAO=20;FDP=31;FR=.;FRO=11;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=0.0236917;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.376;QD=27.3902;RBI=0.0639138;REFB=-0.0052729;REVB=0.0593606;RO=11;SAF=9;SAR=11;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118873;STB=0.565851;STBP=0.324;TYPE=snp;VARB=0.00474013;OID=.;OPOS=228780;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:31:31:11:11:20:20:0.645161:11:9:7:4:11:9:7:4
chr7	228813	.	G	A	298.79	PASS	AF=0.65;AO=25;DP=40;FAO=26;FDP=40;FR=.;FRO=14;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.0168598;FXX=0.0243843;HRUN=3;LEN=1;MLLD=221.997;QD=29.8788;RBI=0.0209714;REFB=-0.00756636;REVB=0.0124717;RO=13;SAF=10;SAR=15;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0394779;STB=0.527323;STBP=0.665;TYPE=snp;VARB=0.00360115;OID=.;OPOS=228813;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:13:14:25:26:0.65:15:10:6:7:15:11:7:7
chr7	229248	.	T	G	1020.62	PASS	AF=0.554286;AO=97;DP=175;FAO=97;FDP=175;FR=.;FRO=78;FSAF=43;FSAR=54;FSRF=42;FSRR=36;FWDB=0.0072601;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=164.044;QD=23.3286;RBI=0.0112921;REFB=-0.00329758;REVB=0.00864888;RO=77;SAF=43;SAR=54;SRF=41;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0726729;STB=0.542544;STBP=0.204;TYPE=snp;VARB=0.0035253;OID=.;OPOS=229248;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:175:175:77:78:97:97:0.554286:54:43:41:36:54:43:42:36
chr7	229313	.	C	T	718.87	PASS	AF=0.614679;AO=66;DP=108;FAO=67;FDP=109;FR=.;FRO=42;FSAF=33;FSAR=34;FSRF=25;FSRR=17;FWDB=0.00658586;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.363;QD=26.3805;RBI=0.0068063;REFB=-0.00602951;REVB=-0.00171817;RO=42;SAF=32;SAR=34;SRF=25;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0789061;STB=0.539523;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=0.00515648;OID=.;OPOS=229313;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:109:42:42:66:67:0.614679:34:32:25:17:34:33:25:17
chr7	299850	.	G	T	2338.64	PASS	AF=1;AO=152;DP=152;FAO=153;FDP=153;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00430928;FXX=0.00649309;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.299;QD=61.1408;RBI=0.0357649;REFB=0;REVB=0.0355044;RO=0;SAF=87;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00020759;OID=.;OPOS=299850;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:152:153:0:0:152:153:1:65:87:0:0:65:88:0:0
chr7	299881	.	A	G	2237.58	PASS	AF=1;AO=141;DP=141;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=89;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0175409;FXX=0.00704176;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.4721;QD=63.4773;RBI=0.0539251;REFB=0;REVB=-0.0509925;RO=0;SAF=89;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.55169e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000346911;OID=.;OPOS=299881;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:141:141:0:0:141:141:1:52:89:0:0:52:89:0:0
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chr7	470281	.	A	G	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0166342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.216;QD=49.5992;RBI=0.0166414;REFB=0;REVB=-0.000487655;RO=0;SAF=5;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000103807;OID=.;OPOS=470281;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:13:5:0:0:13:5:0:0
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chr7	878471	.	G	A	583.67	PASS	AF=0.626506;AO=52;DP=83;FAO=52;FDP=83;FR=.;FRO=31;FSAF=27;FSAR=25;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=0.0103599;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.847;QD=28.1286;RBI=0.0105927;REFB=-0.00725731;REVB=0.0022084;RO=31;SAF=27;SAR=25;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0684849;STB=0.537237;STBP=0.413;TYPE=snp;VARB=0.00571553;OID=.;OPOS=878471;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:31:31:52:52:0.626506:25:27:13:18:25:27:13:18
chr7	881668	.	C	T	322.24	PASS	AF=0.608696;AO=28;DP=46;FAO=28;FDP=46;FR=.;FRO=18;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=0.0285267;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.036;QD=28.0209;RBI=0.0484915;REFB=-0.0462603;REVB=-0.0392129;RO=18;SAF=14;SAR=14;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0394226;STB=0.521724;STBP=0.721;TYPE=snp;VARB=0.0380698;OID=.;OPOS=881668;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:18:18:28:28:0.608696:14:14:10:8:14:14:10:8
chr7	882895	.	C	G	63.01	PASS	AF=0.3;AO=9;DP=30;FAO=9;FDP=30;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=15;FSRR=6;FWDB=-0.0035157;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.6634;QD=8.40195;RBI=0.0443116;REFB=-0.0109415;REVB=-0.0441719;RO=21;SAF=7;SAR=2;SRF=15;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0958897;STB=0.559859;STBP=0.745;TYPE=snp;VARB=0.0222926;OID=.;OPOS=882895;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:30:30:21:21:9:9:0.3:2:7:15:6:2:7:15:6
chr7	897492	.	A	G	955.19	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00609312;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.102;QD=58.7812;RBI=0.0150246;REFB=0;REVB=0.0137336;RO=0;SAF=38;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.04073e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.6372e-05;OID=.;OPOS=897492;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:27:38:0:0:27:38:0:0
chr7	909048	.	G	A	161.5	PASS	AF=0.5;AO=17;DP=34;FAO=17;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.0185072;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.05;QD=19.0005;RBI=0.0494965;REFB=-0.00259346;REVB=-0.0459063;RO=17;SAF=12;SAR=5;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170902;STB=0.597581;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=0.00312497;OID=.;OPOS=909048;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:17:17:17:17:0.5:5:12:9:8:5:12:9:8
chr7	923855	.	G	A	182.99	PASS	AF=0.452381;AO=19;DP=42;FAO=19;FDP=42;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=0.00574201;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.711;QD=17.4273;RBI=0.04749;REFB=-0.0169786;REVB=0.0471416;RO=22;SAF=6;SAR=13;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.265505;STB=0.663091;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.0234073;OID=.;OPOS=923855;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:22:23:19:19:0.452381:13:6:13:9:13:6:14:9
chr7	923935	.	G	A	664.91	PASS	AF=0.623656;AO=56;DP=91;FAO=58;FDP=93;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=44;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=-0.0216701;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.847;QD=28.5981;RBI=0.0234549;REFB=-0.00569561;REVB=0.00897448;RO=35;SAF=14;SAR=42;SRF=14;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13068;STB=0.575136;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=0.00585064;OID=.;OPOS=923935;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:93:35:35:56:58:0.623656:42:14:14:21:44:14:14:21
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chr7	930689	.	C	T	318.43	PASS	AF=0.581818;AO=32;DP=55;FAO=32;FDP=55;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=-0.0115109;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=175.333;QD=23.1588;RBI=0.0199042;REFB=-0.0142364;REVB=-0.0162381;RO=23;SAF=14;SAR=18;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00209362;STB=0.501154;STBP=0.998;TYPE=snp;VARB=0.00962804;OID=.;OPOS=930689;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:23:23:32:32:0.581818:18:14:10:13:18:14:10:13
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chr7	1132720	.	G	A	30.99	PASS	AF=0.5;AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=-0.00374099;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.982;QD=12.3958;RBI=0.0870653;REFB=-0.0268604;REVB=0.0869849;RO=5;SAF=3;SAR=2;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.317065;STB=0.691596;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=0.00680082;OID=.;OPOS=1132720;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:27:10:10:5:5:5:5:0.5:2:3:1:4:2:3:1:4
chr7	1132972	.	G	A	331.43	PASS	AF=0.492958;AO=35;DP=71;FAO=35;FDP=71;FR=.;FRO=36;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=21;FSRR=15;FWDB=0.0493936;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.827;QD=18.6723;RBI=0.0726051;REFB=-0.0393599;REVB=0.0532144;RO=36;SAF=17;SAR=18;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0886509;STB=0.54937;STBP=0.444;TYPE=snp;VARB=0.035438;OID=.;OPOS=1132972;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:36:36:35:35:0.492958:18:17:21:15:18:17:21:15
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chr7	1481919	.	C	A	698.16	PASS	AF=0.962264;AO=51;DP=54;FAO=51;FDP=53;FR=.;FRO=2;FSAF=22;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00595232;FXX=0.0185151;HRUN=2;LEN=1;MLLD=259.542;QD=52.6909;RBI=0.0331415;REFB=-0.13021;REVB=0.0326025;RO=1;SAF=22;SAR=29;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.015962;STB=0.51666;STBP=0.265;TYPE=snp;VARB=0.000663312;OID=.;OPOS=1481919;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:54:53:1:2:51:51:0.962264:29:22:0:1:29:22:0:2
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chr7	1484572	.	A	G	142.51	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0858827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.153;QD=43.8499;RBI=0.0884429;REFB=0;REVB=0.0211262;RO=0;SAF=7;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000268283;OID=.;OPOS=1484572;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:13:0:0:12:13:1:5:7:0:0:6:7:0:0
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chr7	1544128	.	G	T	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0207362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.459;QD=43.4861;RBI=0.0551023;REFB=0;REVB=0.0510517;RO=0;SAF=5;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00120633;OID=.;OPOS=1544128;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:7:5:0:0:7:5:0:0
chr7	1588391	.	A	G	207.09	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00919808;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.943;QD=48.7274;RBI=0.0126924;REFB=0;REVB=-0.00874596;RO=0;SAF=8;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.55523e-06;OID=.;OPOS=1588391;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:9:8:0:0:9:8:0:0
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chr7	1887037	.	T	C	388.0	PASS	AF=0.287293;AO=51;DP=187;FAO=52;FDP=181;FR=.;FRO=129;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=60;FSRR=69;FWDB=-0.0246304;FXX=0.0572887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.853;QD=8.57451;RBI=0.0287727;REFB=-0.00594715;REVB=-0.0148732;RO=105;SAF=26;SAR=25;SRF=49;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0502513;STB=0.524852;STBP=0.662;TYPE=snp;VARB=0.0116321;OID=.;OPOS=1887037;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:187:181:105:129:51:52:0.287293:25:26:49:56:26:26:60:69
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chr7	2297006	.	A	G	1773.79	PASS	AF=0.991525;AO=116;DP=118;FAO=117;FDP=118;FR=.;FRO=1;FSAF=56;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00819882;FXX=0.00840265;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.04;QD=60.1285;RBI=0.0210763;REFB=-0.0106082;REVB=-0.0194162;RO=1;SAF=55;SAR=61;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00772211;STB=0.504064;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=2.57812e-05;OID=.;OPOS=2297006;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:118:118:1:1:116:117:0.991525:61:55:0:1:61:56:0:1
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chr7	2473804	.	G	T	62.58	PASS	AF=0.290323;AO=9;DP=31;FAO=9;FDP=31;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=18;FSRR=4;FWDB=-0.0010035;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.182;QD=8.07479;RBI=0.0127794;REFB=-0.0136075;REVB=0.0127399;RO=22;SAF=7;SAR=2;SRF=18;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0706764;STB=0.543387;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=0.0425252;OID=.;OPOS=2473804;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:31:31:22:22:9:9:0.290323:2:7:18:4:2:7:18:4
chr7	2552880	.	CA	CAGATG,TG	160.88	PASS	AF=0.5,0.0625;AO=13,2;DP=30;FAO=16,2;FDP=32;FR=.;FRO=14;FSAF=6,1;FSAR=10,1;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.0182002,-0.0250662;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=4,2;MLLD=111.856,103.297;QD=20.1104;RBI=0.025528,0.0474074;REFB=-0.107756,-0.0968381;REVB=-0.0179006,-0.0402386;RO=9;SAF=5,1;SAR=8,1;SRF=2;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.128523,0.307174;STB=0.508917,0.623834;STBP=0.97,0.757;TYPE=ins,mnp;VARB=0.0909278,0.03901;OID=.,.;OPOS=2552882,2552880;OREF=-,CA;OALT=GATG,TG;OMAPALT=CAGATG,TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:32:9:14:13,2:16,2:0.5,0.0625:8,1:5,1:2:7:10,1:6,1:5:9
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chr7	2629549	.	T	C	398.0	PASS	AF=0.30814;AO=53;DP=172;FAO=53;FDP=172;FR=.;FRO=119;FSAF=30;FSAR=23;FSRF=54;FSRR=65;FWDB=-0.0343115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.446;QD=9.25574;RBI=0.0457465;REFB=-0.0103539;REVB=-0.0302566;RO=113;SAF=30;SAR=23;SRF=53;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114075;STB=0.577399;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=0.0393721;OID=.;OPOS=2629549;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:172:172:113:119:53:53:0.30814:23:30:53:60:23:30:54:65
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chr7	2653792	.	C	A	48.23	PASS	AF=0.466667;AO=7;DP=15;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=-0.0208134;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=94.7914;QD=12.8606;RBI=0.0551925;REFB=-0.0107731;REVB=-0.0511176;RO=8;SAF=2;SAR=5;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.308464;STB=0.685728;STBP=0.246;TYPE=snp;VARB=0.0286616;OID=.;OPOS=2653792;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:15:15:8:8:7:7:0.466667:5:2:5:3:5:2:5:3
chr7	2748758	.	G	C	969.08	PASS	AF=0.971014;AO=67;DP=69;FAO=67;FDP=69;FR=.;FRO=2;FSAF=26;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00111784;FXX=0.0142837;HRUN=4;LEN=1;MLLD=49.9921;QD=56.1787;RBI=0.0335502;REFB=-0.0819306;REVB=-0.0335316;RO=2;SAF=26;SAR=41;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.022494;STB=0.511901;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.00297311;OID=.;OPOS=2748758;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:69:69:2:2:67:67:0.971014:41:26:0:2:41:26:0:2
chr7	2748803	.	C	T	1170.05	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0269808;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.746;QD=60.7819;RBI=0.0499007;REFB=0;REVB=0.0419775;RO=0;SAF=37;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.77773e-05;OID=.;OPOS=2748803;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:40:37:0:0:40:37:0:0
chr7	2752487	.	G	A	66.83	PASS	AF=0.428571;AO=8;DP=20;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.0104864;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.391;QD=12.7299;RBI=0.0147204;REFB=-0.00935961;REVB=-0.0103308;RO=12;SAF=5;SAR=3;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0434779;STB=0.516093;STBP=0.922;TYPE=snp;VARB=0.0151201;OID=.;OPOS=2752487;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:20:21:12:12:8:9:0.428571:3:5:7:5:4:5:7:5
chr7	2946461	.	T	C	286.49	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0836752;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.122;QD=52.0884;RBI=0.0898096;REFB=0;REVB=-0.0326225;RO=0;SAF=6;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000608817;OID=.;OPOS=2946461;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:22:0:0:21:22:1:15:6:0:0:15:7:0:0
chr7	2957005	.	T	C	763.53	PASS	AF=0.96;AO=47;DP=50;FAO=48;FDP=50;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=27;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00179623;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.667;QD=61.0828;RBI=0.00194989;REFB=-0.0532668;REVB=-0.000758694;RO=1;SAF=26;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0218674;STB=0.511623;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=0.000604271;OID=.;OPOS=2957005;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:50:50:1:1:47:48:0.96:21:26:0:1:21:27:0:1
chr7	4026944	.	C	G	800.8	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00960986;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.2331;QD=57.2002;RBI=0.0111956;REFB=0;REVB=-0.00574387;RO=0;SAF=23;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6027e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000144698;OID=.;OPOS=4026944;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:56:0:0:54:56:1:31:23:0:0:32:24:0:0
chr7	4050731	.	C	T	383.94	PASS	AF=0.627119;AO=37;DP=59;FAO=37;FDP=59;FR=.;FRO=22;FSAF=13;FSAR=24;FSRF=6;FSRR=16;FWDB=-0.021035;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.5747;QD=26.0298;RBI=0.022629;REFB=-0.0312397;REVB=-0.00834278;RO=22;SAF=13;SAR=24;SRF=6;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0600518;STB=0.53277;STBP=0.554;TYPE=snp;VARB=0.0257847;OID=.;OPOS=4050731;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:22:22:37:37:0.627119:24:13:6:16:24:13:6:16
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chr7	4189075	.	G	C	781.52	PASS	AF=0.95;AO=56;DP=60;FAO=57;FDP=60;FR=.;FRO=3;FSAF=29;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.00754778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.1715;QD=52.1016;RBI=0.0608115;REFB=-0.0351181;REVB=0.0603413;RO=3;SAF=28;SAR=28;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0478769;STB=0.525415;STBP=0.137;TYPE=snp;VARB=0.00355554;OID=.;OPOS=4189075;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:60:60:3:3:56:57:0.95:28:28:0:3:28:29:0:3
chr7	4213877	.	T	C	1840.08	PASS	AF=1;AO=118;DP=122;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.007084;FXX=0.0325177;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.918;QD=61.8514;RBI=0.0186258;REFB=0;REVB=0.0172261;RO=0;SAF=55;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000715225;OID=.;OPOS=4213877;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:122:119:0:0:118:119:1:63:55:0:0:64:55:0:0
chr7	4213940	.	T	C	1587.62	PASS	AF=1;AO=98;DP=98;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0014975;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.816;QD=64.1463;RBI=0.00482452;REFB=0;REVB=0.00458623;RO=0;SAF=45;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.78566e-06;OID=.;OPOS=4213940;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:99:0:0:98:99:1:53:45:0:0:53:46:0:0
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chr7	4267072	.	T	A	243.81	PASS	AF=0.451613;AO=28;DP=62;FAO=28;FDP=62;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=-0.0461545;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=42.2636;QD=15.7295;RBI=0.0506947;REFB=-0.0166474;REVB=0.0209694;RO=27;SAF=12;SAR=16;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111794;STB=0.539506;STBP=0.575;TYPE=snp;VARB=0.0519398;OID=.;OPOS=4267072;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:27:34:28:28:0.451613:16:12:15:12:16:12:17:17
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chr7	4800759	.	G	A	1658.85	PASS	AF=0.588462;AO=153;DP=258;FAO=153;FDP=260;FR=.;FRO=107;FSAF=72;FSAR=81;FSRF=38;FSRR=69;FWDB=-0.0246334;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.621;QD=25.5207;RBI=0.025102;REFB=-0.00845252;REVB=-0.00482761;RO=104;SAF=72;SAR=81;SRF=36;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0940989;STB=0.547939;STBP=0.06;TYPE=snp;VARB=0.00620607;OID=.;OPOS=4800759;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:258:260:104:107:153:153:0.588462:81:72:36:68:81:72:38:69
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chr7	4823069	.	CA	C,CG	186.7	PASS	AF=0.1875,0.8125;AO=3,13;DP=16;FAO=3,13;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=3,4;FSAR=0,9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0305465,0.0247785;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=214.04,232.121;QD=46.6745;RBI=0.0616823,0.0441898;REFB=0,0;REVB=0.0535874,0.0365892;RO=0;SAF=3,4;SAR=0,9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0212094,0.00149281;OID=.,.;OPOS=4823070,4823070;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=C,CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.1875,0.8125:3,13:16:3,13:16:0:3,4:0,9:0:0:12:0:3,4:0,9:0:0
chr7	4823396	.	C	T	2170.2	PASS	AF=0.972222;AO=140;DP=147;FAO=140;FDP=144;FR=.;FRO=4;FSAF=71;FSAR=69;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0548077;FXX=0.0204068;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.973;QD=60.2833;RBI=0.0572983;REFB=-0.117038;REVB=0.0167095;RO=1;SAF=71;SAR=69;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00664988;STB=0.500198;STBP=0.912;TYPE=snp;VARB=0.00034198;OID=.;OPOS=4823396;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:147:144:1:4:140:140:0.972222:69:71:1:0:69:71:2:2
chr7	4841470	.	T	C,G	900.47	PASS	AF=0.952381,0.047619;AO=58,5;DP=63;FAO=60,3;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=29,2;FSAR=31,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0131339,0.010074;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=249.366,210.223;QD=57.1725;RBI=0.0155072,0.0114527;REFB=0,0;REVB=0.00824456,0.00544791;RO=0;SAF=28,3;SAR=30,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00233885,0.0560886;OID=.,.;OPOS=4841470,4841470;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:13:63:63:0:0:58,5:60,3:0.952381,0.047619:30,2:28,3:0:0:31,1:29,2:0:0
chr7	4874250	.	G	A	1069.29	PASS	AF=1;AO=72;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0132237;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.31;QD=58.5915;RBI=0.0158019;REFB=-0.0794677;REVB=0.00865066;RO=0;SAF=50;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000856366;OID=.;OPOS=4874250;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:73:73:0:0:72:73:1:22:50:0:0:23:50:0:0
chr7	4874334	.	C	G	2907.18	PASS	AF=1;AO=184;DP=184;FAO=184;FDP=184;FR=.;FRO=0;FSAF=110;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0275692;FXX=0.00540511;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.245;QD=63.1995;RBI=0.0293106;REFB=0;REVB=0.00995243;RO=0;SAF=110;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.72675e-05;OID=.;OPOS=4874334;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:16:184:184:0:0:184:184:1:74:110:0:0:74:110:0:0
chr7	5096958	.	T	C	116.63	PASS	AF=0.269841;AO=17;DP=63;FAO=17;FDP=63;FR=.;FRO=46;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=34;FWDB=-0.00276512;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=220.788;QD=7.40486;RBI=0.0209677;REFB=-0.00358787;REVB=-0.0207846;RO=46;SAF=5;SAR=12;SRF=12;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0495207;STB=0.52992;STBP=0.779;TYPE=snp;VARB=0.0101681;OID=.;OPOS=5096958;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:46:46:17:17:0.269841:12:5:12:34:12:5:12:34
chr7	5104275	.	G	A	119.53	PASS	AF=0.4;AO=14;DP=35;FAO=14;FDP=35;FR=.;FRO=21;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=0.0113946;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=169.426;QD=13.6606;RBI=0.0124734;REFB=-0.00320469;REVB=0.0050744;RO=21;SAF=4;SAR=10;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0578865;STB=0.533931;STBP=0.768;TYPE=snp;VARB=0.00458037;OID=.;OPOS=5104275;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:21:21:14:14:0.4:10:4:7:14:10:4:7:14
chr7	5104359	.	G	A	61.53	PASS	AF=0.257143;AO=9;DP=35;FAO=9;FDP=35;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=0.041062;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=138.989;QD=7.03217;RBI=0.0410989;REFB=8.60175e-05;REVB=0.00174198;RO=26;SAF=5;SAR=4;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0654726;STB=0.541309;STBP=0.792;TYPE=snp;VARB=0.000689673;OID=.;OPOS=5104359;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:35:35:26:26:9:9:0.257143:4:5:13:13:4:5:13:13
chr7	5112035	.	C	T	177.56	PASS	AF=0.545455;AO=18;DP=33;FAO=18;FDP=33;FR=.;FRO=15;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.0242779;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.246;QD=21.5227;RBI=0.0243007;REFB=-0.0256063;REVB=-0.001053;RO=14;SAF=10;SAR=8;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0125302;STB=0.510193;STBP=0.93;TYPE=snp;VARB=0.0171471;OID=.;OPOS=5112035;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:14:15:18:18:0.545455:8:10:8:6:8:10:8:7
chr7	5161512	.	G	T	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0027169;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.528;QD=45.8068;RBI=0.0220511;REFB=0;REVB=0.0218831;RO=0;SAF=9;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000141673;OID=.;OPOS=5161512;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:5:9:0:0:5:9:0:0
chr7	5161640	.	G	C	1134.34	PASS	AF=0.9625;AO=76;DP=80;FAO=77;FDP=80;FR=.;FRO=3;FSAF=49;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0125815;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.106;QD=56.7168;RBI=0.0227972;REFB=0.0868882;REVB=-0.0190111;RO=3;SAF=49;SAR=27;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0497176;STB=0.525417;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=-0.000789581;OID=.;OPOS=5161640;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:80:80:3:3:76:77:0.9625:27:49:0:3:28:49:0:3
chr7	5166500	.	A	C,G	727.28	PASS	AF=0.0638298,0.93617;AO=3,43;DP=46;FAO=3,44;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=0,24;FSAR=3,20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0397245,0.019882;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=108.653,65.6307;QD=61.8965;RBI=0.0462225,0.0331524;REFB=0,0;REVB=-0.0236322,-0.0265289;RO=0;SAF=0,23;SAR=3,20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0592658,-0.00385854;OID=.,.;OPOS=5166500,5166500;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:13:46:47:0:0:3,43:3,44:0.0638298,0.93617:3,20:0,23:0:0:3,20:0,24:0:0
chr7	5254227	.	C	G	2113.16	PASS	AF=1;AO=135;DP=136;FAO=136;FDP=136;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0748695;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.7819;QD=62.1518;RBI=0.0834252;REFB=0;REVB=0.036801;RO=0;SAF=58;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.71349e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.5484e-05;OID=.;OPOS=5254227;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:136:136:0:0:135:136:1:77:58:0:0:78:58:0:0
chr7	5271656	.	GCTTCC	G	153.59	PASS	AF=0.358491;AO=18;DP=50;FAO=19;FDP=53;FR=.;FRO=34;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=23;FSRR=11;FWDB=0.00129002;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=5;MLLD=245.113;QD=11.5915;RBI=0.00292962;REFB=-0.00372678;REVB=-0.00263031;RO=25;SAF=8;SAR=10;SRF=18;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.274043;STB=0.628555;STBP=0.195;TYPE=del;VARB=0.00736046;OID=.;OPOS=5271657;OREF=CTTCC;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.358491:18:50:19:53:34:9:10:23:11:99:25:8:10:18:7
chr7	5338714	.	T	C	62.09	PASS	AF=0.272727;AO=9;DP=33;FAO=9;FDP=33;FR=.;FRO=24;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=20;FWDB=-0.00697926;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.516;QD=7.52631;RBI=0.0136595;REFB=-0.0295634;REVB=-0.0117419;RO=24;SAF=4;SAR=5;SRF=4;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.357831;STB=0.713914;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=0.0289847;OID=.;OPOS=5338714;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:33:33:24:24:9:9:0.272727:5:4:4:20:5:4:4:20
chr7	5346735	.	T	C	88.22	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0250566;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.5277;QD=39.2068;RBI=0.0854817;REFB=0;REVB=0.0817269;RO=0;SAF=8;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00171586;OID=.;OPOS=5346735;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:1:8:0:0:1:8:0:0
chr7	5347749	.	G	A	176.17	PASS	AF=0.333333;AO=23;DP=69;FAO=23;FDP=69;FR=.;FRO=46;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=27;FSRR=19;FWDB=-0.0279794;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=106.903;QD=10.2125;RBI=0.0297947;REFB=-0.01921;REVB=-0.0102412;RO=44;SAF=15;SAR=8;SRF=27;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0468933;STB=0.546517;STBP=0.582;TYPE=snp;VARB=0.0408489;OID=.;OPOS=5347749;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:44:46:23:23:0.333333:8:15:27:17:8:15:27:19
chr7	5347914	.	G	A	93.36	PASS	AF=0.315789;AO=12;DP=38;FAO=12;FDP=38;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=0.0194638;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.838;QD=9.82733;RBI=0.0196885;REFB=-0.00212829;REVB=0.002966;RO=25;SAF=6;SAR=6;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0673181;STB=0.552545;STBP=0.635;TYPE=snp;VARB=0.00261009;OID=.;OPOS=5347914;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:93:38:38:25:26:12:12:0.315789:6:6:14:11:6:6:15:11
chr7	5352923	.	G	A	456.09	PASS	AF=0.5;AO=44;DP=89;FAO=45;FDP=90;FR=.;FRO=45;FSAF=16;FSAR=29;FSRF=19;FSRR=26;FWDB=-0.000142665;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.349;QD=20.2708;RBI=0.0138917;REFB=-0.0123612;REVB=0.013891;RO=42;SAF=15;SAR=29;SRF=17;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0612155;STB=0.535604;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.0161333;OID=.;OPOS=5352923;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:90:42:45:44:45:0.5:29:15:17:25:29:16:19:26
chr7	5372406	.	G	T	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0256497;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.157;QD=47.8224;RBI=0.0287083;REFB=0;REVB=0.0128942;RO=0;SAF=8;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00035197;OID=.;OPOS=5372406;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:8:8:0:0:8:8:0:0
chr7	5410425	.	G	C	61.38	PASS	AF=0.615385;AO=8;DP=13;FAO=8;FDP=13;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0352929;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=294.906;QD=18.8866;RBI=0.0358999;REFB=-0.0189209;REVB=-0.0065736;RO=5;SAF=2;SAR=6;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0453777;STB=0.526251;STBP=0.896;TYPE=snp;VARB=0.0131324;OID=.;OPOS=5410425;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:13:13:5:5:8:8:0.615385:6:2:1:4:6:2:1:4
chr7	5427517	.	G	A	154.74	PASS	AF=0.404762;AO=17;DP=42;FAO=17;FDP=42;FR=.;FRO=25;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=0.0027263;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.805;QD=14.7375;RBI=0.0478156;REFB=-0.0135676;REVB=0.0477378;RO=24;SAF=8;SAR=9;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.197608;STB=0.62313;STBP=0.192;TYPE=snp;VARB=0.0279925;OID=.;OPOS=5427517;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:24:25:17:17:0.404762:9:8:16:8:9:8:17:8
chr7	5427652	.	G	A	330.12	PASS	AF=0.666667;AO=28;DP=42;FAO=28;FDP=42;FR=.;FRO=14;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=-0.0602273;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.608;QD=31.4404;RBI=0.0638359;REFB=-0.00152374;REVB=0.0211586;RO=14;SAF=17;SAR=11;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110722;STB=0.56072;STBP=0.271;TYPE=snp;VARB=0.000331487;OID=.;OPOS=5427652;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:14:14:28:28:0.666667:11:17:6:8:11:17:6:8
chr7	5427718	.	A	AG	126.99	PASS	AF=1;AO=4;DP=34;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0157839;FXX=0.374883;HRUN=1;LEN=1;MLLD=10.9825;QD=25.3976;RBI=0.0893815;REFB=0;REVB=-0.0879769;RO=30;SAF=3;SAR=1;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.378168;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00138041;OID=.;OPOS=5427719;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:4:34:20:20:0:2:18:0:0:3:30:3:1:12:18
chr7	5427720	.	A	C,G	439.3	PASS	AF=0.0967742,0.903226;AO=3,28;DP=32;FAO=3,28;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=3,10;FSAR=0,18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0292364,-0.0135357;FXX=0.0312402;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=27.7445,61.8195;QD=56.6834;RBI=0.0485416,0.0143289;REFB=0,0;REVB=0.0387494,0.00470134;RO=0;SAF=3,10;SAR=0,18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.104192,0.00284151;OID=.,.;OPOS=5427720,5427720;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:12:32:31:0:0:3,28:3,28:0.0967742,0.903226:0,18:3,10:0:0:0,18:3,10:0:0
chr7	5434135	.	A	G	647.26	PASS	AF=0.955556;AO=43;DP=45;FAO=43;FDP=45;FR=.;FRO=2;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.040888;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.3294;QD=57.534;RBI=0.0483763;REFB=-0.119594;REVB=0.0258543;RO=1;SAF=26;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0268199;STB=0.50371;STBP=0.858;TYPE=snp;VARB=0.00384951;OID=.;OPOS=5434135;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:45:45:1:2:43:43:0.955556:17:26:0:1:18:25:1:1
chr7	5467858	.	A	G	83.54	PASS	AF=0.625;AO=10;DP=16;FAO=10;FDP=16;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.0501959;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.7492;QD=20.8858;RBI=0.0504356;REFB=-0.107616;REVB=0.00491069;RO=6;SAF=1;SAR=9;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10769;STB=0.562362;STBP=0.738;TYPE=snp;VARB=0.0393857;OID=.;OPOS=5467858;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:16:16:6:6:10:10:0.625:9:1:1:5:9:1:1:5
chr7	5487423	.	C	G	279.16	PASS	AF=0.577778;AO=20;DP=44;FAO=26;FDP=45;FR=.,HEALED;FRO=19;FSAF=20;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.0742285;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=37.9221;QD=24.8139;RBI=0.117134;REFB=-0.0380834;REVB=-0.0906122;RO=16;SAF=14;SAR=6;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0117295;STB=0.57516;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.0313331;OID=.;OPOS=5487423;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:45:16:19:20:26:0.577778:6:14:11:5:6:20:12:7
chr7	5487457	.	CT	AC,CC	548.21	PASS	AF=0.575,0.425;AO=20,11;DP=38;FAO=23,17;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=16,11;FSAR=7,6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00411949,0.0171646;FXX=0.0243843;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=159,111.358;QD=54.8209;RBI=0.0268359,0.0524519;REFB=0,0;REVB=0.0265178,0.0495639;RO=0;SAF=13,5;SAR=7,6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.00474111,0.0228149;OID=.,.;OPOS=5487457,5487458;OREF=CT,T;OALT=AC,C;OMAPALT=AC,CC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:38:40:0:0:20,11:23,17:0.575,0.425:7,6:13,5:0:0:7,6:16,11:0:0
chr7	5515624	.	T	G	1283.44	PASS	AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0109544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.011;QD=61.8526;RBI=0.0140222;REFB=0;REVB=0.00875347;RO=0;SAF=49;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.85265e-06;OID=.;OPOS=5515624;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:34:49:0:0:34:49:0:0
chr7	5518331	.	A	G	115.97	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0655743;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.8651;QD=42.1718;RBI=0.0683236;REFB=0;REVB=-0.0191869;RO=0;SAF=3;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00160973;OID=.;OPOS=5518331;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:8:3:0:0:8:3:0:0
chr7	5518333	.	A	T	115.99	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0877317;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.46;QD=42.1777;RBI=0.0885283;REFB=0;REVB=-0.0118493;RO=0;SAF=3;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00101661;OID=.;OPOS=5518333;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:8:3:0:0:8:3:0:0
chr7	5528883	.	G	A	447.03	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0023991;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=309.277;QD=57.6807;RBI=0.0148768;REFB=0;REVB=0.014682;RO=0;SAF=20;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.11261e-05;OID=.;OPOS=5528883;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:11:20:0:0:11:20:0:0
chr7	5529758	.	G	A	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0565627;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.874;QD=42.1826;RBI=0.0567543;REFB=0;REVB=-0.00465875;RO=0;SAF=3;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000651805;OID=.;OPOS=5529758;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:8:3:0:0:8:3:0:0
chr7	5540769	.	A	C	935.76	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0329751;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.3569;QD=58.4847;RBI=0.0439445;REFB=0;REVB=-0.0290475;RO=0;SAF=30;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.97738e-05;OID=.;OPOS=5540769;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:34:30:0:0:34:30:0:0
chr7	5541657	.	G	A	323.46	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0821647;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.4632;QD=53.9107;RBI=0.104011;REFB=0;REVB=0.0637748;RO=0;SAF=19;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00342697;OID=.;OPOS=5541657;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:5:19:0:0:5:19:0:0
chr7	5660641	.	T	TA	74.1	PASS	AF=0.371429;AO=13;DP=35;FAO=13;FDP=35;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.0820003;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=28.239;QD=8.46821;RBI=0.0820003;REFB=0.00541661;REVB=6.38083e-05;RO=22;SAF=6;SAR=7;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00748266;STB=0.504418;STBP=0.978;TYPE=ins;VARB=-0.00670335;OID=.;OPOS=5660642;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.371429:13:35:13:35:22:6:7:10:12:74:22:6:7:10:12
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chr7	5965258	.	T	C	108.6	PASS	AF=0.40625;AO=13;DP=32;FAO=13;FDP=32;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=0.0741113;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.008;QD=13.5748;RBI=0.0767632;REFB=0.00110897;REVB=0.0200024;RO=19;SAF=10;SAR=3;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.375174;STB=0.721289;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=-0.000458925;OID=.;OPOS=5965258;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:19:19:13:13:0.40625:3:10:8:11:3:10:8:11
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chr7	5983012	.	A	G	78.88	PASS	AF=0.818182;AO=9;DP=11;FAO=9;FDP=11;FR=.;FRO=2;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.000778981;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.784;QD=28.6827;RBI=0.0419198;REFB=-0.0224844;REVB=0.0419126;RO=2;SAF=5;SAR=4;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176689;STB=0.599781;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=0.0044251;OID=.;OPOS=5983012;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:11:11:2:2:9:9:0.818182:4:5:0:2:4:5:0:2
chr7	6026775	.	T	C	392.79	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0367003;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=204.169;QD=56.1135;RBI=0.0464194;REFB=0;REVB=0.0284226;RO=0;SAF=12;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000153642;OID=.;OPOS=6026775;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:16:12:0:0:16:12:0:0
chr7	6026942	.	G	T	913.45	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0182428;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.917;QD=57.0907;RBI=0.0195552;REFB=0;REVB=0.00704325;RO=0;SAF=34;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000220995;OID=.;OPOS=6026942;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:64:0:0:62:64:1:28:34:0:0:30:34:0:0
chr7	6036980	.	G	C	198.73	PASS	AF=0.944444;AO=16;DP=17;FAO=17;FDP=18;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0436843;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.343;QD=44.1614;RBI=0.046888;REFB=0.10619;REVB=0.0170343;RO=1;SAF=4;SAR=12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101073;STB=0.555487;STBP=0.165;TYPE=snp;VARB=-0.00492201;OID=.;OPOS=6036980;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:17:18:1:1:16:17:0.944444:12:4:1:0:13:4:1:0
chr7	6043386	.	G	A	169.16	PASS	AF=0.375;AO=21;DP=56;FAO=21;FDP=56;FR=.;FRO=35;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=0.0113805;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.146;QD=12.0831;RBI=0.0118151;REFB=-0.00404508;REVB=-0.00317489;RO=35;SAF=8;SAR=13;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146005;STB=0.584693;STBP=0.346;TYPE=snp;VARB=0.00633237;OID=.;OPOS=6043386;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:35:35:21:21:0.375:13:8:18:17:13:8:18:17
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chr7	6045627	.	C	T	133.08	PASS	AF=0.866667;AO=13;DP=15;FAO=13;FDP=15;FR=.;FRO=2;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0329522;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=232.744;QD=35.4875;RBI=0.0559775;REFB=-0.0293046;REVB=0.0452508;RO=2;SAF=6;SAR=7;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112976;STB=0.562406;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=0.00613553;OID=.;OPOS=6045627;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:15:15:2:2:13:13:0.866667:7:6:0:2:7:6:0:2
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chr7	6087389	.	C	A	63.68	PASS	AF=0.36;AO=8;DP=24;FAO=9;FDP=25;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.00136336;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.669;QD=10.1882;RBI=0.0275228;REFB=-0.0165212;REVB=-0.0274891;RO=16;SAF=5;SAR=3;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137746;STB=0.535635;STBP=0.769;TYPE=snp;VARB=0.0288351;OID=.;OPOS=6087389;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:24:25:16:16:8:9:0.36:3:5:8:8:4:5:8:8
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chr7	6193464	.	T	G	540.68	PASS	AF=0.60241;AO=49;DP=83;FAO=50;FDP=83;FR=.;FRO=33;FSAF=17;FSAR=33;FSRF=8;FSRR=25;FWDB=0.00530897;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.506;QD=26.0569;RBI=0.0143742;REFB=-0.012274;REVB=-0.0133579;RO=32;SAF=17;SAR=32;SRF=8;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0796974;STB=0.544433;STBP=0.374;TYPE=snp;VARB=0.00750314;OID=.;OPOS=6193464;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:32:33:49:50:0.60241:32:17:8:24:33:17:8:25
chr7	6193521	.	G	C	237.36	PASS	AF=1;AO=17;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0318887;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.286;QD=49.9695;RBI=0.0348663;REFB=0;REVB=0.0140985;RO=0;SAF=6;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00289084;OID=.;OPOS=6193521;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:17:19:1:11:6:0:0:12:7:0:0
chr7	6194274	.	T	C	825.13	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00548718;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.273;QD=56.9054;RBI=0.00575761;REFB=0;REVB=0.00174384;RO=0;SAF=28;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.3885e-05;OID=.;OPOS=6194274;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:58:0:0:57:58:1:29:28:0:0:30:28:0:0
chr7	6199072	.	G	C	316.82	PASS	AF=0.532258;AO=33;DP=62;FAO=33;FDP=62;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=22;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=0.00432862;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.903;QD=20.4402;RBI=0.0145715;REFB=-0.0173678;REVB=0.0139137;RO=29;SAF=11;SAR=22;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21976;STB=0.622146;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=0.0137146;OID=.;OPOS=6199072;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:29:29:33:33:0.532258:22:11:17:12:22:11:17:12
chr7	6202413	.	T	C	88.79	PASS	AF=0.458333;AO=11;DP=24;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.0138639;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.8275;QD=14.7987;RBI=0.0416563;REFB=-0.0144857;REVB=-0.0392815;RO=13;SAF=4;SAR=7;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0947925;STB=0.555453;STBP=0.634;TYPE=snp;VARB=0.0137464;OID=.;OPOS=6202413;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:24:24:13:13:11:11:0.458333:7:4:6:7:7:4:6:7
chr7	6204999	.	A	C	465.13	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0372171;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.806;QD=58.141;RBI=0.0438264;REFB=0;REVB=0.0231439;RO=0;SAF=14;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.07736e-05;OID=.;OPOS=6204999;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:18:14:0:0:18:14:0:0
chr7	6252291	.	G	A	130.03	PASS	AF=0.384615;AO=15;DP=39;FAO=15;FDP=39;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=-0.000992717;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.636;QD=13.3359;RBI=0.017066;REFB=-0.0290183;REVB=-0.0170371;RO=23;SAF=10;SAR=5;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.201691;STB=0.6314;STBP=0.215;TYPE=snp;VARB=0.0454157;OID=.;OPOS=6252291;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:23:24:15:15:0.384615:5:10:11:12:5:10:11:13
chr7	6370194	.	C	T	574.17	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000132934;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.1069;QD=60.439;RBI=0.0317265;REFB=0;REVB=-0.0317262;RO=0;SAF=13;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00031731;OID=.;OPOS=6370194;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:25:13:0:0:25:13:0:0
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chr7	6461534	.	C	T	845.69	PASS	AF=1;AO=57;DP=60;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148204;FXX=0.0327815;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.9288;QD=57.3352;RBI=0.0196935;REFB=0;REVB=0.0129689;RO=0;SAF=19;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00283603;OID=.;OPOS=6461534;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:59:0:0:57:59:1:38:19:0:0:38:21:0:0
chr7	6590996	.	A	T	293.61	PASS	AF=0.568627;AO=28;DP=50;FAO=29;FDP=51;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.0135104;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.357;QD=23.028;RBI=0.0141955;REFB=-0.0383383;REVB=0.00435685;RO=22;SAF=12;SAR=16;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128741;STB=0.576609;STBP=0.213;TYPE=snp;VARB=0.0150701;OID=.;OPOS=6590996;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:51:22:22:28:29:0.568627:16:12:13:9:17:12:13:9
chr7	6656830	.	G	A	820.22	PASS	AF=0.983051;AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0115274;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=240.239;QD=55.6079;RBI=0.0166686;REFB=-0.0859165;REVB=0.0120399;RO=0;SAF=42;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.83285e-08;STB=0.50588;STBP=0.624;TYPE=snp;VARB=1.08222e-05;OID=.;OPOS=6656830;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:59:59:0:1:58:58:0.983051:16:42:0:0:16:42:1:0
chr7	6656897	.	A	G	810.57	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.011654;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.6592;QD=56.8823;RBI=0.0118137;REFB=0;REVB=0.00193574;RO=0;SAF=41;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.47831e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000948549;OID=.;OPOS=6656897;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:57:0:0:55:57:1:14:41:0:0:16:41:0:0
chr7	6660790	.	G	A	653.88	PASS	AF=1;AO=41;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0288886;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.748;QD=60.8263;RBI=0.0539164;REFB=0;REVB=0.0455239;RO=0;SAF=22;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000342187;OID=.;OPOS=6660790;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:43:0:0:41:43:1:19:22:0:0:21:22:0:0
chr7	6713985	.	A	G	411.09	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00306226;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.128;QD=56.7027;RBI=0.0139538;REFB=0;REVB=0.0136137;RO=0;SAF=15;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00011156;OID=.;OPOS=6713985;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:14:15:0:0:14:15:0:0
chr7	6859453	.	C	G	156.42	PASS	AF=0.615385;AO=16;DP=26;FAO=16;FDP=26;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=-0.0128705;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.0846;QD=24.0641;RBI=0.0268035;REFB=-0.024352;REVB=0.0235112;RO=10;SAF=3;SAR=13;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0139096;STB=0.507803;STBP=0.987;TYPE=snp;VARB=0.0159934;OID=.;OPOS=6859453;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:26:26:10:10:16:16:0.615385:13:3:2:8:13:3:2:8
chr7	7283569	.	G	A	272.76	PASS	AF=0.555556;AO=25;DP=45;FAO=25;FDP=45;FR=.;FRO=20;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=-0.0512454;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.5536;QD=24.2456;RBI=0.0512666;REFB=0.0038936;REVB=-0.00147142;RO=20;SAF=16;SAR=9;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00868714;STB=0.504832;STBP=0.97;TYPE=snp;VARB=-0.00625403;OID=.;OPOS=7283569;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:20:20:25:25:0.555556:9:16:13:7:9:16:13:7
chr7	7476098	.	T	C	288.83	PASS	AF=0.545455;AO=30;DP=55;FAO=30;FDP=55;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=-0.00245862;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.113;QD=21.0059;RBI=0.00246536;REFB=-0.0102618;REVB=-0.000182148;RO=25;SAF=13;SAR=17;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168207;STB=0.5932;STBP=0.151;TYPE=snp;VARB=0.0122486;OID=.;OPOS=7476098;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:25:25:30:30:0.545455:17:13:16:9:17:13:16:9
chr7	7493097	.	C	G	1707.99	PASS	AF=0.626556;AO=136;DP=226;FAO=151;FDP=241;FR=.;FRO=90;FSAF=65;FSAR=86;FSRF=44;FSRR=46;FWDB=0.00914191;FXX=0.00413206;HRUN=1;LEN=1;MLLD=320.697;QD=28.3483;RBI=0.0123182;REFB=-0.0117488;REVB=0.00825615;RO=90;SAF=53;SAR=83;SRF=44;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0753273;STB=0.522109;STBP=0.377;TYPE=snp;VARB=0.0072179;OID=.;OPOS=7493097;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:226:241:90:90:136:151:0.626556:83:53:44:46:86:65:44:46
chr7	7495735	.	T	C	460.77	PASS	AF=0.523256;AO=43;DP=84;FAO=45;FDP=86;FR=.;FRO=41;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=28;FSRR=13;FWDB=0.00208723;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.095;QD=21.4312;RBI=0.00754528;REFB=-0.00602659;REVB=-0.00725084;RO=41;SAF=21;SAR=22;SRF=28;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171334;STB=0.582217;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=0.00601622;OID=.;OPOS=7495735;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:86:41:41:43:45:0.523256:22:21:28:13:22:23:28:13
chr7	7514235	.	C	G	513.55	PASS	AF=0.571429;AO=48;DP=84;FAO=48;FDP=84;FR=.;FRO=36;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=-0.00415561;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.736;QD=24.4547;RBI=0.00650371;REFB=-0.0288083;REVB=0.00500291;RO=36;SAF=25;SAR=23;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00543995;STB=0.502981;STBP=0.972;TYPE=snp;VARB=0.00930613;OID=.;OPOS=7514235;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:36:36:48:48:0.571429:23:25:19:17:23:25:19:17
chr7	7545691	.	G	C	427.99	PASS	AF=0.538462;AO=41;DP=78;FAO=42;FDP=78;FR=.;FRO=36;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=0.0312651;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.028;QD=21.948;RBI=0.033688;REFB=-0.0141166;REVB=-0.0125451;RO=36;SAF=22;SAR=19;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0779009;STB=0.547596;STBP=0.413;TYPE=snp;VARB=0.00915881;OID=.;OPOS=7545691;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:36:36:41:42:0.538462:19:22:16:20:19:23:16:20
chr7	7551443	.	A	T	637.04	PASS	AF=0.615385;AO=57;DP=91;FAO=56;FDP=91;FR=.;FRO=35;FSAF=26;FSAR=30;FSRF=11;FSRR=24;FWDB=-0.0064238;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.211;QD=28.0018;RBI=0.00704515;REFB=-0.0172457;REVB=0.00289292;RO=34;SAF=26;SAR=31;SRF=11;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0928395;STB=0.558452;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.0106773;OID=.;OPOS=7551443;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:34:35:57:56:0.615385:31:26:11:23:30:26:11:24
chr7	7571094	.	G	C	1512.0	PASS	AF=1;AO=101;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00625813;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.951;QD=59.8813;RBI=0.0119526;REFB=0;REVB=0.0101833;RO=0;SAF=53;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11453e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.54629e-06;OID=.;OPOS=7571094;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:101:101:0:0:101:101:1:48:53:0:0:48:53:0:0
chr7	7646651	.	G	T	1362.85	PASS	AF=0.988764;AO=88;DP=89;FAO=88;FDP=89;FR=.;FRO=1;FSAF=49;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0506841;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.321;QD=61.2518;RBI=0.0533851;REFB=-0.146642;REVB=0.0167658;RO=1;SAF=49;SAR=39;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00957343;STB=0.505049;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=0.000304352;OID=.;OPOS=7646651;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:89:89:1:1:88:88:0.988764:39:49:1:0:39:49:1:0
chr7	7646687	.	A	G	1654.16	PASS	AF=1;AO=108;DP=109;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00231482;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.289;QD=59.6095;RBI=0.00744821;REFB=0;REVB=0.00707937;RO=0;SAF=56;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.59964e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000444794;OID=.;OPOS=7646687;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:109:111:0:0:108:111:1:52:56:0:0:53:58:0:0
chr7	8125964	.	C	T	1495.69	PASS	AF=0.971698;AO=103;DP=106;FAO=103;FDP=106;FR=.;FRO=3;FSAF=58;FSAR=45;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.000426514;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=191.577;QD=56.4411;RBI=0.0249414;REFB=-0.163265;REVB=0.0249377;RO=3;SAF=58;SAR=45;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00565245;STB=0.50298;STBP=0.74;TYPE=snp;VARB=0.000506983;OID=.;OPOS=8125964;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:106:106:3:3:103:103:0.971698:45:58:2:1:45:58:2:1
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chr7	8167632	.	C	T	363.82	PASS	AF=0.438202;AO=39;DP=89;FAO=39;FDP=89;FR=.;FRO=50;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=31;FSRR=19;FWDB=0.0180156;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.396;QD=16.3516;RBI=0.0201746;REFB=-0.0198821;REVB=-0.0090804;RO=49;SAF=20;SAR=19;SRF=30;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0990773;STB=0.560409;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=0.0187989;OID=.;OPOS=8167632;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:49:50:39:39:0.438202:19:20:30:19:19:20:31:19
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chr7	11581134	.	T	C	817.91	PASS	AF=0.67;AO=67;DP=100;FAO=67;FDP=100;FR=.;FRO=33;FSAF=43;FSAR=24;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=0.00830945;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.325;QD=32.7163;RBI=0.0101537;REFB=-0.0403444;REVB=0.00583523;RO=33;SAF=43;SAR=24;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0819398;STB=0.54429;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=0.0172091;OID=.;OPOS=11581134;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:33:33:67:67:0.67:24:43:17:16:24:43:17:16
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chr7	11676065	.	G	C	75.62	PASS	AF=0.384615;AO=10;DP=26;FAO=10;FDP=26;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=-0.0303728;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.3869;QD=11.6338;RBI=0.0362074;REFB=0.0205558;REVB=0.0197096;RO=16;SAF=4;SAR=6;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.289664;STB=0.671317;STBP=0.198;TYPE=snp;VARB=-0.0173794;OID=.;OPOS=11676065;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:26:26:16:16:10:10:0.384615:6:4:11:5:6:4:11:5
chr7	11676377	.	G	A	545.52	PASS	AF=0.365169;AO=65;DP=179;FAO=65;FDP=178;FR=.;FRO=113;FSAF=45;FSAR=20;FSRF=61;FSRR=52;FWDB=0.00398348;FXX=0.0111105;HRUN=3;LEN=1;MLLD=157.316;QD=12.2589;RBI=0.0219263;REFB=-0.00845991;REVB=-0.0215614;RO=113;SAF=45;SAR=20;SRF=61;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.182888;STB=0.604444;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.0189644;OID=.;OPOS=11676377;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:179:178:113:113:65:65:0.365169:20:45:61:52:20:45:61:52
chr7	12269417	.	C	G	453.52	PASS	AF=0.48913;AO=45;DP=92;FAO=45;FDP=92;FR=.;FRO=47;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=12;FSRR=35;FWDB=0.00490435;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.223;QD=19.718;RBI=0.00564658;REFB=0.0058751;REVB=0.00279844;RO=47;SAF=22;SAR=23;SRF=12;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.217428;STB=0.619969;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=-0.00667765;OID=.;OPOS=12269417;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:47:47:45:45:0.48913:23:22:12:35:23:22:12:35
chr7	12271997	.	G	A	356.22	PASS	AF=0.590164;AO=32;DP=58;FAO=36;FDP=61;FR=.;FRO=25;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=-0.00372452;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.4811;QD=23.3589;RBI=0.0409472;REFB=-0.038248;REVB=0.0407774;RO=24;SAF=17;SAR=15;SRF=17;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139719;STB=0.562983;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=0.0418419;OID=.;OPOS=12271997;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:61:24:25:32:36:0.590164:15:17:17:7:17:19:17:8
chr7	12370794	.	T	C	691.96	PASS	AF=0.584071;AO=66;DP=113;FAO=66;FDP=113;FR=.;FRO=47;FSAF=38;FSAR=28;FSRF=26;FSRR=21;FWDB=-0.0048274;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.8491;QD=24.4942;RBI=0.0554768;REFB=-0.00106481;REVB=0.0552663;RO=47;SAF=38;SAR=28;SRF=26;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0175692;STB=0.509576;STBP=0.818;TYPE=snp;VARB=0.00114535;OID=.;OPOS=12370794;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:113:47:47:66:66:0.584071:28:38:26:21:28:38:26:21
chr7	12376811	.	A	C	572.3	PASS	AF=0.527273;AO=58;DP=110;FAO=58;FDP=110;FR=.;FRO=52;FSAF=27;FSAR=31;FSRF=24;FSRR=28;FWDB=0.00130202;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=288.594;QD=20.8109;RBI=0.00624566;REFB=0.00494129;REVB=0.00610844;RO=52;SAF=27;SAR=31;SRF=24;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00343641;STB=0.50189;STBP=0.968;TYPE=snp;VARB=-0.00416936;OID=.;OPOS=12376811;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:110:52:52:58:58:0.527273:31:27:24:28:31:27:24:28
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chr7	12395813	.	T	C	940.64	PASS	AF=1;AO=64;DP=65;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0100389;FXX=0.0153822;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.0745;QD=58.7902;RBI=0.0174998;REFB=0;REVB=-0.014334;RO=0;SAF=34;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000218625;OID=.;OPOS=12395813;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:64:0:0:64:64:1:30:34:0:0:30:34:0:0
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chr7	12410112	.	G	A	149.05	PASS	AF=0.3;AO=20;DP=69;FAO=21;FDP=70;FR=.;FRO=49;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=23;FSRR=26;FWDB=-0.00111498;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.562;QD=8.51728;RBI=0.00623449;REFB=-0.00143891;REVB=0.00613398;RO=49;SAF=11;SAR=9;SRF=23;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.095531;STB=0.571361;STBP=0.469;TYPE=snp;VARB=0.00517106;OID=.;OPOS=12410112;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:70:49:49:20:21:0.3:9:11:23:26:9:12:23:26
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chr7	12419108	.	A	T	227.14	PASS	AF=0.35;AO=28;DP=80;FAO=28;FDP=80;FR=.;FRO=52;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=29;FSRR=23;FWDB=-0.0104133;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=109.321;QD=11.3571;RBI=0.0239974;REFB=-0.0131268;REVB=-0.0216204;RO=51;SAF=14;SAR=14;SRF=29;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.076659;STB=0.537473;STBP=0.622;TYPE=snp;VARB=0.0183984;OID=.;OPOS=12419108;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:51:52:28:28:0.35:14:14:29:22:14:14:29:23
chr7	12428608	.	C	A	404.86	PASS	AF=0.66;AO=33;DP=50;FAO=33;FDP=50;FR=.;FRO=17;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=0.00984235;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.529;QD=32.3885;RBI=0.0115686;REFB=0.00693517;REVB=-0.00607953;RO=17;SAF=13;SAR=20;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0661362;STB=0.536061;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=-0.00304298;OID=.;OPOS=12428608;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:17:17:33:33:0.66:20:13:5:12:20:13:5:12
chr7	12428803	.	G	A	751.9	PASS	AF=0.601695;AO=61;DP=110;FAO=71;FDP=118;FR=.;FRO=47;FSAF=29;FSAR=42;FSRF=29;FSRR=18;FWDB=0.00633868;FXX=0.0166653;HRUN=1;LEN=1;MLLD=298.195;QD=25.488;RBI=0.0176668;REFB=-0.00758626;REVB=0.0164905;RO=46;SAF=19;SAR=42;SRF=29;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.260366;STB=0.58331;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.00738908;OID=.;OPOS=12428803;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:118:46:47:61:71:0.601695:42:19:29:17:42:29:29:18
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chr7	12611252	.	T	C	487.15	PASS	AF=0.371069;AO=59;DP=160;FAO=59;FDP=159;FR=.;FRO=100;FSAF=19;FSAR=40;FSRF=51;FSRR=49;FWDB=-0.00200089;FXX=0.00624961;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.143;QD=12.2552;RBI=0.0204692;REFB=-0.00760653;REVB=0.0203712;RO=98;SAF=19;SAR=40;SRF=49;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20481;STB=0.623426;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.013152;OID=.;OPOS=12611252;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:160:159:98:100:59:59:0.371069:40:19:49:49:40:19:51:49
chr7	12620804	.	C	T	286.76	PASS	AF=0.31405;AO=37;DP=120;FAO=38;FDP=121;FR=.;FRO=83;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=45;FSRR=38;FWDB=0.0115315;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.539;QD=9.47952;RBI=0.0115688;REFB=0.00467768;REVB=0.00092771;RO=83;SAF=19;SAR=18;SRF=45;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0339709;STB=0.52891;STBP=0.66;TYPE=snp;VARB=-0.00919438;OID=.;OPOS=12620804;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:121:83:83:37:38:0.31405:18:19:45:38:19:19:45:38
chr7	12636026	.	T	C	446.91	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00570981;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.8659;QD=57.6653;RBI=0.0956463;REFB=0;REVB=0.0954757;RO=0;SAF=13;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.33668e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00161552;OID=.;OPOS=12636026;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:18:13:0:0:18:13:0:0
chr7	12730503	.	T	G	790.56	PASS	AF=0.719101;AO=64;DP=89;FAO=64;FDP=89;FR=.;FRO=25;FSAF=27;FSAR=37;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=-0.00266532;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=245.62;QD=35.5307;RBI=0.0039106;REFB=-0.00165105;REVB=0.00286163;RO=25;SAF=27;SAR=37;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0117334;STB=0.506309;STBP=0.865;TYPE=snp;VARB=0.000774227;OID=.;OPOS=12730503;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:25:25:64:64:0.719101:37:27:10:15:37:27:10:15
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chr7	14758273	.	C	T	2027.41	PASS	AF=0.985075;AO=131;DP=133;FAO=132;FDP=134;FR=.;FRO=2;FSAF=54;FSAR=78;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0138241;FXX=0.00740686;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.0851;QD=60.5197;RBI=0.0142902;REFB=-0.0399796;REVB=0.00362005;RO=2;SAF=53;SAR=78;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00282837;STB=0.501402;STBP=0.858;TYPE=snp;VARB=0.00186125;OID=.;OPOS=14758273;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:133:134:2:2:131:132:0.985075:78:53:1:1:78:54:1:1
chr7	15651770	.	C	T	501.63	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0544719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.2378;QD=59.0154;RBI=0.0545288;REFB=0;REVB=-0.0024912;RO=0;SAF=14;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.48532e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000682721;OID=.;OPOS=15651770;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:20:14:0:0:20:14:0:0
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chr7	16899197	.	C	T	817.74	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00675282;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.541;QD=57.385;RBI=0.00678449;REFB=0;REVB=0.000654766;RO=0;SAF=28;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.76954e-06;OID=.;OPOS=16899197;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:29:28:0:0:29:28:0:0
chr7	16913394	.	A	G	708.28	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0542044;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.1742;QD=62.958;RBI=0.060633;REFB=0;REVB=0.0271707;RO=0;SAF=18;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00122774;OID=.;OPOS=16913394;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:27:18:0:0:27:18:0:0
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chr7	20421490	.	T	C	1896.41	PASS	AF=1;AO=123;DP=123;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0231535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.706;QD=61.6718;RBI=0.0231569;REFB=0;REVB=-0.000392652;RO=0;SAF=57;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.30106e-05;OID=.;OPOS=20421490;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:123:123:0:0:123:123:1:66:57:0:0:66:57:0:0
chr7	20698270	.	A	G	684.28	PASS	AF=0.469388;AO=69;DP=147;FAO=69;FDP=147;FR=.;FRO=78;FSAF=31;FSAR=38;FSRF=35;FSRR=43;FWDB=-0.000475123;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.896;QD=18.6198;RBI=0.00622382;REFB=-0.0117723;REVB=-0.00620566;RO=78;SAF=31;SAR=38;SRF=35;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000539161;STB=0.500299;STBP=0.997;TYPE=snp;VARB=0.0128673;OID=.;OPOS=20698270;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:147:147:78:78:69:69:0.469388:38:31:35:43:38:31:35:43
chr7	20768013	.	G	A	1478.29	PASS	AF=0.971429;AO=101;DP=105;FAO=102;FDP=105;FR=.;FRO=3;FSAF=45;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.00613164;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.271;QD=56.3158;RBI=0.00781079;REFB=0.0108733;REVB=-0.00483854;RO=3;SAF=45;SAR=56;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0247351;STB=0.512818;STBP=0.163;TYPE=snp;VARB=-0.000333465;OID=.;OPOS=20768013;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:105:105:3:3:101:102:0.971429:56:45:0:3:57:45:0:3
chr7	20778646	.	G	A	2081.43	PASS	AF=1;AO=124;DP=124;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0196028;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.983;QD=62.5993;RBI=0.0229923;REFB=0;REVB=0.0120156;RO=0;SAF=58;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.18609e-05;OID=.;OPOS=20778646;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:124:133:0:0:124:133:1:66:58:0:0:68:65:0:0
chr7	20822196	.	A	AC	787.33	PASS	AF=1;AO=67;DP=72;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.077304;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=21.4213;QD=44.99;RBI=0.107869;REFB=0;REVB=0.0752317;RO=3;SAF=34;SAR=33;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0128853;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00309843;OID=.;OPOS=20822197;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:67:72:70:70:0:36:34:0:0:15:3:34:33:2:1
chr7	20824614	.	C	T	586.72	PASS	AF=0.689189;AO=51;DP=74;FAO=51;FDP=74;FR=.;FRO=23;FSAF=33;FSAR=18;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=0.0118372;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=150.628;QD=31.7148;RBI=0.0180446;REFB=-0.0289399;REVB=0.0136194;RO=23;SAF=33;SAR=18;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102549;STB=0.555533;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=0.00788528;OID=.;OPOS=20824614;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:23:23:51:51:0.689189:18:33:11:12:18:33:11:12
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chr7	21737718	.	A	G	1150.79	PASS	AF=0.712121;AO=92;DP=134;FAO=94;FDP=132;FR=.;FRO=38;FSAF=41;FSAR=53;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=-0.00952263;FXX=0.0149243;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.707;QD=34.8723;RBI=0.0166842;REFB=-0.00535182;REVB=0.0136997;RO=37;SAF=41;SAR=51;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0220403;STB=0.518587;STBP=0.544;TYPE=snp;VARB=0.00249774;OID=.;OPOS=21737718;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:134:132:37:38:92:94:0.712121:51:41:18:19:53:41:19:19
chr7	21775387	.	T	C	369.38	PASS	AF=0.415842;AO=42;DP=102;FAO=42;FDP=101;FR=.;FRO=59;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=29;FSRR=30;FWDB=-0.0137078;FXX=0.00980296;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.524;QD=14.629;RBI=0.0291858;REFB=-0.00646357;REVB=0.0257664;RO=59;SAF=17;SAR=25;SRF=29;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.091269;STB=0.551534;STBP=0.415;TYPE=snp;VARB=0.00975278;OID=.;OPOS=21775387;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:101:59:59:42:42:0.415842:25:17:29:30:25:17:29:30
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chr7	21778449	.	C	T	218.06	PASS	AF=0.355263;AO=27;DP=76;FAO=27;FDP=76;FR=.;FRO=49;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=28;FWDB=-0.00794485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.3;QD=11.4766;RBI=0.0431451;REFB=-0.00257897;REVB=-0.0424073;RO=48;SAF=11;SAR=16;SRF=21;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0342195;STB=0.514046;STBP=0.866;TYPE=snp;VARB=0.00585682;OID=.;OPOS=21778449;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:48:49:27:27:0.355263:16:11:21:27:16:11:21:28
chr7	21856151	.	G	A	1407.65	PASS	AF=1;AO=89;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00944239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.94;QD=61.8746;RBI=0.0596056;REFB=0;REVB=-0.0588529;RO=0;SAF=46;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00138529;OID=.;OPOS=21856151;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:91:91:0:0:89:91:1:43:46:0:0:45:46:0:0
chr7	21901566	.	T	C	569.84	PASS	AF=0.542857;AO=57;DP=105;FAO=57;FDP=105;FR=.;FRO=48;FSAF=21;FSAR=36;FSRF=22;FSRR=26;FWDB=0.0268112;FXX=0.0186898;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.709;QD=21.7081;RBI=0.027344;REFB=0.000440941;REVB=-0.00537185;RO=48;SAF=21;SAR=36;SRF=22;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0785035;STB=0.543142;STBP=0.356;TYPE=snp;VARB=-0.000291032;OID=.;OPOS=21901566;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:105:48:48:57:57:0.542857:36:21:22:26:36:21:22:26
chr7	21901593	.	G	A	375.48	PASS	AF=0.47561;AO=39;DP=82;FAO=39;FDP=82;FR=.;FRO=43;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=17;FSRR=26;FWDB=-0.00160682;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.519;QD=18.3163;RBI=0.0186237;REFB=-0.0042113;REVB=-0.0185542;RO=43;SAF=19;SAR=20;SRF=17;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0866531;STB=0.548282;STBP=0.426;TYPE=snp;VARB=0.00366186;OID=.;OPOS=21901593;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:43:43:39:39:0.47561:20:19:17:26:20:19:17:26
chr7	21924014	.	A	G	1379.35	PASS	AF=1;AO=88;DP=89;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0485309;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.361;QD=62.6978;RBI=0.0489328;REFB=0;REVB=0.0062587;RO=0;SAF=39;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.45343e-05;OID=.;OPOS=21924014;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:89:88:0:0:88:88:1:49:39:0:0:49:39:0:0
chr7	21932044	.	C	T	1008.46	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00200876;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.318;QD=59.3214;RBI=0.0235146;REFB=0;REVB=0.0234286;RO=0;SAF=37;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.32141e-05;OID=.;OPOS=21932044;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:31:37:0:0:31:37:0:0
chr7	21941375	.	CTCCAGTG	C	1139.69	PASS	AF=0.962963;AO=73;DP=75;FAO=78;FDP=81;FR=.;FRO=3;FSAF=46;FSAR=32;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0116718;FXX=0;HRUN=1;LEN=7;MLLD=306.533;QD=56.2808;RBI=0.0222134;REFB=-0.0128816;REVB=0.0188999;RO=0;SAF=43;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.502946;STBP=0.79;TYPE=del;VARB=0.000576188;OID=.;OPOS=21941376;OREF=TCCAGTG;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.962963:73:75:78:81:3:46:32:2:1:8:0:43:30:0:0
chr7	21941439	.	A	G	352.91	PASS	AF=0.392523;AO=42;DP=107;FAO=42;FDP=107;FR=.;FRO=65;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=31;FSRR=34;FWDB=0.0249908;FXX=0.0092584;HRUN=4;LEN=1;MLLD=93.9342;QD=13.193;RBI=0.0249959;REFB=0.00385221;REVB=0.000504759;RO=64;SAF=21;SAR=21;SRF=30;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0332805;STB=0.514012;STBP=0.803;TYPE=snp;VARB=-0.0117826;OID=.;OPOS=21941439;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:107:64:65:42:42:0.392523:21:21:30:34:21:21:31:34
chr7	22197507	.	A	G	1495.08	PASS	AF=0.989583;AO=95;DP=96;FAO=95;FDP=96;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0279826;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.2613;QD=62.2951;RBI=0.0360872;REFB=0.0486437;REVB=-0.0227873;RO=1;SAF=34;SAR=61;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00771102;STB=0.504064;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=-0.00109703;OID=.;OPOS=22197507;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:96:96:1:1:95:95:0.989583:61:34:0:1:61:34:0:1
chr7	22202117	.	G	A	251.87	PASS	AF=0.348315;AO=29;DP=87;FAO=31;FDP=89;FR=.;FRO=58;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=25;FSRR=33;FWDB=-0.0115061;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.901;QD=11.32;RBI=0.0144949;REFB=-0.000586779;REVB=-0.0088155;RO=58;SAF=13;SAR=16;SRF=25;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0200148;STB=0.513564;STBP=0.873;TYPE=snp;VARB=0.00111876;OID=.;OPOS=22202117;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:89:58:58:29:31:0.348315:16:13:25:33:17:14:25:33
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chr7	22857682	.	A	G	320.81	PASS	AF=0.55;AO=33;DP=60;FAO=33;FDP=60;FR=.;FRO=27;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=0.0186869;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.013;QD=21.3871;RBI=0.0192617;REFB=-0.00242558;REVB=-0.00467046;RO=27;SAF=18;SAR=15;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0821256;STB=0.545427;STBP=0.484;TYPE=snp;VARB=0.00309595;OID=.;OPOS=22857682;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:27:27:33:33:0.55:15:18:12:15:15:18:12:15
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chr7	23757162	.	G	C	385.26	PASS	AF=0.414141;AO=41;DP=98;FAO=41;FDP=99;FR=.;FRO=58;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=31;FSRR=27;FWDB=-0.0403643;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.2635;QD=15.5659;RBI=0.0588407;REFB=-0.010336;REVB=0.0428131;RO=57;SAF=19;SAR=22;SRF=30;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0648425;STB=0.541585;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.0153852;OID=.;OPOS=23757162;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:99:57:58:41:41:0.414141:22:19:30:27:22:19:31:27
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chr7	24329133	.	C	T	153.42	PASS	AF=0.386364;AO=17;DP=44;FAO=17;FDP=44;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=-0.000692287;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.82;QD=13.9475;RBI=0.0192167;REFB=-0.00985634;REVB=-0.0192042;RO=27;SAF=12;SAR=5;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.249203;STB=0.645714;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=0.0278925;OID=.;OPOS=24329133;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:27:27:17:17:0.386364:5:12:13:14:5:12:13:14
chr7	24703298	.	G	A	1695.29	PASS	AF=1;AO=112;DP=112;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0199744;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.572;QD=60.5459;RBI=0.0538687;REFB=0;REVB=0.0500286;RO=0;SAF=47;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.8673e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.31108e-05;OID=.;OPOS=24703298;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:112:112:0:0:112:112:1:65:47:0:0:65:47:0:0
chr7	24758753	.	C	T	1208.89	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0272096;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.914;QD=61.2098;RBI=0.0278167;REFB=0;REVB=-0.00577964;RO=0;SAF=46;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000116756;OID=.;OPOS=24758753;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:33:46:0:0:33:46:0:0
chr7	24758795	.	T	C	1158.86	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.127752;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.7176;QD=60.2007;RBI=0.127756;REFB=0;REVB=-0.00104716;RO=0;SAF=41;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0011233;OID=.;OPOS=24758795;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:77:0:0:76:77:1:35:41:0:0:35:42:0:0
chr7	24758818	.	G	T	862.69	PASS	AF=0.968254;AO=61;DP=64;FAO=61;FDP=63;FR=.;FRO=2;FSAF=26;FSAR=35;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0188755;FXX=0.0156226;HRUN=3;LEN=1;MLLD=216.426;QD=54.7741;RBI=0.0252056;REFB=-0.0892;REVB=-0.0167044;RO=1;SAF=26;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0178082;STB=0.518512;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.00429266;OID=.;OPOS=24758818;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:64:63:1:2:61:61:0.968254:35:26:1:0:35:26:2:0
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chr7	25194665	.	G	C	809.53	PASS	AF=0.581395;AO=75;DP=129;FAO=75;FDP=129;FR=.;FRO=54;FSAF=42;FSAR=33;FSRF=32;FSRR=22;FWDB=0.00421477;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.826;QD=25.1018;RBI=0.046119;REFB=-0.000536591;REVB=0.045926;RO=52;SAF=42;SAR=33;SRF=30;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129493;STB=0.513885;STBP=0.724;TYPE=snp;VARB=0.000430236;OID=.;OPOS=25194665;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:129:129:52:54:75:75:0.581395:33:42:30:22:33:42:32:22
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chr7	25207994	.	G	A	660.58	PASS	AF=0.528455;AO=65;DP=124;FAO=65;FDP=123;FR=.;FRO=58;FSAF=12;FSAR=53;FSRF=12;FSRR=46;FWDB=0.0176984;FXX=0.0159987;HRUN=4;LEN=1;MLLD=195.392;QD=21.4821;RBI=0.0212953;REFB=-0.0161461;REVB=0.011843;RO=58;SAF=12;SAR=53;SRF=12;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0310253;STB=0.517068;STBP=0.744;TYPE=snp;VARB=0.0166637;OID=.;OPOS=25207994;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:124:123:58:58:65:65:0.528455:53:12:12:46:53:12:12:46
chr7	25267934	.	T	C	151.86	PASS	AF=0.295775;AO=21;DP=71;FAO=21;FDP=71;FR=.;FRO=50;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=24;FSRR=26;FWDB=0.0411027;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.6936;QD=8.55562;RBI=0.0637487;REFB=-0.00132136;REVB=0.0487285;RO=50;SAF=8;SAR=13;SRF=24;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11957;STB=0.57136;STBP=0.455;TYPE=snp;VARB=0.00562424;OID=.;OPOS=25267934;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:50:50:21:21:0.295775:13:8:24:26:13:8:24:26
chr7	25267963	.	G	C	1044.35	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0217565;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.7937;QD=59.6773;RBI=0.0368402;REFB=0;REVB=0.0297298;RO=0;SAF=27;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.56939e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000306712;OID=.;OPOS=25267963;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:70:0:0:69:70:1:42:27:0:0:43:27:0:0
chr7	25304395	.	A	G	717.93	PASS	AF=0.609091;AO=67;DP=110;FAO=67;FDP=110;FR=.;FRO=43;FSAF=33;FSAR=34;FSRF=27;FSRR=16;FWDB=-0.0154662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.173;QD=26.1065;RBI=0.0157976;REFB=-0.00941713;REVB=-0.0032187;RO=42;SAF=33;SAR=34;SRF=26;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0897136;STB=0.55283;STBP=0.184;TYPE=snp;VARB=0.00457403;OID=.;OPOS=25304395;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:110:42:43:67:67:0.609091:34:33:26:16:34:33:27:16
chr7	26224668	.	C	T	1589.69	PASS	AF=1;AO=106;DP=106;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0203152;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.38;QD=59.9882;RBI=0.0215987;REFB=0;REVB=-0.00733453;RO=0;SAF=59;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.59218e-05;OID=.;OPOS=26224668;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:106:106:0:0:106:106:1:47:59:0:0:47:59:0:0
chr7	26251843	.	C	T	40.62	PASS	AF=0.123288;AO=10;DP=81;FAO=9;FDP=73;FR=.;FRO=64;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=19;FSRR=45;FWDB=0.00946965;FXX=0.0987532;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.115;QD=2.22548;RBI=0.00988604;REFB=0.000592647;REVB=-0.00283893;RO=69;SAF=5;SAR=5;SRF=26;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151595;STB=0.718063;STBP=0.214;TYPE=snp;VARB=-0.00311272;OID=.;OPOS=26251843;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:40:81:73:69:64:10:9:0.123288:5:5:26:43:4:5:19:45
chr7	26252932	.	CTGG	C	57.11	PASS	AF=0.150685;AO=11;DP=72;FAO=11;FDP=73;FR=.;FRO=62;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=21;FSRR=41;FWDB=-0.0320145;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=279.265;QD=3.1291;RBI=0.0326044;REFB=-0.00262188;REVB=-0.00617397;RO=61;SAF=7;SAR=4;SRF=21;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.350258;STB=0.737321;STBP=0.107;TYPE=del;VARB=0.0139395;OID=.;OPOS=26252933;OREF=TGG;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.150685:11:72:11:73:62:7:4:21:41:57:61:7:4:21:40
chr7	27135314	.	C	T	266.52	PASS	AF=1;AO=20;DP=21;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000703959;FXX=0.0908678;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.035;QD=53.3036;RBI=0.0294777;REFB=0;REVB=0.0294693;RO=0;SAF=12;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00239215;OID=.;OPOS=27135314;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:20:0:0:20:20:1:8:12:0:0:8:12:0:0
chr7	27169093	.	T	G	1659.15	PASS	AF=1;AO=110;DP=110;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0205042;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.535;QD=60.3327;RBI=0.0212943;REFB=0;REVB=0.0057466;RO=0;SAF=65;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.58497e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.40263e-05;OID=.;OPOS=27169093;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:110:110:0:0:110:110:1:45:65:0:0:45:65:0:0
chr7	27196069	.	A	C	3036.98	PASS	AF=0.994975;AO=197;DP=202;FAO=198;FDP=199;FR=.;FRO=1;FSAF=74;FSAR=124;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0522842;FXX=0.0197035;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.2714;QD=61.0449;RBI=0.0746947;REFB=-0.0500812;REVB=0.0533447;RO=1;SAF=73;SAR=124;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00647929;STB=0.503355;STBP=0.263;TYPE=snp;VARB=0.000899318;OID=.;OPOS=27196069;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:202:199:1:1:197:198:0.994975:124:73:1:0:124:74:1:0
chr7	27196113	.	C	T	3311.66	PASS	AF=0.940928;AO=221;DP=235;FAO=223;FDP=237;FR=.;FRO=14;FSAF=78;FSAR=145;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=0.0847712;FXX=0.00836785;HRUN=5;LEN=1;MLLD=52.9874;QD=55.8931;RBI=0.0945221;REFB=-0.145879;REVB=0.0418122;RO=14;SAF=76;SAR=145;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0457515;STB=0.523335;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.00814961;OID=.;OPOS=27196113;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:26:235:237:14:14:221:223:0.940928:145:76:10:4:145:78:10:4
chr7	27202289	.	A	G	678.62	PASS	AF=1;AO=44;DP=45;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00398848;FXX=0.0444346;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.271;QD=63.127;RBI=0.0248999;REFB=0;REVB=0.0245784;RO=0;SAF=25;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.8237e-05;OID=.;OPOS=27202289;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:43:0:0:44:43:1:19:25:0:0:19:24:0:0
chr7	27210428	.	A	AG	1542.05	PASS	AF=1;AO=86;DP=151;FAO=143;FDP=143;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0808088;FXX=0.00694396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=19.0255;QD=43.1343;RBI=0.0823892;REFB=0;REVB=0.0160596;RO=61;SAF=46;SAR=40;SRF=39;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0807114;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00109355;OID=.;OPOS=27210429;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:86:151:143:143:0:84:59:0:0:30:61:46:40:39:22
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chr7	27210430	.	T	G	214.07	PASS	AF=0.253333;AO=37;DP=149;FAO=38;FDP=150;FR=.;FRO=112;FSAF=27;FSAR=11;FSRF=59;FSRR=53;FWDB=0.00464205;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=37.1437;QD=5.70863;RBI=0.00726852;REFB=-0.0219583;REVB=0.0055931;RO=112;SAF=26;SAR=11;SRF=59;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.231196;STB=0.646143;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.0483248;OID=.;OPOS=27210430;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:149:150:112:112:37:38:0.253333:11:26:59:53:11:27:59:53
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chr7	27279191	.	T	G	772.62	PASS	AF=0.617391;AO=70;DP=114;FAO=71;FDP=115;FR=.;FRO=44;FSAF=28;FSAR=43;FSRF=23;FSRR=21;FWDB=0.00315196;FXX=0.00861995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.702;QD=26.8737;RBI=0.00386881;REFB=-0.0168243;REVB=0.00224339;RO=44;SAF=28;SAR=42;SRF=23;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0890681;STB=0.550299;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=0.00785528;OID=.;OPOS=27279191;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:114:115:44:44:70:71:0.617391:42:28:23:21:43:28:23:21
chr7	27702390	.	C	A	1292.95	PASS	AF=0.685185;AO=110;DP=161;FAO=111;FDP=162;FR=.;FRO=51;FSAF=49;FSAR=62;FSRF=25;FSRR=26;FWDB=0.0166702;FXX=0.00613459;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.192;QD=31.9246;RBI=0.0251038;REFB=-0.0257474;REVB=0.0187699;RO=51;SAF=49;SAR=61;SRF=25;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0266238;STB=0.515503;STBP=0.593;TYPE=snp;VARB=0.0152715;OID=.;OPOS=27702390;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:161:162:51:51:110:111:0.685185:61:49:25:26:62:49:25:26
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chr7	28996557	.	CC	TC,TT	581.63	PASS	AF=0.926829,0.0487805;AO=36,2;DP=41;FAO=38,2;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=18,0;FSAR=20,2;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0512289,0.00369548;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,2;MLLD=124.489,106.232;QD=56.7444;RBI=0.0587601,0.0304091;REFB=-0.158804,0.00346026;REVB=0.0287809,-0.0301837;RO=1;SAF=18,0;SAR=18,2;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0252932,0;STB=0.512189,0.5;STBP=0.521,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.00405038,0.0898759;OID=.,.;OPOS=28996557,28996557;OREF=C,CC;OALT=T,TT;OMAPALT=TC,TT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:41:41:1:1:36,2:38,2:0.926829,0.0487805:18,2:18,0:0:1:20,2:18,0:0:1
chr7	28996944	.	T	C	411.11	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00425839;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.652;QD=56.705;RBI=0.0134364;REFB=0;REVB=0.0127437;RO=0;SAF=12;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.0947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.97159e-05;OID=.;OPOS=28996944;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:17:12:0:0:17:12:0:0
chr7	28997141	.	G	C	739.73	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0652113;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.78;QD=62.9556;RBI=0.0652191;REFB=0;REVB=0.00100778;RO=0;SAF=19;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000834218;OID=.;OPOS=28997141;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:47:0:0:46:47:1:27:19:0:0:27:20:0:0
chr7	28997497	.	GCCA	GCA,GCAG,GGCA	769.62	PASS	AF=1,0,0;AO=50,3,2;DP=55;FAO=56,0,0;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=20,0,0;FSAR=36,0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100348,-0.0863635,-0.0402056;FXX=0;HRUN=2,2,2;LEN=1,2,1;MLLD=25.5025,5.46268,7.85125;QD=54.9727;RBI=0.0852736,0.117532,0.135924;REFB=0,0,0;REVB=-0.0846811,-0.0797188,-0.129842;RO=0;SAF=16,3,0;SAR=34,0,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,mnp,snp;VARB=-0.00174486,0,0;OID=.,.,.;OPOS=28997498,28997499,28997498;OREF=C,CA,C;OALT=-,AG,G;OMAPALT=GCA,GCAG,GGCA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1,0,0:50,3,2:55:56,0,0:56:0:20,0,0:36,0,0:0:0:4:0:16,3,0:34,0,2:0:0
chr7	29186256	.	A	G	1007.68	PASS	AF=1;AO=67;DP=68;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0135241;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.398;QD=58.4163;RBI=0.0166635;REFB=0;REVB=-0.00973502;RO=0;SAF=30;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.72238e-05;OID=.;OPOS=29186256;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:69:0:0:67:69:1:37:30:0:0:38:31:0:0
chr7	29186576	.	A	G	1513.41	PASS	AF=1;AO=101;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0075594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.109;QD=59.9372;RBI=0.0110601;REFB=0;REVB=-0.00807351;RO=0;SAF=59;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.15915e-06;OID=.;OPOS=29186576;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:101:101:0:0:101:101:1:42:59:0:0:42:59:0:0
chr7	29433356	.	A	G	554.8	PASS	AF=0.513514;AO=56;DP=110;FAO=57;FDP=111;FR=.;FRO=54;FSAF=28;FSAR=29;FSRF=32;FSRR=22;FWDB=0.00589089;FXX=0.00892777;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.3745;QD=19.9927;RBI=0.0169627;REFB=-0.00935323;REVB=0.015907;RO=54;SAF=27;SAR=29;SRF=32;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0980615;STB=0.549225;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.00877899;OID=.;OPOS=29433356;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:111:54:54:56:57:0.513514:29:27:32:22:29:28:32:22
chr7	29440195	.	C	T	255.13	PASS	AF=0.521739;AO=24;DP=46;FAO=24;FDP=46;FR=.;FRO=22;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=-0.0100469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.475;QD=22.1848;RBI=0.014945;REFB=-0.00548983;REVB=-0.011064;RO=22;SAF=16;SAR=8;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.297553;STB=0.666528;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.00441388;OID=.;OPOS=29440195;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:22:22:24:24:0.521739:8:16:7:15:8:16:7:15
chr7	29523563	.	G	A	1661.93	PASS	AF=1;AO=109;DP=110;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00231326;FXX=0.0090082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.011;QD=60.4338;RBI=0.0184221;REFB=0;REVB=0.0182763;RO=0;SAF=74;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000103218;OID=.;OPOS=29523563;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:110:110:0:0:109:110:1:35:74:0:0:35:75:0:0
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chr7	29605975	.	C	G	103.48	PASS	AF=0.5;AO=13;DP=25;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=-0.290377;FXX=0.039984;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.098;QD=17.2471;RBI=0.290752;REFB=-0.0824535;REVB=0.0147669;RO=11;SAF=2;SAR=11;SRF=1;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10618;STB=0.610894;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=0.0688472;OID=.;OPOS=29605975;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:24:11:12:13:12:0.5:11:2:1:10:11:1:2:10
chr7	29606288	.	C	T	103.51	PASS	AF=0.545455;AO=12;DP=22;FAO=12;FDP=22;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=9;FWDB=0.024489;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=279.817;QD=18.8207;RBI=0.0244983;REFB=-0.0106368;REVB=0.000676518;RO=10;SAF=5;SAR=7;SRF=1;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.276585;STB=0.655514;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=0.0145338;OID=.;OPOS=29606288;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:22:22:10:10:12:12:0.545455:7:5:1:9:7:5:1:9
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chr7	32529936	.	G	C	501.63	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0151331;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=92.1474;QD=59.0152;RBI=0.0163541;REFB=0;REVB=-0.00620063;RO=0;SAF=13;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000185545;OID=.;OPOS=32529936;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:21:13:0:0:21:13:0:0
chr7	32530105	.	G	C	911.78	PASS	AF=0.969697;AO=64;DP=66;FAO=64;FDP=66;FR=.;FRO=2;FSAF=33;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0274349;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=153.011;QD=55.2594;RBI=0.0275286;REFB=-0.0246369;REVB=-0.00226909;RO=2;SAF=33;SAR=31;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000894695;STB=0.500474;STBP=0.879;TYPE=snp;VARB=0.00022866;OID=.;OPOS=32530105;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:66:66:2:2:64:64:0.969697:31:33:1:1:31:33:1:1
chr7	32530198	.	AA	TC	1008.49	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0140842;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=117.527;QD=59.323;RBI=0.0161331;REFB=0;REVB=-0.00786848;RO=0;SAF=32;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.49594e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=1.63649e-05;OID=.;OPOS=32530198;OREF=AA;OALT=TC;OMAPALT=TC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:36:32:0:0:36:32:0:0
chr7	32535357	.	CCGG	CCCG,CCG,C,CG	478.25	PASS	AF=0,0,0,0.941176;AO=5,14,6,10;DP=54;FAO=0,0,0,48;FDP=51;FR=.;FRO=3;FSAF=0,0,0,21;FSAR=0,0,0,27;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.00570608,0.190593,0.120499,0.201432;FXX=0.0192271;HRUN=5,5,5,5;LEN=1,1,3,2;MLLD=6.40929,10.1331,15.0546,18.447;QD=37.5097;RBI=0.410759,0.334013,0.120832,0.235723;REFB=0.0515205,-0.0268998,-0.045037,-0.0852773;REVB=-0.410719,-0.274297,-0.00897567,0.122435;RO=10;SAF=0,2,0,4;SAR=5,12,6,6;SRF=7;SRR=3;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=-0.767621,-0.490824,-0.783987,-0.253163;STB=0.5,0.5,0.5,0.506232;STBP=1,1,1,0.75;TYPE=snp,del,del,del;VARB=0,0.0260629,-0.0923958,0.0139063;OID=.,.,.,.;OPOS=32535359,32535359,32535358,32535358;OREF=G,G,CGG,CG;OALT=C,-,-,-;OMAPALT=CCCG,CCG,C,CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/4:0,0,0,0.941176:5,14,6,10:54:0,0,0,48:51:3:0,0,0,21:0,0,0,27:1:2:12:10:0,2,0,4:5,12,6,6:7:3
chr7	32598940	.	A	G	362.55	PASS	AF=0.653846;AO=34;DP=52;FAO=34;FDP=52;FR=.;FRO=18;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=0.0445985;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.9286;QD=27.8886;RBI=0.0455896;REFB=-0.0122469;REVB=-0.00945448;RO=18;SAF=14;SAR=20;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0922692;STB=0.550429;STBP=0.368;TYPE=snp;VARB=0.00637904;OID=.;OPOS=32598940;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:18:18:34:34:0.653846:20:14:10:8:20:14:10:8
chr7	32613020	.	A	G	823.3	PASS	AF=0.983051;AO=58;DP=60;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.041593;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.4568;QD=55.8169;RBI=0.0415961;REFB=-0.0462037;REVB=-0.000506318;RO=1;SAF=26;SAR=32;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0145145;STB=0.50769;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.00143358;OID=.;OPOS=32613020;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:60:59:1:1:58:58:0.983051:32:26:0:1:32:26:0:1
chr7	32623796	.	C	T	1280.41	PASS	AF=1;AO=81;DP=81;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0126542;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=296.845;QD=61.7064;RBI=0.014831;REFB=0;REVB=0.0077349;RO=0;SAF=45;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.42691e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.24934e-05;OID=.;OPOS=32623796;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:83:0:0:81:83:1:36:45:0:0:37:46:0:0
chr7	32908135	.	C	G	330.59	PASS	AF=0.589286;AO=33;DP=56;FAO=33;FDP=56;FR=.;FRO=23;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=0.00125199;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=124.83;QD=23.6133;RBI=0.0185809;REFB=-0.00704237;REVB=-0.0185387;RO=23;SAF=15;SAR=18;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0825402;STB=0.545427;STBP=0.441;TYPE=snp;VARB=0.00606147;OID=.;OPOS=32908135;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:23:23:33:33:0.589286:18:15:13:10:18:15:13:10
chr7	32908287	.	T	C	651.22	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00796783;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.473;QD=62.0212;RBI=0.0186435;REFB=0;REVB=0.016855;RO=0;SAF=19;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.44385e-05;OID=.;OPOS=32908287;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:23:19:0:0:23:19:0:0
chr7	32909182	.	G	A	201.89	PASS	AF=0.320988;AO=26;DP=81;FAO=26;FDP=81;FR=.;FRO=55;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=25;FSRR=30;FWDB=-0.0145832;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.767;QD=9.96994;RBI=0.0199265;REFB=-0.00330783;REVB=0.0135793;RO=54;SAF=12;SAR=14;SRF=25;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00165183;STB=0.504776;STBP=0.956;TYPE=snp;VARB=0.00805471;OID=.;OPOS=32909182;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:54:55:26:26:0.320988:14:12:25:29:14:12:25:30
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chr7	33385852	.	C	T	348.9	PASS	AF=0.57377;AO=34;DP=61;FAO=35;FDP=61;FR=.;FRO=26;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=0.0130288;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.62;QD=22.8786;RBI=0.0272526;REFB=-0.0202071;REVB=-0.0239364;RO=26;SAF=16;SAR=18;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0375394;STB=0.514656;STBP=0.807;TYPE=snp;VARB=0.0126246;OID=.;OPOS=33385852;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:26:26:34:35:0.57377:18:16:11:15:19:16:11:15
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chr7	34192762	.	G	C	1547.23	PASS	AF=1;AO=99;DP=99;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0230244;FXX=0.0190458;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.309;QD=60.0865;RBI=0.0421884;REFB=0;REVB=0.0353516;RO=0;SAF=57;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.37041e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000189194;OID=.;OPOS=34192762;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:99:103:0:0:99:103:1:42:57:0:0:46:57:0:0
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chr7	34917740	.	C	T	1566.42	PASS	AF=1;AO=98;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00285553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.463;QD=63.9355;RBI=0.021333;REFB=0;REVB=0.021141;RO=0;SAF=58;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000126084;OID=.;OPOS=34917740;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:98:0:0:98:98:1:40:58:0:0:40:58:0:0
chr7	34932074	.	G	C	1587.64	PASS	AF=0.981818;AO=106;DP=111;FAO=108;FDP=110;FR=.;FRO=2;FSAF=62;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0366842;FXX=0.0090082;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.57;QD=57.7325;RBI=0.0390006;REFB=-0.0440498;REVB=0.0132408;RO=1;SAF=60;SAR=46;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0102054;STB=0.501376;STBP=0.85;TYPE=snp;VARB=0.000189704;OID=.;OPOS=34932074;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:111:110:1:2:106:108:0.981818:46:60:0:1:46:62:1:1
chr7	34932102	.	G	A	1513.09	PASS	AF=1;AO=99;DP=104;FAO=102;FDP=102;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=54;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0115806;FXX=0.0285687;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.578;QD=59.3369;RBI=0.0209997;REFB=0;REVB=0.0175179;RO=0;SAF=53;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.14105e-05;OID=.;OPOS=34932102;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:104:102:0:0:99:102:1:46:53:0:0:48:54:0:0
chr7	34932113	.	T	A	1525.3	PASS	AF=0.981132;AO=104;DP=106;FAO=104;FDP=106;FR=.;FRO=2;FSAF=52;FSAR=52;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0212569;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=257.034;QD=57.5585;RBI=0.0248287;REFB=-0.111289;REVB=0.0128299;RO=2;SAF=52;SAR=52;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00021085;OID=.;OPOS=34932113;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:106:106:2:2:104:104:0.981132:52:52:1:1:52:52:1:1
chr7	34968498	.	A	T	1085.94	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00736291;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.059;QD=60.3302;RBI=0.0129893;REFB=0;REVB=0.0107009;RO=0;SAF=40;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.18246e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.21133e-05;OID=.;OPOS=34968498;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:72:0:0:71:72:1:31:40:0:0:31:41:0:0
chr7	34979905	.	C	A	850.58	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.015862;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.8927;QD=57.6667;RBI=0.0824982;REFB=0;REVB=-0.080959;RO=0;SAF=27;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.96591e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0011383;OID=.;OPOS=34979905;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:32:27:0:0:32:27:0:0
chr7	35058177	.	A	G	692.94	PASS	AF=1;AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0315448;FXX=0.0222173;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.48;QD=62.995;RBI=0.0368622;REFB=0;REVB=0.0190722;RO=0;SAF=22;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000185933;OID=.;OPOS=35058177;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:44:0:0:44:44:1:22:22:0:0:22:22:0:0
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chr7	36320821	.	G	A	1915.07	PASS	AF=1;AO=123;DP=123;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0216415;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.017;QD=61.7766;RBI=0.0219655;REFB=0;REVB=0.00375864;RO=0;SAF=72;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.7235e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.89554e-05;OID=.;OPOS=36320821;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:123:124:0:0:123:124:1:51:72:0:0:51:73:0:0
chr7	36338749	.	T	C	1662.27	PASS	AF=1;AO=110;DP=110;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0120472;FXX=0.0090082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.047;QD=60.446;RBI=0.0200471;REFB=0;REVB=0.0160235;RO=0;SAF=51;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.98213e-06;OID=.;OPOS=36338749;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:110:110:0:0:110:110:1:59:51:0:0:59:51:0:0
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chr7	36396480	.	A	G	392.05	PASS	AF=0.5;AO=40;DP=80;FAO=40;FDP=80;FR=.;FRO=40;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=26;FSRR=14;FWDB=0.000361198;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=56.8622;QD=19.6026;RBI=0.0457583;REFB=-0.0281123;REVB=0.0457569;RO=36;SAF=24;SAR=16;SRF=23;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0349812;STB=0.526303;STBP=0.654;TYPE=snp;VARB=0.0247347;OID=.;OPOS=36396480;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:36:40:40:40:0.5:16:24:23:13:16:24:26:14
chr7	36445856	.	G	A	1275.08	PASS	AF=1;AO=81;DP=81;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00423975;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.06;QD=61.4495;RBI=0.00747077;REFB=0;REVB=-0.00615117;RO=0;SAF=34;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.25769e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.69204e-06;OID=.;OPOS=36445856;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:83:0:0:81:83:1:47:34:0:0:48:35:0:0
chr7	36447349	.	A	ACTT	253.6	PASS	AF=0.439394;AO=27;DP=67;FAO=29;FDP=66;FR=.;FRO=37;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=-0.00667556;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=3;MLLD=240.955;QD=15.3696;RBI=0.00696038;REFB=-0.0241402;REVB=-0.00197074;RO=36;SAF=13;SAR=14;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0093337;STB=0.521541;STBP=0.775;TYPE=ins;VARB=0.029179;OID=.;OPOS=36447350;OREF=-;OALT=CTT;OMAPALT=ACTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.439394:27:67:29:66:37:13:16:18:19:99:36:13:14:17:19
chr7	36552790	.	G	GT,T	987.35	PASS	AF=1,0;AO=67,3;DP=72;FAO=71,0;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=38,0;FSAR=33,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0312325,0.0524648;FXX=0;HRUN=2,3;LEN=1,1;MLLD=24.193,5.07329;QD=55.6254;RBI=0.0428888,0.112969;REFB=0,0;REVB=-0.0293936,-0.100047;RO=1;SAF=36,1;SAR=31,2;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0149999,0.163246;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=8.4628e-05,0;OID=.,.;OPOS=36552791,36552790;OREF=-,G;OALT=T,T;OMAPALT=GT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:71:1:0:67,3:71,0:1,0:31,2:36,1:0:1:33,0:38,0:0:0
chr7	36729756	.	AT	AC,GC	1169.22	PASS	AF=0.961538,0.0384615;AO=74,3;DP=77;FAO=75,3;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=28,3;FSAR=47,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00921665,0.0156726;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=104.329,51.1618;QD=59.9602;RBI=0.0108136,0.0197427;REFB=0,0;REVB=-0.00565571,-0.0120061;RO=0;SAF=28,3;SAR=46,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=-0.0024193,0.0111671;OID=.,.;OPOS=36729757,36729756;OREF=T,AT;OALT=C,GC;OMAPALT=AC,GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:77:78:0:0:74,3:75,3:0.961538,0.0384615:46,0:28,3:0:0:47,0:28,3:0:0
chr7	36763672	.	C	T	187.41	PASS	AF=0.513514;AO=19;DP=37;FAO=19;FDP=37;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=0.0330086;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.67;QD=20.2603;RBI=0.0335844;REFB=-0.029589;REVB=0.00619199;RO=18;SAF=5;SAR=14;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.274686;STB=0.656076;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=0.039513;OID=.;OPOS=36763672;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:18:18:19:19:0.513514:14:5:10:8:14:5:10:8
chr7	36763688	.	C	T	172.13	PASS	AF=0.473684;AO=18;DP=38;FAO=18;FDP=38;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=15;FWDB=0.00754372;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.116;QD=18.1184;RBI=0.0185269;REFB=-0.0256988;REVB=-0.0169215;RO=20;SAF=10;SAR=8;SRF=5;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.277998;STB=0.65698;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=0.0271575;OID=.;OPOS=36763688;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:20:20:18:18:0.473684:8:10:5:15:8:10:5:15
chr7	37209284	.	G	A	450.91	PASS	AF=1;AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0184262;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.003;QD=58.1825;RBI=0.0269913;REFB=0;REVB=-0.0197233;RO=0;SAF=18;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.33668e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000130772;OID=.;OPOS=37209284;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:31:0:0:31:31:1:13:18:0:0:13:18:0:0
chr7	37354536	.	A	G	222.07	PASS	AF=0.44898;AO=22;DP=49;FAO=22;FDP=49;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=-0.0268463;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.175;QD=18.1283;RBI=0.0270321;REFB=-0.000175034;REVB=0.00316339;RO=27;SAF=10;SAR=12;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0831127;STB=0.547128;STBP=0.549;TYPE=snp;VARB=0.000180875;OID=.;OPOS=37354536;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:27:27:22:22:0.44898:12:10:10:17:12:10:10:17
chr7	37355590	.	C	CT	599.9	PASS	AF=1;AO=58;DP=67;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00320933;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=20.2467;QD=38.7032;RBI=0.128986;REFB=0;REVB=-0.128946;RO=6;SAF=28;SAR=30;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0617193;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00165737;OID=.;OPOS=37355591;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:58:67:62:62:0:28:34:0:0:12:6:28:30:5:1
chr7	37780436	.	G	A	337.15	PASS	AF=0.38835;AO=40;DP=103;FAO=40;FDP=103;FR=.;FRO=63;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=27;FSRR=36;FWDB=-0.0047082;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.359;QD=13.0931;RBI=0.00765131;REFB=-0.00880468;REVB=0.0060312;RO=63;SAF=19;SAR=21;SRF=27;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0502424;STB=0.528536;STBP=0.665;TYPE=snp;VARB=0.0131992;OID=.;OPOS=37780436;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:103:63:63:40:40:0.38835:21:19:27:36:21:19:27:36
chr7	37907304	.	T	C	279.5	PASS	AF=0.318966;AO=37;DP=116;FAO=37;FDP=116;FR=.;FRO=79;FSAF=25;FSAR=12;FSRF=42;FSRR=37;FWDB=0.0253363;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.364;QD=9.63784;RBI=0.0367461;REFB=0.000800693;REVB=0.0266147;RO=79;SAF=25;SAR=12;SRF=42;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177374;STB=0.603688;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=-0.00347354;OID=.;OPOS=37907304;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:116:116:79:79:37:37:0.318966:12:25:42:37:12:25:42:37
chr7	37934146	.	TA	CT	146.07	PASS	AF=0.307692;AO=20;DP=65;FAO=20;FDP=65;FR=.;FRO=45;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=21;FSRR=24;FWDB=-0.00464547;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=125.488;QD=8.98916;RBI=0.00627304;REFB=-0.00674725;REVB=0.00421552;RO=45;SAF=12;SAR=8;SRF=21;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155819;STB=0.5925;STBP=0.333;TYPE=mnp;VARB=0.0157309;OID=.;OPOS=37934146;OREF=TA;OALT=CT;OMAPALT=CT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:45:45:20:20:0.307692:8:12:21:24:8:12:21:24
chr7	37936530	.	T	C	592.1	PASS	AF=0.658228;AO=52;DP=79;FAO=52;FDP=79;FR=.;FRO=27;FSAF=28;FSAR=24;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=0.00289879;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.878;QD=29.9796;RBI=0.00862484;REFB=-0.00546313;REVB=-0.00812311;RO=27;SAF=28;SAR=24;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0593066;STB=0.532151;STBP=0.465;TYPE=snp;VARB=0.00317091;OID=.;OPOS=37936530;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:27:27:52:52:0.658228:24:28:12:15:24:28:12:15
chr7	37951726	.	G	A	1452.8	PASS	AF=1;AO=91;DP=91;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0500852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.968;QD=63.1653;RBI=0.0600253;REFB=0;REVB=0.0330833;RO=0;SAF=53;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000251034;OID=.;OPOS=37951726;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:91:92:0:0:91:92:1:38:53:0:0:39:53:0:0
chr7	37988589	.	C	T	504.58	PASS	AF=0.586207;AO=41;DP=87;FAO=51;FDP=87;FR=.;FRO=36;FSAF=24;FSAR=27;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=0.0631284;FXX=0.0645092;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.532;QD=23.1992;RBI=0.0638845;REFB=-0.00677917;REVB=0.00980006;RO=33;SAF=18;SAR=23;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110692;STB=0.523671;STBP=0.609;TYPE=snp;VARB=0.0210295;OID=.;OPOS=37988589;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:33:36:41:51:0.586207:23:18:19:14:27:24:19:17
chr7	37991129	.	C	A	1540.86	PASS	AF=1;AO=100;DP=103;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000792787;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.631;QD=59.2638;RBI=0.0178505;REFB=0;REVB=0.0178329;RO=0;SAF=47;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.25225e-05;OID=.;OPOS=37991129;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:103:104:0:0:100:104:1:53:47:0:0:57:47:0:0
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chr7	38289121	.	C	T	1656.93	PASS	AF=0.991071;AO=109;DP=111;FAO=111;FDP=112;FR=.;FRO=1;FSAF=55;FSAR=56;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0257717;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.0759;QD=59.1762;RBI=0.0297057;REFB=-0.0951989;REVB=0.0147733;RO=1;SAF=53;SAR=56;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0088725;STB=0.504504;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.000624221;OID=.;OPOS=38289121;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:111:112:1:1:109:111:0.991071:56:53:1:0:56:55:1:0
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chr7	38305043	.	T	C	43.15	PASS	AF=0.0777202;AO=15;DP=193;FAO=15;FDP=193;FR=.;FRO=178;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=105;FSRR=73;FWDB=-0.00544321;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=239.73;QD=0.894335;RBI=0.00572325;REFB=-3.65986e-06;REVB=-0.00176836;RO=176;SAF=4;SAR=11;SRF=103;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.349377;STB=0.780761;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.00440018;OID=.;OPOS=38305043;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:193:193:176:178:15:15:0.0777202:11:4:103:73:11:4:105:73
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chr7	38331271	.	C	A	450.24	PASS	AF=0.597222;AO=41;DP=73;FAO=43;FDP=72;FR=.;FRO=29;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=-0.00732071;FXX=0.0270234;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.776;QD=25.0134;RBI=0.0170531;REFB=-0.0132776;REVB=0.0154018;RO=29;SAF=21;SAR=20;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.056032;STB=0.539337;STBP=0.435;TYPE=snp;VARB=0.0121183;OID=.;OPOS=38331271;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:72:29:29:41:43:0.597222:20:21:17:12:22:21:17:12
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chr7	38388895	.	A	T	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0251644;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=237.418;QD=50.4132;RBI=0.0293891;REFB=0;REVB=0.0151813;RO=0;SAF=8;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.41338e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000232376;OID=.;OPOS=38388895;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:11:8:0:0:11:8:0:0
chr7	38389410	.	G	C	1623.66	PASS	AF=0.990909;AO=108;DP=109;FAO=109;FDP=110;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0185665;FXX=0.0090082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.6119;QD=59.0421;RBI=0.0241142;REFB=-0.0839608;REVB=0.0153877;RO=1;SAF=39;SAR=69;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00683021;STB=0.503596;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=0.0020656;OID=.;OPOS=38389410;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:109:110:1:1:108:109:0.990909:69:39:0:1:69:40:0:1
chr7	38393319	.	A	G	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00235554;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.7231;QD=43.4861;RBI=0.0160418;REFB=0;REVB=0.0158679;RO=0;SAF=5;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000937236;OID=.;OPOS=38393319;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:7:5:0:0:7:5:0:0
chr7	38393343	.	T	C	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0238791;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.151;QD=55.6561;RBI=0.0509106;REFB=0;REVB=0.0449631;RO=0;SAF=12;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.03235e-05;OID=.;OPOS=38393343;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:15:12:0:0:15:12:0:0
chr7	38393390	.	T	G	610.68	PASS	AF=0.953488;AO=41;DP=43;FAO=41;FDP=43;FR=.;FRO=2;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.000609234;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.82;QD=56.8074;RBI=0.00508942;REFB=-0.134581;REVB=0.00505283;RO=2;SAF=23;SAR=18;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0493148;STB=0.526303;STBP=0.167;TYPE=snp;VARB=0.00151808;OID=.;OPOS=38393390;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:43:43:2:2:41:41:0.953488:18:23:0:2:18:23:0:2
chr7	38393424	.	G	A	715.89	PASS	AF=0.978723;AO=45;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00706508;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=186.229;QD=60.9265;RBI=0.0103157;REFB=-0.0918661;REVB=0.00751657;RO=0;SAF=26;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.15971e-08;STB=0.50943;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.000494791;OID=.;OPOS=38393424;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:47:47:0:1:45:46:0.978723:19:26:0:0:20:26:1:0
chr7	38393448	.	G	C	729.01	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.014387;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.777;QD=57.1775;RBI=0.0143963;REFB=0;REVB=0.000516822;RO=0;SAF=28;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.97956e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.91296e-05;OID=.;OPOS=38393448;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:23:28:0:0:23:28:0:0
chr7	38393524	.	C	T	629.17	PASS	AF=0.954545;AO=42;DP=44;FAO=42;FDP=44;FR=.;FRO=2;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0187052;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.728;QD=57.197;RBI=0.0187231;REFB=0.0468907;REVB=0.000818944;RO=2;SAF=25;SAR=17;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0360825;STB=0.519222;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=-0.000716218;OID=.;OPOS=38393524;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:44:44:2:2:42:42:0.954545:17:25:2:0:17:25:2:0
chr7	38393534	.	C	T	631.91	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00249372;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.802;QD=61.65;RBI=0.0144047;REFB=0;REVB=0.0141872;RO=0;SAF=25;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.1719e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000175801;OID=.;OPOS=38393534;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:16:25:0:0:16:25:0:0
chr7	38393592	.	C	A	447.02	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0522551;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.0444;QD=57.68;RBI=0.0522551;REFB=0;REVB=-2.66465e-05;RO=0;SAF=19;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.47712e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000683016;OID=.;OPOS=38393592;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:12:19:0:0:12:19:0:0
chr7	38393713	.	A	G	340.69	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0194712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.145;QD=54.5102;RBI=0.0202058;REFB=0;REVB=0.00539876;RO=0;SAF=18;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000200031;OID=.;OPOS=38393713;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:7:18:0:0:7:18:0:0
chr7	38393798	.	A	G	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0442747;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.698;QD=40.7629;RBI=0.0452099;REFB=0;REVB=-0.00914811;RO=0;SAF=6;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000321179;OID=.;OPOS=38393798;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:4:6:0:0:4:6:0:0
chr7	38397930	.	A	G	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0258403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.641;QD=48.7353;RBI=0.0258403;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=17;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000479627;OID=.;OPOS=38397930;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:0:17:0:0:0:17:0:0
chr7	38398565	.	G	C	490.1	PASS	AF=0.971429;AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0493898;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.9151;QD=56.0119;RBI=0.0501258;REFB=-0.0871059;REVB=-0.00855788;RO=1;SAF=14;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.022804;STB=0.512188;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=0.0028479;OID=.;OPOS=38398565;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:35:35:1:1:34:34:0.971429:20:14:0:1:20:14:0:1
chr7	38402496	.	A	G	1472.58	PASS	AF=1;AO=92;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0200024;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=178.119;QD=63.3367;RBI=0.0332137;REFB=0;REVB=0.0265152;RO=0;SAF=39;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.31516e-05;OID=.;OPOS=38402496;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:93:93:0:0:92:93:1:53:39:0:0:54:39:0:0
chr7	38402517	.	C	T	835.54	PASS	AF=0.69;AO=66;DP=98;FAO=69;FDP=100;FR=.;FRO=31;FSAF=21;FSAR=48;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=0.0475815;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.0172;QD=33.4217;RBI=0.0618144;REFB=-0.0178709;REVB=-0.039459;RO=32;SAF=18;SAR=48;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198452;STB=0.583468;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.0151615;OID=.;OPOS=38402517;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:100:32:31:66:69:0.69:48:18:18:14:48:21:17:14
chr7	38431436	.	C	T	444.42	PASS	AF=0.431034;AO=50;DP=116;FAO=50;FDP=116;FR=.;FRO=66;FSAF=22;FSAR=28;FSRF=33;FSRR=33;FWDB=0.021746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.287;QD=15.3249;RBI=0.0292134;REFB=-0.024425;REVB=-0.0195073;RO=65;SAF=22;SAR=28;SRF=32;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.053124;STB=0.534337;STBP=0.555;TYPE=snp;VARB=0.0262891;OID=.;OPOS=38431436;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:116:116:65:66:50:50:0.431034:28:22:32:33:28:22:33:33
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chr7	38467842	.	A	G	187.38	PASS	AF=0.411765;AO=21;DP=51;FAO=21;FDP=51;FR=.;FRO=30;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=0.0375498;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.8188;QD=14.6965;RBI=0.0380084;REFB=-0.0146216;REVB=-0.00588659;RO=30;SAF=9;SAR=12;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0395583;STB=0.522705;STBP=0.81;TYPE=snp;VARB=0.0156027;OID=.;OPOS=38467842;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:30:30:21:21:0.411765:12:9:14:16:12:9:14:16
chr7	38467923	.	A	G	638.58	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0399322;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.424;QD=60.8171;RBI=0.0459369;REFB=0;REVB=0.0227073;RO=0;SAF=9;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.40541e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00127276;OID=.;OPOS=38467923;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:42:0:0:41:42:1:32:9:0:0:32:10:0:0
chr7	38468463	.	C	T	281.83	PASS	AF=0.354839;AO=33;DP=94;FAO=33;FDP=93;FR=.;FRO=60;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=31;FSRR=29;FWDB=-0.00210461;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.664;QD=12.1218;RBI=0.0331322;REFB=-0.00469957;REVB=-0.0330653;RO=60;SAF=18;SAR=15;SRF=31;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0323756;STB=0.518653;STBP=0.792;TYPE=snp;VARB=0.00812314;OID=.;OPOS=38468463;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:93:60:60:33:33:0.354839:15:18:31:29:15:18:31:29
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chr7	38468695	.	C	T	101.9	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0454168;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.351;QD=40.7615;RBI=0.0480378;REFB=0;REVB=-0.0156504;RO=0;SAF=3;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000608468;OID=.;OPOS=38468695;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:7:3:0:0:7:3:0:0
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chr7	42950640	.	C	T	1499.62	PASS	AF=1;AO=94;DP=95;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0703215;FXX=0.0208312;HRUN=3;LEN=1;MLLD=70.3461;QD=63.8137;RBI=0.0711334;REFB=0;REVB=-0.0107161;RO=0;SAF=42;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000839264;OID=.;OPOS=42950640;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:94:0:0:94:94:1:52:42:0:0:52:42:0:0
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chr7	42976789	.	A	G	2029.84	PASS	AF=0.992424;AO=130;DP=131;FAO=131;FDP=132;FR=.;FRO=1;FSAF=61;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0197896;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.738;QD=61.5103;RBI=0.031928;REFB=-0.0277644;REVB=0.0250554;RO=0;SAF=61;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.503546;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=0.000163759;OID=.;OPOS=42976789;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:131:132:0:1:130:131:0.992424:69:61:0:0:70:61:0:1
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chr7	43916138	.	C	G	192.12	PASS	AF=0.265306;AO=24;DP=97;FAO=26;FDP=98;FR=.;FRO=72;FSAF=7;FSAR=19;FSRF=36;FSRR=36;FWDB=0.0159187;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.299;QD=7.84141;RBI=0.0173099;REFB=-0.00313388;REVB=-0.00679913;RO=72;SAF=6;SAR=18;SRF=36;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.326159;STB=0.679556;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.00722941;OID=.;OPOS=43916138;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:98:72:72:24:26:0.265306:18:6:36:36:19:7:36:36
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chr7	43917013	.	G	A	217.49	PASS	AF=0.288462;AO=30;DP=104;FAO=30;FDP=104;FR=.;FRO=74;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=22;FSRR=52;FWDB=0.020266;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.312;QD=8.36509;RBI=0.0204094;REFB=-0.0054528;REVB=0.00241566;RO=74;SAF=9;SAR=21;SRF=22;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00387327;STB=0.502292;STBP=0.983;TYPE=snp;VARB=0.0152576;OID=.;OPOS=43917013;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:104:74:74:30:30:0.288462:21:9:22:52:21:9:22:52
chr7	43917274	.	A	G	132.66	PASS	AF=0.310345;AO=15;DP=58;FAO=18;FDP=58;FR=.;FRO=40;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=-0.00626645;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.397;QD=9.14895;RBI=0.00801917;REFB=-0.00374902;REVB=0.00500386;RO=30;SAF=7;SAR=8;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0746519;STB=0.555494;STBP=0.61;TYPE=snp;VARB=0.00318039;OID=.;OPOS=43917274;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:30:40:15:18:0.310345:8:7:16:14:10:8:21:19
chr7	44147484	.	GC	G	45.32	PASS	AF=0.444444;AO=9;DP=23;FAO=8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=-0.0785197;FXX=0.279888;HRUN=5;LEN=1;MLLD=13.5806;QD=10.072;RBI=0.136678;REFB=-0.185423;REVB=-0.111873;RO=7;SAF=3;SAR=6;SRF=2;SRR=5;SSEN=0.461538;SSEP=0;SSSB=0.041038;STB=0.545344;STBP=0.797;TYPE=del;VARB=0.134472;OID=.;OPOS=44147485;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.444444:9:23:8:18:10:3:5:3:7:44:7:3:6:2:5
chr7	44148553	.	A	G	1589.81	PASS	AF=1;AO=106;DP=106;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0272292;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.431;QD=59.9928;RBI=0.0273169;REFB=0;REVB=-0.00218768;RO=0;SAF=55;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.78722e-05;OID=.;OPOS=44148553;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:106:106:0:0:106:106:1:51:55:0:0:51:55:0:0
chr7	44148952	.	G	A	62.69	PASS	AF=0.3;AO=9;DP=30;FAO=9;FDP=30;FR=.;FRO=21;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=-0.0615574;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=59.4765;QD=8.35871;RBI=0.0633762;REFB=-0.0046651;REVB=-0.0150743;RO=20;SAF=4;SAR=5;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.282867;STB=0.651856;STBP=0.341;TYPE=snp;VARB=0.0467909;OID=.;OPOS=44148952;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:30:30:20:21:9:9:0.3:5:4:14:6:5:4:14:7
chr7	44148957	.	A	AG	53.23	PASS	AF=0.5;AO=8;DP=27;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=0.058768;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=12.5227;QD=8.87206;RBI=0.121746;REFB=-0.0943756;REVB=0.106623;RO=16;SAF=6;SAR=2;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160269;STB=0.543407;STBP=0.766;TYPE=ins;VARB=0.115995;OID=.;OPOS=44148958;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.5:8:27:12:24:12:7:5:8:4:52:16:6:2:10:6
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chr7	44259706	.	G	A	71.69	PASS	AF=0.277778;AO=10;DP=36;FAO=10;FDP=36;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=0.0517688;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.746;QD=7.96578;RBI=0.0518461;REFB=-0.00238777;REVB=0.00283065;RO=26;SAF=6;SAR=4;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117391;STB=0.572887;STBP=0.614;TYPE=snp;VARB=0.0117741;OID=.;OPOS=44259706;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:71:36:36:26:26:10:10:0.277778:4:6:13:13:4:6:13:13
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chr7	44574064	.	G	A	117.22	PASS	AF=0.290909;AO=16;DP=55;FAO=16;FDP=55;FR=.;FRO=39;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=-0.0196321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.639;QD=8.52514;RBI=0.0196458;REFB=-0.00277483;REVB=0.000734478;RO=39;SAF=7;SAR=9;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0587699;STB=0.535425;STBP=0.725;TYPE=snp;VARB=0.00646582;OID=.;OPOS=44574064;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:39:39:16:16:0.290909:9:7:19:20:9:7:19:20
chr7	44579180	.	G	C	139.44	PASS	AF=0.311475;AO=19;DP=61;FAO=19;FDP=61;FR=.;FRO=42;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=24;FSRR=18;FWDB=0.0477104;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.3685;QD=9.1434;RBI=0.0746856;REFB=0.00775265;REVB=0.05746;RO=42;SAF=9;SAR=10;SRF=24;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112992;STB=0.566941;STBP=0.492;TYPE=snp;VARB=-0.00766109;OID=.;OPOS=44579180;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:42:42:19:19:0.311475:10:9:24:18:10:9:24:18
chr7	44606098	.	C	T	88.22	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0247767;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.703;QD=39.2068;RBI=0.0265745;REFB=0;REVB=-0.00960837;RO=0;SAF=2;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000314435;OID=.;OPOS=44606098;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:7:2:0:0:7:2:0:0
chr7	44608718	.	C	T	224.43	PASS	AF=0.636364;AO=21;DP=33;FAO=21;FDP=33;FR=.;FRO=12;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.0441099;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.437;QD=27.2036;RBI=0.0509781;REFB=-0.0230956;REVB=0.0255556;RO=12;SAF=14;SAR=7;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17222;STB=0.595651;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=0.0156311;OID=.;OPOS=44608718;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:33:33:12:12:21:21:0.636364:7:14:5:7:7:14:5:7
chr7	44612229	.	G	A	346.92	PASS	AF=0.394231;AO=41;DP=104;FAO=41;FDP=104;FR=.;FRO=63;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=34;FSRR=29;FWDB=0.00624326;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.961;QD=13.343;RBI=0.00629578;REFB=-0.0114944;REVB=-0.000811459;RO=63;SAF=22;SAR=19;SRF=34;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00332456;STB=0.501886;STBP=0.989;TYPE=snp;VARB=0.0158437;OID=.;OPOS=44612229;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:104:63:63:41:41:0.394231:19:22:34:29:19:22:34:29
chr7	44620836	.	C	A	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0132788;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=241.257;QD=53.2772;RBI=0.0178844;REFB=0;REVB=0.0119802;RO=0;SAF=5;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000133377;OID=.;OPOS=44620836;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:18:5:0:0:18:5:0:0
chr7	44747499	.	G	A	98.55	PASS	AF=0.428571;AO=12;DP=28;FAO=12;FDP=28;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.00598011;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.7717;QD=14.0784;RBI=0.0488074;REFB=-0.00411413;REVB=-0.0484397;RO=15;SAF=5;SAR=7;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0484683;STB=0.512175;STBP=0.953;TYPE=snp;VARB=0.00624298;OID=.;OPOS=44747499;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:28:28:15:16:12:12:0.428571:7:5:7:8:7:5:7:9
chr7	44748451	.	G	A	124.19	PASS	AF=0.541667;AO=13;DP=27;FAO=13;FDP=24;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=2;FSRR=9;FWDB=-0.00445818;FXX=0.142806;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.621;QD=20.6983;RBI=0.00451095;REFB=-0.0182187;REVB=-0.000687983;RO=10;SAF=2;SAR=11;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0638491;STB=0.523772;STBP=0.89;TYPE=snp;VARB=0.0148683;OID=.;OPOS=44748451;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:27:24:10:11:13:13:0.541667:11:2:2:8:11:2:2:9
chr7	44836314	.	A	G	1770.23	PASS	AF=1;AO=116;DP=117;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000779951;FXX=0.00854628;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.0634;QD=61.0425;RBI=0.0110744;REFB=0;REVB=0.0110469;RO=0;SAF=61;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.12874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000167328;OID=.;OPOS=44836314;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:117:116:0:0:116:116:1:55:61:0:0:55:61:0:0
chr7	45004063	.	T	C	740.26	PASS	AF=1;AO=51;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000391999;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.176;QD=56.943;RBI=0.0207068;REFB=0;REVB=0.0207031;RO=0;SAF=25;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94283e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.94651e-05;OID=.;OPOS=45004063;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:51:52:1:26:25:0:0:27:25:0:0
chr7	45009325	.	G	A	851.23	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0223818;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.846;QD=57.7102;RBI=0.0521627;REFB=0;REVB=0.0471169;RO=0;SAF=30;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000208193;OID=.;OPOS=45009325;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:29:30:0:0:29:30:0:0
chr7	45009341	.	A	G	972.87	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00259599;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.6902;QD=58.962;RBI=0.0489049;REFB=0;REVB=-0.048836;RO=0;SAF=30;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00051042;OID=.;OPOS=45009341;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:36:30:0:0:36:30:0:0
chr7	45009723	.	G	A	626.49	PASS	AF=0.97619;AO=40;DP=41;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.038954;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.264;QD=59.666;RBI=0.0392096;REFB=-0.0608267;REVB=0.00446965;RO=1;SAF=19;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0240441;STB=0.512814;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.000801302;OID=.;OPOS=45009723;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:41:42:1:1:40:41:0.97619:21:19:1:0:22:19:1:0
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chr7	47879049	.	G	A	608.64	PASS	AF=0.364103;AO=71;DP=194;FAO=71;FDP=195;FR=.;FRO=124;FSAF=31;FSAR=40;FSRF=74;FSRR=50;FWDB=-0.00143674;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.186;QD=12.4848;RBI=0.00731142;REFB=-0.00547251;REVB=-0.00716887;RO=122;SAF=31;SAR=40;SRF=74;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187602;STB=0.60083;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.0119497;OID=.;OPOS=47879049;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:194:195:122:124:71:71:0.364103:40:31:74:48:40:31:74:50
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chr7	47921682	.	A	T	302.37	PASS	AF=0.327103;AO=28;DP=108;FAO=35;FDP=107;FR=.,HEALED;FRO=68;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=27;FSRR=41;FWDB=-0.00252414;FXX=0.0092584;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.112;QD=11.3036;RBI=0.00982892;REFB=-0.00858985;REVB=0.00949929;RO=67;SAF=13;SAR=15;SRF=27;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0740712;STB=0.517941;STBP=0.801;TYPE=snp;VARB=0.0408043;OID=.;OPOS=47921682;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:107:67:68:28:35:0.327103:15:13:27:40:22:13:27:41
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chr7	48086161	.	T	C	689.67	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0270789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.615;QD=62.6976;RBI=0.0432112;REFB=0;REVB=0.033674;RO=0;SAF=13;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.53512e-05;OID=.;OPOS=48086161;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:44:0:0:43:44:1:30:13:0:0:31:13:0:0
chr7	48089542	.	T	C	1321.54	PASS	AF=1;AO=78;DP=78;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0548215;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.771;QD=61.467;RBI=0.055741;REFB=0;REVB=-0.0100828;RO=0;SAF=34;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.47622e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000149898;OID=.;OPOS=48089542;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:78:86:0:0:78:86:1:44:34:0:0:44:42:0:0
chr7	48089571	.	C	A	857.34	PASS	AF=0.876712;AO=64;DP=73;FAO=64;FDP=73;FR=.;FRO=9;FSAF=30;FSAR=34;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=0.00439712;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=178.469;QD=46.9776;RBI=0.00445681;REFB=-0.138189;REVB=0.000726973;RO=5;SAF=30;SAR=34;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0369322;STB=0.53062;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=0.00118651;OID=.;OPOS=48089571;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:73:73:5:9:64:64:0.876712:34:30:1:4:34:30:2:7
chr7	48092486	.	T	C	340.73	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0806333;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.158;QD=54.5169;RBI=0.0826958;REFB=0;REVB=0.0183538;RO=0;SAF=11;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000582301;OID=.;OPOS=48092486;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:14:11:0:0:14:11:0:0
chr7	48287840	.	G	A	834.4	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00353665;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.165;QD=57.5451;RBI=0.00658447;REFB=0;REVB=0.00555404;RO=0;SAF=33;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.40942e-05;OID=.;OPOS=48287840;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:25:33:0:0:25:33:0:0
chr7	48311485	.	A	C	2382.6	PASS	AF=0.562982;AO=219;DP=391;FAO=219;FDP=389;FR=.;FRO=170;FSAF=128;FSAR=91;FSRF=95;FSRR=75;FWDB=0.00946105;FXX=0.0101779;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.3627;QD=24.4997;RBI=0.0239109;REFB=-0.00096826;REVB=-0.0219594;RO=169;SAF=128;SAR=91;SRF=95;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0184129;STB=0.511494;STBP=0.594;TYPE=snp;VARB=0.000627052;OID=.;OPOS=48311485;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:391:389:169:170:219:219:0.562982:91:128:95:74:91:128:95:75
chr7	48311563	.	T	G	3931.14	PASS	AF=0.992218;AO=255;DP=257;FAO=255;FDP=257;FR=.;FRO=2;FSAF=127;FSAR=128;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0525307;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.57;QD=61.1851;RBI=0.0645319;REFB=-0.0565943;REVB=0.0374819;RO=2;SAF=127;SAR=128;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.91535e-05;STB=0.500015;STBP=0.866;TYPE=snp;VARB=0.000240864;OID=.;OPOS=48311563;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:257:257:2:2:255:255:0.992218:128:127:1:1:128:127:1:1
chr7	48311803	.	G	T	196.64	PASS	AF=0.465116;AO=20;DP=43;FAO=20;FDP=43;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=-0.00594057;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.6497;QD=18.2918;RBI=0.0145845;REFB=-0.018492;REVB=-0.0133198;RO=23;SAF=8;SAR=12;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115994;STB=0.565971;STBP=0.425;TYPE=snp;VARB=0.0129291;OID=.;OPOS=48311803;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:23:23:20:20:0.465116:12:8:12:11:12:8:12:11
chr7	48313949	.	C	T	475.05	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0436137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.949;QD=57.5812;RBI=0.0638173;REFB=0;REVB=-0.0465885;RO=0;SAF=12;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.79713e-05;OID=.;OPOS=48313949;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:33:0:0:30:33:1:18:12:0:0:19:14:0:0
chr7	48314279	.	G	A	967.22	PASS	AF=0.985294;AO=65;DP=66;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00399915;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.3531;QD=56.8952;RBI=0.038637;REFB=-0.0285977;REVB=0.0384295;RO=0;SAF=44;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.510635;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=0.00512466;OID=.;OPOS=48314279;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:66:68:0:1:65:67:0.985294:21:44:0:0:23:44:0:1
chr7	48315796	.	C	A	981.98	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0299378;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.46;QD=58.626;RBI=0.0411312;REFB=0;REVB=0.0282047;RO=0;SAF=30;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000278377;OID=.;OPOS=48315796;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:67:0:0:66:67:1:36:30:0:0:36:31:0:0
chr7	48318811	.	C	T	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0211067;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.89;QD=59.4356;RBI=0.034283;REFB=0;REVB=-0.0270155;RO=0;SAF=23;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000127638;OID=.;OPOS=48318811;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:12:23:0:0:12:23:0:0
chr7	48336844	.	C	T	1567.79	PASS	AF=1;AO=98;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0729944;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.8692;QD=63.9915;RBI=0.0732218;REFB=0;REVB=0.0057664;RO=0;SAF=51;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000244356;OID=.;OPOS=48336844;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:98:0:0:98:98:1:47:51:0:0:47:51:0:0
chr7	48450157	.	T	C	261.45	PASS	AF=0.268116;AO=36;DP=136;FAO=37;FDP=138;FR=.;FRO=101;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=52;FSRR=49;FWDB=-0.0108306;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.814;QD=7.57819;RBI=0.0199099;REFB=-0.00978726;REVB=-0.0167064;RO=100;SAF=16;SAR=20;SRF=52;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0930289;STB=0.540519;STBP=0.567;TYPE=snp;VARB=0.0240847;OID=.;OPOS=48450157;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:136:138:100:101:36:37:0.268116:20:16:52:48:20:17:52:49
chr7	48506566	.	A	G	1094.77	PASS	AF=0.622642;AO=99;DP=161;FAO=99;FDP=159;FR=.;FRO=60;FSAF=42;FSAR=57;FSRF=23;FSRR=37;FWDB=0.00339915;FXX=0.0304859;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.053;QD=27.5414;RBI=0.00345769;REFB=-0.000468162;REVB=-0.000633573;RO=60;SAF=42;SAR=57;SRF=23;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0293788;STB=0.515873;STBP=0.624;TYPE=snp;VARB=0.000102382;OID=.;OPOS=48506566;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:161:159:60:60:99:99:0.622642:57:42:23:37:57:42:23:37
chr7	48506642	.	A	G	838.25	PASS	AF=0.646552;AO=74;DP=116;FAO=75;FDP=116;FR=.;FRO=41;FSAF=37;FSAR=38;FSRF=14;FSRR=27;FWDB=0.00836912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.968;QD=28.9051;RBI=0.00836913;REFB=0.000250092;REVB=1.63898e-05;RO=41;SAF=37;SAR=37;SRF=14;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104613;STB=0.553751;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=-0.00013679;OID=.;OPOS=48506642;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:116:116:41:41:74:75:0.646552:37:37:14:27:38:37:14:27
chr7	48545976	.	A	G	1733.2	PASS	AF=0.991379;AO=115;DP=116;FAO=115;FDP=116;FR=.;FRO=1;FSAF=61;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00126135;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.568;QD=59.7656;RBI=0.00964075;REFB=-0.0736345;REVB=-0.00955788;RO=1;SAF=61;SAR=54;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00871291;STB=0.504586;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=-1.42511e-05;OID=.;OPOS=48545976;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:116:116:1:1:115:115:0.991379:54:61:0:1:54:61:0:1
chr7	48964322	.	G	T	1996.49	PASS	AF=1;AO=125;DP=125;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0185823;FXX=0.00757518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.276;QD=60.9615;RBI=0.0188961;REFB=0;REVB=0.00342944;RO=0;SAF=69;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.44067e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00121609;OID=.;OPOS=48964322;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:125:131:0:0:125:131:1:56:69:0:0:58:73:0:0
chr7	48964751	.	G	A	132.66	PASS	AF=0.310345;AO=18;DP=58;FAO=18;FDP=58;FR=.;FRO=40;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=-0.000565172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.536;QD=9.14899;RBI=0.0388572;REFB=-0.00168697;REVB=-0.0388531;RO=38;SAF=10;SAR=8;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0337149;STB=0.521212;STBP=0.843;TYPE=snp;VARB=0.00297943;OID=.;OPOS=48964751;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:38:40:18:18:0.310345:8:10:20:18:8:10:21:19
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chr7	51093013	.	A	T	147.67	PASS	AF=0.681818;AO=14;DP=21;FAO=15;FDP=22;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.0013839;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.8778;QD=26.8487;RBI=0.0417584;REFB=-0.00940736;REVB=0.0417355;RO=7;SAF=4;SAR=10;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110177;STB=0.571339;STBP=0.397;TYPE=snp;VARB=0.00420314;OID=.;OPOS=51093013;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:21:22:7:7:14:15:0.681818:10:4:1:6:10:5:1:6
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chr7	51097063	.	T	G	1556.75	PASS	AF=1;AO=103;DP=103;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0251509;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.443;QD=59.8749;RBI=0.0266902;REFB=0;REVB=0.00893305;RO=0;SAF=52;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.62123e-05;OID=.;OPOS=51097063;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:103:104:0:0:103:104:1:51:52:0:0:51:53:0:0
chr7	51133140	.	C	G	431.77	PASS	AF=0.723404;AO=34;DP=47;FAO=34;FDP=47;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=28;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=0.0540867;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.278;QD=36.7461;RBI=0.0540956;REFB=-0.0104884;REVB=0.000977487;RO=13;SAF=6;SAR=28;SRF=3;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.045918;STB=0.524985;STBP=0.666;TYPE=snp;VARB=0.00466125;OID=.;OPOS=51133140;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:13:13:34:34:0.723404:28:6:3:10:28:6:3:10
chr7	51287470	.	A	G	257.15	PASS	AF=0.453125;AO=29;DP=64;FAO=29;FDP=64;FR=.;FRO=35;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=0.00150567;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.9366;QD=16.0719;RBI=0.0167448;REFB=-0.0170814;REVB=-0.016677;RO=35;SAF=17;SAR=12;SRF=13;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206372;STB=0.616126;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=0.01348;OID=.;OPOS=51287470;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:35:35:29:29:0.453125:12:17:13:22:12:17:13:22
chr7	53103371	.	G	T	1747.49	PASS	AF=1;AO=115;DP=115;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0533085;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.0882;QD=60.7821;RBI=0.0864196;REFB=0;REVB=0.0680187;RO=0;SAF=64;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000628343;OID=.;OPOS=53103371;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:115:115:0:0:115:115:1:51:64:0:0:51:64:0:0
chr7	53103382	.	G	T	1992.71	PASS	AF=1;AO=128;DP=129;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0371509;FXX=0.00775134;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.807;QD=62.2721;RBI=0.05772;REFB=0;REVB=0.0441748;RO=0;SAF=72;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.21615e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.44842e-05;OID=.;OPOS=53103382;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:129:128:0:0:128:128:1:56:72:0:0:56:72:0:0
chr7	53103673	.	C	A	648.78	PASS	AF=0.892857;AO=50;DP=57;FAO=50;FDP=56;FR=.;FRO=6;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.00632398;FXX=0.0175408;HRUN=3;LEN=1;MLLD=134.828;QD=46.3416;RBI=0.0294896;REFB=-0.0844584;REVB=0.0288035;RO=6;SAF=27;SAR=23;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0749823;STB=0.539984;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=0.00149534;OID=.;OPOS=53103673;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:26:57:56:6:6:50:50:0.892857:23:27:1:5:23:27:1:5
chr7	53104078	.	G	A	1877.74	PASS	AF=1;AO=122;DP=122;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.013589;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.644;QD=61.5653;RBI=0.0300731;REFB=0;REVB=0.0268278;RO=0;SAF=31;SAR=91;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.72449e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.45271e-05;OID=.;OPOS=53104078;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:122:122:0:0:122:122:1:91:31:0:0:91:31:0:0
chr7	53557963	.	A	G	268.62	PASS	AF=0.330189;AO=35;DP=106;FAO=35;FDP=106;FR=.;FRO=71;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=34;FSRR=37;FWDB=0.00178536;FXX=0.0275204;HRUN=3;LEN=1;MLLD=205.127;QD=10.1366;RBI=0.00900927;REFB=0.00209598;REVB=0.00883059;RO=71;SAF=18;SAR=17;SRF=34;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0408481;STB=0.523693;STBP=0.742;TYPE=snp;VARB=-0.00443649;OID=.;OPOS=53557963;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:106:71:71:35:35:0.330189:17:18:34:37:17:18:34:37
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chr7	55433884	.	A	C	937.95	PASS	AF=0.482759;AO=96;DP=201;FAO=98;FDP=203;FR=.;FRO=105;FSAF=53;FSAR=45;FSRF=55;FSRR=50;FWDB=0.00848549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.696;QD=18.4819;RBI=0.00863991;REFB=-0.00414205;REVB=-0.00162622;RO=103;SAF=52;SAR=44;SRF=53;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0255567;STB=0.508841;STBP=0.797;TYPE=snp;VARB=0.00455003;OID=.;OPOS=55433884;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:201:203:103:105:96:98:0.482759:44:52:53:50:45:53:55:50
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chr7	56088789	.	G	A	54.57	PASS	AF=0.1375;AO=11;DP=81;FAO=11;FDP=80;FR=.;FRO=69;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=39;FSRR=30;FWDB=0.00306924;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.792;QD=2.72835;RBI=0.0201645;REFB=0.00683106;REVB=-0.0199296;RO=68;SAF=7;SAR=4;SRF=38;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0985751;STB=0.563863;STBP=0.727;TYPE=snp;VARB=-0.0351762;OID=.;OPOS=56088789;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:81:80:68:69:11:11:0.1375:4:7:38:30:4:7:39:30
chr7	56088811	.	T	C	74.92	PASS	AF=0.166667;AO=14;DP=84;FAO=14;FDP=84;FR=.;FRO=70;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=40;FSRR=30;FWDB=0.0222691;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.1908;QD=3.56743;RBI=0.0222956;REFB=-0.00381774;REVB=-0.00108799;RO=69;SAF=7;SAR=7;SRF=40;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100288;STB=0.55944;STBP=0.622;TYPE=snp;VARB=0.0193598;OID=.;OPOS=56088811;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:84:84:69:70:14:14:0.166667:7:7:40:29:7:7:40:30
chr7	56088825	.	T	A	85.32	PASS	AF=0.178571;AO=15;DP=85;FAO=15;FDP=84;FR=.;FRO=69;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=38;FSRR=31;FWDB=0.0170649;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.568;QD=4.06271;RBI=0.0180041;REFB=0.00133469;REVB=-0.00573901;RO=69;SAF=7;SAR=8;SRF=38;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105283;STB=0.56863;STBP=0.539;TYPE=snp;VARB=-0.00630567;OID=.;OPOS=56088825;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:85:84:69:69:15:15:0.178571:8:7:38:31:8:7:38:31
chr7	56088902	.	C	T	47.94	PASS	AF=0.142857;AO=9;DP=63;FAO=9;FDP=63;FR=.;FRO=54;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=22;FSRR=32;FWDB=-0.0159592;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.863;QD=3.04355;RBI=0.022543;REFB=-0.00750365;REVB=0.0159215;RO=54;SAF=2;SAR=7;SRF=22;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.25355;STB=0.682486;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.0430195;OID=.;OPOS=56088902;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:63:63:54:54:9:9:0.142857:7:2:22:32:7:2:22:32
chr7	56088907	.	GC	CT	58.35	PASS	AF=0.183673;AO=9;DP=49;FAO=9;FDP=49;FR=.;FRO=40;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=29;FWDB=-0.0193956;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=252.514;QD=4.76321;RBI=0.0223399;REFB=-0.00383297;REVB=-0.0110852;RO=37;SAF=2;SAR=7;SRF=8;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0106853;STB=0.558146;STBP=0.736;TYPE=mnp;VARB=0.0130277;OID=.;OPOS=56088907;OREF=GC;OALT=CT;OMAPALT=CT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:58:49:49:37:40:9:9:0.183673:7:2:8:29:7:2:11:29
chr7	56126360	.	T	C	435.93	PASS	AF=0.941176;AO=31;DP=34;FAO=32;FDP=34;FR=.;FRO=2;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0876748;FXX=0.0285633;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.108;QD=51.2855;RBI=0.0951432;REFB=-0.186979;REVB=0.0369508;RO=1;SAF=16;SAR=15;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0300873;STB=0.501844;STBP=0.875;TYPE=snp;VARB=0.00602453;OID=.;OPOS=56126360;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:34:34:1:2:31:32:0.941176:15:16:0:1:15:17:1:1
chr7	56136194	.	C	T	322.36	PASS	AF=0.448718;AO=35;DP=78;FAO=35;FDP=78;FR=.;FRO=43;FSAF=23;FSAR=12;FSRF=30;FSRR=13;FWDB=-0.00217364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.578;QD=16.5314;RBI=0.0131642;REFB=-0.00708129;REVB=-0.0129835;RO=43;SAF=23;SAR=12;SRF=30;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0448894;STB=0.525172;STBP=0.737;TYPE=snp;VARB=0.0100152;OID=.;OPOS=56136194;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:43:43:35:35:0.448718:12:23:30:13:12:23:30:13
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chr7	56879527	.	A	G	3612.6	PASS	AF=0.766304;AO=281;DP=368;FAO=282;FDP=368;FR=.;FRO=86;FSAF=137;FSAR=145;FSRF=43;FSRR=43;FWDB=0.00367328;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=322.207;QD=39.2674;RBI=0.00951054;REFB=-0.0202403;REVB=0.00877254;RO=86;SAF=136;SAR=145;SRF=43;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00707074;STB=0.503317;STBP=0.823;TYPE=snp;VARB=0.00600407;OID=.;OPOS=56879527;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:368:368:86:86:281:282:0.766304:145:136:43:43:145:137:43:43
chr7	56879552	.	T	C	3912.58	PASS	AF=0.775194;AO=299;DP=386;FAO=300;FDP=387;FR=.;FRO=87;FSAF=142;FSAR=158;FSRF=45;FSRR=42;FWDB=-0.0131163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.284;QD=40.4401;RBI=0.0147617;REFB=-0.0169042;REVB=-0.00677271;RO=86;SAF=142;SAR=157;SRF=45;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0203773;STB=0.509888;STBP=0.492;TYPE=snp;VARB=0.0126463;OID=.;OPOS=56879552;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:386:387:86:87:299:300:0.775194:157:142:45:41:158:142:45:42
chr7	56879674	.	A	C	76.47	PASS	AF=0.19403;AO=13;DP=67;FAO=13;FDP=67;FR=.;FRO=54;FSAF=1;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=37;FWDB=0.025398;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.7163;QD=4.56521;RBI=0.0615162;REFB=-0.00869298;REVB=-0.0560284;RO=54;SAF=1;SAR=12;SRF=17;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.455827;STB=0.814469;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.0207467;OID=.;OPOS=56879674;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:67:67:54:54:13:13:0.19403:12:1:17:37:12:1:17:37
chr7	57257226	.	G	A	55.15	PASS	AF=0.10687;AO=14;DP=131;FAO=14;FDP=131;FR=.;FRO=117;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=57;FSRR=60;FWDB=-0.0320171;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.911;QD=1.68391;RBI=0.0453645;REFB=-0.00111617;REVB=-0.0321379;RO=116;SAF=9;SAR=5;SRF=56;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.193012;STB=0.639145;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=0.00670171;OID=.;OPOS=57257226;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:131:131:116:117:14:14:0.10687:5:9:56:60:5:9:57:60
chr7	57509966	.	C	A	410.26	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00439216;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.212;QD=56.5869;RBI=0.00805205;REFB=0;REVB=0.00674866;RO=0;SAF=15;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.90233e-05;OID=.;OPOS=57509966;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:14:15:0:0:14:15:0:0
chr7	57510054	.	CGT	C,CGA	218.47	PASS	AF=0.833333,0.166667;AO=14,4;DP=18;FAO=15,3;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=7,1;FSAR=8,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0253886,0.0670012;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=205.915,64.4404;QD=48.5479;RBI=0.0952372,0.0729897;REFB=0,0;REVB=0.0917908,0.0289541;RO=0;SAF=6,2;SAR=8,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.00332023,0.0381489;OID=.,.;OPOS=57510055,57510056;OREF=GT,T;OALT=-,A;OMAPALT=C,CGA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.833333,0.166667:14,4:18:15,3:18:0:7,1:8,2:0:0:15:0:6,2:8,2:0:0
chr7	57528997	.	T	C	135.54	PASS	AF=1;AO=9;DP=13;FAO=12;FDP=12;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00332919;FXX=0.076864;HRUN=1;LEN=1;MLLD=331.021;QD=45.1804;RBI=0.0561516;REFB=0;REVB=0.0560529;RO=0;SAF=8;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000579378;OID=.;OPOS=57528997;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:12:0:0:9:12:1:1:8:0:0:4:8:0:0
chr7	57529392	.	A	C	208.12	PASS	AF=0.9;AO=18;DP=20;FAO=18;FDP=20;FR=.;FRO=2;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0801556;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.3645;QD=41.6239;RBI=0.108156;REFB=-0.140468;REVB=-0.0726138;RO=2;SAF=10;SAR=8;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0102827;STB=0.505612;STBP=0.871;TYPE=snp;VARB=0.0174646;OID=.;OPOS=57529392;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:20:20:2:2:18:18:0.9:8:10:1:1:8:10:1:1
chr7	63529956	.	G	A	199.82	PASS	AF=0.40678;AO=24;DP=59;FAO=24;FDP=59;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=-0.044792;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.026;QD=13.5471;RBI=0.0473335;REFB=-0.0180801;REVB=-0.0153013;RO=34;SAF=13;SAR=11;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0428441;STB=0.516298;STBP=0.848;TYPE=snp;VARB=0.0289573;OID=.;OPOS=63529956;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:34:35:24:24:0.40678:11:13:17:17:11:13:18:17
chr7	63537849	.	G	A	157.74	PASS	AF=0.357143;AO=20;DP=56;FAO=20;FDP=56;FR=.;FRO=36;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=22;FWDB=0.00078147;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=305.312;QD=11.2669;RBI=0.00510449;REFB=-0.0037257;REVB=-0.00504431;RO=36;SAF=7;SAR=13;SRF=14;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0462175;STB=0.527;STBP=0.73;TYPE=snp;VARB=0.00704088;OID=.;OPOS=63537849;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:36:36:20:20:0.357143:13:7:14:22:13:7:14:22
chr7	63565953	.	A	C	629.16	PASS	AF=0.954545;AO=42;DP=44;FAO=42;FDP=44;FR=.;FRO=2;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0396039;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=90.7549;QD=57.1959;RBI=0.082674;REFB=0.0446426;REVB=0.0725708;RO=1;SAF=18;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0253627;STB=0.50331;STBP=0.851;TYPE=snp;VARB=-0.000351985;OID=.;OPOS=63565953;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:44:44:1:2:42:42:0.954545:24:18:1:0:24:18:1:1
chr7	63566387	.	A	ATGT	626.26	PASS	AF=0.933333;AO=39;DP=47;FAO=42;FDP=45;FR=.;FRO=3;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.00626328;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=3;MLLD=177.099;QD=55.6674;RBI=0.0630752;REFB=0.0187917;REVB=0.0627635;RO=4;SAF=18;SAR=21;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0934331;STB=0.538443;STBP=0.09;TYPE=ins;VARB=-0.000100371;OID=.;OPOS=63566388;OREF=-;OALT=TGT;OMAPALT=ATGT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.933333:39:47:42:45:3:18:24:3:0:13:4:18:21:4:0
chr7	63568887	.	A	ATAACT	223.6	PASS	AF=0.617647;AO=21;DP=36;FAO=21;FDP=34;FR=.;FRO=13;FSAF=16;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=0.0337682;FXX=0;HRUN=1;LEN=5;MLLD=296.487;QD=26.3058;RBI=0.0365642;REFB=-0.0136888;REVB=-0.0140232;RO=15;SAF=16;SAR=5;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.348473;STB=0.691163;STBP=0.01;TYPE=ins;VARB=0.00537077;OID=.;OPOS=63568888;OREF=-;OALT=TAACT;OMAPALT=ATAACT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.617647:21:36:21:34:13:16:5:4:9:99:15:16:5:5:10
chr7	63570733	.	T	C	712.11	PASS	AF=1;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0669331;FXX=0.0217344;HRUN=3;LEN=1;MLLD=239.473;QD=63.2984;RBI=0.0669334;REFB=0;REVB=-0.000202876;RO=0;SAF=21;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000126222;OID=.;OPOS=63570733;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:45:0:0:45:45:1:24:21:0:0:24:21:0:0
chr7	63572046	.	GA	G,GG	675.57	PASS	AF=1,0;AO=7,35;DP=42;FAO=42,0;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=33,0;FSAR=9,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0528684,-0.106038;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=208.518,194.793;QD=64.3397;RBI=0.0681756,0.109652;REFB=0,0;REVB=0.0430447,0.027919;RO=0;SAF=0,33;SAR=7,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.000212591,0;OID=.,.;OPOS=63572047,63572047;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1,0:7,35:42:42,0:42:0:33,0:9,0:0:0:4:0:0,33:7,2:0:0
chr7	63679733	.	A	G	418.44	PASS	AF=0.438776;AO=41;DP=97;FAO=43;FDP=98;FR=.;FRO=55;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=27;FSRR=28;FWDB=-0.000162686;FXX=0.0101;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.86;QD=17.079;RBI=0.025969;REFB=-0.0116006;REVB=0.0259685;RO=55;SAF=19;SAR=22;SRF=27;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0280548;STB=0.51451;STBP=0.799;TYPE=snp;VARB=0.0141764;OID=.;OPOS=63679733;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:98:55:55:41:43:0.438776:22:19:27:28:23:20:27:28
chr7	63726645	.	T	C	58.61	PASS	AF=0.5;AO=8;DP=16;FAO=8;FDP=16;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.0304197;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.241;QD=14.6534;RBI=0.0308032;REFB=0.0152224;REVB=0.0048456;RO=8;SAF=5;SAR=3;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00450052;OID=.;OPOS=63726645;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:16:16:8:8:8:8:0.5:3:5:5:3:3:5:5:3
chr7	63726678	.	T	A	70.57	PASS	AF=0.5625;AO=9;DP=16;FAO=9;FDP=16;FR=.;FRO=7;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.00227478;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.982;QD=17.6422;RBI=0.123491;REFB=0.0339428;REVB=0.12347;RO=7;SAF=7;SAR=2;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0657708;STB=0.538372;STBP=0.821;TYPE=snp;VARB=-0.00592417;OID=.;OPOS=63726678;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:16:16:7:7:9:9:0.5625:2:7:5:2:2:7:5:2
chr7	63796744	.	T	C	349.47	PASS	AF=0.385321;AO=42;DP=109;FAO=42;FDP=109;FR=.;FRO=67;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=34;FSRR=33;FWDB=0.013864;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.554;QD=12.8245;RBI=0.031467;REFB=-0.00121378;REVB=0.0282482;RO=67;SAF=17;SAR=25;SRF=34;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112275;STB=0.563879;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.00258572;OID=.;OPOS=63796744;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:109:67:67:42:42:0.385321:25:17:34:33:25:17:34:33
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chr7	64169019	.	G	A	174.39	PASS	AF=0.461538;AO=38;DP=40;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=0.00374334;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.656;QD=17.8857;RBI=0.0111624;REFB=-0.0120765;REVB=0.010516;RO=1;SAF=15;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0199387;STB=0.504499;STBP=0.973;TYPE=snp;VARB=0.0343618;OID=.;OPOS=64169019;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:39:1:21:38:18:0.461538:23:15:0:1:11:7:8:13
chr7	64254901	.	T	C	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0424535;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.6404;QD=49.5989;RBI=0.0855678;REFB=0;REVB=0.0742937;RO=0;SAF=15;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.32e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000923288;OID=.;OPOS=64254901;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:3:15:0:0:3:15:0:0
chr7	64291333	.	T	A	1033.02	PASS	AF=1;AO=70;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0179622;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=295.374;QD=58.1982;RBI=0.0240829;REFB=-0.128684;REVB=-0.016042;RO=1;SAF=36;SAR=34;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129528;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00027819;OID=.;OPOS=64291333;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:71:71:1:0:70:71:1:34:36:1:0:34:37:0:0
chr7	64291987	.	G	A	110.65	PASS	AF=0.448276;AO=13;DP=29;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.00576801;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.3347;QD=15.2626;RBI=0.0506884;REFB=-0.00335566;REVB=-0.0503592;RO=16;SAF=4;SAR=9;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.251107;STB=0.646177;STBP=0.206;TYPE=snp;VARB=0.000883028;OID=.;OPOS=64291987;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:16:16:13:13:0.448276:9:4:9:7:9:4:9:7
chr7	64291991	.	T	A	382.58	PASS	AF=0.965517;AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0108443;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=254.462;QD=52.7702;RBI=0.0198495;REFB=-0.0707365;REVB=-0.0166254;RO=0;SAF=13;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.516118;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.000359886;OID=.;OPOS=64291991;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:29:29:0:1:28:28:0.965517:15:13:0:0:15:13:0:1
chr7	64389089	.	A	C	191.26	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0296861;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.8032;QD=47.8147;RBI=0.0925611;REFB=0;REVB=0.0876715;RO=0;SAF=11;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.36667e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00554219;OID=.;OPOS=64389089;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:5:11:0:0:5:11:0:0
chr7	64438667	.	G	A	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0124325;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=372.705;QD=48.7373;RBI=0.0148553;REFB=0;REVB=0.00813108;RO=0;SAF=9;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.40802e-05;OID=.;OPOS=64438667;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:8:9:0:0:8:9:0:0
chr7	64439613	.	T	G	98.54	PASS	AF=0.428571;AO=12;DP=28;FAO=12;FDP=28;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=0.0230008;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=104.722;QD=14.0767;RBI=0.0381164;REFB=-0.00737239;REVB=0.0303945;RO=16;SAF=3;SAR=9;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.377878;STB=0.72184;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=0.00678679;OID=.;OPOS=64439613;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:28:28:16:16:12:12:0.428571:9:3:10:6:9:3:10:6
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chr7	64451699	.	T	C	1451.52	PASS	AF=1;AO=92;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00666956;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.408;QD=62.431;RBI=0.0112065;REFB=0;REVB=0.00900572;RO=0;SAF=31;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.48762e-05;OID=.;OPOS=64451699;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:93:93:0:0:92:93:1:61:31:0:0:62:31:0:0
chr7	64451963	.	T	C	1264.68	PASS	AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00565937;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.284;QD=61.6918;RBI=0.0271124;REFB=0;REVB=0.0265152;RO=0;SAF=43;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.10525e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.59936e-05;OID=.;OPOS=64451963;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:39:43:0:0:39:43:0:0
chr7	64452541	.	G	A	48.03	PASS	AF=0.5;AO=6;DP=13;FAO=7;FDP=14;FR=.;FRO=7;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=-0.00595915;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.285;QD=13.7228;RBI=0.0162578;REFB=-0.0228903;REVB=-0.0151263;RO=7;SAF=5;SAR=1;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0392853;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0355753;OID=.;OPOS=64452541;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:13:14:7:7:6:7:0.5:1:5:6:1:1:6:6:1
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chr7	64453136	.	G	A	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00147705;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=251.708;QD=56.1915;RBI=0.00441898;REFB=0;REVB=0.00416481;RO=0;SAF=16;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.38384e-05;OID=.;OPOS=64453136;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:12:16:0:0:12:16:0:0
chr7	64453615	.	T	C	481.62	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0639815;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.0417;QD=58.3775;RBI=0.0730616;REFB=0;REVB=0.0352755;RO=0;SAF=15;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.64315e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000988403;OID=.;OPOS=64453615;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:18:15:0:0:18:15:0:0
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chr7	64864894	.	C	T	118.81	PASS	AF=0.619048;AO=13;DP=21;FAO=13;FDP=21;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=-0.0633879;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.018;QD=22.6309;RBI=0.0651258;REFB=-0.0215458;REVB=-0.014945;RO=8;SAF=4;SAR=9;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0518484;STB=0.529366;STBP=0.767;TYPE=snp;VARB=0.00766358;OID=.;OPOS=64864894;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:21:21:8:8:13:13:0.619048:9:4:3:5:9:4:3:5
chr7	65279676	.	A	T	552.3	PASS	AF=0.408163;AO=59;DP=146;FAO=60;FDP=147;FR=.;FRO=87;FSAF=28;FSAR=32;FSRF=44;FSRR=43;FWDB=0.000446326;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.747;QD=15.0286;RBI=0.0349889;REFB=-0.0296249;REVB=-0.034986;RO=87;SAF=28;SAR=31;SRF=44;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0330037;STB=0.523153;STBP=0.643;TYPE=snp;VARB=0.0455262;OID=.;OPOS=65279676;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:146:147:87:87:59:60:0.408163:31:28:44:43:32:28:44:43
chr7	65279757	.	A	T	382.86	PASS	AF=0.379032;AO=35;DP=118;FAO=47;FDP=124;FR=.;FRO=77;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=27;FSRR=50;FWDB=0.0167724;FXX=0.0606015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.85;QD=12.3502;RBI=0.0168274;REFB=-0.00975209;REVB=0.00135953;RO=68;SAF=14;SAR=21;SRF=31;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0653424;STB=0.598934;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=0.0146708;OID=.;OPOS=65279757;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:118:124:68:77:35:47:0.379032:21:14:31:37:23:24:27:50
chr7	65425894	.	A	G	688.16	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0074159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.9451;QD=62.5599;RBI=0.0328058;REFB=0;REVB=-0.0319566;RO=0;SAF=20;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000162545;OID=.;OPOS=65425894;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:44:0:0:43:44:1:23:20:0:0:23:21:0:0
chr7	65429359	.	G	A	193.25	PASS	AF=0.316456;AO=25;DP=81;FAO=25;FDP=79;FR=.;FRO=54;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=33;FSRR=21;FWDB=-0.0375972;FXX=0.0246883;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.317;QD=9.78492;RBI=0.0376792;REFB=0.00867166;REVB=-0.00248433;RO=54;SAF=16;SAR=9;SRF=33;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0359546;STB=0.521156;STBP=0.83;TYPE=snp;VARB=-0.0235025;OID=.;OPOS=65429359;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:79:54:54:25:25:0.316456:9:16:33:21:9:16:33:21
chr7	65579838	.	A	G	140.75	PASS	AF=0.470588;AO=14;DP=32;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=13;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.000188819;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.249;QD=16.5583;RBI=0.0228116;REFB=-0.0227568;REVB=-0.0228108;RO=18;SAF=13;SAR=1;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.621526;STB=0.728132;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.0356515;OID=.;OPOS=65579838;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:34:18:18:14:16:0.470588:1:13:8:10:3:13:8:10
chr7	65579987	.	C	G	150.31	PASS	AF=0.346939;AO=17;DP=49;FAO=17;FDP=49;FR=.;FRO=32;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=-0.0290367;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.4641;QD=12.27;RBI=0.0809675;REFB=-0.00194719;REVB=-0.0755818;RO=32;SAF=9;SAR=8;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101664;STB=0.559739;STBP=0.54;TYPE=snp;VARB=-0.000770847;OID=.;OPOS=65579987;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:32:32:17:17:0.346939:8:9:14:18:8:9:14:18
chr7	65842543	.	C	CAT	601.8	PASS	AF=1;AO=39;DP=41;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0141325;FXX=0.0487686;HRUN=0;LEN=2;MLLD=194.186;QD=61.7231;RBI=0.0375038;REFB=0;REVB=0.0347392;RO=1;SAF=22;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0208334;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000102345;OID=.;OPOS=65842544;OREF=-;OALT=AT;OMAPALT=CAT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:39:41:39:39:0:22:17:0:0:4:1:22:17:1:0
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chr7	65860213	.	T	TAGAG	394.92	PASS	AF=1;AO=27;DP=29;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00545028;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=4;MLLD=316.623;QD=56.4165;RBI=0.00622022;REFB=0;REVB=-0.00299761;RO=0;SAF=13;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=8.4874e-05;OID=.;OPOS=65860214;OREF=-;OALT=AGAG;OMAPALT=TAGAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:27:29:28:28:0:14:14:0:0:4:0:13:14:0:0
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chr7	66147149	.	A	G	45.35	PASS	AF=0.318182;AO=7;DP=22;FAO=7;FDP=22;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=-0.0197985;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=227.666;QD=8.24621;RBI=0.0231845;REFB=-0.0199552;REVB=-0.012064;RO=14;SAF=6;SAR=1;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.388841;STB=0.736049;STBP=0.205;TYPE=snp;VARB=0.0382632;OID=.;OPOS=66147149;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:22:22:14:15:7:7:0.318182:1:6:8:6:1:6:9:6
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chr7	66774604	.	G	C	1065.73	PASS	AF=1;AO=71;DP=72;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0110909;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.805;QD=60.0412;RBI=0.0111034;REFB=0;REVB=0.000526695;RO=0;SAF=37;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.12261e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.94144e-05;OID=.;OPOS=66774604;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:71:0:0:71:71:1:34:37:0:0:34:37:0:0
chr7	66785634	.	T	A	100.24	PASS	AF=0.26;AO=14;DP=50;FAO=13;FDP=50;FR=.;FRO=37;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=22;FSRR=15;FWDB=-0.0119236;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.2439;QD=8.01914;RBI=0.0399718;REFB=-0.0242203;REVB=-0.038152;RO=35;SAF=9;SAR=5;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0536592;STB=0.516104;STBP=0.925;TYPE=snp;VARB=0.0632527;OID=.;OPOS=66785634;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:35:37:14:13:0.26:5:9:21:14:5:8:22:15
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chr7	70228020	.	G	T	200.85	PASS	AF=0.512821;AO=20;DP=39;FAO=20;FDP=39;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=-0.0117553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.701;QD=20.6003;RBI=0.0119694;REFB=-0.00110406;REVB=0.00225367;RO=19;SAF=9;SAR=11;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200385;STB=0.612549;STBP=0.194;TYPE=snp;VARB=0.00137057;OID=.;OPOS=70228020;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:19:19:20:20:0.512821:11:9:13:6:11:9:13:6
chr7	70252283	.	G	A	191.73	PASS	AF=0.369231;AO=24;DP=65;FAO=24;FDP=65;FR=.;FRO=41;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=27;FWDB=-0.0277353;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.9655;QD=11.7988;RBI=0.0339984;REFB=-0.0150262;REVB=0.0196633;RO=41;SAF=11;SAR=13;SRF=14;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130586;STB=0.575103;STBP=0.369;TYPE=snp;VARB=0.0232981;OID=.;OPOS=70252283;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:41:41:24:24:0.369231:13:11:14:27:13:11:14:27
chr7	70597522	.	C	A	2924.83	PASS	AF=1;AO=183;DP=185;FAO=186;FDP=186;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=98;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0413741;FXX=0.0106377;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.8831;QD=62.8995;RBI=0.0728157;REFB=0;REVB=0.0599191;RO=0;SAF=86;SAR=97;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.06882e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000457357;OID=.;OPOS=70597522;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:16:185:186:0:0:183:186:1:97:86:0:0:98:88:0:0
chr7	70597675	.	T	C	758.21	PASS	AF=0.964912;AO=55;DP=57;FAO=55;FDP=57;FR=.;FRO=2;FSAF=19;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0238801;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.7349;QD=53.208;RBI=0.0247136;REFB=-0.00163044;REVB=0.00636413;RO=2;SAF=19;SAR=36;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0112503;STB=0.505971;STBP=0.792;TYPE=snp;VARB=-0.000194431;OID=.;OPOS=70597675;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:57:57:2:2:55:55:0.964912:36:19:1:1:36:19:1:1
chr7	71150706	.	A	T	519.98	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0153312;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.414;QD=59.4262;RBI=0.0284743;REFB=0;REVB=0.0239946;RO=0;SAF=20;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000297083;OID=.;OPOS=71150706;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:15:20:0:0:15:20:0:0
chr7	71248676	.	C	T	298.08	PASS	AF=0.395349;AO=34;DP=86;FAO=34;FDP=86;FR=.;FRO=52;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=28;FSRR=24;FWDB=-0.0117602;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.804;QD=13.8644;RBI=0.0236459;REFB=-0.012511;REVB=-0.020514;RO=52;SAF=19;SAR=15;SRF=28;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0218561;STB=0.512441;STBP=0.876;TYPE=snp;VARB=0.0182587;OID=.;OPOS=71248676;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:52:52:34:34:0.395349:15:19:28:24:15:19:28:24
chr7	71252189	.	A	AG	237.78	PASS	AF=1;AO=19;DP=20;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.172418;FXX=0.049975;HRUN=3;LEN=1;MLLD=25.7309;QD=50.059;RBI=0.24871;REFB=0;REVB=-0.179245;RO=1;SAF=7;SAR=12;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0368096;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00226462;OID=.;OPOS=71252190;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:19:20:19:19:0:7:12:0:0:4:1:7:12:0:1
chr7	72413443	.	G	A	54.74	PASS	AF=0.777778;AO=7;DP=9;FAO=7;FDP=9;FR=.;FRO=2;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00340028;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.5016;QD=24.3281;RBI=0.0917986;REFB=0.0489916;REVB=0.0917356;RO=2;SAF=2;SAR=5;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145918;STB=0.583115;STBP=0.62;TYPE=snp;VARB=-0.00276095;OID=.;OPOS=72413443;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:9:9:2:2:7:7:0.777778:5:2:0:2:5:2:0:2
chr7	72413487	.	G	A	85.77	PASS	AF=0.37931;AO=11;DP=29;FAO=11;FDP=29;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.0134891;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.4709;QD=11.8299;RBI=0.0551704;REFB=0.0227975;REVB=0.0534959;RO=18;SAF=3;SAR=8;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199273;STB=0.619488;STBP=0.409;TYPE=snp;VARB=-0.0118196;OID=.;OPOS=72413487;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:29:29:18:18:11:11:0.37931:8:3:8:10:8:3:8:10
chr7	72413494	.	G	A	76.73	PASS	AF=0.357143;AO=10;DP=29;FAO=10;FDP=28;FR=.,HEALED;FRO=18;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.00891472;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.087;QD=10.9617;RBI=0.00908956;REFB=-0.00617594;REVB=-0.00177423;RO=14;SAF=3;SAR=7;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139625;STB=0.60135;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.00942102;OID=.;OPOS=72413494;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:29:28:14:18:10:10:0.357143:7:3:6:8:7:3:8:10
chr7	72413593	.	T	C	133.0	PASS	AF=0.283582;AO=19;DP=67;FAO=19;FDP=67;FR=.;FRO=48;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=28;FSRR=20;FWDB=-0.0318674;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.61;QD=7.94027;RBI=0.0346943;REFB=-0.00245304;REVB=-0.0137172;RO=48;SAF=12;SAR=7;SRF=28;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0604294;STB=0.536385;STBP=0.705;TYPE=snp;VARB=0.00580003;OID=.;OPOS=72413593;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:48:48:19:19:0.283582:7:12:28:20:7:12:28:20
chr7	72418963	.	T	C	289.5	PASS	AF=0.92;AO=23;DP=25;FAO=23;FDP=25;FR=.;FRO=2;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0269155;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.1076;QD=46.32;RBI=0.0306982;REFB=0.0401329;REVB=-0.0147627;RO=2;SAF=8;SAR=15;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0245642;STB=0.513296;STBP=0.78;TYPE=snp;VARB=-0.0313886;OID=.;OPOS=72418963;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:25:25:2:2:23:23:0.92:15:8:1:1:15:8:1:1
chr7	72738749	.	A	G	340.68	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0517209;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.5291;QD=54.5081;RBI=0.0517421;REFB=0;REVB=0.00147989;RO=0;SAF=12;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000556181;OID=.;OPOS=72738749;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:13:12:0:0:13:12:0:0
chr7	72738762	.	CA	TG	323.47	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0263035;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=142.84;QD=53.9112;RBI=0.0304848;REFB=0;REVB=0.0154094;RO=0;SAF=11;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000407012;OID=.;OPOS=72738762;OREF=CA;OALT=TG;OMAPALT=TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:13:11:0:0:13:11:0:0
chr7	72891754	.	C	T	156.48	PASS	AF=0.404762;AO=17;DP=43;FAO=17;FDP=42;FR=.;FRO=25;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=0.0148849;FXX=0.0232504;HRUN=2;LEN=1;MLLD=290.91;QD=14.9031;RBI=0.0193914;REFB=-0.00846175;REVB=0.0124284;RO=25;SAF=8;SAR=9;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.091655;STB=0.55301;STBP=0.583;TYPE=snp;VARB=0.0119355;OID=.;OPOS=72891754;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:42:25:25:17:17:0.404762:9:8:14:11:9:8:14:11
chr7	72951204	.	G	A	158.05	PASS	AF=0.64;AO=16;DP=25;FAO=16;FDP=25;FR=.;FRO=9;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.010819;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=313.237;QD=25.2873;RBI=0.0127399;REFB=-0.0273726;REVB=-0.0067271;RO=9;SAF=7;SAR=9;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0763025;STB=0.54266;STBP=0.627;TYPE=snp;VARB=0.0140672;OID=.;OPOS=72951204;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:25:25:9:9:16:16:0.64:9:7:5:4:9:7:5:4
chr7	73020301	.	T	C	1116.73	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00341378;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.724;QD=60.3636;RBI=0.00386897;REFB=0;REVB=0.00182072;RO=0;SAF=30;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.93382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.27522e-05;OID=.;OPOS=73020301;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:44:30:0:0:44:30:0:0
chr7	73097238	.	G	A	63.35	PASS	AF=0.310345;AO=9;DP=29;FAO=9;FDP=29;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=17;FWDB=-0.0114248;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=346.594;QD=8.7375;RBI=0.0120628;REFB=0.00345866;REVB=-0.00387125;RO=20;SAF=4;SAR=5;SRF=3;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.364862;STB=0.715075;STBP=0.221;TYPE=snp;VARB=-0.0134842;OID=.;OPOS=73097238;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:29:29:20:20:9:9:0.310345:5:4:3:17:5:4:3:17
chr7	73097948	.	G	C	66.19	PASS	AF=0.409091;AO=9;DP=22;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=3;FWDB=-0.00722635;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.8465;QD=12.034;RBI=0.0179931;REFB=0.026773;REVB=0.0164782;RO=13;SAF=2;SAR=7;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.519322;STB=0.807046;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=-0.033083;OID=.;OPOS=73097948;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:22:22:13:13:9:9:0.409091:7:2:10:3:7:2:10:3
chr7	73108310	.	T	C	263.38	PASS	AF=0.518519;AO=28;DP=54;FAO=28;FDP=54;FR=.;FRO=26;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=-0.0128684;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.7624;QD=19.5099;RBI=0.0153952;REFB=-0.000133846;REVB=0.00845073;RO=26;SAF=18;SAR=10;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0103607;STB=0.505776;STBP=0.959;TYPE=snp;VARB=3.3175e-05;OID=.;OPOS=73108310;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:26:26:28:28:0.518519:10:18:17:9:10:18:17:9
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chr7	73246461	.	A	G	169.73	PASS	AF=0.315068;AO=22;DP=72;FAO=23;FDP=73;FR=.;FRO=50;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=23;FSRR=27;FWDB=0.00656314;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.006;QD=9.30008;RBI=0.0249739;REFB=-0.00481417;REVB=0.0240961;RO=50;SAF=13;SAR=9;SRF=23;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153381;STB=0.602061;STBP=0.251;TYPE=snp;VARB=0.0156616;OID=.;OPOS=73246461;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:73:50:50:22:23:0.315068:9:13:23:27:9:14:23:27
chr7	73246496	.	C	T	338.42	PASS	AF=0.37963;AO=41;DP=108;FAO=41;FDP=108;FR=.;FRO=67;FSAF=25;FSAR=16;FSRF=31;FSRR=36;FWDB=0.0106883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.246;QD=12.5341;RBI=0.014488;REFB=-0.000120924;REVB=0.00978075;RO=67;SAF=25;SAR=16;SRF=31;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161306;STB=0.59194;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.000236013;OID=.;OPOS=73246496;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:108:67:67:41:41:0.37963:16:25:31:36:16:25:31:36
chr7	73246555	.	C	G	425.0	PASS	AF=0.428571;AO=48;DP=112;FAO=48;FDP=112;FR=.;FRO=64;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=30;FSRR=34;FWDB=-0.0126485;FXX=0.00884877;HRUN=2;LEN=1;MLLD=283.332;QD=15.1784;RBI=0.0139567;REFB=-0.0275341;REVB=-0.0058996;RO=63;SAF=25;SAR=23;SRF=29;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0611649;STB=0.529727;STBP=0.618;TYPE=snp;VARB=0.0350331;OID=.;OPOS=73246555;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:112:63:64:48:48:0.428571:23:25:29:34:23:25:30:34
chr7	73249165	.	T	A	174.11	PASS	AF=0.5;AO=18;DP=36;FAO=18;FDP=36;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.0229801;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.2937;QD=19.3456;RBI=0.0253197;REFB=-0.0135241;REVB=-0.0106304;RO=17;SAF=8;SAR=10;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0731248;STB=0.527919;STBP=0.678;TYPE=snp;VARB=0.0193862;OID=.;OPOS=73249165;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:17:18:18:18:0.5:10:8:9:8:10:8:9:9
chr7	73249299	.	G	C	308.0	PASS	AF=0.588235;AO=30;DP=51;FAO=30;FDP=51;FR=.;FRO=21;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.0178048;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.848;QD=24.1569;RBI=0.0224076;REFB=-0.00842898;REVB=-0.0136047;RO=21;SAF=17;SAR=13;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103272;STB=0.556974;STBP=0.345;TYPE=snp;VARB=0.00588736;OID=.;OPOS=73249299;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:21:21:30:30:0.588235:13:17:9:12:13:17:9:12
chr7	73254812	.	T	C	54.85	PASS	AF=0.444444;AO=7;DP=17;FAO=8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=-0.0567596;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.6582;QD=12.1886;RBI=0.0708589;REFB=-0.0104971;REVB=-0.0424184;RO=7;SAF=0;SAR=7;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.733671;STB=0.583101;STBP=0.708;TYPE=snp;VARB=0.00189225;OID=.;OPOS=73254812;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:17:18:7:10:7:8:0.444444:7:0:1:6:7:1:2:8
chr7	73275565	.	T	A	90.34	PASS	AF=0.5;AO=11;DP=22;FAO=11;FDP=22;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=0.00521666;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.907;QD=16.4263;RBI=0.00747563;REFB=-0.00932633;REVB=0.00535457;RO=11;SAF=4;SAR=7;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0874175;STB=0.55037;STBP=0.702;TYPE=snp;VARB=0.00470191;OID=.;OPOS=73275565;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:22:22:11:11:11:11:0.5:7:4:3:8:7:4:3:8
chr7	73279482	.	T	C	48.08	PASS	AF=0.466667;AO=6;DP=15;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=-0.0360905;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.546;QD=12.8224;RBI=0.0720045;REFB=-0.00947306;REVB=0.0623067;RO=8;SAF=2;SAR=4;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.474505;STB=0.788741;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=0.0192244;OID=.;OPOS=73279482;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:15:15:8:8:6:7:0.466667:4:2:7:1:5:2:7:1
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chr7	73753250	.	T	C	483.34	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00298419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.788;QD=58.5866;RBI=0.0129308;REFB=0;REVB=0.0125817;RO=0;SAF=13;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.82173e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.19527e-05;OID=.;OPOS=73753250;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:20:13:0:0:20:13:0:0
chr7	73814749	.	G	C	1666.86	PASS	AF=0.982609;AO=108;DP=110;FAO=113;FDP=115;FR=.;FRO=2;FSAF=68;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0710762;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.487;QD=57.9778;RBI=0.071632;REFB=-0.0228697;REVB=-0.00890606;RO=2;SAF=63;SAR=45;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00295606;STB=0.501845;STBP=0.858;TYPE=snp;VARB=0.00136166;OID=.;OPOS=73814749;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:110:115:2:2:108:113:0.982609:45:63:1:1:45:68:1:1
chr7	73933815	.	C	T	94.5	PASS	AF=0.611111;AO=11;DP=18;FAO=11;FDP=18;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.0663574;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.132;QD=20.9999;RBI=0.073722;REFB=0.0137052;REVB=0.0321188;RO=7;SAF=5;SAR=6;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0178658;STB=0.510186;STBP=0.943;TYPE=snp;VARB=-0.00993657;OID=.;OPOS=73933815;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:18:18:7:7:11:11:0.611111:6:5:3:4:6:5:3:4
chr7	74193668	.	G	A	51.47	PASS	AF=0.222222;AO=8;DP=35;FAO=8;FDP=36;FR=.;FRO=28;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=22;FWDB=-0.015278;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.718;QD=5.71875;RBI=0.0468048;REFB=-0.00320242;REVB=-0.0442411;RO=27;SAF=5;SAR=3;SRF=6;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.460676;STB=0.790576;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=0.0161312;OID=.;OPOS=74193668;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:51:35:36:27:28:8:8:0.222222:3:5:6:21:3:5:6:22
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chr7	75441111	.	G	T	30.1	PASS	AF=0.416667;AO=5;DP=12;FAO=5;FDP=12;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=0;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=-0.0119616;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=255.572;QD=10.0339;RBI=0.0119616;REFB=-0.00613835;REVB=0;RO=7;SAF=5;SAR=0;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0117125;OID=.;OPOS=75441111;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:12:12:7:7:5:5:0.416667:0:5:7:0:0:5:7:0
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chr7	75442730	.	T	G	181.65	PASS	AF=0.389831;AO=22;DP=58;FAO=23;FDP=59;FR=.;FRO=36;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=-0.0241974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.432;QD=12.3152;RBI=0.0382628;REFB=-0.00542365;REVB=-0.0296399;RO=34;SAF=5;SAR=17;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.293628;STB=0.644018;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=0.0218936;OID=.;OPOS=75442730;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:59:34:36:22:23:0.389831:17:5:16:18:17:6:17:19
chr7	75513062	.	A	G	503.57	PASS	AF=0.945946;AO=35;DP=38;FAO=35;FDP=37;FR=.;FRO=2;FSAF=23;FSAR=12;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0368042;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.64;QD=54.4396;RBI=0.0409131;REFB=-0.0982907;REVB=0.01787;RO=2;SAF=23;SAR=12;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.038958;STB=0.520822;STBP=0.428;TYPE=snp;VARB=0.00275111;OID=.;OPOS=75513062;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:38:37:2:2:35:35:0.945946:12:23:2:0:12:23:2:0
chr7	75544591	.	G	A	156.39	PASS	AF=0.615385;AO=16;DP=26;FAO=16;FDP=26;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.042775;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.09;QD=24.0602;RBI=0.0434546;REFB=-0.0308242;REVB=0.00765541;RO=10;SAF=4;SAR=12;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.201004;STB=0.613484;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=0.0203319;OID=.;OPOS=75544591;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:26:26:10:10:16:16:0.615385:12:4:5:5:12:4:5:5
chr7	75614953	.	T	C	1060.87	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00135982;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.7467;QD=59.7674;RBI=0.104488;REFB=0;REVB=0.104479;RO=0;SAF=51;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.64454e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00085239;OID=.;OPOS=75614953;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:71:0:0:69:71:1:18:51:0:0:20:51:0:0
chr7	75615006	.	C	T	977.52	PASS	AF=0.971831;AO=68;DP=71;FAO=69;FDP=71;FR=.;FRO=2;FSAF=44;FSAR=25;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0799566;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.019;QD=55.0716;RBI=0.0804077;REFB=-0.00698197;REVB=-0.00850503;RO=3;SAF=43;SAR=25;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0318384;STB=0.511108;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.000505004;OID=.;OPOS=75615006;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:71:71:3:2:68:69:0.971831:25:43:3:0:25:44:2:0
chr7	75616577	.	G	A	169.36	PASS	AF=0.439024;AO=18;DP=41;FAO=18;FDP=41;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=0.00212919;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.7992;QD=16.5231;RBI=0.0113803;REFB=-0.0311404;REVB=0.0111794;RO=23;SAF=5;SAR=13;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173098;STB=0.599883;STBP=0.325;TYPE=snp;VARB=0.0387832;OID=.;OPOS=75616577;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:23:23:18:18:0.439024:13:5:10:13:13:5:10:13
chr7	75621827	.	A	G	556.99	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00483418;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=195.261;QD=60.2153;RBI=0.0235329;REFB=0;REVB=0.023031;RO=0;SAF=15;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.82408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.68712e-05;OID=.;OPOS=75621827;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:22:15:0:0:22:15:0:0
chr7	75629778	.	T	C	442.46	PASS	AF=0.7;AO=34;DP=49;FAO=35;FDP=50;FR=.;FRO=15;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=4;FWDB=0.0180757;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.634;QD=35.3969;RBI=0.022508;REFB=-0.0138049;REVB=0.0134118;RO=15;SAF=21;SAR=13;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0702256;STB=0.534227;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.00547877;OID=.;OPOS=75629778;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:50:15:15:34:35:0.7:13:21:11:4:13:22:11:4
chr7	75633160	.	C	T	153.61	PASS	AF=0.571429;AO=16;DP=28;FAO=16;FDP=28;FR=.;FRO=12;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.0277507;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.417;QD=21.9446;RBI=0.0279456;REFB=-0.0340443;REVB=-0.00329493;RO=12;SAF=9;SAR=7;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11081;STB=0.562422;STBP=0.48;TYPE=snp;VARB=0.0229453;OID=.;OPOS=75633160;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:28:28:12:12:16:16:0.571429:7:9:5:7:7:9:5:7
chr7	75677504	.	C	T	1144.6	PASS	AF=0.974684;AO=77;DP=79;FAO=77;FDP=79;FR=.;FRO=2;FSAF=26;FSAR=51;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.102935;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.3844;QD=57.9545;RBI=0.104347;REFB=-0.147953;REVB=0.017105;RO=2;SAF=26;SAR=51;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00866446;STB=0.504579;STBP=0.771;TYPE=snp;VARB=0.00418348;OID=.;OPOS=75677504;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:79:79:2:2:77:77:0.974684:51:26:1:1:51:26:1:1
chr7	75716765	.	C	T	157.91	PASS	AF=0.282051;AO=22;DP=78;FAO=22;FDP=78;FR=.;FRO=56;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=38;FSRR=18;FWDB=-0.000477693;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.308;QD=8.09792;RBI=0.00812404;REFB=-0.00138124;REVB=0.00810998;RO=55;SAF=9;SAR=13;SRF=37;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.307754;STB=0.68636;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.00348979;OID=.;OPOS=75716765;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:55:56:22:22:0.282051:13:9:37:18:13:9:38:18
chr7	75716781	.	G	A	1212.38	PASS	AF=1;AO=79;DP=80;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0249119;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.18;QD=61.3863;RBI=0.0401541;REFB=0;REVB=0.031492;RO=0;SAF=44;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.37809e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.76172e-06;OID=.;OPOS=75716781;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:80:79:0:0:79:79:1:35:44:0:0:35:44:0:0
chr7	75716789	.	C	A	135.77	PASS	AF=0.253165;AO=20;DP=79;FAO=20;FDP=79;FR=.;FRO=59;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=37;FSRR=22;FWDB=-0.00404857;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.65;QD=6.87445;RBI=0.0162901;REFB=-0.000201258;REVB=-0.015779;RO=59;SAF=8;SAR=12;SRF=37;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.272806;STB=0.664867;STBP=0.103;TYPE=snp;VARB=0.000392446;OID=.;OPOS=75716789;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:59:59:20:20:0.253165:12:8:37:22:12:8:37:22
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chr7	75716804	.	G	A	97.32	PASS	AF=0.207792;AO=16;DP=77;FAO=16;FDP=77;FR=.;FRO=61;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=38;FSRR=23;FWDB=0.0141797;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=313.998;QD=5.05551;RBI=0.0203484;REFB=-0.00165956;REVB=-0.0145943;RO=61;SAF=7;SAR=9;SRF=38;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.229083;STB=0.643708;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=0.00806497;OID=.;OPOS=75716804;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:77:77:61:61:16:16:0.207792:9:7:38:23:9:7:38:23
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chr7	75932721	.	ATTTTTTT	AATTTTTT,ATTTTTT,ATTTTTTA	65.22	PASS	AF=0.666667,0.111111,0.222222;AO=4,2,2;DP=9;FAO=6,1,2;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0,1;FSAR=6,1,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0661637,-0.04031,-0.0336863;FXX=0;HRUN=7,7,7;LEN=1,1,1;MLLD=15.2983,8.43304,11.4139;QD=28.9854;RBI=0.176102,0.202111,0.100833;REFB=-0.0115853,-0.0380188,-0.0656657;REVB=0.1632,0.19805,0.09504;RO=1;SAF=0,0,1;SAR=4,2,1;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0.25849;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=snp,del,snp;VARB=0.0730432,0.0373676,0.0464165;OID=.,.,.;OPOS=75932722,75932722,75932728;OREF=T,T,T;OALT=A,-,A;OMAPALT=AATTTTTT,ATTTTTT,ATTTTTTA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/3:0.666667,0.111111,0.222222:4,2,2:9:6,1,2:9:0:0,0,1:6,1,1:0:0:11:1:0,0,1:4,2,1:0:1
chr7	75959188	.	G	A	59.4	PASS	AF=0.533333;AO=8;DP=15;FAO=8;FDP=15;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.00414592;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.941;QD=15.8391;RBI=0.0331829;REFB=-0.031093;REVB=0.0329228;RO=7;SAF=3;SAR=5;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158056;STB=0.592984;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=0.0339844;OID=.;OPOS=75959188;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:15:15:7:7:8:8:0.533333:5:3:4:3:5:3:4:3
chr7	76029673	.	G	A	184.79	PASS	AF=0.389831;AO=23;DP=59;FAO=23;FDP=59;FR=.;FRO=36;FSAF=18;FSAR=5;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=0.0140621;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.9174;QD=12.5283;RBI=0.0270926;REFB=-0.0199489;REVB=0.0231574;RO=34;SAF=18;SAR=5;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.305568;STB=0.696784;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.0366491;OID=.;OPOS=76029673;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:34:36:23:23:0.389831:5:18:18:16:5:18:18:18
chr7	76069811	.	T	C	311.28	PASS	AF=0.5;AO=33;DP=67;FAO=33;FDP=66;FR=.;FRO=33;FSAF=9;FSAR=24;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=-0.0126504;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=306.487;QD=18.8652;RBI=0.0183254;REFB=-0.0192146;REVB=0.0132585;RO=34;SAF=9;SAR=24;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.279495;STB=0.662618;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.0129172;OID=.;OPOS=76069811;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:66:34:33:33:33:0.5:24:9:19:15:24:9:19:14
chr7	76112060	.	C	T	233.87	PASS	AF=0.724138;AO=21;DP=29;FAO=21;FDP=29;FR=.;FRO=8;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.00160273;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.046;QD=32.2578;RBI=0.026456;REFB=-0.0243795;REVB=0.0264074;RO=8;SAF=14;SAR=7;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0907263;STB=0.549951;STBP=0.456;TYPE=snp;VARB=0.0099978;OID=.;OPOS=76112060;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:29:29:8:8:21:21:0.724138:7:14:4:4:7:14:4:4
chr7	76131645	.	A	G	747.09	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0157216;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.76;QD=63.582;RBI=0.0270134;REFB=0;REVB=0.0219672;RO=0;SAF=29;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000197023;OID=.;OPOS=76131645;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:18:29:0:0:18:29:0:0
chr7	76131650	.	G	A	214.39	PASS	AF=0.46;AO=23;DP=51;FAO=23;FDP=50;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=0.0142345;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.997;QD=17.1514;RBI=0.0221716;REFB=0.0025678;REVB=0.0169988;RO=27;SAF=13;SAR=10;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0631228;STB=0.535684;STBP=0.679;TYPE=snp;VARB=-0.00210124;OID=.;OPOS=76131650;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:50:27:27:23:23:0.46:10:13:17:10:10:13:17:10
chr7	76131695	.	A	G	834.4	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00221421;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.437;QD=57.5448;RBI=0.00325152;REFB=0;REVB=0.0023811;RO=0;SAF=33;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.18622e-05;OID=.;OPOS=76131695;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:25:33:0:0:25:33:0:0
chr7	76132898	.	T	C	53.69	PASS	AF=0.296296;AO=8;DP=27;FAO=8;FDP=27;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=-0.0384925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.071;QD=7.95468;RBI=0.0385295;REFB=-0.0157128;REVB=0.00168863;RO=19;SAF=5;SAR=3;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0731589;STB=0.545344;STBP=0.804;TYPE=snp;VARB=0.0234953;OID=.;OPOS=76132898;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:27:27:19:19:8:8:0.296296:3:5:13:6:3:5:13:6
chr7	76135134	.	G	A	64.23	PASS	AF=0.333333;AO=9;DP=27;FAO=9;FDP=27;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=0.058414;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.5757;QD=9.5162;RBI=0.107062;REFB=-0.0108517;REVB=0.0897224;RO=18;SAF=3;SAR=6;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0271813;OID=.;OPOS=76135134;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:27:27:18:18:9:9:0.333333:6:3:6:12:6:3:6:12
chr7	76140023	.	G	A	39.35	PASS	AF=0.545455;AO=6;DP=11;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=-0.00202899;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.256;QD=14.3106;RBI=0.10471;REFB=-0.0101527;REVB=0.10469;RO=5;SAF=5;SAR=1;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.290708;STB=0.666254;STBP=0.721;TYPE=snp;VARB=0.0136451;OID=.;OPOS=76140023;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:11:11:5:5:6:6:0.545455:1:5:5:0:1:5:5:0
chr7	76140186	.	T	C	133.51	PASS	AF=0.240964;AO=20;DP=83;FAO=20;FDP=83;FR=.;FRO=63;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=24;FSRR=39;FWDB=-0.00838137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.967;QD=6.43437;RBI=0.00843218;REFB=-0.00153584;REVB=0.000924274;RO=62;SAF=7;SAR=13;SRF=23;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0280601;STB=0.525398;STBP=0.837;TYPE=snp;VARB=0.00375007;OID=.;OPOS=76140186;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:62:63:20:20:0.240964:13:7:23:39:13:7:24:39
chr7	76144455	.	A	C	557.08	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.024518;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.929;QD=60.2245;RBI=0.0254789;REFB=0;REVB=-0.00693124;RO=0;SAF=8;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000115546;OID=.;OPOS=76144455;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:29:8:0:0:29:8:0:0
chr7	76144483	.	A	G	135.95	PASS	AF=0.454545;AO=15;DP=34;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=14;FWDB=0.0107192;FXX=0.0294031;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.127;QD=16.4784;RBI=0.0132908;REFB=-0.00485848;REVB=-0.00785768;RO=19;SAF=5;SAR=10;SRF=4;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14237;STB=0.571339;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.0114843;OID=.;OPOS=76144483;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:33:19:18:15:15:0.454545:10:5:4:15:10:5:4:14
chr7	76144560	.	T	C	272.54	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0433326;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.155;QD=51.9131;RBI=0.0438098;REFB=0;REVB=-0.00644835;RO=0;SAF=3;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000186732;OID=.;OPOS=76144560;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:18:3:0:0:18:3:0:0
chr7	76240785	.	CA	C	210.07	PASS	AF=0.477273;AO=21;DP=44;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=0.0260854;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.283;QD=19.0974;RBI=0.0434314;REFB=-0.0141233;REVB=-0.0347252;RO=21;SAF=12;SAR=9;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0427514;STB=0.548973;STBP=0.531;TYPE=del;VARB=0.0155666;OID=.;OPOS=76240786;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.477273:21:44:21:44:23:12:9:11:12:99:21:12:9:11:10
chr7	76240888	.	A	G	253.37	PASS	AF=0.441176;AO=28;DP=66;FAO=30;FDP=68;FR=.;FRO=38;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=23;FWDB=0.0614242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.325;QD=14.9041;RBI=0.0643563;REFB=-0.00848426;REVB=0.0192042;RO=38;SAF=17;SAR=11;SRF=15;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214131;STB=0.595268;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=0.0128546;OID=.;OPOS=76240888;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:68:38:38:28:30:0.441176:11:17:15:23:13:17:15:23
chr7	76885769	.	A	G	365.04	PASS	AF=0.964286;AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0459326;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.2449;QD=52.1481;RBI=0.0495425;REFB=-0.111385;REVB=0.0185647;RO=0;SAF=6;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.538432;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=0.00329191;OID=.;OPOS=76885769;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:28:28:0:1:27:27:0.964286:21:6:0:0:21:6:1:0
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chr7	76990178	.	C	G	389.25	PASS	AF=0.47619;AO=40;DP=84;FAO=40;FDP=84;FR=.;FRO=44;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=18;FSRR=26;FWDB=-0.00249623;FXX=0.0117633;HRUN=3;LEN=1;MLLD=260.543;QD=18.5357;RBI=0.00321344;REFB=-0.0126798;REVB=-0.00202363;RO=44;SAF=16;SAR=24;SRF=18;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00887267;STB=0.504948;STBP=0.947;TYPE=snp;VARB=0.0161842;OID=.;OPOS=76990178;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:44:44:40:40:0.47619:24:16:18:26:24:16:18:26
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chr7	77053084	.	T	C	120.36	PASS	AF=0.65;AO=13;DP=20;FAO=13;FDP=20;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=-0.0296206;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.8649;QD=24.0727;RBI=0.0632708;REFB=0.00726923;REVB=0.055909;RO=7;SAF=4;SAR=9;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0161289;STB=0.509077;STBP=0.952;TYPE=snp;VARB=-0.00174316;OID=.;OPOS=77053084;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:20:20:7:7:13:13:0.65:9:4:2:5:9:4:2:5
chr7	77247821	.	G	A	209.34	PASS	AF=0.409836;AO=25;DP=61;FAO=25;FDP=61;FR=.;FRO=36;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=24;FSRR=12;FWDB=-0.00446783;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.3277;QD=13.7269;RBI=0.00512133;REFB=-0.00322664;REVB=-0.00250331;RO=35;SAF=12;SAR=13;SRF=23;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180665;STB=0.609291;STBP=0.183;TYPE=snp;VARB=0.00470973;OID=.;OPOS=77247821;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:35:36:25:25:0.409836:13:12:23:12:13:12:24:12
chr7	77256713	.	A	G	135.77	PASS	AF=0.7;AO=14;DP=20;FAO=14;FDP=20;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.0178045;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.913;QD=27.1542;RBI=0.0210014;REFB=-0.0174974;REVB=-0.011138;RO=5;SAF=4;SAR=10;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.050881;STB=0.545392;STBP=0.648;TYPE=snp;VARB=0.00971033;OID=.;OPOS=77256713;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:20:20:5:6:14:14:0.7:10:4:1:4:10:4:1:5
chr7	77268968	.	G	A	214.1	PASS	AF=0.431034;AO=25;DP=58;FAO=25;FDP=58;FR=.;FRO=33;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=-0.00664468;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.289;QD=14.7658;RBI=0.00673512;REFB=-0.0232296;REVB=-0.00110001;RO=33;SAF=14;SAR=11;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165017;STB=0.593633;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=0.0194218;OID=.;OPOS=77268968;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:33:33:25:25:0.431034:11:14:13:20:11:14:13:20
chr7	77402478	.	T	TA	44.91	PASS	AF=0.631579;AO=10;DP=19;FAO=12;FDP=19;FR=.;FRO=7;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.108866;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=7.9787;QD=9.4553;RBI=0.11315;REFB=-0.172378;REVB=-0.03084;RO=9;SAF=4;SAR=6;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.215579;STB=0.526272;STBP=0.806;TYPE=ins;VARB=0.1556;OID=.;OPOS=77402479;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.631579:10:19:12:19:7:6:6:4:3:26:9:4:6:6:3
chr7	77552127	.	G	A	747.09	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000176247;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.28;QD=63.5822;RBI=0.0124985;REFB=0;REVB=-0.0124973;RO=0;SAF=22;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.28232e-05;OID=.;OPOS=77552127;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:25:22:0:0:25:22:0:0
chr7	77648671	.	G	C	30.96	PASS	AF=0.5;AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=-0.0659617;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.021;QD=12.386;RBI=0.108255;REFB=0.0345001;REVB=0.085838;RO=5;SAF=3;SAR=2;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179553;STB=0.608297;STBP=0.611;TYPE=snp;VARB=-0.0334372;OID=.;OPOS=77648671;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:27:10:10:5:5:5:5:0.5:2:3:4:1:2:3:4:1
chr7	77756580	.	T	C	192.85	PASS	AF=0.423077;AO=22;DP=52;FAO=22;FDP=52;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=-0.0014674;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.618;QD=14.8345;RBI=0.0241512;REFB=-0.00783662;REVB=0.0241065;RO=29;SAF=12;SAR=10;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0966586;STB=0.564402;STBP=0.459;TYPE=snp;VARB=0.00787877;OID=.;OPOS=77756580;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:29:30:22:22:0.423077:10:12:13:16:10:12:13:17
chr7	77789403	.	A	G	267.21	PASS	AF=0.54;AO=26;DP=51;FAO=27;FDP=50;FR=.;FRO=23;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=-0.00663994;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.084;QD=21.3766;RBI=0.0070039;REFB=-0.0388031;REVB=-0.0022284;RO=23;SAF=17;SAR=9;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0412921;STB=0.510261;STBP=0.886;TYPE=snp;VARB=0.0171814;OID=.;OPOS=77789403;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:50:23:23:26:27:0.54:9:17:14:9:10:17:14:9
chr7	80088041	.	G	A	2140.65	PASS	AF=1;AO=136;DP=136;FAO=136;FDP=136;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00162018;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.382;QD=62.9603;RBI=0.0133759;REFB=0;REVB=-0.0132775;RO=0;SAF=79;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.0304e-05;OID=.;OPOS=80088041;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:136:136:0:0:136:136:1:57:79:0:0:57:79:0:0
chr7	80290528	.	T	TG	198.25	PASS	AF=0.574468;AO=25;DP=52;FAO=27;FDP=47;FR=.;FRO=20;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=5;FSRR=15;FWDB=0.0365228;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=28.3362;QD=16.8726;RBI=0.0653954;REFB=0.0262954;REVB=0.0542462;RO=27;SAF=11;SAR=14;SRF=7;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174178;STB=0.571139;STBP=0.298;TYPE=ins;VARB=-0.0194172;OID=.;OPOS=80290529;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.574468:25:52:27:47:20:11:16:5:15:99:27:11:14:7:20
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chr7	80374438	.	T	C	1649.77	PASS	AF=0.990991;AO=110;DP=113;FAO=110;FDP=111;FR=.;FRO=1;FSAF=56;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0241587;FXX=0.0176975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.428;QD=59.4511;RBI=0.0262026;REFB=0.0289769;REVB=0.0101456;RO=1;SAF=56;SAR=54;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00871036;STB=0.504586;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=1.19356e-05;OID=.;OPOS=80374438;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:113:111:1:1:110:110:0.990991:54:56:0:1:54:56:0:1
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chr7	82582846	.	C	T	457.05	PASS	AF=0.556962;AO=44;DP=79;FAO=44;FDP=79;FR=.;FRO=35;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=21;FSRR=14;FWDB=0.00258844;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.37;QD=23.1416;RBI=0.00796234;REFB=0.0109876;REVB=0.00752986;RO=35;SAF=23;SAR=21;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0626152;STB=0.534397;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=-0.00920455;OID=.;OPOS=82582846;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:35:35:44:44:0.556962:21:23:21:14:21:23:21:14
chr7	82764425	.	C	G	556.53	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0160362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.464;QD=60.1657;RBI=0.0209049;REFB=0;REVB=0.013411;RO=0;SAF=15;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.82408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.23763e-06;OID=.;OPOS=82764425;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:22:15:0:0:22:15:0:0
chr7	82784832	.	C	G	68.09	PASS	AF=0.473684;AO=9;DP=19;FAO=9;FDP=19;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=10;FWDB=-0.102919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.7068;QD=14.3342;RBI=0.112959;REFB=-0.00772199;REVB=-0.0465547;RO=10;SAF=6;SAR=3;SRF=0;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.549025;STB=0.811964;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.00942329;OID=.;OPOS=82784832;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:19:19:10:10:9:9:0.473684:3:6:0:10:3:6:0:10
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chr7	83034754	.	T	A	1477.89	PASS	AF=1;AO=91;DP=93;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00531154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.678;QD=62.8888;RBI=0.00538017;REFB=0;REVB=-0.000856599;RO=2;SAF=51;SAR=40;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0182246;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.64465e-05;OID=.;OPOS=83034754;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:93:94:2:0:91:94:1:40:51:2:0:40:54:0:0
chr7	83037751	.	C	A	557.13	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00444355;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.3608;QD=60.2302;RBI=0.0205702;REFB=0;REVB=-0.0200845;RO=0;SAF=14;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.91909e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000327332;OID=.;OPOS=83037751;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:23:14:0:0:23:14:0:0
chr7	83590852	.	T	C	575.44	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.029538;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.503;QD=60.5722;RBI=0.030921;REFB=0;REVB=0.00914408;RO=0;SAF=20;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.51048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000466366;OID=.;OPOS=83590852;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:18:20:0:0:18:20:0:0
chr7	83606518	.	G	A	908.5	PASS	AF=1;AO=62;DP=63;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0344663;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.146;QD=58.613;RBI=0.0353799;REFB=0;REVB=-0.00798804;RO=0;SAF=27;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.46408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000177402;OID=.;OPOS=83606518;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:62:0:0:62:62:1:35:27:0:0:35:27:0:0
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chr7	87138645	.	A	G	311.94	PASS	AF=0.393258;AO=35;DP=90;FAO=35;FDP=89;FR=.;FRO=54;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=34;FSRR=20;FWDB=-0.0336748;FXX=0.0111099;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.2191;QD=14.0196;RBI=0.0345141;REFB=0.00127809;REVB=-0.00756482;RO=55;SAF=15;SAR=20;SRF=34;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.201235;STB=0.620186;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=-0.0032734;OID=.;OPOS=87138645;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:89:55:54:35:35:0.393258:20:15:34:21:20:15:34:20
chr7	87160618	.	A	C	218.06	PASS	AF=0.355263;AO=27;DP=76;FAO=27;FDP=76;FR=.;FRO=49;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=26;FSRR=23;FWDB=-0.0188705;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.183;QD=11.477;RBI=0.0209217;REFB=-0.0010537;REVB=0.00903448;RO=49;SAF=15;SAR=12;SRF=26;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0280151;STB=0.516212;STBP=0.863;TYPE=snp;VARB=0.00145006;OID=.;OPOS=87160618;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:49:49:27:27:0.355263:12:15:26:23:12:15:26:23
chr7	87229501	.	T	C	833.74	PASS	AF=0.967742;AO=58;DP=62;FAO=60;FDP=62;FR=.;FRO=2;FSAF=17;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0615046;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.5111;QD=53.7897;RBI=0.0617484;REFB=-0.0807009;REVB=-0.00548186;RO=4;SAF=17;SAR=41;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00633514;STB=0.508538;STBP=0.559;TYPE=snp;VARB=0.00124987;OID=.;OPOS=87229501;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:62:62:4:2:58:60:0.967742:41:17:1:3:43:17:1:1
chr7	87774727	.	T	C	253.6	PASS	AF=0.482759;AO=28;DP=58;FAO=28;FDP=58;FR=.;FRO=30;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=-0.00416126;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.817;QD=17.4898;RBI=0.00623386;REFB=-0.0134807;REVB=-0.00464165;RO=30;SAF=19;SAR=9;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.233924;STB=0.631617;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.0154494;OID=.;OPOS=87774727;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:30:30:28:28:0.482759:9:19:13:17:9:19:13:17
chr7	87778380	.	A	T	263.38	PASS	AF=0.46875;AO=29;DP=63;FAO=30;FDP=64;FR=.;FRO=34;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=13;FWDB=0.0501164;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.975;QD=16.4609;RBI=0.051752;REFB=-0.00890662;REVB=0.012908;RO=34;SAF=13;SAR=16;SRF=21;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161231;STB=0.579658;STBP=0.255;TYPE=snp;VARB=0.0116256;OID=.;OPOS=87778380;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:64:34:34:29:30:0.46875:16:13:21:13:16:14:21:13
chr7	87813635	.	C	T	361.83	PASS	AF=0.463415;AO=39;DP=82;FAO=38;FDP=82;FR=.;FRO=44;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=23;FSRR=21;FWDB=0.00598851;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.738;QD=17.6502;RBI=0.00844114;REFB=-0.00303701;REVB=-0.00594899;RO=43;SAF=19;SAR=20;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0447964;STB=0.512189;STBP=0.858;TYPE=snp;VARB=0.00272864;OID=.;OPOS=87813635;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:43:44:39:38:0.463415:20:19:23:20:19:19:23:21
chr7	87913361	.	C	T	520.05	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00357583;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.4725;QD=59.4344;RBI=0.0068854;REFB=0;REVB=-0.00588407;RO=0;SAF=23;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.13263e-05;OID=.;OPOS=87913361;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:12:23:0:0:12:23:0:0
chr7	88423881	.	T	C	205.41	PASS	AF=0.431034;AO=22;DP=58;FAO=25;FDP=58;FR=.;FRO=33;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=-0.000782966;FXX=0.0333278;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.973;QD=14.1662;RBI=0.0123908;REFB=0.000469125;REVB=0.012366;RO=30;SAF=10;SAR=12;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0794843;STB=0.514511;STBP=0.857;TYPE=snp;VARB=-0.00112498;OID=.;OPOS=88423881;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:30:33:22:25:0.431034:12:10:16:14:12:13:18:15
chr7	88956699	.	A	G	4052.83	PASS	AF=1;AO=257;DP=257;FAO=260;FDP=260;FR=.;FRO=0;FSAF=116;FSAR=144;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0163204;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.18;QD=62.3512;RBI=0.0491284;REFB=0;REVB=0.0463384;RO=0;SAF=113;SAR=144;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.21562e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.87599e-05;OID=.;OPOS=88956699;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:22:257:260:0:0:257:260:1:144:113:0:0:144:116:0:0
chr7	88963039	.	G	A	255.89	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0815119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.905;QD=51.1782;RBI=0.0816667;REFB=0;REVB=0.00502615;RO=0;SAF=10;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00113123;OID=.;OPOS=88963039;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:10:10:0:0:10:10:0:0
chr7	88964000	.	C	T	502.07	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0234918;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.457;QD=59.0669;RBI=0.0235116;REFB=0;REVB=0.000963524;RO=0;SAF=16;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.60901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.75011e-05;OID=.;OPOS=88964000;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:34:0:0:33:34:1:17:16:0:0:17:17:0:0
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chr7	88964198	.	T	A	36.57	PASS	AF=0.0990099;AO=10;DP=101;FAO=10;FDP=101;FR=.;FRO=91;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=31;FSRR=60;FWDB=-0.0661373;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.8308;QD=1.44839;RBI=0.0700748;REFB=-0.0168248;REVB=0.0231589;RO=86;SAF=9;SAR=1;SRF=29;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.606815;STB=0.93138;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.16153;OID=.;OPOS=88964198;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:101:101:86:91:10:10:0.0990099:1:9:29:57:1:9:31:60
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chr7	89861890	.	G	T	211.2	PASS	AF=1;AO=17;DP=18;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0246474;FXX=0.0555247;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.6322;QD=49.6943;RBI=0.0615654;REFB=0;REVB=-0.0564164;RO=0;SAF=13;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00142785;OID=.;OPOS=89861890;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:17:0:0:17:17:1:4:13:0:0:4:13:0:0
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chr7	89881239	.	G	C	279.34	PASS	AF=0.508475;AO=30;DP=59;FAO=30;FDP=59;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=0.00112825;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=187.266;QD=18.9383;RBI=0.0252369;REFB=0.00542311;REVB=-0.0252116;RO=29;SAF=13;SAR=17;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.193575;STB=0.607751;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=-0.00685969;OID=.;OPOS=89881239;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:29:29:30:30:0.508475:17:13:19:10:17:13:19:10
chr7	89906609	.	C	T	252.84	PASS	AF=0.322917;AO=30;DP=95;FAO=31;FDP=96;FR=.;FRO=65;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=25;FSRR=40;FWDB=0.00751178;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.994;QD=10.5351;RBI=0.0138838;REFB=0.00203558;REVB=0.0116761;RO=63;SAF=14;SAR=16;SRF=24;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10097;STB=0.567525;STBP=0.37;TYPE=snp;VARB=-0.00379006;OID=.;OPOS=89906609;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:96:63:65:30:31:0.322917:16:14:24:39:16:15:25:40
chr7	89912301	.	G	A	818.3	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00450556;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.768;QD=57.4246;RBI=0.00625762;REFB=0;REVB=0.00434256;RO=0;SAF=33;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.27406e-05;OID=.;OPOS=89912301;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:56:57:0:0:56:57:1:23:33:0:0:23:34:0:0
chr7	89938588	.	C	G	801.69	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0385329;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.37;QD=57.2633;RBI=0.0385634;REFB=0;REVB=-0.00153377;RO=0;SAF=35;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.67221e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000444937;OID=.;OPOS=89938588;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:56:0:0:55:56:1:20:35:0:0:20:36:0:0
chr7	89938680	.	C	T	248.91	PASS	AF=0.408451;AO=29;DP=70;FAO=29;FDP=71;FR=.;FRO=42;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=24;FSRR=18;FWDB=-0.00193352;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.208;QD=14.0232;RBI=0.00245169;REFB=-0.0116388;REVB=-0.0015074;RO=41;SAF=19;SAR=10;SRF=23;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103133;STB=0.552977;STBP=0.467;TYPE=snp;VARB=0.0166096;OID=.;OPOS=89938680;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:71:41:42:29:29:0.408451:10:19:23:18:10:19:24:18
chr7	89969831	.	A	G	519.47	PASS	AF=0.5;AO=49;DP=99;FAO=50;FDP=100;FR=.;FRO=50;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=15;FSRR=35;FWDB=0.00177665;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.251;QD=20.7787;RBI=0.00905976;REFB=-0.0253312;REVB=0.00888384;RO=50;SAF=23;SAR=26;SRF=15;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157213;STB=0.590764;STBP=0.095;TYPE=snp;VARB=0.027948;OID=.;OPOS=89969831;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:100:50:50:49:50:0.5:26:23:15:35:26:24:15:35
chr7	89969878	.	A	G	382.91	PASS	AF=0.454545;AO=40;DP=88;FAO=40;FDP=88;FR=.;FRO=48;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=14;FSRR=34;FWDB=-0.00807037;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.1152;QD=17.405;RBI=0.00988234;REFB=-0.00332978;REVB=-0.00570349;RO=47;SAF=17;SAR=23;SRF=14;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128832;STB=0.576064;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=0.00422969;OID=.;OPOS=89969878;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:47:48:40:40:0.454545:23:17:14:33:23:17:14:34
chr7	89983808	.	T	G	429.02	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0119531;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=295.121;QD=57.2026;RBI=0.0143278;REFB=0;REVB=0.00789999;RO=0;SAF=19;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.07705e-05;OID=.;OPOS=89983808;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:11:19:0:0:11:19:0:0
chr7	89984409	.	A	G	868.26	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0184572;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.077;QD=57.8843;RBI=0.0201728;REFB=0;REVB=0.00814083;RO=0;SAF=26;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.4087e-05;OID=.;OPOS=89984409;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:34:26:0:0:34:26:0:0
chr7	90042857	.	G	T	159.56	PASS	AF=0.472222;AO=17;DP=36;FAO=17;FDP=36;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.0163857;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.0816;QD=17.7293;RBI=0.0534364;REFB=-0.0223709;REVB=-0.0508622;RO=19;SAF=7;SAR=10;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0582958;STB=0.533294;STBP=0.685;TYPE=snp;VARB=0.0215273;OID=.;OPOS=90042857;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:19:19:17:17:0.472222:10:7:9:10:10:7:9:10
chr7	90043182	.	A	G	228.33	PASS	AF=0.45614;AO=26;DP=57;FAO=26;FDP=57;FR=.;FRO=31;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=-0.0267875;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.34;QD=16.0232;RBI=0.0282116;REFB=0.00193009;REVB=0.00884996;RO=31;SAF=14;SAR=12;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0726166;STB=0.540953;STBP=0.583;TYPE=snp;VARB=-0.00182576;OID=.;OPOS=90043182;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:31:31:26:26:0.45614:12:14:19:12:12:14:19:12
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chr7	90043314	.	C	T	834.39	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0238204;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.246;QD=57.5439;RBI=0.0245831;REFB=0;REVB=-0.00607582;RO=0;SAF=27;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.07727e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.92852e-05;OID=.;OPOS=90043314;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:31:27:0:0:31:27:0:0
chr7	90044945	.	G	A	294.54	PASS	AF=0.309524;AO=39;DP=126;FAO=39;FDP=126;FR=.;FRO=87;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=47;FSRR=40;FWDB=-0.0531541;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.4509;QD=9.35057;RBI=0.0572531;REFB=-0.00736282;REVB=-0.0212733;RO=87;SAF=15;SAR=24;SRF=47;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184613;STB=0.607788;STBP=0.118;TYPE=snp;VARB=0.0111699;OID=.;OPOS=90044945;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:126:126:87:87:39:39:0.309524:24:15:47:40:24:15:47:40
chr7	90236415	.	A	G	657.49	PASS	AF=0.942308;AO=48;DP=52;FAO=49;FDP=52;FR=.;FRO=3;FSAF=16;FSAR=33;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0272695;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=169.387;QD=50.5758;RBI=0.0306458;REFB=-0.172565;REVB=0.0139836;RO=3;SAF=16;SAR=32;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0407958;STB=0.521959;STBP=0.271;TYPE=snp;VARB=0.00361211;OID=.;OPOS=90236415;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:52:52:3:3:48:49:0.942308:32:16:2:1:33:16:2:1
chr7	90338850	.	C	T	340.96	PASS	AF=0.538462;AO=35;DP=65;FAO=35;FDP=65;FR=.;FRO=30;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=-0.0131599;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.989;QD=20.9823;RBI=0.0324038;REFB=-0.0187102;REVB=-0.0296112;RO=30;SAF=19;SAR=16;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00799084;STB=0.504422;STBP=0.962;TYPE=snp;VARB=0.0159796;OID=.;OPOS=90338850;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:30:30:35:35:0.538462:16:19:16:14:16:19:16:14
chr7	90836916	.	C	A	222.93	PASS	AF=0.462963;AO=25;DP=55;FAO=25;FDP=54;FR=.;FRO=29;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.0269274;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.19;QD=16.5131;RBI=0.0274396;REFB=-0.012899;REVB=-0.00527698;RO=30;SAF=14;SAR=11;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0581785;STB=0.52315;STBP=0.762;TYPE=snp;VARB=0.0151739;OID=.;OPOS=90836916;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:54:30:29:25:25:0.462963:11:14:15:15:11:14:15:14
chr7	90838866	.	G	A	240.46	PASS	AF=0.511111;AO=23;DP=45;FAO=23;FDP=45;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=6;FSRR=16;FWDB=-0.0199403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.126;QD=21.3739;RBI=0.0246857;REFB=-0.0281664;REVB=-0.0145522;RO=21;SAF=9;SAR=14;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0969141;STB=0.562448;STBP=0.431;TYPE=snp;VARB=0.0237144;OID=.;OPOS=90838866;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:21:22:23:23:0.511111:14:9:6:15:14:9:6:16
chr7	90838869	.	G	C	708.51	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0387858;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.304;QD=62.9783;RBI=0.0390359;REFB=0;REVB=0.0044116;RO=0;SAF=14;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000485165;OID=.;OPOS=90838869;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:45:0:0:44:45:1:30:14:0:0:30:15:0:0
chr7	91632306	.	C	T	483.35	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0115676;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.576;QD=58.5878;RBI=0.0153334;REFB=0;REVB=0.0100649;RO=0;SAF=15;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.64315e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000102294;OID=.;OPOS=91632306;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:18:15:0:0:18:15:0:0
chr7	91641928	.	A	G	212.28	PASS	AF=0.645161;AO=20;DP=31;FAO=20;FDP=31;FR=.;FRO=11;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=0.0304496;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.157;QD=27.3906;RBI=0.0311685;REFB=-0.0189346;REVB=0.00665584;RO=11;SAF=12;SAR=8;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0866655;STB=0.547899;STBP=0.466;TYPE=snp;VARB=0.00848335;OID=.;OPOS=91641928;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:31:31:11:11:20:20:0.645161:8:12:8:3:8:12:8:3
chr7	91652178	.	A	AAAC,C	98.63	PASS	AF=0.333333,0;AO=10,2;DP=43;FAO=12,0;FDP=36;FR=.;FRO=24;FSAF=8,0;FSAR=4,0;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.0112979,0.015458;FXX=0.099975;HRUN=3,3;LEN=3,1;MLLD=251.174,143.312;QD=10.9589;RBI=0.0149507,0.0155358;REFB=-0.00546252,-0.00945135;REVB=-0.00979185,-0.0015525;RO=28;SAF=7,2;SAR=3,0;SRF=14;SRR=14;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.244248,0.46666;STB=0.666389,0.5;STBP=0.162,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.0170229,0;OID=.,.;OPOS=91652179,91652178;OREF=-,A;OALT=AAC,C;OMAPALT=AAAC,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:43:36:28:24:10,2:12,0:0.333333,0:3,0:7,2:14:14:4,0:8,0:10:14
chr7	91691601	.	C	T	174.35	PASS	AF=0.366667;AO=22;DP=60;FAO=22;FDP=60;FR=.;FRO=38;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=-0.0224229;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.901;QD=11.6237;RBI=0.0252648;REFB=-0.0127724;REVB=-0.0116415;RO=37;SAF=12;SAR=10;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121935;STB=0.578243;STBP=0.371;TYPE=snp;VARB=0.0202283;OID=.;OPOS=91691601;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:37:38:22:22:0.366667:10:12:16:21:10:12:16:22
chr7	91712698	.	A	G	76.46	PASS	AF=0.333333;AO=10;DP=31;FAO=10;FDP=30;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.020594;FXX=0.0322477;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.277;QD=10.1942;RBI=0.0211244;REFB=-0.00389297;REVB=0.004704;RO=20;SAF=4;SAR=6;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111111;STB=0.567431;STBP=0.647;TYPE=snp;VARB=0.0118654;OID=.;OPOS=91712698;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:31:30:20:20:10:10:0.333333:6:4:10:10:6:4:10:10
chr7	91713972	.	C	T	603.77	PASS	AF=0.484375;AO=62;DP=128;FAO=62;FDP=128;FR=.;FRO=66;FSAF=33;FSAR=29;FSRF=35;FSRR=31;FWDB=-0.0145333;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.054;QD=18.8678;RBI=0.0435182;REFB=-0.0115502;REVB=-0.0410197;RO=64;SAF=33;SAR=29;SRF=33;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0153303;STB=0.501012;STBP=0.981;TYPE=snp;VARB=0.0110548;OID=.;OPOS=91713972;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:128:128:64:66:62:62:0.484375:29:33:33:31:29:33:35:31
chr7	91714911	.	C	T	2040.29	PASS	AF=0.977941;AO=133;DP=136;FAO=133;FDP=136;FR=.;FRO=3;FSAF=78;FSAR=55;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.000800376;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.162;QD=60.0084;RBI=0.0017917;REFB=-0.00300104;REVB=0.001603;RO=2;SAF=78;SAR=55;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0169678;STB=0.505744;STBP=0.401;TYPE=snp;VARB=7.02339e-05;OID=.;OPOS=91714911;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:136:136:2:3:133:133:0.977941:55:78:0:2:55:78:1:2
chr7	91715662	.	C	T	349.23	PASS	AF=0.521739;AO=36;DP=69;FAO=36;FDP=69;FR=.;FRO=33;FSAF=12;FSAR=24;FSRF=10;FSRR=23;FWDB=-0.0279774;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.279;QD=20.2453;RBI=0.0292733;REFB=-0.00595816;REVB=-0.00861325;RO=33;SAF=12;SAR=24;SRF=10;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0297488;STB=0.516474;STBP=0.8;TYPE=snp;VARB=0.00739038;OID=.;OPOS=91715662;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:33:33:36:36:0.521739:24:12:10:23:24:12:10:23
chr7	91726927	.	A	C	202.02	PASS	AF=0.526316;AO=20;DP=38;FAO=20;FDP=38;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.00175512;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.502;QD=21.2648;RBI=0.00972022;REFB=-0.0246773;REVB=0.00956045;RO=18;SAF=10;SAR=10;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0467648;STB=0.52629;STBP=0.75;TYPE=snp;VARB=0.0245008;OID=.;OPOS=91726927;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:18:18:20:20:0.526316:10:10:10:8:10:10:10:8
chr7	91743150	.	A	G	170.3	PASS	AF=0.473684;AO=17;DP=37;FAO=18;FDP=38;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=0.00836338;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.35;QD=17.9262;RBI=0.0141921;REFB=0.0080652;REVB=0.0114661;RO=20;SAF=4;SAR=13;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.189159;STB=0.574743;STBP=0.401;TYPE=snp;VARB=-0.0155721;OID=.;OPOS=91743150;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:38:20:20:17:18:0.473684:13:4:8:12:13:5:8:12
chr7	91779242	.	G	A	223.56	PASS	AF=0.433333;AO=26;DP=60;FAO=26;FDP=60;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=-0.0596913;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.402;QD=14.9038;RBI=0.059701;REFB=-0.000999406;REVB=-0.00107801;RO=34;SAF=11;SAR=15;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0184332;STB=0.510463;STBP=0.918;TYPE=snp;VARB=0.000663087;OID=.;OPOS=91779242;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:34:34:26:26:0.433333:15:11:15:19:15:11:15:19
chr7	91779971	.	T	G	272.07	PASS	AF=0.38961;AO=22;DP=83;FAO=30;FDP=77;FR=.,HEALED;FRO=46;FSAF=6;FSAR=24;FSRF=14;FSRR=32;FWDB=0.0546535;FXX=0.0722804;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.1303;QD=14.1336;RBI=0.0550148;REFB=0.0113387;REVB=-0.00629467;RO=28;SAF=4;SAR=18;SRF=7;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103274;STB=0.588171;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=-0.00695484;OID=.;OPOS=91779971;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:77:28:46:22:30:0.38961:18:4:7:21:24:6:14:32
chr7	91842554	.	T	C	408.16	PASS	AF=0.483146;AO=41;DP=86;FAO=43;FDP=89;FR=.;FRO=46;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=28;FSRR=18;FWDB=0.00844124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.778;QD=18.3441;RBI=0.00931652;REFB=-0.0277019;REVB=-0.00394246;RO=45;SAF=21;SAR=20;SRF=27;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0827312;STB=0.550291;STBP=0.36;TYPE=snp;VARB=0.0282176;OID=.;OPOS=91842554;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:89:45:46:41:43:0.483146:20:21:27:18:21:22:28:18
chr7	92027537	.	C	G	248.25	PASS	AF=0.459016;AO=28;DP=61;FAO=28;FDP=61;FR=.;FRO=33;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=0.0166579;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.4878;QD=16.2786;RBI=0.060977;REFB=-0.00812899;REVB=0.0586576;RO=32;SAF=15;SAR=13;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00424893;STB=0.505297;STBP=0.942;TYPE=snp;VARB=0.0114211;OID=.;OPOS=92027537;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:32:33:28:28:0.459016:13:15:17:15:13:15:18:15
chr7	92029302	.	G	A	422.92	PASS	AF=0.505882;AO=43;DP=85;FAO=43;FDP=85;FR=.;FRO=42;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=19;FSRR=23;FWDB=0.00530621;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.167;QD=19.9021;RBI=0.0186168;REFB=0.0161904;REVB=-0.0178446;RO=42;SAF=20;SAR=23;SRF=19;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0114187;STB=0.506326;STBP=0.91;TYPE=snp;VARB=-0.0096507;OID=.;OPOS=92029302;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:42:42:43:43:0.505882:23:20:19:23:23:20:19:23
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chr7	92100399	.	C	T	631.16	PASS	AF=0.525;AO=63;DP=120;FAO=63;FDP=120;FR=.;FRO=57;FSAF=20;FSAR=43;FSRF=24;FSRR=33;FWDB=-0.0168625;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=249.824;QD=21.0387;RBI=0.0176619;REFB=0.000744563;REVB=0.00525347;RO=57;SAF=20;SAR=43;SRF=24;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0989;STB=0.554496;STBP=0.237;TYPE=snp;VARB=-0.00092125;OID=.;OPOS=92100399;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:120:57:57:63:63:0.525:43:20:24:33:43:20:24:33
chr7	92131289	.	G	T	834.4	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0220958;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.628;QD=57.545;RBI=0.0228782;REFB=0;REVB=-0.00593162;RO=0;SAF=28;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.82515e-05;OID=.;OPOS=92131289;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:30:28:0:0:30:28:0:0
chr7	92241633	.	G	C	128.27	PASS	AF=0.357143;AO=15;DP=42;FAO=15;FDP=42;FR=.;FRO=27;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=-0.00268391;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.103;QD=12.2166;RBI=0.00681536;REFB=-0.00370741;REVB=-0.00626464;RO=27;SAF=5;SAR=10;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.2455;STB=0.644965;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=0.00457113;OID=.;OPOS=92241633;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:27:27:15:15:0.357143:10:5:15:12:10:5:15:12
chr7	92600509	.	T	C	501.66	PASS	AF=1;AO=33;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.003343;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.136;QD=59.0186;RBI=0.0110711;REFB=0;REVB=0.0105543;RO=0;SAF=11;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.25887e-05;OID=.;OPOS=92600509;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:33:34:1:22:11:0:0:23:11:0:0
chr7	92734451	.	A	G	279.72	PASS	AF=0.5;AO=30;DP=61;FAO=30;FDP=60;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=-0.0678667;FXX=0.0163908;HRUN=3;LEN=1;MLLD=64.7025;QD=18.6479;RBI=0.0679047;REFB=0.0127563;REVB=-0.00227051;RO=29;SAF=13;SAR=17;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0804786;STB=0.534224;STBP=0.644;TYPE=snp;VARB=-0.0133577;OID=.;OPOS=92734451;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:60:29:30:30:30:0.5:17:13:10:19:17:13:11:19
chr7	92762681	.	A	G	421.88	PASS	AF=0.457447;AO=43;DP=95;FAO=43;FDP=94;FR=.;FRO=51;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=30;FSRR=21;FWDB=0.0681095;FXX=0.0105252;HRUN=4;LEN=1;MLLD=54.033;QD=17.9522;RBI=0.0826362;REFB=0.0182958;REVB=0.0467958;RO=52;SAF=17;SAR=26;SRF=30;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177945;STB=0.604602;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=-0.0185591;OID=.;OPOS=92762681;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:94:52:51:43:43:0.457447:26:17:30:22:26:17:30:21
chr7	92764982	.	C	T	203.16	PASS	AF=0.284404;AO=27;DP=105;FAO=31;FDP=109;FR=.;FRO=78;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=31;FSRR=47;FWDB=-0.0134671;FXX=0.00909008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.108;QD=7.45553;RBI=0.0169904;REFB=-0.000437274;REVB=0.0103592;RO=77;SAF=10;SAR=17;SRF=30;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0251143;STB=0.532636;STBP=0.684;TYPE=snp;VARB=0.00142591;OID=.;OPOS=92764982;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:109:77:78:27:31:0.284404:17:10:30:47:20:11:31:47
chr7	92900512	.	GTTTT	GTTTG,GTTT,GTTTTT	98.88	PASS	AF=0.5625,0.3125,0;AO=8,2,2;DP=19;FAO=9,5,0;FDP=16;FR=.;FRO=2;FSAF=1,3,0;FSAR=8,2,0;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0117849,0.175525,-0.175525;FXX=0.157812;HRUN=14,14,14;LEN=1,1,1;MLLD=160.006,2.76885,2.73147;QD=24.719;RBI=0.0730409,0.678044,0.678044;REFB=-0.00926814,-0.205298,0.205298;REVB=-0.0720839,-0.654931,0.654931;RO=1;SAF=1,2,2;SAR=7,0,0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.286738,0,0;STB=0.749315,0.62455,0.5;STBP=0.026,0.425,1;TYPE=snp,del,ins;VARB=0.0213588,-0.159647,0.0516231;OID=.,.,.;OPOS=92900516,92900513,92900513;OREF=T,T,-;OALT=G,-,T;OMAPALT=GTTTG,GTTT,GTTTTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.5625,0.3125,0:8,2,2:19:9,5,0:16:2:1,3,0:8,2,0:2:0:21:1:1,2,2:7,0,0:1:0
chr7	92970847	.	C	T	642.16	PASS	AF=0.52459;AO=64;DP=122;FAO=64;FDP=122;FR=.;FRO=58;FSAF=31;FSAR=33;FSRF=21;FSRR=37;FWDB=-0.0304369;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.768;QD=21.0545;RBI=0.0367937;REFB=-0.00218427;REVB=-0.020673;RO=58;SAF=31;SAR=33;SRF=21;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106435;STB=0.558397;STBP=0.197;TYPE=snp;VARB=0.00195861;OID=.;OPOS=92970847;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:122:122:58:58:64:64:0.52459:33:31:21:37:33:31:21:37
chr7	93054827	.	C	CTCTT	1138.83	PASS	AF=0.909091;AO=73;DP=93;FAO=80;FDP=88;FR=.;FRO=8;FSAF=72;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=0.00724012;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=4;MLLD=261.493;QD=51.7648;RBI=0.0173592;REFB=-0.0314935;REVB=-0.0157772;RO=11;SAF=70;SAR=3;SRF=9;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179218;STB=0.506248;STBP=0.878;TYPE=ins;VARB=0.00199703;OID=.;OPOS=93054828;OREF=-;OALT=TCTT;OMAPALT=CTCTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.909091:73:93:80:88:8:72:8:7:1:31:11:70:3:9:2
chr7	93055650	.	G	A	1208.95	PASS	AF=1;AO=78;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0226686;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.632;QD=61.2128;RBI=0.0226867;REFB=0;REVB=-0.000907771;RO=0;SAF=41;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.4281e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000141148;OID=.;OPOS=93055650;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:79:0:0:78:79:1:37:41:0:0:37:42:0:0
chr7	93055753	.	A	G	670.27	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00718111;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.678;QD=62.3507;RBI=0.00762473;REFB=0;REVB=0.00256287;RO=0;SAF=26;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.75441e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.51077e-05;OID=.;OPOS=93055753;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:17:26:0:0:17:26:0:0
chr7	93116299	.	A	G,T	767.12	PASS	AF=0.98,0.02;AO=44,3;DP=47;FAO=49,1;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=24,0;FSAR=25,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0286362,0.0227645;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=179.101,132.541;QD=61.3694;RBI=0.028722,0.022765;REFB=0,0;REVB=0.00221779,0.000150944;RO=0;SAF=22,0;SAR=22,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00173511,0.0391139;OID=.,.;OPOS=93116299,93116299;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:5:47:50:0:0:44,3:49,1:0.98,0.02:22,3:22,0:0:0:25,1:24,0:0:0
chr7	93515993	.	T	G	63.42	PASS	AF=0.310345;AO=9;DP=29;FAO=9;FDP=29;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.000738315;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=172.637;QD=8.74763;RBI=0.016594;REFB=-0.00079049;REVB=0.0165776;RO=18;SAF=4;SAR=5;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0608169;STB=0.572359;STBP=0.638;TYPE=snp;VARB=0.00379458;OID=.;OPOS=93515993;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:29:29:18:20:9:9:0.310345:5:4:9:9:5:4:11:9
chr7	93518486	.	C	T	287.15	PASS	AF=0.444444;AO=32;DP=72;FAO=32;FDP=72;FR=.;FRO=40;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=23;FSRR=17;FWDB=-0.00463362;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=45.9296;QD=15.9527;RBI=0.00529745;REFB=0.00488995;REVB=-0.00256759;RO=40;SAF=12;SAR=20;SRF=23;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198338;STB=0.611818;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=-0.00729506;OID=.;OPOS=93518486;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:40:40:32:32:0.444444:20:12:23:17:20:12:23:17
chr7	93623458	.	A	G	165.22	PASS	AF=0.367347;AO=18;DP=49;FAO=18;FDP=49;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=0.000860357;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.536;QD=13.4871;RBI=0.00704733;REFB=0.000474695;REVB=0.00699461;RO=31;SAF=9;SAR=9;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.087494;STB=0.550964;STBP=0.588;TYPE=snp;VARB=-0.00100251;OID=.;OPOS=93623458;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:31:31:18:18:0.367347:9:9:18:13:9:9:18:13
chr7	94027699	.	T	C	5328.51	PASS	AF=0.991279;AO=333;DP=338;FAO=341;FDP=344;FR=.;FRO=3;FSAF=175;FSAR=166;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0311361;FXX=0.00578018;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.937;QD=61.9594;RBI=0.0367266;REFB=-0.0371647;REVB=0.0194778;RO=4;SAF=169;SAR=164;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0114911;STB=0.501569;STBP=0.481;TYPE=snp;VARB=5.86714e-05;OID=.;OPOS=94027699;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:15:338:344:4:3:333:341:0.991279:164:169:0:4:166:175:1:2
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chr7	94038934	.	C	T	2529.42	PASS	AF=1;AO=164;DP=164;FAO=164;FDP=164;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=100;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0104681;FXX=0.00606024;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.1779;QD=61.6933;RBI=0.0160859;REFB=0;REVB=-0.0122137;RO=0;SAF=64;SAR=100;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.08075e-06;OID=.;OPOS=94038934;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:164:164:0:0:164:164:1:100:64:0:0:100:64:0:0
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chr7	94295183	.	T	A	665.82	PASS	AF=0.509259;AO=54;DP=111;FAO=55;FDP=108;FR=.,HEALED;FRO=37;FSAF=36;FSAR=19;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=-0.035927;FXX=0.0270246;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.552;QD=24.66;RBI=0.0367795;REFB=-0.0220911;REVB=0.00787284;RO=26;SAF=35;SAR=19;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18662;STB=0.549134;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=0.00489769;OID=.;OPOS=94295183;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:108:26:37:54:55:0.509259:19:35:9:17:19:36:20:17
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chr7	95213953	.	A	C	1126.75	PASS	AF=0.974359;AO=76;DP=78;FAO=76;FDP=78;FR=.;FRO=2;FSAF=37;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0101538;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.17;QD=57.782;RBI=0.024771;REFB=-0.0594363;REVB=0.0225943;RO=1;SAF=37;SAR=39;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0119796;STB=0.512497;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=5.86466e-05;OID=.;OPOS=95213953;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:78:78:1:2:76:76:0.974359:39:37:0:1:39:37:0:2
chr7	95216394	.	T	G	752.85	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0401709;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.2497;QD=56.8185;RBI=0.055929;REFB=0;REVB=0.0389147;RO=0;SAF=23;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.72004e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.35471e-05;OID=.;OPOS=95216394;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:30:23:0:0:30:23:0:0
chr7	95800820	.	T	C	253.74	PASS	AF=0.638889;AO=23;DP=36;FAO=23;FDP=36;FR=.;FRO=13;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.00774082;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.068;QD=28.1928;RBI=0.00932245;REFB=0.00774953;REVB=-0.00519497;RO=13;SAF=10;SAR=13;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118003;STB=0.565161;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=-0.00605157;OID=.;OPOS=95800820;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:13:13:23:23:0.638889:13:10:8:5:13:10:8:5
chr7	96640130	.	C	T	91.26	PASS	AF=0.52381;AO=11;DP=21;FAO=11;FDP=21;FR=.;FRO=10;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=-0.00203042;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=252.9;QD=17.3825;RBI=0.0038239;REFB=-0.023339;REVB=0.00324031;RO=10;SAF=1;SAR=10;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.211187;STB=0.624731;STBP=0.459;TYPE=snp;VARB=0.0192246;OID=.;OPOS=96640130;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:21:21:10:10:11:11:0.52381:10:1:2:8:10:1:2:8
chr7	97488569	.	A	T	866.25	PASS	AF=1;AO=59;DP=61;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00767555;FXX=0.0322529;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.555;QD=57.7503;RBI=0.0111213;REFB=0;REVB=0.00804787;RO=0;SAF=32;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.96591e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000679214;OID=.;OPOS=97488569;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:60:0:0:59:60:1:27:32:0:0:27:33:0:0
chr7	97854393	.	G	A	613.34	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0363447;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.01;QD=61.3341;RBI=0.0576614;REFB=0;REVB=0.0447649;RO=0;SAF=25;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000503024;OID=.;OPOS=97854393;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:15:25:0:0:15:25:0:0
chr7	97863145	.	G	A	393.33	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0239377;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.168;QD=56.1898;RBI=0.0258009;REFB=0;REVB=0.00962666;RO=0;SAF=8;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.75204e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000262327;OID=.;OPOS=97863145;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:20:8:0:0:20:8:0:0
chr7	97866224	.	T	C	346.56	PASS	AF=0.480519;AO=36;DP=77;FAO=37;FDP=77;FR=.;FRO=40;FSAF=25;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=18;FWDB=-0.0114105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.66;QD=18.0031;RBI=0.0212609;REFB=0.000501024;REVB=-0.0179395;RO=40;SAF=24;SAR=12;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117749;STB=0.570737;STBP=0.265;TYPE=snp;VARB=-0.000550807;OID=.;OPOS=97866224;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:40:40:36:37:0.480519:12:24:22:18:12:25:22:18
chr7	98453710	.	C	T	213.9	PASS	AF=0.512195;AO=21;DP=41;FAO=21;FDP=41;FR=.;FRO=20;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.000700546;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.3573;QD=20.8686;RBI=0.0255128;REFB=0.00689449;REVB=-0.0255032;RO=20;SAF=15;SAR=6;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20371;STB=0.615269;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=-0.00418326;OID=.;OPOS=98453710;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:20:20:21:21:0.512195:6:15:10:10:6:15:10:10
chr7	98460824	.	C	A	621.97	PASS	AF=0.921569;AO=47;DP=51;FAO=47;FDP=51;FR=.;FRO=4;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0406652;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.1952;QD=48.7822;RBI=0.0796622;REFB=-0.0654056;REVB=0.0685012;RO=4;SAF=20;SAR=27;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0484242;STB=0.525815;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=0.0374769;OID=.;OPOS=98460824;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:18:51:51:4:4:47:47:0.921569:27:20:3:1:27:20:3:1
chr7	98650051	.	G	C	80.87	PASS	AF=0.37931;AO=10;DP=28;FAO=11;FDP=29;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=0.0324174;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.0714;QD=11.1541;RBI=0.053775;REFB=-0.0026505;REVB=0.0429053;RO=18;SAF=7;SAR=3;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0413721;STB=0.520511;STBP=0.876;TYPE=snp;VARB=0.0113687;OID=.;OPOS=98650051;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:80:28:29:18:18:10:11:0.37931:3:7:12:6:4:7:12:6
chr7	98782750	.	C	T	217.81	PASS	AF=0.461538;AO=24;DP=52;FAO=24;FDP=52;FR=.;FRO=28;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=-0.0153801;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=154.621;QD=16.755;RBI=0.0616178;REFB=-0.0311938;REVB=-0.0596675;RO=28;SAF=13;SAR=11;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00570018;STB=0.503223;STBP=0.967;TYPE=snp;VARB=0.0381022;OID=.;OPOS=98782750;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:28:28:24:24:0.461538:11:13:15:13:11:13:15:13
chr7	98792835	.	G	A	345.14	PASS	AF=0.445783;AO=37;DP=83;FAO=37;FDP=83;FR=.;FRO=46;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=0.00948369;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=287.985;QD=16.633;RBI=0.0162793;REFB=-0.00623778;REVB=0.0132316;RO=46;SAF=22;SAR=15;SRF=22;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115963;STB=0.565182;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.00865708;OID=.;OPOS=98792835;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:46:46:37:37:0.445783:15:22:22:24:15:22:22:24
chr7	98870997	.	A	G	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0210846;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.098;QD=49.5992;RBI=0.0307284;REFB=0;REVB=0.0223534;RO=0;SAF=8;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000762709;OID=.;OPOS=98870997;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:10:8:0:0:10:8:0:0
chr7	99032458	.	C	T	1430.49	PASS	AF=0.98913;AO=91;DP=94;FAO=91;FDP=92;FR=.;FRO=1;FSAF=50;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00272396;FXX=0.0315756;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.543;QD=62.195;RBI=0.0141475;REFB=0.00411408;REVB=-0.0138828;RO=1;SAF=50;SAR=41;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00938661;STB=0.504949;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=-5.54807e-05;OID=.;OPOS=99032458;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:94:92:1:1:91:91:0.98913:41:50:1:0:41:50:1:0
chr7	99047978	.	T	C	393.26	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00284986;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.6842;QD=56.1794;RBI=0.00317449;REFB=0;REVB=-0.00139846;RO=0;SAF=16;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.71354e-05;OID=.;OPOS=99047978;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:12:16:0:0:12:16:0:0
chr7	99081730	.	A	G	1299.68	PASS	AF=1;AO=83;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-1.81892e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.96;QD=61.8894;RBI=0.0143574;REFB=0;REVB=0.0143574;RO=0;SAF=38;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.04629e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.34531e-05;OID=.;OPOS=99081730;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:84:0:0:83:84:1:45:38:0:0:46:38:0:0
chr7	99130875	.	G	A	130.44	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0382535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.1819;QD=43.4797;RBI=0.0391179;REFB=0;REVB=-0.00817818;RO=0;SAF=7;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00237595;OID=.;OPOS=99130875;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:5:7:0:0:5:7:0:0
chr7	99145845	.	C	T	1029.51	PASS	AF=1;AO=69;DP=70;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0266753;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.074;QD=59.6817;RBI=0.0329177;REFB=0;REVB=0.0192873;RO=0;SAF=37;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000168079;OID=.;OPOS=99145845;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:69:0:0:69:69:1:32:37:0:0:32:37:0:0
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chr7	99662511	.	GTAGTTA	GT,GTA	256.62	PASS	AF=0,1;AO=3,17;DP=20;FAO=0,20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=0,9;FSAR=0,11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0405225,0.0610869;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=5,4;MLLD=230.686,254.356;QD=51.3233;RBI=0.0406627,0.0611031;REFB=0,0;REVB=0.0033736,-0.00140769;RO=0;SAF=3,6;SAR=0,11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=0,0.00026764;OID=.,.;OPOS=99662513,99662512;OREF=AGTTA,TAGT;OALT=-,-;OMAPALT=GT,GTA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	2/2:0,1:3,17:20:0,20:20:0:0,9:0,11:0:0:4:0:3,6:0,11:0:0
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chr7	99711040	.	G	A	223.19	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0137275;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.8084;QD=49.5969;RBI=0.0956588;REFB=0;REVB=0.0946687;RO=0;SAF=11;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00259242;OID=.;OPOS=99711040;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:7:11:0:0:7:11:0:0
chr7	99747130	.	G	A	727.93	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0330776;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.416;QD=57.0922;RBI=0.0336118;REFB=0;REVB=0.00596872;RO=0;SAF=29;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000942037;OID=.;OPOS=99747130;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:22:29:0:0:22:29:0:0
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chr7	99753604	.	C	T	598.2	PASS	AF=1;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0124459;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.18;QD=61.3542;RBI=0.0442298;REFB=0;REVB=-0.0424426;RO=0;SAF=20;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.3303e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000256647;OID=.;OPOS=99753604;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:39:0:0:39:39:1:19:20:0:0:19:20:0:0
chr7	99757612	.	G	A	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.010539;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.388;QD=55.6558;RBI=0.0612071;REFB=0;REVB=0.0602929;RO=0;SAF=11;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000268164;OID=.;OPOS=99757612;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:16:11:0:0:16:11:0:0
chr7	99758136	.	T	G	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0182942;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.851;QD=51.1846;RBI=0.0247773;REFB=0;REVB=0.0167104;RO=0;SAF=11;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000189094;OID=.;OPOS=99758136;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:9:11:0:0:9:11:0:0
chr7	99772298	.	A	C	940.05	PASS	AF=1;AO=58;DP=65;FAO=64;FDP=64;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=30;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0401593;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.364;QD=58.7531;RBI=0.0457051;REFB=0;REVB=0.0218217;RO=0;SAF=28;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000131186;OID=.;OPOS=99772298;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:64:0:0:58:64:1:30:28:0:0:34:30:0:0
chr7	99796146	.	A	C	1540.41	PASS	AF=1;AO=102;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186533;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.605;QD=59.8217;RBI=0.0336716;REFB=0;REVB=-0.0280326;RO=0;SAF=45;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.08171e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.35403e-05;OID=.;OPOS=99796146;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:103:103:0:0:102:103:1:57:45:0:0:58:45:0:0
chr7	99799845	.	T	A	1384.63	PASS	AF=0.988889;AO=89;DP=91;FAO=89;FDP=90;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=48;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.005029;FXX=0.0109878;HRUN=2;LEN=1;MLLD=326.219;QD=61.539;RBI=0.00535064;REFB=-0.0869507;REVB=-0.00182716;RO=1;SAF=41;SAR=48;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0114189;STB=0.506023;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=-8.64054e-06;OID=.;OPOS=99799845;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:91:90:1:1:89:89:0.988889:48:41:1:0:48:41:1:0
chr7	100175473	.	T	C	150.76	PASS	AF=0.695652;AO=12;DP=19;FAO=16;FDP=23;FR=.;FRO=7;FSAF=15;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.022312;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.235;QD=26.2199;RBI=0.0412135;REFB=-0.0333559;REVB=0.0346515;RO=7;SAF=11;SAR=1;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.29733;STB=0.691997;STBP=0.116;TYPE=snp;VARB=0.0197361;OID=.;OPOS=100175473;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:19:23:7:7:12:16:0.695652:1:11:5:2:1:15:5:2
chr7	100212754	.	C	T	218.83	PASS	AF=0.552632;AO=15;DP=39;FAO=21;FDP=38;FR=.,HEALED;FRO=17;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=3;FSRR=14;FWDB=0.014641;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.394;QD=23.0351;RBI=0.0147472;REFB=-0.0149037;REVB=-0.00176673;RO=17;SAF=4;SAR=11;SRF=4;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0379435;STB=0.618944;STBP=0.149;TYPE=snp;VARB=0.0184292;OID=.;OPOS=100212754;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:38:17:17:15:21:0.552632:11:4:4:13:12:9:3:14
chr7	100225031	.	G	A	122.11	PASS	AF=0.684211;AO=13;DP=19;FAO=13;FDP=19;FR=.;FRO=6;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.120966;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.0514;QD=25.708;RBI=0.144661;REFB=0.0180285;REVB=0.0793344;RO=6;SAF=6;SAR=7;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0216875;STB=0.512176;STBP=0.919;TYPE=snp;VARB=0.000700688;OID=.;OPOS=100225031;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:19:19:6:6:13:13:0.684211:7:6:3:3:7:6:3:3
chr7	100278657	.	A	G	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00292173;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.736;QD=51.9153;RBI=0.0200262;REFB=0;REVB=0.0198119;RO=0;SAF=19;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.98875e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000242205;OID=.;OPOS=100278657;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:2:19:0:0:2:19:0:0
chr7	100281768	.	T	C	74.97	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.114021;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.1567;QD=37.487;RBI=0.114036;REFB=0;REVB=0.00185933;RO=0;SAF=5;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00891605;OID=.;OPOS=100281768;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:3:5:0:0:3:5:0:0
chr7	100285476	.	C	T	233.7	PASS	AF=0.578947;AO=22;DP=38;FAO=22;FDP=38;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=17;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=0.0232547;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.19;QD=24.5994;RBI=0.0251334;REFB=0.0217727;REVB=0.0095347;RO=16;SAF=5;SAR=17;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0864358;STB=0.548341;STBP=0.558;TYPE=snp;VARB=-0.0122736;OID=.;OPOS=100285476;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:16:16:22:22:0.578947:17:5:5:11:17:5:5:11
chr7	100348384	.	T	C	253.11	PASS	AF=0.432836;AO=29;DP=67;FAO=29;FDP=67;FR=.;FRO=38;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=25;FWDB=0.0244405;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.6348;QD=15.1112;RBI=0.0297661;REFB=0.00613354;REVB=-0.0169906;RO=38;SAF=12;SAR=17;SRF=13;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0752614;STB=0.54249;STBP=0.597;TYPE=snp;VARB=-0.0102901;OID=.;OPOS=100348384;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:38:38:29:29:0.432836:17:12:13:25:17:12:13:25
chr7	100371358	.	G	A	142.61	PASS	AF=0.4;AO=16;DP=40;FAO=16;FDP=40;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=0.00529582;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.275;QD=14.2613;RBI=0.0174996;REFB=-0.00748926;REVB=0.016679;RO=24;SAF=11;SAR=5;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.322429;STB=0.687266;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=0.0156323;OID=.;OPOS=100371358;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:24:24:16:16:0.4:5:11:9:15:5:11:9:15
chr7	100371474	.	G	A	162.54	PASS	AF=0.515152;AO=17;DP=33;FAO=17;FDP=33;FR=.;FRO=16;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.0247042;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.618;QD=19.7019;RBI=0.0431849;REFB=-0.000486958;REVB=-0.0354208;RO=16;SAF=11;SAR=6;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183655;STB=0.60427;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=0.000246106;OID=.;OPOS=100371474;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:16:16:17:17:0.515152:6:11:7:9:6:11:7:9
chr7	100371476	.	T	TG	103.75	PASS	AF=0.483871;AO=15;DP=33;FAO=15;FDP=31;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.0158193;FXX=0.0605877;HRUN=0;LEN=1;MLLD=220.765;QD=13.3867;RBI=0.0347622;REFB=-0.00107145;REVB=0.0309542;RO=16;SAF=9;SAR=6;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147222;STB=0.584302;STBP=0.394;TYPE=ins;VARB=0.00459289;OID=.;OPOS=100371477;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.483871:15:33:15:31:16:9:6:7:9:99:16:9:6:7:9
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chr7	100373367	.	G	C	165.04	PASS	AF=0.382979;AO=18;DP=47;FAO=18;FDP=47;FR=.;FRO=29;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=9;FWDB=-0.00928686;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.348;QD=14.0463;RBI=0.0123891;REFB=-0.00802927;REVB=-0.00820031;RO=29;SAF=5;SAR=13;SRF=20;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.426907;STB=0.74686;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0095357;OID=.;OPOS=100373367;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:29:29:18:18:0.382979:13:5:20:9:13:5:20:9
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chr7	100391644	.	T	C	1587.62	PASS	AF=1;AO=99;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0109997;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.702;QD=64.1464;RBI=0.0111971;REFB=0;REVB=-0.00209332;RO=0;SAF=70;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.72403e-05;OID=.;OPOS=100391644;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:99:99:0:0:99:99:1:29:70:0:0:29:70:0:0
chr7	100395003	.	G	C	101.12	PASS	AF=0.270833;AO=13;DP=48;FAO=13;FDP=48;FR=.;FRO=35;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=23;FSRR=12;FWDB=-0.00466825;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.3029;QD=8.42654;RBI=0.0332474;REFB=0.000480233;REVB=0.0329181;RO=35;SAF=5;SAR=8;SRF=23;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.315129;STB=0.691082;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=7.50064e-05;OID=.;OPOS=100395003;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:35:35:13:13:0.270833:8:5:23:12:8:5:23:12
chr7	100411278	.	T	C	593.91	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0242917;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.5888;QD=60.9133;RBI=0.0328783;REFB=0;REVB=0.0221562;RO=0;SAF=17;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.53998e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00037648;OID=.;OPOS=100411278;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:39:0:0:38:39:1:21:17:0:0:21:18:0:0
chr7	100416139	.	T	C	119.53	PASS	AF=0.4;AO=14;DP=35;FAO=14;FDP=35;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=-0.0116462;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.811;QD=13.6605;RBI=0.0180648;REFB=-0.0248889;REVB=0.0138095;RO=21;SAF=6;SAR=8;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.050373;STB=0.52937;STBP=0.799;TYPE=snp;VARB=0.0310493;OID=.;OPOS=100416139;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:21:21:14:14:0.4:8:6:8:13:8:6:8:13
chr7	100416250	.	A	G	902.69	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00176299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.653;QD=58.2382;RBI=0.0216499;REFB=0;REVB=-0.021578;RO=0;SAF=25;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.5388e-05;OID=.;OPOS=100416250;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:37:25:0:0:37:25:0:0
chr7	100420155	.	A	G	166.08	PASS	AF=0.566667;AO=17;DP=30;FAO=17;FDP=30;FR=.;FRO=13;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.00744244;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.483;QD=22.144;RBI=0.00760896;REFB=-0.0432091;REVB=0.00158317;RO=13;SAF=13;SAR=4;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144736;STB=0.581986;STBP=0.382;TYPE=snp;VARB=0.0222576;OID=.;OPOS=100420155;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:13:13:17:17:0.566667:4:13:8:5:4:13:8:5
chr7	100424586	.	CG	C,CC	920.29	PASS	AF=0.1875,0.8125;AO=14,49;DP=64;FAO=12,52;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=6,12;FSAR=6,40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.055307,0.0511969;FXX=0.0153822;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=210.941,213.115;QD=57.518;RBI=0.0554208,0.0513099;REFB=0,0;REVB=-0.00355058,-0.00340307;RO=0;SAF=8,10;SAR=6,39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0083961,0.0055263;OID=.,.;OPOS=100424587,100424587;OREF=G,G;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.1875,0.8125:14,49:64:12,52:64:0:6,12:6,40:0:0:36:0:8,10:6,39:0:0
chr7	100458795	.	T	C	1453.48	PASS	AF=1;AO=92;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0119569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.988;QD=63.1946;RBI=0.0139981;REFB=0;REVB=0.00727883;RO=0;SAF=50;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.19993e-05;OID=.;OPOS=100458795;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:92:92:0:0:92:92:1:42:50:0:0:42:50:0:0
chr7	100466441	.	G	A	2176.83	PASS	AF=0.96732;AO=148;DP=154;FAO=148;FDP=153;FR=.;FRO=5;FSAF=74;FSAR=74;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0270721;FXX=0.00649309;HRUN=4;LEN=1;MLLD=153.233;QD=56.9105;RBI=0.0363837;REFB=-0.157876;REVB=0.024308;RO=2;SAF=74;SAR=74;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.503268;STBP=0.72;TYPE=snp;VARB=0.000853025;OID=.;OPOS=100466441;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:154:153:2:5:148:148:0.96732:74:74:1:1:74:74:3:2
chr7	100468284	.	A	G	1439.82	PASS	AF=1;AO=91;DP=93;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0731861;FXX=0.0215031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.0041;QD=63.2887;RBI=0.0829276;REFB=0;REVB=-0.0389972;RO=0;SAF=27;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02153e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00157827;OID=.;OPOS=100468284;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:93:91:0:0:91:91:1:64:27:0:0:64:27:0:0
chr7	100482026	.	T	C	222.67	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0196633;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.3874;QD=49.4832;RBI=0.0456125;REFB=0;REVB=-0.0411564;RO=0;SAF=8;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00218369;OID=.;OPOS=100482026;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:10:8:0:0:10:8:0:0
chr7	100486656	.	T	G	556.89	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0135485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.2187;QD=60.2043;RBI=0.0171959;REFB=0;REVB=-0.0105894;RO=0;SAF=9;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000389116;OID=.;OPOS=100486656;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:28:9:0:0:28:9:0:0
chr7	100494222	.	G	C,GC	2130.83	PASS	AF=0.0215827,0.978417;AO=5,133;DP=142;FAO=3,136;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=3,59;FSAR=0,77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.121393,-0.0386227;FXX=0.00714235;HRUN=2,1;LEN=1,1;MLLD=5.95388,31.0466;QD=61.3189;RBI=0.133158,0.0444881;REFB=0,0;REVB=0.0547244,0.022079;RO=3;SAF=4,57;SAR=1,76;SRF=2;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.116878,-0.0101708;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,ins;VARB=0.0317289,0.000142477;OID=.,.;OPOS=100494222,100494223;OREF=G,-;OALT=C,C;OMAPALT=C,GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	2/2:3:142:139:3:0:5,133:3,136:0.0215827,0.978417:1,76:4,57:2:1:0,77:3,59:0:0
chr7	100549650	.	A	G	176.66	PASS	AF=0.38;AO=19;DP=50;FAO=19;FDP=50;FR=.;FRO=31;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=23;FSRR=8;FWDB=0.0120159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.14;QD=14.1327;RBI=0.0337586;REFB=-0.0259097;REVB=0.0315477;RO=31;SAF=8;SAR=11;SRF=23;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.334316;STB=0.6915;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.0252658;OID=.;OPOS=100549650;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:31:31:19:19:0.38:11:8:23:8:11:8:23:8
chr7	100549697	.	A	G	302.66	PASS	AF=0.464789;AO=33;DP=71;FAO=33;FDP=71;FR=.;FRO=38;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=25;FSRR=13;FWDB=0.0119207;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.607;QD=17.0511;RBI=0.0231051;REFB=-0.0117903;REVB=0.0197925;RO=37;SAF=12;SAR=21;SRF=24;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.266985;STB=0.655603;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0182028;OID=.;OPOS=100549697;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:37:38:33:33:0.464789:21:12:24:13:21:12:25:13
chr7	100549703	.	C	T	304.13	PASS	AF=0.471429;AO=33;DP=70;FAO=33;FDP=70;FR=.;FRO=37;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=24;FSRR=13;FWDB=0.000449227;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.941;QD=17.3788;RBI=0.0100924;REFB=-0.0207246;REVB=0.0100824;RO=37;SAF=12;SAR=21;SRF=24;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.266985;STB=0.649395;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.0340209;OID=.;OPOS=100549703;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:37:37:33:33:0.471429:21:12:24:13:21:12:24:13
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chr7	100549840	.	C	T	35.56	PASS	AF=0.24;AO=6;DP=25;FAO=6;FDP=25;FR=.;FRO=19;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.0184634;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=223.44;QD=5.68926;RBI=0.0355859;REFB=-0.00324272;REVB=0.0304214;RO=19;SAF=2;SAR=4;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167553;STB=0.610731;STBP=0.584;TYPE=snp;VARB=0.0109218;OID=.;OPOS=100549840;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:25:25:19:19:6:6:0.24:4:2:9:10:4:2:9:10
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chr7	100552659	.	T	C	56.53	PASS	AF=0.444444;AO=7;DP=17;FAO=8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=0;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=10;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.119;QD=12.5631;RBI=0.00580467;REFB=-0.0153392;REVB=-0.00580467;RO=10;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.034653;OID=.;OPOS=100552659;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:17:18:10:10:7:8:0.444444:7:0:0:10:8:0:0:10
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chr7	100612952	.	G	A	132.65	PASS	AF=0.428571;AO=15;DP=35;FAO=15;FDP=35;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.0232709;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.647;QD=15.1605;RBI=0.0258885;REFB=-0.0122482;REVB=0.0113437;RO=20;SAF=7;SAR=8;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0820866;STB=0.547465;STBP=0.671;TYPE=snp;VARB=0.0187379;OID=.;OPOS=100612952;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:20:20:15:15:0.428571:8:7:11:9:8:7:11:9
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chr7	100612969	.	A	G	124.88	PASS	AF=0.5;AO=14;DP=28;FAO=14;FDP=28;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=-0.0132387;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.008;QD=17.8394;RBI=0.0145395;REFB=0.00270934;REVB=0.0060111;RO=14;SAF=7;SAR=7;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0623504;STB=0.535663;STBP=0.765;TYPE=snp;VARB=-0.00573394;OID=.;OPOS=100612969;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:28:14:14:14:14:0.5:7:7:6:8:7:7:6:8
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chr7	100634964	.	C	A	208.4	PASS	AF=0.9;AO=18;DP=20;FAO=18;FDP=20;FR=.;FRO=2;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0487074;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=208.788;QD=41.6803;RBI=0.0549904;REFB=0.030479;REVB=0.0255251;RO=2;SAF=6;SAR=12;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0705878;STB=0.53842;STBP=0.424;TYPE=snp;VARB=-0.00134446;OID=.;OPOS=100634964;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:20:20:2:2:18:18:0.9:12:6:0:2:12:6:0:2
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chr7	100635375	.	A	C	109.48	PASS	AF=0.666667;AO=9;DP=18;FAO=12;FDP=18;FR=.,HEALED;FRO=6;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0.146282;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.356;QD=24.3282;RBI=0.146815;REFB=0.00559268;REVB=-0.0124967;RO=6;SAF=2;SAR=7;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.267143;STB=0.649783;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=-0.00370321;OID=.;OPOS=100635375;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:18:18:6:6:9:12:0.666667:7:2:0:6:7:5:0:6
chr7	100635591	.	C	A	323.41	PASS	AF=0.636364;AO=27;DP=43;FAO=28;FDP=44;FR=.;FRO=16;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=-0.00104554;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.63;QD=29.4007;RBI=0.00413642;REFB=-0.0598226;REVB=0.0040021;RO=14;SAF=11;SAR=16;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12808;STB=0.543594;STBP=0.458;TYPE=snp;VARB=0.0287656;OID=.;OPOS=100635591;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:44:14:16:27:28:0.636364:16:11:3:11:16:12:5:11
chr7	100635661	.	T	C	726.87	PASS	AF=1;AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.015079;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.486;QD=57.0091;RBI=0.0230116;REFB=0;REVB=-0.0173826;RO=0;SAF=28;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.97956e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.74303e-06;OID=.;OPOS=100635661;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:51:0:0:51:51:1:23:28:0:0:23:28:0:0
chr7	100635679	.	C	G	447.49	PASS	AF=0.75;AO=39;DP=53;FAO=39;FDP=52;FR=.;FRO=13;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.0367974;FXX=0.0188644;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.708;QD=34.4222;RBI=0.0472964;REFB=-0.0170893;REVB=0.0297137;RO=13;SAF=22;SAR=17;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.047894;STB=0.525883;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=0.00747916;OID=.;OPOS=100635679;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:53:52:13:13:39:39:0.75:17:22:6:7:17:22:6:7
chr7	100637338	.	G	C	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0435453;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.062;QD=49.5991;RBI=0.0563885;REFB=0;REVB=-0.0358256;RO=0;SAF=6;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000141343;OID=.;OPOS=100637338;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:12:6:0:0:12:6:0:0
chr7	100637465	.	C	T	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.120457;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.3526;QD=33.4278;RBI=0.122739;REFB=0;REVB=-0.0235582;RO=0;SAF=5;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00994556;OID=.;OPOS=100637465;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:1:5:0:0:1:5:0:0
chr7	100638828	.	C	T	158.38	PASS	AF=0.447368;AO=16;DP=37;FAO=17;FDP=38;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.00309254;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=83.2774;QD=16.6715;RBI=0.00416011;REFB=-0.0194057;REVB=0.00278257;RO=21;SAF=9;SAR=7;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0384175;STB=0.536235;STBP=0.721;TYPE=snp;VARB=0.0309951;OID=.;OPOS=100638828;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:38:21:21:16:17:0.447368:7:9:11:10:7:10:11:10
chr7	100638856	.	A	G	699.97	PASS	AF=0.978261;AO=45;DP=47;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0253225;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.7883;QD=60.8671;RBI=0.0318464;REFB=-0.171151;REVB=0.0193122;RO=1;SAF=28;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0268394;STB=0.514279;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=0.00632635;OID=.;OPOS=100638856;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:47:46:1:1:45:45:0.978261:17:28:0:1:17:28:0:1
chr7	100639012	.	C	T	222.85	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0868822;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.116;QD=49.5219;RBI=0.0902603;REFB=0;REVB=0.0244621;RO=0;SAF=11;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00191828;OID=.;OPOS=100639012;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:7:11:0:0:7:11:0:0
chr7	100639040	.	C	T	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0756532;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=253.091;QD=42.1826;RBI=0.0776874;REFB=0;REVB=0.0176613;RO=0;SAF=7;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000786675;OID=.;OPOS=100639040;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:4:7:0:0:4:7:0:0
chr7	100639049	.	G	C	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.102939;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=129.711;QD=40.7628;RBI=0.104392;REFB=0;REVB=-0.0173572;RO=0;SAF=6;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00267033;OID=.;OPOS=100639049;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:4:6:0:0:4:6:0:0
chr7	100643477	.	A	C	224.84	PASS	AF=0.280702;AO=33;DP=114;FAO=32;FDP=114;FR=.;FRO=82;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=49;FSRR=33;FWDB=-0.000349731;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.797;QD=7.88925;RBI=0.00736393;REFB=-0.00810157;REVB=0.00735562;RO=75;SAF=18;SAR=15;SRF=44;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0495098;STB=0.525769;STBP=0.77;TYPE=snp;VARB=0.0180616;OID=.;OPOS=100643477;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:114:114:75:82:33:32:0.280702:15:18:44:31:14:18:49:33
chr7	100643832	.	C	G	57.45	PASS	AF=0.166667;AO=10;DP=61;FAO=10;FDP=60;FR=.;FRO=50;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=26;FSRR=24;FWDB=-0.062131;FXX=0.0163908;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.6101;QD=3.83011;RBI=0.0717688;REFB=0.00215886;REVB=0.0359236;RO=49;SAF=4;SAR=6;SRF=26;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160507;STB=0.5998;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=-0.0111243;OID=.;OPOS=100643832;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:61:60:49:50:10:10:0.166667:6:4:26:23:6:4:26:24
chr7	100643842	.	C	T	75.77	PASS	AF=0.2;AO=7;DP=48;FAO=9;FDP=45;FR=.,HEALED;FRO=31;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=22;FWDB=-0.0509592;FXX=0.081616;HRUN=3;LEN=1;MLLD=124.324;QD=6.7349;RBI=0.0517053;REFB=-0.0258259;REVB=0.00875204;RO=27;SAF=5;SAR=2;SRF=6;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.541718;STB=0.698536;STBP=0.206;TYPE=snp;VARB=0.0565277;OID=.;OPOS=100643842;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:58:48:45:27:31:7:9:0.2:2:5:6:21:4:5:9:22
chr7	100643876	.	C	T	33.5	PASS	AF=0.153846;AO=6;DP=39;FAO=6;FDP=39;FR=.;FRO=33;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=0.00212593;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.4092;QD=3.43581;RBI=0.0204623;REFB=-0.00876542;REVB=-0.0203515;RO=33;SAF=4;SAR=2;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.2829;STB=0.699355;STBP=0.341;TYPE=snp;VARB=0.0454122;OID=.;OPOS=100643876;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:39:39:33:33:6:6:0.153846:2:4:14:19:2:4:14:19
chr7	100647819	.	C	T	130.63	PASS	AF=0.608696;AO=14;DP=23;FAO=14;FDP=23;FR=.;FRO=9;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=-0.000719919;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.307;QD=22.7186;RBI=0.0203742;REFB=-0.0536624;REVB=0.0203615;RO=9;SAF=9;SAR=5;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105825;STB=0.559359;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=0.0348121;OID=.;OPOS=100647819;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:23:23:9:9:14:14:0.608696:5:9:7:2:5:9:7:2
chr7	100647875	.	C	A	117.44	PASS	AF=0.590909;AO=13;DP=22;FAO=13;FDP=22;FR=.;FRO=9;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=0.0103343;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.436;QD=21.3533;RBI=0.0104935;REFB=-0.0294203;REVB=-0.00182066;RO=9;SAF=8;SAR=5;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128523;STB=0.572413;STBP=0.492;TYPE=snp;VARB=0.0233885;OID=.;OPOS=100647875;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:22:22:9:9:13:13:0.590909:5:8:7:2:5:8:7:2
chr7	100647920	.	A	C	68.85	PASS	AF=0.5;AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.0526862;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.6459;QD=15.3007;RBI=0.0808893;REFB=0.0136635;REVB=0.0613778;RO=9;SAF=2;SAR=7;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.400241;STB=0.736288;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=-0.00489808;OID=.;OPOS=100647920;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:18:18:9:9:9:9:0.5:7:2:6:3:7:2:6:3
chr7	100648029	.	G	A	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00496026;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.6318;QD=45.8055;RBI=0.0185931;REFB=0;REVB=-0.0179193;RO=0;SAF=4;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.63386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00030161;OID=.;OPOS=100648029;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:10:4:0:0:10:4:0:0
chr7	100648117	.	C	G	30.1	PASS	AF=0.416667;AO=5;DP=12;FAO=5;FDP=12;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.00747311;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.615;QD=10.0339;RBI=0.0671665;REFB=-0.00919518;REVB=0.0667495;RO=7;SAF=4;SAR=1;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112423;STB=0.571121;STBP=0.776;TYPE=snp;VARB=0.0127741;OID=.;OPOS=100648117;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:12:12:7:7:5:5:0.416667:1:4:5:2:1:4:5:2
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chr7	100678086	.	T	C	937.57	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0185485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.9998;QD=58.5983;RBI=0.0409161;REFB=0;REVB=-0.0364703;RO=0;SAF=44;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000536082;OID=.;OPOS=100678086;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:20:44:0:0:20:44:0:0
chr7	100679902	.	A	G	74.43	PASS	AF=0.357143;AO=10;DP=28;FAO=10;FDP=28;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=0.108184;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.7486;QD=10.6328;RBI=0.10939;REFB=-0.000926038;REVB=0.0161981;RO=18;SAF=5;SAR=5;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179247;STB=0.606938;STBP=0.417;TYPE=snp;VARB=0.0115053;OID=.;OPOS=100679902;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:28:28:18:18:10:10:0.357143:5:5:12:6:5:5:12:6
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chr7	100682565	.	T	G	125.3	PASS	AF=0.5;AO=13;DP=27;FAO=14;FDP=28;FR=.;FRO=14;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.0114713;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.665;QD=17.9004;RBI=0.0240735;REFB=-0.02473;REVB=0.0211647;RO=14;SAF=11;SAR=2;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.336616;STB=0.705536;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.0235055;OID=.;OPOS=100682565;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:28:14:14:13:14:0.5:2:11:8:6:2:12:8:6
chr7	100692680	.	T	G	542.03	PASS	AF=0.509091;AO=56;DP=110;FAO=56;FDP=110;FR=.;FRO=54;FSAF=25;FSAR=31;FSRF=28;FSRR=26;FWDB=-0.00751065;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.32;QD=19.71;RBI=0.00941035;REFB=0.0132432;REVB=0.00566965;RO=54;SAF=25;SAR=31;SRF=28;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0643582;STB=0.535515;STBP=0.477;TYPE=snp;VARB=-0.0116376;OID=.;OPOS=100692680;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:110:54:54:56:56:0.509091:31:25:28:26:31:25:28:26
chr7	100731505	.	C	G	45.49	PASS	AF=0.857143;AO=6;DP=7;FAO=6;FDP=7;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0160756;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.4944;QD=25.9931;RBI=0.0341825;REFB=-0.0336294;REVB=-0.0301665;RO=1;SAF=3;SAR=3;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123249;STB=0.571194;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.00717757;OID=.;OPOS=100731505;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:7:7:1:1:6:6:0.857143:3:3:0:1:3:3:0:1
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chr7	100731829	.	T	C	700.46	PASS	AF=0.46875;AO=73;DP=157;FAO=75;FDP=160;FR=.;FRO=85;FSAF=30;FSAR=45;FSRF=49;FSRR=36;FWDB=-0.0060962;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.14;QD=17.5115;RBI=0.0229547;REFB=-0.032979;REVB=0.0221304;RO=84;SAF=29;SAR=44;SRF=48;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168664;STB=0.59396;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.031165;OID=.;OPOS=100731829;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:157:160:84:85:73:75:0.46875:44:29:48:36:45:30:49:36
chr7	100781982	.	A	AG	40.95	PASS	AF=0.545455;AO=6;DP=12;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0892448;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=34.5288;QD=14.8891;RBI=0.110283;REFB=-0.00606054;REVB=0.0647904;RO=6;SAF=5;SAR=1;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.345446;STB=0.739831;STBP=0.153;TYPE=ins;VARB=0.0185042;OID=.;OPOS=100781983;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.545455:6:12:6:11:5:5:1:2:3:24:6:5:1:3:3
chr7	100797864	.	CG	C	62.57	PASS	AF=0.5;AO=10;DP=22;FAO=11;FDP=22;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.0848253;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=15.604;QD=11.3772;RBI=0.119535;REFB=-0.0898153;REVB=0.0842217;RO=10;SAF=3;SAR=7;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185184;STB=0.593048;STBP=0.411;TYPE=del;VARB=0.119441;OID=.;OPOS=100797865;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.5:10:22:11:22:11:4:7:6:5:61:10:3:7:5:5
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chr7	101006382	.	C	T	226.76	PASS	AF=0.471698;AO=24;DP=52;FAO=25;FDP=53;FR=.;FRO=28;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=0.138153;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.6546;QD=17.114;RBI=0.186186;REFB=0.0137674;REVB=0.124815;RO=28;SAF=14;SAR=10;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0802602;STB=0.553803;STBP=0.459;TYPE=snp;VARB=-0.00883064;OID=.;OPOS=101006382;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:53:28:28:24:25:0.471698:10:14:14:14:10:15:14:14
chr7	101200669	.	A	AG	572.71	PASS	AF=1;AO=52;DP=63;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.105387;FXX=0.0161264;HRUN=2;LEN=1;MLLD=15.4409;QD=37.5548;RBI=0.18332;REFB=0;REVB=-0.149999;RO=6;SAF=28;SAR=24;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0399108;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00037037;OID=.;OPOS=101200670;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:52:63:61:61:0:29:32:0:0:11:6:28:24:2:4
chr7	101200727	.	G	A	393.28	PASS	AF=0.541667;AO=39;DP=72;FAO=39;FDP=72;FR=.;FRO=33;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=-0.0160994;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.635;QD=21.8491;RBI=0.0195819;REFB=-0.030911;REVB=-0.0111472;RO=31;SAF=22;SAR=17;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116313;STB=0.56407;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=0.0160468;OID=.;OPOS=101200727;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:31:33:39:39:0.541667:17:22:13:18:17:22:14:19
chr7	101256833	.	T	C	286.5	PASS	AF=0.553191;AO=26;DP=47;FAO=26;FDP=47;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=-0.00969938;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.671;QD=24.3827;RBI=0.0152879;REFB=-0.0377718;REVB=0.011817;RO=21;SAF=13;SAR=13;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0573847;STB=0.53189;STBP=0.63;TYPE=snp;VARB=0.0257699;OID=.;OPOS=101256833;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:21:21:26:26:0.553191:13:13:9:12:13:13:9:12
chr7	101892833	.	C	T	885.4	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0289312;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.5379;QD=58.0592;RBI=0.0396675;REFB=0;REVB=0.0271385;RO=0;SAF=25;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.07942e-05;OID=.;OPOS=101892833;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:36:25:0:0:36:25:0:0
chr7	101916647	.	A	G	174.09	PASS	AF=0.5;AO=18;DP=36;FAO=18;FDP=36;FR=.;FRO=18;FSAF=15;FSAR=3;FSRF=15;FSRR=3;FWDB=0.0110842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.908;QD=19.3438;RBI=0.0562379;REFB=0.00100535;REVB=-0.0551347;RO=17;SAF=15;SAR=3;SRF=15;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0809187;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00106994;OID=.;OPOS=101916647;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:17:18:18:18:0.5:3:15:15:2:3:15:15:3
chr7	101917521	.	G	A	44.96	PASS	AF=0.304348;AO=7;DP=23;FAO=7;FDP=23;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=-0.00696035;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.7243;QD=7.8194;RBI=0.0584919;REFB=-0.0344088;REVB=0.0580763;RO=16;SAF=4;SAR=3;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.349848;STB=0.713753;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=0.0506508;OID=.;OPOS=101917521;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:23:23:16:16:7:7:0.304348:3:4:4:12:3:4:4:12
chr7	101928495	.	G	C	226.81	PASS	AF=0.480769;AO=23;DP=50;FAO=25;FDP=52;FR=.;FRO=27;FSAF=7;FSAR=18;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.0162175;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.975;QD=17.4471;RBI=0.0194852;REFB=-0.0107104;REVB=-0.0108011;RO=27;SAF=7;SAR=16;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109826;STB=0.576448;STBP=0.334;TYPE=snp;VARB=0.0151429;OID=.;OPOS=101928495;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:52:27:27:23:25:0.480769:16:7:11:16:18:7:11:16
chr7	102038153	.	CTGTG	CG,C	165.58	PASS	AF=0,1;AO=3,7;DP=12;FAO=0,14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=0,6;FSAR=0,8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00540705,0.00442275;FXX=0.0666222;HRUN=1,1;LEN=3,4;MLLD=151.016,171.031;QD=47.3075;RBI=0.0579062,0.0737649;REFB=0,0;REVB=0.0576532,0.0736322;RO=0;SAF=0,4;SAR=3,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=0,0.000469628;OID=.,.;OPOS=102038154,102038154;OREF=TGT,TGTG;OALT=-,-;OMAPALT=CG,C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	2/2:0,1:3,7:12:0,14:14:0:0,6:0,8:0:0:4:0:0,4:3,3:0:0
chr7	102063527	.	G	C	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0312019;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.914;QD=51.9165;RBI=0.03133;REFB=0;REVB=0.0028302;RO=0;SAF=9;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000278288;OID=.;OPOS=102063527;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:12:9:0:0:12:9:0:0
chr7	102066539	.	A	G	130.4	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0312729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.002;QD=43.4652;RBI=0.0484464;REFB=0;REVB=0.0370008;RO=0;SAF=3;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000796693;OID=.;OPOS=102066539;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:9:3:0:0:9:3:0:0
chr7	102098010	.	G	A	634.07	PASS	AF=0.956522;AO=41;DP=44;FAO=44;FDP=46;FR=.;FRO=2;FSAF=28;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0188467;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.4923;QD=55.1367;RBI=0.0731634;REFB=-0.0601718;REVB=0.0706943;RO=0;SAF=25;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.1719e-08;STB=0.529398;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=0.0050745;OID=.;OPOS=102098010;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:44:46:0:2:41:44:0.956522:16:25:0:0:16:28:0:2
chr7	102106201	.	G	A	557.5	PASS	AF=0.977273;AO=28;DP=42;FAO=43;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.160276;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=157.797;QD=50.6814;RBI=0.160493;REFB=-0.123583;REVB=0.00834776;RO=0;SAF=5;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.39272e-08;STB=0.50943;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.00388904;OID=.;OPOS=102106201;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:42:44:0:1:28:43:0.977273:23:5:0:0:26:17:0:1
chr7	102108532	.	G	A	1946.43	PASS	AF=0.977099;AO=127;DP=130;FAO=128;FDP=131;FR=.;FRO=3;FSAF=94;FSAR=34;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0128854;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.218;QD=59.433;RBI=0.0282726;REFB=-0.064427;REVB=0.0251656;RO=1;SAF=93;SAR=34;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0137689;STB=0.501983;STBP=0.868;TYPE=snp;VARB=9.47018e-05;OID=.;OPOS=102108532;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:130:131:1:3:127:128:0.977099:34:93:0:1:34:94:2:1
chr7	102180473	.	C	T	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.013722;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.9801;QD=35.5759;RBI=0.039406;REFB=0;REVB=-0.0369397;RO=0;SAF=6;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00455789;OID=.;OPOS=102180473;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:1:6:0:0:1:6:0:0
chr7	102235769	.	T	C	223.18	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0209451;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.4551;QD=49.5957;RBI=0.02393;REFB=0;REVB=-0.0115736;RO=0;SAF=12;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000250769;OID=.;OPOS=102235769;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:6:12:0:0:6:12:0:0
chr7	102246311	.	T	C	50.47	PASS	AF=0.583333;AO=7;DP=12;FAO=7;FDP=12;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.00266682;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=287.101;QD=16.8229;RBI=0.00318795;REFB=-0.0330341;REVB=-0.00174675;RO=5;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.335683;STB=0.691862;STBP=0.199;TYPE=snp;VARB=0.0233859;OID=.;OPOS=102246311;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:12:12:5:5:7:7:0.583333:4:3:0:5:4:3:0:5
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chr7	102389710	.	A	T	109.91	PASS	AF=0.433333;AO=13;DP=30;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=-0.0672126;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.434;QD=14.6547;RBI=0.077993;REFB=-0.0188318;REVB=-0.0395647;RO=17;SAF=6;SAR=7;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00884949;STB=0.505147;STBP=0.946;TYPE=snp;VARB=0.0476884;OID=.;OPOS=102389710;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:17:17:13:13:0.433333:7:6:8:9:7:6:8:9
chr7	102389833	.	G	C	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00647818;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=223.15;QD=53.2757;RBI=0.0122834;REFB=0;REVB=0.0104363;RO=0;SAF=8;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.20824e-05;OID=.;OPOS=102389833;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:15:8:0:0:15:8:0:0
chr7	102462636	.	T	C	433.46	PASS	AF=0.511905;AO=43;DP=84;FAO=43;FDP=84;FR=.;FRO=41;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=26;FSRR=15;FWDB=0.0269122;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.559;QD=20.6411;RBI=0.029896;REFB=-0.00591349;REVB=-0.0130193;RO=41;SAF=18;SAR=25;SRF=26;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188689;STB=0.604348;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.00442369;OID=.;OPOS=102462636;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:41:41:43:43:0.511905:25:18:26:15:25:18:26:15
chr7	102497902	.	T	C	138.95	PASS	AF=0.535714;AO=15;DP=28;FAO=15;FDP=28;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=3;FWDB=0.0266244;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.625;QD=19.8494;RBI=0.0551503;REFB=-0.0154406;REVB=0.048298;RO=13;SAF=8;SAR=7;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.197984;STB=0.611511;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=0.0258457;OID=.;OPOS=102497902;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:28:13:13:15:15:0.535714:7:8:10:3:7:8:10:3
chr7	102553603	.	C	G	447.33	PASS	AF=0.434783;AO=50;DP=115;FAO=50;FDP=115;FR=.;FRO=65;FSAF=33;FSAR=17;FSRF=23;FSRR=42;FWDB=-0.0297008;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.3492;QD=15.5594;RBI=0.12642;REFB=0.0205455;REVB=0.122881;RO=65;SAF=33;SAR=17;SRF=23;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.30652;STB=0.671543;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=-0.0250173;OID=.;OPOS=102553603;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:115:65:65:50:50:0.434783:17:33:23:42:17:33:23:42
chr7	102574920	.	G	C	60.3	PASS	AF=0.571429;AO=8;DP=14;FAO=8;FDP=14;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.0137523;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=346.454;QD=17.2298;RBI=0.0151997;REFB=0.0124572;REVB=-0.00647339;RO=6;SAF=2;SAR=6;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.426988;STB=0.749374;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=-0.00522981;OID=.;OPOS=102574920;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:14:14:6:6:8:8:0.571429:6:2:5:1:6:2:5:1
chr7	102668001	.	A	C	834.41	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00658924;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=267.601;QD=57.5452;RBI=0.0152634;REFB=0;REVB=0.0137678;RO=0;SAF=21;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.3149e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.29341e-05;OID=.;OPOS=102668001;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:37:21:0:0:37:21:0:0
chr7	102740683	.	G	A	670.86	PASS	AF=0.943396;AO=50;DP=53;FAO=50;FDP=53;FR=.;FRO=3;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.00387779;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.297;QD=50.631;RBI=0.0108074;REFB=0.0144593;REVB=-0.0100877;RO=2;SAF=26;SAR=24;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00144916;STB=0.508317;STBP=0.717;TYPE=snp;VARB=-7.68055e-05;OID=.;OPOS=102740683;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:53:53:2:3:50:50:0.943396:24:26:1:1:24:26:2:1
chr7	102742144	.	C	T	575.8	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00767528;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.656;QD=60.61;RBI=0.0108126;REFB=0;REVB=-0.0076159;RO=0;SAF=23;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.79257e-05;OID=.;OPOS=102742144;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:15:23:0:0:15:23:0:0
chr7	102743893	.	C	T	727.78	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0379779;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.7918;QD=63.2852;RBI=0.0390889;REFB=0;REVB=-0.00925334;RO=0;SAF=23;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000178834;OID=.;OPOS=102743893;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:23:23:0:0:23:23:0:0
chr7	102760511	.	A	C	178.22	PASS	AF=0.395833;AO=19;DP=48;FAO=19;FDP=48;FR=.;FRO=29;FSAF=15;FSAR=4;FSRF=23;FSRR=6;FWDB=-0.0326011;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.723;QD=14.8515;RBI=0.0370113;REFB=-0.0209512;REVB=0.0175216;RO=29;SAF=15;SAR=4;SRF=23;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00572811;STB=0.503308;STBP=0.994;TYPE=snp;VARB=0.0330544;OID=.;OPOS=102760511;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:29:29:19:19:0.395833:4:15:23:6:4:15:23:6
chr7	102769131	.	G	A	263.97	PASS	AF=0.434783;AO=30;DP=69;FAO=30;FDP=69;FR=.;FRO=39;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=26;FWDB=-0.0210786;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.448;QD=15.3029;RBI=0.0211473;REFB=-0.00973607;REVB=-0.00170297;RO=39;SAF=14;SAR=16;SRF=13;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135704;STB=0.576421;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.0144583;OID=.;OPOS=102769131;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:39:39:30:30:0.434783:16:14:13:26:16:14:13:26
chr7	102961277	.	CTTTTTT	CTTTTTC,CTTT,CTTTTT	145.3	PASS	AF=0.3,0,0.7;AO=2,8,5;DP=45;FAO=12,0,28;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0,28;FSAR=12,0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0293614,-0.228677,-0.659196;FXX=0.148904;HRUN=20,20,20;LEN=1,3,1;MLLD=168.88,5.33979,2.02998;QD=14.5303;RBI=0.14871,0.483411,1.33109;REFB=0.0271786,0.0958732,0.0508523;REVB=-0.145783,-0.425903,-1.15641;RO=3;SAF=0,8,5;SAR=2,0,0;SRF=3;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.74993,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=snp,del,del;VARB=-0.0155391,0.117761,-0.0556486;OID=.,.,.;OPOS=102961283,102961278,102961278;OREF=T,TTT,T;OALT=C,-,-;OMAPALT=CTTTTTC,CTTT,CTTTTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/3:0.3,0,0.7:2,8,5:45:12,0,28:40:0:0,0,28:12,0,0:0:0:90:3:0,8,5:2,0,0:3:0
chr7	103007949	.	A	C	1251.1	PASS	AF=1;AO=80;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112185;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.792;QD=61.7825;RBI=0.0159332;REFB=0;REVB=0.0113142;RO=0;SAF=37;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000145045;OID=.;OPOS=103007949;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:81:0:0:80:81:1:43:37:0:0:44:37:0:0
chr7	103073964	.	T	C	92.97	PASS	AF=0.307692;AO=12;DP=39;FAO=12;FDP=39;FR=.;FRO=27;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=0.00513932;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.111;QD=9.53508;RBI=0.00683965;REFB=0.00625816;REVB=-0.00451312;RO=27;SAF=3;SAR=9;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.247733;STB=0.651902;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=-0.018225;OID=.;OPOS=103073964;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:39:39:27:27:12:12:0.307692:9:3:12:15:9:3:12:15
chr7	103073979	.	G	C	92.58	PASS	AF=0.3;AO=12;DP=40;FAO=12;FDP=40;FR=.;FRO=28;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=0.000495762;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.9212;QD=9.25788;RBI=0.0154905;REFB=-0.00435448;REVB=-0.0154826;RO=28;SAF=3;SAR=9;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.231737;STB=0.642602;STBP=0.252;TYPE=snp;VARB=0.0110283;OID=.;OPOS=103073979;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:40:40:28:28:12:12:0.3:9:3:12:16:9:3:12:16
chr7	103073993	.	T	C	81.28	PASS	AF=0.275;AO=11;DP=40;FAO=11;FDP=40;FR=.;FRO=29;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=0.0151977;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.715;QD=8.12774;RBI=0.0260813;REFB=-0.0084234;REVB=-0.0211959;RO=28;SAF=3;SAR=8;SRF=9;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0683136;STB=0.562044;STBP=0.648;TYPE=snp;VARB=0.019725;OID=.;OPOS=103073993;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:81:40:40:28:29:11:11:0.275:8:3:9:19:8:3:10:19
chr7	103124785	.	T	C	270.05	PASS	AF=0.531915;AO=25;DP=47;FAO=25;FDP=47;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=0.0173927;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.792;QD=22.9826;RBI=0.0174003;REFB=-0.00444418;REVB=0.000514787;RO=22;SAF=8;SAR=17;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198917;STB=0.611419;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=0.00151325;OID=.;OPOS=103124785;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:22:22:25:25:0.531915:17:8:12:10:17:8:12:10
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chr7	103155705	.	A	G	206.96	PASS	AF=0.4375;AO=21;DP=48;FAO=21;FDP=48;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=-0.00796031;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.482;QD=17.247;RBI=0.0538212;REFB=-0.00563987;REVB=-0.0532292;RO=27;SAF=15;SAR=6;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174079;STB=0.5999;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=0.00557243;OID=.;OPOS=103155705;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:27:27:21:21:0.4375:6:15:15:12:6:15:15:12
chr7	103155864	.	A	G	39.56	PASS	AF=0.5;AO=6;DP=12;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.0161971;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.886;QD=13.1869;RBI=0.0346237;REFB=-0.0274718;REVB=0.0306016;RO=6;SAF=4;SAR=2;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168138;STB=0.599699;STBP=0.611;TYPE=snp;VARB=0.0400257;OID=.;OPOS=103155864;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:12:12:6:6:6:6:0.5:2:4:5:1:2:4:5:1
chr7	103244879	.	G	A	89.78	PASS	AF=0.25;AO=12;DP=48;FAO=12;FDP=48;FR=.;FRO=36;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=22;FWDB=-0.0279833;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.748;QD=7.48135;RBI=0.0301733;REFB=-0.0099184;REVB=-0.0112856;RO=35;SAF=5;SAR=7;SRF=14;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.020626;STB=0.521547;STBP=0.905;TYPE=snp;VARB=0.0336832;OID=.;OPOS=103244879;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:48:48:35:36:12:12:0.25:7:5:14:21:7:5:14:22
chr7	103292112	.	T	G	223.1	PASS	AF=0.462963;AO=25;DP=54;FAO=25;FDP=54;FR=.;FRO=29;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=-0.0192406;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.174;QD=16.5263;RBI=0.0267859;REFB=-0.0167843;REVB=-0.0186355;RO=29;SAF=17;SAR=8;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.19726;STB=0.611801;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=0.0123986;OID=.;OPOS=103292112;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:29:29:25:25:0.462963:8:17:14:15:8:17:14:15
chr7	103838221	.	T	C	145.55	PASS	AF=0.444444;AO=16;DP=36;FAO=16;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.00557427;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.568;QD=16.1724;RBI=0.00751557;REFB=-0.00650801;REVB=0.00504097;RO=20;SAF=8;SAR=8;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00579358;OID=.;OPOS=103838221;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:20:20:16:16:0.444444:8:8:10:10:8:8:10:10
chr7	104263425	.	T	C	289.35	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0127199;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.775;QD=52.6095;RBI=0.0332389;REFB=0;REVB=0.0307087;RO=0;SAF=14;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000201868;OID=.;OPOS=104263425;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:8:14:0:0:8:14:0:0
chr7	104552421	.	A	AG	51.73	PASS	AF=0.325581;AO=14;DP=43;FAO=14;FDP=43;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=-0.00731687;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=16.4838;QD=4.81201;RBI=0.0189615;REFB=-0.0752402;REVB=-0.0174929;RO=29;SAF=8;SAR=6;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214125;STB=0.627274;STBP=0.237;TYPE=ins;VARB=0.13453;OID=.;OPOS=104552422;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.325581:14:43:14:43:29:8:6:11:18:51:29:8:6:11:18
chr7	104717517	.	C	T	107.98	PASS	AF=0.393939;AO=13;DP=33;FAO=13;FDP=33;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=-0.0133509;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.3003;QD=13.0889;RBI=0.0248172;REFB=-0.0119159;REVB=-0.02092;RO=20;SAF=10;SAR=3;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0938032;STB=0.555466;STBP=0.669;TYPE=snp;VARB=0.00736141;OID=.;OPOS=104717517;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:20:20:13:13:0.393939:3:10:14:6:3:10:14:6
chr7	104785779	.	T	G	46.0	PASS	AF=0.35;AO=7;DP=20;FAO=7;FDP=20;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.017311;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.649;QD=9.20058;RBI=0.0209007;REFB=-0.0016919;REVB=-0.0117119;RO=13;SAF=5;SAR=2;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.275446;STB=0.671134;STBP=0.262;TYPE=snp;VARB=0.0042853;OID=.;OPOS=104785779;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:20:20:13:13:7:7:0.35:2:5:6:7:2:5:6:7
chr7	105621512	.	G	T	976.82	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00832185;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.145;QD=59.2009;RBI=0.037731;REFB=0;REVB=0.0368019;RO=0;SAF=32;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000135558;OID=.;OPOS=105621512;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:66:0:0:64:66:1:32:32:0:0:32:34:0:0
chr7	105848638	.	T	C	219.59	PASS	AF=0.44;AO=22;DP=49;FAO=22;FDP=50;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=-0.0168187;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.413;QD=17.5669;RBI=0.0199195;REFB=-0.0228809;REVB=-0.0106732;RO=27;SAF=7;SAR=15;SRF=9;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0167856;STB=0.524669;STBP=0.808;TYPE=snp;VARB=0.0459221;OID=.;OPOS=105848638;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:50:27:28:22:22:0.44:15:7:9:18:15:7:10:18
chr7	105903904	.	T	C	1050.06	PASS	AF=0.986111;AO=71;DP=73;FAO=71;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00931395;FXX=0.0136968;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.1832;QD=58.3365;RBI=0.0307713;REFB=-0.0867399;REVB=0.0293279;RO=1;SAF=37;SAR=34;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0137051;STB=0.507244;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.00354319;OID=.;OPOS=105903904;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:73:72:1:1:71:71:0.986111:34:37:0:1:34:37:0:1
chr7	105917482	.	A	G	269.28	PASS	AF=0.461538;AO=29;DP=64;FAO=30;FDP=65;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=0.00826404;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.9884;QD=16.5712;RBI=0.0198967;REFB=0.00366224;REVB=0.0180993;RO=34;SAF=13;SAR=16;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0497927;STB=0.510281;STBP=0.896;TYPE=snp;VARB=-0.00338764;OID=.;OPOS=105917482;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:65:34:35:29:30:0.461538:16:13:17:17:16:14:17:18
chr7	106300140	.	C	T	333.11	PASS	AF=0.444444;AO=36;DP=81;FAO=36;FDP=81;FR=.;FRO=45;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=23;FWDB=0.0252931;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.803;QD=16.45;RBI=0.0254022;REFB=-0.0116977;REVB=0.00235175;RO=45;SAF=19;SAR=17;SRF=22;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0384422;STB=0.521608;STBP=0.744;TYPE=snp;VARB=0.0186567;OID=.;OPOS=106300140;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:45:45:36:36:0.444444:17:19:22:23:17:19:22:23
chr7	106508978	.	A	G	2329.68	PASS	AF=1;AO=146;DP=146;FAO=146;FDP=146;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00193185;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.7647;QD=63.8269;RBI=0.0122523;REFB=0;REVB=0.0120991;RO=0;SAF=77;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.96699e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.35492e-05;OID=.;OPOS=106508978;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:146:146:0:0:146:146:1:69:77:0:0:69:77:0:0
chr7	106508987	.	T	C	2305.13	PASS	AF=1;AO=150;DP=150;FAO=151;FDP=151;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00179375;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.0382;QD=61.0629;RBI=0.00417007;REFB=0;REVB=0.00376457;RO=0;SAF=77;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.73931e-05;OID=.;OPOS=106508987;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:150:151:0:0:150:151:1:73:77:0:0:74:77:0:0
chr7	106799997	.	G	A	101.68	PASS	AF=0.5;AO=12;DP=24;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.0265027;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.2702;QD=16.9472;RBI=0.0611556;REFB=0.0069692;REVB=0.0551146;RO=12;SAF=3;SAR=9;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.312315;STB=0.681497;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=-0.00802759;OID=.;OPOS=106799997;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:24:24:12:12:12:12:0.5:9:3:7:5:9:3:7:5
chr7	107002806	.	A	G	497.18	PASS	AF=0.559524;AO=47;DP=84;FAO=47;FDP=84;FR=.;FRO=37;FSAF=29;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=0.0114083;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.2736;QD=23.6753;RBI=0.0283298;REFB=-0.033845;REVB=-0.0259312;RO=37;SAF=29;SAR=18;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0637601;STB=0.53504;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.0274507;OID=.;OPOS=107002806;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:37:37:47:47:0.559524:18:29:20:17:18:29:20:17
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chr7	107208250	.	T	C	317.35	PASS	AF=0.532258;AO=30;DP=60;FAO=33;FDP=62;FR=.;FRO=29;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=0.0216457;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.118;QD=20.4744;RBI=0.021797;REFB=-0.0273522;REVB=-0.00256409;RO=30;SAF=16;SAR=14;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0906397;STB=0.521639;STBP=0.739;TYPE=snp;VARB=0.0268117;OID=.;OPOS=107208250;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:62:30:29:30:33:0.532258:14:16:19:11:14:19:18:11
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chr7	107414419	.	A	G	822.86	PASS	AF=1;AO=58;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0152157;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=236.973;QD=54.857;RBI=0.0155939;REFB=-0.0677191;REVB=0.00341339;RO=0;SAF=23;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000131344;OID=.;OPOS=107414419;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:60:60:0:0:58:60:1:35:23:0:0:37:23:0:0
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chr7	107569517	.	A	G	498.06	PASS	AF=0.50495;AO=51;DP=101;FAO=51;FDP=101;FR=.;FRO=50;FSAF=17;FSAR=34;FSRF=23;FSRR=27;FWDB=-0.00257692;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=258.328;QD=19.725;RBI=0.0055975;REFB=-0.0149186;REVB=-0.00496905;RO=50;SAF=17;SAR=34;SRF=23;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121518;STB=0.567349;STBP=0.175;TYPE=snp;VARB=0.0144499;OID=.;OPOS=107569517;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:101:50:50:51:51:0.50495:34:17:23:27:34:17:23:27
chr7	107593989	.	T	C	191.28	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00492478;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.929;QD=47.8206;RBI=0.00844424;REFB=0;REVB=0.00685943;RO=0;SAF=9;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.49972e-05;OID=.;OPOS=107593989;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:7:9:0:0:7:9:0:0
chr7	107603431	.	A	C	784.74	PASS	AF=0.506667;AO=75;DP=150;FAO=76;FDP=150;FR=.;FRO=74;FSAF=37;FSAR=39;FSRF=32;FSRR=42;FWDB=-0.021233;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.12;QD=20.9263;RBI=0.021725;REFB=-0.0160994;REVB=0.00459762;RO=73;SAF=37;SAR=38;SRF=31;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0616538;STB=0.526892;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.0152511;OID=.;OPOS=107603431;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:150:150:73:74:75:76:0.506667:38:37:31:42:39:37:32:42
chr7	107615506	.	C	T	303.31	PASS	AF=0.574468;AO=26;DP=46;FAO=27;FDP=47;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=3;FWDB=0.0360059;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.153;QD=25.8134;RBI=0.0360098;REFB=0.00576091;REVB=0.000529598;RO=20;SAF=12;SAR=14;SRF=17;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.300658;STB=0.668088;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=-0.00333224;OID=.;OPOS=107615506;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:47:20:20:26:27:0.574468:14:12:17:3:15:12:17:3
chr7	107626770	.	G	A	531.89	PASS	AF=0.543478;AO=50;DP=92;FAO=50;FDP=92;FR=.;FRO=42;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=19;FSRR=23;FWDB=0.00500594;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.206;QD=23.1256;RBI=0.00842571;REFB=-0.0134938;REVB=-0.0067774;RO=42;SAF=28;SAR=22;SRF=19;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0895569;STB=0.549239;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=0.0157401;OID=.;OPOS=107626770;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:42:42:50:50:0.543478:22:28:19:23:22:28:19:23
chr7	107640330	.	C	T	214.47	PASS	AF=0.431034;AO=25;DP=58;FAO=25;FDP=58;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=12;FWDB=0.0276142;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.592;QD=14.7909;RBI=0.0332634;REFB=-0.0143912;REVB=-0.0185447;RO=32;SAF=16;SAR=9;SRF=21;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0175422;STB=0.50224;STBP=0.976;TYPE=snp;VARB=0.0184287;OID=.;OPOS=107640330;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:32:33:25:25:0.431034:9:16:21:11:9:16:21:12
chr7	107642217	.	G	A	112.21	PASS	AF=0.481481;AO=13;DP=27;FAO=13;FDP=27;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.00523572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.154;QD=16.6238;RBI=0.0175696;REFB=-0.00878499;REVB=0.0167713;RO=14;SAF=6;SAR=7;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.034656;STB=0.519969;STBP=0.804;TYPE=snp;VARB=0.0134015;OID=.;OPOS=107642217;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:14:14:13:13:0.481481:7:6:7:7:7:6:7:7
chr7	107706895	.	T	C	512.12	PASS	AF=0.61039;AO=47;DP=78;FAO=47;FDP=77;FR=.;FRO=30;FSAF=31;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=10;FWDB=0.0094006;FXX=0.0128189;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.9383;QD=26.6038;RBI=0.0277534;REFB=-0.00860459;REVB=0.0261129;RO=30;SAF=31;SAR=16;SRF=20;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00564854;STB=0.503081;STBP=0.974;TYPE=snp;VARB=0.00252604;OID=.;OPOS=107706895;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:77:30:30:47:47:0.61039:16:31:20:10:16:31:20:10
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chr7	107738948	.	G	A	486.15	PASS	AF=0.418605;AO=54;DP=128;FAO=54;FDP=129;FR=.;FRO=75;FSAF=27;FSAR=27;FSRF=43;FSRR=32;FWDB=-0.0249056;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.761;QD=15.0744;RBI=0.0279032;REFB=-0.00798952;REVB=-0.0125818;RO=73;SAF=27;SAR=27;SRF=41;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0631956;STB=0.54262;STBP=0.421;TYPE=snp;VARB=0.0127685;OID=.;OPOS=107738948;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:128:129:73:75:54:54:0.418605:27:27:41:32:27:27:43:32
chr7	107743664	.	A	G	168.69	PASS	AF=0.428571;AO=18;DP=42;FAO=18;FDP=42;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=5;FWDB=0.0117829;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.381;QD=16.0653;RBI=0.0442442;REFB=0.00330176;REVB=-0.0426464;RO=23;SAF=8;SAR=10;SRF=19;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.366627;STB=0.692117;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=-0.00449821;OID=.;OPOS=107743664;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:23:24:18:18:0.428571:10:8:19:4:10:8:19:5
chr7	107745029	.	A	G	430.55	PASS	AF=0.5;AO=43;DP=86;FAO=43;FDP=86;FR=.;FRO=43;FSAF=14;FSAR=29;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=0.0100658;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.14;QD=20.0255;RBI=0.013274;REFB=-0.0155073;REVB=0.0086533;RO=43;SAF=14;SAR=29;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156374;STB=0.587003;STBP=0.124;TYPE=snp;VARB=0.0313961;OID=.;OPOS=107745029;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:43:43:43:43:0.5:29:14:21:22:29:14:21:22
chr7	107818851	.	T	C	670.14	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0122308;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=219.69;QD=62.3381;RBI=0.0373134;REFB=0;REVB=0.0352519;RO=0;SAF=21;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.09119e-05;OID=.;OPOS=107818851;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:43:0:0:42:43:1:21:21:0:0:21:22:0:0
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chr7	107824889	.	C	G	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0643592;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.427;QD=53.2757;RBI=0.0827303;REFB=0;REVB=0.0519827;RO=0;SAF=16;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00103164;OID=.;OPOS=107824889;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:7:16:0:0:7:16:0:0
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chr7	107849908	.	G	A,T	1504.28	PASS	AF=0.87963,0.111111;AO=90,12;DP=103;FAO=95,12;FDP=108;FR=.;FRO=1;FSAF=47,10;FSAR=48,2;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00284325,-0.00129286;FXX=0.0357111;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=102.08,155.08;QD=55.7139;RBI=0.040611,0.0207808;REFB=-0.0603735,0.00268311;REVB=0.0405113,-0.0207405;RO=1;SAF=47,10;SAR=43,2;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0108952,0.178334;STB=0.505154,0.599814;STBP=0.507,0.138;TYPE=snp,snp;VARB=-1.26297e-05,0.00886179;OID=.,.;OPOS=107849908,107849908;OREF=G,G;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:50:103:108:1:1:90,12:95,12:0.87963,0.111111:43,2:47,10:0:1:48,2:47,10:0:1
chr7	107849909	.	T	A	30.74	PASS	AF=0.0789474;AO=9;DP=114;FAO=9;FDP=114;FR=.;FRO=105;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=58;FSRR=47;FWDB=-0.0161448;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=89.9025;QD=1.07877;RBI=0.0566389;REFB=-0.00417746;REVB=0.0542891;RO=104;SAF=1;SAR=8;SRF=58;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.485199;STB=0.894782;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0263482;OID=.;OPOS=107849909;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:114:114:104:105:9:9:0.0789474:8:1:58:46:8:1:58:47
chr7	107875170	.	T	C	1124.28	PASS	AF=0.950617;AO=76;DP=81;FAO=77;FDP=81;FR=.;FRO=4;FSAF=43;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.00774351;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.54;QD=55.5202;RBI=0.00794328;REFB=-0.0400529;REVB=0.00177025;RO=3;SAF=43;SAR=33;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.016941;STB=0.515383;STBP=0.271;TYPE=snp;VARB=0.000147303;OID=.;OPOS=107875170;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:81:81:3:4:76:77:0.950617:33:43:1:2:34:43:1:3
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chr7	111367623	.	T	C	103.09	PASS	AF=0.302326;AO=13;DP=43;FAO=13;FDP=43;FR=.;FRO=30;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=9;FWDB=0.0118659;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.499;QD=9.58987;RBI=0.0118909;REFB=-0.00121163;REVB=-0.000770212;RO=30;SAF=4;SAR=9;SRF=21;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.431587;STB=0.757213;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.00661965;OID=.;OPOS=111367623;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:30:30:13:13:0.302326:9:4:21:9:9:4:21:9
chr7	112097121	.	C	T	349.24	PASS	AF=0.521739;AO=36;DP=69;FAO=36;FDP=69;FR=.;FRO=33;FSAF=9;FSAR=27;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=0.00188902;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.388;QD=20.246;RBI=0.00212769;REFB=-0.0177287;REVB=0.000979105;RO=33;SAF=9;SAR=27;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.206564;STB=0.615316;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=0.0123213;OID=.;OPOS=112097121;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:33:33:36:36:0.521739:27:9:15:18:27:9:15:18
chr7	112101907	.	ATTTT	ATATT,A,AT,ATT,ATTT	618.63	PASS	AF=0.154762,0,0.440476,0.214286,0.190476;AO=9,10,22,12,10;DP=95;FAO=13,0,37,18,16;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=6,0,21,11,12;FSAR=7,0,16,7,4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00780823,0.0553311,0.0756434,0.115685,0.20869;FXX=0.1683;HRUN=11,11,11,11,11;LEN=1,4,3,2,1;MLLD=144.618,13.6537,12.3044,9.47195,5.17822;QD=29.4585;RBI=0.175943,0.124158,0.162809,0.230251,0.460516;REFB=-0.00978381,-0.0193911,-0.0245718,-0.0304262,-0.0437571;REVB=-0.17577,-0.111147,-0.144169,-0.19908,-0.410516;RO=11;SAF=5,4,13,8,9;SAR=4,6,9,4,1;SRF=10;SRR=1;SSEN=0,0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0,0;SSSB=-0.358971,-0.43747,-0.208769,-0.253613,-0.0231438;STB=0.5,0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1,1,1;TYPE=snp,del,del,del,del;VARB=0.0109511,0.0682823,0.0131017,0.0736214,0.115835;OID=.,.,.,.,.;OPOS=112101909,112101908,112101908,112101908,112101908;OREF=T,TTTT,TTT,TT,T;OALT=A,-,-,-,-;OMAPALT=ATATT,A,AT,ATT,ATTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/3:0.154762,0,0.440476,0.214286,0.190476:9,10,22,12,10:95:13,0,37,18,16:84:0:6,0,21,11,12:7,0,16,7,4:0:0:92:11:5,4,13,8,9:4,6,9,4,1:10:1
chr7	112107999	.	T	C	342.78	PASS	AF=0.546875;AO=35;DP=64;FAO=35;FDP=64;FR=.;FRO=29;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=0.00734867;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.4846;QD=21.4237;RBI=0.0395052;REFB=-0.00900062;REVB=0.0388156;RO=27;SAF=18;SAR=17;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0326418;STB=0.532658;STBP=0.569;TYPE=snp;VARB=0.0141828;OID=.;OPOS=112107999;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:27:29:35:35:0.546875:17:18:15:12:17:18:17:12
chr7	112406504	.	A	C	171.06	PASS	AF=0.392157;AO=20;DP=52;FAO=20;FDP=51;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=23;FWDB=0.00325081;FXX=0.0192271;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.9084;QD=13.4164;RBI=0.0867078;REFB=-0.0177998;REVB=0.0866468;RO=31;SAF=9;SAR=11;SRF=8;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.21113;STB=0.620579;STBP=0.22;TYPE=snp;VARB=0.0290469;OID=.;OPOS=112406504;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:51:31:31:20:20:0.392157:11:9:8:23:11:9:8:23
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chr7	112724417	.	A	G	624.88	PASS	AF=0.97619;AO=41;DP=43;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00504145;FXX=0.0232504;HRUN=3;LEN=1;MLLD=67.9805;QD=59.5119;RBI=0.0225935;REFB=-0.142494;REVB=0.0220238;RO=1;SAF=15;SAR=26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0177076;STB=0.509429;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=0.00360615;OID=.;OPOS=112724417;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:43:42:1:1:41:41:0.97619:26:15:0:1:26:15:0:1
chr7	112724525	.	A	G	429.02	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0294151;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.749;QD=57.2025;RBI=0.0337068;REFB=0;REVB=0.0164589;RO=0;SAF=14;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.56309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000202228;OID=.;OPOS=112724525;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:16:14:0:0:16:14:0:0
chr7	113091231	.	A	G	209.68	PASS	AF=0.466667;AO=21;DP=45;FAO=21;FDP=45;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.0141467;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=149.607;QD=18.6381;RBI=0.0258008;REFB=-0.0167456;REVB=-0.0215766;RO=24;SAF=13;SAR=8;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.19106;STB=0.608407;STBP=0.192;TYPE=snp;VARB=0.0175193;OID=.;OPOS=113091231;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:24:24:21:21:0.466667:8:13:10:14:8:13:10:14
chr7	113518434	.	C	A	82.32	PASS	AF=0.588235;AO=10;DP=17;FAO=10;FDP=17;FR=.;FRO=7;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.025616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.9862;QD=19.369;RBI=0.0320506;REFB=0.00255814;REVB=0.019263;RO=7;SAF=6;SAR=4;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123877;STB=0.571284;STBP=0.554;TYPE=snp;VARB=-0.00405764;OID=.;OPOS=113518434;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:17:17:7:7:10:10:0.588235:4:6:3:4:4:6:3:4
chr7	113518502	.	A	T	726.88	PASS	AF=1;AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00168338;FXX=0.0192271;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.939;QD=57.0101;RBI=0.0172366;REFB=0;REVB=-0.0171542;RO=0;SAF=26;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94283e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.98106e-05;OID=.;OPOS=113518502;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:51:0:0:51:51:1:25:26:0:0:25:26:0:0
chr7	113519719	.	A	T	1256.4	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.018768;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=301.705;QD=61.2878;RBI=0.0230285;REFB=0;REVB=0.0133444;RO=0;SAF=31;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.29578e-05;OID=.;OPOS=113519719;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:75:82:0:0:75:82:1:44:31:0:0:47:35:0:0
chr7	113519796	.	C	T	708.54	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0227359;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.143;QD=62.9815;RBI=0.0238899;REFB=0;REVB=0.00733534;RO=0;SAF=25;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.09779e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.09958e-05;OID=.;OPOS=113519796;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:20:25:0:0:20:25:0:0
chr7	114296545	.	A	C	417.71	PASS	AF=0.554054;AO=41;DP=74;FAO=41;FDP=74;FR=.;FRO=33;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=10;FSRR=23;FWDB=-0.0381419;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.6111;QD=22.5787;RBI=0.0796988;REFB=0.000524875;REVB=0.0699793;RO=33;SAF=20;SAR=21;SRF=10;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150713;STB=0.582742;STBP=0.128;TYPE=snp;VARB=0.000118565;OID=.;OPOS=114296545;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:33:33:41:41:0.554054:21:20:10:23:21:20:10:23
chr7	114296590	.	A	C	195.07	PASS	AF=0.418182;AO=23;DP=56;FAO=23;FDP=55;FR=.;FRO=32;FSAF=1;FSAR=22;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=0.0724076;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.275;QD=14.1871;RBI=0.0732675;REFB=-0.000160956;REVB=0.0111926;RO=32;SAF=1;SAR=22;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.686385;STB=0.907302;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.000495917;OID=.;OPOS=114296590;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:55:32:32:23:23:0.418182:22:1:16:16:22:1:16:16
chr7	114619598	.	C	A	167.48	PASS	AF=0.9375;AO=15;DP=16;FAO=15;FDP=16;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0267426;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=274.906;QD=41.8703;RBI=0.0275126;REFB=-0.0921992;REVB=0.00646352;RO=1;SAF=9;SAR=6;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0699995;STB=0.53841;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=0.00116571;OID=.;OPOS=114619598;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:16:16:1:1:15:15:0.9375:6:9:0:1:6:9:0:1
chr7	115578124	.	G	T	1011.64	PASS	AF=1;AO=68;DP=69;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0115356;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.0106;QD=59.5083;RBI=0.0771513;REFB=0;REVB=-0.076284;RO=0;SAF=47;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000414203;OID=.;OPOS=115578124;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:69:68:0:0:68:68:1:21:47:0:0:21:47:0:0
chr7	115892650	.	T	G	303.06	PASS	AF=0.409639;AO=34;DP=83;FAO=34;FDP=83;FR=.;FRO=49;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=34;FWDB=-0.00989019;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=227.27;QD=14.6054;RBI=0.010047;REFB=-0.00281412;REVB=0.00176824;RO=49;SAF=14;SAR=20;SRF=15;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116643;STB=0.565831;STBP=0.361;TYPE=snp;VARB=0.00481292;OID=.;OPOS=115892650;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:49:49:34:34:0.409639:20:14:15:34:20:14:15:34
chr7	115897392	.	G	C	314.84	PASS	AF=0.411765;AO=35;DP=85;FAO=35;FDP=85;FR=.;FRO=50;FSAF=9;FSAR=26;FSRF=23;FSRR=27;FWDB=-0.00560775;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=210.479;QD=14.8159;RBI=0.00835868;REFB=-0.00742625;REVB=-0.00619844;RO=50;SAF=9;SAR=26;SRF=23;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.237383;STB=0.635517;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=0.0104465;OID=.;OPOS=115897392;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:50:50:35:35:0.411765:26:9:23:27:26:9:23:27
chr7	116165360	.	A	C,G	689.5	PASS	AF=0.96,0.04;AO=46,3;DP=51;FAO=48,2;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=27,2;FSAR=21,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0134825,-0.00514659;FXX=0.019604;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=98.351,173.274;QD=55.1599;RBI=0.0322762,0.00554521;REFB=0,0;REVB=0.0293253,0.00206446;RO=1;SAF=27,2;SAR=19,1;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0240991,0.266641;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00113583,0.0492773;OID=.,.;OPOS=116165360,116165360;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:51:50:1:0:46,3:48,2:0.96,0.04:19,1:27,2:0:1:21,0:27,2:0:0
chr7	116165463	.	T	C	625.32	PASS	AF=0.976744;AO=40;DP=41;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0474742;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.2867;QD=58.1688;RBI=0.0529424;REFB=0.00252669;REVB=0.0234329;RO=1;SAF=30;SAR=10;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0445938;STB=0.521729;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.000809838;OID=.;OPOS=116165463;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:41:43:1:1:40:42:0.976744:10:30:0:1:11:31:0:1
chr7	116397572	.	A	G	413.44	PASS	AF=0.445545;AO=45;DP=101;FAO=45;FDP=101;FR=.;FRO=56;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=25;FSRR=31;FWDB=-0.00534642;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.267;QD=16.374;RBI=0.0083967;REFB=-0.0238509;REVB=-0.00647459;RO=56;SAF=23;SAR=22;SRF=25;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0639926;STB=0.535808;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=0.0271246;OID=.;OPOS=116397572;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:101:56:56:45:45:0.445545:22:23:25:31:22:23:25:31
chr7	116437606	.	G	A	522.21	PASS	AF=0.419118;AO=57;DP=136;FAO=57;FDP=136;FR=.;FRO=79;FSAF=26;FSAR=31;FSRF=49;FSRR=30;FWDB=-0.0127054;FXX=0.00729874;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.875;QD=15.3591;RBI=0.0142391;REFB=-0.00512961;REVB=0.00642863;RO=79;SAF=26;SAR=31;SRF=49;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168653;STB=0.594445;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=0.0063;OID=.;OPOS=116437606;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:136:136:79:79:57:57:0.419118:31:26:49:30:31:26:49:30
chr7	116528240	.	C	T	241.91	PASS	AF=0.41791;AO=28;DP=67;FAO=28;FDP=67;FR=.;FRO=39;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=-0.00252528;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.462;QD=14.4422;RBI=0.0153967;REFB=-0.00163364;REVB=-0.0151882;RO=39;SAF=14;SAR=14;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0131215;STB=0.507457;STBP=0.945;TYPE=snp;VARB=0.00195453;OID=.;OPOS=116528240;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:39:39:28:28:0.41791:14:14:20:19:14:14:20:19
chr7	116596697	.	A	G	1499.82	PASS	AF=1;AO=100;DP=101;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0186028;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.857;QD=59.9927;RBI=0.019276;REFB=0;REVB=0.00504972;RO=0;SAF=46;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.21299e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000134887;OID=.;OPOS=116596697;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:101:100:0:0:100:100:1:54:46:0:0:54:46:0:0
chr7	116598735	.	A	G	1480.47	PASS	AF=0.990099;AO=100;DP=101;FAO=100;FDP=101;FR=.;FRO=1;FSAF=59;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.009409;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.021;QD=58.6326;RBI=0.049759;REFB=-0.172124;REVB=0.0488613;RO=1;SAF=59;SAR=41;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0114294;STB=0.506023;STBP=0.252;TYPE=snp;VARB=0.00127816;OID=.;OPOS=116598735;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:101:101:1:1:100:100:0.990099:41:59:0:1:41:59:0:1
chr7	116608501	.	A	G	2160.82	PASS	AF=0.529563;AO=206;DP=390;FAO=206;FDP=389;FR=.;FRO=183;FSAF=90;FSAR=116;FSRF=83;FSRR=100;FWDB=-0.00454562;FXX=0.00256404;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.255;QD=22.2192;RBI=0.00529635;REFB=-0.0169737;REVB=0.00271821;RO=181;SAF=90;SAR=116;SRF=83;SRR=98;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.018856;STB=0.507947;STBP=0.726;TYPE=snp;VARB=0.0139305;OID=.;OPOS=116608501;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:390:389:181:183:206:206:0.529563:116:90:83:98:116:90:83:100
chr7	117188736	.	C	A	34.36	PASS	AF=0.2;AO=5;DP=30;FAO=6;FDP=30;FR=.;FRO=24;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=-0.0031532;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.846;QD=4.58151;RBI=0.00987425;REFB=-0.00751026;REVB=0.00935725;RO=23;SAF=3;SAR=2;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190883;STB=0.566449;STBP=0.754;TYPE=snp;VARB=0.0230197;OID=.;OPOS=117188736;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:30:30:23:24:5:6:0.2:2:3:10:13:3:3:10:14
chr7	117865028	.	G	A	325.98	PASS	AF=0.636364;AO=28;DP=44;FAO=28;FDP=44;FR=.;FRO=16;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=3;FWDB=0.0110605;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.169;QD=29.6346;RBI=0.0337888;REFB=-0.00423701;REVB=0.0319272;RO=16;SAF=14;SAR=14;SRF=13;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.207627;STB=0.613559;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.00262318;OID=.;OPOS=117865028;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:16:16:28:28:0.636364:14:14:13:3:14:14:13:3
chr7	120428799	.	C	A	1406.86	PASS	AF=0.939394;AO=93;DP=100;FAO=93;FDP=99;FR=.;FRO=6;FSAF=49;FSAR=44;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.00680968;FXX=0.009999;HRUN=4;LEN=1;MLLD=170.546;QD=56.843;RBI=0.028671;REFB=-0.0374342;REVB=0.0278505;RO=4;SAF=49;SAR=44;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0174926;STB=0.51866;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.000364589;OID=.;OPOS=120428799;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:17:100:99:4:6:93:93:0.939394:44:49:3:1:44:49:5:1
chr7	120704289	.	C	T	823.85	PASS	AF=1;AO=57;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00598814;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.46;QD=56.8171;RBI=0.00852073;REFB=0;REVB=-0.00606176;RO=0;SAF=25;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.85828e-06;OID=.;OPOS=120704289;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:57:58:1:32:25:0:0:32:26:0:0
chr7	120740103	.	G	T	2221.79	PASS	AF=0.992958;AO=141;DP=143;FAO=141;FDP=142;FR=.;FRO=1;FSAF=61;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00970459;FXX=0.00699252;HRUN=3;LEN=1;MLLD=103.721;QD=62.5856;RBI=0.0111439;REFB=0.0112332;REVB=0.00547795;RO=1;SAF=61;SAR=80;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00590683;STB=0.503105;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=-4.51015e-05;OID=.;OPOS=120740103;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:143:142:1:1:141:141:0.992958:80:61:0:1:80:61:0:1
chr7	120764477	.	G	C	411.13	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0459381;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.9104;QD=56.708;RBI=0.0459414;REFB=0;REVB=-0.000548184;RO=0;SAF=18;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00107554;OID=.;OPOS=120764477;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:29:0:0:28:29:1:10:18:0:0:10:19:0:0
chr7	120765954	.	T	C	902.68	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00775501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.636;QD=58.2373;RBI=0.0260371;REFB=0;REVB=0.0248554;RO=0;SAF=26;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51662e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.69106e-05;OID=.;OPOS=120765954;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:36:26:0:0:36:26:0:0
chr7	120773954	.	A	G	393.29	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0334919;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=129.131;QD=56.1844;RBI=0.0346104;REFB=0;REVB=0.00872783;RO=0;SAF=15;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000153229;OID=.;OPOS=120773954;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:13:15:0:0:13:15:0:0
chr7	120776097	.	C	G	447.03	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000434569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=317.658;QD=57.6807;RBI=0.00183507;REFB=0;REVB=-0.00178287;RO=0;SAF=13;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.33668e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.23242e-06;OID=.;OPOS=120776097;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:18:13:0:0:18:13:0:0
chr7	121616250	.	G	A	555.13	PASS	AF=0.525253;AO=52;DP=99;FAO=52;FDP=99;FR=.;FRO=47;FSAF=29;FSAR=23;FSRF=12;FSRR=35;FWDB=-0.00521142;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.552;QD=22.4294;RBI=0.00546627;REFB=0.00171047;REVB=0.0016496;RO=47;SAF=29;SAR=23;SRF=12;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.256582;STB=0.64071;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=-0.00175199;OID=.;OPOS=121616250;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:47:47:52:52:0.525253:23:29:12:35:23:29:12:35
chr7	121653374	.	GTGA	G	105.9	PASS	AF=0.433333;AO=11;DP=31;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=-0.0180329;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=214.309;QD=14.1195;RBI=0.0634647;REFB=-0.0159889;REVB=-0.0608488;RO=14;SAF=11;SAR=0;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.80922;STB=0.807397;STBP=0.008;TYPE=del;VARB=0.0284389;OID=.;OPOS=121653375;OREF=TGA;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.433333:11:31:13:30:17:11:2:6:11:99:14:11:0:6:8
chr7	121653398	.	G	A	223.87	PASS	AF=0.478261;AO=22;DP=46;FAO=22;FDP=46;FR=.;FRO=24;FSAF=19;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=0.000404583;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.964;QD=19.4668;RBI=0.0175439;REFB=-0.00189792;REVB=-0.0175392;RO=23;SAF=19;SAR=3;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.538877;STB=0.816422;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.00121666;OID=.;OPOS=121653398;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:23:24:22:22:0.478261:3:19:8:15:3:19:8:16
chr7	122078414	.	T	G	693.62	PASS	AF=0.489362;AO=69;DP=141;FAO=69;FDP=141;FR=.;FRO=72;FSAF=44;FSAR=25;FSRF=38;FSRR=34;FWDB=-0.00148525;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.187;QD=19.6772;RBI=0.0266185;REFB=-0.0123368;REVB=0.0265771;RO=71;SAF=44;SAR=25;SRF=37;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111716;STB=0.558743;STBP=0.188;TYPE=snp;VARB=0.0126633;OID=.;OPOS=122078414;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:141:141:71:72:69:69:0.489362:25:44:37:34:25:44:38:34
chr7	122303321	.	C	T	873.0	PASS	AF=1;AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00274556;FXX=0.0163908;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.525;QD=58.1998;RBI=0.00906096;REFB=0;REVB=-0.00863499;RO=0;SAF=23;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.03034e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.02632e-05;OID=.;OPOS=122303321;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:60:0:0:60:60:1:37:23:0:0:37:23:0:0
chr7	122635024	.	C	T	689.12	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0162512;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.818;QD=62.647;RBI=0.0262406;REFB=0;REVB=-0.0206026;RO=0;SAF=25;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000170977;OID=.;OPOS=122635024;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:19:25:0:0:19:25:0:0
chr7	123097468	.	T	C	1515.01	PASS	AF=0.989691;AO=96;DP=97;FAO=96;FDP=97;FR=.;FRO=1;FSAF=65;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00418685;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.4705;QD=62.4748;RBI=0.00473809;REFB=0.0122731;REVB=0.00221806;RO=1;SAF=65;SAR=31;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00724091;STB=0.503816;STBP=0.609;TYPE=snp;VARB=-0.000423854;OID=.;OPOS=123097468;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:97:97:1:1:96:96:0.989691:31:65:1:0:31:65:1:0
chr7	123119990	.	T	C	1291.22	PASS	AF=0.988235;AO=84;DP=86;FAO=84;FDP=85;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00564112;FXX=0.0116266;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.66;QD=60.7634;RBI=0.0107832;REFB=-0.108388;REVB=0.00918999;RO=1;SAF=45;SAR=39;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0119907;STB=0.506328;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=4.36712e-05;OID=.;OPOS=123119990;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:86:85:1:1:84:84:0.988235:39:45:0:1:39:45:0:1
chr7	123152019	.	C	T	429.02	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0218364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.705;QD=57.2024;RBI=0.0227431;REFB=0;REVB=-0.00635778;RO=0;SAF=14;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.56309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000115015;OID=.;OPOS=123152019;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:16:14:0:0:16:14:0:0
chr7	123152035	.	T	C	453.64	PASS	AF=0.969697;AO=30;DP=32;FAO=32;FDP=33;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0142584;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.134;QD=54.9866;RBI=0.0247821;REFB=-0.0264462;REVB=0.0202694;RO=1;SAF=16;SAR=14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0282472;STB=0.515142;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.00301575;OID=.;OPOS=123152035;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:32:33:1:1:30:32:0.969697:14:16:1:0:16:16:1:0
chr7	123256427	.	C	T	739.06	PASS	AF=0.981481;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0820066;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.2306;QD=54.7453;RBI=0.0860913;REFB=-0.0222826;REVB=-0.0262036;RO=0;SAF=28;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5098;STBP=0.33;TYPE=snp;VARB=0.00290747;OID=.;OPOS=123256427;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:54:54:0:1:53:53:0.981481:25:28:0:0:25:28:0:1
chr7	123264804	.	C	T	1610.38	PASS	AF=1;AO=106;DP=107;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.01159;FXX=0.0092584;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.057;QD=60.2011;RBI=0.0152524;REFB=0;REVB=-0.00991505;RO=0;SAF=59;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000304298;OID=.;OPOS=123264804;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:107:107:0:0:106:107:1:47:59:0:0:47:60:0:0
chr7	123269118	.	G	C	769.34	PASS	AF=1;AO=52;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.047737;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.0962;QD=56.988;RBI=0.0523326;REFB=0;REVB=-0.0214447;RO=2;SAF=23;SAR=29;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0392057;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000898623;OID=.;OPOS=123269118;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:2:0:52:54:1:29:23:2:0:29:25:0:0
chr7	123301940	.	A	G	809.14	PASS	AF=0.966667;AO=58;DP=60;FAO=58;FDP=60;FR=.;FRO=2;FSAF=32;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.000479942;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.7092;QD=53.9428;RBI=0.0153348;REFB=-0.0876612;REVB=0.0153273;RO=1;SAF=32;SAR=26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0177973;STB=0.518512;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.00798745;OID=.;OPOS=123301940;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:60:60:1:2:58:58:0.966667:26:32:0:1:26:32:0:2
chr7	123321978	.	C	A	609.72	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0217763;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=301.454;QD=60.9719;RBI=0.0271123;REFB=0;REVB=0.0161514;RO=0;SAF=22;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.82408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.72316e-05;OID=.;OPOS=123321978;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:40:0:0:37:40:1:15:22:0:0:17:23:0:0
chr7	123324545	.	AAAT	AA,A	255.62	PASS	AF=0.725,0;AO=18,7;DP=33;FAO=29,0;FDP=40;FR=.;FRO=11;FSAF=21,0;FSAR=8,0;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.0454764,-0.0427927;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=2,3;MLLD=107.834,102.319;QD=25.562;RBI=0.047661,0.0438375;REFB=-0.0587932,-0.0669672;REVB=0.0142642,0.00951368;RO=1;SAF=15,3;SAR=3,4;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0296514,-0.124421;STB=0.585595,0.5;STBP=0.105,1;TYPE=del,del;VARB=0.0520719,0.0545517;OID=.,.;OPOS=123324547,123324546;OREF=AT,AAT;OALT=-,-;OMAPALT=AA,A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.725,0:18,7:33:29,0:40:11:21,0:8,0:5:6:54:1:15,3:3,4:1:0
chr7	123388732	.	G	A	2972.65	PASS	AF=0.9801;AO=197;DP=201;FAO=197;FDP=201;FR=.;FRO=4;FSAF=90;FSAR=107;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0119797;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=211.786;QD=59.1572;RBI=0.0125522;REFB=-0.119931;REVB=0.00374753;RO=3;SAF=90;SAR=107;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00603445;STB=0.500865;STBP=0.902;TYPE=snp;VARB=0.000614816;OID=.;OPOS=123388732;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:201:201:3:4:197:197:0.9801:107:90:2:1:107:90:2:2
chr7	123594206	.	G	A	1307.11	PASS	AF=1;AO=83;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0314712;FXX=0.0117633;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.5822;QD=62.2435;RBI=0.0327513;REFB=0;REVB=0.00906685;RO=0;SAF=39;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.03564e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00060598;OID=.;OPOS=123594206;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:84:0:0:83:84:1:44:39:0:0:45:39:0:0
chr7	124116470	.	A	G	216.27	PASS	AF=0.689655;AO=19;DP=29;FAO=20;FDP=29;FR=.;FRO=9;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.011008;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.8919;QD=29.8308;RBI=0.0534711;REFB=-0.0189737;REVB=0.0523257;RO=9;SAF=9;SAR=10;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111661;STB=0.566944;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=0.0146257;OID=.;OPOS=124116470;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:29:29:9:9:19:20:0.689655:10:9:6:3:11:9:6:3
chr7	124387092	.	C	G	295.67	PASS	AF=0.484848;AO=32;DP=66;FAO=32;FDP=66;FR=.;FRO=34;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=10;FWDB=-0.00833699;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.4434;QD=17.9195;RBI=0.0228457;REFB=0.00757154;REVB=0.0212702;RO=34;SAF=18;SAR=14;SRF=24;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137299;STB=0.576425;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=-0.00878551;OID=.;OPOS=124387092;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:34:34:32:32:0.484848:14:18:24:10:14:18:24:10
chr7	124486980	.	T	C	369.0	PASS	AF=0.443182;AO=39;DP=88;FAO=39;FDP=88;FR=.;FRO=49;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=30;FSRR=19;FWDB=0.0150789;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.409;QD=16.7725;RBI=0.0246402;REFB=-0.0215962;REVB=0.0194876;RO=49;SAF=23;SAR=16;SRF=30;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0231709;STB=0.513;STBP=0.849;TYPE=snp;VARB=0.0333249;OID=.;OPOS=124486980;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:49:49:39:39:0.443182:16:23:30:19:16:23:30:19
chr7	124540841	.	A	C	277.34	PASS	AF=0.595238;AO=25;DP=42;FAO=25;FDP=42;FR=.;FRO=17;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.00299331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.56;QD=26.413;RBI=0.0261087;REFB=-0.0109745;REVB=-0.0259365;RO=17;SAF=16;SAR=9;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12867;STB=0.57137;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=0.0032952;OID=.;OPOS=124540841;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:17:17:25:25:0.595238:9:16:8:9:9:16:8:9
chr7	124540872	.	C	T	319.45	PASS	AF=0.532258;AO=33;DP=62;FAO=33;FDP=62;FR=.;FRO=29;FSAF=23;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=-0.0131077;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.076;QD=20.6094;RBI=0.0276827;REFB=-0.0109348;REVB=0.0243828;RO=29;SAF=23;SAR=10;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194673;STB=0.608397;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=0.00881682;OID=.;OPOS=124540872;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:29:29:33:33:0.532258:10:23:14:15:10:23:14:15
chr7	127222157	.	G	A	754.36	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0229803;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.1437;QD=56.9327;RBI=0.023011;REFB=0;REVB=-0.00118748;RO=0;SAF=20;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.88914e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00023613;OID=.;OPOS=127222157;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:33:20:0:0:33:20:0:0
chr7	127224286	.	A	G	670.82	PASS	AF=0.978261;AO=43;DP=44;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00309163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.706;QD=58.3319;RBI=0.00364198;REFB=-0.106208;REVB=-0.00192504;RO=1;SAF=25;SAR=18;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0253725;STB=0.512815;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.000685753;OID=.;OPOS=127224286;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:44:46:1:1:43:45:0.978261:18:25:0:1:19:26:0:1
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chr7	128038555	.	C	G	281.25	PASS	AF=0.54717;AO=29;DP=53;FAO=29;FDP=53;FR=.;FRO=24;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=0.0326649;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.553;QD=21.2262;RBI=0.0357417;REFB=-0.0164184;REVB=0.0145077;RO=24;SAF=15;SAR=14;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0140682;STB=0.507807;STBP=0.959;TYPE=snp;VARB=0.0126747;OID=.;OPOS=128038555;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:24:24:29:29:0.54717:14:15:12:12:14:15:12:12
chr7	128098071	.	G	A	277.75	PASS	AF=0.415584;AO=31;DP=77;FAO=32;FDP=77;FR=.;FRO=45;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=19;FSRR=26;FWDB=0.0152094;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.8167;QD=14.4285;RBI=0.0199845;REFB=-0.00605544;REVB=0.0129635;RO=45;SAF=12;SAR=19;SRF=19;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.038119;STB=0.528992;STBP=0.688;TYPE=snp;VARB=0.0114092;OID=.;OPOS=128098071;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:45:45:31:32:0.415584:19:12:19:26:20:12:19:26
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chr7	128098268	.	GT	G	552.52	PASS	AF=1;AO=47;DP=49;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.048053;FXX=0.039992;HRUN=2;LEN=1;MLLD=24.8984;QD=46.0429;RBI=0.0969757;REFB=0;REVB=0.084233;RO=0;SAF=37;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00356753;OID=.;OPOS=128098269;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:47:49:48:48:0:37:11:0:0:10:0:37:10:0:0
chr7	128117227	.	G	A	263.67	PASS	AF=0.517857;AO=28;DP=55;FAO=29;FDP=56;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=23;FSRF=7;FSRR=20;FWDB=-0.02041;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.9673;QD=18.8337;RBI=0.0212151;REFB=0.0336955;REVB=-0.00578898;RO=27;SAF=6;SAR=22;SRF=7;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0563361;STB=0.536778;STBP=0.616;TYPE=snp;VARB=-0.0321222;OID=.;OPOS=128117227;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:56:27:27:28:29:0.517857:22:6:7:20:23:6:7:20
chr7	128133984	.	G	A	651.23	PASS	AF=1;AO=41;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0273042;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.639;QD=62.0217;RBI=0.02885;REFB=0;REVB=-0.00931709;RO=0;SAF=19;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.20393e-05;OID=.;OPOS=128133984;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:41:42:1:22:19:0:0:23:19:0:0
chr7	128141865	.	T	C	1018.12	PASS	AF=1;AO=67;DP=68;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0163362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.055;QD=59.0212;RBI=0.0192721;REFB=0;REVB=-0.0102245;RO=0;SAF=38;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.87817e-05;OID=.;OPOS=128141865;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:68:69:0:0:67:69:1:29:38:0:0:29:40:0:0
chr7	128292036	.	G	C	30.99	PASS	AF=0.5;AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.0372738;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.6677;QD=12.3958;RBI=0.0691217;REFB=0.0534845;REVB=0.0582106;RO=5;SAF=1;SAR=4;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.363118;STB=0.726279;STBP=0.238;TYPE=snp;VARB=-0.0471565;OID=.;OPOS=128292036;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:27:10:10:5:5:5:5:0.5:4:1:3:2:4:1:3:2
chr7	128312450	.	C	T	108.0	PASS	AF=0.393939;AO=13;DP=33;FAO=13;FDP=33;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=1;FWDB=-0.00595363;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.783;QD=13.0911;RBI=0.0092437;REFB=-0.00302227;REVB=0.00707109;RO=20;SAF=5;SAR=8;SRF=19;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.550786;STB=0.809783;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.00633378;OID=.;OPOS=128312450;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:20:20:13:13:0.393939:8:5:19:1:8:5:19:1
chr7	128315791	.	C	G	152.19	PASS	AF=0.354167;AO=17;DP=49;FAO=17;FDP=48;FR=.;FRO=31;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=-0.024741;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.9388;QD=12.6823;RBI=0.024759;REFB=0.000236093;REVB=-0.000943567;RO=31;SAF=5;SAR=12;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.255817;STB=0.650978;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=-0.000412924;OID=.;OPOS=128315791;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:48:31:31:17:17:0.354167:12:5:16:15:12:5:16:15
chr7	128315882	.	C	A	67.96	PASS	AF=0.473684;AO=9;DP=19;FAO=9;FDP=19;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.0435042;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.7318;QD=14.3076;RBI=0.0487787;REFB=-0.00438143;REVB=0.0220624;RO=10;SAF=6;SAR=3;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.322491;STB=0.689242;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.0210921;OID=.;OPOS=128315882;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:19:19:10:10:9:9:0.473684:3:6:3:7:3:6:3:7
chr7	128317658	.	C	T	352.64	PASS	AF=0.583333;AO=35;DP=61;FAO=35;FDP=60;FR=.;FRO=25;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=0.00471924;FXX=0.0163908;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.872;QD=23.509;RBI=0.0110424;REFB=-2.51397e-05;REVB=-0.00998318;RO=25;SAF=18;SAR=17;SRF=8;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146805;STB=0.5806;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=-8.3297e-06;OID=.;OPOS=128317658;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:60:25:25:35:35:0.583333:17:18:8:17:17:18:8:17
chr7	128323034	.	A	G	71.66	PASS	AF=0.6;AO=9;DP=15;FAO=9;FDP=15;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.0105397;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.9673;QD=19.1083;RBI=0.0318936;REFB=0.0533589;REVB=0.0301017;RO=6;SAF=5;SAR=4;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.038662;STB=0.522338;STBP=0.934;TYPE=snp;VARB=-0.019883;OID=.;OPOS=128323034;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:15:15:6:6:9:9:0.6:4:5:3:3:4:5:3:3
chr7	128359133	.	C	T	519.66	PASS	AF=1;AO=34;DP=38;FAO=35;FDP=35;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0676119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=48.3911;QD=59.3893;RBI=0.0741104;REFB=0;REVB=0.0303478;RO=0;SAF=14;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.48532e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00202167;OID=.;OPOS=128359133;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:35:0:0:34:35:1:20:14:0:0:19:16:0:0
chr7	128364894	.	AA	AG,GC	989.85	PASS	AF=0.955882,0.0441176;AO=65,3;DP=68;FAO=65,3;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=31,0;FSAR=34,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0469135,-0.0190605;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=1,2;MLLD=119.262,76.4674;QD=58.2264;RBI=0.0502247,0.0233769;REFB=0,0;REVB=0.0179345,0.0135343;RO=0;SAF=31,0;SAR=34,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=4.90682e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.00203279,-0.00990117;OID=.,.;OPOS=128364895,128364894;OREF=A,AA;OALT=G,GC;OMAPALT=AG,GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:68:68:0:0:65,3:65,3:0.955882,0.0441176:34,3:31,0:0:0:34,3:31,0:0:0
chr7	128371206	.	G	A	1153.6	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00689361;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.136;QD=60.7156;RBI=0.0127659;REFB=0;REVB=0.0107446;RO=0;SAF=35;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.01083e-05;OID=.;OPOS=128371206;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:41:35:0:0:41:35:0:0
chr7	128451353	.	C	CAGAGAGCCTGGGA	171.09	PASS	AF=0.439024;AO=18;DP=41;FAO=18;FDP=41;FR=.;FRO=23;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=0.0148949;FXX=0.0238039;HRUN=2;LEN=13;MLLD=441.638;QD=16.6919;RBI=0.0153738;REFB=-0.00657694;REVB=0.00380733;RO=23;SAF=13;SAR=5;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.369579;STB=0.71209;STBP=0.026;TYPE=ins;VARB=0.0111424;OID=.;OPOS=128451354;OREF=-;OALT=AGAGAGCCTGGGA;OMAPALT=CAGAGAGCCTGGGA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.439024:18:41:18:41:23:13:5:8:15:99:23:13:5:8:15
chr7	128455767	.	C	G	323.47	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00574583;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=307.898;QD=53.9112;RBI=0.00579775;REFB=0;REVB=0.000774153;RO=0;SAF=3;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.86584e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.47913e-06;OID=.;OPOS=128455767;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:21:3:0:0:21:3:0:0
chr7	128455916	.	G	A	223.59	PASS	AF=0.617647;AO=21;DP=34;FAO=21;FDP=34;FR=.;FRO=13;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.00926198;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.2633;QD=26.305;RBI=0.0430327;REFB=-0.0200051;REVB=0.0420242;RO=13;SAF=11;SAR=10;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0101145;STB=0.505613;STBP=0.945;TYPE=snp;VARB=0.0141038;OID=.;OPOS=128455916;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:13:13:21:21:0.617647:10:11:7:6:10:11:7:6
chr7	128470838	.	C	T	396.6	PASS	AF=0.460674;AO=41;DP=89;FAO=41;FDP=89;FR=.;FRO=48;FSAF=26;FSAR=15;FSRF=29;FSRR=19;FWDB=0.00264716;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=263.796;QD=17.8246;RBI=0.0291034;REFB=-0.0234763;REVB=-0.0289828;RO=48;SAF=26;SAR=15;SRF=29;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.030841;STB=0.517253;STBP=0.774;TYPE=snp;VARB=0.025526;OID=.;OPOS=128470838;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:48:48:41:41:0.460674:15:26:29:19:15:26:29:19
chr7	128477472	.	T	C	163.57	PASS	AF=0.309859;AO=22;DP=72;FAO=22;FDP=71;FR=.;FRO=49;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=29;FSRR=20;FWDB=-0.0716608;FXX=0.013887;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.551;QD=9.21493;RBI=0.0784657;REFB=-0.00167262;REVB=-0.0319626;RO=48;SAF=7;SAR=15;SRF=29;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.329175;STB=0.687728;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.00209697;OID=.;OPOS=128477472;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:71:48:49:22:22:0.309859:15:7:29:19:15:7:29:20
chr7	128477547	.	T	C	324.32	PASS	AF=0.391304;AO=36;DP=94;FAO=36;FDP=92;FR=.;FRO=56;FSAF=8;FSAR=28;FSRF=28;FSRR=28;FWDB=-0.0188349;FXX=0.0212743;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.56;QD=14.1007;RBI=0.0194101;REFB=-0.00349784;REVB=-0.00469019;RO=55;SAF=8;SAR=28;SRF=27;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.324176;STB=0.692192;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.00398412;OID=.;OPOS=128477547;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:92:55:56:36:36:0.391304:28:8:27:28:28:8:28:28
chr7	128484816	.	A	G	409.55	PASS	AF=0.525641;AO=40;DP=77;FAO=41;FDP=78;FR=.;FRO=37;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=0.0107193;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.929;QD=21.0028;RBI=0.0138919;REFB=-0.0264567;REVB=0.00883642;RO=37;SAF=18;SAR=22;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.015425;STB=0.514801;STBP=0.805;TYPE=snp;VARB=0.0184694;OID=.;OPOS=128484816;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:78:37:37:40:41:0.525641:22:18:16:21:22:19:16:21
chr7	128486363	.	C	T	197.7	PASS	AF=0.47619;AO=20;DP=42;FAO=20;FDP=42;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=-0.0122131;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.286;QD=18.8287;RBI=0.0162032;REFB=-0.0186245;REVB=0.0106481;RO=22;SAF=8;SAR=12;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00872089;STB=0.504946;STBP=0.954;TYPE=snp;VARB=0.0249902;OID=.;OPOS=128486363;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:22:22:20:20:0.47619:12:8:9:13:12:8:9:13
chr7	128487866	.	T	C	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000709166;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.146;QD=43.4851;RBI=0.0035925;REFB=0;REVB=-0.00352181;RO=0;SAF=6;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.94825e-05;OID=.;OPOS=128487866;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:6:6:0:0:6:6:0:0
chr7	128488734	.	G	A	450.48	PASS	AF=0.478723;AO=45;DP=93;FAO=45;FDP=94;FR=.;FRO=49;FSAF=27;FSAR=18;FSRF=26;FSRR=23;FWDB=-0.0410303;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=124.077;QD=19.1693;RBI=0.0437832;REFB=-0.0316488;REVB=0.0152802;RO=48;SAF=27;SAR=18;SRF=25;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0751984;STB=0.537101;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.0311304;OID=.;OPOS=128488734;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:94:48:49:45:45:0.478723:18:27:25:23:18:27:26:23
chr7	128526791	.	C	T	45.66	PASS	AF=0.333333;AO=7;DP=21;FAO=7;FDP=21;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=0.0183067;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.686;QD=8.69805;RBI=0.0291184;REFB=-0.0103023;REVB=-0.0226439;RO=14;SAF=6;SAR=1;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.595941;STB=0.867405;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.00833111;OID=.;OPOS=128526791;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:21:21:14:14:7:7:0.333333:1:6:4:10:1:6:4:10
chr7	128550680	.	GC	G	282.13	PASS	AF=1;AO=24;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0747229;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=17.5078;QD=40.3045;RBI=0.126518;REFB=0;REVB=0.102094;RO=0;SAF=13;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0.323529;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00366031;OID=.;OPOS=128550681;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:24:28:28:28:0:16:12:0:0:5:0:13:11:0:0
chr7	128595394	.	G	C	318.37	PASS	AF=0.376238;AO=37;DP=101;FAO=38;FDP=101;FR=.;FRO=63;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=27;FSRR=36;FWDB=-0.0252038;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.9549;QD=12.6089;RBI=0.0448733;REFB=-0.00657648;REVB=-0.0371266;RO=63;SAF=19;SAR=18;SRF=27;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0933899;STB=0.544531;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=0.0128829;OID=.;OPOS=128595394;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:101:63:63:37:38:0.376238:18:19:27:36:19:19:27:36
chr7	128607384	.	G	A	545.19	PASS	AF=0.390244;AO=64;DP=163;FAO=64;FDP=164;FR=.;FRO=100;FSAF=30;FSAR=34;FSRF=55;FSRR=45;FWDB=-0.0343016;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.9943;QD=13.2973;RBI=0.0418174;REFB=-0.0016342;REVB=-0.0239185;RO=99;SAF=30;SAR=34;SRF=55;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0932327;STB=0.549414;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.00211306;OID=.;OPOS=128607384;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:163:164:99:100:64:64:0.390244:34:30:55:44:34:30:55:45
chr7	128630227	.	C	T	885.36	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00742255;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.159;QD=58.0566;RBI=0.0102376;REFB=0;REVB=0.00705087;RO=0;SAF=30;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.64262e-05;OID=.;OPOS=128630227;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:61:0:0:60:61:1:30:30:0:0:30:31:0:0
chr7	128641226	.	G	C	199.89	PASS	AF=0.40678;AO=24;DP=59;FAO=24;FDP=59;FR=.;FRO=35;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=-0.00233684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.1623;QD=13.5515;RBI=0.0146151;REFB=0.0174197;REVB=-0.0144271;RO=35;SAF=9;SAR=15;SRF=13;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00395191;STB=0.502261;STBP=0.996;TYPE=snp;VARB=-0.026045;OID=.;OPOS=128641226;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:35:35:24:24:0.40678:15:9:13:22:15:9:13:22
chr7	128767410	.	A	G	794.68	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0117282;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.9709;QD=63.5747;RBI=0.0164386;REFB=0;REVB=0.0115186;RO=0;SAF=28;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00136902;OID=.;OPOS=128767410;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:50:0:0:49:50:1:21:28:0:0:21:29:0:0
chr7	128767490	.	T	C	498.9	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0286048;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.308;QD=57.017;RBI=0.0286175;REFB=0;REVB=-0.000851883;RO=0;SAF=16;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.1382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000132665;OID=.;OPOS=128767490;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:35:35:0:0:35:35:1:19:16:0:0:19:16:0:0
chr7	128767506	.	T	G	393.3	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0266848;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.6472;QD=56.185;RBI=0.0347978;REFB=0;REVB=-0.022334;RO=0;SAF=15;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000874349;OID=.;OPOS=128767506;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:13:15:0:0:13:15:0:0
chr7	128804780	.	C	G	708.81	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.113824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.1609;QD=63.0054;RBI=0.120159;REFB=0;REVB=0.0384996;RO=0;SAF=18;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00173403;OID=.;OPOS=128804780;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:45:0:0:44:45:1:26:18:0:0:27:18:0:0
chr7	128846328	.	G	C	1468.98	PASS	AF=0.989583;AO=94;DP=96;FAO=95;FDP=96;FR=.;FRO=1;FSAF=51;FSAR=44;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00124534;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=296.655;QD=61.2075;RBI=0.0227648;REFB=-0.117331;REVB=0.0227307;RO=1;SAF=51;SAR=43;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.010899;STB=0.504853;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.000248864;OID=.;OPOS=128846328;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:96:96:1:1:94:95:0.989583:43:51:0:1:44:51:1:0
chr7	129043234	.	A	C	173.73	PASS	AF=0.473684;AO=18;DP=39;FAO=18;FDP=38;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=0.00919998;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.994;QD=18.287;RBI=0.0240654;REFB=-0.00918411;REVB=0.0222375;RO=19;SAF=12;SAR=6;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.314421;STB=0.666481;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.00694237;OID=.;OPOS=129043234;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:38:19:20:18:18:0.473684:6:12:6:13:6:12:7:13
chr7	129067053	.	T	C	174.28	PASS	AF=0.366667;AO=22;DP=60;FAO=22;FDP=60;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=28;FSRR=10;FWDB=-0.0169262;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.044;QD=11.6187;RBI=0.0342914;REFB=-0.013732;REVB=0.0298228;RO=38;SAF=15;SAR=7;SRF=28;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.071651;STB=0.541331;STBP=0.688;TYPE=snp;VARB=0.0208539;OID=.;OPOS=129067053;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:38:38:22:22:0.366667:7:15:28:10:7:15:28:10
chr7	129142694	.	C	G	540.63	PASS	AF=0.909091;AO=39;DP=44;FAO=40;FDP=44;FR=.;FRO=4;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.0480175;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=38.3626;QD=49.1483;RBI=0.0480595;REFB=-0.219244;REVB=0.00200804;RO=5;SAF=16;SAR=23;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.041234;STB=0.532694;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.0289167;OID=.;OPOS=129142694;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:16:44:44:5:4:39:40:0.909091:23:16:3:2:24:16:3:1
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chr7	129395075	.	G	A	34.72	PASS	AF=0.2;AO=6;DP=30;FAO=6;FDP=30;FR=.;FRO=24;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=-0.0735397;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.2713;QD=4.62988;RBI=0.0758602;REFB=-0.00307116;REVB=0.0186194;RO=22;SAF=3;SAR=3;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00541645;OID=.;OPOS=129395075;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:30:30:22:24:6:6:0.2:3:3:11:11:3:3:12:12
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chr7	129962360	.	A	G	726.76	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0162185;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.834;QD=63.1963;RBI=0.0163239;REFB=0;REVB=-0.00185231;RO=0;SAF=25;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.85991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.59752e-05;OID=.;OPOS=129962360;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:21:25:0:0:21:25:0:0
chr7	129962682	.	A	G	769.51	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0101599;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.553;QD=57.0007;RBI=0.0440718;REFB=0;REVB=0.0428847;RO=0;SAF=26;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.52846e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.65961e-05;OID=.;OPOS=129962682;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:28:26:0:0:28:26:0:0
chr7	129984274	.	A	G	320.78	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.026381;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.8274;QD=53.4627;RBI=0.0568023;REFB=0;REVB=-0.0503046;RO=0;SAF=12;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000631188;OID=.;OPOS=129984274;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:12:12:0:0:12:12:0:0
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chr7	129989878	.	T	C	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0527076;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.953;QD=59.4355;RBI=0.0534661;REFB=0;REVB=0.00897364;RO=0;SAF=22;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.39865e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000251165;OID=.;OPOS=129989878;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:13:22:0:0:13:22:0:0
chr7	130002317	.	T	C	145.07	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0390659;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.59;QD=44.6359;RBI=0.0766541;REFB=0;REVB=0.0659523;RO=0;SAF=7;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00152834;OID=.;OPOS=130002317;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:6:7:0:0:6:7:0:0
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chr7	131185995	.	C	A	90.68	PASS	AF=0.240741;AO=13;DP=54;FAO=13;FDP=54;FR=.;FRO=41;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=25;FSRR=16;FWDB=-0.0166273;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.874;QD=6.717;RBI=0.023358;REFB=-0.000860271;REVB=-0.0164052;RO=41;SAF=7;SAR=6;SRF=25;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0881982;STB=0.554831;STBP=0.665;TYPE=snp;VARB=0.00236284;OID=.;OPOS=131185995;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:90:54:54:41:41:13:13:0.240741:6:7:25:16:6:7:25:16
chr7	131195712	.	G	A	1189.07	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0123903;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.8673;QD=60.978;RBI=0.0690329;REFB=0;REVB=0.0679119;RO=0;SAF=61;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000394436;OID=.;OPOS=131195712;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:78:0:0:76:78:1:15:61:0:0:17:61:0:0
chr7	131195959	.	C	T	650.44	PASS	AF=1;AO=42;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0642507;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.5604;QD=60.5064;RBI=0.07109;REFB=0;REVB=-0.0304243;RO=0;SAF=13;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.36943e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0010744;OID=.;OPOS=131195959;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:42:43:1:29:13:0:0:29:14:0:0
chr7	131812922	.	T	C	445.05	PASS	AF=0.941176;AO=32;DP=34;FAO=32;FDP=34;FR=.;FRO=2;FSAF=10;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0316828;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.7139;QD=52.3588;RBI=0.0521967;REFB=-0.0690195;REVB=-0.0414813;RO=0;SAF=10;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512704;STBP=0.547;TYPE=snp;VARB=0.00332271;OID=.;OPOS=131812922;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:34:34:0:2:32:32:0.941176:22:10:0:0:22:10:1:1
chr7	131814185	.	A	G	936.67	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0225008;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.625;QD=58.5418;RBI=0.0800036;REFB=0;REVB=0.0767743;RO=0;SAF=40;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00010617;OID=.;OPOS=131814185;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:64:0:0:61:64:1:21:40:0:0:22:42:0:0
chr7	131814529	.	G	A	72.7	PASS	AF=0.30303;AO=10;DP=33;FAO=10;FDP=33;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=-0.00508672;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=229.883;QD=8.812;RBI=0.016248;REFB=-0.00883333;REVB=-0.0154313;RO=23;SAF=5;SAR=5;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.225143;STB=0.636111;STBP=0.321;TYPE=snp;VARB=0.016371;OID=.;OPOS=131814529;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:33:33:23:23:10:10:0.30303:5:5:7:16:5:5:7:16
chr7	131815310	.	A	G	741.5	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0181738;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.9305;QD=57.0381;RBI=0.0261691;REFB=0;REVB=-0.0188292;RO=0;SAF=27;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000491966;OID=.;OPOS=131815310;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:25:27:0:0:25:27:0:0
chr7	131817850	.	T	C	376.48	PASS	AF=0.481481;AO=39;DP=82;FAO=39;FDP=81;FR=.;FRO=42;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=28;FSRR=14;FWDB=-0.0112742;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.9955;QD=18.5918;RBI=0.011285;REFB=-0.0279786;REVB=-0.000493809;RO=41;SAF=22;SAR=17;SRF=27;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0896793;STB=0.554803;STBP=0.37;TYPE=snp;VARB=0.0287432;OID=.;OPOS=131817850;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:81:41:42:39:39:0.481481:17:22:27:14:17:22:28:14
chr7	131859678	.	G	T	98.55	PASS	AF=0.428571;AO=12;DP=28;FAO=12;FDP=28;FR=.;FRO=16;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.0126629;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.014;QD=14.0792;RBI=0.0203432;REFB=-0.00707576;REVB=-0.0159216;RO=16;SAF=1;SAR=11;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.596078;STB=0.858653;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.00855507;OID=.;OPOS=131859678;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:28:28:16:16:12:12:0.428571:11:1:9:7:11:1:9:7
chr7	131864591	.	T	C	223.49	PASS	AF=0.458333;AO=22;DP=49;FAO=22;FDP=48;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=20;FWDB=-0.00463927;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.579;QD=18.6243;RBI=0.00513381;REFB=-0.00568671;REVB=0.00219844;RO=27;SAF=11;SAR=11;SRF=7;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.235245;STB=0.645712;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=0.0107257;OID=.;OPOS=131864591;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:48:27:26:22:22:0.458333:11:11:7:20:11:11:6:20
chr7	131870108	.	A	G	527.96	PASS	AF=0.515464;AO=50;DP=98;FAO=50;FDP=97;FR=.;FRO=47;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=29;FSRR=18;FWDB=0.0243682;FXX=0.0202;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.2124;QD=21.7715;RBI=0.0244818;REFB=-0.0193163;REVB=-0.00235544;RO=46;SAF=26;SAR=24;SRF=29;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0966109;STB=0.547245;STBP=0.371;TYPE=snp;VARB=0.0149582;OID=.;OPOS=131870108;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:97:46:47:50:50:0.515464:24:26:29:17:24:26:29:18
chr7	131912277	.	G	C	1657.87	PASS	AF=1;AO=108;DP=108;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0240533;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.944;QD=60.2862;RBI=0.0426738;REFB=0;REVB=0.035249;RO=0;SAF=63;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.69741e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.2124e-05;OID=.;OPOS=131912277;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:108:110:0:0:108:110:1:45:63:0:0:47:63:0:0
chr7	132070054	.	T	C	243.8	PASS	AF=0.4375;AO=28;DP=64;FAO=28;FDP=64;FR=.;FRO=36;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=12;FSRR=24;FWDB=0.00614986;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.382;QD=15.2372;RBI=0.0159474;REFB=-0.0166632;REVB=0.0147138;RO=36;SAF=10;SAR=18;SRF=12;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0259964;STB=0.514695;STBP=0.826;TYPE=snp;VARB=0.0267587;OID=.;OPOS=132070054;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:36:36:28:28:0.4375:18:10:12:24:18:10:12:24
chr7	132720555	.	T	C	461.27	PASS	AF=0.443478;AO=51;DP=115;FAO=51;FDP=115;FR=.;FRO=64;FSAF=24;FSAR=27;FSRF=38;FSRR=26;FWDB=-0.00451283;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=186.19;QD=16.044;RBI=0.0108054;REFB=-0.0237437;REVB=-0.00981787;RO=62;SAF=24;SAR=27;SRF=38;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139277;STB=0.568202;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=0.0238505;OID=.;OPOS=132720555;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:115:62:64:51:51:0.443478:27:24:38:24:27:24:38:26
chr7	132767617	.	C	A	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0208921;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.3696;QD=33.4285;RBI=0.125566;REFB=0;REVB=-0.123815;RO=0;SAF=3;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0113589;OID=.;OPOS=132767617;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:3:3:0:0:3:3:0:0
chr7	133580447	.	G	A	458.19	PASS	AF=0.55;AO=44;DP=80;FAO=44;FDP=80;FR=.;FRO=36;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=-0.00867273;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.523;QD=22.9094;RBI=0.0227989;REFB=-0.0228653;REVB=0.0210849;RO=36;SAF=24;SAR=20;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00833335;STB=0.504585;STBP=0.941;TYPE=snp;VARB=0.01828;OID=.;OPOS=133580447;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:36:36:44:44:0.55:20:24:20:16:20:24:20:16
chr7	133749164	.	G	A	613.36	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0104049;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=315.046;QD=61.3364;RBI=0.0118104;REFB=0;REVB=-0.00558791;RO=0;SAF=25;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.86657e-06;OID=.;OPOS=133749164;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:15:25:0:0:15:25:0:0
chr7	133868507	.	C	T	1607.05	PASS	AF=1;AO=107;DP=107;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00265914;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=319.872;QD=60.0767;RBI=0.00275969;REFB=0;REVB=0.000738159;RO=0;SAF=46;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.73491e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.06839e-06;OID=.;OPOS=133868507;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:107:107:0:0:107:107:1:61:46:0:0:61:46:0:0
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chr7	134215370	.	G	T	87.87	PASS	AF=0.392857;AO=10;DP=28;FAO=11;FDP=28;FR=.;FRO=17;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=-0.0222256;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.128;QD=12.5533;RBI=0.0235511;REFB=0.00392933;REVB=0.00778978;RO=17;SAF=2;SAR=8;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.208773;STB=0.558029;STBP=0.697;TYPE=snp;VARB=-0.0106439;OID=.;OPOS=134215370;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:28:28:17:17:10:11:0.392857:8:2:6:11:8:3:6:11
chr7	134225788	.	C	T	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00128579;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.409;QD=48.7373;RBI=0.0538682;REFB=0;REVB=0.0538529;RO=0;SAF=13;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000128972;OID=.;OPOS=134225788;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:4:13:0:0:4:13:0:0
chr7	134225827	.	A	G	289.35	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0395777;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.435;QD=52.6097;RBI=0.0835999;REFB=0;REVB=0.073638;RO=0;SAF=16;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17051e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00146861;OID=.;OPOS=134225827;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:6:16:0:0:6:16:0:0
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chr7	134719551	.	C	G	1482.15	PASS	AF=0.990196;AO=100;DP=101;FAO=101;FDP=102;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0314635;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.6521;QD=58.1234;RBI=0.0315948;REFB=-0.0247382;REVB=-0.00287741;RO=0;SAF=46;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.21299e-08;STB=0.504504;STBP=0.485;TYPE=snp;VARB=0.00117991;OID=.;OPOS=134719551;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:101:102:0:1:100:101:0.990196:54:46:0:0:55:46:0:1
chr7	134735830	.	A	G	327.81	PASS	AF=0.578947;AO=33;DP=57;FAO=33;FDP=57;FR=.;FRO=24;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=-0.0405062;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.3876;QD=23.0045;RBI=0.0549308;REFB=-0.0182687;REVB=0.0371031;RO=23;SAF=14;SAR=19;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00803396;STB=0.503266;STBP=0.971;TYPE=snp;VARB=0.0180393;OID=.;OPOS=134735830;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:23:24:33:33:0.578947:19:14:10:13:19:14:10:14
chr7	134849213	.	G	A	290.12	PASS	AF=0.346939;AO=34;DP=98;FAO=34;FDP=98;FR=.;FRO=64;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=25;FSRR=39;FWDB=0.00738556;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.848;QD=11.8415;RBI=0.00811842;REFB=-0.0159445;REVB=-0.00337078;RO=63;SAF=21;SAR=13;SRF=25;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.24616;STB=0.646069;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.027174;OID=.;OPOS=134849213;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:63:64:34:34:0.346939:13:21:25:38:13:21:25:39
chr7	134849280	.	T	A	1843.47	PASS	AF=0.991803;AO=121;DP=122;FAO=121;FDP=122;FR=.;FRO=1;FSAF=62;FSAR=59;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0141378;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=227.402;QD=60.4417;RBI=0.0318701;REFB=-0.0719648;REVB=0.0285626;RO=0;SAF=62;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.503999;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=0.000303614;OID=.;OPOS=134849280;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:122:122:0:1:121:121:0.991803:59:62:0:0:59:62:1:0
chr7	134849577	.	A	C	251.64	PASS	AF=0.489796;AO=24;DP=49;FAO=24;FDP=49;FR=.;FRO=25;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=0.000333839;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.767;QD=20.5421;RBI=0.00752768;REFB=-0.025833;REVB=-0.00752028;RO=25;SAF=14;SAR=10;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.200654;STB=0.612702;STBP=0.127;TYPE=snp;VARB=0.0302521;OID=.;OPOS=134849577;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:25:25:24:24:0.489796:10:14:9:16:10:14:9:16
chr7	134850465	.	C	T	632.23	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0178836;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.858;QD=61.6813;RBI=0.0475178;REFB=0;REVB=0.044024;RO=0;SAF=23;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000437322;OID=.;OPOS=134850465;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:18:23:0:0:18:23:0:0
chr7	134850469	.	A	G	651.23	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000565917;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.621;QD=62.0215;RBI=0.0226418;REFB=0;REVB=-0.0226347;RO=0;SAF=25;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.98888e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.49444e-05;OID=.;OPOS=134850469;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:17:25:0:0:17:25:0:0
chr7	134871775	.	C	T	803.96	PASS	AF=1;AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0109646;FXX=0.0175408;HRUN=2;LEN=1;MLLD=260.834;QD=57.4256;RBI=0.0174701;REFB=0;REVB=0.0136008;RO=0;SAF=25;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.31632e-05;OID=.;OPOS=134871775;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:57:56:0:0:56:56:1:31:25:0:0:31:25:0:0
chr7	134879830	.	G	A	218.05	PASS	AF=0.446429;AO=25;DP=56;FAO=25;FDP=56;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=-0.00743162;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.2124;QD=15.5753;RBI=0.0140072;REFB=-0.0149888;REVB=-0.0118731;RO=30;SAF=10;SAR=15;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.511102;STBP=0.882;TYPE=snp;VARB=0.0163398;OID=.;OPOS=134879830;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:30:31:25:25:0.446429:15:10:12:18:15:10:13:18
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chr7	138417718	.	A	G	1398.81	PASS	AF=1;AO=89;DP=90;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.093028;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.7521;QD=62.8678;RBI=0.0937041;REFB=0;REVB=0.011236;RO=0;SAF=28;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000313084;OID=.;OPOS=138417718;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:90:89:0:0:89:89:1:61:28:0:0:61:28:0:0
chr7	138418910	.	G	A	400.47	PASS	AF=0.966667;AO=29;DP=30;FAO=29;FDP=30;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00333286;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.187;QD=53.3966;RBI=0.0564647;REFB=-0.0775765;REVB=0.0563663;RO=0;SAF=13;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.515141;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=0.000306285;OID=.;OPOS=138418910;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:30:30:0:1:29:29:0.966667:16:13:0:0:16:13:0:1
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chr7	138545946	.	C	T	165.09	PASS	AF=0.377358;AO=20;DP=53;FAO=20;FDP=53;FR=.;FRO=33;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=0.0150548;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.3349;QD=12.4593;RBI=0.0203985;REFB=-0.00424001;REVB=-0.0137641;RO=33;SAF=12;SAR=8;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.219092;STB=0.626741;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.0110402;OID=.;OPOS=138545946;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:33:33:20:20:0.377358:8:12:13:20:8:12:13:20
chr7	138555960	.	G	C	403.17	PASS	AF=0.547945;AO=40;DP=73;FAO=40;FDP=73;FR=.;FRO=33;FSAF=13;FSAR=27;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=0.0136475;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.5763;QD=22.0913;RBI=0.0342335;REFB=-0.00485423;REVB=0.0313955;RO=33;SAF=13;SAR=27;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.214204;STB=0.618407;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.00360087;OID=.;OPOS=138555960;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:33:33:40:40:0.547945:27:13:19:14:27:13:19:14
chr7	138561175	.	C	G	169.15	PASS	AF=0.375;AO=21;DP=56;FAO=21;FDP=56;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=21;FSRR=14;FWDB=-0.00633153;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.9526;QD=12.0822;RBI=0.0098279;REFB=0.00121888;REVB=-0.0075166;RO=34;SAF=15;SAR=6;SRF=21;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118337;STB=0.581314;STBP=0.363;TYPE=snp;VARB=-0.00247477;OID=.;OPOS=138561175;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:34:35:21:21:0.375:6:15:21:13:6:15:21:14
chr7	138583840	.	C	A	937.61	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0122356;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.058;QD=58.6006;RBI=0.013825;REFB=0;REVB=-0.00643591;RO=0;SAF=22;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.91803e-05;OID=.;OPOS=138583840;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:42:22:0:0:42:22:0:0
chr7	138731687	.	A	G	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0337381;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=329.607;QD=46.848;RBI=0.0975082;REFB=0;REVB=0.0914855;RO=0;SAF=13;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000412715;OID=.;OPOS=138731687;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:2:13:0:0:2:13:0:0
chr7	138732457	.	G	A	1098.35	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0079568;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.109;QD=60.1835;RBI=0.0266764;REFB=0;REVB=0.0254622;RO=0;SAF=41;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.9631e-05;OID=.;OPOS=138732457;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:32:41:0:0:32:41:0:0
chr7	138732497	.	G	A	885.3	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00954428;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.663;QD=58.0526;RBI=0.0148457;REFB=0;REVB=-0.0113711;RO=0;SAF=34;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.9444e-05;OID=.;OPOS=138732497;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:27:34:0:0:27:34:0:0
chr7	138738204	.	G	A	1138.17	PASS	AF=0.987013;AO=76;DP=77;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0232937;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.005;QD=59.1256;RBI=0.0254829;REFB=-0.105578;REVB=0.0103334;RO=1;SAF=38;SAR=38;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0122906;STB=0.506492;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.000417325;OID=.;OPOS=138738204;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:77:77:1:1:76:76:0.987013:38:38:0:1:38:38:0:1
chr7	138831707	.	C	T	95.18	PASS	AF=0.352941;AO=12;DP=34;FAO=12;FDP=34;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=0.00415255;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.971;QD=11.1979;RBI=0.041109;REFB=-0.018345;REVB=-0.0408987;RO=21;SAF=7;SAR=5;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.213959;STB=0.639198;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=0.0205133;OID=.;OPOS=138831707;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:34:34:21:22:12:12:0.352941:5:7:8:13:5:7:8:14
chr7	139138871	.	T	G	54.84	PASS	AF=0.166667;AO=5;DP=60;FAO=11;FDP=66;FR=.;FRO=55;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=26;FSRR=29;FWDB=0.0069318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.875;QD=3.32336;RBI=0.00973474;REFB=-0.0137461;REVB=0.00683487;RO=54;SAF=1;SAR=4;SRF=26;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.314014;STB=0.515208;STBP=0.952;TYPE=snp;VARB=0.11917;OID=.;OPOS=139138871;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:60:66:54:55:5:11:0.166667:4:1:26:28:6:5:26:29
chr7	139138950	.	C	G	149.43	PASS	AF=0.377778;AO=18;DP=43;FAO=17;FDP=45;FR=.;FRO=28;FSAF=2;FSAR=15;FSRF=8;FSRR=20;FWDB=-0.145315;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.1;QD=13.283;RBI=0.15149;REFB=-0.0180598;REVB=-0.0428108;RO=25;SAF=3;SAR=15;SRF=5;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0575193;STB=0.681561;STBP=0.139;TYPE=snp;VARB=0.00956433;OID=.;OPOS=139138950;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:45:25:28:18:17:0.377778:15:3:5:20:15:2:8:20
chr7	139252780	.	T	C	785.84	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00385135;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.144;QD=64.1504;RBI=0.0286697;REFB=0;REVB=0.0284098;RO=0;SAF=30;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.48867e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000229896;OID=.;OPOS=139252780;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:19:30:0:0:19:30:0:0
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chr7	139415943	.	G	A	262.05	PASS	AF=0.369048;AO=30;DP=84;FAO=31;FDP=84;FR=.;FRO=53;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=31;FSRR=22;FWDB=-0.00470633;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=230.25;QD=12.4784;RBI=0.0339978;REFB=-0.00193973;REVB=-0.0336704;RO=53;SAF=20;SAR=10;SRF=31;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.097732;STB=0.540514;STBP=0.586;TYPE=snp;VARB=0.00368481;OID=.;OPOS=139415943;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:53:53:30:31:0.369048:10:20:31:22:11:20:31:22
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chr7	139784786	.	C	A	228.34	PASS	AF=0.52381;AO=22;DP=42;FAO=22;FDP=42;FR=.;FRO=20;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=16;FWDB=-0.00878889;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=322.719;QD=21.7465;RBI=0.0130596;REFB=0.00458309;REVB=-0.00965958;RO=20;SAF=14;SAR=8;SRF=4;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.358497;STB=0.699828;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=-0.00338546;OID=.;OPOS=139784786;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:20:20:22:22:0.52381:8:14:4:16:8:14:4:16
chr7	140051091	.	G	A	103.08	PASS	AF=0.302326;AO=13;DP=43;FAO=13;FDP=43;FR=.;FRO=30;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=-0.037134;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.869;QD=9.58921;RBI=0.0371968;REFB=-0.00694437;REVB=0.00216035;RO=30;SAF=7;SAR=6;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00593855;STB=0.503592;STBP=0.973;TYPE=snp;VARB=0.00994141;OID=.;OPOS=140051091;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:30:30:13:13:0.302326:6:7:16:14:6:7:16:14
chr7	140080087	.	C	G	245.2	PASS	AF=0.444444;AO=28;DP=63;FAO=28;FDP=63;FR=.;FRO=35;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=0.0294069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.5069;QD=15.5683;RBI=0.0298715;REFB=-0.0103596;REVB=0.00524793;RO=35;SAF=12;SAR=16;SRF=13;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0579356;STB=0.532687;STBP=0.654;TYPE=snp;VARB=0.0130094;OID=.;OPOS=140080087;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:35:35:28:28:0.444444:16:12:13:22:16:12:13:22
chr7	140159721	.	T	C	41.13	PASS	AF=0.6;AO=6;DP=10;FAO=6;FDP=10;FR=.;FRO=4;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0170367;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=185.984;QD=16.4536;RBI=0.0591731;REFB=-0.0146184;REVB=-0.0566675;RO=4;SAF=3;SAR=3;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0134393;OID=.;OPOS=140159721;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:10:10:4:4:6:6:0.6:3:3:2:2:3:3:2:2
chr7	140173102	.	T	G	40.29	PASS	AF=0.545455;AO=6;DP=11;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=-0.0196646;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=238.507;QD=14.6525;RBI=0.0203865;REFB=-0.00145547;REVB=0.00537723;RO=5;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.333798;STB=0.691819;STBP=0.354;TYPE=snp;VARB=0.00206721;OID=.;OPOS=140173102;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:11:11:5:5:6:6:0.545455:4:2:0:5:4:2:0:5
chr7	140258000	.	T	C	851.2	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00137631;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.595;QD=57.7085;RBI=0.0147786;REFB=0;REVB=-0.0147144;RO=0;SAF=35;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.24049e-05;OID=.;OPOS=140258000;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:24:35:0:0:24:35:0:0
chr7	140301731	.	G	T	365.12	PASS	AF=0.964286;AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00104098;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=260.802;QD=52.1593;RBI=0.0200063;REFB=-0.104527;REVB=0.0199792;RO=0;SAF=24;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.57137;STBP=0.069;TYPE=snp;VARB=0.000737969;OID=.;OPOS=140301731;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:28:28:0:1:27:27:0.964286:3:24:0:0:3:24:0:1
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chr7	141464765	.	C	T	520.05	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0484486;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.266;QD=59.4341;RBI=0.0504019;REFB=0;REVB=0.0138957;RO=0;SAF=20;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00021754;OID=.;OPOS=141464765;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:15:20:0:0:15:20:0:0
chr7	141478308	.	T	C	632.09	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0525747;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.8186;QD=61.6674;RBI=0.0553451;REFB=0;REVB=-0.0172911;RO=0;SAF=19;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000577669;OID=.;OPOS=141478308;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:22:19:0:0:22:19:0:0
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chr7	141478800	.	G	A	1249.93	PASS	AF=0.987952;AO=82;DP=83;FAO=82;FDP=83;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0103828;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.8042;QD=60.2378;RBI=0.014261;REFB=0.0431216;REVB=-0.00977612;RO=1;SAF=43;SAR=39;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0108864;STB=0.505746;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=1.98628e-06;OID=.;OPOS=141478800;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:83:83:1:1:82:82:0.987952:39:43:1:0:39:43:1:0
chr7	141490238	.	G	T	946.55	PASS	AF=1;AO=65;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00837735;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.65;QD=57.3666;RBI=0.0583384;REFB=-0.0092223;REVB=0.0577338;RO=0;SAF=34;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.90682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000331518;OID=.;OPOS=141490238;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:66:66:0:0:65:66:1:31:34:0:0:32:34:0:0
chr7	141501943	.	GG	CA,CG	420.78	PASS	AF=0.0666667,0.933333;AO=2,26;DP=31;FAO=2,28;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=2,13;FSAR=0,15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00977449,0.0799732;FXX=0.0624805;HRUN=2,2;LEN=2,1;MLLD=156.119,47.5404;QD=56.1034;RBI=0.0159784,0.081408;REFB=0,0;REVB=-0.01264,0.0152165;RO=0;SAF=2,12;SAR=0,14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=-0.0159354,0.0171481;OID=.,.;OPOS=141501943,141501943;OREF=GG,G;OALT=CA,C;OMAPALT=CA,CG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:10:31:30:0:0:2,26:2,28:0.0666667,0.933333:0,14:2,12:0:0:0,15:2,13:0:0
chr7	141537735	.	T	G	1312.01	PASS	AF=1;AO=80;DP=80;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186188;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.711;QD=61.0236;RBI=0.0287308;REFB=0;REVB=0.0218815;RO=0;SAF=33;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.71057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000173283;OID=.;OPOS=141537735;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:80:86:0:0:80:86:1:47:33:0:0:50:36:0:0
chr7	141537942	.	T	TCAA	638.36	PASS	AF=1;AO=30;DP=70;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0470062;FXX=0.0465008;HRUN=1;LEN=3;MLLD=330.606;QD=62.2791;RBI=0.0543339;REFB=0;REVB=0.0272506;RO=39;SAF=14;SAR=16;SRF=24;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147885;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000176494;OID=.;OPOS=141537943;OREF=-;OALT=CAA;OMAPALT=TCAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:30:70:41:41:0:24:17:0:0:4:39:14:16:24:15
chr7	141537945	.	T	A	302.25	PASS	AF=0.516129;AO=32;DP=62;FAO=32;FDP=62;FR=.;FRO=30;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=0.0181019;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.176;QD=19.4997;RBI=0.0234425;REFB=-0.0399014;REVB=-0.0148953;RO=30;SAF=20;SAR=12;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140845;STB=0.578463;STBP=0.21;TYPE=snp;VARB=0.0324347;OID=.;OPOS=141537945;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:30:30:32:32:0.516129:12:20:14:16:12:20:14:16
chr7	141672604	.	T	C	177.38	PASS	AF=1;AO=8;DP=19;FAO=17;FDP=17;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.16625;FXX=0.105208;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.3206;QD=41.736;RBI=0.170422;REFB=0;REVB=0.0374753;RO=0;SAF=2;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.58669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0429648;OID=.;OPOS=141672604;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:19:17:0:0:8:17:1:6:2:0:0:6:11:0:0
chr7	141673345	.	C	G	347.1	PASS	AF=0.962963;AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=27;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0615226;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.4274;QD=51.4226;RBI=0.0663332;REFB=-0.0182744;REVB=-0.0248003;RO=1;SAF=19;SAR=7;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0617811;STB=0.533307;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=0.00199992;OID=.;OPOS=141673345;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:27:27:1:1:26:26:0.962963:7:19:0:1:7:19:0:1
chr7	141724852	.	C	T	212.2	PASS	AF=0.376812;AO=26;DP=68;FAO=26;FDP=69;FR=.;FRO=43;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=24;FWDB=0.00138352;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.6138;QD=12.3015;RBI=0.0980362;REFB=-0.00840287;REVB=-0.0980264;RO=41;SAF=10;SAR=16;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0865399;STB=0.537008;STBP=0.685;TYPE=snp;VARB=0.0216177;OID=.;OPOS=141724852;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:69:41:43:26:26:0.376812:16:10:19:22:16:10:19:24
chr7	141727526	.	G	T	258.34	PASS	AF=0.405405;AO=30;DP=74;FAO=30;FDP=74;FR=.;FRO=44;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=24;FSRR=20;FWDB=0.00988794;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.734;QD=13.9642;RBI=0.0258405;REFB=-0.000132741;REVB=-0.0238738;RO=44;SAF=14;SAR=16;SRF=24;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0821363;STB=0.546731;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=6.77224e-05;OID=.;OPOS=141727526;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:44:44:30:30:0.405405:16:14:24:20:16:14:24:20
chr7	141747658	.	A	G	926.58	PASS	AF=1;AO=64;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103953;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.4516;QD=57.0205;RBI=0.0193341;REFB=-0.116293;REVB=0.0163017;RO=1;SAF=27;SAR=37;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0125954;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00167869;OID=.;OPOS=141747658;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:65:65:1:0:64:65:1:37:27:0:1:38:27:0:0
chr7	141755358	.	T	C	533.13	PASS	AF=0.515152;AO=51;DP=99;FAO=51;FDP=99;FR=.;FRO=48;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=17;FSRR=31;FWDB=0.00787905;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.261;QD=21.5407;RBI=0.0142365;REFB=-0.000801541;REVB=0.0118574;RO=48;SAF=27;SAR=24;SRF=17;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153177;STB=0.584383;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=0.000832791;OID=.;OPOS=141755358;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:48:48:51:51:0.515152:24:27:17:31:24:27:17:31
chr7	141780686	.	C	G	179.14	PASS	AF=0.25;AO=27;DP=108;FAO=27;FDP=108;FR=.;FRO=81;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=44;FSRR=37;FWDB=0.0080887;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.784;QD=6.63491;RBI=0.012703;REFB=-0.0102944;REVB=0.00979486;RO=81;SAF=18;SAR=9;SRF=44;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159934;STB=0.597328;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=0.0392241;OID=.;OPOS=141780686;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:108:81:81:27:27:0.25:9:18:44:37:9:18:44:37
chr7	141784326	.	G	C	2094.97	PASS	AF=0.96;AO=144;DP=151;FAO=144;FDP=150;FR=.;FRO=6;FSAF=59;FSAR=85;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.0131764;FXX=0.00662208;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.5703;QD=55.8659;RBI=0.0189343;REFB=-0.061658;REVB=0.0135975;RO=5;SAF=59;SAR=85;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000640785;STB=0.503162;STBP=0.724;TYPE=snp;VARB=0.0120214;OID=.;OPOS=141784326;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:151:150:5:6:144:144:0.96:85:59:2:3:85:59:2:4
chr7	141796131	.	G	A	699.98	PASS	AF=0.925926;AO=50;DP=53;FAO=50;FDP=54;FR=.,HEALED;FRO=2;FSAF=23;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.000726392;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.442;QD=51.8501;RBI=0.0254334;REFB=0.00162928;REVB=-0.0254231;RO=1;SAF=23;SAR=27;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.017117;STB=0.501547;STBP=0.877;TYPE=snp;VARB=0.000521177;OID=.;OPOS=141796131;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:53:54:1:2:50:50:0.925926:27:23:0:1:27:23:1:1
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chr7	141857846	.	A	G	2336.42	PASS	AF=1;AO=152;DP=152;FAO=153;FDP=153;FR=.;FRO=0;FSAF=98;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0311656;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.613;QD=61.0828;RBI=0.0312283;REFB=0;REVB=-0.00197835;RO=0;SAF=98;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.98514e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.21026e-05;OID=.;OPOS=141857846;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:152:153:0:0:152:153:1:54:98:0:0:55:98:0:0
chr7	141896059	.	A	G	444.64	PASS	AF=0.453704;AO=49;DP=108;FAO=49;FDP=108;FR=.;FRO=59;FSAF=31;FSAR=18;FSRF=28;FSRR=31;FWDB=0.0202364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.461;QD=16.4682;RBI=0.0223739;REFB=-0.00381392;REVB=-0.00954345;RO=58;SAF=31;SAR=18;SRF=27;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165821;STB=0.588495;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=0.00331157;OID=.;OPOS=141896059;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:108:58:59:49:49:0.453704:18:31:27:31:18:31:28:31
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chr7	141955128	.	C	T	202.92	PASS	AF=0.540541;AO=19;DP=36;FAO=20;FDP=37;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=3;FSRR=14;FWDB=0.0290695;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.607;QD=21.9372;RBI=0.0310773;REFB=-0.0204224;REVB=0.0109894;RO=17;SAF=5;SAR=14;SRF=3;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0992363;STB=0.547125;STBP=0.631;TYPE=snp;VARB=0.0110322;OID=.;OPOS=141955128;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:37:17:17:19:20:0.540541:14:5:3:14:15:5:3:14
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chr7	142013384	.	G	A,C	1296.14	PASS	AF=0.0352941,0.964706;AO=3,82;DP=85;FAO=3,82;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=3,41;FSAR=0,41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0132142,0.0626006;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=58.5184,99.4961;QD=60.9948;RBI=0.0138348,0.0628462;REFB=0,0;REVB=0.00409694,0.00555012;RO=0;SAF=3,41;SAR=0,41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.149381,0.00118658;OID=.,.;OPOS=142013384,142013384;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:4:85:85:0:0:3,82:3,82:0.0352941,0.964706:0,41:3,41:0:0:0,41:3,41:0:0
chr7	142045848	.	T	C	651.2	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.068473;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.67;QD=62.0192;RBI=0.0718213;REFB=0;REVB=0.0216736;RO=0;SAF=22;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000140296;OID=.;OPOS=142045848;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:20:22:0:0:20:22:0:0
chr7	142045924	.	A	G	255.9	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.078874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.3322;QD=51.1804;RBI=0.0906938;REFB=0;REVB=0.0447689;RO=0;SAF=5;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00259295;OID=.;OPOS=142045924;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:15:5:0:0:15:5:0:0
chr7	142119831	.	G	A	648.03	PASS	AF=0.955556;AO=43;DP=45;FAO=43;FDP=45;FR=.;FRO=2;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0116897;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.223;QD=57.6026;RBI=0.0295025;REFB=-0.107515;REVB=0.0270878;RO=2;SAF=25;SAR=18;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00696279;STB=0.50371;STBP=0.858;TYPE=snp;VARB=0.00964528;OID=.;OPOS=142119831;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:45:45:2:2:43:43:0.955556:18:25:1:1:18:25:1:1
chr7	142124170	.	C	G,T	1053.95	PASS	AF=0.05,0.8875;AO=3,74;DP=80;FAO=4,71;FDP=80;FR=.;FRO=5;FSAF=1,47;FSAR=3,24;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0340203,0.00264072;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=35.3011,215.86;QD=52.6975;RBI=0.0341358,0.0116826;REFB=-0.0109126,-0.0498857;REVB=0.00280623,0.0113802;RO=1;SAF=1,47;SAR=2,27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.266641,-0.00996047;STB=0.538276,0.533216;STBP=0.884,0.054;TYPE=snp,snp;VARB=0.0746322,0.00266555;OID=.,.;OPOS=142124170,142124170;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:17:80:80:1:5:3,74:4,71:0.05,0.8875:2,27:1,47:1:0:3,24:1,47:1:4
chr7	142124424	.	T	G	1893.55	PASS	AF=0.976562;AO=125;DP=126;FAO=125;FDP=128;FR=.;FRO=3;FSAF=69;FSAR=56;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0208297;FXX=0.00775134;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.263;QD=59.1735;RBI=0.0241607;REFB=0.0655512;REVB=0.0122418;RO=1;SAF=69;SAR=56;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00683676;STB=0.505175;STBP=0.468;TYPE=snp;VARB=-0.00275552;OID=.;OPOS=142124424;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:126:128:1:3:125:125:0.976562:56:69:1:0:56:69:1:2
chr7	142124492	.	C	T	39.51	PASS	AF=0.0970874;AO=10;DP=103;FAO=10;FDP=103;FR=.;FRO=93;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=47;FSRR=46;FWDB=-0.013138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.999;QD=1.53439;RBI=0.014478;REFB=-3.2765e-06;REVB=0.00608335;RO=93;SAF=5;SAR=5;SRF=47;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00626639;STB=0.504845;STBP=0.94;TYPE=snp;VARB=0.000205692;OID=.;OPOS=142124492;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:39:103:103:93:93:10:10:0.0970874:5:5:47:46:5:5:47:46
chr7	142124539	.	C	T	77.94	PASS	AF=0.175;AO=12;DP=78;FAO=14;FDP=80;FR=.;FRO=66;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=33;FSRR=33;FWDB=0.00138469;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.0662;QD=3.89697;RBI=0.0120089;REFB=-0.00201724;REVB=-0.0119288;RO=65;SAF=5;SAR=7;SRF=33;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113273;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00854973;OID=.;OPOS=142124539;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:78:80:65:66:12:14:0.175:7:5:33:32:7:7:33:33
chr7	142139348	.	C	T	1183.96	PASS	AF=1;AO=75;DP=76;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00356927;FXX=0.0374953;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.953;QD=61.5042;RBI=0.00381143;REFB=0;REVB=0.0013369;RO=0;SAF=39;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6999e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000381533;OID=.;OPOS=142139348;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:77:0:0:75:77:1:36:39:0:0:38:39:0:0
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chr7	142143804	.	A	C	1428.33	PASS	AF=0.943925;AO=101;DP=107;FAO=101;FDP=107;FR=.;FRO=6;FSAF=72;FSAR=29;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.0271058;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.7;QD=53.3956;RBI=0.0271058;REFB=-0.0743339;REVB=2.21951e-05;RO=6;SAF=72;SAR=29;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0481062;STB=0.525426;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.00170846;OID=.;OPOS=142143804;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:16:107:107:6:6:101:101:0.943925:29:72:2:4:29:72:2:4
chr7	142149160	.	T	G	643.85	PASS	AF=0.446541;AO=70;DP=158;FAO=71;FDP=159;FR=.;FRO=88;FSAF=37;FSAR=34;FSRF=51;FSRR=37;FWDB=0.000310034;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.657;QD=16.1974;RBI=0.000633031;REFB=0.00508021;REVB=0.000551912;RO=88;SAF=36;SAR=34;SRF=51;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0654784;STB=0.53247;STBP=0.471;TYPE=snp;VARB=-0.00593801;OID=.;OPOS=142149160;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:158:159:88:88:70:71:0.446541:34:36:51:37:34:37:51:37
chr7	142149349	.	A	C	1171.63	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0236264;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.577;QD=60.864;RBI=0.026626;REFB=0;REVB=-0.0122776;RO=0;SAF=34;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6391e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.38456e-05;OID=.;OPOS=142149349;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:77:0:0:76:77:1:42:34:0:0:42:35:0:0
chr7	142162001	.	A	C	2216.67	PASS	AF=1;AO=140;DP=140;FAO=140;FDP=140;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.008636;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.737;QD=63.3333;RBI=0.0170649;REFB=0;REVB=0.0147184;RO=0;SAF=71;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.29942e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.45751e-06;OID=.;OPOS=142162001;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:140:140:0:0:140:140:1:69:71:0:0:69:71:0:0
chr7	142162050	.	A	G	720.05	PASS	AF=0.455621;AO=77;DP=169;FAO=77;FDP=169;FR=.;FRO=92;FSAF=41;FSAR=36;FSRF=43;FSRR=49;FWDB=0.0100036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.547;QD=17.0427;RBI=0.0100454;REFB=-0.00656151;REVB=-0.000915218;RO=92;SAF=41;SAR=36;SRF=43;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.063787;STB=0.535403;STBP=0.394;TYPE=snp;VARB=0.00580547;OID=.;OPOS=142162050;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:169:169:92:92:77:77:0.455621:36:41:43:49:36:41:43:49
chr7	142162148	.	C	T	642.32	PASS	AF=0.448718;AO=70;DP=158;FAO=70;FDP=156;FR=.;FRO=86;FSAF=42;FSAR=28;FSRF=50;FSRR=36;FWDB=0.0138664;FXX=0.0126574;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.63;QD=16.4699;RBI=0.0200607;REFB=-0.016869;REVB=-0.0144968;RO=86;SAF=42;SAR=28;SRF=50;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0191096;STB=0.510635;STBP=0.824;TYPE=snp;VARB=0.0199964;OID=.;OPOS=142162148;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:158:156:86:86:70:70:0.448718:28:42:50:36:28:42:50:36
chr7	142162306	.	A	G	182.7	PASS	AF=0.370968;AO=22;DP=61;FAO=23;FDP=62;FR=.;FRO=39;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=24;FWDB=0.00147801;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.209;QD=11.7869;RBI=0.00701339;REFB=-0.0131507;REVB=0.00685588;RO=38;SAF=10;SAR=12;SRF=14;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0960451;STB=0.532346;STBP=0.708;TYPE=snp;VARB=0.0212148;OID=.;OPOS=142162306;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:62:38:39:22:23:0.370968:12:10:14:24:13:10:15:24
chr7	142168414	.	G	C	36.91	PASS	AF=0.122807;AO=7;DP=57;FAO=7;FDP=57;FR=.;FRO=50;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=29;FSRR=21;FWDB=-0.00736989;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.602;QD=2.5899;RBI=0.0074491;REFB=-0.00197189;REVB=0.00108339;RO=49;SAF=2;SAR=5;SRF=28;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.331969;STB=0.748114;STBP=0.218;TYPE=snp;VARB=0.0081491;OID=.;OPOS=142168414;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:57:57:49:50:7:7:0.122807:5:2:28:21:5:2:29:21
chr7	142168429	.	A	G	876.67	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0429002;FXX=0.0322529;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.491;QD=58.4445;RBI=0.0429905;REFB=0;REVB=0.00278454;RO=0;SAF=33;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.00382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00128402;OID=.;OPOS=142168429;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:60:0:0:59:60:1:26:33:0:0:26:34:0:0
chr7	142168452	.	C	A	978.83	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00970745;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.032;QD=58.4377;RBI=0.0213701;REFB=0;REVB=0.019038;RO=0;SAF=36;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00107676;OID=.;OPOS=142168452;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:67:0:0:65:67:1:29:36:0:0:30:37:0:0
chr7	142168662	.	CG	TC	943.84	PASS	AF=1;AO=64;DP=66;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00994195;FXX=0.0302984;HRUN=1;LEN=2;MLLD=181.954;QD=58.9903;RBI=0.0300735;REFB=0;REVB=0.0283826;RO=0;SAF=29;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=4.83245e-05;OID=.;OPOS=142168662;OREF=CG;OALT=TC;OMAPALT=TC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:64:0:0:64:64:1:35:29:0:0:35:29:0:0
chr7	142168819	.	G	A	83.47	PASS	AF=0.323529;AO=11;DP=34;FAO=11;FDP=34;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=0.00221857;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.712;QD=9.82017;RBI=0.0491537;REFB=-0.0192639;REVB=0.0491036;RO=23;SAF=8;SAR=3;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.334127;STB=0.702918;STBP=0.128;TYPE=snp;VARB=0.0287854;OID=.;OPOS=142168819;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:34:34:23:23:11:11:0.323529:3:8:10:13:3:8:10:13
chr7	142168856	.	C	G	385.46	PASS	AF=0.90625;AO=29;DP=32;FAO=29;FDP=32;FR=.;FRO=3;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.00882129;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.3535;QD=48.1821;RBI=0.0396667;REFB=-0.0689925;REVB=-0.0386734;RO=3;SAF=15;SAR=14;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0320137;STB=0.517229;STBP=0.604;TYPE=snp;VARB=0.00838988;OID=.;OPOS=142168856;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:32:32:3:3:29:29:0.90625:14:15:1:2:14:15:1:2
chr7	142176378	.	A	G	1032.93	PASS	AF=1;AO=69;DP=71;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0237401;FXX=0.028165;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.518;QD=59.8798;RBI=0.029952;REFB=0;REVB=0.0182629;RO=0;SAF=27;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.56939e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.00371e-05;OID=.;OPOS=142176378;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:69:0:0:69:69:1:42:27:0:0:42:27:0:0
chr7	142180646	.	AG	CT	67.09	PASS	AF=0.104651;AO=18;DP=174;FAO=18;FDP=172;FR=.;FRO=154;FSAF=17;FSAR=1;FSRF=84;FSRR=70;FWDB=-0.0247094;FXX=0.0114936;HRUN=1;LEN=2;MLLD=233.165;QD=1.56015;RBI=0.0379015;REFB=-0.000851384;REVB=-0.0287397;RO=152;SAF=17;SAR=1;SRF=83;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.546721;STB=0.922245;STBP=0;TYPE=mnp;VARB=0.00700937;OID=.;OPOS=142180646;OREF=AG;OALT=CT;OMAPALT=CT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:174:172:152:154:18:18:0.104651:1:17:83:69:1:17:84:70
chr7	142180704	.	G	T	407.81	PASS	AF=0.277512;AO=58;DP=209;FAO=58;FDP=209;FR=.;FRO=151;FSAF=22;FSAR=36;FSRF=61;FSRR=90;FWDB=-0.00145223;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.472;QD=7.80493;RBI=0.00234439;REFB=-0.00221687;REVB=0.00184043;RO=150;SAF=22;SAR=36;SRF=60;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0266878;STB=0.518744;STBP=0.723;TYPE=snp;VARB=0.00495555;OID=.;OPOS=142180704;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:209:209:150:151:58:58:0.277512:36:22:60:90:36:22:61:90
chr7	142180737	.	T	A	484.1	PASS	AF=0.322751;AO=61;DP=190;FAO=61;FDP=189;FR=.;FRO=128;FSAF=24;FSAR=37;FSRF=56;FSRR=72;FWDB=-0.00323619;FXX=0.00526288;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.545;QD=10.2454;RBI=0.00519677;REFB=-0.0102491;REVB=-0.00406613;RO=128;SAF=24;SAR=37;SRF=56;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0533809;STB=0.530836;STBP=0.566;TYPE=snp;VARB=0.0469971;OID=.;OPOS=142180737;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:190:189:128:128:61:61:0.322751:37:24:56:72:37:24:56:72
chr7	142180770	.	T	C	433.5	PASS	AF=0.335329;AO=55;DP=166;FAO=56;FDP=167;FR=.;FRO=111;FSAF=23;FSAR=33;FSRF=52;FSRR=59;FWDB=0.0030622;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=302.42;QD=10.3833;RBI=0.00457475;REFB=-0.00415871;REVB=-0.00339871;RO=109;SAF=23;SAR=32;SRF=52;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0689405;STB=0.539084;STBP=0.455;TYPE=snp;VARB=0.0102358;OID=.;OPOS=142180770;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:166:167:109:111:55:56:0.335329:32:23:52:57:33:23:52:59
chr7	142231701	.	G	T	740.4	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0344824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.927;QD=56.9536;RBI=0.034599;REFB=0;REVB=-0.00283709;RO=0;SAF=36;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000206162;OID=.;OPOS=142231701;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:16:36:0:0:16:36:0:0
chr7	142242511	.	A	G	47.37	PASS	AF=0.102564;AO=12;DP=117;FAO=12;FDP=117;FR=.;FRO=105;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=55;FSRR=50;FWDB=-0.0414936;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.9999;QD=1.61947;RBI=0.0436659;REFB=-0.00605958;REVB=0.0136014;RO=105;SAF=7;SAR=5;SRF=55;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0712631;STB=0.553866;STBP=0.73;TYPE=snp;VARB=0.0525127;OID=.;OPOS=142242511;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:117:117:105:105:12:12:0.102564:5:7:55:50:5:7:55:50
chr7	142242552	.	G	T	38.46	PASS	AF=0.105882;AO=9;DP=85;FAO=9;FDP=85;FR=.;FRO=76;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=37;FSRR=39;FWDB=-0.0277314;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=245.316;QD=1.81;RBI=0.0277553;REFB=-0.00303932;REVB=0.00115158;RO=75;SAF=4;SAR=5;SRF=36;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0421127;STB=0.537973;STBP=0.821;TYPE=snp;VARB=0.0228907;OID=.;OPOS=142242552;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:85:85:75:76:9:9:0.105882:5:4:36:39:5:4:37:39
chr7	142247134	.	T	C	888.48	PASS	AF=0.984127;AO=62;DP=63;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0170874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.248;QD=56.4114;RBI=0.0793642;REFB=-0.112996;REVB=0.0775028;RO=0;SAF=31;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507934;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=0.000565984;OID=.;OPOS=142247134;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:63:63:0:1:62:62:0.984127:31:31:0:0:31:31:0:1
chr7	142247263	.	G	A	122.27	PASS	AF=0.340909;AO=14;DP=43;FAO=15;FDP=44;FR=.;FRO=29;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=0.00521768;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.105;QD=11.1158;RBI=0.00844172;REFB=-0.000534767;REVB=0.00663615;RO=29;SAF=4;SAR=10;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199707;STB=0.633709;STBP=0.233;TYPE=snp;VARB=0.00225919;OID=.;OPOS=142247263;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:44:29:29:14:15:0.340909:10:4:13:16:11:4:13:16
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chr7	142250938	.	T	G	718.01	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0442505;FXX=0.0425441;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.126;QD=63.823;RBI=0.0442894;REFB=0;REVB=-0.00185421;RO=0;SAF=23;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000524477;OID=.;OPOS=142250938;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:22:23:0:0:22:23:0:0
chr7	142250988	.	G	A	483.1	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0211069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.2861;QD=58.5576;RBI=0.0239618;REFB=0;REVB=-0.0113431;RO=0;SAF=12;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000176375;OID=.;OPOS=142250988;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:21:12:0:0:21:12:0:0
chr7	142251132	.	G	T	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0375212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=306.498;QD=51.9167;RBI=0.0413383;REFB=0;REVB=0.0173498;RO=0;SAF=10;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000262484;OID=.;OPOS=142251132;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:11:10:0:0:11:10:0:0
chr7	142326607	.	C	T	363.6	PASS	AF=0.372881;AO=44;DP=117;FAO=44;FDP=118;FR=.;FRO=74;FSAF=27;FSAR=17;FSRF=27;FSRR=47;FWDB=-0.00434975;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.468;QD=12.3255;RBI=0.0168689;REFB=-0.00866048;REVB=-0.0162985;RO=73;SAF=27;SAR=17;SRF=27;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.26314;STB=0.652993;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0141473;OID=.;OPOS=142326607;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:117:118:73:74:44:44:0.372881:17:27:27:46:17:27:27:47
chr7	142326783	.	A	G	138.0	PASS	AF=0.736842;AO=14;DP=19;FAO=14;FDP=19;FR=.;FRO=5;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.00783376;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=126.501;QD=29.0523;RBI=0.0125627;REFB=-0.00338912;REVB=-0.0098211;RO=5;SAF=7;SAR=7;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0471926;STB=0.526278;STBP=0.743;TYPE=snp;VARB=5.71461e-05;OID=.;OPOS=142326783;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:19:19:5:5:14:14:0.736842:7:7:3:2:7:7:3:2
chr7	142326909	.	C	A,G	616.53	PASS	AF=0.0731707,0.926829;AO=3,38;DP=41;FAO=3,38;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=3,16;FSAR=0,22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0164611,0.00268779;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=163.1,65.059;QD=60.1492;RBI=0.0274355,0.0697116;REFB=0,0;REVB=-0.0219485,0.0696598;RO=0;SAF=3,16;SAR=0,22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00535798,0.00689337;OID=.,.;OPOS=142326909,142326909;OREF=C,C;OALT=A,G;OMAPALT=A,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:13:41:41:0:0:3,38:3,38:0.0731707,0.926829:0,22:3,16:0:0:0,22:3,16:0:0
chr7	142334648	.	A	T	222.69	PASS	AF=0.375;AO=27;DP=72;FAO=27;FDP=72;FR=.;FRO=45;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=25;FSRR=20;FWDB=-0.00472311;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.128;QD=12.3717;RBI=0.0278308;REFB=-0.00436374;REVB=-0.0274271;RO=43;SAF=12;SAR=15;SRF=24;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121386;STB=0.56918;STBP=0.394;TYPE=snp;VARB=0.00733245;OID=.;OPOS=142334648;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:43:45:27:27:0.375:15:12:24:19:15:12:25:20
chr7	142334744	.	C	A	551.98	PASS	AF=0.535354;AO=45;DP=92;FAO=53;FDP=99;FR=.;FRO=46;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=26;FSRR=20;FWDB=0.0198282;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.402;QD=22.3023;RBI=0.0198637;REFB=-0.0180693;REVB=-0.00118703;RO=47;SAF=18;SAR=27;SRF=26;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14203;STB=0.552151;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.0140295;OID=.;OPOS=142334744;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:99:47:46:45:53:0.535354:27:18:26:21:29:24:26:20
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chr7	142374083	.	A	G	221.65	PASS	AF=0.375;AO=27;DP=72;FAO=27;FDP=72;FR=.;FRO=45;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=27;FWDB=0.042145;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.898;QD=12.3139;RBI=0.0565009;REFB=0.00431397;REVB=0.0376318;RO=45;SAF=15;SAR=12;SRF=18;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167729;STB=0.59626;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=-0.00846916;OID=.;OPOS=142374083;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:45:45:27:27:0.375:12:15:18:27:12:15:18:27
chr7	142378633	.	G	A	205.09	PASS	AF=0.42;AO=21;DP=50;FAO=21;FDP=50;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=0.020436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.9745;QD=16.4069;RBI=0.0949259;REFB=0.00221119;REVB=0.0927;RO=28;SAF=8;SAR=13;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191106;STB=0.599904;STBP=0.216;TYPE=snp;VARB=-0.00201064;OID=.;OPOS=142378633;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:28:29:21:21:0.42:13:8:16:12:13:8:16:13
chr7	142378831	.	C	G	716.29	PASS	AF=1;AO=47;DP=48;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0181182;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.247;QD=57.3033;RBI=0.0432199;REFB=0;REVB=0.0392388;RO=0;SAF=20;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.78786e-05;OID=.;OPOS=142378831;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:50:0:0:47:50:1:27:20:0:0:30:20:0:0
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chr7	142458451	.	A	T	126.42	PASS	AF=0.143617;AO=27;DP=188;FAO=27;FDP=188;FR=.;FRO=161;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=83;FSRR=78;FWDB=0.0165221;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.529;QD=2.68975;RBI=0.0166691;REFB=0.000893618;REVB=0.00220833;RO=158;SAF=13;SAR=14;SRF=81;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.039674;STB=0.529112;STBP=0.749;TYPE=snp;VARB=-0.00902979;OID=.;OPOS=142458451;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:188:188:158:161:27:27:0.143617:14:13:81:77:14:13:83:78
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chr7	142458841	.	AT	A	31.89	PASS	AF=0.12;AO=6;DP=51;FAO=6;FDP=50;FR=.;FRO=44;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=30;FSRR=14;FWDB=0.0150487;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.837;QD=2.55107;RBI=0.0191918;REFB=-0.00155904;REVB=-0.0119105;RO=45;SAF=4;SAR=2;SRF=31;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0296391;STB=0.515102;STBP=0.948;TYPE=del;VARB=0.0511591;OID=.;OPOS=142458842;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.12:6:51:6:50:44:4:2:30:14:31:45:4:2:31:14
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chr7	142458987	.	C	G	31.03	PASS	AF=0.1;AO=7;DP=69;FAO=7;FDP=70;FR=.;FRO=63;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=36;FSRR=27;FWDB=-0.0203769;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.976;QD=1.77338;RBI=0.0398986;REFB=-0.00658934;REVB=-0.0343028;RO=62;SAF=3;SAR=4;SRF=35;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155432;STB=0.626156;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.0521388;OID=.;OPOS=142458987;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:31:69:70:62:63:7:7:0.1:4:3:35:27:4:3:36:27
chr7	142460335	.	A	G	210.04	PASS	AF=0.201117;AO=36;DP=179;FAO=36;FDP=179;FR=.;FRO=143;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=84;FSRR=59;FWDB=0.0158724;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.1101;QD=4.69354;RBI=0.0159049;REFB=-0.000757109;REVB=-0.00101554;RO=143;SAF=19;SAR=17;SRF=84;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0771707;STB=0.548018;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.00381596;OID=.;OPOS=142460335;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:179:179:143:143:36:36:0.201117:17:19:84:59:17:19:84:59
chr7	142460369	.	G	A	128.59	PASS	AF=0.156627;AO=26;DP=167;FAO=26;FDP=166;FR=.;FRO=140;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=75;FSRR=65;FWDB=0.0331893;FXX=0.00598767;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.234;QD=3.0985;RBI=0.0335528;REFB=-0.000612776;REVB=-0.00492581;RO=141;SAF=15;SAR=11;SRF=76;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0489878;STB=0.535184;STBP=0.712;TYPE=snp;VARB=0.0048255;OID=.;OPOS=142460369;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:167:166:141:140:26:26:0.156627:11:15:76:65:11:15:75:65
chr7	142460394	.	T	C	75.67	PASS	AF=0.116883;AO=18;DP=154;FAO=18;FDP=154;FR=.;FRO=136;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=71;FSRR=65;FWDB=0.026676;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.0521;QD=1.96544;RBI=0.0364496;REFB=-0.00138663;REVB=-0.0248387;RO=135;SAF=9;SAR=9;SRF=70;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0228325;STB=0.519459;STBP=0.853;TYPE=snp;VARB=0.0112546;OID=.;OPOS=142460394;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:154:154:135:136:18:18:0.116883:9:9:70:65:9:9:71:65
chr7	142479915	.	T	C	920.41	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0119945;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.436;QD=58.4387;RBI=0.0160868;REFB=0;REVB=-0.01072;RO=0;SAF=29;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.63848e-05;OID=.;OPOS=142479915;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:63:0:0:62:63:1:33:29:0:0:33:30:0:0
chr7	142479954	.	C	T	1572.5	PASS	AF=0.99;AO=99;DP=100;FAO=99;FDP=100;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=57;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0013197;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.443;QD=62.8998;RBI=0.00296793;REFB=0.0621982;REVB=-0.00265838;RO=1;SAF=42;SAR=57;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0111598;STB=0.505881;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=-9.96359e-05;OID=.;OPOS=142479954;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:100:100:1:1:99:99:0.99:57:42:1:0:57:42:1:0
chr7	142480002	.	C	A	1739.6	PASS	AF=0.983051;AO=116;DP=118;FAO=116;FDP=118;FR=.;FRO=2;FSAF=50;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0068468;FXX=0.00840265;HRUN=3;LEN=1;MLLD=227.791;QD=58.9695;RBI=0.0250917;REFB=-0.0816947;REVB=0.0241395;RO=2;SAF=50;SAR=66;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141723;STB=0.507461;STBP=0.25;TYPE=snp;VARB=-4.88527e-05;OID=.;OPOS=142480002;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:118:118:2:2:116:116:0.983051:66:50:0:2:66:50:0:2
chr7	142480019	.	T	G	689.99	PASS	AF=0.596491;AO=45;DP=116;FAO=68;FDP=114;FR=.,HEALED;FRO=46;FSAF=21;FSAR=47;FSRF=24;FSRR=22;FWDB=0.00997297;FXX=0.0172399;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.946;QD=24.2101;RBI=0.0106615;REFB=-0.00586889;REVB=-0.00376925;RO=46;SAF=20;SAR=25;SRF=24;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0706456;STB=0.593406;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.00547115;OID=.;OPOS=142480019;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:116:114:46:46:45:68:0.596491:25:20:24:22:47:21:24:22
chr7	142480020	.	C	G	132.49	PASS	AF=0.196581;AO=23;DP=117;FAO=23;FDP=117;FR=.;FRO=94;FSAF=1;FSAR=22;FSRF=45;FSRR=49;FWDB=-0.0416103;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=128.364;QD=4.52951;RBI=0.0416217;REFB=-0.0185226;REVB=-0.000974746;RO=94;SAF=1;SAR=22;SRF=45;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.660192;STB=0.933993;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0380107;OID=.;OPOS=142480020;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:117:117:94:94:23:23:0.196581:22:1:45:49:22:1:45:49
chr7	142480067	.	C	T	902.69	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00579416;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.117;QD=58.2382;RBI=0.00612338;REFB=0;REVB=-0.0019808;RO=0;SAF=24;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.6422e-06;OID=.;OPOS=142480067;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:38:24:0:0:38:24:0:0
chr7	142494043	.	CAGAAA	ACTGTG	88.0	PASS	AF=1;AO=5;DP=16;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.010133;FXX=0.499688;HRUN=2;LEN=6;MLLD=239.583;QD=43.9975;RBI=0.010133;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=5;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.00572224;OID=.;OPOS=142494043;OREF=CAGAAA;OALT=ACTGTG;OMAPALT=ACTGTG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:16:8:0:0:5:8:1:0:5:0:0:0:8:0:0
chr7	142498732	.	GAAAAAC	GAACAAG	92.68	PASS	AF=0.235294;AO=12;DP=52;FAO=12;FDP=51;FR=.,HEALED;FRO=38;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=-0.0259524;FXX=0.0192271;HRUN=5;LEN=4;MLLD=220.474;QD=7.26887;RBI=0.0300365;REFB=0.00159747;REVB=0.0151216;RO=31;SAF=6;SAR=6;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0189251;STB=0.519967;STBP=0.866;TYPE=mnp;VARB=-0.013496;OID=.;OPOS=142498735;OREF=AAAC;OALT=CAAG;OMAPALT=GAACAAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.235294:12:52:12:51:38:6:6:20:18:88:31:6:6:15:16
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chr7	142499071	.	T	C	363.56	PASS	AF=0.428571;AO=39;DP=91;FAO=39;FDP=91;FR=.;FRO=52;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=30;FWDB=-0.0725014;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.214;QD=15.9805;RBI=0.0748615;REFB=-0.00562807;REVB=-0.0186489;RO=51;SAF=22;SAR=17;SRF=21;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152636;STB=0.580206;STBP=0.188;TYPE=snp;VARB=0.0141213;OID=.;OPOS=142499071;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:51:52:39:39:0.428571:17:22:21:30:17:22:22:30
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chr7	143036337	.	C	T	304.95	PASS	AF=0.364583;AO=35;DP=96;FAO=35;FDP=96;FR=.;FRO=61;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=37;FSRR=24;FWDB=-0.0085112;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=302.756;QD=12.7061;RBI=0.0177718;REFB=0.00674325;REVB=-0.0156011;RO=61;SAF=14;SAR=21;SRF=37;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.226338;STB=0.629557;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=-0.0101603;OID=.;OPOS=143036337;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:96:61:61:35:35:0.364583:21:14:37:24:21:14:37:24
chr7	143042837	.	C	T	454.82	PASS	AF=0.494505;AO=45;DP=91;FAO=45;FDP=91;FR=.;FRO=46;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=-0.00376565;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.141;QD=19.9921;RBI=0.0287476;REFB=-0.0226043;REVB=-0.0284999;RO=46;SAF=24;SAR=21;SRF=22;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0501971;STB=0.527847;STBP=0.619;TYPE=snp;VARB=0.0299857;OID=.;OPOS=143042837;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:46:46:45:45:0.494505:21:24:22:24:21:24:22:24
chr7	143043240	.	C	T	173.69	PASS	AF=0.388889;AO=21;DP=54;FAO=21;FDP=54;FR=.;FRO=33;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=0.0357953;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.9701;QD=12.8656;RBI=0.0472137;REFB=0.0015864;REVB=0.0307869;RO=32;SAF=9;SAR=12;SRF=12;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.057938;STB=0.540945;STBP=0.638;TYPE=snp;VARB=-0.00143009;OID=.;OPOS=143043240;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:32:33:21:21:0.388889:12:9:12:20:12:9:12:21
chr7	143053260	.	A	G	557.13	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.01454;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.931;QD=60.2307;RBI=0.0274;REFB=0;REVB=0.0232239;RO=0;SAF=11;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000147307;OID=.;OPOS=143053260;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:26:11:0:0:26:11:0:0
chr7	143088823	.	T	C	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0206245;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.775;QD=55.656;RBI=0.0221541;REFB=0;REVB=0.00808913;RO=0;SAF=16;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000101153;OID=.;OPOS=143088823;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:11:16:0:0:11:16:0:0
chr7	143088867	.	T	C	386.6	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0222361;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.604;QD=55.2284;RBI=0.0320746;REFB=0;REVB=-0.0231156;RO=0;SAF=12;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.37224e-05;OID=.;OPOS=143088867;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:28:0:0:26:28:1:14:12:0:0:14:14:0:0
chr7	143093538	.	G	A	1528.31	PASS	AF=1;AO=95;DP=95;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000825532;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.0892;QD=63.0229;RBI=0.055475;REFB=0;REVB=-0.0554688;RO=0;SAF=44;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00425092;OID=.;OPOS=143093538;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:97:0:0:95:97:1:51:44:0:0:53:44:0:0
chr7	143097100	.	A	G	411.12	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0379473;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.4517;QD=56.7065;RBI=0.0611363;REFB=0;REVB=-0.0479338;RO=0;SAF=9;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000173757;OID=.;OPOS=143097100;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:20:9:0:0:20:9:0:0
chr7	143140930	.	GTCT	G	185.23	PASS	AF=0.413043;AO=19;DP=49;FAO=19;FDP=46;FR=.;FRO=27;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=-0.0205412;FXX=0.079984;HRUN=1;LEN=3;MLLD=255.043;QD=16.1066;RBI=0.0270174;REFB=-0.0182196;REVB=-0.01755;RO=27;SAF=7;SAR=12;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119036;STB=0.568647;STBP=0.419;TYPE=del;VARB=0.0242769;OID=.;OPOS=143140931;OREF=TCT;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.413043:19:49:19:46:27:7:12:13:14:99:27:7:12:13:14
chr7	143141475	.	T	C	56.83	PASS	AF=0.421053;AO=8;DP=19;FAO=8;FDP=19;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=-0.00410181;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.5292;QD=11.9648;RBI=0.0156751;REFB=-0.0234362;REVB=0.0151289;RO=11;SAF=2;SAR=6;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132829;STB=0.580431;STBP=0.634;TYPE=snp;VARB=0.0193899;OID=.;OPOS=143141475;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:19:19:11:11:8:8:0.421053:6:2:4:7:6:2:4:7
chr7	143270172	.	A	G	1163.69	PASS	AF=0.575269;AO=107;DP=184;FAO=107;FDP=186;FR=.;FRO=79;FSAF=22;FSAR=85;FSRF=24;FSRR=55;FWDB=0.0393257;FXX=0.00534731;HRUN=4;LEN=1;MLLD=47.2924;QD=25.0256;RBI=0.0833388;REFB=0.0166998;REVB=-0.0734768;RO=76;SAF=22;SAR=85;SRF=24;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118624;STB=0.559359;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=-0.0127276;OID=.;OPOS=143270172;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:184:186:76:79:107:107:0.575269:85:22:24:52:85:22:24:55
chr7	143451825	.	C	T	105.82	PASS	AF=0.351351;AO=13;DP=37;FAO=13;FDP=37;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=-0.0198916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.81;QD=11.4395;RBI=0.0199554;REFB=0.0073883;REVB=0.00159562;RO=24;SAF=7;SAR=6;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0420088;STB=0.524961;STBP=0.811;TYPE=snp;VARB=-0.0149485;OID=.;OPOS=143451825;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:24:24:13:13:0.351351:6:7:12:12:6:7:12:12
chr7	143453499	.	T	C	116.14	PASS	AF=0.191919;AO=19;DP=99;FAO=19;FDP=99;FR=.;FRO=80;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=33;FSRR=47;FWDB=-0.0253991;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=253.84;QD=4.69255;RBI=0.0280557;REFB=-0.00906154;REVB=0.0119165;RO=80;SAF=9;SAR=10;SRF=33;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0781587;STB=0.549788;STBP=0.677;TYPE=snp;VARB=0.0433529;OID=.;OPOS=143453499;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:80:80:19:19:0.191919:10:9:33:47:10:9:33:47
chr7	143632618	.	C	T	518.44	PASS	AF=0.478261;AO=55;DP=115;FAO=55;FDP=115;FR=.;FRO=60;FSAF=26;FSAR=29;FSRF=26;FSRR=34;FWDB=0.0225905;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.588;QD=18.0326;RBI=0.0243694;REFB=-0.0133519;REVB=0.00913988;RO=59;SAF=26;SAR=29;SRF=26;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0300656;STB=0.520654;STBP=0.704;TYPE=snp;VARB=0.0140113;OID=.;OPOS=143632618;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:115:59:60:55:55:0.478261:29:26:26:33:29:26:26:34
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chr7	143657801	.	A	G	357.6	PASS	AF=0.428571;AO=37;DP=91;FAO=39;FDP=91;FR=.;FRO=52;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=33;FSRR=19;FWDB=0.0125631;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.373;QD=15.7188;RBI=0.0238538;REFB=-0.0162897;REVB=-0.0202774;RO=54;SAF=20;SAR=17;SRF=33;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0750017;STB=0.569857;STBP=0.25;TYPE=snp;VARB=0.0212943;OID=.;OPOS=143657801;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:54:52:37:39:0.428571:17:20:33:21:19:20:33:19
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chr7	143956742	.	C	G	1317.58	PASS	AF=0.460526;AO=139;DP=303;FAO=140;FDP=304;FR=.;FRO=164;FSAF=61;FSAR=79;FSRF=84;FSRR=80;FWDB=-0.0241865;FXX=0.00327858;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.9748;QD=17.3366;RBI=0.0264132;REFB=-0.0105106;REVB=-0.0106146;RO=163;SAF=60;SAR=79;SRF=83;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0762994;STB=0.541499;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=0.0117927;OID=.;OPOS=143956742;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:303:304:163:164:139:140:0.460526:79:60:83:80:79:61:84:80
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chr7	144015437	.	C	T	980.12	PASS	AF=0.985294;AO=67;DP=69;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0205744;FXX=0.0144907;HRUN=3;LEN=1;MLLD=93.9374;QD=57.6539;RBI=0.031214;REFB=-0.0965391;REVB=-0.0234736;RO=1;SAF=42;SAR=25;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0185257;STB=0.509801;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=0.00089509;OID=.;OPOS=144015437;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:69:68:1:1:67:67:0.985294:25:42:0:1:25:42:0:1
chr7	144070301	.	G	A	338.37	PASS	AF=0.37963;AO=41;DP=108;FAO=41;FDP=108;FR=.;FRO=67;FSAF=25;FSAR=16;FSRF=46;FSRR=21;FWDB=-0.0131366;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.0853;QD=12.5323;RBI=0.0212226;REFB=-0.0095871;REVB=0.0166682;RO=67;SAF=25;SAR=16;SRF=46;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0901956;STB=0.551165;STBP=0.459;TYPE=snp;VARB=0.0152242;OID=.;OPOS=144070301;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:108:67:67:41:41:0.37963:16:25:46:21:16:25:46:21
chr7	144095600	.	A	G	115.97	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0179885;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.072;QD=42.1719;RBI=0.0431389;REFB=0;REVB=-0.0392094;RO=0;SAF=9;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00288569;OID=.;OPOS=144095600;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:2:9:0:0:2:9:0:0
chr7	144096174	.	TGGGGGGCT	TGGGGGCTG	55.27	PASS	AF=0.285714;AO=5;DP=22;FAO=6;FDP=21;FR=.,HEALED;FRO=10;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.0264875;FXX=0;HRUN=6;LEN=3;MLLD=18.509;QD=10.5284;RBI=0.0937362;REFB=-0.0744838;REVB=-0.089916;RO=9;SAF=0;SAR=5;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.761805;STB=0.832222;STBP=0.065;TYPE=mnp;VARB=0.105842;OID=.;OPOS=144096180;OREF=GCT;OALT=CTG;OMAPALT=TGGGGGCTG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.285714:5:22:6:21:10:1:5:7:3:30:9:0:5:6:3
chr7	144098992	.	G	A	731.09	PASS	AF=0.96;AO=47;DP=49;FAO=48;FDP=50;FR=.;FRO=2;FSAF=30;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0193515;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=47.9929;QD=58.487;RBI=0.0340963;REFB=0.0524893;REVB=0.0280728;RO=2;SAF=30;SAR=17;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0521576;STB=0.526305;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=-0.0022276;OID=.;OPOS=144098992;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:49:50:2:2:47:48:0.96:17:30:0:2:18:30:0:2
chr7	148113623	.	ATAGTT	A	188.51	PASS	AF=1;AO=13;DP=15;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00766127;FXX=0;HRUN=1;LEN=5;MLLD=317.013;QD=47.1281;RBI=0.0156051;REFB=0;REVB=-0.013595;RO=0;SAF=2;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-1.50122e-05;OID=.;OPOS=148113624;OREF=TAGTT;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:13:15:16:16:0:3:13:0:0:4:0:2:11:0:0
chr7	148131742	.	G	A	418.16	PASS	AF=0.967742;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00724906;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.019;QD=53.9554;RBI=0.0683423;REFB=-0.124014;REVB=0.0679568;RO=1;SAF=17;SAR=13;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0266361;STB=0.514276;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.00186283;OID=.;OPOS=148131742;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:31:31:1:1:30:30:0.967742:13:17:1:0:13:17:1:0
chr7	148143136	.	A	G	2026.77	PASS	AF=1;AO=130;DP=130;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0268068;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.8593;QD=62.362;RBI=0.027365;REFB=0;REVB=-0.00549928;RO=0;SAF=62;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.98983e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000155965;OID=.;OPOS=148143136;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:130:130:0:0:130:130:1:68:62:0:0:68:62:0:0
chr7	148456697	.	A	G	67.81	PASS	AF=0.2;AO=10;DP=50;FAO=10;FDP=50;FR=.;FRO=40;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=20;FSRR=20;FWDB=0.0392373;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.912;QD=5.4244;RBI=0.04896;REFB=2.35195e-05;REVB=0.0292835;RO=39;SAF=8;SAR=2;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.377638;STB=0.758072;STBP=0.11;TYPE=snp;VARB=0.00221796;OID=.;OPOS=148456697;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:50:50:39:40:10:10:0.2:2:8:20:19:2:8:20:20
chr7	148481488	.	G	A	289.1	PASS	AF=0.5;AO=31;DP=63;FAO=31;FDP=62;FR=.;FRO=31;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=-0.0102316;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.87;QD=18.6517;RBI=0.0299625;REFB=-0.014111;REVB=-0.0281614;RO=29;SAF=16;SAR=15;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0886822;STB=0.532204;STBP=0.657;TYPE=snp;VARB=0.0155049;OID=.;OPOS=148481488;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:62:29:31:31:31:0.5:15:16:12:17:15:16:14:17
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chr7	148700542	.	A	C	57.93	PASS	AF=0.470588;AO=8;DP=17;FAO=8;FDP=17;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.013084;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=211.108;QD=13.631;RBI=0.0380247;REFB=-0.013519;REVB=0.0357027;RO=9;SAF=3;SAR=5;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162764;STB=0.596769;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=0.0163539;OID=.;OPOS=148700542;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:17:17:9:9:8:8:0.470588:5:3:5:4:5:3:5:4
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chr7	148730171	.	G	A	285.99	PASS	AF=0.557692;AO=29;DP=52;FAO=29;FDP=52;FR=.;FRO=23;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=-0.00699218;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.526;QD=21.9989;RBI=0.0115677;REFB=-0.00507356;REVB=0.00921525;RO=23;SAF=13;SAR=16;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127518;STB=0.570625;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=0.00522529;OID=.;OPOS=148730171;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:23:23:29:29:0.557692:16:13:14:9:16:13:14:9
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chr7	148730191	.	C	T	371.57	PASS	AF=0.569231;AO=37;DP=65;FAO=37;FDP=65;FR=.;FRO=28;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=-0.0112819;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.7533;QD=22.8658;RBI=0.0285933;REFB=-0.0227543;REVB=-0.0262735;RO=28;SAF=18;SAR=19;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0663704;STB=0.536525;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.0163148;OID=.;OPOS=148730191;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:28:28:37:37:0.569231:19:18:16:12:19:18:16:12
chr7	148801337	.	T	C	166.42	PASS	AF=0.4;AO=18;DP=45;FAO=18;FDP=45;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=-0.0143991;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.841;QD=14.7926;RBI=0.0524785;REFB=0.0116992;REVB=0.0504644;RO=27;SAF=9;SAR=9;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0961317;STB=0.555495;STBP=0.562;TYPE=snp;VARB=-0.0167038;OID=.;OPOS=148801337;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:27:27:18:18:0.4:9:9:16:11:9:9:16:11
chr7	148801658	.	C	T	94.56	PASS	AF=0.611111;AO=11;DP=18;FAO=11;FDP=18;FR=.;FRO=7;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.0188868;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.632;QD=21.0135;RBI=0.0197414;REFB=-0.0120429;REVB=0.0057454;RO=7;SAF=7;SAR=4;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.327739;STB=0.685949;STBP=0.069;TYPE=snp;VARB=0.0117499;OID=.;OPOS=148801658;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:18:18:7:7:11:11:0.611111:4:7:1:6:4:7:1:6
chr7	148822810	.	C	T	1530.4	PASS	AF=1;AO=95;DP=95;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0611839;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.85;QD=63.7668;RBI=0.0628382;REFB=0;REVB=0.0143236;RO=0;SAF=51;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000114666;OID=.;OPOS=148822810;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:96:0:0:95:96:1:44:51:0:0:44:52:0:0
chr7	148848338	.	G	T	90.93	PASS	AF=0.428571;AO=11;DP=28;FAO=12;FDP=28;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.0131499;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.52;QD=12.9899;RBI=0.0440695;REFB=-0.00110283;REVB=0.0420619;RO=16;SAF=7;SAR=4;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.201167;STB=0.633918;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=0.00253589;OID=.;OPOS=148848338;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:90:28:28:16:16:11:12:0.428571:4:7:7:9:4:8:7:9
chr7	148848358	.	G	A	126.62	PASS	AF=0.5;AO=14;DP=28;FAO=14;FDP=28;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.0692448;FXX=0.0344709;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.674;QD=18.0886;RBI=0.0696509;REFB=-0.0207337;REVB=-0.00751002;RO=14;SAF=7;SAR=7;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.024202;OID=.;OPOS=148848358;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:28:14:14:14:14:0.5:7:7:7:7:7:7:7:7
chr7	148851213	.	G	A	632.25	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0195569;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=232.684;QD=61.6833;RBI=0.023157;REFB=0;REVB=0.0124007;RO=0;SAF=18;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.51554e-05;OID=.;OPOS=148851213;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:23:18:0:0:23:18:0:0
chr7	148851273	.	G	C	207.21	PASS	AF=0.588235;AO=20;DP=34;FAO=20;FDP=34;FR=.;FRO=14;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=-0.00274062;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.523;QD=24.3773;RBI=0.0362177;REFB=-0.0169383;REVB=0.0361139;RO=14;SAF=14;SAR=6;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.31227;STB=0.67452;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.00855163;OID=.;OPOS=148851273;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:14:14:20:20:0.588235:6:14:4:10:6:14:4:10
chr7	148937136	.	C	A	387.97	PASS	AF=0.575758;AO=34;DP=62;FAO=38;FDP=66;FR=.;FRO=28;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=7;FSRR=21;FWDB=0.054611;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.029;QD=23.5131;RBI=0.0551923;REFB=-0.0144944;REVB=0.00798917;RO=28;SAF=13;SAR=21;SRF=7;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118408;STB=0.576176;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=0.0159403;OID=.;OPOS=148937136;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:66:28:28:34:38:0.575758:21:13:7:21:22:16:7:21
chr7	148979649	.	G	T	397.17	PASS	AF=0.428571;AO=45;DP=105;FAO=45;FDP=105;FR=.;FRO=60;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=24;FSRR=36;FWDB=-0.00681305;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.633;QD=15.1302;RBI=0.0136436;REFB=-0.00983988;REVB=-0.0118207;RO=57;SAF=18;SAR=27;SRF=22;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0146286;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0150132;OID=.;OPOS=148979649;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:105:57:60:45:45:0.428571:27:18:22:35:27:18:24:36
chr7	148991624	.	C	T	66.9	PASS	AF=0.428571;AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=0.000204462;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=239.273;QD=12.7428;RBI=0.00730596;REFB=-0.0160721;REVB=0.0073031;RO=12;SAF=3;SAR=6;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0940419;STB=0.555438;STBP=0.691;TYPE=snp;VARB=0.025401;OID=.;OPOS=148991624;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:21:21:12:12:9:9:0.428571:6:3:3:9:6:3:3:9
chr7	148991711	.	CA	C,CG	299.24	PASS	AF=0.130435,0.869565;AO=3,20;DP=23;FAO=3,20;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=1,12;FSAR=2,8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00853681,-0.00693294;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=93.1035,115.318;QD=52.0416;RBI=0.0467761,0.0336397;REFB=0,0;REVB=0.0459905,0.0329175;RO=0;SAF=1,12;SAR=2,8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0511839,-0.0139415;OID=.,.;OPOS=148991712,148991712;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=C,CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.130435,0.869565:3,20:23:3,20:23:0:1,12:2,8:0:0:11:0:1,12:2,8:0:0
chr7	148991853	.	G	A	146.85	PASS	AF=0.346154;AO=18;DP=52;FAO=18;FDP=52;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=-0.00274138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.824;QD=11.2959;RBI=0.00716687;REFB=-0.0114543;REVB=-0.00662184;RO=34;SAF=12;SAR=6;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192046;STB=0.613204;STBP=0.248;TYPE=snp;VARB=0.0189851;OID=.;OPOS=148991853;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:34:34:18:18:0.346154:6:12:17:17:6:12:17:17
chr7	149112306	.	A	G	465.13	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00202609;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.263;QD=58.1417;RBI=0.0431531;REFB=0;REVB=-0.0431055;RO=0;SAF=8;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00030896;OID=.;OPOS=149112306;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:24:8:0:0:24:8:0:0
chr7	149152770	.	A	G	102.71	PASS	AF=0.521739;AO=11;DP=22;FAO=12;FDP=23;FR=.;FRO=11;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=0.0290493;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.639;QD=17.8623;RBI=0.0360193;REFB=-0.0187648;REVB=0.0212962;RO=11;SAF=8;SAR=3;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0933525;STB=0.567449;STBP=0.564;TYPE=snp;VARB=0.0201326;OID=.;OPOS=149152770;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:22:23:11:11:11:12:0.521739:3:8:7:4:3:9:7:4
chr7	149152906	.	G	A	258.62	PASS	AF=0.460317;AO=29;DP=63;FAO=29;FDP=63;FR=.;FRO=34;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=13;FWDB=0.00976388;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.851;QD=16.4202;RBI=0.0211916;REFB=0.00219774;REVB=0.0188083;RO=34;SAF=15;SAR=14;SRF=21;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0968546;STB=0.554418;STBP=0.459;TYPE=snp;VARB=-0.00249655;OID=.;OPOS=149152906;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:34:34:29:29:0.460317:14:15:21:13:14:15:21:13
chr7	149191460	.	G	A	701.79	PASS	AF=0.945455;AO=52;DP=55;FAO=52;FDP=55;FR=.;FRO=3;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.00996172;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.025;QD=51.0391;RBI=0.0124553;REFB=-0.0119133;REVB=-0.00747662;RO=3;SAF=26;SAR=26;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0170972;STB=0.509087;STBP=0.711;TYPE=snp;VARB=0.000131695;OID=.;OPOS=149191460;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:55:55:3:3:52:52:0.945455:26:26:1:2:26:26:1:2
chr7	149292293	.	G	A	472.41	PASS	AF=0.619718;AO=44;DP=71;FAO=44;FDP=71;FR=.;FRO=27;FSAF=27;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=-0.054174;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.952;QD=26.6145;RBI=0.0569443;REFB=-0.0111806;REVB=0.017545;RO=27;SAF=27;SAR=17;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14588;STB=0.579664;STBP=0.103;TYPE=snp;VARB=0.00658527;OID=.;OPOS=149292293;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:27:27:44:44:0.619718:17:27:11:16:17:27:11:16
chr7	149317053	.	T	C	520.23	PASS	AF=0.410072;AO=57;DP=139;FAO=57;FDP=139;FR=.;FRO=82;FSAF=28;FSAR=29;FSRF=42;FSRR=40;FWDB=0.00687061;FXX=0.00714235;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.8767;QD=14.9707;RBI=0.0356882;REFB=0.00317123;REVB=0.0350206;RO=82;SAF=28;SAR=29;SRF=42;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.021984;STB=0.512363;STBP=0.816;TYPE=snp;VARB=-0.0062541;OID=.;OPOS=149317053;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:139:139:82:82:57:57:0.410072:29:28:42:40:29:28:42:40
chr7	149318375	.	C	T	133.85	PASS	AF=0.666667;AO=14;DP=21;FAO=14;FDP=21;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=-0.00287316;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=246.412;QD=25.4946;RBI=0.0046172;REFB=-0.0336789;REVB=-0.00361435;RO=6;SAF=3;SAR=11;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0888882;STB=0.53393;STBP=0.771;TYPE=snp;VARB=0.0202504;OID=.;OPOS=149318375;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:21:21:6:7:14:14:0.666667:11:3:2:4:11:3:2:5
chr7	149318471	.	C	T	157.5	PASS	AF=0.447368;AO=14;DP=36;FAO=17;FDP=38;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=0.10093;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=41.8092;QD=16.5785;RBI=0.164869;REFB=-0.000157573;REVB=0.130365;RO=22;SAF=5;SAR=9;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0449826;STB=0.545402;STBP=0.61;TYPE=snp;VARB=0.0127762;OID=.;OPOS=149318471;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:38:22:21:14:17:0.447368:9:5:7:15:10:7:7:14
chr7	149332825	.	C	T	541.57	PASS	AF=0.676056;AO=48;DP=71;FAO=48;FDP=71;FR=.;FRO=23;FSAF=31;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=0.00389404;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=255.823;QD=30.5109;RBI=0.016785;REFB=-0.01637;REVB=0.016327;RO=23;SAF=31;SAR=17;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0240622;STB=0.513044;STBP=0.78;TYPE=snp;VARB=0.00628945;OID=.;OPOS=149332825;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:23:23:48:48:0.676056:17:31:14:9:17:31:14:9
chr7	149332841	.	GTGCC	GTGCT,TGCCC	562.86	PASS	AF=0.69697,0;AO=44,3;DP=67;FAO=46,0;FDP=66;FR=.,HEALED;FRO=13;FSAF=30,0;FSAR=16,0;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=-0.0175826,-0.00435632;FXX=0.0149231;HRUN=5,2;LEN=1,3;MLLD=205.233,33.9245;QD=34.1125;RBI=0.0178471,0.0272725;REFB=-0.0429919,-0.0207556;REVB=0.00306107,-0.0269223;RO=9;SAF=28,0;SAR=16,3;SRF=2;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.135814,-0.587581;STB=0.596287,0.5;STBP=0.014,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.0126508,0;OID=.,.;OPOS=149332845,149332841;OREF=C,GTG;OALT=T,TGC;OMAPALT=GTGCT,TGCCC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:71:67:66:9:13:44,3:46,0:0.69697,0:16,3:28,0:2:7:16,0:30,0:3:10
chr7	149335542	.	C	T	163.65	PASS	AF=0.53125;AO=17;DP=32;FAO=17;FDP=32;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.013195;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.0996;QD=20.4557;RBI=0.0321011;REFB=-0.00106587;REVB=-0.0292638;RO=15;SAF=6;SAR=11;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154764;STB=0.587681;STBP=0.328;TYPE=snp;VARB=0.000279104;OID=.;OPOS=149335542;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:15:15:17:17:0.53125:11:6:8:7:11:6:8:7
chr7	149344105	.	A	G	601.17	PASS	AF=0.97561;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0169907;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=231.244;QD=58.6503;RBI=0.018328;REFB=-0.0332432;REVB=0.00687242;RO=1;SAF=6;SAR=34;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0135993;STB=0.507243;STBP=0.639;TYPE=snp;VARB=0.00011255;OID=.;OPOS=149344105;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:41:41:1:1:40:40:0.97561:34:6:0:1:34:6:0:1
chr7	149426305	.	G	GC	544.71	PASS	AF=1;AO=48;DP=51;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0458364;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=23.3666;QD=44.4658;RBI=0.0774095;REFB=0;REVB=0.0623799;RO=3;SAF=20;SAR=28;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0654868;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00334567;OID=.;OPOS=149426306;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:48:51:49:49:0:21:28:0:0:9:3:20:28:3:0
chr7	149427409	.	T	G	1565.65	PASS	AF=1;AO=97;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0189049;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.5689;QD=63.904;RBI=0.0812262;REFB=0;REVB=-0.0789956;RO=0;SAF=28;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000305182;OID=.;OPOS=149427409;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:98:0:0:97:98:1:69:28:0:0:69:29:0:0
chr7	149474393	.	A	G	201.8	PASS	AF=0.413793;AO=24;DP=56;FAO=24;FDP=58;FR=.;FRO=34;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=-0.0110833;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=107.169;QD=13.9175;RBI=0.024929;REFB=-0.00264299;REVB=-0.0223297;RO=32;SAF=8;SAR=16;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112142;STB=0.585293;STBP=0.338;TYPE=snp;VARB=0.00460011;OID=.;OPOS=149474393;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:58:32:34:24:24:0.413793:16:8:14:18:16:8:16:18
chr7	149479335	.	G	C	542.19	PASS	AF=0.581395;AO=50;DP=86;FAO=50;FDP=86;FR=.;FRO=36;FSAF=31;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=0.00422172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.131;QD=25.2181;RBI=0.0178214;REFB=-0.0159165;REVB=-0.0173142;RO=36;SAF=31;SAR=19;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0733372;STB=0.540158;STBP=0.4;TYPE=snp;VARB=0.0137968;OID=.;OPOS=149479335;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:36:36:50:50:0.581395:19:31:19:17:19:31:19:17
chr7	149483237	.	G	A	258.67	PASS	AF=0.460317;AO=29;DP=63;FAO=29;FDP=63;FR=.;FRO=34;FSAF=6;FSAR=23;FSRF=11;FSRR=23;FWDB=-0.00750632;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=240.57;QD=16.4235;RBI=0.0104417;REFB=-0.0322884;REVB=-0.00725846;RO=34;SAF=6;SAR=23;SRF=11;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151708;STB=0.586143;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.0353257;OID=.;OPOS=149483237;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:34:34:29:29:0.460317:23:6:11:23:23:6:11:23
chr7	149484829	.	C	T	95.67	PASS	AF=0.611111;AO=11;DP=18;FAO=11;FDP=18;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=-0.00444075;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.579;QD=21.26;RBI=0.00657867;REFB=-0.0321699;REVB=-0.00485372;RO=7;SAF=2;SAR=9;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.490817;STB=0.782062;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.00419526;OID=.;OPOS=149484829;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:42:18:18:7:7:11:11:0.611111:9:2:6:1:9:2:6:1
chr7	149485059	.	T	C	99.96	PASS	AF=0.461538;AO=12;DP=26;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=13;FWDB=0.0797259;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.8962;QD=15.3781;RBI=0.0808461;REFB=-0.0324398;REVB=-0.0134117;RO=14;SAF=5;SAR=7;SRF=1;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.362409;STB=0.703959;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.020668;OID=.;OPOS=149485059;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:26:14:14:12:12:0.461538:7:5:1:13:7:5:1:13
chr7	149486294	.	A	G	520.67	PASS	AF=0.482456;AO=55;DP=112;FAO=55;FDP=114;FR=.;FRO=59;FSAF=24;FSAR=31;FSRF=28;FSRR=31;FWDB=-0.0059278;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.852;QD=18.2692;RBI=0.0399714;REFB=-0.0320932;REVB=-0.0395294;RO=55;SAF=24;SAR=31;SRF=28;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0662099;STB=0.519993;STBP=0.711;TYPE=snp;VARB=0.039775;OID=.;OPOS=149486294;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:114:55:59:55:55:0.482456:31:24:28:27:31:24:28:31
chr7	149486382	.	C	G	228.63	PASS	AF=0.35443;AO=28;DP=80;FAO=28;FDP=79;FR=.;FRO=51;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=34;FWDB=-0.0156433;FXX=0.0124984;HRUN=5;LEN=1;MLLD=190.12;QD=11.5763;RBI=0.0196014;REFB=-0.00880045;REVB=-0.0118111;RO=51;SAF=12;SAR=16;SRF=17;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110977;STB=0.563866;STBP=0.413;TYPE=snp;VARB=0.0161796;OID=.;OPOS=149486382;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:79:51:51:28:28:0.35443:16:12:17:34:16:12:17:34
chr7	149489491	.	C	T	272.22	PASS	AF=0.46875;AO=30;DP=65;FAO=30;FDP=64;FR=.;FRO=34;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=-0.00951702;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.483;QD=17.0137;RBI=0.0305625;REFB=-0.0122589;REVB=-0.0290429;RO=34;SAF=20;SAR=10;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137981;STB=0.577724;STBP=0.252;TYPE=snp;VARB=0.0223555;OID=.;OPOS=149489491;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:64:34:34:30:30:0.46875:10:20:18:16:10:20:18:16
chr7	149499172	.	C	T	360.1	PASS	AF=0.571429;AO=36;DP=63;FAO=36;FDP=63;FR=.;FRO=27;FSAF=25;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=8;FWDB=-0.00243576;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.483;QD=22.8632;RBI=0.0399922;REFB=-0.0320117;REVB=0.0399179;RO=26;SAF=25;SAR=11;SRF=18;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00191677;STB=0.50469;STBP=0.952;TYPE=snp;VARB=0.0248903;OID=.;OPOS=149499172;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:26:27:36:36:0.571429:11:25:18:8:11:25:19:8
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chr7	150217335	.	G	T	246.27	PASS	AF=0.4375;AO=28;DP=66;FAO=28;FDP=64;FR=.;FRO=36;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=0.00315023;FXX=0.0302984;HRUN=3;LEN=1;MLLD=177.154;QD=15.392;RBI=0.00941509;REFB=-0.00163957;REVB=-0.00887243;RO=32;SAF=13;SAR=15;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.09285;STB=0.551188;STBP=0.496;TYPE=snp;VARB=0.00196272;OID=.;OPOS=150217335;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:64:32:36:28:28:0.4375:15:13:18:14:15:13:20:16
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chr7	150269542	.	G	T	227.47	PASS	AF=0.45614;AO=24;DP=55;FAO=26;FDP=57;FR=.;FRO=31;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=0.00836499;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.948;QD=15.9625;RBI=0.00956117;REFB=-0.0100046;REVB=0.00463065;RO=30;SAF=16;SAR=8;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.233535;STB=0.629529;STBP=0.098;TYPE=snp;VARB=0.0106384;OID=.;OPOS=150269542;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:57:30:31:24:26:0.45614:8:16:13:17:9:17:13:18
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chr7	150326923	.	C	T	510.16	PASS	AF=0.55814;AO=48;DP=86;FAO=48;FDP=86;FR=.;FRO=38;FSAF=29;FSAR=19;FSRF=29;FSRR=9;FWDB=-0.0131962;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.261;QD=23.7283;RBI=0.016001;REFB=-0.0171331;REVB=-0.00904949;RO=38;SAF=29;SAR=19;SRF=29;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13861;STB=0.575728;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=0.00909771;OID=.;OPOS=150326923;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:38:38:48:48:0.55814:19:29:29:9:19:29:29:9
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chr7	150556002	.	T	C	382.4	PASS	AF=0.449438;AO=39;DP=88;FAO=40;FDP=89;FR=.;FRO=49;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=24;FSRR=25;FWDB=-0.00774522;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.389;QD=17.1863;RBI=0.00855548;REFB=-0.0079183;REVB=0.00363426;RO=48;SAF=18;SAR=21;SRF=23;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0174092;STB=0.508156;STBP=0.879;TYPE=snp;VARB=0.0100288;OID=.;OPOS=150556002;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:89:48:49:39:40:0.449438:21:18:23:25:21:19:24:25
chr7	150556055	.	CG	GC	841.51	PASS	AF=1;AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0291421;FXX=0.0333278;HRUN=1;LEN=2;MLLD=185.889;QD=58.035;RBI=0.0305929;REFB=0;REVB=-0.00930955;RO=0;SAF=22;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000131769;OID=.;OPOS=150556055;OREF=CG;OALT=GC;OMAPALT=GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:58:0:0:58:58:1:36:22:0:0:36:22:0:0
chr7	150557622	.	G	A	452.21	PASS	AF=0.483871;AO=45;DP=93;FAO=45;FDP=93;FR=.;FRO=48;FSAF=27;FSAR=18;FSRF=19;FSRR=29;FWDB=0.00218306;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=209.781;QD=19.4501;RBI=0.00568829;REFB=-0.00328802;REVB=0.0052527;RO=48;SAF=27;SAR=18;SRF=19;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18917;STB=0.605104;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.0036363;OID=.;OPOS=150557622;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:48:48:45:45:0.483871:18:27:19:29:18:27:19:29
chr7	150557665	.	C	G	210.71	PASS	AF=0.371429;AO=25;DP=69;FAO=26;FDP=70;FR=.;FRO=44;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=27;FWDB=0.0283513;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.454;QD=12.0404;RBI=0.0287688;REFB=-0.00300688;REVB=0.00488338;RO=43;SAF=16;SAR=9;SRF=16;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.289156;STB=0.66654;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.00555737;OID=.;OPOS=150557665;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:70:43:44:25:26:0.371429:9:16:16:27:9:17:17:27
chr7	150648198	.	A	G	376.1	PASS	AF=1;AO=24;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0255985;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.507;QD=55.7182;RBI=0.0538837;REFB=0;REVB=0.0474149;RO=0;SAF=9;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00108104;OID=.;OPOS=150648198;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:24:27:1:15:9:0:0:18:9:0:0
chr7	150648789	.	T	C	1026.41	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00286139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.496;QD=59.5017;RBI=0.0151273;REFB=0;REVB=0.0148542;RO=0;SAF=31;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.29397e-05;OID=.;OPOS=150648789;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:38:31:0:0:38:31:0:0
chr7	150649531	.	G	A	449.57	PASS	AF=0.48913;AO=42;DP=89;FAO=45;FDP=92;FR=.;FRO=47;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=28;FWDB=-0.0297422;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.021;QD=19.5465;RBI=0.0555429;REFB=-0.0117508;REVB=0.0469086;RO=47;SAF=26;SAR=16;SRF=19;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.203843;STB=0.588309;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=0.0100275;OID=.;OPOS=150649531;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:92:47:47:42:45:0.48913:16:26:19:28:19:26:19:28
chr7	150649603	.	G	A	580.5	PASS	AF=0.416107;AO=62;DP=149;FAO=62;FDP=149;FR=.;FRO=87;FSAF=35;FSAR=27;FSRF=40;FSRR=47;FWDB=0.0083713;FXX=0.00666622;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.73;QD=15.5838;RBI=0.0210342;REFB=-0.0130409;REVB=0.0192966;RO=86;SAF=35;SAR=27;SRF=39;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115036;STB=0.561194;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=0.0148668;OID=.;OPOS=150649603;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:149:149:86:87:62:62:0.416107:27:35:39:47:27:35:40:47
chr7	150695726	.	T	C	207.85	PASS	AF=0.446809;AO=21;DP=47;FAO=21;FDP=47;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=-0.0365202;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.179;QD=17.6895;RBI=0.0413545;REFB=0.00103345;REVB=-0.0194028;RO=25;SAF=8;SAR=13;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0587823;STB=0.524393;STBP=0.79;TYPE=snp;VARB=-0.00117853;OID=.;OPOS=150695726;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:25:26:21:21:0.446809:13:8:11:14:13:8:11:15
chr7	150696111	.	T	G	946.85	PASS	AF=0.480392;AO=97;DP=212;FAO=98;FDP=204;FR=.;FRO=106;FSAF=56;FSAR=42;FSRF=46;FSRR=60;FWDB=0.00102259;FXX=0.0511604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.407;QD=18.5656;RBI=0.00278149;REFB=-0.0116684;REVB=-0.00258669;RO=83;SAF=55;SAR=42;SRF=39;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0824338;STB=0.571414;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=0.0110657;OID=.;OPOS=150696111;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:212:204:83:106:97:98:0.480392:42:55:39:44:42:56:46:60
chr7	150713827	.	G	A	150.21	PASS	AF=0.327869;AO=20;DP=61;FAO=20;FDP=61;FR=.;FRO=41;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=0.0219318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.1592;QD=9.8501;RBI=0.0542449;REFB=-0.0220802;REVB=0.0496136;RO=41;SAF=6;SAR=14;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172181;STB=0.602044;STBP=0.33;TYPE=snp;VARB=0.0516713;OID=.;OPOS=150713827;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:41:41:20:20:0.327869:14:6:18:23:14:6:18:23
chr7	150715817	.	A	G	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.03995;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.739;QD=35.5758;RBI=0.0441773;REFB=0;REVB=0.0188582;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000708392;OID=.;OPOS=150715817;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:3:4:0:0:3:4:0:0
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chr7	150733115	.	G	A	68.82	PASS	AF=0.5;AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.0175724;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.822;QD=15.2931;RBI=0.0327667;REFB=-0.0200755;REVB=-0.0276563;RO=9;SAF=1;SAR=8;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.322799;STB=0.695121;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=0.00779808;OID=.;OPOS=150733115;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:18:18:9:9:9:9:0.5:8:1:3:6:8:1:3:6
chr7	150734364	.	G	T	458.92	PASS	AF=0.511364;AO=45;DP=88;FAO=45;FDP=88;FR=.;FRO=43;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=25;FSRR=18;FWDB=0.00395473;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.8555;QD=20.8598;RBI=0.0140951;REFB=0.00506964;REVB=0.013529;RO=43;SAF=23;SAR=22;SRF=25;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0622175;STB=0.534398;STBP=0.551;TYPE=snp;VARB=-0.00464492;OID=.;OPOS=150734364;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:43:43:45:45:0.511364:22:23:25:18:22:23:25:18
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chr7	150761680	.	C	A	840.9	PASS	AF=0.938462;AO=61;DP=65;FAO=61;FDP=65;FR=.;FRO=4;FSAF=29;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0145865;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.1458;QD=51.7476;RBI=0.0795246;REFB=-0.206559;REVB=0.0781755;RO=4;SAF=29;SAR=32;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0554299;STB=0.529402;STBP=0.081;TYPE=snp;VARB=0.00605449;OID=.;OPOS=150761680;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:65:65:4:4:61:61:0.938462:32:29:0:4:32:29:0:4
chr7	150765065	.	T	C	2421.65	PASS	AF=1;AO=157;DP=157;FAO=158;FDP=158;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0125498;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.027;QD=61.3076;RBI=0.0175471;REFB=0;REVB=0.0122639;RO=0;SAF=73;SAR=84;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.44084e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.55665e-05;OID=.;OPOS=150765065;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:157:158:0:0:157:158:1:84:73:0:0:85:73:0:0
chr7	150773165	.	C	T	713.32	PASS	AF=1;AO=50;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0467256;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.859;QD=55.9463;RBI=0.0569261;REFB=0;REVB=0.0325162;RO=1;SAF=26;SAR=24;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0192104;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00031784;OID=.;OPOS=150773165;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:1:0:50:51:1:24:26:0:1:25:26:0:0
chr7	150773287	.	T	C	446.54	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0040797;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.139;QD=57.6174;RBI=0.0212419;REFB=0;REVB=0.0208465;RO=0;SAF=13;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.63861e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000186137;OID=.;OPOS=150773287;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:31:0:0:30:31:1:17:13:0:0:17:14:0:0
chr7	150773779	.	TGGGGGGGC	TGGGGGCGG,TGGGGGGC,TGGGGGGCC	192.82	PASS	AF=0.236111,0.333333,0;AO=3,21,4;DP=74;FAO=17,24,0;FDP=72;FR=.;FRO=31;FSAF=17,6,0;FSAR=0,18,0;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=0.00483907,0.0357353,-0.00867564;FXX=0.0399947;HRUN=7,7,7;LEN=3,1,1;MLLD=123.422,8.84402,14.4345;QD=10.7122;RBI=0.0450947,0.271008,0.224267;REFB=-0.0182279,-0.0892009,-0.0201113;REVB=-0.0448343,-0.268642,-0.224099;RO=22;SAF=3,5,3;SAR=0,16,1;SRF=17;SRR=5;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.495784,-0.478646,-0.0356888;STB=0.999142,0.698855,0.5;STBP=0.002,0.014,1;TYPE=mnp,del,snp;VARB=0.159035,0.0683561,0;OID=.,.,.;OPOS=150773785,150773780,150773786;OREF=GGC,G,G;OALT=CGG,-,C;OMAPALT=TGGGGGCGG,TGGGGGGC,TGGGGGGCC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0.236111,0.333333,0:3,21,4:74:17,24,0:72:31:17,6,0:0,18,0:18:13:92:22:3,5,3:0,16,1:17:5
chr7	150773807	.	A	T	1342.03	PASS	AF=0.967033;AO=83;DP=91;FAO=88;FDP=91;FR=.,HEALED;FRO=3;FSAF=47;FSAR=41;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0229105;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159;QD=58.9903;RBI=0.0383251;REFB=0.0141133;REVB=0.0307233;RO=3;SAF=45;SAR=38;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.030529;STB=0.51546;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=-0.000525997;OID=.;OPOS=150773807;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:91:91:3:3:83:88:0.967033:38:45:3:0:41:47:3:0
chr7	150774308	.	G	A	754.36	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0863112;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.143;QD=56.9328;RBI=0.101171;REFB=0;REVB=0.0527829;RO=0;SAF=31;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.76368e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00117321;OID=.;OPOS=150774308;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:22:31:0:0:22:31:0:0
chr7	150864240	.	G	C	272.43	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0976686;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.346;QD=51.8911;RBI=0.0976735;REFB=0;REVB=0.000974105;RO=0;SAF=11;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00157562;OID=.;OPOS=150864240;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:10:11:0:0:10:11:0:0
chr7	150878258	.	TCC	TC,TCG	640.3	PASS	AF=0.0465116,0.953488;AO=5,37;DP=43;FAO=2,41;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=2,21;FSAR=0,20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00185849,0.0525453;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=21.0091,40.436;QD=59.5623;RBI=0.0827393,0.095968;REFB=0,0;REVB=-0.0827184,-0.0803047;RO=0;SAF=5,17;SAR=0,20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.71161e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0272118,0.00853881;OID=.,.;OPOS=150878259,150878260;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=TC,TCG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0465116,0.953488:5,37:43:2,41:43:0:2,21:0,20:0:0:6:0:5,17:0,20:0:0
chr7	150883593	.	G	A	1896.41	PASS	AF=1;AO=123;DP=123;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0153205;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.872;QD=61.672;RBI=0.0171121;REFB=0;REVB=0.00762286;RO=0;SAF=63;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.13745e-05;OID=.;OPOS=150883593;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:123:123:0:0:123:123:1:60:63:0:0:60:63:0:0
chr7	150921950	.	A	G	432.94	PASS	AF=0.448598;AO=48;DP=106;FAO=48;FDP=107;FR=.;FRO=59;FSAF=21;FSAR=27;FSRF=18;FSRR=41;FWDB=-0.0450722;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.829;QD=16.1847;RBI=0.0498238;REFB=-0.0229162;REVB=-0.0212346;RO=58;SAF=21;SAR=27;SRF=18;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12931;STB=0.575544;STBP=0.189;TYPE=snp;VARB=0.0326493;OID=.;OPOS=150921950;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:107:58:59:48:48:0.448598:27:21:18:40:27:21:18:41
chr7	150934816	.	TG	T	259.21	PASS	AF=0.575758;AO=38;DP=66;FAO=38;FDP=66;FR=.;FRO=28;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=0.0445117;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=22.2136;QD=15.7098;RBI=0.0630274;REFB=-0.0350713;REVB=-0.0446224;RO=27;SAF=24;SAR=14;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00158251;STB=0.505152;STBP=0.912;TYPE=del;VARB=0.031124;OID=.;OPOS=150934817;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.575758:38:66:38:66:28:24:14:18:10:99:27:24:14:17:10
chr7	150972189	.	G	A	465.57	PASS	AF=0.422764;AO=52;DP=124;FAO=52;FDP=123;FR=.;FRO=71;FSAF=18;FSAR=34;FSRF=43;FSRR=28;FWDB=0.0378996;FXX=0.00806387;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.5254;QD=15.1404;RBI=0.0555932;REFB=-0.00140983;REVB=0.0406721;RO=67;SAF=18;SAR=34;SRF=38;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.226006;STB=0.650099;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.00240007;OID=.;OPOS=150972189;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:124:123:67:71:52:52:0.422764:34:18:38:29:34:18:43:28
chr7	151046195	.	T	G	80.27	PASS	AF=0.526316;AO=10;DP=19;FAO=10;FDP=19;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.0239876;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.508;QD=16.8981;RBI=0.0743526;REFB=-0.0125368;REVB=0.0703769;RO=9;SAF=5;SAR=5;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0453193;STB=0.526263;STBP=0.854;TYPE=snp;VARB=0.0196248;OID=.;OPOS=151046195;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:19:19:9:9:10:10:0.526316:5:5:4:5:5:5:4:5
chr7	151049231	.	C	T	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00497577;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=179.311;QD=59.4349;RBI=0.00506622;REFB=0;REVB=0.000953069;RO=0;SAF=11;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.56795e-05;OID=.;OPOS=151049231;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:24:11:0:0:24:11:0:0
chr7	151064064	.	C	T	1283.43	PASS	AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0217517;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.329;QD=61.852;RBI=0.0395588;REFB=0;REVB=0.0330418;RO=0;SAF=33;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.15707e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000146898;OID=.;OPOS=151064064;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:50:33:0:0:50:33:0:0
chr7	151074296	.	A	G	96.2	PASS	AF=0.375;AO=12;DP=32;FAO=12;FDP=32;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=-0.0068162;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.533;QD=12.0244;RBI=0.0315455;REFB=-0.0141403;REVB=0.0308003;RO=20;SAF=8;SAR=4;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.23251;STB=0.638063;STBP=0.248;TYPE=snp;VARB=0.0153309;OID=.;OPOS=151074296;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:32:32:20:20:12:12:0.375:4:8:9:11:4:8:9:11
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chr7	151097323	.	A	G	2755.88	PASS	AF=1;AO=176;DP=176;FAO=176;FDP=176;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=109;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00491857;FXX=0.0056494;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.079;QD=62.6336;RBI=0.0154845;REFB=0;REVB=-0.0146826;RO=0;SAF=67;SAR=109;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.41321e-05;OID=.;OPOS=151097323;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:15:176:176:0:0:176:176:1:109:67:0:0:109:67:0:0
chr7	151106066	.	C	T	937.54	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0027882;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.205;QD=58.596;RBI=0.0341144;REFB=0;REVB=0.0340003;RO=0;SAF=33;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.7886e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.2622e-05;OID=.;OPOS=151106066;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:64:0:0:60:64:1:27:33:0:0:31:33:0:0
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chr7	151504019	.	T	C	37.45	PASS	AF=0.352941;AO=6;DP=17;FAO=6;FDP=17;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.0364644;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.091;QD=8.81111;RBI=0.0565072;REFB=-0.0221379;REVB=0.0431672;RO=11;SAF=4;SAR=2;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.22268;STB=0.639526;STBP=0.411;TYPE=snp;VARB=0.0262904;OID=.;OPOS=151504019;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:17:17:11:11:6:6:0.352941:2:4:5:6:2:4:5:6
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chr7	151504499	.	G	A	230.72	PASS	AF=0.421875;AO=27;DP=64;FAO=27;FDP=64;FR=.;FRO=37;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=-0.000791107;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.822;QD=14.4197;RBI=0.00184508;REFB=-0.0040111;REVB=0.00166688;RO=37;SAF=17;SAR=10;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121727;STB=0.569326;STBP=0.356;TYPE=snp;VARB=0.00280537;OID=.;OPOS=151504499;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:37:37:27:27:0.421875:10:17:19:18:10:17:19:18
chr7	151597368	.	G	A	98.89	PASS	AF=0.444444;AO=12;DP=27;FAO=12;FDP=27;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.00494811;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.0938;QD=14.6498;RBI=0.0625154;REFB=-0.0361694;REVB=-0.0623193;RO=15;SAF=7;SAR=5;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0484683;STB=0.528254;STBP=0.785;TYPE=snp;VARB=0.0406062;OID=.;OPOS=151597368;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:27:27:15:15:12:12:0.444444:5:7:8:7:5:7:8:7
chr7	151680072	.	T	C	1503.05	PASS	AF=1;AO=95;DP=96;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0170682;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.9555;QD=63.2862;RBI=0.133039;REFB=0;REVB=0.13194;RO=0;SAF=42;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.69587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000471957;OID=.;OPOS=151680072;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:96:95:0:0:95:95:1:53:42:0:0:53:42:0:0
chr7	151859683	.	G	A	550.22	PASS	AF=0.464;AO=58;DP=125;FAO=58;FDP=125;FR=.;FRO=67;FSAF=38;FSAR=20;FSRF=43;FSRR=24;FWDB=0.00814164;FXX=0.00793588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.217;QD=17.6069;RBI=0.0263337;REFB=-0.00647877;REVB=0.0250435;RO=67;SAF=38;SAR=20;SRF=43;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141981;STB=0.507895;STBP=0.889;TYPE=snp;VARB=0.00746125;OID=.;OPOS=151859683;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:125:125:67:67:58:58:0.464:20:38:43:24:20:38:43:24
chr7	151945012	.	GAAAAT	GAAA,GAAAT	105.52	PASS	AF=0.210256,0.0102564;AO=34,20;DP=198;FAO=41,2;FDP=195;FR=.;FRO=152;FSAF=37,2;FSAR=4,0;FSRF=152;FSRR=0;FWDB=-0.0581707,-0.113588;FXX=0.0151508;HRUN=4,4;LEN=2,1;MLLD=24.5873,13.2687;QD=2.16455;RBI=0.111275,0.159205;REFB=-0.0511566,-0.06506;REVB=0.0948588,0.111553;RO=125;SAF=31,20;SAR=3,0;SRF=125;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0.368573,0.368573;SSSB=-0.616415,0;STB=0.836225,0.5;STBP=0.412,1;TYPE=del,del;VARB=0.160554,0.0313654;OID=.,.;OPOS=151945016,151945013;OREF=AT,A;OALT=-,-;OMAPALT=GAAA,GAAAT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.210256,0.0102564:34,20:198:41,2:195:152:37,2:4,0:152:0:99:125:31,20:3,0:125:0
chr7	151945051	.	A	G	59.16	PASS	AF=0.0650224;AO=28;DP=446;FAO=29;FDP=446;FR=.;FRO=417;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=213;FSRR=204;FWDB=0.00449869;FXX=0.00223709;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.246;QD=0.530582;RBI=0.0446495;REFB=0.000496541;REVB=-0.0444223;RO=397;SAF=8;SAR=20;SRF=206;SRR=191;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.252933;STB=0.720388;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=-0.0181241;OID=.;OPOS=151945051;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:59:446:446:397:417:28:29:0.0650224:20:8:206:191:21:8:213:204
chr7	151945071	.	G	GT	777.74	PASS	AF=0.357143;AO=149;DP=442;FAO=155;FDP=434;FR=.;FRO=279;FSAF=71;FSAR=84;FSRF=129;FSRR=150;FWDB=0.0689942;FXX=0.00686483;HRUN=1;LEN=1;MLLD=25.289;QD=7.16811;RBI=0.105603;REFB=0.0266644;REVB=-0.0799488;RO=288;SAF=69;SAR=80;SRF=134;SRR=154;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00254855;STB=0.502783;STBP=0.925;TYPE=ins;VARB=-0.04977;OID=.;OPOS=151945072;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.357143:149:442:155:434:279:71:84:129:150:99:288:69:80:134:154
chr7	151945101	.	G	C	151.75	PASS	AF=0.113573;AO=40;DP=362;FAO=41;FDP=361;FR=.;FRO=320;FSAF=10;FSAR=31;FSRF=153;FSRR=167;FWDB=0.000606717;FXX=0.00550949;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.252;QD=1.68142;RBI=0.0378845;REFB=-0.00259557;REVB=0.0378796;RO=320;SAF=10;SAR=30;SRF=153;SRR=167;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.294181;STB=0.718359;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.015916;OID=.;OPOS=151945101;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:362:361:320:320:40:41:0.113573:30:10:153:167:31:10:153:167
chr7	151945140	.	C	T	125.15	PASS	AF=0.135266;AO=28;DP=208;FAO=28;FDP=207;FR=.;FRO=179;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=74;FSRR=105;FWDB=-0.0508997;FXX=0.00480746;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.1709;QD=2.41833;RBI=0.0800372;REFB=-0.00670604;REVB=-0.0617671;RO=177;SAF=19;SAR=9;SRF=73;SRR=104;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.329488;STB=0.721128;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.0345387;OID=.;OPOS=151945140;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:208:207:177:179:28:28:0.135266:9:19:73:104:9:19:74:105
chr7	151945167	.	G	T	52.28	PASS	AF=0.107438;AO=13;DP=121;FAO=13;FDP=121;FR=.;FRO=108;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=48;FSRR=60;FWDB=-0.00160628;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=249.479;QD=1.72839;RBI=0.0134788;REFB=-0.00339032;REVB=-0.0133828;RO=108;SAF=7;SAR=6;SRF=48;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112738;STB=0.583207;STBP=0.54;TYPE=snp;VARB=0.0291918;OID=.;OPOS=151945167;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:121:121:108:108:13:13:0.107438:6:7:48:60:6:7:48:60
chr7	151962176	.	T	A	303.51	PASS	AF=0.244681;AO=41;DP=185;FAO=46;FDP=188;FR=.;FRO=142;FSAF=12;FSAR=34;FSRF=70;FSRR=72;FWDB=4.74504e-05;FXX=0.015706;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.909;QD=6.45762;RBI=0.0153393;REFB=-0.0153133;REVB=-0.0153392;RO=141;SAF=12;SAR=29;SRF=69;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.25969;STB=0.686615;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0318688;OID=.;OPOS=151962176;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:185:188:141:142:41:46:0.244681:29:12:69:72:34:12:70:72
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chr7	151962265	.	C	T	42.68	PASS	AF=0.0916031;AO=12;DP=132;FAO=12;FDP=131;FR=.;FRO=119;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=56;FSRR=63;FWDB=0.0353148;FXX=0.00757518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.21;QD=1.30306;RBI=0.0354054;REFB=-0.0012286;REVB=-0.00253022;RO=119;SAF=3;SAR=9;SRF=56;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.265588;STB=0.710478;STBP=0.125;TYPE=snp;VARB=0.0200279;OID=.;OPOS=151962265;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:42:132:131:119:119:12:12:0.0916031:9:3:56:63:9:3:56:63
chr7	151970856	.	T	A	2634.72	PASS	AF=0.677914;AO=220;DP=326;FAO=221;FDP=326;FR=.;FRO=105;FSAF=103;FSAR=118;FSRF=48;FSRR=57;FWDB=-0.00691477;FXX=0.00305801;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.768;QD=32.3278;RBI=0.0137098;REFB=-0.0173598;REVB=0.0118383;RO=104;SAF=102;SAR=118;SRF=48;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00126472;STB=0.502887;STBP=0.862;TYPE=snp;VARB=0.00405507;OID=.;OPOS=151970856;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:326:326:104:105:220:221:0.677914:118:102:48:56:118:103:48:57
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chr7	151970931	.	G	A	62.42	PASS	AF=0.13;AO=13;DP=101;FAO=13;FDP=100;FR=.;FRO=87;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=38;FSRR=49;FWDB=-0.0721105;FXX=0.00990001;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.6972;QD=2.49678;RBI=0.0724095;REFB=-0.000879635;REVB=-0.00657373;RO=88;SAF=7;SAR=6;SRF=39;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116994;STB=0.587654;STBP=0.549;TYPE=snp;VARB=0.0028168;OID=.;OPOS=151970931;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:101:100:88:87:13:13:0.13:6:7:39:49:6:7:38:49
chr7	152099906	.	T	A	925.64	PASS	AF=0.711712;AO=78;DP=111;FAO=79;FDP=111;FR=.;FRO=32;FSAF=44;FSAR=35;FSRF=21;FSRR=11;FWDB=0.0241049;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.766;QD=33.3564;RBI=0.0334986;REFB=-0.0310001;REVB=0.0232617;RO=32;SAF=43;SAR=35;SRF=21;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0578474;STB=0.529186;STBP=0.343;TYPE=snp;VARB=0.0121619;OID=.;OPOS=152099906;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:111:32:32:78:79:0.711712:35:43:21:11:35:44:21:11
chr7	152099917	.	G	A	893.65	PASS	AF=0.7;AO=77;DP=111;FAO=77;FDP=110;FR=.;FRO=33;FSAF=42;FSAR=35;FSRF=22;FSRR=11;FWDB=0.011741;FXX=0.0090082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.69;QD=32.4963;RBI=0.0143602;REFB=-0.0131177;REVB=-0.00826832;RO=34;SAF=42;SAR=35;SRF=22;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0586999;STB=0.536903;STBP=0.262;TYPE=snp;VARB=0.00671772;OID=.;OPOS=152099917;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:110:34:33:77:77:0.7:35:42:22:12:35:42:22:11
chr7	152099924	.	T	C	891.81	PASS	AF=0.7;AO=77;DP=110;FAO=77;FDP=110;FR=.;FRO=33;FSAF=41;FSAR=36;FSRF=22;FSRR=11;FWDB=0.0123374;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.126;QD=32.4293;RBI=0.0127918;REFB=-0.0311467;REVB=0.00337913;RO=33;SAF=41;SAR=36;SRF=22;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0756441;STB=0.540633;STBP=0.209;TYPE=snp;VARB=0.0111259;OID=.;OPOS=152099924;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:110:33:33:77:77:0.7:36:41:22:11:36:41:22:11
chr7	152099948	.	C	A	113.62	PASS	AF=0.186275;AO=19;DP=102;FAO=19;FDP=102;FR=.;FRO=83;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=43;FSRR=40;FWDB=-0.0187049;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=247.564;QD=4.45549;RBI=0.0189421;REFB=-0.00933393;REVB=-0.00298872;RO=83;SAF=11;SAR=8;SRF=43;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0776131;STB=0.549947;STBP=0.665;TYPE=snp;VARB=0.0371999;OID=.;OPOS=152099948;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:83:83:19:19:0.186275:8:11:43:40:8:11:43:40
chr7	154429560	.	C	T	1264.75	PASS	AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00114389;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.69;QD=61.6953;RBI=0.00202181;REFB=0;REVB=0.00166711;RO=0;SAF=42;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.66551e-07;OID=.;OPOS=154429560;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:40:42:0:0:40:42:0:0
chr7	154461112	.	A	G	1643.13	PASS	AF=0.990991;AO=109;DP=110;FAO=110;FDP=111;FR=.;FRO=1;FSAF=50;FSAR=60;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0273407;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=61.8037;QD=59.2119;RBI=0.0451829;REFB=-0.000203179;REVB=0.0359719;RO=1;SAF=50;SAR=59;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00939937;STB=0.50495;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=4.017e-05;OID=.;OPOS=154461112;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:110:111:1:1:109:110:0.990991:59:50:1:0:60:50:1:0
chr7	154667628	.	A	G	350.18	PASS	AF=0.6;AO=30;DP=50;FAO=30;FDP=50;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=23;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=0.015613;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.4535;QD=28.0142;RBI=0.0159523;REFB=-0.0358164;REVB=0.00327217;RO=20;SAF=7;SAR=23;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152794;STB=0.584685;STBP=0.185;TYPE=snp;VARB=0.00965439;OID=.;OPOS=154667628;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:20:20:30:30:0.6:23:7:8:12:23:7:8:12
chr7	154672662	.	C	T	285.1	PASS	AF=0.541667;AO=26;DP=48;FAO=26;FDP=48;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=0.0263732;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.593;QD=23.7584;RBI=0.027097;REFB=-0.0227981;REVB=0.0062209;RO=22;SAF=12;SAR=14;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143066;STB=0.579557;STBP=0.251;TYPE=snp;VARB=0.0144445;OID=.;OPOS=154672662;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:22:22:26:26:0.541667:14:12:14:8:14:12:14:8
chr7	154679447	.	G	A	1376.36	PASS	AF=1;AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00511971;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.9364;QD=62.5619;RBI=0.0117041;REFB=0;REVB=0.0105249;RO=0;SAF=45;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.39218e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.84653e-05;OID=.;OPOS=154679447;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:88:88:0:0:88:88:1:43:45:0:0:43:45:0:0
chr7	154681050	.	C	T	120.86	PASS	AF=0.424242;AO=14;DP=33;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=0.00416444;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.586;QD=14.6498;RBI=0.00756398;REFB=-0.00261299;REVB=0.00631437;RO=19;SAF=7;SAR=7;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183534;STB=0.605916;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=0.00344531;OID=.;OPOS=154681050;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:19:19:14:14:0.424242:7:7:13:6:7:7:13:6
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chr7	154685612	.	G	T	113.72	PASS	AF=0.5;AO=13;DP=27;FAO=13;FDP=26;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.0310091;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.5169;QD=17.4955;RBI=0.0432305;REFB=-0.0351085;REVB=-0.0301216;RO=13;SAF=6;SAR=7;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133159;STB=0.576354;STBP=0.483;TYPE=snp;VARB=0.0408878;OID=.;OPOS=154685612;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:26:13:13:13:13:0.5:7:6:8:5:7:6:8:5
chr7	154738409	.	T	C	522.84	PASS	AF=0.491071;AO=55;DP=112;FAO=55;FDP=112;FR=.;FRO=57;FSAF=29;FSAR=26;FSRF=32;FSRR=25;FWDB=0.0114381;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.183;QD=18.6727;RBI=0.011887;REFB=-0.00373704;REVB=-0.00323611;RO=56;SAF=29;SAR=26;SRF=31;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0240927;STB=0.517449;STBP=0.704;TYPE=snp;VARB=0.00373455;OID=.;OPOS=154738409;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:112:56:57:55:55:0.491071:26:29:31:25:26:29:32:25
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chr7	155755826	.	A	G	871.72	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0221118;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.857;QD=58.1145;RBI=0.0221182;REFB=0;REVB=-0.000530232;RO=0;SAF=29;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.73709e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000103294;OID=.;OPOS=155755826;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:31:29:0:0:31:29:0:0
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chr7	156469190	.	A	G	562.94	PASS	AF=0.553191;AO=52;DP=94;FAO=52;FDP=94;FR=.;FRO=42;FSAF=18;FSAR=34;FSRF=20;FSRR=22;FWDB=0.0280427;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.838;QD=23.9548;RBI=0.0337853;REFB=-0.0210347;REVB=0.0188428;RO=41;SAF=18;SAR=34;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120394;STB=0.561715;STBP=0.196;TYPE=snp;VARB=0.0156005;OID=.;OPOS=156469190;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:41:42:52:52:0.553191:34:18:20:21:34:18:20:22
chr7	156664783	.	C	T	122.46	PASS	AF=0.424242;AO=14;DP=34;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=-0.00819545;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.997;QD=14.8437;RBI=0.0248788;REFB=-0.00840727;REVB=-0.0234902;RO=20;SAF=7;SAR=7;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151967;STB=0.605916;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=0.00870267;OID=.;OPOS=156664783;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:33:20:19:14:14:0.424242:7:7:13:7:7:7:13:6
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chr7	156742749	.	G	A	86.81	PASS	AF=0.714286;AO=10;DP=14;FAO=10;FDP=14;FR=.;FRO=4;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0479704;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.7759;QD=24.8024;RBI=0.048145;REFB=-0.0758858;REVB=-0.00409625;RO=4;SAF=6;SAR=4;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0516928;STB=0.529352;STBP=0.729;TYPE=snp;VARB=0.0290547;OID=.;OPOS=156742749;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:14:14:4:4:10:10:0.714286:4:6:2:2:4:6:2:2
chr7	156742796	.	A	C	40.29	PASS	AF=0.545455;AO=6;DP=11;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0202457;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.136;QD=14.6525;RBI=0.023786;REFB=-0.0219053;REVB=0.0124854;RO=4;SAF=3;SAR=3;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.545304;STBP=0.829;TYPE=snp;VARB=0.0267644;OID=.;OPOS=156742796;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:11:11:4:5:6:6:0.545455:3:3:2:2:3:3:2:3
chr7	156742965	.	G	C	46.0	PASS	AF=0.35;AO=7;DP=20;FAO=7;FDP=20;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.00878509;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.8448;QD=9.19965;RBI=0.120163;REFB=0.00208126;REVB=0.119841;RO=13;SAF=4;SAR=3;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194284;STB=0.619384;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.00346697;OID=.;OPOS=156742965;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:20:20:13:13:7:7:0.35:3:4:5:8:3:4:5:8
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chr7	157959636	.	G	A	801.67	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00555361;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.328;QD=57.2623;RBI=0.0637179;REFB=0;REVB=0.0634754;RO=0;SAF=27;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000132417;OID=.;OPOS=157959636;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:56:0:0:54:56:1:27:27:0:0:29:27:0:0
chr7	157959879	.	C	T	973.3	PASS	AF=1;AO=55;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=32;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00609925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.5076;QD=58.1075;RBI=0.00746554;REFB=0;REVB=0.00430504;RO=0;SAF=32;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.49259e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.37072e-05;OID=.;OPOS=157959879;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:55:67:1:23:32:0:0:35:32:0:0
chr7	157959895	.	C	G,T	746.31	PASS	AF=0.0188679,0.981132;AO=2,51;DP=53;FAO=1,52;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=1,27;FSAR=0,25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0122446,0.0218834;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=181.643,68.9235;QD=56.325;RBI=0.0312822,0.0830496;REFB=0,0;REVB=-0.0287862,0.0801147;RO=0;SAF=1,27;SAR=1,24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.160707,0.000460755;OID=.,.;OPOS=157959895,157959895;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:4:53:53:0:0:2,51:1,52:0.0188679,0.981132:1,24:1,27:0:0:0,25:1,27:0:0
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chr7	158263331	.	T	C	74.51	PASS	AF=0.207547;AO=11;DP=52;FAO=11;FDP=53;FR=.;FRO=42;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=25;FSRR=17;FWDB=0.0278243;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.3469;QD=5.62358;RBI=0.0390744;REFB=0.0133178;REVB=0.0274338;RO=41;SAF=7;SAR=4;SRF=24;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0656811;STB=0.534482;STBP=0.805;TYPE=snp;VARB=-0.0508838;OID=.;OPOS=158263331;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:52:53:41:42:11:11:0.207547:4:7:24:17:4:7:25:17
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chr7	158263344	.	T	A	68.43	PASS	AF=0.208333;AO=10;DP=48;FAO=10;FDP=48;FR=.;FRO=38;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=24;FSRR=14;FWDB=0.0464149;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.5898;QD=5.7029;RBI=0.0464758;REFB=-0.00870765;REVB=-0.00237661;RO=38;SAF=5;SAR=5;SRF=24;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162141;STB=0.603967;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.0144716;OID=.;OPOS=158263344;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:68:48:48:38:38:10:10:0.208333:5:5:24:14:5:5:24:14
chr7	158384305	.	CTGTG	C,CTGTC	158.96	PASS	AF=0.363636,0.0454545;AO=16,2;DP=44;FAO=16,2;FDP=44;FR=.;FRO=26;FSAF=8,1;FSAR=8,1;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=-0.0030099,0.00224932;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=4,1;MLLD=288.057,62.7429;QD=14.4508;RBI=0.00376625,0.0035388;REFB=-0.0012714,-0.00572195;REVB=-0.00226388,-0.00273197;RO=26;SAF=8,1;SAR=8,1;SRF=9;SRR=17;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.163822,0.147215;STB=0.595123,0.641554;STBP=0.366,0.754;TYPE=del,snp;VARB=0.000519636,0.107364;OID=.,.;OPOS=158384306,158384309;OREF=TGTG,G;OALT=-,C;OMAPALT=C,CTGTC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.363636,0.0454545:16,2:44:16,2:44:26:8,1:8,1:9:17:99:26:8,1:8,1:9:17
chr7	158443581	.	AC	A	30.72	PASS	AF=0.230769;AO=13;DP=52;FAO=12;FDP=52;FR=.;FRO=40;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=0.0162467;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=16.6345;QD=2.36309;RBI=0.0457252;REFB=-0.045027;REVB=0.0427415;RO=36;SAF=11;SAR=2;SRF=15;SRR=21;SSEN=0.419643;SSEP=0;SSSB=0.530602;STB=0.810268;STBP=0.023;TYPE=del;VARB=0.111334;OID=.;OPOS=158443582;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.230769:13:52:12:52:40:10:2:18:22:30:36:11:2:15:21
chr7	158445063	.	G	C	380.19	PASS	AF=0.606557;AO=37;DP=61;FAO=37;FDP=61;FR=.;FRO=24;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=3;FWDB=-0.0242858;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.3943;QD=24.9306;RBI=0.0250381;REFB=-0.00329289;REVB=-0.00609172;RO=24;SAF=21;SAR=16;SRF=21;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.234427;STB=0.627389;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.0016525;OID=.;OPOS=158445063;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:24:24:37:37:0.606557:16:21:21:3:16:21:21:3
chr7	158447855	.	T	G	326.02	PASS	AF=0.523077;AO=34;DP=65;FAO=34;FDP=65;FR=.;FRO=31;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=0.00532534;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.2412;QD=20.063;RBI=0.0411093;REFB=-0.0216852;REVB=0.0407629;RO=31;SAF=20;SAR=14;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.006719;STB=0.503729;STBP=0.962;TYPE=snp;VARB=0.0185578;OID=.;OPOS=158447855;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:31:31:34:34:0.523077:14:20:18:13:14:20:18:13
chr7	158524504	.	G	A,T	766.95	PASS	AF=0.946429,0.0535714;AO=52,2;DP=54;FAO=53,3;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=31,3;FSAR=22,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0248011,-0.0156234;FXX=0.0175408;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=140.846,105.558;QD=54.7822;RBI=0.0369629,0.0334556;REFB=0,0;REVB=0.0274073,0.0295835;RO=0;SAF=31,2;SAR=21,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.93989e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00132262,0.0370985;OID=.,.;OPOS=158524504,158524504;OREF=G,G;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:11:54:56:0:0:52,2:53,3:0.946429,0.0535714:21,0:31,2:0:0:22,0:31,3:0:0
chr7	158526495	.	G	A	1069.92	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0371017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.9108;QD=59.44;RBI=0.048211;REFB=0;REVB=-0.0307857;RO=0;SAF=33;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000153304;OID=.;OPOS=158526495;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:72:0:0:70:72:1:37:33:0:0:37:35:0:0
chr7	158526880	.	G	A	645.26	PASS	AF=0.941176;AO=48;DP=51;FAO=48;FDP=51;FR=.;FRO=3;FSAF=8;FSAR=40;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0639534;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.5689;QD=50.6084;RBI=0.0657989;REFB=-0.147734;REVB=0.0154744;RO=0;SAF=8;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.98835e-08;STB=0.578911;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.00925361;OID=.;OPOS=158526880;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:51:51:0:3:48:48:0.941176:40:8:0:0:40:8:3:0
chr7	158528233	.	A	G	1124.32	PASS	AF=0.986842;AO=75;DP=77;FAO=75;FDP=76;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.000837361;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.4927;QD=59.1748;RBI=0.0676246;REFB=-0.00153379;REVB=-0.0676195;RO=1;SAF=41;SAR=34;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0114011;STB=0.506022;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=-0.000781476;OID=.;OPOS=158528233;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:77:76:1:1:75:75:0.986842:34:41:1:0:34:41:1:0
chr7	158534372	.	G	A	340.73	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0322056;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.5524;QD=54.5167;RBI=0.0588566;REFB=0;REVB=0.0492635;RO=0;SAF=14;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00109185;OID=.;OPOS=158534372;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:11:14:0:0:11:14:0:0
chr7	158534381	.	G	C	330.74	PASS	AF=0.961538;AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00283336;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=158.448;QD=50.8824;RBI=0.0159309;REFB=-0.117061;REVB=-0.0156769;RO=1;SAF=15;SAR=10;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.044143;STB=0.52379;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=0.000738848;OID=.;OPOS=158534381;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:26:26:1:1:25:25:0.961538:10:15:0:1:10:15:0:1
chr7	158536267	.	T	C	411.12	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.037945;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.525;QD=56.7065;RBI=0.0380708;REFB=0;REVB=-0.00309247;RO=0;SAF=17;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.0947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00022393;OID=.;OPOS=158536267;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:12:17:0:0:12:17:0:0
chr7	158536334	.	G	A	257.64	PASS	AF=0.88;AO=21;DP=25;FAO=22;FDP=25;FR=.;FRO=3;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.012449;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.997;QD=41.2221;RBI=0.0148374;REFB=-0.151235;REVB=-0.00807271;RO=2;SAF=11;SAR=10;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0038199;STB=0.514693;STBP=0.719;TYPE=snp;VARB=0.00247072;OID=.;OPOS=158536334;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:25:25:2:3:21:22:0.88:10:11:1:1:10:12:2:1
chr7	158536345	.	A	G	263.78	PASS	AF=1;AO=17;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00918508;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=34.291;QD=50.2446;RBI=0.103484;REFB=0;REVB=0.103076;RO=0;SAF=11;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00650035;OID=.;OPOS=158536345;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:17:21:1:6:11:0:0:10:11:0:0
chr7	158536376	.	A	C	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00385983;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=277.116;QD=45.8068;RBI=0.00770837;REFB=0;REVB=0.00667238;RO=0;SAF=8;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.5401e-05;OID=.;OPOS=158536376;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:6:8:0:0:6:8:0:0
chr7	158536388	.	A	C	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.01959;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=194.27;QD=43.4862;RBI=0.0334442;REFB=0;REVB=0.0271063;RO=0;SAF=7;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.37777e-05;OID=.;OPOS=158536388;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:5:7:0:0:5:7:0:0
chr7	158536408	.	T	C	88.22	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0217926;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.838;QD=39.2068;RBI=0.0277173;REFB=0;REVB=-0.017127;RO=0;SAF=6;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000606862;OID=.;OPOS=158536408;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:3:6:0:0:3:6:0:0
chr7	158536411	.	T	C	88.22	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0255735;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.854;QD=39.2067;RBI=0.0328745;REFB=0;REVB=0.0206575;RO=0;SAF=6;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00116291;OID=.;OPOS=158536411;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:3:6:0:0:3:6:0:0
chr7	158540945	.	C	T	368.6	PASS	AF=0.5;AO=38;DP=76;FAO=38;FDP=76;FR=.;FRO=38;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=0.012127;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.503;QD=19.4002;RBI=0.0256364;REFB=0.00462028;REVB=-0.0225867;RO=38;SAF=19;SAR=19;SRF=16;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0710309;STB=0.539453;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=-0.00609795;OID=.;OPOS=158540945;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:38:38:38:38:0.5:19:19:16:22:19:19:16:22
chr7	158662137	.	C	T	282.28	PASS	AF=0.52;AO=26;DP=50;FAO=26;FDP=50;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=-0.0038311;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.936;QD=22.5828;RBI=0.0328063;REFB=-0.0167332;REVB=-0.0325818;RO=24;SAF=11;SAR=15;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172453;STB=0.596257;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=0.0218589;OID=.;OPOS=158662137;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:24:24:26:26:0.52:15:11:15:9:15:11:15:9
chr7	158662182	.	G	A	192.84	PASS	AF=0.423077;AO=22;DP=52;FAO=22;FDP=52;FR=.;FRO=30;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=0.0194349;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.572;QD=14.834;RBI=0.0245096;REFB=0.00126109;REVB=0.0149334;RO=30;SAF=16;SAR=6;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.249511;STB=0.64354;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=-0.00264355;OID=.;OPOS=158662182;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:30:30:22:22:0.423077:6:16:15:15:6:16:15:15
chr7	158664074	.	TGAA	T	48.86	PASS	AF=0.5;AO=7;DP=14;FAO=7;FDP=14;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.000381662;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=296.311;QD=13.9591;RBI=0.00862545;REFB=-0.0255586;REVB=0.008617;RO=7;SAF=3;SAR=4;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119504;STB=0.571224;STBP=0.677;TYPE=del;VARB=0.0246837;OID=.;OPOS=158664075;OREF=GAA;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.5:7:14:7:14:7:3:4:4:3:45:7:3:4:4:3
chr7	158672476	.	C	G	375.41	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0128159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.5354;QD=55.6156;RBI=0.0141913;REFB=0;REVB=0.00609463;RO=0;SAF=14;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000266583;OID=.;OPOS=158672476;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:13:14:0:0:13:14:0:0
chr7	158672619	.	A	G	206.78	PASS	AF=1;AO=17;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0013015;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=130.597;QD=45.9514;RBI=0.0226111;REFB=0;REVB=-0.0225736;RO=1;SAF=8;SAR=9;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0482085;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.71435e-05;OID=.;OPOS=158672619;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:18:18:1:0:17:18:1:9:8:0:1:10:8:0:0
chr7	158715219	.	A	G	341.0	PASS	AF=0.538462;AO=35;DP=65;FAO=35;FDP=65;FR=.;FRO=30;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=-0.0386015;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.8405;QD=20.9848;RBI=0.0450959;REFB=0.0287375;REVB=0.0233144;RO=29;SAF=18;SAR=17;SRF=9;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166813;STB=0.583141;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=-0.0257862;OID=.;OPOS=158715219;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:29:30:35:35:0.538462:17:18:9:20:17:18:10:20
chr7	158719084	.	C	T	195.81	PASS	AF=0.454545;AO=20;DP=44;FAO=20;FDP=44;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=0.0044729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=314.623;QD=17.8006;RBI=0.00712579;REFB=-0.00501686;REVB=0.00554707;RO=24;SAF=8;SAR=12;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.251497;STB=0.642718;STBP=0.103;TYPE=snp;VARB=0.00567459;OID=.;OPOS=158719084;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:24:24:20:20:0.454545:12:8:16:8:12:8:16:8
chr7	158851234	.	T	G	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00958728;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=288.761;QD=52.6132;RBI=0.0272743;REFB=0;REVB=0.0255337;RO=0;SAF=11;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.17498e-05;OID=.;OPOS=158851234;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:11:11:0:0:11:11:0:0
chr8	195679	.	G	A	32.4	PASS	AF=0.625;AO=5;DP=8;FAO=5;FDP=8;FR=.;FRO=3;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0206779;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.638;QD=16.1975;RBI=0.0271083;REFB=-0.00560184;REVB=0.0175295;RO=3;SAF=1;SAR=4;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116878;STB=0.57112;STBP=0.778;TYPE=snp;VARB=0.00589825;OID=.;OPOS=195679;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:8:8:3:3:5:5:0.625:4:1:1:2:4:1:1:2
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chr8	607766	.	C	G	358.36	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0715621;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.89;QD=55.1315;RBI=0.072044;REFB=0;REVB=-0.00831814;RO=0;SAF=13;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00145282;OID=.;OPOS=607766;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:26:0:0:25:26:1:12:13:0:0:12:14:0:0
chr8	608017	.	C	CT	107.17	PASS	AF=1;AO=2;DP=18;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00948132;FXX=0.277624;HRUN=0;LEN=1;MLLD=167.565;QD=32.9758;RBI=0.118978;REFB=0.11597;REVB=-0.1186;RO=16;SAF=2;SAR=0;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.589174;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.0478272;OID=.;OPOS=608018;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:1:2:18:13:13:0:8:5:0:0:7:16:2:0:6:10
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chr8	608034	.	T	C	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00864625;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.938;QD=51.9162;RBI=0.0110218;REFB=0;REVB=0.00683539;RO=0;SAF=7;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.25266e-06;OID=.;OPOS=608034;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:14:7:0:0:14:7:0:0
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chr8	977316	.	A	G	66.47	PASS	AF=0.8;AO=8;DP=10;FAO=8;FDP=10;FR=.;FRO=2;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0311844;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.509;QD=26.5889;RBI=0.0351507;REFB=0.00863161;REVB=-0.0162205;RO=2;SAF=4;SAR=4;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00429559;OID=.;OPOS=977316;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:10:10:2:2:8:8:0.8:4:4:1:1:4:4:1:1
chr8	1497018	.	C	T	74.94	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0274766;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.0154;QD=37.4682;RBI=0.0788987;REFB=0;REVB=0.0739597;RO=0;SAF=4;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00277083;OID=.;OPOS=1497018;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:4:4:0:0:4:4:0:0
chr8	1649960	.	G	A	306.27	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00473466;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.7988;QD=53.2642;RBI=0.0550834;REFB=0;REVB=0.0548795;RO=0;SAF=4;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00101815;OID=.;OPOS=1649960;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:23:0:0:22:23:1:18:4:0:0:18:5:0:0
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chr8	1953759	.	A	T	289.19	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0334485;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.4832;QD=52.5808;RBI=0.0637892;REFB=0;REVB=0.0543163;RO=0;SAF=7;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.79751e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000236802;OID=.;OPOS=1953759;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:15:7:0:0:15:7:0:0
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chr8	2048811	.	A	C	605.73	PASS	AF=1;AO=40;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00452544;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=188.191;QD=59.0954;RBI=0.0186602;REFB=-0.098318;REVB=0.0181031;RO=0;SAF=23;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.4817e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00090641;OID=.;OPOS=2048811;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:41:41:0:0:40:41:1:17:23:0:0:17:24:0:0
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chr8	6479042	.	C	T	973.65	PASS	AF=1;AO=66;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0696489;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.074;QD=58.1285;RBI=0.0705815;REFB=0;REVB=0.0114358;RO=1;SAF=37;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0125996;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00021895;OID=.;OPOS=6479042;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:1:0:66:67:1:29:37:1:0:29:38:0:0
chr8	6479178	.	C	A	536.09	PASS	AF=0.948718;AO=37;DP=39;FAO=37;FDP=39;FR=.;FRO=2;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00744998;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.6584;QD=54.9838;RBI=0.0162689;REFB=0.0378088;REVB=-0.0144629;RO=2;SAF=19;SAR=18;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.049227;STB=0.526302;STBP=0.25;TYPE=snp;VARB=-0.00978507;OID=.;OPOS=6479178;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:39:39:2:2:37:37:0.948718:18:19:0:2:18:19:0:2
chr8	6615663	.	A	G	211.2	PASS	AF=1;AO=17;DP=18;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.062382;FXX=0.0555247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.835;QD=49.6951;RBI=0.0634592;REFB=0;REVB=0.0116428;RO=0;SAF=12;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00129637;OID=.;OPOS=6615663;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:17:0:0:17:17:1:5:12:0:0:5:12:0:0
chr8	6673377	.	CA	C	478.16	PASS	AF=1;AO=33;DP=34;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0373269;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.03;QD=57.9587;RBI=0.0384013;REFB=0;REVB=0.00902041;RO=0;SAF=9;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.0002372;OID=.;OPOS=6673378;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:33:34:33:33:0:9:24:0:0:4:0:9:24:0:0
chr8	6793540	.	C	T	323.47	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00253401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.982;QD=53.9111;RBI=0.0157387;REFB=0;REVB=-0.0155334;RO=0;SAF=13;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.36025e-05;OID=.;OPOS=6793540;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:11:13:0:0:11:13:0:0
chr8	7154617	.	T	A	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.05211;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.3434;QD=37.4885;RBI=0.0566062;REFB=0;REVB=-0.0221091;RO=0;SAF=7;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.78849e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00449467;OID=.;OPOS=7154617;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:1:7:0:0:1:7:0:0
chr8	7154917	.	A	C	1413.25	PASS	AF=1;AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0293941;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.2638;QD=62.8111;RBI=0.0425486;REFB=0;REVB=-0.0307631;RO=0;SAF=39;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.24868e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000204465;OID=.;OPOS=7154917;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:90:90:0:0:90:90:1:51:39:0:0:51:39:0:0
chr8	7215694	.	A	G	30.07	PASS	AF=0.0860215;AO=8;DP=93;FAO=8;FDP=93;FR=.;FRO=85;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=38;FSRR=47;FWDB=0.0350029;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.1672;QD=1.29342;RBI=0.0411559;REFB=0.00128028;REVB=0.0216473;RO=84;SAF=5;SAR=3;SRF=38;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192478;STB=0.659242;STBP=0.376;TYPE=snp;VARB=-0.0270355;OID=.;OPOS=7215694;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:93:93:84:85:8:8:0.0860215:3:5:38:46:3:5:38:47
chr8	7217172	.	G	A	35.18	PASS	AF=0.0745342;AO=12;DP=161;FAO=12;FDP=161;FR=.;FRO=149;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=71;FSRR=78;FWDB=-0.016966;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=307.879;QD=0.873994;RBI=0.0182501;REFB=-0.000320867;REVB=0.00672458;RO=149;SAF=6;SAR=6;SRF=71;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0259313;STB=0.521703;STBP=0.891;TYPE=snp;VARB=0.0045245;OID=.;OPOS=7217172;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:161:161:149:149:12:12:0.0745342:6:6:71:78:6:6:71:78
chr8	7218632	.	C	T	76.81	PASS	AF=0.131783;AO=17;DP=129;FAO=17;FDP=129;FR=.;FRO=112;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=40;FSRR=72;FWDB=-0.00726213;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.4284;QD=2.38157;RBI=0.0432447;REFB=0.00206569;REVB=-0.0426306;RO=112;SAF=11;SAR=6;SRF=40;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.350276;STB=0.736862;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=-0.00983001;OID=.;OPOS=7218632;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:129:129:112:112:17:17:0.131783:6:11:40:72:6:11:40:72
chr8	7308386	.	T	C	121.21	PASS	AF=0.192661;AO=21;DP=109;FAO=21;FDP=109;FR=.;FRO=88;FSAF=4;FSAR=17;FSRF=43;FSRR=45;FWDB=-0.00448659;FXX=0.00909008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.764;QD=4.44817;RBI=0.0103818;REFB=-0.0105158;REVB=-0.00936231;RO=84;SAF=4;SAR=17;SRF=41;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.406273;STB=0.762864;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.0438609;OID=.;OPOS=7308386;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:109:84:88:21:21:0.192661:17:4:41:43:17:4:43:45
chr8	7308729	.	G	C	438.63	PASS	AF=0.32948;AO=56;DP=173;FAO=57;FDP=173;FR=.;FRO=116;FSAF=28;FSAR=29;FSRF=54;FSRR=62;FWDB=0.025047;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.856;QD=10.1418;RBI=0.0255291;REFB=-0.00145855;REVB=-0.00493777;RO=113;SAF=27;SAR=29;SRF=53;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0152597;STB=0.517249;STBP=0.755;TYPE=snp;VARB=0.00300467;OID=.;OPOS=7308729;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:173:173:113:116:56:57:0.32948:29:27:53:60:29:28:54:62
chr8	8098577	.	G	A	362.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0160315;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.742;QD=55.7132;RBI=0.0196026;REFB=0;REVB=0.0112806;RO=0;SAF=10;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.71087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.09854e-05;OID=.;OPOS=8098577;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:26:0:0:26:26:1:16:10:0:0:16:10:0:0
chr8	8099618	.	T	C	51.89	PASS	AF=0.235294;AO=8;DP=34;FAO=8;FDP=34;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=0.0397438;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.8061;QD=6.10436;RBI=0.0397457;REFB=-0.0185532;REVB=0.000387073;RO=26;SAF=5;SAR=3;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149879;STB=0.59677;STBP=0.55;TYPE=snp;VARB=0.0475899;OID=.;OPOS=8099618;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:51:34:34:26:26:8:8:0.235294:3:5:13:13:3:5:13:13
chr8	8176221	.	C	T	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00461455;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.591;QD=51.184;RBI=0.0446582;REFB=0;REVB=-0.0444191;RO=0;SAF=7;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000331585;OID=.;OPOS=8176221;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:13:7:0:0:13:7:0:0
chr8	8176554	.	C	T	1624.41	PASS	AF=1;AO=108;DP=108;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0273447;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.261;QD=60.1634;RBI=0.0275787;REFB=0;REVB=0.00358478;RO=0;SAF=49;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.62579e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.03716e-05;OID=.;OPOS=8176554;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:108:108:0:0:108:108:1:59:49:0:0:59:49:0:0
chr8	8234077	.	G	C	40.29	PASS	AF=0.545455;AO=6;DP=11;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.0851132;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.973;QD=14.6515;RBI=0.113688;REFB=-0.00816067;REVB=0.0753706;RO=5;SAF=2;SAR=4;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0553146;STB=0.53322;STBP=0.914;TYPE=snp;VARB=0.0176602;OID=.;OPOS=8234077;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:11:11:5:5:6:6:0.545455:4:2:2:3:4:2:2:3
chr8	8234192	.	G	C	190.72	PASS	AF=0.72;AO=16;DP=24;FAO=18;FDP=25;FR=.;FRO=7;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.00485348;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.5489;QD=30.516;RBI=0.0392927;REFB=-0.0150702;REVB=-0.0389918;RO=7;SAF=6;SAR=10;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0309522;STB=0.529378;STBP=0.714;TYPE=snp;VARB=0.00303646;OID=.;OPOS=8234192;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:24:25:7:7:16:18:0.72:10:6:3:4:12:6:3:4
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chr8	8819186	.	T	A	728.79	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00443711;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=315.594;QD=57.1598;RBI=0.00796499;REFB=0;REVB=0.00661462;RO=0;SAF=22;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.15703e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.39909e-05;OID=.;OPOS=8819186;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:51:0:0:50:51:1:28:22:0:0:29:22:0:0
chr8	8860620	.	T	C	709.17	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0555567;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.771;QD=63.0376;RBI=0.0620038;REFB=0;REVB=0.0275305;RO=0;SAF=19;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000208714;OID=.;OPOS=8860620;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:45:0:0:44:45:1:25:19:0:0:25:20:0:0
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chr8	9414642	.	G	A	689.38	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00527929;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=301.187;QD=62.6711;RBI=0.0309166;REFB=0;REVB=0.0304625;RO=0;SAF=25;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.06287e-05;OID=.;OPOS=9414642;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:19:25:0:0:19:25:0:0
chr8	9415168	.	G	A	594.54	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0157242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.004;QD=60.9786;RBI=0.0203125;REFB=0;REVB=0.0128587;RO=0;SAF=26;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.14784e-05;OID=.;OPOS=9415168;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:13:26:0:0:13:26:0:0
chr8	9577940	.	T	C	902.38	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0108644;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.213;QD=58.2183;RBI=0.0530575;REFB=0;REVB=-0.0519332;RO=0;SAF=30;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000155643;OID=.;OPOS=9577940;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:32:30:0:0:32:30:0:0
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chr8	10465344	.	C	A	74.97	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0813134;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.234;QD=37.4866;RBI=0.0813134;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=8;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00133669;OID=.;OPOS=10465344;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:0:8:0:0:0:8:0:0
chr8	10465399	.	T	A	99.64	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0302703;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.422;QD=39.8555;RBI=0.182025;REFB=0;REVB=0.179491;RO=0;SAF=7;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00239834;OID=.;OPOS=10465399;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:10:0:0:9:10:1:2:7:0:0:3:7:0:0
chr8	10465748	.	T	C	55.11	PASS	AF=0.777778;AO=7;DP=9;FAO=7;FDP=9;FR=.;FRO=2;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0083765;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.319;QD=24.4921;RBI=0.0514565;REFB=-0.1479;REVB=0.0507701;RO=2;SAF=4;SAR=3;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0278747;STB=0.516083;STBP=0.902;TYPE=snp;VARB=0.0167542;OID=.;OPOS=10465748;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:9:9:2:2:7:7:0.777778:3:4:1:1:3:4:1:1
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chr8	10467207	.	C	A	1321.36	PASS	AF=1;AO=84;DP=84;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0591895;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.6428;QD=62.1815;RBI=0.103422;REFB=0;REVB=0.0848093;RO=0;SAF=54;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000695323;OID=.;OPOS=10467207;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:85:0:0:84:85:1:30:54:0:0:31:54:0:0
chr8	10467652	.	G	C	31.65	PASS	AF=0.555556;AO=4;DP=8;FAO=5;FDP=9;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0158658;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.417;QD=14.0665;RBI=0.0459207;REFB=-0.0467264;REVB=0.0430928;RO=4;SAF=3;SAR=1;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.533194;STBP=0.995;TYPE=snp;VARB=0.0322784;OID=.;OPOS=10467652;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:8:9:4:4:4:5:0.555556:1:3:3:1:1:4:3:1
chr8	10468172	.	G	A	52.35	PASS	AF=0.25;AO=8;DP=32;FAO=8;FDP=32;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=-0.0136443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.082;QD=6.54431;RBI=0.0189312;REFB=0.012063;REVB=-0.0131234;RO=24;SAF=7;SAR=1;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.465288;STB=0.806805;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=-0.0179425;OID=.;OPOS=10468172;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:32:32:24:24:8:8:0.25:1:7:13:11:1:7:13:11
chr8	10469030	.	G	A	48.23	PASS	AF=0.466667;AO=7;DP=15;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=-0.00473501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.941;QD=12.8603;RBI=0.00681023;REFB=-0.0124221;REVB=0.00489479;RO=6;SAF=5;SAR=2;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.304739;STB=0.740074;STBP=0.113;TYPE=snp;VARB=0.0149824;OID=.;OPOS=10469030;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:15:15:6:8:7:7:0.466667:2:5:2:4:2:5:2:6
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chr8	10754511	.	C	T	1587.43	PASS	AF=1;AO=97;DP=98;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00816761;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.6906;QD=64.1385;RBI=0.022579;REFB=0;REVB=0.02105;RO=0;SAF=35;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.81934e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.67368e-05;OID=.;OPOS=10754511;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:99:0:0:97:99:1:62:35:0:0:64:35:0:0
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chr8	11162496	.	A	C	753.81	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0154261;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.5132;QD=56.8912;RBI=0.0159843;REFB=0;REVB=0.00418701;RO=0;SAF=28;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000132526;OID=.;OPOS=11162496;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:53:0:0:52:53:1:24:28:0:0:24:29:0:0
chr8	11184937	.	G	A	800.35	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0177266;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.684;QD=57.1679;RBI=0.0185557;REFB=0;REVB=-0.00548459;RO=0;SAF=30;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.29784e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.40351e-05;OID=.;OPOS=11184937;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:26:30:0:0:26:30:0:0
chr8	11188743	.	C	T	538.54	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0975241;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=138.374;QD=59.8374;RBI=0.0976125;REFB=0;REVB=-0.00415308;RO=0;SAF=17;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000477683;OID=.;OPOS=11188743;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:19:17:0:0:19:17:0:0
chr8	11188752	.	G	A	501.65	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0264089;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=171.088;QD=59.0178;RBI=0.0663056;REFB=0;REVB=0.0608194;RO=0;SAF=17;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000313673;OID=.;OPOS=11188752;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:17:17:0:0:17:17:0:0
chr8	11189316	.	G	C	164.43	PASS	AF=1;AO=14;DP=15;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0204888;FXX=0.0666222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.0491;QD=46.9805;RBI=0.0674375;REFB=0;REVB=0.0642497;RO=0;SAF=9;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00205294;OID=.;OPOS=11189316;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:14:0:0:14:14:1:5:9:0:0:5:9:0:0
chr8	11189488	.	T	C	823.31	PASS	AF=0.983051;AO=57;DP=59;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0174102;FXX=0.0166639;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.181;QD=55.8176;RBI=0.0175109;REFB=-0.150951;REVB=0.0018745;RO=0;SAF=27;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508194;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=-0.000208782;OID=.;OPOS=11189488;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:59:59:0:1:57:58:0.983051:30:27:0:0:30:28:0:1
chr8	11189535	.	T	C	325.1	PASS	AF=1;AO=21;DP=22;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0828394;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.9479;QD=52.0152;RBI=0.102944;REFB=0;REVB=0.0611149;RO=1;SAF=12;SAR=9;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0369221;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00622106;OID=.;OPOS=11189535;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:25:1:0:21:25:1:9:12:1:0:9:16:0:0
chr8	11204165	.	C	T	375.49	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.017655;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.4667;QD=55.6281;RBI=0.0318826;REFB=0;REVB=-0.026548;RO=0;SAF=12;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000797538;OID=.;OPOS=11204165;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:15:12:0:0:15:12:0:0
chr8	11204184	.	G	A	340.74	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00809458;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.36;QD=54.5177;RBI=0.0149728;REFB=0;REVB=0.0125961;RO=0;SAF=10;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.57373e-05;OID=.;OPOS=11204184;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:15:10:0:0:15:10:0:0
chr8	11280885	.	A	G	265.08	PASS	AF=0.741935;AO=23;DP=31;FAO=23;FDP=31;FR=.;FRO=8;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.00717714;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=224.393;QD=34.2038;RBI=0.0244093;REFB=-0.0300145;REVB=0.0233303;RO=8;SAF=10;SAR=13;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0287914;STB=0.515746;STBP=0.813;TYPE=snp;VARB=0.012734;OID=.;OPOS=11280885;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:31:31:8:8:23:23:0.741935:13:10:3:5:13:10:3:5
chr8	11301753	.	A	C	2238.28	PASS	AF=1;AO=141;DP=142;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0220048;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.1214;QD=63.0501;RBI=0.0233646;REFB=0;REVB=-0.00785476;RO=1;SAF=87;SAR=54;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00872358;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000120365;OID=.;OPOS=11301753;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:142:142:1:0:141:142:1:54:87:0:1:55:87:0:0
chr8	11414237	.	T	C	634.34	PASS	AF=0.976744;AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0603935;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.838;QD=59.0081;RBI=0.0644337;REFB=-0.0417063;REVB=0.0224573;RO=0;SAF=26;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509429;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.000648931;OID=.;OPOS=11414237;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:43:43:0:1:42:42:0.976744:16:26:0:0:16:26:1:0
chr8	11418385	.	G	A	573.32	PASS	AF=0.95122;AO=39;DP=41;FAO=39;FDP=41;FR=.;FRO=2;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0309331;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=203.798;QD=55.9333;RBI=0.0338852;REFB=-0.165554;REVB=0.0138329;RO=1;SAF=22;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0208334;STB=0.503175;STBP=0.873;TYPE=snp;VARB=0.00141682;OID=.;OPOS=11418385;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:41:41:1:2:39:39:0.95122:17:22:1:0:17:22:1:1
chr8	11418773	.	C	T	717.06	PASS	AF=0.946429;AO=52;DP=55;FAO=53;FDP=56;FR=.;FRO=3;FSAF=27;FSAR=26;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.104904;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=53.5012;QD=51.2183;RBI=0.109315;REFB=-0.114197;REVB=0.0307388;RO=3;SAF=26;SAR=26;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0170972;STB=0.508426;STBP=0.672;TYPE=snp;VARB=0.00800189;OID=.;OPOS=11418773;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:55:56:3:3:52:53:0.946429:26:26:2:1:26:27:2:1
chr8	11421793	.	C	T	550.07	PASS	AF=0.926829;AO=38;DP=42;FAO=38;FDP=41;FR=.;FRO=3;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.00785749;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.21;QD=53.6649;RBI=0.0323229;REFB=0.00532662;REVB=0.0313533;RO=2;SAF=18;SAR=20;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00246896;STB=0.514131;STBP=0.46;TYPE=snp;VARB=-0.00121657;OID=.;OPOS=11421793;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:42:41:2:3:38:38:0.926829:20:18:1:1:20:18:2:1
chr8	11619261	.	T	A	1026.14	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.027981;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.5238;QD=59.4861;RBI=0.110116;REFB=0;REVB=0.106502;RO=0;SAF=40;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00145369;OID=.;OPOS=11619261;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:68:69:0:0:68:69:1:28:40:0:0:29:40:0:0
chr8	11619334	.	C	T	918.42	PASS	AF=1;AO=64;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0285436;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.8439;QD=55.662;RBI=0.0869786;REFB=-0.136472;REVB=0.0821617;RO=2;SAF=36;SAR=28;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0255165;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00304616;OID=.;OPOS=11619334;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:66:66:2:0:64:66:1:28:36:2:0:28:38:0:0
chr8	11619635	.	T	A	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0297885;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.697;QD=42.1826;RBI=0.0547447;REFB=0;REVB=-0.0459307;RO=0;SAF=7;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000693171;OID=.;OPOS=11619635;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:4:7:0:0:4:7:0:0
chr8	11619986	.	C	T	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.589;QD=43.4861;RBI=0.0044225;REFB=0;REVB=0.0044225;RO=0;SAF=0;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.58062e-05;OID=.;OPOS=11619986;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:12:0:0:0:12:0:0:0
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chr8	11620315	.	T	C	708.56	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00474557;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=217.352;QD=62.9827;RBI=0.0195223;REFB=0;REVB=-0.0189368;RO=0;SAF=23;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.90171e-05;OID=.;OPOS=11620315;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:22:23:0:0:22:23:0:0
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chr8	11995062	.	G	A	50.15	PASS	AF=0.583333;AO=7;DP=12;FAO=7;FDP=12;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.00261909;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.688;QD=16.7179;RBI=0.0486159;REFB=-0.00976485;REVB=-0.0485453;RO=5;SAF=5;SAR=2;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0935942;STB=0.55539;STBP=0.694;TYPE=snp;VARB=0.0149719;OID=.;OPOS=11995062;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:12:12:5:5:7:7:0.583333:2:5:3:2:2:5:3:2
chr8	11995274	.	G	A	88.22	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.01786;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.499;QD=39.2068;RBI=0.0228991;REFB=0;REVB=-0.0143314;RO=0;SAF=1;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.59431e-05;OID=.;OPOS=11995274;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:8:1:0:0:8:1:0:0
chr8	12042880	.	T	C	30.11	PASS	AF=0.416667;AO=5;DP=12;FAO=5;FDP=12;FR=.,HEALED;FRO=7;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.0245845;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.984;QD=10.0363;RBI=0.038131;REFB=-0.00693543;REVB=-0.0291475;RO=5;SAF=2;SAR=3;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162496;STB=0.676751;STBP=0.431;TYPE=snp;VARB=0.0275569;OID=.;OPOS=12042880;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:12:12:5:7:5:5:0.416667:3:2:3:2:3:2:5:2
chr8	12285161	.	T	C	88.22	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0311113;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.4099;QD=39.2068;RBI=0.0843874;REFB=0;REVB=-0.0784431;RO=0;SAF=5;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00710616;OID=.;OPOS=12285161;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:4:5:0:0:4:5:0:0
chr8	12516729	.	T	G	417.57	PASS	AF=0.967742;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0140399;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.5816;QD=53.8798;RBI=0.0150245;REFB=-0.00219077;REVB=-0.00534942;RO=1;SAF=19;SAR=11;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0404935;STB=0.521724;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=8.05982e-05;OID=.;OPOS=12516729;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:31:31:1:1:30:30:0.967742:11:19:0:1:11:19:0:1
chr8	12516857	.	T	C	728.86	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0160864;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.109;QD=57.1651;RBI=0.029566;REFB=0;REVB=0.0248069;RO=0;SAF=22;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.23441e-05;OID=.;OPOS=12516857;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:29:22:0:0:29:22:0:0
chr8	12580049	.	G	A	211.23	PASS	AF=1;AO=17;DP=18;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0272023;FXX=0.0555247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.3357;QD=49.7015;RBI=0.0294784;REFB=0;REVB=-0.0113583;RO=0;SAF=12;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00107981;OID=.;OPOS=12580049;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:17:0:0:17:17:1:5:12:0:0:5:12:0:0
chr8	12809667	.	A	T	1870.51	PASS	AF=0.684211;AO=156;DP=230;FAO=156;FDP=228;FR=.;FRO=72;FSAF=79;FSAR=77;FSRF=35;FSRR=37;FWDB=0.00634866;FXX=0.00869527;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.626;QD=32.816;RBI=0.0130562;REFB=-0.00283173;REVB=0.0114087;RO=72;SAF=79;SAR=77;SRF=35;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0119629;STB=0.506409;STBP=0.763;TYPE=snp;VARB=0.000902145;OID=.;OPOS=12809667;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:230:228:72:72:156:156:0.684211:77:79:35:37:77:79:35:37
chr8	12809700	.	G	A	1603.87	PASS	AF=0.665072;AO=139;DP=210;FAO=139;FDP=209;FR=.;FRO=70;FSAF=68;FSAR=71;FSRF=35;FSRR=35;FWDB=-0.00537884;FXX=0.00476168;HRUN=2;LEN=1;MLLD=244.582;QD=30.6961;RBI=0.01927;REFB=-0.00837252;REVB=0.0185041;RO=70;SAF=68;SAR=71;SRF=35;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00673116;STB=0.503615;STBP=0.869;TYPE=snp;VARB=0.00360419;OID=.;OPOS=12809700;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:210:209:70:70:139:139:0.665072:71:68:35:35:71:68:35:35
chr8	12878637	.	A	G	670.16	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00230843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.6672;QD=62.3407;RBI=0.0278844;REFB=0;REVB=-0.0277887;RO=0;SAF=9;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000376449;OID=.;OPOS=12878637;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:34:9:0:0:34:9:0:0
chr8	12878677	.	T	C	360.12	PASS	AF=0.571429;AO=36;DP=63;FAO=36;FDP=63;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=25;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=-0.00295758;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.737;QD=22.8646;RBI=0.0289251;REFB=-0.0088318;REVB=0.0287735;RO=27;SAF=11;SAR=25;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0578154;STB=0.531897;STBP=0.587;TYPE=snp;VARB=0.00832939;OID=.;OPOS=12878677;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:27:27:36:36:0.571429:25:11:10:17:25:11:10:17
chr8	12878807	.	T	G	511.97	PASS	AF=0.671429;AO=43;DP=70;FAO=47;FDP=70;FR=.;FRO=23;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=0.0106051;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.243;QD=29.2556;RBI=0.0231616;REFB=-0.00432696;REVB=0.020591;RO=25;SAF=25;SAR=18;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0693195;STB=0.546271;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.00250965;OID=.;OPOS=12878807;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:25:23:43:47:0.671429:18:25:12:13:20:27:10:13
chr8	12879062	.	T	C	216.29	PASS	AF=0.689655;AO=20;DP=29;FAO=20;FDP=29;FR=.;FRO=9;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.00548391;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=217.095;QD=29.8325;RBI=0.00703523;REFB=-0.0121804;REVB=0.00440695;RO=9;SAF=8;SAR=12;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0258492;STB=0.514271;STBP=0.88;TYPE=snp;VARB=0.0040234;OID=.;OPOS=12879062;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:29:29:9:9:20:20:0.689655:12:8:4:5:12:8:4:5
chr8	12879099	.	G	A	225.35	PASS	AF=0.636364;AO=21;DP=33;FAO=21;FDP=33;FR=.;FRO=12;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=0.0182875;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=242.622;QD=27.3146;RBI=0.0245865;REFB=-0.0102995;REVB=-0.0164336;RO=12;SAF=9;SAR=12;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122325;STB=0.567506;STBP=0.328;TYPE=snp;VARB=0.00473814;OID=.;OPOS=12879099;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:33:33:12:12:21:21:0.636364:12:9:3:9:12:9:3:9
chr8	12879334	.	T	C	236.5	PASS	AF=0.75;AO=21;DP=28;FAO=21;FDP=28;FR=.;FRO=7;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0477182;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.9385;QD=33.7854;RBI=0.0619774;REFB=0.000570661;REVB=0.0395497;RO=7;SAF=11;SAR=10;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0217704;STB=0.511934;STBP=0.868;TYPE=snp;VARB=0.00253216;OID=.;OPOS=12879334;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:28:28:7:7:21:21:0.75:10:11:4:3:10:11:4:3
chr8	12888743	.	A	G	590.03	PASS	AF=1;AO=38;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0114188;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=146.837;QD=60.5157;RBI=0.0221;REFB=0;REVB=0.0189215;RO=1;SAF=23;SAR=15;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0302093;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.33115e-05;OID=.;OPOS=12888743;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:1:0:38:39:1:15:23:0:1:16:23:0:0
chr8	12888908	.	T	G	538.55	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0222369;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.286;QD=59.8386;RBI=0.0222374;REFB=0;REVB=-0.000146306;RO=0;SAF=16;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.9376e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000193368;OID=.;OPOS=12888908;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:20:16:0:0:20:16:0:0
chr8	12950315	.	G	T	48.86	PASS	AF=0.5;AO=7;DP=14;FAO=7;FDP=14;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.00513535;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.124;QD=13.959;RBI=0.0119654;REFB=-0.0356118;REVB=-0.0108074;RO=7;SAF=3;SAR=4;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.235769;STB=0.639615;STBP=0.37;TYPE=snp;VARB=0.0360067;OID=.;OPOS=12950315;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:14:14:7:7:7:7:0.5:4:3:5:2:4:3:5:2
chr8	12952293	.	C	T	50.64	PASS	AF=0.2;AO=8;DP=40;FAO=8;FDP=40;FR=.;FRO=32;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=0.0139813;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=245.691;QD=5.06441;RBI=0.0183508;REFB=-0.0187472;REVB=0.011886;RO=32;SAF=1;SAR=7;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.565571;STB=0.874063;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.0354034;OID=.;OPOS=12952293;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:50:40:40:32:32:8:8:0.2:7:1:19:13:7:1:19:13
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chr8	13425353	.	T	A	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00664083;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.709;QD=48.7373;RBI=0.0136719;REFB=0;REVB=-0.0119508;RO=0;SAF=12;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.76764e-05;OID=.;OPOS=13425353;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:5:12:0:0:5:12:0:0
chr8	13947515	.	A	G	492.27	PASS	AF=0.803922;AO=41;DP=52;FAO=41;FDP=51;FR=.;FRO=10;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.00373598;FXX=0.0192271;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.009;QD=38.6096;RBI=0.00538013;REFB=-0.00583119;REVB=-0.00387147;RO=10;SAF=24;SAR=17;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105009;STB=0.556494;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=0.00259372;OID=.;OPOS=13947515;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:52:51:10:10:41:41:0.803922:17:24:3:7:17:24:3:7
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chr8	16025964	.	T	C	284.67	PASS	AF=0.657895;AO=25;DP=38;FAO=25;FDP=38;FR=.;FRO=13;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.00864682;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.932;QD=29.965;RBI=0.0123617;REFB=-0.0328017;REVB=-0.00883425;RO=13;SAF=10;SAR=15;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0394779;STB=0.521722;STBP=0.728;TYPE=snp;VARB=0.0102241;OID=.;OPOS=16025964;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:13:13:25:25:0.657895:15:10:6:7:15:10:6:7
chr8	16043667	.	C	T	716.82	PASS	AF=1;AO=45;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0132224;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.991;QD=62.3318;RBI=0.0401512;REFB=0;REVB=-0.0379116;RO=0;SAF=25;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.09779e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.97513e-05;OID=.;OPOS=16043667;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:45:46:1:20:25:0:0:21:25:0:0
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chr8	17270837	.	G	C	159.82	PASS	AF=0.666667;AO=16;DP=24;FAO=16;FDP=24;FR=.;FRO=8;FSAF=2;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=0.0947661;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.619;QD=26.637;RBI=0.0982696;REFB=0.0172964;REVB=-0.026006;RO=8;SAF=2;SAR=14;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.52274e-08;STB=0.5;STBP=0.999;TYPE=snp;VARB=-0.0199557;OID=.;OPOS=17270837;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:24:24:8:8:16:16:0.666667:14:2:1:7:14:2:1:7
chr8	17415862	.	A	C	274.22	PASS	AF=0.568182;AO=25;DP=44;FAO=25;FDP=44;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.0104292;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.39;QD=24.9293;RBI=0.0243949;REFB=-0.0272298;REVB=0.0220531;RO=19;SAF=8;SAR=17;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.249598;STB=0.638984;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.0183525;OID=.;OPOS=17415862;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:19:19:25:25:0.568182:17:8:12:7:17:8:12:7
chr8	17424920	.	T	C	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0048612;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=285.181;QD=53.2772;RBI=0.0101264;REFB=0;REVB=0.00888329;RO=0;SAF=16;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.08541e-05;OID=.;OPOS=17424920;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:7:16:0:0:7:16:0:0
chr8	17425296	.	C	T	727.78	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0157586;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.66;QD=63.2848;RBI=0.0244418;REFB=0;REVB=-0.0186833;RO=0;SAF=33;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.94744e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.42159e-05;OID=.;OPOS=17425296;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:13:33:0:0:13:33:0:0
chr8	17486175	.	C	T	135.05	PASS	AF=0.316667;AO=17;DP=58;FAO=19;FDP=60;FR=.;FRO=41;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=28;FWDB=-0.00551362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.456;QD=9.00323;RBI=0.00663332;REFB=-0.0109025;REVB=-0.00368794;RO=38;SAF=5;SAR=12;SRF=12;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0296912;STB=0.501013;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0223934;OID=.;OPOS=17486175;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:60:38:41:17:19:0.316667:12:5:12:26:13:6:13:28
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chr8	17743020	.	G	A	594.54	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0229749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.225;QD=60.9786;RBI=0.0234806;REFB=0;REVB=-0.00484683;RO=0;SAF=16;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.43889e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.45378e-05;OID=.;OPOS=17743020;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:23:16:0:0:23:16:0:0
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chr8	17817553	.	G	T	215.15	PASS	AF=0.826087;AO=19;DP=23;FAO=19;FDP=23;FR=.;FRO=4;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.015941;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.265;QD=37.4175;RBI=0.0208941;REFB=0.0366699;REVB=0.0135073;RO=4;SAF=8;SAR=11;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18273;STB=0.599895;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=-0.00824904;OID=.;OPOS=17817553;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:20:23:23:4:4:19:19:0.826087:11:8:4:0:11:8:4:0
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chr8	23060274	.	C	A	162.6	PASS	AF=0.5;AO=17;DP=34;FAO=17;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.0086191;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=232.015;QD=19.1296;RBI=0.0300526;REFB=-0.000801828;REVB=-0.0287901;RO=16;SAF=5;SAR=12;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191794;STB=0.597581;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=0.00102016;OID=.;OPOS=23060274;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:16:17:17:17:0.5:12:5:8:8:12:5:8:9
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chr8	23150878	.	T	G	1357.51	PASS	AF=1;AO=85;DP=85;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0216602;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.973;QD=62.4144;RBI=0.0287045;REFB=0;REVB=0.0188356;RO=0;SAF=37;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.77384e-05;OID=.;OPOS=23150878;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:87:0:0:85:87:1:48:37:0:0:49:38:0:0
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chr8	23155130	.	A	C	211.99	PASS	AF=1;AO=17;DP=18;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00572396;FXX=0.0555247;HRUN=3;LEN=1;MLLD=79.5976;QD=49.8807;RBI=0.0348419;REFB=0;REVB=0.0343685;RO=0;SAF=8;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000126848;OID=.;OPOS=23155130;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:17:0:0:17:17:1:9:8:0:0:9:8:0:0
chr8	23167353	.	T	G	557.13	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0165852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.605;QD=60.2301;RBI=0.0237495;REFB=0;REVB=0.0169992;RO=0;SAF=19;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.68991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000235438;OID=.;OPOS=23167353;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:18:19:0:0:18:19:0:0
chr8	23174481	.	G	A	79.69	PASS	AF=0.5;AO=9;DP=19;FAO=10;FDP=20;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.00283781;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.419;QD=15.938;RBI=0.0220707;REFB=-0.00553185;REVB=0.0218875;RO=10;SAF=4;SAR=5;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.040409;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00712174;OID=.;OPOS=23174481;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:19:20:10:10:9:10:0.5:5:4:4:6:6:4:4:6
chr8	23186007	.	T	C	114.69	PASS	AF=0.285714;AO=16;DP=55;FAO=16;FDP=56;FR=.;FRO=40;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=20;FSRR=20;FWDB=-0.0783949;FXX=0.0344768;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.201;QD=8.19218;RBI=0.0787688;REFB=-0.00567974;REVB=-0.00766547;RO=39;SAF=7;SAR=9;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0587699;STB=0.544787;STBP=0.686;TYPE=snp;VARB=0.0150668;OID=.;OPOS=23186007;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:56:39:40:16:16:0.285714:9:7:19:20:9:7:20:20
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chr8	24211278	.	C	T	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00153683;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.535;QD=51.1846;RBI=0.0134284;REFB=0;REVB=0.0133402;RO=0;SAF=12;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.64547e-05;OID=.;OPOS=24211278;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:8:12:0:0:8:12:0:0
chr8	24211331	.	G	A	340.7	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0263379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.332;QD=54.5125;RBI=0.0342255;REFB=0;REVB=-0.0218563;RO=0;SAF=17;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00040181;OID=.;OPOS=24211331;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:8:17:0:0:8:17:0:0
chr8	24211869	.	G	T	58.57	PASS	AF=0.166667;AO=10;DP=59;FAO=10;FDP=60;FR=.;FRO=50;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=30;FSRR=20;FWDB=-0.0407041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.349;QD=3.90482;RBI=0.045901;REFB=-0.00301313;REVB=-0.0212151;RO=49;SAF=3;SAR=7;SRF=30;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.37288;STB=0.739927;STBP=0.131;TYPE=snp;VARB=0.031133;OID=.;OPOS=24211869;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:58:59:60:49:50:10:10:0.166667:7:3:30:19:7:3:30:20
chr8	24211884	.	A	ATGTC	612.39	PASS	AF=0.822581;AO=49;DP=63;FAO=51;FDP=62;FR=.;FRO=11;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=0.00459095;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=4;MLLD=262.206;QD=39.5089;RBI=0.00509865;REFB=-0.00382612;REVB=-0.00221797;RO=12;SAF=28;SAR=21;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.035863;STB=0.512285;STBP=0.692;TYPE=ins;VARB=0.000793646;OID=.;OPOS=24211885;OREF=-;OALT=TGTC;OMAPALT=ATGTC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.822581:49:63:51:62:11:29:22:7:4:64:12:28:21:8:4
chr8	24774683	.	C	A	593.05	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0308826;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.0632;QD=59.3047;RBI=0.0324597;REFB=0;REVB=0.00999493;RO=0;SAF=13;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000580296;OID=.;OPOS=24774683;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:40:0:0:38:40:1:25:13:0:0:27:13:0:0
chr8	24810088	.	T	A	557.03	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0134351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.0982;QD=60.219;RBI=0.0173298;REFB=0;REVB=0.0109463;RO=0;SAF=18;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.68991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.2832e-05;OID=.;OPOS=24810088;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:19:18:0:0:19:18:0:0
chr8	24811064	.	AGG	A,AG	308.37	PASS	AF=0,1;AO=6,38;DP=49;FAO=0,48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=0,42;FSAR=0,6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0109579,-0.0244011;FXX=0.020404;HRUN=7,7;LEN=2,1;MLLD=9.17277,9.2649;QD=25.6973;RBI=0.140604,0.242575;REFB=0.0896147,0.064421;REVB=-0.140177,-0.241345;RO=3;SAF=4,34;SAR=2,4;SRF=3;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.236104,-0.0395819;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=0,-0.00802359;OID=.,.;OPOS=24811065,24811065;OREF=GG,G;OALT=-,-;OMAPALT=A,AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	2/2:0,1:6,38:49:0,48:48:0:0,42:0,6:0:0:5:3:4,34:2,4:3:0
chr8	24811815	.	G	A	352.88	PASS	AF=0.62963;AO=34;DP=54;FAO=34;FDP=54;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=4;FSRR=16;FWDB=-0.0481638;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.184;QD=26.1391;RBI=0.0487221;REFB=-0.0360992;REVB=0.00735515;RO=20;SAF=12;SAR=22;SRF=4;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11801;STB=0.564321;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=0.0242933;OID=.;OPOS=24811815;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:20:20:34:34:0.62963:22:12:4:16:22:12:4:16
chr8	25203022	.	A	G	539.75	PASS	AF=1;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0297638;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.651;QD=59.9726;RBI=0.0297807;REFB=0;REVB=0.0010028;RO=0;SAF=20;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.9376e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000174921;OID=.;OPOS=25203022;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:36:0:0:36:36:1:16:20:0:0:16:20:0:0
chr8	25234858	.	A	G	671.65	PASS	AF=0.960784;AO=49;DP=51;FAO=49;FDP=51;FR=.;FRO=2;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0967549;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.4425;QD=52.6787;RBI=0.101692;REFB=-0.00856134;REVB=-0.0313015;RO=1;SAF=21;SAR=28;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.021881;STB=0.502856;STBP=0.886;TYPE=snp;VARB=0.00274788;OID=.;OPOS=25234858;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:51:51:1:2:49:49:0.960784:28:21:1:0:28:21:1:1
chr8	25267622	.	A	G	146.66	PASS	AF=0.625;AO=15;DP=25;FAO=15;FDP=24;FR=.;FRO=9;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.0371334;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.159;QD=24.4427;RBI=0.0371554;REFB=-0.0288877;REVB=-0.00128034;RO=9;SAF=9;SAR=6;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0468954;STB=0.526281;STBP=0.737;TYPE=snp;VARB=0.0144688;OID=.;OPOS=25267622;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:25:24:9:9:15:15:0.625:6:9:6:3:6:9:6:3
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chr8	25323777	.	T	C	401.62	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0395573;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.793;QD=55.396;RBI=0.0413574;REFB=0;REVB=0.0120688;RO=0;SAF=8;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.06954e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000627926;OID=.;OPOS=25323777;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:29:0:0:27:29:1:19:8:0:0:20:9:0:0
chr8	25364331	.	G	A	41.13	PASS	AF=0.6;AO=6;DP=10;FAO=6;FDP=10;FR=.;FRO=4;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.015643;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.9596;QD=16.4527;RBI=0.065266;REFB=0.0158315;REVB=0.0633636;RO=4;SAF=3;SAR=3;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00235648;OID=.;OPOS=25364331;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:10:10:4:4:6:6:0.6:3:3:2:2:3:3:2:2
chr8	25708267	.	T	C	116.67	PASS	AF=0.35;AO=14;DP=40;FAO=14;FDP=40;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=-0.0350022;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.4994;QD=11.6665;RBI=0.0449409;REFB=-0.00217848;REVB=0.0281874;RO=26;SAF=5;SAR=9;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.201192;STB=0.619392;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.0037756;OID=.;OPOS=25708267;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:26:26:14:14:0.35:9:5:14:12:9:5:14:12
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chr8	26481771	.	T	C	805.92	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0223299;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.1761;QD=57.566;RBI=0.0761269;REFB=0;REVB=0.0727783;RO=0;SAF=26;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.29784e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00146195;OID=.;OPOS=26481771;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:30:26:0:0:30:26:0:0
chr8	26515458	.	T	C	280.9	PASS	AF=0.5;AO=30;DP=60;FAO=30;FDP=60;FR=.;FRO=30;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=0.0318898;FXX=0.0163908;HRUN=3;LEN=1;MLLD=94.9454;QD=18.7265;RBI=0.0358993;REFB=-0.0320578;REVB=0.0164863;RO=30;SAF=19;SAR=11;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.266334;STB=0.64858;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.0172885;OID=.;OPOS=26515458;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:30:30:30:30:0.5:11:19:10:20:11:19:10:20
chr8	26628028	.	A	G	727.76	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0364053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.037;QD=63.2835;RBI=0.0494977;REFB=0;REVB=0.0335362;RO=0;SAF=24;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000285902;OID=.;OPOS=26628028;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:22:24:0:0:22:24:0:0
chr8	26636906	.	T	A	137.35	PASS	AF=0.326531;AO=16;DP=49;FAO=16;FDP=49;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=0.0191387;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.7732;QD=11.2126;RBI=0.0275715;REFB=-0.0188757;REVB=0.0198469;RO=32;SAF=11;SAR=5;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.252834;STB=0.641727;STBP=0.2;TYPE=snp;VARB=0.0430172;OID=.;OPOS=26636906;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:32:33:16:16:0.326531:5:11:15:17:5:11:16:17
chr8	26636925	.	T	C	706.79	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0235367;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.3931;QD=62.826;RBI=0.0317903;REFB=0;REVB=0.0213693;RO=0;SAF=25;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.09779e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.02609e-05;OID=.;OPOS=26636925;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:20:25:0:0:20:25:0:0
chr8	26716715	.	G	A	708.78	PASS	AF=1;AO=44;DP=46;FAO=45;FDP=45;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=15;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0181026;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.606;QD=63.0023;RBI=0.0200333;REFB=0;REVB=0.00858076;RO=0;SAF=14;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.39726e-05;OID=.;OPOS=26716715;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:45:0:0:44:45:1:30:14:0:0:30:15:0:0
chr8	26944733	.	G	A	92.2	PASS	AF=0.292683;AO=12;DP=41;FAO=12;FDP=41;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.00553403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=300.477;QD=8.99487;RBI=0.0262159;REFB=0.00271878;REVB=-0.0256252;RO=29;SAF=7;SAR=5;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0774054;STB=0.547246;STBP=0.701;TYPE=snp;VARB=-0.0119655;OID=.;OPOS=26944733;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:41:41:29:29:12:12:0.292683:5:7:15:14:5:7:15:14
chr8	27101204	.	T	A	1244.97	PASS	AF=0.965116;AO=83;DP=86;FAO=83;FDP=86;FR=.;FRO=3;FSAF=38;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.00603494;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=265.156;QD=57.9058;RBI=0.0061245;REFB=-0.013849;REVB=-0.00104353;RO=3;SAF=38;SAR=45;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00828409;STB=0.504376;STBP=0.707;TYPE=snp;VARB=0.000460811;OID=.;OPOS=27101204;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:86:86:3:3:83:83:0.965116:45:38:1:2:45:38:1:2
chr8	27101206	.	A	C	1290.59	PASS	AF=0.977011;AO=84;DP=86;FAO=85;FDP=87;FR=.;FRO=2;FSAF=39;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0216685;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.6876;QD=59.3377;RBI=0.0480322;REFB=0.0042775;REVB=-0.0428668;RO=2;SAF=38;SAR=46;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00211573;STB=0.500953;STBP=0.857;TYPE=snp;VARB=-0.000744187;OID=.;OPOS=27101206;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:86:87:2:2:84:85:0.977011:46:38:1:1:46:39:1:1
chr8	27101279	.	C	T	583.63	PASS	AF=0.626506;AO=52;DP=83;FAO=52;FDP=83;FR=.;FRO=31;FSAF=23;FSAR=29;FSRF=10;FSRR=21;FWDB=0.00613343;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.164;QD=28.1269;RBI=0.00765663;REFB=-0.0100138;REVB=-0.00458311;RO=31;SAF=23;SAR=29;SRF=10;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0843106;STB=0.545782;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.0054928;OID=.;OPOS=27101279;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:31:31:52:52:0.626506:29:23:10:21:29:23:10:21
chr8	27147716	.	A	C	159.92	PASS	AF=0.666667;AO=16;DP=24;FAO=16;FDP=24;FR=.;FRO=8;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.03826;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=183.977;QD=26.6526;RBI=0.0383867;REFB=-0.016209;REVB=-0.00311625;RO=6;SAF=7;SAR=9;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138331;STB=0.564438;STBP=0.429;TYPE=snp;VARB=0.00665874;OID=.;OPOS=27147716;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:24:24:6:8:16:16:0.666667:9:7:1:5:9:7:2:6
chr8	27277537	.	G	A	231.45	PASS	AF=0.7;AO=21;DP=30;FAO=21;FDP=30;FR=.;FRO=9;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=-0.0126633;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.213;QD=30.8604;RBI=0.033576;REFB=-0.00417286;REVB=0.0310964;RO=9;SAF=14;SAR=7;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00162754;OID=.;OPOS=27277537;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:30:30:9:9:21:21:0.7:7:14:6:3:7:14:6:3
chr8	27315936	.	A	G	538.33	PASS	AF=0.833333;AO=40;DP=48;FAO=40;FDP=48;FR=.;FRO=8;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.00355263;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.9666;QD=44.8609;RBI=0.020178;REFB=-0.0590581;REVB=-0.0198628;RO=8;SAF=16;SAR=24;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0490293;STB=0.526303;STBP=0.461;TYPE=snp;VARB=0.00974424;OID=.;OPOS=27315936;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:50:48:48:8:8:40:40:0.833333:24:16:2:6:24:16:2:6
chr8	27324822	.	T	C	715.61	PASS	AF=1;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00275594;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.104;QD=57.2491;RBI=0.00384378;REFB=0;REVB=0.00267945;RO=0;SAF=23;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.99977e-05;OID=.;OPOS=27324822;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:50:0:0:50:50:1:27:23:0:0:27:23:0:0
chr8	27324844	.	G	A	724.14	PASS	AF=0.981132;AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0586855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.7733;QD=54.6517;RBI=0.0590437;REFB=-0.0783848;REVB=-0.00649373;RO=1;SAF=21;SAR=31;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0218994;STB=0.511623;STBP=0.278;TYPE=snp;VARB=0.00246511;OID=.;OPOS=27324844;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:53:53:1:1:52:52:0.981132:31:21:1:0:31:21:1:0
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chr8	27401964	.	A	C	76.93	PASS	AF=0.434783;AO=9;DP=22;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.0415714;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.1663;QD=13.3783;RBI=0.0749945;REFB=0.0170599;REVB=0.0624179;RO=13;SAF=0;SAR=9;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.789148;STB=0.8268;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=-0.0215215;OID=.;OPOS=27401964;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:22:23:13:13:9:10:0.434783:9:0:7:6:9:1:7:6
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chr8	27767171	.	G	A	669.65	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00633974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.556;QD=62.2926;RBI=0.0510398;REFB=0;REVB=0.0506445;RO=0;SAF=26;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.75441e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000446269;OID=.;OPOS=27767171;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:17:26:0:0:17:26:0:0
chr8	27779545	.	C	T	41.13	PASS	AF=0.6;AO=6;DP=10;FAO=6;FDP=10;FR=.;FRO=4;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0291572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.1148;QD=16.4528;RBI=0.0291572;REFB=-0.0192878;REVB=0;RO=4;SAF=6;SAR=0;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0355468;OID=.;OPOS=27779545;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:10:10:4:4:6:6:0.6:0:6:4:0:0:6:4:0
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chr8	28304769	.	C	T	340.6	PASS	AF=1;AO=24;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0129079;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.856;QD=54.4957;RBI=0.0200837;REFB=0;REVB=0.0153864;RO=0;SAF=8;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.88814e-05;OID=.;OPOS=28304769;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:24:25:1:16:8:0:0:17:8:0:0
chr8	28384712	.	A	G	283.16	PASS	AF=0.366667;AO=32;DP=89;FAO=33;FDP=90;FR=.;FRO=57;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=27;FSRR=30;FWDB=-0.0125174;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.596;QD=12.585;RBI=0.032801;REFB=-0.000974219;REVB=-0.0303186;RO=57;SAF=17;SAR=15;SRF=27;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0639839;STB=0.526229;STBP=0.695;TYPE=snp;VARB=0.00126215;OID=.;OPOS=28384712;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:90:57:57:32:33:0.366667:15:17:27:30:16:17:27:30
chr8	29197672	.	A	G	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0145107;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.755;QD=49.5991;RBI=0.0145114;REFB=0;REVB=-0.000138866;RO=0;SAF=15;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.32e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.05573e-05;OID=.;OPOS=29197672;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:3:15:0:0:3:15:0:0
chr8	29927300	.	C	G	387.02	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.034958;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.346;QD=55.2879;RBI=0.0470312;REFB=0;REVB=-0.0314622;RO=0;SAF=16;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.71087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.11059e-05;OID=.;OPOS=29927300;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:28:0:0:26:28:1:10:16:0:0:10:18:0:0
chr8	29927321	.	A	G	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0352966;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=243.845;QD=51.1846;RBI=0.0449163;REFB=0;REVB=0.0277781;RO=0;SAF=12;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000357187;OID=.;OPOS=29927321;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:8:12:0:0:8:12:0:0
chr8	29961951	.	C	T	166.3	PASS	AF=0.4;AO=18;DP=45;FAO=18;FDP=45;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.0117434;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.7701;QD=14.7825;RBI=0.0359431;REFB=-0.00531558;REVB=-0.0339705;RO=26;SAF=9;SAR=9;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0787827;STB=0.555495;STBP=0.569;TYPE=snp;VARB=0.0136639;OID=.;OPOS=29961951;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:26:27:18:18:0.4:9:9:11:15:9:9:11:16
chr8	29965519	.	T	C	306.33	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0117536;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.0049;QD=53.2752;RBI=0.0205763;REFB=0;REVB=0.016889;RO=0;SAF=10;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000831611;OID=.;OPOS=29965519;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:13:10:0:0:13:10:0:0
chr8	29989564	.	A	G	326.35	PASS	AF=0.75;AO=26;DP=35;FAO=27;FDP=36;FR=.;FRO=9;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.0156584;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.6831;QD=36.2616;RBI=0.0467999;REFB=-0.0240739;REVB=0.0441027;RO=9;SAF=13;SAR=13;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0261803;STB=0.518505;STBP=0.71;TYPE=snp;VARB=0.00619493;OID=.;OPOS=29989564;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:35:36:9:9:26:27:0.75:13:13:5:4:14:13:5:4
chr8	29996158	.	A	G	280.98	PASS	AF=0.75;AO=24;DP=32;FAO=24;FDP=32;FR=.;FRO=8;FSAF=22;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=-0.00117567;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=318.967;QD=35.1219;RBI=0.00547225;REFB=-0.0174284;REVB=0.00534446;RO=8;SAF=22;SAR=2;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.306225;STB=0.670555;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=0.00691564;OID=.;OPOS=29996158;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:32:32:8:8:24:24:0.75:2:22:5:3:2:22:5:3
chr8	29996256	.	T	C	97.6	PASS	AF=0.6875;AO=11;DP=16;FAO=11;FDP=16;FR=.;FRO=5;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=-0.00377435;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.572;QD=24.4007;RBI=0.0772392;REFB=-0.0179167;REVB=0.0771469;RO=5;SAF=9;SAR=2;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0166212;STB=0.509417;STBP=0.999;TYPE=snp;VARB=0.00747432;OID=.;OPOS=29996256;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:16:16:5:5:11:11:0.6875:2:9:4:1:2:9:4:1
chr8	30423886	.	C	CAG	579.86	PASS	AF=0.909091;AO=40;DP=45;FAO=40;FDP=44;FR=.;FRO=4;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0169246;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=2;MLLD=200.286;QD=52.7141;RBI=0.0318136;REFB=-0.0186627;REVB=0.0269381;RO=4;SAF=15;SAR=25;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.066709;STB=0.535696;STBP=0.145;TYPE=ins;VARB=0.00169827;OID=.;OPOS=30423887;OREF=-;OALT=AG;OMAPALT=CAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.909091:40:45:40:44:4:15:25:3:1:19:4:15:25:3:1
chr8	30503371	.	C	T	182.81	PASS	AF=0.941176;AO=16;DP=17;FAO=16;FDP=17;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.028512;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.066;QD=43.014;RBI=0.0444942;REFB=0.0344994;REVB=0.0341584;RO=1;SAF=11;SAR=5;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0828326;STB=0.545396;STBP=0.263;TYPE=snp;VARB=-0.0179912;OID=.;OPOS=30503371;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:17:17:1:1:16:16:0.941176:5:11:0:1:5:11:0:1
chr8	30608976	.	C	T	490.61	PASS	AF=0.971429;AO=31;DP=35;FAO=34;FDP=35;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=23;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0310746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.6467;QD=56.0697;RBI=0.0482367;REFB=-0.113402;REVB=0.0368937;RO=0;SAF=22;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.15349e-08;STB=0.521726;STBP=0.262;TYPE=snp;VARB=0.0101216;OID=.;OPOS=30608976;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:35:35:0:1:31:34:0.971429:9:22:0:0:11:23:0:1
chr8	30620840	.	G	GT	195.05	PASS	AF=1;AO=19;DP=22;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0498823;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=16.9078;QD=37.1518;RBI=0.0668731;REFB=0;REVB=-0.0445396;RO=2;SAF=9;SAR=10;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00460898;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00360005;OID=.;OPOS=30620841;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:19:22:21:21:0:9:12:0:0:3:2:9:10:1:1
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chr8	30695226	.	C	T	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0702549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.8324;QD=33.4285;RBI=0.070453;REFB=0;REVB=0.00527947;RO=0;SAF=5;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00580436;OID=.;OPOS=30695226;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:1:5:0:0:1:5:0:0
chr8	30700598	.	T	C	188.68	PASS	AF=0.692308;AO=18;DP=26;FAO=18;FDP=26;FR=.;FRO=8;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.0150675;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.854;QD=29.028;RBI=0.0268211;REFB=-0.00873502;REVB=0.0221888;RO=8;SAF=12;SAR=6;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170175;STB=0.594486;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=0.00121822;OID=.;OPOS=30700598;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:26:26:8:8:18:18:0.692308:6:12:3:5:6:12:3:5
chr8	30924557	.	C	T	144.02	PASS	AF=0.421053;AO=16;DP=38;FAO=16;FDP=38;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.0203524;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.417;QD=15.1596;RBI=0.0248243;REFB=-0.0183709;REVB=0.0142136;RO=22;SAF=5;SAR=11;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153522;STB=0.58917;STBP=0.362;TYPE=snp;VARB=0.0178798;OID=.;OPOS=30924557;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:22:22:16:16:0.421053:11:5:10:12:11:5:10:12
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chr8	30999280	.	G	T	188.7	PASS	AF=0.415094;AO=22;DP=53;FAO=22;FDP=53;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=21;FWDB=0.00564243;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.835;QD=14.2416;RBI=0.0131244;REFB=-0.00177002;REVB=-0.0118496;RO=31;SAF=9;SAR=13;SRF=10;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0934718;STB=0.553298;STBP=0.57;TYPE=snp;VARB=0.00224231;OID=.;OPOS=30999280;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:31:31:22:22:0.415094:13:9:10:21:13:9:10:21
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chr8	33573577	.	A	G	130.07	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0321989;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.106;QD=43.3563;RBI=0.0324421;REFB=0;REVB=0.00396552;RO=0;SAF=7;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000358027;OID=.;OPOS=33573577;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:12:0:0:11:12:1:4:7:0:0:4:8:0:0
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chr8	37728019	.	T	G	955.07	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0290147;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.6522;QD=58.7733;RBI=0.0302988;REFB=0;REVB=-0.00872743;RO=0;SAF=32;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000404161;OID=.;OPOS=37728019;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:33:32:0:0:33:32:0:0
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chr8	37979919	.	G	A,C	483.38	PASS	AF=0.0606061,0.939394;AO=2,31;DP=33;FAO=2,31;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=1,15;FSAR=1,16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0152764,-0.0164072;FXX=0.0571265;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=152.733,205.368;QD=58.5914;RBI=0.0311005,0.0167203;REFB=0,0;REVB=0.0270901,0.00322066;RO=0;SAF=1,15;SAR=1,16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0533415,-0.0030616;OID=.,.;OPOS=37979919,37979919;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:33:33:0:0:2,31:2,31:0.0606061,0.939394:1,16:1,15:0:0:1,16:1,15:0:0
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chr8	42882555	.	A	ATTTGT,ATTTGTT	708.63	PASS	AF=0.928571,0;AO=45,7;DP=58;FAO=52,0;FDP=56;FR=.;FRO=4;FSAF=26,0;FSAR=26,0;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.0212187,-0.0198069;FXX=0.111093;HRUN=3,3;LEN=5,6;MLLD=253.99,241.845;QD=50.6163;RBI=0.0233016,0.0284001;REFB=-0.00737266,-0.00878397;REVB=-0.00962963,-0.0203532;RO=4;SAF=26,0;SAR=19,7;SRF=3;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0271313,-0.799165;STB=0.51785,0.5;STBP=0.379,1;TYPE=ins,ins;VARB=0.000276538,0;OID=.,.;OPOS=42882556,42882556;OREF=-,-;OALT=TTTGT,TTTGTT;OMAPALT=ATTTGT,ATTTGTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.928571,0:45,7:58:52,0:56:4:26,0:26,0:3:1:17:4:26,0:19,7:3:1
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chr8	47979781	.	G	C	1568.46	PASS	AF=1;AO=98;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0166861;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.103;QD=64.0186;RBI=0.0295012;REFB=0;REVB=-0.0243289;RO=0;SAF=47;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.96042e-05;OID=.;OPOS=47979781;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:98:0:0:98:98:1:51:47:0:0:51:47:0:0
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chr8	48102987	.	A	G	108.6	PASS	AF=0.40625;AO=12;DP=32;FAO=13;FDP=32;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.0115181;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.512;QD=13.5755;RBI=0.0266639;REFB=-0.00759356;REVB=0.0240478;RO=19;SAF=4;SAR=8;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.256991;STB=0.615207;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.0171231;OID=.;OPOS=48102987;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:19:19:12:13:0.40625:8:4:11:8:8:5:11:8
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chr8	49375958	.	T	C	1511.54	PASS	AF=0.990291;AO=102;DP=104;FAO=102;FDP=103;FR=.;FRO=1;FSAF=55;FSAR=47;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00279552;FXX=0.0190458;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.325;QD=58.7006;RBI=0.00879396;REFB=-0.125335;REVB=-0.00833779;RO=1;SAF=55;SAR=47;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00854891;STB=0.504504;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=4.86777e-05;OID=.;OPOS=49375958;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:104:103:1:1:102:102:0.990291:47:55:1:0:47:55:1:0
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chr8	55541617	.	A	G	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0230351;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=291.761;QD=51.9167;RBI=0.0232076;REFB=0;REVB=0.00282436;RO=0;SAF=11;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.31303e-05;OID=.;OPOS=55541617;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:10:11:0:0:10:11:0:0
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chr8	56076791	.	G	A	1007.53	PASS	AF=1;AO=68;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000538652;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.896;QD=57.573;RBI=0.000542495;REFB=-0.105522;REVB=6.44574e-05;RO=0;SAF=41;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.6787e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000238258;OID=.;OPOS=56076791;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:70:70:0:0:68:70:1:27:41:0:0:29:41:0:0
chr8	56651746	.	G	A	88.21	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0287999;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.644;QD=39.204;RBI=0.0476738;REFB=0;REVB=0.0379915;RO=0;SAF=2;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00223469;OID=.;OPOS=56651746;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:7:2:0:0:7:2:0:0
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chr8	56686224	.	T	C	1171.97	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00354848;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.0146;QD=60.8818;RBI=0.0159392;REFB=0;REVB=0.0155392;RO=0;SAF=43;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.11157e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.96926e-05;OID=.;OPOS=56686224;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:34:43:0:0:34:43:0:0
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chr8	56821700	.	T	G	1339.76	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0208523;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.586;QD=62.3142;RBI=0.0286413;REFB=0;REVB=0.0196344;RO=0;SAF=37;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.81153e-05;OID=.;OPOS=56821700;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:49:37:0:0:49:37:0:0
chr8	56821795	.	T	G	1317.28	PASS	AF=1;AO=81;DP=81;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.039843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.803;QD=61.9895;RBI=0.040767;REFB=0;REVB=0.00863032;RO=0;SAF=38;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18592e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.10393e-05;OID=.;OPOS=56821795;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:85:0:0:81:85:1:43:38:0:0:46:39:0:0
chr8	56821809	.	C	T	1175.5	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0103423;FXX=0.0128189;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.744;QD=61.0647;RBI=0.010564;REFB=0;REVB=-0.00215311;RO=0;SAF=32;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.38586e-05;OID=.;OPOS=56821809;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:45:32:0:0:45:32:0:0
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chr8	59060275	.	A	G	549.49	PASS	AF=0.523364;AO=56;DP=108;FAO=56;FDP=107;FR=.;FRO=51;FSAF=24;FSAR=32;FSRF=34;FSRR=17;FWDB=-0.0113602;FXX=0.0092584;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.605;QD=20.5416;RBI=0.0208171;REFB=-0.00760095;REVB=0.0174441;RO=51;SAF=24;SAR=32;SRF=34;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.203988;STB=0.612098;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.00977128;OID=.;OPOS=59060275;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:107:51:51:56:56:0.523364:32:24:34:17:32:24:34:17
chr8	59496490	.	A	G	278.86	PASS	AF=0.54902;AO=28;DP=51;FAO=28;FDP=51;FR=.;FRO=23;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=0.0385636;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.521;QD=21.871;RBI=0.0549012;REFB=-0.0331481;REVB=0.0390767;RO=23;SAF=15;SAR=13;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0466917;STB=0.525928;STBP=0.693;TYPE=snp;VARB=0.0269198;OID=.;OPOS=59496490;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:23:23:28:28:0.54902:13:15:11:12:13:15:11:12
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chr8	59571856	.	A	C	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0415818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.232;QD=48.7368;RBI=0.0464026;REFB=0;REVB=-0.0205949;RO=0;SAF=8;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000237352;OID=.;OPOS=59571856;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:9:8:0:0:9:8:0:0
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chr8	63978658	.	TA	T	409.28	PASS	AF=1;AO=49;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.105737;FXX=0.0172384;HRUN=8;LEN=1;MLLD=9.89483;QD=28.7212;RBI=0.134876;REFB=0;REVB=0.0837324;RO=5;SAF=12;SAR=37;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0594799;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00347978;OID=.;OPOS=63978659;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:49:57:57:57:0:13:44:0:0:8:5:12:37:0:5
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chr8	75460789	.	A	AG	1802.62	PASS	AF=1;AO=147;DP=162;FAO=155;FDP=155;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0358322;FXX=0.012738;HRUN=1;LEN=1;MLLD=21.9065;QD=46.5192;RBI=0.0458323;REFB=0;REVB=-0.0285771;RO=13;SAF=64;SAR=83;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0280846;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000166949;OID=.;OPOS=75460790;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:147:162:155:155:0:70:85:0:0:33:13:64:83:8:5
chr8	75614617	.	A	G	538.55	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0445607;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.4236;QD=59.8391;RBI=0.0747377;REFB=0;REVB=0.0600007;RO=0;SAF=23;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.21415e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000270563;OID=.;OPOS=75614617;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:13:23:0:0:13:23:0:0
chr8	75664694	.	CA	C	1223.15	PASS	AF=1;AO=76;DP=78;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0398546;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.265;QD=60.4025;RBI=0.0416061;REFB=0;REVB=0.0119447;RO=0;SAF=34;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6391e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=1.20665e-05;OID=.;OPOS=75664695;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:76:78:81:81:0:37:44:0:0:7:0:34:42:0:0
chr8	76452313	.	G	A	348.59	PASS	AF=0.474359;AO=35;DP=76;FAO=37;FDP=78;FR=.;FRO=41;FSAF=13;FSAR=24;FSRF=17;FSRR=24;FWDB=0.0155329;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.1394;QD=17.8763;RBI=0.0352582;REFB=-0.00401941;REVB=0.0316523;RO=41;SAF=13;SAR=22;SRF=17;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0438855;STB=0.535695;STBP=0.569;TYPE=snp;VARB=0.00582943;OID=.;OPOS=76452313;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:78:41:41:35:37:0.474359:22:13:17:24:24:13:17:24
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chr8	77690563	.	T	C	893.26	PASS	AF=0.523529;AO=88;DP=169;FAO=89;FDP=170;FR=.;FRO=81;FSAF=50;FSAR=39;FSRF=46;FSRR=35;FWDB=-0.00514814;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.632;QD=21.0178;RBI=0.0172553;REFB=-0.00397148;REVB=-0.0164694;RO=81;SAF=50;SAR=38;SRF=46;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000249909;STB=0.502955;STBP=0.931;TYPE=snp;VARB=0.00342423;OID=.;OPOS=77690563;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:169:170:81:81:88:89:0.523529:38:50:46:35:39:50:46:35
chr8	77745635	.	G	A	505.54	PASS	AF=0.539326;AO=48;DP=88;FAO=48;FDP=89;FR=.;FRO=41;FSAF=19;FSAR=29;FSRF=17;FSRR=24;FWDB=-0.0209168;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.127;QD=22.7211;RBI=0.0239659;REFB=-0.00348736;REVB=-0.0116985;RO=40;SAF=19;SAR=29;SRF=16;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00359588;STB=0.509016;STBP=0.868;TYPE=snp;VARB=0.00344229;OID=.;OPOS=77745635;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:89:40:41:48:48:0.539326:29:19:16:24:29:19:17:24
chr8	77764207	.	G	A	149.75	PASS	AF=0.714286;AO=15;DP=21;FAO=15;FDP=21;FR=.;FRO=6;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.00729207;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.187;QD=28.5231;RBI=0.00979783;REFB=-0.0110499;REVB=-0.00654395;RO=6;SAF=8;SAR=7;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102291;STB=0.556886;STBP=0.463;TYPE=snp;VARB=0.00445162;OID=.;OPOS=77764207;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:21:21:6:6:15:15:0.714286:7:8:2:4:7:8:2:4
chr8	77765398	.	A	G	45.35	PASS	AF=0.318182;AO=7;DP=22;FAO=7;FDP=22;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.00774029;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.629;QD=8.24611;RBI=0.00774034;REFB=0.000643108;REVB=-2.56374e-05;RO=15;SAF=4;SAR=3;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11411;STB=0.571224;STBP=0.69;TYPE=snp;VARB=-0.00413598;OID=.;OPOS=77765398;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:22:22:15:15:7:7:0.318182:3:4:7:8:3:4:7:8
chr8	77768390	.	T	G	592.48	PASS	AF=0.402367;AO=67;DP=168;FAO=68;FDP=169;FR=.;FRO=101;FSAF=23;FSAR=45;FSRF=49;FSRR=52;FWDB=0.00987744;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.218;QD=14.0232;RBI=0.0099476;REFB=-0.010638;REVB=-0.00117939;RO=100;SAF=22;SAR=45;SRF=49;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1807;STB=0.592186;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.0146155;OID=.;OPOS=77768390;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:168:169:100:101:67:68:0.402367:45:22:49:51:45:23:49:52
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chr8	77912148	.	G	A	561.2	PASS	AF=0.54902;AO=55;DP=100;FAO=56;FDP=102;FR=.;FRO=46;FSAF=19;FSAR=37;FSRF=14;FSRR=32;FWDB=-0.0632622;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.272;QD=22.0078;RBI=0.0641659;REFB=0.00173981;REVB=-0.0107316;RO=45;SAF=19;SAR=36;SRF=13;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0522945;STB=0.517766;STBP=0.726;TYPE=snp;VARB=-0.00188838;OID=.;OPOS=77912148;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:102:45:46:55:56:0.54902:36:19:13:32:37:19:14:32
chr8	77912230	.	G	T	149.09	PASS	AF=0.5;AO=16;DP=32;FAO=16;FDP=32;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.018467;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.838;QD=18.6361;RBI=0.0200437;REFB=0.00549352;REVB=-0.00779231;RO=16;SAF=8;SAR=8;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.054861;STB=0.531211;STBP=0.737;TYPE=snp;VARB=-0.00344915;OID=.;OPOS=77912230;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:16:16:16:16:0.5:8:8:9:7:8:8:9:7
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chr8	80678427	.	T	C	1862.45	PASS	AF=1;AO=121;DP=121;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00972609;FXX=0.00819605;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.4459;QD=61.5686;RBI=0.0140961;REFB=0;REVB=-0.0102031;RO=0;SAF=51;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.89359e-06;OID=.;OPOS=80678427;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:121:121:0:0:121:121:1:70:51:0:0:70:51:0:0
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chr8	87660107	.	G	A	352.45	PASS	AF=0.480519;AO=37;DP=77;FAO=37;FDP=77;FR=.;FRO=40;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=22;FSRR=18;FWDB=-0.0279694;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.821;QD=18.3093;RBI=0.0391747;REFB=-0.00367738;REVB=-0.0274294;RO=39;SAF=18;SAR=19;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0478062;STB=0.532942;STBP=0.577;TYPE=snp;VARB=0.00465772;OID=.;OPOS=87660107;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:39:40:37:37:0.480519:19:18:21:18:19:18:22:18
chr8	87666251	.	T	G	1339.6	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0257476;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.793;QD=62.3069;RBI=0.0263861;REFB=0;REVB=0.00576948;RO=0;SAF=40;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.04388e-05;OID=.;OPOS=87666251;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:46:40:0:0:46:40:0:0
chr8	87679303	.	A	C	1775.48	PASS	AF=0.97541;AO=119;DP=122;FAO=119;FDP=122;FR=.;FRO=3;FSAF=58;FSAR=61;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0322531;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=42.4108;QD=58.2124;RBI=0.0423593;REFB=-0.150485;REVB=0.02746;RO=3;SAF=58;SAR=61;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00719847;STB=0.503791;STBP=0.717;TYPE=snp;VARB=0.00354827;OID=.;OPOS=87679303;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:122:122:3:3:119:119:0.97541:61:58:1:2:61:58:1:2
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chr8	92136728	.	C	T	1513.42	PASS	AF=1;AO=101;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=1.03655e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.337;QD=59.9374;RBI=0.0163022;REFB=0;REVB=0.0163022;RO=0;SAF=52;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.10807e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.79223e-05;OID=.;OPOS=92136728;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:101:101:0:0:101:101:1:49:52:0:0:49:52:0:0
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chr8	94739345	.	A	G	1293.87	PASS	AF=1;AO=82;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0203782;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.464;QD=61.613;RBI=0.0266729;REFB=0;REVB=0.0172097;RO=0;SAF=50;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.8799e-06;OID=.;OPOS=94739345;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:84:0:0:82:84:1:32:50:0:0:32:52:0:0
chr8	94744813	.	C	T	689.35	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00163338;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.4204;QD=62.668;RBI=0.0406749;REFB=0;REVB=-0.0406421;RO=0;SAF=25;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000471508;OID=.;OPOS=94744813;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:19:25:0:0:19:25:0:0
chr8	94745050	.	T	C	805.05	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00964389;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.895;QD=64.4041;RBI=0.0313192;REFB=0;REVB=0.0297975;RO=0;SAF=31;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.75971e-05;OID=.;OPOS=94745050;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:19:31:0:0:19:31:0:0
chr8	94745386	.	G	T	668.24	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00558135;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.0492;QD=62.1617;RBI=0.0337972;REFB=0;REVB=-0.0333331;RO=0;SAF=30;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.52854e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000347659;OID=.;OPOS=94745386;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:43:0:0:42:43:1:12:30:0:0:12:31:0:0
chr8	94752754	.	G	A	1713.34	PASS	AF=1;AO=113;DP=113;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0284154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.825;QD=60.649;RBI=0.0319845;REFB=0;REVB=0.0146825;RO=0;SAF=62;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.31804e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.85823e-05;OID=.;OPOS=94752754;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:113:113:0:0:113:113:1:51:62:0:0:51:62:0:0
chr8	94794620	.	C	T	594.54	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0071646;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.255;QD=60.9781;RBI=0.00944036;REFB=0;REVB=-0.00614727;RO=0;SAF=16;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.43889e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.38512e-06;OID=.;OPOS=94794620;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:23:16:0:0:23:16:0:0
chr8	94808165	.	A	G	1353.69	PASS	AF=0.988764;AO=87;DP=90;FAO=88;FDP=89;FR=.;FRO=1;FSAF=52;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0280447;FXX=0.0111099;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.9317;QD=60.8399;RBI=0.0299898;REFB=-0.110512;REVB=-0.0106245;RO=0;SAF=51;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504761;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=0.00103938;OID=.;OPOS=94808165;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:90:89:0:1:87:88:0.988764:36:51:0:0:36:52:1:0
chr8	94935937	.	T	C	651.2	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0081885;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.85;QD=62.0188;RBI=0.0157985;REFB=0;REVB=-0.0135108;RO=0;SAF=21;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.25839e-05;OID=.;OPOS=94935937;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:21:21:0:0:21:21:0:0
chr8	94936532	.	G	C	1212.31	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0129535;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.926;QD=61.3828;RBI=0.0134119;REFB=0;REVB=-0.00347627;RO=0;SAF=39;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33478e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.66241e-05;OID=.;OPOS=94936532;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:40:39:0:0:40:39:0:0
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chr8	101970394	.	T	C	754.35	PASS	AF=1;AO=47;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00211036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.797;QD=62.8627;RBI=0.0038717;REFB=0;REVB=-0.00324598;RO=0;SAF=18;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00051049;OID=.;OPOS=101970394;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:47:48:1:29:18:0:0:29:19:0:0
chr8	102209357	.	A	T	1208.96	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00418979;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.275;QD=61.213;RBI=0.0106721;REFB=0;REVB=-0.00981521;RO=0;SAF=54;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.19596e-06;OID=.;OPOS=102209357;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:25:54:0:0:25:54:0:0
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chr8	104337367	.	A	C	465.13	PASS	AF=1;AO=31;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0145286;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.8966;QD=58.1414;RBI=0.0168529;REFB=0;REVB=-0.0085405;RO=0;SAF=15;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000474838;OID=.;OPOS=104337367;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:31:32:1:16:15:0:0:16:16:0:0
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chr8	116424270	.	A	AC,C	653.14	PASS	AF=0.959184,0.0204082;AO=30,13;DP=52;FAO=47,1;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=25,1;FSAR=22,0;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0352188,-0.0577166;FXX=0.039208;HRUN=0,9;LEN=1,1;MLLD=209.953,198.214;QD=53.3173;RBI=0.0367193,0.0585262;REFB=-0.00997731,-0.0349172;REVB=-0.0103897,-0.0097006;RO=4;SAF=11,13;SAR=19,0;SRF=3;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0877233,0.819633;STB=0.511106,0.989913;STBP=0.318,0.496;TYPE=ins,snp;VARB=0.000352819,0.0390744;OID=.,.;OPOS=116424271,116424270;OREF=-,A;OALT=C,C;OMAPALT=AC,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:52:49:4:1:30,13:47,1:0.959184,0.0204082:19,0:11,13:3:1:22,0:25,1:0:1
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chr8	124664792	.	C	T	1198.02	PASS	AF=1;AO=77;DP=79;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0256964;FXX=0.0249969;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.95;QD=61.4367;RBI=0.0280916;REFB=0;REVB=-0.0113503;RO=0;SAF=34;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.11157e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.72589e-05;OID=.;OPOS=124664792;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:78:0:0:77:78:1:43:34:0:0:43:35:0:0
chr8	124664873	.	AT	GC	1530.05	PASS	AF=1;AO=96;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0332695;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=253.002;QD=63.7519;RBI=0.0340137;REFB=0;REVB=0.00707622;RO=0;SAF=41;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=-2.80047e-05;OID=.;OPOS=124664873;OREF=AT;OALT=GC;OMAPALT=GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:96:96:0:0:96:96:1:55:41:0:0:55:41:0:0
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chr8	125061895	.	G	A	1246.36	PASS	AF=0.606557;AO=108;DP=181;FAO=111;FDP=183;FR=.;FRO=72;FSAF=50;FSAR=61;FSRF=33;FSRR=39;FWDB=0.0156763;FXX=0.0108102;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.876;QD=27.2429;RBI=0.0157325;REFB=-0.0127735;REVB=0.00132904;RO=73;SAF=50;SAR=58;SRF=34;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00208803;STB=0.50313;STBP=0.923;TYPE=snp;VARB=0.00803729;OID=.;OPOS=125061895;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:181:183:73:72:108:111:0.606557:58:50:34:39:61:50:33:39
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chr8	126448789	.	G	A	180.52	PASS	AF=0.307692;AO=24;DP=78;FAO=24;FDP=78;FR=.;FRO=54;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=33;FWDB=-0.0147138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.29;QD=9.2576;RBI=0.0240553;REFB=-0.00520828;REVB=-0.0190305;RO=54;SAF=15;SAR=9;SRF=21;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.272541;STB=0.660247;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.0124822;OID=.;OPOS=126448789;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:54:54:24:24:0.307692:9:15:21:33:9:15:21:33
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chr8	128428795	.	G	A	1274.16	PASS	AF=0.976744;AO=84;DP=86;FAO=84;FDP=86;FR=.;FRO=2;FSAF=49;FSAR=35;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0140993;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.2589;QD=59.2631;RBI=0.0236862;REFB=0.00145533;REVB=-0.0190328;RO=2;SAF=49;SAR=35;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0189401;STB=0.509998;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=-0.000475143;OID=.;OPOS=128428795;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:86:86:2:2:84:84:0.976744:35:49:2:0:35:49:2:0
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chr8	128429519	.	G	A	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.002352;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.008;QD=56.1916;RBI=0.020641;REFB=0;REVB=0.0205066;RO=0;SAF=11;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.31638e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000124346;OID=.;OPOS=128429519;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:17:11:0:0:17:11:0:0
chr8	128429652	.	G	A	623.48	PASS	AF=0.582524;AO=60;DP=103;FAO=60;FDP=103;FR=.;FRO=43;FSAF=26;FSAR=34;FSRF=18;FSRR=25;FWDB=-0.0290265;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.032;QD=24.2126;RBI=0.0340182;REFB=0.00119419;REVB=-0.0177399;RO=43;SAF=26;SAR=34;SRF=18;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.011491;STB=0.506269;STBP=0.879;TYPE=snp;VARB=-0.000987322;OID=.;OPOS=128429652;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:103:43:43:60:60:0.582524:34:26:18:25:34:26:18:25
chr8	128429660	.	T	C	1508.69	PASS	AF=1;AO=99;DP=102;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00768702;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.0633;QD=59.1642;RBI=0.0324442;REFB=0;REVB=0.0315204;RO=3;SAF=40;SAR=59;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.034249;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000371479;OID=.;OPOS=128429660;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:102:102:3:0:99:102:1:59:40:3:0:59:43:0:0
chr8	128429721	.	T	C	920.1	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0274781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.15;QD=58.4189;RBI=0.0311476;REFB=0;REVB=-0.0146673;RO=0;SAF=23;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.12726e-05;OID=.;OPOS=128429721;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:40:23:0:0:40:23:0:0
chr8	128429732	.	C	T	706.46	PASS	AF=1;AO=44;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0582526;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.9359;QD=62.7962;RBI=0.0649494;REFB=0;REVB=-0.0287239;RO=0;SAF=20;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.30465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000203295;OID=.;OPOS=128429732;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:44:45:1:24:20:0:0:24:21:0:0
chr8	128430478	.	G	T	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00252812;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.055;QD=49.5992;RBI=0.0164262;REFB=0;REVB=0.0162305;RO=0;SAF=13;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.50023e-05;OID=.;OPOS=128430478;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:5:13:0:0:5:13:0:0
chr8	128430872	.	A	AATG	523.99	PASS	AF=0.972973;AO=34;DP=37;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.000181193;FXX=0;HRUN=4;LEN=3;MLLD=307.92;QD=56.6472;RBI=0.0171737;REFB=0.0224535;REVB=-0.0171727;RO=1;SAF=15;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0239715;STB=0.512813;STBP=0.508;TYPE=ins;VARB=-0.00131576;OID=.;OPOS=128430873;OREF=-;OALT=ATG;OMAPALT=AATG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.972973:34:37:36:37:1:17:19:0:1:5:1:15:19:0:1
chr8	128431990	.	C	T	353.56	PASS	AF=0.367521;AO=43;DP=119;FAO=43;FDP=117;FR=.;FRO=74;FSAF=11;FSAR=32;FSRF=40;FSRR=34;FWDB=-0.00933524;FXX=0.0168053;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.664;QD=12.0876;RBI=0.0512463;REFB=-0.00457235;REVB=-0.0503888;RO=71;SAF=11;SAR=32;SRF=40;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.352617;STB=0.692018;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0107587;OID=.;OPOS=128431990;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:117:71:74:43:43:0.367521:32:11:40:31:32:11:40:34
chr8	129021179	.	G	A,T	915.94	PASS	AF=0.830986,0.112676;AO=58,9;DP=71;FAO=59,8;FDP=71;FR=.;FRO=4;FSAF=39,5;FSAR=20,3;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.00266016,-0.06205;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=161.036,24.7315;QD=51.6024;RBI=0.00297131,0.0800914;REFB=0.00169703,-0.0593634;REVB=0.00132373,0.0506403;RO=4;SAF=38,6;SAR=20,3;SRF=2;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.020704,0.0966199;STB=0.511319,0.543368;STBP=0.569,0.664;TYPE=snp,snp;VARB=-0.000395574,0.165108;OID=.,.;OPOS=129021179,129021179;OREF=G,G;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:36:71:71:4:4:58,9:59,8:0.830986,0.112676:20,3:38,6:2:2:20,3:39,5:2:2
chr8	129022785	.	T	C	681.03	PASS	AF=0.98;AO=49;DP=51;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00355668;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.227;QD=54.4826;RBI=0.00360099;REFB=-0.0234194;REVB=-0.000563128;RO=1;SAF=21;SAR=28;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0165122;STB=0.508768;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=-3.09817e-05;OID=.;OPOS=129022785;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:51:50:1:1:49:49:0.98:28:21:0:1:28:21:0:1
chr8	129022816	.	G	A	805.19	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0146001;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=275.843;QD=64.4154;RBI=0.0193426;REFB=0;REVB=0.0126875;RO=0;SAF=20;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.04888e-05;OID=.;OPOS=129022816;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:30:20:0:0:30:20:0:0
chr8	129022818	.	T	A	805.19	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0117328;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.119;QD=64.4152;RBI=0.0315792;REFB=0;REVB=0.0293188;RO=0;SAF=20;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000103835;OID=.;OPOS=129022818;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:30:20:0:0:30:20:0:0
chr8	129162433	.	G	T	125.69	PASS	AF=0.5;AO=13;DP=28;FAO=14;FDP=28;FR=.,HEALED;FRO=14;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.00475578;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=33.1123;QD=17.9558;RBI=0.0863919;REFB=0.00597971;REVB=0.0862609;RO=10;SAF=7;SAR=6;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125864;STB=0.535663;STBP=0.766;TYPE=snp;VARB=-0.0101781;OID=.;OPOS=129162433;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:28:10:14:13:14:0.5:6:7:7:3:7:7:8:6
chr8	130760850	.	A	G	785.89	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130841;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.77;QD=64.1539;RBI=0.0132442;REFB=0;REVB=-0.00205267;RO=0;SAF=26;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.64916e-05;OID=.;OPOS=130760850;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:23:26:0:0:23:26:0:0
chr8	130762291	.	G	A	1034.29	PASS	AF=0.661654;AO=88;DP=135;FAO=88;FDP=133;FR=.;FRO=45;FSAF=43;FSAR=45;FSRF=23;FSRR=22;FWDB=0.00195859;FXX=0.0148137;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.127;QD=31.1064;RBI=0.00200285;REFB=-0.0320169;REVB=0.000418717;RO=43;SAF=43;SAR=45;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0281877;STB=0.507604;STBP=0.825;TYPE=snp;VARB=0.0143208;OID=.;OPOS=130762291;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:135:133:43:45:88:88:0.661654:45:43:23:20:45:43:23:22
chr8	131353139	.	T	C	785.55	PASS	AF=1;AO=48;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0873631;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.2789;QD=64.1265;RBI=0.0875893;REFB=0;REVB=0.00629131;RO=0;SAF=31;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00056657;OID=.;OPOS=131353139;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:48:49:1:17:31:0:0:18:31:0:0
chr8	131921956	.	A	G	2292.64	PASS	AF=1;AO=143;DP=143;FAO=144;FDP=144;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.559;QD=63.6845;RBI=0.0130729;REFB=0;REVB=-0.00736126;RO=0;SAF=77;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.14598e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.21493e-06;OID=.;OPOS=131921956;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:143:144:0:0:143:144:1:66:77:0:0:66:78:0:0
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chr8	134488007	.	G	A	115.3	PASS	AF=0.261538;AO=17;DP=65;FAO=17;FDP=65;FR=.;FRO=48;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=25;FSRR=23;FWDB=0.0268479;FXX=0.0151492;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.7503;QD=7.09544;RBI=0.0303737;REFB=-0.00904183;REVB=0.0142041;RO=48;SAF=7;SAR=10;SRF=25;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132219;STB=0.580667;STBP=0.467;TYPE=snp;VARB=0.0448606;OID=.;OPOS=134488007;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:48:48:17:17:0.261538:10:7:25:23:10:7:25:23
chr8	135612111	.	G	T	182.4	PASS	AF=0.257732;AO=25;DP=99;FAO=25;FDP=97;FR=.;FRO=72;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=44;FSRR=28;FWDB=0.0159145;FXX=0.0202;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.22;QD=7.52178;RBI=0.0160145;REFB=-0.00146613;REVB=-0.00178721;RO=71;SAF=12;SAR=13;SRF=43;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153782;STB=0.596646;STBP=0.261;TYPE=snp;VARB=0.0056573;OID=.;OPOS=135612111;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:97:71:72:25:25:0.257732:13:12:43:28:13:12:44:28
chr8	135612595	.	A	G	256.12	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.010329;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.792;QD=51.2237;RBI=0.0389704;REFB=0;REVB=0.0375766;RO=0;SAF=13;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.851e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000210656;OID=.;OPOS=135612595;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:20:0:0:19:20:1:6:13:0:0:7:13:0:0
chr8	135614705	.	A	G	1476.29	PASS	AF=1;AO=91;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.038569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.0277;QD=62.8209;RBI=0.0536601;REFB=0;REVB=-0.0373073;RO=0;SAF=42;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00016273;OID=.;OPOS=135614705;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:94:94:0:0:91:94:1:49:42:0:0:50:44:0:0
chr8	136659426	.	G	A	490.02	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0177609;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.693;QD=57.6496;RBI=0.0191162;REFB=0;REVB=0.00706943;RO=0;SAF=10;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.66877e-06;OID=.;OPOS=136659426;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:34:0:0:32:34:1:22:10:0:0:23:11:0:0
chr8	139143942	.	A	G	994.34	PASS	AF=0.985507;AO=67;DP=68;FAO=68;FDP=69;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0116347;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=72.5306;QD=57.6427;RBI=0.0127745;REFB=-0.152043;REVB=0.00527472;RO=1;SAF=25;SAR=42;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0111201;STB=0.505881;STBP=0.537;TYPE=snp;VARB=0.00160566;OID=.;OPOS=139143942;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:68:69:1:1:67:68:0.985507:42:25:0:1:42:26:0:1
chr8	139144914	.	G	A	1662.62	PASS	AF=0.982609;AO=111;DP=114;FAO=113;FDP=115;FR=.;FRO=2;FSAF=59;FSAR=54;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0225845;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.91;QD=57.8304;RBI=0.032576;REFB=-0.107475;REVB=0.0234763;RO=2;SAF=57;SAR=54;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000454345;STB=0.500385;STBP=0.87;TYPE=snp;VARB=0.000995578;OID=.;OPOS=139144914;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:114:115:2:2:111:113:0.982609:54:57:1:1:54:59:1:1
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chr8	139165272	.	T	C	1542.71	PASS	AF=0.989899;AO=97;DP=99;FAO=98;FDP=99;FR=.;FRO=1;FSAF=54;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0202484;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.867;QD=62.3318;RBI=0.0264051;REFB=-0.00953987;REVB=0.016948;RO=0;SAF=54;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.50386e-08;STB=0.505617;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=0.000103764;OID=.;OPOS=139165272;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:99:99:0:1:97:98:0.989899:43:54:0:0:44:54:0:1
chr8	139165289	.	T	C	1557.5	PASS	AF=1;AO=104;DP=105;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0193925;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.4891;QD=59.9037;RBI=0.0591419;REFB=0;REVB=0.0558721;RO=0;SAF=56;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000237152;OID=.;OPOS=139165289;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:105:104:0:0:104:104:1:48:56:0:0:48:56:0:0
chr8	139626176	.	C	G	1894.52	PASS	AF=1;AO=122;DP=123;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0277925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.7229;QD=61.6105;RBI=0.0286982;REFB=0;REVB=-0.00715306;RO=0;SAF=53;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.9105e-05;OID=.;OPOS=139626176;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:123:123:0:0:122:123:1:69:53:0:0:70:53:0:0
chr8	139647262	.	A	G	816.04	PASS	AF=1;AO=55;DP=56;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00834016;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.152;QD=57.2661;RBI=0.0324428;REFB=0;REVB=0.0313525;RO=0;SAF=29;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.40922e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.52223e-05;OID=.;OPOS=139647262;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:56:57:0:0:55:57:1:26:29:0:0:28:29:0:0
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chr8	139712346	.	A	G	805.12	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108391;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.3318;QD=64.4095;RBI=0.0297353;REFB=0;REVB=-0.0276894;RO=0;SAF=30;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000149394;OID=.;OPOS=139712346;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:20:30:0:0:20:30:0:0
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chr8	141568622	.	G	A	1951.93	PASS	AF=1;AO=126;DP=126;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00242897;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.6411;QD=61.9662;RBI=0.00491633;REFB=0;REVB=-0.0042744;RO=0;SAF=54;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.91287e-06;OID=.;OPOS=141568622;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:126:126:0:0:126:126:1:72:54:0:0:72:54:0:0
chr8	141774282	.	A	C	766.25	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0582585;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.8539;QD=63.8538;RBI=0.0592287;REFB=0;REVB=0.0106764;RO=0;SAF=23;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00096704;OID=.;OPOS=141774282;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:25:23:0:0:25:23:0:0
chr8	141780818	.	T	C	728.81	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000729868;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.2825;QD=57.1612;RBI=0.0423629;REFB=0;REVB=0.0423566;RO=0;SAF=26;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94283e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000350842;OID=.;OPOS=141780818;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:25:26:0:0:25:26:0:0
chr8	141840645	.	G	A	972.81	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00732651;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.918;QD=58.9582;RBI=0.00783375;REFB=0;REVB=-0.00277306;RO=0;SAF=27;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.91393e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.90234e-06;OID=.;OPOS=141840645;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:39:27:0:0:39:27:0:0
chr8	142146708	.	T	C	712.53	PASS	AF=1;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00753215;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.221;QD=63.3362;RBI=0.0110625;REFB=0;REVB=0.00810218;RO=0;SAF=18;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000156771;OID=.;OPOS=142146708;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:45:0:0:45:45:1:27:18:0:0:27:18:0:0
chr8	142152442	.	A	G	338.12	PASS	AF=0.406593;AO=37;DP=92;FAO=37;FDP=91;FR=.;FRO=54;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=35;FSRR=19;FWDB=0.0107425;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.235;QD=14.8622;RBI=0.0107886;REFB=-0.0117153;REVB=-0.000996096;RO=54;SAF=18;SAR=19;SRF=35;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169114;STB=0.595456;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.0164072;OID=.;OPOS=142152442;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:91:54:54:37:37:0.406593:19:18:35:19:19:18:35:19
chr8	142168337	.	C	T	167.76	PASS	AF=0.2875;AO=23;DP=80;FAO=23;FDP=80;FR=.;FRO=57;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=27;FSRR=30;FWDB=-0.00340012;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.264;QD=8.38818;RBI=0.0285581;REFB=-0.0149165;REVB=-0.028355;RO=57;SAF=12;SAR=11;SRF=27;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0573422;STB=0.534172;STBP=0.725;TYPE=snp;VARB=0.047916;OID=.;OPOS=142168337;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:57:57:23:23:0.2875:11:12:27:30:11:12:27:30
chr8	142170884	.	C	T	789.34	PASS	AF=0.474286;AO=80;DP=172;FAO=83;FDP=175;FR=.;FRO=92;FSAF=49;FSAR=34;FSRF=40;FSRR=52;FWDB=0.0145337;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.326;QD=18.0421;RBI=0.0216307;REFB=-0.0114809;REVB=0.0160206;RO=92;SAF=47;SAR=33;SRF=40;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147728;STB=0.582024;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.00739108;OID=.;OPOS=142170884;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:172:175:92:92:80:83:0.474286:33:47:40:52:34:49:40:52
chr8	142178261	.	C	T	680.71	PASS	AF=0.609524;AO=64;DP=105;FAO=64;FDP=105;FR=.;FRO=41;FSAF=31;FSAR=33;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=0.00752171;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=117.503;QD=25.9317;RBI=0.0279547;REFB=-0.0160787;REVB=-0.0269238;RO=40;SAF=31;SAR=33;SRF=18;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0243828;STB=0.508194;STBP=0.838;TYPE=snp;VARB=0.014685;OID=.;OPOS=142178261;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:105:40:41:64:64:0.609524:33:31:18:22:33:31:19:22
chr8	142185580	.	G	A	651.23	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00796537;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=246.831;QD=62.0216;RBI=0.0116542;REFB=0;REVB=0.00850719;RO=0;SAF=27;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.13648e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.81016e-05;OID=.;OPOS=142185580;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:15:27:0:0:15:27:0:0
chr8	142185718	.	T	C	446.98	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0695804;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.2081;QD=57.6745;RBI=0.0714848;REFB=0;REVB=0.0163907;RO=0;SAF=16;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0014335;OID=.;OPOS=142185718;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:15:16:0:0:15:16:0:0
chr8	142200467	.	G	A	509.98	PASS	AF=0.643836;AO=46;DP=73;FAO=47;FDP=73;FR=.;FRO=26;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=0.015907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.399;QD=27.9439;RBI=0.0197502;REFB=-0.02146;REVB=-0.0117065;RO=26;SAF=23;SAR=23;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.503788;STBP=0.968;TYPE=snp;VARB=0.011733;OID=.;OPOS=142200467;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:26:26:46:47:0.643836:23:23:13:13:23:24:13:13
chr8	142202847	.	G	A	189.02	PASS	AF=0.5;AO=19;DP=40;FAO=20;FDP=40;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.00374878;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.4359;QD=18.9024;RBI=0.0499417;REFB=-0.0195689;REVB=0.0498008;RO=21;SAF=6;SAR=13;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159169;STB=0.553137;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.0145071;OID=.;OPOS=142202847;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:21:20:19:20:0.5:13:6:10:11:13:7:9:11
chr8	142202856	.	C	T	573.52	PASS	AF=0.95122;AO=38;DP=40;FAO=39;FDP=41;FR=.;FRO=2;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0268303;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.391;QD=55.9533;RBI=0.0399533;REFB=-0.0596303;REVB=0.029604;RO=2;SAF=16;SAR=22;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0550239;STB=0.527763;STBP=0.137;TYPE=snp;VARB=0.000684512;OID=.;OPOS=142202856;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:40:41:2:2:38:39:0.95122:22:16:2:0:22:17:2:0
chr8	142202884	.	T	C	860.87	PASS	AF=0.939394;AO=62;DP=67;FAO=62;FDP=66;FR=.;FRO=4;FSAF=27;FSAR=35;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.00210411;FXX=0.0149231;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.517;QD=52.174;RBI=0.0172168;REFB=-0.020441;REVB=0.0170878;RO=2;SAF=27;SAR=35;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.03369;STB=0.534472;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.00192673;OID=.;OPOS=142202884;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:67:66:2:4:62:62:0.939394:35:27:2:0:35:27:4:0
chr8	142204326	.	C	G	323.47	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100985;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.822;QD=53.9112;RBI=0.0430652;REFB=0;REVB=0.0418645;RO=0;SAF=16;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000122178;OID=.;OPOS=142204326;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:8:16:0:0:8:16:0:0
chr8	142218119	.	G	A	446.86	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0493431;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.5966;QD=57.6588;RBI=0.052574;REFB=0;REVB=0.0181463;RO=0;SAF=13;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.33668e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0010326;OID=.;OPOS=142218119;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:18:13:0:0:18:13:0:0
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chr8	142490079	.	G	A	2274.61	PASS	AF=1;AO=105;DP=145;FAO=145;FDP=145;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=90;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0539129;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.389;QD=62.7479;RBI=0.0545928;REFB=0;REVB=0.00858878;RO=1;SAF=68;SAR=37;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00692859;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000114999;OID=.;OPOS=142490079;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:145:145:1:0:105:145:1:37:68:1:0:55:90:0:0
chr8	142490080	.	T	A	192.38	PASS	AF=0.210884;AO=30;DP=145;FAO=31;FDP=147;FR=.;FRO=116;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=76;FSRR=40;FWDB=0.00127928;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=72.9479;QD=5.23479;RBI=0.0101123;REFB=0.00497053;REVB=0.0100311;RO=115;SAF=14;SAR=16;SRF=75;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.235536;STB=0.634065;STBP=0.127;TYPE=snp;VARB=-0.00530353;OID=.;OPOS=142490080;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:145:147:115:116:30:31:0.210884:16:14:75:40:16:15:76:40
chr8	142490120	.	G	T	274.95	PASS	AF=0.300813;AO=37;DP=124;FAO=37;FDP=123;FR=.;FRO=86;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=52;FSRR=34;FWDB=0.0116629;FXX=0.00806387;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.5042;QD=8.94143;RBI=0.0174881;REFB=-0.00516999;REVB=-0.0130312;RO=86;SAF=23;SAR=14;SRF=52;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0213527;STB=0.512528;STBP=0.841;TYPE=snp;VARB=0.0164392;OID=.;OPOS=142490120;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:124:123:86:86:37:37:0.300813:14:23:52:34:14:23:52:34
chr8	142500345	.	C	T	561.68	PASS	AF=0.690141;AO=49;DP=72;FAO=49;FDP=71;FR=.;FRO=22;FSAF=14;FSAR=35;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.0115896;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.947;QD=31.6436;RBI=0.0204302;REFB=-0.00400521;REVB=0.0168248;RO=22;SAF=14;SAR=35;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0829993;STB=0.560722;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=0.0027618;OID=.;OPOS=142500345;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:71:22:22:49:49:0.690141:35:14:9:13:35:14:10:12
chr8	142505038	.	T	C	427.77	PASS	AF=0.594203;AO=40;DP=69;FAO=41;FDP=69;FR=.;FRO=28;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=0.0155469;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=209.124;QD=24.7983;RBI=0.0214545;REFB=-0.0206811;REVB=-0.0147847;RO=28;SAF=17;SAR=23;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00274047;STB=0.505811;STBP=0.911;TYPE=snp;VARB=0.0131898;OID=.;OPOS=142505038;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:28:28:40:41:0.594203:23:17:12:16:24:17:12:16
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chr8	143425720	.	T	C	1264.7	PASS	AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0168938;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.553;QD=61.6927;RBI=0.0223321;REFB=0;REVB=0.0146055;RO=0;SAF=41;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.90029e-05;OID=.;OPOS=143425720;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:41:41:0:0:41:41:0:0
chr8	143427178	.	C	G	846.09	PASS	AF=0.983871;AO=54;DP=56;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0323488;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.55;QD=54.5867;RBI=0.0818253;REFB=-0.23165;REVB=0.0751594;RO=1;SAF=29;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159744;STB=0.508472;STBP=0.347;TYPE=snp;VARB=0.00148911;OID=.;OPOS=143427178;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:56:62:1:1:54:61:0.983871:25:29:1:0:29:32:0:1
chr8	143436034	.	A	G	817.75	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00656061;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=305.746;QD=57.3857;RBI=0.0115705;REFB=0;REVB=0.00953067;RO=0;SAF=20;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.42698e-06;OID=.;OPOS=143436034;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:37:20:0:0:37:20:0:0
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chr8	144642178	.	T	C	1283.3	PASS	AF=1;AO=80;DP=81;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0896051;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.136;QD=61.8456;RBI=0.0896139;REFB=0;REVB=0.00125622;RO=0;SAF=12;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.55523e-05;OID=.;OPOS=144642178;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:83:0:0:80:83:1:68:12:0:0:68:15:0:0
chr8	144642244	.	A	G	130.64	PASS	AF=0.608696;AO=14;DP=23;FAO=14;FDP=23;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=9;FWDB=-0.029152;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.2784;QD=22.7195;RBI=0.0476603;REFB=-0.0154065;REVB=-0.037705;RO=9;SAF=6;SAR=8;SRF=0;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.32517;STB=0.679787;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.00461867;OID=.;OPOS=144642244;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:23:23:9:9:14:14:0.608696:8:6:0:9:8:6:0:9
chr8	144642490	.	G	A	286.12	PASS	AF=0.535714;AO=30;DP=56;FAO=30;FDP=56;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=23;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.0268464;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.534;QD=20.4368;RBI=0.0270633;REFB=-0.000961169;REVB=0.00341988;RO=26;SAF=7;SAR=23;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.228203;STB=0.627781;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=0.000834751;OID=.;OPOS=144642490;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:26:26:30:30:0.535714:23:7:12:14:23:7:12:14
chr8	144642596	.	T	C	38.98	PASS	AF=0.461538;AO=6;DP=13;FAO=6;FDP=13;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.0661501;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=71.9799;QD=11.9928;RBI=0.0714745;REFB=0.00348647;REVB=0.0270698;RO=7;SAF=4;SAR=2;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215036;STB=0.631131;STBP=0.442;TYPE=snp;VARB=0.00118412;OID=.;OPOS=144642596;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:13:13:7:7:6:6:0.461538:2:4:3:4:2:4:3:4
chr8	144642626	.	A	G	207.12	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0329349;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.659;QD=48.7337;RBI=0.051587;REFB=0;REVB=-0.0397053;RO=0;SAF=9;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000102654;OID=.;OPOS=144642626;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:8:9:0:0:8:9:0:0
chr8	144642854	.	G	A	444.43	PASS	AF=0.558442;AO=43;DP=77;FAO=43;FDP=77;FR=.;FRO=34;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=11;FSRR=23;FWDB=0.00965015;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.294;QD=23.0874;RBI=0.0269119;REFB=-0.0187334;REVB=0.0251223;RO=33;SAF=18;SAR=25;SRF=11;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0701913;STB=0.543718;STBP=0.42;TYPE=snp;VARB=0.0145526;OID=.;OPOS=144642854;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:33:34:43:43:0.558442:25:18:11:22:25:18:11:23
chr8	144642986	.	T	C	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00814107;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.5382;QD=33.4285;RBI=0.0984703;REFB=0;REVB=0.0981331;RO=0;SAF=3;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00830997;OID=.;OPOS=144642986;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:3:3:0:0:3:3:0:0
chr8	144643603	.	G	A	764.09	PASS	AF=0.646465;AO=64;DP=99;FAO=64;FDP=99;FR=.;FRO=35;FSAF=32;FSAR=32;FSRF=21;FSRR=14;FWDB=-0.00354712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.402;QD=30.8725;RBI=0.0217508;REFB=-0.0269453;REVB=-0.0214596;RO=35;SAF=32;SAR=32;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0653136;STB=0.535343;STBP=0.35;TYPE=snp;VARB=0.0154017;OID=.;OPOS=144643603;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:35:35:64:64:0.646465:32:32:21:14:32:32:21:14
chr8	144649968	.	C	T	1878.03	PASS	AF=1;AO=122;DP=123;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000516735;FXX=0.00812942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.5624;QD=61.5747;RBI=0.0561904;REFB=0;REVB=0.056188;RO=0;SAF=61;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000197417;OID=.;OPOS=144649968;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:123:122:0:0:122:122:1:61:61:0:0:61:61:0:0
chr8	144654255	.	A	G	240.32	PASS	AF=0.3125;AO=30;DP=96;FAO=30;FDP=96;FR=.;FRO=66;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=35;FSRR=31;FWDB=0.00388231;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.913;QD=10.0133;RBI=0.0523085;REFB=0.0033867;REVB=-0.0521642;RO=66;SAF=16;SAR=14;SRF=35;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00356843;STB=0.502091;STBP=0.983;TYPE=snp;VARB=-0.00788393;OID=.;OPOS=144654255;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:96:66:66:30:30:0.3125:14:16:35:31:14:16:35:31
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chr8	144671244	.	C	A	340.58	PASS	AF=0.586207;AO=34;DP=58;FAO=34;FDP=58;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=-0.0131705;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=244.521;QD=23.488;RBI=0.0282094;REFB=-0.0342286;REVB=0.0249462;RO=24;SAF=13;SAR=21;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00586003;STB=0.503224;STBP=0.975;TYPE=snp;VARB=0.0291044;OID=.;OPOS=144671244;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:24:24:34:34:0.586207:21:13:9:15:21:13:9:15
chr8	144671685	.	G	C	561.37	PASS	AF=0.952381;AO=36;DP=40;FAO=40;FDP=42;FR=.;FRO=2;FSAF=31;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0167177;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.534;QD=53.4634;RBI=0.149989;REFB=-0.119953;REVB=0.149055;RO=0;SAF=30;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.50008e-08;STB=0.549974;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.00724325;OID=.;OPOS=144671685;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:40:42:0:2:36:40:0.952381:6:30:0:0:9:31:0:2
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chr8	144811338	.	C	G	955.28	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0271465;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.326;QD=58.7864;RBI=0.059259;REFB=0;REVB=0.0526753;RO=0;SAF=44;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000184921;OID=.;OPOS=144811338;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:65:0:0:64:65:1:20:44:0:0:20:45:0:0
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chr8	144890873	.	A	T	727.43	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.178565;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.751;QD=57.0536;RBI=0.179089;REFB=0;REVB=0.0136965;RO=0;SAF=0;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000629989;OID=.;OPOS=144890873;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:51:0:0:50:51:1:50:0:0:0:50:1:0:0
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chr8	144940331	.	C	T	242.62	PASS	AF=0.147727;AO=52;DP=352;FAO=52;FDP=352;FR=.;FRO=300;FSAF=23;FSAR=29;FSRF=95;FSRR=205;FWDB=0.00410234;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.15;QD=2.75704;RBI=0.00533096;REFB=-0.00573705;REVB=-0.0034044;RO=298;SAF=23;SAR=29;SRF=93;SRR=205;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177936;STB=0.611273;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.0341544;OID=.;OPOS=144940331;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:352:352:298:300:52:52:0.147727:29:23:93:205:29:23:95:205
chr8	144942903	.	T	C	181.36	PASS	AF=0.772727;AO=17;DP=22;FAO=17;FDP=22;FR=.;FRO=5;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.0512606;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.092;QD=32.975;RBI=0.0750438;REFB=-0.0129869;REVB=0.0548081;RO=5;SAF=10;SAR=7;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00500611;STB=0.502759;STBP=0.997;TYPE=snp;VARB=0.0013157;OID=.;OPOS=144942903;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:27:22:22:5:5:17:17:0.772727:7:10:3:2:7:10:3:2
chr8	144994566	.	G	A	670.96	PASS	AF=0.385366;AO=79;DP=205;FAO=79;FDP=205;FR=.;FRO=126;FSAF=30;FSAR=49;FSRF=69;FSRR=57;FWDB=-0.00110912;FXX=0.00966137;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.6177;QD=13.0918;RBI=0.0319012;REFB=-0.00832145;REVB=0.0318819;RO=125;SAF=30;SAR=49;SRF=69;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188383;STB=0.604008;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.0173299;OID=.;OPOS=144994566;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:205:205:125:126:79:79:0.385366:49:30:69:56:49:30:69:57
chr8	144999935	.	G	A	62.54	PASS	AF=0.666667;AO=8;DP=12;FAO=8;FDP=12;FR=.;FRO=4;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0662782;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=37.5732;QD=20.8466;RBI=0.104269;REFB=-0.0029894;REVB=0.0804934;RO=4;SAF=1;SAR=7;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.336275;STB=0.699397;STBP=0.127;TYPE=snp;VARB=0.0125932;OID=.;OPOS=144999935;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:12:12:4:4:8:8:0.666667:7:1:2:2:7:1:2:2
chr8	145024563	.	G	A	184.52	PASS	AF=0.809524;AO=17;DP=21;FAO=17;FDP=21;FR=.;FRO=4;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0201604;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.7306;QD=35.1462;RBI=0.0429225;REFB=-0.018811;REVB=0.0378933;RO=4;SAF=13;SAR=4;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122036;STB=0.566594;STBP=0.321;TYPE=snp;VARB=0.00724886;OID=.;OPOS=145024563;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:20:21:21:4:4:17:17:0.809524:4:13:4:0:4:13:4:0
chr8	145065462	.	GGC	G	38.35	PASS	AF=0.4;AO=5;DP=20;FAO=6;FDP=15;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=8;FWDB=-0.0431111;FXX=0.062461;HRUN=7;LEN=2;MLLD=21.5452;QD=10.2274;RBI=0.294616;REFB=0.00137944;REVB=0.291445;RO=12;SAF=5;SAR=0;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.777599;STB=0.881272;STBP=0.049;TYPE=del;VARB=0.102031;OID=.;OPOS=145065463;OREF=GC;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.4:5:20:6:15:9:5:1:1:8:38:12:5:0:3:9
chr8	145066886	.	A	G	84.79	PASS	AF=0.354839;AO=11;DP=31;FAO=11;FDP=31;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=-0.00122692;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.23;QD=10.9409;RBI=0.0173755;REFB=0.000397022;REVB=-0.0173322;RO=20;SAF=6;SAR=5;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115455;STB=0.568741;STBP=0.589;TYPE=snp;VARB=-0.00186318;OID=.;OPOS=145066886;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:31:31:20:20:11:11:0.354839:5:6:13:7:5:6:13:7
chr8	145107795	.	G	A	1518.09	PASS	AF=0.989691;AO=96;DP=98;FAO=96;FDP=97;FR=.;FRO=1;FSAF=55;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00839572;FXX=0.010203;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.378;QD=62.6018;RBI=0.0256456;REFB=0.00919391;REVB=0.0242324;RO=1;SAF=55;SAR=41;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0114259;STB=0.506023;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=-0.000154461;OID=.;OPOS=145107795;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:98:97:1:1:96:96:0.989691:41:55:0:1:41:55:0:1
chr8	145150832	.	A	G	425.09	PASS	AF=1;AO=29;DP=31;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0048645;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.213;QD=56.6782;RBI=0.0296277;REFB=0;REVB=0.0292256;RO=0;SAF=11;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00135047;OID=.;OPOS=145150832;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:30:0:0:29:30:1:18:11:0:0:19:11:0:0
chr8	145160646	.	T	C	712.91	PASS	AF=1;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0212663;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.396;QD=63.3695;RBI=0.0219675;REFB=0;REVB=0.0055058;RO=0;SAF=23;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.89311e-05;OID=.;OPOS=145160646;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:45:0:0:45:45:1:22:23:0:0:22:23:0:0
chr8	145161823	.	G	A	82.18	PASS	AF=0.9;AO=9;DP=10;FAO=9;FDP=10;FR=.;FRO=1;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0312193;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=163.38;QD=32.8739;RBI=0.0448672;REFB=-0.144529;REVB=0.0322245;RO=0;SAF=2;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.533262;STBP=0.657;TYPE=snp;VARB=0.00404787;OID=.;OPOS=145161823;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:10:10:0:1:9:9:0.9:7:2:0:0:7:2:0:1
chr8	145161896	.	T	C	417.66	PASS	AF=0.967742;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0183686;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.5303;QD=53.8919;RBI=0.0186827;REFB=-0.0483478;REVB=-0.00341139;RO=1;SAF=5;SAR=25;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0182905;STB=0.509797;STBP=0.651;TYPE=snp;VARB=0.00268445;OID=.;OPOS=145161896;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:31:31:1:1:30:30:0.967742:25:5:0:1:25:5:0:1
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chr8	145163477	.	GGC	G,GG,GGG	420.07	PASS	AF=0.290323,0.5,0;AO=17,26,5;DP=72;FAO=18,31,0;FDP=62;FR=.;FRO=13;FSAF=2,26,0;FSAR=16,5,0;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.0989356,-0.151171,-0.0543788;FXX=0.150664;HRUN=4,4,4;LEN=2,1,1;MLLD=17.7195,14.8514,9.0301;QD=27.101;RBI=0.183183,0.160941,0.223245;REFB=0.0173004,-0.0050158,-0.0199648;REVB=-0.154168,0.0552227,0.21652;RO=15;SAF=2,23,0;SAR=15,3,5;SRF=8;SRR=7;SSEN=0.418605,0,0;SSEP=0,0.533333,0;SSSB=-0.471628,0.377255,-0.714275;STB=0.791687,0.604576,0.5;STBP=0.003,0.099,1;TYPE=del,del,snp;VARB=0.062993,-0.0071231,0;OID=.,.,.;OPOS=145163478,145163479,145163479;OREF=GC,C,C;OALT=-,-,G;OMAPALT=G,GG,GGG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.290323,0.5,0:17,26,5:72:18,31,0:62:13:2,26,0:16,5,0:8:5:66:15:2,23,0:15,3,5:8:7
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chr8	145164847	.	A	G	357.36	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0249748;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.1885;QD=54.9778;RBI=0.0520426;REFB=0;REVB=-0.0456584;RO=0;SAF=17;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00186495;OID=.;OPOS=145164847;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:9:17:0:0:9:17:0:0
chr8	145166134	.	C	G	479.42	PASS	AF=0.541176;AO=45;DP=84;FAO=46;FDP=85;FR=.;FRO=39;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=15;FSRR=24;FWDB=0.0482831;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.241;QD=22.5607;RBI=0.0483097;REFB=-0.00806234;REVB=0.00160366;RO=39;SAF=21;SAR=24;SRF=15;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0698224;STB=0.543191;STBP=0.414;TYPE=snp;VARB=0.00502966;OID=.;OPOS=145166134;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:85:39:39:45:46:0.541176:24:21:15:24:24:22:15:24
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chr8	145170704	.	A	C,T	573.02	PASS	AF=0.0512821,0.948718;AO=3,35;DP=39;FAO=2,37;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=2,21;FSAR=0,16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0813376,0.0329988;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=87.0444,61.2348;QD=58.7714;RBI=0.0816122,0.0351623;REFB=0,0;REVB=-0.00668861,-0.0121435;RO=0;SAF=3,19;SAR=0,16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-4.1382e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.151463,-0.00199239;OID=.,.;OPOS=145170704,145170704;OREF=A,A;OALT=C,T;OMAPALT=C,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:39:39:0:0:3,35:2,37:0.0512821,0.948718:0,16:3,19:0:0:0,16:2,21:0:0
chr8	145223288	.	C	G,T	315.26	PASS	AF=0.125,0.875;AO=3,21;DP=24;FAO=3,21;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=3,9;FSAR=0,12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0233714,0.0750288;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=122.321,74.2141;QD=52.5434;RBI=0.025281,0.075088;REFB=0,0;REVB=0.00963886,0.00297938;RO=0;SAF=3,9;SAR=0,12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.090266,0.0039443;OID=.,.;OPOS=145223288,145223288;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:14:24:24:0:0:3,21:3,21:0.125,0.875:0,12:3,9:0:0:0,12:3,9:0:0
chr8	145578296	.	A	G	738.16	PASS	AF=0.627273;AO=69;DP=109;FAO=69;FDP=110;FR=.;FRO=41;FSAF=51;FSAR=18;FSRF=24;FSRR=17;FWDB=0.000399687;FXX=0.0090082;HRUN=3;LEN=1;MLLD=173.633;QD=26.8422;RBI=0.0474323;REFB=0.0105548;REVB=-0.0474307;RO=40;SAF=51;SAR=18;SRF=24;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114495;STB=0.569357;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=-0.00338695;OID=.;OPOS=145578296;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:110:40:41:69:69:0.627273:18:51:24:16:18:51:24:17
chr8	145603114	.	A	C	356.12	PASS	AF=0.603448;AO=35;DP=58;FAO=35;FDP=58;FR=.;FRO=23;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=-0.0281528;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.839;QD=24.5599;RBI=0.0282283;REFB=-0.0240526;REVB=-0.00206309;RO=23;SAF=17;SAR=18;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0260161;STB=0.514278;STBP=0.838;TYPE=snp;VARB=0.0160338;OID=.;OPOS=145603114;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:23:23:35:35:0.603448:18:17:12:11:18:17:12:11
chr8	145618597	.	G	A	100.48	PASS	AF=0.6875;AO=11;DP=17;FAO=11;FDP=16;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0114363;FXX=0.0587889;HRUN=3;LEN=1;MLLD=280.984;QD=25.1191;RBI=0.0142139;REFB=0.0165125;REVB=-0.00844072;RO=6;SAF=4;SAR=7;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0886587;STB=0.512173;STBP=0.894;TYPE=snp;VARB=-0.00599464;OID=.;OPOS=145618597;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:17:16:6:5:11:11:0.6875:7:4:3:3:7:4:2:3
chr8	145623963	.	G	A	307.0	PASS	AF=0.542373;AO=31;DP=58;FAO=32;FDP=59;FR=.;FRO=27;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=0.0990834;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.862;QD=20.8135;RBI=0.100391;REFB=-0.0134316;REVB=0.0161536;RO=26;SAF=19;SAR=12;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126829;STB=0.584362;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=0.0129127;OID=.;OPOS=145623963;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:59:26:27:31:32:0.542373:12:19:12:14:12:20:12:15
chr8	145639726	.	T	C	1512.17	PASS	AF=1;AO=100;DP=103;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0328009;FXX=0.0194156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.3542;QD=59.8878;RBI=0.0894587;REFB=0;REVB=0.0832284;RO=0;SAF=53;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000272273;OID=.;OPOS=145639726;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:103:101:0:0:100:101:1:47:53:0:0:47:54:0:0
chr8	145640411	.	A	G	754.43	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0180791;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.522;QD=56.9382;RBI=0.0183077;REFB=0;REVB=0.00288384;RO=0;SAF=29;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.70744e-05;OID=.;OPOS=145640411;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:24:29:0:0:24:29:0:0
chr8	145641347	.	G	A	350.13	PASS	AF=0.281609;AO=49;DP=172;FAO=49;FDP=174;FR=.;FRO=125;FSAF=22;FSAR=27;FSRF=39;FSRR=86;FWDB=-0.0106731;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=234.338;QD=8.04893;RBI=0.0106732;REFB=-0.0100271;REVB=4.42551e-05;RO=123;SAF=22;SAR=27;SRF=38;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177355;STB=0.601461;STBP=0.11;TYPE=snp;VARB=0.0237918;OID=.;OPOS=145641347;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:172:174:123:125:49:49:0.281609:27:22:38:85:27:22:39:86
chr8	145661320	.	G	A	651.23	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0206943;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.07;QD=62.022;RBI=0.020827;REFB=0;REVB=0.00234683;RO=0;SAF=26;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.75274e-05;OID=.;OPOS=145661320;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:16:26:0:0:16:26:0:0
chr8	145661675	.	G	A	323.46	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0574029;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=68.2626;QD=53.9106;RBI=0.142129;REFB=0;REVB=0.130022;RO=0;SAF=16;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0045998;OID=.;OPOS=145661675;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:8:16:0:0:8:16:0:0
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chr8	145665516	.	T	C	638.85	PASS	AF=0.976744;AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0106293;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.365;QD=59.4277;RBI=0.0129707;REFB=-0.100698;REVB=-0.00743342;RO=1;SAF=22;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0228919;STB=0.512189;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=-6.70502e-05;OID=.;OPOS=145665516;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:43:43:1:1:42:42:0.976744:20:22:0:1:20:22:0:1
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chr8	145692385	.	C	T	557.13	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.004985;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.7523;QD=60.2298;RBI=0.00574429;REFB=0;REVB=-0.00285424;RO=0;SAF=19;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.68991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.17846e-05;OID=.;OPOS=145692385;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:18:19:0:0:18:19:0:0
chr8	145693720	.	A	G	3133.97	PASS	AF=1;AO=205;DP=205;FAO=204;FDP=204;FR=.;FRO=0;FSAF=106;FSAR=98;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000220365;FXX=0.00970827;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.411;QD=61.4503;RBI=0.0195048;REFB=-0.0769154;REVB=0.0195036;RO=0;SAF=107;SAR=98;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.03775e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000322089;OID=.;OPOS=145693720;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:205:204:0:0:205:204:1:98:107:0:0:98:106:0:0
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chr8	145729727	.	C	A	2330.89	PASS	AF=0.987261;AO=151;DP=153;FAO=155;FDP=157;FR=.;FRO=2;FSAF=69;FSAR=86;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0286928;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.637;QD=59.3858;RBI=0.0619287;REFB=-0.10126;REVB=0.0548807;RO=1;SAF=69;SAR=82;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00576581;STB=0.500707;STBP=0.874;TYPE=snp;VARB=0.00270528;OID=.;OPOS=145729727;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:153:157:1:2:151:155:0.987261:82:69:0:1:86:69:1:1
chr8	145731510	.	G	C	321.8	PASS	AF=0.592593;AO=32;DP=54;FAO=32;FDP=54;FR=.;FRO=22;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.00676459;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=242.632;QD=23.8368;RBI=0.0158795;REFB=-0.020844;REVB=-0.0143666;RO=22;SAF=16;SAR=16;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0153429;OID=.;OPOS=145731510;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:22:22:32:32:0.592593:16:16:11:11:16:16:11:11
chr8	145737636	.	A	G	850.74	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0561266;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.7831;QD=57.6772;RBI=0.0637942;REFB=0;REVB=-0.0303233;RO=0;SAF=29;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00105969;OID=.;OPOS=145737636;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:59:0:0:58:59:1:29:29:0:0:30:29:0:0
chr8	145737816	.	C	T	339.05	PASS	AF=0.928571;AO=26;DP=28;FAO=26;FDP=28;FR=.;FRO=2;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0329114;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=106.2;QD=48.4359;RBI=0.0608245;REFB=-0.059261;REVB=0.0511514;RO=0;SAF=12;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50276;STBP=0.879;TYPE=snp;VARB=0.00275808;OID=.;OPOS=145737816;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:28:28:0:2:26:26:0.928571:14:12:0:0:14:12:1:1
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chr8	145741702	.	C	G	207.09	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.108715;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.097;QD=48.7258;RBI=0.108793;REFB=0;REVB=-0.0041093;RO=0;SAF=7;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000574752;OID=.;OPOS=145741702;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:17:0:0:16:17:1:9:7:0:0:9:8:0:0
chr8	145741765	.	G	A	429.0	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0301079;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.4677;QD=57.1997;RBI=0.0832053;REFB=0;REVB=0.0775669;RO=0;SAF=17;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.63861e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000840223;OID=.;OPOS=145741765;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:13:17:0:0:13:17:0:0
chr8	145742514	.	A	G	4717.73	PASS	AF=1;AO=295;DP=295;FAO=295;FDP=295;FR=.;FRO=0;FSAF=153;FSAR=142;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0172261;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.154;QD=63.9693;RBI=0.0172799;REFB=0;REVB=-0.00136231;RO=0;SAF=153;SAR=142;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.91075e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.86712e-05;OID=.;OPOS=145742514;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:25:295:295:0:0:295:295:1:142:153:0:0:142:153:0:0
chr8	145742879	.	T	C	557.09	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0577745;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.2771;QD=60.2259;RBI=0.0634831;REFB=0;REVB=-0.0263099;RO=0;SAF=20;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.71161e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00151533;OID=.;OPOS=145742879;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:17:20:0:0:17:20:0:0
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chr8	146220446	.	G	A	764.83	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.041464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.433;QD=63.7355;RBI=0.043275;REFB=0;REVB=0.0123879;RO=0;SAF=23;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000123048;OID=.;OPOS=146220446;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:48:0:0:47:48:1:24:23:0:0:25:23:0:0
chr8	146221893	.	A	G	754.43	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156751;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.908;QD=56.9379;RBI=0.0157924;REFB=0;REVB=-0.00192192;RO=0;SAF=25;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.08831e-05;OID=.;OPOS=146221893;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:28:25:0:0:28:25:0:0
chr8	146225112	.	C	T	1607.05	PASS	AF=1;AO=107;DP=107;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00452626;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.673;QD=60.0766;RBI=0.00559823;REFB=0;REVB=0.00329441;RO=0;SAF=54;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.66183e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.10772e-05;OID=.;OPOS=146225112;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:107:107:0:0:107:107:1:53:54:0:0:53:54:0:0
chr8	146228390	.	C	T	1576.29	PASS	AF=1;AO=98;DP=99;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0165153;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.733;QD=63.0515;RBI=0.0256732;REFB=0;REVB=0.019656;RO=0;SAF=46;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.34529e-05;OID=.;OPOS=146228390;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:99:100:0:0:98:100:1:52:46:0:0:54:46:0:0
chr8	146228622	.	C	A	790.47	PASS	AF=0.935484;AO=58;DP=62;FAO=58;FDP=62;FR=.;FRO=4;FSAF=21;FSAR=37;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.00906509;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=300.248;QD=50.9979;RBI=0.0187375;REFB=-0.135836;REVB=0.0163987;RO=1;SAF=21;SAR=37;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0219308;STB=0.543463;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.000246938;OID=.;OPOS=146228622;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:62:62:1:4:58:58:0.935484:37:21:1:0:37:21:4:0
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chr8	146229531	.	TA	T,TG	6069.96	PASS	AF=0.167513,0.832487;AO=64,327;DP=394;FAO=66,328;FDP=394;FR=.;FRO=0;FSAF=60,89;FSAR=6,239;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0271981,0.0284561;FXX=0.00755648;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=210.122,229.117;QD=61.624;RBI=0.0289869,0.0308659;REFB=0,0;REVB=0.0100253,0.0119565;RO=0;SAF=58,87;SAR=6,240;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.71345e-08,-4.07227e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0103819,0.00148989;OID=.,.;OPOS=146229532,146229532;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=T,TG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.167513,0.832487:64,327:394:66,328:394:0:60,89:6,239:0:0:99:0:58,87:6,240:0:0
chr8	146229534	.	A	G	254.09	PASS	AF=0.168342;AO=69;DP=398;FAO=67;FDP=398;FR=.;FRO=331;FSAF=61;FSAR=6;FSRF=89;FSRR=242;FWDB=-0.0229307;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=39.9425;QD=2.55371;RBI=0.0376497;REFB=-0.0385878;REVB=0.029861;RO=329;SAF=63;SAR=6;SRF=87;SRR=242;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.734012;STB=0.943745;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.198578;OID=.;OPOS=146229534;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:398:398:329:331:69:67:0.168342:6:63:87:242:6:61:89:242
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chr9	163985	.	A	G	67.61	PASS	AF=0.176471;AO=12;DP=68;FAO=12;FDP=68;FR=.;FRO=56;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=24;FSRR=32;FWDB=0.0105388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.245;QD=3.97684;RBI=0.013875;REFB=-0.000954568;REVB=-0.00902491;RO=56;SAF=1;SAR=11;SRF=24;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.525865;STB=0.864055;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.00361688;OID=.;OPOS=163985;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:68:68:56:56:12:12:0.176471:11:1:24:32:11:1:24:32
chr9	214804	.	A	G	633.55	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0222502;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=48.762;QD=60.3385;RBI=0.132539;REFB=0;REVB=0.130658;RO=0;SAF=35;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.001818;OID=.;OPOS=214804;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:42:0:0:39:42:1:4:35:0:0:6:36:0:0
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chr9	1001922	.	C	G	205.09	PASS	AF=0.42;AO=21;DP=50;FAO=21;FDP=50;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=23;FWDB=-0.0163356;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.3372;QD=16.4071;RBI=0.024525;REFB=-0.0031096;REVB=0.0182926;RO=29;SAF=9;SAR=12;SRF=6;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.241298;STB=0.636248;STBP=0.149;TYPE=snp;VARB=0.00485968;OID=.;OPOS=1001922;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:29:29:21:21:0.42:12:9:6:23:12:9:6:23
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chr9	2804393	.	A	G	300.53	PASS	AF=0.553571;AO=31;DP=56;FAO=31;FDP=56;FR=.;FRO=25;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=7;FWDB=0.012315;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.261;QD=21.4665;RBI=0.0125889;REFB=0.00269228;REVB=0.00261178;RO=25;SAF=15;SAR=16;SRF=18;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.189893;STB=0.604746;STBP=0.095;TYPE=snp;VARB=-0.0010608;OID=.;OPOS=2804393;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:25:25:31:31:0.553571:16:15:18:7:16:15:18:7
chr9	2811505	.	G	A	446.15	PASS	AF=0.511628;AO=43;DP=85;FAO=44;FDP=86;FR=.;FRO=42;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=20;FSRR=22;FWDB=-0.0258848;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.353;QD=20.751;RBI=0.0300128;REFB=-0.0360367;REVB=-0.0151903;RO=42;SAF=18;SAR=25;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0521992;STB=0.521939;STBP=0.721;TYPE=snp;VARB=0.038032;OID=.;OPOS=2811505;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:86:42:42:43:44:0.511628:25:18:20:22:25:19:20:22
chr9	2828765	.	C	G	241.22	PASS	AF=0.522727;AO=23;DP=44;FAO=23;FDP=44;FR=.;FRO=21;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.00767031;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.143;QD=21.9294;RBI=0.0264374;REFB=-0.0199246;REVB=-0.0253002;RO=21;SAF=16;SAR=7;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.200216;STB=0.612664;STBP=0.149;TYPE=snp;VARB=0.0194076;OID=.;OPOS=2828765;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:21:21:23:23:0.522727:7:16:10:11:7:16:10:11
chr9	3301600	.	C	T	347.46	PASS	AF=0.514286;AO=36;DP=70;FAO=36;FDP=70;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=26;FSRF=23;FSRR=11;FWDB=-0.0128236;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.8077;QD=19.8546;RBI=0.0217922;REFB=-0.0223537;REVB=-0.0176198;RO=33;SAF=10;SAR=26;SRF=22;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.345479;STB=0.698584;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0197338;OID=.;OPOS=3301600;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:33:34:36:36:0.514286:26:10:22:11:26:10:23:11
chr9	4386423	.	A	G	905.99	PASS	AF=1;AO=62;DP=63;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0190471;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.8436;QD=58.4506;RBI=0.038436;REFB=0;REVB=0.0333846;RO=0;SAF=28;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.96421e-05;OID=.;OPOS=4386423;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:62:0:0:62:62:1:34:28:0:0:34:28:0:0
chr9	4576680	.	T	C	1283.11	PASS	AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0210652;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.161;QD=61.8366;RBI=0.0382285;REFB=0;REVB=0.031901;RO=0;SAF=40;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000166968;OID=.;OPOS=4576680;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:43:40:0:0:43:40:0:0
chr9	4586213	.	C	CTA	36.58	PASS	AF=0.5;AO=4;DP=27;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0430526;FXX=0.076864;HRUN=1;LEN=2;MLLD=117.167;QD=12.1938;RBI=0.164839;REFB=-0.086696;REVB=-0.159117;RO=22;SAF=3;SAR=1;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.420767;STB=0.780223;STBP=0.098;TYPE=ins;VARB=0.122392;OID=.;OPOS=4586214;OREF=-;OALT=TA;OMAPALT=CTA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.5:4:27:6:12:6:5:1:2:4:35:22:3:1:8:14
chr9	4622453	.	T	C	74.24	PASS	AF=0.344828;AO=10;DP=29;FAO=10;FDP=29;FR=.;FRO=19;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=-0.0290282;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.398;QD=10.24;RBI=0.0301241;REFB=-0.000285798;REVB=0.00805164;RO=19;SAF=1;SAR=9;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.647779;STB=0.892808;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.000202731;OID=.;OPOS=4622453;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:29:29:19:19:10:10:0.344828:9:1:13:6:9:1:13:6
chr9	4625429	.	T	C	313.66	PASS	AF=0.406977;AO=35;DP=86;FAO=35;FDP=86;FR=.;FRO=51;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=31;FSRR=20;FWDB=0.0380307;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.9787;QD=14.589;RBI=0.0460926;REFB=0.014417;REVB=-0.0260422;RO=50;SAF=19;SAR=16;SRF=31;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0814524;STB=0.539061;STBP=0.562;TYPE=snp;VARB=-0.0239853;OID=.;OPOS=4625429;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:50:51:35:35:0.406977:16:19:31:19:16:19:31:20
chr9	4635376	.	C	T	190.84	PASS	AF=0.363636;AO=24;DP=66;FAO=24;FDP=66;FR=.;FRO=42;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=0.0189225;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.9836;QD=11.5661;RBI=0.0322922;REFB=0.000395653;REVB=-0.0261673;RO=42;SAF=16;SAR=8;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138665;STB=0.580576;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=-0.000886577;OID=.;OPOS=4635376;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:42:42:24:24:0.363636:8:16:23:19:8:16:23:19
chr9	4664749	.	C	T	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0102404;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.1682;QD=50.413;RBI=0.0365482;REFB=0;REVB=-0.0350842;RO=0;SAF=8;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.41338e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000553495;OID=.;OPOS=4664749;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:11:8:0:0:11:8:0:0
chr9	4685008	.	C	T	1011.95	PASS	AF=0.985714;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=70;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0317876;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.8367;QD=57.8257;RBI=0.0434885;REFB=-0.0930237;REVB=-0.0296783;RO=0;SAF=22;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505262;STBP=0.618;TYPE=snp;VARB=0.00624379;OID=.;OPOS=4685008;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:69:70:0:1:69:69:0.985714:47:22:0:0:47:22:0:1
chr9	4706214	.	C	T	786.82	PASS	AF=1;AO=54;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0021763;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.328;QD=57.2232;RBI=0.0156571;REFB=0;REVB=0.0155051;RO=0;SAF=33;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.70667e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000131531;OID=.;OPOS=4706214;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:54:55:1:21:33:0:0:22:33:0:0
chr9	4711357	.	CA	C	258.56	PASS	AF=0.5;AO=39;DP=80;FAO=39;FDP=78;FR=.;FRO=39;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=25;FSRR=14;FWDB=-0.0679025;FXX=0.0249969;HRUN=2;LEN=1;MLLD=22.9319;QD=13.2595;RBI=0.086256;REFB=-0.0409875;REVB=-0.0531916;RO=39;SAF=18;SAR=21;SRF=25;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160495;STB=0.588996;STBP=0.135;TYPE=del;VARB=0.0383666;OID=.;OPOS=4711358;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.5:39:80:39:78:39:18:21:25:14:99:39:18:21:25:14
chr9	4711440	.	T	A	243.39	PASS	AF=0.4375;AO=28;DP=63;FAO=28;FDP=64;FR=.;FRO=36;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=-0.00208039;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.4773;QD=15.2116;RBI=0.0138245;REFB=-0.039111;REVB=0.0136671;RO=35;SAF=13;SAR=15;SRF=14;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0638848;STB=0.527008;STBP=0.734;TYPE=snp;VARB=0.0509483;OID=.;OPOS=4711440;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:64:35:36:28:28:0.4375:15:13:14:21:15:13:15:21
chr9	4860300	.	A	G	1330.73	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0417249;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.8591;QD=61.8946;RBI=0.104678;REFB=0;REVB=0.0960032;RO=0;SAF=52;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00078747;OID=.;OPOS=4860300;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:34:52:0:0:34:52:0:0
chr9	5081780	.	G	A	176.03	PASS	AF=0.319444;AO=23;DP=72;FAO=23;FDP=72;FR=.;FRO=49;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=25;FSRR=24;FWDB=-0.00658476;FXX=0.0270234;HRUN=4;LEN=1;MLLD=85.2043;QD=9.77964;RBI=0.0203662;REFB=-0.00283478;REVB=-0.0192723;RO=49;SAF=12;SAR=11;SRF=25;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0133508;STB=0.507853;STBP=0.956;TYPE=snp;VARB=0.00351033;OID=.;OPOS=5081780;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:49:49:23:23:0.319444:11:12:25:24:11:12:25:24
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chr9	5774225	.	T	G	1669.61	PASS	AF=0.982759;AO=111;DP=115;FAO=114;FDP=116;FR=.;FRO=2;FSAF=54;FSAR=60;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00160152;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.792;QD=57.5729;RBI=0.0224055;REFB=-0.0744543;REVB=0.0223482;RO=3;SAF=52;SAR=59;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00677805;STB=0.500455;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=0.000565918;OID=.;OPOS=5774225;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:115:116:3:2:111:114:0.982759:59:52:1:2:60:54:1:1
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chr9	6330915	.	G	A	805.16	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.011367;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.396;QD=64.4129;RBI=0.0123544;REFB=0;REVB=-0.00483976;RO=0;SAF=30;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.02832e-05;OID=.;OPOS=6330915;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:20:30:0:0:20:30:0:0
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chr9	7798435	.	C	T	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0211259;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.195;QD=59.4357;RBI=0.0286128;REFB=0;REVB=-0.0192973;RO=0;SAF=19;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.1382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.58211e-05;OID=.;OPOS=7798435;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:16:19:0:0:16:19:0:0
chr9	7798518	.	G	C	1011.42	PASS	AF=1;AO=68;DP=69;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0282594;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.4123;QD=59.4955;RBI=0.0440837;REFB=0;REVB=0.0338345;RO=0;SAF=38;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00047709;OID=.;OPOS=7798518;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:69:68:0:0:68:68:1:30:38:0:0:30:38:0:0
chr9	7799606	.	C	A	143.17	PASS	AF=0.516129;AO=15;DP=30;FAO=16;FDP=31;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.0149043;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=290.56;QD=18.4731;RBI=0.0154615;REFB=-0.0100287;REVB=0.00411313;RO=15;SAF=7;SAR=8;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0589223;STB=0.518496;STBP=0.894;TYPE=snp;VARB=0.0115724;OID=.;OPOS=7799606;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:31:15:15:15:16:0.516129:8:7:6:9:9:7:6:9
chr9	7799653	.	G	T	181.45	PASS	AF=0.6;AO=18;DP=30;FAO=18;FDP=30;FR=.;FRO=12;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.0513342;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=81.3443;QD=24.1939;RBI=0.0558511;REFB=-0.00215829;REVB=-0.0220034;RO=12;SAF=12;SAR=6;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0652509;STB=0.536544;STBP=0.627;TYPE=snp;VARB=0.00200114;OID=.;OPOS=7799653;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:30:30:12:12:18:18:0.6:6:12:7:5:6:12:7:5
chr9	8389364	.	C	G	620.13	PASS	AF=0.428571;AO=68;DP=157;FAO=69;FDP=161;FR=.;FRO=92;FSAF=34;FSAR=35;FSRF=31;FSRR=61;FWDB=-0.0037038;FXX=0.0122692;HRUN=3;LEN=1;MLLD=214.894;QD=15.4069;RBI=0.00384509;REFB=-0.0144975;REVB=0.00103274;RO=88;SAF=33;SAR=35;SRF=27;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.182503;STB=0.589251;STBP=0.06;TYPE=snp;VARB=0.0180431;OID=.;OPOS=8389364;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:157:161:88:92:68:69:0.428571:35:33:27:61:35:34:31:61
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chr9	8465598	.	A	G	2024.25	PASS	AF=1;AO=127;DP=128;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0398134;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.669;QD=62.2847;RBI=0.0398154;REFB=0;REVB=-0.000399907;RO=0;SAF=63;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.21543e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.0867e-05;OID=.;OPOS=8465598;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:128:130:0:0:127:130:1:64:63:0:0:66:64:0:0
chr9	8518143	.	T	C	598.37	PASS	AF=0.535714;AO=59;DP=112;FAO=60;FDP=112;FR=.;FRO=52;FSAF=41;FSAR=19;FSRF=22;FSRR=30;FWDB=0.0209084;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.495;QD=21.3704;RBI=0.0209239;REFB=-0.00414532;REVB=-0.000806433;RO=52;SAF=40;SAR=19;SRF=22;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.226097;STB=0.626594;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.004699;OID=.;OPOS=8518143;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:112:52:52:59:60:0.535714:19:40:22:30:19:41:22:30
chr9	8518395	.	G	A	1398.69	PASS	AF=0.978723;AO=91;DP=94;FAO=92;FDP=94;FR=.;FRO=2;FSAF=41;FSAR=51;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0560106;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.437;QD=59.5186;RBI=0.056887;REFB=-0.166788;REVB=0.0099474;RO=3;SAF=40;SAR=51;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0139069;STB=0.50117;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=0.00146662;OID=.;OPOS=8518395;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:94:94:3:2:91:92:0.978723:51:40:2:1:51:41:1:1
chr9	8528506	.	A	G	566.75	PASS	AF=1;AO=33;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0633251;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=43.5939;QD=59.6583;RBI=0.0689669;REFB=0;REVB=-0.0273197;RO=0;SAF=14;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.71297e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00226213;OID=.;OPOS=8528506;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:33:38:1:19:14:0:0:20:18:0:0
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chr9	14747412	.	A	G	315.55	PASS	AF=0.56;AO=28;DP=50;FAO=28;FDP=50;FR=.;FRO=22;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.017783;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=285.172;QD=25.2443;RBI=0.0178271;REFB=-0.0241929;REVB=-0.0012537;RO=22;SAF=14;SAR=14;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0172623;OID=.;OPOS=14747412;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:22:22:28:28:0.56:14:14:11:11:14:14:11:11
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chr9	14775859	.	G	A	425.34	PASS	AF=0.531646;AO=42;DP=79;FAO=42;FDP=79;FR=.;FRO=37;FSAF=16;FSAR=26;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=-0.00635267;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.893;QD=21.5361;RBI=0.0116248;REFB=-0.0221825;REVB=0.00973552;RO=37;SAF=16;SAR=26;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0456755;STB=0.52524;STBP=0.663;TYPE=snp;VARB=0.0260826;OID=.;OPOS=14775859;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:37:37:42:42:0.531646:26:16:16:21:26:16:16:21
chr9	14776140	.	C	T	338.98	PASS	AF=0.522388;AO=35;DP=67;FAO=35;FDP=67;FR=.;FRO=32;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=20;FWDB=0.0142385;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.2541;QD=20.2373;RBI=0.0302376;REFB=-0.00502129;REVB=0.0266754;RO=32;SAF=19;SAR=16;SRF=12;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143702;STB=0.579616;STBP=0.188;TYPE=snp;VARB=0.00373264;OID=.;OPOS=14776140;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:32:32:35:35:0.522388:16:19:12:20:16:19:12:20
chr9	14816829	.	G	C	58.61	PASS	AF=0.5;AO=8;DP=16;FAO=8;FDP=16;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=-0.0304923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.152;QD=14.6532;RBI=0.0321268;REFB=-0.0053736;REVB=-0.0101167;RO=8;SAF=4;SAR=4;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105859;STB=0.562346;STBP=0.705;TYPE=snp;VARB=0.00552633;OID=.;OPOS=14816829;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:16:16:8:8:8:8:0.5:4:4:5:3:4:4:5:3
chr9	14824799	.	G	A	481.67	PASS	AF=0.468468;AO=52;DP=111;FAO=52;FDP=111;FR=.;FRO=59;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=30;FSRR=29;FWDB=0.0152353;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=268.213;QD=17.3573;RBI=0.0222398;REFB=-0.0141698;REVB=-0.0162016;RO=59;SAF=26;SAR=26;SRF=30;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00809687;STB=0.504503;STBP=0.957;TYPE=snp;VARB=0.0173194;OID=.;OPOS=14824799;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:111:59:59:52:52:0.468468:26:26:30:29:26:26:30:29
chr9	14859356	.	T	C	369.83	PASS	AF=0.493506;AO=38;DP=78;FAO=38;FDP=77;FR=.;FRO=39;FSAF=13;FSAR=25;FSRF=13;FSRR=26;FWDB=-0.0575028;FXX=0.0253133;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.9049;QD=19.2118;RBI=0.0599522;REFB=-0.00178169;REVB=-0.0169615;RO=40;SAF=13;SAR=25;SRF=14;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00804453;STB=0.504948;STBP=0.914;TYPE=snp;VARB=0.00112642;OID=.;OPOS=14859356;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:77:40:39:38:38:0.493506:25:13:14:26:25:13:13:26
chr9	15188106	.	T	C	1194.03	PASS	AF=1;AO=78;DP=79;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0174845;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.936;QD=61.2322;RBI=0.0174857;REFB=0;REVB=0.00020568;RO=0;SAF=42;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.43944e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.29715e-05;OID=.;OPOS=15188106;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:78:0:0:78:78:1:36:42:0:0:36:42:0:0
chr9	15464898	.	C	A	392.3	PASS	AF=0.935484;AO=31;DP=31;FAO=29;FDP=31;FR=.;FRO=2;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0191406;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.2912;QD=50.619;RBI=0.025672;REFB=0.0304134;REVB=-0.0171082;RO=0;SAF=10;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.555516;STBP=0.056;TYPE=snp;VARB=-0.00202211;OID=.;OPOS=15464898;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:31:31:0:2:31:29:0.935484:21:10:0:0:21:8:2:0
chr9	15591372	.	T	A	142.63	PASS	AF=0.4;AO=16;DP=40;FAO=16;FDP=40;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=-0.0124357;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.412;QD=14.2628;RBI=0.0171019;REFB=-0.00953214;REVB=-0.01174;RO=24;SAF=12;SAR=4;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106728;STB=0.562418;STBP=0.584;TYPE=snp;VARB=0.013632;OID=.;OPOS=15591372;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:24:24:16:16:0.4:4:12:16:8:4:12:16:8
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chr9	15922137	.	A	G	958.65	PASS	AF=0.985075;AO=67;DP=67;FAO=66;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0192519;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.199;QD=57.2328;RBI=0.0233724;REFB=-0.040003;REVB=0.0132526;RO=0;SAF=45;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.511624;STBP=0.176;TYPE=snp;VARB=0.0014201;OID=.;OPOS=15922137;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:67:67:0:1:67:66:0.985075:22:45:0:0:21:45:0:1
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chr9	16685539	.	T	C	61.56	PASS	AF=0.428571;AO=7;DP=19;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=0.103972;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.8045;QD=11.726;RBI=0.109684;REFB=-0.0519948;REVB=-0.0349335;RO=12;SAF=2;SAR=5;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.453553;STB=0.669755;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=0.0345528;OID=.;OPOS=16685539;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:19:21:12:12:7:9:0.428571:5:2:9:3:5:4:9:3
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chr9	17001216	.	A	C	1365.38	PASS	AF=1;AO=87;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00923911;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.295;QD=62.0627;RBI=0.00964009;REFB=0;REVB=0.00275138;RO=0;SAF=52;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.63258e-05;OID=.;OPOS=17001216;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:88:88:0:0:87:88:1:35:52:0:0:35:53:0:0
chr9	17135115	.	C	T	608.69	PASS	AF=0.572816;AO=59;DP=101;FAO=59;FDP=103;FR=.;FRO=44;FSAF=29;FSAR=30;FSRF=24;FSRR=20;FWDB=0.0548803;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.7722;QD=23.6385;RBI=0.0557465;REFB=-0.0232814;REVB=0.00978904;RO=41;SAF=29;SAR=30;SRF=23;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0521832;STB=0.523019;STBP=0.631;TYPE=snp;VARB=0.0168416;OID=.;OPOS=17135115;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:103:41:44:59:59:0.572816:30:29:23:18:30:29:24:20
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chr9	17394536	.	C	T	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.183279;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.539;QD=33.4285;RBI=0.186312;REFB=0;REVB=-0.0334823;RO=0;SAF=3;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0119449;OID=.;OPOS=17394536;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:3:3:0:0:3:3:0:0
chr9	17394996	.	T	C	715.02	PASS	AF=0.978723;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00792797;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.832;QD=60.8524;RBI=0.0219021;REFB=0.18693;REVB=0.0204169;RO=1;SAF=18;SAR=28;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0253996;STB=0.513508;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=-0.00125263;OID=.;OPOS=17394996;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:47:47:1:1:46:46:0.978723:28:18:1:0:28:18:1:0
chr9	17409366	.	G	A	929.25	PASS	AF=0.970149;AO=65;DP=67;FAO=65;FDP=67;FR=.;FRO=2;FSAF=29;FSAR=36;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00592865;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.065;QD=55.4777;RBI=0.00949579;REFB=-0.0381839;REVB=0.00741762;RO=2;SAF=29;SAR=36;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0314649;STB=0.516661;STBP=0.138;TYPE=snp;VARB=0.00193088;OID=.;OPOS=17409366;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:67:67:2:2:65:65:0.970149:36:29:2:0:36:29:2:0
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chr9	19576949	.	T	G	1540.52	PASS	AF=1;AO=102;DP=102;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0105919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.321;QD=59.826;RBI=0.0242399;REFB=0;REVB=0.0218033;RO=0;SAF=61;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.18616e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.4421e-05;OID=.;OPOS=19576949;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:102:103:0:0:102:103:1:41:61:0:0:41:62:0:0
chr9	19786217	.	G	A	99.96	PASS	AF=0.461538;AO=12;DP=26;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.0112074;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.0148;QD=15.3789;RBI=0.0530015;REFB=0.0229261;REVB=-0.051803;RO=14;SAF=4;SAR=8;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0245398;STB=0.514262;STBP=0.924;TYPE=snp;VARB=-0.0278194;OID=.;OPOS=19786217;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:26:14:14:12:12:0.461538:8:4:5:9:8:4:5:9
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chr9	21304803	.	G	A	339.97	PASS	AF=0.630435;AO=29;DP=46;FAO=29;FDP=46;FR=.;FRO=17;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=-0.00289661;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=267.097;QD=29.5625;RBI=0.00359862;REFB=-0.00710335;REVB=0.00213535;RO=17;SAF=17;SAR=12;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156809;STB=0.586147;STBP=0.116;TYPE=snp;VARB=0.00451069;OID=.;OPOS=21304803;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:17:17:29:29:0.630435:12:17:6:11:12:17:6:11
chr9	21481483	.	G	A	519.47	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00130267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.585;QD=59.3684;RBI=0.0600591;REFB=0;REVB=0.0600449;RO=0;SAF=21;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.27896e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000536252;OID=.;OPOS=21481483;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:14:21:0:0:14:21:0:0
chr9	21482181	.	C	A,G	2393.98	PASS	AF=0.0377358,0.962264;AO=7,152;DP=159;FAO=6,153;FDP=159;FR=.;FRO=0;FSAF=4,81;FSAR=2,72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00209906,0.0253569;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=223.983,110.961;QD=60.226;RBI=0.0127269,0.0257541;REFB=0,0;REVB=-0.0125526,-0.00450616;RO=0;SAF=5,80;SAR=2,72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.27427e-08,3.66134e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0929964,-0.00137446;OID=.,.;OPOS=21482181,21482181;OREF=C,C;OALT=A,G;OMAPALT=A,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:159:159:0:0:7,152:6,153:0.0377358,0.962264:2,72:5,80:0:0:2,72:4,81:0:0
chr9	21482238	.	AAAT	A	1769.77	PASS	AF=1;AO=139;DP=149;FAO=143;FDP=143;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0162184;FXX=0.0466636;HRUN=3;LEN=3;MLLD=254.97;QD=49.504;RBI=0.0401019;REFB=0;REVB=0.036676;RO=0;SAF=77;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-2.84942e-05;OID=.;OPOS=21482239;OREF=AAT;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:139:149:143:143:0:80:63:0:0:31:0:77:62:0:0
chr9	21699406	.	G	A	174.09	PASS	AF=0.5;AO=18;DP=36;FAO=18;FDP=36;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=15;FSRF=3;FSRR=15;FWDB=0.0123048;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.5562;QD=19.3433;RBI=0.0203279;REFB=-0.00748039;REVB=0.0161806;RO=18;SAF=3;SAR=15;SRF=3;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00932419;OID=.;OPOS=21699406;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:18:18:18:18:0.5:15:3:3:15:15:3:3:15
chr9	21699444	.	C	T	184.83	PASS	AF=0.475;AO=19;DP=40;FAO=19;FDP=40;FR=.;FRO=21;FSAF=3;FSAR=16;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=-0.0215077;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.6325;QD=18.4832;RBI=0.0215769;REFB=-0.00300603;REVB=-0.00172708;RO=21;SAF=3;SAR=16;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.242105;STB=0.639832;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=0.0145622;OID=.;OPOS=21699444;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:21:21:19:19:0.475:16:3:7:14:16:3:7:14
chr9	21816758	.	G	A	321.24	PASS	AF=0.443038;AO=35;DP=79;FAO=35;FDP=79;FR=.;FRO=44;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=33;FSRR=11;FWDB=-0.00860428;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.615;QD=16.2652;RBI=0.023486;REFB=0.00483295;REVB=0.0218531;RO=44;SAF=16;SAR=19;SRF=33;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.286403;STB=0.659731;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=-0.0069154;OID=.;OPOS=21816758;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:44:44:35:35:0.443038:19:16:33:11:19:16:33:11
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chr9	21968199	.	C	G	787.05	PASS	AF=0.982456;AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0677449;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.8462;QD=55.2315;RBI=0.0772614;REFB=-0.160388;REVB=-0.0371477;RO=1;SAF=30;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154585;STB=0.508194;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.00260558;OID=.;OPOS=21968199;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:57:57:1:1:56:56:0.982456:26:30:1:0:26:30:1:0
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chr9	24545957	.	G	C	894.3	PASS	AF=0.969231;AO=63;DP=65;FAO=63;FDP=65;FR=.;FRO=2;FSAF=30;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0291552;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=129.918;QD=55.034;RBI=0.0291834;REFB=-0.015469;REVB=0.00128321;RO=1;SAF=30;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0140954;STB=0.500734;STBP=0.871;TYPE=snp;VARB=0.000304834;OID=.;OPOS=24545957;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:65:65:1:2:63:63:0.969231:33:30:0:1:33:30:1:1
chr9	24905556	.	A	G	1320.73	PASS	AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00394012;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=200.991;QD=62.1522;RBI=0.00545356;REFB=0;REVB=0.00377052;RO=0;SAF=50;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.10119e-05;OID=.;OPOS=24905556;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:35:50:0:0:35:50:0:0
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chr9	25677933	.	T	C	93.32	PASS	AF=0.578947;AO=11;DP=19;FAO=11;FDP=19;FR=.;FRO=8;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.0122677;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.28;QD=19.646;RBI=0.0166103;REFB=-0.0175223;REVB=0.0111985;RO=8;SAF=1;SAR=10;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.258419;STB=0.651838;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=0.0100107;OID=.;OPOS=25677933;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:19:19:8:8:11:11:0.578947:10:1:2:6:10:1:2:6
chr9	25677953	.	T	C	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0614953;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.3885;QD=43.4859;RBI=0.0635358;REFB=0;REVB=-0.0159727;RO=0;SAF=2;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00372049;OID=.;OPOS=25677953;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:10:2:0:0:10:2:0:0
chr9	25678640	.	T	A	305.0	PASS	AF=0.56;AO=27;DP=50;FAO=28;FDP=50;FR=.;FRO=22;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=5;FSRR=17;FWDB=0.0875959;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.992;QD=24.4003;RBI=0.0904266;REFB=-0.0353819;REVB=0.0224483;RO=22;SAF=10;SAR=17;SRF=5;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129189;STB=0.578894;STBP=0.261;TYPE=snp;VARB=0.0315875;OID=.;OPOS=25678640;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:22:22:27:28:0.56:17:10:5:17:17:11:5:17
chr9	26116150	.	G	T	323.66	PASS	AF=1;AO=23;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0556413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.277;QD=53.9439;RBI=0.056997;REFB=0;REVB=0.0123577;RO=0;SAF=5;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000186913;OID=.;OPOS=26116150;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:23:24:1:18:5:0:0:18:6:0:0
chr9	27183463	.	A	C	447.03	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00755851;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.1;QD=57.6806;RBI=0.022717;REFB=0;REVB=0.0214227;RO=0;SAF=18;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.33668e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.89885e-05;OID=.;OPOS=27183463;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:13:18:0:0:13:18:0:0
chr9	27296705	.	A	G	169.48	PASS	AF=0.439024;AO=18;DP=41;FAO=18;FDP=41;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=0.000922199;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.655;QD=16.5351;RBI=0.0161139;REFB=-0.00704626;REVB=-0.0160875;RO=23;SAF=8;SAR=10;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00957813;STB=0.505488;STBP=0.965;TYPE=snp;VARB=0.00412464;OID=.;OPOS=27296705;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:23:23:18:18:0.439024:10:8:10:13:10:8:10:13
chr9	27328886	.	C	A	556.46	PASS	AF=0.461538;AO=54;DP=124;FAO=60;FDP=130;FR=.;FRO=70;FSAF=25;FSAR=35;FSRF=25;FSRR=45;FWDB=0.0251586;FXX=0.00763301;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.535;QD=17.1217;RBI=0.0251588;REFB=-0.00386774;REVB=9.83173e-05;RO=65;SAF=19;SAR=35;SRF=24;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0185365;STB=0.533322;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.00529178;OID=.;OPOS=27328886;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:124:130:65:70:54:60:0.461538:35:19:24:41:35:25:25:45
chr9	27328964	.	C	T	2256.09	PASS	AF=0.993333;AO=148;DP=149;FAO=149;FDP=150;FR=.;FRO=1;FSAF=54;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0363442;FXX=0.013157;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.471;QD=60.1624;RBI=0.0364618;REFB=-0.127325;REVB=-0.00292623;RO=1;SAF=54;SAR=94;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00503329;STB=0.502617;STBP=0.494;TYPE=snp;VARB=-1.71846e-05;OID=.;OPOS=27328964;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:149:150:1:1:148:149:0.993333:94:54:0:1:95:54:0:1
chr9	27524731	.	A	G	671.86	PASS	AF=0.943396;AO=50;DP=53;FAO=50;FDP=53;FR=.;FRO=3;FSAF=18;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0322448;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.9451;QD=50.7067;RBI=0.0328193;REFB=-0.123719;REVB=0.00611413;RO=0;SAF=18;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.522379;STBP=0.217;TYPE=snp;VARB=0.00350819;OID=.;OPOS=27524731;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:53:53:0:3:50:50:0.943396:32:18:0:0:32:18:0:3
chr9	27556780	.	G	A	65.02	PASS	AF=0.35;AO=7;DP=20;FAO=7;FDP=20;FR=.,HEALED;FRO=11;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.00141511;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.844;QD=13.0045;RBI=0.00423222;REFB=-0.00567084;REVB=-0.00398862;RO=11;SAF=5;SAR=2;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.184599;STB=0.613693;STBP=0.419;TYPE=snp;VARB=0.0213357;OID=.;OPOS=27556780;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:20:20:11:11:7:7:0.35:2:5:6:5:2:5:6:5
chr9	32069857	.	T	G	141.31	PASS	AF=0.380952;AO=16;DP=42;FAO=16;FDP=42;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=-0.00124285;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.8961;QD=13.4585;RBI=0.00291059;REFB=0.0133031;REVB=-0.00263189;RO=26;SAF=6;SAR=10;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174988;STB=0.60228;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=-0.0208622;OID=.;OPOS=32069857;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:26:26:16:16:0.380952:10:6:14:12:10:6:14:12
chr9	32069938	.	G	C	134.17	PASS	AF=0.454545;AO=15;DP=33;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.0440983;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.085;QD=16.2625;RBI=0.0457582;REFB=0.00369904;REVB=0.0122128;RO=14;SAF=5;SAR=10;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.208276;STB=0.624829;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=-0.00946505;OID=.;OPOS=32069938;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:14:18:15:15:0.454545:10:5:8:6:10:5:10:8
chr9	32425910	.	A	G	1106.06	PASS	AF=0.516129;AO=109;DP=216;FAO=112;FDP=217;FR=.;FRO=105;FSAF=58;FSAR=54;FSRF=57;FSRR=48;FWDB=0.000785311;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.497;QD=20.3882;RBI=0.0118082;REFB=-0.00811127;REVB=0.011782;RO=107;SAF=58;SAR=51;SRF=57;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000544023;STB=0.512121;STBP=0.701;TYPE=snp;VARB=0.00764441;OID=.;OPOS=32425910;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:216:217:107:105:109:112:0.516129:51:58:57:50:54:58:57:48
chr9	32436014	.	A	G	203.23	PASS	AF=0.540541;AO=20;DP=37;FAO=20;FDP=37;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=0.0190546;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.245;QD=21.9713;RBI=0.0270876;REFB=-0.0207316;REVB=-0.0192525;RO=17;SAF=8;SAR=12;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.246804;STB=0.638163;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.0276935;OID=.;OPOS=32436014;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:17:17:20:20:0.540541:12:8:12:5:12:8:12:5
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chr9	32526146	.	G	A	131.97	PASS	AF=0.416667;AO=15;DP=36;FAO=15;FDP=36;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=-0.00269606;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.639;QD=14.6638;RBI=0.0594686;REFB=-0.0237284;REVB=0.0594075;RO=21;SAF=5;SAR=10;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151309;STB=0.588114;STBP=0.374;TYPE=snp;VARB=0.0460505;OID=.;OPOS=32526146;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:21:21:15:15:0.416667:10:5:10:11:10:5:10:11
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chr9	32631369	.	C	T	1210.06	PASS	AF=0.515152;AO=118;DP=231;FAO=119;FDP=231;FR=.;FRO=112;FSAF=65;FSAR=54;FSRF=60;FSRR=52;FWDB=0.000448116;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.643;QD=20.9534;RBI=0.0074276;REFB=0.00510212;REVB=-0.00741407;RO=112;SAF=64;SAR=54;SRF=60;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00595857;STB=0.505131;STBP=0.871;TYPE=snp;VARB=-0.00452794;OID=.;OPOS=32631369;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:231:231:112:112:118:119:0.515152:54:64:60:52:54:65:60:52
chr9	32785399	.	C	T	2071.5	PASS	AF=1;AO=132;DP=133;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00488702;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.189;QD=62.3007;RBI=0.0532603;REFB=0;REVB=-0.0530357;RO=0;SAF=53;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.02569e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.19604e-05;OID=.;OPOS=32785399;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:133:133:0:0:132:133:1:79:53:0:0:80:53:0:0
chr9	32785888	.	G	C	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0204349;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=352.367;QD=53.2772;RBI=0.0250596;REFB=0;REVB=0.014505;RO=0;SAF=7;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.30776e-05;OID=.;OPOS=32785888;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:16:7:0:0:16:7:0:0
chr9	32786553	.	T	C	272.29	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000831384;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=155.373;QD=51.865;RBI=0.0343056;REFB=0;REVB=0.0342956;RO=0;SAF=10;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000316076;OID=.;OPOS=32786553;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:11:10:0:0:11:10:0:0
chr9	32786586	.	G	T	253.29	PASS	AF=1;AO=19;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00915417;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.907;QD=50.6576;RBI=0.0112142;REFB=0;REVB=0.00647769;RO=1;SAF=9;SAR=10;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0483869;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.82555e-05;OID=.;OPOS=32786586;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:1:0:19:20:1:10:9:1:0:10:10:0:0
chr9	32786653	.	G	T	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0268829;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.623;QD=51.1846;RBI=0.0373384;REFB=0;REVB=0.0259126;RO=0;SAF=8;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.28697e-06;OID=.;OPOS=32786653;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:12:8:0:0:12:8:0:0
chr9	32820257	.	C	T	1033.09	PASS	AF=1;AO=69;DP=71;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00575568;FXX=0.028165;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.473;QD=59.8891;RBI=0.010481;REFB=0;REVB=-0.00875916;RO=0;SAF=31;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.95475e-05;OID=.;OPOS=32820257;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:69:0:0:69:69:1:38:31:0:0:38:31:0:0
chr9	33026572	.	T	C	756.44	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0233815;FXX=0.0185151;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.2025;QD=57.0901;RBI=0.0430354;REFB=0;REVB=0.0361296;RO=0;SAF=26;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000702243;OID=.;OPOS=33026572;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:27:26:0:0:27:26:0:0
chr9	33062128	.	G	A	118.91	PASS	AF=0.388889;AO=14;DP=36;FAO=14;FDP=36;FR=.;FRO=22;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.0535511;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.441;QD=13.2126;RBI=0.0539416;REFB=-0.004774;REVB=-0.00647932;RO=22;SAF=4;SAR=10;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.23878;STB=0.640815;STBP=0.203;TYPE=snp;VARB=0.00368596;OID=.;OPOS=33062128;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:22:22:14:14:0.388889:10:4:11:11:10:4:11:11
chr9	33240225	.	G	A	894.07	PASS	AF=1;AO=61;DP=63;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.052313;FXX=0.0158705;HRUN=3;LEN=1;MLLD=192.388;QD=57.6816;RBI=0.0584627;REFB=0;REVB=0.0261004;RO=0;SAF=35;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000230786;OID=.;OPOS=33240225;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:62:0:0:61:62:1:26:35:0:0:27:35:0:0
chr9	33352826	.	C	CAAA	254.63	PASS	AF=0.605263;AO=23;DP=40;FAO=23;FDP=38;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.00184603;FXX=0.0499875;HRUN=0;LEN=3;MLLD=248.589;QD=26.8027;RBI=0.00498612;REFB=0.0136323;REVB=-0.0046318;RO=16;SAF=9;SAR=14;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128396;STB=0.557326;STBP=0.365;TYPE=ins;VARB=-0.00873866;OID=.;OPOS=33352827;OREF=-;OALT=AAA;OMAPALT=CAAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.605263:23:40:23:38:15:9:14:8:7:99:16:9:14:9:7
chr9	33395196	.	A	G	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0382782;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.306;QD=49.599;RBI=0.0383072;REFB=0;REVB=-0.00148993;RO=0;SAF=10;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000443762;OID=.;OPOS=33395196;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:8:10:0:0:8:10:0:0
chr9	33442952	.	G	A	717.36	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.022936;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.698;QD=62.3793;RBI=0.0232494;REFB=0;REVB=-0.00380432;RO=0;SAF=20;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.30465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00291953;OID=.;OPOS=33442952;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:46:0:0:44:46:1:24:20:0:0:24:22:0:0
chr9	33447424	.	C	G	5256.44	PASS	AF=0.985714;AO=342;DP=352;FAO=345;FDP=350;FR=.;FRO=5;FSAF=177;FSAR=168;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.0076427;FXX=0.00568166;HRUN=2;LEN=1;MLLD=259.776;QD=60.0736;RBI=0.0144621;REFB=-0.236632;REVB=0.0122777;RO=6;SAF=176;SAR=166;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0169277;STB=0.507331;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.000399088;OID=.;OPOS=33447424;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:352:350:6:5:342:345:0.985714:166:176:0:6:168:177:0:5
chr9	33461567	.	A	G	88.22	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0172605;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=235.772;QD=39.2067;RBI=0.0174412;REFB=0;REVB=-0.00250382;RO=0;SAF=6;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000194611;OID=.;OPOS=33461567;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:3:6:0:0:3:6:0:0
chr9	33524684	.	G	A	455.04	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0172035;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.184;QD=56.8802;RBI=0.0182996;REFB=0;REVB=0.00623836;RO=0;SAF=11;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.46743e-05;OID=.;OPOS=33524684;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:32:0:0:29:32:1:18:11:0:0:19:13:0:0
chr9	33618358	.	A	G	554.03	PASS	AF=0.444444;AO=60;DP=135;FAO=60;FDP=135;FR=.;FRO=75;FSAF=21;FSAR=39;FSRF=28;FSRR=47;FWDB=-0.00167074;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.67;QD=16.4157;RBI=0.00872132;REFB=-0.00681517;REVB=-0.00855979;RO=75;SAF=21;SAR=39;SRF=28;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0252951;STB=0.51412;STBP=0.789;TYPE=snp;VARB=0.0102119;OID=.;OPOS=33618358;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:135:135:75:75:60:60:0.444444:39:21:28:47:39:21:28:47
chr9	33618460	.	A	T	335.93	PASS	AF=0.514706;AO=35;DP=68;FAO=35;FDP=68;FR=.;FRO=33;FSAF=8;FSAR=27;FSRF=10;FSRR=23;FWDB=-0.00694507;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.396;QD=19.7607;RBI=0.014216;REFB=-0.0216168;REVB=0.012404;RO=31;SAF=8;SAR=27;SRF=8;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0346235;STB=0.548504;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=0.0206378;OID=.;OPOS=33618460;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:31:33:35:35:0.514706:27:8:8:23:27:8:10:23
chr9	33618497	.	G	A	255.14	PASS	AF=0.521739;AO=24;DP=46;FAO=24;FDP=46;FR=.;FRO=22;FSAF=4;FSAR=20;FSRF=4;FSRR=18;FWDB=-0.020994;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.537;QD=22.1864;RBI=0.027366;REFB=-0.0198704;REVB=-0.0175542;RO=22;SAF=4;SAR=20;SRF=4;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0228477;STB=0.51281;STBP=0.915;TYPE=snp;VARB=0.0240755;OID=.;OPOS=33618497;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:22:22:24:24:0.521739:20:4:4:18:20:4:4:18
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chr9	33935736	.	A	G	311.28	PASS	AF=0.5;AO=33;DP=67;FAO=33;FDP=66;FR=.;FRO=33;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=11;FWDB=-0.00349144;FXX=0.0149231;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.067;QD=18.8654;RBI=0.0139428;REFB=-0.0197501;REVB=0.0134986;RO=33;SAF=17;SAR=16;SRF=22;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136999;STB=0.576132;STBP=0.239;TYPE=snp;VARB=0.015269;OID=.;OPOS=33935736;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:66:33:33:33:33:0.5:16:17:22:11:16:17:22:11
chr9	33943482	.	C	T	33.04	PASS	AF=0.139535;AO=6;DP=43;FAO=6;FDP=43;FR=.;FRO=37;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=0.0116082;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.551;QD=3.07318;RBI=0.0245779;REFB=-0.00363935;REVB=-0.0216639;RO=34;SAF=2;SAR=4;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133333;STB=0.634463;STBP=0.476;TYPE=snp;VARB=0.0232694;OID=.;OPOS=33943482;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:43:43:34:37:6:6:0.139535:4:2:15:19:4:2:18:19
chr9	33971740	.	A	G	179.7	PASS	AF=0.413043;AO=19;DP=46;FAO=19;FDP=46;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=-0.0288367;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.25;QD=15.6262;RBI=0.0330369;REFB=-0.0111782;REVB=0.0161207;RO=26;SAF=8;SAR=11;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0801459;STB=0.535925;STBP=0.743;TYPE=snp;VARB=0.0158337;OID=.;OPOS=33971740;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:26:27:19:19:0.413043:11:8:13:13:11:8:13:14
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chr9	34017106	.	C	T	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0557293;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=166.407;QD=51.916;RBI=0.0592259;REFB=0;REVB=-0.0200488;RO=0;SAF=7;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000221422;OID=.;OPOS=34017106;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:14:7:0:0:14:7:0:0
chr9	34088022	.	G	GAAAGA	112.29	PASS	AF=1;AO=10;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00125121;FXX=0;HRUN=0;LEN=5;MLLD=306.092;QD=40.8331;RBI=0.00421997;REFB=0;REVB=0.00403022;RO=0;SAF=5;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.000169499;OID=.;OPOS=34088023;OREF=-;OALT=AAAGA;OMAPALT=GAAAGA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:10:11:11:11:0:5:6:0:0:4:0:5:5:0:0
chr9	34107505	.	C	T	131.37	PASS	AF=0.320755;AO=17;DP=54;FAO=17;FDP=53;FR=.;FRO=36;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=-0.0175607;FXX=0.0185151;HRUN=3;LEN=1;MLLD=93.6455;QD=9.91495;RBI=0.0293573;REFB=-0.00480305;REVB=0.023526;RO=35;SAF=9;SAR=8;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0495978;STB=0.538757;STBP=0.726;TYPE=snp;VARB=0.0135486;OID=.;OPOS=34107505;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:53:35:36:17:17:0.320755:8:9:17:18:8:9:17:19
chr9	34251943	.	G	C	836.83	PASS	AF=1;AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0286194;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.763;QD=57.7125;RBI=0.0544473;REFB=0;REVB=-0.0463188;RO=0;SAF=43;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000836108;OID=.;OPOS=34251943;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:58:0:0:58:58:1:15:43:0:0:15:43:0:0
chr9	34252466	.	GCTAA	G	624.42	PASS	AF=1;AO=38;DP=40;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000378455;FXX=0;HRUN=1;LEN=4;MLLD=316.021;QD=60.9193;RBI=0.00665738;REFB=0;REVB=0.00664662;RO=0;SAF=19;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.000429508;OID=.;OPOS=34252467;OREF=CTAA;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:38:40:41:41:0:19:22:0:0:4:0:19:19:0:0
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chr9	34310927	.	T	C	321.23	PASS	AF=0.443038;AO=35;DP=79;FAO=35;FDP=79;FR=.;FRO=44;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=26;FWDB=-0.00592872;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.701;QD=16.2648;RBI=0.0218859;REFB=0.00306177;REVB=0.0210675;RO=44;SAF=18;SAR=17;SRF=18;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103954;STB=0.558408;STBP=0.377;TYPE=snp;VARB=-0.00431154;OID=.;OPOS=34310927;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:44:44:35:35:0.443038:17:18:18:26:17:18:18:26
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chr9	34372783	.	G	C	768.86	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0356955;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.601;QD=56.9523;RBI=0.0541352;REFB=0;REVB=0.0406995;RO=0;SAF=28;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.52846e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000133531;OID=.;OPOS=34372783;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:26:28:0:0:26:28:0:0
chr9	34372873	.	C	G	851.26	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0089952;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.685;QD=57.7123;RBI=0.00954409;REFB=0;REVB=0.00318997;RO=0;SAF=40;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.7823e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.86493e-05;OID=.;OPOS=34372873;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:19:40:0:0:19:40:0:0
chr9	34382726	.	A	G	1820.55	PASS	AF=1;AO=115;DP=117;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0352135;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.659;QD=61.1948;RBI=0.0447989;REFB=0;REVB=-0.0276939;RO=0;SAF=48;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.25339e-05;OID=.;OPOS=34382726;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:117:119:0:0:115:119:1:67:48:0:0:69:50:0:0
chr9	34399170	.	G	A	135.76	PASS	AF=0.483871;AO=15;DP=31;FAO=15;FDP=31;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=0.112588;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.7286;QD=17.518;RBI=0.115649;REFB=-0.0429778;REVB=0.0264298;RO=16;SAF=7;SAR=8;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141648;STB=0.580682;STBP=0.439;TYPE=snp;VARB=0.0508868;OID=.;OPOS=34399170;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:16:16:15:15:0.483871:8:7:5:11:8:7:5:11
chr9	34478671	.	G	A	250.64	PASS	AF=0.466667;AO=20;DP=61;FAO=28;FDP=60;FR=.,HEALED;FRO=32;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=-0.04884;FXX=0.0163908;HRUN=3;LEN=1;MLLD=115.933;QD=16.7092;RBI=0.0496248;REFB=-0.01161;REVB=-0.00879068;RO=30;SAF=11;SAR=9;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120975;STB=0.504851;STBP=0.961;TYPE=snp;VARB=0.0235591;OID=.;OPOS=34478671;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:60:30:32:20:28:0.466667:9:11:13:17:16:12:14:18
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chr9	34622389	.	A	C	236.11	PASS	AF=0.469388;AO=23;DP=49;FAO=23;FDP=49;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=-0.0153239;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.9776;QD=19.2739;RBI=0.0228556;REFB=0.0188573;REVB=-0.0169574;RO=26;SAF=14;SAR=9;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0450092;STB=0.525402;STBP=0.756;TYPE=snp;VARB=-0.0246292;OID=.;OPOS=34622389;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:26:26:23:23:0.469388:9:14:17:9:9:14:17:9
chr9	34627983	.	G	A	83.58	PASS	AF=0.625;AO=10;DP=16;FAO=10;FDP=16;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0459678;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.049;QD=20.8953;RBI=0.0475469;REFB=0.00127205;REVB=0.0121519;RO=6;SAF=2;SAR=8;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.249643;STB=0.644839;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=-0.000578505;OID=.;OPOS=34627983;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:16:16:6:6:10:10:0.625:8:2:3:3:8:2:3:3
chr9	34658652	.	G	A	210.72	PASS	AF=0.477273;AO=21;DP=44;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=0.030022;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.093;QD=19.1565;RBI=0.0303476;REFB=-0.0104456;REVB=0.00443348;RO=23;SAF=7;SAR=14;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141864;STB=0.580566;STBP=0.356;TYPE=snp;VARB=0.00796937;OID=.;OPOS=34658652;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:23:23:21:21:0.477273:14:7:11:12:14:7:11:12
chr9	34723744	.	C	A	870.61	PASS	AF=1;AO=59;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0197619;FXX=0.0163908;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.526;QD=58.0405;RBI=0.0768245;REFB=0;REVB=0.0742392;RO=0;SAF=43;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.74604e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000470398;OID=.;OPOS=34723744;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:59:60:1:16:43:0:0:17:43:0:0
chr9	34723935	.	C	T	223.19	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0228268;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.812;QD=49.5983;RBI=0.0740023;REFB=0;REVB=-0.0703938;RO=0;SAF=17;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000328252;OID=.;OPOS=34723935;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:1:17:0:0:1:17:0:0
chr9	34724241	.	C	A	920.38	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00746623;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.121;QD=58.4366;RBI=0.0352593;REFB=0;REVB=0.0344597;RO=0;SAF=32;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.93293e-05;OID=.;OPOS=34724241;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:63:0:0:62:63:1:30:32:0:0:31:32:0:0
chr9	34724786	.	G	A	160.31	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0208352;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=177.492;QD=45.804;RBI=0.0212448;REFB=0;REVB=0.00415136;RO=0;SAF=10;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.63386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000110108;OID=.;OPOS=34724786;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:4:10:0:0:4:10:0:0
chr9	34724796	.	T	A	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00995401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.914;QD=43.486;RBI=0.0486012;REFB=0;REVB=0.0475709;RO=0;SAF=8;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00114522;OID=.;OPOS=34724796;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:4:8:0:0:4:8:0:0
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chr9	34725069	.	T	A	44.6	PASS	AF=0.130435;AO=9;DP=69;FAO=9;FDP=69;FR=.;FRO=60;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=32;FSRR=28;FWDB=-0.0292434;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.098;QD=2.5857;RBI=0.0371514;REFB=-0.00126387;REVB=0.022914;RO=59;SAF=6;SAR=3;SRF=32;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155431;STB=0.619727;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=0.0240122;OID=.;OPOS=34725069;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:69:69:59:60:9:9:0.130435:3:6:32:27:3:6:32:28
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chr9	34834494	.	C	T	729.21	PASS	AF=0.450867;AO=78;DP=173;FAO=78;FDP=173;FR=.;FRO=95;FSAF=42;FSAR=36;FSRF=46;FSRR=49;FWDB=0.0103182;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.602;QD=16.8603;RBI=0.0419042;REFB=-0.0113882;REVB=-0.040614;RO=95;SAF=42;SAR=36;SRF=46;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0536807;STB=0.529823;STBP=0.488;TYPE=snp;VARB=0.0131605;OID=.;OPOS=34834494;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:173:173:95:95:78:78:0.450867:36:42:46:49:36:42:46:49
chr9	34834880	.	A	C	88.22	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0321403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.447;QD=39.2068;RBI=0.0360218;REFB=0;REVB=-0.0162656;RO=0;SAF=8;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000159399;OID=.;OPOS=34834880;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:1:8:0:0:1:8:0:0
chr9	34835273	.	A	C	873.73	PASS	AF=0.486188;AO=88;DP=183;FAO=88;FDP=181;FR=.;FRO=93;FSAF=33;FSAR=55;FSRF=40;FSRR=53;FWDB=0.00164148;FXX=0.0216205;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.964;QD=19.309;RBI=0.00368276;REFB=-0.00851434;REVB=0.00329671;RO=90;SAF=33;SAR=55;SRF=37;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0350029;STB=0.529746;STBP=0.469;TYPE=snp;VARB=0.00744675;OID=.;OPOS=34835273;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:183:181:90:93:88:88:0.486188:55:33:37:53:55:33:40:53
chr9	34835861	.	C	G	223.14	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0119842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.96;QD=49.5859;RBI=0.012737;REFB=0;REVB=0.00431393;RO=0;SAF=10;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000142098;OID=.;OPOS=34835861;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:8:10:0:0:8:10:0:0
chr9	34978431	.	G	A	949.02	PASS	AF=0.970588;AO=64;DP=69;FAO=66;FDP=68;FR=.;FRO=2;FSAF=39;FSAR=27;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0291734;FXX=0.0144907;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.252;QD=55.8249;RBI=0.0354449;REFB=0.00756224;REVB=-0.020131;RO=1;SAF=37;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0125954;STB=0.512496;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=-7.40735e-05;OID=.;OPOS=34978431;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:69:68:1:2:64:66:0.970588:27:37:1:0:27:39:2:0
chr9	35089403	.	G	A	519.71	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0261819;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.3219;QD=59.3949;RBI=0.0340515;REFB=0;REVB=0.0217719;RO=0;SAF=22;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.39865e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.39185e-05;OID=.;OPOS=35089403;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:13:22:0:0:13:22:0:0
chr9	35107858	.	C	T	364.95	PASS	AF=0.964286;AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0141952;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=256.772;QD=52.1355;RBI=0.0148675;REFB=0.00647071;REVB=0.00442029;RO=0;SAF=15;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.516117;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=6.24961e-07;OID=.;OPOS=35107858;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:28:28:0:1:27:27:0.964286:12:15:0:0:12:15:1:0
chr9	35546735	.	A	G	447.02	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0019536;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.499;QD=57.6803;RBI=0.00835357;REFB=0;REVB=-0.00812192;RO=0;SAF=16;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.06407e-05;OID=.;OPOS=35546735;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:15:16:0:0:15:16:0:0
chr9	35660990	.	A	G	636.97	PASS	AF=1;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000240799;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.163;QD=62.1439;RBI=0.0278493;REFB=0;REVB=-0.0278483;RO=0;SAF=24;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.2194e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000655152;OID=.;OPOS=35660990;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:41:0:0:41:41:1:17:24:0:0:17:24:0:0
chr9	35662251	.	T	C	1069.22	PASS	AF=0.986301;AO=72;DP=74;FAO=72;FDP=73;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.02437;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.0251;QD=58.5876;RBI=0.0440148;REFB=0.135104;REVB=0.0366525;RO=1;SAF=33;SAR=39;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0141159;STB=0.507461;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=-0.00215486;OID=.;OPOS=35662251;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:74:73:1:1:72:72:0.986301:39:33:1:0:39:33:1:0
chr9	35674101	.	T	C	721.39	PASS	AF=0.981481;AO=49;DP=50;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00214294;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=37.2257;QD=53.4359;RBI=0.0329856;REFB=0.00308282;REVB=-0.0329159;RO=1;SAF=19;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0241219;STB=0.511107;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=-0.00121705;OID=.;OPOS=35674101;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:50:54:1:1:49:53:0.981481:30:19:1:0:31:22:1:0
chr9	35674175	.	A	T	35.37	PASS	AF=0.116667;AO=7;DP=60;FAO=7;FDP=60;FR=.;FRO=53;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=21;FSRR=32;FWDB=0.0257749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.326;QD=2.35831;RBI=0.0277628;REFB=-0.000245755;REVB=-0.0103163;RO=52;SAF=3;SAR=4;SRF=21;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0299807;STB=0.529329;STBP=0.887;TYPE=snp;VARB=0.00268949;OID=.;OPOS=35674175;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:60:60:52:53:7:7:0.116667:4:3:21:31:4:3:21:32
chr9	35674178	.	G	A	64.55	PASS	AF=0.180328;AO=11;DP=62;FAO=11;FDP=61;FR=.;FRO=50;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=21;FSRR=29;FWDB=0.0095086;FXX=0.0161264;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.1316;QD=4.23281;RBI=0.0547208;REFB=-0.0152562;REVB=0.0538883;RO=50;SAF=7;SAR=4;SRF=21;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.263675;STB=0.673163;STBP=0.24;TYPE=snp;VARB=0.0185856;OID=.;OPOS=35674178;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:62:61:50:50:11:11:0.180328:4:7:21:29:4:7:21:29
chr9	35674185	.	C	T	82.15	PASS	AF=0.216667;AO=13;DP=61;FAO=13;FDP=60;FR=.;FRO=47;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=18;FSRR=29;FWDB=-0.0119092;FXX=0.0163908;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.3763;QD=5.47675;RBI=0.0473108;REFB=-0.00746011;REVB=0.0457873;RO=48;SAF=9;SAR=4;SRF=19;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.357617;STB=0.732991;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.0260039;OID=.;OPOS=35674185;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:82:61:60:48:47:13:13:0.216667:4:9:19:29:4:9:18:29
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chr9	35674347	.	A	T	729.49	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00930596;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.5666;QD=63.4339;RBI=0.00935347;REFB=0;REVB=-0.000941612;RO=0;SAF=31;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.8085e-05;OID=.;OPOS=35674347;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:15:31:0:0:15:31:0:0
chr9	35675852	.	C	G	427.82	PASS	AF=0.939394;AO=31;DP=33;FAO=31;FDP=33;FR=.;FRO=2;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0129471;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=259.176;QD=51.8564;RBI=0.0402479;REFB=-0.0133334;REVB=0.0381087;RO=2;SAF=20;SAR=11;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0444006;STB=0.523794;STBP=0.416;TYPE=snp;VARB=0.000735036;OID=.;OPOS=35675852;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:33:33:2:2:31:31:0.939394:11:20:2:0:11:20:2:0
chr9	35683240	.	T	TG	74.47	PASS	AF=0.933333;AO=9;DP=25;FAO=14;FDP=15;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0141821;FXX=0.062461;HRUN=8;LEN=1;MLLD=7.7592;QD=19.8585;RBI=0.228799;REFB=0.178708;REVB=0.228359;RO=14;SAF=5;SAR=4;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.270169;STB=0.533286;STBP=0.509;TYPE=ins;VARB=0.0192538;OID=.;OPOS=35683241;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.933333:9:25:14:15:1:7:7:0:1:5:14:5:4:4:10
chr9	35705759	.	G	A	1846.31	PASS	AF=1;AO=120;DP=120;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0340736;FXX=0.00826378;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.92;QD=61.5436;RBI=0.0360056;REFB=0;REVB=0.011636;RO=0;SAF=61;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.48055e-06;OID=.;OPOS=35705759;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:120:120:0:0:120:120:1:59:61:0:0:59:61:0:0
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chr9	35749845	.	G	C	736.57	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0118126;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=329.712;QD=56.6595;RBI=0.028034;REFB=0;REVB=0.0254237;RO=0;SAF=16;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.15223e-05;OID=.;OPOS=35749845;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:52:0:0:50:52:1:34:16:0:0:36:16:0:0
chr9	35802583	.	C	T	1135.13	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0556935;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.2967;QD=60.5404;RBI=0.0569472;REFB=0;REVB=0.0118836;RO=0;SAF=34;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000227346;OID=.;OPOS=35802583;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:41:34:0:0:41:34:0:0
chr9	35807401	.	AGCTGGGGCC	A	987.77	PASS	AF=1;AO=64;DP=70;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00456962;FXX=0.0289813;HRUN=1;LEN=9;MLLD=281.187;QD=58.9713;RBI=0.005406;REFB=0;REVB=0.0028885;RO=0;SAF=15;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=8.84957e-05;OID=.;OPOS=35807402;OREF=GCTGGGGCC;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:64:70:67:67:0:16:51:0:0:5:0:15:49:0:0
chr9	35810245	.	G	A	302.96	PASS	AF=0.574468;AO=27;DP=47;FAO=27;FDP=47;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=0.0174308;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=231.796;QD=25.7838;RBI=0.0333007;REFB=-0.02201;REVB=0.0283743;RO=20;SAF=9;SAR=18;SRF=6;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0291314;STB=0.516117;STBP=0.818;TYPE=snp;VARB=0.0152711;OID=.;OPOS=35810245;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:20:20:27:27:0.574468:18:9:6:14:18:9:6:14
chr9	35811485	.	ACCAGGACCAGAGCCAGGACCAGAG	ACCAGGACCAGAG,ACCAGGACCAGAGCCAGGACCAGGA	205.51	PASS	AF=0.882353,0.117647;AO=13,2;DP=18;FAO=15,2;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=8,0;FSAR=7,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0421593,0.0347192;FXX=0.105208;HRUN=2,1;LEN=12,2;MLLD=199.318,138.148;QD=48.3557;RBI=0.0516099,0.0372089;REFB=0,0;REVB=0.0297687,-0.0133821;RO=0;SAF=7,0;SAR=6,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.00570841,-0.00257;OID=.,.;OPOS=35811486,35811508;OREF=CCAGGACCAGAG,AG;OALT=-,GA;OMAPALT=ACCAGGACCAGAG,ACCAGGACCAGAGCCAGGACCAGGA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.882353,0.117647:13,2:18:15,2:17:0:8,0:7,2:0:0:11:0:7,0:6,2:0:0
chr9	35870001	.	T	C	375.67	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0345303;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.9403;QD=55.6542;RBI=0.0375232;REFB=0;REVB=0.014685;RO=0;SAF=8;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.06954e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00042995;OID=.;OPOS=35870001;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:19:8:0:0:19:8:0:0
chr9	35957355	.	G	A	190.27	PASS	AF=0.542857;AO=19;DP=35;FAO=19;FDP=35;FR=.;FRO=16;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.0115746;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.81;QD=21.7454;RBI=0.0261096;REFB=-0.0291019;REVB=0.0234039;RO=16;SAF=13;SAR=6;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160953;STB=0.59081;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.0220701;OID=.;OPOS=35957355;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:16:16:19:19:0.542857:6:13:8:8:6:13:8:8
chr9	35957669	.	T	C	134.24	PASS	AF=0.454545;AO=15;DP=33;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.00509553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.096;QD=16.2717;RBI=0.00684488;REFB=-0.00509646;REVB=0.00457033;RO=18;SAF=11;SAR=4;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.243262;STB=0.641056;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=0.0060063;OID=.;OPOS=35957669;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:18:18:15:15:0.454545:4:11:9:9:4:11:9:9
chr9	35958047	.	T	C	142.62	PASS	AF=0.4;AO=16;DP=40;FAO=16;FDP=40;FR=.;FRO=24;FSAF=2;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=17;FWDB=-0.0138866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.28;QD=14.262;RBI=0.0167064;REFB=-0.00650371;REVB=-0.009288;RO=24;SAF=2;SAR=14;SRF=7;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.285215;STB=0.66996;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=0.00902027;OID=.;OPOS=35958047;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:24:24:16:16:0.4:14:2:7:17:14:2:7:17
chr9	36169598	.	T	C	109.93	PASS	AF=0.433333;AO=13;DP=30;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=0.00672889;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.797;QD=14.6579;RBI=0.0381588;REFB=-0.00770527;REVB=0.0375609;RO=17;SAF=5;SAR=8;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.252173;STB=0.646244;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=0.0038283;OID=.;OPOS=36169598;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:17:17:13:13:0.433333:8:5:11:6:8:5:11:6
chr9	36211827	.	C	T	180.48	PASS	AF=0.422222;AO=19;DP=45;FAO=19;FDP=45;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.0200972;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.314;QD=16.0425;RBI=0.0226082;REFB=-0.0191115;REVB=0.0103554;RO=26;SAF=7;SAR=12;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0973853;STB=0.556037;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=0.0301224;OID=.;OPOS=36211827;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:26:26:19:19:0.422222:12:7:12:14:12:7:12:14
chr9	36674842	.	C	T	689.22	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00543068;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.701;QD=62.6561;RBI=0.0507604;REFB=0;REVB=-0.0504691;RO=0;SAF=30;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000403311;OID=.;OPOS=36674842;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:14:30:0:0:14:30:0:0
chr9	36840623	.	G	A	448.35	PASS	AF=0.970588;AO=31;DP=34;FAO=33;FDP=34;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0799557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.7466;QD=52.7475;RBI=0.0865697;REFB=-0.10137;REVB=0.0331872;RO=3;SAF=15;SAR=16;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.030003;STB=0.515142;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.00810674;OID=.;OPOS=36840623;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:34:34:3:1:31:33:0.970588:16:15:2:1:16:17:0:1
chr9	37429814	.	A	G	329.47	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0407455;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.162;QD=54.9118;RBI=0.0474456;REFB=0;REVB=0.0243082;RO=0;SAF=9;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00100448;OID=.;OPOS=37429814;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:15:9:0:0:15:9:0:0
chr9	37439784	.	GG	AC,GGAAAC	307.18	PASS	AF=0.0606061,0.727273;AO=2,22;DP=34;FAO=2,24;FDP=33;FR=.;FRO=7;FSAF=2,11;FSAR=0,13;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.011509,-0.00317722;FXX=0.0294031;HRUN=3,3;LEN=2,4;MLLD=170.743,218.273;QD=37.2342;RBI=0.0162859,0.00366118;REFB=-0.0235409,-0.0428036;REVB=0.0115227,0.00181921;RO=7;SAF=2,11;SAR=0,11;SRF=5;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.539624,-0.0945381;STB=0.992254,0.557593;STBP=0.347,0.252;TYPE=mnp,ins;VARB=0.00640205,0.01027;OID=.,.;OPOS=37439784,37439786;OREF=GG,-;OALT=AC,AAAC;OMAPALT=AC,GGAAAC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:45:34:33:7:7:2,22:2,24:0.0606061,0.727273:0,11:2,11:5:2:0,13:2,11:5:2
chr9	37441808	.	A	G	689.38	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.013048;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.831;QD=62.671;RBI=0.0130727;REFB=0;REVB=-0.000803286;RO=0;SAF=19;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.62283e-05;OID=.;OPOS=37441808;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:25:19:0:0:25:19:0:0
chr9	37486603	.	A	G	156.7	PASS	AF=0.53125;AO=16;DP=32;FAO=17;FDP=32;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.0280407;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.8291;QD=19.5873;RBI=0.0280982;REFB=-0.0341016;REVB=-0.00179519;RO=15;SAF=5;SAR=11;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142741;STB=0.590053;STBP=0.34;TYPE=snp;VARB=0.0364194;OID=.;OPOS=37486603;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:15:15:16:17:0.53125:11:5:7:8:12:5:7:8
chr9	37492721	.	G	A	270.77	PASS	AF=0.46875;AO=30;DP=64;FAO=30;FDP=64;FR=.;FRO=34;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=-0.0301962;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.571;QD=16.9228;RBI=0.0308211;REFB=0.00869307;REVB=0.00617479;RO=34;SAF=18;SAR=12;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0115537;STB=0.506489;STBP=0.937;TYPE=snp;VARB=-0.00857024;OID=.;OPOS=37492721;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:34:34:30:30:0.46875:12:18:20:14:12:18:20:14
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chr9	39118108	.	C	T	64.35	PASS	AF=0.727273;AO=8;DP=11;FAO=8;FDP=11;FR=.;FRO=3;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0228724;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.6574;QD=23.3998;RBI=0.0231216;REFB=0.0457337;REVB=-0.0033855;RO=3;SAF=6;SAR=2;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176687;STB=0.59978;STBP=0.538;TYPE=snp;VARB=-0.0204725;OID=.;OPOS=39118108;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:11:11:3:3:8:8:0.727273:2:6:3:0:2:6:3:0
chr9	39118196	.	C	A	45.66	PASS	AF=0.333333;AO=7;DP=21;FAO=7;FDP=21;FR=.;FRO=14;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=0.131683;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.0769;QD=8.69642;RBI=0.134335;REFB=0.0463556;REVB=0.0265599;RO=14;SAF=2;SAR=5;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.439136;STB=0.76852;STBP=0.114;TYPE=snp;VARB=-0.0810591;OID=.;OPOS=39118196;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:21:21:14:14:7:7:0.333333:5:2:10:4:5:2:10:4
chr9	39118205	.	G	T	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0153155;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=226.4;QD=51.9164;RBI=0.0509061;REFB=0;REVB=-0.0485476;RO=0;SAF=12;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000222583;OID=.;OPOS=39118205;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:9:12:0:0:9:12:0:0
chr9	39118207	.	A	G	269.06	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0384951;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.5459;QD=51.2486;RBI=0.0640697;REFB=0;REVB=0.0512157;RO=0;SAF=12;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00193563;OID=.;OPOS=39118207;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:9:12:0:0:9:12:0:0
chr9	39287976	.	C	T	463.79	PASS	AF=0.479167;AO=45;DP=96;FAO=46;FDP=96;FR=.;FRO=50;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=4;FSRR=46;FWDB=-0.0704986;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.816;QD=19.3246;RBI=0.0706246;REFB=0.00137358;REVB=-0.00421595;RO=50;SAF=20;SAR=25;SRF=4;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.372051;STB=0.697605;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=-0.00231358;OID=.;OPOS=39287976;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:96:50:50:45:46:0.479167:25:20:4:46:26:20:4:46
chr9	40503085	.	A	G	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0251043;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.998;QD=48.7371;RBI=0.0251058;REFB=0;REVB=0.00027602;RO=0;SAF=7;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000161864;OID=.;OPOS=40503085;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:10:7:0:0:10:7:0:0
chr9	40503105	.	G	C	83.48	PASS	AF=0.323529;AO=11;DP=34;FAO=11;FDP=34;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=0.0196062;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.8493;QD=9.82165;RBI=0.0358151;REFB=0.0159917;REVB=0.029972;RO=23;SAF=7;SAR=4;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.225056;STB=0.636116;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=-0.0175461;OID=.;OPOS=40503105;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:34:34:23:23:11:11:0.323529:4:7:10:13:4:7:10:13
chr9	40784182	.	TA	T,TG	1573.69	PASS	AF=0.020202,0.979798;AO=14,85;DP=99;FAO=2,97;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=0,46;FSAR=2,51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0673612,0.0669364;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=157.665,181.086;QD=63.5836;RBI=0.0673857,0.0673391;REFB=0,0;REVB=0.00181652,0.00735422;RO=0;SAF=11,35;SAR=3,50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.025849,0.000316371;OID=.,.;OPOS=40784183,40784183;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=T,TG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.020202,0.979798:14,85:99:2,97:99:0:0,46:2,51:0:0:3:0:11,35:3,50:0:0
chr9	43685298	.	G	T	417.71	PASS	AF=0.703704;AO=38;DP=54;FAO=38;FDP=54;FR=.;FRO=16;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=-0.0134047;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.8863;QD=30.9412;RBI=0.0250949;REFB=0.0431729;REVB=-0.0212148;RO=16;SAF=23;SAR=15;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0475305;STB=0.52576;STBP=0.59;TYPE=snp;VARB=-0.0181959;OID=.;OPOS=43685298;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:16:16:38:38:0.703704:15:23:11:5:15:23:11:5
chr9	43818062	.	T	A	465.14	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0120938;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.227;QD=58.1421;RBI=0.0162049;REFB=0;REVB=0.0107861;RO=0;SAF=18;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.33988e-06;OID=.;OPOS=43818062;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:14:18:0:0:14:18:0:0
chr9	43822668	.	C	T	72.47	PASS	AF=0.357143;AO=9;DP=27;FAO=10;FDP=28;FR=.,HEALED;FRO=18;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=0.00594665;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.821;QD=10.3523;RBI=0.0153148;REFB=0.00263271;REVB=-0.0141131;RO=15;SAF=7;SAR=2;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147874;STB=0.564382;STBP=0.635;TYPE=snp;VARB=-0.000556508;OID=.;OPOS=43822668;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:27:28:15:18:9:10:0.357143:2:7:10:5:3:7:11:7
chr9	43822686	.	C	A	186.62	PASS	AF=0.666667;AO=18;DP=27;FAO=18;FDP=27;FR=.;FRO=9;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=0.0171073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.591;QD=27.647;RBI=0.026805;REFB=0.013662;REVB=0.0206361;RO=9;SAF=11;SAR=7;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108425;STB=0.559936;STBP=0.417;TYPE=snp;VARB=-0.00569596;OID=.;OPOS=43822686;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:27:27:9:9:18:18:0.666667:7:11:7:2:7:11:7:2
chr9	43822704	.	G	A	144.18	PASS	AF=0.625;AO=15;DP=24;FAO=15;FDP=24;FR=.;FRO=9;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=-0.00814152;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.741;QD=24.0306;RBI=0.00842828;REFB=0.0019245;REVB=0.00217983;RO=9;SAF=10;SAR=5;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0864865;STB=0.548325;STBP=0.628;TYPE=snp;VARB=-0.00469647;OID=.;OPOS=43822704;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:24:24:9:9:15:15:0.625:5:10:7:2:5:10:7:2
chr9	43822762	.	C	T	61.38	PASS	AF=0.615385;AO=8;DP=13;FAO=8;FDP=13;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0160821;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.962;QD=18.8867;RBI=0.0233827;REFB=0.015134;REVB=-0.016974;RO=5;SAF=4;SAR=4;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199671;STB=0.615111;STBP=0.345;TYPE=snp;VARB=-0.00210966;OID=.;OPOS=43822762;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:13:13:5:5:8:8:0.615385:4:4:4:1:4:4:4:1
chr9	44850313	.	C	T	47.81	PASS	AF=0.4375;AO=6;DP=15;FAO=7;FDP=16;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.00491763;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.905;QD=11.9522;RBI=0.0316985;REFB=-0.0204059;REVB=0.0313147;RO=9;SAF=3;SAR=3;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162993;STB=0.555401;STBP=0.713;TYPE=snp;VARB=0.0384556;OID=.;OPOS=44850313;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:15:16:9:9:6:7:0.4375:3:3:6:3:3:4:6:3
chr9	66457388	.	T	G	54.66	PASS	AF=0.333333;AO=8;DP=24;FAO=8;FDP=24;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=0;FSRF=16;FSRR=0;FWDB=-0.000572208;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=341.054;QD=9.1097;RBI=0.000572208;REFB=-0.00483637;REVB=0;RO=16;SAF=8;SAR=0;SRF=16;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.011169;OID=.;OPOS=66457388;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:24:24:16:16:8:8:0.333333:0:8:16:0:0:8:16:0
chr9	66457440	.	A	G	32.47	PASS	AF=0.101695;AO=6;DP=59;FAO=6;FDP=59;FR=.;FRO=53;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=28;FSRR=25;FWDB=0.00222243;FXX=0.0327815;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.76;QD=2.20137;RBI=0.0022689;REFB=-0.00193643;REVB=-0.000456843;RO=53;SAF=1;SAR=5;SRF=28;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.414062;STB=0.827467;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=0.0150042;OID=.;OPOS=66457440;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:32:59:59:53:53:6:6:0.101695:5:1:28:25:5:1:28:25
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chr9	66457593	.	CAG	CGA,CGG	824.36	PASS	AF=0,0.802632;AO=4,51;DP=77;FAO=0,61;FDP=76;FR=.,HEALED;FRO=11;FSAF=0,20;FSAR=0,41;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=-0.0469398,-0.00636737;FXX=0.0129853;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=59.7534,157.388;QD=43.3873;RBI=0.0902381,0.0458047;REFB=0.0517706,-0.0590051;REVB=-0.0770686,0.04536;RO=11;SAF=1,18;SAR=3,33;SRF=4;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.145094,-0.00387399;STB=0.5,0.506171;STBP=1,0.805;TYPE=mnp,snp;VARB=0,0.0122426;OID=.,.;OPOS=66457594,66457594;OREF=AG,A;OALT=GA,G;OMAPALT=CGA,CGG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,0.802632:4,51:77:0,61:76:11:0,20:0,41:4:7:57:11:1,18:3,33:4:7
chr9	66458150	.	C	T	120.05	PASS	AF=0.130233;AO=28;DP=214;FAO=28;FDP=215;FR=.;FRO=187;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=104;FSRR=83;FWDB=-0.017892;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.987;QD=2.23353;RBI=0.0179653;REFB=-0.00289571;REVB=0.00162056;RO=184;SAF=16;SAR=12;SRF=102;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0219227;STB=0.513504;STBP=0.875;TYPE=snp;VARB=0.0198332;OID=.;OPOS=66458150;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:214:215:184:187:28:28:0.130233:12:16:102:82:12:16:104:83
chr9	66458154	.	A	AC	61.99	PASS	AF=0.151659;AO=31;DP=217;FAO=32;FDP=211;FR=.;FRO=179;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=106;FSRR=73;FWDB=0.0333581;FXX=0.0276485;HRUN=2;LEN=1;MLLD=23.5789;QD=1.17515;RBI=0.0418802;REFB=0.0031225;REVB=-0.0253217;RO=181;SAF=12;SAR=19;SRF=105;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.242859;STB=0.678834;STBP=0.033;TYPE=ins;VARB=-0.0201116;OID=.;OPOS=66458155;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.151659:31:217:32:211:179:12:20:106:73:61:181:12:19:105:76
chr9	66458175	.	C	T	41.17	PASS	AF=0.0717489;AO=16;DP=223;FAO=16;FDP=223;FR=.;FRO=207;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=113;FSRR=94;FWDB=0.0530194;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.7609;QD=0.738415;RBI=0.0549696;REFB=0.00346756;REVB=0.0145122;RO=207;SAF=5;SAR=11;SRF=113;SRR=94;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.254238;STB=0.711755;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=-0.040703;OID=.;OPOS=66458175;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:223:223:207:207:16:16:0.0717489:11:5:113:94:11:5:113:94
chr9	66458183	.	A	G	59.89	PASS	AF=0.0896861;AO=14;DP=217;FAO=20;FDP=223;FR=.;FRO=203;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=106;FSRR=97;FWDB=0.0197288;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.5256;QD=1.07434;RBI=0.0243012;REFB=-0.00147013;REVB=0.0141888;RO=201;SAF=6;SAR=8;SRF=106;SRR=95;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104879;STB=0.610604;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=0.00822546;OID=.;OPOS=66458183;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:59:217:223:201:203:14:20:0.0896861:8:6:106:95:12:8:106:97
chr9	66458195	.	T	G	221.66	PASS	AF=0.188679;AO=36;DP=215;FAO=40;FDP=212;FR=.;FRO=172;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=92;FSRR=80;FWDB=-0.00423973;FXX=0.0139528;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.0842;QD=4.18223;RBI=0.00593871;REFB=-0.00388376;REVB=-0.00415848;RO=173;SAF=12;SAR=24;SRF=93;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.262466;STB=0.629347;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=0.0167296;OID=.;OPOS=66458195;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:215:212:173:172:36:40:0.188679:24:12:93:80:25:15:92:80
chr9	66458231	.	GCC	GC,GCG	1154.88	PASS	AF=0.712121,0.0227273;AO=86,11;DP=138;FAO=94,3;FDP=132;FR=.;FRO=35;FSAF=53,0;FSAR=41,3;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=0.0221374,0.0231388;FXX=0.114086;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=26.3015,18.9567;QD=34.9964;RBI=0.0690147,0.0765683;REFB=-0.0165063,-0.0299544;REVB=-0.0653679,-0.0729884;RO=32;SAF=51,2;SAR=35,9;SRF=16;SRR=16;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0482675,-0.415575;STB=0.521423,0.996337;STBP=0.455,0.079;TYPE=del,snp;VARB=0.00194554,0.00397048;OID=.,.;OPOS=66458232,66458233;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=GC,GCG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.712121,0.0227273:86,11:138:94,3:132:35:53,0:41,3:17:18:99:32:51,2:35,9:16:16
chr9	66458245	.	G	A	61.35	PASS	AF=0.113636;AO=15;DP=132;FAO=15;FDP=132;FR=.;FRO=117;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=61;FSRR=56;FWDB=0.0524803;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.011;QD=1.85904;RBI=0.0541955;REFB=-0.00278732;REVB=0.0135266;RO=117;SAF=10;SAR=5;SRF=61;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180566;STB=0.631945;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=0.029736;OID=.;OPOS=66458245;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:132:132:117:117:15:15:0.113636:5:10:61:56:5:10:61:56
chr9	66499220	.	C	T	104.16	PASS	AF=0.204819;AO=17;DP=83;FAO=17;FDP=83;FR=.;FRO=66;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=27;FSRR=39;FWDB=0.000873181;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.699;QD=5.01954;RBI=0.0142095;REFB=-0.0106642;REVB=0.0141827;RO=65;SAF=7;SAR=10;SRF=27;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00466993;STB=0.502194;STBP=0.995;TYPE=snp;VARB=0.0335552;OID=.;OPOS=66499220;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:65:66:17:17:0.204819:10:7:27:38:10:7:27:39
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chr9	79121906	.	C	T	651.22	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00251207;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.6802;QD=62.0205;RBI=0.0223865;REFB=0;REVB=-0.0222451;RO=0;SAF=18;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000202982;OID=.;OPOS=79121906;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:24:18:0:0:24:18:0:0
chr9	79186658	.	T	G	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.074;QD=33.4284;RBI=0.0375578;REFB=0;REVB=0.0375578;RO=0;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00119234;OID=.;OPOS=79186658;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:6:0:0:0:6:0:0:0
chr9	79186729	.	T	C	483.35	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00400304;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.3097;QD=58.5873;RBI=0.0321958;REFB=0;REVB=0.031946;RO=0;SAF=28;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000141488;OID=.;OPOS=79186729;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:33:0:0:32:33:1:4:28:0:0:5:28:0:0
chr9	79186750	.	G	T	770.63	PASS	AF=0.982143;AO=55;DP=56;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00296205;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=222.675;QD=55.0448;RBI=0.0308423;REFB=-0.0224955;REVB=0.0306998;RO=1;SAF=42;SAR=13;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.034876;STB=0.518512;STBP=0.161;TYPE=snp;VARB=0.000145777;OID=.;OPOS=79186750;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:56:56:1:1:55:55:0.982143:13:42:0:1:13:42:0:1
chr9	79186765	.	C	G	811.63	PASS	AF=0.884058;AO=61;DP=69;FAO=61;FDP=69;FR=.;FRO=8;FSAF=45;FSAR=16;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=0.0239691;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.692;QD=47.0511;RBI=0.0403615;REFB=-0.0737635;REVB=0.0324736;RO=8;SAF=45;SAR=16;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00346647;STB=0.501844;STBP=0.987;TYPE=snp;VARB=0.0080285;OID=.;OPOS=79186765;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:69:69:8:8:61:61:0.884058:16:45:6:2:16:45:6:2
chr9	79186781	.	T	C	890.78	PASS	AF=0.88;AO=66;DP=75;FAO=66;FDP=75;FR=.;FRO=9;FSAF=48;FSAR=18;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=-0.0278466;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.7432;QD=47.5083;RBI=0.028813;REFB=-0.0391269;REVB=0.00739972;RO=9;SAF=48;SAR=18;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0144671;STB=0.50769;STBP=0.713;TYPE=snp;VARB=0.0146801;OID=.;OPOS=79186781;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:75:75:9:9:66:66:0.88:18:48:7:2:18:48:7:2
chr9	79186787	.	C	T	178.63	PASS	AF=0.292683;AO=24;DP=83;FAO=24;FDP=82;FR=.;FRO=58;FSAF=19;FSAR=5;FSRF=43;FSRR=15;FWDB=0.00923949;FXX=0.0120467;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.91;QD=8.71367;RBI=0.016379;REFB=0.000995604;REVB=-0.0135242;RO=58;SAF=19;SAR=5;SRF=43;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0846248;STB=0.55068;STBP=0.636;TYPE=snp;VARB=-0.00297488;OID=.;OPOS=79186787;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:82:58:58:24:24:0.292683:5:19:43:15:5:19:43:15
chr9	79186820	.	A	C	1518.85	PASS	AF=0.842105;AO=112;DP=133;FAO=112;FDP=133;FR=.;FRO=21;FSAF=92;FSAR=20;FSRF=17;FSRR=4;FWDB=-0.00523545;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.5948;QD=45.6796;RBI=0.0580071;REFB=-0.017471;REVB=-0.0577704;RO=20;SAF=92;SAR=20;SRF=17;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0140509;STB=0.50319;STBP=0.919;TYPE=snp;VARB=0.00519062;OID=.;OPOS=79186820;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:133:133:20:21:112:112:0.842105:20:92:17:3:20:92:17:4
chr9	79186886	.	C	G	104.58	PASS	AF=0.371429;AO=12;DP=34;FAO=13;FDP=35;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=18;FSRR=4;FWDB=0.034208;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.2772;QD=11.9522;RBI=0.0342244;REFB=0.0047865;REVB=0.00105883;RO=22;SAF=7;SAR=5;SRF=18;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.283314;STB=0.643374;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=-0.00602216;OID=.;OPOS=79186886;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:35:22:22:12:13:0.371429:5:7:18:4:5:8:18:4
chr9	79186890	.	T	G	35.56	PASS	AF=0.24;AO=6;DP=25;FAO=6;FDP=25;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=16;FSRR=3;FWDB=0.0218549;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.1339;QD=5.68904;RBI=0.0710329;REFB=-0.0114231;REVB=0.0675873;RO=19;SAF=4;SAR=2;SRF=16;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.265763;STB=0.666221;STBP=0.48;TYPE=snp;VARB=0.0423552;OID=.;OPOS=79186890;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:25:25:19:19:6:6:0.24:2:4:16:3:2:4:16:3
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chr9	79325297	.	T	G	1697.42	PASS	AF=0.991228;AO=113;DP=113;FAO=113;FDP=114;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=67;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0301114;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.313;QD=59.5586;RBI=0.0373562;REFB=-0.118641;REVB=0.0221085;RO=0;SAF=46;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.40416e-08;STB=0.505375;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=0.000643905;OID=.;OPOS=79325297;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:113:114:0:1:113:113:0.991228:67:46:0:0:67:46:1:0
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chr9	91652414	.	A	T	766.75	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0237349;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.51;QD=63.8956;RBI=0.0337978;REFB=0;REVB=0.0240612;RO=0;SAF=24;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.08084e-05;OID=.;OPOS=91652414;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:48:0:0:47:48:1:23:24:0:0:23:25:0:0
chr9	91656963	.	T	C	1198.4	PASS	AF=1;AO=79;DP=80;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0116144;FXX=0.0124984;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.725;QD=60.6787;RBI=0.0118287;REFB=-0.0578138;REVB=0.00224125;RO=0;SAF=50;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000118722;OID=.;OPOS=91656963;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:80:79:0:0:79:79:1:29:50:0:0:29:50:0:0
chr9	91978397	.	C	T	324.46	PASS	AF=0.568966;AO=33;DP=58;FAO=33;FDP=58;FR=.;FRO=25;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=0.100109;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=40.1691;QD=22.3767;RBI=0.100827;REFB=0.0328957;REVB=0.0120144;RO=24;SAF=15;SAR=18;SRF=7;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12739;STB=0.55907;STBP=0.33;TYPE=snp;VARB=-0.0234295;OID=.;OPOS=91978397;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:24:25:33:33:0.568966:18:15:7:17:18:15:8:17
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chr9	94456702	.	ATTT	ATTA,ATT,ATTTA	126.88	PASS	AF=0.175,0.25,0;AO=6,7,9;DP=40;FAO=7,10,0;FDP=40;FR=.;FRO=23;FSAF=3,7,0;FSAR=4,3,0;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=-0.125996,-0.014303,-0.264;FXX=0;HRUN=3,3,7;LEN=1,1,1;MLLD=22.3816,20.3115,5.75488;QD=12.6881;RBI=0.178321,0.104712,0.428113;REFB=1.80944e-05,0.0243259,-0.0280669;REVB=-0.126187,0.10373,-0.337023;RO=13;SAF=5,5,6;SAR=1,2,3;SRF=7;SRR=6;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.375164,0.199998,0.13422;STB=0.635141,0.57128,0.5;STBP=0.479,0.609,1;TYPE=snp,del,ins;VARB=-0.0319251,-0.085182,0.0253077;OID=.,.,.;OPOS=94456705,94456703,94456706;OREF=T,T,-;OALT=A,-,A;OMAPALT=ATTA,ATT,ATTTA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0.175,0.25,0:6,7,9:40:7,10,0:40:23:3,7,0:4,3,0:14:9:46:13:5,5,6:1,2,3:7:6
chr9	94456714	.	C	T	156.26	PASS	AF=0.425;AO=17;DP=40;FAO=17;FDP=40;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=0.000382303;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=324.581;QD=15.626;RBI=0.000716245;REFB=-0.00305415;REVB=-0.000605682;RO=22;SAF=10;SAR=7;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00270738;STB=0.512181;STBP=0.899;TYPE=snp;VARB=0.00401564;OID=.;OPOS=94456714;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:22:23:17:17:0.425:7:10:13:9:7:10:14:9
chr9	94486321	.	C	T	112.21	PASS	AF=0.481481;AO=13;DP=27;FAO=13;FDP=27;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=-0.00676046;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.135;QD=16.6238;RBI=0.0108057;REFB=-0.00204333;REVB=-0.00842969;RO=14;SAF=8;SAR=5;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0262873;STB=0.515128;STBP=0.858;TYPE=snp;VARB=0.00329293;OID=.;OPOS=94486321;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:14:14:13:13:0.481481:5:8:9:5:5:8:9:5
chr9	94486688	.	G	A	37.56	PASS	AF=0.4;AO=5;DP=14;FAO=6;FDP=15;FR=.;FRO=9;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=1;FWDB=0.0190207;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.307;QD=10.0164;RBI=0.0454842;REFB=-0.000638343;REVB=0.0413161;RO=9;SAF=1;SAR=4;SRF=8;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.622566;STB=0.881272;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.00433038;OID=.;OPOS=94486688;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:14:15:9:9:5:6:0.4:4:1:8:1:5:1:8:1
chr9	94518328	.	C	T	596.76	PASS	AF=1;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00305508;FXX=0.0487686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.244;QD=61.2065;RBI=0.0164623;REFB=0;REVB=-0.0161764;RO=0;SAF=17;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000258904;OID=.;OPOS=94518328;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:39:0:0:39:39:1:22:17:0:0:22:17:0:0
chr9	94985637	.	T	C	141.96	PASS	AF=0.390244;AO=16;DP=41;FAO=16;FDP=41;FR=.;FRO=25;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.00431558;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=295.173;QD=13.8496;RBI=0.0179837;REFB=-0.0111042;REVB=-0.0174582;RO=25;SAF=8;SAR=8;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0628047;STB=0.53654;STBP=0.707;TYPE=snp;VARB=0.0177908;OID=.;OPOS=94985637;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:25:25:16:16:0.390244:8:8:14:11:8:8:14:11
chr9	95005537	.	A	C	236.26	PASS	AF=0.481481;AO=26;DP=54;FAO=26;FDP=54;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=0.0255275;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.8883;QD=17.5005;RBI=0.0273928;REFB=-0.00738479;REVB=-0.00993539;RO=28;SAF=12;SAR=14;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00254653;STB=0.501432;STBP=0.978;TYPE=snp;VARB=0.00957131;OID=.;OPOS=95005537;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:28:28:26:26:0.481481:14:12:13:15:14:12:13:15
chr9	95063947	.	C	T	291.27	PASS	AF=0.386364;AO=34;DP=88;FAO=34;FDP=88;FR=.;FRO=54;FSAF=10;FSAR=24;FSRF=29;FSRR=25;FWDB=-0.0125156;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.4954;QD=13.2395;RBI=0.0205493;REFB=-0.0117521;REVB=0.0162983;RO=53;SAF=10;SAR=24;SRF=28;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.262777;STB=0.656286;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.0133197;OID=.;OPOS=95063947;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:53:54:34:34:0.386364:24:10:28:25:24:10:29:25
chr9	95068046	.	C	T	1995.28	PASS	AF=1;AO=127;DP=128;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0237306;FXX=0.00775134;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.683;QD=62.3524;RBI=0.0247426;REFB=0;REVB=0.0070038;RO=0;SAF=68;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.42336e-05;OID=.;OPOS=95068046;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:128:128:0:0:127:128:1:59:68:0:0:59:69:0:0
chr9	95072907	.	G	C	286.46	PASS	AF=0.553191;AO=26;DP=47;FAO=26;FDP=47;FR=.;FRO=21;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=-0.0166407;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.3295;QD=24.3794;RBI=0.016929;REFB=-0.0131982;REVB=-0.00311099;RO=21;SAF=12;SAR=14;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125985;STB=0.569979;STBP=0.265;TYPE=snp;VARB=0.0127844;OID=.;OPOS=95072907;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:21:21:26:26:0.553191:14:12:13:8:14:12:13:8
chr9	95076665	.	C	G	311.66	PASS	AF=0.435897;AO=34;DP=77;FAO=34;FDP=78;FR=.;FRO=44;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=25;FSRR=19;FWDB=-0.00188637;FXX=0.0249969;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.8738;QD=15.9825;RBI=0.0173126;REFB=-0.0070407;REVB=0.0172095;RO=42;SAF=19;SAR=15;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0111409;STB=0.505357;STBP=0.953;TYPE=snp;VARB=0.00974549;OID=.;OPOS=95076665;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:78:42:44:34:34:0.435897:15:19:23:19:15:19:25:19
chr9	95077827	.	G	A	170.33	PASS	AF=0.45;AO=18;DP=40;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.0216846;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.464;QD=17.0333;RBI=0.0220719;REFB=-0.00335668;REVB=-0.00411702;RO=22;SAF=8;SAR=10;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0970462;STB=0.555494;STBP=0.565;TYPE=snp;VARB=0.00299757;OID=.;OPOS=95077827;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:22:22:18:18:0.45:10:8:12:10:10:8:12:10
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chr9	95147434	.	C	T	182.98	PASS	AF=0.452381;AO=19;DP=42;FAO=19;FDP=42;FR=.;FRO=23;FSAF=4;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=0.0329573;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.208;QD=17.4267;RBI=0.033583;REFB=0.00137377;REVB=-0.00645226;RO=23;SAF=4;SAR=15;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123173;STB=0.570854;STBP=0.492;TYPE=snp;VARB=-0.0018048;OID=.;OPOS=95147434;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:23:23:19:19:0.452381:15:4:7:16:15:4:7:16
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chr9	95218829	.	G	T	729.0	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103291;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.269;QD=57.1766;RBI=0.0253078;REFB=0;REVB=0.0231039;RO=0;SAF=22;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000122465;OID=.;OPOS=95218829;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:29:22:0:0:29:22:0:0
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chr9	100388197	.	C	T	467.73	PASS	AF=0.494624;AO=46;DP=93;FAO=46;FDP=93;FR=.;FRO=47;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=26;FSRR=21;FWDB=0.00270568;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.659;QD=20.1174;RBI=0.0055885;REFB=0.00337408;REVB=-0.00488985;RO=47;SAF=26;SAR=20;SRF=26;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0111254;STB=0.50617;STBP=0.905;TYPE=snp;VARB=-0.00298548;OID=.;OPOS=100388197;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:47:47:46:46:0.494624:20:26:26:21:20:26:26:21
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chr9	100616583	.	T	C	223.19	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0273455;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.0115;QD=49.598;RBI=0.0296436;REFB=0;REVB=-0.0114441;RO=0;SAF=10;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000279972;OID=.;OPOS=100616583;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:8:10:0:0:8:10:0:0
chr9	100617375	.	T	C	1415.01	PASS	AF=1;AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00639714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.468;QD=62.8894;RBI=0.0320668;REFB=0;REVB=0.0314222;RO=0;SAF=43;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.16558e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.48159e-05;OID=.;OPOS=100617375;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:90:90:0:0:90:90:1:47:43:0:0:47:43:0:0
chr9	100617479	.	G	T	766.27	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0347237;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.231;QD=63.8562;RBI=0.0388378;REFB=0;REVB=-0.0173965;RO=0;SAF=20;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.56477e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.63732e-05;OID=.;OPOS=100617479;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:28:20:0:0:28:20:0:0
chr9	100617583	.	T	C	575.6	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00184883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.023;QD=60.589;RBI=0.00717465;REFB=0;REVB=0.00693234;RO=0;SAF=17;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.53998e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.80706e-05;OID=.;OPOS=100617583;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:21:17:0:0:21:17:0:0
chr9	100672338	.	C	T	270.04	PASS	AF=0.531915;AO=25;DP=47;FAO=25;FDP=47;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=4;FSRR=18;FWDB=0.00925542;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.049;QD=22.9824;RBI=0.0125541;REFB=-0.0044503;REVB=-0.00848193;RO=22;SAF=9;SAR=16;SRF=4;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172187;STB=0.595261;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=0.00399452;OID=.;OPOS=100672338;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:22:22:25:25:0.531915:16:9:4:18:16:9:4:18
chr9	100675816	.	A	G	50.16	PASS	AF=0.291667;AO=8;DP=28;FAO=7;FDP=24;FR=.,HEALED;FRO=16;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.00318059;FXX=0.11107;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.626;QD=8.3605;RBI=0.0322925;REFB=0.00483904;REVB=0.0321355;RO=15;SAF=4;SAR=4;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106688;STB=0.695633;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=-0.00252615;OID=.;OPOS=100675816;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:28:24:15:16:8:7:0.291667:4:4:6:9:2:5:7:9
chr9	100684719	.	A	C	261.78	PASS	AF=0.47541;AO=29;DP=61;FAO=29;FDP=61;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=12;FWDB=0.0032146;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.422;QD=17.1661;RBI=0.0291139;REFB=-0.0158754;REVB=-0.0289358;RO=32;SAF=14;SAR=15;SRF=20;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132582;STB=0.574274;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=0.0173631;OID=.;OPOS=100684719;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:32:32:29:29:0.47541:15:14:20:12:15:14:20:12
chr9	100684757	.	A	G	270.77	PASS	AF=0.46875;AO=30;DP=64;FAO=30;FDP=64;FR=.;FRO=34;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=21;FSRR=13;FWDB=-0.0105686;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.517;QD=16.923;RBI=0.0364502;REFB=-0.0161765;REVB=-0.0348844;RO=34;SAF=15;SAR=15;SRF=21;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111426;STB=0.562459;STBP=0.351;TYPE=snp;VARB=0.0145745;OID=.;OPOS=100684757;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:34:34:30:30:0.46875:15:15:21:13:15:15:21:13
chr9	100684778	.	C	T	265.72	PASS	AF=0.483333;AO=29;DP=60;FAO=29;FDP=60;FR=.;FRO=31;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=0.0079241;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.525;QD=17.7149;RBI=0.0173128;REFB=-0.0158361;REVB=0.0153929;RO=31;SAF=15;SAR=14;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0586526;STB=0.532849;STBP=0.654;TYPE=snp;VARB=0.0181314;OID=.;OPOS=100684778;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:31:31:29:29:0.483333:14:15:18:13:14:15:18:13
chr9	100819192	.	C	T	65.3	PASS	AF=0.375;AO=9;DP=24;FAO=9;FDP=24;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.00595687;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.029;QD=10.8829;RBI=0.0208089;REFB=-0.0225378;REVB=0.0199381;RO=15;SAF=4;SAR=5;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0469885;STB=0.52824;STBP=0.863;TYPE=snp;VARB=0.0303144;OID=.;OPOS=100819192;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:24:24:15:15:9:9:0.375:5:4:6:9:5:4:6:9
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chr9	101778265	.	G	T	206.93	PASS	AF=0.4375;AO=21;DP=48;FAO=21;FDP=48;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.0274329;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.7479;QD=17.2445;RBI=0.0382468;REFB=0.00490532;REVB=-0.0266505;RO=27;SAF=8;SAR=13;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0274036;STB=0.515643;STBP=0.881;TYPE=snp;VARB=-0.00786509;OID=.;OPOS=101778265;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:27:27:21:21:0.4375:13:8:11:16:13:8:11:16
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chr9	101822220	.	C	T	727.8	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00163662;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=294.616;QD=63.2868;RBI=0.00789328;REFB=0;REVB=0.00772174;RO=0;SAF=20;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.98769e-06;OID=.;OPOS=101822220;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:26:20:0:0:26:20:0:0
chr9	101831995	.	G	A	128.45	PASS	AF=0.538462;AO=14;DP=27;FAO=14;FDP=26;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.00620021;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.4082;QD=19.7607;RBI=0.0352897;REFB=-0.0118422;REVB=0.0347407;RO=11;SAF=8;SAR=6;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0910022;STB=0.533285;STBP=0.79;TYPE=snp;VARB=0.00454704;OID=.;OPOS=101831995;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:26:11:12:14:14:0.538462:6:8:5:6:6:8:6:6
chr9	101832262	.	A	AG	363.01	PASS	AF=0.97561;AO=6;DP=49;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0505083;FXX=0.108672;HRUN=1;LEN=1;MLLD=18.5446;QD=35.4156;RBI=0.229443;REFB=0.0153261;REVB=0.223815;RO=43;SAF=3;SAR=3;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0407581;STB=0.515144;STBP=0.293;TYPE=ins;VARB=0.0315543;OID=.;OPOS=101832263;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:0.97561:6:49:40:41:1:24:16:0:1:3:43:3:3:23:20
chr9	101832264	.	T	G	187.64	PASS	AF=0.478261;AO=20;DP=41;FAO=22;FDP=46;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=0.0232687;FXX=0;HRUN=12;LEN=1;MLLD=30.0514;QD=16.3164;RBI=0.0383994;REFB=-0.130201;REVB=0.0305464;RO=20;SAF=9;SAR=11;SRF=15;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.261958;STB=0.611664;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=0.125915;OID=.;OPOS=101832264;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:46:20:24:20:22:0.478261:11:9:15:5:13:9:15:9
chr9	102068344	.	C	G	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0443153;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.4136;QD=40.7628;RBI=0.103747;REFB=0;REVB=-0.0938058;RO=0;SAF=5;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00789264;OID=.;OPOS=102068344;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:5:5:0:0:5:5:0:0
chr9	102068832	.	G	A	2222.39	PASS	AF=0.979452;AO=141;DP=144;FAO=143;FDP=146;FR=.;FRO=3;FSAF=78;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0631477;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.507;QD=60.8873;RBI=0.0796142;REFB=-0.0915195;REVB=0.048485;RO=3;SAF=77;SAR=64;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0217627;STB=0.511277;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.00233588;OID=.;OPOS=102068832;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:144:146:3:3:141:143:0.979452:64:77:0:3:65:78:0:3
chr9	102595069	.	G	A	351.16	PASS	AF=0.474359;AO=37;DP=78;FAO=37;FDP=78;FR=.;FRO=41;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=12;FSRR=29;FWDB=-0.00207703;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=312.727;QD=18.0082;RBI=0.0122437;REFB=0.00173147;REVB=-0.0120663;RO=41;SAF=19;SAR=18;SRF=12;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.207607;STB=0.615378;STBP=0.069;TYPE=snp;VARB=-0.001842;OID=.;OPOS=102595069;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:41:41:37:37:0.474359:18:19:12:29:18:19:12:29
chr9	102713580	.	G	A	785.88	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0125983;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.398;QD=64.1534;RBI=0.0171246;REFB=0;REVB=-0.0115989;RO=0;SAF=22;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.30731e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000139971;OID=.;OPOS=102713580;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:27:22:0:0:27:22:0:0
chr9	102732237	.	T	C	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0515399;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.701;QD=59.4356;RBI=0.052124;REFB=0;REVB=0.00778174;RO=0;SAF=13;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.39865e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000186172;OID=.;OPOS=102732237;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:22:13:0:0:22:13:0:0
chr9	103060386	.	T	G	1025.04	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0188853;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.7466;QD=59.4228;RBI=0.0646941;REFB=0;REVB=0.0618763;RO=0;SAF=37;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000804343;OID=.;OPOS=103060386;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:32:37:0:0:32:37:0:0
chr9	103064530	.	G	A	446.81	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0166606;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.348;QD=57.6523;RBI=0.0205385;REFB=0;REVB=0.0120106;RO=0;SAF=15;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000166812;OID=.;OPOS=103064530;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:31:0:0:30:31:1:15:15:0:0:16:15:0:0
chr9	104133628	.	C	T	483.32	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000687225;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.332;QD=58.5845;RBI=0.0466429;REFB=0;REVB=0.0466378;RO=0;SAF=22;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000186444;OID=.;OPOS=104133628;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:11:22:0:0:11:22:0:0
chr9	104152790	.	G	C	302.24	PASS	AF=0.516129;AO=32;DP=62;FAO=32;FDP=62;FR=.;FRO=30;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=9;FSRR=21;FWDB=-0.0111012;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.041;QD=19.4992;RBI=0.0116538;REFB=-0.0162594;REVB=-0.00354606;RO=30;SAF=14;SAR=18;SRF=9;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123969;STB=0.568709;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=0.0156926;OID=.;OPOS=104152790;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:30:30:32:32:0.516129:18:14:9:21:18:14:9:21
chr9	104152846	.	G	A	412.73	PASS	AF=0.532468;AO=39;DP=74;FAO=41;FDP=77;FR=.;FRO=36;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=12;FSRR=24;FWDB=0.00590346;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.104;QD=21.4407;RBI=0.0102345;REFB=-0.0154226;REVB=0.0083603;RO=35;SAF=19;SAR=20;SRF=11;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148917;STB=0.572485;STBP=0.184;TYPE=snp;VARB=0.0142577;OID=.;OPOS=104152846;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:77:35:36:39:41:0.532468:20:19:11:24:21:20:12:24
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chr9	104433347	.	G	A	66.5	PASS	AF=0.8;AO=8;DP=10;FAO=8;FDP=10;FR=.;FRO=2;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0525473;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.108;QD=26.6016;RBI=0.0527754;REFB=-0.0207148;REVB=-0.00490141;RO=2;SAF=5;SAR=3;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0459355;STB=0.526249;STBP=0.896;TYPE=snp;VARB=0.0132088;OID=.;OPOS=104433347;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:10:10:2:2:8:8:0.8:3:5:1:1:3:5:1:1
chr9	104449063	.	C	T	449.73	PASS	AF=0.463918;AO=45;DP=91;FAO=45;FDP=97;FR=.;FRO=52;FSAF=32;FSAR=13;FSRF=39;FSRR=13;FWDB=-0.0285853;FXX=0.010203;HRUN=3;LEN=1;MLLD=138.42;QD=18.5457;RBI=0.041148;REFB=-0.032532;REVB=-0.0295979;RO=46;SAF=32;SAR=13;SRF=33;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0069865;STB=0.525915;STBP=0.7;TYPE=snp;VARB=0.0236646;OID=.;OPOS=104449063;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:97:46:52:45:45:0.463918:13:32:33:13:13:32:39:13
chr9	104449294	.	G	A	497.29	PASS	AF=0.602564;AO=46;DP=78;FAO=47;FDP=78;FR=.;FRO=31;FSAF=17;FSAR=30;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=0.00914362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.216;QD=25.502;RBI=0.0108748;REFB=-0.0148324;REVB=-0.00588696;RO=32;SAF=16;SAR=30;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0474454;STB=0.510859;STBP=0.835;TYPE=snp;VARB=0.010733;OID=.;OPOS=104449294;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:32:31:46:47:0.602564:30:16:13:19:30:17:12:19
chr9	104499575	.	T	C	2134.04	PASS	AF=1;AO=136;DP=136;FAO=136;FDP=136;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0401854;FXX=0.00729874;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.4575;QD=62.7657;RBI=0.040956;REFB=0;REVB=-0.00790759;RO=0;SAF=82;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000294331;OID=.;OPOS=104499575;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:136:136:0:0:136:136:1:54:82:0:0:54:82:0:0
chr9	105018910	.	A	C	173.12	PASS	AF=0.486486;AO=18;DP=36;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=0.0227096;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.191;QD=18.7161;RBI=0.0257223;REFB=-0.0140158;REVB=0.0120794;RO=18;SAF=8;SAR=10;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512182;STBP=0.906;TYPE=snp;VARB=0.0124647;OID=.;OPOS=105018910;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:37:18:19:18:18:0.486486:10:8:8:10:10:8:8:11
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chr9	105780618	.	G	A	2765.67	PASS	AF=1;AO=174;DP=174;FAO=177;FDP=177;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=97;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0437137;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.5561;QD=62.5009;RBI=0.0578155;REFB=0;REVB=0.0378383;RO=0;SAF=80;SAR=94;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000296376;OID=.;OPOS=105780618;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:15:174:177:0:0:174:177:1:94:80:0:0:97:80:0:0
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chr9	107360851	.	T	C	402.82	PASS	AF=0.488095;AO=41;DP=84;FAO=41;FDP=84;FR=.;FRO=43;FSAF=28;FSAR=13;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=0.000694101;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.496;QD=19.1818;RBI=0.0174496;REFB=-0.00742428;REVB=0.0174358;RO=43;SAF=28;SAR=13;SRF=22;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168782;STB=0.59421;STBP=0.127;TYPE=snp;VARB=0.00572358;OID=.;OPOS=107360851;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:43:43:41:41:0.488095:13:28:22:21:13:28:22:21
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chr9	107361129	.	C	T	270.76	PASS	AF=0.46875;AO=30;DP=64;FAO=30;FDP=64;FR=.;FRO=34;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=0.0114432;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.1263;QD=16.9228;RBI=0.0187674;REFB=-0.000284975;REVB=-0.0148752;RO=34;SAF=14;SAR=16;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0593248;STB=0.533311;STBP=0.662;TYPE=snp;VARB=0.00025346;OID=.;OPOS=107361129;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:34:34:30:30:0.46875:16:14:18:16:16:14:18:16
chr9	107361312	.	T	C	271.24	PASS	AF=0.793103;AO=17;DP=29;FAO=23;FDP=29;FR=.;FRO=6;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0373789;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.37;QD=37.4117;RBI=0.0403712;REFB=-0.00932476;REVB=0.0152529;RO=5;SAF=6;SAR=11;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0210576;STB=0.538888;STBP=0.453;TYPE=snp;VARB=0.00231427;OID=.;OPOS=107361312;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:29:29:5:6:17:23:0.793103:11:6:2:3:11:12:2:4
chr9	107361439	.	G	C	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0110493;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=232.829;QD=47.8218;RBI=0.0142306;REFB=0;REVB=0.00896783;RO=0;SAF=10;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000124259;OID=.;OPOS=107361439;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:6:10:0:0:6:10:0:0
chr9	107361451	.	GC	AG	153.08	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0587905;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=207.483;QD=40.8207;RBI=0.168526;REFB=0;REVB=0.157939;RO=0;SAF=10;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.0124491;OID=.;OPOS=107361451;OREF=GC;OALT=AG;OMAPALT=AG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:5:10:0:0:5:10:0:0
chr9	107361460	.	G	A	152.39	PASS	AF=0.933333;AO=14;DP=15;FAO=14;FDP=15;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0273239;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.8234;QD=40.6367;RBI=0.0314333;REFB=0.0294285;REVB=0.0155388;RO=0;SAF=9;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.526279;STBP=0.633;TYPE=snp;VARB=-0.0012195;OID=.;OPOS=107361460;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:15:15:0:1:14:14:0.933333:5:9:0:0:5:9:1:0
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chr9	107361599	.	G	C	283.84	PASS	AF=0.530612;AO=26;DP=49;FAO=26;FDP=49;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=-0.0116378;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.7279;QD=23.1703;RBI=0.0312914;REFB=-0.0669769;REVB=-0.0290468;RO=23;SAF=12;SAR=14;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0226847;STB=0.512649;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=0.0254054;OID=.;OPOS=107361599;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:23:23:26:26:0.530612:14:12:10:13:14:12:10:13
chr9	107361642	.	G	A	446.47	PASS	AF=0.517647;AO=42;DP=83;FAO=44;FDP=85;FR=.;FRO=41;FSAF=17;FSAR=27;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=0.00309843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.352;QD=21.0101;RBI=0.00312421;REFB=-0.00373562;REVB=0.000400497;RO=40;SAF=17;SAR=25;SRF=18;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0409486;STB=0.52645;STBP=0.656;TYPE=snp;VARB=0.0037995;OID=.;OPOS=107361642;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:85:40:41:42:44:0.517647:25:17:18:22:27:17:18:23
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chr9	107367390	.	GATGTTA	GA,GAT	177.62	PASS	AF=0.0175439,0.368421;AO=8,14;DP=58;FAO=1,21;FDP=57;FR=.;FRO=35;FSAF=1,13;FSAR=0,8;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=0.00715472,0.013526;FXX=0.0172384;HRUN=1,1;LEN=5,4;MLLD=239.995,257.617;QD=12.4645;RBI=0.0299042,0.0205051;REFB=-0.00539222,-0.0101347;REVB=-0.0290357,-0.0154113;RO=34;SAF=7,7;SAR=1,7;SRF=18;SRR=16;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.473149,-0.0343684;STB=0.989112,0.549248;STBP=0.47,0.583;TYPE=del,del;VARB=0.0169089,0.0216958;OID=.,.;OPOS=107367391,107367393;OREF=ATGTT,GTTA;OALT=-,-;OMAPALT=GA,GAT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0.0175439,0.368421:8,14:58:1,21:57:35:1,13:0,8:19:16:99:34:7,7:1,7:18:16
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chr9	107533175	.	C	G	390.43	PASS	AF=0.386555;AO=46;DP=120;FAO=46;FDP=119;FR=.;FRO=73;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=26;FSRR=47;FWDB=-0.0211121;FXX=0.00833264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.955;QD=13.1237;RBI=0.0286367;REFB=-0.00191609;REVB=-0.0193478;RO=73;SAF=23;SAR=23;SRF=26;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156021;STB=0.588198;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=0.0032537;OID=.;OPOS=107533175;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:119:73:73:46:46:0.386555:23:23:26:47:23:23:26:47
chr9	107562804	.	T	C	724.1	PASS	AF=0.959184;AO=47;DP=49;FAO=47;FDP=49;FR=.;FRO=2;FSAF=28;FSAR=19;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0118601;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=332.177;QD=59.1104;RBI=0.0120195;REFB=-0.123013;REVB=-0.0019514;RO=1;SAF=28;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.016502;STB=0.517234;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=0.000468887;OID=.;OPOS=107562804;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:49:49:1:2:47:47:0.959184:19:28:1:0:19:28:2:0
chr9	107568705	.	C	T	578.66	PASS	AF=0.537037;AO=58;DP=110;FAO=58;FDP=108;FR=.;FRO=50;FSAF=26;FSAR=32;FSRF=34;FSRR=16;FWDB=0.0155978;FXX=0.0181802;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.121;QD=21.4317;RBI=0.0191228;REFB=-0.0196272;REVB=0.011063;RO=50;SAF=26;SAR=32;SRF=34;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.193483;STB=0.606025;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0115398;OID=.;OPOS=107568705;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:108:50:50:58:58:0.537037:32:26:34:16:32:26:34:16
chr9	107586753	.	T	C	902.29	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00137513;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.98;QD=58.2123;RBI=0.0343673;REFB=0;REVB=0.0343398;RO=0;SAF=28;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000121172;OID=.;OPOS=107586753;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:34:28:0:0:34:28:0:0
chr9	107588033	.	C	T	267.09	PASS	AF=0.528302;AO=28;DP=53;FAO=28;FDP=53;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=7;FWDB=0.00945364;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.917;QD=20.1579;RBI=0.020734;REFB=0.0214048;REVB=-0.0184534;RO=25;SAF=13;SAR=15;SRF=18;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21474;STB=0.619093;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=-0.0106133;OID=.;OPOS=107588033;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:25:25:28:28:0.528302:15:13:18:7:15:13:18:7
chr9	107591272	.	G	T	1434.43	PASS	AF=1;AO=91;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00991971;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.566;QD=63.052;RBI=0.0136156;REFB=0;REVB=-0.00932657;RO=0;SAF=48;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.79498e-05;OID=.;OPOS=107591272;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:91:91:0:0:91:91:1:43:48:0:0:43:48:0:0
chr9	108152199	.	G	A	920.11	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00153562;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=295.02;QD=58.4197;RBI=0.00365236;REFB=0;REVB=-0.00331385;RO=0;SAF=31;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.65782e-06;OID=.;OPOS=108152199;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:32:31:0:0:32:31:0:0
chr9	108308662	.	G	T	159.29	PASS	AF=0.328125;AO=21;DP=64;FAO=21;FDP=64;FR=.;FRO=43;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=25;FWDB=-0.00894015;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.118;QD=9.95579;RBI=0.00983549;REFB=-0.00758908;REVB=0.00410007;RO=43;SAF=13;SAR=8;SRF=18;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.227475;STB=0.633552;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=0.018551;OID=.;OPOS=108308662;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:43:43:21:21:0.328125:8:13:18:25:8:13:18:25
chr9	108398331	.	T	G	379.46	PASS	AF=0.43956;AO=40;DP=91;FAO=40;FDP=91;FR=.;FRO=51;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=25;FSRR=26;FWDB=-0.0227271;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.9272;QD=16.6796;RBI=0.0245992;REFB=-0.0179284;REVB=0.00941275;RO=51;SAF=17;SAR=23;SRF=25;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0657524;STB=0.536946;STBP=0.575;TYPE=snp;VARB=0.0216262;OID=.;OPOS=108398331;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:51:51:40:40:0.43956:23:17:25:26:23:17:25:26
chr9	108425267	.	C	T	123.97	PASS	AF=0.482759;AO=14;DP=29;FAO=14;FDP=29;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.0124537;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.149;QD=17.0994;RBI=0.0143179;REFB=-0.0129464;REVB=0.0070646;RO=15;SAF=6;SAR=8;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0946828;STB=0.554377;STBP=0.612;TYPE=snp;VARB=0.0136034;OID=.;OPOS=108425267;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:15:15:14:14:0.482759:8:6:8:7:8:6:8:7
chr9	108536426	.	AT	A	58.71	PASS	AF=0.368421;AO=13;DP=38;FAO=14;FDP=38;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=0.0156149;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=14.943;QD=6.17984;RBI=0.201884;REFB=0.0154248;REVB=-0.20128;RO=21;SAF=8;SAR=5;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.242909;STB=0.622052;STBP=0.253;TYPE=del;VARB=-0.0604557;OID=.;OPOS=108536427;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.368421:13:38:14:38:24:8:6:9:15:58:21:8:5:8:13
chr9	109622255	.	C	T	377.54	PASS	AF=0.430108;AO=40;DP=93;FAO=40;FDP=93;FR=.;FRO=53;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=26;FSRR=27;FWDB=-0.0195731;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=255.174;QD=16.2384;RBI=0.0224059;REFB=-0.0114682;REVB=-0.0109048;RO=53;SAF=20;SAR=20;SRF=26;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00955005;STB=0.505374;STBP=0.965;TYPE=snp;VARB=0.0147611;OID=.;OPOS=109622255;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:53:53:40:40:0.430108:20:20:26:27:20:20:26:27
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chr9	109689859	.	T	C	226.43	PASS	AF=0.471698;AO=25;DP=53;FAO=25;FDP=53;FR=.;FRO=28;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.0131661;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.071;QD=17.0887;RBI=0.0131958;REFB=-0.0125207;REVB=0.000884253;RO=27;SAF=13;SAR=12;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00136784;STB=0.510566;STBP=0.851;TYPE=snp;VARB=0.0245425;OID=.;OPOS=109689859;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:27:28:25:25:0.471698:12:13:14:13:12:13:14:14
chr9	109690733	.	G	A	59.59	PASS	AF=0.209302;AO=9;DP=43;FAO=9;FDP=43;FR=.;FRO=34;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=25;FSRR=9;FWDB=-0.00361501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.694;QD=5.5434;RBI=0.011012;REFB=-0.00149435;REVB=-0.0104018;RO=33;SAF=7;SAR=2;SRF=24;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0820281;STB=0.545992;STBP=0.807;TYPE=snp;VARB=0.00334516;OID=.;OPOS=109690733;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:59:43:43:33:34:9:9:0.209302:2:7:24:9:2:7:25:9
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chr9	110084328	.	C	T	197.78	PASS	AF=0.425926;AO=23;DP=54;FAO=23;FDP=54;FR=.;FRO=31;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=0.013805;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.348;QD=14.6506;RBI=0.0155781;REFB=-0.00545745;REVB=0.00721794;RO=31;SAF=11;SAR=12;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102762;STB=0.558537;STBP=0.465;TYPE=snp;VARB=0.00706402;OID=.;OPOS=110084328;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:31:31:23:23:0.425926:12:11:18:13:12:11:18:13
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chr9	110425506	.	A	T	132.15	PASS	AF=0.636364;AO=14;DP=22;FAO=14;FDP=22;FR=.;FRO=8;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=0.0032037;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=253.62;QD=24.0275;RBI=0.00323546;REFB=-0.00880138;REVB=0.000452257;RO=8;SAF=11;SAR=3;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0334373;STB=0.51884;STBP=0.88;TYPE=snp;VARB=0.00559445;OID=.;OPOS=110425506;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:22:22:8:8:14:14:0.636364:3:11:6:2:3:11:6:2
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chr9	111618163	.	G	A	517.67	PASS	AF=0.947368;AO=36;DP=38;FAO=36;FDP=38;FR=.;FRO=2;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00994349;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=104.759;QD=54.4917;RBI=0.0261396;REFB=-0.000579897;REVB=0.0241745;RO=2;SAF=17;SAR=19;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00274091;STB=0.501465;STBP=0.863;TYPE=snp;VARB=0.00015479;OID=.;OPOS=111618163;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:38:38:2:2:36:36:0.947368:19:17:1:1:19:17:1:1
chr9	111618602	.	A	G	594.48	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0114852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.3383;QD=60.9728;RBI=0.0241741;REFB=0;REVB=-0.0212715;RO=0;SAF=23;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.43889e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.80881e-05;OID=.;OPOS=111618602;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:16:23:0:0:16:23:0:0
chr9	111618796	.	C	T	754.43	PASS	AF=1;AO=52;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0216582;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=206.339;QD=56.9383;RBI=0.0216988;REFB=0;REVB=-0.0013266;RO=0;SAF=24;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.03205e-05;OID=.;OPOS=111618796;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:52:53:1:28:24:0:0:28:25:0:0
chr9	111625259	.	G	A	279.6	PASS	AF=0.956522;AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00528322;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=270.183;QD=48.626;RBI=0.0581144;REFB=0.0473676;REVB=0.0578738;RO=1;SAF=15;SAR=7;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0298327;STB=0.516115;STBP=0.615;TYPE=snp;VARB=-0.000584807;OID=.;OPOS=111625259;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:23:23:1:1:22:22:0.956522:7:15:1:0:7:15:1:0
chr9	111625620	.	G	A	347.96	PASS	AF=0.962963;AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=27;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00818535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.612;QD=51.5495;RBI=0.042853;REFB=-0.168093;REVB=0.042064;RO=1;SAF=15;SAR=11;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.029965;STB=0.516117;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.00263584;OID=.;OPOS=111625620;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:27:27:1:1:26:26:0.962963:11:15:1:0:11:15:1:0
chr9	111625913	.	A	G	689.38	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0254457;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.369;QD=62.6708;RBI=0.0354988;REFB=0;REVB=0.0247524;RO=0;SAF=26;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0002855;OID=.;OPOS=111625913;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:18:26:0:0:18:26:0:0
chr9	111641806	.	G	A	329.71	PASS	AF=0.771429;AO=27;DP=35;FAO=27;FDP=35;FR=.;FRO=8;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.0205387;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=236.786;QD=37.6808;RBI=0.0206226;REFB=-0.0267815;REVB=-0.00185836;RO=8;SAF=14;SAR=13;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0602461;STB=0.532745;STBP=0.494;TYPE=snp;VARB=0.00772712;OID=.;OPOS=111641806;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:51:35:35:8:8:27:27:0.771429:13:14:3:5:13:14:3:5
chr9	111641825	.	G	A	52.87	PASS	AF=0.266667;AO=8;DP=30;FAO=8;FDP=30;FR=.;FRO=22;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=-0.0237727;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=276.528;QD=7.04876;RBI=0.0270132;REFB=-0.00698987;REVB=-0.0128285;RO=22;SAF=3;SAR=5;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.246752;STB=0.655357;STBP=0.324;TYPE=snp;VARB=0.0189087;OID=.;OPOS=111641825;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:30:30:22:22:8:8:0.266667:5:3:13:9:5:3:13:9
chr9	111644396	.	G	A	139.54	PASS	AF=0.380952;AO=14;DP=40;FAO=16;FDP=42;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=0.0230345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.113;QD=13.2897;RBI=0.0272617;REFB=-0.00284794;REVB=0.0145812;RO=26;SAF=9;SAR=5;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.279725;STB=0.687266;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.00730459;OID=.;OPOS=111644396;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:42:26:26:14:16:0.380952:5:9:10:16:5:11:10:16
chr9	111651620	.	A	T	350.67	PASS	AF=0.417582;AO=38;DP=91;FAO=38;FDP=91;FR=.;FRO=53;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=31;FSRR=22;FWDB=0.00134658;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.8143;QD=15.4141;RBI=0.0110335;REFB=-3.95254e-05;REVB=-0.010951;RO=53;SAF=17;SAR=21;SRF=31;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141082;STB=0.579602;STBP=0.207;TYPE=snp;VARB=-8.85487e-05;OID=.;OPOS=111651620;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:53:53:38:38:0.417582:21:17:31:22:21:17:31:22
chr9	111659439	.	T	C	260.46	PASS	AF=0.416667;AO=30;DP=72;FAO=30;FDP=72;FR=.;FRO=42;FSAF=21;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=0.00302846;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=70.9862;QD=14.4699;RBI=0.00399854;REFB=0.0162631;REVB=0.00261089;RO=41;SAF=21;SAR=9;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.229201;STB=0.624913;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=-0.0128271;OID=.;OPOS=111659439;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:41:42:30:30:0.416667:9:21:20:21:9:21:21:21
chr9	111659483	.	T	G	1085.58	PASS	AF=0.974684;AO=71;DP=73;FAO=77;FDP=79;FR=.;FRO=2;FSAF=44;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0286256;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=109.766;QD=54.9659;RBI=0.035897;REFB=0.0442491;REVB=0.0216604;RO=2;SAF=43;SAR=28;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0325786;STB=0.514702;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.000472901;OID=.;OPOS=111659483;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:73:79:2:2:71:77:0.974684:28:43:0:2:33:44:0:2
chr9	111660851	.	C	T	551.23	PASS	AF=1;AO=36;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0147635;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.5089;QD=59.5921;RBI=0.0241334;REFB=0;REVB=-0.0190909;RO=0;SAF=8;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000483932;OID=.;OPOS=111660851;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:36:37:1:28:8:0:0:28:9:0:0
chr9	111679872	.	G	A	250.67	PASS	AF=0.42029;AO=29;DP=69;FAO=29;FDP=69;FR=.;FRO=40;FSAF=7;FSAR=22;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=-0.0218001;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.541;QD=14.5314;RBI=0.0277831;REFB=-0.00448867;REVB=-0.0172237;RO=39;SAF=7;SAR=22;SRF=18;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.2556;STB=0.640921;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.00516149;OID=.;OPOS=111679872;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:39:40:29:29:0.42029:22:7:18:21:22:7:18:22
chr9	111718134	.	AAT	AAA,AA,A	51.76	PASS	AF=0,0,0.20339;AO=3,8,13;DP=69;FAO=0,0,12;FDP=59;FR=.;FRO=47;FSAF=0,0,1;FSAR=0,0,11;FSRF=20;FSRR=27;FWDB=-0.0096868,-0.272409,-0.295153;FXX=0.0781128;HRUN=6,6,6;LEN=1,1,2;MLLD=16.0599,9.86473,19.7326;QD=3.50896;RBI=0.0354759,0.27701,0.295467;REFB=-0.013264,-0.0494207,-0.0362644;REVB=-0.0341278,-0.050275,-0.0136049;RO=38;SAF=0,3,3;SAR=3,5,10;SRF=14;SRR=24;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.46176,0.0085521,-0.198462;STB=0.5,0.5,0.858015;STBP=1,1,0.018;TYPE=snp,del,del;VARB=0,0,0.102842;OID=.,.,.;OPOS=111718136,111718136,111718135;OREF=T,T,AT;OALT=A,-,-;OMAPALT=AAA,AA,A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/3:0,0,0.20339:3,8,13:69:0,0,12:59:47:0,0,1:0,0,11:20:27:51:38:0,3,3:3,5,10:14:24
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chr9	111782670	.	G	A	133.85	PASS	AF=0.666667;AO=14;DP=21;FAO=14;FDP=21;FR=.;FRO=7;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.0816377;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=63.7246;QD=25.4942;RBI=0.121648;REFB=-0.00694554;REVB=0.090186;RO=7;SAF=9;SAR=5;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0454578;STB=0.52551;STBP=0.799;TYPE=snp;VARB=0.00394028;OID=.;OPOS=111782670;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:21:21:7:7:14:14:0.666667:5:9:4:3:5:9:4:3
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chr9	112629397	.	G	A,T	470.13	PASS	AF=0.685714,0.285714;AO=24,10;DP=34;FAO=24,10;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=14,4;FSAR=10,6;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0418923,0.0292291;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=113.606,48.8589;QD=53.7295;RBI=0.0438418,0.0545631;REFB=-0.143677,-0.123514;REVB=-0.0129282,-0.0460738;RO=0;SAF=14,4;SAR=10,6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.52379,0.538386;STBP=0.31,0.523;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00517044,0.0479285;OID=.,.;OPOS=112629397,112629397;OREF=G,G;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:70:34:35:0:1:24,10:24,10:0.685714,0.285714:10,6:14,4:0:0:10,6:14,4:0:1
chr9	112629858	.	A	G	483.34	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00580466;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.766;QD=58.5872;RBI=0.0533804;REFB=0;REVB=0.0530638;RO=0;SAF=18;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.64315e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000136839;OID=.;OPOS=112629858;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:15:18:0:0:15:18:0:0
chr9	112710511	.	CAAAAT	CAAAT,CAAATA,CCAAAT	248.97	PASS	AF=0.555556,0.031746,0;AO=27,4,3;DP=65;FAO=35,2,0;FDP=63;FR=.;FRO=26;FSAF=8,2,0;FSAR=27,0,0;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=0.143694,0.0297101,0.0790859;FXX=0.0307645;HRUN=4,4,4;LEN=1,2,1;MLLD=16.3846,21.0069,20.4354;QD=15.8077;RBI=0.174499,0.104135,0.0793666;REFB=-0.0402025,-0.0118371,-0.00266809;REVB=-0.0990042,-0.0998074,0.00666876;RO=25;SAF=6,3,0;SAR=21,1,3;SRF=10;SRR=15;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.192909,0.384338,-0.532459;STB=0.604176,0.99539,0.5;STBP=0.092,0.096,1;TYPE=del,mnp,snp;VARB=0.0505737,-0.0454822,0;OID=.,.,.;OPOS=112710512,112710515,112710512;OREF=A,AT,A;OALT=-,TA,C;OMAPALT=CAAAT,CAAATA,CCAAAT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.555556,0.031746,0:27,4,3:65:35,2,0:63:26:8,2,0:27,0,0:11:15:99:25:6,3,0:21,1,3:10:15
chr9	112713075	.	C	CA,CAA	449.66	PASS	AF=1,0;AO=36,5;DP=50;FAO=44,0;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=22,0;FSAR=22,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.139449,-0.0738808;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=1,2;MLLD=17.5064,9.01091;QD=40.8786;RBI=0.176058,0.0930718;REFB=0,0;REVB=-0.107472,-0.0566037;RO=9;SAF=18,3;SAR=18,2;SRF=6;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0618124,-0.0717807;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,ins;VARB=-0.00730757,0;OID=.,.;OPOS=112713076,112713076;OREF=-,-;OALT=A,AA;OMAPALT=CA,CAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1,0:36,5:50:44,0:44:0:22,0:22,0:0:0:9:9:18,3:18,2:6:3
chr9	112899361	.	A	C	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00820119;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.952;QD=59.4356;RBI=0.0476191;REFB=0;REVB=0.0469075;RO=0;SAF=24;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000212624;OID=.;OPOS=112899361;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:11:24:0:0:11:24:0:0
chr9	112900340	.	AG	AGGAAGCT,CT	58.62	PASS	AF=0.175,0.05;AO=6,2;DP=27;FAO=7,2;FDP=40;FR=.;FRO=31;FSAF=5,2;FSAR=2,0;FSRF=10;FSRR=21;FWDB=-0.00879091,-0.0266673;FXX=0;HRUN=2,1;LEN=6,2;MLLD=240.755,206.718;QD=5.86153;RBI=0.0118095,0.0273537;REFB=-0.0133344,-0.0138606;REVB=0.00788577,0.00608898;RO=15;SAF=5,2;SAR=1,0;SRF=7;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.442109,0.554201;STB=0.79237,0.996382;STBP=0.136,0.041;TYPE=ins,mnp;VARB=0.0506466,0.0292491;OID=.,.;OPOS=112900342,112900340;OREF=-,AG;OALT=GAAGCT,CT;OMAPALT=AGGAAGCT,CT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:27:40:15:31:6,2:7,2:0.175,0.05:1,0:5,2:7:8:2,0:5,2:10:21
chr9	112900481	.	GGCC	G,GC,GGC	176.47	PASS	AF=0.0740741,0.814815,0;AO=3,5,8;DP=28;FAO=2,22,0;FDP=27;FR=.;FRO=3;FSAF=2,14,0;FSAR=0,8,0;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.109489,0.253912,0.00133596;FXX=0.0689417;HRUN=5,5,7;LEN=3,2,1;MLLD=15.0474,14.6075,7.96676;QD=26.1441;RBI=0.160838,0.281813,0.292671;REFB=-0.0426248,-0.103967,0.0260752;REVB=0.117817,0.12226,0.292668;RO=7;SAF=3,2,6;SAR=0,3,2;SRF=5;SRR=2;SSEN=0.354167,0.354167,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.618996,-0.286688,0.0368153;STB=0.5,0.548345,0.5;STBP=1,0.258,1;TYPE=del,del,del;VARB=-0.0469631,0.0151202,0.030507;OID=.,.,.;OPOS=112900482,112900482,112900483;OREF=GCC,GC,C;OALT=-,-,-;OMAPALT=G,GC,GGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0.0740741,0.814815,0:3,5,8:28:2,22,0:27:3:2,14,0:0,8,0:3:0:7:7:3,2,6:0,3,2:5:2
chr9	112900785	.	A	G	256.4	PASS	AF=1;AO=20;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.170872;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.0439;QD=48.8385;RBI=0.172903;REFB=0;REVB=0.0264264;RO=1;SAF=10;SAR=10;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0438656;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0116426;OID=.;OPOS=112900785;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:21:21:1:0:20:21:1:10:10:1:0:10:11:0:0
chr9	112931646	.	G	A	736.36	PASS	AF=1;AO=46;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0222567;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.9354;QD=62.669;RBI=0.0256734;REFB=0;REVB=-0.0127971;RO=0;SAF=30;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.31553e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00379314;OID=.;OPOS=112931646;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:46:47:1:16:30:0:0:16:31:0:0
chr9	112932329	.	G	A	919.96	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00903038;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.91;QD=58.4099;RBI=0.00965381;REFB=0;REVB=0.00341294;RO=0;SAF=27;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.46408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.9241e-05;OID=.;OPOS=112932329;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:63:0:0:62:63:1:35:27:0:0:35:28:0:0
chr9	112960869	.	A	G	1510.85	PASS	AF=1;AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0202714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.754;QD=63.6146;RBI=0.0291131;REFB=0;REVB=-0.0208959;RO=0;SAF=42;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.69587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.56655e-07;OID=.;OPOS=112960869;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:95:0:0:95:95:1:53:42:0:0:53:42:0:0
chr9	112963504	.	A	G	850.63	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0062774;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.63;QD=57.6698;RBI=0.00697563;REFB=0;REVB=-0.00304198;RO=0;SAF=30;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.06491e-06;OID=.;OPOS=112963504;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:29:30:0:0:29:30:0:0
chr9	113006420	.	A	G	1202.01	PASS	AF=1;AO=59;DP=85;FAO=81;FDP=81;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=73;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00749396;FXX=0.0240935;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.4983;QD=59.3583;RBI=0.108205;REFB=0;REVB=0.107945;RO=1;SAF=53;SAR=6;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00882198;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000632508;OID=.;OPOS=113006420;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:81:1:0:59:81:1:6:53:1:0:8:73:0:0
chr9	113006421	.	T	G	185.11	PASS	AF=0.284091;AO=24;DP=87;FAO=25;FDP=88;FR=.;FRO=63;FSAF=22;FSAR=3;FSRF=54;FSRR=9;FWDB=-0.0217603;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=98.5662;QD=8.41395;RBI=0.0483475;REFB=-0.0528275;REVB=0.0431737;RO=62;SAF=21;SAR=3;SRF=53;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0524988;STB=0.536555;STBP=0.788;TYPE=snp;VARB=0.00782108;OID=.;OPOS=113006421;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:88:62:63:24:25:0.284091:3:21:53:9:3:22:54:9
chr9	113128561	.	TGAGGGTAG	T	348.39	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0126159;FXX=0.0740466;HRUN=1;LEN=8;MLLD=327.189;QD=55.742;RBI=0.0188305;REFB=0;REVB=-0.0139795;RO=0;SAF=19;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-3.20925e-06;OID=.;OPOS=113128562;OREF=GAGGGTAG;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:25:25:25:25:0:19:6:0:0:4:0:19:6:0:0
chr9	113166697	.	T	A	1453.49	PASS	AF=1;AO=92;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00130314;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.303;QD=63.195;RBI=0.00380582;REFB=0;REVB=-0.00357576;RO=0;SAF=50;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.7985e-06;OID=.;OPOS=113166697;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:92:92:0:0:92:92:1:42:50:0:0:42:50:0:0
chr9	113169630	.	TG	CA	713.58	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0209773;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=2;MLLD=152.406;QD=63.4293;RBI=0.0516582;REFB=0;REVB=0.0472072;RO=0;SAF=24;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000417843;OID=.;OPOS=113169630;OREF=TG;OALT=CA;OMAPALT=CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:21:24:0:0:21:24:0:0
chr9	113196733	.	A	C	154.34	PASS	AF=0.344828;AO=20;DP=58;FAO=20;FDP=58;FR=.;FRO=38;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=-0.000896053;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=274.553;QD=10.6444;RBI=0.00356681;REFB=-0.0102909;REVB=-0.00345243;RO=38;SAF=9;SAR=11;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.026658;STB=0.515609;STBP=0.868;TYPE=snp;VARB=0.0183317;OID=.;OPOS=113196733;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:38:38:20:20:0.344828:11:9:18:20:11:9:18:20
chr9	113208250	.	T	G	754.43	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0271902;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.608;QD=56.9379;RBI=0.0274644;REFB=0;REVB=-0.00387101;RO=0;SAF=21;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.81969e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.34012e-05;OID=.;OPOS=113208250;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:32:21:0:0:32:21:0:0
chr9	113221247	.	T	C	346.28	PASS	AF=0.45122;AO=37;DP=82;FAO=37;FDP=82;FR=.;FRO=45;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=25;FSRR=20;FWDB=6.78018e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.69;QD=16.8918;RBI=0.0464199;REFB=-0.0101315;REVB=0.0464198;RO=44;SAF=21;SAR=16;SRF=25;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000606231;STB=0.506699;STBP=0.929;TYPE=snp;VARB=0.0127708;OID=.;OPOS=113221247;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:44:45:37:37:0.45122:16:21:25:19:16:21:25:20
chr9	113252047	.	C	A	212.63	PASS	AF=0.321429;AO=27;DP=85;FAO=27;FDP=84;FR=.;FRO=57;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=33;FWDB=-0.00707721;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.352;QD=10.1251;RBI=0.00707739;REFB=0.00152561;REVB=5.12921e-05;RO=57;SAF=13;SAR=14;SRF=25;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0499026;STB=0.541157;STBP=0.611;TYPE=snp;VARB=-0.00283668;OID=.;OPOS=113252047;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:84:57:57:27:27:0.321429:14:13:25:32:14:13:24:33
chr9	113636353	.	T	G	72.02	PASS	AF=0.285714;AO=10;DP=35;FAO=10;FDP=35;FR=.;FRO=25;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=18;FSRR=7;FWDB=0.00432616;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=185.945;QD=8.23056;RBI=0.0170418;REFB=-0.00573344;REVB=-0.0164835;RO=24;SAF=3;SAR=7;SRF=18;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.483401;STB=0.777284;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.00632202;OID=.;OPOS=113636353;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:35:35:24:25:10:10:0.285714:7:3:18:6:7:3:18:7
chr9	113636379	.	C	T	92.49	PASS	AF=0.3;AO=12;DP=40;FAO=12;FDP=40;FR=.;FRO=28;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=20;FSRR=8;FWDB=0.00965186;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.645;QD=9.24869;RBI=0.0419552;REFB=-0.00285193;REVB=-0.0408299;RO=28;SAF=5;SAR=7;SRF=20;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.334544;STB=0.6997;STBP=0.138;TYPE=snp;VARB=0.0276543;OID=.;OPOS=113636379;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:40:40:28:28:12:12:0.3:7:5:20:8:7:5:20:8
chr9	114089882	.	C	T	305.51	PASS	AF=0.478261;AO=33;DP=69;FAO=33;FDP=69;FR=.;FRO=36;FSAF=25;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=0.00582037;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.821;QD=17.7106;RBI=0.0124462;REFB=-0.00273362;REVB=-0.0110014;RO=33;SAF=25;SAR=8;SRF=12;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.374771;STB=0.693655;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.00248696;OID=.;OPOS=114089882;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:33:36:33:33:0.478261:8:25:12:21:8:25:15:21
chr9	114090279	.	A	G	99.96	PASS	AF=0.461538;AO=12;DP=26;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=0.020444;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.733;QD=15.3789;RBI=0.0235293;REFB=-0.00668248;REVB=-0.0116477;RO=14;SAF=3;SAR=9;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0428589;STB=0.524957;STBP=0.827;TYPE=snp;VARB=0.00918872;OID=.;OPOS=114090279;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:26:14:14:12:12:0.461538:9:3:4:10:9:3:4:10
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chr9	114174384	.	C	T	391.43	PASS	AF=0.43617;AO=40;DP=93;FAO=41;FDP=94;FR=.;FRO=53;FSAF=26;FSAR=15;FSRF=29;FSRR=24;FWDB=0.00655517;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.049;QD=16.6566;RBI=0.0226533;REFB=-0.00142395;REVB=-0.0216841;RO=53;SAF=26;SAR=14;SRF=29;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109855;STB=0.551361;STBP=0.411;TYPE=snp;VARB=0.00176775;OID=.;OPOS=114174384;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:94:53:53:40:41:0.43617:14:26:29:24:15:26:29:24
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chr9	114371322	.	T	A	295.63	PASS	AF=0.484848;AO=32;DP=66;FAO=32;FDP=66;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=0.0598805;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.519;QD=17.917;RBI=0.1214;REFB=-0.000964232;REVB=0.105605;RO=34;SAF=11;SAR=21;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.229097;STB=0.628297;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=0.00466726;OID=.;OPOS=114371322;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:34:34:32:32:0.484848:21:11:20:14:21:11:20:14
chr9	114371493	.	C	T	315.92	PASS	AF=0.56;AO=27;DP=49;FAO=28;FDP=50;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.0113665;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.211;QD=25.2734;RBI=0.0127032;REFB=-0.00884462;REVB=0.00567216;RO=21;SAF=9;SAR=18;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120648;STB=0.584553;STBP=0.202;TYPE=snp;VARB=0.011247;OID=.;OPOS=114371493;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:50:21:22:27:28:0.56:18:9:10:11:19:9:11:11
chr9	114454544	.	T	C	1096.33	PASS	AF=0.961538;AO=75;DP=78;FAO=75;FDP=78;FR=.;FRO=3;FSAF=31;FSAR=44;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0295772;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.1326;QD=56.2219;RBI=0.0296888;REFB=-0.0118973;REVB=-0.00257088;RO=3;SAF=31;SAR=44;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0436078;STB=0.523071;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=0.000119489;OID=.;OPOS=114454544;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:78:78:3:3:75:75:0.961538:44:31:3:0:44:31:3:0
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chr9	114464487	.	T	C	751.65	PASS	AF=1;AO=53;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0221839;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.521;QD=55.6779;RBI=0.0872426;REFB=0;REVB=0.0843751;RO=1;SAF=27;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0171308;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000544949;OID=.;OPOS=114464487;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:1:0:53:54:1:26:27:1:0:26:28:0:0
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chr9	115926263	.	C	G	348.64	PASS	AF=0.4625;AO=37;DP=80;FAO=37;FDP=80;FR=.;FRO=43;FSAF=24;FSAR=13;FSRF=24;FSRR=19;FWDB=0.0239057;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.2021;QD=17.432;RBI=0.0304817;REFB=-0.0184495;REVB=-0.0189116;RO=43;SAF=24;SAR=13;SRF=24;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0921501;STB=0.551696;STBP=0.404;TYPE=snp;VARB=0.0420223;OID=.;OPOS=115926263;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:43:43:37:37:0.4625:13:24:24:19:13:24:24:19
chr9	115928275	.	T	C	785.21	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0111233;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=252.09;QD=57.1062;RBI=0.0286452;REFB=0;REVB=0.0263974;RO=0;SAF=21;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.74723e-05;OID=.;OPOS=115928275;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:34:21:0:0:34:21:0:0
chr9	115931692	.	A	G	192.13	PASS	AF=0.320513;AO=25;DP=78;FAO=25;FDP=78;FR=.;FRO=53;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=35;FWDB=0.0128427;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.2037;QD=9.85295;RBI=0.0847783;REFB=-0.00497431;REVB=-0.0837999;RO=52;SAF=12;SAR=13;SRF=18;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15651;STB=0.5962;STBP=0.277;TYPE=snp;VARB=0.00881498;OID=.;OPOS=115931692;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:52:53:25:25:0.320513:13:12:18:34:13:12:18:35
chr9	115931703	.	G	A	579.96	PASS	AF=0.641975;AO=51;DP=80;FAO=52;FDP=81;FR=.;FRO=29;FSAF=18;FSAR=34;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=0.0198641;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.523;QD=28.64;RBI=0.0235244;REFB=-0.00823274;REVB=0.012602;RO=29;SAF=17;SAR=34;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131105;STB=0.564929;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=0.00396879;OID=.;OPOS=115931703;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:81:29:29:51:52:0.641975:34:17:15:14:34:18:15:14
chr9	115950706	.	A	C	320.79	PASS	AF=0.581818;AO=32;DP=56;FAO=32;FDP=55;FR=.;FRO=23;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.00428117;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.278;QD=23.3304;RBI=0.0065125;REFB=-0.00738988;REVB=0.00490757;RO=23;SAF=13;SAR=19;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0558906;STB=0.53083;STBP=0.603;TYPE=snp;VARB=0.00620725;OID=.;OPOS=115950706;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:55:23:23:32:32:0.581818:19:13:11:12:19:13:11:12
chr9	115983540	.	G	A	635.68	PASS	AF=0.45098;AO=69;DP=153;FAO=69;FDP=153;FR=.;FRO=84;FSAF=39;FSAR=30;FSRF=51;FSRR=33;FWDB=0.00311819;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=109.592;QD=16.619;RBI=0.0373082;REFB=0.00231076;REVB=0.0371777;RO=84;SAF=39;SAR=30;SRF=51;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0423863;STB=0.523553;STBP=0.608;TYPE=snp;VARB=-0.00350993;OID=.;OPOS=115983540;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:153:153:84:84:69:69:0.45098:30:39:51:33:30:39:51:33
chr9	115985499	.	G	C	174.09	PASS	AF=0.5;AO=18;DP=36;FAO=18;FDP=36;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=0.0160029;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.178;QD=19.3436;RBI=0.0160207;REFB=0.00514211;REVB=0.000754932;RO=18;SAF=9;SAR=9;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147378;STB=0.583243;STBP=0.351;TYPE=snp;VARB=-0.00466779;OID=.;OPOS=115985499;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:18:18:18:18:0.5:9:9:6:12:9:9:6:12
chr9	116044998	.	A	G	63.36	PASS	AF=0.310345;AO=9;DP=29;FAO=9;FDP=29;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.00699015;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=235.853;QD=8.73948;RBI=0.00999971;REFB=-0.0133552;REVB=-0.00715067;RO=19;SAF=4;SAR=5;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0905072;STB=0.572359;STBP=0.638;TYPE=snp;VARB=0.023988;OID=.;OPOS=116044998;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:29:29:19:20:9:9:0.310345:5:4:10:9:5:4:11:9
chr9	116060124	.	T	C	128.35	PASS	AF=0.365854;AO=15;DP=41;FAO=15;FDP=41;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.0033371;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.3413;QD=12.5221;RBI=0.0418666;REFB=-0.0182782;REVB=-0.0417334;RO=26;SAF=7;SAR=8;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00555343;STB=0.503264;STBP=0.978;TYPE=snp;VARB=0.0350084;OID=.;OPOS=116060124;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:26:26:15:15:0.365854:8:7:12:14:8:7:12:14
chr9	116060221	.	C	T	162.5	PASS	AF=0.515152;AO=17;DP=33;FAO=17;FDP=33;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.0431597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.173;QD=19.697;RBI=0.0470976;REFB=-0.0400389;REVB=0.0188526;RO=16;SAF=9;SAR=8;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0784583;STB=0.544432;STBP=0.611;TYPE=snp;VARB=0.0386612;OID=.;OPOS=116060221;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:16:16:17:17:0.515152:8:9:7:9:8:9:7:9
chr9	116060487	.	T	C	90.33	PASS	AF=0.5;AO=11;DP=22;FAO=11;FDP=22;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=-0.0521822;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.2145;QD=16.4241;RBI=0.0523512;REFB=0.0219354;REVB=-0.00420278;RO=10;SAF=3;SAR=8;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0278546;STB=0.554352;STBP=0.642;TYPE=snp;VARB=-0.0284956;OID=.;OPOS=116060487;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:22:22:10:11:11:11:0.5:8:3:3:7:8:3:4:7
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chr9	116356373	.	G	C	676.75	PASS	AF=0.977778;AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0356106;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.544;QD=60.1553;RBI=0.0494319;REFB=-0.0703683;REVB=0.0342842;RO=1;SAF=13;SAR=31;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.034762;STB=0.51851;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.000903238;OID=.;OPOS=116356373;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:45:45:1:1:44:44:0.977778:31:13:1:0:31:13:1:0
chr9	116356516	.	A	G	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00639166;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.9;QD=48.7372;RBI=0.0369737;REFB=0;REVB=-0.036417;RO=0;SAF=5;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000609224;OID=.;OPOS=116356516;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:12:5:0:0:12:5:0:0
chr9	116356529	.	C	G	172.58	PASS	AF=1;AO=12;DP=14;FAO=15;FDP=15;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0100497;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=286.527;QD=46.0214;RBI=0.0649849;REFB=0;REVB=0.0642031;RO=0;SAF=3;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000531138;OID=.;OPOS=116356529;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:15:0:0:12:15:1:9:3:0:0:12:3:0:0
chr9	116764283	.	C	T	706.98	PASS	AF=0.958333;AO=46;DP=48;FAO=46;FDP=48;FR=.;FRO=2;FSAF=16;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00987752;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.376;QD=58.9148;RBI=0.0105273;REFB=-0.204924;REVB=-0.0036413;RO=2;SAF=16;SAR=30;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.013067;STB=0.506955;STBP=0.775;TYPE=snp;VARB=0.00146;OID=.;OPOS=116764283;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:48:48:2:2:46:46:0.958333:30:16:1:1:30:16:1:1
chr9	116764883	.	C	CCCT,CCT	59.71	PASS	AF=0,0.533333;AO=3,5;DP=15;FAO=0,8;FDP=15;FR=.;FRO=7;FSAF=0,3;FSAR=0,5;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.0163022,0.0215454;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=3,2;MLLD=164.067,167.807;QD=15.9229;RBI=0.0174161,0.0233615;REFB=-0.0795073,-0.0897572;REVB=-0.00612849,0.00903074;RO=7;SAF=0,3;SAR=3,2;SRF=5;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.722194,-0.115149;STB=0.5,0.655356;STBP=1,0.244;TYPE=ins,ins;VARB=0,0.0497755;OID=.,.;OPOS=116764884,116764884;OREF=-,-;OALT=CCT,CT;OMAPALT=CCCT,CCT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,0.533333:3,5:15:0,8:15:7:0,3:0,5:5:2:47:7:0,3:3,2:5:2
chr9	116770776	.	C	T	692.32	PASS	AF=1;AO=41;DP=42;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0695265;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.596;QD=62.9377;RBI=0.0741112;REFB=0;REVB=0.0256618;RO=0;SAF=25;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.1719e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000271514;OID=.;OPOS=116770776;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:44:0:0:41:44:1:16:25:0:0:17:27:0:0
chr9	116770785	.	G	A	689.38	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.034722;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=234.43;QD=62.671;RBI=0.0350362;REFB=0;REVB=0.0046817;RO=0;SAF=29;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000105421;OID=.;OPOS=116770785;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:15:29:0:0:15:29:0:0
chr9	116813001	.	T	C	1180.59	PASS	AF=0.975309;AO=79;DP=81;FAO=79;FDP=81;FR=.;FRO=2;FSAF=33;FSAR=46;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0291586;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.1001;QD=58.3008;RBI=0.031278;REFB=-0.0519967;REVB=-0.0113176;RO=2;SAF=33;SAR=46;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.027824;STB=0.514702;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=0.000761061;OID=.;OPOS=116813001;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:81:81:2:2:79:79:0.975309:46:33:2:0:46:33:2:0
chr9	116818032	.	A	AC	899.27	PASS	AF=1;AO=10;DP=71;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0389934;FXX=0.042851;HRUN=0;LEN=1;MLLD=267.537;QD=53.688;RBI=0.0395517;REFB=0;REVB=0.00662185;RO=57;SAF=3;SAR=7;SRF=28;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.24048;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000519894;OID=.;OPOS=116818033;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:10:71:67:67:0:30:37:0:0:5:57:3:7:28:29
chr9	116818033	.	A	C	650.42	PASS	AF=0.75;AO=54;DP=72;FAO=54;FDP=72;FR=.;FRO=18;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.00262561;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=264.32;QD=36.1344;RBI=0.0162725;REFB=-0.00643735;REVB=0.0160593;RO=15;SAF=25;SAR=29;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00150886;STB=0.509294;STBP=0.785;TYPE=snp;VARB=0.000324291;OID=.;OPOS=116818033;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:15:18:54:54:0.75:29:25:7:8:29:25:9:9
chr9	116931099	.	G	A	68.84	PASS	AF=0.5;AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.0300435;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.3278;QD=15.2981;RBI=0.044825;REFB=-0.0261169;REVB=0.0332665;RO=8;SAF=3;SAR=6;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0782009;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0217616;OID=.;OPOS=116931099;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:18:18:8:9:9:9:0.5:6:3:2:6:6:3:3:6
chr9	117044538	.	G	T	419.49	PASS	AF=0.432432;AO=43;DP=106;FAO=48;FDP=111;FR=.;FRO=63;FSAF=31;FSAR=17;FSRF=34;FSRR=29;FWDB=0.022725;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.781;QD=15.1169;RBI=0.0342499;REFB=-0.037694;REVB=-0.0256247;RO=63;SAF=27;SAR=16;SRF=34;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.096269;STB=0.563387;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=0.0426515;OID=.;OPOS=117044538;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:111:63:63:43:48:0.432432:16:27:34:29:17:31:34:29
chr9	117044751	.	T	C	613.33	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00112223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.57;QD=61.3328;RBI=0.0331668;REFB=0;REVB=0.0331478;RO=0;SAF=19;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.42704e-05;OID=.;OPOS=117044751;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:21:19:0:0:21:19:0:0
chr9	117051020	.	A	G	485.17	PASS	AF=0.546512;AO=42;DP=82;FAO=47;FDP=86;FR=.;FRO=39;FSAF=21;FSAR=26;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=0.00897438;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=339.363;QD=22.5659;RBI=0.0222978;REFB=-0.0180955;REVB=0.020412;RO=40;SAF=20;SAR=22;SRF=21;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0429777;STB=0.530072;STBP=0.576;TYPE=snp;VARB=0.0147745;OID=.;OPOS=117051020;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:86:40:39:42:47:0.546512:22:20:21:19:26:21:20:19
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chr9	117085635	.	T	C	470.7	PASS	AF=0.904762;AO=30;DP=35;FAO=38;FDP=42;FR=.;FRO=4;FSAF=11;FSAR=27;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0917524;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=42.5142;QD=44.8289;RBI=0.143476;REFB=-0.200699;REVB=0.110304;RO=5;SAF=5;SAR=25;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.178408;STB=0.523868;STBP=0.404;TYPE=snp;VARB=0.0294344;OID=.;OPOS=117085635;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:17:35:42:5:4:30:38:0.904762:25:5:3:2:27:11:2:2
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chr9	117103973	.	A	G	433.59	PASS	AF=0.56;AO=43;DP=76;FAO=42;FDP=75;FR=.;FRO=33;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=24;FSRR=9;FWDB=0.000743997;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.989;QD=23.1249;RBI=0.0198034;REFB=-0.0212099;REVB=-0.0197895;RO=33;SAF=22;SAR=21;SRF=24;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171836;STB=0.599954;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.0133762;OID=.;OPOS=117103973;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:75:33:33:43:42:0.56:21:22:24:9:21:21:24:9
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chr9	117138278	.	C	T	60.3	PASS	AF=0.571429;AO=8;DP=14;FAO=8;FDP=14;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0.0996676;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.959;QD=17.2294;RBI=0.0996683;REFB=0.0160591;REVB=0.000352362;RO=6;SAF=1;SAR=7;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.266181;STB=0.649715;STBP=0.72;TYPE=snp;VARB=-0.00845772;OID=.;OPOS=117138278;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:14:14:6:6:8:8:0.571429:7:1:0:6:7:1:0:6
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chr9	117166338	.	G	C	323.47	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0134676;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.609;QD=53.9112;RBI=0.0578241;REFB=0;REVB=0.0562338;RO=0;SAF=15;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000272549;OID=.;OPOS=117166338;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:9:15:0:0:9:15:0:0
chr9	117169033	.	A	G	285.33	PASS	AF=0.476923;AO=31;DP=67;FAO=31;FDP=65;FR=.;FRO=34;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=23;FWDB=-0.0306355;FXX=0.0298463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.3745;QD=17.5586;RBI=0.0350054;REFB=-0.0222902;REVB=-0.0169364;RO=34;SAF=16;SAR=15;SRF=11;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179383;STB=0.600135;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.0132919;OID=.;OPOS=117169033;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:65:34:34:31:31:0.476923:15:16:11:23:15:16:11:23
chr9	117186677	.	A	G	1026.4	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159146;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.019;QD=59.5013;RBI=0.0190387;REFB=0;REVB=0.0104497;RO=0;SAF=33;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.36169e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.43953e-05;OID=.;OPOS=117186677;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:36:33:0:0:36:33:0:0
chr9	117188566	.	C	G,T	1759.45	PASS	AF=0.0413223,0.950413;AO=5,112;DP=118;FAO=5,115;FDP=121;FR=.;FRO=1;FSAF=2,54;FSAR=3,61;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.000963064,-0.00566434;FXX=0.00819605;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=66.2517,201.549;QD=58.1635;RBI=0.054319,0.0349;REFB=-0.107878,-0.132833;REVB=0.0543105,0.0344373;RO=0;SAF=2,54;SAR=3,58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.599598,0.504586;STBP=0.517,0.306;TYPE=snp,snp;VARB=0.0347154,-0.000529231;OID=.,.;OPOS=117188566,117188566;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:10:118:121:0:1:5,112:5,115:0.0413223,0.950413:3,58:2,54:0:0:3,61:2,54:1:0
chr9	117377843	.	G	C	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0133983;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.655;QD=59.4352;RBI=0.0268563;REFB=0;REVB=0.0232755;RO=0;SAF=13;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.39865e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.52794e-05;OID=.;OPOS=117377843;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:22:13:0:0:22:13:0:0
chr9	117386719	.	C	T	204.48	PASS	AF=0.555556;AO=20;DP=36;FAO=20;FDP=36;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=-0.0309811;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.8166;QD=22.7198;RBI=0.0400787;REFB=-0.00640139;REVB=-0.0254258;RO=16;SAF=7;SAR=13;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.267581;STB=0.64985;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.0049765;OID=.;OPOS=117386719;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:16:16:20:20:0.555556:13:7:11:5:13:7:11:5
chr9	117428960	.	T	C	428.65	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0211433;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.257;QD=57.1526;RBI=0.0412442;REFB=0;REVB=0.0354125;RO=0;SAF=15;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.07952e-05;OID=.;OPOS=117428960;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:30:0:0:29:30:1:14:15:0:0:15:15:0:0
chr9	117430611	.	A	T	1098.73	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00395947;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.537;QD=60.2046;RBI=0.0275609;REFB=0;REVB=-0.027275;RO=0;SAF=45;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.1195e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.21611e-05;OID=.;OPOS=117430611;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:28:45:0:0:28:45:0:0
chr9	117433685	.	C	T	1344.03	PASS	AF=0.977778;AO=88;DP=90;FAO=88;FDP=90;FR=.;FRO=2;FSAF=58;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0167361;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.2705;QD=59.7347;RBI=0.0605946;REFB=0.0907321;REVB=-0.0582375;RO=2;SAF=58;SAR=30;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00743259;STB=0.503923;STBP=0.743;TYPE=snp;VARB=-0.00278722;OID=.;OPOS=117433685;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:90:90:2:2:88:88:0.977778:30:58:1:1:30:58:1:1
chr9	117553249	.	T	C	136.88	PASS	AF=0.5;AO=15;DP=30;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=0.0202224;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.8906;QD=18.251;RBI=0.027326;REFB=-0.0158407;REVB=0.0183784;RO=14;SAF=5;SAR=10;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.319546;STB=0.666444;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=0.0244639;OID=.;OPOS=117553249;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:14:15:15:15:0.5:10:5:10:4:10:5:10:5
chr9	117792583	.	C	G	1098.46	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00601539;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.8209;QD=60.1895;RBI=0.0377128;REFB=0;REVB=0.03723;RO=0;SAF=42;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.98661e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00036821;OID=.;OPOS=117792583;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:31:42:0:0:31:42:0:0
chr9	117797597	.	T	C	341.01	PASS	AF=0.564516;AO=34;DP=61;FAO=35;FDP=62;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=25;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=0.0128245;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.354;QD=22.0006;RBI=0.0134851;REFB=-0.000703901;REVB=-0.00416916;RO=27;SAF=9;SAR=25;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198687;STB=0.595797;STBP=0.11;TYPE=snp;VARB=0.000992184;OID=.;OPOS=117797597;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:62:27:27:34:35:0.564516:25:9:13:14:25:10:13:14
chr9	117808785	.	T	A	1989.69	PASS	AF=1;AO=128;DP=128;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=99;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00201166;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=331.465;QD=62.1778;RBI=0.0288292;REFB=0;REVB=0.0287589;RO=0;SAF=99;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.66275e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.26164e-05;OID=.;OPOS=117808785;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:128:128:0:0:128:128:1:29:99:0:0:29:99:0:0
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chr9	117835899	.	C	T	652.46	PASS	AF=0.619565;AO=57;DP=92;FAO=57;FDP=92;FR=.;FRO=35;FSAF=38;FSAR=19;FSRF=12;FSRR=23;FWDB=0.0124569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.578;QD=28.3677;RBI=0.0198449;REFB=-0.0220757;REVB=-0.0154482;RO=35;SAF=38;SAR=19;SRF=12;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.232884;STB=0.62682;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.017158;OID=.;OPOS=117835899;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:35:35:57:57:0.619565:19:38:12:23:19:38:12:23
chr9	117846580	.	T	C	1291.12	PASS	AF=1;AO=83;DP=83;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00969476;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.638;QD=61.482;RBI=0.0126307;REFB=0;REVB=-0.00809603;RO=0;SAF=43;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000117166;OID=.;OPOS=117846580;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:84:0:0:83:84:1:40:43:0:0:41:43:0:0
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chr9	117853022	.	C	T	1325.72	PASS	AF=0.977528;AO=87;DP=89;FAO=87;FDP=89;FR=.;FRO=2;FSAF=38;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0361908;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.2837;QD=59.5831;RBI=0.0361912;REFB=-0.0656141;REVB=-0.00016972;RO=0;SAF=38;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509998;STBP=0.237;TYPE=snp;VARB=0.000656015;OID=.;OPOS=117853022;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:89:89:0:2:87:87:0.977528:49:38:0:0:49:38:0:2
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chr9	119106948	.	C	T	339.2	PASS	AF=0.530303;AO=35;DP=66;FAO=35;FDP=66;FR=.;FRO=31;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=0.0084255;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.391;QD=20.5576;RBI=0.00858607;REFB=-0.00926359;REVB=-0.00165274;RO=31;SAF=18;SAR=17;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00156318;STB=0.500866;STBP=0.986;TYPE=snp;VARB=0.00854975;OID=.;OPOS=119106948;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:31:31:35:35:0.530303:17:18:16:15:17:18:16:15
chr9	119158814	.	T	C	767.42	PASS	AF=0.965517;AO=50;DP=52;FAO=56;FDP=58;FR=.;FRO=2;FSAF=29;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0245422;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.282;QD=52.9253;RBI=0.0701989;REFB=-0.00098385;REVB=0.065769;RO=0;SAF=29;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.20481e-08;STB=0.517851;STBP=0.264;TYPE=snp;VARB=0.000261579;OID=.;OPOS=119158814;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:52:58:0:2:50:56:0.965517:21:29:0:0:27:29:0:2
chr9	119159966	.	T	C	642.43	PASS	AF=0.976744;AO=41;DP=44;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.039444;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.994;QD=59.7604;RBI=0.0396913;REFB=0.0694847;REVB=0.00442308;RO=1;SAF=19;SAR=22;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0208513;STB=0.511106;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=-0.000882145;OID=.;OPOS=119159966;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:44:43:1:1:41:42:0.976744:22:19:0:1:22:20:0:1
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chr9	119188267	.	AG	A	53.62	PASS	AF=0.375;AO=17;DP=50;FAO=18;FDP=48;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=-0.0733131;FXX=0.039992;HRUN=3;LEN=1;MLLD=11.4598;QD=4.46858;RBI=0.25869;REFB=-0.081624;REVB=-0.248084;RO=27;SAF=10;SAR=7;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0.207407;SSSB=0.0352677;STB=0.596225;STBP=0.319;TYPE=del;VARB=0.0417657;OID=.;OPOS=119188268;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.375:17:50:18:48:30:8:10:18:12:53:27:10:7:15:12
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chr9	123291036	.	C	G	491.92	PASS	AF=0.582278;AO=46;DP=79;FAO=46;FDP=79;FR=.;FRO=33;FSAF=28;FSAR=18;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=0.00736816;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.552;QD=24.9075;RBI=0.0237895;REFB=-0.012816;REVB=0.0226197;RO=32;SAF=28;SAR=18;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0360112;STB=0.514345;STBP=0.778;TYPE=snp;VARB=0.00613056;OID=.;OPOS=123291036;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:32:33:46:46:0.582278:18:28:18:14:18:28:19:14
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chr9	123342259	.	C	A	1098.73	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0290203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.801;QD=60.2044;RBI=0.0380632;REFB=0;REVB=0.0246299;RO=0;SAF=31;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.98661e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000106022;OID=.;OPOS=123342259;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:42:31:0:0:42:31:0:0
chr9	123342275	.	A	G	937.53	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0325422;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.533;QD=58.5957;RBI=0.0387561;REFB=0;REVB=-0.0210484;RO=0;SAF=29;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.30171e-05;OID=.;OPOS=123342275;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:35:29:0:0:35:29:0:0
chr9	123583192	.	A	G	198.56	PASS	AF=0.487805;AO=20;DP=41;FAO=20;FDP=41;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=0.0591081;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.416;QD=19.3715;RBI=0.0609072;REFB=-0.0312933;REVB=0.0146942;RO=21;SAF=13;SAR=7;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0304087;STB=0.517224;STBP=0.871;TYPE=snp;VARB=0.0418272;OID=.;OPOS=123583192;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:21:21:20:20:0.487805:7:13:13:8:7:13:13:8
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chr9	123783934	.	T	C	1246.16	PASS	AF=1;AO=80;DP=80;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0197364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.812;QD=61.539;RBI=0.0197471;REFB=0;REVB=-0.000651198;RO=0;SAF=34;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.3274e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.50285e-05;OID=.;OPOS=123783934;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:80:81:0:0:80:81:1:46:34:0:0:47:34:0:0
chr9	123800218	.	C	T	1539.04	PASS	AF=1;AO=96;DP=97;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.1678;QD=63.4657;RBI=0.0265454;REFB=0;REVB=-0.0223051;RO=0;SAF=53;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.47084e-06;OID=.;OPOS=123800218;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:97:97:0:0:96:97:1:43:53:0:0:44:53:0:0
chr9	124045528	.	G	A	39.05	PASS	AF=0.461538;AO=6;DP=13;FAO=6;FDP=13;FR=.;FRO=7;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.00798002;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.01;QD=12.0155;RBI=0.0120666;REFB=-0.0171428;REVB=-0.00905106;RO=7;SAF=1;SAR=5;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160904;STB=0.599629;STBP=0.636;TYPE=snp;VARB=0.00784055;OID=.;OPOS=124045528;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:13:13:7:7:6:6:0.461538:5:1:2:5:5:1:2:5
chr9	124045949	.	GTTCA	G	167.22	PASS	AF=0.560976;AO=35;DP=48;FAO=23;FDP=41;FR=.;FRO=18;FSAF=2;FSAR=21;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=-0.0877644;FXX=0.359319;HRUN=2;LEN=4;MLLD=111.024;QD=16.3146;RBI=0.0878318;REFB=-0.0417896;REVB=-0.00343867;RO=0;SAF=14;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.27896e-08;STB=0.717708;STBP=0.033;TYPE=del;VARB=0.0614442;OID=.;OPOS=124045950;OREF=TTCA;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.560976:35:48:23:41:18:2:21:6:12:99:0:14:21:0:0
chr9	124046830	.	CT	CC,C	262.56	PASS	AF=0.0952381,0.904762;AO=2,19;DP=21;FAO=2,19;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=0,6;FSAR=2,13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0256094,-0.0625304;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=9.08445,26.6101;QD=50.0116;RBI=0.0478096,0.175499;REFB=0,0;REVB=-0.0403722,-0.163981;RO=0;SAF=0,6;SAR=2,13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-3.851e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,del;VARB=0.0544802,-0.0150526;OID=.,.;OPOS=124046831,124046831;OREF=T,T;OALT=C,-;OMAPALT=CC,C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0952381,0.904762:2,19:21:2,19:21:0:0,6:2,13:0:0:7:0:0,6:2,13:0:0
chr9	124083614	.	C	T	740.42	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00799676;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.87;QD=56.9555;RBI=0.0110613;REFB=0;REVB=0.00764221;RO=0;SAF=21;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.93989e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.47824e-05;OID=.;OPOS=124083614;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:31:21:0:0:31:21:0:0
chr9	124218133	.	C	T	735.68	PASS	AF=1;AO=51;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0290563;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.048;QD=56.5904;RBI=0.0363688;REFB=0;REVB=0.0218729;RO=0;SAF=23;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.97956e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000211306;OID=.;OPOS=124218133;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:51:52:1:28:23:0:0:29:23:0:0
chr9	124241369	.	T	G	840.27	PASS	AF=0.983333;AO=58;DP=60;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00116919;FXX=0.0163908;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.324;QD=56.0181;RBI=0.0138031;REFB=-0.152153;REVB=-0.0137535;RO=0;SAF=33;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507244;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=-0.000256021;OID=.;OPOS=124241369;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:60:60:0:1:58:59:0.983333:25:33:0:0:25:34:1:0
chr9	124256975	.	G	T	657.78	PASS	AF=0.977273;AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0129167;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=315.695;QD=59.7979;RBI=0.0160749;REFB=-0.092993;REVB=0.00956886;RO=1;SAF=26;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0177216;STB=0.50943;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.000174106;OID=.;OPOS=124256975;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:44:44:1:1:43:43:0.977273:17:26:1:0:17:26:1:0
chr9	124914613	.	C	T	321.21	PASS	AF=0.443038;AO=35;DP=79;FAO=35;FDP=79;FR=.;FRO=44;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=27;FSRR=17;FWDB=0.0171273;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.643;QD=16.264;RBI=0.0218719;REFB=-0.00108185;REVB=-0.0136027;RO=44;SAF=19;SAR=16;SRF=27;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0711466;STB=0.539963;STBP=0.567;TYPE=snp;VARB=0.00098925;OID=.;OPOS=124914613;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:44:44:35:35:0.443038:16:19:27:17:16:19:27:17
chr9	124966449	.	C	T	612.86	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00926718;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.9598;QD=61.2859;RBI=0.0511811;REFB=0;REVB=-0.0503351;RO=0;SAF=16;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00105231;OID=.;OPOS=124966449;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:24:16:0:0:24:16:0:0
chr9	124976152	.	G	C	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.576;QD=33.4285;RBI=0.0249433;REFB=0;REVB=-0.0249433;RO=0;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000715192;OID=.;OPOS=124976152;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:6:0:0:0:6:0:0:0
chr9	125133479	.	T	C	1008.4	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00772009;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.729;QD=59.3175;RBI=0.00792153;REFB=0;REVB=0.00177503;RO=0;SAF=19;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.2642e-05;OID=.;OPOS=125133479;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:49:19:0:0:49:19:0:0
chr9	125289083	.	A	G	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00360074;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.787;QD=42.1826;RBI=0.0148019;REFB=0;REVB=-0.0143572;RO=0;SAF=7;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000220041;OID=.;OPOS=125289083;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:4:7:0:0:4:7:0:0
chr9	125289521	.	G	A	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0394827;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.066;QD=43.4854;RBI=0.0394915;REFB=0;REVB=-0.000833403;RO=0;SAF=2;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000527549;OID=.;OPOS=125289521;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:10:2:0:0:10:2:0:0
chr9	125315542	.	C	T	766.46	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00845983;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.799;QD=63.872;RBI=0.0122552;REFB=0;REVB=0.00886685;RO=0;SAF=20;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.56477e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.29745e-05;OID=.;OPOS=125315542;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:28:20:0:0:28:20:0:0
chr9	125315557	.	T	C	740.11	PASS	AF=0.979167;AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=48;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.000709542;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.3925;QD=61.6761;RBI=0.0684594;REFB=-0.135635;REVB=0.0684558;RO=0;SAF=19;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508768;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.00387992;OID=.;OPOS=125315557;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:48:48:0:1:47:47:0.979167:28:19:0:0:28:19:0:1
chr9	125315778	.	G	C	817.61	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0701191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.6523;QD=57.3761;RBI=0.0714675;REFB=0;REVB=0.0138173;RO=0;SAF=30;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000535358;OID=.;OPOS=125315778;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:27:30:0:0:27:30:0:0
chr9	125316033	.	T	C	676.76	PASS	AF=0.977778;AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0203951;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.173;QD=60.1568;RBI=0.0259582;REFB=-0.0602647;REVB=0.0160582;RO=1;SAF=22;SAR=22;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0208755;STB=0.511106;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.00105654;OID=.;OPOS=125316033;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:45:45:1:1:44:44:0.977778:22:22:1:0:22:22:1:0
chr9	125316042	.	T	C	708.52	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0249758;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.48;QD=62.9793;RBI=0.0422285;REFB=0;REVB=-0.0340508;RO=0;SAF=25;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.09779e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.71379e-05;OID=.;OPOS=125316042;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:20:25:0:0:20:25:0:0
chr9	125316179	.	T	G	689.09	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0130542;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.4215;QD=62.6449;RBI=0.0595285;REFB=0;REVB=0.0580795;RO=0;SAF=19;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000739966;OID=.;OPOS=125316179;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:25:19:0:0:25:19:0:0
chr9	125316350	.	C	T	1606.85	PASS	AF=1;AO=100;DP=100;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00355034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.7224;QD=64.274;RBI=0.0303181;REFB=0;REVB=-0.0301095;RO=0;SAF=48;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.19274e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000116603;OID=.;OPOS=125316350;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:100:100:0:0:100:100:1:52:48:0:0:52:48:0:0
chr9	125316455	.	C	T	651.21	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0587169;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.757;QD=62.0199;RBI=0.0641904;REFB=0;REVB=-0.0259371;RO=0;SAF=21;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000496145;OID=.;OPOS=125316455;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:21:21:0:0:21:21:0:0
chr9	125330125	.	C	G	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0224917;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.7911;QD=44.6898;RBI=0.0364565;REFB=0;REVB=-0.0286914;RO=0;SAF=6;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00267656;OID=.;OPOS=125330125;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:7:6:0:0:7:6:0:0
chr9	125330184	.	A	C	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0213428;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.789;QD=37.488;RBI=0.0277464;REFB=0;REVB=0.0177298;RO=0;SAF=3;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.1754e-05;OID=.;OPOS=125330184;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:5:3:0:0:5:3:0:0
chr9	125330325	.	C	G	446.62	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00945219;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.284;QD=57.6284;RBI=0.0381324;REFB=0;REVB=-0.0369423;RO=0;SAF=18;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.33668e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000143197;OID=.;OPOS=125330325;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:13:18:0:0:13:18:0:0
chr9	125330678	.	T	G	1793.39	PASS	AF=1;AO=118;DP=119;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0239043;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.107;QD=60.2821;RBI=0.0239046;REFB=-0.0445117;REVB=0.000113824;RO=0;SAF=61;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.03988e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.07908e-05;OID=.;OPOS=125330678;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:119:119:0:0:118:119:1:57:61:0:0:58:61:0:0
chr9	125330739	.	G	A	1835.68	PASS	AF=0.98374;AO=121;DP=125;FAO=121;FDP=123;FR=.;FRO=2;FSAF=63;FSAR=58;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.011118;FXX=0.0159987;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.2736;QD=59.697;RBI=0.0198459;REFB=-0.0219081;REVB=0.0164393;RO=1;SAF=63;SAR=58;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00812005;STB=0.500336;STBP=0.863;TYPE=snp;VARB=0.000765847;OID=.;OPOS=125330739;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:125:123:1:2:121:121:0.98374:58:63:0:1:58:63:1:1
chr9	125377087	.	A	G	744.23	PASS	AF=1;AO=52;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0184391;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=96.3524;QD=56.1684;RBI=0.0188482;REFB=0;REVB=-0.00390594;RO=1;SAF=32;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0144938;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.56189e-05;OID=.;OPOS=125377087;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:1:0:52:53:1:20:32:1:0:20:33:0:0
chr9	125377505	.	A	G	375.92	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0243882;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.469;QD=55.6921;RBI=0.0286827;REFB=0;REVB=0.0150967;RO=0;SAF=12;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000120512;OID=.;OPOS=125377505;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:27:0:0:25:27:1:13:12:0:0:14:13:0:0
chr9	125377734	.	A	G	239.63	PASS	AF=0.490566;AO=26;DP=53;FAO=26;FDP=53;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=0.0588003;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.282;QD=18.0854;RBI=0.0589421;REFB=-0.00276645;REVB=-0.00408486;RO=27;SAF=11;SAR=15;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0494418;STB=0.527715;STBP=0.697;TYPE=snp;VARB=0.00248996;OID=.;OPOS=125377734;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:27:27:26:26:0.490566:15:11:10:17:15:11:10:17
chr9	125378014	.	T	G	66.28	PASS	AF=0.409091;AO=9;DP=22;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.00613822;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.794;QD=12.0517;RBI=0.0126422;REFB=-0.00534591;REVB=0.0110521;RO=13;SAF=6;SAR=3;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.208265;STB=0.624716;STBP=0.348;TYPE=snp;VARB=0.00761585;OID=.;OPOS=125378014;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:22:22:13:13:9:9:0.409091:3:6:6:7:3:6:6:7
chr9	125390874	.	A	C	780.95	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.02856;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.402;QD=56.7964;RBI=0.0319744;REFB=0;REVB=0.0143767;RO=0;SAF=27;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.06237e-05;OID=.;OPOS=125390874;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:55:0:0:53:55:1:26:27:0:0:26:29:0:0
chr9	125391026	.	A	C	544.44	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0026818;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.269;QD=60.4934;RBI=0.0494396;REFB=0;REVB=0.0493668;RO=0;SAF=21;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000498046;OID=.;OPOS=125391026;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:15:21:0:0:15:21:0:0
chr9	125391127	.	C	T	101.75	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0388272;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.9543;QD=40.7007;RBI=0.0411516;REFB=0;REVB=0.0136346;RO=0;SAF=3;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00226587;OID=.;OPOS=125391127;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:7:3:0:0:7:3:0:0
chr9	125391241	.	G	A	207.12	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0527542;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.144;QD=48.7339;RBI=0.0654138;REFB=0;REVB=0.0386776;RO=0;SAF=10;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00014573;OID=.;OPOS=125391241;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:7:10:0:0:7:10:0:0
chr9	125391369	.	A	G	163.64	PASS	AF=0.53125;AO=17;DP=32;FAO=17;FDP=32;FR=.;FRO=15;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=0.00954224;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.51;QD=20.4553;RBI=0.0139953;REFB=-0.0439945;REVB=-0.0102379;RO=15;SAF=11;SAR=6;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0420242;STB=0.523781;STBP=0.82;TYPE=snp;VARB=0.0304016;OID=.;OPOS=125391369;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:15:15:17:17:0.53125:6:11:9:6:6:11:9:6
chr9	125391677	.	T	C	141.31	PASS	AF=0.380952;AO=16;DP=42;FAO=16;FDP=42;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=-0.0134105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.821;QD=13.4577;RBI=0.0134662;REFB=-0.00890894;REVB=-0.00122435;RO=25;SAF=8;SAR=8;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147043;STB=0.571341;STBP=0.492;TYPE=snp;VARB=0.0158211;OID=.;OPOS=125391677;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:25:26:16:16:0.380952:8:8:9:16:8:8:10:16
chr9	125424507	.	A	C	176.73	PASS	AF=0.396226;AO=21;DP=53;FAO=21;FDP=53;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=-0.0186869;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.8058;QD=13.3381;RBI=0.0230199;REFB=-0.0078438;REVB=0.0134431;RO=32;SAF=12;SAR=9;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0753835;STB=0.543437;STBP=0.637;TYPE=snp;VARB=0.0127502;OID=.;OPOS=125424507;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:32:32:21:21:0.396226:9:12:16:16:9:12:16:16
chr9	125486968	.	G	A	2369.8	PASS	AF=0.98773;AO=154;DP=160;FAO=161;FDP=163;FR=.;FRO=2;FSAF=56;FSAR=105;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0389896;FXX=0.00609719;HRUN=3;LEN=1;MLLD=164.299;QD=58.1546;RBI=0.0391515;REFB=-0.0770033;REVB=0.00355704;RO=5;SAF=49;SAR=105;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0460982;STB=0.508771;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=0.00101602;OID=.;OPOS=125486968;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:160:163:5:2:154:161:0.98773:105:49:5:0:105:56:2:0
chr9	125512193	.	C	A	937.68	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.14218;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.8159;QD=58.6053;RBI=0.148698;REFB=0;REVB=0.0435438;RO=0;SAF=32;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00122851;OID=.;OPOS=125512193;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:64:0:0:57:64:1:25:32:0:0:25:39:0:0
chr9	125512575	.	G	A	340.74	PASS	AF=1;AO=21;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0275998;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.174;QD=54.5176;RBI=0.0314487;REFB=0;REVB=0.0150755;RO=0;SAF=12;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.44934e-05;OID=.;OPOS=125512575;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:21:25:1:9:12:0:0:9:16:0:0
chr9	125512770	.	T	C	465.1	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0338009;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.4332;QD=58.1376;RBI=0.0368339;REFB=0;REVB=0.0146368;RO=0;SAF=4;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000200845;OID=.;OPOS=125512770;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:28:4:0:0:28:4:0:0
chr9	125512788	.	G	A	671.08	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0262619;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.5253;QD=62.426;RBI=0.0481072;REFB=0;REVB=0.0403065;RO=0;SAF=10;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.09277e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000829341;OID=.;OPOS=125512788;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:43:0:0:41:43:1:31:10:0:0:33:10:0:0
chr9	125512795	.	G	C	727.8	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0473156;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=243.815;QD=63.2867;RBI=0.0487324;REFB=0;REVB=-0.0116654;RO=0;SAF=12;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.12678e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000138671;OID=.;OPOS=125512795;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:34:12:0:0:34:12:0:0
chr9	125512826	.	G	A	1026.26	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0214086;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=79.0704;QD=59.4932;RBI=0.022473;REFB=0;REVB=-0.00683414;RO=0;SAF=24;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.60845e-05;OID=.;OPOS=125512826;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:45:24:0:0:45:24:0:0
chr9	125524836	.	A	G	1093.86	PASS	AF=0.986667;AO=74;DP=76;FAO=74;FDP=75;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0110855;FXX=0.0131562;HRUN=3;LEN=1;MLLD=94.7272;QD=58.3391;RBI=0.0263204;REFB=-0.0981103;REVB=-0.0238721;RO=0;SAF=43;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507934;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=-0.000295248;OID=.;OPOS=125524836;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:76:75:0:1:74:74:0.986667:31:43:0:0:31:43:0:1
chr9	125611817	.	T	A	35.7	PASS	AF=0.075;AO=6;DP=80;FAO=6;FDP=80;FR=.,HEALED;FRO=71;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=31;FSRR=40;FWDB=-0.0626582;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.174;QD=1.7852;RBI=0.0628042;REFB=-0.000409285;REVB=-0.00428001;RO=68;SAF=3;SAR=3;SRF=28;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0967109;STB=0.55825;STBP=0.796;TYPE=snp;VARB=0.00320539;OID=.;OPOS=125611817;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:23:80:80:68:71:6:6:0.075:3:3:28:40:3:3:31:40
chr9	125637471	.	A	T	708.55	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00549777;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.397;QD=62.9819;RBI=0.00754522;REFB=0;REVB=-0.00516767;RO=0;SAF=21;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.08002e-05;OID=.;OPOS=125637471;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:24:21:0:0:24:21:0:0
chr9	125637648	.	T	C	469.93	PASS	AF=1;AO=32;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0165799;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.3005;QD=56.9608;RBI=0.0840283;REFB=0;REVB=0.0823763;RO=1;SAF=17;SAR=15;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0301077;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00152988;OID=.;OPOS=125637648;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:1:0:32:33:1:15:17:0:1:16:17:0:0
chr9	125772780	.	TCTC	T	391.74	PASS	AF=0.493827;AO=40;DP=81;FAO=40;FDP=81;FR=.;FRO=41;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=13;FSRR=28;FWDB=-0.0242175;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=268.079;QD=19.345;RBI=0.0282408;REFB=-0.00501051;REVB=-0.0145277;RO=36;SAF=15;SAR=25;SRF=12;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0385016;STB=0.531757;STBP=0.604;TYPE=del;VARB=0.00513363;OID=.;OPOS=125772781;OREF=CTC;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.493827:40:81:40:81:41:15:25:13:28:99:36:15:25:12:24
chr9	125866070	.	G	C	1249.36	PASS	AF=1;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00754305;FXX=0.0121936;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.636;QD=61.6968;RBI=0.00754313;REFB=0;REVB=-3.33778e-05;RO=0;SAF=51;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.40248e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.82954e-05;OID=.;OPOS=125866070;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:81:0:0:81:81:1:30:51:0:0:30:51:0:0
chr9	125920376	.	G	A	710.11	PASS	AF=0.980769;AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00934561;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.2956;QD=54.6235;RBI=0.0468598;REFB=-0.136433;REVB=-0.0459184;RO=1;SAF=22;SAR=29;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.015962;STB=0.508471;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.00582108;OID=.;OPOS=125920376;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:52:52:1:1:51:51:0.980769:29:22:0:1:29:22:0:1
chr9	126028395	.	C	G	769.5	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00927446;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.019;QD=57.0002;RBI=0.032693;REFB=0;REVB=0.0313499;RO=0;SAF=35;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.86274e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000129808;OID=.;OPOS=126028395;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:19:35:0:0:19:35:0:0
chr9	126118600	.	C	T	600.23	PASS	AF=0.440559;AO=63;DP=143;FAO=63;FDP=143;FR=.;FRO=80;FSAF=43;FSAR=20;FSRF=50;FSRR=30;FWDB=-0.0021272;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.758;QD=16.7897;RBI=0.0910881;REFB=-0.00211362;REVB=0.0910633;RO=79;SAF=43;SAR=20;SRF=50;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0557103;STB=0.536148;STBP=0.483;TYPE=snp;VARB=0.00425044;OID=.;OPOS=126118600;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:143:143:79:80:63:63:0.440559:20:43:50:29:20:43:50:30
chr9	126125318	.	C	A	1249.69	PASS	AF=0.987952;AO=82;DP=83;FAO=82;FDP=83;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0201933;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.3486;QD=60.226;RBI=0.0622805;REFB=-0.0675706;REVB=0.058916;RO=1;SAF=37;SAR=45;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0126271;STB=0.506665;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.00188729;OID=.;OPOS=126125318;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:83:83:1:1:82:82:0.987952:45:37:1:0:45:37:1:0
chr9	126133497	.	C	T	253.74	PASS	AF=0.638889;AO=23;DP=36;FAO=23;FDP=36;FR=.;FRO=13;FSAF=20;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=3;FWDB=-0.0218697;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=251.722;QD=28.1931;RBI=0.0220503;REFB=-0.0259802;REVB=-0.00281625;RO=13;SAF=20;SAR=3;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128078;STB=0.57136;STBP=0.404;TYPE=snp;VARB=0.0134658;OID=.;OPOS=126133497;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:13:13:23:23:0.638889:3:20:10:3:3:20:10:3
chr9	126133547	.	T	C	149.39	PASS	AF=1;AO=13;DP=14;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0544535;FXX=0.0713776;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.567;QD=45.9648;RBI=0.0713151;REFB=0;REVB=0.0460506;RO=0;SAF=1;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.00075e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00106947;OID=.;OPOS=126133547;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:13:0:0:13:13:1:12:1:0:0:12:1:0:0
chr9	126133845	.	G	C	143.35	PASS	AF=0.410256;AO=16;DP=39;FAO=16;FDP=39;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=-0.0394533;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.122;QD=14.7026;RBI=0.0667503;REFB=-0.0179162;REVB=0.0538427;RO=23;SAF=12;SAR=4;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170819;STB=0.599867;STBP=0.364;TYPE=snp;VARB=0.0225811;OID=.;OPOS=126133845;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:23:23:16:16:0.410256:4:12:14:9:4:12:14:9
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chr9	127220392	.	G	C	147.13	PASS	AF=0.470588;AO=16;DP=34;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=0.019664;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.0407;QD=17.3088;RBI=0.0265554;REFB=-0.0535855;REVB=0.017847;RO=18;SAF=12;SAR=4;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154634;STB=0.589167;STBP=0.394;TYPE=snp;VARB=0.0383204;OID=.;OPOS=127220392;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:18:18:16:16:0.470588:4:12:11:7:4:12:11:7
chr9	127220938	.	G	C	266.83	PASS	AF=0.54;AO=25;DP=48;FAO=27;FDP=50;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=0.0561164;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.602;QD=21.3467;RBI=0.0671284;REFB=-0.0317011;REVB=-0.0368398;RO=22;SAF=12;SAR=13;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0982537;STB=0.578114;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=0.0284727;OID=.;OPOS=127220938;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:50:22:23:25:27:0.54:13:12:8:14:13:14:8:15
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chr9	127231774	.	C	G	340.69	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0264228;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=64.627;QD=54.5104;RBI=0.0296887;REFB=0;REVB=0.0135372;RO=0;SAF=10;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000786422;OID=.;OPOS=127231774;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:15:10:0:0:15:10:0:0
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chr9	127618776	.	A	G	322.96	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00784916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.5064;QD=53.8265;RBI=0.0106625;REFB=0;REVB=0.00721659;RO=0;SAF=10;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000297511;OID=.;OPOS=127618776;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:14:10:0:0:14:10:0:0
chr9	127618839	.	C	G	482.5	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00701695;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.8314;QD=58.4846;RBI=0.0202655;REFB=0;REVB=0.0190119;RO=0;SAF=10;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000246916;OID=.;OPOS=127618839;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:23:10:0:0:23:10:0:0
chr9	127643456	.	T	C	483.35	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00482403;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.821;QD=58.5876;RBI=0.00587913;REFB=0;REVB=0.0033605;RO=0;SAF=22;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.10278e-05;OID=.;OPOS=127643456;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:11:22:0:0:11:22:0:0
chr9	127651789	.	G	A	234.07	PASS	AF=0.435484;AO=26;DP=61;FAO=27;FDP=62;FR=.;FRO=35;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=25;FSRR=10;FWDB=-0.0268271;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.08;QD=15.1011;RBI=0.0363348;REFB=-0.00934951;REVB=0.0245056;RO=35;SAF=9;SAR=17;SRF=25;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.360754;STB=0.708185;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0220933;OID=.;OPOS=127651789;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:62:35:35:26:27:0.435484:17:9:25:10:18:9:25:10
chr9	127661645	.	G	A	211.67	PASS	AF=0.416667;AO=25;DP=61;FAO=25;FDP=60;FR=.;FRO=35;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=21;FSRR=14;FWDB=0.0423268;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.0595;QD=14.1111;RBI=0.0437624;REFB=-0.00903484;REVB=0.0111171;RO=34;SAF=12;SAR=13;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10926;STB=0.569666;STBP=0.385;TYPE=snp;VARB=0.00987219;OID=.;OPOS=127661645;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:60:34:35:25:25:0.416667:13:12:20:14:13:12:21:14
chr9	127674200	.	A	C	937.6	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0337932;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.135;QD=58.6002;RBI=0.0358054;REFB=0;REVB=0.0118341;RO=0;SAF=22;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000137481;OID=.;OPOS=127674200;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:42:22:0:0:42:22:0:0
chr9	127818276	.	C	T	470.92	PASS	AF=1;AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0323985;FXX=0.11108;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.043;QD=58.8649;RBI=0.0324003;REFB=-0.095103;REVB=-0.000340597;RO=0;SAF=16;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00141356;OID=.;OPOS=127818276;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:33:32:0:0:32:32:1:16:16:0:0:16:16:0:0
chr9	127951863	.	G	A	316.0	PASS	AF=0.896552;AO=25;DP=29;FAO=26;FDP=29;FR=.;FRO=3;FSAF=23;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.00419413;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.9419;QD=43.5857;RBI=0.00629069;REFB=0.0107902;REVB=-0.0046885;RO=3;SAF=23;SAR=2;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.285622;STB=0.550856;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=-0.0108503;OID=.;OPOS=127951863;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:29:29:3:3:25:26:0.896552:2:23:1:2:3:23:2:1
chr9	127962916	.	G	A	547.47	PASS	AF=0.973684;AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0378175;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.088;QD=57.6279;RBI=0.0602714;REFB=-0.154069;REVB=0.0469306;RO=1;SAF=13;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0346573;STB=0.518508;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=0.00200926;OID=.;OPOS=127962916;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:38:38:1:1:37:37:0.973684:24:13:1:0:24:13:1:0
chr9	128064664	.	C	T	37.14	PASS	AF=0.333333;AO=6;DP=18;FAO=6;FDP=18;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.0106907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.599;QD=8.25426;RBI=0.0106915;REFB=-0.00680118;REVB=0.000135679;RO=12;SAF=3;SAR=3;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0179383;OID=.;OPOS=128064664;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:18:18:12:12:6:6:0.333333:3:3:6:6:3:3:6:6
chr9	128072273	.	G	C	234.94	PASS	AF=0.46;AO=23;DP=50;FAO=23;FDP=50;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=-0.0253495;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.7263;QD=18.7954;RBI=0.0315233;REFB=-0.0067275;REVB=0.0187383;RO=27;SAF=8;SAR=15;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133486;STB=0.575801;STBP=0.377;TYPE=snp;VARB=0.018373;OID=.;OPOS=128072273;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:27:27:23:23:0.46:15:8:13:14:15:8:13:14
chr9	128074807	.	T	C	754.35	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00752811;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.6273;QD=56.9318;RBI=0.0313481;REFB=0;REVB=-0.0304307;RO=0;SAF=29;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000305724;OID=.;OPOS=128074807;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:24:29:0:0:24:29:0:0
chr9	128113096	.	C	T	429.12	PASS	AF=0.440367;AO=48;DP=108;FAO=48;FDP=109;FR=.;FRO=61;FSAF=30;FSAR=18;FSRF=33;FSRR=28;FWDB=-0.000166319;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.956;QD=15.7475;RBI=0.0326482;REFB=0.000404618;REVB=-0.0326478;RO=60;SAF=30;SAR=18;SRF=33;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0775751;STB=0.548905;STBP=0.398;TYPE=snp;VARB=-0.000547476;OID=.;OPOS=128113096;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:109:60:61:48:48:0.440367:18:30:33:27:18:30:33:28
chr9	128728459	.	A	G	47.38	PASS	AF=0.35;AO=7;DP=21;FAO=7;FDP=20;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=1;FWDB=0.0319188;FXX=0.0475964;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.5322;QD=9.47651;RBI=0.0332417;REFB=-0.00946535;REVB=-0.0092846;RO=13;SAF=3;SAR=4;SRF=12;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.514281;STB=0.799398;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=0.0113903;OID=.;OPOS=128728459;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:21:20:13:13:7:7:0.35:4:3:12:1:4:3:12:1
chr9	129265715	.	C	G	1171.98	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.011245;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.1379;QD=60.8821;RBI=0.0670193;REFB=0;REVB=0.0660692;RO=0;SAF=38;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5078e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000472565;OID=.;OPOS=129265715;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:39:38:0:0:39:38:0:0
chr9	129265797	.	G	C	539.84	PASS	AF=0.568182;AO=50;DP=88;FAO=50;FDP=88;FR=.;FRO=38;FSAF=22;FSAR=28;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=0.00238007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.381;QD=24.5382;RBI=0.0154681;REFB=-0.0069392;REVB=-0.0152839;RO=37;SAF=22;SAR=28;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0574675;STB=0.537462;STBP=0.443;TYPE=snp;VARB=0.00535436;OID=.;OPOS=129265797;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:37:38:50:50:0.568182:28:22:19:18:28:22:20:18
chr9	129453229	.	A	G	1417.8	PASS	AF=1;AO=89;DP=91;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0377618;FXX=0.0109878;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.145;QD=63.0136;RBI=0.0441712;REFB=0;REVB=0.022916;RO=0;SAF=43;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.41366e-05;OID=.;OPOS=129453229;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:91:90:0:0:89:90:1:46:43:0:0:46:44:0:0
chr9	129455587	.	G	C	175.42	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00222809;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.753;QD=46.7797;RBI=0.00769203;REFB=0;REVB=-0.00736226;RO=0;SAF=4;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.63386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.13645e-05;OID=.;OPOS=129455587;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:15:0:0:14:15:1:10:4:0:0:11:4:0:0
chr9	129460914	.	A	G	202.02	PASS	AF=0.526316;AO=20;DP=38;FAO=20;FDP=38;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.0262137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.509;QD=21.2648;RBI=0.0413205;REFB=0.000421463;REVB=-0.031941;RO=17;SAF=11;SAR=9;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0651145;STB=0.54995;STBP=0.537;TYPE=snp;VARB=-0.000240894;OID=.;OPOS=129460914;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:17:18:20:20:0.526316:9:11:8:9:9:11:8:10
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chr9	129643296	.	G	T	168.83	PASS	AF=0.607143;AO=17;DP=28;FAO=17;FDP=28;FR=.;FRO=11;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.0717613;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.2663;QD=24.1189;RBI=0.071768;REFB=-0.0259582;REVB=-0.000983511;RO=11;SAF=7;SAR=10;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0307576;STB=0.517221;STBP=0.827;TYPE=snp;VARB=0.0136961;OID=.;OPOS=129643296;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:28:28:11:11:17:17:0.607143:10:7:5:6:10:7:5:6
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chr9	130630639	.	A	G	1674.57	PASS	AF=1;AO=103;DP=103;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00890206;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.882;QD=60.3449;RBI=0.104656;REFB=0;REVB=0.104276;RO=0;SAF=61;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.08734e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000573768;OID=.;OPOS=130630639;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:103:111:0:0:103:111:1:42:61:0:0:49:62:0:0
chr9	130647583	.	T	C	1194.59	PASS	AF=1;AO=78;DP=78;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0136147;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.794;QD=60.4854;RBI=0.0223086;REFB=0;REVB=-0.0176724;RO=0;SAF=48;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00215233;OID=.;OPOS=130647583;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:79:0:0:78:79:1:30:48:0:0:31:48:0:0
chr9	130648680	.	G	A	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00728473;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.424;QD=55.0981;RBI=0.025089;REFB=0;REVB=0.0240082;RO=0;SAF=21;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000296702;OID=.;OPOS=130648680;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:5:21:0:0:5:21:0:0
chr9	130670310	.	A	G	289.55	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00613718;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=317.553;QD=52.6452;RBI=0.0648201;REFB=0;REVB=0.0645289;RO=0;SAF=20;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.78928e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000134995;OID=.;OPOS=130670310;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:22:0:0:21:22:1:1:20:0:0:2:20:0:0
chr9	130690412	.	G	C	785.89	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0104854;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=309.093;QD=64.1539;RBI=0.0211733;REFB=0;REVB=0.0183947;RO=0;SAF=5;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.39862e-06;OID=.;OPOS=130690412;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:44:5:0:0:44:5:0:0
chr9	130698029	.	G	C	708.55	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00878318;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.6;QD=62.9826;RBI=0.0441095;REFB=0;REVB=-0.0432262;RO=0;SAF=21;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000158524;OID=.;OPOS=130698029;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:24:21:0:0:24:21:0:0
chr9	130698043	.	A	G	689.38	PASS	AF=1;AO=43;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0541687;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.523;QD=62.6704;RBI=0.0635276;REFB=0;REVB=0.033189;RO=0;SAF=20;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000350425;OID=.;OPOS=130698043;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:43:44:1:23:20:0:0:23:21:0:0
chr9	130703789	.	G	A	685.38	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.027866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.36;QD=62.3068;RBI=0.042154;REFB=0;REVB=0.0316298;RO=0;SAF=20;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000400577;OID=.;OPOS=130703789;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:44:0:0:42:44:1:22:20:0:0:23:21:0:0
chr9	130703852	.	A	AAAC	74.96	PASS	AF=0.75;AO=8;DP=16;FAO=9;FDP=12;FR=.;FRO=3;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0222482;FXX=0.076864;HRUN=4;LEN=3;MLLD=274.7;QD=24.9857;RBI=0.025015;REFB=-0.015065;REVB=0.0114354;RO=8;SAF=2;SAR=6;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128818;STB=0.538372;STBP=0.783;TYPE=ins;VARB=0.00481082;OID=.;OPOS=130703853;OREF=-;OALT=AAC;OMAPALT=AAAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.75:8:16:9:12:3:2:7:1:2:16:8:2:6:3:5
chr9	130707081	.	A	G	955.12	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0114475;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=160.015;QD=58.7763;RBI=0.0120535;REFB=0;REVB=0.00377377;RO=0;SAF=28;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.99207e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.70894e-05;OID=.;OPOS=130707081;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:37:28:0:0:37:28:0:0
chr9	130829039	.	A	G	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0876246;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.1037;QD=50.4132;RBI=0.0895291;REFB=0;REVB=0.0183679;RO=0;SAF=7;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0033346;OID=.;OPOS=130829039;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:12:7:0:0:12:7:0:0
chr9	130860866	.	T	C	890.06	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00240893;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.692;QD=58.3643;RBI=0.0158949;REFB=0;REVB=0.0157113;RO=0;SAF=41;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.14674e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.21537e-05;OID=.;OPOS=130860866;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:20:41:0:0:20:41:0:0
chr9	130864676	.	T	C	375.67	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.026127;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.91;QD=55.6543;RBI=0.030618;REFB=0;REVB=0.0159637;RO=0;SAF=18;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000188945;OID=.;OPOS=130864676;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:9:18:0:0:9:18:0:0
chr9	130869499	.	A	T	754.42	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0340745;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.2343;QD=56.9372;RBI=0.0342414;REFB=0;REVB=0.00337616;RO=0;SAF=21;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.93989e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000108987;OID=.;OPOS=130869499;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:53:0:0:52:53:1:31:21:0:0:32:21:0:0
chr9	130883511	.	C	T	1959.43	PASS	AF=0.984615;AO=128;DP=130;FAO=128;FDP=130;FR=.;FRO=2;FSAF=47;FSAR=81;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0166742;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.04;QD=60.29;RBI=0.0202773;REFB=0.113414;REVB=0.0115385;RO=2;SAF=47;SAR=81;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00417219;STB=0.502195;STBP=0.774;TYPE=snp;VARB=3.77529e-05;OID=.;OPOS=130883511;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:130:130:2:2:128:128:0.984615:81:47:1:1:81:47:1:1
chr9	131079470	.	C	G	1085.02	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0330513;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.221;QD=60.2788;RBI=0.0334838;REFB=0;REVB=0.00536403;RO=0;SAF=40;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.18246e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.94609e-05;OID=.;OPOS=131079470;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:72:0:0:71:72:1:31:40:0:0:31:41:0:0
chr9	131085373	.	G	C	526.78	PASS	AF=0.972973;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0800796;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=178.366;QD=56.9495;RBI=0.080096;REFB=-0.0437971;REVB=0.00161827;RO=0;SAF=8;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508767;STBP=0.629;TYPE=snp;VARB=5.42843e-05;OID=.;OPOS=131085373;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:37:37:0:1:36:36:0.972973:28:8:0:0:28:8:0:1
chr9	131196695	.	C	T	129.0	PASS	AF=0.416667;AO=14;DP=34;FAO=15;FDP=36;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=0.0408921;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.5713;QD=14.3331;RBI=0.0458883;REFB=0.00890844;REVB=0.0208225;RO=18;SAF=9;SAR=5;SRF=13;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0866726;STB=0.530571;STBP=0.758;TYPE=snp;VARB=-0.0034835;OID=.;OPOS=131196695;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:36:18:21:14:15:0.416667:5:9:13:5:5:10:13:8
chr9	131196704	.	G	A	120.04	PASS	AF=0.4;AO=13;DP=34;FAO=14;FDP=35;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=0.0122571;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.105;QD=13.7183;RBI=0.0157956;REFB=-0.0195955;REVB=0.00996318;RO=21;SAF=9;SAR=4;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0861387;STB=0.515396;STBP=0.909;TYPE=snp;VARB=0.027513;OID=.;OPOS=131196704;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:35:21:21:13:14:0.4:4:9:13:8:5:9:13:8
chr9	131235321	.	A	G	290.32	PASS	AF=1;AO=18;DP=21;FAO=22;FDP=22;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=5;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0134415;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.867;QD=52.7859;RBI=0.0189214;REFB=0;REVB=0.013317;RO=0;SAF=5;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.13059e-05;OID=.;OPOS=131235321;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:22:0:0:18:22:1:13:5:0:0:17:5:0:0
chr9	131247176	.	C	T	161.81	PASS	AF=0.695652;AO=16;DP=23;FAO=16;FDP=23;FR=.;FRO=7;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.0201293;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=136.473;QD=28.141;RBI=0.023687;REFB=-0.0196248;REVB=0.0124854;RO=7;SAF=6;SAR=10;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0309522;STB=0.51722;STBP=0.839;TYPE=snp;VARB=0.0116482;OID=.;OPOS=131247176;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:23:23:7:7:16:16:0.695652:10:6:3:4:10:6:3:4
chr9	131254812	.	T	A	52.36	PASS	AF=0.25;AO=8;DP=32;FAO=8;FDP=32;FR=.;FRO=24;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=7;FWDB=-0.0282635;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.457;QD=6.54471;RBI=0.0303911;REFB=-0.0204192;REVB=0.011171;RO=24;SAF=3;SAR=5;SRF=17;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.377471;STB=0.734775;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.0377697;OID=.;OPOS=131254812;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:32:32:24:24:8:8:0.25:5:3:17:7:5:3:17:7
chr9	131285955	.	A	G	335.84	PASS	AF=0.566667;AO=34;DP=60;FAO=34;FDP=60;FR=.;FRO=26;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=0.0086052;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.444;QD=22.3891;RBI=0.00999506;REFB=0.00828062;REVB=-0.00508446;RO=26;SAF=21;SAR=13;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.095238;STB=0.5526;STBP=0.343;TYPE=snp;VARB=-0.00620036;OID=.;OPOS=131285955;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:26:26:34:34:0.566667:13:21:13:13:13:21:13:13
chr9	131303522	.	G	A	317.62	PASS	AF=0.465753;AO=34;DP=73;FAO=34;FDP=73;FR=.;FRO=39;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=17;FWDB=-0.000622631;FXX=0.0135117;HRUN=3;LEN=1;MLLD=210.306;QD=17.404;RBI=0.00847735;REFB=0.0074517;REVB=0.00845445;RO=39;SAF=19;SAR=15;SRF=22;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0051048;STB=0.50286;STBP=0.966;TYPE=snp;VARB=-0.0097488;OID=.;OPOS=131303522;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:39:39:34:34:0.465753:15:19:22:17:15:19:22:17
chr9	131346218	.	A	C	919.51	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0263274;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.542;QD=58.3814;RBI=0.0267746;REFB=0;REVB=0.00487345;RO=0;SAF=30;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.80565e-05;OID=.;OPOS=131346218;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:63:0:0:61:63:1:31:30:0:0:33:30:0:0
chr9	131360750	.	C	T	129.85	PASS	AF=0.375;AO=14;DP=39;FAO=15;FDP=40;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.0444857;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.383;QD=12.9849;RBI=0.0467419;REFB=-0.0335922;REVB=0.0143465;RO=25;SAF=6;SAR=8;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142004;STB=0.599867;STBP=0.357;TYPE=snp;VARB=0.0387157;OID=.;OPOS=131360750;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:40:25:25:14:15:0.375:8:6:14:11:9:6:14:11
chr9	131375701	.	A	G	727.76	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0246646;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.3526;QD=63.2834;RBI=0.0250181;REFB=0;REVB=0.00419117;RO=0;SAF=28;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.06241e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000180608;OID=.;OPOS=131375701;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:18:28:0:0:18:28:0:0
chr9	131379967	.	C	T	255.68	PASS	AF=0.491228;AO=28;DP=57;FAO=28;FDP=57;FR=.;FRO=29;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=0.0202442;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.579;QD=17.9424;RBI=0.0270027;REFB=0.00184827;REVB=0.0178695;RO=28;SAF=14;SAR=14;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127887;STB=0.578892;STBP=0.262;TYPE=snp;VARB=-0.00225533;OID=.;OPOS=131379967;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:28:29:28:28:0.491228:14:14:10:18:14:14:10:19
chr9	131379998	.	C	A	227.09	PASS	AF=0.511628;AO=22;DP=43;FAO=22;FDP=43;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=0.00327005;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.9139;QD=21.1246;RBI=0.0168179;REFB=-0.0185557;REVB=-0.0164969;RO=20;SAF=11;SAR=11;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127519;STB=0.581323;STBP=0.288;TYPE=snp;VARB=0.0233343;OID=.;OPOS=131379998;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:20:21:22:22:0.511628:11:11:7:13:11:11:7:14
chr9	131390472	.	C	A	59.4	PASS	AF=0.533333;AO=8;DP=15;FAO=8;FDP=15;FR=.;FRO=7;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.021352;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.626;QD=15.8391;RBI=0.0391538;REFB=-0.0109376;REVB=0.0328194;RO=7;SAF=1;SAR=7;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.359217;STB=0.717291;STBP=0.173;TYPE=snp;VARB=0.0056823;OID=.;OPOS=131390472;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:15:15:7:7:8:8:0.533333:7:1:3:4:7:1:3:4
chr9	131397479	.	G	A	218.98	PASS	AF=0.36;AO=27;DP=74;FAO=27;FDP=75;FR=.;FRO=48;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=32;FWDB=-0.00614102;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.286;QD=11.6787;RBI=0.00625525;REFB=-0.022578;REVB=-0.00118994;RO=47;SAF=13;SAR=14;SRF=16;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157281;STB=0.59555;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=0.0237796;OID=.;OPOS=131397479;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:75:47:48:27:27:0.36:14:13:16:31:14:13:16:32
chr9	131398636	.	C	T	93.83	PASS	AF=0.324324;AO=12;DP=37;FAO=12;FDP=37;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=-0.00485224;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.946;QD=10.1435;RBI=0.0058812;REFB=0.00351211;REVB=-0.0033233;RO=25;SAF=5;SAR=7;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0718642;STB=0.543306;STBP=0.668;TYPE=snp;VARB=-0.0047787;OID=.;OPOS=131398636;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:93:37:37:25:25:12:12:0.324324:7:5:12:13:7:5:12:13
chr9	131403096	.	A	G	174.09	PASS	AF=0.5;AO=18;DP=36;FAO=18;FDP=36;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=-0.0179018;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.439;QD=19.3428;RBI=0.0183896;REFB=-0.0139469;REVB=-0.00420745;RO=18;SAF=11;SAR=7;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.195856;STB=0.610988;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=0.0208486;OID=.;OPOS=131403096;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:18:18:18:18:0.5:7:11:7:11:7:11:7:11
chr9	131465167	.	A	G	670.37	PASS	AF=0.943396;AO=49;DP=53;FAO=50;FDP=53;FR=.;FRO=3;FSAF=17;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0550296;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.4032;QD=50.5937;RBI=0.0829516;REFB=0.0517222;REVB=-0.0620701;RO=4;SAF=16;SAR=33;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0123855;STB=0.521731;STBP=0.261;TYPE=snp;VARB=-0.0107423;OID=.;OPOS=131465167;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:53:53:4:3:49:50:0.943396:33:16:1:3:33:17:0:3
chr9	131479023	.	T	C	429.02	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00411511;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.642;QD=57.2026;RBI=0.0159771;REFB=0;REVB=0.015438;RO=0;SAF=11;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.69304e-05;OID=.;OPOS=131479023;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:19:11:0:0:19:11:0:0
chr9	131483749	.	T	A	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0169673;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.695;QD=45.8058;RBI=0.0283855;REFB=0;REVB=-0.0227562;RO=0;SAF=7;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.40161e-05;OID=.;OPOS=131483749;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:7:7:0:0:7:7:0:0
chr9	131492850	.	T	C	158.56	PASS	AF=1;AO=13;DP=16;FAO=14;FDP=14;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0492895;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.058;QD=45.3031;RBI=0.0574739;REFB=0;REVB=0.0295601;RO=0;SAF=6;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0049557;OID=.;OPOS=131492850;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:14:0:0:13:14:1:7:6:0:0:5:9:0:0
chr9	131565554	.	T	C	290.11	PASS	AF=0.457143;AO=32;DP=70;FAO=32;FDP=70;FR=.;FRO=38;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=-0.0275427;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.261;QD=16.5774;RBI=0.0296747;REFB=-0.00743008;REVB=-0.0110446;RO=38;SAF=20;SAR=12;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173759;STB=0.597764;STBP=0.148;TYPE=snp;VARB=0.00780285;OID=.;OPOS=131565554;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:38:38:32:32:0.457143:12:20:17:21:12:20:17:21
chr9	131570274	.	C	T	41.14	PASS	AF=0.6;AO=6;DP=10;FAO=6;FDP=10;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.00710579;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=104.49;QD=16.4558;RBI=0.0433002;REFB=-0.0551941;REVB=-0.0427132;RO=4;SAF=4;SAR=2;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0648362;STB=0.538337;STBP=0.881;TYPE=snp;VARB=0.0412605;OID=.;OPOS=131570274;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:10:10:4:4:6:6:0.6:2:4:3:1:2:4:3:1
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chr9	131586374	.	G	A	55.4	PASS	AF=0.363636;AO=8;DP=22;FAO=8;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=-0.0223102;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.6627;QD=10.073;RBI=0.0432233;REFB=-0.0295969;REVB=0.0370204;RO=14;SAF=6;SAR=2;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.34871;STB=0.713729;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=0.0553509;OID=.;OPOS=131586374;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:22:22:14:14:8:8:0.363636:2:6:6:8:2:6:6:8
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chr9	131678501	.	CGG	CGC,CG	732.06	PASS	AF=0.0722892,0.927711;AO=6,14;DP=83;FAO=6,77;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=0,55;FSAR=6,22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.1175,0.905535;FXX=0.0119033;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=190.738,10.8087;QD=35.2802;RBI=0.15401,0.905875;REFB=0,0;REVB=-0.0995637,0.0248154;RO=57;SAF=0,2;SAR=6,12;SRF=53;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.837508,-0.792954;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,del;VARB=0.213776,-0.000717344;OID=.,.;OPOS=131678503,131678502;OREF=G,G;OALT=C,-;OMAPALT=CGC,CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0722892,0.927711:6,14:83:6,77:83:0:0,55:6,22:0:0:21:57:0,2:6,12:53:4
chr9	131689361	.	G	A	207.02	PASS	AF=0.436364;AO=24;DP=55;FAO=24;FDP=55;FR=.;FRO=31;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=0.0126881;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.011;QD=15.0559;RBI=0.0127291;REFB=-0.00863995;REVB=-0.00102092;RO=31;SAF=15;SAR=9;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0127356;STB=0.50724;STBP=0.943;TYPE=snp;VARB=0.0149342;OID=.;OPOS=131689361;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:31:31:24:24:0.436364:9:15:19:12:9:15:19:12
chr9	131702891	.	A	G	334.42	PASS	AF=0.507246;AO=35;DP=68;FAO=35;FDP=69;FR=.;FRO=34;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=12;FSRR=22;FWDB=-0.0530367;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.5601;QD=19.3869;RBI=0.0737079;REFB=-0.00340276;REVB=-0.0511855;RO=33;SAF=16;SAR=19;SRF=12;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0830556;STB=0.552159;STBP=0.417;TYPE=snp;VARB=0.00129729;OID=.;OPOS=131702891;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:69:33:34:35:35:0.507246:19:16:12:21:19:16:12:22
chr9	131767668	.	A	C	213.69	PASS	AF=0.6;AO=20;DP=35;FAO=21;FDP=35;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=-0.0255417;FXX=0.0277701;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.3992;QD=24.4222;RBI=0.0399864;REFB=-0.0608302;REVB=-0.0307658;RO=15;SAF=9;SAR=11;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0128771;STB=0.519108;STBP=0.807;TYPE=snp;VARB=0.0369796;OID=.;OPOS=131767668;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:15:14:20:21:0.6:11:9:7:8:11:10:6:8
chr9	131771505	.	C	T	242.33	PASS	AF=0.430769;AO=28;DP=65;FAO=28;FDP=65;FR=.;FRO=37;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=0.0163762;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=187.782;QD=14.9129;RBI=0.0167369;REFB=-0.00435597;REVB=0.00345593;RO=36;SAF=17;SAR=11;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108459;STB=0.554516;STBP=0.437;TYPE=snp;VARB=0.00614231;OID=.;OPOS=131771505;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:36:37:28:28:0.430769:11:17:18:18:11:17:19:18
chr9	131849036	.	C	T	92.97	PASS	AF=0.307692;AO=12;DP=39;FAO=12;FDP=39;FR=.;FRO=27;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=0.0228147;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.791;QD=9.53566;RBI=0.0265126;REFB=0.00758585;REVB=0.0135058;RO=27;SAF=4;SAR=8;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.255379;STB=0.654912;STBP=0.203;TYPE=snp;VARB=-0.0145514;OID=.;OPOS=131849036;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:39:39:27:27:12:12:0.307692:8:4:15:12:8:4:15:12
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chr9	132618578	.	T	C	289.76	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0506378;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.143;QD=52.6843;RBI=0.0510486;REFB=0;REVB=-0.00646298;RO=0;SAF=7;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00021582;OID=.;OPOS=132618578;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:22:0:0:21:22:1:14:7:0:0:14:8:0:0
chr9	132620364	.	T	C	400.18	PASS	AF=0.966667;AO=24;DP=30;FAO=29;FDP=30;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0182338;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=164.905;QD=53.3574;RBI=0.0353661;REFB=-0.110912;REVB=0.0303033;RO=1;SAF=8;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0544279;STB=0.519986;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=0.000911199;OID=.;OPOS=132620364;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:30:30:1:1:24:29:0.966667:16:8:1:0:17:12:1:0
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chr9	132631680	.	T	C	548.86	PASS	AF=0.973684;AO=37;DP=39;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0309488;FXX=0.0256345;HRUN=2;LEN=1;MLLD=215.227;QD=57.7744;RBI=0.0386283;REFB=-0.0765387;REVB=0.0231153;RO=1;SAF=13;SAR=24;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0191166;STB=0.510199;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.000509729;OID=.;OPOS=132631680;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:39:38:1:1:37:37:0.973684:24:13:0:1:24:13:0:1
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chr9	132636033	.	T	C	362.03	PASS	AF=1;AO=25;DP=27;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0230931;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.873;QD=55.6967;RBI=0.0363073;REFB=0;REVB=0.0280165;RO=0;SAF=14;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.22874e-05;OID=.;OPOS=132636033;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:26:0:0:25:26:1:11:14:0:0:11:15:0:0
chr9	132636937	.	AG	A,GA	61.61	PASS	AF=0.342857,0;AO=13,2;DP=34;FAO=12,0;FDP=35;FR=.;FRO=23;FSAF=3,0;FSAR=9,0;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=-0.152171,-0.0612279;FXX=0;HRUN=4,1;LEN=1,2;MLLD=13.1008,23.6577;QD=7.0407;RBI=0.154673,0.0647819;REFB=-0.117331,-0.0813427;REVB=-0.0277075,-0.0211624;RO=19;SAF=2,1;SAR=11,1;SRF=8;SRR=11;SSEN=0,0;SSEP=0.388889,0;SSSB=-0.357233,0.0776352;STB=0.609973,0.5;STBP=0.406,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.163146,0.0735025;OID=.,.;OPOS=132636938,132636937;OREF=G,AG;OALT=-,GA;OMAPALT=A,GA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:34:35:19:23:13,2:12,0:0.342857,0:11,1:2,1:8:11:9,0:3,0:9:14
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chr9	132651363	.	G	C	45.98	PASS	AF=0.857143;AO=6;DP=7;FAO=6;FDP=7;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0128954;FXX=0;HRUN=12;LEN=1;MLLD=307.306;QD=26.2766;RBI=0.0199451;REFB=-0.0804505;REVB=0.0152157;RO=1;SAF=1;SAR=5;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.281147;STB=0.666027;STBP=0.127;TYPE=snp;VARB=0.000545149;OID=.;OPOS=132651363;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:7:7:1:1:6:6:0.857143:5:1:1:0:5:1:1:0
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chr9	133048501	.	G	A	972.88	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0277413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.604;QD=58.9622;RBI=0.0288262;REFB=0;REVB=-0.00783393;RO=0;SAF=32;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.75585e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.46673e-05;OID=.;OPOS=133048501;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:34:32:0:0:34:32:0:0
chr9	133270720	.	G	A	270.61	PASS	AF=0.413333;AO=31;DP=75;FAO=31;FDP=75;FR=.;FRO=44;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=27;FSRR=17;FWDB=-0.0122301;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.419;QD=14.4323;RBI=0.012963;REFB=-0.0103042;REVB=-0.00429672;RO=44;SAF=11;SAR=20;SRF=27;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.266401;STB=0.651145;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.00909206;OID=.;OPOS=133270720;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:44:44:31:31:0.413333:20:11:27:17:20:11:27:17
chr9	133284310	.	G	A	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.137164;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.6701;QD=51.1835;RBI=0.137249;REFB=0;REVB=0.00483014;RO=0;SAF=8;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00325552;OID=.;OPOS=133284310;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:12:8:0:0:12:8:0:0
chr9	133294244	.	G	A	199.17	PASS	AF=0.454545;AO=20;DP=44;FAO=20;FDP=44;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=17;FWDB=0.0360721;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.07;QD=18.1067;RBI=0.0428327;REFB=-0.044499;REVB=0.0230964;RO=23;SAF=8;SAR=12;SRF=6;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14163;STB=0.563046;STBP=0.473;TYPE=snp;VARB=0.0363812;OID=.;OPOS=133294244;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:23:24:20:20:0.454545:12:8:6:17:12:8:7:17
chr9	133305012	.	G	A	458.94	PASS	AF=0.511364;AO=45;DP=88;FAO=45;FDP=88;FR=.;FRO=43;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=27;FSRR=16;FWDB=-0.00779034;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.96;QD=20.8608;RBI=0.0101867;REFB=-0.0139662;REVB=-0.00656354;RO=43;SAF=21;SAR=24;SRF=27;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141697;STB=0.578279;STBP=0.138;TYPE=snp;VARB=0.00962744;OID=.;OPOS=133305012;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:43:43:45:45:0.511364:24:21:27:16:24:21:27:16
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chr9	133761001	.	A	G	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0306949;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.378;QD=43.4862;RBI=0.0313887;REFB=0;REVB=0.0065632;RO=0;SAF=7;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00029347;OID=.;OPOS=133761001;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:5:7:0:0:5:7:0:0
chr9	133787225	.	A	G	1549.57	PASS	AF=1;AO=96;DP=97;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00722931;FXX=0.019998;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.021;QD=63.2477;RBI=0.0157508;REFB=0;REVB=0.0139938;RO=0;SAF=40;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000422989;OID=.;OPOS=133787225;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:97:98:0:0:96:98:1:56:40:0:0:56:42:0:0
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chr9	133911598	.	A	G	891.78	PASS	AF=1;AO=61;DP=63;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00337362;FXX=0.031741;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.448;QD=58.4777;RBI=0.0217007;REFB=0;REVB=0.0214369;RO=0;SAF=26;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000126554;OID=.;OPOS=133911598;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:61:0:0:61:61:1:35:26:0:0:35:26:0:0
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chr9	134133539	.	G	T	612.03	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0410854;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.534;QD=61.203;RBI=0.0437457;REFB=0;REVB=0.0150225;RO=0;SAF=17;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.71161e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000124406;OID=.;OPOS=134133539;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:40:0:0:37:40:1:20:17:0:0:20:20:0:0
chr9	134136515	.	A	G	1472.58	PASS	AF=1;AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0264136;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.783;QD=63.3366;RBI=0.0602236;REFB=0;REVB=-0.0541221;RO=0;SAF=44;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.84593e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.7138e-05;OID=.;OPOS=134136515;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:93:93:0:0:93:93:1:49:44:0:0:49:44:0:0
chr9	134136677	.	A	G	594.54	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0157438;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.656;QD=60.9783;RBI=0.0176632;REFB=0;REVB=-0.00800763;RO=0;SAF=25;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.15341e-05;OID=.;OPOS=134136677;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:14:25:0:0:14:25:0:0
chr9	134183379	.	C	T	1201.96	PASS	AF=0.89899;AO=88;DP=100;FAO=89;FDP=99;FR=.;FRO=10;FSAF=43;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=10;FWDB=-0.00167846;FXX=0.0198;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.417;QD=48.5638;RBI=0.0572361;REFB=-0.113824;REVB=0.0572115;RO=10;SAF=43;SAR=45;SRF=0;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0944191;STB=0.549009;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0049288;OID=.;OPOS=134183379;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:40:100:99:10:10:88:89:0.89899:45:43:0:10:46:43:0:10
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chr9	134350647	.	T	C	432.81	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0530021;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.082;QD=57.708;RBI=0.0539876;REFB=0;REVB=-0.0102685;RO=0;SAF=14;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.56309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00039149;OID=.;OPOS=134350647;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:16:14:0:0:16:14:0:0
chr9	134351065	.	G	T	192.88	PASS	AF=1;AO=15;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0265691;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=35.9489;QD=42.8627;RBI=0.164579;REFB=0;REVB=0.16242;RO=2;SAF=5;SAR=10;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0828326;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0117684;OID=.;OPOS=134351065;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:18:18:2:0:15:18:1:10:5:0:2:13:5:0:0
chr9	134351343	.	C	T	339.14	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0301796;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.0239;QD=54.2625;RBI=0.0366978;REFB=0;REVB=-0.0208787;RO=0;SAF=11;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000258261;OID=.;OPOS=134351343;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:14:11:0:0:14:11:0:0
chr9	134373770	.	G	C	145.21	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00224749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.3121;QD=44.6787;RBI=0.00225253;REFB=0;REVB=0.000150597;RO=0;SAF=10;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00013463;OID=.;OPOS=134373770;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:3:10:0:0:3:10:0:0
chr9	134385436	.	A	G	689.33	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0107136;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.498;QD=62.6664;RBI=0.0112375;REFB=0;REVB=0.00339127;RO=0;SAF=20;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.30465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.93049e-05;OID=.;OPOS=134385436;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:24:20:0:0:24:20:0:0
chr9	134386744	.	T	C	735.5	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0129295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.409;QD=56.5769;RBI=0.0351736;REFB=0;REVB=0.032711;RO=0;SAF=15;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.746e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000654338;OID=.;OPOS=134386744;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:52:0:0:51:52:1:36:15:0:0:37:15:0:0
chr9	134387488	.	T	C	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00226029;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.535;QD=56.1915;RBI=0.00815463;REFB=0;REVB=-0.00783512;RO=0;SAF=16;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.42933e-05;OID=.;OPOS=134387488;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:12:16:0:0:12:16:0:0
chr9	134401335	.	C	T	383.8	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0424083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.0786;QD=54.828;RBI=0.0424983;REFB=0;REVB=0.00276355;RO=0;SAF=15;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00200347;OID=.;OPOS=134401335;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:28:0:0:27:28:1:12:15:0:0:12:16:0:0
chr9	134406071	.	C	G	272.55	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.098329;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.4998;QD=51.914;RBI=0.0984302;REFB=0;REVB=-0.00446181;RO=0;SAF=9;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00170029;OID=.;OPOS=134406071;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:12:9:0:0:12:9:0:0
chr9	134473655	.	C	T	149.61	PASS	AF=0.34;AO=17;DP=50;FAO=17;FDP=50;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=22;FWDB=0.0397448;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.3635;QD=11.969;RBI=0.0458595;REFB=0.0148143;REVB=0.0228789;RO=33;SAF=11;SAR=6;SRF=11;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.341317;STB=0.699776;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=-0.0302834;OID=.;OPOS=134473655;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:33:33:17:17:0.34:6:11:11:22:6:11:11:22
chr9	134658234	.	G	A	225.86	PASS	AF=0.471698;AO=24;DP=54;FAO=25;FDP=53;FR=.;FRO=28;FSAF=5;FSAR=20;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=-0.00824825;FXX=0.036357;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.568;QD=17.0462;RBI=0.0209696;REFB=-0.00995234;REVB=0.0192793;RO=30;SAF=5;SAR=19;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20096;STB=0.612146;STBP=0.165;TYPE=snp;VARB=0.00971558;OID=.;OPOS=134658234;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:53:30:28:24:25:0.471698:19:5:11:19:20:5:10:18
chr9	135073967	.	C	T	765.23	PASS	AF=0.571429;AO=72;DP=126;FAO=72;FDP=126;FR=.;FRO=54;FSAF=49;FSAR=23;FSRF=27;FSRR=27;FWDB=0.0280599;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.19;QD=24.293;RBI=0.0283696;REFB=-0.024574;REVB=-0.0041804;RO=54;SAF=49;SAR=23;SRF=27;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152855;STB=0.583587;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.0155661;OID=.;OPOS=135073967;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:126:126:54:54:72:72:0.571429:23:49:27:27:23:49:27:27
chr9	135102254	.	C	T	495.62	PASS	AF=0.378378;AO=56;DP=148;FAO=56;FDP=148;FR=.;FRO=92;FSAF=33;FSAR=23;FSRF=42;FSRR=50;FWDB=-0.00260612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.72;QD=13.3951;RBI=0.0121694;REFB=-0.0255932;REVB=-0.0118871;RO=90;SAF=33;SAR=23;SRF=41;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145826;STB=0.582699;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=0.0324507;OID=.;OPOS=135102254;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:148:148:90:92:56:56:0.378378:23:33:41:49:23:33:42:50
chr9	135105944	.	G	A	229.32	PASS	AF=0.45614;AO=26;DP=58;FAO=26;FDP=57;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=20;FWDB=-0.00213507;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.973;QD=16.0927;RBI=0.0121145;REFB=-0.0178121;REVB=0.0119249;RO=31;SAF=12;SAR=14;SRF=11;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104487;STB=0.55886;STBP=0.468;TYPE=snp;VARB=0.0258613;OID=.;OPOS=135105944;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:57:31:31:26:26:0.45614:14:12:11:20:14:12:11:20
chr9	135105964	.	A	G	858.11	PASS	AF=1;AO=49;DP=61;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.028972;FXX=0.0327815;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.0835;QD=58.1769;RBI=0.0434546;REFB=0;REVB=-0.0323871;RO=0;SAF=11;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000398859;OID=.;OPOS=135105964;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:59:0:0:49:59:1:38:11:0:0:38:21:0:0
chr9	135139826	.	T	C	48.23	PASS	AF=0.466667;AO=7;DP=15;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.0288026;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.052;QD=12.8607;RBI=0.0298888;REFB=-0.00369137;REVB=-0.00798454;RO=8;SAF=5;SAR=2;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.402505;STB=0.740074;STBP=0.113;TYPE=snp;VARB=0.00489684;OID=.;OPOS=135139826;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:15:15:8:8:7:7:0.466667:2:5:2:6:2:5:2:6
chr9	135139901	.	T	C	74.97	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.01147;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.5284;QD=37.4864;RBI=0.0138222;REFB=0;REVB=0.00771307;RO=0;SAF=7;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.78849e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000241113;OID=.;OPOS=135139901;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:1:7:0:0:1:7:0:0
chr9	135172412	.	A	G	234.9	PASS	AF=0.46;AO=23;DP=50;FAO=23;FDP=50;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=0.00749375;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.095;QD=18.7918;RBI=0.00758722;REFB=-0.0163064;REVB=-0.00118727;RO=27;SAF=12;SAR=11;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143808;STB=0.581246;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=0.0127152;OID=.;OPOS=135172412;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:27:27:23:23:0.46:11:12:10:17:11:12:10:17
chr9	135173685	.	T	C	190.05	PASS	AF=0.4;AO=20;DP=50;FAO=20;FDP=50;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=0.029222;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=77.3778;QD=15.2036;RBI=0.0996954;REFB=-0.00270853;REVB=-0.0953165;RO=30;SAF=12;SAR=8;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173384;STB=0.5999;STBP=0.25;TYPE=snp;VARB=0.00136852;OID=.;OPOS=135173685;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:30:30:20:20:0.4:8:12:13:17:8:12:13:17
chr9	135202829	.	T	C	261.73	PASS	AF=0.676471;AO=22;DP=33;FAO=23;FDP=34;FR=.;FRO=11;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=-0.0125748;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.306;QD=30.7917;RBI=0.0142273;REFB=-0.00700234;REVB=0.00665514;RO=11;SAF=7;SAR=15;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202733;STB=0.596731;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=0.00155511;OID=.;OPOS=135202829;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:33:34:11:11:22:23:0.676471:15:7:7:4:15:8:7:4
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chr9	135296997	.	TGAGAATCCTGGGTTCTCATGCTCTGGTTTCTCTTCAAATCGTATAAATCTTTCGCCTTTTACTAAAGATTTCTGTG	T	50.0	PASS	AO=71;DP=69;LEN=76;RO=0;SAF=33;SAR=23;SRF=13;SRR=0;TYPE=del;FR=.;OID=.;OPOS=135296998;OREF=GAGAATCCTGGGTTCTCATGCTCTGGTTTCTCTTCAAATCGTATAAATCTTTCGCCTTTTACTAAAGATTTCTGTG;OALT=-;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:RO:AO:SAR:SAF:SRF:SRR	1/1:99:69:0:71:23:33:13:0
chr9	135297016	.	T	G	48.86	PASS	AF=0.5;AO=7;DP=14;FAO=7;FDP=14;FR=.;FRO=7;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.412;QD=13.9591;RBI=0.0255373;REFB=-0.0357032;REVB=-0.0255373;RO=7;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00438716;OID=.;OPOS=135297016;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:14:14:7:7:7:7:0.5:7:0:0:7:7:0:0:7
chr9	135297019	.	TC	AG,T	54.37	PASS	AF=0,1;AO=6,6;DP=14;FAO=0,6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0;FSAR=0,6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0,0;FXX=0.142653;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=83.8779,196.208;QD=36.2437;RBI=0.00580525,0.00838265;REFB=0,0;REVB=-0.00580525,-0.00838265;RO=0;SAF=0,0;SAR=6,6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,del;VARB=0,-0.000160676;OID=.,.;OPOS=135297019,135297020;OREF=TC,C;OALT=AG,-;OMAPALT=AG,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	2/2:3:14:6:0:0:6,6:0,6:0,1:6,6:0,0:0:0:0,6:0,0:0:0
chr9	135297022	.	G	C	45.55	PASS	AF=0.857143;AO=6;DP=7;FAO=6;FDP=7;FR=.;FRO=1;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=356.822;QD=26.0262;RBI=0.0139265;REFB=0.0495924;REVB=0.0139265;RO=1;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00776382;OID=.;OPOS=135297022;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:7:7:1:1:6:6:0.857143:6:0:0:1:6:0:0:1
chr9	135374764	.	G	A	446.18	PASS	AF=0.565789;AO=43;DP=76;FAO=43;FDP=76;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=27;FSRF=22;FSRR=11;FWDB=0.00422488;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=226.043;QD=23.4831;RBI=0.0179325;REFB=-0.0316663;REVB=0.0174277;RO=33;SAF=16;SAR=27;SRF=22;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.232747;STB=0.627847;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.024922;OID=.;OPOS=135374764;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:33:33:43:43:0.565789:27:16:22:11:27:16:22:11
chr9	135374898	.	T	C	1572.75	PASS	AF=1;AO=105;DP=105;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0342064;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.7087;QD=59.9143;RBI=0.0351681;REFB=0;REVB=-0.00816817;RO=0;SAF=50;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.80947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000196458;OID=.;OPOS=135374898;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:105:105:0:0:105:105:1:55:50:0:0:55:50:0:0
chr9	135448320	.	C	A	923.24	PASS	AF=1;AO=63;DP=64;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0185909;FXX=0.0156226;HRUN=3;LEN=1;MLLD=236.655;QD=58.6184;RBI=0.0186224;REFB=0;REVB=0.00108388;RO=0;SAF=38;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.74086e-05;OID=.;OPOS=135448320;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:63:0:0:63:63:1:25:38:0:0:25:38:0:0
chr9	135470414	.	T	C	823.66	PASS	AF=0.546099;AO=77;DP=140;FAO=77;FDP=141;FR=.;FRO=64;FSAF=45;FSAR=32;FSRF=24;FSRR=40;FWDB=-0.0119729;FXX=0.00704176;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.459;QD=23.3662;RBI=0.0215966;REFB=-0.00771465;REVB=-0.0179739;RO=62;SAF=45;SAR=32;SRF=22;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186421;STB=0.594689;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.00532128;OID=.;OPOS=135470414;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:140:141:62:64:77:77:0.546099:32:45:22:40:32:45:24:40
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chr9	135781239	.	A	G	127.28	PASS	AF=0.340909;AO=15;DP=44;FAO=15;FDP=44;FR=.;FRO=29;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=0.00419846;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=230.205;QD=11.5705;RBI=0.00430979;REFB=0.00131786;REVB=0.000973262;RO=28;SAF=4;SAR=11;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.23886;STB=0.633709;STBP=0.233;TYPE=snp;VARB=-0.00234249;OID=.;OPOS=135781239;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:28:29:15:15:0.340909:11:4:13:15:11:4:13:16
chr9	135917679	.	T	A	115.07	PASS	AF=0.541667;AO=13;DP=24;FAO=13;FDP=24;FR=.;FRO=11;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.0307678;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.1522;QD=19.1787;RBI=0.0680778;REFB=0.00513287;REVB=-0.0607283;RO=11;SAF=8;SAR=5;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0582442;STB=0.533281;STBP=0.775;TYPE=snp;VARB=-0.0053065;OID=.;OPOS=135917679;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:24:24:11:11:13:13:0.541667:5:8:6:5:5:8:6:5
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chr9	135961809	.	T	C	501.66	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0262356;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.955;QD=59.0187;RBI=0.0295787;REFB=0;REVB=-0.0136599;RO=0;SAF=14;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.48532e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000101433;OID=.;OPOS=135961809;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:20:14:0:0:20:14:0:0
chr9	135968511	.	C	CTG	1092.02	PASS	AF=0.986486;AO=71;DP=78;FAO=73;FDP=74;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00102622;FXX=0.0512755;HRUN=2;LEN=2;MLLD=268.868;QD=59.0279;RBI=0.00839562;REFB=-0.0189184;REVB=0.00833267;RO=1;SAF=32;SAR=39;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0145478;STB=0.507244;STBP=0.32;TYPE=ins;VARB=-1.42931e-05;OID=.;OPOS=135968512;OREF=-;OALT=TG;OMAPALT=CTG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:0.986486:71:78:73:74:1:34:39:1:0:3:1:32:39:1:0
chr9	135974079	.	G	C	519.99	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0265726;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.575;QD=59.4271;RBI=0.0270823;REFB=0;REVB=0.00522923;RO=0;SAF=21;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.27896e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000188047;OID=.;OPOS=135974079;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:14:21:0:0:14:21:0:0
chr9	135974100	.	G	A	557.13	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0183216;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=226.533;QD=60.2307;RBI=0.0195545;REFB=0;REVB=0.00683354;RO=0;SAF=25;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.78899e-05;OID=.;OPOS=135974100;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:12:25:0:0:12:25:0:0
chr9	135976698	.	G	A	82.32	PASS	AF=0.588235;AO=10;DP=17;FAO=10;FDP=17;FR=.;FRO=7;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.00173861;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=272.662;QD=19.3688;RBI=0.0209056;REFB=-0.00939622;REVB=0.0208332;RO=7;SAF=6;SAR=4;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0211612;STB=0.512171;STBP=0.944;TYPE=snp;VARB=0.00811066;OID=.;OPOS=135976698;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:17:17:7:7:10:10:0.588235:4:6:4:3:4:6:4:3
chr9	135985796	.	C	T	54.66	PASS	AF=0.333333;AO=8;DP=24;FAO=8;FDP=24;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.0340059;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.1547;QD=9.11008;RBI=0.0340158;REFB=-0.00659748;REVB=0.000820629;RO=16;SAF=3;SAR=5;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202856;STB=0.624687;STBP=0.428;TYPE=snp;VARB=0.0136792;OID=.;OPOS=135985796;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:24:24:16:16:8:8:0.333333:5:3:9:7:5:3:9:7
chr9	136004699	.	G	A	392.68	PASS	AF=0.44086;AO=41;DP=92;FAO=41;FDP=93;FR=.;FRO=52;FSAF=15;FSAR=26;FSRF=21;FSRR=31;FWDB=-0.00372834;FXX=0.0106372;HRUN=3;LEN=1;MLLD=181.827;QD=16.8896;RBI=0.00492187;REFB=-0.0137933;REVB=-0.00321315;RO=51;SAF=15;SAR=26;SRF=21;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0481253;STB=0.522602;STBP=0.737;TYPE=snp;VARB=0.0165024;OID=.;OPOS=136004699;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:93:51:52:41:41:0.44086:26:15:21:30:26:15:21:31
chr9	136031346	.	A	G	297.43	PASS	AF=0.757576;AO=24;DP=32;FAO=25;FDP=33;FR=.;FRO=8;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=-0.0211747;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.612;QD=36.0524;RBI=0.0330441;REFB=-0.0373934;REVB=0.0253681;RO=8;SAF=10;SAR=14;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0196788;STB=0.506324;STBP=0.921;TYPE=snp;VARB=0.0138731;OID=.;OPOS=136031346;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:32:33:8:8:24:25:0.757576:14:10:3:5:15:10:3:5
chr9	136037742	.	G	A	419.35	PASS	AF=0.512195;AO=41;DP=81;FAO=42;FDP=82;FR=.;FRO=40;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=-0.0257821;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.8987;QD=20.4562;RBI=0.0739176;REFB=-0.0365566;REVB=0.0692755;RO=40;SAF=16;SAR=25;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0776755;STB=0.53506;STBP=0.554;TYPE=snp;VARB=0.0428872;OID=.;OPOS=136037742;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:82:40:40:41:42:0.512195:25:16:19:21:25:17:19:21
chr9	136083580	.	T	G	212.48	PASS	AF=0.325301;AO=27;DP=83;FAO=27;FDP=83;FR=.;FRO=56;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=22;FSRR=34;FWDB=-0.0229777;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.517;QD=10.24;RBI=0.0290351;REFB=0.000352876;REVB=0.01775;RO=56;SAF=14;SAR=13;SRF=22;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14473;STB=0.584308;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=-0.000893937;OID=.;OPOS=136083580;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:56:56:27:27:0.325301:13:14:22:34:13:14:22:34
chr9	136131651	.	G	A	429.08	PASS	AF=0.440367;AO=48;DP=109;FAO=48;FDP=109;FR=.;FRO=61;FSAF=32;FSAR=16;FSRF=23;FSRR=38;FWDB=0.014885;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.832;QD=15.7459;RBI=0.0151502;REFB=-0.00450076;REVB=0.00282274;RO=61;SAF=32;SAR=16;SRF=23;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.290182;STB=0.662509;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.00899925;OID=.;OPOS=136131651;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:109:61:61:48:48:0.440367:16:32:23:38:16:32:23:38
chr9	136132907	.	GT	GTC,TC	279.53	PASS	AF=0.492063,0.015873;AO=27,3;DP=66;FAO=31,1;FDP=63;FR=.;FRO=31;FSAF=19,0;FSAR=12,1;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.00333674,0.00895566;FXX=0.0307645;HRUN=0,4;LEN=1,2;MLLD=204.669,197.292;QD=17.7482;RBI=0.0163729,0.0189206;REFB=-0.00082945,-0.00151418;REVB=0.0160293,0.0166669;RO=32;SAF=16,1;SAR=11,2;SRF=14;SRR=18;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.149431,-0.110203;STB=0.565914,0.989577;STBP=0.313,0.471;TYPE=ins,mnp;VARB=0.00183798,0.0307262;OID=.,.;OPOS=136132909,136132907;OREF=-,GT;OALT=C,TC;OMAPALT=GTC,TC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:63:32:31:27,3:31,1:0.492063,0.015873:11,2:16,1:14:18:12,1:19,0:15:16
chr9	136133506	.	A	G	483.35	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00867927;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.555;QD=58.5878;RBI=0.0204094;REFB=0;REVB=0.018472;RO=0;SAF=18;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.64315e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.04891e-05;OID=.;OPOS=136133506;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:15:18:0:0:15:18:0:0
chr9	136133531	.	A	G	174.09	PASS	AF=0.5;AO=18;DP=36;FAO=18;FDP=36;FR=.;FRO=18;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=-0.000286998;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.974;QD=19.3436;RBI=0.0401175;REFB=-0.0281996;REVB=-0.0401164;RO=18;SAF=12;SAR=6;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.248975;STB=0.64135;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=0.0180913;OID=.;OPOS=136133531;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:18:18:18:18:0.5:6:12:7:11:6:12:7:11
chr9	136135237	.	AT	GC	483.35	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00752964;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=139.098;QD=58.5878;RBI=0.0272818;REFB=0;REVB=0.0262221;RO=0;SAF=19;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.71297e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000169517;OID=.;OPOS=136135237;OREF=AT;OALT=GC;OMAPALT=GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:14:19:0:0:14:19:0:0
chr9	136136770	.	A	C	306.13	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0200147;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.3391;QD=53.2406;RBI=0.0428079;REFB=0;REVB=-0.0378408;RO=0;SAF=8;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00047017;OID=.;OPOS=136136770;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:15:8:0:0:15:8:0:0
chr9	136199466	.	G	A	2771.02	PASS	AF=1;AO=175;DP=179;FAO=177;FDP=177;FR=.;FRO=0;FSAF=103;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.042782;FXX=0.0111726;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.526;QD=62.622;RBI=0.0470476;REFB=0;REVB=0.0195749;RO=0;SAF=102;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.54377e-06;OID=.;OPOS=136199466;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:15:179:177:0:0:175:177:1:73:102:0:0:74:103:0:0
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chr9	136199551	.	G	A	629.48	PASS	AF=0.507937;AO=62;DP=127;FAO=64;FDP=126;FR=.;FRO=62;FSAF=29;FSAR=35;FSRF=28;FSRR=34;FWDB=0.00466921;FXX=0.0078734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.468;QD=19.9834;RBI=0.00598402;REFB=-0.00775278;REVB=0.0037426;RO=62;SAF=28;SAR=34;SRF=28;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.500751;STBP=0.998;TYPE=snp;VARB=0.00506489;OID=.;OPOS=136199551;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:127:126:62:62:62:64:0.507937:34:28:28:34:35:29:28:34
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chr9	136301982	.	C	G	398.14	PASS	AF=0.519481;AO=39;DP=76;FAO=40;FDP=77;FR=.;FRO=37;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=14;FSRR=23;FWDB=0.0137138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.334;QD=20.6824;RBI=0.0235462;REFB=-0.00932419;REVB=0.0191404;RO=35;SAF=20;SAR=19;SRF=13;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120663;STB=0.558413;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.00806879;OID=.;OPOS=136301982;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:77:35:37:39:40:0.519481:19:20:13:22:20:20:14:23
chr9	136304497	.	A	G	157.88	PASS	AF=0.367347;AO=18;DP=50;FAO=18;FDP=49;FR=.;FRO=31;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=0.0107101;FXX=0.039208;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.378;QD=12.8883;RBI=0.0307834;REFB=0.000892513;REVB=-0.0288602;RO=31;SAF=14;SAR=4;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.319924;STB=0.688891;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=-0.000475475;OID=.;OPOS=136304497;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:49:31:31:18:18:0.367347:4:14:16:15:4:14:16:15
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chr9	136328657	.	T	C	594.45	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.080068;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.27;QD=60.9694;RBI=0.0840421;REFB=0;REVB=0.0255382;RO=0;SAF=18;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.34792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000249219;OID=.;OPOS=136328657;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:21:18:0:0:21:18:0:0
chr9	136340200	.	T	G	812.05	PASS	AF=0.983051;AO=55;DP=56;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0167794;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.435;QD=55.0542;RBI=0.0618072;REFB=-0.125693;REVB=0.059486;RO=0;SAF=34;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.510635;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.0012584;OID=.;OPOS=136340200;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:56:59:0:1:55:58:0.983051:21:34:0:0:23:35:0:1
chr9	136379805	.	TCCCCG	GTCCCG,TCCC,TCCCG,TCCCGG	167.3	PASS	AF=0,0.666667,0,0;AO=3,12,5,2;DP=33;FAO=0,20,0,0;FDP=30;FR=.;FRO=10;FSAF=0,14,0,0;FSAR=0,6,0,0;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=-0.123277,-0.0634985,-0.211067,-0.1596;FXX=0;HRUN=1,4,4,4;LEN=2,2,1,1;MLLD=11.454,22.5628,11.8442,12.4108;QD=22.3063;RBI=0.159877,0.0819493,0.219422,0.196286;REFB=-0.109709,-0.199899,-0.160891,0.0237936;REVB=0.101801,-0.0518037,0.0599732,0.114263;RO=6;SAF=3,7,5,2;SAR=0,5,0,0;SRF=2;SRR=4;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=0.711122,0.147396,0.764618,0.658493;STB=0.5,0.574549,0.5,0.5;STBP=1,0.279,1,1;TYPE=mnp,del,del,snp;VARB=0,0.101282,0,0;OID=.,.,.,.;OPOS=136379805,136379809,136379806,136379809;OREF=TC,CG,C,C;OALT=GT,-,-,G;OMAPALT=GTCCCG,TCCC,TCCCG,TCCCGG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:58:33:30:6:10:3,12,5,2:0,20,0,0:0,0.666667,0,0:0,5,0,0:3,7,5,2:2:4:0,6,0,0:0,14,0,0:5:5
chr9	136379890	.	A	G	292.61	PASS	AF=0.604651;AO=26;DP=42;FAO=26;FDP=43;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=22;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=-0.0306997;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.592;QD=27.2195;RBI=0.0307971;REFB=-0.0119801;REVB=0.00244819;RO=16;SAF=4;SAR=22;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115278;STB=0.592735;STBP=0.244;TYPE=snp;VARB=0.00832523;OID=.;OPOS=136379890;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:43:16:17:26:26:0.604651:22:4:4:12:22:4:5:12
chr9	136412170	.	C	T	766.46	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00108852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.287;QD=63.8718;RBI=0.0226503;REFB=0;REVB=-0.0226242;RO=0;SAF=15;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000101416;OID=.;OPOS=136412170;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:33:15:0:0:33:15:0:0
chr9	136412236	.	A	T	834.41	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0282054;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.557;QD=57.5452;RBI=0.0283345;REFB=0;REVB=0.00270218;RO=0;SAF=20;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.38905e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.85006e-05;OID=.;OPOS=136412236;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:38:20:0:0:38:20:0:0
chr9	136412255	.	A	C	817.75	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0248332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.424;QD=57.3856;RBI=0.0257401;REFB=0;REVB=0.00677244;RO=0;SAF=21;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.35197e-05;OID=.;OPOS=136412255;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:36:21:0:0:36:21:0:0
chr9	136419629	.	G	A	1467.65	PASS	AF=0.979798;AO=94;DP=100;FAO=97;FDP=99;FR=.;FRO=2;FSAF=36;FSAR=61;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0281753;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.59;QD=59.2988;RBI=0.0405504;REFB=-0.129057;REVB=0.0291631;RO=2;SAF=36;SAR=58;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0160684;STB=0.502784;STBP=0.776;TYPE=snp;VARB=0.00115858;OID=.;OPOS=136419629;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:100:99:2:2:94:97:0.979798:58:36:0:2:61:36:1:1
chr9	136440514	.	C	T	497.98	PASS	AF=0.44;AO=55;DP=125;FAO=55;FDP=125;FR=.;FRO=70;FSAF=26;FSAR=29;FSRF=43;FSRR=27;FWDB=-0.00929437;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=136.617;QD=15.9353;RBI=0.0105416;REFB=-0.0185003;REVB=-0.00497393;RO=69;SAF=26;SAR=29;SRF=42;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13493;STB=0.578797;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.0201805;OID=.;OPOS=136440514;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:125:125:69:70:55:55:0.44:29:26:42:27:29:26:43:27
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chr9	136536679	.	G	A	698.72	PASS	AF=0.980392;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.000274082;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.587;QD=54.8017;RBI=0.0243142;REFB=-0.0763273;REVB=0.0243126;RO=0;SAF=22;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.15703e-08;STB=0.508768;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.00068275;OID=.;OPOS=136536679;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:51:51:0:1:50:50:0.980392:28:22:0:0:28:22:0:1
chr9	136536793	.	C	G	1378.44	PASS	AF=0.942308;AO=98;DP=104;FAO=98;FDP=104;FR=.;FRO=6;FSAF=45;FSAR=53;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0118045;FXX=0.0095229;HRUN=5;LEN=1;MLLD=72.4609;QD=53.0171;RBI=0.0141444;REFB=-0.0642558;REVB=-0.00779209;RO=1;SAF=45;SAR=53;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0104236;STB=0.502369;STBP=0.905;TYPE=snp;VARB=0.0074043;OID=.;OPOS=136536793;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:17:104:104:1:6:98:98:0.942308:53:45:1:0:53:45:3:3
chr9	136555629	.	T	C	750.47	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00633578;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.676;QD=63.87;RBI=0.0382267;REFB=0;REVB=0.037698;RO=0;SAF=25;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000144538;OID=.;OPOS=136555629;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:22:25:0:0:22:25:0:0
chr9	136559460	.	C	T	447.0	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0627725;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.998;QD=57.677;RBI=0.0634065;REFB=0;REVB=-0.008944;RO=0;SAF=20;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000193155;OID=.;OPOS=136559460;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:31:0:0:30:31:1:10:20:0:0:11:20:0:0
chr9	136573412	.	G	A	440.67	PASS	AF=0.461538;AO=48;DP=104;FAO=48;FDP=104;FR=.;FRO=56;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=31;FSRR=25;FWDB=0.00702293;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.114;QD=16.949;RBI=0.0164331;REFB=-0.0286275;REVB=0.0148568;RO=56;SAF=25;SAR=23;SRF=31;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0317191;STB=0.517678;STBP=0.745;TYPE=snp;VARB=0.0294131;OID=.;OPOS=136573412;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:104:56:56:48:48:0.461538:23:25:31:25:23:25:31:25
chr9	136628770	.	T	C	1406.85	PASS	AF=1;AO=93;DP=94;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00156355;FXX=0.0686207;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.225;QD=59.2358;RBI=0.0310003;REFB=0;REVB=0.0309608;RO=0;SAF=45;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000794881;OID=.;OPOS=136628770;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:94:95:0:0:93:95:1:48:45:0:0:49:46:0:0
chr9	136897978	.	A	T	222.19	PASS	AF=0.647059;AO=11;DP=26;FAO=22;FDP=34;FR=.;FRO=12;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.169795;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=21.6588;QD=26.1396;RBI=0.213578;REFB=-0.126493;REVB=0.129558;RO=15;SAF=7;SAR=4;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0324673;STB=0.538886;STBP=0.556;TYPE=snp;VARB=0.102496;OID=.;OPOS=136897978;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:69:26:34:15:12:11:22:0.647059:4:7:10:5:7:15:7:5
chr9	136898627	.	A	G	128.31	PASS	AF=0.518519;AO=14;DP=27;FAO=14;FDP=27;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.0437005;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.54;QD=19.0093;RBI=0.0439448;REFB=-0.00975607;REVB=-0.00462706;RO=13;SAF=7;SAR=7;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0324097;STB=0.518492;STBP=0.864;TYPE=snp;VARB=0.00726723;OID=.;OPOS=136898627;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:13:13:14:14:0.518519:7:7:6:7:7:7:6:7
chr9	136907005	.	G	A	193.95	PASS	AF=0.545455;AO=17;DP=33;FAO=18;FDP=33;FR=.,HEALED;FRO=12;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=-0.0835015;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=53.6597;QD=23.5087;RBI=0.0891087;REFB=-0.0695342;REVB=0.0311107;RO=11;SAF=5;SAR=12;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.312094;STB=0.636209;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.0112223;OID=.;OPOS=136907005;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:93:33:33:11:12:17:18:0.545455:12:5:8:3:12:6:8:4
chr9	136913355	.	T	C	188.69	PASS	AF=0.415094;AO=22;DP=53;FAO=22;FDP=53;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=-0.00618922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.104;QD=14.2407;RBI=0.00654771;REFB=-0.0107907;REVB=0.00213682;RO=31;SAF=12;SAR=10;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0363894;STB=0.520814;STBP=0.828;TYPE=snp;VARB=0.0141237;OID=.;OPOS=136913355;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:31:31:22:22:0.415094:10:12:18:13:10:12:18:13
chr9	137005023	.	C	T	353.61	PASS	AF=0.426966;AO=38;DP=90;FAO=38;FDP=89;FR=.;FRO=51;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=29;FSRR=22;FWDB=0.0233135;FXX=0.0111099;HRUN=3;LEN=1;MLLD=152.019;QD=15.8924;RBI=0.0233501;REFB=-0.0289362;REVB=-0.00130569;RO=51;SAF=21;SAR=17;SRF=29;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0164739;STB=0.509282;STBP=0.892;TYPE=snp;VARB=0.0411443;OID=.;OPOS=137005023;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:89:51:51:38:38:0.426966:17:21:29:22:17:21:29:22
chr9	137271318	.	C	A	367.67	PASS	AF=0.580645;AO=35;DP=60;FAO=36;FDP=62;FR=.;FRO=26;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=0.0988174;FXX=0.0312451;HRUN=5;LEN=1;MLLD=77.9914;QD=23.7206;RBI=0.101147;REFB=-0.00144638;REVB=0.0215825;RO=24;SAF=16;SAR=19;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0932494;STB=0.527762;STBP=0.622;TYPE=snp;VARB=0.00170524;OID=.;OPOS=137271318;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:62:24:26:35:36:0.580645:19:16:14:10:19:17:14:12
chr9	137330560	.	C	T	215.35	PASS	AF=0.40625;AO=24;DP=64;FAO=26;FDP=64;FR=.;FRO=38;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=0.00110043;FXX=0.0447694;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.782;QD=13.4592;RBI=0.00126309;REFB=-0.0156652;REVB=-0.000620037;RO=39;SAF=6;SAR=18;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.331227;STB=0.650753;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.0192957;OID=.;OPOS=137330560;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:39:38:24:26:0.40625:18:6:21:18:18:8:21:17
chr9	137332311	.	T	G	768.98	PASS	AF=0.548872;AO=73;DP=133;FAO=73;FDP=133;FR=.;FRO=60;FSAF=30;FSAR=43;FSRF=26;FSRR=34;FWDB=-0.00996448;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.787;QD=23.1273;RBI=0.0220139;REFB=-0.0240541;REVB=0.0196296;RO=60;SAF=30;SAR=43;SRF=26;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0189817;STB=0.510383;STBP=0.791;TYPE=snp;VARB=0.0186388;OID=.;OPOS=137332311;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:133:133:60:60:73:73:0.548872:43:30:26:34:43:30:26:34
chr9	137619195	.	C	T	172.21	PASS	AF=0.653846;AO=17;DP=26;FAO=17;FDP=26;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=-0.0169667;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=280.972;QD=26.4935;RBI=0.0183244;REFB=-0.0359922;REVB=0.00692196;RO=9;SAF=4;SAR=13;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.011361;STB=0.506322;STBP=0.973;TYPE=snp;VARB=0.0194513;OID=.;OPOS=137619195;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:26:26:9:9:17:17:0.653846:13:4:2:7:13:4:2:7
chr9	137630587	.	T	C	130.02	PASS	AF=0.384615;AO=15;DP=39;FAO=15;FDP=39;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.0304487;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.1586;QD=13.3355;RBI=0.0308009;REFB=-0.0099092;REVB=-0.00464467;RO=23;SAF=6;SAR=9;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171272;STB=0.612096;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=0.0201899;OID=.;OPOS=137630587;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:23:24:15:15:0.384615:9:6:13:10:9:6:14:10
chr9	137686906	.	C	T	729.01	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0147637;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=258.341;QD=57.1775;RBI=0.0224955;REFB=0;REVB=-0.0169729;RO=0;SAF=27;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.98982e-06;OID=.;OPOS=137686906;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:24:27:0:0:24:27:0:0
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chr9	137711997	.	G	C	337.94	PASS	AF=0.617021;AO=29;DP=47;FAO=29;FDP=47;FR=.;FRO=18;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=0.000739637;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=63.4046;QD=28.7604;RBI=0.0181108;REFB=0.0244001;REVB=0.0180957;RO=18;SAF=17;SAR=12;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0179217;STB=0.509857;STBP=0.894;TYPE=snp;VARB=-0.0246456;OID=.;OPOS=137711997;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:18:18:29:29:0.617021:12:17:11:7:12:17:11:7
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chr9	137968919	.	G	A,GAA	1094.87	PASS	AF=0.0810811,0.918919;AO=9,60;DP=78;FAO=6,68;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=1,31;FSAR=5,37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0314604,0.0171576;FXX=0.0512755;HRUN=2,0;LEN=1,2;MLLD=29.8245,225.225;QD=59.1824;RBI=0.0731071,0.0280199;REFB=0,0;REVB=0.0659916,0.0221525;RO=6;SAF=2,27;SAR=7,33;SRF=2;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.102872,0.0201952;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,ins;VARB=0.0218823,-0.000808945;OID=.,.;OPOS=137968919,137968920;OREF=G,-;OALT=A,AA;OMAPALT=A,GAA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:23:78:74:6:0:9,60:6,68:0.0810811,0.918919:7,33:2,27:2:4:5,37:1,31:0:0
chr9	137978552	.	A	G	156.63	PASS	AF=0.323077;AO=21;DP=65;FAO=21;FDP=65;FR=.;FRO=44;FSAF=4;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=26;FWDB=-0.00340263;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.5916;QD=9.63858;RBI=0.0201322;REFB=-0.00649529;REVB=-0.0198426;RO=44;SAF=4;SAR=17;SRF=18;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.308208;STB=0.684784;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.014559;OID=.;OPOS=137978552;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:44:44:21:21:0.323077:17:4:18:26:17:4:18:26
chr9	137982127	.	T	C	315.94	PASS	AF=0.416667;AO=34;DP=83;FAO=35;FDP=84;FR=.;FRO=49;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=23;FSRR=26;FWDB=0.00417862;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.524;QD=15.0447;RBI=0.00905567;REFB=-0.0111013;REVB=-0.00803395;RO=49;SAF=19;SAR=15;SRF=23;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0931772;STB=0.559693;STBP=0.37;TYPE=snp;VARB=0.0151467;OID=.;OPOS=137982127;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:84:49:49:34:35:0.416667:15:19:23:26:15:20:23:26
chr9	138236031	.	A	G	1363.07	PASS	AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000414297;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.273;QD=62.6698;RBI=0.00503649;REFB=0;REVB=0.00501942;RO=0;SAF=49;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.62192e-05;OID=.;OPOS=138236031;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:38:49:0:0:38:49:0:0
chr9	138236212	.	T	G	1349.71	PASS	AF=1;AO=84;DP=84;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.022589;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.197;QD=62.0557;RBI=0.0243515;REFB=0;REVB=0.00909575;RO=0;SAF=29;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.48925e-06;OID=.;OPOS=138236212;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:87:0:0:84:87:1:55:29:0:0:57:30:0:0
chr9	138376649	.	T	C	1227.47	PASS	AF=1;AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0344079;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.3102;QD=61.3735;RBI=0.0533051;REFB=0;REVB=0.0407128;RO=0;SAF=39;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.29116e-05;OID=.;OPOS=138376649;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:80:80:0:0:80:80:1:41:39:0:0:41:39:0:0
chr9	138376972	.	A	G	50.13	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0185449;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.771;QD=33.4208;RBI=0.0449514;REFB=0;REVB=-0.0409477;RO=0;SAF=3;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00040406;OID=.;OPOS=138376972;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:3:3:0:0:3:3:0:0
chr9	138377657	.	T	C,G	1502.71	PASS	AF=0.959184,0.0306122;AO=91,4;DP=97;FAO=94,3;FDP=98;FR=.;FRO=1;FSAF=53,0;FSAR=41,3;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.000983358,-0.0186218;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=158.305,66.1846;QD=61.3352;RBI=0.0247346,0.022506;REFB=0.0142675,-0.04642;REVB=0.0247151,-0.0126392;RO=1;SAF=53,0;SAR=38,4;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0123103,0;STB=0.506023,0.5;STBP=0.309,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00130298,0.0524608;OID=.,.;OPOS=138377657,138377657;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:7:97:98:1:1:91,4:94,3:0.959184,0.0306122:38,4:53,0:0:1:41,3:53,0:0:1
chr9	138377853	.	A	G	1132.0	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00872876;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.622;QD=60.3733;RBI=0.0479377;REFB=0;REVB=0.0471363;RO=0;SAF=45;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.27032e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000101545;OID=.;OPOS=138377853;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:75:0:0:72:75:1:27:45:0:0:30:45:0:0
chr9	138377915	.	G	A	689.33	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0456543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.6104;QD=62.6665;RBI=0.0708118;REFB=0;REVB=0.0541294;RO=0;SAF=21;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00140974;OID=.;OPOS=138377915;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:23:21:0:0:23:21:0:0
chr9	138378856	.	A	G	1008.41	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0244838;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.474;QD=59.3184;RBI=0.0385202;REFB=0;REVB=-0.029738;RO=0;SAF=25;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.88258e-05;OID=.;OPOS=138378856;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:43:25:0:0:43:25:0:0
chr9	138379002	.	T	G	681.73	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0174172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.667;QD=60.5979;RBI=0.028649;REFB=0;REVB=0.0227466;RO=0;SAF=31;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.72514e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000319756;OID=.;OPOS=138379002;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:45:0:0:42:45:1:11:31:0:0:12:33:0:0
chr9	138379059	.	G	T	1096.27	PASS	AF=1;AO=70;DP=71;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0470388;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.3052;QD=59.2579;RBI=0.103245;REFB=0;REVB=0.0919068;RO=0;SAF=37;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00124359;OID=.;OPOS=138379059;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:74:0:0:70:74:1:33:37:0:0:33:41:0:0
chr9	138380334	.	T	C	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0127725;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.388;QD=59.4357;RBI=0.0236246;REFB=0;REVB=0.0198743;RO=0;SAF=16;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.1382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.7063e-05;OID=.;OPOS=138380334;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:19:16:0:0:19:16:0:0
chr9	138391299	.	T	A	209.62	PASS	AF=0.423729;AO=23;DP=57;FAO=25;FDP=59;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=26;FSRR=8;FWDB=-0.00177588;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.6477;QD=14.2114;RBI=0.0688516;REFB=-0.0209513;REVB=0.0688286;RO=34;SAF=12;SAR=11;SRF=26;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.259589;STB=0.662081;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.0294361;OID=.;OPOS=138391299;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:59:34:34:23:25:0.423729:11:12:26:8:13:12:26:8
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chr9	138440527	.	T	C	929.3	PASS	AF=0.970149;AO=65;DP=67;FAO=65;FDP=67;FR=.;FRO=2;FSAF=31;FSAR=34;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0297425;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.202;QD=55.4807;RBI=0.0301357;REFB=0.00708867;REVB=0.00485211;RO=2;SAF=31;SAR=34;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0295018;STB=0.51562;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=-0.000152428;OID=.;OPOS=138440527;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:67:67:2:2:65:65:0.970149:34:31:2:0:34:31:2:0
chr9	138440641	.	T	C	731.37	PASS	AF=1;AO=44;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0163449;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.123;QD=63.5974;RBI=0.0236499;REFB=0;REVB=0.0170928;RO=0;SAF=20;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.30465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.01946e-05;OID=.;OPOS=138440641;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:44:46:1:24:20:0:0:24:22:0:0
chr9	138456155	.	C	A	130.17	PASS	AF=0.365854;AO=15;DP=42;FAO=15;FDP=41;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=-0.00492156;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.338;QD=12.6995;RBI=0.00937225;REFB=-0.00680476;REVB=-0.00797605;RO=27;SAF=8;SAR=7;SRF=18;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148551;STB=0.577458;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=0.0104793;OID=.;OPOS=138456155;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:41:27:26:15:15:0.365854:7:8:18:9:7:8:17:9
chr9	138457209	.	C	G	690.45	PASS	AF=1;AO=44;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0195821;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.3566;QD=61.3735;RBI=0.097356;REFB=0;REVB=0.0953662;RO=0;SAF=19;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000880253;OID=.;OPOS=138457209;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:44:45:1:25:19:0:0:26:19:0:0
chr9	138457475	.	CT	C,CC	456.84	PASS	AF=1,0;AO=28,2;DP=32;FAO=32,0;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=5,0;FSAR=27,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0751311,0.082202;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=310.717,295.119;QD=57.105;RBI=0.0761398,0.0831476;REFB=0,0;REVB=-0.0123528,-0.0125037;RO=0;SAF=3,0;SAR=25,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.13441e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.000161021,0;OID=.,.;OPOS=138457476,138457476;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1,0:28,2:32:32,0:32:0:5,0:27,0:0:0:4:0:3,0:25,2:0:0
chr9	138458462	.	C	T	1459.38	PASS	AF=0.990196;AO=96;DP=97;FAO=101;FDP=102;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0125544;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.3483;QD=57.2307;RBI=0.0320463;REFB=-0.0104389;REVB=-0.0294848;RO=1;SAF=42;SAR=54;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00870172;STB=0.504424;STBP=0.484;TYPE=snp;VARB=0.000446981;OID=.;OPOS=138458462;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:97:102:1:1:96:101:0.990196:54:42:0:1:56:45:0:1
chr9	138458570	.	C	T	2251.89	PASS	AF=0.979866;AO=144;DP=146;FAO=146;FDP=149;FR=.;FRO=3;FSAF=93;FSAR=53;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.00734974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.095;QD=60.4533;RBI=0.0610972;REFB=-0.00360258;REVB=0.0606535;RO=2;SAF=93;SAR=51;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0101164;STB=0.500646;STBP=0.951;TYPE=snp;VARB=0.000525671;OID=.;OPOS=138458570;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:146:149:2:3:144:146:0.979866:51:93:2:0:53:93:2:1
chr9	138515991	.	A	G	231.05	PASS	AF=0.464286;AO=26;DP=56;FAO=26;FDP=56;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=-0.0054112;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.1156;QD=16.5039;RBI=0.00870558;REFB=0.0112287;REVB=0.00681953;RO=30;SAF=13;SAR=13;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0316469;STB=0.517843;STBP=0.821;TYPE=snp;VARB=-0.0135362;OID=.;OPOS=138515991;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:30:30:26:26:0.464286:13:13:16:14:13:13:16:14
chr9	138516190	.	T	C	309.89	PASS	AF=0.5;AO=33;DP=66;FAO=33;FDP=66;FR=.;FRO=33;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=-0.0262325;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.5455;QD=18.781;RBI=0.0323262;REFB=-0.018715;REVB=-0.0188902;RO=32;SAF=15;SAR=18;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0152189;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.015742;OID=.;OPOS=138516190;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:32:33:33:33:0.5:18:15:14:18:18:15:15:18
chr9	138518010	.	A	G	1433.49	PASS	AF=1;AO=90;DP=90;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.019801;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.191;QD=63.0106;RBI=0.0204153;REFB=0;REVB=0.00497023;RO=0;SAF=57;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.18591e-05;OID=.;OPOS=138518010;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:90:91:0:0:90:91:1:33:57:0:0:34:57:0:0
chr9	138523332	.	C	A	954.3	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0132168;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=305.859;QD=58.7263;RBI=0.0289698;REFB=0;REVB=0.0257792;RO=0;SAF=29;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.87078e-06;OID=.;OPOS=138523332;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:65:0:0:64:65:1:35:29:0:0:36:29:0:0
chr9	138557934	.	C	A	279.42	PASS	AF=0.530612;AO=25;DP=48;FAO=26;FDP=49;FR=.;FRO=23;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=-0.0085;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.725;QD=22.8095;RBI=0.0334939;REFB=-0.0075174;REVB=0.0323973;RO=23;SAF=15;SAR=10;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0686647;STB=0.526295;STBP=0.716;TYPE=snp;VARB=0.00950194;OID=.;OPOS=138557934;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:49:23:23:25:26:0.530612:10:15:12:11:11:15:12:11
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chr9	138586966	.	GC	AA	1480.01	PASS	AF=1;AO=93;DP=95;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0298553;FXX=0.0210504;HRUN=4;LEN=2;MLLD=147.353;QD=63.6561;RBI=0.0298569;REFB=0;REVB=-0.000308606;RO=0;SAF=37;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=7.18266e-05;OID=.;OPOS=138586966;OREF=GC;OALT=AA;OMAPALT=AA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:93:0:0:93:93:1:56:37:0:0:56:37:0:0
chr9	138644203	.	T	C	288.45	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00662406;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.3516;QD=52.4446;RBI=0.100829;REFB=0;REVB=0.100611;RO=0;SAF=11;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00163482;OID=.;OPOS=138644203;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:11:11:0:0:11:11:0:0
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chr9	138702620	.	C	A	307.98	PASS	AF=0.588235;AO=30;DP=51;FAO=30;FDP=51;FR=.;FRO=21;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=-0.0028328;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.81;QD=24.155;RBI=0.0028329;REFB=-0.00624846;REVB=2.46256e-05;RO=21;SAF=19;SAR=11;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0114315;STB=0.506307;STBP=0.937;TYPE=snp;VARB=0.00457818;OID=.;OPOS=138702620;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:21:21:30:30:0.588235:11:19:13:8:11:19:13:8
chr9	138712896	.	C	T	428.52	PASS	AF=0.545455;AO=42;DP=77;FAO=42;FDP=77;FR=.;FRO=35;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=0.0204654;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.607;QD=22.2608;RBI=0.0268751;REFB=-0.0161198;REVB=-0.0174195;RO=34;SAF=22;SAR=20;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0432323;STB=0.53027;STBP=0.567;TYPE=snp;VARB=0.00755255;OID=.;OPOS=138712896;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:34:35:42:42:0.545455:20:22:16:18:20:22:16:19
chr9	138838140	.	T	C	520.02	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.001489;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.19;QD=59.4313;RBI=0.00275427;REFB=0;REVB=-0.00231709;RO=0;SAF=17;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.42556e-06;OID=.;OPOS=138838140;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:18:17:0:0:18:17:0:0
chr9	138898893	.	C	G	1494.88	PASS	AF=1;AO=93;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00432633;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.842;QD=63.6118;RBI=0.00456617;REFB=0;REVB=-0.0014604;RO=0;SAF=51;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.8776e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.73e-05;OID=.;OPOS=138898893;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:94:94:0:0:93:94:1:42:51:0:0:42:52:0:0
chr9	138899253	.	G	GCA	48.23	PASS	AF=0.466667;AO=7;DP=18;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=-0.0275994;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=198.656;QD=12.8607;RBI=0.0315131;REFB=-0.0361489;REVB=0.01521;RO=11;SAF=2;SAR=5;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.270468;STB=0.555391;STBP=0.758;TYPE=ins;VARB=0.0442404;OID=.;OPOS=138899254;OREF=-;OALT=CA;OMAPALT=GCA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.466667:7:18:7:15:8:2:5:3:5:47:11:2:5:6:5
chr9	138903671	.	A	G	162.85	PASS	AF=0.515152;AO=16;DP=32;FAO=17;FDP=33;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=-0.00408736;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.959;QD=19.739;RBI=0.0376652;REFB=0.00662377;REVB=-0.0374428;RO=16;SAF=5;SAR=11;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0658609;STB=0.556388;STBP=0.559;TYPE=snp;VARB=-0.0042187;OID=.;OPOS=138903671;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:33:16:16:16:17:0.515152:11:5:4:12:11:6:4:12
chr9	138905136	.	C	T	584.38	PASS	AF=0.495868;AO=60;DP=121;FAO=60;FDP=121;FR=.;FRO=61;FSAF=26;FSAR=34;FSRF=28;FSRR=33;FWDB=0.0176788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.3471;QD=19.3182;RBI=0.019742;REFB=-0.0122028;REVB=0.00878669;RO=61;SAF=26;SAR=34;SRF=28;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0237638;STB=0.513131;STBP=0.797;TYPE=snp;VARB=0.0179886;OID=.;OPOS=138905136;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:121:121:61:61:60:60:0.495868:34:26:28:33:34:26:28:33
chr9	139006673	.	G	GA	57.72	PASS	AF=0.4;AO=13;DP=30;FAO=12;FDP=30;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.00350754;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=17.2015;QD=7.69597;RBI=0.0888882;REFB=-0.00685383;REVB=-0.088819;RO=15;SAF=4;SAR=9;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.277322;STB=0.604472;STBP=0.361;TYPE=ins;VARB=-0.0242886;OID=.;OPOS=139006674;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.4:13:30:12:30:18:4:8:9:9:57:15:4:9:9:6
chr9	139100733	.	G	A	68.82	PASS	AF=0.5;AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=1;FWDB=-0.0625521;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.7611;QD=15.2926;RBI=0.0767599;REFB=-0.0139848;REVB=-0.0444894;RO=9;SAF=4;SAR=5;SRF=8;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.372859;STB=0.713877;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=0.00721864;OID=.;OPOS=139100733;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:18:18:9:9:9:9:0.5:5:4:8:1:5:4:8:1
chr9	139100805	.	T	C	923.75	PASS	AF=1;AO=63;DP=64;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0432195;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.398;QD=58.6511;RBI=0.0645493;REFB=0;REVB=0.0479447;RO=0;SAF=28;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.01837e-05;OID=.;OPOS=139100805;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:63:0:0:63:63:1:35:28:0:0:35:28:0:0
chr9	139110654	.	C	T	275.76	PASS	AF=0.705882;AO=24;DP=34;FAO=24;FDP=34;FR=.;FRO=10;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.0138964;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.872;QD=32.4422;RBI=0.0175291;REFB=0.00795918;REVB=-0.0106845;RO=10;SAF=14;SAR=10;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151918;STB=0.583264;STBP=0.128;TYPE=snp;VARB=-0.0025746;OID=.;OPOS=139110654;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:71:34:34:10:10:24:24:0.705882:10:14:3:7:10:14:3:7
chr9	139142808	.	T	C	607.22	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.022139;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.9124;QD=60.7217;RBI=0.079064;REFB=0;REVB=0.0759012;RO=0;SAF=13;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000970178;OID=.;OPOS=139142808;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:40:0:0:37:40:1:24:13:0:0:27:13:0:0
chr9	139235481	.	TC	GT,T	261.13	PASS	AF=0.0909091,0.454545;AO=6,22;DP=55;FAO=5,25;FDP=55;FR=.;FRO=25;FSAF=5,6;FSAR=0,19;FSRF=6;FSRR=19;FWDB=-0.0231872,-0.105604;FXX=0.017854;HRUN=1,4;LEN=2,1;MLLD=52.9237,24.2228;QD=18.9912;RBI=0.0304507,0.117204;REFB=0.00352311,0.00190661;REVB=-0.0197382,0.0508376;RO=24;SAF=4,5;SAR=2,17;SRF=5;SRR=19;SSEN=0,0.306569;SSEP=0,0;SSSB=0.511624,0.0253055;STB=0.998534,0.5;STBP=0,1;TYPE=mnp,del;VARB=-0.0337374,-0.000737129;OID=.,.;OPOS=139235481,139235482;OREF=TC,C;OALT=GT,-;OMAPALT=GT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:55:55:24:25:6,22:5,25:0.0909091,0.454545:2,17:4,5:5:19:0,19:5,6:6:19
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chr9	139243226	.	C	T	184.83	PASS	AF=0.475;AO=19;DP=40;FAO=19;FDP=40;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=6;FSRR=15;FWDB=-0.0237174;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.661;QD=18.483;RBI=0.0441089;REFB=-0.0167929;REVB=0.0371898;RO=19;SAF=5;SAR=14;SRF=4;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0621804;STB=0.515034;STBP=0.9;TYPE=snp;VARB=0.0158973;OID=.;OPOS=139243226;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:19:21:19:19:0.475:14:5:4:15:14:5:6:15
chr9	139252495	.	G	A	2412.47	PASS	AF=1;AO=156;DP=158;FAO=157;FDP=157;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0517967;FXX=0.0187488;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.603;QD=61.4643;RBI=0.0766399;REFB=0;REVB=0.0564869;RO=0;SAF=70;SAR=86;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000132337;OID=.;OPOS=139252495;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:158:157:0:0:156:157:1:86:70:0:0:86:71:0:0
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chr9	139261991	.	A	G	150.09	PASS	AF=0.516129;AO=16;DP=30;FAO=16;FDP=31;FR=.;FRO=15;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.120382;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.9241;QD=19.3663;RBI=0.168546;REFB=-0.00338018;REVB=-0.117966;RO=14;SAF=10;SAR=6;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106233;STB=0.578413;STBP=0.379;TYPE=snp;VARB=-0.00712502;OID=.;OPOS=139261991;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:31:14:15:16:16:0.516129:6:10:7:7:6:10:7:8
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chr9	139656670	.	T	C	1847.74	PASS	AF=0.931818;AO=121;DP=132;FAO=123;FDP=132;FR=.,HEALED;FRO=6;FSAF=73;FSAR=50;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=-0.0162744;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.644;QD=55.992;RBI=0.0386624;REFB=0.0204726;REVB=0.0350703;RO=3;SAF=71;SAR=50;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0196464;STB=0.519734;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=-0.00458527;OID=.;OPOS=139656670;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:132:132:3:6:121:123:0.931818:50:71:3:0:50:73:6:0
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chr9	139657834	.	G	C	711.55	PASS	AF=0.962963;AO=52;DP=54;FAO=52;FDP=54;FR=.;FRO=2;FSAF=32;FSAR=20;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00784105;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=294.079;QD=52.7075;RBI=0.0178137;REFB=-0.0378892;REVB=0.0159952;RO=2;SAF=32;SAR=20;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0285316;STB=0.515146;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=0.00209404;OID=.;OPOS=139657834;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:54:54:2:2:52:52:0.962963:20:32:2:0:20:32:2:0
chr9	139690840	.	G	A	240.14	PASS	AF=0.465517;AO=27;DP=58;FAO=27;FDP=58;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=0.00635501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.934;QD=16.5617;RBI=0.0112811;REFB=-0.0245909;REVB=0.00932076;RO=31;SAF=10;SAR=17;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141757;STB=0.579992;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=0.0204987;OID=.;OPOS=139690840;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:31:31:27:27:0.465517:17:10:16:15:17:10:16:15
chr9	139700605	.	T	C,G	704.06	PASS	AF=0.96,0.04;AO=49,2;DP=51;FAO=48,2;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=31,2;FSAR=17,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0102647,-0.0318939;FXX=0.019604;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=64.0117,161.818;QD=56.3251;RBI=0.0437585,0.0405579;REFB=0,0;REVB=0.0425375,-0.0250544;RO=0;SAF=31,2;SAR=18,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=4.58521e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00665435,0.126189;OID=.,.;OPOS=139700605,139700605;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:7:51:50:0:0:49,2:48,2:0.96,0.04:18,0:31,2:0:0:17,0:31,2:0:0
chr9	139701108	.	A	C	483.31	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0593651;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.3768;QD=58.5835;RBI=0.0613953;REFB=0;REVB=-0.0156577;RO=0;SAF=12;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00139102;OID=.;OPOS=139701108;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:21:12:0:0:21:12:0:0
chr9	139726239	.	A	G	1093.4	PASS	AF=0.987179;AO=72;DP=75;FAO=77;FDP=78;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0295965;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.3351;QD=56.0719;RBI=0.0529778;REFB=0.0768065;REVB=0.0439397;RO=3;SAF=33;SAR=39;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0158317;STB=0.506848;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.00545236;OID=.;OPOS=139726239;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:75:78:3:1:72:77:0.987179:39:33:2:1:41:36:1:0
chr9	139732331	.	G	C	1453.76	PASS	AF=1;AO=91;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0263057;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.0916;QD=63.207;RBI=0.0272819;REFB=0;REVB=-0.00723279;RO=1;SAF=48;SAR=43;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00977343;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.33443e-05;OID=.;OPOS=139732331;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:92:92:1:0:91:92:1:43:48:1:0:43:49:0:0
chr9	139739643	.	T	C	373.67	PASS	AF=1;AO=24;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0631699;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.019;QD=55.3585;RBI=0.0644411;REFB=0;REVB=-0.0127365;RO=0;SAF=10;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000425856;OID=.;OPOS=139739643;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:24:27:1:14:10:0:0:14:13:0:0
chr9	139749067	.	C	T	731.55	PASS	AF=1;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0595537;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.871;QD=63.6132;RBI=0.0600693;REFB=0;REVB=0.00785346;RO=0;SAF=23;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000248134;OID=.;OPOS=139749067;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:46:0:0:46:46:1:23:23:0:0:23:23:0:0
chr9	139752895	.	GGCCT	G,GGC,GGCCG	355.7	PASS	AF=0,0.357143,0.642857;AO=4,4,14;DP=28;FAO=0,10,18;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=0,10,7;FSAR=0,0,11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0579658,0.0427563,0.0445478;FXX=0;HRUN=2,2,1;LEN=4,2,1;MLLD=62.9522,78.0969,88.2193;QD=50.8143;RBI=0.0648335,0.0484913,0.0663137;REFB=0,0,0;REVB=-0.0290405,0.0228758,0.0491223;RO=0;SAF=4,4,3;SAR=0,0,11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0.23208,0;SSEP=0.460587,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,del,snp;VARB=0,0.0688521,0.0137958;OID=.,.,.;OPOS=139752896,139752898,139752899;OREF=GCCT,CT,T;OALT=-,-,G;OMAPALT=G,GGC,GGCCG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	2/3:0,0.357143,0.642857:4,4,14:28:0,10,18:28:0:0,10,7:0,0,11:0:0:50:0:4,4,3:0,0,11:0:0
chr9	139795049	.	A	G	329.17	PASS	AF=0.539683;AO=33;DP=62;FAO=34;FDP=63;FR=.;FRO=29;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=-0.00151573;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.2352;QD=20.8999;RBI=0.0660133;REFB=-0.0499687;REVB=-0.0659959;RO=28;SAF=17;SAR=16;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0716344;STB=0.553042;STBP=0.39;TYPE=snp;VARB=0.0314331;OID=.;OPOS=139795049;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:63:28:29:33:34:0.539683:16:17:12:16:16:18:12:17
chr9	139839904	.	T	G	243.92	PASS	AF=1;AO=18;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0378711;FXX=0.049975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.1928;QD=51.3525;RBI=0.0535982;REFB=0;REVB=-0.0379282;RO=0;SAF=7;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000476834;OID=.;OPOS=139839904;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:18:19:1:11:7:0:0:11:8:0:0
chr9	139840543	.	A	C,G	318.05	PASS	AF=0.125,0.875;AO=2,22;DP=24;FAO=3,21;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=2,16;FSAR=1,5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0497804,0.0146206;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=25.7947,64.5685;QD=53.0083;RBI=0.0696057,0.0808397;REFB=0,0;REVB=-0.0486504,-0.0795066;RO=0;SAF=1,17;SAR=1,5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.58081e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0365697,-0.0439064;OID=.,.;OPOS=139840543,139840543;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:14:24:24:0:0:2,22:3,21:0.125,0.875:1,5:1,17:0:0:1,5:2,16:0:0
chr9	139848688	.	C	T	1972.46	PASS	AF=1;AO=124;DP=127;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0316375;FXX=0.0230751;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.695;QD=62.1246;RBI=0.0354253;REFB=0;REVB=0.015938;RO=0;SAF=58;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000245386;OID=.;OPOS=139848688;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:127:127:0:0:124:127:1:66:58:0:0:69:58:0:0
chr9	139849843	.	G	A	39.05	PASS	AF=0.461538;AO=6;DP=13;FAO=6;FDP=13;FR=.;FRO=7;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.0157928;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.26;QD=12.0156;RBI=0.0600389;REFB=-0.00526926;REVB=0.0579246;RO=7;SAF=1;SAR=5;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.505451;STB=0.809724;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=0.00934692;OID=.;OPOS=139849843;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:13:13:7:7:6:6:0.461538:5:1:5:2:5:1:5:2
chr9	139872048	.	A	G	2121.45	PASS	AF=1;AO=135;DP=135;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0302849;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.791;QD=62.8577;RBI=0.0561632;REFB=0;REVB=-0.0472983;RO=0;SAF=75;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.67788e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.78804e-05;OID=.;OPOS=139872048;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:135:135:0:0:135:135:1:60:75:0:0:60:75:0:0
chr9	139878317	.	C	T	444.37	PASS	AF=0.942857;AO=32;DP=35;FAO=33;FDP=35;FR=.;FRO=2;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0124263;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.89;QD=50.7853;RBI=0.0190269;REFB=-0.187591;REVB=-0.0144086;RO=3;SAF=17;SAR=15;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0755361;STB=0.5263;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=0.00852853;OID=.;OPOS=139878317;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:35:35:3:2:32:33:0.942857:15:17:3:0:15:18:2:0
chr9	139878828	.	T	C	272.56	PASS	AF=1;AO=20;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0110196;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.592;QD=51.9161;RBI=0.0133802;REFB=0;REVB=0.0075894;RO=0;SAF=7;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.08347e-05;OID=.;OPOS=139878828;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:20:21:1:13:7:0:0:13:8:0:0
chr9	139902214	.	A	G	1135.25	PASS	AF=1;AO=74;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00255468;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.3648;QD=60.5464;RBI=0.0422738;REFB=0;REVB=-0.0421965;RO=0;SAF=31;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000182698;OID=.;OPOS=139902214;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:75:0:0:74:75:1:43:31:0:0:44:31:0:0
chr9	139904037	.	A	G	323.18	PASS	AF=0.925926;AO=25;DP=27;FAO=25;FDP=27;FR=.;FRO=2;FSAF=18;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0232962;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.795;QD=47.879;RBI=0.0241826;REFB=-0.0312894;REVB=-0.00648726;RO=2;SAF=18;SAR=7;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0488216;STB=0.526295;STBP=0.445;TYPE=snp;VARB=0.00482405;OID=.;OPOS=139904037;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:27:27:2:2:25:25:0.925926:7:18:2:0:7:18:2:0
chr9	139906359	.	G	A	651.23	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0070058;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.972;QD=62.022;RBI=0.0501757;REFB=0;REVB=0.0496842;RO=0;SAF=20;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000152213;OID=.;OPOS=139906359;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:22:20:0:0:22:20:0:0
chr9	139912484	.	A	G	323.46	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00930429;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.453;QD=53.9091;RBI=0.0139464;REFB=0;REVB=0.0103891;RO=0;SAF=15;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.0314e-06;OID=.;OPOS=139912484;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:9:15:0:0:9:15:0:0
chr9	139913239	.	T	G	1622.82	PASS	AF=1;AO=104;DP=104;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0136121;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.712;QD=59.553;RBI=0.0440446;REFB=0;REVB=0.0418884;RO=0;SAF=65;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.95772e-05;OID=.;OPOS=139913239;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:104:109:0:0:104:109:1:39:65:0:0:41:68:0:0
chr9	139923265	.	A	G	991.29	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0265661;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.674;QD=59.1815;RBI=0.045895;REFB=0;REVB=0.0374245;RO=0;SAF=33;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000113005;OID=.;OPOS=139923265;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:67:0:0:65:67:1:32:33:0:0:34:33:0:0
chr9	139926402	.	T	C	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00297945;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.4395;QD=53.2757;RBI=0.00554015;REFB=0;REVB=0.00467078;RO=0;SAF=9;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.84921e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.77385e-05;OID=.;OPOS=139926402;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:14:9:0:0:14:9:0:0
chr9	139937558	.	C	T	193.04	PASS	AF=0.425532;AO=20;DP=47;FAO=20;FDP=47;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=-0.000905566;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.8957;QD=16.4293;RBI=0.00400875;REFB=-0.024893;REVB=0.00390513;RO=24;SAF=13;SAR=7;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.263231;STB=0.659461;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.0504201;OID=.;OPOS=139937558;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:24:27:20:20:0.425532:7:13:9:15:7:13:10:17
chr9	139937795	.	T	C	972.86	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0195731;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.93;QD=58.9613;RBI=0.0256745;REFB=0;REVB=0.0166156;RO=0;SAF=21;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.47552e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.76032e-06;OID=.;OPOS=139937795;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:45:21:0:0:45:21:0:0
chr9	139937799	.	G	A	927.53	PASS	AF=1;AO=62;DP=63;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112047;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.956;QD=57.9703;RBI=0.0166584;REFB=0;REVB=0.0123271;RO=0;SAF=21;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.99858e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000256191;OID=.;OPOS=139937799;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:64:0:0:62:64:1:41:21:0:0:43:21:0:0
chr9	139943112	.	A	G	1026.14	PASS	AF=0.880952;AO=74;DP=84;FAO=74;FDP=84;FR=.;FRO=10;FSAF=51;FSAR=23;FSRF=10;FSRR=0;FWDB=-0.00802597;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=211.833;QD=48.8639;RBI=0.0312215;REFB=-0.0772509;REVB=0.0301723;RO=9;SAF=51;SAR=23;SRF=9;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0765151;STB=0.544631;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.0016095;OID=.;OPOS=139943112;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:84:84:9:10:74:74:0.880952:23:51:9:0:23:51:10:0
chr9	139943549	.	G	A	279.6	PASS	AF=0.956522;AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0629459;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.47;QD=48.626;RBI=0.0640247;REFB=-0.105016;REVB=0.0117035;RO=1;SAF=8;SAR=14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0542958;STB=0.529385;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=0.00162895;OID=.;OPOS=139943549;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:23:23:1:1:22:22:0.956522:14:8:1:0:14:8:1:0
chr9	139944736	.	C	G	682.97	PASS	AF=0.961538;AO=50;DP=52;FAO=50;FDP=52;FR=.;FRO=2;FSAF=23;FSAR=27;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0122438;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.366;QD=52.5362;RBI=0.0249131;REFB=-0.00899238;REVB=-0.0216968;RO=1;SAF=23;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0200269;STB=0.520825;STBP=0.182;TYPE=snp;VARB=0.000395036;OID=.;OPOS=139944736;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:52:52:1:2:50:50:0.961538:27:23:1:0:27:23:2:0
chr9	139945363	.	G	A	223.15	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00117738;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.2151;QD=49.5892;RBI=0.0967552;REFB=0;REVB=0.096748;RO=0;SAF=6;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00367082;OID=.;OPOS=139945363;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:12:6:0:0:12:6:0:0
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chr9	140002989	.	T	C	371.58	PASS	AF=0.569231;AO=37;DP=65;FAO=37;FDP=65;FR=.;FRO=28;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.0305146;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.3277;QD=22.8666;RBI=0.0477876;REFB=0.00082377;REVB=0.0367765;RO=28;SAF=18;SAR=19;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.010573;STB=0.50582;STBP=0.966;TYPE=snp;VARB=-0.000489179;OID=.;OPOS=140002989;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:28:28:37:37:0.569231:19:18:14:14:19:18:14:14
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chr9	140108868	.	G	A	171.22	PASS	AF=0.461538;AO=18;DP=39;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0203904;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=192.418;QD=17.5607;RBI=0.0250584;REFB=-0.00163266;REVB=0.0145656;RO=21;SAF=13;SAR=5;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.207007;STB=0.618908;STBP=0.183;TYPE=snp;VARB=0.00217239;OID=.;OPOS=140108868;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:21:21:18:18:0.461538:5:13:11:10:5:13:11:10
chr9	140109141	.	C	T	123.08	PASS	AF=0.466667;AO=14;DP=30;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=0.01107;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.842;QD=16.4113;RBI=0.0115219;REFB=-0.0288817;REVB=-0.00319518;RO=16;SAF=5;SAR=9;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0178685;STB=0.510294;STBP=0.945;TYPE=snp;VARB=0.0223114;OID=.;OPOS=140109141;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:16:16:14:14:0.466667:9:5:6:10:9:5:6:10
chr9	140120396	.	C	T	55.83	PASS	AF=0.380952;AO=8;DP=21;FAO=8;FDP=21;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.041767;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.097;QD=10.6345;RBI=0.0459172;REFB=-0.0262448;REVB=-0.0190764;RO=11;SAF=3;SAR=5;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0795566;STB=0.506313;STBP=0.995;TYPE=snp;VARB=0.0461013;OID=.;OPOS=140120396;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:21:21:11:13:8:8:0.380952:5:3:5:6:5:3:5:8
chr9	140123132	.	C	G	155.97	PASS	AF=0.615385;AO=16;DP=26;FAO=16;FDP=26;FR=.;FRO=10;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.0629045;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.9871;QD=23.9948;RBI=0.0645021;REFB=-0.0547017;REVB=-0.0142671;RO=10;SAF=8;SAR=8;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0363431;OID=.;OPOS=140123132;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:26:26:10:10:16:16:0.615385:8:8:5:5:8:8:5:5
chr9	140128085	.	T	C	199.72	PASS	AF=0.4;AO=24;DP=59;FAO=24;FDP=60;FR=.;FRO=36;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=23;FSRR=13;FWDB=-0.0307874;FXX=0.0163908;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.2361;QD=13.3145;RBI=0.0327518;REFB=-0.0024352;REVB=-0.011172;RO=35;SAF=16;SAR=8;SRF=22;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0435828;STB=0.518503;STBP=0.845;TYPE=snp;VARB=0.0046902;OID=.;OPOS=140128085;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:60:35:36:24:24:0.4:8:16:22:13:8:16:23:13
chr9	140130606	.	A	T	1324.7	PASS	AF=1;AO=85;DP=86;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103183;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.2335;QD=62.3387;RBI=0.0226594;REFB=0;REVB=-0.0201738;RO=0;SAF=46;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00133631;OID=.;OPOS=140130606;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:85:0:0:85:85:1:39:46:0:0:39:46:0:0
chr9	140139184	.	A	G	281.21	PASS	AF=0.54717;AO=29;DP=53;FAO=29;FDP=53;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.0263469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.428;QD=21.2234;RBI=0.0326154;REFB=0.00609215;REVB=0.0192251;RO=22;SAF=13;SAR=16;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110917;STB=0.542344;STBP=0.544;TYPE=snp;VARB=-0.00392054;OID=.;OPOS=140139184;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:22:24:29:29:0.54717:16:13:13:9:16:13:13:11
chr9	140139757	.	G	A	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0153359;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.929;QD=53.2767;RBI=0.0160619;REFB=0;REVB=0.00477421;RO=0;SAF=12;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.15253e-05;OID=.;OPOS=140139757;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:11:12:0:0:11:12:0:0
chr9	140147152	.	C	G	146.34	PASS	AF=0.339286;AO=19;DP=56;FAO=19;FDP=56;FR=.;FRO=37;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=-0.0256873;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.245;QD=10.4525;RBI=0.0369519;REFB=-0.0303471;REVB=0.0265632;RO=37;SAF=8;SAR=11;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134253;STB=0.578864;STBP=0.417;TYPE=snp;VARB=0.060312;OID=.;OPOS=140147152;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:37:37:19:19:0.339286:11:8:20:17:11:8:20:17
chr9	140167022	.	G	A	314.03	PASS	AF=0.4375;AO=32;DP=79;FAO=35;FDP=80;FR=.;FRO=45;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=34;FWDB=0.0702413;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.692;QD=15.7015;RBI=0.0704626;REFB=-0.00448842;REVB=0.00558029;RO=45;SAF=17;SAR=15;SRF=11;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.293637;STB=0.664249;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.0180234;OID=.;OPOS=140167022;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:80:45:45:32:35:0.4375:15:17:11:34:16:19:11:34
chr9	140175422	.	C	T	216.25	PASS	AF=0.538462;AO=21;DP=39;FAO=21;FDP=39;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=0.0757675;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.142;QD=22.1796;RBI=0.0787795;REFB=-0.00617671;REVB=-0.0215753;RO=18;SAF=11;SAR=10;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156133;STB=0.587297;STBP=0.264;TYPE=snp;VARB=0.00757593;OID=.;OPOS=140175422;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:18:18:21:21:0.538462:10:11:6:12:10:11:6:12
chr9	140176294	.	G	T	71.66	PASS	AF=0.6;AO=9;DP=15;FAO=9;FDP=15;FR=.;FRO=6;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0104527;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=259.034;QD=19.1085;RBI=0.0275038;REFB=-0.0139862;REVB=-0.0254401;RO=6;SAF=6;SAR=3;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122922;STB=0.571265;STBP=0.539;TYPE=snp;VARB=0.00814993;OID=.;OPOS=140176294;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:15:15:6:6:9:9:0.6:3:6:3:3:3:6:3:3
chr9	140177040	.	A	T	1339.3	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0512819;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.3983;QD=62.2931;RBI=0.0712598;REFB=0;REVB=-0.0494785;RO=0;SAF=40;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000804602;OID=.;OPOS=140177040;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:46:40:0:0:46:40:0:0
chr9	140201604	.	C	T	142.46	PASS	AF=0.410256;AO=16;DP=39;FAO=16;FDP=39;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=0.00912861;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.591;QD=14.6108;RBI=0.0332706;REFB=-0.021706;REVB=-0.0319938;RO=22;SAF=10;SAR=6;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.216029;STB=0.636773;STBP=0.176;TYPE=snp;VARB=0.0185244;OID=.;OPOS=140201604;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:22:23:16:16:0.410256:6:10:9:13:6:10:9:14
chr9	140243844	.	C	T	607.66	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0326131;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.495;QD=60.7663;RBI=0.0328144;REFB=0;REVB=-0.00362908;RO=0;SAF=19;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.3303e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000217412;OID=.;OPOS=140243844;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:40:0:0:39:40:1:20:19:0:0:21:19:0:0
chr9	140247143	.	T	G	882.6	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0639703;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.0593;QD=57.8754;RBI=0.0678488;REFB=0;REVB=-0.022611;RO=0;SAF=37;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000433562;OID=.;OPOS=140247143;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:61:0:0:59:61:1:22:37:0:0:22:39:0:0
chr9	140250818	.	C	G,T	979.55	PASS	AF=0.102941,0.897059;AO=7,61;DP=68;FAO=7,61;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=6,35;FSAR=1,26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.035076,-0.0223745;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=22.4717,116.9;QD=57.6203;RBI=0.0480343,0.0287685;REFB=0,0;REVB=0.0328172,0.0180834;RO=0;SAF=6,35;SAR=1,26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0611479,-0.00332304;OID=.,.;OPOS=140250818,140250818;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:31:68:68:0:0:7,61:7,61:0.102941,0.897059:1,26:6,35:0:0:1,26:6,35:0:0
chr9	140262426	.	C	T	239.44	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.114009;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.95;QD=50.4078;RBI=0.11727;REFB=0;REVB=0.0274642;RO=0;SAF=6;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.851e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000973992;OID=.;OPOS=140262426;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:13:6:0:0:13:6:0:0
chr9	140330976	.	T	C	1025.49	PASS	AF=1;AO=69;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0180061;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.43;QD=58.5993;RBI=0.0524146;REFB=0;REVB=-0.0492247;RO=1;SAF=36;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141097;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.45373e-05;OID=.;OPOS=140330976;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:70:70:1:0:69:70:1:33:36:0:1:34:36:0:0
chr9	140332478	.	A	G	478.79	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0138478;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.7;QD=58.0354;RBI=0.0169071;REFB=0;REVB=-0.00969997;RO=0;SAF=20;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.82852e-06;OID=.;OPOS=140332478;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:33:0:0:32:33:1:12:20:0:0:13:20:0:0
chr9	140356422	.	G	C	1246.09	PASS	AF=1;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00879896;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=226.663;QD=61.5354;RBI=0.0397322;REFB=0;REVB=0.0387456;RO=0;SAF=53;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.50795e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.5125e-05;OID=.;OPOS=140356422;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:81:0:0:81:81:1:28:53:0:0:28:53:0:0
chr9	140357972	.	A	G	471.91	PASS	AF=0.970588;AO=33;DP=34;FAO=33;FDP=34;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0211273;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.4429;QD=55.5187;RBI=0.0268942;REFB=-0.0344341;REVB=-0.0166414;RO=1;SAF=16;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0283046;STB=0.515142;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.00718645;OID=.;OPOS=140357972;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:34:34:1:1:33:33:0.970588:17:16:1:0:17:16:1:0
chr9	140374861	.	A	G	885.43	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0115739;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.781;QD=58.0609;RBI=0.0131857;REFB=0;REVB=-0.00631721;RO=0;SAF=33;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.2065e-05;OID=.;OPOS=140374861;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:28:33:0:0:28:33:0:0
chr9	140392616	.	G	A	324.07	PASS	AF=0.592593;AO=32;DP=54;FAO=32;FDP=54;FR=.;FRO=22;FSAF=24;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.00666564;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.239;QD=24.0052;RBI=0.00968628;REFB=0.00683972;REVB=-0.00702803;RO=21;SAF=24;SAR=8;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.262167;STB=0.638205;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=-0.00260546;OID=.;OPOS=140392616;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:21:22:32:32:0.592593:8:24:9:12:8:24:10:12
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chr9	140772484	.	TCCCG	TCC,TCCG,TCCGG	143.61	PASS	AF=0.941176,0,0;AO=3,6,2;DP=23;FAO=16,0,0;FDP=17;FR=.;FRO=1;FSAF=14,0,0;FSAR=2,0,0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0331021,0.364567,0.336205;FXX=0.149925;HRUN=3,3,3;LEN=2,1,1;MLLD=22.5782,13.6154,6.38806;QD=33.7898;RBI=0.277653,0.553168,0.408406;REFB=0.12602,-0.0525543,-0.186996;REVB=0.275673,0.416035,0.231866;RO=10;SAF=3,6,2;SAR=0,0,0;SRF=9;SRR=1;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.552458,0.685248,0.463326;STB=0.51722,0.5,0.5;STBP=0.64,1,1;TYPE=del,del,snp;VARB=-0.00285486,0.0684745,0;OID=.,.,.;OPOS=140772487,140772485,140772487;OREF=CG,C,C;OALT=-,-,G;OMAPALT=TCC,TCCG,TCCGG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.941176,0,0:3,6,2:23:16,0,0:17:1:14,0,0:2,0,0:1:0:8:10:3,6,2:0,0,0:9:1
chr9	140777306	.	C	G	274.24	PASS	AF=0.376471;AO=32;DP=85;FAO=32;FDP=85;FR=.;FRO=53;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=28;FSRR=25;FWDB=0.0250848;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.7402;QD=12.9053;RBI=0.0255534;REFB=-0.0169397;REVB=-0.00487115;RO=51;SAF=15;SAR=17;SRF=28;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0861342;STB=0.537082;STBP=0.609;TYPE=snp;VARB=0.0231032;OID=.;OPOS=140777306;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:51:53:32:32:0.376471:17:15:28:23:17:15:28:25
chr9	140786516	.	C	T	90.35	PASS	AF=0.5;AO=11;DP=22;FAO=11;FDP=22;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=9;FWDB=-0.0150318;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=268.38;QD=16.4266;RBI=0.0191476;REFB=-0.00802966;REVB=0.0118607;RO=11;SAF=3;SAR=8;SRF=2;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105136;STB=0.560337;STBP=0.702;TYPE=snp;VARB=0.00965152;OID=.;OPOS=140786516;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:22:22:11:11:11:11:0.5:8:3:2:9:8:3:2:9
chr9	140786918	.	T	C	803.7	PASS	AF=0.982759;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.041029;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=89.2075;QD=55.4275;RBI=0.0448998;REFB=-0.0662333;REVB=0.0182376;RO=0;SAF=30;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509088;STBP=0.34;TYPE=snp;VARB=0.000812859;OID=.;OPOS=140786918;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:58:58:0:1:57:57:0.982759:27:30:0:0:27:30:0:1
chr9	140878616	.	G	A	484.0	PASS	AF=0.412214;AO=54;DP=131;FAO=54;FDP=131;FR=.;FRO=77;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=38;FSRR=39;FWDB=0.00807617;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=224.81;QD=14.7786;RBI=0.0133916;REFB=-0.00440735;REVB=0.0106823;RO=77;SAF=24;SAR=30;SRF=38;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0515393;STB=0.528999;STBP=0.568;TYPE=snp;VARB=0.00783982;OID=.;OPOS=140878616;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:131:131:77:77:54:54:0.412214:30:24:38:39:30:24:38:39
chr9	140881314	.	A	C	447.03	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00204063;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.907;QD=57.6807;RBI=0.0484427;REFB=0;REVB=0.0483997;RO=0;SAF=19;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.47712e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00012231;OID=.;OPOS=140881314;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:12:19:0:0:12:19:0:0
chr9	140911670	.	C	T	619.94	PASS	AF=0.97619;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00732255;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.589;QD=59.0417;RBI=0.0143426;REFB=-0.0059336;REVB=-0.0123325;RO=1;SAF=20;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0218198;STB=0.511622;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=-6.24902e-05;OID=.;OPOS=140911670;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:42:42:1:1:41:41:0.97619:21:20:0:1:21:20:0:1
chr9	140952690	.	G	A	340.78	PASS	AF=0.425287;AO=37;DP=87;FAO=37;FDP=87;FR=.;FRO=50;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=33;FWDB=0.00789133;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.6584;QD=15.668;RBI=0.0138302;REFB=0.00429473;REVB=-0.0113579;RO=50;SAF=21;SAR=16;SRF=17;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.228689;STB=0.628522;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=-0.00604299;OID=.;OPOS=140952690;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:50:50:37:37:0.425287:16:21:17:33:16:21:17:33
chr9	141008876	.	C	T	149.09	PASS	AF=0.5;AO=16;DP=32;FAO=16;FDP=32;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=0.0424232;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.389;QD=18.6366;RBI=0.043414;REFB=0.00913874;REVB=-0.00922183;RO=16;SAF=5;SAR=11;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0619456;STB=0.535353;STBP=0.741;TYPE=snp;VARB=-0.0118159;OID=.;OPOS=141008876;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:16:16:16:16:0.5:11:5:6:10:11:5:6:10
chr9	141016262	.	T	G	1286.64	PASS	AF=1;AO=81;DP=82;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00474221;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.011;QD=62.0069;RBI=0.0085772;REFB=0;REVB=-0.00714701;RO=0;SAF=52;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.45212e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.45417e-05;OID=.;OPOS=141016262;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:83:0:0:81:83:1:29:52:0:0:31:52:0:0
chr9	141069521	.	T	C	279.02	PASS	AF=0.609756;AO=25;DP=41;FAO=25;FDP=41;FR=.;FRO=16;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=0.0231852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.699;QD=27.2216;RBI=0.025875;REFB=-0.0143925;REVB=0.0114876;RO=16;SAF=12;SAR=13;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164343;STB=0.590482;STBP=0.167;TYPE=snp;VARB=0.00528496;OID=.;OPOS=141069521;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:16:16:25:25:0.609756:13:12:4:12:13:12:4:12
chr9	141069563	.	A	G	431.59	PASS	AF=1;AO=29;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00609774;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.458;QD=57.5457;RBI=0.0166956;REFB=0;REVB=0.0155422;RO=0;SAF=11;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.06272e-05;OID=.;OPOS=141069563;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:29:30:1:18:11:0:0:19:11:0:0
chr9	141069905	.	C	T	80.27	PASS	AF=0.526316;AO=10;DP=19;FAO=10;FDP=19;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=9;FWDB=0.0195033;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.564;QD=16.8984;RBI=0.0195136;REFB=0.00464608;REVB=-0.000635526;RO=9;SAF=2;SAR=8;SRF=0;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.322631;STB=0.67974;STBP=0.342;TYPE=snp;VARB=-0.00223644;OID=.;OPOS=141069905;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:19:19:9:9:10:10:0.526316:8:2:0:9:8:2:0:9
chr9	141070125	.	C	T	205.13	PASS	AF=0.42;AO=21;DP=50;FAO=21;FDP=50;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=-0.0135624;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=201.816;QD=16.41;RBI=0.0141053;REFB=-0.0222594;REVB=-0.00387579;RO=28;SAF=11;SAR=10;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130437;STB=0.583256;STBP=0.343;TYPE=snp;VARB=0.0314464;OID=.;OPOS=141070125;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:28:29:21:21:0.42:10:11:11:17:10:11:11:18
chr9	141070283	.	T	C	538.54	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000988827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.225;QD=59.8381;RBI=0.0143785;REFB=0;REVB=0.0143445;RO=0;SAF=13;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.21415e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.87752e-05;OID=.;OPOS=141070283;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:23:13:0:0:23:13:0:0
chr9	141070335	.	T	G	204.21	PASS	AF=1;AO=16;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0118281;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.0479;QD=48.05;RBI=0.036473;REFB=0;REVB=0.0345019;RO=0;SAF=7;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000489745;OID=.;OPOS=141070335;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:16:17:1:9:7:0:0:10:7:0:0
chr9	141070916	.	G	A	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.025258;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.371;QD=40.7628;RBI=0.0518329;REFB=0;REVB=0.0452623;RO=0;SAF=4;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000595023;OID=.;OPOS=141070916;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:6:4:0:0:6:4:0:0
chr9	141070950	.	A	G	34.86	PASS	AF=0.555556;AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=9;FR=.;FRO=4;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0485538;FXX=0.0999001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.6281;QD=15.4937;RBI=0.0485831;REFB=-0.0575414;REVB=0.00168742;RO=4;SAF=3;SAR=2;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.251123;STB=0.651584;STBP=0.409;TYPE=snp;VARB=0.0707716;OID=.;OPOS=141070950;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:23:10:9:4:4:5:5:0.555556:2:3:1:3:2:3:1:3
chr9	141071438	.	A	G	1008.44	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0498438;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.194;QD=59.3199;RBI=0.0518889;REFB=0;REVB=0.0144238;RO=0;SAF=26;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.74249e-05;OID=.;OPOS=141071438;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:42:26:0:0:42:26:0:0
chr9	141071475	.	C	G	1153.53	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.027528;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.5203;QD=60.7122;RBI=0.0762569;REFB=0;REVB=-0.0711149;RO=0;SAF=28;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.86654e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000784167;OID=.;OPOS=141071475;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:48:28:0:0:48:28:0:0
chr9	141071552	.	C	T	40.33	PASS	AF=0.428571;AO=6;DP=15;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.0416549;FXX=0.0666222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.031;QD=11.5226;RBI=0.0427236;REFB=-0.00226307;REVB=0.009496;RO=8;SAF=2;SAR=4;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0912889;STB=0.555379;STBP=0.773;TYPE=snp;VARB=0.0217651;OID=.;OPOS=141071552;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:40:15:14:8:8:6:6:0.428571:4:2:2:6:4:2:2:6
chr9	141107536	.	G	GGCA	35.4	PASS	AF=0.214286;AO=5;DP=36;FAO=6;FDP=28;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=-0.00135509;FXX=0;HRUN=2;LEN=3;MLLD=142.987;QD=5.05651;RBI=0.00654573;REFB=-0.0320966;REVB=-0.00640393;RO=30;SAF=4;SAR=1;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.265862;STB=0.734406;STBP=0.257;TYPE=ins;VARB=0.131682;OID=.;OPOS=141107537;OREF=-;OALT=GCA;OMAPALT=GGCA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.214286:5:36:6:28:22:5:1:13:9:35:30:4:1:18:12
chr10	93816	.	C	T	209.03	PASS	AF=0.258333;AO=30;DP=119;FAO=31;FDP=120;FR=.;FRO=89;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=38;FSRR=51;FWDB=0.00401894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.403;QD=6.96754;RBI=0.0233643;REFB=-0.012916;REVB=-0.0230161;RO=87;SAF=14;SAR=16;SRF=36;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0660556;STB=0.542337;STBP=0.604;TYPE=snp;VARB=0.0259703;OID=.;OPOS=93816;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:120:87:89:30:31:0.258333:16:14:36:51:16:15:38:51
chr10	93945	.	G	A	385.24	PASS	AF=0.666667;AO=34;DP=53;FAO=36;FDP=54;FR=.;FRO=18;FSAF=12;FSAR=24;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.00444614;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.8288;QD=28.5363;RBI=0.0304537;REFB=-0.0226144;REVB=0.0301274;RO=18;SAF=12;SAR=22;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0620954;STB=0.540518;STBP=0.467;TYPE=snp;VARB=0.0106324;OID=.;OPOS=93945;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:54:18:18:34:36:0.666667:22:12:8:10:24:12:8:10
chr10	94026	.	G	A	75.62	PASS	AF=0.384615;AO=10;DP=26;FAO=10;FDP=26;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=13;FWDB=0.0300988;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.31;QD=11.6341;RBI=0.0343568;REFB=0.00278949;REVB=0.0165666;RO=16;SAF=3;SAR=7;SRF=3;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14995;STB=0.588075;STBP=0.596;TYPE=snp;VARB=-0.00483619;OID=.;OPOS=94026;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:26:26:16:16:10:10:0.384615:7:3:3:13:7:3:3:13
chr10	94545	.	C	T	1098.71	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0473437;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=156.894;QD=60.2034;RBI=0.0491235;REFB=0;REVB=0.013103;RO=0;SAF=31;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.98661e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000136794;OID=.;OPOS=94545;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:42:31:0:0:42:31:0:0
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chr10	370931	.	C	T	373.25	PASS	AF=0.75;AO=30;DP=40;FAO=30;FDP=40;FR=.;FRO=10;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=0.0400751;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.225;QD=37.3251;RBI=0.0416878;REFB=-0.00930494;REVB=0.0114831;RO=10;SAF=12;SAR=18;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0981227;STB=0.553157;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.0036218;OID=.;OPOS=370931;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:70:40:40:10:10:30:30:0.75:18:12:2:8:18:12:2:8
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chr10	3180316	.	T	C	504.75	PASS	AF=0.692308;AO=45;DP=65;FAO=45;FDP=65;FR=.;FRO=20;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=-0.00707706;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.717;QD=31.0617;RBI=0.0528364;REFB=-0.013097;REVB=0.0523603;RO=20;SAF=22;SAR=23;SRF=6;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107744;STB=0.558274;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=0.00393902;OID=.;OPOS=3180316;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:20:20:45:45:0.692308:23:22:6:14:23:22:6:14
chr10	3181003	.	A	G	632.26	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.028773;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.128;QD=61.6835;RBI=0.052402;REFB=0;REVB=0.043796;RO=0;SAF=20;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000448579;OID=.;OPOS=3181003;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:41:0:0:40:41:1:20:20:0:0:21:20:0:0
chr10	3189380	.	C	T	972.85	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0167921;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.3;QD=58.9607;RBI=0.0245852;REFB=0;REVB=-0.017957;RO=0;SAF=43;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.07262e-05;OID=.;OPOS=3189380;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:23:43:0:0:23:43:0:0
chr10	3190265	.	A	G	667.22	PASS	AF=0.910714;AO=51;DP=56;FAO=51;FDP=56;FR=.;FRO=5;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0239061;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.568;QD=47.6585;RBI=0.0726067;REFB=-0.125954;REVB=0.0685582;RO=2;SAF=25;SAR=26;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000696368;STB=0.508056;STBP=0.736;TYPE=snp;VARB=0.00825861;OID=.;OPOS=3190265;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:23:56:56:2:5:51:51:0.910714:26:25:1:1:26:25:2:3
chr10	3193557	.	TAAAAAAGAAACAA	T	104.07	PASS	AF=0.518519;AO=15;DP=32;FAO=14;FDP=27;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=3;FWDB=0.0112422;FXX=0.128991;HRUN=6;LEN=13;MLLD=280.768;QD=15.4174;RBI=0.0139417;REFB=0.00621284;REVB=0.00824526;RO=10;SAF=5;SAR=10;SRF=8;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0.304348;SSSB=-0.327413;STB=0.728845;STBP=0.02;TYPE=del;VARB=-0.003876;OID=.;OPOS=3193558;OREF=AAAAAAGAAACAA;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.518519:15:32:14:27:13:4:10:10:3:85:10:5:10:8:2
chr10	3197856	.	C	G	250.34	PASS	AF=0.509804;AO=26;DP=51;FAO=26;FDP=51;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=-0.0298222;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.445;QD=19.6345;RBI=0.0372398;REFB=-0.00753522;REVB=0.0223033;RO=25;SAF=12;SAR=14;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.016234;STB=0.509084;STBP=0.909;TYPE=snp;VARB=0.00855255;OID=.;OPOS=3197856;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:25:25:26:26:0.509804:14:12:12:13:14:12:12:13
chr10	3200292	.	G	A	790.48	PASS	AF=1;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00788502;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.849;QD=64.5292;RBI=0.00955497;REFB=0;REVB=0.00539665;RO=0;SAF=27;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.30731e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000135318;OID=.;OPOS=3200292;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:49:0:0:49:49:1:22:27:0:0:22:27:0:0
chr10	3202065	.	T	C	1399.39	PASS	AF=1;AO=83;DP=84;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.021457;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.73;QD=62.8937;RBI=0.116611;REFB=0;REVB=0.11462;RO=0;SAF=37;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.12122e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000450886;OID=.;OPOS=3202065;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:89:0:0:83:89:1:46:37:0:0:52:37:0:0
chr10	3206027	.	A	G	1044.39	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.011444;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.421;QD=59.6792;RBI=0.0313205;REFB=0;REVB=0.0291549;RO=0;SAF=29;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.45962e-05;OID=.;OPOS=3206027;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:41:29:0:0:41:29:0:0
chr10	3208557	.	A	G	619.9	PASS	AF=0.97619;AO=39;DP=40;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0447423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.022;QD=59.0377;RBI=0.049498;REFB=0.13065;REVB=0.0211703;RO=1;SAF=20;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0240334;STB=0.512814;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=-0.000623278;OID=.;OPOS=3208557;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:40:42:1:1:39:41:0.97619:19:20:0:1:19:22:0:1
chr10	3214369	.	A	G	617.21	PASS	AF=1;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00281907;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.807;QD=61.7209;RBI=0.0263618;REFB=0;REVB=0.0262106;RO=0;SAF=16;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.17467e-06;OID=.;OPOS=3214369;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:40:0:0:40:40:1:24:16:0:0:24:16:0:0
chr10	3821327	.	A	T	350.14	PASS	AF=0.422222;AO=36;DP=88;FAO=38;FDP=90;FR=.;FRO=52;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=27;FSRR=25;FWDB=0.00695034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.183;QD=15.5619;RBI=0.0142892;REFB=-0.0130586;REVB=0.0124849;RO=52;SAF=20;SAR=16;SRF=27;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0381455;STB=0.519424;STBP=0.777;TYPE=snp;VARB=0.0171926;OID=.;OPOS=3821327;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:90:52:52:36:38:0.422222:16:20:27:25:17:21:27:25
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chr10	4875591	.	A	G	509.04	PASS	AF=0.421053;AO=56;DP=133;FAO=56;FDP=133;FR=.;FRO=77;FSAF=25;FSAR=31;FSRF=44;FSRR=33;FWDB=0.0309374;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.2238;QD=15.3094;RBI=0.0469282;REFB=0.00279744;REVB=-0.0352864;RO=76;SAF=25;SAR=31;SRF=43;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122192;STB=0.572052;STBP=0.176;TYPE=snp;VARB=-0.00445364;OID=.;OPOS=4875591;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:133:133:76:77:56:56:0.421053:31:25:43:33:31:25:44:33
chr10	4875664	.	G	A	385.85	PASS	AF=0.409091;AO=45;DP=110;FAO=45;FDP=110;FR=.;FRO=65;FSAF=17;FSAR=28;FSRF=38;FSRR=27;FWDB=-0.00532013;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.338;QD=14.0308;RBI=0.00613001;REFB=0.0114469;REVB=0.0030452;RO=63;SAF=17;SAR=28;SRF=36;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.201256;STB=0.622168;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=-0.00822995;OID=.;OPOS=4875664;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:110:63:65:45:45:0.409091:28:17:36:27:28:17:38:27
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chr10	4889662	.	T	G	62.03	PASS	AF=0.272727;AO=9;DP=33;FAO=9;FDP=33;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.0471479;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.9955;QD=7.51903;RBI=0.0734354;REFB=-0.0138835;REVB=-0.0563013;RO=24;SAF=5;SAR=4;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0162722;STB=0.510181;STBP=0.969;TYPE=snp;VARB=0.0804797;OID=.;OPOS=4889662;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:33:33:24:24:9:9:0.272727:4:5:13:11:4:5:13:11
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chr10	5046957	.	A	T	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0376209;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.466;QD=43.4862;RBI=0.0376211;REFB=0;REVB=-0.000113745;RO=0;SAF=10;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00042869;OID=.;OPOS=5046957;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:2:10:0:0:2:10:0:0
chr10	5120157	.	G	T	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00914921;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.613;QD=55.0987;RBI=0.0337212;REFB=0;REVB=0.0324563;RO=0;SAF=16;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.71087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000129695;OID=.;OPOS=5120157;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:10:16:0:0:10:16:0:0
chr10	5136651	.	C	G	1432.88	PASS	AF=1;AO=91;DP=92;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0147337;FXX=0.0108684;HRUN=2;LEN=1;MLLD=223.191;QD=62.9838;RBI=0.0157328;REFB=0;REVB=0.00551715;RO=0;SAF=42;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.97097e-05;OID=.;OPOS=5136651;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:92:91:0:0:91:91:1:49:42:0:0:49:42:0:0
chr10	5139685	.	G	A	734.33	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0139008;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=328.695;QD=56.4865;RBI=0.0151388;REFB=0;REVB=-0.00599571;RO=0;SAF=31;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.69488e-05;OID=.;OPOS=5139685;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:52:0:0:47:52:1:16:31:0:0:16:36:0:0
chr10	5199934	.	G	C	446.76	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0347249;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.1343;QD=57.6458;RBI=0.042984;REFB=0;REVB=0.0253339;RO=0;SAF=23;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.39343e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00127963;OID=.;OPOS=5199934;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:8:23:0:0:8:23:0:0
chr10	5202060	.	C	T	264.03	PASS	AF=1;AO=20;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0334671;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=51.0793;QD=50.2919;RBI=0.0335122;REFB=0;REVB=-0.00173773;RO=0;SAF=13;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00101761;OID=.;OPOS=5202060;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:20:21:1:7:13:0:0:7:14:0:0
chr10	5202104	.	C	T	207.08	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0108809;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.7395;QD=48.7246;RBI=0.0800971;REFB=0;REVB=-0.0793546;RO=0;SAF=11;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00346858;OID=.;OPOS=5202104;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:6:11:0:0:6:11:0:0
chr10	5202145	.	T	A	57.08	PASS	AF=0.875;AO=7;DP=8;FAO=7;FDP=8;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0328069;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=189.422;QD=28.5377;RBI=0.0328262;REFB=0.0132692;REVB=-0.00112493;RO=1;SAF=5;SAR=2;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0796435;STB=0.54533;STBP=0.646;TYPE=snp;VARB=-0.00686628;OID=.;OPOS=5202145;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:8:8:1:1:7:7:0.875:2:5:1:0:2:5:1:0
chr10	5244441	.	A	G,T	703.66	PASS	AF=0.90566,0.0754717;AO=47,4;DP=52;FAO=48,4;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=30,4;FSAR=18,0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0128067,-0.00909104;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=238.238,25.1676;QD=53.1066;RBI=0.0262672,0.0482851;REFB=-0.0495659,-0.0820436;REVB=-0.0229336,-0.0474215;RO=1;SAF=29,4;SAR=18,0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0159432,0;STB=0.508193,0.5;STBP=0.525,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000881068,0.191684;OID=.,.;OPOS=5244441,5244441;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:13:52:53:1:1:47,4:48,4:0.90566,0.0754717:18,0:29,4:1:0:18,0:30,4:1:0
chr10	5255025	.	A	G	660.35	PASS	AF=1;AO=37;DP=53;FAO=52;FDP=52;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0442214;FXX=0.0370302;HRUN=3;LEN=1;MLLD=125.552;QD=50.7958;RBI=0.044321;REFB=-0.106127;REVB=-0.00296984;RO=8;SAF=16;SAR=21;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0193765;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0120966;OID=.;OPOS=5255025;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:53:52:8:0:37:52:1:21:16:3:5:26:26:0:0
chr10	5435918	.	G	A	253.05	PASS	AF=0.509434;AO=27;DP=53;FAO=27;FDP=53;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=-0.0175608;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.6592;QD=19.0979;RBI=0.024018;REFB=0.00803375;REVB=0.0163854;RO=26;SAF=7;SAR=20;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.33177;STB=0.686422;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=-0.00630654;OID=.;OPOS=5435918;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:26:26:27:27:0.509434:20:7:16:10:20:7:16:10
chr10	5436260	.	A	G	172.48	PASS	AF=0.362069;AO=19;DP=56;FAO=21;FDP=58;FR=.;FRO=37;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=0.0221869;FXX=0.0645057;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.718;QD=11.8955;RBI=0.0258382;REFB=-0.0203085;REVB=-0.0132422;RO=36;SAF=6;SAR=13;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.243697;STB=0.585894;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.0260098;OID=.;OPOS=5436260;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:58:36:37:19:21:0.362069:13:6:19:17:13:8:19:18
chr10	5437365	.	A	G	223.87	PASS	AF=0.478261;AO=22;DP=46;FAO=22;FDP=46;FR=.;FRO=24;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.0240315;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.073;QD=19.4668;RBI=0.0283919;REFB=-0.0109682;REVB=-0.0151192;RO=24;SAF=14;SAR=8;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0915131;STB=0.551819;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.0122132;OID=.;OPOS=5437365;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:24:24:22:22:0.478261:8:14:13:11:8:14:13:11
chr10	5446794	.	C	T	129.21	PASS	AF=0.333333;AO=15;DP=47;FAO=16;FDP=48;FR=.;FRO=32;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=11;FWDB=-0.0288131;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.735;QD=10.7671;RBI=0.0340586;REFB=-0.00289764;REVB=0.0181602;RO=32;SAF=6;SAR=9;SRF=21;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.285797;STB=0.642687;STBP=0.188;TYPE=snp;VARB=0.00368834;OID=.;OPOS=5446794;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:48:32:32:15:16:0.333333:9:6:21:11:9:7:21:11
chr10	5471200	.	C	T	1574.57	PASS	AF=0.990654;AO=106;DP=107;FAO=106;FDP=107;FR=.;FRO=1;FSAF=55;FSAR=51;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00311691;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.3246;QD=58.8623;RBI=0.0216726;REFB=-0.151781;REVB=0.0214473;RO=1;SAF=55;SAR=51;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00855122;STB=0.504504;STBP=0.496;TYPE=snp;VARB=0.00191893;OID=.;OPOS=5471200;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:107:107:1:1:106:106:0.990654:51:55:1:0:51:55:1:0
chr10	5495218	.	T	C	632.24	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00439804;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.472;QD=61.6822;RBI=0.0499901;REFB=0;REVB=0.0497963;RO=0;SAF=20;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.24256e-05;OID=.;OPOS=5495218;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:21:20:0:0:21:20:0:0
chr10	5499040	.	A	AT	431.18	PASS	AF=0.584906;AO=59;DP=109;FAO=62;FDP=106;FR=.;FRO=44;FSAF=35;FSAR=27;FSRF=15;FSRR=29;FWDB=-0.156467;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=22.5016;QD=16.2708;RBI=0.159152;REFB=-0.0165249;REVB=-0.0291077;RO=48;SAF=33;SAR=26;SRF=17;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166792;STB=0.592116;STBP=0.032;TYPE=ins;VARB=0.00259639;OID=.;OPOS=5499041;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.584906:59:109:62:106:44:35:27:15:29:99:48:33:26:17:31
chr10	5499703	.	ATA	AT,ATT,TAT	1482.56	PASS	AF=0.990196,0,0.00980392;AO=52,57,9;DP=136;FAO=101,0,1;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=44,0,1;FSAR=57,0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0441716,-0.0456653,-0.0476857;FXX=0.0642143;HRUN=1,1,1;LEN=1,1,3;MLLD=142.596,137.299,123.831;QD=58.1397;RBI=0.154292,0.0832796,0.100111;REFB=0,0,0;REVB=0.147834,0.0696432,0.0880241;RO=10;SAF=14,41,9;SAR=38,16,0;SRF=1;SRR=9;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.0671575,0.194204,0.840874;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,snp,mnp;VARB=-0.00214592,0.0244562,0.0623733;OID=.,.,.;OPOS=5499705,5499705,5499703;OREF=A,A,ATA;OALT=-,T,TAT;OMAPALT=AT,ATT,TAT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/3:3:136:102:10:0:52,57,9:101,0,1:0.990196,0,0.00980392:38,16,0:14,41,9:1:9:57,0,0:44,0,1:0:0
chr10	5541230	.	T	C	503.78	PASS	AF=0.533333;AO=48;DP=89;FAO=48;FDP=90;FR=.;FRO=42;FSAF=27;FSAR=21;FSRF=17;FSRR=25;FWDB=-0.0293006;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.328;QD=22.39;RBI=0.0374825;REFB=-0.000253232;REVB=-0.0233754;RO=40;SAF=27;SAR=21;SRF=16;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133933;STB=0.573377;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=-2.73895e-05;OID=.;OPOS=5541230;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:90:40:42:48:48:0.533333:21:27:16:24:21:27:17:25
chr10	5541294	.	C	T	403.05	PASS	AF=0.461538;AO=42;DP=91;FAO=42;FDP=91;FR=.;FRO=49;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=26;FSRR=23;FWDB=-0.0256062;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.553;QD=17.7163;RBI=0.0256414;REFB=-0.0136725;REVB=-0.00134317;RO=49;SAF=20;SAR=22;SRF=26;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0524088;STB=0.529275;STBP=0.628;TYPE=snp;VARB=0.0224383;OID=.;OPOS=5541294;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:49:49:42:42:0.461538:22:20:26:23:22:20:26:23
chr10	5567366	.	G	A	796.66	PASS	AF=0.66;AO=65;DP=99;FAO=66;FDP=100;FR=.;FRO=34;FSAF=26;FSAR=40;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=-0.00607303;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.517;QD=31.8664;RBI=0.0144137;REFB=-0.0424798;REVB=0.0130718;RO=34;SAF=26;SAR=39;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0839774;STB=0.547249;STBP=0.192;TYPE=snp;VARB=0.0206074;OID=.;OPOS=5567366;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:100:34:34:65:66:0.66:39:26:18:16:40:26:18:16
chr10	5567695	.	G	A	1513.87	PASS	AF=1;AO=100;DP=100;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0390311;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.566;QD=59.9552;RBI=0.0417542;REFB=0;REVB=0.0148319;RO=0;SAF=54;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.21299e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.60759e-05;OID=.;OPOS=5567695;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:100:101:0:0:100:101:1:46:54:0:0:47:54:0:0
chr10	5567967	.	G	T	405.58	PASS	AF=0.429907;AO=46;DP=107;FAO=46;FDP=107;FR=.;FRO=61;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=14;FSRR=47;FWDB=0.0127286;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=301.917;QD=15.1621;RBI=0.0160794;REFB=-0.0174976;REVB=-0.00982494;RO=61;SAF=22;SAR=24;SRF=14;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.258788;STB=0.643802;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.0240158;OID=.;OPOS=5567967;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:107:61:61:46:46:0.429907:24:22:14:47:24:22:14:47
chr10	5673528	.	G	A	392.92	PASS	AF=1;AO=24;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0930618;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=165.885;QD=56.1312;RBI=0.0933027;REFB=0;REVB=0.00670155;RO=0;SAF=7;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000248409;OID=.;OPOS=5673528;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:24:28:1:17:7:0:0:19:9:0:0
chr10	5683806	.	G	A	554.35	PASS	AF=0.405063;AO=64;DP=158;FAO=64;FDP=158;FR=.;FRO=94;FSAF=40;FSAR=24;FSRF=56;FSRR=38;FWDB=0.0103997;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.616;QD=14.0343;RBI=0.0137934;REFB=-0.00605966;REVB=-0.00906105;RO=94;SAF=40;SAR=24;SRF=56;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0326733;STB=0.518389;STBP=0.721;TYPE=snp;VARB=0.0111213;OID=.;OPOS=5683806;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:158:158:94:94:64:64:0.405063:24:40:56:38:24:40:56:38
chr10	5765637	.	C	T	323.34	PASS	AF=0.515152;AO=32;DP=64;FAO=34;FDP=66;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=23;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=-0.0233751;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.91;QD=19.5962;RBI=0.0361937;REFB=-0.00335136;REVB=0.0276331;RO=31;SAF=11;SAR=21;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1589;STB=0.591373;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.00410663;OID=.;OPOS=5765637;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:66:31:32:32:34:0.515152:21:11:16:15:23:11:16:16
chr10	5781628	.	T	G	834.06	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.038766;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.2649;QD=57.5213;RBI=0.0885165;REFB=0;REVB=-0.0795762;RO=0;SAF=30;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000495461;OID=.;OPOS=5781628;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:28:30:0:0:28:30:0:0
chr10	5781969	.	A	T	483.34	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00222251;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.4554;QD=58.587;RBI=0.0628263;REFB=0;REVB=0.062787;RO=0;SAF=15;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.64315e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000908781;OID=.;OPOS=5781969;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:18:15:0:0:18:15:0:0
chr10	5788608	.	G	C	182.77	PASS	AF=0.941176;AO=16;DP=17;FAO=16;FDP=17;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0253335;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.456;QD=43.0044;RBI=0.0379567;REFB=-0.0438725;REVB=0.0282652;RO=1;SAF=7;SAR=9;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0481057;STB=0.526283;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.00157558;OID=.;OPOS=5788608;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:17:17:1:1:16:16:0.941176:9:7:0:1:9:7:0:1
chr10	5789966	.	CCTGCCTCAG	C	63.26	PASS	AF=0.354839;AO=10;DP=32;FAO=11;FDP=31;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=-0.0103971;FXX=0.0312402;HRUN=2;LEN=9;MLLD=329.803;QD=8.16223;RBI=0.0135447;REFB=-0.00261624;REVB=-0.008681;RO=19;SAF=8;SAR=2;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.515826;STB=0.739455;STBP=0.059;TYPE=del;VARB=0.00712739;OID=.;OPOS=5789967;OREF=CTGCCTCAG;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.354839:10:32:11:31:20:8:3:7:13:63:19:8:2:6:13
chr10	5790420	.	T	C	207.07	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0946915;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.533;QD=48.7215;RBI=0.0947017;REFB=0;REVB=-0.00138646;RO=0;SAF=7;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000827428;OID=.;OPOS=5790420;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:10:7:0:0:10:7:0:0
chr10	5790616	.	A	G	255.69	PASS	AF=0.467742;AO=27;DP=61;FAO=29;FDP=62;FR=.;FRO=33;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=0.0356712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.983;QD=16.4963;RBI=0.0356777;REFB=-0.0158104;REVB=-0.000680025;RO=33;SAF=18;SAR=9;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18451;STB=0.616031;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=0.021939;OID=.;OPOS=5790616;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:62:33:33:27:29:0.467742:9:18:16:17:9:20:16:17
chr10	5804531	.	G	A	910.49	PASS	AF=1;AO=62;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0105813;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.791;QD=57.8086;RBI=0.0221923;REFB=0;REVB=0.0195073;RO=0;SAF=30;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.92531e-05;OID=.;OPOS=5804531;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:62:63:1:32:30:0:0:32:31:0:0
chr10	5920121	.	T	C	429.58	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0070127;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.537;QD=57.2775;RBI=0.0607627;REFB=0;REVB=0.0603567;RO=0;SAF=20;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.41836e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00073611;OID=.;OPOS=5920121;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:30:0:0:27:30:1:7:20:0:0:10:20:0:0
chr10	5925971	.	C	A	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0299709;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=174.492;QD=43.4856;RBI=0.0361182;REFB=0;REVB=-0.0201562;RO=0;SAF=8;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000107182;OID=.;OPOS=5925971;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:4:8:0:0:4:8:0:0
chr10	6000259	.	T	C	305.48	PASS	AF=0.478261;AO=33;DP=69;FAO=33;FDP=69;FR=.;FRO=36;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=0.00936988;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=109.632;QD=17.7092;RBI=0.0340382;REFB=-0.00729214;REVB=0.0327231;RO=36;SAF=19;SAR=14;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0713565;STB=0.53994;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=0.00868355;OID=.;OPOS=6000259;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:36:36:33:33:0.478261:14:19:18:18:14:19:18:18
chr10	6001696	.	C	T	323.47	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00760551;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=344.781;QD=53.9112;RBI=0.0284382;REFB=0;REVB=0.0274024;RO=0;SAF=13;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.99831e-05;OID=.;OPOS=6001696;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:11:13:0:0:11:13:0:0
chr10	6002368	.	T	G	964.25	PASS	AF=0.971014;AO=67;DP=69;FAO=67;FDP=69;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.020927;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.3086;QD=55.8986;RBI=0.0280433;REFB=-0.00730399;REVB=0.0186677;RO=2;SAF=27;SAR=40;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0230419;STB=0.512191;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=0.00344492;OID=.;OPOS=6002368;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:69:69:2:2:67:67:0.971014:40:27:0:2:40:27:0:2
chr10	6005756	.	G	A	564.21	PASS	AF=0.607143;AO=51;DP=84;FAO=51;FDP=84;FR=.;FRO=33;FSAF=23;FSAR=28;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=0.00588059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.746;QD=26.8673;RBI=0.0270938;REFB=-0.0413858;REVB=0.0264479;RO=33;SAF=23;SAR=28;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0898842;STB=0.549;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=0.0241514;OID=.;OPOS=6005756;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:33:33:51:51:0.607143:28:23:19:14:28:23:19:14
chr10	6008154	.	C	T	247.59	PASS	AF=0.560976;AO=23;DP=42;FAO=23;FDP=41;FR=.;FRO=18;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.0253358;FXX=0.0238039;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.0464;QD=24.1549;RBI=0.0263562;REFB=0.00934413;REVB=-0.00726264;RO=19;SAF=15;SAR=8;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192303;STB=0.594629;STBP=0.185;TYPE=snp;VARB=-0.00877914;OID=.;OPOS=6008154;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:41:19:18:23:23:0.560976:8:15:8:11:8:15:8:10
chr10	6061407	.	T	C	266.54	PASS	AF=0.447761;AO=30;DP=67;FAO=30;FDP=67;FR=.;FRO=37;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=25;FSRR=12;FWDB=0.0164636;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.973;QD=15.9131;RBI=0.0215751;REFB=-0.00652022;REVB=-0.013944;RO=37;SAF=12;SAR=18;SRF=25;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.265263;STB=0.649026;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.00837548;OID=.;OPOS=6061407;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:37:37:30:30:0.447761:18:12:25:12:18:12:25:12
chr10	6191735	.	T	C	632.25	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0403707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.3903;QD=61.6833;RBI=0.0565803;REFB=0;REVB=0.0396427;RO=0;SAF=12;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.44781e-06;OID=.;OPOS=6191735;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:29:12:0:0:29:12:0:0
chr10	6287695	.	G	A	42.23	PASS	AF=0.666667;AO=5;DP=8;FAO=6;FDP=9;FR=.;FRO=3;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0665287;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.602;QD=18.767;RBI=0.0670338;REFB=0.00985595;REVB=-0.00821325;RO=3;SAF=1;SAR=4;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.23409;STB=0.635975;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=-0.00604036;OID=.;OPOS=6287695;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:8:9:3:3:5:6:0.666667:4:1:0:3:4:2:0:3
chr10	6392848	.	G	A	463.96	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00770508;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.431;QD=57.9944;RBI=0.0127977;REFB=0;REVB=-0.0102182;RO=0;SAF=20;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.1721e-05;OID=.;OPOS=6392848;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:32:0:0:31:32:1:11:20:0:0:11:21:0:0
chr10	6393009	.	A	G	272.54	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0314614;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.3076;QD=51.9123;RBI=0.0329324;REFB=0;REVB=-0.00973258;RO=0;SAF=11;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000692103;OID=.;OPOS=6393009;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:10:11:0:0:10:11:0:0
chr10	6393260	.	C	G	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0310605;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.897;QD=46.8479;RBI=0.0331986;REFB=0;REVB=0.0117214;RO=0;SAF=8;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000270886;OID=.;OPOS=6393260;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:7:8:0:0:7:8:0:0
chr10	6393706	.	ACAGG	A	103.72	PASS	AF=1;AO=7;DP=12;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00880569;FXX=0.166528;HRUN=1;LEN=4;MLLD=156.905;QD=41.4878;RBI=0.0420446;REFB=0;REVB=0.0411121;RO=0;SAF=6;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00342669;OID=.;OPOS=6393707;OREF=CAGG;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:7:12:10:10:0:7:3:0:0:3:0:6:1:0:0
chr10	6498723	.	G	A	516.6	PASS	AF=0.532609;AO=49;DP=92;FAO=49;FDP=92;FR=.;FRO=43;FSAF=16;FSAR=33;FSRF=24;FSRR=19;FWDB=-0.0187983;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.71;QD=22.4609;RBI=0.0199115;REFB=-0.0144521;REVB=0.00656448;RO=43;SAF=16;SAR=33;SRF=24;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.205237;STB=0.613335;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.014172;OID=.;OPOS=6498723;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:43:43:49:49:0.532609:33:16:24:19:33:16:24:19
chr10	6527143	.	G	A	192.98	PASS	AF=0.410714;AO=23;DP=56;FAO=23;FDP=56;FR=.;FRO=33;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=0.00654328;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.069;QD=13.7844;RBI=0.00705811;REFB=0.000287697;REVB=-0.00264621;RO=33;SAF=17;SAR=6;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.339676;STB=0.695404;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=-0.00020561;OID=.;OPOS=6527143;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:33:33:23:23:0.410714:6:17:14:19:6:17:14:19
chr10	7285632	.	A	G	229.58	PASS	AF=0.536585;AO=22;DP=41;FAO=22;FDP=41;FR=.;FRO=19;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.0440978;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.06;QD=22.3979;RBI=0.0443306;REFB=-0.0261358;REVB=0.00453663;RO=19;SAF=12;SAR=10;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0159319;STB=0.50892;STBP=0.932;TYPE=snp;VARB=0.0243194;OID=.;OPOS=7285632;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:19:19:22:22:0.536585:10:12:10:9:10:12:10:9
chr10	7528721	.	A	C	562.96	PASS	AF=0.504348;AO=58;DP=115;FAO=58;FDP=115;FR=.;FRO=57;FSAF=26;FSAR=32;FSRF=25;FSRR=32;FWDB=0.0271529;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.6;QD=19.5811;RBI=0.0409857;REFB=-0.00578118;REVB=0.0307009;RO=57;SAF=26;SAR=32;SRF=25;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00879383;STB=0.504853;STBP=0.929;TYPE=snp;VARB=0.0151909;OID=.;OPOS=7528721;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:115:57:57:58:58:0.504348:32:26:25:32:32:26:25:32
chr10	7528738	.	G	A	484.83	PASS	AF=0.48;AO=47;DP=99;FAO=48;FDP=100;FR=.;FRO=52;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=22;FSRR=30;FWDB=-0.0700227;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.3922;QD=19.3931;RBI=0.0700333;REFB=-0.00517083;REVB=0.00121416;RO=52;SAF=22;SAR=25;SRF=22;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0428069;STB=0.518511;STBP=0.729;TYPE=snp;VARB=0.00499475;OID=.;OPOS=7528738;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:100:52:52:47:48:0.48:25:22:22:30:26:22:22:30
chr10	7605067	.	C	T	209.33	PASS	AF=0.409836;AO=25;DP=61;FAO=25;FDP=61;FR=.;FRO=36;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=23;FSRR=13;FWDB=0.00466796;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=202.52;QD=13.7267;RBI=0.0168243;REFB=-0.00926821;REVB=-0.0161637;RO=35;SAF=9;SAR=16;SRF=23;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.299052;STB=0.662227;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.0205178;OID=.;OPOS=7605067;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:35:36:25:25:0.409836:16:9:23:12:16:9:23:13
chr10	7605077	.	TC	T	711.72	PASS	AF=1;AO=59;DP=63;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0262173;FXX=0.0476115;HRUN=2;LEN=1;MLLD=27.7924;QD=47.4483;RBI=0.0841651;REFB=0;REVB=-0.0799777;RO=0;SAF=31;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0.213368;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.000892921;OID=.;OPOS=7605078;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:59:63:60:60:0:31:29:0:0:13:0:31:28:0:0
chr10	7605101	.	A	G	1063.29	PASS	AF=0.986301;AO=69;DP=70;FAO=72;FDP=73;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.100858;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.1902;QD=58.2624;RBI=0.110107;REFB=0.0400802;REVB=-0.0441725;RO=1;SAF=36;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141097;STB=0.507461;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=-0.00712965;OID=.;OPOS=7605101;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:70:73:1:1:69:72:0.986301:33:36:0:1:33:39:0:1
chr10	7618501	.	A	G	461.19	PASS	AF=0.464646;AO=45;DP=98;FAO=46;FDP=99;FR=.;FRO=53;FSAF=29;FSAR=17;FSRF=38;FSRR=15;FWDB=-0.0167747;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.4;QD=18.6339;RBI=0.0263372;REFB=-0.0217011;REVB=-0.0203041;RO=53;SAF=29;SAR=16;SRF=38;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0788438;STB=0.551019;STBP=0.377;TYPE=snp;VARB=0.0176813;OID=.;OPOS=7618501;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:99:53:53:45:46:0.464646:16:29:38:15:17:29:38:15
chr10	7618686	.	T	G	205.03	PASS	AF=0.477273;AO=19;DP=42;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=0.0234645;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.117;QD=18.6389;RBI=0.0327687;REFB=-0.0290078;REVB=0.0228737;RO=23;SAF=11;SAR=8;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0134659;STB=0.503308;STBP=0.968;TYPE=snp;VARB=0.0392918;OID=.;OPOS=7618686;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:44:23:23:19:21:0.477273:8:11:13:10:9:12:13:10
chr10	7659233	.	G	A	154.08	PASS	AF=0.344828;AO=20;DP=58;FAO=20;FDP=58;FR=.;FRO=38;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=29;FWDB=-0.0828345;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.5698;QD=10.6259;RBI=0.0831962;REFB=-0.00141602;REVB=0.00774919;RO=36;SAF=7;SAR=13;SRF=9;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127551;STB=0.585578;STBP=0.406;TYPE=snp;VARB=0.00968152;OID=.;OPOS=7659233;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:36:38:20:20:0.344828:13:7:9:27:13:7:9:29
chr10	7679393	.	C	T	140.04	PASS	AF=0.555556;AO=15;DP=27;FAO=15;FDP=27;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.0211924;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.0499;QD=20.7472;RBI=0.035147;REFB=0.0170704;REVB=-0.0280392;RO=12;SAF=8;SAR=7;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0395277;STB=0.522358;STBP=0.83;TYPE=snp;VARB=-0.0282581;OID=.;OPOS=7679393;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:12:12:15:15:0.555556:7:8:7:5:7:8:7:5
chr10	7763661	.	A	G	1015.34	PASS	AF=0.985714;AO=69;DP=70;FAO=69;FDP=70;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.019664;FXX=0.0140825;HRUN=2;LEN=1;MLLD=225.967;QD=58.0197;RBI=0.0198309;REFB=-0.0736008;REVB=0.00256728;RO=1;SAF=30;SAR=39;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0119679;STB=0.506327;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=0.0030138;OID=.;OPOS=7763661;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:70:70:1:1:69:69:0.985714:39:30:0:1:39:30:0:1
chr10	7797903	.	C	CAACT	276.55	PASS	AF=1;AO=21;DP=22;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00576493;FXX=0.0454339;HRUN=2;LEN=4;MLLD=255.048;QD=52.6754;RBI=0.00664702;REFB=0;REVB=-0.00330885;RO=0;SAF=14;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-4.98757e-05;OID=.;OPOS=7797904;OREF=-;OALT=AACT;OMAPALT=CAACT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:21:22:21:21:0:14:7:0:0:4:0:14:7:0:0
chr10	7808086	.	T	C	112.23	PASS	AF=0.481481;AO=13;DP=27;FAO=13;FDP=27;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.0155652;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.9023;QD=16.6271;RBI=0.0486602;REFB=0.0140985;REVB=-0.0461036;RO=14;SAF=5;SAR=8;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106228;STB=0.561308;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=-0.0182213;OID=.;OPOS=7808086;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:14:14:13:13:0.481481:8:5:7:7:8:5:7:7
chr10	8006798	.	A	G	110.65	PASS	AF=0.448276;AO=13;DP=29;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=-0.0132435;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.59;QD=15.2624;RBI=0.0200044;REFB=0.0157491;REVB=0.0149928;RO=16;SAF=6;SAR=7;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145117;STB=0.58366;STBP=0.466;TYPE=snp;VARB=-0.00773739;OID=.;OPOS=8006798;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:16:16:13:13:0.448276:7:6:5:11:7:6:5:11
chr10	8007559	.	GT	CC	182.98	PASS	AF=0.615385;AO=16;DP=26;FAO=16;FDP=26;FR=.,HEALED;FRO=8;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0153122;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=100.211;QD=28.1506;RBI=0.0156695;REFB=-0.0355711;REVB=0.00332718;RO=8;SAF=3;SAR=13;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.249318;STB=0.640648;STBP=0.09;TYPE=mnp;VARB=0.0321002;OID=.;OPOS=8007559;OREF=GT;OALT=CC;OMAPALT=CC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:26:26:8:8:16:16:0.615385:13:3:4:4:13:3:4:4
chr10	11299735	.	A	T	173.73	PASS	AF=0.388889;AO=21;DP=54;FAO=21;FDP=54;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=24;FSRR=9;FWDB=-0.00450268;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.456;QD=12.8691;RBI=0.019774;REFB=-0.0121171;REVB=0.0192546;RO=33;SAF=11;SAR=10;SRF=24;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.220606;STB=0.626007;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=0.0203662;OID=.;OPOS=11299735;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:33:33:21:21:0.388889:10:11:24:9:10:11:24:9
chr10	11356160	.	C	T	270.11	PASS	AF=0.355556;AO=32;DP=90;FAO=32;FDP=90;FR=.;FRO=58;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=26;FSRR=32;FWDB=-0.00474362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.09;QD=12.0049;RBI=0.0199946;REFB=-0.00497338;REVB=0.0194237;RO=55;SAF=15;SAR=17;SRF=25;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0157144;STB=0.51326;STBP=0.865;TYPE=snp;VARB=0.00910111;OID=.;OPOS=11356160;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:55:58:32:32:0.355556:17:15:25:30:17:15:26:32
chr10	11372861	.	C	CTGAT	192.31	PASS	AF=0.387097;AO=22;DP=62;FAO=24;FDP=62;FR=.;FRO=38;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=-0.0104834;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=4;MLLD=247.851;QD=12.4073;RBI=0.0127741;REFB=-0.00140849;REVB=-0.00729902;RO=38;SAF=13;SAR=9;SRF=21;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0427807;STB=0.519215;STBP=0.841;TYPE=ins;VARB=0.00145455;OID=.;OPOS=11372862;OREF=-;OALT=TGAT;OMAPALT=CTGAT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.387097:22:62:24:62:38:14:10:21:17:99:38:13:9:21:17
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chr10	11373422	.	T	G	34.35	PASS	AF=0.0833333;AO=12;DP=122;FAO=10;FDP=120;FR=.;FRO=110;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=42;FSRR=68;FWDB=-0.00988247;FXX=0.0163921;HRUN=7;LEN=1;MLLD=206.421;QD=1.14497;RBI=0.0145112;REFB=0.000351857;REVB=-0.010626;RO=110;SAF=5;SAR=7;SRF=42;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.04293;STB=0.58316;STBP=0.605;TYPE=snp;VARB=-0.00472329;OID=.;OPOS=11373422;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:122:120:110:110:12:10:0.0833333:7:5:42:68:7:3:42:68
chr10	11376313	.	G	A	348.55	PASS	AF=0.325926;AO=44;DP=135;FAO=44;FDP=135;FR=.;FRO=91;FSAF=15;FSAR=29;FSRF=48;FSRR=43;FWDB=-0.044209;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.422;QD=10.3275;RBI=0.0460204;REFB=-0.0083132;REVB=-0.0127843;RO=89;SAF=15;SAR=29;SRF=47;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.220973;STB=0.628424;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.0135508;OID=.;OPOS=11376313;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:135:135:89:91:44:44:0.325926:29:15:47:42:29:15:48:43
chr10	11502655	.	A	T	259.47	PASS	AF=0.326923;AO=16;DP=51;FAO=17;FDP=52;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=14;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=1;FWDB=0.00823903;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=154.66;QD=19.959;RBI=0.10387;REFB=-0.030622;REVB=-0.103542;RO=15;SAF=6;SAR=10;SRF=15;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.500553;STB=0.743517;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.0591863;OID=.;OPOS=11502655;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:51:52:15:14:16:17:0.326923:10:6:15:0:11:6:13:1
chr10	11504313	.	C	T	501.65	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0517947;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.0405;QD=59.0173;RBI=0.0582835;REFB=0;REVB=-0.0267258;RO=0;SAF=20;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.48532e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00158059;OID=.;OPOS=11504313;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:14:20:0:0:14:20:0:0
chr10	11504752	.	T	C	283.01	PASS	AF=0.421053;AO=32;DP=76;FAO=32;FDP=76;FR=.;FRO=44;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=32;FSRR=12;FWDB=0.0150397;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.8721;QD=14.8951;RBI=0.0492965;REFB=-0.00389919;REVB=0.0469462;RO=44;SAF=15;SAR=17;SRF=32;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.262463;STB=0.647402;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.00704615;OID=.;OPOS=11504752;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:44:44:32:32:0.421053:17:15:32:12:17:15:32:12
chr10	11532807	.	T	C	84.28	PASS	AF=0.314286;AO=11;DP=36;FAO=11;FDP=35;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=19;FSRR=5;FWDB=0.0216853;FXX=0.0277701;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.5731;QD=9.63254;RBI=0.0251883;REFB=-0.0235057;REVB=-0.0128139;RO=25;SAF=6;SAR=5;SRF=20;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.31111;STB=0.675404;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.0487627;OID=.;OPOS=11532807;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:36:35:25:24:11:11:0.314286:5:6:20:5:5:6:19:5
chr10	11789382	.	G	A	411.12	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.033654;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.2098;QD=56.7061;RBI=0.0656626;REFB=0;REVB=-0.0563825;RO=0;SAF=15;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00177663;OID=.;OPOS=11789382;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:14:15:0:0:14:15:0:0
chr10	11789405	.	G	A	429.01	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00664629;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.8278;QD=57.2013;RBI=0.014812;REFB=0;REVB=0.0132372;RO=0;SAF=17;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.63861e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000204513;OID=.;OPOS=11789405;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:13:17:0:0:13:17:0:0
chr10	11797436	.	T	C	483.29	PASS	AF=1;AO=31;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159792;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.9733;QD=58.581;RBI=0.017584;REFB=0;REVB=0.00733919;RO=0;SAF=16;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000221414;OID=.;OPOS=11797436;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:31:33:1:15:16:0:0:16:17:0:0
chr10	11797467	.	G	A	632.26	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00260577;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.86;QD=61.6839;RBI=0.0396412;REFB=0;REVB=0.0395555;RO=0;SAF=24;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.2194e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000137035;OID=.;OPOS=11797467;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:17:24:0:0:17:24:0:0
chr10	11805354	.	A	G	524.67	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0429792;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.292;QD=59.9623;RBI=0.0453619;REFB=0;REVB=0.0145083;RO=0;SAF=14;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.27896e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00196841;OID=.;OPOS=11805354;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:21:14:0:0:21:14:0:0
chr10	11805357	.	G	A	538.53	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0653012;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.9157;QD=59.8366;RBI=0.0676057;REFB=0;REVB=0.017501;RO=0;SAF=15;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00158262;OID=.;OPOS=11805357;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:36:0:0:35:36:1:20:15:0:0:21:15:0:0
chr10	11912431	.	C	T	583.47	PASS	AF=0.576087;AO=53;DP=92;FAO=53;FDP=92;FR=.;FRO=39;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=0.00859662;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=107.387;QD=25.3681;RBI=0.00882919;REFB=-0.0246661;REVB=-0.00201312;RO=37;SAF=22;SAR=31;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0341494;STB=0.531121;STBP=0.489;TYPE=snp;VARB=0.0155029;OID=.;OPOS=11912431;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:37:39:53:53:0.576087:31:22:17:20:31:22:19:20
chr10	11913907	.	A	T	230.7	PASS	AF=0.421875;AO=27;DP=64;FAO=27;FDP=64;FR=.;FRO=37;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=22;FWDB=0.0154474;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=62.4038;QD=14.4185;RBI=0.0361107;REFB=-0.00138676;REVB=-0.0326398;RO=35;SAF=13;SAR=14;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0528987;STB=0.544154;STBP=0.599;TYPE=snp;VARB=0.00296907;OID=.;OPOS=11913907;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:35:37:27:27:0.421875:14:13:15:20:14:13:15:22
chr10	12071397	.	G	A	373.29	PASS	AF=0.62069;AO=36;DP=59;FAO=36;FDP=58;FR=.;FRO=22;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.00572604;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.195;QD=25.7443;RBI=0.00576513;REFB=-0.000297209;REVB=-0.000670213;RO=23;SAF=21;SAR=15;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0757162;STB=0.532146;STBP=0.563;TYPE=snp;VARB=0.000146668;OID=.;OPOS=12071397;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:58:23:22:36:36:0.62069:15:21:11:12:15:21:11:11
chr10	12111090	.	T	C	1589.59	PASS	AF=1;AO=106;DP=106;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0485591;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.64;QD=59.9846;RBI=0.0624775;REFB=0;REVB=0.0393122;RO=0;SAF=46;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.72596e-05;OID=.;OPOS=12111090;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:106:106:0:0:106:106:1:60:46:0:0:60:46:0:0
chr10	12131081	.	T	G	164.37	PASS	AF=0.375;AO=18;DP=48;FAO=18;FDP=48;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=21;FWDB=-0.00811747;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.7146;QD=13.6974;RBI=0.00852064;REFB=-0.00282884;REVB=-0.00259;RO=30;SAF=11;SAR=7;SRF=9;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.324644;STB=0.687305;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.00238572;OID=.;OPOS=12131081;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:30:30:18:18:0.375:7:11:9:21:7:11:9:21
chr10	12143105	.	C	G	726.5	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0118604;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.2219;QD=63.1735;RBI=0.14913;REFB=0;REVB=-0.148658;RO=0;SAF=26;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00093035;OID=.;OPOS=12143105;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:20:26:0:0:20:26:0:0
chr10	12148259	.	A	C	761.06	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00667659;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.069;QD=63.4213;RBI=0.0237311;REFB=0;REVB=-0.0227726;RO=0;SAF=13;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.94744e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.22516e-05;OID=.;OPOS=12148259;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:48:0:0:46:48:1:33:13:0:0:34:14:0:0
chr10	12148286	.	T	C	724.05	PASS	AF=0.981132;AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0296728;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=68.9644;QD=54.6457;RBI=0.0374843;REFB=-0.0623628;REVB=0.022904;RO=0;SAF=14;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.517235;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=0.000792462;OID=.;OPOS=12148286;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:53:53:0:1:52:52:0.981132:38:14:0:0:38:14:1:0
chr10	12149939	.	C	T	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00683437;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.158;QD=50.4135;RBI=0.0118518;REFB=0;REVB=-0.00968279;RO=0;SAF=13;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.851e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.96842e-05;OID=.;OPOS=12149939;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:6:13:0:0:6:13:0:0
chr10	12191933	.	C	T	503.27	PASS	AF=0.647887;AO=45;DP=74;FAO=46;FDP=71;FR=.;FRO=25;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=5;FSRR=20;FWDB=-0.00204358;FXX=0.0405351;HRUN=2;LEN=1;MLLD=279.466;QD=28.3531;RBI=0.0173343;REFB=-0.00468857;REVB=-0.0172134;RO=25;SAF=22;SAR=23;SRF=5;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.191259;STB=0.60559;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.00214412;OID=.;OPOS=12191933;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:71:25:25:45:46:0.647887:23:22:5:20:23:23:5:20
chr10	12209752	.	T	C	357.49	PASS	AF=0.506849;AO=37;DP=73;FAO=37;FDP=73;FR=.;FRO=36;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=26;FSRR=10;FWDB=0.0447004;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.358;QD=19.5884;RBI=0.0475898;REFB=-0.0205054;REVB=0.0163299;RO=35;SAF=16;SAR=21;SRF=26;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.267152;STB=0.639986;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.0100713;OID=.;OPOS=12209752;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:35:36:37:37:0.506849:21:16:26:9:21:16:26:10
chr10	12212186	.	T	A	153.24	PASS	AF=0.386364;AO=17;DP=44;FAO=17;FDP=44;FR=.;FRO=27;FSAF=2;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=-0.0177649;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.048;QD=13.9311;RBI=0.0177895;REFB=-0.00208221;REVB=-0.000936248;RO=26;SAF=2;SAR=15;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.558485;STB=0.838062;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.00246841;OID=.;OPOS=12212186;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:26:27:17:17:0.386364:15:2:15:11:15:2:16:11
chr10	12238325	.	TGGGA	T	54.34	PASS	AF=0.391304;AO=7;DP=24;FAO=9;FDP=23;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=-0.00779111;FXX=0.11534;HRUN=3;LEN=4;MLLD=224.755;QD=9.44986;RBI=0.0129838;REFB=6.6496e-05;REVB=-0.0103865;RO=14;SAF=5;SAR=2;SRF=9;SRR=5;SSEN=0.377643;SSEP=0;SSSB=0.0885977;STB=0.554337;STBP=0.739;TYPE=del;VARB=-0.000412447;OID=.;OPOS=12238326;OREF=GGGA;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.391304:7:24:9:23:14:5:4:9:5:54:14:5:2:9:5
chr10	12292348	.	G	T	147.18	PASS	AF=0.444444;AO=16;DP=37;FAO=16;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=0.0645544;FXX=0.0270197;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.918;QD=16.3535;RBI=0.0682375;REFB=0.00202229;REVB=-0.022115;RO=20;SAF=7;SAR=9;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0871019;STB=0.549939;STBP=0.616;TYPE=snp;VARB=-0.00187078;OID=.;OPOS=12292348;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:36:20:20:16:16:0.444444:9:7:7:13:9:7:7:13
chr10	12867598	.	C	G	393.32	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0227852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.0912;QD=56.1881;RBI=0.0227908;REFB=0;REVB=0.00050662;RO=0;SAF=8;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.75204e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000460794;OID=.;OPOS=12867598;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:20:8:0:0:20:8:0:0
chr10	12940455	.	A	G	660.88	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0197923;FXX=0.0454442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.085;QD=62.9407;RBI=0.0199783;REFB=0;REVB=-0.00271995;RO=0;SAF=16;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.1719e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000380344;OID=.;OPOS=12940455;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:42:0:0:41:42:1:25:16:0:0:25:17:0:0
chr10	13152400	.	T	A	251.92	PASS	AF=0.621622;AO=23;DP=37;FAO=23;FDP=37;FR=.;FRO=14;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=3;FWDB=-0.0187599;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.18;QD=27.2348;RBI=0.0310039;REFB=0.00391201;REVB=0.0246842;RO=12;SAF=9;SAR=14;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.221696;STB=0.646527;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=-0.00374359;OID=.;OPOS=13152400;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:12:14:23:23:0.621622:14:9:9:3:14:9:11:3
chr10	13158257	.	G	A	57.93	PASS	AF=0.470588;AO=8;DP=17;FAO=8;FDP=17;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.00685044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.517;QD=13.631;RBI=0.0219137;REFB=-0.00144237;REVB=-0.0208154;RO=9;SAF=5;SAR=3;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0401081;STB=0.523751;STBP=0.833;TYPE=snp;VARB=0.00222397;OID=.;OPOS=13158257;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:17:17:9:9:8:8:0.470588:3:5:6:3:3:5:6:3
chr10	13158262	.	C	T	68.82	PASS	AF=0.5;AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=-0.0262384;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.67;QD=15.2927;RBI=0.0264283;REFB=-0.00945898;REVB=0.00316201;RO=9;SAF=5;SAR=4;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0973785;STB=0.556839;STBP=0.721;TYPE=snp;VARB=0.013299;OID=.;OPOS=13158262;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:18:18:9:9:9:9:0.5:4:5:6:3:4:5:6:3
chr10	13166076	.	A	G	392.32	PASS	AF=1;AO=27;DP=30;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0298428;FXX=0.0666445;HRUN=3;LEN=1;MLLD=144.832;QD=56.0459;RBI=0.0350709;REFB=0;REVB=-0.0184222;RO=0;SAF=9;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00563225;OID=.;OPOS=13166076;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:28:0:0:27:28:1:18:9:0:0:19:9:0:0
chr10	13206233	.	A	T	596.47	PASS	AF=0.630952;AO=52;DP=83;FAO=53;FDP=84;FR=.;FRO=31;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=23;FSRR=8;FWDB=-0.0132942;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.986;QD=28.4035;RBI=0.0213291;REFB=-0.0328446;REVB=0.0166791;RO=31;SAF=21;SAR=31;SRF=23;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.229721;STB=0.61913;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.00686046;OID=.;OPOS=13206233;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:84:31:31:52:53:0.630952:31:21:23:8:31:22:23:8
chr10	13275553	.	T	G	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00282976;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.327;QD=42.1826;RBI=0.0338811;REFB=0;REVB=0.0337627;RO=0;SAF=7;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000267786;OID=.;OPOS=13275553;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:4:7:0:0:4:7:0:0
chr10	13337588	.	G	A	557.13	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00761782;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.226;QD=60.2307;RBI=0.0168471;REFB=0;REVB=-0.0150265;RO=0;SAF=17;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.71161e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.97232e-05;OID=.;OPOS=13337588;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:20:17:0:0:20:17:0:0
chr10	13375906	.	T	C	937.61	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0278459;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.915;QD=58.6004;RBI=0.0281414;REFB=0;REVB=-0.00406737;RO=0;SAF=28;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.22097e-05;OID=.;OPOS=13375906;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:36:28:0:0:36:28:0:0
chr10	13481427	.	T	A	483.34	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00560431;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.944;QD=58.5863;RBI=0.0371212;REFB=0;REVB=0.0366957;RO=0;SAF=7;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.44409e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000306041;OID=.;OPOS=13481427;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:26:7:0:0:26:7:0:0
chr10	13494594	.	T	C	1609.18	PASS	AF=1;AO=107;DP=108;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0057248;FXX=0.0092584;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.667;QD=60.1563;RBI=0.0407048;REFB=0;REVB=0.0403002;RO=0;SAF=47;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.71637e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.19927e-05;OID=.;OPOS=13494594;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:108:107:0:0:107:107:1:60:47:0:0:60:47:0:0
chr10	13633835	.	A	G	873.2	PASS	AF=1;AO=58;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0670363;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.1365;QD=58.2135;RBI=0.0702975;REFB=0;REVB=-0.0211629;RO=0;SAF=30;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000594175;OID=.;OPOS=13633835;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:58:60:1:28:30:0:0:28:32:0:0
chr10	13685766	.	G	A	272.54	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0307695;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.823;QD=51.9124;RBI=0.068766;REFB=0;REVB=-0.061498;RO=0;SAF=12;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000189119;OID=.;OPOS=13685766;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:9:12:0:0:9:12:0:0
chr10	13687890	.	G	A	110.64	PASS	AF=0.448276;AO=13;DP=29;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.028938;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.419;QD=15.2603;RBI=0.0358054;REFB=0.00121023;REVB=-0.021086;RO=16;SAF=9;SAR=4;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.305054;STB=0.677143;STBP=0.128;TYPE=snp;VARB=-0.0139936;OID=.;OPOS=13687890;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:16:16:13:13:0.448276:4:9:6:10:4:9:6:10
chr10	13769842	.	A	G	377.23	PASS	AF=0.4875;AO=39;DP=80;FAO=39;FDP=80;FR=.;FRO=41;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=14;FSRR=27;FWDB=0.00340573;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.304;QD=18.8614;RBI=0.00527171;REFB=-0.0188122;REVB=0.00402392;RO=40;SAF=18;SAR=21;SRF=14;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103234;STB=0.562469;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=0.0288022;OID=.;OPOS=13769842;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:40:41:39:39:0.4875:21:18:14:26:21:18:14:27
chr10	14705494	.	G	C	464.83	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0865845;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.9073;QD=58.1035;RBI=0.120081;REFB=0;REVB=0.0832013;RO=0;SAF=13;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.33668e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.27712e-05;OID=.;OPOS=14705494;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:32:0:0:31:32:1:18:13:0:0:19:13:0:0
chr10	15058964	.	C	T	425.8	PASS	AF=0.693878;AO=34;DP=49;FAO=34;FDP=49;FR=.;FRO=15;FSAF=24;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=3;FWDB=0.0296457;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.916;QD=34.7589;RBI=0.0306267;REFB=-0.0464;REVB=0.00768919;RO=14;SAF=24;SAR=10;SRF=12;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102622;STB=0.535694;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.0191041;OID=.;OPOS=15058964;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:14:15:34:34:0.693878:10:24:12:2:10:24:12:3
chr10	15106441	.	A	G	343.23	PASS	AF=0.493151;AO=36;DP=73;FAO=36;FDP=73;FR=.;FRO=37;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=0.00727514;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=263.607;QD=18.8072;RBI=0.00862457;REFB=-0.00128394;REVB=0.00463201;RO=37;SAF=17;SAR=19;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0130022;STB=0.507242;STBP=0.905;TYPE=snp;VARB=0.00112921;OID=.;OPOS=15106441;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:37:37:36:36:0.493151:19:17:18:19:19:17:18:19
chr10	15573050	.	A	G	426.7	PASS	AF=0.408333;AO=49;DP=120;FAO=49;FDP=120;FR=.;FRO=71;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=30;FSRR=41;FWDB=0.0174435;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.731;QD=14.2235;RBI=0.0224437;REFB=-0.0243466;REVB=-0.0141225;RO=71;SAF=27;SAR=22;SRF=30;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134227;STB=0.575604;STBP=0.197;TYPE=snp;VARB=0.0358207;OID=.;OPOS=15573050;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:120:71:71:49:49:0.408333:22:27:30:41:22:27:30:41
chr10	15617559	.	G	A	372.88	PASS	AF=0.413462;AO=41;DP=102;FAO=43;FDP=104;FR=.;FRO=61;FSAF=27;FSAR=16;FSRF=35;FSRR=26;FWDB=0.000458043;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.771;QD=14.3413;RBI=0.00975105;REFB=-0.00757381;REVB=0.00974028;RO=56;SAF=27;SAR=14;SRF=34;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0572157;STB=0.53338;STBP=0.572;TYPE=snp;VARB=0.00665843;OID=.;OPOS=15617559;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:104:56:61:41:43:0.413462:14:27:34:22:16:27:35:26
chr10	15713667	.	C	G	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0267489;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.971;QD=48.7372;RBI=0.0284924;REFB=0;REVB=0.00981389;RO=0;SAF=11;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000193062;OID=.;OPOS=15713667;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:6:11:0:0:6:11:0:0
chr10	16794623	.	C	T	337.3	PASS	AF=0.38835;AO=40;DP=103;FAO=40;FDP=103;FR=.;FRO=63;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=40;FSRR=23;FWDB=-0.0272004;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.482;QD=13.0991;RBI=0.0282394;REFB=-0.0196956;REVB=-0.00758931;RO=63;SAF=17;SAR=23;SRF=40;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.222952;STB=0.626312;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.0213846;OID=.;OPOS=16794623;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:103:63:63:40:40:0.38835:23:17:40:23:23:17:40:23
chr10	16796919	.	C	A	397.03	PASS	AF=0.573529;AO=39;DP=68;FAO=39;FDP=68;FR=.;FRO=29;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=-0.0227799;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.917;QD=23.3549;RBI=0.0257771;REFB=-0.0184351;REVB=0.0120638;RO=29;SAF=22;SAR=17;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0726455;STB=0.539871;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.0136273;OID=.;OPOS=16796919;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:29:29:39:39:0.573529:17:22:19:10:17:22:19:10
chr10	16918972	.	A	G	327.34	PASS	AF=0.472973;AO=35;DP=74;FAO=35;FDP=74;FR=.;FRO=39;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=-0.0183891;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.406;QD=17.6943;RBI=0.0198873;REFB=0.00102305;REVB=-0.00757271;RO=39;SAF=17;SAR=18;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0470495;STB=0.526301;STBP=0.688;TYPE=snp;VARB=-0.00140321;OID=.;OPOS=16918972;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:39:39:35:35:0.472973:18:17:17:22:18:17:17:22
chr10	16943371	.	G	C	754.43	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00664592;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=298.344;QD=56.9383;RBI=0.0111147;REFB=0;REVB=0.00890893;RO=0;SAF=18;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.41099e-06;OID=.;OPOS=16943371;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:35:18:0:0:35:18:0:0
chr10	16948390	.	G	C	88.79	PASS	AF=0.458333;AO=11;DP=24;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.00998455;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.0904;QD=14.7978;RBI=0.0148362;REFB=0.0181;REVB=0.0109737;RO=13;SAF=6;SAR=5;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0659235;STB=0.538392;STBP=0.773;TYPE=snp;VARB=-0.0103616;OID=.;OPOS=16948390;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:24:24:13:13:11:11:0.458333:5:6:8:5:5:6:8:5
chr10	16949550	.	T	C	217.03	PASS	AF=0.40625;AO=26;DP=64;FAO=26;FDP=64;FR=.;FRO=38;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=23;FSRR=15;FWDB=0.00562743;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.426;QD=13.5644;RBI=0.00779912;REFB=-0.00729181;REVB=-0.00539983;RO=38;SAF=16;SAR=10;SRF=23;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0110727;STB=0.506324;STBP=0.951;TYPE=snp;VARB=0.00691531;OID=.;OPOS=16949550;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:38:38:26:26:0.40625:10:16:23:15:10:16:23:15
chr10	16961959	.	T	C	135.75	PASS	AF=0.7;AO=14;DP=20;FAO=14;FDP=20;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.0299637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.7638;QD=27.1497;RBI=0.0330893;REFB=0.0278369;REVB=0.0140385;RO=6;SAF=5;SAR=9;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0139697;STB=0.507801;STBP=0.966;TYPE=snp;VARB=-0.00743275;OID=.;OPOS=16961959;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:20:20:6:6:14:14:0.7:9:5:2:4:9:5:2:4
chr10	16961995	.	A	C	94.25	PASS	AF=0.333333;AO=12;DP=36;FAO=12;FDP=36;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.0104186;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=234.07;QD=10.4723;RBI=0.0169173;REFB=-0.00964272;REVB=-0.0133285;RO=24;SAF=6;SAR=6;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0926362;STB=0.555464;STBP=0.636;TYPE=snp;VARB=0.0186718;OID=.;OPOS=16961995;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:36:36:24:24:12:12:0.333333:6:6:10:14:6:6:10:14
chr10	16967401	.	C	T	785.88	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00285757;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.604;QD=64.1534;RBI=0.0326787;REFB=0;REVB=-0.0325535;RO=0;SAF=16;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000113856;OID=.;OPOS=16967401;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:33:16:0:0:33:16:0:0
chr10	17024503	.	G	A	747.1	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0147208;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=252.702;QD=63.5826;RBI=0.0209046;REFB=0;REVB=-0.0148425;RO=0;SAF=25;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.33801e-07;OID=.;OPOS=17024503;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:22:25:0:0:22:25:0:0
chr10	17024615	.	A	T	651.23	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0217225;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.609;QD=62.022;RBI=0.0218527;REFB=0;REVB=-0.00238215;RO=0;SAF=21;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.00553e-05;OID=.;OPOS=17024615;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:21:21:0:0:21:21:0:0
chr10	17113563	.	C	T	944.17	PASS	AF=0.984848;AO=65;DP=67;FAO=65;FDP=66;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0179945;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.6317;QD=57.2222;RBI=0.0185466;REFB=-0.133615;REVB=0.0044914;RO=1;SAF=27;SAR=38;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0122705;STB=0.506491;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.00312685;OID=.;OPOS=17113563;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:67:66:1:1:65:65:0.984848:38:27:0:1:38:27:0:1
chr10	17147521	.	G	T	1486.97	PASS	AF=0.969697;AO=96;DP=99;FAO=96;FDP=99;FR=.;FRO=3;FSAF=45;FSAR=51;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0195099;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.3511;QD=60.0797;RBI=0.0208392;REFB=-0.0397873;REVB=-0.00732375;RO=2;SAF=45;SAR=51;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0206077;STB=0.516126;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=0.00586926;OID=.;OPOS=17147521;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:99:99:2:3:96:96:0.969697:51:45:2:0:51:45:3:0
chr10	17156151	.	A	G	554.65	PASS	AF=0.95;AO=38;DP=40;FAO=38;FDP=40;FR=.;FRO=2;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0109513;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=190.935;QD=55.4646;RBI=0.0146082;REFB=-0.00975482;REVB=0.00966792;RO=1;SAF=23;SAR=15;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0302093;STB=0.531233;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=0.000679953;OID=.;OPOS=17156151;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:40:40:1:2:38:38:0.95:15:23:0:1:15:23:0:2
chr10	17187634	.	G	C	183.72	PASS	AF=0.44186;AO=19;DP=44;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=17;FWDB=0.0229587;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=306.414;QD=17.09;RBI=0.0230847;REFB=0.00412692;REVB=-0.00240796;RO=24;SAF=11;SAR=8;SRF=7;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.274918;STB=0.656168;STBP=0.087;TYPE=snp;VARB=-0.00505268;OID=.;OPOS=17187634;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:43:24:24:19:19:0.44186:8:11:7:17:8:11:7:17
chr10	17204187	.	G	A	113.4	PASS	AF=0.297872;AO=14;DP=47;FAO=14;FDP=47;FR=.;FRO=33;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=25;FSRR=8;FWDB=-0.0490216;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.6442;QD=9.65107;RBI=0.0602966;REFB=0.00977004;REVB=0.0351079;RO=33;SAF=7;SAR=7;SRF=25;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.306;STB=0.680626;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=-0.0242022;OID=.;OPOS=17204187;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:33:33:14:14:0.297872:7:7:25:8:7:7:25:8
chr10	17204247	.	A	T	84.68	PASS	AF=0.55;AO=10;DP=17;FAO=11;FDP=20;FR=.;FRO=9;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.021574;FXX=0;HRUN=15;LEN=1;MLLD=72.9675;QD=16.9367;RBI=0.042213;REFB=-0.054474;REVB=-0.0362836;RO=6;SAF=7;SAR=3;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144541;STB=0.685364;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=0.00822234;OID=.;OPOS=17204247;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:17:20:6:9:10:11:0.55:3:7:3:3:3:8:3:6
chr10	17210822	.	A	C	126.57	PASS	AF=0.764706;AO=13;DP=17;FAO=13;FDP=17;FR=.;FRO=4;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.00463113;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=210.855;QD=29.7802;RBI=0.0358554;REFB=-0.0373244;REVB=0.0355551;RO=4;SAF=10;SAR=3;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144739;STB=0.581261;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.0118715;OID=.;OPOS=17210822;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:17:17:4:4:13:13:0.764706:3:10:2:2:3:10:2:2
chr10	17216556	.	C	T	251.06	PASS	AF=0.5;AO=24;DP=48;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=18;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.0701953;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.7474;QD=20.9212;RBI=0.0987823;REFB=0.0556429;REVB=0.0695023;RO=24;SAF=18;SAR=6;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176622;STB=0.599911;STBP=0.2;TYPE=snp;VARB=-0.0501842;OID=.;OPOS=17216556;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:24:24:24:24:0.5:6:18:14:10:6:18:14:10
chr10	17256340	.	T	A	36.17	PASS	AF=0.0833333;AO=12;DP=140;FAO=12;FDP=144;FR=.;FRO=132;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=90;FSRR=42;FWDB=0.0585264;FXX=0.00689608;HRUN=5;LEN=1;MLLD=38.1705;QD=1.00465;RBI=0.0593461;REFB=-0.0030182;REVB=-0.00982959;RO=127;SAF=1;SAR=11;SRF=90;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.636453;STB=0.949145;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.0438747;OID=.;OPOS=17256340;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:140:144:127:132:12:12:0.0833333:11:1:90:37:11:1:90:42
chr10	17256354	.	ATT	ATA,AT	991.3	PASS	AF=0.0970149,0.902985;AO=14,68;DP=135;FAO=13,121;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=0,55;FSAR=13,66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0706117,0.870515;FXX=0.0218962;HRUN=6,6;LEN=1,1;MLLD=227.499,10.1491;QD=29.5911;RBI=0.0726873,0.871738;REFB=-0.00375167,0.105645;REVB=-0.017246,0.0461605;RO=47;SAF=0,12;SAR=14,56;SRF=40;SRR=7;SSEN=0,0.448276;SSEP=0,0;SSSB=-0.850461,-0.537365;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,del;VARB=0.0396577,0.0185144;OID=.,.;OPOS=17256356,17256355;OREF=T,T;OALT=A,-;OMAPALT=ATA,AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0970149,0.902985:14,68:135:13,121:134:0:0,55:13,66:0:0:47:47:0,12:14,56:40:7
chr10	17756596	.	T	C	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.051637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.2669;QD=55.6558;RBI=0.0864189;REFB=0;REVB=0.0692954;RO=0;SAF=14;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00181296;OID=.;OPOS=17756596;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:13:14:0:0:13:14:0:0
chr10	17891705	.	A	G	928.92	PASS	AF=0.477833;AO=97;DP=204;FAO=97;FDP=203;FR=.;FRO=106;FSAF=36;FSAR=61;FSRF=41;FSRR=65;FWDB=0.02843;FXX=0.00490172;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.958;QD=18.3038;RBI=0.029203;REFB=-0.00687569;REVB=0.00667484;RO=107;SAF=36;SAR=61;SRF=41;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0122112;STB=0.508717;STBP=0.806;TYPE=snp;VARB=0.00944401;OID=.;OPOS=17891705;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:204:203:107:106:97:97:0.477833:61:36:41:66:61:36:41:65
chr10	18122716	.	A	G	180.4	PASS	AF=0.359375;AO=23;DP=65;FAO=23;FDP=64;FR=.;FRO=41;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=0.0534194;FXX=0.0153822;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.6763;QD=11.275;RBI=0.0543523;REFB=-0.00325522;REVB=0.010027;RO=41;SAF=12;SAR=11;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0105424;STB=0.506117;STBP=0.959;TYPE=snp;VARB=0.00892491;OID=.;OPOS=18122716;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:64:41:41:23:23:0.359375:11:12:21:20:11:12:21:20
chr10	18242304	.	T	C	501.63	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0311984;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.36;QD=59.0148;RBI=0.0312481;REFB=0;REVB=-0.0017613;RO=0;SAF=21;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000121746;OID=.;OPOS=18242304;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:13:21:0:0:13:21:0:0
chr10	18254606	.	C	A	85.3	PASS	AF=0.366667;AO=11;DP=30;FAO=11;FDP=30;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=0.0251672;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=190.542;QD=11.373;RBI=0.0353648;REFB=0.00692926;REVB=-0.0248451;RO=19;SAF=4;SAR=7;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0054687;STB=0.503262;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0132165;OID=.;OPOS=18254606;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:30:30:19:19:11:11:0.366667:7:4:7:12:7:4:7:12
chr10	18266989	.	G	A	109.25	PASS	AF=0.419355;AO=13;DP=31;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=0.0155429;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.357;QD=14.0973;RBI=0.0171224;REFB=0.0053205;REVB=-0.00718281;RO=18;SAF=5;SAR=8;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.275431;STB=0.659955;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=-0.00632051;OID=.;OPOS=18266989;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:18:18:13:13:0.419355:8:5:12:6:8:5:12:6
chr10	18828371	.	C	T	174.1	PASS	AF=0.5;AO=18;DP=36;FAO=18;FDP=36;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=4;FSRR=14;FWDB=0.0141562;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.387;QD=19.3446;RBI=0.0164331;REFB=-0.0333392;REVB=-0.00834572;RO=18;SAF=4;SAR=14;SRF=4;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0318392;OID=.;OPOS=18828371;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:18:18:18:18:0.5:14:4:4:14:14:4:4:14
chr10	18829222	.	A	ATGT	184.79	PASS	AF=0.377049;AO=22;DP=63;FAO=23;FDP=61;FR=.;FRO=38;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=-0.0100183;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=216.256;QD=12.1174;RBI=0.0162619;REFB=0.00561201;REVB=-0.0128095;RO=40;SAF=11;SAR=11;SRF=18;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0554305;STB=0.502855;STBP=0.965;TYPE=ins;VARB=-0.00817805;OID=.;OPOS=18829223;OREF=-;OALT=TGT;OMAPALT=ATGT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.377049:22:63:23:61:38:11:12:18:20:99:40:11:11:18:22
chr10	18829981	.	A	ATGTT	944.27	PASS	AF=0.806818;AO=68;DP=95;FAO=71;FDP=88;FR=.;FRO=17;FSAF=35;FSAR=36;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.0143349;FXX=0.0329634;HRUN=1;LEN=4;MLLD=225.378;QD=42.9215;RBI=0.0145347;REFB=-0.00433547;REVB=-0.00240129;RO=21;SAF=33;SAR=35;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0169699;STB=0.50704;STBP=0.803;TYPE=ins;VARB=0.00111659;OID=.;OPOS=18829982;OREF=-;OALT=TGTT;OMAPALT=ATGTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.806818:68:95:71:88:17:35:36:9:8:99:21:33:35:11:10
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chr10	18965960	.	G	T	652.54	PASS	AF=0.515873;AO=65;DP=125;FAO=65;FDP=126;FR=.;FRO=61;FSAF=29;FSAR=36;FSRF=37;FSRR=24;FWDB=-0.0128857;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.434;QD=20.7155;RBI=0.0373237;REFB=-0.00593397;REVB=0.0350288;RO=60;SAF=29;SAR=36;SRF=37;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148049;STB=0.577236;STBP=0.081;TYPE=snp;VARB=0.00590839;OID=.;OPOS=18965960;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:125:126:60:61:65:65:0.515873:36:29:37:23:36:29:37:24
chr10	18966490	.	C	T	141.96	PASS	AF=0.390244;AO=16;DP=41;FAO=16;FDP=41;FR=.;FRO=25;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.0189354;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.031;QD=13.8496;RBI=0.0237046;REFB=-0.00879364;REVB=-0.0142604;RO=25;SAF=10;SAR=6;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0708753;STB=0.541349;STBP=0.693;TYPE=snp;VARB=0.0169094;OID=.;OPOS=18966490;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:25:25:16:16:0.390244:6:10:14:11:6:10:14:11
chr10	19492832	.	A	C	558.2	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0731646;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.228;QD=60.3454;RBI=0.0738338;REFB=0;REVB=0.0099175;RO=0;SAF=11;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000252821;OID=.;OPOS=19492832;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:37:0:0:35:37:1:24:11:0:0:24:13:0:0
chr10	19498278	.	G	A	1008.49	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142144;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=329.303;QD=59.3228;RBI=0.0153843;REFB=0;REVB=0.00588446;RO=0;SAF=41;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.6787e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.62094e-05;OID=.;OPOS=19498278;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:27:41:0:0:27:41:0:0
chr10	19676553	.	A	G	1185.45	PASS	AF=0.975309;AO=79;DP=82;FAO=79;FDP=81;FR=.;FRO=2;FSAF=55;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0123196;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.798;QD=58.5406;RBI=0.0123234;REFB=-0.0389425;REVB=0.000304175;RO=2;SAF=55;SAR=24;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0378196;STB=0.519995;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=4.5511e-05;OID=.;OPOS=19676553;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:82:81:2:2:79:79:0.975309:24:55:0:2:24:55:0:2
chr10	19676561	.	G	A	1366.09	PASS	AF=1;AO=87;DP=88;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00842301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.366;QD=61.3973;RBI=0.0110135;REFB=-0.107922;REVB=0.00709583;RO=0;SAF=61;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000158889;OID=.;OPOS=19676561;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:88:89:0:0:87:89:1:26:61:0:0:27:62:0:0
chr10	19678286	.	C	T	1062.42	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0379678;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.103;QD=59.8548;RBI=0.0447915;REFB=0;REVB=0.023764;RO=0;SAF=35;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11607e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000115919;OID=.;OPOS=19678286;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:36:35:0:0:36:35:0:0
chr10	19678497	.	G	A	708.56	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00903077;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.932;QD=62.9827;RBI=0.0278698;REFB=0;REVB=0.0263661;RO=0;SAF=24;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000160859;OID=.;OPOS=19678497;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:21:24:0:0:21:24:0:0
chr10	19778072	.	A	G	1102.36	PASS	AF=0.986667;AO=73;DP=75;FAO=74;FDP=75;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00165159;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=302.558;QD=58.7923;RBI=0.00254873;REFB=-0.00534009;REVB=0.00194121;RO=1;SAF=23;SAR=50;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00936786;STB=0.504949;STBP=0.611;TYPE=snp;VARB=-1.98262e-06;OID=.;OPOS=19778072;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:75:75:1:1:73:74:0.986667:50:23:0:1:50:24:0:1
chr10	19780543	.	C	T	365.79	PASS	AF=0.5;AO=36;DP=74;FAO=38;FDP=76;FR=.;FRO=38;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=0.00586932;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.911;QD=19.252;RBI=0.0140717;REFB=-0.0176395;REVB=0.0127892;RO=38;SAF=16;SAR=20;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00272389;STB=0.51343;STBP=0.839;TYPE=snp;VARB=0.0165024;OID=.;OPOS=19780543;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:76:38:38:36:38:0.5:20:16:17:21:22:16:17:21
chr10	19787418	.	T	G	257.12	PASS	AF=0.453125;AO=29;DP=63;FAO=29;FDP=64;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=23;FSRR=12;FWDB=-0.00106656;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.582;QD=16.0698;RBI=0.0064944;REFB=-0.0184676;REVB=0.00640622;RO=33;SAF=13;SAR=16;SRF=21;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176609;STB=0.61269;STBP=0.113;TYPE=snp;VARB=0.0254878;OID=.;OPOS=19787418;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:64:33:35:29:29:0.453125:16:13:21:12:16:13:23:12
chr10	19896830	.	C	A	281.41	PASS	AF=0.517241;AO=30;DP=58;FAO=30;FDP=58;FR=.;FRO=28;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=-0.00974919;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.874;QD=19.4078;RBI=0.0221689;REFB=-0.00637854;REVB=0.0199101;RO=28;SAF=17;SAR=13;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180103;STB=0.600162;STBP=0.137;TYPE=snp;VARB=0.00609177;OID=.;OPOS=19896830;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:28:28:30:30:0.517241:13:17:10:18:13:17:10:18
chr10	20036605	.	A	AGT	56.18	PASS	AF=0.275862;AO=8;DP=39;FAO=8;FDP=29;FR=.;FRO=21;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=5;FWDB=-0.00126575;FXX=0.0937207;HRUN=0;LEN=2;MLLD=103.638;QD=7.74843;RBI=0.0518314;REFB=0.00980276;REVB=0.051816;RO=28;SAF=3;SAR=5;SRF=20;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.391247;STB=0.759455;STBP=0.11;TYPE=ins;VARB=-0.0324886;OID=.;OPOS=20036606;OREF=-;OALT=GT;OMAPALT=AGT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.275862:8:39:8:29:21:3:5:16:5:56:28:3:5:20:8
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chr10	21074455	.	T	C	506.52	PASS	AF=0.473684;AO=54;DP=115;FAO=54;FDP=114;FR=.;FRO=60;FSAF=30;FSAR=24;FSRF=42;FSRR=18;FWDB=-0.00947885;FXX=0.0086949;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.523;QD=17.7726;RBI=0.0264086;REFB=-0.00155107;REVB=0.0246489;RO=60;SAF=30;SAR=24;SRF=42;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141558;STB=0.578285;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.00199385;OID=.;OPOS=21074455;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:114:60:60:54:54:0.473684:24:30:42:18:24:30:42:18
chr10	21112137	.	A	T	167.44	PASS	AF=0.333333;AO=22;DP=66;FAO=22;FDP=66;FR=.;FRO=44;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=29;FSRR=15;FWDB=-0.00671152;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.11;QD=10.1481;RBI=0.00858476;REFB=-0.00670139;REVB=-0.0053529;RO=44;SAF=14;SAR=8;SRF=29;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0282046;STB=0.516502;STBP=0.907;TYPE=snp;VARB=0.0219436;OID=.;OPOS=21112137;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:44:44:22:22:0.333333:8:14:29:15:8:14:29:15
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chr10	21415006	.	T	C	570.21	PASS	AF=0.508621;AO=58;DP=117;FAO=59;FDP=116;FR=.;FRO=57;FSAF=28;FSAR=31;FSRF=27;FSRR=30;FWDB=-0.00536135;FXX=0.00854628;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.105;QD=19.6624;RBI=0.00672559;REFB=-0.00695453;REVB=-0.00406073;RO=56;SAF=28;SAR=30;SRF=26;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0164799;STB=0.500439;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00713925;OID=.;OPOS=21415006;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:117:116:56:57:58:59:0.508621:30:28:26:30:31:28:27:30
chr10	21435340	.	ACACT	A	362.11	PASS	AF=1;AO=25;DP=27;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0482095;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=4;MLLD=239.755;QD=55.7087;RBI=0.0488056;REFB=0;REVB=-0.00760447;RO=0;SAF=14;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000162696;OID=.;OPOS=21435341;OREF=CACT;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:25:27:26:26:0:15:11:0:0:4:0:14:11:0:0
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chr10	21806999	.	TTTA	T,TT,TTTT	79.43	PASS	AF=0.217391,0.304348,0;AO=4,6,10;DP=35;FAO=5,7,0;FDP=23;FR=.;FRO=11;FSAF=4,5,0;FSAR=1,2,0;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.0167403,0.0282172,0.170759;FXX=0.0416493;HRUN=7,7,6;LEN=3,2,1;MLLD=21.8131,15.6551,8.35873;QD=13.8132;RBI=0.0192745,0.0348383,0.171541;REFB=0.000747743,-0.0411861,-0.137889;REVB=-0.00955349,-0.0204327,-0.0163604;RO=13;SAF=3,4,0;SAR=1,2,10;SRF=7;SRR=6;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.252798,0.144953,-0.798705;STB=0.755664,0.666173,0.5;STBP=0.211,0.304,1;TYPE=del,del,snp;VARB=0.0585087,0.00736719,0;OID=.,.,.;OPOS=21807000,21807001,21807002;OREF=TTA,TA,A;OALT=-,-,T;OMAPALT=T,TT,TTTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0.217391,0.304348,0:4,6,10:35:5,7,0:23:11:4,5,0:1,2,0:5:6:43:13:3,4,0:1,2,10:7:6
chr10	21827796	.	G	A	126.67	PASS	AF=0.333333;AO=14;DP=45;FAO=15;FDP=45;FR=.;FRO=30;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=-0.00779359;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.58;QD=11.2596;RBI=0.0219447;REFB=-0.00659087;REVB=0.0205141;RO=30;SAF=6;SAR=8;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11335;STB=0.547109;STBP=0.669;TYPE=snp;VARB=0.00971343;OID=.;OPOS=21827796;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:30:30:14:15:0.333333:8:6:10:20:9:6:10:20
chr10	22015245	.	A	G	254.75	PASS	AF=0.333333;AO=31;DP=93;FAO=31;FDP=93;FR=.;FRO=62;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=32;FSRR=30;FWDB=0.0245608;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.087;QD=10.9569;RBI=0.0264152;REFB=-0.005993;REVB=0.00972272;RO=61;SAF=13;SAR=18;SRF=32;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120567;STB=0.564812;STBP=0.39;TYPE=snp;VARB=0.013951;OID=.;OPOS=22015245;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:61:62:31:31:0.333333:18:13:32:29:18:13:32:30
chr10	22498749	.	A	T	1491.51	PASS	AF=1;AO=94;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.028532;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.376;QD=63.4683;RBI=0.0305968;REFB=0;REVB=0.0110495;RO=0;SAF=50;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000232395;OID=.;OPOS=22498749;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:94:94:0:0:94:94:1:44:50:0:0:44:50:0:0
chr10	22825596	.	C	T	500.58	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0126967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.1684;QD=58.8923;RBI=0.0630138;REFB=0;REVB=0.0617214;RO=0;SAF=22;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000556877;OID=.;OPOS=22825596;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:34:0:0:33:34:1:11:22:0:0:12:22:0:0
chr10	23556110	.	A	G	317.86	PASS	AF=0.485714;AO=34;DP=70;FAO=34;FDP=70;FR=.;FRO=36;FSAF=10;FSAR=24;FSRF=12;FSRR=24;FWDB=0.00484978;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=109.927;QD=18.1632;RBI=0.00485806;REFB=-0.0255438;REVB=0.00028354;RO=33;SAF=10;SAR=24;SRF=12;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0714431;STB=0.523795;STBP=0.71;TYPE=snp;VARB=0.0251308;OID=.;OPOS=23556110;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:33:36:34:34:0.485714:24:10:12:21:24:10:12:24
chr10	23633566	.	C	A	1476.04	PASS	AF=0.980583;AO=101;DP=103;FAO=101;FDP=103;FR=.;FRO=2;FSAF=60;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00122282;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=242.205;QD=57.3221;RBI=0.0566154;REFB=-0.0811792;REVB=0.0566022;RO=2;SAF=60;SAR=41;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00358884;STB=0.501892;STBP=0.863;TYPE=snp;VARB=0.000402403;OID=.;OPOS=23633566;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:103:103:2:2:101:101:0.980583:41:60:1:1:41:60:1:1
chr10	23730995	.	C	CT	34.19	PASS	AF=0.273973;AO=12;DP=78;FAO=20;FDP=73;FR=.;FRO=53;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=23;FSRR=30;FWDB=0.132871;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=7.9724;QD=1.87347;RBI=0.162707;REFB=-0.0644664;REVB=-0.0939095;RO=61;SAF=6;SAR=6;SRF=26;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0921095;STB=0.583591;STBP=0.404;TYPE=ins;VARB=0.0519988;OID=.;OPOS=23730996;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.273973:12:78:20:73:53:11:9:23:30:34:61:6:6:26:35
chr10	24564653	.	C	T	122.63	PASS	AF=0.684211;AO=11;DP=19;FAO=13;FDP=19;FR=.,HEALED;FRO=6;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.00873165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.218;QD=25.8164;RBI=0.0250778;REFB=-0.0194347;REVB=0.0235086;RO=6;SAF=8;SAR=3;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161641;STB=0.56746;STBP=0.42;TYPE=snp;VARB=0.00582039;OID=.;OPOS=24564653;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:19:19:6:6:11:13:0.684211:3:8:3:3:4:9:3:3
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chr10	24873150	.	AATA	AATATA,AA,AAT,TATA	157.35	PASS	AF=0.294118,0.588235,0,0;AO=3,3,2,2;DP=17;FAO=5,10,0,0;FDP=17;FR=.;FRO=2;FSAF=5,8,0,0;FSAR=0,2,0,0;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0115449,0.0957997,0.0944015,-0.0219033;FXX=0.0555247;HRUN=1,1,1,3;LEN=2,2,1,1;MLLD=34.7334,98.5125,96.005,47.2863;QD=37.0246;RBI=0.0283381,0.101826,0.0953526,0.0356819;REFB=-0.0973091,-0.0555014,-0.0549301,-0.0564749;REVB=-0.0258798,0.0345116,0.0134337,-0.0281681;RO=2;SAF=3,3,0,2;SAR=0,0,2,0;SRF=2;SRR=0;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=0,0,-0.727176,0;STB=0.5,0.555452,0.5,0.5;STBP=1,0.641,1,1;TYPE=ins,del,del,snp;VARB=0.0202076,0.0249189,0,0;OID=.,.,.,.;OPOS=24873151,24873151,24873153,24873150;OREF=-,AT,A,A;OALT=AT,-,-,T;OMAPALT=AATATA,AA,AAT,TATA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:32:17:17:2:2:3,3,2,2:5,10,0,0:0.294118,0.588235,0,0:0,0,2,0:3,3,0,2:2:0:0,2,0,0:5,8,0,0:2:0
chr10	24873369	.	C	G	205.16	PASS	AF=0.442308;AO=23;DP=52;FAO=23;FDP=52;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=-0.0316839;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.397;QD=15.7818;RBI=0.033762;REFB=-0.0181635;REVB=0.011662;RO=29;SAF=12;SAR=11;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0635979;STB=0.536103;STBP=0.665;TYPE=snp;VARB=0.0132307;OID=.;OPOS=24873369;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:29:29:23:23:0.442308:11:12:17:12:11:12:17:12
chr10	24879281	.	A	G	941.24	PASS	AF=1;AO=60;DP=62;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000957943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.442;QD=57.9222;RBI=0.0211799;REFB=0;REVB=0.0211583;RO=0;SAF=31;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.73709e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.60204e-05;OID=.;OPOS=24879281;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:65:0:0:60:65:1:29:31:0:0:33:32:0:0
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chr10	25312689	.	A	G	204.51	PASS	AF=0.42;AO=21;DP=50;FAO=21;FDP=50;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=9;FWDB=0.0198083;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.9747;QD=16.3607;RBI=0.044182;REFB=0.00725724;REVB=-0.0394928;RO=29;SAF=9;SAR=12;SRF=20;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.259893;STB=0.64791;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=-0.011032;OID=.;OPOS=25312689;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:29:29:21:21:0.42:12:9:20:9:12:9:20:9
chr10	25313818	.	C	T	44.25	PASS	AF=0.269231;AO=7;DP=26;FAO=7;FDP=26;FR=.;FRO=19;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.0143304;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.411;QD=6.80822;RBI=0.0169441;REFB=0.00266803;REVB=-0.00904099;RO=19;SAF=3;SAR=4;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170567;STB=0.60839;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=-0.0105999;OID=.;OPOS=25313818;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:26:26:19:19:7:7:0.269231:4:3:11:8:4:3:11:8
chr10	25314538	.	A	C	57.79	PASS	AF=0.347826;AO=8;DP=23;FAO=8;FDP=23;FR=.;FRO=15;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=0.216098;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=28.4557;QD=10.0498;RBI=0.234078;REFB=0.0117453;REVB=0.0899676;RO=14;SAF=3;SAR=5;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.204846;STB=0.644803;STBP=0.41;TYPE=snp;VARB=0.0266818;OID=.;OPOS=25314538;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:23:23:14:15:8:8:0.347826:5:3:8:6:5:3:9:6
chr10	25314637	.	G	C	431.59	PASS	AF=0.44898;AO=43;DP=98;FAO=44;FDP=98;FR=.,HEALED;FRO=54;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=30;FSRR=24;FWDB=-0.00580382;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=269.58;QD=17.616;RBI=0.0299845;REFB=-0.0282595;REVB=0.0294174;RO=41;SAF=19;SAR=24;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0408194;STB=0.568151;STBP=0.245;TYPE=snp;VARB=-0.00406792;OID=.;OPOS=25314637;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:41:54:43:44:0.44898:24:19:20:21:25:19:30:24
chr10	25701341	.	C	G	523.84	PASS	AF=0.661972;AO=47;DP=70;FAO=47;FDP=71;FR=.;FRO=24;FSAF=17;FSAR=30;FSRF=18;FSRR=6;FWDB=-0.0397462;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.6936;QD=29.512;RBI=0.0608481;REFB=-0.0238551;REVB=-0.0460731;RO=23;SAF=17;SAR=30;SRF=17;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.230321;STB=0.631713;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0109441;OID=.;OPOS=25701341;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:71:23:24:47:47:0.661972:30:17:17:6:30:17:18:6
chr10	25888180	.	A	G	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0312486;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.876;QD=43.4862;RBI=0.0316604;REFB=0;REVB=0.00508993;RO=0;SAF=8;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000594834;OID=.;OPOS=25888180;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:4:8:0:0:4:8:0:0
chr10	26355906	.	G	A	501.65	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0050606;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.339;QD=59.0171;RBI=0.0215554;REFB=0;REVB=-0.0209529;RO=0;SAF=19;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.40663e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00016342;OID=.;OPOS=26355906;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:15:19:0:0:15:19:0:0
chr10	26355992	.	A	G	439.53	PASS	AF=0.96875;AO=31;DP=33;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0818;FXX=0.0302939;HRUN=3;LEN=1;MLLD=134.735;QD=54.9413;RBI=0.08186;REFB=-0.0182121;REVB=0.00313463;RO=1;SAF=14;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0266551;STB=0.514277;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.000582848;OID=.;OPOS=26355992;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:33:32:1:1:31:31:0.96875:17:14:0:1:17:14:0:1
chr10	26357747	.	CG	TA	501.66	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000403027;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=181.404;QD=59.0187;RBI=0.0286817;REFB=0;REVB=-0.0286789;RO=0;SAF=15;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.40663e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=-0.000209833;OID=.;OPOS=26357747;OREF=CG;OALT=TA;OMAPALT=TA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:19:15:0:0:19:15:0:0
chr10	26446312	.	G	A	1472.56	PASS	AF=1;AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130575;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.081;QD=63.336;RBI=0.0255816;REFB=0;REVB=-0.0219982;RO=0;SAF=43;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.37889e-05;OID=.;OPOS=26446312;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:93:93:0:0:93:93:1:50:43:0:0:50:43:0:0
chr10	26462790	.	G	A	520.03	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0586859;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.9985;QD=59.432;RBI=0.0588699;REFB=0;REVB=0.00465196;RO=0;SAF=13;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.39865e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00107321;OID=.;OPOS=26462790;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:22:13:0:0:22:13:0:0
chr10	26463043	.	A	T	179.58	PASS	AF=1;AO=11;DP=16;FAO=15;FDP=15;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0435866;FXX=0.062461;HRUN=7;LEN=1;MLLD=278.243;QD=47.8872;RBI=0.0437258;REFB=0;REVB=-0.00348661;RO=0;SAF=4;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000226433;OID=.;OPOS=26463043;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:15:0:0:11:15:1:7:4:0:0:9:6:0:0
chr10	26463130	.	C	A	323.46	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0106457;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.004;QD=53.91;RBI=0.0143661;REFB=0;REVB=-0.00964643;RO=0;SAF=12;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000193341;OID=.;OPOS=26463130;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:12:12:0:0:12:12:0:0
chr10	26790109	.	T	C	113.84	PASS	AF=0.52;AO=13;DP=25;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.07471;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=45.7904;QD=18.2144;RBI=0.0790681;REFB=-0.00375285;REVB=0.0258878;RO=12;SAF=5;SAR=8;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167751;STB=0.596124;STBP=0.336;TYPE=snp;VARB=0.000351458;OID=.;OPOS=26790109;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:25:12:12:13:13:0.52:8:5:7:5:8:5:7:5
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chr10	27303605	.	A	T	725.0	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00818578;FXX=0.0192271;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.2564;QD=56.8628;RBI=0.0243509;REFB=0;REVB=-0.0229338;RO=0;SAF=29;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000752083;OID=.;OPOS=27303605;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:22:29:0:0:22:29:0:0
chr10	27317778	.	T	C	183.89	PASS	AF=0.463415;AO=19;DP=41;FAO=19;FDP=41;FR=.;FRO=22;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.0071793;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.649;QD=17.9403;RBI=0.00808848;REFB=0.00750781;REVB=0.00372573;RO=22;SAF=14;SAR=5;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20486;STB=0.617515;STBP=0.192;TYPE=snp;VARB=-0.0055634;OID=.;OPOS=27317778;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:22:22:19:19:0.463415:5:14:12:10:5:14:12:10
chr10	27317840	.	C	T	708.55	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.039522;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.7243;QD=62.9825;RBI=0.0498419;REFB=0;REVB=0.0303682;RO=0;SAF=28;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000118263;OID=.;OPOS=27317840;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:17:28:0:0:17:28:0:0
chr10	27324405	.	G	A	347.13	PASS	AF=0.5;AO=36;DP=74;FAO=36;FDP=72;FR=.;FRO=36;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=22;FWDB=-0.00431153;FXX=0.0270234;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.9809;QD=19.2848;RBI=0.030565;REFB=-0.00697378;REVB=-0.0302593;RO=34;SAF=24;SAR=12;SRF=12;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.276768;STB=0.64143;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.0105313;OID=.;OPOS=27324405;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:72:34:36:36:36:0.5:12:24:12:22:12:24:14:22
chr10	27353007	.	T	C	75.62	PASS	AF=0.384615;AO=10;DP=26;FAO=10;FDP=26;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.00172743;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.49;QD=11.6337;RBI=0.0103538;REFB=-0.0078358;REVB=0.0102087;RO=16;SAF=6;SAR=4;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0397865;STB=0.523762;STBP=0.847;TYPE=snp;VARB=0.0185208;OID=.;OPOS=27353007;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:26:26:16:16:10:10:0.384615:4:6:9:7:4:6:9:7
chr10	27381349	.	T	C	453.37	PASS	AF=1;AO=31;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0357647;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.088;QD=56.6711;RBI=0.0519271;REFB=0;REVB=0.0376472;RO=0;SAF=17;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00189567;OID=.;OPOS=27381349;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:31:32:1:14:17:0:0:15:17:0:0
chr10	27389197	.	T	C	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0441021;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.669;QD=53.2768;RBI=0.0476637;REFB=0;REVB=-0.0180784;RO=0;SAF=9;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.84921e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000387445;OID=.;OPOS=27389197;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:14:9:0:0:14:9:0:0
chr10	27400861	.	G	A	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0246648;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.8136;QD=53.2769;RBI=0.0353858;REFB=0;REVB=-0.0253732;RO=0;SAF=11;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00136164;OID=.;OPOS=27400861;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:12:11:0:0:12:11:0:0
chr10	27434483	.	G	A	1513.4	PASS	AF=1;AO=101;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0078484;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.915;QD=59.9367;RBI=0.00835307;REFB=0;REVB=-0.00285945;RO=0;SAF=45;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.15371e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.67839e-06;OID=.;OPOS=27434483;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:101:101:0:0:101:101:1:56:45:0:0:56:45:0:0
chr10	27437964	.	T	C	106.33	PASS	AF=0.361111;AO=13;DP=36;FAO=13;FDP=36;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.00119979;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.941;QD=11.8142;RBI=0.0077134;REFB=-0.0078176;REVB=0.00761952;RO=23;SAF=6;SAR=7;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0648377;STB=0.538402;STBP=0.77;TYPE=snp;VARB=0.0144806;OID=.;OPOS=27437964;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:23:23:13:13:0.361111:7:6:12:11:7:6:12:11
chr10	27442121	.	A	G	76.69	PASS	AF=0.416667;AO=10;DP=24;FAO=10;FDP=24;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.000327949;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.167;QD=12.7823;RBI=0.0205056;REFB=-0.0256399;REVB=-0.020503;RO=13;SAF=7;SAR=3;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0917417;STB=0.58316;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=0.0390213;OID=.;OPOS=27442121;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:24:24:13:14:10:10:0.416667:3:7:8:5:3:7:8:6
chr10	27443083	.	A	T	152.17	PASS	AF=0.75;AO=9;DP=19;FAO=15;FDP=20;FR=.;FRO=5;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.0120167;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=262.49;QD=30.433;RBI=0.0142379;REFB=-0.0182349;REVB=-0.00763642;RO=1;SAF=4;SAR=5;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0984833;STB=0.516756;STBP=0.834;TYPE=snp;VARB=0.00392932;OID=.;OPOS=27443083;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:19:20:1:5:9:15:0.75:5:4:1:0:7:8:3:2
chr10	27458898	.	C	A	60.85	PASS	AF=0.615385;AO=8;DP=13;FAO=8;FDP=13;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.00949221;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.013;QD=18.7229;RBI=0.0391672;REFB=-0.0177455;REVB=0.0379996;RO=5;SAF=5;SAR=3;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.276405;STB=0.659985;STBP=0.198;TYPE=snp;VARB=0.0146511;OID=.;OPOS=27458898;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:13:13:5:5:8:8:0.615385:3:5:1:4:3:5:1:4
chr10	27499771	.	G	A	285.3	PASS	AF=0.426667;AO=32;DP=75;FAO=32;FDP=75;FR=.;FRO=43;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=24;FSRR=19;FWDB=-0.0429517;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.406;QD=15.2158;RBI=0.0429776;REFB=-0.010473;REVB=0.00149111;RO=43;SAF=13;SAR=19;SRF=24;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154235;STB=0.587247;STBP=0.209;TYPE=snp;VARB=0.00976095;OID=.;OPOS=27499771;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:43:43:32:32:0.426667:19:13:24:19:19:13:24:19
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chr10	27538942	.	T	C	168.7	PASS	AF=0.428571;AO=18;DP=42;FAO=18;FDP=42;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=0.0267174;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.9827;QD=16.0663;RBI=0.0584315;REFB=0.0100019;REVB=0.0519656;RO=24;SAF=6;SAR=12;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0456741;STB=0.526286;STBP=0.79;TYPE=snp;VARB=-0.00473438;OID=.;OPOS=27538942;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:24:24:18:18:0.428571:12:6:9:15:12:6:9:15
chr10	27539137	.	T	C	74.68	PASS	AF=0.357143;AO=10;DP=28;FAO=10;FDP=28;FR=.;FRO=18;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.0327216;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.987;QD=10.6681;RBI=0.0401726;REFB=-0.00896674;REVB=-0.0233052;RO=17;SAF=1;SAR=9;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.466808;STB=0.809242;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.00591318;OID=.;OPOS=27539137;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:28:28:17:18:10:10:0.357143:9:1:7:10:9:1:8:10
chr10	27539166	.	G	A	46.0	PASS	AF=0.35;AO=7;DP=20;FAO=7;FDP=20;FR=.;FRO=13;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.00379267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=316.566;QD=9.19978;RBI=0.0140752;REFB=-0.0114822;REVB=0.0135546;RO=12;SAF=2;SAR=5;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.233803;STB=0.671134;STBP=0.277;TYPE=snp;VARB=0.0212355;OID=.;OPOS=27539166;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:20:20:12:13:7:7:0.35:5:2:6:6:5:2:7:6
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chr10	27687775	.	T	C	754.42	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00153564;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.04;QD=56.9374;RBI=0.0121229;REFB=0;REVB=0.0120253;RO=0;SAF=23;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.84538e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.21226e-05;OID=.;OPOS=27687775;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:53:0:0:52:53:1:29:23:0:0:29:24:0:0
chr10	27687965	.	A	G	123.27	PASS	AF=0.466667;AO=14;DP=30;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=0.0504118;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.482;QD=16.4356;RBI=0.0524224;REFB=0.000440838;REVB=0.0143788;RO=16;SAF=6;SAR=8;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112138;STB=0.564268;STBP=0.568;TYPE=snp;VARB=7.49536e-05;OID=.;OPOS=27687965;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:16:16:14:14:0.466667:8:6:5:11:8:6:5:11
chr10	27687994	.	A	G	69.64	PASS	AF=0.529412;AO=9;DP=17;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.0167965;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.442;QD=16.3852;RBI=0.021264;REFB=-0.00319065;REVB=0.0130398;RO=7;SAF=4;SAR=5;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.240193;STB=0.594396;STBP=0.468;TYPE=snp;VARB=0.00253837;OID=.;OPOS=27687994;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:17:17:7:8:9:9:0.529412:5:4:1:6:5:4:2:6
chr10	27692205	.	G	A	206.96	PASS	AF=0.4375;AO=21;DP=48;FAO=21;FDP=48;FR=.;FRO=27;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=0.00948329;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.298;QD=17.247;RBI=0.0118289;REFB=-0.00577823;REVB=-0.00707039;RO=26;SAF=7;SAR=14;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169657;STB=0.608589;STBP=0.198;TYPE=snp;VARB=0.00959182;OID=.;OPOS=27692205;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:26:27:21:21:0.4375:14:7:13:13:14:7:14:13
chr10	27692279	.	A	C,G	730.99	PASS	AF=0.301887,0.698113;AO=16,37;DP=53;FAO=16,37;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=7,12;FSAR=9,25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186157,0.0201384;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=129.8,152.958;QD=55.1691;RBI=0.03604,0.0306819;REFB=0,0;REVB=0.03086,0.0231479;RO=0;SAF=7,12;SAR=9,25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.0264067,0.00467925;OID=.,.;OPOS=27692279,27692279;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:53:53:0:0:16,37:16,37:0.301887,0.698113:9,25:7,12:0:0:9,25:7,12:0:0
chr10	27794104	.	T	G	595.12	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0215733;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.006;QD=61.0375;RBI=0.0339199;REFB=0;REVB=0.0261754;RO=0;SAF=9;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.11662e-05;OID=.;OPOS=27794104;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:39:0:0:37:39:1:28:9:0:0:30:9:0:0
chr10	28101455	.	C	A	385.81	PASS	AF=0.414141;AO=41;DP=99;FAO=41;FDP=99;FR=.;FRO=58;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=29;FSRR=29;FWDB=-0.021724;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.0824;QD=15.5883;RBI=0.0251317;REFB=0.0123952;REVB=-0.0126362;RO=58;SAF=19;SAR=22;SRF=29;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0380298;STB=0.521471;STBP=0.711;TYPE=snp;VARB=-0.0199855;OID=.;OPOS=28101455;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:58:58:41:41:0.414141:22:19:29:29:22:19:29:29
chr10	28151547	.	G	T	223.12	PASS	AF=0.462963;AO=25;DP=54;FAO=25;FDP=54;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.00794734;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.642;QD=16.5274;RBI=0.0119295;REFB=-0.00212697;REVB=-0.00889675;RO=29;SAF=10;SAR=15;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112975;STB=0.563858;STBP=0.396;TYPE=snp;VARB=0.00154685;OID=.;OPOS=28151547;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:29:29:25:25:0.462963:15:10:15:14:15:10:15:14
chr10	28224075	.	G	A	228.11	PASS	AF=0.402985;AO=27;DP=67;FAO=27;FDP=67;FR=.;FRO=40;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=0.00389843;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.134;QD=13.6182;RBI=0.0043615;REFB=0.00374438;REVB=-0.00195574;RO=39;SAF=15;SAR=12;SRF=18;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.097389;STB=0.562867;STBP=0.424;TYPE=snp;VARB=-0.0033077;OID=.;OPOS=28224075;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:39:40:27:27:0.402985:12:15:18:21:12:15:18:22
chr10	28228865	.	A	G	331.57	PASS	AF=0.591837;AO=28;DP=49;FAO=29;FDP=49;FR=.;FRO=20;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=-0.00611845;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.122;QD=27.0669;RBI=0.0252558;REFB=-0.0185578;REVB=-0.0245034;RO=20;SAF=18;SAR=10;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0058703;STB=0.502331;STBP=0.978;TYPE=snp;VARB=0.0169451;OID=.;OPOS=28228865;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:20:20:28:29:0.591837:10:18:13:7:10:19:13:7
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chr10	28378758	.	T	C	1231.53	PASS	AF=0.987805;AO=81;DP=82;FAO=81;FDP=82;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00348622;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=228.859;QD=60.0748;RBI=0.00516755;REFB=-0.0927092;REVB=0.00381443;RO=1;SAF=40;SAR=41;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.011691;STB=0.506171;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=-6.19596e-06;OID=.;OPOS=28378758;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:82:82:1:1:81:81:0.987805:41:40:1:0:41:40:1:0
chr10	28909299	.	GT	G	215.45	PASS	AF=0.545455;AO=29;DP=55;FAO=30;FDP=55;FR=.;FRO=25;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=0.0290834;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=28.0029;QD=15.6694;RBI=0.0420668;REFB=0.049102;REVB=-0.0303935;RO=24;SAF=17;SAR=12;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00241382;STB=0.515479;STBP=0.833;TYPE=del;VARB=-0.0426548;OID=.;OPOS=28909300;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.545455:29:55:30:55:25:17:13:15:10:99:24:17:12:14:10
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chr10	29578084	.	A	G	709.7	PASS	AF=0.980769;AO=52;DP=52;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0300344;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.078;QD=54.5921;RBI=0.114851;REFB=-0.0511339;REVB=-0.110854;RO=0;SAF=25;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5102;STBP=0.334;TYPE=snp;VARB=-0.000176069;OID=.;OPOS=29578084;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:52:52:0:1:52:51:0.980769:27:25:0:0:27:24:1:0
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chr10	29747417	.	C	T	209.31	PASS	AF=0.409836;AO=25;DP=61;FAO=25;FDP=61;FR=.;FRO=36;FSAF=18;FSAR=7;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=0.00662663;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.341;QD=13.7253;RBI=0.0175381;REFB=-0.00723549;REVB=0.016238;RO=31;SAF=18;SAR=7;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154719;STB=0.625075;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=0.0155961;OID=.;OPOS=29747417;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:31:36:25:25:0.409836:7:18:18:13:7:18:19:17
chr10	29754609	.	T	C	211.74	PASS	AF=0.488372;AO=21;DP=43;FAO=21;FDP=43;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.0110287;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.055;QD=19.697;RBI=0.0231836;REFB=0.00347549;REVB=-0.0203924;RO=22;SAF=12;SAR=9;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0238914;STB=0.513501;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=-0.00404714;OID=.;OPOS=29754609;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:22:22:21:21:0.488372:9:12:12:10:9:12:12:10
chr10	29759225	.	A	G	390.96	PASS	AF=0.43617;AO=41;DP=94;FAO=41;FDP=94;FR=.;FRO=53;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=22;FSRR=31;FWDB=-0.00281528;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.8074;QD=16.6364;RBI=0.0404127;REFB=-0.014394;REVB=-0.0403146;RO=53;SAF=20;SAR=21;SRF=22;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0732085;STB=0.541083;STBP=0.485;TYPE=snp;VARB=0.0164082;OID=.;OPOS=29759225;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:53:53:41:41:0.43617:21:20:22:31:21:20:22:31
chr10	29779936	.	G	A	93.32	PASS	AF=0.578947;AO=11;DP=19;FAO=11;FDP=19;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.0102244;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.605;QD=19.6457;RBI=0.0196897;REFB=0.00272463;REVB=0.0168269;RO=8;SAF=4;SAR=7;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0932099;STB=0.553098;STBP=0.637;TYPE=snp;VARB=-0.00345956;OID=.;OPOS=29779936;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:19:19:8:8:11:11:0.578947:7:4:2:6:7:4:2:6
chr10	29783885	.	A	G	273.91	PASS	AF=0.483871;AO=30;DP=62;FAO=30;FDP=62;FR=.;FRO=32;FSAF=22;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=-0.00801058;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.931;QD=17.6719;RBI=0.00858457;REFB=-0.0143694;REVB=0.00308634;RO=32;SAF=22;SAR=8;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180857;STB=0.601918;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.0139174;OID=.;OPOS=29783885;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:32:32:30:30:0.483871:8:22:18:14:8:22:18:14
chr10	29784072	.	G	C	277.34	PASS	AF=0.595238;AO=25;DP=42;FAO=25;FDP=42;FR=.;FRO=17;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=0.0108913;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=213.875;QD=26.4135;RBI=0.0190999;REFB=-0.0224514;REVB=0.0156904;RO=17;SAF=15;SAR=10;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.221617;STB=0.622544;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=0.0210047;OID=.;OPOS=29784072;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:17:17:25:25:0.595238:10:15:5:12:10:15:5:12
chr10	29784114	.	T	C	349.2	PASS	AF=1;AO=25;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0425313;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.776;QD=53.7227;RBI=0.0431864;REFB=0;REVB=0.00749328;RO=0;SAF=9;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00216257;OID=.;OPOS=29784114;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:25:26:1:16:9:0:0:17:9:0:0
chr10	29812602	.	G	T	304.91	PASS	AF=0.586957;AO=27;DP=46;FAO=27;FDP=46;FR=.;FRO=19;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=-0.0164655;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.239;QD=26.514;RBI=0.0529096;REFB=-0.00746632;REVB=0.0502823;RO=19;SAF=14;SAR=13;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150889;STB=0.583273;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=0.00448838;OID=.;OPOS=29812602;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:19:19:27:27:0.586957:13:14:6:13:13:14:6:13
chr10	29812889	.	G	A	205.09	PASS	AF=0.42;AO=21;DP=50;FAO=21;FDP=50;FR=.;FRO=29;FSAF=1;FSAR=20;FSRF=9;FSRR=20;FWDB=0.00386204;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.361;QD=16.4074;RBI=0.0116938;REFB=0.0360207;REVB=-0.0110377;RO=29;SAF=1;SAR=20;SRF=9;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.553396;STB=0.832888;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=-0.0210409;OID=.;OPOS=29812889;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:29:29:21:21:0.42:20:1:9:20:20:1:9:20
chr10	29821089	.	C	T	539.99	PASS	AF=0.520408;AO=51;DP=98;FAO=51;FDP=98;FR=.;FRO=47;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=16;FSRR=31;FWDB=-0.0080221;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.799;QD=22.0402;RBI=0.00906423;REFB=-0.0144138;REVB=-0.00421974;RO=44;SAF=25;SAR=26;SRF=16;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106965;STB=0.572032;STBP=0.148;TYPE=snp;VARB=0.0184632;OID=.;OPOS=29821089;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:44:47:51:51:0.520408:26:25:16:28:26:25:16:31
chr10	29821523	.	T	C	205.29	PASS	AF=0.428571;AO=24;DP=56;FAO=24;FDP=56;FR=.;FRO=32;FSAF=18;FSAR=6;FSRF=22;FSRR=10;FWDB=0.0257413;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=48.3284;QD=14.6636;RBI=0.0351841;REFB=-0.00812184;REVB=0.0239855;RO=32;SAF=18;SAR=6;SRF=22;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0794072;STB=0.545415;STBP=0.586;TYPE=snp;VARB=0.0116989;OID=.;OPOS=29821523;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:32:32:24:24:0.428571:6:18:22:10:6:18:22:10
chr10	29822032	.	C	T	289.35	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0176188;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.271;QD=52.6096;RBI=0.0427929;REFB=0;REVB=0.0389976;RO=0;SAF=16;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17051e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000711047;OID=.;OPOS=29822032;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:6:16:0:0:6:16:0:0
chr10	29822159	.	T	C	356.11	PASS	AF=0.603448;AO=35;DP=58;FAO=35;FDP=58;FR=.;FRO=23;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=-0.0153602;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.018;QD=24.5596;RBI=0.0198273;REFB=-0.011453;REVB=-0.0125375;RO=23;SAF=15;SAR=20;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0276057;STB=0.515143;STBP=0.79;TYPE=snp;VARB=0.00688801;OID=.;OPOS=29822159;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:23:23:35:35:0.603448:20:15:9:14:20:15:9:14
chr10	29839798	.	A	G	837.29	PASS	AF=1;AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.041813;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.441;QD=57.7439;RBI=0.0423224;REFB=0;REVB=0.00654721;RO=0;SAF=36;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.36121e-05;OID=.;OPOS=29839798;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:58:0:0:58:58:1:22:36:0:0:22:36:0:0
chr10	29839864	.	A	C	1571.92	PASS	AF=1;AO=98;DP=99;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0165192;FXX=0.0101;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.1045;QD=64.16;RBI=0.0294201;REFB=0;REVB=-0.0243446;RO=0;SAF=62;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000377368;OID=.;OPOS=29839864;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:99:98:0:0:98:98:1:36:62:0:0:36:62:0:0
chr10	30000932	.	ATTTTT	ATTT,ATTTTA,ATTTT	74.54	PASS	AF=0.136364,0.0454545,0.204545;AO=5,3,8;DP=48;FAO=6,2,9;FDP=44;FR=.;FRO=27;FSAF=6,1,4;FSAR=0,1,5;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=-0.0397188,-0.0384545,-0.0750236;FXX=0.083316;HRUN=6,6,6;LEN=2,1,1;MLLD=23.0235,187.425,11.4007;QD=6.77674;RBI=0.0887247,0.0398195,0.172321;REFB=0.00194708,-0.000633339,0.00549167;REVB=0.0793378,0.0103365,0.155132;RO=23;SAF=5,2,3;SAR=0,1,5;SRF=10;SRR=13;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.694909,0.245189,-0.0723403;STB=0.998286,0.585377,0.52824;STBP=0.007,0.778,0.878;TYPE=del,snp,del;VARB=-0.0105674,-0.0211297,-0.0723401;OID=.,.,.;OPOS=30000933,30000937,30000933;OREF=TT,T,T;OALT=-,A,-;OMAPALT=ATTT,ATTTTA,ATTTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/3:0.136364,0.0454545,0.204545:5,3,8:48:6,2,9:44:27:6,1,4:0,1,5:11:16:28:23:5,2,3:0,1,5:10:13
chr10	30728101	.	T	C	243.16	PASS	AF=0.381579;AO=29;DP=76;FAO=29;FDP=76;FR=.;FRO=47;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=16;FSRR=31;FWDB=-0.00669072;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.1693;QD=12.7978;RBI=0.055418;REFB=-0.00132608;REVB=0.0550126;RO=46;SAF=9;SAR=20;SRF=16;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0458491;STB=0.521361;STBP=0.781;TYPE=snp;VARB=0.0020825;OID=.;OPOS=30728101;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:46:47:29:29:0.381579:20:9:16:30:20:9:16:31
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chr10	30993448	.	G	A	251.06	PASS	AF=0.509804;AO=26;DP=51;FAO=26;FDP=51;FR=.;FRO=25;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=0.0110582;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.128;QD=19.6906;RBI=0.0258037;REFB=-0.020558;REVB=0.0233141;RO=25;SAF=17;SAR=9;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158493;STB=0.588906;STBP=0.205;TYPE=snp;VARB=0.0368431;OID=.;OPOS=30993448;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:25:25:26:26:0.509804:9:17:12:13:9:17:12:13
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chr10	33143396	.	G	A	752.59	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0104313;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.716;QD=56.799;RBI=0.0128702;REFB=0;REVB=0.00753862;RO=0;SAF=17;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.31071e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.61929e-05;OID=.;OPOS=33143396;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:53:0:0:52:53:1:35:17:0:0:35:18:0:0
chr10	33190285	.	G	A	214.24	PASS	AF=0.947368;AO=18;DP=19;FAO=18;FDP=19;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00337154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.981;QD=45.1021;RBI=0.0401152;REFB=-0.0128682;REVB=0.0399732;RO=1;SAF=10;SAR=8;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0437188;STB=0.523783;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.00115908;OID=.;OPOS=33190285;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:19:19:1:1:18:18:0.947368:8:10:1:0:8:10:1:0
chr10	33190567	.	C	A	323.6	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0201997;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=391.08;QD=53.9325;RBI=0.02481;REFB=0;REVB=0.0144051;RO=0;SAF=3;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.17055e-06;OID=.;OPOS=33190567;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:24:0:0:23:24:1:20:3:0:0:21:3:0:0
chr10	33200558	.	G	A	75.66	PASS	AF=0.384615;AO=10;DP=25;FAO=10;FDP=26;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=0.0152377;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=132.529;QD=11.64;RBI=0.0208495;REFB=0.000746829;REVB=0.0142307;RO=15;SAF=5;SAR=5;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101015;STB=0.576773;STBP=0.577;TYPE=snp;VARB=-0.000593962;OID=.;OPOS=33200558;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:25:26:15:16:10:10:0.384615:5:5:9:6:5:5:10:6
chr10	33209266	.	G	T	902.71	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00662513;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.9;QD=58.2393;RBI=0.0220958;REFB=0;REVB=0.0210792;RO=0;SAF=38;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.06981e-05;OID=.;OPOS=33209266;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:24:38:0:0:24:38:0:0
chr10	33214802	.	A	G	617.28	PASS	AF=1;AO=39;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0343262;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.826;QD=61.7282;RBI=0.0374311;REFB=0;REVB=0.0149263;RO=0;SAF=25;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000104472;OID=.;OPOS=33214802;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:39:40:1:14:25:0:0:15:25:0:0
chr10	33466566	.	C	T	105.82	PASS	AF=0.351351;AO=13;DP=37;FAO=13;FDP=37;FR=.;FRO=24;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=-0.0334703;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.857;QD=11.4396;RBI=0.0366493;REFB=-0.0057637;REVB=-0.0149302;RO=24;SAF=4;SAR=9;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0322518;STB=0.519201;STBP=0.853;TYPE=snp;VARB=0.0123241;OID=.;OPOS=33466566;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:24:24:13:13:0.351351:9:4:8:16:9:4:8:16
chr10	33466843	.	T	C	130.64	PASS	AF=0.608696;AO=14;DP=23;FAO=14;FDP=23;FR=.;FRO=9;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.0139648;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.8937;QD=22.7197;RBI=0.0561387;REFB=-0.0513469;REVB=0.054374;RO=9;SAF=8;SAR=6;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.011206;STB=0.50632;STBP=0.958;TYPE=snp;VARB=0.0252563;OID=.;OPOS=33466843;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:23:23:9:9:14:14:0.608696:6:8:5:4:6:8:5:4
chr10	33468014	.	T	C	86.63	PASS	AF=0.366667;AO=11;DP=31;FAO=11;FDP=30;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-8.29696e-05;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.608;QD=11.551;RBI=0.0096248;REFB=-0.00406186;REVB=0.00962444;RO=19;SAF=6;SAR=5;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0760866;STB=0.545372;STBP=0.755;TYPE=snp;VARB=0.00660814;OID=.;OPOS=33468014;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:31:30:19:19:11:11:0.366667:5:6:9:10:5:6:9:10
chr10	33469181	.	A	G	161.5	PASS	AF=0.5;AO=17;DP=34;FAO=17;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.0148315;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.145;QD=19.0004;RBI=0.03948;REFB=-0.0259614;REVB=-0.0365882;RO=17;SAF=9;SAR=8;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0521373;STB=0.529582;STBP=0.761;TYPE=snp;VARB=0.0331091;OID=.;OPOS=33469181;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:17:17:17:17:0.5:8:9:10:7:8:9:10:7
chr10	33495267	.	C	T	101.41	PASS	AF=0.228571;AO=16;DP=70;FAO=16;FDP=70;FR=.;FRO=54;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=27;FSRR=27;FWDB=0.0109457;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=293.943;QD=5.79506;RBI=0.0114781;REFB=-0.000986425;REVB=-0.00345536;RO=54;SAF=3;SAR=13;SRF=27;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.417498;STB=0.76435;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.00216235;OID=.;OPOS=33495267;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:54:54:16:16:0.228571:13:3:27:27:13:3:27:27
chr10	33502240	.	C	T	263.6	PASS	AF=0.413333;AO=30;DP=75;FAO=31;FDP=75;FR=.;FRO=44;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=32;FSRR=12;FWDB=0.00733157;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.7069;QD=14.0585;RBI=0.0244785;REFB=0.00524326;REVB=0.0233548;RO=44;SAF=15;SAR=15;SRF=32;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.23942;STB=0.641553;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=-0.00517915;OID=.;OPOS=33502240;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:44:44:30:31:0.413333:15:15:32:12:16:15:32:12
chr10	33510663	.	G	A	285.19	PASS	AF=0.432432;AO=32;DP=74;FAO=32;FDP=74;FR=.;FRO=42;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=25;FWDB=-0.0176632;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.68;QD=15.4157;RBI=0.0247175;REFB=-0.00227995;REVB=0.0172906;RO=42;SAF=15;SAR=17;SRF=17;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.064882;STB=0.536604;STBP=0.593;TYPE=snp;VARB=0.00379808;OID=.;OPOS=33510663;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:42:42:32:32:0.432432:17:15:17:25:17:15:17:25
chr10	33510768	.	G	A	168.12	PASS	AF=0.470588;AO=14;DP=52;FAO=24;FDP=51;FR=.;FRO=27;FSAF=4;FSAR=20;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=-0.0430819;FXX=0.0377287;HRUN=4;LEN=1;MLLD=145.932;QD=13.1856;RBI=0.047052;REFB=-0.00833699;REVB=0.0189165;RO=25;SAF=4;SAR=10;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.266974;STB=0.731488;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0352409;OID=.;OPOS=33510768;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:51:25:27:14:24:0.470588:10:4:13:12:20:4:14:13
chr10	33552695	.	CA	CG,TG	1459.27	PASS	AF=0.572917,0.427083;AO=55,41;DP=96;FAO=55,41;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=22,16;FSAR=33,25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00782149,-0.0204243;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=67.9682,229.416;QD=60.8031;RBI=0.023392,0.0218861;REFB=0,0;REVB=0.0220456,-0.00786444;RO=0;SAF=22,16;SAR=33,25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-3.1719e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.00819883,0.00803559;OID=.,.;OPOS=33552696,33552695;OREF=A,CA;OALT=G,TG;OMAPALT=CG,TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:96:96:0:0:55,41:55,41:0.572917,0.427083:33,25:22,16:0:0:33,25:22,16:0:0
chr10	33577361	.	G	A	253.18	PASS	AF=0.509434;AO=27;DP=53;FAO=27;FDP=53;FR=.;FRO=26;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=0.041991;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.5424;QD=19.1077;RBI=0.0420447;REFB=0.00707756;REVB=0.0021239;RO=26;SAF=16;SAR=11;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141832;STB=0.507931;STBP=0.948;TYPE=snp;VARB=-0.0058891;OID=.;OPOS=33577361;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:26:26:27:27:0.509434:11:16:15:11:11:16:15:11
chr10	33623251	.	G	A	62.28	PASS	AF=0.666667;AO=8;DP=12;FAO=8;FDP=12;FR=.;FRO=4;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.00938925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.5372;QD=20.761;RBI=0.0900831;REFB=-0.0212141;REVB=0.0895924;RO=4;SAF=1;SAR=7;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141787;STB=0.5831;STBP=0.665;TYPE=snp;VARB=0.01989;OID=.;OPOS=33623251;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:12:12:4:4:8:8:0.666667:7:1:1:3:7:1:1:3
chr10	34400149	.	G	A	354.09	PASS	AF=0.625;AO=30;DP=48;FAO=30;FDP=48;FR=.;FRO=18;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=0.0208771;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.5585;QD=29.5072;RBI=0.0256468;REFB=-0.0188166;REVB=-0.0148965;RO=18;SAF=15;SAR=15;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113872;STB=0.562459;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=0.0110689;OID=.;OPOS=34400149;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:18:18:30:30:0.625:15:15:12:6:15:15:12:6
chr10	34591402	.	C	T	332.62	PASS	AF=0.58;AO=28;DP=49;FAO=29;FDP=50;FR=.;FRO=21;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=0.020494;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.2465;QD=26.6092;RBI=0.0623633;REFB=-0.0368669;REVB=-0.0588997;RO=21;SAF=17;SAR=11;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.175679;STB=0.586147;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.024798;OID=.;OPOS=34591402;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:50:21:21:28:29:0.58:11:17:8:13:12:17:8:13
chr10	34688287	.	G	A	566.65	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.026388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.2964;QD=59.647;RBI=0.0348179;REFB=0;REVB=-0.0227149;RO=0;SAF=24;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00379699;OID=.;OPOS=34688287;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:38:0:0:37:38:1:13:24:0:0:13:25:0:0
chr10	35302705	.	C	T	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00392761;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.322;QD=55.6557;RBI=0.0320183;REFB=0;REVB=-0.0317765;RO=0;SAF=12;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000302169;OID=.;OPOS=35302705;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:15:12:0:0:15:12:0:0
chr10	35321414	.	C	T	785.89	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0117924;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.345;QD=64.1539;RBI=0.0132113;REFB=0;REVB=-0.00595647;RO=0;SAF=30;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.48867e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.37933e-06;OID=.;OPOS=35321414;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:19:30:0:0:19:30:0:0
chr10	35338699	.	G	A	749.93	PASS	AF=0.948276;AO=54;DP=59;FAO=55;FDP=58;FR=.;FRO=3;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.00548416;FXX=0.0169463;HRUN=3;LEN=1;MLLD=163.349;QD=51.7194;RBI=0.00702979;REFB=0.127694;REVB=-0.00439795;RO=3;SAF=30;SAR=24;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0553369;STB=0.528292;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=-0.00103782;OID=.;OPOS=35338699;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:59:58:3:3:54:55:0.948276:24:30:0:3:25:30:0:3
chr10	35362977	.	A	G	785.88	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0326234;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.131;QD=64.1532;RBI=0.0328259;REFB=0;REVB=-0.00364073;RO=0;SAF=28;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000220615;OID=.;OPOS=35362977;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:21:28:0:0:21:28:0:0
chr10	35426755	.	A	G	990.48	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0632716;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.919;QD=59.1332;RBI=0.0636482;REFB=0;REVB=0.0069139;RO=0;SAF=38;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000209522;OID=.;OPOS=35426755;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:29:38:0:0:29:38:0:0
chr10	35464778	.	C	T	785.2	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00937657;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.559;QD=57.1057;RBI=0.0183229;REFB=0;REVB=0.015742;RO=0;SAF=32;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.49259e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.15681e-05;OID=.;OPOS=35464778;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:23:32:0:0:23:32:0:0
chr10	35772402	.	G	A	632.26	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00158591;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.439;QD=61.684;RBI=0.0201241;REFB=0;REVB=-0.0200615;RO=0;SAF=13;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.96072e-05;OID=.;OPOS=35772402;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:28:13:0:0:28:13:0:0
chr10	37447358	.	T	G	429.9	PASS	AF=0.444444;AO=44;DP=99;FAO=44;FDP=99;FR=.;FRO=55;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=30;FSRR=25;FWDB=-3.50921e-05;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=251.386;QD=17.3698;RBI=0.0203576;REFB=0.00115511;REVB=0.0203576;RO=55;SAF=22;SAR=22;SRF=30;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0450773;STB=0.525241;STBP=0.666;TYPE=snp;VARB=-0.00143092;OID=.;OPOS=37447358;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:55:55:44:44:0.444444:22:22:30:25:22:22:30:25
chr10	37478445	.	G	A	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.10566;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.7283;QD=33.4284;RBI=0.10579;REFB=0;REVB=-0.00523712;RO=0;SAF=3;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0112849;OID=.;OPOS=37478445;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:3:3:0:0:3:3:0:0
chr10	37488689	.	G	C	559.17	PASS	AF=0.422535;AO=60;DP=142;FAO=60;FDP=142;FR=.;FRO=82;FSAF=23;FSAR=37;FSRF=36;FSRR=46;FWDB=-0.0360858;FXX=0.00699252;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.991;QD=15.7512;RBI=0.037632;REFB=-0.0149497;REVB=-0.0106762;RO=82;SAF=23;SAR=37;SRF=36;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.05965;STB=0.533469;STBP=0.491;TYPE=snp;VARB=0.018612;OID=.;OPOS=37488689;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:142:142:82:82:60:60:0.422535:37:23:36:46:37:23:36:46
chr10	37505159	.	G	A	78.64	PASS	AF=0.47619;AO=10;DP=21;FAO=10;FDP=21;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.0006488;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.418;QD=14.9785;RBI=0.0010852;REFB=-0.00228393;REVB=-0.000869889;RO=11;SAF=5;SAR=5;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0406606;STB=0.523762;STBP=0.851;TYPE=snp;VARB=0.00370863;OID=.;OPOS=37505159;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:21:21:11:11:10:10:0.47619:5:5:6:5:5:5:6:5
chr10	37505179	.	T	C	138.93	PASS	AF=0.535714;AO=12;DP=28;FAO=15;FDP=28;FR=.,HEALED;FRO=13;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.00858736;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.207;QD=19.8475;RBI=0.00883982;REFB=-0.013058;REVB=-0.00209752;RO=13;SAF=5;SAR=7;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0410576;STB=0.564015;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.0085479;OID=.;OPOS=37505179;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:28:13:13:12:15:0.535714:7:5:6:7:10:5:6:7
chr10	37508450	.	A	C	140.34	PASS	AF=0.517241;AO=15;DP=29;FAO=15;FDP=29;FR=.;FRO=14;FSAF=2;FSAR=13;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.0298416;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.937;QD=19.3577;RBI=0.0374796;REFB=0.00351364;REVB=-0.022676;RO=14;SAF=2;SAR=13;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.298867;STB=0.6738;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=-0.00208615;OID=.;OPOS=37508450;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:14:14:15:15:0.517241:13:2:5:9:13:2:5:9
chr10	37890955	.	G	A	56.78	PASS	AF=0.421053;AO=8;DP=19;FAO=8;FDP=19;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=-0.00284224;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.604;QD=11.9536;RBI=0.0122539;REFB=-0.0130677;REVB=0.0119197;RO=11;SAF=6;SAR=2;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132829;STB=0.580431;STBP=0.645;TYPE=snp;VARB=0.0119568;OID=.;OPOS=37890955;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:19:19:11:11:8:8:0.421053:2:6:7:4:2:6:7:4
chr10	37891465	.	G	T	337.71	PASS	AF=0.717949;AO=28;DP=39;FAO=28;FDP=39;FR=.;FRO=11;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.0645187;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.5694;QD=34.637;RBI=0.0646675;REFB=0.0231694;REVB=0.00438435;RO=11;SAF=18;SAR=10;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102409;STB=0.555944;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=-0.00597617;OID=.;OPOS=37891465;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:39:39:11:11:28:28:0.717949:10:18:5:6:10:18:5:6
chr10	37891576	.	G	A	173.08	PASS	AF=0.486486;AO=18;DP=37;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.0421883;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.0187;QD=18.7118;RBI=0.0538451;REFB=0.0171315;REVB=0.033458;RO=19;SAF=14;SAR=4;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.269045;STB=0.654488;STBP=0.081;TYPE=snp;VARB=-0.0183422;OID=.;OPOS=37891576;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:19:19:18:18:0.486486:4:14:10:9:4:14:10:9
chr10	38344700	.	C	G	117.17	PASS	AF=0.358974;AO=14;DP=39;FAO=14;FDP=39;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=19;FSRR=6;FWDB=-0.00140735;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.067;QD=12.0176;RBI=0.00140876;REFB=0.0119478;REVB=-6.31867e-05;RO=25;SAF=9;SAR=5;SRF=19;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146705;STB=0.585661;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=-0.00984151;OID=.;OPOS=38344700;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:25:25:14:14:0.358974:5:9:19:6:5:9:19:6
chr10	38407519	.	A	G	133.85	PASS	AF=0.666667;AO=14;DP=21;FAO=14;FDP=21;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.00470357;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.687;QD=25.4947;RBI=0.0190807;REFB=-0.00627407;REVB=-0.0184918;RO=7;SAF=5;SAR=9;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.214765;STB=0.620515;STBP=0.165;TYPE=snp;VARB=0.00515448;OID=.;OPOS=38407519;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:21:21:7:7:14:14:0.666667:9:5:5:2:9:5:5:2
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chr10	38740000	.	T	C	87.37	PASS	AF=0.423077;AO=11;DP=26;FAO=11;FDP=26;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.0497814;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.267;QD=13.4409;RBI=0.0517362;REFB=-0.00126344;REVB=-0.0140872;RO=13;SAF=4;SAR=7;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165392;STB=0.599815;STBP=0.386;TYPE=snp;VARB=0.00208631;OID=.;OPOS=38740000;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:26:26:13:15:11:11:0.423077:7:4:7:6:7:4:8:7
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chr10	38740546	.	G	T	157.84	PASS	AF=0.447368;AO=17;DP=38;FAO=17;FDP=38;FR=.;FRO=21;FSAF=3;FSAR=14;FSRF=6;FSRR=15;FWDB=-0.016786;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.991;QD=16.6144;RBI=0.0338236;REFB=-0.0165656;REVB=-0.0293644;RO=21;SAF=3;SAR=14;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157536;STB=0.591431;STBP=0.41;TYPE=snp;VARB=0.0257138;OID=.;OPOS=38740546;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:21:21:17:17:0.447368:14:3:6:15:14:3:6:15
chr10	42907201	.	G	A	242.71	PASS	AF=0.371795;AO=29;DP=78;FAO=29;FDP=78;FR=.;FRO=49;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=25;FWDB=-0.0242721;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.21;QD=12.4466;RBI=0.025825;REFB=0.00166443;REVB=-0.00882015;RO=49;SAF=12;SAR=17;SRF=24;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.084062;STB=0.548353;STBP=0.537;TYPE=snp;VARB=-0.00289061;OID=.;OPOS=42907201;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:49:49:29:29:0.371795:17:12:24:25:17:12:24:25
chr10	42907260	.	T	C	165.05	PASS	AF=0.382979;AO=18;DP=47;FAO=18;FDP=47;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=0.0245567;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.341;QD=14.0469;RBI=0.0271347;REFB=-0.0105502;REVB=-0.011544;RO=29;SAF=7;SAR=11;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173515;STB=0.600837;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=0.0183181;OID=.;OPOS=42907260;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:29:29:18:18:0.382979:11:7:16:13:11:7:16:13
chr10	42920832	.	G	A	135.07	PASS	AF=0.4;AO=15;DP=39;FAO=16;FDP=40;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=0.037624;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.222;QD=13.5069;RBI=0.0391316;REFB=-0.0170221;REVB=0.0107574;RO=24;SAF=8;SAR=7;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0530746;STB=0.549938;STBP=0.654;TYPE=snp;VARB=0.0308085;OID=.;OPOS=42920832;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:40:24:24:15:16:0.4:7:8:14:10:8:8:14:10
chr10	42920884	.	C	T	94.28	PASS	AF=0.375;AO=11;DP=31;FAO=12;FDP=32;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.0407536;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.93;QD=11.7853;RBI=0.0441828;REFB=-0.00208768;REVB=-0.0170663;RO=20;SAF=4;SAR=7;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202063;STB=0.638063;STBP=0.245;TYPE=snp;VARB=0.00271696;OID=.;OPOS=42920884;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:31:32:20:20:11:12:0.375:7:4:11:9:8:4:11:9
chr10	42949664	.	A	T	239.57	PASS	AF=0.490566;AO=26;DP=53;FAO=26;FDP=53;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=20;FSRR=7;FWDB=0.0480684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.8846;QD=18.0811;RBI=0.0531413;REFB=-0.0128744;REVB=0.0226589;RO=27;SAF=9;SAR=17;SRF=20;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.349192;STB=0.695201;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.0325939;OID=.;OPOS=42949664;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:27:27:26:26:0.490566:17:9:20:7:17:9:20:7
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chr10	43595968	.	A	G	200.12	PASS	AF=0.3;AO=26;DP=89;FAO=27;FDP=90;FR=.;FRO=63;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=37;FSRR=26;FWDB=-0.0154355;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.4466;QD=8.89409;RBI=0.0212366;REFB=-0.0198298;REVB=0.0145855;RO=62;SAF=9;SAR=17;SRF=36;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.277224;STB=0.650012;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.04349;OID=.;OPOS=43595968;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:90:62:63:26:27:0.3:17:9:36:26:17:10:37:26
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chr10	43623812	.	C	T	503.96	PASS	AF=0.469565;AO=54;DP=115;FAO=54;FDP=115;FR=.;FRO=61;FSAF=40;FSAR=14;FSRF=42;FSRR=19;FWDB=-0.00163939;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.396;QD=17.5289;RBI=0.0271107;REFB=-0.00280176;REVB=-0.0270611;RO=61;SAF=40;SAR=14;SRF=42;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0624934;STB=0.534833;STBP=0.536;TYPE=snp;VARB=0.00297921;OID=.;OPOS=43623812;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:115:61:61:54:54:0.469565:14:40:42:19:14:40:42:19
chr10	43624833	.	T	C	321.24	PASS	AF=0.367347;AO=37;DP=99;FAO=36;FDP=98;FR=.;FRO=62;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=37;FSRR=25;FWDB=0.0035734;FXX=0.019998;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.513;QD=13.1119;RBI=0.0124153;REFB=-0.0159188;REVB=0.0118899;RO=62;SAF=15;SAR=22;SRF=37;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.207934;STB=0.630265;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.0268171;OID=.;OPOS=43624833;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:98:62:62:37:36:0.367347:22:15:37:25:22:14:37:25
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chr10	43690189	.	G	A	1080.56	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0193247;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=260.434;QD=60.0308;RBI=0.0202716;REFB=0;REVB=0.00612312;RO=0;SAF=43;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.16073e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.9138e-05;OID=.;OPOS=43690189;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:29:43:0:0:29:43:0:0
chr10	43691691	.	C	T	135.74	PASS	AF=0.7;AO=14;DP=20;FAO=14;FDP=20;FR=.;FRO=6;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0971979;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.1732;QD=27.1472;RBI=0.0995995;REFB=-0.00311501;REVB=0.02174;RO=6;SAF=12;SAR=2;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176469;STB=0.599839;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=0.00612204;OID=.;OPOS=43691691;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:20:20:6:6:14:14:0.7:2:12:4:2:2:12:4:2
chr10	43837352	.	A	G	487.73	PASS	AF=0.944444;AO=34;DP=36;FAO=34;FDP=36;FR=.;FRO=2;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.000306282;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.501;QD=54.1917;RBI=0.000459061;REFB=-0.0548733;REVB=-0.000341948;RO=2;SAF=15;SAR=19;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0466996;STB=0.524985;STBP=0.236;TYPE=snp;VARB=0.000519492;OID=.;OPOS=43837352;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:36:36:2:2:34:34:0.944444:19:15:0:2:19:15:0:2
chr10	43870117	.	ACCCTTG	A	50.12	PASS	AF=0.347826;AO=8;DP=23;FAO=8;FDP=23;FR=.;FRO=15;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=0.0181474;FXX=0;HRUN=3;LEN=6;MLLD=293.321;QD=8.71653;RBI=0.0191646;REFB=-0.0086486;REVB=0.00616054;RO=14;SAF=2;SAR=6;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0.682927;SSSB=0.0515286;STB=0.514249;STBP=0.989;TYPE=del;VARB=0.0136352;OID=.;OPOS=43870118;OREF=CCCTTG;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.347826:8:23:8:23:15:2:6:4:11:50:14:2:6:3:11
chr10	43871158	.	G	A	59.39	PASS	AF=0.533333;AO=8;DP=15;FAO=8;FDP=15;FR=.;FRO=7;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.0114103;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.6909;QD=15.8374;RBI=0.0449673;REFB=-0.0193081;REVB=0.0434955;RO=7;SAF=6;SAR=2;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168179;STB=0.599733;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.0259033;OID=.;OPOS=43871158;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:15:15:7:7:8:8:0.533333:2:6:4:3:2:6:4:3
chr10	43883342	.	T	A	310.04	PASS	AF=0.627907;AO=27;DP=43;FAO=27;FDP=43;FR=.;FRO=16;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=-0.00943205;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.016;QD=28.8407;RBI=0.0121527;REFB=-0.0217463;REVB=0.00766326;RO=16;SAF=14;SAR=13;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0722961;STB=0.539763;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=0.0141482;OID=.;OPOS=43883342;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:16:16:27:27:0.627907:13:14:10:6:13:14:10:6
chr10	43971248	.	C	G	141.29	PASS	AF=0.380952;AO=16;DP=42;FAO=16;FDP=42;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=8;FWDB=0.170891;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=44.2114;QD=13.4563;RBI=0.17108;REFB=0.00990553;REVB=-0.00804148;RO=26;SAF=7;SAR=9;SRF=18;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.265885;STB=0.653888;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=-0.0982564;OID=.;OPOS=43971248;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:26:26:16:16:0.380952:9:7:18:8:9:7:18:8
chr10	43971579	.	T	G	172.21	PASS	AF=0.653846;AO=17;DP=25;FAO=17;FDP=26;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=-0.0140196;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=317.242;QD=26.4935;RBI=0.0141059;REFB=-0.00935331;REVB=0.00155854;RO=8;SAF=6;SAR=11;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.013827;STB=0.507454;STBP=0.964;TYPE=snp;VARB=0.00491293;OID=.;OPOS=43971579;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:25:26:8:9:17:17:0.653846:11:6:3:5:11:6:3:6
chr10	43977893	.	A	G	129.28	PASS	AF=0.583333;AO=14;DP=24;FAO=14;FDP=24;FR=.;FRO=10;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.0462367;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.634;QD=21.5459;RBI=0.0502062;REFB=-0.0224523;REVB=-0.0195662;RO=10;SAF=9;SAR=5;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.182643;STB=0.603508;STBP=0.253;TYPE=snp;VARB=0.00282383;OID=.;OPOS=43977893;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:24:24:10:10:14:14:0.583333:5:9:4:6:5:9:4:6
chr10	43978087	.	A	G	85.75	PASS	AF=0.37931;AO=11;DP=29;FAO=11;FDP=29;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=-0.0400399;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.7072;QD=11.8278;RBI=0.0401519;REFB=-0.00268578;REVB=0.00299713;RO=18;SAF=8;SAR=3;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.405501;STB=0.74031;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=0.00216808;OID=.;OPOS=43978087;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:29:29:18:18:11:11:0.37931:3:8:6:12:3:8:6:12
chr10	44052903	.	A	C	716.72	PASS	AF=1;AO=36;DP=56;FAO=55;FDP=55;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=33;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0538549;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.663;QD=52.1251;RBI=0.0581161;REFB=0;REVB=0.0218432;RO=0;SAF=14;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00722569;OID=.;OPOS=44052903;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:55:0:0:36:55:1:22:14:0:0:22:33:0:0
chr10	44053013	.	G	C	868.27	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00571069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.641;QD=57.8847;RBI=0.00597114;REFB=0;REVB=-0.00174429;RO=0;SAF=31;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.73709e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.90288e-05;OID=.;OPOS=44053013;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:29:31:0:0:29:31:0:0
chr10	44053030	.	A	G	30.41	PASS	AF=0.109091;AO=6;DP=55;FAO=6;FDP=55;FR=.;FRO=49;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=25;FSRR=24;FWDB=0.00300457;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.9486;QD=2.21198;RBI=0.0281641;REFB=0.00366466;REVB=0.0280034;RO=49;SAF=4;SAR=2;SRF=25;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.182192;STB=0.641496;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=-0.0411921;OID=.;OPOS=44053030;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:55:55:49:49:6:6:0.109091:2:4:25:24:2:4:25:24
chr10	44053585	.	C	T	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0141896;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.979;QD=51.1845;RBI=0.0297802;REFB=0;REVB=-0.0261823;RO=0;SAF=9;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.04059e-05;OID=.;OPOS=44053585;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:11:9:0:0:11:9:0:0
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chr10	46999151	.	T	C	108.61	PASS	AF=0.40625;AO=13;DP=32;FAO=13;FDP=32;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=-0.0204532;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.9183;QD=13.5766;RBI=0.0206342;REFB=-0.0133859;REVB=0.00272726;RO=19;SAF=8;SAR=5;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.247318;STB=0.644331;STBP=0.197;TYPE=snp;VARB=0.0120272;OID=.;OPOS=46999151;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:19:19:13:13:0.40625:5:8:7:12:5:8:7:12
chr10	46999178	.	A	C	272.98	PASS	AF=0.625;AO=24;DP=39;FAO=25;FDP=40;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.0223783;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=321.828;QD=27.2976;RBI=0.0232542;REFB=-0.0176107;REVB=0.00632234;RO=15;SAF=8;SAR=16;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100145;STB=0.542338;STBP=0.484;TYPE=snp;VARB=0.00903154;OID=.;OPOS=46999178;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:40:15:15:24:25:0.625:16:8:7:8:16:9:7:8
chr10	46999189	.	CA	CG,TG	592.45	PASS	AF=0.65,0.35;AO=25,16;DP=42;FAO=26,14;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=10,8;FSAR=16,6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00612678,0.0248541;FXX=0.0476077;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=95.8689,133.829;QD=59.2451;RBI=0.0170107,0.0274435;REFB=0,0;REVB=-0.015869,-0.0116369;RO=0;SAF=10,9;SAR=15,7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=-0.000421541,0.00473211;OID=.,.;OPOS=46999190,46999189;OREF=A,CA;OALT=G,TG;OMAPALT=CG,TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:42:40:0:0:25,16:26,14:0.65,0.35:15,7:10,9:0:0:16,6:10,8:0:0
chr10	46999198	.	G	T	167.16	PASS	AF=0.409091;AO=18;DP=44;FAO=18;FDP=44;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=-0.0157101;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=335.984;QD=15.1962;RBI=0.0212704;REFB=-0.0147304;REVB=-0.0143395;RO=26;SAF=11;SAR=7;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.229768;STB=0.632354;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.0209204;OID=.;OPOS=46999198;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:26:26:18:18:0.409091:7:11:10:16:7:11:10:16
chr10	46999465	.	A	G	56.78	PASS	AF=0.421053;AO=8;DP=19;FAO=8;FDP=19;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=0.0586855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.076;QD=11.9536;RBI=0.060229;REFB=-0.00896004;REVB=0.0135478;RO=11;SAF=2;SAR=6;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0286032;STB=0.517197;STBP=0.962;TYPE=snp;VARB=0.0104232;OID=.;OPOS=46999465;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:19:19:11:11:8:8:0.421053:6:2:3:8:6:2:3:8
chr10	46999484	.	G	T	72.93	PASS	AF=0.642857;AO=9;DP=14;FAO=9;FDP=14;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0239901;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=287.816;QD=20.838;RBI=0.0298136;REFB=-0.0407931;REVB=0.017701;RO=5;SAF=2;SAR=7;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0202228;STB=0.511602;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0205628;OID=.;OPOS=46999484;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:14:14:5:5:9:9:0.642857:7:2:1:4:7:2:1:4
chr10	46999577	.	G	T	33.54	PASS	AF=0.714286;AO=4;DP=6;FAO=5;FDP=7;FR=.;FRO=2;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.148238;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.759;QD=19.1673;RBI=0.175012;REFB=0.0250208;REVB=0.0930321;RO=2;SAF=3;SAR=1;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.407562;STB=0.666029;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.00655935;OID=.;OPOS=46999577;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:6:7:2:2:4:5:0.714286:1:3:0:2:2:3:0:2
chr10	46999596	.	G	A	63.83	PASS	AF=0.8;AO=7;DP=9;FAO=8;FDP=10;FR=.;FRO=2;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.124021;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=33.6118;QD=25.5308;RBI=0.184833;REFB=-0.0797828;REVB=0.137047;RO=2;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174483;STB=0.599759;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=0.0513749;OID=.;OPOS=46999596;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:9:10:2:2:7:8:0.8:4:3:0:2:4:4:0:2
chr10	46999604	.	A	G	191.88	PASS	AF=1;AO=12;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0175831;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.015;QD=47.9703;RBI=0.125908;REFB=0;REVB=0.124674;RO=0;SAF=8;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00134551;OID=.;OPOS=46999604;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:12:16:1:4:8:0:0:8:8:0:0
chr10	46999732	.	G	A	399.29	PASS	AF=0.432692;AO=45;DP=104;FAO=45;FDP=104;FR=.;FRO=59;FSAF=29;FSAR=16;FSRF=35;FSRR=24;FWDB=0.0084569;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=179.336;QD=15.3573;RBI=0.027806;REFB=-0.0156271;REVB=-0.0264887;RO=59;SAF=29;SAR=16;SRF=35;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0553585;STB=0.531121;STBP=0.582;TYPE=snp;VARB=0.0188212;OID=.;OPOS=46999732;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:104:59:59:45:45:0.432692:16:29:35:24:16:29:35:24
chr10	46999747	.	T	C	1033.04	PASS	AF=0.728814;AO=85;DP=116;FAO=86;FDP=118;FR=.;FRO=32;FSAF=47;FSAR=39;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=0.0102341;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.5985;QD=35.0184;RBI=0.0132081;REFB=-0.0367226;REVB=-0.00834975;RO=31;SAF=47;SAR=38;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0303595;STB=0.51295;STBP=0.631;TYPE=snp;VARB=0.011894;OID=.;OPOS=46999747;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:116:118:31:32:85:86:0.728814:38:47:19:12:39:47:19:13
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chr10	47000079	.	T	C	306.74	PASS	AF=0.574074;AO=31;DP=54;FAO=31;FDP=54;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=-0.0018927;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.141;QD=22.7218;RBI=0.0158998;REFB=-0.0303111;REVB=-0.0157868;RO=23;SAF=12;SAR=19;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172162;STB=0.595119;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=0.0171936;OID=.;OPOS=47000079;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:23:23:31:31:0.574074:19:12:14:9:19:12:14:9
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chr10	47000188	.	A	G	243.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=20;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00510079;FXX=0.049975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.7439;QD=51.2546;RBI=0.0772094;REFB=0;REVB=-0.0770407;RO=0;SAF=5;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00133976;OID=.;OPOS=47000188;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:19:0:0:19:19:1:14:5:0:0:14:5:0:0
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chr10	47000547	.	G	T	292.18	PASS	AF=0.574074;AO=28;DP=51;FAO=31;FDP=54;FR=.;FRO=23;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=0.0039882;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.81;QD=21.6428;RBI=0.0109984;REFB=0.0125895;REVB=-0.0102498;RO=23;SAF=13;SAR=15;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151686;STB=0.558186;STBP=0.345;TYPE=snp;VARB=-0.0108045;OID=.;OPOS=47000547;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:54:23:23:28:31:0.574074:15:13:15:8:15:16:15:8
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chr10	47000863	.	A	G	1139.82	PASS	AF=1;AO=72;DP=73;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0464823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.346;QD=59.9906;RBI=0.0492957;REFB=0;REVB=0.0164151;RO=0;SAF=18;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.33789e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00018195;OID=.;OPOS=47000863;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:76:0:0:72:76:1:54:18:0:0:55:21:0:0
chr10	47000873	.	T	A,G	1000.91	PASS	AF=0.471429,0.528571;AO=33,36;DP=69;FAO=33,37;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=5,17;FSAR=28,20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00708018,-0.00231298;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=54.8833,159.793;QD=57.1948;RBI=0.0179419,0.0137376;REFB=0,0;REVB=0.0164859,-0.0135415;RO=0;SAF=5,17;SAR=28,19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=4.47732e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0163961,0.00222869;OID=.,.;OPOS=47000873,47000873;OREF=T,T;OALT=A,G;OMAPALT=A,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:69:70:0:0:33,36:33,37:0.471429,0.528571:28,19:5,17:0:0:28,20:5,17:0:0
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chr10	47001504	.	G	T	457.47	PASS	AF=0.40625;AO=51;DP=128;FAO=52;FDP=128;FR=.;FRO=76;FSAF=17;FSAR=35;FSRF=31;FSRR=45;FWDB=0.0221771;FXX=0.00775134;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.691;QD=14.2961;RBI=0.0268307;REFB=-0.00827917;REVB=0.0151017;RO=77;SAF=16;SAR=35;SRF=31;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10463;STB=0.552611;STBP=0.371;TYPE=snp;VARB=0.0164241;OID=.;OPOS=47001504;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:128:128:77:76:51:52:0.40625:35:16:31:46:35:17:31:45
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chr10	47001984	.	G	A	453.87	PASS	AF=0.969697;AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=33;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00331106;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.136;QD=55.0144;RBI=0.0131406;REFB=-0.153633;REVB=0.0127166;RO=0;SAF=18;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.517231;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.00127017;OID=.;OPOS=47001984;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:33:33:0:1:32:32:0.969697:14:18:0:0:14:18:0:1
chr10	47002079	.	T	C	435.4	PASS	AF=0.518072;AO=42;DP=81;FAO=43;FDP=83;FR=.;FRO=40;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=-0.0203138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.5057;QD=20.9833;RBI=0.0427058;REFB=-0.0163428;REVB=0.037565;RO=38;SAF=24;SAR=18;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0393013;STB=0.516122;STBP=0.787;TYPE=snp;VARB=0.0231298;OID=.;OPOS=47002079;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:83:38:40:42:43:0.518072:18:24:20:18:19:24:21:19
chr10	47002118	.	T	A	609.93	PASS	AF=0.459854;AO=63;DP=139;FAO=63;FDP=137;FR=.;FRO=74;FSAF=33;FSAR=30;FSRF=34;FSRR=40;FWDB=-0.00868466;FXX=0.0143875;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.819;QD=17.8083;RBI=0.0165991;REFB=-0.00975373;REVB=0.0141459;RO=73;SAF=33;SAR=30;SRF=34;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0560604;STB=0.534711;STBP=0.485;TYPE=snp;VARB=0.0152001;OID=.;OPOS=47002118;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:139:137:73:74:63:63:0.459854:30:33:34:39:30:33:34:40
chr10	47002127	.	T	C,G	2243.49	PASS	AF=0.966887,0.0331126;AO=133,10;DP=143;FAO=146,5;FDP=151;FR=.;FRO=0;FSAF=73,1;FSAR=73,4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00668887,-0.00572362;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=164.087,124.771;QD=59.4301;RBI=0.0258828,0.0146345;REFB=0,0;REVB=0.0250036,0.0134688;RO=0;SAF=64,4;SAR=69,6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00259648,0.0327672;OID=.,.;OPOS=47002127,47002127;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:5:143:151:0:0:133,10:146,5:0.966887,0.0331126:69,6:64,4:0:0:73,4:73,1:0:0
chr10	47002135	.	A	G	794.13	PASS	AF=0.519481;AO=80;DP=154;FAO=80;FDP=154;FR=.;FRO=74;FSAF=36;FSAR=44;FSRF=40;FSRR=34;FWDB=-0.0116874;FXX=0.0064512;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.757;QD=20.6269;RBI=0.0549861;REFB=-0.0104577;REVB=-0.0537297;RO=74;SAF=36;SAR=44;SRF=40;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0793628;STB=0.543552;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=0.0155516;OID=.;OPOS=47002135;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:154:154:74:74:80:80:0.519481:44:36:40:34:44:36:40:34
chr10	47002501	.	T	A	183.48	PASS	AF=0.370968;AO=22;DP=61;FAO=23;FDP=62;FR=.;FRO=39;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=28;FSRR=11;FWDB=0.0021436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.918;QD=11.8373;RBI=0.0252603;REFB=-0.00864112;REVB=0.0251692;RO=38;SAF=11;SAR=11;SRF=27;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.232082;STB=0.648979;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=0.0190443;OID=.;OPOS=47002501;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:62:38:39:22:23:0.370968:11:11:27:11:12:11:28:11
chr10	47002542	.	C	A	1190.42	PASS	AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0408808;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.131;QD=61.0471;RBI=0.0410345;REFB=0;REVB=-0.00354781;RO=0;SAF=51;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000121849;OID=.;OPOS=47002542;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:27:51:0:0:27:51:0:0
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chr10	47002724	.	G	A	117.12	PASS	AF=0.358974;AO=14;DP=39;FAO=14;FDP=39;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=-0.0681691;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.7338;QD=12.0127;RBI=0.0689684;REFB=-0.0165124;REVB=0.0104697;RO=24;SAF=7;SAR=7;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0446326;STB=0.512802;STBP=0.951;TYPE=snp;VARB=0.0200338;OID=.;OPOS=47002724;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:24:25:14:14:0.358974:7:7:11:13:7:7:12:13
chr10	47002757	.	AAAT	GAAC,GAAT	460.67	PASS	AF=0.0625,0.9375;AO=2,26;DP=33;FAO=2,30;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=2,13;FSAR=0,17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0309734,-0.218601;FXX=0.0302939;HRUN=3,3;LEN=4,1;MLLD=149.812,44.3928;QD=57.5834;RBI=0.0412712,0.218811;REFB=0,0;REVB=-0.0272756,0.00958062;RO=0;SAF=2,9;SAR=0,17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0707177,-0.00879482;OID=.,.;OPOS=47002757,47002757;OREF=AAAT,A;OALT=GAAC,G;OMAPALT=GAAC,GAAT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:33:32:0:0:2,26:2,30:0.0625,0.9375:0,17:2,9:0:0:0,17:2,13:0:0
chr10	47002792	.	T	C	113.4	PASS	AF=0.297872;AO=14;DP=47;FAO=14;FDP=47;FR=.;FRO=33;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=22;FWDB=-0.0315006;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.227;QD=9.65109;RBI=0.0319501;REFB=-0.0111876;REVB=0.00534055;RO=33;SAF=4;SAR=10;SRF=11;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0651101;STB=0.53951;STBP=0.765;TYPE=snp;VARB=0.0140005;OID=.;OPOS=47002792;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:33:33:14:14:0.297872:10:4:11:22:10:4:11:22
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chr10	47002917	.	T	C	732.22	PASS	AF=0.949153;AO=50;DP=54;FAO=56;FDP=59;FR=.;FRO=3;FSAF=25;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0369135;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=40.7967;QD=49.6421;RBI=0.0500102;REFB=-0.023259;REVB=-0.0337403;RO=4;SAF=20;SAR=30;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0218417;STB=0.523069;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=0.00166327;OID=.;OPOS=47002917;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:54:59:4:3:50:56:0.949153:30:20:1:3:31:25:0:3
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chr10	47005504	.	T	C	843.41	PASS	AF=0.51497;AO=83;DP=162;FAO=86;FDP=167;FR=.;FRO=81;FSAF=47;FSAR=39;FSRF=43;FSRR=38;FWDB=-0.00713544;FXX=0.0118336;HRUN=3;LEN=1;MLLD=194.171;QD=20.2014;RBI=0.00727341;REFB=-0.0153519;REVB=0.00140997;RO=79;SAF=46;SAR=37;SRF=43;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00889535;STB=0.507643;STBP=0.84;TYPE=snp;VARB=0.0132994;OID=.;OPOS=47005504;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:162:167:79:81:83:86:0.51497:37:46:43:36:39:47:43:38
chr10	47005575	.	C	T	608.35	PASS	AF=0.463235;AO=63;DP=136;FAO=63;FDP=136;FR=.;FRO=73;FSAF=29;FSAR=34;FSRF=39;FSRR=34;FWDB=-0.00845575;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=226.653;QD=17.8927;RBI=0.00880942;REFB=-0.00751334;REVB=-0.0024711;RO=73;SAF=29;SAR=34;SRF=39;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0714313;STB=0.53967;STBP=0.418;TYPE=snp;VARB=0.00806732;OID=.;OPOS=47005575;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:136:136:73:73:63:63:0.463235:34:29:39:34:34:29:39:34
chr10	47005611	.	CAGA	C	200.3	PASS	AF=0.28866;AO=24;DP=92;FAO=28;FDP=97;FR=.;FRO=69;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=39;FSRR=30;FWDB=0.0107502;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=265.334;QD=8.25974;RBI=0.0166887;REFB=-0.00425477;REVB=-0.0127651;RO=66;SAF=11;SAR=13;SRF=39;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160572;STB=0.546359;STBP=0.584;TYPE=del;VARB=0.0115266;OID=.;OPOS=47005612;OREF=AGA;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.28866:24:92:28:97:69:14:14:39:30:99:66:11:13:39:27
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chr10	47086978	.	G	A	419.05	PASS	AF=0.271493;AO=60;DP=222;FAO=60;FDP=221;FR=.;FRO=161;FSAF=24;FSAR=36;FSRF=81;FSRR=80;FWDB=-0.0206528;FXX=0.0045043;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.556;QD=7.58462;RBI=0.0276861;REFB=-0.00177463;REVB=0.0184386;RO=162;SAF=24;SAR=36;SRF=81;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124687;STB=0.575843;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.00443463;OID=.;OPOS=47086978;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:222:221:162:161:60:60:0.271493:36:24:81:81:36:24:81:80
chr10	47087474	.	C	T	1589.34	PASS	AF=1;AO=106;DP=106;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.018792;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.2158;QD=59.9752;RBI=0.0270002;REFB=0;REVB=0.0193874;RO=0;SAF=58;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.20093e-06;OID=.;OPOS=47087474;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:106:106:0:0:106:106:1:48:58:0:0:48:58:0:0
chr10	47087501	.	C	T	450.76	PASS	AF=0.473684;AO=45;DP=96;FAO=45;FDP=95;FR=.;FRO=50;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=27;FSRR=23;FWDB=0.0406688;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.277;QD=18.9794;RBI=0.0409367;REFB=-0.01722;REVB=-0.00467524;RO=50;SAF=20;SAR=25;SRF=27;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0903891;STB=0.550329;STBP=0.362;TYPE=snp;VARB=0.0200997;OID=.;OPOS=47087501;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:95:50:50:45:45:0.473684:25:20:27:23:25:20:27:23
chr10	47087608	.	T	C	1382.71	PASS	AF=0.988889;AO=89;DP=90;FAO=89;FDP=90;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00352799;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.785;QD=61.4539;RBI=0.0305168;REFB=-0.128198;REVB=0.0303122;RO=1;SAF=42;SAR=47;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00997727;STB=0.505262;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.000499921;OID=.;OPOS=47087608;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:90:90:1:1:89:89:0.988889:47:42:0:1:47:42:0:1
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chr10	47087730	.	G	GT	479.78	PASS	AF=1;AO=10;DP=78;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.194779;FXX=0.499934;HRUN=0;LEN=1;MLLD=110.214;QD=50.5031;RBI=0.196397;REFB=0;REVB=0.0251548;RO=68;SAF=10;SAR=0;SRF=29;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.696714;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00205744;OID=.;OPOS=47087731;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:10:78:38:38:0:38:0:0:0:3:68:10:0:29:39
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chr10	47747159	.	G	C	95.42	PASS	AF=0.909091;AO=10;DP=11;FAO=10;FDP=11;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00564197;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=265.386;QD=34.6981;RBI=0.00847974;REFB=-0.147889;REVB=0.00633041;RO=0;SAF=6;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.538386;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.0019715;OID=.;OPOS=47747159;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:11:11:0:1:10:10:0.909091:4:6:0:0:4:6:1:0
chr10	48428941	.	T	C	37.78	PASS	AF=0.375;AO=6;DP=16;FAO=6;FDP=16;FR=.;FRO=10;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=-0.0721219;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.728;QD=9.44485;RBI=0.0725362;REFB=-0.0198547;REVB=0.00774178;RO=10;SAF=1;SAR=5;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0568762;STB=0.535589;STBP=0.89;TYPE=snp;VARB=0.0227121;OID=.;OPOS=48428941;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:16:16:10:10:6:6:0.375:5:1:2:8:5:1:2:8
chr10	49659559	.	C	T	564.0	PASS	AF=0.952381;AO=39;DP=42;FAO=40;FDP=42;FR=.;FRO=2;FSAF=26;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0265103;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.371;QD=53.7147;RBI=0.044592;REFB=-0.0688242;REVB=0.0358559;RO=3;SAF=25;SAR=14;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00372627;STB=0.507809;STBP=0.788;TYPE=snp;VARB=0.00195268;OID=.;OPOS=49659559;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:42:42:3:2:39:40:0.952381:14:25:2:1:14:26:1:1
chr10	49659637	.	T	C	65.94	PASS	AF=0.375;AO=9;DP=24;FAO=9;FDP=24;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.0322399;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.124;QD=10.9894;RBI=0.0323247;REFB=-0.0323799;REVB=-0.0023404;RO=14;SAF=5;SAR=4;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0163296;STB=0.513987;STBP=0.948;TYPE=snp;VARB=0.0451869;OID=.;OPOS=49659637;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:24:24:14:15:9:9:0.375:4:5:8:6:4:5:8:7
chr10	49667795	.	T	C	919.86	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0579119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.391;QD=58.4038;RBI=0.0603721;REFB=0;REVB=0.0170589;RO=0;SAF=31;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.80484e-05;OID=.;OPOS=49667795;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:32:31:0:0:32:31:0:0
chr10	49687800	.	G	A	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0360485;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=276.962;QD=45.8068;RBI=0.0377847;REFB=0;REVB=0.0113221;RO=0;SAF=9;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000239514;OID=.;OPOS=49687800;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:5:9:0:0:5:9:0:0
chr10	49933974	.	T	C	427.61	PASS	AF=0.545455;AO=39;DP=76;FAO=42;FDP=77;FR=.;FRO=35;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=25;FSRR=10;FWDB=0.00290388;FXX=0.0253133;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.623;QD=22.2134;RBI=0.00296516;REFB=-0.0277585;REVB=0.000599722;RO=36;SAF=18;SAR=21;SRF=25;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200159;STB=0.597358;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=0.0213925;OID=.;OPOS=49933974;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:77:36:35:39:42:0.545455:21:18:25:11:21:21:25:10
chr10	49968431	.	C	T	220.11	PASS	AF=0.369863;AO=26;DP=72;FAO=27;FDP=73;FR=.;FRO=46;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=27;FWDB=-0.0191061;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.93;QD=12.061;RBI=0.0202136;REFB=-0.0163563;REVB=0.00659893;RO=46;SAF=10;SAR=16;SRF=19;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0328412;STB=0.528382;STBP=0.733;TYPE=snp;VARB=0.0294023;OID=.;OPOS=49968431;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:73:46:46:26:27:0.369863:16:10:19:27:17:10:19:27
chr10	49982526	.	C	T	389.96	PASS	AF=0.541667;AO=39;DP=72;FAO=39;FDP=72;FR=.;FRO=33;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=8;FSRR=25;FWDB=0.0129078;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=228.98;QD=21.6643;RBI=0.0136739;REFB=-0.0277271;REVB=0.00451272;RO=33;SAF=20;SAR=19;SRF=8;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.224286;STB=0.62317;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.0173852;OID=.;OPOS=49982526;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:33:33:39:39:0.541667:19:20:8:25:19:20:8:25
chr10	50013402	.	T	C	971.7	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0307387;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.815;QD=58.8907;RBI=0.0360485;REFB=0;REVB=-0.0188315;RO=0;SAF=37;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.1743e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.25803e-05;OID=.;OPOS=50013402;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:66:0:0:64:66:1:27:37:0:0:28:38:0:0
chr10	50025396	.	G	A	783.87	PASS	AF=1;AO=53;DP=54;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0453799;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.408;QD=57.0083;RBI=0.0455469;REFB=0;REVB=0.00389725;RO=0;SAF=19;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.97342e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.78947e-05;OID=.;OPOS=50025396;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:55:0:0:53:55:1:34:19:0:0:34:21:0:0
chr10	50038800	.	A	G	785.89	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.022207;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=192.251;QD=64.1539;RBI=0.0324644;REFB=0;REVB=0.0236809;RO=0;SAF=19;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.48867e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000117181;OID=.;OPOS=50038800;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:30:19:0:0:30:19:0:0
chr10	50083111	.	T	C	1569.59	PASS	AF=0.964286;AO=108;DP=112;FAO=108;FDP=112;FR=.;FRO=4;FSAF=49;FSAR=59;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.00745694;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=50.269;QD=56.0568;RBI=0.0076289;REFB=-0.0949884;REVB=-0.00161063;RO=2;SAF=49;SAR=59;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0189771;STB=0.51065;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=0.00345567;OID=.;OPOS=50083111;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:112:112:2:4:108:108:0.964286:59:49:2:0:59:49:3:1
chr10	50098651	.	G	A	724.65	PASS	AF=0.626168;AO=67;DP=107;FAO=67;FDP=107;FR=.;FRO=40;FSAF=30;FSAR=37;FSRF=24;FSRR=16;FWDB=0.00883766;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.486;QD=27.0897;RBI=0.0121225;REFB=-0.00382117;REVB=0.00829756;RO=40;SAF=30;SAR=37;SRF=24;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10484;STB=0.556839;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.00192231;OID=.;OPOS=50098651;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:107:40:40:67:67:0.626168:37:30:24:16:37:30:24:16
chr10	50109902	.	G	A	734.27	PASS	AF=0.979167;AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=48;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0666593;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.3232;QD=61.1891;RBI=0.0685321;REFB=-0.0796024;REVB=-0.015912;RO=1;SAF=26;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0177461;STB=0.50943;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.00223284;OID=.;OPOS=50109902;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:48:48:1:1:47:47:0.979167:21:26:1:0:21:26:1:0
chr10	50121784	.	T	C	833.56	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0194429;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.5463;QD=57.4871;RBI=0.0637227;REFB=0;REVB=0.060684;RO=0;SAF=42;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.83285e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000480006;OID=.;OPOS=50121784;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:16:42:0:0:16:42:0:0
chr10	50122181	.	C	A	885.39	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0330046;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.46;QD=58.0586;RBI=0.0340063;REFB=0;REVB=0.0081931;RO=0;SAF=29;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.33764e-05;OID=.;OPOS=50122181;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:32:29:0:0:32:29:0:0
chr10	50184949	.	C	T	225.35	PASS	AF=0.636364;AO=21;DP=33;FAO=21;FDP=33;FR=.;FRO=12;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=0.0106856;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.519;QD=27.3146;RBI=0.0113046;REFB=0.0167122;REVB=-0.00368949;RO=12;SAF=11;SAR=10;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.178844;STB=0.598762;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=-0.00897177;OID=.;OPOS=50184949;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:33:33:12:12:21:21:0.636364:10:11:3:9:10:11:3:9
chr10	50186415	.	C	T	238.14	PASS	AF=0.457627;AO=27;DP=59;FAO=27;FDP=59;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=-0.00787914;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=154.767;QD=16.1448;RBI=0.0124176;REFB=-0.0148222;REVB=0.00959766;RO=29;SAF=14;SAR=13;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0626766;STB=0.540954;STBP=0.581;TYPE=snp;VARB=0.0210895;OID=.;OPOS=50186415;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:29:32:27:27:0.457627:13:14:17:12:13:14:19:13
chr10	50227785	.	T	C	1176.9	PASS	AF=1;AO=76;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0404663;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.637;QD=60.3539;RBI=0.0434006;REFB=0;REVB=0.0156871;RO=0;SAF=31;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000170535;OID=.;OPOS=50227785;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:78:0:0:76:78:1:45:31:0:0:45:33:0:0
chr10	50531214	.	C	G	180.09	PASS	AF=0.580645;AO=18;DP=31;FAO=18;FDP=31;FR=.;FRO=13;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=0.0248852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.1412;QD=23.238;RBI=0.0421299;REFB=-0.041002;REVB=-0.0339949;RO=13;SAF=9;SAR=9;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0863657;STB=0.548334;STBP=0.55;TYPE=snp;VARB=0.016687;OID=.;OPOS=50531214;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:13:13:18:18:0.580645:9:9:5:8:9:9:5:8
chr10	50531549	.	G	T	100.19	PASS	AF=0.428571;AO=13;DP=29;FAO=12;FDP=28;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=-0.0344789;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.91;QD=14.3134;RBI=0.0406817;REFB=-0.0136438;REVB=-0.0215917;RO=16;SAF=3;SAR=10;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101624;STB=0.545376;STBP=0.768;TYPE=snp;VARB=0.0341112;OID=.;OPOS=50531549;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:28:16:16:13:12:0.428571:10:3:5:11:9:3:5:11
chr10	50531604	.	T	C	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0394658;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.687;QD=48.7371;RBI=0.0446776;REFB=0;REVB=-0.0209413;RO=0;SAF=6;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00114502;OID=.;OPOS=50531604;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:11:6:0:0:11:6:0:0
chr10	50531972	.	A	C	97.29	PASS	AF=0.4;AO=13;DP=30;FAO=12;FDP=30;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.0433349;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.845;QD=12.9724;RBI=0.0882121;REFB=-0.00559723;REVB=-0.0768341;RO=17;SAF=4;SAR=9;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.226252;STB=0.604472;STBP=0.361;TYPE=snp;VARB=0.0107382;OID=.;OPOS=50531972;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:30:30:17:18:13:12:0.4:9:4:9:8:8:4:9:9
chr10	50532683	.	T	C	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0843853;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.6269;QD=33.4277;RBI=0.0858498;REFB=0;REVB=0.0157899;RO=0;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00637204;OID=.;OPOS=50532683;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:5:1:0:0:5:1:0:0
chr10	50533617	.	T	C	184.71	PASS	AF=0.583333;AO=11;DP=24;FAO=14;FDP=24;FR=.,HEALED;FRO=5;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=-0.0264398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=35.9996;QD=30.7845;RBI=0.0461242;REFB=-0.0860302;REVB=-0.0377938;RO=3;SAF=4;SAR=7;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.242563;STB=0.631404;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=0.0797364;OID=.;OPOS=50533617;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:24:24:3:5:11:14:0.583333:7:4:3:0:7:7:5:0
chr10	50534395	.	G	A	67.91	PASS	AF=0.409091;AO=9;DP=23;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=0.0182111;FXX=0.0434594;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.825;QD=12.3471;RBI=0.0182572;REFB=-0.0119221;REVB=-0.00129678;RO=13;SAF=4;SAR=5;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0604717;STB=0.536003;STBP=0.755;TYPE=snp;VARB=0.013911;OID=.;OPOS=50534395;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:23:22:13:13:9:9:0.409091:5:4:5:8:5:4:5:8
chr10	50534646	.	C	T	99.21	PASS	AF=0.444444;AO=12;DP=27;FAO=12;FDP=27;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=12;FWDB=0.0263188;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.2365;QD=14.6983;RBI=0.0481145;REFB=-0.00810918;REVB=0.040278;RO=15;SAF=6;SAR=6;SRF=3;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.290292;STB=0.666419;STBP=0.151;TYPE=snp;VARB=0.0135791;OID=.;OPOS=50534646;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:15:15:12:12:0.444444:6:6:3:12:6:6:3:12
chr10	50534862	.	T	C	351.22	PASS	AF=0.401961;AO=41;DP=103;FAO=41;FDP=102;FR=.;FRO=61;FSAF=12;FSAR=29;FSRF=24;FSRR=37;FWDB=0.0119184;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.471;QD=13.7733;RBI=0.0263133;REFB=-0.019163;REVB=0.0234594;RO=61;SAF=12;SAR=29;SRF=24;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120584;STB=0.568593;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=0.0270438;OID=.;OPOS=50534862;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:102:61:61:41:41:0.401961:29:12:24:37:29:12:24:37
chr10	50678317	.	C	G	254.67	PASS	AF=0.38961;AO=30;DP=77;FAO=30;FDP=77;FR=.;FRO=47;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=23;FSRR=24;FWDB=-0.00758298;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.441;QD=13.2297;RBI=0.018597;REFB=-0.00592105;REVB=0.0169808;RO=47;SAF=15;SAR=15;SRF=23;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0113567;STB=0.506489;STBP=0.96;TYPE=snp;VARB=0.0112794;OID=.;OPOS=50678317;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:47:47:30:30:0.38961:15:15:23:24:15:15:23:24
chr10	50683438	.	T	C	1021.62	PASS	AF=0.451477;AO=107;DP=236;FAO=107;FDP=237;FR=.;FRO=130;FSAF=49;FSAR=58;FSRF=68;FSRR=62;FWDB=-0.0143474;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.2816;QD=17.2425;RBI=0.0201673;REFB=-0.0278397;REVB=-0.014173;RO=127;SAF=49;SAR=58;SRF=65;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0529226;STB=0.535758;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.0193126;OID=.;OPOS=50683438;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:236:237:127:130:107:107:0.451477:58:49:65:62:58:49:68:62
chr10	50723684	.	G	A	920.11	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103021;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.387;QD=58.4197;RBI=0.0120321;REFB=0;REVB=-0.00621593;RO=0;SAF=27;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.31521e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.12315e-06;OID=.;OPOS=50723684;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:36:27:0:0:36:27:0:0
chr10	50724016	.	C	T	465.54	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0167684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=287.378;QD=58.1925;RBI=0.02916;REFB=0;REVB=0.0238563;RO=0;SAF=15;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000104479;OID=.;OPOS=50724016;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:32:0:0:31:32:1:16:15:0:0:17:15:0:0
chr10	50732280	.	C	T	116.67	PASS	AF=0.35;AO=14;DP=40;FAO=14;FDP=40;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=-0.00546649;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=226.373;QD=11.6668;RBI=0.00820736;REFB=-0.00903582;REVB=-0.00612195;RO=26;SAF=7;SAR=7;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0844256;STB=0.549929;STBP=0.685;TYPE=snp;VARB=0.0177807;OID=.;OPOS=50732280;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:26:26:14:14:0.35:7:7:15:11:7:7:15:11
chr10	50740876	.	G	C	304.99	PASS	AF=0.702703;AO=25;DP=36;FAO=26;FDP=37;FR=.;FRO=11;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.00676405;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.204;QD=32.9722;RBI=0.0295406;REFB=0.0044067;REVB=-0.0287557;RO=11;SAF=14;SAR=11;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0591256;STB=0.536814;STBP=0.546;TYPE=snp;VARB=-0.00159708;OID=.;OPOS=50740876;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:82:36:37:11:11:25:26:0.702703:11:14:5:6:11:15:5:6
chr10	50820345	.	C	A	738.96	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0551131;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.094;QD=62.8902;RBI=0.0571979;REFB=0;REVB=0.0153018;RO=0;SAF=18;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000104647;OID=.;OPOS=50820345;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:29:18:0:0:29:18:0:0
chr10	50856652	.	G	A	538.44	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000607675;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.28;QD=59.8263;RBI=0.0274695;REFB=0;REVB=0.0274628;RO=0;SAF=19;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000160677;OID=.;OPOS=50856652;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:17:19:0:0:17:19:0:0
chr10	50863147	.	T	C	1055.64	PASS	AF=0.986301;AO=71;DP=72;FAO=72;FDP=73;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0489707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.97;QD=57.843;RBI=0.0499871;REFB=-0.0367343;REVB=0.010029;RO=1;SAF=32;SAR=39;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0119714;STB=0.506327;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.00143812;OID=.;OPOS=50863147;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:72:73:1:1:71:72:0.986301:39:32:0:1:39:33:0:1
chr10	50872912	.	C	T	989.69	PASS	AF=0.958333;AO=69;DP=72;FAO=69;FDP=72;FR=.;FRO=3;FSAF=35;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.00336376;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.7985;QD=54.9826;RBI=0.0482812;REFB=-0.00693052;REVB=0.0481639;RO=3;SAF=35;SAR=34;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0136838;STB=0.507244;STBP=0.61;TYPE=snp;VARB=0.00536779;OID=.;OPOS=50872912;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:72:72:3:3:69:69:0.958333:34:35:1:2:34:35:1:2
chr10	50916484	.	A	G	805.09	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0279661;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.391;QD=64.4073;RBI=0.0289746;REFB=0;REVB=0.00757788;RO=0;SAF=20;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.14841e-05;OID=.;OPOS=50916484;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:30:20:0:0:30:20:0:0
chr10	50942763	.	C	T	804.43	PASS	AF=0.982759;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0088894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.8978;QD=55.4777;RBI=0.0221453;REFB=-0.089024;REVB=-0.0202829;RO=1;SAF=21;SAR=36;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0129222;STB=0.506847;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.00306323;OID=.;OPOS=50942763;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:58:58:1:1:57:57:0.982759:36:21:0:1:36:21:0:1
chr10	50947852	.	T	C	322.85	PASS	AF=0.507463;AO=34;DP=67;FAO=34;FDP=67;FR=.;FRO=33;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=-0.0116546;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.361;QD=19.2744;RBI=0.0119024;REFB=-0.00830592;REVB=-0.00241625;RO=33;SAF=15;SAR=19;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0152286;STB=0.50847;STBP=0.917;TYPE=snp;VARB=0.0128874;OID=.;OPOS=50947852;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:33:33:34:34:0.507463:19:15:14:19:19:15:14:19
chr10	50960209	.	G	A	575.8	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000261479;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.492;QD=60.6103;RBI=0.0563314;REFB=0;REVB=0.0563308;RO=0;SAF=17;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.53998e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.67522e-05;OID=.;OPOS=50960209;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:21:17:0:0:21:17:0:0
chr10	51465552	.	A	T	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0172837;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=330.818;QD=44.6898;RBI=0.0240139;REFB=0;REVB=-0.0166717;RO=0;SAF=8;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.05342e-06;OID=.;OPOS=51465552;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:5:8:0:0:5:8:0:0
chr10	51549545	.	G	T	777.75	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00902742;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.715;QD=63.49;RBI=0.0203249;REFB=0;REVB=0.0182101;RO=0;SAF=18;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000128086;OID=.;OPOS=51549545;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:49:0:0:47:49:1:29:18:0:0:31:18:0:0
chr10	51568378	.	T	G	994.23	PASS	AF=0.985507;AO=68;DP=69;FAO=68;FDP=69;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0176658;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=307.198;QD=57.6364;RBI=0.0217054;REFB=-0.0179245;REVB=0.0126112;RO=1;SAF=35;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141074;STB=0.50746;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=7.53107e-05;OID=.;OPOS=51568378;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:69:69:1:1:68:68:0.985507:33:35:0:1:33:35:0:1
chr10	51623147	.	C	T	66.81	PASS	AF=0.428571;AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.0993974;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.6923;QD=12.7262;RBI=0.104515;REFB=0.0225731;REVB=0.0323036;RO=12;SAF=7;SAR=2;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.225785;STB=0.636033;STBP=0.338;TYPE=snp;VARB=-0.021459;OID=.;OPOS=51623147;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:21:21:12:12:9:9:0.428571:2:7:7:5:2:7:7:5
chr10	51623174	.	C	A	30.1	PASS	AF=0.416667;AO=5;DP=12;FAO=5;FDP=12;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.0234259;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=256.928;QD=10.034;RBI=0.0254855;REFB=0.00298057;REVB=-0.0100368;RO=7;SAF=4;SAR=1;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.378245;STB=0.7397;STBP=0.21;TYPE=snp;VARB=-0.00306901;OID=.;OPOS=51623174;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:12:12:7:7:5:5:0.416667:1:4:3:4:1:4:3:4
chr10	51631812	.	A	G	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00800897;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.5281;QD=42.1826;RBI=0.0158887;REFB=0;REVB=0.0137225;RO=0;SAF=4;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00032954;OID=.;OPOS=51631812;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:7:4:0:0:7:4:0:0
chr10	51827934	.	G	A	1090.34	PASS	AF=0.973684;AO=74;DP=76;FAO=74;FDP=76;FR=.;FRO=2;FSAF=11;FSAR=63;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0296902;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.9579;QD=57.3864;RBI=0.0393215;REFB=0.00399023;REVB=0.0257812;RO=2;SAF=11;SAR=63;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0785609;STB=0.541655;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=7.18398e-05;OID=.;OPOS=51827934;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:76:76:2:2:74:74:0.973684:63:11:2:0:63:11:2:0
chr10	52002980	.	T	G	923.81	PASS	AF=0.984615;AO=63;DP=64;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00903535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.093;QD=56.85;RBI=0.0147685;REFB=0.0613182;REVB=0.0116821;RO=1;SAF=34;SAR=29;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0160049;STB=0.508194;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=2.21099e-05;OID=.;OPOS=52002980;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:64:65:1:1:63:64:0.984615:29:34:0:1:30:34:0:1
chr10	52005153	.	A	G	762.99	PASS	AF=1;AO=52;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=42;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0384526;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.624;QD=55.4902;RBI=0.0544818;REFB=0;REVB=0.0385961;RO=1;SAF=40;SAR=12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0116329;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.61725e-06;OID=.;OPOS=52005153;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:1:0:52:55:1:12:40:1:0:13:42:0:0
chr10	52103707	.	A	G	200.81	PASS	AF=0.366197;AO=25;DP=70;FAO=26;FDP=71;FR=.;FRO=45;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=21;FSRR=24;FWDB=0.0171789;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.108;QD=11.3131;RBI=0.0312574;REFB=-0.00704159;REVB=-0.0261134;RO=45;SAF=16;SAR=9;SRF=21;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.19498;STB=0.595112;STBP=0.239;TYPE=snp;VARB=0.013526;OID=.;OPOS=52103707;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:71:45:45:25:26:0.366197:9:16:21:24:10:16:21:24
chr10	53059406	.	T	C	468.97	PASS	AF=0.5;AO=46;DP=92;FAO=46;FDP=92;FR=.;FRO=46;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=23;FSRR=23;FWDB=-0.00150441;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.346;QD=20.3898;RBI=0.020857;REFB=-0.0120752;REVB=0.0208027;RO=46;SAF=24;SAR=22;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0196285;STB=0.510875;STBP=0.788;TYPE=snp;VARB=0.0110958;OID=.;OPOS=53059406;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:46:46:46:46:0.5:22:24:23:23:22:24:23:23
chr10	54053817	.	C	T	770.62	PASS	AF=0.982143;AO=55;DP=56;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00772225;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.052;QD=55.0441;RBI=0.0159189;REFB=0.0564368;REVB=0.0139204;RO=1;SAF=23;SAR=32;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0145046;STB=0.507689;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=-0.00210795;OID=.;OPOS=54053817;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:56:56:1:1:55:55:0.982143:32:23:0:1:32:23:0:1
chr10	54405572	.	A	G	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00923598;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.122;QD=51.9167;RBI=0.00932819;REFB=0;REVB=-0.00130832;RO=0;SAF=15;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.02757e-05;OID=.;OPOS=54405572;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:6:15:0:0:6:15:0:0
chr10	54528266	.	G	C	411.06	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00576356;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.296;QD=56.6981;RBI=0.00865887;REFB=0;REVB=0.006462;RO=0;SAF=14;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.05071e-05;OID=.;OPOS=54528266;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:15:14:0:0:15:14:0:0
chr10	54531235	.	C	T	248.28	PASS	AF=0.352941;AO=30;DP=85;FAO=30;FDP=85;FR=.;FRO=55;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=29;FSRR=26;FWDB=-0.0462937;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.3245;QD=11.6839;RBI=0.0676098;REFB=-0.0111552;REVB=0.0492745;RO=55;SAF=12;SAR=18;SRF=29;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143409;STB=0.582883;STBP=0.27;TYPE=snp;VARB=0.0285494;OID=.;OPOS=54531235;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:55:55:30:30:0.352941:18:12:29:26:18:12:29:26
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chr10	55582905	.	G	T	1008.47	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00241824;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=337.09;QD=59.3215;RBI=0.00539962;REFB=0;REVB=0.00482784;RO=0;SAF=40;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.63012e-06;OID=.;OPOS=55582905;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:28:40:0:0:28:40:0:0
chr10	55755491	.	C	T	156.23	PASS	AF=0.425;AO=17;DP=40;FAO=17;FDP=40;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=0.0128643;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.221;QD=15.623;RBI=0.0174768;REFB=-0.00242192;REVB=-0.01183;RO=23;SAF=12;SAR=5;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.24054;STB=0.639327;STBP=0.17;TYPE=snp;VARB=0.00404217;OID=.;OPOS=55755491;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:23:23:17:17:0.425:5:12:11:12:5:12:11:12
chr10	55949151	.	G	A	182.31	PASS	AF=0.365079;AO=23;DP=63;FAO=23;FDP=63;FR=.;FRO=40;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=16;FWDB=0.00143841;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.1929;QD=11.5752;RBI=0.0277981;REFB=-0.0251955;REVB=-0.0277608;RO=40;SAF=9;SAR=14;SRF=24;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.226616;STB=0.631035;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=0.0318946;OID=.;OPOS=55949151;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:40:40:23:23:0.365079:14:9:24:16:14:9:24:16
chr10	55955444	.	T	G	261.1	PASS	AF=0.509091;AO=28;DP=55;FAO=28;FDP=55;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=0.000705759;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.017;QD=18.9892;RBI=0.0166864;REFB=0.00762973;REVB=0.0166715;RO=27;SAF=15;SAR=13;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0476899;STB=0.526639;STBP=0.698;TYPE=snp;VARB=-0.0067004;OID=.;OPOS=55955444;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:27:27:28:28:0.509091:13:15:13:14:13:15:13:14
chr10	56287569	.	T	C	251.08	PASS	AF=0.509804;AO=26;DP=51;FAO=26;FDP=51;FR=.;FRO=25;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=0.0032649;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=228.713;QD=19.6924;RBI=0.0124806;REFB=-0.00648101;REVB=0.0120459;RO=25;SAF=15;SAR=11;SRF=17;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0941937;STB=0.552551;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00530919;OID=.;OPOS=56287569;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:25:25:26:26:0.509804:11:15:17:8:11:15:17:8
chr10	56335031	.	A	G	1061.39	PASS	AF=0.960526;AO=73;DP=76;FAO=73;FDP=76;FR=.;FRO=3;FSAF=42;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0347353;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.74;QD=55.8626;RBI=0.0358295;REFB=0.0436092;REVB=0.00878718;RO=3;SAF=42;SAR=31;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0435964;STB=0.523071;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=-0.000531229;OID=.;OPOS=56335031;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:76:76:3:3:73:73:0.960526:31:42:0:3:31:42:0:3
chr10	56335067	.	A	G	1526.42	PASS	AF=0.887097;AO=111;DP=125;FAO=110;FDP=124;FR=.;FRO=14;FSAF=53;FSAR=57;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=-0.00586885;FXX=0.00799936;HRUN=11;LEN=1;MLLD=241.465;QD=49.2394;RBI=0.00978038;REFB=-0.110128;REVB=-0.00782384;RO=2;SAF=53;SAR=58;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000758219;STB=0.518179;STBP=0.27;TYPE=snp;VARB=0.000425087;OID=.;OPOS=56335067;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:125:124:2:14:111:110:0.887097:58:53:1:1:57:53:9:5
chr10	56345303	.	T	C	96.71	PASS	AF=0.387097;AO=12;DP=30;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.00542428;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.524;QD=12.4788;RBI=0.00961681;REFB=-0.0161851;REVB=-0.00794104;RO=18;SAF=6;SAR=6;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.516102;STBP=0.944;TYPE=snp;VARB=0.0303932;OID=.;OPOS=56345303;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:30:31:18:19:12:12:0.387097:6:6:9:9:6:6:10:9
chr10	56345335	.	T	C	94.66	PASS	AF=0.342857;AO=12;DP=35;FAO=12;FDP=35;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=-0.0402132;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.9295;QD=10.8179;RBI=0.0408672;REFB=-0.00584894;REVB=-0.00728177;RO=23;SAF=6;SAR=6;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0716318;STB=0.542786;STBP=0.727;TYPE=snp;VARB=0.0107299;OID=.;OPOS=56345335;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:35:35:23:23:12:12:0.342857:6:6:10:13:6:6:10:13
chr10	56423968	.	A	C	342.91	PASS	AF=0.435294;AO=37;DP=85;FAO=37;FDP=85;FR=.;FRO=48;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=30;FWDB=0.00724517;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.941;QD=16.1371;RBI=0.0130951;REFB=-0.00547163;REVB=-0.0109082;RO=48;SAF=21;SAR=16;SRF=18;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.191356;STB=0.60749;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=0.00701162;OID=.;OPOS=56423968;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:48:48:37:37:0.435294:16:21:18:30:16:21:18:30
chr10	57357632	.	G	A	238.57	PASS	AF=0.628571;AO=22;DP=35;FAO=22;FDP=35;FR=.;FRO=13;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.04754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.1177;QD=27.2645;RBI=0.0721504;REFB=0.002089;REVB=-0.0542737;RO=13;SAF=11;SAR=11;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0257879;STB=0.514273;STBP=0.817;TYPE=snp;VARB=-0.00563765;OID=.;OPOS=57357632;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:13:13:22:22:0.628571:11:11:7:6:11:11:7:6
chr10	57358664	.	C	A	115.65	PASS	AF=0.333333;AO=14;DP=42;FAO=14;FDP=42;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.00553085;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.2122;QD=11.0139;RBI=0.0118317;REFB=0.00441751;REVB=0.0104594;RO=28;SAF=10;SAR=4;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.253341;STB=0.651947;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=-0.00755667;OID=.;OPOS=57358664;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:28:28:14:14:0.333333:4:10:14:14:4:10:14:14
chr10	57358667	.	G	A	619.72	PASS	AF=0.97619;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00099968;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=226.9;QD=59.0208;RBI=0.0051868;REFB=-0.0938515;REVB=-0.00508955;RO=1;SAF=23;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0199652;STB=0.510633;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=-5.11955e-05;OID=.;OPOS=57358667;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:42:42:1:1:41:41:0.97619:18:23:1:0:18:23:1:0
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chr10	57359819	.	T	C	203.39	PASS	AF=0.5;AO=18;DP=42;FAO=20;FDP=40;FR=.,HEALED;FRO=20;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.0505261;FXX=0.0476077;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.3672;QD=20.3386;RBI=0.0509148;REFB=-0.00606681;REVB=-0.00627878;RO=14;SAF=9;SAR=9;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111377;STB=0.524975;STBP=0.8;TYPE=snp;VARB=0.00135816;OID=.;OPOS=57359819;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:40:14:20:18:20:0.5:9:9:5:9:10:10:9:11
chr10	58118375	.	C	T	243.73	PASS	AF=0.4375;AO=28;DP=64;FAO=28;FDP=64;FR=.;FRO=36;FSAF=20;FSAR=8;FSRF=30;FSRR=6;FWDB=0.00358659;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.106;QD=15.2329;RBI=0.0127341;REFB=-0.0171501;REVB=0.0122186;RO=36;SAF=20;SAR=8;SRF=30;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157642;STB=0.588178;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=0.023898;OID=.;OPOS=58118375;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:36:36:28:28:0.4375:8:20:30:6:8:20:30:6
chr10	58118630	.	T	C	246.68	PASS	AF=0.451613;AO=27;DP=62;FAO=28;FDP=62;FR=.;FRO=34;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=20;FWDB=0.0528977;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.1807;QD=15.915;RBI=0.0537148;REFB=0.0035839;REVB=-0.00933392;RO=34;SAF=13;SAR=14;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0689946;STB=0.529049;STBP=0.677;TYPE=snp;VARB=-0.00104546;OID=.;OPOS=58118630;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:34:34:27:28:0.451613:14:13:14:20:15:13:14:20
chr10	60556237	.	TCC	CTC,TC,TCT	43.99	PASS	AF=0,0.191489,0.0638298;AO=2,10,3;DP=47;FAO=0,9,3;FDP=47;FR=.;FRO=35;FSAF=0,1,0;FSAR=0,8,3;FSRF=20;FSRR=15;FWDB=-0.0141387,0.02479,0.00541057;FXX=0;HRUN=1,3,3;LEN=2,1,1;MLLD=110.018,14.6082,146.837;QD=3.74399;RBI=0.114902,0.100231,0.100571;REFB=-0.0259459,-0.134228,-0.0301655;REVB=-0.114029,-0.0971169,-0.100426;RO=32;SAF=0,2,0;SAR=2,8,3;SRF=19;SRR=13;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0.567251,0;SSSB=-0.493111,-0.472393,-0.579947;STB=0.5,0.878709,0.996857;STBP=1,0.023,0.04;TYPE=mnp,del,snp;VARB=0,0.155693,0.255889;OID=.,.,.;OPOS=60556237,60556238,60556239;OREF=TC,C,C;OALT=CT,-,T;OMAPALT=CTC,TC,TCT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:29:47:47:32:35:2,10,3:0,9,3:0,0.191489,0.0638298:2,8,3:0,2,0:19:13:0,8,3:0,1,0:20:15
chr10	60573753	.	G	T	525.22	PASS	AF=0.431818;AO=55;DP=130;FAO=57;FDP=132;FR=.;FRO=75;FSAF=34;FSAR=23;FSRF=43;FSRR=32;FWDB=-0.00617207;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.696;QD=15.9156;RBI=0.0330232;REFB=-0.0168331;REVB=0.0324413;RO=75;SAF=34;SAR=21;SRF=43;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0481624;STB=0.51359;STBP=0.793;TYPE=snp;VARB=0.0160487;OID=.;OPOS=60573753;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:130:132:75:75:55:57:0.431818:21:34:43:32:23:34:43:32
chr10	60577393	.	T	C	346.42	PASS	AF=0.445783;AO=36;DP=84;FAO=37;FDP=83;FR=.;FRO=46;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=27;FWDB=-0.048649;FXX=0.0119033;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.1357;QD=16.6948;RBI=0.0487675;REFB=0.0329004;REVB=0.00339818;RO=47;SAF=21;SAR=15;SRF=20;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158259;STB=0.585178;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=-0.0260129;OID=.;OPOS=60577393;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:83:47:46:36:37:0.445783:15:21:20:27:16:21:19:27
chr10	60588553	.	T	C	401.66	PASS	AF=0.476744;AO=41;DP=87;FAO=41;FDP=86;FR=.;FRO=45;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=22;FSRR=23;FWDB=-0.0154793;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.786;QD=18.6819;RBI=0.0159181;REFB=-0.00944815;REVB=0.00371174;RO=46;SAF=18;SAR=23;SRF=22;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0375273;STB=0.526303;STBP=0.646;TYPE=snp;VARB=0.010424;OID=.;OPOS=60588553;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:86:46:45:41:41:0.476744:23:18:22:24:23:18:22:23
chr10	61005244	.	G	C	1116.47	PASS	AF=1;AO=73;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0035226;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.6062;QD=60.3496;RBI=0.0757465;REFB=0;REVB=0.0756645;RO=0;SAF=29;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000371564;OID=.;OPOS=61005244;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:0:0:73:74:1:44:29:0:0:44:30:0:0
chr10	61122268	.	T	TTA	272.55	PASS	AF=1;AO=20;DP=22;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.056473;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=208.523;QD=51.9149;RBI=0.0606361;REFB=0;REVB=0.0220803;RO=1;SAF=10;SAR=10;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0438656;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000445617;OID=.;OPOS=61122269;OREF=-;OALT=TA;OMAPALT=TTA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:20:22:21:21:0:10:11:0:0:4:1:10:10:1:0
chr10	61414011	.	G	T	1553.05	PASS	AF=1;AO=94;DP=94;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0102443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=323.361;QD=63.39;RBI=0.0404712;REFB=0;REVB=0.0391532;RO=0;SAF=47;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.72024e-05;OID=.;OPOS=61414011;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:94:98:0:0:94:98:1:47:47:0:0:51:47:0:0
chr10	61549657	.	AT	A	578.45	PASS	AF=1;AO=46;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0749181;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=24.6117;QD=46.2761;RBI=0.0960692;REFB=0;REVB=0.0601378;RO=1;SAF=26;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0177403;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00372949;OID=.;OPOS=61549658;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:46:50:50:50:0:29:21:0:0:11:1:26:20:1:0
chr10	61551428	.	T	C	373.07	PASS	AF=1;AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000345957;FXX=0.0357015;HRUN=3;LEN=1;MLLD=147.472;QD=55.2695;RBI=0.00266851;REFB=0;REVB=-0.00264599;RO=0;SAF=11;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000438805;OID=.;OPOS=61551428;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:28:27:0:0:27:27:1:16:11:0:0:16:11:0:0
chr10	61552692	.	G	T	834.41	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0260502;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=234.763;QD=57.5453;RBI=0.0282485;REFB=0;REVB=-0.0109256;RO=0;SAF=27;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.07727e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.79686e-05;OID=.;OPOS=61552692;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:31:27:0:0:31:27:0:0
chr10	61552774	.	C	T	447.0	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00554835;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.838;QD=57.6768;RBI=0.0407553;REFB=0;REVB=0.0403758;RO=0;SAF=25;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.16261e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000540914;OID=.;OPOS=61552774;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:6:25:0:0:6:25:0:0
chr10	61665886	.	C	A	2022.05	PASS	AF=1;AO=127;DP=127;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00364763;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.449;QD=62.217;RBI=0.00975043;REFB=0;REVB=0.00904244;RO=0;SAF=57;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.31614e-05;OID=.;OPOS=61665886;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:127:130:0:0:127:130:1:70:57:0:0:72:58:0:0
chr10	61719232	.	A	AT	669.45	PASS	AF=1;AO=56;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.020763;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=23.5661;QD=43.8982;RBI=0.105704;REFB=0;REVB=-0.103645;RO=3;SAF=24;SAR=32;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0231841;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00326242;OID=.;OPOS=61719233;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:56:61:61:61:0:26:35:0:0:12:3:24:32:2:1
chr10	61840347	.	G	A	179.7	PASS	AF=0.413043;AO=19;DP=46;FAO=19;FDP=46;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=-0.0112656;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.58;QD=15.6262;RBI=0.0323557;REFB=-0.00925982;REVB=0.0303311;RO=27;SAF=8;SAR=11;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137074;STB=0.578864;STBP=0.404;TYPE=snp;VARB=0.0149199;OID=.;OPOS=61840347;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:27:27:19:19:0.413043:11:8:15:12:11:8:15:12
chr10	61841573	.	CTTTT	CTTT,CTTTC	1019.99	PASS	AF=0.963415,0.0365854;AO=66,6;DP=82;FAO=79,3;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=29,0;FSAR=50,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.12898,0.00445272;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=17.3901,8.1899;QD=49.7555;RBI=0.178203,0.0682254;REFB=0,0;REVB=-0.122966,-0.0680799;RO=1;SAF=20,2;SAR=46,4;SRF=0;SRR=1;SSEN=0.422397,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0101625,0.0962265;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.00936482,-0.00817882;OID=.,.;OPOS=61841574,61841577;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=CTTT,CTTTC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.963415,0.0365854:66,6:82:79,3:82:0:29,0:50,3:0:0:8:1:20,2:46,4:0:1
chr10	61965625	.	A	G	339.17	PASS	AF=0.473684;AO=36;DP=76;FAO=36;FDP=76;FR=.;FRO=40;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=15;FSRR=25;FWDB=0.00311058;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.382;QD=17.8511;RBI=0.0335985;REFB=-0.00920713;REVB=-0.0334542;RO=40;SAF=13;SAR=23;SRF=15;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0140971;STB=0.507882;STBP=0.898;TYPE=snp;VARB=0.0103484;OID=.;OPOS=61965625;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:40:40:36:36:0.473684:23:13:15:25:23:13:15:25
chr10	63170292	.	A	G	300.25	PASS	AF=0.452055;AO=33;DP=73;FAO=33;FDP=73;FR=.;FRO=40;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=27;FWDB=-0.0395686;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.686;QD=16.4519;RBI=0.0426555;REFB=-0.0280098;REVB=-0.0159319;RO=39;SAF=16;SAR=17;SRF=13;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147472;STB=0.588086;STBP=0.218;TYPE=snp;VARB=0.036342;OID=.;OPOS=63170292;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:39:40:33:33:0.452055:17:16:13:26:17:16:13:27
chr10	63422754	.	G	GGGCCGACCCCGGCA,GGGGCCGACCCCGGCA	1215.05	PASS	AF=0,0.716418;AO=31,63;DP=147;FAO=0,96;FDP=134;FR=.;FRO=38;FSAF=0,42;FSAR=0,54;FSRF=29;FSRR=9;FWDB=-0.0164332,0.0120589;FXX=0.0884294;HRUN=5,5;LEN=14,15;MLLD=269.379,278.617;QD=36.27;RBI=0.0166313,0.0131226;REFB=-0.038625,-0.0353512;REVB=0.00255882,0.00517549;RO=43;SAF=26,14;SAR=5,49;SRF=33;SRR=10;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.121058,-0.431417;STB=0.5,0.591648;STBP=1,0.002;TYPE=ins,ins;VARB=0,0.0109676;OID=.,.;OPOS=63422755,63422755;OREF=-,-;OALT=GGCCGACCCCGGCA,GGGCCGACCCCGGCA;OMAPALT=GGGCCGACCCCGGCA,GGGGCCGACCCCGGCA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,0.716418:31,63:147:0,96:134:38:0,42:0,54:29:9:99:43:26,14:5,49:33:10
chr10	63520698	.	T	C	1365.64	PASS	AF=0.978261;AO=88;DP=92;FAO=90;FDP=92;FR=.;FRO=2;FSAF=45;FSAR=45;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0102999;FXX=0.0107515;HRUN=4;LEN=1;MLLD=151.1;QD=59.3758;RBI=0.012081;REFB=-0.146153;REVB=0.00631354;RO=0;SAF=45;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.39218e-08;STB=0.510867;STBP=0.199;TYPE=snp;VARB=0.000226501;OID=.;OPOS=63520698;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:92:92:0:2:88:90:0.978261:43:45:0:0:45:45:2:0
chr10	63958112	.	T	C	851.24	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0363809;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.975;QD=57.7109;RBI=0.0405102;REFB=0;REVB=0.0178187;RO=0;SAF=25;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.03209e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000222932;OID=.;OPOS=63958112;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:34:25:0:0:34:25:0:0
chr10	63995983	.	C	T	1339.75	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000468114;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.61;QD=62.3137;RBI=0.0465897;REFB=0;REVB=-0.0465873;RO=0;SAF=45;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000100722;OID=.;OPOS=63995983;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:41:45:0:0:41:45:0:0
chr10	64000878	.	T	G	306.65	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0152039;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.231;QD=53.33;RBI=0.0643474;REFB=0;REVB=0.0625254;RO=0;SAF=11;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000267604;OID=.;OPOS=64000878;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:23:0:0:22:23:1:11:11:0:0:12:11:0:0
chr10	64110037	.	C	T	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0165357;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.1268;QD=46.8477;RBI=0.108973;REFB=0;REVB=-0.107711;RO=0;SAF=7;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00308312;OID=.;OPOS=64110037;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:8:7:0:0:8:7:0:0
chr10	64415184	.	A	G	513.01	PASS	AF=0.531915;AO=49;DP=94;FAO=50;FDP=94;FR=.;FRO=44;FSAF=32;FSAR=18;FSRF=27;FSRR=17;FWDB=0.00987776;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.141;QD=21.8303;RBI=0.0252932;REFB=-0.0313767;REVB=0.0232846;RO=44;SAF=32;SAR=17;SRF=27;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0368231;STB=0.513285;STBP=0.783;TYPE=snp;VARB=0.0199279;OID=.;OPOS=64415184;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:44:44:49:50:0.531915:17:32:27:17:18:32:27:17
chr10	64564892	.	G	T	36.61	PASS	AF=0.3;AO=6;DP=20;FAO=6;FDP=20;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=12;FSRR=2;FWDB=-0.00985197;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=135.904;QD=7.32136;RBI=0.0134022;REFB=-0.00116444;REVB=-0.00908611;RO=14;SAF=5;SAR=1;SRF=12;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0493816;STB=0.53115;STBP=0.916;TYPE=snp;VARB=0.00195452;OID=.;OPOS=64564892;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:20:20:14:14:6:6:0.3:1:5:12:2:1:5:12:2
chr10	64564934	.	C	G	197.79	PASS	AF=0.425926;AO=23;DP=54;FAO=23;FDP=54;FR=.;FRO=31;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=25;FSRR=6;FWDB=-0.00645644;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=248.265;QD=14.6513;RBI=0.0103522;REFB=-0.00504447;REVB=0.00809206;RO=31;SAF=16;SAR=7;SRF=25;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141263;STB=0.579734;STBP=0.395;TYPE=snp;VARB=0.00747328;OID=.;OPOS=64564934;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:31:31:23:23:0.425926:7:16:25:6:7:16:25:6
chr10	64565011	.	G	A	443.46	PASS	AF=0.466019;AO=47;DP=101;FAO=48;FDP=103;FR=.;FRO=55;FSAF=31;FSAR=17;FSRF=32;FSRR=23;FWDB=0.0136894;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.5685;QD=17.2217;RBI=0.0159297;REFB=-0.0107266;REVB=0.00814593;RO=54;SAF=31;SAR=16;SRF=32;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0696116;STB=0.536549;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.0151179;OID=.;OPOS=64565011;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:103:54:55:47:48:0.466019:16:31:32:22:17:31:32:23
chr10	64566572	.	T	C	178.73	PASS	AF=0.5625;AO=18;DP=32;FAO=18;FDP=32;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.0505693;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.57;QD=22.3411;RBI=0.0519935;REFB=-0.00136007;REVB=-0.0120858;RO=14;SAF=7;SAR=11;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0322033;STB=0.518096;STBP=0.819;TYPE=snp;VARB=0.00151545;OID=.;OPOS=64566572;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:14:14:18:18:0.5625:11:7:6:8:11:7:6:8
chr10	64567364	.	C	T	700.51	PASS	AF=0.507353;AO=69;DP=136;FAO=69;FDP=136;FR=.;FRO=67;FSAF=49;FSAR=20;FSRF=35;FSRR=32;FWDB=-0.00626778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.432;QD=20.6032;RBI=0.0201559;REFB=0.00452251;REVB=-0.0191566;RO=67;SAF=49;SAR=20;SRF=35;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18557;STB=0.602618;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=-0.00526365;OID=.;OPOS=64567364;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:136:136:67:67:69:69:0.507353:20:49:35:32:20:49:35:32
chr10	64567938	.	C	T	112.23	PASS	AF=0.481481;AO=13;DP=27;FAO=13;FDP=27;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=-0.0145938;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.338;QD=16.6272;RBI=0.0188575;REFB=-0.00107591;REVB=0.0119426;RO=14;SAF=7;SAR=6;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.288924;STB=0.664572;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=0.00148212;OID=.;OPOS=64567938;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:14:14:13:13:0.481481:6:7:3:11:6:7:3:11
chr10	64572037	.	ATT	A,AT	316.47	PASS	AF=0,1;AO=8,36;DP=54;FAO=0,54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=0,22;FSAR=0,32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0599026,-0.111867;FXX=0.0181785;HRUN=8,8;LEN=2,1;MLLD=8.62591,8.00439;QD=23.4421;RBI=0.109104,0.212008;REFB=0.0656297,0.054578;REVB=0.0911887,0.180093;RO=9;SAF=5,15;SAR=3,21;SRF=1;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.436331,0.11934;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=0.00161899,0.00796477;OID=.,.;OPOS=64572038,64572038;OREF=TT,T;OALT=-,-;OMAPALT=A,AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	2/2:0,1:8,36:54:0,54:54:0:0,22:0,32:0:0:5:9:5,15:3,21:1:8
chr10	64572093	.	T	C	273.9	PASS	AF=0.483871;AO=30;DP=62;FAO=30;FDP=62;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=-0.0289955;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.644;QD=17.6711;RBI=0.0382512;REFB=-0.0307437;REVB=0.0249482;RO=32;SAF=12;SAR=18;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150559;STB=0.584359;STBP=0.197;TYPE=snp;VARB=0.0257745;OID=.;OPOS=64572093;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:32:32:30:30:0.483871:18:12:18:14:18:12:18:14
chr10	64573771	.	C	T	414.96	PASS	AF=1;AO=29;DP=30;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0481804;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.739;QD=57.2354;RBI=0.0535547;REFB=0;REVB=-0.023383;RO=0;SAF=25;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.10829e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.33973e-05;OID=.;OPOS=64573771;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:29:0:0:29:29:1:4:25:0:0:4:25:0:0
chr10	64869942	.	A	G	276.13	PASS	AF=0.595238;AO=25;DP=42;FAO=25;FDP=42;FR=.;FRO=17;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=-0.0281782;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.9834;QD=26.298;RBI=0.045587;REFB=-0.0177949;REVB=0.0358351;RO=17;SAF=12;SAR=13;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.050068;STB=0.527703;STBP=0.691;TYPE=snp;VARB=0.0210134;OID=.;OPOS=64869942;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:17:17:25:25:0.595238:13:12:7:10:13:12:7:10
chr10	64945364	.	G	A	105.85	PASS	AF=0.6;AO=12;DP=20;FAO=12;FDP=20;FR=.;FRO=8;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.00350281;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.396;QD=21.1707;RBI=0.0114746;REFB=-0.00951915;REVB=-0.0109269;RO=8;SAF=9;SAR=3;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.204835;STB=0.617437;STBP=0.231;TYPE=snp;VARB=0.00172138;OID=.;OPOS=64945364;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:20:20:8:8:12:12:0.6:3:9:4:4:3:9:4:4
chr10	64967445	.	A	T	825.26	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0047072;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.2221;QD=56.9146;RBI=0.014821;REFB=0;REVB=0.0140536;RO=0;SAF=20;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00103539;OID=.;OPOS=64967445;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:58:0:0:57:58:1:37:20:0:0:38:20:0:0
chr10	64967950	.	ACTAAAC	A	65.67	PASS	AF=0.5;AO=7;DP=17;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=1;FWDB=-0.0327187;FXX=0;HRUN=1;LEN=6;MLLD=221.146;QD=14.5939;RBI=0.0354669;REFB=-0.0233478;REVB=-0.013689;RO=9;SAF=4;SAR=3;SRF=8;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.328854;STB=0.713877;STBP=0.135;TYPE=del;VARB=0.0271562;OID=.;OPOS=64967951;OREF=CTAAAC;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.5:7:17:9:18:9:4:5:8:1:61:9:4:3:8:1
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chr10	69571336	.	G	A	250.97	PASS	AF=0.534884;AO=23;DP=43;FAO=23;FDP=43;FR=.,HEALED;FRO=19;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=-0.0646924;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.0447;QD=23.3464;RBI=0.0647868;REFB=-0.102386;REVB=0.00349577;RO=13;SAF=13;SAR=10;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0177353;STB=0.555508;STBP=0.434;TYPE=snp;VARB=0.0417677;OID=.;OPOS=69571336;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:13:19:23:23:0.534884:10:13:7:6:10:13:13:6
chr10	69666598	.	T	C	325.34	PASS	AF=0.466667;AO=35;DP=75;FAO=35;FDP=75;FR=.;FRO=40;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=25;FWDB=0.00305055;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.2835;QD=17.3517;RBI=0.00305055;REFB=-0.0101351;REVB=2.21511e-06;RO=40;SAF=18;SAR=17;SRF=15;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132399;STB=0.57399;STBP=0.246;TYPE=snp;VARB=0.0116587;OID=.;OPOS=69666598;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:40:40:35:35:0.466667:17:18:15:25:17:18:15:25
chr10	69676830	.	T	C	235.0	PASS	AF=0.442623;AO=27;DP=61;FAO=27;FDP=61;FR=.;FRO=34;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=21;FSRR=13;FWDB=-0.000820353;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=259.415;QD=15.4097;RBI=0.0167347;REFB=-0.00328632;REVB=-0.0167146;RO=34;SAF=17;SAR=10;SRF=21;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0125937;STB=0.507128;STBP=0.94;TYPE=snp;VARB=0.0043305;OID=.;OPOS=69676830;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:34:34:27:27:0.442623:10:17:21:13:10:17:21:13
chr10	69773841	.	G	A	1465.56	PASS	AF=0.990196;AO=99;DP=102;FAO=101;FDP=102;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=56;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0592635;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=60.512;QD=57.4729;RBI=0.0635567;REFB=-0.144392;REVB=-0.0229629;RO=1;SAF=45;SAR=54;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0104245;STB=0.505493;STBP=0.273;TYPE=snp;VARB=0.00185401;OID=.;OPOS=69773841;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:102:102:1:1:99:101:0.990196:54:45:1:0:56:45:1:0
chr10	69934258	.	C	G	221.11	PASS	AF=0.740741;AO=20;DP=27;FAO=20;FDP=27;FR=.;FRO=7;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0.0125388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.394;QD=32.7572;RBI=0.0185398;REFB=-0.00300189;REVB=-0.0136566;RO=7;SAF=7;SAR=13;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194631;STB=0.605965;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.000911629;OID=.;OPOS=69934258;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:27:27:7:7:20:20:0.740741:13:7:0:7:13:7:0:7
chr10	69948844	.	T	C	1944.07	PASS	AF=0.984496;AO=127;DP=130;FAO=127;FDP=129;FR=.;FRO=2;FSAF=60;FSAR=67;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0168731;FXX=0.00769172;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.411;QD=60.2813;RBI=0.0290884;REFB=-0.0536375;REVB=-0.0236945;RO=0;SAF=60;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.500428;STBP=0.867;TYPE=snp;VARB=0.000247534;OID=.;OPOS=69948844;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:130:129:0:2:127:127:0.984496:67:60:0:0:67:60:1:1
chr10	70051810	.	A	G	609.78	PASS	AF=0.75;AO=53;DP=70;FAO=51;FDP=68;FR=.;FRO=17;FSAF=23;FSAR=28;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=-0.00572023;FXX=0.0285673;HRUN=8;LEN=1;MLLD=220.197;QD=35.8695;RBI=0.00665449;REFB=-0.00683104;REVB=0.00340018;RO=17;SAF=25;SAR=28;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000502978;STB=0.504943;STBP=0.916;TYPE=snp;VARB=0.000396812;OID=.;OPOS=70051810;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:68:17:17:53:51:0.75:28:25:8:9:28:23:8:9
chr10	70051928	.	A	G	1381.02	PASS	AF=1;AO=65;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0248333;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.295;QD=62.7735;RBI=0.030856;REFB=0;REVB=0.0183139;RO=0;SAF=32;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.92388e-05;OID=.;OPOS=70051928;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:88:88:0:0:65:88:1:33:32:0:0:55:33:0:0
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chr10	70105286	.	C	A	245.03	PASS	AF=0.444444;AO=28;DP=63;FAO=28;FDP=63;FR=.;FRO=35;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=26;FWDB=0.00460969;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.9547;QD=15.5573;RBI=0.00672722;REFB=-0.0247693;REVB=0.00489962;RO=35;SAF=16;SAR=12;SRF=9;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.302379;STB=0.669491;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.0310248;OID=.;OPOS=70105286;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:35:35:28:28:0.444444:12:16:9:26:12:16:9:26
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chr10	70221194	.	G	A	418.34	PASS	AF=0.661017;AO=39;DP=59;FAO=39;FDP=59;FR=.;FRO=20;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.00964185;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.91;QD=28.3617;RBI=0.0363464;REFB=-0.00682966;REVB=-0.0350442;RO=19;SAF=17;SAR=22;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0549082;STB=0.538913;STBP=0.407;TYPE=snp;VARB=0.00422232;OID=.;OPOS=70221194;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:19:20:39:39:0.661017:22:17:10:9:22:17:11:9
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chr10	70332580	.	A	G	185.79	PASS	AF=0.487179;AO=19;DP=39;FAO=19;FDP=39;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=0.00472535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.208;QD=19.0556;RBI=0.0113696;REFB=-0.00304863;REVB=0.0103411;RO=20;SAF=8;SAR=11;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161163;STB=0.591302;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.0134665;OID=.;OPOS=70332580;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:20:20:19:19:0.487179:11:8:12:8:11:8:12:8
chr10	70332672	.	T	A	147.24	PASS	AF=0.470588;AO=16;DP=34;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.00283921;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.823;QD=17.3226;RBI=0.00333782;REFB=0.000754765;REVB=-0.00175497;RO=18;SAF=8;SAR=8;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000565916;OID=.;OPOS=70332672;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:18:18:16:16:0.470588:8:8:9:9:8:8:9:9
chr10	70332862	.	C	T	174.12	PASS	AF=0.68;AO=17;DP=25;FAO=17;FDP=25;FR=.;FRO=8;FSAF=1;FSAR=16;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=-0.0386538;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.059;QD=27.859;RBI=0.0423933;REFB=0.00377758;REVB=-0.0174092;RO=8;SAF=1;SAR=16;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.629937;STB=0.860977;STBP=0;TYPE=snp;VARB=-0.00148192;OID=.;OPOS=70332862;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:25:25:8:8:17:17:0.68:16:1:6:2:16:1:6:2
chr10	70405539	.	A	G	67.41	PASS	AF=0.45;AO=9;DP=20;FAO=9;FDP=20;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.0138106;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.5515;QD=13.4819;RBI=0.0706965;REFB=-0.00696599;REVB=0.0693344;RO=11;SAF=4;SAR=5;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0769224;STB=0.545355;STBP=0.741;TYPE=snp;VARB=0.00630735;OID=.;OPOS=70405539;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:20:20:11:11:9:9:0.45:5:4:4:7:5:4:4:7
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chr10	70641860	.	T	C	136.7	PASS	AF=0.32;AO=16;DP=50;FAO=16;FDP=50;FR=.;FRO=34;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=0.0307672;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.2694;QD=10.9363;RBI=0.0329863;REFB=0.00085109;REVB=-0.0118944;RO=34;SAF=6;SAR=10;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177728;STB=0.605927;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=-0.000791239;OID=.;OPOS=70641860;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:34:34:16:16:0.32:10:6:18:16:10:6:18:16
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chr10	70645697	.	C	T	303.76	PASS	AF=0.65;AO=26;DP=40;FAO=26;FDP=40;FR=.;FRO=14;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.00196943;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.428;QD=30.3764;RBI=0.0318297;REFB=-0.0204961;REVB=-0.0317687;RO=13;SAF=16;SAR=10;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0486566;STB=0.5418;STBP=0.45;TYPE=snp;VARB=0.00946672;OID=.;OPOS=70645697;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:13:14:26:26:0.65:10:16:7:6:10:16:7:7
chr10	70696713	.	C	T	708.56	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00401195;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.31;QD=62.9829;RBI=0.0194415;REFB=0;REVB=0.0190231;RO=0;SAF=23;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.50441e-05;OID=.;OPOS=70696713;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:22:23:0:0:22:23:0:0
chr10	70700944	.	A	G	78.86	PASS	AF=0.454545;AO=10;DP=21;FAO=10;FDP=22;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=-0.0862248;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.3213;QD=14.339;RBI=0.110411;REFB=-0.083649;REVB=-0.0689624;RO=11;SAF=2;SAR=8;SRF=2;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0259375;STB=0.529355;STBP=0.848;TYPE=snp;VARB=0.0889956;OID=.;OPOS=70700944;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:21:22:11:12:10:10:0.454545:8:2:2:9:8:2:2:10
chr10	70748784	.	G	A	192.4	PASS	AF=0.416667;AO=20;DP=48;FAO=20;FDP=48;FR=.;FRO=28;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=0.00522244;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.96;QD=16.0331;RBI=0.0335196;REFB=0.00728897;REVB=0.0331102;RO=28;SAF=14;SAR=6;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.25078;STB=0.644587;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=-0.0062053;OID=.;OPOS=70748784;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:28:28:20:20:0.416667:6:14:13:15:6:14:13:15
chr10	70856852	.	G	A	291.69	PASS	AF=0.516667;AO=31;DP=60;FAO=31;FDP=60;FR=.;FRO=29;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.00468694;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.323;QD=19.4461;RBI=0.0049626;REFB=-0.00944577;REVB=-0.00163095;RO=29;SAF=16;SAR=15;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0289608;STB=0.516119;STBP=0.818;TYPE=snp;VARB=0.00753934;OID=.;OPOS=70856852;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:29:29:31:31:0.516667:15:16:14:15:15:16:14:15
chr10	70992635	.	G	A	300.05	PASS	AF=0.5;AO=32;DP=65;FAO=32;FDP=64;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=22;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=-0.00967325;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.714;QD=18.7532;RBI=0.0119743;REFB=-0.00524386;REVB=-0.00705784;RO=30;SAF=10;SAR=22;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11591;STB=0.585051;STBP=0.206;TYPE=snp;VARB=0.00635694;OID=.;OPOS=70992635;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:64:30:32:32:32:0.5:22:10:13:17:22:10:15:17
chr10	70992664	.	C	T	785.48	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0335608;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.2924;QD=64.1211;RBI=0.0360177;REFB=0;REVB=0.0130745;RO=0;SAF=22;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.30731e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000362716;OID=.;OPOS=70992664;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:27:22:0:0:27:22:0:0
chr10	70992884	.	G	A	33.15	PASS	AF=0.142857;AO=6;DP=42;FAO=6;FDP=42;FR=.;FRO=36;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=-0.0125141;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.8368;QD=3.15761;RBI=0.10247;REFB=0.0143542;REVB=0.101703;RO=34;SAF=3;SAR=3;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0668267;OID=.;OPOS=70992884;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:42:42:34:36:6:6:0.142857:3:3:17:17:3:3:18:18
chr10	71018660	.	T	C	651.23	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00357935;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.67;QD=62.022;RBI=0.0043943;REFB=0;REVB=0.00254914;RO=0;SAF=23;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.35886e-06;OID=.;OPOS=71018660;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:19:23:0:0:19:23:0:0
chr10	71026510	.	C	A	768.32	PASS	AF=1;AO=53;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0333866;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.2455;QD=56.9123;RBI=0.0453213;REFB=0;REVB=0.0306489;RO=0;SAF=22;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.76368e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000347676;OID=.;OPOS=71026510;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:53:54:1:31:22:0:0:31:23:0:0
chr10	71060610	.	A	G	255.91	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0222761;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.2407;QD=51.1828;RBI=0.0246924;REFB=0;REVB=0.0106531;RO=0;SAF=10;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000419407;OID=.;OPOS=71060610;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:10:10:0:0:10:10:0:0
chr10	71060634	.	G	A	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00617999;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.418;QD=46.848;RBI=0.0254951;REFB=0;REVB=0.0247348;RO=0;SAF=5;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000150069;OID=.;OPOS=71060634;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:10:5:0:0:10:5:0:0
chr10	71142420	.	G	A	273.94	PASS	AF=0.470588;AO=24;DP=68;FAO=32;FDP=68;FR=.,HEALED;FRO=36;FSAF=22;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=23;FWDB=0.0886879;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=38.4083;QD=16.1142;RBI=0.111676;REFB=-0.0143035;REVB=0.0678673;RO=36;SAF=14;SAR=10;SRF=13;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.229439;STB=0.674611;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.0333356;OID=.;OPOS=71142420;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:36:36:24:32:0.470588:10:14:13:23:10:22:13:23
chr10	71168685	.	A	T	538.55	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0192186;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.77;QD=59.8388;RBI=0.0481347;REFB=0;REVB=0.0441315;RO=0;SAF=25;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.58193e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00020236;OID=.;OPOS=71168685;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:11:25:0:0:11:25:0:0
chr10	71168727	.	C	T	1318.73	PASS	AF=0.923077;AO=91;DP=99;FAO=96;FDP=104;FR=.;FRO=8;FSAF=50;FSAR=46;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.0151239;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.1021;QD=50.7205;RBI=0.120593;REFB=-0.137187;REVB=0.119641;RO=8;SAF=49;SAR=42;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0250566;STB=0.511225;STBP=0.425;TYPE=snp;VARB=0.01178;OID=.;OPOS=71168727;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:99:104:8:8:91:96:0.923077:42:49:3:5:46:50:3:5
chr10	71332204	.	A	G	732.46	PASS	AF=0.947368;AO=54;DP=57;FAO=54;FDP=57;FR=.;FRO=3;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0036228;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=211.805;QD=51.401;RBI=0.0183324;REFB=-0.0224558;REVB=0.0179709;RO=3;SAF=28;SAR=26;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0147023;STB=0.50781;STBP=0.71;TYPE=snp;VARB=0.00034419;OID=.;OPOS=71332204;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:57:57:3:3:54:54:0.947368:26:28:2:1:26:28:2:1
chr10	71390392	.	C	T	692.98	PASS	AF=1;AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0272801;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.317;QD=62.9979;RBI=0.027529;REFB=0;REVB=-0.00369345;RO=0;SAF=31;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000117852;OID=.;OPOS=71390392;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:44:0:0:44:44:1:13:31:0:0:13:31:0:0
chr10	71392557	.	C	T	490.92	PASS	AF=0.971429;AO=34;DP=36;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0142375;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.21;QD=56.1055;RBI=0.0172073;REFB=-0.0209624;REVB=-0.00966349;RO=0;SAF=18;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.515143;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.000258621;OID=.;OPOS=71392557;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:36:35:0:1:34:34:0.971429:16:18:0:0:16:18:0:1
chr10	71392692	.	T	C	801.32	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0994491;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.36;QD=57.2374;RBI=0.107422;REFB=0;REVB=0.0406117;RO=0;SAF=21;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000207924;OID=.;OPOS=71392692;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:35:21:0:0:35:21:0:0
chr10	71562437	.	G	A	646.49	PASS	AF=0.897959;AO=44;DP=49;FAO=44;FDP=49;FR=.,HEALED;FRO=5;FSAF=29;FSAR=15;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0236014;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.702;QD=52.7746;RBI=0.0320893;REFB=-0.133557;REVB=0.0217416;RO=0;SAF=29;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506677;STBP=0.84;TYPE=snp;VARB=0.00405068;OID=.;OPOS=71562437;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:49:49:0:5:44:44:0.897959:15:29:0:0:15:29:3:2
chr10	71640255	.	G	A	144.23	PASS	AF=0.576923;AO=15;DP=29;FAO=15;FDP=26;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=10;FWDB=0.0421558;FXX=0.103413;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.9919;QD=22.1891;RBI=0.106135;REFB=-0.0658169;REVB=0.0974044;RO=10;SAF=5;SAR=10;SRF=1;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.203027;STB=0.624855;STBP=0.226;TYPE=snp;VARB=0.015086;OID=.;OPOS=71640255;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:29:26:10:11:15:15:0.576923:10:5:1:9:10:5:1:10
chr10	71657272	.	A	G	726.89	PASS	AF=0.963636;AO=53;DP=55;FAO=53;FDP=55;FR=.;FRO=2;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0147271;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=223.815;QD=52.8647;RBI=0.0204779;REFB=-0.0267161;REVB=-0.0142288;RO=2;SAF=24;SAR=29;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00325731;STB=0.501729;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=0.00107225;OID=.;OPOS=71657272;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:55:55:2:2:53:53:0.963636:29:24:1:1:29:24:1:1
chr10	71658512	.	G	A	734.74	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0114732;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.209;QD=56.5182;RBI=0.0135529;REFB=0;REVB=-0.00721443;RO=0;SAF=23;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.84538e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.22097e-05;OID=.;OPOS=71658512;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:29:23:0:0:29:23:0:0
chr10	71872404	.	G	A	1111.45	PASS	AF=1;AO=74;DP=76;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0151652;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.3388;QD=57.7375;RBI=0.0155752;REFB=-0.0811277;REVB=0.00355017;RO=0;SAF=32;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00526361;OID=.;OPOS=71872404;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:76:77:0:0:74:77:1:42:32:0:0:42:35:0:0
chr10	71872410	.	C	T	1062.44	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108129;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=254.273;QD=59.8558;RBI=0.01458;REFB=0;REVB=0.00978051;RO=0;SAF=31;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.18246e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.29591e-05;OID=.;OPOS=71872410;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:40:31:0:0:40:31:0:0
chr10	71874048	.	G	A	501.66	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00781184;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.125;QD=59.0184;RBI=0.0118981;REFB=0;REVB=-0.00897439;RO=0;SAF=21;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.946e-05;OID=.;OPOS=71874048;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:13:21:0:0:13:21:0:0
chr10	71905569	.	C	A	127.09	PASS	AF=0.722222;AO=13;DP=19;FAO=13;FDP=18;FR=.;FRO=5;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0174173;FXX=0.0526039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.527;QD=28.2424;RBI=0.0471791;REFB=-0.0140853;REVB=0.0438464;RO=6;SAF=10;SAR=3;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0525104;STB=0.599866;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=0.00572871;OID=.;OPOS=71905569;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:19:18:6:5:13:13:0.722222:3:10:5:1:3:10:5:0
chr10	71905695	.	A	G	222.5	PASS	AF=0.44898;AO=22;DP=50;FAO=22;FDP=49;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=-0.00916598;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.846;QD=18.1634;RBI=0.0503044;REFB=-0.00773298;REVB=-0.0494623;RO=27;SAF=11;SAR=11;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0538499;STB=0.530585;STBP=0.704;TYPE=snp;VARB=0.0089051;OID=.;OPOS=71905695;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:49:27:27:22:22:0.44898:11:11:15:12:11:11:15:12
chr10	71905735	.	G	A	277.94	PASS	AF=0.449275;AO=31;DP=69;FAO=31;FDP=69;FR=.;FRO=38;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=24;FSRR=14;FWDB=-0.00277508;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.568;QD=16.1122;RBI=0.00547639;REFB=-0.0241685;REVB=0.0047212;RO=37;SAF=16;SAR=15;SRF=23;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102665;STB=0.563869;STBP=0.378;TYPE=snp;VARB=0.0215936;OID=.;OPOS=71905735;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:37:38:31:31:0.449275:15:16:23:14:15:16:24:14
chr10	71993094	.	T	G	138.93	PASS	AF=0.326531;AO=16;DP=49;FAO=16;FDP=49;FR=.;FRO=33;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=0.0028612;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.175;QD=11.3409;RBI=0.00749042;REFB=-0.00944412;REVB=-0.00692242;RO=33;SAF=7;SAR=9;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0881603;STB=0.552364;STBP=0.594;TYPE=snp;VARB=0.0130673;OID=.;OPOS=71993094;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:33:33:16:16:0.326531:9:7:17:16:9:7:17:16
chr10	72014967	.	G	T	206.63	PASS	AF=0.396825;AO=25;DP=63;FAO=25;FDP=63;FR=.;FRO=38;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=23;FSRR=15;FWDB=0.00234952;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=105.277;QD=13.1195;RBI=0.0154798;REFB=-0.022091;REVB=0.0153004;RO=38;SAF=13;SAR=12;SRF=23;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0903866;STB=0.551683;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.0384559;OID=.;OPOS=72014967;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:38:38:25:25:0.396825:12:13:23:15:12:13:23:15
chr10	72043389	.	T	G	743.06	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0550874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.611;QD=56.0799;RBI=0.0551686;REFB=0;REVB=0.00299361;RO=0;SAF=8;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.72506e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000213607;OID=.;OPOS=72043389;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:53:0:0:51:53:1:43:8:0:0:44:9:0:0
chr10	72179746	.	C	T	37.15	PASS	AF=0.333333;AO=6;DP=18;FAO=6;FDP=18;FR=.;FRO=12;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=12;FWDB=0.000589214;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=223.405;QD=8.25454;RBI=0.0219516;REFB=-0.00399464;REVB=0.0219437;RO=12;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.480689;STB=0.772248;STBP=0.819;TYPE=snp;VARB=0.0113097;OID=.;OPOS=72179746;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:18:18:12:12:6:6:0.333333:5:1:0:12:5:1:0:12
chr10	72181460	.	G	T	470.36	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0541542;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.8324;QD=57.0132;RBI=0.0546549;REFB=0;REVB=-0.00738066;RO=0;SAF=15;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000567768;OID=.;OPOS=72181460;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:33:0:0:32:33:1:17:15:0:0:17:16:0:0
chr10	72195439	.	T	C	255.92	PASS	AF=1;AO=8;DP=19;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0253216;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.9891;QD=51.1831;RBI=0.112164;REFB=0;REVB=0.109268;RO=0;SAF=2;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.58669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00398482;OID=.;OPOS=72195439;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:20:0:0:8:20:1:6:2:0:0:6:14:0:0
chr10	72289701	.	G	A	435.73	PASS	AF=0.96875;AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0079168;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=189.475;QD=54.4662;RBI=0.050291;REFB=-0.107748;REVB=0.049664;RO=0;SAF=21;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.51162;STBP=0.62;TYPE=snp;VARB=0.00104648;OID=.;OPOS=72289701;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:32:32:0:1:31:31:0.96875:10:21:0:0:10:21:1:0
chr10	72307101	.	C	T	851.25	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0742455;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.792;QD=57.7117;RBI=0.07426;REFB=0;REVB=0.001469;RO=0;SAF=27;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.96591e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000282472;OID=.;OPOS=72307101;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:32:27:0:0:32:27:0:0
chr10	72324143	.	A	G	1421.74	PASS	AF=0.952381;AO=101;DP=105;FAO=100;FDP=105;FR=.;FRO=5;FSAF=52;FSAR=48;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.00854545;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.0971;QD=54.1615;RBI=0.0580405;REFB=0.0290664;REVB=-0.057408;RO=4;SAF=53;SAR=48;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00179136;STB=0.503816;STBP=0.79;TYPE=snp;VARB=-0.012565;OID=.;OPOS=72324143;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:105:105:4:5:101:100:0.952381:48:53:2:2:48:52:3:2
chr10	72358577	.	G	A	1358.19	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0300015;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.6143;QD=62.4456;RBI=0.0852007;REFB=0;REVB=0.0797438;RO=0;SAF=45;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000812028;OID=.;OPOS=72358577;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:87:0:0:86:87:1:41:45:0:0:42:45:0:0
chr10	72500763	.	T	C	153.98	PASS	AF=0.4;AO=14;DP=41;FAO=18;FDP=45;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=19;FWDB=0.0523406;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.801;QD=13.6873;RBI=0.0573232;REFB=-0.0101352;REVB=-0.0233756;RO=27;SAF=4;SAR=10;SRF=8;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0142313;STB=0.59174;STBP=0.329;TYPE=snp;VARB=0.0165677;OID=.;OPOS=72500763;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:45:27:27:14:18:0.4:10:4:8:19:10:8:8:19
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chr10	72513682	.	C	T	652.17	PASS	AF=0.507812;AO=65;DP=130;FAO=65;FDP=128;FR=.;FRO=63;FSAF=36;FSAR=29;FSRF=40;FSRR=23;FWDB=0.0846944;FXX=0.0153834;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.7383;QD=20.3803;RBI=0.0847518;REFB=-0.018714;REVB=0.00311988;RO=62;SAF=36;SAR=29;SRF=40;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0828438;STB=0.540714;STBP=0.367;TYPE=snp;VARB=0.0125046;OID=.;OPOS=72513682;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:130:128:62:63:65:65:0.507812:29:36:40:22:29:36:40:23
chr10	72517837	.	C	T	154.96	PASS	AF=0.592593;AO=16;DP=27;FAO=16;FDP=27;FR=.;FRO=11;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=-0.0149901;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=178.357;QD=22.9576;RBI=0.0312698;REFB=-0.029641;REVB=-0.0274426;RO=11;SAF=9;SAR=7;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0548302;STB=0.530768;STBP=0.717;TYPE=snp;VARB=0.0188065;OID=.;OPOS=72517837;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:27:27:11:11:16:16:0.592593:7:9:7:4:7:9:7:4
chr10	72520330	.	A	G	729.0	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0583819;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.259;QD=57.1766;RBI=0.0588127;REFB=0;REVB=0.0071057;RO=0;SAF=21;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000275221;OID=.;OPOS=72520330;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:30:21:0:0:30:21:0:0
chr10	72520567	.	A	G	110.65	PASS	AF=0.448276;AO=13;DP=29;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=3;FWDB=-0.0103446;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.512;QD=15.2624;RBI=0.0722593;REFB=-0.0125671;REVB=-0.071515;RO=16;SAF=7;SAR=6;SRF=13;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.272703;STB=0.655526;STBP=0.196;TYPE=snp;VARB=0.023769;OID=.;OPOS=72520567;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:16:16:13:13:0.448276:6:7:13:3:6:7:13:3
chr10	72532037	.	C	T	378.08	PASS	AF=0.4875;AO=39;DP=80;FAO=39;FDP=80;FR=.;FRO=41;FSAF=14;FSAR=25;FSRF=24;FSRR=17;FWDB=-0.0388253;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.575;QD=18.904;RBI=0.040102;REFB=-0.0227511;REVB=-0.0100381;RO=41;SAF=14;SAR=25;SRF=24;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.211038;STB=0.617624;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.0176987;OID=.;OPOS=72532037;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:41:41:39:39:0.4875:25:14:24:17:25:14:24:17
chr10	72533986	.	C	T	165.05	PASS	AF=0.382979;AO=18;DP=47;FAO=18;FDP=47;FR=.;FRO=29;FSAF=15;FSAR=3;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=-0.00260115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.989;QD=14.0465;RBI=0.0144068;REFB=-0.0114003;REVB=-0.01417;RO=28;SAF=15;SAR=3;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.35074;STB=0.720441;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.0202621;OID=.;OPOS=72533986;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:28:29:18:18:0.382979:3:15:16:12:3:15:16:13
chr10	72537086	.	C	T	37.43	PASS	AF=0.352941;AO=6;DP=17;FAO=6;FDP=17;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=0.0417923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.7126;QD=8.80774;RBI=0.0419647;REFB=0.0151647;REVB=0.00379972;RO=11;SAF=5;SAR=1;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.272391;STB=0.675005;STBP=0.412;TYPE=snp;VARB=-0.0265698;OID=.;OPOS=72537086;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:17:17:11:11:6:6:0.352941:1:5:7:4:1:5:7:4
chr10	72619205	.	C	T	1447.36	PASS	AF=1;AO=91;DP=91;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0170128;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.368;QD=62.9289;RBI=0.0207912;REFB=0;REVB=0.0119516;RO=0;SAF=37;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.1701e-05;OID=.;OPOS=72619205;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:91:92:0:0:91:92:1:54:37:0:0:55:37:0:0
chr10	73051388	.	T	C	530.04	PASS	AF=0.563218;AO=49;DP=90;FAO=49;FDP=87;FR=.;FRO=38;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=0.00521472;FXX=0.0333296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.264;QD=24.3694;RBI=0.0323459;REFB=-0.0348775;REVB=0.0319228;RO=35;SAF=26;SAR=23;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0532537;STB=0.509661;STBP=0.844;TYPE=snp;VARB=0.0247144;OID=.;OPOS=73051388;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:87:35:38:49:49:0.563218:23:26:21:14:23:26:21:17
chr10	73057755	.	G	C	455.93	PASS	AF=0.428571;AO=51;DP=119;FAO=51;FDP=119;FR=.;FRO=68;FSAF=18;FSAR=33;FSRF=36;FSRR=32;FWDB=-0.0117468;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.317;QD=15.3253;RBI=0.0205962;REFB=0.0062936;REVB=-0.0169179;RO=67;SAF=18;SAR=33;SRF=36;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191149;STB=0.603617;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=-0.0168092;OID=.;OPOS=73057755;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:119:67:68:51:51:0.428571:33:18:36:31:33:18:36:32
chr10	73082563	.	A	G	412.59	PASS	AF=0.434343;AO=42;DP=98;FAO=43;FDP=99;FR=.;FRO=56;FSAF=28;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=34;FWDB=0.0315142;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.6801;QD=16.6705;RBI=0.0404294;REFB=-0.0120177;REVB=-0.0253256;RO=56;SAF=27;SAR=15;SRF=21;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.270627;STB=0.646491;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.0237259;OID=.;OPOS=73082563;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:99:56:56:42:43:0.434343:15:27:21:35:15:28:22:34
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chr10	73121945	.	T	C	225.01	PASS	AF=0.488889;AO=22;DP=44;FAO=22;FDP=45;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=-0.0270506;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.407;QD=20.0006;RBI=0.0277228;REFB=-0.00877641;REVB=0.00606786;RO=21;SAF=12;SAR=10;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0602592;STB=0.512184;STBP=0.868;TYPE=snp;VARB=0.0108647;OID=.;OPOS=73121945;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:45:21:23:22:22:0.488889:10:12:10:11:10:12:12:11
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chr10	73434888	.	G	C	248.58	PASS	AF=0.589744;AO=23;DP=39;FAO=23;FDP=39;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=3;FSRR=13;FWDB=0.0649406;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.1058;QD=25.4953;RBI=0.0660999;REFB=0.0149248;REVB=0.0123256;RO=16;SAF=9;SAR=14;SRF=3;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165353;STB=0.591167;STBP=0.217;TYPE=snp;VARB=-0.00679114;OID=.;OPOS=73434888;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:16:16:23:23:0.589744:14:9:3:13:14:9:3:13
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chr10	73537614	.	G	A	135.07	PASS	AF=0.46875;AO=15;DP=32;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=-0.0232053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.0683;QD=16.8835;RBI=0.0232059;REFB=-0.0275567;REVB=0.000169857;RO=17;SAF=12;SAR=3;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.353611;STB=0.705579;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.0306136;OID=.;OPOS=73537614;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:17:17:15:15:0.46875:3:12:8:9:3:12:8:9
chr10	73550117	.	C	G	237.68	PASS	AF=0.4;AO=28;DP=68;FAO=28;FDP=70;FR=.;FRO=42;FSAF=6;FSAR=22;FSRF=26;FSRR=16;FWDB=-0.0182711;FXX=0.0140825;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.268;QD=13.5818;RBI=0.0215578;REFB=-0.0171043;REVB=0.0114414;RO=40;SAF=6;SAR=22;SRF=25;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.444261;STB=0.755174;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0161262;OID=.;OPOS=73550117;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:70:40:42:28:28:0.4:22:6:25:15:22:6:26:16
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chr10	73558886	.	G	A	239.34	PASS	AF=0.5;AO=23;DP=46;FAO=23;FDP=46;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=0.015672;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.644;QD=20.8117;RBI=0.0302468;REFB=-0.0178548;REVB=0.02587;RO=23;SAF=8;SAR=15;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122044;STB=0.568801;STBP=0.35;TYPE=snp;VARB=0.0144606;OID=.;OPOS=73558886;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:23:23:23:23:0.5:15:8:11:12:15:8:11:12
chr10	73558952	.	C	T	227.07	PASS	AF=0.402985;AO=27;DP=67;FAO=27;FDP=67;FR=.;FRO=40;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=-0.0053431;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=159.863;QD=13.5567;RBI=0.0111517;REFB=-0.0136511;REVB=0.00978838;RO=40;SAF=8;SAR=19;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.201646;STB=0.615757;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.0149512;OID=.;OPOS=73558952;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:40:40:27:27:0.402985:19:8:19:21:19:8:19:21
chr10	73562744	.	G	A	161.7	PASS	AF=0.35;AO=20;DP=60;FAO=21;FDP=60;FR=.,HEALED;FRO=39;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=0.0197012;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=63.7594;QD=10.7798;RBI=0.064665;REFB=-0.0177999;REVB=-0.0615908;RO=28;SAF=8;SAR=12;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.243301;STB=0.570663;STBP=0.454;TYPE=snp;VARB=0.0316483;OID=.;OPOS=73562744;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:28:39:20:21:0.35:12:8:18:10:13:8:19:20
chr10	73571765	.	T	C	291.96	PASS	AF=0.555556;AO=30;DP=53;FAO=30;FDP=54;FR=.;FRO=24;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=17;FWDB=-0.107271;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.7417;QD=21.6263;RBI=0.107409;REFB=-0.0172417;REVB=0.00544188;RO=23;SAF=15;SAR=15;SRF=6;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18828;STB=0.592533;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=0.0106905;OID=.;OPOS=73571765;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:54:23:24:30:30:0.555556:15:15:6:17:15:15:7:17
chr10	73574843	.	G	A	174.12	PASS	AF=0.68;AO=17;DP=25;FAO=17;FDP=25;FR=.;FRO=8;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.0216487;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.724;QD=27.8589;RBI=0.0455054;REFB=0.00292695;REVB=0.040026;RO=8;SAF=8;SAR=9;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0886834;STB=0.549238;STBP=0.536;TYPE=snp;VARB=-5.08458e-05;OID=.;OPOS=73574843;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:25:25:8:8:17:17:0.68:9:8:5:3:9:8:5:3
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chr10	75676843	.	G	T	181.99	PASS	AF=0.422222;AO=19;DP=46;FAO=19;FDP=45;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=0.00575949;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=328.321;QD=16.177;RBI=0.00754337;REFB=-0.0064349;REVB=-0.00487141;RO=27;SAF=11;SAR=8;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.210268;STB=0.632049;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=0.00890757;OID=.;OPOS=75676843;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:45:27:26:19:19:0.422222:8:11:10:17:8:11:9:17
chr10	75865065	.	G	A	196.24	PASS	AF=0.487805;AO=19;DP=40;FAO=20;FDP=41;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=-0.0117736;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.9809;QD=19.1453;RBI=0.0539299;REFB=-0.011328;REVB=-0.052629;RO=21;SAF=6;SAR=13;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.323943;STB=0.660857;STBP=0.065;TYPE=snp;VARB=0.0069867;OID=.;OPOS=75865065;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:41:21:21:19:20:0.487805:13:6:14:7:13:7:14:7
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chr10	75878915	.	C	CTA	289.16	PASS	AF=0.619048;AO=25;DP=44;FAO=26;FDP=42;FR=.;FRO=16;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=-0.00244996;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=2;MLLD=195.275;QD=27.5391;RBI=0.0152798;REFB=-0.0331897;REVB=-0.0150821;RO=19;SAF=13;SAR=12;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128834;STB=0.557577;STBP=0.347;TYPE=ins;VARB=0.021436;OID=.;OPOS=75878916;OREF=-;OALT=TA;OMAPALT=CTA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.619048:25:44:26:42:16:14:12:11:5:99:19:13:12:13:6
chr10	75883134	.	C	CTT	166.68	PASS	AF=0.486486;AO=16;DP=43;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=-0.022775;FXX=0;HRUN=0;LEN=2;MLLD=239.504;QD=18.0196;RBI=0.0230795;REFB=-0.0105792;REVB=-0.0037369;RO=26;SAF=7;SAR=9;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0665645;STB=0.511099;STBP=0.897;TYPE=ins;VARB=0.00835248;OID=.;OPOS=75883135;OREF=-;OALT=TT;OMAPALT=CTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.486486:16:43:18:37:19:7:11:7:12:99:26:7:9:13:13
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chr10	76855412	.	G	A	1116.94	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00470668;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.488;QD=60.3751;RBI=0.0273651;REFB=0;REVB=0.0269573;RO=0;SAF=36;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.79579e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.73356e-05;OID=.;OPOS=76855412;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:38:36:0:0:38:36:0:0
chr10	76861680	.	T	C	753.0	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00439314;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.3343;QD=64.085;RBI=0.00991367;REFB=0;REVB=-0.00888714;RO=0;SAF=17;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000962072;OID=.;OPOS=76861680;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:47:0:0:48:47:1:31:17:0:0:31:16:0:0
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chr10	77795862	.	A	G	345.38	PASS	AF=0.564516;AO=32;DP=60;FAO=35;FDP=62;FR=.;FRO=27;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=9;FSRR=18;FWDB=0.0296433;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.981;QD=22.2827;RBI=0.0297264;REFB=-0.00832158;REVB=0.00222097;RO=27;SAF=15;SAR=17;SRF=9;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113351;STB=0.566629;STBP=0.256;TYPE=snp;VARB=0.0130069;OID=.;OPOS=77795862;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:62:27:27:32:35:0.564516:17:15:9:18:18:17:9:18
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chr10	78629795	.	C	G	194.79	PASS	AF=0.425532;AO=20;DP=48;FAO=20;FDP=47;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=0.00761731;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.732;QD=16.5779;RBI=0.0168711;REFB=-0.0042022;REVB=0.0150536;RO=26;SAF=12;SAR=8;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137865;STB=0.589653;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=0.00526909;OID=.;OPOS=78629795;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:47:26:27:20:20:0.425532:8:12:12:14:8:12:12:15
chr10	79253623	.	G	GCC	187.39	PASS	AF=0.568182;AO=24;DP=46;FAO=25;FDP=44;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.0181555;FXX=0.0222173;HRUN=2;LEN=2;MLLD=47.1468;QD=17.0352;RBI=0.0302507;REFB=-0.00139608;REVB=0.0241968;RO=20;SAF=10;SAR=14;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0277624;STB=0.514694;STBP=0.827;TYPE=ins;VARB=0.0014224;OID=.;OPOS=79253624;OREF=-;OALT=CC;OMAPALT=GCC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.568182:24:46:25:44:19:11:14:9:10:99:20:10:14:9:11
chr10	79550544	.	C	T	66.83	PASS	AF=0.428571;AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=0.0327335;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.0986;QD=12.7291;RBI=0.0748288;REFB=-0.0332696;REVB=-0.0672894;RO=12;SAF=5;SAR=4;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110103;STB=0.565077;STBP=0.616;TYPE=snp;VARB=0.0230972;OID=.;OPOS=79550544;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:21:21:12:12:9:9:0.428571:4:5:8:4:4:5:8:4
chr10	79566632	.	G	A	96.74	PASS	AF=0.387097;AO=12;DP=31;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=16;FWDB=0.0162422;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.4875;QD=12.4823;RBI=0.0348506;REFB=-0.00281797;REVB=0.0308343;RO=19;SAF=7;SAR=5;SRF=3;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.427938;STB=0.745854;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.00419982;OID=.;OPOS=79566632;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:31:31:19:19:12:12:0.387097:5:7:3:16:5:7:3:16
chr10	79579222	.	G	A	200.86	PASS	AF=0.512821;AO=20;DP=39;FAO=20;FDP=39;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.0118301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.408;QD=20.6011;RBI=0.0145655;REFB=-0.00304405;REVB=0.00849716;RO=18;SAF=9;SAR=11;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0888256;STB=0.537238;STBP=0.667;TYPE=snp;VARB=0.00386019;OID=.;OPOS=79579222;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:18:19:20:20:0.512821:11:9:10:8:11:9:10:9
chr10	79584178	.	G	C	239.66	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0713512;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.092;QD=50.4554;RBI=0.0814033;REFB=0;REVB=0.0391857;RO=0;SAF=6;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00113705;OID=.;OPOS=79584178;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:19:0:0:18:19:1:12:6:0:0:12:7:0:0
chr10	79606441	.	A	C	200.94	PASS	AF=0.433962;AO=23;DP=53;FAO=23;FDP=53;FR=.;FRO=30;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=-0.01601;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=163.574;QD=15.1656;RBI=0.0368188;REFB=-0.00328535;REVB=0.0331557;RO=30;SAF=9;SAR=14;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0769762;STB=0.54388;STBP=0.609;TYPE=snp;VARB=0.0033545;OID=.;OPOS=79606441;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:30:30:23:23:0.433962:14:9:14:16:14:9:14:16
chr10	79616605	.	T	C	1331.31	PASS	AF=1;AO=85;DP=85;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0299244;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.808;QD=61.9215;RBI=0.030082;REFB=0;REVB=0.00307489;RO=0;SAF=33;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.65426e-05;OID=.;OPOS=79616605;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:86:0:0:85:86:1:52:33:0:0:52:34:0:0
chr10	79628875	.	A	G	557.08	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00637233;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.997;QD=60.2251;RBI=0.0280251;REFB=0;REVB=0.0272911;RO=0;SAF=23;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.91909e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000150337;OID=.;OPOS=79628875;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:14:23:0:0:14:23:0:0
chr10	79750815	.	C	T	38.57	PASS	AF=0.428571;AO=6;DP=14;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0201391;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.322;QD=11.0197;RBI=0.0228158;REFB=-0.00311733;REVB=-0.0107228;RO=8;SAF=5;SAR=1;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.373885;STB=0.734403;STBP=0.195;TYPE=snp;VARB=0.0141832;OID=.;OPOS=79750815;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:14:14:8:8:6:6:0.428571:1:5:4:4:1:5:4:4
chr10	79760818	.	A	G	670.26	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0435449;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.38;QD=62.3498;RBI=0.0489909;REFB=0;REVB=0.0224489;RO=0;SAF=18;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.65211e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00038586;OID=.;OPOS=79760818;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:25:18:0:0:25:18:0:0
chr10	79762028	.	G	A	834.39	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00950274;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.014;QD=57.5441;RBI=0.0263851;REFB=0;REVB=-0.0246145;RO=0;SAF=26;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.09576e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000160587;OID=.;OPOS=79762028;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:32:26:0:0:32:26:0:0
chr10	81045207	.	T	C	231.39	PASS	AF=0.378378;AO=28;DP=74;FAO=28;FDP=74;FR=.;FRO=46;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=28;FSRR=18;FWDB=-0.0258924;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.966;QD=12.5075;RBI=0.026026;REFB=-0.0119852;REVB=0.00263284;RO=40;SAF=17;SAR=11;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0608599;STB=0.501011;STBP=0.981;TYPE=snp;VARB=0.0120564;OID=.;OPOS=81045207;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:40:46:28:28:0.378378:11:17:22:18:11:17:28:18
chr10	81045280	.	T	C	388.03	PASS	AF=0.412844;AO=45;DP=109;FAO=45;FDP=109;FR=.;FRO=64;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=31;FSRR=33;FWDB=-0.0400366;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.2104;QD=14.2395;RBI=0.0403749;REFB=-0.0126314;REVB=0.00521575;RO=64;SAF=24;SAR=21;SRF=31;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0509891;STB=0.528751;STBP=0.625;TYPE=snp;VARB=0.0133026;OID=.;OPOS=81045280;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:109:64:64:45:45:0.412844:21:24:31:33:21:24:31:33
chr10	81053475	.	G	A	104.86	PASS	AF=0.433333;AO=13;DP=31;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=4;FWDB=-0.045437;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.3698;QD=13.9807;RBI=0.0493678;REFB=-0.0321908;REVB=-0.0193044;RO=17;SAF=3;SAR=10;SRF=13;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.504272;STB=0.791647;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.0651748;OID=.;OPOS=81053475;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:30:17:17:13:13:0.433333:10:3:13:4:10:3:13:4
chr10	81056383	.	C	A	183.41	PASS	AF=0.545455;AO=17;DP=33;FAO=18;FDP=33;FR=.,HEALED;FRO=14;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.0588352;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=33.9849;QD=22.2317;RBI=0.0589785;REFB=0.00142701;REVB=0.00410879;RO=9;SAF=7;SAR=10;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0208503;STB=0.524448;STBP=0.824;TYPE=snp;VARB=-0.0121533;OID=.;OPOS=81056383;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:9:14:17:18:0.545455:10:7:4:5:10:8:7:7
chr10	81145701	.	G	C	364.31	PASS	AF=0.964286;AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0247706;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.3113;QD=52.0442;RBI=0.0729871;REFB=-0.112177;REVB=0.0686552;RO=1;SAF=17;SAR=10;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0442286;STB=0.523792;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.0153981;OID=.;OPOS=81145701;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:28:28:1:1:27:27:0.964286:10:17:0:1:10:17:0:1
chr10	81145979	.	GC	G	31.55	PASS	AF=0.296296;AO=6;DP=26;FAO=8;FDP=27;FR=.;FRO=19;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=0.00311861;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=16.3975;QD=4.6747;RBI=0.0141289;REFB=-0.0476834;REVB=0.0137804;RO=19;SAF=1;SAR=5;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.525807;STB=0.881953;STBP=0.02;TYPE=del;VARB=0.13221;OID=.;OPOS=81145980;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.296296:6:26:8:27:19:1:7:13:6:31:19:1:5:12:7
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chr10	81275625	.	TG	T,TT	173.65	PASS	AF=0.2,0.8;AO=5,11;DP=16;FAO=3,12;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=0,6;FSAR=3,6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0227386,-0.021506;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=175.357,177.312;QD=46.3066;RBI=0.026103,0.0301906;REFB=0,0;REVB=0.0128189,0.0211888;RO=0;SAF=1,5;SAR=4,6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0400408,0.00716727;OID=.,.;OPOS=81275626,81275626;OREF=G,G;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.2,0.8:5,11:16:3,12:15:0:0,6:3,6:0:0:11:0:1,5:4,6:0:0
chr10	81275976	.	G	A	447.03	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0137351;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.19;QD=57.6806;RBI=0.0166604;REFB=0;REVB=-0.00942959;RO=0;SAF=14;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.35962e-05;OID=.;OPOS=81275976;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:17:14:0:0:17:14:0:0
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chr10	81319483	.	A	G	447.03	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0405608;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.752;QD=57.6806;RBI=0.0420385;REFB=0;REVB=0.0110479;RO=0;SAF=12;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.47712e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000132192;OID=.;OPOS=81319483;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:19:12:0:0:19:12:0:0
chr10	81371698	.	C	T	197.7	PASS	AF=0.47619;AO=20;DP=42;FAO=20;FDP=42;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=0.0319167;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.223;QD=18.8282;RBI=0.033541;REFB=-0.0106996;REVB=-0.0103111;RO=22;SAF=10;SAR=10;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126165;STB=0.571359;STBP=0.398;TYPE=snp;VARB=0.00995816;OID=.;OPOS=81371698;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:22:22:20:20:0.47619:10:10:8:14:10:10:8:14
chr10	81373674	.	T	C	177.32	PASS	AF=0.37931;AO=22;DP=58;FAO=22;FDP=58;FR=.;FRO=36;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=-0.0189209;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.464;QD=12.229;RBI=0.0189219;REFB=0.00498803;REVB=-0.00018955;RO=36;SAF=14;SAR=8;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.207771;STB=0.620143;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=-0.0114577;OID=.;OPOS=81373674;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:36:36:22:22:0.37931:8:14:16:20:8:14:16:20
chr10	81701722	.	T	C	958.38	PASS	AF=1;AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0476869;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.4843;QD=58.9774;RBI=0.0478;REFB=0;REVB=0.0032865;RO=0;SAF=37;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.99207e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000158843;OID=.;OPOS=81701722;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:65:0:0:65:65:1:28:37:0:0:28:37:0:0
chr10	81706324	.	A	G	631.78	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00364335;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.8401;QD=61.6373;RBI=0.0088561;REFB=0;REVB=-0.00807196;RO=0;SAF=20;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.43389e-05;OID=.;OPOS=81706324;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:21:20:0:0:21:20:0:0
chr10	81841692	.	G	T	816.73	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0318203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.299;QD=57.3142;RBI=0.0348739;REFB=0;REVB=0.0142708;RO=0;SAF=28;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.70387e-05;OID=.;OPOS=81841692;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:56:57:0:0:56:57:1:28:28:0:0:29:28:0:0
chr10	81915136	.	T	C	490.03	PASS	AF=0.971429;AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0627589;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.2579;QD=56.0032;RBI=0.0908351;REFB=0.005803;REVB=0.0656684;RO=1;SAF=12;SAR=22;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0207798;STB=0.511105;STBP=0.545;TYPE=snp;VARB=-0.00238156;OID=.;OPOS=81915136;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:35:35:1:1:34:34:0.971429:22:12:0:1:22:12:0:1
chr10	81917708	.	A	G	304.8	PASS	AF=0.586957;AO=27;DP=46;FAO=27;FDP=46;FR=.;FRO=19;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=0.00634763;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.262;QD=26.5046;RBI=0.0295721;REFB=-0.0236452;REVB=0.0288828;RO=19;SAF=14;SAR=13;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111776;STB=0.561752;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.013899;OID=.;OPOS=81917708;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:19:19:27:27:0.586957:13:14:7:12:13:14:7:12
chr10	81926702	.	G	A	682.37	PASS	AF=0.448485;AO=74;DP=164;FAO=74;FDP=165;FR=.;FRO=91;FSAF=52;FSAR=22;FSRF=54;FSRR=37;FWDB=-0.00178362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.953;QD=16.5422;RBI=0.00703448;REFB=-0.00305682;REVB=0.00680461;RO=88;SAF=52;SAR=22;SRF=54;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0992551;STB=0.568129;STBP=0.128;TYPE=snp;VARB=0.00307275;OID=.;OPOS=81926702;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:164:165:88:91:74:74:0.448485:22:52:54:34:22:52:54:37
chr10	82012954	.	A	G	193.2	PASS	AF=0.425532;AO=18;DP=45;FAO=20;FDP=47;FR=.;FRO=27;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=0.0107383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.098;QD=16.4425;RBI=0.0157755;REFB=0.00100968;REVB=-0.0115567;RO=26;SAF=7;SAR=11;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.192366;STB=0.640116;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=-0.00104883;OID=.;OPOS=82012954;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:47:26:27:18:20:0.425532:11:7:15:11:13:7:16:11
chr10	82013134	.	C	T	757.98	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0135666;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.042;QD=57.2057;RBI=0.0644225;REFB=0;REVB=0.0629778;RO=0;SAF=26;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000115061;OID=.;OPOS=82013134;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:27:26:0:0:27:26:0:0
chr10	82013146	.	T	C	779.23	PASS	AF=1;AO=54;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0181959;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.941;QD=56.6713;RBI=0.0200881;REFB=0;REVB=-0.00851121;RO=0;SAF=28;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.52846e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.80707e-05;OID=.;OPOS=82013146;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:54:55:1:26:28:0:0:26:29:0:0
chr10	82033594	.	G	A	1062.79	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0240226;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.037;QD=59.8757;RBI=0.0281766;REFB=0;REVB=0.0147253;RO=0;SAF=36;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000119169;OID=.;OPOS=82033594;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:71:0:0:70:71:1:34:36:0:0:34:37:0:0
chr10	82034842	.	A	G	1140.34	PASS	AF=0.987013;AO=73;DP=74;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0626056;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.7573;QD=59.2383;RBI=0.0792283;REFB=-0.0308656;REVB=0.0485558;RO=1;SAF=40;SAR=33;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0116794;STB=0.505746;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.00153647;OID=.;OPOS=82034842;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:74:77:1:1:73:76:0.987013:33:40:1:0:33:43:1:0
chr10	82034854	.	T	C	1153.59	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00743393;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.056;QD=60.7155;RBI=0.0168321;REFB=0;REVB=0.0151016;RO=0;SAF=40;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60877e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.5239e-05;OID=.;OPOS=82034854;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:36:40:0:0:36:40:0:0
chr10	82040052	.	A	G	669.75	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0495077;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.187;QD=62.3019;RBI=0.0497254;REFB=0;REVB=-0.00464715;RO=0;SAF=14;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000465893;OID=.;OPOS=82040052;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:43:0:0:42:43:1:28:14:0:0:28:15:0:0
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chr10	84602973	.	A	G	403.18	PASS	AF=0.644068;AO=38;DP=60;FAO=38;FDP=59;FR=.;FRO=21;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=0.0372919;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.8273;QD=27.3339;RBI=0.0389615;REFB=-0.0346358;REVB=-0.0112831;RO=21;SAF=23;SAR=15;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0229554;STB=0.512528;STBP=0.808;TYPE=snp;VARB=0.0227551;OID=.;OPOS=84602973;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:59:21:21:38:38:0.644068:15:23:12:9:15:23:12:9
chr10	84745256	.	C	T	593.92	PASS	AF=0.97561;AO=39;DP=40;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0629569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.144;QD=57.9435;RBI=0.0644634;REFB=-0.120451;REVB=0.013855;RO=1;SAF=19;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0228628;STB=0.511622;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.00647586;OID=.;OPOS=84745256;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:40:41:1:1:39:40:0.97561:20:19:0:1:21:19:0:1
chr10	85763132	.	T	C	507.67	PASS	AF=0.482143;AO=53;DP=112;FAO=54;FDP=112;FR=.;FRO=58;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=28;FSRR=30;FWDB=-0.026852;FXX=0.00884877;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.2213;QD=18.131;RBI=0.0716269;REFB=-0.0195131;REVB=-0.0664032;RO=58;SAF=24;SAR=29;SRF=27;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0120296;STB=0.519993;STBP=0.701;TYPE=snp;VARB=0.0137313;OID=.;OPOS=85763132;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:112:58:58:53:54:0.482143:29:24:27:31:30:24:28:30
chr10	85993836	.	A	G	487.3	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00170641;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=305.559;QD=59.0666;RBI=0.00309014;REFB=0;REVB=0.00257626;RO=0;SAF=13;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.82173e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000214295;OID=.;OPOS=85993836;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:20:13:0:0:20:13:0:0
chr10	86274871	.	C	T	503.95	PASS	AF=0.469565;AO=54;DP=115;FAO=54;FDP=115;FR=.;FRO=61;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=32;FSRR=29;FWDB=-0.00747243;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.973;QD=17.5285;RBI=0.00758276;REFB=-0.00271792;REVB=0.00128882;RO=61;SAF=25;SAR=29;SRF=32;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.058835;STB=0.532698;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.00282475;OID=.;OPOS=86274871;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:115:61:61:54:54:0.469565:29:25:32:29:29:25:32:29
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chr10	88422151	.	C	A	610.4	PASS	AF=0.435374;AO=64;DP=147;FAO=64;FDP=147;FR=.;FRO=83;FSAF=31;FSAR=33;FSRF=32;FSRR=51;FWDB=0.0535919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.293;QD=16.6095;RBI=0.0536134;REFB=0.00772883;REVB=0.00151749;RO=83;SAF=31;SAR=33;SRF=32;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100519;STB=0.556037;STBP=0.265;TYPE=snp;VARB=-0.0103959;OID=.;OPOS=88422151;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:147:147:83:83:64:64:0.435374:33:31:32:51:33:31:32:51
chr10	88439193	.	G	A	289.55	PASS	AF=0.568627;AO=28;DP=50;FAO=29;FDP=51;FR=.;FRO=22;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=-0.00966182;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.118;QD=22.7097;RBI=0.0141516;REFB=-0.0115395;REVB=0.01034;RO=22;SAF=11;SAR=17;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158312;STB=0.592528;STBP=0.137;TYPE=snp;VARB=0.00595607;OID=.;OPOS=88439193;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:51:22:22:28:29:0.568627:17:11:13:9:18:11:13:9
chr10	88505700	.	T	G	717.8	PASS	AF=1;AO=45;DP=52;FAO=50;FDP=50;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00506335;FXX=0.0384541;HRUN=1;LEN=1;MLLD=297.936;QD=57.4244;RBI=0.0152533;REFB=0;REVB=0.0143884;RO=0;SAF=25;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.09779e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00030843;OID=.;OPOS=88505700;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:50:0:0:45:50:1:20:25:0:0:23:27:0:0
chr10	88635779	.	C	A	594.53	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.014957;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.8184;QD=60.9773;RBI=0.057873;REFB=0;REVB=-0.0559069;RO=0;SAF=23;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.43889e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00109499;OID=.;OPOS=88635779;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:16:23:0:0:16:23:0:0
chr10	88683890	.	T	A	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00135954;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=157.579;QD=56.1911;RBI=0.00929864;REFB=0;REVB=0.00919871;RO=0;SAF=14;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.59476e-05;OID=.;OPOS=88683890;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:14:14:0:0:14:14:0:0
chr10	88702350	.	G	C	207.07	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0925966;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.676;QD=48.7228;RBI=0.118609;REFB=0;REVB=0.0741211;RO=0;SAF=9;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00705399;OID=.;OPOS=88702350;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:8:9:0:0:8:9:0:0
chr10	88717140	.	T	A	1280.6	PASS	AF=1;AO=82;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0148582;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.073;QD=61.7158;RBI=0.0202112;REFB=0;REVB=0.0137014;RO=0;SAF=50;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.18819e-06;OID=.;OPOS=88717140;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:83:0:0:82:83:1:32:50:0:0:33:50:0:0
chr10	88717154	.	C	T	1191.72	PASS	AF=0.942529;AO=81;DP=89;FAO=82;FDP=87;FR=.;FRO=5;FSAF=49;FSAR=33;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0206255;FXX=0.0224694;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.927;QD=54.7919;RBI=0.0385991;REFB=-0.0714869;REVB=0.0326263;RO=4;SAF=49;SAR=32;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0327877;STB=0.511746;STBP=0.374;TYPE=snp;VARB=0.0016961;OID=.;OPOS=88717154;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:16:89:87:4:5:81:82:0.942529:32:49:1:3:33:49:2:3
chr10	88730106	.	C	T	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0562893;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.399;QD=42.1818;RBI=0.0765907;REFB=0;REVB=0.051939;RO=0;SAF=3;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0062898;OID=.;OPOS=88730106;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:8:3:0:0:8:3:0:0
chr10	88730177	.	A	G	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00229821;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.988;QD=42.1824;RBI=0.113322;REFB=0;REVB=0.113299;RO=0;SAF=4;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00150422;OID=.;OPOS=88730177;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:7:4:0:0:7:4:0:0
chr10	88730312	.	T	C	296.37	PASS	AF=0.958333;AO=23;DP=24;FAO=23;FDP=24;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0353936;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.386;QD=49.3945;RBI=0.0356297;REFB=-0.10968;REVB=0.00409537;RO=1;SAF=16;SAR=7;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0615783;STB=0.533304;STBP=0.256;TYPE=snp;VARB=0.00239771;OID=.;OPOS=88730312;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:24:24:1:1:23:23:0.958333:7:16:0:1:7:16:0:1
chr10	88768253	.	A	G	686.62	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0216806;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.8596;QD=62.42;RBI=0.0503662;REFB=0;REVB=0.045461;RO=0;SAF=22;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.002575;OID=.;OPOS=88768253;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:44:0:0:43:44:1:21:22:0:0:22:22:0:0
chr10	88768657	.	C	T	727.7	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0611461;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.2884;QD=63.278;RBI=0.0622594;REFB=0;REVB=-0.0117209;RO=0;SAF=15;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000525397;OID=.;OPOS=88768657;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:31:15:0:0:31:15:0:0
chr10	88782084	.	A	G	435.8	PASS	AF=0.96875;AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0738591;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.5525;QD=54.4745;RBI=0.0834545;REFB=-0.0201376;REVB=-0.0388522;RO=1;SAF=14;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0266551;STB=0.514277;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=-0.000196537;OID=.;OPOS=88782084;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:32:32:1:1:31:31:0.96875:17:14:0:1:17:14:0:1
chr10	88782151	.	C	T	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00185977;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.434;QD=42.1824;RBI=0.0142256;REFB=0;REVB=0.0141035;RO=0;SAF=6;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000381881;OID=.;OPOS=88782151;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:5:6:0:0:5:6:0:0
chr10	88820789	.	T	C	651.21	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0380651;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.722;QD=62.0202;RBI=0.0437835;REFB=0;REVB=0.0216344;RO=0;SAF=18;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000105755;OID=.;OPOS=88820789;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:24:18:0:0:24:18:0:0
chr10	88988115	.	G	A	141.96	PASS	AF=0.390244;AO=16;DP=41;FAO=16;FDP=41;FR=.;FRO=25;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=4;FSRR=21;FWDB=-0.00752809;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.993;QD=13.8497;RBI=0.00781989;REFB=-0.0110721;REVB=-0.00211628;RO=24;SAF=3;SAR=13;SRF=4;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.036342;STB=0.528463;STBP=0.869;TYPE=snp;VARB=0.0166264;OID=.;OPOS=88988115;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:24:25:16:16:0.390244:13:3:4:20:13:3:4:21
chr10	89267957	.	C	T	1514.84	PASS	AF=0.989691;AO=96;DP=97;FAO=96;FDP=97;FR=.;FRO=1;FSAF=55;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00797744;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=293.817;QD=62.4675;RBI=0.00801066;REFB=-0.0570318;REVB=0.000728833;RO=1;SAF=55;SAR=41;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0114259;STB=0.506023;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=6.72077e-06;OID=.;OPOS=89267957;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:97:97:1:1:96:96:0.989691:41:55:0:1:41:55:0:1
chr10	89720907	.	T	G	822.03	PASS	AF=0.515528;AO=82;DP=160;FAO=83;FDP=161;FR=.;FRO=78;FSAF=36;FSAR=47;FSRF=29;FSRR=49;FWDB=0.0512861;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.3542;QD=20.4231;RBI=0.0532978;REFB=0.027826;REVB=0.0145048;RO=78;SAF=35;SAR=47;SRF=29;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0503627;STB=0.530787;STBP=0.447;TYPE=snp;VARB=-0.0246681;OID=.;OPOS=89720907;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:160:161:78:78:82:83:0.515528:47:35:29:49:47:36:29:49
chr10	90305177	.	C	T	30.1	PASS	AF=0.416667;AO=5;DP=12;FAO=5;FDP=12;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.000277866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.509;QD=10.0339;RBI=0.0337989;REFB=0.00455061;REVB=0.0337978;RO=7;SAF=3;SAR=2;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115149;STB=0.571156;STBP=0.764;TYPE=snp;VARB=-0.000541823;OID=.;OPOS=90305177;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:12:12:7:7:5:5:0.416667:2:3:5:2:2:3:5:2
chr10	90342837	.	C	G	767.72	PASS	AF=0.509804;AO=78;DP=153;FAO=78;FDP=153;FR=.;FRO=75;FSAF=40;FSAR=38;FSRF=34;FSRR=41;FWDB=0.0567604;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.1898;QD=20.071;RBI=0.0661761;REFB=-0.00738458;REVB=0.0340225;RO=75;SAF=40;SAR=38;SRF=34;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0530013;STB=0.529129;STBP=0.495;TYPE=snp;VARB=0.00648938;OID=.;OPOS=90342837;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:153:153:75:75:78:78:0.509804:38:40:34:41:38:40:34:41
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chr10	90356598	.	A	G	1297.96	PASS	AF=1;AO=83;DP=86;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000635504;FXX=0.0232531;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.2309;QD=61.8077;RBI=0.0284569;REFB=0;REVB=-0.0284499;RO=0;SAF=28;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00020151;OID=.;OPOS=90356598;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:84:0:0:83:84:1:55:28:0:0:55:29:0:0
chr10	90425327	.	T	C	1320.87	PASS	AF=1;AO=66;DP=89;FAO=87;FDP=87;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=52;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00931105;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.3019;QD=60.7297;RBI=0.0350197;REFB=0;REVB=0.0337592;RO=0;SAF=52;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.71841e-05;OID=.;OPOS=90425327;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:89:87:0:0:66:87:1:14:52:0:0:35:52:0:0
chr10	90429652	.	A	G	209.3	PASS	AF=0.361111;AO=26;DP=72;FAO=26;FDP=72;FR=.;FRO=46;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=23;FSRR=23;FWDB=0.00330984;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=164.237;QD=11.6279;RBI=0.00522794;REFB=0.00112085;REVB=-0.00404677;RO=45;SAF=8;SAR=18;SRF=23;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.233591;STB=0.629693;STBP=0.115;TYPE=snp;VARB=-0.00249108;OID=.;OPOS=90429652;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:45:46:26:26:0.361111:18:8:23:22:18:8:23:23
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chr10	90490921	.	G	A	162.2	PASS	AF=0.37037;AO=20;DP=54;FAO=20;FDP=54;FR=.;FRO=34;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=-0.011852;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=215.988;QD=12.0148;RBI=0.0127256;REFB=0.00584812;REVB=0.00463357;RO=34;SAF=5;SAR=15;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.266183;STB=0.656083;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=-0.00729962;OID=.;OPOS=90490921;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:34:34:20:20:0.37037:15:5:16:18:15:5:16:18
chr10	90503075	.	T	C	431.71	PASS	AF=0.56;AO=42;DP=75;FAO=42;FDP=75;FR=.;FRO=33;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=22;FWDB=0.0239446;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.406;QD=23.0247;RBI=0.0244263;REFB=0.00326491;REVB=0.00482708;RO=33;SAF=25;SAR=17;SRF=11;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.208041;STB=0.614313;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=-0.00312714;OID=.;OPOS=90503075;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:33:33:42:42:0.56:17:25:11:22:17:25:11:22
chr10	90512306	.	G	C	222.19	PASS	AF=0.419355;AO=26;DP=61;FAO=26;FDP=62;FR=.;FRO=36;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=-0.0212235;FXX=0.0158705;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.4867;QD=14.3347;RBI=0.0328055;REFB=-0.0134255;REVB=0.0250153;RO=35;SAF=15;SAR=11;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121109;STB=0.56105;STBP=0.428;TYPE=snp;VARB=0.0245698;OID=.;OPOS=90512306;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:62:35:36:26:26:0.419355:11:15:16:19:11:15:17:19
chr10	90524237	.	T	C	102.68	PASS	AF=0.295455;AO=13;DP=44;FAO=13;FDP=44;FR=.;FRO=31;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=-0.0104732;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.998;QD=9.33495;RBI=0.0234134;REFB=-0.00422239;REVB=0.0209403;RO=31;SAF=3;SAR=10;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.215577;STB=0.63269;STBP=0.288;TYPE=snp;VARB=0.0119079;OID=.;OPOS=90524237;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:31:31:13:13:0.295455:10:3:12:19:10:3:12:19
chr10	90530660	.	C	A	426.53	PASS	AF=0.483146;AO=43;DP=89;FAO=43;FDP=89;FR=.;FRO=46;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=19;FSRR=27;FWDB=-0.0327026;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.4273;QD=19.17;RBI=0.0341598;REFB=0.00579851;REVB=0.009871;RO=46;SAF=20;SAR=23;SRF=19;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0488206;STB=0.527136;STBP=0.628;TYPE=snp;VARB=-0.00890192;OID=.;OPOS=90530660;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:46:46:43:43:0.483146:23:20:19:27:23:20:19:27
chr10	90537942	.	C	T	443.71	PASS	AF=0.466019;AO=48;DP=102;FAO=48;FDP=103;FR=.;FRO=55;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=31;FSRR=24;FWDB=-0.0220526;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.3974;QD=17.2313;RBI=0.0237145;REFB=0.0147862;REVB=-0.00872114;RO=54;SAF=26;SAR=22;SRF=31;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0311339;STB=0.511832;STBP=0.836;TYPE=snp;VARB=-0.0173952;OID=.;OPOS=90537942;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:103:54:55:48:48:0.466019:22:26:31:23:22:26:31:24
chr10	90749256	.	G	A	793.4	PASS	AF=1;AO=55;DP=58;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0120555;FXX=0.0517152;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.769;QD=57.7021;RBI=0.0340031;REFB=0;REVB=0.0317943;RO=0;SAF=25;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.09692e-05;OID=.;OPOS=90749256;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:58:55:0:0:55:55:1:30:25:0:0:30:25:0:0
chr10	90771829	.	T	C	400.21	PASS	AF=0.966667;AO=29;DP=30;FAO=29;FDP=30;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00144238;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.8346;QD=53.3611;RBI=0.0602427;REFB=0.0259632;REVB=-0.0602254;RO=1;SAF=11;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0404624;STB=0.521724;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=-0.00271168;OID=.;OPOS=90771829;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:30:30:1:1:29:29:0.966667:18:11:1:0:18:11:1:0
chr10	90966546	.	C	T	85.27	PASS	AF=0.366667;AO=11;DP=30;FAO=11;FDP=30;FR=.;FRO=19;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=0.0313131;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.697;QD=11.3692;RBI=0.0322542;REFB=-0.0290766;REVB=-0.00773448;RO=19;SAF=1;SAR=10;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.659571;STB=0.896675;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0249984;OID=.;OPOS=90966546;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:30:30:19:19:11:11:0.366667:10:1:13:6:10:1:13:6
chr10	90966996	.	C	G	86.86	PASS	AF=0.407407;AO=11;DP=27;FAO=11;FDP=27;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=13;FWDB=0.000439319;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.4313;QD=12.8688;RBI=0.0172126;REFB=-0.00357955;REVB=-0.017207;RO=16;SAF=4;SAR=7;SRF=3;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.207001;STB=0.619962;STBP=0.375;TYPE=snp;VARB=0.00705587;OID=.;OPOS=90966996;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:27:27:16:16:11:11:0.407407:7:4:3:13:7:4:3:13
chr10	91066460	.	T	A	729.01	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00850049;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=246.393;QD=57.1773;RBI=0.0123556;REFB=0;REVB=0.00896672;RO=0;SAF=18;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=8.62909e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.75208e-07;OID=.;OPOS=91066460;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:33:18:0:0:33:18:0:0
chr10	91066769	.	C	A	692.97	PASS	AF=1;AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0136685;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.134;QD=62.9969;RBI=0.0194658;REFB=0;REVB=-0.0138596;RO=0;SAF=15;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.646e-05;OID=.;OPOS=91066769;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:44:0:0:44:44:1:29:15:0:0:29:15:0:0
chr10	91067595	.	C	G	1499.01	PASS	AF=1;AO=90;DP=90;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0297716;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.786;QD=63.1162;RBI=0.0348232;REFB=0;REVB=-0.018064;RO=0;SAF=47;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.16558e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.71556e-06;OID=.;OPOS=91067595;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:90:95:0:0:90:95:1:43:47:0:0:43:52:0:0
chr10	91099943	.	C	G	753.6	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000122919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.573;QD=56.8757;RBI=0.0390913;REFB=0;REVB=0.0390911;RO=0;SAF=34;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.19096e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000147739;OID=.;OPOS=91099943;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:53:0:0:52:53:1:18:34:0:0:19:34:0:0
chr10	91100068	.	C	A	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0285929;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.667;QD=50.4135;RBI=0.0310776;REFB=0;REVB=0.0121764;RO=0;SAF=5;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000166749;OID=.;OPOS=91100068;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:14:5:0:0:14:5:0:0
chr10	91143529	.	T	A	1062.43	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000454594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.502;QD=59.8553;RBI=0.0114921;REFB=0;REVB=0.0114831;RO=0;SAF=28;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.30751e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.68124e-05;OID=.;OPOS=91143529;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:43:28:0:0:43:28:0:0
chr10	91162497	.	A	G	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00387111;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=274.802;QD=52.6132;RBI=0.00461478;REFB=0;REVB=0.00251211;RO=0;SAF=11;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.48842e-06;OID=.;OPOS=91162497;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:11:11:0:0:11:11:0:0
chr10	91162677	.	C	T	109.43	PASS	AF=0.371429;AO=12;DP=36;FAO=13;FDP=35;FR=.;FRO=22;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=6;FWDB=-0.0276326;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.236;QD=12.5059;RBI=0.0278683;REFB=-0.0141011;REVB=-0.00361705;RO=21;SAF=3;SAR=9;SRF=15;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.478794;STB=0.749643;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.0428897;OID=.;OPOS=91162677;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:35:21:22:12:13:0.371429:9:3:15:6:9:4:16:6
chr10	91172556	.	AG	A	87.23	PASS	AF=0.458333;AO=8;DP=21;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=0.0312187;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.884;QD=14.538;RBI=0.0312611;REFB=-0.0117379;REVB=0.00162718;RO=13;SAF=4;SAR=4;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198042;STB=0.626645;STBP=0.289;TYPE=del;VARB=0.0173884;OID=.;OPOS=91172557;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.458333:8:21:11:24:13:5:6:9:4:87:13:4:4:9:4
chr10	91178000	.	C	T	340.74	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00344704;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.681;QD=54.5177;RBI=0.00516322;REFB=0;REVB=0.00384406;RO=0;SAF=13;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.82384e-05;OID=.;OPOS=91178000;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:12:13:0:0:12:13:0:0
chr10	91343930	.	TTA	T,TT,TTT	90.67	PASS	AF=0.535714,0,0;AO=8,4,5;DP=33;FAO=15,0,0;FDP=28;FR=.;FRO=13;FSAF=3,0,0;FSAR=12,0,0;FSRF=1;FSRR=12;FWDB=0.128739,0.120968,-0.00348503;FXX=0;HRUN=7,7,7;LEN=2,1,1;MLLD=16.7869,9.8422,8.97596;QD=12.9534;RBI=0.184163,0.261885,0.141457;REFB=0.074079,0.100128,0.0446653;REVB=-0.13169,-0.232272,-0.141414;RO=12;SAF=1,1,0;SAR=7,3,5;SRF=3;SRR=9;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.219509,0,-0.666427;STB=0.599885,0.5,0.5;STBP=0.475,1,1;TYPE=del,del,snp;VARB=-0.0665224,-0.0171988,0;OID=.,.,.;OPOS=91343931,91343932,91343932;OREF=TA,A,A;OALT=-,-,T;OMAPALT=T,TT,TTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.535714,0,0:8,4,5:33:15,0,0:28:13:3,0,0:12,0,0:1:12:78:12:1,1,0:7,3,5:3:9
chr10	91352966	.	G	A	1751.14	PASS	AF=0.991453;AO=116;DP=117;FAO=116;FDP=117;FR=.;FRO=1;FSAF=59;FSAR=57;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0146773;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.7832;QD=59.8681;RBI=0.0220133;REFB=-0.0476092;REVB=0.0164062;RO=1;SAF=59;SAR=57;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00798151;STB=0.504201;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=0.000478252;OID=.;OPOS=91352966;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:117:117:1:1:116:116:0.991453:57:59:1:0:57:59:1:0
chr10	91404448	.	C	G	89.58	PASS	AF=0.478261;AO=10;DP=22;FAO=11;FDP=23;FR=.;FRO=12;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=-0.00887129;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.24;QD=15.5789;RBI=0.0222325;REFB=-0.0224962;REVB=-0.0203859;RO=12;SAF=8;SAR=2;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0684722;STB=0.555448;STBP=0.664;TYPE=snp;VARB=0.0315324;OID=.;OPOS=91404448;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:22:23:12:12:10:11:0.478261:2:8:9:3:2:9:9:3
chr10	91468925	.	C	G	133.45	PASS	AF=0.441176;AO=15;DP=34;FAO=15;FDP=34;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=-0.0025462;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.215;QD=15.7003;RBI=0.011021;REFB=-0.00501266;REVB=-0.0107228;RO=19;SAF=9;SAR=6;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0320951;STB=0.518494;STBP=0.881;TYPE=snp;VARB=0.0139269;OID=.;OPOS=91468925;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:19:19:15:15:0.441176:6:9:12:7:6:9:12:7
chr10	91470834	.	A	C	159.53	PASS	AF=0.472222;AO=17;DP=36;FAO=17;FDP=36;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.0743953;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.6017;QD=17.7253;RBI=0.0782943;REFB=-0.0374286;REVB=0.0243995;RO=19;SAF=8;SAR=9;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.051485;STB=0.529377;STBP=0.766;TYPE=snp;VARB=0.075734;OID=.;OPOS=91470834;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:19:19:17:17:0.472222:9:8:10:9:9:8:10:9
chr10	91484780	.	G	A	181.29	PASS	AF=0.431818;AO=19;DP=44;FAO=19;FDP=44;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=0.00675277;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.796;QD=16.4807;RBI=0.0199979;REFB=-0.0131622;REVB=-0.0188233;RO=25;SAF=12;SAR=7;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0332383;STB=0.519064;STBP=0.845;TYPE=snp;VARB=0.0160655;OID=.;OPOS=91484780;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:25:25:19:19:0.431818:7:12:15:10:7:12:15:10
chr10	91487649	.	A	T	310.91	PASS	AF=0.447368;AO=34;DP=76;FAO=34;FDP=76;FR=.;FRO=42;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=24;FSRR=18;FWDB=0.00398088;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.9939;QD=16.3635;RBI=0.0041473;REFB=-0.0205277;REVB=-0.00116307;RO=42;SAF=21;SAR=13;SRF=24;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0473985;STB=0.526683;STBP=0.691;TYPE=snp;VARB=0.024102;OID=.;OPOS=91487649;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:42:42:34:34:0.447368:13:21:24:18:13:21:24:18
chr10	91488979	.	A	T	365.31	PASS	AF=0.46988;AO=38;DP=83;FAO=39;FDP=83;FR=.;FRO=44;FSAF=12;FSAR=27;FSRF=34;FSRR=10;FWDB=-0.00976527;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.606;QD=17.605;RBI=0.0102893;REFB=-0.00606668;REVB=-0.00324172;RO=44;SAF=11;SAR=27;SRF=34;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.447348;STB=0.73654;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0109015;OID=.;OPOS=91488979;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:44:44:38:39:0.46988:27:11:34:10:27:12:34:10
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chr10	91498127	.	T	C	575.8	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0460074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.229;QD=60.61;RBI=0.0465682;REFB=0;REVB=-0.0072053;RO=0;SAF=20;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.51048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000252185;OID=.;OPOS=91498127;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:18:20:0:0:18:20:0:0
chr10	91498254	.	A	G	197.64	PASS	AF=0.47619;AO=20;DP=42;FAO=20;FDP=42;FR=.;FRO=22;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=0.0128617;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=127.427;QD=18.8227;RBI=0.0134943;REFB=-0.00426031;REVB=0.00408325;RO=22;SAF=13;SAR=7;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.225245;STB=0.62789;STBP=0.134;TYPE=snp;VARB=0.00712471;OID=.;OPOS=91498254;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:22:22:20:20:0.47619:7:13:9:13:7:13:9:13
chr10	91498318	.	A	G	72.93	PASS	AF=0.642857;AO=9;DP=14;FAO=9;FDP=14;FR=.;FRO=5;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=-0.0622146;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=153.012;QD=20.8377;RBI=0.0651228;REFB=-0.0132848;REVB=-0.0192437;RO=5;SAF=6;SAR=3;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.397983;STB=0.726799;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.0128658;OID=.;OPOS=91498318;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:14:14:5:5:9:9:0.642857:3:6:0:5:3:6:0:5
chr10	91503660	.	A	G	166.99	PASS	AF=0.444444;AO=16;DP=36;FAO=16;FDP=36;FR=.,HEALED;FRO=18;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.0149619;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=115.236;QD=18.5541;RBI=0.0168279;REFB=-0.00623615;REVB=-0.00770195;RO=18;SAF=10;SAR=6;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169121;STB=0.596892;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.00925668;OID=.;OPOS=91503660;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:18:18:16:16:0.444444:6:10:8:10:6:10:8:10
chr10	91738556	.	C	A	1427.58	PASS	AF=0.978723;AO=91;DP=93;FAO=92;FDP=94;FR=.;FRO=2;FSAF=40;FSAR=52;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0177364;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.2912;QD=60.748;RBI=0.0233822;REFB=-0.000739645;REVB=-0.0152364;RO=2;SAF=40;SAR=51;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00249885;STB=0.501411;STBP=0.86;TYPE=snp;VARB=0.000320078;OID=.;OPOS=91738556;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:93:94:2:2:91:92:0.978723:51:40:1:1:52:40:1:1
chr10	91923501	.	G	A	1253.62	PASS	AF=0.987952;AO=83;DP=84;FAO=82;FDP=83;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00833083;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.949;QD=60.4152;RBI=0.00925473;REFB=-0.032557;REVB=-0.0040308;RO=0;SAF=30;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504761;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=-0.00011818;OID=.;OPOS=91923501;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:84:83:0:1:83:82:0.987952:53:30:0:0:52:30:0:1
chr10	93667635	.	C	T	716.5	PASS	AF=0.981481;AO=52;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0249962;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=212.526;QD=53.0741;RBI=0.0277175;REFB=-0.0981055;REVB=0.0119771;RO=1;SAF=23;SAR=29;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0159663;STB=0.510634;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=0.000748887;OID=.;OPOS=93667635;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:54:54:1:1:52:53:0.981481:29:23:0:1:30:23:1:0
chr10	93810972	.	TGA	ATG,TG	43.13	PASS	AF=0,0.666667;AO=3,3;DP=14;FAO=0,10;FDP=15;FR=.;FRO=5;FSAF=0,5;FSAR=0,5;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.151386,0.201946;FXX=0;HRUN=1,7;LEN=3,1;MLLD=18.6916,9.74821;QD=11.5021;RBI=0.156033,0.216328;REFB=-0.0275195,-0.0171542;REVB=0.0377969,0.0775596;RO=6;SAF=0,3;SAR=3,0;SRF=3;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.672276,0.672276;STB=0.5,0.533267;STBP=1,0.771;TYPE=mnp,del;VARB=0,0.0388445;OID=.,.;OPOS=93810972,93810974;OREF=TGA,A;OALT=ATG,-;OMAPALT=ATG,TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:22:14:15:6:5:3,3:0,10:0,0.666667:3,0:0,3:3:3:0,5:0,5:2:3
chr10	93841227	.	A	G	614.84	PASS	AF=0.954545;AO=40;DP=42;FAO=42;FDP=44;FR=.;FRO=2;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0809699;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.604;QD=55.8942;RBI=0.0813781;REFB=-0.0281789;REVB=0.0081405;RO=2;SAF=22;SAR=18;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00450343;STB=0.50331;STBP=0.85;TYPE=snp;VARB=0.00335105;OID=.;OPOS=93841227;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:42:44:2:2:40:42:0.954545:18:22:1:1:18:24:1:1
chr10	93999850	.	A	G	241.04	PASS	AF=1;AO=11;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0207902;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.806;QD=50.7453;RBI=0.138483;REFB=0;REVB=0.136913;RO=0;SAF=6;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00112621;OID=.;OPOS=93999850;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:11:19:1:5:6:0:0:10:9:0:0
chr10	94449932	.	C	T	38.15	PASS	AF=0.4;AO=6;DP=15;FAO=6;FDP=15;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.00392165;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=253;QD=10.1734;RBI=0.00603276;REFB=0.0126144;REVB=-0.0045842;RO=9;SAF=2;SAR=4;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0125067;OID=.;OPOS=94449932;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:15:15:9:9:6:6:0.4:4:2:3:6:4:2:3:6
chr10	94695617	.	C	T	613.34	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0205906;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.573;QD=61.3335;RBI=0.0205965;REFB=0;REVB=-0.000494653;RO=0;SAF=11;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.97233e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000115656;OID=.;OPOS=94695617;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:29:11:0:0:29:11:0:0
chr10	95072906	.	T	C	1121.5	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00839473;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.464;QD=60.6214;RBI=0.00840928;REFB=0;REVB=0.000494509;RO=0;SAF=31;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000311072;OID=.;OPOS=95072906;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:43:31:0:0:43:31:0:0
chr10	95168634	.	A	G	324.76	PASS	AF=0.404494;AO=36;DP=89;FAO=36;FDP=89;FR=.;FRO=53;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=29;FSRR=24;FWDB=-0.0101636;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.4259;QD=14.5961;RBI=0.0165058;REFB=-0.00823493;REVB=-0.0130054;RO=53;SAF=15;SAR=21;SRF=29;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137187;STB=0.577818;STBP=0.221;TYPE=snp;VARB=0.0225336;OID=.;OPOS=95168634;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:53:53:36:36:0.404494:21:15:29:24:21:15:29:24
chr10	95237963	.	A	G	2017.73	PASS	AF=0.977778;AO=133;DP=135;FAO=132;FDP=135;FR=.;FRO=3;FSAF=50;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.00847773;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.0127;QD=59.7846;RBI=0.0381747;REFB=0.054536;REVB=-0.0372214;RO=2;SAF=50;SAR=83;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0113151;STB=0.508981;STBP=0.226;TYPE=snp;VARB=-0.00632747;OID=.;OPOS=95237963;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:135:135:2:3:133:132:0.977778:83:50:0:2:82:50:0:3
chr10	95262981	.	A	G	198.56	PASS	AF=0.944444;AO=17;DP=18;FAO=17;FDP=18;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0668326;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.4027;QD=44.1251;RBI=0.0691028;REFB=-0.105093;REVB=0.0175671;RO=1;SAF=5;SAR=12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0830155;STB=0.545399;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=0.0106081;OID=.;OPOS=95262981;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:18:18:1:1:17:17:0.944444:12:5:1:0:12:5:1:0
chr10	95276742	.	G	C	961.07	PASS	AF=0.605442;AO=81;DP=141;FAO=89;FDP=147;FR=.;FRO=58;FSAF=47;FSAR=42;FSRF=37;FSRR=21;FWDB=0.0030627;FXX=0.0199987;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.298;QD=26.1516;RBI=0.0337703;REFB=0.00421776;REVB=0.0336311;RO=59;SAF=41;SAR=40;SRF=37;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0938617;STB=0.54368;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=-0.00291224;OID=.;OPOS=95276742;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:141:147:59:58:81:89:0.605442:40:41:37:22:42:47:37:21
chr10	95279506	.	A	T	868.24	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0112157;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.137;QD=57.8828;RBI=0.0177539;REFB=0;REVB=0.0137627;RO=0;SAF=21;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.58785e-06;OID=.;OPOS=95279506;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:39:21:0:0:39:21:0:0
chr10	95279653	.	A	G	411.12	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186655;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.974;QD=56.7062;RBI=0.0254377;REFB=0;REVB=0.0172823;RO=0;SAF=15;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000356658;OID=.;OPOS=95279653;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:14:15:0:0:14:15:0:0
chr10	95326676	.	C	T	99.22	PASS	AF=0.444444;AO=12;DP=27;FAO=12;FDP=27;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=3;FWDB=0.0032116;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.668;QD=14.7;RBI=0.00906803;REFB=-0.025431;REVB=0.00848026;RO=15;SAF=4;SAR=8;SRF=12;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.424038;STB=0.743816;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.0525704;OID=.;OPOS=95326676;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:15:15:12:12:0.444444:8:4:12:3:8:4:12:3
chr10	95381773	.	T	A	228.91	PASS	AF=0.45614;AO=26;DP=57;FAO=26;FDP=57;FR=.;FRO=31;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=6.63646e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.556;QD=16.0641;RBI=0.0134501;REFB=0.000671669;REVB=-0.0134499;RO=31;SAF=14;SAR=12;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00961627;STB=0.505431;STBP=0.963;TYPE=snp;VARB=-0.00073966;OID=.;OPOS=95381773;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:31:31:26:26:0.45614:12:14:17:14:12:14:17:14
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chr10	95389083	.	A	G	212.64	PASS	AF=0.423729;AO=24;DP=58;FAO=25;FDP=59;FR=.;FRO=34;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=0.0115149;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.779;QD=14.4165;RBI=0.0232173;REFB=-0.00608833;REVB=-0.0201606;RO=32;SAF=14;SAR=10;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115551;STB=0.591763;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=0.00893659;OID=.;OPOS=95389083;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:59:32:34:24:25:0.423729:10:14:15:17:10:15:15:19
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chr10	95660785	.	G	A	385.36	PASS	AF=0.575758;AO=38;DP=66;FAO=38;FDP=66;FR=.;FRO=28;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=0.0016632;FXX=0.0149231;HRUN=4;LEN=1;MLLD=320.543;QD=23.3554;RBI=0.00311888;REFB=-0.010919;REVB=-0.0026384;RO=28;SAF=21;SAR=17;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122883;STB=0.567532;STBP=0.227;TYPE=snp;VARB=0.00661524;OID=.;OPOS=95660785;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:28:28:38:38:0.575758:17:21:11:17:17:21:11:17
chr10	95791613	.	T	C	411.02	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00221279;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.717;QD=56.6922;RBI=0.00578372;REFB=0;REVB=0.00534368;RO=0;SAF=14;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.18079e-05;OID=.;OPOS=95791613;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:15:14:0:0:15:14:0:0
chr10	95791763	.	G	A	658.07	PASS	AF=0.957447;AO=42;DP=44;FAO=45;FDP=47;FR=.;FRO=2;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.017729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.002;QD=56.0058;RBI=0.0210709;REFB=-0.0263953;REVB=0.0113871;RO=2;SAF=22;SAR=20;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0446492;STB=0.520824;STBP=0.227;TYPE=snp;VARB=0.00203961;OID=.;OPOS=95791763;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:44:47:2:2:42:45:0.957447:20:22:0:2:23:22:0:2
chr10	96039597	.	G	C	644.26	PASS	AF=1;AO=37;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00817566;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.294;QD=61.3578;RBI=0.178041;REFB=0;REVB=0.177853;RO=0;SAF=19;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.68991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000569652;OID=.;OPOS=96039597;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:37:42:1:18:19:0:0:23:19:0:0
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chr10	96066341	.	A	G	277.42	PASS	AF=0.5;AO=30;DP=60;FAO=30;FDP=60;FR=.;FRO=30;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=0.0294595;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.016;QD=18.4947;RBI=0.0321764;REFB=0.00786534;REVB=0.0129406;RO=30;SAF=16;SAR=14;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148394;STB=0.582727;STBP=0.217;TYPE=snp;VARB=-0.0106145;OID=.;OPOS=96066341;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:30:30:30:30:0.5:14:16:11:19:14:16:11:19
chr10	96106240	.	G	C	95.79	PASS	AF=0.354839;AO=8;DP=30;FAO=11;FDP=31;FR=.,HEALED;FRO=17;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=4;FWDB=-0.0243249;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.173;QD=12.3604;RBI=0.0279984;REFB=-0.00118368;REVB=0.0138639;RO=13;SAF=6;SAR=2;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0266423;STB=0.637358;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=0.0201606;OID=.;OPOS=96106240;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:30:31:13:17:8:11:0.354839:2:6:10:3:5:6:13:4
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chr10	96827178	.	T	C	271.37	PASS	AF=0.520833;AO=25;DP=49;FAO=25;FDP=48;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=0.0125906;FXX=0.020404;HRUN=2;LEN=1;MLLD=231.895;QD=22.6142;RBI=0.0230001;REFB=-0.0177583;REVB=0.0192478;RO=23;SAF=10;SAR=15;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0470952;STB=0.526295;STBP=0.738;TYPE=snp;VARB=0.0178141;OID=.;OPOS=96827178;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:48:23:23:25:25:0.520833:15:10:8:15:15:10:8:15
chr10	97106165	.	T	C	770.62	PASS	AF=0.982143;AO=55;DP=56;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00918556;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=125.122;QD=55.0446;RBI=0.0112274;REFB=0.0130295;REVB=0.00645592;RO=0;SAF=31;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5102;STBP=0.331;TYPE=snp;VARB=-0.00137949;OID=.;OPOS=97106165;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:56:56:0:1:55:55:0.982143:24:31:0:0:24:31:0:1
chr10	97116219	.	C	T	428.74	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0150587;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.062;QD=57.1649;RBI=0.0154765;REFB=0;REVB=-0.00357208;RO=0;SAF=16;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.56309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000110809;OID=.;OPOS=97116219;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:14:16:0:0:14:16:0:0
chr10	97127462	.	C	A	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0694135;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.165;QD=55.6561;RBI=0.07314;REFB=0;REVB=-0.0230484;RO=0;SAF=6;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000200358;OID=.;OPOS=97127462;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:21:6:0:0:21:6:0:0
chr10	97141523	.	G	A	787.53	PASS	AF=1;AO=55;DP=56;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0135501;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.554;QD=57.275;RBI=0.01644;REFB=0;REVB=0.00930955;RO=0;SAF=24;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000101615;OID=.;OPOS=97141523;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:55:0:0:55:55:1:31:24:0:0:31:24:0:0
chr10	97192324	.	A	G	1480.1	PASS	AF=0.990099;AO=100;DP=101;FAO=100;FDP=101;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0151323;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.4234;QD=58.6179;RBI=0.0211326;REFB=-0.0511463;REVB=-0.0147512;RO=1;SAF=38;SAR=62;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00759066;STB=0.503999;STBP=0.481;TYPE=snp;VARB=0.000694983;OID=.;OPOS=97192324;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:101:101:1:1:100:100:0.990099:62:38:0:1:62:38:0:1
chr10	97447373	.	A	T	1886.86	PASS	AF=0.991935;AO=123;DP=126;FAO=123;FDP=124;FR=.;FRO=1;FSAF=58;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00299732;FXX=0.0158718;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.72;QD=60.8666;RBI=0.0463515;REFB=-0.0693125;REVB=0.0462545;RO=0;SAF=58;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.503816;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=4.61959e-05;OID=.;OPOS=97447373;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:126:124:0:1:123:123:0.991935:65:58:0:0:65:58:0:1
chr10	97628617	.	C	A	30.85	PASS	AF=0.12069;AO=6;DP=58;FAO=7;FDP=58;FR=.;FRO=51;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=28;FSRR=23;FWDB=0.0303987;FXX=0.0169463;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.128;QD=2.12744;RBI=0.0304431;REFB=-0.00730303;REVB=-0.00164285;RO=50;SAF=1;SAR=5;SRF=28;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.444332;STB=0.856124;STBP=0.065;TYPE=snp;VARB=0.15067;OID=.;OPOS=97628617;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:58:58:50:51:6:7:0.12069:5:1:28:22:6:1:28:23
chr10	97698370	.	C	T	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0352213;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.481;QD=59.4356;RBI=0.0405562;REFB=0;REVB=0.0201063;RO=0;SAF=20;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000173124;OID=.;OPOS=97698370;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:15:20:0:0:15:20:0:0
chr10	97784683	.	C	T	517.93	PASS	AF=0.410072;AO=57;DP=139;FAO=57;FDP=139;FR=.;FRO=82;FSAF=33;FSAR=24;FSRF=42;FSRR=40;FWDB=0.0338849;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=281.156;QD=14.9043;RBI=0.033901;REFB=-0.00142419;REVB=0.00104315;RO=82;SAF=33;SAR=24;SRF=42;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0708334;STB=0.539863;STBP=0.424;TYPE=snp;VARB=0.00264473;OID=.;OPOS=97784683;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:139:139:82:82:57:57:0.410072:24:33:42:40:24:33:42:40
chr10	97817650	.	G	T	227.02	PASS	AF=0.402985;AO=27;DP=67;FAO=27;FDP=67;FR=.;FRO=40;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=-0.00759015;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.736;QD=13.5536;RBI=0.0158333;REFB=-0.0170766;REVB=-0.0138955;RO=40;SAF=11;SAR=16;SRF=18;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0456055;STB=0.526058;STBP=0.734;TYPE=snp;VARB=0.0225639;OID=.;OPOS=97817650;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:40:40:27:27:0.402985:16:11:18:22:16:11:18:22
chr10	97818692	.	T	C	79.27	PASS	AF=0.5;AO=10;DP=20;FAO=10;FDP=20;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.00608324;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=119.493;QD=15.8549;RBI=0.00694573;REFB=-0.00219939;REVB=-0.00335222;RO=9;SAF=4;SAR=6;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0373874;STB=0.550917;STBP=0.602;TYPE=snp;VARB=0.00252006;OID=.;OPOS=97818692;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:20:20:9:10:10:10:0.5:6:4:4:5:6:4:5:5
chr10	97920062	.	G	A	172.13	PASS	AF=0.473684;AO=18;DP=38;FAO=18;FDP=38;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=-0.000836399;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=359.562;QD=18.1185;RBI=0.00358319;REFB=-0.00421186;REVB=0.00348421;RO=20;SAF=10;SAR=8;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142977;STB=0.581306;STBP=0.357;TYPE=snp;VARB=0.00468033;OID=.;OPOS=97920062;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:20:20:18:18:0.473684:8:10:8:12:8:10:8:12
chr10	97920099	.	T	TC	465.51	PASS	AF=1;AO=39;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.01838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=26.0982;QD=44.3345;RBI=0.118961;REFB=0;REVB=0.117532;RO=3;SAF=17;SAR=22;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0597422;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00327769;OID=.;OPOS=97920100;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:39:42:42:42:0:17:25:0:0:9:3:17:22:0:3
chr10	97959237	.	C	A	564.7	PASS	AF=0.508772;AO=58;DP=114;FAO=58;FDP=114;FR=.;FRO=56;FSAF=43;FSAR=15;FSRF=35;FSRR=21;FWDB=-0.00501481;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=269.65;QD=19.8141;RBI=0.00702656;REFB=0.00636589;REVB=-0.00492181;RO=56;SAF=43;SAR=15;SRF=35;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125442;STB=0.569511;STBP=0.197;TYPE=snp;VARB=-0.00513623;OID=.;OPOS=97959237;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:114:114:56:56:58:58:0.508772:15:43:35:21:15:43:35:21
chr10	97990583	.	A	G	168.45	PASS	AF=0.381818;AO=17;DP=51;FAO=21;FDP=55;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=-0.00750177;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.481;QD=12.2511;RBI=0.0322841;REFB=-0.0378213;REVB=0.0314004;RO=31;SAF=11;SAR=6;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148913;STB=0.503469;STBP=0.967;TYPE=snp;VARB=0.0491069;OID=.;OPOS=97990583;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:55:31:34:17:21:0.381818:6:11:16:15:10:11:18:16
chr10	98078127	.	C	T	1305.14	PASS	AF=1;AO=81;DP=87;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0179569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.343;QD=58.658;RBI=0.0250118;REFB=-0.0511539;REVB=0.017411;RO=6;SAF=38;SAR=43;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0616229;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000859532;OID=.;OPOS=98078127;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:87:89:6:0:81:89:1:43:38:0:6:51:38:0:0
chr10	98078239	.	A	G	754.41	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00508988;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.7377;QD=56.9362;RBI=0.0214124;REFB=0;REVB=0.0207987;RO=0;SAF=16;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.33586e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00019054;OID=.;OPOS=98078239;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:37:16:0:0:37:16:0:0
chr10	98287261	.	G	C	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00656558;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=262.943;QD=51.9167;RBI=0.00886353;REFB=0;REVB=-0.00595443;RO=0;SAF=9;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.9507e-05;OID=.;OPOS=98287261;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:12:9:0:0:12:9:0:0
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chr10	98386558	.	G	A	955.17	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.027182;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.3191;QD=58.7799;RBI=0.061253;REFB=0;REVB=-0.0548914;RO=0;SAF=38;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.04073e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000827154;OID=.;OPOS=98386558;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:27:38:0:0:27:38:0:0
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chr10	98808866	.	C	G	727.31	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.018937;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.112;QD=55.9471;RBI=0.0198514;REFB=0;REVB=-0.0059554;RO=0;SAF=25;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.1134e-05;OID=.;OPOS=98808866;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:52:0:0:47:52:1:22:25:0:0:24:28:0:0
chr10	98819317	.	A	G	708.56	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0579737;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.673;QD=62.9827;RBI=0.0580157;REFB=0;REVB=0.00220656;RO=0;SAF=16;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.49331e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.25122e-05;OID=.;OPOS=98819317;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:29:16:0:0:29:16:0:0
chr10	98901433	.	C	T	2200.67	PASS	AF=0.967742;AO=149;DP=156;FAO=150;FDP=155;FR=.;FRO=5;FSAF=76;FSAR=74;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=-0.00398884;FXX=0.012738;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.1213;QD=56.7914;RBI=0.00490269;REFB=-0.0964363;REVB=-0.00285053;RO=5;SAF=75;SAR=74;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0187151;STB=0.50989;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.00155147;OID=.;OPOS=98901433;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:156:155:5:5:149:150:0.967742:74:75:1:4:74:76:1:4
chr10	98901438	.	T	C	234.26	PASS	AF=0.216561;AO=21;DP=160;FAO=34;FDP=157;FR=.,HEALED;FRO=122;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=68;FSRR=54;FWDB=-0.0155808;FXX=0.0187488;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.008;QD=5.96843;RBI=0.0194992;REFB=-0.0122508;REVB=0.0117241;RO=113;SAF=11;SAR=10;SRF=59;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00214382;STB=0.65859;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.0311935;OID=.;OPOS=98901438;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:160:157:113:122:21:34:0.216561:10:11:59:54:22:12:68:54
chr10	98901463	.	T	C	138.11	PASS	AF=0.158192;AO=28;DP=178;FAO=28;FDP=177;FR=.;FRO=149;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=80;FSRR=69;FWDB=-0.00349051;FXX=0.00561766;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.8128;QD=3.12111;RBI=0.00840779;REFB=-0.0235346;REVB=-0.007649;RO=148;SAF=12;SAR=16;SRF=79;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134109;STB=0.590626;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=0.0522303;OID=.;OPOS=98901463;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:178:177:148:149:28:28:0.158192:16:12:79:69:16:12:80:69
chr10	98901465	.	T	C	31.17	PASS	AF=0.0677966;AO=12;DP=177;FAO=12;FDP=177;FR=.;FRO=165;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=87;FSRR=78;FWDB=0.00421017;FXX=0.00561766;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.392;QD=0.704457;RBI=0.0214857;REFB=-0.000241409;REVB=-0.0210692;RO=165;SAF=5;SAR=7;SRF=87;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118238;STB=0.602263;STBP=0.49;TYPE=snp;VARB=0.00525125;OID=.;OPOS=98901465;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:31:177:177:165:165:12:12:0.0677966:7:5:87:78:7:5:87:78
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chr10	98901477	.	T	C	40.63	PASS	AF=0.0773481;AO=14;DP=181;FAO=14;FDP=181;FR=.;FRO=167;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=83;FSRR=84;FWDB=-0.00352677;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.0176;QD=0.897869;RBI=0.0541658;REFB=-0.00720603;REVB=-0.0540509;RO=165;SAF=6;SAR=8;SRF=81;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.070285;STB=0.563201;STBP=0.629;TYPE=snp;VARB=0.0488381;OID=.;OPOS=98901477;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:40:181:181:165:167:14:14:0.0773481:8:6:81:84:8:6:83:84
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chr10	99422648	.	A	G	187.08	PASS	AF=0.513514;AO=18;DP=37;FAO=19;FDP=37;FR=.;FRO=18;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.0392054;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.3127;QD=20.2252;RBI=0.0487767;REFB=-0.0401607;REVB=0.029019;RO=18;SAF=11;SAR=7;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148563;STB=0.592924;STBP=0.273;TYPE=snp;VARB=0.0382512;OID=.;OPOS=99422648;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:18:18:18:19:0.513514:7:11:8:10:7:12:8:10
chr10	99439454	.	G	T	405.61	PASS	AF=0.446809;AO=42;DP=94;FAO=42;FDP=94;FR=.;FRO=52;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=23;FSRR=29;FWDB=-0.0363904;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=210.723;QD=17.2602;RBI=0.0396474;REFB=-0.0202559;REVB=-0.015737;RO=50;SAF=17;SAR=25;SRF=23;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0549831;STB=0.521366;STBP=0.713;TYPE=snp;VARB=0.0291307;OID=.;OPOS=99439454;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:50:52:42:42:0.446809:25:17:23:27:25:17:23:29
chr10	99439541	.	G	C	325.75	PASS	AF=0.603774;AO=32;DP=53;FAO=32;FDP=53;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=-0.0466515;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.0486;QD=24.5849;RBI=0.0492449;REFB=-0.00502775;REVB=0.0157701;RO=21;SAF=11;SAR=21;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0660562;STB=0.536375;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.00261816;OID=.;OPOS=99439541;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:21:21:32:32:0.603774:21:11:9:12:21:11:9:12
chr10	99473729	.	C	G	154.96	PASS	AF=0.592593;AO=16;DP=27;FAO=16;FDP=27;FR=.;FRO=11;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=2;FWDB=0.00695693;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=290.543;QD=22.9576;RBI=0.0214874;REFB=-0.00560668;REVB=0.02033;RO=11;SAF=8;SAR=8;SRF=9;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.232167;STB=0.629478;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=0.00348857;OID=.;OPOS=99473729;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:27:27:11:11:16:16:0.592593:8:8:9:2:8:8:9:2
chr10	99498234	.	G	A	133.48	PASS	AF=0.441176;AO=15;DP=34;FAO=15;FDP=34;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=0.0302978;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.9683;QD=15.703;RBI=0.057159;REFB=-0.00775267;REVB=-0.0484685;RO=18;SAF=10;SAR=5;SRF=13;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0607709;STB=0.511096;STBP=0.951;TYPE=snp;VARB=0.00866327;OID=.;OPOS=99498234;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:18:19:15:15:0.441176:5:10:13:5:5:10:13:6
chr10	99504630	.	G	T	172.19	PASS	AF=0.653846;AO=17;DP=26;FAO=17;FDP=26;FR=.;FRO=9;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.0302381;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.9849;QD=26.4906;RBI=0.0328474;REFB=0.01228;REVB=0.01283;RO=9;SAF=9;SAR=8;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0163095;STB=0.50908;STBP=0.927;TYPE=snp;VARB=-0.00641609;OID=.;OPOS=99504630;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:26:26:9:9:17:17:0.653846:8:9:5:4:8:9:5:4
chr10	99664456	.	T	C	202.02	PASS	AF=0.526316;AO=20;DP=38;FAO=20;FDP=38;FR=.;FRO=18;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.00575137;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=222.292;QD=21.2649;RBI=0.0232389;REFB=-0.0160277;REVB=-0.022516;RO=18;SAF=14;SAR=6;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.228507;STB=0.629079;STBP=0.111;TYPE=snp;VARB=0.0181764;OID=.;OPOS=99664456;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:18:18:20:20:0.526316:6:14:8:10:6:14:8:10
chr10	99969568	.	A	G	224.91	PASS	AF=0.488889;AO=22;DP=45;FAO=22;FDP=45;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=0.00806728;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.898;QD=19.9919;RBI=0.0107099;REFB=-0.0146998;REVB=-0.00704422;RO=23;SAF=11;SAR=11;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0985473;STB=0.555506;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=0.0160535;OID=.;OPOS=99969568;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:23:23:22:22:0.488889:11:11:14:9:11:11:14:9
chr10	99991408	.	A	G	1135.2	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0397307;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.441;QD=60.5441;RBI=0.0400434;REFB=0;REVB=0.00499448;RO=0;SAF=37;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.94235e-05;OID=.;OPOS=99991408;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:38:37:0:0:38:37:0:0
chr10	100017453	.	T	G	272.54	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00409193;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.487;QD=51.9124;RBI=0.0291609;REFB=0;REVB=-0.0288724;RO=0;SAF=10;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000450976;OID=.;OPOS=100017453;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:11:10:0:0:11:10:0:0
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chr10	100167396	.	G	A	271.37	PASS	AF=0.543478;AO=25;DP=46;FAO=25;FDP=46;FR=.;FRO=21;FSAF=18;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.00217846;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.959;QD=23.5977;RBI=0.021975;REFB=-0.0307114;REVB=-0.0218668;RO=21;SAF=18;SAR=7;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180429;STB=0.601094;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=0.0167906;OID=.;OPOS=100167396;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:21:21:25:25:0.543478:7:18:11:10:7:18:11:10
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chr10	101473218	.	A	G	151.28	PASS	AF=0.933333;AO=14;DP=15;FAO=14;FDP=15;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0118489;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=37.5193;QD=40.34;RBI=0.0476023;REFB=-0.159332;REVB=-0.046104;RO=0;SAF=5;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.526279;STBP=0.631;TYPE=snp;VARB=0.0151971;OID=.;OPOS=101473218;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:15:15:0:1:14:14:0.933333:9:5:0:0:9:5:0:1
chr10	101544447	.	A	T	970.91	PASS	AF=1;AO=65;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0308887;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.767;QD=58.8433;RBI=0.0316073;REFB=0;REVB=0.0067015;RO=0;SAF=36;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.31339e-05;OID=.;OPOS=101544447;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:65:66:1:29:36:0:0:30:36:0:0
chr10	101604207	.	C	T	183.07	PASS	AF=0.4;AO=22;DP=55;FAO=22;FDP=55;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=0.0368814;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.945;QD=13.3139;RBI=0.0372306;REFB=-0.0147905;REVB=-0.00508731;RO=33;SAF=11;SAR=11;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110906;STB=0.563579;STBP=0.433;TYPE=snp;VARB=0.0154895;OID=.;OPOS=101604207;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:33:33:22:22:0.4:11:11:20:13:11:11:20:13
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chr10	101639877	.	A	C	213.59	PASS	AF=0.366197;AO=26;DP=72;FAO=26;FDP=71;FR=.;FRO=45;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=25;FWDB=-0.00332151;FXX=0.0273935;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.56;QD=12.0335;RBI=0.00957552;REFB=0.00185527;REVB=0.00898099;RO=46;SAF=15;SAR=11;SRF=20;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156433;STB=0.583719;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=-0.00291164;OID=.;OPOS=101639877;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:71:46:45:26:26:0.366197:11:15:20:26:11:15:20:25
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chr10	101646265	.	C	T	300.53	PASS	AF=0.452055;AO=33;DP=73;FAO=33;FDP=73;FR=.;FRO=40;FSAF=11;FSAR=22;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=-0.0422014;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=181.097;QD=16.4672;RBI=0.04324;REFB=-0.00326052;REVB=0.00942018;RO=39;SAF=11;SAR=22;SRF=18;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131759;STB=0.582473;STBP=0.233;TYPE=snp;VARB=0.0026068;OID=.;OPOS=101646265;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:39:40:33:33:0.452055:22:11:18:21:22:11:19:21
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chr10	101977883	.	C	T	689.21	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00833029;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.6175;QD=62.6557;RBI=0.00887212;REFB=0;REVB=0.00305302;RO=0;SAF=21;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.76389e-05;OID=.;OPOS=101977883;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:23:21:0:0:23:21:0:0
chr10	102006681	.	C	T	785.14	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0094054;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.35;QD=57.1011;RBI=0.0353764;REFB=0;REVB=-0.0341032;RO=0;SAF=22;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.35686e-05;OID=.;OPOS=102006681;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:33:22:0:0:33:22:0:0
chr10	102116311	.	A	C	219.84	PASS	AF=0.364865;AO=27;DP=74;FAO=27;FDP=74;FR=.;FRO=47;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=29;FWDB=0.00183848;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.477;QD=11.8834;RBI=0.0245839;REFB=-0.00230156;REVB=-0.0245151;RO=47;SAF=17;SAR=10;SRF=18;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.268244;STB=0.654379;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.00391661;OID=.;OPOS=102116311;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:47:47:27:27:0.364865:10:17:18:29:10:17:18:29
chr10	102222957	.	G	C	249.2	PASS	AF=0.414286;AO=29;DP=70;FAO=29;FDP=70;FR=.;FRO=41;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=-0.0272143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.8057;QD=14.2398;RBI=0.0401432;REFB=-0.0180878;REVB=-0.0295103;RO=41;SAF=16;SAR=13;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0660041;STB=0.537523;STBP=0.612;TYPE=snp;VARB=0.0230207;OID=.;OPOS=102222957;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:41:41:29:29:0.414286:13:16:20:21:13:16:20:21
chr10	102247408	.	C	A	461.93	PASS	AF=0.523256;AO=45;DP=86;FAO=45;FDP=86;FR=.;FRO=41;FSAF=27;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=0.00994258;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=263.534;QD=21.4852;RBI=0.0328267;REFB=-0.0205253;REVB=-0.0312848;RO=41;SAF=27;SAR=18;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.098565;STB=0.554478;STBP=0.325;TYPE=snp;VARB=0.0155238;OID=.;OPOS=102247408;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:41:41:45:45:0.523256:18:27:20:21:18:27:20:21
chr10	102247526	.	G	C	406.87	PASS	AF=0.441176;AO=45;DP=102;FAO=45;FDP=102;FR=.;FRO=57;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=34;FSRR=23;FWDB=-0.0370529;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=248.719;QD=15.9557;RBI=0.037191;REFB=-0.0167807;REVB=0.00320147;RO=56;SAF=26;SAR=19;SRF=33;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0117024;STB=0.510748;STBP=0.866;TYPE=snp;VARB=0.0203583;OID=.;OPOS=102247526;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:56:57:45:45:0.441176:19:26:33:23:19:26:34:23
chr10	102265183	.	G	A	68.82	PASS	AF=0.5;AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=8;FWDB=0.0419496;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.589;QD=15.293;RBI=0.0420151;REFB=-0.038701;REVB=0.00234527;RO=8;SAF=3;SAR=6;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.207482;STB=0.636106;STBP=0.407;TYPE=snp;VARB=0.0355837;OID=.;OPOS=102265183;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:18:18:8:9:9:9:0.5:6:3:1:7:6:3:1:8
chr10	102265815	.	A	G	48.85	PASS	AF=0.5;AO=7;DP=14;FAO=7;FDP=14;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.00516981;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.2166;QD=13.9574;RBI=0.0365235;REFB=-0.0151613;REVB=0.0361557;RO=7;SAF=2;SAR=5;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0189271;OID=.;OPOS=102265815;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:14:14:7:7:7:7:0.5:5:2:2:5:5:2:2:5
chr10	102265847	.	A	C	76.69	PASS	AF=0.416667;AO=10;DP=24;FAO=10;FDP=24;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.02022;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.002;QD=12.781;RBI=0.0208095;REFB=-0.0269124;REVB=0.00491805;RO=14;SAF=5;SAR=5;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0703453;STB=0.541584;STBP=0.767;TYPE=snp;VARB=0.0364746;OID=.;OPOS=102265847;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:24:24:14:14:10:10:0.416667:5:5:8:6:5:5:8:6
chr10	102269085	.	C	A	166.75	PASS	AF=0.382979;AO=18;DP=47;FAO=18;FDP=47;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.0365018;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.969;QD=14.1917;RBI=0.0398539;REFB=-0.0117344;REVB=0.0159985;RO=28;SAF=11;SAR=7;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0813272;STB=0.559255;STBP=0.494;TYPE=snp;VARB=0.0151788;OID=.;OPOS=102269085;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:28:29:18:18:0.382979:7:11:15:13:7:11:15:14
chr10	102269206	.	A	G	148.18	PASS	AF=0.470588;AO=16;DP=34;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=0.0399355;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=231.549;QD=17.4332;RBI=0.041255;REFB=-0.00211652;REVB=0.0103504;RO=18;SAF=6;SAR=10;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0416401;STB=0.52378;STBP=0.774;TYPE=snp;VARB=0.0024211;OID=.;OPOS=102269206;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:18:18:16:16:0.470588:10:6:6:12:10:6:6:12
chr10	102295836	.	C	G	486.83	PASS	AF=0.510204;AO=47;DP=95;FAO=50;FDP=98;FR=.;FRO=48;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=21;FSRR=27;FWDB=0.0194346;FXX=0.0297;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.4879;QD=19.8704;RBI=0.0756751;REFB=-0.0318376;REVB=-0.0731369;RO=47;SAF=26;SAR=21;SRF=22;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0769603;STB=0.550102;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.0294884;OID=.;OPOS=102295836;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:98:47:48:47:50:0.510204:21:26:22:25:23:27:21:27
chr10	102309220	.	G	C	319.9	PASS	AF=0.448718;AO=33;DP=78;FAO=35;FDP=78;FR=.;FRO=43;FSAF=24;FSAR=11;FSRF=23;FSRR=20;FWDB=0.0183343;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.544;QD=16.4049;RBI=0.019859;REFB=0.005988;REVB=-0.00763099;RO=42;SAF=22;SAR=11;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126265;STB=0.589955;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=-0.010392;OID=.;OPOS=102309220;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:42:43:33:35:0.448718:11:22:23:19:11:24:23:20
chr10	102313607	.	A	G	173.55	PASS	AF=0.486486;AO=18;DP=36;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=3;FWDB=0.00847896;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=127.98;QD=18.7616;RBI=0.0161458;REFB=-0.0216766;REVB=0.0137403;RO=18;SAF=11;SAR=7;SRF=15;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.220183;STB=0.631978;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=0.0194416;OID=.;OPOS=102313607;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:37:18:19:18:18:0.486486:7:11:15:3:7:11:16:3
chr10	102506070	.	G	C	4001.38	PASS	AF=0.992308;AO=196;DP=263;FAO=258;FDP=260;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=0;FSAF=110;FSAR=148;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.254128;FXX=0.0114064;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.5146;QD=61.5597;RBI=0.257478;REFB=-0.0871015;REVB=-0.0414003;RO=1;SAF=49;SAR=147;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00322905;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00294034;OID=.;OPOS=102506070;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:263:260:1:0:196:258:0.992308:147:49:0:1:148:110:0:0
chr10	102685853	.	TTA	T,TAA	40.16	PASS	AF=0.153846,0;AO=11,6;DP=79;FAO=10,0;FDP=65;FR=.;FRO=55;FSAF=6,0;FSAR=4,0;FSRF=35;FSRR=20;FWDB=-0.17086,-0.0685314;FXX=0.0298463;HRUN=6,6;LEN=2,1;MLLD=21.6446,19.3973;QD=2.47157;RBI=0.17102,0.11519;REFB=-0.0402764,-0.0122235;REVB=0.00738839,0.0925855;RO=55;SAF=7,6;SAR=4,0;SRF=36;SRR=19;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0246078,0.549283;STB=0.532404,0.5;STBP=0.892,1;TYPE=del,snp;VARB=0.167739,0;OID=.,.;OPOS=102685854,102685854;OREF=TA,T;OALT=-,A;OMAPALT=T,TAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.153846,0:11,6:79:10,0:65:55:6,0:4,0:35:20:41:55:7,6:4,0:36:19
chr10	102734778	.	C	G	837.06	PASS	AF=0.983333;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00343011;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.981;QD=55.8039;RBI=0.0556877;REFB=-0.0019073;REVB=-0.0555819;RO=1;SAF=29;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159925;STB=0.508472;STBP=0.548;TYPE=snp;VARB=2.90491e-05;OID=.;OPOS=102734778;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:60:60:1:1:59:59:0.983333:30:29:1:0:30:29:1:0
chr10	102745062	.	G	T	1289.45	PASS	AF=0.977011;AO=85;DP=87;FAO=85;FDP=87;FR=.;FRO=2;FSAF=43;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.020935;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=76.5237;QD=59.2851;RBI=0.0647744;REFB=-0.125926;REVB=-0.0612981;RO=1;SAF=43;SAR=42;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.011146;STB=0.511625;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=0.00101469;OID=.;OPOS=102745062;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:87:87:1:2:85:85:0.977011:42:43:0:1:42:43:0:2
chr10	102746503	.	C	T	340.74	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0231174;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.745;QD=54.5175;RBI=0.0241184;REFB=0;REVB=-0.00687631;RO=0;SAF=10;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.54964e-05;OID=.;OPOS=102746503;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:15:10:0:0:15:10:0:0
chr10	102750623	.	T	C	907.9	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0412509;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.659;QD=58.5744;RBI=0.0477447;REFB=0;REVB=0.0240401;RO=0;SAF=30;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000337643;OID=.;OPOS=102750623;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:32:30:0:0:32:30:0:0
chr10	102750782	.	GC	AA,GA	261.27	PASS	AF=0.142857,0.857143;AO=3,17;DP=21;FAO=3,18;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=3,8;FSAR=0,10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00694419,0.0049978;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=126.537,126.557;QD=49.7665;RBI=0.00833409,0.0430642;REFB=0,0;REVB=0.00460818,0.0427732;RO=0;SAF=3,7;SAR=0,10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.00796354,0.0011032;OID=.,.;OPOS=102750782,102750783;OREF=GC,C;OALT=AA,A;OMAPALT=AA,GA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:14:21:21:0:0:3,17:3,18:0.142857,0.857143:0,10:3,7:0:0:0,10:3,8:0:0
chr10	102766574	.	A	G	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0438808;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.7839;QD=51.184;RBI=0.0606651;REFB=0;REVB=0.0418896;RO=0;SAF=12;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00121152;OID=.;OPOS=102766574;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:8:12:0:0:8:12:0:0
chr10	102770082	.	T	G	2668.45	PASS	AF=0.994413;AO=161;DP=166;FAO=178;FDP=179;FR=.;FRO=1;FSAF=112;FSAR=66;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0200436;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.3314;QD=59.6301;RBI=0.0382858;REFB=-0.0662165;REVB=0.03262;RO=4;SAF=100;SAR=61;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00632295;STB=0.502222;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=0.00211593;OID=.;OPOS=102770082;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:166:179:4:1:161:178:0.994413:61:100:3:1:66:112:1:0
chr10	102770327	.	A	G	651.18	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0155468;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.388;QD=62.0173;RBI=0.0417099;REFB=0;REVB=-0.0387042;RO=0;SAF=19;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000294706;OID=.;OPOS=102770327;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:23:19:0:0:23:19:0:0
chr10	102798962	.	C	A	885.43	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00504324;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=262.174;QD=58.0611;RBI=0.0171778;REFB=0;REVB=-0.0164208;RO=0;SAF=37;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.48189e-05;OID=.;OPOS=102798962;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:24:37:0:0:24:37:0:0
chr10	102824349	.	G	C	708.39	PASS	AF=0.962963;AO=52;DP=54;FAO=52;FDP=54;FR=.;FRO=2;FSAF=29;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0109042;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.2091;QD=52.4732;RBI=0.0126374;REFB=-0.0737917;REVB=0.00638775;RO=2;SAF=29;SAR=23;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00407395;STB=0.502164;STBP=0.884;TYPE=snp;VARB=0.0579219;OID=.;OPOS=102824349;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:54:54:2:2:52:52:0.962963:23:29:1:1:23:29:1:1
chr10	102925957	.	A	G	393.11	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0219368;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.378;QD=56.1581;RBI=0.0227027;REFB=0;REVB=0.00584716;RO=0;SAF=13;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000251217;OID=.;OPOS=102925957;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:15:13:0:0:15:13:0:0
chr10	103124606	.	A	G	8364.81	PASS	AF=0.935537;AO=566;DP=605;FAO=566;FDP=605;FR=.;FRO=39;FSAF=194;FSAR=372;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=0.00683148;FXX=0.00493413;HRUN=1;LEN=1;MLLD=288.185;QD=55.3045;RBI=0.00906272;REFB=0.00180866;REVB=-0.00595515;RO=38;SAF=194;SAR=372;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0242085;STB=0.517474;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=-3.28155e-05;OID=.;OPOS=103124606;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:605:605:38:39:566:566:0.935537:372:194:20:18:372:194:23:16
chr10	103124633	.	T	C	178.49	PASS	AF=0.0932722;AO=61;DP=654;FAO=61;FDP=654;FR=.;FRO=593;FSAF=17;FSAR=44;FSRF=222;FSRR=371;FWDB=0.00623507;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.093;QD=1.09165;RBI=0.0094267;REFB=0.000316441;REVB=0.00707012;RO=592;SAF=17;SAR=44;SRF=222;SRR=370;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129782;STB=0.598452;STBP=0.115;TYPE=snp;VARB=-0.00465349;OID=.;OPOS=103124633;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:654:654:592:593:61:61:0.0932722:44:17:222:370:44:17:222:371
chr10	103124647	.	A	G	8774.61	PASS	AF=0.91821;AO=593;DP=647;FAO=595;FDP=648;FR=.;FRO=53;FSAF=211;FSAR=384;FSRF=23;FSRR=30;FWDB=0.0293333;FXX=0.00154081;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.626;QD=54.1643;RBI=0.0319544;REFB=-0.0738747;REVB=-0.0126743;RO=51;SAF=211;SAR=382;SRF=23;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0155681;STB=0.507059;STBP=0.243;TYPE=snp;VARB=0.00730127;OID=.;OPOS=103124647;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:647:648:51:53:593:595:0.91821:382:211:23:28:384:211:23:30
chr10	103124653	.	T	C	83.05	PASS	AF=0.066358;AO=43;DP=648;FAO=43;FDP=648;FR=.;FRO=605;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=214;FSRR=391;FWDB=0.0065789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.432;QD=0.51265;RBI=0.021093;REFB=-0.00212591;REVB=-0.0200408;RO=601;SAF=20;SAR=23;SRF=213;SRR=388;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126987;STB=0.606014;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=0.0282547;OID=.;OPOS=103124653;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:648:648:601:605:43:43:0.066358:23:20:213:388:23:20:214:391
chr10	103124696	.	T	C	6741.41	PASS	AF=0.919679;AO=448;DP=491;FAO=458;FDP=498;FR=.;FRO=40;FSAF=188;FSAR=270;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=0.0336387;FXX=0.00200397;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.218;QD=54.1479;RBI=0.0340874;REFB=-0.0356075;REVB=-0.00551272;RO=40;SAF=183;SAR=265;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0107084;STB=0.503275;STBP=0.65;TYPE=snp;VARB=0.000807104;OID=.;OPOS=103124696;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:491:498:40:40:448:458:0.919679:265:183:19:21:270:188:18:22
chr10	103124715	.	A	G	5217.52	PASS	AF=0.913043;AO=340;DP=374;FAO=357;FDP=391;FR=.;FRO=34;FSAF=170;FSAR=187;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=0.0628672;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.784;QD=53.3761;RBI=0.0629901;REFB=-0.0456537;REVB=-0.00393362;RO=34;SAF=153;SAR=187;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00359138;STB=0.500488;STBP=0.957;TYPE=snp;VARB=0.00191997;OID=.;OPOS=103124715;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:374:391:34:34:340:357:0.913043:187:153:16:18:187:170:16:18
chr10	103124726	.	A	G	4110.53	PASS	AF=0.908228;AO=277;DP=309;FAO=287;FDP=316;FR=.;FRO=29;FSAF=142;FSAR=145;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.0297363;FXX=0.00940409;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.19;QD=52.032;RBI=0.0301356;REFB=-0.000139222;REVB=0.00488969;RO=31;SAF=134;SAR=143;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00619113;STB=0.501103;STBP=0.907;TYPE=snp;VARB=4.65664e-05;OID=.;OPOS=103124726;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:309:316:31:29:277:287:0.908228:143:134:16:15:145:142:14:15
chr10	103124736	.	C	T	2667.96	PASS	AF=0.873874;AO=189;DP=218;FAO=194;FDP=222;FR=.;FRO=28;FSAF=105;FSAR=89;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.00686925;FXX=0.00892817;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.477;QD=48.0713;RBI=0.00707851;REFB=-0.0174001;REVB=0.00170845;RO=28;SAF=102;SAR=87;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00974585;STB=0.505232;STBP=0.681;TYPE=snp;VARB=0.00351135;OID=.;OPOS=103124736;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:218:222:28:28:189:194:0.873874:87:102:14:14:89:105:14:14
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chr10	103789437	.	G	A	54.0	PASS	AF=0.307692;AO=8;DP=26;FAO=8;FDP=26;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=0.00855709;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.928;QD=8.30751;RBI=0.0303824;REFB=-0.00982272;REVB=-0.0291525;RO=18;SAF=6;SAR=2;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180179;STB=0.613332;STBP=0.477;TYPE=snp;VARB=0.0324348;OID=.;OPOS=103789437;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:26:26:18:18:8:8:0.307692:2:6:11:7:2:6:11:7
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chr10	104160434	.	A	G	594.47	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0149635;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.779;QD=60.9708;RBI=0.0172149;REFB=0;REVB=0.00851157;RO=0;SAF=22;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.92518e-05;OID=.;OPOS=104160434;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:17:22:0:0:17:22:0:0
chr10	104162770	.	G	A	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00749724;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=238.777;QD=33.4285;RBI=0.00766649;REFB=0;REVB=-0.001602;RO=0;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.53939e-05;OID=.;OPOS=104162770;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:5:1:0:0:5:1:0:0
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chr10	104835919	.	C	T	425.14	PASS	AF=0.585714;AO=41;DP=70;FAO=41;FDP=70;FR=.;FRO=29;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.0264169;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.613;QD=24.2935;RBI=0.0363333;REFB=-0.0201562;REVB=0.024945;RO=29;SAF=20;SAR=21;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00381328;STB=0.502091;STBP=0.966;TYPE=snp;VARB=0.0102189;OID=.;OPOS=104835919;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:29:29:41:41:0.585714:21:20:14:15:21:20:14:15
chr10	104837816	.	G	A	109.53	PASS	AF=0.277778;AO=15;DP=53;FAO=15;FDP=54;FR=.;FRO=39;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=-0.0169806;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.708;QD=8.11329;RBI=0.01736;REFB=-0.000279323;REVB=-0.00360937;RO=34;SAF=8;SAR=7;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139853;STB=0.569932;STBP=0.544;TYPE=snp;VARB=0.000165564;OID=.;OPOS=104837816;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:54:34:39:15:15:0.277778:7:8:14:20:7:8:17:22
chr10	104849468	.	G	A	851.26	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00122184;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.24;QD=57.7124;RBI=0.0238576;REFB=0;REVB=0.0238263;RO=0;SAF=26;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.00382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.1125e-05;OID=.;OPOS=104849468;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:33:26:0:0:33:26:0:0
chr10	104851301	.	G	T	243.84	PASS	AF=0.424242;AO=28;DP=67;FAO=28;FDP=66;FR=.;FRO=38;FSAF=20;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=-0.00250007;FXX=0.0294074;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.582;QD=14.7782;RBI=0.011837;REFB=0.00512454;REVB=0.0115699;RO=37;SAF=20;SAR=8;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.245156;STB=0.648038;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=-0.00433154;OID=.;OPOS=104851301;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:66:37:38:28:28:0.424242:8:20:18:19:8:20:18:20
chr10	104851396	.	G	T	391.55	PASS	AF=0.603175;AO=38;DP=63;FAO=38;FDP=63;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=26;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.0174148;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.065;QD=24.8602;RBI=0.0182826;REFB=-0.00510459;REVB=0.00556575;RO=25;SAF=12;SAR=26;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159462;STB=0.587656;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=0.00767556;OID=.;OPOS=104851396;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:25:25:38:38:0.603175:26:12:13:12:26:12:13:12
chr10	104855670	.	G	A	60.04	PASS	AF=0.219512;AO=9;DP=41;FAO=9;FDP=41;FR=.;FRO=32;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=-0.028637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.494;QD=5.8575;RBI=0.0645133;REFB=-0.00138517;REVB=-0.0578091;RO=32;SAF=4;SAR=5;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10443;STB=0.567418;STBP=0.68;TYPE=snp;VARB=0.002765;OID=.;OPOS=104855670;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:60:41:41:32:32:9:9:0.219512:5:4:17:15:5:4:17:15
chr10	105049105	.	C	G	289.49	PASS	AF=0.545455;AO=30;DP=54;FAO=30;FDP=55;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=24;FSRF=7;FSRR=18;FWDB=0.00108756;FXX=0.017854;HRUN=3;LEN=1;MLLD=186.022;QD=21.0536;RBI=0.0145298;REFB=-0.0112624;REVB=-0.014489;RO=24;SAF=6;SAR=24;SRF=6;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0599258;STB=0.553154;STBP=0.463;TYPE=snp;VARB=0.0110914;OID=.;OPOS=105049105;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:55:24:25:30:30:0.545455:24:6:6:18:24:6:7:18
chr10	105154089	.	A	G	623.93	PASS	AF=0.57732;AO=56;DP=97;FAO=56;FDP=97;FR=.;FRO=41;FSAF=28;FSAR=28;FSRF=25;FSRR=16;FWDB=-0.0452612;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.6999;QD=25.7289;RBI=0.0814454;REFB=-0.0522974;REVB=-0.0677109;RO=41;SAF=28;SAR=28;SRF=25;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0849341;STB=0.546375;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.0279314;OID=.;OPOS=105154089;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:41:41:56:56:0.57732:28:28:25:16:28:28:25:16
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chr10	105233110	.	C	T	1135.31	PASS	AF=1;AO=73;DP=74;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.033649;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.8478;QD=60.5498;RBI=0.127893;REFB=0;REVB=0.123387;RO=0;SAF=36;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.89682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000829388;OID=.;OPOS=105233110;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:75:0:0:73:75:1:37:36:0:0:39:36:0:0
chr10	105238652	.	G	A	295.08	PASS	AF=0.365591;AO=34;DP=94;FAO=34;FDP=93;FR=.;FRO=59;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=35;FSRR=24;FWDB=-0.0199851;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.227;QD=12.6916;RBI=0.0207308;REFB=-0.0110635;REVB=0.00551049;RO=60;SAF=20;SAR=14;SRF=36;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0135275;STB=0.503266;STBP=0.969;TYPE=snp;VARB=0.0221582;OID=.;OPOS=105238652;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:93:60:59:34:34:0.365591:14:20:36:24:14:20:35:24
chr10	105344756	.	T	C	74.97	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.169806;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.9629;QD=37.4867;RBI=0.170112;REFB=0;REVB=0.0101977;RO=0;SAF=3;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0122387;OID=.;OPOS=105344756;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:5:3:0:0:5:3:0:0
chr10	105362104	.	G	A	47.36	PASS	AF=0.275862;AO=7;DP=28;FAO=8;FDP=29;FR=.;FRO=21;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=16;FSRR=5;FWDB=0.0114534;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.152;QD=6.53252;RBI=0.0288142;REFB=-0.00410945;REVB=0.0264401;RO=21;SAF=4;SAR=3;SRF=16;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.242602;STB=0.689249;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.0155113;OID=.;OPOS=105362104;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:28:29:21:21:7:8:0.275862:3:4:16:5:4:4:16:5
chr10	105362209	.	T	C	272.55	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0125033;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=84.597;QD=51.9144;RBI=0.0332918;REFB=0;REVB=-0.0308547;RO=0;SAF=10;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000249481;OID=.;OPOS=105362209;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:11:10:0:0:11:10:0:0
chr10	105363289	.	T	C	108.01	PASS	AF=0.393939;AO=13;DP=33;FAO=13;FDP=33;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=-0.0243441;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.688;QD=13.0917;RBI=0.0253353;REFB=-0.00192882;REVB=0.00701727;RO=20;SAF=7;SAR=6;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.064306;STB=0.537678;STBP=0.753;TYPE=snp;VARB=0.00250124;OID=.;OPOS=105363289;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:20:20:13:13:0.393939:6:7:12:8:6:7:12:8
chr10	105657316	.	G	C	727.8	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00993833;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=222.024;QD=63.2867;RBI=0.0386169;REFB=0;REVB=0.0373162;RO=0;SAF=21;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.85991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000131029;OID=.;OPOS=105657316;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:25:21:0:0:25:21:0:0
chr10	105657363	.	C	G	199.47	PASS	AF=0.431373;AO=22;DP=51;FAO=22;FDP=51;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=0.00546263;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.2801;QD=15.645;RBI=0.0177052;REFB=0.00456501;REVB=0.0168414;RO=29;SAF=12;SAR=10;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0763129;STB=0.543439;STBP=0.612;TYPE=snp;VARB=-0.00742668;OID=.;OPOS=105657363;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:29:29:22:22:0.431373:10:12:18:11:10:12:18:11
chr10	105659826	.	T	C	1196.09	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0584323;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.292;QD=60.5614;RBI=0.0641545;REFB=0;REVB=0.0264851;RO=0;SAF=28;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000637273;OID=.;OPOS=105659826;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:51:28:0:0:51:28:0:0
chr10	105758670	.	A	G	393.09	PASS	AF=0.5;AO=39;DP=79;FAO=40;FDP=80;FR=.;FRO=40;FSAF=13;FSAR=27;FSRF=22;FSRR=18;FWDB=0.0341132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.612;QD=19.6545;RBI=0.0351844;REFB=0.0161847;REVB=0.00861571;RO=40;SAF=12;SAR=27;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.232132;STB=0.617586;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=-0.0102166;OID=.;OPOS=105758670;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:80:40:40:39:40:0.5:27:12:22:18:27:13:22:18
chr10	105793750	.	T	C	230.79	PASS	AF=0.480769;AO=25;DP=52;FAO=25;FDP=52;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=-0.011488;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.402;QD=17.7533;RBI=0.0164636;REFB=-0.0168086;REVB=-0.0117931;RO=27;SAF=10;SAR=15;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.210285;STB=0.618227;STBP=0.118;TYPE=snp;VARB=0.0146039;OID=.;OPOS=105793750;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:27:27:25:25:0.480769:15:10:17:10:15:10:17:10
chr10	105796819	.	A	G	306.31	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0140808;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.7035;QD=53.2706;RBI=0.112782;REFB=0;REVB=-0.111899;RO=0;SAF=15;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00382237;OID=.;OPOS=105796819;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:8:15:0:0:8:15:0:0
chr10	105798872	.	T	C	1331.09	PASS	AF=1;AO=85;DP=85;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0256729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.807;QD=61.9113;RBI=0.032735;REFB=0;REVB=0.0203098;RO=0;SAF=48;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.82434e-06;OID=.;OPOS=105798872;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:86:0:0:85:86:1:37:48:0:0:38:48:0:0
chr10	105799216	.	G	T	1109.67	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0395032;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.0667;QD=59.982;RBI=0.0427988;REFB=0;REVB=-0.0164693;RO=0;SAF=39;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00020693;OID=.;OPOS=105799216;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:74:0:0:70:74:1:31:39:0:0:32:42:0:0
chr10	105801253	.	G	A	238.12	PASS	AF=1;AO=12;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0376124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=47.3207;QD=50.1304;RBI=0.191131;REFB=0;REVB=0.187393;RO=0;SAF=1;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.23983e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00504112;OID=.;OPOS=105801253;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:12:19:1:11:1:0:0:11:8:0:0
chr10	105805497	.	C	T	306.12	PASS	AF=0.425;AO=34;DP=79;FAO=34;FDP=80;FR=.;FRO=46;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=27;FWDB=0.0153383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.6008;QD=15.3059;RBI=0.0154042;REFB=-0.00311086;REVB=-0.00142319;RO=44;SAF=20;SAR=14;SRF=19;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156441;STB=0.600234;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=0.00514206;OID=.;OPOS=105805497;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:80:44:46:34:34:0.425:14:20:19:25:14:20:19:27
chr10	105810400	.	T	C	1557.63	PASS	AF=0.972973;AO=107;DP=111;FAO=108;FDP=111;FR=.;FRO=3;FSAF=42;FSAR=66;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0111801;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=291.563;QD=56.1307;RBI=0.0166388;REFB=-0.0284395;REVB=0.0123229;RO=3;SAF=41;SAR=66;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154513;STB=0.507868;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=0.00127058;OID=.;OPOS=105810400;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:111:111:3:3:107:108:0.972973:66:41:2:1:66:42:2:1
chr10	105815116	.	A	G	127.84	PASS	AF=0.253333;AO=19;DP=75;FAO=19;FDP=75;FR=.;FRO=56;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=35;FSRR=21;FWDB=0.00437027;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.364;QD=6.81786;RBI=0.0178479;REFB=-0.000339848;REVB=-0.0173045;RO=56;SAF=14;SAR=5;SRF=35;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158196;STB=0.597592;STBP=0.366;TYPE=snp;VARB=0.00145681;OID=.;OPOS=105815116;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:56:56:19:19:0.253333:5:14:35:21:5:14:35:21
chr10	105816916	.	C	T	1731.29	PASS	AF=1;AO=113;DP=114;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0174185;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.3629;QD=60.7469;RBI=0.0180087;REFB=0;REVB=-0.00457268;RO=0;SAF=67;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.40416e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.99536e-05;OID=.;OPOS=105816916;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:114:114:0:0:113:114:1:46:67:0:0:47:67:0:0
chr10	105819956	.	G	A	1732.28	PASS	AF=1;AO=112;DP=112;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00224013;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.6369;QD=60.7817;RBI=0.00312033;REFB=0;REVB=-0.00217216;RO=0;SAF=64;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.41465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.2408e-05;OID=.;OPOS=105819956;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:112:114:0:0:112:114:1:48:64:0:0:50:64:0:0
chr10	105824333	.	G	A	734.22	PASS	AF=0.979167;AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=48;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0387409;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.671;QD=61.1852;RBI=0.0392346;REFB=-0.0609614;REVB=0.00620453;RO=0;SAF=19;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512815;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.0014426;OID=.;OPOS=105824333;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:48:48:0:1:47:47:0.979167:28:19:0:0:28:19:1:0
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chr10	106937890	.	C	T	136.33	PASS	AF=0.177305;AO=24;DP=140;FAO=25;FDP=141;FR=.;FRO=116;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=50;FSRR=66;FWDB=-0.00840657;FXX=0.00704176;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.2174;QD=3.86747;RBI=0.0523377;REFB=-0.00240721;REVB=-0.0516582;RO=111;SAF=15;SAR=9;SRF=49;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.231865;STB=0.636764;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=0.0132823;OID=.;OPOS=106937890;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:140:141:111:116:24:25:0.177305:9:15:49:62:10:15:50:66
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chr10	108380213	.	G	A	408.35	PASS	AF=0.5125;AO=41;DP=80;FAO=41;FDP=80;FR=.;FRO=39;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=22;FSRR=17;FWDB=-0.00960665;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.666;QD=20.4174;RBI=0.0140641;REFB=0.0092506;REVB=0.0102718;RO=39;SAF=23;SAR=18;SRF=22;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00279329;STB=0.501547;STBP=0.993;TYPE=snp;VARB=-0.00681116;OID=.;OPOS=108380213;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:39:39:41:41:0.5125:18:23:22:17:18:23:22:17
chr10	108389111	.	A	G	286.88	PASS	AF=0.346535;AO=35;DP=100;FAO=35;FDP=101;FR=.;FRO=66;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=36;FSRR=30;FWDB=0.00658605;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=164.722;QD=11.3616;RBI=0.00978979;REFB=-0.00448098;REVB=0.0072432;RO=65;SAF=17;SAR=18;SRF=35;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0594227;STB=0.538961;STBP=0.594;TYPE=snp;VARB=0.00875055;OID=.;OPOS=108389111;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:101:65:66:35:35:0.346535:18:17:35:30:18:17:36:30
chr10	108729824	.	C	T	285.79	PASS	AF=0.37931;AO=33;DP=87;FAO=33;FDP=87;FR=.;FRO=54;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=34;FSRR=20;FWDB=0.00942028;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.1694;QD=13.1398;RBI=0.0398367;REFB=0.0124714;REVB=-0.0387068;RO=53;SAF=17;SAR=16;SRF=33;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116805;STB=0.571386;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=-0.0210097;OID=.;OPOS=108729824;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:53:54:33:33:0.37931:16:17:33:20:16:17:34:20
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chr10	112266822	.	GC	AT	639.47	PASS	AF=1;AO=41;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0295096;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=199.405;QD=60.902;RBI=0.0297971;REFB=0;REVB=0.00412923;RO=0;SAF=21;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000228583;OID=.;OPOS=112266822;OREF=GC;OALT=AT;OMAPALT=AT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:41:42:1:20:21:0:0:20:22:0:0
chr10	112271257	.	C	G	481.24	PASS	AF=0.782609;AO=32;DP=48;FAO=36;FDP=46;FR=.;FRO=10;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=-0.00839983;FXX=0.041658;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.6681;QD=41.8467;RBI=0.0148627;REFB=-0.000708995;REVB=0.0122614;RO=0;SAF=15;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.503729;STBP=0.925;TYPE=snp;VARB=0.000498102;OID=.;OPOS=112271257;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:70:48:46:0:10:32:36:0.782609:17:15:0:0:21:15:4:6
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chr10	112402492	.	G	C,T	1440.26	PASS	AF=0.473684,0.526316;AO=45,50;DP=95;FAO=45,50;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=19,25;FSAR=26,25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0288883,-0.0010148;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=52.4718,129.438;QD=60.6426;RBI=0.0477588,0.00823662;REFB=0,0;REVB=-0.0380312,-0.00817387;RO=0;SAF=19,25;SAR=26,25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-5.15971e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00502653,0.00798857;OID=.,.;OPOS=112402492,112402492;OREF=G,G;OALT=C,T;OMAPALT=C,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:95:95:0:0:45,50:45,50:0.473684,0.526316:26,25:19,25:0:0:26,25:19,25:0:0
chr10	112572458	.	G	C	632.24	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00842735;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=115.709;QD=61.6823;RBI=0.0170562;REFB=0;REVB=0.0148288;RO=0;SAF=19;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.01366e-05;OID=.;OPOS=112572458;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:22:19:0:0:22:19:0:0
chr10	112595719	.	G	C	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000767288;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.685;QD=56.1907;RBI=0.0648158;REFB=0;REVB=0.0648113;RO=0;SAF=15;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000150795;OID=.;OPOS=112595719;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:13:15:0:0:13:15:0:0
chr10	112641053	.	A	G	501.97	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00963669;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=123.99;QD=59.0549;RBI=0.0890227;REFB=0;REVB=0.0884995;RO=0;SAF=23;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000560436;OID=.;OPOS=112641053;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:34:0:0:33:34:1:10:23:0:0:11:23:0:0
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chr10	112838892	.	C	A	195.51	PASS	AF=0.575758;AO=19;DP=34;FAO=19;FDP=33;FR=.;FRO=14;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.0211815;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.67;QD=23.6976;RBI=0.021402;REFB=-0.0242616;REVB=0.00306424;RO=13;SAF=14;SAR=5;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.225502;STB=0.645227;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.0133377;OID=.;OPOS=112838892;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:33:13:14:19:19:0.575758:5:14:6:7:5:14:6:8
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chr10	113917085	.	T	A	1001.88	PASS	AF=1;AO=67;DP=69;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0213275;FXX=0.042851;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.416;QD=59.8139;RBI=0.0214355;REFB=0;REVB=-0.00214994;RO=0;SAF=34;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.61397e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000383323;OID=.;OPOS=113917085;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:69:67:0:0:67:67:1:33:34:0:0:33:34:0:0
chr10	113920465	.	G	A	2221.66	PASS	AF=0.986111;AO=140;DP=144;FAO=142;FDP=144;FR=.;FRO=2;FSAF=58;FSAR=84;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0166576;FXX=0.0136977;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.327;QD=61.7128;RBI=0.0456313;REFB=-0.152158;REVB=0.0424822;RO=1;SAF=58;SAR=82;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00576343;STB=0.508473;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=0.00132923;OID=.;OPOS=113920465;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:144:144:1:2:140:142:0.986111:82:58:0:1:84:58:2:0
chr10	113935379	.	T	C	279.58	PASS	AF=0.956522;AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0248152;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=51.8437;QD=48.6221;RBI=0.0439595;REFB=-0.0753876;REVB=-0.0362856;RO=0;SAF=9;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2029e-08;STB=0.518502;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.00365419;OID=.;OPOS=113935379;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:23:23:0:1:22:22:0.956522:13:9:0:0:13:9:0:1
chr10	113940329	.	T	C	851.24	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0277703;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.8;QD=57.711;RBI=0.0350267;REFB=0;REVB=0.0213467;RO=0;SAF=38;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.22967e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000174783;OID=.;OPOS=113940329;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:21:38:0:0:21:38:0:0
chr10	114053546	.	C	G	2117.9	PASS	AF=0.985714;AO=137;DP=140;FAO=138;FDP=140;FR=.;FRO=2;FSAF=66;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00552652;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.6214;QD=60.5114;RBI=0.0290403;REFB=-0.0593376;REVB=0.0285096;RO=0;SAF=66;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.49328e-08;STB=0.506848;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.00106346;OID=.;OPOS=114053546;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:140:140:0:2:137:138:0.985714:71:66:0:0:72:66:0:2
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chr10	114200355	.	G	A	466.7	PASS	AF=0.7;AO=42;DP=60;FAO=42;FDP=60;FR=.;FRO=18;FSAF=15;FSAR=27;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.01537;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.9039;QD=31.1136;RBI=0.0597927;REFB=-0.00659764;REVB=-0.0577835;RO=18;SAF=15;SAR=27;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115124;STB=0.56247;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=0.00170263;OID=.;OPOS=114200355;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:18:18:42:42:0.7:27:15:10:8:27:15:10:8
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chr10	114925369	.	C	A	340.97	PASS	AF=0.586207;AO=34;DP=58;FAO=34;FDP=58;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=29;FSRF=4;FSRR=20;FWDB=0.0688385;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.7697;QD=23.5151;RBI=0.0704695;REFB=0.00100875;REVB=-0.0150735;RO=24;SAF=5;SAR=29;SRF=4;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0286596;STB=0.515801;STBP=0.842;TYPE=snp;VARB=-0.00056379;OID=.;OPOS=114925369;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:24:24:34:34:0.586207:29:5:4:20:29:5:4:20
chr10	115334124	.	C	T	920.1	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.063877;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.5178;QD=58.4193;RBI=0.0643934;REFB=0;REVB=-0.00813872;RO=0;SAF=36;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.31521e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000471904;OID=.;OPOS=115334124;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:27:36:0:0:27:36:0:0
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chr10	115405664	.	C	T	435.92	PASS	AF=0.630769;AO=41;DP=65;FAO=41;FDP=65;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=28;FSRF=17;FSRR=7;FWDB=0.0155407;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.911;QD=26.8258;RBI=0.0170821;REFB=-0.00420281;REVB=-0.00709121;RO=24;SAF=13;SAR=28;SRF=17;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.27181;STB=0.648574;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.00174863;OID=.;OPOS=115405664;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:24:24:41:41:0.630769:28:13:17:7:28:13:17:7
chr10	115409840	.	C	T	320.73	PASS	AF=0.367347;AO=36;DP=98;FAO=36;FDP=98;FR=.;FRO=62;FSAF=25;FSAR=11;FSRF=31;FSRR=31;FWDB=0.0109093;FXX=0.019998;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.098;QD=13.091;RBI=0.0115139;REFB=-0.015539;REVB=0.0036819;RO=61;SAF=25;SAR=11;SRF=30;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.233763;STB=0.630177;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.02452;OID=.;OPOS=115409840;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:61:62:36:36:0.367347:11:25:30:31:11:25:31:31
chr10	115410234	.	T	C	512.56	PASS	AF=0.514851;AO=52;DP=101;FAO=52;FDP=101;FR=.;FRO=49;FSAF=24;FSAR=28;FSRF=21;FSRR=28;FWDB=0.00550172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.066;QD=20.2995;RBI=0.0201909;REFB=-0.00324112;REVB=0.0194268;RO=47;SAF=24;SAR=28;SRF=21;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0127807;STB=0.516123;STBP=0.753;TYPE=snp;VARB=0.00276252;OID=.;OPOS=115410234;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:101:47:49:52:52:0.514851:28:24:21:26:28:24:21:28
chr10	115411598	.	C	A	149.09	PASS	AF=0.5;AO=16;DP=32;FAO=16;FDP=32;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=-0.0245519;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.645;QD=18.6367;RBI=0.0252318;REFB=-0.0333999;REVB=0.00581804;RO=16;SAF=8;SAR=8;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.221033;STB=0.624853;STBP=0.191;TYPE=snp;VARB=0.0328338;OID=.;OPOS=115411598;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:16:16:16:16:0.5:8:8:12:4:8:8:12:4
chr10	115411614	.	A	G	483.29	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0108587;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.87;QD=58.5809;RBI=0.0415176;REFB=0;REVB=0.0400724;RO=0;SAF=18;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.64315e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000469608;OID=.;OPOS=115411614;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:15:18:0:0:15:18:0:0
chr10	115412793	.	A	G	194.95	PASS	AF=0.418182;AO=23;DP=55;FAO=23;FDP=55;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=23;FWDB=0.0445362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.007;QD=14.1782;RBI=0.0482394;REFB=0.00512183;REVB=-0.0185355;RO=31;SAF=14;SAR=9;SRF=8;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.342069;STB=0.683819;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=-0.0104456;OID=.;OPOS=115412793;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:31:32:23:23:0.418182:9:14:8:23:9:14:9:23
chr10	115417289	.	G	A	853.54	PASS	AF=1;AO=58;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0122272;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.356;QD=57.867;RBI=0.0125443;REFB=0;REVB=-0.00280287;RO=0;SAF=33;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000153142;OID=.;OPOS=115417289;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:58:59:1:25:33:0:0:26:33:0:0
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chr10	115489167	.	G	A	75.62	PASS	AF=0.384615;AO=10;DP=26;FAO=10;FDP=26;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=-0.0132202;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.086;QD=11.6342;RBI=0.0226983;REFB=-0.0038388;REVB=-0.018451;RO=16;SAF=5;SAR=5;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194738;STB=0.615166;STBP=0.365;TYPE=snp;VARB=0.00718897;OID=.;OPOS=115489167;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:26:26:16:16:10:10:0.384615:5:5:11:5:5:5:11:5
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chr10	115609830	.	TTAAAAA	TAAAA,TAAAAAC,TTAAAA	110.03	PASS	AF=0.163636,0.0363636,0.272727;AO=7,2,14;DP=55;FAO=9,2,15;FDP=55;FR=.;FRO=29;FSAF=7,2,10;FSAR=2,0,5;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=0.0922914,-0.0270964,0.118207;FXX=0;HRUN=6,6,7;LEN=2,6,1;MLLD=14.5239,257.657,7.91388;QD=8.00194;RBI=0.166851,0.0349282,0.184972;REFB=0.0274637,0.00695319,-0.0435037;REVB=0.139002,0.0220401,0.142274;RO=25;SAF=6,2,9;SAR=1,0,5;SRF=16;SRR=9;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.337018,0.428369,0.00336707;STB=0.670818,0.993933,0.557299;STBP=0.292,0.21,0.611;TYPE=del,mnp,del;VARB=0.0817741,0.0213124,0.105959;OID=.,.,.;OPOS=115609831,115609831,115609832;OREF=TA,TAAAAA,A;OALT=-,AAAAAC,-;OMAPALT=TAAAA,TAAAAAC,TTAAAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/3:0.163636,0.0363636,0.272727:7,2,14:55:9,2,15:55:29:7,2,10:2,0,5:17:12:35:25:6,2,9:1,0,5:16:9
chr10	115609915	.	C	G	820.18	PASS	AF=0.983051;AO=57;DP=59;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0153855;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.969;QD=55.6053;RBI=0.0157307;REFB=0.0264924;REVB=-0.00327719;RO=1;SAF=26;SAR=31;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0149715;STB=0.50769;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=2.97595e-05;OID=.;OPOS=115609915;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:59:59:1:1:57:58:0.983051:31:26:0:1:32:26:0:1
chr10	115675025	.	G	A	362.26	PASS	AF=1;AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.020933;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.574;QD=55.733;RBI=0.0273595;REFB=0;REVB=-0.0176168;RO=0;SAF=12;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00236632;OID=.;OPOS=115675025;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:26:0:0:26:26:1:14:12:0:0:14:12:0:0
chr10	115805056	.	G	C	84.77	PASS	AF=0.354839;AO=11;DP=31;FAO=11;FDP=31;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=17;FWDB=-0.0306293;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=225.486;QD=10.9377;RBI=0.0307631;REFB=-0.00906542;REVB=-0.00286514;RO=20;SAF=5;SAR=6;SRF=3;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.354506;STB=0.705222;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=0.019528;OID=.;OPOS=115805056;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:31:31:20:20:11:11:0.354839:6:5:3:17:6:5:3:17
chr10	115947871	.	G	A	173.96	PASS	AF=0.68;AO=17;DP=25;FAO=17;FDP=25;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=-0.0363138;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.5422;QD=27.8332;RBI=0.0382129;REFB=0.0429623;REVB=-0.011897;RO=8;SAF=6;SAR=11;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.230969;STB=0.628418;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=-0.0226413;OID=.;OPOS=115947871;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:25:25:8:8:17:17:0.68:11:6:6:2:11:6:6:2
chr10	116032519	.	A	G	736.49	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0205733;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.8339;QD=56.6533;RBI=0.0863171;REFB=0;REVB=-0.0838295;RO=0;SAF=28;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.97956e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00141496;OID=.;OPOS=116032519;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:52:0:0:51:52:1:23:28:0:0:24:28:0:0
chr10	116050008	.	A	G	148.12	PASS	AF=0.484848;AO=16;DP=33;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=0.0422485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.0403;QD=17.9543;RBI=0.045433;REFB=-0.0122835;REVB=0.01671;RO=17;SAF=8;SAR=8;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132974;STB=0.575665;STBP=0.386;TYPE=snp;VARB=0.0300621;OID=.;OPOS=116050008;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:17:17:16:16:0.484848:8:8:11:6:8:8:11:6
chr10	116060387	.	T	C	69.14	PASS	AF=0.529412;AO=8;DP=16;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.0556801;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.189;QD=16.2679;RBI=0.0561445;REFB=-0.025562;REVB=-0.00720636;RO=8;SAF=4;SAR=4;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.213273;STB=0.640727;STBP=0.26;TYPE=snp;VARB=0.0359592;OID=.;OPOS=116060387;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:16:17:8:8:8:9:0.529412:4:4:2:6:4:5:2:6
chr10	116073696	.	C	T	1080.54	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0190044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.623;QD=60.03;RBI=0.0197602;REFB=0;REVB=-0.00541257;RO=0;SAF=36;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.57662e-05;OID=.;OPOS=116073696;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:36:36:0:0:36:36:0:0
chr10	116085784	.	C	CCCG	451.16	PASS	AF=1;AO=30;DP=33;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0542141;FXX=0.0312402;HRUN=3;LEN=3;MLLD=153.217;QD=58.2137;RBI=0.0564636;REFB=0;REVB=-0.015779;RO=2;SAF=16;SAR=14;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00389373;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000109911;OID=.;OPOS=116085785;OREF=-;OALT=CCG;OMAPALT=CCCG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:30:33:31:31:0:17:14:0:0:4:2:16:14:1:1
chr10	116183816	.	C	T	48.23	PASS	AF=0.466667;AO=7;DP=15;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.00423352;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=272.081;QD=12.8607;RBI=0.00495944;REFB=-0.0112264;REVB=0.00258328;RO=8;SAF=2;SAR=5;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.308464;STB=0.685728;STBP=0.246;TYPE=snp;VARB=0.0130371;OID=.;OPOS=116183816;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:15:15:8:8:7:7:0.466667:5:2:5:3:5:2:5:3
chr10	116307504	.	A	G	708.56	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0303477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.197;QD=62.9828;RBI=0.0325151;REFB=0;REVB=-0.0116726;RO=0;SAF=28;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.86406e-05;OID=.;OPOS=116307504;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:17:28:0:0:17:28:0:0
chr10	116335246	.	G	A	480.92	PASS	AF=0.547619;AO=46;DP=84;FAO=46;FDP=84;FR=.;FRO=38;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=22;FSRR=16;FWDB=0.00256922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.789;QD=22.9007;RBI=0.0138821;REFB=-0.0120802;REVB=-0.0136423;RO=38;SAF=24;SAR=22;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0472461;STB=0.525976;STBP=0.63;TYPE=snp;VARB=0.00984014;OID=.;OPOS=116335246;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:38:38:46:46:0.547619:22:24:22:16:22:24:22:16
chr10	116931101	.	C	CTT,T	500.58	PASS	AF=0.8,0.2;AO=23,10;DP=37;FAO=28,7;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=15,2;FSAR=13,5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0275071,-0.0123019;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=43.7725,218.801;QD=57.2094;RBI=0.0316039,0.02801;REFB=0,0;REVB=-0.0155616,-0.025164;RO=3;SAF=10,5;SAR=13,5;SRF=3;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.12022,-0.205201;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.00284063,0.0160154;OID=.,.;OPOS=116931102,116931101;OREF=-,C;OALT=TT,T;OMAPALT=CTT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:42:37:35:3:0:23,10:28,7:0.8,0.2:13,5:10,5:3:0:13,5:15,2:0:0
chr10	117075175	.	G	A	1026.37	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0189173;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.195;QD=59.4997;RBI=0.0194686;REFB=0;REVB=-0.00460013;RO=0;SAF=27;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.56939e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.50177e-05;OID=.;OPOS=117075175;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:42:27:0:0:42:27:0:0
chr10	117823739	.	A	G	393.87	PASS	AF=0.549296;AO=39;DP=71;FAO=39;FDP=71;FR=.;FRO=32;FSAF=26;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=0.0016344;FXX=0.013887;HRUN=3;LEN=1;MLLD=126.074;QD=22.1899;RBI=0.00660536;REFB=-0.018049;REVB=-0.00639996;RO=32;SAF=26;SAR=13;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194972;STB=0.607786;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=0.00949597;OID=.;OPOS=117823739;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:32:32:39:39:0.549296:13:26:14:18:13:26:14:18
chr10	118231328	.	A	G	158.53	PASS	AF=0.285714;AO=22;DP=76;FAO=22;FDP=77;FR=.;FRO=55;FSAF=5;FSAR=17;FSRF=33;FSRR=22;FWDB=-0.0257266;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.49;QD=8.23533;RBI=0.0260835;REFB=-0.00512383;REVB=-0.0043003;RO=54;SAF=5;SAR=17;SRF=32;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.440237;STB=0.767888;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.0292736;OID=.;OPOS=118231328;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:77:54:55:22:22:0.285714:17:5:32:22:17:5:33:22
chr10	118231360	.	G	A	955.09	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0252223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.1623;QD=58.7746;RBI=0.0255199;REFB=0;REVB=-0.00388589;RO=0;SAF=32;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.61274e-05;OID=.;OPOS=118231360;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:33:32:0:0:33:32:0:0
chr10	118231362	.	TA	T,TG	911.5	PASS	AF=0.125,0.875;AO=9,54;DP=64;FAO=8,56;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=8,24;FSAR=0,32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00211201,-0.00400093;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=203.245,222.303;QD=56.969;RBI=0.0152066,0.0172761;REFB=0,0;REVB=0.0150592,0.0168065;RO=0;SAF=9,22;SAR=0,32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.64875e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0284579,0.00625623;OID=.,.;OPOS=118231363,118231363;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=T,TG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.125,0.875:9,54:64:8,56:64:0:8,24:0,32:0:0:32:0:9,22:0,32:0:0
chr10	118231366	.	A	G	45.83	PASS	AF=0.16129;AO=10;DP=62;FAO=10;FDP=62;FR=.;FRO=52;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=23;FSRR=29;FWDB=-0.122056;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=37.7797;QD=2.95664;RBI=0.123519;REFB=-0.0330138;REVB=0.018955;RO=52;SAF=9;SAR=1;SRF=23;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.574688;STB=0.893232;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.215241;OID=.;OPOS=118231366;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:62:62:52:52:10:10:0.16129:1:9:23:29:1:9:23:29
chr10	118236610	.	T	A	428.95	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0639824;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.828;QD=57.1927;RBI=0.0654392;REFB=0;REVB=0.0137312;RO=0;SAF=14;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.56309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000247626;OID=.;OPOS=118236610;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:16:14:0:0:16:14:0:0
chr10	118313265	.	T	C	346.46	PASS	AF=0.480519;AO=36;DP=76;FAO=37;FDP=77;FR=.;FRO=40;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=29;FSRR=11;FWDB=0.0276618;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.5534;QD=17.9977;RBI=0.0533732;REFB=-0.0256175;REVB=0.0456456;RO=40;SAF=16;SAR=20;SRF=29;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.260234;STB=0.648517;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.040423;OID=.;OPOS=118313265;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:77:40:40:36:37:0.480519:20:16:29:11:21:16:29:11
chr10	118354250	.	C	T	145.09	PASS	AF=0.327586;AO=18;DP=57;FAO=19;FDP=58;FR=.;FRO=39;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=0.0231692;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=48.2354;QD=10.0062;RBI=0.0341587;REFB=-0.0164149;REVB=-0.0250999;RO=39;SAF=12;SAR=6;SRF=23;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0954672;STB=0.569645;STBP=0.465;TYPE=snp;VARB=0.0283409;OID=.;OPOS=118354250;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:58:39:39:18:19:0.327586:6:12:23:16:6:13:23:16
chr10	118357676	.	C	T	52.07	PASS	AF=0.210526;AO=8;DP=39;FAO=8;FDP=38;FR=.;FRO=30;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=-0.0228334;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.077;QD=5.48126;RBI=0.0288914;REFB=-0.00413483;REVB=-0.0177017;RO=30;SAF=5;SAR=3;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151767;STB=0.599748;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=0.0147191;OID=.;OPOS=118357676;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:39:38:30:30:8:8:0.210526:3:5:15:15:3:5:15:15
chr10	118363642	.	T	C	1898.99	PASS	AF=0.992;AO=124;DP=125;FAO=124;FDP=125;FR=.;FRO=1;FSAF=56;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0142665;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.775;QD=60.7676;RBI=0.0298249;REFB=-0.0121564;REVB=0.0261915;RO=1;SAF=56;SAR=68;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00693621;STB=0.503649;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.000201287;OID=.;OPOS=118363642;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:125:125:1:1:124:124:0.992:68:56:0:1:68:56:0:1
chr10	118368606	.	T	C	158.7	PASS	AF=0.459459;AO=17;DP=37;FAO=17;FDP=37;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.0147904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.872;QD=17.1565;RBI=0.021105;REFB=-0.00818953;REVB=-0.0150555;RO=20;SAF=8;SAR=9;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0748639;STB=0.542807;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=0.00923321;OID=.;OPOS=118368606;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:20:20:17:17:0.459459:9:8:11:9:9:8:11:9
chr10	118380511	.	A	G	88.25	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.058073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.473;QD=39.222;RBI=0.0634621;REFB=0;REVB=0.0255923;RO=0;SAF=6;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.58669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00110269;OID=.;OPOS=118380511;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:9:0:0:8:9:1:2:6:0:0:3:6:0:0
chr10	118383463	.	A	AG	1150.86	PASS	AF=1;AO=95;DP=100;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.198977;FXX=0.0291234;HRUN=1;LEN=1;MLLD=21.6971;QD=46.0345;RBI=0.199779;REFB=0;REVB=0.0178765;RO=3;SAF=41;SAR=54;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0334341;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00305313;OID=.;OPOS=118383464;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:95:100:100:100:0:44:56:0:0:22:3:41:54:3:0
chr10	118387282	.	A	G	850.17	PASS	AF=0.983607;AO=59;DP=59;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0173054;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.082;QD=55.7485;RBI=0.0223473;REFB=-0.0507686;REVB=0.0141395;RO=0;SAF=22;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.511107;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=0.000444502;OID=.;OPOS=118387282;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:59:61:0:1:59:60:0.983607:37:22:0:0:38:22:1:0
chr10	118397884	.	A	G	83.38	PASS	AF=0.323529;AO=11;DP=34;FAO=11;FDP=34;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=-0.000220502;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.5403;QD=9.80904;RBI=0.0405046;REFB=-0.00533367;REVB=-0.040504;RO=23;SAF=8;SAR=3;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.414735;STB=0.749559;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.00769532;OID=.;OPOS=118397884;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:34:34:23:23:11:11:0.323529:3:8:8:15:3:8:8:15
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chr10	118890573	.	T	C	196.56	PASS	AF=0.357143;AO=24;DP=68;FAO=25;FDP=70;FR=.;FRO=45;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=32;FWDB=0.0232023;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.2375;QD=11.232;RBI=0.0275551;REFB=-0.0204752;REVB=-0.014864;RO=44;SAF=12;SAR=12;SRF=12;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.256136;STB=0.64695;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=0.0297948;OID=.;OPOS=118890573;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:70:44:45:24:25:0.357143:12:12:12:32:12:13:13:32
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chr10	119026566	.	T	C	329.85	PASS	AF=0.428571;AO=36;DP=84;FAO=36;FDP=84;FR=.;FRO=48;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=21;FSRR=27;FWDB=-0.0246194;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=153.344;QD=15.707;RBI=0.0685906;REFB=-0.0143503;REVB=0.0640199;RO=46;SAF=13;SAR=23;SRF=21;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0995873;STB=0.546063;STBP=0.486;TYPE=snp;VARB=0.0221908;OID=.;OPOS=119026566;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:46:48:36:36:0.428571:23:13:21:25:23:13:21:27
chr10	119133968	.	G	C	516.95	PASS	AF=0.474138;AO=55;DP=116;FAO=55;FDP=116;FR=.;FRO=61;FSAF=27;FSAR=28;FSRF=29;FSRR=32;FWDB=-0.00205511;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=314.54;QD=17.8259;RBI=0.00590027;REFB=-0.00359775;REVB=-0.0055308;RO=61;SAF=27;SAR=28;SRF=29;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0146868;STB=0.508153;STBP=0.881;TYPE=snp;VARB=0.00383912;OID=.;OPOS=119133968;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:116:116:61:61:55:55:0.474138:28:27:29:32:28:27:29:32
chr10	119134058	.	T	C	305.13	PASS	AF=0.368421;AO=34;DP=94;FAO=35;FDP=95;FR=.;FRO=60;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=37;FSRR=23;FWDB=-0.0691856;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.6124;QD=12.8477;RBI=0.083249;REFB=0.0054104;REVB=-0.0463007;RO=60;SAF=19;SAR=15;SRF=37;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0658422;STB=0.529395;STBP=0.676;TYPE=snp;VARB=-0.0112576;OID=.;OPOS=119134058;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:95:60:60:34:35:0.368421:15:19:37:23:15:20:37:23
chr10	119134216	.	C	A	40.11	PASS	AF=0.352941;AO=5;DP=17;FAO=6;FDP=17;FR=.,HEALED;FRO=11;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=2;FWDB=-0.00906257;FXX=0.0555247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.0815;QD=9.43691;RBI=0.0245578;REFB=-0.0269729;REVB=0.0228244;RO=8;SAF=2;SAR=3;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.33255;STB=0.784921;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.158788;OID=.;OPOS=119134216;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:17:17:8:11:5:6:0.352941:3:2:6:2:4:2:9:2
chr10	119768551	.	C	T	406.0	PASS	AF=0.488095;AO=41;DP=84;FAO=41;FDP=84;FR=.;FRO=43;FSAF=29;FSAR=12;FSRF=30;FSRR=13;FWDB=-0.0164187;FXX=0.0232531;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.94;QD=19.3334;RBI=0.0244916;REFB=-0.0149562;REVB=-0.0181732;RO=43;SAF=29;SAR=12;SRF=30;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.010655;STB=0.505929;STBP=0.922;TYPE=snp;VARB=0.0155725;OID=.;OPOS=119768551;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:43:43:41:41:0.488095:12:29:30:13:12:29:30:13
chr10	120069611	.	T	C	340.74	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0205378;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.207;QD=54.5177;RBI=0.0211131;REFB=0;REVB=-0.00489518;RO=0;SAF=12;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.30816e-05;OID=.;OPOS=120069611;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:13:12:0:0:13:12:0:0
chr10	120070427	.	G	T	58.62	PASS	AF=0.5;AO=8;DP=16;FAO=8;FDP=16;FR=.;FRO=8;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=-0.0484238;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.976;QD=14.6538;RBI=0.0484535;REFB=0.0216069;REVB=-0.00169766;RO=8;SAF=1;SAR=7;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.323155;STB=0.681501;STBP=0.769;TYPE=snp;VARB=-0.00732957;OID=.;OPOS=120070427;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:16:16:8:8:8:8:0.5:7:1:0:8:7:1:0:8
chr10	120353910	.	T	C	632.39	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0212445;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.383;QD=61.6967;RBI=0.0249381;REFB=0;REVB=-0.0130607;RO=0;SAF=20;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.11491e-05;OID=.;OPOS=120353910;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:41:0:0:40:41:1:20:20:0:0:20:21:0:0
chr10	120791060	.	A	C	318.3	PASS	AF=1;AO=23;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112865;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.856;QD=53.0503;RBI=0.020504;REFB=0;REVB=0.0171182;RO=0;SAF=9;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.84921e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000134168;OID=.;OPOS=120791060;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:23:24:1:14:9:0:0:14:10:0:0
chr10	120791778	.	TAAATACC	T	413.34	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00199748;FXX=0;HRUN=3;LEN=7;MLLD=313.829;QD=48.6284;RBI=0.0147587;REFB=0;REVB=-0.0146229;RO=0;SAF=23;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-2.17859e-05;OID=.;OPOS=120791779;OREF=AAATACC;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:33:33:34:34:0:24:10:0:0:7:0:23:10:0:0
chr10	120792297	.	G	GCTA	531.91	PASS	AF=0.789474;AO=44;DP=57;FAO=45;FDP=57;FR=.;FRO=12;FSAF=17;FSAR=28;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=0.00684617;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=296.338;QD=37.3273;RBI=0.021379;REFB=-0.00907758;REVB=0.0202532;RO=12;SAF=16;SAR=28;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125414;STB=0.562673;STBP=0.07;TYPE=ins;VARB=0.00215472;OID=.;OPOS=120792298;OREF=-;OALT=CTA;OMAPALT=GCTA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.789474:44:57:45:57:12:17:28:8:4:77:12:16:28:8:4
chr10	120792684	.	A	G	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0147912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.909;QD=53.2772;RBI=0.0731024;REFB=0;REVB=0.0715904;RO=0;SAF=15;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000435911;OID=.;OPOS=120792684;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:8:15:0:0:8:15:0:0
chr10	120792703	.	C	A	638.81	PASS	AF=0.976744;AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00366923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.401;QD=59.4241;RBI=0.0151324;REFB=-0.0382585;REVB=0.0146808;RO=0;SAF=23;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512814;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.000388711;OID=.;OPOS=120792703;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:43:43:0:1:42:42:0.976744:19:23:0:0:19:23:0:1
chr10	120820528	.	A	G	272.22	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0100947;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=63.7763;QD=51.852;RBI=0.026704;REFB=0;REVB=0.0247224;RO=0;SAF=12;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000295888;OID=.;OPOS=120820528;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:9:12:0:0:9:12:0:0
chr10	120828969	.	A	G	376.34	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0286046;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.184;QD=55.754;RBI=0.0560446;REFB=0;REVB=0.0481952;RO=0;SAF=15;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000587634;OID=.;OPOS=120828969;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:27:0:0:25:27:1:10:15:0:0:10:17:0:0
chr10	120896027	.	G	A	756.31	PASS	AF=1;AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00466227;FXX=0.040808;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.5112;QD=64.3667;RBI=0.0735357;REFB=0;REVB=-0.0733877;RO=0;SAF=26;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.67479e-05;OID=.;OPOS=120896027;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:47:0:0:47:47:1:21:26:0:0:21:26:0:0
chr10	120909785	.	C	T	804.06	PASS	AF=0.95082;AO=58;DP=63;FAO=58;FDP=61;FR=.;FRO=3;FSAF=36;FSAR=22;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.00473063;FXX=0.031741;HRUN=2;LEN=1;MLLD=271.335;QD=52.725;RBI=0.00849663;REFB=-0.0138014;REVB=0.0070579;RO=3;SAF=36;SAR=22;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00452884;STB=0.502403;STBP=0.918;TYPE=snp;VARB=0.000868667;OID=.;OPOS=120909785;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:63:61:3:3:58:58:0.95082:22:36:2:1:22:36:2:1
chr10	120909795	.	TGGGGC	TGGGC,TGGGCA	309.18	PASS	AF=0.9375,0;AO=20,2;DP=31;FAO=30,0;FDP=32;FR=.;FRO=2;FSAF=8,0;FSAR=22,0;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.123211,-0.0701039;FXX=0.0302939;HRUN=4,4;LEN=1,2;MLLD=16.0974,35.8622;QD=38.6474;RBI=0.137759,0.0703519;REFB=-0.166761,-0.00422128;REVB=0.0616165,0.00590176;RO=7;SAF=3,2;SAR=17,0;SRF=3;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.212323,0.621371;STB=0.518312,0.5;STBP=0.567,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.0487671,0;OID=.,.;OPOS=120909796,120909799;OREF=G,GC;OALT=-,CA;OMAPALT=TGGGC,TGGGCA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.9375,0:20,2:31:30,0:32:2:8,0:22,0:1:1:6:7:3,2:17,0:3:4
chr10	120917445	.	G	A	358.08	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000944869;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.351;QD=55.0894;RBI=0.0579041;REFB=0;REVB=0.0578964;RO=0;SAF=11;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000198131;OID=.;OPOS=120917445;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:15:11:0:0:15:11:0:0
chr10	120919246	.	T	C	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0126979;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.562;QD=51.1846;RBI=0.0139636;REFB=0;REVB=0.00580895;RO=0;SAF=12;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000426279;OID=.;OPOS=120919246;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:8:12:0:0:8:12:0:0
chr10	120920588	.	T	C	519.98	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0470758;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.7243;QD=59.4263;RBI=0.0550778;REFB=0;REVB=-0.0285908;RO=0;SAF=17;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00147444;OID=.;OPOS=120920588;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:18:17:0:0:18:17:0:0
chr10	120933324	.	G	A	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.817;QD=49.5991;RBI=0.0328984;REFB=0;REVB=-0.0328984;RO=0;SAF=0;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000506382;OID=.;OPOS=120933324;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:18:0:0:0:18:0:0:0
chr10	121196335	.	G	A	382.13	PASS	AF=0.506494;AO=39;DP=77;FAO=39;FDP=77;FR=.;FRO=38;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=25;FSRR=13;FWDB=-0.00823183;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.486;QD=19.851;RBI=0.0126753;REFB=-0.0127053;REVB=0.00963849;RO=38;SAF=24;SAR=15;SRF=25;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0403716;STB=0.522377;STBP=0.721;TYPE=snp;VARB=0.011587;OID=.;OPOS=121196335;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:38:38:39:39:0.506494:15:24:25:13:15:24:25:13
chr10	121436068	.	T	G	80.12	PASS	AF=0.526316;AO=9;DP=18;FAO=10;FDP=19;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=0.0400301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.711;QD=16.8664;RBI=0.042288;REFB=-0.0410495;REVB=-0.0136334;RO=9;SAF=3;SAR=6;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112036;STB=0.590739;STBP=0.47;TYPE=snp;VARB=0.0304143;OID=.;OPOS=121436068;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:18:19:9:9:9:10:0.526316:6:3:2:7:6:4:2:7
chr10	121436286	.	C	T	134.93	PASS	AF=0.46875;AO=14;DP=32;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.049787;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.9789;QD=16.8662;RBI=0.073361;REFB=-0.0151435;REVB=0.0538804;RO=18;SAF=10;SAR=4;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17127;STB=0.545393;STBP=0.673;TYPE=snp;VARB=0.0396033;OID=.;OPOS=121436286;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:18:17:14:15:0.46875:4:10:10:8:5:10:10:7
chr10	121436362	.	A	G	224.91	PASS	AF=0.488889;AO=22;DP=45;FAO=22;FDP=45;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.00921579;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.334;QD=19.9919;RBI=0.020921;REFB=0.00063918;REVB=-0.0187818;RO=23;SAF=10;SAR=12;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0609466;STB=0.534382;STBP=0.67;TYPE=snp;VARB=-0.00101499;OID=.;OPOS=121436362;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:23:23:22:22:0.488889:12:10:12:11:12:10:12:11
chr10	121527997	.	C	T	303.49	PASS	AF=0.563636;AO=31;DP=55;FAO=31;FDP=55;FR=.;FRO=24;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.0035941;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.623;QD=22.0718;RBI=0.00400283;REFB=-0.00979236;REVB=0.00176213;RO=24;SAF=19;SAR=12;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156572;STB=0.586642;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=0.0118824;OID=.;OPOS=121527997;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:24:24:31:31:0.563636:12:19:10:14:12:19:10:14
chr10	121551581	.	A	C	358.11	PASS	AF=0.5625;AO=36;DP=64;FAO=36;FDP=64;FR=.;FRO=28;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=7.82351e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=299.564;QD=22.3817;RBI=0.0164836;REFB=-0.0148189;REVB=0.0164835;RO=28;SAF=16;SAR=20;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0127699;STB=0.507038;STBP=0.904;TYPE=snp;VARB=0.0132224;OID=.;OPOS=121551581;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:28:28:36:36:0.5625:20:16:12:16:20:16:12:16
chr10	121579040	.	T	C	200.96	PASS	AF=0.433962;AO=23;DP=53;FAO=23;FDP=53;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=0.0223015;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=227.272;QD=15.167;RBI=0.0224454;REFB=0.0183698;REVB=0.0025371;RO=30;SAF=8;SAR=15;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124136;STB=0.570871;STBP=0.389;TYPE=snp;VARB=-0.0162949;OID=.;OPOS=121579040;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:30:30:23:23:0.433962:15:8:14:16:15:8:14:16
chr10	121586827	.	A	G	67.42	PASS	AF=0.45;AO=9;DP=20;FAO=9;FDP=20;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.0292358;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.167;QD=13.4848;RBI=0.0449667;REFB=-0.0179514;REVB=-0.0341654;RO=10;SAF=2;SAR=7;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.286347;STB=0.652961;STBP=0.25;TYPE=snp;VARB=0.0214204;OID=.;OPOS=121586827;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:20:20:10:11:9:9:0.45:7:2:5:5:7:2:5:6
chr10	121588537	.	A	G	221.69	PASS	AF=0.375;AO=27;DP=72;FAO=27;FDP=72;FR=.;FRO=45;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=24;FSRR=21;FWDB=-0.0267037;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.1;QD=12.3158;RBI=0.0499819;REFB=-0.0044384;REVB=0.0422505;RO=45;SAF=9;SAR=18;SRF=24;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.222768;STB=0.628474;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=0.0114799;OID=.;OPOS=121588537;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:45:45:27:27:0.375:18:9:24:21:18:9:24:21
chr10	121588554	.	T	A	282.79	PASS	AF=0.417722;AO=32;DP=79;FAO=33;FDP=79;FR=.;FRO=46;FSAF=10;FSAR=23;FSRF=23;FSRR=23;FWDB=0.0516435;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.6298;QD=14.3184;RBI=0.071619;REFB=-0.00761459;REVB=0.0496209;RO=46;SAF=10;SAR=22;SRF=22;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183693;STB=0.622564;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=0.0087985;OID=.;OPOS=121588554;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:46:46:32:33:0.417722:22:10:22:24:23:10:23:23
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chr10	121671651	.	T	C	367.6	PASS	AF=0.362903;AO=44;DP=123;FAO=45;FDP=124;FR=.;FRO=79;FSAF=19;FSAR=26;FSRF=35;FSRR=44;FWDB=-0.0124071;FXX=0.00799936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.592;QD=11.8581;RBI=0.0217979;REFB=-0.0095081;REVB=0.0179224;RO=78;SAF=19;SAR=25;SRF=34;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00463994;STB=0.513527;STBP=0.827;TYPE=snp;VARB=0.015429;OID=.;OPOS=121671651;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:123:124:78:79:44:45:0.362903:25:19:34:44:26:19:35:44
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chr10	121693246	.	A	G	239.34	PASS	AF=0.5;AO=23;DP=46;FAO=23;FDP=46;FR=.;FRO=23;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=0.0181302;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=243.523;QD=20.8117;RBI=0.0281597;REFB=-0.007829;REVB=0.0215468;RO=23;SAF=15;SAR=8;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160489;STB=0.590471;STBP=0.231;TYPE=snp;VARB=0.00731367;OID=.;OPOS=121693246;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:23:23:23:23:0.5:8:15:11:12:8:15:11:12
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chr10	122216862	.	C	T	594.75	PASS	AF=0.407186;AO=67;DP=165;FAO=68;FDP=167;FR=.;FRO=99;FSAF=41;FSAR=27;FSRF=41;FSRR=58;FWDB=0.0235319;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.396;QD=14.2456;RBI=0.0236618;REFB=-0.00701803;REVB=-0.00247619;RO=97;SAF=40;SAR=27;SRF=40;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.193614;STB=0.611478;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.00819231;OID=.;OPOS=122216862;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:165:167:97:99:67:68:0.407186:27:40:40:57:27:41:41:58
chr10	122358342	.	G	C,T	688.31	PASS	AF=0.941176,0.0392157;AO=48,2;DP=51;FAO=48,2;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=20,0;FSAR=28,2;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0240903,0.0188689;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=103.01,31.2377;QD=53.9853;RBI=0.0241993,0.0189909;REFB=-0.122904,-0.0665688;REVB=0.00229462,-0.00214984;RO=1;SAF=20,0;SAR=28,2;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0165072,0;STB=0.508768,0.5;STBP=0.529,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00181187,0.0688471;OID=.,.;OPOS=122358342,122358342;OREF=G,G;OALT=C,T;OMAPALT=C,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:51:51:1:1:48,2:48,2:0.941176,0.0392157:28,2:20,0:0:1:28,2:20,0:0:1
chr10	122358463	.	G	A	1246.11	PASS	AF=1;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0109512;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=208.952;QD=61.5363;RBI=0.025174;REFB=0;REVB=0.0226672;RO=0;SAF=36;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.42691e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.17053e-05;OID=.;OPOS=122358463;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:81:0:0:81:81:1:45:36:0:0:45:36:0:0
chr10	122359344	.	C	T	972.88	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00912476;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.57;QD=58.9626;RBI=0.0219328;REFB=0;REVB=0.0199446;RO=0;SAF=44;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.52372e-05;OID=.;OPOS=122359344;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:22:44:0:0:22:44:0:0
chr10	122624679	.	G	A	849.4	PASS	AF=0.953125;AO=61;DP=64;FAO=61;FDP=64;FR=.;FRO=3;FSAF=33;FSAR=28;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0226851;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.8344;QD=53.0873;RBI=0.0268574;REFB=-0.0901113;REVB=0.0143772;RO=3;SAF=33;SAR=28;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0409966;STB=0.521732;STBP=0.131;TYPE=snp;VARB=0.00826861;OID=.;OPOS=122624679;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:64:64:3:3:61:61:0.953125:28:33:3:0:28:33:3:0
chr10	122645376	.	A	T	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.117264;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.033;QD=47.8212;RBI=0.118455;REFB=0;REVB=0.0167574;RO=0;SAF=3;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.78418e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000927687;OID=.;OPOS=122645376;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:13:3:0:0:13:3:0:0
chr10	122663585	.	G	A	1062.43	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0113313;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.696;QD=59.855;RBI=0.0188408;REFB=0;REVB=-0.0150524;RO=0;SAF=32;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.69917e-05;OID=.;OPOS=122663585;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:39:32:0:0:39:32:0:0
chr10	123239112	.	G	A	615.93	PASS	AF=0.447552;AO=64;DP=144;FAO=64;FDP=143;FR=.;FRO=79;FSAF=33;FSAR=31;FSRF=37;FSRR=42;FWDB=0.0038705;FXX=0.00694396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.657;QD=17.2287;RBI=0.00423554;REFB=-0.0115438;REVB=0.00172017;RO=80;SAF=33;SAR=31;SRF=38;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0404675;STB=0.526089;STBP=0.584;TYPE=snp;VARB=0.020955;OID=.;OPOS=123239112;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:144:143:80:79:64:64:0.447552:31:33:38:42:31:33:37:42
chr10	123298158	.	T	C	785.75	PASS	AF=0.552239;AO=73;DP=135;FAO=74;FDP=134;FR=.;FRO=60;FSAF=32;FSAR=42;FSRF=36;FSRR=24;FWDB=0.00303755;FXX=0.00740686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.728;QD=23.4553;RBI=0.0256485;REFB=-0.0074567;REVB=0.025468;RO=61;SAF=32;SAR=41;SRF=37;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139445;STB=0.574859;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.00636808;OID=.;OPOS=123298158;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:135:134:61:60:73:74:0.552239:41:32:37:24:42:32:36:24
chr10	123310871	.	A	G	534.77	PASS	AF=0.549451;AO=50;DP=91;FAO=50;FDP=91;FR=.;FRO=41;FSAF=29;FSAR=21;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=-0.0488151;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.3103;QD=23.5063;RBI=0.0508214;REFB=-0.00940672;REVB=-0.0141387;RO=41;SAF=29;SAR=21;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0764953;STB=0.542039;STBP=0.382;TYPE=snp;VARB=0.00611583;OID=.;OPOS=123310871;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:41:41:50:50:0.549451:21:29:20:21:21:29:20:21
chr10	123549691	.	T	G	186.84	PASS	AF=0.5;AO=19;DP=38;FAO=19;FDP=38;FR=.;FRO=19;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=0.00164251;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.988;QD=19.6677;RBI=0.0033098;REFB=0.00102185;REVB=-0.00287349;RO=19;SAF=14;SAR=5;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.340786;STB=0.693665;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=-0.000517294;OID=.;OPOS=123549691;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:19:19:19:19:0.5:5:14:7:12:5:14:7:12
chr10	123596254	.	T	C	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00308453;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.2399;QD=44.6892;RBI=0.091573;REFB=0;REVB=0.0915211;RO=0;SAF=6;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00450712;OID=.;OPOS=123596254;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:7:6:0:0:7:6:0:0
chr10	123673339	.	T	C	853.56	PASS	AF=1;AO=58;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00553293;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.757;QD=57.8686;RBI=0.0695009;REFB=0;REVB=0.0692803;RO=0;SAF=22;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000185752;OID=.;OPOS=123673339;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:58:59:1:36:22:0:0:37:22:0:0
chr10	123719928	.	C	T	108.38	PASS	AF=0.351351;AO=13;DP=38;FAO=13;FDP=37;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=17;FWDB=-0.00657313;FXX=0.0512689;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.225;QD=11.7164;RBI=0.0369499;REFB=-0.00635819;REVB=-0.0363605;RO=24;SAF=5;SAR=8;SRF=7;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111091;STB=0.565515;STBP=0.593;TYPE=snp;VARB=0.00750614;OID=.;OPOS=123719928;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:37:24:24:13:13:0.351351:8:5:7:17:8:5:7:17
chr10	123845322	.	T	C	447.02	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.017643;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.001;QD=57.6794;RBI=0.0471585;REFB=0;REVB=0.0437338;RO=0;SAF=20;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000118078;OID=.;OPOS=123845322;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:11:20:0:0:11:20:0:0
chr10	123976391	.	C	A	782.1	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0185633;FXX=0.017854;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.802;QD=56.8801;RBI=0.0193;REFB=0;REVB=0.00528116;RO=0;SAF=32;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.49259e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000637663;OID=.;OPOS=123976391;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:23:32:0:0:23:32:0:0
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chr10	124183732	.	T	C	3164.54	PASS	AF=1;AO=205;DP=205;FAO=205;FDP=205;FR=.;FRO=0;FSAF=103;FSAR=102;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00251441;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.4512;QD=61.7471;RBI=0.0160998;REFB=0;REVB=-0.0159023;RO=0;SAF=103;SAR=102;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.03006e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.76364e-05;OID=.;OPOS=124183732;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:17:205:205:0:0:205:205:1:102:103:0:0:102:103:0:0
chr10	124189197	.	A	G	990.48	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0574775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.0834;QD=59.1334;RBI=0.0715111;REFB=0;REVB=0.0425461;RO=0;SAF=51;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17211e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000425351;OID=.;OPOS=124189197;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:16:51:0:0:16:51:0:0
chr10	124214251	.	G	A	285.22	PASS	AF=0.432432;AO=32;DP=74;FAO=32;FDP=74;FR=.;FRO=42;FSAF=26;FSAR=6;FSRF=37;FSRR=5;FWDB=-0.0194331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.987;QD=15.4173;RBI=0.0993542;REFB=-0.0188669;REVB=0.0974352;RO=42;SAF=26;SAR=6;SRF=37;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123971;STB=0.569238;STBP=0.447;TYPE=snp;VARB=0.0262321;OID=.;OPOS=124214251;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:42:42:32:32:0.432432:6:26:37:5:6:26:37:5
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chr10	124339378	.	A	G	247.34	PASS	AF=0.402778;AO=29;DP=72;FAO=29;FDP=72;FR=.;FRO=43;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=24;FSRR=19;FWDB=0.0146112;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.718;QD=13.7412;RBI=0.0504544;REFB=-0.00500104;REVB=0.0482924;RO=43;SAF=19;SAR=10;SRF=24;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107816;STB=0.561628;STBP=0.422;TYPE=snp;VARB=0.00665721;OID=.;OPOS=124339378;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:43:43:29:29:0.402778:10:19:24:19:10:19:24:19
chr10	124348684	.	C	T	270.97	PASS	AF=0.262069;AO=38;DP=146;FAO=38;FDP=145;FR=.;FRO=107;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=50;FSRR=57;FWDB=0.0392045;FXX=0.00684885;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.709;QD=7.47508;RBI=0.040632;REFB=-0.0124544;REVB=-0.0106754;RO=107;SAF=16;SAR=22;SRF=50;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0578693;STB=0.534591;STBP=0.592;TYPE=snp;VARB=0.0389283;OID=.;OPOS=124348684;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:146:145:107:107:38:38:0.262069:22:16:50:57:22:16:50:57
chr10	124351954	.	G	A	1804.77	PASS	AF=0.722222;AO=143;DP=198;FAO=143;FDP=198;FR=.;FRO=55;FSAF=72;FSAR=71;FSRF=20;FSRR=35;FWDB=0.00745335;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.325;QD=36.46;RBI=0.026428;REFB=-0.0199853;REVB=0.0253552;RO=55;SAF=72;SAR=71;SRF=20;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0726974;STB=0.538825;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.0055164;OID=.;OPOS=124351954;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:198:198:55:55:143:143:0.722222:71:72:20:35:71:72:20:35
chr10	124351992	.	C	T	619.33	PASS	AF=0.387978;AO=71;DP=183;FAO=71;FDP=183;FR=.;FRO=112;FSAF=37;FSAR=34;FSRF=57;FSRR=55;FWDB=0.00456505;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=269.362;QD=13.5374;RBI=0.0108754;REFB=-0.00268841;REVB=0.00987085;RO=112;SAF=37;SAR=34;SRF=57;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0132434;STB=0.507472;STBP=0.874;TYPE=snp;VARB=0.00381648;OID=.;OPOS=124351992;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:183:183:112:112:71:71:0.387978:34:37:57:55:34:37:57:55
chr10	124402677	.	A	G	785.07	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0183697;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.201;QD=57.0961;RBI=0.0573214;REFB=0;REVB=-0.0542982;RO=0;SAF=34;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.77753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00027343;OID=.;OPOS=124402677;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:55:0:0:54:55:1:20:34:0:0:20:35:0:0
chr10	124457452	.	C	T	866.16	PASS	AF=1;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143572;FXX=0.063482;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.816;QD=58.7223;RBI=0.0282574;REFB=0;REVB=0.0243383;RO=0;SAF=36;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00172604;OID=.;OPOS=124457452;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:59:0:0:59:59:1:23:36:0:0:23:36:0:0
chr10	124457906	.	C	T	1736.63	PASS	AF=0.991379;AO=115;DP=116;FAO=115;FDP=116;FR=.;FRO=1;FSAF=51;FSAR=64;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0111578;FXX=0.00854628;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.176;QD=59.8837;RBI=0.0111973;REFB=0.014068;REVB=0.000938782;RO=1;SAF=51;SAR=64;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00922029;STB=0.504854;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=1.51101e-05;OID=.;OPOS=124457906;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:116:116:1:1:115:115:0.991379:64:51:1:0:64:51:1:0
chr10	124459139	.	T	C	990.62	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0261356;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.8632;QD=59.1413;RBI=0.0370181;REFB=0;REVB=0.0262158;RO=0;SAF=23;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.11549e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.28303e-07;OID=.;OPOS=124459139;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:44:23:0:0:44:23:0:0
chr10	124459248	.	G	T	364.11	PASS	AF=0.423913;AO=39;DP=92;FAO=39;FDP=92;FR=.;FRO=53;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=19;FSRR=34;FWDB=-0.0104321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.267;QD=15.8308;RBI=0.0138968;REFB=-0.01146;REVB=-0.00918117;RO=53;SAF=19;SAR=20;SRF=19;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132424;STB=0.574431;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=0.0184332;OID=.;OPOS=124459248;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:53:53:39:39:0.423913:20:19:19:34:20:19:19:34
chr10	124816515	.	C	G	446.99	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0189985;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.2681;QD=57.6757;RBI=0.0791989;REFB=0;REVB=0.0768864;RO=0;SAF=12;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.47712e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00093041;OID=.;OPOS=124816515;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:19:12:0:0:19:12:0:0
chr10	125426412	.	A	G	151.53	PASS	AF=0.333333;AO=20;DP=60;FAO=20;FDP=60;FR=.;FRO=40;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=24;FSRR=16;FWDB=-0.0172938;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.468;QD=10.1023;RBI=0.0178817;REFB=-0.00979647;REVB=-0.00454777;RO=39;SAF=9;SAR=11;SRF=23;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156378;STB=0.598913;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=0.0162605;OID=.;OPOS=125426412;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:39:40:20:20:0.333333:11:9:23:16:11:9:24:16
chr10	125426565	.	G	C	1124.04	PASS	AF=0.986842;AO=75;DP=77;FAO=75;FDP=76;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.017515;FXX=0.0129853;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.773;QD=59.1602;RBI=0.0178824;REFB=0.00263567;REVB=0.00360625;RO=1;SAF=35;SAR=40;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133266;STB=0.50704;STBP=0.325;TYPE=snp;VARB=-6.87896e-05;OID=.;OPOS=125426565;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:77:76:1:1:75:75:0.986842:40:35:1:0:40:35:1:0
chr10	125449015	.	G	A	727.71	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0404106;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.929;QD=63.2795;RBI=0.0409081;REFB=0;REVB=-0.00636048;RO=0;SAF=24;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000153778;OID=.;OPOS=125449015;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:22:24:0:0:22:24:0:0
chr10	125450846	.	A	AC	34.5	PASS	AF=0.150943;AO=9;DP=54;FAO=8;FDP=53;FR=.;FRO=45;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=29;FSRR=16;FWDB=-0.0639734;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=22.0628;QD=2.60382;RBI=0.130938;REFB=-0.0407053;REVB=-0.114246;RO=43;SAF=1;SAR=8;SRF=29;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.636922;STB=0.900392;STBP=0.036;TYPE=ins;VARB=0.062504;OID=.;OPOS=125450847;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.150943:9:54:8:53:45:1:7:29:16:34:43:1:8:29:14
chr10	125450857	.	C	G	748.79	PASS	AF=1;AO=45;DP=54;FAO=53;FDP=53;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=31;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0788402;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.708;QD=56.5122;RBI=0.108703;REFB=0;REVB=0.0748374;RO=0;SAF=26;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.15971e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00122868;OID=.;OPOS=125450857;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:53:0:0:45:53:1:19:26:0:0:22:31:0:0
chr10	125506302	.	T	C	340.74	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00220838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.368;QD=54.5176;RBI=0.0110812;REFB=0;REVB=0.0108589;RO=0;SAF=11;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.9324e-05;OID=.;OPOS=125506302;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:14:11:0:0:14:11:0:0
chr10	125521626	.	G	A	207.31	PASS	AF=0.588235;AO=20;DP=34;FAO=20;FDP=34;FR=.;FRO=14;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=3;FWDB=-0.0207043;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.199;QD=24.3899;RBI=0.0260852;REFB=-0.00436021;REVB=0.0158673;RO=14;SAF=9;SAR=11;SRF=11;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.244552;STB=0.635709;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.00450495;OID=.;OPOS=125521626;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:14:14:20:20:0.588235:11:9:11:3:11:9:11:3
chr10	125528048	.	G	A	680.84	PASS	AF=0.448485;AO=73;DP=165;FAO=74;FDP=165;FR=.;FRO=91;FSAF=43;FSAR=31;FSRF=56;FSRR=35;FWDB=-0.00279621;FXX=0.00602373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.224;QD=16.5052;RBI=0.00412368;REFB=-0.00743506;REVB=0.00303084;RO=91;SAF=43;SAR=30;SRF=56;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0272835;STB=0.519548;STBP=0.675;TYPE=snp;VARB=0.0104999;OID=.;OPOS=125528048;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:165:165:91:91:73:74:0.448485:30:43:56:35:31:43:56:35
chr10	125601975	.	G	A	174.09	PASS	AF=0.5;AO=18;DP=36;FAO=18;FDP=36;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=0.00627774;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.045;QD=19.3436;RBI=0.0208539;REFB=0.00498896;REVB=-0.0198866;RO=18;SAF=10;SAR=8;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194029;STB=0.609637;STBP=0.207;TYPE=snp;VARB=-0.00323791;OID=.;OPOS=125601975;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:18:18:18:18:0.5:8:10:6:12:8:10:6:12
chr10	126089434	.	G	A	174.91	PASS	AF=0.486486;AO=18;DP=37;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=14;FWDB=-0.0621948;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.6101;QD=18.9088;RBI=0.0722975;REFB=-0.00486455;REVB=-0.0368611;RO=18;SAF=9;SAR=9;SRF=5;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197011;STB=0.621494;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=0.00574436;OID=.;OPOS=126089434;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:18:19:18:18:0.486486:9:9:5:13:9:9:5:14
chr10	126172863	.	A	G	651.23	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0493202;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.575;QD=62.022;RBI=0.0513399;REFB=0;REVB=-0.0142584;RO=0;SAF=15;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.13648e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00017161;OID=.;OPOS=126172863;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:27:15:0:0:27:15:0:0
chr10	126517989	.	G	A	955.17	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0254925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.9345;QD=58.7799;RBI=0.0264847;REFB=0;REVB=-0.00718126;RO=0;SAF=32;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000187583;OID=.;OPOS=126517989;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:33:32:0:0:33:32:0:0
chr10	126674093	.	T	C	411.04	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0139402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.133;QD=56.6954;RBI=0.0249542;REFB=0;REVB=-0.0206975;RO=0;SAF=15;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.17296e-05;OID=.;OPOS=126674093;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:14:15:0:0:14:15:0:0
chr10	126674227	.	C	CT	1000.62	PASS	AF=1;AO=99;DP=118;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0490589;FXX=0.00909008;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.9268;QD=36.72;RBI=0.0660748;REFB=0;REVB=-0.0442618;RO=12;SAF=40;SAR=59;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0376956;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.000953659;OID=.;OPOS=126674228;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:99:118:109:109:0:42:67:0:0:19:12:40:59:7:5
chr10	126677239	.	GAAGAA	G	80.73	PASS	AF=0.52381;AO=10;DP=23;FAO=11;FDP=21;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=-0.0109386;FXX=0.124948;HRUN=2;LEN=5;MLLD=184.027;QD=15.378;RBI=0.018845;REFB=0.00556974;REVB=0.0153454;RO=8;SAF=3;SAR=7;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167675;STB=0.621126;STBP=0.25;TYPE=del;VARB=-0.00757051;OID=.;OPOS=126677240;OREF=AAGAA;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.52381:10:23:11:21:10:3:8:5:5:71:8:3:7:4:4
chr10	126677262	.	G	A	50.93	PASS	AF=0.210526;AO=8;DP=38;FAO=8;FDP=38;FR=.;FRO=30;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=22;FWDB=0.00458832;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.3717;QD=5.36136;RBI=0.044321;REFB=-0.00231021;REVB=-0.0440828;RO=30;SAF=6;SAR=2;SRF=8;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.535812;STB=0.836516;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.0142818;OID=.;OPOS=126677262;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:50:38:38:30:30:8:8:0.210526:2:6:8:22:2:6:8:22
chr10	126677266	.	A	T	92.95	PASS	AF=0.3;AO=11;DP=40;FAO=12;FDP=40;FR=.,HEALED;FRO=28;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=20;FWDB=0.00401338;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=38.8419;QD=9.29503;RBI=0.105366;REFB=-0.0124473;REVB=-0.10529;RO=20;SAF=6;SAR=5;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.208678;STB=0.6997;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=0.0178548;OID=.;OPOS=126677266;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:40:40:20:28:11:12:0.3:5:6:7:13:5:7:8:20
chr10	126677287	.	GACAA	G	32.6	PASS	AF=0.12766;AO=6;DP=47;FAO=6;FDP=47;FR=.;FRO=41;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=14;FSRR=27;FWDB=0.00430414;FXX=0;HRUN=1;LEN=4;MLLD=287.806;QD=2.77408;RBI=0.0147425;REFB=-0.00621771;REVB=-0.0141002;RO=41;SAF=4;SAR=2;SRF=14;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.368444;STB=0.76239;STBP=0.199;TYPE=del;VARB=0.054403;OID=.;OPOS=126677288;OREF=ACAA;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.12766:6:47:6:47:41:4:2:14:27:32:41:4:2:14:27
chr10	126677308	.	A	T	99.53	PASS	AF=0.259259;AO=14;DP=53;FAO=14;FDP=54;FR=.;FRO=40;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=24;FWDB=0.0250071;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=46.9386;QD=7.37295;RBI=0.0341062;REFB=-0.00965484;REVB=-0.0231922;RO=39;SAF=6;SAR=8;SRF=16;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0224939;STB=0.521708;STBP=0.876;TYPE=snp;VARB=0.0262961;OID=.;OPOS=126677308;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:54:39:40:14:14:0.259259:8:6:16:23:8:6:16:24
chr10	126677323	.	A	T	92.87	PASS	AF=0.245283;AO=13;DP=53;FAO=13;FDP=53;FR=.;FRO=40;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=23;FWDB=0.00993538;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.21;QD=7.00932;RBI=0.00996261;REFB=-0.00345092;REVB=-0.000736108;RO=40;SAF=5;SAR=8;SRF=17;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.050778;STB=0.531673;STBP=0.812;TYPE=snp;VARB=0.00796467;OID=.;OPOS=126677323;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:53:53:40:40:13:13:0.245283:8:5:17:23:8:5:17:23
chr10	126677363	.	T	C	56.78	PASS	AF=0.173077;AO=8;DP=51;FAO=9;FDP=52;FR=.;FRO=43;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=20;FSRR=23;FWDB=0.0294069;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=56.3448;QD=4.3677;RBI=0.0354113;REFB=-0.0245314;REVB=0.019728;RO=43;SAF=3;SAR=5;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111631;STB=0.517203;STBP=0.949;TYPE=snp;VARB=0.0769823;OID=.;OPOS=126677363;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:51:52:43:43:8:9:0.173077:5:3:20:23:5:4:20:23
chr10	126677367	.	T	G	57.98	PASS	AF=0.18;AO=9;DP=50;FAO=9;FDP=50;FR=.;FRO=41;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=-0.0202027;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.098;QD=4.6386;RBI=0.020264;REFB=-0.00553407;REVB=0.0015743;RO=41;SAF=4;SAR=5;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0233907;STB=0.51566;STBP=0.954;TYPE=snp;VARB=0.0364409;OID=.;OPOS=126677367;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:50:50:41:41:9:9:0.18:5:4:19:22:5:4:19:22
chr10	126677391	.	A	C	40.51	PASS	AF=0.145833;AO=7;DP=48;FAO=7;FDP=48;FR=.;FRO=41;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=0.0183364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.9201;QD=3.37596;RBI=0.0297646;REFB=-0.00600587;REVB=0.0234459;RO=41;SAF=3;SAR=4;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100219;STB=0.571225;STBP=0.751;TYPE=snp;VARB=0.0341327;OID=.;OPOS=126677391;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:40:48:48:41:41:7:7:0.145833:4:3:21:20:4:3:21:20
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chr10	126683087	.	T	C	92.61	PASS	AF=0.183908;AO=16;DP=87;FAO=16;FDP=87;FR=.;FRO=71;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=42;FSRR=29;FWDB=-0.0151644;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.619;QD=4.25793;RBI=0.0296005;REFB=-0.00275209;REVB=0.0254211;RO=71;SAF=6;SAR=10;SRF=42;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.267676;STB=0.672061;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.0161018;OID=.;OPOS=126683087;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:87:87:71:71:16:16:0.183908:10:6:42:29:10:6:42:29
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chr10	126683123	.	A	C	119.88	PASS	AF=0.211111;AO=19;DP=89;FAO=19;FDP=90;FR=.;FRO=71;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=39;FSRR=32;FWDB=-0.0357554;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.095;QD=5.32816;RBI=0.0374956;REFB=-0.00424135;REVB=0.0112902;RO=70;SAF=6;SAR=13;SRF=38;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.285434;STB=0.684017;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.0137607;OID=.;OPOS=126683123;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:90:70:71:19:19:0.211111:13:6:38:32:13:6:39:32
chr10	126683150	.	AC	AT,GT	119.24	PASS	AF=0.144928,0.130435;AO=10,8;DP=69;FAO=10,9;FDP=69;FR=.;FRO=50;FSAF=4,2;FSAR=6,7;FSRF=28;FSRR=22;FWDB=0.00478427,0.0121142;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=83.4695,126.856;QD=6.91261;RBI=0.038578,0.0387313;REFB=-0.00835324,-0.00735313;REVB=-0.0382802,-0.0367881;RO=50;SAF=4,2;SAR=6,6;SRF=28;SRR=22;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.195402,-0.369515;STB=0.631321,0.782959;STBP=0.405,0.097;TYPE=snp,mnp;VARB=0.0264328,0.023487;OID=.,.;OPOS=126683151,126683150;OREF=C,AC;OALT=T,GT;OMAPALT=AT,GT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:69:69:50:50:10,8:10,9:0.144928,0.130435:6,6:4,2:28:22:6,7:4,2:28:22
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chr10	126691605	.	C	A	48.42	PASS	AF=0.131579;AO=10;DP=76;FAO=10;FDP=76;FR=.;FRO=66;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=34;FSRR=32;FWDB=-0.0018087;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.761;QD=2.54851;RBI=0.00703081;REFB=-8.86288e-05;REVB=-0.00679418;RO=64;SAF=4;SAR=6;SRF=32;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122561;STB=0.5998;STBP=0.562;TYPE=snp;VARB=0.000481009;OID=.;OPOS=126691605;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:48:76:76:64:66:10:10:0.131579:6:4:32:32:6:4:34:32
chr10	126691608	.	C	T	49.97	PASS	AF=0.136986;AO=8;DP=74;FAO=10;FDP=73;FR=.;FRO=63;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=33;FSRR=30;FWDB=0.00208944;FXX=0.0394685;HRUN=1;LEN=1;MLLD=300.103;QD=2.73832;RBI=0.0052037;REFB=-0.00563938;REVB=0.00476578;RO=66;SAF=4;SAR=4;SRF=34;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0177704;STB=0.606345;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.027389;OID=.;OPOS=126691608;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:49:74:73:66:63:8:10:0.136986:4:4:34:32:6:4:33:30
chr10	126691631	.	T	A	48.84	PASS	AF=0.133333;AO=10;DP=75;FAO=10;FDP=75;FR=.;FRO=65;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=33;FSRR=32;FWDB=-0.00511758;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.56;QD=2.60477;RBI=0.0116708;REFB=-0.000313046;REVB=0.010489;RO=65;SAF=4;SAR=6;SRF=33;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131561;STB=0.593395;STBP=0.552;TYPE=snp;VARB=0.00130055;OID=.;OPOS=126691631;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:48:75:75:65:65:10:10:0.133333:6:4:33:32:6:4:33:32
chr10	126691634	.	T	A	48.87	PASS	AF=0.133333;AO=10;DP=75;FAO=10;FDP=75;FR=.;FRO=65;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=33;FSRR=32;FWDB=-0.00190462;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.749;QD=2.60615;RBI=0.00208682;REFB=-0.00558983;REVB=0.0008528;RO=63;SAF=4;SAR=6;SRF=32;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132162;STB=0.593395;STBP=0.552;TYPE=snp;VARB=0.0184371;OID=.;OPOS=126691634;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:48:75:75:63:65:10:10:0.133333:6:4:32:31:6:4:33:32
chr10	126714714	.	G	C	192.9	PASS	AF=0.575758;AO=19;DP=33;FAO=19;FDP=33;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.014999;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=245.603;QD=23.3816;RBI=0.0222312;REFB=-0.0260529;REVB=0.016409;RO=14;SAF=5;SAR=14;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20463;STB=0.615255;STBP=0.141;TYPE=snp;VARB=0.0127023;OID=.;OPOS=126714714;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:14:14:19:19:0.575758:14:5:7:7:14:5:7:7
chr10	126714966	.	A	G	97.03	PASS	AF=0.611111;AO=11;DP=19;FAO=11;FDP=18;FR=.;FRO=7;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.0121567;FXX=0.0526039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.9293;QD=21.5615;RBI=0.0826748;REFB=-0.0294017;REVB=-0.0817761;RO=7;SAF=8;SAR=3;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124286;STB=0.571292;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.00613657;OID=.;OPOS=126714966;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:48:19:18:7:7:11:11:0.611111:3:8:4:3:3:8:4:3
chr10	126715075	.	T	C	63.35	PASS	AF=0.310345;AO=9;DP=29;FAO=9;FDP=29;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.0230414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.538;QD=8.73784;RBI=0.0231619;REFB=-0.0151028;REVB=0.0023596;RO=20;SAF=5;SAR=4;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00628668;STB=0.503867;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0295182;OID=.;OPOS=126715075;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:29:29:20:20:9:9:0.310345:4:5:11:9:4:5:11:9
chr10	126715242	.	GGCC	G,GC	36.49	PASS	AF=0,0.310345;AO=4,5;DP=35;FAO=0,9;FDP=29;FR=.;FRO=20;FSAF=0,1;FSAR=0,8;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.0563098,-0.1051;FXX=0.0644953;HRUN=3,3;LEN=3,2;MLLD=33.087,23.4449;QD=5.0332;RBI=0.150341,0.212999;REFB=-0.0180851,-0.0579547;REVB=-0.139398,-0.185263;RO=24;SAF=0,1;SAR=4,4;SRF=15;SRR=9;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.677679,-0.476343;STB=0.5,0.848687;STBP=1,0.025;TYPE=del,del;VARB=0,0.121893;OID=.,.;OPOS=126715243,126715243;OREF=GCC,GC;OALT=-,-;OMAPALT=G,GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,0.310345:4,5:35:0,9:29:20:0,1:0,8:11:9:36:24:0,1:4,4:15:9
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chr10	126715744	.	G	A	537.0	PASS	AF=0.52381;AO=55;DP=105;FAO=55;FDP=105;FR=.;FRO=50;FSAF=26;FSAR=29;FSRF=21;FSRR=29;FWDB=-0.00730178;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.5742;QD=20.4571;RBI=0.0408663;REFB=-0.0104358;REVB=0.0402087;RO=50;SAF=26;SAR=29;SRF=21;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0458715;STB=0.525243;STBP=0.611;TYPE=snp;VARB=0.0131946;OID=.;OPOS=126715744;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:105:50:50:55:55:0.52381:29:26:21:29:29:26:21:29
chr10	126721374	.	A	G	156.98	PASS	AF=0.435897;AO=17;DP=39;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=-0.0250029;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.006;QD=16.1;RBI=0.0309273;REFB=0.00072256;REVB=0.0182031;RO=22;SAF=9;SAR=8;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117594;STB=0.567489;STBP=0.454;TYPE=snp;VARB=-0.00243117;OID=.;OPOS=126721374;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:22:22:17:17:0.435897:8:9:9:13:8:9:9:13
chr10	126727602	.	T	A	154.89	PASS	AF=0.227723;AO=23;DP=101;FAO=23;FDP=101;FR=.;FRO=78;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=32;FSRR=46;FWDB=-0.0142692;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=157.793;QD=6.13417;RBI=0.0200765;REFB=0.00140792;REVB=0.0141229;RO=78;SAF=6;SAR=17;SRF=32;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.209355;STB=0.630738;STBP=0.173;TYPE=snp;VARB=-0.00352142;OID=.;OPOS=126727602;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:101:78:78:23:23:0.227723:17:6:32:46:17:6:32:46
chr10	126727604	.	T	C	156.81	PASS	AF=0.23;AO=23;DP=100;FAO=23;FDP=100;FR=.;FRO=77;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=32;FSRR=45;FWDB=-0.0601721;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.4119;QD=6.27218;RBI=0.060662;REFB=-0.0105055;REVB=-0.00769397;RO=77;SAF=6;SAR=17;SRF=32;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.215675;STB=0.634453;STBP=0.182;TYPE=snp;VARB=0.0396034;OID=.;OPOS=126727604;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:77:77:23:23:0.23:17:6:32:45:17:6:32:45
chr10	126727630	.	T	G	154.92	PASS	AF=0.258824;AO=22;DP=87;FAO=22;FDP=85;FR=.;FRO=63;FSAF=5;FSAR=17;FSRF=26;FSRR=37;FWDB=0.0073379;FXX=0.0229859;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.559;QD=7.29032;RBI=0.0126456;REFB=-0.00473403;REVB=0.0102989;RO=63;SAF=5;SAR=17;SRF=26;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.261963;STB=0.66107;STBP=0.114;TYPE=snp;VARB=0.0181901;OID=.;OPOS=126727630;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:85:63:63:22:22:0.258824:17:5:26:37:17:5:26:37
chr10	127265374	.	T	C	362.85	PASS	AF=0.423913;AO=39;DP=90;FAO=39;FDP=92;FR=.;FRO=53;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=25;FSRR=28;FWDB=0.00444621;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.471;QD=15.7761;RBI=0.0214842;REFB=-0.0219701;REVB=0.0210191;RO=51;SAF=23;SAR=16;SRF=23;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140213;STB=0.553354;STBP=0.4;TYPE=snp;VARB=0.0202077;OID=.;OPOS=127265374;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:92:51:53:39:39:0.423913:16:23:23:28:17:22:25:28
chr10	127441439	.	G	A	168.9	PASS	AF=0.34375;AO=22;DP=64;FAO=22;FDP=64;FR=.;FRO=42;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=24;FWDB=-0.00281163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.691;QD=10.5563;RBI=0.020843;REFB=-0.00208278;REVB=-0.0206525;RO=41;SAF=8;SAR=14;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0880844;STB=0.544869;STBP=0.607;TYPE=snp;VARB=0.00443674;OID=.;OPOS=127441439;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:41:42:22:22:0.34375:14:8:18:23:14:8:18:24
chr10	127445408	.	G	T	74.97	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0395064;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.9548;QD=37.4855;RBI=0.0753073;REFB=0;REVB=-0.0641127;RO=0;SAF=4;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00848655;OID=.;OPOS=127445408;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:4:4:0:0:4:4:0:0
chr10	127462525	.	A	G	187.36	PASS	AF=0.411765;AO=21;DP=51;FAO=21;FDP=51;FR=.;FRO=30;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=-0.0132458;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.2262;QD=14.695;RBI=0.0403008;REFB=-0.00413835;REVB=-0.0380618;RO=30;SAF=10;SAR=11;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0441393;STB=0.525304;STBP=0.756;TYPE=snp;VARB=0.00676182;OID=.;OPOS=127462525;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:30:30:21:21:0.411765:11:10:13:17:11:10:13:17
chr10	127530325	.	T	C	199.68	PASS	AF=0.5;AO=20;DP=40;FAO=20;FDP=40;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=-0.0114075;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.117;QD=19.9678;RBI=0.0114968;REFB=-0.00980571;REVB=-0.00143007;RO=20;SAF=12;SAR=8;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176923;STB=0.5999;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=0.00794679;OID=.;OPOS=127530325;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:20:20:20:20:0.5:8:12:8:12:8:12:8:12
chr10	127579186	.	C	A	253.73	PASS	AF=0.21466;AO=40;DP=192;FAO=41;FDP=191;FR=.;FRO=150;FSAF=25;FSAR=16;FSRF=80;FSRR=70;FWDB=-0.0197566;FXX=0.0103622;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.408;QD=5.3138;RBI=0.0217419;REFB=-0.00407229;REVB=-0.0090768;RO=148;SAF=24;SAR=16;SRF=78;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0945329;STB=0.561327;STBP=0.367;TYPE=snp;VARB=0.0166088;OID=.;OPOS=127579186;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:192:191:148:150:40:41:0.21466:16:24:78:70:16:25:80:70
chr10	127579210	.	T	C	205.02	PASS	AF=0.182266;AO=37;DP=204;FAO=37;FDP=203;FR=.;FRO=166;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=90;FSRR=76;FWDB=-0.000633463;FXX=0.00490172;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.5664;QD=4.0398;RBI=0.0307574;REFB=-0.000739121;REVB=0.0307508;RO=166;SAF=20;SAR=17;SRF=90;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00210856;STB=0.50134;STBP=0.985;TYPE=snp;VARB=0.00336357;OID=.;OPOS=127579210;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:204:203:166:166:37:37:0.182266:17:20:90:76:17:20:90:76
chr10	127579214	.	A	G	63.44	PASS	AF=0.0926829;AO=19;DP=205;FAO=19;FDP=205;FR=.;FRO=186;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=102;FSRR=84;FWDB=0.0131591;FXX=0.00485413;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.306;QD=1.23777;RBI=0.0194587;REFB=-0.00310412;REVB=-0.0143346;RO=186;SAF=8;SAR=11;SRF=102;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149824;STB=0.614095;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.0220763;OID=.;OPOS=127579214;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:205:205:186:186:19:19:0.0926829:11:8:102:84:11:8:102:84
chr10	127579238	.	G	T	561.61	PASS	AF=0.344828;AO=70;DP=203;FAO=70;FDP=203;FR=.;FRO=133;FSAF=26;FSAR=44;FSRF=75;FSRR=58;FWDB=-0.017384;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.545;QD=11.0663;RBI=0.0253067;REFB=-0.00267223;REVB=-0.0183908;RO=133;SAF=26;SAR=44;SRF=75;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.220807;STB=0.626232;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.00649017;OID=.;OPOS=127579238;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:203:203:133:133:70:70:0.344828:44:26:75:58:44:26:75:58
chr10	127579264	.	A	G	63.22	PASS	AF=0.0983607;AO=18;DP=183;FAO=18;FDP=183;FR=.;FRO=165;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=75;FSRR=90;FWDB=-0.0163129;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.7976;QD=1.3818;RBI=0.0266848;REFB=-0.0031282;REVB=-0.0211179;RO=163;SAF=11;SAR=7;SRF=74;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186897;STB=0.639153;STBP=0.25;TYPE=snp;VARB=0.041903;OID=.;OPOS=127579264;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:183:183:163:165:18:18:0.0983607:7:11:74:89:7:11:75:90
chr10	127585173	.	T	C	126.6	PASS	AF=0.538462;AO=13;DP=25;FAO=14;FDP=26;FR=.;FRO=12;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.00325996;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.4576;QD=19.4761;RBI=0.0124058;REFB=-0.0208381;REVB=0.0119698;RO=12;SAF=8;SAR=5;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0991777;STB=0.568865;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.0309252;OID=.;OPOS=127585173;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:26:12:12:13:14:0.538462:5:8:6:6:5:9:6:6
chr10	127585179	.	G	C	328.82	PASS	AF=0.866667;AO=26;DP=30;FAO=26;FDP=30;FR=.;FRO=4;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0161241;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=323.661;QD=43.8422;RBI=0.0190731;REFB=-0.0332422;REVB=-0.010188;RO=4;SAF=18;SAR=8;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121098;STB=0.565662;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=0.00412908;OID=.;OPOS=127585179;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:20:30:30:4:4:26:26:0.866667:8:18:1:3:8:18:1:3
chr10	127585195	.	C	G	35.19	PASS	AF=0.222222;AO=6;DP=27;FAO=6;FDP=27;FR=.;FRO=21;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=15;FSRR=6;FWDB=0.0158208;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.3662;QD=5.21367;RBI=0.10023;REFB=-0.0016577;REVB=-0.0989731;RO=21;SAF=4;SAR=2;SRF=15;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0648388;STB=0.542719;STBP=0.874;TYPE=snp;VARB=-0.00334056;OID=.;OPOS=127585195;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:27:27:21:21:6:6:0.222222:2:4:15:6:2:4:15:6
chr10	127727913	.	G	A	251.39	PASS	AF=0.426471;AO=29;DP=68;FAO=29;FDP=68;FR=.;FRO=39;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=-0.103003;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.5366;QD=14.7878;RBI=0.104368;REFB=-0.00693146;REVB=-0.0168265;RO=38;SAF=16;SAR=13;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0520206;STB=0.522433;STBP=0.793;TYPE=snp;VARB=0.00721601;OID=.;OPOS=127727913;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:38:39:29:29:0.426471:13:16:19:19:13:16:20:19
chr10	127753478	.	G	A	773.13	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00425998;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.888;QD=63.1128;RBI=0.0123749;REFB=0;REVB=0.0116186;RO=0;SAF=28;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.56477e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000651713;OID=.;OPOS=127753478;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:49:0:0:48:49:1:20:28:0:0:20:29:0:0
chr10	127806693	.	G	A	1071.94	PASS	AF=0.596386;AO=99;DP=166;FAO=99;FDP=166;FR=.;FRO=67;FSAF=59;FSAR=40;FSRF=33;FSRR=34;FWDB=-0.00350483;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=268.553;QD=25.8299;RBI=0.00358603;REFB=0.0019032;REVB=0.000758827;RO=67;SAF=59;SAR=40;SRF=33;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0785619;STB=0.542621;STBP=0.2;TYPE=snp;VARB=-0.00145017;OID=.;OPOS=127806693;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:166:166:67:67:99:99:0.596386:40:59:33:34:40:59:33:34
chr10	127834139	.	T	G	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0312069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.827;QD=52.6132;RBI=0.0319131;REFB=0;REVB=0.00667616;RO=0;SAF=10;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.41073e-05;OID=.;OPOS=127834139;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:12:10:0:0:12:10:0:0
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chr10	129249662	.	G	A	519.96	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0449938;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.748;QD=59.4237;RBI=0.069544;REFB=0;REVB=0.0530275;RO=0;SAF=8;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000449825;OID=.;OPOS=129249662;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:27:8:0:0:27:8:0:0
chr10	129249676	.	C	T	179.78	PASS	AF=0.5625;AO=18;DP=32;FAO=18;FDP=32;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=0.0262694;FXX=0.0302939;HRUN=2;LEN=1;MLLD=250.764;QD=22.4725;RBI=0.0320362;REFB=-0.0221016;REVB=0.0183367;RO=13;SAF=6;SAR=12;SRF=3;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0895612;STB=0.560911;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.0217865;OID=.;OPOS=129249676;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:13:14:18:18:0.5625:12:6:3:10:12:6:3:11
chr10	129249693	.	G	A	161.56	PASS	AF=0.5;AO=17;DP=34;FAO=17;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.00811107;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.626;QD=19.0068;RBI=0.0520122;REFB=-0.00932159;REVB=0.0513759;RO=17;SAF=6;SAR=11;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160346;STB=0.591288;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.0110253;OID=.;OPOS=129249693;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:17:17:17:17:0.5:11:6:9:8:11:6:9:8
chr10	129249701	.	C	G	464.45	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0625891;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.5372;QD=58.0556;RBI=0.0626198;REFB=0;REVB=0.00195928;RO=0;SAF=16;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00135318;OID=.;OPOS=129249701;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:32:0:0:31:32:1:15:16:0:0:16:16:0:0
chr10	129534478	.	A	AGCGCGC,AGCGCGGC	87.03	PASS	AF=0,0.714286;AO=2,7;DP=14;FAO=0,10;FDP=14;FR=.;FRO=4;FSAF=0,6;FSAR=0,4;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0162422,0.0236815;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=6,7;MLLD=234.219,250.068;QD=24.8666;RBI=0.0168026,0.0244118;REFB=-0.034645,-0.0339326;REVB=-0.0043033,-0.0059264;RO=4;SAF=2,4;SAR=0,3;SRF=2;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.623114,0.0448465;STB=0.5,0.529352;STBP=1,0.729;TYPE=ins,ins;VARB=0,0.0130024;OID=.,.;OPOS=129534479,129534479;OREF=-,-;OALT=GCGCGC,GCGCGGC;OMAPALT=AGCGCGC,AGCGCGGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,0.714286:2,7:14:0,10:14:4:0,6:0,4:2:2:21:4:2,4:0,3:2:2
chr10	129534679	.	T	C	1586.28	PASS	AF=1;AO=101;DP=101;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00642804;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.649;QD=59.8597;RBI=0.0509096;REFB=0;REVB=0.0505022;RO=0;SAF=68;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-9.32919e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.06836e-05;OID=.;OPOS=129534679;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:101:106:0:0:101:106:1:33:68:0:0:38:68:0:0
chr10	129534739	.	C	G	1721.17	PASS	AF=0.938931;AO=120;DP=130;FAO=123;FDP=131;FR=.;FRO=8;FSAF=67;FSAR=56;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=0.01471;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=52.1312;QD=52.5549;RBI=0.016446;REFB=-0.0754823;REVB=0.0073544;RO=6;SAF=67;SAR=53;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0252624;STB=0.512664;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.00464314;OID=.;OPOS=129534739;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:20:130:131:6:8:120:123:0.938931:53:67:5:1:56:67:6:2
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chr10	129845903	.	C	T	905.92	PASS	AF=1;AO=62;DP=63;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.048108;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.944;QD=58.4463;RBI=0.055085;REFB=0;REVB=0.0268324;RO=0;SAF=30;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000116678;OID=.;OPOS=129845903;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:62:0:0:62:62:1:32:30:0:0:32:30:0:0
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chr10	129917560	.	T	C	269.53	PASS	AF=0.407895;AO=31;DP=76;FAO=31;FDP=76;FR=.;FRO=45;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=28;FWDB=0.0107084;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.5621;QD=14.186;RBI=0.0113449;REFB=0.00125254;REVB=-0.00374652;RO=45;SAF=17;SAR=14;SRF=17;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176277;STB=0.599937;STBP=0.161;TYPE=snp;VARB=-0.00175483;OID=.;OPOS=129917560;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:45:45:31:31:0.407895:14:17:17:28:14:17:17:28
chr10	131761693	.	T	G	649.75	PASS	AF=0.47482;AO=66;DP=139;FAO=66;FDP=139;FR=.;FRO=73;FSAF=35;FSAR=31;FSRF=43;FSRR=30;FWDB=-0.0523903;FXX=0.00714235;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.28;QD=18.6978;RBI=0.0545279;REFB=-0.0120642;REVB=0.0151177;RO=73;SAF=35;SAR=31;SRF=43;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0561353;STB=0.531069;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=0.0118533;OID=.;OPOS=131761693;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:139:139:73:73:66:66:0.47482:31:35:43:30:31:35:43:30
chr10	131934747	.	G	C	194.84	PASS	AF=0.444444;AO=20;DP=45;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=16;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=0.0382462;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.8295;QD=17.3191;RBI=0.0384731;REFB=-0.00566649;REVB=-0.00417161;RO=25;SAF=16;SAR=4;SRF=8;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.484249;STB=0.77749;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.00770309;OID=.;OPOS=131934747;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:25:25:20:20:0.444444:4:16:8:17:4:16:8:17
chr10	131959150	.	C	T	260.52	PASS	AF=0.509091;AO=28;DP=55;FAO=28;FDP=55;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=-0.0083911;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=190.559;QD=18.9471;RBI=0.010866;REFB=-0.0176968;REVB=-0.00690352;RO=26;SAF=15;SAR=13;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0308883;STB=0.508469;STBP=0.932;TYPE=snp;VARB=0.0178031;OID=.;OPOS=131959150;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:26:27:28:28:0.509091:13:15:13:13:13:15:14:13
chr10	131967693	.	T	A	237.68	PASS	AF=0.490196;AO=25;DP=51;FAO=25;FDP=51;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.006673;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=285.067;QD=18.6418;RBI=0.00724689;REFB=-0.00423261;REVB=-0.00282638;RO=26;SAF=10;SAR=15;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.092369;STB=0.551958;STBP=0.458;TYPE=snp;VARB=0.00426728;OID=.;OPOS=131967693;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:26:26:25:25:0.490196:15:10:13:13:15:10:13:13
chr10	132891254	.	G	A	199.68	PASS	AF=0.5;AO=19;DP=39;FAO=20;FDP=40;FR=.;FRO=20;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=-0.00174064;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.421;QD=19.9683;RBI=0.00213247;REFB=-0.013516;REVB=0.00123192;RO=20;SAF=10;SAR=9;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158713;STB=0.598913;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=0.0171637;OID=.;OPOS=132891254;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:40:20:20:19:20:0.5:9:10:7:13:9:11:7:13
chr10	133607904	.	G	A	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159209;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.188;QD=50.4129;RBI=0.0290958;REFB=0;REVB=0.0243535;RO=0;SAF=12;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000333743;OID=.;OPOS=133607904;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:7:12:0:0:7:12:0:0
chr10	133607937	.	G	A	255.05	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.019929;FXX=0.0475964;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.525;QD=51.01;RBI=0.0295164;REFB=0;REVB=0.0217727;RO=0;SAF=12;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.98411e-05;OID=.;OPOS=133607937;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:20:20:0:0:20:20:1:8:12:0:0:8:12:0:0
chr10	133607947	.	T	G	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00761698;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.2983;QD=51.9164;RBI=0.0232315;REFB=0;REVB=-0.0219473;RO=0;SAF=13;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000545207;OID=.;OPOS=133607947;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:8:13:0:0:8:13:0:0
chr10	133608210	.	A	G	1049.92	PASS	AF=1;AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0212347;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.905;QD=59.9952;RBI=0.0240409;REFB=0;REVB=0.0112718;RO=0;SAF=35;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000567297;OID=.;OPOS=133608210;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:70:0:0:70:70:1:35:35:0:0:35:35:0:0
chr10	133608237	.	G	A	826.72	PASS	AF=0.983051;AO=58;DP=61;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0304801;FXX=0.0327815;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.6041;QD=56.0486;RBI=0.0720325;REFB=-0.153107;REVB=0.0652659;RO=0;SAF=30;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508194;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.00421307;OID=.;OPOS=133608237;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:61:59:0:1:58:58:0.983051:28:30:0:0:28:30:1:0
chr10	133608291	.	TT	GG	604.47	PASS	AF=1;AO=37;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0551183;FXX=0.0487686;HRUN=2;LEN=2;MLLD=99.57;QD=61.9964;RBI=0.0552118;REFB=0;REVB=-0.0032117;RO=0;SAF=19;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.68991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.00088218;OID=.;OPOS=133608291;OREF=TT;OALT=GG;OMAPALT=GG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:37:39:1:18:19:0:0:18:21:0:0
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chr10	133961494	.	C	T	294.2	PASS	AF=0.477612;AO=32;DP=67;FAO=32;FDP=67;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=0.0465609;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.899;QD=17.5639;RBI=0.04806;REFB=-0.0121198;REVB=0.0119099;RO=35;SAF=14;SAR=18;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0185565;STB=0.51039;STBP=0.877;TYPE=snp;VARB=0.0136538;OID=.;OPOS=133961494;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:35:35:32:32:0.477612:18:14:16:19:18:14:16:19
chr10	133963466	.	A	G	2528.88	PASS	AF=1;AO=160;DP=163;FAO=163;FDP=163;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00568328;FXX=0.0297601;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.8845;QD=62.0584;RBI=0.00569251;REFB=0;REVB=0.000324095;RO=0;SAF=83;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.30228e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000719025;OID=.;OPOS=133963466;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:163:163:0:0:160:163:1:77:83:0:0:79:84:0:0
chr10	133981682	.	G	A	375.33	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00706556;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=65.5459;QD=55.6039;RBI=0.0845873;REFB=0;REVB=0.0842917;RO=0;SAF=13;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0013487;OID=.;OPOS=133981682;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:14:13:0:0:14:13:0:0
chr10	134013974	.	C	A	102.5	PASS	AF=0.521739;AO=12;DP=23;FAO=12;FDP=23;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.00675123;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.6117;QD=17.8257;RBI=0.0323971;REFB=0.0174976;REVB=0.0316859;RO=11;SAF=4;SAR=8;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183634;STB=0.605879;STBP=0.336;TYPE=snp;VARB=-0.0125502;OID=.;OPOS=134013974;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:23:23:11:11:12:12:0.521739:8:4:6:5:8:4:6:5
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chr10	134017295	.	A	G	604.27	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00950512;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.591;QD=60.4271;RBI=0.0214063;REFB=0;REVB=-0.0191802;RO=0;SAF=28;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.4927e-05;OID=.;OPOS=134017295;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:40:0:0:39:40:1:11:28:0:0:11:29:0:0
chr10	134018817	.	G	A	521.67	PASS	AF=0.455285;AO=56;DP=123;FAO=56;FDP=123;FR=.;FRO=67;FSAF=30;FSAR=26;FSRF=36;FSRR=31;FWDB=0.00638227;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.147;QD=16.965;RBI=0.0723615;REFB=-0.00780426;REVB=0.0720795;RO=65;SAF=30;SAR=26;SRF=35;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00266675;STB=0.500875;STBP=0.991;TYPE=snp;VARB=0.00771699;OID=.;OPOS=134018817;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:123:123:65:67:56:56:0.455285:26:30:35:30:26:30:36:31
chr10	134036193	.	A	G	575.35	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.020983;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.1814;QD=60.5626;RBI=0.0476534;REFB=0;REVB=-0.042785;RO=0;SAF=19;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.68991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000727328;OID=.;OPOS=134036193;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:38:0:0:37:38:1:18:19:0:0:19:19:0:0
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chr10	134624504	.	C	T	246.75	PASS	AF=0.344828;AO=30;DP=87;FAO=30;FDP=87;FR=.;FRO=57;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=24;FSRR=33;FWDB=0.00403906;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.811;QD=11.3446;RBI=0.0166971;REFB=-0.000436678;REVB=-0.0162012;RO=57;SAF=14;SAR=16;SRF=24;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.052072;STB=0.530119;STBP=0.661;TYPE=snp;VARB=0.000786961;OID=.;OPOS=134624504;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:57:57:30:30:0.344828:16:14:24:33:16:14:24:33
chr10	134646988	.	C	T	158.67	PASS	AF=0.459459;AO=17;DP=37;FAO=17;FDP=37;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=-0.0241877;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.3746;QD=17.1533;RBI=0.0309044;REFB=0.000568059;REVB=-0.0192365;RO=20;SAF=10;SAR=7;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0610493;STB=0.534843;STBP=0.677;TYPE=snp;VARB=-0.00203185;OID=.;OPOS=134646988;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:20:20:17:17:0.459459:7:10:13:7:7:10:13:7
chr10	134682855	.	C	T	123.98	PASS	AF=0.482759;AO=14;DP=29;FAO=14;FDP=29;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=-0.00658128;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.785;QD=17.1002;RBI=0.00922504;REFB=-0.0307723;REVB=0.00646437;RO=15;SAF=5;SAR=9;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0413564;STB=0.523775;STBP=0.831;TYPE=snp;VARB=0.0351298;OID=.;OPOS=134682855;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:15:15:14:14:0.482759:9:5:6:9:9:5:6:9
chr10	134722022	.	A	G	304.91	PASS	AF=0.586957;AO=27;DP=46;FAO=27;FDP=46;FR=.;FRO=19;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=-0.00496201;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.198;QD=26.5138;RBI=0.00553673;REFB=-0.021104;REVB=0.00245639;RO=19;SAF=17;SAR=10;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.234224;STB=0.629534;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.00770838;OID=.;OPOS=134722022;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:19:19:27:27:0.586957:10:17:6:13:10:17:6:13
chr10	134726621	.	G	C	87.18	PASS	AF=0.458333;AO=11;DP=24;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=-0.0100217;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.7062;QD=14.5298;RBI=0.0151808;REFB=-0.00488634;REVB=0.0114028;RO=13;SAF=5;SAR=6;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140078;STB=0.581253;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.0112618;OID=.;OPOS=134726621;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:24:24:13:13:11:11:0.458333:6:5:4:9:6:5:4:9
chr10	134735672	.	A	G	1549.01	PASS	AF=1;AO=103;DP=104;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0145319;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.903;QD=59.5774;RBI=0.0155528;REFB=0;REVB=0.00554198;RO=0;SAF=65;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000218572;OID=.;OPOS=134735672;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:104:104:0:0:103:104:1:38:65:0:0:38:66:0:0
chr10	134736026	.	G	A	728.54	PASS	AF=1;AO=50;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0041166;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=298.337;QD=57.14;RBI=0.011414;REFB=0;REVB=0.0106458;RO=0;SAF=29;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.20481e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.29769e-05;OID=.;OPOS=134736026;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:50:51:1:21:29:0:0:21:30:0:0
chr10	134736052	.	G	T	769.5	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.077337;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.381;QD=57;RBI=0.0803058;REFB=0;REVB=0.0216335;RO=0;SAF=30;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000350036;OID=.;OPOS=134736052;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:24:30:0:0:24:30:0:0
chr10	134736076	.	T	G	769.43	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00614207;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.813;QD=56.995;RBI=0.00861263;REFB=0;REVB=-0.00603757;RO=0;SAF=29;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.86597e-07;OID=.;OPOS=134736076;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:25:29:0:0:25:29:0:0
chr10	134738232	.	A	G	2167.27	PASS	AF=0.992806;AO=138;DP=139;FAO=138;FDP=139;FR=.;FRO=1;FSAF=61;FSAR=77;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0259128;FXX=0.00714235;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.277;QD=62.3675;RBI=0.0289146;REFB=-0.0398854;REVB=0.0128288;RO=1;SAF=61;SAR=77;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00773012;STB=0.504064;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=0.000200664;OID=.;OPOS=134738232;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:139:139:1:1:138:138:0.992806:77:61:1:0:77:61:1:0
chr10	134748331	.	C	T	754.39	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0074323;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.439;QD=56.935;RBI=0.0197886;REFB=0;REVB=-0.0183399;RO=0;SAF=29;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.47957e-05;OID=.;OPOS=134748331;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:24:29:0:0:24:29:0:0
chr10	134756013	.	T	C	322.1	PASS	AF=1;AO=21;DP=22;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0248529;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.603;QD=53.6839;RBI=0.0595483;REFB=0;REVB=0.054114;RO=0;SAF=12;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000289546;OID=.;OPOS=134756013;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:24:0:0:21:24:1:9:12:0:0:9:15:0:0
chr10	134777790	.	G	A	929.3	PASS	AF=0.970149;AO=65;DP=67;FAO=65;FDP=67;FR=.;FRO=2;FSAF=11;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0078204;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=274.926;QD=55.4807;RBI=0.0183617;REFB=-0.0655249;REVB=0.016613;RO=1;SAF=11;SAR=54;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00866996;STB=0.509088;STBP=0.624;TYPE=snp;VARB=0.000523333;OID=.;OPOS=134777790;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:67:67:1:2:65:65:0.970149:54:11:0:1:54:11:0:2
chr10	134884516	.	G	A	501.64	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0313728;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.685;QD=59.0162;RBI=0.0387613;REFB=0;REVB=0.0227637;RO=0;SAF=15;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.40663e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.22722e-05;OID=.;OPOS=134884516;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:19:15:0:0:19:15:0:0
chr10	134884546	.	A	G	589.27	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0353476;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.8129;QD=60.4383;RBI=0.046969;REFB=0;REVB=0.0309295;RO=0;SAF=14;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000515962;OID=.;OPOS=134884546;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:25:14:0:0:25:14:0:0
chr10	134884595	.	G	A	1097.93	PASS	AF=0.961538;AO=75;DP=78;FAO=75;FDP=78;FR=.;FRO=3;FSAF=34;FSAR=41;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0135742;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=184.18;QD=56.304;RBI=0.0285196;REFB=-0.0872405;REVB=0.025082;RO=2;SAF=34;SAR=41;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00231214;STB=0.508262;STBP=0.474;TYPE=snp;VARB=0.00287472;OID=.;OPOS=134884595;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:78:78:2:3:75:75:0.961538:41:34:1:1:41:34:2:1
chr10	134884610	.	C	G	1249.73	PASS	AF=0.987952;AO=82;DP=83;FAO=82;FDP=83;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=44;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.037417;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.8532;QD=60.228;RBI=0.0417438;REFB=-0.0804726;REVB=0.0185071;RO=0;SAF=38;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.11453e-08;STB=0.506492;STBP=0.327;TYPE=snp;VARB=0.000807084;OID=.;OPOS=134884610;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:83:83:0:1:82:82:0.987952:44:38:0:0:44:38:1:0
chr10	134886618	.	G	C	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0234695;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.724;QD=53.2772;RBI=0.031325;REFB=0;REVB=0.0207469;RO=0;SAF=9;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.84921e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.03091e-06;OID=.;OPOS=134886618;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:14:9:0:0:14:9:0:0
chr10	134942166	.	A	G	637.53	PASS	AF=0.443038;AO=70;DP=159;FAO=70;FDP=158;FR=.;FRO=88;FSAF=23;FSAR=47;FSRF=32;FSRR=56;FWDB=-0.00419472;FXX=0.00628891;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.229;QD=16.1401;RBI=0.0364292;REFB=-0.0221089;REVB=-0.0361869;RO=88;SAF=23;SAR=47;SRF=32;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0390767;STB=0.521794;STBP=0.64;TYPE=snp;VARB=0.0254049;OID=.;OPOS=134942166;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:159:158:88:88:70:70:0.443038:47:23:32:56:47:23:32:56
chr10	134942832	.	G	A	133.94	PASS	AF=0.441176;AO=15;DP=33;FAO=15;FDP=34;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=3;FWDB=-0.0303014;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=64.0433;QD=15.758;RBI=0.0359595;REFB=-0.0371063;REVB=-0.0193626;RO=18;SAF=9;SAR=6;SRF=15;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.247164;STB=0.649179;STBP=0.191;TYPE=snp;VARB=0.0273331;OID=.;OPOS=134942832;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:34:18:19:15:15:0.441176:6:9:15:3:6:9:16:3
chr10	134997480	.	C	T	114.47	PASS	AF=0.5;AO=14;DP=26;FAO=13;FDP=26;FR=.;FRO=13;FSAF=1;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=2;FWDB=-0.021856;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.6426;QD=17.6109;RBI=0.0227244;REFB=-0.0103232;REVB=0.00622194;RO=12;SAF=2;SAR=12;SRF=10;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.588069;STB=0.910719;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00499663;OID=.;OPOS=134997480;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:26:12:13:14:13:0.5:12:2:10:2:12:1:11:2
chr10	134999602	.	G	C	411.32	PASS	AF=0.47191;AO=42;DP=89;FAO=42;FDP=89;FR=.;FRO=47;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=21;FSRR=26;FWDB=-0.0055607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.5266;QD=18.4861;RBI=0.030432;REFB=-0.00464309;REVB=-0.0299197;RO=47;SAF=18;SAR=24;SRF=21;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0175716;STB=0.509799;STBP=0.87;TYPE=snp;VARB=0.0100947;OID=.;OPOS=134999602;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:47:47:42:42:0.47191:24:18:21:26:24:18:21:26
chr10	135012162	.	T	C	175.41	PASS	AF=1;AO=14;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0191102;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.51;QD=46.7762;RBI=0.0191315;REFB=0;REVB=0.000903698;RO=0;SAF=8;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00010033;OID=.;OPOS=135012162;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:14:15:1:6:8:0:0:6:9:0:0
chr10	135012429	.	TT	AC	66.83	PASS	AF=0.428571;AO=9;DP=20;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.0370018;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=255.061;QD=12.7293;RBI=0.0375891;REFB=0.00329532;REVB=0.00661828;RO=10;SAF=1;SAR=8;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.394404;STB=0.799199;STBP=0.063;TYPE=mnp;VARB=-0.00458932;OID=.;OPOS=135012429;OREF=TT;OALT=AC;OMAPALT=AC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:20:21:10:12:9:9:0.428571:8:1:4:6:8:1:6:6
chr10	135012652	.	T	C	785.2	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0660831;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.669;QD=57.1057;RBI=0.0673931;REFB=0;REVB=-0.0132233;RO=0;SAF=26;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.40922e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000215098;OID=.;OPOS=135012652;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:29:26:0:0:29:26:0:0
chr10	135012953	.	CA	C	86.76	PASS	AF=0.456522;AO=16;DP=46;FAO=21;FDP=46;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=21;FSRR=4;FWDB=-0.0658206;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=12.8134;QD=7.5442;RBI=0.0934827;REFB=-0.106655;REVB=-0.0663828;RO=23;SAF=9;SAR=7;SRF=20;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.341279;STB=0.674961;STBP=0.053;TYPE=del;VARB=0.15299;OID=.;OPOS=135012954;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.456522:16:46:21:46:25:11:10:21:4:86:23:9:7:20:3
chr10	135015427	.	C	A	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00549501;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.933;QD=42.1824;RBI=0.0200936;REFB=0;REVB=0.0193276;RO=0;SAF=4;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000333192;OID=.;OPOS=135015427;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:7:4:0:0:7:4:0:0
chr10	135015667	.	C	T	746.21	PASS	AF=1;AO=44;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0163264;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.3365;QD=63.5076;RBI=0.0801331;REFB=0;REVB=0.0784523;RO=0;SAF=26;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00110185;OID=.;OPOS=135015667;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:44:47:1:18:26:0:0:21:26:0:0
chr10	135016089	.	T	C	1144.83	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.079729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.385;QD=60.2541;RBI=0.0797927;REFB=0;REVB=0.00318766;RO=0;SAF=32;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.95599e-05;OID=.;OPOS=135016089;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:44:32:0:0:44:32:0:0
chr10	135016175	.	T	G	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0554156;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.095;QD=45.8068;RBI=0.0564859;REFB=0;REVB=-0.0109442;RO=0;SAF=9;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000293585;OID=.;OPOS=135016175;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:5:9:0:0:5:9:0:0
chr10	135032376	.	A	G	187.59	PASS	AF=0.389831;AO=23;DP=59;FAO=23;FDP=59;FR=.;FRO=36;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=22;FSRR=14;FWDB=-0.00999867;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=169.995;QD=12.7182;RBI=0.0111611;REFB=-0.00930962;REVB=0.0049594;RO=36;SAF=10;SAR=13;SRF=22;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185273;STB=0.606323;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=0.0206571;OID=.;OPOS=135032376;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:36:36:23:23:0.389831:13:10:22:14:13:10:22:14
chr10	135051562	.	A	G	807.05	PASS	AF=1;AO=50;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=23;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00458323;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.5059;QD=56.635;RBI=0.0522777;REFB=0;REVB=0.0520764;RO=0;SAF=23;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0008868;OID=.;OPOS=135051562;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:57:57:0:0:50:57:1:27:23:0:0:34:23:0:0
chr10	135053604	.	G	A	194.97	PASS	AF=0.444444;AO=20;DP=42;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=-0.00734917;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=181.26;QD=17.331;RBI=0.0140507;REFB=-0.033189;REVB=-0.0119755;RO=22;SAF=12;SAR=8;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0939744;STB=0.567499;STBP=0.442;TYPE=snp;VARB=0.0297213;OID=.;OPOS=135053604;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:45:22:25:20:20:0.444444:8:12:11:11:8:12:12:13
chr10	135053710	.	C	A	212.29	PASS	AF=0.645161;AO=20;DP=31;FAO=20;FDP=31;FR=.;FRO=11;FSAF=17;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=0.0734337;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.925;QD=27.3924;RBI=0.0984457;REFB=-0.0271304;REVB=0.0655671;RO=11;SAF=17;SAR=3;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218874;STB=0.622897;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=0.033756;OID=.;OPOS=135053710;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:31:31:11:11:20:20:0.645161:3:17:7:4:3:17:7:4
chr10	135053721	.	C	A	170.49	PASS	AF=0.62963;AO=17;DP=27;FAO=17;FDP=27;FR=.;FRO=10;FSAF=15;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.026593;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=264.803;QD=25.2576;RBI=0.0294322;REFB=-0.0150785;REVB=0.0126122;RO=10;SAF=15;SAR=2;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.4542;STB=0.759123;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.0110023;OID=.;OPOS=135053721;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:27:27:10:10:17:17:0.62963:2:15:4:6:2:15:4:6
chr10	135061112	.	C	T	49.59	PASS	AF=0.538462;AO=7;DP=13;FAO=7;FDP=13;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.00632846;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.7548;QD=15.2589;RBI=0.0187979;REFB=0.00405028;REVB=-0.0177006;RO=6;SAF=3;SAR=4;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0767769;STB=0.545327;STBP=0.819;TYPE=snp;VARB=-0.00550642;OID=.;OPOS=135061112;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:13:13:6:6:7:7:0.538462:4:3:2:4:4:3:2:4
chr10	135076596	.	T	C	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0133307;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.516;QD=53.2772;RBI=0.0330792;REFB=0;REVB=0.0302742;RO=0;SAF=18;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000289609;OID=.;OPOS=135076596;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:5:18:0:0:5:18:0:0
chr10	135082346	.	A	G	727.68	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0651165;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.8499;QD=63.2763;RBI=0.0912414;REFB=0;REVB=-0.0639127;RO=0;SAF=25;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.85991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.88948e-05;OID=.;OPOS=135082346;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:21:25:0:0:21:25:0:0
chr10	135084232	.	C	CAGA	1375.39	PASS	AF=0.95098;AO=94;DP=107;FAO=97;FDP=102;FR=.;FRO=5;FSAF=39;FSAR=58;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.005837;FXX=0.0377323;HRUN=1;LEN=3;MLLD=252.771;QD=53.9367;RBI=0.0118626;REFB=-0.0348355;REVB=0.0103271;RO=7;SAF=39;SAR=55;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0590431;STB=0.530114;STBP=0.009;TYPE=ins;VARB=-0.000119046;OID=.;OPOS=135084233;OREF=-;OALT=AGA;OMAPALT=CAGA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.95098:94:107:97:102:5:39:58:5:0:13:7:39:55:6:1
chr10	135084322	.	A	G	1434.42	PASS	AF=1;AO=91;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0733887;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.2741;QD=63.0516;RBI=0.0809862;REFB=0;REVB=-0.0342472;RO=0;SAF=28;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.91974e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000713336;OID=.;OPOS=135084322;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:91:91:0:0:91:91:1:63:28:0:0:63:28:0:0
chr10	135085321	.	C	T	428.98	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0599561;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=125.158;QD=57.1979;RBI=0.0692832;REFB=0;REVB=0.0347192;RO=0;SAF=11;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000730556;OID=.;OPOS=135085321;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:19:11:0:0:19:11:0:0
chr10	135085426	.	A	G	747.1	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0314723;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.366;QD=63.583;RBI=0.0341893;REFB=0;REVB=-0.0133567;RO=0;SAF=21;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.23408e-05;OID=.;OPOS=135085426;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:26:21:0:0:26:21:0:0
chr10	135085754	.	G	A	1572.71	PASS	AF=0.99;AO=99;DP=100;FAO=99;FDP=100;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=66;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00606163;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=298.596;QD=62.9083;RBI=0.00967198;REFB=-0.0865305;REVB=0.00753683;RO=1;SAF=33;SAR=66;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0141557;STB=0.507461;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=5.79523e-05;OID=.;OPOS=135085754;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:100:100:1:1:99:99:0.99:66:33:1:0:66:33:1:0
chr10	135087521	.	G	A	414.98	PASS	AF=1;AO=29;DP=30;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0202504;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.934;QD=57.2387;RBI=0.0204231;REFB=0;REVB=0.00265084;RO=0;SAF=19;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.03753e-05;OID=.;OPOS=135087521;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:29:0:0:29:29:1:10:19:0:0:10:19:0:0
chr10	135089035	.	A	G	1058.83	PASS	AF=1;AO=71;DP=74;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0310285;FXX=0.0270234;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.1192;QD=58.8239;RBI=0.0587714;REFB=-0.0802118;REVB=0.049913;RO=0;SAF=34;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.12261e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00141711;OID=.;OPOS=135089035;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:74:72:0:0:71:72:1:37:34:0:0:38:34:0:0
chr10	135097434	.	A	G	666.87	PASS	AF=0.956522;AO=44;DP=46;FAO=44;FDP=46;FR=.;FRO=2;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0200894;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=151.669;QD=57.9885;RBI=0.0201095;REFB=-0.0240787;REVB=0.000898629;RO=2;SAF=18;SAR=26;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00766011;STB=0.50408;STBP=0.85;TYPE=snp;VARB=0.000392491;OID=.;OPOS=135097434;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:46:46:2:2:44:44:0.956522:26:18:1:1:26:18:1:1
chr10	135098672	.	G	A	708.53	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00888997;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.247;QD=62.9804;RBI=0.0639946;REFB=0;REVB=0.0633742;RO=0;SAF=20;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.09779e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000400895;OID=.;OPOS=135098672;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:25:20:0:0:25:20:0:0
chr10	135098830	.	T	C	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0256789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=297.082;QD=55.0987;RBI=0.0334657;REFB=0;REVB=-0.0214604;RO=0;SAF=15;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000109438;OID=.;OPOS=135098830;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:11:15:0:0:11:15:0:0
chr10	135098845	.	C	T	376.28	PASS	AF=0.933333;AO=28;DP=30;FAO=28;FDP=30;FR=.;FRO=2;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00543271;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.131;QD=50.1705;RBI=0.00574063;REFB=-0.0252352;REVB=-0.00185484;RO=1;SAF=18;SAR=10;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0442673;STB=0.510302;STBP=0.783;TYPE=snp;VARB=0.00324914;OID=.;OPOS=135098845;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:30:30:1:2:28:28:0.933333:10:18:0:1:10:18:1:1
chr10	135160950	.	C	T	246.92	PASS	AF=0.913043;AO=20;DP=22;FAO=21;FDP=23;FR=.;FRO=2;FSAF=4;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0992722;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=50.7086;QD=42.9427;RBI=0.104086;REFB=-0.233495;REVB=0.0312867;RO=2;SAF=3;SAR=17;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0512216;STB=0.527752;STBP=0.632;TYPE=snp;VARB=0.0318002;OID=.;OPOS=135160950;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:22:23:2:2:20:21:0.913043:17:3:0:2:17:4:0:2
chr10	135165790	.	A	G	447.02	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0305799;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.258;QD=57.6803;RBI=0.0505754;REFB=0;REVB=-0.0402833;RO=0;SAF=15;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.90251e-05;OID=.;OPOS=135165790;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:16:15:0:0:16:15:0:0
chr10	135180430	.	A	G	1382.31	PASS	AF=0.988889;AO=89;DP=90;FAO=89;FDP=90;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00637949;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.423;QD=61.436;RBI=0.0318608;REFB=-0.149436;REVB=-0.0312156;RO=0;SAF=46;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505375;STBP=0.489;TYPE=snp;VARB=0.000465646;OID=.;OPOS=135180430;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:90:90:0:1:89:89:0.988889:43:46:0:0:43:46:1:0
chr10	135184126	.	G	A	1665.64	PASS	AF=0.991071;AO=111;DP=113;FAO=111;FDP=112;FR=.;FRO=1;FSAF=55;FSAR=56;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0112153;FXX=0.00884877;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.302;QD=59.4872;RBI=0.0322085;REFB=0.0150469;REVB=0.0301928;RO=1;SAF=55;SAR=56;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.008554;STB=0.504504;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=-7.40943e-05;OID=.;OPOS=135184126;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:113:112:1:1:111:111:0.991071:56:55:1:0:56:55:1:0
chr10	135186806	.	A	G	431.23	PASS	AF=0.96875;AO=29;DP=30;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0744178;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.9835;QD=53.9035;RBI=0.0761582;REFB=-0.0624271;REVB=0.0161886;RO=1;SAF=8;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0216718;STB=0.510632;STBP=0.643;TYPE=snp;VARB=0.00656142;OID=.;OPOS=135186806;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:30:32:1:1:29:31:0.96875:21:8:0:1:23:8:0:1
chr10	135204950	.	C	G	573.98	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0231048;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=142.598;QD=60.4186;RBI=0.0274572;REFB=0;REVB=-0.0148346;RO=0;SAF=16;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.15842e-05;OID=.;OPOS=135204950;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:22:16:0:0:22:16:0:0
chr10	135205009	.	C	G	1013.04	PASS	AF=0.985714;AO=69;DP=70;FAO=69;FDP=70;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0212926;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=254.544;QD=57.8879;RBI=0.0220878;REFB=-0.128247;REVB=0.00587348;RO=1;SAF=36;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141097;STB=0.507461;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=5.44635e-05;OID=.;OPOS=135205009;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:70:70:1:1:69:69:0.985714:33:36:0:1:33:36:0:1
chr10	135233541	.	A	G	1714.17	PASS	AF=0.982759;AO=114;DP=119;FAO=114;FDP=116;FR=.;FRO=2;FSAF=65;FSAR=49;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00114911;FXX=0.0333306;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.636;QD=59.1094;RBI=0.00297821;REFB=-0.099773;REVB=0.0027476;RO=0;SAF=65;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.29464e-08;STB=0.501234;STBP=0.871;TYPE=snp;VARB=0.00012118;OID=.;OPOS=135233541;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:119:116:0:2:114:114:0.982759:49:65:0:0:49:65:1:1
chr10	135271789	.	C	T	1380.85	PASS	AF=1;AO=88;DP=89;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0188887;FXX=0.0112347;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.229;QD=62.7657;RBI=0.0250988;REFB=0;REVB=0.0165277;RO=0;SAF=41;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.63548e-05;OID=.;OPOS=135271789;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:89:88:0:0:88:88:1:47:41:0:0:47:41:0:0
chr10	135278193	.	A	G	287.94	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.107139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.656;QD=52.3527;RBI=0.107323;REFB=0;REVB=0.00629414;RO=0;SAF=7;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000650791;OID=.;OPOS=135278193;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:22:0:0:21:22:1:14:7:0:0:14:8:0:0
chr10	135279810	.	T	G	575.79	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0305814;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.903;QD=60.6098;RBI=0.0446393;REFB=0;REVB=0.0325184;RO=0;SAF=15;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000157966;OID=.;OPOS=135279810;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:23:15:0:0:23:15:0:0
chr10	135280765	.	C	T	786.73	PASS	AF=0.982456;AO=55;DP=57;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0157778;FXX=0.0172384;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.721;QD=55.2089;RBI=0.0241119;REFB=-0.130295;REVB=0.0182331;RO=1;SAF=20;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0229835;STB=0.512191;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=-0.000255449;OID=.;OPOS=135280765;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:57:57:1:1:55:56:0.982456:35:20:1:0:36:20:1:0
chr10	135347397	.	T	C	744.43	PASS	AF=0.964912;AO=53;DP=54;FAO=55;FDP=57;FR=.;FRO=2;FSAF=26;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0108907;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.5383;QD=52.241;RBI=0.0125009;REFB=-0.0436402;REVB=0.00613726;RO=1;SAF=26;SAR=27;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0171308;STB=0.516661;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=0.00793664;OID=.;OPOS=135347397;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:54:57:1:2:53:55:0.964912:27:26:0:1:29:26:0:2
chr10	135351362	.	T	C	766.46	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00536818;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=236.514;QD=63.8718;RBI=0.0114207;REFB=0;REVB=0.0100804;RO=0;SAF=24;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.26406e-06;OID=.;OPOS=135351362;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:24:24:0:0:24:24:0:0
chr10	135381592	.	C	G	317.19	PASS	AF=0.96;AO=24;DP=26;FAO=24;FDP=25;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0148795;FXX=0.0384468;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.778;QD=50.7506;RBI=0.0651856;REFB=-0.148469;REVB=0.0634646;RO=0;SAF=13;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.521721;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=0.00185814;OID=.;OPOS=135381592;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:26:25:0:1:24:24:0.96:11:13:0:0:11:13:0:1
chr10	135381623	.	T	C	594.49	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0109705;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.888;QD=60.9733;RBI=0.0115305;REFB=0;REVB=-0.0035496;RO=0;SAF=21;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.34792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.96693e-05;OID=.;OPOS=135381623;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:18:21:0:0:18:21:0:0
chr10	135381766	.	C	T	528.73	PASS	AF=0.925;AO=37;DP=40;FAO=37;FDP=40;FR=.;FRO=3;FSAF=11;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0418252;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=174.479;QD=52.8727;RBI=0.0459863;REFB=-0.165603;REVB=0.0191152;RO=3;SAF=11;SAR=26;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0510354;STB=0.527258;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.00177358;OID=.;OPOS=135381766;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:40:40:3:3:37:37:0.925:26:11:0:3:26:11:0:3
chr10	135381927	.	T	G	501.65	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.010913;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.396;QD=59.0178;RBI=0.0367854;REFB=0;REVB=-0.0351293;RO=0;SAF=18;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000141695;OID=.;OPOS=135381927;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:16:18:0:0:16:18:0:0
chr10	135438888	.	C	T	65.42	PASS	AF=0.141304;AO=13;DP=93;FAO=13;FDP=92;FR=.;FRO=79;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=37;FSRR=42;FWDB=0.0248848;FXX=0.0107515;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.6864;QD=2.84449;RBI=0.0401767;REFB=-0.0086847;REVB=-0.0315422;RO=80;SAF=8;SAR=5;SRF=37;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188608;STB=0.625432;STBP=0.357;TYPE=snp;VARB=0.0551684;OID=.;OPOS=135438888;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:93:92:80:79:13:13:0.141304:5:8:37:43:5:8:37:42
chr10	135438929	.	T	G	65.95	PASS	AF=0.12963;AO=14;DP=108;FAO=14;FDP=108;FR=.;FRO=94;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=42;FSRR=52;FWDB=-0.0233795;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.1611;QD=2.44269;RBI=0.0236;REFB=-0.00351016;REVB=0.00321891;RO=94;SAF=9;SAR=5;SRF=42;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.239771;STB=0.667733;STBP=0.213;TYPE=snp;VARB=0.00650444;OID=.;OPOS=135438929;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:108:108:94:94:14:14:0.12963:5:9:42:52:5:9:42:52
chr10	135438951	.	G	A	77.42	PASS	AF=0.141593;AO=16;DP=113;FAO=16;FDP=113;FR=.;FRO=97;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=44;FSRR=53;FWDB=-0.0100304;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=250.716;QD=2.74063;RBI=0.0100306;REFB=-0.00322075;REVB=-5.94932e-05;RO=95;SAF=8;SAR=8;SRF=43;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0594542;STB=0.539774;STBP=0.736;TYPE=snp;VARB=0.0223425;OID=.;OPOS=135438951;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:113:113:95:97:16:16:0.141593:8:8:43:52:8:8:44:53
chr10	135438955	.	C	T	94.44	PASS	AF=0.162162;AO=18;DP=111;FAO=18;FDP=111;FR=.;FRO=93;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=42;FSRR=51;FWDB=-0.00398433;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=138.219;QD=3.40322;RBI=0.0128881;REFB=-0.00511312;REVB=-0.0122568;RO=93;SAF=9;SAR=9;SRF=42;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0612701;STB=0.540496;STBP=0.712;TYPE=snp;VARB=0.023855;OID=.;OPOS=135438955;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:111:111:93:93:18:18:0.162162:9:9:42:51:9:9:42:51
chr10	135438967	.	C	T	100.22	PASS	AF=0.166667;AO=19;DP=114;FAO=19;FDP=114;FR=.;FRO=95;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=43;FSRR=52;FWDB=-0.0203352;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.487;QD=3.5164;RBI=0.0210998;REFB=-0.00270748;REVB=-0.00562869;RO=95;SAF=9;SAR=10;SRF=43;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0268153;STB=0.517607;STBP=0.865;TYPE=snp;VARB=0.0120387;OID=.;OPOS=135438967;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:114:114:95:95:19:19:0.166667:10:9:43:52:10:9:43:52
chr10	135438977	.	G	A	86.5	PASS	AF=0.151786;AO=17;DP=113;FAO=17;FDP=112;FR=.;FRO=95;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=43;FSRR=52;FWDB=-0.00463571;FXX=0.00884877;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.984;QD=3.08935;RBI=0.0139656;REFB=-0.013514;REVB=-0.0131738;RO=94;SAF=8;SAR=9;SRF=42;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0301597;STB=0.515294;STBP=0.909;TYPE=snp;VARB=0.0575128;OID=.;OPOS=135438977;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:113:112:94:95:17:17:0.151786:9:8:42:52:9:8:43:52
chr11	193096	.	T	C	30.82	PASS	AF=0.217391;AO=5;DP=27;FAO=5;FDP=23;FR=.;FRO=18;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=17;FWDB=-0.0810745;FXX=0.148093;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.6606;QD=5.36008;RBI=0.0810763;REFB=-0.0141797;REVB=0.000540332;RO=18;SAF=2;SAR=3;SRF=1;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.530355;STB=0.815649;STBP=0.547;TYPE=snp;VARB=0.0379518;OID=.;OPOS=193096;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:27:23:18:18:5:5:0.217391:3:2:1:17:3:2:1:17
chr11	193112	.	C	T	63.35	PASS	AF=0.310345;AO=9;DP=29;FAO=9;FDP=29;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=18;FWDB=0.0189227;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.173;QD=8.73752;RBI=0.023958;REFB=-0.00546598;REVB=-0.014694;RO=20;SAF=4;SAR=5;SRF=2;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.43678;STB=0.753701;STBP=0.128;TYPE=snp;VARB=0.0129857;OID=.;OPOS=193112;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:29:29:20:20:9:9:0.310345:5:4:2:18:5:4:2:18
chr11	193722	.	A	G	137.78	PASS	AF=0.333333;AO=16;DP=48;FAO=16;FDP=48;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=24;FSRR=8;FWDB=0.0114921;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.6805;QD=11.4813;RBI=0.026003;REFB=-0.0215978;REVB=-0.0233257;RO=30;SAF=11;SAR=5;SRF=22;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0608021;STB=0.550254;STBP=0.675;TYPE=snp;VARB=0.0256623;OID=.;OPOS=193722;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:30:32:16:16:0.333333:5:11:22:8:5:11:24:8
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chr11	193865	.	T	G	294.33	PASS	AF=0.477612;AO=32;DP=67;FAO=32;FDP=67;FR=.;FRO=35;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=15;FWDB=0.00873494;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.252;QD=17.5719;RBI=0.0435052;REFB=-0.0161631;REVB=0.0426193;RO=35;SAF=17;SAR=15;SRF=20;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0377336;STB=0.521114;STBP=0.741;TYPE=snp;VARB=0.011405;OID=.;OPOS=193865;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:35:35:32:32:0.477612:15:17:20:15:15:17:20:15
chr11	197337	.	G	A	248.61	PASS	AF=0.474576;AO=27;DP=60;FAO=28;FDP=59;FR=.;FRO=31;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=20;FWDB=-0.00645855;FXX=0.0166639;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.231;QD=16.8548;RBI=0.00884036;REFB=-0.00783228;REVB=0.00603649;RO=30;SAF=15;SAR=12;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.175273;STB=0.612361;STBP=0.114;TYPE=snp;VARB=0.00722943;OID=.;OPOS=197337;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:59:30:31:27:28:0.474576:12:15:11:19:12:16:11:20
chr11	214421	.	G	C	222.69	PASS	AF=0.458333;AO=22;DP=48;FAO=22;FDP=48;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=18;FWDB=-0.0502396;FXX=0.020404;HRUN=4;LEN=1;MLLD=126.619;QD=18.5576;RBI=0.0661555;REFB=-0.0258362;REVB=-0.0430411;RO=26;SAF=14;SAR=8;SRF=8;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.307703;STB=0.67392;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.0469604;OID=.;OPOS=214421;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:26:26:22:22:0.458333:8:14:8:18:8:14:8:18
chr11	223796	.	A	G	106.55	PASS	AF=0.325;AO=13;DP=42;FAO=13;FDP=40;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=0.0425248;FXX=0.0476077;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.635;QD=10.6545;RBI=0.0426165;REFB=-0.00339615;REVB=0.00279346;RO=27;SAF=10;SAR=3;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.273809;STB=0.689341;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=0.0133184;OID=.;OPOS=223796;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:40:27:27:13:13:0.325:3:10:15:12:3:10:14:13
chr11	223832	.	C	A	169.35	PASS	AF=0.9375;AO=14;DP=15;FAO=15;FDP=16;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0273401;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.195;QD=42.3374;RBI=0.027383;REFB=-0.175437;REVB=-0.0015314;RO=1;SAF=6;SAR=8;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0534678;STB=0.529373;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=0.00428913;OID=.;OPOS=223832;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:15:16:1:1:14:15:0.9375:8:6:0:1:8:7:0:1
chr11	233067	.	C	T	349.86	PASS	AF=0.468354;AO=37;DP=79;FAO=37;FDP=79;FR=.;FRO=42;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=17;FSRR=25;FWDB=0.0170351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.452;QD=17.7145;RBI=0.0490714;REFB=-0.0110746;REVB=-0.0460196;RO=42;SAF=14;SAR=23;SRF=17;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0264395;STB=0.514793;STBP=0.802;TYPE=snp;VARB=0.0139279;OID=.;OPOS=233067;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:42:42:37:37:0.468354:23:14:17:25:23:14:17:25
chr11	233212	.	C	A	191.62	PASS	AF=0.408163;AO=20;DP=49;FAO=20;FDP=49;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=22;FWDB=0.0466372;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.3142;QD=15.6421;RBI=0.0620003;REFB=-0.0372953;REVB=-0.0408535;RO=28;SAF=8;SAR=12;SRF=7;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166197;STB=0.601676;STBP=0.273;TYPE=snp;VARB=0.0353986;OID=.;OPOS=233212;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:28:29:20:20:0.408163:12:8:7:21:12:8:7:22
chr11	237087	.	A	G	1513.03	PASS	AF=1;AO=101;DP=102;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0141535;FXX=0.00980296;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.318;QD=59.9219;RBI=0.028127;REFB=0;REVB=-0.0243065;RO=0;SAF=55;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.13729e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.02977e-06;OID=.;OPOS=237087;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:102:101:0:0:101:101:1:46:55:0:0:46:55:0:0
chr11	244106	.	A	G	410.76	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0312843;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=53.2228;QD=56.6558;RBI=0.0451452;REFB=0;REVB=-0.0325481;RO=0;SAF=13;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00140035;OID=.;OPOS=244106;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:16:13:0:0:16:13:0:0
chr11	244108	.	A	G	411.12	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00138491;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=291.19;QD=56.7066;RBI=0.0146635;REFB=0;REVB=0.014598;RO=0;SAF=13;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.65509e-05;OID=.;OPOS=244108;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:16:13:0:0:16:13:0:0
chr11	244115	.	G	A	447.02	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0324763;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.349;QD=57.6801;RBI=0.0448911;REFB=0;REVB=0.030992;RO=0;SAF=13;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.33668e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000452972;OID=.;OPOS=244115;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:18:13:0:0:18:13:0:0
chr11	244129	.	C	T	429.02	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0197936;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.262;QD=57.2023;RBI=0.0305654;REFB=0;REVB=0.0232907;RO=0;SAF=11;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.6074e-05;OID=.;OPOS=244129;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:19:11:0:0:19:11:0:0
chr11	244141	.	G	A	325.91	PASS	AF=0.925926;AO=25;DP=28;FAO=25;FDP=27;FR=.;FRO=2;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0143923;FXX=0.0357015;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.206;QD=48.2833;RBI=0.0380754;REFB=-0.0450773;REVB=-0.0352505;RO=2;SAF=10;SAR=15;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0579364;STB=0.531225;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.00684175;OID=.;OPOS=244141;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:28:27:2:2:25:25:0.925926:15:10:0:2:15:10:0:2
chr11	244167	.	C	T	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0710976;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=106.607;QD=56.1912;RBI=0.0711301;REFB=0;REVB=0.00215183;RO=0;SAF=8;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.75204e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000666239;OID=.;OPOS=244167;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:20:8:0:0:20:8:0:0
chr11	244171	.	T	C	349.95	PASS	AF=0.962963;AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=27;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0046998;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=286.553;QD=51.8449;RBI=0.00972901;REFB=-0.172247;REVB=0.00851854;RO=0;SAF=6;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.14057e-08;STB=0.538431;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=-0.00014226;OID=.;OPOS=244171;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:27:27:0:1:26:26:0.962963:20:6:0:0:20:6:1:0
chr11	244197	.	T	C	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00520893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.989;QD=53.277;RBI=0.0137977;REFB=0;REVB=0.0127766;RO=0;SAF=5;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000111099;OID=.;OPOS=244197;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:18:5:0:0:18:5:0:0
chr11	244414	.	C	T	853.87	PASS	AF=0.983607;AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00949856;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.9327;QD=55.9916;RBI=0.0128717;REFB=0.0270595;REVB=-0.00868659;RO=1;SAF=37;SAR=23;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0125858;STB=0.506664;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.00266777;OID=.;OPOS=244414;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:61:61:1:1:60:60:0.983607:23:37:1:0:23:37:1:0
chr11	244490	.	ATACCTTTTAG	A,AT	432.8	PASS	AF=0.965517,0.0344828;AO=24,4;DP=36;FAO=28,1;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=14,0;FSAR=14,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0251254,-0.0217764;FXX=0.216158;HRUN=1,1;LEN=10,9;MLLD=256.96,242.52;QD=59.6968;RBI=0.035328,0.0274268;REFB=0,0;REVB=0.024835,0.0166738;RO=0;SAF=14,0;SAR=10,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=0.000600894,-0.00336137;OID=.,.;OPOS=244491,244492;OREF=TACCTTTTAG,ACCTTTTAG;OALT=-,-;OMAPALT=A,AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.965517,0.0344828:24,4:36:28,1:29:0:14,0:14,1:0:0:6:0:14,0:10,4:0:0
chr11	280221	.	A	C	124.09	PASS	AF=0.722222;AO=13;DP=18;FAO=13;FDP=18;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0782794;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.374;QD=27.5755;RBI=0.0782905;REFB=0.00306969;REVB=0.00132019;RO=5;SAF=3;SAR=10;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0217954;STB=0.512177;STBP=0.894;TYPE=snp;VARB=-0.000150761;OID=.;OPOS=280221;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:18:18:5:5:13:13:0.722222:10:3:1:4:10:3:1:4
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chr11	284538	.	T	C	215.88	PASS	AF=0.468085;AO=21;DP=46;FAO=22;FDP=47;FR=.;FRO=25;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=-0.00158356;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.792;QD=18.3727;RBI=0.0184799;REFB=-0.0458083;REVB=0.0184119;RO=25;SAF=7;SAR=14;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0696018;STB=0.520642;STBP=0.793;TYPE=snp;VARB=0.0487792;OID=.;OPOS=284538;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:47:25:25:21:22:0.468085:14:7:10:15:14:8:10:15
chr11	289935	.	T	C	36.82	PASS	AF=0.0742857;AO=13;DP=174;FAO=13;FDP=175;FR=.;FRO=162;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=70;FSRR=92;FWDB=-0.0456804;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.658;QD=0.841509;RBI=0.0509108;REFB=-0.00355586;REVB=-0.0224768;RO=161;SAF=9;SAR=4;SRF=70;SRR=91;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.280171;STB=0.731863;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=0.0458932;OID=.;OPOS=289935;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:174:175:161:162:13:13:0.0742857:4:9:70:91:4:9:70:92
chr11	308290	.	T	C	766.31	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00717395;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.9932;QD=63.859;RBI=0.0351655;REFB=0;REVB=0.034426;RO=0;SAF=27;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.84675e-05;OID=.;OPOS=308290;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:21:27:0:0:21:27:0:0
chr11	308314	.	T	C	501.65	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000789351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.58;QD=59.0173;RBI=0.0234028;REFB=0;REVB=-0.0233895;RO=0;SAF=16;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000104442;OID=.;OPOS=308314;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:18:16:0:0:18:16:0:0
chr11	308362	.	T	TC	202.81	PASS	AF=1;AO=4;DP=24;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.164924;FXX=0.0416493;HRUN=0;LEN=1;MLLD=105.039;QD=35.2712;RBI=0.165582;REFB=0;REVB=-0.0147438;RO=19;SAF=1;SAR=3;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.319187;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00414732;OID=.;OPOS=308363;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:4:24:23:23:0:11:12:0:0:3:19:1:3:10:9
chr11	308363	.	G	C	292.98	PASS	AF=0.958333;AO=21;DP=23;FAO=23;FDP=24;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.129003;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.575;QD=48.8304;RBI=0.129008;REFB=0.00577198;REVB=-0.00120044;RO=1;SAF=9;SAR=12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0485363;STB=0.523789;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=-0.0014909;OID=.;OPOS=308363;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:23:24:1:1:21:23:0.958333:12:9:1:0:13:10:1:0
chr11	308426	.	G	C	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.025252;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.1682;QD=45.8065;RBI=0.0756849;REFB=0;REVB=-0.071348;RO=0;SAF=6;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00402324;OID=.;OPOS=308426;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:8:6:0:0:8:6:0:0
chr11	309127	.	A	G	178.2	PASS	AF=0.395833;AO=19;DP=48;FAO=19;FDP=48;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.0152852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.336;QD=14.85;RBI=0.0153529;REFB=-0.00773216;REVB=-0.00144044;RO=29;SAF=8;SAR=11;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101077;STB=0.558437;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.0206608;OID=.;OPOS=309127;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:29:29:19:19:0.395833:11:8:15:14:11:8:15:14
chr11	314207	.	C	G	657.01	PASS	AF=0.961538;AO=45;DP=51;FAO=50;FDP=52;FR=.,HEALED;FRO=2;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0735028;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.4845;QD=50.5394;RBI=0.074439;REFB=-0.0240466;REVB=0.0117687;RO=2;SAF=25;SAR=20;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0446978;STB=0.520825;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=0.0170585;OID=.;OPOS=314207;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:51:52:2:2:45:50:0.961538:20:25:0:2:23:27:0:2
chr11	320772	.	A	G	429.02	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00196366;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.615;QD=57.2026;RBI=0.0362101;REFB=0;REVB=-0.0361568;RO=0;SAF=17;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.63861e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000182802;OID=.;OPOS=320772;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:13:17:0:0:13:17:0:0
chr11	372157	.	C	T	173.48	PASS	AF=0.5;AO=17;DP=36;FAO=18;FDP=36;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.0730702;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.2715;QD=19.2758;RBI=0.0745627;REFB=-0.0672009;REVB=0.0148441;RO=17;SAF=8;SAR=9;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0521373;STB=0.527747;STBP=0.759;TYPE=snp;VARB=0.0614269;OID=.;OPOS=372157;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:17:18:17:18:0.5:9:8:7:10:9:9:8:10
chr11	372700	.	G	C	91.46	PASS	AF=0.37037;AO=9;DP=27;FAO=10;FDP=27;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=13;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=-0.0255189;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=279.618;QD=13.5493;RBI=0.0257327;REFB=0.0034714;REVB=0.00331024;RO=9;SAF=5;SAR=4;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.280017;STB=0.608488;STBP=0.409;TYPE=snp;VARB=0.00371345;OID=.;OPOS=372700;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:69:27:27:9:13:9:10:0.37037:4:5:2:7:5:5:4:9
chr11	379598	.	A	G	272.91	PASS	AF=0.916667;AO=22;DP=24;FAO=22;FDP=24;FR=.;FRO=2;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0568152;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.163;QD=45.4842;RBI=0.0592744;REFB=-0.00768408;REVB=0.0168965;RO=2;SAF=11;SAR=11;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0768812;STB=0.541629;STBP=0.217;TYPE=snp;VARB=0.000304694;OID=.;OPOS=379598;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:24:24:2:2:22:22:0.916667:11:11:2:0:11:11:2:0
chr11	400109	.	A	G	557.06	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0301509;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.04;QD=60.2221;RBI=0.045503;REFB=0;REVB=0.03408;RO=0;SAF=7;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.00464e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000396973;OID=.;OPOS=400109;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:30:7:0:0:30:7:0:0
chr11	404468	.	G	A	726.66	PASS	AF=0.963636;AO=52;DP=55;FAO=53;FDP=55;FR=.;FRO=2;FSAF=29;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.000816668;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.2695;QD=52.8481;RBI=0.112944;REFB=-0.121279;REVB=0.112941;RO=3;SAF=29;SAR=23;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0575594;STB=0.519992;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.00596767;OID=.;OPOS=404468;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:55:55:3:2:52:53:0.963636:23:29:0:3:24:29:0:2
chr11	406043	.	G	A	1507.07	PASS	AF=1;AO=90;DP=90;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0134854;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.836;QD=63.4555;RBI=0.0182454;REFB=0;REVB=-0.0122897;RO=0;SAF=58;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.68907e-07;OID=.;OPOS=406043;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:90:95:0:0:90:95:1:32:58:0:0:34:61:0:0
chr11	428385	.	A	G	323.45	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186378;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.7657;QD=53.9079;RBI=0.0390416;REFB=0;REVB=0.0343057;RO=0;SAF=12;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000767822;OID=.;OPOS=428385;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:12:12:0:0:12:12:0:0
chr11	428489	.	T	C	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0196451;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.737;QD=42.1821;RBI=0.0872813;REFB=0;REVB=0.0850418;RO=0;SAF=5;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00139258;OID=.;OPOS=428489;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:6:5:0:0:6:5:0:0
chr11	431834	.	A	G	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.318;QD=55.6556;RBI=0.00137616;REFB=0;REVB=-0.00137616;RO=0;SAF=0;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.21175e-06;OID=.;OPOS=431834;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:27:0:0:0:27:0:0:0
chr11	433387	.	A	G	955.2	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0053205;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=218.936;QD=58.7817;RBI=0.0176622;REFB=0;REVB=-0.0168418;RO=0;SAF=33;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.76314e-05;OID=.;OPOS=433387;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:32:33:0:0:32:33:0:0
chr11	549959	.	C	T	785.18	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0183337;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.165;QD=64.0961;RBI=0.0268881;REFB=0;REVB=0.0196683;RO=0;SAF=28;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.06241e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000147155;OID=.;OPOS=549959;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:49:0:0:46:49:1:18:28:0:0:18:31:0:0
chr11	551753	.	G	A	2099.11	PASS	AF=0.985507;AO=130;DP=136;FAO=136;FDP=138;FR=.;FRO=2;FSAF=64;FSAR=72;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0128643;FXX=0.00719373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.046;QD=60.8436;RBI=0.0594406;REFB=-0.0232227;REVB=0.0580319;RO=1;SAF=62;SAR=68;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00693819;STB=0.500428;STBP=0.877;TYPE=snp;VARB=7.6056e-05;OID=.;OPOS=551753;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:136:138:1:2:130:136:0.985507:68:62:0:1:72:64:1:1
chr11	554166	.	C	G	1252.66	PASS	AF=1;AO=81;DP=81;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0331818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.975;QD=61.1051;RBI=0.0337699;REFB=0;REVB=0.00627473;RO=0;SAF=49;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.32002e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0001831;OID=.;OPOS=554166;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:82:0:0:81:82:1:32:49:0:0:33:49:0:0
chr11	554214	.	G	C	1044.33	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0625658;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.3612;QD=59.6761;RBI=0.0661782;REFB=0;REVB=-0.0215654;RO=0;SAF=33;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000254626;OID=.;OPOS=554214;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:37:33:0:0:37:33:0:0
chr11	556521	.	C	G	670.2	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0222998;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.7478;QD=62.3438;RBI=0.0257507;REFB=0;REVB=-0.0128771;RO=0;SAF=32;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.61286e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000234387;OID=.;OPOS=556521;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:11:32:0:0:11:32:0:0
chr11	556857	.	G	C	748.26	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0451363;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.738;QD=56.4724;RBI=0.0744977;REFB=0;REVB=0.0592674;RO=0;SAF=23;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.84538e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000469909;OID=.;OPOS=556857;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:53:0:0:52:53:1:29:23:0:0:29:24:0:0
chr11	557989	.	C	T	1731.0	PASS	AF=1;AO=114;DP=114;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0812179;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.7924;QD=60.737;RBI=0.0818674;REFB=0;REVB=0.0102921;RO=0;SAF=60;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.23871e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000428052;OID=.;OPOS=557989;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:114:114:0:0:114:114:1:54:60:0:0:54:60:0:0
chr11	558884	.	C	T	170.37	PASS	AF=1;AO=14;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0837446;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.601;QD=45.4328;RBI=0.0854531;REFB=0;REVB=0.0170021;RO=0;SAF=11;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00853749;OID=.;OPOS=558884;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:14:15:1:3:11:0:0:4:11:0:0
chr11	559016	.	C	T	115.41	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.044713;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.111;QD=41.9662;RBI=0.0546055;REFB=0;REVB=-0.031345;RO=0;SAF=5;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000215138;OID=.;OPOS=559016;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:11:0:0:10:11:1:5:5:0:0:5:6:0:0
chr11	562219	.	C	G	525.96	PASS	AF=0.972973;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00708683;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.5994;QD=56.86;RBI=0.0130576;REFB=-0.0867755;REVB=-0.0109671;RO=1;SAF=13;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0199188;STB=0.510632;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.00272327;OID=.;OPOS=562219;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:37:37:1:1:36:36:0.972973:23:13:0:1:23:13:0:1
chr11	610277	.	T	C	501.63	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0238894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.603;QD=59.0153;RBI=0.0337585;REFB=0;REVB=-0.0238523;RO=0;SAF=17;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000368706;OID=.;OPOS=610277;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:17:17:0:0:17:17:0:0
chr11	614864	.	C	T	754.75	PASS	AF=0.981818;AO=54;DP=55;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0302964;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=203.854;QD=54.891;RBI=0.0303841;REFB=-0.0573766;REVB=-0.00230625;RO=1;SAF=35;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0132766;STB=0.50704;STBP=0.536;TYPE=snp;VARB=0.000258247;OID=.;OPOS=614864;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:55:55:1:1:54:54:0.981818:19:35:1:0:19:35:1:0
chr11	615196	.	C	T	163.97	PASS	AF=0.375;AO=18;DP=48;FAO=18;FDP=48;FR=.;FRO=30;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=22;FSRR=8;FWDB=0.080589;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=45.224;QD=13.6641;RBI=0.0845355;REFB=-0.0267925;REVB=-0.0255279;RO=30;SAF=10;SAR=8;SRF=22;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200194;STB=0.615266;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=0.0442926;OID=.;OPOS=615196;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:30:30:18:18:0.375:8:10:22:8:8:10:22:8
chr11	616970	.	A	T	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0259912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.367;QD=45.8068;RBI=0.0359675;REFB=0;REVB=0.024862;RO=0;SAF=4;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.63386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.82787e-06;OID=.;OPOS=616970;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:10:4:0:0:10:4:0:0
chr11	617537	.	C	T	1713.39	PASS	AF=0.966942;AO=116;DP=121;FAO=117;FDP=121;FR=.;FRO=4;FSAF=59;FSAR=58;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0440076;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.443;QD=56.641;RBI=0.0453054;REFB=-0.0741921;REVB=0.0107661;RO=4;SAF=58;SAR=58;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0158124;STB=0.508124;STBP=0.409;TYPE=snp;VARB=0.00105082;OID=.;OPOS=617537;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:121:121:4:4:116:117:0.966942:58:58:3:1:58:59:3:1
chr11	617967	.	C	G	1306.11	PASS	AF=0.988372;AO=85;DP=86;FAO=85;FDP=86;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.07591;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.466;QD=60.7491;RBI=0.0772332;REFB=-0.0838126;REVB=0.014235;RO=1;SAF=42;SAR=43;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.011146;STB=0.505881;STBP=0.545;TYPE=snp;VARB=0.000307199;OID=.;OPOS=617967;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:86:86:1:1:85:85:0.988372:43:42:1:0:43:42:1:0
chr11	618767	.	CGGGT	CGGTG	95.25	PASS	AF=0.529412;AO=5;DP=19;FAO=9;FDP=17;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=5;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.058919;FXX=0.105208;HRUN=3;LEN=2;MLLD=25.5032;QD=22.4129;RBI=0.242228;REFB=-0.109961;REVB=0.234953;RO=7;SAF=1;SAR=4;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112423;STB=0.685212;STBP=0.192;TYPE=mnp;VARB=0.126366;OID=.;OPOS=618770;OREF=GT;OALT=TG;OMAPALT=CGGTG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.529412:5:19:9:17:5:1:8:2:3:34:7:1:4:2:5
chr11	618857	.	CA	AC	45.01	PASS	AF=0.208333;AO=5;DP=26;FAO=5;FDP=24;FR=.,HEALED;FRO=17;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.0125517;FXX=0.0768935;HRUN=5;LEN=2;MLLD=53.6426;QD=7.50222;RBI=0.03525;REFB=-0.0391419;REVB=-0.0329396;RO=16;SAF=3;SAR=2;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183179;STB=0.5996;STBP=0.679;TYPE=mnp;VARB=0.00191213;OID=.;OPOS=618857;OREF=CA;OALT=AC;OMAPALT=AC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:26:24:16:17:5:5:0.208333:2:3:7:9:2:3:8:9
chr11	618998	.	G	A	477.82	PASS	AF=0.813953;AO=35;DP=45;FAO=35;FDP=43;FR=.;FRO=8;FSAF=12;FSAR=23;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.104408;FXX=0.0652032;HRUN=5;LEN=1;MLLD=78.2493;QD=44.4484;RBI=0.107118;REFB=-0.0470402;REVB=0.0239398;RO=4;SAF=12;SAR=23;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0837858;STB=0.556155;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=0.00529916;OID=.;OPOS=618998;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:51:45:43:4:8:35:35:0.813953:23:12:3:1:23:12:5:3
chr11	619789	.	T	G	159.77	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00900718;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.193;QD=45.6486;RBI=0.0364431;REFB=0;REVB=0.0353125;RO=0;SAF=5;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000100099;OID=.;OPOS=619789;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:9:5:0:0:9:5:0:0
chr11	624400	.	C	T	160.5	PASS	AF=0.435897;AO=17;DP=41;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.0231604;FXX=0.0487686;HRUN=3;LEN=1;MLLD=196.789;QD=16.4613;RBI=0.0235299;REFB=-0.00355214;REVB=-0.00415366;RO=21;SAF=9;SAR=8;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.05124;STB=0.516597;STBP=0.813;TYPE=snp;VARB=0.00517751;OID=.;OPOS=624400;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:39:21:22:17:17:0.435897:8:9:10:11:8:9:11:11
chr11	639801	.	G	A	538.74	PASS	AF=0.52381;AO=55;DP=105;FAO=55;FDP=105;FR=.;FRO=50;FSAF=32;FSAR=23;FSRF=23;FSRR=27;FWDB=0.0150748;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.908;QD=20.5235;RBI=0.0328073;REFB=-0.0115357;REVB=0.0291388;RO=50;SAF=32;SAR=23;SRF=23;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106095;STB=0.558443;STBP=0.213;TYPE=snp;VARB=0.0102008;OID=.;OPOS=639801;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:105:50:50:55:55:0.52381:23:32:23:27:23:32:23:27
chr11	704583	.	A	G	465.59	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0117393;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=148.417;QD=58.1993;RBI=0.0147086;REFB=0;REVB=0.00886175;RO=0;SAF=15;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.96723e-05;OID=.;OPOS=704583;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:32:0:0:31:32:1:16:15:0:0:17:15:0:0
chr11	704604	.	GA	G	336.93	PASS	AF=1;AO=24;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0982485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.136;QD=53.9092;RBI=0.0984652;REFB=0;REVB=-0.00652809;RO=0;SAF=12;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000614044;OID=.;OPOS=704605;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:24:25:25:25:0:13:12:0:0:4:0:12:12:0:0
chr11	721877	.	G	C	186.85	PASS	AF=0.5;AO=19;DP=38;FAO=19;FDP=38;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=-0.00439756;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=229.611;QD=19.6682;RBI=0.00983537;REFB=-0.0198064;REVB=0.0087975;RO=19;SAF=9;SAR=10;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14155;STB=0.579751;STBP=0.36;TYPE=snp;VARB=0.0228151;OID=.;OPOS=721877;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:19:19:19:19:0.5:10:9:6:13:10:9:6:13
chr11	726178	.	G	C	207.11	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0138864;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.096;QD=48.7323;RBI=0.0140939;REFB=0;REVB=-0.00240983;RO=0;SAF=7;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000196121;OID=.;OPOS=726178;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:10:7:0:0:10:7:0:0
chr11	793588	.	G	A	168.96	PASS	AF=0.298701;AO=23;DP=75;FAO=23;FDP=77;FR=.;FRO=54;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=26;FSRR=28;FWDB=-0.0236475;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=110.252;QD=8.77695;RBI=0.0241503;REFB=-0.00905589;REVB=-0.00490243;RO=51;SAF=6;SAR=17;SRF=24;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.266586;STB=0.66815;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.0375363;OID=.;OPOS=793588;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:77:51:54:23:23:0.298701:17:6:24:27:17:6:26:28
chr11	801644	.	A	T	30.5	PASS	AF=0.454545;AO=5;DP=11;FAO=5;FDP=11;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.055336;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.8194;QD=11.0924;RBI=0.0563953;REFB=0.015595;REVB=-0.0108792;RO=6;SAF=3;SAR=2;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.231195;STB=0.639509;STBP=0.538;TYPE=snp;VARB=-0.00228831;OID=.;OPOS=801644;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:11:11:6:6:5:5:0.454545:2:3:5:1:2:3:5:1
chr11	821778	.	G	A	258.62	PASS	AF=0.460317;AO=29;DP=63;FAO=29;FDP=63;FR=.;FRO=34;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=-0.0046658;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.692;QD=16.4206;RBI=0.0541869;REFB=-0.0157661;REVB=0.0539856;RO=34;SAF=16;SAR=13;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0497927;STB=0.528033;STBP=0.686;TYPE=snp;VARB=0.0275354;OID=.;OPOS=821778;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:34:34:29:29:0.460317:13:16:17:17:13:16:17:17
chr11	823809	.	C	G	323.54	PASS	AF=0.574468;AO=26;DP=48;FAO=27;FDP=47;FR=.,HEALED;FRO=15;FSAF=19;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.0352153;FXX=0.020829;HRUN=3;LEN=1;MLLD=30.5766;QD=27.5356;RBI=0.0380955;REFB=-0.108226;REVB=0.0145309;RO=11;SAF=18;SAR=8;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.191816;STB=0.593677;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=-0.00861879;OID=.;OPOS=823809;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:47:11:15:26:27:0.574468:8:18:4:7:8:19:7:8
chr11	828916	.	G	A	788.53	PASS	AF=1;AO=55;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0128279;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=118.188;QD=56.3233;RBI=0.01869;REFB=0;REVB=0.0135927;RO=1;SAF=24;SAR=31;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0149647;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000114981;OID=.;OPOS=828916;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:1:0:55:56:1:31:24:0:1:32:24:0:0
chr11	829539	.	A	G	1156.6	PASS	AF=1;AO=76;DP=77;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00641582;FXX=0.0129853;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.537;QD=60.8737;RBI=0.00765489;REFB=0;REVB=0.00417549;RO=0;SAF=33;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.66218e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.16346e-06;OID=.;OPOS=829539;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:76:0:0:76:76:1:43:33:0:0:43:33:0:0
chr11	830487	.	C	T	152.91	PASS	AF=1;AO=12;DP=13;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0488628;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.65;QD=43.6885;RBI=0.052992;REFB=0;REVB=0.020508;RO=0;SAF=2;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00165798;OID=.;OPOS=830487;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:14:0:0:12:14:1:10:2:0:0:12:2:0:0
chr11	830670	.	G	T	658.59	PASS	AF=1;AO=40;DP=41;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.058658;FXX=0.0454442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.347;QD=62.7231;RBI=0.0660482;REFB=0;REVB=0.030358;RO=0;SAF=18;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.19993e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00011367;OID=.;OPOS=830670;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:42:0:0:40:42:1:22:18:0:0:22:20:0:0
chr11	831122	.	C	T	884.0	PASS	AF=1;AO=54;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=30;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0342787;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.97;QD=57.9674;RBI=0.05881;REFB=0;REVB=0.0477868;RO=0;SAF=26;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.52846e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000445392;OID=.;OPOS=831122;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:54:61:1:28:26:0:0:31:30:0:0
chr11	837582	.	G	A	1101.95	PASS	AF=0.986667;AO=74;DP=75;FAO=74;FDP=75;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.012454;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.8019;QD=58.7705;RBI=0.0547724;REFB=-0.0511565;REVB=0.0533378;RO=0;SAF=36;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.79579e-08;STB=0.506848;STBP=0.335;TYPE=snp;VARB=0.00153985;OID=.;OPOS=837582;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:75:75:0:1:74:74:0.986667:38:36:0:0:38:36:1:0
chr11	840477	.	A	G	276.54	PASS	AF=1;AO=21;DP=22;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0158456;FXX=0.0454339;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.723;QD=52.6734;RBI=0.0217026;REFB=0;REVB=0.0148296;RO=0;SAF=8;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000351173;OID=.;OPOS=840477;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:21:0:0:21:21:1:13:8:0:0:13:8:0:0
chr11	862652	.	T	C	720.1	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00494996;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.215;QD=62.6175;RBI=0.0252678;REFB=0;REVB=-0.0247783;RO=0;SAF=22;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000414649;OID=.;OPOS=862652;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:46:0:0:45:46:1:23:22:0:0:23:23:0:0
chr11	870446	.	G	A	766.46	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0117213;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=277.997;QD=63.8718;RBI=0.0124751;REFB=0;REVB=0.0042708;RO=0;SAF=29;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.68592e-05;OID=.;OPOS=870446;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:19:29:0:0:19:29:0:0
chr11	900929	.	C	G	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156673;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.091;QD=56.1914;RBI=0.0167295;REFB=0;REVB=0.00586628;RO=0;SAF=12;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00010921;OID=.;OPOS=900929;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:16:12:0:0:16:12:0:0
chr11	903070	.	G	C	708.55	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00520938;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.452;QD=62.9822;RBI=0.00522102;REFB=0;REVB=0.000348545;RO=0;SAF=25;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.09779e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.66113e-05;OID=.;OPOS=903070;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:20:25:0:0:20:25:0:0
chr11	972118	.	C	A	227.14	PASS	AF=0.511628;AO=22;DP=43;FAO=22;FDP=43;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.0127309;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.264;QD=21.1294;RBI=0.0237331;REFB=-0.00646265;REVB=0.0200297;RO=21;SAF=13;SAR=9;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141499;STB=0.579545;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=0.00402324;OID=.;OPOS=972118;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:21:21:22:22:0.511628:9:13:9:12:9:13:9:12
chr11	1010649	.	C	T	251.87	PASS	AF=0.426471;AO=29;DP=68;FAO=29;FDP=68;FR=.;FRO=39;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=25;FWDB=-0.022112;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.9316;QD=14.8159;RBI=0.0281046;REFB=0.00267311;REVB=-0.0173473;RO=39;SAF=14;SAR=15;SRF=14;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126316;STB=0.571381;STBP=0.335;TYPE=snp;VARB=-0.00467635;OID=.;OPOS=1010649;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:39:39:29:29:0.426471:15:14:14:25:15:14:14:25
chr11	1016594	.	A	G	54.6	PASS	AF=0.333333;AO=8;DP=24;FAO=8;FDP=24;FR=.;FRO=16;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.0170578;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.3114;QD=9.09962;RBI=0.0525782;REFB=-0.0097288;REVB=-0.0497343;RO=15;SAF=1;SAR=7;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.456052;STB=0.776955;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=0.0540735;OID=.;OPOS=1016594;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:24:24:15:16:8:8:0.333333:7:1:7:8:7:1:7:9
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chr11	1016614	.	G	T	315.53	PASS	AF=0.52381;AO=33;DP=63;FAO=33;FDP=63;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=25;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=-0.0437499;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.6895;QD=20.0336;RBI=0.057581;REFB=0.0472189;REVB=0.0374367;RO=30;SAF=8;SAR=25;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0995253;STB=0.55552;STBP=0.447;TYPE=snp;VARB=-0.0471638;OID=.;OPOS=1016614;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:30:30:33:33:0.52381:25:8:10:20:25:8:10:20
chr11	1016618	.	G	C	375.66	PASS	AF=0.569231;AO=37;DP=67;FAO=37;FDP=65;FR=.,HEALED;FRO=28;FSAF=8;FSAR=29;FSRF=9;FSRR=19;FWDB=-0.000355264;FXX=0.0298463;HRUN=4;LEN=1;MLLD=199.58;QD=23.1177;RBI=0.0219322;REFB=-0.0477392;REVB=-0.0219293;RO=21;SAF=8;SAR=29;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.182598;STB=0.562108;STBP=0.327;TYPE=snp;VARB=0.0297197;OID=.;OPOS=1016618;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:65:21:28:37:37:0.569231:29:8:9:12:29:8:9:19
chr11	1016630	.	G	A	30.57	PASS	AF=0.0879121;AO=8;DP=91;FAO=8;FDP=91;FR=.;FRO=83;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=25;FSRR=58;FWDB=0.00651234;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.94;QD=1.34395;RBI=0.00936399;REFB=-0.00361493;REVB=0.00672858;RO=83;SAF=1;SAR=7;SRF=25;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.27163;STB=0.736131;STBP=0.227;TYPE=snp;VARB=0.0376704;OID=.;OPOS=1016630;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:91:91:83:83:8:8:0.0879121:7:1:25:58:7:1:25:58
chr11	1016640	.	G	A	34.2	PASS	AF=0.0947368;AO=9;DP=96;FAO=9;FDP=95;FR=.;FRO=86;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=25;FSRR=61;FWDB=-0.0481378;FXX=0.0104156;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.299;QD=1.44003;RBI=0.0492271;REFB=0.00107765;REVB=0.0102988;RO=82;SAF=1;SAR=8;SRF=22;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.274859;STB=0.750219;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=-0.00856894;OID=.;OPOS=1016640;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:96:95:82:86:9:9:0.0947368:8:1:22:60:8:1:25:61
chr11	1016665	.	C	T	144.3	PASS	AF=0.222222;AO=21;DP=99;FAO=22;FDP=99;FR=.;FRO=77;FSAF=2;FSAR=20;FSRF=28;FSRR=49;FWDB=-0.0202975;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.652;QD=5.8301;RBI=0.0243578;REFB=-0.014154;REVB=-0.0134652;RO=77;SAF=2;SAR=19;SRF=28;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.46907;STB=0.812653;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0376923;OID=.;OPOS=1016665;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:77:77:21:22:0.222222:19:2:28:49:20:2:28:49
chr11	1016704	.	C	A	36.32	PASS	AF=0.0877193;AO=10;DP=111;FAO=10;FDP=114;FR=.;FRO=104;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=41;FSRR=63;FWDB=-0.0289349;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.0373;QD=1.27456;RBI=0.0458614;REFB=-0.00996351;REVB=-0.0355814;RO=99;SAF=2;SAR=8;SRF=40;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.263092;STB=0.707362;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=0.0904716;OID=.;OPOS=1016704;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:111:114:99:104:10:10:0.0877193:8:2:40:59:8:2:41:63
chr11	1016713	.	T	C	53.96	PASS	AF=0.111111;AO=12;DP=117;FAO=13;FDP=117;FR=.;FRO=104;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=44;FSRR=60;FWDB=0.0317691;FXX=0.00847386;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.896;QD=1.84475;RBI=0.0358795;REFB=-0.00684949;REVB=-0.0166752;RO=103;SAF=4;SAR=8;SRF=44;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117187;STB=0.535464;STBP=0.819;TYPE=snp;VARB=0.042544;OID=.;OPOS=1016713;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:117:117:103:104:12:13:0.111111:8:4:44:59:8:5:44:60
chr11	1016724	.	A	G	74.46	PASS	AF=0.135593;AO=16;DP=119;FAO=16;FDP=118;FR=.;FRO=102;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=45;FSRR=57;FWDB=-0.0426624;FXX=0.00840265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.343;QD=2.52401;RBI=0.0437477;REFB=-0.01573;REVB=-0.00968438;RO=100;SAF=4;SAR=12;SRF=44;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.255351;STB=0.680316;STBP=0.131;TYPE=snp;VARB=0.0567703;OID=.;OPOS=1016724;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:119:118:100:102:16:16:0.135593:12:4:44:56:12:4:45:57
chr11	1016776	.	C	G	368.03	PASS	AF=0.427083;AO=40;DP=126;FAO=41;FDP=96;FR=.;FRO=55;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=30;FSRR=25;FWDB=-0.00993688;FXX=0.238076;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.723;QD=15.3347;RBI=0.0191147;REFB=-0.0219585;REVB=-0.0163288;RO=55;SAF=21;SAR=19;SRF=30;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0210742;STB=0.519075;STBP=0.779;TYPE=snp;VARB=0.0260942;OID=.;OPOS=1016776;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:126:96:55:55:40:41:0.427083:19:21:30:25:20:21:30:25
chr11	1016779	.	G	A	55.17	PASS	AF=0.107692;AO=14;DP=129;FAO=14;FDP=130;FR=.;FRO=116;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=69;FSRR=47;FWDB=-0.00949786;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.193;QD=1.69766;RBI=0.0121452;REFB=-0.00599852;REVB=-0.00756946;RO=110;SAF=4;SAR=10;SRF=67;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.379132;STB=0.761655;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.0754923;OID=.;OPOS=1016779;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:129:130:110:116:14:14:0.107692:10:4:67:43:10:4:69:47
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chr11	1016800	.	G	A	126.18	PASS	AF=0.179688;AO=19;DP=128;FAO=23;FDP=128;FR=.;FRO=105;FSAF=4;FSAR=19;FSRF=69;FSRR=36;FWDB=-0.00903678;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=218.285;QD=3.943;RBI=0.0288769;REFB=-0.0108632;REVB=-0.0274264;RO=105;SAF=4;SAR=15;SRF=69;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.528355;STB=0.862816;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0839573;OID=.;OPOS=1016800;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:128:128:105:105:19:23:0.179688:15:4:69:36:19:4:69:36
chr11	1016802	.	T	A	102.89	PASS	AF=0.162602;AO=19;DP=123;FAO=20;FDP=123;FR=.;FRO=103;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=67;FSRR=36;FWDB=-0.010731;FXX=0.00806387;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.063;QD=3.34606;RBI=0.0190931;REFB=-0.01689;REVB=-0.0157922;RO=97;SAF=4;SAR=15;SRF=66;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.550925;STB=0.808712;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0879925;OID=.;OPOS=1016802;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:123:123:97:103:19:20:0.162602:15:4:66:31:15:5:67:36
chr11	1016810	.	G	T	141.17	PASS	AF=0.196581;AO=21;DP=121;FAO=23;FDP=117;FR=.,HEALED;FRO=94;FSAF=5;FSAR=18;FSRF=69;FSRR=25;FWDB=0.0133752;FXX=0.0639949;HRUN=4;LEN=1;MLLD=218.67;QD=4.82616;RBI=0.076043;REFB=-0.0315796;REVB=-0.0748575;RO=66;SAF=4;SAR=17;SRF=62;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.764475;STB=0.860767;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0737047;OID=.;OPOS=1016810;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:121:117:66:94:21:23:0.196581:17:4:62:4:18:5:69:25
chr11	1016819	.	G	T	58.21	PASS	AF=0.0949721;AO=17;DP=177;FAO=17;FDP=179;FR=.;FRO=162;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=72;FSRR=90;FWDB=0.000821792;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.495;QD=1.30075;RBI=0.049202;REFB=-0.0110154;REVB=-0.0491951;RO=160;SAF=9;SAR=8;SRF=71;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101739;STB=0.576382;STBP=0.56;TYPE=snp;VARB=0.0720773;OID=.;OPOS=1016819;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:58:177:179:160:162:17:17:0.0949721:8:9:71:89:8:9:72:90
chr11	1016825	.	G	A	59.7	PASS	AF=0.0918367;AO=18;DP=195;FAO=18;FDP=196;FR=.;FRO=178;FSAF=2;FSAR=16;FSRF=83;FSRR=95;FWDB=-8.27441e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.393;QD=1.21836;RBI=0.0283681;REFB=-0.00317257;REVB=-0.0283679;RO=177;SAF=2;SAR=16;SRF=82;SRR=95;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.450251;STB=0.859234;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0516799;OID=.;OPOS=1016825;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:59:195:196:177:178:18:18:0.0918367:16:2:82:95:16:2:83:95
chr11	1016833	.	G	T	40.78	PASS	AF=0.0742574;AO=15;DP=200;FAO=15;FDP=202;FR=.;FRO=187;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=80;FSRR=107;FWDB=0.01081;FXX=0.00492587;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.9681;QD=0.807444;RBI=0.0149724;REFB=-0.00274883;REVB=-0.0103593;RO=184;SAF=8;SAR=7;SRF=78;SRR=106;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122295;STB=0.596733;STBP=0.484;TYPE=snp;VARB=0.057388;OID=.;OPOS=1016833;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:40:200:202:184:187:15:15:0.0742574:7:8:78:106:7:8:80:107
chr11	1016834	.	G	A	222.72	PASS	AF=0.192118;AO=39;DP=203;FAO=39;FDP=203;FR=.;FRO=164;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=63;FSRR=101;FWDB=0.0370598;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.5287;QD=4.38848;RBI=0.0489946;REFB=-0.00673166;REVB=0.0320474;RO=146;SAF=25;SAR=14;SRF=61;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.280677;STB=0.699927;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.0350301;OID=.;OPOS=1016834;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:203:203:146:164:39:39:0.192118:14:25:61:85:14:25:63:101
chr11	1016869	.	AGG	CAG,CAT,TGG	503.97	PASS	AF=0,0,0.379085;AO=13,9,58;DP=176;FAO=0,0,58;FDP=153;FR=.;FRO=95;FSAF=0,0,37;FSAR=0,0,21;FSRF=43;FSRR=52;FWDB=-0.00459695,0.00315873,-0.000263027;FXX=0.130674;HRUN=2,2,2;LEN=2,3,1;MLLD=128.581,145.926,117.361;QD=13.1757;RBI=0.0155593,0.0149005,0.0278204;REFB=-0.000592238,-0.00730544,-0.00886177;REVB=-0.0148648,-0.0145619,-0.0278192;RO=80;SAF=2,2,37;SAR=11,7,21;SRF=40;SRR=40;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.452223,-0.331465,0.146906;STB=0.5,0.5,0.616485;STBP=1,1,0.03;TYPE=mnp,mnp,snp;VARB=0,0.101106,0.0177321;OID=.,.,.;OPOS=1016869,1016869,1016869;OREF=AG,AGG,A;OALT=CA,CAT,T;OMAPALT=CAG,CAT,TGG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/3:99:176:153:80:95:13,9,58:0,0,58:0,0,0.379085:11,7,21:2,2,37:40:40:0,0,21:0,0,37:43:52
chr11	1016887	.	G	A	32.65	PASS	AF=0.0728477;AO=11;DP=152;FAO=11;FDP=151;FR=.;FRO=140;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=84;FSRR=56;FWDB=-0.0141502;FXX=0.00657851;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.56;QD=0.864768;RBI=0.0170995;REFB=-0.00244139;REVB=-0.00960016;RO=140;SAF=2;SAR=9;SRF=84;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.437308;STB=0.855612;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0344349;OID=.;OPOS=1016887;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:32:152:151:140:140:11:11:0.0728477:9:2:84:56:9:2:84:56
chr11	1016890	.	G	A	509.87	PASS	AF=0.387755;AO=52;DP=142;FAO=57;FDP=147;FR=.;FRO=90;FSAF=27;FSAR=30;FSRF=59;FSRR=31;FWDB=0.0037593;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=220.438;QD=13.8739;RBI=0.0231783;REFB=-0.0125958;REVB=-0.0228714;RO=90;SAF=25;SAR=27;SRF=59;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.193981;STB=0.610325;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.0237703;OID=.;OPOS=1016890;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:142:147:90:90:52:57:0.387755:27:25:59:31:30:27:59:31
chr11	1016894	.	G	A	164.71	PASS	AF=0.207143;AO=26;DP=138;FAO=29;FDP=140;FR=.;FRO=111;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=62;FSRR=49;FWDB=-0.00483493;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.326;QD=4.70607;RBI=0.00722766;REFB=-0.0118257;REVB=0.00537238;RO=112;SAF=18;SAR=8;SRF=62;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186979;STB=0.61109;STBP=0.199;TYPE=snp;VARB=0.0546661;OID=.;OPOS=1016894;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:138:140:112:111:26:29:0.207143:8:18:62:50:9:20:62:49
chr11	1016910	.	G	A	98.72	PASS	AF=0.174757;AO=18;DP=104;FAO=18;FDP=103;FR=.;FRO=85;FSAF=15;FSAR=3;FSRF=57;FSRR=28;FWDB=0.018201;FXX=0.0190458;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.124;QD=3.83373;RBI=0.0182849;REFB=-0.00611138;REVB=0.00174964;RO=85;SAF=15;SAR=3;SRF=57;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.270915;STB=0.682587;STBP=0.131;TYPE=snp;VARB=0.0128436;OID=.;OPOS=1016910;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:104:103:85:85:18:18:0.174757:3:15:57:28:3:15:57:28
chr11	1016914	.	G	T	449.37	PASS	AF=0.42268;AO=33;DP=97;FAO=41;FDP=97;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=49;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=48;FSRR=1;FWDB=0.00761516;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.5588;QD=18.5308;RBI=0.113457;REFB=-0.00162021;REVB=0.113201;RO=43;SAF=23;SAR=10;SRF=43;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.446049;STB=0.739047;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=-0.00140169;OID=.;OPOS=1016914;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:43:49:33:41:0.42268:10:23:43:0:17:24:48:1
chr11	1016928	.	C	G	886.22	PASS	AF=0.8;AO=68;DP=85;FAO=68;FDP=85;FR=.;FRO=17;FSAF=46;FSAR=22;FSRF=14;FSRR=3;FWDB=0.00445024;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.558;QD=41.7047;RBI=0.0280764;REFB=-0.0423271;REVB=0.0277214;RO=15;SAF=46;SAR=22;SRF=12;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0487224;STB=0.534403;STBP=0.252;TYPE=snp;VARB=0.0139356;OID=.;OPOS=1016928;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:15:17:68:68:0.8:22:46:12:3:22:46:14:3
chr11	1016933	.	C	T	227.45	PASS	AF=0.341463;AO=28;DP=83;FAO=28;FDP=82;FR=.;FRO=54;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=40;FSRR=14;FWDB=-0.0107243;FXX=0.0238067;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.086;QD=11.0951;RBI=0.0438379;REFB=-0.029146;REVB=-0.0425059;RO=54;SAF=19;SAR=9;SRF=40;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0840693;STB=0.548521;STBP=0.597;TYPE=snp;VARB=0.0521123;OID=.;OPOS=1016933;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:82:54:54:28:28:0.341463:9:19:40:14:9:19:40:14
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chr11	1017045	.	G	T	104.45	PASS	AF=0.151079;AO=21;DP=139;FAO=21;FDP=139;FR=.;FRO=118;FSAF=3;FSAR=18;FSRF=21;FSRR=97;FWDB=-0.00751973;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.67;QD=3.00588;RBI=0.0436875;REFB=-0.00994178;REVB=-0.0430355;RO=118;SAF=3;SAR=18;SRF=21;SRR=97;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0820518;STB=0.555927;STBP=0.688;TYPE=snp;VARB=0.0427208;OID=.;OPOS=1017045;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:139:139:118:118:21:21:0.151079:18:3:21:97:18:3:21:97
chr11	1017069	.	G	A	256.64	PASS	AF=0.246667;AO=37;DP=150;FAO=37;FDP=150;FR=.;FRO=113;FSAF=7;FSAR=30;FSRF=22;FSRR=91;FWDB=-0.00762201;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.2771;QD=6.84365;RBI=0.00831269;REFB=-0.00498671;REVB=0.0033175;RO=113;SAF=7;SAR=30;SRF=22;SRR=91;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0110885;STB=0.506694;STBP=0.94;TYPE=snp;VARB=0.0102745;OID=.;OPOS=1017069;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:150:150:113:113:37:37:0.246667:30:7:22:91:30:7:22:91
chr11	1017084	.	G	A	305.59	PASS	AF=0.292857;AO=40;DP=136;FAO=41;FDP=140;FR=.;FRO=99;FSAF=7;FSAR=34;FSRF=22;FSRR=77;FWDB=0.00379123;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=116.969;QD=8.73121;RBI=0.0216387;REFB=-0.0188778;REVB=-0.021304;RO=96;SAF=7;SAR=33;SRF=21;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0843722;STB=0.559243;STBP=0.475;TYPE=snp;VARB=0.0511912;OID=.;OPOS=1017084;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:136:140:96:99:40:41:0.292857:33:7:21:75:34:7:22:77
chr11	1017110	.	C	T	226.31	PASS	AF=0.246269;AO=33;DP=135;FAO=33;FDP=134;FR=.;FRO=101;FSAF=9;FSAR=24;FSRF=24;FSRR=77;FWDB=0.00558953;FXX=0.0289834;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.205;QD=6.75555;RBI=0.00845742;REFB=-0.0147029;REVB=0.00634706;RO=100;SAF=9;SAR=24;SRF=25;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0365094;STB=0.534371;STBP=0.69;TYPE=snp;VARB=0.047002;OID=.;OPOS=1017110;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:135:134:100:101:33:33:0.246269:24:9:25:75:24:9:24:77
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chr11	1017135	.	G	A	93.95	PASS	AF=0.136986;AO=20;DP=146;FAO=20;FDP=146;FR=.;FRO=126;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=31;FSRR=95;FWDB=0.00830659;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=238.034;QD=2.5741;RBI=0.0256344;REFB=-0.00211759;REVB=-0.0242513;RO=126;SAF=5;SAR=15;SRF=31;SRR=95;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00669219;STB=0.504583;STBP=0.977;TYPE=snp;VARB=0.032302;OID=.;OPOS=1017135;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:93:146:146:126:126:20:20:0.136986:15:5:31:95:15:5:31:95
chr11	1017154	.	T	G	130.78	PASS	AF=0.162338;AO=24;DP=154;FAO=25;FDP=154;FR=.;FRO=129;FSAF=6;FSAR=19;FSRF=32;FSRR=97;FWDB=-0.0103379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.927;QD=3.39677;RBI=0.0217021;REFB=-0.0051777;REVB=-0.0190816;RO=126;SAF=6;SAR=18;SRF=31;SRR=95;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00678112;STB=0.50916;STBP=0.947;TYPE=snp;VARB=0.0324941;OID=.;OPOS=1017154;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:154:154:126:129:24:25:0.162338:18:6:31:95:19:6:32:97
chr11	1017158	.	G	T	100.46	PASS	AF=0.141892;AO=20;DP=147;FAO=21;FDP=148;FR=.;FRO=127;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=33;FSRR=94;FWDB=-0.0363849;FXX=0.00671096;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.4786;QD=2.71521;RBI=0.0393582;REFB=-0.00253413;REVB=0.015007;RO=127;SAF=6;SAR=14;SRF=34;SRR=93;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0500419;STB=0.527819;STBP=0.818;TYPE=snp;VARB=0.0169887;OID=.;OPOS=1017158;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:147:148:127:127:20:21:0.141892:14:6:34:93:15:6:33:94
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chr11	1017183	.	G	T	251.95	PASS	AF=0.26087;AO=36;DP=138;FAO=36;FDP=138;FR=.;FRO=102;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=24;FSRR=78;FWDB=0.0180537;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.4455;QD=7.3029;RBI=0.019227;REFB=-0.00317202;REVB=0.00661387;RO=102;SAF=13;SAR=23;SRF=24;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181325;STB=0.606693;STBP=0.195;TYPE=snp;VARB=0.0128241;OID=.;OPOS=1017183;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:138:138:102:102:36:36:0.26087:23:13:24:78:23:13:24:78
chr11	1017186	.	A	G	35.9	PASS	AF=0.0814815;AO=12;DP=133;FAO=11;FDP=135;FR=.;FRO=124;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=33;FSRR=91;FWDB=-0.0307386;FXX=0.0073524;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.9198;QD=1.06378;RBI=0.0710141;REFB=-0.0155803;REVB=-0.0640167;RO=120;SAF=4;SAR=8;SRF=32;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0933062;STB=0.601982;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.0920647;OID=.;OPOS=1017186;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:133:135:120:124:12:11:0.0814815:8:4:32:88:7:4:33:91
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chr11	1017231	.	A	G	637.23	PASS	AF=0.6;AO=55;DP=94;FAO=57;FDP=95;FR=.;FRO=38;FSAF=28;FSAR=29;FSRF=8;FSRR=30;FWDB=0.0270062;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.802;QD=26.8305;RBI=0.0273037;REFB=-0.0362648;REVB=0.00401949;RO=38;SAF=28;SAR=27;SRF=8;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.22363;STB=0.612722;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.0315672;OID=.;OPOS=1017231;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:95:38:38:55:57:0.6:27:28:8:30:29:28:8:30
chr11	1017239	.	CG	TA	574.38	PASS	AF=0.56383;AO=52;DP=96;FAO=53;FDP=94;FR=.;FRO=41;FSAF=27;FSAR=26;FSRF=9;FSRR=32;FWDB=0.00466136;FXX=0.0208312;HRUN=2;LEN=2;MLLD=182.069;QD=24.4419;RBI=0.00904312;REFB=-0.016365;REVB=-0.00774917;RO=38;SAF=26;SAR=26;SRF=8;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.224546;STB=0.625855;STBP=0.006;TYPE=mnp;VARB=0.0110601;OID=.;OPOS=1017239;OREF=CG;OALT=TA;OMAPALT=TA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:94:38:41:52:53:0.56383:26:26:8:30:26:27:9:32
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chr11	1017325	.	A	C	194.55	PASS	AF=0.324675;AO=25;DP=78;FAO=25;FDP=77;FR=.;FRO=52;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=32;FWDB=0.0191042;FXX=0.0253133;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.3907;QD=10.1066;RBI=0.0192418;REFB=-0.00706054;REVB=-0.0022972;RO=51;SAF=14;SAR=11;SRF=20;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190705;STB=0.616712;STBP=0.134;TYPE=snp;VARB=0.00918464;OID=.;OPOS=1017325;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:77:51:52:25:25:0.324675:11:14:20:31:11:14:20:32
chr11	1017337	.	TC	CA	123.48	PASS	AF=0.215909;AO=19;DP=90;FAO=19;FDP=88;FR=.;FRO=69;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=34;FSRR=35;FWDB=0.00170436;FXX=0.0222198;HRUN=1;LEN=2;MLLD=175.809;QD=5.61273;RBI=0.0252464;REFB=-0.0090069;REVB=-0.0251889;RO=68;SAF=7;SAR=12;SRF=34;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166576;STB=0.599163;STBP=0.346;TYPE=mnp;VARB=0.0384317;OID=.;OPOS=1017337;OREF=TC;OALT=CA;OMAPALT=CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:88:68:69:19:19:0.215909:12:7:34:34:12:7:34:35
chr11	1017381	.	G	C	72.97	PASS	AF=0.178082;AO=13;DP=73;FAO=13;FDP=73;FR=.;FRO=60;FSAF=12;FSAR=1;FSRF=32;FSRR=28;FWDB=0.0103061;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.338;QD=3.99848;RBI=0.0196641;REFB=-0.00374583;REVB=0.016747;RO=59;SAF=12;SAR=1;SRF=32;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.561985;STB=0.887064;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0207803;OID=.;OPOS=1017381;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:73:73:59:60:13:13:0.178082:1:12:32:27:1:12:32:28
chr11	1017384	.	G	C	120.98	PASS	AF=0.257143;AO=18;DP=70;FAO=18;FDP=70;FR=.;FRO=52;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=30;FSRR=22;FWDB=0.00494127;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.273;QD=6.91303;RBI=0.00504975;REFB=-0.00361734;REVB=-0.00104108;RO=51;SAF=13;SAR=5;SRF=29;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.204182;STB=0.62;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=0.0109569;OID=.;OPOS=1017384;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:51:52:18:18:0.257143:5:13:29:22:5:13:30:22
chr11	1017421	.	G	T	116.0	PASS	AF=0.288136;AO=14;DP=60;FAO=17;FDP=59;FR=.,HEALED;FRO=41;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=34;FSRR=7;FWDB=0.0484254;FXX=0.0166639;HRUN=3;LEN=1;MLLD=37.571;QD=7.86442;RBI=0.087283;REFB=-0.0363271;REVB=-0.0726175;RO=33;SAF=9;SAR=5;SRF=30;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.402055;STB=0.687322;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.0720929;OID=.;OPOS=1017421;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:59:33:41:14:17:0.288136:5:9:30:3:7:10:34:7
chr11	1017440	.	C	T	96.8	PASS	AF=0.205128;AO=16;DP=78;FAO=16;FDP=78;FR=.;FRO=62;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=33;FSRR=29;FWDB=-0.00299872;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.03;QD=4.96394;RBI=0.0230689;REFB=-0.014853;REVB=-0.0228732;RO=61;SAF=6;SAR=10;SRF=33;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.206683;STB=0.624844;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.0514102;OID=.;OPOS=1017440;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:78:78:61:62:16:16:0.205128:10:6:33:28:10:6:33:29
chr11	1017443	.	C	G	202.61	PASS	AF=0.333333;AO=25;DP=81;FAO=25;FDP=75;FR=.;FRO=50;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=30;FSRR=20;FWDB=-0.0137868;FXX=0.0853554;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.949;QD=10.8061;RBI=0.0349144;REFB=-0.0113748;REVB=-0.0320771;RO=50;SAF=12;SAR=13;SRF=30;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136634;STB=0.579555;STBP=0.341;TYPE=snp;VARB=0.0345838;OID=.;OPOS=1017443;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:75:50:50:25:25:0.333333:13:12:30:20:13:12:30:20
chr11	1017464	.	T	C	66.32	PASS	AF=0.162162;AO=12;DP=83;FAO=12;FDP=74;FR=.;FRO=62;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=32;FSRR=30;FWDB=0.0340481;FXX=0.108421;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.2036;QD=3.58472;RBI=0.0424691;REFB=0.0124887;REVB=-0.0253841;RO=64;SAF=5;SAR=7;SRF=32;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103924;STB=0.583195;STBP=0.559;TYPE=snp;VARB=-0.0566503;OID=.;OPOS=1017464;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:83:74:64:62:12:12:0.162162:7:5:32:32:7:5:32:30
chr11	1017466	.	TG	CA,CG	30.18	PASS	AF=0.0512821,0.0512821;AO=4,4;DP=81;FAO=4,4;FDP=78;FR=.;FRO=70;FSAF=3,1;FSAR=1,3;FSRF=34;FSRR=36;FWDB=0.0209356,0.016196;FXX=0.0487745;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=155.82,155.408;QD=1.54777;RBI=0.0211642,0.0213965;REFB=-0.00283446,-0.000352289;REVB=-0.0031025,-0.0139822;RO=69;SAF=3,1;SAR=1,3;SRF=33;SRR=36;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.252085,-0.216614;STB=0.748755,0.727997;STBP=0.397,0.416;TYPE=mnp,snp;VARB=0.00901931,-0.00593383;OID=.,.;OPOS=1017466,1017466;OREF=TG,T;OALT=CA,C;OMAPALT=CA,CG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:81:78:69:70:4,4:4,4:0.0512821,0.0512821:1,3:3,1:33:36:1,3:3,1:34:36
chr11	1017470	.	GC	TC,TT	50.29	PASS	AF=0.103896,0.038961;AO=8,3;DP=77;FAO=8,3;FDP=77;FR=.;FRO=66;FSAF=4,1;FSAR=4,2;FSRF=33;FSRR=33;FWDB=0.0145738,0.0105906;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=160.925,170.942;QD=2.6123;RBI=0.0147849,0.021174;REFB=-0.00428531,-0.00516179;REVB=-0.00248946,-0.0183351;RO=59;SAF=4,1;SAR=4,2;SRF=31;SRR=28;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0302481,-0.164938;STB=0.5,0.659127;STBP=1,0.689;TYPE=snp,mnp;VARB=0.0232236,0.00553997;OID=.,.;OPOS=1017470,1017470;OREF=G,GC;OALT=T,TT;OMAPALT=TC,TT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:77:77:59:66:8,3:8,3:0.103896,0.038961:4,2:4,1:31:28:4,2:4,1:33:33
chr11	1017552	.	T	C	87.27	PASS	AF=0.125786;AO=20;DP=159;FAO=20;FDP=159;FR=.;FRO=139;FSAF=2;FSAR=18;FSRF=44;FSRR=95;FWDB=0.0108842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.058;QD=2.19548;RBI=0.0115631;REFB=-0.00532476;REVB=0.00390377;RO=138;SAF=2;SAR=18;SRF=44;SRR=94;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.383821;STB=0.785225;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.0322658;OID=.;OPOS=1017552;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:159:159:138:139:20:20:0.125786:18:2:44:94:18:2:44:95
chr11	1017556	.	G	A	34.6	PASS	AF=0.0764331;AO=12;DP=156;FAO=12;FDP=157;FR=.;FRO=145;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=44;FSRR=101;FWDB=0.025498;FXX=0.00632871;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.9045;QD=0.881408;RBI=0.0283489;REFB=-0.00220479;REVB=0.0123898;RO=144;SAF=3;SAR=9;SRF=44;SRR=100;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0756272;STB=0.561645;STBP=0.701;TYPE=snp;VARB=0.0399193;OID=.;OPOS=1017556;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:156:157:144:145:12:12:0.0764331:9:3:44:100:9:3:44:101
chr11	1017575	.	C	T	82.79	PASS	AF=0.135338;AO=18;DP=133;FAO=18;FDP=133;FR=.;FRO=115;FSAF=2;FSAR=16;FSRF=42;FSRR=73;FWDB=-0.0228617;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.804;QD=2.48977;RBI=0.024743;REFB=-0.00281924;REVB=-0.00946376;RO=114;SAF=2;SAR=16;SRF=41;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.404383;STB=0.797788;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.0135485;OID=.;OPOS=1017575;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:82:133:133:114:115:18:18:0.135338:16:2:41:73:16:2:42:73
chr11	1017596	.	T	G	159.7	PASS	AF=0.244681;AO=22;DP=93;FAO=23;FDP=94;FR=.;FRO=71;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=28;FSRR=43;FWDB=-0.0142288;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.705;QD=6.79578;RBI=0.0258916;REFB=-0.0140464;REVB=-0.0216314;RO=71;SAF=13;SAR=9;SRF=28;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.240599;STB=0.626827;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=0.0376912;OID=.;OPOS=1017596;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:94:71:71:22:23:0.244681:9:13:28:43:10:13:28:43
chr11	1017655	.	G	A	74.48	PASS	AF=0.243902;AO=10;DP=43;FAO=10;FDP=41;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=24;FSRR=7;FWDB=0.00239357;FXX=0.0465008;HRUN=5;LEN=1;MLLD=213.583;QD=7.26649;RBI=0.014301;REFB=-0.00845323;REVB=-0.0140993;RO=31;SAF=9;SAR=1;SRF=24;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.280189;STB=0.685259;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.0244391;OID=.;OPOS=1017655;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:43:41:31:31:10:10:0.243902:1:9:24:7:1:9:24:7
chr11	1017691	.	C	G	128.18	PASS	AF=0.201835;AO=22;DP=104;FAO=22;FDP=109;FR=.;FRO=87;FSAF=4;FSAR=18;FSRF=24;FSRR=63;FWDB=-0.0457458;FXX=0.0180164;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.864;QD=4.70398;RBI=0.0657427;REFB=-0.0222417;REVB=-0.0472168;RO=80;SAF=4;SAR=18;SRF=25;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.22112;STB=0.608586;STBP=0.365;TYPE=snp;VARB=0.10729;OID=.;OPOS=1017691;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:109:80:87:22:22:0.201835:18:4:25:55:18:4:24:63
chr11	1017710	.	G	T	60.35	PASS	AF=0.109489;AO=15;DP=141;FAO=15;FDP=137;FR=.;FRO=122;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=29;FSRR=93;FWDB=-0.0181691;FXX=0.0283668;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.895;QD=1.762;RBI=0.0224892;REFB=-0.00853692;REVB=-0.0132531;RO=126;SAF=4;SAR=11;SRF=29;SRR=97;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.05947;STB=0.533974;STBP=0.839;TYPE=snp;VARB=0.0383416;OID=.;OPOS=1017710;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:60:141:137:126:122:15:15:0.109489:11:4:29:97:11:4:29:93
chr11	1017744	.	T	C	43.6	PASS	AF=0.0860927;AO=13;DP=150;FAO=13;FDP=151;FR=.;FRO=138;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=28;FSRR=110;FWDB=0.0107194;FXX=0.00657851;HRUN=3;LEN=1;MLLD=136.625;QD=1.15506;RBI=0.0111672;REFB=-0.00565656;REVB=0.00313079;RO=137;SAF=3;SAR=10;SRF=28;SRR=109;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0450827;STB=0.537259;STBP=0.87;TYPE=snp;VARB=0.046079;OID=.;OPOS=1017744;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:150:151:137:138:13:13:0.0860927:10:3:28:109:10:3:28:110
chr11	1017746	.	T	G	203.14	PASS	AF=0.213333;AO=32;DP=150;FAO=32;FDP=150;FR=.;FRO=118;FSAF=9;FSAR=23;FSRF=23;FSRR=95;FWDB=0.00739205;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=89.4157;QD=5.4171;RBI=0.00769985;REFB=-0.00286927;REVB=0.00215528;RO=115;SAF=9;SAR=23;SRF=22;SRR=93;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155849;STB=0.590606;STBP=0.348;TYPE=snp;VARB=0.01321;OID=.;OPOS=1017746;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:150:150:115:118:32:32:0.213333:23:9:22:93:23:9:23:95
chr11	1017767	.	G	C	126.29	PASS	AF=0.16;AO=24;DP=150;FAO=24;FDP=150;FR=.;FRO=126;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=31;FSRR=95;FWDB=-0.0124084;FXX=0.00662208;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.813;QD=3.36765;RBI=0.0223031;REFB=-0.0105766;REVB=-0.0185327;RO=125;SAF=8;SAR=16;SRF=31;SRR=94;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13189;STB=0.587235;STBP=0.408;TYPE=snp;VARB=0.0650997;OID=.;OPOS=1017767;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:150:150:125:126:24:24:0.16:16:8:31:94:16:8:31:95
chr11	1017773	.	G	A	228.39	PASS	AF=0.233766;AO=35;DP=154;FAO=36;FDP=154;FR=.;FRO=118;FSAF=10;FSAR=26;FSRF=33;FSRR=85;FWDB=-0.00426338;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.1111;QD=5.93208;RBI=0.0238165;REFB=-0.0218556;REVB=0.0234318;RO=118;SAF=10;SAR=25;SRF=33;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00941448;STB=0.501794;STBP=0.993;TYPE=snp;VARB=0.0772689;OID=.;OPOS=1017773;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:154:154:118:118:35:36:0.233766:25:10:33:85:26:10:33:85
chr11	1017783	.	A	G	756.98	PASS	AF=0.5;AO=77;DP=154;FAO=78;FDP=156;FR=.;FRO=78;FSAF=24;FSAR=54;FSRF=23;FSRR=55;FWDB=-0.000706359;FXX=0.00636902;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.061;QD=19.4097;RBI=0.0174741;REFB=-0.0275498;REVB=-0.0174598;RO=74;SAF=23;SAR=54;SRF=23;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0128007;STB=0.507565;STBP=0.863;TYPE=snp;VARB=0.0237734;OID=.;OPOS=1017783;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:154:156:74:78:77:78:0.5:54:23:23:51:54:24:23:55
chr11	1017789	.	A	C	84.78	PASS	AF=0.122699;AO=19;DP=161;FAO=20;FDP=163;FR=.;FRO=143;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=47;FSRR=96;FWDB=-0.0138765;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.82;QD=2.08043;RBI=0.0238251;REFB=-0.00097778;REVB=-0.0193669;RO=134;SAF=5;SAR=14;SRF=46;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116409;STB=0.58418;STBP=0.476;TYPE=snp;VARB=0.0121862;OID=.;OPOS=1017789;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:161:163:134:143:19:20:0.122699:14:5:46:88:15:5:47:96
chr11	1017793	.	T	G	44.88	PASS	AF=0.0843373;AO=14;DP=164;FAO=14;FDP=166;FR=.;FRO=152;FSAF=1;FSAR=13;FSRF=52;FSRR=100;FWDB=0.00101072;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.4866;QD=1.08147;RBI=0.0104231;REFB=0.00144892;REVB=-0.010374;RO=150;SAF=1;SAR=13;SRF=51;SRR=99;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.41003;STB=0.858457;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=-0.0222103;OID=.;OPOS=1017793;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:164:166:150:152:14:14:0.0843373:13:1:51:99:13:1:52:100
chr11	1017797	.	C	G	39.67	PASS	AF=0.0848485;AO=10;DP=162;FAO=14;FDP=165;FR=.;FRO=151;FSAF=2;FSAR=12;FSRF=54;FSRR=97;FWDB=-0.0175255;FXX=0.0178561;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.519;QD=0.961804;RBI=0.0227802;REFB=-0.00570341;REVB=-0.0145531;RO=149;SAF=2;SAR=8;SRF=52;SRR=97;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.182606;STB=0.754633;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=0.0810218;OID=.;OPOS=1017797;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:39:162:165:149:151:10:14:0.0848485:8:2:52:97:12:2:54:97
chr11	1017833	.	C	T	100.95	PASS	AF=0.138365;AO=20;DP=158;FAO=22;FDP=159;FR=.;FRO=137;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=39;FSRR=98;FWDB=0.00894293;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.1;QD=2.53955;RBI=0.0433175;REFB=-0.0157028;REVB=-0.0423843;RO=135;SAF=6;SAR=14;SRF=39;SRR=96;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0167394;STB=0.534068;STBP=0.775;TYPE=snp;VARB=0.074049;OID=.;OPOS=1017833;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:158:159:135:137:20:22:0.138365:14:6:39:96:15:7:39:98
chr11	1017844	.	TC	CG,TG	392.34	PASS	AF=0.0980392,0.248366;AO=15,37;DP=155;FAO=15,38;FDP=153;FR=.;FRO=100;FSAF=3,7;FSAR=12,31;FSRF=35;FSRR=65;FWDB=-0.012531,-0.0561197;FXX=0.0129024;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=160.285,173.466;QD=10.2574;RBI=0.0132688,0.0579288;REFB=-0.0239569,-0.0298151;REVB=-0.00436305,-0.0143641;RO=95;SAF=3,7;SAR=12,30;SRF=32;SRR=63;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.211396,-0.23639;STB=0.663513,0.65948;STBP=0.247,0.032;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0273315,0.0504146;OID=.,.;OPOS=1017844,1017845;OREF=TC,C;OALT=CG,G;OMAPALT=CG,TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:155:153:95:100:15,37:15,38:0.0980392,0.248366:12,30:3,7:32:63:12,31:3,7:35:65
chr11	1017858	.	A	G	320.53	PASS	AF=0.27381;AO=46;DP=168;FAO=46;FDP=168;FR=.;FRO=122;FSAF=10;FSAR=36;FSRF=45;FSRR=77;FWDB=-0.023193;FXX=0.00591681;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.9993;QD=7.63172;RBI=0.05523;REFB=-0.0244966;REVB=-0.0501243;RO=117;SAF=10;SAR=36;SRF=43;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.224665;STB=0.636591;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.0665067;OID=.;OPOS=1017858;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:168:168:117:122:46:46:0.27381:36:10:43:74:36:10:45:77
chr11	1017883	.	C	A	68.73	PASS	AF=0.108434;AO=17;DP=167;FAO=18;FDP=166;FR=.;FRO=148;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=61;FSRR=87;FWDB=-0.0423314;FXX=0.0404601;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.3822;QD=1.65624;RBI=0.0470185;REFB=-0.00845858;REVB=-0.0204642;RO=142;SAF=4;SAR=13;SRF=60;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.247371;STB=0.69231;STBP=0.115;TYPE=snp;VARB=0.0476072;OID=.;OPOS=1017883;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:68:167:166:142:148:17:18:0.108434:13:4:60:82:14:4:61:87
chr11	1017891	.	GCAT	GCGT,GTGC,TGAT	168.21	PASS	AF=0.0769231,0.0591716,0.0710059;AO=12,10,12;DP=172;FAO=13,10,12;FDP=169;FR=.;FRO=134;FSAF=2,2,10;FSAR=11,8,2;FSRF=55;FSRR=79;FWDB=0.00941201,0.00561538,0.00364281;FXX=0.0174408;HRUN=1,1,1;LEN=1,3,2;MLLD=111.15,158.954,103.898;QD=3.98121;RBI=0.0771221,0.0485729,0.0684756;REFB=-0.00811291,-0.00953261,-0.0147906;REVB=-0.0765456,-0.0482472,-0.0683787;RO=128;SAF=2,2,10;SAR=10,8,2;SRF=53;SRR=75;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.316802,-0.254891,0.462133;STB=0.776473,0.723321,0.861148;STBP=0.061,0.188,0.019;TYPE=snp,mnp,mnp;VARB=0.0651963,0.0777335,0.038075;OID=.,.,.;OPOS=1017893,1017892,1017891;OREF=A,CAT,GC;OALT=G,TGC,TG;OMAPALT=GCGT,GTGC,TGAT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:172:169:128:134:12,10,12:13,10,12:0.0769231,0.0591716,0.0710059:10,8,2:2,2,10:53:75:11,8,2:2,2,10:55:79
chr11	1017899	.	A	T	37.79	PASS	AF=0.0760234;AO=14;DP=172;FAO=13;FDP=171;FR=.;FRO=158;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=64;FSRR=94;FWDB=-0.00600465;FXX=0.00581362;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.281;QD=0.883928;RBI=0.0322098;REFB=-0.00176027;REVB=-0.0316452;RO=149;SAF=11;SAR=3;SRF=60;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.424024;STB=0.875098;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0227347;OID=.;OPOS=1017899;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:172:171:149:158:14:13:0.0760234:3:11:60:89:2:11:64:94
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chr11	1018048	.	A	G	35.37	PASS	AF=0.230769;AO=6;DP=26;FAO=6;FDP=26;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=17;FSRR=3;FWDB=-0.0456252;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.2866;QD=5.442;RBI=0.0489613;REFB=-0.00889003;REVB=0.0177638;RO=19;SAF=4;SAR=2;SRF=17;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.367157;STB=0.676956;STBP=0.458;TYPE=snp;VARB=0.0474825;OID=.;OPOS=1018048;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:26:26:19:20:6:6:0.230769:2:4:17:2:2:4:17:3
chr11	1018138	.	T	C	30.92	PASS	AF=0.357143;AO=5;DP=15;FAO=5;FDP=14;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=-0.0307955;FXX=0.0666222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.484;QD=8.83461;RBI=0.0597029;REFB=-0.0132245;REVB=0.0511476;RO=10;SAF=3;SAR=2;SRF=8;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.236266;STB=0.624553;STBP=0.581;TYPE=snp;VARB=0.0118578;OID=.;OPOS=1018138;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:15:14:10:9:5:5:0.357143:2:3:8:2:2:3:7:2
chr11	1018374	.	T	A	176.39	PASS	AF=0.529412;AO=16;DP=32;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.0147093;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.923;QD=20.7514;RBI=0.0817062;REFB=-0.00957515;REVB=0.0803712;RO=16;SAF=8;SAR=8;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.054861;STB=0.555494;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.0159769;OID=.;OPOS=1018374;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:34:16:16:16:18:0.529412:8:8:9:7:10:8:9:7
chr11	1018456	.	G	A	48.32	PASS	AF=0.156863;AO=8;DP=51;FAO=8;FDP=51;FR=.;FRO=43;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=-0.0401565;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.815;QD=3.79004;RBI=0.0406141;REFB=-0.0117501;REVB=0.00607952;RO=43;SAF=2;SAR=6;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.300697;STB=0.710791;STBP=0.218;TYPE=snp;VARB=0.0424879;OID=.;OPOS=1018456;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:48:51:51:43:43:8:8:0.156863:6:2:21:22:6:2:21:22
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chr11	1075747	.	T	C	405.91	PASS	AF=0.451613;AO=39;DP=90;FAO=42;FDP=93;FR=.;FRO=51;FSAF=27;FSAR=15;FSRF=38;FSRR=13;FWDB=-0.00491324;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.949;QD=17.4584;RBI=0.0058264;REFB=-0.0174453;REVB=-0.00313162;RO=49;SAF=25;SAR=14;SRF=37;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128673;STB=0.56323;STBP=0.373;TYPE=snp;VARB=0.0174605;OID=.;OPOS=1075747;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:93:49:51:39:42:0.451613:14:25:37:12:15:27:38:13
chr11	1093710	.	C	G	137.6	PASS	AF=0.928571;AO=13;DP=14;FAO=13;FDP=14;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0712724;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=86.1996;QD=39.3154;RBI=0.0781617;REFB=-0.131619;REVB=0.0320858;RO=0;SAF=5;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60098e-08;STB=0.529367;STBP=0.536;TYPE=snp;VARB=0.00966272;OID=.;OPOS=1093710;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:14:14:0:1:13:13:0.928571:8:5:0:0:8:5:0:1
chr11	1094690	.	C	T	215.39	PASS	AF=1;AO=17;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.014401;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.755;QD=47.8639;RBI=0.0145104;REFB=0;REVB=-0.00177909;RO=0;SAF=1;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000291673;OID=.;OPOS=1094690;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:17:18:1:16:1:0:0:17:1:0:0
chr11	1094753	.	A	C	342.35	PASS	AF=0.962963;AO=24;DP=25;FAO=26;FDP=27;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0372861;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.8757;QD=50.7191;RBI=0.0512893;REFB=0.0261897;REVB=-0.0352185;RO=1;SAF=8;SAR=16;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0280951;STB=0.51514;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=-0.0234976;OID=.;OPOS=1094753;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:25:27:1:1:24:26:0.962963:16:8:0:1:16:10:0:1
chr11	1096494	.	T	C	2118.34	PASS	AF=0.992701;AO=132;DP=133;FAO=136;FDP=137;FR=.;FRO=1;FSAF=77;FSAR=59;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0278627;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.4627;QD=61.8492;RBI=0.046181;REFB=0.0432469;REVB=0.0368288;RO=0;SAF=74;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.90274e-08;STB=0.503225;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=-1.00598e-05;OID=.;OPOS=1096494;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:133:137:0:1:132:136:0.992701:58:74:0:0:59:77:1:0
chr11	1101649	.	T	C	713.82	PASS	AF=1;AO=49;DP=50;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0320011;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.8274;QD=55.9862;RBI=0.0715289;REFB=0;REVB=0.0639712;RO=1;SAF=23;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0200211;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00142721;OID=.;OPOS=1101649;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:51:1:0:49:51:1:26:23:1:0:26:25:0:0
chr11	1158073	.	T	C	1840.28	PASS	AF=1;AO=120;DP=120;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0123593;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.05;QD=61.3426;RBI=0.0163254;REFB=0;REVB=0.0106661;RO=0;SAF=62;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.84183e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.10665e-05;OID=.;OPOS=1158073;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:120:120:0:0:120:120:1:58:62:0:0:58:62:0:0
chr11	1161315	.	T	C	557.07	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0185773;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.643;QD=60.2237;RBI=0.0200979;REFB=0;REVB=-0.00766858;RO=0;SAF=11;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.34078e-05;OID=.;OPOS=1161315;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:26:11:0:0:26:11:0:0
chr11	1212877	.	A	G	109.19	PASS	AF=0.193548;AO=19;DP=94;FAO=18;FDP=93;FR=.;FRO=75;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=36;FSRR=39;FWDB=-0.0414499;FXX=0.0106372;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.8177;QD=4.6965;RBI=0.0517651;REFB=-0.0141826;REVB=-0.0310086;RO=73;SAF=8;SAR=11;SRF=36;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0911403;STB=0.528814;STBP=0.774;TYPE=snp;VARB=0.0585623;OID=.;OPOS=1212877;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:93:73:75:19:18:0.193548:11:8:36:37:10:8:36:39
chr11	1212878	.	C	G	64.86	PASS	AF=0.139785;AO=13;DP=93;FAO=13;FDP=93;FR=.;FRO=80;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=38;FSRR=42;FWDB=0.0201649;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.707;QD=2.78982;RBI=0.0283945;REFB=-0.00661205;REVB=-0.0199906;RO=79;SAF=6;SAR=7;SRF=38;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0242363;STB=0.51161;STBP=0.964;TYPE=snp;VARB=0.0243745;OID=.;OPOS=1212878;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:93:93:79:80:13:13:0.139785:7:6:38:41:7:6:38:42
chr11	1212921	.	C	T	66.88	PASS	AF=0.196078;AO=10;DP=51;FAO=10;FDP=51;FR=.;FRO=41;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=28;FWDB=-0.0412053;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=179.732;QD=5.24586;RBI=0.0414211;REFB=-0.00870036;REVB=-0.00422349;RO=41;SAF=3;SAR=7;SRF=13;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0245241;STB=0.516096;STBP=0.974;TYPE=snp;VARB=0.0287924;OID=.;OPOS=1212921;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:51:51:41:41:10:10:0.196078:7:3:13:28:7:3:13:28
chr11	1212954	.	C	A	138.22	PASS	AF=0.326531;AO=15;DP=49;FAO=16;FDP=49;FR=.;FRO=33;FSAF=2;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=-0.00173562;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.692;QD=11.2835;RBI=0.084478;REFB=-0.0526023;REVB=0.0844602;RO=34;SAF=2;SAR=13;SRF=21;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.58143;STB=0.850359;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0640267;OID=.;OPOS=1212954;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:34:33:15:16:0.326531:13:2:21:13:14:2:20:13
chr11	1213047	.	T	C	51.93	PASS	AF=0.242424;AO=8;DP=32;FAO=8;FDP=33;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=21;FSRR=4;FWDB=-0.102769;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.299;QD=6.29434;RBI=0.213834;REFB=-0.0253654;REVB=-0.187519;RO=24;SAF=7;SAR=1;SRF=20;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0989219;STB=0.555406;STBP=0.824;TYPE=snp;VARB=0.104268;OID=.;OPOS=1213047;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:51:32:33:24:25:8:8:0.242424:1:7:20:4:1:7:21:4
chr11	1213118	.	C	G	36.65	PASS	AF=0.193548;AO=6;DP=29;FAO=6;FDP=31;FR=.;FRO=25;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=0.0173707;FXX=0.0312402;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.4705;QD=4.72864;RBI=0.0377637;REFB=-0.0619266;REVB=-0.0335314;RO=20;SAF=1;SAR=5;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.463449;STB=0.758529;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=0.0842735;OID=.;OPOS=1213118;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:29:31:20:25:6:6:0.193548:5:1:11:9:5:1:11:14
chr11	1213125	.	G	A	92.92	PASS	AF=0.292683;AO=13;DP=38;FAO=12;FDP=41;FR=.;FRO=29;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=20;FWDB=0.00357363;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.7759;QD=9.06569;RBI=0.0930532;REFB=-0.0427161;REVB=-0.0929846;RO=22;SAF=5;SAR=8;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0272451;STB=0.579273;STBP=0.552;TYPE=snp;VARB=0.0641725;OID=.;OPOS=1213125;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:38:41:22:29:13:12:0.292683:8:5:9:13:7:5:9:20
chr11	1213131	.	T	C	41.83	PASS	AF=0.155556;AO=7;DP=47;FAO=7;FDP=45;FR=.;FRO=38;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=28;FWDB=-0.0230241;FXX=0.0425441;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.777;QD=3.71859;RBI=0.0334167;REFB=0.00427442;REVB=-0.0242192;RO=37;SAF=1;SAR=6;SRF=11;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.261844;STB=0.659469;STBP=0.46;TYPE=snp;VARB=-0.0331935;OID=.;OPOS=1213131;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:47:45:37:38:7:7:0.155556:6:1:11:26:6:1:10:28
chr11	1213135	.	C	T	58.45	PASS	AF=0.1875;AO=9;DP=48;FAO=9;FDP=48;FR=.;FRO=39;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=28;FWDB=0.0998996;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.8883;QD=4.87065;RBI=0.100284;REFB=-0.00692877;REVB=0.00877376;RO=39;SAF=1;SAR=8;SRF=11;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.323264;STB=0.726653;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=0.0446418;OID=.;OPOS=1213135;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:58:48:48:39:39:9:9:0.1875:8:1:11:28:8:1:11:28
chr11	1213174	.	A	G	146.85	PASS	AF=0.346154;AO=18;DP=52;FAO=18;FDP=52;FR=.;FRO=34;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=33;FWDB=0.03061;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.36;QD=11.2962;RBI=0.0306232;REFB=-0.0170261;REVB=-0.000897904;RO=33;SAF=7;SAR=11;SRF=1;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.494155;STB=0.777587;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.0134439;OID=.;OPOS=1213174;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:33:34:18:18:0.346154:11:7:1:32:11:7:1:33
chr11	1213177	.	C	T	146.85	PASS	AF=0.346154;AO=18;DP=52;FAO=18;FDP=52;FR=.;FRO=34;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=31;FWDB=0.0111415;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=224.727;QD=11.2962;RBI=0.0295431;REFB=0.00114513;REVB=-0.0273617;RO=34;SAF=7;SAR=11;SRF=3;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.404323;STB=0.72754;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=-0.00186485;OID=.;OPOS=1213177;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:34:34:18:18:0.346154:11:7:3:31:11:7:3:31
chr11	1213204	.	C	G	137.82	PASS	AF=0.327273;AO=18;DP=55;FAO=18;FDP=55;FR=.;FRO=37;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=32;FWDB=-0.0152075;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.706;QD=10.0235;RBI=0.0187056;REFB=0.0083663;REVB=-0.0108918;RO=37;SAF=6;SAR=12;SRF=5;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.290697;STB=0.666518;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=-0.0198246;OID=.;OPOS=1213204;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:37:37:18:18:0.327273:12:6:5:32:12:6:5:32
chr11	1250488	.	C	T	344.56	PASS	AF=0.5;AO=36;DP=72;FAO=36;FDP=72;FR=.;FRO=36;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=0.00781706;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.047;QD=19.142;RBI=0.00990951;REFB=-0.0192066;REVB=0.00609032;RO=36;SAF=17;SAR=19;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0502433;STB=0.527935;STBP=0.67;TYPE=snp;VARB=0.0196359;OID=.;OPOS=1250488;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:36:36:36:36:0.5:19:17:15:21:19:17:15:21
chr11	1252708	.	G	C	194.89	PASS	AF=0.444444;AO=19;DP=44;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=0.0027508;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=179.344;QD=17.3235;RBI=0.0156821;REFB=0.00201185;REVB=0.0154389;RO=25;SAF=8;SAR=11;SRF=17;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.252402;STB=0.6257;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=-0.00250859;OID=.;OPOS=1252708;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:45:25:25:19:20:0.444444:11:8:17:8:11:9:17:8
chr11	1253942	.	T	C	133.43	PASS	AF=0.441176;AO=15;DP=34;FAO=15;FDP=34;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.0228384;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.028;QD=15.6979;RBI=0.0231069;REFB=-0.0204427;REVB=0.00351201;RO=19;SAF=8;SAR=7;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0577034;STB=0.533289;STBP=0.748;TYPE=snp;VARB=0.0346823;OID=.;OPOS=1253942;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:19:19:15:15:0.441176:7:8:9:10:7:8:9:10
chr11	1255089	.	CCCCTGCCCTGCCCTGCCCT	CCCCTGCCCTGCCCT,CCCCTGCCCTGCCCTGCCCC	59.63	PASS	AF=0.4,0.133333;AO=6,2;DP=16;FAO=6,2;FDP=15;FR=.;FRO=7;FSAF=0,0;FSAR=6,2;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0,0;FXX=0.062461;HRUN=1,1;LEN=5,1;MLLD=232.274,91.6607;QD=15.9015;RBI=0.00562721,0.0127992;REFB=-0.0289896,0.00964745;REVB=-0.00562721,-0.0127992;RO=7;SAF=0,0;SAR=6,2;SRF=0;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0417192,0.00508848;OID=.,.;OPOS=1255090,1255108;OREF=CCCTG,T;OALT=-,C;OMAPALT=CCCCTGCCCTGCCCT,CCCCTGCCCTGCCCTGCCCC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.4,0.133333:6,2:16:6,2:15:7:0,0:6,2:0:7:43:7:0,0:6,2:0:7
chr11	1255773	.	C	T	523.44	PASS	AF=0.491071;AO=54;DP=111;FAO=55;FDP=112;FR=.;FRO=57;FSAF=26;FSAR=29;FSRF=32;FSRR=25;FWDB=0.0191265;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.538;QD=18.6942;RBI=0.0196865;REFB=-0.0055583;REVB=-0.00466206;RO=57;SAF=26;SAR=28;SRF=32;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0739518;STB=0.545026;STBP=0.366;TYPE=snp;VARB=0.0072395;OID=.;OPOS=1255773;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:112:57:57:54:55:0.491071:28:26:32:25:29:26:32:25
chr11	1256409	.	G	A	680.16	PASS	AF=0.463087;AO=68;DP=147;FAO=69;FDP=149;FR=.;FRO=80;FSAF=36;FSAR=33;FSRF=47;FSRR=33;FWDB=-0.0154054;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.847;QD=18.2594;RBI=0.0213292;REFB=-0.0113291;REVB=-0.0147516;RO=79;SAF=36;SAR=32;SRF=47;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0639778;STB=0.535474;STBP=0.439;TYPE=snp;VARB=0.0140814;OID=.;OPOS=1256409;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:147:149:79:80:68:69:0.463087:32:36:47:32:33:36:47:33
chr11	1258175	.	C	T	41.95	PASS	AF=0.12;AO=9;DP=75;FAO=9;FDP=75;FR=.;FRO=66;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=40;FSRR=26;FWDB=0.0173485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.739;QD=2.23752;RBI=0.0239642;REFB=-0.000836002;REVB=-0.0165322;RO=66;SAF=6;SAR=3;SRF=40;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.077926;STB=0.557561;STBP=0.76;TYPE=snp;VARB=0.023373;OID=.;OPOS=1258175;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:75:75:66:66:9:9:0.12:3:6:40:26:3:6:40:26
chr11	1258199	.	C	T	34.45	PASS	AF=0.09;AO=9;DP=100;FAO=9;FDP=100;FR=.;FRO=91;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=55;FSRR=36;FWDB=0.00900803;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.036;QD=1.37816;RBI=0.0519632;REFB=0.00705691;REVB=0.0511764;RO=89;SAF=6;SAR=3;SRF=53;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0865886;STB=0.561012;STBP=0.725;TYPE=snp;VARB=-0.0648965;OID=.;OPOS=1258199;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:100:100:89:91:9:9:0.09:3:6:53:36:3:6:55:36
chr11	1258217	.	T	G	68.84	PASS	AF=0.130435;AO=15;DP=115;FAO=15;FDP=115;FR=.;FRO=100;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=61;FSRR=39;FWDB=-0.0237178;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.721;QD=2.39437;RBI=0.0464302;REFB=-9.97857e-06;REVB=-0.0399153;RO=100;SAF=10;SAR=5;SRF=61;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0756765;STB=0.553386;STBP=0.673;TYPE=snp;VARB=-0.0011976;OID=.;OPOS=1258217;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:68:115:115:100:100:15:15:0.130435:5:10:61:39:5:10:61:39
chr11	1258226	.	C	T	95.9	PASS	AF=0.157025;AO=19;DP=121;FAO=19;FDP=121;FR=.;FRO=102;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=63;FSRR=39;FWDB=-0.000569051;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=236.72;QD=3.17026;RBI=0.0170337;REFB=-0.000330111;REVB=-0.0170242;RO=100;SAF=13;SAR=6;SRF=62;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0892369;STB=0.561892;STBP=0.589;TYPE=snp;VARB=0.00172622;OID=.;OPOS=1258226;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:121:121:100:102:19:19:0.157025:6:13:62:38:6:13:63:39
chr11	1258240	.	CA	TG	104.05	PASS	AF=0.165289;AO=20;DP=121;FAO=20;FDP=121;FR=.;FRO=101;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=62;FSRR=39;FWDB=-0.00696676;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=211.9;QD=3.43965;RBI=0.0169343;REFB=-0.00381901;REVB=-0.0154349;RO=101;SAF=14;SAR=6;SRF=62;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120587;STB=0.580027;STBP=0.469;TYPE=mnp;VARB=0.0303562;OID=.;OPOS=1258240;OREF=CA;OALT=TG;OMAPALT=TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:121:121:101:101:20:20:0.165289:6:14:62:39:6:14:62:39
chr11	1258283	.	G	A	96.85	PASS	AF=0.17;AO=17;DP=99;FAO=17;FDP=100;FR=.;FRO=83;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=45;FSRR=38;FWDB=-0.0088363;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.075;QD=3.87381;RBI=0.0147812;REFB=-0.00194673;REVB=-0.0118492;RO=82;SAF=10;SAR=7;SRF=44;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.066131;STB=0.538876;STBP=0.749;TYPE=snp;VARB=0.010587;OID=.;OPOS=1258283;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:99:100:82:83:17:17:0.17:7:10:44:38:7:10:45:38
chr11	1258286	.	C	T	97.55	PASS	AF=0.173469;AO=17;DP=98;FAO=17;FDP=98;FR=.;FRO=81;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=45;FSRR=36;FWDB=-0.00455446;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.052;QD=3.98166;RBI=0.0200487;REFB=-0.00844673;REVB=-0.0195245;RO=81;SAF=10;SAR=7;SRF=45;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.042089;STB=0.527575;STBP=0.83;TYPE=snp;VARB=0.0338503;OID=.;OPOS=1258286;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:98:98:81:81:17:17:0.173469:7:10:45:36:7:10:45:36
chr11	1258295	.	A	G	110.15	PASS	AF=0.197802;AO=18;DP=92;FAO=18;FDP=91;FR=.;FRO=73;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=40;FSRR=33;FWDB=-0.013858;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.387;QD=4.84194;RBI=0.0227026;REFB=-0.00992668;REVB=-0.0179822;RO=73;SAF=11;SAR=7;SRF=40;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0814697;STB=0.552012;STBP=0.641;TYPE=snp;VARB=0.0325332;OID=.;OPOS=1258295;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:91:73:73:18:18:0.197802:7:11:40:33:7:11:40:33
chr11	1262312	.	G	A	172.06	PASS	AF=0.403846;AO=20;DP=52;FAO=21;FDP=52;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=22;FWDB=-0.00942678;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.2317;QD=13.2353;RBI=0.0177061;REFB=-0.0282713;REVB=0.0149881;RO=32;SAF=9;SAR=11;SRF=10;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151136;STB=0.612144;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=0.0417748;OID=.;OPOS=1262312;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:32:31:20:21:0.403846:11:9:10:22:11:10:9:22
chr11	1264823	.	T	C	61.78	PASS	AF=1;AO=5;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.180487;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.584;QD=35.3042;RBI=0.182063;REFB=0;REVB=0.0239059;RO=0;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00130693;OID=.;OPOS=1264823;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:5:7:1:5:0:0:0:5:2:0:0
chr11	1267844	.	TG	CT,TC,T	318.34	PASS	AF=0,0,0.729167;AO=2,3,21;DP=48;FAO=0,0,35;FDP=48;FR=.;FRO=13;FSAF=0,0,33;FSAR=0,0,2;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=0.0670179,-0.0204446,0.190065;FXX=0;HRUN=1,3,3;LEN=2,1,1;MLLD=13.2715,27.5082,16.4447;QD=26.5286;RBI=0.113071,0.0207745,0.218296;REFB=-0.0744056,-0.0349965,-0.112649;REVB=0.0910699,0.00368712,0.10737;RO=19;SAF=2,3,20;SAR=0,0,1;SRF=8;SRR=11;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.550427,0.629797,0.679864;STB=0.5,0.5,0.845887;STBP=1,1,0;TYPE=mnp,snp,del;VARB=0,0,0.0669057;OID=.,.,.;OPOS=1267844,1267845,1267845;OREF=TG,G,G;OALT=CT,C,-;OMAPALT=CT,TC,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/3:66:48:48:19:13:2,3,21:0,0,35:0,0,0.729167:0,0,1:2,3,20:8:11:0,0,2:0,0,33:3:10
chr11	1268513	.	G	C	50.47	PASS	AF=0.583333;AO=7;DP=12;FAO=7;FDP=12;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0282986;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.988;QD=16.8229;RBI=0.0373235;REFB=-0.0313559;REVB=-0.0243358;RO=5;SAF=2;SAR=5;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0775494;STB=0.54533;STBP=0.803;TYPE=snp;VARB=0.022196;OID=.;OPOS=1268513;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:12:12:5:5:7:7:0.583333:5:2:1:4:5:2:1:4
chr11	1269627	.	C	T	57.36	PASS	AF=0.444444;AO=8;DP=18;FAO=8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=0;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=10;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.633;QD=12.7462;RBI=0.00556268;REFB=-0.0341129;REVB=0.00556268;RO=10;SAF=0;SAR=8;SRF=0;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0330983;OID=.;OPOS=1269627;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:18:18:10:10:8:8:0.444444:8:0:0:10:8:0:0:10
chr11	1272858	.	C	T	65.8	PASS	AF=0.8;AO=7;DP=9;FAO=8;FDP=10;FR=.;FRO=2;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0251745;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.42;QD=26.3214;RBI=0.0257716;REFB=-0.0743739;REVB=-0.00551543;RO=2;SAF=4;SAR=3;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0278747;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.019357;OID=.;OPOS=1272858;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:9:10:2:2:7:8:0.8:3:4:1:1:4:4:1:1
chr11	1276327	.	G	A	553.1	PASS	AF=0.471545;AO=58;DP=125;FAO=58;FDP=123;FR=.;FRO=65;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=33;FSRR=32;FWDB=-0.000746836;FXX=0.0159987;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.902;QD=17.9871;RBI=0.00633934;REFB=-0.014962;REVB=0.00629519;RO=65;SAF=30;SAR=28;SRF=33;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00909622;STB=0.505049;STBP=0.901;TYPE=snp;VARB=0.0179459;OID=.;OPOS=1276327;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:125:123:65:65:58:58:0.471545:28:30:33:32:28:30:33:32
chr11	1309956	.	C	T	246.72	PASS	AF=0.391892;AO=28;DP=74;FAO=29;FDP=74;FR=.;FRO=45;FSAF=22;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=29;FWDB=-0.00698583;FXX=0.0133316;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.01;QD=13.336;RBI=0.00878162;REFB=-0.00910911;REVB=0.00532118;RO=28;SAF=21;SAR=7;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188677;STB=0.748408;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0141435;OID=.;OPOS=1309956;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:28:45:28:29:0.391892:7:21:16:12:7:22:16:29
chr11	1482851	.	T	C	95.55	PASS	AF=0.647059;AO=11;DP=17;FAO=11;FDP=17;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.0702367;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.4564;QD=22.4814;RBI=0.078834;REFB=-0.022605;REVB=0.0357995;RO=6;SAF=5;SAR=6;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0765456;STB=0.5434;STBP=0.684;TYPE=snp;VARB=0.0217543;OID=.;OPOS=1482851;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:17:17:6:6:11:11:0.647059:6:5:2:4:6:5:2:4
chr11	1491096	.	G	A	176.26	PASS	AF=0.529412;AO=18;DP=34;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.00810679;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.079;QD=20.7366;RBI=0.00911532;REFB=-0.0284251;REVB=0.0041676;RO=16;SAF=7;SAR=11;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0421209;STB=0.523783;STBP=0.783;TYPE=snp;VARB=0.0189792;OID=.;OPOS=1491096;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:16:16:18:18:0.529412:11:7:7:9:11:7:7:9
chr11	1501670	.	G	C	582.45	PASS	AF=0.975;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0194709;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.1216;QD=58.2454;RBI=0.0215282;REFB=-0.144329;REVB=-0.0091841;RO=1;SAF=22;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0208334;STB=0.511105;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.00629189;OID=.;OPOS=1501670;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:40:40:1:1:39:39:0.975:17:22:1:0:17:22:1:0
chr11	1502097	.	A	G	801.33	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00424591;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.252;QD=57.2375;RBI=0.0109021;REFB=0;REVB=-0.0100414;RO=0;SAF=21;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.64812e-05;OID=.;OPOS=1502097;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:35:21:0:0:35:21:0:0
chr11	1507731	.	A	G	302.22	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0177716;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.229;QD=52.5603;RBI=0.0203617;REFB=0;REVB=0.00993824;RO=0;SAF=12;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000181103;OID=.;OPOS=1507731;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:23:0:0:22:23:1:10:12:0:0:10:13:0:0
chr11	1576079	.	C	T	260.8	PASS	AF=0.304348;AO=35;DP=118;FAO=35;FDP=115;FR=.;FRO=80;FSAF=30;FSAR=5;FSRF=69;FSRR=11;FWDB=-0.00777086;FXX=0.0254216;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.969;QD=9.07121;RBI=0.0421283;REFB=-0.0120009;REVB=-0.0414054;RO=76;SAF=30;SAR=5;SRF=65;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00448251;STB=0.507688;STBP=0.965;TYPE=snp;VARB=0.0288777;OID=.;OPOS=1576079;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:118:115:76:80:35:35:0.304348:5:30:65:11:5:30:69:11
chr11	1576137	.	C	T	207.95	PASS	AF=0.306818;AO=26;DP=88;FAO=27;FDP=88;FR=.;FRO=61;FSAF=24;FSAR=3;FSRF=58;FSRR=3;FWDB=-0.00577834;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.946;QD=9.45246;RBI=0.0516909;REFB=-0.000837235;REVB=-0.0513669;RO=59;SAF=23;SAR=3;SRF=56;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.231787;STB=0.630694;STBP=0.479;TYPE=snp;VARB=0.00883092;OID=.;OPOS=1576137;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:59:61:26:27:0.306818:3:23:56:3:3:24:58:3
chr11	1642884	.	A	C	31.6	PASS	AF=0.555556;AO=5;DP=9;FAO=5;FDP=9;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=-0.015831;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.402;QD=14.0436;RBI=0.0264201;REFB=-0.0831709;REVB=-0.0211518;RO=4;SAF=2;SAR=3;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.341697;STB=0.699373;STBP=0.342;TYPE=snp;VARB=0.0812289;OID=.;OPOS=1642884;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:9:9:4:4:5:5:0.555556:3:2:0:4:3:2:0:4
chr11	1652021	.	C	A	104.77	PASS	AF=0.571429;AO=11;DP=22;FAO=12;FDP=21;FR=.,HEALED;FRO=9;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.0155903;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=138.077;QD=19.9554;RBI=0.0788126;REFB=-0.0500354;REVB=0.0772552;RO=6;SAF=5;SAR=6;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0283365;STB=0.537129;STBP=0.757;TYPE=snp;VARB=0.0297545;OID=.;OPOS=1652021;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:22:21:6:9:11:12:0.571429:6:5:3:3:5:7:6:3
chr11	1652103	.	G	C	65.31	PASS	AF=0.375;AO=9;DP=24;FAO=9;FDP=24;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=-0.0440448;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.38;QD=10.8847;RBI=0.0492441;REFB=-0.0250873;REVB=0.0220237;RO=14;SAF=6;SAR=3;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0268092;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0479794;OID=.;OPOS=1652103;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:24:24:14:15:9:9:0.375:3:6:9:5:3:6:10:5
chr11	1855854	.	G	C	1422.58	PASS	AF=0.980583;AO=97;DP=101;FAO=101;FDP=103;FR=.;FRO=2;FSAF=30;FSAR=71;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0139553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.253;QD=55.2456;RBI=0.0736316;REFB=-0.104212;REVB=0.0722971;RO=3;SAF=29;SAR=68;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00232826;STB=0.5047;STBP=0.55;TYPE=snp;VARB=0.00232327;OID=.;OPOS=1855854;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:101:103:3:2:97:101:0.980583:68:29:1:2:71:30:1:1
chr11	1857173	.	T	C	697.33	PASS	AF=1;AO=44;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0715573;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.045;QD=61.9849;RBI=0.0722189;REFB=0;REVB=0.0097528;RO=0;SAF=23;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.70015e-05;OID=.;OPOS=1857173;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:44:45:1:21:23:0:0:21:24:0:0
chr11	1857747	.	T	C	185.23	PASS	AF=0.333333;AO=24;DP=72;FAO=24;FDP=72;FR=.;FRO=48;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=34;FSRR=14;FWDB=0.00278136;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.006;QD=10.2903;RBI=0.020201;REFB=0.00249805;REVB=-0.0200086;RO=48;SAF=11;SAR=13;SRF=34;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.282447;STB=0.66314;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=-0.00689277;OID=.;OPOS=1857747;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:48:48:24:24:0.333333:13:11:34:14:13:11:34:14
chr11	1857751	.	C	G	196.1	PASS	AF=0.342105;AO=24;DP=74;FAO=26;FDP=76;FR=.;FRO=50;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=35;FSRR=15;FWDB=0.0334241;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.2613;QD=10.3212;RBI=0.045098;REFB=-0.00573895;REVB=-0.0302765;RO=50;SAF=11;SAR=13;SRF=35;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.275883;STB=0.676345;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.0120359;OID=.;OPOS=1857751;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:76:50:50:24:26:0.342105:13:11:35:15:15:11:35:15
chr11	1858262	.	C	T	194.32	PASS	AF=0.59375;AO=19;DP=32;FAO=19;FDP=32;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.00945325;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.712;QD=24.2896;RBI=0.011248;REFB=-0.0213023;REVB=-0.00609535;RO=12;SAF=8;SAR=11;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113182;STB=0.578864;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.0186407;OID=.;OPOS=1858262;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:12:13:19:19:0.59375:11:8:7:5:11:8:8:5
chr11	1858572	.	C	T	64.33	PASS	AF=0.727273;AO=8;DP=11;FAO=8;FDP=11;FR=.;FRO=3;FSAF=8;FSAR=0;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0358327;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.3714;QD=23.3923;RBI=0.0358327;REFB=0.00971909;REVB=0;RO=3;SAF=8;SAR=0;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000392099;OID=.;OPOS=1858572;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:11:11:3:3:8:8:0.727273:0:8:3:0:0:8:3:0
chr11	1861760	.	T	C	769.33	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0226842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.976;QD=56.9872;RBI=0.0498843;REFB=0;REVB=0.0444283;RO=0;SAF=29;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.32349e-05;OID=.;OPOS=1861760;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:25:29:0:0:25:29:0:0
chr11	1874404	.	C	T	131.99	PASS	AF=0.416667;AO=15;DP=36;FAO=15;FDP=36;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=0.00465432;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.319;QD=14.6657;RBI=0.0201512;REFB=-0.021864;REVB=-0.0196063;RO=21;SAF=9;SAR=6;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0200359;STB=0.511612;STBP=0.939;TYPE=snp;VARB=0.0260484;OID=.;OPOS=1874404;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:21:21:15:15:0.416667:6:9:13:8:6:9:13:8
chr11	1887806	.	T	A	468.92	PASS	AF=1;AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.024575;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.198;QD=58.615;RBI=0.0295935;REFB=0;REVB=0.0164879;RO=0;SAF=12;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000120647;OID=.;OPOS=1887806;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:32:0:0:32:32:1:20:12:0:0:20:12:0:0
chr11	1890990	.	G	A	296.26	PASS	AF=0.958333;AO=23;DP=24;FAO=23;FDP=24;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0233883;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=102.146;QD=49.376;RBI=0.050178;REFB=-0.119345;REVB=0.0443939;RO=0;SAF=12;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.52172;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.00289745;OID=.;OPOS=1890990;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:24:24:0:1:23:23:0.958333:11:12:0:0:11:12:0:1
chr11	1891722	.	C	T	198.14	PASS	AF=0.944444;AO=17;DP=18;FAO=17;FDP=18;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00533195;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.077;QD=44.031;RBI=0.0726861;REFB=-0.04681;REVB=-0.0724903;RO=1;SAF=10;SAR=7;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0609958;STB=0.533294;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.00431409;OID=.;OPOS=1891722;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:18:18:1:1:17:17:0.944444:7:10:0:1:7:10:0:1
chr11	1902768	.	G	A	2239.21	PASS	AF=0.986301;AO=140;DP=144;FAO=144;FDP=146;FR=.;FRO=2;FSAF=44;FSAR=100;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0256541;FXX=0.0135126;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.119;QD=61.3483;RBI=0.0616631;REFB=-0.142025;REVB=0.0560733;RO=2;SAF=41;SAR=99;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0226235;STB=0.51111;STBP=0.06;TYPE=snp;VARB=0.000415019;OID=.;OPOS=1902768;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:144:146:2:2:140:144:0.986301:99:41:2:0:100:44:2:0
chr11	1911115	.	T	C	247.6	PASS	AF=1;AO=19;DP=21;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0372127;FXX=0.0951928;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.977;QD=52.1272;RBI=0.0730409;REFB=0;REVB=0.0628506;RO=0;SAF=12;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00516359;OID=.;OPOS=1911115;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:19:0:0:19:19:1:7:12:0:0:7:12:0:0
chr11	1959707	.	C	T	228.94	PASS	AF=0.378378;AO=27;DP=74;FAO=28;FDP=74;FR=.;FRO=46;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=27;FSRR=19;FWDB=0.0483284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.028;QD=12.375;RBI=0.0496731;REFB=-0.0197575;REVB=0.0114796;RO=46;SAF=15;SAR=12;SRF=27;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0349423;STB=0.532141;STBP=0.695;TYPE=snp;VARB=0.0259818;OID=.;OPOS=1959707;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:46:46:27:28:0.378378:12:15:27:19:13:15:27:19
chr11	1974029	.	G	A	109.93	PASS	AF=0.433333;AO=13;DP=29;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=-0.0159199;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.878;QD=14.6579;RBI=0.0161103;REFB=-0.0138884;REVB=-0.00246924;RO=16;SAF=5;SAR=8;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112115;STB=0.550186;STBP=0.662;TYPE=snp;VARB=0.0225678;OID=.;OPOS=1974029;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:30:16:17:13:13:0.433333:8:5:8:8:8:5:8:9
chr11	1993975	.	C	A	954.26	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0326115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.075;QD=58.7238;RBI=0.0375818;REFB=0;REVB=0.0186784;RO=0;SAF=28;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00018315;OID=.;OPOS=1993975;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:65:0:0:64:65:1:36:28:0:0:36:29:0:0
chr11	2016908	.	G	A	94.62	PASS	AF=0.611111;AO=11;DP=18;FAO=11;FDP=18;FR=.;FRO=7;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=-0.00589217;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.001;QD=21.0269;RBI=0.0225226;REFB=-0.106185;REVB=0.0217382;RO=6;SAF=8;SAR=3;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.087178;STB=0.567454;STBP=0.557;TYPE=snp;VARB=0.0220409;OID=.;OPOS=2016908;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:18:18:6:7:11:11:0.611111:3:8:5:1:3:8:6:1
chr11	2167543	.	T	G	233.7	PASS	AF=0.578947;AO=22;DP=38;FAO=22;FDP=38;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.0119471;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=241.818;QD=24.5996;RBI=0.0217786;REFB=-0.0151021;REVB=0.0182092;RO=16;SAF=8;SAR=14;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107476;STB=0.559944;STBP=0.385;TYPE=snp;VARB=0.00631625;OID=.;OPOS=2167543;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:16:16:22:22:0.578947:14:8:8:8:14:8:8:8
chr11	2167618	.	A	G	177.4	PASS	AF=0.545455;AO=18;DP=33;FAO=18;FDP=33;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=-0.0499636;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.7434;QD=21.5035;RBI=0.0631854;REFB=-0.0124986;REVB=-0.0386786;RO=15;SAF=4;SAR=14;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.342305;STB=0.694422;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.0167599;OID=.;OPOS=2167618;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:15:15:18:18:0.545455:14:4:9:6:14:4:9:6
chr11	2181060	.	T	G	238.88	PASS	AF=1;AO=16;DP=20;FAO=19;FDP=19;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=18;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0274408;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.486;QD=50.2901;RBI=0.225584;REFB=0;REVB=0.223909;RO=1;SAF=16;SAR=0;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.848323;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000454544;OID=.;OPOS=2181060;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:19:1:0:16:19:1:0:16:0:1:1:18:0:0
chr11	2190951	.	C	T	868.03	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0941;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.8377;QD=57.8684;RBI=0.0963202;REFB=0;REVB=0.0205614;RO=0;SAF=20;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000903388;OID=.;OPOS=2190951;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:40:20:0:0:40:20:0:0
chr11	2246115	.	T	A	88.63	PASS	AF=0.125;AO=22;DP=173;FAO=22;FDP=176;FR=.;FRO=154;FSAF=21;FSAR=1;FSRF=74;FSRR=80;FWDB=0.0151615;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=39.9418;QD=2.01442;RBI=0.0347195;REFB=-0.00148474;REVB=-0.0312342;RO=151;SAF=21;SAR=1;SRF=74;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.623007;STB=0.94667;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0172908;OID=.;OPOS=2246115;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:173:176:151:154:22:22:0.125:1:21:74:77:1:21:74:80
chr11	2337218	.	G	A	160.28	PASS	AF=0.485714;AO=17;DP=35;FAO=17;FDP=35;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=4;FWDB=-0.0222552;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.845;QD=18.3171;RBI=0.0251644;REFB=-0.0182233;REVB=0.0117455;RO=18;SAF=8;SAR=9;SRF=14;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.275789;STB=0.655461;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.00589952;OID=.;OPOS=2337218;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:18:18:17:17:0.485714:9:8:14:4:9:8:14:4
chr11	2424684	.	A	C	577.78	PASS	AF=1;AO=22;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0494666;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.452;QD=60.819;RBI=0.145209;REFB=0;REVB=0.136524;RO=0;SAF=19;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000214183;OID=.;OPOS=2424684;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:22:38:1:3:19:0:0:14:24:0:0
chr11	2435946	.	A	G	68.83	PASS	AF=0.5;AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=0.0244848;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.97;QD=15.2949;RBI=0.0264246;REFB=-0.0121988;REVB=0.00993755;RO=9;SAF=4;SAR=5;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.280017;STB=0.662315;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=0.0154018;OID=.;OPOS=2435946;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:18:18:9:9:9:9:0.5:5:4:7:2:5:4:7:2
chr11	2435956	.	C	T	68.33	PASS	AF=0.473684;AO=9;DP=19;FAO=9;FDP=19;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.0378269;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.12;QD=14.386;RBI=0.0388443;REFB=-0.0565612;REVB=-0.00883203;RO=10;SAF=4;SAR=5;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.225517;STB=0.631902;STBP=0.329;TYPE=snp;VARB=0.0434971;OID=.;OPOS=2435956;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:19:19:10:10:9:9:0.473684:5:4:7:3:5:4:7:3
chr11	2439542	.	A	G	249.18	PASS	AF=0.459016;AO=28;DP=61;FAO=28;FDP=61;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=23;FSRR=10;FWDB=-0.00294551;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.831;QD=16.3395;RBI=0.0173284;REFB=-0.0173174;REVB=-0.0170762;RO=33;SAF=11;SAR=17;SRF=23;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.285973;STB=0.660461;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.0198667;OID=.;OPOS=2439542;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:33:33:28:28:0.459016:17:11:23:10:17:11:23:10
chr11	2439767	.	T	C	86.86	PASS	AF=0.407407;AO=11;DP=27;FAO=11;FDP=27;FR=.;FRO=16;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=14;FWDB=0.0244728;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.537;QD=12.8689;RBI=0.0312704;REFB=-0.0198421;REVB=-0.0194658;RO=16;SAF=2;SAR=9;SRF=2;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104557;STB=0.560874;STBP=0.757;TYPE=snp;VARB=0.0267941;OID=.;OPOS=2439767;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:27:27:16:16:11:11:0.407407:9:2:2:14:9:2:2:14
chr11	2909699	.	C	T	758.87	PASS	AF=0.64486;AO=69;DP=107;FAO=69;FDP=107;FR=.;FRO=38;FSAF=41;FSAR=28;FSRF=14;FSRR=24;FWDB=-0.0106246;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=308.849;QD=28.369;RBI=0.0175564;REFB=0.000117149;REVB=0.0139766;RO=38;SAF=41;SAR=28;SRF=14;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148914;STB=0.580587;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=-6.27647e-05;OID=.;OPOS=2909699;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:107:38:38:69:69:0.64486:28:41:14:24:28:41:14:24
chr11	2924610	.	G	A	989.32	PASS	AF=0.933333;AO=70;DP=75;FAO=70;FDP=75;FR=.;FRO=5;FSAF=38;FSAR=32;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0167052;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.811;QD=52.7635;RBI=0.0178859;REFB=-0.126381;REVB=-0.00639084;RO=4;SAF=38;SAR=32;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0472066;STB=0.530855;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=0.00289392;OID=.;OPOS=2924610;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:17:75:75:4:5:70:70:0.933333:32:38:4:0:32:38:5:0
chr11	2929552	.	A	G	485.3	PASS	AF=1;AO=30;DP=31;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0644363;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.096;QD=58.8239;RBI=0.064455;REFB=0;REVB=0.00155232;RO=0;SAF=6;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.42677e-05;OID=.;OPOS=2929552;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:33:0:0:30:33:1:24:6:0:0:24:9:0:0
chr11	2939297	.	G	A	565.69	PASS	AF=0.479675;AO=59;DP=123;FAO=59;FDP=123;FR=.;FRO=64;FSAF=45;FSAR=14;FSRF=33;FSRR=31;FWDB=0.00690902;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.593;QD=18.3965;RBI=0.00736489;REFB=-0.0146185;REVB=0.0025509;RO=64;SAF=45;SAR=14;SRF=33;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.267905;STB=0.649608;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0161231;OID=.;OPOS=2939297;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:123:123:64:64:59:59:0.479675:14:45:33:31:14:45:33:31
chr11	2999507	.	G	T	115.05	PASS	AF=0.304348;AO=14;DP=47;FAO=14;FDP=46;FR=.;FRO=32;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=-0.0534291;FXX=0.0212721;HRUN=2;LEN=1;MLLD=213.618;QD=10.0047;RBI=0.0540718;REFB=0.0070854;REVB=0.00831176;RO=31;SAF=3;SAR=11;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.240541;STB=0.6614;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=-0.0149105;OID=.;OPOS=2999507;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:46:31:32:14:14:0.304348:11:3:12:19:11:3:13:19
chr11	3028140	.	G	A	225.31	PASS	AF=0.636364;AO=21;DP=32;FAO=21;FDP=33;FR=.;FRO=12;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=0.00125257;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=152.175;QD=27.3101;RBI=0.00181434;REFB=-0.026377;REVB=0.0013126;RO=11;SAF=13;SAR=8;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160918;STB=0.604551;STBP=0.113;TYPE=snp;VARB=0.0179366;OID=.;OPOS=3028140;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:32:33:11:12:21:21:0.636364:8:13:4:7:8:13:4:8
chr11	3061780	.	C	T	230.85	PASS	AF=0.480769;AO=25;DP=51;FAO=25;FDP=52;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=7;FSRR=20;FWDB=0.0415059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.1389;QD=17.7575;RBI=0.0447346;REFB=-0.0335605;REVB=0.0166865;RO=24;SAF=8;SAR=17;SRF=6;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0726036;STB=0.537176;STBP=0.645;TYPE=snp;VARB=0.0275627;OID=.;OPOS=3061780;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:52:24:27:25:25:0.480769:17:8:6:18:17:8:7:20
chr11	3109403	.	A	G	60.28	PASS	AF=0.225;AO=9;DP=40;FAO=9;FDP=40;FR=.;FRO=31;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=-0.0157862;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.737;QD=6.02789;RBI=0.0622548;REFB=-0.00696947;REVB=-0.0602201;RO=31;SAF=6;SAR=3;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0701218;STB=0.545351;STBP=0.805;TYPE=snp;VARB=0.0120663;OID=.;OPOS=3109403;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:60:40:40:31:31:9:9:0.225:3:6:19:12:3:6:19:12
chr11	3109408	.	C	T	80.3	PASS	AF=0.255814;AO=11;DP=43;FAO=11;FDP=43;FR=.;FRO=32;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=20;FSRR=12;FWDB=0.014179;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=257.91;QD=7.46945;RBI=0.0159075;REFB=-0.00431119;REVB=0.00721133;RO=32;SAF=7;SAR=4;SRF=20;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0145346;STB=0.509074;STBP=0.956;TYPE=snp;VARB=0.0167466;OID=.;OPOS=3109408;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:80:43:43:32:32:11:11:0.255814:4:7:20:12:4:7:20:12
chr11	3243346	.	C	T	115.83	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0496915;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.274;QD=42.1206;RBI=0.125743;REFB=0;REVB=-0.115508;RO=0;SAF=9;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0039125;OID=.;OPOS=3243346;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:2:9:0:0:2:9:0:0
chr11	3243427	.	T	C	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0512048;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.499;QD=51.9162;RBI=0.0621997;REFB=0;REVB=-0.035311;RO=0;SAF=11;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000189548;OID=.;OPOS=3243427;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:10:11:0:0:10:11:0:0
chr11	3243638	.	A	G	586.38	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0452631;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=304.632;QD=60.1418;RBI=0.0485636;REFB=0;REVB=0.0175976;RO=0;SAF=11;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000109951;OID=.;OPOS=3243638;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:39:0:0:38:39:1:27:11:0:0:28:11:0:0
chr11	3243665	.	C	T	613.36	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0635168;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.705;QD=61.3361;RBI=0.0652239;REFB=0;REVB=0.0148247;RO=0;SAF=8;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000459567;OID=.;OPOS=3243665;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:32:8:0:0:32:8:0:0
chr11	3243673	.	G	C	630.34	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0928459;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.4892;QD=61.4965;RBI=0.0966555;REFB=0;REVB=0.0268688;RO=0;SAF=10;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.09277e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00158047;OID=.;OPOS=3243673;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:31:10:0:0:31:10:0:0
chr11	3243909	.	G	A	129.46	PASS	AF=1;AO=9;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00584738;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=58.5275;QD=43.1534;RBI=0.0814177;REFB=0;REVB=-0.0812075;RO=0;SAF=6;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00140791;OID=.;OPOS=3243909;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:9:12:1:3:6:0:0:6:6:0:0
chr11	3244005	.	TC	T	845.46	PASS	AF=0.987013;AO=71;DP=75;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0590107;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=21.1248;QD=43.92;RBI=0.154833;REFB=-0.0541477;REVB=-0.143146;RO=2;SAF=37;SAR=34;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0248734;STB=0.506327;STBP=0.487;TYPE=del;VARB=0.00128296;OID=.;OPOS=3244006;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:0.987013:71:75:76:77:1:39:37:1:0:10:2:37:34:2:0
chr11	3249552	.	C	T	63.7	PASS	AF=0.321429;AO=9;DP=28;FAO=9;FDP=28;FR=.;FRO=19;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.008681;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.947;QD=9.09995;RBI=0.0256344;REFB=-0.0190378;REVB=-0.0241198;RO=19;SAF=2;SAR=7;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.407925;STB=0.751486;STBP=0.081;TYPE=snp;VARB=0.0526984;OID=.;OPOS=3249552;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:28:28:19:19:9:9:0.321429:7:2:11:8:7:2:11:8
chr11	3249984	.	C	T	263.51	PASS	AF=0.518519;AO=28;DP=54;FAO=28;FDP=54;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=0.00249012;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.597;QD=19.5191;RBI=0.00805909;REFB=-0.0147549;REVB=-0.00766474;RO=25;SAF=14;SAR=14;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0847192;STB=0.555516;STBP=0.418;TYPE=snp;VARB=0.0103272;OID=.;OPOS=3249984;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:25:26:28:28:0.518519:14:14:10:15:14:14:10:16
chr11	3361087	.	T	C	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.069342;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.656;QD=55.0986;RBI=0.0711725;REFB=0;REVB=0.0160376;RO=0;SAF=7;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.63811e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000255087;OID=.;OPOS=3361087;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:19:7:0:0:19:7:0:0
chr11	3436490	.	C	T	55.24	PASS	AF=0.615385;AO=7;DP=13;FAO=8;FDP=13;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.00832422;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.5746;QD=16.9969;RBI=0.026345;REFB=-0.0357345;REVB=0.0249953;RO=5;SAF=4;SAR=3;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0206743;STB=0.510178;STBP=0.994;TYPE=snp;VARB=0.0259647;OID=.;OPOS=3436490;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:13:13:5:5:7:8:0.615385:3:4:3:2:3:5:3:2
chr11	3436492	.	A	G	134.6	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0627625;FXX=0.076864;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.337;QD=44.8672;RBI=0.0887567;REFB=0;REVB=0.0627584;RO=0;SAF=8;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.6986e-06;OID=.;OPOS=3436492;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:4:8:0:0:4:8:0:0
chr11	3659993	.	G	T	179.98	PASS	AF=0.422222;AO=18;DP=44;FAO=19;FDP=45;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=0.0312967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.68;QD=15.9984;RBI=0.0315644;REFB=-0.0210396;REVB=0.00410199;RO=26;SAF=12;SAR=6;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177953;STB=0.61278;STBP=0.214;TYPE=snp;VARB=0.0244743;OID=.;OPOS=3659993;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:45:26:26:18:19:0.422222:6:12:13:13:6:13:13:13
chr11	3661140	.	T	C	367.74	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00465732;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.815;QD=54.4797;RBI=0.0553896;REFB=0;REVB=0.0551935;RO=0;SAF=13;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000422774;OID=.;OPOS=3661140;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:27:0:0:25:27:1:12:13:0:0:14:13:0:0
chr11	3661585	.	A	ATGG	166.34	PASS	AF=0.761905;AO=15;DP=21;FAO=16;FDP=21;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.00643693;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=204.942;QD=31.6842;RBI=0.0114807;REFB=0.0208254;REVB=-0.00950649;RO=5;SAF=4;SAR=11;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173409;STB=0.575066;STBP=0.257;TYPE=ins;VARB=-0.00448675;OID=.;OPOS=3661586;OREF=-;OALT=TGG;OMAPALT=ATGG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.761905:15:21:16:21:5:5:11:3:2:26:5:4:11:3:2
chr11	3714489	.	C	T	247.12	PASS	AF=0.490909;AO=27;DP=55;FAO=27;FDP=55;FR=.;FRO=28;FSAF=23;FSAR=4;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=0.0260696;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.135;QD=17.9723;RBI=0.031004;REFB=-0.0218284;REVB=-0.0167817;RO=27;SAF=23;SAR=4;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.330705;STB=0.68301;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.0319089;OID=.;OPOS=3714489;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:27:28:27:27:0.490909:4:23:16:11:4:23:17:11
chr11	3721904	.	A	G	213.14	PASS	AF=0.512195;AO=21;DP=40;FAO=21;FDP=41;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.0105709;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.393;QD=20.7939;RBI=0.0269002;REFB=-0.0185433;REVB=-0.0247362;RO=19;SAF=10;SAR=11;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0866726;STB=0.535929;STBP=0.682;TYPE=snp;VARB=0.0184491;OID=.;OPOS=3721904;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:41:19:20:21:21:0.512195:11:10:11:8:11:10:11:9
chr11	3838910	.	G	C	60.3	PASS	AF=0.571429;AO=8;DP=14;FAO=8;FDP=14;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.060746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.015;QD=17.2273;RBI=0.0645625;REFB=-0.0444535;REVB=-0.0218688;RO=6;SAF=3;SAR=5;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17296;STB=0.599771;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=0.0518255;OID=.;OPOS=3838910;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:14:14:6:6:8:8:0.571429:5:3:1:5:5:3:1:5
chr11	4103524	.	A	G	150.92	PASS	AF=0.354167;AO=17;DP=48;FAO=17;FDP=48;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.0176414;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.5917;QD=12.5768;RBI=0.0260104;REFB=0.00248117;REVB=0.0191133;RO=31;SAF=9;SAR=8;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0500547;STB=0.529377;STBP=0.802;TYPE=snp;VARB=-0.00357304;OID=.;OPOS=4103524;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:31:31:17:17:0.354167:8:9:15:16:8:9:15:16
chr11	4141132	.	C	A	294.19	PASS	AF=0.477612;AO=32;DP=66;FAO=32;FDP=67;FR=.;FRO=35;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=23;FSRR=12;FWDB=-0.0158463;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.469;QD=17.5633;RBI=0.0269509;REFB=-0.0337067;REVB=0.0218002;RO=34;SAF=12;SAR=20;SRF=23;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.274;STB=0.645666;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.0259234;OID=.;OPOS=4141132;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:67:34:35:32:32:0.477612:20:12:23:11:20:12:23:12
chr11	4159457	.	A	G	369.95	PASS	AF=0.448276;AO=39;DP=87;FAO=39;FDP=87;FR=.;FRO=48;FSAF=13;FSAR=26;FSRF=18;FSRR=30;FWDB=-0.0185894;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.309;QD=17.0093;RBI=0.0201651;REFB=-0.0126343;REVB=0.0078146;RO=48;SAF=13;SAR=26;SRF=18;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0452403;STB=0.52541;STBP=0.718;TYPE=snp;VARB=0.0157161;OID=.;OPOS=4159457;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:48:48:39:39:0.448276:26:13:18:30:26:13:18:30
chr11	4159466	.	G	A	364.7	PASS	AF=0.475;AO=38;DP=80;FAO=38;FDP=80;FR=.;FRO=42;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=17;FSRR=25;FWDB=-0.0236929;FXX=0.0123442;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.382;QD=18.2352;RBI=0.0241223;REFB=-0.00184526;REVB=-0.00453138;RO=41;SAF=14;SAR=24;SRF=16;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0216602;STB=0.520269;STBP=0.747;TYPE=snp;VARB=0.0020795;OID=.;OPOS=4159466;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:41:42:38:38:0.475:24:14:16:25:24:14:17:25
chr11	4388905	.	C	T	57.33	PASS	AF=0.444444;AO=8;DP=18;FAO=8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=2;FWDB=-0.0314204;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.888;QD=12.7408;RBI=0.0377597;REFB=-0.0127571;REVB=-0.0209418;RO=10;SAF=3;SAR=5;SRF=8;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.380216;STB=0.72318;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.0176805;OID=.;OPOS=4388905;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:18:18:10:10:8:8:0.444444:5:3:8:2:5:3:8:2
chr11	4389404	.	AG	A	69.57	PASS	AF=0.333333;AO=11;DP=37;FAO=13;FDP=39;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.0929353;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=22.9028;QD=7.13553;RBI=0.124295;REFB=0.0238431;REVB=0.0825366;RO=26;SAF=5;SAR=6;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0080845;STB=0.552763;STBP=0.665;TYPE=del;VARB=-0.0492785;OID=.;OPOS=4389405;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.333333:11:37:13:39:26:5:8:12:14:69:26:5:6:12:14
chr11	4389587	.	G	C	50.0	PASS	AF=0.538462;AO=7;DP=13;FAO=7;FDP=13;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0221577;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.7458;QD=15.3849;RBI=0.0439703;REFB=0.0140525;REVB=-0.0379792;RO=6;SAF=3;SAR=4;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183473;STB=0.60839;STBP=0.454;TYPE=snp;VARB=-0.0227205;OID=.;OPOS=4389587;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:13:13:6:6:7:7:0.538462:4:3:4:2:4:3:4:2
chr11	4510285	.	A	G	1918.82	PASS	AF=0.992;AO=107;DP=126;FAO=124;FDP=125;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=75;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.078617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.443;QD=61.4024;RBI=0.0980979;REFB=0;REVB=0.0586734;RO=0;SAF=62;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.75633e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000650438;OID=.;OPOS=4510285;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:126:125:0:0:107:124:0.992:45:62:0:0:49:75:0:0
chr11	4510587	.	C	T	435.84	PASS	AF=0.96875;AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0315787;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=182.292;QD=54.4801;RBI=0.0464195;REFB=0.0556132;REVB=0.0340228;RO=1;SAF=13;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0345339;STB=0.518507;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=-0.000358732;OID=.;OPOS=4510587;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:32:32:1:1:31:31:0.96875:18:13:1:0:18:13:1:0
chr11	4566711	.	C	T	1552.54	PASS	AF=1;AO=96;DP=98;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00576862;FXX=0.010203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.965;QD=64.0223;RBI=0.0136586;REFB=0;REVB=0.0123807;RO=0;SAF=54;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.97879e-05;OID=.;OPOS=4566711;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:97:0:0:96:97:1:42:54:0:0:42:55:0:0
chr11	4567335	.	C	G	130.41	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.10176;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.3212;QD=43.4694;RBI=0.13669;REFB=0;REVB=0.0912639;RO=0;SAF=8;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000572578;OID=.;OPOS=4567335;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:4:8:0:0:4:8:0:0
chr11	4592706	.	T	TAC	1218.42	PASS	AF=0.824561;AO=92;DP=116;FAO=94;FDP=114;FR=.;FRO=20;FSAF=46;FSAR=48;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=-0.00970302;FXX=0.0172399;HRUN=1;LEN=2;MLLD=285.044;QD=42.7515;RBI=0.021778;REFB=0.00193304;REVB=-0.019497;RO=20;SAF=46;SAR=46;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0671417;STB=0.536905;STBP=0.101;TYPE=ins;VARB=-0.000699145;OID=.;OPOS=4592707;OREF=-;OALT=AC;OMAPALT=TAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.824561:92:116:94:114:20:46:48:14:6:99:20:46:46:14:6
chr11	4608542	.	C	T	743.84	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112429;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.846;QD=63.3051;RBI=0.0273431;REFB=0;REVB=0.0249247;RO=0;SAF=23;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000665507;OID=.;OPOS=4608542;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:47:0:0:46:47:1:23:23:0:0:24:23:0:0
chr11	4615390	.	C	T	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00128932;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.181;QD=46.8475;RBI=0.00263287;REFB=0;REVB=-0.00229558;RO=0;SAF=6;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.19777e-05;OID=.;OPOS=4615390;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:9:6:0:0:9:6:0:0
chr11	4615508	.	C	G	710.26	PASS	AF=0.980769;AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00308027;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.9574;QD=54.6356;RBI=0.0384319;REFB=-0.0650363;REVB=-0.0383082;RO=0;SAF=29;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.511107;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=0.00115192;OID=.;OPOS=4615508;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:52:52:0:1:51:51:0.980769:22:29:0:0:22:29:0:1
chr11	4674575	.	G	A	73.82	PASS	AF=0.333333;AO=10;DP=30;FAO=10;FDP=30;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=0.0152411;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.2979;QD=9.84231;RBI=0.0263621;REFB=0.00368343;REVB=0.0215097;RO=20;SAF=4;SAR=6;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0581876;STB=0.535142;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=-0.00482291;OID=.;OPOS=4674575;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:30:30:20:20:10:10:0.333333:6:4:7:13:6:4:7:13
chr11	4675056	.	G	A	81.61	PASS	AF=0.282051;AO=11;DP=39;FAO=11;FDP=39;FR=.;FRO=28;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=-0.0617167;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.842;QD=8.37005;RBI=0.0627243;REFB=-0.00762312;REVB=-0.0111975;RO=28;SAF=5;SAR=6;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0114211;STB=0.507029;STBP=0.955;TYPE=snp;VARB=0.0211506;OID=.;OPOS=4675056;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:81:39:39:28:28:11:11:0.282051:6:5:13:15:6:5:13:15
chr11	4675379	.	A	G	225.89	PASS	AF=0.397059;AO=27;DP=68;FAO=27;FDP=68;FR=.;FRO=41;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=23;FSRR=18;FWDB=-0.00868525;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.941;QD=13.2874;RBI=0.00962279;REFB=-0.00329484;REVB=-0.00414301;RO=40;SAF=16;SAR=11;SRF=23;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0189526;STB=0.519582;STBP=0.797;TYPE=snp;VARB=0.00535752;OID=.;OPOS=4675379;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:40:41:27:27:0.397059:11:16:23:17:11:16:23:18
chr11	4675784	.	A	T	171.21	PASS	AF=0.461538;AO=18;DP=39;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.00914619;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.549;QD=17.56;RBI=0.0363128;REFB=-0.00893714;REVB=0.0351421;RO=21;SAF=4;SAR=14;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.322666;STB=0.68605;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.0150746;OID=.;OPOS=4675784;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:21:21:18:18:0.461538:14:4:11:10:14:4:11:10
chr11	4675846	.	C	G	196.91	PASS	AF=0.393443;AO=24;DP=61;FAO=24;FDP=61;FR=.;FRO=37;FSAF=5;FSAR=19;FSRF=13;FSRR=24;FWDB=-0.0668147;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.4871;QD=12.9121;RBI=0.0700856;REFB=-0.0252318;REVB=-0.0211611;RO=36;SAF=5;SAR=19;SRF=12;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173077;STB=0.6139;STBP=0.227;TYPE=snp;VARB=0.0426345;OID=.;OPOS=4675846;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:36:37:24:24:0.393443:19:5:12:24:19:5:13:24
chr11	4675959	.	A	G	163.84	PASS	AF=0.384615;AO=19;DP=51;FAO=20;FDP=52;FR=.;FRO=32;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=21;FWDB=0.00849675;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.538;QD=12.6028;RBI=0.00850024;REFB=-0.012705;REVB=0.000243676;RO=32;SAF=12;SAR=7;SRF=11;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.303978;STB=0.684031;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.0200589;OID=.;OPOS=4675959;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:52:32:32:19:20:0.384615:7:12:11:21:7:13:11:21
chr11	4676062	.	G	C	164.82	PASS	AF=0.548387;AO=16;DP=30;FAO=17;FDP=31;FR=.;FRO=14;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=0.0210465;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.807;QD=21.2676;RBI=0.0210479;REFB=0.00615134;REVB=0.000245465;RO=14;SAF=10;SAR=6;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.275361;STB=0.661466;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=-0.00352091;OID=.;OPOS=4676062;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:31:14:14:16:17:0.548387:6:10:4:10:6:11:4:10
chr11	4676398	.	C	G	310.65	PASS	AF=0.447368;AO=34;DP=76;FAO=34;FDP=76;FR=.;FRO=42;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=0.00194809;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.489;QD=16.3498;RBI=0.00202992;REFB=-0.0184;REVB=-0.000570553;RO=42;SAF=14;SAR=20;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133993;STB=0.575383;STBP=0.239;TYPE=snp;VARB=0.0365167;OID=.;OPOS=4676398;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:42:42:34:34:0.447368:20:14:23:19:20:14:23:19
chr11	4676457	.	G	A	117.75	PASS	AF=0.368421;AO=14;DP=38;FAO=14;FDP=38;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=-0.0630177;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.537;QD=12.3949;RBI=0.0636579;REFB=-0.0144495;REVB=-0.00900539;RO=24;SAF=5;SAR=9;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.32371;STB=0.689521;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=0.0197711;OID=.;OPOS=4676457;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:24:24:14:14:0.368421:9:5:16:8:9:5:16:8
chr11	4703165	.	C	A	804.98	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.034611;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.13;QD=64.3985;RBI=0.0419141;REFB=0;REVB=-0.0236403;RO=0;SAF=38;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000773264;OID=.;OPOS=4703165;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:12:38:0:0:12:38:0:0
chr11	4712079	.	A	G	1510.69	PASS	AF=1;AO=94;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0343333;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.131;QD=63.6078;RBI=0.0353682;REFB=0;REVB=0.00849303;RO=0;SAF=43;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.10063e-05;OID=.;OPOS=4712079;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:95:0:0:94:95:1:51:43:0:0:52:43:0:0
chr11	4730985	.	C	T	616.87	PASS	AF=1;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00710948;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.081;QD=61.6871;RBI=0.0118406;REFB=0;REVB=-0.00946866;RO=0;SAF=18;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.19993e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00017369;OID=.;OPOS=4730985;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:40:0:0:40:40:1:22:18:0:0:22:18:0:0
chr11	4731180	.	G	A	1898.9	PASS	AF=0.992;AO=123;DP=124;FAO=124;FDP=125;FR=.;FRO=1;FSAF=65;FSAR=59;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00388465;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.727;QD=60.7649;RBI=0.0218381;REFB=-0.0371637;REVB=-0.0214898;RO=1;SAF=64;SAR=59;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00736582;STB=0.503816;STBP=0.492;TYPE=snp;VARB=0.000816955;OID=.;OPOS=4731180;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:124:125:1:1:123:124:0.992:59:64:1:0:59:65:1:0
chr11	4731468	.	G	A	850.94	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0584743;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.6443;QD=57.6911;RBI=0.0625978;REFB=0;REVB=0.0223435;RO=0;SAF=31;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000843947;OID=.;OPOS=4731468;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:28:31:0:0:28:31:0:0
chr11	4731583	.	C	T	1111.43	PASS	AF=0.974026;AO=75;DP=77;FAO=75;FDP=77;FR=.;FRO=2;FSAF=35;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0254637;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.974;QD=57.7367;RBI=0.0379599;REFB=-0.194842;REVB=0.0281523;RO=2;SAF=35;SAR=40;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0230683;STB=0.512192;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=0.00154787;OID=.;OPOS=4731583;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:77:77:2:2:75:75:0.974026:40:35:0:2:40:35:0:2
chr11	4928621	.	G	A	438.58	PASS	AF=0.409836;AO=50;DP=121;FAO=50;FDP=122;FR=.;FRO=72;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=39;FSRR=33;FWDB=-0.0253189;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.4123;QD=14.3796;RBI=0.0283503;REFB=0.0069088;REVB=-0.012755;RO=71;SAF=25;SAR=25;SRF=38;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0366961;STB=0.52458;STBP=0.651;TYPE=snp;VARB=-0.010425;OID=.;OPOS=4928621;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:121:122:71:72:50:50:0.409836:25:25:38:33:25:25:39:33
chr11	4929061	.	C	G	218.99	PASS	AF=0.567568;AO=21;DP=37;FAO=21;FDP=37;FR=.;FRO=16;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.0189004;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.443;QD=23.675;RBI=0.020737;REFB=0.0113338;REVB=-0.00853229;RO=16;SAF=13;SAR=8;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0457773;STB=0.525582;STBP=0.72;TYPE=snp;VARB=-0.00608825;OID=.;OPOS=4929061;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:16:16:21:21:0.567568:8:13:9:7:8:13:9:7
chr11	4945196	.	T	G	127.99	PASS	AF=0.56;AO=14;DP=25;FAO=14;FDP=25;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=-0.0455837;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.9068;QD=20.4777;RBI=0.0465801;REFB=0.00767187;REVB=-0.00958313;RO=11;SAF=5;SAR=9;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0731378;STB=0.541344;STBP=0.673;TYPE=snp;VARB=-0.0106516;OID=.;OPOS=4945196;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:25:25:11:11:14:14:0.56:9:5:3:8:9:5:3:8
chr11	4945229	.	G	A	54.73	PASS	AF=0.777778;AO=7;DP=9;FAO=7;FDP=9;FR=.;FRO=2;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0311211;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.8271;QD=24.3264;RBI=0.0351951;REFB=-0.0618992;REVB=0.0164368;RO=2;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174483;STB=0.599732;STBP=0.37;TYPE=snp;VARB=0.024408;OID=.;OPOS=4945229;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:9:9:2:2:7:7:0.777778:4:3:0:2:4:3:0:2
chr11	4964753	.	A	G	1952.87	PASS	AF=1;AO=125;DP=125;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0467285;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.474;QD=61.9957;RBI=0.04679;REFB=0;REVB=-0.00239727;RO=0;SAF=50;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.07689e-05;OID=.;OPOS=4964753;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:125:126:0:0:125:126:1:75:50:0:0:75:51:0:0
chr11	4965301	.	G	T	936.01	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0226189;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.9275;QD=58.5005;RBI=0.0479256;REFB=0;REVB=-0.0422522;RO=0;SAF=36;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.31521e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000201706;OID=.;OPOS=4965301;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:64:0:0:63:64:1:27:36:0:0:27:37:0:0
chr11	4967468	.	G	A	1135.26	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00407957;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.643;QD=60.5471;RBI=0.0182285;REFB=0;REVB=0.0177661;RO=0;SAF=46;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.27888e-05;OID=.;OPOS=4967468;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:75:0:0:74:75:1:28:46:0:0:28:47:0:0
chr11	4968198	.	C	A	223.19	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0217997;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.54;QD=49.597;RBI=0.0303562;REFB=0;REVB=0.0211251;RO=0;SAF=10;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00116667;OID=.;OPOS=4968198;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:8:10:0:0:8:10:0:0
chr11	4976086	.	C	T	969.78	PASS	AF=0.971014;AO=65;DP=69;FAO=67;FDP=69;FR=.;FRO=2;FSAF=35;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0153353;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.9155;QD=56.2194;RBI=0.0421653;REFB=-0.0884956;REVB=0.0392777;RO=2;SAF=35;SAR=30;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0304517;STB=0.515147;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=0.00144212;OID=.;OPOS=4976086;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:69:69:2:2:65:67:0.971014:30:35:0:2:32:35:0:2
chr11	4976554	.	A	G	313.28	PASS	AF=0.96;AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=25;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00182536;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.197;QD=50.1253;RBI=0.0234634;REFB=-0.107196;REVB=0.0233923;RO=1;SAF=9;SAR=15;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0487199;STB=0.526294;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.00252585;OID=.;OPOS=4976554;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:25:25:1:1:24:24:0.96:15:9:1:0:15:9:1:0
chr11	4976811	.	C	A	289.35	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0277474;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.8768;QD=52.6082;RBI=0.118613;REFB=0;REVB=-0.115322;RO=0;SAF=11;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00358922;OID=.;OPOS=4976811;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:11:11:0:0:11:11:0:0
chr11	5010905	.	A	G	368.62	PASS	AF=0.5;AO=38;DP=76;FAO=38;FDP=76;FR=.;FRO=38;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=0.00404297;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.542;QD=19.4012;RBI=0.0233102;REFB=-0.00414848;REVB=0.0229569;RO=38;SAF=23;SAR=15;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120182;STB=0.566866;STBP=0.251;TYPE=snp;VARB=0.00368934;OID=.;OPOS=5010905;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:38:38:38:38:0.5:15:23:18:20:15:23:18:20
chr11	5020416	.	A	G	1572.57	PASS	AF=1;AO=97;DP=103;FAO=106;FDP=106;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=53;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0638826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.767;QD=59.3423;RBI=0.0672694;REFB=0;REVB=0.0210758;RO=0;SAF=44;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000831291;OID=.;OPOS=5020416;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:103:106:0:0:97:106:1:53:44:0:0:53:53:0:0
chr11	5021055	.	C	G	379.26	PASS	AF=0.411215;AO=44;DP=108;FAO=44;FDP=107;FR=.;FRO=63;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=31;FSRR=32;FWDB=-0.0072908;FXX=0.0092584;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.605;QD=14.1778;RBI=0.0185034;REFB=-0.00875499;REVB=0.0170065;RO=63;SAF=20;SAR=24;SRF=31;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0392895;STB=0.522174;STBP=0.718;TYPE=snp;VARB=0.0114132;OID=.;OPOS=5021055;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:107:63:63:44:44:0.411215:24:20:31:32:24:20:31:32
chr11	5079946	.	C	T	885.42	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0258838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.417;QD=58.0606;RBI=0.0261802;REFB=0;REVB=0.00392842;RO=0;SAF=25;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.46436e-05;OID=.;OPOS=5079946;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:36:25:0:0:36:25:0:0
chr11	5080359	.	G	A	242.39	PASS	AF=0.666667;AO=22;DP=33;FAO=22;FDP=33;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.000987688;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.531;QD=29.3801;RBI=0.0011211;REFB=-0.00263699;REVB=0.000530421;RO=11;SAF=6;SAR=16;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128847;STB=0.57136;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.00166468;OID=.;OPOS=5080359;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:33:33:11:11:22:22:0.666667:16:6:5:6:16:6:5:6
chr11	5141902	.	T	C	77.31	PASS	AF=0.434783;AO=10;DP=22;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=3;FWDB=-0.0111132;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=270.76;QD=13.4455;RBI=0.0150619;REFB=-0.0150275;REVB=-0.0101665;RO=12;SAF=6;SAR=4;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151473;STB=0.603583;STBP=0.477;TYPE=snp;VARB=0.031203;OID=.;OPOS=5141902;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:22:23:12:13:10:10:0.434783:4:6:9:3:4:6:10:3
chr11	5141980	.	A	G	121.7	PASS	AF=0.4375;AO=14;DP=32;FAO=14;FDP=32;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.0182568;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.394;QD=15.2119;RBI=0.0323918;REFB=-0.0289588;REVB=-0.0267567;RO=18;SAF=4;SAR=10;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17127;STB=0.59985;STBP=0.342;TYPE=snp;VARB=0.0515089;OID=.;OPOS=5141980;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:18:18:14:14:0.4375:10:4:8:10:10:4:8:10
chr11	5142134	.	C	T	88.79	PASS	AF=0.458333;AO=11;DP=24;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.0100586;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.221;QD=14.7986;RBI=0.0109122;REFB=-0.0176581;REVB=-0.00423094;RO=13;SAF=5;SAR=6;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148238;STB=0.586311;STBP=0.479;TYPE=snp;VARB=0.0185503;OID=.;OPOS=5142134;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:24:24:13:13:11:11:0.458333:6:5:8:5:6:5:8:5
chr11	5142270	.	T	G	325.64	PASS	AF=0.603774;AO=32;DP=53;FAO=32;FDP=53;FR=.;FRO=21;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=5;FSRR=16;FWDB=0.000334931;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.562;QD=24.5767;RBI=0.00799458;REFB=0.019791;REVB=0.00798756;RO=21;SAF=16;SAR=16;SRF=5;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189379;STB=0.603711;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=-0.0150894;OID=.;OPOS=5142270;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:21:21:32:32:0.603774:16:16:5:16:16:16:5:16
chr11	5142530	.	C	T	292.01	PASS	AF=0.555556;AO=30;DP=54;FAO=30;FDP=54;FR=.;FRO=24;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=-0.00234879;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=312.119;QD=21.6305;RBI=0.00255592;REFB=0.00531165;REVB=0.00100793;RO=22;SAF=15;SAR=15;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0347989;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00395794;OID=.;OPOS=5142530;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:22:24:30:30:0.555556:15:15:10:12:15:15:12:12
chr11	5142549	.	T	C	312.79	PASS	AF=0.55;AO=33;DP=60;FAO=33;FDP=60;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=0.0111108;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.667;QD=20.8528;RBI=0.0140498;REFB=-0.0140102;REVB=0.00859915;RO=27;SAF=16;SAR=17;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0574416;STB=0.561896;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.0202742;OID=.;OPOS=5142549;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:27:27:33:33:0.55:17:16:15:12:18:15:16:11
chr11	5142671	.	A	G	395.97	PASS	AF=0.465909;AO=41;DP=88;FAO=41;FDP=88;FR=.;FRO=47;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=26;FSRR=21;FWDB=0.0182719;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=242.139;QD=17.9987;RBI=0.0187257;REFB=0.000330833;REVB=0.00409773;RO=44;SAF=20;SAR=21;SRF=25;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0746305;STB=0.534867;STBP=0.579;TYPE=snp;VARB=-0.00049792;OID=.;OPOS=5142671;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:44:47:41:41:0.465909:21:20:25:19:21:20:26:21
chr11	5172785	.	GA	G,GG	639.28	PASS	AF=0.047619,0.952381;AO=9,33;DP=42;FAO=2,40;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=0,13;FSAR=2,27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0162627,-0.0099745;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=226.586,236.761;QD=60.8834;RBI=0.0260618,0.0218335;REFB=0,0;REVB=0.0203652,0.0194219;RO=0;SAF=0,13;SAR=9,20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-4.82173e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0117195,0.00230566;OID=.,.;OPOS=5172786,5172786;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.047619,0.952381:9,33:42:2,40:42:0:0,13:2,27:0:0:7:0:0,13:9,20:0:0
chr11	5221645	.	C	G	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00430096;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=256.437;QD=51.1846;RBI=0.00611699;REFB=0;REVB=0.00434963;RO=0;SAF=14;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5931e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.52843e-07;OID=.;OPOS=5221645;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:6:14:0:0:6:14:0:0
chr11	5248243	.	A	G	251.69	PASS	AF=0.474576;AO=28;DP=59;FAO=28;FDP=59;FR=.;FRO=31;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=0.00440714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.079;QD=17.064;RBI=0.00785462;REFB=0.00941762;REVB=-0.00650171;RO=31;SAF=13;SAR=15;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0423766;STB=0.523793;STBP=0.762;TYPE=snp;VARB=-0.0149901;OID=.;OPOS=5248243;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:31:31:28:28:0.474576:15:13:13:18:15:13:13:18
chr11	5269583	.	GTGA	AGAG	718.8	PASS	AF=1;AO=44;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0360645;FXX=0.041658;HRUN=1;LEN=4;MLLD=293.368;QD=62.5047;RBI=0.0393664;REFB=0;REVB=0.0157819;RO=0;SAF=20;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.30465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.00292736;OID=.;OPOS=5269583;OREF=GTGA;OALT=AGAG;OMAPALT=AGAG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:44:46:1:24:20:0:0:25:21:0:0
chr11	5322520	.	G	A	122.33	PASS	AF=0.451613;AO=14;DP=31;FAO=14;FDP=31;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.0203885;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.068;QD=15.7842;RBI=0.0352189;REFB=-0.00935057;REVB=-0.0287172;RO=17;SAF=5;SAR=9;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167604;STB=0.597015;STBP=0.344;TYPE=snp;VARB=0.0132786;OID=.;OPOS=5322520;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:17:17:14:14:0.451613:9:5:9:8:9:5:9:8
chr11	5322737	.	A	G	35.75	PASS	AF=0.25;AO=6;DP=24;FAO=6;FDP=24;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.00884943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.381;QD=5.95779;RBI=0.0232908;REFB=-0.00674149;REVB=-0.0215441;RO=18;SAF=3;SAR=3;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0637242;STB=0.541529;STBP=0.828;TYPE=snp;VARB=0.0155288;OID=.;OPOS=5322737;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:24:24:18:18:6:6:0.25:3:3:10:8:3:3:10:8
chr11	5323071	.	C	T	651.23	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0267893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=302.625;QD=62.0219;RBI=0.0276801;REFB=0;REVB=0.00696589;RO=0;SAF=18;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.51425e-05;OID=.;OPOS=5323071;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:24:18:0:0:24:18:0:0
chr11	5344592	.	A	C	78.64	PASS	AF=0.47619;AO=10;DP=21;FAO=10;FDP=21;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.0104595;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.8428;QD=14.9785;RBI=0.0268714;REFB=0.0444532;REVB=0.0247522;RO=11;SAF=6;SAR=4;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0501495;STB=0.529352;STBP=0.81;TYPE=snp;VARB=-0.0484375;OID=.;OPOS=5344592;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:21:21:11:11:10:10:0.47619:4:6:6:5:4:6:6:5
chr11	5344772	.	T	C	250.43	PASS	AF=0.5;AO=27;DP=57;FAO=27;FDP=54;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=0.0171827;FXX=0.0526223;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.409;QD=18.5504;RBI=0.0187385;REFB=-0.0304279;REVB=-0.00747552;RO=30;SAF=13;SAR=14;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0795481;STB=0.518505;STBP=0.826;TYPE=snp;VARB=0.0152277;OID=.;OPOS=5344772;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:54:30:27:27:27:0.5:14:13:17:13:14:13:14:13
chr11	5344847	.	A	G	144.76	PASS	AF=0.432432;AO=16;DP=37;FAO=16;FDP=37;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.0240003;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.4548;QD=15.6493;RBI=0.0374548;REFB=-0.0195625;REVB=0.0287549;RO=21;SAF=7;SAR=9;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0384175;STB=0.522156;STBP=0.82;TYPE=snp;VARB=0.0286557;OID=.;OPOS=5344847;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:21:21:16:16:0.432432:9:7:10:11:9:7:10:11
chr11	5344902	.	C	G	63.7	PASS	AF=0.321429;AO=9;DP=28;FAO=9;FDP=28;FR=.;FRO=19;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.0216249;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.173;QD=9.09987;RBI=0.0449854;REFB=-0.00529986;REVB=-0.0394468;RO=19;SAF=1;SAR=8;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.456797;STB=0.790427;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.0241191;OID=.;OPOS=5344902;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:28:28:19:19:9:9:0.321429:8:1:8:11:8:1:8:11
chr11	5345128	.	G	A	160.82	PASS	AF=0.727273;AO=15;DP=22;FAO=16;FDP=22;FR=.;FRO=6;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.0314141;FXX=0.0434594;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.196;QD=29.2394;RBI=0.0362853;REFB=-0.00828071;REVB=-0.0181598;RO=7;SAF=9;SAR=6;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.256359;STB=0.624844;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.00430244;OID=.;OPOS=5345128;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:22:22:7:6:15:16:0.727273:6:9:1:6:6:10:1:5
chr11	5345170	.	A	G	90.34	PASS	AF=0.5;AO=11;DP=22;FAO=11;FDP=22;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=10;FWDB=-0.00681749;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.473;QD=16.4261;RBI=0.00705667;REFB=-0.013643;REVB=0.00182165;RO=11;SAF=5;SAR=6;SRF=1;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.33488;STB=0.689369;STBP=0.139;TYPE=snp;VARB=0.0136702;OID=.;OPOS=5345170;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:22:22:11:11:11:11:0.5:6:5:1:10:6:5:1:10
chr11	5345486	.	G	A	252.09	PASS	AF=0.510638;AO=22;DP=46;FAO=24;FDP=47;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=0.00964688;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.54;QD=21.4548;RBI=0.0130258;REFB=-0.0183371;REVB=0.00875271;RO=23;SAF=9;SAR=13;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.016718;STB=0.51281;STBP=0.897;TYPE=snp;VARB=0.0162431;OID=.;OPOS=5345486;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:47:23:23:22:24:0.510638:13:9:9:14:14:10:9:14
chr11	5372863	.	T	A	422.67	PASS	AF=0.424779;AO=48;DP=113;FAO=48;FDP=113;FR=.;FRO=65;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=33;FSRR=32;FWDB=-0.00401649;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.96;QD=14.9616;RBI=0.0340789;REFB=-0.00629987;REVB=0.0338414;RO=65;SAF=25;SAR=23;SRF=33;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.013465;STB=0.507564;STBP=0.898;TYPE=snp;VARB=0.00665592;OID=.;OPOS=5372863;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:113:65:65:48:48:0.424779:23:25:33:32:23:25:33:32
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chr11	5411031	.	C	T	66.79	PASS	AF=0.428571;AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=0.0632705;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.9761;QD=12.7221;RBI=0.0729661;REFB=-0.0130319;REVB=-0.0363441;RO=12;SAF=5;SAR=4;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.211189;STB=0.624732;STBP=0.35;TYPE=snp;VARB=0.0186075;OID=.;OPOS=5411031;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:21:21:12:12:9:9:0.428571:4:5:4:8:4:5:4:8
chr11	5411239	.	T	C	287.94	PASS	AF=0.565217;AO=26;DP=46;FAO=26;FDP=46;FR=.;FRO=20;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=-0.0229081;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.74;QD=25.0386;RBI=0.0233756;REFB=0.00164409;REVB=-0.00465169;RO=20;SAF=15;SAR=11;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0185652;STB=0.510301;STBP=0.898;TYPE=snp;VARB=-0.00219241;OID=.;OPOS=5411239;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:20:20:26:26:0.565217:11:15:12:8:11:15:12:8
chr11	5411395	.	C	A	358.4	PASS	AF=0.452381;AO=38;DP=84;FAO=38;FDP=84;FR=.;FRO=46;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=23;FSRR=23;FWDB=0.00747114;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.758;QD=17.0668;RBI=0.0176817;REFB=-0.00670276;REVB=0.0160257;RO=46;SAF=18;SAR=20;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0257238;STB=0.514422;STBP=0.783;TYPE=snp;VARB=0.00688806;OID=.;OPOS=5411395;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:46:46:38:38:0.452381:20:18:23:23:20:18:23:23
chr11	5411398	.	T	G	357.19	PASS	AF=0.447059;AO=38;DP=85;FAO=38;FDP=85;FR=.;FRO=47;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=24;FSRR=23;FWDB=-0.010696;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.3292;QD=16.809;RBI=0.0214002;REFB=0.00548317;REVB=0.0185355;RO=47;SAF=18;SAR=20;SRF=24;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0364125;STB=0.520435;STBP=0.744;TYPE=snp;VARB=-0.0105924;OID=.;OPOS=5411398;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:47:47:38:38:0.447059:20:18:24:23:20:18:24:23
chr11	5411579	.	GT	AC	357.46	PASS	AF=0.44186;AO=38;DP=87;FAO=38;FDP=86;FR=.;FRO=48;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=28;FSRR=20;FWDB=-0.00431432;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=2;MLLD=163.482;QD=16.6262;RBI=0.0143207;REFB=-0.0159952;REVB=-0.0136554;RO=48;SAF=19;SAR=19;SRF=28;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0828276;STB=0.546487;STBP=0.462;TYPE=mnp;VARB=0.0199206;OID=.;OPOS=5411579;OREF=GT;OALT=AC;OMAPALT=AC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:86:48:48:38:38:0.44186:19:19:28:20:19:19:28:20
chr11	5424050	.	G	A	385.13	PASS	AF=0.52;AO=39;DP=75;FAO=39;FDP=75;FR=.;FRO=36;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=23;FWDB=-0.0415405;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.2059;QD=20.5402;RBI=0.0439192;REFB=-0.0207594;REVB=0.0142578;RO=36;SAF=21;SAR=18;SRF=13;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152787;STB=0.584479;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=0.0177118;OID=.;OPOS=5424050;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:36:36:39:39:0.52:18:21:13:23:18:21:13:23
chr11	5424490	.	C	T	481.2	PASS	AF=0.381579;AO=48;DP=154;FAO=58;FDP=152;FR=.,HEALED;FRO=94;FSAF=29;FSAR=29;FSRF=41;FSRR=53;FWDB=-0.0176462;FXX=0.0129862;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.198;QD=12.6631;RBI=0.0266712;REFB=-0.0214413;REVB=-0.0199991;RO=68;SAF=27;SAR=21;SRF=31;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110934;STB=0.53946;STBP=0.477;TYPE=snp;VARB=0.0476922;OID=.;OPOS=5424490;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:154:152:68:94:48:58:0.381579:21:27:31:37:29:29:41:53
chr11	5443442	.	G	C	727.78	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00550272;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.544;QD=63.2848;RBI=0.0275917;REFB=0;REVB=0.0270375;RO=0;SAF=27;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000220485;OID=.;OPOS=5443442;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:19:27:0:0:19:27:0:0
chr11	5443700	.	C	T	805.18	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00279108;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.314;QD=64.414;RBI=0.00866817;REFB=0;REVB=-0.00820652;RO=0;SAF=18;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.72636e-05;OID=.;OPOS=5443700;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:32:18:0:0:32:18:0:0
chr11	5443739	.	T	C	740.62	PASS	AF=0.964912;AO=54;DP=57;FAO=55;FDP=57;FR=.;FRO=2;FSAF=23;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0299984;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=248.873;QD=51.9735;RBI=0.0345932;REFB=-0.0827043;REVB=0.0172274;RO=2;SAF=22;SAR=32;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00644039;STB=0.502946;STBP=0.867;TYPE=snp;VARB=0.000446772;OID=.;OPOS=5443739;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:57:57:2:2:54:55:0.964912:32:22:1:1:32:23:1:1
chr11	5443867	.	C	T	338.71	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.011686;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.9488;QD=54.1933;RBI=0.0407433;REFB=0;REVB=-0.0390314;RO=0;SAF=17;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000618844;OID=.;OPOS=5443867;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:8:17:0:0:8:17:0:0
chr11	5443887	.	T	C	222.85	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0256834;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.753;QD=49.5217;RBI=0.0415289;REFB=0;REVB=-0.0326346;RO=0;SAF=10;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.99999e-05;OID=.;OPOS=5443887;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:8:10:0:0:8:10:0:0
chr11	5443893	.	G	A	162.29	PASS	AF=1;AO=14;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0699974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.7978;QD=43.2759;RBI=0.0751336;REFB=0;REVB=0.0273024;RO=0;SAF=8;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0150178;OID=.;OPOS=5443893;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:15:15:0:0:14:15:1:6:8:0:0:6:9:0:0
chr11	5443963	.	G	A	88.21	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159682;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.708;QD=39.2049;RBI=0.0243535;REFB=0;REVB=-0.0183878;RO=0;SAF=6;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.09617e-05;OID=.;OPOS=5443963;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:3:6:0:0:3:6:0:0
chr11	5444061	.	G	A	393.32	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0293547;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.866;QD=56.1879;RBI=0.0298764;REFB=0;REVB=-0.00555875;RO=0;SAF=9;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.62669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000166148;OID=.;OPOS=5444061;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:19:9:0:0:19:9:0:0
chr11	5444136	.	C	T	1520.87	PASS	AF=1;AO=95;DP=98;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00788552;FXX=0.0306091;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.4712;QD=64.0367;RBI=0.0148831;REFB=0;REVB=0.0126224;RO=0;SAF=38;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000151057;OID=.;OPOS=5444136;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:95:0:0:95:95:1:57:38:0:0:57:38:0:0
chr11	5444353	.	T	C	409.74	PASS	AF=0.9375;AO=30;DP=32;FAO=30;FDP=32;FR=.;FRO=2;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0175644;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.7809;QD=51.218;RBI=0.0203284;REFB=0.0434224;REVB=0.0102341;RO=2;SAF=16;SAR=14;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0547702;STB=0.529392;STBP=0.243;TYPE=snp;VARB=-0.00342681;OID=.;OPOS=5444353;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:32:32:2:2:30:30:0.9375:14:16:2:0:14:16:2:0
chr11	5462255	.	C	G	296.13	PASS	AF=0.54386;AO=30;DP=58;FAO=31;FDP=57;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=-0.0238617;FXX=0.0338926;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.7564;QD=20.7808;RBI=0.0264135;REFB=-0.0309295;REVB=-0.0113265;RO=24;SAF=14;SAR=16;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159508;STB=0.591412;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.0101944;OID=.;OPOS=5462255;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:57:24:26:30:31:0.54386:16:14:16:8:17:14:17:9
chr11	5462374	.	C	T	449.06	PASS	AF=0.52381;AO=44;DP=84;FAO=44;FDP=84;FR=.;FRO=40;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=16;FSRR=24;FWDB=0.0137305;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.5891;QD=21.3839;RBI=0.0652121;REFB=0.00165671;REVB=0.0637502;RO=40;SAF=18;SAR=26;SRF=16;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00811651;STB=0.504482;STBP=0.953;TYPE=snp;VARB=-0.00086227;OID=.;OPOS=5462374;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:40:40:44:44:0.52381:26:18:16:24:26:18:16:24
chr11	5462702	.	G	A	144.18	PASS	AF=0.625;AO=15;DP=24;FAO=15;FDP=24;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=0.032301;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.836;QD=24.0298;RBI=0.0326962;REFB=-0.0300845;REVB=0.00506804;RO=9;SAF=6;SAR=9;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127774;STB=0.571338;STBP=0.399;TYPE=snp;VARB=0.0441958;OID=.;OPOS=5462702;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:24:24:9:9:15:15:0.625:9:6:2:7:9:6:2:7
chr11	5474838	.	G	T	201.99	PASS	AF=0.373134;AO=25;DP=67;FAO=25;FDP=67;FR=.;FRO=42;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=23;FWDB=-0.0014927;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=310.293;QD=12.059;RBI=0.00193167;REFB=-0.00436897;REVB=-0.00122605;RO=42;SAF=11;SAR=14;SRF=19;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0136187;STB=0.507853;STBP=0.926;TYPE=snp;VARB=0.00751251;OID=.;OPOS=5474838;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:42:42:25:25:0.373134:14:11:19:23:14:11:19:23
chr11	5475170	.	G	C	254.4	PASS	AF=0.439394;AO=29;DP=66;FAO=29;FDP=66;FR=.;FRO=37;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=0.00172815;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.324;QD=15.4184;RBI=0.0189498;REFB=-0.0266485;REVB=-0.0188708;RO=37;SAF=10;SAR=19;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0927119;STB=0.552536;STBP=0.483;TYPE=snp;VARB=0.0322943;OID=.;OPOS=5475170;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:37:37:29:29:0.439394:19:10:16:21:19:10:16:21
chr11	5475506	.	G	A	305.51	PASS	AF=0.478261;AO=33;DP=69;FAO=33;FDP=69;FR=.;FRO=36;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=21;FSRR=15;FWDB=0.0111374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.087;QD=17.7108;RBI=0.0399459;REFB=-0.0168035;REVB=0.0383619;RO=36;SAF=20;SAR=13;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.022056;STB=0.512344;STBP=0.863;TYPE=snp;VARB=0.0117364;OID=.;OPOS=5475506;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:36:36:33:33:0.478261:13:20:21:15:13:20:21:15
chr11	5510284	.	A	G	1015.12	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0681322;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.49;QD=58.8474;RBI=0.068742;REFB=0;REVB=0.00913584;RO=0;SAF=34;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000268628;OID=.;OPOS=5510284;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:68:69:0:0:68:69:1:34:34:0:0:34:35:0:0
chr11	5510341	.	C	T	534.41	PASS	AF=0.456;AO=57;DP=125;FAO=57;FDP=125;FR=.;FRO=68;FSAF=27;FSAR=30;FSRF=36;FSRR=32;FWDB=0.0136997;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.387;QD=17.1011;RBI=0.0139989;REFB=-0.00997542;REVB=0.00287926;RO=66;SAF=27;SAR=30;SRF=35;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0546027;STB=0.530292;STBP=0.555;TYPE=snp;VARB=0.0139279;OID=.;OPOS=5510341;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:125:125:66:68:57:57:0.456:30:27:35:31:30:27:36:32
chr11	5510497	.	T	C	1264.6	PASS	AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.035368;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.4778;QD=61.6879;RBI=0.0353883;REFB=0;REVB=0.00119992;RO=0;SAF=31;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.2938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00017384;OID=.;OPOS=5510497;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:51:31:0:0:51:31:0:0
chr11	5510626	.	T	C	738.07	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0177802;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.748;QD=62.8141;RBI=0.0301183;REFB=0;REVB=0.0243101;RO=0;SAF=22;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000151718;OID=.;OPOS=5510626;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:47:0:0:45:47:1:23:22:0:0:23:24:0:0
chr11	5510928	.	G	A	358.06	PASS	AF=1;AO=25;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0222682;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.7316;QD=55.0855;RBI=0.0409001;REFB=0;REVB=0.0343067;RO=0;SAF=11;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00123493;OID=.;OPOS=5510928;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:25:26:1:14:11:0:0:15:11:0:0
chr11	5529865	.	G	A	538.54	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00246089;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.604;QD=59.838;RBI=0.00357348;REFB=0;REVB=-0.00259109;RO=0;SAF=17;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.38187e-05;OID=.;OPOS=5529865;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:19:17:0:0:19:17:0:0
chr11	5529920	.	G	C	33.08	PASS	AF=0.5;AO=5;DP=11;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=-0.0198741;FXX=0.0908265;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.868;QD=13.2321;RBI=0.0428502;REFB=-0.0103714;REVB=-0.0379626;RO=5;SAF=3;SAR=2;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179553;STB=0.608297;STBP=0.611;TYPE=snp;VARB=0.0156382;OID=.;OPOS=5529920;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:11:10:5:5:5:5:0.5:2:3:4:1:2:3:4:1
chr11	5536415	.	C	T	273.31	PASS	AF=0.543478;AO=25;DP=46;FAO=25;FDP=46;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=-0.0360069;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.809;QD=23.7664;RBI=0.0370572;REFB=-0.00244102;REVB=-0.0087603;RO=21;SAF=13;SAR=12;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0422618;STB=0.523541;STBP=0.72;TYPE=snp;VARB=0.0015033;OID=.;OPOS=5536415;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:21:21:25:25:0.543478:12:13:12:9:12:13:12:9
chr11	5536537	.	A	C	1656.61	PASS	AF=0.99115;AO=108;DP=109;FAO=112;FDP=113;FR=.;FRO=1;FSAF=63;FSAR=49;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0716102;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.3751;QD=58.641;RBI=0.0782901;REFB=-0.053308;REVB=-0.0316437;RO=1;SAF=63;SAR=45;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00747538;STB=0.503936;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.000194276;OID=.;OPOS=5536537;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:109:113:1:1:108:112:0.99115:45:63:1:0:49:63:1:0
chr11	5536848	.	G	A	493.1	PASS	AF=0.490566;AO=53;DP=108;FAO=52;FDP=106;FR=.;FRO=54;FSAF=15;FSAR=37;FSRF=23;FSRR=31;FWDB=0.0380063;FXX=0.0185168;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.057;QD=18.6074;RBI=0.0389709;REFB=-0.00210379;REVB=0.00861679;RO=54;SAF=15;SAR=38;SRF=23;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148339;STB=0.579523;STBP=0.109;TYPE=snp;VARB=0.00225604;OID=.;OPOS=5536848;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:106:54:54:53:52:0.490566:38:15:23:31:37:15:23:31
chr11	5536852	.	A	G	506.37	PASS	AF=0.5;AO=53;DP=106;FAO=53;FDP=106;FR=.;FRO=53;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=15;FSRR=38;FWDB=-0.00578837;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.703;QD=19.1083;RBI=0.00937607;REFB=-0.00355836;REVB=0.00737601;RO=53;SAF=22;SAR=31;SRF=15;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126352;STB=0.569581;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.00380887;OID=.;OPOS=5536852;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:106:53:53:53:53:0.5:31:22:15:38:31:22:15:38
chr11	5537045	.	T	G	94.25	PASS	AF=0.333333;AO=12;DP=36;FAO=12;FDP=36;FR=.;FRO=24;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.00488273;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.753;QD=10.4725;RBI=0.00603387;REFB=0.000503881;REVB=0.00354494;RO=23;SAF=4;SAR=8;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.211998;STB=0.64127;STBP=0.225;TYPE=snp;VARB=-0.000893671;OID=.;OPOS=5537045;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:36:36:23:24:12:12:0.333333:8:4:12:11:8:4:13:11
chr11	5537161	.	A	G	289.71	PASS	AF=0.508197;AO=31;DP=61;FAO=31;FDP=61;FR=.;FRO=30;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=11;FWDB=-0.01295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.749;QD=18.9974;RBI=0.0299694;REFB=-0.0112567;REVB=-0.0270271;RO=30;SAF=17;SAR=14;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0763654;STB=0.542492;STBP=0.539;TYPE=snp;VARB=0.0146484;OID=.;OPOS=5537161;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:30:30:31:31:0.508197:14:17:19:11:14:17:19:11
chr11	5537780	.	C	A	147.23	PASS	AF=0.457143;AO=16;DP=36;FAO=16;FDP=35;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=0.0467332;FXX=0.0277701;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.9504;QD=16.8267;RBI=0.0523745;REFB=0.00774594;REVB=-0.0236452;RO=20;SAF=6;SAR=10;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0259529;STB=0.503812;STBP=0.977;TYPE=snp;VARB=-0.0105974;OID=.;OPOS=5537780;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:35:20:19:16:16:0.457143:10:6:7:13:10:6:7:12
chr11	5565906	.	A	G	709.84	PASS	AF=0.980769;AO=50;DP=52;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0145897;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.986;QD=54.6027;RBI=0.0156562;REFB=-0.047789;REVB=0.00567969;RO=0;SAF=16;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50704;STBP=0.606;TYPE=snp;VARB=0.000567241;OID=.;OPOS=5565906;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:52:52:0:1:50:51:0.980769:34:16:0:0:35:16:0:1
chr11	5566030	.	A	G	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.011153;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.171;QD=47.8224;RBI=0.032125;REFB=0;REVB=0.0301268;RO=0;SAF=10;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000213794;OID=.;OPOS=5566030;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:6:10:0:0:6:10:0:0
chr11	5566365	.	T	C	1026.33	PASS	AF=1;AO=69;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0173703;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.295;QD=58.6475;RBI=0.105287;REFB=0;REVB=0.103845;RO=1;SAF=45;SAR=24;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0192871;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000259927;OID=.;OPOS=5566365;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:70:70:1:0:69:70:1:24:45:0:1:25:45:0:0
chr11	5602275	.	A	G	123.12	PASS	AF=0.466667;AO=14;DP=30;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=0.0294153;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.8865;QD=16.4161;RBI=0.0313124;REFB=-0.0276969;REVB=0.0107332;RO=16;SAF=6;SAR=8;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.291666;STB=0.666444;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=0.0323959;OID=.;OPOS=5602275;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:16:16:14:14:0.466667:8:6:12:4:8:6:12:4
chr11	5602438	.	T	A	483.32	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0334384;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.8734;QD=58.5846;RBI=0.092483;REFB=0;REVB=0.0862264;RO=0;SAF=20;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.82173e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00157843;OID=.;OPOS=5602438;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:13:20:0:0:13:20:0:0
chr11	5602605	.	G	A	231.26	PASS	AF=0.490196;AO=24;DP=50;FAO=25;FDP=51;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=19;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=-0.0242158;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.047;QD=18.1381;RBI=0.0242421;REFB=-0.0219072;REVB=-0.0011274;RO=25;SAF=6;SAR=18;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163288;STB=0.612806;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.0383481;OID=.;OPOS=5602605;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:51:25:26:24:25:0.490196:18:6:10:15:19:6:11:15
chr11	5602615	.	A	G	727.7	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0333;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.5011;QD=63.2782;RBI=0.0476175;REFB=0;REVB=-0.0340373;RO=0;SAF=16;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.31553e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.96466e-06;OID=.;OPOS=5602615;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:30:16:0:0:30:16:0:0
chr11	5602679	.	T	C	619.28	PASS	AF=1;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0282878;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.761;QD=61.9282;RBI=0.0364992;REFB=0;REVB=-0.0230649;RO=0;SAF=20;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00324207;OID=.;OPOS=5602679;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:40:0:0:40:40:1:20:20:0:0:20:20:0:0
chr11	5602790	.	A	G	1227.5	PASS	AF=1;AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00767175;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.051;QD=61.3751;RBI=0.0107881;REFB=0;REVB=-0.00758464;RO=0;SAF=46;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.3274e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.44058e-07;OID=.;OPOS=5602790;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:80:80:0:0:80:80:1:34:46:0:0:34:46:0:0
chr11	5602928	.	G	C	1333.61	PASS	AF=1;AO=76;DP=80;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0283426;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.995;QD=59.9376;RBI=0.0370921;REFB=0;REVB=0.0239274;RO=4;SAF=38;SAR=38;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0236196;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000517277;OID=.;OPOS=5602928;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:80:89:4:0:76:89:1:38:38:3:1:41:48:0:0
chr11	5602968	.	G	A	1404.78	PASS	AF=1;AO=87;DP=88;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000467621;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.438;QD=62.4347;RBI=0.0258217;REFB=0;REVB=0.0258175;RO=0;SAF=46;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000333926;OID=.;OPOS=5602968;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:88:90:0:0:87:90:1:41:46:0:0:43:47:0:0
chr11	5625784	.	A	G	155.5	PASS	AF=0.414634;AO=17;DP=41;FAO=17;FDP=41;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=-0.00592886;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=158.595;QD=15.1707;RBI=0.0146176;REFB=-0.0233825;REVB=-0.0133612;RO=24;SAF=12;SAR=5;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.300915;STB=0.674346;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=0.0415767;OID=.;OPOS=5625784;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:24:24:17:17:0.414634:5:12:10:14:5:12:10:14
chr11	5625847	.	A	G	450.03	PASS	AF=0.891892;AO=33;DP=37;FAO=33;FDP=37;FR=.;FRO=4;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.023175;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=240.509;QD=48.652;RBI=0.0236348;REFB=-0.039005;REVB=0.00463926;RO=3;SAF=13;SAR=20;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00987718;STB=0.516398;STBP=0.579;TYPE=snp;VARB=0.00129225;OID=.;OPOS=5625847;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:19:37:37:3:4:33:33:0.891892:20:13:1:2:20:13:1:3
chr11	5629607	.	G	A	458.42	PASS	AF=0.403101;AO=52;DP=129;FAO=52;FDP=129;FR=.;FRO=77;FSAF=19;FSAR=33;FSRF=29;FSRR=48;FWDB=0.00514294;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.011;QD=14.2147;RBI=0.010013;REFB=-0.00764004;REVB=0.00859124;RO=77;SAF=19;SAR=33;SRF=29;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0127639;STB=0.507202;STBP=0.902;TYPE=snp;VARB=0.0113838;OID=.;OPOS=5629607;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:129:129:77:77:52:52:0.403101:33:19:29:48:33:19:29:48
chr11	5632212	.	G	A	2855.46	PASS	AF=0.960396;AO=191;DP=199;FAO=194;FDP=202;FR=.;FRO=8;FSAF=98;FSAR=96;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.0101925;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=190.268;QD=56.5438;RBI=0.0179645;REFB=-0.11829;REVB=0.0147931;RO=8;SAF=97;SAR=94;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000600552;STB=0.500204;STBP=0.932;TYPE=snp;VARB=0.000467995;OID=.;OPOS=5632212;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:199:202:8:8:191:194:0.960396:94:97:4:4:96:98:4:4
chr11	5664831	.	C	A	803.49	PASS	AF=0.982759;AO=55;DP=56;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0329075;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.023;QD=55.4128;RBI=0.0346313;REFB=-0.197185;REVB=0.01079;RO=0;SAF=31;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5098;STBP=0.331;TYPE=snp;VARB=0.000865537;OID=.;OPOS=5664831;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:56:58:0:1:55:57:0.982759:24:31:0:0:25:32:0:1
chr11	5686870	.	T	A	319.73	PASS	AF=0.492754;AO=34;DP=69;FAO=34;FDP=69;FR=.;FRO=35;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=26;FWDB=-0.00578144;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.723;QD=18.5353;RBI=0.0143827;REFB=0.017346;REVB=-0.0131695;RO=35;SAF=21;SAR=13;SRF=9;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.319512;STB=0.67732;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=-0.016412;OID=.;OPOS=5686870;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:35:35:34:34:0.492754:13:21:9:26:13:21:9:26
chr11	5701281	.	G	A	490.1	PASS	AF=0.971429;AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00502429;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=268.765;QD=56.0119;RBI=0.0206034;REFB=-0.0464307;REVB=0.0199814;RO=1;SAF=17;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0267062;STB=0.514277;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=0.00299907;OID=.;OPOS=5701281;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:35:35:1:1:34:34:0.971429:17:17:1:0:17:17:1:0
chr11	5701409	.	G	C	88.22	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0460399;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.4905;QD=39.2067;RBI=0.0667576;REFB=0;REVB=-0.0483416;RO=0;SAF=3;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000156617;OID=.;OPOS=5701409;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:6:3:0:0:6:3:0:0
chr11	5717762	.	T	C	317.25	PASS	AF=0.515152;AO=33;DP=67;FAO=34;FDP=66;FR=.;FRO=32;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=21;FWDB=-0.00359753;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.023;QD=19.227;RBI=0.0284966;REFB=-0.0107586;REVB=0.0282686;RO=31;SAF=17;SAR=16;SRF=11;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139343;STB=0.589329;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=0.000307816;OID=.;OPOS=5717762;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:66:31:32:33:34:0.515152:16:17:11:20:16:18:11:21
chr11	5718517	.	G	A	577.11	PASS	AF=0.391813;AO=67;DP=171;FAO=67;FDP=171;FR=.;FRO=104;FSAF=45;FSAR=22;FSRF=60;FSRR=44;FWDB=0.00669836;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.4966;QD=13.4998;RBI=0.069087;REFB=0.00598457;REVB=-0.0687615;RO=104;SAF=45;SAR=22;SRF=60;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110437;STB=0.562481;STBP=0.213;TYPE=snp;VARB=-0.0105869;OID=.;OPOS=5718517;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:171:171:104:104:67:67:0.391813:22:45:60:44:22:45:60:44
chr11	5719719	.	A	G	261.99	PASS	AF=0.585366;AO=24;DP=41;FAO=24;FDP=41;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=-0.0168929;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.5237;QD=25.5603;RBI=0.0225558;REFB=-0.0119273;REVB=0.0149463;RO=17;SAF=9;SAR=15;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0290245;STB=0.516115;STBP=0.855;TYPE=snp;VARB=0.0107479;OID=.;OPOS=5719719;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:17:17:24:24:0.585366:15:9:7:10:15:9:7:10
chr11	5758062	.	T	C	1472.92	PASS	AF=0.969388;AO=95;DP=98;FAO=95;FDP=98;FR=.;FRO=3;FSAF=52;FSAR=43;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0644933;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.0059;QD=60.1192;RBI=0.0660542;REFB=-0.19479;REVB=-0.0142748;RO=3;SAF=52;SAR=43;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0265697;STB=0.514016;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=0.00324425;OID=.;OPOS=5758062;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:98:98:3:3:95:95:0.969388:43:52:3:0:43:52:3:0
chr11	5758118	.	A	C	1287.78	PASS	AF=1;AO=83;DP=84;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0294593;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.619;QD=62.0618;RBI=0.0318439;REFB=0;REVB=0.0120905;RO=0;SAF=44;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.03564e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00039901;OID=.;OPOS=5758118;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:83:0:0:83:83:1:39:44:0:0:39:44:0:0
chr11	5776287	.	C	T	2678.72	PASS	AF=0.983051;AO=174;DP=178;FAO=174;FDP=177;FR=.;FRO=3;FSAF=98;FSAR=76;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.00768107;FXX=0.0166657;HRUN=3;LEN=1;MLLD=193.289;QD=60.5361;RBI=0.0135377;REFB=-0.00242424;REVB=0.0111476;RO=3;SAF=98;SAR=76;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00752754;STB=0.503955;STBP=0.453;TYPE=snp;VARB=0.000257921;OID=.;OPOS=5776287;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:178:177:3:3:174:174:0.983051:76:98:1:2:76:98:1:2
chr11	5776470	.	T	G	610.0	PASS	AF=1;AO=40;DP=42;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0399163;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.6867;QD=59.5123;RBI=0.0444997;REFB=-0.0930068;REVB=0.01967;RO=0;SAF=19;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00963078;OID=.;OPOS=5776470;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:42:41:0:0:40:41:1:21:19:0:0:22:19:0:0
chr11	5776595	.	T	G	564.95	PASS	AF=0.854167;AO=41;DP=48;FAO=41;FDP=48;FR=.;FRO=7;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.0412377;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.0703;QD=47.0791;RBI=0.048726;REFB=-0.128346;REVB=0.0259553;RO=4;SAF=20;SAR=21;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0435723;STB=0.532979;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=0.0131198;OID=.;OPOS=5776595;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:48:48:4:7:41:41:0.854167:21:20:3:1:21:20:5:2
chr11	5776623	.	A	T	667.2	PASS	AF=0.956522;AO=44;DP=46;FAO=44;FDP=46;FR=.;FRO=2;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00405003;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.956;QD=58.0173;RBI=0.0250945;REFB=-0.0562171;REVB=0.0247655;RO=1;SAF=23;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0199884;STB=0.50099;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=0.00264715;OID=.;OPOS=5776623;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:46:46:1:2:44:44:0.956522:21:23:1:0:21:23:1:1
chr11	5799468	.	C	T	715.02	PASS	AF=0.978723;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.029685;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.95;QD=60.8526;RBI=0.0349358;REFB=-0.0629773;REVB=-0.0184204;RO=1;SAF=24;SAR=22;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0191868;STB=0.5102;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.00103083;OID=.;OPOS=5799468;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:47:47:1:1:46:46:0.978723:22:24:1:0:22:24:1:0
chr11	5809230	.	G	A	1841.5	PASS	AF=1;AO=118;DP=118;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00232139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.512;QD=61.3833;RBI=0.0131611;REFB=0;REVB=0.0129548;RO=0;SAF=54;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.81607e-06;OID=.;OPOS=5809230;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:118:120:0:0:118:120:1:64:54:0:0:66:54:0:0
chr11	5809308	.	A	T	797.6	PASS	AF=0.982759;AO=56;DP=58;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00441165;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.253;QD=55.007;RBI=0.0383048;REFB=-0.0715293;REVB=-0.0380499;RO=0;SAF=23;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507244;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.00322388;OID=.;OPOS=5809308;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:58:58:0:1:56:57:0.982759:33:23:0:0:34:23:0:1
chr11	5809548	.	G	A	1014.17	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0121724;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.58;QD=59.6568;RBI=0.0313975;REFB=0;REVB=0.0289419;RO=0;SAF=27;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.6787e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000237048;OID=.;OPOS=5809548;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:68:68:0:0:68:68:1:41:27:0:0:41:27:0:0
chr11	5809811	.	G	T	843.63	PASS	AF=1;AO=59;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.107939;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.0077;QD=56.2421;RBI=0.12206;REFB=-0.0226475;REVB=0.0569898;RO=0;SAF=35;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000655724;OID=.;OPOS=5809811;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:60:60:0:0:59:60:1:24:35:0:0:25:35:0:0
chr11	5809990	.	G	A	510.4	PASS	AF=0.923077;AO=37;DP=39;FAO=36;FDP=39;FR=.;FRO=3;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0791584;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.7966;QD=52.3488;RBI=0.0818676;REFB=-0.100738;REVB=0.0208866;RO=1;SAF=16;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0283678;STB=0.51964;STBP=0.456;TYPE=snp;VARB=0.0103873;OID=.;OPOS=5809990;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:39:39:1:3:37:36:0.923077:21:16:1:0:21:15:2:1
chr11	5862532	.	A	C	289.37	PASS	AF=1;AO=21;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0374376;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.366;QD=52.6132;RBI=0.0382184;REFB=0;REVB=0.00768582;RO=0;SAF=6;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000193218;OID=.;OPOS=5862532;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:21:22:1:15:6:0:0:16:6:0:0
chr11	5862653	.	T	C	649.88	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0114027;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.614;QD=61.8935;RBI=0.0125588;REFB=0;REVB=-0.00526335;RO=0;SAF=20;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.1164e-05;OID=.;OPOS=5862653;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:42:0:0:41:42:1:21:20:0:0:21:21:0:0
chr11	5862731	.	A	G	747.1	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00463306;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=228.638;QD=63.5829;RBI=0.0170556;REFB=0;REVB=-0.0164143;RO=0;SAF=25;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.39876e-05;OID=.;OPOS=5862731;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:22:25:0:0:22:25:0:0
chr11	5862780	.	T	C	616.68	PASS	AF=1;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0696614;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.4003;QD=61.6683;RBI=0.0872505;REFB=0;REVB=0.052535;RO=0;SAF=22;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.19993e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000350513;OID=.;OPOS=5862780;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:40:0:0:40:40:1:18:22:0:0:18:22:0:0
chr11	5862845	.	A	G	617.01	PASS	AF=1;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00782614;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.24;QD=61.7011;RBI=0.0137225;REFB=0;REVB=-0.011272;RO=0;SAF=29;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.97233e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.10295e-06;OID=.;OPOS=5862845;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:40:0:0:40:40:1:11:29:0:0:11:29:0:0
chr11	5862937	.	C	A	786.63	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.092631;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.436;QD=64.2144;RBI=0.0926681;REFB=0;REVB=-0.00262417;RO=0;SAF=27;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000285111;OID=.;OPOS=5862937;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:49:0:0:47:49:1:20:27:0:0:21:28:0:0
chr11	5862984	.	G	C	689.35	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0339641;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.398;QD=62.6682;RBI=0.0361531;REFB=0;REVB=-0.012389;RO=0;SAF=21;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.22401e-05;OID=.;OPOS=5862984;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:23:21:0:0:23:21:0:0
chr11	5863013	.	T	C	740.43	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.031344;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.966;QD=56.9558;RBI=0.0412801;REFB=0;REVB=0.0268626;RO=0;SAF=24;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00018484;OID=.;OPOS=5863013;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:28:24:0:0:28:24:0:0
chr11	5863113	.	G	A	1023.63	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0262289;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.144;QD=59.341;RBI=0.0270352;REFB=0;REVB=-0.00655325;RO=0;SAF=35;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00011178;OID=.;OPOS=5863113;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:34:35:0:0:34:35:0:0
chr11	5906048	.	G	A	651.22	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00171301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.0416;QD=62.0206;RBI=0.00651301;REFB=0;REVB=0.0062837;RO=0;SAF=24;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.29269e-05;OID=.;OPOS=5906048;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:18:24:0:0:18:24:0:0
chr11	5906073	.	G	T	557.11	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00278409;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=113.226;QD=60.2283;RBI=0.00432145;REFB=0;REVB=-0.00330512;RO=0;SAF=18;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.68991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.60833e-05;OID=.;OPOS=5906073;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:19:18:0:0:19:18:0:0
chr11	5906192	.	A	C	450.77	PASS	AF=1;AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0119908;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.331;QD=58.1638;RBI=0.031868;REFB=0;REVB=-0.0295261;RO=0;SAF=9;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.15349e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000106982;OID=.;OPOS=5906192;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:31:0:0:31:31:1:22:9:0:0:22:9:0:0
chr11	5906205	.	G	A	538.47	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0012987;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.692;QD=59.8294;RBI=0.0105102;REFB=0;REVB=0.0104297;RO=0;SAF=13;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.21415e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.43184e-05;OID=.;OPOS=5906205;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:23:13:0:0:23:13:0:0
chr11	5989293	.	G	A	650.38	PASS	AF=1;AO=41;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0168987;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.5952;QD=61.9411;RBI=0.0393415;REFB=0;REVB=0.0355273;RO=0;SAF=20;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000458094;OID=.;OPOS=5989293;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:41:42:1:21:20:0:0:22:20:0:0
chr11	5989415	.	C	T	868.76	PASS	AF=1;AO=59;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0187493;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=263;QD=57.9174;RBI=0.0918164;REFB=0;REVB=0.0898817;RO=0;SAF=27;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.96591e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000180368;OID=.;OPOS=5989415;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:59:60:1:32:27:0:0:33:27:0:0
chr11	6007272	.	A	G	517.83	PASS	AF=0.947368;AO=35;DP=37;FAO=36;FDP=38;FR=.;FRO=2;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00787644;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.528;QD=54.508;RBI=0.0079201;REFB=-0.111241;REVB=0.000830489;RO=2;SAF=19;SAR=16;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0549407;STB=0.527762;STBP=0.248;TYPE=snp;VARB=0.00166928;OID=.;OPOS=6007272;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:37:38:2:2:35:36:0.947368:16:19:0:2:17:19:0:2
chr11	6007613	.	T	G	803.82	PASS	AF=1;AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00153075;FXX=0.0175408;HRUN=4;LEN=1;MLLD=222.857;QD=57.416;RBI=0.0035843;REFB=0;REVB=0.00324099;RO=0;SAF=19;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.65905e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.83904e-06;OID=.;OPOS=6007613;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:57:56:0:0:56:56:1:37:19:0:0:37:19:0:0
chr11	6007680	.	A	G	736.21	PASS	AF=1;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0164136;FXX=0.041658;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.207;QD=64.0179;RBI=0.0242353;REFB=0;REVB=0.017831;RO=0;SAF=14;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000136867;OID=.;OPOS=6007680;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:46:0:0:46:46:1:32:14:0:0:32:14:0:0
chr11	6007743	.	A	G	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0107017;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.25;QD=55.0985;RBI=0.0210102;REFB=0;REVB=-0.0180804;RO=0;SAF=4;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.50493e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000163456;OID=.;OPOS=6007743;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:22:4:0:0:22:4:0:0
chr11	6129837	.	C	T	397.03	PASS	AF=1;AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0170812;FXX=0.0344709;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.7795;QD=56.719;RBI=0.0747739;REFB=0;REVB=0.0727968;RO=0;SAF=12;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00202116;OID=.;OPOS=6129837;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:28:0:0:28:28:1:16:12:0:0:16:12:0:0
chr11	6173364	.	T	A	453.75	PASS	AF=0.969697;AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=33;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.111212;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.5162;QD=54.9999;RBI=0.127602;REFB=-0.0170536;REVB=-0.0625642;RO=1;SAF=13;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0345573;STB=0.518507;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=-0.00302239;OID=.;OPOS=6173364;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:33:33:1:1:32:32:0.969697:19:13:1:0:19:13:1:0
chr11	6221169	.	A	G	1171.94	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0323812;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.404;QD=60.88;RBI=0.0323985;REFB=0;REVB=0.00105968;RO=0;SAF=42;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.43057e-05;OID=.;OPOS=6221169;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:35:42:0:0:35:42:0:0
chr11	6221214	.	T	A	444.17	PASS	AF=0.511628;AO=43;DP=84;FAO=44;FDP=86;FR=.;FRO=42;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=27;FSRR=15;FWDB=-0.0136702;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.7805;QD=20.659;RBI=0.0350131;REFB=-0.0292502;REVB=0.0322342;RO=41;SAF=17;SAR=26;SRF=26;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.209533;STB=0.613157;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.0193534;OID=.;OPOS=6221214;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:86:41:42:43:44:0.511628:26:17:26:15:26:18:27:15
chr11	6231731	.	C	T	131.27	PASS	AF=0.405405;AO=15;DP=37;FAO=15;FDP=37;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.00901609;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.301;QD=14.1918;RBI=0.0141825;REFB=-0.0109709;REVB=-0.0109478;RO=22;SAF=7;SAR=8;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0340922;STB=0.519829;STBP=0.82;TYPE=snp;VARB=0.0223056;OID=.;OPOS=6231731;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:22:22:15:15:0.405405:8:7:11:11:8:7:11:11
chr11	6243804	.	A	G	923.4	PASS	AF=0.984615;AO=64;DP=65;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0222529;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.149;QD=56.8247;RBI=0.0239005;REFB=-0.0895565;REVB=-0.00872036;RO=1;SAF=32;SAR=32;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0145314;STB=0.50769;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=0.0017441;OID=.;OPOS=6243804;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:65:65:1:1:64:64:0.984615:32:32:0:1:32:32:0:1
chr11	6291120	.	G	A	265.47	PASS	AF=0.615385;AO=24;DP=39;FAO=24;FDP=39;FR=.;FRO=15;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=0.0141041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.7556;QD=27.2272;RBI=0.0197742;REFB=-0.00775781;REVB=0.0138597;RO=15;SAF=13;SAR=11;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0883466;STB=0.548767;STBP=0.475;TYPE=snp;VARB=0.00357558;OID=.;OPOS=6291120;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:15:15:24:24:0.615385:11:13:10:5:11:13:10:5
chr11	6340525	.	A	T	147.01	PASS	AF=0.470588;AO=16;DP=34;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=0.0127101;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.429;QD=17.2955;RBI=0.01692;REFB=-0.0273984;REVB=-0.0111687;RO=18;SAF=4;SAR=12;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.352469;STB=0.702859;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.0117465;OID=.;OPOS=6340525;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:18:18:16:16:0.470588:12:4:11:7:12:4:11:7
chr11	6341684	.	C	G	54.75	PASS	AF=0.777778;AO=7;DP=9;FAO=7;FDP=9;FR=.;FRO=2;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0271404;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=64.6766;QD=24.334;RBI=0.0276045;REFB=-0.129096;REVB=-0.00504047;RO=2;SAF=2;SAR=5;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145918;STB=0.583115;STBP=0.62;TYPE=snp;VARB=0.0104536;OID=.;OPOS=6341684;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:9:9:2:2:7:7:0.777778:5:2:0:2:5:2:0:2
chr11	6411935	.	T	C	740.38	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0173771;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.01;QD=56.9525;RBI=0.0239628;REFB=0;REVB=0.0165001;RO=0;SAF=25;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000133608;OID=.;OPOS=6411935;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:27:25:0:0:27:25:0:0
chr11	6519642	.	G	A	230.24	PASS	AF=0.52381;AO=22;DP=43;FAO=22;FDP=42;FR=.;FRO=20;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.0111753;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.31;QD=21.9275;RBI=0.0194355;REFB=-0.00636762;REVB=-0.0159013;RO=21;SAF=11;SAR=11;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0206751;STB=0.523788;STBP=0.745;TYPE=snp;VARB=0.00370935;OID=.;OPOS=6519642;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:42:21:20:22:22:0.52381:11:11:11:10:11:11:11:9
chr11	6520015	.	G	T	269.37	PASS	AF=0.5;AO=29;DP=59;FAO=29;FDP=58;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=-0.00570065;FXX=0.0333278;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.496;QD=18.5772;RBI=0.00815928;REFB=0.000245881;REVB=-0.00583751;RO=28;SAF=12;SAR=17;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133592;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000504872;OID=.;OPOS=6520015;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:58:28:29:29:29:0.5:17:12:12:16:17:12:12:17
chr11	6520164	.	T	A	237.68	PASS	AF=0.490196;AO=25;DP=51;FAO=25;FDP=51;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=20;FSRF=8;FSRR=18;FWDB=-0.0439504;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.7553;QD=18.6417;RBI=0.0440904;REFB=-0.0127431;REVB=0.00351032;RO=26;SAF=5;SAR=20;SRF=8;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137156;STB=0.577711;STBP=0.358;TYPE=snp;VARB=0.0135774;OID=.;OPOS=6520164;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:26:26:25:25:0.490196:20:5:8:18:20:5:8:18
chr11	6530278	.	C	T	529.01	PASS	AF=0.536082;AO=49;DP=94;FAO=52;FDP=97;FR=.;FRO=45;FSAF=31;FSAR=21;FSRF=24;FSRR=21;FWDB=-0.00378398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.667;QD=21.8149;RBI=0.00791114;REFB=-0.0130819;REVB=0.00694749;RO=44;SAF=29;SAR=20;SRF=24;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0408216;STB=0.529903;STBP=0.558;TYPE=snp;VARB=0.0139522;OID=.;OPOS=6530278;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:97:44:45:49:52:0.536082:20:29:24:20:21:31:24:21
chr11	6532519	.	C	T	358.4	PASS	AF=0.452381;AO=38;DP=84;FAO=38;FDP=84;FR=.;FRO=46;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=21;FSRR=25;FWDB=-0.00484595;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.375;QD=17.0665;RBI=0.0125334;REFB=-0.0120979;REVB=-0.0115587;RO=45;SAF=17;SAR=21;SRF=21;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.018838;STB=0.505061;STBP=0.929;TYPE=snp;VARB=0.0165024;OID=.;OPOS=6532519;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:45:46:38:38:0.452381:21:17:21:24:21:17:21:25
chr11	6549779	.	A	C	268.76	PASS	AF=0.520833;AO=25;DP=48;FAO=25;FDP=48;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=0.0226572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.131;QD=22.3968;RBI=0.0234654;REFB=-0.00309929;REVB=-0.00610564;RO=22;SAF=12;SAR=13;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.059713;STB=0.54268;STBP=0.562;TYPE=snp;VARB=0.00276959;OID=.;OPOS=6549779;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:22:23:25:25:0.520833:13:12:9:13:13:12:9:14
chr11	6549995	.	A	G	83.9	PASS	AF=0.333333;AO=11;DP=33;FAO=11;FDP=33;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.0338947;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.542;QD=10.1694;RBI=0.0354084;REFB=-0.00381275;REVB=0.0102423;RO=22;SAF=5;SAR=6;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.0833e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00550658;OID=.;OPOS=6549995;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:33:33:22:22:11:11:0.333333:6:5:10:12:6:5:10:12
chr11	6550004	.	A	G	63.7	PASS	AF=0.321429;AO=9;DP=28;FAO=9;FDP=28;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=-0.0218585;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.475;QD=9.10006;RBI=0.0278355;REFB=-0.00141342;REVB=-0.0172343;RO=19;SAF=4;SAR=5;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0864553;STB=0.552731;STBP=0.752;TYPE=snp;VARB=0.00235736;OID=.;OPOS=6550004;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:28:28:19:19:9:9:0.321429:5:4:7:12:5:4:7:12
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chr11	6555365	.	A	G	393.2	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0374016;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.491;QD=56.1715;RBI=0.0470526;REFB=0;REVB=0.0285494;RO=0;SAF=10;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000667459;OID=.;OPOS=6555365;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:18:10:0:0:18:10:0:0
chr11	6567895	.	C	CTGCCCTACTGCA	284.8	PASS	AF=0.714286;AO=22;DP=35;FAO=25;FDP=35;FR=.;FRO=10;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=-0.02806;FXX=0;HRUN=1;LEN=12;MLLD=380.506;QD=32.548;RBI=0.0289348;REFB=-0.0079964;REVB=-0.00706143;RO=10;SAF=10;SAR=12;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0259305;STB=0.505716;STBP=0.951;TYPE=ins;VARB=0.00351331;OID=.;OPOS=6567896;OREF=-;OALT=TGCCCTACTGCA;OMAPALT=CTGCCCTACTGCA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.714286:22:35:25:35:10:13:12:5:5:72:10:10:12:5:5
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chr11	6579106	.	C	A	59.33	PASS	AF=0.533333;AO=8;DP=15;FAO=8;FDP=15;FR=.;FRO=7;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.122025;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=38.8449;QD=15.8223;RBI=0.14641;REFB=-0.0617948;REVB=-0.080905;RO=6;SAF=6;SAR=2;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0861157;STB=0.521684;STBP=0.953;TYPE=snp;VARB=0.0356587;OID=.;OPOS=6579106;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:15:15:6:7:8:8:0.533333:2:6:5:1:2:6:5:2
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chr11	6588228	.	G	A	453.51	PASS	AF=0.48913;AO=45;DP=92;FAO=45;FDP=92;FR=.;FRO=47;FSAF=16;FSAR=29;FSRF=24;FSRR=23;FWDB=0.000657672;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.333;QD=19.7176;RBI=0.0055929;REFB=0.0135759;REVB=-0.00555409;RO=47;SAF=16;SAR=29;SRF=24;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147899;STB=0.582292;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=-0.0158925;OID=.;OPOS=6588228;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:47:47:45:45:0.48913:29:16:24:23:29:16:24:23
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chr11	6626072	.	C	A	433.7	PASS	AF=0.505747;AO=43;DP=87;FAO=44;FDP=87;FR=.;FRO=43;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=-0.00394187;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.973;QD=19.9401;RBI=0.0045963;REFB=-0.00312675;REVB=0.00236382;RO=43;SAF=22;SAR=21;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0209562;STB=0.516981;STBP=0.768;TYPE=snp;VARB=0.00263617;OID=.;OPOS=6626072;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:43:43:43:44:0.505747:21:22:21:22:21:23:21:22
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chr11	6630028	.	TC	T	869.86	PASS	AF=1;AO=82;DP=99;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0632926;FXX=0.0605999;HRUN=5;LEN=1;MLLD=14.2309;QD=37.4134;RBI=0.0850622;REFB=0;REVB=-0.0568298;RO=6;SAF=42;SAR=40;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0.650794;SSSB=-0.0199203;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00215936;OID=.;OPOS=6630029;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:82:99:93:93:0:49:44:0:0:16:6:42:40:4:2
chr11	6630833	.	G	A	551.01	PASS	AF=0.504425;AO=56;DP=112;FAO=57;FDP=113;FR=.;FRO=56;FSAF=22;FSAR=35;FSRF=25;FSRR=31;FWDB=-0.0112095;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.885;QD=19.5049;RBI=0.0112883;REFB=-0.00747039;REVB=0.00133086;RO=55;SAF=22;SAR=34;SRF=24;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.040488;STB=0.531148;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.0106148;OID=.;OPOS=6630833;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:113:55:56:56:57:0.504425:34:22:24:31:35:22:25:31
chr11	6634149	.	C	T	1062.44	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000989242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.3;QD=59.8555;RBI=0.0152528;REFB=0;REVB=0.0152207;RO=0;SAF=36;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11607e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.27002e-05;OID=.;OPOS=6634149;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:35:36:0:0:35:36:0:0
chr11	6634189	.	G	A	277.57	PASS	AF=0.449275;AO=31;DP=69;FAO=31;FDP=69;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=-0.0267635;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.83;QD=16.091;RBI=0.0272943;REFB=-0.0074784;REVB=0.00535672;RO=37;SAF=15;SAR=16;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.080808;STB=0.537791;STBP=0.623;TYPE=snp;VARB=0.0186839;OID=.;OPOS=6634189;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:37:38:31:31:0.449275:16:15:21:16:16:15:21:17
chr11	6636106	.	T	A	176.09	PASS	AF=0.372881;AO=21;DP=58;FAO=22;FDP=59;FR=.;FRO=37;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=22;FWDB=-0.0225452;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.6554;QD=11.9385;RBI=0.0245567;REFB=-0.0131924;REVB=-0.00973362;RO=35;SAF=10;SAR=11;SRF=14;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0828679;STB=0.559269;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=0.0191904;OID=.;OPOS=6636106;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:59:35:37:21:22:0.372881:11:10:14:21:11:11:15:22
chr11	6638506	.	A	T	277.47	PASS	AF=0.395062;AO=31;DP=85;FAO=32;FDP=81;FR=.;FRO=49;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=28;FWDB=0.00218663;FXX=0.0470533;HRUN=2;LEN=1;MLLD=228.135;QD=13.7021;RBI=0.00499292;REFB=-0.0102398;REVB=0.00448864;RO=40;SAF=13;SAR=18;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0563365;STB=0.513913;STBP=0.836;TYPE=snp;VARB=0.0139627;OID=.;OPOS=6638506;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:81:40:49:31:32:0.395062:18:13:19:21:19:13:21:28
chr11	6648424	.	G	A	252.54	PASS	AF=0.5;AO=24;DP=48;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=7;FWDB=0.0090994;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.383;QD=21.0451;RBI=0.0217613;REFB=-0.00745347;REVB=0.0197675;RO=24;SAF=12;SAR=12;SRF=17;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186228;STB=0.604084;STBP=0.163;TYPE=snp;VARB=0.00915757;OID=.;OPOS=6648424;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:24:24:24:24:0.5:12:12:17:7:12:12:17:7
chr11	6648573	.	T	C	185.8	PASS	AF=0.487179;AO=19;DP=39;FAO=19;FDP=39;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=-0.054712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.29;QD=19.0559;RBI=0.0575947;REFB=-0.0196402;REVB=-0.0179929;RO=20;SAF=8;SAR=11;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.204864;STB=0.61588;STBP=0.184;TYPE=snp;VARB=0.00758344;OID=.;OPOS=6648573;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:20:20:19:19:0.487179:11:8:13:7:11:8:13:7
chr11	6652618	.	C	T	213.8	PASS	AF=0.512195;AO=21;DP=41;FAO=21;FDP=41;FR=.;FRO=20;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=0.0224364;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=204.83;QD=20.8585;RBI=0.0288031;REFB=-0.00702663;REVB=0.0180617;RO=20;SAF=14;SAR=7;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0632754;STB=0.53568;STBP=0.698;TYPE=snp;VARB=0.00632483;OID=.;OPOS=6652618;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:20:20:21:21:0.512195:7:14:12:8:7:14:12:8
chr11	6655433	.	G	A	249.73	PASS	AF=0.405405;AO=30;DP=74;FAO=30;FDP=74;FR=.;FRO=44;FSAF=21;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=28;FWDB=-0.0047526;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.45;QD=13.4988;RBI=0.00934793;REFB=-0.00259537;REVB=-0.00804963;RO=44;SAF=21;SAR=9;SRF=16;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.351182;STB=0.699867;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.00436784;OID=.;OPOS=6655433;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:44:44:30:30:0.405405:9:21:16:28:9:21:16:28
chr11	6662741	.	GCCCCCAG	GCCCCAG,GCCCCCAGCAG,GCCCCCAGC	180.14	PASS	AF=0,0.316456,0;AO=11,13,10;DP=84;FAO=0,25,0;FDP=79;FR=.;FRO=54;FSAF=0,18,0;FSAR=0,7,0;FSRF=30;FSRR=24;FWDB=-0.329784,-0.0277232,-0.0748835;FXX=0.0365809;HRUN=5,1,1;LEN=1,3,1;MLLD=10.3791,129.071,16.0623;QD=9.12116;RBI=0.37128,0.0335897,0.491529;REFB=-0.0324722,-0.0424715,-0.0685174;REVB=0.170562,0.0189655,-0.485791;RO=24;SAF=11,12,0;SAR=0,1,10;SRF=17;SRR=7;SSEN=0.341772,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.743113,0.429568,-0.81103;STB=0.5,0.624056,0.5;STBP=1,0.166,1;TYPE=del,ins,ins;VARB=0,0.102667,0;OID=.,.,.;OPOS=6662742,6662746,6662749;OREF=C,-,-;OALT=-,CAG,C;OMAPALT=GCCCCAG,GCCCCCAGCAG,GCCCCCAGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,0.316456,0:11,13,10:84:0,25,0:79:54:0,18,0:0,7,0:30:24:99:24:11,12,0:0,1,10:17:7
chr11	6735869	.	A	G	335.96	PASS	AF=0.514706;AO=35;DP=68;FAO=35;FDP=68;FR=.;FRO=33;FSAF=26;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=0.0343423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.499;QD=19.7623;RBI=0.0385424;REFB=0.0103809;REVB=-0.0174965;RO=33;SAF=26;SAR=9;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.277999;STB=0.655368;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=-0.00803481;OID=.;OPOS=6735869;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:33:33:35:35:0.514706:9:26:15:18:9:26:15:18
chr11	6736745	.	G	A	194.35	PASS	AF=0.59375;AO=19;DP=32;FAO=19;FDP=32;FR=.;FRO=13;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.0514362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.197;QD=24.2932;RBI=0.0532633;REFB=-0.0166034;REVB=-0.0138314;RO=13;SAF=10;SAR=9;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0470885;STB=0.526288;STBP=0.761;TYPE=snp;VARB=0.0172826;OID=.;OPOS=6736745;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:13:13:19:19:0.59375:9:10:6:7:9:10:6:7
chr11	6737138	.	T	C	197.78	PASS	AF=0.425926;AO=23;DP=54;FAO=23;FDP=54;FR=.;FRO=31;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.0122108;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=199.19;QD=14.6501;RBI=0.0133182;REFB=-0.00378135;REVB=-0.00531691;RO=31;SAF=15;SAR=8;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174729;STB=0.599911;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=0.00408383;OID=.;OPOS=6737138;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:31:31:23:23:0.425926:8:15:15:16:8:15:15:16
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chr11	6738291	.	C	T	340.42	PASS	AF=0.48;AO=36;DP=75;FAO=36;FDP=75;FR=.;FRO=39;FSAF=9;FSAR=27;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=0.00168474;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.6106;QD=18.156;RBI=0.0322121;REFB=-0.0152959;REVB=-0.032168;RO=38;SAF=9;SAR=27;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.236288;STB=0.641137;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.0212312;OID=.;OPOS=6738291;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:38:39:36:36:0.48:27:9:18:20:27:9:19:20
chr11	6738728	.	T	C	255.14	PASS	AF=0.521739;AO=24;DP=46;FAO=24;FDP=46;FR=.;FRO=22;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.00233348;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.3092;QD=22.1864;RBI=0.0604104;REFB=-0.0148084;REVB=-0.0603653;RO=22;SAF=17;SAR=7;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194607;STB=0.609466;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=0.00851928;OID=.;OPOS=6738728;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:22:22:24:24:0.521739:7:17:11:11:7:17:11:11
chr11	6738952	.	G	T	334.41	PASS	AF=0.507246;AO=35;DP=69;FAO=35;FDP=69;FR=.;FRO=34;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=-0.0525513;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.717;QD=19.3862;RBI=0.0548794;REFB=0.000817449;REVB=0.0158146;RO=34;SAF=14;SAR=21;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141814;STB=0.578902;STBP=0.204;TYPE=snp;VARB=-0.00118384;OID=.;OPOS=6738952;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:34:34:35:35:0.507246:21:14:19:15:21:14:19:15
chr11	6739109	.	G	A	274.52	PASS	AF=0.527273;AO=30;DP=55;FAO=29;FDP=55;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=-0.0788181;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.98;QD=19.9649;RBI=0.0790143;REFB=0.0357726;REVB=-0.00556381;RO=25;SAF=9;SAR=21;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128205;STB=0.559398;STBP=0.385;TYPE=snp;VARB=-0.035301;OID=.;OPOS=6739109;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:25:26:30:29:0.527273:21:9:11:14:20:9:11:15
chr11	6739407	.	A	G	291.39	PASS	AF=0.407407;AO=33;DP=81;FAO=33;FDP=81;FR=.;FRO=48;FSAF=23;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=26;FWDB=-0.0135608;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.4776;QD=14.3896;RBI=0.0151768;REFB=0.000661071;REVB=0.0068148;RO=48;SAF=23;SAR=10;SRF=22;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.259329;STB=0.647795;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=-0.00259963;OID=.;OPOS=6739407;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:48:48:33:33:0.407407:10:23:22:26:10:23:22:26
chr11	6739551	.	T	C	109.26	PASS	AF=0.419355;AO=13;DP=31;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.00219816;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=144.316;QD=14.0974;RBI=0.00723314;REFB=-0.0144239;REVB=-0.00689104;RO=18;SAF=7;SAR=6;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0171216;STB=0.509985;STBP=0.952;TYPE=snp;VARB=0.0256615;OID=.;OPOS=6739551;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:18:18:13:13:0.419355:6:7:10:8:6:7:10:8
chr11	6739809	.	C	T	104.77	PASS	AF=0.5;AO=12;DP=26;FAO=13;FDP=26;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.0425949;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=45.3838;QD=16.1191;RBI=0.0818159;REFB=0.0114527;REVB=-0.0698535;RO=13;SAF=6;SAR=6;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0345229;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0139135;OID=.;OPOS=6739809;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:26:13:13:12:13:0.5:6:6:7:6:6:7:7:6
chr11	6739814	.	C	T	334.02	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00871323;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.211;QD=53.4424;RBI=0.0501545;REFB=0;REVB=0.0493919;RO=0;SAF=13;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000818056;OID=.;OPOS=6739814;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:25:0:0:23:25:1:10:13:0:0:11:14:0:0
chr11	6739822	.	T	C	90.67	PASS	AF=0.458333;AO=11;DP=25;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.0386623;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.1107;QD=15.1123;RBI=0.0509907;REFB=-0.0186355;REVB=0.0332457;RO=13;SAF=6;SAR=5;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0777652;STB=0.545372;STBP=0.735;TYPE=snp;VARB=0.0257405;OID=.;OPOS=6739822;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:90:25:24:13:13:11:11:0.458333:5:6:6:7:5:6:6:7
chr11	6739841	.	G	A	137.4	PASS	AF=0.517241;AO=15;DP=29;FAO=15;FDP=29;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.0181679;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.8746;QD=18.9517;RBI=0.0608949;REFB=-0.0409376;REVB=-0.0581216;RO=13;SAF=7;SAR=8;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.058655;STB=0.550392;STBP=0.637;TYPE=snp;VARB=0.0368664;OID=.;OPOS=6739841;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:13:14:15:15:0.517241:8:7:7:6:8:7:8:6
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chr11	6740206	.	C	T	73.45	PASS	AF=0.294118;AO=10;DP=35;FAO=10;FDP=34;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=19;FSRR=5;FWDB=-0.00226022;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.127;QD=8.64136;RBI=0.00737749;REFB=-0.0179345;REVB=-0.00702273;RO=24;SAF=8;SAR=2;SRF=19;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0147162;STB=0.509072;STBP=0.986;TYPE=snp;VARB=0.0203429;OID=.;OPOS=6740206;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:35:34:24:24:10:10:0.294118:2:8:19:5:2:8:19:5
chr11	6740285	.	G	A	50.83	PASS	AF=0.205128;AO=8;DP=39;FAO=8;FDP=39;FR=.;FRO=31;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=-0.00333093;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=144.07;QD=5.213;RBI=0.0468433;REFB=-0.00182277;REVB=-0.0467248;RO=31;SAF=3;SAR=5;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170787;STB=0.61262;STBP=0.486;TYPE=snp;VARB=0.0406715;OID=.;OPOS=6740285;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:50:39:39:31:31:8:8:0.205128:5:3:16:15:5:3:16:15
chr11	6740308	.	C	T	359.37	PASS	AF=0.666667;AO=29;DP=44;FAO=30;FDP=45;FR=.;FRO=15;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.0105697;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.997;QD=31.9437;RBI=0.0208858;REFB=-0.0173608;REVB=0.0180138;RO=15;SAF=12;SAR=17;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0336593;STB=0.52292;STBP=0.693;TYPE=snp;VARB=0.00764772;OID=.;OPOS=6740308;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:45:15:15:29:30:0.666667:17:12:7:8:18:12:7:8
chr11	6740462	.	G	C	223.84	PASS	AF=0.478261;AO=22;DP=46;FAO=22;FDP=46;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=-0.032508;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.842;QD=19.4647;RBI=0.0348185;REFB=-0.014996;REVB=-0.0124725;RO=24;SAF=9;SAR=13;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0327725;STB=0.518502;STBP=0.81;TYPE=snp;VARB=0.0164619;OID=.;OPOS=6740462;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:24:24:22:22:0.478261:13:9:9:15:13:9:9:15
chr11	6790106	.	T	C	1255.26	PASS	AF=0.976471;AO=83;DP=85;FAO=83;FDP=85;FR=.;FRO=2;FSAF=38;FSAR=45;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00728745;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.7135;QD=59.071;RBI=0.0170856;REFB=-0.160086;REVB=0.0154535;RO=2;SAF=38;SAR=45;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0242725;STB=0.512817;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=-0.000123515;OID=.;OPOS=6790106;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:85:85:2:2:83:83:0.976471:45:38:2:0:45:38:2:0
chr11	6807163	.	C	T	265.74	PASS	AF=0.531915;AO=25;DP=48;FAO=25;FDP=47;FR=.;FRO=22;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=-0.00868869;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.527;QD=22.6161;RBI=0.0331538;REFB=-0.00396223;REVB=-0.0319951;RO=22;SAF=13;SAR=12;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0927583;STB=0.551741;STBP=0.477;TYPE=snp;VARB=0.00306988;OID=.;OPOS=6807163;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:47:22:22:25:25:0.531915:12:13:9:13:12:13:9:13
chr11	6807243	.	G	A	59.37	PASS	AF=0.5;AO=7;DP=14;FAO=8;FDP=16;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=0.0415581;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.047;QD=14.8434;RBI=0.0445532;REFB=0.00999829;REVB=-0.0160596;RO=7;SAF=3;SAR=4;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.260141;STB=0.687096;STBP=0.236;TYPE=snp;VARB=-0.0128251;OID=.;OPOS=6807243;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:14:16:7:8:7:8:0.5:4:3:1:6:4:4:1:7
chr11	6816778	.	A	G	57.32	PASS	AF=0.444444;AO=8;DP=18;FAO=8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.0404085;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.703;QD=12.7389;RBI=0.0413897;REFB=-0.0189918;REVB=-0.00895859;RO=10;SAF=5;SAR=3;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119124;STB=0.571247;STBP=0.584;TYPE=snp;VARB=0.0211039;OID=.;OPOS=6816778;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:18:18:10:10:8:8:0.444444:3:5:5:5:3:5:5:5
chr11	6891113	.	A	G	1522.57	PASS	AF=0.989691;AO=96;DP=99;FAO=96;FDP=97;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0643756;FXX=0.0202;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.9791;QD=62.7864;RBI=0.078632;REFB=0.00943246;REVB=0.0451529;RO=0;SAF=41;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504504;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.000975233;OID=.;OPOS=6891113;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:99:97:0:1:96:96:0.989691:55:41:0:0:55:41:0:1
chr11	6891528	.	C	G	660.38	PASS	AF=0.977273;AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00711197;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.4336;QD=60.0346;RBI=0.00782792;REFB=-0.108405;REVB=0.00327051;RO=0;SAF=25;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.65211e-08;STB=0.513507;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.00558579;OID=.;OPOS=6891528;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:44:44:0:1:43:43:0.977273:18:25:0:0:18:25:0:1
chr11	6891605	.	A	G	817.78	PASS	AF=1;AO=57;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0635844;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.7832;QD=56.3984;RBI=0.0835419;REFB=0;REVB=0.0541874;RO=0;SAF=25;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00254181;OID=.;OPOS=6891605;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:58:58:0:0:57:58:1:32:25:0:0:33:25:0:0
chr11	6891758	.	A	C	415.15	PASS	AF=1;AO=29;DP=30;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0193346;FXX=0.0333222;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.858;QD=57.2627;RBI=0.0215263;REFB=0;REVB=0.00946341;RO=0;SAF=13;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.60016e-05;OID=.;OPOS=6891758;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:29:0:0:29:29:1:16:13:0:0:16:13:0:0
chr11	6898758	.	A	C	271.37	PASS	AF=0.543478;AO=25;DP=46;FAO=25;FDP=46;FR=.;FRO=21;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=-0.0185334;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.9012;QD=23.597;RBI=0.0268365;REFB=0.00433722;REVB=0.019409;RO=21;SAF=14;SAR=11;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.089853;STB=0.549961;STBP=0.453;TYPE=snp;VARB=-0.00338394;OID=.;OPOS=6898758;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:21:21:25:25:0.543478:11:14:14:7:11:14:14:7
chr11	6913244	.	A	G	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0400154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.941;QD=56.1909;RBI=0.0447012;REFB=0;REVB=-0.019924;RO=0;SAF=17;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.31638e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000107743;OID=.;OPOS=6913244;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:11:17:0:0:11:17:0:0
chr11	6913290	.	A	G	76.7	PASS	AF=0.416667;AO=10;DP=24;FAO=10;FDP=24;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.00152326;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.5023;QD=12.7833;RBI=0.0144475;REFB=-0.0164275;REVB=0.0143669;RO=14;SAF=4;SAR=6;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0290505;STB=0.517207;STBP=0.915;TYPE=snp;VARB=0.0127553;OID=.;OPOS=6913290;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:24:24:14:14:10:10:0.416667:6:4:6:8:6:4:6:8
chr11	6942476	.	C	A	538.55	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0451282;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.2394;QD=59.8392;RBI=0.0559608;REFB=0;REVB=0.0330917;RO=0;SAF=20;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.9376e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00139159;OID=.;OPOS=6942476;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:16:20:0:0:16:20:0:0
chr11	6942726	.	G	C	819.01	PASS	AF=0.983051;AO=57;DP=58;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0609675;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=68.771;QD=55.526;RBI=0.071574;REFB=0.0791575;REVB=0.0374941;RO=1;SAF=20;SAR=37;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0125779;STB=0.506491;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=-0.00145727;OID=.;OPOS=6942726;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:58:59:1:1:57:58:0.983051:37:20:0:1:38:20:0:1
chr11	6953858	.	A	G	223.19	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00197232;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.0579;QD=49.5987;RBI=0.0318445;REFB=0;REVB=-0.0317834;RO=0;SAF=4;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00111256;OID=.;OPOS=6953858;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:14:4:0:0:14:4:0:0
chr11	6976988	.	A	T	419.19	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00145091;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.483;QD=55.8914;RBI=0.0964126;REFB=0;REVB=0.0964017;RO=0;SAF=22;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00146989;OID=.;OPOS=6976988;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:30:0:0:29:30:1:7:22:0:0:8:22:0:0
chr11	7022160	.	A	G	1162.35	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.016654;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.096;QD=60.3818;RBI=0.0509519;REFB=0;REVB=0.0481534;RO=0;SAF=33;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.47239e-05;OID=.;OPOS=7022160;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:77:0:0:72:77:1:39:33:0:0:44:33:0:0
chr11	7022531	.	A	T	798.23	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0236007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.006;QD=56.0158;RBI=0.0237152;REFB=0;REVB=-0.00232807;RO=0;SAF=35;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.67221e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000494457;OID=.;OPOS=7022531;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:57:0:0:55:57:1:20:35:0:0:21:36:0:0
chr11	7022717	.	T	C	821.11	PASS	AF=1;AO=56;DP=58;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0170528;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.278;QD=57.6215;RBI=0.0181162;REFB=0;REVB=0.00611548;RO=0;SAF=26;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.29784e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.75476e-06;OID=.;OPOS=7022717;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:57:0:0:56:57:1:30:26:0:0:30:27:0:0
chr11	7059960	.	A	C	754.02	PASS	AF=0.981818;AO=54;DP=55;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00569987;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.291;QD=54.8376;RBI=0.0253552;REFB=-0.0373016;REVB=-0.0247062;RO=1;SAF=29;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159744;STB=0.508471;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=-0.000123143;OID=.;OPOS=7059960;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:55:55:1:1:54:54:0.981818:25:29:1:0:25:29:1:0
chr11	7063755	.	C	T	1882.74	PASS	AF=1;AO=122;DP=122;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0050198;FXX=0.00812942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.52;QD=61.7293;RBI=0.00633245;REFB=0;REVB=-0.00386026;RO=0;SAF=67;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.30975e-06;OID=.;OPOS=7063755;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:122:122:0:0:122:122:1:55:67:0:0:55:67:0:0
chr11	7071031	.	G	A	1159.47	PASS	AF=0.975309;AO=75;DP=77;FAO=79;FDP=81;FR=.;FRO=2;FSAF=46;FSAR=33;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0842226;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.6693;QD=57.2576;RBI=0.0965207;REFB=-0.00819934;REVB=-0.0471466;RO=2;SAF=42;SAR=33;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0219966;STB=0.510636;STBP=0.233;TYPE=snp;VARB=0.00224318;OID=.;OPOS=7071031;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:77:81:2:2:75:79:0.975309:33:42:2:0:33:46:2:0
chr11	7079038	.	G	A	1957.21	PASS	AF=1;AO=125;DP=125;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0120661;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.294;QD=61.6445;RBI=0.0152343;REFB=0;REVB=-0.00930028;RO=0;SAF=54;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.48324e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000144685;OID=.;OPOS=7079038;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:125:127:0:0:125:127:1:71:54:0:0:73:54:0:0
chr11	7110363	.	G	A	716.88	PASS	AF=0.482993;AO=71;DP=147;FAO=71;FDP=147;FR=.;FRO=76;FSAF=46;FSAR=25;FSRF=53;FSRR=23;FWDB=-0.019437;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.212;QD=19.507;RBI=0.0219851;REFB=-0.0190895;REVB=-0.0102737;RO=76;SAF=46;SAR=25;SRF=53;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0516663;STB=0.528499;STBP=0.558;TYPE=snp;VARB=0.0201155;OID=.;OPOS=7110363;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:147:147:76:76:71:71:0.482993:25:46:53:23:25:46:53:23
chr11	7324475	.	T	C	727.46	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0857659;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.011;QD=63.2571;RBI=0.0861157;REFB=0;REVB=0.00775474;RO=0;SAF=14;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000216128;OID=.;OPOS=7324475;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:46:0:0:44:46:1:30:14:0:0:31:15:0:0
chr11	7439264	.	C	T	391.03	PASS	AF=0.549296;AO=39;DP=71;FAO=39;FDP=71;FR=.;FRO=32;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=11;FWDB=0.015466;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.1645;QD=22.03;RBI=0.0287994;REFB=-0.00245648;REVB=-0.0242942;RO=32;SAF=23;SAR=16;SRF=21;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0568506;STB=0.531305;STBP=0.566;TYPE=snp;VARB=0.00152379;OID=.;OPOS=7439264;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:32:32:39:39:0.549296:16:23:21:11:16:23:21:11
chr11	7441737	.	T	C	431.87	PASS	AF=0.422414;AO=49;DP=116;FAO=49;FDP=116;FR=.;FRO=67;FSAF=18;FSAR=31;FSRF=31;FSRR=36;FWDB=0.0240268;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.5372;QD=14.892;RBI=0.0240872;REFB=-0.0104239;REVB=-0.001704;RO=67;SAF=18;SAR=31;SRF=31;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101971;STB=0.557407;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=0.0137752;OID=.;OPOS=7441737;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:116:116:67:67:49:49:0.422414:31:18:31:36:31:18:31:36
chr11	7488872	.	C	T	1818.1	PASS	AF=0.99187;AO=120;DP=123;FAO=122;FDP=123;FR=.;FRO=1;FSAF=56;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00452418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.4308;QD=59.1252;RBI=0.0332619;REFB=-0.0422962;REVB=0.0329528;RO=2;SAF=56;SAR=64;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0146113;STB=0.503759;STBP=0.485;TYPE=snp;VARB=0.000921507;OID=.;OPOS=7488872;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:123:123:2:1:120:122:0.99187:64:56:0:2:66:56:0:1
chr11	7488927	.	A	C	2011.41	PASS	AF=0.992366;AO=130;DP=131;FAO=130;FDP=131;FR=.;FRO=1;FSAF=67;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.053707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.7761;QD=61.417;RBI=0.0840333;REFB=-0.0685621;REVB=0.0646309;RO=1;SAF=67;SAR=63;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00748422;STB=0.503936;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=0.000452418;OID=.;OPOS=7488927;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:131:131:1:1:130:130:0.992366:63:67:0:1:63:67:0:1
chr11	7489819	.	A	C	619.95	PASS	AF=0.97619;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0441747;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=83.7217;QD=59.0425;RBI=0.0473206;REFB=-0.133701;REVB=0.0169659;RO=0;SAF=24;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.2194e-08;STB=0.514279;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.0028255;OID=.;OPOS=7489819;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:42:42:0:1:41:41:0.97619:17:24:0:0:17:24:0:1
chr11	7509566	.	A	T	124.88	PASS	AF=0.5;AO=14;DP=28;FAO=14;FDP=28;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.0140951;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.827;QD=17.8398;RBI=0.0364077;REFB=-0.0300946;REVB=0.0335685;RO=14;SAF=4;SAR=10;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.204512;STB=0.6178;STBP=0.238;TYPE=snp;VARB=0.0303308;OID=.;OPOS=7509566;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:28:14:14:14:14:0.5:10:4:7:7:10:4:7:7
chr11	7509682	.	G	A	32.4	PASS	AF=0.625;AO=5;DP=8;FAO=5;FDP=8;FR=.;FRO=3;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.00956704;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=61.3424;QD=16.1989;RBI=0.0653829;REFB=0.0562938;REVB=-0.0646791;RO=3;SAF=1;SAR=4;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.335094;STB=0.704971;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=-0.0425934;OID=.;OPOS=7509682;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:8:8:3:3:5:5:0.625:4:1:2:1:4:1:2:1
chr11	7619518	.	T	C	1950.85	PASS	AF=1;AO=126;DP=126;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00543799;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.09;QD=61.9319;RBI=0.0169834;REFB=0;REVB=0.0160892;RO=0;SAF=47;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.25967e-06;OID=.;OPOS=7619518;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:126:126:0:0:126:126:1:79:47:0:0:79:47:0:0
chr11	7670440	.	A	G	1523.6	PASS	AF=0.990385;AO=103;DP=103;FAO=103;FDP=104;FR=.;FRO=1;FSAF=60;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0159127;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.631;QD=58.5998;RBI=0.016254;REFB=-0.0960664;REVB=0.00331348;RO=0;SAF=60;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504131;STBP=0.471;TYPE=snp;VARB=0.00326977;OID=.;OPOS=7670440;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:103:104:0:1:103:103:0.990385:43:60:0:0:43:60:1:0
chr11	7673015	.	G	A	605.32	PASS	AF=0.56;AO=54;DP=98;FAO=56;FDP=100;FR=.;FRO=44;FSAF=32;FSAR=24;FSRF=17;FSRR=27;FWDB=0.00654267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=309.407;QD=24.2129;RBI=0.006543;REFB=-0.0115918;REVB=6.48885e-05;RO=43;SAF=30;SAR=24;SRF=16;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147583;STB=0.581168;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=0.00825133;OID=.;OPOS=7673015;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:100:43:44:54:56:0.56:24:30:16:27:24:32:17:27
chr11	7686602	.	G	GTGTT	334.22	PASS	AF=0.961538;AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0261575;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=4;MLLD=292.501;QD=51.4185;RBI=0.0284086;REFB=0.0164857;REVB=-0.0110831;RO=1;SAF=11;SAR=14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0403161;STB=0.521722;STBP=0.312;TYPE=ins;VARB=-0.000778545;OID=.;OPOS=7686603;OREF=-;OALT=TGTT;OMAPALT=GTGTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.961538:25:26:25:26:1:11:14:1:0:6:1:11:14:1:0
chr11	7686674	.	T	C	959.04	PASS	AF=1;AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00241992;FXX=0.0151492;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.4661;QD=59.0176;RBI=0.0113338;REFB=0;REVB=-0.0110725;RO=0;SAF=26;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.10038e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00117175;OID=.;OPOS=7686674;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:65:0:0:65:65:1:39:26:0:0:39:26:0:0
chr11	7687146	.	G	A	754.36	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0208248;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=186.224;QD=56.9327;RBI=0.0209593;REFB=0;REVB=0.00237114;RO=0;SAF=27;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.37485e-05;OID=.;OPOS=7687146;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:26:27:0:0:26:27:0:0
chr11	7687715	.	T	C	1495.03	PASS	AF=1;AO=94;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000716205;FXX=0.0105252;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.913;QD=63.6184;RBI=0.0259697;REFB=0;REVB=0.0259598;RO=0;SAF=42;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.04383e-05;OID=.;OPOS=7687715;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:94:94:0:0:94:94:1:52:42:0:0:52:42:0:0
chr11	7695569	.	A	G	133.92	PASS	AF=0.416667;AO=15;DP=37;FAO=15;FDP=36;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=16;FSRR=5;FWDB=-0.00666427;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.7033;QD=14.8801;RBI=0.0348231;REFB=-0.0162748;REVB=-0.0341794;RO=21;SAF=11;SAR=4;SRF=16;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.037545;STB=0.521711;STBP=0.863;TYPE=snp;VARB=0.0104131;OID=.;OPOS=7695569;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:36:21:21:15:15:0.416667:4:11:16:5:4:11:16:5
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chr11	7717219	.	A	T	182.82	PASS	AF=0.941176;AO=16;DP=17;FAO=16;FDP=17;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00921174;FXX=0;HRUN=25;LEN=1;MLLD=303.179;QD=43.0161;RBI=0.101166;REFB=-0.00235327;REVB=0.100746;RO=1;SAF=15;SAR=1;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0295327;STB=0.516109;STBP=0.64;TYPE=snp;VARB=0.000277737;OID=.;OPOS=7717219;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:17:17:1:1:16:16:0.941176:1:15:1:0:1:15:1:0
chr11	7721870	.	G	A	2484.62	PASS	AF=0.982456;AO=165;DP=171;FAO=168;FDP=171;FR=.;FRO=3;FSAF=86;FSAR=82;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0591875;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.2993;QD=58.1197;RBI=0.0897723;REFB=-0.211744;REVB=0.0674974;RO=3;SAF=85;SAR=80;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00618139;STB=0.502717;STBP=0.737;TYPE=snp;VARB=0.00622051;OID=.;OPOS=7721870;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:171:171:3:3:165:168:0.982456:80:85:1:2:82:86:2:1
chr11	7721974	.	C	T	551.55	PASS	AF=0.402685;AO=59;DP=148;FAO=60;FDP=149;FR=.;FRO=89;FSAF=27;FSAR=33;FSRF=35;FSRR=54;FWDB=0.00509185;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.331;QD=14.8068;RBI=0.00545827;REFB=-0.0116628;REVB=-0.00196616;RO=88;SAF=27;SAR=32;SRF=35;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.064568;STB=0.53446;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.0176992;OID=.;OPOS=7721974;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:148:149:88:89:59:60:0.402685:32:27:35:53:33:27:35:54
chr11	7727872	.	T	C	430.66	PASS	AF=0.5;AO=43;DP=86;FAO=43;FDP=86;FR=.;FRO=43;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=0.000659745;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.337;QD=20.0307;RBI=0.0127122;REFB=-0.00917498;REVB=-0.012695;RO=43;SAF=26;SAR=17;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106745;STB=0.559266;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.00944348;OID=.;OPOS=7727872;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:43:43:43:43:0.5:17:26:21:22:17:26:21:22
chr11	7749695	.	C	T	416.12	PASS	AF=0.446602;AO=46;DP=103;FAO=46;FDP=103;FR=.;FRO=57;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=35;FSRR=22;FWDB=-0.0230663;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.131;QD=16.1598;RBI=0.023963;REFB=-0.00490644;REVB=-0.00649414;RO=57;SAF=23;SAR=23;SRF=35;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11294;STB=0.56308;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=0.0050336;OID=.;OPOS=7749695;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:103:57:57:46:46:0.446602:23:23:35:22:23:23:35:22
chr11	7750622	.	T	C	469.18	PASS	AF=0.463636;AO=51;DP=110;FAO=51;FDP=110;FR=.;FRO=59;FSAF=24;FSAR=27;FSRF=42;FSRR=17;FWDB=0.00365792;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.591;QD=17.0609;RBI=0.00695952;REFB=-0.0145503;REVB=0.00592068;RO=59;SAF=24;SAR=27;SRF=42;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.230848;STB=0.627859;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.0226558;OID=.;OPOS=7750622;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:110:59:59:51:51:0.463636:27:24:42:17:27:24:42:17
chr11	7817538	.	T	C	262.98	PASS	AF=0.954545;AO=21;DP=22;FAO=21;FDP=22;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0188781;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=254.822;QD=47.8153;RBI=0.0233954;REFB=-0.0279288;REVB=0.0138189;RO=1;SAF=10;SAR=11;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0439301;STB=0.523787;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.000428759;OID=.;OPOS=7817538;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:22:22:1:1:21:21:0.954545:11:10:1:0:11:10:1:0
chr11	7817665	.	T	C	501.37	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0400979;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.336;QD=58.9842;RBI=0.0402971;REFB=0;REVB=0.00400142;RO=0;SAF=16;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000397047;OID=.;OPOS=7817665;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:18:16:0:0:18:16:0:0
chr11	7817852	.	C	G	433.0	PASS	AF=1;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00731215;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.306;QD=57.7328;RBI=0.0185208;REFB=0;REVB=0.0170163;RO=0;SAF=16;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.56309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.66215e-05;OID=.;OPOS=7817852;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:30:0:0:30:30:1:14:16:0:0:14:16:0:0
chr11	7817856	.	C	T	447.03	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00832619;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.54;QD=57.6806;RBI=0.0142985;REFB=0;REVB=0.0116242;RO=0;SAF=16;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000108616;OID=.;OPOS=7817856;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:15:16:0:0:15:16:0:0
chr11	7817959	.	G	A	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0170819;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.1795;QD=40.7623;RBI=0.0596828;REFB=0;REVB=-0.057186;RO=0;SAF=5;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0011338;OID=.;OPOS=7817959;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:5:5:0:0:5:5:0:0
chr11	7818056	.	T	C	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0349722;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.333;QD=33.4285;RBI=0.0503123;REFB=0;REVB=0.0361701;RO=0;SAF=3;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.82894e-05;OID=.;OPOS=7818056;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:3:3:0:0:3:3:0:0
chr11	7818151	.	G	A	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00842104;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=261.385;QD=48.7373;RBI=0.0288281;REFB=0;REVB=0.0275708;RO=0;SAF=10;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000115832;OID=.;OPOS=7818151;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:7:10:0:0:7:10:0:0
chr11	7818190	.	C	T	323.47	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0176926;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.799;QD=53.9108;RBI=0.0229046;REFB=0;REVB=-0.0145463;RO=0;SAF=15;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000247473;OID=.;OPOS=7818190;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:9:15:0:0:9:15:0:0
chr11	7818313	.	C	T	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.039837;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.21;QD=52.6128;RBI=0.0638517;REFB=0;REVB=0.0499004;RO=0;SAF=11;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000495819;OID=.;OPOS=7818313;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:11:11:0:0:11:11:0:0
chr11	7818383	.	G	GATATGGTTACCAGGTAGATGC	35.09	PASS	AF=0.625;AO=4;DP=9;FAO=5;FDP=8;FR=.;FRO=3;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0191562;FXX=0.110988;HRUN=1;LEN=21;MLLD=665.533;QD=17.5431;RBI=0.0255998;REFB=-0.0168207;REVB=0.0169821;RO=3;SAF=3;SAR=1;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.490704;STB=0.713517;STBP=0.175;TYPE=ins;VARB=0.00951052;OID=.;OPOS=7818384;OREF=-;OALT=ATATGGTTACCAGGTAGATGC;OMAPALT=GATATGGTTACCAGGTAGATGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.625:4:9:5:8:3:3:2:0:3:17:3:3:1:0:3
chr11	7818518	.	C	T	88.22	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0211439;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=169.866;QD=39.2068;RBI=0.0218611;REFB=0;REVB=0.00555379;RO=0;SAF=7;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000210958;OID=.;OPOS=7818518;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:2:7:0:0:2:7:0:0
chr11	7870670	.	A	G	426.49	PASS	AF=0.451923;AO=47;DP=104;FAO=47;FDP=104;FR=.;FRO=57;FSAF=30;FSAR=17;FSRF=27;FSRR=30;FWDB=-0.00752584;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.709;QD=16.4033;RBI=0.0258997;REFB=-0.00711851;REVB=-0.0247822;RO=55;SAF=30;SAR=17;SRF=26;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164161;STB=0.592646;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=0.00595435;OID=.;OPOS=7870670;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:104:55:57:47:47:0.451923:17:30:26:29:17:30:27:30
chr11	7870760	.	G	A	342.14	PASS	AF=0.486486;AO=34;DP=73;FAO=36;FDP=74;FR=.;FRO=38;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=23;FWDB=-0.0104316;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.38;QD=18.4942;RBI=0.0119636;REFB=-0.00515173;REVB=0.00585743;RO=38;SAF=20;SAR=14;SRF=15;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18159;STB=0.611049;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=0.00540479;OID=.;OPOS=7870760;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:74:38:38:34:36:0.486486:14:20:15:23:14:22:15:23
chr11	7871011	.	A	G	440.12	PASS	AF=0.429825;AO=49;DP=114;FAO=49;FDP=114;FR=.;FRO=65;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=26;FSRR=39;FWDB=0.015422;FXX=0.0338954;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.9044;QD=15.4428;RBI=0.015481;REFB=-0.0102;REVB=-0.0013507;RO=58;SAF=27;SAR=22;SRF=25;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116285;STB=0.585461;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=0.0250235;OID=.;OPOS=7871011;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:114:114:58:65:49:49:0.429825:22:27:25:33:22:27:26:39
chr11	7910768	.	T	C	109.93	PASS	AF=0.433333;AO=13;DP=30;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=-0.00333127;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.658;QD=14.6578;RBI=0.0116507;REFB=0.00117442;REVB=0.0111643;RO=17;SAF=9;SAR=4;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0503595;STB=0.529366;STBP=0.817;TYPE=snp;VARB=-0.00154327;OID=.;OPOS=7910768;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:17:17:13:13:0.433333:4:9:11:6:4:9:11:6
chr11	7949350	.	A	G	1916.04	PASS	AF=1;AO=124;DP=124;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00175113;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.653;QD=61.3134;RBI=0.00786107;REFB=0;REVB=-0.00766355;RO=0;SAF=64;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.47389e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.12272e-05;OID=.;OPOS=7949350;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:124:125:0:0:124:125:1:60:64:0:0:61:64:0:0
chr11	7949791	.	A	C	305.04	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0556767;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=45.6637;QD=53.0507;RBI=0.0670215;REFB=0;REVB=0.0373093;RO=0;SAF=6;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.9951e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0027372;OID=.;OPOS=7949791;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:17:6:0:0:17:6:0:0
chr11	7949860	.	G	A	375.67	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0322826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.441;QD=55.6546;RBI=0.0324553;REFB=0;REVB=-0.00334356;RO=0;SAF=10;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000125227;OID=.;OPOS=7949860;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:17:10:0:0:17:10:0:0
chr11	8014479	.	C	T	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00809921;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.28;QD=43.4859;RBI=0.0152839;REFB=0;REVB=0.0129615;RO=0;SAF=10;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00037971;OID=.;OPOS=8014479;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:2:10:0:0:2:10:0:0
chr11	8159892	.	G	T	1695.12	PASS	AF=1;AO=112;DP=112;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0251414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.358;QD=60.5401;RBI=0.0282942;REFB=0;REVB=-0.0129797;RO=0;SAF=68;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.18298e-05;OID=.;OPOS=8159892;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:112:112:0:0:112:112:1:44:68:0:0:44:68:0:0
chr11	8174966	.	G	A,T	768.89	PASS	AF=0.938776,0.0612245;AO=46,3;DP=49;FAO=46,3;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=23,0;FSAR=23,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0119349,0.0033604;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=122.159,78.6361;QD=62.7664;RBI=0.0144559,0.00360785;REFB=0,0;REVB=-0.00815677,-0.00131313;RO=0;SAF=23,0;SAR=23,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00406515,0.0586012;OID=.,.;OPOS=8174966,8174966;OREF=G,G;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:7:49:49:0:0:46,3:46,3:0.938776,0.0612245:23,3:23,0:0:0:23,3:23,0:0:0
chr11	8284860	.	G	T	261.65	PASS	AF=0.537037;AO=29;DP=55;FAO=29;FDP=54;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=7;FWDB=-0.0110615;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.004;QD=19.3811;RBI=0.0433716;REFB=-0.0385806;REVB=0.0419374;RO=23;SAF=13;SAR=16;SRF=16;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195469;STB=0.623817;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.0243302;OID=.;OPOS=8284860;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:54:23:25:29:29:0.537037:16:13:16:7:16:13:18:7
chr11	8486310	.	C	A	380.73	PASS	AF=0.470588;AO=38;DP=84;FAO=40;FDP=85;FR=.;FRO=45;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=35;FSRR=10;FWDB=-0.0204167;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.946;QD=17.9165;RBI=0.0315042;REFB=-0.0283395;REVB=0.0239931;RO=45;SAF=18;SAR=20;SRF=35;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.29287;STB=0.658082;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.0498249;OID=.;OPOS=8486310;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:85:45:45:38:40:0.470588:20:18:35:10:21:19:35:10
chr11	8646441	.	GGC	G,GG	65.85	PASS	AF=0.178571,0.142857;AO=10,9;DP=55;FAO=10,8;FDP=56;FR=.;FRO=38;FSAF=2,4;FSAR=8,4;FSRF=22;FSRR=16;FWDB=-0.056449,-0.00456335;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=2,1;MLLD=21.2308,11.8351;QD=4.70386;RBI=0.0686381,0.0689463;REFB=-0.0707101,-0.122949;REVB=-0.0390473,-0.0687951;RO=32;SAF=6,2;SAR=4,7;SRF=20;SRR=12;SSEN=0.286088,0;SSEP=0,0.428571;SSSB=-0.0315568,-0.471283;STB=0.7994,0.565057;STBP=0.055,0.717;TYPE=del,del;VARB=0.163258,0.193986;OID=.,.;OPOS=8646442,8646443;OREF=GC,C;OALT=-,-;OMAPALT=G,GG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.178571,0.142857:10,9:55:10,8:56:38:2,4:8,4:22:16:26:32:6,2:4,7:20:12
chr11	8646670	.	T	G	201.91	PASS	AF=0.373134;AO=25;DP=67;FAO=25;FDP=67;FR=.;FRO=42;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=28;FWDB=0.00902275;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.7895;QD=12.0544;RBI=0.0716707;REFB=-0.00582514;REVB=-0.0711005;RO=42;SAF=15;SAR=10;SRF=14;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.283788;STB=0.662666;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.00802799;OID=.;OPOS=8646670;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:42:42:25:25:0.373134:10:15:14:28:10:15:14:28
chr11	8646763	.	G	C	56.28	PASS	AF=0.4;AO=8;DP=20;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=-0.0278854;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.567;QD=11.2569;RBI=0.031137;REFB=-0.0134339;REVB=0.0138535;RO=12;SAF=2;SAR=6;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102563;STB=0.562336;STBP=0.718;TYPE=snp;VARB=0.0335725;OID=.;OPOS=8646763;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:20:20:12:12:8:8:0.4:6:2:4:8:6:2:4:8
chr11	8693405	.	G	A	406.91	PASS	AF=0.506173;AO=41;DP=81;FAO=41;FDP=81;FR=.;FRO=40;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=26;FSRR=14;FWDB=0.00509872;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.078;QD=20.0945;RBI=0.00844099;REFB=-0.00227713;REVB=-0.00672706;RO=40;SAF=19;SAR=22;SRF=26;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165084;STB=0.591354;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=0.00269869;OID=.;OPOS=8693405;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:40:40:41:41:0.506173:22:19:26:14:22:19:26:14
chr11	8693575	.	C	T	115.02	PASS	AF=0.52;AO=13;DP=24;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=0.083489;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=135.016;QD=18.4024;RBI=0.0840546;REFB=0.00511472;REVB=0.00973469;RO=11;SAF=4;SAR=9;SRF=2;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126109;STB=0.584496;STBP=0.492;TYPE=snp;VARB=-0.00517147;OID=.;OPOS=8693575;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:93:24:25:11:12:13:13:0.52:9:4:2:9:9:4:2:10
chr11	8706406	.	T	G	443.37	PASS	AF=0.5;AO=44;DP=88;FAO=44;FDP=88;FR=.;FRO=44;FSAF=17;FSAR=27;FSRF=26;FSRR=18;FWDB=0.0127492;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.734;QD=20.1529;RBI=0.0134583;REFB=0.00608018;REVB=-0.00431082;RO=43;SAF=17;SAR=27;SRF=25;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175214;STB=0.602757;STBP=0.06;TYPE=snp;VARB=-0.00531006;OID=.;OPOS=8706406;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:43:44:44:44:0.5:27:17:25:18:27:17:26:18
chr11	8751640	.	G	C	323.32	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0714766;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.6921;QD=53.8869;RBI=0.0828031;REFB=0;REVB=0.0418026;RO=0;SAF=15;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00293031;OID=.;OPOS=8751640;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:9:15:0:0:9:15:0:0
chr11	8797709	.	A	G	70.19	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0698583;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.5975;QD=35.0965;RBI=0.0709984;REFB=0;REVB=0.0126721;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0201485;OID=.;OPOS=8797709;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:8:0:0:7:8:1:3:4:0:0:3:5:0:0
chr11	8797711	.	A	G	108.99	PASS	AF=0.916667;AO=11;DP=12;FAO=11;FDP=12;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0864678;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.3765;QD=36.331;RBI=0.169259;REFB=-0.0346935;REVB=0.145506;RO=1;SAF=8;SAR=3;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.052924;STB=0.52936;STBP=0.664;TYPE=snp;VARB=0.0170435;OID=.;OPOS=8797711;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:12:12:1:1:11:11:0.916667:3:8:1:0:3:8:1:0
chr11	8866808	.	C	G	613.36	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0441817;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.5376;QD=61.336;RBI=0.0501632;REFB=0;REVB=0.0237555;RO=0;SAF=16;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000793288;OID=.;OPOS=8866808;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:24:16:0:0:24:16:0:0
chr11	8938934	.	C	T	328.66	PASS	AF=0.479452;AO=35;DP=73;FAO=35;FDP=73;FR=.;FRO=38;FSAF=12;FSAR=23;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=0.0208431;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.907;QD=18.0086;RBI=0.0215512;REFB=-0.0219328;REVB=0.00547887;RO=38;SAF=12;SAR=23;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177292;STB=0.59929;STBP=0.131;TYPE=snp;VARB=0.023363;OID=.;OPOS=8938934;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:38:38:35:35:0.479452:23:12:20:18:23:12:20:18
chr11	8942942	.	C	T	597.35	PASS	AF=0.556604;AO=59;DP=106;FAO=59;FDP=106;FR=.;FRO=47;FSAF=33;FSAR=26;FSRF=27;FSRR=20;FWDB=0.000318893;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=263.798;QD=22.5415;RBI=0.0037643;REFB=0.0010284;REVB=-0.00375076;RO=47;SAF=33;SAR=26;SRF=27;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0124584;STB=0.50682;STBP=0.873;TYPE=snp;VARB=-0.000754226;OID=.;OPOS=8942942;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:106:47:47:59:59:0.556604:26:33:27:20:26:33:27:20
chr11	8942999	.	G	A	1557.02	PASS	AF=1;AO=102;DP=102;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.015641;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.722;QD=59.8855;RBI=0.0217141;REFB=0;REVB=0.0150619;RO=0;SAF=57;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.08171e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.75823e-05;OID=.;OPOS=8942999;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:102:104:0:0:102:104:1:45:57:0:0:45:59:0:0
chr11	8947021	.	A	G	412.17	PASS	AF=1;AO=22;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.188298;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.2756;QD=56.8512;RBI=0.190169;REFB=0;REVB=-0.0266109;RO=0;SAF=7;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.79751e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00390356;OID=.;OPOS=8947021;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:22:29:1:15:7:0:0:16:13:0:0
chr11	8947179	.	G	A	387.52	PASS	AF=0.584615;AO=38;DP=64;FAO=38;FDP=65;FR=.;FRO=27;FSAF=25;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.0140858;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.128;QD=23.8473;RBI=0.0182557;REFB=-0.0327552;REVB=-0.0116129;RO=26;SAF=25;SAR=13;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180552;STB=0.592668;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=0.0263324;OID=.;OPOS=8947179;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:65:26:27:38:38:0.584615:13:25:11:15:13:25:12:15
chr11	8947283	.	G	C	165.51	PASS	AF=0.34375;AO=22;DP=64;FAO=22;FDP=64;FR=.;FRO=42;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=-0.03096;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.0666;QD=10.3444;RBI=0.034341;REFB=-0.0473821;REVB=0.0148587;RO=42;SAF=8;SAR=14;SRF=21;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156763;STB=0.591752;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=0.0831889;OID=.;OPOS=8947283;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:42:42:22:22:0.34375:14:8:21:21:14:8:21:21
chr11	8947586	.	C	G	70.97	PASS	AF=0.5625;AO=9;DP=15;FAO=9;FDP=16;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.000443939;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=139.424;QD=17.7429;RBI=0.00991532;REFB=-0.0205617;REVB=0.00990538;RO=6;SAF=4;SAR=5;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0787225;STB=0.507027;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.014905;OID=.;OPOS=8947586;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:15:16:6:7:9:9:0.5625:5:4:2:4:5:4:3:4
chr11	8948680	.	A	T	227.15	PASS	AF=0.511628;AO=22;DP=43;FAO=22;FDP=43;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=0.00450548;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.928;QD=21.1301;RBI=0.0226998;REFB=0.0103486;REVB=-0.0222482;RO=21;SAF=6;SAR=16;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0639505;STB=0.536049;STBP=0.64;TYPE=snp;VARB=-0.0103971;OID=.;OPOS=8948680;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:21:21:22:22:0.511628:16:6:7:14:16:6:7:14
chr11	8959370	.	G	A	466.4	PASS	AF=0.542169;AO=45;DP=83;FAO=45;FDP=83;FR=.;FRO=38;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=-0.0115572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.131;QD=22.477;RBI=0.0178494;REFB=-0.0108941;REVB=0.0136027;RO=38;SAF=22;SAR=23;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0345593;STB=0.519026;STBP=0.73;TYPE=snp;VARB=0.0133911;OID=.;OPOS=8959370;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:38:38:45:45:0.542169:23:22:17:21:23:22:17:21
chr11	8959511	.	T	G	454.68	PASS	AF=0.85;AO=33;DP=41;FAO=34;FDP=40;FR=.;FRO=6;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.0118054;FXX=0.0243843;HRUN=3;LEN=1;MLLD=207.873;QD=45.4675;RBI=0.0120526;REFB=-0.0289832;REVB=-0.00242849;RO=0;SAF=12;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.53479;STBP=0.327;TYPE=snp;VARB=0.000785892;OID=.;OPOS=8959511;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:41:40:0:6:33:34:0.85:21:12:0:0:21:13:1:5
chr11	8959545	.	C	A	106.32	PASS	AF=0.361111;AO=13;DP=36;FAO=13;FDP=36;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=-0.0142902;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.462;QD=11.8131;RBI=0.0203293;REFB=0.00057491;REVB=-0.0144593;RO=23;SAF=5;SAR=8;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0075912;STB=0.504498;STBP=0.989;TYPE=snp;VARB=-0.00147775;OID=.;OPOS=8959545;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:23:23:13:13:0.361111:8:5:9:14:8:5:9:14
chr11	8968878	.	GAGGACAT	G	37.17	PASS	AF=0.428571;AO=4;DP=14;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=0.00308379;FXX=0.0666222;HRUN=1;LEN=7;MLLD=280.444;QD=10.6211;RBI=0.00819272;REFB=-0.00169053;REVB=-0.00759018;RO=8;SAF=0;SAR=4;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.633251;STB=0.545312;STBP=0.855;TYPE=del;VARB=0.00157034;OID=.;OPOS=8968879;OREF=AGGACAT;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.428571:4:14:6:14:8:1:5:1:7:37:8:0:4:1:7
chr11	8969309	.	T	C	119.53	PASS	AF=0.4;AO=14;DP=35;FAO=14;FDP=35;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=0.0126591;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.1722;QD=13.6608;RBI=0.0598508;REFB=0.00449313;REVB=0.0584967;RO=21;SAF=7;SAR=7;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122488;STB=0.571329;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=-0.00323957;OID=.;OPOS=8969309;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:21:21:14:14:0.4:7:7:8:13:7:7:8:13
chr11	8977830	.	A	G	212.63	PASS	AF=0.477273;AO=21;DP=44;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=-0.0376558;FXX=0.0222173;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.341;QD=19.3299;RBI=0.0480441;REFB=-0.00842701;REVB=0.0298375;RO=23;SAF=11;SAR=10;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121916;STB=0.568901;STBP=0.4;TYPE=snp;VARB=0.00952438;OID=.;OPOS=8977830;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:23:23:21:21:0.477273:10:11:9:14:10:11:9:14
chr11	9005036	.	T	A	1062.42	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0023259;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.101;QD=59.8548;RBI=0.0114553;REFB=0;REVB=-0.0112167;RO=0;SAF=39;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.53054e-06;OID=.;OPOS=9005036;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:32:39:0:0:32:39:0:0
chr11	9045960	.	T	A	716.09	PASS	AF=0.514706;AO=68;DP=134;FAO=70;FDP=136;FR=.;FRO=66;FSAF=34;FSAR=36;FSRF=35;FSRR=31;FWDB=0.0042323;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.267;QD=21.0616;RBI=0.00568553;REFB=-0.0146298;REVB=-0.00379643;RO=65;SAF=33;SAR=35;SRF=35;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0471792;STB=0.521623;STBP=0.624;TYPE=snp;VARB=0.0171519;OID=.;OPOS=9045960;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:134:136:65:66:68:70:0.514706:35:33:35:30:36:34:35:31
chr11	9052423	.	A	C	784.44	PASS	AF=1;AO=54;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.145862;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.697;QD=57.0504;RBI=0.14795;REFB=0;REVB=0.0247705;RO=0;SAF=12;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00024195;OID=.;OPOS=9052423;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:54:55:1:42:12:0:0:43:12:0:0
chr11	9069046	.	G	A	384.21	PASS	AF=0.45977;AO=39;DP=87;FAO=40;FDP=87;FR=.;FRO=47;FSAF=26;FSAR=14;FSRF=25;FSRR=22;FWDB=-0.0148585;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.909;QD=17.6648;RBI=0.0209813;REFB=-0.0151646;REVB=0.0148135;RO=47;SAF=25;SAR=14;SRF=25;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111265;STB=0.567238;STBP=0.278;TYPE=snp;VARB=0.0138031;OID=.;OPOS=9069046;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:47:47:39:40:0.45977:14:25:25:22:14:26:25:22
chr11	9316937	.	G	A	978.35	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00604647;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.809;QD=59.294;RBI=0.0395961;REFB=0;REVB=0.0391317;RO=0;SAF=34;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.75585e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000378518;OID=.;OPOS=9316937;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:32:34:0:0:32:34:0:0
chr11	9406349	.	T	C	2005.98	PASS	AF=1;AO=128;DP=129;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.040957;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.095;QD=62.201;RBI=0.0432331;REFB=0;REVB=0.013843;RO=0;SAF=65;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.1359e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.54944e-05;OID=.;OPOS=9406349;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:129:129:0:0:128:129:1:63:65:0:0:63:66:0:0
chr11	9537904	.	G	C	340.73	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0432145;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=219.981;QD=54.5174;RBI=0.0433534;REFB=0;REVB=-0.00346813;RO=0;SAF=10;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000133711;OID=.;OPOS=9537904;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:15:10:0:0:15:10:0:0
chr11	9769483	.	C	T	149.66	PASS	AF=0.34;AO=17;DP=50;FAO=17;FDP=50;FR=.;FRO=33;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=22;FWDB=-0.00582362;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.498;QD=11.9726;RBI=0.0119411;REFB=-0.0107229;REVB=-0.0104247;RO=33;SAF=8;SAR=9;SRF=11;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156716;STB=0.591782;STBP=0.371;TYPE=snp;VARB=0.0254972;OID=.;OPOS=9769483;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:33:33:17:17:0.34:9:8:11:22:9:8:11:22
chr11	9800601	.	G	A	757.51	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0195724;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=295.918;QD=57.1705;RBI=0.0234528;REFB=0;REVB=-0.0129211;RO=0;SAF=26;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.58771e-05;OID=.;OPOS=9800601;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:27:26:0:0:27:26:0:0
chr11	9800821	.	T	C	632.25	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00826816;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.334;QD=61.6833;RBI=0.0187458;REFB=0;REVB=-0.0168238;RO=0;SAF=26;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.61859e-05;OID=.;OPOS=9800821;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:15:26:0:0:15:26:0:0
chr11	10328747	.	T	TC	225.57	PASS	AF=0.558824;AO=31;DP=74;FAO=38;FDP=68;FR=.;FRO=30;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.0169187;FXX=0.0285673;HRUN=4;LEN=1;MLLD=16.8276;QD=13.2686;RBI=0.0381505;REFB=0.0167285;REVB=-0.0341939;RO=38;SAF=14;SAR=17;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0730923;STB=0.564507;STBP=0.259;TYPE=ins;VARB=-0.0191899;OID=.;OPOS=10328748;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.558824:31:74:38:68:30:16:22:17:13:99:38:14:17:20:18
chr11	10529822	.	A	G	65.28	PASS	AF=0.375;AO=9;DP=24;FAO=9;FDP=24;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=0.0692765;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.009;QD=10.8796;RBI=0.0693269;REFB=-0.0133577;REVB=-0.00264546;RO=15;SAF=4;SAR=5;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119127;STB=0.571275;STBP=0.643;TYPE=snp;VARB=0.0217851;OID=.;OPOS=10529822;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:24:24:15:15:9:9:0.375:5:4:5:10:5:4:5:10
chr11	10530471	.	T	C	215.11	PASS	AF=0.525;AO=21;DP=40;FAO=21;FDP=40;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.025217;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=181.409;QD=21.5113;RBI=0.0259282;REFB=-0.0233896;REVB=0.00603116;RO=18;SAF=10;SAR=11;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110708;STB=0.548647;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.0154491;OID=.;OPOS=10530471;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:18:19:21:21:0.525:11:10:11:7:11:10:11:8
chr11	10533952	.	T	C	206.1	PASS	AF=0.428571;AO=21;DP=49;FAO=21;FDP=49;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=0.0254904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.084;QD=16.8245;RBI=0.031734;REFB=-0.0110674;REVB=0.018902;RO=28;SAF=11;SAR=10;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0594165;STB=0.533948;STBP=0.703;TYPE=snp;VARB=0.012743;OID=.;OPOS=10533952;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:28:28:21:21:0.428571:10:11:13:15:10:11:13:15
chr11	10536298	.	T	C	38.57	PASS	AF=0.428571;AO=6;DP=14;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.035538;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.002;QD=11.0197;RBI=0.0509809;REFB=0.0175226;REVB=0.0365528;RO=8;SAF=2;SAR=4;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.271446;STB=0.666111;STBP=0.364;TYPE=snp;VARB=-0.00397875;OID=.;OPOS=10536298;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:14:14:8:8:6:6:0.428571:4:2:5:3:4:2:5:3
chr11	10655609	.	C	T	1153.57	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0492177;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.722;QD=60.7143;RBI=0.0492354;REFB=0;REVB=-0.00131813;RO=0;SAF=32;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000230226;OID=.;OPOS=10655609;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:44:32:0:0:44:32:0:0
chr11	10673739	.	T	C,G	3932.24	PASS	AF=0.942748,0.0496183;AO=249,11;DP=262;FAO=247,13;FDP=262;FR=.;FRO=2;FSAF=108,12;FSAR=139,1;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00981481,-0.0250475;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=194.199,71.8835;QD=60.0342;RBI=0.0101734,0.0262792;REFB=-0.0459729,-0.0278274;REVB=0.0026774,-0.00795097;RO=0;SAF=109,11;SAR=140,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-5.55993e-08,0;STB=0.500512,0.648367;STBP=0.87,0.136;TYPE=snp,snp;VARB=-0.000881673,0.0549747;OID=.,.;OPOS=10673739,10673739;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:16:262:262:0:2:249,11:247,13:0.942748,0.0496183:140,0:109,11:0:0:139,1:108,12:1:1
chr11	10715124	.	T	C	905.96	PASS	AF=0.984375;AO=64;DP=64;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0338794;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.53;QD=56.6223;RBI=0.0484686;REFB=-0.00337969;REVB=0.0346611;RO=0;SAF=30;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508472;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.000179948;OID=.;OPOS=10715124;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:64:64:0:1:64:63:0.984375:34:30:0:0:34:29:1:0
chr11	10786142	.	C	T	311.85	PASS	AF=0.453333;AO=34;DP=75;FAO=34;FDP=75;FR=.;FRO=41;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=25;FWDB=-0.016265;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.7758;QD=16.6319;RBI=0.0194662;REFB=-0.0108434;REVB=0.0106951;RO=41;SAF=15;SAR=19;SRF=16;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0506293;STB=0.528406;STBP=0.685;TYPE=snp;VARB=0.0166983;OID=.;OPOS=10786142;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:41:41:34:34:0.453333:19:15:16:25:19:15:16:25
chr11	10786175	.	C	T	246.68	PASS	AF=0.451613;AO=28;DP=62;FAO=28;FDP=62;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=0.00961291;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.5356;QD=15.9151;RBI=0.0262357;REFB=0.00956258;REVB=-0.0244111;RO=34;SAF=12;SAR=16;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0699742;STB=0.539506;STBP=0.575;TYPE=snp;VARB=-0.0121198;OID=.;OPOS=10786175;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:34:34:28:28:0.451613:16:12:17:17:16:12:17:17
chr11	10822350	.	C	T	2209.71	PASS	AF=1;AO=139;DP=141;FAO=140;FDP=140;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00956902;FXX=0.0070917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.377;QD=63.1345;RBI=0.019901;REFB=0;REVB=0.0174495;RO=0;SAF=72;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.36576e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000175479;OID=.;OPOS=10822350;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:141:140:0:0:139:140:1:67:72:0:0:68:72:0:0
chr11	10823079	.	T	C	162.96	PASS	AF=0.36;AO=18;DP=50;FAO=18;FDP=50;FR=.;FRO=32;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=-0.00539776;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.437;QD=13.0369;RBI=0.0185094;REFB=-0.0124784;REVB=-0.0177049;RO=32;SAF=8;SAR=10;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0268064;STB=0.515678;STBP=0.875;TYPE=snp;VARB=0.0174503;OID=.;OPOS=10823079;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:32:32:18:18:0.36:10:8:15:17:10:8:15:17
chr11	10828361	.	C	A	324.93	PASS	AF=0.53125;AO=33;DP=63;FAO=34;FDP=64;FR=.;FRO=30;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=0.0494018;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.8379;QD=20.3078;RBI=0.0497922;REFB=0.0265556;REVB=0.00622307;RO=30;SAF=16;SAR=17;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0156081;STB=0.501844;STBP=0.985;TYPE=snp;VARB=-0.0218462;OID=.;OPOS=10828361;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:64:30:30:33:34:0.53125:17:16:14:16:18:16:14:16
chr11	11292700	.	G	C	508.12	PASS	AF=0.5;AO=49;DP=98;FAO=49;FDP=98;FR=.;FRO=49;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=38;FSRR=11;FWDB=-0.00427808;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.435;QD=20.7396;RBI=0.00512291;REFB=-0.00679089;REVB=-0.00281819;RO=47;SAF=27;SAR=22;SRF=36;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.197911;STB=0.61607;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.0037532;OID=.;OPOS=11292700;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:47:49:49:49:0.5:22:27:36:11:22:27:38:11
chr11	11354346	.	T	C	270.61	PASS	AF=0.413333;AO=31;DP=75;FAO=31;FDP=75;FR=.;FRO=44;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=-0.00531171;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.537;QD=14.4324;RBI=0.0227634;REFB=-0.0161429;REVB=0.022135;RO=43;SAF=15;SAR=16;SRF=22;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0284331;STB=0.50946;STBP=0.879;TYPE=snp;VARB=0.0272741;OID=.;OPOS=11354346;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:43:44:31:31:0.413333:16:15:22:21:16:15:22:22
chr11	11373508	.	T	C	483.32	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00759176;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.8127;QD=58.5848;RBI=0.00761741;REFB=0;REVB=0.00062455;RO=0;SAF=16;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.60901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000161693;OID=.;OPOS=11373508;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:17:16:0:0:17:16:0:0
chr11	11373587	.	A	G	1208.96	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0193435;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=334.337;QD=61.2132;RBI=0.0230593;REFB=0;REVB=0.0125524;RO=0;SAF=37;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.83681e-05;OID=.;OPOS=11373587;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:42:37:0:0:42:37:0:0
chr11	11373635	.	C	T	1518.12	PASS	AF=1;AO=95;DP=96;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0155297;FXX=0.0206164;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.7906;QD=63.9207;RBI=0.0155298;REFB=0;REVB=1.60749e-05;RO=0;SAF=49;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00100978;OID=.;OPOS=11373635;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:96:95:0:0:95:95:1:46:49:0:0:46:49:0:0
chr11	11373808	.	T	G	1555.7	PASS	AF=0.990566;AO=106;DP=106;FAO=105;FDP=106;FR=.;FRO=1;FSAF=51;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0186872;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.33;QD=58.7055;RBI=0.0267779;REFB=-0.0802295;REVB=-0.0191793;RO=0;SAF=51;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504586;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=0.000170578;OID=.;OPOS=11373808;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:106:106:0:1:106:105:0.990566:55:51:0:0:54:51:0:1
chr11	11373925	.	A	C	1772.12	PASS	AF=1;AO=116;DP=118;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0268053;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.5603;QD=60.0718;RBI=0.0276345;REFB=-0.0508313;REVB=0.00671873;RO=1;SAF=62;SAR=54;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00871341;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000215145;OID=.;OPOS=11373925;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:118:118:1:0:116:118:1:54:62:0:1:56:62:0:0
chr11	11373960	.	C	T	531.53	PASS	AF=0.482759;AO=56;DP=116;FAO=56;FDP=116;FR=.;FRO=60;FSAF=29;FSAR=27;FSRF=29;FSRR=31;FWDB=-0.0105917;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.148;QD=18.3287;RBI=0.0260965;REFB=-0.0154723;REVB=-0.0238505;RO=60;SAF=29;SAR=27;SRF=29;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0322131;STB=0.517851;STBP=0.737;TYPE=snp;VARB=0.0172659;OID=.;OPOS=11373960;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:116:116:60:60:56:56:0.482759:27:29:29:31:27:29:29:31
chr11	11374016	.	T	A	1629.49	PASS	AF=1;AO=107;DP=108;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0195961;FXX=0.0181802;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.34;QD=60.3514;RBI=0.0392876;REFB=0;REVB=-0.0340516;RO=0;SAF=52;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.31053e-05;OID=.;OPOS=11374016;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:108:108:0:0:107:108:1:55:52:0:0:55:53:0:0
chr11	11374269	.	A	G	809.4	PASS	AF=0.5125;AO=82;DP=160;FAO=82;FDP=160;FR=.;FRO=78;FSAF=34;FSAR=48;FSRF=45;FSRR=33;FWDB=0.0332549;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.47;QD=20.235;RBI=0.0354551;REFB=-0.0130795;REVB=0.0122954;RO=78;SAF=34;SAR=48;SRF=45;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144305;STB=0.579266;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.00926193;OID=.;OPOS=11374269;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:160:160:78:78:82:82:0.5125:48:34:45:33:48:34:45:33
chr11	11374283	.	T	G	2687.85	PASS	AF=1;AO=172;DP=175;FAO=173;FDP=173;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0241044;FXX=0.0170445;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.647;QD=62.1469;RBI=0.0245914;REFB=0.021804;REVB=0.00487014;RO=1;SAF=84;SAR=88;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0053783;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000164631;OID=.;OPOS=11374283;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:175:173:1:0:172:173:1:88:84:0:1:88:85:0:0
chr11	11913585	.	G	T	866.74	PASS	AF=0.953846;AO=61;DP=65;FAO=62;FDP=65;FR=.;FRO=3;FSAF=36;FSAR=26;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0054618;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=284.318;QD=53.3377;RBI=0.00712587;REFB=-0.0352424;REVB=-0.00457677;RO=2;SAF=35;SAR=26;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0262099;STB=0.519994;STBP=0.141;TYPE=snp;VARB=-3.38835e-05;OID=.;OPOS=11913585;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:65:65:2:3:61:62:0.953846:26:35:2:0:26:36:3:0
chr11	11976628	.	G	A	472.84	PASS	AF=0.472222;AO=51;DP=108;FAO=51;FDP=108;FR=.;FRO=57;FSAF=18;FSAR=33;FSRF=32;FSRR=25;FWDB=0.0246748;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.9527;QD=17.5126;RBI=0.052743;REFB=-0.0161124;REVB=-0.0466152;RO=57;SAF=18;SAR=33;SRF=32;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.201913;STB=0.612427;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.0132206;OID=.;OPOS=11976628;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:108:57:57:51:51:0.472222:33:18:32:25:33:18:32:25
chr11	11977573	.	T	C	251.69	PASS	AF=0.510638;AO=23;DP=46;FAO=24;FDP=47;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=-0.00023195;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.378;QD=21.4201;RBI=0.00589117;REFB=-0.018908;REVB=-0.0058866;RO=23;SAF=11;SAR=12;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.038631;STB=0.510629;STBP=0.905;TYPE=snp;VARB=0.0225851;OID=.;OPOS=11977573;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:47:23:23:23:24:0.510638:12:11:12:11:12:12:12:11
chr11	11978815	.	T	TGA	534.92	PASS	AF=0.491228;AO=55;DP=115;FAO=56;FDP=114;FR=.;FRO=58;FSAF=38;FSAR=18;FSRF=32;FSRR=26;FWDB=-0.000310926;FXX=0.0338954;HRUN=1;LEN=2;MLLD=273.773;QD=18.7692;RBI=0.00745831;REFB=-0.00818079;REVB=-0.00745182;RO=58;SAF=38;SAR=17;SRF=32;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141358;STB=0.570233;STBP=0.19;TYPE=ins;VARB=0.00794867;OID=.;OPOS=11978816;OREF=-;OALT=GA;OMAPALT=TGA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.491228:55:115:56:114:58:38:18:32:26:99:58:38:17:32:26
chr11	11986061	.	T	C	851.61	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0312383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.355;QD=57.736;RBI=0.0367655;REFB=0;REVB=-0.0193873;RO=0;SAF=29;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.16423e-05;OID=.;OPOS=11986061;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:59:0:0:58:59:1:29:29:0:0:29:30:0:0
chr11	12023779	.	CA	AA,C	59.02	PASS	AF=0.010101,0.20202;AO=8,15;DP=102;FAO=1,20;FDP=99;FR=.;FRO=78;FSAF=1,10;FSAR=0,10;FSRF=36;FSRR=42;FWDB=0.00784491,0.205855;FXX=0.0388312;HRUN=1,7;LEN=1,1;MLLD=212.075,10.4091;QD=2.3848;RBI=0.0082629,0.209377;REFB=-3.75081e-07,-0.0256512;REVB=-0.00259478,0.0382412;RO=64;SAF=8,7;SAR=0,8;SRF=29;SRR=35;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.65616,0.0170741;STB=0.990797,0.530582;STBP=0.261,0.756;TYPE=snp,del;VARB=0.0384773,0.0657836;OID=.,.;OPOS=12023779,12023780;OREF=C,A;OALT=A,-;OMAPALT=AA,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:56:102:99:64:78:8,15:1,20:0.010101,0.20202:0,8:8,7:29:35:0,10:1,10:36:42
chr11	12225946	.	T	G	436.59	PASS	AF=0.443038;AO=33;DP=80;FAO=35;FDP=79;FR=.,HEALED;FRO=35;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=0.00865366;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.802;QD=22.1056;RBI=0.0274387;REFB=-0.025511;REVB=0.0260384;RO=34;SAF=14;SAR=19;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0961915;STB=0.543185;STBP=0.496;TYPE=snp;VARB=0.0201726;OID=.;OPOS=12225946;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:79:34:35:33:35:0.443038:19:14:18:16:20:15:18:17
chr11	12229655	.	T	G	588.61	PASS	AF=0.41358;AO=67;DP=162;FAO=67;FDP=162;FR=.;FRO=95;FSAF=31;FSAR=36;FSRF=43;FSRR=52;FWDB=0.0154463;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.248;QD=14.5335;RBI=0.0224599;REFB=-0.0114398;REVB=-0.0163052;RO=95;SAF=31;SAR=36;SRF=43;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.010579;STB=0.505933;STBP=0.896;TYPE=snp;VARB=0.0133824;OID=.;OPOS=12229655;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:162:162:95:95:67:67:0.41358:36:31:43:52:36:31:43:52
chr11	12246233	.	G	C	391.54	PASS	AF=0.44086;AO=41;DP=93;FAO=41;FDP=93;FR=.;FRO=52;FSAF=25;FSAR=16;FSRF=28;FSRR=24;FWDB=-0.0187696;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.4899;QD=16.8403;RBI=0.0238922;REFB=0.0134114;REVB=0.0147832;RO=51;SAF=25;SAR=16;SRF=27;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0816431;STB=0.541105;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=-0.0302952;OID=.;OPOS=12246233;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:51:52:41:41:0.44086:16:25:27:24:16:25:28:24
chr11	12265542	.	A	G	1452.89	PASS	AF=1;AO=92;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0273059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.724;QD=63.1692;RBI=0.0295061;REFB=0;REVB=0.0111803;RO=0;SAF=47;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.9386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.84771e-05;OID=.;OPOS=12265542;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:92:92:0:0:92:92:1:45:47:0:0:45:47:0:0
chr11	12285090	.	C	T	203.35	PASS	AF=0.421053;AO=24;DP=57;FAO=24;FDP=57;FR=.;FRO=33;FSAF=18;FSAR=6;FSRF=29;FSRR=4;FWDB=-0.00992669;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.108;QD=14.2704;RBI=0.0103829;REFB=-0.00190118;REVB=0.00304376;RO=33;SAF=18;SAR=6;SRF=29;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196936;STB=0.610311;STBP=0.278;TYPE=snp;VARB=0.00232582;OID=.;OPOS=12285090;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:33:33:24:24:0.421053:6:18:29:4:6:18:29:4
chr11	12315407	.	G	C	306.32	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00526261;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.8108;QD=53.2732;RBI=0.090117;REFB=0;REVB=0.0899632;RO=0;SAF=15;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00229603;OID=.;OPOS=12315407;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:8:15:0:0:8:15:0:0
chr11	12315716	.	C	T	182.82	PASS	AF=0.941176;AO=16;DP=17;FAO=16;FDP=17;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0310226;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=224.064;QD=43.0164;RBI=0.0326869;REFB=-0.0357;REVB=0.0102974;RO=1;SAF=11;SAR=5;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0828326;STB=0.545396;STBP=0.263;TYPE=snp;VARB=0.000695777;OID=.;OPOS=12315716;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:17:17:1:1:16:16:0.941176:5:11:0:1:5:11:0:1
chr11	12315891	.	G	A	163.36	PASS	AF=1;AO=14;DP=15;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0426161;FXX=0.0666222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.878;QD=46.6737;RBI=0.0426183;REFB=0;REVB=0.000432785;RO=0;SAF=8;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000427948;OID=.;OPOS=12315891;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:14:0:0:14:14:1:6:8:0:0:6:8:0:0
chr11	12525925	.	C	T	239.71	PASS	AF=0.3625;AO=29;DP=80;FAO=29;FDP=80;FR=.;FRO=51;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=23;FSRR=28;FWDB=0.000604624;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.47;QD=11.9858;RBI=0.0267841;REFB=-0.00886926;REVB=-0.0267772;RO=51;SAF=14;SAR=15;SRF=23;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0352382;STB=0.520297;STBP=0.794;TYPE=snp;VARB=0.0159141;OID=.;OPOS=12525925;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:51:51:29:29:0.3625:15:14:23:28:15:14:23:28
chr11	12534707	.	G	A	902.7	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0180887;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.495;QD=58.2387;RBI=0.0184277;REFB=0;REVB=0.00351822;RO=0;SAF=36;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51662e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.66832e-05;OID=.;OPOS=12534707;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:26:36:0:0:26:36:0:0
chr11	12903443	.	C	T	613.36	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0199105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.223;QD=61.3363;RBI=0.0276657;REFB=0;REVB=0.0192084;RO=0;SAF=25;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000126827;OID=.;OPOS=12903443;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:15:25:0:0:15:25:0:0
chr11	13398129	.	T	A	1596.92	PASS	AF=1;AO=106;DP=107;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00198701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.43;QD=59.6979;RBI=0.0564357;REFB=0;REVB=0.0564007;RO=0;SAF=58;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.46504e-05;OID=.;OPOS=13398129;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:107:107:0:0:106:107:1:48:58:0:0:49:58:0:0
chr11	13441126	.	A	G	282.6	PASS	AF=0.351064;AO=33;DP=94;FAO=33;FDP=94;FR=.;FRO=61;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=32;FSRR=29;FWDB=0.00511137;FXX=0.0208312;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.265;QD=12.0256;RBI=0.00550209;REFB=-0.00328883;REVB=-0.00203639;RO=59;SAF=14;SAR=19;SRF=31;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113054;STB=0.56529;STBP=0.368;TYPE=snp;VARB=0.00621925;OID=.;OPOS=13441126;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:59:61:33:33:0.351064:19:14:31:28:19:14:32:29
chr11	13443250	.	C	T	237.51	PASS	AF=0.45;AO=26;DP=60;FAO=27;FDP=60;FR=.;FRO=33;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=7;FSRR=26;FWDB=0.0178612;FXX=0.0163908;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.3599;QD=15.8339;RBI=0.0195816;REFB=-0.00948453;REVB=-0.00802605;RO=33;SAF=7;SAR=19;SRF=7;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.074764;STB=0.534859;STBP=0.72;TYPE=snp;VARB=0.0100093;OID=.;OPOS=13443250;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:33:33:26:27:0.45:19:7:7:26:20:7:7:26
chr11	13929046	.	T	A	82.32	PASS	AF=0.588235;AO=10;DP=17;FAO=10;FDP=17;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.0139893;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=259.524;QD=19.3689;RBI=0.0274463;REFB=-0.00536246;REVB=-0.0236135;RO=7;SAF=3;SAR=7;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.207621;STB=0.620002;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=0.00431769;OID=.;OPOS=13929046;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:17:17:7:7:10:10:0.588235:7:3:4:3:7:3:4:3
chr11	14101493	.	G	GC	747.43	PASS	AF=1;AO=63;DP=65;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0324909;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=25.6256;QD=46.7141;RBI=0.0811597;REFB=0;REVB=0.0743723;RO=1;SAF=30;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0140954;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.0023877;OID=.;OPOS=14101494;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:63:65:64:64:0:30:34:0:0:14:1:30:33:0:1
chr11	14264916	.	A	G	286.94	PASS	AF=0.37931;AO=33;DP=87;FAO=33;FDP=87;FR=.;FRO=54;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=30;FWDB=0.0427762;FXX=0.0113623;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.6271;QD=13.1926;RBI=0.0429886;REFB=-0.0141587;REVB=-0.00426902;RO=52;SAF=16;SAR=17;SRF=24;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0250328;STB=0.525124;STBP=0.74;TYPE=snp;VARB=0.0127955;OID=.;OPOS=14264916;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:52:54:33:33:0.37931:17:16:24:28:17:16:24:30
chr11	14284477	.	G	A	206.96	PASS	AF=0.4375;AO=21;DP=48;FAO=21;FDP=48;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.0323652;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=222.716;QD=17.247;RBI=0.0337181;REFB=-0.0117579;REVB=0.00945533;RO=27;SAF=6;SAR=15;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174079;STB=0.5999;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=0.0129107;OID=.;OPOS=14284477;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:27:27:21:21:0.4375:15:6:12:15:15:6:12:15
chr11	14632570	.	A	C	275.86	PASS	AF=0.54902;AO=27;DP=50;FAO=28;FDP=51;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=0.00726564;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.353;QD=21.6359;RBI=0.0185458;REFB=-0.0102038;REVB=0.0170633;RO=23;SAF=12;SAR=15;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0281779;STB=0.522711;STBP=0.754;TYPE=snp;VARB=0.0084107;OID=.;OPOS=14632570;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:51:23:23:27:28:0.54902:15:12:11:12:16:12:11:12
chr11	14810762	.	A	G	539.79	PASS	AF=0.568182;AO=50;DP=88;FAO=50;FDP=88;FR=.;FRO=38;FSAF=29;FSAR=21;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=0.0141594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=327.99;QD=24.5359;RBI=0.0145132;REFB=0.00146139;REVB=0.00318529;RO=38;SAF=29;SAR=21;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0639225;STB=0.535041;STBP=0.474;TYPE=snp;VARB=-0.00123211;OID=.;OPOS=14810762;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:38:38:50:50:0.568182:21:29:19:19:21:29:19:19
chr11	14913575	.	G	A	1282.15	PASS	AF=0.488806;AO=130;DP=267;FAO=131;FDP=268;FR=.;FRO=137;FSAF=54;FSAR=77;FSRF=73;FSRR=64;FWDB=0.0167628;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.458;QD=19.1366;RBI=0.0298803;REFB=-0.00826316;REVB=0.0247355;RO=137;SAF=54;SAR=76;SRF=73;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110468;STB=0.562228;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.00965896;OID=.;OPOS=14913575;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:267:268:137:137:130:131:0.488806:76:54:73:64:77:54:73:64
chr11	14991539	.	T	C	1523.06	PASS	AF=0.990385;AO=103;DP=104;FAO=103;FDP=104;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=59;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00957134;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.3835;QD=58.5793;RBI=0.0441847;REFB=0.0266483;REVB=-0.0431356;RO=1;SAF=44;SAR=59;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0106617;STB=0.505617;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=-0.000548221;OID=.;OPOS=14991539;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:104:104:1:1:103:103:0.990385:59:44:1:0:59:44:1:0
chr11	15199957	.	T	C	804.11	PASS	AF=1;AO=48;DP=49;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0661393;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.8318;QD=64.3285;RBI=0.09623;REFB=0;REVB=0.0698985;RO=0;SAF=27;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00183365;OID=.;OPOS=15199957;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:50:0:0:48:50:1:21:27:0:0:21:29:0:0
chr11	15992319	.	A	C	192.41	PASS	AF=0.416667;AO=20;DP=48;FAO=20;FDP=48;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=0.016751;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.934;QD=16.0341;RBI=0.0235745;REFB=-0.00782894;REVB=0.016588;RO=28;SAF=11;SAR=9;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0590962;STB=0.533865;STBP=0.721;TYPE=snp;VARB=0.0127601;OID=.;OPOS=15992319;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:28:28:20:20:0.416667:9:11:17:11:9:11:17:11
chr11	16133413	.	A	G	444.76	PASS	AF=0.505747;AO=44;DP=87;FAO=44;FDP=87;FR=.;FRO=43;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=14;FSRR=29;FWDB=-0.00679258;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.214;QD=20.4487;RBI=0.00770591;REFB=-0.0157374;REVB=0.00363895;RO=42;SAF=22;SAR=22;SRF=13;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168593;STB=0.586169;STBP=0.103;TYPE=snp;VARB=0.0133419;OID=.;OPOS=16133413;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:42:43:44:44:0.505747:22:22:13:29:22:22:14:29
chr11	16598424	.	G	A	145.55	PASS	AF=0.444444;AO=16;DP=36;FAO=16;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.0190034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.1364;QD=16.1717;RBI=0.0341287;REFB=-0.00804808;REVB=-0.0283485;RO=20;SAF=10;SAR=6;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123809;STB=0.571338;STBP=0.46;TYPE=snp;VARB=0.00983768;OID=.;OPOS=16598424;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:20:20:16:16:0.444444:6:10:10:10:6:10:10:10
chr11	16812397	.	G	A	185.37	PASS	AF=0.475;AO=19;DP=39;FAO=19;FDP=40;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=-0.00722435;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.5111;QD=18.5374;RBI=0.132352;REFB=-0.0259753;REVB=0.132154;RO=20;SAF=6;SAR=13;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13202;STB=0.565146;STBP=0.426;TYPE=snp;VARB=0.0289017;OID=.;OPOS=16812397;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:40:20:21:19:19:0.475:13:6:9:11:13:6:9:12
chr11	16863907	.	C	T	206.96	PASS	AF=0.4375;AO=21;DP=48;FAO=21;FDP=48;FR=.;FRO=27;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=-0.0132717;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.463;QD=17.247;RBI=0.0160779;REFB=0.000933406;REVB=-0.00907513;RO=27;SAF=5;SAR=16;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.307322;STB=0.676879;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=-0.00158572;OID=.;OPOS=16863907;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:27:27:21:21:0.4375:16:5:14:13:16:5:14:13
chr11	17035718	.	A	G	239.54	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0985232;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.0607;QD=50.4287;RBI=0.102638;REFB=0;REVB=-0.0287693;RO=0;SAF=9;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00073358;OID=.;OPOS=17035718;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:19:0:0:18:19:1:9:9:0:0:9:10:0:0
chr11	17108868	.	ACT	A	173.07	PASS	AF=0.439024;AO=16;DP=50;FAO=18;FDP=41;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=17;FWDB=-0.000783153;FXX=0.179964;HRUN=1;LEN=2;MLLD=202.807;QD=16.8853;RBI=0.0330402;REFB=0.00203668;REVB=-0.0330309;RO=20;SAF=7;SAR=9;SRF=5;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190615;STB=0.606631;STBP=0.29;TYPE=del;VARB=-0.00176226;OID=.;OPOS=17108869;OREF=CT;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.439024:16:50:18:41:23:8:10:6:17:99:20:7:9:5:15
chr11	17172133	.	T	C	444.73	PASS	AF=0.505747;AO=44;DP=87;FAO=44;FDP=87;FR=.;FRO=43;FSAF=31;FSAR=13;FSRF=26;FSRR=17;FWDB=0.0431337;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.809;QD=20.4476;RBI=0.0434239;REFB=-0.0142002;REVB=0.00501186;RO=43;SAF=31;SAR=13;SRF=26;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101707;STB=0.556526;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.017361;OID=.;OPOS=17172133;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:43:43:44:44:0.505747:13:31:26:17:13:31:26:17
chr11	17333663	.	G	A	429.01	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0254749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.4437;QD=57.2012;RBI=0.0388531;REFB=0;REVB=0.0293359;RO=0;SAF=12;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000700978;OID=.;OPOS=17333663;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:18:12:0:0:18:12:0:0
chr11	17339127	.	T	C	411.12	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00266501;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=232.131;QD=56.7066;RBI=0.0244896;REFB=0;REVB=0.0243442;RO=0;SAF=17;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.0947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.484e-05;OID=.;OPOS=17339127;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:12:17:0:0:12:17:0:0
chr11	17352467	.	CAAAAAAAATTACA	CAAAAAAAATT,CAAAAAAATTACA	173.17	PASS	AF=0.5,0;AO=11,5;DP=36;FAO=18,0;FDP=36;FR=.;FRO=18;FSAF=12,0;FSAR=6,0;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.0368393,-0.110177;FXX=0;HRUN=1,8;LEN=3,1;MLLD=286.083,7.60585;QD=19.2411;RBI=0.041289,0.194057;REFB=0.00521754,-0.00355662;REVB=0.0186454,0.159747;RO=9;SAF=6,4;SAR=5,1;SRF=2;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.249998,0.548753;STB=0.615253,0.5;STBP=0.198,1;TYPE=del,del;VARB=-0.0055278,0.0227306;OID=.,.;OPOS=17352478,17352468;OREF=ACA,A;OALT=-,-;OMAPALT=CAAAAAAAATT,CAAAAAAATTACA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.5,0:11,5:36:18,0:36:18:12,0:6,0:8:10:99:9:6,4:5,1:2:7
chr11	17408251	.	G	A	83.45	PASS	AF=0.323529;AO=11;DP=34;FAO=11;FDP=34;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=17;FSRR=6;FWDB=0.00831595;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.352;QD=9.81721;RBI=0.115293;REFB=0.00537495;REVB=0.114993;RO=23;SAF=7;SAR=4;SRF=17;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130723;STB=0.57818;STBP=0.612;TYPE=snp;VARB=-0.0176566;OID=.;OPOS=17408251;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:34:34:23:23:11:11:0.323529:4:7:17:6:4:7:17:6
chr11	17408404	.	C	T	174.34	PASS	AF=0.366667;AO=22;DP=60;FAO=22;FDP=60;FR=.;FRO=38;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=28;FWDB=0.014805;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.471;QD=11.6229;RBI=0.056847;REFB=-0.00393109;REVB=-0.0548853;RO=38;SAF=11;SAR=11;SRF=10;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.261782;STB=0.649876;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=0.00481829;OID=.;OPOS=17408404;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:38:38:22:22:0.366667:11:11:10:28:11:11:10:28
chr11	17408630	.	C	T	177.97	PASS	AF=0.395833;AO=19;DP=48;FAO=19;FDP=48;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=0.00559317;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.173;QD=14.831;RBI=0.0157835;REFB=-0.0137285;REVB=-0.0147593;RO=28;SAF=6;SAR=13;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200255;STB=0.627448;STBP=0.183;TYPE=snp;VARB=0.0211632;OID=.;OPOS=17408630;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:28:29:19:19:0.395833:13:6:14:14:13:6:15:14
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chr11	17409069	.	G	A	68.82	PASS	AF=0.5;AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.0260135;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=226.322;QD=15.2931;RBI=0.0268657;REFB=-0.00501096;REVB=0.00671296;RO=9;SAF=5;SAR=4;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00619177;OID=.;OPOS=17409069;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:18:18:9:9:9:9:0.5:4:5:5:4:4:5:5:4
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chr11	17448704	.	G	A	220.58	PASS	AF=0.44898;AO=21;DP=48;FAO=22;FDP=49;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=4;FSRR=23;FWDB=0.00869846;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.551;QD=18.0067;RBI=0.00885033;REFB=-0.0224177;REVB=-0.00163252;RO=27;SAF=10;SAR=11;SRF=4;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.336307;STB=0.67554;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=0.0500628;OID=.;OPOS=17448704;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:49:27:27:21:22:0.44898:11:10:4:23:12:10:4:23
chr11	17449929	.	C	T	85.78	PASS	AF=0.37931;AO=11;DP=29;FAO=11;FDP=29;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=-0.0299183;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.895;QD=11.8315;RBI=0.0723114;REFB=0.0195383;REVB=0.0658319;RO=17;SAF=10;SAR=1;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.375057;STB=0.760267;STBP=0.095;TYPE=snp;VARB=-0.0206997;OID=.;OPOS=17449929;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:29:29:17:18:11:11:0.37931:1:10:12:5:1:10:12:6
chr11	17452492	.	G	A	249.52	PASS	AF=0.414286;AO=28;DP=69;FAO=29;FDP=70;FR=.;FRO=41;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=29;FWDB=0.00460527;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.69;QD=14.258;RBI=0.0315627;REFB=-0.00692462;REVB=0.0312249;RO=40;SAF=12;SAR=16;SRF=12;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1394;STB=0.574951;STBP=0.34;TYPE=snp;VARB=0.00753737;OID=.;OPOS=17452492;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:70:40:41:28:29:0.414286:16:12:12:28:17:12:12:29
chr11	17522638	.	G	A	257.97	PASS	AF=0.519231;AO=26;DP=50;FAO=27;FDP=52;FR=.;FRO=25;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.0270149;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.6038;QD=19.8438;RBI=0.0328205;REFB=-0.000174591;REVB=-0.0186382;RO=24;SAF=13;SAR=13;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.500713;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000257354;OID=.;OPOS=17522638;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:52:24:25:26:27:0.519231:13:13:12:12:13:14:13:12
chr11	17542439	.	T	C,G	1353.19	PASS	AF=0.835165,0.164835;AO=73,15;DP=88;FAO=76,15;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=48,3;FSAR=28,12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00249713,0.00299138;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=185.442,148.545;QD=59.4808;RBI=0.0817435,0.0759004;REFB=0,0;REVB=0.0817053,0.0758414;RO=0;SAF=48,3;SAR=25,12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-7.96369e-05,0.0787336;OID=.,.;OPOS=17542439,17542439;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:56:88:91:0:0:73,15:76,15:0.835165,0.164835:25,12:48,3:0:0:28,12:48,3:0:0
chr11	17593709	.	T	C	428.5	PASS	AF=0.411765;AO=49;DP=119;FAO=49;FDP=119;FR=.;FRO=70;FSAF=32;FSAR=17;FSRF=30;FSRR=40;FWDB=0.00862071;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=311.946;QD=14.4034;RBI=0.0212143;REFB=-0.0180557;REVB=-0.0193837;RO=69;SAF=32;SAR=17;SRF=30;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.22994;STB=0.633718;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.024974;OID=.;OPOS=17593709;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:119:69:70:49:49:0.411765:17:32:30:39:17:32:30:40
chr11	17596313	.	G	A	525.21	PASS	AF=0.515464;AO=50;DP=97;FAO=50;FDP=97;FR=.;FRO=47;FSAF=22;FSAR=28;FSRF=27;FSRR=20;FWDB=0.00854565;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.311;QD=21.6579;RBI=0.0133628;REFB=-0.00870417;REVB=0.0102731;RO=47;SAF=22;SAR=28;SRF=27;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117859;STB=0.565048;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=0.00921122;OID=.;OPOS=17596313;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:47:47:50:50:0.515464:28:22:27:20:28:22:27:20
chr11	17598187	.	G	A	47.19	PASS	AF=0.411765;AO=7;DP=17;FAO=7;FDP=17;FR=.;FRO=10;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=0.00189025;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.784;QD=11.1041;RBI=0.00608552;REFB=-0.0150605;REVB=-0.0057845;RO=9;SAF=2;SAR=5;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.263271;STB=0.689101;STBP=0.255;TYPE=snp;VARB=0.0219008;OID=.;OPOS=17598187;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:17:17:9:10:7:7:0.411765:5:2:5:4:5:2:6:4
chr11	17600033	.	G	A	471.43	PASS	AF=0.378378;AO=56;DP=150;FAO=56;FDP=148;FR=.;FRO=92;FSAF=31;FSAR=25;FSRF=42;FSRR=50;FWDB=0.0144388;FXX=0.0263141;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.571;QD=12.7414;RBI=0.014448;REFB=-0.00636295;REVB=0.000515856;RO=86;SAF=31;SAR=25;SRF=37;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131728;STB=0.560219;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=0.0188967;OID=.;OPOS=17600033;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:150:148:86:92:56:56:0.378378:25:31:37:49:25:31:42:50
chr11	17615203	.	G	A	185.59	PASS	AF=0.407407;AO=22;DP=54;FAO=22;FDP=54;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=0.00406355;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=295.758;QD=13.7477;RBI=0.00692646;REFB=-0.0119892;REVB=0.00560922;RO=32;SAF=10;SAR=12;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0177837;STB=0.510195;STBP=0.91;TYPE=snp;VARB=0.0221811;OID=.;OPOS=17615203;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:32:32:22:22:0.407407:12:10:14:18:12:10:14:18
chr11	17618490	.	C	T	286.41	PASS	AF=0.438356;AO=32;DP=73;FAO=32;FDP=73;FR=.;FRO=41;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=24;FSRR=17;FWDB=-0.0303456;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.241;QD=15.6935;RBI=0.0306326;REFB=-0.016484;REVB=0.00418368;RO=41;SAF=12;SAR=20;SRF=24;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.209963;STB=0.618482;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=0.0276668;OID=.;OPOS=17618490;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:41:41:32:32:0.438356:20:12:24:17:20:12:24:17
chr11	17627613	.	G	C	1233.4	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0244371;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.964;QD=60.166;RBI=0.0492299;REFB=0;REVB=0.0427365;RO=0;SAF=47;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000159373;OID=.;OPOS=17627613;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:77:82:0:0:77:82:1:30:47:0:0:33:49:0:0
chr11	17631751	.	C	T	92.96	PASS	AF=0.307692;AO=12;DP=39;FAO=12;FDP=39;FR=.;FRO=27;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=18;FWDB=0.0452826;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=73.197;QD=9.53485;RBI=0.0595404;REFB=0.00327241;REVB=0.0386593;RO=27;SAF=5;SAR=7;SRF=9;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100375;STB=0.560441;STBP=0.647;TYPE=snp;VARB=-0.0081338;OID=.;OPOS=17631751;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:39:39:27:27:12:12:0.307692:7:5:9:18:7:5:9:18
chr11	17632651	.	C	T	308.71	PASS	AF=0.384615;AO=34;DP=90;FAO=35;FDP=91;FR=.;FRO=56;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=36;FWDB=0.00604307;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.6559;QD=13.5698;RBI=0.00650937;REFB=-0.00724045;REVB=-0.00241934;RO=56;SAF=14;SAR=20;SRF=20;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0622245;STB=0.545429;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.0135687;OID=.;OPOS=17632651;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:91:56:56:34:35:0.384615:20:14:20:36:20:15:20:36
chr11	17656686	.	C	T	301.11	PASS	AF=0.4;AO=34;DP=85;FAO=34;FDP=85;FR=.;FRO=51;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=27;FSRR=24;FWDB=0.0615426;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.1254;QD=14.1696;RBI=0.0683372;REFB=0.0102696;REVB=0.0297066;RO=51;SAF=16;SAR=18;SRF=27;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0620224;STB=0.535249;STBP=0.624;TYPE=snp;VARB=-0.0120432;OID=.;OPOS=17656686;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:51:51:34:34:0.4:18:16:27:24:18:16:27:24
chr11	17663444	.	C	T	473.26	PASS	AF=0.516854;AO=46;DP=89;FAO=46;FDP=89;FR=.;FRO=43;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=23;FSRR=20;FWDB=0.00925977;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.45;QD=21.2703;RBI=0.013367;REFB=-0.0217372;REVB=-0.00964018;RO=43;SAF=23;SAR=23;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.030493;STB=0.516847;STBP=0.74;TYPE=snp;VARB=0.0178471;OID=.;OPOS=17663444;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:43:43:46:46:0.516854:23:23:23:20:23:23:23:20
chr11	17663742	.	G	C	359.85	PASS	AF=0.402062;AO=39;DP=96;FAO=39;FDP=97;FR=.;FRO=58;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=36;FSRR=22;FWDB=0.0237222;FXX=0.010203;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.641;QD=14.8392;RBI=0.043187;REFB=-0.0258302;REVB=-0.0360884;RO=57;SAF=24;SAR=15;SRF=36;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0180283;STB=0.503354;STBP=0.969;TYPE=snp;VARB=0.0371922;OID=.;OPOS=17663742;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:97:57:58:39:39:0.402062:15:24:36:21:15:24:36:22
chr11	17795089	.	G	A	152.19	PASS	AF=0.428571;AO=15;DP=40;FAO=18;FDP=42;FR=.;FRO=24;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=-0.0197097;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.237;QD=14.4947;RBI=0.0227508;REFB=-0.0211485;REVB=-0.0113633;RO=24;SAF=11;SAR=4;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13383;STB=0.610605;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=0.0224469;OID=.;OPOS=17795089;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:42:24:24:15:18:0.428571:4:11:15:9:4:14:15:9
chr11	17948311	.	T	C	766.46	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0142685;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.782;QD=63.8717;RBI=0.0359197;REFB=0;REVB=0.0329642;RO=0;SAF=31;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.32626e-05;OID=.;OPOS=17948311;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:17:31:0:0:17:31:0:0
chr11	18127530	.	A	ACCTCCT	122.31	PASS	AF=0.257143;AO=17;DP=73;FAO=18;FDP=70;FR=.;FRO=52;FSAF=2;FSAR=16;FSRF=27;FSRR=25;FWDB=-0.085421;FXX=0.0410903;HRUN=2;LEN=6;MLLD=227.605;QD=6.9892;RBI=0.0854528;REFB=-0.0214561;REVB=0.00232971;RO=52;SAF=2;SAR=15;SRF=28;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.562212;STB=0.849382;STBP=0.002;TYPE=ins;VARB=0.0554126;OID=.;OPOS=18127531;OREF=-;OALT=CCTCCT;OMAPALT=ACCTCCT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.257143:17:73:18:70:52:2:16:27:25:99:52:2:15:28:24
chr11	18159169	.	A	G	1339.76	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0157636;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.835;QD=62.3145;RBI=0.0289286;REFB=0;REVB=-0.0242563;RO=0;SAF=55;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.47494e-05;OID=.;OPOS=18159169;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:31:55:0:0:31:55:0:0
chr11	18159254	.	A	G	1466.1	PASS	AF=0.962264;AO=101;DP=106;FAO=102;FDP=106;FR=.;FRO=4;FSAF=55;FSAR=47;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.00595237;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.351;QD=55.3247;RBI=0.0286819;REFB=-0.0316133;REVB=-0.0280575;RO=4;SAF=55;SAR=46;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0213916;STB=0.51096;STBP=0.273;TYPE=snp;VARB=0.0017178;OID=.;OPOS=18159254;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:106:106:4:4:101:102:0.962264:46:55:1:3:47:55:1:3
chr11	18194827	.	C	G	870.33	PASS	AF=0.983871;AO=60;DP=61;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0307188;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.656;QD=56.1503;RBI=0.0410052;REFB=-0.165672;REVB=0.027162;RO=0;SAF=27;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.7886e-08;STB=0.509088;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.000527652;OID=.;OPOS=18194827;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:61:62:0:1:60:61:0.983871:33:27:0:0:34:27:1:0
chr11	18194878	.	T	G	1026.33	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0522403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.3931;QD=59.4971;RBI=0.0523777;REFB=0;REVB=-0.00379114;RO=0;SAF=35;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000431975;OID=.;OPOS=18194878;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:34:35:0:0:34:35:0:0
chr11	18194964	.	A	G	740.35	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0432081;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.642;QD=56.9502;RBI=0.0493997;REFB=0;REVB=0.0239456;RO=0;SAF=31;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.93989e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000369355;OID=.;OPOS=18194964;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:21:31:0:0:21:31:0:0
chr11	18195051	.	T	C	1026.28	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0250977;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=117.447;QD=59.4943;RBI=0.0347417;REFB=0;REVB=0.0240227;RO=0;SAF=43;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.59343e-06;OID=.;OPOS=18195051;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:68:69:0:0:68:69:1:25:43:0:0:25:44:0:0
chr11	18195448	.	C	T	972.87	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0230393;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.251;QD=58.9615;RBI=0.0331253;REFB=0;REVB=0.0238007;RO=0;SAF=26;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000143603;OID=.;OPOS=18195448;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:40:26:0:0:40:26:0:0
chr11	18210480	.	T	C	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0212222;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.473;QD=35.5759;RBI=0.0799339;REFB=0;REVB=0.0770652;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00126624;OID=.;OPOS=18210480;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:3:4:0:0:3:4:0:0
chr11	18231749	.	T	G	465.07	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0464405;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.2414;QD=58.1335;RBI=0.0508492;REFB=0;REVB=-0.0207104;RO=0;SAF=20;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000541176;OID=.;OPOS=18231749;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:12:20:0:0:12:20:0:0
chr11	18231915	.	T	C	432.7	PASS	AF=1;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0086297;FXX=0.0322477;HRUN=6;LEN=1;MLLD=299.74;QD=57.6937;RBI=0.0110634;REFB=0;REVB=-0.00692296;RO=0;SAF=18;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.28779e-06;OID=.;OPOS=18231915;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:30:0:0:30:30:1:12:18:0:0:12:18:0:0
chr11	18253176	.	C	T	411.11	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0182043;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.42;QD=56.7053;RBI=0.0287013;REFB=0;REVB=0.0221894;RO=0;SAF=11;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.32744e-05;OID=.;OPOS=18253176;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:18:11:0:0:18:11:0:0
chr11	18267027	.	C	T	1132.16	PASS	AF=0.987013;AO=74;DP=75;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0499293;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.4353;QD=58.8136;RBI=0.050059;REFB=0.00836547;REVB=0.00360124;RO=1;SAF=35;SAR=39;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0119765;STB=0.506171;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=-0.000118429;OID=.;OPOS=18267027;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:75:77:1:1:74:76:0.987013:39:35:0:1:40:36:0:1
chr11	18267463	.	A	G	294.98	PASS	AF=0.507937;AO=32;DP=64;FAO=32;FDP=63;FR=.;FRO=31;FSAF=22;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=11;FWDB=0.00995136;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.2202;QD=18.729;RBI=0.0203551;REFB=-0.076934;REVB=0.0177568;RO=30;SAF=22;SAR=10;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0534664;STB=0.523794;STBP=0.724;TYPE=snp;VARB=0.0369808;OID=.;OPOS=18267463;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:63:30:31:32:32:0.507937:10:22:19:11:10:22:20:11
chr11	18267471	.	A	G	215.03	PASS	AF=0.438596;AO=25;DP=57;FAO=25;FDP=57;FR=.;FRO=32;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=10;FWDB=0.0310236;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.88;QD=15.0901;RBI=0.0478961;REFB=-0.0177271;REVB=-0.0364907;RO=32;SAF=15;SAR=10;SRF=22;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0923399;STB=0.552198;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.0111647;OID=.;OPOS=18267471;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:32:32:25:25:0.438596:10:15:22:10:10:15:22:10
chr11	18267478	.	G	A	133.82	PASS	AF=0.326923;AO=17;DP=53;FAO=17;FDP=52;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=-0.0408051;FXX=0.0188644;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.4108;QD=10.2935;RBI=0.0457674;REFB=0.0017278;REVB=-0.0207269;RO=34;SAF=14;SAR=3;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.38964;STB=0.728465;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=-0.0151468;OID=.;OPOS=18267478;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:52:34:35:17:17:0.326923:3:14:18:16:3:14:19:16
chr11	18291321	.	T	C	629.72	PASS	AF=0.451389;AO=63;DP=143;FAO=65;FDP=144;FR=.;FRO=79;FSAF=33;FSAR=32;FSRF=38;FSRR=41;FWDB=0.00460059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.255;QD=17.4922;RBI=0.00513838;REFB=-0.00911403;REVB=-0.00228857;RO=79;SAF=33;SAR=30;SRF=38;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0426921;STB=0.514629;STBP=0.78;TYPE=snp;VARB=0.0124887;OID=.;OPOS=18291321;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:143:144:79:79:63:65:0.451389:30:33:38:41:32:33:38:41
chr11	18301129	.	AG	GA	45.06	PASS	AF=0.304348;AO=7;DP=23;FAO=7;FDP=23;FR=.;FRO=16;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.0158908;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=233.273;QD=7.83716;RBI=0.0186459;REFB=0.00635834;REVB=-0.00975464;RO=16;SAF=1;SAR=6;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.455337;STB=0.79317;STBP=0.103;TYPE=mnp;VARB=-0.013268;OID=.;OPOS=18301129;OREF=AG;OALT=GA;OMAPALT=GA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:23:23:16:16:7:7:0.304348:6:1:8:8:6:1:8:8
chr11	18327684	.	G	T	53.22	PASS	AF=0.258065;AO=9;DP=31;FAO=8;FDP=31;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.060031;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.926;QD=6.86663;RBI=0.0600325;REFB=-0.0058151;REVB=-0.000418479;RO=22;SAF=6;SAR=3;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.244319;STB=0.60948;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=0.0162362;OID=.;OPOS=18327684;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:31:31:22:23:9:8:0.258065:3:6:10:12:3:5:11:12
chr11	18333436	.	A	T	270.04	PASS	AF=0.531915;AO=25;DP=47;FAO=25;FDP=47;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=0.0189388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=298.759;QD=22.9824;RBI=0.019123;REFB=-0.00658621;REVB=0.00264814;RO=22;SAF=8;SAR=17;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0412452;STB=0.523058;STBP=0.769;TYPE=snp;VARB=0.00633263;OID=.;OPOS=18333436;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:22:22:25:25:0.531915:17:8:8:14:17:8:8:14
chr11	18388122	.	A	C	239.65	PASS	AF=0.490566;AO=26;DP=53;FAO=26;FDP=53;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=0.00589882;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=331.095;QD=18.0872;RBI=0.0168942;REFB=-0.0130203;REVB=-0.0158309;RO=27;SAF=11;SAR=15;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.019775;STB=0.511103;STBP=0.884;TYPE=snp;VARB=0.0138429;OID=.;OPOS=18388122;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:27:27:26:26:0.490566:15:11:12:15:15:11:12:15
chr11	18424451	.	C	T	1302.16	PASS	AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0218449;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.5;QD=62.0076;RBI=0.0222356;REFB=0;REVB=-0.00415037;RO=0;SAF=47;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.99643e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.28474e-05;OID=.;OPOS=18424451;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:37:47:0:0:37:47:0:0
chr11	18424487	.	A	G	1098.63	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00156891;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.5805;QD=60.1986;RBI=0.0131523;REFB=0;REVB=0.0130584;RO=0;SAF=45;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.1195e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.35324e-05;OID=.;OPOS=18424487;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:28:45:0:0:28:45:0:0
chr11	18467821	.	T	C	1208.96	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0249021;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=267.75;QD=61.2132;RBI=0.0267549;REFB=0;REVB=0.00978321;RO=0;SAF=36;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.89281e-05;OID=.;OPOS=18467821;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:43:36:0:0:43:36:0:0
chr11	18555901	.	C	G	715.44	PASS	AF=1;AO=46;DP=47;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0165092;FXX=0.0425441;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.126;QD=63.5945;RBI=0.0177012;REFB=0;REVB=0.00638582;RO=0;SAF=24;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000416936;OID=.;OPOS=18555901;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:45:0:0:46:45:1:22:24:0:0:22:23:0:0
chr11	18555949	.	T	C	851.25	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.015362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.569;QD=57.7121;RBI=0.0264848;REFB=0;REVB=0.0215744;RO=0;SAF=28;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.07751e-05;OID=.;OPOS=18555949;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:31:28:0:0:31:28:0:0
chr11	18600322	.	T	G	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0145211;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.081;QD=55.0984;RBI=0.0167704;REFB=0;REVB=0.00838953;RO=0;SAF=10;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.71087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.64032e-05;OID=.;OPOS=18600322;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:16:10:0:0:16:10:0:0
chr11	18724558	.	C	T	224.92	PASS	AF=0.488889;AO=22;DP=45;FAO=22;FDP=45;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=0.00659597;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.428;QD=19.9925;RBI=0.00853189;REFB=0.00201971;REVB=0.00541169;RO=21;SAF=6;SAR=16;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.278503;STB=0.660716;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=-0.00460116;OID=.;OPOS=18724558;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:21:23:22:22:0.488889:16:6:12:9:16:6:13:10
chr11	18735396	.	G	T	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00654091;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.791;QD=51.1846;RBI=0.0272457;REFB=0;REVB=0.0264489;RO=0;SAF=12;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000147065;OID=.;OPOS=18735396;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:8:12:0:0:8:12:0:0
chr11	18735947	.	T	C	718.63	PASS	AF=0.978723;AO=46;DP=48;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0458567;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.358;QD=61.1601;RBI=0.0462913;REFB=-0.103988;REVB=-0.0063283;RO=1;SAF=21;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0218604;STB=0.511623;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.00192464;OID=.;OPOS=18735947;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:48:47:1:1:46:46:0.978723:25:21:1:0:25:21:1:0
chr11	18737095	.	C	T	760.3	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0431398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.105;QD=56.3183;RBI=0.0437524;REFB=0;REVB=0.00729582;RO=0;SAF=20;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.88914e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000497242;OID=.;OPOS=18737095;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:54:0:0:53:54:1:33:20:0:0:33:21:0:0
chr11	18738281	.	C	T	393.13	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00434795;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.05;QD=56.1607;RBI=0.0268899;REFB=0;REVB=0.026536;RO=0;SAF=15;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000273513;OID=.;OPOS=18738281;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:13:15:0:0:13:15:0:0
chr11	18764026	.	G	C	135.98	PASS	AF=0.483871;AO=15;DP=31;FAO=15;FDP=31;FR=.;FRO=16;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=0.0148316;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=263.778;QD=17.5454;RBI=0.0259867;REFB=-0.0134814;REVB=-0.0213386;RO=14;SAF=12;SAR=3;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180048;STB=0.5817;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.00946254;OID=.;OPOS=18764026;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:14:16:15:15:0.483871:3:12:9:5:3:12:11:5
chr11	18956194	.	T	C	610.2	PASS	AF=0.560748;AO=60;DP=107;FAO=60;FDP=107;FR=.;FRO=47;FSAF=28;FSAR=32;FSRF=20;FSRR=27;FWDB=-0.00533052;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.981;QD=22.8112;RBI=0.00534063;REFB=-0.00470456;REVB=0.000328463;RO=47;SAF=28;SAR=32;SRF=20;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0332524;STB=0.518187;STBP=0.661;TYPE=snp;VARB=0.00389497;OID=.;OPOS=18956194;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:107:47:47:60:60:0.560748:32:28:20:27:32:28:20:27
chr11	19167850	.	A	G	1437.88	PASS	AF=0.989247;AO=92;DP=93;FAO=92;FDP=93;FR=.;FRO=1;FSAF=51;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0314478;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.1685;QD=61.8444;RBI=0.0365449;REFB=-0.0759583;REVB=-0.0186164;RO=0;SAF=51;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.99529e-08;STB=0.504853;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.000833177;OID=.;OPOS=19167850;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:93:93:0:1:92:92:0.989247:41:51:0:0:41:51:1:0
chr11	19245854	.	T	C	1387.42	PASS	AF=0.978261;AO=90;DP=92;FAO=90;FDP=92;FR=.;FRO=2;FSAF=46;FSAR=44;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00709127;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=137.029;QD=60.3226;RBI=0.0218743;REFB=0.0392608;REVB=0.020693;RO=2;SAF=46;SAR=44;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0201594;STB=0.510636;STBP=0.204;TYPE=snp;VARB=-0.000158878;OID=.;OPOS=19245854;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:92:92:2:2:90:90:0.978261:44:46:2:0:44:46:2:0
chr11	19612775	.	C	T	868.24	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0402306;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.611;QD=57.8826;RBI=0.0497412;REFB=0;REVB=-0.0292521;RO=0;SAF=22;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.79525e-05;OID=.;OPOS=19612775;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:38:22:0:0:38:22:0:0
chr11	19735987	.	A	G	387.42	PASS	AF=0.465116;AO=41;DP=86;FAO=40;FDP=86;FR=.;FRO=46;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=-0.0313944;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.999;QD=18.0196;RBI=0.0326337;REFB=-0.001691;REVB=-0.00890789;RO=45;SAF=23;SAR=18;SRF=22;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0680149;STB=0.552082;STBP=0.37;TYPE=snp;VARB=0.00283841;OID=.;OPOS=19735987;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:45:46:41:40:0.465116:18:23:22:23:17:23:22:24
chr11	19799526	.	CG	C	828.67	PASS	AF=0.545455;AO=72;DP=143;FAO=78;FDP=143;FR=.;FRO=65;FSAF=29;FSAR=49;FSRF=35;FSRR=30;FWDB=0.00858697;FXX=0.0205465;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.033;QD=23.1797;RBI=0.0106508;REFB=-0.0231353;REVB=-0.00630105;RO=65;SAF=23;SAR=49;SRF=35;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199801;STB=0.577831;STBP=0.05;TYPE=del;VARB=0.01255;OID=.;OPOS=19799527;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.545455:72:143:78:143:65:29:49:35:30:99:65:23:49:35:30
chr11	19854078	.	C	T	648.09	PASS	AF=0.503876;AO=65;DP=129;FAO=65;FDP=129;FR=.;FRO=64;FSAF=31;FSAR=34;FSRF=41;FSRR=23;FWDB=0.0049698;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.2813;QD=20.0959;RBI=0.00999684;REFB=-0.0117008;REVB=0.00867397;RO=63;SAF=31;SAR=34;SRF=41;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154719;STB=0.580759;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.0118555;OID=.;OPOS=19854078;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:129:129:63:64:65:65:0.503876:34:31:41:22:34:31:41:23
chr11	19901632	.	G	A	127.21	PASS	AF=0.340909;AO=15;DP=44;FAO=15;FDP=44;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=-0.000926763;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.7044;QD=11.5644;RBI=0.0178607;REFB=-0.0465559;REVB=-0.0178367;RO=28;SAF=8;SAR=7;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00263309;STB=0.512179;STBP=0.928;TYPE=snp;VARB=0.0484812;OID=.;OPOS=19901632;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:28:29:15:15:0.340909:7:8:15:13:7:8:16:13
chr11	19955500	.	A	G	1172.01	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0064408;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=307.408;QD=60.8836;RBI=0.00995662;REFB=0;REVB=0.00759278;RO=0;SAF=41;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.52206e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.46062e-07;OID=.;OPOS=19955500;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:36:41:0:0:36:41:0:0
chr11	19970558	.	T	C	914.0	PASS	AF=1;AO=63;DP=64;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00100488;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.073;QD=58.0315;RBI=0.043034;REFB=0;REVB=-0.0430223;RO=0;SAF=29;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.2034e-05;OID=.;OPOS=19970558;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:64:63:0:0:63:63:1:34:29:0:0:34:29:0:0
chr11	19970579	.	C	G,T	1332.47	PASS	AF=0.0909091,0.909091;AO=8,80;DP=88;FAO=8,80;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=5,46;FSAR=3,34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0204855,-0.00277254;FXX=0.0112347;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=22.8962,98.7824;QD=60.5669;RBI=0.0208758,0.0119747;REFB=0,0;REVB=-0.00401813,0.0116493;RO=0;SAF=5,46;SAR=3,34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=4.46938e-08,-3.3274e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.135153,-0.00046167;OID=.,.;OPOS=19970579,19970579;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:30:88:88:0:0:8,80:8,80:0.0909091,0.909091:3,34:5,46:0:0:3,34:5,46:0:0
chr11	20065673	.	G	T	834.4	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00302538;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.902;QD=57.5447;RBI=0.0533961;REFB=0;REVB=0.0533103;RO=0;SAF=25;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.2157e-05;OID=.;OPOS=20065673;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:33:25:0:0:33:25:0:0
chr11	20065779	.	C	G	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0190057;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.26;QD=44.6893;RBI=0.0198265;REFB=0;REVB=0.00564562;RO=0;SAF=5;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00125531;OID=.;OPOS=20065779;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:8:5:0:0:8:5:0:0
chr11	20067064	.	C	T	888.95	PASS	AF=1;AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.029391;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.336;QD=58.2918;RBI=0.0677072;REFB=0;REVB=0.0609953;RO=0;SAF=33;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000248707;OID=.;OPOS=20067064;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:61:0:0:61:61:1:28:33:0:0:28:33:0:0
chr11	20089725	.	T	C	813.2	PASS	AF=0.550725;AO=74;DP=139;FAO=76;FDP=138;FR=.;FRO=62;FSAF=29;FSAR=47;FSRF=25;FSRR=37;FWDB=0.00548541;FXX=0.0142847;HRUN=3;LEN=1;MLLD=68.5507;QD=23.571;RBI=0.0168652;REFB=-0.00206325;REVB=0.0159482;RO=63;SAF=29;SAR=45;SRF=26;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0182444;STB=0.510251;STBP=0.802;TYPE=snp;VARB=0.00221092;OID=.;OPOS=20089725;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:139:138:63:62:74:76:0.550725:45:29:26:37:47:29:25:37
chr11	20089792	.	G	C	723.79	PASS	AF=0.496503;AO=71;DP=144;FAO=71;FDP=143;FR=.;FRO=72;FSAF=37;FSAR=34;FSRF=34;FSRR=38;FWDB=-0.00933601;FXX=0.00694396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.6514;QD=20.246;RBI=0.0159208;REFB=-0.00867863;REVB=-0.0128961;RO=72;SAF=37;SAR=34;SRF=34;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0446343;STB=0.524609;STBP=0.58;TYPE=snp;VARB=0.00696353;OID=.;OPOS=20089792;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:144:143:72:72:71:71:0.496503:34:37:34:38:34:37:34:38
chr11	20089944	.	T	C	399.39	PASS	AF=0.573529;AO=38;DP=69;FAO=39;FDP=68;FR=.;FRO=29;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=0.0357971;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.97;QD=23.4932;RBI=0.0361143;REFB=0.0104282;REVB=-0.00477588;RO=29;SAF=19;SAR=19;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122173;STB=0.571393;STBP=0.203;TYPE=snp;VARB=-0.00752589;OID=.;OPOS=20089944;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:68:29:29:38:39:0.573529:19:19:10:19:19:20:10:19
chr11	20099112	.	A	T	740.43	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00923117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.172;QD=56.9562;RBI=0.0108912;REFB=0;REVB=-0.0057796;RO=0;SAF=26;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.06971e-05;OID=.;OPOS=20099112;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:26:26:0:0:26:26:0:0
chr11	20099541	.	C	T	319.6	PASS	AF=0.961538;AO=23;DP=24;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0615472;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.6525;QD=49.1687;RBI=0.0677954;REFB=-0.161078;REVB=0.0284283;RO=0;SAF=12;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.519984;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.00870152;OID=.;OPOS=20099541;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:24:26:0:1:23:25:0.961538:11:12:0:0:12:13:0:1
chr11	20101704	.	C	T	854.94	PASS	AF=1;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0383441;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.76;QD=57.9621;RBI=0.0500018;REFB=0;REVB=0.0320922;RO=0;SAF=14;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000141313;OID=.;OPOS=20101704;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:59:0:0:59:59:1:45:14:0:0:45:14:0:0
chr11	20101744	.	C	A	834.38	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00536972;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.017;QD=57.5434;RBI=0.0114795;REFB=0;REVB=0.0101462;RO=0;SAF=16;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.83285e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000107483;OID=.;OPOS=20101744;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:42:16:0:0:42:16:0:0
chr11	20112417	.	A	C	708.56	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00356945;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.276;QD=62.9829;RBI=0.044309;REFB=0;REVB=0.044165;RO=0;SAF=20;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.09779e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.51114e-05;OID=.;OPOS=20112417;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:25:20:0:0:25:20:0:0
chr11	20117232	.	T	C	1367.09	PASS	AF=0.978022;AO=90;DP=91;FAO=89;FDP=91;FR=.;FRO=2;FSAF=50;FSAR=39;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00216431;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.828;QD=60.092;RBI=0.0510733;REFB=-0.0377719;REVB=0.0510274;RO=0;SAF=51;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.24868e-08;STB=0.509802;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=0.000319474;OID=.;OPOS=20117232;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:91:91:0:2:90:89:0.978022:39:51:0:0:39:50:2:0
chr11	20124914	.	A	C	1030.04	PASS	AF=0.985915;AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=71;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0102404;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.334;QD=58.0304;RBI=0.0182047;REFB=-0.155585;REVB=-0.0150515;RO=1;SAF=40;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0116744;STB=0.506171;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.000985574;OID=.;OPOS=20124914;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:71:71:1:1:70:70:0.985915:30:40:1:0:30:40:1:0
chr11	20139937	.	C	T	134.25	PASS	AF=0.454545;AO=15;DP=33;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.00698021;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=290.366;QD=16.2721;RBI=0.00705128;REFB=-0.0072083;REVB=0.000998651;RO=17;SAF=9;SAR=6;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121036;STB=0.585251;STBP=0.422;TYPE=snp;VARB=0.0108626;OID=.;OPOS=20139937;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:17:18:15:15:0.454545:6:9:8:9:6:9:8:10
chr11	20140387	.	A	G	1014.16	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0530703;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=40.7741;QD=58.7919;RBI=0.0571878;REFB=0;REVB=-0.0213069;RO=0;SAF=9;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.95869e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000698412;OID=.;OPOS=20140387;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:67:69:0:0:67:69:1:58:9:0:0:60:9:0:0
chr11	20140471	.	A	G	766.12	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0849582;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=85.8939;QD=63.8431;RBI=0.0862062;REFB=0;REVB=0.0146155;RO=0;SAF=1;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000565126;OID=.;OPOS=20140471;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:47:1:0:0:47:1:0:0
chr11	20142377	.	GTCAC	G	538.56	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0117663;FXX=0;HRUN=1;LEN=4;MLLD=321.503;QD=59.8394;RBI=0.0326999;REFB=0;REVB=0.0305096;RO=0;SAF=19;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=2.7229e-05;OID=.;OPOS=20142378;OREF=TCAC;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:36:36:36:36:0:19:17:0:0:4:0:19:17:0:0
chr11	20142448	.	T	C	722.71	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0110708;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=54.3456;QD=62.8447;RBI=0.0111292;REFB=0;REVB=0.0011389;RO=0;SAF=20;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000146343;OID=.;OPOS=20142448;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:26:20:0:0:26:20:0:0
chr11	20429454	.	T	C	1092.29	PASS	AF=0.974026;AO=71;DP=73;FAO=75;FDP=77;FR=.;FRO=2;FSAF=41;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0122071;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.836;QD=56.7423;RBI=0.018145;REFB=-0.0971304;REVB=0.0134249;RO=2;SAF=40;SAR=31;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0295294;STB=0.514282;STBP=0.148;TYPE=snp;VARB=0.00031797;OID=.;OPOS=20429454;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:73:77:2:2:71:75:0.974026:31:40:0:2:34:41:0:2
chr11	20529886	.	G	A	1227.28	PASS	AF=1;AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000459717;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.524;QD=61.364;RBI=0.0342322;REFB=0;REVB=-0.0342291;RO=0;SAF=45;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.30416e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.62171e-05;OID=.;OPOS=20529886;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:80:80:0:0:80:80:1:35:45:0:0:35:45:0:0
chr11	20622975	.	G	A	251.52	PASS	AF=0.489796;AO=24;DP=49;FAO=24;FDP=49;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=0.0294424;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.4626;QD=20.5319;RBI=0.0470809;REFB=-0.0140342;REVB=0.036739;RO=25;SAF=9;SAR=15;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0985021;STB=0.555508;STBP=0.444;TYPE=snp;VARB=0.0151411;OID=.;OPOS=20622975;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:25:25:24:24:0.489796:15:9:12:13:15:9:12:13
chr11	20623023	.	C	T	223.55	PASS	AF=0.433333;AO=26;DP=60;FAO=26;FDP=60;FR=.;FRO=34;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=-0.000740002;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.722;QD=14.9034;RBI=0.00145457;REFB=-0.0176534;REVB=-0.00125227;RO=33;SAF=15;SAR=11;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00117732;STB=0.510463;STBP=0.913;TYPE=snp;VARB=0.0208932;OID=.;OPOS=20623023;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:33:34:26:26:0.433333:11:15:19:14:11:15:19:15
chr11	20623042	.	T	C	958.68	PASS	AF=0.985075;AO=66;DP=67;FAO=66;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00839015;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=246.149;QD=57.2343;RBI=0.0147042;REFB=0.0164263;REVB=0.0120755;RO=1;SAF=40;SAR=26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0178244;STB=0.509431;STBP=0.278;TYPE=snp;VARB=1.91439e-05;OID=.;OPOS=20623042;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:67:67:1:1:66:66:0.985075:26:40:0:1:26:40:0:1
chr11	20623156	.	C	G	820.28	PASS	AF=0.983607;AO=53;DP=55;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0416875;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.4693;QD=53.7885;RBI=0.191656;REFB=-0.153614;REVB=0.187068;RO=2;SAF=30;SAR=23;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00459838;STB=0.507934;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=0.0103695;OID=.;OPOS=20623156;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:55:61:2:1:53:60:0.983607:23:30:1:1:29:31:1:0
chr11	20629164	.	G	A	216.68	PASS	AF=0.4;AO=26;DP=65;FAO=26;FDP=65;FR=.;FRO=39;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=23;FWDB=-0.0521527;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.573;QD=13.3341;RBI=0.0572177;REFB=-0.00273214;REVB=-0.0235363;RO=38;SAF=16;SAR=10;SRF=15;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.227869;STB=0.622548;STBP=0.131;TYPE=snp;VARB=0.00453647;OID=.;OPOS=20629164;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:38:39:26:26:0.4:10:16:15:23:10:16:16:23
chr11	20639400	.	A	G	958.19	PASS	AF=1;AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0366034;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.203;QD=58.9657;RBI=0.0366704;REFB=0;REVB=-0.00221628;RO=0;SAF=26;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.10038e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000232567;OID=.;OPOS=20639400;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:65:0:0:65:65:1:39:26:0:0:39:26:0:0
chr11	20673867	.	G	A	693.48	PASS	AF=0.474026;AO=73;DP=154;FAO=73;FDP=154;FR=.;FRO=81;FSAF=40;FSAR=33;FSRF=36;FSRR=45;FWDB=0.0293401;FXX=0.0128197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.486;QD=18.0125;RBI=0.0307947;REFB=-0.00449812;REVB=0.00935265;RO=81;SAF=40;SAR=33;SRF=36;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0982376;STB=0.554356;STBP=0.218;TYPE=snp;VARB=0.00539327;OID=.;OPOS=20673867;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:154:154:81:81:73:73:0.474026:33:40:36:45:33:40:36:45
chr11	20676319	.	G	A	414.2	PASS	AF=0.442308;AO=46;DP=102;FAO=46;FDP=104;FR=.;FRO=58;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=30;FSRR=28;FWDB=-0.0022068;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=218.819;QD=15.9308;RBI=0.0136104;REFB=-0.00606908;REVB=0.0134303;RO=56;SAF=26;SAR=20;SRF=28;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0644937;STB=0.527015;STBP=0.645;TYPE=snp;VARB=0.00469037;OID=.;OPOS=20676319;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:104:56:58:46:46:0.442308:20:26:28:28:20:26:30:28
chr11	20805286	.	G	A	279.56	PASS	AF=0.956522;AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0184335;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.217;QD=48.6192;RBI=0.0326209;REFB=-0.12016;REVB=-0.0269134;RO=1;SAF=8;SAR=14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0542958;STB=0.529385;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=0.00138174;OID=.;OPOS=20805286;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:23:23:1:1:22:22:0.956522:14:8:1:0:14:8:1:0
chr11	21305927	.	T	C	1788.29	PASS	AF=0.991597;AO=118;DP=119;FAO=118;FDP=119;FR=.;FRO=1;FSAF=58;FSAR=60;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00276857;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.573;QD=60.1108;RBI=0.011251;REFB=-0.0729773;REVB=0.010905;RO=1;SAF=58;SAR=60;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00811878;STB=0.504273;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.000215895;OID=.;OPOS=21305927;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:119:119:1:1:118:118:0.991597:60:58:1:0:60:58:1:0
chr11	22696451	.	A	G	285.43	PASS	AF=0.484848;AO=28;DP=62;FAO=32;FDP=66;FR=.;FRO=34;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=-0.0230694;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.249;QD=17.2988;RBI=0.0687642;REFB=-0.00649193;REVB=0.064779;RO=33;SAF=18;SAR=10;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156382;STB=0.532422;STBP=0.6;TYPE=snp;VARB=0.00750418;OID=.;OPOS=22696451;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:66:33:34:28:32:0.484848:10:18:16:17:14:18:17:17
chr11	22709973	.	C	A	1737.11	PASS	AF=0.991379;AO=115;DP=116;FAO=115;FDP=116;FR=.;FRO=1;FSAF=53;FSAR=62;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00197782;FXX=0.00854628;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.6646;QD=59.9002;RBI=0.0122195;REFB=0.0743249;REVB=-0.0120584;RO=1;SAF=53;SAR=62;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00887576;STB=0.504672;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=8.67035e-05;OID=.;OPOS=22709973;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:116:116:1:1:115:115:0.991379:62:53:1:0:62:53:1:0
chr11	22834189	.	C	T	342.46	PASS	AF=0.386792;AO=38;DP=105;FAO=41;FDP=106;FR=.;FRO=65;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=26;FSRR=39;FWDB=0.0375327;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.5344;QD=12.9229;RBI=0.0518881;REFB=-0.0257044;REVB=-0.0358283;RO=66;SAF=16;SAR=22;SRF=27;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0136275;STB=0.524424;STBP=0.702;TYPE=snp;VARB=0.0305788;OID=.;OPOS=22834189;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:106:66:65:38:41:0.386792:22:16:27:39:23:18:26:39
chr11	22881002	.	C	T	1358.59	PASS	AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000436254;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.249;QD=62.4639;RBI=0.00299019;REFB=0;REVB=-0.00295819;RO=0;SAF=42;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.519e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.09036e-05;OID=.;OPOS=22881002;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:45:42:0:0:45:42:0:0
chr11	24759855	.	G	A	337.4	PASS	AF=0.522388;AO=35;DP=67;FAO=35;FDP=67;FR=.;FRO=32;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=-0.0185186;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.819;QD=20.143;RBI=0.0188142;REFB=-0.0310089;REVB=-0.00332224;RO=32;SAF=16;SAR=19;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0170599;STB=0.509461;STBP=0.892;TYPE=snp;VARB=0.0146003;OID=.;OPOS=24759855;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:32:32:35:35:0.522388:19:16:14:18:19:16:14:18
chr11	24784862	.	A	T	2906.22	PASS	AF=0.994624;AO=186;DP=186;FAO=185;FDP=186;FR=.;FRO=1;FSAF=77;FSAR=108;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0382216;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.643;QD=62.4993;RBI=0.0401917;REFB=0.00485822;REVB=0.0124293;RO=0;SAF=77;SAR=109;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.502304;STBP=0.486;TYPE=snp;VARB=-2.46057e-06;OID=.;OPOS=24784862;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:186:186:0:1:186:185:0.994624:109:77:0:0:108:77:0:1
chr11	25098938	.	G	C	2601.96	PASS	AF=1;AO=155;DP=157;FAO=169;FDP=169;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=115;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.106032;FXX=0.00588201;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.0535;QD=61.5849;RBI=0.10624;REFB=0;REVB=-0.00663771;RO=0;SAF=42;SAR=113;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.44487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000364914;OID=.;OPOS=25098938;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:157:169:0:0:155:169:1:113:42:0:0:115:54:0:0
chr11	26481611	.	G	A	508.3	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100281;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.3;QD=58.0909;RBI=0.0308335;REFB=0;REVB=0.0291571;RO=0;SAF=25;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000276291;OID=.;OPOS=26481611;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:35:0:0:34:35:1:9:25:0:0:9:26:0:0
chr11	26568966	.	A	G	755.75	PASS	AF=0.51049;AO=73;DP=144;FAO=73;FDP=143;FR=.;FRO=70;FSAF=40;FSAR=33;FSRF=30;FSRR=40;FWDB=0.00136551;FXX=0.0137922;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.866;QD=21.1398;RBI=0.03133;REFB=-0.0102366;REVB=-0.0313003;RO=69;SAF=40;SAR=33;SRF=30;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.099893;STB=0.558301;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=0.00891772;OID=.;OPOS=26568966;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:144:143:69:70:73:73:0.51049:33:40:30:39:33:40:30:40
chr11	26586801	.	G	A	457.19	PASS	AF=0.475728;AO=49;DP=103;FAO=49;FDP=103;FR=.;FRO=54;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=21;FSRR=33;FWDB=-0.00561678;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=174.575;QD=17.7549;RBI=0.00608057;REFB=-0.00269084;REVB=0.00232918;RO=53;SAF=24;SAR=25;SRF=20;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10562;STB=0.553018;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.00368624;OID=.;OPOS=26586801;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:103:53:54:49:49:0.475728:25:24:20:33:25:24:21:33
chr11	26587133	.	T	C	824.54	PASS	AF=0.584615;AO=76;DP=130;FAO=76;FDP=130;FR=.;FRO=54;FSAF=41;FSAR=35;FSRF=21;FSRR=33;FWDB=0.0220276;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.519;QD=25.3705;RBI=0.032057;REFB=-0.0177226;REVB=0.0232902;RO=53;SAF=41;SAR=35;SRF=20;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121999;STB=0.562307;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=0.0106362;OID=.;OPOS=26587133;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:130:130:53:54:76:76:0.584615:35:41:20:33:35:41:21:33
chr11	26621117	.	A	C	504.5	PASS	AF=0.388158;AO=59;DP=152;FAO=59;FDP=152;FR=.;FRO=93;FSAF=19;FSAR=40;FSRF=34;FSRR=59;FWDB=0.0013736;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.189;QD=13.2764;RBI=0.0153102;REFB=-0.0119884;REVB=-0.0152485;RO=93;SAF=19;SAR=40;SRF=34;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0527084;STB=0.529857;STBP=0.601;TYPE=snp;VARB=0.0188346;OID=.;OPOS=26621117;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:152:152:93:93:59:59:0.388158:40:19:34:59:40:19:34:59
chr11	26677947	.	C	T	532.01	PASS	AF=0.417266;AO=58;DP=139;FAO=58;FDP=139;FR=.;FRO=81;FSAF=35;FSAR=23;FSRF=48;FSRR=33;FWDB=-0.00677019;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.8664;QD=15.3097;RBI=0.0130755;REFB=0.00490843;REVB=-0.0111863;RO=79;SAF=35;SAR=23;SRF=46;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.022614;STB=0.506589;STBP=0.888;TYPE=snp;VARB=-0.00520171;OID=.;OPOS=26677947;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:139:139:79:81:58:58:0.417266:23:35:46:33:23:35:48:33
chr11	26692733	.	T	C	375.37	PASS	AF=0.378151;AO=45;DP=119;FAO=45;FDP=119;FR=.;FRO=74;FSAF=19;FSAR=26;FSRF=34;FSRR=40;FWDB=0.00636139;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.9795;QD=12.6174;RBI=0.00949315;REFB=0.0221628;REVB=-0.00704646;RO=74;SAF=19;SAR=26;SRF=34;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0413629;STB=0.523546;STBP=0.704;TYPE=snp;VARB=-0.040497;OID=.;OPOS=26692733;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:119:74:74:45:45:0.378151:26:19:34:40:26:19:34:40
chr11	26692742	.	G	A	368.58	PASS	AF=0.385965;AO=44;DP=115;FAO=44;FDP=114;FR=.;FRO=70;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=33;FSRR=37;FWDB=0.0209731;FXX=0.0086949;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.881;QD=12.9324;RBI=0.0242389;REFB=0.00712073;REVB=-0.0121512;RO=69;SAF=19;SAR=25;SRF=32;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0348173;STB=0.524605;STBP=0.677;TYPE=snp;VARB=-0.0135848;OID=.;OPOS=26692742;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:114:69:70:44:44:0.385965:25:19:32:37:25:19:33:37
chr11	26702664	.	C	T	1104.17	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000390886;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.4904;QD=59.685;RBI=0.0145138;REFB=0;REVB=-0.0145085;RO=0;SAF=35;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000539828;OID=.;OPOS=26702664;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:74:0:0:72:74:1:37:35:0:0:39:35:0:0
chr11	26743115	.	G	A	371.21	PASS	AF=0.448276;AO=39;DP=88;FAO=39;FDP=87;FR=.;FRO=48;FSAF=26;FSAR=13;FSRF=22;FSRR=26;FWDB=-0.0026371;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.692;QD=17.067;RBI=0.00807365;REFB=-0.00106319;REVB=-0.00763083;RO=48;SAF=26;SAR=13;SRF=22;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.211609;STB=0.618985;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.000603468;OID=.;OPOS=26743115;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:87:48:48:39:39:0.448276:13:26:22:26:13:26:22:26
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chr11	27018626	.	G	A	292.82	PASS	AF=0.470588;AO=32;DP=68;FAO=32;FDP=68;FR=.;FRO=36;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=0.0217978;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=221.612;QD=17.2244;RBI=0.0220347;REFB=0.000909037;REVB=0.00322191;RO=36;SAF=14;SAR=18;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00665208;STB=0.503729;STBP=0.963;TYPE=snp;VARB=-0.000944667;OID=.;OPOS=27018626;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:36:36:32:32:0.470588:18:14:16:20:18:14:16:20
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chr11	27077118	.	C	T	990.65	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.020259;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=236.758;QD=59.1432;RBI=0.0222686;REFB=0;REVB=-0.00924471;RO=0;SAF=28;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.74073e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.37045e-05;OID=.;OPOS=27077118;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:39:28:0:0:39:28:0:0
chr11	27114788	.	C	T	376.91	PASS	AF=0.47561;AO=39;DP=82;FAO=39;FDP=82;FR=.;FRO=43;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=-0.0188716;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.97;QD=18.3858;RBI=0.0292689;REFB=-0.00397967;REVB=-0.0223726;RO=42;SAF=19;SAR=20;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0102296;STB=0.500625;STBP=0.982;TYPE=snp;VARB=0.00356024;OID=.;OPOS=27114788;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:42:43:39:39:0.47561:20:19:20:22:20:19:21:22
chr11	27388910	.	T	C	611.95	PASS	AF=0.578947;AO=55;DP=95;FAO=55;FDP=95;FR=.;FRO=40;FSAF=28;FSAR=27;FSRF=16;FSRR=24;FWDB=-0.00831887;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.413;QD=25.7664;RBI=0.0130004;REFB=-0.0122324;REVB=0.00999038;RO=40;SAF=28;SAR=27;SRF=16;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0839657;STB=0.545855;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=0.00899581;OID=.;OPOS=27388910;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:40:40:55:55:0.578947:27:28:16:24:27:28:16:24
chr11	27390089	.	T	C	1086.54	PASS	AF=0.986486;AO=73;DP=74;FAO=73;FDP=74;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0132069;FXX=0.0133316;HRUN=3;LEN=1;MLLD=119.489;QD=58.7319;RBI=0.0601669;REFB=0.0602326;REVB=-0.0586996;RO=1;SAF=40;SAR=33;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0116794;STB=0.506171;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=-0.000562655;OID=.;OPOS=27390089;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:74:74:1:1:73:73:0.986486:33:40:1:0:33:40:1:0
chr11	27517670	.	T	C	358.18	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.012313;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.62;QD=55.105;RBI=0.0433667;REFB=0;REVB=0.041582;RO=0;SAF=12;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000312373;OID=.;OPOS=27517670;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:26:0:0:24:26:1:12:12:0:0:14:12:0:0
chr11	27679662	.	T	C	917.88	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.014284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.383;QD=58.2778;RBI=0.0344412;REFB=0;REVB=0.0313395;RO=0;SAF=27;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000264356;OID=.;OPOS=27679662;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:63:0:0:61:63:1:34:27:0:0:35:28:0:0
chr11	27679916	.	C	T	398.87	PASS	AF=0.471264;AO=41;DP=87;FAO=41;FDP=87;FR=.;FRO=46;FSAF=28;FSAR=13;FSRF=28;FSRR=18;FWDB=0.00955515;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.493;QD=18.3389;RBI=0.0164924;REFB=-0.0100793;REVB=-0.0134425;RO=45;SAF=28;SAR=13;SRF=27;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0864362;STB=0.543838;STBP=0.476;TYPE=snp;VARB=0.0125983;OID=.;OPOS=27679916;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:45:46:41:41:0.471264:13:28:27:18:13:28:28:18
chr11	28057820	.	C	T	720.04	PASS	AF=0.455621;AO=75;DP=167;FAO=77;FDP=169;FR=.;FRO=92;FSAF=31;FSAR=46;FSRF=45;FSRR=47;FWDB=-0.00678795;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.2116;QD=17.0423;RBI=0.00678993;REFB=-0.007227;REVB=-0.000163924;RO=91;SAF=31;SAR=44;SRF=45;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0811937;STB=0.548036;STBP=0.273;TYPE=snp;VARB=0.00706851;OID=.;OPOS=28057820;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:167:169:91:92:75:77:0.455621:44:31:45:46:46:31:45:47
chr11	28080584	.	CTTTTTT	CTTTTT,CTTTTTC	179.4	PASS	AF=0.265957,0.170213;AO=34,12;DP=98;FAO=25,16;FDP=94;FR=.;FRO=53;FSAF=7,15;FSAR=18,1;FSRF=11;FSRR=42;FWDB=-0.251721,-0.0221657;FXX=0.0408122;HRUN=6,6;LEN=1,1;MLLD=8.72113,26.3319;QD=7.63391;RBI=0.260179,0.0478612;REFB=-0.145879,-0.0791453;REVB=-0.0657981,-0.042419;RO=41;SAF=8,11;SAR=26,1;SRF=8;SRR=33;SSEN=0.417163,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0563306,0.753385;STB=0.564468,0.960806;STBP=0.502,0;TYPE=del,snp;VARB=0.0546889,0.0806436;OID=.,.;OPOS=28080585,28080590;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=CTTTTT,CTTTTTC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.265957,0.170213:34,12:98:25,16:94:53:7,15:18,1:11:42:83:41:8,11:26,1:8:33
chr11	28134974	.	C	A	242.4	PASS	AF=0.376623;AO=29;DP=77;FAO=29;FDP=77;FR=.;FRO=48;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=28;FSRR=20;FWDB=-0.00893132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.398;QD=12.5923;RBI=0.0214339;REFB=-0.00181011;REVB=0.0194845;RO=48;SAF=19;SAR=10;SRF=28;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0834898;STB=0.548043;STBP=0.557;TYPE=snp;VARB=0.0030205;OID=.;OPOS=28134974;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:48:48:29:29:0.376623:10:19:28:20:10:19:28:20
chr11	30255185	.	C	T	920.11	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00156507;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.16;QD=58.4194;RBI=0.0114533;REFB=0;REVB=0.0113458;RO=0;SAF=38;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.79867e-05;OID=.;OPOS=30255185;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:25:38:0:0:25:38:0:0
chr11	31458730	.	T	G	411.12	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0147099;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.576;QD=56.7058;RBI=0.0174045;REFB=0;REVB=0.00930235;RO=0;SAF=10;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.657e-05;OID=.;OPOS=31458730;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:19:10:0:0:19:10:0:0
chr11	31838128	.	G	A	729.0	PASS	AF=1;AO=50;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0343321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.029;QD=57.1767;RBI=0.0576533;REFB=0;REVB=-0.0463164;RO=0;SAF=21;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.20481e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.66561e-05;OID=.;OPOS=31838128;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:50:51:1:29:21:0:0:29:22:0:0
chr11	32124579	.	C	T	224.62	PASS	AF=0.470588;AO=24;DP=51;FAO=24;FDP=51;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.000191116;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.342;QD=17.6173;RBI=0.0195663;REFB=0.00910126;REVB=-0.0195653;RO=26;SAF=10;SAR=14;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0421909;STB=0.515038;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=-0.0154445;OID=.;OPOS=32124579;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:26:27:24:24:0.470588:14:10:12:14:14:10:12:15
chr11	32124978	.	T	C	183.87	PASS	AF=0.463415;AO=19;DP=41;FAO=19;FDP=41;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=5;FWDB=-0.00516611;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.9655;QD=17.9385;RBI=0.0139464;REFB=0.0105849;REVB=0.0129543;RO=22;SAF=8;SAR=11;SRF=17;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.323215;STB=0.682205;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=-0.00719073;OID=.;OPOS=32124978;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:22:22:19:19:0.463415:11:8:17:5:11:8:17:5
chr11	32125961	.	C	T	165.73	PASS	AF=0.391304;AO=18;DP=46;FAO=18;FDP=46;FR=.;FRO=28;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=-1.42401e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.812;QD=14.4112;RBI=0.0533464;REFB=-0.0070559;REVB=-0.0533464;RO=28;SAF=5;SAR=13;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.383032;STB=0.721975;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.0183077;OID=.;OPOS=32125961;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:28:28:18:18:0.391304:13:5:18:10:13:5:18:10
chr11	32635932	.	T	C	287.64	PASS	AF=0.492063;AO=31;DP=62;FAO=31;FDP=63;FR=.;FRO=32;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=-0.0154878;FXX=0.0156226;HRUN=3;LEN=1;MLLD=149.929;QD=18.2631;RBI=0.0166999;REFB=-0.0208569;REVB=-0.00624622;RO=31;SAF=15;SAR=16;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0289507;STB=0.507687;STBP=0.907;TYPE=snp;VARB=0.0208664;OID=.;OPOS=32635932;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:63:31:32:31:31:0.492063:16:15:14:17:16:15:15:17
chr11	32657266	.	T	C	281.65	PASS	AF=0.415584;AO=32;DP=77;FAO=32;FDP=77;FR=.;FRO=45;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=22;FSRR=23;FWDB=0.00572467;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.064;QD=14.6312;RBI=0.0135021;REFB=0.00559977;REVB=0.0122285;RO=45;SAF=19;SAR=13;SRF=22;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109251;STB=0.561999;STBP=0.354;TYPE=snp;VARB=-0.00680721;OID=.;OPOS=32657266;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:45:45:32:32:0.415584:13:19:22:23:13:19:22:23
chr11	32722320	.	A	T	445.73	PASS	AF=0.37931;AO=53;DP=141;FAO=55;FDP=145;FR=.;FRO=90;FSAF=34;FSAR=21;FSRF=43;FSRR=47;FWDB=0.00980195;FXX=0.00684885;HRUN=7;LEN=1;MLLD=33.4007;QD=12.2961;RBI=0.0326116;REFB=-0.0379334;REVB=-0.0311037;RO=88;SAF=34;SAR=19;SRF=41;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196107;STB=0.588412;STBP=0.116;TYPE=snp;VARB=0.0547405;OID=.;OPOS=32722320;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:141:145:88:90:53:55:0.37931:19:34:41:47:21:34:43:47
chr11	32874926	.	G	A	565.87	PASS	AF=0.974359;AO=39;DP=40;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00229836;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.4487;QD=58.0378;RBI=0.00988746;REFB=-0.127237;REVB=0.00961662;RO=0;SAF=25;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.517232;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.00206596;OID=.;OPOS=32874926;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:40:39:0:1:39:38:0.974359:14:25:0:0:14:24:0:1
chr11	32954344	.	G	A	689.38	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00254744;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.436;QD=62.6705;RBI=0.0232122;REFB=0;REVB=-0.023072;RO=0;SAF=24;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.30465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000177235;OID=.;OPOS=32954344;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:20:24:0:0:20:24:0:0
chr11	32956244	.	A	G	207.08	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0588925;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.4621;QD=48.724;RBI=0.107986;REFB=0;REVB=0.0905128;RO=0;SAF=6;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00554986;OID=.;OPOS=32956244;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:11:6:0:0:11:6:0:0
chr11	32956620	.	A	G	564.28	PASS	AF=0.974359;AO=37;DP=38;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0325263;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.319;QD=57.8752;RBI=0.0337938;REFB=-0.144735;REVB=-0.00916835;RO=0;SAF=27;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.67388e-08;STB=0.509086;STBP=0.613;TYPE=snp;VARB=0.00155954;OID=.;OPOS=32956620;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:38:39:0:1:37:38:0.974359:10:27:0:0:11:27:1:0
chr11	33053107	.	C	T	327.87	PASS	AF=0.578947;AO=33;DP=57;FAO=33;FDP=57;FR=.;FRO=24;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=0.00661396;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.197;QD=23.0082;RBI=0.0354181;REFB=-0.0145243;REVB=-0.0347951;RO=23;SAF=16;SAR=17;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0922285;STB=0.558819;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=0.0169136;OID=.;OPOS=33053107;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:23:24:33:33:0.578947:17:16:14:9:17:16:15:9
chr11	33054958	.	A	G	153.93	PASS	AF=0.358491;AO=19;DP=53;FAO=19;FDP=53;FR=.;FRO=34;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=0.0255966;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.065;QD=11.617;RBI=0.0260142;REFB=0.00541076;REVB=0.00464279;RO=33;SAF=6;SAR=13;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.286419;STB=0.659059;STBP=0.095;TYPE=snp;VARB=-0.00907932;OID=.;OPOS=33054958;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:33:34:19:19:0.358491:13:6:19:14:13:6:19:15
chr11	33065394	.	C	T	180.09	PASS	AF=0.353846;AO=23;DP=65;FAO=23;FDP=65;FR=.;FRO=42;FSAF=5;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=22;FWDB=-0.00927971;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.467;QD=11.0822;RBI=0.0202684;REFB=0.00648604;REVB=-0.0180193;RO=42;SAF=5;SAR=18;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.326521;STB=0.692126;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=-0.0170427;OID=.;OPOS=33065394;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:42:42:23:23:0.353846:18:5:20:22:18:5:20:22
chr11	33076191	.	T	C	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00768599;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.937;QD=51.1835;RBI=0.0137993;REFB=0;REVB=-0.0114606;RO=0;SAF=12;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.16578e-05;OID=.;OPOS=33076191;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:8:12:0:0:8:12:0:0
chr11	33078251	.	A	T	557.7	PASS	AF=0.544554;AO=55;DP=101;FAO=55;FDP=101;FR=.;FRO=46;FSAF=32;FSAR=23;FSRF=29;FSRR=17;FWDB=0.0154338;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=272.997;QD=22.0869;RBI=0.0173166;REFB=-0.012392;REVB=0.00785272;RO=46;SAF=32;SAR=23;SRF=29;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0417793;STB=0.522914;STBP=0.666;TYPE=snp;VARB=0.0104658;OID=.;OPOS=33078251;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:101:46:46:55:55:0.544554:23:32:29:17:23:32:29:17
chr11	33564123	.	T	C	306.33	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0126858;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.609;QD=53.2743;RBI=0.0179824;REFB=0;REVB=0.0127451;RO=0;SAF=12;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.73147e-07;OID=.;OPOS=33564123;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:11:12:0:0:11:12:0:0
chr11	33565593	.	C	T	801.32	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0173081;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.581;QD=57.2368;RBI=0.0391223;REFB=0;REVB=0.0350854;RO=0;SAF=27;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000358218;OID=.;OPOS=33565593;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:29:27:0:0:29:27:0:0
chr11	33581306	.	G	A	754.4	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0107621;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.6089;QD=56.9355;RBI=0.0224913;REFB=0;REVB=0.0197493;RO=0;SAF=17;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.19417e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000209216;OID=.;OPOS=33581306;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:36:17:0:0:36:17:0:0
chr11	33631376	.	T	C	240.39	PASS	AF=0.5;AO=23;DP=46;FAO=23;FDP=46;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=6;FWDB=-0.0190463;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.861;QD=20.9037;RBI=0.0246815;REFB=-0.00952959;REVB=-0.0156975;RO=22;SAF=12;SAR=11;SRF=16;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181793;STB=0.609852;STBP=0.151;TYPE=snp;VARB=0.00552916;OID=.;OPOS=33631376;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:22:23:23:23:0.5:11:12:16:6:11:12:17:6
chr11	33631423	.	G	A	344.67	PASS	AF=0.529412;AO=32;DP=64;FAO=36;FDP=68;FR=.;FRO=32;FSAF=26;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=-0.0043827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.974;QD=20.2747;RBI=0.0339263;REFB=-0.0159123;REVB=0.033642;RO=30;SAF=26;SAR=6;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.308003;STB=0.601792;STBP=0.104;TYPE=snp;VARB=0.0171181;OID=.;OPOS=33631423;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:68:30:32:32:36:0.529412:6:26:16:14:10:26:17:15
chr11	33640104	.	A	C	210.27	PASS	AF=0.444444;AO=24;DP=54;FAO=24;FDP=54;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=0.0160611;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.876;QD=15.5754;RBI=0.0164857;REFB=-0.012822;REVB=0.00371745;RO=30;SAF=12;SAR=12;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0652725;STB=0.537006;STBP=0.632;TYPE=snp;VARB=0.0190365;OID=.;OPOS=33640104;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:30:30:24:24:0.444444:12:12:13:17:12:12:13:17
chr11	33667333	.	A	G	204.0	PASS	AF=0.526316;AO=20;DP=39;FAO=20;FDP=38;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.00767857;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.048;QD=21.4737;RBI=0.00789827;REFB=-0.0144408;REVB=0.00184993;RO=18;SAF=11;SAR=9;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0523046;STB=0.529383;STBP=0.722;TYPE=snp;VARB=0.0204931;OID=.;OPOS=33667333;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:38:18:18:20:20:0.526316:9:11:11:7:9:11:11:7
chr11	33689652	.	G	A	195.2	PASS	AF=0.418182;AO=23;DP=55;FAO=23;FDP=55;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=-0.0117301;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.697;QD=14.1965;RBI=0.0380775;REFB=-0.0159468;REVB=0.0362257;RO=32;SAF=11;SAR=12;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0097023;STB=0.505542;STBP=0.954;TYPE=snp;VARB=0.0169812;OID=.;OPOS=33689652;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:32:32:23:23:0.418182:12:11:15:17:12:11:15:17
chr11	33886294	.	A	G	363.05	PASS	AF=0.419355;AO=39;DP=93;FAO=39;FDP=93;FR=.;FRO=54;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=25;FSRR=29;FWDB=-0.0531028;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.226;QD=15.6149;RBI=0.0540028;REFB=0.00698373;REVB=0.00981789;RO=54;SAF=20;SAR=19;SRF=25;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0512441;STB=0.528911;STBP=0.666;TYPE=snp;VARB=-0.00999383;OID=.;OPOS=33886294;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:54:54:39:39:0.419355:19:20:25:29:19:20:25:29
chr11	34093349	.	AT	A	918.78	PASS	AF=1;AO=94;DP=115;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.113483;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=11.5936;QD=31.6821;RBI=0.276068;REFB=0;REVB=0.251664;RO=6;SAF=55;SAR=39;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0.368421;SSSB=0.0484798;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00176364;OID=.;OPOS=34093350;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:94:115:116:116:0:67:49:0:0:17:6:55:39:1:5
chr11	34122369	.	G	T	1358.62	PASS	AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00528072;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=252.747;QD=62.4651;RBI=0.00565375;REFB=0;REVB=0.00201963;RO=0;SAF=56;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.00429e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.3804e-06;OID=.;OPOS=34122369;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:31:56:0:0:31:56:0:0
chr11	34152939	.	T	C	1403.66	PASS	AF=0.989011;AO=90;DP=92;FAO=90;FDP=91;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00132259;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.889;QD=61.6995;RBI=0.0752725;REFB=0.126;REVB=0.0752609;RO=1;SAF=37;SAR=53;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00885968;STB=0.504672;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=-0.000279592;OID=.;OPOS=34152939;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:92:91:1:1:90:90:0.989011:53:37:0:1:53:37:0:1
chr11	34154641	.	C	T	471.91	PASS	AF=0.970588;AO=33;DP=34;FAO=33;FDP=34;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00577073;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=87.0587;QD=55.5192;RBI=0.0130732;REFB=0.00589757;REVB=0.0117306;RO=1;SAF=9;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0490904;STB=0.526299;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=-0.00242676;OID=.;OPOS=34154641;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:34:34:1:1:33:33:0.970588:24:9:1:0:24:9:1:0
chr11	34378381	.	G	C	833.99	PASS	AF=0.534247;AO=78;DP=146;FAO=78;FDP=146;FR=.;FRO=68;FSAF=36;FSAR=42;FSRF=28;FSRR=40;FWDB=-0.0129275;FXX=0.00680226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.949;QD=22.8491;RBI=0.0238231;REFB=-0.0428382;REVB=0.0200106;RO=67;SAF=36;SAR=42;SRF=28;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0371721;STB=0.523398;STBP=0.55;TYPE=snp;VARB=0.0319468;OID=.;OPOS=34378381;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:146:146:67:68:78:78:0.534247:42:36:28:39:42:36:28:40
chr11	34482908	.	C	T	1265.94	PASS	AF=1;AO=80;DP=81;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0919811;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.169;QD=61.7532;RBI=0.0920226;REFB=0;REVB=0.00276663;RO=1;SAF=29;SAR=51;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0160447;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000308998;OID=.;OPOS=34482908;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:82:1:0:80:82:1:51:29:1:0:51:31:0:0
chr11	34501596	.	A	G	747.06	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0196356;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.803;QD=63.5796;RBI=0.0206546;REFB=0;REVB=0.00640746;RO=0;SAF=28;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.12131e-05;OID=.;OPOS=34501596;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:19:28:0:0:19:28:0:0
chr11	34643955	.	G	A	352.22	PASS	AF=0.354839;AO=42;DP=122;FAO=44;FDP=124;FR=.;FRO=80;FSAF=12;FSAR=32;FSRF=38;FSRR=42;FWDB=0.0435941;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.225;QD=11.3619;RBI=0.0436024;REFB=-0.0166971;REVB=-0.000850166;RO=73;SAF=11;SAR=31;SRF=38;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.306798;STB=0.643018;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.0202657;OID=.;OPOS=34643955;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:122:124:73:80:42:44:0.354839:31:11:38:35:32:12:38:42
chr11	34680634	.	G	A	785.88	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0133185;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.471;QD=64.1534;RBI=0.0191414;REFB=0;REVB=-0.0137481;RO=0;SAF=29;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.17572e-05;OID=.;OPOS=34680634;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:20:29:0:0:20:29:0:0
chr11	34680853	.	G	T	854.63	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00708694;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.389;QD=57.9409;RBI=0.0291961;REFB=0;REVB=0.028323;RO=0;SAF=29;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000220479;OID=.;OPOS=34680853;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:30:29:0:0:30:29:0:0
chr11	34909926	.	T	G	1339.77	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00166655;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=358.98;QD=62.3147;RBI=0.00994063;REFB=0;REVB=0.00979993;RO=0;SAF=42;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.01364e-06;OID=.;OPOS=34909926;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:44:42:0:0:44:42:0:0
chr11	34910397	.	C	T	1548.69	PASS	AF=1;AO=97;DP=97;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0246972;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.218;QD=63.8636;RBI=0.0349736;REFB=0;REVB=0.0247629;RO=0;SAF=45;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46922e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.91478e-05;OID=.;OPOS=34910397;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:97:97:0:0:97:97:1:52:45:0:0:52:45:0:0
chr11	34918375	.	A	G	806.72	PASS	AF=1;AO=56;DP=58;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0118916;FXX=0.0344768;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.687;QD=57.6228;RBI=0.0159747;REFB=0;REVB=-0.0106668;RO=0;SAF=31;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000204067;OID=.;OPOS=34918375;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:58:56:0:0:56:56:1:25:31:0:0:25:31:0:0
chr11	34937813	.	G	A	1587.65	PASS	AF=1;AO=97;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0229196;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.841;QD=64.1476;RBI=0.0357802;REFB=0;REVB=0.0274756;RO=0;SAF=45;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46922e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.0291e-05;OID=.;OPOS=34937813;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:99:99:0:0:97:99:1:52:45:0:0:54:45:0:0
chr11	34937931	.	G	A	483.33	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0184736;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.165;QD=58.5851;RBI=0.0194279;REFB=0;REVB=0.00601414;RO=0;SAF=14;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.71297e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000176224;OID=.;OPOS=34937931;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:19:14:0:0:19:14:0:0
chr11	34938265	.	C	T	1234.71	PASS	AF=0.987805;AO=81;DP=83;FAO=81;FDP=82;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0214229;FXX=0.0120467;HRUN=4;LEN=1;MLLD=217.201;QD=60.2298;RBI=0.0296695;REFB=0.0631559;REVB=0.0205266;RO=1;SAF=47;SAR=34;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0137227;STB=0.507245;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=-6.59982e-05;OID=.;OPOS=34938265;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:83:82:1:1:81:81:0.987805:34:47:0:1:34:47:0:1
chr11	34963416	.	T	C	1315.68	PASS	AF=0.988372;AO=85;DP=89;FAO=85;FDP=86;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00379858;FXX=0.0337041;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.782;QD=61.1945;RBI=0.00918838;REFB=-0.0877724;REVB=0.00836643;RO=0;SAF=29;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.20959e-08;STB=0.504424;STBP=0.537;TYPE=snp;VARB=0.00016568;OID=.;OPOS=34963416;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:89:86:0:1:85:85:0.988372:56:29:0:0:56:29:0:1
chr11	34991727	.	T	C	673.76	PASS	AF=1;AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0155685;FXX=0.0227221;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.9985;QD=62.6754;RBI=0.025309;REFB=0;REVB=-0.0199541;RO=0;SAF=20;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00134038;OID=.;OPOS=34991727;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:43:0:0:43:43:1:23:20:0:0:23:20:0:0
chr11	34999745	.	C	G	749.67	PASS	AF=1;AO=49;DP=51;FAO=53;FDP=53;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=29;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.009928;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.0462;QD=56.5792;RBI=0.0576044;REFB=0;REVB=0.0567424;RO=0;SAF=28;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000276898;OID=.;OPOS=34999745;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:53:0:0:49:53:1:21:28:0:0:24:29:0:0
chr11	35017205	.	G	T	651.2	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0287364;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.38;QD=62.0193;RBI=0.0311902;REFB=0;REVB=0.0121262;RO=0;SAF=22;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000152592;OID=.;OPOS=35017205;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:20:22:0:0:20:22:0:0
chr11	35017363	.	C	A	260.79	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0627205;FXX=0.0475964;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.395;QD=52.1578;RBI=0.0637098;REFB=0;REVB=0.0111841;RO=0;SAF=5;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000382137;OID=.;OPOS=35017363;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:15:5:0:0:15:5:0:0
chr11	35226155	.	A	G	817.75	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.013028;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=238.654;QD=57.3858;RBI=0.0169868;REFB=0;REVB=0.0109006;RO=0;SAF=27;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.84915e-05;OID=.;OPOS=35226155;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:30:27:0:0:30:27:0:0
chr11	35229673	.	T	C	980.65	PASS	AF=0.985294;AO=67;DP=69;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.000816645;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.906;QD=57.6853;RBI=0.0341118;REFB=-0.0830782;REVB=0.0341021;RO=0;SAF=40;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509088;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=0.000110723;OID=.;OPOS=35229673;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:69:68:0:1:67:67:0.985294:27:40:0:0:27:40:0:1
chr11	35274829	.	A	G	3774.0	PASS	AF=0.995885;AO=236;DP=243;FAO=242;FDP=243;FR=.;FRO=1;FSAF=114;FSAR=128;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0531925;FXX=0.00409819;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.63;QD=62.1235;RBI=0.0812907;REFB=0.0235725;REVB=0.0614715;RO=2;SAF=112;SAR=124;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000408261;STB=0.502183;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.000392022;OID=.;OPOS=35274829;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:243:243:2:1:236:242:0.995885:124:112:1:1:128:114:1:0
chr11	35641312	.	G	A	115.58	PASS	AF=0.8;AO=12;DP=15;FAO=12;FDP=15;FR=.;FRO=3;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0607692;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.4562;QD=30.8208;RBI=0.0691233;REFB=-0.078356;REVB=-0.0329414;RO=3;SAF=3;SAR=9;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0387972;STB=0.521702;STBP=0.883;TYPE=snp;VARB=0.0161954;OID=.;OPOS=35641312;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:15:15:3:3:12:12:0.8:9:3:1:2:9:3:1:2
chr11	35641844	.	GC	G	733.55	PASS	AF=1;AO=73;DP=91;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0508183;FXX=0.0109878;HRUN=7;LEN=1;MLLD=11.9236;QD=32.6024;RBI=0.117365;REFB=0;REVB=-0.105792;RO=5;SAF=30;SAR=43;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.072562;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.00096812;OID=.;OPOS=35641845;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:73:91:90:90:0:42:48:0:0:13:5:30:43:5:0
chr11	35827958	.	A	G	506.88	PASS	AF=0.545455;AO=48;DP=88;FAO=48;FDP=88;FR=.;FRO=40;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=17;FSRR=23;FWDB=-0.0284038;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=230.579;QD=23.0401;RBI=0.0332239;REFB=-0.00602771;REVB=0.0172353;RO=39;SAF=26;SAR=22;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0861915;STB=0.552908;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=0.00544427;OID=.;OPOS=35827958;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:39:40:48:48:0.545455:22:26:17:22:22:26:17:23
chr11	36103228	.	A	G	237.65	PASS	AF=0.442623;AO=28;DP=61;FAO=27;FDP=61;FR=.;FRO=34;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=22;FWDB=-0.0012077;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.672;QD=15.5835;RBI=0.00295134;REFB=-0.00527074;REVB=-0.00269293;RO=33;SAF=19;SAR=9;SRF=11;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.32954;STB=0.673785;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.00294991;OID=.;OPOS=36103228;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:33:34:28:27:0.442623:9:19:11:22:9:18:12:22
chr11	36422792	.	G	A	437.24	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0155892;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.627;QD=56.4186;RBI=0.0240942;REFB=0;REVB=0.0183714;RO=0;SAF=16;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.56309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000519937;OID=.;OPOS=36422792;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:31:0:0:30:31:1:14:16:0:0:15:16:0:0
chr11	36484208	.	T	C	868.26	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.015286;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.062;QD=57.884;RBI=0.0452618;REFB=0;REVB=0.0426024;RO=0;SAF=23;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.03034e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000142206;OID=.;OPOS=36484208;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:37:23:0:0:37:23:0:0
chr11	36595600	.	A	G	183.71	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0516904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.2816;QD=45.9284;RBI=0.0531619;REFB=0;REVB=-0.0124217;RO=0;SAF=4;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33019e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00566588;OID=.;OPOS=36595600;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:16:0:0:15:16:1:11:4:0:0:12:4:0:0
chr11	36597313	.	A	G	323.47	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0323837;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.1824;QD=53.9111;RBI=0.0385296;REFB=0;REVB=0.0208765;RO=0;SAF=14;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000293687;OID=.;OPOS=36597313;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:10:14:0:0:10:14:0:0
chr11	36601170	.	G	A	1108.27	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.016089;FXX=0.0266631;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.337;QD=60.7271;RBI=0.0209288;REFB=0;REVB=-0.013385;RO=0;SAF=47;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.2476e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000473514;OID=.;OPOS=36601170;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:26:47:0:0:26:47:0:0
chr11	40137543	.	T	C	1567.75	PASS	AF=1;AO=97;DP=97;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00702676;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.266;QD=63.9896;RBI=0.0245818;REFB=0;REVB=0.0235561;RO=0;SAF=42;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.94244e-05;OID=.;OPOS=40137543;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:97:98:0:0:97:98:1:55:42:0:0:56:42:0:0
chr11	41144553	.	C	T	1045.36	PASS	AF=0.467532;AO=108;DP=231;FAO=108;FDP=231;FR=.;FRO=123;FSAF=49;FSAR=59;FSRF=66;FSRR=57;FWDB=-0.0498993;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.3946;QD=18.1015;RBI=0.0534303;REFB=-0.00466063;REVB=0.0191013;RO=122;SAF=49;SAR=59;SRF=66;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0838402;STB=0.544141;STBP=0.214;TYPE=snp;VARB=0.00478357;OID=.;OPOS=41144553;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:231:231:122:123:108:108:0.467532:59:49:66:56:59:49:66:57
chr11	43911365	.	T	C,G	630.1	PASS	AF=0.928571,0.0714286;AO=37,3;DP=40;FAO=39,3;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=21,1;FSAR=18,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00194577,-0.00410793;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=173.264,128.594;QD=60.0099;RBI=0.00727522,0.0145399;REFB=0,0;REVB=-0.00701019,-0.0139476;RO=0;SAF=19,1;SAR=18,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.68991e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00378973,0.0630987;OID=.,.;OPOS=43911365,43911365;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:13:40:42:0:0:37,3:39,3:0.928571,0.0714286:18,2:19,1:0:0:18,2:21,1:0:0
chr11	43940644	.	G	T	902.71	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0024627;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=176.606;QD=58.2396;RBI=0.00497812;REFB=0;REVB=0.0043263;RO=0;SAF=26;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51662e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.29352e-05;OID=.;OPOS=43940644;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:36:26:0:0:36:26:0:0
chr11	43941471	.	C	T	204.95	PASS	AF=0.42;AO=21;DP=50;FAO=21;FDP=50;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=8;FWDB=0.00646141;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.4645;QD=16.3964;RBI=0.0146257;REFB=-0.00408229;REVB=0.013121;RO=29;SAF=12;SAR=9;SRF=21;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163188;STB=0.592731;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.00657948;OID=.;OPOS=43941471;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:29:29:21:21:0.42:9:12:21:8:9:12:21:8
chr11	43946967	.	A	G	1245.89	PASS	AF=1;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0203303;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.424;QD=61.5256;RBI=0.0209748;REFB=0;REVB=-0.00515939;RO=0;SAF=32;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.32002e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000114445;OID=.;OPOS=43946967;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:81:0:0:81:81:1:49:32:0:0:49:32:0:0
chr11	43947990	.	T	C	382.56	PASS	AF=0.965517;AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0337101;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.9117;QD=52.7667;RBI=0.053957;REFB=-0.0959885;REVB=-0.0421307;RO=1;SAF=8;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0227089;STB=0.512187;STBP=0.614;TYPE=snp;VARB=0.00387831;OID=.;OPOS=43947990;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:29:29:1:1:28:28:0.965517:20:8:0:1:20:8:0:1
chr11	43964842	.	G	C	33.62	PASS	AF=0.833333;AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=0;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=239.395;QD=22.4134;RBI=0.0110031;REFB=0.147519;REVB=-0.0110031;RO=1;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00206239;OID=.;OPOS=43964842;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:6:6:1:1:5:5:0.833333:5:0:0:1:5:0:0:1
chr11	44080210	.	T	C	806.5	PASS	AF=1;AO=56;DP=58;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0325881;FXX=0.0344768;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.351;QD=57.6075;RBI=0.0408586;REFB=0;REVB=0.0246464;RO=0;SAF=17;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.87981e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000144945;OID=.;OPOS=44080210;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:58:56:0:0:56:56:1:39:17:0:0:39:17:0:0
chr11	44089352	.	G	A	371.8	PASS	AF=0.458824;AO=39;DP=85;FAO=39;FDP=85;FR=.;FRO=46;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=27;FSRR=19;FWDB=-0.0118072;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.628;QD=17.4965;RBI=0.0149434;REFB=-0.00200749;REVB=0.00915948;RO=46;SAF=22;SAR=17;SRF=27;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0225405;STB=0.512609;STBP=0.871;TYPE=snp;VARB=0.00283309;OID=.;OPOS=44089352;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:46:46:39:39:0.458824:17:22:27:19:17:22:27:19
chr11	44096238	.	G	A	379.54	PASS	AF=1;AO=27;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.05808;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.105;QD=54.2201;RBI=0.0581104;REFB=0;REVB=0.00187959;RO=0;SAF=6;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000694575;OID=.;OPOS=44096238;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:27:28:1:21:6:0:0:21:7:0:0
chr11	44101118	.	C	T	381.86	PASS	AF=0.52;AO=38;DP=73;FAO=39;FDP=75;FR=.;FRO=36;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=23;FSRR=13;FWDB=-0.0145385;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.885;QD=20.3656;RBI=0.064013;REFB=0.00755028;REVB=0.0623401;RO=35;SAF=21;SAR=17;SRF=23;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0925932;STB=0.548832;STBP=0.42;TYPE=snp;VARB=-0.00909188;OID=.;OPOS=44101118;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:75:35:36:38:39:0.52:17:21:23:12:18:21:23:13
chr11	44104981	.	C	T	990.65	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0140195;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=235.128;QD=59.1432;RBI=0.0250825;REFB=0;REVB=0.0207987;RO=0;SAF=27;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.15814e-06;OID=.;OPOS=44104981;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:40:27:0:0:40:27:0:0
chr11	44129290	.	C	A	522.84	PASS	AF=0.486726;AO=55;DP=114;FAO=55;FDP=113;FR=.;FRO=58;FSAF=23;FSAR=32;FSRF=34;FSRR=24;FWDB=0.00905996;FXX=0.00877116;HRUN=2;LEN=1;MLLD=226.087;QD=18.5075;RBI=0.00915418;REFB=0.00151414;REVB=0.00131005;RO=55;SAF=23;SAR=32;SRF=33;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164002;STB=0.586087;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=-0.00206955;OID=.;OPOS=44129290;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:114:113:55:58:55:55:0.486726:32:23:33:22:32:23:34:24
chr11	44286566	.	G	A	209.78	PASS	AF=0.428571;AO=21;DP=49;FAO=21;FDP=49;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=21;FWDB=-0.00345253;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.656;QD=17.1249;RBI=0.00785221;REFB=-0.0245306;REVB=0.00705246;RO=28;SAF=6;SAR=15;SRF=7;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0447983;STB=0.525524;STBP=0.788;TYPE=snp;VARB=0.05127;OID=.;OPOS=44286566;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:28:28:21:21:0.428571:15:6:7:21:15:6:7:21
chr11	44297054	.	T	C	1640.96	PASS	AF=1;AO=108;DP=108;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00674891;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.805;QD=60.2188;RBI=0.0121251;REFB=0;REVB=0.0100733;RO=0;SAF=64;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.72235e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.95309e-05;OID=.;OPOS=44297054;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:108:109:0:0:108:109:1:44:64:0:0:45:64:0:0
chr11	44331309	.	G	A	70.54	PASS	AF=0.5625;AO=9;DP=16;FAO=9;FDP=16;FR=.;FRO=7;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.0199865;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.9604;QD=17.6357;RBI=0.173256;REFB=0.0218301;REVB=0.1721;RO=7;SAF=6;SAR=3;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.041038;STB=0.523757;STBP=0.884;TYPE=snp;VARB=-0.00742395;OID=.;OPOS=44331309;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:16:16:7:7:9:9:0.5625:3:6:5:2:3:6:5:2
chr11	44331509	.	C	G	281.82	PASS	AF=0.517241;AO=30;DP=58;FAO=30;FDP=58;FR=.;FRO=28;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=19;FWDB=0.00562463;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=169.124;QD=19.4358;RBI=0.00630808;REFB=-0.0120082;REVB=0.00285577;RO=27;SAF=16;SAR=14;SRF=8;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.200364;STB=0.601301;STBP=0.137;TYPE=snp;VARB=0.00581129;OID=.;OPOS=44331509;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:27:28:30:30:0.517241:14:16:8:19:14:16:9:19
chr11	44636839	.	C	T	2511.61	PASS	AF=1;AO=161;DP=166;FAO=162;FDP=162;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00632565;FXX=0.0240949;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.329;QD=62.0152;RBI=0.0260072;REFB=0;REVB=0.0252262;RO=0;SAF=94;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00146709;OID=.;OPOS=44636839;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:166:162:0:0:161:162:1:67:94:0:0:67:95:0:0
chr11	44640640	.	C	G	2444.16	PASS	AF=0.98773;AO=160;DP=163;FAO=161;FDP=163;FR=.;FRO=2;FSAF=72;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00363695;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.513;QD=59.9794;RBI=0.0145154;REFB=-0.0137569;REVB=0.0140524;RO=2;SAF=72;SAR=88;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.01069;STB=0.505555;STBP=0.225;TYPE=snp;VARB=0.000113758;OID=.;OPOS=44640640;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:163:163:2:2:160:161:0.98773:88:72:0:2:89:72:0:2
chr11	44925359	.	C	CT,T	996.53	PASS	AF=0.942857,0.0571429;AO=63,4;DP=73;FAO=66,4;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=16,4;FSAR=50,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0412521,-0.0250917;FXX=0.0140825;HRUN=1,2;LEN=1,1;MLLD=27.9535,23.1035;QD=56.9444;RBI=0.0970478,0.0694958;REFB=0,0;REVB=-0.0878438,-0.0648079;RO=4;SAF=16,4;SAR=47,0;SRF=2;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0358098,0.719948;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=-0.00101199,0.00263482;OID=.,.;OPOS=44925360,44925359;OREF=-,C;OALT=T,T;OMAPALT=CT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:14:73:70:4:0:63,4:66,4:0.942857,0.0571429:47,0:16,4:2:2:50,0:16,4:0:0
chr11	45670395	.	C	T	134.25	PASS	AF=0.517241;AO=14;DP=29;FAO=15;FDP=29;FR=.;FRO=14;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.0269666;FXX=0.0644953;HRUN=3;LEN=1;MLLD=113.95;QD=18.5176;RBI=0.0402609;REFB=0.00546328;REVB=-0.0298955;RO=14;SAF=8;SAR=6;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1854;STB=0.616284;STBP=0.227;TYPE=snp;VARB=0.00190348;OID=.;OPOS=45670395;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:14:14:14:15:0.517241:6:8:5:9:6:9:5:9
chr11	45672261	.	A	G	163.65	PASS	AF=0.53125;AO=17;DP=32;FAO=17;FDP=32;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=-0.00226143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.455;QD=20.4561;RBI=0.0344871;REFB=0.00371022;REVB=-0.0344128;RO=15;SAF=6;SAR=11;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.259921;STB=0.646886;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=-0.0055812;OID=.;OPOS=45672261;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:15:15:17:17:0.53125:11:6:10:5:11:6:10:5
chr11	45793154	.	A	C	251.61	PASS	AF=0.474576;AO=28;DP=59;FAO=28;FDP=59;FR=.;FRO=31;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.0227057;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.4473;QD=17.0584;RBI=0.0364259;REFB=0.00194239;REVB=-0.0284832;RO=31;SAF=15;SAR=13;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0485052;STB=0.527253;STBP=0.698;TYPE=snp;VARB=-0.00229816;OID=.;OPOS=45793154;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:31:31:28:28:0.474576:13:15:15:16:13:15:15:16
chr11	45793218	.	G	C	998.54	PASS	AF=0.985507;AO=68;DP=69;FAO=68;FDP=69;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.016111;FXX=0.0142837;HRUN=4;LEN=1;MLLD=74.7793;QD=57.8866;RBI=0.0588403;REFB=0.0264331;REVB=0.0565917;RO=1;SAF=36;SAR=32;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0145412;STB=0.50769;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=0.000169467;OID=.;OPOS=45793218;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:69:69:1:1:68:68:0.985507:32:36:0:1:32:36:0:1
chr11	45827350	.	A	G	618.98	PASS	AF=0.525424;AO=62;DP=118;FAO=62;FDP=118;FR=.;FRO=56;FSAF=23;FSAR=39;FSRF=32;FSRR=24;FWDB=-0.0174031;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.139;QD=20.9825;RBI=0.0315267;REFB=-0.012617;REVB=-0.0262882;RO=55;SAF=23;SAR=39;SRF=31;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167962;STB=0.596796;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.0113967;OID=.;OPOS=45827350;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:118:118:55:56:62:62:0.525424:39:23:31:24:39:23:32:24
chr11	45834198	.	T	C	62.73	PASS	AF=0.153846;AO=12;DP=78;FAO=12;FDP=78;FR=.;FRO=66;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=37;FSRR=29;FWDB=-0.00991538;FXX=0.0126566;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.323;QD=3.21713;RBI=0.0132804;REFB=-0.0075747;REVB=-0.0088348;RO=64;SAF=5;SAR=7;SRF=35;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160902;STB=0.620057;STBP=0.434;TYPE=snp;VARB=0.0367483;OID=.;OPOS=45834198;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:78:78:64:66:12:12:0.153846:7:5:35:29:7:5:37:29
chr11	45834201	.	C	T	63.87	PASS	AF=0.16;AO=12;DP=75;FAO=12;FDP=75;FR=.;FRO=63;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=33;FSRR=30;FWDB=-0.00197417;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.717;QD=3.40622;RBI=0.00628412;REFB=-0.00958739;REVB=0.00596598;RO=63;SAF=5;SAR=7;SRF=33;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132989;STB=0.589651;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=0.0388468;OID=.;OPOS=45834201;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:75:75:63:63:12:12:0.16:7:5:33:30:7:5:33:30
chr11	45848227	.	A	G	50.65	PASS	AF=0.117021;AO=11;DP=94;FAO=11;FDP=94;FR=.;FRO=83;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=37;FSRR=46;FWDB=0.013448;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.734;QD=2.15512;RBI=0.0153818;REFB=-8.38646e-05;REVB=0.00746671;RO=83;SAF=4;SAR=7;SRF=37;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102175;STB=0.575011;STBP=0.585;TYPE=snp;VARB=-0.150534;OID=.;OPOS=45848227;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:50:94:94:83:83:11:11:0.117021:7:4:37:46:7:4:37:46
chr11	45848232	.	T	C	63.01	PASS	AF=0.131313;AO=13;DP=99;FAO=13;FDP=99;FR=.;FRO=86;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=40;FSRR=46;FWDB=-0.0120211;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.358;QD=2.54586;RBI=0.017915;REFB=-0.0111064;REVB=0.0132831;RO=86;SAF=5;SAR=8;SRF=40;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101038;STB=0.571317;STBP=0.629;TYPE=snp;VARB=0.0233315;OID=.;OPOS=45848232;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:99:99:86:86:13:13:0.131313:8:5:40:46:8:5:40:46
chr11	45848271	.	A	G	82.21	PASS	AF=0.164835;AO=15;DP=91;FAO=15;FDP=91;FR=.;FRO=76;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=32;FSRR=44;FWDB=-0.00126426;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.903;QD=3.61368;RBI=0.021546;REFB=-0.00331175;REVB=-0.0215089;RO=76;SAF=5;SAR=10;SRF=32;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116657;STB=0.578018;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.0163674;OID=.;OPOS=45848271;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:82:91:91:76:76:15:15:0.164835:10:5:32:44:10:5:32:44
chr11	45848275	.	T	C	76.22	PASS	AF=0.164706;AO=14;DP=86;FAO=14;FDP=85;FR=.;FRO=71;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=32;FSRR=39;FWDB=0.000829609;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.806;QD=3.5866;RBI=0.0655341;REFB=-0.00423897;REVB=0.0655289;RO=70;SAF=5;SAR=9;SRF=32;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129018;STB=0.581034;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.0248745;OID=.;OPOS=45848275;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:86:85:70:71:14:14:0.164706:9:5:32:38:9:5:32:39
chr11	45868849	.	GC	CG,GCG	126.29	PASS	AF=0,0.339286;AO=3,14;DP=57;FAO=0,19;FDP=56;FR=.;FRO=37;FSAF=0,7;FSAR=0,12;FSRF=9;FSRR=28;FWDB=-0.0337838,0.122136;FXX=0.0175408;HRUN=5,3;LEN=2,1;MLLD=24.9856,20.1144;QD=9.02073;RBI=0.0433944,0.122192;REFB=-0.00161829,-0.00752271;REVB=0.0272347,0.00367612;RO=37;SAF=3,4;SAR=0,10;SRF=9;SRR=28;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.657138,0.0642581;STB=0.5,0.59313;STBP=1,0.361;TYPE=mnp,ins;VARB=0,0.0146809;OID=.,.;OPOS=45868849,45868851;OREF=GC,-;OALT=CG,G;OMAPALT=CG,GCG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:57:56:37:37:3,14:0,19:0,0.339286:0,10:3,4:9:28:0,12:0,7:9:28
chr11	45903814	.	A	AGT	50.24	PASS	AF=0.304348;AO=7;DP=31;FAO=7;FDP=23;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.0373984;FXX=0.178508;HRUN=1;LEN=2;MLLD=148.864;QD=8.73666;RBI=0.0447639;REFB=-0.0533811;REVB=0.0246002;RO=23;SAF=4;SAR=3;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00743092;STB=0.506311;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.115299;OID=.;OPOS=45903815;OREF=-;OALT=GT;OMAPALT=AGT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.304348:7:31:7:23:16:4:3:9:7:50:23:4:3:13:10
chr11	45935384	.	A	G	747.07	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0136313;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.391;QD=63.5803;RBI=0.0306356;REFB=0;REVB=-0.0274359;RO=0;SAF=23;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000191539;OID=.;OPOS=45935384;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:24:23:0:0:24:23:0:0
chr11	45937267	.	C	T	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0824737;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.902;QD=37.4885;RBI=0.0992225;REFB=0;REVB=0.0551651;RO=0;SAF=3;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0027649;OID=.;OPOS=45937267;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:5:3:0:0:5:3:0:0
chr11	45949534	.	C	T	766.11	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00601632;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.8659;QD=56.7487;RBI=0.0239724;REFB=0;REVB=0.0232052;RO=0;SAF=33;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.88914e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000128153;OID=.;OPOS=45949534;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:54:0:0:53:54:1:20:33:0:0:20:34:0:0
chr11	45975130	.	C	T	269.56	PASS	AF=0.407895;AO=31;DP=76;FAO=31;FDP=76;FR=.;FRO=45;FSAF=6;FSAR=25;FSRF=15;FSRR=30;FWDB=-0.0325371;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.393;QD=14.1874;RBI=0.0327513;REFB=-0.0114376;REVB=0.00373971;RO=45;SAF=6;SAR=25;SRF=15;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198063;STB=0.613954;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.0196272;OID=.;OPOS=45975130;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:45:45:31:31:0.407895:25:6:15:30:25:6:15:30
chr11	46342081	.	TG	T	738.22	PASS	AF=1;AO=63;DP=71;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0695378;FXX=0.0422476;HRUN=4;LEN=1;MLLD=19.6559;QD=43.4248;RBI=0.0761453;REFB=-0.0228746;REVB=0.0310259;RO=2;SAF=36;SAR=27;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0336963;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00113764;OID=.;OPOS=46342082;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:63:71:68:68:0:38:30:0:0:12:2:36:27:0:2
chr11	46342259	.	A	AG	342.71	PASS	AF=1;AO=29;DP=33;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.205616;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=22.976;QD=42.8392;RBI=0.208369;REFB=-0.0137885;REVB=0.0337593;RO=3;SAF=21;SAR=8;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0124398;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.0138925;OID=.;OPOS=46342260;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:29:33:32:32:0:23:9:0:0:5:3:21:8:2:1
chr11	46401517	.	A	G	56.37	PASS	AF=0.126316;AO=12;DP=94;FAO=12;FDP=95;FR=.;FRO=83;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=39;FSRR=44;FWDB=-0.0526415;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.189;QD=2.37337;RBI=0.0543076;REFB=-0.00356302;REVB=-0.0133487;RO=82;SAF=7;SAR=5;SRF=38;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146313;STB=0.598441;STBP=0.478;TYPE=snp;VARB=0.0318079;OID=.;OPOS=46401517;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:94:95:82:83:12:12:0.126316:5:7:38:44:5:7:39:44
chr11	46702920	.	T	C	2064.88	PASS	AF=1;AO=132;DP=132;FAO=132;FDP=132;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00346469;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=241.088;QD=62.5721;RBI=0.00362768;REFB=0;REVB=-0.00107517;RO=0;SAF=60;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.87096e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.40723e-06;OID=.;OPOS=46702920;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:132:132:0:0:132:132:1:72:60:0:0:72:60:0:0
chr11	46801502	.	T	C	313.28	PASS	AF=1;AO=23;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00251777;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=116.459;QD=52.2134;RBI=0.00888571;REFB=0;REVB=0.00852154;RO=0;SAF=12;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00127447;OID=.;OPOS=46801502;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:23:24:1:11:12:0:0:11:13:0:0
chr11	46878684	.	C	T	39.05	PASS	AF=0.461538;AO=6;DP=13;FAO=6;FDP=13;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.00979707;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.343;QD=12.0151;RBI=0.0146493;REFB=-0.00110473;REVB=-0.0108913;RO=7;SAF=4;SAR=2;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0484388;STB=0.529316;STBP=0.883;TYPE=snp;VARB=0.000976334;OID=.;OPOS=46878684;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:13:13:7:7:6:6:0.461538:2:4:5:2:2:4:5:2
chr11	46879973	.	A	G	214.25	PASS	AF=0.947368;AO=18;DP=19;FAO=18;FDP=19;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0293957;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=239.572;QD=45.1051;RBI=0.0301599;REFB=-0.0519776;REVB=0.00674614;RO=1;SAF=12;SAR=6;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0367456;STB=0.519978;STBP=0.612;TYPE=snp;VARB=0.000328304;OID=.;OPOS=46879973;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:19:19:1:1:18:18:0.947368:6:12:1:0:6:12:1:0
chr11	46879990	.	T	C	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0281334;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.353;QD=51.9161;RBI=0.0584011;REFB=0;REVB=0.0511781;RO=0;SAF=16;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.78933e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000191364;OID=.;OPOS=46879990;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:5:16:0:0:5:16:0:0
chr11	46890165	.	C	T	501.61	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000700608;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=250.347;QD=59.0124;RBI=0.0017982;REFB=0;REVB=0.0016561;RO=0;SAF=19;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.40663e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.79452e-06;OID=.;OPOS=46890165;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:15:19:0:0:15:19:0:0
chr11	46893108	.	T	C,G	776.61	PASS	AF=0.979592,0.0204082;AO=47,2;DP=49;FAO=48,1;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=19,1;FSAR=29,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00641356,0.0294968;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=121.449,71.4299;QD=63.397;RBI=0.0137339,0.0358837;REFB=0,0;REVB=0.0121443,0.0204347;RO=0;SAF=18,2;SAR=29,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00113195,-0.0501774;OID=.,.;OPOS=46893108,46893108;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:4:49:49:0:0:47,2:48,1:0.979592,0.0204082:29,0:18,2:0:0:29,0:19,1:0:0
chr11	46898771	.	T	C	1530.46	PASS	AF=1;AO=94;DP=95;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00793537;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.033;QD=63.7693;RBI=0.0316144;REFB=0;REVB=0.0306023;RO=0;SAF=45;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.46788e-05;OID=.;OPOS=46898771;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:96:0:0:94:96:1:49:45:0:0:50:46:0:0
chr11	46914583	.	T	C	509.96	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0367239;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=62.5613;QD=58.2808;RBI=0.0656613;REFB=0;REVB=-0.0544312;RO=0;SAF=15;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.40663e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00151801;OID=.;OPOS=46914583;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:35:0:0:34:35:1:19:15:0:0:19:16:0:0
chr11	46914598	.	A	G	483.35	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0366943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.935;QD=58.5874;RBI=0.0430574;REFB=0;REVB=0.022527;RO=0;SAF=17;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.60901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000239375;OID=.;OPOS=46914598;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:16:17:0:0:16:17:0:0
chr11	46969616	.	T	C	1302.97	PASS	AF=1;AO=82;DP=83;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0026675;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.045;QD=62.0464;RBI=0.0384156;REFB=0;REVB=0.0383229;RO=0;SAF=47;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.16565e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.93341e-05;OID=.;OPOS=46969616;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:84:0:0:82:84:1:35:47:0:0:35:49:0:0
chr11	47188314	.	T	C	1013.3	PASS	AF=0.985714;AO=67;DP=68;FAO=69;FDP=70;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0284912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.337;QD=57.9027;RBI=0.0286882;REFB=-0.0623133;REVB=0.00335608;RO=1;SAF=34;SAR=33;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0136967;STB=0.506847;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.000401589;OID=.;OPOS=47188314;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:68:70:1:1:67:69:0.985714:33:34:1:0:33:36:1:0
chr11	47196982	.	C	T	117.3	PASS	AF=0.368421;AO=14;DP=38;FAO=14;FDP=38;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=-0.00291531;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.273;QD=12.3472;RBI=0.0195003;REFB=-0.00510448;REVB=-0.0192811;RO=24;SAF=9;SAR=5;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.242189;STB=0.642653;STBP=0.198;TYPE=snp;VARB=0.011335;OID=.;OPOS=47196982;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:24:24:14:14:0.368421:5:9:10:14:5:9:10:14
chr11	47202120	.	G	A	216.29	PASS	AF=0.689655;AO=20;DP=29;FAO=20;FDP=29;FR=.;FRO=9;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.00163968;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.796;QD=29.8336;RBI=0.0271301;REFB=-0.0274167;REVB=0.0270805;RO=9;SAF=13;SAR=7;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0571198;STB=0.531566;STBP=0.663;TYPE=snp;VARB=0.0161463;OID=.;OPOS=47202120;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:29:29:9:9:20:20:0.689655:7:13:5:4:7:13:5:4
chr11	47238522	.	T	C	720.4	PASS	AF=0.981132;AO=51;DP=52;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0266641;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.398;QD=54.37;RBI=0.033511;REFB=-0.13945;REVB=0.0202981;RO=1;SAF=13;SAR=38;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0122334;STB=0.506327;STBP=0.643;TYPE=snp;VARB=0.00192354;OID=.;OPOS=47238522;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:52:53:1:1:51:52:0.981132:38:13:0:1:39:13:0:1
chr11	47259668	.	T	C	115.64	PASS	AF=0.333333;AO=14;DP=42;FAO=14;FDP=42;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=-0.00945548;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.934;QD=11.0138;RBI=0.0526298;REFB=-0.0161462;REVB=0.0517735;RO=28;SAF=10;SAR=4;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176372;STB=0.605901;STBP=0.377;TYPE=snp;VARB=0.0271356;OID=.;OPOS=47259668;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:28:28:14:14:0.333333:4:10:16:12:4:10:16:12
chr11	47266808	.	T	G	317.19	PASS	AF=0.571429;AO=27;DP=48;FAO=28;FDP=49;FR=.;FRO=21;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.00244074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.211;QD=25.8931;RBI=0.00244127;REFB=-0.0105648;REVB=-5.08819e-05;RO=20;SAF=17;SAR=10;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0642388;STB=0.553807;STBP=0.42;TYPE=snp;VARB=0.00777935;OID=.;OPOS=47266808;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:49:20:21:27:28:0.571429:10:17:11:9:10:18:11:10
chr11	47269159	.	T	C	621.91	PASS	AF=0.565657;AO=56;DP=99;FAO=56;FDP=99;FR=.;FRO=43;FSAF=25;FSAR=31;FSRF=18;FSRR=25;FWDB=0.0156235;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.53;QD=25.1276;RBI=0.0292841;REFB=0.00994238;REVB=0.0247683;RO=43;SAF=25;SAR=31;SRF=18;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0223976;STB=0.512253;STBP=0.785;TYPE=snp;VARB=-0.0106608;OID=.;OPOS=47269159;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:43:43:56:56:0.565657:31:25:18:25:31:25:18:25
chr11	47270255	.	C	T	544.71	PASS	AF=0.533981;AO=48;DP=102;FAO=55;FDP=103;FR=.,HEALED;FRO=47;FSAF=24;FSAR=31;FSRF=23;FSRR=24;FWDB=-0.0239856;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=84.4907;QD=21.1539;RBI=0.0625376;REFB=-0.0322643;REVB=-0.057755;RO=37;SAF=17;SAR=31;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0885563;STB=0.524658;STBP=0.592;TYPE=snp;VARB=0.0270916;OID=.;OPOS=47270255;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:103:37:47:48:55:0.533981:31:17:17:20:31:24:23:24
chr11	47282024	.	C	T	167.91	PASS	AF=0.418605;AO=18;DP=43;FAO=18;FDP=43;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=0.0159696;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.8323;QD=15.6191;RBI=0.0240858;REFB=0.002012;REVB=-0.0180305;RO=25;SAF=11;SAR=7;SRF=17;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0747578;STB=0.54289;STBP=0.658;TYPE=snp;VARB=-0.00264356;OID=.;OPOS=47282024;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:25:25:18:18:0.418605:7:11:17:8:7:11:17:8
chr11	47298360	.	G	A	355.14	PASS	AF=0.493333;AO=37;DP=75;FAO=37;FDP=75;FR=.;FRO=38;FSAF=25;FSAR=12;FSRF=25;FSRR=13;FWDB=0.0506188;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.463;QD=18.9405;RBI=0.0508432;REFB=-0.00429583;REVB=-0.00477185;RO=36;SAF=25;SAR=12;SRF=25;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0191578;STB=0.510199;STBP=0.898;TYPE=snp;VARB=0.00590476;OID=.;OPOS=47298360;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:36:38:37:37:0.493333:12:25:25:11:12:25:25:13
chr11	47303275	.	T	C	134.24	PASS	AF=0.454545;AO=15;DP=33;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.01826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.103;QD=16.2709;RBI=0.028445;REFB=0.0111589;REVB=-0.0218104;RO=18;SAF=5;SAR=10;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.216322;STB=0.624829;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=-0.00636448;OID=.;OPOS=47303275;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:18:18:15:15:0.454545:10:5:10:8:10:5:10:8
chr11	47306585	.	G	A	143.3	PASS	AF=0.410256;AO=16;DP=39;FAO=16;FDP=39;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=-0.00521395;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.639;QD=14.6977;RBI=0.0318952;REFB=-0.0108446;REVB=-0.0314661;RO=23;SAF=9;SAR=7;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0481099;STB=0.527834;STBP=0.779;TYPE=snp;VARB=0.0123095;OID=.;OPOS=47306585;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:23:23:16:16:0.410256:7:9:14:9:7:9:14:9
chr11	47331116	.	T	C	689.37	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0157459;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.573;QD=62.6702;RBI=0.0213663;REFB=0;REVB=0.0144424;RO=0;SAF=17;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.54734e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.02949e-06;OID=.;OPOS=47331116;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:27:17:0:0:27:17:0:0
chr11	47346145	.	G	A	256.37	PASS	AF=0.491228;AO=28;DP=58;FAO=28;FDP=57;FR=.;FRO=29;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=9;FWDB=-0.00140916;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.805;QD=17.9909;RBI=0.0297404;REFB=-0.0143956;REVB=0.029707;RO=29;SAF=14;SAR=14;SRF=20;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172826;STB=0.596425;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=0.0174747;OID=.;OPOS=47346145;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:57:29:29:28:28:0.491228:14:14:20:9:14:14:20:9
chr11	47354787	.	C	T	283.75	PASS	AF=0.530612;AO=26;DP=49;FAO=26;FDP=49;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.00803695;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=311.012;QD=23.1636;RBI=0.00945724;REFB=-0.00928325;REVB=0.00498465;RO=23;SAF=14;SAR=12;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0506998;STB=0.52828;STBP=0.687;TYPE=snp;VARB=0.00784474;OID=.;OPOS=47354787;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:23:23:26:26:0.530612:12:14:11:12:12:14:11:12
chr11	47364762	.	A	G	756.67	PASS	AF=1;AO=46;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0547607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.08;QD=63.0559;RBI=0.0574582;REFB=0;REVB=0.0173986;RO=0;SAF=23;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000233634;OID=.;OPOS=47364762;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:46:48:1:23:23:0:0:24:24:0:0
chr11	47431728	.	AAA	AAG,GAA	376.51	PASS	AF=0.0357143,0.964286;AO=2,13;DP=29;FAO=1,27;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=1,12;FSAR=0,15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0143668,-0.0670818;FXX=0.0344709;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=4.80854,30.5525;QD=53.7873;RBI=0.126945,0.0813922;REFB=0,0;REVB=-0.126129,0.0460948;RO=0;SAF=1,9;SAR=1,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.13177,-0.0108696;OID=.,.;OPOS=47431730,47431728;OREF=A,A;OALT=G,G;OMAPALT=AAG,GAA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:6:29:28:0:0:2,13:1,27:0.0357143,0.964286:1,4:1,9:0:0:0,15:1,12:0:0
chr11	47434986	.	G	A	460.97	PASS	AF=0.632353;AO=43;DP=68;FAO=43;FDP=68;FR=.;FRO=25;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.0243273;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.143;QD=27.1158;RBI=0.0953038;REFB=-0.0555097;REVB=0.0921466;RO=24;SAF=21;SAR=22;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00764841;STB=0.511622;STBP=0.829;TYPE=snp;VARB=0.033287;OID=.;OPOS=47434986;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:24:25:43:43:0.632353:22:21:12:12:22:21:13:12
chr11	47460265	.	C	T	310.14	PASS	AF=0.627907;AO=27;DP=43;FAO=27;FDP=43;FR=.;FRO=16;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.00506651;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=235.663;QD=28.8505;RBI=0.0118709;REFB=-0.00211235;REVB=-0.0107354;RO=15;SAF=13;SAR=14;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0531219;STB=0.516395;STBP=0.807;TYPE=snp;VARB=0.000725613;OID=.;OPOS=47460265;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:15:16:27:27:0.627907:14:13:6:9:14:13:7:9
chr11	47460306	.	A	G	853.98	PASS	AF=0.983607;AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0116037;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.5325;QD=55.9987;RBI=0.0129697;REFB=-0.102601;REVB=0.00579373;RO=1;SAF=31;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.014981;STB=0.507934;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=0.00108953;OID=.;OPOS=47460306;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:61:61:1:1:60:60:0.983607:29:31:1:0:29:31:1:0
chr11	47469439	.	A	G	1680.38	PASS	AF=1;AO=111;DP=112;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0209969;FXX=0.00892777;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.034;QD=60.5544;RBI=0.0213925;REFB=0;REVB=0.00409484;RO=0;SAF=47;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.67718e-05;OID=.;OPOS=47469439;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:112:111:0:0:111:111:1:64:47:0:0:64:47:0:0
chr11	47579103	.	CCG	ATA	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0143059;FXX=0;HRUN=2;LEN=3;MLLD=272.201;QD=37.4885;RBI=0.0143059;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=8;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=-0.000103133;OID=.;OPOS=47579103;OREF=CCG;OALT=ATA;OMAPALT=ATA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:0:8:0:0:0:8:0:0
chr11	47579119	.	A	T	689.3	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0372841;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.861;QD=62.6633;RBI=0.0386761;REFB=0;REVB=0.0102831;RO=0;SAF=15;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.57028e-05;OID=.;OPOS=47579119;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:29:15:0:0:29:15:0:0
chr11	47593945	.	A	C	902.66	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00642055;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.488;QD=58.2362;RBI=0.0687598;REFB=0;REVB=0.0684594;RO=0;SAF=31;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000105318;OID=.;OPOS=47593945;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:31:31:0:0:31:31:0:0
chr11	47609867	.	G	A	1287.22	PASS	AF=0.988235;AO=84;DP=85;FAO=84;FDP=85;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.011712;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=124.789;QD=60.5753;RBI=0.0240271;REFB=-0.00463434;REVB=0.0209793;RO=1;SAF=41;SAR=43;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0114132;STB=0.506023;STBP=0.334;TYPE=snp;VARB=7.44719e-05;OID=.;OPOS=47609867;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:85:85:1:1:84:84:0.988235:43:41:1:0:43:41:1:0
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chr11	47701528	.	C	A	302.61	PASS	AF=0.52459;AO=31;DP=60;FAO=32;FDP=61;FR=.;FRO=29;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=0.00826626;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.582;QD=19.8429;RBI=0.0174149;REFB=-0.00500431;REVB=-0.015328;RO=29;SAF=18;SAR=13;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.025641;STB=0.520535;STBP=0.761;TYPE=snp;VARB=0.00239986;OID=.;OPOS=47701528;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:61:29:29:31:32:0.52459:13:18:16:13:13:19:16:13
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chr11	47772590	.	T	TA	33.44	PASS	AF=0.274194;AO=18;DP=66;FAO=17;FDP=62;FR=.;FRO=45;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=25;FSRR=20;FWDB=0.0363514;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=7.17094;QD=2.1574;RBI=0.0863711;REFB=-0.0664522;REVB=0.0783488;RO=43;SAF=14;SAR=4;SRF=22;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.34362;STB=0.672195;STBP=0.109;TYPE=ins;VARB=0.0684294;OID=.;OPOS=47772591;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.274194:18:66:17:62:45:13:4:25:20:33:43:14:4:22:21
chr11	47788695	.	G	C	58.62	PASS	AF=0.5;AO=8;DP=16;FAO=8;FDP=16;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=-0.0157089;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=218.992;QD=14.6539;RBI=0.0157424;REFB=-0.0351475;REVB=0.00102738;RO=8;SAF=5;SAR=3;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.309389;STB=0.681384;STBP=0.195;TYPE=snp;VARB=0.0286972;OID=.;OPOS=47788695;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:16:16:8:8:8:8:0.5:3:5:2:6:3:5:2:6
chr11	47826090	.	A	C	197.12	PASS	AF=0.434783;AO=20;DP=48;FAO=20;FDP=46;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=0.00514717;FXX=0.041658;HRUN=3;LEN=1;MLLD=279.392;QD=17.1404;RBI=0.0067121;REFB=-0.0101816;REVB=0.00430801;RO=26;SAF=9;SAR=11;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0658443;STB=0.537574;STBP=0.692;TYPE=snp;VARB=0.0130836;OID=.;OPOS=47826090;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:46:26:26:20:20:0.434783:11:9:10:16:11:9:10:16
chr11	47834592	.	G	A	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.022463;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.369;QD=46.8474;RBI=0.0247772;REFB=0;REVB=0.0104557;RO=0;SAF=8;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000322393;OID=.;OPOS=47834592;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:7:8:0:0:7:8:0:0
chr11	47857253	.	T	C	194.1	PASS	AF=0.434783;AO=18;DP=46;FAO=20;FDP=46;FR=.,HEALED;FRO=26;FSAF=3;FSAR=17;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=-0.0368674;FXX=0.041658;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.3576;QD=16.8782;RBI=0.0401045;REFB=-0.0176367;REVB=0.0157848;RO=19;SAF=2;SAR=16;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.423927;STB=0.690403;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.0240088;OID=.;OPOS=47857253;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:19:26:18:20:0.434783:16:2:8:11:17:3:10:16
chr11	47869855	.	C	T	1059.0	PASS	AF=0.581395;AO=71;DP=128;FAO=75;FDP=129;FR=.,HEALED;FRO=30;FSAF=41;FSAR=34;FSRF=4;FSRR=26;FWDB=0.0337658;FXX=0.00769172;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.074;QD=32.8371;RBI=0.0356437;REFB=-0.0553778;REVB=0.0114171;RO=28;SAF=39;SAR=32;SRF=3;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.229871;STB=0.616511;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0312099;OID=.;OPOS=47869855;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:128:129:28:30:71:75:0.581395:32:39:3:25:34:41:4:26
chr11	48118347	.	T	TA	67.48	PASS	AF=0.352941;AO=12;DP=34;FAO=12;FDP=34;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=-0.119218;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=24.2598;QD=7.93898;RBI=0.124231;REFB=-0.00925151;REVB=-0.0349355;RO=22;SAF=5;SAR=7;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112953;STB=0.566903;STBP=0.601;TYPE=ins;VARB=-0.00244392;OID=.;OPOS=48118348;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.352941:12:34:12:34:22:5:7:7:15:67:22:5:7:7:15
chr11	48145166	.	G	A	118.65	PASS	AF=0.278689;AO=17;DP=61;FAO=17;FDP=61;FR=.;FRO=44;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=27;FWDB=-0.0114002;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.625;QD=7.78044;RBI=0.0252576;REFB=-0.00315475;REVB=-0.0225384;RO=43;SAF=12;SAR=5;SRF=17;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.364503;STB=0.725638;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.0059245;OID=.;OPOS=48145166;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:43:44:17:17:0.278689:5:12:17:26:5:12:17:27
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chr11	48188872	.	G	A	253.49	PASS	AF=0.509434;AO=27;DP=54;FAO=27;FDP=53;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=-0.00903485;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.6867;QD=19.1309;RBI=0.0133951;REFB=-0.00641818;REVB=0.00988947;RO=26;SAF=7;SAR=20;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.270213;STB=0.652054;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.0151791;OID=.;OPOS=48188872;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:53:26:26:27:27:0.509434:20:7:14:12:20:7:14:12
chr11	48190383	.	A	T	1335.67	PASS	AF=0.977778;AO=85;DP=85;FAO=88;FDP=90;FR=.;FRO=2;FSAF=45;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00481328;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.571;QD=59.3632;RBI=0.0107619;REFB=-0.0416831;REVB=0.00962554;RO=0;SAF=44;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.500253;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=0.000689722;OID=.;OPOS=48190383;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:85:90:0:2:85:88:0.977778:41:44:0:0:43:45:1:1
chr11	48190527	.	T	C	817.67	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00724325;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.9022;QD=57.38;RBI=0.0719381;REFB=0;REVB=0.0715725;RO=0;SAF=25;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000894383;OID=.;OPOS=48190527;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:32:25:0:0:32:25:0:0
chr11	48190777	.	G	T	493.97	PASS	AF=0.495238;AO=52;DP=105;FAO=52;FDP=105;FR=.;FRO=53;FSAF=24;FSAR=28;FSRF=19;FSRR=34;FWDB=-0.0332911;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.1314;QD=18.8179;RBI=0.0336684;REFB=0.0145639;REVB=-0.00502642;RO=53;SAF=24;SAR=28;SRF=19;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0954423;STB=0.552729;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=-0.0159811;OID=.;OPOS=48190777;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:105:53:53:52:52:0.495238:28:24:19:34:28:24:19:34
chr11	48238421	.	T	G	1659.2	PASS	AF=1;AO=110;DP=110;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00681579;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.249;QD=60.3345;RBI=0.0230886;REFB=0;REVB=0.0220597;RO=0;SAF=41;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.37273e-05;OID=.;OPOS=48238421;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:110:110:0:0:110:110:1:69:41:0:0:69:41:0:0
chr11	48238880	.	C	T	261.81	PASS	AF=0.47541;AO=29;DP=60;FAO=29;FDP=61;FR=.;FRO=32;FSAF=21;FSAR=8;FSRF=22;FSRR=10;FWDB=-0.0146177;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.693;QD=17.1676;RBI=0.0146664;REFB=-0.0127754;REVB=0.00119381;RO=31;SAF=21;SAR=8;SRF=22;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0165184;STB=0.523529;STBP=0.777;TYPE=snp;VARB=0.0153142;OID=.;OPOS=48238880;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:61:31:32:29:29:0.47541:8:21:22:9:8:21:22:10
chr11	48239071	.	C	A	233.36	PASS	AF=0.383562;AO=28;DP=73;FAO=28;FDP=73;FR=.;FRO=45;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=26;FSRR=19;FWDB=0.0303316;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.3495;QD=12.7871;RBI=0.0456579;REFB=0.0198839;REVB=0.0341268;RO=45;SAF=13;SAR=15;SRF=26;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121512;STB=0.569571;STBP=0.366;TYPE=snp;VARB=-0.0290552;OID=.;OPOS=48239071;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:45:45:28:28:0.383562:15:13:26:19:15:13:26:19
chr11	48266736	.	C	G	341.04	PASS	AF=0.538462;AO=35;DP=65;FAO=35;FDP=65;FR=.;FRO=30;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=0.013483;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.583;QD=20.9869;RBI=0.0343032;REFB=-0.00516927;REVB=0.0315423;RO=30;SAF=20;SAR=15;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115343;STB=0.56384;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=0.00655182;OID=.;OPOS=48266736;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:30:30:35:35:0.538462:15:20:13:17:15:20:13:17
chr11	48285842	.	A	G	1004.55	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.020286;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.774;QD=59.0914;RBI=0.0434659;REFB=0;REVB=0.0384417;RO=0;SAF=39;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.10038e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.54566e-05;OID=.;OPOS=48285842;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:68:0:0:65:68:1:26:39:0:0:29:39:0:0
chr11	48285856	.	C	T	201.48	PASS	AF=0.369231;AO=24;DP=68;FAO=24;FDP=65;FR=.;FRO=41;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=-0.000368673;FXX=0.0972087;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.1124;QD=12.3987;RBI=0.0181769;REFB=-0.00541034;REVB=-0.0181732;RO=37;SAF=13;SAR=11;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00119715;STB=0.53399;STBP=0.697;TYPE=snp;VARB=0.032466;OID=.;OPOS=48285856;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:65:37:41:24:24:0.369231:11:13:20:17:11:13:20:21
chr11	48285906	.	C	T	269.3	PASS	AF=0.461538;AO=30;DP=65;FAO=30;FDP=65;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=23;FSRR=12;FWDB=0.00175605;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=222.579;QD=16.5724;RBI=0.00348104;REFB=0.00266345;REVB=-0.00300565;RO=34;SAF=15;SAR=15;SRF=23;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167499;STB=0.584561;STBP=0.244;TYPE=snp;VARB=-0.00176025;OID=.;OPOS=48285906;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:34:35:30:30:0.461538:15:15:23:11:15:15:23:12
chr11	48285981	.	CCTT	C	85.77	PASS	AF=0.357143;AO=13;DP=44;FAO=15;FDP=42;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=19;FSRR=8;FWDB=-0.0214233;FXX=0.0454442;HRUN=2;LEN=3;MLLD=242.679;QD=8.16847;RBI=0.0238616;REFB=-0.0164942;REVB=-0.0105081;RO=26;SAF=6;SAR=7;SRF=18;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.255481;STB=0.611511;STBP=0.281;TYPE=del;VARB=0.0313432;OID=.;OPOS=48285982;OREF=CTT;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.357143:13:44:15:42:27:8:7:19:8:85:26:6:7:18:8
chr11	48286231	.	T	A	80.27	PASS	AF=0.526316;AO=10;DP=19;FAO=10;FDP=19;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=0.0286781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.715;QD=16.8984;RBI=0.0361283;REFB=-0.00159213;REVB=-0.0219732;RO=9;SAF=6;SAR=4;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157971;STB=0.590739;STBP=0.475;TYPE=snp;VARB=0.00129384;OID=.;OPOS=48286231;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:19:19:9:9:10:10:0.526316:4:6:7:2:4:6:7:2
chr11	48328644	.	C	T	84.31	PASS	AF=0.34375;AO=11;DP=32;FAO=11;FDP=32;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=0.0142563;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.266;QD=10.5386;RBI=0.0170773;REFB=-0.00663045;REVB=-0.00940175;RO=21;SAF=5;SAR=6;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0819168;STB=0.549045;STBP=0.719;TYPE=snp;VARB=0.01478;OID=.;OPOS=48328644;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:32:32:21:21:11:11:0.34375:6:5:8:13:6:5:8:13
chr11	48346513	.	T	C	50.94	PASS	AF=0.123596;AO=11;DP=89;FAO=11;FDP=89;FR=.;FRO=78;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=41;FSRR=37;FWDB=-0.0177348;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.3248;QD=2.28942;RBI=0.0220034;REFB=0.00161522;REVB=0.013024;RO=77;SAF=2;SAR=9;SRF=40;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.419853;STB=0.807362;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=-0.0126873;OID=.;OPOS=48346513;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:50:89:89:77:78:11:11:0.123596:9:2:40:37:9:2:41:37
chr11	48346523	.	C	T	43.02	PASS	AF=0.108696;AO=10;DP=92;FAO=10;FDP=92;FR=.;FRO=82;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=43;FSRR=39;FWDB=-0.00391179;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.5527;QD=1.87052;RBI=0.028741;REFB=0.000916094;REVB=0.0284736;RO=80;SAF=3;SAR=7;SRF=41;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.255088;STB=0.6996;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=-0.0054407;OID=.;OPOS=48346523;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:92:92:80:82:10:10:0.108696:7:3:41:39:7:3:43:39
chr11	48346535	.	G	C	69.72	PASS	AF=0.137255;AO=14;DP=99;FAO=14;FDP=102;FR=.;FRO=88;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=48;FSRR=40;FWDB=-0.0895372;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.6603;QD=2.73412;RBI=0.091963;REFB=-0.00691072;REVB=-0.0209829;RO=85;SAF=5;SAR=9;SRF=45;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.214011;STB=0.660438;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=0.0327567;OID=.;OPOS=48346535;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:69:99:102:85:88:14:14:0.137255:9:5:45:40:9:5:48:40
chr11	48346541	.	A	T	80.3	PASS	AF=0.146789;AO=16;DP=109;FAO=16;FDP=109;FR=.;FRO=93;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=50;FSRR=43;FWDB=-0.0324535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.1255;QD=2.94662;RBI=0.0415271;REFB=-0.00540052;REVB=-0.0259088;RO=89;SAF=7;SAR=9;SRF=48;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127466;STB=0.584843;STBP=0.48;TYPE=snp;VARB=0.0253713;OID=.;OPOS=48346541;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:80:109:109:89:93:16:16:0.146789:9:7:48:41:9:7:50:43
chr11	48346547	.	C	T	84.55	PASS	AF=0.149123;AO=17;DP=114;FAO=17;FDP=114;FR=.;FRO=97;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=49;FSRR=48;FWDB=-0.011456;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.772;QD=2.9668;RBI=0.0198466;REFB=-0.00361764;REVB=-0.0162065;RO=97;SAF=8;SAR=9;SRF=49;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0434871;STB=0.529377;STBP=0.814;TYPE=snp;VARB=0.0114661;OID=.;OPOS=48346547;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:114:114:97:97:17:17:0.149123:9:8:49:48:9:8:49:48
chr11	48346551	.	C	A	85.66	PASS	AF=0.151786;AO=17;DP=113;FAO=17;FDP=112;FR=.;FRO=95;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=47;FSRR=48;FWDB=-0.00955382;FXX=0.00884877;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.686;QD=3.05913;RBI=0.022087;REFB=-0.00217021;REVB=-0.0199138;RO=96;SAF=8;SAR=9;SRF=47;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0239397;STB=0.520481;STBP=0.842;TYPE=snp;VARB=0.0145367;OID=.;OPOS=48346551;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:113:112:96:95:17:17:0.151786:9:8:47:49:9:8:47:48
chr11	48346579	.	C	A	178.17	PASS	AF=0.231405;AO=28;DP=123;FAO=28;FDP=121;FR=.;FRO=93;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=44;FSRR=49;FWDB=-0.0136643;FXX=0.0162588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.089;QD=5.88992;RBI=0.015689;REFB=-0.012147;REVB=0.00770932;RO=95;SAF=17;SAR=11;SRF=44;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180754;STB=0.603119;STBP=0.226;TYPE=snp;VARB=0.0582128;OID=.;OPOS=48346579;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:123:121:95:93:28:28:0.231405:11:17:44:51:11:17:44:49
chr11	48346588	.	A	C	254.43	PASS	AF=0.268657;AO=36;DP=134;FAO=36;FDP=134;FR=.;FRO=98;FSAF=23;FSAR=13;FSRF=47;FSRR=51;FWDB=-0.00654897;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=217.477;QD=7.59504;RBI=0.00663518;REFB=-0.0139016;REVB=-0.00106608;RO=98;SAF=23;SAR=13;SRF=47;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197623;STB=0.617902;STBP=0.104;TYPE=snp;VARB=0.0280815;OID=.;OPOS=48346588;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:134:134:98:98:36:36:0.268657:13:23:47:51:13:23:47:51
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chr11	48346615	.	G	A	349.82	PASS	AF=0.284884;AO=49;DP=172;FAO=49;FDP=172;FR=.;FRO=123;FSAF=31;FSAR=18;FSRF=60;FSRR=63;FWDB=-0.00182255;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=50.6799;QD=8.13542;RBI=0.021869;REFB=-0.00622182;REVB=-0.0217929;RO=116;SAF=31;SAR=18;SRF=57;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172535;STB=0.605163;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=0.017084;OID=.;OPOS=48346615;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:172:172:116:123:49:49:0.284884:18:31:57:59:18:31:60:63
chr11	48346660	.	TTTGCTGATC	T	228.84	PASS	AF=0.304878;AO=47;DP=176;FAO=50;FDP=164;FR=.;FRO=114;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=50;FSRR=64;FWDB=-0.00315233;FXX=0.029584;HRUN=5;LEN=9;MLLD=324.016;QD=5.58154;RBI=0.0137178;REFB=-0.00216055;REVB=-0.0133507;RO=117;SAF=27;SAR=20;SRF=53;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146946;STB=0.583866;STBP=0.159;TYPE=del;VARB=0.00605725;OID=.;OPOS=48346661;OREF=TTGCTGATC;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.304878:47:176:50:164:114:28:22:50:64:99:117:27:20:53:64
chr11	48346681	.	G	A	506.77	PASS	AF=0.321951;AO=66;DP=205;FAO=66;FDP=205;FR=.;FRO=139;FSAF=39;FSAR=27;FSRF=63;FSRR=76;FWDB=0.00833387;FXX=0.00966137;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.734;QD=9.88817;RBI=0.0174158;REFB=0.000508828;REVB=-0.0152924;RO=139;SAF=39;SAR=27;SRF=63;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161715;STB=0.593237;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=-0.000817576;OID=.;OPOS=48346681;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:205:205:139:139:66:66:0.321951:27:39:63:76:27:39:63:76
chr11	48346729	.	G	C	375.88	PASS	AF=0.301775;AO=50;DP=168;FAO=51;FDP=169;FR=.;FRO=118;FSAF=17;FSAR=34;FSRF=54;FSRR=64;FWDB=0.0056251;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.67;QD=8.89653;RBI=0.00783758;REFB=-0.00478265;REVB=-0.00545764;RO=118;SAF=16;SAR=34;SRF=54;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17506;STB=0.59163;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=0.0128279;OID=.;OPOS=48346729;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:168:169:118:118:50:51:0.301775:34:16:54:64:34:17:54:64
chr11	48346791	.	C	T	288.98	PASS	AF=0.324786;AO=37;DP=117;FAO=38;FDP=117;FR=.;FRO=79;FSAF=9;FSAR=29;FSRF=30;FSRR=49;FWDB=-0.00332051;FXX=0.00847386;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.227;QD=9.87952;RBI=0.00457539;REFB=-0.00208785;REVB=0.00314776;RO=79;SAF=9;SAR=28;SRF=30;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.189988;STB=0.616955;STBP=0.107;TYPE=snp;VARB=0.00481826;OID=.;OPOS=48346791;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:117:117:79:79:37:38:0.324786:28:9:30:49:29:9:30:49
chr11	48346822	.	A	C	205.11	PASS	AF=0.287234;AO=27;DP=94;FAO=27;FDP=94;FR=.;FRO=67;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=24;FSRR=43;FWDB=0.020888;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.5486;QD=8.72816;RBI=0.0216079;REFB=0.00533344;REVB=-0.00553087;RO=65;SAF=9;SAR=18;SRF=24;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0471449;STB=0.51967;STBP=0.833;TYPE=snp;VARB=-0.015474;OID=.;OPOS=48346822;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:65:67:27:27:0.287234:18:9:24:41:18:9:24:43
chr11	48346843	.	C	T	197.75	PASS	AF=0.298851;AO=26;DP=87;FAO=26;FDP=87;FR=.;FRO=61;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=41;FWDB=-0.0167874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.871;QD=9.09199;RBI=0.0168953;REFB=-0.00331556;REVB=0.00190681;RO=58;SAF=8;SAR=18;SRF=20;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.049789;STB=0.516381;STBP=0.848;TYPE=snp;VARB=0.00777189;OID=.;OPOS=48346843;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:58:61:26:26:0.298851:18:8:20:38:18:8:20:41
chr11	48346916	.	G	C	257.73	PASS	AF=0.320755;AO=34;DP=107;FAO=34;FDP=106;FR=.;FRO=72;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=32;FSRR=40;FWDB=-0.00405087;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.7455;QD=9.72548;RBI=0.00703387;REFB=0.00536631;REVB=0.00575028;RO=72;SAF=16;SAR=18;SRF=32;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0306547;STB=0.517847;STBP=0.823;TYPE=snp;VARB=-0.00639617;OID=.;OPOS=48346916;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:106:72:72:34:34:0.320755:18:16:32:40:18:16:32:40
chr11	48346924	.	T	C	265.71	PASS	AF=0.324074;AO=35;DP=108;FAO=35;FDP=108;FR=.;FRO=73;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=31;FSRR=42;FWDB=0.0117093;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.2085;QD=9.84116;RBI=0.0153793;REFB=0.012172;REVB=0.00997082;RO=73;SAF=16;SAR=19;SRF=31;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0381997;STB=0.522192;STBP=0.761;TYPE=snp;VARB=-0.0266738;OID=.;OPOS=48346924;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:108:73:73:35:35:0.324074:19:16:31:42:19:16:31:42
chr11	48346932	.	G	A	277.33	PASS	AF=0.333333;AO=36;DP=108;FAO=36;FDP=108;FR=.;FRO=72;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=32;FSRR=40;FWDB=-0.000461025;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.634;QD=10.2714;RBI=0.0142557;REFB=-0.0065553;REVB=-0.0142483;RO=72;SAF=15;SAR=21;SRF=32;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0326414;STB=0.518917;STBP=0.789;TYPE=snp;VARB=0.00991618;OID=.;OPOS=48346932;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:108:72:72:36:36:0.333333:21:15:32:40:21:15:32:40
chr11	48346961	.	AA	TG	375.9	PASS	AF=0.40367;AO=44;DP=110;FAO=44;FDP=109;FR=.;FRO=65;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=35;FSRR=30;FWDB=-0.0150143;FXX=0.00909008;HRUN=2;LEN=2;MLLD=221.692;QD=13.7943;RBI=0.0176488;REFB=-0.0107326;REVB=-0.00927632;RO=65;SAF=23;SAR=21;SRF=35;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0166419;STB=0.509406;STBP=0.893;TYPE=mnp;VARB=0.0172061;OID=.;OPOS=48346961;OREF=AA;OALT=TG;OMAPALT=TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:109:65:65:44:44:0.40367:21:23:35:30:21:23:35:30
chr11	48346996	.	G	A	69.37	PASS	AF=0.131579;AO=15;DP=114;FAO=15;FDP=114;FR=.;FRO=99;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=55;FSRR=44;FWDB=0.0010634;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.476;QD=2.43413;RBI=0.0211689;REFB=-0.00621681;REVB=0.0211421;RO=95;SAF=7;SAR=8;SRF=51;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0872018;STB=0.576643;STBP=0.56;TYPE=snp;VARB=0.0330275;OID=.;OPOS=48346996;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:69:114:114:95:99:15:15:0.131579:8:7:51:44:8:7:55:44
chr11	48346999	.	T	G	345.78	PASS	AF=0.375;AO=41;DP=111;FAO=42;FDP=112;FR=.;FRO=70;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=42;FSRR=28;FWDB=0.0648379;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.2971;QD=12.3491;RBI=0.0652274;REFB=-0.0181934;REVB=0.00711753;RO=69;SAF=21;SAR=20;SRF=41;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0905353;STB=0.547923;STBP=0.455;TYPE=snp;VARB=0.0321398;OID=.;OPOS=48346999;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:112:69:70:41:42:0.375:20:21:41:28:20:22:42:28
chr11	48347014	.	G	A	357.18	PASS	AF=0.380531;AO=42;DP=113;FAO=43;FDP=113;FR=.;FRO=70;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=42;FSRR=28;FWDB=0.0303245;FXX=0.00877116;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.613;QD=12.6436;RBI=0.0304287;REFB=-0.00565574;REVB=-0.00251549;RO=68;SAF=21;SAR=21;SRF=41;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11202;STB=0.568934;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=0.0401494;OID=.;OPOS=48347014;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:113:68:70:42:43:0.380531:21:21:41:27:22:21:42:28
chr11	48347023	.	C	T	412.41	PASS	AF=0.423423;AO=46;DP=110;FAO=47;FDP=111;FR=.;FRO=64;FSAF=23;FSAR=24;FSRF=41;FSRR=23;FWDB=0.000591575;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.213;QD=14.8617;RBI=0.000593843;REFB=-0.00717101;REVB=5.18567e-05;RO=63;SAF=23;SAR=23;SRF=40;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138964;STB=0.586896;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=0.00794353;OID=.;OPOS=48347023;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:111:63:64:46:47:0.423423:23:23:40:23:24:23:41:23
chr11	48347067	.	C	T	463.84	PASS	AF=0.479167;AO=46;DP=96;FAO=46;FDP=96;FR=.;FRO=50;FSAF=17;FSAR=29;FSRF=30;FSRR=20;FWDB=-0.0257362;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=271.929;QD=19.3266;RBI=0.025889;REFB=-0.0185533;REVB=-0.00280892;RO=50;SAF=17;SAR=29;SRF=30;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.216833;STB=0.620621;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.0264864;OID=.;OPOS=48347067;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:96:50:50:46:46:0.479167:29:17:30:20:29:17:30:20
chr11	48347100	.	C	T	394.28	PASS	AF=0.506329;AO=40;DP=79;FAO=40;FDP=79;FR=.;FRO=39;FSAF=13;FSAR=27;FSRF=27;FSRR=12;FWDB=-0.0336073;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.411;QD=19.9638;RBI=0.038543;REFB=-0.00425557;REVB=0.018871;RO=39;SAF=13;SAR=27;SRF=27;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.325434;STB=0.680439;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00500173;OID=.;OPOS=48347100;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:39:39:40:40:0.506329:27:13:27:12:27:13:27:12
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chr11	48347130	.	C	G	355.15	PASS	AF=0.493333;AO=37;DP=75;FAO=37;FDP=75;FR=.;FRO=38;FSAF=13;FSAR=24;FSRF=23;FSRR=15;FWDB=-0.000423069;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.5014;QD=18.9414;RBI=0.00917627;REFB=0.0309492;REVB=0.00916652;RO=38;SAF=13;SAR=24;SRF=23;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.233509;STB=0.630126;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=-0.0311987;OID=.;OPOS=48347130;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:38:38:37:37:0.493333:24:13:23:15:24:13:23:15
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chr11	48347267	.	T	C	165.9	PASS	AF=0.225;AO=26;DP=120;FAO=27;FDP=120;FR=.;FRO=93;FSAF=20;FSAR=7;FSRF=52;FSRR=41;FWDB=-0.00706005;FXX=0.00826378;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.855;QD=5.53018;RBI=0.013088;REFB=0.00099041;REVB=0.0110205;RO=92;SAF=19;SAR=7;SRF=51;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.240619;STB=0.655615;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=-0.00905098;OID=.;OPOS=48347267;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:120:92:93:26:27:0.225:7:19:51:41:7:20:52:41
chr11	48347306	.	G	T	102.83	PASS	AF=0.163934;AO=19;DP=122;FAO=20;FDP=122;FR=.;FRO=102;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=59;FSRR=43;FWDB=-0.0045027;FXX=0.00812942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=302.762;QD=3.37143;RBI=0.00452395;REFB=8.08277e-05;REVB=-0.000438064;RO=101;SAF=14;SAR=5;SRF=58;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.223965;STB=0.610205;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=-0.00047898;OID=.;OPOS=48347306;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:122:122:101:102:19:20:0.163934:5:14:58:43:6:14:59:43
chr11	48347342	.	G	A	71.36	PASS	AF=0.136364;AO=16;DP=110;FAO=15;FDP=110;FR=.;FRO=95;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=51;FSRR=44;FWDB=-0.0610192;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.421;QD=2.59487;RBI=0.0646591;REFB=-0.00705585;REVB=-0.0213883;RO=90;SAF=9;SAR=7;SRF=50;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00884487;STB=0.503041;STBP=0.978;TYPE=snp;VARB=0.0433224;OID=.;OPOS=48347342;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:71:110:110:90:95:16:15:0.136364:7:9:50:40:7:8:51:44
chr11	48347346	.	A	T	74.95	PASS	AF=0.141509;AO=15;DP=106;FAO=15;FDP=106;FR=.;FRO=91;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=47;FSRR=44;FWDB=-0.0153506;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.688;QD=2.82825;RBI=0.0429686;REFB=-0.00579579;REVB=-0.040133;RO=90;SAF=8;SAR=7;SRF=47;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0139204;STB=0.514483;STBP=0.955;TYPE=snp;VARB=0.0596956;OID=.;OPOS=48347346;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:106:106:90:91:15:15:0.141509:7:8:47:43:7:8:47:44
chr11	48347358	.	C	T	52.24	PASS	AF=0.121212;AO=12;DP=97;FAO=12;FDP=99;FR=.;FRO=87;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=46;FSRR=41;FWDB=-0.0479725;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.3852;QD=2.11062;RBI=0.0552378;REFB=-0.00652932;REVB=0.0273835;RO=84;SAF=7;SAR=5;SRF=44;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0734019;STB=0.548471;STBP=0.725;TYPE=snp;VARB=0.0139921;OID=.;OPOS=48347358;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:97:99:84:87:12:12:0.121212:5:7:44:40:5:7:46:41
chr11	48347363	.	C	T	55.21	PASS	AF=0.12;AO=12;DP=99;FAO=12;FDP=100;FR=.;FRO=88;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=46;FSRR=42;FWDB=-0.0135259;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.763;QD=2.20845;RBI=0.0137347;REFB=-0.00313725;REVB=-0.00238582;RO=87;SAF=7;SAR=5;SRF=45;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0810571;STB=0.553782;STBP=0.735;TYPE=snp;VARB=0.0290679;OID=.;OPOS=48347363;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:99:100:87:88:12:12:0.12:5:7:45:42:5:7:46:42
chr11	48347392	.	T	C	34.94	PASS	AF=0.105263;AO=8;DP=76;FAO=8;FDP=76;FR=.;FRO=68;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=33;FSRR=35;FWDB=-0.0115484;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.151;QD=1.83906;RBI=0.0181602;REFB=-0.00362644;REVB=0.0140152;RO=67;SAF=4;SAR=4;SRF=32;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0262096;STB=0.513125;STBP=0.943;TYPE=snp;VARB=0.0247284;OID=.;OPOS=48347392;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:76:76:67:68:8:8:0.105263:4:4:32:35:4:4:33:35
chr11	48347419	.	A	G	48.56	PASS	AF=0.145161;AO=9;DP=62;FAO=9;FDP=62;FR=.;FRO=53;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=26;FSRR=27;FWDB=0.024279;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.4308;QD=3.13292;RBI=0.0706741;REFB=0.00718173;REVB=0.0663729;RO=53;SAF=4;SAR=5;SRF=26;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0563903;STB=0.53948;STBP=0.797;TYPE=snp;VARB=-0.0149254;OID=.;OPOS=48347419;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:48:62:62:53:53:9:9:0.145161:5:4:26:27:5:4:26:27
chr11	48347492	.	G	A	86.86	PASS	AF=0.407407;AO=11;DP=27;FAO=11;FDP=27;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=-0.0166526;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.2866;QD=12.8677;RBI=0.0551729;REFB=0.0260493;REVB=-0.0525998;RO=16;SAF=5;SAR=6;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146881;STB=0.586057;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=-0.0416772;OID=.;OPOS=48347492;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:27:27:16:16:11:11:0.407407:6:5:5:11:6:5:5:11
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chr11	48367097	.	A	G	53.57	PASS	AF=0.258065;AO=8;DP=31;FAO=8;FDP=31;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=-0.028524;FXX=0.0312402;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.7;QD=6.91199;RBI=0.0292879;REFB=-0.00745485;REVB=0.00664571;RO=22;SAF=5;SAR=3;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0721645;STB=0.521685;STBP=0.969;TYPE=snp;VARB=0.033455;OID=.;OPOS=48367097;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:31:31:22:23:8:8:0.258065:3:5:15:7:3:5:15:8
chr11	48367133	.	C	A	43.82	PASS	AF=0.25;AO=7;DP=28;FAO=7;FDP=28;FR=.;FRO=21;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=15;FSRR=6;FWDB=-0.0171623;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.7843;QD=6.26012;RBI=0.0174874;REFB=-0.0172285;REVB=-0.0033559;RO=21;SAF=4;SAR=3;SRF=15;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177928;STB=0.612607;STBP=0.569;TYPE=snp;VARB=0.00894578;OID=.;OPOS=48367133;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:28:28:21:21:7:7:0.25:3:4:15:6:3:4:15:6
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chr11	48367195	.	C	T	86.3	PASS	AF=0.392857;AO=11;DP=28;FAO=11;FDP=28;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=-0.0129781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.718;QD=12.3289;RBI=0.0525781;REFB=0.000866653;REVB=0.0509512;RO=16;SAF=6;SAR=5;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146881;STB=0.599828;STBP=0.415;TYPE=snp;VARB=-0.00510935;OID=.;OPOS=48367195;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:28:28:16:17:11:11:0.392857:5:6:11:5:5:6:12:5
chr11	48367249	.	C	T	244.1	PASS	AF=0.5;AO=26;DP=52;FAO=26;FDP=52;FR=.;FRO=26;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.00145567;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=243.973;QD=18.7769;RBI=0.00658792;REFB=-0.0072199;REVB=-0.00642508;RO=26;SAF=15;SAR=11;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103435;STB=0.557991;STBP=0.432;TYPE=snp;VARB=0.00544194;OID=.;OPOS=48367249;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:26:26:26:26:0.5:11:15:12:14:11:15:12:14
chr11	48367252	.	G	A	244.1	PASS	AF=0.5;AO=26;DP=52;FAO=26;FDP=52;FR=.;FRO=26;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.0623364;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.2198;QD=18.7766;RBI=0.063052;REFB=0.0178003;REVB=0.00947225;RO=26;SAF=15;SAR=11;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103435;STB=0.557991;STBP=0.432;TYPE=snp;VARB=-0.0184128;OID=.;OPOS=48367252;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:26:26:26:26:0.5:11:15:12:14:11:15:12:14
chr11	48367311	.	T	C	332.0	PASS	AF=0.439024;AO=36;DP=82;FAO=36;FDP=82;FR=.;FRO=46;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=22;FWDB=-0.00594152;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.5605;QD=16.1949;RBI=0.0182373;REFB=0.00374287;REVB=-0.0172423;RO=45;SAF=19;SAR=17;SRF=23;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0164976;STB=0.503395;STBP=0.976;TYPE=snp;VARB=-0.00435596;OID=.;OPOS=48367311;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:45:46:36:36:0.439024:17:19:23:22:17:19:24:22
chr11	48367363	.	C	T	280.65	PASS	AF=0.354839;AO=33;DP=93;FAO=33;FDP=93;FR=.;FRO=60;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=31;FSRR=29;FWDB=0.0324787;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.4771;QD=12.071;RBI=0.0324983;REFB=-0.0155818;REVB=-0.00112719;RO=60;SAF=16;SAR=17;SRF=31;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0356086;STB=0.520509;STBP=0.811;TYPE=snp;VARB=0.026661;OID=.;OPOS=48367363;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:60:60:33:33:0.354839:17:16:31:29:17:16:31:29
chr11	48367387	.	C	T	264.32	PASS	AF=0.382716;AO=31;DP=80;FAO=31;FDP=81;FR=.;FRO=50;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=28;FSRR=22;FWDB=0.035233;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.8053;QD=13.0529;RBI=0.0377588;REFB=-0.00409082;REVB=0.0135781;RO=49;SAF=12;SAR=19;SRF=27;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176512;STB=0.60696;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.00668969;OID=.;OPOS=48367387;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:81:49:50:31:31:0.382716:19:12:27:22:19:12:28:22
chr11	48367419	.	G	A	156.15	PASS	AF=0.318182;AO=21;DP=66;FAO=21;FDP=66;FR=.;FRO=45;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=27;FSRR=18;FWDB=-0.00783738;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=262.304;QD=9.4636;RBI=0.010976;REFB=-0.00474184;REVB=-0.00768434;RO=45;SAF=11;SAR=10;SRF=27;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0888165;STB=0.552277;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=0.00897502;OID=.;OPOS=48367419;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:45:45:21:21:0.318182:10:11:27:18:10:11:27:18
chr11	48367424	.	C	G	157.11	PASS	AF=0.323077;AO=21;DP=65;FAO=21;FDP=65;FR=.;FRO=44;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=27;FSRR=17;FWDB=-0.00888967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.665;QD=9.66856;RBI=0.0117495;REFB=-0.00217777;REVB=0.00768267;RO=44;SAF=11;SAR=10;SRF=27;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104317;STB=0.561243;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.00775663;OID=.;OPOS=48367424;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:44:44:21:21:0.323077:10:11:27:17:10:11:27:17
chr11	48367455	.	G	A	130.04	PASS	AF=0.3;AO=18;DP=60;FAO=18;FDP=60;FR=.;FRO=42;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=0.000447538;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=282.195;QD=8.66923;RBI=0.00085234;REFB=-5.7755e-05;REVB=0.000725392;RO=42;SAF=11;SAR=7;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104294;STB=0.56243;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.000150694;OID=.;OPOS=48367455;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:42:42:18:18:0.3:7:11:22:20:7:11:22:20
chr11	48367469	.	TG	CA	152.15	PASS	AF=0.369565;AO=17;DP=46;FAO=17;FDP=46;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=-0.033935;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=208.682;QD=13.2308;RBI=0.041715;REFB=-0.0280571;REVB=-0.0242601;RO=29;SAF=10;SAR=7;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114474;STB=0.566931;STBP=0.516;TYPE=mnp;VARB=0.0295831;OID=.;OPOS=48367469;OREF=TG;OALT=CA;OMAPALT=CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:29:29:17:17:0.369565:7:10:14:15:7:10:14:15
chr11	48367474	.	A	G	127.2	PASS	AF=0.340909;AO=15;DP=44;FAO=15;FDP=44;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.0245468;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.769;QD=11.5638;RBI=0.0319898;REFB=-0.00547575;REVB=-0.0205134;RO=29;SAF=11;SAR=4;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.295138;STB=0.676129;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=0.00564428;OID=.;OPOS=48367474;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:29:29:15:15:0.340909:4:11:14:15:4:11:14:15
chr11	48367499	.	A	G	143.96	PASS	AF=0.421053;AO=16;DP=38;FAO=16;FDP=38;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.0017023;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.19;QD=15.1539;RBI=0.0101041;REFB=-0.00562727;REVB=-0.00995971;RO=22;SAF=12;SAR=4;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.277003;STB=0.661549;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=0.00956364;OID=.;OPOS=48367499;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:22:22:16:16:0.421053:4:12:11:11:4:12:11:11
chr11	48367511	.	T	G	84.79	PASS	AF=0.354839;AO=11;DP=31;FAO=11;FDP=31;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.00721313;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.495;QD=10.9406;RBI=0.024949;REFB=-0.00199783;REVB=0.0238835;RO=20;SAF=9;SAR=2;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.392792;STB=0.739243;STBP=0.069;TYPE=snp;VARB=0.0144853;OID=.;OPOS=48367511;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:31:31:20:20:11:11:0.354839:2:9:10:10:2:9:10:10
chr11	48373748	.	C	G	108.96	PASS	AF=0.262295;AO=16;DP=62;FAO=16;FDP=61;FR=.;FRO=45;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=22;FSRR=23;FWDB=0.0175499;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.7492;QD=7.14469;RBI=0.0240372;REFB=0.00776196;REVB=-0.0164253;RO=43;SAF=3;SAR=13;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.401012;STB=0.750236;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=-0.0189182;OID=.;OPOS=48373748;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:61:43:45:16:16:0.262295:13:3:21:22:13:3:22:23
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chr11	48373805	.	G	A	146.98	PASS	AF=0.269231;AO=21;DP=78;FAO=21;FDP=78;FR=.;FRO=57;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=28;FSRR=29;FWDB=-0.0211732;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.3607;QD=7.53765;RBI=0.022106;REFB=-0.00251071;REVB=-0.00635359;RO=57;SAF=9;SAR=12;SRF=28;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0763495;STB=0.546081;STBP=0.689;TYPE=snp;VARB=0.0118409;OID=.;OPOS=48373805;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:57:57:21:21:0.269231:12:9:28:29:12:9:28:29
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chr11	48373885	.	A	G	375.42	PASS	AF=0.378151;AO=45;DP=119;FAO=45;FDP=119;FR=.;FRO=74;FSAF=19;FSAR=26;FSRF=34;FSRR=40;FWDB=0.0134347;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=245.135;QD=12.6193;RBI=0.0142313;REFB=-0.00842147;REVB=-0.00469452;RO=74;SAF=19;SAR=26;SRF=34;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0413629;STB=0.523546;STBP=0.704;TYPE=snp;VARB=0.0127107;OID=.;OPOS=48373885;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:119:74:74:45:45:0.378151:26:19:34:40:26:19:34:40
chr11	48373900	.	A	G	361.08	PASS	AF=0.366667;AO=44;DP=120;FAO=44;FDP=120;FR=.;FRO=76;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=34;FSRR=42;FWDB=-0.00559416;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.9572;QD=12.0359;RBI=0.0057562;REFB=-0.0110964;REVB=0.00135618;RO=76;SAF=21;SAR=23;SRF=34;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0332944;STB=0.519003;STBP=0.765;TYPE=snp;VARB=0.0189932;OID=.;OPOS=48373900;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:120:76:76:44:44:0.366667:23:21:34:42:23:21:34:42
chr11	48373936	.	A	G	483.98	PASS	AF=0.412214;AO=54;DP=131;FAO=54;FDP=131;FR=.;FRO=77;FSAF=26;FSAR=28;FSRF=36;FSRR=41;FWDB=-0.0253688;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.1863;QD=14.7781;RBI=0.0277591;REFB=-0.00805609;REVB=-0.0112691;RO=75;SAF=26;SAR=28;SRF=34;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0292108;STB=0.508212;STBP=0.871;TYPE=snp;VARB=0.0107663;OID=.;OPOS=48373936;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:131:131:75:77:54:54:0.412214:28:26:34:41:28:26:36:41
chr11	48373976	.	T	G	370.86	PASS	AF=0.392857;AO=44;DP=112;FAO=44;FDP=112;FR=.;FRO=68;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=31;FSRR=37;FWDB=0.0124259;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.5;QD=13.2451;RBI=0.013822;REFB=-0.0114034;REVB=-0.00605336;RO=68;SAF=22;SAR=22;SRF=31;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0472494;STB=0.526774;STBP=0.66;TYPE=snp;VARB=0.0184854;OID=.;OPOS=48373976;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:112:68:68:44:44:0.392857:22:22:31:37:22:22:31:37
chr11	48373986	.	A	G	370.7	PASS	AF=0.4;AO=40;DP=100;FAO=40;FDP=100;FR=.;FRO=60;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=28;FSRR=32;FWDB=0.028658;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.967;QD=14.828;RBI=0.0287601;REFB=-0.00521833;REVB=0.00242115;RO=60;SAF=21;SAR=19;SRF=28;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0616808;STB=0.534948;STBP=0.593;TYPE=snp;VARB=0.00553013;OID=.;OPOS=48373986;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:60:60:40:40:0.4:19:21:28:32:19:21:28:32
chr11	48374000	.	C	CT	74.78	PASS	AF=0.366197;AO=24;DP=85;FAO=26;FDP=71;FR=.;FRO=45;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=25;FWDB=0.0185636;FXX=0.0405351;HRUN=5;LEN=1;MLLD=9.80108;QD=4.21303;RBI=0.167907;REFB=-0.0276994;REVB=0.166878;RO=56;SAF=14;SAR=10;SRF=27;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119965;STB=0.583719;STBP=0.286;TYPE=ins;VARB=-0.0171149;OID=.;OPOS=48374001;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.366197:24:85:26:71:45:15:11:20:25:74:56:14:10:27:29
chr11	48387098	.	A	C	102.43	PASS	AF=0.264151;AO=14;DP=53;FAO=14;FDP=53;FR=.;FRO=39;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=22;FSRR=17;FWDB=-0.00305358;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.045;QD=7.73068;RBI=0.00487861;REFB=-0.0166218;REVB=0.0038048;RO=38;SAF=6;SAR=8;SRF=21;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14729;STB=0.598791;STBP=0.407;TYPE=snp;VARB=0.0229861;OID=.;OPOS=48387098;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:38:39:14:14:0.264151:8:6:21:17:8:6:22:17
chr11	48387107	.	T	C	97.52	PASS	AF=0.254902;AO=12;DP=49;FAO=13;FDP=51;FR=.;FRO=38;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=-0.00167005;FXX=0.0192271;HRUN=3;LEN=1;MLLD=169.853;QD=7.64901;RBI=0.00839691;REFB=-0.013892;REVB=-0.00822915;RO=37;SAF=6;SAR=6;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0489376;STB=0.548119;STBP=0.694;TYPE=snp;VARB=0.0583133;OID=.;OPOS=48387107;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:49:51:37:38:12:13:0.254902:6:6:20:17:7:6:20:18
chr11	48387115	.	G	A	67.81	PASS	AF=0.2;AO=10;DP=50;FAO=10;FDP=50;FR=.;FRO=40;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=0.0105593;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=276.767;QD=5.4245;RBI=0.0241743;REFB=-0.0035991;REVB=-0.0217462;RO=40;SAF=3;SAR=7;SRF=21;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.278955;STB=0.682556;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=0.0176834;OID=.;OPOS=48387115;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:50:50:40:40:10:10:0.2:7:3:21:19:7:3:21:19
chr11	48387118	.	G	A	67.78	PASS	AF=0.2;AO=10;DP=50;FAO=10;FDP=50;FR=.;FRO=40;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=-0.0251017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.055;QD=5.42224;RBI=0.0312418;REFB=5.72583e-05;REVB=-0.0185998;RO=39;SAF=3;SAR=7;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.293318;STB=0.682556;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=-0.00113107;OID=.;OPOS=48387118;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:50:50:39:40:10:10:0.2:7:3:21:18:7:3:21:19
chr11	48387275	.	T	C	94.04	PASS	AF=0.461538;AO=11;DP=25;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.0103818;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.7894;QD=14.4676;RBI=0.10832;REFB=-0.0442717;REVB=0.107821;RO=14;SAF=7;SAR=4;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134192;STB=0.545378;STBP=0.655;TYPE=snp;VARB=0.0823443;OID=.;OPOS=48387275;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:25:26:14:14:11:12:0.461538:4:7:7:7:5:7:7:7
chr11	48387301	.	G	A	61.53	PASS	AF=0.257143;AO=9;DP=35;FAO=9;FDP=35;FR=.;FRO=26;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=-0.00729438;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.8;QD=7.03222;RBI=0.0290071;REFB=-3.43702e-05;REVB=0.028075;RO=26;SAF=3;SAR=6;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.324668;STB=0.703267;STBP=0.202;TYPE=snp;VARB=0.000491536;OID=.;OPOS=48387301;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:35:35:26:26:9:9:0.257143:6:3:16:10:6:3:16:10
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chr11	48387535	.	T	C	94.07	PASS	AF=0.223881;AO=15;DP=67;FAO=15;FDP=67;FR=.;FRO=52;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=29;FSRR=23;FWDB=-0.0219194;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.1087;QD=5.61583;RBI=0.0237409;REFB=-0.00589478;REVB=0.00911973;RO=52;SAF=9;SAR=6;SRF=29;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0536019;STB=0.533697;STBP=0.79;TYPE=snp;VARB=0.0213448;OID=.;OPOS=48387535;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:67:67:52:52:15:15:0.223881:6:9:29:23:6:9:29:23
chr11	48387540	.	G	T	85.85	PASS	AF=0.212121;AO=14;DP=66;FAO=14;FDP=66;FR=.;FRO=52;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=29;FSRR=23;FWDB=0.0205956;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.261;QD=5.20314;RBI=0.0210852;REFB=-0.00249484;REVB=-0.00451775;RO=52;SAF=8;SAR=6;SRF=29;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.01731;STB=0.510997;STBP=0.945;TYPE=snp;VARB=0.00820094;OID=.;OPOS=48387540;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:66:66:52:52:14:14:0.212121:6:8:29:23:6:8:29:23
chr11	48387930	.	T	C	37.51	PASS	AF=0.0789474;AO=12;DP=152;FAO=12;FDP=152;FR=.;FRO=140;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=59;FSRR=81;FWDB=0.00758494;FXX=0.00653552;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.329;QD=0.987122;RBI=0.0108179;REFB=-5.83942e-05;REVB=0.00771329;RO=139;SAF=5;SAR=7;SRF=58;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000692071;STB=0.504497;STBP=0.997;TYPE=snp;VARB=-0.00256375;OID=.;OPOS=48387930;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:152:152:139:140:12:12:0.0789474:7:5:58:81:7:5:59:81
chr11	48387946	.	G	T	56.57	PASS	AF=0.100671;AO=15;DP=149;FAO=15;FDP=149;FR=.;FRO=134;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=58;FSRR=76;FWDB=-0.0136301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.406;QD=1.51868;RBI=0.0156144;REFB=-0.000410014;REVB=-0.00761777;RO=130;SAF=7;SAR=8;SRF=58;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0248252;STB=0.530645;STBP=0.813;TYPE=snp;VARB=0.00322243;OID=.;OPOS=48387946;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:149:149:130:134:15:15:0.100671:8:7:58:72:8:7:58:76
chr11	48387960	.	T	C	137.04	PASS	AF=0.172414;AO=25;DP=144;FAO=25;FDP=145;FR=.;FRO=120;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=54;FSRR=66;FWDB=-0.00777339;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.3444;QD=3.78042;RBI=0.0146791;REFB=0.00173545;REVB=0.0124519;RO=119;SAF=11;SAR=14;SRF=53;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00695804;STB=0.508373;STBP=0.937;TYPE=snp;VARB=-0.004689;OID=.;OPOS=48387960;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:144:145:119:120:25:25:0.172414:14:11:53:66:14:11:54:66
chr11	48387978	.	T	A	176.12	PASS	AF=0.227642;AO=28;DP=123;FAO=28;FDP=123;FR=.;FRO=95;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=41;FSRR=54;FWDB=0.00462588;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=229.329;QD=5.72749;RBI=0.0115391;REFB=-0.00537795;REVB=-0.0105713;RO=94;SAF=14;SAR=14;SRF=41;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0802986;STB=0.552808;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.0195343;OID=.;OPOS=48387978;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:123:123:94:95:28:28:0.227642:14:14:41:53:14:14:41:54
chr11	48387983	.	T	C	188.14	PASS	AF=0.241667;AO=29;DP=120;FAO=29;FDP=120;FR=.;FRO=91;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=40;FSRR=51;FWDB=0.012409;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.542;QD=6.27122;RBI=0.0135295;REFB=-0.00381235;REVB=-0.00539117;RO=91;SAF=14;SAR=15;SRF=40;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0541218;STB=0.532849;STBP=0.693;TYPE=snp;VARB=0.041899;OID=.;OPOS=48387983;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:120:91:91:29:29:0.241667:15:14:40:51:15:14:40:51
chr11	48510654	.	A	C	200.94	PASS	AF=0.367647;AO=25;DP=68;FAO=25;FDP=68;FR=.;FRO=43;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=-0.00483359;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.963;QD=11.8201;RBI=0.0232696;REFB=-0.00275471;REVB=-0.022762;RO=41;SAF=10;SAR=15;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12233;STB=0.571371;STBP=0.401;TYPE=snp;VARB=0.00435197;OID=.;OPOS=48510654;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:41:43:25:25:0.367647:15:10:21:20:15:10:22:21
chr11	48510777	.	G	A	257.39	PASS	AF=0.336957;AO=30;DP=92;FAO=31;FDP=92;FR=.;FRO=61;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=38;FSRR=23;FWDB=-0.00166991;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.648;QD=11.1908;RBI=0.0193544;REFB=-0.0234799;REVB=0.0192823;RO=60;SAF=20;SAR=10;SRF=38;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.04219;STB=0.515923;STBP=0.854;TYPE=snp;VARB=0.0369795;OID=.;OPOS=48510777;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:60:61:30:31:0.336957:10:20:38:22:11:20:38:23
chr11	48511315	.	C	T	80.27	PASS	AF=0.526316;AO=10;DP=19;FAO=10;FDP=19;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=0.0038016;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.63;QD=16.8982;RBI=0.0254994;REFB=-0.00098591;REVB=-0.0252144;RO=9;SAF=6;SAR=4;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.300918;STB=0.673141;STBP=0.141;TYPE=snp;VARB=0.000567653;OID=.;OPOS=48511315;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:19:19:9:9:10:10:0.526316:4:6:2:7:4:6:2:7
chr11	48998688	.	A	G	165.73	PASS	AF=0.391304;AO=18;DP=46;FAO=18;FDP=46;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.0124118;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.941;QD=14.4111;RBI=0.0127455;REFB=-0.0168235;REVB=-0.00289702;RO=28;SAF=10;SAR=8;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0585465;STB=0.533943;STBP=0.722;TYPE=snp;VARB=0.0266262;OID=.;OPOS=48998688;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:28:28:18:18:0.391304:8:10:14:14:8:10:14:14
chr11	49000423	.	C	G	1157.41	PASS	AF=0.987179;AO=77;DP=78;FAO=77;FDP=78;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0276011;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.519;QD=59.3545;RBI=0.0276024;REFB=0.0902814;REVB=-0.000274981;RO=1;SAF=31;SAR=46;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0101785;STB=0.505375;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=7.11929e-05;OID=.;OPOS=49000423;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:78:78:1:1:77:77:0.987179:46:31:0:1:46:31:0:1
chr11	49000522	.	C	T	785.32	PASS	AF=1;AO=54;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0710493;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.092;QD=57.114;RBI=0.0754821;REFB=0;REVB=-0.0254861;RO=0;SAF=24;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000187077;OID=.;OPOS=49000522;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:54:55:1:30:24:0:0:30:25:0:0
chr11	49055751	.	T	C	82.31	PASS	AF=0.588235;AO=10;DP=17;FAO=10;FDP=17;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.0161702;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.5542;QD=19.3661;RBI=0.0413969;REFB=-0.064655;REVB=0.0381082;RO=7;SAF=5;SAR=5;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.051088;STB=0.529353;STBP=0.765;TYPE=snp;VARB=0.0701517;OID=.;OPOS=49055751;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:17:17:7:7:10:10:0.588235:5:5:3:4:5:5:3:4
chr11	49059362	.	C	A	1572.78	PASS	AF=1;AO=97;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0253551;FXX=0.0101;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.6318;QD=64.195;RBI=0.0269052;REFB=0;REVB=-0.00900048;RO=0;SAF=51;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000384133;OID=.;OPOS=49059362;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:98:0:0:97:98:1:46:51:0:0:47:51:0:0
chr11	49075605	.	G	A	1135.22	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0154623;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.368;QD=60.5451;RBI=0.0301607;REFB=0;REVB=0.0258956;RO=0;SAF=44;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.12075e-05;OID=.;OPOS=49075605;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:31:44:0:0:31:44:0:0
chr11	49076898	.	T	G	246.68	PASS	AF=0.451613;AO=28;DP=62;FAO=28;FDP=62;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=10;FSRR=24;FWDB=0.0100016;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.281;QD=15.9147;RBI=0.0207837;REFB=0.00101731;REVB=-0.0182189;RO=34;SAF=11;SAR=17;SRF=10;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103459;STB=0.558128;STBP=0.425;TYPE=snp;VARB=-0.0015531;OID=.;OPOS=49076898;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:34:34:28:28:0.451613:17:11:10:24:17:11:10:24
chr11	49077889	.	AT	A	421.45	PASS	AF=0.973333;AO=55;DP=75;FAO=73;FDP=75;FR=.;FRO=2;FSAF=34;FSAR=39;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00103966;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=9.30155;QD=22.4775;RBI=0.23344;REFB=0.0606433;REVB=0.233438;RO=15;SAF=31;SAR=24;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118669;STB=0.514282;STBP=0.15;TYPE=del;VARB=0.0173998;OID=.;OPOS=49077890;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:0.973333:55:75:73:75:2:34:39:2:0:3:15:31:24:4:11
chr11	49079350	.	A	G	542.99	PASS	AF=0.509091;AO=56;DP=110;FAO=56;FDP=110;FR=.;FRO=54;FSAF=26;FSAR=30;FSRF=25;FSRR=29;FWDB=0.0107695;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.4341;QD=19.745;RBI=0.0346082;REFB=0.0123205;REVB=-0.0328899;RO=54;SAF=26;SAR=30;SRF=25;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00118271;STB=0.500652;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0077707;OID=.;OPOS=49079350;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:110:54:54:56:56:0.509091:30:26:25:29:30:26:25:29
chr11	49080565	.	A	C	383.74	PASS	AF=0.513158;AO=39;DP=76;FAO=39;FDP=76;FR=.;FRO=37;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=-0.0241436;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=125.843;QD=20.1969;RBI=0.0377699;REFB=-0.0238225;REVB=-0.0290457;RO=34;SAF=18;SAR=21;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00766358;STB=0.501018;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0181133;OID=.;OPOS=49080565;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:34:37:39:39:0.513158:21:18:16:18:21:18:17:20
chr11	49172981	.	GAC	CAG,G	203.05	PASS	AF=0.0285714,0.542857;AO=3,13;DP=35;FAO=1,19;FDP=35;FR=.;FRO=15;FSAF=0,9;FSAR=1,10;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=-0.0752426,-0.0638526;FXX=0.0540395;HRUN=1,1;LEN=3,2;MLLD=76.7648,108.201;QD=23.206;RBI=0.0830972,0.0769925;REFB=-0.0545238,-0.0843756;REVB=-0.0352661,-0.0430197;RO=14;SAF=0,8;SAR=3,5;SRF=4;SRR=10;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.563498,0.290292;STB=0.986556,0.562436;STBP=0.49,0.436;TYPE=mnp,del;VARB=0.0356557,0.0768027;OID=.,.;OPOS=49172981,49172982;OREF=GAC,AC;OALT=CAG,-;OMAPALT=CAG,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:35:35:14:15:3,13:1,19:0.0285714,0.542857:3,5:0,8:4:10:1,10:0,9:5:10
chr11	49196490	.	T	C	169.49	PASS	AF=0.439024;AO=18;DP=41;FAO=18;FDP=41;FR=.;FRO=23;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=0.00563757;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.533;QD=16.5359;RBI=0.00857953;REFB=-0.00876605;REVB=0.00646731;RO=23;SAF=13;SAR=5;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173098;STB=0.599883;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.011874;OID=.;OPOS=49196490;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:23:23:18:18:0.439024:5:13:13:10:5:13:13:10
chr11	49207315	.	A	G	131.7	PASS	AF=0.271429;AO=19;DP=69;FAO=19;FDP=70;FR=.;FRO=51;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=26;FSRR=25;FWDB=-0.00444308;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.999;QD=7.52573;RBI=0.0047961;REFB=-0.00221616;REVB=-0.00180599;RO=50;SAF=7;SAR=12;SRF=25;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160612;STB=0.604469;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.00644478;OID=.;OPOS=49207315;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:70:50:51:19:19:0.271429:12:7:25:25:12:7:26:25
chr11	49221885	.	T	A	329.13	PASS	AF=0.328125;AO=42;DP=128;FAO=42;FDP=128;FR=.;FRO=86;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=50;FSRR=36;FWDB=-0.030639;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.825;QD=10.2854;RBI=0.0313794;REFB=-0.00507181;REVB=-0.00677632;RO=85;SAF=19;SAR=23;SRF=49;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142848;STB=0.586001;STBP=0.19;TYPE=snp;VARB=0.00915204;OID=.;OPOS=49221885;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:128:128:85:86:42:42:0.328125:23:19:49:36:23:19:50:36
chr11	49227620	.	A	G	348.5	PASS	AF=0.4625;AO=37;DP=80;FAO=37;FDP=80;FR=.;FRO=43;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=24;FSRR=19;FWDB=-0.00209419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.0777;QD=17.4251;RBI=0.037501;REFB=-0.0208853;REVB=0.0374425;RO=42;SAF=21;SAR=16;SRF=24;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00373975;STB=0.505152;STBP=0.935;TYPE=snp;VARB=0.0226213;OID=.;OPOS=49227620;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:42:43:37:37:0.4625:16:21:24:18:16:21:24:19
chr11	49598209	.	T	C	506.76	PASS	AF=0.469565;AO=53;DP=117;FAO=54;FDP=115;FR=.;FRO=61;FSAF=34;FSAR=20;FSRF=21;FSRR=40;FWDB=-0.0032767;FXX=0.0170926;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.174;QD=17.6264;RBI=0.00832978;REFB=-0.0209046;REVB=0.00765823;RO=63;SAF=33;SAR=20;SRF=23;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.249088;STB=0.649627;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0154521;OID=.;OPOS=49598209;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:117:115:63:61:53:54:0.469565:20:33:23:40:20:34:21:40
chr11	49830142	.	G	T	1822.52	PASS	AF=1;AO=119;DP=119;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0154097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=296.663;QD=61.2613;RBI=0.0160429;REFB=0;REVB=0.00446267;RO=0;SAF=57;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.9434e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.09143e-05;OID=.;OPOS=49830142;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:119:119:0:0:119:119:1:62:57:0:0:62:57:0:0
chr11	49974371	.	G	A	761.86	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00523976;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.386;QD=56.4339;RBI=0.0103745;REFB=0;REVB=-0.00895404;RO=0;SAF=24;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.32336e-06;OID=.;OPOS=49974371;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:54:0:0:53:54:1:29:24:0:0:30:24:0:0
chr11	49974931	.	G	A	96.63	PASS	AF=0.317073;AO=12;DP=40;FAO=13;FDP=41;FR=.;FRO=28;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=0.0087036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.769;QD=9.4271;RBI=0.00906609;REFB=-0.0212356;REVB=-0.00253798;RO=28;SAF=4;SAR=8;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116751;STB=0.59002;STBP=0.469;TYPE=snp;VARB=0.0398531;OID=.;OPOS=49974931;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:40:41:28:28:12:13:0.317073:8:4:12:16:9:4:12:16
chr11	51411460	.	G	A	477.09	PASS	AF=0.391304;AO=54;DP=136;FAO=54;FDP=138;FR=.;FRO=84;FSAF=22;FSAR=32;FSRF=52;FSRR=32;FWDB=-0.0271274;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.822;QD=13.8287;RBI=0.0304208;REFB=0.000350989;REVB=-0.013767;RO=82;SAF=22;SAR=32;SRF=50;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.214038;STB=0.627072;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=-0.00104995;OID=.;OPOS=51411460;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:136:138:82:84:54:54:0.391304:32:22:50:32:32:22:52:32
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chr11	51412327	.	T	A	232.59	PASS	AF=0.457627;AO=25;DP=54;FAO=27;FDP=59;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=-0.0168797;FXX=0.0327815;HRUN=5;LEN=1;MLLD=201.211;QD=15.7691;RBI=0.0168838;REFB=-0.0133192;REVB=0.0003695;RO=29;SAF=10;SAR=15;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112975;STB=0.58915;STBP=0.216;TYPE=snp;VARB=0.020665;OID=.;OPOS=51412327;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:59:29:32:25:27:0.457627:15:10:15:14:17:10:17:15
chr11	55029787	.	G	A	36.39	PASS	AF=0.285714;AO=6;DP=21;FAO=6;FDP=21;FR=.;FRO=15;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.0360571;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=234.951;QD=6.9305;RBI=0.0379538;REFB=-0.0115723;REVB=-0.011848;RO=15;SAF=2;SAR=4;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154555;STB=0.599657;STBP=0.566;TYPE=snp;VARB=0.0287032;OID=.;OPOS=55029787;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:21:21:15:15:6:6:0.285714:4:2:7:8:4:2:7:8
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chr11	55494281	.	G	A	35.93	PASS	AF=0.0869565;AO=10;DP=115;FAO=10;FDP=115;FR=.;FRO=105;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=47;FSRR=58;FWDB=0.00279162;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.605;QD=1.24985;RBI=0.0228054;REFB=-0.000505217;REVB=0.0226339;RO=105;SAF=6;SAR=4;SRF=47;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172187;STB=0.636719;STBP=0.34;TYPE=snp;VARB=0.0114891;OID=.;OPOS=55494281;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:115:115:105:105:10:10:0.0869565:4:6:47:58:4:6:47:58
chr11	55494285	.	T	C	40.89	PASS	AF=0.0932203;AO=11;DP=118;FAO=11;FDP=118;FR=.;FRO=107;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=47;FSRR=60;FWDB=0.0260116;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=60.2909;QD=1.38602;RBI=0.0311912;REFB=0.000615566;REVB=0.0172131;RO=107;SAF=6;SAR=5;SRF=47;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123067;STB=0.59525;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=-0.00149504;OID=.;OPOS=55494285;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:40:118:118:107:107:11:11:0.0932203:5:6:47:60:5:6:47:60
chr11	55494298	.	A	C	52.7	PASS	AF=0.108333;AO=13;DP=118;FAO=13;FDP=120;FR=.;FRO=107;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=49;FSRR=58;FWDB=-0.00452805;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.8444;QD=1.7566;RBI=0.0397683;REFB=0.00658039;REVB=0.0395097;RO=105;SAF=6;SAR=7;SRF=47;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0169385;STB=0.503221;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0512315;OID=.;OPOS=55494298;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:118:120:105:107:13:13:0.108333:7:6:47:58:7:6:49:58
chr11	55541098	.	G	A	613.34	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0376445;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.148;QD=61.3335;RBI=0.0438271;REFB=0;REVB=-0.0224434;RO=0;SAF=20;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000496335;OID=.;OPOS=55541098;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:20:20:0:0:20:20:0:0
chr11	55541284	.	G	A	177.86	PASS	AF=0.5;AO=18;DP=37;FAO=19;FDP=38;FR=.;FRO=19;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=-0.0028266;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.4135;QD=18.7224;RBI=0.0246079;REFB=-0.0136456;REVB=0.0244451;RO=18;SAF=12;SAR=6;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.248975;STB=0.63144;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.0104974;OID=.;OPOS=55541284;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:38:18:19:18:19:0.5:6:12:7:11:7:12:7:12
chr11	55563602	.	G	A	518.35	PASS	AF=0.4375;AO=56;DP=123;FAO=56;FDP=128;FR=.;FRO=72;FSAF=33;FSAR=23;FSRF=41;FSRR=31;FWDB=-0.0349757;FXX=0.00775134;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.017;QD=16.1985;RBI=0.0369752;REFB=-0.0392134;REVB=0.0119944;RO=67;SAF=33;SAR=23;SRF=36;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0519022;STB=0.511477;STBP=0.834;TYPE=snp;VARB=0.0404026;OID=.;OPOS=55563602;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:123:128:67:72:56:56:0.4375:23:33:36:31:23:33:41:31
chr11	55563738	.	G	A	314.35	PASS	AF=0.465753;AO=34;DP=73;FAO=34;FDP=73;FR=.;FRO=39;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=0.00898538;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.011;QD=17.2245;RBI=0.0222455;REFB=-0.0136625;REVB=0.02035;RO=39;SAF=17;SAR=17;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0366566;STB=0.520536;STBP=0.762;TYPE=snp;VARB=0.0144536;OID=.;OPOS=55563738;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:39:39:34:34:0.465753:17:17:21:18:17:17:21:18
chr11	55563776	.	T	G	1008.49	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0370016;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.537;QD=59.3228;RBI=0.0395397;REFB=0;REVB=0.013938;RO=0;SAF=35;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.86718e-05;OID=.;OPOS=55563776;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:33:35:0:0:33:35:0:0
chr11	55563900	.	T	C	62.99	PASS	AF=0.346154;AO=8;DP=25;FAO=9;FDP=26;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.000980166;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.517;QD=9.69032;RBI=0.00439715;REFB=-0.00866625;REVB=0.00428652;RO=17;SAF=4;SAR=4;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0323108;STB=0.555432;STBP=0.721;TYPE=snp;VARB=0.0335664;OID=.;OPOS=55563900;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:25:26:17:17:8:9:0.346154:4:4:9:8:5:4:9:8
chr11	55578987	.	T	C	233.73	PASS	AF=0.472727;AO=26;DP=56;FAO=26;FDP=55;FR=.;FRO=29;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=20;FWDB=0.0423733;FXX=0.017854;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.713;QD=16.9982;RBI=0.0449486;REFB=-0.00233804;REVB=-0.0149962;RO=29;SAF=14;SAR=12;SRF=9;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.211739;STB=0.618697;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=0.00123933;OID=.;OPOS=55578987;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:55:29:29:26:26:0.472727:12:14:9:20:12:14:9:20
chr11	55578991	.	C	T	244.81	PASS	AF=0.482143;AO=27;DP=57;FAO=27;FDP=56;FR=.;FRO=29;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=20;FWDB=0.0221143;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.5171;QD=17.4866;RBI=0.0500841;REFB=-0.0122592;REVB=-0.0449374;RO=29;SAF=14;SAR=13;SRF=9;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.191382;STB=0.60702;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.0114624;OID=.;OPOS=55578991;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:56:29:29:27:27:0.482143:13:14:9:20:13:14:9:20
chr11	55579102	.	C	T	710.01	PASS	AF=0.471698;AO=75;DP=158;FAO=75;FDP=159;FR=.;FRO=84;FSAF=37;FSAR=38;FSRF=38;FSRR=46;FWDB=-0.0065047;FXX=0.00624961;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.383;QD=17.8619;RBI=0.0148018;REFB=-0.00469764;REVB=-0.0132959;RO=83;SAF=37;SAR=38;SRF=37;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0451951;STB=0.521646;STBP=0.61;TYPE=snp;VARB=0.00495631;OID=.;OPOS=55579102;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:158:159:83:84:75:75:0.471698:38:37:37:46:38:37:38:46
chr11	55579145	.	C	T	39.4	PASS	AF=0.0752688;AO=14;DP=186;FAO=14;FDP=186;FR=.;FRO=172;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=85;FSRR=87;FWDB=-0.0135838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.752;QD=0.847205;RBI=0.0150932;REFB=-0.00223259;REVB=-0.00657923;RO=171;SAF=7;SAR=7;SRF=84;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00977506;STB=0.505369;STBP=0.954;TYPE=snp;VARB=0.030662;OID=.;OPOS=55579145;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:39:186:186:171:172:14:14:0.0752688:7:7:84:87:7:7:85:87
chr11	55579182	.	A	G	49.65	PASS	AF=0.0846561;AO=15;DP=189;FAO=16;FDP=189;FR=.;FRO=173;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=93;FSRR=80;FWDB=-0.0120615;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=280.72;QD=1.05078;RBI=0.0121863;REFB=-0.000533678;REVB=-0.00173943;RO=172;SAF=8;SAR=7;SRF=92;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00176757;STB=0.534349;STBP=0.799;TYPE=snp;VARB=0.006829;OID=.;OPOS=55579182;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:49:189:189:172:173:15:16:0.0846561:7:8:92:80:8:8:93:80
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chr11	55579801	.	T	C	289.46	PASS	AF=0.39759;AO=33;DP=83;FAO=33;FDP=83;FR=.;FRO=50;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=25;FSRR=25;FWDB=0.0108255;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.834;QD=13.95;RBI=0.0116346;REFB=-0.0121387;REVB=-0.00426299;RO=50;SAF=16;SAR=17;SRF=25;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0160349;STB=0.509125;STBP=0.873;TYPE=snp;VARB=0.017845;OID=.;OPOS=55579801;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:50:50:33:33:0.39759:17:16:25:25:17:16:25:25
chr11	55587117	.	T	A	340.73	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0125745;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.973;QD=54.5175;RBI=0.049737;REFB=0;REVB=0.0481212;RO=0;SAF=10;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00065368;OID=.;OPOS=55587117;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:15:10:0:0:15:10:0:0
chr11	55587457	.	G	A	491.68	PASS	AF=0.435484;AO=54;DP=124;FAO=54;FDP=124;FR=.;FRO=70;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=23;FSRR=47;FWDB=0.0127633;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.2959;QD=15.8607;RBI=0.0142283;REFB=-0.0014255;REVB=0.00628827;RO=68;SAF=25;SAR=29;SRF=23;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126788;STB=0.577129;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=0.00275699;OID=.;OPOS=55587457;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:124:124:68:70:54:54:0.435484:29:25:23:45:29:25:23:47
chr11	55587511	.	A	G	1423.2	PASS	AF=1;AO=88;DP=90;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00658106;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.112;QD=62.5583;RBI=0.00960378;REFB=0;REVB=-0.00699445;RO=0;SAF=36;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.57365e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000779178;OID=.;OPOS=55587511;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:90:91:0:0:88:91:1:52:36:0:0:52:39:0:0
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chr11	55595012	.	A	T	87.71	PASS	AF=0.192308;AO=15;DP=77;FAO=15;FDP=78;FR=.;FRO=63;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=27;FSRR=36;FWDB=-0.0196624;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.173;QD=4.49786;RBI=0.0219701;REFB=-0.006568;REVB=-0.00980185;RO=62;SAF=6;SAR=9;SRF=26;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.025031;STB=0.523778;STBP=0.844;TYPE=snp;VARB=0.0178274;OID=.;OPOS=55595012;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:77:78:62:63:15:15:0.192308:9:6:26:36:9:6:27:36
chr11	55595017	.	GA	TG	88.71	PASS	AF=0.197368;AO=15;DP=76;FAO=15;FDP=76;FR=.;FRO=61;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=26;FSRR=35;FWDB=-0.0143653;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=213.532;QD=4.66892;RBI=0.0213453;REFB=-0.00178607;REVB=-0.0157879;RO=60;SAF=6;SAR=9;SRF=26;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0428144;STB=0.52171;STBP=0.877;TYPE=mnp;VARB=0.00594922;OID=.;OPOS=55595017;OREF=GA;OALT=TG;OMAPALT=TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:76:76:60:61:15:15:0.197368:9:6:26:34:9:6:26:35
chr11	55595114	.	GCG	TTC	173.69	PASS	AF=0.360656;AO=22;DP=62;FAO=22;FDP=61;FR=.;FRO=39;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=26;FWDB=0.00476157;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=3;MLLD=238.438;QD=11.3896;RBI=0.0208784;REFB=-0.00805515;REVB=-0.0203282;RO=38;SAF=7;SAR=15;SRF=13;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0296684;STB=0.511063;STBP=0.882;TYPE=mnp;VARB=0.0159518;OID=.;OPOS=55595114;OREF=GCG;OALT=TTC;OMAPALT=TTC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:61:38:39:22:22:0.360656:15:7:13:25:15:7:13:26
chr11	55606302	.	G	T	551.43	PASS	AF=0.554348;AO=51;DP=93;FAO=51;FDP=92;FR=.;FRO=41;FSAF=30;FSAR=21;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=0.00499288;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.725;QD=23.9751;RBI=0.0104511;REFB=-0.0250882;REVB=-0.00918131;RO=42;SAF=30;SAR=21;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0540544;STB=0.534537;STBP=0.461;TYPE=snp;VARB=0.0168456;OID=.;OPOS=55606302;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:92:42:41:51:51:0.554348:21:30:22:20:21:30:21:20
chr11	55652963	.	A	G	102.5	PASS	AF=0.521739;AO=12;DP=23;FAO=12;FDP=23;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.0254666;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.369;QD=17.8261;RBI=0.0680384;REFB=-0.0275834;REVB=0.0630926;RO=11;SAF=6;SAR=6;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0377853;STB=0.521703;STBP=0.851;TYPE=snp;VARB=0.0199969;OID=.;OPOS=55652963;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:23:23:11:11:12:12:0.521739:6:6:5:6:6:6:5:6
chr11	55652971	.	C	A	293.41	PASS	AF=1;AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00181231;FXX=0.0434594;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.342;QD=53.3478;RBI=0.0254155;REFB=0;REVB=0.0253508;RO=0;SAF=10;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000196044;OID=.;OPOS=55652971;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:22:0:0:22:22:1:12:10:0:0:12:10:0:0
chr11	55656483	.	T	A	149.1	PASS	AF=0.5;AO=16;DP=32;FAO=16;FDP=32;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.0616465;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.951;QD=18.6371;RBI=0.0624534;REFB=-0.0171004;REVB=0.0100067;RO=16;SAF=7;SAR=9;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0562335;STB=0.53196;STBP=0.755;TYPE=snp;VARB=0.0177414;OID=.;OPOS=55656483;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:16:16:16:16:0.5:9:7:6:10:9:7:6:10
chr11	55681494	.	G	A	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00508873;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.374;QD=55.0985;RBI=0.0102651;REFB=0;REVB=0.00891498;RO=0;SAF=11;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000106317;OID=.;OPOS=55681494;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:15:11:0:0:15:11:0:0
chr11	55681566	.	G	A	72.93	PASS	AF=0.642857;AO=9;DP=14;FAO=9;FDP=14;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.0333804;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.015;QD=20.8379;RBI=0.0496246;REFB=0.00826838;REVB=0.0367198;RO=5;SAF=1;SAR=8;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.441617;STB=0.76119;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=-0.00574315;OID=.;OPOS=55681566;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:14:14:5:5:9:9:0.642857:8:1:3:2:8:1:3:2
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chr11	55703247	.	G	A	257.96	PASS	AF=0.5;AO=27;DP=55;FAO=28;FDP=56;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.0059435;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.249;QD=18.4256;RBI=0.0224468;REFB=0.00233989;REVB=-0.0216457;RO=28;SAF=10;SAR=17;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153374;STB=0.572486;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=-0.00322783;OID=.;OPOS=55703247;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:56:28:28:27:28:0.5:17:10:15:13:17:11:15:13
chr11	55703728	.	A	G	267.89	PASS	AF=0.454545;AO=30;DP=66;FAO=30;FDP=66;FR=.;FRO=36;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=0.00700511;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.217;QD=16.2357;RBI=0.011652;REFB=-0.0159807;REVB=-0.00931111;RO=36;SAF=17;SAR=13;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0917739;STB=0.55169;STBP=0.462;TYPE=snp;VARB=0.0161442;OID=.;OPOS=55703728;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:36:36:30:30:0.454545:13:17:17:19:13:17:17:19
chr11	55746891	.	G	A	3100.75	PASS	AF=0.994898;AO=195;DP=197;FAO=195;FDP=196;FR=.;FRO=1;FSAF=86;FSAR=109;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0100949;FXX=0.00507588;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.2191;QD=63.2806;RBI=0.0122644;REFB=-0.0557913;REVB=0.00696492;RO=1;SAF=86;SAR=109;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00550554;STB=0.50289;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.000153364;OID=.;OPOS=55746891;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:197:196:1:1:195:195:0.994898:109:86:1:0:109:86:1:0
chr11	55761221	.	C	T	1135.21	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00730237;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.5494;QD=60.5447;RBI=0.00962457;REFB=0;REVB=-0.00626958;RO=0;SAF=45;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.32981e-05;OID=.;OPOS=55761221;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:30:45:0:0:30:45:0:0
chr11	55761528	.	T	C	191.91	PASS	AF=0.369231;AO=24;DP=65;FAO=24;FDP=65;FR=.;FRO=41;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=19;FWDB=-0.0253896;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.7861;QD=11.8097;RBI=0.0295693;REFB=-0.0194524;REVB=-0.0151563;RO=41;SAF=14;SAR=10;SRF=22;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0518757;STB=0.530001;STBP=0.771;TYPE=snp;VARB=0.027868;OID=.;OPOS=55761528;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:41:41:24:24:0.369231:10:14:22:19:10:14:22:19
chr11	55761738	.	T	G	725.84	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00498958;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.228;QD=56.9286;RBI=0.00599487;REFB=0;REVB=0.00332304;RO=0;SAF=26;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.10374e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.86391e-05;OID=.;OPOS=55761738;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:51:0:0:50:51:1:24:26:0:0:24:27:0:0
chr11	55798152	.	G	A	566.73	PASS	AF=0.974359;AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0239242;FXX=0.0249938;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.035;QD=58.1266;RBI=0.0248672;REFB=-0.0437624;REVB=-0.00678316;RO=0;SAF=21;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.53998e-08;STB=0.514278;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=0.000447004;OID=.;OPOS=55798152;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:39:39:0:1:38:38:0.974359:17:21:0:0:17:21:0:1
chr11	55798259	.	G	T	93.32	PASS	AF=0.578947;AO=11;DP=19;FAO=11;FDP=19;FR=.;FRO=8;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.0346895;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.164;QD=19.646;RBI=0.0348758;REFB=-0.0146125;REVB=-0.00359912;RO=8;SAF=7;SAR=4;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104359;STB=0.559889;STBP=0.597;TYPE=snp;VARB=0.00916481;OID=.;OPOS=55798259;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:19:19:8:8:11:11:0.578947:4:7:4:4:4:7:4:4
chr11	55872657	.	A	C	669.85	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0285063;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.292;QD=62.3113;RBI=0.0293408;REFB=0;REVB=0.00694776;RO=0;SAF=24;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000149905;OID=.;OPOS=55872657;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:19:24:0:0:19:24:0:0
chr11	55872876	.	C	T	2476.12	PASS	AF=0.993865;AO=162;DP=163;FAO=162;FDP=163;FR=.;FRO=1;FSAF=76;FSAR=86;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0449872;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=243.321;QD=60.7636;RBI=0.045767;REFB=0.0127704;REVB=0.00841278;RO=0;SAF=76;SAR=86;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.22958e-08;STB=0.503268;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=1.78444e-05;OID=.;OPOS=55872876;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:163:163:0:1:162:162:0.993865:86:76:0:0:86:76:1:0
chr11	55873024	.	A	G	1848.1	PASS	AF=1;AO=120;DP=122;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.018706;FXX=0.0163921;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.917;QD=61.6034;RBI=0.0192207;REFB=0;REVB=-0.00441815;RO=0;SAF=62;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.84183e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.86057e-05;OID=.;OPOS=55873024;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:122:120:0:0:120:120:1:58:62:0:0:58:62:0:0
chr11	55873334	.	A	G	273.79	PASS	AF=0.483871;AO=30;DP=62;FAO=30;FDP=62;FR=.;FRO=32;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=23;FSRR=9;FWDB=-0.0222009;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.1411;QD=17.664;RBI=0.0222165;REFB=0.00653483;REVB=-0.000831605;RO=32;SAF=16;SAR=14;SRF=23;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174719;STB=0.597313;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=-0.00499634;OID=.;OPOS=55873334;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:32:32:30:30:0.483871:14:16:23:9:14:16:23:9
chr11	55873368	.	G	A	698.98	PASS	AF=0.980392;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0333427;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.0773;QD=54.8216;RBI=0.052212;REFB=-0.0154128;REVB=-0.0401791;RO=1;SAF=33;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0140538;STB=0.50746;STBP=0.623;TYPE=snp;VARB=-0.000288613;OID=.;OPOS=55873368;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:51:51:1:1:50:50:0.980392:17:33:1:0:17:33:1:0
chr11	55889895	.	C	T	531.81	PASS	AF=0.53;AO=53;DP=99;FAO=53;FDP=100;FR=.;FRO=47;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=22;FSRR=25;FWDB=-0.0135542;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.145;QD=21.2723;RBI=0.0454253;REFB=-0.000971099;REVB=-0.043356;RO=42;SAF=26;SAR=27;SRF=19;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0308199;STB=0.51057;STBP=0.834;TYPE=snp;VARB=0.000574802;OID=.;OPOS=55889895;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:100:42:47:53:53:0.53:27:26:19:23:27:26:22:25
chr11	55890256	.	G	GT	1430.2	PASS	AF=0.990826;AO=14;DP=112;FAO=108;FDP=109;FR=.;FRO=1;FSAF=60;FSAR=48;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0480041;FXX=0.00909008;HRUN=0;LEN=1;MLLD=52.012;QD=52.4844;RBI=0.0487938;REFB=-0.0547701;REVB=-0.00874296;RO=97;SAF=9;SAR=5;SRF=53;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122237;STB=0.504131;STBP=0.515;TYPE=ins;VARB=0.00615797;OID=.;OPOS=55890257;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:0.990826:14:112:108:109:1:60:48:1:0:5:97:9:5:53:44
chr11	55890257	.	C	T	1235.44	PASS	AF=0.854545;AO=94;DP=110;FAO=94;FDP=110;FR=.;FRO=16;FSAF=50;FSAR=44;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=0.0178166;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=81.3842;QD=44.9252;RBI=0.0223391;REFB=-0.00112165;REVB=-0.013476;RO=16;SAF=50;SAR=44;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0429365;STB=0.522784;STBP=0.262;TYPE=snp;VARB=0.000193784;OID=.;OPOS=55890257;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:79:110:110:16:16:94:94:0.854545:44:50:11:5:44:50:11:5
chr11	55890259	.	C	A	34.86	PASS	AF=0.1;AO=13;DP=110;FAO=11;FDP=110;FR=.;FRO=99;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=56;FSRR=43;FWDB=-0.0480744;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=38.2941;QD=1.26754;RBI=0.0531638;REFB=-0.035156;REVB=-0.0226988;RO=96;SAF=8;SAR=5;SRF=53;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0790906;STB=0.518361;STBP=0.915;TYPE=snp;VARB=0.2445;OID=.;OPOS=55890259;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:110:110:96:99:13:11:0.1:5:8:53:43:5:6:56:43
chr11	55890668	.	G	A	155.69	PASS	AF=0.350877;AO=19;DP=57;FAO=20;FDP=57;FR=.;FRO=37;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=0.00677632;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.354;QD=10.9258;RBI=0.0546345;REFB=-0.00179654;REVB=-0.0542127;RO=37;SAF=8;SAR=11;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0438589;STB=0.539528;STBP=0.679;TYPE=snp;VARB=0.00221867;OID=.;OPOS=55890668;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:37:37:19:20:0.350877:11:8:17:20:12:8:17:20
chr11	55904382	.	A	C	496.23	PASS	AF=0.566265;AO=47;DP=83;FAO=47;FDP=83;FR=.;FRO=36;FSAF=23;FSAR=24;FSRF=14;FSRR=22;FWDB=0.0662412;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.7342;QD=23.9148;RBI=0.0662838;REFB=-0.0207852;REVB=0.0023753;RO=36;SAF=23;SAR=24;SRF=14;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0796665;STB=0.543661;STBP=0.386;TYPE=snp;VARB=0.0214744;OID=.;OPOS=55904382;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:36:36:47:47:0.566265:24:23:14:22:24:23:14:22
chr11	55904828	.	A	G	292.79	PASS	AF=0.470588;AO=32;DP=68;FAO=32;FDP=68;FR=.;FRO=36;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=0.00364408;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.427;QD=17.2231;RBI=0.00413187;REFB=-0.0120479;REVB=0.00194759;RO=36;SAF=15;SAR=17;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0230751;STB=0.512931;STBP=0.836;TYPE=snp;VARB=0.0156876;OID=.;OPOS=55904828;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:36:36:32:32:0.470588:17:15:16:20:17:15:16:20
chr11	55905078	.	C	T	382.11	PASS	AF=0.493671;AO=39;DP=81;FAO=39;FDP=79;FR=.;FRO=40;FSAF=10;FSAR=29;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=-0.0444171;FXX=0.0246883;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.454;QD=19.3474;RBI=0.0444171;REFB=-0.0168147;REVB=8.02022e-05;RO=38;SAF=10;SAR=29;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.267067;STB=0.651839;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.00992028;OID=.;OPOS=55905078;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:79:38:40:39:39:0.493671:29:10:20:18:29:10:21:19
chr11	55944474	.	G	A	96.7	PASS	AF=0.387097;AO=13;DP=31;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.0153741;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.092;QD=12.4768;RBI=0.0533971;REFB=0.0264999;REVB=-0.051136;RO=18;SAF=9;SAR=4;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.254806;STB=0.711497;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=-0.0308869;OID=.;OPOS=55944474;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:31:31:18:19:13:12:0.387097:4:9:8:10:3:9:8:11
chr11	55999678	.	G	T	521.32	PASS	AF=0.5;AO=50;DP=100;FAO=50;FDP=100;FR=.;FRO=50;FSAF=29;FSAR=21;FSRF=28;FSRR=22;FWDB=-0.0328351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.5072;QD=20.8526;RBI=0.0357305;REFB=-0.016121;REVB=-0.0140898;RO=50;SAF=29;SAR=21;SRF=28;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0184733;STB=0.510225;STBP=0.833;TYPE=snp;VARB=0.0149661;OID=.;OPOS=55999678;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:50:50:50:50:0.5:21:29:28:22:21:29:28:22
chr11	55999950	.	G	C	223.94	PASS	AF=0.478261;AO=22;DP=46;FAO=22;FDP=46;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=0.053938;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.4708;QD=19.4726;RBI=0.0539403;REFB=-0.00632195;REVB=0.000499654;RO=24;SAF=9;SAR=13;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.046491;STB=0.526292;STBP=0.743;TYPE=snp;VARB=0.00716618;OID=.;OPOS=55999950;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:24:24:22:22:0.478261:13:9:11:13:13:9:11:13
chr11	56000403	.	C	G	1540.55	PASS	AF=1;AO=103;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0164826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.602;QD=59.8273;RBI=0.0181798;REFB=0;REVB=-0.00766997;RO=0;SAF=52;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.06134e-05;OID=.;OPOS=56000403;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:103:103:0:0:103:103:1:51:52:0:0:51:52:0:0
chr11	56000451	.	G	A	237.86	PASS	AF=0.376623;AO=29;DP=77;FAO=29;FDP=77;FR=.;FRO=48;FSAF=6;FSAR=23;FSRF=26;FSRR=22;FWDB=-0.0192792;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.788;QD=12.3564;RBI=0.0357876;REFB=-0.00911628;REVB=0.0301506;RO=48;SAF=6;SAR=23;SRF=26;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.399277;STB=0.731438;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.0184127;OID=.;OPOS=56000451;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:48:48:29:29:0.376623:23:6:26:22:23:6:26:22
chr11	56000471	.	G	A	206.66	PASS	AF=0.396825;AO=25;DP=63;FAO=25;FDP=63;FR=.;FRO=38;FSAF=7;FSAR=18;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=-0.014535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.132;QD=13.1211;RBI=0.0145393;REFB=-0.00848545;REVB=-0.000350981;RO=38;SAF=7;SAR=18;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.24911;STB=0.643621;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=0.0090914;OID=.;OPOS=56000471;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:38:38:25:25:0.396825:18:7:19:19:18:7:19:19
chr11	56043702	.	G	C	651.23	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000407874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.117;QD=62.0219;RBI=0.00364055;REFB=0;REVB=-0.00361763;RO=0;SAF=22;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.62387e-06;OID=.;OPOS=56043702;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:20:22:0:0:20:22:0:0
chr11	56086147	.	T	G	427.01	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.107587;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.9898;QD=56.9345;RBI=0.110186;REFB=0;REVB=0.0237891;RO=0;SAF=18;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00181025;OID=.;OPOS=56086147;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:12:18:0:0:12:18:0:0
chr11	56113516	.	T	C	937.59	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0161936;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.256;QD=58.5996;RBI=0.0884626;REFB=0;REVB=0.0869678;RO=0;SAF=30;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000220695;OID=.;OPOS=56113516;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:34:30:0:0:34:30:0:0
chr11	56127746	.	A	G	243.22	PASS	AF=0.522727;AO=22;DP=44;FAO=23;FDP=44;FR=.;FRO=21;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.0117003;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.612;QD=22.1108;RBI=0.0133831;REFB=-0.00816236;REVB=0.00649693;RO=22;SAF=16;SAR=6;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.223447;STB=0.58994;STBP=0.26;TYPE=snp;VARB=0.00817643;OID=.;OPOS=56127746;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:22:21:22:23:0.522727:6:16:11:11:7:16:11:10
chr11	56128524	.	C	T	241.69	PASS	AF=0.522727;AO=23;DP=44;FAO=23;FDP=44;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.0176399;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.988;QD=21.9722;RBI=0.021172;REFB=-0.0041348;REVB=0.0117084;RO=21;SAF=7;SAR=16;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159835;STB=0.58994;STBP=0.25;TYPE=snp;VARB=0.00394318;OID=.;OPOS=56128524;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:21:21:23:23:0.522727:16:7:10:11:16:7:10:11
chr11	56128673	.	A	AT	191.54	PASS	AF=0.550725;AO=34;DP=76;FAO=38;FDP=69;FR=.;FRO=31;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=-0.202692;FXX=0.0142837;HRUN=4;LEN=1;MLLD=12.793;QD=11.104;RBI=0.231982;REFB=-0.0307707;REVB=-0.112834;RO=37;SAF=15;SAR=19;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0677124;STB=0.536213;STBP=0.542;TYPE=ins;VARB=-0.000948645;OID=.;OPOS=56128674;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.550725:34:76:38:69:31:19:19:13:18:99:37:15:19:19:18
chr11	56143424	.	A	G	246.31	PASS	AF=0.39726;AO=29;DP=73;FAO=29;FDP=73;FR=.;FRO=44;FSAF=25;FSAR=4;FSRF=18;FSRR=26;FWDB=0.0216014;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.042;QD=13.4963;RBI=0.0247906;REFB=-0.00609679;REVB=-0.0121637;RO=44;SAF=25;SAR=4;SRF=18;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.541314;STB=0.813209;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0136416;OID=.;OPOS=56143424;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:44:44:29:29:0.39726:4:25:18:26:4:25:18:26
chr11	56143690	.	C	A	57.98	PASS	AF=0.18;AO=9;DP=50;FAO=9;FDP=50;FR=.;FRO=41;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=0.0664162;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.354;QD=4.63838;RBI=0.0677366;REFB=0.000659847;REVB=0.0133093;RO=40;SAF=7;SAR=2;SRF=20;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.355466;STB=0.732786;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=-0.00400198;OID=.;OPOS=56143690;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:50:50:40:41:9:9:0.18:2:7:20:20:2:7:21:20
chr11	56185224	.	A	G	99.96	PASS	AF=0.461538;AO=12;DP=26;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.013046;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.825;QD=15.3789;RBI=0.0133055;REFB=0.00988156;REVB=0.00261466;RO=14;SAF=6;SAR=6;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0172752;OID=.;OPOS=56185224;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:26:14:14:12:12:0.461538:6:6:7:7:6:6:7:7
chr11	56294275	.	T	C	766.41	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.4788;QD=63.8673;RBI=0.0601744;REFB=0;REVB=-0.0584482;RO=0;SAF=26;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000483682;OID=.;OPOS=56294275;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:22:26:0:0:22:26:0:0
chr11	56294338	.	G	A	876.95	PASS	AF=0.96875;AO=62;DP=64;FAO=62;FDP=64;FR=.;FRO=2;FSAF=38;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00285451;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=175.89;QD=54.8094;RBI=0.00731602;REFB=-0.0135916;REVB=0.00673616;RO=2;SAF=38;SAR=24;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.037724;STB=0.519993;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=2.55025e-05;OID=.;OPOS=56294338;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:64:64:2:2:62:62:0.96875:24:38:0:2:24:38:0:2
chr11	56294431	.	G	T	354.55	PASS	AF=0.537313;AO=36;DP=67;FAO=36;FDP=67;FR=.;FRO=31;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=25;FSRR=6;FWDB=0.000102883;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=252.054;QD=21.1669;RBI=0.00708033;REFB=-0.00375354;REVB=0.00707958;RO=29;SAF=13;SAR=23;SRF=25;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.389237;STB=0.698537;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.00343254;OID=.;OPOS=56294431;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:29:31:36:36:0.537313:23:13:25:4:23:13:25:6
chr11	56310222	.	C	T	76.67	PASS	AF=0.416667;AO=10;DP=24;FAO=10;FDP=24;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.00489472;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.9148;QD=12.7792;RBI=0.0339338;REFB=-0.00965584;REVB=-0.033579;RO=14;SAF=8;SAR=2;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.400953;STB=0.74022;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=0.0085913;OID=.;OPOS=56310222;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:24:24:14:14:10:10:0.416667:2:8:6:8:2:8:6:8
chr11	56310497	.	C	T	95.49	PASS	AF=0.333333;AO=12;DP=37;FAO=12;FDP=36;FR=.;FRO=24;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=-0.0119885;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.233;QD=10.6103;RBI=0.0236232;REFB=-0.00609037;REVB=-0.0203551;RO=23;SAF=4;SAR=8;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.211998;STB=0.64127;STBP=0.225;TYPE=snp;VARB=0.0216753;OID=.;OPOS=56310497;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:37:36:23:24:12:12:0.333333:8:4:12:11:8:4:13:11
chr11	56344993	.	C	A	388.78	PASS	AF=0.534247;AO=36;DP=70;FAO=39;FDP=73;FR=.;FRO=34;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=0.00697621;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.636;QD=21.3031;RBI=0.0113246;REFB=-0.00549847;REVB=0.00892068;RO=34;SAF=14;SAR=22;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0474969;STB=0.527458;STBP=0.634;TYPE=snp;VARB=0.00479455;OID=.;OPOS=56344993;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:73:34:34:36:39:0.534247:22:14:15:19:24:15:15:19
chr11	56431834	.	A	G	163.61	PASS	AF=0.53125;AO=17;DP=32;FAO=17;FDP=32;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.0244167;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.7864;QD=20.4515;RBI=0.0309476;REFB=-0.0234396;REVB=-0.0190153;RO=15;SAF=5;SAR=12;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15853;STB=0.590053;STBP=0.34;TYPE=snp;VARB=0.018923;OID=.;OPOS=56431834;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:15:15:17:17:0.53125:12:5:7:8:12:5:7:8
chr11	56467881	.	T	C	388.45	PASS	AF=0.386555;AO=46;DP=119;FAO=46;FDP=119;FR=.;FRO=73;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=35;FSRR=38;FWDB=0.00263741;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.9722;QD=13.057;RBI=0.0290995;REFB=0.00659985;REVB=0.0289797;RO=73;SAF=24;SAR=22;SRF=35;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0456849;STB=0.52592;STBP=0.668;TYPE=snp;VARB=-0.0105731;OID=.;OPOS=56467881;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:119:73:73:46:46:0.386555:22:24:35:38:22:24:35:38
chr11	56467926	.	A	G	593.77	PASS	AF=0.404762;AO=68;DP=166;FAO=68;FDP=168;FR=.;FRO=100;FSAF=37;FSAR=31;FSRF=54;FSRR=46;FWDB=-0.018076;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.0482;QD=14.1374;RBI=0.0351668;REFB=0.0127456;REVB=-0.0301656;RO=98;SAF=37;SAR=31;SRF=54;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00732057;STB=0.502468;STBP=0.954;TYPE=snp;VARB=-0.0212468;OID=.;OPOS=56467926;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:166:168:98:100:68:68:0.404762:31:37:54:44:31:37:54:46
chr11	56468020	.	TG	CA,CG	2269.5	PASS	AF=0.348993,0.651007;AO=51,95;DP=150;FAO=52,97;FDP=149;FR=.;FRO=0;FSAF=24,52;FSAR=28,45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00111145,0.019523;FXX=0.00666622;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=136.828,116.456;QD=60.9263;RBI=0.00390439,0.0442897;REFB=0,0;REVB=0.00374285,0.0397546;RO=0;SAF=23,52;SAR=28,43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.97956e-08,4.67486e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0217845,-0.000726911;OID=.,.;OPOS=56468020,56468020;OREF=TG,T;OALT=CA,C;OMAPALT=CA,CG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:150:149:0:0:51,95:52,97:0.348993,0.651007:28,43:23,52:0:0:28,45:24,52:0:0
chr11	56468044	.	T	G	400.44	PASS	AF=0.355556;AO=48;DP=136;FAO=48;FDP=135;FR=.;FRO=87;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=45;FSRR=42;FWDB=-0.0137856;FXX=0.0073524;HRUN=6;LEN=1;MLLD=255.271;QD=11.865;RBI=0.0166176;REFB=0.00133389;REVB=-0.00927911;RO=86;SAF=23;SAR=25;SRF=46;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0624608;STB=0.524519;STBP=0.707;TYPE=snp;VARB=-0.00236084;OID=.;OPOS=56468044;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:136:135:86:87:48:48:0.355556:25:23:46:40:25:23:45:42
chr11	56468047	.	AC	AT,GT	1924.27	PASS	AF=0.607692,0.392308;AO=79,50;DP=131;FAO=79,51;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=41,25;FSAR=38,26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00823977,-0.00659655;FXX=0.0151504;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=118.894,178.516;QD=59.2082;RBI=0.00829368,0.00665813;REFB=0,0;REVB=-0.000944159,-0.00090349;RO=0;SAF=41,24;SAR=38,26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-4.10374e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.00162106,0.000632831;OID=.,.;OPOS=56468048,56468047;OREF=C,AC;OALT=T,GT;OMAPALT=AT,GT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:131:130:0:0:79,50:79,51:0.607692,0.392308:38,26:41,24:0:0:38,26:41,25:0:0
chr11	56468111	.	C	T	541.78	PASS	AF=0.439024;AO=54;DP=121;FAO=54;FDP=123;FR=.,HEALED;FRO=64;FSAF=21;FSAR=33;FSRF=30;FSRR=34;FWDB=-0.00353045;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.522;QD=17.619;RBI=0.0238605;REFB=-0.0199865;REVB=-0.0235979;RO=62;SAF=21;SAR=33;SRF=30;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0936431;STB=0.544643;STBP=0.394;TYPE=snp;VARB=0.0178973;OID=.;OPOS=56468111;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:121:123:62:64:54:54:0.439024:33:21:30:32:33:21:30:34
chr11	56468155	.	T	G	427.57	PASS	AF=0.455446;AO=45;DP=100;FAO=46;FDP=101;FR=.;FRO=55;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=25;FSRR=30;FWDB=0.024957;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.866;QD=16.9334;RBI=0.0249579;REFB=-0.0109096;REVB=-0.00021412;RO=54;SAF=19;SAR=26;SRF=24;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0221276;STB=0.510912;STBP=0.843;TYPE=snp;VARB=0.0125527;OID=.;OPOS=56468155;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:101:54:55:45:46:0.455446:26:19:24:30:26:20:25:30
chr11	56468198	.	A	G	313.41	PASS	AF=0.472222;AO=33;DP=71;FAO=34;FDP=72;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=22;FSRR=16;FWDB=-0.0294262;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.819;QD=17.4116;RBI=0.0484509;REFB=-0.0233206;REVB=-0.0384913;RO=38;SAF=14;SAR=19;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147288;STB=0.572433;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=0.0234057;OID=.;OPOS=56468198;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:72:38:38:33:34:0.472222:19:14:22:16:19:15:22:16
chr11	56468200	.	C	T	300.17	PASS	AF=0.452055;AO=33;DP=73;FAO=33;FDP=73;FR=.;FRO=40;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=24;FSRR=16;FWDB=0.0131607;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.5962;QD=16.4477;RBI=0.0157489;REFB=-6.1554e-05;REVB=0.00865007;RO=40;SAF=14;SAR=19;SRF=24;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170301;STB=0.595652;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=0.000520015;OID=.;OPOS=56468200;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:40:40:33:33:0.452055:19:14:24:16:19:14:24:16
chr11	56468202	.	G	A	305.49	PASS	AF=0.465753;AO=33;DP=73;FAO=34;FDP=73;FR=.;FRO=39;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=-0.00882718;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.917;QD=16.7393;RBI=0.0448246;REFB=-0.0165889;REVB=0.0439468;RO=39;SAF=14;SAR=19;SRF=23;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158988;STB=0.578943;STBP=0.239;TYPE=snp;VARB=0.0258527;OID=.;OPOS=56468202;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:39:39:33:34:0.465753:19:14:23:16:19:15:23:16
chr11	56468212	.	G	A	332.84	PASS	AF=0.492958;AO=35;DP=72;FAO=35;FDP=71;FR=.;FRO=36;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=15;FWDB=0.00558152;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.906;QD=18.7515;RBI=0.0323739;REFB=-0.0188501;REVB=0.0318891;RO=36;SAF=16;SAR=19;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114395;STB=0.563717;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.00939823;OID=.;OPOS=56468212;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:71:36:36:35:35:0.492958:19:16:21:15:19:16:21:15
chr11	56468259	.	C	T	342.91	PASS	AF=0.546875;AO=35;DP=64;FAO=35;FDP=64;FR=.;FRO=29;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=0.0128023;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=184.962;QD=21.4321;RBI=0.0152767;REFB=-0.0499571;REVB=-0.0083354;RO=27;SAF=21;SAR=14;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152923;STB=0.56958;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=0.0246803;OID=.;OPOS=56468259;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:27:29:35:35:0.546875:14:21:11:16:14:21:13:16
chr11	56468368	.	C	T	289.5	PASS	AF=0.293233;AO=39;DP=133;FAO=39;FDP=133;FR=.;FRO=94;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=49;FSRR=45;FWDB=0.000509804;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.057;QD=8.70678;RBI=0.0662597;REFB=-0.010591;REVB=-0.0662577;RO=92;SAF=24;SAR=15;SRF=47;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127322;STB=0.568012;STBP=0.329;TYPE=snp;VARB=0.0220865;OID=.;OPOS=56468368;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:133:133:92:94:39:39:0.293233:15:24:47:45:15:24:49:45
chr11	56468403	.	G	A	263.95	PASS	AF=0.295082;AO=36;DP=123;FAO=36;FDP=122;FR=.;FRO=86;FSAF=23;FSAR=13;FSRF=44;FSRR=42;FWDB=-0.0214717;FXX=0.00812942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.149;QD=8.65398;RBI=0.0262627;REFB=-0.00560703;REVB=-0.0151228;RO=85;SAF=23;SAR=13;SRF=44;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14896;STB=0.592176;STBP=0.22;TYPE=snp;VARB=0.019718;OID=.;OPOS=56468403;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:123:122:85:86:36:36:0.295082:13:23:44:41:13:23:44:42
chr11	56468416	.	G	A	258.56	PASS	AF=0.283465;AO=36;DP=127;FAO=36;FDP=127;FR=.;FRO=91;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=46;FSRR=45;FWDB=0.073002;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.092;QD=8.14345;RBI=0.0844799;REFB=-0.0172014;REVB=0.0425155;RO=91;SAF=21;SAR=15;SRF=46;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.095077;STB=0.55626;STBP=0.457;TYPE=snp;VARB=0.0481276;OID=.;OPOS=56468416;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:127:127:91:91:36:36:0.283465:15:21:46:45:15:21:46:45
chr11	56468448	.	AA	GT	191.29	PASS	AF=0.269231;AO=27;DP=104;FAO=28;FDP=104;FR=.;FRO=76;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=38;FSRR=38;FWDB=-0.00934672;FXX=0;HRUN=4;LEN=2;MLLD=156.944;QD=7.35735;RBI=0.0131505;REFB=-0.00444506;REVB=0.00925072;RO=75;SAF=18;SAR=9;SRF=38;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.201593;STB=0.606664;STBP=0.183;TYPE=mnp;VARB=0.015668;OID=.;OPOS=56468448;OREF=AA;OALT=GT;OMAPALT=GT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:104:75:76:27:28:0.269231:9:18:38:37:10:18:38:38
chr11	56468452	.	A	C	222.45	PASS	AF=0.28972;AO=31;DP=107;FAO=31;FDP=107;FR=.;FRO=76;FSAF=22;FSAR=9;FSRF=38;FSRR=38;FWDB=-0.036129;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.8293;QD=8.31571;RBI=0.036645;REFB=-0.0153899;REVB=-0.00612821;RO=75;SAF=22;SAR=9;SRF=37;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.270488;STB=0.65682;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.0454046;OID=.;OPOS=56468452;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:107:75:76:31:31:0.28972:9:22:37:38:9:22:38:38
chr11	56468493	.	A	G	661.24	PASS	AF=0.617021;AO=56;DP=92;FAO=58;FDP=94;FR=.;FRO=36;FSAF=39;FSAR=19;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=0.0431963;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.6749;QD=28.1377;RBI=0.0438907;REFB=-0.0149964;REVB=0.0077764;RO=36;SAF=37;SAR=19;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122967;STB=0.571234;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.00964505;OID=.;OPOS=56468493;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:94:36:36:56:58:0.617021:19:37:18:18:19:39:18:18
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chr11	56468560	.	TA	CG	694.27	PASS	AF=0.607477;AO=65;DP=109;FAO=65;FDP=107;FR=.;FRO=42;FSAF=47;FSAR=18;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=0.0409655;FXX=0.0183469;HRUN=1;LEN=2;MLLD=156.501;QD=25.9539;RBI=0.0409745;REFB=-0.00435993;REVB=-0.00085558;RO=42;SAF=47;SAR=18;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.16454;STB=0.589799;STBP=0.031;TYPE=mnp;VARB=0.00314545;OID=.;OPOS=56468560;OREF=TA;OALT=CG;OMAPALT=CG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:107:42:42:65:65:0.607477:18:47:22:20:18:47:22:20
chr11	56468637	.	C	T	365.9	PASS	AF=0.312102;AO=50;DP=157;FAO=49;FDP=157;FR=.;FRO=108;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=61;FSRR=47;FWDB=-0.0198746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.942;QD=9.32237;RBI=0.020881;REFB=-0.0209867;REVB=-0.00640438;RO=104;SAF=26;SAR=24;SRF=60;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0668825;STB=0.537625;STBP=0.555;TYPE=snp;VARB=0.0355499;OID=.;OPOS=56468637;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:157:157:104:108:50:49:0.312102:24:26:60:44:24:25:61:47
chr11	56468646	.	C	T	381.27	PASS	AF=0.328671;AO=47;DP=143;FAO=47;FDP=143;FR=.;FRO=96;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=50;FSRR=46;FWDB=-0.0109628;FXX=0.00694396;HRUN=4;LEN=1;MLLD=173.143;QD=10.665;RBI=0.0180096;REFB=9.5738e-05;REVB=0.0142886;RO=94;SAF=25;SAR=22;SRF=49;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0123324;STB=0.50746;STBP=0.91;TYPE=snp;VARB=-0.000357625;OID=.;OPOS=56468646;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:143:143:94:96:47:47:0.328671:22:25:49:45:22:25:50:46
chr11	56468694	.	C	T	246.38	PASS	AF=0.295652;AO=34;DP=116;FAO=34;FDP=115;FR=.;FRO=81;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=37;FSRR=44;FWDB=-0.0230741;FXX=0.00861995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.36;QD=8.56982;RBI=0.0260728;REFB=-0.00997101;REVB=-0.0121398;RO=80;SAF=15;SAR=19;SRF=37;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0256967;STB=0.511116;STBP=0.89;TYPE=snp;VARB=0.0135079;OID=.;OPOS=56468694;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:116:115:80:81:34:34:0.295652:19:15:37:43:19:15:37:44
chr11	56468699	.	T	A	210.03	PASS	AF=0.285714;AO=30;DP=106;FAO=30;FDP=105;FR=.;FRO=75;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=33;FSRR=42;FWDB=0.000506426;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.5159;QD=8.00131;RBI=0.0178827;REFB=-0.0108483;REVB=0.0178755;RO=75;SAF=13;SAR=17;SRF=33;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00816225;STB=0.504839;STBP=0.961;TYPE=snp;VARB=0.0155483;OID=.;OPOS=56468699;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:105:75:75:30:30:0.285714:17:13:33:42:17:13:33:42
chr11	56468704	.	T	C	179.43	PASS	AF=0.252525;AO=25;DP=99;FAO=25;FDP=99;FR=.;FRO=74;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=32;FSRR=42;FWDB=-0.0216487;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.2104;QD=7.24965;RBI=0.0216736;REFB=-0.0132025;REVB=0.00103898;RO=74;SAF=10;SAR=15;SRF=32;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0411837;STB=0.52498;STBP=0.787;TYPE=snp;VARB=0.0324342;OID=.;OPOS=56468704;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:74:74:25:25:0.252525:15:10:32:42:15:10:32:42
chr11	56468720	.	T	C	178.62	PASS	AF=0.289157;AO=24;DP=85;FAO=24;FDP=83;FR=.;FRO=59;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=37;FWDB=-0.020692;FXX=0.0235266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.902;QD=8.60809;RBI=0.0208008;REFB=-0.00721894;REVB=0.00212494;RO=61;SAF=10;SAR=14;SRF=24;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0288956;STB=0.532332;STBP=0.706;TYPE=snp;VARB=0.0179403;OID=.;OPOS=56468720;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:83:61:59:24:24:0.289157:14:10:24:37:14:10:22:37
chr11	56508541	.	C	T	93.39	PASS	AF=0.315789;AO=12;DP=38;FAO=12;FDP=38;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.0603024;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.142;QD=9.8303;RBI=0.0608588;REFB=0.00442255;REVB=0.00821083;RO=26;SAF=8;SAR=4;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194556;STB=0.61798;STBP=0.338;TYPE=snp;VARB=-0.01646;OID=.;OPOS=56508541;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:93:38:38:26:26:12:12:0.315789:4:8:13:13:4:8:13:13
chr11	56510672	.	T	C	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0538428;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=240.457;QD=35.5759;RBI=0.0557707;REFB=0;REVB=0.0145371;RO=0;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000775285;OID=.;OPOS=56510672;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:4:3:0:0:4:3:0:0
chr11	56511160	.	A	G	122.33	PASS	AF=0.451613;AO=14;DP=31;FAO=14;FDP=31;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=0.0347983;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=286.399;QD=15.7844;RBI=0.0348207;REFB=0.00195035;REVB=0.00124994;RO=17;SAF=4;SAR=10;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0748824;STB=0.543414;STBP=0.695;TYPE=snp;VARB=-0.00171278;OID=.;OPOS=56511160;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:17:17:14:14:0.451613:10:4:6:11:10:4:6:11
chr11	56756399	.	G	T	268.84	PASS	AF=0.447761;AO=30;DP=68;FAO=30;FDP=67;FR=.;FRO=37;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=-0.00562203;FXX=0.0147037;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.321;QD=16.0504;RBI=0.00972481;REFB=-0.0168962;REVB=-0.00793503;RO=35;SAF=14;SAR=16;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0728516;STB=0.555519;STBP=0.445;TYPE=snp;VARB=0.018768;OID=.;OPOS=56756399;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:67:35:37:30:30:0.447761:16:14:19:16:16:14:21:16
chr11	56756664	.	G	A,T	1208.43	PASS	AF=0.938272,0.0617284;AO=73,7;DP=80;FAO=76,5;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=33,5;FSAR=43,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00667753,-0.011249;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=80.7064,173.706;QD=59.6757;RBI=0.0219959,0.0167505;REFB=0,0;REVB=-0.0209578,0.0124112;RO=0;SAF=31,7;SAR=42,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.98661e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.0064172,0.0747927;OID=.,.;OPOS=56756664,56756664;OREF=G,G;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:10:80:81:0:0:73,7:76,5:0.938272,0.0617284:42,0:31,7:0:0:43,0:33,5:0:0
chr11	56949691	.	G	A	174.09	PASS	AF=0.5;AO=18;DP=36;FAO=18;FDP=36;FR=.;FRO=18;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=-0.00897507;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.104;QD=19.3435;RBI=0.0117251;REFB=-0.021333;REVB=0.00754497;RO=18;SAF=12;SAR=6;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.293785;STB=0.666481;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.0190866;OID=.;OPOS=56949691;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:18:18:18:18:0.5:6:12:6:12:6:12:6:12
chr11	56954846	.	C	T	897.68	PASS	AF=0.529762;AO=88;DP=167;FAO=89;FDP=168;FR=.;FRO=79;FSAF=49;FSAR=40;FSRF=37;FSRR=42;FWDB=0.00744485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.052;QD=21.3733;RBI=0.0113133;REFB=-0.0224106;REVB=0.00851854;RO=79;SAF=49;SAR=39;SRF=37;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0766405;STB=0.538742;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.0254333;OID=.;OPOS=56954846;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:167:168:79:79:88:89:0.529762:39:49:37:42:40:49:37:42
chr11	56956516	.	G	A	139.56	PASS	AF=0.355556;AO=16;DP=45;FAO=16;FDP=45;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=-0.0635454;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.8832;QD=12.405;RBI=0.064329;REFB=-0.0112049;REVB=0.0100095;RO=29;SAF=11;SAR=5;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121422;STB=0.571772;STBP=0.492;TYPE=snp;VARB=0.0155639;OID=.;OPOS=56956516;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:29:29:16:16:0.355556:5:11:17:12:5:11:17:12
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chr11	57137371	.	G	A	253.19	PASS	AF=0.509434;AO=26;DP=52;FAO=27;FDP=53;FR=.;FRO=26;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=8;FWDB=0.0096574;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.855;QD=19.109;RBI=0.0669895;REFB=-0.00793354;REVB=0.0662897;RO=26;SAF=18;SAR=8;SRF=18;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.514275;STBP=0.871;TYPE=snp;VARB=0.00794141;OID=.;OPOS=57137371;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:53:26:26:26:27:0.509434:8:18:18:8:9:18:18:8
chr11	57137424	.	C	T	699.26	PASS	AF=0.978261;AO=45;DP=47;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0662195;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.054;QD=60.8051;RBI=0.0662469;REFB=0.0164525;REVB=0.00190267;RO=1;SAF=27;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0170902;STB=0.509087;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.000313799;OID=.;OPOS=57137424;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:47:46:1:1:45:45:0.978261:18:27:1:0:18:27:1:0
chr11	57147016	.	A	G	1513.41	PASS	AF=1;AO=101;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0167339;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.579;QD=59.937;RBI=0.0179691;REFB=0;REVB=0.00654712;RO=0;SAF=40;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.60377e-05;OID=.;OPOS=57147016;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:101:101:0:0:101:101:1:61:40:0:0:61:40:0:0
chr11	57148175	.	A	G	1333.56	PASS	AF=1;AO=85;DP=88;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0110217;FXX=0.034087;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.289;QD=62.7559;RBI=0.0139298;REFB=0;REVB=-0.00851819;RO=0;SAF=39;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.31551e-05;OID=.;OPOS=57148175;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:88:85:0:0:85:85:1:46:39:0:0:46:39:0:0
chr11	57155001	.	G	A	3389.37	PASS	AF=1;AO=218;DP=220;FAO=218;FDP=218;FR=.;FRO=0;FSAF=100;FSAR=118;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0194541;FXX=0.0090905;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.185;QD=62.1903;RBI=0.0195359;REFB=-0.0613131;REVB=-0.00178542;RO=1;SAF=100;SAR=118;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00474076;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000199758;OID=.;OPOS=57155001;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:220:218:1:0:218:218:1:118:100:1:0:118:100:0:0
chr11	57155288	.	T	C	2549.47	PASS	AF=1;AO=163;DP=166;FAO=165;FDP=165;FR=.;FRO=0;FSAF=89;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0228032;FXX=0.00602373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.82;QD=61.8052;RBI=0.0377338;REFB=0;REVB=0.0300642;RO=0;SAF=88;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.67713e-05;OID=.;OPOS=57155288;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:166:165:0:0:163:165:1:75:88:0:0:76:89:0:0
chr11	57157405	.	A	G	74.22	PASS	AF=0.344828;AO=10;DP=29;FAO=10;FDP=29;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=16;FWDB=-0.0272268;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.4907;QD=10.2367;RBI=0.0690078;REFB=-0.0654363;REVB=-0.0634096;RO=18;SAF=5;SAR=5;SRF=3;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.367162;STB=0.723779;STBP=0.151;TYPE=snp;VARB=0.0942077;OID=.;OPOS=57157405;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:29:29:18:19:10:10:0.344828:5:5:3:15:5:5:3:16
chr11	57308985	.	CCGG	C,CG	56.32	PASS	AF=0,0.533333;AO=2,6;DP=17;FAO=0,8;FDP=15;FR=.;FRO=7;FSAF=0,7;FSAR=0,1;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=-0.0124074,0.0256401;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=3,2;MLLD=33.0951,30.2156;QD=15.0193;RBI=0.0259037,0.0733391;REFB=-0.0168655,-0.0214027;REVB=0.0227389,0.068711;RO=9;SAF=2,5;SAR=0,1;SRF=4;SRR=5;SSEN=0,0;SSEP=0.5,0.5;SSSB=0.602534,0.426681;STB=0.5,0.822615;STBP=1,0.02;TYPE=del,del;VARB=0,0.0289948;OID=.,.;OPOS=57308986,57308986;OREF=CGG,CG;OALT=-,-;OMAPALT=C,CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,0.533333:2,6:17:0,8:15:7:0,7:0,1:2:5:46:9:2,5:0,1:4:5
chr11	57313469	.	C	G	1828.71	PASS	AF=0.878378;AO=129;DP=148;FAO=130;FDP=148;FR=.;FRO=18;FSAF=59;FSAR=71;FSRF=3;FSRR=15;FWDB=-0.0282845;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=45.8577;QD=49.4245;RBI=0.0389144;REFB=-0.0335441;REVB=0.0267268;RO=17;SAF=59;SAR=70;SRF=2;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0759093;STB=0.535453;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.0360675;OID=.;OPOS=57313469;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:148:148:17:18:129:130:0.878378:70:59:2:15:71:59:3:15
chr11	57353983	.	T	G	281.02	PASS	AF=1;AO=21;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0082203;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=248.148;QD=51.0943;RBI=0.00898658;REFB=0;REVB=0.00363116;RO=0;SAF=9;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000216333;OID=.;OPOS=57353983;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:21:22:1:12:9:0:0:13:9:0:0
chr11	57463500	.	T	C	754.75	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.051467;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.5147;QD=56.9623;RBI=0.0624006;REFB=0;REVB=0.0352842;RO=0;SAF=23;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.84538e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000217326;OID=.;OPOS=57463500;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:53:0:0:52:53:1:29:23:0:0:30:23:0:0
chr11	57466652	.	C	T	238.3	PASS	AF=0.457627;AO=27;DP=59;FAO=27;FDP=59;FR=.;FRO=32;FSAF=21;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=-0.00678822;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.019;QD=16.156;RBI=0.0318035;REFB=-0.00573569;REVB=-0.0310706;RO=32;SAF=21;SAR=6;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.3351;STB=0.690834;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.0130728;OID=.;OPOS=57466652;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:32:32:27:27:0.457627:6:21:15:17:6:21:15:17
chr11	57468129	.	T	C	1494.99	PASS	AF=1;AO=93;DP=95;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0925058;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.412;QD=63.6165;RBI=0.0930987;REFB=0;REVB=0.0104902;RO=0;SAF=36;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.09153e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0001268;OID=.;OPOS=57468129;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:94:0:0:93:94:1:57:36:0:0:58:36:0:0
chr11	57571232	.	C	T	753.56	PASS	AF=0.979592;AO=48;DP=49;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0219099;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.793;QD=61.5151;RBI=0.0328932;REFB=-0.0564565;REVB=-0.0245341;RO=1;SAF=24;SAR=24;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.019199;STB=0.5102;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.000132466;OID=.;OPOS=57571232;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:49:49:1:1:48:48:0.979592:24:24:0:1:24:24:0:1
chr11	57798723	.	A	G	594.53	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00133999;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.079;QD=60.9778;RBI=0.00771145;REFB=0;REVB=0.00759413;RO=0;SAF=16;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.43889e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.69124e-05;OID=.;OPOS=57798723;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:23:16:0:0:23:16:0:0
chr11	57798942	.	A	G	453.37	PASS	AF=0.969697;AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=33;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00334786;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.159;QD=54.9541;RBI=0.0208074;REFB=0.0522822;REVB=-0.0205363;RO=0;SAF=10;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.523794;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=-0.000311596;OID=.;OPOS=57798942;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:33:33:0:1:32:32:0.969697:22:10:0:0:22:10:1:0
chr11	57947264	.	C	G	769.51	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0218344;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=260.861;QD=57.0007;RBI=0.0295533;REFB=0;REVB=0.0199162;RO=0;SAF=34;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.77753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.01616e-05;OID=.;OPOS=57947264;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:20:34:0:0:20:34:0:0
chr11	57948952	.	G	A	632.24	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0411832;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.178;QD=61.6822;RBI=0.0489001;REFB=0;REVB=0.026366;RO=0;SAF=24;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.2194e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000208886;OID=.;OPOS=57948952;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:17:24:0:0:17:24:0:0
chr11	57958775	.	C	T	1008.48	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000185166;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.895;QD=59.3224;RBI=0.00629055;REFB=0;REVB=-0.00628782;RO=0;SAF=33;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.25116e-05;OID=.;OPOS=57958775;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:35:33:0:0:35:33:0:0
chr11	57958972	.	C	A	613.11	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00293101;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.3333;QD=61.3113;RBI=0.0535127;REFB=0;REVB=-0.0534323;RO=0;SAF=25;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000865846;OID=.;OPOS=57958972;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:15:25:0:0:15:25:0:0
chr11	57971171	.	C	T	61.39	PASS	AF=0.185185;AO=9;DP=52;FAO=10;FDP=54;FR=.;FRO=44;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=26;FWDB=0.0350281;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.514;QD=4.54772;RBI=0.0394387;REFB=-0.0130869;REVB=-0.018123;RO=43;SAF=2;SAR=7;SRF=18;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.269658;STB=0.701309;STBP=0.198;TYPE=snp;VARB=0.0276768;OID=.;OPOS=57971171;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:52:54:43:44:9:10:0.185185:7:2:18:25:8:2:18:26
chr11	57971195	.	G	A	732.93	PASS	AF=0.979167;AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=48;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0401703;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.497;QD=61.0775;RBI=0.0401704;REFB=-0.00960879;REVB=-0.000100401;RO=1;SAF=20;SAR=27;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0171015;STB=0.509087;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.00136799;OID=.;OPOS=57971195;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:48:48:1:1:47:47:0.979167:27:20:0:1:27:20:0:1
chr11	57971201	.	G	A	714.92	PASS	AF=0.978723;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0205801;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.1099;QD=60.844;RBI=0.0387687;REFB=0.075188;REVB=-0.0328553;RO=1;SAF=21;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0218604;STB=0.511623;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=-0.0106517;OID=.;OPOS=57971201;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:47:47:1:1:46:46:0.978723:25:21:1:0:25:21:1:0
chr11	57982229	.	A	G	855.36	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.014032;FXX=0.0483793;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.341;QD=57.9904;RBI=0.022067;REFB=0;REVB=0.0170311;RO=0;SAF=31;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.07727e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000641094;OID=.;OPOS=57982229;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:59:0:0:58:59:1:27:31:0:0:28:31:0:0
chr11	57982584	.	T	C	865.51	PASS	AF=0.983871;AO=60;DP=62;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0539897;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.5287;QD=55.8394;RBI=0.0545063;REFB=-0.123579;REVB=-0.00748623;RO=1;SAF=30;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154718;STB=0.507934;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.00118775;OID=.;OPOS=57982584;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:62:62:1:1:60:61:0.983871:30:30:1:0:30:31:1:0
chr11	57982620	.	A	G	902.71	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.005567;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.616;QD=58.2394;RBI=0.0470421;REFB=0;REVB=-0.0467115;RO=0;SAF=33;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.25397e-05;OID=.;OPOS=57982620;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:29:33:0:0:29:33:0:0
chr11	57982726	.	G	T	576.01	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0240287;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.188;QD=60.6329;RBI=0.0260224;REFB=0;REVB=0.00998926;RO=0;SAF=23;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.91909e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000120299;OID=.;OPOS=57982726;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:38:0:0:37:38:1:14:23:0:0:14:24:0:0
chr11	57982763	.	A	G	306.33	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00283005;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.737;QD=53.2744;RBI=0.0170092;REFB=0;REVB=0.0167722;RO=0;SAF=15;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000293843;OID=.;OPOS=57982763;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:8:15:0:0:8:15:0:0
chr11	57982832	.	T	A	447.0	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0452474;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.8517;QD=57.6775;RBI=0.0810966;REFB=0;REVB=0.0673003;RO=0;SAF=24;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.71661e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00193772;OID=.;OPOS=57982832;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:7:24:0:0:7:24:0:0
chr11	57982896	.	G	T	1185.97	PASS	AF=1;AO=77;DP=79;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00302702;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.823;QD=60.8188;RBI=0.00795309;REFB=0;REVB=-0.00735451;RO=0;SAF=56;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.42054e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.38768e-05;OID=.;OPOS=57982896;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:78:0:0:77:78:1:21:56:0:0:21:57:0:0
chr11	57983194	.	A	G	561.07	PASS	AF=1;AO=36;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0763033;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.771;QD=60.6564;RBI=0.0771242;REFB=0;REVB=-0.0112226;RO=0;SAF=18;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.38486e-05;OID=.;OPOS=57983194;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:36:37:1:18:18:0:0:18:19:0:0
chr11	57996223	.	A	G	270.99	PASS	AF=0.543478;AO=25;DP=46;FAO=25;FDP=46;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=18;FSRF=4;FSRR=17;FWDB=-0.00576354;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.8;QD=23.5644;RBI=0.0079233;REFB=0.00429588;REVB=0.00543693;RO=21;SAF=7;SAR=18;SRF=4;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0956628;STB=0.553007;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=-0.00463015;OID=.;OPOS=57996223;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:21:21:25:25:0.543478:18:7:4:17:18:7:4:17
chr11	57996312	.	C	G	1339.55	PASS	AF=1;AO=85;DP=85;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00940912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.762;QD=61.5887;RBI=0.0288699;REFB=0;REVB=-0.0272935;RO=0;SAF=36;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.25834e-05;OID=.;OPOS=57996312;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:87:0:0:85:87:1:49:36:0:0:50:37:0:0
chr11	58034543	.	C	T	972.78	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.022089;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.907;QD=58.9564;RBI=0.0230344;REFB=0;REVB=0.00653148;RO=0;SAF=29;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.54616e-05;OID=.;OPOS=58034543;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:37:29:0:0:37:29:0:0
chr11	58123152	.	T	C	1463.45	PASS	AF=0.979167;AO=94;DP=96;FAO=94;FDP=96;FR=.;FRO=2;FSAF=43;FSAR=51;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00593056;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.536;QD=60.9769;RBI=0.0285774;REFB=-0.0227169;REVB=0.0279553;RO=2;SAF=43;SAR=51;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0016925;STB=0.500893;STBP=0.87;TYPE=snp;VARB=0.000628217;OID=.;OPOS=58123152;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:96:96:2:2:94:94:0.979167:51:43:1:1:51:43:1:1
chr11	58125620	.	T	C	911.94	PASS	AF=1;AO=62;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0166727;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.338;QD=57.9006;RBI=0.0199656;REFB=0;REVB=0.010984;RO=0;SAF=29;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000416435;OID=.;OPOS=58125620;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:62:63:1:33:29:0:0:34:29:0:0
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chr11	58318619	.	C	G	1080.67	PASS	AF=0.986486;AO=73;DP=74;FAO=73;FDP=74;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00627304;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.061;QD=58.4145;RBI=0.0062996;REFB=-0.0616289;REVB=-0.0005778;RO=1;SAF=36;SAR=37;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.012613;STB=0.506665;STBP=0.496;TYPE=snp;VARB=0.000169137;OID=.;OPOS=58318619;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:74:74:1:1:73:73:0.986486:37:36:0:1:37:36:0:1
chr11	58602309	.	C	T	398.84	PASS	AF=0.966667;AO=28;DP=29;FAO=29;FDP=30;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0262188;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.1554;QD=53.1782;RBI=0.07442;REFB=0.0102963;REVB=0.0696485;RO=1;SAF=16;SAR=12;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0372036;STB=0.519986;STBP=0.327;TYPE=snp;VARB=0.0016163;OID=.;OPOS=58602309;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:29:30:1:1:28:29:0.966667:12:16:0:1:12:17:0:1
chr11	58973982	.	GTA	G	357.62	PASS	AF=0.535211;AO=26;DP=77;FAO=38;FDP=71;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=28;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=-0.0394959;FXX=0.112486;HRUN=1;LEN=2;MLLD=144.722;QD=20.1474;RBI=0.0432024;REFB=-0.0454711;REVB=0.0175078;RO=29;SAF=5;SAR=21;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.331276;STB=0.632033;STBP=0.023;TYPE=del;VARB=0.029977;OID=.;OPOS=58973983;OREF=TA;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.535211:26:77:38:71:33:10:28:17:16:99:29:5:21:14:15
chr11	58978940	.	C	T	370.0	PASS	AF=0.506667;AO=38;DP=75;FAO=38;FDP=75;FR=.;FRO=37;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=0.0140294;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.0504;QD=19.7335;RBI=0.0170041;REFB=-0.0017707;REVB=-0.00960817;RO=37;SAF=24;SAR=14;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108874;STB=0.560551;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.00172406;OID=.;OPOS=58978940;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:37:37:38:38:0.506667:14:24:19:18:14:24:19:18
chr11	58982071	.	C	T	307.23	PASS	AF=0.6;AO=27;DP=45;FAO=27;FDP=45;FR=.;FRO=18;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.00740187;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.186;QD=27.3091;RBI=0.0284126;REFB=-0.0150583;REVB=-0.0274315;RO=18;SAF=15;SAR=12;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00771629;OID=.;OPOS=58982071;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:18:18:27:27:0.6:12:15:10:8:12:15:10:8
chr11	59058590	.	C	G	1595.92	PASS	AF=1;AO=104;DP=104;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00240739;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=286.238;QD=59.6606;RBI=0.0457657;REFB=0;REVB=0.0457023;RO=0;SAF=55;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.7374e-05;OID=.;OPOS=59058590;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:104:107:0:0:104:107:1:49:55:0:0:52:55:0:0
chr11	59132798	.	G	C	294.29	PASS	AF=0.619048;AO=26;DP=42;FAO=26;FDP=42;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=0.0197476;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.0274;QD=28.0271;RBI=0.0241923;REFB=-0.00395417;REVB=0.013975;RO=16;SAF=8;SAR=18;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.230943;STB=0.627805;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=0.00363901;OID=.;OPOS=59132798;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:16:16:26:26:0.619048:18:8:10:6:18:8:10:6
chr11	59132882	.	A	G	96.0	PASS	AF=0.647059;AO=11;DP=17;FAO=11;FDP=17;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.0141429;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.516;QD=22.5878;RBI=0.0182476;REFB=-0.0166887;REVB=-0.0115306;RO=6;SAF=3;SAR=8;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161641;STB=0.592415;STBP=0.396;TYPE=snp;VARB=0.00953211;OID=.;OPOS=59132882;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:17:17:6:6:11:11:0.647059:8:3:3:3:8:3:3:3
chr11	59189915	.	C	T	156.15	PASS	AF=0.318182;AO=21;DP=66;FAO=21;FDP=66;FR=.;FRO=45;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=26;FWDB=-0.0117734;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=279.567;QD=9.46376;RBI=0.0207802;REFB=-0.0142626;REVB=-0.0171233;RO=45;SAF=11;SAR=10;SRF=19;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117001;STB=0.568901;STBP=0.458;TYPE=snp;VARB=0.0321462;OID=.;OPOS=59189915;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:45:45:21:21:0.318182:10:11:19:26:10:11:19:26
chr11	59211188	.	G	A	754.64	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0906275;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.6458;QD=56.9541;RBI=0.0906343;REFB=0;REVB=-0.0011062;RO=0;SAF=30;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000803537;OID=.;OPOS=59211188;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:53:0:0:52:53:1:22:30:0:0:22:31:0:0
chr11	59211265	.	T	C	410.96	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0701778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.949;QD=56.684;RBI=0.0735632;REFB=0;REVB=0.0220592;RO=0;SAF=13;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000570718;OID=.;OPOS=59211265;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:16:13:0:0:16:13:0:0
chr11	59224720	.	A	G	1765.52	PASS	AF=1;AO=114;DP=114;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0731748;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.847;QD=60.8799;RBI=0.0777196;REFB=0;REVB=-0.0261875;RO=0;SAF=60;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.23871e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000101038;OID=.;OPOS=59224720;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:114:116:0:0:114:116:1:54:60:0:0:54:62:0:0
chr11	59271637	.	T	C	310.07	PASS	AF=0.388889;AO=35;DP=90;FAO=35;FDP=90;FR=.;FRO=55;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=20;FSRR=35;FWDB=0.00842685;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.797;QD=13.7808;RBI=0.00858303;REFB=-0.0108526;REVB=0.00162995;RO=55;SAF=16;SAR=19;SRF=20;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102289;STB=0.558107;STBP=0.41;TYPE=snp;VARB=0.0146682;OID=.;OPOS=59271637;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:55:55:35:35:0.388889:19:16:20:35:19:16:20:35
chr11	59323951	.	G	A	2135.15	PASS	AF=0.973154;AO=144;DP=148;FAO=145;FDP=149;FR=.;FRO=4;FSAF=65;FSAR=80;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0103418;FXX=0.0132442;HRUN=4;LEN=1;MLLD=247.875;QD=57.3195;RBI=0.0139967;REFB=-0.233016;REVB=0.00943159;RO=4;SAF=65;SAR=79;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00251998;STB=0.501403;STBP=0.868;TYPE=snp;VARB=0.000495227;OID=.;OPOS=59323951;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:148:149:4:4:144:145:0.973154:79:65:2:2:80:65:2:2
chr11	59480951	.	T	C	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0182613;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.436;QD=55.6561;RBI=0.0196023;REFB=0;REVB=0.00712558;RO=0;SAF=18;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.90029e-05;OID=.;OPOS=59480951;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:9:18:0:0:9:18:0:0
chr11	59573980	.	C	T	116.21	PASS	AF=0.341463;AO=12;DP=40;FAO=14;FDP=41;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=-0.0273867;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.492;QD=11.3371;RBI=0.0277557;REFB=-0.0083749;REVB=-0.0045109;RO=28;SAF=5;SAR=7;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.096537;STB=0.535161;STBP=0.839;TYPE=snp;VARB=0.0135614;OID=.;OPOS=59573980;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:41:28:27:12:14:0.341463:7:5:14:14:8:6:13:14
chr11	59814173	.	G	A	176.78	PASS	AF=0.396226;AO=21;DP=53;FAO=21;FDP=53;FR=.;FRO=32;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=-0.036301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.25;QD=13.3417;RBI=0.0363047;REFB=-0.00322277;REVB=-0.000522298;RO=31;SAF=6;SAR=15;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155563;STB=0.582739;STBP=0.377;TYPE=snp;VARB=0.00356673;OID=.;OPOS=59814173;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:31:32:21:21:0.396226:15:6:13:18:15:6:13:19
chr11	59831716	.	C	A	529.98	PASS	AF=0.529412;AO=53;DP=102;FAO=54;FDP=102;FR=.;FRO=48;FSAF=29;FSAR=25;FSRF=23;FSRR=25;FWDB=0.0172841;FXX=0.0097078;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.118;QD=20.7836;RBI=0.0173334;REFB=-0.00750691;REVB=0.00130595;RO=46;SAF=28;SAR=25;SRF=22;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0422892;STB=0.527263;STBP=0.602;TYPE=snp;VARB=0.00430858;OID=.;OPOS=59831716;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:46:48:53:54:0.529412:25:28:22:24:25:29:23:25
chr11	59837097	.	C	T	363.21	PASS	AF=0.521127;AO=37;DP=72;FAO=37;FDP=71;FR=.;FRO=34;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=-0.00281027;FXX=0.013887;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.575;QD=20.4624;RBI=0.0111981;REFB=-0.0100445;REVB=-0.0108397;RO=33;SAF=21;SAR=16;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121989;STB=0.560608;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.00960822;OID=.;OPOS=59837097;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:71:33:34:37:37:0.521127:16:21:14:19:16:21:15:19
chr11	59837721	.	T	TTATGAAAA	157.86	PASS	AF=0.447368;AO=17;DP=43;FAO=17;FDP=38;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=0.00940573;FXX=0;HRUN=2;LEN=8;MLLD=353.75;QD=16.6166;RBI=0.0154894;REFB=-0.00411752;REVB=-0.0123066;RO=26;SAF=9;SAR=8;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110385;STB=0.60724;STBP=0.269;TYPE=ins;VARB=0.0049781;OID=.;OPOS=59837722;OREF=-;OALT=TATGAAAA;OMAPALT=TTATGAAAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.447368:17:43:17:38:21:9:8:7:14:99:26:9:8:11:15
chr11	59945745	.	T	C	579.38	PASS	AF=1;AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00504675;FXX=0.0256345;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.062;QD=60.9875;RBI=0.00515353;REFB=0;REVB=-0.00104366;RO=0;SAF=19;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.78335e-06;OID=.;OPOS=59945745;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:38:0:0:38:38:1:19:19:0:0:19:19:0:0
chr11	59946302	.	C	T	658.4	PASS	AF=1;AO=38;DP=43;FAO=42;FDP=42;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=14;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00128783;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=330.984;QD=62.7049;RBI=0.004733;REFB=0;REVB=0.00455442;RO=0;SAF=9;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000383518;OID=.;OPOS=59946302;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:42:0:0:38:42:1:29:9:0:0:28:14:0:0
chr11	60050125	.	A	G	214.33	PASS	AF=0.38806;AO=26;DP=67;FAO=26;FDP=67;FR=.;FRO=41;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=26;FWDB=0.0104421;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.175;QD=12.7956;RBI=0.0278096;REFB=-0.003211;REVB=-0.0257748;RO=41;SAF=10;SAR=16;SRF=15;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0212614;STB=0.512186;STBP=0.89;TYPE=snp;VARB=0.00407887;OID=.;OPOS=60050125;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:41:41:26:26:0.38806:16:10:15:26:16:10:15:26
chr11	60070176	.	A	G	272.3	PASS	AF=0.47619;AO=30;DP=63;FAO=30;FDP=63;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=0.00994227;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.677;QD=17.2891;RBI=0.0238;REFB=-0.0194097;REVB=0.0216239;RO=33;SAF=11;SAR=19;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.197473;STB=0.610858;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.0177128;OID=.;OPOS=60070176;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:33:33:30:30:0.47619:19:11:19:14:19:11:19:14
chr11	60073597	.	C	T	1751.58	PASS	AF=0.991525;AO=116;DP=118;FAO=117;FDP=118;FR=.;FRO=1;FSAF=63;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0482145;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.628;QD=59.3757;RBI=0.0507298;REFB=-0.0020969;REVB=0.0157756;RO=1;SAF=63;SAR=53;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00887625;STB=0.504586;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=-4.29998e-05;OID=.;OPOS=60073597;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:118:118:1:1:116:117:0.991525:53:63:0:1:54:63:0:1
chr11	60105313	.	T	C	437.87	PASS	AF=0.4375;AO=49;DP=112;FAO=49;FDP=112;FR=.;FRO=63;FSAF=29;FSAR=20;FSRF=38;FSRR=25;FWDB=-0.0261247;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.2054;QD=15.6383;RBI=0.0270236;REFB=0.00955907;REVB=-0.00691199;RO=63;SAF=29;SAR=20;SRF=38;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0118128;STB=0.506614;STBP=0.914;TYPE=snp;VARB=-0.0136408;OID=.;OPOS=60105313;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:112:63:63:49:49:0.4375:20:29:38:25:20:29:38:25
chr11	60105366	.	T	C	652.38	PASS	AF=0.585859;AO=57;DP=99;FAO=58;FDP=99;FR=.;FRO=41;FSAF=32;FSAR=26;FSRF=27;FSRR=14;FWDB=0.00504459;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.002;QD=26.359;RBI=0.00576702;REFB=-0.00182931;REVB=0.00279475;RO=41;SAF=31;SAR=26;SRF=27;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.089413;STB=0.545116;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=0.0016969;OID=.;OPOS=60105366;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:41:41:57:58:0.585859:26:31:27:14:26:32:27:14
chr11	60152563	.	T	A	1556.31	PASS	AF=1;AO=104;DP=104;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0280483;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.87;QD=59.8581;RBI=0.0545115;REFB=0;REVB=0.0467419;RO=0;SAF=55;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00010358;OID=.;OPOS=60152563;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:104:104:0:0:104:104:1:49:55:0:0:49:55:0:0
chr11	60152584	.	G	A	1682.65	PASS	AF=1;AO=111;DP=113;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0391589;FXX=0.0176975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.6473;QD=60.6359;RBI=0.049612;REFB=0;REVB=-0.030462;RO=0;SAF=57;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.40739e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.32392e-05;OID=.;OPOS=60152584;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:113:111:0:0:111:111:1:54:57:0:0:54:57:0:0
chr11	60157107	.	T	G	959.93	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0259696;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.377;QD=59.0727;RBI=0.0259924;REFB=0;REVB=-0.00108875;RO=0;SAF=38;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.04073e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.27714e-05;OID=.;OPOS=60157107;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:27:38:0:0:27:38:0:0
chr11	60157166	.	C	T	557.13	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0168921;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=297.686;QD=60.2307;RBI=0.0177659;REFB=0;REVB=-0.00550311;RO=0;SAF=15;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.82408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.99713e-05;OID=.;OPOS=60157166;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:22:15:0:0:22:15:0:0
chr11	60162389	.	C	T	673.02	PASS	AF=0.363229;AO=81;DP=223;FAO=81;FDP=223;FR=.;FRO=142;FSAF=31;FSAR=50;FSRF=58;FSRR=84;FWDB=-0.00581411;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.2656;QD=12.0721;RBI=0.0545227;REFB=0.000579724;REVB=-0.0542118;RO=140;SAF=31;SAR=50;SRF=56;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0203103;STB=0.517197;STBP=0.692;TYPE=snp;VARB=-0.00168227;OID=.;OPOS=60162389;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:223:223:140:142:81:81:0.363229:50:31:56:84:50:31:58:84
chr11	60165352	.	ATT	A	1092.42	PASS	AF=1;AO=88;DP=90;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0152597;FXX=0.0219756;HRUN=2;LEN=2;MLLD=221.631;QD=49.0977;RBI=0.0181968;REFB=0;REVB=-0.00991293;RO=0;SAF=45;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.39218e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=2.15315e-05;OID=.;OPOS=60165353;OREF=TT;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:88:90:89:89:0:46:43:0:0:19:0:45:43:0:0
chr11	60172087	.	C	T	349.71	PASS	AF=1;AO=22;DP=27;FAO=26;FDP=26;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0361536;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.868;QD=53.8017;RBI=0.040274;REFB=0;REVB=-0.0177457;RO=0;SAF=13;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2029e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.89168e-05;OID=.;OPOS=60172087;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:26:0:0:22:26:1:9:13:0:0:9:17:0:0
chr11	60173360	.	A	G	207.32	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0180302;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.307;QD=48.7809;RBI=0.0181164;REFB=0;REVB=0.0017653;RO=0;SAF=7;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.33339e-05;OID=.;OPOS=60173360;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:17:0:0:16:17:1:9:7:0:0:9:8:0:0
chr11	60182970	.	A	T	109.26	PASS	AF=0.419355;AO=13;DP=31;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.00803962;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=322.683;QD=14.0975;RBI=0.0137308;REFB=-0.00845606;REVB=-0.011131;RO=18;SAF=6;SAR=7;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0383131;STB=0.522354;STBP=0.804;TYPE=snp;VARB=0.00982327;OID=.;OPOS=60182970;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:18:18:13:13:0.419355:7:6:9:9:7:6:9:9
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chr11	60264947	.	C	T	284.48	PASS	AF=0.484375;AO=31;DP=64;FAO=31;FDP=64;FR=.;FRO=33;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=12;FWDB=-0.01819;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.5041;QD=17.7801;RBI=0.0242679;REFB=-0.0230591;REVB=0.0160641;RO=31;SAF=12;SAR=19;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202189;STB=0.627546;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.0399683;OID=.;OPOS=60264947;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:31:33:31:31:0.484375:19:12:19:12:19:12:21:12
chr11	60265002	.	C	T	215.99	PASS	AF=0.461538;AO=24;DP=55;FAO=24;FDP=52;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.00187131;FXX=0.0545355;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.304;QD=16.6149;RBI=0.0479281;REFB=-0.00177692;REVB=-0.0478915;RO=26;SAF=11;SAR=13;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0385395;STB=0.541632;STBP=0.631;TYPE=snp;VARB=0.00127932;OID=.;OPOS=60265002;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:52:26:28:24:24:0.461538:13:11:13:13:13:11:15:13
chr11	60285575	.	A	G,T	1465.74	PASS	AF=0.93,0.07;AO=93,6;DP=99;FAO=93,7;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=53,5;FSAR=40,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00512207,-0.004048;FXX=0.00990001;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=222.676,140.616;QD=58.6294;RBI=0.00809208,0.0130113;REFB=0,0;REVB=-0.00626467,-0.0123656;RO=0;SAF=53,4;SAR=40,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.92821e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00263456,0.0427747;OID=.,.;OPOS=60285575,60285575;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:21:99:100:0:0:93,6:93,7:0.93,0.07:40,2:53,4:0:0:40,2:53,5:0:0
chr11	60291413	.	C	T	238.22	PASS	AF=0.489362;AO=23;DP=47;FAO=23;FDP=47;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=-0.0056652;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.521;QD=20.2744;RBI=0.0176955;REFB=-0.0141881;REVB=-0.0167642;RO=24;SAF=11;SAR=12;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.057389;STB=0.532319;STBP=0.652;TYPE=snp;VARB=0.0141584;OID=.;OPOS=60291413;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:24:24:23:23:0.489362:12:11:13:11:12:11:13:11
chr11	60296879	.	C	T	240.89	PASS	AF=0.315789;AO=30;DP=95;FAO=30;FDP=95;FR=.;FRO=65;FSAF=6;FSAR=24;FSRF=28;FSRR=37;FWDB=-0.00777351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.437;QD=10.1426;RBI=0.0724335;REFB=-0.00598607;REVB=-0.0720152;RO=65;SAF=6;SAR=24;SRF=28;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.320067;STB=0.690215;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.0214195;OID=.;OPOS=60296879;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:65:65:30:30:0.315789:24:6:28:37:24:6:28:37
chr11	60504436	.	T	C	37.81	PASS	AF=0.3;AO=7;DP=21;FAO=6;FDP=20;FR=.;FRO=14;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.0162307;FXX=0.0475964;HRUN=16;LEN=1;MLLD=171.621;QD=7.56161;RBI=0.0166966;REFB=0.00348945;REVB=-0.0039167;RO=13;SAF=2;SAR=5;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.275446;STB=0.666111;STBP=0.365;TYPE=snp;VARB=-0.00273066;OID=.;OPOS=60504436;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:21:20:13:14:7:6:0.3:5:2:7:6:4:2:8:6
chr11	60531264	.	A	G	230.79	PASS	AF=0.480769;AO=25;DP=52;FAO=25;FDP=52;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=-0.0199516;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.408;QD=17.7534;RBI=0.0214918;REFB=-0.00966145;REVB=-0.00798962;RO=27;SAF=9;SAR=16;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.24856;STB=0.639888;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.00818502;OID=.;OPOS=60531264;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:27:27:25:25:0.480769:16:9:17:10:16:9:17:10
chr11	60531285	.	G	T	125.27	PASS	AF=0.303571;AO=17;DP=57;FAO=17;FDP=56;FR=.;FRO=39;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=-0.0203572;FXX=0.0175408;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.901;QD=8.94755;RBI=0.0220321;REFB=0.00142672;REVB=0.00842621;RO=38;SAF=10;SAR=7;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162581;STB=0.588131;STBP=0.392;TYPE=snp;VARB=-0.0102769;OID=.;OPOS=60531285;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:56:38:39:17:17:0.303571:7:10:17:21:7:10:18:21
chr11	60531346	.	T	G	210.38	PASS	AF=0.666667;AO=19;DP=29;FAO=20;FDP=30;FR=.;FRO=10;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.00580943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.368;QD=28.0502;RBI=0.061756;REFB=-0.00939743;REVB=0.0614822;RO=7;SAF=13;SAR=6;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.205582;STB=0.618927;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.00269024;OID=.;OPOS=60531346;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:29:30:7:10:19:20:0.666667:6:13:2:5:7:13:3:7
chr11	60559805	.	A	G	655.98	PASS	AF=1;AO=42;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0671014;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.809;QD=61.0218;RBI=0.0706257;REFB=0;REVB=0.0220315;RO=0;SAF=21;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00345043;OID=.;OPOS=60559805;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:42:43:1:21:21:0:0:22:21:0:0
chr11	60610065	.	G	A	905.93	PASS	AF=0.984375;AO=63;DP=64;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0234594;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=289.104;QD=56.6204;RBI=0.024327;REFB=0.020509;REVB=-0.00643885;RO=1;SAF=18;SAR=45;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0103802;STB=0.505493;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=-0.000175953;OID=.;OPOS=60610065;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:64:64:1:1:63:63:0.984375:45:18:0:1:45:18:0:1
chr11	60620585	.	A	G	465.12	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00879126;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.009;QD=58.1406;RBI=0.0907885;REFB=0;REVB=-0.0903618;RO=0;SAF=22;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000315464;OID=.;OPOS=60620585;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:10:22:0:0:10:22:0:0
chr11	60620590	.	C	G	582.32	PASS	AF=0.975;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0128352;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.1783;QD=58.232;RBI=0.0455909;REFB=-0.00344054;REVB=-0.0437468;RO=1;SAF=28;SAR=11;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0164521;STB=0.508767;STBP=0.603;TYPE=snp;VARB=0.000215348;OID=.;OPOS=60620590;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:40:40:1:1:39:39:0.975:11:28:1:0:11:28:1:0
chr11	60635091	.	T	C	195.35	PASS	AF=1;AO=15;DP=17;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0131753;FXX=0.0587889;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.1208;QD=48.8377;RBI=0.0131995;REFB=0;REVB=-0.000799226;RO=0;SAF=5;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000279232;OID=.;OPOS=60635091;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:16:0:0:15:16:1:10:5:0:0:11:5:0:0
chr11	60637164	.	C	T	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=271.812;QD=40.7629;RBI=0.00874662;REFB=0;REVB=0.00874662;RO=0;SAF=0;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.33159e-05;OID=.;OPOS=60637164;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:10:0:0:0:10:0:0:0
chr11	60638461	.	C	T	1518.52	PASS	AF=1;AO=96;DP=96;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0263036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.958;QD=59.5498;RBI=0.0274616;REFB=0;REVB=0.0078904;RO=0;SAF=41;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.38221e-05;OID=.;OPOS=60638461;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:96:102:0:0:96:102:1:55:41:0:0:58:44:0:0
chr11	60638470	.	A	G	1568.11	PASS	AF=1;AO=98;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00534474;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.951;QD=64.0047;RBI=0.00738603;REFB=0;REVB=-0.00509776;RO=0;SAF=40;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.58075e-05;OID=.;OPOS=60638470;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:98:0:0:98:98:1:58:40:0:0:58:40:0:0
chr11	60689445	.	T	C	1272.15	PASS	AF=1;AO=67;DP=78;FAO=83;FDP=83;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=24;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.189606;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.376;QD=61.3086;RBI=0.189606;REFB=0;REVB=0.000227893;RO=0;SAF=7;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00619839;OID=.;OPOS=60689445;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:78:83:0:0:67:83:1:60:7:0:0:59:24:0:0
chr11	60695301	.	C	A	1479.28	PASS	AF=0.929204;AO=105;DP=113;FAO=105;FDP=113;FR=.;FRO=8;FSAF=35;FSAR=70;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=0.0352023;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=242.25;QD=52.3638;RBI=0.0398136;REFB=-0.105449;REVB=0.018599;RO=6;SAF=35;SAR=70;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0389553;STB=0.516775;STBP=0.245;TYPE=snp;VARB=0.00224611;OID=.;OPOS=60695301;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:24:113:113:6:8:105:105:0.929204:70:35:0:6:70:35:1:7
chr11	60696170	.	C	T	144.76	PASS	AF=0.363636;AO=16;DP=45;FAO=16;FDP=44;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=0.0148637;FXX=0.0638162;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.614;QD=13.1596;RBI=0.0159095;REFB=-0.0320031;REVB=0.0056731;RO=28;SAF=7;SAR=9;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.049575;STB=0.529034;STBP=0.787;TYPE=snp;VARB=0.0302525;OID=.;OPOS=60696170;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:44:28:28:16:16:0.363636:9:7:11:17:9:7:11:17
chr11	60703777	.	G	A	606.12	PASS	AF=0.953488;AO=39;DP=40;FAO=41;FDP=43;FR=.;FRO=2;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.000435377;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.529;QD=56.3831;RBI=0.0268301;REFB=-0.107154;REVB=0.0268266;RO=0;SAF=17;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504082;STBP=0.852;TYPE=snp;VARB=0.00138353;OID=.;OPOS=60703777;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:40:43:0:2:39:41:0.953488:22:17:0:0:24:17:1:1
chr11	60705454	.	A	G	837.76	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0170072;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.7994;QD=57.7767;RBI=0.0331704;REFB=0;REVB=0.0284786;RO=0;SAF=29;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000589449;OID=.;OPOS=60705454;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:29:29:0:0:29:29:0:0
chr11	60776186	.	C	T	443.16	PASS	AF=0.7;AO=35;DP=50;FAO=35;FDP=50;FR=.;FRO=15;FSAF=10;FSAR=25;FSRF=11;FSRR=4;FWDB=-0.000293853;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.153;QD=35.4526;RBI=0.0194603;REFB=-0.00734602;REVB=0.0194581;RO=15;SAF=10;SAR=25;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.264107;STB=0.644086;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0048977;OID=.;OPOS=60776186;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:15:15:35:35:0.7:25:10:11:4:25:10:11:4
chr11	60776306	.	C	T	77.93	PASS	AF=0.454545;AO=10;DP=22;FAO=10;FDP=22;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=0.124127;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.0334;QD=14.1684;RBI=0.124128;REFB=-0.0200001;REVB=-0.000507967;RO=12;SAF=3;SAR=7;SRF=2;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160599;STB=0.592856;STBP=0.539;TYPE=snp;VARB=0.0183584;OID=.;OPOS=60776306;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:22:22:12:12:10:10:0.454545:7:3:2:10:7:3:2:10
chr11	60785352	.	A	G	236.39	PASS	AF=0.490196;AO=24;DP=50;FAO=25;FDP=51;FR=.;FRO=26;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=0.00607748;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.13;QD=18.5403;RBI=0.00866722;REFB=-0.00972977;REVB=-0.0061794;RO=25;SAF=14;SAR=10;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165647;STB=0.590478;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=0.00779905;OID=.;OPOS=60785352;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:51:25:26:24:25:0.490196:10:14:10:15:10:15:11:15
chr11	60785464	.	G	A	329.09	PASS	AF=0.771429;AO=27;DP=35;FAO=27;FDP=35;FR=.;FRO=8;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0598734;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.089;QD=37.6098;RBI=0.0669061;REFB=0.011064;REVB=-0.0298597;RO=8;SAF=12;SAR=15;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0235624;STB=0.512811;STBP=0.799;TYPE=snp;VARB=-0.00540678;OID=.;OPOS=60785464;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:51:35:35:8:8:27:27:0.771429:15:12:4:4:15:12:4:4
chr11	60892606	.	A	G	552.62	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.110071;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.5769;QD=59.7428;RBI=0.110114;REFB=0;REVB=-0.00309307;RO=0;SAF=17;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.71161e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00138814;OID=.;OPOS=60892606;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:20:17:0:0:20:17:0:0
chr11	60893235	.	C	T	557.13	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0228987;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.801;QD=60.2307;RBI=0.0233835;REFB=0;REVB=0.0047367;RO=0;SAF=22;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.82408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.19904e-05;OID=.;OPOS=60893235;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:15:22:0:0:15:22:0:0
chr11	60899767	.	A	G	766.12	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00153097;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.306;QD=63.8435;RBI=0.0129921;REFB=0;REVB=0.0129016;RO=0;SAF=33;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.1057e-05;OID=.;OPOS=60899767;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:48:0:0:47:48:1:14:33:0:0:15:33:0:0
chr11	61106892	.	G	C	613.31	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00262481;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.5779;QD=61.3312;RBI=0.0389423;REFB=0;REVB=-0.0388537;RO=0;SAF=21;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000439221;OID=.;OPOS=61106892;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:19:21:0:0:19:21:0:0
chr11	61108974	.	G	A	748.84	PASS	AF=1;AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0203267;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.7457;QD=63.7307;RBI=0.0312753;REFB=0;REVB=0.0237691;RO=0;SAF=21;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.91397e-05;OID=.;OPOS=61108974;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:47:0:0:47:47:1:26:21:0:0:26:21:0:0
chr11	61112802	.	C	T	728.7	PASS	AF=0.981481;AO=52;DP=53;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00123708;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.9786;QD=53.9779;RBI=0.0483614;REFB=-0.0810512;REVB=0.0483456;RO=1;SAF=36;SAR=16;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0285241;STB=0.515146;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=0.00125703;OID=.;OPOS=61112802;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:53:54:1:1:52:53:0.981481:16:36:0:1:16:37:0:1
chr11	61165280	.	G	A	1143.29	PASS	AF=1;AO=76;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0249474;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.7579;QD=59.3917;RBI=0.025348;REFB=-0.111059;REVB=0.00448877;RO=0;SAF=37;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00117518;OID=.;OPOS=61165280;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:77:77:0:0:76:77:1:39:37:0:0:40:37:0:0
chr11	61165731	.	C	CA	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=18;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.024887;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=312.115;QD=47.8224;RBI=0.0310029;REFB=0;REVB=0.0184883;RO=2;SAF=8;SAR=8;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101301;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000276994;OID=.;OPOS=61165732;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:16:18:16:16:0:8:8:0:0:4:2:8:8:2:0
chr11	61165741	.	G	C	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0209897;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.69;QD=47.8223;RBI=0.0210375;REFB=0;REVB=0.00141759;RO=0;SAF=8;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000122553;OID=.;OPOS=61165741;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:8:8:0:0:8:8:0:0
chr11	61166306	.	G	A	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.011749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.262;QD=49.5992;RBI=0.0138524;REFB=0;REVB=-0.00733824;RO=0;SAF=5;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.97451e-05;OID=.;OPOS=61166306;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:13:5:0:0:13:5:0:0
chr11	61179285	.	G	A	1062.2	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00630551;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.148;QD=59.8422;RBI=0.00963286;REFB=0;REVB=-0.00728235;RO=0;SAF=36;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11607e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.44372e-06;OID=.;OPOS=61179285;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:35:36:0:0:35:36:0:0
chr11	61204361	.	A	C	1561.9	PASS	AF=1;AO=97;DP=97;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00295568;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.202;QD=63.7512;RBI=0.0520076;REFB=0;REVB=0.0519236;RO=0;SAF=51;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000382771;OID=.;OPOS=61204361;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:97:98:0:0:97:98:1:46:51:0:0:46:52:0:0
chr11	61249383	.	C	A	809.44	PASS	AF=1;AO=56;DP=59;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0239086;FXX=0.0508388;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.1065;QD=57.817;RBI=0.0292123;REFB=0;REVB=0.0167851;RO=0;SAF=31;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0002988;OID=.;OPOS=61249383;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:59:56:0:0:56:56:1:25:31:0:0:25:31:0:0
chr11	61277031	.	C	T	50.6	PASS	AF=0.583333;AO=6;DP=11;FAO=7;FDP=12;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0672626;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.761;QD=16.867;RBI=0.0672728;REFB=-0.0239256;REVB=0.00117223;RO=5;SAF=4;SAR=2;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.207272;STB=0.571224;STBP=0.651;TYPE=snp;VARB=0.0285044;OID=.;OPOS=61277031;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:11:12:5:5:6:7:0.583333:2:4:2:3:3:4:2:3
chr11	61277698	.	A	G	160.74	PASS	AF=0.372549;AO=19;DP=51;FAO=19;FDP=51;FR=.;FRO=32;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=-0.00392435;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.894;QD=12.6072;RBI=0.0116764;REFB=-0.0094396;REVB=0.0109972;RO=32;SAF=7;SAR=12;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111933;STB=0.565241;STBP=0.544;TYPE=snp;VARB=0.0184764;OID=.;OPOS=61277698;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:32:32:19:19:0.372549:12:7:15:17:12:7:15:17
chr11	61277775	.	A	G	187.88	PASS	AF=0.347826;AO=23;DP=69;FAO=24;FDP=69;FR=.;FRO=45;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=27;FWDB=-0.0239751;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.725;QD=10.8916;RBI=0.0336388;REFB=-0.00598273;REVB=-0.0235959;RO=45;SAF=10;SAR=13;SRF=18;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0403436;STB=0.511213;STBP=0.919;TYPE=snp;VARB=0.0102435;OID=.;OPOS=61277775;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:45:45:23:24:0.347826:13:10:18:27:14:10:18:27
chr11	61277885	.	G	A	489.17	PASS	AF=0.625;AO=45;DP=73;FAO=45;FDP=72;FR=.;FRO=27;FSAF=28;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=5;FWDB=0.000588771;FXX=0.0399947;HRUN=5;LEN=1;MLLD=213.909;QD=27.1761;RBI=0.0174439;REFB=-0.0228648;REVB=0.0174339;RO=25;SAF=28;SAR=17;SRF=21;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159274;STB=0.579776;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=0.011378;OID=.;OPOS=61277885;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:72:25:27:45:45:0.625:17:28:21:4:17:28:22:5
chr11	61278246	.	T	C	235.54	PASS	AF=0.490196;AO=25;DP=51;FAO=25;FDP=51;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=-0.046448;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.7228;QD=18.4739;RBI=0.0635516;REFB=-0.00257656;REVB=-0.043375;RO=25;SAF=13;SAR=12;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0716692;STB=0.529111;STBP=0.707;TYPE=snp;VARB=0.00229883;OID=.;OPOS=61278246;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:25:26:25:25:0.490196:12:13:15:10:12:13:15:11
chr11	61487690	.	G	A	1098.37	PASS	AF=0.986842;AO=74;DP=76;FAO=75;FDP=76;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=42;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0464187;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.7702;QD=57.8091;RBI=0.0464632;REFB=-0.100533;REVB=0.00203489;RO=1;SAF=33;SAR=41;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0113997;STB=0.507461;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=0.00186763;OID=.;OPOS=61487690;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:76:76:1:1:74:75:0.986842:41:33:0:1:42:33:1:0
chr11	61505168	.	G	A	1274.46	PASS	AF=1;AO=82;DP=82;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130201;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.108;QD=61.4195;RBI=0.0208754;REFB=0;REVB=0.0163175;RO=0;SAF=47;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.16565e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000261111;OID=.;OPOS=61505168;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:83:0:0:82:83:1:35:47:0:0:35:48:0:0
chr11	61534872	.	A	C	878.73	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0357713;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.6836;QD=57.6214;RBI=0.0420467;REFB=0;REVB=0.0220985;RO=0;SAF=29;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000299006;OID=.;OPOS=61534872;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:56:61:0:0:56:61:1:27:29:0:0:29:32:0:0
chr11	61539094	.	AC	A	37.67	PASS	AF=0.36;AO=10;DP=25;FAO=9;FDP=25;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.0571938;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=15.9781;QD=6.02736;RBI=0.0830878;REFB=-0.0942794;REVB=0.0602698;RO=15;SAF=8;SAR=2;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.430131;STB=0.732786;STBP=0.103;TYPE=del;VARB=0.136701;OID=.;OPOS=61539095;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.36:10:25:9:25:16:7:2:7:9:37:15:8:2:6:9
chr11	61551356	.	T	C	483.35	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0297834;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.231;QD=58.5875;RBI=0.0470261;REFB=0;REVB=0.0363923;RO=0;SAF=8;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.21902e-05;OID=.;OPOS=61551356;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:25:8:0:0:25:8:0:0
chr11	61564299	.	G	T	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0292702;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.706;QD=37.488;RBI=0.0310077;REFB=0;REVB=0.010234;RO=0;SAF=5;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000541851;OID=.;OPOS=61564299;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:3:5:0:0:3:5:0:0
chr11	61578346	.	GGCC	GC,GGC,GGCT	210.11	PASS	AF=0.253165,0.0379747,0.151899;AO=19,11,7;DP=91;FAO=20,3,12;FDP=79;FR=.;FRO=44;FSAF=11,2,0;FSAR=9,1,12;FSRF=38;FSRR=6;FWDB=-0.148944,-0.175496,-0.0302535;FXX=0.102261;HRUN=5,5,5;LEN=2,1,1;MLLD=16.476,11.1359,184.077;QD=10.6385;RBI=0.149413,0.178406,0.0359707;REFB=-0.100512,-0.0943972,-0.00869397;REVB=0.0118258,-0.0320941,-0.0194581;RO=33;SAF=13,7,0;SAR=6,4,7;SRF=30;SRR=3;SSEN=0,0.366667,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.334069,-0.430641,-0.842929;STB=0.72755,0.73968,0.999464;STBP=0.053,0.818,0;TYPE=del,del,snp;VARB=0.180531,0.111758,0.106535;OID=.,.,.;OPOS=61578347,61578348,61578349;OREF=GC,C,C;OALT=-,-,T;OMAPALT=GC,GGC,GGCT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.253165,0.0379747,0.151899:19,11,7:91:20,3,12:79:44:11,2,0:9,1,12:38:6:88:33:13,7,0:6,4,7:30:3
chr11	61582708	.	T	C	295.46	PASS	AF=0.958333;AO=23;DP=24;FAO=23;FDP=24;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0297406;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.693;QD=49.2436;RBI=0.0768598;REFB=0.0137654;REVB=-0.0708726;RO=1;SAF=10;SAR=13;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0440445;STB=0.523789;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=-0.00966309;OID=.;OPOS=61582708;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:24:24:1:1:23:23:0.958333:13:10:1:0:13:10:1:0
chr11	61593816	.	C	T	901.58	PASS	AF=0.955224;AO=64;DP=67;FAO=64;FDP=67;FR=.;FRO=3;FSAF=31;FSAR=33;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0217822;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.028;QD=53.8258;RBI=0.0423727;REFB=-0.14338;REVB=0.0363453;RO=3;SAF=31;SAR=33;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0435365;STB=0.52307;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=0.00170705;OID=.;OPOS=61593816;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:67:67:3:3:64:64:0.955224:33:31:3:0:33:31:3:0
chr11	61658800	.	C	T	223.19	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.1164;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.862;QD=49.5987;RBI=0.118471;REFB=0;REVB=0.0220559;RO=0;SAF=2;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00202061;OID=.;OPOS=61658800;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:16:2:0:0:16:2:0:0
chr11	61719387	.	T	C	406.97	PASS	AF=0.9375;AO=30;DP=32;FAO=30;FDP=32;FR=.;FRO=2;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0127273;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.4338;QD=50.8715;RBI=0.0179126;REFB=-0.0953928;REVB=-0.0126047;RO=2;SAF=19;SAR=11;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.016613;STB=0.508923;STBP=0.774;TYPE=snp;VARB=0.00847778;OID=.;OPOS=61719387;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:32:32:2:2:30:30:0.9375:11:19:1:1:11:19:1:1
chr11	61722645	.	C	A	538.52	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0164489;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.487;QD=59.8354;RBI=0.0257733;REFB=0;REVB=0.0198419;RO=0;SAF=10;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000248665;OID=.;OPOS=61722645;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:26:10:0:0:26:10:0:0
chr11	61730234	.	T	C	88.21	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00888527;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.711;QD=39.2066;RBI=0.0222499;REFB=0;REVB=0.0203988;RO=0;SAF=4;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000156896;OID=.;OPOS=61730234;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:5:4:0:0:5:4:0:0
chr11	61734977	.	G	C	37.17	PASS	AF=0.352941;AO=5;DP=16;FAO=6;FDP=17;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=11;FSRR=0;FWDB=0.0307827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.48;QD=8.74639;RBI=0.0307827;REFB=-0.0253526;REVB=0;RO=11;SAF=5;SAR=0;SRF=11;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0680313;OID=.;OPOS=61734977;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:16:17:11:11:5:6:0.352941:0:5:11:0:0:6:11:0
chr11	61734982	.	T	C	36.61	PASS	AF=0.3;AO=6;DP=20;FAO=6;FDP=20;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=14;FSRR=0;FWDB=0.00761933;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.507;QD=7.32291;RBI=0.00761933;REFB=-0.00602974;REVB=0;RO=13;SAF=6;SAR=0;SRF=13;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00807563;OID=.;OPOS=61734982;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:20:20:13:14:6:6:0.3:0:6:13:0:0:6:14:0
chr11	61734985	.	G	C	54.94	PASS	AF=0.347826;AO=8;DP=23;FAO=8;FDP=23;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=0;FSRF=15;FSRR=0;FWDB=0.0507433;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.596;QD=9.55501;RBI=0.0507433;REFB=0.00675251;REVB=0;RO=15;SAF=8;SAR=0;SRF=15;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00393174;OID=.;OPOS=61734985;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:23:23:15:15:8:8:0.347826:0:8:15:0:0:8:15:0
chr11	61735059	.	A	C	144.82	PASS	AF=0.410256;AO=16;DP=40;FAO=16;FDP=39;FR=.;FRO=23;FSAF=15;FSAR=1;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=0.00149885;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.072;QD=14.8529;RBI=0.00973296;REFB=-0.00810374;REVB=-0.00961686;RO=24;SAF=15;SAR=1;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.577226;STB=0.854341;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.00805963;OID=.;OPOS=61735059;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:39:24:23:16:16:0.410256:1:15:14:10:1:15:13:10
chr11	61735080	.	G	T	131.99	PASS	AF=0.416667;AO=15;DP=36;FAO=15;FDP=36;FR=.;FRO=21;FSAF=14;FSAR=1;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0205222;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.887;QD=14.6657;RBI=0.0224139;REFB=0.00534933;REVB=-0.00901251;RO=21;SAF=14;SAR=1;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.597167;STB=0.85972;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=-0.0134527;OID=.;OPOS=61735080;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:21:21:15:15:0.416667:1:14:11:10:1:14:11:10
chr11	61906374	.	T	C	160.42	PASS	AF=0.53125;AO=16;DP=32;FAO=17;FDP=32;FR=.;FRO=15;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=-0.0250183;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.4924;QD=20.0522;RBI=0.025638;REFB=-0.00229892;REVB=0.00560291;RO=15;SAF=12;SAR=4;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0892964;STB=0.521713;STBP=0.873;TYPE=snp;VARB=0.00298557;OID=.;OPOS=61906374;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:15:15:16:17:0.53125:4:12:10:5:5:12:10:5
chr11	61914274	.	C	T	31.59	PASS	AF=0.555556;AO=5;DP=9;FAO=5;FDP=9;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.0511461;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.353;QD=14.0414;RBI=0.0862793;REFB=-0.0954051;REVB=0.0694852;RO=4;SAF=2;SAR=3;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118169;STB=0.571155;STBP=0.737;TYPE=snp;VARB=0.0295936;OID=.;OPOS=61914274;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:9:9:4:4:5:5:0.555556:3:2:1:3:3:2:1:3
chr11	62010863	.	C	T	682.24	PASS	AF=0.559322;AO=66;DP=118;FAO=66;FDP=118;FR=.;FRO=52;FSAF=46;FSAR=20;FSRF=24;FSRR=28;FWDB=0.00383369;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=290.127;QD=23.1266;RBI=0.00556619;REFB=-0.0120751;REVB=-0.00403551;RO=52;SAF=46;SAR=20;SRF=24;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20405;STB=0.611938;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0102572;OID=.;OPOS=62010863;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:118:118:52:52:66:66:0.559322:20:46:24:28:20:46:24:28
chr11	62105611	.	C	T	611.95	PASS	AF=0.578947;AO=55;DP=95;FAO=55;FDP=95;FR=.;FRO=40;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=0.0143979;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=245.953;QD=25.7661;RBI=0.0201807;REFB=-0.00864294;REVB=-0.0141409;RO=39;SAF=30;SAR=25;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0444288;STB=0.52974;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.00579672;OID=.;OPOS=62105611;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:39:40:55:55:0.578947:25:30:19:20:25:30:19:21
chr11	62160723	.	C	T	282.25	PASS	AF=0.52;AO=26;DP=50;FAO=26;FDP=50;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=-0.00534217;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.259;QD=22.5799;RBI=0.00786618;REFB=-0.0107922;REVB=-0.00577391;RO=24;SAF=12;SAR=14;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.068799;STB=0.538432;STBP=0.621;TYPE=snp;VARB=0.0110836;OID=.;OPOS=62160723;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:24:24:26:26:0.52:14:12:13:11:14:12:13:11
chr11	62160729	.	G	A	251.1	PASS	AF=0.509804;AO=26;DP=51;FAO=26;FDP=51;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.000986301;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=134.007;QD=19.6938;RBI=0.0310292;REFB=-0.0339609;REVB=0.0310135;RO=25;SAF=12;SAR=14;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0512521;STB=0.528679;STBP=0.682;TYPE=snp;VARB=0.0212137;OID=.;OPOS=62160729;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:25:25:26:26:0.509804:14:12:13:12:14:12:13:12
chr11	62236191	.	T	C	112.23	PASS	AF=0.481481;AO=13;DP=27;FAO=13;FDP=27;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=-0.0245877;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.468;QD=16.6268;RBI=0.0449278;REFB=0.0125172;REVB=-0.0376026;RO=14;SAF=5;SAR=8;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.230409;STB=0.632566;STBP=0.194;TYPE=snp;VARB=-0.017635;OID=.;OPOS=62236191;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:14:14:13:13:0.481481:8:5:9:5:8:5:9:5
chr11	62236219	.	T	C	272.55	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00359742;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.912;QD=51.9141;RBI=0.0129289;REFB=0;REVB=0.0124184;RO=0;SAF=10;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.73406e-05;OID=.;OPOS=62236219;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:11:10:0:0:11:10:0:0
chr11	62292882	.	G	T	1315.35	PASS	AF=0.967391;AO=87;DP=92;FAO=89;FDP=92;FR=.;FRO=3;FSAF=43;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.018495;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=47.1728;QD=57.1891;RBI=0.0545491;REFB=-0.168487;REVB=-0.0513181;RO=4;SAF=41;SAR=46;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.023229;STB=0.504891;STBP=0.716;TYPE=snp;VARB=0.0130345;OID=.;OPOS=62292882;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:92:92:4:3:87:89:0.967391:46:41:3:1:46:43:1:2
chr11	62293948	.	G	A	147.23	PASS	AF=0.470588;AO=16;DP=34;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.0146714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.221;QD=17.3212;RBI=0.0249847;REFB=-0.0405099;REVB=0.0202234;RO=16;SAF=8;SAR=8;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.054861;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0473567;OID=.;OPOS=62293948;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:16:18:16:16:0.470588:8:8:9:7:8:8:9:9
chr11	62334908	.	G	C	303.78	PASS	AF=0.5625;AO=27;DP=49;FAO=27;FDP=48;FR=.;FRO=21;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.0182065;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=309.455;QD=25.3153;RBI=0.0248548;REFB=-0.000482426;REVB=0.0169199;RO=20;SAF=17;SAR=10;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0642388;STB=0.548351;STBP=0.445;TYPE=snp;VARB=0.000358409;OID=.;OPOS=62334908;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:48:20:21:27:27:0.5625:10:17:11:9:10:17:11:10
chr11	62370155	.	G	A	67.43	PASS	AF=0.45;AO=9;DP=20;FAO=9;FDP=20;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=0.0247189;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=129.219;QD=13.4856;RBI=0.0269026;REFB=-0.0373625;REVB=0.0106171;RO=11;SAF=3;SAR=6;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.356162;STB=0.709231;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=0.0142835;OID=.;OPOS=62370155;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:20:20:11:11:9:9:0.45:6:3:8:3:6:3:8:3
chr11	62378660	.	G	A	193.15	PASS	AF=0.425532;AO=13;DP=47;FAO=20;FDP=47;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=-0.00530041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.3662;QD=16.4384;RBI=0.0199072;REFB=-0.000140805;REVB=-0.0191886;RO=20;SAF=4;SAR=9;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.257812;STB=0.574395;STBP=0.386;TYPE=snp;VARB=-0.000286083;OID=.;OPOS=62378660;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:20:27:13:20:0.425532:9:4:11:9:10:10:17:10
chr11	62378801	.	T	C	573.99	PASS	AF=0.458904;AO=52;DP=145;FAO=67;FDP=146;FR=.;FRO=79;FSAF=36;FSAR=31;FSRF=36;FSRR=43;FWDB=0.00323324;FXX=0.0394711;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.796;QD=15.7256;RBI=0.0455452;REFB=-0.000875581;REVB=0.0454303;RO=56;SAF=33;SAR=19;SRF=24;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.195184;STB=0.544105;STBP=0.342;TYPE=snp;VARB=0.00253683;OID=.;OPOS=62378801;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:145:146:56:79:52:67:0.458904:19:33:24:32:31:36:36:43
chr11	62381106	.	G	C	108.78	PASS	AF=0.916667;AO=11;DP=12;FAO=11;FDP=12;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0590142;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.578;QD=36.2594;RBI=0.155651;REFB=-0.00663445;REVB=0.14403;RO=1;SAF=9;SAR=2;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0473806;STB=0.526269;STBP=0.669;TYPE=snp;VARB=0.0161589;OID=.;OPOS=62381106;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:12:12:1:1:11:11:0.916667:2:9:1:0:2:9:1:0
chr11	62383715	.	G	C	148.46	PASS	AF=0.5;AO=4;DP=42;FAO=21;FDP=42;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.0162691;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.1089;QD=14.1387;RBI=0.0673921;REFB=-0.04347;REVB=0.0653988;RO=1;SAF=0;SAR=4;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.524115;STBP=0.778;TYPE=snp;VARB=0.00250361;OID=.;OPOS=62383715;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:1:21:4:21:0.5:4:0:0:1:12:9:10:11
chr11	62394070	.	G	C	77.27	PASS	AF=0.434783;AO=10;DP=23;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.0315356;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.888;QD=13.4386;RBI=0.0315875;REFB=-0.0154911;REVB=-0.00181014;RO=13;SAF=6;SAR=4;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154027;STB=0.509073;STBP=0.975;TYPE=snp;VARB=0.0599296;OID=.;OPOS=62394070;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:23:23:13:13:10:10:0.434783:4:6:8:5:4:6:8:5
chr11	62430659	.	T	A	181.95	PASS	AF=0.6;AO=17;DP=31;FAO=18;FDP=30;FR=.;FRO=12;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.029391;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.733;QD=24.2604;RBI=0.0298365;REFB=-0.0105519;REVB=-0.00513689;RO=10;SAF=13;SAR=4;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138246;STB=0.565142;STBP=0.413;TYPE=snp;VARB=0.00557289;OID=.;OPOS=62430659;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:31:30:10:12:17:18:0.6:4:13:6:4:5:13:7:5
chr11	62434173	.	G	A	62.41	PASS	AF=0.28125;AO=9;DP=32;FAO=9;FDP=32;FR=.;FRO=23;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=0.0107355;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.8678;QD=7.80071;RBI=0.0279898;REFB=0.00265752;REVB=0.0258491;RO=23;SAF=3;SAR=6;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123874;STB=0.5776;STBP=0.639;TYPE=snp;VARB=-0.00400827;OID=.;OPOS=62434173;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:32:32:23:23:9:9:0.28125:6:3:10:13:6:3:10:13
chr11	62438750	.	T	C	512.57	PASS	AF=0.462185;AO=55;DP=119;FAO=55;FDP=119;FR=.;FRO=64;FSAF=14;FSAR=41;FSRF=34;FSRR=30;FWDB=-0.00837999;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.514;QD=17.2291;RBI=0.0135922;REFB=-0.0160669;REVB=0.0107015;RO=63;SAF=14;SAR=41;SRF=34;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.299412;STB=0.664352;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0153802;OID=.;OPOS=62438750;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:119:63:64:55:55:0.462185:41:14:34:29:41:14:34:30
chr11	62439569	.	G	A	486.76	PASS	AF=0.452991;AO=52;DP=116;FAO=53;FDP=117;FR=.;FRO=64;FSAF=19;FSAR=34;FSRF=26;FSRR=38;FWDB=-0.0073306;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.429;QD=16.6415;RBI=0.00762331;REFB=-0.0173869;REVB=-0.00209217;RO=64;SAF=18;SAR=34;SRF=26;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0640114;STB=0.52794;STBP=0.613;TYPE=snp;VARB=0.0248254;OID=.;OPOS=62439569;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:116:117:64:64:52:53:0.452991:34:18:26:38:34:19:26:38
chr11	62445523	.	G	A	207.99	PASS	AF=0.446809;AO=21;DP=47;FAO=21;FDP=47;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=-0.00546616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.3477;QD=17.701;RBI=0.0081274;REFB=-0.0496734;REVB=-0.00601462;RO=25;SAF=10;SAR=11;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15601;STB=0.576541;STBP=0.356;TYPE=snp;VARB=0.0294403;OID=.;OPOS=62445523;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:25:26:21:21:0.446809:11:10:16:9:11:10:16:10
chr11	62458275	.	T	C	45.66	PASS	AF=0.333333;AO=7;DP=21;FAO=7;FDP=21;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.000133552;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.6365;QD=8.69803;RBI=0.0316717;REFB=-0.000748939;REVB=0.0316714;RO=14;SAF=3;SAR=4;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152225;STB=0.594327;STBP=0.568;TYPE=snp;VARB=0.00361703;OID=.;OPOS=62458275;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:21:21:14:14:7:7:0.333333:4:3:8:6:4:3:8:6
chr11	62496519	.	T	C	350.19	PASS	AF=0.6;AO=30;DP=50;FAO=30;FDP=50;FR=.;FRO=20;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=2;FWDB=-0.0518228;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.8896;QD=28.0148;RBI=0.0665506;REFB=-0.0602554;REVB=0.0417539;RO=20;SAF=15;SAR=15;SRF=18;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.293078;STB=0.659904;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0263924;OID=.;OPOS=62496519;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:20:20:30:30:0.6:15:15:18:2:15:15:18:2
chr11	62505764	.	C	T	128.51	PASS	AF=0.340909;AO=15;DP=45;FAO=15;FDP=44;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=-0.000216025;FXX=0.0222173;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.2229;QD=11.6829;RBI=0.0203494;REFB=0.00360603;REVB=0.0203483;RO=28;SAF=9;SAR=6;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.225515;STB=0.642672;STBP=0.196;TYPE=snp;VARB=-0.0062483;OID=.;OPOS=62505764;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:44:28:29:15:15:0.340909:6:9:11:17:6:9:11:18
chr11	62521475	.	T	C	297.87	PASS	AF=0.54386;AO=30;DP=56;FAO=31;FDP=57;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=-0.0222863;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=47.6745;QD=20.9029;RBI=0.0436763;REFB=0.00282189;REVB=-0.0375625;RO=24;SAF=11;SAR=19;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0772067;STB=0.533311;STBP=0.608;TYPE=snp;VARB=-0.00373393;OID=.;OPOS=62521475;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:57:24:26:30:31:0.54386:19:11:11:13:20:11:11:15
chr11	62563353	.	G	A	393.27	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00891857;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=302.817;QD=56.1817;RBI=0.00965979;REFB=0;REVB=0.0037109;RO=0;SAF=18;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.74862e-05;OID=.;OPOS=62563353;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:10:18:0:0:10:18:0:0
chr11	62564009	.	T	C	447.01	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00245712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.9745;QD=57.6784;RBI=0.00548396;REFB=0;REVB=-0.00490269;RO=0;SAF=19;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.47712e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000156472;OID=.;OPOS=62564009;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:12:19:0:0:12:19:0:0
chr11	62609095	.	A	G	65.5	PASS	AF=0.183333;AO=11;DP=60;FAO=11;FDP=60;FR=.;FRO=49;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=21;FSRR=28;FWDB=0.00223585;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.509;QD=4.367;RBI=0.00385042;REFB=-0.00474605;REVB=0.00313476;RO=49;SAF=10;SAR=1;SRF=21;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.606891;STB=0.902674;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.018404;OID=.;OPOS=62609095;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:60:60:49:49:11:11:0.183333:1:10:21:28:1:10:21:28
chr11	62609112	.	A	G	1427.34	PASS	AF=0.668508;AO=121;DP=181;FAO=121;FDP=181;FR=.;FRO=60;FSAF=60;FSAR=61;FSRF=24;FSRR=36;FWDB=0.00196284;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.6392;QD=31.5434;RBI=0.0230873;REFB=0.0185742;REVB=-0.0230037;RO=60;SAF=60;SAR=61;SRF=24;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0591918;STB=0.531793;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=-0.00998276;OID=.;OPOS=62609112;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:181:181:60:60:121:121:0.668508:61:60:24:36:61:60:24:36
chr11	62609122	.	T	C	62.99	PASS	AF=0.0827068;AO=22;DP=266;FAO=22;FDP=266;FR=.;FRO=244;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=104;FSRR=140;FWDB=0.00394012;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.917;QD=0.947261;RBI=0.0440824;REFB=0.000894075;REVB=-0.043906;RO=242;SAF=11;SAR=11;SRF=103;SRR=139;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0867494;STB=0.567609;STBP=0.491;TYPE=snp;VARB=-0.0141565;OID=.;OPOS=62609122;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:266:266:242:244:22:22:0.0827068:11:11:103:139:11:11:104:140
chr11	62609171	.	TATT	CTGC,TGCT	3559.1	PASS	AF=0.777778,0.036036;AO=254,12;DP=336;FAO=259,12;FDP=333;FR=.;FRO=62;FSAF=130,7;FSAR=129,5;FSRF=29;FSRR=33;FWDB=-0.00755146,0.00627669;FXX=0.0176986;HRUN=1,1;LEN=4,2;MLLD=214.747,174.503;QD=42.752;RBI=0.0299881,0.0474843;REFB=-0.0293894,-0.0413744;REVB=0.0290217,0.0470676;RO=60;SAF=129,7;SAR=125,5;SRF=28;SRR=32;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0148647,0.144647;STB=0.506603,0.596253;STBP=0.646,0.49;TYPE=mnp,mnp;VARB=0.00842781,0.00425098;OID=.,.;OPOS=62609171,62609172;OREF=TATT,AT;OALT=CTGC,GC;OMAPALT=CTGC,TGCT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:336:333:60:62:254,12:259,12:0.777778,0.036036:125,5:129,7:28:32:129,5:130,7:29:33
chr11	62652779	.	C	T	428.59	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0361278;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.9504;QD=57.1448;RBI=0.0385474;REFB=0;REVB=-0.013442;RO=0;SAF=18;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00115418;OID=.;OPOS=62652779;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:12:18:0:0:12:18:0:0
chr11	62847453	.	T	C	782.1	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0134858;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.0271;QD=63.8445;RBI=0.0274788;REFB=0;REVB=0.023942;RO=0;SAF=25;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000302145;OID=.;OPOS=62847453;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:49:0:0:48:49:1:23:25:0:0:24:25:0:0
chr11	62848445	.	A	G	187.33	PASS	AF=0.411765;AO=21;DP=51;FAO=21;FDP=51;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=-0.00463344;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.06;QD=14.6925;RBI=0.0624031;REFB=-0.0267128;REVB=-0.0622309;RO=30;SAF=13;SAR=8;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158106;STB=0.590822;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=0.0382531;OID=.;OPOS=62848445;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:30:30:21:21:0.411765:8:13:14:16:8:13:14:16
chr11	62848487	.	A	C	785.67	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0216076;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.318;QD=64.1359;RBI=0.0359713;REFB=0;REVB=-0.0287584;RO=0;SAF=29;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.05971e-06;OID=.;OPOS=62848487;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:49:0:0:47:49:1:18:29:0:0:18:31:0:0
chr11	62863518	.	A	G	221.71	PASS	AF=0.397059;AO=25;DP=65;FAO=27;FDP=68;FR=.;FRO=41;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=23;FSRR=18;FWDB=-0.0432877;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=44.7585;QD=13.0416;RBI=0.0582862;REFB=0.00539276;REVB=0.0390314;RO=40;SAF=13;SAR=12;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0322085;STB=0.547791;STBP=0.559;TYPE=snp;VARB=-0.0137817;OID=.;OPOS=62863518;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:68:40:41:25:27:0.397059:12:13:22:18:14:13:23:18
chr11	62886319	.	G	C	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0109355;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.8841;QD=51.1844;RBI=0.0459611;REFB=0;REVB=0.0446412;RO=0;SAF=9;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00100269;OID=.;OPOS=62886319;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:11:9:0:0:11:9:0:0
chr11	62902172	.	A	C	588.26	PASS	AF=0.97561;AO=39;DP=41;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0337786;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.57;QD=57.3907;RBI=0.0410286;REFB=-0.0220988;REVB=0.0232885;RO=1;SAF=24;SAR=15;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0302234;STB=0.515144;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.0032285;OID=.;OPOS=62902172;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:41:41:1:1:39:40:0.97561:15:24:0:1:16:24:0:1
chr11	62910849	.	T	C	868.27	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00169531;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.284;QD=57.8849;RBI=0.00359771;REFB=0;REVB=0.00317324;RO=0;SAF=29;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.73709e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.77361e-06;OID=.;OPOS=62910849;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:31:29:0:0:31:29:0:0
chr11	62911079	.	G	C	651.23	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0393611;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.286;QD=62.0218;RBI=0.0395835;REFB=0;REVB=0.00419074;RO=0;SAF=18;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000246098;OID=.;OPOS=62911079;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:24:18:0:0:24:18:0:0
chr11	62931484	.	T	C	316.79	PASS	AF=0.367347;AO=36;DP=98;FAO=36;FDP=98;FR=.;FRO=62;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=45;FWDB=0.0259463;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.664;QD=12.9301;RBI=0.0374245;REFB=-0.0226938;REVB=-0.02697;RO=62;SAF=24;SAR=12;SRF=17;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.414939;STB=0.735363;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0404474;OID=.;OPOS=62931484;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:62:62:36:36:0.367347:12:24:17:45:12:24:17:45
chr11	62951221	.	C	G	334.76	PASS	AF=0.507246;AO=35;DP=69;FAO=35;FDP=69;FR=.;FRO=34;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=22;FWDB=0.0286841;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.8795;QD=19.4064;RBI=0.0323227;REFB=-0.0211636;REVB=0.014899;RO=33;SAF=19;SAR=16;SRF=12;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155589;STB=0.592723;STBP=0.113;TYPE=snp;VARB=0.0410398;OID=.;OPOS=62951221;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:33:34:35:35:0.507246:16:19:12:21:16:19:12:22
chr11	62984868	.	T	C	209.39	PASS	AF=0.466667;AO=21;DP=44;FAO=21;FDP=45;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=7;FWDB=-0.0241005;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.1525;QD=18.6128;RBI=0.0360621;REFB=0.00868494;REVB=0.0268261;RO=23;SAF=13;SAR=8;SRF=17;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122019;STB=0.551677;STBP=0.576;TYPE=snp;VARB=-0.00942194;OID=.;OPOS=62984868;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:45:23:24:21:21:0.466667:8:13:17:6:8:13:17:7
chr11	62985544	.	C	T	186.65	PASS	AF=0.666667;AO=18;DP=27;FAO=18;FDP=27;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=15;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.0472657;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.8508;QD=27.6516;RBI=0.0507062;REFB=-0.0442387;REVB=-0.0183597;RO=9;SAF=3;SAR=15;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.242251;STB=0.636192;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=0.0205299;OID=.;OPOS=62985544;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:27:27:9:9:18:18:0.666667:15:3:4:5:15:3:4:5
chr11	63057925	.	G	A	124.06	PASS	AF=0.272727;AO=17;DP=66;FAO=18;FDP=66;FR=.;FRO=48;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=29;FWDB=-0.0192768;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.963;QD=7.51901;RBI=0.0243895;REFB=-0.00532193;REVB=0.0149417;RO=48;SAF=7;SAR=10;SRF=19;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0199918;STB=0.536043;STBP=0.728;TYPE=snp;VARB=0.0298346;OID=.;OPOS=63057925;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:48:48:17:18:0.272727:10:7:19:29:10:8:19:29
chr11	63064823	.	T	C	498.05	PASS	AF=0.50495;AO=51;DP=101;FAO=51;FDP=101;FR=.;FRO=50;FSAF=22;FSAR=29;FSRF=29;FSRR=21;FWDB=0.044331;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.4775;QD=19.7247;RBI=0.0483777;REFB=-0.0216726;REVB=0.0193692;RO=49;SAF=22;SAR=29;SRF=29;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141959;STB=0.573449;STBP=0.141;TYPE=snp;VARB=0.0207768;OID=.;OPOS=63064823;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:101:49:50:51:51:0.50495:29:22:29:20:29:22:29:21
chr11	63072310	.	C	T	356.58	PASS	AF=0.5;AO=36;DP=73;FAO=37;FDP=74;FR=.;FRO=37;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=25;FWDB=-0.0237946;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.706;QD=19.2746;RBI=0.0526918;REFB=-0.00698199;REVB=-0.0470133;RO=37;SAF=19;SAR=17;SRF=12;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.184087;STB=0.60688;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=0.00424278;OID=.;OPOS=63072310;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:74:37:37:36:37:0.5:17:19:12:25:17:20:12:25
chr11	63129876	.	T	G	483.31	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00775558;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.087;QD=58.5834;RBI=0.00934752;REFB=0;REVB=-0.00521795;RO=0;SAF=14;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.71297e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.90673e-06;OID=.;OPOS=63129876;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:19:14:0:0:19:14:0:0
chr11	63233710	.	A	G	416.17	PASS	AF=0.401639;AO=28;DP=123;FAO=49;FDP=122;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=73;FSAF=22;FSAR=27;FSRF=51;FSRR=22;FWDB=0.0289706;FXX=0.00812942;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.3871;QD=13.6449;RBI=0.258787;REFB=-0.0139524;REVB=0.257161;RO=58;SAF=21;SAR=7;SRF=51;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.231122;STB=0.646385;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.0275821;OID=.;OPOS=63233710;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:123:122:58:73:28:49:0.401639:7:21:51:7:27:22:51:22
chr11	63258416	.	T	C	805.19	PASS	AF=1;AO=55;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00335382;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.759;QD=57.5137;RBI=0.00961043;REFB=0;REVB=0.00900623;RO=0;SAF=38;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.97918e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000367148;OID=.;OPOS=63258416;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:55:56:1:17:38:0:0:18:38:0:0
chr11	63313644	.	T	C	1015.68	PASS	AF=0.985714;AO=69;DP=71;FAO=69;FDP=70;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0135941;FXX=0.0140825;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.073;QD=58.0388;RBI=0.0229844;REFB=-0.130358;REVB=0.0185333;RO=1;SAF=30;SAR=39;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0119679;STB=0.506327;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=0.000572932;OID=.;OPOS=63313644;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:71:70:1:1:69:69:0.985714:39:30:0:1:39:30:0:1
chr11	63413962	.	AAAAT	A	971.02	PASS	AF=0.965517;AO=73;DP=86;FAO=84;FDP=87;FR=.;FRO=3;FSAF=58;FSAR=26;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0239253;FXX=0.0224694;HRUN=4;LEN=4;MLLD=246.257;QD=44.6444;RBI=0.0284118;REFB=-0.0698507;REVB=-0.0153235;RO=0;SAF=51;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512602;STBP=0.253;TYPE=del;VARB=0.00133244;OID=.;OPOS=63413963;OREF=AAAT;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:0.965517:73:86:84:87:3:58:26:3:0:5:0:51:22:0:0
chr11	63487386	.	T	C	601.15	PASS	AF=0.97561;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.009148;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=216.865;QD=58.6487;RBI=0.0134293;REFB=-0.0790129;REVB=0.00983161;RO=1;SAF=20;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.022873;STB=0.512189;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.000364343;OID=.;OPOS=63487386;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:41:41:1:1:40:40:0.97561:20:20:0:1:20:20:0:1
chr11	63585804	.	C	A	74.1	PASS	AF=0.6;AO=8;DP=15;FAO=9;FDP=15;FR=.;FRO=6;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0207628;FXX=0.062461;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.541;QD=19.7601;RBI=0.0222588;REFB=0.00614352;REVB=-0.00802235;RO=6;SAF=6;SAR=2;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.325838;STB=0.699519;STBP=0.101;TYPE=snp;VARB=-0.00401938;OID=.;OPOS=63585804;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:39:15:15:6:6:8:9:0.6:2:6:2:4:2:7:2:4
chr11	63661820	.	C	T	769.5	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0367577;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.051;QD=56.9999;RBI=0.0367595;REFB=0;REVB=-0.000370438;RO=0;SAF=33;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.70667e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.89905e-05;OID=.;OPOS=63661820;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:21:33:0:0:21:33:0:0
chr11	63673603	.	CTG	C	58.38	PASS	AF=1;AO=6;DP=7;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0985597;FXX=0.249688;HRUN=1;LEN=2;MLLD=185.942;QD=38.9204;RBI=0.0991322;REFB=0;REVB=0.0106381;RO=0;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00319116;OID=.;OPOS=63673604;OREF=TG;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:6:7:6:6:0:2:4:0:0:3:0:2:4:0:0
chr11	63681513	.	T	C	740.63	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0283688;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.2922;QD=56.9714;RBI=0.101498;REFB=0;REVB=0.0974528;RO=0;SAF=38;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000911569;OID=.;OPOS=63681513;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:52:0:0:51:52:1:13:38:0:0:14:38:0:0
chr11	63723885	.	C	T	460.16	PASS	AF=0.464646;AO=46;DP=99;FAO=46;FDP=99;FR=.;FRO=53;FSAF=29;FSAR=17;FSRF=32;FSRR=21;FWDB=0.0031842;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=315.235;QD=18.5924;RBI=0.00884413;REFB=0.000258567;REVB=0.00825103;RO=51;SAF=29;SAR=17;SRF=31;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0227278;STB=0.515187;STBP=0.81;TYPE=snp;VARB=-0.000306016;OID=.;OPOS=63723885;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:51:53:46:46:0.464646:17:29:31:20:17:29:32:21
chr11	63764302	.	G	C	130.63	PASS	AF=0.608696;AO=14;DP=23;FAO=14;FDP=23;FR=.;FRO=9;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.0185704;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=159.487;QD=22.7176;RBI=0.0185704;REFB=0.00689161;REVB=3.86001e-05;RO=9;SAF=9;SAR=5;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0643851;STB=0.536371;STBP=0.72;TYPE=snp;VARB=-0.00318297;OID=.;OPOS=63764302;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:23:23:9:9:14:14:0.608696:5:9:5:4:5:9:5:4
chr11	63767186	.	A	G	108.61	PASS	AF=0.5;AO=12;DP=26;FAO=13;FDP=26;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.100956;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.5024;QD=16.7099;RBI=0.101792;REFB=-0.0375615;REVB=-0.013016;RO=13;SAF=3;SAR=9;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.218591;STB=0.638067;STBP=0.215;TYPE=snp;VARB=0.010934;OID=.;OPOS=63767186;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:26:13:13:12:13:0.5:9:3:6:7:10:3:6:7
chr11	63883985	.	T	C	175.77	PASS	AF=0.372881;AO=22;DP=59;FAO=22;FDP=59;FR=.;FRO=37;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=24;FSRR=13;FWDB=-0.0802351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.8346;QD=11.9165;RBI=0.0804615;REFB=0.0017863;REVB=0.0060315;RO=36;SAF=14;SAR=8;SRF=23;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0029321;STB=0.508354;STBP=0.935;TYPE=snp;VARB=-0.00444434;OID=.;OPOS=63883985;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:36:37:22:22:0.372881:8:14:23:13:8:14:24:13
chr11	63884027	.	C	T	130.65	PASS	AF=0.394737;AO=15;DP=38;FAO=15;FDP=38;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=0.0212929;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.795;QD=13.7531;RBI=0.0264796;REFB=0.00456214;REVB=0.0157411;RO=22;SAF=9;SAR=6;SRF=16;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140917;STB=0.561719;STBP=0.603;TYPE=snp;VARB=-0.00647322;OID=.;OPOS=63884027;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:22:23:15:15:0.394737:6:9:16:6:6:9:16:7
chr11	63884453	.	C	T	778.8	PASS	AF=0.540146;AO=73;DP=137;FAO=74;FDP=137;FR=.;FRO=63;FSAF=38;FSAR=36;FSRF=35;FSRR=28;FWDB=0.0160534;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.7027;QD=22.7386;RBI=0.0180502;REFB=0.00156994;REVB=-0.00825216;RO=61;SAF=37;SAR=36;SRF=34;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0420712;STB=0.519362;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=-0.00116516;OID=.;OPOS=63884453;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:137:137:61:63:73:74:0.540146:36:37:34:27:36:38:35:28
chr11	63884474	.	C	T	603.34	PASS	AF=0.516949;AO=61;DP=118;FAO=61;FDP=118;FR=.;FRO=57;FSAF=37;FSAR=24;FSRF=31;FSRR=26;FWDB=0.0376956;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.1724;QD=20.4522;RBI=0.0379026;REFB=-0.0385196;REVB=-0.00395605;RO=56;SAF=37;SAR=24;SRF=30;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0635313;STB=0.531293;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.0309616;OID=.;OPOS=63884474;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:118:118:56:57:61:61:0.516949:24:37:30:26:24:37:31:26
chr11	63885305	.	C	T	106.45	PASS	AF=0.571429;AO=12;DP=21;FAO=12;FDP=21;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=-0.0441408;FXX=0.0454339;HRUN=3;LEN=1;MLLD=105.548;QD=20.2754;RBI=0.0442013;REFB=-0.0272162;REVB=0.00231271;RO=9;SAF=6;SAR=6;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125311;STB=0.571312;STBP=0.493;TYPE=snp;VARB=0.0227697;OID=.;OPOS=63885305;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:68:21:21:9:9:12:12:0.571429:6:6:6:3:6:6:6:3
chr11	63885632	.	A	G	392.57	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0811927;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.2486;QD=56.0817;RBI=0.0849915;REFB=0;REVB=0.0251257;RO=0;SAF=12;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00261508;OID=.;OPOS=63885632;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:16:12:0:0:16:12:0:0
chr11	63886539	.	C	T	459.0	PASS	AF=0.46;AO=46;DP=100;FAO=46;FDP=100;FR=.;FRO=54;FSAF=18;FSAR=28;FSRF=24;FSRR=30;FWDB=-0.0352821;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.375;QD=18.3599;RBI=0.0355975;REFB=-0.0037906;REVB=0.00472776;RO=53;SAF=18;SAR=28;SRF=24;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0610033;STB=0.529717;STBP=0.621;TYPE=snp;VARB=0.0034402;OID=.;OPOS=63886539;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:53:54:46:46:0.46:28:18:24:29:28:18:24:30
chr11	63988045	.	G	A	506.23	PASS	AF=0.661765;AO=45;DP=70;FAO=45;FDP=68;FR=.;FRO=23;FSAF=32;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=-0.00869418;FXX=0.0684838;HRUN=3;LEN=1;MLLD=142.557;QD=29.778;RBI=0.0131258;REFB=-0.0279556;REVB=0.00983353;RO=22;SAF=32;SAR=13;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0213387;STB=0.523762;STBP=0.653;TYPE=snp;VARB=0.0180343;OID=.;OPOS=63988045;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:68:22:23:45:45:0.661765:13:32:15:7:13:32:15:8
chr11	63988102	.	C	T	237.23	PASS	AF=0.349398;AO=29;DP=83;FAO=29;FDP=83;FR=.;FRO=54;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=28;FSRR=26;FWDB=0.00858699;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.919;QD=11.4329;RBI=0.0108646;REFB=-0.00332561;REVB=-0.00665613;RO=54;SAF=14;SAR=15;SRF=28;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0401692;STB=0.52324;STBP=0.786;TYPE=snp;VARB=0.00683458;OID=.;OPOS=63988102;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:54:54:29:29:0.349398:15:14:28:26:15:14:28:26
chr11	63991801	.	T	C	205.36	PASS	AF=0.488372;AO=20;DP=42;FAO=21;FDP=43;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.00226184;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.6873;QD=19.1035;RBI=0.0114608;REFB=0.00552056;REVB=0.0112354;RO=21;SAF=12;SAR=8;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0267355;STB=0.513501;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=-0.00406461;OID=.;OPOS=63991801;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:43:21:22:20:21:0.488372:8:12:12:9:9:12:12:10
chr11	63994692	.	T	C	540.66	PASS	AF=0.509091;AO=56;DP=110;FAO=56;FDP=110;FR=.;FRO=54;FSAF=20;FSAR=36;FSRF=15;FSRR=39;FWDB=0.0364332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.756;QD=19.6605;RBI=0.0380311;REFB=-0.00734535;REVB=0.0109081;RO=54;SAF=20;SAR=36;SRF=15;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0790139;STB=0.543463;STBP=0.4;TYPE=snp;VARB=0.00787756;OID=.;OPOS=63994692;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:110:54:54:56:56:0.509091:36:20:15:39:36:20:15:39
chr11	63994696	.	T	C	1313.72	PASS	AF=0.882883;AO=97;DP=111;FAO=98;FDP=111;FR=.;FRO=13;FSAF=22;FSAR=76;FSRF=13;FSRR=0;FWDB=0.0196221;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.1828;QD=47.3411;RBI=0.0207759;REFB=-0.00896546;REVB=0.00682721;RO=14;SAF=21;SAR=76;SRF=14;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.234527;STB=0.61401;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0175909;OID=.;OPOS=63994696;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:111:111:14:13:97:98:0.882883:76:21:14:0:76:22:13:0
chr11	63997329	.	A	G	1513.39	PASS	AF=1;AO=100;DP=100;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0063585;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.034;QD=59.9361;RBI=0.0198206;REFB=0;REVB=-0.018773;RO=0;SAF=51;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.18771e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.66017e-05;OID=.;OPOS=63997329;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:100:101:0:0:100:101:1:49:51:0:0:50:51:0:0
chr11	63997338	.	T	C	1555.99	PASS	AF=1;AO=96;DP=97;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00526025;FXX=0.010203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.329;QD=64.1644;RBI=0.0458621;REFB=0;REVB=0.0455595;RO=0;SAF=50;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.54587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.96754e-05;OID=.;OPOS=63997338;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:97:97:0:0:96:97:1:46:50:0:0:47:50:0:0
chr11	64011441	.	T	C	510.16	PASS	AF=1;AO=34;DP=36;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0536532;FXX=0.0555401;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.68;QD=60.0185;RBI=0.0540014;REFB=0;REVB=0.00612215;RO=0;SAF=14;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.48532e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000279616;OID=.;OPOS=64011441;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:34:0:0:34:34:1:20:14:0:0:20:14:0:0
chr11	64012225	.	G	C	501.66	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0102798;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.043;QD=59.0187;RBI=0.0449742;REFB=0;REVB=0.0437836;RO=0;SAF=12;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.75716e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000463364;OID=.;OPOS=64012225;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:22:12:0:0:22:12:0:0
chr11	64022459	.	A	G	1046.68	PASS	AF=1;AO=57;DP=69;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0174014;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.051;QD=59.8101;RBI=0.027731;REFB=0;REVB=0.0215917;RO=0;SAF=22;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.01785e-05;OID=.;OPOS=64022459;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:70:0:0:57:70:1:35:22:0:0:40:30:0:0
chr11	64026144	.	G	A	42.04	PASS	AF=0.189189;AO=7;DP=37;FAO=7;FDP=37;FR=.;FRO=30;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=25;FWDB=-0.0636888;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.8107;QD=4.54434;RBI=0.0652778;REFB=-0.004666;REVB=0.0143155;RO=28;SAF=1;SAR=6;SRF=4;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.537201;STBP=0.906;TYPE=snp;VARB=0.013792;OID=.;OPOS=64026144;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:42:37:37:28:30:7:7:0.189189:6:1:4:24:6:1:5:25
chr11	64034911	.	G	A	145.84	PASS	AF=0.652174;AO=15;DP=23;FAO=15;FDP=23;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=0.00464518;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.856;QD=25.3639;RBI=0.0160939;REFB=-0.00112145;REVB=0.015409;RO=8;SAF=3;SAR=12;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.388585;STB=0.719678;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.000325092;OID=.;OPOS=64034911;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:23:23:8:8:15:15:0.652174:12:3:6:2:12:3:6:2
chr11	64083252	.	T	C	74.15	PASS	AF=0.20339;AO=11;DP=59;FAO=12;FDP=59;FR=.;FRO=47;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=18;FSRR=29;FWDB=-0.0118914;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.553;QD=5.02733;RBI=0.014451;REFB=-0.00329939;REVB=-0.00821137;RO=45;SAF=4;SAR=7;SRF=17;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.018675;STB=0.527813;STBP=0.873;TYPE=snp;VARB=0.0209046;OID=.;OPOS=64083252;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:59:59:45:47:11:12:0.20339:7:4:17:28:7:5:18:29
chr11	64083269	.	G	A	80.72	PASS	AF=0.244444;AO=11;DP=46;FAO=11;FDP=45;FR=.;FRO=34;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=20;FWDB=-0.00915428;FXX=0.0217344;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.3615;QD=7.17521;RBI=0.0181601;REFB=-0.0236799;REVB=0.015684;RO=33;SAF=5;SAR=6;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0367502;STB=0.532728;STBP=0.819;TYPE=snp;VARB=0.0652815;OID=.;OPOS=64083269;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:80:46:45:33:34:11:11:0.244444:6:5:14:19:6:5:14:20
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chr11	64083290	.	G	A	91.68	PASS	AF=0.285714;AO=12;DP=42;FAO=12;FDP=42;FR=.;FRO=30;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=0.00754505;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.4815;QD=8.73185;RBI=0.0174885;REFB=-0.0237639;REVB=0.0157772;RO=30;SAF=5;SAR=7;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0200891;STB=0.512275;STBP=0.937;TYPE=snp;VARB=0.0548981;OID=.;OPOS=64083290;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:91:42:42:30:30:12:12:0.285714:7:5:12:18:7:5:12:18
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chr11	64083295	.	CGGG	C	55.38	PASS	AF=0.275;AO=11;DP=40;FAO=11;FDP=40;FR=.;FRO=29;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=0.000107966;FXX=0;HRUN=3;LEN=3;MLLD=206.651;QD=5.53795;RBI=0.0203266;REFB=-0.0255582;REVB=-0.0203263;RO=28;SAF=5;SAR=6;SRF=10;SRR=18;SSEN=0.426471;SSEP=0;SSSB=0.116593;STB=0.555457;STBP=0.67;TYPE=del;VARB=0.0489703;OID=.;OPOS=64083296;OREF=GGG;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.275:11:40:11:40:29:5:6:11:18:55:28:5:6:10:18
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chr11	64083318	.	G	A	104.82	PASS	AF=0.333333;AO=13;DP=39;FAO=13;FDP=39;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=-0.0102775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.121;QD=10.751;RBI=0.0105574;REFB=7.62699e-05;REVB=0.00241474;RO=26;SAF=5;SAR=8;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0446188;STB=0.526707;STBP=0.839;TYPE=snp;VARB=-0.000775565;OID=.;OPOS=64083318;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:26:26:13:13:0.333333:8:5:11:15:8:5:11:15
chr11	64083320	.	T	C	98.46	PASS	AF=0.342857;AO=13;DP=37;FAO=12;FDP=35;FR=.;FRO=23;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=0.0240588;FXX=0.0540395;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.438;QD=11.2522;RBI=0.0276663;REFB=-0.0277281;REVB=-0.01366;RO=23;SAF=5;SAR=8;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0560947;STB=0.541596;STBP=0.758;TYPE=snp;VARB=0.0297468;OID=.;OPOS=64083320;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:37:35:23:23:13:12:0.342857:8:5:10:13:8:4:9:14
chr11	64083328	.	C	T	107.15	PASS	AF=0.382353;AO=13;DP=34;FAO=13;FDP=34;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.0298173;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.9992;QD=12.6057;RBI=0.0431181;REFB=0.00346668;REVB=0.0311464;RO=20;SAF=5;SAR=8;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.016668;STB=0.528258;STBP=0.824;TYPE=snp;VARB=-0.0045541;OID=.;OPOS=64083328;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:20:21:13:13:0.382353:8:5:8:12:8:5:9:12
chr11	64083331	.	C	T	95.06	PASS	AF=0.352941;AO=12;DP=34;FAO=12;FDP=34;FR=.;FRO=22;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.000993605;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.281;QD=11.1836;RBI=0.0130954;REFB=-0.00294229;REVB=-0.0130576;RO=21;SAF=4;SAR=8;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109101;STB=0.58319;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.0179536;OID=.;OPOS=64083331;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:34:34:21:22:12:12:0.352941:8:4:9:12:8:4:10:12
chr11	64084113	.	A	G	955.1	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00356187;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.094;QD=58.7752;RBI=0.0173488;REFB=0;REVB=0.0169792;RO=0;SAF=32;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.82821e-05;OID=.;OPOS=64084113;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:33:32:0:0:33:32:0:0
chr11	64085785	.	A	G	990.5	PASS	AF=1;AO=66;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.018853;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.949;QD=59.1343;RBI=0.0188577;REFB=0;REVB=0.0004248;RO=0;SAF=27;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.91393e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.47365e-05;OID=.;OPOS=64085785;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:66:67:1:39:27:0:0:39:28:0:0
chr11	64107735	.	G	A	150.76	PASS	AF=0.516129;AO=16;DP=30;FAO=16;FDP=31;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=4;FWDB=0.00112302;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=167.087;QD=19.4524;RBI=0.0175928;REFB=-0.0368672;REVB=-0.0175569;RO=14;SAF=7;SAR=9;SRF=11;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.281733;STB=0.640149;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.0192332;OID=.;OPOS=64107735;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:31:14:15:16:16:0.516129:9:7:11:3:9:7:11:4
chr11	64109118	.	T	G	76.69	PASS	AF=0.416667;AO=10;DP=24;FAO=10;FDP=24;FR=.;FRO=14;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.00566967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.737;QD=12.7823;RBI=0.0102674;REFB=-0.0209891;REVB=-0.00855999;RO=14;SAF=2;SAR=8;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202882;STB=0.621953;STBP=0.36;TYPE=snp;VARB=0.0243082;OID=.;OPOS=64109118;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:24:24:14:14:10:10:0.416667:8:2:5:9:8:2:5:9
chr11	64110668	.	G	A	955.84	PASS	AF=0.587097;AO=90;DP=153;FAO=91;FDP=155;FR=.;FRO=64;FSAF=31;FSAR=60;FSRF=34;FSRR=30;FWDB=-0.000296058;FXX=0.0189861;HRUN=5;LEN=1;MLLD=175.355;QD=24.6669;RBI=0.0268148;REFB=-0.0299107;REVB=0.0268132;RO=60;SAF=30;SAR=60;SRF=31;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14384;STB=0.582941;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.0227082;OID=.;OPOS=64110668;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:153:155:60:64:90:91:0.587097:60:30:31:29:60:31:34:30
chr11	64110683	.	G	C	1064.11	PASS	AF=0.62585;AO=85;DP=140;FAO=92;FDP=147;FR=.;FRO=55;FSAF=31;FSAR=61;FSRF=24;FSRR=31;FWDB=-0.0158;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.96;QD=28.9554;RBI=0.036752;REFB=-0.0266827;REVB=0.0331824;RO=55;SAF=30;SAR=55;SRF=24;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0647162;STB=0.54051;STBP=0.248;TYPE=snp;VARB=0.0215794;OID=.;OPOS=64110683;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:140:147:55:55:85:92:0.62585:55:30:24:31:61:31:24:31
chr11	64111928	.	T	C	147.09	PASS	AF=0.425;AO=15;DP=39;FAO=17;FDP=40;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=0.0114685;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.963;QD=14.7092;RBI=0.0395997;REFB=-0.0153701;REVB=0.0379027;RO=21;SAF=5;SAR=10;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507034;STBP=0.967;TYPE=snp;VARB=0.00957208;OID=.;OPOS=64111928;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:40:21:23:15:17:0.425:10:5:7:14:12:5:7:16
chr11	64116843	.	A	C	429.35	PASS	AF=1;AO=29;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.121216;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.7834;QD=57.2464;RBI=0.121317;REFB=0;REVB=0.00494438;RO=0;SAF=11;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00130375;OID=.;OPOS=64116843;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:29:30:1:18:11:0:0:18:12:0:0
chr11	64124515	.	T	C	99.63	PASS	AF=0.375;AO=11;DP=30;FAO=12;FDP=32;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=-0.0375678;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.584;QD=12.4541;RBI=0.0396845;REFB=-0.0296918;REVB=0.0127873;RO=19;SAF=6;SAR=5;SRF=5;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.296694;STB=0.624805;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=0.0653022;OID=.;OPOS=64124515;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:32:19:20:11:12:0.375:5:6:5:14:6:6:6:14
chr11	64124823	.	C	T	407.87	PASS	AF=0.518987;AO=40;DP=78;FAO=41;FDP=79;FR=.;FRO=38;FSAF=25;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=-0.00879388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.188;QD=20.6516;RBI=0.0114102;REFB=-0.0109944;REVB=-0.00727044;RO=38;SAF=25;SAR=15;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136257;STB=0.566718;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=0.0090463;OID=.;OPOS=64124823;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:79:38:38:40:41:0.518987:15:25:18:20:16:25:18:20
chr11	64124940	.	T	G	303.26	PASS	AF=0.5625;AO=23;DP=41;FAO=27;FDP=48;FR=.,HEALED;FRO=21;FSAF=5;FSAR=22;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=0.067616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=48.0661;QD=25.2713;RBI=0.202421;REFB=0.0105474;REVB=0.190794;RO=12;SAF=5;SAR=18;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.274097;STB=0.620291;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=-0.000352773;OID=.;OPOS=64124940;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:48:12:21:23:27:0.5625:18:5:7:5:22:5:8:13
chr11	64127744	.	A	G	108.02	PASS	AF=0.393939;AO=13;DP=33;FAO=13;FDP=33;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.0236085;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.8418;QD=13.0929;RBI=0.0276248;REFB=-0.00130934;REVB=-0.0143446;RO=19;SAF=9;SAR=4;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.231534;STB=0.651933;STBP=0.175;TYPE=snp;VARB=0.00224837;OID=.;OPOS=64127744;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:19:20:13:13:0.393939:4:9:9:10:4:9:9:11
chr11	64360934	.	G	A	179.5	PASS	AF=0.545455;AO=18;DP=34;FAO=18;FDP=33;FR=.;FRO=15;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=4;FWDB=-0.00867146;FXX=0.0294031;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.995;QD=21.7574;RBI=0.0241563;REFB=-0.0207539;REVB=0.0225462;RO=15;SAF=13;SAR=5;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0112405;STB=0.506322;STBP=0.977;TYPE=snp;VARB=0.0168506;OID=.;OPOS=64360934;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:33:15:15:18:18:0.545455:5:13:11:4:5:13:11:4
chr11	64367325	.	A	G	1717.39	PASS	AF=1;AO=107;DP=107;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.037714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.968;QD=60.2593;RBI=0.0394676;REFB=0;REVB=0.0116336;RO=0;SAF=52;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000100841;OID=.;OPOS=64367325;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:107:114:0:0:107:114:1:55:52:0:0:56:58:0:0
chr11	64367862	.	T	C	152.71	PASS	AF=0.357143;AO=18;DP=54;FAO=20;FDP=56;FR=.;FRO=36;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=28;FSRR=8;FWDB=0.0453288;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=35.7017;QD=10.9078;RBI=0.0454097;REFB=-0.0117572;REVB=-0.00270912;RO=35;SAF=12;SAR=6;SRF=27;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140995;STB=0.562441;STBP=0.575;TYPE=snp;VARB=0.0245667;OID=.;OPOS=64367862;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:56:35:36:18:20:0.357143:6:12:27:8:6:14:28:8
chr11	64368987	.	G	A	287.94	PASS	AF=0.5;AO=31;DP=62;FAO=31;FDP=62;FR=.;FRO=31;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=-0.0108423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.065;QD=18.5768;RBI=0.0194827;REFB=0.0105997;REVB=-0.0161871;RO=31;SAF=16;SAR=15;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0289507;STB=0.516152;STBP=0.822;TYPE=snp;VARB=-0.0112064;OID=.;OPOS=64368987;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:31:31:31:31:0.5:15:16:17:14:15:16:17:14
chr11	64415767	.	G	A	174.92	PASS	AF=0.396226;AO=20;DP=52;FAO=21;FDP=53;FR=.;FRO=32;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=21;FWDB=-0.0255276;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.6392;QD=13.2016;RBI=0.0341658;REFB=-0.0183357;REVB=-0.0227078;RO=31;SAF=9;SAR=11;SRF=11;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10265;STB=0.553023;STBP=0.572;TYPE=snp;VARB=0.0358984;OID=.;OPOS=64415767;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:53:31:32:20:21:0.396226:11:9:11:20:12:9:11:21
chr11	64496357	.	G	T	314.79	PASS	AF=0.418605;AO=32;DP=84;FAO=36;FDP=86;FR=.;FRO=50;FSAF=25;FSAR=11;FSRF=33;FSRR=17;FWDB=0.00674481;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.226;QD=14.6412;RBI=0.0559303;REFB=-0.0285621;REVB=0.0555221;RO=51;SAF=24;SAR=8;SRF=33;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135091;STB=0.523156;STBP=0.733;TYPE=snp;VARB=0.0251537;OID=.;OPOS=64496357;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:86:51:50:32:36:0.418605:8:24:33:18:11:25:33:17
chr11	64496440	.	T	G	623.25	PASS	AF=0.5;AO=63;DP=127;FAO=63;FDP=126;FR=.;FRO=63;FSAF=26;FSAR=37;FSRF=37;FSRR=26;FWDB=0.00816729;FXX=0.0078734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.911;QD=19.7856;RBI=0.00974711;REFB=-0.0116584;REVB=-0.00531992;RO=63;SAF=26;SAR=37;SRF=37;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158178;STB=0.587274;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.0159003;OID=.;OPOS=64496440;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:127:126:63:63:63:63:0.5:37:26:37:26:37:26:37:26
chr11	64507680	.	A	C	115.99	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0127938;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.0994;QD=42.1793;RBI=0.0272329;REFB=0;REVB=0.0240406;RO=0;SAF=8;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00213088;OID=.;OPOS=64507680;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:3:8:0:0:3:8:0:0
chr11	64511050	.	G	C	511.91	PASS	AF=0.509615;AO=53;DP=104;FAO=53;FDP=104;FR=.;FRO=51;FSAF=27;FSAR=26;FSRF=21;FSRR=30;FWDB=0.0156356;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.054;QD=19.6887;RBI=0.0264044;REFB=-0.039237;REVB=0.0212772;RO=51;SAF=27;SAR=26;SRF=21;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0866611;STB=0.547808;STBP=0.342;TYPE=snp;VARB=0.0276324;OID=.;OPOS=64511050;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:104:51:51:53:53:0.509615:26:27:21:30:26:27:21:30
chr11	64519062	.	T	C	143.81	PASS	AF=0.421053;AO=16;DP=37;FAO=16;FDP=38;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=16;FWDB=-0.0322544;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.815;QD=15.1378;RBI=0.0441163;REFB=-0.0587026;REVB=0.0300982;RO=21;SAF=9;SAR=7;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.267971;STB=0.663271;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.0261869;OID=.;OPOS=64519062;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:38:21:22:16:16:0.421053:7:9:6:15:7:9:6:16
chr11	64522945	.	GC	G	52.33	PASS	AF=0.317073;AO=13;DP=41;FAO=13;FDP=41;FR=.;FRO=28;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=8;FWDB=-0.0377167;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=15.0429;QD=5.10573;RBI=0.0946612;REFB=-0.0393983;REVB=-0.0868228;RO=26;SAF=2;SAR=11;SRF=19;SRR=7;SSEN=0.302763;SSEP=0;SSSB=-0.615781;STB=0.863755;STBP=0.008;TYPE=del;VARB=0.0827606;OID=.;OPOS=64522946;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.317073:13:41:13:41:28:2:11:20:8:52:26:2:11:19:7
chr11	64543927	.	G	GT	221.53	PASS	AF=0.525424;AO=30;DP=60;FAO=31;FDP=59;FR=.;FRO=28;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.124327;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=27.7233;QD=15.0192;RBI=0.125201;REFB=0.028249;REVB=0.0147747;RO=30;SAF=20;SAR=10;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157407;STB=0.572035;STBP=0.268;TYPE=ins;VARB=-0.0270859;OID=.;OPOS=64543928;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.525424:30:60:31:59:28:20:11:14:14:99:30:20:10:15:15
chr11	64559898	.	T	C	182.72	PASS	AF=0.941176;AO=16;DP=17;FAO=16;FDP=17;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0257746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.507;QD=42.9927;RBI=0.0297316;REFB=0.00216412;REVB=0.0148202;RO=0;SAF=4;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.07465e-08;STB=0.519975;STBP=0.629;TYPE=snp;VARB=0.000467124;OID=.;OPOS=64559898;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:17:17:0:1:16:16:0.941176:12:4:0:0:12:4:0:1
chr11	64572018	.	T	C	579.47	PASS	AF=1;AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0752547;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.887;QD=60.9971;RBI=0.0872838;REFB=0;REVB=0.0442174;RO=0;SAF=19;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000442098;OID=.;OPOS=64572018;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:38:0:0:38:38:1:19:19:0:0:19:19:0:0
chr11	64572557	.	A	G	747.97	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0123645;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.552;QD=63.6568;RBI=0.0505217;REFB=0;REVB=0.0489853;RO=0;SAF=30;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.31553e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000379631;OID=.;OPOS=64572557;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:47:0:0:46:47:1:16:30:0:0:17:30:0:0
chr11	64572602	.	G	A	281.41	PASS	AF=0.517241;AO=30;DP=58;FAO=30;FDP=58;FR=.;FRO=28;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=-0.00856156;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.31;QD=19.4075;RBI=0.00868694;REFB=-0.000810215;REVB=-0.00147055;RO=27;SAF=18;SAR=12;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164446;STB=0.599933;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=0.000801292;OID=.;OPOS=64572602;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:27:28:30:30:0.517241:12:18:11:16:12:18:11:17
chr11	64573750	.	G	T	360.37	PASS	AF=0.652174;AO=30;DP=47;FAO=30;FDP=46;FR=.;FRO=16;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.0216034;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.1256;QD=31.3365;RBI=0.0223043;REFB=-0.00982196;REVB=-0.00554753;RO=16;SAF=13;SAR=17;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0824192;STB=0.545159;STBP=0.391;TYPE=snp;VARB=0.00204728;OID=.;OPOS=64573750;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:46:16:16:30:30:0.652174:17:13:9:7:17:13:9:7
chr11	64597205	.	G	T	289.22	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0642753;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.8817;QD=52.5846;RBI=0.0647671;REFB=0;REVB=0.007966;RO=0;SAF=14;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00208187;OID=.;OPOS=64597205;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:8:14:0:0:8:14:0:0
chr11	64601933	.	T	C	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0325999;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.564;QD=55.6556;RBI=0.0434379;REFB=0;REVB=0.0287072;RO=0;SAF=16;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.23077e-05;OID=.;OPOS=64601933;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:11:16:0:0:11:16:0:0
chr11	64621162	.	CA	C	33.51	PASS	AF=0.340909;AO=17;DP=45;FAO=15;FDP=44;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=0.0104915;FXX=0.0222173;HRUN=7;LEN=1;MLLD=7.97293;QD=3.04647;RBI=0.0788476;REFB=-0.0944963;REVB=0.0781465;RO=24;SAF=11;SAR=6;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.234768;STB=0.555817;STBP=0.606;TYPE=del;VARB=0.0834708;OID=.;OPOS=64621163;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.340909:17:45:15:44:29:8:7:13:16:33:24:11:6:10:14
chr11	64621856	.	A	G	446.6	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00488228;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.363;QD=57.6262;RBI=0.0635763;REFB=0;REVB=0.0633885;RO=0;SAF=10;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000200767;OID=.;OPOS=64621856;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:31:0:0:29:31:1:19:10:0:0:21:10:0:0
chr11	64656757	.	G	A	445.34	PASS	AF=0.941176;AO=32;DP=34;FAO=32;FDP=34;FR=.;FRO=2;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0298703;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=49.5191;QD=52.3934;RBI=0.0684957;REFB=-0.0184694;REVB=0.0616395;RO=2;SAF=16;SAR=16;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00297417;OID=.;OPOS=64656757;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:34:34:2:2:32:32:0.941176:16:16:1:1:16:16:1:1
chr11	64677293	.	G	C	222.53	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0515476;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.0557;QD=49.4511;RBI=0.0582428;REFB=0;REVB=0.0271121;RO=0;SAF=9;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00108171;OID=.;OPOS=64677293;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:9:9:0:0:9:9:0:0
chr11	64677562	.	C	T	295.87	PASS	AF=0.516667;AO=31;DP=61;FAO=31;FDP=60;FR=.;FRO=29;FSAF=22;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=0.0215026;FXX=0.0476115;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.141;QD=19.7243;RBI=0.0234107;REFB=-0.0215366;REVB=0.00925737;RO=27;SAF=22;SAR=9;SRF=18;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0427884;STB=0.53111;STBP=0.645;TYPE=snp;VARB=0.0238714;OID=.;OPOS=64677562;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:60:27:29:31:31:0.516667:9:22:18:9:9:22:19:10
chr11	64851453	.	CT	C	455.64	PASS	AF=1;AO=38;DP=43;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0397301;FXX=0.0232504;HRUN=2;LEN=1;MLLD=26.5981;QD=43.3946;RBI=0.0397748;REFB=0;REVB=-0.00188413;RO=0;SAF=10;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.00061822;OID=.;OPOS=64851454;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:38:43:42:42:0:14:28:0:0:9:0:10:28:0:0
chr11	64852421	.	T	C	593.55	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0184849;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.3225;QD=60.8772;RBI=0.0213013;REFB=0;REVB=0.0105855;RO=0;SAF=21;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.34792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00029416;OID=.;OPOS=64852421;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:18:21:0:0:18:21:0:0
chr11	64856500	.	A	G	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0470203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.299;QD=48.7371;RBI=0.0541979;REFB=0;REVB=0.0269537;RO=0;SAF=2;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.95117e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00177497;OID=.;OPOS=64856500;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:15:2:0:0:15:2:0:0
chr11	64878661	.	T	C	530.33	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0873667;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.7961;QD=58.9254;RBI=0.0915248;REFB=0;REVB=-0.0272736;RO=0;SAF=14;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.48532e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00112016;OID=.;OPOS=64878661;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:36:0:0:34:36:1:20:14:0:0:20:16:0:0
chr11	64884052	.	G	A	905.96	PASS	AF=0.984375;AO=63;DP=64;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0156879;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=233.821;QD=56.6223;RBI=0.027289;REFB=-0.0514572;REVB=0.0223288;RO=0;SAF=38;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509801;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=0.00017902;OID=.;OPOS=64884052;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:64:64:0:1:63:63:0.984375:25:38:0:0:25:38:0:1
chr11	64895202	.	A	G	762.94	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159948;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=312.356;QD=63.5781;RBI=0.0170162;REFB=0;REVB=0.00580675;RO=0;SAF=26;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.7484e-05;OID=.;OPOS=64895202;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:48:0:0:47:48:1:21:26:0:0:21:27:0:0
chr11	64937683	.	C	T	320.79	PASS	AF=0.55;AO=33;DP=60;FAO=33;FDP=60;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.0100101;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.6762;QD=21.3857;RBI=0.0209518;REFB=-0.00929225;REVB=0.0184059;RO=27;SAF=15;SAR=18;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00828864;STB=0.504584;STBP=0.957;TYPE=snp;VARB=0.0106022;OID=.;OPOS=64937683;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:27:27:33:33:0.55:18:15:12:15:18:15:12:15
chr11	64948277	.	A	C	472.0	PASS	AF=0.485437;AO=50;DP=103;FAO=50;FDP=103;FR=.;FRO=53;FSAF=36;FSAR=14;FSRF=26;FSRR=27;FWDB=0.00886456;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.093;QD=18.33;RBI=0.00892879;REFB=0.00630505;REVB=-0.00106905;RO=53;SAF=36;SAR=14;SRF=26;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.232489;STB=0.629638;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=-0.00869258;OID=.;OPOS=64948277;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:103:53:53:50:50:0.485437:14:36:26:27:14:36:26:27
chr11	64950970	.	C	T	52.6	PASS	AF=0.258065;AO=8;DP=31;FAO=8;FDP=31;FR=.;FRO=23;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=19;FWDB=0.0182032;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.851;QD=6.78766;RBI=0.0241869;REFB=-0.00435867;REVB=-0.0159263;RO=22;SAF=4;SAR=4;SRF=4;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.385824;STB=0.741472;STBP=0.17;TYPE=snp;VARB=0.0191689;OID=.;OPOS=64950970;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:31:31:22:23:8:8:0.258065:4:4:4:18:4:4:4:19
chr11	64972286	.	G	C	554.0	PASS	AF=0.56383;AO=47;DP=89;FAO=53;FDP=94;FR=.;FRO=41;FSAF=33;FSAR=20;FSRF=28;FSRR=13;FWDB=-0.000175772;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.431;QD=23.5744;RBI=0.0136953;REFB=-0.0424499;REVB=0.0136942;RO=41;SAF=27;SAR=20;SRF=28;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0954599;STB=0.528357;STBP=0.551;TYPE=snp;VARB=0.0345045;OID=.;OPOS=64972286;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:94:41:41:47:53:0.56383:20:27:28:13:20:33:28:13
chr11	64981472	.	G	C	274.55	PASS	AF=0.527273;AO=29;DP=54;FAO=29;FDP=55;FR=.;FRO=26;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=-0.104412;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.153;QD=19.9674;RBI=0.104847;REFB=0.0197346;REVB=0.00953228;RO=25;SAF=15;SAR=14;SRF=8;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163816;STB=0.58047;STBP=0.205;TYPE=snp;VARB=-0.0203951;OID=.;OPOS=64981472;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:55:25:26:29:29:0.527273:14:15:8:17:14:15:9:17
chr11	64981522	.	C	A	203.12	PASS	AF=0.540541;AO=20;DP=37;FAO=20;FDP=37;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=4;FSRR=13;FWDB=0.0258485;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.209;QD=21.9589;RBI=0.0459704;REFB=-0.0213783;REVB=0.038015;RO=17;SAF=5;SAR=15;SRF=4;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0162001;STB=0.509082;STBP=0.948;TYPE=snp;VARB=0.0163944;OID=.;OPOS=64981522;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:17:17:20:20:0.540541:15:5:4:13:15:5:4:13
chr11	64981587	.	G	A	261.77	PASS	AF=0.5;AO=22;DP=47;FAO=25;FDP=50;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=19;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=0.0666262;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.0775;QD=20.9415;RBI=0.0668908;REFB=-0.0374943;REVB=0.00594412;RO=24;SAF=6;SAR=16;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11149;STB=0.575693;STBP=0.353;TYPE=snp;VARB=0.0316157;OID=.;OPOS=64981587;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:50:24:25:22:25:0.5:16:6:9:15:19:6:9:16
chr11	64981837	.	C	T	136.88	PASS	AF=0.5;AO=15;DP=30;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.0034542;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.837;QD=18.2507;RBI=0.01253;REFB=-0.0179506;REVB=0.0120444;RO=15;SAF=6;SAR=9;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0224125;OID=.;OPOS=64981837;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:15:15:15:15:0.5:9:6:6:9:9:6:6:9
chr11	64981853	.	G	T	101.76	PASS	AF=0.461538;AO=12;DP=27;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.0279405;FXX=0.0370233;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.4778;QD=15.6558;RBI=0.0743756;REFB=0.0524707;REVB=0.0689279;RO=15;SAF=4;SAR=8;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0692817;STB=0.514262;STBP=0.924;TYPE=snp;VARB=-0.0616533;OID=.;OPOS=64981853;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:26:15:14:12:12:0.461538:8:4:6:9:8:4:5:9
chr11	64990041	.	G	C	575.79	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0347956;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.871;QD=60.6092;RBI=0.0367982;REFB=0;REVB=0.0119738;RO=0;SAF=22;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000318985;OID=.;OPOS=64990041;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:16:22:0:0:16:22:0:0
chr11	65000719	.	C	T	465.05	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00428386;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=143.82;QD=58.1317;RBI=0.0133232;REFB=0;REVB=0.0126157;RO=0;SAF=7;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.92337e-05;OID=.;OPOS=65000719;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:25:7:0:0:25:7:0:0
chr11	65004301	.	G	T	955.7	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0354329;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.361;QD=58.8123;RBI=0.0731609;REFB=0;REVB=0.064008;RO=0;SAF=33;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000448623;OID=.;OPOS=65004301;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:65:0:0:64:65:1:31:33:0:0:32:33:0:0
chr11	65004309	.	C	T	138.32	PASS	AF=0.306452;AO=19;DP=62;FAO=19;FDP=62;FR=.;FRO=43;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=0.0305965;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.483;QD=8.92381;RBI=0.0307011;REFB=-0.0175628;REVB=-0.00253288;RO=43;SAF=9;SAR=10;SRF=22;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0442065;STB=0.526288;STBP=0.817;TYPE=snp;VARB=0.029619;OID=.;OPOS=65004309;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:43:43:19:19:0.306452:10:9:22:21:10:9:22:21
chr11	65089792	.	G	C	350.59	PASS	AF=0.9;AO=26;DP=29;FAO=27;FDP=30;FR=.;FRO=3;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.067406;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=49.752;QD=46.7454;RBI=0.123096;REFB=-0.20726;REVB=0.103;RO=3;SAF=18;SAR=8;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0057468;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0247118;OID=.;OPOS=65089792;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:29:30:3:3:26:27:0.9:8:18:2:1:9:18:2:1
chr11	65120391	.	T	C	619.91	PASS	AF=0.877551;AO=43;DP=49;FAO=43;FDP=49;FR=.;FRO=6;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0130222;FXX=0;HRUN=10;LEN=1;MLLD=223.539;QD=50.6052;RBI=0.0159966;REFB=-0.110006;REVB=-0.00929052;RO=3;SAF=22;SAR=21;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0189708;STB=0.519003;STBP=0.486;TYPE=snp;VARB=0.000794044;OID=.;OPOS=65120391;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:32:49:49:3:6:43:43:0.877551:21:22:2:1:21:22:4:2
chr11	65144075	.	T	C	557.68	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0425013;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.721;QD=60.2896;RBI=0.0425064;REFB=0;REVB=0.000658855;RO=0;SAF=9;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000190314;OID=.;OPOS=65144075;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:37:0:0:36:37:1:27:9:0:0:27:10:0:0
chr11	65180883	.	A	G	1284.0	PASS	AF=1;AO=82;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0596125;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.127;QD=61.1427;RBI=0.059926;REFB=0;REVB=0.00612181;RO=0;SAF=28;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.44411e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00163497;OID=.;OPOS=65180883;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:84:0:0:82:84:1:54:28:0:0:54:30:0:0
chr11	65339027	.	C	T	78.56	PASS	AF=0.47619;AO=10;DP=21;FAO=10;FDP=21;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.0166627;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.4153;QD=14.9629;RBI=0.0684501;REFB=0.0220063;REVB=0.0663911;RO=11;SAF=3;SAR=7;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151801;STB=0.589287;STBP=0.469;TYPE=snp;VARB=-0.0266761;OID=.;OPOS=65339027;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:21:21:11:11:10:10:0.47619:7:3:5:6:7:3:5:6
chr11	65347636	.	G	C	846.09	PASS	AF=1;AO=59;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0165886;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.8302;QD=56.4062;RBI=0.0981798;REFB=0;REVB=0.0967682;RO=0;SAF=25;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.03209e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00228355;OID=.;OPOS=65347636;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:60:60:0:0:59:60:1:34:25:0:0:35:25:0:0
chr11	65349849	.	A	T	74.96	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.109775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=47.611;QD=37.4817;RBI=0.109775;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=8;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00875774;OID=.;OPOS=65349849;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:0:8:0:0:0:8:0:0
chr11	65351074	.	G	A	801.33	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000231544;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.374;QD=57.2375;RBI=0.00841029;REFB=0;REVB=0.0084071;RO=0;SAF=36;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.57266e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.56249e-05;OID=.;OPOS=65351074;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:20:36:0:0:20:36:0:0
chr11	65380916	.	G	A	667.32	PASS	AF=0.585586;AO=64;DP=110;FAO=65;FDP=111;FR=.;FRO=46;FSAF=37;FSAR=28;FSRF=26;FSRR=20;FWDB=0.00496059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.5123;QD=24.0475;RBI=0.009932;REFB=-0.0268381;REVB=-0.00860449;RO=45;SAF=36;SAR=28;SRF=26;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0117761;STB=0.501694;STBP=0.972;TYPE=snp;VARB=0.0366935;OID=.;OPOS=65380916;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:111:45:46:64:65:0.585586:28:36:26:19:28:37:26:20
chr11	65381035	.	C	A	286.12	PASS	AF=0.535714;AO=30;DP=56;FAO=30;FDP=56;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=25;FWDB=-0.0107851;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=179.678;QD=20.4368;RBI=0.0108987;REFB=-0.00253555;REVB=0.00156953;RO=26;SAF=9;SAR=21;SRF=1;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.300455;STB=0.663375;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.00168089;OID=.;OPOS=65381035;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:26:26:30:30:0.535714:21:9:1:25:21:9:1:25
chr11	65383896	.	G	C	1339.71	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.026123;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.2038;QD=62.3122;RBI=0.0428313;REFB=0;REVB=-0.0339427;RO=0;SAF=43;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000433337;OID=.;OPOS=65383896;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:43:43:0:0:43:43:0:0
chr11	65384727	.	C	T	564.65	PASS	AF=0.55914;AO=52;DP=93;FAO=52;FDP=93;FR=.;FRO=41;FSAF=21;FSAR=31;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=0.0011735;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=265.849;QD=24.2858;RBI=0.00831315;REFB=-0.00281926;REVB=0.00822991;RO=41;SAF=21;SAR=31;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0291696;STB=0.515999;STBP=0.75;TYPE=snp;VARB=0.00216422;OID=.;OPOS=65384727;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:41:41:52:52:0.55914:31:21:18:23:31:21:18:23
chr11	65385606	.	A	G	805.19	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00544839;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.105;QD=64.4152;RBI=0.018316;REFB=0;REVB=-0.0174869;RO=0;SAF=26;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.10374e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.66793e-05;OID=.;OPOS=65385606;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:24:26:0:0:24:26:0:0
chr11	65387378	.	T	A	354.85	PASS	AF=0.521739;AO=36;DP=72;FAO=36;FDP=69;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=-0.0520789;FXX=0.0416609;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.8365;QD=20.571;RBI=0.0544024;REFB=-0.00708391;REVB=0.0157294;RO=33;SAF=16;SAR=20;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0351064;STB=0.51947;STBP=0.787;TYPE=snp;VARB=0.0182123;OID=.;OPOS=65387378;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:69:33:33:36:36:0.521739:20:16:16:17:20:16:16:17
chr11	65408937	.	C	T	170.34	PASS	AF=0.391304;AO=18;DP=45;FAO=18;FDP=46;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=20;FSRR=8;FWDB=0.0156152;FXX=0.0212721;HRUN=4;LEN=1;MLLD=48.4395;QD=14.8125;RBI=0.0271658;REFB=0.0163869;REVB=-0.0222295;RO=27;SAF=11;SAR=7;SRF=19;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104216;STB=0.567991;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.0258537;OID=.;OPOS=65408937;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:46:27:28:18:18:0.391304:7:11:19:8:7:11:20:8
chr11	65412467	.	G	A	401.76	PASS	AF=0.533333;AO=40;DP=75;FAO=40;FDP=75;FR=.;FRO=35;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=-0.0129077;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=160.021;QD=21.4273;RBI=0.0179553;REFB=-0.0382826;REVB=0.0124814;RO=34;SAF=20;SAR=20;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.024477;STB=0.506663;STBP=0.896;TYPE=snp;VARB=0.035363;OID=.;OPOS=65412467;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:34:35:40:40:0.533333:20:20:18:16:20:20:18:17
chr11	65421945	.	GGC	G,GGG	89.74	PASS	AF=0.631579,0;AO=6,4;DP=21;FAO=12,0;FDP=19;FR=.;FRO=7;FSAF=5,0;FSAR=7,0;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.177193,-0.131943;FXX=0;HRUN=4,5;LEN=2,1;MLLD=25.2829,14.3769;QD=18.8929;RBI=0.181138,0.132124;REFB=-0.105507,-0.0553067;REVB=0.0375958,0.00691114;RO=10;SAF=1,4;SAR=5,0;SRF=1;SRR=9;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.137251,0.80368;STB=0.607311,0.5;STBP=0.266,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0937231,0;OID=.,.;OPOS=65421946,65421947;OREF=GC,C;OALT=-,G;OMAPALT=G,GGG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.631579,0:6,4:21:12,0:19:7:5,0:7,0:1:6:42:10:1,4:5,0:1:9
chr11	65423082	.	G	A	1134.92	PASS	AF=0.987013;AO=74;DP=75;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0434608;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.179;QD=58.9571;RBI=0.0475387;REFB=0.0411167;REVB=0.0192637;RO=1;SAF=38;SAR=36;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0129601;STB=0.506492;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=-0.00876965;OID=.;OPOS=65423082;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:75:77:1:1:74:76:0.987013:36:38:0:1:38:38:0:1
chr11	65546857	.	A	C	319.1	PASS	AF=0.378947;AO=36;DP=95;FAO=36;FDP=95;FR=.;FRO=59;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=23;FSRR=36;FWDB=-0.0237223;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.737;QD=13.4359;RBI=0.0411079;REFB=-0.0147063;REVB=-0.0335725;RO=59;SAF=20;SAR=16;SRF=23;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17873;STB=0.601796;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=0.0317937;OID=.;OPOS=65546857;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:59:59:36:36:0.378947:16:20:23:36:16:20:23:36
chr11	65547133	.	G	A	49.59	PASS	AF=0.538462;AO=7;DP=13;FAO=7;FDP=13;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=-0.0093857;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.4533;QD=15.2581;RBI=0.0096322;REFB=-0.00179812;REVB=-0.00216513;RO=6;SAF=5;SAR=2;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.414385;STB=0.744007;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=0.000345421;OID=.;OPOS=65547133;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:13:13:6:6:7:7:0.538462:2:5:1:5:2:5:1:5
chr11	65547333	.	G	A	306.97	PASS	AF=0.361905;AO=38;DP=105;FAO=38;FDP=105;FR=.;FRO=67;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=25;FSRR=42;FWDB=-0.0260382;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.464;QD=11.6942;RBI=0.0298328;REFB=-0.00842127;REVB=0.0145606;RO=66;SAF=14;SAR=24;SRF=24;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0057057;STB=0.503224;STBP=0.98;TYPE=snp;VARB=0.0131366;OID=.;OPOS=65547333;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:105:66:67:38:38:0.361905:24:14:24:42:24:14:25:42
chr11	65547455	.	C	A	147.17	PASS	AF=0.470588;AO=16;DP=34;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=-0.00593493;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=268.695;QD=17.3145;RBI=0.00715131;REFB=-0.0016656;REVB=0.00398972;RO=18;SAF=10;SAR=6;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218222;STB=0.624844;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=0.00166252;OID=.;OPOS=65547455;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:18:18:16:16:0.470588:6:10:7:11:6:10:7:11
chr11	65563501	.	TTA	T,TT,TTT	294.91	PASS	AF=0.3125,0.291667,0;AO=11,11,8;DP=54;FAO=15,14,0;FDP=48;FR=.;FRO=19;FSAF=6,8,0;FSAR=9,6,0;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.0243674,-0.0236968,-0.0225509;FXX=0.058812;HRUN=4,1,1;LEN=2,1,1;MLLD=254.383,256.713,255.318;QD=24.5758;RBI=0.0266758,0.0261474,0.0248131;REFB=0.0258019,0.0247803,0.0236736;REVB=0.0108549,0.0110521,0.0103511;RO=21;SAF=3,6,6;SAR=8,5,2;SRF=11;SRR=10;SSEN=0.482828,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.288232,0.0237364,0.280468;STB=0.571332,0.526278,0.5;STBP=0.451,0.805,1;TYPE=del,del,snp;VARB=-0.0490975,-0.013703,-0.00480526;OID=.,.,.;OPOS=65563502,65563503,65563503;OREF=TA,A,A;OALT=-,-,T;OMAPALT=T,TT,TTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.3125,0.291667,0:11,11,8:54:15,14,0:48:19:6,8,0:9,6,0:10:9:60:21:3,6,6:8,5,2:11:10
chr11	65617113	.	AG	A	148.6	PASS	AF=1;AO=13;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.105977;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=15.4887;QD=39.626;RBI=0.24865;REFB=0;REVB=-0.224935;RO=0;SAF=10;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.00853864;OID=.;OPOS=65617114;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:13:15:15:15:0:11:4:0:0:4:0:10:3:0:0
chr11	65617750	.	C	G	249.0	PASS	AF=0.489796;AO=23;DP=50;FAO=24;FDP=49;FR=.,HEALED;FRO=25;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.0304292;FXX=0.019996;HRUN=5;LEN=1;MLLD=42.2893;QD=20.3263;RBI=0.0584372;REFB=-0.0141144;REVB=-0.0498896;RO=18;SAF=8;SAR=15;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12604;STB=0.619616;STBP=0.116;TYPE=snp;VARB=0.00835653;OID=.;OPOS=65617750;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:49:18:25:23:24:0.489796:15:8:9:9:16:8:14:11
chr11	65623519	.	G	A	282.28	PASS	AF=0.52;AO=26;DP=50;FAO=26;FDP=50;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=19;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=-0.00191893;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=112.188;QD=22.5823;RBI=0.0195321;REFB=-0.00245816;REVB=0.0194376;RO=22;SAF=7;SAR=19;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.351725;STB=0.680637;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0019215;OID=.;OPOS=65623519;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:22:24:26:26:0.52:19:7:15:7:19:7:15:9
chr11	65624934	.	A	C	360.92	PASS	AF=0.463415;AO=38;DP=80;FAO=38;FDP=82;FR=.;FRO=44;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=27;FWDB=-0.00144431;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=268.569;QD=17.6056;RBI=0.0078275;REFB=-0.00987274;REVB=0.0076931;RO=42;SAF=21;SAR=17;SRF=15;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.182243;STB=0.588489;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.00965148;OID=.;OPOS=65624934;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:82:42:44:38:38:0.463415:17:21:15:27:17:21:17:27
chr11	65628334	.	G	A	124.63	PASS	AF=0.5;AO=14;DP=28;FAO=14;FDP=28;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.0219151;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.366;QD=17.805;RBI=0.0441457;REFB=-0.0120368;REVB=0.038322;RO=14;SAF=7;SAR=7;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0117288;OID=.;OPOS=65628334;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:28:14:14:14:14:0.5:7:7:7:7:7:7:7:7
chr11	65629932	.	T	C	128.43	PASS	AF=0.340909;AO=15;DP=45;FAO=15;FDP=44;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=0.0314876;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.272;QD=11.6751;RBI=0.0316751;REFB=-0.0128401;REVB=-0.00344118;RO=30;SAF=6;SAR=9;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.076315;STB=0.532666;STBP=0.782;TYPE=snp;VARB=0.019391;OID=.;OPOS=65629932;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:44:30:29:15:15:0.340909:9:6:14:16:9:6:13:16
chr11	65629934	.	G	C	127.64	PASS	AF=0.333333;AO=15;DP=46;FAO=15;FDP=45;FR=.;FRO=30;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=0.0298121;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.0518;QD=11.3459;RBI=0.0350442;REFB=-0.020485;REVB=0.0184211;RO=30;SAF=6;SAR=9;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0385257;STB=0.522905;STBP=0.831;TYPE=snp;VARB=0.00819286;OID=.;OPOS=65629934;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:45:30:30:15:15:0.333333:9:6:13:17:9:6:13:17
chr11	65631167	.	C	T	486.03	PASS	AF=0.567901;AO=46;DP=81;FAO=46;FDP=81;FR=.;FRO=35;FSAF=31;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=0.00210113;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=255.5;QD=24.0014;RBI=0.0184601;REFB=-0.0143514;REVB=0.0183401;RO=35;SAF=31;SAR=15;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157926;STB=0.58688;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=0.0088268;OID=.;OPOS=65631167;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:35:35:46:46:0.567901:15:31:17:18:15:31:17:18
chr11	65631973	.	G	A	167.65	PASS	AF=0.391304;AO=18;DP=47;FAO=18;FDP=46;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=-0.0030259;FXX=0.0212721;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.918;QD=14.5783;RBI=0.0117138;REFB=-0.0154053;REVB=0.0113162;RO=28;SAF=10;SAR=8;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0957581;STB=0.555494;STBP=0.583;TYPE=snp;VARB=0.0234391;OID=.;OPOS=65631973;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:46:28:28:18:18:0.391304:8:10:13:15:8:10:13:15
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chr11	65636053	.	T	C	340.74	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0373252;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.146;QD=54.5177;RBI=0.0383806;REFB=0;REVB=0.00893863;RO=0;SAF=10;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000260346;OID=.;OPOS=65636053;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:15:10:0:0:15:10:0:0
chr11	65638719	.	G	A	237.11	PASS	AF=0.479167;AO=23;DP=48;FAO=23;FDP=48;FR=.;FRO=25;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.0224513;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.4369;QD=19.7591;RBI=0.0226876;REFB=-0.0157583;REVB=-0.00326604;RO=25;SAF=15;SAR=8;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0905406;STB=0.551212;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.0198151;OID=.;OPOS=65638719;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:25:25:23:23:0.479167:8:15:14:11:8:15:14:11
chr11	65639675	.	AC	A,CA	189.37	PASS	AF=0.694444,0;AO=14,2;DP=36;FAO=25,0;FDP=36;FR=.;FRO=11;FSAF=12,0;FSAR=13,0;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=0.269499,0.0203228;FXX=0;HRUN=3,1;LEN=1,2;MLLD=17.6648,79.4651;QD=21.0405;RBI=0.276301,0.127918;REFB=-0.153365,-0.0487898;REVB=-0.0609313,-0.126293;RO=18;SAF=3,0;SAR=11,2;SRF=10;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0.377643,0;SSSB=-0.366694,-0.545442;STB=0.563708,0.5;STBP=0.248,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.13016,0;OID=.,.;OPOS=65639676,65639675;OREF=C,AC;OALT=-,CA;OMAPALT=A,CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:36:36:18:11:14,2:25,0:0.694444,0:11,2:3,0:10:8:13,0:12,0:3:8
chr11	65649774	.	A	G	521.98	PASS	AF=1;AO=35;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00502658;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.2124;QD=57.9979;RBI=0.00506;REFB=0;REVB=-0.000580602;RO=1;SAF=14;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.032238;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.1719e-06;OID=.;OPOS=65649774;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:1:0:35:36:1:21:14:1:0:21:15:0:0
chr11	65649984	.	T	C	375.67	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0213051;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.954;QD=55.6542;RBI=0.0357072;REFB=0;REVB=0.0286548;RO=0;SAF=16;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000261949;OID=.;OPOS=65649984;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:11:16:0:0:11:16:0:0
chr11	65664346	.	T	C	145.07	PASS	AF=0.432432;AO=16;DP=36;FAO=16;FDP=37;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=-0.0357393;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.573;QD=15.6837;RBI=0.0410253;REFB=-0.0417668;REVB=-0.020144;RO=20;SAF=10;SAR=6;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0259529;STB=0.525516;STBP=0.778;TYPE=snp;VARB=0.0401428;OID=.;OPOS=65664346;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:37:20:21:16:16:0.432432:6:10:13:7:6:10:14:7
chr11	65684929	.	C	T	505.41	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.033548;FXX=0.0285633;HRUN=6;LEN=1;MLLD=353.438;QD=59.4596;RBI=0.0335548;REFB=0;REVB=-0.000674796;RO=0;SAF=13;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.39865e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.66236e-05;OID=.;OPOS=65684929;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:34:0:0:35:34:1:22:13:0:0:21:13:0:0
chr11	65685225	.	T	C	340.74	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0268797;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.808;QD=54.5175;RBI=0.0381349;REFB=0;REVB=-0.0270509;RO=0;SAF=7;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000468136;OID=.;OPOS=65685225;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:18:7:0:0:18:7:0:0
chr11	65713207	.	T	C	863.37	PASS	AF=1;AO=59;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00578968;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.7825;QD=57.5578;RBI=0.00635903;REFB=0;REVB=-0.00262999;RO=0;SAF=15;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000512174;OID=.;OPOS=65713207;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:59:60:1:44:15:0:0:44:16:0:0
chr11	65727301	.	A	G	212.38	PASS	AF=0.512195;AO=20;DP=41;FAO=21;FDP=41;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=4.08267e-06;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.119;QD=20.72;RBI=0.0240622;REFB=0.00432501;REVB=0.0240622;RO=19;SAF=8;SAR=12;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155274;STB=0.559384;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=-0.00655877;OID=.;OPOS=65727301;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:19:20:20:21:0.512195:12:8:11:8:12:9:11:9
chr11	65732651	.	G	A	280.89	PASS	AF=0.410256;AO=32;DP=78;FAO=32;FDP=78;FR=.;FRO=46;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=28;FWDB=0.0158896;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.632;QD=14.4047;RBI=0.0160119;REFB=-0.0318159;REVB=0.00197544;RO=45;SAF=12;SAR=20;SRF=17;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00304938;STB=0.510198;STBP=0.9;TYPE=snp;VARB=0.0386521;OID=.;OPOS=65732651;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:45:46:32:32:0.410256:20:12:17:28:20:12:18:28
chr11	65733393	.	C	T	363.23	PASS	AF=0.475;AO=38;DP=80;FAO=38;FDP=80;FR=.;FRO=42;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=20;FSRR=22;FWDB=0.0168654;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.153;QD=18.1615;RBI=0.0398462;REFB=-0.0113223;REVB=-0.0361009;RO=40;SAF=16;SAR=22;SRF=18;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0271776;STB=0.529396;STBP=0.621;TYPE=snp;VARB=0.0169045;OID=.;OPOS=65733393;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:40:42:38:38:0.475:22:16:18:22:22:16:20:22
chr11	65735174	.	G	C	60.46	PASS	AF=0.571429;AO=8;DP=14;FAO=8;FDP=14;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.00806614;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=163.277;QD=17.2755;RBI=0.0200842;REFB=-0.0361389;REVB=-0.0183932;RO=4;SAF=3;SAR=5;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0788369;STB=0.519183;STBP=0.966;TYPE=snp;VARB=0.0207233;OID=.;OPOS=65735174;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:14:14:4:6:8:8:0.571429:5:3:1:3:5:3:2:4
chr11	65788072	.	C	T	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000299756;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.822;QD=45.8067;RBI=0.00951996;REFB=0;REVB=0.00951524;RO=0;SAF=2;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.22019e-05;OID=.;OPOS=65788072;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:12:2:0:0:12:2:0:0
chr11	65790527	.	G	T	517.82	PASS	AF=0.947368;AO=36;DP=38;FAO=36;FDP=38;FR=.;FRO=2;FSAF=9;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0347171;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.679;QD=54.5073;RBI=0.0415218;REFB=-0.00698614;REVB=0.0227768;RO=2;SAF=9;SAR=27;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0334223;STB=0.517847;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.00134746;OID=.;OPOS=65790527;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:38:38:2:2:36:36:0.947368:27:9:0:2:27:9:0:2
chr11	65809875	.	C	A	990.18	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0480812;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=143.573;QD=59.1152;RBI=0.0481209;REFB=0;REVB=0.00195376;RO=0;SAF=27;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.02891e-05;OID=.;OPOS=65809875;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:40:27:0:0:40:27:0:0
chr11	65810209	.	C	T	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0433731;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.824;QD=49.599;RBI=0.0433768;REFB=0;REVB=0.000570215;RO=0;SAF=2;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000362357;OID=.;OPOS=65810209;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:16:2:0:0:16:2:0:0
chr11	65810749	.	T	C	538.55	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00398263;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.199;QD=59.8386;RBI=0.0368873;REFB=0;REVB=0.0366717;RO=0;SAF=12;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000105839;OID=.;OPOS=65810749;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:24:12:0:0:24:12:0:0
chr11	65819899	.	T	TGCC	260.41	PASS	AF=0.422535;AO=26;DP=87;FAO=30;FDP=71;FR=.;FRO=41;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=28;FSRR=13;FWDB=-0.0363919;FXX=0.0273935;HRUN=1;LEN=3;MLLD=122.479;QD=14.671;RBI=0.0438053;REFB=-0.0319881;REVB=-0.0243832;RO=56;SAF=16;SAR=10;SRF=32;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.053132;STB=0.569576;STBP=0.332;TYPE=ins;VARB=0.0358034;OID=.;OPOS=65819900;OREF=-;OALT=GCC;OMAPALT=TGCC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.422535:26:87:30:71:41:17:13:28:13:99:56:16:10:32:24
chr11	65868310	.	T	A	538.51	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0347329;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.5414;QD=59.834;RBI=0.072973;REFB=0;REVB=-0.0641769;RO=0;SAF=18;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00152068;OID=.;OPOS=65868310;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:18:18:0:0:18:18:0:0
chr11	65985000	.	A	C	533.39	PASS	AF=1;AO=32;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0232315;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=40.4047;QD=59.2653;RBI=0.0575143;REFB=0;REVB=0.0526136;RO=0;SAF=18;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00130446;OID=.;OPOS=65985000;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:32:36:1:14:18:0:0:16:20:0:0
chr11	66006668	.	C	A	106.85	PASS	AF=0.371429;AO=13;DP=35;FAO=13;FDP=35;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.0252461;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=187.55;QD=12.2113;RBI=0.0301891;REFB=-0.0231253;REVB=-0.0165535;RO=22;SAF=7;SAR=6;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0564458;STB=0.533283;STBP=0.775;TYPE=snp;VARB=0.0481171;OID=.;OPOS=66006668;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:22:22:13:13:0.371429:6:7:13:9:6:7:13:9
chr11	66010633	.	T	C	519.98	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0232993;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.458;QD=59.4259;RBI=0.0622799;REFB=0;REVB=-0.0577575;RO=0;SAF=16;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.1382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000461003;OID=.;OPOS=66010633;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:19:16:0:0:19:16:0:0
chr11	66031660	.	C	T	103.51	PASS	AF=0.545455;AO=12;DP=22;FAO=12;FDP=22;FR=.;FRO=10;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.0171805;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=170.531;QD=18.8207;RBI=0.0174373;REFB=-0.0409385;REVB=-0.00298173;RO=10;SAF=8;SAR=4;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0301131;STB=0.517213;STBP=0.909;TYPE=snp;VARB=0.0102116;OID=.;OPOS=66031660;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:22:22:10:10:12:12:0.545455:4:8:7:3:4:8:7:3
chr11	66035286	.	CA	C	699.08	PASS	AF=1;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00820078;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=48.0948;QD=62.1401;RBI=0.0424162;REFB=0;REVB=-0.0416159;RO=0;SAF=19;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.15971e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.000407278;OID=.;OPOS=66035287;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:45:46:45:45:0:19:26:0:0:4:0:19:26:0:0
chr11	66100152	.	TT	CC,CT	538.9	PASS	AF=0.0810811,0.918919;AO=3,33;DP=37;FAO=3,34;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=0,16;FSAR=3,18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0020197,-0.0626988;FXX=0.0263089;HRUN=2,2;LEN=2,1;MLLD=213.486,47.4919;QD=58.2593;RBI=0.00234127,0.086579;REFB=0,0;REVB=0.00118421,0.0597058;RO=0;SAF=0,16;SAR=3,17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-4.60901e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.015938,0.016083;OID=.,.;OPOS=66100152,66100152;OREF=TT,T;OALT=CC,C;OMAPALT=CC,CT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:14:37:37:0:0:3,33:3,34:0.0810811,0.918919:3,17:0,16:0:0:3,18:0,16:0:0
chr11	66102088	.	G	A	174.42	PASS	AF=0.5;AO=18;DP=36;FAO=18;FDP=36;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.0204085;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=134.493;QD=19.3797;RBI=0.0204252;REFB=-0.0172183;REVB=-0.000826608;RO=17;SAF=8;SAR=10;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123057;STB=0.555494;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.0122121;OID=.;OPOS=66102088;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:17:18:18:18:0.5:10:8:10:7:10:8:10:8
chr11	66107674	.	A	G	398.18	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0215951;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.38;QD=56.8835;RBI=0.0284407;REFB=0;REVB=-0.0185074;RO=0;SAF=12;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000300307;OID=.;OPOS=66107674;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:16:12:0:0:16:12:0:0
chr11	66114900	.	C	T	316.71	PASS	AF=0.367347;AO=36;DP=98;FAO=36;FDP=98;FR=.;FRO=62;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=22;FSRR=40;FWDB=0.0496591;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.3626;QD=12.9268;RBI=0.0574965;REFB=-0.00783664;REVB=0.0289796;RO=62;SAF=15;SAR=21;SRF=22;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0713342;STB=0.540758;STBP=0.567;TYPE=snp;VARB=0.0153512;OID=.;OPOS=66114900;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:62:62:36:36:0.367347:21:15:22:40:21:15:22:40
chr11	66206169	.	C	T	100.73	PASS	AF=0.48;AO=12;DP=25;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=0.037515;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.261;QD=16.1169;RBI=0.0378974;REFB=-0.0177808;REVB=0.00536977;RO=13;SAF=6;SAR=6;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103751;STB=0.559901;STBP=0.581;TYPE=snp;VARB=0.0158121;OID=.;OPOS=66206169;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:25:13:13:12:12:0.48:6:6:5:8:6:6:5:8
chr11	66240882	.	T	C	120.22	PASS	AF=0.411765;AO=14;DP=34;FAO=14;FDP=34;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=-0.0233938;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.987;QD=14.1435;RBI=0.0234134;REFB=-0.0198262;REVB=0.000959984;RO=19;SAF=6;SAR=8;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116789;STB=0.57884;STBP=0.46;TYPE=snp;VARB=0.0222295;OID=.;OPOS=66240882;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:19:20:14:14:0.411765:8:6:6:13:8:6:6:14
chr11	66254085	.	G	T	298.6	PASS	AF=0.54;AO=27;DP=50;FAO=27;FDP=50;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=-0.0132488;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.002;QD=23.8877;RBI=0.0136678;REFB=0.0155133;REVB=0.00335816;RO=23;SAF=11;SAR=16;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166278;STB=0.592524;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=-0.0127024;OID=.;OPOS=66254085;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:23:23:27:27:0.54:16:11:14:9:16:11:14:9
chr11	66272142	.	A	G	613.36	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0163403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.924;QD=61.3362;RBI=0.0227931;REFB=0;REVB=-0.0158909;RO=0;SAF=18;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.19993e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00015472;OID=.;OPOS=66272142;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:22:18:0:0:22:18:0:0
chr11	66272237	.	G	A	218.99	PASS	AF=0.567568;AO=21;DP=37;FAO=21;FDP=37;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=3;FSRR=13;FWDB=-0.0478244;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.661;QD=23.6744;RBI=0.0514113;REFB=-0.012422;REVB=0.0188667;RO=15;SAF=9;SAR=12;SRF=3;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180555;STB=0.609659;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.0147603;OID=.;OPOS=66272237;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:15:16:21:21:0.567568:12:9:3:12:12:9:3:13
chr11	66276849	.	G	A	128.23	PASS	AF=0.56;AO=13;DP=24;FAO=14;FDP=25;FR=.;FRO=11;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=-0.00891587;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.386;QD=20.5163;RBI=0.0294067;REFB=-0.0139724;REVB=0.0280225;RO=11;SAF=7;SAR=6;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00564475;STB=0.511611;STBP=0.943;TYPE=snp;VARB=0.0216824;OID=.;OPOS=66276849;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:24:25:11:11:13:14:0.56:6:7:6:5:6:8:6:5
chr11	66282095	.	G	A	131.3	PASS	AF=0.405405;AO=15;DP=37;FAO=15;FDP=37;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.00933624;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.586;QD=14.1949;RBI=0.0170345;REFB=0.000411824;REVB=0.0142481;RO=21;SAF=5;SAR=10;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151309;STB=0.576817;STBP=0.437;TYPE=snp;VARB=-0.00039786;OID=.;OPOS=66282095;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:21:22:15:15:0.405405:10:5:10:11:10:5:10:12
chr11	66327673	.	G	A	1343.43	PASS	AF=0.988636;AO=86;DP=87;FAO=87;FDP=88;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0202484;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.59;QD=61.0649;RBI=0.0408495;REFB=-0.0732045;REVB=0.0354779;RO=1;SAF=24;SAR=62;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00758154;STB=0.503936;STBP=0.594;TYPE=snp;VARB=0.000746202;OID=.;OPOS=66327673;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:87:88:1:1:86:87:0.988636:62:24:0:1:63:24:0:1
chr11	66328055	.	A	G	151.7	PASS	AF=0.377778;AO=16;DP=44;FAO=17;FDP=45;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=0.0113419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.14;QD=13.484;RBI=0.0236799;REFB=-0.0357348;REVB=0.0207869;RO=28;SAF=11;SAR=5;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0965433;STB=0.569648;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.0338695;OID=.;OPOS=66328055;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:45:28:28:16:17:0.377778:5:11:17:11:5:12:17:11
chr11	66328095	.	T	C	727.79	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00821537;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.314;QD=63.2862;RBI=0.00870366;REFB=0;REVB=0.00287424;RO=0;SAF=27;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.99145e-05;OID=.;OPOS=66328095;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:19:27:0:0:19:27:0:0
chr11	66328719	.	T	C	829.24	PASS	AF=1;AO=55;DP=56;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0287259;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.795;QD=57.189;RBI=0.0299166;REFB=0;REVB=0.00835641;RO=0;SAF=26;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.40922e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000130031;OID=.;OPOS=66328719;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:56:58:0:0:55:58:1:29:26:0:0:29:29:0:0
chr11	66328741	.	A	C	340.58	PASS	AF=0.586207;AO=34;DP=58;FAO=34;FDP=58;FR=.;FRO=24;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.03383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.613;QD=23.4879;RBI=0.0339438;REFB=-0.0297983;REVB=-0.00277716;RO=24;SAF=19;SAR=15;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0187301;STB=0.510303;STBP=0.868;TYPE=snp;VARB=0.0234617;OID=.;OPOS=66328741;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:24:24:34:34:0.586207:15:19:14:10:15:19:14:10
chr11	66329732	.	A	G	538.54	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0382272;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.823;QD=59.8378;RBI=0.0447917;REFB=0;REVB=0.0233448;RO=0;SAF=19;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000620908;OID=.;OPOS=66329732;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:17:19:0:0:17:19:0:0
chr11	66331000	.	A	G	236.6	PASS	AF=0.45;AO=27;DP=60;FAO=27;FDP=60;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=-0.00650515;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.591;QD=15.773;RBI=0.00734138;REFB=-0.00503348;REVB=-0.00340278;RO=32;SAF=11;SAR=16;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0602054;STB=0.526562;STBP=0.752;TYPE=snp;VARB=0.00651402;OID=.;OPOS=66331000;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:32:33:27:27:0.45:16:11:15:17:16:11:15:18
chr11	66331458	.	A	G	501.65	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00939535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.6801;QD=59.0178;RBI=0.0842316;REFB=0;REVB=-0.0837059;RO=0;SAF=24;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00100901;OID=.;OPOS=66331458;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:10:24:0:0:10:24:0:0
chr11	66333598	.	C	T	572.52	PASS	AF=0.975;AO=40;DP=40;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0387872;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.1648;QD=57.2521;RBI=0.0630065;REFB=-0.136879;REVB=-0.0496525;RO=0;SAF=20;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512814;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=0.00460208;OID=.;OPOS=66333598;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:40:40:0:1:40:39:0.975:20:20:0:0:20:19:1:0
chr11	66335548	.	A	G	610.63	PASS	AF=1;AO=28;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.057383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.305;QD=61.0633;RBI=0.0614998;REFB=0;REVB=0.0221229;RO=0;SAF=17;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.31638e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000282474;OID=.;OPOS=66335548;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:28:40:1:11:17:0:0:16:24:0:0
chr11	66408033	.	C	G	78.64	PASS	AF=0.47619;AO=10;DP=21;FAO=10;FDP=21;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=-0.020941;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.074;QD=14.9786;RBI=0.0214409;REFB=-0.00497027;REVB=0.00460279;RO=10;SAF=5;SAR=5;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.523762;STBP=0.851;TYPE=snp;VARB=0.00735593;OID=.;OPOS=66408033;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:21:21:10:11:10:10:0.47619:5:5:5:5:5:5:6:5
chr11	66408071	.	G	C	79.41	PASS	AF=0.5;AO=10;DP=20;FAO=10;FDP=20;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.00452933;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=298.39;QD=15.8821;RBI=0.00788969;REFB=-0.00975251;REVB=-0.00646006;RO=10;SAF=5;SAR=5;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00820399;OID=.;OPOS=66408071;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:20:20:10:10:10:10:0.5:5:5:5:5:5:5:5:5
chr11	66458980	.	G	A	369.27	PASS	AF=0.487179;AO=38;DP=78;FAO=38;FDP=78;FR=.;FRO=40;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=24;FWDB=-0.000333136;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.234;QD=18.9367;RBI=0.00787276;REFB=0.0113283;REVB=0.0078657;RO=40;SAF=20;SAR=18;SRF=16;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115888;STB=0.564483;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=-0.00850247;OID=.;OPOS=66458980;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:40:40:38:38:0.487179:18:20:16:24:18:20:16:24
chr11	66460037	.	G	A	548.2	PASS	AF=0.542553;AO=51;DP=94;FAO=51;FDP=94;FR=.;FRO=43;FSAF=21;FSAR=30;FSRF=18;FSRR=25;FWDB=0.0402435;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.3829;QD=23.3276;RBI=0.0488432;REFB=-0.0239608;REVB=0.0276788;RO=43;SAF=21;SAR=30;SRF=18;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00586626;STB=0.503225;STBP=0.956;TYPE=snp;VARB=0.0267157;OID=.;OPOS=66460037;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:43:43:51:51:0.542553:30:21:18:25:30:21:18:25
chr11	66460512	.	G	A	95.68	PASS	AF=0.363636;AO=12;DP=33;FAO=12;FDP=33;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=0.00140949;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.96;QD=11.5972;RBI=0.0026297;REFB=-0.00984319;REVB=0.00222005;RO=21;SAF=8;SAR=4;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.055847;STB=0.533277;STBP=0.803;TYPE=snp;VARB=0.0132327;OID=.;OPOS=66460512;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:33:33:21:21:12:12:0.363636:4:8:13:8:4:8:13:8
chr11	66460527	.	C	T	250.16	PASS	AF=0.605263;AO=22;DP=38;FAO=23;FDP=38;FR=.;FRO=15;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=0.021366;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.027;QD=26.3327;RBI=0.0222184;REFB=-0.0211075;REVB=-0.00609516;RO=15;SAF=15;SAR=7;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0126567;STB=0.506324;STBP=0.977;TYPE=snp;VARB=0.0133875;OID=.;OPOS=66460527;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:15:15:22:23:0.605263:7:15:10:5:8:15:10:5
chr11	66468469	.	A	G	1396.42	PASS	AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0288464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.2328;QD=62.7602;RBI=0.0334114;REFB=0;REVB=-0.0168584;RO=0;SAF=37;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.21095e-05;OID=.;OPOS=66468469;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:52:37:0:0:52:37:0:0
chr11	66837965	.	T	C	613.35	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0109146;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.319;QD=61.3352;RBI=0.0258197;REFB=0;REVB=0.0233993;RO=0;SAF=20;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000191519;OID=.;OPOS=66837965;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:20:20:0:0:20:20:0:0
chr11	66995603	.	T	C	695.87	PASS	AF=0.978261;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0125018;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.06;QD=60.5101;RBI=0.0129431;REFB=-0.055785;REVB=0.00335092;RO=1;SAF=30;SAR=15;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.030296;STB=0.516122;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=0.000225011;OID=.;OPOS=66995603;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:46:46:1:1:45:45:0.978261:15:30:0:1:15:30:0:1
chr11	67050292	.	G	A	64.46	PASS	AF=0.346154;AO=9;DP=26;FAO=9;FDP=26;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.00966623;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=252.457;QD=9.91688;RBI=0.0134946;REFB=-0.0248898;REVB=-0.00941638;RO=17;SAF=6;SAR=3;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0908725;STB=0.555429;STBP=0.727;TYPE=snp;VARB=0.040403;OID=.;OPOS=67050292;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:26:26:17:17:9:9:0.346154:3:6:10:7:3:6:10:7
chr11	67068859	.	T	C	109.89	PASS	AF=0.433333;AO=13;DP=30;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=-0.0682928;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.757;QD=14.6524;RBI=0.0683176;REFB=-0.000307474;REVB=0.00184111;RO=17;SAF=5;SAR=8;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.252173;STB=0.646244;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=-0.000902228;OID=.;OPOS=67068859;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:17:17:13:13:0.433333:8:5:11:6:8:5:11:6
chr11	67071584	.	C	G	548.12	PASS	AF=0.539216;AO=55;DP=102;FAO=55;FDP=102;FR=.;FRO=47;FSAF=12;FSAR=43;FSRF=15;FSRR=32;FWDB=0.00853062;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.8914;QD=21.4949;RBI=0.0127038;REFB=-0.0319584;REVB=-0.00941356;RO=47;SAF=12;SAR=43;SRF=15;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114608;STB=0.563294;STBP=0.22;TYPE=snp;VARB=0.0208012;OID=.;OPOS=67071584;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:47:47:55:55:0.539216:43:12:15:32:43:12:15:32
chr11	67176972	.	G	A	360.96	PASS	AF=0.571429;AO=36;DP=63;FAO=36;FDP=63;FR=.;FRO=27;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=0.00986588;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.408;QD=22.9182;RBI=0.0177045;REFB=-0.0228779;REVB=0.0147008;RO=26;SAF=22;SAR=14;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.087074;STB=0.55693;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.0164269;OID=.;OPOS=67176972;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:26:27:36:36:0.571429:14:22:13:13:14:22:13:14
chr11	67177278	.	G	A	501.65	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000828499;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.939;QD=59.018;RBI=0.0428743;REFB=0;REVB=0.0428663;RO=0;SAF=13;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000197116;OID=.;OPOS=67177278;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:21:13:0:0:21:13:0:0
chr11	67192555	.	G	A	252.92	PASS	AF=0.474576;AO=28;DP=58;FAO=28;FDP=59;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=-0.0183872;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.844;QD=17.1474;RBI=0.0194326;REFB=-0.00809024;REVB=-0.00628784;RO=30;SAF=12;SAR=16;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.066429;STB=0.546308;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=0.018839;OID=.;OPOS=67192555;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:59:30:31:28:28:0.474576:16:12:15:15:16:12:16:15
chr11	67200819	.	C	T	239.14	PASS	AF=0.490566;AO=24;DP=53;FAO=26;FDP=53;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.0230379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.6897;QD=18.0483;RBI=0.0708949;REFB=0.0080618;REVB=0.0670473;RO=27;SAF=14;SAR=10;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164399;STB=0.586041;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=-0.00726648;OID=.;OPOS=67200819;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:27:27:24:26:0.490566:10:14:11:16:11:15:11:16
chr11	67205890	.	C	A	220.89	PASS	AF=0.454545;AO=25;DP=55;FAO=25;FDP=55;FR=.;FRO=30;FSAF=18;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=0.0536312;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.469;QD=16.065;RBI=0.057616;REFB=-0.00963078;REVB=0.0210546;RO=29;SAF=18;SAR=7;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.244024;STB=0.648778;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.0117113;OID=.;OPOS=67205890;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:29:30:25:25:0.454545:7:18:14:15:7:18:14:16
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chr11	67223783	.	C	T	325.25	PASS	AF=0.477273;AO=21;DP=44;FAO=21;FDP=44;FR=.,HEALED;FRO=13;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=0.0793983;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.7407;QD=29.5685;RBI=0.0794883;REFB=0.000758269;REVB=0.003782;RO=12;SAF=11;SAR=10;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0701954;STB=0.553022;STBP=0.436;TYPE=snp;VARB=-0.0257907;OID=.;OPOS=67223783;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:12:13:21:21:0.477273:10:11:5:7:10:11:5:8
chr11	67257037	.	C	T	261.71	PASS	AF=0.47541;AO=29;DP=61;FAO=29;FDP=61;FR=.;FRO=32;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=0.00343519;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.1623;QD=17.1612;RBI=0.00767037;REFB=-0.000273482;REVB=-0.00685814;RO=32;SAF=16;SAR=13;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1353;STB=0.575876;STBP=0.277;TYPE=snp;VARB=0.000212163;OID=.;OPOS=67257037;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:32:32:29:29:0.47541:13:16:13:19:13:16:13:19
chr11	67257823	.	C	A	447.01	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0863415;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.6958;QD=57.6782;RBI=0.0888047;REFB=0;REVB=-0.0207709;RO=0;SAF=11;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00148593;OID=.;OPOS=67257823;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:20:11:0:0:20:11:0:0
chr11	67258391	.	A	G	386.58	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00679239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.118;QD=55.2254;RBI=0.0114698;REFB=0;REVB=0.00924227;RO=0;SAF=9;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000657296;OID=.;OPOS=67258391;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:28:0:0:27:28:1:18:9:0:0:19:9:0:0
chr11	67263767	.	A	G	232.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0149191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.83;QD=48.8836;RBI=0.0433535;REFB=0;REVB=0.0407056;RO=0;SAF=14;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000234637;OID=.;OPOS=67263767;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:19:0:0:18:19:1:4:14:0:0:4:15:0:0
chr11	67352689	.	A	G	343.21	PASS	AF=0.596491;AO=34;DP=57;FAO=34;FDP=57;FR=.;FRO=23;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=-0.0144087;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.786;QD=24.0851;RBI=0.0175975;REFB=-0.0118034;REVB=-0.0101025;RO=23;SAF=18;SAR=16;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0693769;STB=0.538122;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=0.00517997;OID=.;OPOS=67352689;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:23:23:34:34:0.596491:16:18:10:13:16:18:10:13
chr11	67353970	.	T	C	221.87	PASS	AF=0.458333;AO=22;DP=48;FAO=22;FDP=48;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=19;FWDB=-0.00581812;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.4432;QD=18.4894;RBI=0.00725733;REFB=0.00667548;REVB=-0.00433801;RO=26;SAF=8;SAR=14;SRF=7;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100855;STB=0.556912;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=-0.00479721;OID=.;OPOS=67353970;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:26:26:22:22:0.458333:14:8:7:19:14:8:7:19
chr11	67372477	.	G	T	330.14	PASS	AF=0.666667;AO=28;DP=42;FAO=28;FDP=42;FR=.;FRO=14;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.00629024;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=248.799;QD=31.4415;RBI=0.0202216;REFB=-0.0255777;REVB=-0.0192183;RO=14;SAF=12;SAR=16;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0440104;STB=0.524121;STBP=0.682;TYPE=snp;VARB=0.0163509;OID=.;OPOS=67372477;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:14:14:28:28:0.666667:16:12:7:7:16:12:7:7
chr11	67395456	.	A	T	69.62	PASS	AF=0.529412;AO=9;DP=17;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.0131571;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.894;QD=16.3806;RBI=0.0437512;REFB=-0.000452092;REVB=-0.041726;RO=8;SAF=5;SAR=4;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0571344;STB=0.53326;STBP=0.835;TYPE=snp;VARB=0.000197989;OID=.;OPOS=67395456;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:17:17:8:8:9:9:0.529412:4:5:5:3:4:5:5:3
chr11	67395714	.	C	T	320.68	PASS	AF=0.443038;AO=35;DP=79;FAO=35;FDP=79;FR=.;FRO=44;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=0.0551233;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.7051;QD=16.237;RBI=0.0553664;REFB=-0.0213327;REVB=0.00518307;RO=44;SAF=19;SAR=16;SRF=22;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0425394;STB=0.523934;STBP=0.748;TYPE=snp;VARB=0.0277107;OID=.;OPOS=67395714;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:44:44:35:35:0.443038:16:19:22:22:16:19:22:22
chr11	67402362	.	T	G	106.3	PASS	AF=0.361111;AO=12;DP=35;FAO=13;FDP=36;FR=.;FRO=23;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=-0.0149365;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.547;QD=11.8111;RBI=0.0153071;REFB=-0.00525098;REVB=-0.00334762;RO=22;SAF=3;SAR=9;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0923577;STB=0.502509;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00622967;OID=.;OPOS=67402362;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:36:22:23:12:13:0.361111:9:3:7:15:9:4:7:16
chr11	67430698	.	G	A	476.77	PASS	AF=0.479592;AO=47;DP=98;FAO=47;FDP=98;FR=.;FRO=51;FSAF=19;FSAR=28;FSRF=27;FSRR=24;FWDB=0.00821339;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.009;QD=19.46;RBI=0.00830273;REFB=-0.0105399;REVB=-0.0012147;RO=51;SAF=19;SAR=28;SRF=27;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118434;STB=0.565877;STBP=0.204;TYPE=snp;VARB=0.00973365;OID=.;OPOS=67430698;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:51:51:47:47:0.479592:28:19:27:24:28:19:27:24
chr11	67430762	.	T	C	376.34	PASS	AF=0.541667;AO=37;DP=70;FAO=39;FDP=72;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=-0.0218949;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.238;QD=20.9079;RBI=0.0426788;REFB=0.00418648;REVB=0.0366346;RO=32;SAF=16;SAR=21;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00432378;STB=0.520807;STBP=0.709;TYPE=snp;VARB=-0.00241497;OID=.;OPOS=67430762;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:72:32:33:37:39:0.541667:21:16:14:18:23:16:15:18
chr11	67431914	.	G	A	430.19	PASS	AF=0.552632;AO=42;DP=76;FAO=42;FDP=76;FR=.;FRO=34;FSAF=13;FSAR=29;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=-0.0223209;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.136;QD=22.6417;RBI=0.0229529;REFB=-0.00794323;REVB=0.0053489;RO=34;SAF=13;SAR=29;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118483;STB=0.565427;STBP=0.217;TYPE=snp;VARB=0.00571971;OID=.;OPOS=67431914;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:34:34:42:42:0.552632:29:13:15:19:29:13:15:19
chr11	67432804	.	T	C	613.36	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0297401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.734;QD=61.3363;RBI=0.0418304;REFB=0;REVB=0.029416;RO=0;SAF=24;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000174349;OID=.;OPOS=67432804;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:16:24:0:0:16:24:0:0
chr11	67432854	.	T	C	673.64	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.020127;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.6306;QD=62.664;RBI=0.055164;REFB=0;REVB=0.0513612;RO=0;SAF=28;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000294219;OID=.;OPOS=67432854;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:15:28:0:0:15:28:0:0
chr11	67433869	.	C	T	39.61	PASS	AF=0.5;AO=6;DP=12;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.089626;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.861;QD=13.2049;RBI=0.0917228;REFB=-0.0138505;REVB=0.0195003;RO=6;SAF=3;SAR=3;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0247629;OID=.;OPOS=67433869;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:12:12:6:6:6:6:0.5:3:3:3:3:3:3:3:3
chr11	67434416	.	C	A	125.85	PASS	AF=0.518519;AO=14;DP=27;FAO=14;FDP=27;FR=.;FRO=13;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.00347485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=349.579;QD=18.645;RBI=0.0208768;REFB=0.00502042;REVB=0.0205856;RO=13;SAF=10;SAR=4;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165626;STB=0.595095;STBP=0.342;TYPE=snp;VARB=-0.00423025;OID=.;OPOS=67434416;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:13:13:14:14:0.518519:4:10:7:6:4:10:7:6
chr11	67564197	.	T	C	613.17	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0369427;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.4953;QD=61.3168;RBI=0.0429284;REFB=0;REVB=0.0218652;RO=0;SAF=26;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000472191;OID=.;OPOS=67564197;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:14:26:0:0:14:26:0:0
chr11	67564238	.	C	T	313.46	PASS	AF=0.96;AO=23;DP=24;FAO=24;FDP=25;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0407205;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=146.609;QD=50.153;RBI=0.046295;REFB=-0.147258;REVB=0.0220243;RO=1;SAF=15;SAR=8;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0543643;STB=0.526294;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=0.00248472;OID=.;OPOS=67564238;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:24:25:1:1:23:24:0.96:8:15:0:1:9:15:0:1
chr11	67564241	.	C	T	340.67	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0869561;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.0404;QD=54.5069;RBI=0.0873464;REFB=0;REVB=-0.00824786;RO=0;SAF=15;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000828636;OID=.;OPOS=67564241;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:10:15:0:0:10:15:0:0
chr11	67572698	.	G	T	526.37	PASS	AF=0.972973;AO=28;DP=37;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0334609;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=162.108;QD=56.905;RBI=0.0373215;REFB=-0.054355;REVB=0.0165305;RO=0;SAF=19;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.62669e-08;STB=0.512188;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.000462859;OID=.;OPOS=67572698;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:37:37:0:1:28:36:0.972973:9:19:0:0:16:20:1:0
chr11	67663113	.	G	A	95.33	PASS	AF=0.909091;AO=10;DP=11;FAO=10;FDP=11;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0154142;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.168;QD=34.6656;RBI=0.0164242;REFB=0.0337111;REVB=0.00567078;RO=1;SAF=3;SAR=7;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0596689;STB=0.533268;STBP=0.621;TYPE=snp;VARB=-0.00124097;OID=.;OPOS=67663113;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:11:11:1:1:10:10:0.909091:7:3:0:1:7:3:0:1
chr11	67663116	.	T	A	115.99	PASS	AF=1;AO=10;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00106592;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.576;QD=42.1794;RBI=0.0731075;REFB=0;REVB=0.0730998;RO=0;SAF=3;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00211387;OID=.;OPOS=67663116;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:10:11:1:7:3:0:0:8:3:0:0
chr11	67765163	.	A	AG	576.57	PASS	AF=1;AO=47;DP=53;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0896264;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=20.3563;QD=44.3511;RBI=0.0955659;REFB=0;REVB=0.0331654;RO=5;SAF=30;SAR=17;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00745496;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00255578;OID=.;OPOS=67765164;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:47:53:52:52:0:33:19:0:0:10:5:30:17:3:2
chr11	67786064	.	A	AC,C	869.6	PASS	AF=1,0;AO=56,5;DP=68;FAO=61,0;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=20,0;FSAR=41,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0239897,-0.154356;FXX=0.102926;HRUN=1,2;LEN=1,1;MLLD=26.1104,6.28487;QD=57.0232;RBI=0.0505533,0.191519;REFB=0,0;REVB=-0.0444986,-0.113373;RO=7;SAF=17,3;SAR=39,2;SRF=1;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0403512,0.413035;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=-0.00151779,0;OID=.,.;OPOS=67786065,67786064;OREF=-,A;OALT=C,C;OMAPALT=AC,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:68:61:7:0:56,5:61,0:1,0:39,2:17,3:1:6:41,0:20,0:0:0
chr11	67789293	.	G	GC	545.05	PASS	AF=1;AO=44;DP=52;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0467715;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=29.1847;QD=46.387;RBI=0.0502734;REFB=0;REVB=-0.018435;RO=5;SAF=15;SAR=29;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0942728;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00211206;OID=.;OPOS=67789294;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:44:52:47:47:0:16:31:0:0:10:5:15:29:4:1
chr11	67790188	.	G	A	398.8	PASS	AF=0.58209;AO=39;DP=67;FAO=39;FDP=67;FR=.;FRO=28;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=9;FSRR=19;FWDB=0.027549;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.2394;QD=23.8089;RBI=0.0746667;REFB=0.0295384;REVB=0.0693986;RO=28;SAF=17;SAR=22;SRF=9;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0898302;STB=0.549227;STBP=0.386;TYPE=snp;VARB=-0.0192067;OID=.;OPOS=67790188;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:28:28:39:39:0.58209:22:17:9:19:22:17:9:19
chr11	67795378	.	G	GC	198.04	PASS	AF=1;AO=17;DP=22;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0172399;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=16.5052;QD=41.6933;RBI=0.094921;REFB=0;REVB=0.0933423;RO=5;SAF=6;SAR=11;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188832;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00776901;OID=.;OPOS=67795379;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:17:22:19:19:0:7:12:0:0:4:5:6:11:4:1
chr11	67814979	.	G	C	1319.65	PASS	AF=0.966667;AO=87;DP=90;FAO=87;FDP=90;FR=.;FRO=3;FSAF=42;FSAR=45;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0177722;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.6348;QD=58.6511;RBI=0.0457554;REFB=-0.121963;REVB=-0.0421628;RO=3;SAF=42;SAR=45;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0116154;STB=0.506134;STBP=0.485;TYPE=snp;VARB=0.0032021;OID=.;OPOS=67814979;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:90:90:3:3:87:87:0.966667:45:42:2:1:45:42:2:1
chr11	67957518	.	A	T	767.1	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0315967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.455;QD=63.9246;RBI=0.0341989;REFB=0;REVB=0.0130849;RO=0;SAF=13;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.94744e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000150267;OID=.;OPOS=67957518;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:48:0:0:46:48:1:33:13:0:0:34:14:0:0
chr11	68030173	.	C	A	300.35	PASS	AF=0.5625;AO=27;DP=49;FAO=27;FDP=48;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0156429;FXX=0.020404;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.2579;QD=25.0293;RBI=0.0307391;REFB=-0.0236767;REVB=-0.0264612;RO=21;SAF=11;SAR=16;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0930916;STB=0.551685;STBP=0.446;TYPE=snp;VARB=0.0180272;OID=.;OPOS=68030173;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:48:21:21:27:27:0.5625:16:11:11:10:16:11:11:10
chr11	68171013	.	T	C	1753.37	PASS	AF=0.952;AO=119;DP=125;FAO=119;FDP=125;FR=.;FRO=6;FSAF=52;FSAR=67;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.00799721;FXX=0.00793588;HRUN=5;LEN=1;MLLD=124.397;QD=56.1077;RBI=0.0107017;REFB=-0.242626;REVB=0.00711127;RO=1;SAF=52;SAR=67;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00703708;STB=0.51117;STBP=0.278;TYPE=snp;VARB=0.000753318;OID=.;OPOS=68171013;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:125:125:1:6:119:119:0.952:67:52:0:1:67:52:4:2
chr11	68192690	.	G	A	982.5	PASS	AF=0.985507;AO=63;DP=64;FAO=68;FDP=69;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0217301;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.128;QD=56.9566;RBI=0.0332716;REFB=-0.0906319;REVB=0.0251952;RO=1;SAF=33;SAR=30;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0154807;STB=0.50704;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.000476803;OID=.;OPOS=68192690;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:64:69:1:1:63:68:0.985507:30:33:0:1:35:33:0:1
chr11	68549340	.	A	G	1094.04	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0170008;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=149.148;QD=59.9476;RBI=0.045917;REFB=0;REVB=0.0426538;RO=0;SAF=41;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000166758;OID=.;OPOS=68549340;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:32:41:0:0:32:41:0:0
chr11	68704270	.	A	G	252.76	PASS	AF=0.5;AO=24;DP=48;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=-0.00368014;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.5754;QD=21.0636;RBI=0.0164265;REFB=-0.00425883;REVB=-0.0160089;RO=23;SAF=6;SAR=18;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149457;STB=0.576855;STBP=0.345;TYPE=snp;VARB=0.00463495;OID=.;OPOS=68704270;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:23:24:24:24:0.5:18:6:9:14:18:6:9:15
chr11	68773298	.	C	T	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0171193;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.023;QD=33.4283;RBI=0.131106;REFB=0;REVB=0.129983;RO=0;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00520525;OID=.;OPOS=68773298;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:2:4:0:0:2:4:0:0
chr11	68777183	.	G	T	87.3	PASS	AF=0.34375;AO=11;DP=34;FAO=11;FDP=32;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0195959;FXX=0.0588062;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.4308;QD=10.9119;RBI=0.0214607;REFB=-0.00776845;REVB=-0.00875;RO=19;SAF=7;SAR=4;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120689;STB=0.576329;STBP=0.547;TYPE=snp;VARB=0.0205997;OID=.;OPOS=68777183;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:34:32:19:21:11:11:0.34375:4:7:10:9:4:7:11:10
chr11	68822739	.	T	C	922.65	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000885568;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.974;QD=57.6653;RBI=0.0661897;REFB=0;REVB=0.0661838;RO=0;SAF=29;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.73709e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.65402e-05;OID=.;OPOS=68822739;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:64:0:0:60:64:1:31:29:0:0:34:30:0:0
chr11	68834968	.	T	C	636.58	PASS	AF=1;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0102191;FXX=0.0238039;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.56;QD=62.105;RBI=0.0216715;REFB=0;REVB=0.0191108;RO=0;SAF=24;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.2194e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000985606;OID=.;OPOS=68834968;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:41:0:0:41:41:1:17:24:0:0:17:24:0:0
chr11	68840160	.	A	G	291.6	PASS	AF=0.516667;AO=31;DP=60;FAO=31;FDP=60;FR=.;FRO=29;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=-0.00445025;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=287.441;QD=19.4401;RBI=0.00445083;REFB=-0.00118468;REVB=7.17984e-05;RO=29;SAF=17;SAR=14;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0571282;STB=0.531802;STBP=0.638;TYPE=snp;VARB=0.00110697;OID=.;OPOS=68840160;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:29:29:31:31:0.516667:14:17:14:15:14:17:14:15
chr11	68840412	.	C	G	36.87	PASS	AF=0.315789;AO=6;DP=19;FAO=6;FDP=19;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.0132323;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.27;QD=7.76195;RBI=0.0425644;REFB=-0.0162329;REVB=-0.0404554;RO=13;SAF=3;SAR=3;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0414775;STB=0.526228;STBP=0.937;TYPE=snp;VARB=0.0376311;OID=.;OPOS=68840412;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:19:19:13:13:6:6:0.315789:3:3:6:7:3:3:6:7
chr11	68851414	.	T	C	919.43	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00778847;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.906;QD=58.3766;RBI=0.0176107;REFB=0;REVB=-0.0157949;RO=0;SAF=34;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.06768e-05;OID=.;OPOS=68851414;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:29:34:0:0:29:34:0:0
chr11	68851466	.	G	T	305.98	PASS	AF=0.5;AO=31;DP=64;FAO=33;FDP=66;FR=.;FRO=33;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=0.0204052;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.928;QD=18.5441;RBI=0.0489415;REFB=-0.0204973;REVB=0.0444848;RO=30;SAF=18;SAR=13;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0175867;STB=0.51575;STBP=0.815;TYPE=snp;VARB=0.0162354;OID=.;OPOS=68851466;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:66:30:33:31:33:0.5:13:18:18:12:13:20:19:14
chr11	68855363	.	G	A	853.78	PASS	AF=0.505882;AO=86;DP=170;FAO=86;FDP=170;FR=.;FRO=84;FSAF=43;FSAR=43;FSRF=42;FSRR=42;FWDB=-0.0111396;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=169.188;QD=20.0888;RBI=0.0118227;REFB=-0.0201947;REVB=-0.00396038;RO=82;SAF=43;SAR=43;SRF=42;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0108394;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0159567;OID=.;OPOS=68855363;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:170:170:82:84:86:86:0.505882:43:43:42:40:43:43:42:42
chr11	69063136	.	C	T	773.22	PASS	AF=0.982143;AO=55;DP=57;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0127705;FXX=0.0175408;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.5202;QD=55.2302;RBI=0.0299877;REFB=-0.0868756;REVB=0.0271326;RO=1;SAF=27;SAR=28;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0165384;STB=0.508769;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.000901863;OID=.;OPOS=69063136;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:57:56:1:1:55:55:0.982143:28:27:0:1:28:27:0:1
chr11	69063393	.	T	C	488.88	PASS	AF=1;AO=33;DP=34;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0479469;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.527;QD=59.2578;RBI=0.0490944;REFB=0;REVB=0.0105524;RO=0;SAF=14;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.71297e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000272483;OID=.;OPOS=69063393;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:33:0:0:33:33:1:19:14:0:0:19:14:0:0
chr11	69063572	.	A	G	447.03	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0469497;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.546;QD=57.6807;RBI=0.0478698;REFB=0;REVB=0.00934024;RO=0;SAF=15;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000202556;OID=.;OPOS=69063572;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:16:15:0:0:16:15:0:0
chr11	69063984	.	C	A,T	970.06	PASS	AF=0.0447761,0.955224;AO=3,63;DP=66;FAO=3,64;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=0,40;FSAR=3,24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00208119,0.0435921;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=176.543,54.7955;QD=57.9142;RBI=0.00334153,0.0489763;REFB=0,0;REVB=-0.00261428,-0.0223251;RO=0;SAF=0,39;SAR=3,24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-5.51964e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.211431,-0.00370278;OID=.,.;OPOS=69063984,69063984;OREF=C,C;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:10:66:67:0:0:3,63:3,64:0.0447761,0.955224:3,24:0,39:0:0:3,24:0,40:0:0
chr11	69462910	.	G	A	628.84	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0202041;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.156;QD=61.35;RBI=0.0217978;REFB=0;REVB=-0.00818145;RO=0;SAF=26;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.87138e-05;OID=.;OPOS=69462910;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:41:0:0:40:41:1:14:26:0:0:15:26:0:0
chr11	69588020	.	C	T	349.89	PASS	AF=0.468354;AO=37;DP=79;FAO=37;FDP=79;FR=.;FRO=42;FSAF=32;FSAR=5;FSRF=28;FSRR=14;FWDB=0.00215631;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=254.615;QD=17.7159;RBI=0.00425449;REFB=-0.0191757;REVB=-0.00366756;RO=42;SAF=32;SAR=5;SRF=28;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.297598;STB=0.669496;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.0230682;OID=.;OPOS=69588020;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:42:42:37:37:0.468354:5:32:28:14:5:32:28:14
chr11	70007311	.	A	G	781.53	PASS	AF=1;AO=53;DP=54;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00375256;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.1177;QD=56.8389;RBI=0.0556723;REFB=0;REVB=-0.0555457;RO=1;SAF=25;SAR=28;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0184728;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000697466;OID=.;OPOS=70007311;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:55:1:0:53:55:1:28:25:1:0:28:27:0:0
chr11	70007392	.	A	G	880.73	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.034738;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.822;QD=57.753;RBI=0.0350213;REFB=0;REVB=0.00444534;RO=0;SAF=28;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000175714;OID=.;OPOS=70007392;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:33:28:0:0:33:28:0:0
chr11	70016247	.	T	G,TG	967.92	PASS	AF=0,1;AO=6,60;DP=87;FAO=0,82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=0,37;FSAR=0,45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0464446,0.0542856;FXX=0.0238067;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=5.663,17.0637;QD=47.2156;RBI=0.0464944,0.177736;REFB=0,0;REVB=0.00215065,0.169243;RO=18;SAF=1,31;SAR=5,29;SRF=4;SRR=14;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.102181,0.126392;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,ins;VARB=0,0.000972404;OID=.,.;OPOS=70016247,70016248;OREF=T,-;OALT=G,G;OMAPALT=G,TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	2/2:5:87:82:18:0:6,60:0,82:0,1:5,29:1,31:4:14:0,45:0,37:0:0
chr11	70709559	.	C	T	344.06	PASS	AF=0.435294;AO=37;DP=85;FAO=37;FDP=85;FR=.;FRO=48;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=28;FWDB=0.00402682;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.788;QD=16.1909;RBI=0.0156016;REFB=-0.0126228;REVB=0.015073;RO=47;SAF=19;SAR=18;SRF=20;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0874112;STB=0.554539;STBP=0.406;TYPE=snp;VARB=0.0146674;OID=.;OPOS=70709559;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:47:48:37:37:0.435294:18:19:20:27:18:19:20:28
chr11	71146248	.	AAGCAAGGAACAG	A	367.71	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00414756;FXX=0;HRUN=4;LEN=12;MLLD=425.402;QD=47.4468;RBI=0.0174087;REFB=0;REVB=0.0169074;RO=0;SAF=17;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.63861e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=2.72997e-05;OID=.;OPOS=71146249;OREF=AGCAAGGAACAG;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:30:30:31:31:0:17:14:0:0:7:0:17:13:0:0
chr11	71146691	.	A	G	919.98	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0144066;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.341;QD=58.4112;RBI=0.0145398;REFB=0;REVB=-0.00196381;RO=0;SAF=29;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.85645e-05;OID=.;OPOS=71146691;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:34:29:0:0:34:29:0:0
chr11	71146952	.	G	A	888.57	PASS	AF=0.984127;AO=62;DP=63;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00455308;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=303.732;QD=56.4171;RBI=0.0320999;REFB=0.128786;REVB=0.0317753;RO=1;SAF=40;SAR=22;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0209743;STB=0.511108;STBP=0.291;TYPE=snp;VARB=-0.000162083;OID=.;OPOS=71146952;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:63:63:1:1:62:62:0.984127:22:40:0:1:22:40:0:1
chr11	71152461	.	A	G	920.06	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00884501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.5539;QD=58.4167;RBI=0.0121832;REFB=0;REVB=0.00837828;RO=0;SAF=19;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.08994e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000149526;OID=.;OPOS=71152461;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:44:19:0:0:44:19:0:0
chr11	71155129	.	G	A	648.54	PASS	AF=0.537815;AO=64;DP=119;FAO=64;FDP=119;FR=.;FRO=55;FSAF=40;FSAR=24;FSRF=31;FSRR=24;FWDB=0.00333051;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=293.524;QD=21.7997;RBI=0.00598624;REFB=0.00131479;REVB=0.00497421;RO=55;SAF=40;SAR=24;SRF=31;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0542653;STB=0.529792;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=-0.000999211;OID=.;OPOS=71155129;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:119:55:55:64:64:0.537815:24:40:31:24:24:40:31:24
chr11	71155153	.	A	G	1623.46	PASS	AF=1;AO=106;DP=106;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0150827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.2907;QD=60.1282;RBI=0.0184484;REFB=0;REVB=-0.0106233;RO=0;SAF=64;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.79622e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.3858e-06;OID=.;OPOS=71155153;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:106:108:0:0:106:108:1:42:64:0:0:43:65:0:0
chr11	71174553	.	C	T	476.5	PASS	AF=0.9;AO=33;DP=42;FAO=36;FDP=40;FR=.;FRO=4;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0511189;FXX=0.0476077;HRUN=4;LEN=1;MLLD=77.1596;QD=47.6502;RBI=0.0590075;REFB=-0.0324244;REVB=0.0294746;RO=0;SAF=17;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.60901e-08;STB=0.552602;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.00206819;OID=.;OPOS=71174553;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:19:42:40:0:4:33:36:0.9:16:17:0:0:17:19:0:4
chr11	71184678	.	A	C	1864.21	PASS	AF=0.984127;AO=123;DP=126;FAO=124;FDP=126;FR=.;FRO=2;FSAF=56;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0497878;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.256;QD=59.1812;RBI=0.0541115;REFB=-0.047538;REVB=0.0211952;RO=2;SAF=55;SAR=68;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0137669;STB=0.507245;STBP=0.237;TYPE=snp;VARB=0.00125529;OID=.;OPOS=71184678;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:126:126:2:2:123:124:0.984127:68:55:0:2:68:56:0:2
chr11	71185479	.	T	C	1249.18	PASS	AF=1;AO=81;DP=82;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0284431;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.928;QD=61.6877;RBI=0.0394211;REFB=0;REVB=0.027295;RO=0;SAF=39;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000123648;OID=.;OPOS=71185479;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:81:0:0:81:81:1:42:39:0:0:42:39:0:0
chr11	71185518	.	T	C	1525.6	PASS	AF=1;AO=102;DP=102;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00450611;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.839;QD=59.8275;RBI=0.0194797;REFB=0;REVB=0.0189513;RO=0;SAF=47;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.05013e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.47368e-05;OID=.;OPOS=71185518;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:102:102:0:0:102:102:1:55:47:0:0:55:47:0:0
chr11	71189436	.	T	C	760.36	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0110881;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=313.863;QD=63.363;RBI=0.0113512;REFB=0;REVB=0.00242981;RO=0;SAF=24;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.31684e-05;OID=.;OPOS=71189436;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:48:0:0:47:48:1:23:24:0:0:24:24:0:0
chr11	71239086	.	C	A	740.43	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0609916;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.634;QD=56.9562;RBI=0.0616838;REFB=0;REVB=0.00921513;RO=0;SAF=20;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.00761e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000239398;OID=.;OPOS=71239086;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:32:20:0:0:32:20:0:0
chr11	71249386	.	T	C	88.22	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0986262;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.651;QD=39.2068;RBI=0.0999375;REFB=0;REVB=0.0161366;RO=0;SAF=3;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00199337;OID=.;OPOS=71249386;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:6:3:0:0:6:3:0:0
chr11	71259822	.	A	G	112.0	PASS	AF=0.28;AO=14;DP=50;FAO=14;FDP=50;FR=.;FRO=36;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=-0.0273152;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.872;QD=8.95962;RBI=0.0560988;REFB=-0.0159685;REVB=-0.0489996;RO=36;SAF=9;SAR=5;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.264727;STB=0.66079;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.0504447;OID=.;OPOS=71259822;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:36:36:14:14:0.28:5:9:15:21:5:9:15:21
chr11	71260243	.	T	C	358.13	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000994643;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.331;QD=55.0974;RBI=0.0233837;REFB=0;REVB=0.0233625;RO=0;SAF=16;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.71087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000139274;OID=.;OPOS=71260243;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:10:16:0:0:10:16:0:0
chr11	71260296	.	G	A	132.7	PASS	AF=0.428571;AO=15;DP=35;FAO=15;FDP=35;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=5;FWDB=-0.00608794;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.833;QD=15.1657;RBI=0.0359029;REFB=0.0294834;REVB=-0.035383;RO=20;SAF=6;SAR=9;SRF=15;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.335542;STB=0.692071;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=-0.040987;OID=.;OPOS=71260296;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:20:20:15:15:0.428571:9:6:15:5:9:6:15:5
chr11	71260348	.	T	A	136.87	PASS	AF=0.5;AO=15;DP=30;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=-0.0249599;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.157;QD=18.2499;RBI=0.0316876;REFB=-0.0118179;REVB=0.019522;RO=15;SAF=8;SAR=7;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174033;STB=0.59899;STBP=0.34;TYPE=snp;VARB=0.01027;OID=.;OPOS=71260348;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:15:15:15:15:0.5:7:8:5:10:7:8:5:10
chr11	71276632	.	T	C	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0134655;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.142;QD=47.822;RBI=0.045201;REFB=0;REVB=0.0431487;RO=0;SAF=9;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00044283;OID=.;OPOS=71276632;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:7:9:0:0:7:9:0:0
chr11	71276681	.	T	C	59.96	PASS	AF=1;AO=5;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0708943;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.953;QD=34.2601;RBI=0.0717004;REFB=0;REVB=-0.010721;RO=0;SAF=2;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000842289;OID=.;OPOS=71276681;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:5:7:1:3:2:0:0:3:4:0:0
chr11	71277273	.	T	G	148.13	PASS	AF=0.484848;AO=16;DP=33;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=0.00490445;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.904;QD=17.9555;RBI=0.0175403;REFB=-0.0182821;REVB=-0.0168407;RO=16;SAF=9;SAR=7;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163462;STB=0.606611;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=0.014932;OID=.;OPOS=71277273;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:16:17:16:16:0.484848:7:9:6:10:7:9:6:11
chr11	71277598	.	A	C	1183.42	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0140873;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.2;QD=60.6881;RBI=0.0251169;REFB=0;REVB=0.0207944;RO=0;SAF=32;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000361313;OID=.;OPOS=71277598;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:78:0:0:76:78:1:44:32:0:0:45:33:0:0
chr11	71277647	.	CCGCT	C	396.49	PASS	AF=1;AO=28;DP=31;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.033552;FXX=0;HRUN=2;LEN=4;MLLD=293.595;QD=48.059;RBI=0.0373163;REFB=0;REVB=-0.0163331;RO=0;SAF=3;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.13441e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.000134457;OID=.;OPOS=71277648;OREF=CGCT;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:28:31:33:33:0:6:27:0:0:7:0:3:25:0:0
chr11	71498591	.	C	G	62.4	PASS	AF=0.290323;AO=9;DP=31;FAO=9;FDP=31;FR=.;FRO=22;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.00308599;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.9718;QD=8.05181;RBI=0.0418958;REFB=-0.0301921;REVB=-0.041782;RO=22;SAF=2;SAR=7;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.427134;STB=0.765821;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=0.0748181;OID=.;OPOS=71498591;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:31:31:22:22:9:9:0.290323:7:2:13:9:7:2:13:9
chr11	71498601	.	G	T	52.36	PASS	AF=0.25;AO=8;DP=32;FAO=8;FDP=32;FR=.;FRO=24;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=0.0227514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.381;QD=6.54549;RBI=0.0288244;REFB=-0.0125037;REVB=0.0176982;RO=23;SAF=1;SAR=7;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.574539;STB=0.874063;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.0331189;OID=.;OPOS=71498601;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:32:32:23:24:8:8:0.25:7:1:14:9:7:1:15:9
chr11	71498648	.	A	G	72.35	PASS	AF=0.294118;AO=10;DP=34;FAO=10;FDP=34;FR=.;FRO=24;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.0239577;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.301;QD=8.51124;RBI=0.0484632;REFB=-0.0223096;REVB=-0.0421273;RO=24;SAF=3;SAR=7;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.324412;STB=0.6996;STBP=0.175;TYPE=snp;VARB=0.0743195;OID=.;OPOS=71498648;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:34:34:24:24:10:10:0.294118:7:3:14:10:7:3:14:10
chr11	71498671	.	G	C	43.62	PASS	AF=0.241379;AO=7;DP=29;FAO=7;FDP=29;FR=.;FRO=22;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.00963846;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.603;QD=6.01599;RBI=0.0142493;REFB=-0.00360693;REVB=-0.0104949;RO=22;SAF=1;SAR=6;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.499735;STB=0.828782;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=0.00923958;OID=.;OPOS=71498671;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:29:29:22:22:7:7:0.241379:6:1:12:10:6:1:12:10
chr11	71504475	.	T	C	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.04829;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.7066;QD=37.4884;RBI=0.0494741;REFB=0;REVB=0.0107591;RO=0;SAF=6;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.58669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00289407;OID=.;OPOS=71504475;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:2:6:0:0:2:6:0:0
chr11	71507261	.	A	G	116.67	PASS	AF=0.35;AO=14;DP=40;FAO=14;FDP=40;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=0.0272991;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.601;QD=11.6673;RBI=0.0273432;REFB=-0.0113871;REVB=-0.00155259;RO=26;SAF=5;SAR=9;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.240837;STB=0.642653;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=0.0157816;OID=.;OPOS=71507261;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:26:26:14:14:0.35:9:5:15:11:9:5:15:11
chr11	71544269	.	C	T	766.42	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0688375;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.1393;QD=63.8683;RBI=0.0725891;REFB=0;REVB=0.0230342;RO=0;SAF=25;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000758033;OID=.;OPOS=71544269;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:23:25:0:0:23:25:0:0
chr11	71548465	.	A	G	290.88	PASS	AF=0.354167;AO=34;DP=96;FAO=34;FDP=96;FR=.;FRO=62;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=36;FSRR=26;FWDB=0.112559;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.66;QD=12.1199;RBI=0.112657;REFB=-0.00426155;REVB=-0.00469653;RO=62;SAF=20;SAR=14;SRF=36;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00876479;STB=0.505048;STBP=0.957;TYPE=snp;VARB=0.0111443;OID=.;OPOS=71548465;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:96:62:62:34:34:0.354167:14:20:36:26:14:20:36:26
chr11	71548520	.	A	T	232.91	PASS	AF=0.322222;AO=29;DP=91;FAO=29;FDP=90;FR=.;FRO=61;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=38;FSRR=23;FWDB=0.00563036;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=308.376;QD=10.3514;RBI=0.00846174;REFB=-0.00329609;REVB=-0.00631666;RO=61;SAF=16;SAR=13;SRF=38;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0845795;STB=0.549262;STBP=0.55;TYPE=snp;VARB=0.00579786;OID=.;OPOS=71548520;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:90:61:61:29:29:0.322222:13:16:38:23:13:16:38:23
chr11	71548544	.	A	G	181.14	PASS	AF=0.359375;AO=23;DP=64;FAO=23;FDP=64;FR=.;FRO=41;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=27;FSRR=14;FWDB=-0.0151571;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.77;QD=11.3211;RBI=0.0187781;REFB=-0.00248323;REVB=0.0110852;RO=41;SAF=13;SAR=10;SRF=27;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106876;STB=0.561746;STBP=0.495;TYPE=snp;VARB=0.03365;OID=.;OPOS=71548544;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:41:41:23:23:0.359375:10:13:27:14:10:13:27:14
chr11	71615069	.	G	A	148.14	PASS	AF=0.484848;AO=16;DP=33;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.0351323;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.641;QD=17.9561;RBI=0.0362576;REFB=-0.0248531;REVB=-0.00896291;RO=17;SAF=10;SAR=6;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0894054;STB=0.551116;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=0.0289509;OID=.;OPOS=71615069;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:17:17:16:16:0.484848:6:10:9:8:6:10:9:8
chr11	71627159	.	C	A	244.07	PASS	AF=0.5;AO=26;DP=52;FAO=26;FDP=52;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=8;FSRR=18;FWDB=0.035096;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.2785;QD=18.7748;RBI=0.0355971;REFB=0.0199223;REVB=-0.0059516;RO=26;SAF=11;SAR=15;SRF=8;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107696;STB=0.56014;STBP=0.433;TYPE=snp;VARB=-0.0266961;OID=.;OPOS=71627159;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:26:26:26:26:0.5:15:11:8:18:15:11:8:18
chr11	71701763	.	G	A	533.58	PASS	AF=0.514019;AO=55;DP=107;FAO=55;FDP=107;FR=.;FRO=52;FSAF=20;FSAR=35;FSRF=29;FSRR=23;FWDB=-0.0310122;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=295.955;QD=19.9468;RBI=0.0312044;REFB=-0.0135769;REVB=0.00345792;RO=52;SAF=20;SAR=35;SRF=29;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174719;STB=0.596486;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.0115926;OID=.;OPOS=71701763;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:107:52:52:55:55:0.514019:35:20:29:23:35:20:29:23
chr11	71706544	.	A	G	950.03	PASS	AF=0.565217;AO=89;DP=161;FAO=91;FDP=161;FR=.;FRO=70;FSAF=31;FSAR=60;FSRF=37;FSRR=33;FWDB=-0.0139082;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=227.601;QD=23.6032;RBI=0.0162062;REFB=-0.000338502;REVB=0.0083188;RO=70;SAF=31;SAR=58;SRF=37;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151939;STB=0.585935;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.000236623;OID=.;OPOS=71706544;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:161:161:70:70:89:91:0.565217:58:31:37:33:60:31:37:33
chr11	71707489	.	T	C	428.99	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0232531;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.406;QD=57.1984;RBI=0.0271562;REFB=0;REVB=0.0140268;RO=0;SAF=8;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000267946;OID=.;OPOS=71707489;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:22:8:0:0:22:8:0:0
chr11	71708013	.	G	A	206.96	PASS	AF=0.4375;AO=21;DP=48;FAO=21;FDP=48;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=6;FSRR=21;FWDB=0.0152482;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.156;QD=17.247;RBI=0.0152712;REFB=-0.00595747;REVB=-0.000837796;RO=27;SAF=6;SAR=15;SRF=6;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.08007;STB=0.545413;STBP=0.684;TYPE=snp;VARB=0.00748183;OID=.;OPOS=71708013;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:27:27:21:21:0.4375:15:6:6:21:15:6:6:21
chr11	71714526	.	G	C	1280.87	PASS	AF=0.965909;AO=85;DP=88;FAO=85;FDP=88;FR=.;FRO=3;FSAF=47;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0132893;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=246.579;QD=58.2214;RBI=0.065369;REFB=0.0226244;REVB=0.0640039;RO=3;SAF=47;SAR=38;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.035936;STB=0.518983;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=-4.51955e-05;OID=.;OPOS=71714526;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:88:88:3:3:85:85:0.965909:38:47:0:3:38:47:0:3
chr11	71717106	.	G	A	337.34	PASS	AF=0.38835;AO=40;DP=103;FAO=40;FDP=103;FR=.;FRO=63;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=29;FSRR=34;FWDB=-0.0162075;FXX=0.00961446;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.154;QD=13.1006;RBI=0.0345422;REFB=-0.0138067;REVB=-0.0305037;RO=63;SAF=23;SAR=17;SRF=29;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123509;STB=0.570213;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=0.0188564;OID=.;OPOS=71717106;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:103:63:63:40:40:0.38835:17:23:29:34:17:23:29:34
chr11	71726168	.	G	C	148.14	PASS	AF=0.551724;AO=15;DP=28;FAO=16;FDP=29;FR=.;FRO=13;FSAF=15;FSAR=1;FSRF=12;FSRR=1;FWDB=0.00184058;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.148;QD=20.4336;RBI=0.0302818;REFB=-0.0243539;REVB=-0.0302258;RO=13;SAF=14;SAR=1;SRF=12;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0324619;STB=0.526281;STBP=0.849;TYPE=snp;VARB=0.0183534;OID=.;OPOS=71726168;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:29:13:13:15:16:0.551724:1:14:12:1:1:15:12:1
chr11	71821236	.	A	G	127.73	PASS	AF=0.348837;AO=15;DP=43;FAO=15;FDP=43;FR=.;FRO=28;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.0199686;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.83;QD=11.8813;RBI=0.0224381;REFB=-0.023482;REVB=-0.0102333;RO=28;SAF=8;SAR=7;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0367416;STB=0.52171;STBP=0.794;TYPE=snp;VARB=0.040072;OID=.;OPOS=71821236;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:28:28:15:15:0.348837:7:8:14:14:7:8:14:14
chr11	71850156	.	C	CTA	436.51	PASS	AF=0.518072;AO=43;DP=84;FAO=43;FDP=83;FR=.;FRO=40;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=17;FSRR=23;FWDB=-0.00651296;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=2;MLLD=265.276;QD=21.0365;RBI=0.00652157;REFB=-0.0337125;REVB=-0.000334945;RO=40;SAF=21;SAR=22;SRF=17;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0553361;STB=0.530587;STBP=0.594;TYPE=ins;VARB=0.0276021;OID=.;OPOS=71850157;OREF=-;OALT=TA;OMAPALT=CTA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.518072:43:84:43:83:40:21:22:17:23:99:40:21:22:17:23
chr11	71941033	.	G	C	36.61	PASS	AF=0.3;AO=6;DP=20;FAO=6;FDP=20;FR=.;FRO=14;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.0423876;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.9116;QD=7.32288;RBI=0.0557081;REFB=0.03387;REVB=-0.0361481;RO=14;SAF=2;SAR=4;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187917;STB=0.620278;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=-0.0775985;OID=.;OPOS=71941033;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:20:20:14:14:6:6:0.3:4:2:7:7:4:2:7:7
chr11	71941212	.	A	G	146.33	PASS	AF=0.457143;AO=15;DP=35;FAO=16;FDP=35;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.0262373;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.3882;QD=16.723;RBI=0.0297483;REFB=-0.00884917;REVB=-0.0140201;RO=19;SAF=6;SAR=9;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17311;STB=0.576417;STBP=0.447;TYPE=snp;VARB=0.0114176;OID=.;OPOS=71941212;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:19:19:15:16:0.457143:9:6:11:8:9:7:11:8
chr11	71945332	.	A	G	144.67	PASS	AF=0.4;AO=16;DP=40;FAO=16;FDP=40;FR=.;FRO=24;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=-0.000378347;FXX=0.0243843;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.3726;QD=14.4667;RBI=0.0628725;REFB=-0.0163767;REVB=0.0628713;RO=24;SAF=4;SAR=12;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.28395;STB=0.666444;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.0267667;OID=.;OPOS=71945332;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:24:24:16:16:0.4:12:4:12:12:12:4:12:12
chr11	71948536	.	C	G	54.74	PASS	AF=0.777778;AO=7;DP=9;FAO=7;FDP=9;FR=.;FRO=2;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0311512;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.879;QD=24.3282;RBI=0.0424982;REFB=0.000979184;REVB=0.0289085;RO=2;SAF=5;SAR=2;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.28674;STB=0.666171;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=-0.000170894;OID=.;OPOS=71948536;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:9:9:2:2:7:7:0.777778:2:5:0:2:2:5:0:2
chr11	72040784	.	T	C	173.59	PASS	AF=0.473684;AO=18;DP=38;FAO=18;FDP=38;FR=.;FRO=20;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=4;FWDB=-0.0634008;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.2766;QD=18.2729;RBI=0.0640598;REFB=-0.00587182;REVB=-0.00916482;RO=20;SAF=11;SAR=7;SRF=16;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194659;STB=0.609567;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=0.00299147;OID=.;OPOS=72040784;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:20:20:18:18:0.473684:7:11:16:4:7:11:16:4
chr11	72281818	.	A	G	192.92	PASS	AF=0.410714;AO=23;DP=56;FAO=23;FDP=56;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=-0.0102327;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.716;QD=13.7798;RBI=0.0108126;REFB=-0.0108609;REVB=0.00349354;RO=33;SAF=10;SAR=13;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0430735;STB=0.524621;STBP=0.778;TYPE=snp;VARB=0.0145522;OID=.;OPOS=72281818;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:33:33:23:23:0.410714:13:10:13:20:13:10:13:20
chr11	72281884	.	C	T	326.54	PASS	AF=0.413793;AO=36;DP=87;FAO=36;FDP=87;FR=.;FRO=51;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=24;FSRR=27;FWDB=0.000847749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.426;QD=15.0133;RBI=0.00760609;REFB=-0.00518843;REVB=-0.0075587;RO=51;SAF=20;SAR=16;SRF=24;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0880754;STB=0.549844;STBP=0.459;TYPE=snp;VARB=0.0216256;OID=.;OPOS=72281884;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:51:51:36:36:0.413793:16:20:24:27:16:20:24:27
chr11	72281941	.	A	G	284.57	PASS	AF=0.484375;AO=31;DP=65;FAO=31;FDP=64;FR=.;FRO=33;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=-0.100474;FXX=0.0153822;HRUN=3;LEN=1;MLLD=162.901;QD=17.7856;RBI=0.100894;REFB=-0.00322565;REVB=-0.00920478;RO=33;SAF=13;SAR=18;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171194;STB=0.595726;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=0.00219078;OID=.;OPOS=72281941;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:64:33:33:31:31:0.484375:18:13:20:13:18:13:20:13
chr11	72287350	.	A	G	465.11	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.245069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.584;QD=58.1392;RBI=0.245307;REFB=0;REVB=0.0108043;RO=0;SAF=1;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00122319;OID=.;OPOS=72287350;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:31:1:0:0:31:1:0:0
chr11	72288599	.	G	A	318.51	PASS	AF=0.485714;AO=34;DP=70;FAO=34;FDP=70;FR=.;FRO=36;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=-0.00764031;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.619;QD=18.2006;RBI=0.0162244;REFB=-0.0157311;REVB=0.0143128;RO=35;SAF=15;SAR=19;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0925815;STB=0.558789;STBP=0.355;TYPE=snp;VARB=0.0179735;OID=.;OPOS=72288599;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:35:36:34:34:0.485714:19:15:19:16:19:15:20:16
chr11	72291927	.	T	C	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0168329;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=278.13;QD=48.7373;RBI=0.024285;REFB=0;REVB=0.0175047;RO=0;SAF=5;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.0286e-06;OID=.;OPOS=72291927;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:12:5:0:0:12:5:0:0
chr11	72293602	.	A	G	1029.97	PASS	AF=0.985915;AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=71;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0368074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.488;QD=58.0265;RBI=0.0450235;REFB=-0.0847337;REVB=0.0259294;RO=1;SAF=27;SAR=43;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0171877;STB=0.509088;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=0.0010105;OID=.;OPOS=72293602;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:71:71:1:1:70:70:0.985915:43:27:1:0:43:27:1:0
chr11	72295502	.	T	C	1142.71	PASS	AF=1;AO=75;DP=77;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00108205;FXX=0.0259707;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.688;QD=60.9448;RBI=0.00307876;REFB=0;REVB=-0.00288235;RO=0;SAF=44;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.37354e-05;OID=.;OPOS=72295502;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:75:0:0:75:75:1:31:44:0:0:31:44:0:0
chr11	72295906	.	A	G	279.97	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0734256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.01;QD=50.9035;RBI=0.073808;REFB=0;REVB=-0.00750348;RO=0;SAF=7;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00180642;OID=.;OPOS=72295906;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:22:0:0:21:22:1:14:7:0:0:14:8:0:0
chr11	72408055	.	G	C	166.32	PASS	AF=0.4;AO=18;DP=45;FAO=18;FDP=45;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=-0.0123349;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=131.452;QD=14.7837;RBI=0.0361748;REFB=-0.0165629;REVB=0.0340068;RO=27;SAF=10;SAR=8;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152668;STB=0.588138;STBP=0.35;TYPE=snp;VARB=0.0254107;OID=.;OPOS=72408055;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:27:27:18:18:0.4:8:10:11:16:8:10:11:16
chr11	72423315	.	G	A	303.76	PASS	AF=0.52459;AO=27;DP=61;FAO=32;FDP=61;FR=.;FRO=29;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=0.00185057;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.978;QD=19.9187;RBI=0.0293634;REFB=-0.00586998;REVB=0.029305;RO=25;SAF=12;SAR=15;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133402;STB=0.559549;STBP=0.363;TYPE=snp;VARB=0.0104728;OID=.;OPOS=72423315;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:25:29:27:32:0.52459:15:12:15:10:15:17:19:10
chr11	72532569	.	G	T	676.49	PASS	AF=0.977778;AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0412543;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.8043;QD=60.1326;RBI=0.0415292;REFB=0.0743693;REVB=0.00477059;RO=1;SAF=22;SAR=22;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0208755;STB=0.511106;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=-0.00534675;OID=.;OPOS=72532569;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:45:45:1:1:44:44:0.977778:22:22:1:0:22:22:1:0
chr11	72532621	.	T	G	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0263914;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.164;QD=59.4356;RBI=0.0315617;REFB=0;REVB=-0.01731;RO=0;SAF=22;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.39865e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.86835e-05;OID=.;OPOS=72532621;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:13:22:0:0:13:22:0:0
chr11	72532708	.	C	T	593.66	PASS	AF=0.952381;AO=40;DP=42;FAO=40;FDP=42;FR=.;FRO=2;FSAF=29;FSAR=11;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0315987;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=211.305;QD=56.5387;RBI=0.0317975;REFB=-0.215477;REVB=-0.00355022;RO=0;SAF=29;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.97233e-08;STB=0.516658;STBP=0.427;TYPE=snp;VARB=0.00153763;OID=.;OPOS=72532708;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:42:42:0:2:40:40:0.952381:11:29:0:0:11:29:2:0
chr11	72945341	.	C	T	1909.1	PASS	AF=0.962406;AO=127;DP=133;FAO=128;FDP=133;FR=.;FRO=5;FSAF=63;FSAR=65;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.00220646;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.22;QD=57.4166;RBI=0.00222013;REFB=-0.0206069;REVB=-0.000245959;RO=5;SAF=62;SAR=65;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00804201;STB=0.504053;STBP=0.562;TYPE=snp;VARB=0.00538335;OID=.;OPOS=72945341;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:133:133:5:5:127:128:0.962406:65:62:3:2:65:63:3:2
chr11	72946020	.	C	T	575.78	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.035289;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.521;QD=60.6087;RBI=0.0361778;REFB=0;REVB=0.00797019;RO=0;SAF=15;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000121074;OID=.;OPOS=72946020;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:23:15:0:0:23:15:0:0
chr11	72946140	.	G	C	88.0	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0434655;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=40.009;QD=39.1126;RBI=0.0978645;REFB=0;REVB=0.0876825;RO=0;SAF=3;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00889057;OID=.;OPOS=72946140;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:6:3:0:0:6:3:0:0
chr11	73100179	.	A	C	225.89	PASS	AF=0.440678;AO=26;DP=60;FAO=26;FDP=59;FR=.;FRO=33;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=21;FSRR=12;FWDB=-0.027656;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.388;QD=15.3146;RBI=0.0420843;REFB=-0.00648467;REVB=-0.0317212;RO=33;SAF=18;SAR=8;SRF=21;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0628183;STB=0.535686;STBP=0.686;TYPE=snp;VARB=0.01226;OID=.;OPOS=73100179;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:59:33:33:26:26:0.440678:8:18:21:12:8:18:21:12
chr11	73387057	.	TTAAGTA	T	223.96	PASS	AF=0.525424;AO=31;DP=62;FAO=31;FDP=59;FR=.;FRO=28;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=0.0342651;FXX=0.0483793;HRUN=3;LEN=6;MLLD=245.442;QD=15.184;RBI=0.0349979;REFB=0.00631986;REVB=0.00712424;RO=29;SAF=15;SAR=16;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148362;STB=0.558305;STBP=0.368;TYPE=del;VARB=-0.00440455;OID=.;OPOS=73387058;OREF=TAAGTA;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.525424:31:62:31:59:28:15:16:17:11:99:29:15:16:19:10
chr11	73390772	.	GAA	G	101.94	PASS	AF=0.432432;AO=14;DP=35;FAO=16;FDP=37;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=-0.00602456;FXX=0.0263089;HRUN=3;LEN=2;MLLD=38.8157;QD=11.0208;RBI=0.109716;REFB=-0.0436597;REVB=-0.10955;RO=19;SAF=7;SAR=7;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13069;STB=0.54049;STBP=0.675;TYPE=del;VARB=0.0476093;OID=.;OPOS=73390773;OREF=AA;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.432432:14:35:16:37:21:8:8:12:9:99:19:7:7:12:7
chr11	73441772	.	A	C	528.29	PASS	AF=0.925;AO=37;DP=40;FAO=37;FDP=40;FR=.;FRO=3;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.00450301;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=233.477;QD=52.8291;RBI=0.0260466;REFB=0.0598541;REVB=0.0256544;RO=3;SAF=17;SAR=20;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0757409;STB=0.540519;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=-0.00227158;OID=.;OPOS=73441772;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:40:40:3:3:37:37:0.925:20:17:3:0:20:17:3:0
chr11	73543621	.	T	C	160.52	PASS	AF=0.485714;AO=17;DP=35;FAO=17;FDP=35;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=0.00824631;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.952;QD=18.3449;RBI=0.0270357;REFB=-0.0242636;REVB=0.0257474;RO=18;SAF=6;SAR=11;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0195133;STB=0.511098;STBP=0.881;TYPE=snp;VARB=0.0234086;OID=.;OPOS=73543621;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:18:18:17:17:0.485714:11:6:6:12:11:6:6:12
chr11	73620537	.	C	G	605.62	PASS	AF=0.504202;AO=59;DP=119;FAO=60;FDP=119;FR=.,HEALED;FRO=56;FSAF=30;FSAR=30;FSRF=37;FSRR=19;FWDB=0.00316665;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.2044;QD=20.357;RBI=0.094867;REFB=-0.0672358;REVB=-0.0948141;RO=41;SAF=30;SAR=29;SRF=36;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.281625;STB=0.577561;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=0.0257805;OID=.;OPOS=73620537;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:119:41:56:59:60:0.504202:29:30:36:5:30:30:37:19
chr11	73670645	.	T	C	364.55	PASS	AF=0.481013;AO=38;DP=79;FAO=38;FDP=79;FR=.;FRO=41;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=10;FSRR=31;FWDB=-0.0371444;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.858;QD=18.458;RBI=0.038366;REFB=-0.00749499;REVB=-0.00960449;RO=41;SAF=19;SAR=19;SRF=10;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.240004;STB=0.632846;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.00946156;OID=.;OPOS=73670645;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:41:41:38:38:0.481013:19:19:10:31:19:19:10:31
chr11	73765731	.	A	C	199.44	PASS	AF=0.431373;AO=21;DP=51;FAO=22;FDP=51;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=-0.0235304;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.1997;QD=15.6423;RBI=0.0755197;REFB=0.00669862;REVB=0.0717603;RO=30;SAF=8;SAR=13;SRF=20;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.287219;STB=0.637356;STBP=0.103;TYPE=snp;VARB=-0.00769932;OID=.;OPOS=73765731;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:30:29:21:22:0.431373:13:8:20:10:13:9:19:10
chr11	73785326	.	T	C	449.83	PASS	AF=0.581081;AO=43;DP=74;FAO=43;FDP=74;FR=.;FRO=31;FSAF=29;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=9;FWDB=-0.00945416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.951;QD=24.3151;RBI=0.0184159;REFB=-0.0198588;REVB=0.015804;RO=31;SAF=29;SAR=14;SRF=22;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0310598;STB=0.517009;STBP=0.772;TYPE=snp;VARB=0.0103349;OID=.;OPOS=73785326;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:31:31:43:43:0.581081:14:29:22:9:14:29:22:9
chr11	73796917	.	C	T	382.72	PASS	AF=0.616667;AO=37;DP=60;FAO=37;FDP=60;FR=.;FRO=23;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=-0.0369169;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=167.47;QD=25.5144;RBI=0.0379539;REFB=-0.0219061;REVB=0.00881174;RO=23;SAF=17;SAR=20;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0174155;STB=0.509532;STBP=0.85;TYPE=snp;VARB=0.013517;OID=.;OPOS=73796917;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:23:23:37:37:0.616667:20:17:10:13:20:17:10:13
chr11	73814438	.	G	C	359.38	PASS	AF=0.513889;AO=37;DP=71;FAO=37;FDP=72;FR=.;FRO=35;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=20;FSRR=15;FWDB=0.000725553;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=97.806;QD=19.9655;RBI=0.0129071;REFB=-0.00358899;REVB=-0.0128866;RO=34;SAF=16;SAR=21;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109342;STB=0.567531;STBP=0.271;TYPE=snp;VARB=0.00619886;OID=.;OPOS=73814438;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:72:34:35:37:37:0.513889:21:16:19:15:21:16:20:15
chr11	73946931	.	T	C	322.15	PASS	AF=0.418605;AO=36;DP=87;FAO=36;FDP=86;FR=.;FRO=50;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=29;FSRR=21;FWDB=-0.00699762;FXX=0.0114929;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.0813;QD=14.9836;RBI=0.0113429;REFB=-2.9221e-05;REVB=0.00892722;RO=51;SAF=18;SAR=18;SRF=29;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0711102;STB=0.546486;STBP=0.49;TYPE=snp;VARB=0.00159546;OID=.;OPOS=73946931;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:86:51:50:36:36:0.418605:18:18:29:22:18:18:29:21
chr11	74043708	.	G	A	214.45	PASS	AF=0.468085;AO=19;DP=44;FAO=22;FDP=47;FR=.;FRO=25;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=0.000558697;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.075;QD=18.2514;RBI=0.017876;REFB=-0.00958554;REVB=0.0178673;RO=25;SAF=14;SAR=5;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199577;STB=0.570758;STBP=0.385;TYPE=snp;VARB=0.00957112;OID=.;OPOS=74043708;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:47:25:25:19:22:0.468085:5:14:14:11:7:15:14:11
chr11	74046975	.	C	T	258.31	PASS	AF=0.405405;AO=30;DP=74;FAO=30;FDP=74;FR=.;FRO=44;FSAF=22;FSAR=8;FSRF=32;FSRR=12;FWDB=-0.00857775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.164;QD=13.9626;RBI=0.00923582;REFB=-0.00461082;REVB=-0.0034238;RO=44;SAF=22;SAR=8;SRF=32;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00805049;STB=0.504584;STBP=0.969;TYPE=snp;VARB=0.00182646;OID=.;OPOS=74046975;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:44:44:30:30:0.405405:8:22:32:12:8:22:32:12
chr11	74049569	.	A	G	262.95	PASS	AF=0.318182;AO=35;DP=110;FAO=35;FDP=110;FR=.;FRO=75;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=43;FSRR=32;FWDB=0.0105986;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.3731;QD=9.56165;RBI=0.014233;REFB=-0.004396;REVB=-0.00949987;RO=75;SAF=14;SAR=21;SRF=43;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20148;STB=0.617262;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.00586433;OID=.;OPOS=74049569;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:110:75:75:35:35:0.318182:21:14:43:32:21:14:43:32
chr11	74053547	.	C	T	234.95	PASS	AF=0.46;AO=23;DP=50;FAO=23;FDP=50;FR=.;FRO=27;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=-0.0046682;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.438;QD=18.7956;RBI=0.0115176;REFB=-0.00701253;REVB=-0.0105291;RO=26;SAF=14;SAR=9;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104113;STB=0.549956;STBP=0.545;TYPE=snp;VARB=0.00920186;OID=.;OPOS=74053547;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:26:27:23:23:0.46:9:14:13:13:9:14:14:13
chr11	74203308	.	T	A	992.95	PASS	AF=1;AO=67;DP=68;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0052315;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.2533;QD=59.2805;RBI=0.0103982;REFB=0;REVB=-0.00898634;RO=0;SAF=33;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.61397e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000426957;OID=.;OPOS=74203308;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:67:0:0:67:67:1:34:33:0:0:34:33:0:0
chr11	74204269	.	T	G	734.17	PASS	AF=0.979167;AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=48;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0170366;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.233;QD=61.1811;RBI=0.0553918;REFB=-0.168804;REVB=0.0527068;RO=0;SAF=16;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507933;STBP=0.612;TYPE=snp;VARB=0.00850217;OID=.;OPOS=74204269;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:48:48:0:1:47:47:0.979167:31:16:0:0:31:16:0:1
chr11	74208029	.	C	T	1472.04	PASS	AF=1;AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00264748;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.972;QD=63.3137;RBI=0.00594896;REFB=0;REVB=0.00532738;RO=0;SAF=48;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.1744e-06;OID=.;OPOS=74208029;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:93:93:0:0:93:93:1:45:48:0:0:45:48:0:0
chr11	74208214	.	G	A	82.04	PASS	AF=0.9;AO=9;DP=10;FAO=9;FDP=10;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0113238;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.5788;QD=32.8157;RBI=0.0154905;REFB=-0.0828383;REVB=-0.0105701;RO=1;SAF=4;SAR=5;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0984833;STB=0.555432;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.039924;OID=.;OPOS=74208214;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:10:10:1:1:9:9:0.9:5:4:1:0:5:4:1:0
chr11	74208592	.	G	T	357.98	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0095145;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.6838;QD=55.0736;RBI=0.0275986;REFB=0;REVB=0.0259067;RO=0;SAF=10;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.71087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000627945;OID=.;OPOS=74208592;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:16:10:0:0:16:10:0:0
chr11	74278090	.	C	T	474.34	PASS	AF=0.36478;AO=59;DP=159;FAO=58;FDP=159;FR=.;FRO=101;FSAF=36;FSAR=22;FSRF=58;FSRR=43;FWDB=-0.0087795;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.946;QD=11.9331;RBI=0.0301196;REFB=-0.00926671;REVB=-0.0288117;RO=99;SAF=36;SAR=23;SRF=58;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0279796;STB=0.530842;STBP=0.559;TYPE=snp;VARB=0.0162177;OID=.;OPOS=74278090;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:159:159:99:101:59:58:0.36478:23:36:58:41:22:36:58:43
chr11	74329615	.	T	C	249.39	PASS	AF=0.605263;AO=22;DP=37;FAO=23;FDP=38;FR=.;FRO=15;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=-0.00121232;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.268;QD=26.2512;RBI=0.00203507;REFB=-0.0147007;REVB=0.00163456;RO=15;SAF=16;SAR=6;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.304554;STB=0.649031;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.00881418;OID=.;OPOS=74329615;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:38:15:15:22:23:0.605263:6:16:5:10:7:16:5:10
chr11	74396330	.	C	T	259.14	PASS	AF=0.55814;AO=24;DP=43;FAO=24;FDP=43;FR=.;FRO=19;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.0236557;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.554;QD=24.106;RBI=0.028054;REFB=0.00399752;REVB=-0.0150809;RO=18;SAF=17;SAR=7;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0867009;STB=0.565354;STBP=0.348;TYPE=snp;VARB=-0.00471415;OID=.;OPOS=74396330;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:18:19:24:24:0.55814:7:17:11:7:7:17:11:8
chr11	74408740	.	C	T	164.09	PASS	AF=0.372549;AO=19;DP=51;FAO=19;FDP=51;FR=.;FRO=32;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=23;FSRR=9;FWDB=0.0337414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.1724;QD=12.8701;RBI=0.0451941;REFB=-0.00740415;REVB=-0.030067;RO=31;SAF=9;SAR=10;SRF=23;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.28585;STB=0.651584;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.0116231;OID=.;OPOS=74408740;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:31:32:19:19:0.372549:10:9:23:8:10:9:23:9
chr11	74419357	.	C	T	465.1	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00344072;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.8922;QD=58.1369;RBI=0.0138744;REFB=0;REVB=0.013441;RO=0;SAF=22;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000346437;OID=.;OPOS=74419357;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:10:22:0:0:10:22:0:0
chr11	74419378	.	C	G,T	534.49	PASS	AF=0.0810811,0.918919;AO=3,33;DP=37;FAO=3,34;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=3,22;FSAR=0,12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.014521,0.0546039;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=187.065,51.2366;QD=57.7831;RBI=0.0212479,0.0587249;REFB=0,0;REVB=-0.0155117,0.0216107;RO=0;SAF=3,22;SAR=0,11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.167567,-0.00403972;OID=.,.;OPOS=74419378,74419378;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:12:37:37:0:0:3,33:3,34:0.0810811,0.918919:0,11:3,22:0:0:0,12:3,22:0:0
chr11	74553074	.	C	T	1530.91	PASS	AF=1;AO=96;DP=97;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0277852;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.386;QD=63.7878;RBI=0.0278583;REFB=0;REVB=-0.00201627;RO=0;SAF=50;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.54587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.57477e-05;OID=.;OPOS=74553074;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:97:96:0:0:96:96:1:46:50:0:0:46:50:0:0
chr11	74559446	.	G	C	740.33	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0423901;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.0621;QD=56.9487;RBI=0.079518;REFB=0;REVB=0.0672769;RO=0;SAF=17;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.31071e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000218812;OID=.;OPOS=74559446;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:35:17:0:0:35:17:0:0
chr11	74559481	.	C	T	613.36	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00655194;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.066;QD=61.3363;RBI=0.0478679;REFB=0;REVB=0.0474173;RO=0;SAF=14;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000106741;OID=.;OPOS=74559481;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:26:14:0:0:26:14:0:0
chr11	74563077	.	G	A	1320.94	PASS	AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0171893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.895;QD=62.1618;RBI=0.0281953;REFB=0;REVB=0.0223496;RO=0;SAF=36;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000110039;OID=.;OPOS=74563077;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:49:36:0:0:49:36:0:0
chr11	74705696	.	T	C	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0587515;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.077;QD=56.1912;RBI=0.0592323;REFB=0;REVB=0.00753177;RO=0;SAF=11;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.31638e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000360616;OID=.;OPOS=74705696;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:17:11:0:0:17:11:0:0
chr11	74904362	.	T	C	1510.8	PASS	AF=1;AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.042103;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.158;QD=63.6128;RBI=0.0526575;REFB=0;REVB=0.0316252;RO=0;SAF=54;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.56466e-05;OID=.;OPOS=74904362;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:95:0:0:95:95:1:41:54:0:0:41:54:0:0
chr11	74976729	.	C	T	46.76	PASS	AF=0.388889;AO=7;DP=18;FAO=7;FDP=18;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=-0.0295208;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=277.406;QD=10.3903;RBI=0.0309467;REFB=-0.0139626;REVB=-0.0092857;RO=11;SAF=2;SAR=5;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.350103;STB=0.713673;STBP=0.209;TYPE=snp;VARB=0.0232529;OID=.;OPOS=74976729;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:18:18:11:11:7:7:0.388889:5:2:7:4:5:2:7:4
chr11	74994352	.	G	A	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00232558;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.455;QD=55.6556;RBI=0.0119341;REFB=0;REVB=-0.0117053;RO=0;SAF=16;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000105537;OID=.;OPOS=74994352;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:11:16:0:0:11:16:0:0
chr11	75145952	.	A	G	393.46	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0213679;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.099;QD=56.2087;RBI=0.029112;REFB=0;REVB=0.0197718;RO=0;SAF=23;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00010454;OID=.;OPOS=75145952;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:28:0:0:27:28:1:4:23:0:0:4:24:0:0
chr11	75152243	.	C	T	101.75	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0935453;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.524;QD=40.6982;RBI=0.0941042;REFB=0;REVB=0.0102406;RO=0;SAF=9;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.8593e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00231735;OID=.;OPOS=75152243;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:1:9:0:0:1:9:0:0
chr11	75160575	.	G	A	768.26	PASS	AF=0.513889;AO=74;DP=144;FAO=74;FDP=144;FR=.;FRO=70;FSAF=43;FSAR=31;FSRF=40;FSRR=30;FWDB=-0.00652324;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.652;QD=21.3406;RBI=0.00773287;REFB=-0.0141587;REVB=0.00415267;RO=70;SAF=43;SAR=31;SRF=40;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00875093;STB=0.50481;STBP=0.92;TYPE=snp;VARB=0.0117454;OID=.;OPOS=75160575;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:144:144:70:70:74:74:0.513889:31:43:40:30:31:43:40:30
chr11	75277628	.	A	G	750.88	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00620251;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.57;QD=56.6703;RBI=0.0329469;REFB=0;REVB=0.0323578;RO=0;SAF=22;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.57189e-05;OID=.;OPOS=75277628;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:53:0:0:52:53:1:30:22:0:0:31:22:0:0
chr11	75277992	.	C	T	314.98	PASS	AF=0.52381;AO=33;DP=63;FAO=33;FDP=63;FR=.;FRO=30;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=0.00828453;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.223;QD=19.9989;RBI=0.0157004;REFB=-0.0141026;REVB=-0.0133368;RO=30;SAF=15;SAR=18;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106139;STB=0.558789;STBP=0.34;TYPE=snp;VARB=0.0136999;OID=.;OPOS=75277992;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:30:30:33:33:0.52381:18:15:10:20:18:15:10:20
chr11	75905800	.	G	A	67.46	PASS	AF=0.8;AO=8;DP=10;FAO=8;FDP=10;FR=.;FRO=2;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0205445;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=134.079;QD=26.9833;RBI=0.0288339;REFB=-0.154549;REVB=0.0202316;RO=2;SAF=3;SAR=5;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14689;STB=0.583138;STBP=0.428;TYPE=snp;VARB=0.0120815;OID=.;OPOS=75905800;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:10:10:2:2:8:8:0.8:5:3:0:2:5:3:0:2
chr11	76207633	.	G	A	728.97	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130579;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.592;QD=57.174;RBI=0.0137578;REFB=0;REVB=-0.00433222;RO=0;SAF=24;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.31512e-05;OID=.;OPOS=76207633;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:27:24:0:0:27:24:0:0
chr11	76207709	.	G	A	118.32	PASS	AF=0.378378;AO=14;DP=37;FAO=14;FDP=37;FR=.;FRO=23;FSAF=2;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=-0.0237136;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.192;QD=12.7913;RBI=0.0288037;REFB=-0.00392809;REVB=-0.0163499;RO=23;SAF=2;SAR=12;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.314221;STB=0.689337;STBP=0.128;TYPE=snp;VARB=0.00423185;OID=.;OPOS=76207709;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:23:23:14:14:0.378378:12:2:8:15:12:2:8:15
chr11	76257215	.	T	C	324.81	PASS	AF=0.460526;AO=35;DP=76;FAO=35;FDP=76;FR=.;FRO=41;FSAF=10;FSAR=25;FSRF=26;FSRR=15;FWDB=0.00497458;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.207;QD=17.0952;RBI=0.0173787;REFB=-0.0134822;REVB=0.0166515;RO=41;SAF=10;SAR=25;SRF=26;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.342115;STB=0.692196;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0219226;OID=.;OPOS=76257215;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:41:41:35:35:0.460526:25:10:26:15:25:10:26:15
chr11	76368553	.	A	G	919.19	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0180913;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.2079;QD=58.3612;RBI=0.0226431;REFB=0;REVB=0.0136167;RO=0;SAF=31;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000329967;OID=.;OPOS=76368553;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:32:31:0:0:32:31:0:0
chr11	76368639	.	A	C	1015.3	PASS	AF=1;AO=68;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00727191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.43;QD=58.8579;RBI=0.00802452;REFB=0;REVB=0.00339296;RO=0;SAF=39;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.4907e-05;OID=.;OPOS=76368639;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:68:69:1:29:39:0:0:30:39:0:0
chr11	76370792	.	A	G	557.13	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00693308;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.151;QD=60.2307;RBI=0.0147138;REFB=0;REVB=0.012978;RO=0;SAF=16;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.7558e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.23914e-05;OID=.;OPOS=76370792;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:21:16:0:0:21:16:0:0
chr11	76372052	.	A	G	228.15	PASS	AF=1;AO=18;DP=19;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0087652;FXX=0.0526039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.4589;QD=50.6997;RBI=0.120617;REFB=0;REVB=-0.120299;RO=0;SAF=10;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00280615;OID=.;OPOS=76372052;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:18:0:0:18:18:1:8:10:0:0:8:10:0:0
chr11	76372418	.	T	C	310.74	PASS	AF=1;AO=22;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0162273;FXX=0.0416493;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.7332;QD=54.0411;RBI=0.0365321;REFB=0;REVB=0.0327302;RO=0;SAF=10;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00116453;OID=.;OPOS=76372418;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:22:23:1:12:10:0:0:13:10:0:0
chr11	76400134	.	C	T	451.26	PASS	AF=0.46875;AO=45;DP=97;FAO=45;FDP=96;FR=.;FRO=51;FSAF=30;FSAR=15;FSRF=31;FSRR=20;FWDB=0.0108737;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.3626;QD=18.8024;RBI=0.0122127;REFB=-0.01917;REVB=-0.00555995;RO=49;SAF=30;SAR=15;SRF=30;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0560578;STB=0.534336;STBP=0.579;TYPE=snp;VARB=0.020524;OID=.;OPOS=76400134;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:96:49:51:45:45:0.46875:15:30:30:19:15:30:31:20
chr11	76405613	.	C	T	341.17	PASS	AF=0.486486;AO=35;DP=74;FAO=36;FDP=74;FR=.;FRO=38;FSAF=23;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=0.00961231;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.4;QD=18.4416;RBI=0.0101773;REFB=-0.00727054;REVB=-0.00334379;RO=38;SAF=22;SAR=13;SRF=16;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.195151;STB=0.613503;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.00672037;OID=.;OPOS=76405613;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:38:38:35:36:0.486486:13:22:16:22:13:23:16:22
chr11	76415209	.	G	A	251.02	PASS	AF=0.42029;AO=29;DP=69;FAO=29;FDP=69;FR=.;FRO=40;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=25;FWDB=0.115588;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=38.4241;QD=14.5521;RBI=0.13628;REFB=-0.0097787;REVB=0.0721921;RO=37;SAF=16;SAR=13;SRF=15;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144291;STB=0.601316;STBP=0.165;TYPE=snp;VARB=0.0172896;OID=.;OPOS=76415209;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:37:40:29:29:0.42029:13:16:15:22:13:16:15:25
chr11	76418596	.	C	T	331.64	PASS	AF=0.548387;AO=34;DP=62;FAO=34;FDP=62;FR=.;FRO=28;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=-0.0289644;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.6422;QD=21.3959;RBI=0.0308619;REFB=0.00529955;REVB=0.0106546;RO=28;SAF=18;SAR=16;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0936416;STB=0.551694;STBP=0.408;TYPE=snp;VARB=-0.00458882;OID=.;OPOS=76418596;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:28:28:34:34:0.548387:16:18:18:10:16:18:18:10
chr11	76418737	.	A	G	190.94	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.106094;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.0538;QD=47.7348;RBI=0.106125;REFB=0;REVB=-0.00256041;RO=0;SAF=6;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00414204;OID=.;OPOS=76418737;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:10:6:0:0:10:6:0:0
chr11	76430684	.	A	C	766.5	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0593856;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.186;QD=63.8748;RBI=0.0645016;REFB=0;REVB=0.0251755;RO=0;SAF=26;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.8528e-05;OID=.;OPOS=76430684;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:48:0:0:47:48:1:21:26:0:0:21:27:0:0
chr11	76507692	.	T	A	2294.7	PASS	AF=0.993289;AO=142;DP=146;FAO=148;FDP=149;FR=.;FRO=1;FSAF=53;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0468033;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.6938;QD=61.6026;RBI=0.0475762;REFB=-0.00155137;REVB=0.00854066;RO=0;SAF=48;SAR=94;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.502617;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.00275018;OID=.;OPOS=76507692;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:146:149:0:1:142:148:0.993289:94:48:0:0:95:53:0:1
chr11	76637651	.	G	A	1124.46	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.030557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.7537;QD=59.9712;RBI=0.0316442;REFB=0;REVB=-0.0082235;RO=0;SAF=38;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.79579e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000520323;OID=.;OPOS=76637651;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:75:0:0:74:75:1:36:38:0:0:36:39:0:0
chr11	76637680	.	G	A	1081.0	PASS	AF=1;AO=58;DP=73;FAO=72;FDP=72;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=37;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.105118;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.681;QD=60.0555;RBI=0.105127;REFB=0;REVB=0.00138548;RO=0;SAF=23;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00160933;OID=.;OPOS=76637680;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:72:0:0:58:72:1:35:23:0:0:35:37:0:0
chr11	76687399	.	A	C	1074.32	PASS	AF=0.973333;AO=73;DP=75;FAO=73;FDP=75;FR=.;FRO=2;FSAF=40;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00993042;FXX=0.0131562;HRUN=4;LEN=1;MLLD=264.326;QD=57.2971;RBI=0.0141159;REFB=-0.00780583;REVB=0.0100322;RO=2;SAF=40;SAR=33;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0278028;STB=0.514702;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=-7.67362e-06;OID=.;OPOS=76687399;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:75:75:2:2:73:73:0.973333:33:40:0:2:33:40:0:2
chr11	76701606	.	G	A	833.9	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00782407;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.263;QD=57.51;RBI=0.0186166;REFB=0;REVB=-0.0168926;RO=0;SAF=20;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.01685e-05;OID=.;OPOS=76701606;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:58:0:0:57:58:1:37:20:0:0:38:20:0:0
chr11	76732308	.	G	A	538.52	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00454388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.154;QD=59.835;RBI=0.00610858;REFB=0;REVB=0.00408264;RO=0;SAF=19;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.29418e-05;OID=.;OPOS=76732308;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:17:19:0:0:17:19:0:0
chr11	76732949	.	T	C	191.51	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.117515;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=92.2017;QD=47.8785;RBI=0.118251;REFB=0;REVB=-0.013177;RO=0;SAF=5;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00221952;OID=.;OPOS=76732949;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:16:0:0:15:16:1:10:5:0:0:10:6:0:0
chr11	76733024	.	A	G	123.15	PASS	AF=0.923077;AO=12;DP=13;FAO=12;FDP=13;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00579343;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=257.615;QD=37.893;RBI=0.00589461;REFB=-0.0111574;REVB=0.00108748;RO=1;SAF=4;SAR=8;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0531285;STB=0.529364;STBP=0.634;TYPE=snp;VARB=0.000224506;OID=.;OPOS=76733024;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:13:13:1:1:12:12:0.923077:8:4:0:1:8:4:0:1
chr11	76751541	.	CT	C	373.91	PASS	AF=1;AO=31;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0488959;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=27.3923;QD=46.7385;RBI=0.0934877;REFB=0;REVB=-0.0796815;RO=0;SAF=17;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.00533884;OID=.;OPOS=76751542;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:31:32:32:32:0:18:14:0:0:7:0:17:14:0:0
chr11	76751584	.	CT	C,CC	995.21	PASS	AF=1,0;AO=65,3;DP=69;FAO=69,0;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=33,0;FSAR=36,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00186093,-0.00250727;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=194.481,172.364;QD=57.6932;RBI=0.0171347,0.0125735;REFB=0,0;REVB=0.0170334,-0.012321;RO=0;SAF=31,2;SAR=34,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=4.90682e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.000183784,0;OID=.,.;OPOS=76751585,76751585;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1,0:65,3:69:69,0:69:0:33,0:36,0:0:0:5:0:31,2:34,1:0:0
chr11	76751603	.	CT	C	984.33	PASS	AF=0.988372;AO=81;DP=87;FAO=85;FDP=86;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.103267;FXX=0.0114929;HRUN=2;LEN=1;MLLD=26.1032;QD=45.7826;RBI=0.134234;REFB=-0.0130385;REVB=-0.08576;RO=1;SAF=43;SAR=38;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0122979;STB=0.505881;STBP=0.545;TYPE=del;VARB=-0.00118104;OID=.;OPOS=76751604;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:0.988372:81:87:85:86:1:43:42:0:1:13:1:43:38:0:1
chr11	76799004	.	T	C	246.37	PASS	AF=0.467742;AO=26;DP=61;FAO=29;FDP=62;FR=.;FRO=33;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=0.000521036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.008;QD=15.8949;RBI=0.0314169;REFB=-0.00713347;REVB=0.0314126;RO=33;SAF=12;SAR=14;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0826887;STB=0.51504;STBP=0.845;TYPE=snp;VARB=0.00585559;OID=.;OPOS=76799004;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:62:33:33:26:29:0.467742:14:12:18:15:14:15:18:15
chr11	76814110	.	G	A	314.43	PASS	AF=0.465753;AO=34;DP=68;FAO=34;FDP=73;FR=.;FRO=39;FSAF=9;FSAR=25;FSRF=11;FSRR=28;FWDB=-0.0709287;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=150.157;QD=17.2289;RBI=0.0721575;REFB=-0.0284428;REVB=-0.0132603;RO=34;SAF=9;SAR=25;SRF=11;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0652591;STB=0.511764;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=0.0273366;OID=.;OPOS=76814110;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:73:34:39:34:34:0.465753:25:9:11:23:25:9:11:28
chr11	76836864	.	G	A	1213.64	PASS	AF=0.588235;AO=109;DP=188;FAO=110;FDP=187;FR=.;FRO=77;FSAF=56;FSAR=54;FSRF=33;FSRR=44;FWDB=0.0117491;FXX=0.0105815;HRUN=4;LEN=1;MLLD=169.662;QD=25.9602;RBI=0.0122893;REFB=-0.0141265;REVB=-0.00360334;RO=77;SAF=55;SAR=54;SRF=33;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.05799;STB=0.53312;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=0.00855738;OID=.;OPOS=76836864;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:188:187:77:77:109:110:0.588235:54:55:33:44:54:56:33:44
chr11	76853783	.	T	C	173.06	PASS	AF=0.486486;AO=18;DP=36;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=-0.0298021;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.589;QD=18.7088;RBI=0.0375392;REFB=-0.0199983;REVB=-0.0228261;RO=17;SAF=8;SAR=10;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0804767;STB=0.539834;STBP=0.647;TYPE=snp;VARB=0.0158895;OID=.;OPOS=76853783;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:37:17:19:18:18:0.486486:10:8:6:11:10:8:7:12
chr11	76868372	.	T	C	824.43	PASS	AF=1;AO=57;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.030555;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.7201;QD=56.8571;RBI=0.116376;REFB=0;REVB=0.112294;RO=0;SAF=30;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00165292;OID=.;OPOS=76868372;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:57:58:1:27:30:0:0:28:30:0:0
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chr11	76917220	.	A	G	144.73	PASS	AF=0.410256;AO=16;DP=40;FAO=16;FDP=39;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.000125355;FXX=0.0249938;HRUN=3;LEN=1;MLLD=61.4267;QD=14.8441;RBI=0.00784459;REFB=0.0097901;REVB=0.00784359;RO=24;SAF=9;SAR=7;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0217597;STB=0.501627;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0265853;OID=.;OPOS=76917220;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:39:24:23:16:16:0.410256:7:9:13:11:7:9:13:10
chr11	76919478	.	C	A	383.09	PASS	AF=0.965517;AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0190031;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.9622;QD=52.8396;RBI=0.0191789;REFB=-0.0268482;REVB=0.00259077;RO=1;SAF=17;SAR=11;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0404293;STB=0.521723;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=-0.000432882;OID=.;OPOS=76919478;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:29:29:1:1:28:28:0.965517:11:17:0:1:11:17:0:1
chr11	76928149	.	A	G	643.65	PASS	AF=0.438272;AO=71;DP=162;FAO=71;FDP=162;FR=.;FRO=91;FSAF=31;FSAR=40;FSRF=49;FSRR=42;FWDB=-0.0188684;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=263.382;QD=15.8926;RBI=0.0192132;REFB=-0.000550062;REVB=0.00362362;RO=91;SAF=31;SAR=40;SRF=49;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102739;STB=0.557281;STBP=0.205;TYPE=snp;VARB=0.000583909;OID=.;OPOS=76928149;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:162:162:91:91:71:71:0.438272:40:31:49:42:40:31:49:42
chr11	76979550	.	T	C	88.79	PASS	AF=0.236364;AO=13;DP=55;FAO=13;FDP=55;FR=.;FRO=42;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=-0.0318574;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=185.145;QD=6.45734;RBI=0.035049;REFB=-0.0159883;REVB=-0.0146128;RO=42;SAF=7;SAR=6;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0179179;STB=0.511219;STBP=0.962;TYPE=snp;VARB=0.0579676;OID=.;OPOS=76979550;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:55:55:42:42:13:13:0.236364:6:7:22:20:6:7:22:20
chr11	77033699	.	A	G	393.33	PASS	AF=0.557143;AO=39;DP=70;FAO=39;FDP=70;FR=.;FRO=31;FSAF=29;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=0.0618014;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.076;QD=22.476;RBI=0.0621992;REFB=0.0015435;REVB=-0.00702309;RO=31;SAF=29;SAR=10;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127594;STB=0.570624;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=-0.000997731;OID=.;OPOS=77033699;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:31:31:39:39:0.557143:10:29:19:12:10:29:19:12
chr11	77301341	.	G	A	194.05	PASS	AF=0.434783;AO=20;DP=46;FAO=20;FDP=46;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.000299924;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.8543;QD=16.8739;RBI=0.0145966;REFB=-0.0171075;REVB=0.0145935;RO=26;SAF=12;SAR=8;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137865;STB=0.578868;STBP=0.365;TYPE=snp;VARB=0.0196705;OID=.;OPOS=77301341;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:26:26:20:20:0.434783:8:12:12:14:8:12:12:14
chr11	77378388	.	T	C	237.67	PASS	AF=0.490196;AO=24;DP=50;FAO=25;FDP=51;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=-0.0173888;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.997;QD=18.6411;RBI=0.0174359;REFB=0.00318996;REVB=-0.00128017;RO=26;SAF=11;SAR=13;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105472;STB=0.568667;STBP=0.357;TYPE=snp;VARB=-0.00496536;OID=.;OPOS=77378388;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:51:26:26:24:25:0.490196:13:11:9:17:13:12:9:17
chr11	77378505	.	A	G	102.42	PASS	AF=0.521739;AO=12;DP=22;FAO=12;FDP=23;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.0402181;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.6778;QD=17.8121;RBI=0.0441462;REFB=-0.0222232;REVB=-0.0182041;RO=10;SAF=5;SAR=7;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145313;STB=0.56194;STBP=0.572;TYPE=snp;VARB=0.0281549;OID=.;OPOS=77378505;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:22:23:10:11:12:12:0.521739:7:5:6:4:7:5:6:5
chr11	77402734	.	C	A	157.04	PASS	AF=0.435897;AO=17;DP=39;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=-0.031217;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=235.506;QD=16.1065;RBI=0.0621014;REFB=-0.00710561;REVB=-0.053685;RO=22;SAF=12;SAR=5;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126847;STB=0.573289;STBP=0.439;TYPE=snp;VARB=0.009742;OID=.;OPOS=77402734;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:22:22:17:17:0.435897:5:12:13:9:5:12:13:9
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chr11	77412851	.	A	G	284.99	PASS	AF=0.39759;AO=27;DP=79;FAO=33;FDP=83;FR=.;FRO=50;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=29;FSRR=21;FWDB=0.00501075;FXX=0.0235266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.765;QD=13.7346;RBI=0.0160564;REFB=-0.0110848;REVB=-0.0152545;RO=44;SAF=18;SAR=9;SRF=29;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00915423;STB=0.535941;STBP=0.634;TYPE=snp;VARB=0.0149051;OID=.;OPOS=77412851;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:83:44:50:27:33:0.39759:9:18:29:15:12:21:29:21
chr11	77504709	.	C	T	214.82	PASS	AF=0.525;AO=21;DP=40;FAO=21;FDP=40;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=14;FWDB=0.0683071;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.9421;QD=21.4818;RBI=0.0694782;REFB=-0.0416424;REVB=-0.0127027;RO=19;SAF=9;SAR=12;SRF=5;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146837;STB=0.582015;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=0.0381512;OID=.;OPOS=77504709;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:19:19:21:21:0.525:12:9:5:14:12:9:5:14
chr11	77553638	.	T	C	772.8	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0196309;FXX=0.039992;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.749;QD=64.4001;RBI=0.0259052;REFB=0;REVB=0.0169028;RO=0;SAF=16;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.94087e-05;OID=.;OPOS=77553638;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:48:0:0:47:48:1:31:16:0:0:32:16:0:0
chr11	77583266	.	G	A	355.07	PASS	AF=0.493333;AO=37;DP=75;FAO=37;FDP=75;FR=.;FRO=38;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=26;FSRR=12;FWDB=-0.00473416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.4316;QD=18.9372;RBI=0.0531475;REFB=-0.0352859;REVB=0.0529362;RO=38;SAF=18;SAR=19;SRF=26;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179662;STB=0.599661;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=0.0288112;OID=.;OPOS=77583266;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:38:38:37:37:0.493333:19:18:26:12:19:18:26:12
chr11	77597486	.	C	T	646.42	PASS	AF=0.941176;AO=48;DP=51;FAO=48;FDP=51;FR=.;FRO=3;FSAF=21;FSAR=27;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0194581;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=145.353;QD=50.6996;RBI=0.0207181;REFB=0.154164;REVB=0.00711478;RO=3;SAF=21;SAR=27;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0625875;STB=0.533319;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=-0.00325716;OID=.;OPOS=77597486;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:51:51:3:3:48:48:0.941176:27:21:3:0:27:21:3:0
chr11	77597567	.	C	T	306.27	PASS	AF=0.923077;AO=24;DP=26;FAO=24;FDP=26;FR=.;FRO=2;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00171234;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.212;QD=47.1178;RBI=0.0109067;REFB=0.0436755;REVB=0.0107715;RO=2;SAF=11;SAR=13;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0661048;STB=0.535685;STBP=0.243;TYPE=snp;VARB=-0.00379675;OID=.;OPOS=77597567;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:26:26:2:2:24:24:0.923077:13:11:0:2:13:11:0:2
chr11	77597794	.	G	C	340.63	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00510887;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.152;QD=54.5001;RBI=0.00804694;REFB=0;REVB=0.00621713;RO=0;SAF=11;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.05617e-06;OID=.;OPOS=77597794;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:25:0:0:23:25:1:12:11:0:0:14:11:0:0
chr11	77614592	.	C	T	36.94	PASS	AF=0.103448;AO=9;DP=86;FAO=9;FDP=87;FR=.;FRO=78;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=40;FSRR=38;FWDB=0.0102975;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.644;QD=1.69835;RBI=0.0175689;REFB=0.000294244;REVB=-0.0142348;RO=77;SAF=4;SAR=5;SRF=39;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0728946;STB=0.561089;STBP=0.76;TYPE=snp;VARB=-0.00193558;OID=.;OPOS=77614592;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:86:87:77:78:9:9:0.103448:5:4:39:38:5:4:40:38
chr11	77629132	.	A	AT	348.48	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0499965;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=27.0006;QD=46.464;RBI=0.0546493;REFB=0;REVB=-0.0220656;RO=0;SAF=9;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00127346;OID=.;OPOS=77629133;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:30:30:30:30:0:9:21:0:0:6:0:9:21:0:0
chr11	77635882	.	A	C	263.53	PASS	AF=0.483333;AO=29;DP=60;FAO=29;FDP=60;FR=.;FRO=31;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=0.0115183;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=264.549;QD=17.5684;RBI=0.0115499;REFB=-6.13706e-05;REVB=-0.000852757;RO=31;SAF=18;SAR=11;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0693006;STB=0.538895;STBP=0.56;TYPE=snp;VARB=9.66294e-05;OID=.;OPOS=77635882;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:31:31:29:29:0.483333:11:18:17:14:11:18:17:14
chr11	77727379	.	T	C	56.78	PASS	AF=0.421053;AO=8;DP=19;FAO=8;FDP=19;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.00192031;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=294.299;QD=11.9536;RBI=0.00727999;REFB=0.000511915;REVB=-0.00702216;RO=11;SAF=4;SAR=4;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.043798;STB=0.52625;STBP=0.927;TYPE=snp;VARB=-0.000755008;OID=.;OPOS=77727379;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:19:19:11:11:8:8:0.421053:4:4:5:6:4:4:5:6
chr11	77790653	.	T	C	2296.17	PASS	AF=0.993151;AO=145;DP=146;FAO=145;FDP=146;FR=.;FRO=1;FSAF=56;FSAR=89;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0447005;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.7726;QD=62.9089;RBI=0.0514185;REFB=-0.00727587;REVB=-0.025411;RO=1;SAF=56;SAR=89;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00841613;STB=0.504424;STBP=0.288;TYPE=snp;VARB=-0.000161448;OID=.;OPOS=77790653;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:146:146:1:1:145:145:0.993151:89:56:1:0:89:56:1:0
chr11	77909014	.	G	A	594.46	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00375782;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.4696;QD=60.9707;RBI=0.0139153;REFB=0;REVB=0.0133983;RO=0;SAF=16;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.43889e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000132742;OID=.;OPOS=77909014;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:23:16:0:0:23:16:0:0
chr11	77920563	.	G	T	561.49	PASS	AF=1;AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00141122;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.188;QD=60.702;RBI=0.0257013;REFB=0;REVB=0.0256626;RO=0;SAF=17;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.71161e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000497544;OID=.;OPOS=77920563;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:37:0:0:37:37:1:20:17:0:0:20:17:0:0
chr11	77920863	.	C	A	234.53	PASS	AF=0.869565;AO=14;DP=23;FAO=20;FDP=23;FR=.;FRO=3;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.133635;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=39.3282;QD=40.7879;RBI=0.134238;REFB=-0.18609;REVB=0.0127097;RO=0;SAF=9;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50239;STBP=0.962;TYPE=snp;VARB=0.0128684;OID=.;OPOS=77920863;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:23:23:0:3:14:20:0.869565:5:9:0:0:7:13:2:1
chr11	77920930	.	A	G	264.23	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0140151;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.601;QD=50.3301;RBI=0.096056;REFB=0;REVB=0.095028;RO=0;SAF=12;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000524175;OID=.;OPOS=77920930;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:21:0:0:20:21:1:8:12:0:0:8:13:0:0
chr11	77921527	.	G	C	785.59	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00508538;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.154;QD=57.1341;RBI=0.0184526;REFB=0;REVB=0.0177381;RO=0;SAF=26;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.52846e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.41443e-05;OID=.;OPOS=77921527;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:55:0:0:54:55:1:28:26:0:0:28:27:0:0
chr11	77928185	.	C	CATTA	551.47	PASS	AF=0.973684;AO=33;DP=41;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0486007;FXX=0.0499875;HRUN=1;LEN=4;MLLD=291.047;QD=58.049;RBI=0.0526075;REFB=0.0458172;REVB=0.0201377;RO=3;SAF=11;SAR=22;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.511105;STBP=0.506;TYPE=ins;VARB=-0.000300562;OID=.;OPOS=77928186;OREF=-;OALT=ATTA;OMAPALT=CATTA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.973684:33:41:37:38:1:15:22:0:1:5:3:11:22:1:2
chr11	77929844	.	T	C	58.62	PASS	AF=0.5;AO=8;DP=16;FAO=8;FDP=16;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=-0.0234776;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=172.193;QD=14.6539;RBI=0.0314319;REFB=-0.00772899;REVB=0.020899;RO=8;SAF=5;SAR=3;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00790897;OID=.;OPOS=77929844;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:16:16:8:8:8:8:0.5:3:5:5:3:3:5:5:3
chr11	77930138	.	T	C	808.53	PASS	AF=0.966667;AO=58;DP=60;FAO=58;FDP=60;FR=.;FRO=2;FSAF=28;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.013474;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.993;QD=53.9019;RBI=0.0238403;REFB=-0.0357705;REVB=0.0196675;RO=1;SAF=28;SAR=30;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0154654;STB=0.500575;STBP=0.87;TYPE=snp;VARB=0.00269432;OID=.;OPOS=77930138;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:60:60:1:2:58:58:0.966667:30:28:0:1:30:28:1:1
chr11	77930345	.	T	C	968.73	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00349579;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.388;QD=58.7108;RBI=0.00350425;REFB=0;REVB=0.000243303;RO=0;SAF=40;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.51501e-05;OID=.;OPOS=77930345;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:66:0:0:65:66:1:25:40:0:0:25:41:0:0
chr11	77936166	.	A	G	429.0	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00878763;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.353;QD=57.2003;RBI=0.0197368;REFB=0;REVB=0.0176725;RO=0;SAF=17;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.63861e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000171032;OID=.;OPOS=77936166;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:13:17:0:0:13:17:0:0
chr11	77937800	.	G	A	1040.54	PASS	AF=1;AO=54;DP=76;FAO=77;FDP=77;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=36;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.101239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.162;QD=54.0542;RBI=0.101254;REFB=0;REVB=-0.00172494;RO=0;SAF=14;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00638648;OID=.;OPOS=77937800;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:77:0:0:54:77:1:40:14:0:0:41:36:0:0
chr11	78176991	.	G	A	271.17	PASS	AF=0.538462;AO=27;DP=51;FAO=28;FDP=52;FR=.;FRO=24;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=0.006347;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.973;QD=20.8595;RBI=0.0449984;REFB=0.00759035;REVB=0.0445485;RO=20;SAF=14;SAR=13;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0242295;STB=0.519217;STBP=0.795;TYPE=snp;VARB=-0.010574;OID=.;OPOS=78176991;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:52:20:24:27:28:0.538462:13:14:11:9:14:14:11:13
chr11	78277277	.	A	G	182.99	PASS	AF=0.452381;AO=19;DP=42;FAO=19;FDP=42;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.024215;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.624;QD=17.4276;RBI=0.0354075;REFB=-0.00541213;REVB=-0.0258327;RO=23;SAF=11;SAR=8;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0556529;STB=0.531773;STBP=0.69;TYPE=snp;VARB=0.00540091;OID=.;OPOS=78277277;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:23:23:19:19:0.452381:8:11:12:11:8:11:12:11
chr11	78279790	.	T	G	337.93	PASS	AF=0.467532;AO=36;DP=76;FAO=36;FDP=77;FR=.;FRO=41;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=-0.0183832;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=220.813;QD=17.5547;RBI=0.0184139;REFB=0.00407125;REVB=0.0010629;RO=40;SAF=21;SAR=15;SRF=20;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.079421;STB=0.53844;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=-0.00477199;OID=.;OPOS=78279790;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:77:40:41:36:36:0.467532:15:21:20:20:15:21:21:20
chr11	78290350	.	G	A	269.56	PASS	AF=0.407895;AO=31;DP=76;FAO=31;FDP=76;FR=.;FRO=45;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=27;FSRR=18;FWDB=-0.0268618;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.701;QD=14.1874;RBI=0.0480203;REFB=0.0020468;REVB=-0.0398044;RO=44;SAF=16;SAR=15;SRF=26;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.077636;STB=0.54984;STBP=0.478;TYPE=snp;VARB=-0.00326428;OID=.;OPOS=78290350;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:44:45:31:31:0.407895:15:16:26:18:15:16:27:18
chr11	78443586	.	G	A	274.52	PASS	AF=0.527273;AO=29;DP=55;FAO=29;FDP=55;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=0.0427887;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.2036;QD=19.9653;RBI=0.0454514;REFB=-0.0212542;REVB=-0.0153284;RO=24;SAF=11;SAR=18;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135287;STB=0.576869;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=0.0185688;OID=.;OPOS=78443586;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:24:26:29:29:0.527273:18:11:13:11:18:11:14:12
chr11	79133220	.	T	C	194.41	PASS	AF=0.558824;AO=18;DP=34;FAO=19;FDP=34;FR=.;FRO=15;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.0623233;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.7661;QD=22.8714;RBI=0.0629032;REFB=-0.0360402;REVB=-0.00852165;RO=15;SAF=11;SAR=7;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171356;STB=0.603663;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=0.0249136;OID=.;OPOS=79133220;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:15:15:18:19:0.558824:7:11:6:9:7:12:6:9
chr11	81264998	.	G	T	469.47	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00211358;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.327;QD=58.6834;RBI=0.0153937;REFB=0;REVB=0.0152479;RO=0;SAF=12;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.08146e-05;OID=.;OPOS=81264998;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:20:12:0:0:20:12:0:0
chr11	82443672	.	C	G	306.33	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0181727;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=59.8056;QD=53.2745;RBI=0.0251141;REFB=0;REVB=-0.0173341;RO=0;SAF=10;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.19619e-05;OID=.;OPOS=82443672;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:13:10:0:0:13:10:0:0
chr11	82443817	.	G	A	709.06	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0347682;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.9831;QD=63.0275;RBI=0.0403053;REFB=0;REVB=0.0203885;RO=0;SAF=23;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000620963;OID=.;OPOS=82443817;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:45:0:0:44:45:1:21:23:0:0:21:24:0:0
chr11	82535963	.	C	T	708.55	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0203134;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=204.467;QD=62.9825;RBI=0.0365497;REFB=0;REVB=-0.030385;RO=0;SAF=33;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.2922e-05;OID=.;OPOS=82535963;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:12:33:0:0:12:33:0:0
chr11	82643760	.	G	T	145.54	PASS	AF=0.444444;AO=16;DP=36;FAO=16;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=-0.0433949;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.1682;QD=16.1713;RBI=0.0434909;REFB=0.0171857;REVB=-0.00288799;RO=18;SAF=8;SAR=8;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0513688;STB=0.555487;STBP=0.564;TYPE=snp;VARB=-0.0217882;OID=.;OPOS=82643760;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:18:20:16:16:0.444444:8:8:8:10:8:8:8:12
chr11	82644904	.	G	A	39.62	PASS	AF=0.5;AO=6;DP=12;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.00526517;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.315;QD=13.2053;RBI=0.0285444;REFB=-0.00171523;REVB=-0.0280546;RO=6;SAF=5;SAR=1;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.345446;STB=0.713468;STBP=0.206;TYPE=snp;VARB=0.000749028;OID=.;OPOS=82644904;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:12:12:6:6:6:6:0.5:1:5:3:3:1:5:3:3
chr11	82973004	.	C	T	73.05	PASS	AF=0.3125;AO=10;DP=32;FAO=10;FDP=32;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=-0.00553156;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.189;QD=9.13177;RBI=0.0161969;REFB=0.00281807;REVB=-0.015223;RO=21;SAF=6;SAR=4;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.339836;STB=0.6864;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=-0.00801372;OID=.;OPOS=82973004;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:32:32:21:22:10:10:0.3125:4:6:6:15:4:6:7:15
chr11	82996986	.	A	C	299.98	PASS	AF=0.5;AO=32;DP=65;FAO=32;FDP=64;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=0.0137003;FXX=0.0153822;HRUN=3;LEN=1;MLLD=260.977;QD=18.7489;RBI=0.0148053;REFB=-0.0160999;REVB=-0.0056124;RO=32;SAF=14;SAR=18;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0843072;STB=0.547029;STBP=0.469;TYPE=snp;VARB=0.0147437;OID=.;OPOS=82996986;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:64:32:32:32:32:0.5:18:14:17:15:18:14:17:15
chr11	83182715	.	G	A	169.19	PASS	AF=0.384615;AO=20;DP=52;FAO=20;FDP=52;FR=.;FRO=32;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=-0.0776884;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.886;QD=13.0144;RBI=0.077817;REFB=-0.0141689;REVB=0.00447126;RO=32;SAF=8;SAR=12;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107793;STB=0.562437;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0194346;OID=.;OPOS=83182715;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:32:32:20:20:0.384615:12:8:16:16:12:8:16:16
chr11	85195025	.	A	C	3465.32	PASS	AF=0.970085;AO=226;DP=233;FAO=227;FDP=234;FR=.;FRO=7;FSAF=78;FSAR=149;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.0127772;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.174;QD=59.2362;RBI=0.0134197;REFB=0.0222303;REVB=-0.00410258;RO=7;SAF=78;SAR=148;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0142477;STB=0.507518;STBP=0.209;TYPE=snp;VARB=-0.000909146;OID=.;OPOS=85195025;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:233:234:7:7:226:227:0.970085:148:78:4:3:149:78:4:3
chr11	85195069	.	C	G	52.19	PASS	AF=0.0731707;AO=21;DP=286;FAO=21;FDP=287;FR=.;FRO=266;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=92;FSRR=174;FWDB=-0.0289435;FXX=0.0034721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.2935;QD=0.727333;RBI=0.0317654;REFB=-0.00222527;REVB=-0.0130888;RO=264;SAF=5;SAR=16;SRF=92;SRR=172;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143834;STB=0.62018;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=0.0320962;OID=.;OPOS=85195069;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:286:287:264:266:21:21:0.0731707:16:5:92:172:16:5:92:174
chr11	85195075	.	T	C	4203.23	PASS	AF=0.961672;AO=275;DP=286;FAO=276;FDP=287;FR=.;FRO=11;FSAF=89;FSAR=187;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=-0.0135508;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=219.35;QD=58.5816;RBI=0.0167474;REFB=-0.0169921;REVB=0.00984135;RO=9;SAF=89;SAR=186;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0234355;STB=0.509712;STBP=0.111;TYPE=snp;VARB=-2.8592e-06;OID=.;OPOS=85195075;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:286:287:9:11:275:276:0.961672:186:89:6:3:187:89:6:5
chr11	85195154	.	A	T	3290.88	PASS	AF=0.986175;AO=213;DP=216;FAO=214;FDP=217;FR=.;FRO=3;FSAF=91;FSAR=123;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0358224;FXX=0.009132;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.929;QD=60.6613;RBI=0.0501305;REFB=-0.0999426;REVB=0.0350688;RO=3;SAF=91;SAR=122;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00646513;STB=0.50341;STBP=0.482;TYPE=snp;VARB=0.00130934;OID=.;OPOS=85195154;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:216:217:3:3:213:214:0.986175:122:91:2:1:123:91:2:1
chr11	85195185	.	T	C	1594.19	PASS	AF=0.964602;AO=109;DP=115;FAO=109;FDP=113;FR=.;FRO=4;FSAF=42;FSAR=67;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0255944;FXX=0.0173898;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.657;QD=56.4314;RBI=0.0271221;REFB=0.0105929;REVB=0.00897427;RO=4;SAF=42;SAR=67;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00810936;STB=0.504276;STBP=0.654;TYPE=snp;VARB=-3.61059e-05;OID=.;OPOS=85195185;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:115:113:4:4:109:109:0.964602:67:42:2:2:67:42:2:2
chr11	85195190	.	CA	GG	1317.12	PASS	AF=0.956522;AO=83;DP=87;FAO=88;FDP=92;FR=.;FRO=4;FSAF=33;FSAR=55;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.00229112;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=281.67;QD=57.2662;RBI=0.0270813;REFB=-0.0337107;REVB=0.0269842;RO=4;SAF=33;SAR=50;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00927612;STB=0.505779;STBP=0.644;TYPE=mnp;VARB=0.00112736;OID=.;OPOS=85195190;OREF=CA;OALT=GG;OMAPALT=GG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:87:92:4:4:83:88:0.956522:50:33:2:2:55:33:2:2
chr11	85195226	.	T	C	602.31	PASS	AF=0.931818;AO=41;DP=44;FAO=41;FDP=44;FR=.;FRO=3;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.026503;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.287;QD=54.7554;RBI=0.0276698;REFB=0.00717282;REVB=0.00795047;RO=2;SAF=19;SAR=22;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0407606;STB=0.531899;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=-0.000150366;OID=.;OPOS=85195226;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:44:44:2:3:41:41:0.931818:22:19:0:2:22:19:0:3
chr11	85195232	.	A	G	35.95	PASS	AF=0.26087;AO=6;DP=23;FAO=6;FDP=23;FR=.;FRO=17;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=17;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.822;QD=6.25133;RBI=0.0175643;REFB=-0.00482022;REVB=0.0175643;RO=17;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00891892;OID=.;OPOS=85195232;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:23:23:17:17:6:6:0.26087:6:0:0:17:6:0:0:17
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chr11	85415906	.	G	A	670.43	PASS	AF=0.536585;AO=66;DP=123;FAO=66;FDP=123;FR=.;FRO=57;FSAF=31;FSAR=35;FSRF=24;FSRR=33;FWDB=-0.0499561;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.8547;QD=21.8025;RBI=0.0508675;REFB=-0.0133003;REVB=0.00958571;RO=56;SAF=31;SAR=35;SRF=24;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0346542;STB=0.522681;STBP=0.586;TYPE=snp;VARB=0.0117784;OID=.;OPOS=85415906;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:123:123:56:57:66:66:0.536585:35:31:24:32:35:31:24:33
chr11	85435730	.	C	T	452.19	PASS	AF=0.483871;AO=45;DP=93;FAO=45;FDP=93;FR=.;FRO=48;FSAF=28;FSAR=17;FSRF=20;FSRR=28;FWDB=0.00123708;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.181;QD=19.4491;RBI=0.0355394;REFB=-0.00974096;REVB=-0.0355179;RO=48;SAF=28;SAR=17;SRF=20;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192206;STB=0.606889;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.00640804;OID=.;OPOS=85435730;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:48:48:45:45:0.483871:17:28:20:28:17:28:20:28
chr11	85436352	.	G	A	472.94	PASS	AF=0.440678;AO=51;DP=119;FAO=52;FDP=118;FR=.;FRO=66;FSAF=25;FSAR=27;FSRF=31;FSRR=35;FWDB=0.00100521;FXX=0.00840265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.243;QD=16.0318;RBI=0.0022196;REFB=-0.00691191;REVB=-0.00197893;RO=66;SAF=25;SAR=26;SRF=31;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0206644;STB=0.506203;STBP=0.911;TYPE=snp;VARB=0.00283463;OID=.;OPOS=85436352;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:118:66:66:51:52:0.440678:26:25:31:35:27:25:31:35
chr11	85436394	.	T	C	429.51	PASS	AF=0.448598;AO=47;DP=106;FAO=48;FDP=107;FR=.;FRO=59;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=25;FSRR=34;FWDB=0.00518311;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.648;QD=16.0563;RBI=0.0222798;REFB=-0.00155287;REVB=0.0216686;RO=59;SAF=21;SAR=26;SRF=25;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0232793;STB=0.519268;STBP=0.708;TYPE=snp;VARB=0.00175186;OID=.;OPOS=85436394;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:107:59:59:47:48:0.448598:26:21:25:34:26:22:25:34
chr11	85436500	.	T	C	131.31	PASS	AF=0.405405;AO=15;DP=37;FAO=15;FDP=37;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=-0.0359591;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.416;QD=14.1955;RBI=0.0364433;REFB=-0.00110603;REVB=-0.00592113;RO=22;SAF=9;SAR=6;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00964467;STB=0.50561;STBP=0.987;TYPE=snp;VARB=0.0010677;OID=.;OPOS=85436500;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:22:22:15:15:0.405405:6:9:13:9:6:9:13:9
chr11	85436699	.	A	G	1264.72	PASS	AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0235057;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.16;QD=61.6937;RBI=0.0235347;REFB=0;REVB=-0.00116861;RO=0;SAF=46;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.14462e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.98834e-05;OID=.;OPOS=85436699;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:36:46:0:0:36:46:0:0
chr11	85436868	.	G	C	283.65	PASS	AF=0.462687;AO=30;DP=66;FAO=31;FDP=67;FR=.;FRO=36;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=23;FSRR=13;FWDB=0.0773932;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.875;QD=16.934;RBI=0.0775696;REFB=0.00701402;REVB=0.00522791;RO=35;SAF=12;SAR=18;SRF=23;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.24293;STB=0.616482;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=-0.00634888;OID=.;OPOS=85436868;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:67:35:36:30:31:0.462687:18:12:23:12:18:13:23:13
chr11	85437896	.	A	G	242.92	PASS	AF=0.534884;AO=22;DP=43;FAO=23;FDP=43;FR=.;FRO=20;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=-0.0215175;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.7306;QD=22.5969;RBI=0.0475822;REFB=0.0234122;REVB=0.0424389;RO=20;SAF=13;SAR=9;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.202833;STB=0.619615;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=-0.00773893;OID=.;OPOS=85437896;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:20:20:22:23:0.534884:9:13:7:13:9:14:7:13
chr11	85447611	.	T	C	365.14	PASS	AF=0.428571;AO=39;DP=91;FAO=39;FDP=91;FR=.;FRO=52;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=32;FSRR=20;FWDB=0.0513802;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.012;QD=16.0501;RBI=0.0514063;REFB=0.00472636;REVB=0.0016385;RO=52;SAF=18;SAR=21;SRF=32;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155157;STB=0.587204;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=-0.00467086;OID=.;OPOS=85447611;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:52:52:39:39:0.428571:21:18:32:20:21:18:32:20
chr11	85456703	.	T	C	245.72	PASS	AF=0.357143;AO=28;DP=83;FAO=30;FDP=84;FR=.;FRO=54;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=29;FSRR=25;FWDB=0.0335252;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.12;QD=11.7008;RBI=0.0400096;REFB=-0.0114627;REVB=-0.0218363;RO=54;SAF=12;SAR=16;SRF=29;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122941;STB=0.588457;STBP=0.226;TYPE=snp;VARB=0.0217797;OID=.;OPOS=85456703;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:84:54:54:28:30:0.357143:16:12:29:25:18:12:29:25
chr11	85565397	.	G	A	167.32	PASS	AF=0.368421;AO=21;DP=57;FAO=21;FDP=57;FR=.;FRO=36;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=23;FWDB=-0.018676;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.885;QD=11.7418;RBI=0.0338575;REFB=-0.0103792;REVB=-0.0282407;RO=36;SAF=9;SAR=12;SRF=13;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0760468;STB=0.544;STBP=0.637;TYPE=snp;VARB=0.018752;OID=.;OPOS=85565397;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:36:36:21:21:0.368421:12:9:13:23:12:9:13:23
chr11	85669592	.	TTA	T,TTT	77.05	PASS	AF=0.478261,0;AO=10,7;DP=41;FAO=11,0;FDP=23;FR=.;FRO=12;FSAF=5,0;FSAR=6,0;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=-0.206056,0.0656745;FXX=0.342759;HRUN=8,7;LEN=2,1;MLLD=16.9018,8.64853;QD=13.4;RBI=0.221489,0.104312;REFB=-0.0950953,-0.0379307;REVB=-0.0812313,-0.0810425;RO=19;SAF=3,0;SAR=7,7;SRF=6;SRR=13;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0201317,-0.699533;STB=0.655489,0.5;STBP=0.227,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0875778,0;OID=.,.;OPOS=85669593,85669594;OREF=TA,A;OALT=-,T;OMAPALT=T,TTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.478261,0:10,7:41:11,0:23:12:5,0:6,0:2:10:74:19:3,0:7,7:6:13
chr11	85669601	.	G	A	65.9	PASS	AF=0.138889;AO=5;DP=36;FAO=5;FDP=36;FR=.,HEALED;FRO=26;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=21;FWDB=0.0117007;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.154;QD=7.32264;RBI=0.0142061;REFB=-0.00357147;REVB=0.00805658;RO=25;SAF=2;SAR=3;SRF=4;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.346531;STB=0.695037;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.0183528;OID=.;OPOS=85669601;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:31:36:36:25:26:5:5:0.138889:3:2:4:21:3:2:5:21
chr11	85692181	.	A	T	566.33	PASS	AF=0.565217;AO=52;DP=92;FAO=52;FDP=92;FR=.;FRO=40;FSAF=28;FSAR=24;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=-0.00351935;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.516;QD=24.623;RBI=0.0196635;REFB=0.00682073;REVB=-0.019346;RO=40;SAF=28;SAR=24;SRF=18;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0701849;STB=0.538447;STBP=0.397;TYPE=snp;VARB=-0.00460727;OID=.;OPOS=85692181;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:40:40:52:52:0.565217:24:28:18:22:24:28:18:22
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chr11	85718641	.	T	C	727.62	PASS	AF=0.510791;AO=71;DP=139;FAO=71;FDP=139;FR=.;FRO=68;FSAF=36;FSAR=35;FSRF=29;FSRR=39;FWDB=0.035164;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.605;QD=20.9387;RBI=0.0352092;REFB=-0.0032018;REVB=0.00178497;RO=68;SAF=36;SAR=35;SRF=29;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.071603;STB=0.539369;STBP=0.394;TYPE=snp;VARB=0.00281793;OID=.;OPOS=85718641;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:139:139:68:68:71:71:0.510791:35:36:29:39:35:36:29:39
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chr11	86267714	.	C	A	548.03	PASS	AF=0.548387;AO=51;DP=93;FAO=51;FDP=93;FR=.;FRO=42;FSAF=23;FSAR=28;FSRF=16;FSRR=26;FWDB=-0.000128238;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=237.452;QD=23.571;RBI=0.0196749;REFB=0.000974198;REVB=-0.0196744;RO=42;SAF=23;SAR=28;SRF=16;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0585442;STB=0.532121;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=-0.000810804;OID=.;OPOS=86267714;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:42:42:51:51:0.548387:28:23:16:26:28:23:16:26
chr11	86660886	.	G	A	1511.12	PASS	AF=1;AO=101;DP=102;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0142562;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.765;QD=59.8462;RBI=0.0240211;REFB=0;REVB=-0.0193333;RO=0;SAF=55;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.13729e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.79666e-05;OID=.;OPOS=86660886;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:102:101:0:0:101:101:1:46:55:0:0:46:55:0:0
chr11	87013438	.	G	A	522.78	PASS	AF=0.505051;AO=50;DP=99;FAO=50;FDP=99;FR=.;FRO=49;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=25;FSRR=24;FWDB=-0.0157708;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=228.599;QD=21.1223;RBI=0.0157897;REFB=0.0004321;REVB=-0.000772383;RO=49;SAF=26;SAR=24;SRF=25;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00877617;STB=0.504852;STBP=0.944;TYPE=snp;VARB=-0.000531736;OID=.;OPOS=87013438;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:49:49:50:50:0.505051:24:26:25:24:24:26:25:24
chr11	87034002	.	C	T	242.15	PASS	AF=0.473684;AO=27;DP=57;FAO=27;FDP=57;FR=.;FRO=30;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=0.00197788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.121;QD=16.9929;RBI=0.00652027;REFB=0.000231427;REVB=-0.00621304;RO=30;SAF=14;SAR=13;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110609;STB=0.562131;STBP=0.403;TYPE=snp;VARB=-0.000270273;OID=.;OPOS=87034002;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:30:30:27:27:0.473684:13:14:12:18:13:14:12:18
chr11	88045583	.	A	G	1522.93	PASS	AF=0.990385;AO=103;DP=104;FAO=103;FDP=104;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0720846;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.4645;QD=58.5744;RBI=0.0733887;REFB=-0.100586;REVB=-0.0137738;RO=1;SAF=48;SAR=55;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00854954;STB=0.504504;STBP=0.467;TYPE=snp;VARB=0.00132632;OID=.;OPOS=88045583;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:104:104:1:1:103:103:0.990385:55:48:0:1:55:48:0:1
chr11	88301120	.	G	A	30.1	PASS	AF=0.416667;AO=5;DP=12;FAO=5;FDP=12;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.0300342;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=237.077;QD=10.0338;RBI=0.0328527;REFB=-0.00346186;REVB=0.0133134;RO=7;SAF=3;SAR=2;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.413035;STB=0.749164;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=0.0075888;OID=.;OPOS=88301120;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:12:12:7:7:5:5:0.416667:2:3:1:6:2:3:1:6
chr11	88645129	.	T	A	266.57	PASS	AF=0.447761;AO=30;DP=67;FAO=30;FDP=67;FR=.;FRO=37;FSAF=7;FSAR=23;FSRF=14;FSRR=23;FWDB=0.0097396;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=266.767;QD=15.9144;RBI=0.0136484;REFB=0.00064899;REVB=0.00956135;RO=37;SAF=7;SAR=23;SRF=14;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17576;STB=0.599928;STBP=0.198;TYPE=snp;VARB=-0.000739165;OID=.;OPOS=88645129;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:37:37:30:30:0.447761:23:7:14:23:23:7:14:23
chr11	88645211	.	G	A	192.98	PASS	AF=0.410714;AO=23;DP=56;FAO=23;FDP=56;FR=.;FRO=33;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=10;FSRR=23;FWDB=-0.0568324;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.057;QD=13.7842;RBI=0.0593709;REFB=-0.0207911;REVB=-0.017175;RO=33;SAF=7;SAR=16;SRF=10;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00160199;STB=0.500917;STBP=0.999;TYPE=snp;VARB=0.0332131;OID=.;OPOS=88645211;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:33:33:23:23:0.410714:16:7:10:23:16:7:10:23
chr11	89133449	.	C	T	1457.45	PASS	AF=1;AO=91;DP=93;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0198306;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.997;QD=63.3676;RBI=0.02017;REFB=0;REVB=0.00368452;RO=0;SAF=49;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000318996;OID=.;OPOS=89133449;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:93:92:0:0:91:92:1:42:49:0:0:43:49:0:0
chr11	89224101	.	G	T	311.96	PASS	AF=0.357798;AO=39;DP=109;FAO=39;FDP=109;FR=.;FRO=70;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=36;FSRR=34;FWDB=0.000279182;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=213.583;QD=11.448;RBI=0.0136792;REFB=-0.00649759;REVB=-0.0136763;RO=70;SAF=24;SAR=15;SRF=36;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11562;STB=0.566439;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.0147741;OID=.;OPOS=89224101;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:109:70:70:39:39:0.357798:15:24:36:34:15:24:36:34
chr11	89224131	.	T	TCTC	320.04	PASS	AF=0.443038;AO=33;DP=86;FAO=35;FDP=79;FR=.;FRO=44;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=-0.0080449;FXX=0.048187;HRUN=1;LEN=3;MLLD=224.304;QD=16.2047;RBI=0.00960962;REFB=-0.0252701;REVB=0.00525589;RO=51;SAF=20;SAR=13;SRF=26;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104477;STB=0.556668;STBP=0.42;TYPE=ins;VARB=0.0329376;OID=.;OPOS=89224132;OREF=-;OALT=CTC;OMAPALT=TCTC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.443038:33:86:35:79:44:21:14:22:22:99:51:20:13:26:25
chr11	89450991	.	G	A	36.55	PASS	AF=0.0833333;AO=11;DP=132;FAO=11;FDP=132;FR=.;FRO=121;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=71;FSRR=50;FWDB=-0.0111251;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.413;QD=1.1076;RBI=0.0264212;REFB=-0.00465951;REVB=-0.0239648;RO=121;SAF=8;SAR=3;SRF=71;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171033;STB=0.641181;STBP=0.364;TYPE=snp;VARB=0.0409378;OID=.;OPOS=89450991;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:132:132:121:121:11:11:0.0833333:3:8:71:50:3:8:71:50
chr11	89531619	.	A	G	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000563473;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.483;QD=40.763;RBI=0.0384706;REFB=0;REVB=0.0384664;RO=0;SAF=5;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000965225;OID=.;OPOS=89531619;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:5:5:0:0:5:5:0:0
chr11	89531764	.	T	C	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.7905;QD=35.5757;RBI=0.0294684;REFB=0;REVB=0.0294684;RO=0;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00244424;OID=.;OPOS=89531764;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:7:0:0:0:7:0:0:0
chr11	89531780	.	G	C	74.9	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.3144;QD=37.4497;RBI=0.0173786;REFB=0;REVB=0.0173786;RO=0;SAF=0;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00115033;OID=.;OPOS=89531780;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:8:0:0:0:8:0:0:0
chr11	89774236	.	C	G	613.18	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0721376;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.5024;QD=61.3183;RBI=0.0846762;REFB=0;REVB=-0.044342;RO=0;SAF=20;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000402135;OID=.;OPOS=89774236;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:20:20:0:0:20:20:0:0
chr11	89774397	.	T	C	223.19	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0115323;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.35;QD=49.5986;RBI=0.0120929;REFB=0;REVB=0.00363922;RO=0;SAF=8;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000101342;OID=.;OPOS=89774397;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:10:8:0:0:10:8:0:0
chr11	89774448	.	G	A	766.34	PASS	AF=1;AO=48;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=33;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0670983;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.8732;QD=56.7657;RBI=0.131598;REFB=0;REVB=0.113207;RO=0;SAF=30;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.73384e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00240613;OID=.;OPOS=89774448;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:48:54:1:18:30:0:0:21:33:0:0
chr11	89774540	.	C	A	686.49	PASS	AF=0.45679;AO=74;DP=160;FAO=74;FDP=162;FR=.;FRO=88;FSAF=47;FSAR=27;FSRF=43;FSRR=45;FWDB=-0.0599793;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.8516;QD=16.9505;RBI=0.0843159;REFB=0.0290394;REVB=-0.0592592;RO=86;SAF=47;SAR=27;SRF=43;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135282;STB=0.582021;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=-0.0354185;OID=.;OPOS=89774540;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:160:162:86:88:74:74:0.45679:27:47:43:43:27:47:43:45
chr11	89868755	.	G	A	1322.56	PASS	AF=1;AO=84;DP=84;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00475641;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.6786;QD=61.5143;RBI=0.0470148;REFB=0;REVB=-0.0467736;RO=0;SAF=47;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.99643e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000163734;OID=.;OPOS=89868755;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:86:0:0:84:86:1:37:47:0:0:38:48:0:0
chr11	89880604	.	G	A	579.08	PASS	AF=0.604651;AO=52;DP=87;FAO=52;FDP=86;FR=.;FRO=34;FSAF=27;FSAR=25;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=0.0102068;FXX=0.0114929;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.299;QD=26.9341;RBI=0.0125897;REFB=0.00217686;REVB=-0.00737038;RO=33;SAF=27;SAR=25;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0245061;STB=0.507607;STBP=0.877;TYPE=snp;VARB=-0.00165865;OID=.;OPOS=89880604;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:86:33:34:52:52:0.604651:25:27:16:17:25:27:17:17
chr11	89896571	.	G	A	464.99	PASS	AF=0.422764;AO=52;DP=123;FAO=52;FDP=123;FR=.;FRO=71;FSAF=24;FSAR=28;FSRF=40;FSRR=31;FWDB=-0.00145416;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=327.518;QD=15.1217;RBI=0.00451481;REFB=-0.00677881;REVB=-0.00427422;RO=71;SAF=24;SAR=28;SRF=40;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104407;STB=0.558581;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.0113032;OID=.;OPOS=89896571;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:123:123:71:71:52:52:0.422764:28:24:40:31:28:24:40:31
chr11	89916080	.	G	C	1638.51	PASS	AF=1;AO=108;DP=109;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0172331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.778;QD=60.1288;RBI=0.0203869;REFB=0;REVB=0.0108924;RO=0;SAF=51;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.60583e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.04338e-05;OID=.;OPOS=89916080;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:109:109:0:0:108:109:1:57:51:0:0:58:51:0:0
chr11	89935586	.	G	T	1568.43	PASS	AF=1;AO=98;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0122558;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.1616;QD=64.0177;RBI=0.0245377;REFB=0;REVB=-0.0212578;RO=0;SAF=50;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.35849e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000103155;OID=.;OPOS=89935586;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:98:0:0:98:98:1:48:50:0:0:48:50:0:0
chr11	89939442	.	T	TA	325.91	PASS	AF=1;AO=9;DP=52;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.105326;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.5842;QD=28.9696;RBI=0.188073;REFB=0;REVB=-0.155813;RO=43;SAF=6;SAR=3;SRF=27;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0518569;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00396061;OID=.;OPOS=89939443;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:9:52:45:45:0:28:17:0:0:6:43:6:3:27:16
chr11	89939448	.	G	A	671.34	PASS	AF=0.977778;AO=43;DP=44;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00165224;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.9323;QD=59.6749;RBI=0.0455694;REFB=-0.0119858;REVB=-0.0455394;RO=1;SAF=26;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0177216;STB=0.509087;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.00815666;OID=.;OPOS=89939448;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:44:45:1:1:43:44:0.977778:17:26:1:0:17:27:1:0
chr11	91545212	.	C	G	579.17	PASS	AF=1;AO=37;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0199822;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.8926;QD=60.9652;RBI=0.0610733;REFB=0;REVB=0.0577119;RO=0;SAF=15;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.82408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000570746;OID=.;OPOS=91545212;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:37:38:1:22:15:0:0:23:15:0:0
chr11	92086345	.	G	A	1445.46	PASS	AF=1;AO=77;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=49;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0750876;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.262;QD=62.8461;RBI=0.0751129;REFB=0;REVB=-0.00195117;RO=0;SAF=35;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.10118e-05;OID=.;OPOS=92086345;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:92:92:0:0:77:92:1:42:35:0:0:43:49:0:0
chr11	92531356	.	A	G	611.2	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00539546;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=317.051;QD=61.1196;RBI=0.0191729;REFB=0;REVB=0.0183981;RO=0;SAF=20;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.3303e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.49589e-05;OID=.;OPOS=92531356;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:40:0:0:39:40:1:19:20:0:0:19:21:0:0
chr11	92531823	.	G	A	176.27	PASS	AF=0.529412;AO=18;DP=34;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.023782;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.139;QD=20.7374;RBI=0.0239709;REFB=0.0151697;REVB=0.0030034;RO=13;SAF=10;SAR=8;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0129189;STB=0.526286;STBP=0.8;TYPE=snp;VARB=-0.0198907;OID=.;OPOS=92531823;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:13:16:18:18:0.529412:8:10:7:6:8:10:8:8
chr11	92532677	.	T	C	167.37	PASS	AF=0.9375;AO=14;DP=16;FAO=15;FDP=16;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0644982;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.1257;QD=41.8433;RBI=0.0645021;REFB=-0.0026908;REVB=-0.000706467;RO=2;SAF=3;SAR=11;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0900727;STB=0.571326;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=0.00126814;OID=.;OPOS=92532677;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:16:16:2:1:14:15:0.9375:11:3:1:1:12:3:1:0
chr11	92533057	.	A	G	95.68	PASS	AF=0.363636;AO=12;DP=33;FAO=12;FDP=33;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=15;FWDB=0.0110349;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.589;QD=11.597;RBI=0.0204073;REFB=-0.0292174;REVB=-0.0171665;RO=19;SAF=9;SAR=3;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.444132;STB=0.782162;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.030439;OID=.;OPOS=92533057;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:33:33:19:21:12:12:0.363636:3:9:6:13:3:9:6:15
chr11	92534442	.	A	G	289.3	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00602508;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.385;QD=52.6;RBI=0.00602513;REFB=0;REVB=2.42444e-05;RO=0;SAF=12;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.04445e-05;OID=.;OPOS=92534442;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:22:0:0:21:22:1:9:12:0:0:10:12:0:0
chr11	92590448	.	A	G	416.04	PASS	AF=0.438776;AO=43;DP=98;FAO=43;FDP=98;FR=.;FRO=55;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=32;FSRR=23;FWDB=0.00742049;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.169;QD=16.9811;RBI=0.00759837;REFB=-0.00925961;REVB=0.0016345;RO=55;SAF=21;SAR=22;SRF=32;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0933548;STB=0.552321;STBP=0.387;TYPE=snp;VARB=0.010174;OID=.;OPOS=92590448;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:55:55:43:43:0.438776:22:21:32:23:22:21:32:23
chr11	92623877	.	G	A	294.21	PASS	AF=0.477612;AO=32;DP=67;FAO=32;FDP=67;FR=.;FRO=35;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=24;FSRR=11;FWDB=0.0023218;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=232.093;QD=17.5646;RBI=0.0193843;REFB=-0.00694342;REVB=0.0192448;RO=35;SAF=16;SAR=16;SRF=24;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173895;STB=0.596957;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=0.00763019;OID=.;OPOS=92623877;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:35:35:32:32:0.477612:16:16:24:11:16:16:24:11
chr11	92627848	.	A	G	1717.32	PASS	AF=1;AO=113;DP=113;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0206277;FXX=0.00877116;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.056;QD=60.7902;RBI=0.0213118;REFB=0;REVB=0.00535647;RO=0;SAF=52;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.30758e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.61089e-05;OID=.;OPOS=92627848;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:113:113:0:0:113:113:1:61:52:0:0:61:52:0:0
chr11	92629305	.	C	T	422.13	PASS	AF=0.518519;AO=42;DP=81;FAO=42;FDP=81;FR=.;FRO=39;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=0.00997446;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.0872;QD=20.8459;RBI=0.010028;REFB=-0.00416215;REVB=0.0010349;RO=39;SAF=19;SAR=23;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0304462;STB=0.516846;STBP=0.79;TYPE=snp;VARB=0.00390499;OID=.;OPOS=92629305;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:39:39:42:42:0.518519:23:19:19:20:23:19:19:20
chr11	92718127	.	G	C	501.27	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0298295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.25;QD=58.9734;RBI=0.0340426;REFB=0;REVB=-0.0164042;RO=0;SAF=19;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.71297e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.06278e-05;OID=.;OPOS=92718127;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:34:0:0:33:34:1:14:19:0:0:14:20:0:0
chr11	93085537	.	T	G	1212.41	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0383491;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.452;QD=60.6203;RBI=0.0426798;REFB=0;REVB=0.0187326;RO=0;SAF=38;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000189406;OID=.;OPOS=93085537;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:75:80:0:0:75:80:1:37:38:0:0:39:41:0:0
chr11	93129483	.	GA	CG	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.03385;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=112.179;QD=55.0982;RBI=0.0412614;REFB=0;REVB=0.0235941;RO=0;SAF=11;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000637133;OID=.;OPOS=93129483;OREF=GA;OALT=CG;OMAPALT=CG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:15:11:0:0:15:11:0:0
chr11	93141580	.	C	A	591.5	PASS	AF=1;AO=32;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0223271;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.288;QD=60.6664;RBI=0.0226783;REFB=0;REVB=0.00397599;RO=0;SAF=14;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000396617;OID=.;OPOS=93141580;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:32:39:1:18:14:0:0:23:16:0:0
chr11	93211764	.	A	G	937.46	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0123048;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.4711;QD=58.5911;RBI=0.0318777;REFB=0;REVB=0.0294071;RO=0;SAF=31;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000386386;OID=.;OPOS=93211764;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:33:31:0:0:33:31:0:0
chr11	93212254	.	C	T	918.54	PASS	AF=1;AO=63;DP=64;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0167163;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.45;QD=58.32;RBI=0.018424;REFB=0;REVB=0.00774656;RO=0;SAF=29;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.87178e-05;OID=.;OPOS=93212254;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:63:0:0:63:63:1:34:29:0:0:34:29:0:0
chr11	93402096	.	C	A	289.32	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.118652;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.1459;QD=52.6042;RBI=0.118693;REFB=0;REVB=-0.00312095;RO=0;SAF=12;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000992978;OID=.;OPOS=93402096;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:10:12:0:0:10:12:0:0
chr11	93408831	.	G	A	755.8	PASS	AF=0.981818;AO=54;DP=56;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0295516;FXX=0.017854;HRUN=3;LEN=1;MLLD=261.909;QD=54.9674;RBI=0.0357258;REFB=0.0829267;REVB=-0.0200757;RO=1;SAF=28;SAR=26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0177809;STB=0.50943;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=-0.000276433;OID=.;OPOS=93408831;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:56:55:1:1:54:54:0.981818:26:28:0:1:26:28:0:1
chr11	93425159	.	C	A	1847.11	PASS	AF=1;AO=121;DP=122;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0514037;FXX=0.0163921;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.8687;QD=61.5704;RBI=0.0553844;REFB=0;REVB=0.0206176;RO=0;SAF=57;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.75944e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000159614;OID=.;OPOS=93425159;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:122:120:0:0:121:120:1:64:57:0:0:63:57:0:0
chr11	93431177	.	A	G	278.89	PASS	AF=0.4;AO=32;DP=80;FAO=32;FDP=80;FR=.;FRO=48;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=24;FSRR=24;FWDB=0.00349402;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.6518;QD=13.9443;RBI=0.01199;REFB=-0.00174574;REVB=0.0114697;RO=48;SAF=19;SAR=13;SRF=24;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100085;STB=0.557016;STBP=0.413;TYPE=snp;VARB=0.00216865;OID=.;OPOS=93431177;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:48:48:32:32:0.4:13:19:24:24:13:19:24:24
chr11	93462607	.	A	T	1677.34	PASS	AF=1;AO=111;DP=111;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00763898;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.4169;QD=60.4446;RBI=0.00817842;REFB=0;REVB=-0.00292104;RO=0;SAF=44;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.5935e-05;OID=.;OPOS=93462607;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:111:111:0:0:111:111:1:67:44:0:0:67:44:0:0
chr11	93463726	.	T	TAG	175.09	PASS	AF=0.392857;AO=18;DP=59;FAO=22;FDP=56;FR=.;FRO=34;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=26;FSRR=8;FWDB=0.00543621;FXX=0.0508388;HRUN=0;LEN=2;MLLD=214.501;QD=12.5067;RBI=0.011105;REFB=-0.00089722;REVB=0.00968346;RO=33;SAF=11;SAR=7;SRF=25;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180128;STB=0.560495;STBP=0.523;TYPE=ins;VARB=0.00171441;OID=.;OPOS=93463727;OREF=-;OALT=AG;OMAPALT=TAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.392857:18:59:22:56:34:15:7:26:8:99:33:11:7:25:8
chr11	93464175	.	A	C	167.25	PASS	AF=0.368421;AO=21;DP=57;FAO=21;FDP=57;FR=.;FRO=36;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=21;FSRR=15;FWDB=-0.0145944;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=189.353;QD=11.7368;RBI=0.071242;REFB=-0.0103837;REVB=0.0697311;RO=36;SAF=13;SAR=8;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0406585;STB=0.52362;STBP=0.788;TYPE=snp;VARB=0.0205829;OID=.;OPOS=93464175;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:36:36:21:21:0.368421:8:13:21:15:8:13:21:15
chr11	93469840	.	GAAAAAAAT	GAAAAAATA	33.61	PASS	AF=0.146341;AO=4;DP=42;FAO=6;FDP=41;FR=.,HEALED;FRO=32;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=24;FWDB=0.00539909;FXX=0.0238039;HRUN=7;LEN=2;MLLD=21.0839;QD=3.27854;RBI=0.0364165;REFB=-0.0558113;REVB=0.0360141;RO=20;SAF=1;SAR=3;SRF=4;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0821032;STB=0.811699;STBP=0.159;TYPE=mnp;VARB=0.115696;OID=.;OPOS=93469847;OREF=AT;OALT=TA;OMAPALT=GAAAAAATA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.146341:4:42:6:41:32:4:2:8:24:21:20:1:3:4:16
chr11	93474570	.	T	A,TGCGTGA	1468.95	PASS	AF=0.0366972,0.926606;AO=4,96;DP=110;FAO=4,101;FDP=109;FR=.;FRO=4;FSAF=3,51;FSAR=1,50;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.00190604,0.0124928;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,6;MLLD=79.5497,209.385;QD=53.9062;RBI=0.0178549,0.0232661;REFB=-0.0645457,-0.0763543;REVB=0.0177529,0.0196276;RO=6;SAF=3,49;SAR=1,47;SRF=6;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.426205,-0.0546072;STB=0.699286,0.518864;STBP=0.753,0.052;TYPE=snp,ins;VARB=0.0679649,0.00244763;OID=.,.;OPOS=93474570,93474571;OREF=T,-;OALT=A,GCGTGA;OMAPALT=A,TGCGTGA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:8:110:109:6:4:4,96:4,101:0.0366972,0.926606:1,47:3,49:6:0:1,50:3,51:4:0
chr11	93517874	.	C	G	1028.98	PASS	AF=1;AO=62;DP=63;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0980096;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.394;QD=59.6509;RBI=0.100912;REFB=0;REVB=0.0240263;RO=0;SAF=29;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000107638;OID=.;OPOS=93517874;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:63:69:0:0:62:69:1:33:29:0:0:34:35:0:0
chr11	93517886	.	G	C	858.99	PASS	AF=1;AO=58;DP=59;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.133465;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.5568;QD=57.2662;RBI=0.13351;REFB=0;REVB=0.00343166;RO=0;SAF=30;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000543439;OID=.;OPOS=93517886;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:60:0:0:58:60:1:28:30:0:0:29:31:0:0
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chr11	93845511	.	A	G	1171.94	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0293091;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.893;QD=60.8798;RBI=0.0381619;REFB=0;REVB=0.0244399;RO=0;SAF=33;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.58027e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.15722e-05;OID=.;OPOS=93845511;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:44:33:0:0:44:33:0:0
chr11	93862493	.	A	C	383.19	PASS	AF=0.449438;AO=40;DP=90;FAO=40;FDP=89;FR=.;FRO=49;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=32;FSRR=17;FWDB=-0.0351597;FXX=0.0111099;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.1667;QD=17.2218;RBI=0.0351598;REFB=0.0213434;REVB=5.20273e-05;RO=49;SAF=19;SAR=21;SRF=32;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174112;STB=0.597276;STBP=0.125;TYPE=snp;VARB=-0.0224788;OID=.;OPOS=93862493;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:89:49:49:40:40:0.449438:21:19:32:17:21:19:32:17
chr11	94212865	.	T	C	66.82	PASS	AF=0.428571;AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.0131706;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.3322;QD=12.7278;RBI=0.0731024;REFB=0.00251791;REVB=0.0719061;RO=12;SAF=4;SAR=5;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0535863;STB=0.531844;STBP=0.772;TYPE=snp;VARB=0.0023066;OID=.;OPOS=94212865;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:21:21:12:12:9:9:0.428571:5:4:6:6:5:4:6:6
chr11	94231257	.	C	G	1071.99	PASS	AF=0.973333;AO=73;DP=75;FAO=73;FDP=75;FR=.;FRO=2;FSAF=24;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0235945;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.341;QD=57.1726;RBI=0.0236329;REFB=0.0076937;REVB=0.00134788;RO=2;SAF=24;SAR=49;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0189154;STB=0.509997;STBP=0.411;TYPE=snp;VARB=-8.82524e-05;OID=.;OPOS=94231257;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:75:75:2:2:73:73:0.973333:49:24:0:2:49:24:0:2
chr11	94231847	.	G	A	256.42	PASS	AF=0.533333;AO=24;DP=45;FAO=24;FDP=45;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=6;FWDB=-0.0391308;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.393;QD=22.7928;RBI=0.0395212;REFB=0.0160852;REVB=-0.005541;RO=21;SAF=13;SAR=11;SRF=15;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147688;STB=0.582165;STBP=0.265;TYPE=snp;VARB=-0.00964526;OID=.;OPOS=94231847;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:21:21:24:24:0.533333:11:13:15:6:11:13:15:6
chr11	94232145	.	C	T	264.35	PASS	AF=0.585366;AO=24;DP=42;FAO=24;FDP=41;FR=.;FRO=17;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=-0.00768955;FXX=0.0238039;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.075;QD=25.7901;RBI=0.00876823;REFB=4.96467e-05;REVB=-0.00421339;RO=17;SAF=11;SAR=13;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14022;STB=0.577714;STBP=0.262;TYPE=snp;VARB=-0.000195225;OID=.;OPOS=94232145;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:41:17:17:24:24:0.585366:13:11:11:6:13:11:11:6
chr11	94245740	.	A	G	1120.8	PASS	AF=0.986842;AO=75;DP=76;FAO=75;FDP=76;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0235888;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.79;QD=58.9894;RBI=0.025155;REFB=-0.0756645;REVB=0.00873752;RO=1;SAF=25;SAR=50;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00937034;STB=0.504949;STBP=0.615;TYPE=snp;VARB=2.37984e-05;OID=.;OPOS=94245740;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:76:76:1:1:75:75:0.986842:50:25:0:1:50:25:0:1
chr11	94261255	.	C	G	1511.17	PASS	AF=0.989691;AO=96;DP=97;FAO=96;FDP=97;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=60;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0323536;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=204.451;QD=62.3163;RBI=0.0419002;REFB=-0.144922;REVB=0.0266246;RO=1;SAF=36;SAR=60;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129899;STB=0.506848;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=0.000442618;OID=.;OPOS=94261255;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:97:97:1:1:96:96:0.989691:60:36:1:0:60:36:1:0
chr11	94282014	.	G	A	194.34	PASS	AF=0.59375;AO=19;DP=32;FAO=19;FDP=32;FR=.;FRO=13;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=0.0134409;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.756;QD=24.2929;RBI=0.0265184;REFB=-0.00220842;REVB=0.0228598;RO=13;SAF=11;SAR=8;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.195537;STB=0.609007;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=0.00162749;OID=.;OPOS=94282014;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:13:13:19:19:0.59375:8:11:4:9:8:11:4:9
chr11	94320237	.	T	C	691.47	PASS	AF=0.980392;AO=49;DP=51;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0825875;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=211.554;QD=54.233;RBI=0.087103;REFB=-0.0905012;REVB=0.0276808;RO=1;SAF=26;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0200211;STB=0.50943;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.000433544;OID=.;OPOS=94320237;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:51:51:1:1:49:50:0.980392:23:26:0:1:24:26:1:0
chr11	94322352	.	AG	TA	130.59	PASS	AF=0.424242;AO=13;DP=33;FAO=14;FDP=33;FR=.,HEALED;FRO=18;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=16;FWDB=-0.0204995;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=228.871;QD=15.8285;RBI=0.0205545;REFB=-0.0133796;REVB=-0.00150325;RO=18;SAF=6;SAR=7;SRF=2;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.372735;STB=0.692085;STBP=0.108;TYPE=mnp;VARB=0.0186086;OID=.;OPOS=94322352;OREF=AG;OALT=TA;OMAPALT=TA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:18:18:13:14:0.424242:7:6:2:16:8:6:2:16
chr11	94326710	.	G	A	283.75	PASS	AF=0.530612;AO=26;DP=49;FAO=26;FDP=49;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=0.0231147;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.649;QD=23.1633;RBI=0.0269853;REFB=0.0180143;REVB=0.0139253;RO=23;SAF=8;SAR=18;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.22829;STB=0.627805;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=-0.0140047;OID=.;OPOS=94326710;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:23:23:26:26:0.530612:18:8:13:10:18:8:13:10
chr11	94326765	.	G	C	244.32	PASS	AF=0.482143;AO=27;DP=56;FAO=27;FDP=56;FR=.;FRO=29;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=20;FWDB=-0.0406542;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.4289;QD=17.4517;RBI=0.0630231;REFB=0.0279007;REVB=0.0481575;RO=29;SAF=16;SAR=11;SRF=9;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.255902;STB=0.643217;STBP=0.06;TYPE=snp;VARB=-0.0307091;OID=.;OPOS=94326765;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:29:29:27:27:0.482143:11:16:9:20:11:16:9:20
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chr11	94699507	.	A	AT,T	1427.3	PASS	AF=1,0;AO=87,6;DP=106;FAO=98,0;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=46,0;FSAR=52,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0448532,-0.00239441;FXX=0.0297;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=27.846,268.982;QD=58.257;RBI=0.0719523,0.0116421;REFB=0,0;REVB=0.0562612,-0.0113932;RO=8;SAF=35,6;SAR=52,0;SRF=7;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0768805,0.702488;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.00199936,0;OID=.,.;OPOS=94699508,94699507;OREF=-,A;OALT=T,T;OMAPALT=AT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:106:98:8:0:87,6:98,0:1,0:52,0:35,6:7:1:52,0:46,0:0:0
chr11	94800902	.	G	GC	1343.46	PASS	AF=1;AO=113;DP=120;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0881526;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=20.6852;QD=44.7821;RBI=0.0919573;REFB=0;REVB=0.0261775;RO=4;SAF=51;SAR=62;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00318586;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.000467542;OID=.;OPOS=94800903;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:113:120:120:120:0:55:65:0:0:24:4:51:62:2:2
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chr11	95528714	.	C	T	326.73	PASS	AF=0.413793;AO=36;DP=87;FAO=36;FDP=87;FR=.;FRO=51;FSAF=25;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=31;FWDB=-0.0127022;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.704;QD=15.0222;RBI=0.0201353;REFB=-0.00160422;REVB=-0.0156232;RO=51;SAF=25;SAR=11;SRF=20;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.316782;STB=0.679511;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.00227666;OID=.;OPOS=95528714;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:51:51:36:36:0.413793:11:25:20:31:11:25:20:31
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chr11	95657111	.	T	G	492.23	PASS	AF=0.489796;AO=46;DP=96;FAO=48;FDP=98;FR=.;FRO=50;FSAF=18;FSAR=30;FSRF=25;FSRR=25;FWDB=-0.0493154;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.278;QD=20.091;RBI=0.0517992;REFB=-0.0258635;REVB=-0.0158478;RO=49;SAF=18;SAR=28;SRF=24;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0936564;STB=0.565762;STBP=0.199;TYPE=snp;VARB=0.0230467;OID=.;OPOS=95657111;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:98:49:50:46:48:0.489796:28:18:24:25:30:18:25:25
chr11	96116444	.	T	C	212.82	PASS	AF=0.5;AO=20;DP=42;FAO=21;FDP=42;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=-0.00507791;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.674;QD=20.2683;RBI=0.0109728;REFB=-0.00027984;REVB=0.00972712;RO=21;SAF=10;SAR=10;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107847;STB=0.5479;STBP=0.569;TYPE=snp;VARB=0.000254973;OID=.;OPOS=96116444;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:21:21:20:21:0.5:10:10:8:13:11:10:8:13
chr11	96125435	.	CTT	C	353.0	PASS	AF=0.594595;AO=43;DP=75;FAO=44;FDP=74;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=33;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=-0.013908;FXX=0.0263123;HRUN=3;LEN=2;MLLD=42.9603;QD=19.0813;RBI=0.0164505;REFB=-0.0124493;REVB=0.00878553;RO=29;SAF=10;SAR=33;SRF=9;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0763122;STB=0.543083;STBP=0.432;TYPE=del;VARB=0.00828172;OID=.;OPOS=96125436;OREF=TT;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.594595:43:75:44:74:30:11:33:10:20:99:29:10:33:9:20
chr11	96126361	.	A	G	237.39	PASS	AF=0.45;AO=27;DP=61;FAO=27;FDP=60;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=23;FWDB=0.0315002;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.6739;QD=15.826;RBI=0.0329208;REFB=-0.0146514;REVB=0.00956631;RO=33;SAF=16;SAR=11;SRF=10;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.276231;STB=0.655311;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.0510466;OID=.;OPOS=96126361;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:60:33:33:27:27:0.45:11:16:10:23:11:16:10:23
chr11	96126603	.	ATTGAAACTACT	A	42.65	PASS	AF=0.25;AO=8;DP=35;FAO=9;FDP=36;FR=.;FRO=27;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=-0.00963616;FXX=0;HRUN=2;LEN=11;MLLD=280.147;QD=4.73894;RBI=0.0115639;REFB=-0.00467106;REVB=0.00639282;RO=21;SAF=2;SAR=6;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.280468;STB=0.713776;STBP=0.179;TYPE=del;VARB=0.0155384;OID=.;OPOS=96126604;OREF=TTGAAACTACT;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.25:8:35:9:36:27:2:7:13:14:42:21:2:6:10:11
chr11	97716872	.	A	G	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0608551;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=272.969;QD=49.5992;RBI=0.0633183;REFB=0;REVB=0.017489;RO=0;SAF=7;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000397071;OID=.;OPOS=97716872;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:11:7:0:0:11:7:0:0
chr11	98991112	.	C	T	280.24	PASS	AF=0.455882;AO=30;DP=68;FAO=31;FDP=68;FR=.;FRO=37;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=0.0144003;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.026;QD=16.4846;RBI=0.0321753;REFB=0.00175289;REVB=-0.0287729;RO=37;SAF=10;SAR=20;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131564;STB=0.580294;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=-0.00220338;OID=.;OPOS=98991112;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:37:37:30:31:0.455882:20:10:17:20:21:10:17:20
chr11	100512794	.	G	A	392.28	PASS	AF=0.476744;AO=41;DP=86;FAO=41;FDP=86;FR=.;FRO=45;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=28;FWDB=-0.00984995;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.0448;QD=18.2455;RBI=0.0135804;REFB=0.0201158;REVB=0.00934906;RO=45;SAF=23;SAR=18;SRF=17;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170715;STB=0.595005;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=-0.0223303;OID=.;OPOS=100512794;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:45:45:41:41:0.476744:18:23:17:28:18:23:17:28
chr11	100792335	.	G	A	350.85	PASS	AF=0.529412;AO=36;DP=68;FAO=36;FDP=68;FR=.;FRO=32;FSAF=28;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=0.00157229;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.506;QD=20.6383;RBI=0.00353216;REFB=-0.00662626;REVB=0.00316292;RO=32;SAF=28;SAR=8;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.305009;STB=0.670395;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.00935981;OID=.;OPOS=100792335;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:32:32:36:36:0.529412:8:28:15:17:8:28:15:17
chr11	100814570	.	A	G	350.84	PASS	AF=0.364407;AO=43;DP=118;FAO=43;FDP=118;FR=.;FRO=75;FSAF=16;FSAR=27;FSRF=29;FSRR=46;FWDB=0.00107049;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.707;QD=11.893;RBI=0.00291836;REFB=0.00481396;REVB=0.00271494;RO=74;SAF=16;SAR=27;SRF=29;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0232763;STB=0.509857;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=-0.00884902;OID=.;OPOS=100814570;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:118:118:74:75:43:43:0.364407:27:16:29:45:27:16:29:46
chr11	100820630	.	A	G	508.82	PASS	AF=0.427481;AO=54;DP=129;FAO=56;FDP=131;FR=.;FRO=75;FSAF=25;FSAR=31;FSRF=34;FSRR=41;FWDB=0.0561171;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=47.3011;QD=15.5364;RBI=0.0614117;REFB=-0.0322276;REVB=0.0249453;RO=75;SAF=24;SAR=30;SRF=34;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00930142;STB=0.503994;STBP=0.944;TYPE=snp;VARB=0.0439291;OID=.;OPOS=100820630;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:129:131:75:75:54:56:0.427481:30:24:34:41:31:25:34:41
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chr11	100846936	.	A	G	323.42	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0749292;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.143;QD=53.9027;RBI=0.0750218;REFB=0;REVB=-0.00372666;RO=0;SAF=11;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000223754;OID=.;OPOS=100846936;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:13:11:0:0:13:11:0:0
chr11	100847050	.	A	G	371.11	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.043207;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.385;QD=54.9792;RBI=0.0450199;REFB=0;REVB=0.0126471;RO=0;SAF=11;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00265338;OID=.;OPOS=100847050;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:27:0:0:26:27:1:15:11:0:0:15:12:0:0
chr11	100847069	.	G	A	340.66	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00186299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.576;QD=54.5055;RBI=0.00568485;REFB=0;REVB=-0.00537093;RO=0;SAF=10;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.48652e-05;OID=.;OPOS=100847069;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:15:10:0:0:15:10:0:0
chr11	100859439	.	G	A	168.68	PASS	AF=0.428571;AO=18;DP=42;FAO=18;FDP=42;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=6;FWDB=0.000215967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.8028;QD=16.065;RBI=0.010319;REFB=-0.0074587;REVB=-0.0103167;RO=24;SAF=6;SAR=12;SRF=18;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.39861;STB=0.727036;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.014677;OID=.;OPOS=100859439;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:24:24:18:18:0.428571:12:6:18:6:12:6:18:6
chr11	100863096	.	A	G	349.87	PASS	AF=0.413043;AO=38;DP=92;FAO=38;FDP=92;FR=.;FRO=54;FSAF=11;FSAR=27;FSRF=29;FSRR=25;FWDB=0.00634418;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=161.956;QD=15.2116;RBI=0.0273474;REFB=0.00062938;REVB=0.0266013;RO=54;SAF=11;SAR=27;SRF=29;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.270538;STB=0.653669;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=-0.00114797;OID=.;OPOS=100863096;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:54:54:38:38:0.413043:27:11:29:25:27:11:29:25
chr11	100863196	.	T	C	471.49	PASS	AF=0.5625;AO=45;DP=80;FAO=45;FDP=80;FR=.;FRO=35;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=-0.00457167;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=273.837;QD=23.5743;RBI=0.00847469;REFB=-0.013517;REVB=-0.00713584;RO=35;SAF=20;SAR=25;SRF=14;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0360123;STB=0.519765;STBP=0.711;TYPE=snp;VARB=0.00920265;OID=.;OPOS=100863196;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:35:35:45:45:0.5625:25:20:14:21:25:20:14:21
chr11	100863319	.	A	C	402.68	PASS	AF=0.488095;AO=41;DP=84;FAO=41;FDP=84;FR=.;FRO=43;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=17;FSRR=26;FWDB=0.0640565;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.9001;QD=19.175;RBI=0.070153;REFB=0.0409187;REVB=0.0286044;RO=43;SAF=19;SAR=22;SRF=17;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0633454;STB=0.535194;STBP=0.548;TYPE=snp;VARB=-0.0365003;OID=.;OPOS=100863319;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:43:43:41:41:0.488095:22:19:17:26:22:19:17:26
chr11	100863354	.	C	A	434.88	PASS	AF=0.518072;AO=43;DP=83;FAO=43;FDP=83;FR=.;FRO=40;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=15;FSRR=25;FWDB=-0.03713;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.0844;QD=20.9582;RBI=0.043245;REFB=-0.000697693;REVB=-0.0221697;RO=39;SAF=17;SAR=26;SRF=15;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00968262;STB=0.510295;STBP=0.856;TYPE=snp;VARB=0.000110828;OID=.;OPOS=100863354;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:39:40:43:43:0.518072:26:17:15:24:26:17:15:25
chr11	100863611	.	G	A	348.89	PASS	AF=0.408602;AO=38;DP=93;FAO=38;FDP=93;FR=.;FRO=55;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=28;FSRR=27;FWDB=0.00616083;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=261.345;QD=15.0061;RBI=0.00864463;REFB=-0.00965993;REVB=0.00606414;RO=55;SAF=21;SAR=17;SRF=28;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0457152;STB=0.525883;STBP=0.737;TYPE=snp;VARB=0.0156733;OID=.;OPOS=100863611;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:55:55:38:38:0.408602:17:21:28:27:17:21:28:27
chr11	100863814	.	T	A	322.94	PASS	AF=0.559322;AO=33;DP=59;FAO=33;FDP=59;FR=.;FRO=26;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=-0.00927333;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.4053;QD=21.8944;RBI=0.0542675;REFB=-0.00634873;REVB=-0.0534693;RO=26;SAF=21;SAR=12;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0179618;STB=0.509928;STBP=0.89;TYPE=snp;VARB=0.00291628;OID=.;OPOS=100863814;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:26:26:33:33:0.559322:12:21:16:10:12:21:16:10
chr11	100864367	.	G	A	454.77	PASS	AF=0.425;AO=51;DP=120;FAO=51;FDP=120;FR=.;FRO=69;FSAF=24;FSAR=27;FSRF=31;FSRR=38;FWDB=0.00168432;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.535;QD=15.159;RBI=0.0108886;REFB=-0.0155301;REVB=-0.0107575;RO=68;SAF=24;SAR=27;SRF=30;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.030132;STB=0.51231;STBP=0.819;TYPE=snp;VARB=0.0127525;OID=.;OPOS=100864367;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:120:68:69:51:51:0.425:27:24:30:38:27:24:31:38
chr11	101771248	.	G	A	538.55	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00527305;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.933;QD=59.839;RBI=0.0339446;REFB=0;REVB=-0.0335326;RO=0;SAF=18;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00016688;OID=.;OPOS=101771248;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:18:18:0:0:18:18:0:0
chr11	101826949	.	T	C	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0560279;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.134;QD=52.6132;RBI=0.0560731;REFB=0;REVB=0.00224985;RO=0;SAF=11;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000332885;OID=.;OPOS=101826949;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:11:11:0:0:11:11:0:0
chr11	101832590	.	C	A	137.99	PASS	AF=0.736842;AO=14;DP=19;FAO=14;FDP=19;FR=.;FRO=5;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=-0.0535417;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.023;QD=29.0496;RBI=0.0555578;REFB=-0.000224434;REVB=0.0148312;RO=5;SAF=7;SAR=7;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141904;STB=0.578837;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=-0.000322389;OID=.;OPOS=101832590;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:19:19:5:5:14:14:0.736842:7:7:1:4:7:7:1:4
chr11	101832608	.	T	C	140.59	PASS	AF=0.777778;AO=14;DP=18;FAO=14;FDP=18;FR=.;FRO=4;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.0224165;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=228.61;QD=31.2416;RBI=0.032185;REFB=-0.00520378;REVB=0.0230948;RO=4;SAF=7;SAR=7;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100039;STB=0.555477;STBP=0.397;TYPE=snp;VARB=0.00152278;OID=.;OPOS=101832608;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:18:18:4:4:14:14:0.777778:7:7:1:3:7:7:1:3
chr11	101832670	.	G	A	114.03	PASS	AF=0.52;AO=13;DP=25;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=-0.106649;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.957;QD=18.2448;RBI=0.106663;REFB=-0.00833263;REVB=-0.00168502;RO=12;SAF=8;SAR=5;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.299224;STB=0.670407;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=0.024541;OID=.;OPOS=101832670;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:25:12:12:13:13:0.52:5:8:3:9:5:8:3:9
chr11	101833644	.	C	T	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00887865;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=242.453;QD=59.4355;RBI=0.0260777;REFB=0;REVB=0.0245197;RO=0;SAF=19;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.1382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.3938e-05;OID=.;OPOS=101833644;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:16:19:0:0:16:19:0:0
chr11	101833768	.	G	A	224.92	PASS	AF=0.488889;AO=22;DP=45;FAO=22;FDP=45;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=-0.00848955;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.308;QD=19.9928;RBI=0.0170958;REFB=-0.015114;REVB=-0.014839;RO=23;SAF=12;SAR=10;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138886;STB=0.578243;STBP=0.34;TYPE=snp;VARB=0.0144324;OID=.;OPOS=101833768;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:23:23:22:22:0.488889:10:12:9:14:10:12:9:14
chr11	101857758	.	G	A	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0217787;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.687;QD=55.6556;RBI=0.0231525;REFB=0;REVB=0.00785655;RO=0;SAF=9;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000153018;OID=.;OPOS=101857758;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:18:9:0:0:18:9:0:0
chr11	102398593	.	C	T	692.61	PASS	AF=0.511278;AO=68;DP=134;FAO=68;FDP=133;FR=.;FRO=65;FSAF=34;FSAR=34;FSRF=29;FSRR=36;FWDB=-0.0102401;FXX=0.0148137;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.1155;QD=20.8304;RBI=0.0478007;REFB=-0.0136721;REVB=-0.046691;RO=62;SAF=34;SAR=34;SRF=29;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0280028;STB=0.526308;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=0.0156963;OID=.;OPOS=102398593;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:134:133:62:65:68:68:0.511278:34:34:29:33:34:34:29:36
chr11	102477377	.	G	T	256.55	PASS	AF=0.491228;AO=28;DP=56;FAO=28;FDP=57;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=20;FWDB=0.0146486;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.3595;QD=18.0036;RBI=0.0550454;REFB=-0.0239014;REVB=0.0530604;RO=28;SAF=13;SAR=15;SRF=9;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130023;STB=0.579563;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=0.0170591;OID=.;OPOS=102477377;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:57:28:29:28:28:0.491228:15:13:9:19:15:13:9:20
chr11	102477395	.	A	G	210.29	PASS	AF=0.444444;AO=24;DP=54;FAO=24;FDP=54;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=-0.0317621;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.066;QD=15.577;RBI=0.0322054;REFB=-0.00226784;REVB=0.0053254;RO=30;SAF=11;SAR=13;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125083;STB=0.570698;STBP=0.388;TYPE=snp;VARB=0.0012316;OID=.;OPOS=102477395;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:30:30:24:24:0.444444:13:11:10:20:13:11:10:20
chr11	102495998	.	T	G	606.27	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0851769;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.0411;QD=60.627;RBI=0.0860656;REFB=0;REVB=-0.0123359;RO=0;SAF=13;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00768782;OID=.;OPOS=102495998;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:40:0:0:39:40:1:26:13:0:0:26:14:0:0
chr11	102563739	.	C	T	1039.94	PASS	AF=0.972603;AO=71;DP=73;FAO=71;FDP=73;FR=.;FRO=2;FSAF=32;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00235384;FXX=0.0135117;HRUN=3;LEN=1;MLLD=109.601;QD=56.9829;RBI=0.00872893;REFB=-0.00313828;REVB=-0.00840558;RO=2;SAF=32;SAR=39;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0236314;STB=0.512496;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=0.000121141;OID=.;OPOS=102563739;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:73:73:2:2:71:71:0.972603:39:32:0:2:39:32:0:2
chr11	102567207	.	T	A	742.43	PASS	AF=0.96;AO=48;DP=50;FAO=48;FDP=50;FR=.;FRO=2;FSAF=21;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0218668;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.525;QD=59.3946;RBI=0.0588393;REFB=-0.11568;REVB=0.0546251;RO=2;SAF=21;SAR=27;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00477083;STB=0.502537;STBP=0.874;TYPE=snp;VARB=0.0052779;OID=.;OPOS=102567207;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:50:50:2:2:48:48:0.96:27:21:1:1:27:21:1:1
chr11	102576358	.	T	C	766.43	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000252662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.045;QD=63.8693;RBI=0.021845;REFB=0;REVB=0.0218435;RO=0;SAF=28;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.56477e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.6009e-05;OID=.;OPOS=102576358;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:20:28:0:0:20:28:0:0
chr11	102576375	.	G	A	125.72	PASS	AF=0.307692;AO=16;DP=52;FAO=16;FDP=52;FR=.;FRO=36;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=23;FSRR=13;FWDB=-0.0372187;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.4645;QD=9.67069;RBI=0.0544123;REFB=-0.000557884;REVB=-0.0396922;RO=35;SAF=11;SAR=5;SRF=22;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0757594;STB=0.537995;STBP=0.749;TYPE=snp;VARB=-0.00131461;OID=.;OPOS=102576375;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:35:36:16:16:0.307692:5:11:22:13:5:11:23:13
chr11	102576382	.	G	A	119.42	PASS	AF=0.296296;AO=16;DP=54;FAO=16;FDP=54;FR=.;FRO=38;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=25;FSRR=13;FWDB=-0.0163172;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.328;QD=8.84557;RBI=0.017884;REFB=-0.0052341;REVB=-0.00732019;RO=37;SAF=11;SAR=5;SRF=24;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0511942;STB=0.523779;STBP=0.85;TYPE=snp;VARB=0.0125594;OID=.;OPOS=102576382;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:37:38:16:16:0.296296:5:11:24:13:5:11:25:13
chr11	102587062	.	G	A	352.85	PASS	AF=0.493333;AO=37;DP=75;FAO=37;FDP=75;FR=.;FRO=38;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=23;FWDB=-0.0169386;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.0265;QD=18.8185;RBI=0.0373575;REFB=-0.030777;REVB=0.0332966;RO=38;SAF=19;SAR=18;SRF=15;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1079;STB=0.559997;STBP=0.334;TYPE=snp;VARB=0.0321986;OID=.;OPOS=102587062;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:38:38:37:37:0.493333:18:19:15:23:18:19:15:23
chr11	102593248	.	T	C	466.33	PASS	AF=0.459459;AO=51;DP=111;FAO=51;FDP=111;FR=.;FRO=60;FSAF=32;FSAR=19;FSRF=28;FSRR=32;FWDB=-0.0143627;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=48.8415;QD=16.8048;RBI=0.0209791;REFB=-0.00168975;REVB=-0.0152916;RO=60;SAF=32;SAR=19;SRF=28;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158965;STB=0.588709;STBP=0.095;TYPE=snp;VARB=0.00131181;OID=.;OPOS=102593248;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:111:60:60:51:51:0.459459:19:32:28:32:19:32:28:32
chr11	102595492	.	G	A	263.27	PASS	AF=0.467742;AO=27;DP=66;FAO=29;FDP=62;FR=.;FRO=33;FSAF=22;FSAR=7;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=-0.0120586;FXX=0.0605969;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.818;QD=16.9853;RBI=0.0127044;REFB=-0.0102993;REVB=-0.00399903;RO=31;SAF=22;SAR=5;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.255432;STB=0.616736;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=0.00882918;OID=.;OPOS=102595492;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:62:31:33:27:29:0.467742:5:22:19:12:7:22:19:14
chr11	102651313	.	G	C	442.02	PASS	AF=0.494382;AO=44;DP=89;FAO=44;FDP=89;FR=.;FRO=45;FSAF=28;FSAR=16;FSRF=27;FSRR=18;FWDB=-0.0500781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.2323;QD=19.8659;RBI=0.0533103;REFB=-0.00933132;REVB=-0.0182803;RO=43;SAF=28;SAR=16;SRF=25;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0520689;STB=0.519642;STBP=0.717;TYPE=snp;VARB=0.0101878;OID=.;OPOS=102651313;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:43:45:44:44:0.494382:16:28:25:18:16:28:27:18
chr11	102661435	.	A	G	489.04	PASS	AF=0.485981;AO=52;DP=107;FAO=52;FDP=107;FR=.;FRO=55;FSAF=30;FSAR=22;FSRF=29;FSRR=26;FWDB=0.00332514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.05;QD=18.2817;RBI=0.0727744;REFB=-0.0250245;REVB=0.0726984;RO=54;SAF=30;SAR=22;SRF=29;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.037301;STB=0.525921;STBP=0.6;TYPE=snp;VARB=0.02873;OID=.;OPOS=102661435;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:107:54:55:52:52:0.485981:22:30:29:25:22:30:29:26
chr11	102663459	.	G	A	341.74	PASS	AF=0.430233;AO=37;DP=86;FAO=37;FDP=86;FR=.;FRO=49;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=20;FSRR=29;FWDB=-0.00180342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.2935;QD=15.8947;RBI=0.00765438;REFB=-0.0213831;REVB=0.0074389;RO=49;SAF=16;SAR=21;SRF=20;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0250925;STB=0.514131;STBP=0.822;TYPE=snp;VARB=0.0255761;OID=.;OPOS=102663459;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:49:49:37:37:0.430233:21:16:20:29:21:16:20:29
chr11	102666316	.	T	C	575.78	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000523492;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.367;QD=60.6086;RBI=0.0262653;REFB=0;REVB=0.02626;RO=0;SAF=12;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.05056e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000137834;OID=.;OPOS=102666316;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:26:12:0:0:26:12:0:0
chr11	102709425	.	A	G	1302.17	PASS	AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.072436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.525;QD=62.0082;RBI=0.0800064;REFB=0;REVB=0.0339713;RO=0;SAF=35;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000197608;OID=.;OPOS=102709425;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:49:35:0:0:49:35:0:0
chr11	102713465	.	A	G	1269.43	PASS	AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0085071;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.284;QD=61.9233;RBI=0.00850729;REFB=0;REVB=5.69464e-05;RO=0;SAF=39;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.10525e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000521941;OID=.;OPOS=102713465;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:43:39:0:0:43:39:0:0
chr11	102713620	.	T	C	596.95	PASS	AF=0.901961;AO=46;DP=51;FAO=46;FDP=51;FR=.;FRO=5;FSAF=14;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0404199;FXX=0.0192271;HRUN=6;LEN=1;MLLD=66.1749;QD=46.8195;RBI=0.0447417;REFB=-0.0604914;REVB=0.0191846;RO=1;SAF=14;SAR=32;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0144681;STB=0.51219;STBP=0.671;TYPE=snp;VARB=0.00279124;OID=.;OPOS=102713620;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:24:51:51:1:5:46:46:0.901961:32:14:0:1:32:14:1:4
chr11	102736642	.	T	C	480.96	PASS	AF=0.547619;AO=46;DP=84;FAO=46;FDP=84;FR=.;FRO=38;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=23;FSRR=15;FWDB=0.0370548;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.3049;QD=22.9028;RBI=0.0370699;REFB=0.000249497;REVB=-0.00105949;RO=38;SAF=22;SAR=24;SRF=23;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104159;STB=0.557251;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=5.53965e-05;OID=.;OPOS=102736642;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:38:38:46:46:0.547619:24:22:23:15:24:22:23:15
chr11	102738795	.	G	T	339.16	PASS	AF=1;AO=24;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0664655;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.1268;QD=54.2655;RBI=0.0894289;REFB=0;REVB=-0.059832;RO=0;SAF=12;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000667417;OID=.;OPOS=102738795;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:24:25:1:12:12:0:0:13:12:0:0
chr11	103029516	.	A	G	1194.33	PASS	AF=0.9875;AO=79;DP=80;FAO=79;FDP=80;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0341955;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=223.468;QD=59.7164;RBI=0.0371422;REFB=-0.132132;REVB=0.0144986;RO=1;SAF=34;SAR=45;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0137195;STB=0.507245;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=0.00101561;OID=.;OPOS=103029516;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:80:80:1:1:79:79:0.9875:45:34:1:0:45:34:1:0
chr11	103047007	.	C	A	1877.76	PASS	AF=1;AO=122;DP=122;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0657485;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.4453;QD=61.566;RBI=0.0884218;REFB=0;REVB=-0.0591232;RO=0;SAF=63;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.65337e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00055395;OID=.;OPOS=103047007;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:122:122:0:0:122:122:1:59:63:0:0:59:63:0:0
chr11	103057048	.	A	G	1686.78	PASS	AF=1;AO=111;DP=112;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0106236;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=288.609;QD=60.2422;RBI=0.0216079;REFB=0;REVB=-0.0188159;RO=0;SAF=64;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.03814e-05;OID=.;OPOS=103057048;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:112:112:0:0:111:112:1:47:64:0:0:48:64:0:0
chr11	103058126	.	C	T	1339.39	PASS	AF=1;AO=85;DP=85;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0309254;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.303;QD=62.2973;RBI=0.0349916;REFB=0;REVB=0.0163717;RO=0;SAF=46;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000139159;OID=.;OPOS=103058126;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:86:0:0:85:86:1:39:46:0:0:39:47:0:0
chr11	103082590	.	G	A	2485.82	PASS	AF=0.993902;AO=162;DP=163;FAO=163;FDP=164;FR=.;FRO=1;FSAF=83;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0155091;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.113;QD=60.6297;RBI=0.0174374;REFB=-0.00985195;REVB=-0.00797068;RO=0;SAF=83;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.21923e-08;STB=0.503105;STBP=0.335;TYPE=snp;VARB=8.21532e-05;OID=.;OPOS=103082590;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:163:164:0:1:162:163:0.993902:79:83:0:0:80:83:0:1
chr11	103158278	.	C	T	451.76	PASS	AF=0.589041;AO=43;DP=73;FAO=43;FDP=73;FR=.;FRO=30;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=-0.0745167;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.7278;QD=24.7539;RBI=0.0830341;REFB=-0.0174153;REVB=-0.0366323;RO=30;SAF=24;SAR=19;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0937399;STB=0.551348;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.0108589;OID=.;OPOS=103158278;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:30:30:43:43:0.589041:19:24:13:17:19:24:13:17
chr11	103229027	.	T	C	217.82	PASS	AF=0.40625;AO=26;DP=64;FAO=26;FDP=64;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=27;FSRR=11;FWDB=0.00911957;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.4355;QD=13.6138;RBI=0.0154617;REFB=-0.00494895;REVB=0.0124859;RO=38;SAF=15;SAR=11;SRF=27;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146796;STB=0.583273;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.00502873;OID=.;OPOS=103229027;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:38:38:26:26:0.40625:11:15:27:11:11:15:27:11
chr11	103274940	.	A	T	402.67	PASS	AF=0.488372;AO=36;DP=85;FAO=42;FDP=86;FR=.;FRO=44;FSAF=26;FSAR=16;FSRF=31;FSRR=13;FWDB=-0.0228618;FXX=0.0444395;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.136;QD=18.729;RBI=0.0527225;REFB=-0.0346866;REVB=0.0475079;RO=48;SAF=25;SAR=11;SRF=32;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0326186;STB=0.547397;STBP=0.438;TYPE=snp;VARB=0.0392899;OID=.;OPOS=103274940;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:86:48:44:36:42:0.488372:11:25:32:16:16:26:31:13
chr11	103275034	.	G	T	310.2	PASS	AF=0.397727;AO=31;DP=84;FAO=35;FDP=88;FR=.;FRO=53;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=27;FSRR=26;FWDB=-0.0599115;FXX=0.0112347;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.7748;QD=14.1001;RBI=0.065765;REFB=-0.0157076;REVB=0.0271229;RO=53;SAF=15;SAR=16;SRF=27;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0280685;STB=0.548991;STBP=0.479;TYPE=snp;VARB=0.0567437;OID=.;OPOS=103275034;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:88:53:53:31:35:0.397727:16:15:27:26:20:15:27:26
chr11	103277984	.	G	T	175.42	PASS	AF=0.392157;AO=20;DP=51;FAO=20;FDP=51;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=-0.0168993;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.6487;QD=13.7581;RBI=0.0264575;REFB=0.00530606;REVB=0.0203571;RO=31;SAF=12;SAR=8;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0141903;STB=0.508189;STBP=0.941;TYPE=snp;VARB=-0.00772109;OID=.;OPOS=103277984;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:31:31:20:20:0.392157:8:12:19:12:8:12:19:12
chr11	103278048	.	G	C	247.12	PASS	AF=0.490909;AO=27;DP=56;FAO=27;FDP=55;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=0.00986979;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.646;QD=17.9723;RBI=0.0154594;REFB=-0.0250364;REVB=-0.0118988;RO=29;SAF=12;SAR=15;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0673308;STB=0.528434;STBP=0.648;TYPE=snp;VARB=0.0259059;OID=.;OPOS=103278048;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:55:29:28:27:27:0.490909:15:12:15:14:15:12:14:14
chr11	103278083	.	C	G	225.28	PASS	AF=0.511628;AO=18;DP=39;FAO=22;FDP=43;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.0245774;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.889;QD=20.9563;RBI=0.0499247;REFB=-0.0182238;REVB=0.043456;RO=19;SAF=6;SAR=12;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134812;STB=0.557469;STBP=0.451;TYPE=snp;VARB=0.0184256;OID=.;OPOS=103278083;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:43:19:21:18:22:0.511628:12:6:9:10:14:8:10:11
chr11	103278129	.	C	CTCTA	151.26	PASS	AF=0.551724;AO=15;DP=29;FAO=16;FDP=29;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.0264869;FXX=0;HRUN=2;LEN=4;MLLD=314.5;QD=20.8638;RBI=0.026809;REFB=0.0122193;REVB=-0.00414302;RO=13;SAF=4;SAR=11;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114985;STB=0.57437;STBP=0.435;TYPE=ins;VARB=-0.0104815;OID=.;OPOS=103278130;OREF=-;OALT=TCTA;OMAPALT=CTCTA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.551724:15:29:16:29:13:4:12:5:8:99:13:4:11:5:8
chr11	103279098	.	C	T	491.09	PASS	AF=0.484848;AO=48;DP=99;FAO=48;FDP=99;FR=.;FRO=51;FSAF=21;FSAR=27;FSRF=25;FSRR=26;FWDB=-0.0231575;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.3775;QD=19.8422;RBI=0.0506603;REFB=-0.00984645;REVB=-0.0450577;RO=51;SAF=21;SAR=27;SRF=25;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0493005;STB=0.527377;STBP=0.587;TYPE=snp;VARB=0.0119264;OID=.;OPOS=103279098;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:51:51:48:48:0.484848:27:21:25:26:27:21:25:26
chr11	103306680	.	G	A	300.48	PASS	AF=0.507937;AO=32;DP=63;FAO=32;FDP=63;FR=.;FRO=31;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=-0.00320495;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.545;QD=19.0783;RBI=0.0256448;REFB=-0.000150528;REVB=-0.0254438;RO=31;SAF=21;SAR=11;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0719797;STB=0.540167;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=1.22982e-05;OID=.;OPOS=103306680;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:31:31:32:32:0.507937:11:21:18:13:11:21:18:13
chr11	103778154	.	C	T	857.09	PASS	AF=0.545455;AO=84;DP=153;FAO=84;FDP=154;FR=.;FRO=70;FSAF=41;FSAR=43;FSRF=29;FSRR=41;FWDB=0.00868364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=296.034;QD=22.262;RBI=0.00910296;REFB=-0.00302495;REVB=0.00273096;RO=69;SAF=41;SAR=43;SRF=28;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0681449;STB=0.533615;STBP=0.387;TYPE=snp;VARB=0.0026025;OID=.;OPOS=103778154;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:153:154:69:70:84:84:0.545455:43:41:28:41:43:41:29:41
chr11	103780455	.	A	G	544.87	PASS	AF=0.595238;AO=50;DP=85;FAO=50;FDP=84;FR=.;FRO=34;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=27;FSRR=7;FWDB=0.0627135;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.3701;QD=25.9461;RBI=0.0704372;REFB=-0.0207002;REVB=0.0320688;RO=34;SAF=24;SAR=26;SRF=27;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.23183;STB=0.626015;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0164943;OID=.;OPOS=103780455;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:84:34:34:50:50:0.595238:26:24:27:7:26:24:27:7
chr11	103907805	.	A	C	394.96	PASS	AF=0.432692;AO=43;DP=103;FAO=45;FDP=104;FR=.;FRO=59;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=30;FSRR=29;FWDB=0.0282473;FXX=0.0188661;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.071;QD=15.1907;RBI=0.029091;REFB=-0.0155087;REVB=-0.00695521;RO=58;SAF=16;SAR=27;SRF=30;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151295;STB=0.562472;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=0.0222966;OID=.;OPOS=103907805;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:104:58:59:43:45:0.432692:27:16:30:28:27:18:30:29
chr11	103908735	.	G	A	168.89	PASS	AF=0.607143;AO=17;DP=28;FAO=17;FDP=28;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.0320925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.072;QD=24.1271;RBI=0.0321219;REFB=-0.017102;REVB=-0.00137357;RO=11;SAF=5;SAR=12;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126934;STB=0.571341;STBP=0.382;TYPE=snp;VARB=0.00876917;OID=.;OPOS=103908735;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:28:28:11:11:17:17:0.607143:12:5:5:6:12:5:5:6
chr11	103908968	.	C	T	159.59	PASS	AF=0.472222;AO=17;DP=36;FAO=17;FDP=36;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.000125847;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=321.345;QD=17.7318;RBI=0.0105054;REFB=-0.0107027;REVB=-0.0105046;RO=19;SAF=5;SAR=12;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181555;STB=0.604188;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=0.0095413;OID=.;OPOS=103908968;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:19:19:17:17:0.472222:12:5:9:10:12:5:9:10
chr11	103909897	.	A	G	156.43	PASS	AF=0.615385;AO=16;DP=26;FAO=16;FDP=26;FR=.;FRO=10;FSAF=15;FSAR=1;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=0.0417831;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.604;QD=24.0668;RBI=0.0421549;REFB=-0.00536435;REVB=0.00558694;RO=10;SAF=15;SAR=1;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.483069;STB=0.780775;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.00757415;OID=.;OPOS=103909897;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:26:26:10:10:16:16:0.615385:1:15:6:4:1:15:6:4
chr11	104758035	.	G	A	465.14	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0130622;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.0309;QD=58.1419;RBI=0.0261859;REFB=0;REVB=0.0226953;RO=0;SAF=12;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000126056;OID=.;OPOS=104758035;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:20:12:0:0:20:12:0:0
chr11	104761100	.	T	C	393.29	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-2.99112e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.796;QD=56.1837;RBI=0.0788179;REFB=0;REVB=0.0788179;RO=0;SAF=18;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000396798;OID=.;OPOS=104761100;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:10:18:0:0:10:18:0:0
chr11	104761206	.	C	T	786.91	PASS	AF=0.982456;AO=55;DP=56;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=4.17419e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.6835;QD=55.2217;RBI=0.0366267;REFB=-0.0795587;REVB=-0.0366267;RO=0;SAF=29;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.40922e-08;STB=0.508194;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.00135391;OID=.;OPOS=104761206;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:56:57:0:1:55:56:0.982456:26:29:0:0:26:30:1:0
chr11	104763117	.	G	A	834.4	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00868607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.702;QD=57.5449;RBI=0.0146503;REFB=0;REVB=0.0117976;RO=0;SAF=27;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.07727e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.00681e-06;OID=.;OPOS=104763117;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:31:27:0:0:31:27:0:0
chr11	104763716	.	A	G	902.71	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0189635;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=310.773;QD=58.2396;RBI=0.0190565;REFB=0;REVB=0.0018812;RO=0;SAF=25;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.78886e-05;OID=.;OPOS=104763716;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:37:25:0:0:37:25:0:0
chr11	104768000	.	G	A	786.94	PASS	AF=1;AO=54;DP=55;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0236768;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.3656;QD=55.2238;RBI=0.0261409;REFB=0;REVB=0.0110795;RO=0;SAF=19;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.86274e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00107791;OID=.;OPOS=104768000;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:57:0:0:54:57:1:35:19:0:0:37:20:0:0
chr11	104768098	.	T	C	951.22	PASS	AF=0.985075;AO=65;DP=67;FAO=66;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0224192;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.2043;QD=56.7892;RBI=0.0665928;REFB=-0.0811226;REVB=0.0627055;RO=1;SAF=35;SAR=30;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0154862;STB=0.508194;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.00162235;OID=.;OPOS=104768098;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:67:67:1:1:65:66:0.985075:30:35:0:1:30:36:0:1
chr11	104819327	.	T	C	1396.46	PASS	AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00314143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.921;QD=62.762;RBI=0.0180308;REFB=0;REVB=-0.0177551;RO=0;SAF=33;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.35588e-05;OID=.;OPOS=104819327;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:56:33:0:0:56:33:0:0
chr11	104877927	.	T	C	1861.66	PASS	AF=0.99187;AO=122;DP=123;FAO=122;FDP=123;FR=.;FRO=1;FSAF=73;FSAR=49;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00893807;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.871;QD=60.5418;RBI=0.0153501;REFB=-0.0888655;REVB=-0.0124794;RO=1;SAF=73;SAR=49;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00646389;STB=0.503401;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=0.000159558;OID=.;OPOS=104877927;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:123:123:1:1:122:122:0.99187:49:73:1:0:49:73:1:0
chr11	105223502	.	T	C	754.36	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0233711;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.9154;QD=56.9329;RBI=0.043476;REFB=0;REVB=-0.0366599;RO=0;SAF=28;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000174014;OID=.;OPOS=105223502;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:25:28:0:0:25:28:0:0
chr11	105782654	.	C	T	1560.66	PASS	AF=0.416867;AO=173;DP=415;FAO=173;FDP=415;FR=.;FRO=242;FSAF=91;FSAR=82;FSRF=128;FSRR=114;FWDB=-0.000527517;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.611;QD=15.0425;RBI=0.00249471;REFB=-0.00548902;REVB=-0.0024383;RO=242;SAF=91;SAR=82;SRF=128;SRR=114;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00306021;STB=0.501704;STBP=0.961;TYPE=snp;VARB=0.00777259;OID=.;OPOS=105782654;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:415:415:242:242:173:173:0.416867:82:91:128:114:82:91:128:114
chr11	105852683	.	AC	A	561.06	PASS	AF=0.468254;AO=60;DP=127;FAO=59;FDP=126;FR=.;FRO=67;FSAF=24;FSAR=35;FSRF=27;FSRR=40;FWDB=-0.0316868;FXX=0.0078734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.613;QD=17.8113;RBI=0.0379761;REFB=-0.0219077;REVB=-0.0209317;RO=67;SAF=24;SAR=36;SRF=27;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00295414;STB=0.502091;STBP=0.968;TYPE=del;VARB=0.0241478;OID=.;OPOS=105852684;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.468254:60:127:59:126:67:24:35:27:40:99:67:24:36:27:40
chr11	107286943	.	C	T	277.41	PASS	AF=0.5;AO=30;DP=60;FAO=30;FDP=60;FR=.;FRO=30;FSAF=23;FSAR=7;FSRF=23;FSRR=7;FWDB=0.00555121;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=272.777;QD=18.4941;RBI=0.0765544;REFB=0.00481662;REVB=-0.0763528;RO=29;SAF=23;SAR=7;SRF=22;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00983981;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00395966;OID=.;OPOS=107286943;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:29:30:30:30:0.5:7:23:22:7:7:23:23:7
chr11	107299623	.	A	C	402.66	PASS	AF=0.398305;AO=47;DP=118;FAO=47;FDP=118;FR=.;FRO=71;FSAF=14;FSAR=33;FSRF=23;FSRR=48;FWDB=0.0141716;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.2185;QD=13.6496;RBI=0.0168744;REFB=-0.00592878;REVB=-0.00916038;RO=70;SAF=14;SAR=33;SRF=23;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.038095;STB=0.518463;STBP=0.764;TYPE=snp;VARB=0.00862439;OID=.;OPOS=107299623;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:118:118:70:71:47:47:0.398305:33:14:23:47:33:14:23:48
chr11	107328544	.	G	A	130.62	PASS	AF=0.394737;AO=15;DP=38;FAO=15;FDP=38;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=-0.0424123;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.561;QD=13.749;RBI=0.042462;REFB=-0.00512903;REVB=-0.00205416;RO=22;SAF=6;SAR=9;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0571694;STB=0.52171;STBP=0.846;TYPE=snp;VARB=0.00801072;OID=.;OPOS=107328544;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:22:23:15:15:0.394737:9:6:10:12:9:6:10:13
chr11	107462522	.	G	C	316.7	PASS	AF=0.532258;AO=33;DP=62;FAO=33;FDP=62;FR=.;FRO=29;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=-0.00747242;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=179.152;QD=20.4319;RBI=0.00986795;REFB=-0.0416698;REVB=-0.00644511;RO=27;SAF=18;SAR=15;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0220302;STB=0.529394;STBP=0.66;TYPE=snp;VARB=0.0301557;OID=.;OPOS=107462522;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:27:29:33:33:0.532258:15:18:14:13:15:18:14:15
chr11	107463159	.	A	G	353.74	PASS	AF=0.377193;AO=42;DP=116;FAO=43;FDP=114;FR=.;FRO=71;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=43;FSRR=28;FWDB=0.010395;FXX=0.0172399;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.011;QD=12.412;RBI=0.0136179;REFB=-0.00759051;REVB=0.00879721;RO=68;SAF=20;SAR=22;SRF=42;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153115;STB=0.586838;STBP=0.18;TYPE=snp;VARB=0.0148404;OID=.;OPOS=107463159;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:116:114:68:71:42:43:0.377193:22:20:42:26:23:20:43:28
chr11	107535758	.	G	A	64.37	PASS	AF=0.727273;AO=8;DP=11;FAO=8;FDP=11;FR=.;FRO=3;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0149254;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.128;QD=23.4061;RBI=0.0354878;REFB=-0.0533252;REVB=0.0321965;RO=3;SAF=7;SAR=1;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156255;STB=0.588042;STBP=0.66;TYPE=snp;VARB=0.0161475;OID=.;OPOS=107535758;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:11:11:3:3:8:8:0.727273:1:7:3:0:1:7:3:0
chr11	107578721	.	C	G	232.24	PASS	AF=0.564103;AO=22;DP=39;FAO=22;FDP=39;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.0519607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.854;QD=23.8199;RBI=0.0525699;REFB=-0.0227743;REVB=-0.0079796;RO=17;SAF=7;SAR=15;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175807;STB=0.598411;STBP=0.167;TYPE=snp;VARB=0.0119396;OID=.;OPOS=107578721;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:17:17:22:22:0.564103:15:7:9:8:15:7:9:8
chr11	107677399	.	C	A,CA	75.19	PASS	AF=0,0.555556;AO=2,8;DP=19;FAO=0,10;FDP=18;FR=.;FRO=8;FSAF=0,3;FSAR=0,7;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0185796,-0.0930255;FXX=0.0526039;HRUN=1,3;LEN=1,1;MLLD=196.292,19.3069;QD=16.7097;RBI=0.02449,0.193972;REFB=0.00254197,0.0813709;REVB=-0.0159549,-0.170209;RO=8;SAF=2,2;SAR=0,6;SRF=4;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.590874,-0.23873;STB=0.5,0.597357;STBP=1,0.436;TYPE=snp,ins;VARB=0,-0.0903123;OID=.,.;OPOS=107677399,107677400;OREF=C,-;OALT=A,A;OMAPALT=A,CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:52:19:18:8:8:2,8:0,10:0,0.555556:0,6:2,2:4:4:0,7:0,3:4:4
chr11	107917087	.	A	G	976.23	PASS	AF=0.985294;AO=67;DP=68;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0808286;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.5896;QD=57.4255;RBI=0.0857931;REFB=-0.0434691;REVB=-0.0287609;RO=1;SAF=29;SAR=38;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0122746;STB=0.506492;STBP=0.495;TYPE=snp;VARB=0.00175876;OID=.;OPOS=107917087;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:68:68:1:1:67:67:0.985294:38:29:0:1:38:29:0:1
chr11	108043988	.	C	T	766.35	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00793997;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.843;QD=63.8628;RBI=0.0402934;REFB=0;REVB=0.0395034;RO=0;SAF=30;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.73384e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000143685;OID=.;OPOS=108043988;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:18:30:0:0:18:30:0:0
chr11	108093208	.	A	T	1283.32	PASS	AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00959945;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.329;QD=61.8465;RBI=0.0101499;REFB=0;REVB=0.00329712;RO=0;SAF=38;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.04629e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.8212e-05;OID=.;OPOS=108093208;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:45:38:0:0:45:38:0:0
chr11	108183167	.	A	G	708.55	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159787;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.482;QD=62.9818;RBI=0.0191382;REFB=0;REVB=0.0105334;RO=0;SAF=20;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.09779e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.8621e-05;OID=.;OPOS=108183167;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:25:20:0:0:25:20:0:0
chr11	108345515	.	G	GA	921.98	PASS	AF=0.987013;AO=74;DP=77;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0189507;FXX=0.0128189;HRUN=0;LEN=1;MLLD=172.234;QD=47.8953;RBI=0.0230154;REFB=-0.117162;REVB=0.0130606;RO=2;SAF=31;SAR=43;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0214946;STB=0.505493;STBP=0.504;TYPE=ins;VARB=0.0007085;OID=.;OPOS=108345516;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:0.987013:74:77:76:77:1:31:45:0:1:10:2:31:43:0:2
chr11	108380335	.	T	C	632.26	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0163342;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=227.429;QD=61.684;RBI=0.0163955;REFB=0;REVB=-0.00141668;RO=0;SAF=22;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.41485e-05;OID=.;OPOS=108380335;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:19:22:0:0:19:22:0:0
chr11	108383303	.	C	T	227.1	PASS	AF=0.397059;AO=27;DP=69;FAO=27;FDP=68;FR=.;FRO=41;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=29;FWDB=-0.0030004;FXX=0.0144907;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.48;QD=13.3586;RBI=0.0152604;REFB=0.0104166;REVB=0.0149625;RO=41;SAF=13;SAR=14;SRF=12;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.202484;STB=0.614882;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=-0.0226926;OID=.;OPOS=108383303;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:68:41:41:27:27:0.397059:14:13:12:29:14:13:12:29
chr11	108383676	.	A	G	263.52	PASS	AF=0.483333;AO=29;DP=60;FAO=29;FDP=60;FR=.;FRO=31;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=21;FWDB=0.0377731;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.998;QD=17.5681;RBI=0.0408119;REFB=-0.0268557;REVB=0.0154531;RO=31;SAF=15;SAR=14;SRF=10;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.178947;STB=0.599933;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=0.0331872;OID=.;OPOS=108383676;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:31:31:29:29:0.483333:14:15:10:21:14:15:10:21
chr11	108384207	.	C	T	109.94	PASS	AF=0.433333;AO=13;DP=30;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.0113124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.069;QD=14.6581;RBI=0.0115702;REFB=-0.0115434;REVB=0.00242898;RO=16;SAF=6;SAR=7;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0366376;STB=0.538402;STBP=0.748;TYPE=snp;VARB=0.0108412;OID=.;OPOS=108384207;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:16:17:13:13:0.433333:7:6:8:8:7:6:9:8
chr11	109036116	.	T	C	208.81	PASS	AF=0.606061;AO=20;DP=33;FAO=20;FDP=33;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.007458;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.217;QD=25.3098;RBI=0.0368545;REFB=-0.0198371;REVB=0.0360919;RO=13;SAF=5;SAR=15;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.178288;STB=0.599893;STBP=0.187;TYPE=snp;VARB=0.015084;OID=.;OPOS=109036116;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:13:13:20:20:0.606061:15:5:6:7:15:5:6:7
chr11	111164651	.	T	C	205.22	PASS	AF=0.361111;AO=25;DP=72;FAO=26;FDP=72;FR=.;FRO=46;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=24;FSRR=22;FWDB=0.00263159;FXX=0.0270234;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.314;QD=11.4011;RBI=0.0162793;REFB=-0.00888692;REVB=0.0160652;RO=46;SAF=14;SAR=11;SRF=24;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0430333;STB=0.510721;STBP=0.879;TYPE=snp;VARB=0.0171225;OID=.;OPOS=111164651;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:46:46:25:26:0.361111:11:14:24:22:12:14:24:22
chr11	111167557	.	A	C	142.69	PASS	AF=0.6;AO=15;DP=25;FAO=15;FDP=25;FR=.;FRO=10;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.00940088;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.121;QD=22.8309;RBI=0.0111849;REFB=-0.0113733;REVB=-0.00606016;RO=10;SAF=9;SAR=6;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.211469;STB=0.61889;STBP=0.148;TYPE=snp;VARB=0.00967821;OID=.;OPOS=111167557;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:25:25:10:10:15:15:0.6:6:9:3:7:6:9:3:7
chr11	111167776	.	C	G	280.92	PASS	AF=0.581395;AO=25;DP=43;FAO=25;FDP=43;FR=.;FRO=18;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.00206086;FXX=0.0444346;HRUN=5;LEN=1;MLLD=207.662;QD=26.1318;RBI=0.0027445;REFB=0.00390045;REVB=-0.0018125;RO=18;SAF=12;SAR=13;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0269005;STB=0.514913;STBP=0.84;TYPE=snp;VARB=-0.00239824;OID=.;OPOS=111167776;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:18:18:25:25:0.581395:13:12:8:10:13:12:8:10
chr11	111167792	.	T	G	317.15	PASS	AF=0.56;AO=28;DP=47;FAO=28;FDP=50;FR=.;FRO=22;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.00963189;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.909;QD=25.3717;RBI=0.0464342;REFB=-0.0478678;REVB=-0.0454242;RO=19;SAF=13;SAR=15;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0709935;STB=0.504307;STBP=0.96;TYPE=snp;VARB=0.0266116;OID=.;OPOS=111167792;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:50:19:22:28:28:0.56:15:13:7:12:15:13:10:12
chr11	111168767	.	C	T	465.0	PASS	AF=0.535714;AO=45;DP=84;FAO=45;FDP=84;FR=.;FRO=39;FSAF=19;FSAR=26;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=0.0238455;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.3109;QD=22.1427;RBI=0.0402324;REFB=-0.0073752;REVB=-0.0324042;RO=38;SAF=19;SAR=26;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130471;STB=0.577743;STBP=0.134;TYPE=snp;VARB=0.00632537;OID=.;OPOS=111168767;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:38:39:45:45:0.535714:26:19:22:16:26:19:23:16
chr11	111179054	.	A	G	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0876482;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.743;QD=44.6893;RBI=0.0969897;REFB=0;REVB=0.0415307;RO=0;SAF=9;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00349453;OID=.;OPOS=111179054;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:4:9:0:0:4:9:0:0
chr11	111325007	.	C	T	179.64	PASS	AF=1;AO=15;DP=16;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.005195;FXX=0.062461;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.393;QD=47.9049;RBI=0.019449;REFB=0;REVB=-0.0187424;RO=0;SAF=6;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000133824;OID=.;OPOS=111325007;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:15:0:0:15:15:1:9:6:0:0:9:6:0:0
chr11	111327213	.	G	A	322.85	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0583828;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.639;QD=53.808;RBI=0.0682472;REFB=0;REVB=0.035343;RO=0;SAF=10;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00079045;OID=.;OPOS=111327213;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:24:0:0:23:24:1:13:10:0:0:14:10:0:0
chr11	111368047	.	G	T	923.22	PASS	AF=1;AO=63;DP=64;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0296164;FXX=0.0156226;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.541;QD=58.617;RBI=0.0397296;REFB=0;REVB=-0.0264823;RO=0;SAF=28;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000175858;OID=.;OPOS=111368047;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:63:0:0:63:63:1:35:28:0:0:35:28:0:0
chr11	111420364	.	A	G	1415.39	PASS	AF=1;AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0315299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.208;QD=62.9061;RBI=0.0377308;REFB=0;REVB=0.0207238;RO=0;SAF=41;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.50827e-05;OID=.;OPOS=111420364;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:90:90:0:0:90:90:1:49:41:0:0:49:41:0:0
chr11	111431656	.	GAAT	G	729.18	PASS	AF=0.955224;AO=61;DP=67;FAO=64;FDP=67;FR=.;FRO=3;FSAF=40;FSAR=24;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0138262;FXX=0.042851;HRUN=2;LEN=3;MLLD=279.096;QD=43.5334;RBI=0.0194748;REFB=-0.0557211;REVB=0.0137151;RO=0;SAF=39;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.01474e-08;STB=0.501991;STBP=0.951;TYPE=del;VARB=0.00205908;OID=.;OPOS=111431657;OREF=AAT;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.955224:61:67:64:67:3:40:24:2:1:3:0:39:22:0:0
chr11	111553893	.	T	C	279.29	PASS	AF=0.956522;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0333825;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=199.93;QD=48.5713;RBI=0.0419854;REFB=-0.0877586;REVB=0.0254633;RO=0;SAF=8;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.517226;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.00420132;OID=.;OPOS=111553893;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:22:23:0:1:22:22:0.956522:14:8:0:0:14:8:0:1
chr11	111631612	.	G	T	217.24	PASS	AF=0.552632;AO=20;DP=37;FAO=21;FDP=38;FR=.;FRO=17;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.0418418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.79;QD=22.8671;RBI=0.0418925;REFB=-0.0282411;REVB=-0.00206048;RO=17;SAF=12;SAR=8;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00999867;STB=0.514498;STBP=0.871;TYPE=snp;VARB=0.0268643;OID=.;OPOS=111631612;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:38:17:17:20:21:0.552632:8:12:10:7:8:13:10:7
chr11	111692182	.	G	A	135.07	PASS	AF=0.46875;AO=15;DP=32;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.00377801;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.1502;QD=16.8838;RBI=0.0431367;REFB=0.00487025;REVB=0.0429709;RO=17;SAF=11;SAR=4;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155927;STB=0.590117;STBP=0.398;TYPE=snp;VARB=-0.0101464;OID=.;OPOS=111692182;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:17:17:15:15:0.46875:4:11:10:7:4:11:10:7
chr11	111724133	.	C	T	88.79	PASS	AF=0.458333;AO=11;DP=24;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.0098086;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.4963;QD=14.7984;RBI=0.0583852;REFB=0.0144703;REVB=-0.0575554;RO=13;SAF=8;SAR=3;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121367;STB=0.571292;STBP=0.609;TYPE=snp;VARB=-0.017488;OID=.;OPOS=111724133;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:24:24:13:13:11:11:0.458333:3:8:8:5:3:8:8:5
chr11	111747297	.	A	G	307.16	PASS	AF=0.425;AO=33;DP=78;FAO=34;FDP=80;FR=.;FRO=46;FSAF=10;FSAR=24;FSRF=17;FSRR=29;FWDB=0.0173566;FXX=0.0123442;HRUN=4;LEN=1;MLLD=75.5649;QD=15.3581;RBI=0.0181482;REFB=0.0120713;REVB=-0.00530158;RO=45;SAF=10;SAR=23;SRF=17;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0864016;STB=0.550054;STBP=0.468;TYPE=snp;VARB=-0.0111684;OID=.;OPOS=111747297;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:80:45:46:33:34:0.425:23:10:17:28:24:10:17:29
chr11	111749349	.	A	T	785.19	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000866579;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.981;QD=57.105;RBI=0.0151929;REFB=0;REVB=0.0151682;RO=0;SAF=32;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.49259e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.98867e-05;OID=.;OPOS=111749349;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:23:32:0:0:23:32:0:0
chr11	111754574	.	A	C	64.86	PASS	AF=0.36;AO=9;DP=25;FAO=9;FDP=25;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=0.0143682;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.803;QD=10.3783;RBI=0.0787446;REFB=0.0498239;REVB=0.0774227;RO=16;SAF=5;SAR=4;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145075;STB=0.586972;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=-0.0757069;OID=.;OPOS=111754574;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:25:25:16:16:9:9:0.36:4:5:11:5:4:5:11:5
chr11	111781047	.	A	C	266.14	PASS	AF=0.5;AO=25;DP=50;FAO=25;FDP=50;FR=.;FRO=25;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=-0.00129232;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.463;QD=21.291;RBI=0.00288958;REFB=0.0013158;REVB=-0.00258449;RO=25;SAF=8;SAR=17;SRF=17;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.320625;STB=0.679856;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=-0.000684357;OID=.;OPOS=111781047;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:25:25:25:25:0.5:17:8:17:8:17:8:17:8
chr11	111848531	.	C	T	314.42	PASS	AF=0.658537;AO=27;DP=40;FAO=27;FDP=41;FR=.;FRO=14;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.0394426;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.8012;QD=30.6754;RBI=0.0396007;REFB=-0.0602627;REVB=-0.00353526;RO=13;SAF=13;SAR=14;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0337738;STB=0.506324;STBP=0.953;TYPE=snp;VARB=0.0238712;OID=.;OPOS=111848531;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:41:13:14:27:27:0.658537:14:13:7:6:14:13:7:7
chr11	111853106	.	G	GC	311.57	PASS	AF=1;AO=26;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.109611;FXX=0.0322477;HRUN=2;LEN=1;MLLD=19.8931;QD=41.5423;RBI=0.129335;REFB=0;REVB=0.0686511;RO=4;SAF=11;SAR=15;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142132;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00715768;OID=.;OPOS=111853107;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:26:30:30:30:0:15:15:0:0:6:4:11:15:4:0
chr11	111896324	.	C	T	158.69	PASS	AF=0.459459;AO=17;DP=37;FAO=17;FDP=37;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.0144366;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.494;QD=17.1561;RBI=0.0146785;REFB=0.00539605;REVB=-0.00265371;RO=20;SAF=7;SAR=10;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0369472;STB=0.521148;STBP=0.848;TYPE=snp;VARB=-0.00655934;OID=.;OPOS=111896324;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:20:20:17:17:0.459459:10:7:9:11:10:7:9:11
chr11	111908162	.	T	C	178.54	PASS	AF=0.387755;AO=19;DP=50;FAO=19;FDP=49;FR=.;FRO=30;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.0258562;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.9487;QD=14.5743;RBI=0.0346376;REFB=-0.0112993;REVB=0.0230482;RO=30;SAF=5;SAR=14;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.335063;STB=0.695046;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.0173574;OID=.;OPOS=111908162;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:49:30:30:19:19:0.387755:14:5:17:13:14:5:17:13
chr11	111916647	.	G	A	259.97	PASS	AF=0.410959;AO=29;DP=72;FAO=30;FDP=73;FR=.;FRO=43;FSAF=10;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=23;FWDB=-0.0642767;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.467;QD=14.2449;RBI=0.0642926;REFB=0.00403816;REVB=0.00143304;RO=43;SAF=10;SAR=19;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13242;STB=0.582468;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=-0.0079405;OID=.;OPOS=111916647;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:73:43:43:29:30:0.410959:19:10:20:23:20:10:20:23
chr11	111953921	.	TTAT	TTA,TT,TTT	274.49	PASS	AF=0.223881,0.0149254,0.358209;AO=19,10,15;DP=68;FAO=15,1,24;FDP=67;FR=.;FRO=27;FSAF=8,1,18;FSAR=7,0,6;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=-0.311755,-0.0130351,-0.0108008;FXX=0.0945818;HRUN=9,1,1;LEN=1,2,1;MLLD=5.61091,200.669,204.128;QD=16.3875;RBI=0.422514,0.0230468,0.0303923;REFB=-0.0569588,-0.0112942,-0.010375;REVB=-0.285178,0.0190064,0.0284083;RO=15;SAF=8,7,12;SAR=11,3,3;SRF=7;SRR=8;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.0365105,0.245627,0.342688;STB=0.603639,0.992247,0.711157;STBP=0.311,0.261,0.011;TYPE=del,del,del;VARB=0.0919662,0.00678937,0.0137778;OID=.,.,.;OPOS=111953924,111953922,111953923;OREF=T,TA,A;OALT=-,-,-;OMAPALT=TTA,TT,TTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/3:0.223881,0.0149254,0.358209:19,10,15:68:15,1,24:67:27:8,1,18:7,0,6:10:17:99:15:8,7,12:11,3,3:7:8
chr11	111956989	.	C	A	949.37	PASS	AF=0.985075;AO=64;DP=65;FAO=66;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00383562;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.325;QD=56.6785;RBI=0.0518928;REFB=-0.0105089;REVB=0.0517509;RO=0;SAF=35;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507934;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=5.31448e-05;OID=.;OPOS=111956989;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:65:67:0:1:64:66:0.985075:29:35:0:0:31:35:0:1
chr11	112065434	.	T	C	1026.22	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0164251;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.034;QD=59.4908;RBI=0.0185543;REFB=0;REVB=-0.00863011;RO=0;SAF=36;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.36169e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.19088e-05;OID=.;OPOS=112065434;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:33:36:0:0:33:36:0:0
chr11	112088499	.	A	C	1799.68	PASS	AF=0.991803;AO=118;DP=122;FAO=121;FDP=122;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0100722;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.8885;QD=59.0058;RBI=0.0803279;REFB=-0.0700314;REVB=0.0796939;RO=3;SAF=45;SAR=73;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0191165;STB=0.503267;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.00184398;OID=.;OPOS=112088499;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:122:122:3:1:118:121:0.991803:73:45:0:3:76:45:0:1
chr11	112123095	.	A	G	670.25	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0104102;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.9479;QD=62.3487;RBI=0.0816463;REFB=0;REVB=-0.08098;RO=0;SAF=18;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.65211e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00139224;OID=.;OPOS=112123095;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:25:18:0:0:25:18:0:0
chr11	112223299	.	G	A	429.02	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0195772;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.576;QD=57.2023;RBI=0.0196541;REFB=0;REVB=-0.00173683;RO=0;SAF=15;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.9413e-05;OID=.;OPOS=112223299;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:15:15:0:0:15:15:0:0
chr11	112832339	.	GC	G	262.39	PASS	AF=1;AO=23;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00713997;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=23.4519;QD=43.7317;RBI=0.0506628;REFB=0;REVB=-0.0501571;RO=0;SAF=18;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.00175349;OID=.;OPOS=112832340;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:23:24:24:24:0:19:5:0:0:5:0:18:5:0:0
chr11	112832353	.	T	C	323.47	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0176336;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=225.903;QD=53.9112;RBI=0.0391523;REFB=0;REVB=0.0349565;RO=0;SAF=19;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000245002;OID=.;OPOS=112832353;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:5:19:0:0:5:19:0:0
chr11	112832358	.	T	C	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0141102;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=258.299;QD=53.2772;RBI=0.0163436;REFB=0;REVB=-0.00824729;RO=0;SAF=18;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.2017e-05;OID=.;OPOS=112832358;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:5:18:0:0:5:18:0:0
chr11	113103996	.	T	G	1346.77	PASS	AF=0.932692;AO=97;DP=104;FAO=97;FDP=104;FR=.;FRO=7;FSAF=47;FSAR=50;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.0169602;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.7928;QD=51.799;RBI=0.0540737;REFB=-0.0751874;REVB=0.0513451;RO=7;SAF=47;SAR=50;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0253659;STB=0.513403;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.0260924;OID=.;OPOS=113103996;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:104:104:7:7:97:97:0.932692:50:47:2:5:50:47:2:5
chr11	113111501	.	T	C	682.87	PASS	AF=0.912281;AO=52;DP=57;FAO=52;FDP=57;FR=.;FRO=5;FSAF=12;FSAR=40;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.0701093;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.0262;QD=47.9205;RBI=0.0838814;REFB=-0.0905346;REVB=-0.0460519;RO=3;SAF=12;SAR=40;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0146854;STB=0.520438;STBP=0.389;TYPE=snp;VARB=0.00716641;OID=.;OPOS=113111501;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:57:57:3:5:52:52:0.912281:40:12:1:2:40:12:2:3
chr11	113113515	.	G	A	801.65	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0421841;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.956;QD=57.2609;RBI=0.0449185;REFB=0;REVB=0.0154331;RO=0;SAF=25;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000138963;OID=.;OPOS=113113515;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:56:0:0:55:56:1:30:25:0:0:31:25:0:0
chr11	113194168	.	A	C	538.56	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0262919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.171;QD=59.8394;RBI=0.0492524;REFB=0;REVB=0.0416477;RO=0;SAF=16;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.9376e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.00781e-05;OID=.;OPOS=113194168;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:20:16:0:0:20:16:0:0
chr11	113266821	.	G	A	545.19	PASS	AF=0.973684;AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0131309;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.928;QD=57.3883;RBI=0.0360828;REFB=-0.102824;REVB=0.0336088;RO=1;SAF=18;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0240105;STB=0.512814;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00304992;OID=.;OPOS=113266821;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:38:38:1:1:37:37:0.973684:19:18:0:1:19:18:0:1
chr11	113270015	.	G	C	480.85	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.115006;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.6015;QD=58.2848;RBI=0.115006;REFB=0;REVB=8.30885e-05;RO=0;SAF=17;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00219392;OID=.;OPOS=113270015;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:33:0:0:32:33:1:15:17:0:0:16:17:0:0
chr11	113270374	.	C	T	2176.67	PASS	AF=0.979021;AO=140;DP=144;FAO=140;FDP=143;FR=.;FRO=3;FSAF=73;FSAR=67;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0159086;FXX=0.00694396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.352;QD=60.8859;RBI=0.0771665;REFB=-0.137083;REVB=0.0755089;RO=3;SAF=73;SAR=67;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00751128;STB=0.503951;STBP=0.463;TYPE=snp;VARB=0.000691608;OID=.;OPOS=113270374;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:144:143:3:3:140:140:0.979021:67:73:1:2:67:73:1:2
chr11	113270828	.	G	A	1079.21	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100153;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.2916;QD=59.956;RBI=0.0105509;REFB=0;REVB=-0.00331895;RO=0;SAF=37;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.97791e-05;OID=.;OPOS=113270828;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:72:0:0:70:72:1:33:37:0:0:34:38:0:0
chr11	113283477	.	A	G	575.75	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0145343;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.923;QD=60.6051;RBI=0.0431609;REFB=0;REVB=-0.0406401;RO=0;SAF=28;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000222574;OID=.;OPOS=113283477;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:10:28:0:0:10:28:0:0
chr11	113561025	.	G	A	2379.34	PASS	AF=1;AO=156;DP=157;FAO=156;FDP=156;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00288038;FXX=0.00636902;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.3494;QD=61.0088;RBI=0.00374348;REFB=0;REVB=-0.00239103;RO=0;SAF=73;SAR=83;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.13966e-05;OID=.;OPOS=113561025;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:157:156:0:0:156:156:1:83:73:0:0:83:73:0:0
chr11	113561054	.	A	G	2337.04	PASS	AF=1;AO=153;DP=154;FAO=153;FDP=153;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0155528;FXX=0.00649309;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.606;QD=61.099;RBI=0.0254983;REFB=0;REVB=0.0202059;RO=0;SAF=67;SAR=86;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.22955e-05;OID=.;OPOS=113561054;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:154:153:0:0:153:153:1:86:67:0:0:86:67:0:0
chr11	113561057	.	A	G	2162.11	PASS	AF=0.961039;AO=147;DP=153;FAO=148;FDP=154;FR=.;FRO=6;FSAF=62;FSAR=86;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=-0.0156354;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.3406;QD=56.1586;RBI=0.0169781;REFB=-0.183781;REVB=-0.00661738;RO=6;SAF=62;SAR=85;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0312599;STB=0.516491;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.00637386;OID=.;OPOS=113561057;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:153:154:6:6:147:148:0.961039:85:62:5:1:86:62:5:1
chr11	113570405	.	T	C	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00426679;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.989;QD=55.0979;RBI=0.010274;REFB=0;REVB=0.00934606;RO=0;SAF=8;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.28381e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000105395;OID=.;OPOS=113570405;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:18:8:0:0:18:8:0:0
chr11	113576932	.	A	G	594.46	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0700866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.7538;QD=60.9699;RBI=0.0915484;REFB=0;REVB=0.058898;RO=0;SAF=16;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.43889e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00124765;OID=.;OPOS=113576932;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:23:16:0:0:23:16:0:0
chr11	113670052	.	T	A	619.94	PASS	AF=0.97619;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.010301;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=248.291;QD=59.0423;RBI=0.014642;REFB=-0.0485951;REVB=0.0104057;RO=1;SAF=23;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0199652;STB=0.510633;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=5.25638e-05;OID=.;OPOS=113670052;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:42:42:1:1:41:41:0.97619:18:23:1:0:18:23:1:0
chr11	113679119	.	C	T	306.31	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0355068;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.2734;QD=53.2706;RBI=0.0363399;REFB=0;REVB=-0.00773674;RO=0;SAF=15;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000799323;OID=.;OPOS=113679119;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:8:15:0:0:8:15:0:0
chr11	113803104	.	G	A	335.84	PASS	AF=0.566667;AO=34;DP=60;FAO=34;FDP=60;FR=.;FRO=26;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.0120756;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.6036;QD=22.3895;RBI=0.012442;REFB=-0.00646718;REVB=0.00299756;RO=26;SAF=18;SAR=16;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0532915;STB=0.529394;STBP=0.631;TYPE=snp;VARB=0.00558646;OID=.;OPOS=113803104;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:26:26:34:34:0.566667:16:18:12:14:16:18:12:14
chr11	113848273	.	A	T	36.49	PASS	AF=0.3;AO=6;DP=20;FAO=6;FDP=20;FR=.;FRO=14;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=12;FWDB=-0.118134;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.6352;QD=7.29723;RBI=0.118357;REFB=0.0370708;REVB=-0.0072667;RO=14;SAF=2;SAR=4;SRF=2;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.272723;STB=0.666221;STBP=0.469;TYPE=snp;VARB=-0.0928475;OID=.;OPOS=113848273;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:20:20:14:14:6:6:0.3:4:2:2:12:4:2:2:12
chr11	114393652	.	C	T	272.8	PASS	AF=0.424658;AO=31;DP=73;FAO=31;FDP=73;FR=.;FRO=42;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=27;FWDB=0.0202952;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=245.795;QD=14.9479;RBI=0.0275894;REFB=-0.00365964;REVB=0.018689;RO=42;SAF=19;SAR=12;SRF=15;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.256383;STB=0.644817;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.0046306;OID=.;OPOS=114393652;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:42:42:31:31:0.424658:12:19:15:27:12:19:15:27
chr11	114401577	.	T	C	386.93	PASS	AF=0.512821;AO=39;DP=78;FAO=40;FDP=78;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=15;FSRR=23;FWDB=-0.00617034;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=123.784;QD=19.8424;RBI=0.00779202;REFB=-0.00499535;REVB=-0.00475841;RO=36;SAF=14;SAR=25;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0533254;STB=0.510199;STBP=0.886;TYPE=snp;VARB=0.00336067;OID=.;OPOS=114401577;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:36:38:39:40:0.512821:25:14:15:21:25:15:15:23
chr11	114421857	.	T	C	72.35	PASS	AF=0.294118;AO=10;DP=34;FAO=10;FDP=34;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=0.0150284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.209;QD=8.51176;RBI=0.0177395;REFB=-0.00535721;REVB=0.00942529;RO=23;SAF=5;SAR=5;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0246742;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0127415;OID=.;OPOS=114421857;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:34:34:23:24:10:10:0.294118:5:5:12:11:5:5:12:12
chr11	114421861	.	G	A	72.35	PASS	AF=0.294118;AO=10;DP=34;FAO=10;FDP=34;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=0.0169171;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.8517;QD=8.5118;RBI=0.0245956;REFB=0.0277361;REVB=-0.0178537;RO=24;SAF=5;SAR=5;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0614096;OID=.;OPOS=114421861;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:34:34:24:24:10:10:0.294118:5:5:12:12:5:5:12:12
chr11	114421895	.	G	A	53.41	PASS	AF=0.285714;AO=8;DP=28;FAO=8;FDP=28;FR=.;FRO=20;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=-0.000866271;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.765;QD=7.62976;RBI=0.0227349;REFB=-0.000774427;REVB=-0.0227184;RO=19;SAF=3;SAR=5;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113905;STB=0.555414;STBP=0.793;TYPE=snp;VARB=0.00270675;OID=.;OPOS=114421895;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:28:28:19:20:8:8:0.285714:5:3:9:10:5:3:9:11
chr11	114441943	.	G	A	251.63	PASS	AF=0.37037;AO=29;DP=79;FAO=30;FDP=81;FR=.;FRO=51;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=25;FSRR=26;FWDB=-0.00802675;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=78.9047;QD=12.4264;RBI=0.0389154;REFB=-0.0141743;REVB=-0.0380786;RO=41;SAF=9;SAR=20;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14444;STB=0.62788;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.0300799;OID=.;OPOS=114441943;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:81:41:51:29:30:0.37037:20:9:18:23:21:9:25:26
chr11	114442103	.	A	G	39.95	PASS	AF=0.666667;AO=5;DP=8;FAO=6;FDP=9;FR=.;FRO=3;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0190341;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.6356;QD=17.7574;RBI=0.0401957;REFB=0.00353134;REVB=0.0354033;RO=2;SAF=3;SAR=2;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.212944;STB=0.555372;STBP=0.703;TYPE=snp;VARB=0.00217092;OID=.;OPOS=114442103;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:8:9:2:3:5:6:0.666667:2:3:2:0:3:3:2:1
chr11	114569054	.	A	G	1258.14	PASS	AF=1;AO=82;DP=82;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0459395;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.2626;QD=60.6331;RBI=0.0464381;REFB=0;REVB=0.00678686;RO=0;SAF=43;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.10525e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00191354;OID=.;OPOS=114569054;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:83:0:0:82:83:1:39:43:0:0:40:43:0:0
chr11	114576626	.	A	T	208.01	PASS	AF=0.375;AO=18;DP=59;FAO=21;FDP=56;FR=.,HEALED;FRO=31;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=-0.00282799;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=40.842;QD=14.858;RBI=0.0273101;REFB=-0.00317884;REVB=0.0271633;RO=34;SAF=9;SAR=9;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0983387;STB=0.542921;STBP=0.63;TYPE=snp;VARB=0.0324279;OID=.;OPOS=114576626;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:56:34:31:18:21:0.375:9:9:20:14:11:10:17:14
chr11	116628630	.	C	T	140.96	PASS	AF=0.576923;AO=15;DP=26;FAO=15;FDP=26;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=-0.0111827;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.7443;QD=21.6863;RBI=0.0279532;REFB=-0.0180937;REVB=0.0256189;RO=10;SAF=4;SAR=11;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.189223;STB=0.631997;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.0310546;OID=.;OPOS=116628630;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:26:26:10:11:15:15:0.576923:11:4:5:5:11:4:6:5
chr11	116633825	.	C	G,T	907.09	PASS	AF=0.015625,0.984375;AO=3,60;DP=64;FAO=1,63;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=1,38;FSAR=0,25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0522087,0.0262439;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=23.5172,131.768;QD=56.6928;RBI=0.0540855,0.0310171;REFB=0,0;REVB=0.0141241,0.0165324;RO=0;SAF=3,36;SAR=0,24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-5.9695e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.126185,0.000704782;OID=.,.;OPOS=116633825,116633825;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:3:64:64:0:0:3,60:1,63:0.015625,0.984375:0,24:3,36:0:0:0,25:1,38:0:0
chr11	116633947	.	G	A	90.59	PASS	AF=0.555556;AO=10;DP=18;FAO=10;FDP=18;FR=.,HEALED;FRO=6;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.00373363;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.22;QD=20.1307;RBI=0.00585908;REFB=-0.00355361;REVB=0.0045154;RO=6;SAF=1;SAR=9;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.422407;STB=0.749373;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=-0.00950071;OID=.;OPOS=116633947;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:18:18:6:6:10:10:0.555556:9:1:3:3:9:1:3:3
chr11	116661826	.	T	C	1185.51	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00797904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=309.519;QD=60.7952;RBI=0.0190022;REFB=0;REVB=0.0172458;RO=0;SAF=42;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.98661e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.77306e-05;OID=.;OPOS=116661826;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:78:0:0:73:78:1:31:42:0:0:33:45:0:0
chr11	116662579	.	C	G,T	580.7	PASS	AF=0.0512821,0.948718;AO=2,37;DP=39;FAO=2,37;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=0,13;FSAR=2,24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0243081,-0.00655616;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=139.893,110.218;QD=59.5593;RBI=0.0316616,0.00935465;REFB=0,0;REVB=-0.0202872,0.00667279;RO=0;SAF=0,13;SAR=2,24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.161336,0.000694786;OID=.,.;OPOS=116662579,116662579;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:7:39:39:0:0:2,37:2,37:0.0512821,0.948718:2,24:0,13:0:0:2,24:0,13:0:0
chr11	116692334	.	C	T	208.1	PASS	AF=0.552632;AO=20;DP=38;FAO=21;FDP=38;FR=.;FRO=17;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=-0.00974002;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.819;QD=21.905;RBI=0.0345041;REFB=-0.00211711;REVB=0.0331008;RO=18;SAF=10;SAR=10;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0936166;STB=0.52894;STBP=0.7;TYPE=snp;VARB=0.00185211;OID=.;OPOS=116692334;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:18:17:20:21:0.552632:10:10:7:11:11:10:7:10
chr11	116693464	.	C	T	267.02	PASS	AF=0.340426;AO=32;DP=94;FAO=32;FDP=94;FR=.;FRO=62;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=40;FSRR=22;FWDB=0.0123808;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.525;QD=11.3624;RBI=0.0131551;REFB=-0.0125745;REVB=-0.00444678;RO=62;SAF=14;SAR=18;SRF=40;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.233345;STB=0.634384;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.0333257;OID=.;OPOS=116693464;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:62:62:32:32:0.340426:18:14:40:22:18:14:40:22
chr11	116701535	.	T	C	186.79	PASS	AF=0.5;AO=19;DP=38;FAO=19;FDP=38;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.0665074;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.175;QD=19.6623;RBI=0.0666578;REFB=-0.0416447;REVB=-0.00447559;RO=19;SAF=5;SAR=14;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.299517;STB=0.670469;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.0297263;OID=.;OPOS=116701535;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:19:19:19:19:0.5:14:5:11:8:14:5:11:8
chr11	116728842	.	G	A	205.08	PASS	AF=0.42;AO=21;DP=50;FAO=21;FDP=50;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.0101134;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.497;QD=16.406;RBI=0.0208963;REFB=0.00791673;REVB=0.0182859;RO=29;SAF=13;SAR=8;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105865;STB=0.560726;STBP=0.436;TYPE=snp;VARB=-0.0168021;OID=.;OPOS=116728842;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:29:29:21:21:0.42:8:13:15:14:8:13:15:14
chr11	116729013	.	T	C	172.81	PASS	AF=0.461538;AO=18;DP=38;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=-0.0137513;FXX=0.0249938;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.644;QD=17.7239;RBI=0.0227735;REFB=-0.0347197;REVB=-0.018153;RO=20;SAF=7;SAR=11;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0381998;STB=0.504499;STBP=0.973;TYPE=snp;VARB=0.0413302;OID=.;OPOS=116729013;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:39:20:21:18:18:0.461538:11:7:7:13:11:7:8:13
chr11	116729196	.	T	C	307.0	PASS	AF=0.586957;AO=27;DP=46;FAO=27;FDP=46;FR=.;FRO=19;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.0201834;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.763;QD=26.6958;RBI=0.0202512;REFB=-0.0301714;REVB=-0.00165535;RO=19;SAF=16;SAR=11;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.09012;STB=0.549881;STBP=0.412;TYPE=snp;VARB=0.018903;OID=.;OPOS=116729196;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:19:19:27:27:0.586957:11:16:9:10:11:16:9:10
chr11	117042377	.	G	A	334.27	PASS	AF=0.45;AO=36;DP=80;FAO=36;FDP=80;FR=.;FRO=44;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=25;FWDB=-0.022535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.185;QD=16.7134;RBI=0.0228981;REFB=-0.0224395;REVB=-0.00406175;RO=44;SAF=22;SAR=14;SRF=19;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176434;STB=0.599107;STBP=0.127;TYPE=snp;VARB=0.0293669;OID=.;OPOS=117042377;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:44:44:36:36:0.45:14:22:19:25:14:22:19:25
chr11	117077034	.	A	G	132.12	PASS	AF=0.416667;AO=15;DP=35;FAO=15;FDP=36;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=0.0259363;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.238;QD=14.6796;RBI=0.0264928;REFB=-0.00199119;REVB=-0.00540145;RO=19;SAF=7;SAR=8;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108301;STB=0.560805;STBP=0.559;TYPE=snp;VARB=0.00143122;OID=.;OPOS=117077034;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:36:19:21:15:15:0.416667:8:7:11:8:8:7:12:9
chr11	117156552	.	T	C	594.54	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0143658;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.095;QD=60.9781;RBI=0.0276114;REFB=0;REVB=0.02358;RO=0;SAF=24;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.5604e-05;OID=.;OPOS=117156552;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:15:24:0:0:15:24:0:0
chr11	117160347	.	A	G	567.6	PASS	AF=1;AO=37;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0328136;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.661;QD=59.7477;RBI=0.0335452;REFB=0;REVB=0.00696795;RO=0;SAF=16;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.7558e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000512106;OID=.;OPOS=117160347;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:37:38:1:21:16:0:0:22:16:0:0
chr11	117252489	.	T	C	854.3	PASS	AF=0.45283;AO=75;DP=191;FAO=96;FDP=212;FR=.;FRO=116;FSAF=59;FSAR=37;FSRF=81;FSRR=35;FWDB=0.0131152;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.09;QD=16.1188;RBI=0.0131961;REFB=-0.0169715;REVB=0.00145896;RO=109;SAF=46;SAR=29;SRF=79;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128762;STB=0.549417;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=0.0239793;OID=.;OPOS=117252489;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:191:212:109:116:75:96:0.45283:29:46:79:30:37:59:81:35
chr11	117282800	.	G	T	185.81	PASS	AF=0.487179;AO=19;DP=39;FAO=19;FDP=39;FR=.;FRO=20;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.00854738;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.892;QD=19.0569;RBI=0.0233207;REFB=-0.0238965;REVB=0.0216978;RO=20;SAF=13;SAR=6;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13202;STB=0.575139;STBP=0.384;TYPE=snp;VARB=0.0172722;OID=.;OPOS=117282800;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:20:20:19:19:0.487179:6:13:11:9:6:13:11:9
chr11	117309989	.	C	T	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0327938;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.167;QD=44.6898;RBI=0.095816;REFB=0;REVB=-0.0900293;RO=0;SAF=6;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00372772;OID=.;OPOS=117309989;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:7:6:0:0:7:6:0:0
chr11	117310022	.	A	G	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0407841;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.614;QD=52.6132;RBI=0.0417723;REFB=0;REVB=-0.00903226;RO=0;SAF=9;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2029e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000266761;OID=.;OPOS=117310022;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:13:9:0:0:13:9:0:0
chr11	117335722	.	T	C	823.61	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0484378;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.4111;QD=56.8007;RBI=0.0632019;REFB=0;REVB=0.0405989;RO=0;SAF=25;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00352559;OID=.;OPOS=117335722;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:56:58:0:0:56:58:1:31:25:0:0:31:27:0:0
chr11	117693255	.	T	C	1573.36	PASS	AF=1;AO=104;DP=104;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00146359;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.463;QD=59.9376;RBI=0.0038264;REFB=0;REVB=0.00353542;RO=0;SAF=56;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.3388e-06;OID=.;OPOS=117693255;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:104:105:0:0:104:105:1:48:56:0:0:48:57:0:0
chr11	117774291	.	A	C	393.32	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0612547;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.2454;QD=56.189;RBI=0.0617384;REFB=0;REVB=-0.00771321;RO=0;SAF=12;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00166482;OID=.;OPOS=117774291;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:16:12:0:0:16:12:0:0
chr11	117781435	.	A	G	508.29	PASS	AF=0.972222;AO=34;DP=34;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0191503;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.535;QD=56.4762;RBI=0.0383043;REFB=-0.101889;REVB=0.0331736;RO=0;SAF=16;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.515143;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.00309791;OID=.;OPOS=117781435;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:34:36:0:1:34:35:0.972222:18:16:0:0:19:16:1:0
chr11	117789342	.	T	C	163.47	PASS	AF=0.38;AO=18;DP=48;FAO=19;FDP=50;FR=.;FRO=31;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=-0.023142;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.6118;QD=13.0774;RBI=0.024925;REFB=-0.0211386;REVB=-0.00925761;RO=26;SAF=7;SAR=11;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115825;STB=0.612646;STBP=0.202;TYPE=snp;VARB=0.0780799;OID=.;OPOS=117789342;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:50:26:31:18:19:0.38:11:7:13:13:12:7:17:14
chr11	117789345	.	G	C	148.5	PASS	AF=0.34;AO=17;DP=50;FAO=17;FDP=50;FR=.;FRO=33;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=-0.0595085;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=37.2094;QD=11.8802;RBI=0.106245;REFB=-0.0165935;REVB=0.0880151;RO=33;SAF=7;SAR=10;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116318;STB=0.568639;STBP=0.485;TYPE=snp;VARB=0.0293225;OID=.;OPOS=117789345;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:33:33:17:17:0.34:10:7:17:16:10:7:17:16
chr11	117864047	.	A	G	252.47	PASS	AF=0.5;AO=24;DP=47;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=19;FSRF=5;FSRR=19;FWDB=-0.0230545;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=95.3822;QD=21.0392;RBI=0.0266257;REFB=-0.0534089;REVB=0.0133198;RO=23;SAF=5;SAR=19;SRF=4;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.047068;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0532201;OID=.;OPOS=117864047;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:48:23:24:24:24:0.5:19:5:4:19:19:5:5:19
chr11	117864113	.	G	A	244.29	PASS	AF=0.547619;AO=23;DP=41;FAO=23;FDP=42;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.0179855;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=170.1;QD=23.2659;RBI=0.0297094;REFB=-0.0180915;REVB=-0.0236468;RO=18;SAF=10;SAR=13;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00772773;STB=0.517804;STBP=0.815;TYPE=snp;VARB=0.0137963;OID=.;OPOS=117864113;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:42:18:19:23:23:0.547619:13:10:8:10:13:10:9:10
chr11	117864846	.	A	G	152.15	PASS	AF=0.369565;AO=17;DP=46;FAO=17;FDP=46;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=20;FWDB=0.0289235;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.188;QD=13.2308;RBI=0.0320062;REFB=-0.00301503;REVB=-0.0137051;RO=29;SAF=8;SAR=9;SRF=9;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176789;STB=0.602483;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=0.0108198;OID=.;OPOS=117864846;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:29:29:17:17:0.369565:9:8:9:20:9:8:9:20
chr11	117869670	.	A	G	239.45	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0423339;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.518;QD=50.4114;RBI=0.0423478;REFB=0;REVB=0.00108314;RO=0;SAF=6;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.851e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000244825;OID=.;OPOS=117869670;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:13:6:0:0:13:6:0:0
chr11	117896135	.	C	T	956.56	PASS	AF=0.369775;AO=113;DP=312;FAO=115;FDP=311;FR=.;FRO=196;FSAF=61;FSAR=54;FSRF=88;FSRR=108;FWDB=-0.000146242;FXX=0.00320503;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.583;QD=12.303;RBI=0.00100004;REFB=0.0033249;REVB=-0.000989293;RO=196;SAF=59;SAR=54;SRF=88;SRR=108;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0818697;STB=0.551196;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=-0.00622966;OID=.;OPOS=117896135;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:312:311:196:196:113:115:0.369775:54:59:88:108:54:61:88:108
chr11	117965595	.	C	T	168.68	PASS	AF=0.428571;AO=18;DP=42;FAO=18;FDP=42;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=-0.0425394;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.8904;QD=16.0647;RBI=0.049274;REFB=-0.0123271;REVB=-0.0248662;RO=24;SAF=5;SAR=13;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199228;STB=0.615249;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=0.0160256;OID=.;OPOS=117965595;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:24:24:18:18:0.428571:13:5:11:13:13:5:11:13
chr11	117982460	.	T	TG	67.94	PASS	AF=0.432432;AO=4;DP=39;FAO=16;FDP=37;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.104763;FXX=0.0263089;HRUN=3;LEN=1;MLLD=16.4752;QD=7.34505;RBI=0.169129;REFB=0.0222416;REVB=-0.132775;RO=35;SAF=1;SAR=3;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.370803;STB=0.522156;STBP=0.801;TYPE=ins;VARB=-0.0288311;OID=.;OPOS=117982461;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.432432:4:39:16:37:21:9:7:11:10:67:35:1:3:21:14
chr11	117982464	.	A	G	157.12	PASS	AF=0.435897;AO=16;DP=36;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.01254;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.8127;QD=16.1149;RBI=0.07202;REFB=0.0108439;REVB=-0.0709199;RO=19;SAF=10;SAR=6;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0965432;STB=0.586103;STBP=0.388;TYPE=snp;VARB=-0.0117679;OID=.;OPOS=117982464;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:39:19:22:16:17:0.435897:6:10:10:9:6:11:11:11
chr11	117982495	.	T	G	594.54	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00156345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.337;QD=60.9786;RBI=0.0361081;REFB=0;REVB=0.0360743;RO=0;SAF=19;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.3303e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.49269e-05;OID=.;OPOS=117982495;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:20:19:0:0:20:19:0:0
chr11	117988082	.	T	C	876.95	PASS	AF=0.96875;AO=62;DP=64;FAO=62;FDP=64;FR=.;FRO=2;FSAF=49;FSAR=13;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00822776;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=301.531;QD=54.8094;RBI=0.00958929;REFB=-0.0189301;REVB=-0.00492529;RO=2;SAF=49;SAR=13;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0188826;STB=0.509997;STBP=0.602;TYPE=snp;VARB=-7.96449e-06;OID=.;OPOS=117988082;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:64:64:2:2:62:62:0.96875:13:49:2:0:13:49:2:0
chr11	117988105	.	C	T	305.48	PASS	AF=0.478261;AO=33;DP=69;FAO=33;FDP=69;FR=.;FRO=36;FSAF=28;FSAR=5;FSRF=27;FSRR=9;FWDB=-0.0523899;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.8267;QD=17.7091;RBI=0.0755484;REFB=-0.0276565;REVB=-0.0544321;RO=34;SAF=28;SAR=5;SRF=25;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171095;STB=0.587647;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=0.0191833;OID=.;OPOS=117988105;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:34:36:33:33:0.478261:5:28:25:9:5:28:27:9
chr11	118006671	.	A	G	108.61	PASS	AF=0.40625;AO=13;DP=32;FAO=13;FDP=32;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.00100691;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.258;QD=13.5766;RBI=0.00513418;REFB=-0.0196748;REVB=0.00503447;RO=18;SAF=5;SAR=8;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117074;STB=0.585233;STBP=0.438;TYPE=snp;VARB=0.0331399;OID=.;OPOS=118006671;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:18:19:13:13:0.40625:8:5:9:9:8:5:10:9
chr11	118033936	.	C	T	161.51	PASS	AF=0.5;AO=17;DP=34;FAO=17;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=0.0513272;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.931;QD=19.0005;RBI=0.0523144;REFB=-0.0120857;REVB=-0.0101151;RO=17;SAF=5;SAR=12;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0130405;OID=.;OPOS=118033936;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:17:17:17:17:0.5:12:5:5:12:12:5:5:12
chr11	118074337	.	A	G	501.58	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0360368;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.291;QD=59.0092;RBI=0.0536407;REFB=0;REVB=0.0397325;RO=0;SAF=24;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00117198;OID=.;OPOS=118074337;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:10:24:0:0:10:24:0:0
chr11	118081345	.	A	T	1190.45	PASS	AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-9.96217e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.895;QD=61.049;RBI=0.0133769;REFB=0;REVB=0.0133765;RO=0;SAF=41;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.4281e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.02129e-05;OID=.;OPOS=118081345;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:37:41:0:0:37:41:0:0
chr11	118083664	.	A	G	1250.77	PASS	AF=0.965116;AO=83;DP=87;FAO=83;FDP=86;FR=.;FRO=3;FSAF=38;FSAR=45;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.00217169;FXX=0.0114929;HRUN=3;LEN=1;MLLD=70.6824;QD=58.1752;RBI=0.0282296;REFB=-0.127334;REVB=0.0281459;RO=1;SAF=38;SAR=45;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0104093;STB=0.507326;STBP=0.484;TYPE=snp;VARB=0.00323524;OID=.;OPOS=118083664;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:87:86:1:3:83:83:0.965116:45:38:0:1:45:38:2:1
chr11	118107805	.	A	G	885.81	PASS	AF=1;AO=60;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0191211;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.741;QD=58.0861;RBI=0.0285035;REFB=0;REVB=0.0211384;RO=0;SAF=47;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000104801;OID=.;OPOS=118107805;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:60:61:1:13:47:0:0:14:47:0:0
chr11	118110977	.	T	C	1829.32	PASS	AF=1;AO=118;DP=119;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0191412;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=94.8244;QD=60.9773;RBI=0.0262595;REFB=0;REVB=-0.0179772;RO=0;SAF=70;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.2502e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000303065;OID=.;OPOS=118110977;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:119:120:0:0:118:120:1:48:70:0:0:48:72:0:0
chr11	118179197	.	A	G	372.23	PASS	AF=0.965517;AO=27;DP=29;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.05181;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.955;QD=51.342;RBI=0.0518846;REFB=-0.111698;REVB=0.0027826;RO=2;SAF=8;SAR=19;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102852;STB=0.526297;STBP=0.256;TYPE=snp;VARB=0.00117881;OID=.;OPOS=118179197;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:29:29:2:1:27:28:0.965517:19:8:2:0:19:9:1:0
chr11	118182829	.	T	A	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0107895;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.032;QD=45.8067;RBI=0.108547;REFB=0;REVB=0.10801;RO=0;SAF=11;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00119934;OID=.;OPOS=118182829;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:3:11:0:0:3:11:0:0
chr11	118359176	.	CTTTTTTAC	CTTTTTAC,CTTTTTACT	36.48	PASS	AF=0.188889,0;AO=29,3;DP=82;FAO=17,0;FDP=90;FR=.;FRO=73;FSAF=15,0;FSAR=2,0;FSRF=39;FSRR=34;FWDB=-0.120956,-0.102676;FXX=0;HRUN=6,6;LEN=1,3;MLLD=8.85978,101.889;QD=1.62126;RBI=0.129956,0.102712;REFB=-0.17587,-0.0178559;REVB=0.0475202,0.00269631;RO=48;SAF=23,3;SAR=6,0;SRF=21;SRR=27;SSEN=0.456311,0;SSEP=0,0;SSSB=0.417563,0.505654;STB=0.832889,0.5;STBP=0.005,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.165072,0;OID=.,.;OPOS=118359177,118359182;OREF=T,TAC;OALT=-,ACT;OMAPALT=CTTTTTAC,CTTTTTACT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.188889,0:29,3:82:17,0:90:73:15,0:2,0:39:34:37:48:23,3:6,0:21:27
chr11	118404281	.	CT	C,CG	140.91	PASS	AF=0.4,0;AO=14,2;DP=40;FAO=16,0;FDP=40;FR=.;FRO=24;FSAF=5,0;FSAR=11,0;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=0.00275383,-6.01912e-05;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=200.61,201.797;QD=14.0907;RBI=0.0345692,0.0280411;REFB=-0.0102856,-0.00929118;REVB=0.0344594,0.0280411;RO=22;SAF=4,1;SAR=10,1;SRF=14;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.365339,-0.133582;STB=0.687266,0.5;STBP=0.083,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0200879,0.061853;OID=.,.;OPOS=118404282,118404282;OREF=T,T;OALT=-,G;OMAPALT=C,CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.4,0:14,2:40:16,0:40:24:5,0:11,0:15:9:99:22:4,1:10,1:14:8
chr11	118404804	.	G	A	160.41	PASS	AF=0.64;AO=16;DP=26;FAO=16;FDP=25;FR=.;FRO=9;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.0283983;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.1451;QD=25.6655;RBI=0.0357754;REFB=-0.00548097;REVB=-0.0217581;RO=9;SAF=12;SAR=4;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151559;STB=0.585252;STBP=0.327;TYPE=snp;VARB=0.00280253;OID=.;OPOS=118404804;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:26:25:9:9:16:16:0.64:4:12:5:4:4:12:5:4
chr11	118405068	.	A	G	83.57	PASS	AF=0.625;AO=10;DP=16;FAO=10;FDP=16;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.00601056;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.226;QD=20.8923;RBI=0.00601499;REFB=-0.00207832;REVB=0.000230925;RO=6;SAF=4;SAR=6;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0459658;STB=0.526264;STBP=0.821;TYPE=snp;VARB=0.000843543;OID=.;OPOS=118405068;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:16:16:6:6:10:10:0.625:6:4:2:4:6:4:2:4
chr11	118405305	.	G	A	207.83	PASS	AF=0.606061;AO=19;DP=32;FAO=20;FDP=33;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.0961135;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.311;QD=25.1913;RBI=0.10276;REFB=-0.00143781;REVB=0.036358;RO=13;SAF=8;SAR=11;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0300096;STB=0.524975;STBP=0.75;TYPE=snp;VARB=0.00248886;OID=.;OPOS=118405305;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:33:13:13:19:20:0.606061:11:8:6:7:12:8:6:7
chr11	118405835	.	G	A	135.07	PASS	AF=0.46875;AO=15;DP=32;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=16;FWDB=-0.0332234;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.037;QD=16.8837;RBI=0.0340514;REFB=-0.00450269;REVB=-0.00746327;RO=17;SAF=6;SAR=9;SRF=1;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.366372;STB=0.704015;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=0.00610088;OID=.;OPOS=118405835;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:17:17:15:15:0.46875:9:6:1:16:9:6:1:16
chr11	118430519	.	C	T	198.02	PASS	AF=0.512821;AO=20;DP=39;FAO=20;FDP=39;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.0653721;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.0836;QD=20.3093;RBI=0.0669552;REFB=-0.0102142;REVB=-0.0144736;RO=19;SAF=7;SAR=13;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20201;STB=0.614057;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.0114937;OID=.;OPOS=118430519;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:19:19:20:20:0.512821:13:7:11:8:13:7:11:8
chr11	118471423	.	T	C	1242.25	PASS	AF=1;AO=80;DP=80;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00677449;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.912;QD=61.3455;RBI=0.0206228;REFB=0;REVB=-0.0194783;RO=0;SAF=35;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.30416e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000101313;OID=.;OPOS=118471423;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:80:81:0:0:80:81:1:45:35:0:0:45:36:0:0
chr11	118472354	.	C	A	1190.43	PASS	AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0352868;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.4155;QD=61.0475;RBI=0.0373671;REFB=0;REVB=0.0122938;RO=0;SAF=53;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000322896;OID=.;OPOS=118472354;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:25:53:0:0:25:53:0:0
chr11	118505676	.	GTA	GA,GAG,GGA	1059.58	PASS	AF=0.918919,0.027027,0.0540541;AO=67,3,4;DP=74;FAO=68,2,4;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=36,1,3;FSAR=32,1,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0272609,0.0237277,0.0217256;FXX=0;HRUN=1,1,1;LEN=1,2,1;MLLD=94.0357,74.2869,75.2621;QD=57.2745;RBI=0.0351748,0.0525578,0.0760106;REFB=0,0,0;REVB=-0.0222286,-0.0468969,-0.0728396;RO=0;SAF=36,1,3;SAR=31,2,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,4.86674e-08;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,mnp,snp;VARB=0.000689104,0.052783,-0.0619528;OID=.,.,.;OPOS=118505677,118505677,118505677;OREF=T,TA,T;OALT=-,AG,G;OMAPALT=GA,GAG,GGA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/3:0.918919,0.027027,0.0540541:67,3,4:74:68,2,4:74:0:36,1,3:32,1,1:0:0:10:0:36,1,3:31,2,1:0:0
chr11	118509668	.	A	G	272.76	PASS	AF=0.555556;AO=25;DP=45;FAO=25;FDP=45;FR=.;FRO=20;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=-0.0209382;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.819;QD=24.2457;RBI=0.0858521;REFB=-0.0225057;REVB=-0.0832597;RO=20;SAF=14;SAR=11;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0880191;STB=0.54898;STBP=0.463;TYPE=snp;VARB=0.0113717;OID=.;OPOS=118509668;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:20:20:25:25:0.555556:11:14:9:11:11:14:9:11
chr11	118529017	.	T	G	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.050195;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.238;QD=44.6897;RBI=0.0662465;REFB=0;REVB=-0.0432326;RO=0;SAF=9;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000170799;OID=.;OPOS=118529017;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:4:9:0:0:4:9:0:0
chr11	118529069	.	G	C	256.43	PASS	AF=0.913043;AO=22;DP=23;FAO=21;FDP=23;FR=.;FRO=2;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0184339;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.7549;QD=44.5963;RBI=0.0313921;REFB=-0.0433391;REVB=0.0254098;RO=0;SAF=9;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2029e-08;STB=0.538425;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.00373767;OID=.;OPOS=118529069;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:23:23:0:2:22:21:0.913043:13:9:0:0:12:9:0:2
chr11	118529078	.	G	C	296.89	PASS	AF=0.958333;AO=23;DP=24;FAO=23;FDP=24;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0334604;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.952;QD=49.4816;RBI=0.0867143;REFB=-0.162791;REVB=0.0799986;RO=1;SAF=10;SAR=13;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0342828;STB=0.518502;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=0.0135565;OID=.;OPOS=118529078;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:24:24:1:1:23:23:0.958333:13:10:0:1:13:10:0:1
chr11	118529127	.	G	A	145.83	PASS	AF=0.652174;AO=15;DP=23;FAO=15;FDP=23;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0039533;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.669;QD=25.3609;RBI=0.0110112;REFB=-0.0269648;REVB=0.0102771;RO=8;SAF=6;SAR=9;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0636683;STB=0.535666;STBP=0.676;TYPE=snp;VARB=0.00968479;OID=.;OPOS=118529127;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:23:23:8:8:15:15:0.652174:9:6:4:4:9:6:4:4
chr11	118530611	.	T	C	195.47	PASS	AF=0.387097;AO=24;DP=62;FAO=24;FDP=62;FR=.;FRO=38;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=-0.0329787;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.527;QD=12.6108;RBI=0.0361483;REFB=-0.0128569;REVB=0.0148023;RO=38;SAF=10;SAR=14;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0616696;STB=0.535489;STBP=0.658;TYPE=snp;VARB=0.0169199;OID=.;OPOS=118530611;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:38:38:24:24:0.387097:14:10:18:20:14:10:18:20
chr11	118534082	.	C	T	474.27	PASS	AF=0.47;AO=47;DP=100;FAO=47;FDP=100;FR=.;FRO=53;FSAF=23;FSAR=24;FSRF=35;FSRR=18;FWDB=-0.00324658;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.802;QD=18.9707;RBI=0.0370263;REFB=0.000820976;REVB=0.0368837;RO=53;SAF=23;SAR=24;SRF=35;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162657;STB=0.590293;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=-0.00118078;OID=.;OPOS=118534082;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:53:53:47:47:0.47:24:23:35:18:24:23:35:18
chr11	118619253	.	C	T	207.12	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0179278;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.1725;QD=48.7348;RBI=0.0180434;REFB=0;REVB=0.00203935;RO=0;SAF=10;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000793712;OID=.;OPOS=118619253;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:7:10:0:0:7:10:0:0
chr11	118621825	.	G	GT	807.8	PASS	AF=1;AO=74;DP=84;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.028484;FXX=0.0119033;HRUN=2;LEN=1;MLLD=14.8235;QD=38.9301;RBI=0.106315;REFB=0;REVB=0.102428;RO=6;SAF=30;SAR=44;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0138415;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-6.83048e-05;OID=.;OPOS=118621826;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:74:84:83:83:0:34:49:0:0:16:6:30:44:3:3
chr11	118622744	.	G	A	483.27	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0111738;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.0761;QD=58.5781;RBI=0.0116662;REFB=0;REVB=-0.00335361;RO=0;SAF=18;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.64315e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000297187;OID=.;OPOS=118622744;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:15:18:0:0:15:18:0:0
chr11	118828942	.	A	G	63.7	PASS	AF=0.321429;AO=9;DP=28;FAO=9;FDP=28;FR=.;FRO=19;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=14;FWDB=-0.0239909;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=339.443;QD=9.10002;RBI=0.0239909;REFB=-0.00383838;REVB=3.48674e-05;RO=19;SAF=3;SAR=6;SRF=5;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0913134;STB=0.555438;STBP=0.724;TYPE=snp;VARB=0.00732606;OID=.;OPOS=118828942;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:28:28:19:19:9:9:0.321429:6:3:5:14:6:3:5:14
chr11	118865465	.	C	T	68.82	PASS	AF=0.5;AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=-0.0109893;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=272.447;QD=15.2931;RBI=0.039099;REFB=-0.00518625;REVB=-0.0375229;RO=8;SAF=6;SAR=3;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.207482;STB=0.565081;STBP=0.675;TYPE=snp;VARB=0.00348605;OID=.;OPOS=118865465;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:18:18:8:9:9:9:0.5:3:6:7:1:3:6:7:2
chr11	118872404	.	T	C	478.01	PASS	AF=0.484536;AO=47;DP=97;FAO=47;FDP=97;FR=.;FRO=50;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=28;FSRR=22;FWDB=0.0314745;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.1178;QD=19.7118;RBI=0.0330949;REFB=0.00105336;REVB=0.0102288;RO=50;SAF=25;SAR=22;SRF=28;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0262216;STB=0.514557;STBP=0.782;TYPE=snp;VARB=-0.000558999;OID=.;OPOS=118872404;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:50:50:47:47:0.484536:22:25:28:22:22:25:28:22
chr11	118898435	.	AC	A	471.89	PASS	AF=1;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0563017;FXX=0.0243843;HRUN=2;LEN=1;MLLD=34.9072;QD=47.1889;RBI=0.0625042;REFB=0;REVB=0.0271457;RO=0;SAF=27;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.00103521;OID=.;OPOS=118898436;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:40:41:40:40:0:27:13:0:0:9:0:27:13:0:0
chr11	118919206	.	T	C	575.79	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0400565;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.869;QD=60.6099;RBI=0.061528;REFB=0;REVB=0.0467031;RO=0;SAF=20;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.51048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000432068;OID=.;OPOS=118919206;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:18:20:0:0:18:20:0:0
chr11	118922200	.	G	A	554.89	PASS	AF=0.538462;AO=55;DP=103;FAO=56;FDP=104;FR=.;FRO=48;FSAF=25;FSAR=31;FSRF=19;FSRR=29;FWDB=0.0109366;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.578;QD=21.3417;RBI=0.0141066;REFB=-0.0135567;REVB=0.00890992;RO=48;SAF=25;SAR=30;SRF=19;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0504568;STB=0.523735;STBP=0.63;TYPE=snp;VARB=0.011293;OID=.;OPOS=118922200;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:104:48:48:55:56:0.538462:30:25:19:29:31:25:19:29
chr11	118925341	.	G	A	293.61	PASS	AF=1;AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00996143;FXX=0.0434594;HRUN=2;LEN=1;MLLD=226.847;QD=53.3844;RBI=0.0352654;REFB=0;REVB=0.0338292;RO=0;SAF=8;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.10036e-05;OID=.;OPOS=118925341;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:22:0:0:22:22:1:14:8:0:0:14:8:0:0
chr11	118927013	.	T	TC	513.55	PASS	AF=1;AO=45;DP=51;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.135041;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=19.9882;QD=41.9222;RBI=0.13586;REFB=0;REVB=0.0148873;RO=6;SAF=23;SAR=22;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0710959;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00468391;OID=.;OPOS=118927014;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:45:51:49:49:0:26:23:0:0:9:6:23:22:5:1
chr11	118947634	.	C	T	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0193093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.492;QD=46.848;RBI=0.0685481;REFB=0;REVB=-0.0657722;RO=0;SAF=8;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000907712;OID=.;OPOS=118947634;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:7:8:0:0:7:8:0:0
chr11	118967758	.	T	C	131.32	PASS	AF=0.405405;AO=15;DP=37;FAO=15;FDP=37;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.000899339;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.065;QD=14.1962;RBI=0.00875075;REFB=-0.0071105;REVB=0.00870441;RO=21;SAF=6;SAR=9;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0296633;STB=0.533288;STBP=0.775;TYPE=snp;VARB=0.0153225;OID=.;OPOS=118967758;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:21:22:15:15:0.405405:9:6:9:12:9:6:10:12
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chr11	119005132	.	C	T	227.51	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.033538;FXX=0.0526039;HRUN=4;LEN=1;MLLD=144.69;QD=50.5581;RBI=0.0360384;REFB=0;REVB=0.0131897;RO=0;SAF=3;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.32e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000230114;OID=.;OPOS=119005132;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:15:3:0:0:15:3:0:0
chr11	119043656	.	C	T	1025.48	PASS	AF=0.959459;AO=70;DP=73;FAO=71;FDP=74;FR=.;FRO=3;FSAF=37;FSAR=34;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.00636144;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=129.304;QD=55.4315;RBI=0.00825715;REFB=-0.0973351;REVB=0.00526428;RO=2;SAF=36;SAR=34;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.025541;STB=0.505912;STBP=0.729;TYPE=snp;VARB=0.000503475;OID=.;OPOS=119043656;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:73:74:2:3:70:71:0.959459:34:36:2:0:34:37:2:1
chr11	119052826	.	C	A	3810.68	PASS	AF=1;AO=237;DP=238;FAO=243;FDP=243;FR=.;FRO=0;FSAF=126;FSAR=117;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.101038;FXX=0.00409819;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.5269;QD=62.7272;RBI=0.125226;REFB=0;REVB=0.0739786;RO=0;SAF=120;SAR=117;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02014e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00092681;OID=.;OPOS=119052826;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:20:238:243:0:0:237:243:1:117:120:0:0:117:126:0:0
chr11	119054351	.	A	G	132.71	PASS	AF=0.428571;AO=15;DP=35;FAO=15;FDP=35;FR=.;FRO=20;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=-0.0450662;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.581;QD=15.1671;RBI=0.0461442;REFB=-0.00505735;REVB=0.00991626;RO=20;SAF=11;SAR=4;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.382624;STB=0.721708;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=0.00878098;OID=.;OPOS=119054351;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:20:20:15:15:0.428571:4:11:7:13:4:11:7:13
chr11	119054488	.	C	T	613.36	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0309055;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.996;QD=61.3355;RBI=0.0560387;REFB=0;REVB=0.0467459;RO=0;SAF=23;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.4817e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000565579;OID=.;OPOS=119054488;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:17:23:0:0:17:23:0:0
chr11	119059404	.	G	A	371.15	PASS	AF=1;AO=20;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0294319;FXX=0.0644953;HRUN=4;LEN=1;MLLD=97.2191;QD=51.1928;RBI=0.0456657;REFB=0;REVB=0.0349159;RO=0;SAF=18;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.19193e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00886158;OID=.;OPOS=119059404;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:29:29:0:0:20:29:1:2:18:0:0:3:26:0:0
chr11	119063908	.	C	T	103.51	PASS	AF=0.545455;AO=12;DP=22;FAO=12;FDP=22;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.080972;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.468;QD=18.8198;RBI=0.0868281;REFB=-0.00519248;REVB=0.0313473;RO=10;SAF=7;SAR=5;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0972526;STB=0.555466;STBP=0.642;TYPE=snp;VARB=0.00653518;OID=.;OPOS=119063908;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:22:22:10:10:12:12:0.545455:5:7:7:3:5:7:7:3
chr11	119065709	.	G	C	526.57	PASS	AF=0.972973;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0300036;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.2089;QD=56.9261;RBI=0.0302994;REFB=0.0381036;REVB=-0.00422349;RO=1;SAF=16;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0228293;STB=0.512188;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=-0.00719219;OID=.;OPOS=119065709;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:37:37:1:1:36:36:0.972973:20:16:0:1:20:16:0:1
chr11	119178818	.	TA	T	30.85	PASS	AF=0.361702;AO=15;DP=48;FAO=17;FDP=47;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=-0.142901;FXX=0.020829;HRUN=7;LEN=1;MLLD=7.47722;QD=2.6253;RBI=0.233764;REFB=-0.0816715;REVB=0.184999;RO=24;SAF=11;SAR=4;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.305418;STB=0.639828;STBP=0.166;TYPE=del;VARB=0.073069;OID=.;OPOS=119178819;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.361702:15:48:17:47:30:12:5:15:15:30:24:11:4:11:13
chr11	119216231	.	A	G	726.13	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00534744;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.716;QD=56.9516;RBI=0.0129768;REFB=0;REVB=-0.0118238;RO=0;SAF=17;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.91044e-05;OID=.;OPOS=119216231;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:34:17:0:0:34:17:0:0
chr11	119216279	.	G	A	60.8	PASS	AF=0.285714;AO=5;DP=23;FAO=6;FDP=21;FR=.,HEALED;FRO=13;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=-0.00563898;FXX=0.0869187;HRUN=7;LEN=1;MLLD=311.343;QD=11.5817;RBI=0.00694001;REFB=-0.00686653;REVB=0.00404544;RO=15;SAF=2;SAR=3;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.222219;STB=0.631171;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=0.0086309;OID=.;OPOS=119216279;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:23:21:15:13:5:6:0.285714:3:2:9:6:3:3:9:4
chr11	119229964	.	G	A	1377.51	PASS	AF=1;AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0110702;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.683;QD=62.6141;RBI=0.017612;REFB=0;REVB=0.013698;RO=0;SAF=40;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.43431e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.7001e-05;OID=.;OPOS=119229964;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:88:88:0:0:88:88:1:48:40:0:0:48:40:0:0
chr11	119244095	.	C	T	686.62	PASS	AF=1;AO=43;DP=44;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00246335;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.713;QD=61.0327;RBI=0.0109157;REFB=0;REVB=0.0106341;RO=0;SAF=16;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000681152;OID=.;OPOS=119244095;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:45:0:0:43:45:1:27:16:0:0:29:16:0:0
chr11	119252199	.	T	G	3930.29	PASS	AF=1;AO=242;DP=242;FAO=246;FDP=246;FR=.;FRO=0;FSAF=141;FSAR=105;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.053528;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.303;QD=63.9071;RBI=0.0668154;REFB=0;REVB=0.0399881;RO=0;SAF=137;SAR=105;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.57083e-05;OID=.;OPOS=119252199;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:21:242:246:0:0:242:246:1:105:137:0:0:105:141:0:0
chr11	119290034	.	G	C	214.57	PASS	AF=0.947368;AO=18;DP=19;FAO=18;FDP=19;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0110058;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=265.11;QD=45.1731;RBI=0.0131507;REFB=-0.163811;REVB=0.00719803;RO=1;SAF=15;SAR=3;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0296514;STB=0.516111;STBP=0.643;TYPE=snp;VARB=0.000610736;OID=.;OPOS=119290034;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:19:19:1:1:18:18:0.947368:3:15:1:0:3:15:1:0
chr11	119510644	.	A	C	2978.61	PASS	AF=1;AO=188;DP=188;FAO=188;FDP=188;FR=.;FRO=0;FSAF=113;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00767387;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.5627;QD=63.3748;RBI=0.0115563;REFB=0;REVB=0.00864065;RO=0;SAF=113;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.50649e-06;OID=.;OPOS=119510644;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:16:188:188:0:0:188:188:1:75:113:0:0:75:113:0:0
chr11	119534606	.	TG	GT,T	48.04	PASS	AF=0,0.372549;AO=4,16;DP=49;FAO=0,19;FDP=51;FR=.;FRO=32;FSAF=0,1;FSAR=0,18;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=-0.0505174,0.0103025;FXX=0.0192271;HRUN=1,4;LEN=2,1;MLLD=61.7615,9.64225;QD=3.76754;RBI=0.142441,0.0741496;REFB=-0.0445606,-0.17881;REVB=-0.133181,-0.0734303;RO=27;SAF=0,1;SAR=4,15;SRF=13;SRR=14;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.61134,-0.622243;STB=0.5,0.881824;STBP=1,0.001;TYPE=mnp,del;VARB=0.0609852,0.173982;OID=.,.;OPOS=119534606,119534607;OREF=TG,G;OALT=GT,-;OMAPALT=GT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:49:49:51:27:32:4,16:0,19:0,0.372549:4,15:0,1:13:14:0,18:0,1:14:18
chr11	119879425	.	T	C	817.74	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00670291;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.361;QD=57.3853;RBI=0.0248856;REFB=0;REVB=0.0239659;RO=0;SAF=23;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000102842;OID=.;OPOS=119879425;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:34:23:0:0:34:23:0:0
chr11	119993897	.	CCTCT	CCT,CCTC	613.86	PASS	AF=1,0;AO=33,5;DP=41;FAO=40,0;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=13,0;FSAR=27,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.106249,0.0447851;FXX=0.0243843;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=262.167,240.05;QD=61.3863;RBI=0.106315,0.0448381;REFB=0,0;REVB=0.00375706,0.00217893;RO=0;SAF=7,4;SAR=26,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.44409e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=0.000155086,0;OID=.,.;OPOS=119993898,119993901;OREF=CT,T;OALT=-,-;OMAPALT=CCT,CCTC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1,0:33,5:41:40,0:40:0:13,0:27,0:0:0:4:0:7,4:26,1:0:0
chr11	119999191	.	A	G	834.38	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0344756;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.61;QD=57.5435;RBI=0.0358721;REFB=0;REVB=-0.00991163;RO=0;SAF=28;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000108403;OID=.;OPOS=119999191;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:30:28:0:0:30:28:0:0
chr11	120008429	.	G	A	419.51	PASS	AF=0.561644;AO=41;DP=73;FAO=41;FDP=73;FR=.;FRO=32;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=-0.00610254;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.104;QD=22.987;RBI=0.0255519;REFB=-0.0165282;REVB=0.0248124;RO=32;SAF=20;SAR=21;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0345975;STB=0.519029;STBP=0.722;TYPE=snp;VARB=0.0143061;OID=.;OPOS=120008429;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:32:32:41:41:0.561644:21:20:17:15:21:20:17:15
chr11	120040695	.	C	T	220.21	PASS	AF=0.454545;AO=25;DP=55;FAO=25;FDP=55;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=0.0728353;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.9369;QD=16.0149;RBI=0.0752732;REFB=-0.0241163;REVB=-0.0190018;RO=30;SAF=13;SAR=12;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147383;STB=0.583148;STBP=0.263;TYPE=snp;VARB=0.0280043;OID=.;OPOS=120040695;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:30:30:25:25:0.454545:12:13:11:19:12:13:11:19
chr11	120041110	.	T	A	452.2	PASS	AF=0.54321;AO=44;DP=81;FAO=44;FDP=81;FR=.;FRO=37;FSAF=26;FSAR=18;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=-0.0174175;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.462;QD=22.3308;RBI=0.017878;REFB=-0.00805424;REVB=-0.0040316;RO=37;SAF=26;SAR=18;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0199248;STB=0.510978;STBP=0.839;TYPE=snp;VARB=0.00952025;OID=.;OPOS=120041110;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:37:37:44:44:0.54321:18:26:21:16:18:26:21:16
chr11	120041444	.	C	T	407.76	PASS	AF=0.666667;AO=38;DP=57;FAO=38;FDP=57;FR=.;FRO=19;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=15;FSRR=4;FWDB=-0.0127052;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.3427;QD=28.6147;RBI=0.0184835;REFB=0.0212562;REVB=-0.0134245;RO=19;SAF=16;SAR=22;SRF=15;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.222795;STB=0.621067;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=-0.0137351;OID=.;OPOS=120041444;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:19:19:38:38:0.666667:22:16:15:4:22:16:15:4
chr11	120042081	.	G	A	204.27	PASS	AF=0.488372;AO=20;DP=42;FAO=21;FDP=43;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=0.0129079;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.803;QD=19.0019;RBI=0.0129562;REFB=0.0110364;REVB=0.00111766;RO=22;SAF=6;SAR=14;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0675636;STB=0.546829;STBP=0.605;TYPE=snp;VARB=-0.00156817;OID=.;OPOS=120042081;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:43:22:22:20:21:0.488372:14:6:8:14:15:6:8:14
chr11	120042082	.	G	A	244.2	PASS	AF=0.547619;AO=23;DP=42;FAO=23;FDP=42;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=0.0334829;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.605;QD=23.2568;RBI=0.0334837;REFB=-0.0096214;REVB=-0.00023223;RO=19;SAF=8;SAR=15;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0289003;STB=0.516115;STBP=0.843;TYPE=snp;VARB=0.00481439;OID=.;OPOS=120042082;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:19:19:23:23:0.547619:15:8:6:13:15:8:6:13
chr11	120042087	.	T	C	185.8	PASS	AF=0.487179;AO=19;DP=39;FAO=19;FDP=39;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=-0.0109567;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.4884;QD=19.0568;RBI=0.0180932;REFB=-0.0171172;REVB=0.0143984;RO=20;SAF=6;SAR=13;SRF=6;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0166401;STB=0.509424;STBP=0.924;TYPE=snp;VARB=0.0181693;OID=.;OPOS=120042087;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:20:20:19:19:0.487179:13:6:6:14:13:6:6:14
chr11	120175749	.	A	G	935.71	PASS	AF=1;AO=56;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=26;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00174812;FXX=0.0302984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.9466;QD=58.4816;RBI=0.00739633;REFB=0;REVB=-0.00718678;RO=0;SAF=26;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.29784e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.82585e-05;OID=.;OPOS=120175749;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:56:64:1:30:26:0:0:38:26:0:0
chr11	120198093	.	G	A	109.25	PASS	AF=0.419355;AO=13;DP=31;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=3;FWDB=0.0155099;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.347;QD=14.0971;RBI=0.0333905;REFB=-0.011635;REVB=-0.0295697;RO=18;SAF=7;SAR=6;SRF=15;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.309454;STB=0.676691;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=0.0256746;OID=.;OPOS=120198093;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:18:18:13:13:0.419355:6:7:15:3:6:7:15:3
chr11	120292570	.	T	A	1108.73	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0266544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.017;QD=59.9313;RBI=0.0316678;REFB=0;REVB=0.0170996;RO=0;SAF=30;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.1178e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.77173e-05;OID=.;OPOS=120292570;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:74:0:0:72:74:1:42:30:0:0:43:31:0:0
chr11	120355230	.	A	G	412.32	PASS	AF=0.532468;AO=41;DP=77;FAO=41;FDP=77;FR=.;FRO=36;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=12;FSRR=24;FWDB=0.00331882;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.7999;QD=21.419;RBI=0.00339025;REFB=-0.0106577;REVB=-0.00069225;RO=34;SAF=21;SAR=20;SRF=10;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179103;STB=0.583294;STBP=0.131;TYPE=snp;VARB=0.0185963;OID=.;OPOS=120355230;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:34:36:41:41:0.532468:20:21:10:24:20:21:12:24
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chr11	120745874	.	C	T	429.91	PASS	AF=0.444444;AO=44;DP=99;FAO=44;FDP=99;FR=.;FRO=55;FSAF=31;FSAR=13;FSRF=22;FSRR=33;FWDB=0.00645884;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.093;QD=17.37;RBI=0.0312768;REFB=-0.0059588;REVB=-0.0306026;RO=54;SAF=31;SAR=13;SRF=22;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.301669;STB=0.674151;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.00828289;OID=.;OPOS=120745874;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:54:55:44:44:0.444444:13:31:22:32:13:31:22:33
chr11	120776001	.	G	A	707.74	PASS	AF=1;AO=36;DP=44;FAO=45;FDP=45;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=28;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.025755;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.001;QD=62.9104;RBI=0.13924;REFB=0;REVB=0.136837;RO=0;SAF=27;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000468749;OID=.;OPOS=120776001;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:45:0:0:36:45:1:9:27:0:0:17:28:0:0
chr11	120823608	.	G	A	471.51	PASS	AF=0.464286;AO=51;DP=108;FAO=52;FDP=112;FR=.;FRO=60;FSAF=30;FSAR=22;FSRF=35;FSRR=25;FWDB=-0.020542;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=196.791;QD=16.8396;RBI=0.0214839;REFB=-0.0174294;REVB=0.00629168;RO=57;SAF=29;SAR=22;SRF=32;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00697957;STB=0.50352;STBP=0.95;TYPE=snp;VARB=0.0221537;OID=.;OPOS=120823608;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:112:57:60:51:52:0.464286:22:29:32:25:22:30:35:25
chr11	120827609	.	A	G	681.68	PASS	AF=0.961538;AO=50;DP=52;FAO=50;FDP=52;FR=.;FRO=2;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0346765;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.3302;QD=52.4371;RBI=0.0475154;REFB=-0.188831;REVB=-0.0324846;RO=2;SAF=28;SAR=22;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0324419;STB=0.517235;STBP=0.248;TYPE=snp;VARB=0.00826622;OID=.;OPOS=120827609;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:52:52:2:2:50:50:0.961538:22:28:2:0:22:28:2:0
chr11	121032978	.	G	A	363.0	PASS	AF=1;AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0110562;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.496;QD=55.8468;RBI=0.0221717;REFB=0;REVB=-0.0192183;RO=0;SAF=12;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.24033e-06;OID=.;OPOS=121032978;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:26:0:0:26:26:1:14:12:0:0:14:12:0:0
chr11	121403229	.	T	C	1556.35	PASS	AF=1;AO=104;DP=104;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0271019;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.762;QD=59.8595;RBI=0.0310809;REFB=0;REVB=-0.0152154;RO=0;SAF=51;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.23512e-05;OID=.;OPOS=121403229;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:104:104:0:0:104:104:1:53:51:0:0:53:51:0:0
chr11	121437819	.	C	G	727.6	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0640791;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.016;QD=63.2698;RBI=0.0650486;REFB=0;REVB=0.0111888;RO=0;SAF=16;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.31553e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000110892;OID=.;OPOS=121437819;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:30:16:0:0:30:16:0:0
chr11	121448090	.	T	G	689.38	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00404691;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.194;QD=62.6711;RBI=0.0153913;REFB=0;REVB=-0.0148497;RO=0;SAF=25;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.98808e-05;OID=.;OPOS=121448090;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:19:25:0:0:19:25:0:0
chr11	121475922	.	T	A	651.23	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0214113;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.775;QD=62.0219;RBI=0.0252545;REFB=0;REVB=0.013392;RO=0;SAF=19;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.96503e-05;OID=.;OPOS=121475922;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:23:19:0:0:23:19:0:0
chr11	121491782	.	G	A	990.64	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0191202;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.143;QD=59.1425;RBI=0.0265205;REFB=0;REVB=-0.0183781;RO=0;SAF=34;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.61397e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000171832;OID=.;OPOS=121491782;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:33:34:0:0:33:34:0:0
chr11	122322268	.	A	C	1590.09	PASS	AF=1;AO=105;DP=105;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0304468;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.473;QD=60.0035;RBI=0.0307293;REFB=0;REVB=0.0041568;RO=0;SAF=45;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000226783;OID=.;OPOS=122322268;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:105:106:0:0:105:106:1:60:45:0:0:60:46:0:0
chr11	122449920	.	A	C	89.58	PASS	AF=0.478261;AO=11;DP=23;FAO=11;FDP=23;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.00167421;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.2576;QD=15.5792;RBI=0.00773173;REFB=-0.00327203;REVB=-0.00754829;RO=11;SAF=2;SAR=9;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.373023;STB=0.705461;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.000524203;OID=.;OPOS=122449920;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:23:23:11:12:11:11:0.478261:9:2:6:5:9:2:6:6
chr11	122665437	.	A	G	190.27	PASS	AF=0.542857;AO=19;DP=35;FAO=19;FDP=35;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=2;FWDB=-0.00424679;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.067;QD=21.7454;RBI=0.0260622;REFB=-0.0120463;REVB=0.0257139;RO=16;SAF=8;SAR=11;SRF=14;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.35859;STB=0.699233;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.00885688;OID=.;OPOS=122665437;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:16:16:19:19:0.542857:11:8:14:2:11:8:14:2
chr11	122681254	.	T	C	32.97	PASS	AF=0.206897;AO=4;DP=28;FAO=6;FDP=29;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=0.00329235;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.703;QD=4.54807;RBI=0.00708202;REFB=-0.00642701;REVB=-0.0062702;RO=24;SAF=3;SAR=1;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.369782;STB=0.822428;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.0681349;OID=.;OPOS=122681254;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:32:28:29:24:23:4:6:0.206897:1:3:10:14:1:5:10:13
chr11	122684355	.	G	C	53.09	PASS	AF=0.275862;AO=8;DP=29;FAO=8;FDP=29;FR=.;FRO=21;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=15;FWDB=0.100015;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=44.4102;QD=7.32256;RBI=0.116616;REFB=-0.00752084;REVB=0.0599678;RO=21;SAF=2;SAR=6;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0525008;STB=0.533247;STBP=0.845;TYPE=snp;VARB=0.0277743;OID=.;OPOS=122684355;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:29:29:21:21:8:8:0.275862:6:2:6:15:6:2:6:15
chr11	122738261	.	A	G	203.23	PASS	AF=0.540541;AO=20;DP=37;FAO=20;FDP=37;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=0.0137522;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=293.687;QD=21.971;RBI=0.0238219;REFB=-0.00689944;REVB=-0.0194514;RO=17;SAF=9;SAR=11;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131193;STB=0.573336;STBP=0.365;TYPE=snp;VARB=0.00606154;OID=.;OPOS=122738261;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:17:17:20:20:0.540541:11:9:5:12:11:9:5:12
chr11	122742028	.	C	G	98.55	PASS	AF=0.428571;AO=12;DP=28;FAO=12;FDP=28;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=0.00531195;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.274;QD=14.0791;RBI=0.0198954;REFB=-0.00321422;REVB=-0.0191731;RO=15;SAF=4;SAR=8;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.314161;STB=0.697354;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.00895293;OID=.;OPOS=122742028;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:28:28:15:16:12:12:0.428571:8:4:10:5:8:4:11:5
chr11	122742428	.	T	G	82.31	PASS	AF=0.588235;AO=10;DP=17;FAO=10;FDP=17;FR=.;FRO=7;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.00635103;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=95.8237;QD=19.3666;RBI=0.00867062;REFB=-0.0148175;REVB=-0.00590288;RO=6;SAF=8;SAR=2;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.249643;STB=0.685302;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.0126687;OID=.;OPOS=122742428;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:17:17:6:7:10:10:0.588235:2:8:3:3:2:8:3:4
chr11	122928622	.	A	G	117.19	PASS	AF=1;AO=5;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.235177;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.708;QD=42.6133;RBI=0.235755;REFB=0;REVB=-0.0165002;RO=0;SAF=1;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00286522;OID=.;OPOS=122928622;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:5:11:1:4:1:0:0:4:7:0:0
chr11	122929624	.	A	G	1102.06	PASS	AF=1;AO=72;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112038;FXX=0.0135117;HRUN=3;LEN=1;MLLD=253.231;QD=60.3866;RBI=0.0131036;REFB=0;REVB=0.00679538;RO=0;SAF=40;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.05346e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.66614e-05;OID=.;OPOS=122929624;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:72:73:1:32:40:0:0:32:41:0:0
chr11	122943802	.	T	C	91.81	PASS	AF=0.245283;AO=11;DP=50;FAO=13;FDP=53;FR=.;FRO=40;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=20;FWDB=0.00725045;FXX=0.036357;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.055;QD=6.92926;RBI=0.0153663;REFB=-0.0148;REVB=0.0135482;RO=38;SAF=5;SAR=6;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0553836;STB=0.588098;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=0.0338684;OID=.;OPOS=122943802;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:91:50:53:38:40:11:13:0.245283:6:5:19:19:8:5:20:20
chr11	122955402	.	C	T	64.85	PASS	AF=0.36;AO=9;DP=25;FAO=9;FDP=25;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=-0.0420842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.876;QD=10.3762;RBI=0.0421459;REFB=-0.0150504;REVB=-0.00228056;RO=16;SAF=3;SAR=6;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104147;STB=0.562369;STBP=0.715;TYPE=snp;VARB=0.02268;OID=.;OPOS=122955402;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:25:25:16:16:9:9:0.36:6:3:4:12:6:3:4:12
chr11	123596703	.	A	C	147.67	PASS	AF=0.681818;AO=15;DP=22;FAO=15;FDP=22;FR=.;FRO=7;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.00627853;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.248;QD=26.8495;RBI=0.00766373;REFB=-0.0122584;REVB=0.00439463;RO=7;SAF=12;SAR=3;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0722156;STB=0.540484;STBP=0.651;TYPE=snp;VARB=0.00447089;OID=.;OPOS=123596703;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:22:22:7:7:15:15:0.681818:3:12:5:2:3:12:5:2
chr11	123600475	.	A	G	1212.98	PASS	AF=0.987654;AO=80;DP=81;FAO=80;FDP=81;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.000639402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.5922;QD=59.9002;RBI=0.0479149;REFB=-0.0863734;REVB=0.0479106;RO=1;SAF=39;SAR=41;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0114082;STB=0.506023;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.00117233;OID=.;OPOS=123600475;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:81:81:1:1:80:80:0.987654:41:39:0:1:41:39:0:1
chr11	123676413	.	G	A	205.38	PASS	AF=0.428571;AO=24;DP=56;FAO=24;FDP=56;FR=.;FRO=32;FSAF=5;FSAR=19;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=-0.0149231;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.75;QD=14.6701;RBI=0.015482;REFB=-0.020303;REVB=0.00412236;RO=32;SAF=5;SAR=19;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.247663;STB=0.642726;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.0173781;OID=.;OPOS=123676413;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:32:32:24:24:0.428571:19:5:13:19:19:5:13:19
chr11	123753937	.	A	G	1332.34	PASS	AF=0.988506;AO=86;DP=88;FAO=86;FDP=87;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=44;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00127081;FXX=0.0224694;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.286;QD=61.2571;RBI=0.00177167;REFB=-0.0278612;REVB=0.00123444;RO=1;SAF=42;SAR=44;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0111471;STB=0.505881;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=-0.000538218;OID=.;OPOS=123753937;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:88:87:1:1:86:86:0.988506:44:42:1:0:44:42:1:0
chr11	123754844	.	T	C	770.48	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0214415;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.626;QD=57.0725;RBI=0.0627327;REFB=0;REVB=0.0589547;RO=0;SAF=23;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.84538e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000331558;OID=.;OPOS=123754844;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:54:0:0:52:54:1:29:23:0:0:30:24:0:0
chr11	123756112	.	TCTATTTG	T	304.9	PASS	AF=0.458333;AO=33;DP=73;FAO=33;FDP=72;FR=.;FRO=39;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=22;FSRR=17;FWDB=-0.00211201;FXX=0.0270234;HRUN=1;LEN=7;MLLD=306.499;QD=16.9389;RBI=0.00750522;REFB=-0.013302;REVB=-0.00720193;RO=36;SAF=20;SAR=13;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0486804;STB=0.523546;STBP=0.732;TYPE=del;VARB=0.0135835;OID=.;OPOS=123756113;OREF=CTATTTG;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.458333:33:73:33:72:39:20:13:22:17:99:36:20:13:20:16
chr11	123777497	.	G	A	766.41	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0407903;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.89;QD=63.8676;RBI=0.0489891;REFB=0;REVB=0.0271308;RO=0;SAF=25;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000456583;OID=.;OPOS=123777497;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:23:25:0:0:23:25:0:0
chr11	123777536	.	G	A	876.41	PASS	AF=0.984375;AO=61;DP=63;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0663851;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.4928;QD=54.7755;RBI=0.0872575;REFB=-0.154103;REVB=0.0566294;RO=2;SAF=34;SAR=27;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0269576;STB=0.50704;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.00680493;OID=.;OPOS=123777536;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:63:64:2:1:61:63:0.984375:27:34:2:0:28:35:1:0
chr11	123777986	.	T	C	817.75	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0361033;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.657;QD=57.3859;RBI=0.0361838;REFB=0;REVB=0.00241247;RO=0;SAF=29;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.74134e-05;OID=.;OPOS=123777986;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:28:29:0:0:28:29:0:0
chr11	123778031	.	G	A	803.86	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00346002;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.471;QD=64.3088;RBI=0.0127718;REFB=0;REVB=0.0122942;RO=0;SAF=26;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.41647e-05;OID=.;OPOS=123778031;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:50:0:0:47:50:1:21:26:0:0:21:29:0:0
chr11	123778173	.	T	G	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.150823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.5434;QD=46.8472;RBI=0.153843;REFB=0;REVB=-0.0303333;RO=0;SAF=12;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0052368;OID=.;OPOS=123778173;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:3:12:0:0:3:12:0:0
chr11	123811013	.	G	A	258.49	PASS	AF=0.545455;AO=24;DP=45;FAO=24;FDP=44;FR=.;FRO=20;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=0.0244992;FXX=0.0222173;HRUN=3;LEN=1;MLLD=183.81;QD=23.4987;RBI=0.0253454;REFB=-0.0191603;REVB=0.00649428;RO=17;SAF=14;SAR=10;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00376762;STB=0.507806;STBP=0.932;TYPE=snp;VARB=0.0147329;OID=.;OPOS=123811013;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:44:17:20:24:24:0.545455:10:14:10:7:10:14:12:8
chr11	123811344	.	C	T	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0368476;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.6894;QD=46.848;RBI=0.0492789;REFB=0;REVB=-0.0327211;RO=0;SAF=7;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00271014;OID=.;OPOS=123811344;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:8:7:0:0:8:7:0:0
chr11	123813795	.	T	C	118.89	PASS	AF=0.388889;AO=14;DP=35;FAO=14;FDP=36;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=-0.0226125;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.686;QD=13.2103;RBI=0.0248162;REFB=-0.0335926;REVB=-0.0102234;RO=21;SAF=6;SAR=8;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101877;STB=0.570151;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.047392;OID=.;OPOS=123813795;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:36:21:22:14:14:0.388889:8:6:7:14:8:6:7:15
chr11	123814261	.	G	A	201.95	PASS	AF=0.373134;AO=25;DP=67;FAO=25;FDP=67;FR=.;FRO=42;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=25;FSRR=17;FWDB=-0.0115131;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.107;QD=12.0567;RBI=0.0258383;REFB=-0.00160931;REVB=0.0231315;RO=42;SAF=11;SAR=14;SRF=25;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167478;STB=0.596374;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=0.00341175;OID=.;OPOS=123814261;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:42:42:25:25:0.373134:14:11:25:17:14:11:25:17
chr11	123814356	.	G	A	312.8	PASS	AF=0.561404;AO=32;DP=57;FAO=32;FDP=57;FR=.;FRO=25;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=7;FWDB=-0.0260726;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.9347;QD=21.9508;RBI=0.0278715;REFB=-0.00577978;REVB=0.00985069;RO=24;SAF=15;SAR=17;SRF=18;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.216715;STB=0.609055;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=0.00980365;OID=.;OPOS=123814356;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:24:25:32:32:0.561404:17:15:18:6:17:15:18:7
chr11	123814478	.	A	G	211.72	PASS	AF=0.488372;AO=21;DP=43;FAO=21;FDP=43;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.0440592;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.777;QD=19.6953;RBI=0.0442465;REFB=0.00623842;REVB=0.00406692;RO=22;SAF=6;SAR=15;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.289366;STB=0.664173;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=-0.00380299;OID=.;OPOS=123814478;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:22:22:21:21:0.488372:15:6:13:9:15:6:13:9
chr11	123814555	.	C	A	60.3	PASS	AF=0.571429;AO=8;DP=14;FAO=8;FDP=14;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0384165;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.8894;QD=17.2298;RBI=0.0385032;REFB=0.0424756;REVB=-0.00258143;RO=6;SAF=2;SAR=6;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21129;STB=0.624664;STBP=0.386;TYPE=snp;VARB=-0.0273717;OID=.;OPOS=123814555;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:14:14:6:6:8:8:0.571429:6:2:3:3:6:2:3:3
chr11	123847473	.	A	G	291.6	PASS	AF=0.516667;AO=31;DP=60;FAO=31;FDP=60;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=-0.0205539;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.157;QD=19.4397;RBI=0.0206178;REFB=-0.0100645;REVB=-0.00162237;RO=29;SAF=13;SAR=18;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.055892;STB=0.531127;STBP=0.678;TYPE=snp;VARB=0.00890105;OID=.;OPOS=123847473;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:29:29:31:31:0.516667:18:13:14:15:18:13:14:15
chr11	123848121	.	T	C	89.53	PASS	AF=0.478261;AO=11;DP=23;FAO=11;FDP=23;FR=.;FRO=12;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=0.00729496;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.03;QD=15.5712;RBI=0.0209504;REFB=0.03139;REVB=-0.0196393;RO=12;SAF=9;SAR=2;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.094561;STB=0.555448;STBP=0.664;TYPE=snp;VARB=-0.0313342;OID=.;OPOS=123848121;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:23:23:12:12:11:11:0.478261:2:9:9:3:2:9:9:3
chr11	123848212	.	C	T	237.15	PASS	AF=0.479167;AO=23;DP=48;FAO=23;FDP=48;FR=.;FRO=25;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=20;FSRR=5;FWDB=-0.0111514;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=176.31;QD=19.7625;RBI=0.0546989;REFB=-0.0102906;REVB=-0.0535501;RO=25;SAF=14;SAR=9;SRF=20;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196055;STB=0.609475;STBP=0.199;TYPE=snp;VARB=0.0121446;OID=.;OPOS=123848212;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:25:25:23:23:0.479167:9:14:20:5:9:14:20:5
chr11	123886307	.	CA	CG,TG	1180.88	PASS	AF=0.621951,0.365854;AO=44,33;DP=83;FAO=51,30;FDP=82;FR=.;FRO=1;FSAF=16,16;FSAR=35,14;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0248929,0.0226558;FXX=0.0120467;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=62.9994,61.7154;QD=57.6039;RBI=0.0508291,0.0304481;REFB=-0.061938,-0.0100331;REVB=0.0443164,0.020342;RO=0;SAF=16,18;SAR=28,15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,4.64315e-08;STB=0.515146,0.515141;STBP=0.21,0.53;TYPE=snp,mnp;VARB=0.0211608,-0.0207086;OID=.,.;OPOS=123886308,123886307;OREF=A,CA;OALT=G,TG;OMAPALT=CG,TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:83:82:0:1:44,33:51,30:0.621951,0.365854:28,15:16,18:0:0:35,14:16,16:1:0
chr11	123886681	.	A	G	651.04	PASS	AF=0.916667;AO=44;DP=48;FAO=44;FDP=48;FR=.;FRO=4;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.00951425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.1187;QD=54.253;RBI=0.0256514;REFB=-0.0426873;REVB=-0.0238217;RO=4;SAF=22;SAR=22;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00618922;OID=.;OPOS=123886681;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:18:48:48:4:4:44:44:0.916667:22:22:2:2:22:22:2:2
chr11	123886717	.	G	A	68.36	PASS	AF=0.208333;AO=9;DP=47;FAO=10;FDP=48;FR=.;FRO=38;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=-0.0297127;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.787;QD=5.69654;RBI=0.0298054;REFB=-0.00342407;REVB=0.00234872;RO=38;SAF=3;SAR=6;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.236667;STB=0.5998;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.00961109;OID=.;OPOS=123886717;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:68:47:48:38:38:9:10:0.208333:6:3:20:18:6:4:20:18
chr11	123886822	.	C	T	483.63	PASS	AF=0.49505;AO=50;DP=101;FAO=50;FDP=101;FR=.;FRO=51;FSAF=31;FSAR=19;FSRF=30;FSRR=21;FWDB=0.0231858;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.038;QD=19.1537;RBI=0.0243633;REFB=-0.00743145;REVB=-0.00748273;RO=50;SAF=31;SAR=19;SRF=29;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0379198;STB=0.516875;STBP=0.782;TYPE=snp;VARB=0.00701082;OID=.;OPOS=123886822;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:101:50:51:50:50:0.49505:19:31:29:21:19:31:30:21
chr11	123886865	.	T	A	1779.97	PASS	AF=1;AO=117;DP=119;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0343613;FXX=0.00833264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.2745;QD=59.8308;RBI=0.0894876;REFB=-0.0740206;REVB=0.0826276;RO=1;SAF=71;SAR=46;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0102123;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00160872;OID=.;OPOS=123886865;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:119:119:1:0:117:119:1:46:71:0:1:47:72:0:0
chr11	123886984	.	A	G	1415.43	PASS	AF=1;AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00971948;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.001;QD=62.9078;RBI=0.0398302;REFB=0;REVB=-0.0386262;RO=0;SAF=39;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.24868e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.58677e-05;OID=.;OPOS=123886984;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:90:90:0:0:90:90:1:51:39:0:0:51:39:0:0
chr11	123887164	.	A	C	789.77	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0160255;FXX=0.019996;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.629;QD=64.4707;RBI=0.0172745;REFB=0;REVB=-0.006449;RO=0;SAF=15;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000224446;OID=.;OPOS=123887164;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:49:0:0:48:49:1:33:15:0:0:33:16:0:0
chr11	123887184	.	T	G	601.16	PASS	AF=0.97561;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0186855;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.192;QD=58.6497;RBI=0.0197503;REFB=-0.123025;REVB=0.00639747;RO=0;SAF=13;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.518509;STBP=0.262;TYPE=snp;VARB=0.00079188;OID=.;OPOS=123887184;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:41:41:0:1:40:40:0.97561:27:13:0:0:27:13:1:0
chr11	123893745	.	C	T	530.55	PASS	AF=0.524272;AO=54;DP=103;FAO=54;FDP=103;FR=.;FRO=49;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=32;FSRR=17;FWDB=0.00181106;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.5118;QD=20.604;RBI=0.00440547;REFB=-0.000420223;REVB=-0.004016;RO=49;SAF=28;SAR=26;SRF=32;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117135;STB=0.564376;STBP=0.185;TYPE=snp;VARB=0.000350774;OID=.;OPOS=123893745;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:103:49:49:54:54:0.524272:26:28:32:17:26:28:32:17
chr11	123893904	.	C	T	127.6	PASS	AF=0.518519;AO=14;DP=27;FAO=14;FDP=27;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=3;FWDB=0.0204867;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.342;QD=18.9037;RBI=0.0218297;REFB=-0.0278459;REVB=0.00753884;RO=13;SAF=6;SAR=8;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.281696;STB=0.659579;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.0244822;OID=.;OPOS=123893904;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:27:27:13:13:14:14:0.518519:8:6:10:3:8:6:10:3
chr11	123894119	.	A	G	144.18	PASS	AF=0.625;AO=15;DP=24;FAO=15;FDP=24;FR=.;FRO=9;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.0122149;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.077;QD=24.0299;RBI=0.0291303;REFB=0.0305797;REVB=-0.0264457;RO=9;SAF=7;SAR=8;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132903;STB=0.574487;STBP=0.39;TYPE=snp;VARB=-0.0262053;OID=.;OPOS=123894119;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:24:24:9:9:15:15:0.625:8:7:6:3:8:7:6:3
chr11	123894136	.	A	G	465.13	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00969295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.5;QD=58.1418;RBI=0.0121612;REFB=0;REVB=0.00734455;RO=0;SAF=15;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.83825e-05;OID=.;OPOS=123894136;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:17:15:0:0:17:15:0:0
chr11	123894234	.	A	G	310.33	PASS	AF=0.384615;AO=35;DP=92;FAO=35;FDP=91;FR=.;FRO=56;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=28;FSRR=28;FWDB=-0.0193961;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.911;QD=13.6411;RBI=0.0202945;REFB=-0.00310938;REVB=-0.00597169;RO=56;SAF=17;SAR=18;SRF=28;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154097;STB=0.508789;STBP=0.88;TYPE=snp;VARB=0.00540594;OID=.;OPOS=123894234;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:91:56:56:35:35:0.384615:18:17:28:28:18:17:28:28
chr11	123894246	.	A	G	288.99	PASS	AF=0.35;AO=35;DP=101;FAO=35;FDP=100;FR=.;FRO=65;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=34;FSRR=31;FWDB=-0.0127812;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.672;QD=11.5596;RBI=0.0322999;REFB=0.000762271;REVB=-0.0296634;RO=64;SAF=17;SAR=18;SRF=34;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0510848;STB=0.524258;STBP=0.723;TYPE=snp;VARB=-0.00272905;OID=.;OPOS=123894246;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:100:64:65:35:35:0.35:18:17:34:30:18:17:34:31
chr11	123894317	.	G	T	268.97	PASS	AF=0.318584;AO=33;DP=114;FAO=36;FDP=113;FR=.;FRO=77;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=40;FSRR=37;FWDB=-0.000163647;FXX=0.0341851;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.774;QD=9.52092;RBI=0.00434842;REFB=-0.00323803;REVB=0.00434534;RO=81;SAF=16;SAR=17;SRF=40;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0108029;STB=0.532169;STBP=0.677;TYPE=snp;VARB=0.00823285;OID=.;OPOS=123894317;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:114:113:81:77:33:36:0.318584:17:16:40:41:19:17:40:37
chr11	123894329	.	C	G	241.92	PASS	AF=0.3;AO=33;DP=112;FAO=33;FDP=110;FR=.;FRO=77;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=39;FSRR=38;FWDB=0.0109118;FXX=0.0178555;HRUN=1;LEN=1;MLLD=293.352;QD=8.79708;RBI=0.0146078;REFB=-0.00585541;REVB=-0.0097119;RO=77;SAF=16;SAR=17;SRF=40;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.041206;STB=0.515142;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=0.0137645;OID=.;OPOS=123894329;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:110:77:77:33:33:0.3:17:16:40:37:17:16:39:38
chr11	123894402	.	A	G	79.13	PASS	AF=0.194444;AO=15;DP=72;FAO=14;FDP=72;FR=.;FRO=58;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=30;FSRR=28;FWDB=0.00537087;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.725;QD=4.39633;RBI=0.0057208;REFB=-0.0123641;REVB=-0.00197011;RO=57;SAF=6;SAR=9;SRF=30;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157242;STB=0.571327;STBP=0.583;TYPE=snp;VARB=0.0980288;OID=.;OPOS=123894402;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:79:72:72:57:58:15:14:0.194444:9:6:30:27:8:6:30:28
chr11	123894556	.	A	G	99.76	PASS	AF=0.413793;AO=12;DP=29;FAO=12;FDP=29;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=15;FWDB=-0.0339955;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.9061;QD=13.7597;RBI=0.0522937;REFB=-0.0118615;REVB=-0.0397358;RO=17;SAF=4;SAR=8;SRF=2;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.27509;STB=0.656929;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=0.00295707;OID=.;OPOS=123894556;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:17:17:12:12:0.413793:8:4:2:15:8:4:2:15
chr11	123900694	.	A	G	236.49	PASS	AF=0.4;AO=28;DP=69;FAO=28;FDP=70;FR=.;FRO=42;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=25;FWDB=0.0026137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.627;QD=13.5139;RBI=0.0327739;REFB=-0.0253216;REVB=-0.0326695;RO=40;SAF=12;SAR=16;SRF=16;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0302935;STB=0.514634;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=0.035919;OID=.;OPOS=123900694;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:70:40:42:28:28:0.4:16:12:16:24:16:12:17:25
chr11	123900916	.	C	T	343.81	PASS	AF=0.48;AO=35;DP=75;FAO=36;FDP=75;FR=.;FRO=39;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=0.00419252;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.146;QD=18.3365;RBI=0.00902359;REFB=-0.0129967;REVB=0.00799049;RO=39;SAF=19;SAR=16;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.028416;STB=0.522376;STBP=0.727;TYPE=snp;VARB=0.0135327;OID=.;OPOS=123900916;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:39:39:35:36:0.48:16:19:20:19:16:20:20:19
chr11	123909099	.	G	T	570.71	PASS	AF=0.53211;AO=57;DP=113;FAO=58;FDP=109;FR=.;FRO=51;FSAF=32;FSAR=26;FSRF=30;FSRR=21;FWDB=0.00461407;FXX=0.0353951;HRUN=1;LEN=1;MLLD=313.758;QD=20.9435;RBI=0.0131294;REFB=-0.00566947;REVB=0.0122919;RO=48;SAF=32;SAR=25;SRF=29;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.036352;STB=0.517324;STBP=0.73;TYPE=snp;VARB=0.00557502;OID=.;OPOS=123909099;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:109:48:51:57:58:0.53211:25:32:29:19:26:32:30:21
chr11	123909627	.	T	C	289.48	PASS	AF=0.92;AO=23;DP=25;FAO=23;FDP=25;FR=.;FRO=2;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0190051;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.517;QD=46.3163;RBI=0.0335975;REFB=-0.0599754;REVB=-0.0277056;RO=2;SAF=17;SAR=6;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131403;STB=0.571363;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.00215369;OID=.;OPOS=123909627;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:25:25:2:2:23:23:0.92:6:17:0:2:6:17:0:2
chr11	123909637	.	G	T	102.78	PASS	AF=0.428571;AO=12;DP=28;FAO=12;FDP=28;FR=.,HEALED;FRO=16;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=0.00517058;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=256.316;QD=14.6831;RBI=0.0901679;REFB=-0.00736416;REVB=-0.0900196;RO=12;SAF=7;SAR=5;SRF=10;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.236162;STB=0.562399;STBP=0.604;TYPE=snp;VARB=-0.000116819;OID=.;OPOS=123909637;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:28:12:16:12:12:0.428571:5:7:10:2:5:7:11:5
chr11	123909695	.	G	C	692.91	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00396663;FXX=0.0222173;HRUN=3;LEN=1;MLLD=184.518;QD=62.9917;RBI=0.0304372;REFB=0;REVB=0.0301776;RO=0;SAF=17;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.54734e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.10376e-05;OID=.;OPOS=123909695;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:27:17:0:0:27:17:0:0
chr11	124095414	.	C	G	2455.86	PASS	AF=1;AO=160;DP=160;FAO=160;FDP=160;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00983453;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.5033;QD=61.3966;RBI=0.0198589;REFB=0;REVB=0.0172527;RO=0;SAF=81;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.29815e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.69755e-05;OID=.;OPOS=124095414;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:160:160:0:0:160:160:1:79:81:0:0:79:81:0:0
chr11	124095525	.	T	C	1913.91	PASS	AF=1;AO=124;DP=124;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0113327;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.226;QD=61.739;RBI=0.0274149;REFB=0;REVB=-0.0249629;RO=0;SAF=74;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.33754e-05;OID=.;OPOS=124095525;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:124:124:0:0:124:124:1:50:74:0:0:50:74:0:0
chr11	124095647	.	A	C	1624.25	PASS	AF=1;AO=108;DP=108;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0774391;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.3829;QD=60.1572;RBI=0.0899206;REFB=0;REVB=0.0457044;RO=0;SAF=58;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.61453e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000778068;OID=.;OPOS=124095647;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:108:108:0:0:108:108:1:50:58:0:0:50:58:0:0
chr11	124096122	.	G	A	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0412542;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.7612;QD=48.737;RBI=0.0547804;REFB=0;REVB=-0.0360414;RO=0;SAF=8;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000197917;OID=.;OPOS=124096122;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:9:8:0:0:9:8:0:0
chr11	124096195	.	G	A	147.23	PASS	AF=0.875;AO=13;DP=16;FAO=14;FDP=16;FR=.;FRO=2;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0455527;FXX=0.111049;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.9019;QD=36.807;RBI=0.0474006;REFB=-0.0940603;REVB=0.0131061;RO=2;SAF=6;SAR=7;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00929408;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0339486;OID=.;OPOS=124096195;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:16:16:2:2:13:14:0.875:7:6:1:1:7:7:1:1
chr11	124096247	.	G	A	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0155636;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=352.428;QD=55.0987;RBI=0.0168596;REFB=0;REVB=0.00648242;RO=0;SAF=16;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.71087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.09469e-05;OID=.;OPOS=124096247;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:10:16:0:0:10:16:0:0
chr11	124120821	.	T	C	1025.31	PASS	AF=1;AO=67;DP=68;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00516581;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.6488;QD=59.4381;RBI=0.196092;REFB=0;REVB=0.196024;RO=0;SAF=41;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00165035;OID=.;OPOS=124120821;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:68:69:0:0:67:69:1:26:41:0:0:27:42:0:0
chr11	124252422	.	G	A	477.59	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00746874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=332.324;QD=57.89;RBI=0.0127571;REFB=0;REVB=-0.0103422;RO=0;SAF=20;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.58601e-05;OID=.;OPOS=124252422;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:33:0:0:31:33:1:11:20:0:0:11:22:0:0
chr11	124252718	.	G	A	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0272883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.4685;QD=46.8475;RBI=0.0429348;REFB=0;REVB=-0.0331473;RO=0;SAF=8;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000159774;OID=.;OPOS=124252718;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:7:8:0:0:7:8:0:0
chr11	124252750	.	G	A	130.45	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0276798;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.287;QD=43.4844;RBI=0.0278694;REFB=0;REVB=-0.00324547;RO=0;SAF=6;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000211455;OID=.;OPOS=124252750;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:6:6:0:0:6:6:0:0
chr11	124252892	.	A	G	330.36	PASS	AF=0.961538;AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00700346;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.0967;QD=50.8246;RBI=0.00868372;REFB=-0.038643;REVB=-0.00513405;RO=1;SAF=13;SAR=12;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0370998;STB=0.519984;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.0107305;OID=.;OPOS=124252892;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:26:26:1:1:25:25:0.961538:12:13:0:1:12:13:0:1
chr11	124253100	.	G	A	43.17	PASS	AF=0.0982143;AO=11;DP=112;FAO=11;FDP=112;FR=.;FRO=101;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=42;FSRR=59;FWDB=-0.03532;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.099;QD=1.5418;RBI=0.0361509;REFB=-0.000117661;REVB=-0.00770594;RO=101;SAF=1;SAR=10;SRF=42;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.444682;STB=0.860956;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.000708534;OID=.;OPOS=124253100;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:112:112:101:101:11:11:0.0982143:10:1:42:59:10:1:42:59
chr11	124253147	.	A	G	799.86	PASS	AF=0.706522;AO=65;DP=91;FAO=65;FDP=92;FR=.;FRO=27;FSAF=26;FSAR=39;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=-0.0107394;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.4711;QD=34.7767;RBI=0.0265263;REFB=-0.0436096;REVB=-0.0242551;RO=26;SAF=26;SAR=39;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0752948;STB=0.535703;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=0.0291859;OID=.;OPOS=124253147;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:92:26:27:65:65:0.706522:39:26:14:12:39:26:14:13
chr11	124253161	.	G	A	732.25	PASS	AF=0.709302;AO=60;DP=85;FAO=61;FDP=86;FR=.;FRO=25;FSAF=26;FSAR=35;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=-0.0264509;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=44.8418;QD=34.0579;RBI=0.0279754;REFB=-0.0259478;REVB=-0.00910883;RO=25;SAF=25;SAR=35;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0130648;STB=0.504086;STBP=0.888;TYPE=snp;VARB=0.0108581;OID=.;OPOS=124253161;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:86:25:25:60:61:0.709302:35:25:11:14:35:26:11:14
chr11	124253170	.	G	A	688.37	PASS	AF=0.730769;AO=57;DP=78;FAO=57;FDP=78;FR=.;FRO=21;FSAF=25;FSAR=32;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=-0.0361148;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.819;QD=35.3011;RBI=0.0364263;REFB=-0.00499471;REVB=-0.00475409;RO=21;SAF=25;SAR=32;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00509556;STB=0.502741;STBP=0.942;TYPE=snp;VARB=0.00296318;OID=.;OPOS=124253170;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:21:21:57:57:0.730769:32:25:9:12:32:25:9:12
chr11	124253181	.	T	C	1044.39	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00976464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.574;QD=59.6793;RBI=0.01648;REFB=0;REVB=-0.0132756;RO=0;SAF=31;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.30516e-06;OID=.;OPOS=124253181;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:39:31:0:0:39:31:0:0
chr11	124266906	.	C	T	387.5	PASS	AF=0.833333;AO=29;DP=35;FAO=30;FDP=36;FR=.;FRO=6;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.00196642;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.844;QD=43.0554;RBI=0.0111207;REFB=-0.0511975;REVB=0.0109454;RO=5;SAF=19;SAR=10;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0748356;STB=0.523606;STBP=0.589;TYPE=snp;VARB=0.00831357;OID=.;OPOS=124266906;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:35:36:5:6:29:30:0.833333:10:19:2:3:11:19:3:3
chr11	124266912	.	A	G	387.67	PASS	AF=0.833333;AO=30;DP=36;FAO=30;FDP=36;FR=.;FRO=6;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0219427;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.874;QD=43.0739;RBI=0.0483615;REFB=-0.0315228;REVB=0.043097;RO=6;SAF=19;SAR=11;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0436791;STB=0.523606;STBP=0.589;TYPE=snp;VARB=0.00387843;OID=.;OPOS=124266912;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:36:36:6:6:30:30:0.833333:11:19:3:3:11:19:3:3
chr11	124440362	.	C	G	651.22	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00524637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.365;QD=62.0213;RBI=0.0199736;REFB=0;REVB=0.0192723;RO=0;SAF=19;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.95329e-05;OID=.;OPOS=124440362;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:23:19:0:0:23:19:0:0
chr11	124440617	.	C	T	1160.77	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00876798;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.171;QD=60.2999;RBI=0.0107146;REFB=0;REVB=0.00615826;RO=0;SAF=32;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.24768e-07;OID=.;OPOS=124440617;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:77:0:0:74:77:1:42:32:0:0:45:32:0:0
chr11	124493199	.	C	A	1847.02	PASS	AF=0.93985;AO=125;DP=133;FAO=125;FDP=133;FR=.;FRO=8;FSAF=48;FSAR=77;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=0.0204168;FXX=0.0148137;HRUN=5;LEN=1;MLLD=131.315;QD=55.5496;RBI=0.0321409;REFB=-0.158328;REVB=0.0248232;RO=8;SAF=48;SAR=77;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0583025;STB=0.530763;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.00128154;OID=.;OPOS=124493199;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:17:133:133:8:8:125:125:0.93985:77:48:7:1:77:48:7:1
chr11	124742365	.	G	A	272.94	PASS	AF=0.430556;AO=31;DP=72;FAO=31;FDP=72;FR=.;FRO=41;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=-0.0120892;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.3092;QD=15.1636;RBI=0.0273356;REFB=0.0116966;REVB=0.024517;RO=41;SAF=14;SAR=17;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.01281;STB=0.507242;STBP=0.927;TYPE=snp;VARB=-0.016034;OID=.;OPOS=124742365;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:41:41:31:31:0.430556:17:14:18:23:17:14:18:23
chr11	124747837	.	G	A	273.65	PASS	AF=0.430556;AO=31;DP=72;FAO=31;FDP=72;FR=.;FRO=41;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=29;FSRR=12;FWDB=-0.0210639;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=108.489;QD=15.2028;RBI=0.0213873;REFB=0.00469829;REVB=0.00370525;RO=41;SAF=16;SAR=15;SRF=29;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195234;STB=0.609689;STBP=0.131;TYPE=snp;VARB=-0.0133702;OID=.;OPOS=124747837;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:41:41:31:31:0.430556:15:16:29:12:15:16:29:12
chr11	124766128	.	A	G	676.65	PASS	AF=0.531746;AO=66;DP=127;FAO=67;FDP=126;FR=.;FRO=59;FSAF=32;FSAR=35;FSRF=22;FSRR=37;FWDB=0.0296943;FXX=0.0078734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.893;QD=21.4808;RBI=0.0572709;REFB=-0.0302872;REVB=-0.0489715;RO=55;SAF=32;SAR=34;SRF=22;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0706811;STB=0.549342;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=0.018492;OID=.;OPOS=124766128;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:127:126:55:59:66:67:0.531746:34:32:22:33:35:32:22:37
chr11	124767067	.	T	C	87.24	PASS	AF=0.37931;AO=11;DP=30;FAO=11;FDP=29;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.000965065;FXX=0.0333222;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.8252;QD=12.0334;RBI=0.031636;REFB=-0.0020095;REVB=0.0316213;RO=18;SAF=9;SAR=2;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.431518;STB=0.760047;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.00371059;OID=.;OPOS=124767067;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:30:29:18:18:11:11:0.37931:2:9:8:10:2:9:8:10
chr11	124767125	.	G	A	99.86	PASS	AF=0.545455;AO=11;DP=21;FAO=12;FDP=22;FR=.;FRO=10;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=0.0667883;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.2376;QD=18.1554;RBI=0.0878071;REFB=0.0196406;REVB=0.0570036;RO=10;SAF=9;SAR=2;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.243156;STB=0.651885;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=-0.00942907;OID=.;OPOS=124767125;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:21:22:10:10:11:12:0.545455:2:9:6:4:2:10:6:4
chr11	124789755	.	T	C	955.17	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00846629;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.821;QD=58.7799;RBI=0.0121776;REFB=0;REVB=0.00875298;RO=0;SAF=27;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.04073e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.18085e-05;OID=.;OPOS=124789755;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:38:27:0:0:38:27:0:0
chr11	124793682	.	T	C	253.95	PASS	AF=0.510638;AO=24;DP=47;FAO=24;FDP=47;FR=.;FRO=23;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.0101512;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.644;QD=21.6128;RBI=0.0158181;REFB=-0.0249067;REVB=0.0121312;RO=23;SAF=15;SAR=9;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0546921;STB=0.5307;STBP=0.711;TYPE=snp;VARB=0.0213535;OID=.;OPOS=124793682;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:23:23:24:24:0.510638:9:15:13:10:9:15:13:10
chr11	124794712	.	C	T	370.05	PASS	AF=0.506667;AO=38;DP=75;FAO=38;FDP=75;FR=.;FRO=37;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=0.0169261;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.906;QD=19.7362;RBI=0.0340469;REFB=0.0102753;REVB=-0.0295414;RO=37;SAF=21;SAR=17;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0134372;STB=0.507459;STBP=0.932;TYPE=snp;VARB=-0.00824411;OID=.;OPOS=124794712;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:37:37:38:38:0.506667:17:21:21:16:17:21:21:16
chr11	124857708	.	G	A	167.17	PASS	AF=0.409091;AO=18;DP=44;FAO=18;FDP=44;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=0.00403889;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=245.628;QD=15.1971;RBI=0.0211971;REFB=7.8469e-05;REVB=-0.0208088;RO=26;SAF=6;SAR=12;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0575692;STB=0.533296;STBP=0.725;TYPE=snp;VARB=-0.000207284;OID=.;OPOS=124857708;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:26:26:18:18:0.409091:12:6:10:16:12:6:10:16
chr11	124862514	.	A	G	154.09	PASS	AF=0.395349;AO=17;DP=43;FAO=17;FDP=43;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=0.0534486;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.862;QD=14.3336;RBI=0.0787533;REFB=0.00120306;REVB=0.0578388;RO=26;SAF=7;SAR=10;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.05285;STB=0.53069;STBP=0.753;TYPE=snp;VARB=0.00244054;OID=.;OPOS=124862514;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:26:26:17:17:0.395349:10:7:12:14:10:7:12:14
chr11	124863136	.	C	A	393.3	PASS	AF=0.515152;AO=32;DP=67;FAO=34;FDP=66;FR=.,HEALED;FRO=26;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=-0.0379266;FXX=0.0149231;HRUN=3;LEN=1;MLLD=121.15;QD=23.8364;RBI=0.0420106;REFB=-0.0324482;REVB=-0.0180682;RO=21;SAF=18;SAR=14;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0625847;STB=0.545961;STBP=0.433;TYPE=snp;VARB=0.0237403;OID=.;OPOS=124863136;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:66:21:26:32:34:0.515152:14:18:10:11:16:18:11:15
chr11	124908352	.	T	C	141.31	PASS	AF=0.380952;AO=16;DP=42;FAO=16;FDP=42;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=-0.0240482;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.832;QD=13.4584;RBI=0.032003;REFB=-0.000581832;REVB=-0.0211158;RO=26;SAF=10;SAR=6;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0533805;STB=0.53121;STBP=0.774;TYPE=snp;VARB=-6.28144e-05;OID=.;OPOS=124908352;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:26:26:16:16:0.380952:6:10:15:11:6:10:15:11
chr11	124947149	.	G	A	727.73	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0487055;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.216;QD=63.281;RBI=0.0496446;REFB=0;REVB=0.00961041;RO=0;SAF=25;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.85991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000142576;OID=.;OPOS=124947149;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:21:25:0:0:21:25:0:0
chr11	124947396	.	A	G	754.43	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0188696;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.244;QD=56.9383;RBI=0.0192698;REFB=0;REVB=0.00390727;RO=0;SAF=18;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.23882e-05;OID=.;OPOS=124947396;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:35:18:0:0:35:18:0:0
chr11	124955032	.	T	C	358.13	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0321568;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.6672;QD=55.0976;RBI=0.05043;REFB=0;REVB=0.0388475;RO=0;SAF=14;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000734485;OID=.;OPOS=124955032;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:12:14:0:0:12:14:0:0
chr11	124972208	.	A	G	429.0	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00531374;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.715;QD=57.2003;RBI=0.00764315;REFB=0;REVB=-0.00549381;RO=0;SAF=12;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.10527e-07;OID=.;OPOS=124972208;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:18:12:0:0:18:12:0:0
chr11	124972518	.	A	G	769.55	PASS	AF=0.982143;AO=53;DP=54;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0352836;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.2183;QD=54.9677;RBI=0.055234;REFB=-0.0813274;REVB=0.0424955;RO=1;SAF=35;SAR=18;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0254518;STB=0.512191;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=0.0208048;OID=.;OPOS=124972518;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:54:56:1:1:53:55:0.982143:18:35:0:1:20:35:0:1
chr11	124972522	.	T	C	844.33	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0017357;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.149;QD=57.2424;RBI=0.0339056;REFB=0;REVB=0.0338611;RO=0;SAF=37;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.3149e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.86382e-05;OID=.;OPOS=124972522;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:59:0:0:58:59:1:21:37:0:0:22:37:0:0
chr11	125003004	.	A	G	117.59	PASS	AF=0.4;AO=13;DP=34;FAO=14;FDP=35;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.00137568;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.584;QD=13.4393;RBI=0.00714732;REFB=-0.0381668;REVB=0.00701368;RO=20;SAF=5;SAR=8;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121279;STB=0.528884;STBP=0.809;TYPE=snp;VARB=0.0394569;OID=.;OPOS=125003004;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:35:20:21:13:14:0.4:8:5:10:10:8:6:10:11
chr11	125009370	.	C	A	486.29	PASS	AF=0.46087;AO=52;DP=115;FAO=53;FDP=115;FR=.;FRO=62;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=34;FSRR=28;FWDB=0.0113024;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.07;QD=16.9144;RBI=0.0113253;REFB=-0.00491591;REVB=-0.000720049;RO=62;SAF=21;SAR=31;SRF=34;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141843;STB=0.572155;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.00482066;OID=.;OPOS=125009370;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:115:62:62:52:53:0.46087:31:21:34:28:31:22:34:28
chr11	125301587	.	T	C	801.25	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0166901;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.722;QD=57.2324;RBI=0.0167748;REFB=0;REVB=0.00168325;RO=0;SAF=29;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.19561e-05;OID=.;OPOS=125301587;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:27:29:0:0:27:29:0:0
chr11	125443429	.	T	C	181.72	PASS	AF=0.392857;AO=22;DP=57;FAO=22;FDP=56;FR=.;FRO=34;FSAF=5;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=22;FWDB=0.00995458;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.565;QD=12.9798;RBI=0.0224273;REFB=0.000904978;REVB=0.020097;RO=30;SAF=5;SAR=17;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176227;STB=0.597012;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=-0.00122812;OID=.;OPOS=125443429;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:56:30:34:22:22:0.392857:17:5:11:19:17:5:12:22
chr11	125443473	.	A	C	216.27	PASS	AF=0.538462;AO=21;DP=39;FAO=21;FDP=39;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=0.0339747;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.4802;QD=22.1815;RBI=0.0534943;REFB=0.0114506;REVB=0.0413203;RO=18;SAF=5;SAR=16;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100989;STB=0.556905;STBP=0.546;TYPE=snp;VARB=-0.0106239;OID=.;OPOS=125443473;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:18:18:21:21:0.538462:16:5:6:12:16:5:6:12
chr11	125452300	.	A	AC,C	663.21	PASS	AF=0.964286,0.0357143;AO=48,2;DP=55;FAO=54,2;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=22,2;FSAR=32,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0359464,-0.0129604;FXX=0;HRUN=3,1;LEN=1,1;MLLD=20.8609,124.974;QD=47.3724;RBI=0.0727388,0.0307475;REFB=-0.0727248,-0.10663;REVB=-0.063236,-0.0278826;RO=4;SAF=18,2;SAR=30,0;SRF=2;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0191412,0.623114;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.0113784,0.0173332;OID=.,.;OPOS=125452301,125452300;OREF=-,A;OALT=C,C;OMAPALT=AC,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:6:55:56:4:0:48,2:54,2:0.964286,0.0357143:30,0:18,2:2:2:32,0:22,2:0:0
chr11	125452313	.	A	G	164.17	PASS	AF=0.355932;AO=21;DP=59;FAO=21;FDP=59;FR=.;FRO=38;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=0.0038147;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.958;QD=11.1304;RBI=0.00668659;REFB=-0.00145635;REVB=-0.00549168;RO=38;SAF=7;SAR=14;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133785;STB=0.578236;STBP=0.395;TYPE=snp;VARB=0.0023416;OID=.;OPOS=125452313;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:38:38:21:21:0.355932:14:7:17:21:14:7:17:21
chr11	125479363	.	G	A	1119.42	PASS	AF=0.986842;AO=75;DP=76;FAO=75;FDP=76;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00850743;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.871;QD=58.917;RBI=0.0176014;REFB=0.0113869;REVB=0.0154089;RO=0;SAF=39;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6999e-08;STB=0.506327;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=3.44577e-06;OID=.;OPOS=125479363;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:76:76:0:1:75:75:0.986842:36:39:0:0:36:39:1:0
chr11	125479496	.	C	T	817.73	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0266216;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.125;QD=57.3847;RBI=0.0290848;REFB=0;REVB=0.011714;RO=0;SAF=25;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000115139;OID=.;OPOS=125479496;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:32:25:0:0:32:25:0:0
chr11	125525195	.	A	G	1666.77	PASS	AF=1;AO=110;DP=112;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00257987;FXX=0.0178555;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.774;QD=60.61;RBI=0.0157081;REFB=0;REVB=-0.0154948;RO=0;SAF=49;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.8105e-05;OID=.;OPOS=125525195;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:112:110:0:0:110:110:1:61:49:0:0:61:49:0:0
chr11	125617610	.	A	G	868.27	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00597546;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.39;QD=57.8849;RBI=0.0108236;REFB=0;REVB=-0.00902459;RO=0;SAF=25;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.03209e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.55106e-06;OID=.;OPOS=125617610;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:60:0:0:59:60:1:34:25:0:0:35:25:0:0
chr11	125648503	.	G	A	773.98	PASS	AF=1;AO=54;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0438256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.584;QD=56.2892;RBI=0.0442158;REFB=0;REVB=-0.00586066;RO=0;SAF=34;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.77753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000824617;OID=.;OPOS=125648503;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:54:55:1:20:34:0:0:20:35:0:0
chr11	125708198	.	C	T	518.1	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00178046;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.691;QD=59.2111;RBI=0.00523197;REFB=0;REVB=0.0049197;RO=0;SAF=17;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.21734e-06;OID=.;OPOS=125708198;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:35:0:0:34:35:1:17:17:0:0:17:18:0:0
chr11	125766044	.	C	A	501.66	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0105296;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.17;QD=59.0183;RBI=0.0214855;REFB=0;REVB=-0.0187284;RO=0;SAF=13;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.50856e-05;OID=.;OPOS=125766044;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:21:13:0:0:21:13:0:0
chr11	125766173	.	A	C	358.07	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0465872;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.619;QD=55.0881;RBI=0.0473629;REFB=0;REVB=-0.00853692;RO=0;SAF=11;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000222289;OID=.;OPOS=125766173;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:15:11:0:0:15:11:0:0
chr11	125810714	.	T	C	136.88	PASS	AF=0.5;AO=15;DP=30;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.04794;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.37;QD=18.2511;RBI=0.0521263;REFB=-0.0227475;REVB=0.0204671;RO=15;SAF=12;SAR=3;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.28767;STB=0.66642;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=0.0222679;OID=.;OPOS=125810714;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:15:15:15:15:0.5:3:12:8:7:3:12:8:7
chr11	125810721	.	G	A	101.59	PASS	AF=0.5;AO=12;DP=24;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.00805011;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.5442;QD=16.9311;RBI=0.0083639;REFB=-0.0015239;REVB=-0.00226949;RO=12;SAF=9;SAR=3;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171635;STB=0.599822;STBP=0.402;TYPE=snp;VARB=0.00180725;OID=.;OPOS=125810721;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:24:24:12:12:12:12:0.5:3:9:7:5:3:9:7:5
chr11	125812875	.	G	A	339.18	PASS	AF=0.473684;AO=36;DP=76;FAO=36;FDP=76;FR=.;FRO=40;FSAF=9;FSAR=27;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=0.00709912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.8424;QD=17.8515;RBI=0.067852;REFB=0.0264607;REVB=0.0674796;RO=39;SAF=9;SAR=27;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.250951;STB=0.636282;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=-0.0268335;OID=.;OPOS=125812875;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:39:40:36:36:0.473684:27:9:19:20:27:9:19:21
chr11	125813527	.	G	A	216.41	PASS	AF=0.38806;AO=24;DP=67;FAO=26;FDP=67;FR=.;FRO=41;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=24;FWDB=0.0126358;FXX=0.0289813;HRUN=1;LEN=1;MLLD=315.868;QD=12.9197;RBI=0.0159875;REFB=-0.00249805;REVB=0.00979477;RO=42;SAF=12;SAR=12;SRF=16;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131196;STB=0.575285;STBP=0.341;TYPE=snp;VARB=0.00446425;OID=.;OPOS=125813527;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:42:41:24:26:0.38806:12:12:16:26:12:14:17:24
chr11	125825708	.	A	G	243.96	PASS	AF=0.5;AO=26;DP=52;FAO=26;FDP=52;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=4;FSRR=22;FWDB=0.00501002;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.685;QD=18.7665;RBI=0.00508603;REFB=-0.00940391;REVB=0.000876058;RO=26;SAF=12;SAR=14;SRF=4;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.28648;STB=0.658429;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.0149736;OID=.;OPOS=125825708;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:26:26:26:26:0.5:14:12:4:22:14:12:4:22
chr11	125828488	.	T	G	78.88	PASS	AF=0.818182;AO=9;DP=11;FAO=9;FDP=11;FR=.;FRO=2;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0141827;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=255.508;QD=28.6837;RBI=0.0401883;REFB=0.00779732;REVB=0.0376026;RO=1;SAF=8;SAR=1;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0524171;STB=0.63963;STBP=0.218;TYPE=snp;VARB=-0.000281003;OID=.;OPOS=125828488;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:11:11:1:2:9:9:0.818182:1:8:1:0:1:8:1:1
chr11	125828490	.	A	G	95.33	PASS	AF=0.909091;AO=10;DP=11;FAO=10;FDP=11;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0543398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.4473;QD=34.6655;RBI=0.0543425;REFB=0.0447074;REVB=-0.000540611;RO=1;SAF=8;SAR=2;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0526894;STB=0.529355;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=-0.00364032;OID=.;OPOS=125828490;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:11:11:1:1:10:10:0.909091:2:8:1:0:2:8:1:0
chr11	125828492	.	A	T	87.57	PASS	AF=0.833333;AO=10;DP=12;FAO=10;FDP=12;FR=.;FRO=2;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.117072;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.415;QD=29.1895;RBI=0.16579;REFB=-0.135766;REVB=0.11739;RO=2;SAF=8;SAR=2;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0994744;STB=0.555452;STBP=0.641;TYPE=snp;VARB=0.0335961;OID=.;OPOS=125828492;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:12:12:2:2:10:10:0.833333:2:8:2:0:2:8:2:0
chr11	125830970	.	A	T	747.03	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00846881;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.993;QD=63.5769;RBI=0.0294658;REFB=0;REVB=-0.0282226;RO=0;SAF=24;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.0143e-05;OID=.;OPOS=125830970;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:23:24:0:0:23:24:0:0
chr11	125848261	.	C	T	100.73	PASS	AF=0.48;AO=12;DP=25;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.0185646;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.716;QD=16.1176;RBI=0.0203001;REFB=-0.0176481;REVB=-0.00821273;RO=13;SAF=5;SAR=7;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0410576;STB=0.52377;STBP=0.815;TYPE=snp;VARB=0.015492;OID=.;OPOS=125848261;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:25:13:13:12:12:0.48:7:5:6:7:7:5:6:7
chr11	125871735	.	C	T	452.16	PASS	AF=0.483871;AO=45;DP=93;FAO=45;FDP=93;FR=.;FRO=48;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=21;FSRR=27;FWDB=0.0144962;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.879;QD=19.4476;RBI=0.0158213;REFB=0.00299762;REVB=-0.00633836;RO=48;SAF=23;SAR=22;SRF=21;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0682818;STB=0.537931;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=-0.0037371;OID=.;OPOS=125871735;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:48:48:45:45:0.483871:22:23:21:27:22:23:21:27
chr11	125885001	.	C	A	269.26	PASS	AF=0.461538;AO=30;DP=64;FAO=30;FDP=65;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=23;FSRR=12;FWDB=0.0113498;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.2068;QD=16.57;RBI=0.0793412;REFB=-0.00457595;REVB=-0.0785252;RO=34;SAF=14;SAR=16;SRF=23;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19707;STB=0.60156;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=0.00402136;OID=.;OPOS=125885001;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:65:34:35:30:30:0.461538:16:14:23:11:16:14:23:12
chr11	125889526	.	C	T	410.07	PASS	AF=0.466667;AO=42;DP=90;FAO=42;FDP=90;FR=.;FRO=48;FSAF=31;FSAR=11;FSRF=23;FSRR=25;FWDB=-0.018599;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.7584;QD=18.2254;RBI=0.0331119;REFB=-0.0185905;REVB=0.0273948;RO=48;SAF=31;SAR=11;SRF=23;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.271631;STB=0.652554;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.0225845;OID=.;OPOS=125889526;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:48:48:42:42:0.466667:11:31:23:25:11:31:23:25
chr11	125891269	.	C	T	379.61	PASS	AF=0.43956;AO=40;DP=91;FAO=40;FDP=91;FR=.;FRO=51;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=23;FSRR=28;FWDB=0.00214269;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.589;QD=16.6863;RBI=0.0122918;REFB=-0.00246043;REVB=0.0121036;RO=50;SAF=23;SAR=17;SRF=23;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114176;STB=0.569585;STBP=0.239;TYPE=snp;VARB=0.00301252;OID=.;OPOS=125891269;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:50:51:40:40:0.43956:17:23:23:27:17:23:23:28
chr11	126074192	.	A	G	1024.7	PASS	AF=0.935065;AO=72;DP=77;FAO=72;FDP=77;FR=.;FRO=5;FSAF=40;FSAR=32;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.054528;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=52.6347;QD=53.2312;RBI=0.0623989;REFB=-0.151984;REVB=-0.0303368;RO=1;SAF=40;SAR=32;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0145499;STB=0.510201;STBP=0.555;TYPE=snp;VARB=0.00905172;OID=.;OPOS=126074192;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:17:77:77:1:5:72:72:0.935065:32:40:0:1:32:40:2:3
chr11	126081403	.	T	C	1100.81	PASS	AF=0.986667;AO=73;DP=76;FAO=74;FDP=75;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.000720714;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.416;QD=58.7097;RBI=0.0124406;REFB=-0.0464688;REVB=0.0124197;RO=1;SAF=36;SAR=37;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129584;STB=0.506848;STBP=0.335;TYPE=snp;VARB=0.000135055;OID=.;OPOS=126081403;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:76:75:1:1:73:74:0.986667:37:36:1:0:38:36:1:0
chr11	126139100	.	T	C	929.3	PASS	AF=0.970149;AO=65;DP=67;FAO=65;FDP=67;FR=.;FRO=2;FSAF=40;FSAR=25;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00150686;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.661;QD=55.4805;RBI=0.0654333;REFB=-0.126404;REVB=0.0654159;RO=2;SAF=40;SAR=25;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0230343;STB=0.512191;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.00155395;OID=.;OPOS=126139100;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:67:67:2:2:65:65:0.970149:25:40:2:0:25:40:2:0
chr11	126139255	.	A	T	232.07	PASS	AF=0.428571;AO=27;DP=63;FAO=27;FDP=63;FR=.;FRO=36;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=0.00713381;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.488;QD=14.7348;RBI=0.0320453;REFB=-0.0159894;REVB=-0.0312412;RO=36;SAF=16;SAR=11;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0382511;STB=0.521723;STBP=0.773;TYPE=snp;VARB=0.0226569;OID=.;OPOS=126139255;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:36:36:27:27:0.428571:11:16:20:16:11:16:20:16
chr11	126139313	.	T	A	685.23	PASS	AF=0.944444;AO=51;DP=54;FAO=51;FDP=54;FR=.;FRO=3;FSAF=20;FSAR=31;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0349552;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.8672;QD=50.7575;RBI=0.0379404;REFB=-0.159178;REVB=-0.0147514;RO=3;SAF=20;SAR=31;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.029854;STB=0.515879;STBP=0.403;TYPE=snp;VARB=0.00706354;OID=.;OPOS=126139313;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:54:54:3:3:51:51:0.944444:31:20:2:1:31:20:2:1
chr11	126174164	.	C	T	780.92	PASS	AF=0.982456;AO=54;DP=55;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00405781;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.3621;QD=54.8011;RBI=0.00578469;REFB=-0.0491369;REVB=-0.00412273;RO=0;SAF=30;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509431;STBP=0.329;TYPE=snp;VARB=0.0187022;OID=.;OPOS=126174164;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:55:57:0:1:54:56:0.982456:24:30:0:0:26:30:0:1
chr11	126176578	.	G	A	972.86	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.011471;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.744;QD=58.9609;RBI=0.0347827;REFB=0;REVB=-0.0328368;RO=0;SAF=32;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.75585e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.1756e-05;OID=.;OPOS=126176578;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:34:32:0:0:34:32:0:0
chr11	126228403	.	G	C	366.04	PASS	AF=0.544118;AO=37;DP=68;FAO=37;FDP=68;FR=.;FRO=31;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.00716228;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=248.539;QD=21.5315;RBI=0.00813455;REFB=-0.00565524;REVB=-0.00385651;RO=31;SAF=15;SAR=22;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.066146;STB=0.536565;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=0.00495002;OID=.;OPOS=126228403;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:31:31:37:37:0.544118:22:15:15:16:22:15:15:16
chr11	126277216	.	C	T	1139.33	PASS	AF=0.987013;AO=75;DP=76;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=42;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0342915;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.941;QD=59.1858;RBI=0.0424294;REFB=-0.114021;REVB=-0.0249869;RO=1;SAF=34;SAR=41;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0137127;STB=0.507244;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=0.000624403;OID=.;OPOS=126277216;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:76:77:1:1:75:76:0.987013:41:34:1:0:42:34:1:0
chr11	126278075	.	C	T	594.35	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0141414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.933;QD=60.9593;RBI=0.024327;REFB=0;REVB=-0.0197945;RO=0;SAF=14;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.62263e-05;OID=.;OPOS=126278075;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:25:14:0:0:25:14:0:0
chr11	126294817	.	G	A	564.93	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0391042;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.509;QD=59.4668;RBI=0.0444628;REFB=0;REVB=0.0211612;RO=0;SAF=24;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000660317;OID=.;OPOS=126294817;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:38:0:0:37:38:1:13:24:0:0:14:24:0:0
chr11	126310082	.	A	T	244.4	PASS	AF=0.482143;AO=27;DP=55;FAO=27;FDP=56;FR=.;FRO=29;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.00466149;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.053;QD=17.457;RBI=0.01497;REFB=-0.0359383;REVB=-0.0142258;RO=27;SAF=16;SAR=11;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100449;STB=0.557598;STBP=0.433;TYPE=snp;VARB=0.0410011;OID=.;OPOS=126310082;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:56:27:29:27:27:0.482143:11:16:13:14:11:16:14:15
chr11	126391297	.	T	G	175.15	PASS	AF=0.514286;AO=18;DP=35;FAO=18;FDP=35;FR=.;FRO=17;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=0.00971281;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.5;QD=20.0169;RBI=0.0117512;REFB=-0.018861;REVB=0.00661461;RO=17;SAF=13;SAR=5;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0173039;STB=0.509793;STBP=0.967;TYPE=snp;VARB=0.0231375;OID=.;OPOS=126391297;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:17:17:18:18:0.514286:5:13:12:5:5:13:12:5
chr11	126865297	.	C	T	384.06	PASS	AF=0.45977;AO=40;DP=87;FAO=40;FDP=87;FR=.;FRO=47;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=25;FSRR=22;FWDB=-0.00664569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.46;QD=17.658;RBI=0.00671279;REFB=-0.0104489;REVB=0.000946744;RO=47;SAF=20;SAR=20;SRF=25;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0308168;STB=0.517233;STBP=0.783;TYPE=snp;VARB=0.0140828;OID=.;OPOS=126865297;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:47:47:40:40:0.45977:20:20:25:22:20:20:25:22
chr11	127277853	.	G	A	553.16	PASS	AF=0.541667;AO=51;DP=97;FAO=52;FDP=96;FR=.;FRO=44;FSAF=25;FSAR=27;FSRF=17;FSRR=27;FWDB=-0.0321401;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.7316;QD=23.0484;RBI=0.0350599;REFB=-0.0152042;REVB=0.0140076;RO=42;SAF=25;SAR=26;SRF=16;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0901045;STB=0.543462;STBP=0.37;TYPE=snp;VARB=0.0122697;OID=.;OPOS=127277853;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:96:42:44:51:52:0.541667:26:25:16:26:27:25:17:27
chr11	128328913	.	G	A	439.44	PASS	AF=0.5375;AO=43;DP=80;FAO=43;FDP=80;FR=.;FRO=37;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=9;FSRR=28;FWDB=-0.0561695;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.2246;QD=21.9718;RBI=0.0607374;REFB=-0.0204819;REVB=-0.0231089;RO=37;SAF=19;SAR=24;SRF=9;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173457;STB=0.595139;STBP=0.101;TYPE=snp;VARB=0.0213472;OID=.;OPOS=128328913;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:37:37:43:43:0.5375:24:19:9:28:24:19:9:28
chr11	128328959	.	C	T	335.65	PASS	AF=0.455696;AO=36;DP=79;FAO=36;FDP=79;FR=.;FRO=43;FSAF=11;FSAR=25;FSRF=15;FSRR=28;FWDB=-0.0210641;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.2851;QD=16.9951;RBI=0.0572954;REFB=-0.0319318;REVB=-0.0532829;RO=42;SAF=11;SAR=25;SRF=15;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0568138;STB=0.527154;STBP=0.682;TYPE=snp;VARB=0.0139433;OID=.;OPOS=128328959;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:42:43:36:36:0.455696:25:11:15:27:25:11:15:28
chr11	128333503	.	T	C	360.09	PASS	AF=1;AO=26;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0217916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.891;QD=53.3466;RBI=0.0475566;REFB=0;REVB=0.0422701;RO=1;SAF=13;SAR=13;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0343929;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00213091;OID=.;OPOS=128333503;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:1:0:26:27:1:13:13:0:1:14:13:0:0
chr11	128638216	.	TGG	T,TG	686.99	PASS	AF=0,0.989899;AO=16,70;DP=100;FAO=0,98;FDP=99;FR=.;FRO=1;FSAF=0,55;FSAR=0,43;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0220133,-0.0448392;FXX=0.0198;HRUN=7,7;LEN=2,1;MLLD=9.38556,10.2211;QD=27.7571;RBI=0.0936013,0.17889;REFB=0.0704187,0.069521;REVB=-0.0909759,-0.17318;RO=7;SAF=6,45;SAR=10,25;SRF=4;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.110844,0.0132651;STB=0.5,0.504504;STBP=1,0.487;TYPE=del,del;VARB=0,-0.00390742;OID=.,.;OPOS=128638217,128638217;OREF=GG,G;OALT=-,-;OMAPALT=T,TG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	2/2:0,0.989899:16,70:100:0,98:99:1:0,55:0,43:1:0:9:7:6,45:10,25:4:3
chr11	128781339	.	T	C	1309.6	PASS	AF=1;AO=84;DP=86;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0185967;FXX=0.0232531;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.76;QD=62.3618;RBI=0.0233929;REFB=0;REVB=0.0141911;RO=0;SAF=42;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.36341e-05;OID=.;OPOS=128781339;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:84:0:0:84:84:1:42:42:0:0:42:42:0:0
chr11	128781978	.	T	G	689.35	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0268014;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.8784;QD=62.6678;RBI=0.0463278;REFB=0;REVB=-0.0377882;RO=0;SAF=30;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000979038;OID=.;OPOS=128781978;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:14:30:0:0:14:30:0:0
chr11	128782002	.	T	C	728.92	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0242609;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.45;QD=57.1703;RBI=0.0259657;REFB=0;REVB=0.00925347;RO=0;SAF=31;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.13361e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.79564e-05;OID=.;OPOS=128782002;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:20:31:0:0:20:31:0:0
chr11	128782012	.	C	G	817.63	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143917;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.972;QD=57.3776;RBI=0.059946;REFB=0;REVB=-0.0581928;RO=0;SAF=37;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00013837;OID=.;OPOS=128782012;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:20:37:0:0:20:37:0:0
chr11	128787554	.	C	T	207.03	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0260082;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.5498;QD=48.713;RBI=0.0313456;REFB=0;REVB=-0.0174963;RO=0;SAF=6;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000191402;OID=.;OPOS=128787554;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:11:6:0:0:11:6:0:0
chr11	128805548	.	G	A	286.11	PASS	AF=0.535714;AO=30;DP=56;FAO=30;FDP=56;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=7;FSRR=19;FWDB=0.0357181;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.364;QD=20.4363;RBI=0.0366548;REFB=-0.00390654;REVB=0.00823333;RO=25;SAF=14;SAR=16;SRF=7;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155957;STB=0.593161;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=0.00604071;OID=.;OPOS=128805548;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:25:26:30:30:0.535714:16:14:7:18:16:14:7:19
chr11	128805557	.	T	C	300.46	PASS	AF=0.507937;AO=32;DP=63;FAO=32;FDP=63;FR=.;FRO=31;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=-0.0198802;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.092;QD=19.0768;RBI=0.020959;REFB=-0.00938241;REVB=-0.00663768;RO=31;SAF=13;SAR=19;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0175992;STB=0.509798;STBP=0.909;TYPE=snp;VARB=0.00766691;OID=.;OPOS=128805557;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:31:31:32:32:0.507937:19:13:12:19:19:13:12:19
chr11	128814046	.	C	T	488.82	PASS	AF=0.516484;AO=47;DP=92;FAO=47;FDP=91;FR=.;FRO=44;FSAF=32;FSAR=15;FSRF=23;FSRR=21;FWDB=-0.0114404;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=296.425;QD=21.4868;RBI=0.0119796;REFB=-0.00928193;REVB=-0.0035537;RO=44;SAF=32;SAR=15;SRF=23;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149161;STB=0.582665;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=0.00792331;OID=.;OPOS=128814046;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:91:44:44:47:47:0.516484:15:32:23:21:15:32:23:21
chr11	128842873	.	T	C	228.34	PASS	AF=0.52381;AO=22;DP=42;FAO=22;FDP=42;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.00671962;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=344.603;QD=21.7465;RBI=0.00796312;REFB=-0.00698557;REVB=0.00427293;RO=20;SAF=10;SAR=12;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0387148;STB=0.521719;STBP=0.817;TYPE=snp;VARB=0.00497231;OID=.;OPOS=128842873;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:20:20:22:22:0.52381:12:10:10:10:12:10:10:10
chr11	128868239	.	T	C	330.03	PASS	AF=0.423529;AO=36;DP=85;FAO=36;FDP=85;FR=.;FRO=49;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=35;FSRR=14;FWDB=0.000555262;FXX=0.0116266;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.15;QD=15.5306;RBI=0.00178644;REFB=0.000192896;REVB=-0.00169795;RO=49;SAF=19;SAR=17;SRF=35;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194553;STB=0.6091;STBP=0.113;TYPE=snp;VARB=-0.00084748;OID=.;OPOS=128868239;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:49:49:36:36:0.423529:17:19:35:14:17:19:35:14
chr11	129072915	.	C	G	267.39	PASS	AF=0.88;AO=22;DP=25;FAO=22;FDP=25;FR=.;FRO=3;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.00747414;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.426;QD=42.783;RBI=0.0324841;REFB=0.0817613;REVB=0.0316126;RO=3;SAF=10;SAR=12;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10243;STB=0.555506;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=-0.0118323;OID=.;OPOS=129072915;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:25:25:3:3:22:22:0.88:12:10:0:3:12:10:0:3
chr11	129312660	.	C	T	885.43	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0407445;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.4946;QD=58.0608;RBI=0.0431677;REFB=0;REVB=0.0142595;RO=0;SAF=26;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000509664;OID=.;OPOS=129312660;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:35:26:0:0:35:26:0:0
chr11	129321066	.	C	T	256.43	PASS	AF=0.533333;AO=24;DP=45;FAO=24;FDP=45;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=-0.010067;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=241.54;QD=22.7937;RBI=0.0163232;REFB=-0.0144925;REVB=0.0128493;RO=21;SAF=6;SAR=18;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.331935;STB=0.686582;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.00969807;OID=.;OPOS=129321066;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:21:21:24:24:0.533333:18:6:13:8:18:6:13:8
chr11	129321818	.	T	G	130.42	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0173416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.095;QD=43.4744;RBI=0.0289199;REFB=0;REVB=-0.0231437;RO=0;SAF=8;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.1806e-05;OID=.;OPOS=129321818;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:4:8:0:0:4:8:0:0
chr11	129722553	.	C	T	144.08	PASS	AF=0.4;AO=16;DP=41;FAO=16;FDP=40;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=-0.0188816;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.229;QD=14.4083;RBI=0.0200081;REFB=0.00471387;REVB=0.00661888;RO=24;SAF=6;SAR=10;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.295006;STB=0.670525;STBP=0.111;TYPE=snp;VARB=-0.0029596;OID=.;OPOS=129722553;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:40:24:24:16:16:0.4:10:6:16:8:10:6:16:8
chr11	129746707	.	G	T	586.08	PASS	AF=0.508333;AO=58;DP=121;FAO=61;FDP=120;FR=.;FRO=59;FSAF=33;FSAR=28;FSRF=46;FSRR=13;FWDB=0.000319587;FXX=0.0163921;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.918;QD=19.536;RBI=0.0158669;REFB=-0.0100476;REVB=0.0158637;RO=57;SAF=31;SAR=27;SRF=45;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.235976;STB=0.62044;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0137497;OID=.;OPOS=129746707;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:121:120:57:59:58:61:0.508333:27:31:45:12:28:33:46:13
chr11	129754644	.	A	G	494.56	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0199709;FXX=0.0571265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.319;QD=59.9466;RBI=0.0199724;REFB=0;REVB=-0.000247736;RO=0;SAF=14;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.71297e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00120519;OID=.;OPOS=129754644;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:19:14:0:0:19:14:0:0
chr11	129758327	.	G	A	233.49	PASS	AF=0.435484;AO=27;DP=62;FAO=27;FDP=62;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=-0.00258902;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.033;QD=15.0641;RBI=0.0243165;REFB=-0.00673818;REVB=-0.0241783;RO=35;SAF=13;SAR=14;SRF=14;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0816209;STB=0.546185;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.00448355;OID=.;OPOS=129758327;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:35:35:27:27:0.435484:14:13:14:21:14:13:14:21
chr11	129775599	.	C	T	92.58	PASS	AF=0.3;AO=12;DP=40;FAO=12;FDP=40;FR=.;FRO=28;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=0.00924039;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.4334;QD=9.25819;RBI=0.00924255;REFB=-0.00164364;REVB=-0.000199829;RO=28;SAF=4;SAR=8;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0743733;STB=0.545377;STBP=0.687;TYPE=snp;VARB=0.00212389;OID=.;OPOS=129775599;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:40:40:28:28:12:12:0.3:8:4:11:17:8:4:11:17
chr11	129785615	.	C	T	241.7	PASS	AF=0.522727;AO=23;DP=44;FAO=23;FDP=44;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=-0.037764;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=122.302;QD=21.9726;RBI=0.0393851;REFB=-0.0237327;REVB=-0.0111832;RO=20;SAF=13;SAR=10;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0128376;STB=0.503016;STBP=0.997;TYPE=snp;VARB=0.0145156;OID=.;OPOS=129785615;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:20:21:23:23:0.522727:10:13:11:9:10:13:12:9
chr11	129794950	.	T	C	252.01	PASS	AF=0.375;AO=30;DP=80;FAO=30;FDP=80;FR=.;FRO=50;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=30;FSRR=20;FWDB=0.0099645;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.3623;QD=12.6004;RBI=0.0321267;REFB=-0.0161935;REVB=0.0305423;RO=50;SAF=18;SAR=12;SRF=30;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0255337;OID=.;OPOS=129794950;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:50:50:30:30:0.375:12:18:30:20:12:18:30:20
chr11	129801043	.	C	T	733.8	PASS	AF=0.493151;AO=72;DP=146;FAO=72;FDP=146;FR=.;FRO=74;FSAF=28;FSAR=44;FSRF=39;FSRR=35;FWDB=-0.0158388;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.9616;QD=20.1041;RBI=0.0168449;REFB=-0.00680227;REVB=0.00573422;RO=71;SAF=28;SAR=44;SRF=38;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13405;STB=0.571298;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=0.00956699;OID=.;OPOS=129801043;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:146:146:71:74:72:72:0.493151:44:28:38:33:44:28:39:35
chr11	129801124	.	T	C	543.21	PASS	AF=0.53125;AO=50;DP=94;FAO=51;FDP=96;FR=.;FRO=45;FSAF=19;FSAR=32;FSRF=25;FSRR=20;FWDB=0.0107163;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.684;QD=22.6339;RBI=0.0108973;REFB=-0.0114838;REVB=0.00197813;RO=44;SAF=19;SAR=31;SRF=24;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143353;STB=0.587611;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=0.0177065;OID=.;OPOS=129801124;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:96:44:45:50:51:0.53125:31:19:24:20:32:19:25:20
chr11	130013782	.	GA	G,GT	30.83	PASS	AF=0.292683,0.0243902;AO=9,2;DP=41;FAO=12,1;FDP=41;FR=.;FRO=28;FSAF=4,0;FSAR=8,1;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=0.267164,0.0456741;FXX=0;HRUN=8,8;LEN=1,1;MLLD=6.77535,69.6601;QD=3.00788;RBI=0.267334,0.0457131;REFB=-0.133246,-0.0117226;REVB=0.00955836,0.00188821;RO=26;SAF=3,0;SAR=6,2;SRF=16;SRR=10;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.324668,-0.53246;STB=0.666389,0.991174;STBP=0.199,0.264;TYPE=del,snp;VARB=0.098333,0.0627384;OID=.,.;OPOS=130013783,130013783;OREF=A,A;OALT=-,T;OMAPALT=G,GT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.292683,0.0243902:9,2:41:12,1:41:28:4,0:8,1:16:12:28:26:3,0:6,2:16:10
chr11	130066334	.	A	AT	83.22	PASS	AF=1;AO=2;DP=15;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0193015;FXX=0.333111;HRUN=0;LEN=1;MLLD=31.7255;QD=33.2882;RBI=0.0411288;REFB=0;REVB=-0.0363184;RO=13;SAF=2;SAR=0;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.513867;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00394704;OID=.;OPOS=130066335;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:1:2:15:10:10:0:10:0:0:0:3:13:2:0:8:5
chr11	130066335	.	C	G,T	170.41	PASS	AF=0.133333,0.866667;AO=2,13;DP=15;FAO=2,13;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=2,8;FSAR=0,5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0538843,0.00861894;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=52.6194,96.2823;QD=45.443;RBI=0.0642621,0.0327427;REFB=0,0;REVB=-0.0350157,-0.0315879;RO=0;SAF=2,8;SAR=0,5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.60098e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.154881,0.00116171;OID=.,.;OPOS=130066335,130066335;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:10:15:15:0:0:2,13:2,13:0.133333,0.866667:0,5:2,8:0:0:0,5:2,8:0:0
chr11	130078470	.	G	A	224.87	PASS	AF=0.488889;AO=22;DP=45;FAO=22;FDP=45;FR=.;FRO=23;FSAF=4;FSAR=18;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=0.0262913;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.364;QD=19.9886;RBI=0.0304453;REFB=-0.0055386;REVB=-0.0153521;RO=23;SAF=4;SAR=18;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.297137;STB=0.670038;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.00480393;OID=.;OPOS=130078470;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:23:23:22:22:0.488889:18:4:10:13:18:4:10:13
chr11	130271678	.	T	G	677.7	PASS	AF=0.977778;AO=43;DP=44;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00883356;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.325;QD=60.2396;RBI=0.0386767;REFB=-0.172592;REVB=0.0376544;RO=1;SAF=22;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0208679;STB=0.510633;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.00163763;OID=.;OPOS=130271678;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:44:45:1:1:43:44:0.977778:21:22:1:0:21:23:1:0
chr11	130275458	.	G	A	164.82	PASS	AF=0.486486;AO=17;DP=36;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=-0.0123343;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=59.4601;QD=17.8187;RBI=0.0152831;REFB=0.032451;REVB=-0.00902441;RO=19;SAF=9;SAR=8;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148115;STB=0.595134;STBP=0.278;TYPE=snp;VARB=-0.0308116;OID=.;OPOS=130275458;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:37:19:19:17:18:0.486486:8:9:7:12:8:10:7:12
chr11	130281488	.	G	A	609.45	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.103353;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.461;QD=60.945;RBI=0.111366;REFB=0;REVB=0.0414802;RO=0;SAF=8;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.26572e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000399617;OID=.;OPOS=130281488;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:40:0:0:38:40:1:30:8:0:0:30:10:0:0
chr11	130340962	.	A	G	1824.15	PASS	AF=0.991803;AO=120;DP=122;FAO=121;FDP=122;FR=.;FRO=1;FSAF=67;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.04577;FXX=0.00812942;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.922;QD=59.8081;RBI=0.0501658;REFB=-0.0766671;REVB=-0.0205355;RO=0;SAF=66;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504586;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.000573832;OID=.;OPOS=130340962;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:122:122:0:1:120:121:0.991803:54:66:0:0:54:67:0:1
chr11	130343304	.	ACCCCCG	ACCCC,ACCCCG	86.96	PASS	AF=0.166667,0.444444;AO=7,12;DP=34;FAO=6,16;FDP=36;FR=.;FRO=14;FSAF=5,14;FSAR=1,2;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.144219,-0.248244;FXX=0.0526177;HRUN=5,5;LEN=2,1;MLLD=16.2347,9.86099;QD=9.66256;RBI=0.211875,0.248606;REFB=-0.0308469,-0.0755642;REVB=-0.155216,-0.0134134;RO=9;SAF=5,12;SAR=2,0;SRF=4;SRR=5;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.263271,0.821146;STB=0.728298,0.71762;STBP=0.243,0.038;TYPE=del,del;VARB=0.063127,-0.00427354;OID=.,.;OPOS=130343309,130343305;OREF=CG,C;OALT=-,-;OMAPALT=ACCCC,ACCCCG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0.166667,0.444444:7,12:34:6,16:36:14:5,14:1,2:8:6:41:9:5,12:2,0:4:5
chr11	130542882	.	C	T	1290.32	PASS	AF=0.988235;AO=84;DP=86;FAO=84;FDP=85;FR=.;FRO=1;FSAF=54;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00843108;FXX=0.0116266;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.5002;QD=60.7208;RBI=0.0297665;REFB=-0.0658178;REVB=-0.0285475;RO=1;SAF=54;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0086921;STB=0.504586;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.000830051;OID=.;OPOS=130542882;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:86:85:1:1:84:84:0.988235:30:54:1:0:30:54:1:0
chr11	130750642	.	A	C	670.27	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0154827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.136;QD=62.3509;RBI=0.0167486;REFB=0;REVB=-0.00638742;RO=0;SAF=21;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.14005e-05;OID=.;OPOS=130750642;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:22:21:0:0:22:21:0:0
chr11	130775688	.	C	T	1178.75	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0432459;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.45;QD=60.4486;RBI=0.0443;REFB=0;REVB=0.00960654;RO=0;SAF=40;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.71047e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.49912e-05;OID=.;OPOS=130775688;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:78:0:0:75:78:1:35:40:0:0:35:43:0:0
chr11	130775782	.	C	T	932.67	PASS	AF=0.894737;AO=68;DP=76;FAO=68;FDP=76;FR=.;FRO=8;FSAF=32;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=0.00656549;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=280.163;QD=49.0879;RBI=0.0184331;REFB=-0.0622864;REVB=0.0172243;RO=8;SAF=32;SAR=36;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.069038;STB=0.536651;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.00157956;OID=.;OPOS=130775782;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:76:76:8:8:68:68:0.894737:36:32:1:7:36:32:1:7
chr11	130776524	.	T	C	418.1	PASS	AF=0.967742;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.032356;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.7;QD=53.9486;RBI=0.0377337;REFB=-0.128206;REVB=-0.0194146;RO=0;SAF=16;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.56309e-08;STB=0.515141;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=0.00129077;OID=.;OPOS=130776524;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:31:31:0:1:30:30:0.967742:14:16:0:0:14:16:1:0
chr11	130776613	.	A	G	520.04	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0139938;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.166;QD=59.4334;RBI=0.0166047;REFB=0;REVB=0.008938;RO=0;SAF=18;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000191413;OID=.;OPOS=130776613;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:17:18:0:0:17:18:0:0
chr11	130780015	.	C	T	905.03	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.011814;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.047;QD=57.4622;RBI=0.0239409;REFB=0;REVB=0.0208229;RO=0;SAF=34;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.63145e-05;OID=.;OPOS=130780015;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:29:34:0:0:29:34:0:0
chr11	130780225	.	C	A	745.59	PASS	AF=1;AO=53;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0953142;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.5881;QD=55.2291;RBI=0.0954619;REFB=0;REVB=0.00530879;RO=0;SAF=21;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.81969e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00149377;OID=.;OPOS=130780225;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:53:54:1:32:21:0:0:32:22:0:0
chr11	130784754	.	C	G	428.87	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-4.06086e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.671;QD=57.1833;RBI=0.00518397;REFB=0;REVB=-0.00518381;RO=0;SAF=22;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.56327e-05;OID=.;OPOS=130784754;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:30:0:0:29:30:1:7:22:0:0:7:23:0:0
chr11	130784971	.	C	G	684.61	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0309624;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.476;QD=62.2376;RBI=0.0471161;REFB=0;REVB=0.0355141;RO=0;SAF=21;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.04829e-05;OID=.;OPOS=130784971;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:44:0:0:43:44:1:22:21:0:0:23:21:0:0
chr11	131531000	.	T	C	1586.52	PASS	AF=1;AO=95;DP=96;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00501801;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.173;QD=63.4606;RBI=0.00860593;REFB=0;REVB=0.00699153;RO=0;SAF=48;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.24965e-06;OID=.;OPOS=131531000;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:96:100:0:0:95:100:1:47:48:0:0:49:51:0:0
chr11	131531015	.	T	G	1667.96	PASS	AF=0.982456;AO=112;DP=114;FAO=112;FDP=114;FR=.;FRO=2;FSAF=53;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0136518;FXX=0.0086949;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.128;QD=58.5248;RBI=0.014714;REFB=-0.165084;REVB=-0.00548907;RO=1;SAF=53;SAR=59;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00797967;STB=0.508332;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=5.10425e-05;OID=.;OPOS=131531015;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:114:114:1:2:112:112:0.982456:59:53:0:1:59:53:0:2
chr11	131531223	.	A	G	1084.25	PASS	AF=0.986486;AO=73;DP=74;FAO=73;FDP=74;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0224448;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.8235;QD=58.6082;RBI=0.0302735;REFB=-0.00411228;REVB=-0.0203154;RO=1;SAF=28;SAR=45;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0165924;STB=0.50877;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.000256685;OID=.;OPOS=131531223;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:74:74:1:1:73:73:0.986486:45:28:1:0:45:28:1:0
chr11	131531564	.	A	T	1662.06	PASS	AF=1;AO=110;DP=111;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00674732;FXX=0.0090082;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.507;QD=60.4385;RBI=0.022005;REFB=0;REVB=-0.020945;RO=0;SAF=56;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.46761e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.32139e-05;OID=.;OPOS=131531564;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:111:110:0:0:110:110:1:54:56:0:0:54:56:0:0
chr11	131531720	.	C	T	740.4	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00143969;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.659;QD=56.9541;RBI=0.0155675;REFB=0;REVB=-0.0155008;RO=0;SAF=23;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.84538e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.10303e-05;OID=.;OPOS=131531720;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:29:23:0:0:29:23:0:0
chr11	132177633	.	A	C,G	1327.45	PASS	AF=0.942529,0.0574713;AO=80,6;DP=86;FAO=82,5;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=31,3;FSAR=51,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0171955,-0.0168204;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=307.422,264.177;QD=61.0322;RBI=0.0196004,0.0178813;REFB=0,0;REVB=-0.00940687,-0.00606756;RO=0;SAF=30,4;SAR=50,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00045326,0.0158111;OID=.,.;OPOS=132177633,132177633;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:12:86:87:0:0:80,6:82,5:0.942529,0.0574713:50,2:30,4:0:0:51,2:31,3:0:0
chr11	132289761	.	G	A	405.48	PASS	AF=0.429907;AO=46;DP=107;FAO=46;FDP=107;FR=.;FRO=61;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=36;FSRR=25;FWDB=0.0530859;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.463;QD=15.1583;RBI=0.0581389;REFB=0.00744747;REVB=0.0237068;RO=61;SAF=20;SAR=26;SRF=36;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15689;STB=0.588007;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=-0.00787929;OID=.;OPOS=132289761;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:107:61:61:46:46:0.429907:26:20:36:25:26:20:36:25
chr11	133714522	.	G	A	171.87	PASS	AF=0.404255;AO=18;DP=46;FAO=19;FDP=47;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.0609088;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.179;QD=14.6275;RBI=0.0610098;REFB=-0.000504448;REVB=0.00350888;RO=28;SAF=9;SAR=9;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0374803;STB=0.505612;STBP=0.96;TYPE=snp;VARB=0.00215535;OID=.;OPOS=133714522;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:47:28:28:18:19:0.404255:9:9:15:13:9:10:15:13
chr11	133788992	.	T	C	318.4	PASS	AF=0.581818;AO=32;DP=55;FAO=32;FDP=55;FR=.;FRO=23;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=-0.00449216;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.331;QD=23.1565;RBI=0.0135197;REFB=-0.0284703;REVB=-0.0127516;RO=23;SAF=15;SAR=17;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105806;STB=0.558288;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.0226786;OID=.;OPOS=133788992;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:23:23:32:32:0.581818:17:15:14:9:17:15:14:9
chr11	133805585	.	C	T	412.14	PASS	AF=0.423423;AO=47;DP=111;FAO=47;FDP=111;FR=.;FRO=64;FSAF=23;FSAR=24;FSRF=40;FSRR=24;FWDB=0.0188766;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=196.405;QD=14.8519;RBI=0.0191523;REFB=-0.00276088;REVB=0.00323812;RO=62;SAF=23;SAR=24;SRF=38;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125093;STB=0.577949;STBP=0.183;TYPE=snp;VARB=0.00318927;OID=.;OPOS=133805585;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:111:62:64:47:47:0.423423:24:23:38:24:24:23:40:24
chr11	133814191	.	A	G	581.2	PASS	AF=0.545455;AO=52;DP=97;FAO=54;FDP=99;FR=.;FRO=45;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=16;FSRR=29;FWDB=-0.012659;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.418;QD=23.483;RBI=0.016162;REFB=-0.0057402;REVB=-0.0100479;RO=45;SAF=24;SAR=28;SRF=16;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0907292;STB=0.549433;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=0.0052608;OID=.;OPOS=133814191;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:99:45:45:52:54:0.545455:28:24:16:29:29:25:16:29
chr11	133815981	.	C	G	132.45	PASS	AF=0.441176;AO=13;DP=32;FAO=15;FDP=34;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.000554814;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.288;QD=15.5819;RBI=0.0514998;REFB=-0.0188331;REVB=0.0514968;RO=18;SAF=11;SAR=2;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.321688;STB=0.56798;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=0.0214067;OID=.;OPOS=133815981;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:34:18:19:13:15:0.441176:2:11:11:7:4:11:12:7
chr11	134018656	.	T	C	352.7	PASS	AF=0.426966;AO=38;DP=89;FAO=38;FDP=89;FR=.;FRO=51;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=30;FWDB=-0.0195288;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.8107;QD=15.8516;RBI=0.0239209;REFB=-0.0234475;REVB=0.0138143;RO=49;SAF=19;SAR=19;SRF=20;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0920334;STB=0.550535;STBP=0.415;TYPE=snp;VARB=0.0265918;OID=.;OPOS=134018656;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:49:51:38:38:0.426966:19:19:20:29:19:19:21:30
chr11	134021477	.	G	T	183.69	PASS	AF=0.463415;AO=19;DP=41;FAO=19;FDP=41;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=1;FWDB=-0.00187612;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.003;QD=17.9207;RBI=0.00874625;REFB=-0.00993978;REVB=0.00854266;RO=21;SAF=8;SAR=11;SRF=20;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.473397;STB=0.768455;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.00977982;OID=.;OPOS=134021477;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:21:22:19:19:0.463415:11:8:20:1:11:8:21:1
chr11	134047243	.	T	C	416.3	PASS	AF=0.438776;AO=44;DP=98;FAO=43;FDP=98;FR=.;FRO=55;FSAF=16;FSAR=27;FSRF=26;FSRR=29;FWDB=0.00537425;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.223;QD=16.9918;RBI=0.0134804;REFB=-0.00339218;REVB=-0.0123628;RO=54;SAF=16;SAR=28;SRF=26;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120442;STB=0.558593;STBP=0.324;TYPE=snp;VARB=0.00266314;OID=.;OPOS=134047243;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:54:55:44:43:0.438776:28:16:26:28:27:16:26:29
chr11	134073019	.	A	T	37.15	PASS	AF=0.333333;AO=6;DP=18;FAO=6;FDP=18;FR=.;FRO=12;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=-0.0211786;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=277.444;QD=8.2546;RBI=0.0215795;REFB=-0.000131573;REVB=0.00414015;RO=12;SAF=1;SAR=5;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.329965;STB=0.713469;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=8.27736e-05;OID=.;OPOS=134073019;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:18:18:12:12:6:6:0.333333:5:1:5:7:5:1:5:7
chr11	134151975	.	G	C	447.66	PASS	AF=0.431034;AO=50;DP=117;FAO=50;FDP=116;FR=.;FRO=66;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=29;FSRR=37;FWDB=-0.00230254;FXX=0.00854628;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.494;QD=15.4367;RBI=0.0211441;REFB=-0.00600772;REVB=0.0210183;RO=65;SAF=28;SAR=22;SRF=29;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114717;STB=0.568452;STBP=0.217;TYPE=snp;VARB=0.00861727;OID=.;OPOS=134151975;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:117:116:65:66:50:50:0.431034:22:28:29:36:22:28:29:37
chr11	134182375	.	G	A	803.46	PASS	AF=0.982759;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0100873;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.189;QD=55.4109;RBI=0.0372559;REFB=-0.118306;REVB=0.0358643;RO=0;SAF=28;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508769;STBP=0.557;TYPE=snp;VARB=0.000781469;OID=.;OPOS=134182375;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:58:58:0:1:57:57:0.982759:29:28:0:0:29:28:1:0
chr11	134244123	.	C	G	306.94	PASS	AF=0.485294;AO=33;DP=68;FAO=33;FDP=68;FR=.;FRO=35;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=0.000621135;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=232.441;QD=18.055;RBI=0.00948277;REFB=-0.00658998;REVB=0.00946241;RO=35;SAF=12;SAR=21;SRF=14;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0357409;STB=0.519988;STBP=0.789;TYPE=snp;VARB=0.00712949;OID=.;OPOS=134244123;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:35:35:33:33:0.485294:21:12:14:21:21:12:14:21
chr12	78795	.	C	G	109.04	PASS	AF=0.916667;AO=11;DP=12;FAO=11;FDP=12;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.000236912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.4181;QD=36.3463;RBI=0.022397;REFB=-0.0138777;REVB=0.0223957;RO=1;SAF=6;SAR=5;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0815441;STB=0.545372;STBP=0.563;TYPE=snp;VARB=0.00337811;OID=.;OPOS=78795;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:12:12:1:1:11:11:0.916667:5:6:0:1:5:6:0:1
chr12	89710	.	G	A	43.68	PASS	AF=0.75;AO=6;DP=8;FAO=6;FDP=8;FR=.;FRO=2;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0031808;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=267.614;QD=21.8421;RBI=0.0462809;REFB=0.0216249;REVB=0.0461715;RO=2;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144764;STB=0.583085;STBP=0.681;TYPE=snp;VARB=-0.00395933;OID=.;OPOS=89710;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:8:8:2:2:6:6:0.75:5:1:0:2:5:1:0:2
chr12	90902	.	C	T	1541.22	PASS	AF=0.631336;AO=136;DP=216;FAO=137;FDP=217;FR=.;FRO=80;FSAF=82;FSAR=55;FSRF=33;FSRR=47;FWDB=0.0510296;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.31;QD=28.4095;RBI=0.0515187;REFB=-0.0185003;REVB=0.00708273;RO=79;SAF=81;SAR=55;SRF=33;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122614;STB=0.569395;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.0103622;OID=.;OPOS=90902;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:216:217:79:80:136:137:0.631336:55:81:33:46:55:82:33:47
chr12	92119	.	T	C	97.91	PASS	AF=0.413793;AO=12;DP=29;FAO=12;FDP=29;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=-0.0566761;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.202;QD=13.5043;RBI=0.0672182;REFB=-0.0197584;REVB=-0.0361401;RO=17;SAF=7;SAR=5;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113103;STB=0.566363;STBP=0.593;TYPE=snp;VARB=0.0298743;OID=.;OPOS=92119;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:29:29:17:17:12:12:0.413793:5:7:8:9:5:7:8:9
chr12	92991	.	C	G	424.71	PASS	AF=0.684211;AO=39;DP=57;FAO=39;FDP=57;FR=.;FRO=18;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=13;FSRR=5;FWDB=0.00256222;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.7774;QD=29.804;RBI=0.0229493;REFB=0.00149202;REVB=0.0228059;RO=18;SAF=17;SAR=22;SRF=13;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165378;STB=0.589767;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=-0.000162129;OID=.;OPOS=92991;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:18:18:39:39:0.684211:22:17:13:5:22:17:13:5
chr12	235022	.	C	T	279.62	PASS	AF=0.956522;AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0178187;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=204.34;QD=48.63;RBI=0.0258113;REFB=-0.0304399;REVB=0.0186739;RO=0;SAF=18;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.555502;STBP=0.107;TYPE=snp;VARB=0.000219807;OID=.;OPOS=235022;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:23:23:0:1:22:22:0.956522:4:18:0:0:4:18:0:1
chr12	248202	.	C	G	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00449575;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.084;QD=37.4885;RBI=0.00449575;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=8;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.41464e-05;OID=.;OPOS=248202;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:0:8:0:0:0:8:0:0
chr12	274647	.	T	C	347.46	PASS	AF=0.45679;AO=37;DP=81;FAO=37;FDP=81;FR=.;FRO=44;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=18;FSRR=26;FWDB=0.0101924;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=229.37;QD=17.1586;RBI=0.0116552;REFB=-0.00284699;REVB=0.00565329;RO=44;SAF=18;SAR=19;SRF=18;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0752866;STB=0.542146;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.00387171;OID=.;OPOS=274647;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:44:44:37:37:0.45679:19:18:18:26:19:18:18:26
chr12	284058	.	T	C	106.48	PASS	AF=0.382353;AO=11;DP=32;FAO=13;FDP=34;FR=.;FRO=21;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=18;FWDB=0.0158175;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.4481;QD=12.5266;RBI=0.0478782;REFB=-0.0531061;REVB=-0.0451899;RO=21;SAF=0;SAR=11;SRF=3;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.7307;STB=0.513254;STBP=0.946;TYPE=snp;VARB=0.0655768;OID=.;OPOS=284058;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:34:21:21:11:13:0.382353:11:0:3:18:11:2:3:18
chr12	311949	.	A	G	708.47	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0240109;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.4016;QD=62.9749;RBI=0.0481564;REFB=0;REVB=-0.0417434;RO=0;SAF=23;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000232748;OID=.;OPOS=311949;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:22:23:0:0:22:23:0:0
chr12	319111	.	T	C	163.61	PASS	AF=0.305556;AO=22;DP=73;FAO=22;FDP=72;FR=.;FRO=50;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=26;FSRR=24;FWDB=-0.00052862;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.028;QD=9.08919;RBI=0.0013121;REFB=-0.0288448;REVB=-0.00120091;RO=49;SAF=9;SAR=13;SRF=25;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118747;STB=0.57734;STBP=0.392;TYPE=snp;VARB=0.0489684;OID=.;OPOS=319111;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:72:49:50:22:22:0.305556:13:9:25:24:13:9:26:24
chr12	319125	.	A	G	163.01	PASS	AF=0.309859;AO=22;DP=71;FAO=22;FDP=71;FR=.;FRO=49;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=24;FSRR=25;FWDB=-0.000728903;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.9667;QD=9.1835;RBI=0.00280192;REFB=0.00543115;REVB=-0.00270545;RO=49;SAF=9;SAR=13;SRF=24;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0952418;STB=0.556369;STBP=0.556;TYPE=snp;VARB=-0.00893979;OID=.;OPOS=319125;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:49:49:22:22:0.309859:13:9:24:25:13:9:24:25
chr12	393489	.	CTTTTTTTTTTTT	CTTTTTTTTTTT,CTTTTTTTTTTTA,TCTTTTTTTTTTA	238.81	PASS	AF=0.210526,0.736842,0;AO=8,9,2;DP=39;FAO=8,28,0;FDP=38;FR=.;FRO=2;FSAF=5,15,0;FSAR=3,13,0;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00461865,0.0878697,-0.0125263;FXX=0.0499875;HRUN=12,12,2;LEN=1,1,13;MLLD=5.31007,14.3321,178.837;QD=25.1376;RBI=0.100127,0.155906,0.0962982;REFB=0.123904,0.0767228,0.00527308;REVB=-0.10002,-0.128785,-0.09548;RO=5;SAF=5,4,0;SAR=3,5,2;SRF=5;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.293689,-0.338781,-0.78221;STB=0.526249,0.502391,0.5;STBP=0.896,0.883,1;TYPE=del,snp,mnp;VARB=0.175695,-0.0232006,0.023497;OID=.,.,.;OPOS=393490,393501,393489;OREF=T,T,CTTTTTTTTTTTT;OALT=-,A,TCTTTTTTTTTTA;OMAPALT=CTTTTTTTTTTT,CTTTTTTTTTTTA,TCTTTTTTTTTTA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:27:39:38:5:2:8,9,2:8,28,0:0.210526,0.736842,0:3,5,2:5,4,0:5:0:3,13,0:5,15,0:1:1
chr12	406292	.	G	A	683.15	PASS	AF=0.961538;AO=50;DP=52;FAO=50;FDP=52;FR=.;FRO=2;FSAF=19;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00825801;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.16;QD=52.5499;RBI=0.0167478;REFB=-0.174726;REVB=0.0145703;RO=1;SAF=19;SAR=31;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0241289;STB=0.504884;STBP=0.783;TYPE=snp;VARB=0.00163639;OID=.;OPOS=406292;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:52:52:1:2:50:50:0.961538:31:19:1:0:31:19:1:1
chr12	427575	.	A	G	651.0	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00709975;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.773;QD=62.0003;RBI=0.0166037;REFB=0;REVB=-0.0150092;RO=0;SAF=19;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.85194e-05;OID=.;OPOS=427575;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:23:19:0:0:23:19:0:0
chr12	547683	.	T	C	38.57	PASS	AF=0.428571;AO=6;DP=14;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.0272601;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.037;QD=11.0196;RBI=0.0377949;REFB=-0.0222495;REVB=0.0261791;RO=8;SAF=3;SAR=3;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.236249;STB=0.642419;STBP=0.426;TYPE=snp;VARB=0.0429284;OID=.;OPOS=547683;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:14:14:8:8:6:6:0.428571:3:3:2:6:3:3:2:6
chr12	662448	.	T	C	455.07	PASS	AF=0.454545;AO=50;DP=110;FAO=50;FDP=110;FR=.;FRO=60;FSAF=31;FSAR=19;FSRF=38;FSRR=22;FWDB=-0.00308554;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=270.057;QD=16.548;RBI=0.0151973;REFB=-0.0214886;REVB=-0.0148808;RO=60;SAF=31;SAR=19;SRF=38;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0138841;STB=0.507743;STBP=0.901;TYPE=snp;VARB=0.025056;OID=.;OPOS=662448;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:110:60:60:50:50:0.454545:19:31:38:22:19:31:38:22
chr12	862989	.	T	C	1125.47	PASS	AF=1;AO=74;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0470993;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.7404;QD=60.0248;RBI=0.0648851;REFB=0;REVB=0.0446288;RO=0;SAF=36;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.79579e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000213288;OID=.;OPOS=862989;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:75:0:0:74:75:1:38:36:0:0:39:36:0:0
chr12	939302	.	A	G	151.2	PASS	AF=0.533333;AO=16;DP=30;FAO=16;FDP=30;FR=.;FRO=14;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.0314876;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.623;QD=20.1601;RBI=0.0314954;REFB=-0.00901713;REVB=0.000704296;RO=14;SAF=11;SAR=5;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105752;STB=0.560107;STBP=0.538;TYPE=snp;VARB=0.0111871;OID=.;OPOS=939302;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:14:14:16:16:0.533333:5:11:8:6:5:11:8:6
chr12	971291	.	C	T	150.11	PASS	AF=0.516129;AO=16;DP=31;FAO=16;FDP=31;FR=.;FRO=15;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=1;FWDB=0.000624311;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.8844;QD=19.3696;RBI=0.00144584;REFB=-0.00674536;REVB=-0.0013041;RO=15;SAF=12;SAR=4;SRF=14;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.241272;STB=0.634009;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=0.00494176;OID=.;OPOS=971291;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:15:15:16:16:0.516129:4:12:14:1:4:12:14:1
chr12	974326	.	G	C	798.22	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0206041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.225;QD=57.0155;RBI=0.0229107;REFB=0;REVB=0.0100187;RO=0;SAF=22;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.76368e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.9933e-05;OID=.;OPOS=974326;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:56:0:0:53:56:1:31:22:0:0:33:23:0:0
chr12	974355	.	T	TC	446.43	PASS	AF=1;AO=35;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0868761;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=20.1642;QD=45.788;RBI=0.0871555;REFB=0;REVB=-0.00697392;RO=4;SAF=9;SAR=26;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0587754;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00302818;OID=.;OPOS=974356;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:35:39:39:39:0:10:29:0:0:8:4:9:26:2:2
chr12	987482	.	G	A	144.77	PASS	AF=0.432432;AO=16;DP=37;FAO=16;FDP=37;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0183383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.917;QD=15.6505;RBI=0.0262492;REFB=0.0116026;REVB=-0.018781;RO=21;SAF=8;SAR=8;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0234155;STB=0.513497;STBP=0.94;TYPE=snp;VARB=-0.011647;OID=.;OPOS=987482;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:21:21:16:16:0.432432:8:8:11:10:8:8:11:10
chr12	990912	.	A	C	209.38	PASS	AF=0.444444;AO=23;DP=53;FAO=24;FDP=54;FR=.;FRO=30;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=0.0100363;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.768;QD=15.5094;RBI=0.017791;REFB=-0.0163624;REVB=-0.0146899;RO=26;SAF=14;SAR=9;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174786;STB=0.624896;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=0.0141853;OID=.;OPOS=990912;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:54:26:30:23:24:0.444444:9:14:11:15:9:15:12:18
chr12	994014	.	C	T	144.02	PASS	AF=0.421053;AO=16;DP=38;FAO=16;FDP=38;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=-0.0113709;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.146;QD=15.1605;RBI=0.0171309;REFB=-0.034883;REVB=0.012813;RO=22;SAF=6;SAR=10;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.216029;STB=0.624844;STBP=0.204;TYPE=snp;VARB=0.0215035;OID=.;OPOS=994014;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:22:22:16:16:0.421053:10:6:13:9:10:6:13:9
chr12	994487	.	G	C	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0183197;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.822;QD=56.1916;RBI=0.0233993;REFB=0;REVB=0.0145573;RO=0;SAF=15;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.57657e-05;OID=.;OPOS=994487;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:13:15:0:0:13:15:0:0
chr12	998365	.	G	T	147.23	PASS	AF=0.470588;AO=16;DP=34;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.00231996;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.9029;QD=17.3209;RBI=0.0289179;REFB=-0.00059106;REVB=0.0288246;RO=17;SAF=4;SAR=12;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.228247;STB=0.649799;STBP=0.118;TYPE=snp;VARB=0.00157189;OID=.;OPOS=998365;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:17:18:16:16:0.470588:12:4:8:9:12:4:9:9
chr12	1017197	.	C	T	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000694755;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.194;QD=51.184;RBI=0.010868;REFB=0;REVB=0.0108457;RO=0;SAF=9;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000222724;OID=.;OPOS=1017197;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:11:9:0:0:11:9:0:0
chr12	1590013	.	C	T	120.36	PASS	AF=0.65;AO=13;DP=20;FAO=13;FDP=20;FR=.;FRO=7;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.0134929;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.48;QD=24.0727;RBI=0.0339718;REFB=-0.0141686;REVB=-0.0311773;RO=7;SAF=9;SAR=4;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176469;STB=0.59984;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.00584572;OID=.;OPOS=1590013;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:20:20:7:7:13:13:0.65:4:9:3:4:4:9:3:4
chr12	1590069	.	G	A	71.65	PASS	AF=0.6;AO=9;DP=15;FAO=9;FDP=15;FR=.;FRO=6;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.053302;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.9928;QD=19.1065;RBI=0.0542775;REFB=-0.015764;REVB=0.0102445;RO=6;SAF=6;SAR=3;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.235001;STB=0.636055;STBP=0.225;TYPE=snp;VARB=0.0373101;OID=.;OPOS=1590069;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:15:15:6:6:9:9:0.6:3:6:2:4:3:6:2:4
chr12	1995403	.	T	C	1549.2	PASS	AF=1;AO=95;DP=95;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0180945;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.376;QD=63.8846;RBI=0.0962574;REFB=0;REVB=0.0945414;RO=0;SAF=60;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000108545;OID=.;OPOS=1995403;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:97:0:0:95:97:1:35:60:0:0:35:62:0:0
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chr12	2694638	.	C	T	218.61	PASS	AF=0.4;AO=26;DP=65;FAO=26;FDP=65;FR=.;FRO=39;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=23;FWDB=0.0260987;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.756;QD=13.4529;RBI=0.0260992;REFB=-0.00894655;REVB=-0.000169059;RO=37;SAF=9;SAR=17;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0945772;STB=0.541369;STBP=0.619;TYPE=snp;VARB=0.016399;OID=.;OPOS=2694638;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:37:39:26:26:0.4:17:9:16:21:17:9:16:23
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chr12	2791130	.	C	T	295.46	PASS	AF=0.590909;AO=26;DP=46;FAO=26;FDP=44;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=0.0284732;FXX=0.0434688;HRUN=2;LEN=1;MLLD=227.796;QD=26.86;RBI=0.0294835;REFB=-0.00797729;REVB=-0.00765176;RO=18;SAF=11;SAR=15;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0688202;STB=0.538015;STBP=0.578;TYPE=snp;VARB=0.00425771;OID=.;OPOS=2791130;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:44:18:18:26:26:0.590909:15:11:6:12:15:11:6:12
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chr12	2968458	.	T	C	545.76	PASS	AF=0.973684;AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0898061;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=47.6915;QD=57.4485;RBI=0.098045;REFB=-0.181354;REVB=-0.0393408;RO=1;SAF=16;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0283678;STB=0.515143;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.00539917;OID=.;OPOS=2968458;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:38:38:1:1:37:37:0.973684:21:16:1:0:21:16:1:0
chr12	2973615	.	T	C	125.65	PASS	AF=0.307692;AO=16;DP=52;FAO=16;FDP=52;FR=.;FRO=36;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=-0.00508915;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.971;QD=9.66524;RBI=0.0229706;REFB=-0.00543354;REVB=0.0223998;RO=36;SAF=9;SAR=7;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135974;STB=0.581239;STBP=0.447;TYPE=snp;VARB=0.0104601;OID=.;OPOS=2973615;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:36:36:16:16:0.307692:7:9:16:20:7:9:16:20
chr12	2996174	.	A	G	975.96	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0113117;FXX=0.0149231;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.27;QD=59.1494;RBI=0.0156319;REFB=0;REVB=0.010789;RO=0;SAF=42;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.1333e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.87739e-05;OID=.;OPOS=2996174;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:24:42:0:0:24:42:0:0
chr12	2997397	.	G	A	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0808713;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.705;QD=55.0984;RBI=0.0810377;REFB=0;REVB=0.00519069;RO=0;SAF=8;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.28381e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000972136;OID=.;OPOS=2997397;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:18:8:0:0:18:8:0:0
chr12	3046802	.	A	G	398.84	PASS	AF=0.432692;AO=45;DP=104;FAO=45;FDP=104;FR=.;FRO=59;FSAF=30;FSAR=15;FSRF=35;FSRR=24;FWDB=0.00880874;FXX=0.0095229;HRUN=3;LEN=1;MLLD=177.29;QD=15.3399;RBI=0.0114748;REFB=-0.00636772;REVB=0.00735374;RO=57;SAF=30;SAR=15;SRF=34;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0762773;STB=0.545434;STBP=0.433;TYPE=snp;VARB=0.0078491;OID=.;OPOS=3046802;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:104:57:59:45:45:0.432692:15:30:34:23:15:30:35:24
chr12	3049698	.	T	C	38.57	PASS	AF=0.428571;AO=6;DP=14;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=0;FWDB=-0.0258009;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.979;QD=11.0197;RBI=0.0265194;REFB=0.0120798;REVB=0.00613147;RO=8;SAF=3;SAR=3;SRF=8;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.495365;STB=0.785069;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=-0.0116214;OID=.;OPOS=3049698;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:14:14:8:8:6:6:0.428571:3:3:8:0:3:3:8:0
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chr12	3749874	.	T	C	711.54	PASS	AF=0.962963;AO=52;DP=54;FAO=52;FDP=54;FR=.;FRO=2;FSAF=20;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0162774;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.408;QD=52.7063;RBI=0.0304101;REFB=-0.0771643;REVB=0.0256869;RO=0;SAF=20;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.00761e-08;STB=0.515146;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.000415891;OID=.;OPOS=3749874;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:54:54:0:2:52:52:0.962963:32:20:0:0:32:20:0:2
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chr12	4388084	.	C	G	180.74	PASS	AF=0.580645;AO=18;DP=31;FAO=18;FDP=31;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.101397;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.0344;QD=23.3214;RBI=0.124932;REFB=0.0289954;REVB=-0.0729844;RO=13;SAF=6;SAR=12;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161584;STB=0.590805;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=-0.0130999;OID=.;OPOS=4388084;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:13:13:18:18:0.580645:12:6:7:6:12:6:7:6
chr12	4414126	.	G	A	207.12	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.499;QD=48.7342;RBI=0.016754;REFB=0;REVB=0.016754;RO=0;SAF=0;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000291692;OID=.;OPOS=4414126;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:17:0:0:0:17:0:0:0
chr12	4461485	.	G	A	267.53	PASS	AF=0.510204;AO=25;DP=49;FAO=25;FDP=49;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=0.00420386;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=281.736;QD=21.839;RBI=0.0133558;REFB=-0.00317523;REVB=0.0126769;RO=24;SAF=11;SAR=14;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16068;STB=0.58988;STBP=0.206;TYPE=snp;VARB=0.00294645;OID=.;OPOS=4461485;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:24:24:25:25:0.510204:14:11:15:9:14:11:15:9
chr12	4478080	.	T	A	119.53	PASS	AF=0.4;AO=14;DP=35;FAO=14;FDP=35;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=15;FWDB=0.0062945;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.137;QD=13.6609;RBI=0.00828212;REFB=-0.00873172;REVB=-0.00538264;RO=21;SAF=7;SAR=7;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.221956;STB=0.6284;STBP=0.252;TYPE=snp;VARB=0.0121369;OID=.;OPOS=4478080;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:21:21:14:14:0.4:7:7:6:15:7:7:6:15
chr12	4553332	.	A	G	282.69	PASS	AF=0.484375;AO=31;DP=63;FAO=31;FDP=64;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=10;FSRR=23;FWDB=-0.0429986;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.6013;QD=17.6678;RBI=0.0652771;REFB=-0.00262429;REVB=0.0491144;RO=32;SAF=10;SAR=21;SRF=9;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0437885;STB=0.51162;STBP=0.867;TYPE=snp;VARB=0.00305956;OID=.;OPOS=4553332;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:64:32:33:31:31:0.484375:21:10:9:23:21:10:10:23
chr12	4553383	.	A	G	223.89	PASS	AF=0.478261;AO=22;DP=46;FAO=22;FDP=46;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=0.00850866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.955;QD=19.469;RBI=0.0103973;REFB=-0.0215245;REVB=0.00597556;RO=24;SAF=9;SAR=13;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.046491;STB=0.526292;STBP=0.743;TYPE=snp;VARB=0.0202307;OID=.;OPOS=4553383;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:24:24:22:22:0.478261:13:9:11:13:13:9:11:13
chr12	4554548	.	G	C	809.09	PASS	AF=0.983051;AO=56;DP=57;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0592594;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.2751;QD=54.8538;RBI=0.0594286;REFB=0.0245034;REVB=0.00448075;RO=1;SAF=33;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0200576;STB=0.510635;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=-0.00466564;OID=.;OPOS=4554548;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:57:59:1:1:56:58:0.983051:23:33:0:1:23:35:0:1
chr12	4702173	.	C	T	140.72	PASS	AF=0.372093;AO=16;DP=43;FAO=16;FDP=43;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=3;FSRF=19;FSRR=8;FWDB=-0.0122658;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.2399;QD=13.0905;RBI=0.0311313;REFB=0.000712483;REVB=-0.0286131;RO=26;SAF=13;SAR=3;SRF=19;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127263;STB=0.598192;STBP=0.383;TYPE=snp;VARB=-0.00342783;OID=.;OPOS=4702173;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:26:27:16:16:0.372093:3:13:19:7:3:13:19:8
chr12	4705317	.	C	T	162.57	PASS	AF=0.485714;AO=17;DP=36;FAO=17;FDP=35;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.0214827;FXX=0.0277701;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.6378;QD=18.5797;RBI=0.0241438;REFB=-0.0046263;REVB=0.011019;RO=19;SAF=10;SAR=7;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106788;STB=0.574236;STBP=0.428;TYPE=snp;VARB=0.00353736;OID=.;OPOS=4705317;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:35:19:18:17:17:0.485714:7:10:9:10:7:10:8:10
chr12	4716513	.	C	T	267.53	PASS	AF=0.510204;AO=25;DP=49;FAO=25;FDP=49;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=-0.00930734;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.191;QD=21.8387;RBI=0.0273159;REFB=-0.0160218;REVB=-0.0256813;RO=24;SAF=13;SAR=12;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126394;STB=0.570676;STBP=0.328;TYPE=snp;VARB=0.0148488;OID=.;OPOS=4716513;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:24:24:25:25:0.510204:12:13:9:15:12:13:9:15
chr12	4716572	.	C	A	168.89	PASS	AF=0.607143;AO=17;DP=28;FAO=17;FDP=28;FR=.;FRO=11;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.0730871;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.7666;QD=24.1267;RBI=0.0757628;REFB=0.00638244;REVB=-0.0199568;RO=11;SAF=7;SAR=10;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0307576;STB=0.517221;STBP=0.827;TYPE=snp;VARB=-0.00733562;OID=.;OPOS=4716572;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:28:28:11:11:17:17:0.607143:10:7:5:6:10:7:5:6
chr12	4735734	.	T	C	552.91	PASS	AF=0.566667;AO=51;DP=90;FAO=51;FDP=90;FR=.;FRO=39;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=0.00938518;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.626;QD=24.5737;RBI=0.0134213;REFB=0.0163961;REVB=0.00959425;RO=39;SAF=25;SAR=26;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0430011;STB=0.523551;STBP=0.633;TYPE=snp;VARB=-0.00986003;OID=.;OPOS=4735734;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:39:39:51:51:0.566667:26:25:17:22:26:25:17:22
chr12	4735737	.	A	G	458.79	PASS	AF=0.43956;AO=40;DP=90;FAO=40;FDP=91;FR=.,HEALED;FRO=41;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=25;FSRR=16;FWDB=0.0201232;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.1315;QD=20.1664;RBI=0.033062;REFB=-0.0239437;REVB=-0.0262326;RO=35;SAF=18;SAR=22;SRF=25;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.220672;STB=0.580328;STBP=0.161;TYPE=snp;VARB=-0.00354797;OID=.;OPOS=4735737;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:91:35:41:40:40:0.43956:22:18:25:10:22:18:25:16
chr12	4735894	.	G	A	131.52	PASS	AF=0.394737;AO=15;DP=38;FAO=15;FDP=38;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=-0.00397431;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.7747;QD=13.8442;RBI=0.0203894;REFB=-0.00490295;REVB=-0.0199983;RO=23;SAF=6;SAR=9;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0371963;STB=0.52171;STBP=0.846;TYPE=snp;VARB=0.000240531;OID=.;OPOS=4735894;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:23:23:15:15:0.394737:9:6:10:13:9:6:10:13
chr12	4736086	.	A	G	170.41	PASS	AF=0.62963;AO=17;DP=27;FAO=17;FDP=27;FR=.;FRO=10;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=2;FWDB=-0.0511677;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.0354;QD=25.2464;RBI=0.0548189;REFB=0.0068384;REVB=0.0196716;RO=10;SAF=10;SAR=7;SRF=8;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149988;STB=0.583241;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=-0.00561799;OID=.;OPOS=4736086;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:27:27:10:10:17:17:0.62963:7:10:8:2:7:10:8:2
chr12	4736495	.	C	T	708.45	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0231173;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.834;QD=62.973;RBI=0.0232248;REFB=0;REVB=0.00223231;RO=0;SAF=28;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.15398e-05;OID=.;OPOS=4736495;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:17:28:0:0:17:28:0:0
chr12	4736631	.	A	G	1135.13	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0462935;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.3178;QD=60.5405;RBI=0.0500581;REFB=0;REVB=-0.0190454;RO=0;SAF=28;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94731e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000502753;OID=.;OPOS=4736631;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:47:28:0:0:47:28:0:0
chr12	4736677	.	G	C,T	984.64	PASS	AF=0.926471,0.0735294;AO=62,6;DP=68;FAO=63,5;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=24,0;FSAR=39,5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0387694,-0.00277501;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=64.3081,165.086;QD=57.92;RBI=0.0391934,0.0125227;REFB=0,0;REVB=0.00574959,-0.0122114;RO=0;SAF=23,1;SAR=39,5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=5.75648e-08,3.18042e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.022153,0.110019;OID=.,.;OPOS=4736677,4736677;OREF=G,G;OALT=C,T;OMAPALT=C,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:19:68:68:0:0:62,6:63,5:0.926471,0.0735294:39,5:23,1:0:0:39,5:24,0:0:0
chr12	4736690	.	A	G	895.69	PASS	AF=0.969231;AO=63;DP=65;FAO=63;FDP=65;FR=.;FRO=2;FSAF=19;FSAR=44;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0078539;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.7137;QD=55.1192;RBI=0.0157532;REFB=-0.0943207;REVB=0.0136558;RO=2;SAF=19;SAR=44;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0135938;STB=0.507202;STBP=0.572;TYPE=snp;VARB=0.00562152;OID=.;OPOS=4736690;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:65:65:2:2:63:63:0.969231:44:19:1:1:44:19:1:1
chr12	4737318	.	A	G	101.59	PASS	AF=0.5;AO=12;DP=24;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.0281273;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.174;QD=16.9315;RBI=0.0699182;REFB=-0.0052709;REVB=-0.064011;RO=11;SAF=6;SAR=6;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113581;STB=0.541598;STBP=0.735;TYPE=snp;VARB=0.00908594;OID=.;OPOS=4737318;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:24:24:11:12:12:12:0.5:6:6:4:7:6:6:5:7
chr12	4737459	.	C	T	190.28	PASS	AF=0.542857;AO=19;DP=35;FAO=19;FDP=35;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.0183978;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=210.383;QD=21.7458;RBI=0.0194797;REFB=-0.0172955;REVB=0.00640141;RO=15;SAF=9;SAR=10;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0468823;STB=0.512035;STBP=0.96;TYPE=snp;VARB=0.0133098;OID=.;OPOS=4737459;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:15:16:19:19:0.542857:10:9:8:7:10:9:8:8
chr12	4737715	.	C	T	443.65	PASS	AF=0.66129;AO=41;DP=62;FAO=41;FDP=62;FR=.;FRO=21;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0285779;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=250.012;QD=28.6227;RBI=0.0322829;REFB=-0.011919;REVB=0.0150164;RO=21;SAF=18;SAR=23;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0531765;STB=0.528931;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=0.0062463;OID=.;OPOS=4737715;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:21:21:41:41:0.66129:23:18:11:10:23:18:11:10
chr12	4740515	.	A	T	646.47	PASS	AF=0.496183;AO=65;DP=131;FAO=65;FDP=131;FR=.;FRO=66;FSAF=28;FSAR=37;FSRF=32;FSRR=34;FWDB=0.0273397;FXX=0.00757518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.858;QD=19.7395;RBI=0.0274237;REFB=-0.0148537;REVB=-0.00214503;RO=64;SAF=28;SAR=37;SRF=32;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0628729;STB=0.527558;STBP=0.548;TYPE=snp;VARB=0.0131;OID=.;OPOS=4740515;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:131:131:64:66:65:65:0.496183:37:28:32:32:37:28:32:34
chr12	4794351	.	A	G	769.51	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00896546;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.377;QD=57.0007;RBI=0.0181414;REFB=0;REVB=0.0157712;RO=0;SAF=30;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.52061e-05;OID=.;OPOS=4794351;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:24:30:0:0:24:30:0:0
chr12	4854783	.	C	T	108.79	PASS	AF=0.666667;AO=12;DP=18;FAO=12;FDP=18;FR=.;FRO=6;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.100071;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=44.0967;QD=24.1764;RBI=0.105884;REFB=0.0376298;REVB=-0.0346;RO=6;SAF=6;SAR=6;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0984044;STB=0.555464;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=-0.0150599;OID=.;OPOS=4854783;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:18:18:6:6:12:12:0.666667:6:6:2:4:6:6:2:4
chr12	4921228	.	T	C	271.69	PASS	AF=0.418919;AO=31;DP=74;FAO=31;FDP=74;FR=.;FRO=43;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=25;FWDB=0.0122092;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.309;QD=14.6859;RBI=0.0369569;REFB=-0.00464085;REVB=0.0348819;RO=43;SAF=20;SAR=11;SRF=18;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.233712;STB=0.632603;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=0.00598859;OID=.;OPOS=4921228;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:43:43:31:31:0.418919:11:20:18:25:11:20:18:25
chr12	4921301	.	T	C	140.11	PASS	AF=0.363636;AO=16;DP=44;FAO=16;FDP=44;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.00243371;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.394;QD=12.737;RBI=0.01061;REFB=-0.00571977;REVB=-0.0103271;RO=28;SAF=9;SAR=7;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0680712;STB=0.53995;STBP=0.704;TYPE=snp;VARB=0.00956134;OID=.;OPOS=4921301;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:28:28:16:16:0.363636:7:9:14:14:7:9:14:14
chr12	4921689	.	C	T	214.99	PASS	AF=0.525;AO=21;DP=40;FAO=21;FDP=40;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=4;FWDB=0.0105597;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.055;QD=21.499;RBI=0.0178935;REFB=-0.0081971;REVB=0.0144454;RO=19;SAF=10;SAR=11;SRF=15;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.263761;STB=0.646929;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.0132167;OID=.;OPOS=4921689;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:19:19:21:21:0.525:11:10:15:4:11:10:15:4
chr12	4921782	.	C	G	146.31	PASS	AF=0.64;AO=14;DP=23;FAO=16;FDP=25;FR=.;FRO=9;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.0555106;FXX=0.0384468;HRUN=3;LEN=1;MLLD=32.3848;QD=23.4094;RBI=0.153577;REFB=-0.0499545;REVB=-0.143194;RO=9;SAF=9;SAR=5;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.018083;STB=0.553004;STBP=0.561;TYPE=snp;VARB=0.0296235;OID=.;OPOS=4921782;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:23:25:9:9:14:16:0.64:5:9:6:3:5:11:5:4
chr12	4922030	.	C	G	332.0	PASS	AF=0.439024;AO=36;DP=82;FAO=36;FDP=82;FR=.;FRO=46;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=0.00454835;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.162;QD=16.195;RBI=0.005415;REFB=-0.00662795;REVB=-0.00293849;RO=45;SAF=14;SAR=22;SRF=21;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.079121;STB=0.551503;STBP=0.426;TYPE=snp;VARB=0.011464;OID=.;OPOS=4922030;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:45:46:36:36:0.439024:22:14:21:24:22:14:22:24
chr12	4922734	.	A	G	97.91	PASS	AF=0.413793;AO=12;DP=29;FAO=12;FDP=29;FR=.;FRO=17;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.00335042;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.893;QD=13.5055;RBI=0.00814867;REFB=0.00185344;REVB=-0.00742803;RO=17;SAF=3;SAR=9;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.24777;STB=0.646796;STBP=0.22;TYPE=snp;VARB=-0.00211815;OID=.;OPOS=4922734;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:29:29:17:17:12:12:0.413793:9:3:8:9:9:3:8:9
chr12	4923049	.	T	C	103.46	PASS	AF=0.309524;AO=13;DP=42;FAO=13;FDP=42;FR=.;FRO=29;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.0259979;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=49.6808;QD=9.85364;RBI=0.0586994;REFB=-0.00510311;REVB=0.0526282;RO=29;SAF=3;SAR=10;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.317016;STB=0.693557;STBP=0.115;TYPE=snp;VARB=0.0120502;OID=.;OPOS=4923049;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:29:29:13:13:0.309524:10:3:14:15:10:3:14:15
chr12	4923697	.	G	T	501.92	PASS	AF=0.514563;AO=48;DP=98;FAO=53;FDP=103;FR=.;FRO=50;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=22;FSRR=28;FWDB=0.00336857;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.026;QD=19.492;RBI=0.0201825;REFB=-0.00647497;REVB=0.0198994;RO=49;SAF=23;SAR=25;SRF=21;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0463034;STB=0.506289;STBP=0.917;TYPE=snp;VARB=0.00664924;OID=.;OPOS=4923697;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:103:49:50:48:53:0.514563:25:23:21:28:29:24:22:28
chr12	5021228	.	T	C	801.32	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0417221;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.76;QD=57.2374;RBI=0.0419447;REFB=0;REVB=0.00431565;RO=0;SAF=33;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000222809;OID=.;OPOS=5021228;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:23:33:0:0:23:33:0:0
chr12	5021984	.	T	A	237.37	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0608202;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.269;QD=49.9727;RBI=0.0666038;REFB=0;REVB=0.0271471;RO=0;SAF=11;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.41338e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00211152;OID=.;OPOS=5021984;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:8:11:0:0:8:11:0:0
chr12	5022041	.	G	A	88.21	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0355269;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.4859;QD=39.2046;RBI=0.0464527;REFB=0;REVB=-0.0299281;RO=0;SAF=7;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000334936;OID=.;OPOS=5022041;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:2:7:0:0:2:7:0:0
chr12	5022438	.	C	T	327.38	PASS	AF=1;AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112766;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.652;QD=54.5637;RBI=0.0112835;REFB=0;REVB=0.000393774;RO=0;SAF=14;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.48976e-05;OID=.;OPOS=5022438;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:24:0:0:24:24:1:10:14:0:0:10:14:0:0
chr12	5023713	.	T	C	692.71	PASS	AF=1;AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0173596;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.935;QD=62.9739;RBI=0.0885606;REFB=0;REVB=0.0868425;RO=0;SAF=23;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0003509;OID=.;OPOS=5023713;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:44:0:0:44:44:1:21:23:0:0:21:23:0:0
chr12	5023959	.	A	T	362.0	PASS	AF=1;AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0241011;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.9402;QD=55.6927;RBI=0.0252941;REFB=0;REVB=-0.00767649;RO=0;SAF=16;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.71087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000650957;OID=.;OPOS=5023959;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:26:0:0:26:26:1:10:16:0:0:10:16:0:0
chr12	5024206	.	C	T	152.37	PASS	AF=0.551724;AO=16;DP=29;FAO=16;FDP=29;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.0194357;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=238.259;QD=21.0168;RBI=0.0197395;REFB=-0.0324656;REVB=-0.00344969;RO=13;SAF=7;SAR=9;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0803505;STB=0.545398;STBP=0.634;TYPE=snp;VARB=0.0140394;OID=.;OPOS=5024206;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:13:13:16:16:0.551724:9:7:7:6:9:7:7:6
chr12	5025094	.	T	C	1417.27	PASS	AF=1;AO=88;DP=89;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00210096;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.175;QD=62.2974;RBI=0.051808;REFB=0;REVB=0.0517654;RO=0;SAF=70;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.14043e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.65909e-05;OID=.;OPOS=5025094;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:89:91:0:0:88:91:1:18:70:0:0:21:70:0:0
chr12	5027291	.	G	A	36.19	PASS	AF=0.109589;AO=8;DP=73;FAO=8;FDP=73;FR=.;FRO=65;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=20;FSRR=45;FWDB=-0.0140779;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.386;QD=1.98286;RBI=0.0268411;REFB=-0.00367542;REVB=-0.0228529;RO=65;SAF=3;SAR=5;SRF=20;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0886183;STB=0.565881;STBP=0.757;TYPE=snp;VARB=0.0291489;OID=.;OPOS=5027291;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:73:73:65:65:8:8:0.109589:5:3:20:45:5:3:20:45
chr12	5154462	.	T	C,G	455.31	PASS	AF=0.9375,0.0625;AO=30,2;DP=32;FAO=30,2;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=16,0;FSAR=14,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.027828,-0.0376639;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=81.5455,155.413;QD=56.9141;RBI=0.0305954,0.0377796;REFB=0,0;REVB=-0.0127154,0.00295384;RO=0;SAF=16,0;SAR=14,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-5.56309e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00136897,0.0672779;OID=.,.;OPOS=5154462,5154462;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:32:32:0:0:30,2:30,2:0.9375,0.0625:14,2:16,0:0:0:14,2:16,0:0:0
chr12	5603632	.	G	A	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00412459;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.666;QD=44.6898;RBI=0.0174296;REFB=0;REVB=0.0169345;RO=0;SAF=9;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000387824;OID=.;OPOS=5603632;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:4:9:0:0:4:9:0:0
chr12	6030302	.	T	C	140.31	PASS	AF=0.555556;AO=14;DP=27;FAO=15;FDP=27;FR=.,HEALED;FRO=12;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.0120597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.953;QD=20.7873;RBI=0.0425969;REFB=-0.0127662;REVB=0.0408541;RO=8;SAF=8;SAR=6;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.208803;STB=0.522358;STBP=0.83;TYPE=snp;VARB=0.0128899;OID=.;OPOS=6030302;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:8:12:14:15:0.555556:6:8:7:1:7:8:7:5
chr12	6030405	.	A	G	366.17	PASS	AF=0.590164;AO=36;DP=61;FAO=36;FDP=61;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=25;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=-0.000513376;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.7348;QD=24.011;RBI=0.029771;REFB=-0.0386216;REVB=-0.0297666;RO=25;SAF=11;SAR=25;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112081;STB=0.561762;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=0.0162151;OID=.;OPOS=6030405;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:25:25:36:36:0.590164:25:11:11:14:25:11:11:14
chr12	6030437	.	A	G	421.75	PASS	AF=0.625;AO=40;DP=64;FAO=40;FDP=64;FR=.;FRO=24;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.000370513;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.834;QD=26.3595;RBI=0.0137233;REFB=-0.0207507;REVB=-0.0137183;RO=24;SAF=15;SAR=25;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117911;STB=0.564483;STBP=0.19;TYPE=snp;VARB=0.0126122;OID=.;OPOS=6030437;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:24:24:40:40:0.625:25:15:13:11:25:15:13:11
chr12	6054395	.	A	G	885.03	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0401626;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.649;QD=58.0349;RBI=0.0401737;REFB=0;REVB=0.000944273;RO=0;SAF=22;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.01474e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000117277;OID=.;OPOS=6054395;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:39:22:0:0:39:22:0:0
chr12	6091000	.	A	G	1339.68	PASS	AF=1;AO=85;DP=85;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0547743;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.7191;QD=62.3109;RBI=0.0591984;REFB=0;REVB=0.0224552;RO=0;SAF=59;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000290307;OID=.;OPOS=6091000;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:86:0:0:85:86:1:26:59:0:0:27:59:0:0
chr12	6105387	.	G	A,C	660.5	PASS	AF=0.953488,0.0465116;AO=41,2;DP=43;FAO=41,2;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=25,0;FSAR=16,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0319036,-0.0370556;FXX=0.0227221;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=88.5858,125.775;QD=61.4415;RBI=0.0585589,0.0390097;REFB=0,0;REVB=-0.0491051,-0.0121919;RO=0;SAF=25,0;SAR=16,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.1719e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00597903,-0.0448453;OID=.,.;OPOS=6105387,6105387;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:43:43:0:0:41,2:41,2:0.953488,0.0465116:16,2:25,0:0:0:16,2:25,0:0:0
chr12	6127943	.	A	G	78.86	PASS	AF=0.229167;AO=11;DP=48;FAO=11;FDP=48;FR=.;FRO=37;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=22;FSRR=15;FWDB=-0.00852351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.976;QD=6.57167;RBI=0.00915496;REFB=0.00301942;REVB=-0.00334112;RO=37;SAF=5;SAR=6;SRF=22;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16896;STB=0.606553;STBP=0.473;TYPE=snp;VARB=-0.00823093;OID=.;OPOS=6127943;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:48:48:37:37:11:11:0.229167:6:5:22:15:6:5:22:15
chr12	6128443	.	T	C	120.35	PASS	AF=0.411765;AO=14;DP=34;FAO=14;FDP=34;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=-0.0260674;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.0471;QD=14.1591;RBI=0.0263539;REFB=-0.0109553;REVB=-0.00387587;RO=19;SAF=7;SAR=7;SRF=5;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.236955;STB=0.617488;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=0.0308673;OID=.;OPOS=6128443;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:19:20:14:14:0.411765:7:7:5:14:7:7:6:14
chr12	6143984	.	T	C	623.16	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000190088;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.114;QD=60.796;RBI=0.00126233;REFB=0;REVB=0.00124793;RO=0;SAF=26;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000145918;OID=.;OPOS=6143984;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:41:0:0:40:41:1:14:26:0:0:14:27:0:0
chr12	6167118	.	C	T	532.03	PASS	AF=0.590361;AO=49;DP=83;FAO=49;FDP=83;FR=.;FRO=34;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=-0.000628233;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.397;QD=25.6399;RBI=0.00255197;REFB=-0.0109517;REVB=0.00247343;RO=34;SAF=21;SAR=28;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0980621;STB=0.553611;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=0.00789489;OID=.;OPOS=6167118;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:34:34:49:49:0.590361:28:21:19:15:28:21:19:15
chr12	6167196	.	A	G	324.05	PASS	AF=0.622222;AO=28;DP=45;FAO=28;FDP=45;FR=.;FRO=17;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.0240189;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.359;QD=28.8047;RBI=0.0256165;REFB=-0.0218511;REVB=-0.00890483;RO=17;SAF=10;SAR=18;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123429;STB=0.568057;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=0.0133899;OID=.;OPOS=6167196;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:17:17:28:28:0.622222:18:10:9:8:18:10:9:8
chr12	6172202	.	T	C	237.27	PASS	AF=0.292035;AO=32;DP=112;FAO=33;FDP=113;FR=.;FRO=80;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=39;FSRR=41;FWDB=-0.0118209;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.35;QD=8.39903;RBI=0.0302988;REFB=-0.0136395;REVB=-0.0278977;RO=79;SAF=19;SAR=13;SRF=38;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136239;STB=0.58468;STBP=0.261;TYPE=snp;VARB=0.0384286;OID=.;OPOS=6172202;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:113:79:80:32:33:0.292035:13:19:38:41:13:20:39:41
chr12	6173433	.	C	T	578.84	PASS	AF=0.542056;AO=58;DP=107;FAO=58;FDP=107;FR=.;FRO=49;FSAF=37;FSAR=21;FSRF=17;FSRR=32;FWDB=-0.0035556;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.513;QD=21.6389;RBI=0.00425933;REFB=-0.00198599;REVB=-0.00234512;RO=49;SAF=37;SAR=21;SRF=17;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.243332;STB=0.633556;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.00147158;OID=.;OPOS=6173433;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:107:49:49:58:58:0.542056:21:37:17:32:21:37:17:32
chr12	6174414	.	T	G	432.29	PASS	AF=0.666667;AO=40;DP=60;FAO=40;FDP=60;FR=.;FRO=20;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.00360222;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.018;QD=28.8195;RBI=0.00489666;REFB=-0.0260487;REVB=0.00331682;RO=20;SAF=22;SAR=18;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0308306;STB=0.51677;STBP=0.716;TYPE=snp;VARB=0.0135964;OID=.;OPOS=6174414;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:20:20:40:40:0.666667:18:22:10:10:18:22:10:10
chr12	6174423	.	T	A	391.14	PASS	AF=0.649123;AO=37;DP=57;FAO=37;FDP=57;FR=.;FRO=20;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.0177309;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.656;QD=27.4483;RBI=0.02313;REFB=-0.0194691;REVB=-0.014853;RO=20;SAF=19;SAR=18;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0086908;STB=0.504741;STBP=0.952;TYPE=snp;VARB=0.0111508;OID=.;OPOS=6174423;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:20:20:37:37:0.649123:18:19:10:10:18:19:10:10
chr12	6204902	.	CA	C	190.25	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00162725;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.3331;QD=47.5615;RBI=0.0592286;REFB=0;REVB=-0.0592062;RO=0;SAF=7;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.00206119;OID=.;OPOS=6204903;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:16:16:16:16:0:7:9:0:0:4:0:7:9:0:0
chr12	6219682	.	G	A	252.78	PASS	AF=0.5;AO=24;DP=48;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.0105835;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=256.862;QD=21.0649;RBI=0.0250783;REFB=0.00206498;REVB=0.0227357;RO=24;SAF=12;SAR=12;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0370741;STB=0.520816;STBP=0.823;TYPE=snp;VARB=-0.00162075;OID=.;OPOS=6219682;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:24:24:24:24:0.5:12:12:13:11:12:12:13:11
chr12	6344600	.	C	A	270.46	PASS	AF=0.461538;AO=29;DP=65;FAO=30;FDP=65;FR=.;FRO=35;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=-0.0162684;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.771;QD=16.6436;RBI=0.0180301;REFB=0.00310332;REVB=-0.00777326;RO=36;SAF=18;SAR=11;SRF=14;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.226566;STB=0.607291;STBP=0.131;TYPE=snp;VARB=-0.00294175;OID=.;OPOS=6344600;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:36:35:29:30:0.461538:11:18:14:22:12:18:14:21
chr12	6421495	.	G	A	746.75	PASS	AF=0.642857;AO=63;DP=98;FAO=63;FDP=98;FR=.;FRO=35;FSAF=41;FSAR=22;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=-0.0305616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.897;QD=30.4794;RBI=0.0320402;REFB=-0.0116933;REVB=0.0096211;RO=35;SAF=41;SAR=22;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152802;STB=0.582911;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.00518037;OID=.;OPOS=6421495;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:35:35:63:63:0.642857:22:41:15:20:22:41:15:20
chr12	6427052	.	C	T	232.75	PASS	AF=0.428571;AO=27;DP=64;FAO=27;FDP=63;FR=.;FRO=36;FSAF=6;FSAR=21;FSRF=12;FSRR=24;FWDB=0.0145197;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.6706;QD=14.7778;RBI=0.0692216;REFB=-0.0226117;REVB=0.0676817;RO=36;SAF=6;SAR=21;SRF=12;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145495;STB=0.583267;STBP=0.337;TYPE=snp;VARB=0.0392986;OID=.;OPOS=6427052;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:63:36:36:27:27:0.428571:21:6:12:24:21:6:12:24
chr12	6428116	.	T	G	411.12	PASS	AF=0.57971;AO=40;DP=69;FAO=40;FDP=69;FR=.;FRO=29;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=0.00204735;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.621;QD=23.8329;RBI=0.0166066;REFB=0.00380553;REVB=0.0164799;RO=29;SAF=22;SAR=18;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.028081;STB=0.515411;STBP=0.806;TYPE=snp;VARB=-0.00243548;OID=.;OPOS=6428116;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:29:29:40:40:0.57971:18:22:17:12:18:22:17:12
chr12	6437389	.	T	C	538.12	PASS	AF=0.561798;AO=50;DP=89;FAO=50;FDP=89;FR=.;FRO=39;FSAF=29;FSAR=21;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=0.0129291;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.18;QD=24.1849;RBI=0.0175738;REFB=-0.0265003;REVB=-0.0119028;RO=39;SAF=29;SAR=21;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0545185;STB=0.52991;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.0177226;OID=.;OPOS=6437389;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:39:39:50:50:0.561798:21:29:20:19:21:29:20:19
chr12	6439470	.	A	G	638.84	PASS	AF=0.976744;AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0174031;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=278.279;QD=59.4269;RBI=0.0206328;REFB=-0.082663;REVB=0.0110836;RO=1;SAF=15;SAR=27;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0170712;STB=0.509087;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.000342355;OID=.;OPOS=6439470;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:43:43:1:1:42:42:0.976744:27:15:0:1:27:15:0:1
chr12	6442346	.	A	G	393.32	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0520161;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.4289;QD=56.1879;RBI=0.0555235;REFB=0;REVB=-0.019421;RO=0;SAF=10;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00176336;OID=.;OPOS=6442346;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:18:10:0:0:18:10:0:0
chr12	6457062	.	T	C	1073.25	PASS	AF=1;AO=71;DP=73;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0801067;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.5373;QD=59.6253;RBI=0.0844406;REFB=0;REVB=-0.0267046;RO=0;SAF=37;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.12261e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000628058;OID=.;OPOS=6457062;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:72:0:0:71:72:1:34:37:0:0:34:38:0:0
chr12	6483851	.	G	A	172.18	PASS	AF=0.653846;AO=17;DP=25;FAO=17;FDP=26;FR=.;FRO=9;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=-0.00356526;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=259.474;QD=26.4898;RBI=0.0037269;REFB=-0.0143454;REVB=-0.00108569;RO=8;SAF=11;SAR=6;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0664305;STB=0.507454;STBP=0.967;TYPE=snp;VARB=0.00671213;OID=.;OPOS=6483851;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:25:26:8:9:17:17:0.653846:6:11:6:2:6:11:6:3
chr12	6484708	.	CT	C,CC,CG	727.16	PASS	AF=0.0212766,0.957447,0.0212766;AO=16,29,2;DP=47;FAO=1,45,1;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=1,27,1;FSAR=0,18,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0856649,0.0791835,0.0912669;FXX=0;HRUN=1,1,1;LEN=1,1,1;MLLD=100.715,122.668,81.7281;QD=61.8856;RBI=0.0911805,0.0808508,0.0935614;REFB=0,0,0;REVB=0.0312315,0.0163348,0.0205932;RO=0;SAF=16,11,2;SAR=0,18,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,snp,snp;VARB=-0.128814,0.0113167,-0.0937395;OID=.,.,.;OPOS=6484709,6484709,6484709;OREF=T,T,T;OALT=-,C,G;OMAPALT=C,CC,CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	2/3:0.0212766,0.957447,0.0212766:16,29,2:47:1,45,1:47:0:1,27,1:0,18,0:0:0:5:0:16,11,2:0,18,0:0:0
chr12	6495275	.	C	A	698.99	PASS	AF=0.980392;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0488402;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.148;QD=54.8226;RBI=0.0579234;REFB=0.00190607;REVB=0.0311408;RO=0;SAF=22;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.15703e-08;STB=0.508768;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.000190352;OID=.;OPOS=6495275;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:51:51:0:1:50:50:0.980392:28:22:0:0:28:22:0:1
chr12	6500105	.	T	G	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0408544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.31;QD=35.5759;RBI=0.052289;REFB=0;REVB=0.0326352;RO=0;SAF=1;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00216912;OID=.;OPOS=6500105;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:6:1:0:0:6:1:0:0
chr12	6560473	.	A	G	411.12	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00399437;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.516;QD=56.7066;RBI=0.015319;REFB=0;REVB=0.0147891;RO=0;SAF=11;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.26692e-05;OID=.;OPOS=6560473;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:18:11:0:0:18:11:0:0
chr12	6562285	.	C	T	387.74	PASS	AF=0.666667;AO=36;DP=54;FAO=36;FDP=54;FR=.;FRO=18;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=4;FWDB=-0.00668406;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.713;QD=28.7218;RBI=0.00975483;REFB=-0.026094;REVB=0.00710493;RO=17;SAF=24;SAR=12;SRF=14;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108474;STB=0.542834;STBP=0.409;TYPE=snp;VARB=0.013365;OID=.;OPOS=6562285;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:17:18:36:36:0.666667:12:24:14:3:12:24:14:4
chr12	6562293	.	C	T	344.9	PASS	AF=0.634615;AO=33;DP=54;FAO=33;FDP=52;FR=.;FRO=19;FSAF=23;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=4;FWDB=-0.000180357;FXX=0.0370302;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.166;QD=26.5308;RBI=0.00733931;REFB=-0.0538639;REVB=-0.00733709;RO=17;SAF=23;SAR=10;SRF=13;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0510825;STB=0.541286;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.0193288;OID=.;OPOS=6562293;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:52:17:19:33:33:0.634615:10:23:13:4:10:23:15:4
chr12	6562753	.	A	G	196.71	PASS	AF=0.465116;AO=20;DP=43;FAO=20;FDP=43;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=0.00363403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.8772;QD=18.2984;RBI=0.0206864;REFB=-0.0184176;REVB=0.0203647;RO=23;SAF=8;SAR=12;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0961387;STB=0.554403;STBP=0.559;TYPE=snp;VARB=0.0140481;OID=.;OPOS=6562753;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:23:23:20:20:0.465116:12:8:7:16:12:8:7:16
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chr12	6562823	.	C	T	62.69	PASS	AF=0.290323;AO=9;DP=31;FAO=9;FDP=31;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=16;FWDB=0.00957359;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.589;QD=8.08963;RBI=0.012868;REFB=-0.00165071;REVB=0.00859832;RO=22;SAF=5;SAR=4;SRF=6;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.319852;STB=0.694061;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.00834433;OID=.;OPOS=6562823;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:31:31:22:22:9:9:0.290323:4:5:6:16:4:5:6:16
chr12	6562836	.	G	A	56.85	PASS	AF=0.363636;AO=8;DP=23;FAO=8;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=0.000648397;FXX=0.0434594;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.725;QD=10.3368;RBI=0.0594566;REFB=-0.00299379;REVB=0.059453;RO=14;SAF=4;SAR=4;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.226511;STB=0.636048;STBP=0.336;TYPE=snp;VARB=0.0044509;OID=.;OPOS=6562836;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:23:22:14:14:8:8:0.363636:4:4:4:10:4:4:4:10
chr12	6572048	.	A	G	130.62	PASS	AF=0.394737;AO=15;DP=38;FAO=15;FDP=38;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=-0.0141308;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.3417;QD=13.7498;RBI=0.0620641;REFB=-0.00346484;REVB=-0.060434;RO=22;SAF=8;SAR=7;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0594022;STB=0.546039;STBP=0.672;TYPE=snp;VARB=0.0037019;OID=.;OPOS=6572048;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:22:23:15:15:0.394737:7:8:13:9:7:8:14:9
chr12	6573146	.	T	C	470.19	PASS	AF=0.611111;AO=44;DP=72;FAO=44;FDP=72;FR=.;FRO=28;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=-0.0361566;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.4171;QD=26.1215;RBI=0.0862513;REFB=-0.0167958;REVB=-0.078307;RO=27;SAF=19;SAR=25;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00895057;STB=0.512815;STBP=0.795;TYPE=snp;VARB=0.0163918;OID=.;OPOS=6573146;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:27:28:44:44:0.611111:25:19:12:15:25:19:13:15
chr12	6575044	.	G	T	221.57	PASS	AF=0.458333;AO=22;DP=48;FAO=22;FDP=48;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.0413317;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.9702;QD=18.464;RBI=0.0444854;REFB=-0.00210535;REVB=0.0164512;RO=26;SAF=13;SAR=9;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124296;STB=0.570546;STBP=0.382;TYPE=snp;VARB=0.00304558;OID=.;OPOS=6575044;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:26:26:22:22:0.458333:9:13:12:14:9:13:12:14
chr12	6619284	.	C	G	218.51	PASS	AF=0.446429;AO=26;DP=57;FAO=25;FDP=56;FR=.;FRO=31;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=0.0394573;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.943;QD=15.6078;RBI=0.0517387;REFB=-0.0116612;REVB=-0.0334666;RO=30;SAF=14;SAR=12;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0995669;STB=0.577463;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.0154027;OID=.;OPOS=6619284;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:56:30:31:26:25:0.446429:12:14:13:17:11:14:13:18
chr12	6631169	.	C	A	160.11	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0524731;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.544;QD=45.7446;RBI=0.133692;REFB=0;REVB=-0.122964;RO=0;SAF=5;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00236816;OID=.;OPOS=6631169;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:14:0:0:13:14:1:8:5:0:0:8:6:0:0
chr12	6637845	.	T	C	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0165818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.363;QD=51.9166;RBI=0.0166943;REFB=0;REVB=0.00193454;RO=0;SAF=10;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000106528;OID=.;OPOS=6637845;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:11:10:0:0:11:10:0:0
chr12	6638116	.	C	T	135.07	PASS	AF=0.46875;AO=15;DP=32;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=4;FWDB=0.000540037;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.193;QD=16.8839;RBI=0.00853977;REFB=0.000411598;REVB=0.00852268;RO=17;SAF=8;SAR=7;SRF=13;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.220733;STB=0.625378;STBP=0.251;TYPE=snp;VARB=-0.000389806;OID=.;OPOS=6638116;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:17:17:15:15:0.46875:7:8:13:4:7:8:13:4
chr12	6639088	.	A	G	1070.41	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0377933;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.2259;QD=59.4673;RBI=0.0463051;REFB=0;REVB=0.026755;RO=0;SAF=44;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000216073;OID=.;OPOS=6639088;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:72:0:0:69:72:1:25:44:0:0:26:46:0:0
chr12	6639981	.	C	G	166.07	PASS	AF=0.566667;AO=17;DP=30;FAO=17;FDP=30;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.00930773;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.8741;QD=22.1422;RBI=0.0222445;REFB=0.00264389;REVB=-0.0202036;RO=13;SAF=8;SAR=9;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111111;STB=0.562427;STBP=0.481;TYPE=snp;VARB=-0.00304151;OID=.;OPOS=6639981;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:13:13:17:17:0.566667:9:8:8:5:9:8:8:5
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chr12	6646320	.	T	C	234.84	PASS	AF=0.55;AO=22;DP=41;FAO=22;FDP=40;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=13;FWDB=-0.00586486;FXX=0.0476077;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.059;QD=23.4843;RBI=0.00789532;REFB=-0.00908478;REVB=0.00528578;RO=18;SAF=11;SAR=11;SRF=5;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17956;STB=0.599913;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=0.00277795;OID=.;OPOS=6646320;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:40:18:18:22:22:0.55:11:11:5:13:11:11:5:13
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chr12	6747295	.	G	A	358.13	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00507496;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.7382;QD=55.0974;RBI=0.0508586;REFB=0;REVB=-0.0506047;RO=0;SAF=18;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.28381e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000408905;OID=.;OPOS=6747295;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:8:18:0:0:8:18:0:0
chr12	6835068	.	A	G	574.47	PASS	AF=0.95122;AO=40;DP=41;FAO=39;FDP=41;FR=.;FRO=2;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.107581;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.3346;QD=56.0457;RBI=0.107938;REFB=-0.0883926;REVB=-0.00876187;RO=0;SAF=20;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.524987;STBP=0.238;TYPE=snp;VARB=0.00216119;OID=.;OPOS=6835068;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:41:41:0:2:40:39:0.95122:20:20:0:0:20:19:2:0
chr12	6835081	.	G	A	501.63	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0297546;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=155.36;QD=59.0151;RBI=0.0356147;REFB=0;REVB=0.0195722;RO=0;SAF=18;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.328e-05;OID=.;OPOS=6835081;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:16:18:0:0:16:18:0:0
chr12	6836852	.	A	G	446.98	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0932385;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.984;QD=57.6752;RBI=0.097894;REFB=0;REVB=-0.0298299;RO=0;SAF=14;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00132141;OID=.;OPOS=6836852;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:17:14:0:0:17:14:0:0
chr12	6836913	.	G	T	344.86	PASS	AF=1;AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00880734;FXX=0.0384468;HRUN=2;LEN=1;MLLD=242.641;QD=55.1768;RBI=0.00950665;REFB=0;REVB=0.00357871;RO=0;SAF=9;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00021651;OID=.;OPOS=6836913;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:25:0:0:25:25:1:16:9:0:0:16:9:0:0
chr12	6840209	.	G	A	295.84	PASS	AF=0.958333;AO=23;DP=24;FAO=23;FDP=24;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.026807;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.3956;QD=49.3072;RBI=0.0749944;REFB=-0.0443191;REVB=-0.0700396;RO=1;SAF=7;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0615783;STB=0.533304;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=0.018123;OID=.;OPOS=6840209;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:24:24:1:1:23:23:0.958333:16:7:1:0:16:7:1:0
chr12	6887020	.	T	C	1227.0	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0153253;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.375;QD=61.3498;RBI=0.0532069;REFB=0;REVB=0.050952;RO=0;SAF=44;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.37809e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.60462e-05;OID=.;OPOS=6887020;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:79:80:0:0:79:80:1:35:44:0:0:36:44:0:0
chr12	6926363	.	T	C	626.48	PASS	AF=1;AO=36;DP=52;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.121283;FXX=0.0192271;HRUN=3;LEN=1;MLLD=105.433;QD=49.1353;RBI=0.121288;REFB=0;REVB=0.00111012;RO=0;SAF=2;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00364436;OID=.;OPOS=6926363;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:52:51:0:0:36:51:1:34:2:0:0:34:17:0:0
chr12	6928075	.	T	C	320.99	PASS	AF=0.925926;AO=24;DP=24;FAO=25;FDP=27;FR=.;FRO=2;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.000809174;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.88;QD=47.5539;RBI=0.0429119;REFB=-0.117977;REVB=0.0429042;RO=0;SAF=8;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.515139;STBP=0.599;TYPE=snp;VARB=0.00772726;OID=.;OPOS=6928075;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:24:27:0:2:24:25:0.925926:16:8:0:0:17:8:1:1
chr12	6928569	.	T	A	577.45	PASS	AF=0.604651;AO=52;DP=86;FAO=52;FDP=86;FR=.;FRO=34;FSAF=28;FSAR=24;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=0.0189099;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.192;QD=26.8583;RBI=0.0226173;REFB=-0.0209211;REVB=-0.0124079;RO=34;SAF=28;SAR=24;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0705238;STB=0.538447;STBP=0.403;TYPE=snp;VARB=0.0161666;OID=.;OPOS=6928569;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:34:34:52:52:0.604651:24:28:15:19:24:28:15:19
chr12	6928586	.	CA	AG	754.91	PASS	AF=0.882353;AO=58;DP=68;FAO=60;FDP=68;FR=.;FRO=8;FSAF=25;FSAR=35;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0467756;FXX=0;HRUN=4;LEN=2;MLLD=42.1292;QD=44.4066;RBI=0.0561372;REFB=-0.196053;REVB=-0.0310392;RO=8;SAF=23;SAR=35;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0536258;STB=0.510047;STBP=0.629;TYPE=mnp;VARB=0.0335991;OID=.;OPOS=6928586;OREF=CA;OALT=AG;OMAPALT=AG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:32:68:68:8:8:58:60:0.882353:35:23:5:3:35:25:4:4
chr12	6932967	.	G	C	116.21	PASS	AF=0.565217;AO=13;DP=23;FAO=13;FDP=23;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.0126501;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.337;QD=20.2096;RBI=0.0126704;REFB=-0.00846523;REVB=0.000717068;RO=9;SAF=7;SAR=6;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0677349;STB=0.559908;STBP=0.552;TYPE=snp;VARB=0.00424761;OID=.;OPOS=6932967;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:23:23:9:10:13:13:0.565217:6:7:4:5:6:7:4:6
chr12	6933223	.	C	T	178.89	PASS	AF=0.4;AO=21;DP=51;FAO=20;FDP=50;FR=.;FRO=30;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=-0.0131778;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.944;QD=14.3111;RBI=0.0186587;REFB=-0.0269508;REVB=0.0132096;RO=28;SAF=14;SAR=7;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0650706;STB=0.567497;STBP=0.471;TYPE=snp;VARB=0.0387611;OID=.;OPOS=6933223;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:50:28:30:21:20:0.4:7:14:17:11:6:14:18:12
chr12	6933787	.	A	G	44.24	PASS	AF=0.411765;AO=6;DP=16;FAO=7;FDP=17;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=1;FWDB=-0.00423428;FXX=0.0555247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.45;QD=10.4096;RBI=0.0125434;REFB=0.00162573;REVB=-0.0118071;RO=10;SAF=4;SAR=2;SRF=9;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.309981;STB=0.708624;STBP=0.25;TYPE=snp;VARB=0.00254499;OID=.;OPOS=6933787;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:16:17:10:10:6:7:0.411765:2:4:9:1:3:4:9:1
chr12	6939850	.	A	G	102.68	PASS	AF=0.295455;AO=13;DP=44;FAO=13;FDP=44;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=-0.0953293;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=95.8996;QD=9.33425;RBI=0.095492;REFB=0.00334241;REVB=0.00557251;RO=31;SAF=9;SAR=4;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102272;STB=0.562401;STBP=0.642;TYPE=snp;VARB=-0.00916552;OID=.;OPOS=6939850;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:31:31:13:13:0.295455:4:9:19:12:4:9:19:12
chr12	6942823	.	A	G	711.57	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0627275;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.345;QD=63.2508;RBI=0.0629369;REFB=0;REVB=-0.00512975;RO=0;SAF=26;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.15971e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000218373;OID=.;OPOS=6942823;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:19:26:0:0:19:26:0:0
chr12	7053040	.	C	T	123.08	PASS	AF=0.466667;AO=14;DP=30;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=2;FWDB=-0.0706947;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=54.1863;QD=16.4111;RBI=0.0846531;REFB=-0.0331241;REVB=-0.0465662;RO=16;SAF=10;SAR=4;SRF=14;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.203882;STB=0.615242;STBP=0.384;TYPE=snp;VARB=0.0371388;OID=.;OPOS=7053040;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:16:16:14:14:0.466667:4:10:14:2:4:10:14:2
chr12	7055860	.	T	C	322.89	PASS	AF=0.507463;AO=34;DP=67;FAO=34;FDP=67;FR=.;FRO=33;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=-0.0138401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.049;QD=19.2769;RBI=0.0224026;REFB=-0.0133168;REVB=-0.0176161;RO=32;SAF=14;SAR=20;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158712;STB=0.580938;STBP=0.198;TYPE=snp;VARB=0.0122977;OID=.;OPOS=7055860;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:32:33:34:34:0.507463:20:14:19:13:20:14:19:14
chr12	7065635	.	T	C	487.08	PASS	AF=1;AO=33;DP=34;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0432189;FXX=0.0294031;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.204;QD=59.0398;RBI=0.0488916;REFB=0;REVB=0.0228585;RO=0;SAF=21;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.54342e-05;OID=.;OPOS=7065635;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:33:0:0:33:33:1:12:21:0:0:12:21:0:0
chr12	7079215	.	T	G	594.53	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00519886;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.631;QD=60.9769;RBI=0.0149449;REFB=0;REVB=-0.0140114;RO=0;SAF=9;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.68708e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.35266e-05;OID=.;OPOS=7079215;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:30:9:0:0:30:9:0:0
chr12	7080212	.	T	C	222.68	PASS	AF=1;AO=17;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.025554;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=106.443;QD=49.4832;RBI=0.0514161;REFB=0;REVB=0.0446163;RO=0;SAF=7;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000220973;OID=.;OPOS=7080212;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:17:18:1:10:7:0:0:11:7:0:0
chr12	7090742	.	G	A	169.17	PASS	AF=0.375;AO=21;DP=56;FAO=21;FDP=56;FR=.;FRO=35;FSAF=19;FSAR=2;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=-0.00584392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.091;QD=12.0836;RBI=0.040634;REFB=-0.0165851;REVB=-0.0402116;RO=35;SAF=19;SAR=2;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.552979;STB=0.829504;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0279132;OID=.;OPOS=7090742;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:35:35:21:21:0.375:2:19:18:17:2:19:18:17
chr12	7241055	.	A	G	454.83	PASS	AF=0.494505;AO=45;DP=91;FAO=45;FDP=91;FR=.;FRO=46;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=19;FSRR=27;FWDB=0.0032358;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.281;QD=19.9923;RBI=0.0236037;REFB=-0.00854529;REVB=-0.0233808;RO=46;SAF=23;SAR=22;SRF=19;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0892409;STB=0.549466;STBP=0.369;TYPE=snp;VARB=0.00885532;OID=.;OPOS=7241055;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:46:46:45:45:0.494505:22:23:19:27:22:23:19:27
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chr12	7244962	.	T	G	229.51	PASS	AF=0.415385;AO=27;DP=65;FAO=27;FDP=65;FR=.;FRO=38;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=15;FSRR=23;FWDB=0.0134538;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.5899;QD=14.1239;RBI=0.0137778;REFB=-0.0246114;REVB=-0.0029703;RO=38;SAF=8;SAR=19;SRF=15;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114161;STB=0.56528;STBP=0.413;TYPE=snp;VARB=0.0440333;OID=.;OPOS=7244962;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:38:38:27:27:0.415385:19:8:15:23:19:8:15:23
chr12	7249598	.	T	C	287.29	PASS	AF=0.508197;AO=30;DP=60;FAO=31;FDP=61;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=0.0107187;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.649;QD=18.8385;RBI=0.0156575;REFB=-0.0155518;REVB=-0.0114135;RO=29;SAF=12;SAR=18;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0190724;STB=0.506662;STBP=0.955;TYPE=snp;VARB=0.0128529;OID=.;OPOS=7249598;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:61:29:30:30:31:0.508197:18:12:11:18:19:12:12:18
chr12	7277236	.	T	A	214.26	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.036496;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.279;QD=47.6134;RBI=0.0367108;REFB=0;REVB=-0.00396599;RO=0;SAF=4;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00173213;OID=.;OPOS=7277236;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:18:0:0:17:18:1:13:4:0:0:14:4:0:0
chr12	7309199	.	G	A	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00958363;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=108.149;QD=50.4121;RBI=0.0210613;REFB=0;REVB=0.0187545;RO=0;SAF=14;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000105685;OID=.;OPOS=7309199;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:5:14:0:0:5:14:0:0
chr12	7309471	.	C	A	689.38	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0409821;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=138.267;QD=62.6709;RBI=0.0427043;REFB=0;REVB=0.0120055;RO=0;SAF=25;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000207629;OID=.;OPOS=7309471;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:19:25:0:0:19:25:0:0
chr12	7309473	.	G	C	708.56	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0124891;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.693;QD=62.9828;RBI=0.0196205;REFB=0;REVB=0.0151323;RO=0;SAF=27;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000110776;OID=.;OPOS=7309473;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:18:27:0:0:18:27:0:0
chr12	7463241	.	A	T	353.81	PASS	AF=0.37069;AO=43;DP=117;FAO=43;FDP=116;FR=.;FRO=73;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=38;FSRR=35;FWDB=0.00439211;FXX=0.00854628;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.517;QD=12.2003;RBI=0.00555809;REFB=-0.0117447;REVB=-0.00340613;RO=73;SAF=18;SAR=25;SRF=38;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112971;STB=0.564486;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.0153852;OID=.;OPOS=7463241;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:117:116:73:73:43:43:0.37069:25:18:38:35:25:18:38:35
chr12	7551022	.	A	T	601.15	PASS	AF=0.97561;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.016476;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=293.93;QD=58.6486;RBI=0.0178897;REFB=-0.0307709;REVB=0.00696995;RO=1;SAF=22;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0208425;STB=0.511106;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00131167;OID=.;OPOS=7551022;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:41:41:1:1:40:40:0.97561:18:22:1:0:18:22:1:0
chr12	7551050	.	A	C	741.07	PASS	AF=1;AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00127452;FXX=0.0188644;HRUN=3;LEN=1;MLLD=317.008;QD=57.0051;RBI=0.0239036;REFB=0;REVB=0.0238696;RO=0;SAF=30;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.01942e-05;OID=.;OPOS=7551050;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:52:0:0:52:52:1:22:30:0:0:22:30:0:0
chr12	7585971	.	A	G	1116.73	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0322655;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.305;QD=60.3638;RBI=0.0739195;REFB=0;REVB=0.0665058;RO=0;SAF=45;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.1195e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000319906;OID=.;OPOS=7585971;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:74:0:0:73:74:1:28:45:0:0:28:46:0:0
chr12	7649484	.	T	C	805.08	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00364729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.0122;QD=64.4061;RBI=0.040557;REFB=0;REVB=0.0403926;RO=0;SAF=27;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000376888;OID=.;OPOS=7649484;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:23:27:0:0:23:27:0:0
chr12	7649653	.	T	C	726.83	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0879875;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=287.187;QD=63.2025;RBI=0.0880577;REFB=0;REVB=0.00351476;RO=0;SAF=20;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.74577e-05;OID=.;OPOS=7649653;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:46:0:0:42:46:1:22:20:0:0:23:23:0:0
chr12	7655137	.	A	G	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0664722;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.0976;QD=55.6557;RBI=0.0703977;REFB=0;REVB=-0.0231793;RO=0;SAF=10;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00204905;OID=.;OPOS=7655137;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:17:10:0:0:17:10:0:0
chr12	7655278	.	T	A	954.72	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0379291;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.667;QD=58.7517;RBI=0.0445241;REFB=0;REVB=-0.023319;RO=0;SAF=35;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000605824;OID=.;OPOS=7655278;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:30:35:0:0:30:35:0:0
chr12	7779227	.	A	G	767.16	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.120954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.395;QD=63.9298;RBI=0.120955;REFB=0;REVB=-0.00063924;RO=0;SAF=14;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000524014;OID=.;OPOS=7779227;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:48:0:0:47:48:1:33:14:0:0:33:15:0:0
chr12	7805236	.	C	G	176.15	PASS	AF=0.529412;AO=18;DP=34;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.0114611;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.3382;QD=20.7239;RBI=0.0270126;REFB=-0.044889;REVB=-0.0244606;RO=16;SAF=12;SAR=6;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147069;STB=0.583238;STBP=0.346;TYPE=snp;VARB=0.0378072;OID=.;OPOS=7805236;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:16:16:18:18:0.529412:6:12:8:8:6:12:8:8
chr12	7867847	.	G	C	315.89	PASS	AF=0.465753;AO=33;DP=73;FAO=34;FDP=73;FR=.;FRO=39;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=24;FSRR=15;FWDB=6.8802e-05;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.196;QD=17.3088;RBI=0.00330439;REFB=-0.00841174;REVB=0.00330367;RO=36;SAF=20;SAR=13;SRF=23;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0323187;STB=0.501278;STBP=0.99;TYPE=snp;VARB=0.007421;OID=.;OPOS=7867847;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:36:39:33:34:0.465753:13:20:23:13:13:21:24:15
chr12	7966958	.	C	T	180.53	PASS	AF=0.307692;AO=24;DP=78;FAO=24;FDP=78;FR=.;FRO=54;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=30;FSRR=24;FWDB=-0.00747325;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=237.963;QD=9.2579;RBI=0.0106646;REFB=-0.00133216;REVB=0.00760817;RO=54;SAF=14;SAR=10;SRF=30;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0332416;STB=0.519634;STBP=0.831;TYPE=snp;VARB=0.00309041;OID=.;OPOS=7966958;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:54:54:24:24:0.307692:10:14:30:24:10:14:30:24
chr12	7967071	.	G	A	291.1	PASS	AF=0.586957;AO=25;DP=44;FAO=27;FDP=46;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.0289735;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.0962;QD=25.3127;RBI=0.0290171;REFB=-0.0241152;REVB=0.00158891;RO=19;SAF=10;SAR=15;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0998414;STB=0.566616;STBP=0.26;TYPE=snp;VARB=0.0504725;OID=.;OPOS=7967071;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:46:19:19:25:27:0.586957:15:10:10:9:17:10:10:9
chr12	8037075	.	C	A	63.35	PASS	AF=0.310345;AO=9;DP=28;FAO=9;FDP=29;FR=.;FRO=20;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=-0.0740265;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.8216;QD=8.73805;RBI=0.11954;REFB=-0.00148242;REVB=-0.0938613;RO=19;SAF=3;SAR=6;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162054;STB=0.585171;STBP=0.643;TYPE=snp;VARB=-0.00853227;OID=.;OPOS=8037075;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:28:29:19:20:9:9:0.310345:6:3:9:10:6:3:9:11
chr12	8043688	.	G	C	756.85	PASS	AF=0.981818;AO=54;DP=56;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0229556;FXX=0.017854;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.08;QD=55.0439;RBI=0.0248114;REFB=0.0260933;REVB=0.00941533;RO=0;SAF=24;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5102;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=-3.56353e-05;OID=.;OPOS=8043688;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:56:55:0:1:54:54:0.981818:30:24:0:0:30:24:1:0
chr12	8249050	.	C	G	346.22	PASS	AF=0.507042;AO=36;DP=71;FAO=36;FDP=71;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=0.10185;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.2706;QD=19.5053;RBI=0.102569;REFB=-0.0345926;REVB=0.0121217;RO=34;SAF=13;SAR=23;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10034;STB=0.56415;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=0.0332981;OID=.;OPOS=8249050;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:34:35:36:36:0.507042:23:13:16:18:23:13:17:18
chr12	8278181	.	A	T	139.52	PASS	AF=0.355556;AO=16;DP=45;FAO=16;FDP=45;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=0.00186762;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.9725;QD=12.4019;RBI=0.00948581;REFB=-0.0319358;REVB=-0.00930014;RO=29;SAF=6;SAR=10;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194375;STB=0.614381;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=0.032453;OID=.;OPOS=8278181;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:29:29:16:16:0.355556:10:6:16:13:10:6:16:13
chr12	8374770	.	G	A	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0164577;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.256;QD=40.7628;RBI=0.041303;REFB=0;REVB=0.0378824;RO=0;SAF=5;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0010442;OID=.;OPOS=8374770;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:5:5:0:0:5:5:0:0
chr12	8374781	.	C	CACG	41.14	PASS	AF=0.6;AO=6;DP=10;FAO=6;FDP=10;FR=.;FRO=4;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.0379095;FXX=0;HRUN=0;LEN=3;MLLD=255.609;QD=16.4544;RBI=0.0501741;REFB=-0.0212211;REVB=-0.0328682;RO=4;SAF=1;SAR=5;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.559127;STB=0.832219;STBP=0.025;TYPE=ins;VARB=0.00227526;OID=.;OPOS=8374782;OREF=-;OALT=ACG;OMAPALT=CACG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.6:6:10:6:10:4:1:5:4:0:22:4:1:5:4:0
chr12	8374813	.	G	T	33.48	PASS	AF=0.714286;AO=5;DP=7;FAO=5;FDP=7;FR=.;FRO=2;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0115187;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=244.228;QD=19.1341;RBI=0.0368018;REFB=-0.00687539;REVB=0.0349527;RO=2;SAF=1;SAR=4;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.413629;STB=0.748924;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.00538577;OID=.;OPOS=8374813;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:7:7:2:2:5:5:0.714286:4:1:2:0:4:1:2:0
chr12	8376110	.	T	C	612.58	PASS	AF=1;AO=38;DP=39;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0300412;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=302.302;QD=61.2582;RBI=0.042952;REFB=0;REVB=0.0306986;RO=0;SAF=17;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.53998e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.21976e-05;OID=.;OPOS=8376110;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:40:0:0:38:40:1:21:17:0:0:23:17:0:0
chr12	8637403	.	G	T	778.69	PASS	AF=0.496894;AO=78;DP=160;FAO=80;FDP=161;FR=.;FRO=81;FSAF=37;FSAR=43;FSRF=34;FSRR=47;FWDB=-0.00994645;FXX=0.00617246;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.143;QD=19.3463;RBI=0.0188992;REFB=-0.0271154;REVB=0.0160701;RO=80;SAF=37;SAR=41;SRF=33;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0571876;STB=0.521693;STBP=0.616;TYPE=snp;VARB=0.0268181;OID=.;OPOS=8637403;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:160:161:80:81:78:80:0.496894:41:37:33:47:43:37:34:47
chr12	8693333	.	G	A	175.15	PASS	AF=0.514286;AO=18;DP=35;FAO=18;FDP=35;FR=.;FRO=17;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.00532908;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.6615;QD=20.0168;RBI=0.097036;REFB=0.0206663;REVB=0.0968895;RO=17;SAF=13;SAR=5;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132909;STB=0.575558;STBP=0.407;TYPE=snp;VARB=-0.00945898;OID=.;OPOS=8693333;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:17:17:18:18:0.514286:5:13:10:7:5:13:10:7
chr12	8808006	.	T	C	141.22	PASS	AF=0.535714;AO=15;DP=28;FAO=15;FDP=28;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.061813;FXX=0.0344709;HRUN=3;LEN=1;MLLD=172.962;QD=20.1741;RBI=0.0623998;REFB=0.00417097;REVB=-0.00853784;RO=13;SAF=5;SAR=10;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.046223;STB=0.52628;STBP=0.793;TYPE=snp;VARB=-0.00466859;OID=.;OPOS=8808006;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:28:13:13:15:15:0.535714:10:5:5:8:10:5:5:8
chr12	8926011	.	T	C	2107.01	PASS	AF=0.992647;AO=133;DP=135;FAO=135;FDP=136;FR=.;FRO=1;FSAF=57;FSAR=78;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00848078;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.852;QD=61.971;RBI=0.0439502;REFB=0.0284787;REVB=0.0431242;RO=1;SAF=57;SAR=76;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00826592;STB=0.504347;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=-3.70541e-05;OID=.;OPOS=8926011;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:135:136:1:1:133:135:0.992647:76:57:1:0:78:57:1:0
chr12	9004512	.	G	A	729.0	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.016624;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.993;QD=57.1764;RBI=0.0173785;REFB=0;REVB=0.00506492;RO=0;SAF=23;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.97956e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.36223e-05;OID=.;OPOS=9004512;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:28:23:0:0:28:23:0:0
chr12	9004892	.	C	A	613.36	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000833568;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.136;QD=61.3359;RBI=0.0259435;REFB=0;REVB=0.0259301;RO=0;SAF=13;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.45248e-05;OID=.;OPOS=9004892;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:27:13:0:0:27:13:0:0
chr12	9013755	.	C	T	519.18	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0328763;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.1883;QD=57.6868;RBI=0.0333386;REFB=0;REVB=-0.00553283;RO=0;SAF=5;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00457849;OID=.;OPOS=9013755;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:36:0:0:34:36:1:29:5:0:0:29:7:0:0
chr12	9016573	.	A	G	785.84	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00697898;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.947;QD=64.1503;RBI=0.0220724;REFB=0;REVB=-0.02094;RO=0;SAF=26;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.97683e-05;OID=.;OPOS=9016573;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:23:26:0:0:23:26:0:0
chr12	9020489	.	A	G	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0377975;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.324;QD=45.8068;RBI=0.088103;REFB=0;REVB=0.0795832;RO=0;SAF=9;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00106814;OID=.;OPOS=9020489;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:5:9:0:0:5:9:0:0
chr12	9020912	.	A	G	182.82	PASS	AF=0.941176;AO=16;DP=17;FAO=16;FDP=17;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0271919;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.412;QD=43.016;RBI=0.0282459;REFB=-0.0880058;REVB=-0.00764396;RO=1;SAF=7;SAR=9;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0481057;STB=0.526283;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.00548431;OID=.;OPOS=9020912;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:17:17:1:1:16:16:0.941176:9:7:0:1:9:7:0:1
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chr12	9074259	.	C	T	140.17	PASS	AF=0.555556;AO=15;DP=27;FAO=15;FDP=27;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=1;FWDB=0.0297321;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=156.012;QD=20.7652;RBI=0.0300385;REFB=-0.0170386;REVB=-0.00427924;RO=12;SAF=7;SAR=8;SRF=11;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.350619;STB=0.695425;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.0183036;OID=.;OPOS=9074259;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:27:27:12:12:15:15:0.555556:8:7:11:1:8:7:11:1
chr12	9248233	.	T	C	1677.04	PASS	AF=1;AO=110;DP=111;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.018838;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.248;QD=60.434;RBI=0.0245711;REFB=0;REVB=0.0157757;RO=0;SAF=57;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.67364e-06;OID=.;OPOS=9248233;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:111:111:0:0:110:111:1:53:57:0:0:53:58:0:0
chr12	9251297	.	C	T	569.84	PASS	AF=0.53;AO=53;DP=99;FAO=53;FDP=100;FR=.;FRO=47;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=19;FSRR=28;FWDB=0.00386359;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.595;QD=22.7937;RBI=0.00983163;REFB=-0.0256276;REVB=-0.00904066;RO=45;SAF=26;SAR=27;SRF=18;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0758601;STB=0.540627;STBP=0.416;TYPE=snp;VARB=0.0203544;OID=.;OPOS=9251297;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:100:45:47:53:53:0.53:27:26:18:27:27:26:19:28
chr12	9305473	.	T	C	1634.81	PASS	AF=0.973684;AO=111;DP=114;FAO=111;FDP=114;FR=.;FRO=3;FSAF=63;FSAR=48;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.00631942;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=305.528;QD=57.3617;RBI=0.013988;REFB=-0.0228881;REVB=0.0124791;RO=2;SAF=63;SAR=48;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00231145;STB=0.506267;STBP=0.458;TYPE=snp;VARB=0.00037503;OID=.;OPOS=9305473;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:114:114:2:3:111:111:0.973684:48:63:1:1:48:63:1:2
chr12	9307373	.	T	G	1486.03	PASS	AF=1;AO=90;DP=91;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0146853;FXX=0.0104156;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.9027;QD=62.5697;RBI=0.0507561;REFB=0;REVB=0.0485852;RO=0;SAF=47;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.16558e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000979805;OID=.;OPOS=9307373;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:91:95:0:0:90:95:1:43:47:0:0:45:50:0:0
chr12	9312951	.	G	A	369.09	PASS	AF=0.6;AO=36;DP=60;FAO=36;FDP=60;FR=.;FRO=24;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=-0.00589012;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.204;QD=24.606;RBI=0.00851921;REFB=-0.00704279;REVB=0.00615496;RO=22;SAF=19;SAR=17;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0507129;STB=0.527762;STBP=0.618;TYPE=snp;VARB=0.00529065;OID=.;OPOS=9312951;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:22:24:36:36:0.6:17:19:10:12:17:19:11:13
chr12	9315209	.	A	G	400.39	PASS	AF=0.533333;AO=39;DP=74;FAO=40;FDP=75;FR=.;FRO=35;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=-0.00414701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.714;QD=21.3539;RBI=0.00520787;REFB=-0.00139389;REVB=0.00315027;RO=35;SAF=18;SAR=21;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0284181;STB=0.521757;STBP=0.698;TYPE=snp;VARB=0.00125815;OID=.;OPOS=9315209;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:75:35:35:39:40:0.533333:21:18:15:20:21:19:15:20
chr12	9316773	.	T	C	361.33	PASS	AF=0.433333;AO=36;DP=86;FAO=39;FDP=90;FR=.;FRO=51;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=36;FWDB=-0.0214102;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=76.0997;QD=16.0592;RBI=0.0313425;REFB=-0.0270353;REVB=-0.0228901;RO=50;SAF=21;SAR=15;SRF=14;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.30471;STB=0.636298;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.0184495;OID=.;OPOS=9316773;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:90:50:51:36:39:0.433333:15:21:14:36:18:21:15:36
chr12	9317784	.	A	G	283.49	PASS	AF=0.455882;AO=30;DP=66;FAO=31;FDP=68;FR=.;FRO=37;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=0.0571312;FXX=0.0285673;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.33;QD=16.6759;RBI=0.0587154;REFB=-0.0114473;REVB=0.0135473;RO=36;SAF=14;SAR=16;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0216508;STB=0.513299;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=0.0128991;OID=.;OPOS=9317784;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:68:36:37:30:31:0.455882:16:14:16:20:16:15:17:20
chr12	9317885	.	G	A	63.35	PASS	AF=0.310345;AO=9;DP=29;FAO=9;FDP=29;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=18;FWDB=-0.0172568;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.488;QD=8.73784;RBI=0.0271537;REFB=-0.0100251;REVB=-0.0209649;RO=20;SAF=5;SAR=4;SRF=2;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.511667;STB=0.796643;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=0.0226625;OID=.;OPOS=9317885;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:29:29:20:20:9:9:0.310345:4:5:2:18:4:5:2:18
chr12	9345273	.	A	G	735.56	PASS	AF=1;AO=31;DP=55;FAO=54;FDP=54;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00444496;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.7464;QD=54.4859;RBI=0.0635618;REFB=0;REVB=0.0634062;RO=0;SAF=24;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.71661e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000372041;OID=.;OPOS=9345273;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:54:0:0:31:54:1:7:24:0:0:29:25:0:0
chr12	9346792	.	G	C	219.07	PASS	AF=0.430769;AO=24;DP=61;FAO=28;FDP=65;FR=.;FRO=37;FSAF=21;FSAR=7;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=-0.0136803;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=37.2045;QD=13.4815;RBI=0.0544267;REFB=-0.056665;REVB=0.0526793;RO=32;SAF=20;SAR=4;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.350324;STB=0.66654;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.0935079;OID=.;OPOS=9346792;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:65:32:37:24:28:0.430769:4:20:18:14:7:21:18:19
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chr12	9573224	.	C	T	497.39	PASS	AF=0.5;AO=52;DP=104;FAO=52;FDP=104;FR=.;FRO=52;FSAF=29;FSAR=23;FSRF=25;FSRR=27;FWDB=0.0403345;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.613;QD=19.1305;RBI=0.043958;REFB=-0.0113836;REVB=0.0174767;RO=52;SAF=29;SAR=23;SRF=25;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0698073;STB=0.538618;STBP=0.436;TYPE=snp;VARB=0.00943972;OID=.;OPOS=9573224;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:104:52:52:52:52:0.5:23:29:25:27:23:29:25:27
chr12	9574002	.	C	T	747.84	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0141332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.374;QD=56.4404;RBI=0.0483561;REFB=0;REVB=0.0462447;RO=0;SAF=24;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000125036;OID=.;OPOS=9574002;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:53:0:0:49:53:1:25:24:0:0:29:24:0:0
chr12	9574042	.	C	A	442.72	PASS	AF=0.551282;AO=43;DP=77;FAO=43;FDP=78;FR=.;FRO=35;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=0.0115571;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.331;QD=22.7037;RBI=0.0150598;REFB=-0.0074828;REVB=-0.00965552;RO=34;SAF=25;SAR=18;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136428;STB=0.581357;STBP=0.115;TYPE=snp;VARB=0.00566552;OID=.;OPOS=9574042;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:78:34:35:43:43:0.551282:18:25:14:20:18:25:14:21
chr12	9578197	.	A	T	563.79	PASS	AF=0.974359;AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.014139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.0739;QD=57.8244;RBI=0.0294005;REFB=-0.0488737;REVB=-0.0257774;RO=1;SAF=8;SAR=30;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0153672;STB=0.508192;STBP=0.643;TYPE=snp;VARB=0.00138311;OID=.;OPOS=9578197;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:39:39:1:1:38:38:0.974359:30:8:0:1:30:8:0:1
chr12	9580293	.	A	G	51.26	PASS	AF=0.125;AO=11;DP=88;FAO=11;FDP=88;FR=.;FRO=77;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=35;FSRR=42;FWDB=0.00311865;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.587;QD=2.33005;RBI=0.0244115;REFB=-0.00804488;REVB=-0.0242115;RO=76;SAF=6;SAR=5;SRF=34;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119204;STB=0.578913;STBP=0.628;TYPE=snp;VARB=0.0415029;OID=.;OPOS=9580293;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:51:88:88:76:77:11:11:0.125:5:6:34:42:5:6:35:42
chr12	9581791	.	T	C	165.05	PASS	AF=0.382979;AO=18;DP=47;FAO=18;FDP=47;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=0.00787387;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.966;QD=14.0468;RBI=0.00787605;REFB=-0.0177159;REVB=-0.000185459;RO=28;SAF=10;SAR=8;SRF=19;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133661;STB=0.563039;STBP=0.496;TYPE=snp;VARB=0.0247993;OID=.;OPOS=9581791;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:28:29:18:18:0.382979:8:10:19:9:8:10:19:10
chr12	9589681	.	C	G	58.45	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0812482;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.068;QD=33.3984;RBI=0.0812482;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=6;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00131754;OID=.;OPOS=9589681;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:7:0:0:6:7:1:0:6:0:0:0:7:0:0
chr12	9590052	.	G	A	119.53	PASS	AF=0.4;AO=14;DP=35;FAO=14;FDP=35;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=-0.000723351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.337;QD=13.6606;RBI=0.0213371;REFB=-0.0202229;REVB=0.0213249;RO=21;SAF=8;SAR=6;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.240764;STB=0.639808;STBP=0.2;TYPE=snp;VARB=0.0377606;OID=.;OPOS=9590052;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:21:21:14:14:0.4:6:8:7:14:6:8:7:14
chr12	9597776	.	G	A	1491.69	PASS	AF=1;AO=94;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0182446;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.117;QD=63.476;RBI=0.0202029;REFB=0;REVB=0.00867723;RO=0;SAF=41;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.31109e-05;OID=.;OPOS=9597776;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:94:94:0:0:94:94:1:53:41:0:0:53:41:0:0
chr12	9833524	.	C	G	1098.7	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0363631;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.37;QD=60.2028;RBI=0.0364619;REFB=0;REVB=-0.00268144;RO=0;SAF=41;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.2019e-05;OID=.;OPOS=9833524;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:32:41:0:0:32:41:0:0
chr12	9833628	.	C	T	707.3	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00711202;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.578;QD=62.8712;RBI=0.0227777;REFB=0;REVB=0.021639;RO=0;SAF=6;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.44635e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.01763e-05;OID=.;OPOS=9833628;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:39:6:0:0:39:6:0:0
chr12	9885707	.	A	ATAAGT,T	513.54	PASS	AF=0.729167,0.0833333;AO=34,5;DP=49;FAO=35,4;FDP=48;FR=.;FRO=9;FSAF=16,4;FSAR=19,0;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=-0.0529831,-0.0298978;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=5,1;MLLD=171.835,95.7491;QD=42.7947;RBI=0.0530002,0.0299646;REFB=-0.00924227,0.00699119;REVB=-0.00134661,0.00200002;RO=10;SAF=16,4;SAR=18,1;SRF=7;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.096138,0.141542;STB=0.565293,0.995756;STBP=0.114,0.209;TYPE=ins,snp;VARB=0.00649887,-0.0303511;OID=.,.;OPOS=9885708,9885707;OREF=-,A;OALT=TAAGT,T;OMAPALT=ATAAGT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:49:48:10:9:34,5:35,4:0.729167,0.0833333:18,1:16,4:7:3:19,0:16,4:7:2
chr12	9905690	.	A	G	990.65	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00999904;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.939;QD=59.1431;RBI=0.0200764;REFB=0;REVB=0.0174093;RO=0;SAF=36;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.72788e-05;OID=.;OPOS=9905690;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:31:36:0:0:31:36:0:0
chr12	9906143	.	GT	G,TG	367.27	PASS	AF=0.58,0.34;AO=22,13;DP=49;FAO=29,17;FDP=50;FR=.;FRO=4;FSAF=23,0;FSAR=6,17;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.0931242,-0.0444683;FXX=0.019604;HRUN=5,1;LEN=1,2;MLLD=9.61306,15.7247;QD=29.3816;RBI=0.0946505,0.0451774;REFB=0.104667,0.0380863;REVB=-0.0169294,-0.00797293;RO=5;SAF=18,0;SAR=4,13;SRF=4;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0.461538,0;SSSB=0.0102928,-0.841937;STB=0.507881,0.998986;STBP=0.905,0;TYPE=del,mnp;VARB=0.0270304,-0.04453;OID=.,.;OPOS=9906144,9906143;OREF=T,GT;OALT=-,TG;OMAPALT=G,TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:49:50:5:4:22,13:29,17:0.58,0.34:4,13:18,0:4:1:6,17:23,0:3:1
chr12	9994445	.	GTGT	G	632.34	PASS	AF=1;AO=38;DP=44;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0141473;FXX=0.0888691;HRUN=1;LEN=3;MLLD=282.316;QD=61.6921;RBI=0.0150934;REFB=0;REVB=0.00525948;RO=0;SAF=24;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.76123e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.000226914;OID=.;OPOS=9994446;OREF=TGT;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:38:44:41:41:0:26:15:0:0:3:0:24:14:0:0
chr12	10015177	.	A	G	189.88	PASS	AF=0.358209;AO=24;DP=67;FAO=24;FDP=67;FR=.;FRO=43;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=28;FWDB=-0.024672;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=196.038;QD=11.3359;RBI=0.0249747;REFB=-0.0158404;REVB=-0.00387668;RO=43;SAF=16;SAR=8;SRF=15;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.344444;STB=0.698868;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.0214149;OID=.;OPOS=10015177;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:43:43:24:24:0.358209:8:16:15:28:8:16:15:28
chr12	10041364	.	G	A	352.94	PASS	AF=0.480519;AO=37;DP=78;FAO=37;FDP=77;FR=.;FRO=40;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=22;FSRR=18;FWDB=-0.0229926;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.06;QD=18.3345;RBI=0.0262359;REFB=-0.000400694;REVB=-0.0126359;RO=40;SAF=18;SAR=19;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0590607;STB=0.532942;STBP=0.577;TYPE=snp;VARB=-0.000524152;OID=.;OPOS=10041364;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:77:40:40:37:37:0.480519:19:18:22:18:19:18:22:18
chr12	10136672	.	G	A	1196.24	PASS	AF=1;AO=71;DP=72;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0310691;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.246;QD=60.5693;RBI=0.0330319;REFB=0;REVB=0.0112168;RO=0;SAF=24;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.55249e-05;OID=.;OPOS=10136672;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:79:0:0:71:79:1:47:24:0:0:53:26:0:0
chr12	10137557	.	A	C	499.86	PASS	AF=0.945946;AO=35;DP=37;FAO=35;FDP=37;FR=.;FRO=2;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00891084;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=228.427;QD=54.039;RBI=0.00891248;REFB=-0.101413;REVB=0.000170843;RO=0;SAF=15;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.503935;STBP=0.863;TYPE=snp;VARB=0.000405186;OID=.;OPOS=10137557;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:37:37:0:2:35:35:0.945946:20:15:0:0:20:15:1:1
chr12	10149406	.	T	C	299.13	PASS	AF=0.576923;AO=30;DP=53;FAO=30;FDP=52;FR=.;FRO=22;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=0.0418021;FXX=0.0188644;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.3181;QD=23.0099;RBI=0.0448686;REFB=0.00811945;REVB=-0.0163027;RO=23;SAF=19;SAR=11;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0914963;STB=0.539163;STBP=0.556;TYPE=snp;VARB=-0.00597574;OID=.;OPOS=10149406;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:52:23:22:30:30:0.576923:11:19:12:11:11:19:12:10
chr12	10149851	.	C	T	1406.38	PASS	AF=0.978495;AO=91;DP=93;FAO=91;FDP=93;FR=.;FRO=2;FSAF=40;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00446635;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=238.148;QD=60.4894;RBI=0.00887194;REFB=0.0607997;REVB=0.00766571;RO=2;SAF=40;SAR=51;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0182246;STB=0.509613;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=-0.00184319;OID=.;OPOS=10149851;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:93:93:2:2:91:91:0.978495:51:40:0:2:51:40:0:2
chr12	10150961	.	G	A	304.89	PASS	AF=0.586957;AO=27;DP=46;FAO=27;FDP=46;FR=.;FRO=19;FSAF=21;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.0189282;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.6932;QD=26.5121;RBI=0.0297645;REFB=-0.0249463;REVB=-0.0229706;RO=19;SAF=21;SAR=6;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188118;STB=0.604854;STBP=0.113;TYPE=snp;VARB=0.0224875;OID=.;OPOS=10150961;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:19:19:27:27:0.586957:6:21:11:8:6:21:11:8
chr12	10150974	.	A	G	265.41	PASS	AF=0.615385;AO=24;DP=39;FAO=24;FDP=39;FR=.;FRO=15;FSAF=20;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=0.0245429;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.897;QD=27.2218;RBI=0.0258645;REFB=-0.0388342;REVB=-0.00816213;RO=15;SAF=20;SAR=4;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.237216;STB=0.632786;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=0.0220003;OID=.;OPOS=10150974;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:15:15:24:24:0.615385:4:20:9:6:4:20:9:6
chr12	10151642	.	T	C	2018.58	PASS	AF=0.984962;AO=130;DP=133;FAO=131;FDP=133;FR=.;FRO=2;FSAF=62;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0242458;FXX=0.00746213;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.6235;QD=60.7093;RBI=0.0783718;REFB=-0.0749454;REVB=0.0745271;RO=0;SAF=62;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.98983e-08;STB=0.507142;STBP=0.245;TYPE=snp;VARB=0.000989012;OID=.;OPOS=10151642;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:133:133:0:2:130:131:0.984962:68:62:0:0:69:62:0:2
chr12	10165469	.	A	G	1677.36	PASS	AF=1;AO=111;DP=111;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00368444;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.285;QD=60.4455;RBI=0.0542257;REFB=0;REVB=0.0541004;RO=0;SAF=62;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000119546;OID=.;OPOS=10165469;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:111:111:0:0:111:111:1:49:62:0:0:49:62:0:0
chr12	10167277	.	G	C	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0035638;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.495;QD=55.6559;RBI=0.0367907;REFB=0;REVB=0.0366177;RO=0;SAF=11;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00025011;OID=.;OPOS=10167277;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:16:11:0:0:16:11:0:0
chr12	10206925	.	A	G	1042.01	PASS	AF=0.986111;AO=70;DP=71;FAO=71;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00171281;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.488;QD=57.8893;RBI=0.0021782;REFB=-0.0254235;REVB=-0.00134567;RO=1;SAF=26;SAR=44;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0106256;STB=0.505493;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.000508871;OID=.;OPOS=10206925;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:71:72:1:1:70:71:0.986111:44:26:0:1:45:26:0:1
chr12	10236797	.	A	G	743.42	PASS	AF=1;AO=52;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0420294;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.651;QD=56.1068;RBI=0.0469114;REFB=0;REVB=-0.0208375;RO=0;SAF=29;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.84538e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000165883;OID=.;OPOS=10236797;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:52:53:1:23:29:0:0:23:30:0:0
chr12	10236824	.	C	T	801.33	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00923301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.117;QD=57.2375;RBI=0.00931863;REFB=0;REVB=-0.00126032;RO=0;SAF=31;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.94467e-05;OID=.;OPOS=10236824;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:25:31:0:0:25:31:0:0
chr12	10236921	.	G	T	340.73	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0430471;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=71.2825;QD=54.517;RBI=0.0433399;REFB=0;REVB=-0.00502926;RO=0;SAF=10;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0011091;OID=.;OPOS=10236921;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:15:10:0:0:15:10:0:0
chr12	10236942	.	C	G	289.37	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00128691;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=261.837;QD=52.613;RBI=0.00129882;REFB=0;REVB=0.000175444;RO=0;SAF=9;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.99437e-06;OID=.;OPOS=10236942;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:22:0:0:21:22:1:12:9:0:0:13:9:0:0
chr12	10237014	.	T	C	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0211419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.081;QD=33.4285;RBI=0.0223501;REFB=0;REVB=-0.00724871;RO=0;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000245114;OID=.;OPOS=10237014;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:4:2:0:0:4:2:0:0
chr12	10251445	.	C	G	819.52	PASS	AF=0.983051;AO=57;DP=59;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00626297;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.5238;QD=55.5607;RBI=0.024073;REFB=-0.0186161;REVB=-0.023244;RO=2;SAF=24;SAR=33;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00516834;STB=0.50746;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.00402179;OID=.;OPOS=10251445;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:59:59:2:1:57:58:0.983051:33:24:1:1:33:25:0:1
chr12	10271055	.	T	C	690.73	PASS	AF=1;AO=42;DP=43;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0395391;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.461;QD=61.3979;RBI=0.0395864;REFB=0;REVB=-0.00193327;RO=0;SAF=30;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.52854e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000473085;OID=.;OPOS=10271055;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:45:0:0:42:45:1:12:30:0:0:12:33:0:0
chr12	10313448	.	C	G	277.16	PASS	AF=0.54902;AO=28;DP=51;FAO=28;FDP=51;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=-0.0631935;FXX=0.0377287;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.1436;QD=21.7378;RBI=0.0634541;REFB=-0.0310143;REVB=0.00574449;RO=23;SAF=12;SAR=16;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0762207;STB=0.542342;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=0.0330291;OID=.;OPOS=10313448;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:23:23:28:28:0.54902:16:12:12:11:16:12:12:11
chr12	10366088	.	C	T	38.56	PASS	AF=0.428571;AO=6;DP=14;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=0.0482848;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.196;QD=11.0171;RBI=0.0530292;REFB=0.0186959;REVB=0.0219243;RO=8;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.389464;STB=0.721754;STBP=0.794;TYPE=snp;VARB=-0.0139004;OID=.;OPOS=10366088;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:14:14:8:8:6:6:0.428571:5:1:0:8:5:1:0:8
chr12	10367240	.	CTT	CT,CTC	261.04	PASS	AF=0.529412,0.0196078;AO=26,2;DP=51;FAO=27,1;FDP=51;FR=.;FRO=23;FSAF=15,0;FSAR=12,1;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=-0.0278239,-0.00136682;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=27.2523,28.4302;QD=20.4735;RBI=0.0324329,0.0343738;REFB=-0.00333631,0.000258485;REVB=-0.016665,-0.0343466;RO=23;SAF=14,1;SAR=12,1;SRF=8;SRR=15;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.159369,0.149041;STB=0.594645,0.986975;STBP=0.166,0.477;TYPE=del,snp;VARB=0.00654022,-0.0917962;OID=.,.;OPOS=10367241,10367242;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=CT,CTC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.529412,0.0196078:26,2:51:27,1:51:23:15,0:12,1:8:15:99:23:14,1:12,1:8:15
chr12	10367376	.	C	T	130.49	PASS	AF=0.365854;AO=15;DP=42;FAO=15;FDP=41;FR=.;FRO=26;FSAF=1;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=0.00562455;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.6693;QD=12.7303;RBI=0.0521282;REFB=0.0137697;REVB=-0.0518238;RO=25;SAF=1;SAR=14;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.630847;STB=0.889202;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=-0.0232385;OID=.;OPOS=10367376;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:41:25:26:15:15:0.365854:14:1:13:12:14:1:14:12
chr12	10462052	.	T	G	976.98	PASS	AF=1;AO=66;DP=67;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.109757;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.55;QD=59.2107;RBI=0.113153;REFB=0;REVB=0.0275139;RO=0;SAF=36;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000589843;OID=.;OPOS=10462052;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:66:0:0:66:66:1:30:36:0:0:30:36:0:0
chr12	10467533	.	T	A	201.06	PASS	AF=0.413793;AO=24;DP=58;FAO=24;FDP=58;FR=.;FRO=34;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=-0.00346307;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.563;QD=13.8664;RBI=0.0197946;REFB=-0.00894399;REVB=-0.0194893;RO=34;SAF=13;SAR=11;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0728923;STB=0.541632;STBP=0.619;TYPE=snp;VARB=0.0204019;OID=.;OPOS=10467533;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:34:34:24:24:0.413793:11:13:16:18:11:13:16:18
chr12	10525740	.	C	T	854.11	PASS	AF=1;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0083476;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.56;QD=57.9057;RBI=0.0571311;REFB=0;REVB=-0.056518;RO=0;SAF=36;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.89547e-05;OID=.;OPOS=10525740;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:59:0:0:59:59:1:23:36:0:0:23:36:0:0
chr12	10532111	.	T	G	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00600002;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=276.823;QD=46.848;RBI=0.00826913;REFB=0;REVB=-0.00569019;RO=0;SAF=6;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.18979e-06;OID=.;OPOS=10532111;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:9:6:0:0:9:6:0:0
chr12	10532326	.	T	C	803.82	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00697848;FXX=0.0175408;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.921;QD=57.416;RBI=0.0211293;REFB=0;REVB=0.0199436;RO=0;SAF=30;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.29784e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.91093e-05;OID=.;OPOS=10532326;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:26:30:0:0:26:30:0:0
chr12	10560957	.	T	C	895.07	PASS	AF=0.969231;AO=63;DP=65;FAO=63;FDP=65;FR=.;FRO=2;FSAF=34;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0265027;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.588;QD=55.0813;RBI=0.0265074;REFB=-0.0630853;REVB=0.00049987;RO=2;SAF=34;SAR=29;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0314539;STB=0.516661;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=0.000724986;OID=.;OPOS=10560957;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:65:65:2:2:63:63:0.969231:29:34:0:2:29:34:0:2
chr12	10562025	.	C	T	1135.26	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000340077;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=242.415;QD=60.547;RBI=0.00929987;REFB=0;REVB=0.00929365;RO=0;SAF=38;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.22932e-05;OID=.;OPOS=10562025;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:37:38:0:0:37:38:0:0
chr12	10562089	.	A	C	1594.23	PASS	AF=1;AO=106;DP=107;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0115928;FXX=0.0185168;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.994;QD=60.1595;RBI=0.0126263;REFB=0;REVB=-0.00500294;RO=0;SAF=54;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.04507e-05;OID=.;OPOS=10562089;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:107:106:0:0:106:106:1:52:54:0:0:52:54:0:0
chr12	10570965	.	C	G	1087.3	PASS	AF=1;AO=72;DP=73;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0347083;FXX=0.0270234;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.9504;QD=60.4055;RBI=0.0400308;REFB=0;REVB=-0.0199449;RO=0;SAF=35;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000595949;OID=.;OPOS=10570965;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:72:0:0:72:72:1:37:35:0:0:37:35:0:0
chr12	10571042	.	A	G	1208.8	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0242214;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.8146;QD=61.2052;RBI=0.0497477;REFB=0;REVB=0.0434529;RO=0;SAF=34;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.40017e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000333831;OID=.;OPOS=10571042;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:45:34:0:0:45:34:0:0
chr12	10571091	.	T	G	740.43	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0105493;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.681;QD=56.9565;RBI=0.027863;REFB=0;REVB=-0.0257887;RO=0;SAF=24;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.81967e-05;OID=.;OPOS=10571091;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:28:24:0:0:28:24:0:0
chr12	10571106	.	G	C	613.36	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0150222;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.315;QD=61.3358;RBI=0.0150954;REFB=0;REVB=0.00148523;RO=0;SAF=17;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.4817e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.29725e-05;OID=.;OPOS=10571106;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:23:17:0:0:23:17:0:0
chr12	10572982	.	A	G	1629.73	PASS	AF=1;AO=108;DP=110;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.062257;FXX=0.0181802;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.5479;QD=60.3603;RBI=0.0642978;REFB=0;REVB=0.0160708;RO=0;SAF=48;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000389011;OID=.;OPOS=10572982;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:110:108:0:0:108:108:1:60:48:0:0:60:48:0:0
chr12	10573094	.	CA	GG	729.01	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00689167;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=303.995;QD=57.1775;RBI=0.00850826;REFB=0;REVB=-0.00498953;RO=0;SAF=17;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=2.02063e-06;OID=.;OPOS=10573094;OREF=CA;OALT=GG;OMAPALT=GG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:34:17:0:0:34:17:0:0
chr12	10587111	.	A	G	9118.1	PASS	AF=0.97377;AO=594;DP=611;FAO=594;FDP=610;FR=.;FRO=16;FSAF=323;FSAR=271;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=-0.0110177;FXX=0.00163663;HRUN=5;LEN=1;MLLD=295.996;QD=59.7908;RBI=0.0112299;REFB=-0.0347983;REVB=-0.00217257;RO=14;SAF=323;SAR=271;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00755696;STB=0.502148;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=2.89287e-05;OID=.;OPOS=10587111;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:611:610:14:16:594:594:0.97377:271:323:10:4:271:323:10:6
chr12	10587631	.	C	T	1552.63	PASS	AF=0.989899;AO=98;DP=99;FAO=98;FDP=99;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=54;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00278636;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.004;QD=62.7324;RBI=0.0328751;REFB=-0.0105339;REVB=0.0327568;RO=1;SAF=44;SAR=54;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0106577;STB=0.505617;STBP=0.271;TYPE=snp;VARB=0.000271351;OID=.;OPOS=10587631;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:99:99:1:1:98:98:0.989899:54:44:1:0:54:44:1:0
chr12	10588530	.	C	G	442.17	PASS	AF=0.322034;AO=57;DP=177;FAO=57;FDP=177;FR=.;FRO=120;FSAF=26;FSAR=31;FSRF=57;FSRR=63;FWDB=-0.0150907;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.0248;QD=9.99244;RBI=0.015838;REFB=-0.000235021;REVB=0.0048075;RO=120;SAF=26;SAR=31;SRF=57;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0222476;STB=0.512852;STBP=0.857;TYPE=snp;VARB=0.000535096;OID=.;OPOS=10588530;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:177:177:120:120:57:57:0.322034:31:26:57:63:31:26:57:63
chr12	10588581	.	T	C	302.97	PASS	AF=0.35514;AO=38;DP=106;FAO=38;FDP=107;FR=.;FRO=69;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=30;FSRR=39;FWDB=-0.00137921;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.651;QD=11.3261;RBI=0.00395907;REFB=-0.015623;REVB=0.00371106;RO=67;SAF=17;SAR=21;SRF=28;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0333003;STB=0.508217;STBP=0.899;TYPE=snp;VARB=0.0204736;OID=.;OPOS=10588581;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:107:67:69:38:38:0.35514:21:17:28:39:21:17:30:39
chr12	10603669	.	G	GC	1526.87	PASS	AF=0.990826;AO=12;DP=118;FAO=108;FDP=109;FR=.;FRO=1;FSAF=64;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.107954;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=142.848;QD=56.0319;RBI=0.108281;REFB=0.00947908;REVB=-0.00840236;RO=106;SAF=2;SAR=10;SRF=65;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.502755;STB=0.505617;STBP=0.279;TYPE=ins;VARB=0.00027526;OID=.;OPOS=10603670;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:0.990826:12:118:108:109:1:64:44:0:1:5:106:2:10:65:41
chr12	10603670	.	T	C	1348.75	PASS	AF=0.855932;AO=101;DP=118;FAO=101;FDP=118;FR=.;FRO=17;FSAF=63;FSAR=38;FSRF=2;FSRR=15;FWDB=0.0182497;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=152.262;QD=45.7204;RBI=0.0182497;REFB=-0.0529006;REVB=2.05275e-05;RO=17;SAF=63;SAR=38;SRF=2;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14085;STB=0.574783;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00123884;OID=.;OPOS=10603670;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:81:118:118:17:17:101:101:0.855932:38:63:2:15:38:63:2:15
chr12	10658507	.	G	A	389.95	PASS	AF=0.541667;AO=39;DP=72;FAO=39;FDP=72;FR=.;FRO=33;FSAF=13;FSAR=26;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=-0.00231502;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=110.579;QD=21.6638;RBI=0.04236;REFB=-0.0133267;REVB=0.0422967;RO=33;SAF=13;SAR=26;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0821248;STB=0.545431;STBP=0.446;TYPE=snp;VARB=0.0167119;OID=.;OPOS=10658507;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:33:33:39:39:0.541667:26:13:14:19:26:13:14:19
chr12	10659228	.	A	T	1204.48	PASS	AF=0.522124;AO=118;DP=226;FAO=118;FDP=226;FR=.;FRO=108;FSAF=59;FSAR=59;FSRF=55;FSRR=53;FWDB=0.00788693;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=46.523;QD=21.3182;RBI=0.0261127;REFB=-0.027252;REVB=0.0248932;RO=102;SAF=59;SAR=59;SRF=50;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00832741;STB=0.504424;STBP=0.87;TYPE=snp;VARB=0.0247776;OID=.;OPOS=10659228;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:226:226:102:108:118:118:0.522124:59:59:50:52:59:59:55:53
chr12	10659438	.	T	C	1866.97	PASS	AF=1;AO=121;DP=122;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0104229;FXX=0.0162588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=286.55;QD=61.718;RBI=0.017714;REFB=0;REVB=0.014323;RO=0;SAF=48;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.99806e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.99885e-06;OID=.;OPOS=10659438;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:122:121:0:0:121:121:1:73:48:0:0:73:48:0:0
chr12	10659964	.	C	G	959.44	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103443;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.987;QD=59.0424;RBI=0.019727;REFB=0;REVB=0.0167973;RO=0;SAF=37;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.99207e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.41708e-05;OID=.;OPOS=10659964;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:28:37:0:0:28:37:0:0
chr12	10675250	.	G	C	566.76	PASS	AF=1;AO=36;DP=37;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0281802;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.4316;QD=59.6594;RBI=0.0307505;REFB=0;REVB=0.0123073;RO=0;SAF=24;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0147324;OID=.;OPOS=10675250;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:38:0:0:36:38:1:12:24:0:0:14:24:0:0
chr12	10675295	.	G	A	77.43	PASS	AF=0.333333;AO=10;DP=33;FAO=11;FDP=33;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=-0.0588274;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.5768;QD=9.38591;RBI=0.0604107;REFB=-0.0177353;REVB=0.0137401;RO=22;SAF=5;SAR=5;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15422;STB=0.619356;STBP=0.355;TYPE=snp;VARB=0.0157275;OID=.;OPOS=10675295;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:33:33:22:22:10:11:0.333333:5:5:14:8:6:5:14:8
chr12	10763205	.	T	C	100.73	PASS	AF=0.48;AO=12;DP=24;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=-0.0361401;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.653;QD=16.1171;RBI=0.0367677;REFB=0.00571933;REVB=0.00676422;RO=12;SAF=5;SAR=7;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154012;STB=0.559345;STBP=0.594;TYPE=snp;VARB=-0.00281897;OID=.;OPOS=10763205;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:24:25:12:13:12:12:0.48:7:5:3:9:7:5:4:9
chr12	10763236	.	G	C	449.02	PASS	AF=0.941176;AO=32;DP=34;FAO=32;FDP=34;FR=.;FRO=2;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0133914;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.4887;QD=52.8253;RBI=0.0134086;REFB=-0.0444066;REVB=-0.000679982;RO=2;SAF=14;SAR=18;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00695581;STB=0.503729;STBP=0.875;TYPE=snp;VARB=0.00169272;OID=.;OPOS=10763236;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:34:34:2:2:32:32:0.941176:18:14:1:1:18:14:1:1
chr12	10771779	.	C	T	2493.03	PASS	AF=0.443894;AO=263;DP=608;FAO=269;FDP=606;FR=.;FRO=337;FSAF=127;FSAR=142;FSRF=178;FSRR=159;FWDB=0.0119093;FXX=0.0146339;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.1738;QD=16.4556;RBI=0.0124367;REFB=0.010712;REVB=0.00358341;RO=343;SAF=124;SAR=139;SRF=181;SRR=162;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0574197;STB=0.531168;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=-0.0154293;OID=.;OPOS=10771779;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:608:606:343:337:263:269:0.443894:139:124:181:162:142:127:178:159
chr12	10782115	.	T	C	217.82	PASS	AF=0.461538;AO=24;DP=52;FAO=24;FDP=52;FR=.;FRO=28;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=-0.029985;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.554;QD=16.755;RBI=0.029985;REFB=0.0123643;REVB=-5.2961e-05;RO=28;SAF=17;SAR=7;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109955;STB=0.562446;STBP=0.469;TYPE=snp;VARB=-0.00993576;OID=.;OPOS=10782115;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:28:28:24:24:0.461538:7:17:17:11:7:17:17:11
chr12	10783729	.	A	G	584.18	PASS	AF=0.68;AO=51;DP=75;FAO=51;FDP=75;FR=.;FRO=24;FSAF=31;FSAR=20;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=-0.00359349;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.6047;QD=31.1562;RBI=0.0318405;REFB=-0.00144781;REVB=-0.0316371;RO=24;SAF=31;SAR=20;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0406147;STB=0.52199;STBP=0.576;TYPE=snp;VARB=0.000213789;OID=.;OPOS=10783729;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:24:24:51:51:0.68:20:31:13:11:20:31:13:11
chr12	10856219	.	C	T	44.28	PASS	AF=0.269231;AO=7;DP=26;FAO=7;FDP=26;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=0.081461;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.372;QD=6.81286;RBI=0.0816272;REFB=-0.0051338;REVB=-0.00520603;RO=19;SAF=4;SAR=3;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170567;STB=0.60839;STBP=0.536;TYPE=snp;VARB=0.0131972;OID=.;OPOS=10856219;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:26:26:19:19:7:7:0.269231:3:4:8:11:3:4:8:11
chr12	10871667	.	A	G	1545.5	PASS	AF=1;AO=97;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.059404;FXX=0.0101;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.499;QD=63.0818;RBI=0.135758;REFB=0;REVB=0.122071;RO=1;SAF=46;SAR=51;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0092091;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00109112;OID=.;OPOS=10871667;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:98:98:1:0:97:98:1:51:46:0:1:52:46:0:0
chr12	10958658	.	T	C	1068.27	PASS	AF=0.986301;AO=72;DP=73;FAO=72;FDP=73;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00229198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.957;QD=58.5356;RBI=0.0564941;REFB=-0.0785132;REVB=0.0564476;RO=1;SAF=35;SAR=37;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133212;STB=0.50704;STBP=0.327;TYPE=snp;VARB=0.00024414;OID=.;OPOS=10958658;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:73:73:1:1:72:72:0.986301:37:35:1:0:37:35:1:0
chr12	10959031	.	C	T	793.06	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000142119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.421;QD=56.6474;RBI=0.0150156;REFB=0;REVB=0.0150149;RO=0;SAF=22;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.76368e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000425071;OID=.;OPOS=10959031;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:56:0:0:53:56:1:31:22:0:0:34:22:0:0
chr12	10962115	.	A	C,G	708.85	PASS	AF=0.0652174,0.934783;AO=3,43;DP=46;FAO=3,43;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=3,21;FSAR=0,22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103024,0.0803498;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=232.748,59.9931;QD=61.6387;RBI=0.0166245,0.0805624;REFB=0,0;REVB=-0.0130474,-0.0058501;RO=0;SAF=3,21;SAR=0,22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.179661,-0.00325003;OID=.,.;OPOS=10962115,10962115;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:13:46:46:0:0:3,43:3,43:0.0652174,0.934783:0,22:3,21:0:0:0,22:3,21:0:0
chr12	10978001	.	T	C	31.05	PASS	AF=0.1;AO=7;DP=70;FAO=7;FDP=70;FR=.;FRO=63;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=33;FSRR=30;FWDB=-0.0032047;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.814;QD=1.77433;RBI=0.00380301;REFB=-0.00176791;REVB=-0.00204763;RO=63;SAF=2;SAR=5;SRF=33;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.273041;STB=0.713675;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=0.0173905;OID=.;OPOS=10978001;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:31:70:70:63:63:7:7:0.1:5:2:33:30:5:2:33:30
chr12	10978402	.	G	A,T	407.82	PASS	AF=0.933333,0.0666667;AO=27,2;DP=30;FAO=28,2;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=15,1;FSAR=13,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00824857,0.0534315;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=169.873,13.9649;QD=54.3757;RBI=0.0179407,0.0722843;REFB=0,0;REVB=-0.015932,-0.0486837;RO=0;SAF=14,1;SAR=13,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.39874e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00152906,0.021888;OID=.,.;OPOS=10978402,10978402;OREF=G,G;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:30:30:0:0:27,2:28,2:0.933333,0.0666667:13,1:14,1:0:0:13,1:15,1:0:0
chr12	10999708	.	T	C	1069.01	PASS	AF=0.986301;AO=71;DP=73;FAO=72;FDP=73;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0068003;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.867;QD=58.5759;RBI=0.0454473;REFB=0.012965;REVB=0.0449357;RO=0;SAF=44;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505493;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=8.25532e-05;OID=.;OPOS=10999708;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:73:73:0:1:71:72:0.986301:27:44:0:0:27:45:1:0
chr12	10999780	.	C	G,T	1059.77	PASS	AF=0.0684932,0.931507;AO=6,65;DP=72;FAO=5,68;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=4,59;FSAR=1,9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0384514,-0.0094243;FXX=0.0135117;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=28.9146,72.703;QD=58.0698;RBI=0.0386941,0.0142933;REFB=0,0;REVB=-0.00432669,0.0107461;RO=0;SAF=5,56;SAR=1,9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.18042e-08,5.13074e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.18875,0.000140592;OID=.,.;OPOS=10999780,10999780;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:16:72:73:0:0:6,65:5,68:0.0684932,0.931507:1,9:5,56:0:0:1,9:4,59:0:0
chr12	11061122	.	T	C	175.15	PASS	AF=0.514286;AO=18;DP=35;FAO=18;FDP=35;FR=.;FRO=17;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.00399289;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.143;QD=20.0173;RBI=0.0091291;REFB=-0.0287809;REVB=0.00820959;RO=17;SAF=12;SAR=6;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176087;STB=0.599886;STBP=0.27;TYPE=snp;VARB=0.0213166;OID=.;OPOS=11061122;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:17:17:18:18:0.514286:6:12:8:9:6:12:8:9
chr12	11083356	.	A	G	605.99	PASS	AF=0.456522;AO=63;DP=138;FAO=63;FDP=138;FR=.;FRO=75;FSAF=21;FSAR=42;FSRF=36;FSRR=39;FWDB=-0.0600808;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2988;QD=17.5649;RBI=0.0624732;REFB=-0.00557507;REVB=0.0171228;RO=75;SAF=21;SAR=42;SRF=36;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151664;STB=0.584588;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=0.00591506;OID=.;OPOS=11083356;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:138:138:75:75:63:63:0.456522:42:21:36:39:42:21:36:39
chr12	11083677	.	T	C	651.23	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0209009;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.549;QD=62.0219;RBI=0.0246869;REFB=0;REVB=-0.0131375;RO=0;SAF=24;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.13695e-05;OID=.;OPOS=11083677;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:18:24:0:0:18:24:0:0
chr12	11091432	.	C	T	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00582112;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=279.175;QD=44.6898;RBI=0.00784882;REFB=0;REVB=0.00526483;RO=0;SAF=8;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.38311e-05;OID=.;OPOS=11091432;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:5:8:0:0:5:8:0:0
chr12	11091693	.	T	A	187.39	PASS	AF=0.411765;AO=21;DP=51;FAO=21;FDP=51;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=0.000941757;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.269;QD=14.6975;RBI=0.00177148;REFB=0.00496215;REVB=-0.00150041;RO=29;SAF=11;SAR=10;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0415451;STB=0.514005;STBP=0.844;TYPE=snp;VARB=-0.00644103;OID=.;OPOS=11091693;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:29:30:21:21:0.411765:10:11:14:15:10:11:15:15
chr12	11138683	.	C	T	433.69	PASS	AF=0.567568;AO=42;DP=74;FAO=42;FDP=74;FR=.;FRO=32;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=-0.00687555;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.022;QD=23.4429;RBI=0.00728257;REFB=0.00948761;REVB=0.00240056;RO=32;SAF=19;SAR=23;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0367847;STB=0.520199;STBP=0.688;TYPE=snp;VARB=-0.00715785;OID=.;OPOS=11138683;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:32:32:42:42:0.567568:23:19:13:19:23:19:13:19
chr12	11138852	.	C	T	426.69	PASS	AF=0.483146;AO=43;DP=89;FAO=43;FDP=89;FR=.;FRO=46;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=21;FSRR=25;FWDB=0.0158957;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.384;QD=19.1771;RBI=0.0545259;REFB=-0.0228533;REVB=-0.0521575;RO=46;SAF=19;SAR=24;SRF=21;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0137777;STB=0.507664;STBP=0.897;TYPE=snp;VARB=0.0242269;OID=.;OPOS=11138852;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:46:46:43:43:0.483146:24:19:21:25:24:19:21:25
chr12	11139305	.	G	A	198.29	PASS	AF=0.342466;AO=25;DP=72;FAO=25;FDP=73;FR=.;FRO=48;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=24;FSRR=24;FWDB=-0.0312511;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.6309;QD=10.8651;RBI=0.0375237;REFB=-0.00617536;REVB=-0.0207701;RO=47;SAF=14;SAR=11;SRF=24;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0557486;STB=0.539616;STBP=0.647;TYPE=snp;VARB=0.0117475;OID=.;OPOS=11139305;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:73:47:48:25:25:0.342466:11:14:24:23:11:14:24:24
chr12	11149711	.	C	A	289.44	PASS	AF=0.39759;AO=33;DP=82;FAO=33;FDP=83;FR=.;FRO=50;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=27;FSRR=23;FWDB=-0.0216349;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.022;QD=13.9488;RBI=0.0413835;REFB=-0.000964662;REVB=-0.0352778;RO=49;SAF=13;SAR=20;SRF=26;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144963;STB=0.588614;STBP=0.216;TYPE=snp;VARB=0.00138825;OID=.;OPOS=11149711;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:83:49:50:33:33:0.39759:20:13:26:23:20:13:27:23
chr12	11149720	.	A	G	275.21	PASS	AF=0.380952;AO=32;DP=84;FAO=32;FDP=84;FR=.;FRO=52;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=28;FSRR=24;FWDB=0.0085659;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=220.524;QD=13.1051;RBI=0.0113199;REFB=-0.00203841;REVB=0.00740038;RO=51;SAF=14;SAR=18;SRF=28;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119729;STB=0.562461;STBP=0.376;TYPE=snp;VARB=0.00340841;OID=.;OPOS=11149720;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:51:52:32:32:0.380952:18:14:28:23:18:14:28:24
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chr12	11150319	.	T	C	65.31	PASS	AF=0.375;AO=9;DP=24;FAO=9;FDP=24;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=-0.0124825;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.722;QD=10.8847;RBI=0.0192146;REFB=-0.011914;REVB=0.0146078;RO=15;SAF=6;SAR=3;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.276263;STB=0.666296;STBP=0.227;TYPE=snp;VARB=0.0118143;OID=.;OPOS=11150319;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:24:24:15:15:9:9:0.375:3:6:6:9:3:6:6:9
chr12	11174276	.	G	A	270.79	PASS	AF=0.48;AO=23;DP=50;FAO=24;FDP=50;FR=.,HEALED;FRO=24;FSAF=18;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=-0.0138718;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.0234;QD=21.6635;RBI=0.0706472;REFB=-0.00926601;REVB=-0.0692719;RO=24;SAF=18;SAR=5;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.300212;STB=0.64273;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=0.0201031;OID=.;OPOS=11174276;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:24:24:23:24:0.48:5:18:12:12:6:18:12:12
chr12	11174302	.	A	G	56.18	PASS	AF=0.146667;AO=11;DP=75;FAO=11;FDP=75;FR=.;FRO=64;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=41;FSRR=23;FWDB=-0.00172756;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=284.08;QD=2.99607;RBI=0.0112621;REFB=-0.000108373;REVB=-0.0111288;RO=64;SAF=3;SAR=8;SRF=41;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.432857;STB=0.790536;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.00064921;OID=.;OPOS=11174302;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:75:75:64:64:11:11:0.146667:8:3:41:23:8:3:41:23
chr12	11174327	.	C	T	108.08	PASS	AF=0.189474;AO=18;DP=95;FAO=18;FDP=95;FR=.;FRO=77;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=42;FSRR=35;FWDB=0.00355318;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=196.855;QD=4.55062;RBI=0.0162075;REFB=4.94774e-06;REVB=-0.0158132;RO=77;SAF=7;SAR=11;SRF=42;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196488;STB=0.625877;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=-0.000116566;OID=.;OPOS=11174327;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:77:77:18:18:0.189474:11:7:42:35:11:7:42:35
chr12	11174372	.	C	G	123.81	PASS	AF=0.231707;AO=19;DP=82;FAO=19;FDP=82;FR=.;FRO=63;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=36;FSRR=27;FWDB=-0.0507436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.6339;QD=6.03958;RBI=0.0682816;REFB=0.0106827;REVB=-0.0456888;RO=63;SAF=6;SAR=13;SRF=36;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.314861;STB=0.694454;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=-0.0276716;OID=.;OPOS=11174372;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:63:63:19:19:0.231707:13:6:36:27:13:6:36:27
chr12	11174380	.	C	T	107.9	PASS	AF=0.226667;AO=17;DP=75;FAO=17;FDP=75;FR=.;FRO=58;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=34;FSRR=24;FWDB=-0.0148871;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.763;QD=5.75442;RBI=0.0165376;REFB=-0.00197859;REVB=0.00720194;RO=58;SAF=6;SAR=11;SRF=34;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.284866;STB=0.67672;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=0.00736209;OID=.;OPOS=11174380;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:58:58:17:17:0.226667:11:6:34:24:11:6:34:24
chr12	11174390	.	G	A	106.75	PASS	AF=0.220779;AO=17;DP=77;FAO=17;FDP=77;FR=.;FRO=60;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=35;FSRR=25;FWDB=0.00261672;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.889;QD=5.5452;RBI=0.0215532;REFB=0.000624891;REVB=-0.0213938;RO=59;SAF=6;SAR=11;SRF=34;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.274007;STB=0.675959;STBP=0.115;TYPE=snp;VARB=-0.00667991;OID=.;OPOS=11174390;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:59:60:17:17:0.220779:11:6:34:25:11:6:35:25
chr12	11174397	.	T	A	108.48	PASS	AF=0.22973;AO=17;DP=74;FAO=17;FDP=74;FR=.;FRO=57;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=33;FSRR=24;FWDB=0.00136666;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=215.984;QD=5.86394;RBI=0.023071;REFB=0.00268897;REVB=-0.0230305;RO=57;SAF=6;SAR=11;SRF=33;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.276219;STB=0.671164;STBP=0.128;TYPE=snp;VARB=-0.0149856;OID=.;OPOS=11174397;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:57:57:17:17:0.22973:11:6:33:24:11:6:33:24
chr12	11174416	.	A	G	101.41	PASS	AF=0.228571;AO=16;DP=70;FAO=16;FDP=70;FR=.;FRO=54;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=30;FSRR=24;FWDB=-0.00803244;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.5486;QD=5.79498;RBI=0.0244744;REFB=0.00835095;REVB=0.0231187;RO=54;SAF=6;SAR=10;SRF=30;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.221766;STB=0.638126;STBP=0.218;TYPE=snp;VARB=-0.0291955;OID=.;OPOS=11174416;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:54:54:16:16:0.228571:10:6:30:24:10:6:30:24
chr12	11174753	.	G	A	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0221652;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.326;QD=56.1916;RBI=0.0576902;REFB=0;REVB=0.0532623;RO=0;SAF=15;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000145912;OID=.;OPOS=11174753;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:13:15:0:0:13:15:0:0
chr12	11183046	.	C	T	48.39	PASS	AF=0.0824742;AO=16;DP=194;FAO=16;FDP=194;FR=.;FRO=178;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=88;FSRR=90;FWDB=-0.0604629;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.1168;QD=0.997773;RBI=0.0663129;REFB=-0.00357081;REVB=0.0272331;RO=178;SAF=6;SAR=10;SRF=88;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137435;STB=0.610251;STBP=0.37;TYPE=snp;VARB=0.0207904;OID=.;OPOS=11183046;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:48:194:194:178:178:16:16:0.0824742:10:6:88:90:10:6:88:90
chr12	11183052	.	G	A	36.82	PASS	AF=0.0707071;AO=14;DP=198;FAO=14;FDP=198;FR=.;FRO=184;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=92;FSRR=92;FWDB=-0.0189984;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.375;QD=0.743857;RBI=0.0399279;REFB=-0.000797938;REVB=-0.0351183;RO=183;SAF=4;SAR=10;SRF=92;SRR=91;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.239031;STB=0.701463;STBP=0.128;TYPE=snp;VARB=0.0152176;OID=.;OPOS=11183052;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:198:198:183:184:14:14:0.0707071:10:4:92:91:10:4:92:92
chr12	11183066	.	A	T	38.94	PASS	AF=0.0744681;AO=14;DP=188;FAO=14;FDP=188;FR=.;FRO=174;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=87;FSRR=87;FWDB=-0.010488;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=291.024;QD=0.828571;RBI=0.0105468;REFB=0.00102646;REVB=0.00111218;RO=174;SAF=4;SAR=10;SRF=87;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.239744;STB=0.700788;STBP=0.149;TYPE=snp;VARB=-0.0134504;OID=.;OPOS=11183066;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:188:188:174:174:14:14:0.0744681:10:4:87:87:10:4:87:87
chr12	11183217	.	C	T	236.0	PASS	AF=0.383562;AO=28;DP=73;FAO=28;FDP=73;FR=.;FRO=45;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=33;FWDB=0.00826686;FXX=0.0266631;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.832;QD=12.9314;RBI=0.0160609;REFB=-0.0141654;REVB=-0.01377;RO=45;SAF=13;SAR=15;SRF=12;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.21946;STB=0.624543;STBP=0.116;TYPE=snp;VARB=0.0120975;OID=.;OPOS=11183217;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:45:45:28:28:0.383562:15:13:12:33:15:13:12:33
chr12	11183255	.	G	A	192.67	PASS	AF=0.423077;AO=22;DP=52;FAO=22;FDP=52;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=6;FSRR=24;FWDB=0.0141211;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.738;QD=14.8205;RBI=0.0141459;REFB=0.00421715;REVB=-0.00083713;RO=30;SAF=8;SAR=14;SRF=6;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.191251;STB=0.607912;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=-0.00718944;OID=.;OPOS=11183255;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:30:30:22:22:0.423077:14:8:6:24:14:8:6:24
chr12	11183451	.	A	T	1116.9	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0139662;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.259;QD=60.3732;RBI=0.0364398;REFB=0;REVB=-0.0336572;RO=0;SAF=41;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000160427;OID=.;OPOS=11183451;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:33:41:0:0:33:41:0:0
chr12	11183512	.	A	G	344.06	PASS	AF=0.5;AO=36;DP=72;FAO=36;FDP=72;FR=.;FRO=36;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=21;FSRR=15;FWDB=-0.032101;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2172;QD=19.1143;RBI=0.0324287;REFB=-0.00402504;REVB=-0.00459848;RO=36;SAF=19;SAR=17;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0502433;STB=0.527935;STBP=0.671;TYPE=snp;VARB=0.00359536;OID=.;OPOS=11183512;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:36:36:36:36:0.5:17:19:21:15:17:19:21:15
chr12	11183576	.	T	C	49.26	PASS	AF=0.147541;AO=9;DP=61;FAO=9;FDP=61;FR=.;FRO=52;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=35;FSRR=17;FWDB=0.0301978;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.0388;QD=3.23044;RBI=0.0302485;REFB=-0.00177314;REVB=-0.00174953;RO=52;SAF=5;SAR=4;SRF=35;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151321;STB=0.603558;STBP=0.563;TYPE=snp;VARB=0.0127642;OID=.;OPOS=11183576;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:49:61:61:52:52:9:9:0.147541:4:5:35:17:4:5:35:17
chr12	11183642	.	A	G	150.32	PASS	AF=0.346939;AO=17;DP=49;FAO=17;FDP=49;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=21;FSRR=11;FWDB=-0.00356211;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.0394;QD=12.2706;RBI=0.00586137;REFB=-0.0243611;REVB=-0.00465479;RO=32;SAF=10;SAR=7;SRF=21;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.07942;STB=0.546546;STBP=0.662;TYPE=snp;VARB=0.0466219;OID=.;OPOS=11183642;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:32:32:17:17:0.346939:7:10:21:11:7:10:21:11
chr12	11183676	.	C	T	146.85	PASS	AF=0.346154;AO=18;DP=52;FAO=18;FDP=52;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=-0.00852721;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.333;QD=11.2961;RBI=0.0100175;REFB=-0.0122657;REVB=0.00525705;RO=34;SAF=10;SAR=8;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00368238;STB=0.502162;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0214339;OID=.;OPOS=11183676;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:34:34:18:18:0.346154:8:10:19:15:8:10:19:15
chr12	11183697	.	C	A	90.43	PASS	AF=0.26087;AO=12;DP=46;FAO=12;FDP=46;FR=.;FRO=34;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=-0.0355827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.9774;QD=7.86316;RBI=0.0559408;REFB=-0.014774;REVB=-0.0431652;RO=34;SAF=6;SAR=6;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0350619;STB=0.521703;STBP=0.877;TYPE=snp;VARB=0.0183657;OID=.;OPOS=11183697;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:90:46:46:34:34:12:12:0.26087:6:6:18:16:6:6:18:16
chr12	11183722	.	A	C	41.09	PASS	AF=0.159091;AO=7;DP=44;FAO=7;FDP=44;FR=.;FRO=37;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=-0.0119601;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=76.8896;QD=3.73508;RBI=0.0201114;REFB=0.00103366;REVB=0.0161686;RO=37;SAF=5;SAR=2;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.219172;STB=0.654711;STBP=0.455;TYPE=snp;VARB=-0.009589;OID=.;OPOS=11183722;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:44:44:37:37:7:7:0.159091:2:5:20:17:2:5:20:17
chr12	11183752	.	T	C	41.66	PASS	AF=0.175;AO=7;DP=40;FAO=7;FDP=40;FR=.;FRO=33;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=0.00154742;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.377;QD=4.16604;RBI=0.0115873;REFB=0.0027544;REVB=0.0114835;RO=33;SAF=5;SAR=2;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179687;STB=0.624626;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=-0.0114476;OID=.;OPOS=11183752;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:40:40:33:33:7:7:0.175:2:5:19:14:2:5:19:14
chr12	11183832	.	G	A	94.56	PASS	AF=0.611111;AO=11;DP=18;FAO=11;FDP=18;FR=.;FRO=7;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.00526648;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.618;QD=21.014;RBI=0.0123245;REFB=-0.000962719;REVB=-0.0111426;RO=7;SAF=6;SAR=5;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.175522;STB=0.599822;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.000617044;OID=.;OPOS=11183832;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:18:18:7:7:11:11:0.611111:5:6:2:5:5:6:2:5
chr12	11214145	.	C	T	695.27	PASS	AF=0.485915;AO=69;DP=145;FAO=69;FDP=142;FR=.;FRO=73;FSAF=41;FSAR=28;FSRF=34;FSRR=39;FWDB=-0.0190877;FXX=0.0206882;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.149;QD=19.5849;RBI=0.0198336;REFB=-0.00406971;REVB=-0.005388;RO=71;SAF=41;SAR=28;SRF=34;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107312;STB=0.566723;STBP=0.137;TYPE=snp;VARB=0.00854195;OID=.;OPOS=11214145;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:145:142:71:73:69:69:0.485915:28:41:34:37:28:41:34:39
chr12	11214212	.	A	T	637.2	PASS	AF=0.507937;AO=64;DP=126;FAO=64;FDP=126;FR=.;FRO=62;FSAF=31;FSAR=33;FSRF=30;FSRR=32;FWDB=-0.00158818;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=256.999;QD=20.2284;RBI=0.0243062;REFB=-0.0150692;REVB=-0.0242542;RO=62;SAF=31;SAR=33;SRF=30;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000450495;STB=0.500248;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0134178;OID=.;OPOS=11214212;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:126:126:62:62:64:64:0.507937:33:31:30:32:33:31:30:32
chr12	11244166	.	G	C	582.4	PASS	AF=0.975;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-3.14563e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.692;QD=58.24;RBI=0.00981494;REFB=0.0354283;REVB=0.00981489;RO=1;SAF=27;SAR=12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0170496;STB=0.509086;STBP=0.604;TYPE=snp;VARB=4.13962e-05;OID=.;OPOS=11244166;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:40:40:1:1:39:39:0.975:12:27:1:0:12:27:1:0
chr12	11244194	.	T	C	689.37	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.037694;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.413;QD=62.6699;RBI=0.0390031;REFB=0;REVB=-0.0100202;RO=0;SAF=28;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00013088;OID=.;OPOS=11244194;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:16:28:0:0:16:28:0:0
chr12	11244725	.	C	G	224.22	PASS	AF=0.904762;AO=19;DP=21;FAO=19;FDP=21;FR=.;FRO=2;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00474289;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=274.998;QD=42.7088;RBI=0.00757326;REFB=-0.0360029;REVB=-0.00590417;RO=2;SAF=8;SAR=11;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101867;STB=0.555497;STBP=0.141;TYPE=snp;VARB=0.00286939;OID=.;OPOS=11244725;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:21:21:2:2:19:19:0.904762:11:8:2:0:11:8:2:0
chr12	11286088	.	A	C	589.95	PASS	AF=0.4375;AO=62;DP=143;FAO=63;FDP=144;FR=.;FRO=81;FSAF=27;FSAR=36;FSRF=42;FSRR=39;FWDB=-0.0186409;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=46.0383;QD=16.3874;RBI=0.0209225;REFB=0.0164839;REVB=0.00950095;RO=81;SAF=26;SAR=36;SRF=42;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101223;STB=0.550882;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=-0.0235585;OID=.;OPOS=11286088;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:143:144:81:81:62:63:0.4375:36:26:42:39:36:27:42:39
chr12	11338613	.	CA	GG	243.44	PASS	AF=1;AO=18;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0123396;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=280.93;QD=48.6881;RBI=0.0162897;REFB=0;REVB=0.0106344;RO=0;SAF=11;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.00365964;OID=.;OPOS=11338613;OREF=CA;OALT=GG;OMAPALT=GG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:18:20:1:7:11:0:0:7:13:0:0
chr12	11338669	.	C	T	359.43	PASS	AF=0.513889;AO=37;DP=72;FAO=37;FDP=72;FR=.;FRO=35;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=21;FSRR=14;FWDB=-0.025602;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.485;QD=19.9685;RBI=0.0263475;REFB=0.00323299;REVB=-0.00622297;RO=35;SAF=19;SAR=18;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.076034;STB=0.542146;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=-0.0044261;OID=.;OPOS=11338669;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:35:35:37:37:0.513889:18:19:21:14:18:19:21:14
chr12	11338750	.	T	C	370.55	PASS	AF=0.4;AO=40;DP=100;FAO=40;FDP=100;FR=.;FRO=60;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=39;FSRR=21;FWDB=-0.00195973;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.051;QD=14.8218;RBI=0.0220687;REFB=0.00525877;REVB=0.0219816;RO=60;SAF=17;SAR=23;SRF=39;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.234783;STB=0.632549;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=-0.00733842;OID=.;OPOS=11338750;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:60:60:40:40:0.4:23:17:39:21:23:17:39:21
chr12	11338781	.	C	A	1436.8	PASS	AF=0.989247;AO=92;DP=93;FAO=92;FDP=93;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0159499;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.4527;QD=61.7981;RBI=0.0401483;REFB=0.0337339;REVB=-0.0368441;RO=0;SAF=45;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.9386e-08;STB=0.505262;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=-0.000511956;OID=.;OPOS=11338781;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:93:93:0:1:92:92:0.989247:47:45:0:0:47:45:0:1
chr12	11338957	.	A	G	32.23	PASS	AF=0.625;AO=5;DP=8;FAO=5;FDP=8;FR=.;FRO=3;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.105214;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.6071;QD=16.1145;RBI=0.11009;REFB=-0.0714839;REVB=-0.0324019;RO=3;SAF=2;SAR=3;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0436878;STB=0.526212;STBP=0.986;TYPE=snp;VARB=0.0281187;OID=.;OPOS=11338957;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:8:8:3:3:5:5:0.625:3:2:1:2:3:2:1:2
chr12	11338983	.	T	C	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.12327;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.397;QD=33.428;RBI=0.127585;REFB=0;REVB=-0.0329002;RO=0;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00190266;OID=.;OPOS=11338983;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:4:2:0:0:4:2:0:0
chr12	11418954	.	A	G	211.75	PASS	AF=0.488372;AO=21;DP=43;FAO=21;FDP=43;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=0.0183099;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.843;QD=19.6972;RBI=0.0184592;REFB=-0.00120826;REVB=-0.00234296;RO=22;SAF=9;SAR=12;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104038;STB=0.558567;STBP=0.486;TYPE=snp;VARB=0.00130937;OID=.;OPOS=11418954;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:22:22:21:21:0.488372:12:9:7:15:12:9:7:15
chr12	11461292	.	C	G	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0392627;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.349;QD=33.4285;RBI=0.084614;REFB=0;REVB=-0.0749531;RO=0;SAF=5;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00126362;OID=.;OPOS=11461292;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:1:5:0:0:1:5:0:0
chr12	11462275	.	A	G	545.22	PASS	AF=0.973684;AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00260717;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=255.196;QD=57.3915;RBI=0.0106225;REFB=-0.0264153;REVB=-0.0102975;RO=1;SAF=14;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.019929;STB=0.510633;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=6.73612e-05;OID=.;OPOS=11462275;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:38:38:1:1:37:37:0.973684:23:14:0:1:23:14:0:1
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chr12	12240159	.	A	C	187.92	PASS	AF=0.347826;AO=24;DP=69;FAO=24;FDP=69;FR=.;FRO=45;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=23;FSRR=22;FWDB=-0.0131448;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=325.34;QD=10.8937;RBI=0.0132974;REFB=0.001227;REVB=0.0020091;RO=45;SAF=11;SAR=13;SRF=23;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0591926;STB=0.534433;STBP=0.689;TYPE=snp;VARB=-0.00207135;OID=.;OPOS=12240159;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:45:45:24:24:0.347826:13:11:23:22:13:11:23:22
chr12	12301898	.	C	T	1012.29	PASS	AF=0.985915;AO=69;DP=70;FAO=70;FDP=71;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00570373;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.7869;QD=57.0305;RBI=0.00757905;REFB=-0.0994831;REVB=0.00499095;RO=0;SAF=33;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.36169e-08;STB=0.507461;STBP=0.327;TYPE=snp;VARB=0.0026724;OID=.;OPOS=12301898;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:70:71:0:1:69:70:0.985915:36:33:0:0:37:33:1:0
chr12	12483134	.	T	A	291.52	PASS	AF=0.714286;AO=25;DP=35;FAO=25;FDP=35;FR=.;FRO=10;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=0.0178941;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=264.783;QD=33.3166;RBI=0.0234437;REFB=0.00566732;REVB=-0.0151462;RO=10;SAF=12;SAR=13;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0625578;STB=0.534219;STBP=0.537;TYPE=snp;VARB=-0.0021603;OID=.;OPOS=12483134;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:71:35:35:10:10:25:25:0.714286:13:12:6:4:13:12:6:4
chr12	12618690	.	G	A	89.0	PASS	AF=0.769231;AO=10;DP=13;FAO=10;FDP=13;FR=.;FRO=3;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0132704;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.692;QD=27.3838;RBI=0.0161334;REFB=-0.0190374;REVB=0.00917524;RO=3;SAF=5;SAR=5;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0680236;STB=0.538385;STBP=0.694;TYPE=snp;VARB=0.00876091;OID=.;OPOS=12618690;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:13:13:3:3:10:10:0.769231:5:5:2:1:5:5:2:1
chr12	12672899	.	G	A	304.88	PASS	AF=0.586957;AO=27;DP=46;FAO=27;FDP=46;FR=.;FRO=19;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.0468776;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.213;QD=26.511;RBI=0.0468789;REFB=-0.00243361;REVB=-0.000348613;RO=19;SAF=17;SAR=10;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0400468;STB=0.522168;STBP=0.729;TYPE=snp;VARB=0.00150917;OID=.;OPOS=12672899;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:19:19:27:27:0.586957:10:17:11:8:10:17:11:8
chr12	12814818	.	C	T	820.65	PASS	AF=0.983051;AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0101823;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=123.244;QD=55.6375;RBI=0.0375511;REFB=-0.0121312;REVB=-0.0361442;RO=0;SAF=23;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.510635;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=-0.000452684;OID=.;OPOS=12814818;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:59:59:0:1:58:58:0.983051:35:23:0:0:35:23:1:0
chr12	12941884	.	C	T	242.15	PASS	AF=0.473684;AO=27;DP=57;FAO=27;FDP=57;FR=.;FRO=30;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=0.0174845;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.243;QD=16.9927;RBI=0.0254781;REFB=0.00056253;REVB=-0.0185318;RO=30;SAF=16;SAR=11;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179592;STB=0.600962;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=-0.00047257;OID=.;OPOS=12941884;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:30:30:27:27:0.473684:11:16:12:18:11:16:12:18
chr12	12941956	.	A	ATCCT	184.08	PASS	AF=0.407407;AO=20;DP=56;FAO=22;FDP=54;FR=.;FRO=32;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=-0.00262202;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=4;MLLD=308.515;QD=13.6356;RBI=0.00369547;REFB=-0.00224528;REVB=-0.00260413;RO=33;SAF=14;SAR=6;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.301953;STB=0.665377;STBP=0.06;TYPE=ins;VARB=0.00411005;OID=.;OPOS=12941957;OREF=-;OALT=TCCT;OMAPALT=ATCCT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.407407:20:56:22:54:32:15:7:13:19:99:33:14:6:14:19
chr12	13028652	.	CA	C,CG	253.77	PASS	AF=0.15,0.85;AO=3,15;DP=19;FAO=3,17;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=3,5;FSAR=0,12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0594027,0.0709567;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=191.807,211.079;QD=50.7539;RBI=0.0594046,0.0709866;REFB=0,0;REVB=-0.000473921,0.00205966;RO=0;SAF=3,3;SAR=0,12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.00675334,0.0073976;OID=.,.;OPOS=13028653,13028653;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=C,CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.15,0.85:3,15:19:3,17:20:0:3,5:0,12:0:0:6:0:3,3:0,12:0:0
chr12	13061294	.	C	T	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00474671;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=321.006;QD=44.6898;RBI=0.0127863;REFB=0;REVB=0.0118725;RO=0;SAF=7;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.58095e-05;OID=.;OPOS=13061294;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:6:7:0:0:6:7:0:0
chr12	13102605	.	G	A	150.11	PASS	AF=0.516129;AO=16;DP=31;FAO=16;FDP=31;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.0150905;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.675;QD=19.3689;RBI=0.015423;REFB=-0.0061267;REVB=0.00318504;RO=15;SAF=9;SAR=7;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0251235;STB=0.514268;STBP=0.914;TYPE=snp;VARB=0.00528007;OID=.;OPOS=13102605;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:15:15:16:16:0.516129:7:9:8:7:7:9:8:7
chr12	13136623	.	T	A,C	574.09	PASS	AF=0.0952381,0.857143;AO=6,33;DP=41;FAO=4,36;FDP=42;FR=.;FRO=2;FSAF=3,17;FSAR=1,19;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0412019,-0.0120898;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=53.0044,121.771;QD=54.6755;RBI=0.0718069,0.0556018;REFB=-0.0399007,-0.012125;REVB=-0.0588101,-0.0542715;RO=1;SAF=5,14;SAR=1,19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.281147,0.0239571;STB=0.599463,0.501465;STBP=0.601,0.863;TYPE=snp,snp;VARB=0.0594995,0.000287072;OID=.,.;OPOS=13136623,13136623;OREF=T,T;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:18:41:42:1:2:6,33:4,36:0.0952381,0.857143:1,19:5,14:0:1:1,19:3,17:1:1
chr12	13208552	.	C	T	298.99	PASS	AF=0.395349;AO=34;DP=87;FAO=34;FDP=86;FR=.;FRO=52;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=21;FSRR=31;FWDB=0.00404694;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.4762;QD=13.9063;RBI=0.0306698;REFB=0.0028507;REVB=-0.0304017;RO=51;SAF=16;SAR=18;SRF=21;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0626048;STB=0.540666;STBP=0.563;TYPE=snp;VARB=-0.00448808;OID=.;OPOS=13208552;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:86:51:52:34:34:0.395349:18:16:21:30:18:16:21:31
chr12	13214537	.	A	G	261.62	PASS	AF=0.422535;AO=30;DP=71;FAO=30;FDP=71;FR=.;FRO=41;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=0.0135098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.662;QD=14.7391;RBI=0.0379596;REFB=-0.0128688;REVB=-0.0354742;RO=41;SAF=13;SAR=17;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00589286;STB=0.503341;STBP=0.976;TYPE=snp;VARB=0.0136629;OID=.;OPOS=13214537;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:41:41:30:30:0.422535:17:13:18:23:17:13:18:23
chr12	13221606	.	T	C	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00983084;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=94.3842;QD=56.1912;RBI=0.0110573;REFB=0;REVB=-0.00506141;RO=0;SAF=9;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.62669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000192054;OID=.;OPOS=13221606;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:19:9:0:0:19:9:0:0
chr12	13349823	.	C	T	455.32	PASS	AF=0.55;AO=44;DP=80;FAO=44;FDP=80;FR=.;FRO=36;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=12;FSRR=24;FWDB=0.0422441;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.7438;QD=22.7662;RBI=0.0441634;REFB=0.0014125;REVB=0.012878;RO=36;SAF=25;SAR=19;SRF=12;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190303;STB=0.604565;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=-0.000852413;OID=.;OPOS=13349823;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:36:36:44:44:0.55:19:25:12:24:19:25:12:24
chr12	13369196	.	C	T	799.71	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0390673;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.9369;QD=57.1219;RBI=0.0501261;REFB=0;REVB=-0.0314066;RO=0;SAF=26;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.29784e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000796438;OID=.;OPOS=13369196;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:30:26:0:0:30:26:0:0
chr12	13525603	.	T	G	221.85	PASS	AF=0.578947;AO=21;DP=37;FAO=22;FDP=38;FR=.;FRO=16;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=-0.00105546;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=156.08;QD=23.3522;RBI=0.00217353;REFB=0.010852;REVB=-0.00190006;RO=16;SAF=11;SAR=10;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162899;STB=0.59707;STBP=0.163;TYPE=snp;VARB=-0.00840322;OID=.;OPOS=13525603;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:38:16:16:21:22:0.578947:10:11:5:11:10:12:5:11
chr12	13526328	.	G	T	253.91	PASS	AF=0.510638;AO=24;DP=47;FAO=24;FDP=47;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=0.0503314;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.5958;QD=21.6094;RBI=0.0519414;REFB=-0.00606884;REVB=-0.0128318;RO=23;SAF=12;SAR=12;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.056906;STB=0.531888;STBP=0.669;TYPE=snp;VARB=0.00738627;OID=.;OPOS=13526328;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:23:23:24:24:0.510638:12:12:10:13:12:12:10:13
chr12	13593879	.	G	A	613.34	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0671664;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.136;QD=61.334;RBI=0.0677624;REFB=0;REVB=0.00896724;RO=0;SAF=15;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000128199;OID=.;OPOS=13593879;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:25:15:0:0:25:15:0:0
chr12	13715975	.	A	G	240.11	PASS	AF=0.490566;AO=27;DP=53;FAO=26;FDP=53;FR=.;FRO=27;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=0.00874717;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.09;QD=18.1216;RBI=0.00922983;REFB=-0.00794641;REVB=-0.00294562;RO=26;SAF=17;SAR=10;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150845;STB=0.609779;STBP=0.134;TYPE=snp;VARB=0.00721732;OID=.;OPOS=13715975;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:26:27:27:26:0.490566:10:17:12:14:9:17:12:15
chr12	13717508	.	G	A	250.38	PASS	AF=0.48;AO=24;DP=50;FAO=24;FDP=50;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=-0.00280307;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.256;QD=20.03;RBI=0.0173219;REFB=-0.0175191;REVB=0.0170936;RO=26;SAF=14;SAR=10;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147764;STB=0.583264;STBP=0.27;TYPE=snp;VARB=0.016293;OID=.;OPOS=13717508;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:26:26:24:24:0.48:10:14:11:15:10:14:11:15
chr12	14018777	.	G	C	896.07	PASS	AF=0.984127;AO=61;DP=62;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.124588;FXX=0.0307645;HRUN=5;LEN=1;MLLD=113.577;QD=56.8934;RBI=0.124651;REFB=0.0292464;REVB=0.0039543;RO=1;SAF=27;SAR=34;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0171613;STB=0.508769;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=0.000269677;OID=.;OPOS=14018777;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:62:63:1:1:61:62:0.984127:34:27:1:0:34:28:1:0
chr12	14019128	.	C	T	80.95	PASS	AF=0.268293;AO=11;DP=41;FAO=11;FDP=41;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=0.000343146;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=235.955;QD=7.89733;RBI=0.0155114;REFB=-0.0116069;REVB=-0.0155076;RO=30;SAF=8;SAR=3;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.281301;STB=0.675723;STBP=0.216;TYPE=snp;VARB=0.0346878;OID=.;OPOS=14019128;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:80:41:41:30:30:11:11:0.268293:3:8:15:15:3:8:15:15
chr12	14577892	.	A	T	201.98	PASS	AF=0.526316;AO=20;DP=38;FAO=20;FDP=38;FR=.;FRO=18;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=5;FWDB=-0.0254928;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.0833;QD=21.2614;RBI=0.0413312;REFB=0.00239026;REVB=0.0325329;RO=15;SAF=12;SAR=8;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0539316;STB=0.561738;STBP=0.495;TYPE=snp;VARB=-0.00491437;OID=.;OPOS=14577892;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:15:18:20:20:0.526316:8:12:10:5:8:12:13:5
chr12	14587301	.	A	G	226.98	PASS	AF=0.448276;AO=26;DP=58;FAO=26;FDP=58;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=-0.0108075;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=312.168;QD=15.6538;RBI=0.0125926;REFB=-0.00196819;REVB=0.00646305;RO=32;SAF=14;SAR=12;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0070653;STB=0.503997;STBP=0.964;TYPE=snp;VARB=0.00255451;OID=.;OPOS=14587301;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:32:32:26:26:0.448276:12:14:17:15:12:14:17:15
chr12	14656768	.	G	C	382.1	PASS	AF=0.506494;AO=38;DP=77;FAO=39;FDP=77;FR=.;FRO=38;FSAF=27;FSAR=12;FSRF=31;FSRR=7;FWDB=-0.0441185;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.7592;QD=19.8494;RBI=0.0905077;REFB=-0.00211236;REVB=0.0790266;RO=38;SAF=27;SAR=11;SRF=31;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122473;STB=0.575647;STBP=0.255;TYPE=snp;VARB=0.00240076;OID=.;OPOS=14656768;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:38:38:38:39:0.506494:11:27:31:7:12:27:31:7
chr12	14664250	.	A	G	154.1	PASS	AF=0.395349;AO=17;DP=43;FAO=17;FDP=43;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=20;FWDB=0.00942378;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.418;QD=14.3348;RBI=0.0321147;REFB=-0.0218249;REVB=0.030701;RO=26;SAF=7;SAR=10;SRF=6;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.205213;STB=0.617521;STBP=0.278;TYPE=snp;VARB=0.0245052;OID=.;OPOS=14664250;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:26:26:17:17:0.395349:10:7:6:20:10:7:6:20
chr12	14664595	.	A	G	113.73	PASS	AF=0.52;AO=13;DP=25;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=-0.00213005;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.888;QD=18.196;RBI=0.0394135;REFB=-0.0131903;REVB=0.0393559;RO=12;SAF=5;SAR=8;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.234295;STB=0.633942;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.010021;OID=.;OPOS=14664595;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:25:12:12:13:13:0.52:8:5:8:4:8:5:8:4
chr12	14688644	.	C	T	1026.34	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0150634;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.922;QD=59.4978;RBI=0.0168454;REFB=0;REVB=-0.00754072;RO=0;SAF=20;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.28744e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.57481e-05;OID=.;OPOS=14688644;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:49:20:0:0:49:20:0:0
chr12	14794062	.	G	A	1181.8	PASS	AF=0.975309;AO=81;DP=81;FAO=79;FDP=81;FR=.;FRO=2;FSAF=43;FSAR=36;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00648309;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.3961;QD=58.3607;RBI=0.00987396;REFB=-0.0476781;REVB=-0.00744746;RO=0;SAF=45;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.42691e-08;STB=0.511361;STBP=0.233;TYPE=snp;VARB=0.00128684;OID=.;OPOS=14794062;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:81:81:0:2:81:79:0.975309:36:45:0:0:36:43:2:0
chr12	14827463	.	AATC	A	230.38	PASS	AF=0.430233;AO=35;DP=85;FAO=37;FDP=86;FR=.;FRO=49;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=23;FSRR=26;FWDB=-0.00154668;FXX=0.0227247;HRUN=2;LEN=3;MLLD=329.49;QD=10.7153;RBI=0.0128072;REFB=0.00019241;REVB=-0.0127135;RO=48;SAF=16;SAR=19;SRF=23;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0226377;STB=0.505686;STBP=0.937;TYPE=del;VARB=-0.000237489;OID=.;OPOS=14827464;OREF=ATC;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.430233:35:85:37:86:49:17:20:23:26:99:48:16:19:23:25
chr12	14829893	.	A	C	4231.2	PASS	AF=0.992727;AO=271;DP=275;FAO=273;FDP=275;FR=.;FRO=2;FSAF=139;FSAR=134;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0289256;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.2993;QD=61.5447;RBI=0.0593815;REFB=-0.109136;REVB=0.0518602;RO=4;SAF=139;SAR=132;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00729344;STB=0.500067;STBP=0.86;TYPE=snp;VARB=0.00102602;OID=.;OPOS=14829893;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:275:275:4:2:271:273:0.992727:132:139:1:3:134:139:1:1
chr12	14927825	.	C	G	134.24	PASS	AF=0.454545;AO=15;DP=33;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.00754646;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=276.385;QD=16.2717;RBI=0.00980377;REFB=-0.00239923;REVB=-0.00625818;RO=18;SAF=6;SAR=9;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.043351;STB=0.524966;STBP=0.802;TYPE=snp;VARB=0.00304807;OID=.;OPOS=14927825;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:18:18:15:15:0.454545:9:6:8:10:9:6:8:10
chr12	14927994	.	T	C	788.83	PASS	AF=1;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0135147;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.4322;QD=64.3941;RBI=0.0221483;REFB=0;REVB=-0.017547;RO=0;SAF=32;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.70321e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000233293;OID=.;OPOS=14927994;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:49:0:0:49:49:1:17:32:0:0:17:32:0:0
chr12	14928016	.	G	T	273.14	PASS	AF=0.555556;AO=22;DP=43;FAO=25;FDP=45;FR=.;FRO=20;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.0040373;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=162.936;QD=24.2788;RBI=0.00675162;REFB=-0.0345938;REVB=-0.00541152;RO=8;SAF=17;SAR=5;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0742047;STB=0.563301;STBP=0.378;TYPE=snp;VARB=0.012641;OID=.;OPOS=14928016;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:45:8:20:22:25:0.555556:5:17:7:1:8:17:11:9
chr12	14929872	.	A	G	754.42	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0269886;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.711;QD=56.9372;RBI=0.0362286;REFB=0;REVB=0.0241687;RO=0;SAF=29;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000214038;OID=.;OPOS=14929872;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:24:29:0:0:24:29:0:0
chr12	14930055	.	G	T	613.08	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00835417;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=101.65;QD=61.3083;RBI=0.0244056;REFB=0;REVB=0.0229313;RO=0;SAF=16;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.38627e-05;OID=.;OPOS=14930055;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:24:16:0:0:24:16:0:0
chr12	14959391	.	T	C	245.27	PASS	AF=0.337079;AO=30;DP=89;FAO=30;FDP=89;FR=.;FRO=59;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=27;FSRR=32;FWDB=0.00606049;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=222.26;QD=11.0235;RBI=0.00877721;REFB=-0.00423313;REVB=-0.00634901;RO=59;SAF=13;SAR=17;SRF=27;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0280889;STB=0.516314;STBP=0.831;TYPE=snp;VARB=0.00594647;OID=.;OPOS=14959391;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:59:59:30:30:0.337079:17:13:27:32:17:13:27:32
chr12	14976063	.	A	G	180.48	PASS	AF=0.422222;AO=19;DP=45;FAO=19;FDP=45;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=0.00252569;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=268.372;QD=16.0426;RBI=0.0167812;REFB=0.00556792;REVB=0.01659;RO=26;SAF=10;SAR=9;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0904698;STB=0.551833;STBP=0.563;TYPE=snp;VARB=-0.00799668;OID=.;OPOS=14976063;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:26:26:19:19:0.422222:9:10:16:10:9:10:16:10
chr12	14976178	.	T	A	257.09	PASS	AF=0.453125;AO=29;DP=64;FAO=29;FDP=64;FR=.;FRO=35;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=22;FSRR=13;FWDB=-0.0052463;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.044;QD=16.0678;RBI=0.00908223;REFB=-0.00681793;REVB=-0.00741372;RO=35;SAF=10;SAR=19;SRF=22;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.275122;STB=0.655065;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.0122566;OID=.;OPOS=14976178;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:35:35:29:29:0.453125:19:10:22:13:19:10:22:13
chr12	14982352	.	G	C	1138.35	PASS	AF=0.453184;AO=120;DP=267;FAO=121;FDP=267;FR=.;FRO=146;FSAF=57;FSAR=64;FSRF=59;FSRR=87;FWDB=0.0351432;FXX=0.0037312;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.8953;QD=17.0539;RBI=0.0402825;REFB=0.00567504;REVB=0.0196885;RO=143;SAF=56;SAR=64;SRF=58;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0606123;STB=0.536891;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=-0.00467131;OID=.;OPOS=14982352;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:267:267:143:146:120:121:0.453184:64:56:58:85:64:57:59:87
chr12	14993439	.	C	T	165.73	PASS	AF=0.391304;AO=18;DP=46;FAO=18;FDP=46;FR=.;FRO=28;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.0177964;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=298.356;QD=14.4116;RBI=0.0193859;REFB=0.00194334;REVB=-0.00768771;RO=28;SAF=5;SAR=13;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.250913;STB=0.646426;STBP=0.115;TYPE=snp;VARB=-0.00289415;OID=.;OPOS=14993439;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:28:28:18:18:0.391304:13:5:14:14:13:5:14:14
chr12	14993608	.	G	A	531.08	PASS	AF=0.529412;AO=52;DP=102;FAO=54;FDP=102;FR=.;FRO=48;FSAF=31;FSAR=23;FSRF=26;FSRR=22;FWDB=0.00515083;FXX=0.0192289;HRUN=1;LEN=1;MLLD=302.348;QD=20.8268;RBI=0.00728083;REFB=-0.00834204;REVB=-0.00514582;RO=50;SAF=30;SAR=22;SRF=27;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0333563;STB=0.515515;STBP=0.769;TYPE=snp;VARB=0.00718998;OID=.;OPOS=14993608;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:50:48:52:54:0.529412:22:30:27:23:23:31:26:22
chr12	14993854	.	A	G	227.15	PASS	AF=0.511628;AO=22;DP=43;FAO=22;FDP=43;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=-0.0140203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.16;QD=21.1306;RBI=0.0168975;REFB=-0.0122003;REVB=0.00943173;RO=21;SAF=11;SAR=11;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0620553;STB=0.534852;STBP=0.658;TYPE=snp;VARB=0.00680276;OID=.;OPOS=14993854;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:21:21:22:22:0.511628:11:11:12:9:11:11:12:9
chr12	15035081	.	T	C	355.62	PASS	AF=0.513889;AO=35;DP=70;FAO=37;FDP=72;FR=.;FRO=35;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=5.22161e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.939;QD=19.7568;RBI=0.00316583;REFB=0.00323149;REVB=0.0031654;RO=34;SAF=20;SAR=15;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0638967;STB=0.553746;STBP=0.397;TYPE=snp;VARB=-0.00262341;OID=.;OPOS=15035081;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:72:34:35:35:37:0.513889:15:20:17:17:15:22:17:18
chr12	15081897	.	AG	CA,CG	969.71	PASS	AF=0.514706,0.485294;AO=35,32;DP=68;FAO=35,33;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=18,18;FSAR=17,15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00324057,0.00431058;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=2,1;MLLD=127.172,134.204;QD=57.0417;RBI=0.0531615,0.0792808;REFB=0,0;REVB=-0.0530626,-0.0791635;RO=0;SAF=18,18;SAR=17,14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=4.11116e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.00345867,-0.00538812;OID=.,.;OPOS=15081897,15081897;OREF=AG,A;OALT=CA,C;OMAPALT=CA,CG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:68:68:0:0:35,32:35,33:0.514706,0.485294:17,14:18,18:0:0:17,15:18,18:0:0
chr12	15095558	.	C	G	551.34	PASS	AF=0.56044;AO=51;DP=91;FAO=51;FDP=91;FR=.;FRO=40;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=16;FSRR=24;FWDB=0.0298542;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.539;QD=24.2349;RBI=0.031219;REFB=-0.0280189;REVB=0.0091296;RO=40;SAF=26;SAR=25;SRF=16;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.087921;STB=0.548174;STBP=0.336;TYPE=snp;VARB=0.0180249;OID=.;OPOS=15095558;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:40:40:51:51:0.56044:25:26:16:24:25:26:16:24
chr12	15103473	.	C	T	268.75	PASS	AF=0.520833;AO=25;DP=48;FAO=25;FDP=48;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=0.00162518;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.776;QD=22.3959;RBI=0.0544908;REFB=-0.0129319;REVB=-0.0544665;RO=22;SAF=14;SAR=11;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.200566;STB=0.620596;STBP=0.109;TYPE=snp;VARB=0.0122215;OID=.;OPOS=15103473;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:22:23:25:25:0.520833:11:14:7:15:11:14:7:16
chr12	15103605	.	A	G	1822.26	PASS	AF=1;AO=119;DP=119;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.070708;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.6102;QD=61.2524;RBI=0.0724861;REFB=0;REVB=0.0159564;RO=0;SAF=52;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.0287e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000405249;OID=.;OPOS=15103605;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:119:119:0:0:119:119:1:67:52:0:0:67:52:0:0
chr12	15262179	.	G	A	187.66	PASS	AF=0.415094;AO=22;DP=54;FAO=22;FDP=53;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=-0.0104668;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.063;QD=14.163;RBI=0.0114126;REFB=-0.00875858;REVB=0.00454911;RO=31;SAF=9;SAR=13;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17463;STB=0.599909;STBP=0.263;TYPE=snp;VARB=0.0148326;OID=.;OPOS=15262179;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:53:31:31:22:22:0.415094:13:9:18:13:13:9:18:13
chr12	15776095	.	C	T	244.1	PASS	AF=0.5;AO=26;DP=52;FAO=26;FDP=52;FR=.;FRO=26;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=0.0163535;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.547;QD=18.7769;RBI=0.0243158;REFB=-0.0104074;REVB=-0.017995;RO=26;SAF=15;SAR=11;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137164;STB=0.576864;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.0112271;OID=.;OPOS=15776095;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:26:26:26:26:0.5:11:15:11:15:11:15:11:15
chr12	16189694	.	T	A	1769.38	PASS	AF=0.991525;AO=117;DP=118;FAO=117;FDP=118;FR=.;FRO=1;FSAF=55;FSAR=62;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0151087;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.491;QD=59.979;RBI=0.0232931;REFB=-0.00938249;REVB=-0.0177284;RO=1;SAF=55;SAR=62;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.008557;STB=0.504504;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=1.49547e-05;OID=.;OPOS=16189694;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:118:118:1:1:117:117:0.991525:62:55:1:0:62:55:1:0
chr12	16347308	.	G	A	1654.51	PASS	AF=1;AO=109;DP=109;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0178443;FXX=0.0267833;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.1684;QD=60.7159;RBI=0.0335318;REFB=0;REVB=-0.0283894;RO=0;SAF=50;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00138788;OID=.;OPOS=16347308;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:109:109:0:0:109:109:1:59:50:0:0:59:50:0:0
chr12	16369828	.	A	T	538.52	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.012686;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.452;QD=59.8359;RBI=0.0323606;REFB=0;REVB=0.0297704;RO=0;SAF=15;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.90297e-05;OID=.;OPOS=16369828;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:21:15:0:0:21:15:0:0
chr12	16397677	.	G	A	1478.29	PASS	AF=0.971429;AO=102;DP=105;FAO=102;FDP=105;FR=.;FRO=3;FSAF=52;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.00616736;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=226.811;QD=56.3159;RBI=0.0157243;REFB=-0.00800923;REVB=-0.0144643;RO=3;SAF=52;SAR=50;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0276146;STB=0.51456;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=6.03617e-05;OID=.;OPOS=16397677;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:105:105:3:3:102:102:0.971429:50:52:0:3:50:52:0:3
chr12	16425499	.	T	A,TA	34.12	PASS	AF=0,0.28;AO=4,13;DP=50;FAO=0,14;FDP=50;FR=.;FRO=36;FSAF=0,9;FSAR=0,5;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=-0.0783278,-0.0230467;FXX=0;HRUN=2,7;LEN=1,1;MLLD=25.4846,7.67066;QD=2.72989;RBI=0.0799642,0.0533297;REFB=-0.0547933,-0.100172;REVB=-0.0160945,-0.0480928;RO=31;SAF=3,7;SAR=1,6;SRF=15;SRR=16;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.29849,0.0633165;STB=0.5,0.624098;STBP=1,0.267;TYPE=snp,ins;VARB=0.0608045,0.107355;OID=.,.;OPOS=16425499,16425500;OREF=T,-;OALT=A,A;OMAPALT=A,TA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:34:50:50:31:36:4,13:0,14:0,0.28:1,6:3,7:15:16:0,5:0,9:17:19
chr12	16430284	.	G	A	746.87	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0363964;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.117;QD=63.5636;RBI=0.0382998;REFB=0;REVB=0.0119238;RO=0;SAF=23;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.98661e-05;OID=.;OPOS=16430284;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:24:23:0:0:24:23:0:0
chr12	18435398	.	GCCC	G	47.68	PASS	AF=0.4375;AO=7;DP=16;FAO=7;FDP=16;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.00527902;FXX=0;HRUN=4;LEN=3;MLLD=62.7089;QD=11.9196;RBI=0.0226047;REFB=0.00832338;REVB=-0.0219797;RO=9;SAF=5;SAR=2;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0.472222;SSSB=0.163877;STB=0.5997;STBP=0.569;TYPE=del;VARB=-0.0120374;OID=.;OPOS=18435399;OREF=CCC;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.4375:7:16:7:16:9:5:2:5:4:47:9:5:2:5:4
chr12	18435452	.	C	T	39.62	PASS	AF=0.5;AO=6;DP=12;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=-0.0193561;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.033;QD=13.2053;RBI=0.0385986;REFB=-0.00770877;REVB=-0.0333945;RO=6;SAF=4;SAR=2;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168138;STB=0.599699;STBP=0.611;TYPE=snp;VARB=0.0175213;OID=.;OPOS=18435452;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:12:12:6:6:6:6:0.5:2:4:5:1:2:4:5:1
chr12	18473928	.	T	C	1922.59	PASS	AF=1;AO=123;DP=123;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0308182;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.777;QD=61.5228;RBI=0.0312167;REFB=0;REVB=0.00497249;RO=0;SAF=57;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000495173;OID=.;OPOS=18473928;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:123:125:0:0:123:125:1:66:57:0:0:66:59:0:0
chr12	18499636	.	C	T	357.46	PASS	AF=0.44186;AO=38;DP=87;FAO=38;FDP=86;FR=.;FRO=48;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=24;FWDB=-0.0162496;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.5116;QD=16.6259;RBI=0.018849;REFB=-0.00683567;REVB=0.00955181;RO=49;SAF=24;SAR=14;SRF=24;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145613;STB=0.575717;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.0132095;OID=.;OPOS=18499636;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:86:49:48:38:38:0.44186:14:24:24:25:14:24:24:24
chr12	18511315	.	T	C	377.93	PASS	AF=0.596774;AO=37;DP=62;FAO=37;FDP=62;FR=.;FRO=25;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=0.0105131;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=217.417;QD=24.3824;RBI=0.016865;REFB=0.00576673;REVB=-0.0131872;RO=25;SAF=20;SAR=17;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0738532;STB=0.540519;STBP=0.439;TYPE=snp;VARB=-0.00305315;OID=.;OPOS=18511315;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:25:25:37:37:0.596774:17:20:11:14:17:20:11:14
chr12	18649057	.	C	T	249.73	PASS	AF=0.5;AO=27;DP=54;FAO=27;FDP=54;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=18;FWDB=-0.0109078;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=213.26;QD=18.4984;RBI=0.0143628;REFB=-0.00702338;REVB=-0.00934403;RO=27;SAF=13;SAR=14;SRF=9;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133523;STB=0.574532;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.00806465;OID=.;OPOS=18649057;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:27:27:27:27:0.5:14:13:9:18:14:13:9:18
chr12	19329493	.	T	C	57.93	PASS	AF=0.470588;AO=8;DP=17;FAO=8;FDP=17;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.0601962;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.389;QD=13.6308;RBI=0.0603087;REFB=-0.01355;REVB=-0.00368236;RO=9;SAF=4;SAR=4;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0494619;STB=0.529338;STBP=0.848;TYPE=snp;VARB=0.0230569;OID=.;OPOS=19329493;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:17:17:9:9:8:8:0.470588:4:4:4:5:4:4:4:5
chr12	19427764	.	T	C	232.07	PASS	AF=0.428571;AO=27;DP=63;FAO=27;FDP=63;FR=.;FRO=36;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=-0.000843327;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.057;QD=14.7347;RBI=0.00598538;REFB=0.00121134;REVB=-0.00592567;RO=36;SAF=14;SAR=13;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0186436;STB=0.51058;STBP=0.879;TYPE=snp;VARB=-0.00204164;OID=.;OPOS=19427764;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:36:36:27:27:0.428571:13:14:18:18:13:14:18:18
chr12	19427766	.	A	G	257.13	PASS	AF=0.453125;AO=29;DP=64;FAO=29;FDP=64;FR=.;FRO=35;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=-0.00227192;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.772;QD=16.0706;RBI=0.0144076;REFB=-0.00962691;REVB=-0.0142273;RO=34;SAF=16;SAR=13;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0497927;STB=0.520593;STBP=0.763;TYPE=snp;VARB=0.012212;OID=.;OPOS=19427766;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:34:35:29:29:0.453125:13:16:17:17:13:16:18:17
chr12	19877449	.	A	G	1024.17	PASS	AF=0.512953;AO=99;DP=193;FAO=99;FDP=193;FR=.;FRO=94;FSAF=43;FSAR=56;FSRF=57;FSRR=37;FWDB=0.00677975;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.091;QD=21.2264;RBI=0.00805828;REFB=-0.00646622;REVB=-0.00435555;RO=94;SAF=43;SAR=56;SRF=57;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152138;STB=0.583377;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.0048902;OID=.;OPOS=19877449;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:193:193:94:94:99:99:0.512953:56:43:57:37:56:43:57:37
chr12	20704509	.	T	G	1495.44	PASS	AF=0.641414;AO=126;DP=197;FAO=127;FDP=198;FR=.;FRO=71;FSAF=8;FSAR=119;FSRF=41;FSRR=30;FWDB=-0.0359058;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.663;QD=30.2108;RBI=0.0382764;REFB=-0.0212699;REVB=-0.0132609;RO=71;SAF=8;SAR=118;SRF=41;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.598265;STB=0.830203;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0269119;OID=.;OPOS=20704509;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:197:198:71:71:126:127:0.641414:118:8:41:30:119:8:41:30
chr12	20766559	.	C	T	801.32	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0642861;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.326;QD=57.2373;RBI=0.0648877;REFB=0;REVB=-0.00881522;RO=0;SAF=12;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.84125e-05;OID=.;OPOS=20766559;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:44:12:0:0:44:12:0:0
chr12	20903757	.	T	C	344.98	PASS	AF=0.5;AO=36;DP=71;FAO=36;FDP=72;FR=.;FRO=36;FSAF=10;FSAR=26;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=-0.0276542;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.8251;QD=19.1654;RBI=0.0311043;REFB=-0.0393458;REVB=0.014238;RO=35;SAF=10;SAR=26;SRF=14;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126007;STB=0.58031;STBP=0.216;TYPE=snp;VARB=0.0360275;OID=.;OPOS=20903757;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:72:35:36:36:36:0.5:26:10:14:21:26:10:15:21
chr12	20905250	.	C	T	289.87	PASS	AF=0.5;AO=31;DP=62;FAO=31;FDP=62;FR=.;FRO=31;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=-0.00567081;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.976;QD=18.7014;RBI=0.0102816;REFB=0.0050144;REVB=-0.00857635;RO=30;SAF=17;SAR=14;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0721736;STB=0.532338;STBP=0.621;TYPE=snp;VARB=-0.00466799;OID=.;OPOS=20905250;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:30:31:31:31:0.5:14:17:14:16:14:17:15:16
chr12	21011480	.	T	G	1491.53	PASS	AF=1;AO=94;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00838793;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.587;QD=63.4693;RBI=0.0134319;REFB=0;REVB=0.0104909;RO=0;SAF=46;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.73299e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.11655e-05;OID=.;OPOS=21011480;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:94:94:0:0:94:94:1:48:46:0:0:48:46:0:0
chr12	21011813	.	C	T	1295.08	PASS	AF=0.988372;AO=84;DP=85;FAO=85;FDP=86;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0506726;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.3424;QD=60.2363;RBI=0.0539495;REFB=-0.0447857;REVB=-0.0185159;RO=1;SAF=44;SAR=40;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0106442;STB=0.505493;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=0.00366686;OID=.;OPOS=21011813;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:85:86:1:1:84:85:0.988372:40:44:1:0:40:45:1:0
chr12	21013948	.	C	T	340.6	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0437282;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.6362;QD=54.4957;RBI=0.0440301;REFB=0;REVB=-0.00514729;RO=0;SAF=11;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000842875;OID=.;OPOS=21013948;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:14:11:0:0:14:11:0:0
chr12	21015760	.	G	A	2083.01	PASS	AF=1;AO=133;DP=134;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144769;FXX=0.00746213;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.4194;QD=62.6468;RBI=0.015227;REFB=0;REVB=-0.00472045;RO=0;SAF=64;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.99461e-05;OID=.;OPOS=21015760;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:134:133:0:0:133:133:1:69:64:0:0:69:64:0:0
chr12	21036411	.	A	G	1305.59	PASS	AF=0.988372;AO=85;DP=86;FAO=85;FDP=86;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0273519;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.928;QD=60.7249;RBI=0.0284615;REFB=-0.104229;REVB=0.00786958;RO=1;SAF=43;SAR=42;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.011146;STB=0.505881;STBP=0.545;TYPE=snp;VARB=0.000841099;OID=.;OPOS=21036411;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:86:86:1:1:85:85:0.988372:42:43:0:1:42:43:0:1
chr12	21054369	.	G	A	1200.42	PASS	AF=0.97561;AO=80;DP=82;FAO=80;FDP=82;FR=.;FRO=2;FSAF=41;FSAR=39;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0403843;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=250.068;QD=58.557;RBI=0.0422854;REFB=0.0692061;REVB=0.0125366;RO=1;SAF=41;SAR=39;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0114082;STB=0.511902;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=-0.000188082;OID=.;OPOS=21054369;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:82:82:1:2:80:80:0.97561:39:41:1:0:39:41:2:0
chr12	21054918	.	T	C	1054.67	PASS	AF=1;AO=70;DP=72;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0121451;FXX=0.0410903;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.788;QD=60.267;RBI=0.0547755;REFB=0;REVB=0.0534121;RO=0;SAF=33;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.92828e-05;OID=.;OPOS=21054918;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:70:0:0:70:70:1:37:33:0:0:37:33:0:0
chr12	21176135	.	T	C	1482.54	PASS	AF=1;AO=99;DP=101;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.026069;FXX=0.0291234;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.0208;QD=59.3016;RBI=0.132777;REFB=0;REVB=0.130193;RO=0;SAF=51;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000903545;OID=.;OPOS=21176135;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:101:100:0:0:99:100:1:48:51:0:0:48:52:0:0
chr12	21201663	.	G	A	1098.99	PASS	AF=0.46063;AO=114;DP=253;FAO=117;FDP=254;FR=.;FRO=137;FSAF=59;FSAR=58;FSRF=66;FSRR=71;FWDB=0.00512631;FXX=0.0193043;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.703;QD=17.3069;RBI=0.0331812;REFB=-0.0215452;REVB=0.0327828;RO=134;SAF=57;SAR=57;SRF=64;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0218744;STB=0.512144;STBP=0.703;TYPE=snp;VARB=0.0257476;OID=.;OPOS=21201663;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:253:254:134:137:114:117:0.46063:57:57:64:70:58:59:66:71
chr12	21329738	.	A	G	411.06	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0594564;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.0886;QD=56.6978;RBI=0.0617485;REFB=0;REVB=0.016668;RO=0;SAF=22;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00181981;OID=.;OPOS=21329738;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:7:22:0:0:7:22:0:0
chr12	21609773	.	A	G	267.83	PASS	AF=0.454545;AO=30;DP=66;FAO=30;FDP=66;FR=.;FRO=36;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=0.00821869;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.802;QD=16.2323;RBI=0.0145177;REFB=-0.0124298;REVB=0.0119674;RO=36;SAF=11;SAR=19;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133124;STB=0.575106;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.0425594;OID=.;OPOS=21609773;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:36:36:30:30:0.454545:19:11:18:18:19:11:18:18
chr12	21622051	.	A	C	323.52	PASS	AF=0.448718;AO=35;DP=79;FAO=35;FDP=78;FR=.;FRO=43;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=24;FSRR=19;FWDB=0.004066;FXX=0.0126566;HRUN=4;LEN=1;MLLD=130.1;QD=16.5909;RBI=0.00524601;REFB=-0.010641;REVB=0.00331485;RO=43;SAF=19;SAR=16;SRF=24;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0151218;STB=0.508495;STBP=0.901;TYPE=snp;VARB=0.0118799;OID=.;OPOS=21622051;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:78:43:43:35:35:0.448718:16:19:24:19:16:19:24:19
chr12	21623179	.	T	C	187.93	PASS	AF=0.513514;AO=19;DP=37;FAO=19;FDP=37;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.0198177;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.1345;QD=20.3167;RBI=0.0201382;REFB=-0.026103;REVB=0.00357859;RO=18;SAF=11;SAR=8;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0688096;STB=0.538864;STBP=0.693;TYPE=snp;VARB=0.0143945;OID=.;OPOS=21623179;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:18:18:19:19:0.513514:8:11:9:9:8:11:9:9
chr12	21623969	.	A	G	264.8	PASS	AF=0.529412;AO=27;DP=51;FAO=27;FDP=51;FR=.;FRO=24;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=0.0393929;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.057;QD=20.7684;RBI=0.0411706;REFB=-0.021517;REVB=-0.0119675;RO=23;SAF=15;SAR=12;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0641169;STB=0.526296;STBP=0.748;TYPE=snp;VARB=0.0177254;OID=.;OPOS=21623969;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:23:24:27:27:0.529412:12:15:11:12:12:15:12:12
chr12	21654831	.	G	T	816.02	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0482943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.711;QD=57.2647;RBI=0.0524379;REFB=0;REVB=0.0204302;RO=0;SAF=13;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.60164e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.75062e-05;OID=.;OPOS=21654831;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:56:57:0:0:56:57:1:43:13:0:0:43:14:0:0
chr12	21670252	.	G	C	132.14	PASS	AF=0.636364;AO=14;DP=22;FAO=14;FDP=22;FR=.;FRO=8;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.00661613;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=61.5035;QD=24.0259;RBI=0.0224249;REFB=-0.0196953;REVB=0.0214267;RO=8;SAF=8;SAR=6;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126876;STB=0.571326;STBP=0.428;TYPE=snp;VARB=0.0121718;OID=.;OPOS=21670252;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:22:22:8:8:14:14:0.636364:6:8:3:5:6:8:3:5
chr12	21712574	.	C	T	858.94	PASS	AF=1;AO=59;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00857205;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.8795;QD=57.2628;RBI=0.0539021;REFB=0;REVB=-0.0532162;RO=0;SAF=32;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.96591e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000427093;OID=.;OPOS=21712574;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:59:60:1:27:32:0:0:28:32:0:0
chr12	21713402	.	T	C	1320.94	PASS	AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0110258;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.009;QD=62.1617;RBI=0.0138194;REFB=0;REVB=-0.00833114;RO=0;SAF=36;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.95338e-06;OID=.;OPOS=21713402;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:49:36:0:0:49:36:0:0
chr12	21797029	.	A	G	766.46	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0652828;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.062;QD=63.8714;RBI=0.0714547;REFB=0;REVB=0.0290505;RO=0;SAF=21;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000305616;OID=.;OPOS=21797029;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:48:0:0:47:48:1:26:21:0:0:27:21:0:0
chr12	22017422	.	A	G	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00798281;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.88;QD=51.9167;RBI=0.00809791;REFB=0;REVB=-0.00136047;RO=0;SAF=11;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.76122e-05;OID=.;OPOS=22017422;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:10:11:0:0:10:11:0:0
chr12	22063115	.	A	G	1330.3	PASS	AF=1;AO=84;DP=84;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0111983;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.477;QD=61.8743;RBI=0.0481419;REFB=0;REVB=0.0468214;RO=0;SAF=50;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.06517e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.63083e-05;OID=.;OPOS=22063115;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:86:0:0:84:86:1:34:50:0:0:35:51:0:0
chr12	22348500	.	A	G	1767.55	PASS	AF=1;AO=116;DP=116;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0280967;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.537;QD=60.95;RBI=0.0305368;REFB=0;REVB=0.0119612;RO=0;SAF=58;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.80591e-05;OID=.;OPOS=22348500;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:116:116:0:0:116:116:1:58:58:0:0:58:58:0:0
chr12	22354921	.	A	G	414.99	PASS	AF=1;AO=29;DP=30;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00691687;FXX=0.0333222;HRUN=3;LEN=1;MLLD=247.013;QD=57.2394;RBI=0.0257784;REFB=0;REVB=0.0248331;RO=0;SAF=11;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.34666e-05;OID=.;OPOS=22354921;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:29:0:0:29:29:1:18:11:0:0:18:11:0:0
chr12	22478425	.	A	G	1011.11	PASS	AF=0.879518;AO=73;DP=83;FAO=73;FDP=83;FR=.;FRO=10;FSAF=42;FSAR=31;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.00476931;FXX=0.0119033;HRUN=5;LEN=1;MLLD=179.546;QD=48.7283;RBI=0.0064205;REFB=-0.100008;REVB=-0.00429843;RO=2;SAF=42;SAR=31;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0219909;STB=0.533592;STBP=0.124;TYPE=snp;VARB=0.00191364;OID=.;OPOS=22478425;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:83:83:2:10:73:73:0.879518:31:42:2:0:31:42:3:7
chr12	22814036	.	A	G	1005.56	PASS	AF=0.934211;AO=71;DP=76;FAO=71;FDP=76;FR=.;FRO=5;FSAF=33;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.0364993;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.3934;QD=52.9241;RBI=0.0393167;REFB=-0.0744938;REVB=-0.0146151;RO=5;SAF=33;SAR=38;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0582598;STB=0.530856;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.0409557;OID=.;OPOS=22814036;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:17:76:76:5:5:71:71:0.934211:38:33:0:5:38:33:0:5
chr12	22839581	.	A	G	322.81	PASS	AF=0.507463;AO=34;DP=67;FAO=34;FDP=67;FR=.;FRO=33;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=-0.0428302;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.2578;QD=19.2724;RBI=0.0436813;REFB=-0.00907469;REVB=0.00858058;RO=33;SAF=17;SAR=17;SRF=12;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120886;STB=0.567125;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=0.0116197;OID=.;OPOS=22839581;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:33:33:34:34:0.507463:17:17:12:21:17:17:12:21
chr12	23687354	.	G	A	251.88	PASS	AF=0.621622;AO=23;DP=37;FAO=23;FDP=37;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=-0.0133293;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.975;QD=27.2299;RBI=0.0460082;REFB=-0.01085;REVB=0.044035;RO=13;SAF=7;SAR=16;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.26419;STB=0.635114;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.00943682;OID=.;OPOS=23687354;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:13:14:23:23:0.621622:16:7:9:4:16:7:9:5
chr12	23893912	.	G	T	1096.57	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0708906;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.5278;QD=60.0859;RBI=0.0720653;REFB=0;REVB=-0.012959;RO=0;SAF=40;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.05346e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000732329;OID=.;OPOS=23893912;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:73:0:0:72:73:1:32:40:0:0:32:41:0:0
chr12	24859899	.	G	A	283.68	PASS	AF=0.526316;AO=30;DP=57;FAO=30;FDP=57;FR=.;FRO=27;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.00748669;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=252.307;QD=19.9073;RBI=0.0162288;REFB=-0.015246;REVB=0.0143987;RO=27;SAF=14;SAR=16;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0508901;STB=0.528283;STBP=0.691;TYPE=snp;VARB=0.0133149;OID=.;OPOS=24859899;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:27:27:30:30:0.526316:16:14:11:16:16:14:11:16
chr12	24964383	.	T	C	374.76	PASS	AF=0.933333;AO=28;DP=30;FAO=28;FDP=30;FR=.;FRO=2;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0631953;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.6135;QD=49.9677;RBI=0.0720009;REFB=-0.0323007;REVB=0.0345033;RO=2;SAF=12;SAR=16;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00901772;STB=0.504851;STBP=0.882;TYPE=snp;VARB=0.0102865;OID=.;OPOS=24964383;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:30:30:2:2:28:28:0.933333:16:12:1:1:16:12:1:1
chr12	24964523	.	C	T	631.93	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0687946;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.692;QD=61.652;RBI=0.0796764;REFB=0;REVB=-0.040195;RO=0;SAF=16;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.1719e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00127983;OID=.;OPOS=24964523;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:25:16:0:0:25:16:0:0
chr12	24968131	.	G	A	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0514572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.636;QD=33.4285;RBI=0.0559873;REFB=0;REVB=-0.0220621;RO=0;SAF=5;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00143695;OID=.;OPOS=24968131;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:1:5:0:0:1:5:0:0
chr12	24968150	.	A	C	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0108695;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=215.405;QD=42.1826;RBI=0.0112407;REFB=0;REVB=0.00286509;RO=0;SAF=7;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.29278e-05;OID=.;OPOS=24968150;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:4:7:0:0:4:7:0:0
chr12	24970708	.	G	A	833.36	PASS	AF=1;AO=54;DP=55;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0314589;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.472;QD=55.557;RBI=0.0314618;REFB=0;REVB=-0.000424818;RO=0;SAF=21;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.70667e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00145349;OID=.;OPOS=24970708;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:55:60:0:0:54:60:1:33:21:0:0:36:24:0:0
chr12	25054891	.	G	A	955.08	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0209685;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.2541;QD=58.7743;RBI=0.0370841;REFB=0;REVB=-0.0305868;RO=0;SAF=29;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.85655e-05;OID=.;OPOS=25054891;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:36:29:0:0:36:29:0:0
chr12	25148755	.	C	G	846.74	PASS	AF=0.9;AO=62;DP=70;FAO=63;FDP=70;FR=.;FRO=7;FSAF=38;FSAR=25;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.00817143;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=110.138;QD=48.3852;RBI=0.0350233;REFB=-0.142516;REVB=0.0340567;RO=1;SAF=37;SAR=25;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0185094;STB=0.50331;STBP=0.905;TYPE=snp;VARB=0.00583178;OID=.;OPOS=25148755;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:70:70:1:7:62:63:0.9:25:37:0:1:25:38:4:3
chr12	25242595	.	C	G	1155.25	PASS	AF=1;AO=73;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=46;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00312654;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.5712;QD=60.8026;RBI=0.0138652;REFB=0;REVB=0.0135081;RO=0;SAF=43;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.76338e-05;OID=.;OPOS=25242595;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:73:76:1:30:43:0:0:30:46:0:0
chr12	25243115	.	G	C	390.54	PASS	AF=1;AO=23;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0374113;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.523;QD=55.7914;RBI=0.0395247;REFB=0;REVB=0.0127511;RO=0;SAF=9;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.84921e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000251536;OID=.;OPOS=25243115;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:23:28:1:14:9:0:0:15:13:0:0
chr12	25261735	.	G	T	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0453486;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.681;QD=33.4285;RBI=0.0827221;REFB=0;REVB=-0.0691841;RO=0;SAF=5;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000452684;OID=.;OPOS=25261735;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:1:5:0:0:1:5:0:0
chr12	25343516	.	C	T	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0072901;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.614;QD=53.2769;RBI=0.00733288;REFB=0;REVB=-0.000790955;RO=0;SAF=14;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.84921e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.87868e-05;OID=.;OPOS=25343516;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:9:14:0:0:9:14:0:0
chr12	25357574	.	CAA	C,CGA	634.95	PASS	AF=0.928571,0.0714286;AO=39,3;DP=42;FAO=39,3;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=22,2;FSAR=17,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0269613,-0.00418775;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=2,1;MLLD=145.246,123.546;QD=60.4717;RBI=0.0416494,0.011656;REFB=0,0;REVB=0.0317453,0.0108777;RO=0;SAF=22,2;SAR=17,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.00258617,0.0429645;OID=.,.;OPOS=25357575,25357575;OREF=AA,A;OALT=-,G;OMAPALT=C,CGA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.928571,0.0714286:39,3:42:39,3:42:0:22,2:17,1:0:0:13:0:22,2:17,1:0:0
chr12	25357628	.	TA	T	143.23	PASS	AF=1;AO=12;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0478275;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.3155;QD=44.0694;RBI=0.0502927;REFB=0;REVB=-0.0155525;RO=0;SAF=4;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.0011812;OID=.;OPOS=25357629;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:12:13:13:13:0:5:8:0:0:4:0:4:8:0:0
chr12	25361091	.	T	C	1822.56	PASS	AF=0.975806;AO=121;DP=125;FAO=121;FDP=124;FR=.;FRO=3;FSAF=62;FSAR=59;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0237019;FXX=0.00799936;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.829;QD=58.7922;RBI=0.039628;REFB=-0.16317;REVB=0.0317585;RO=1;SAF=62;SAR=59;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00798372;STB=0.503735;STBP=0.744;TYPE=snp;VARB=0.000967355;OID=.;OPOS=25361091;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:125:124:1:3:121:121:0.975806:59:62:0:1:59:62:2:1
chr12	25362217	.	A	G	1607.01	PASS	AF=1;AO=107;DP=107;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0491991;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.446;QD=60.0752;RBI=0.0539425;REFB=0;REVB=0.0221187;RO=0;SAF=53;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.66183e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.75239e-05;OID=.;OPOS=25362217;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:107:107:0:0:107:107:1:54:53:0:0:54:53:0:0
chr12	25362465	.	G	A	237.4	PASS	AF=1;AO=17;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.002784;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.217;QD=49.9798;RBI=0.0116047;REFB=0;REVB=0.0112658;RO=0;SAF=10;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000193982;OID=.;OPOS=25362465;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:17:19:1:7:10:0:0:9:10:0:0
chr12	25362552	.	A	C	289.71	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0193443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.149;QD=52.675;RBI=0.0199868;REFB=0;REVB=0.00502684;RO=0;SAF=8;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.78381e-05;OID=.;OPOS=25362552;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:22:0:0:21:22:1:13:8:0:0:14:8:0:0
chr12	25368462	.	C	T	969.96	PASS	AF=0.971429;AO=67;DP=71;FAO=68;FDP=70;FR=.;FRO=2;FSAF=30;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0250743;FXX=0.0140825;HRUN=3;LEN=1;MLLD=207.009;QD=55.4264;RBI=0.025469;REFB=-0.0153792;REVB=-0.00446686;RO=2;SAF=29;SAR=38;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00374279;STB=0.501703;STBP=0.877;TYPE=snp;VARB=0.000484358;OID=.;OPOS=25368462;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:71:70:2:2:67:68:0.971429:38:29:1:1:38:30:1:1
chr12	25671759	.	T	A	1177.61	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0241638;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.1142;QD=61.1748;RBI=0.0931495;REFB=0;REVB=0.0899607;RO=0;SAF=41;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00128486;OID=.;OPOS=25671759;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:77:0:0:76:77:1:35:41:0:0:36:41:0:0
chr12	26491838	.	G	A	447.03	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00121106;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.929;QD=57.6806;RBI=0.0199035;REFB=0;REVB=0.0198667;RO=0;SAF=11;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.01948e-05;OID=.;OPOS=26491838;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:20:11:0:0:20:11:0:0
chr12	26784850	.	G	A	244.31	PASS	AF=0.381579;AO=28;DP=76;FAO=29;FDP=76;FR=.;FRO=47;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=26;FSRR=21;FWDB=0.0103004;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.068;QD=12.8585;RBI=0.0295939;REFB=-0.0240359;REVB=0.0277435;RO=47;SAF=19;SAR=9;SRF=26;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146435;STB=0.566844;STBP=0.381;TYPE=snp;VARB=0.0423525;OID=.;OPOS=26784850;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:47:47:28:29:0.381579:9:19:26:21:10:19:26:21
chr12	26809316	.	G	A	280.9	PASS	AF=0.410256;AO=32;DP=78;FAO=32;FDP=78;FR=.;FRO=46;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=30;FWDB=-0.00149729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.981;QD=14.4051;RBI=0.00364353;REFB=0.00753486;REVB=0.00332166;RO=46;SAF=18;SAR=14;SRF=16;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.220212;STB=0.62453;STBP=0.069;TYPE=snp;VARB=-0.0117869;OID=.;OPOS=26809316;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:46:46:32:32:0.410256:14:18:16:30:14:18:16:30
chr12	26810777	.	T	C	955.16	PASS	AF=1;AO=64;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0109084;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.998;QD=58.7789;RBI=0.0276842;REFB=0;REVB=0.0254445;RO=0;SAF=36;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.50018e-05;OID=.;OPOS=26810777;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:64:65:1:28:36:0:0:28:37:0:0
chr12	26810816	.	T	G	152.13	PASS	AF=0.338983;AO=20;DP=59;FAO=20;FDP=59;FR=.;FRO=39;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=0.0418349;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.277;QD=10.314;RBI=0.04192;REFB=0.0123172;REVB=-0.00266858;RO=36;SAF=13;SAR=7;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.228548;STB=0.626378;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=-0.0317719;OID=.;OPOS=26810816;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:36:39:20:20:0.338983:7:13:16:20:7:13:18:21
chr12	26834804	.	T	TACTC	1176.12	PASS	AF=0.9875;AO=77;DP=82;FAO=79;FDP=80;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00923538;FXX=0.0243873;HRUN=1;LEN=4;MLLD=309.633;QD=58.806;RBI=0.0275552;REFB=-0.0358531;REVB=0.0259614;RO=2;SAF=38;SAR=39;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0242558;STB=0.506171;STBP=0.523;TYPE=ins;VARB=1.08643e-05;OID=.;OPOS=26834805;OREF=-;OALT=ACTC;OMAPALT=TACTC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:0.9875:77:82:79:80:1:40:39:1:0:3:2:38:39:2:0
chr12	26868322	.	T	C	475.98	PASS	AF=0.576923;AO=45;DP=78;FAO=45;FDP=78;FR=.;FRO=33;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=0.00865827;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=231.634;QD=24.4093;RBI=0.00961114;REFB=0.000901273;REVB=0.00417233;RO=32;SAF=18;SAR=27;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148043;STB=0.575096;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=-0.000634775;OID=.;OPOS=26868322;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:32:33:45:45:0.576923:27:18:19:13:27:18:19:14
chr12	26943170	.	A	T	165.06	PASS	AF=0.382979;AO=18;DP=47;FAO=18;FDP=47;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.00831265;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=266.452;QD=14.0473;RBI=0.0154827;REFB=-0.00796633;REVB=-0.0130619;RO=28;SAF=13;SAR=5;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.250913;STB=0.638081;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=0.0144474;OID=.;OPOS=26943170;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:28:29:18:18:0.382979:5:13:14:14:5:13:15:14
chr12	27064232	.	C	T	1457.76	PASS	AF=1;AO=92;DP=93;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0107166;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.606;QD=63.3809;RBI=0.0169843;REFB=0;REVB=0.0131765;RO=0;SAF=41;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.99529e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.06563e-05;OID=.;OPOS=27064232;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:93:92:0:0:92:92:1:51:41:0:0:51:41:0:0
chr12	27175640	.	A	G	979.13	PASS	AF=0.971429;AO=68;DP=69;FAO=68;FDP=70;FR=.;FRO=2;FSAF=32;FSAR=36;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00467846;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.4327;QD=55.9504;RBI=0.0947664;REFB=-0.0228914;REVB=-0.0946508;RO=1;SAF=32;SAR=36;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0145412;STB=0.515147;STBP=0.17;TYPE=snp;VARB=0.00374078;OID=.;OPOS=27175640;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:69:70:1:2:68:68:0.971429:36:32:1:0:36:32:2:0
chr12	27470866	.	G	A	712.59	PASS	AF=1;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00915973;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.728;QD=63.3417;RBI=0.0436595;REFB=0;REVB=-0.0426879;RO=0;SAF=33;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.88886e-05;OID=.;OPOS=27470866;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:45:0:0:45:45:1:12:33:0:0:12:33:0:0
chr12	27627805	.	G	A	369.66	PASS	AF=0.560606;AO=37;DP=66;FAO=37;FDP=66;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=30;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=-0.0712605;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.009;QD=22.4037;RBI=0.0712971;REFB=-0.0205269;REVB=0.00228236;RO=29;SAF=7;SAR=30;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.240532;STB=0.633957;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.0149242;OID=.;OPOS=27627805;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:29:29:37:37:0.560606:30:7:12:17:30:7:12:17
chr12	27641473	.	G	A	72.42	PASS	AF=0.322581;AO=9;DP=30;FAO=10;FDP=31;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=0.0658233;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.74;QD=9.345;RBI=0.0664419;REFB=-0.0214115;REVB=0.00904527;RO=21;SAF=7;SAR=2;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.448716;STB=0.712955;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=0.0586863;OID=.;OPOS=27641473;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:30:31:21:21:9:10:0.322581:2:7:8:13:3:7:8:13
chr12	27648710	.	C	T	219.85	PASS	AF=0.44;AO=22;DP=50;FAO=22;FDP=50;FR=.;FRO=28;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=-0.00775509;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.656;QD=17.5879;RBI=0.0077957;REFB=-0.00389121;REVB=-0.000794696;RO=28;SAF=15;SAR=7;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0814537;STB=0.546515;STBP=0.598;TYPE=snp;VARB=0.00475051;OID=.;OPOS=27648710;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:28:28:22:22:0.44:7:15:17:11:7:15:17:11
chr12	27648786	.	A	G	77.93	PASS	AF=0.454545;AO=9;DP=21;FAO=10;FDP=22;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=-0.0259995;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.8135;QD=14.1697;RBI=0.0361424;REFB=-0.00954931;REVB=0.0251058;RO=12;SAF=6;SAR=3;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.538386;STBP=0.737;TYPE=snp;VARB=0.0146914;OID=.;OPOS=27648786;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:21:22:12:12:9:10:0.454545:3:6:8:4:4:6:8:4
chr12	27788021	.	G	A	223.18	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00961147;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.4871;QD=49.596;RBI=0.029822;REFB=0;REVB=-0.0282307;RO=0;SAF=7;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00140746;OID=.;OPOS=27788021;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:11:7:0:0:11:7:0:0
chr12	27800746	.	G	T	1522.92	PASS	AF=0.990385;AO=103;DP=104;FAO=103;FDP=104;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0198564;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.5012;QD=58.5739;RBI=0.021685;REFB=-0.0456948;REVB=0.00871574;RO=1;SAF=39;SAR=64;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00735701;STB=0.503875;STBP=0.48;TYPE=snp;VARB=0.00299391;OID=.;OPOS=27800746;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:104:104:1:1:103:103:0.990385:64:39:0:1:64:39:0:1
chr12	27849795	.	CA	TG	134.63	PASS	AF=1;AO=12;DP=13;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0166833;FXX=0.076864;HRUN=2;LEN=2;MLLD=262.629;QD=44.8759;RBI=0.0204845;REFB=0;REVB=0.0118863;RO=0;SAF=7;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=-3.88071e-05;OID=.;OPOS=27849795;OREF=CA;OALT=TG;OMAPALT=TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:12:0:0:12:12:1:5:7:0:0:5:7:0:0
chr12	27867706	.	C	T	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.017511;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.255;QD=55.6561;RBI=0.0176249;REFB=0;REVB=-0.0020007;RO=0;SAF=12;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.80662e-05;OID=.;OPOS=27867706;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:15:12:0:0:15:12:0:0
chr12	27915718	.	A	T	769.91	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0149311;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.322;QD=57.0303;RBI=0.0153731;REFB=0;REVB=0.0036599;RO=0;SAF=22;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.76368e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.37163e-05;OID=.;OPOS=27915718;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:54:0:0:53:54:1:31:22:0:0:32:22:0:0
chr12	27952702	.	A	T	208.78	PASS	AF=0.456522;AO=21;DP=46;FAO=21;FDP=46;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=0.0105569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.8642;QD=18.1544;RBI=0.0132439;REFB=-0.00947897;REVB=-0.00799695;RO=25;SAF=6;SAR=15;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.203495;STB=0.616322;STBP=0.165;TYPE=snp;VARB=0.00930086;OID=.;OPOS=27952702;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:25:25:21:21:0.456522:15:6:12:13:15:6:12:13
chr12	27959201	.	G	A	211.89	PASS	AF=0.45098;AO=23;DP=51;FAO=23;FDP=51;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=-0.0143116;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=192.83;QD=16.6187;RBI=0.0289761;REFB=-0.0208792;REVB=0.0251951;RO=28;SAF=11;SAR=12;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0899296;STB=0.550976;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.0223505;OID=.;OPOS=27959201;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:28:28:23:23:0.45098:12:11:16:12:12:11:16:12
chr12	28098719	.	T	C	292.56	PASS	AF=0.369565;AO=33;DP=90;FAO=34;FDP=92;FR=.;FRO=58;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=38;FSRR=20;FWDB=0.0233351;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.4292;QD=12.72;RBI=0.0436504;REFB=-0.0101052;REVB=0.0368894;RO=57;SAF=16;SAR=17;SRF=38;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200501;STB=0.615125;STBP=0.087;TYPE=snp;VARB=0.0240017;OID=.;OPOS=28098719;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:92:57:58:33:34:0.369565:17:16:38:19:18:16:38:20
chr12	28457618	.	A	C	1512.05	PASS	AF=1;AO=101;DP=102;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0355201;FXX=0.00980296;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.426;QD=59.8832;RBI=0.0367988;REFB=0;REVB=0.0096161;RO=0;SAF=59;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000105691;OID=.;OPOS=28457618;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:102:101:0:0:101:101:1:42:59:0:0:42:59:0:0
chr12	28605426	.	G	A	301.12	PASS	AF=0.4;AO=34;DP=85;FAO=34;FDP=85;FR=.;FRO=51;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=28;FSRR=23;FWDB=-0.0209046;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.647;QD=14.1701;RBI=0.0224893;REFB=-0.0100248;REVB=-0.00829245;RO=51;SAF=14;SAR=20;SRF=28;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145072;STB=0.582476;STBP=0.221;TYPE=snp;VARB=0.0126139;OID=.;OPOS=28605426;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:51:51:34:34:0.4:20:14:28:23:20:14:28:23
chr12	28658350	.	C	T	319.87	PASS	AF=0.492754;AO=34;DP=69;FAO=34;FDP=69;FR=.;FRO=35;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=0.000793177;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.496;QD=18.543;RBI=0.00248899;REFB=0.00266445;REVB=0.00235922;RO=34;SAF=20;SAR=14;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106583;STB=0.552646;STBP=0.394;TYPE=snp;VARB=-0.0031016;OID=.;OPOS=28658350;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:34:35:34:34:0.492754:14:20:16:18:14:20:17:18
chr12	29423460	.	G	A	754.34	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00258774;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.4869;QD=56.9314;RBI=0.00425188;REFB=0;REVB=0.00337373;RO=0;SAF=22;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.76368e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.93265e-05;OID=.;OPOS=29423460;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:31:22:0:0:31:22:0:0
chr12	29630081	.	G	A	538.55	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0163163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.5876;QD=59.8386;RBI=0.0169123;REFB=0;REVB=-0.00445019;RO=0;SAF=19;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00010489;OID=.;OPOS=29630081;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:17:19:0:0:17:19:0:0
chr12	29639186	.	T	C	125.23	PASS	AF=0.3125;AO=15;DP=48;FAO=15;FDP=48;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=-0.0121219;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=266.208;QD=10.4362;RBI=0.0123529;REFB=-0.00692576;REVB=-0.0023775;RO=33;SAF=11;SAR=4;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.36055;STB=0.71642;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=0.0139042;OID=.;OPOS=29639186;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:33:33:15:15:0.3125:4:11:14:19:4:11:14:19
chr12	29642573	.	A	C	143.22	PASS	AF=0.327586;AO=19;DP=58;FAO=19;FDP=58;FR=.;FRO=39;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=26;FWDB=-0.0457703;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.1591;QD=9.87704;RBI=0.058218;REFB=-0.0224366;REVB=0.035978;RO=39;SAF=9;SAR=10;SRF=13;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163039;STB=0.595492;STBP=0.325;TYPE=snp;VARB=0.042265;OID=.;OPOS=29642573;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:39:39:19:19:0.327586:10:9:13:26:10:9:13:26
chr12	29648275	.	G	A	462.62	PASS	AF=0.474227;AO=46;DP=97;FAO=46;FDP=97;FR=.;FRO=51;FSAF=17;FSAR=29;FSRF=30;FSRR=21;FWDB=-0.0303434;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.061;QD=19.0772;RBI=0.0303994;REFB=-0.00713508;REVB=-0.00184466;RO=51;SAF=17;SAR=29;SRF=30;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.208034;STB=0.615855;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.00775367;OID=.;OPOS=29648275;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:51:51:46:46:0.474227:29:17:30:21:29:17:30:21
chr12	29653884	.	T	TAG	1272.09	PASS	AF=0.412979;AO=138;DP=348;FAO=140;FDP=339;FR=.;FRO=199;FSAF=64;FSAR=76;FSRF=93;FSRR=106;FWDB=0.00285376;FXX=0.0116615;HRUN=3;LEN=2;MLLD=285.05;QD=15.0099;RBI=0.024618;REFB=-0.00867601;REVB=-0.024452;RO=193;SAF=63;SAR=75;SRF=86;SRR=107;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0115289;STB=0.506021;STBP=0.86;TYPE=ins;VARB=0.0132667;OID=.;OPOS=29653885;OREF=-;OALT=AG;OMAPALT=TAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.412979:138:348:140:339:199:64:76:93:106:99:193:63:75:86:107
chr12	29655637	.	C	T	210.06	PASS	AF=0.366197;AO=26;DP=70;FAO=26;FDP=71;FR=.;FRO=45;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=27;FWDB=-0.00595014;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.4403;QD=11.8344;RBI=0.0358198;REFB=-0.0220056;REVB=-0.0353221;RO=43;SAF=9;SAR=17;SRF=16;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0306335;STB=0.536813;STBP=0.658;TYPE=snp;VARB=0.0336692;OID=.;OPOS=29655637;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:71:43:45:26:26:0.366197:17:9:16:27:17:9:18:27
chr12	29670504	.	G	A	79.71	PASS	AF=0.244444;AO=11;DP=45;FAO=11;FDP=45;FR=.;FRO=34;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=25;FWDB=-0.00303608;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.383;QD=7.08571;RBI=0.00626921;REFB=-0.0173368;REVB=0.005485;RO=34;SAF=7;SAR=4;SRF=9;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.426951;STB=0.759898;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.0448517;OID=.;OPOS=29670504;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:79:45:45:34:34:11:11:0.244444:4:7:9:25:4:7:9:25
chr12	30781912	.	A	G	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00196473;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=306.772;QD=52.6132;RBI=0.00728615;REFB=0;REVB=0.00701626;RO=0;SAF=7;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.79751e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.4901e-06;OID=.;OPOS=30781912;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:15:7:0:0:15:7:0:0
chr12	30782076	.	T	C	340.74	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00807082;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.033;QD=54.5176;RBI=0.0170508;REFB=0;REVB=0.0150198;RO=0;SAF=14;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.727e-05;OID=.;OPOS=30782076;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:11:14:0:0:11:14:0:0
chr12	30783546	.	G	T	1301.92	PASS	AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.038135;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.2173;QD=61.9962;RBI=0.0435001;REFB=0;REVB=0.0209281;RO=0;SAF=46;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.981e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000129596;OID=.;OPOS=30783546;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:38:46:0:0:38:46:0:0
chr12	30816460	.	G	A	294.21	PASS	AF=0.477612;AO=32;DP=67;FAO=32;FDP=67;FR=.;FRO=35;FSAF=22;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=-0.00586296;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=216.871;QD=17.5646;RBI=0.0150637;REFB=-0.0102275;REVB=-0.0138759;RO=35;SAF=22;SAR=10;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.250525;STB=0.640686;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.0103394;OID=.;OPOS=30816460;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:35:35:32:32:0.477612:10:22:15:20:10:22:15:20
chr12	30823971	.	A	G	1492.42	PASS	AF=0.990196;AO=101;DP=102;FAO=101;FDP=102;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=55;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0181656;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.1634;QD=58.5263;RBI=0.0616896;REFB=0.0692313;REVB=-0.0589543;RO=1;SAF=46;SAR=55;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0102019;STB=0.505375;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=-0.00131005;OID=.;OPOS=30823971;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:102:102:1:1:101:101:0.990196:55:46:1:0:55:46:1:0
chr12	30868002	.	C	T	993.88	PASS	AF=1;AO=67;DP=68;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00356923;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.758;QD=59.3363;RBI=0.0120538;REFB=0;REVB=0.0115133;RO=0;SAF=40;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.17299e-05;OID=.;OPOS=30868002;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:67:0:0:67:67:1:27:40:0:0:27:40:0:0
chr12	30869451	.	G	C	178.07	PASS	AF=0.233333;AO=27;DP=119;FAO=28;FDP=120;FR=.;FRO=92;FSAF=21;FSAR=7;FSRF=45;FSRR=47;FWDB=-0.0301678;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.2489;QD=5.93576;RBI=0.0318348;REFB=-0.0102679;REVB=-0.0101664;RO=92;SAF=20;SAR=7;SRF=45;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.328582;STB=0.71037;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.0256423;OID=.;OPOS=30869451;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:120:92:92:27:28:0.233333:7:20:45:47:7:21:45:47
chr12	30881809	.	T	C	424.95	PASS	AF=0.565789;AO=40;DP=73;FAO=43;FDP=76;FR=.;FRO=33;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=0.0109121;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.52;QD=22.3657;RBI=0.016737;REFB=-0.00754246;REVB=0.0126906;RO=32;SAF=19;SAR=21;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00505564;STB=0.504613;STBP=0.931;TYPE=snp;VARB=0.0114828;OID=.;OPOS=30881809;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:76:32:33:40:43:0.565789:21:19:15:17:23:20:15:18
chr12	30948848	.	G	C	340.49	PASS	AF=0.423913;AO=38;DP=90;FAO=39;FDP=92;FR=.;FRO=53;FSAF=10;FSAR=29;FSRF=27;FSRR=26;FWDB=-0.00595973;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.659;QD=14.804;RBI=0.00852169;REFB=-0.0144002;REVB=0.00609105;RO=45;SAF=10;SAR=28;SRF=24;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.284147;STB=0.661034;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0210244;OID=.;OPOS=30948848;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:92:45:53:38:39:0.423913:28:10:24:21:29:10:27:26
chr12	31107131	.	A	G	213.05	PASS	AF=0.477273;AO=21;DP=44;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=17;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=0.0259309;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.363;QD=19.3678;RBI=0.0303131;REFB=-0.00699598;REVB=0.0156995;RO=23;SAF=17;SAR=4;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.286871;STB=0.664629;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.0122936;OID=.;OPOS=31107131;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:23:23:21:21:0.477273:4:17:13:10:4:17:13:10
chr12	31107955	.	G	A	507.96	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0181172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.426;QD=58.0521;RBI=0.0301931;REFB=0;REVB=-0.0241535;RO=0;SAF=8;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.13789e-05;OID=.;OPOS=31107955;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:35:0:0:33:35:1:25:8:0:0:26:9:0:0
chr12	31135478	.	T	C	1917.59	PASS	AF=0.992063;AO=125;DP=126;FAO=125;FDP=126;FR=.;FRO=1;FSAF=56;FSAR=69;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0536938;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.4599;QD=60.8758;RBI=0.0677017;REFB=-0.0439663;REVB=-0.0412372;RO=1;SAF=56;SAR=69;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00840909;STB=0.504424;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=-0.000108986;OID=.;OPOS=31135478;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:126:126:1:1:125:125:0.992063:69:56:1:0:69:56:1:0
chr12	31135579	.	T	C	468.96	PASS	AF=0.484211;AO=47;DP=97;FAO=46;FDP=95;FR=.;FRO=49;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=25;FSRR=24;FWDB=-0.0523345;FXX=0.0206164;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.103;QD=19.7455;RBI=0.0538384;REFB=-0.0125954;REVB=-0.0126359;RO=48;SAF=23;SAR=24;SRF=24;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0096946;STB=0.516476;STBP=0.767;TYPE=snp;VARB=0.00955595;OID=.;OPOS=31135579;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:95:48:49:47:46:0.484211:24:23:24:24:24:22:25:24
chr12	31231138	.	G	T	239.65	PASS	AF=0.490566;AO=26;DP=53;FAO=26;FDP=53;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=0.0143487;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.175;QD=18.0867;RBI=0.0349735;REFB=-0.00927999;REVB=0.0318945;RO=27;SAF=15;SAR=11;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0872687;STB=0.54901;STBP=0.494;TYPE=snp;VARB=0.00681155;OID=.;OPOS=31231138;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:27:27:26:26:0.490566:11:15:13:14:11:15:13:14
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chr12	31255263	.	G	A	277.43	PASS	AF=0.5;AO=30;DP=60;FAO=30;FDP=60;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=5;FSRR=25;FWDB=0.0405515;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=261.636;QD=18.495;RBI=0.0446036;REFB=-0.0272555;REVB=0.0185757;RO=29;SAF=11;SAR=19;SRF=4;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.234964;STB=0.614145;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=0.0215358;OID=.;OPOS=31255263;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:29:30:30:30:0.5:19:11:4:25:19:11:5:25
chr12	31255405	.	C	T	398.59	PASS	AF=0.526316;AO=39;DP=74;FAO=40;FDP=76;FR=.;FRO=36;FSAF=26;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=0.0180621;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.997;QD=20.9781;RBI=0.0255816;REFB=-0.0208546;REVB=0.0181158;RO=35;SAF=26;SAR=13;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138595;STB=0.574547;STBP=0.202;TYPE=snp;VARB=0.0178234;OID=.;OPOS=31255405;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:76:35:36:39:40:0.526316:13:26:18:17:14:26:18:18
chr12	31256905	.	T	C	336.07	PASS	AF=0.591837;AO=29;DP=49;FAO=29;FDP=49;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.0287562;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.907;QD=27.434;RBI=0.0342149;REFB=-0.0296011;REVB=0.0185401;RO=20;SAF=10;SAR=19;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158333;STB=0.587567;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.0294489;OID=.;OPOS=31256905;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:20:20:29:29:0.591837:19:10:11:9:19:10:11:9
chr12	31267744	.	A	C	81.28	PASS	AF=0.275;AO=11;DP=40;FAO=11;FDP=40;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=-0.00117603;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.687;QD=8.12765;RBI=0.0162851;REFB=-0.0183878;REVB=0.0162425;RO=29;SAF=6;SAR=5;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00741697;STB=0.504579;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0344909;OID=.;OPOS=31267744;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:81:40:40:29:29:11:11:0.275:5:6:16:13:5:6:16:13
chr12	31283446	.	T	G	345.64	PASS	AF=0.45679;AO=36;DP=81;FAO=37;FDP=81;FR=.;FRO=44;FSAF=24;FSAR=13;FSRF=28;FSRR=16;FWDB=0.0277428;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.987;QD=17.0684;RBI=0.0448868;REFB=-0.0161228;REVB=0.0352869;RO=44;SAF=24;SAR=12;SRF=28;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0329268;STB=0.507285;STBP=0.907;TYPE=snp;VARB=0.0235992;OID=.;OPOS=31283446;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:44:44:36:37:0.45679:12:24:28:16:13:24:28:16
chr12	31288955	.	G	A	118.88	PASS	AF=0.278689;AO=17;DP=62;FAO=17;FDP=61;FR=.;FRO=44;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=0.00276739;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.416;QD=7.79527;RBI=0.0114998;REFB=-0.00362082;REVB=0.0111618;RO=45;SAF=10;SAR=7;SRF=22;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119471;STB=0.564126;STBP=0.536;TYPE=snp;VARB=0.00769906;OID=.;OPOS=31288955;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:61:45:44:17:17:0.278689:7:10:22:23:7:10:22:22
chr12	31297871	.	G	C	520.01	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00890077;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.5993;QD=59.4298;RBI=0.0879078;REFB=0;REVB=0.087456;RO=0;SAF=19;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.1382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00185962;OID=.;OPOS=31297871;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:16:19:0:0:16:19:0:0
chr12	31300891	.	C	A	1549.27	PASS	AF=1;AO=97;DP=97;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0104017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=302.298;QD=63.8874;RBI=0.0109714;REFB=0;REVB=0.00348943;RO=0;SAF=51;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.34464e-05;OID=.;OPOS=31300891;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:97:97:0:0:97:97:1:46:51:0:0:46:51:0:0
chr12	31301888	.	T	C	143.0	PASS	AF=0.339623;AO=18;DP=53;FAO=18;FDP=53;FR=.;FRO=35;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=0.00161826;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=300.112;QD=10.7925;RBI=0.0114966;REFB=-0.000260648;REVB=-0.0113822;RO=35;SAF=11;SAR=7;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142152;STB=0.58377;STBP=0.395;TYPE=snp;VARB=0.00041836;OID=.;OPOS=31301888;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:35:35:18:18:0.339623:7:11:17:18:7:11:17:18
chr12	31648826	.	C	T	304.72	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.03018;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.735;QD=52.9948;RBI=0.0463321;REFB=0;REVB=0.0351544;RO=0;SAF=9;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2029e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000182406;OID=.;OPOS=31648826;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:23:0:0:22:23:1:13:9:0:0:14:9:0:0
chr12	31944475	.	C	T	93.32	PASS	AF=0.578947;AO=11;DP=19;FAO=11;FDP=19;FR=.;FRO=8;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=-0.0266872;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.747;QD=19.6457;RBI=0.0304688;REFB=-0.00876724;REVB=-0.0147017;RO=8;SAF=7;SAR=4;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00898424;STB=0.505145;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00260305;OID=.;OPOS=31944475;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:19:19:8:8:11:11:0.578947:4:7:5:3:4:7:5:3
chr12	31944567	.	T	G	49.59	PASS	AF=0.538462;AO=7;DP=13;FAO=7;FDP=13;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.00255523;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.296;QD=15.2596;RBI=0.0215693;REFB=-0.0157661;REVB=-0.0214174;RO=6;SAF=5;SAR=2;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12173;STB=0.571239;STBP=0.733;TYPE=snp;VARB=0.00876448;OID=.;OPOS=31944567;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:13:13:6:6:7:7:0.538462:2:5:5:1:2:5:5:1
chr12	32134240	.	C	T	774.3	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0116148;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.781;QD=63.2083;RBI=0.0184963;REFB=0;REVB=-0.0143948;RO=0;SAF=29;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.87377e-05;OID=.;OPOS=32134240;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:20:29:0:0:20:29:0:0
chr12	32134638	.	T	C	465.14	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0163532;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.947;QD=58.142;RBI=0.0170973;REFB=0;REVB=-0.00498883;RO=0;SAF=16;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.03668e-05;OID=.;OPOS=32134638;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:16:16:0:0:16:16:0:0
chr12	32135441	.	T	C	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0512552;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.288;QD=46.848;RBI=0.0533832;REFB=0;REVB=0.0149223;RO=0;SAF=10;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000369871;OID=.;OPOS=32135441;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:5:10:0:0:5:10:0:0
chr12	32137901	.	A	G	265.32	PASS	AF=0.615385;AO=24;DP=39;FAO=24;FDP=39;FR=.;FRO=15;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.0571153;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=180.767;QD=27.2121;RBI=0.0572069;REFB=-0.00314395;REVB=0.00323694;RO=15;SAF=14;SAR=10;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127923;STB=0.570756;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=0.00289169;OID=.;OPOS=32137901;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:15:15:24:24:0.615385:10:14:6:9:10:14:6:9
chr12	32261239	.	A	G	147.57	PASS	AF=0.875;AO=14;DP=16;FAO=14;FDP=16;FR=.;FRO=2;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0119875;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=246.979;QD=36.8927;RBI=0.0130125;REFB=-0.0293313;REVB=-0.00506204;RO=2;SAF=9;SAR=5;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0908241;STB=0.549931;STBP=0.419;TYPE=snp;VARB=0.00459982;OID=.;OPOS=32261239;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:16:16:2:2:14:14:0.875:5:9:2:0:5:9:2:0
chr12	32261252	.	A	C	147.57	PASS	AF=0.875;AO=14;DP=16;FAO=14;FDP=16;FR=.;FRO=2;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0165262;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=298.602;QD=36.8927;RBI=0.0165289;REFB=-0.0416402;REVB=-0.000298619;RO=2;SAF=9;SAR=5;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0908241;STB=0.549931;STBP=0.419;TYPE=snp;VARB=0.00868857;OID=.;OPOS=32261252;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:16:16:2:2:14:14:0.875:5:9:2:0:5:9:2:0
chr12	32261419	.	G	A	46.0	PASS	AF=0.35;AO=7;DP=20;FAO=7;FDP=20;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.00474868;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.3495;QD=9.20006;RBI=0.0416038;REFB=-0.0099411;REVB=-0.0413319;RO=13;SAF=5;SAR=2;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118161;STB=0.57355;STBP=0.673;TYPE=snp;VARB=0.0183886;OID=.;OPOS=32261419;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:20:20:13:13:7:7:0.35:2:5:8:5:2:5:8:5
chr12	32261435	.	A	G	45.06	PASS	AF=0.304348;AO=7;DP=23;FAO=7;FDP=23;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.00438368;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=170.468;QD=7.83693;RBI=0.0135029;REFB=-0.00674753;REVB=0.0127715;RO=16;SAF=4;SAR=3;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0100525;STB=0.506311;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0148054;OID=.;OPOS=32261435;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:23:23:16:16:7:7:0.304348:3:4:9:7:3:4:9:7
chr12	32552769	.	C	G	297.21	PASS	AF=0.492308;AO=32;DP=65;FAO=32;FDP=65;FR=.;FRO=33;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=0.00541068;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=237.354;QD=18.2899;RBI=0.0147637;REFB=-0.00330986;REVB=0.0137365;RO=33;SAF=19;SAR=13;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0450208;STB=0.525157;STBP=0.719;TYPE=snp;VARB=0.0031586;OID=.;OPOS=32552769;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:33:33:32:32:0.492308:13:19:18:15:13:19:18:15
chr12	32735236	.	C	T	40.28	PASS	AF=0.545455;AO=6;DP=11;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0411987;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.0578;QD=14.6479;RBI=0.104573;REFB=-0.00287504;REVB=0.0961153;RO=5;SAF=2;SAR=4;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.344857;STB=0.70522;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=0.0165769;OID=.;OPOS=32735236;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:11:11:5:5:6:6:0.545455:4:2:4:1:4:2:4:1
chr12	32764184	.	G	A	283.41	PASS	AF=0.526316;AO=32;DP=57;FAO=30;FDP=57;FR=.;FRO=27;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.00808824;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.9935;QD=19.8887;RBI=0.0341313;REFB=0.00913767;REVB=-0.0331591;RO=25;SAF=17;SAR=15;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0723031;STB=0.575212;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=-0.00850285;OID=.;OPOS=32764184;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:25:27:32:30:0.526316:15:17:11:14:13:17:11:16
chr12	32777362	.	G	A	188.7	PASS	AF=0.415094;AO=21;DP=53;FAO=22;FDP=53;FR=.;FRO=31;FSAF=17;FSAR=5;FSRF=22;FSRR=9;FWDB=-0.019404;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.32;QD=14.2416;RBI=0.0195752;REFB=-0.0123228;REVB=0.00258363;RO=31;SAF=16;SAR=5;SRF=22;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0710252;STB=0.549606;STBP=0.583;TYPE=snp;VARB=0.0186492;OID=.;OPOS=32777362;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:31:31:21:22:0.415094:5:16:22:9:5:17:22:9
chr12	32854366	.	A	C	164.18	PASS	AF=0.355932;AO=21;DP=59;FAO=21;FDP=59;FR=.;FRO=38;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=0.0211133;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.647;QD=11.1305;RBI=0.0282651;REFB=0.00149713;REVB=-0.0187921;RO=38;SAF=9;SAR=12;SRF=21;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13679;STB=0.579634;STBP=0.402;TYPE=snp;VARB=-0.00203816;OID=.;OPOS=32854366;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:38:38:21:21:0.355932:12:9:21:17:12:9:21:17
chr12	32860302	.	G	A	153.61	PASS	AF=0.571429;AO=16;DP=28;FAO=16;FDP=28;FR=.;FRO=12;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.00217335;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=269.125;QD=21.9446;RBI=0.00223477;REFB=0.00585766;REVB=-0.00052031;RO=12;SAF=9;SAR=7;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.047897;STB=0.526993;STBP=0.804;TYPE=snp;VARB=-0.00647559;OID=.;OPOS=32860302;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:28:28:12:12:16:16:0.571429:7:9:6:6:7:9:6:6
chr12	32875406	.	A	G	140.7	PASS	AF=0.372093;AO=16;DP=43;FAO=16;FDP=43;FR=.;FRO=27;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.00171645;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.815;QD=13.0886;RBI=0.0108517;REFB=0.00390666;REVB=-0.0107151;RO=27;SAF=7;SAR=9;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00755148;STB=0.504419;STBP=0.98;TYPE=snp;VARB=-0.00594435;OID=.;OPOS=32875406;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:27:27:16:16:0.372093:9:7:12:15:9:7:12:15
chr12	32908237	.	C	A	130.62	PASS	AF=0.384615;AO=15;DP=39;FAO=15;FDP=39;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=0.0302176;FXX=0.0249938;HRUN=6;LEN=1;MLLD=44.1922;QD=13.3972;RBI=0.0409486;REFB=-0.0280712;REVB=0.0276349;RO=24;SAF=8;SAR=7;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.209085;STB=0.621466;STBP=0.236;TYPE=snp;VARB=0.0476517;OID=.;OPOS=32908237;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:24:24:15:15:0.384615:7:8:8:16:7:8:8:16
chr12	32908518	.	G	A	102.5	PASS	AF=0.521739;AO=12;DP=23;FAO=12;FDP=23;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=-0.0141761;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.439;QD=17.8253;RBI=0.0957038;REFB=-0.018219;REVB=-0.0946481;RO=9;SAF=6;SAR=6;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125311;STB=0.56511;STBP=0.555;TYPE=snp;VARB=0.0218089;OID=.;OPOS=32908518;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:23:23:9:11:12:12:0.521739:6:6:3:6:6:6:4:7
chr12	32943927	.	C	T	331.68	PASS	AF=0.548387;AO=34;DP=62;FAO=34;FDP=62;FR=.;FRO=28;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=0.00140142;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.578;QD=21.3986;RBI=0.00408248;REFB=5.98841e-05;REVB=0.0038344;RO=27;SAF=17;SAR=17;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.014834;STB=0.51612;STBP=0.771;TYPE=snp;VARB=-7.62936e-05;OID=.;OPOS=32943927;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:27:28:34:34:0.548387:17:17:13:14:17:17:13:15
chr12	38712142	.	C	G	2255.09	PASS	AF=1;AO=141;DP=142;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0284362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.642;QD=63.5237;RBI=0.0294489;REFB=0;REVB=0.00765621;RO=0;SAF=69;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.45855e-05;OID=.;OPOS=38712142;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:142:142:0:0:141:142:1:72:69:0:0:73:69:0:0
chr12	39705271	.	T	C	128.92	PASS	AF=0.365854;AO=15;DP=41;FAO=15;FDP=41;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=-0.057542;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=47.8223;QD=12.5771;RBI=0.0626326;REFB=-0.0301826;REVB=-0.0247338;RO=26;SAF=6;SAR=9;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149835;STB=0.588117;STBP=0.445;TYPE=snp;VARB=0.0453621;OID=.;OPOS=39705271;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:26:26:15:15:0.365854:9:6:14:12:9:6:14:12
chr12	40152900	.	G	A	1167.76	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.010303;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.951;QD=60.6629;RBI=0.0130595;REFB=0;REVB=0.00802485;RO=0;SAF=41;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.41935e-05;OID=.;OPOS=40152900;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:77:0:0:74:77:1:33:41:0:0:34:43:0:0
chr12	40619082	.	G	A	1062.29	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000192999;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.814;QD=59.8472;RBI=0.0235931;REFB=0;REVB=-0.0235923;RO=0;SAF=28;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.30751e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.09826e-05;OID=.;OPOS=40619082;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:43:28:0:0:43:28:0:0
chr12	40688695	.	T	C	582.32	PASS	AF=0.427632;AO=65;DP=153;FAO=65;FDP=152;FR=.;FRO=87;FSAF=29;FSAR=36;FSRF=39;FSRR=48;FWDB=0.00534069;FXX=0.00653552;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.75;QD=15.3241;RBI=0.00584981;REFB=-0.009033;REVB=0.00238692;RO=87;SAF=29;SAR=36;SRF=39;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00219595;STB=0.501228;STBP=0.98;TYPE=snp;VARB=0.0137299;OID=.;OPOS=40688695;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:153:152:87:87:65:65:0.427632:36:29:39:48:36:29:39:48
chr12	40821176	.	G	A	113.82	PASS	AF=0.219512;AO=18;DP=81;FAO=18;FDP=82;FR=.;FRO=64;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=30;FSRR=34;FWDB=0.0332533;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.8145;QD=5.55235;RBI=0.0573935;REFB=0.00419532;REVB=-0.0467785;RO=63;SAF=12;SAR=6;SRF=30;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.239574;STB=0.655563;STBP=0.151;TYPE=snp;VARB=-0.0176127;OID=.;OPOS=40821176;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:82:63:64:18:18:0.219512:6:12:30:33:6:12:30:34
chr12	40821839	.	C	T	694.61	PASS	AF=0.492857;AO=69;DP=140;FAO=69;FDP=140;FR=.;FRO=71;FSAF=23;FSAR=46;FSRF=34;FSRR=37;FWDB=-0.0775781;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.736;QD=19.846;RBI=0.0776541;REFB=-0.00737048;REVB=-0.00343455;RO=70;SAF=23;SAR=46;SRF=33;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134419;STB=0.578657;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=0.0055034;OID=.;OPOS=40821839;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:140:140:70:71:69:69:0.492857:46:23:33:37:46:23:34:37
chr12	40827579	.	C	T	236.5	PASS	AF=0.45;AO=27;DP=60;FAO=27;FDP=60;FR=.;FRO=33;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=-0.0332427;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.621;QD=15.7666;RBI=0.0496096;REFB=0.0070372;REVB=-0.0368244;RO=33;SAF=13;SAR=14;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120938;STB=0.568216;STBP=0.354;TYPE=snp;VARB=-0.0105974;OID=.;OPOS=40827579;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:33:33:27:27:0.45:14:13:20:13:14:13:20:13
chr12	40835749	.	T	C	1487.55	PASS	AF=1;AO=97;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00514115;FXX=0.0198;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.344;QD=60.1028;RBI=0.013511;REFB=0;REVB=0.0124946;RO=0;SAF=47;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.92868e-05;OID=.;OPOS=40835749;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:99:99:0:0:97:99:1:50:47:0:0:51:48:0:0
chr12	40837264	.	T	C	293.29	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0736736;FXX=0.0434594;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.712;QD=53.3256;RBI=0.0853995;REFB=0;REVB=0.0431888;RO=0;SAF=16;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17051e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00130873;OID=.;OPOS=40837264;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:6:16:0:0:6:16:0:0
chr12	40843504	.	A	C	727.37	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00224718;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.335;QD=63.2491;RBI=0.0162568;REFB=0;REVB=0.0161008;RO=0;SAF=27;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.26643e-05;OID=.;OPOS=40843504;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:19:27:0:0:19:27:0:0
chr12	41337435	.	C	T	282.29	PASS	AF=0.52;AO=26;DP=50;FAO=26;FDP=50;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=7;FWDB=-0.00524159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.303;QD=22.583;RBI=0.0294384;REFB=-0.0052356;REVB=-0.028968;RO=24;SAF=11;SAR=15;SRF=17;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.241307;STB=0.634341;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=0.00536523;OID=.;OPOS=41337435;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:24:24:26:26:0.52:15:11:17:7:15:11:17:7
chr12	41966395	.	G	C	92.17	PASS	AF=0.217391;AO=14;DP=67;FAO=15;FDP=69;FR=.;FRO=54;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=27;FSRR=27;FWDB=-0.0152023;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.442;QD=5.34302;RBI=0.0199363;REFB=-0.00636376;REVB=-0.0128976;RO=52;SAF=9;SAR=5;SRF=26;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179595;STB=0.578841;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.0300994;OID=.;OPOS=41966395;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:67:69:52:54:14:15:0.217391:5:9:26:26:6:9:27:27
chr12	41967677	.	G	A	174.35	PASS	AF=0.366667;AO=22;DP=60;FAO=22;FDP=60;FR=.;FRO=38;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=-0.022579;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.77;QD=11.6231;RBI=0.0228731;REFB=-0.0138612;REVB=-0.00365633;RO=38;SAF=9;SAR=13;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128649;STB=0.574627;STBP=0.396;TYPE=snp;VARB=0.0259808;OID=.;OPOS=41967677;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:38:38:22:22:0.366667:13:9:20:18:13:9:20:18
chr12	42476798	.	T	C	105.14	PASS	AF=0.270833;AO=11;DP=49;FAO=13;FDP=48;FR=.,HEALED;FRO=35;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=-0.157032;FXX=0.020404;HRUN=6;LEN=1;MLLD=55.4735;QD=8.7618;RBI=0.179121;REFB=-0.0095747;REVB=-0.0861713;RO=25;SAF=7;SAR=4;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180307;STB=0.634715;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=0.0214742;OID=.;OPOS=42476798;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:48:25:35:11:13:0.270833:4:7:12:13:5:8:15:20
chr12	42512910	.	T	A	32.92	PASS	AF=0.136364;AO=6;DP=44;FAO=6;FDP=44;FR=.;FRO=38;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=22;FSRR=16;FWDB=-0.0144931;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.569;QD=2.99302;RBI=0.0205037;REFB=0.00435393;REVB=0.0145036;RO=38;SAF=2;SAR=4;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.284331;STB=0.705223;STBP=0.364;TYPE=snp;VARB=-0.011565;OID=.;OPOS=42512910;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:32:44:44:38:38:6:6:0.136364:4:2:22:16:4:2:22:16
chr12	42512924	.	C	T	32.92	PASS	AF=0.136364;AO=6;DP=44;FAO=6;FDP=44;FR=.;FRO=38;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=-0.00688627;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.854;QD=2.99308;RBI=0.0390424;REFB=-0.00125833;REVB=-0.0384303;RO=38;SAF=2;SAR=4;SRF=21;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.255972;STB=0.685957;STBP=0.396;TYPE=snp;VARB=0.0229925;OID=.;OPOS=42512924;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:32:44:44:38:38:6:6:0.136364:4:2:21:17:4:2:21:17
chr12	42553219	.	T	C	55.11	PASS	AF=0.307692;AO=7;DP=27;FAO=8;FDP=26;FR=.;FRO=18;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.00744562;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.111;QD=8.47884;RBI=0.0135143;REFB=-0.00523851;REVB=-0.0112782;RO=18;SAF=1;SAR=6;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.459736;STB=0.813055;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.0167376;OID=.;OPOS=42553219;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:27:26:18:18:7:8:0.307692:6:1:9:9:7:1:9:9
chr12	42606229	.	T	C	92.2	PASS	AF=0.292683;AO=12;DP=41;FAO=12;FDP=41;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=0.00384622;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.455;QD=8.99486;RBI=0.0188816;REFB=-0.0072297;REVB=0.0184857;RO=29;SAF=7;SAR=5;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194632;STB=0.61828;STBP=0.382;TYPE=snp;VARB=0.00859511;OID=.;OPOS=42606229;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:41:41:29:29:12:12:0.292683:5:7:12:17:5:7:12:17
chr12	42629550	.	T	C	747.1	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.048441;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.253;QD=63.5828;RBI=0.0522088;REFB=0;REVB=0.0194739;RO=0;SAF=30;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000136426;OID=.;OPOS=42629550;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:17:30:0:0:17:30:0:0
chr12	42636124	.	A	G	729.01	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0266105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.472;QD=57.1775;RBI=0.0333295;REFB=0;REVB=0.0200683;RO=0;SAF=31;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.13361e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000119404;OID=.;OPOS=42636124;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:20:31:0:0:20:31:0:0
chr12	42838886	.	C	T	164.78	PASS	AF=0.548387;AO=17;DP=31;FAO=17;FDP=31;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=-0.0124261;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.3773;QD=21.2619;RBI=0.0272795;REFB=0.00466508;REVB=-0.024285;RO=14;SAF=7;SAR=10;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.238708;STB=0.634174;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=-0.00657772;OID=.;OPOS=42838886;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:14:14:17:17:0.548387:10:7:10:4:10:7:10:4
chr12	42839836	.	A	C	1162.64	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0544203;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.4967;QD=60.397;RBI=0.0572439;REFB=0;REVB=-0.0177566;RO=0;SAF=52;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000445778;OID=.;OPOS=42839836;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:25:52:0:0:25:52:0:0
chr12	42853084	.	C	A	266.14	PASS	AF=0.5;AO=25;DP=50;FAO=25;FDP=50;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=-0.00183523;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.947;QD=21.2914;RBI=0.00202909;REFB=-0.0113375;REVB=-0.000865536;RO=25;SAF=12;SAR=13;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107791;STB=0.560339;STBP=0.448;TYPE=snp;VARB=0.0114839;OID=.;OPOS=42853084;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:25:25:25:25:0.5:13:12:9:16:13:12:9:16
chr12	42853871	.	G	A	195.6	PASS	AF=0.387097;AO=24;DP=62;FAO=24;FDP=62;FR=.;FRO=38;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=29;FWDB=0.00109367;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=233.701;QD=12.6193;RBI=0.0166784;REFB=-0.0162606;REVB=-0.0166425;RO=38;SAF=13;SAR=11;SRF=9;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.321464;STB=0.682279;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.0281864;OID=.;OPOS=42853871;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:38:38:24:24:0.387097:11:13:9:29:11:13:9:29
chr12	42854204	.	CA	C,CG	997.4	PASS	AF=0.130435,0.869565;AO=9,60;DP=70;FAO=9,60;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=8,44;FSAR=1,16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0193542,0.0189743;FXX=0.0142837;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=284.454,306.008;QD=57.8205;RBI=0.0221448,0.0252214;REFB=0,0;REVB=0.0107614,0.0166161;RO=0;SAF=8,45;SAR=1,15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.00121373,-0.00115269;OID=.,.;OPOS=42854205,42854205;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=C,CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.130435,0.869565:9,60:70:9,60:69:0:8,44:1,16:0:0:41:0:8,45:1,15:0:0
chr12	42854208	.	A	G	211.23	PASS	AF=0.371429;AO=26;DP=70;FAO=26;FDP=70;FR=.;FRO=44;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=35;FSRR=9;FWDB=-0.0143205;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=276.223;QD=12.07;RBI=0.0149172;REFB=-0.0105346;REVB=-0.00417688;RO=44;SAF=18;SAR=8;SRF=35;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141717;STB=0.580765;STBP=0.393;TYPE=snp;VARB=0.015707;OID=.;OPOS=42854208;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:44:44:26:26:0.371429:8:18:35:9:8:18:35:9
chr12	42863262	.	A	G	344.04	PASS	AF=0.659091;AO=29;DP=44;FAO=29;FDP=44;FR=.;FRO=15;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=0.0470103;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.7181;QD=31.2768;RBI=0.0475598;REFB=-0.0254587;REVB=-0.00720838;RO=15;SAF=19;SAR=10;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0079335;STB=0.504345;STBP=0.968;TYPE=snp;VARB=0.015884;OID=.;OPOS=42863262;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:15:15:29:29:0.659091:10:19:10:5:10:19:10:5
chr12	42863266	.	C	T	103.09	PASS	AF=0.302326;AO=13;DP=43;FAO=13;FDP=43;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=19;FSRR=11;FWDB=-0.00281122;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.026;QD=9.58994;RBI=0.00716408;REFB=0.00815682;REVB=0.00658947;RO=30;SAF=8;SAR=5;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0219983;STB=0.513288;STBP=0.932;TYPE=snp;VARB=-0.0220395;OID=.;OPOS=42863266;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:30:30:13:13:0.302326:5:8:19:11:5:8:19:11
chr12	43777630	.	C	A	199.13	PASS	AF=0.655172;AO=19;DP=29;FAO=19;FDP=29;FR=.;FRO=10;FSAF=15;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=2;FWDB=-0.0106869;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=221.427;QD=27.4659;RBI=0.0191619;REFB=-0.00675181;REVB=0.0159049;RO=10;SAF=15;SAR=4;SRF=8;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00990355;STB=0.505489;STBP=0.988;TYPE=snp;VARB=0.00301196;OID=.;OPOS=43777630;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:29:29:10:10:19:19:0.655172:4:15:8:2:4:15:8:2
chr12	43860526	.	A	G	206.04	PASS	AF=0.444444;AO=23;DP=53;FAO=24;FDP=54;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=0.0104351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.484;QD=15.2623;RBI=0.0117538;REFB=-0.00648204;REVB=-0.00540917;RO=29;SAF=12;SAR=11;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172952;STB=0.614237;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.00830705;OID=.;OPOS=43860526;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:54:29:30:23:24:0.444444:11:12:10:19:11:13:10:20
chr12	43944909	.	C	G	164.68	PASS	AF=0.548387;AO=17;DP=31;FAO=17;FDP=31;FR=.;FRO=14;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=0.0232716;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.3231;QD=21.2493;RBI=0.0318376;REFB=0.0195742;REVB=-0.0217271;RO=13;SAF=9;SAR=8;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127272;STB=0.551664;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=-0.0153352;OID=.;OPOS=43944909;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:13:14:17:17:0.548387:8:9:9:4:8:9:9:5
chr12	45269284	.	C	T	271.68	PASS	AF=0.418919;AO=31;DP=73;FAO=31;FDP=74;FR=.;FRO=43;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=25;FSRR=18;FWDB=0.00584328;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.0331;QD=14.6852;RBI=0.0174169;REFB=-0.0179503;REVB=-0.0164075;RO=42;SAF=19;SAR=12;SRF=24;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0438392;STB=0.519113;STBP=0.794;TYPE=snp;VARB=0.0276528;OID=.;OPOS=45269284;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:74:42:43:31:31:0.418919:12:19:24:18:12:19:25:18
chr12	45410075	.	A	G	484.19	PASS	AF=0.495146;AO=50;DP=101;FAO=51;FDP=103;FR=.;FRO=52;FSAF=31;FSAR=20;FSRF=22;FSRR=30;FWDB=7.65577e-05;FXX=0.0282992;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.071;QD=18.8036;RBI=0.0151441;REFB=-0.00542408;REVB=-0.0151439;RO=51;SAF=30;SAR=20;SRF=21;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17187;STB=0.593833;STBP=0.06;TYPE=snp;VARB=0.00452214;OID=.;OPOS=45410075;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:103:51:52:50:51:0.495146:20:30:21:30:20:31:22:30
chr12	45417666	.	T	C	176.28	PASS	AF=0.529412;AO=18;DP=34;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.00161388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.805;QD=20.7383;RBI=0.0183542;REFB=0.018441;REVB=0.0182831;RO=16;SAF=6;SAR=12;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198161;STB=0.612117;STBP=0.196;TYPE=snp;VARB=-0.0221773;OID=.;OPOS=45417666;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:16:16:18:18:0.529412:12:6:9:7:12:6:9:7
chr12	46246206	.	G	T	402.81	PASS	AF=0.488095;AO=41;DP=84;FAO=41;FDP=84;FR=.;FRO=43;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=27;FSRR=16;FWDB=-0.018074;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.749;QD=19.1814;RBI=0.0236431;REFB=0.0111192;REVB=0.0152422;RO=43;SAF=22;SAR=19;SRF=27;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0851878;STB=0.547302;STBP=0.437;TYPE=snp;VARB=-0.0104638;OID=.;OPOS=46246206;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:43:43:41:41:0.488095:19:22:27:16:19:22:27:16
chr12	46367944	.	A	G	208.39	PASS	AF=0.356164;AO=26;DP=73;FAO=26;FDP=73;FR=.;FRO=47;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=21;FSRR=26;FWDB=-0.00310871;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=249.433;QD=11.4185;RBI=0.0100015;REFB=0.00317628;REVB=0.00950615;RO=47;SAF=14;SAR=12;SRF=21;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101606;STB=0.558779;STBP=0.484;TYPE=snp;VARB=-0.00524742;OID=.;OPOS=46367944;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:47:47:26:26:0.356164:12:14:21:26:12:14:21:26
chr12	46758493	.	GA	G,GG	235.74	PASS	AF=0.0526316,0.947368;AO=2,17;DP=19;FAO=1,18;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=1,11;FSAR=0,7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00374074,-0.00172799;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=282.564,292.286;QD=49.6302;RBI=0.0176335,0.012837;REFB=0,0;REVB=0.0172322,0.0127201;RO=0;SAF=1,11;SAR=1,6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0252833,0.00298685;OID=.,.;OPOS=46758494,46758494;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0526316,0.947368:2,17:19:1,18:19:0:1,11:0,7:0:0:6:0:1,11:1,6:0:0
chr12	46759017	.	T	A	323.47	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00753781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.414;QD=53.9112;RBI=0.0162546;REFB=0;REVB=0.0144012;RO=0;SAF=12;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.40509e-05;OID=.;OPOS=46759017;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:12:12:0:0:12:12:0:0
chr12	46761127	.	G	A	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00237572;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=260.556;QD=49.5989;RBI=0.00450125;REFB=0;REVB=0.00382325;RO=0;SAF=7;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.08336e-05;OID=.;OPOS=46761127;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:11:7:0:0:11:7:0:0
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chr12	47170764	.	G	A	43.33	PASS	AF=0.194444;AO=7;DP=36;FAO=7;FDP=36;FR=.;FRO=29;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=-0.0881603;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.997;QD=4.81393;RBI=0.0881904;REFB=-0.0010816;REVB=0.00230461;RO=27;SAF=1;SAR=6;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.384073;STB=0.79151;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=-0.00256054;OID=.;OPOS=47170764;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:36:36:27:29:7:7:0.194444:6:1:11:16:6:1:13:16
chr12	47470223	.	T	A,TTACTA	931.64	PASS	AF=0.0923077,0.907692;AO=9,51;DP=68;FAO=6,59;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=3,31;FSAR=3,28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00925153,0.0113461;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,5;MLLD=144.607,258.754;QD=57.3316;RBI=0.0134842,0.0152059;REFB=0,0;REVB=0.00980984,0.0101234;RO=4;SAF=3,27;SAR=6,24;SRF=3;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.228994,-0.030303;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,ins;VARB=0.0158693,-0.000605952;OID=.,.;OPOS=47470223,47470224;OREF=T,-;OALT=A,TACTA;OMAPALT=A,TTACTA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:23:68:65:4:0:9,51:6,59:0.0923077,0.907692:6,24:3,27:3:1:3,28:3,31:0:0
chr12	47471439	.	G	A	181.28	PASS	AF=0.431818;AO=19;DP=44;FAO=19;FDP=44;FR=.;FRO=25;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=-0.0147493;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=167.327;QD=16.4804;RBI=0.0231377;REFB=-0.00598598;REVB=-0.0178273;RO=25;SAF=8;SAR=11;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0214855;STB=0.512302;STBP=0.903;TYPE=snp;VARB=0.00806858;OID=.;OPOS=47471439;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:25:25:19:19:0.431818:11:8:10:15:11:8:10:15
chr12	47581629	.	T	C	1585.03	PASS	AF=1;AO=92;DP=94;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0544405;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.374;QD=63.4013;RBI=0.0876195;REFB=0;REVB=0.0686543;RO=0;SAF=43;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000266413;OID=.;OPOS=47581629;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:94:100:0:0:92:100:1:49:43:0:0:55:45:0:0
chr12	47629368	.	G	T	779.16	PASS	AF=0.47929;AO=81;DP=169;FAO=81;FDP=169;FR=.;FRO=88;FSAF=48;FSAR=33;FSRF=40;FSRR=48;FWDB=0.00280293;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=252.306;QD=18.4417;RBI=0.00470695;REFB=-0.00247983;REVB=-0.0037814;RO=88;SAF=48;SAR=33;SRF=40;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131043;STB=0.57242;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=0.00260661;OID=.;OPOS=47629368;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:169:169:88:88:81:81:0.47929:33:48:40:48:33:48:40:48
chr12	47740029	.	A	G	616.19	PASS	AF=0.484615;AO=63;DP=130;FAO=63;FDP=130;FR=.;FRO=67;FSAF=39;FSAR=24;FSRF=38;FSRR=29;FWDB=0.000254943;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=174.193;QD=18.9595;RBI=0.0100093;REFB=-0.0081516;REVB=0.0100061;RO=67;SAF=39;SAR=24;SRF=38;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0504937;STB=0.52796;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=0.00869692;OID=.;OPOS=47740029;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:130:130:67:67:63:63:0.484615:24:39:38:29:24:39:38:29
chr12	47740069	.	C	A	1877.29	PASS	AF=1;AO=121;DP=121;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0180093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.107;QD=61.5505;RBI=0.0487115;REFB=0;REVB=0.0452601;RO=0;SAF=65;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.40676e-05;OID=.;OPOS=47740069;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:121:122:0:0:121:122:1:56:65:0:0:57:65:0:0
chr12	47758032	.	A	G	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.685;QD=37.4883;RBI=0.0217556;REFB=0;REVB=0.0217556;RO=0;SAF=0;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000330198;OID=.;OPOS=47758032;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:8:0:0:0:8:0:0:0
chr12	48134695	.	T	C	144.75	PASS	AF=0.432432;AO=16;DP=37;FAO=16;FDP=37;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=-0.0148944;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.969;QD=15.6489;RBI=0.0155592;REFB=0.00617989;REVB=-0.00449931;RO=21;SAF=8;SAR=8;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0234155;STB=0.513497;STBP=0.918;TYPE=snp;VARB=-0.016184;OID=.;OPOS=48134695;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:21:21:16:16:0.432432:8:8:10:11:8:8:10:11
chr12	48144925	.	T	C	1131.68	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0320161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.764;QD=60.3563;RBI=0.0447644;REFB=0;REVB=0.0312861;RO=0;SAF=39;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.28495e-05;OID=.;OPOS=48144925;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:75:0:0:72:75:1:33:39:0:0:34:41:0:0
chr12	48151822	.	C	G	674.34	PASS	AF=0.464516;AO=72;DP=160;FAO=72;FDP=155;FR=.;FRO=83;FSAF=24;FSAR=48;FSRF=52;FSRR=31;FWDB=0.0901775;FXX=0.031248;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.4679;QD=17.4023;RBI=0.0915472;REFB=0.00248395;REVB=0.0157769;RO=88;SAF=24;SAR=48;SRF=57;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.309745;STB=0.657965;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=-0.00195474;OID=.;OPOS=48151822;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:160:155:88:83:72:72:0.464516:48:24:57:31:48:24:52:31
chr12	48175353	.	G	T	348.83	PASS	AF=0.18254;AO=23;DP=125;FAO=23;FDP=126;FR=.,HEALED;FRO=80;FSAF=21;FSAR=2;FSRF=46;FSRR=34;FWDB=-0.0116546;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.652;QD=11.074;RBI=0.017356;REFB=-0.00611746;REVB=0.0128609;RO=80;SAF=21;SAR=2;SRF=46;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.542138;STB=0.849071;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.00820703;OID=.;OPOS=48175353;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:125:126:80:80:23:23:0.18254:2:21:46:34:2:21:46:34
chr12	48176792	.	C	T	201.5	PASS	AF=0.413793;AO=24;DP=58;FAO=24;FDP=58;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=0.00928328;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.323;QD=13.8963;RBI=0.00944033;REFB=-0.00952549;REVB=0.00171484;RO=34;SAF=10;SAR=14;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0257136;STB=0.514694;STBP=0.853;TYPE=snp;VARB=0.0248294;OID=.;OPOS=48176792;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:34:34:24:24:0.413793:14:10:15:19:14:10:15:19
chr12	48177170	.	C	G	243.58	PASS	AF=0.522727;AO=24;DP=45;FAO=23;FDP=44;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=-0.0086418;FXX=0.0222173;HRUN=6;LEN=1;MLLD=256.435;QD=22.1432;RBI=0.0167498;REFB=-0.00991502;REVB=-0.0143483;RO=20;SAF=10;SAR=14;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0277624;STB=0.519983;STBP=0.797;TYPE=snp;VARB=0.0069209;OID=.;OPOS=48177170;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:44:20:21:24:23:0.522727:14:10:9:11:13:10:10:11
chr12	48177238	.	A	G	534.1	PASS	AF=0.597561;AO=49;DP=82;FAO=49;FDP=82;FR=.;FRO=33;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=9;FSRR=24;FWDB=-0.0217437;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.225;QD=26.0536;RBI=0.0217459;REFB=-0.0243584;REVB=-0.000313448;RO=33;SAF=26;SAR=23;SRF=9;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188774;STB=0.602821;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.0159948;OID=.;OPOS=48177238;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:33:33:49:49:0.597561:23:26:9:24:23:26:9:24
chr12	48192639	.	G	A	129.21	PASS	AF=0.608696;AO=14;DP=23;FAO=14;FDP=23;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=0.0398119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.2529;QD=22.4713;RBI=0.0402886;REFB=-0.0443447;REVB=0.00617929;RO=9;SAF=6;SAR=8;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150374;STB=0.584301;STBP=0.362;TYPE=snp;VARB=0.0827326;OID=.;OPOS=48192639;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:23:23:9:9:14:14:0.608696:8:6:2:7:8:6:2:7
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chr12	48376291	.	G	A	156.85	PASS	AF=0.64;AO=15;DP=25;FAO=16;FDP=25;FR=.;FRO=9;FSAF=13;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.0108802;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.9577;QD=25.0965;RBI=0.0155026;REFB=-0.0790574;REVB=0.0110431;RO=9;SAF=13;SAR=2;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.462036;STB=0.708799;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.0303133;OID=.;OPOS=48376291;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:25:25:9:9:15:16:0.64:2:13:3:6:3:13:3:6
chr12	48380682	.	G	A	587.97	PASS	AF=0.557692;AO=58;DP=103;FAO=58;FDP=104;FR=.;FRO=46;FSAF=27;FSAR=31;FSRF=18;FSRR=28;FWDB=0.00297508;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=312.861;QD=22.6143;RBI=0.00393336;REFB=-0.011274;REVB=0.00257298;RO=45;SAF=27;SAR=31;SRF=18;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.052787;STB=0.533121;STBP=0.473;TYPE=snp;VARB=0.00895116;OID=.;OPOS=48380682;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:104:45:46:58:58:0.557692:31:27:18:27:31:27:18:28
chr12	48389643	.	A	C	216.3	PASS	AF=0.538462;AO=21;DP=39;FAO=21;FDP=39;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=18;FWDB=0.0618093;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.9233;QD=22.1847;RBI=0.0761153;REFB=-0.000970994;REVB=0.0444201;RO=18;SAF=5;SAR=16;SRF=0;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.33047;STB=0.679874;STBP=0.141;TYPE=snp;VARB=0.00174391;OID=.;OPOS=48389643;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:18:18:21:21:0.538462:16:5:0:18:16:5:0:18
chr12	48391416	.	G	T	480.12	PASS	AF=0.619718;AO=44;DP=74;FAO=44;FDP=71;FR=.;FRO=27;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=0.0295018;FXX=0.0657808;HRUN=6;LEN=1;MLLD=150.996;QD=27.0491;RBI=0.0309798;REFB=-0.00234521;REVB=0.00945465;RO=27;SAF=24;SAR=20;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0704578;STB=0.538444;STBP=0.394;TYPE=snp;VARB=0.00171777;OID=.;OPOS=48391416;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:71:27:27:44:44:0.619718:20:24:12:15:20:24:12:15
chr12	48398080	.	T	A	338.63	PASS	AF=0.522388;AO=34;DP=68;FAO=35;FDP=67;FR=.;FRO=32;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=-0.0226019;FXX=0.0289813;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.404;QD=20.2166;RBI=0.0455485;REFB=-0.0200449;REVB=0.0395451;RO=32;SAF=15;SAR=19;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0243012;STB=0.505576;STBP=0.954;TYPE=snp;VARB=0.0137998;OID=.;OPOS=48398080;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:67:32:32:34:35:0.522388:19:15:15:17:19:16:15:17
chr12	48413944	.	C	T	79.33	PASS	AF=0.244444;AO=13;DP=45;FAO=11;FDP=45;FR=.;FRO=34;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=24;FWDB=-0.0464508;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.7404;QD=7.05191;RBI=0.0543832;REFB=-0.00430342;REVB=-0.0282817;RO=32;SAF=3;SAR=10;SRF=10;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12208;STB=0.519963;STBP=0.923;TYPE=snp;VARB=0.0181001;OID=.;OPOS=48413944;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:79:45:45:32:34:13:11:0.244444:10:3:10:22:8:3:10:24
chr12	48413950	.	A	C	80.03	PASS	AF=0.289474;AO=10;DP=38;FAO=11;FDP=38;FR=.;FRO=27;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=20;FWDB=-0.0185504;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=40.5149;QD=8.42414;RBI=0.078632;REFB=-0.0210643;REVB=0.0764125;RO=28;SAF=3;SAR=7;SRF=7;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0732683;STB=0.512173;STBP=0.983;TYPE=snp;VARB=0.0542339;OID=.;OPOS=48413950;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:80:38:38:28:27:10:11:0.289474:7:3:7:21:8:3:7:20
chr12	48438140	.	CAT	C	289.71	PASS	AF=1;AO=20;DP=23;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.215018;FXX=0.0434594;HRUN=1;LEN=2;MLLD=140.295;QD=52.6752;RBI=0.226116;REFB=0;REVB=0.0699695;RO=0;SAF=13;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00222073;OID=.;OPOS=48438141;OREF=AT;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:20:23:22:22:0:15:7:0:0:4:0:13:7:0:0
chr12	48477422	.	A	G	263.53	PASS	AF=0.483333;AO=29;DP=60;FAO=29;FDP=60;FR=.;FRO=31;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.00635311;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=249.668;QD=17.5685;RBI=0.00739907;REFB=0.00989019;REVB=-0.00379266;RO=31;SAF=14;SAR=15;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00102591;STB=0.500575;STBP=0.97;TYPE=snp;VARB=-0.0113918;OID=.;OPOS=48477422;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:31:31:29:29:0.483333:15:14:15:16:15:14:15:16
chr12	48501161	.	A	T	161.82	PASS	AF=0.33871;AO=21;DP=62;FAO=21;FDP=62;FR=.;FRO=41;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=-0.0211057;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.651;QD=10.4399;RBI=0.0458291;REFB=-0.00573545;REVB=-0.0406799;RO=41;SAF=9;SAR=12;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0120099;STB=0.507036;STBP=0.958;TYPE=snp;VARB=0.0043609;OID=.;OPOS=48501161;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:41:41:21:21:0.33871:12:9:18:23:12:9:18:23
chr12	48512285	.	C	A	723.19	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00374995;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.113;QD=62.8858;RBI=0.0239541;REFB=0;REVB=0.0236587;RO=0;SAF=26;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.75441e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00013359;OID=.;OPOS=48512285;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:46:0:0:43:46:1:17:26:0:0:18:28:0:0
chr12	48512331	.	C	T	192.41	PASS	AF=0.416667;AO=20;DP=48;FAO=20;FDP=48;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=0.008453;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=252.2;QD=16.0341;RBI=0.0109235;REFB=-0.00738205;REVB=-0.00691884;RO=28;SAF=9;SAR=11;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0509692;STB=0.529259;STBP=0.735;TYPE=snp;VARB=0.00938449;OID=.;OPOS=48512331;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:28:28:20:20:0.416667:11:9:14:14:11:9:14:14
chr12	48525861	.	A	G	123.72	PASS	AF=0.340909;AO=13;DP=44;FAO=15;FDP=44;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=-0.0140266;FXX=0.0638162;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.478;QD=11.2472;RBI=0.0169169;REFB=-0.0122941;REVB=-0.00945693;RO=28;SAF=7;SAR=6;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.043696;STB=0.510624;STBP=0.949;TYPE=snp;VARB=0.039693;OID=.;OPOS=48525861;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:28:29:13:15:0.340909:6:7:14:14:8:7:14:15
chr12	48526712	.	G	A	446.1	PASS	AF=0.565789;AO=43;DP=76;FAO=43;FDP=76;FR=.;FRO=33;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=0.032759;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.709;QD=23.479;RBI=0.0361563;REFB=-0.00590526;REVB=0.0153012;RO=33;SAF=26;SAR=17;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144023;STB=0.579171;STBP=0.125;TYPE=snp;VARB=0.00262988;OID=.;OPOS=48526712;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:33:33:43:43:0.565789:17:26:14:19:17:26:14:19
chr12	48541757	.	A	G	128.04	PASS	AF=0.56;AO=14;DP=25;FAO=14;FDP=25;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.00180802;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.437;QD=20.4856;RBI=0.0296872;REFB=-0.0227638;REVB=0.0296321;RO=11;SAF=5;SAR=9;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150655;STB=0.585674;STBP=0.385;TYPE=snp;VARB=0.00803796;OID=.;OPOS=48541757;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:25:25:11:11:14:14:0.56:9:5:6:5:9:5:6:5
chr12	48578325	.	A	C	94.56	PASS	AF=0.611111;AO=11;DP=18;FAO=11;FDP=18;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.0601865;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.295;QD=21.0135;RBI=0.0601896;REFB=-0.0310909;REVB=0.00061596;RO=7;SAF=5;SAR=6;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0178658;STB=0.510186;STBP=0.943;TYPE=snp;VARB=0.022834;OID=.;OPOS=48578325;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:18:18:7:7:11:11:0.611111:6:5:3:4:6:5:3:4
chr12	48578809	.	T	C	142.64	PASS	AF=0.4;AO=16;DP=40;FAO=16;FDP=40;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=-0.00411783;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.21;QD=14.2637;RBI=0.0132739;REFB=-0.010542;REVB=0.012619;RO=24;SAF=7;SAR=9;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0662823;STB=0.538414;STBP=0.691;TYPE=snp;VARB=0.0115661;OID=.;OPOS=48578809;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:24:24:16:16:0.4:9:7:9:15:9:7:9:15
chr12	48596241	.	A	G	298.09	PASS	AF=0.54386;AO=30;DP=56;FAO=31;FDP=57;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=-0.0142826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.358;QD=20.9182;RBI=0.0144884;REFB=-0.00636201;REVB=0.00243364;RO=26;SAF=13;SAR=17;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151456;STB=0.589107;STBP=0.173;TYPE=snp;VARB=0.00419592;OID=.;OPOS=48596241;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:57:26:26:30:31:0.54386:17:13:16:10:18:13:16:10
chr12	48597053	.	A	G	192.9	PASS	AF=0.575758;AO=19;DP=33;FAO=19;FDP=33;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.0132288;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.41;QD=23.3816;RBI=0.0140225;REFB=-0.00381914;REVB=-0.00465056;RO=14;SAF=10;SAR=9;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0739392;STB=0.541358;STBP=0.581;TYPE=snp;VARB=0.00232384;OID=.;OPOS=48597053;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:14:14:19:19:0.575758:9:10:6:8:9:10:6:8
chr12	48723595	.	G	A	264.81	PASS	AF=0.529412;AO=27;DP=51;FAO=27;FDP=51;FR=.;FRO=24;FSAF=20;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=-0.000584532;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.915;QD=20.769;RBI=0.000762779;REFB=-0.0386095;REVB=0.000490055;RO=24;SAF=20;SAR=7;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194397;STB=0.609051;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=0.0375998;OID=.;OPOS=48723595;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:24:24:27:27:0.529412:7:20:13:11:7:20:13:11
chr12	48866585	.	A	C	891.38	PASS	AF=1;AO=61;DP=63;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00474047;FXX=0.031741;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.232;QD=58.4513;RBI=0.0150065;REFB=0;REVB=-0.0142381;RO=0;SAF=28;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.76719e-05;OID=.;OPOS=48866585;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:61:0:0:61:61:1:33:28:0:0:33:28:0:0
chr12	48866792	.	C	T	754.39	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0330857;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.998;QD=56.9353;RBI=0.035277;REFB=0;REVB=0.0122394;RO=0;SAF=35;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.37925e-05;OID=.;OPOS=48866792;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:18:35:0:0:18:35:0:0
chr12	48919556	.	A	G	632.95	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0386662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.304;QD=61.7507;RBI=0.0399935;REFB=0;REVB=0.010218;RO=0;SAF=19;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000303821;OID=.;OPOS=48919556;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:41:0:0:40:41:1:21:19:0:0:21:20:0:0
chr12	48919659	.	T	C	219.21	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0128268;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.292;QD=48.7136;RBI=0.0130266;REFB=0;REVB=-0.00227258;RO=0;SAF=8;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000246049;OID=.;OPOS=48919659;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:18:0:0:17:18:1:9:8:0:0:9:9:0:0
chr12	48919796	.	C	T	411.07	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130533;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.649;QD=56.699;RBI=0.0200476;REFB=0;REVB=0.0152156;RO=0;SAF=17;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.0947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.97578e-05;OID=.;OPOS=48919796;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:12:17:0:0:12:17:0:0
chr12	48920006	.	G	A	801.11	PASS	AF=1;AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.022045;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.8628;QD=57.222;RBI=0.0313742;REFB=0;REVB=0.0223239;RO=0;SAF=35;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00055125;OID=.;OPOS=48920006;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:57:56:0:0:56:56:1:21:35:0:0:21:35:0:0
chr12	48954040	.	A	G	293.53	PASS	AF=0.525424;AO=31;DP=60;FAO=31;FDP=59;FR=.;FRO=28;FSAF=23;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=0.00477636;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.459;QD=19.9003;RBI=0.00967827;REFB=-0.0166195;REVB=0.00841756;RO=28;SAF=23;SAR=8;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.233821;STB=0.630833;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.0153134;OID=.;OPOS=48954040;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:59:28:28:31:31:0.525424:8:23:14:14:8:23:14:14
chr12	49048738	.	G	T	747.1	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00408356;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=313.573;QD=63.583;RBI=0.00810011;REFB=0;REVB=0.00699545;RO=0;SAF=23;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.24283e-06;OID=.;OPOS=49048738;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:24:23:0:0:24:23:0:0
chr12	49075811	.	T	G	585.97	PASS	AF=1;AO=36;DP=37;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0369765;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.346;QD=60.0995;RBI=0.0588216;REFB=0;REVB=0.0457463;RO=0;SAF=28;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000917484;OID=.;OPOS=49075811;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:39:0:0:36:39:1:8:28:0:0:11:28:0:0
chr12	49086963	.	G	A	799.25	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0141589;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=203.369;QD=57.0892;RBI=0.0243257;REFB=0;REVB=0.0197804;RO=0;SAF=25;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000113132;OID=.;OPOS=49086963;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:56:0:0:55:56:1:30:25:0:0:30:26:0:0
chr12	49221622	.	G	A	211.89	PASS	AF=0.45098;AO=23;DP=51;FAO=23;FDP=51;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=-0.00563856;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.784;QD=16.6186;RBI=0.00564064;REFB=-0.0278033;REVB=0.000153453;RO=28;SAF=7;SAR=16;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0963506;STB=0.554864;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=0.0261423;OID=.;OPOS=49221622;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:28:28:23:23:0.45098:16:7:11:17:16:7:11:17
chr12	49222217	.	T	C	52.91	PASS	AF=0.7;AO=7;DP=10;FAO=7;FDP=10;FR=.;FRO=3;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.9242;QD=21.1638;RBI=0.0298862;REFB=0.0124722;REVB=-0.0298862;RO=3;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0330372;OID=.;OPOS=49222217;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:10:10:3:3:7:7:0.7:7:0:0:3:7:0:0:3
chr12	49230035	.	T	G	55.83	PASS	AF=0.380952;AO=8;DP=21;FAO=8;FDP=21;FR=.;FRO=13;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=0.0452058;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.627;QD=10.6346;RBI=0.0452058;REFB=-0.00747747;REVB=2.14944e-05;RO=13;SAF=1;SAR=7;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.296557;STB=0.685717;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=0.00790022;OID=.;OPOS=49230035;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:21:21:13:13:8:8:0.380952:7:1:4:9:7:1:4:9
chr12	49255798	.	G	C	651.22	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0139824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.411;QD=62.0209;RBI=0.0370381;REFB=0;REVB=0.0342975;RO=0;SAF=28;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000477536;OID=.;OPOS=49255798;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:14:28:0:0:14:28:0:0
chr12	49308284	.	A	G	309.41	PASS	AF=0.533333;AO=32;DP=60;FAO=32;FDP=60;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=0.0112964;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.6505;QD=20.6273;RBI=0.0143254;REFB=0.00144542;REVB=-0.00880951;RO=28;SAF=11;SAR=21;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0124178;STB=0.506892;STBP=0.937;TYPE=snp;VARB=0.00117196;OID=.;OPOS=49308284;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:28:28:32:32:0.533333:21:11:10:18:21:11:10:18
chr12	49312593	.	A	G	373.56	PASS	AF=0.578125;AO=37;DP=64;FAO=37;FDP=64;FR=.;FRO=27;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=0.0127213;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.0581;QD=23.3475;RBI=0.0485226;REFB=0.031593;REVB=0.0468253;RO=27;SAF=20;SAR=17;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0169708;STB=0.509333;STBP=0.87;TYPE=snp;VARB=-0.0216004;OID=.;OPOS=49312593;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:27:27:37:37:0.578125:17:20:14:13:17:20:14:13
chr12	49314862	.	C	A	371.11	PASS	AF=0.513514;AO=38;DP=74;FAO=38;FDP=74;FR=.;FRO=36;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=0.0255637;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.5639;QD=20.0598;RBI=0.0536254;REFB=-0.0200002;REVB=-0.0471401;RO=36;SAF=21;SAR=17;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118912;STB=0.565923;STBP=0.252;TYPE=snp;VARB=0.0223747;OID=.;OPOS=49314862;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:36:36:38:38:0.513514:17:21:15:21:17:21:15:21
chr12	49314994	.	A	G	212.58	PASS	AF=0.666667;AO=19;DP=29;FAO=20;FDP=30;FR=.;FRO=10;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=-0.00651724;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.511;QD=28.3444;RBI=0.016446;REFB=-0.0443682;REVB=0.0150996;RO=9;SAF=12;SAR=7;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.237543;STB=0.63145;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=0.0169108;OID=.;OPOS=49314994;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:29:30:9:10:19:20:0.666667:7:12:2:7:8:12:2:8
chr12	49332092	.	G	A	335.98	PASS	AF=0.514706;AO=35;DP=68;FAO=35;FDP=68;FR=.;FRO=33;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=5.14039e-06;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.488;QD=19.7636;RBI=0.0154599;REFB=-0.0068716;REVB=0.0154599;RO=33;SAF=13;SAR=22;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0759293;STB=0.542229;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.0074881;OID=.;OPOS=49332092;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:33:33:35:35:0.514706:22:13:15:18:22:13:15:18
chr12	49332366	.	C	T	120.36	PASS	AF=0.65;AO=13;DP=20;FAO=13;FDP=20;FR=.;FRO=7;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.0620575;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.125;QD=24.0714;RBI=0.0777462;REFB=-0.0425901;REVB=-0.0468332;RO=7;SAF=8;SAR=5;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118466;STB=0.566825;STBP=0.417;TYPE=snp;VARB=0.0267034;OID=.;OPOS=49332366;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:20:20:7:7:13:13:0.65:5:8:3:4:5:8:3:4
chr12	49334762	.	G	C	785.83	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00662221;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.457;QD=64.1491;RBI=0.0385223;REFB=0;REVB=-0.0379488;RO=0;SAF=25;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000108937;OID=.;OPOS=49334762;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:24:25:0:0:24:25:0:0
chr12	49359587	.	T	G	381.15	PASS	AF=0.4875;AO=39;DP=80;FAO=39;FDP=80;FR=.;FRO=41;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=15;FSRR=26;FWDB=0.0167405;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.108;QD=19.0577;RBI=0.025761;REFB=-0.0253244;REVB=0.0195802;RO=41;SAF=16;SAR=23;SRF=15;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0426227;STB=0.523702;STBP=0.713;TYPE=snp;VARB=0.0265368;OID=.;OPOS=49359587;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:41:41:39:39:0.4875:23:16:15:26:23:16:15:26
chr12	49359989	.	G	A	215.79	PASS	AF=0.538462;AO=21;DP=39;FAO=21;FDP=39;FR=.;FRO=18;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.00382472;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.302;QD=22.1321;RBI=0.00910222;REFB=-0.0073717;REVB=-0.00825965;RO=18;SAF=13;SAR=8;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190399;STB=0.606777;STBP=0.167;TYPE=snp;VARB=0.00850552;OID=.;OPOS=49359989;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:18:18:21:21:0.538462:8:13:7:11:8:13:7:11
chr12	49390677	.	T	C	482.52	PASS	AF=0.495238;AO=50;DP=103;FAO=52;FDP=105;FR=.;FRO=53;FSAF=28;FSAR=24;FSRF=26;FSRR=27;FWDB=0.00985756;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.559;QD=18.3818;RBI=0.00992379;REFB=-0.00977069;REVB=-0.00114463;RO=53;SAF=28;SAR=22;SRF=26;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.064737;STB=0.52422;STBP=0.624;TYPE=snp;VARB=0.00943045;OID=.;OPOS=49390677;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:105:53:53:50:52:0.495238:22:28:26:27:24:28:26:27
chr12	49391196	.	TC	CT,T	166.65	PASS	AF=0.0748299,0.238095;AO=11,43;DP=143;FAO=11,35;FDP=147;FR=.;FRO=101;FSAF=0,6;FSAR=11,29;FSRF=76;FSRR=25;FWDB=-0.0140071,-0.0459909;FXX=0.0264883;HRUN=1,5;LEN=2,1;MLLD=123.336,10.8614;QD=4.53466;RBI=0.0307411,0.11806;REFB=-0.0108259,-0.109004;REVB=-0.0273645,-0.108733;RO=82;SAF=0,15;SAR=11,28;SRF=63;SRR=19;SSEN=0,0;SSEP=0,0.381818;SSSB=-0.771916,-0.452286;STB=0.999416,0.879906;STBP=0,0;TYPE=mnp,del;VARB=0.0882797,0.0985536;OID=.,.;OPOS=49391196,49391197;OREF=TC,C;OALT=CT,-;OMAPALT=CT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:143:147:82:101:11,43:11,35:0.0748299,0.238095:11,28:0,15:63:19:11,29:0,6:76:25
chr12	49425978	.	T	C	164.39	PASS	AF=0.375;AO=18;DP=48;FAO=18;FDP=48;FR=.;FRO=30;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=-0.0290901;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.084;QD=13.6991;RBI=0.0312462;REFB=-0.0256182;REVB=-0.0114056;RO=29;SAF=4;SAR=14;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.346553;STB=0.696099;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.0299645;OID=.;OPOS=49425978;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:29:30:18:18:0.375:14:4:15:14:14:4:15:15
chr12	49434074	.	C	A	126.1	PASS	AF=0.37037;AO=9;DP=27;FAO=10;FDP=27;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=9;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.0831042;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=27.4399;QD=18.681;RBI=0.0945159;REFB=-0.00249397;REVB=0.0450215;RO=8;SAF=3;SAR=6;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.238988;STB=0.624753;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.0491047;OID=.;OPOS=49434074;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:60:27:27:8:9:9:10:0.37037:6:3:5:3:6:4:6:3
chr12	49436554	.	G	A	380.71	PASS	AF=0.444444;AO=40;DP=90;FAO=40;FDP=90;FR=.;FRO=50;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=33;FWDB=0.0362841;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.607;QD=16.9203;RBI=0.0366334;REFB=0.00163554;REVB=-0.00504635;RO=50;SAF=22;SAR=18;SRF=17;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.205819;STB=0.615076;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=-0.00237353;OID=.;OPOS=49436554;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:50:50:40:40:0.444444:18:22:17:33:18:22:17:33
chr12	49444545	.	G	A	99.23	PASS	AF=0.444444;AO=12;DP=27;FAO=12;FDP=27;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=14;FWDB=0.101773;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.251;QD=14.7014;RBI=0.104004;REFB=-0.00625175;REVB=0.0214289;RO=15;SAF=4;SAR=8;SRF=1;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.332617;STB=0.687261;STBP=0.215;TYPE=snp;VARB=0.0154603;OID=.;OPOS=49444545;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:15:15:12:12:0.444444:8:4:1:14:8:4:1:14
chr12	49494962	.	A	G	848.23	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0516013;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.5661;QD=57.5071;RBI=0.0535523;REFB=0;REVB=0.0143234;RO=0;SAF=25;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.03209e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000424641;OID=.;OPOS=49494962;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:34:25:0:0:34:25:0:0
chr12	49500398	.	G	A	920.11	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0142485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.194;QD=58.4197;RBI=0.0145233;REFB=0;REVB=0.00281154;RO=0;SAF=38;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.05917e-05;OID=.;OPOS=49500398;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:25:38:0:0:25:38:0:0
chr12	49500509	.	C	T	357.56	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0222244;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.018;QD=55.0086;RBI=0.0223719;REFB=0;REVB=-0.00256503;RO=0;SAF=9;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.38566e-05;OID=.;OPOS=49500509;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:17:9:0:0:17:9:0:0
chr12	49522578	.	T	C	223.18	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00302428;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.255;QD=49.5956;RBI=0.00467681;REFB=0;REVB=-0.0035674;RO=0;SAF=9;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.69133e-05;OID=.;OPOS=49522578;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:9:9:0:0:9:9:0:0
chr12	49522605	.	C	T	393.28	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0247038;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.6267;QD=56.1829;RBI=0.0311565;REFB=0;REVB=0.0189855;RO=0;SAF=15;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000524031;OID=.;OPOS=49522605;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:28:0:0:27:28:1:12:15:0:0:13:15:0:0
chr12	49579696	.	C	G	651.23	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.023626;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.644;QD=62.022;RBI=0.0380275;REFB=0;REVB=0.0297977;RO=0;SAF=22;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000116105;OID=.;OPOS=49579696;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:20:22:0:0:20:22:0:0
chr12	49580180	.	T	C	953.33	PASS	AF=0.931507;AO=68;DP=73;FAO=68;FDP=73;FR=.;FRO=5;FSAF=29;FSAR=39;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0498365;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.1636;QD=52.2371;RBI=0.0609153;REFB=-0.0419852;REVB=-0.0350286;RO=5;SAF=29;SAR=39;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0489184;STB=0.525942;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=0.00269493;OID=.;OPOS=49580180;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:18:73:73:5:5:68:68:0.931507:39:29:4:1:39:29:4:1
chr12	49667103	.	A	T	729.32	PASS	AF=1;AO=45;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0183854;FXX=0.0212721;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.865;QD=63.4195;RBI=0.0184701;REFB=0;REVB=0.00176677;RO=0;SAF=16;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.49331e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.27157e-05;OID=.;OPOS=49667103;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:45:46:1:29:16:0:0:29:17:0:0
chr12	49863348	.	G	A	32.01	PASS	AF=0.5;AO=2;DP=7;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0283211;FXX=0.0908265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.527;QD=12.8029;RBI=0.0510524;REFB=0.0421344;REVB=-0.0424767;RO=5;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0498631;OID=.;OPOS=49863348;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:7:10:5:5:2:5:0.5:2:0:0:5:4:1:1:4
chr12	49992644	.	A	G	198.36	PASS	AF=0.4;AO=24;DP=60;FAO=24;FDP=60;FR=.;FRO=36;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=22;FWDB=-0.00902817;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=222.503;QD=13.2237;RBI=0.0181624;REFB=-0.00465694;REVB=-0.0157596;RO=36;SAF=11;SAR=13;SRF=14;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.073806;STB=0.542219;STBP=0.637;TYPE=snp;VARB=0.0112768;OID=.;OPOS=49992644;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:36:36:24:24:0.4:13:11:14:22:13:11:14:22
chr12	50185334	.	A	G	220.56	PASS	AF=1;AO=15;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0139025;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.06;QD=49.0143;RBI=0.0227315;REFB=0;REVB=0.0179845;RO=0;SAF=10;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00504945;OID=.;OPOS=50185334;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:15:18:1:5:10:0:0:5:13:0:0
chr12	50189602	.	A	G	739.6	PASS	AF=1;AO=49;DP=50;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0806424;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.601;QD=53.7888;RBI=0.0811733;REFB=-0.180205;REVB=0.00926859;RO=0;SAF=14;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.22152e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000585005;OID=.;OPOS=50189602;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:50:55:0:0:49:55:1:35:14:0:0:37:18:0:0
chr12	50189807	.	C	A	411.11	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0011762;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.0767;QD=56.7054;RBI=0.0496565;REFB=0;REVB=0.0496426;RO=0;SAF=20;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000963078;OID=.;OPOS=50189807;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:9:20:0:0:9:20:0:0
chr12	50189834	.	T	G	428.83	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00944087;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.833;QD=57.1777;RBI=0.0261245;REFB=0;REVB=0.024359;RO=0;SAF=19;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.48773e-05;OID=.;OPOS=50189834;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:11:19:0:0:11:19:0:0
chr12	50190653	.	C	T	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0228667;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.756;QD=51.9164;RBI=0.0236702;REFB=0;REVB=-0.00611503;RO=0;SAF=10;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000202974;OID=.;OPOS=50190653;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:11:10:0:0:11:10:0:0
chr12	50190667	.	A	T	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0211944;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.866;QD=50.4134;RBI=0.0251884;REFB=0;REVB=-0.0136108;RO=0;SAF=10;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000252261;OID=.;OPOS=50190667;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:9:10:0:0:9:10:0:0
chr12	50232169	.	A	T	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0131368;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=237.636;QD=42.1827;RBI=0.0350667;REFB=0;REVB=0.032513;RO=0;SAF=6;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000144228;OID=.;OPOS=50232169;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:5:6:0:0:5:6:0:0
chr12	50263148	.	G	A	267.25	PASS	AF=0.5;AO=28;DP=55;FAO=29;FDP=58;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=-0.078279;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=146.62;QD=18.4311;RBI=0.0802406;REFB=-0.0369141;REVB=-0.0176337;RO=26;SAF=10;SAR=18;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128406;STB=0.553468;STBP=0.426;TYPE=snp;VARB=0.0379845;OID=.;OPOS=50263148;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:58:26:29:28:29:0.5:18:10:13:13:18:11:14:15
chr12	50348078	.	T	C	632.26	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0432665;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.033;QD=61.6837;RBI=0.0433571;REFB=0;REVB=0.00280262;RO=0;SAF=21;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.95097e-05;OID=.;OPOS=50348078;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:20:21:0:0:20:21:0:0
chr12	50452708	.	C	G	1268.67	PASS	AF=0.988095;AO=83;DP=84;FAO=83;FDP=84;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00688114;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=258.363;QD=60.4127;RBI=0.0222658;REFB=-0.0216005;REVB=0.0211758;RO=1;SAF=43;SAR=40;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0108876;STB=0.505746;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.000178106;OID=.;OPOS=50452708;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:84:84:1:1:83:83:0.988095:40:43:1:0:40:43:1:0
chr12	50476158	.	G	T	1882.99	PASS	AF=1;AO=122;DP=122;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0169847;FXX=0.00812942;HRUN=3;LEN=1;MLLD=229.784;QD=61.7374;RBI=0.0198723;REFB=0;REVB=-0.0103164;RO=0;SAF=73;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000119334;OID=.;OPOS=50476158;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:122:122:0:0:122:122:1:49:73:0:0:49:73:0:0
chr12	50523947	.	A	G	501.53	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.076511;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.8718;QD=59.0038;RBI=0.078981;REFB=0;REVB=-0.0195976;RO=0;SAF=15;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.40663e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00193644;OID=.;OPOS=50523947;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:19:15:0:0:19:15:0:0
chr12	50523964	.	T	C	465.13	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00202186;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.234;QD=58.141;RBI=0.011991;REFB=0;REVB=0.0118193;RO=0;SAF=12;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.13637e-05;OID=.;OPOS=50523964;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:20:12:0:0:20:12:0:0
chr12	50526814	.	G	A	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0195299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.405;QD=53.2772;RBI=0.0225235;REFB=0;REVB=-0.0112202;RO=0;SAF=16;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.96316e-05;OID=.;OPOS=50526814;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:7:16:0:0:7:16:0:0
chr12	50537815	.	A	G	801.32	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00400728;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.564;QD=57.2369;RBI=0.014421;REFB=0;REVB=0.013853;RO=0;SAF=24;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.47128e-05;OID=.;OPOS=50537815;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:32:24:0:0:32:24:0:0
chr12	50650041	.	A	C	186.63	PASS	AF=0.666667;AO=18;DP=27;FAO=18;FDP=27;FR=.;FRO=9;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=-0.029083;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.7614;QD=27.6491;RBI=0.0343054;REFB=0.00426521;REVB=-0.0181946;RO=9;SAF=8;SAR=10;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0681572;STB=0.537774;STBP=0.601;TYPE=snp;VARB=-0.00387687;OID=.;OPOS=50650041;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:27:27:9:9:18:18:0.666667:10:8:3:6:10:8:3:6
chr12	50650057	.	T	C	447.01	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.047746;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.2183;QD=57.6781;RBI=0.0484461;REFB=0;REVB=0.00820609;RO=0;SAF=12;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.47712e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000809458;OID=.;OPOS=50650057;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:19:12:0:0:19:12:0:0
chr12	50744119	.	G	A	356.17	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0123427;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.729;QD=54.7957;RBI=0.0124686;REFB=0;REVB=0.00176798;RO=0;SAF=10;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.71087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000102022;OID=.;OPOS=50744119;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:16:10:0:0:16:10:0:0
chr12	50744171	.	T	C	712.13	PASS	AF=1;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00888998;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.154;QD=63.3006;RBI=0.024644;REFB=0;REVB=0.0229846;RO=0;SAF=16;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.49331e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.73986e-05;OID=.;OPOS=50744171;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:45:0:0:45:45:1:29:16:0:0:29:16:0:0
chr12	50744753	.	T	C	283.44	PASS	AF=0.956522;AO=22;DP=24;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00136404;FXX=0.0416493;HRUN=4;LEN=1;MLLD=260.492;QD=49.2936;RBI=0.00184395;REFB=0.0106693;REVB=-0.00124079;RO=1;SAF=16;SAR=6;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0280287;STB=0.515138;STBP=0.619;TYPE=snp;VARB=-9.03242e-05;OID=.;OPOS=50744753;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:24:23:1:1:22:22:0.956522:6:16:1:0:6:16:1:0
chr12	50749221	.	G	C	490.06	PASS	AF=0.971429;AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0158813;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.1207;QD=56.007;RBI=0.0258451;REFB=-0.0171828;REVB=0.0203901;RO=1;SAF=17;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0267062;STB=0.514277;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=0.00892978;OID=.;OPOS=50749221;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:35:35:1:1:34:34:0.971429:17:17:1:0:17:17:1:0
chr12	50749227	.	T	G	503.75	PASS	AF=0.9;AO=35;DP=40;FAO=36;FDP=40;FR=.;FRO=4;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0166627;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=199.529;QD=50.3747;RBI=0.0170638;REFB=-0.0514897;REVB=0.00367766;RO=2;SAF=19;SAR=16;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00435799;STB=0.505615;STBP=0.883;TYPE=snp;VARB=0.0014748;OID=.;OPOS=50749227;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:19:40:40:2:4:35:36:0.9:16:19:1:1:16:20:2:2
chr12	50749554	.	G	T	132.7	PASS	AF=0.428571;AO=14;DP=35;FAO=15;FDP=35;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=5;FWDB=-0.0216578;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.79;QD=15.1657;RBI=0.0382548;REFB=-0.00807573;REVB=-0.0315337;RO=20;SAF=6;SAR=8;SRF=15;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.317553;STB=0.692071;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=0.0172302;OID=.;OPOS=50749554;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:20:20:14:15:0.428571:8:6:15:5:9:6:15:5
chr12	50754563	.	T	G	296.39	PASS	AF=0.958333;AO=23;DP=24;FAO=23;FDP=24;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00336293;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=254.346;QD=49.3989;RBI=0.00720311;REFB=-0.128111;REVB=0.00636989;RO=1;SAF=13;SAR=10;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0440445;STB=0.523789;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=0.000734382;OID=.;OPOS=50754563;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:24:24:1:1:23:23:0.958333:10:13:0:1:10:13:0:1
chr12	50824275	.	C	G	284.61	PASS	AF=0.541667;AO=26;DP=48;FAO=26;FDP=48;FR=.;FRO=22;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.0182405;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.1641;QD=23.7171;RBI=0.0407882;REFB=-0.0446658;REVB=0.0364823;RO=22;SAF=18;SAR=8;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.208113;STB=0.616345;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.0442868;OID=.;OPOS=50824275;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:22:22:26:26:0.541667:8:18:10:12:8:18:10:12
chr12	50870145	.	G	A	2645.16	PASS	AF=0.994186;AO=171;DP=173;FAO=171;FDP=172;FR=.;FRO=1;FSAF=79;FSAR=92;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0197897;FXX=0.00578001;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.955;QD=61.5155;RBI=0.0202769;REFB=-0.13105;REVB=-0.00441835;RO=1;SAF=79;SAR=92;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00598681;STB=0.503144;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.000215754;OID=.;OPOS=50870145;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:173:172:1:1:171:171:0.994186:92:79:1:0:92:79:1:0
chr12	51112586	.	T	C	319.84	PASS	AF=0.492754;AO=34;DP=69;FAO=34;FDP=69;FR=.;FRO=35;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=9;FSRR=26;FWDB=-0.011708;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.8341;QD=18.5412;RBI=0.0118275;REFB=0.00564909;REVB=0.0016766;RO=35;SAF=17;SAR=17;SRF=9;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.222183;STB=0.62312;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=-0.00597279;OID=.;OPOS=51112586;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:35:35:34:34:0.492754:17:17:9:26:17:17:9:26
chr12	51135275	.	T	C	766.34	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.015747;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.7113;QD=63.8614;RBI=0.0485209;REFB=0;REVB=0.0458946;RO=0;SAF=26;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000658399;OID=.;OPOS=51135275;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:22:26:0:0:22:26:0:0
chr12	51141883	.	A	G	310.61	PASS	AF=0.584906;AO=31;DP=53;FAO=31;FDP=53;FR=.;FRO=22;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=0.00446115;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.149;QD=23.4425;RBI=0.0352436;REFB=-0.0241443;REVB=-0.0349601;RO=22;SAF=17;SAR=14;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00222653;STB=0.501228;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0178182;OID=.;OPOS=51141883;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:22:22:31:31:0.584906:14:17:12:10:14:17:12:10
chr12	51214638	.	G	T	338.13	PASS	AF=0.576271;AO=34;DP=59;FAO=34;FDP=59;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=23;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=-0.0110418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.559;QD=22.9243;RBI=0.0127556;REFB=-0.00428654;REVB=0.00638614;RO=24;SAF=11;SAR=23;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.263847;STB=0.638149;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.0026729;OID=.;OPOS=51214638;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:24:25:34:34:0.576271:23:11:16:8:23:11:16:9
chr12	51235317	.	A	G	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0033801;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.677;QD=55.6558;RBI=0.00470217;REFB=0;REVB=-0.00326884;RO=0;SAF=15;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.817e-07;OID=.;OPOS=51235317;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:12:15:0:0:12:15:0:0
chr12	51236802	.	T	C	57.32	PASS	AF=0.444444;AO=8;DP=18;FAO=8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=-0.000387759;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.0981;QD=12.7389;RBI=0.00695457;REFB=-0.0208343;REVB=0.00694376;RO=10;SAF=5;SAR=3;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0763832;STB=0.545344;STBP=0.809;TYPE=snp;VARB=0.0284755;OID=.;OPOS=51236802;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:18:18:10:10:8:8:0.444444:3:5:7:3:3:5:7:3
chr12	51333796	.	C	CA	116.79	PASS	AF=0.485714;AO=17;DP=36;FAO=17;FDP=35;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=0.0206498;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=26.5655;QD=13.3468;RBI=0.0927448;REFB=-0.0141559;REVB=-0.0904167;RO=19;SAF=9;SAR=8;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0460992;STB=0.513498;STBP=0.902;TYPE=ins;VARB=0.0106767;OID=.;OPOS=51333797;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.485714:17:36:17:35:18:9:8:10:8:99:19:9:8:11:8
chr12	51354803	.	C	T	521.02	PASS	AF=0.509434;AO=54;DP=106;FAO=54;FDP=106;FR=.;FRO=52;FSAF=22;FSAR=32;FSRF=28;FSRR=24;FWDB=-0.0175854;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.0094;QD=19.661;RBI=0.0344588;REFB=-0.0102143;REVB=-0.0296338;RO=52;SAF=22;SAR=32;SRF=28;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117592;STB=0.564947;STBP=0.17;TYPE=snp;VARB=0.010112;OID=.;OPOS=51354803;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:106:52:52:54:54:0.509434:32:22:28:24:32:22:28:24
chr12	51393116	.	C	T	171.2	PASS	AF=0.461538;AO=18;DP=39;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=-0.00727083;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=127.918;QD=17.5589;RBI=0.0123331;REFB=0.00592698;REVB=-0.00996199;RO=21;SAF=9;SAR=9;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0673869;STB=0.538419;STBP=0.665;TYPE=snp;VARB=-0.00675417;OID=.;OPOS=51393116;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:21:21:18:18:0.461538:9:9:9:12:9:9:9:12
chr12	51402905	.	T	G	516.94	PASS	AF=1;AO=34;DP=36;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0203799;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.173;QD=59.079;RBI=0.11973;REFB=0;REVB=0.117982;RO=0;SAF=20;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.48532e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000815168;OID=.;OPOS=51402905;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:35:0:0:34:35:1:14:20:0:0:15:20:0:0
chr12	51442944	.	G	A	1956.21	PASS	AF=1;AO=126;DP=127;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0210732;FXX=0.0078734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.507;QD=62.1018;RBI=0.0312755;REFB=0;REVB=0.0231102;RO=0;SAF=67;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.31893e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.51941e-05;OID=.;OPOS=51442944;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:127:126:0:0:126:126:1:59:67:0:0:59:67:0:0
chr12	51518787	.	C	G	140.1	PASS	AF=0.555556;AO=15;DP=27;FAO=15;FDP=27;FR=.;FRO=12;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=11;FWDB=0.0227585;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.054;QD=20.7548;RBI=0.026965;REFB=-0.00945906;REVB=0.0144624;RO=12;SAF=11;SAR=4;SRF=1;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.488133;STB=0.774304;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.00754593;OID=.;OPOS=51518787;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:12:12:15:15:0.555556:4:11:1:11:4:11:1:11
chr12	51590593	.	C	T	102.29	PASS	AF=0.288889;AO=13;DP=45;FAO=13;FDP=45;FR=.;FRO=32;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=0.00825988;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.907;QD=9.09218;RBI=0.0171669;REFB=-0.00759818;REVB=-0.0150492;RO=32;SAF=7;SAR=6;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0449609;STB=0.527355;STBP=0.808;TYPE=snp;VARB=0.0199631;OID=.;OPOS=51590593;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:32:32:13:13:0.288889:6:7:16:16:6:7:16:16
chr12	51636259	.	C	T	727.46	PASS	AF=1;AO=50;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0352589;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.097;QD=57.0553;RBI=0.0392171;REFB=0;REVB=-0.0171693;RO=0;SAF=25;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.62595e-05;OID=.;OPOS=51636259;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:50:51:1:25:25:0:0:25:26:0:0
chr12	51681903	.	T	C	1736.54	PASS	AF=0.983051;AO=116;DP=118;FAO=116;FDP=118;FR=.;FRO=2;FSAF=48;FSAR=68;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.000792337;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.296;QD=58.8656;RBI=0.0193283;REFB=-0.0711939;REVB=0.019312;RO=1;SAF=48;SAR=68;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00979084;STB=0.501505;STBP=0.855;TYPE=snp;VARB=0.000276663;OID=.;OPOS=51681903;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:118:118:1:2:116:116:0.983051:68:48:1:0:68:48:1:1
chr12	51685831	.	T	C	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0117778;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=258.061;QD=52.6132;RBI=0.0237823;REFB=0;REVB=0.0206611;RO=0;SAF=7;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.79751e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000102256;OID=.;OPOS=51685831;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:15:7:0:0:15:7:0:0
chr12	51722311	.	C	T	264.01	PASS	AF=0.434783;AO=30;DP=69;FAO=30;FDP=69;FR=.;FRO=39;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=-0.0232356;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.483;QD=15.3051;RBI=0.0384393;REFB=-0.00471667;REVB=-0.0306217;RO=39;SAF=11;SAR=19;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124484;STB=0.570523;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=0.0054199;OID=.;OPOS=51722311;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:39:39:30:30:0.434783:19:11:19:20:19:11:19:20
chr12	51723598	.	AGGGGGC	AGGGG,AGGGGC	156.53	PASS	AF=0,1;AO=8,8;DP=24;FAO=0,21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=0,10;FSAR=0,11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.419006,0.132013;FXX=0.0454339;HRUN=5,5;LEN=2,1;MLLD=7.52906,11.0414;QD=29.8155;RBI=0.427158,0.234744;REFB=-0.0110105,-0.0309109;REVB=0.0830565,0.194107;RO=4;SAF=7,0;SAR=1,8;SRF=0;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.567155,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=-0.0189045,0.0277768;OID=.,.;OPOS=51723603,51723599;OREF=GC,G;OALT=-,-;OMAPALT=AGGGG,AGGGGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	2/2:0,1:8,8:24:0,21:21:0:0,10:0,11:0:0:3:4:7,0:1,8:0:4
chr12	51733734	.	G	A	137.89	PASS	AF=0.333333;AO=16;DP=48;FAO=16;FDP=48;FR=.;FRO=32;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=20;FWDB=-0.054857;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.918;QD=11.4907;RBI=0.0565065;REFB=-0.00981039;REVB=-0.0135536;RO=32;SAF=6;SAR=10;SRF=12;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17895e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.019658;OID=.;OPOS=51733734;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:32:32:16:16:0.333333:10:6:12:20:10:6:12:20
chr12	51737607	.	G	A	186.64	PASS	AF=0.666667;AO=18;DP=27;FAO=18;FDP=27;FR=.;FRO=9;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.00583087;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=217.735;QD=27.6503;RBI=0.0325933;REFB=-0.0309516;REVB=-0.0320674;RO=9;SAF=9;SAR=9;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100115;STB=0.555495;STBP=0.456;TYPE=snp;VARB=0.0214168;OID=.;OPOS=51737607;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:27:27:9:9:18:18:0.666667:9:9:3:6:9:9:3:6
chr12	51740387	.	ACTGG	A,AATGG	335.27	PASS	AF=0.16,0.84;AO=4,21;DP=26;FAO=4,21;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=2,6;FSAR=2,15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0277942,0.0233755;FXX=0.0384468;HRUN=1,1;LEN=4,1;MLLD=182.889,86.6963;QD=53.6434;RBI=0.0343686,0.0312341;REFB=0,0;REVB=-0.0202159,0.020716;RO=0;SAF=2,6;SAR=2,15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.00819605,0.00444703;OID=.,.;OPOS=51740388,51740388;OREF=CTGG,C;OALT=-,A;OMAPALT=A,AATGG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.16,0.84:4,21:26:4,21:25:0:2,6:2,15:0:0:20:0:2,6:2,15:0:0
chr12	51771040	.	T	C	322.12	PASS	AF=0.592593;AO=32;DP=54;FAO=32;FDP=54;FR=.;FRO=22;FSAF=24;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=0.0162052;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.399;QD=23.8606;RBI=0.0543268;REFB=-0.0060861;REVB=0.0518536;RO=22;SAF=24;SAR=8;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.281848;STB=0.656146;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.00368881;OID=.;OPOS=51771040;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:22:22:32:32:0.592593:8:24:9:13:8:24:9:13
chr12	52080965	.	C	T	1102.53	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0164223;FXX=0.0135117;HRUN=3;LEN=1;MLLD=232.55;QD=60.4129;RBI=0.0164272;REFB=0;REVB=0.000399085;RO=0;SAF=19;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.00876e-05;OID=.;OPOS=52080965;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:54:19:0:0:54:19:0:0
chr12	52182545	.	A	G	178.95	PASS	AF=0.404255;AO=19;DP=47;FAO=19;FDP=47;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.000582946;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.629;QD=15.2295;RBI=0.0196609;REFB=-0.00318282;REVB=-0.0196522;RO=28;SAF=10;SAR=9;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0271912;STB=0.515679;STBP=0.841;TYPE=snp;VARB=0.0100051;OID=.;OPOS=52182545;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:28:28:19:19:0.404255:9:10:14:14:9:10:14:14
chr12	52184271	.	T	C	68.04	PASS	AF=0.473684;AO=9;DP=19;FAO=9;FDP=19;FR=.,HEALED;FRO=10;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.0106509;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.532;QD=14.3245;RBI=0.0113424;REFB=0.00751862;REVB=-0.00389972;RO=8;SAF=4;SAR=5;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163174;STB=0.523757;STBP=0.869;TYPE=snp;VARB=-0.00873249;OID=.;OPOS=52184271;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:19:19:8:10:9:9:0.473684:5:4:2:6:5:4:4:6
chr12	52200742	.	C	A	93.2	PASS	AF=0.578947;AO=11;DP=19;FAO=11;FDP=19;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=-0.00254356;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.1972;QD=19.6201;RBI=0.00590654;REFB=-0.0652523;REVB=0.00533081;RO=7;SAF=4;SAR=7;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0469824;STB=0.505145;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0460796;OID=.;OPOS=52200742;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:19:19:7:8:11:11:0.578947:7:4:3:4:7:4:3:5
chr12	52204246	.	T	C	990.59	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00905544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.404;QD=59.1398;RBI=0.00951758;REFB=0;REVB=0.00292971;RO=0;SAF=18;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.68381e-05;OID=.;OPOS=52204246;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:49:18:0:0:49:18:0:0
chr12	52211942	.	G	A	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00320538;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.392;QD=53.2769;RBI=0.0111193;REFB=0;REVB=-0.0106473;RO=0;SAF=8;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.93673e-05;OID=.;OPOS=52211942;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:15:8:0:0:15:8:0:0
chr12	52215102	.	T	G	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0672435;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.486;QD=35.5759;RBI=0.0802862;REFB=0;REVB=0.0438655;RO=0;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000191295;OID=.;OPOS=52215102;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:4:3:0:0:4:3:0:0
chr12	52282060	.	C	T	439.42	PASS	AF=0.5375;AO=43;DP=80;FAO=43;FDP=80;FR=.;FRO=37;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=24;FSRR=13;FWDB=0.0352617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.2316;QD=21.971;RBI=0.0415854;REFB=-0.0260076;REVB=-0.0220445;RO=32;SAF=24;SAR=19;SRF=24;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154775;STB=0.542838;STBP=0.429;TYPE=snp;VARB=0.0198031;OID=.;OPOS=52282060;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:32:37:43:43:0.5375:19:24:24:8:19:24:24:13
chr12	52282873	.	A	T	276.28	PASS	AF=0.675676;AO=24;DP=36;FAO=25;FDP=37;FR=.;FRO=12;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.0361881;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.16;QD=29.8678;RBI=0.0400882;REFB=-0.0216066;REVB=-0.0172478;RO=11;SAF=14;SAR=10;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0313952;STB=0.505613;STBP=0.942;TYPE=snp;VARB=0.0135491;OID=.;OPOS=52282873;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:36:37:11:12:24:25:0.675676:10:14:7:4:10:15:7:5
chr12	52284233	.	T	C	793.7	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0118088;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.524;QD=63.4959;RBI=0.0136412;REFB=0;REVB=-0.0068289;RO=0;SAF=30;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.48867e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00020551;OID=.;OPOS=52284233;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:50:0:0:49:50:1:19:30:0:0:19:31:0:0
chr12	52284500	.	A	G	285.34	PASS	AF=0.625;AO=25;DP=42;FAO=25;FDP=40;FR=.;FRO=15;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.030099;FXX=0.0476077;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.328;QD=28.5342;RBI=0.036273;REFB=-0.0193115;REVB=0.020243;RO=17;SAF=13;SAR=12;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121739;STB=0.544874;STBP=0.488;TYPE=snp;VARB=0.012139;OID=.;OPOS=52284500;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:40:17:15:25:25:0.625:12:13:6:11:12:13:6:9
chr12	52285086	.	G	A	104.01	PASS	AF=0.8;AO=11;DP=15;FAO=12;FDP=15;FR=.;FRO=3;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0219621;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.571;QD=27.7364;RBI=0.0675437;REFB=-0.0164989;REVB=0.0638735;RO=4;SAF=6;SAR=5;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.223563;STB=0.588096;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=0.00426924;OID=.;OPOS=52285086;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:16:15:15:4:3:11:12:0.8:5:6:4:0:5:7:3:0
chr12	52306221	.	C	T	180.69	PASS	AF=0.487179;AO=18;DP=38;FAO=19;FDP=39;FR=.;FRO=20;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=4;FWDB=0.00062026;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.373;QD=18.5323;RBI=0.0536693;REFB=-0.0102432;REVB=0.0536657;RO=20;SAF=12;SAR=6;SRF=16;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147657;STB=0.572298;STBP=0.464;TYPE=snp;VARB=0.0186445;OID=.;OPOS=52306221;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:39:20:20:18:19:0.487179:6:12:16:4:6:13:16:4
chr12	52380694	.	A	G	213.03	PASS	AF=0.444444;AO=24;DP=55;FAO=24;FDP=54;FR=.;FRO=30;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=0.028469;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.647;QD=15.7801;RBI=0.0333487;REFB=-0.0245034;REVB=0.017368;RO=30;SAF=6;SAR=18;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10182;STB=0.558089;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=0.0207376;OID=.;OPOS=52380694;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:54:30:30:24:24:0.444444:18:6:10:20:18:6:10:20
chr12	52602013	.	C	T	450.58	PASS	AF=0.53012;AO=44;DP=83;FAO=44;FDP=83;FR=.;FRO=39;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=15;FSRR=24;FWDB=0.00752806;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=215.388;QD=21.7148;RBI=0.00758961;REFB=-0.021441;REVB=-0.000964603;RO=39;SAF=22;SAR=22;SRF=15;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0983169;STB=0.554192;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=0.0185658;OID=.;OPOS=52602013;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:39:39:44:44:0.53012:22:22:15:24:22:22:15:24
chr12	52631313	.	A	G	1266.67	PASS	AF=0.988235;AO=83;DP=86;FAO=84;FDP=85;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0521677;FXX=0.0229859;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.157;QD=59.6081;RBI=0.0910468;REFB=-0.108485;REVB=0.0746194;RO=2;SAF=47;SAR=36;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0255827;STB=0.506665;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=0.00387215;OID=.;OPOS=52631313;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:86:85:2:1:83:84:0.988235:36:47:0:2:37:47:0:1
chr12	52639302	.	G	C	753.43	PASS	AF=0.979592;AO=48;DP=49;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0516093;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=56.1178;QD=61.5045;RBI=0.0971163;REFB=0.0575639;REVB=0.0822681;RO=1;SAF=20;SAR=28;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0229399;STB=0.51219;STBP=0.335;TYPE=snp;VARB=-0.00123043;OID=.;OPOS=52639302;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:49:49:1:1:48:48:0.979592:28:20:1:0:28:20:1:0
chr12	52661302	.	C	A	197.81	PASS	AF=0.944444;AO=16;DP=17;FAO=17;FDP=18;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0405337;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.3088;QD=43.9567;RBI=0.0539302;REFB=-0.0361524;REVB=0.0355737;RO=1;SAF=11;SAR=5;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0397692;STB=0.521714;STBP=0.626;TYPE=snp;VARB=0.0281621;OID=.;OPOS=52661302;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:17:18:1:1:16:17:0.944444:5:11:1:0:6:11:1:0
chr12	52681925	.	A	C	1029.59	PASS	AF=1;AO=69;DP=70;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00539118;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.5347;QD=59.6865;RBI=0.00570204;REFB=0;REVB=-0.00185699;RO=0;SAF=31;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.40715e-05;OID=.;OPOS=52681925;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:69:0:0:69:69:1:38:31:0:0:38:31:0:0
chr12	52699548	.	T	C	1717.66	PASS	AF=0.991304;AO=101;DP=116;FAO=114;FDP=115;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=66;FSAR=48;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0239657;FXX=0.00861995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.82;QD=59.7447;RBI=0.0670649;REFB=-0.00146781;REVB=0.0626366;RO=1;SAF=64;SAR=37;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.007356;STB=0.503759;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.000371034;OID=.;OPOS=52699548;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:116:115:1:1:101:114:0.991304:37:64:1:0:48:66:1:0
chr12	52708420	.	G	A	1828.16	PASS	AF=1;AO=119;DP=121;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0135053;FXX=0.0165276;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.645;QD=61.4508;RBI=0.0351518;REFB=0;REVB=0.0324539;RO=0;SAF=62;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.9434e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.21913e-05;OID=.;OPOS=52708420;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:121:119:0:0:119:119:1:57:62:0:0:57:62:0:0
chr12	52708565	.	A	G	427.57	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186976;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.722;QD=57.0097;RBI=0.0676081;REFB=0;REVB=0.0649712;RO=0;SAF=13;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.63861e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000346195;OID=.;OPOS=52708565;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:17:13:0:0:17:13:0:0
chr12	52712975	.	G	A,C	886.93	PASS	AF=0.9375,0.046875;AO=60,3;DP=64;FAO=60,3;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=36,3;FSAR=24,0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.027329,0.00350221;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=191.949,31.6703;QD=55.433;RBI=0.034795,0.0942673;REFB=-0.135488,-0.139005;REVB=0.0215366,-0.0942022;RO=1;SAF=36,3;SAR=24,0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0129304,0;STB=0.506847,0.5;STBP=0.499,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000596382,0.189464;OID=.,.;OPOS=52712975,52712975;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:64:64:1:1:60,3:60,3:0.9375,0.046875:24,0:36,3:1:0:24,0:36,3:1:0
chr12	52713086	.	G	A	238.55	PASS	AF=0.411765;AO=28;DP=68;FAO=28;FDP=68;FR=.;FRO=40;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=0.00553804;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.6746;QD=14.0321;RBI=0.06216;REFB=-0.00275461;REVB=0.0619128;RO=39;SAF=10;SAR=18;SRF=18;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111819;STB=0.572316;STBP=0.368;TYPE=snp;VARB=0.00767114;OID=.;OPOS=52713086;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:39:40:28:28:0.411765:18:10:18:21:18:10:19:21
chr12	52753861	.	C	T	941.03	PASS	AF=1;AO=64;DP=65;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00964144;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.0684;QD=58.8145;RBI=0.112592;REFB=0;REVB=0.112179;RO=0;SAF=38;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00123133;OID=.;OPOS=52753861;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:64:0:0:64:64:1:26:38:0:0:26:38:0:0
chr12	52774235	.	A	G	727.67	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0607654;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.4274;QD=63.276;RBI=0.0611251;REFB=0;REVB=-0.00662186;RO=0;SAF=16;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.31553e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000549989;OID=.;OPOS=52774235;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:30:16:0:0:30:16:0:0
chr12	52777502	.	A	G	894.64	PASS	AF=1;AO=61;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000180989;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.159;QD=57.7189;RBI=0.0281835;REFB=0;REVB=-0.0281829;RO=0;SAF=34;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.42398e-05;OID=.;OPOS=52777502;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:61:62:1:27:34:0:0:27:35:0:0
chr12	52789509	.	T	C	530.41	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00134678;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.47;QD=58.9346;RBI=0.00225314;REFB=0;REVB=0.00180633;RO=0;SAF=17;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000271297;OID=.;OPOS=52789509;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:36:0:0:35:36:1:18:17:0:0:19:17:0:0
chr12	52789597	.	A	G	312.14	PASS	AF=0.862069;AO=25;DP=29;FAO=25;FDP=29;FR=.;FRO=4;FSAF=7;FSAR=18;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.00320865;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=230.778;QD=43.0541;RBI=0.00753461;REFB=-0.0874486;REVB=-0.00681725;RO=3;SAF=7;SAR=18;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162483;STB=0.611017;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.000718065;OID=.;OPOS=52789597;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:19:29:29:3:4:25:25:0.862069:18:7:3:0:18:7:4:0
chr12	52789605	.	T	A	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00639568;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=297.154;QD=55.6561;RBI=0.0122043;REFB=0;REVB=-0.0103943;RO=0;SAF=10;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.19032e-05;OID=.;OPOS=52789605;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:17:10:0:0:17:10:0:0
chr12	52818377	.	C	T	1365.39	PASS	AF=0.957447;AO=90;DP=94;FAO=90;FDP=94;FR=.;FRO=4;FSAF=54;FSAR=36;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.000300987;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=152.697;QD=58.1016;RBI=0.0144405;REFB=-0.100541;REVB=0.0144373;RO=0;SAF=54;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504424;STBP=0.735;TYPE=snp;VARB=0.000829275;OID=.;OPOS=52818377;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:94:94:0:4:90:90:0.957447:36:54:0:0:36:54:2:2
chr12	52818504	.	T	G	805.15	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0102797;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.514;QD=64.4122;RBI=0.0116134;REFB=0;REVB=-0.00540364;RO=0;SAF=21;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.20481e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.50102e-05;OID=.;OPOS=52818504;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:29:21:0:0:29:21:0:0
chr12	52822258	.	A	G	563.79	PASS	AF=0.974359;AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0410981;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.261;QD=57.8246;RBI=0.0476389;REFB=-0.0338908;REVB=0.0240917;RO=1;SAF=22;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0208236;STB=0.511105;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.00139645;OID=.;OPOS=52822258;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:39:39:1:1:38:38:0.974359:16:22:1:0:16:22:1:0
chr12	52825363	.	G	A	747.06	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00391309;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=114.451;QD=63.5794;RBI=0.0248219;REFB=0;REVB=0.0245115;RO=0;SAF=31;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.30778e-05;OID=.;OPOS=52825363;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:16:31:0:0:16:31:0:0
chr12	52827740	.	G	C	1226.2	PASS	AF=1;AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00541431;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=186.549;QD=61.3101;RBI=0.0194328;REFB=0;REVB=0.0186633;RO=0;SAF=39;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.3033e-06;OID=.;OPOS=52827740;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:80:80:0:0:80:80:1:41:39:0:0:41:39:0:0
chr12	52827818	.	T	C	823.75	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00456288;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.898;QD=56.8101;RBI=0.0247243;REFB=0;REVB=0.0242996;RO=0;SAF=25;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000208086;OID=.;OPOS=52827818;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:58:0:0:57:58:1:32:25:0:0:32:26:0:0
chr12	52841765	.	G	A	677.47	PASS	AF=0.977778;AO=43;DP=44;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00955471;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.645;QD=60.2199;RBI=0.0108742;REFB=-0.00353771;REVB=-0.00519196;RO=1;SAF=19;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0240734;STB=0.512815;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=3.64126e-05;OID=.;OPOS=52841765;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:44:45:1:1:43:44:0.977778:24:19:1:0:25:19:1:0
chr12	52842736	.	T	C	160.29	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.127335;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.1469;QD=45.7968;RBI=0.129879;REFB=0;REVB=-0.0255829;RO=0;SAF=8;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00299427;OID=.;OPOS=52842736;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:6:8:0:0:6:8:0:0
chr12	52843779	.	T	C	358.07	PASS	AF=0.333333;AO=39;DP=132;FAO=45;FDP=135;FR=.;FRO=90;FSAF=36;FSAR=9;FSRF=51;FSRR=39;FWDB=0.00372052;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.689;QD=10.6095;RBI=0.0106335;REFB=-0.0215642;REVB=-0.00996143;RO=90;SAF=31;SAR=8;SRF=51;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.318862;STB=0.688079;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.0334054;OID=.;OPOS=52843779;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:132:135:90:90:39:45:0.333333:8:31:51:39:9:36:51:39
chr12	52843783	.	T	C	306.47	PASS	AF=0.335878;AO=44;DP=131;FAO=44;FDP=131;FR=.;FRO=87;FSAF=36;FSAR=8;FSRF=50;FSRR=37;FWDB=-0.047236;FXX=0.00757518;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.2592;QD=9.35772;RBI=0.0542956;REFB=-0.0412808;REVB=-0.0267726;RO=87;SAF=36;SAR=8;SRF=50;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.344168;STB=0.701803;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0894281;OID=.;OPOS=52843783;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:131:131:87:87:44:44:0.335878:8:36:50:37:8:36:50:37
chr12	52844265	.	T	C	444.92	PASS	AF=0.454545;AO=45;DP=99;FAO=45;FDP=99;FR=.;FRO=54;FSAF=17;FSAR=28;FSRF=35;FSRR=19;FWDB=-0.014186;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.979;QD=17.9766;RBI=0.014453;REFB=-0.0292707;REVB=-0.00276528;RO=54;SAF=17;SAR=28;SRF=35;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.260999;STB=0.645612;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0325027;OID=.;OPOS=52844265;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:54:54:45:45:0.454545:28:17:35:19:28:17:35:19
chr12	52845435	.	C	T	411.49	PASS	AF=0.47191;AO=42;DP=89;FAO=42;FDP=89;FR=.;FRO=47;FSAF=28;FSAR=14;FSRF=30;FSRR=17;FWDB=-0.00681515;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.147;QD=18.4937;RBI=0.0191696;REFB=-0.00252556;REVB=-0.0179173;RO=47;SAF=28;SAR=14;SRF=30;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0298479;STB=0.516659;STBP=0.788;TYPE=snp;VARB=0.00275216;OID=.;OPOS=52845435;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:47:47:42:42:0.47191:14:28:30:17:14:28:30:17
chr12	52845801	.	T	C	273.28	PASS	AF=0.685714;AO=24;DP=34;FAO=24;FDP=35;FR=.;FRO=11;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=-0.0198747;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.627;QD=31.2314;RBI=0.0354772;REFB=-0.0342736;REVB=0.0293875;RO=10;SAF=14;SAR=10;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00920859;STB=0.517227;STBP=0.776;TYPE=snp;VARB=0.0108532;OID=.;OPOS=52845801;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:34:35:10:11:24:24:0.685714:10:14:6:4:10:14:7:4
chr12	52863564	.	C	T	210.49	PASS	AF=0.446429;AO=24;DP=55;FAO=25;FDP=56;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=-0.000852425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.055;QD=15.0347;RBI=0.0276293;REFB=-0.0114439;REVB=0.0276162;RO=31;SAF=11;SAR=13;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120773;STB=0.555511;STBP=0.491;TYPE=snp;VARB=0.0143298;OID=.;OPOS=52863564;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:56:31:31:24:25:0.446429:13:11:18:13:13:12:18:13
chr12	52863621	.	T	G	186.07	PASS	AF=0.416667;AO=19;DP=47;FAO=20;FDP=48;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=-0.0194423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.016;QD=15.5056;RBI=0.0195185;REFB=-0.0111503;REVB=-0.00172284;RO=28;SAF=8;SAR=11;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190523;STB=0.59082;STBP=0.34;TYPE=snp;VARB=0.0167961;OID=.;OPOS=52863621;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:48:28:28:19:20:0.416667:11:8:17:11:11:9:17:11
chr12	52865443	.	T	C	459.09	PASS	AF=0.942857;AO=32;DP=34;FAO=33;FDP=35;FR=.;FRO=2;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0498431;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.3183;QD=52.4675;RBI=0.0773007;REFB=0.022874;REVB=0.0590852;RO=2;SAF=12;SAR=20;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0444293;STB=0.523795;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=-0.0149672;OID=.;OPOS=52865443;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:34:35:2:2:32:33:0.942857:20:12:0:2:20:13:0:2
chr12	52881544	.	G	C	147.98	PASS	AF=0.229167;AO=22;DP=96;FAO=22;FDP=96;FR=.;FRO=74;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=48;FSRR=26;FWDB=-0.000335812;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.488;QD=6.16599;RBI=0.0136587;REFB=-0.00591245;REVB=0.0136546;RO=74;SAF=9;SAR=13;SRF=48;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.292869;STB=0.67842;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=0.0296712;OID=.;OPOS=52881544;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:96:74:74:22:22:0.229167:13:9:48:26:13:9:48:26
chr12	52881632	.	C	A	177.77	PASS	AF=0.292683;AO=24;DP=82;FAO=24;FDP=82;FR=.;FRO=58;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=32;FSRR=26;FWDB=0.0131283;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.161;QD=8.67189;RBI=0.0132051;REFB=-0.00744027;REVB=-0.00142188;RO=58;SAF=17;SAR=7;SRF=32;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.201313;STB=0.62047;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=0.0366454;OID=.;OPOS=52881632;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:58:58:24:24:0.292683:7:17:32:26:7:17:32:26
chr12	52884735	.	A	G	912.9	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0271803;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.816;QD=57.9621;RBI=0.02756;REFB=0;REVB=0.00455933;RO=0;SAF=30;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000200457;OID=.;OPOS=52884735;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:63:0:0:62:63:1:32:30:0:0:32:31:0:0
chr12	52886478	.	T	C	438.34	PASS	AF=0.640625;AO=41;DP=64;FAO=41;FDP=64;FR=.;FRO=23;FSAF=16;FSAR=25;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=0.0139017;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.238;QD=27.3962;RBI=0.015925;REFB=-0.0172305;REVB=0.00776857;RO=23;SAF=16;SAR=25;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145857;STB=0.579559;STBP=0.098;TYPE=snp;VARB=0.00934459;OID=.;OPOS=52886478;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:23:23:41:41:0.640625:25:16:14:9:25:16:14:9
chr12	52886490	.	A	G	279.91	PASS	AF=0.405063;AO=32;DP=79;FAO=32;FDP=79;FR=.;FRO=47;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=27;FWDB=-0.00323732;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.276;QD=14.1725;RBI=0.0166526;REFB=-0.0307777;REVB=-0.0163349;RO=46;SAF=20;SAR=12;SRF=19;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.220064;STB=0.618973;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=0.0312205;OID=.;OPOS=52886490;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:46:47:32:32:0.405063:12:20:19:27:12:20:20:27
chr12	52886911	.	T	C	708.56	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0333156;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.574;QD=62.9827;RBI=0.0483084;REFB=0;REVB=0.0349825;RO=0;SAF=21;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0002984;OID=.;OPOS=52886911;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:24:21:0:0:24:21:0:0
chr12	52938320	.	C	T	419.43	PASS	AF=0.452632;AO=43;DP=95;FAO=43;FDP=95;FR=.;FRO=52;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=11;FSRR=41;FWDB=-0.00850634;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.36;QD=17.6601;RBI=0.0291658;REFB=-0.00851666;REVB=-0.0278978;RO=52;SAF=25;SAR=18;SRF=11;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.351563;STB=0.69469;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0117953;OID=.;OPOS=52938320;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:52:52:43:43:0.452632:18:25:11:41:18:25:11:41
chr12	52946498	.	C	T	369.3	PASS	AF=0.443182;AO=38;DP=87;FAO=39;FDP=88;FR=.;FRO=49;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=17;FSRR=32;FWDB=0.027961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.3345;QD=16.7862;RBI=0.0288703;REFB=0.0132255;REVB=-0.00718873;RO=45;SAF=19;SAR=19;SRF=15;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161847;STB=0.591945;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=-0.0218773;OID=.;OPOS=52946498;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:88:45:49:38:39:0.443182:19:19:15:30:19:20:17:32
chr12	52946543	.	C	T	391.5	PASS	AF=0.533333;AO=39;DP=74;FAO=40;FDP=75;FR=.;FRO=35;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=0.0231136;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.3094;QD=20.8799;RBI=0.0335841;REFB=-0.00585449;REVB=-0.024365;RO=35;SAF=17;SAR=22;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00637151;STB=0.510116;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=0.0138236;OID=.;OPOS=52946543;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:75:35:35:39:40:0.533333:22:17:15:20:22:18:15:20
chr12	52965173	.	T	G	708.56	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00662632;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=200.551;QD=62.9829;RBI=0.00680286;REFB=0;REVB=-0.00153973;RO=0;SAF=21;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.23378e-05;OID=.;OPOS=52965173;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:45:0:0:44:45:1:23:21:0:0:24:21:0:0
chr12	52965722	.	T	C	889.7	PASS	AF=1;AO=61;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0210599;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.862;QD=57.4;RBI=0.0226982;REFB=0;REVB=0.00846696;RO=0;SAF=27;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000264435;OID=.;OPOS=52965722;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:61:62:1:34:27:0:0:35:27:0:0
chr12	52965761	.	C	T	933.9	PASS	AF=0.984848;AO=62;DP=63;FAO=65;FDP=66;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0645983;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.092;QD=56.6001;RBI=0.0720114;REFB=-0.0602797;REVB=0.031823;RO=0;SAF=27;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.46408e-08;STB=0.508472;STBP=0.335;TYPE=snp;VARB=0.00354657;OID=.;OPOS=52965761;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:63:66:0:1:62:65:0.984848:35:27:0:0:36:29:1:0
chr12	52965782	.	T	C	900.62	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0526896;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.4338;QD=58.1042;RBI=0.0748039;REFB=0;REVB=-0.0530983;RO=0;SAF=26;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00121968;OID=.;OPOS=52965782;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:62:0:0:61:62:1:35:26:0:0:35:27:0:0
chr12	52966390	.	A	T	469.23	PASS	AF=0.745455;AO=41;DP=55;FAO=41;FDP=55;FR=.;FRO=14;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.028679;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.516;QD=34.1258;RBI=0.0397737;REFB=-0.0162286;REVB=0.0275584;RO=14;SAF=21;SAR=20;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0279494;STB=0.51509;STBP=0.723;TYPE=snp;VARB=0.00439882;OID=.;OPOS=52966390;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:55:55:14:14:41:41:0.745455:20:21:8:6:20:21:8:6
chr12	52966437	.	C	T	89.46	PASS	AF=0.244898;AO=12;DP=49;FAO=12;FDP=49;FR=.;FRO=37;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=-0.0125582;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.846;QD=7.30302;RBI=0.0134333;REFB=-0.00964595;REVB=-0.00476914;RO=37;SAF=5;SAR=7;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117146;STB=0.573256;STBP=0.553;TYPE=snp;VARB=0.0332444;OID=.;OPOS=52966437;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:49:49:37:37:12:12:0.244898:7:5:19:18:7:5:19:18
chr12	52981442	.	C	A	689.41	PASS	AF=0.63;AO=63;DP=101;FAO=63;FDP=100;FR=.;FRO=37;FSAF=38;FSAR=25;FSRF=24;FSRR=13;FWDB=0.0229773;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.1566;QD=27.5762;RBI=0.0286348;REFB=-0.0165454;REVB=-0.0170879;RO=36;SAF=38;SAR=25;SRF=24;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0449697;STB=0.517696;STBP=0.653;TYPE=snp;VARB=0.0110103;OID=.;OPOS=52981442;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:100:36:37:63:63:0.63:25:38:24:12:25:38:24:13
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chr12	52985293	.	A	G	448.0	PASS	AF=0.459184;AO=45;DP=97;FAO=45;FDP=98;FR=.;FRO=53;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=27;FSRR=26;FWDB=-0.00106046;FXX=0.0101;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.1264;QD=18.2857;RBI=0.0345009;REFB=-0.0236549;REVB=-0.0344846;RO=52;SAF=21;SAR=24;SRF=26;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0320863;STB=0.52315;STBP=0.668;TYPE=snp;VARB=0.0223364;OID=.;OPOS=52985293;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:98:52:53:45:45:0.459184:24:21:26:26:24:21:27:26
chr12	52986187	.	T	C	164.35	PASS	AF=0.515152;AO=17;DP=34;FAO=17;FDP=33;FR=.;FRO=16;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=-0.019212;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.864;QD=19.921;RBI=0.0306893;REFB=0.00332809;REVB=0.0239318;RO=14;SAF=12;SAR=5;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00813096;STB=0.510626;STBP=0.942;TYPE=snp;VARB=-0.00174246;OID=.;OPOS=52986187;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:33:14:16:17:17:0.515152:5:12:10:4:5:12:11:5
chr12	52992812	.	T	C	531.52	PASS	AF=0.537634;AO=50;DP=93;FAO=50;FDP=93;FR=.;FRO=43;FSAF=36;FSAR=14;FSRF=27;FSRR=16;FWDB=-0.0187301;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.6684;QD=22.861;RBI=0.0362389;REFB=0.0294476;REVB=0.0310232;RO=43;SAF=36;SAR=14;SRF=27;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0913804;STB=0.550438;STBP=0.351;TYPE=snp;VARB=-0.0248628;OID=.;OPOS=52992812;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:43:43:50:50:0.537634:14:36:27:16:14:36:27:16
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chr12	53003082	.	C	T	131.31	PASS	AF=0.405405;AO=15;DP=37;FAO=15;FDP=37;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=-0.0136967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.475;QD=14.1956;RBI=0.028566;REFB=-0.00557571;REVB=0.0250682;RO=22;SAF=9;SAR=6;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.23825;STB=0.638118;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.00889725;OID=.;OPOS=53003082;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:22:22:15:15:0.405405:6:9:8:14:6:9:8:14
chr12	53007492	.	C	T	579.0	PASS	AF=0.662338;AO=50;DP=76;FAO=51;FDP=77;FR=.;FRO=26;FSAF=30;FSAR=21;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=0.0387553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.545;QD=30.0778;RBI=0.043884;REFB=-0.0133219;REVB=0.0205873;RO=25;SAF=29;SAR=21;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111339;STB=0.556392;STBP=0.17;TYPE=snp;VARB=0.0103067;OID=.;OPOS=53007492;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:77:25:26:50:51:0.662338:21:29:10:15:21:30:11:15
chr12	53008372	.	C	T	176.65	PASS	AF=0.38;AO=19;DP=50;FAO=19;FDP=50;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.0283617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.219;QD=14.1319;RBI=0.0504019;REFB=-0.0137237;REVB=-0.0416649;RO=31;SAF=9;SAR=10;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0108965;STB=0.506322;STBP=0.956;TYPE=snp;VARB=0.0286438;OID=.;OPOS=53008372;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:31:31:19:19:0.38:10:9:15:16:10:9:15:16
chr12	53069235	.	G	A	51.04	PASS	AF=0.777778;AO=6;DP=9;FAO=7;FDP=9;FR=.;FRO=2;FSAF=7;FSAR=0;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.112219;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=48.4163;QD=22.6863;RBI=0.112219;REFB=-0.0924463;REVB=0;RO=3;SAF=6;SAR=0;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.133395;OID=.;OPOS=53069235;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:9:9:3:2:6:7:0.777778:0:6:3:0:0:7:2:0
chr12	53070121	.	T	G	351.1	PASS	AF=0.583333;AO=35;DP=60;FAO=35;FDP=60;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.0191978;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.5025;QD=23.4068;RBI=0.0539479;REFB=0.0228531;REVB=-0.0504165;RO=24;SAF=13;SAR=22;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129726;STB=0.564065;STBP=0.27;TYPE=snp;VARB=-0.0171755;OID=.;OPOS=53070121;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:24:25:35:35:0.583333:22:13:13:11:22:13:13:12
chr12	53070145	.	G	A	378.2	PASS	AF=0.606557;AO=37;DP=61;FAO=37;FDP=61;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=24;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=-0.0296729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.319;QD=24.8001;RBI=0.0296828;REFB=-0.0414334;REVB=-0.0007636;RO=23;SAF=13;SAR=24;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0942698;STB=0.561764;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=0.0213141;OID=.;OPOS=53070145;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:23:24:37:37:0.606557:24:13:11:12:24:13:12:12
chr12	53085089	.	T	C	501.52	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0167717;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.763;QD=59.0018;RBI=0.0204302;REFB=0;REVB=-0.0116664;RO=0;SAF=15;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.40663e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00011146;OID=.;OPOS=53085089;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:19:15:0:0:19:15:0:0
chr12	53086645	.	G	A	251.07	PASS	AF=0.509804;AO=26;DP=51;FAO=26;FDP=51;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=-0.0315118;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.778;QD=19.6916;RBI=0.0410391;REFB=-0.0359541;REVB=0.0262909;RO=25;SAF=11;SAR=15;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0151314;STB=0.508468;STBP=0.922;TYPE=snp;VARB=0.0433779;OID=.;OPOS=53086645;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:25:25:26:26:0.509804:15:11:11:14:15:11:11:14
chr12	53090190	.	C	T	190.99	PASS	AF=0.566667;AO=17;DP=30;FAO=17;FDP=30;FR=.,HEALED;FRO=11;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.0099333;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.9293;QD=25.4659;RBI=0.101691;REFB=-0.0271171;REVB=-0.101205;RO=10;SAF=8;SAR=9;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0471163;STB=0.542324;STBP=0.602;TYPE=snp;VARB=0.0104635;OID=.;OPOS=53090190;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:30:30:10:11:17:17:0.566667:9:8:4:6:9:8:4:7
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chr12	53096913	.	G	A	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00148318;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.302;QD=42.1826;RBI=0.0055191;REFB=0;REVB=-0.00531607;RO=0;SAF=1;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.53208e-05;OID=.;OPOS=53096913;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:10:1:0:0:10:1:0:0
chr12	53162773	.	A	G	446.99	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0866881;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.4245;QD=57.6765;RBI=0.0874202;REFB=0;REVB=0.0112904;RO=0;SAF=12;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.47712e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00193687;OID=.;OPOS=53162773;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:19:12:0:0:19:12:0:0
chr12	53164848	.	G	A	263.78	PASS	AF=0.483333;AO=29;DP=60;FAO=29;FDP=60;FR=.;FRO=31;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=11;FWDB=-0.0106296;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.914;QD=17.5856;RBI=0.0185651;REFB=-0.00140438;REVB=-0.0152208;RO=29;SAF=17;SAR=12;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0644526;STB=0.531715;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=0.00105505;OID=.;OPOS=53164848;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:29:31:29:29:0.483333:12:17:19:10:12:17:20:11
chr12	53165940	.	C	T	524.17	PASS	AF=1;AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0195836;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.9098;QD=59.905;RBI=0.0230107;REFB=0;REVB=0.012082;RO=0;SAF=19;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.1382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000241761;OID=.;OPOS=53165940;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:35:0:0:35:35:1:16:19:0:0:16:19:0:0
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chr12	53186122	.	G	A	451.8	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00014033;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.472;QD=58.2968;RBI=0.0126231;REFB=0;REVB=0.0126224;RO=0;SAF=19;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.47712e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000268081;OID=.;OPOS=53186122;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:12:19:0:0:12:19:0:0
chr12	53204614	.	C	G,T	875.58	PASS	AF=0.078125,0.90625;AO=5,57;DP=63;FAO=5,58;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=5,31;FSAR=0,27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00466053,0.0685634;FXX=0.0153822;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=117.946,128.171;QD=54.724;RBI=0.00749536,0.0686457;REFB=-0.0253805,-0.134241;REVB=0.00587025,0.00335938;RO=1;SAF=5,31;SAR=0,26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-0.0149715;STB=0.5,0.507934;STBP=1,0.51;TYPE=snp,snp;VARB=0.0781924,0.00146941;OID=.,.;OPOS=53204614,53204614;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:19:63:64:1:1:5,57:5,58:0.078125,0.90625:0,26:5,31:1:0:0,27:5,31:1:0
chr12	53217701	.	C	A	186.17	PASS	AF=0.5;AO=18;DP=37;FAO=19;FDP=38;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.032037;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.529;QD=19.5964;RBI=0.0325909;REFB=0.0139606;REVB=-0.00598317;RO=19;SAF=5;SAR=13;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.287827;STB=0.670469;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=-0.00683334;OID=.;OPOS=53217701;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:38:19:19:18:19:0.5:13:5:11:8:14:5:11:8
chr12	53227803	.	A	G	45.97	PASS	AF=0.35;AO=6;DP=20;FAO=7;FDP=20;FR=.;FRO=13;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=11;FWDB=0.0143734;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.825;QD=9.19427;RBI=0.0711758;REFB=-0.00658205;REVB=-0.0697093;RO=13;SAF=1;SAR=5;SRF=2;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0255261;STB=0.514244;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0113591;OID=.;OPOS=53227803;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:20:20:13:13:6:7:0.35:5:1:2:11:6:1:2:11
chr12	53242440	.	A	G	217.82	PASS	AF=0.461538;AO=24;DP=52;FAO=24;FDP=52;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=-0.0126247;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.5043;QD=16.7555;RBI=0.0244286;REFB=-0.0192259;REVB=-0.0209134;RO=26;SAF=11;SAR=13;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.178977;STB=0.579552;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.0267305;OID=.;OPOS=53242440;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:26:28:24:24:0.461538:13:11:17:9:13:11:17:11
chr12	53343493	.	G	A	111.96	PASS	AF=0.481481;AO=13;DP=27;FAO=13;FDP=27;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=-0.0563815;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.3413;QD=16.5867;RBI=0.0797509;REFB=-0.0223611;REVB=-0.0564034;RO=13;SAF=10;SAR=3;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0884388;STB=0.5384;STBP=0.725;TYPE=snp;VARB=0.017105;OID=.;OPOS=53343493;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:13:14:13:13:0.481481:3:10:9:4:3:10:10:4
chr12	53431264	.	C	T	144.79	PASS	AF=0.410256;AO=16;DP=40;FAO=16;FDP=39;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=19;FWDB=0.0413561;FXX=0.0249938;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.304;QD=14.8499;RBI=0.0485368;REFB=0.0122482;REVB=-0.0254065;RO=24;SAF=5;SAR=11;SRF=5;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133721;STB=0.602296;STBP=0.369;TYPE=snp;VARB=-0.0173695;OID=.;OPOS=53431264;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:39:24:23:16:16:0.410256:11:5:5:19:11:5:4:19
chr12	53433089	.	C	A	1466.35	PASS	AF=1;AO=93;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00206509;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.042;QD=62.3981;RBI=0.0486697;REFB=0;REVB=0.0486258;RO=1;SAF=45;SAR=48;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00977519;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000134625;OID=.;OPOS=53433089;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:94:94:1:0:93:94:1:48:45:0:1:49:45:0:0
chr12	53433486	.	C	T	190.27	PASS	AF=0.542857;AO=19;DP=35;FAO=19;FDP=35;FR=.;FRO=16;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=-0.00992114;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=315.036;QD=21.7452;RBI=0.0127761;REFB=-0.00908253;REVB=-0.00804989;RO=16;SAF=13;SAR=6;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.304947;STB=0.67155;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.0070447;OID=.;OPOS=53433486;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:16:16:19:19:0.542857:6:13:5:11:6:13:5:11
chr12	53449573	.	G	A	184.07	PASS	AF=0.290698;AO=23;DP=85;FAO=25;FDP=86;FR=.;FRO=61;FSAF=6;FSAR=19;FSRF=25;FSRR=36;FWDB=-0.00093774;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.4846;QD=8.56118;RBI=0.0341953;REFB=2.69857e-05;REVB=0.0341824;RO=62;SAF=5;SAR=18;SRF=25;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.265954;STB=0.640792;STBP=0.104;TYPE=snp;VARB=0.00127097;OID=.;OPOS=53449573;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:86:62:61:23:25:0.290698:18:5:25:37:19:6:25:36
chr12	53449597	.	T	C	163.72	PASS	AF=0.309859;AO=22;DP=72;FAO=22;FDP=71;FR=.;FRO=49;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=32;FWDB=-0.032833;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.109;QD=9.22345;RBI=0.0334266;REFB=-0.0011864;REVB=0.00627187;RO=49;SAF=6;SAR=16;SRF=17;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102377;STB=0.560918;STBP=0.545;TYPE=snp;VARB=0.00351427;OID=.;OPOS=53449597;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:71:49:49:22:22:0.309859:16:6:17:32:16:6:17:32
chr12	53451849	.	G	C	203.23	PASS	AF=0.540541;AO=20;DP=37;FAO=20;FDP=37;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.000976903;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.786;QD=21.971;RBI=0.0130089;REFB=-0.00817329;REVB=0.0129722;RO=17;SAF=6;SAR=14;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103359;STB=0.558222;STBP=0.49;TYPE=snp;VARB=0.00765502;OID=.;OPOS=53451849;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:17:17:20:20:0.540541:14:6:7:10:14:6:7:10
chr12	53452263	.	CCAGGTGGCAGG	C	195.07	PASS	AF=0.709677;AO=21;DP=25;FAO=22;FDP=31;FR=.;FRO=9;FSAF=17;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.00914972;FXX=0.0312402;HRUN=2;LEN=11;MLLD=331.957;QD=25.1705;RBI=0.0101181;REFB=-0.0471322;REVB=0.00431951;RO=0;SAF=17;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0.511335;SSEP=0;SSSB=-4.45803e-08;STB=0.618065;STBP=0.072;TYPE=del;VARB=0.02097;OID=.;OPOS=53452264;OREF=CAGGTGGCAGG;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.709677:21:25:22:31:9:17:5:4:5:46:0:17:4:0:0
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chr12	53456619	.	C	T	39.05	PASS	AF=0.461538;AO=6;DP=13;FAO=6;FDP=13;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=-0.0152018;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.725;QD=12.015;RBI=0.0405508;REFB=0.00431543;REVB=0.0375935;RO=6;SAF=4;SAR=2;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.396745;STB=0.699353;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=-0.00345762;OID=.;OPOS=53456619;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:13:13:6:7:6:6:0.461538:2:4:1:5:2:4:2:5
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chr12	53458391	.	G	A	322.69	PASS	AF=0.395604;AO=36;DP=91;FAO=36;FDP=91;FR=.;FRO=55;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=32;FSRR=23;FWDB=-0.011562;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.02;QD=14.1842;RBI=0.013548;REFB=-0.000614972;REVB=-0.00706183;RO=55;SAF=17;SAR=19;SRF=32;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116121;STB=0.565921;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=0.0011955;OID=.;OPOS=53458391;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:55:55:36:36:0.395604:19:17:32:23:19:17:32:23
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chr12	53509933	.	C	T	449.83	PASS	AF=0.46875;AO=45;DP=97;FAO=45;FDP=96;FR=.;FRO=51;FSAF=16;FSAR=29;FSRF=17;FSRR=34;FWDB=-0.00974314;FXX=0.0103082;HRUN=3;LEN=1;MLLD=222.666;QD=18.7429;RBI=0.0124976;REFB=-0.0163646;REVB=-0.007827;RO=51;SAF=16;SAR=29;SRF=17;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0232969;STB=0.512971;STBP=0.829;TYPE=snp;VARB=0.0177605;OID=.;OPOS=53509933;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:96:51:51:45:45:0.46875:29:16:17:34:29:16:17:34
chr12	53563865	.	G	A	205.16	PASS	AF=0.442308;AO=23;DP=52;FAO=23;FDP=52;FR=.;FRO=29;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=-0.00572467;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.152;QD=15.7818;RBI=0.00657257;REFB=-0.0199186;REVB=0.00322906;RO=29;SAF=15;SAR=8;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.298357;STB=0.669276;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.0231703;OID=.;OPOS=53563865;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:29:29:23:23:0.442308:8:15:10:19:8:15:10:19
chr12	53574366	.	C	T	246.15	PASS	AF=0.402778;AO=29;DP=72;FAO=29;FDP=72;FR=.;FRO=43;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=35;FSRR=8;FWDB=0.00623566;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.4;QD=13.6748;RBI=0.0250533;REFB=-0.0220121;REVB=0.0242648;RO=43;SAF=20;SAR=9;SRF=35;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164729;STB=0.592757;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=0.0365663;OID=.;OPOS=53574366;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:43:43:29:29:0.402778:9:20:35:8:9:20:35:8
chr12	53574395	.	G	A	136.8	PASS	AF=0.346154;AO=18;DP=52;FAO=18;FDP=52;FR=.;FRO=34;FSAF=17;FSAR=1;FSRF=8;FSRR=26;FWDB=0.0452612;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.87;QD=10.5227;RBI=0.0452655;REFB=-0.0195653;REVB=0.000625399;RO=33;SAF=17;SAR=1;SRF=7;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.773762;STB=0.947866;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.119517;OID=.;OPOS=53574395;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:33:34:18:18:0.346154:1:17:7:26:1:17:8:26
chr12	53607263	.	AG	A,GA	238.12	PASS	AF=0.571429,0.392857;AO=12,8;DP=28;FAO=16,11;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=16,0;FSAR=0,11;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.300221,0.102887;FXX=0;HRUN=5,1;LEN=1,2;MLLD=10.3035,46.13;QD=34.0171;RBI=0.432599,0.127162;REFB=-0.0120064,-0.0193391;REVB=-0.311462,-0.0747291;RO=5;SAF=12,0;SAR=0,8;SRF=4;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.807496,-0.814474;STB=0.998798,0.5;STBP=0.022,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.0604361,-0.000659973;OID=.,.;OPOS=53607264,53607263;OREF=G,AG;OALT=-,GA;OMAPALT=A,GA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:85:28:28:5:1:12,8:16,11:0.571429,0.392857:0,8:12,0:4:1:0,11:16,0:0:1
chr12	53647363	.	C	T	117.39	PASS	AF=0.590909;AO=13;DP=22;FAO=13;FDP=22;FR=.;FRO=9;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.0385121;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.729;QD=21.3434;RBI=0.0401592;REFB=-0.0622261;REVB=0.0113832;RO=9;SAF=7;SAR=6;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0124041;STB=0.507031;STBP=0.961;TYPE=snp;VARB=0.0209542;OID=.;OPOS=53647363;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:22:22:9:9:13:13:0.590909:6:7:5:4:6:7:5:4
chr12	53647373	.	T	C	313.34	PASS	AF=0.96;AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=25;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.000850983;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.101;QD=50.1337;RBI=0.0130528;REFB=-0.0112002;REVB=-0.0130251;RO=1;SAF=12;SAR=12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0370602;STB=0.519983;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.000109939;OID=.;OPOS=53647373;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:25:25:1:1:24:24:0.96:12:12:1:0:12:12:1:0
chr12	53662624	.	C	A,G	509.32	PASS	AF=0.942857,0.0571429;AO=33,2;DP=35;FAO=33,2;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=21,2;FSAR=12,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0281838,0.0302472;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=216.516,11.6266;QD=58.2085;RBI=0.0283098,0.0308249;REFB=0,0;REVB=-0.00266774,0.00593997;RO=0;SAF=21,2;SAR=12,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00104423,0.109822;OID=.,.;OPOS=53662624,53662624;OREF=C,C;OALT=A,G;OMAPALT=A,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:35:35:0:0:33,2:33,2:0.942857,0.0571429:12,0:21,2:0:0:12,0:21,2:0:0
chr12	53670545	.	C	A	1739.48	PASS	AF=1;AO=114;DP=114;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0352713;FXX=0.0172399;HRUN=4;LEN=1;MLLD=103.515;QD=61.0343;RBI=0.0367214;REFB=0;REVB=0.0102175;RO=0;SAF=56;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.23074e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000247422;OID=.;OPOS=53670545;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:114:114:0:0:114:114:1:58:56:0:0:58:56:0:0
chr12	53681883	.	A	T	513.12	PASS	AF=0.972222;AO=35;DP=37;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00370908;FXX=0.0270197;HRUN=3;LEN=1;MLLD=155.655;QD=57.0135;RBI=0.00404791;REFB=-0.0134212;REVB=0.0016212;RO=0;SAF=14;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.27896e-08;STB=0.517231;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=0.00144316;OID=.;OPOS=53681883;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:37:36:0:1:35:35:0.972222:21:14:0:0:21:14:1:0
chr12	53682326	.	G	A	1461.87	PASS	AF=0.979381;AO=94;DP=97;FAO=95;FDP=97;FR=.;FRO=2;FSAF=58;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0630864;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.3451;QD=60.2834;RBI=0.112872;REFB=-0.120105;REVB=0.0935953;RO=2;SAF=57;SAR=37;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00439596;STB=0.502393;STBP=0.795;TYPE=snp;VARB=0.00436;OID=.;OPOS=53682326;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:97:97:2:2:94:95:0.979381:37:57:1:1:37:58:1:1
chr12	53686703	.	G	A	407.9	PASS	AF=0.967742;AO=29;DP=31;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0489041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.8101;QD=52.6325;RBI=0.106997;REFB=-0.118523;REVB=0.0951668;RO=1;SAF=10;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0238907;STB=0.512187;STBP=0.619;TYPE=snp;VARB=0.00648894;OID=.;OPOS=53686703;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:31:31:1:1:29:30:0.967742:19:10:0:1:20:10:0:1
chr12	53693532	.	AA	GC	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0516968;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=240.228;QD=33.4285;RBI=0.051711;REFB=0;REVB=0.00120869;RO=0;SAF=3;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000659474;OID=.;OPOS=53693532;OREF=AA;OALT=GC;OMAPALT=GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:3:3:0:0:3:3:0:0
chr12	53700848	.	C	T	1502.27	PASS	AF=1;AO=98;DP=98;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0289706;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.2389;QD=58.9124;RBI=0.0289794;REFB=0;REVB=0.00071574;RO=0;SAF=57;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00094269;OID=.;OPOS=53700848;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:102:0:0:98:102:1:41:57:0:0:45:57:0:0
chr12	53700860	.	A	G	1525.94	PASS	AF=1;AO=100;DP=102;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00938034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.141;QD=59.8409;RBI=0.0449319;REFB=0;REVB=0.0439418;RO=0;SAF=54;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.21299e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.83967e-05;OID=.;OPOS=53700860;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:102:102:0:0:100:102:1:46:54:0:0:47:55:0:0
chr12	53703021	.	G	A	619.18	PASS	AF=1;AO=40;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0848872;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.4831;QD=60.4075;RBI=0.105876;REFB=0;REVB=0.0632757;RO=1;SAF=24;SAR=16;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0284076;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00285661;OID=.;OPOS=53703021;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:1:0:40:41:1:16:24:0:1:17:24:0:0
chr12	53722098	.	A	G	483.35	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0125926;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.624;QD=58.5877;RBI=0.0305945;REFB=0;REVB=-0.0278828;RO=0;SAF=12;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.041e-05;OID=.;OPOS=53722098;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:21:12:0:0:21:12:0:0
chr12	53722128	.	G	A	393.31	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0611745;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.4365;QD=56.1875;RBI=0.0692854;REFB=0;REVB=0.0325292;RO=0;SAF=9;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.62669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00116005;OID=.;OPOS=53722128;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:19:9:0:0:19:9:0:0
chr12	54067544	.	A	G	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0265677;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.469;QD=43.4861;RBI=0.0510651;REFB=0;REVB=-0.0436097;RO=0;SAF=4;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00244097;OID=.;OPOS=54067544;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:8:4:0:0:8:4:0:0
chr12	54105074	.	T	C	569.72	PASS	AF=0.53;AO=53;DP=100;FAO=53;FDP=100;FR=.;FRO=47;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=25;FSRR=22;FWDB=0.0067996;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.296;QD=22.7887;RBI=0.00688403;REFB=-0.0146661;REVB=0.00107488;RO=47;SAF=28;SAR=25;SRF=25;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00309505;STB=0.501703;STBP=0.979;TYPE=snp;VARB=0.0108384;OID=.;OPOS=54105074;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:47:47:53:53:0.53:25:28:25:22:25:28:25:22
chr12	54107905	.	G	A	106.91	PASS	AF=0.371429;AO=13;DP=35;FAO=13;FDP=35;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=-0.00314135;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=291.03;QD=12.2178;RBI=0.00334101;REFB=-0.000377827;REVB=-0.00113767;RO=22;SAF=5;SAR=8;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0272451;STB=0.516104;STBP=0.916;TYPE=snp;VARB=0.000450501;OID=.;OPOS=54107905;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:22:22:13:13:0.371429:8:5:9:13:8:5:9:13
chr12	54109659	.	C	T	302.74	PASS	AF=0.357143;AO=35;DP=98;FAO=35;FDP=98;FR=.;FRO=63;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=33;FSRR=30;FWDB=0.0942948;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.2809;QD=12.3566;RBI=0.107051;REFB=-0.00215293;REVB=0.0506784;RO=62;SAF=19;SAR=16;SRF=32;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0298582;STB=0.512302;STBP=0.883;TYPE=snp;VARB=0.00692254;OID=.;OPOS=54109659;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:62:63:35:35:0.357143:16:19:32:30:16:19:33:30
chr12	54109733	.	A	G	1928.71	PASS	AF=1;AO=124;DP=125;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0168309;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.0113;QD=61.7189;RBI=0.041433;REFB=0;REVB=-0.0378605;RO=0;SAF=66;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.24708e-05;OID=.;OPOS=54109733;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:125:125:0:0:124:125:1:58:66:0:0:58:67:0:0
chr12	54115875	.	C	T	310.14	PASS	AF=0.627907;AO=27;DP=43;FAO=27;FDP=43;FR=.;FRO=16;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.0395799;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.031;QD=28.8503;RBI=0.0455397;REFB=-0.0273465;REVB=0.0225232;RO=16;SAF=13;SAR=14;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0546842;STB=0.530098;STBP=0.587;TYPE=snp;VARB=0.0155281;OID=.;OPOS=54115875;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:16:16:27:27:0.627907:14:13:9:7:14:13:9:7
chr12	54117972	.	G	A	34.26	PASS	AF=0.833333;AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0912742;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=43.5817;QD=22.843;RBI=0.106681;REFB=-0.0845748;REVB=-0.0552251;RO=1;SAF=2;SAR=3;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121807;STB=0.571154;STBP=0.616;TYPE=snp;VARB=0.0355361;OID=.;OPOS=54117972;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:6:6:1:1:5:5:0.833333:3:2:0:1:3:2:0:1
chr12	54340077	.	G	A	455.93	PASS	AF=0.614286;AO=42;DP=69;FAO=43;FDP=70;FR=.;FRO=27;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.000803112;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.855;QD=26.053;RBI=0.00354997;REFB=0.000426459;REVB=-0.00345793;RO=27;SAF=26;SAR=16;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127859;STB=0.562893;STBP=0.215;TYPE=snp;VARB=-0.000124174;OID=.;OPOS=54340077;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:70:27:27:42:43:0.614286:16:26:12:15:17:26:12:15
chr12	54340209	.	TTA	T,TTT	63.57	PASS	AF=0.2,0;AO=12,7;DP=78;FAO=13,0;FDP=65;FR=.;FRO=52;FSAF=11,0;FSAR=2,0;FSRF=34;FSRR=18;FWDB=0.0158822,0.091678;FXX=0.0151492;HRUN=6,6;LEN=2,1;MLLD=18.9037,15.1213;QD=3.91194;RBI=0.0465451,0.0982777;REFB=-0.0207672,0.00609582;REVB=0.0437516,-0.0354068;RO=46;SAF=10,1;SAR=2,6;SRF=28;SRR=18;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.338713,-0.531426;STB=0.709303,0.5;STBP=0.149,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0560321,0;OID=.,.;OPOS=54340210,54340211;OREF=TA,A;OALT=-,T;OMAPALT=T,TTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.2,0:12,7:78:13,0:65:52:11,0:2,0:34:18:64:46:10,1:2,6:28:18
chr12	54367061	.	T	C,G	761.61	PASS	AF=0.0408163,0.959184;AO=2,46;DP=48;FAO=2,47;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=2,24;FSAR=0,23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00323741,0.0248367;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=114.037,175.096;QD=62.1723;RBI=0.0138271,0.0298908;REFB=0,0;REVB=0.0134427,0.0166313;RO=0;SAF=2,23;SAR=0,23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.161611,0.000747581;OID=.,.;OPOS=54367061,54367061;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:7:48:49:0:0:2,46:2,47:0.0408163,0.959184:0,23:2,23:0:0:0,23:2,24:0:0
chr12	54379670	.	C	T	285.63	PASS	AF=0.438356;AO=32;DP=75;FAO=32;FDP=73;FR=.;FRO=41;FSAF=23;FSAR=9;FSRF=30;FSRR=11;FWDB=0.00498774;FXX=0.0266631;HRUN=5;LEN=1;MLLD=104.653;QD=15.6511;RBI=0.0101758;REFB=-0.0046253;REVB=0.0088696;RO=41;SAF=23;SAR=9;SRF=30;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0160866;STB=0.509066;STBP=0.926;TYPE=snp;VARB=0.00339066;OID=.;OPOS=54379670;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:73:41:41:32:32:0.438356:9:23:30:11:9:23:30:11
chr12	54385599	.	C	T	216.69	PASS	AF=0.4;AO=26;DP=65;FAO=26;FDP=65;FR=.;FRO=39;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=27;FWDB=0.0595418;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.466;QD=13.3346;RBI=0.0595927;REFB=-0.00551174;REVB=-0.00246162;RO=39;SAF=9;SAR=17;SRF=12;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0453563;STB=0.525877;STBP=0.774;TYPE=snp;VARB=0.00849989;OID=.;OPOS=54385599;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:39:39:26:26:0.4:17:9:12:27:17:9:12:27
chr12	54496166	.	G	T	636.17	PASS	AF=1;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0050367;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.8378;QD=62.0652;RBI=0.0360897;REFB=0;REVB=-0.0357365;RO=0;SAF=22;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00106408;OID=.;OPOS=54496166;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:41:0:0:41:41:1:19:22:0:0:19:22:0:0
chr12	54496219	.	A	G	164.82	PASS	AF=0.548387;AO=17;DP=31;FAO=17;FDP=31;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.0495627;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.048;QD=21.2669;RBI=0.0495701;REFB=-0.00981297;REVB=0.000857304;RO=13;SAF=10;SAR=7;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0216718;STB=0.507803;STBP=0.953;TYPE=snp;VARB=0.0117986;OID=.;OPOS=54496219;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:13:14:17:17:0.548387:7:10:8:5:7:10:8:6
chr12	54767812	.	G	A	106.31	PASS	AF=0.361111;AO=13;DP=36;FAO=13;FDP=36;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.000397009;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=236.132;QD=11.8121;RBI=0.00516213;REFB=-0.00160662;REVB=0.00514684;RO=23;SAF=6;SAR=7;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111318;STB=0.565857;STBP=0.567;TYPE=snp;VARB=0.00319644;OID=.;OPOS=54767812;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:23:23:13:13:0.361111:7:6:13:10:7:6:13:10
chr12	54790124	.	C	T	182.12	PASS	AF=0.44186;AO=19;DP=43;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=17;FWDB=-0.0156553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.379;QD=16.9412;RBI=0.0157252;REFB=0.00784237;REVB=0.00148125;RO=23;SAF=12;SAR=7;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.307386;STB=0.6839;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=-0.0120241;OID=.;OPOS=54790124;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:23:24:19:19:0.44186:7:12:7:16:7:12:7:17
chr12	54799450	.	A	G	130.45	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0181801;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.951;QD=43.4844;RBI=0.0397727;REFB=0;REVB=-0.0353744;RO=0;SAF=6;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.66588e-05;OID=.;OPOS=54799450;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:6:6:0:0:6:6:0:0
chr12	54905815	.	C	G,T	1230.94	PASS	AF=0.97561,0.0243902;AO=79,3;DP=82;FAO=80,2;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=33,0;FSAR=47,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0432404,0.00552183;FXX=0.0238067;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=109.369,163.97;QD=60.0457;RBI=0.0470522,0.00951978;REFB=-0.0978185,-0.0436431;REVB=0.0185519,-0.00775471;RO=0;SAF=33,0;SAR=46,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000648769,0.159899;OID=.,.;OPOS=54905815,54905815;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:3:82:82:0:0:79,3:80,2:0.97561,0.0243902:46,3:33,0:0:0:47,2:33,0:0:0
chr12	54969875	.	AC	AA,A	36.55	PASS	AF=0.0740741,0.222222;AO=2,5;DP=26;FAO=2,6;FDP=27;FR=.;FRO=19;FSAF=2,5;FSAR=0,1;FSRF=4;FSRR=15;FWDB=-0.0440741,-0.0590088;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=29.261,18.8156;QD=5.41437;RBI=0.0851994,0.0748306;REFB=-0.00852376,-0.0131954;REVB=0.0729137,0.0460173;RO=18;SAF=2,5;SAR=0,0;SRF=4;SRR=14;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.666653,0.779102;STB=0.997148,0.897844;STBP=0.023,0.083;TYPE=snp,del;VARB=0.0659989,0.0440855;OID=.,.;OPOS=54969876,54969876;OREF=C,C;OALT=A,-;OMAPALT=AA,A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0.0740741,0.222222:2,5:26:2,6:27:19:2,5:0,1:4:15:24:18:2,5:0,0:4:14
chr12	54970454	.	T	C	837.05	PASS	AF=1;AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0188063;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.8536;QD=57.7276;RBI=0.0829755;REFB=0;REVB=0.0808161;RO=0;SAF=23;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00104668;OID=.;OPOS=54970454;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:58:0:0:58:58:1:35:23:0:0:35:23:0:0
chr12	54972992	.	T	C	613.35	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0169747;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.9562;QD=61.3347;RBI=0.0368322;REFB=0;REVB=0.0326874;RO=0;SAF=5;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000473982;OID=.;OPOS=54972992;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:35:5:0:0:35:5:0:0
chr12	54973623	.	T	C	629.42	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0023662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.476;QD=61.4068;RBI=0.00237529;REFB=0;REVB=0.00020758;RO=0;SAF=26;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00016515;OID=.;OPOS=54973623;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:41:0:0:40:41:1:14:26:0:0:14:27:0:0
chr12	54975837	.	T	C	1783.72	PASS	AF=0.967742;AO=120;DP=124;FAO=120;FDP=124;FR=.;FRO=4;FSAF=38;FSAR=82;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0757883;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.7047;QD=57.5392;RBI=0.0873284;REFB=-0.097864;REVB=-0.0433864;RO=4;SAF=38;SAR=82;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0474102;STB=0.524996;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.00325615;OID=.;OPOS=54975837;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:124:124:4:4:120:120:0.967742:82:38:4:0:82:38:4:0
chr12	55248357	.	G	T	126.6	PASS	AF=0.246753;AO=19;DP=75;FAO=19;FDP=77;FR=.;FRO=58;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=27;FSRR=31;FWDB=-0.0389065;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.106;QD=6.57673;RBI=0.0389587;REFB=0.000803016;REVB=-0.00201604;RO=56;SAF=7;SAR=12;SRF=25;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.098845;STB=0.575378;STBP=0.465;TYPE=snp;VARB=-0.00338904;OID=.;OPOS=55248357;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:77:56:58:19:19:0.246753:12:7:25:31:12:7:27:31
chr12	55250612	.	A	G	936.34	PASS	AF=0.970149;AO=65;DP=68;FAO=65;FDP=67;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0192562;FXX=0.0289813;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.551;QD=55.9007;RBI=0.0192734;REFB=-0.10296;REVB=0.000814246;RO=2;SAF=27;SAR=38;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00490527;STB=0.502597;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=0.00519757;OID=.;OPOS=55250612;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:68:67:2:2:65:65:0.970149:38:27:1:1:38:27:1:1
chr12	55344024	.	G	A	906.77	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0124418;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.0045;QD=58.501;RBI=0.099662;REFB=0;REVB=0.0988823;RO=0;SAF=35;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000892941;OID=.;OPOS=55344024;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:62:0:0:61:62:1:26:35:0:0:26:36:0:0
chr12	55344133	.	C	G	1722.88	PASS	AF=0.982906;AO=115;DP=118;FAO=115;FDP=117;FR=.;FRO=2;FSAF=51;FSAR=64;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00255941;FXX=0.00847386;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.225;QD=58.9017;RBI=0.00381969;REFB=0.00578011;REVB=0.0028354;RO=1;SAF=51;SAR=64;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00922029;STB=0.509614;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=-0.000185521;OID=.;OPOS=55344133;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:118:117:1:2:115:115:0.982906:64:51:1:0:64:51:2:0
chr12	55355033	.	C	T	1641.27	PASS	AF=0.990991;AO=110;DP=110;FAO=110;FDP=111;FR=.;FRO=1;FSAF=57;FSAR=53;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00215875;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.6603;QD=59.145;RBI=0.011986;REFB=0.00385216;REVB=-0.01179;RO=0;SAF=57;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504347;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=-0.000106227;OID=.;OPOS=55355033;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:110:111:0:1:110:110:0.990991:53:57:0:0:53:57:1:0
chr12	55368245	.	G	A	2220.0	PASS	AF=0.992958;AO=141;DP=142;FAO=141;FDP=142;FR=.;FRO=1;FSAF=64;FSAR=77;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00509196;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.616;QD=62.5352;RBI=0.0100904;REFB=-0.0728016;REVB=0.00871139;RO=0;SAF=64;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.503875;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=6.55182e-05;OID=.;OPOS=55368245;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:142:142:0:1:141:141:0.992958:77:64:0:0:77:64:1:0
chr12	55422604	.	CAG	C	236.21	PASS	AF=0.341176;AO=28;DP=82;FAO=29;FDP=85;FR=.;FRO=56;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=27;FSRR=29;FWDB=-0.0208224;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=241.295;QD=11.1156;RBI=0.020997;REFB=-0.0110014;REVB=0.00270187;RO=54;SAF=15;SAR=13;SRF=27;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0405448;STB=0.545866;STBP=0.57;TYPE=del;VARB=0.0216007;OID=.;OPOS=55422605;OREF=AG;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.341176:28:82:29:85:56:16:13:27:29:99:54:15:13:27:27
chr12	55688267	.	G	A	651.21	PASS	AF=1;AO=41;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.013614;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.535;QD=62.02;RBI=0.0289716;REFB=0;REVB=0.0255737;RO=0;SAF=22;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.28037e-05;OID=.;OPOS=55688267;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:41:42:1:19:22:0:0:20:22:0:0
chr12	55714772	.	G	A	358.12	PASS	AF=1;AO=25;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0284225;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.616;QD=55.0952;RBI=0.0300808;REFB=0;REVB=0.00984963;RO=0;SAF=8;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000251487;OID=.;OPOS=55714772;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:25:26:1:17:8:0:0:17:9:0:0
chr12	55714876	.	C	G	519.96	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0105448;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.9949;QD=59.4242;RBI=0.038937;REFB=0;REVB=-0.037482;RO=0;SAF=21;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.27896e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000773659;OID=.;OPOS=55714876;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:14:21:0:0:14:21:0:0
chr12	55715119	.	G	A	411.12	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0434459;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.204;QD=56.7065;RBI=0.0692831;REFB=0;REVB=0.0539686;RO=0;SAF=14;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000670249;OID=.;OPOS=55715119;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:15:14:0:0:15:14:0:0
chr12	55759753	.	A	G	286.1	PASS	AF=0.535714;AO=30;DP=56;FAO=30;FDP=56;FR=.;FRO=26;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=0.0212434;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.771;QD=20.4356;RBI=0.0214474;REFB=-0.0103342;REVB=-0.00295107;RO=26;SAF=16;SAR=14;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0919229;STB=0.551035;STBP=0.437;TYPE=snp;VARB=0.00865791;OID=.;OPOS=55759753;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:26:26:30:30:0.535714:14:16:11:15:14:16:11:15
chr12	55794976	.	A	G	775.09	PASS	AF=0.982456;AO=55;DP=57;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00783136;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=235.403;QD=54.3924;RBI=0.00815751;REFB=0.111182;REVB=0.0022836;RO=2;SAF=33;SAR=22;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0409364;STB=0.510634;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=-0.000252007;OID=.;OPOS=55794976;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:57:57:2:1:55:56:0.982456:22:33:0:2:23:33:0:1
chr12	55806238	.	A	G	779.34	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.01168;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.899;QD=56.6791;RBI=0.0193041;REFB=0;REVB=0.0153696;RO=0;SAF=29;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000603104;OID=.;OPOS=55806238;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:55:0:0:54:55:1:25:29:0:0:26:29:0:0
chr12	55808469	.	C	G	1000.68	PASS	AF=0.985714;AO=68;DP=69;FAO=69;FDP=70;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.013112;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.4186;QD=57.1816;RBI=0.0411176;REFB=-0.059186;REVB=-0.0389709;RO=0;SAF=36;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.49594e-08;STB=0.506847;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.00084218;OID=.;OPOS=55808469;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:69:70:0:1:68:69:0.985714:32:36:0:0:33:36:1:0
chr12	55820121	.	C	T	862.21	PASS	AF=0.983871;AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0251315;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.0349;QD=55.6262;RBI=0.0498873;REFB=-0.0108663;REVB=-0.0430947;RO=1;SAF=30;SAR=31;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.014984;STB=0.507934;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.00245738;OID=.;OPOS=55820121;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:62:62:1:1:61:61:0.983871:31:30:0:1:31:30:0:1
chr12	55863224	.	C	G	854.08	PASS	AF=0.983607;AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.054571;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.5282;QD=56.0055;RBI=0.0636542;REFB=-0.0996255;REVB=-0.0327699;RO=0;SAF=26;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509431;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=0.00105577;OID=.;OPOS=55863224;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:61:61:0:1:60:60:0.983607:34:26:0:0:34:26:1:0
chr12	55863381	.	A	G	145.2	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0199316;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.4534;QD=44.6783;RBI=0.0607202;REFB=0;REVB=-0.0573556;RO=0;SAF=7;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00197531;OID=.;OPOS=55863381;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:6:7:0:0:6:7:0:0
chr12	55886294	.	G	A	447.0	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00804486;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.6;QD=57.6774;RBI=0.0388766;REFB=0;REVB=-0.0380351;RO=0;SAF=21;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000226407;OID=.;OPOS=55886294;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:10:21:0:0:10:21:0:0
chr12	55886489	.	T	A	495.49	PASS	AF=0.9;AO=35;DP=39;FAO=36;FDP=40;FR=.;FRO=4;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0755236;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=43.1153;QD=49.5491;RBI=0.14487;REFB=-0.0845039;REVB=0.123626;RO=4;SAF=23;SAR=12;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0198348;STB=0.509429;STBP=0.835;TYPE=snp;VARB=0.0120609;OID=.;OPOS=55886489;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:16:39:40:4:4:35:36:0.9:12:23:3:1:12:24:3:1
chr12	55945119	.	A	G	800.01	PASS	AF=1;AO=48;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=35;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0263301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.933;QD=56.1414;RBI=0.0306117;REFB=0;REVB=0.0156141;RO=0;SAF=26;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000137223;OID=.;OPOS=55945119;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:57:57:0:0:48:57:1:22:26:0:0:22:35:0:0
chr12	56082724	.	C	T	121.78	PASS	AF=0.4375;AO=14;DP=32;FAO=14;FDP=32;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=0.0671761;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.3644;QD=15.2222;RBI=0.0671838;REFB=-0.00333649;REVB=-0.00101627;RO=18;SAF=11;SAR=3;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.212814;STB=0.624804;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=0.00315191;OID=.;OPOS=56082724;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:18:18:14:14:0.4375:3:11:11:7:3:11:11:7
chr12	56089357	.	C	G,T	1357.45	PASS	AF=0.0561798,0.94382;AO=4,84;DP=89;FAO=5,84;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=3,31;FSAR=2,53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000430974,0.0735238;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=153.756,102.165;QD=61.0091;RBI=0.00641394,0.0745133;REFB=0,0;REVB=-0.00639944,-0.012103;RO=0;SAF=2,31;SAR=2,53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-3.17151e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.203315,-0.00221188;OID=.,.;OPOS=56089357,56089357;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:14:89:89:0:0:4,84:5,84:0.0561798,0.94382:2,53:2,31:0:0:2,53:3,31:0:0
chr12	56151291	.	T	C	69.64	PASS	AF=0.529412;AO=9;DP=17;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0111691;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=324.14;QD=16.3859;RBI=0.0112086;REFB=0.0163427;REVB=-0.000940181;RO=8;SAF=6;SAR=3;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14199;STB=0.583142;STBP=0.564;TYPE=snp;VARB=-0.012217;OID=.;OPOS=56151291;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:17:17:8:8:9:9:0.529412:3:6:4:4:3:6:4:4
chr12	56236531	.	A	G	1658.81	PASS	AF=1;AO=106;DP=106;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0306986;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.832;QD=60.3202;RBI=0.069538;REFB=0;REVB=0.062395;RO=0;SAF=76;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.59566e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000184222;OID=.;OPOS=56236531;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:106:110:0:0:106:110:1:30:76:0:0:32:78:0:0
chr12	56295734	.	A	G	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0101941;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.821;QD=37.4885;RBI=0.0420625;REFB=0;REVB=0.0408085;RO=0;SAF=5;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000392472;OID=.;OPOS=56295734;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:3:5:0:0:3:5:0:0
chr12	56330572	.	G	A	276.49	PASS	AF=0.333333;AO=33;DP=99;FAO=33;FDP=99;FR=.;FRO=66;FSAF=5;FSAR=28;FSRF=23;FSRR=43;FWDB=0.00171095;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.867;QD=11.1712;RBI=0.0144725;REFB=-0.00954909;REVB=0.014371;RO=65;SAF=5;SAR=28;SRF=23;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.322763;STB=0.68819;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.0224147;OID=.;OPOS=56330572;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:65:66:33:33:0.333333:28:5:23:42:28:5:23:43
chr12	56335107	.	A	G	263.72	PASS	AF=0.6;AO=24;DP=40;FAO=24;FDP=40;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.00385948;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=194.896;QD=26.3721;RBI=0.00579156;REFB=-0.0224706;REVB=0.00431817;RO=16;SAF=9;SAR=15;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0474226;STB=0.526294;STBP=0.677;TYPE=snp;VARB=0.0102998;OID=.;OPOS=56335107;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:16:16:24:24:0.6:15:9:7:9:15:9:7:9
chr12	56348028	.	G	A	328.0	PASS	AF=0.651163;AO=28;DP=43;FAO=28;FDP=43;FR=.;FRO=15;FSAF=20;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.00199712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.652;QD=30.5112;RBI=0.0145417;REFB=0.00211154;REVB=0.0144039;RO=15;SAF=20;SAR=8;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.175912;STB=0.596942;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=-0.00095162;OID=.;OPOS=56348028;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:15:15:28:28:0.651163:8:20:7:8:8:20:7:8
chr12	56351277	.	G	A	317.71	PASS	AF=0.465753;AO=33;DP=73;FAO=34;FDP=73;FR=.;FRO=39;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=-0.00372309;FXX=0.0266631;HRUN=1;LEN=1;MLLD=302.615;QD=17.4087;RBI=0.0047778;REFB=-0.029011;REVB=-0.00299432;RO=39;SAF=13;SAR=20;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140868;STB=0.568141;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=0.0280575;OID=.;OPOS=56351277;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:39:39:33:34:0.465753:20:13:21:18:20:14:21:18
chr12	56351346	.	G	A	215.41	PASS	AF=0.511628;AO=21;DP=43;FAO=22;FDP=43;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=-0.00284895;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=196.663;QD=20.0385;RBI=0.00887378;REFB=-0.00433823;REVB=0.00840401;RO=22;SAF=12;SAR=9;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0652453;STB=0.556693;STBP=0.458;TYPE=snp;VARB=0.00564111;OID=.;OPOS=56351346;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:22:21:21:22:0.511628:9:12:11:11:9:13:10:11
chr12	56365381	.	C	G	69.6	PASS	AF=0.529412;AO=9;DP=17;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0244494;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.238;QD=16.3765;RBI=0.0304166;REFB=0.00861696;REVB=-0.0180942;RO=8;SAF=4;SAR=5;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0450094;STB=0.526257;STBP=0.931;TYPE=snp;VARB=-0.0162817;OID=.;OPOS=56365381;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:17:17:8:8:9:9:0.529412:5:4:4:4:5:4:4:4
chr12	56388479	.	A	G	36.8	PASS	AF=0.0746888;AO=24;DP=255;FAO=18;FDP=241;FR=.,HEALED;FRO=223;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=91;FSRR=132;FWDB=-0.102359;FXX=0.0548998;HRUN=7;LEN=1;MLLD=30.8668;QD=0.610862;RBI=0.135639;REFB=-0.0201704;REVB=-0.0889976;RO=173;SAF=11;SAR=13;SRF=67;SRR=106;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0909375;STB=0.534299;STBP=0.763;TYPE=snp;VARB=0.194479;OID=.;OPOS=56388479;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:255:241:173:223:24:18:0.0746888:13:11:67:106:10:8:91:132
chr12	56398454	.	G	C	738.99	PASS	AF=0.981481;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0367719;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.4419;QD=54.7399;RBI=0.0390652;REFB=0.0401262;REVB=0.0131876;RO=1;SAF=24;SAR=29;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0159704;STB=0.508471;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=-0.00686673;OID=.;OPOS=56398454;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:54:54:1:1:53:53:0.981481:29:24:0:1:29:24:0:1
chr12	56420725	.	TG	T	152.77	PASS	AF=0.814815;AO=8;DP=28;FAO=22;FDP=27;FR=.;FRO=5;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0100654;FXX=0.0357015;HRUN=5;LEN=1;MLLD=12.0325;QD=22.6332;RBI=0.218963;REFB=-0.128052;REVB=0.218732;RO=3;SAF=4;SAR=4;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.239249;STB=0.595578;STBP=0.055;TYPE=del;VARB=0.0585109;OID=.;OPOS=56420726;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.814815:8:28:22:27:5:7:15:4:1:12:3:4:4:3:0
chr12	56435929	.	C	G	302.39	PASS	AF=1;AO=23;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.109355;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.9961;QD=50.3976;RBI=0.110881;REFB=-0.075625;REVB=0.0183325;RO=1;SAF=11;SAR=12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0402265;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0121426;OID=.;OPOS=56435929;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:24:24:1:0:23:24:1:12:11:1:0:12:12:0:0
chr12	56551339	.	CA	CAAAA,CAAA,C	41.17	PASS	AF=0.178571,0.107143,0;AO=5,3,3;DP=29;FAO=5,3,0;FDP=28;FR=.;FRO=20;FSAF=1,1,0;FSAR=4,2,0;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=-0.0671653,-0.101951,0.178797;FXX=0.0666445;HRUN=6,6,6;LEN=3,2,1;MLLD=23.5449,18.1086,8.60807;QD=5.88191;RBI=0.0968334,0.145703,0.264055;REFB=0.0241446,0.0336745,-0.058634;REVB=0.0697533,0.104093,-0.19431;RO=12;SAF=1,1,1;SAR=4,2,2;SRF=5;SRR=7;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0.448276;SSSB=-0.27779,-0.0961013,-0.0961013;STB=0.691457,0.562074,0.5;STBP=0.432,0.906,1;TYPE=ins,ins,del;VARB=-0.00316453,0.00393256,0.0791058;OID=.,.,.;OPOS=56551340,56551340,56551340;OREF=-,-,A;OALT=AAA,AA,-;OMAPALT=CAAAA,CAAA,C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.178571,0.107143,0:5,3,3:29:5,3,0:28:20:1,1,0:4,2,0:8:12:18:12:1,1,1:4,2,2:5:7
chr12	56647911	.	G	C	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.067252;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.1404;QD=55.656;RBI=0.0677578;REFB=0;REVB=0.00826434;RO=0;SAF=16;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00118406;OID=.;OPOS=56647911;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:11:16:0:0:11:16:0:0
chr12	56649601	.	A	G	1712.96	PASS	AF=1;AO=111;DP=111;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0458141;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.29;QD=60.6358;RBI=0.0608829;REFB=0;REVB=0.0400974;RO=0;SAF=66;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.53129e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.58183e-05;OID=.;OPOS=56649601;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:111:113:0:0:111:113:1:45:66:0:0:46:67:0:0
chr12	56663299	.	GCC	GC,G,TAG	519.71	PASS	AF=0.666667,0.176471,0.156863;AO=9,9,6;DP=51;FAO=34,9,8;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=32,1,0;FSAR=2,8,8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.542967,0.279072,0.140329;FXX=0;HRUN=3,3,1;LEN=1,2,3;MLLD=12.7303,16.765,115.909;QD=40.7616;RBI=0.554047,0.285135,0.14383;REFB=0,0,0;REVB=0.110251,0.0584877,0.0315416;RO=23;SAF=9,1,0;SAR=0,8,6;SRF=22;SRR=1;SSEN=0.551402,0.551402,0;SSEP=0.483906,0.483906,0;SSSB=0.674955,-0.788514,-0.855696;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,del,mnp;VARB=0.00212423,0.0149556,0.12153;OID=.,.,.;OPOS=56663300,56663300,56663299;OREF=C,CC,GCC;OALT=-,-,TAG;OMAPALT=GC,G,TAG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/3:48:51:51:23:0:9,9,6:34,9,8:0.666667,0.176471,0.156863:0,8,6:9,1,0:22:1:2,8,8:32,1,0:0:0
chr12	56722060	.	T	G	729.0	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0477669;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.9494;QD=57.1761;RBI=0.0634119;REFB=0;REVB=0.041706;RO=0;SAF=20;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.13361e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000658595;OID=.;OPOS=56722060;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:31:20:0:0:31:20:0:0
chr12	56815922	.	C	T	740.44	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000778582;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=177.791;QD=56.9567;RBI=0.00546469;REFB=0;REVB=0.00540895;RO=0;SAF=31;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.93989e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.34324e-05;OID=.;OPOS=56815922;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:21:31:0:0:21:31:0:0
chr12	56822378	.	T	A	323.46	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00998505;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.638;QD=53.9099;RBI=0.0753475;REFB=0;REVB=0.074683;RO=0;SAF=11;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00128491;OID=.;OPOS=56822378;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:13:11:0:0:13:11:0:0
chr12	56825311	.	C	T	375.63	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00181213;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.604;QD=55.6484;RBI=0.0189236;REFB=0;REVB=-0.0188367;RO=0;SAF=12;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000116561;OID=.;OPOS=56825311;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:15:12:0:0:15:12:0:0
chr12	56862886	.	T	C	674.54	PASS	AF=1;AO=42;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00617537;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.171;QD=62.748;RBI=0.00893829;REFB=0;REVB=0.00646202;RO=0;SAF=21;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.19107e-05;OID=.;OPOS=56862886;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:42:43:1:21:21:0:0:21:22:0:0
chr12	56956213	.	T	C	582.45	PASS	AF=0.975;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0143908;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.5035;QD=58.245;RBI=0.0187093;REFB=-0.0884245;REVB=0.0119559;RO=1;SAF=16;SAR=23;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.028395;STB=0.515144;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=-0.000619129;OID=.;OPOS=56956213;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:40:40:1:1:39:39:0.975:23:16:1:0:23:16:1:0
chr12	56989729	.	GTT	G,GT	144.76	PASS	AF=0.115385,0.884615;AO=6,17;DP=26;FAO=3,23;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=0,3;FSAR=3,20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0222414,-0.0358952;FXX=0;HRUN=8,8;LEN=2,1;MLLD=8.60199,7.28757;QD=22.2706;RBI=0.0311211,0.0522568;REFB=0,0;REVB=0.0217679,0.0379777;RO=3;SAF=0,3;SAR=6,14;SRF=0;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0.0886692;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=0.0496448,-0.0265915;OID=.,.;OPOS=56989730,56989730;OREF=TT,T;OALT=-,-;OMAPALT=G,GT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.115385,0.884615:6,17:26:3,23:26:0:0,3:3,20:0:0:7:3:0,3:6,14:0:3
chr12	57106660	.	A	T	56.28	PASS	AF=0.4;AO=8;DP=20;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.00497949;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.857;QD=11.2569;RBI=0.0277305;REFB=0.00162473;REVB=-0.0272797;RO=12;SAF=4;SAR=4;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0128265;OID=.;OPOS=57106660;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:20:20:12:12:8:8:0.4:4:4:6:6:4:4:6:6
chr12	57108203	.	A	G	272.31	PASS	AF=0.47619;AO=30;DP=63;FAO=30;FDP=63;FR=.;FRO=33;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=0.0245792;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.403;QD=17.2892;RBI=0.0345572;REFB=-0.0235836;REVB=0.0242912;RO=33;SAF=17;SAR=13;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0768321;STB=0.543102;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.0132081;OID=.;OPOS=57108203;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:33:33:30:30:0.47619:13:17:16:17:13:17:16:17
chr12	57109792	.	A	G	61.86	PASS	AF=0.375;AO=8;DP=24;FAO=9;FDP=24;FR=.;FRO=15;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=0.0490312;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.422;QD=10.3096;RBI=0.0559654;REFB=-0.0278411;REVB=-0.0269828;RO=15;SAF=2;SAR=6;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.379089;STB=0.666296;STBP=0.227;TYPE=snp;VARB=0.0348258;OID=.;OPOS=57109792;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:24:24:15:15:8:9:0.375:6:2:9:6:6:3:9:6
chr12	57114100	.	A	G	68.72	PASS	AF=0.5;AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.,HEALED;FRO=9;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=8;FWDB=0.045984;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=188.984;QD=15.2714;RBI=0.0702299;REFB=-0.0326555;REVB=-0.0530822;RO=7;SAF=3;SAR=6;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174375;STB=0.636106;STBP=0.407;TYPE=snp;VARB=0.0370486;OID=.;OPOS=57114100;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:18:18:7:9:9:9:0.5:6:3:1:6:6:3:1:8
chr12	57114307	.	A	T	53.63	PASS	AF=0.296296;AO=8;DP=27;FAO=8;FDP=27;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.0456883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.8851;QD=7.94469;RBI=0.0463639;REFB=-0.00246593;REVB=0.00788593;RO=19;SAF=4;SAR=4;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0296329;STB=0.518472;STBP=0.929;TYPE=snp;VARB=0.0178326;OID=.;OPOS=57114307;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:27:27:19:19:8:8:0.296296:4:4:10:9:4:4:10:9
chr12	57133140	.	T	G	242.26	PASS	AF=0.666667;AO=22;DP=33;FAO=22;FDP=33;FR=.;FRO=11;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=-0.0145199;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.7866;QD=29.3648;RBI=0.0145217;REFB=-0.0181922;REVB=-0.000226974;RO=11;SAF=10;SAR=12;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0550494;STB=0.530359;STBP=0.642;TYPE=snp;VARB=0.0096265;OID=.;OPOS=57133140;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:33:33:11:11:22:22:0.666667:12:10:6:5:12:10:6:5
chr12	57137828	.	T	A	103.45	PASS	AF=0.309524;AO=13;DP=42;FAO=13;FDP=42;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=-0.00050247;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.924;QD=9.85267;RBI=0.00101381;REFB=-0.000662332;REVB=0.000880531;RO=29;SAF=7;SAR=6;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0552878;STB=0.533283;STBP=0.797;TYPE=snp;VARB=0.000547225;OID=.;OPOS=57137828;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:29:29:13:13:0.309524:6:7:17:12:6:7:17:12
chr12	57324080	.	G	A	71.96	PASS	AF=0.173333;AO=13;DP=75;FAO=13;FDP=75;FR=.;FRO=62;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=33;FSRR=29;FWDB=-0.0134026;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.2905;QD=3.83761;RBI=0.0213238;REFB=0.00666686;REVB=0.0165854;RO=62;SAF=6;SAR=7;SRF=33;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0881197;STB=0.558193;STBP=0.69;TYPE=snp;VARB=-0.0470007;OID=.;OPOS=57324080;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:71:75:75:62:62:13:13:0.173333:7:6:33:29:7:6:33:29
chr12	57430827	.	T	TC	44.84	PASS	AF=0.195652;AO=7;DP=48;FAO=9;FDP=46;FR=.;FRO=37;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=29;FSRR=8;FWDB=0.0132566;FXX=0.0212721;HRUN=0;LEN=1;MLLD=29.0896;QD=3.8992;RBI=0.0597294;REFB=0.01292;REVB=-0.0582397;RO=37;SAF=1;SAR=6;SRF=28;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.651002;STB=0.936787;STBP=0.03;TYPE=ins;VARB=-0.0918024;OID=.;OPOS=57430828;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.195652:7:48:9:46:37:1:8:29:8:44:37:1:6:28:9
chr12	57489648	.	C	T	920.06	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0312161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.9134;QD=58.4163;RBI=0.0492538;REFB=0;REVB=-0.0380985;RO=0;SAF=28;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.1559e-05;OID=.;OPOS=57489648;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:35:28:0:0:35:28:0:0
chr12	57567762	.	C	T	289.35	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00866159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.657;QD=52.6088;RBI=0.0313908;REFB=0;REVB=0.0301722;RO=0;SAF=10;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000254113;OID=.;OPOS=57567762;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:12:10:0:0:12:10:0:0
chr12	57588433	.	G	A	846.13	PASS	AF=0.491429;AO=86;DP=175;FAO=86;FDP=175;FR=.;FRO=89;FSAF=29;FSAR=57;FSRF=44;FSRR=45;FWDB=-0.0106391;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.973;QD=19.3401;RBI=0.0107507;REFB=-0.0162005;REVB=0.00154474;RO=89;SAF=29;SAR=57;SRF=44;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152946;STB=0.584472;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.0237983;OID=.;OPOS=57588433;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:175:175:89:89:86:86:0.491429:57:29:44:45:57:29:44:45
chr12	57589659	.	C	T	597.84	PASS	AF=1;AO=39;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.031109;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.935;QD=59.7841;RBI=0.0712961;REFB=0;REVB=0.0641511;RO=1;SAF=18;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0218009;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000624365;OID=.;OPOS=57589659;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:1:0:39:40:1:21:18:0:1:22:18:0:0
chr12	57589784	.	A	C	503.7	PASS	AF=0.972973;AO=34;DP=35;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0670797;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.8479;QD=54.4543;RBI=0.0804695;REFB=-0.0902347;REVB=-0.0444484;RO=1;SAF=13;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0346006;STB=0.51612;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=0.0107523;OID=.;OPOS=57589784;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:35:37:1:1:34:36:0.972973:21:13:1:0:21:15:1:0
chr12	57590797	.	C	T	1899.12	PASS	AF=1;AO=122;DP=124;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0154541;FXX=0.0159987;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.855;QD=61.7601;RBI=0.0333264;REFB=0;REVB=0.0295265;RO=0;SAF=48;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.91599e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.639e-05;OID=.;OPOS=57590797;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:124:123:0:0:122:123:1:74:48:0:0:74:49:0:0
chr12	57590869	.	T	C	2312.65	PASS	AF=1;AO=145;DP=145;FAO=145;FDP=145;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0150668;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=324.689;QD=63.7972;RBI=0.0161097;REFB=0;REVB=-0.00570214;RO=0;SAF=57;SAR=88;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.86418e-06;OID=.;OPOS=57590869;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:145:145:0:0:145:145:1:88:57:0:0:88:57:0:0
chr12	57619362	.	G	A	955.18	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0151499;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.192;QD=58.7801;RBI=0.0164857;REFB=0;REVB=0.00650087;RO=0;SAF=35;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.01622e-05;OID=.;OPOS=57619362;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:30:35:0:0:30:35:0:0
chr12	57620254	.	G	A	488.87	PASS	AF=0.52809;AO=47;DP=89;FAO=47;FDP=89;FR=.;FRO=42;FSAF=31;FSAR=16;FSRF=24;FSRR=18;FWDB=0.0537465;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.8016;QD=21.9714;RBI=0.0692196;REFB=-0.00761726;REVB=0.0436197;RO=42;SAF=31;SAR=16;SRF=24;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0813831;STB=0.544965;STBP=0.392;TYPE=snp;VARB=0.00776704;OID=.;OPOS=57620254;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:42:42:47:47:0.52809:16:31:24:18:16:31:24:18
chr12	57627074	.	G	T	165.23	PASS	AF=0.391304;AO=18;DP=46;FAO=18;FDP=46;FR=.;FRO=28;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=0.07353;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.303;QD=14.3674;RBI=0.07353;REFB=-0.0254304;REVB=-1.06058e-06;RO=28;SAF=4;SAR=14;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.219194;STB=0.628587;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=0.0296366;OID=.;OPOS=57627074;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:28:28:18:18:0.391304:14:4:11:17:14:4:11:17
chr12	57649840	.	C	T	270.04	PASS	AF=0.531915;AO=25;DP=47;FAO=25;FDP=47;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=0.0117176;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=293.221;QD=22.9824;RBI=0.0117294;REFB=-0.0101058;REVB=-0.000524997;RO=22;SAF=10;SAR=15;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123338;STB=0.56891;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=0.0111779;OID=.;OPOS=57649840;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:22:22:25:25:0.531915:15:10:12:10:15:10:12:10
chr12	57873498	.	T	G	336.74	PASS	AF=0.38835;AO=40;DP=99;FAO=40;FDP=103;FR=.;FRO=63;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=25;FSRR=38;FWDB=0.0211806;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=50.6472;QD=13.0774;RBI=0.0896428;REFB=0.00447107;REVB=-0.0871046;RO=59;SAF=23;SAR=17;SRF=25;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158548;STB=0.607828;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=-0.00984702;OID=.;OPOS=57873498;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:103:59:63:40:40:0.38835:17:23:25:34:17:23:25:38
chr12	57911160	.	G	A	204.72	PASS	AF=0.428571;AO=21;DP=49;FAO=21;FDP=49;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=-0.0187794;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.9708;QD=16.712;RBI=0.0189775;REFB=0.0230083;REVB=-0.00273475;RO=28;SAF=12;SAR=9;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.073897;STB=0.542129;STBP=0.627;TYPE=snp;VARB=-0.0270085;OID=.;OPOS=57911160;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:28:28:21:21:0.428571:9:12:18:10:9:12:18:10
chr12	57958313	.	A	G	903.21	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0307306;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.728;QD=58.2715;RBI=0.0393194;REFB=0;REVB=0.0245285;RO=0;SAF=25;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.13724e-05;OID=.;OPOS=57958313;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:62:0:0:61:62:1:36:25:0:0:37:25:0:0
chr12	57985204	.	C	T	1453.47	PASS	AF=1;AO=92;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0172393;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=225.561;QD=63.1944;RBI=0.0209715;REFB=0;REVB=0.0119419;RO=0;SAF=45;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.9386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.13428e-05;OID=.;OPOS=57985204;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:92:92:0:0:92:92:1:47:45:0:0:47:45:0:0
chr12	57994743	.	T	G	1587.17	PASS	AF=1;AO=106;DP=106;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0341894;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.971;QD=59.8934;RBI=0.0604428;REFB=0;REVB=-0.0498439;RO=0;SAF=56;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000507132;OID=.;OPOS=57994743;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:106:106:0:0:106:106:1:50:56:0:0:50:56:0:0
chr12	57995089	.	T	C	538.56	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00558177;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=290.374;QD=59.8394;RBI=0.0455285;REFB=0;REVB=0.0451851;RO=0;SAF=15;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000105533;OID=.;OPOS=57995089;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:21:15:0:0:21:15:0:0
chr12	58002599	.	C	T	553.01	PASS	AF=0.95122;AO=37;DP=40;FAO=39;FDP=41;FR=.;FRO=2;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0268371;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.1049;QD=53.9523;RBI=0.0655909;REFB=-0.194943;REVB=0.0598492;RO=0;SAF=17;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.71161e-08;STB=0.521728;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=0.00833233;OID=.;OPOS=58002599;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:40:41:0:2:37:39:0.95122:20:17:0:0:22:17:0:2
chr12	58010163	.	A	G	955.2	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0193664;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.751;QD=58.7817;RBI=0.0196511;REFB=0;REVB=0.00333261;RO=0;SAF=29;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.35458e-05;OID=.;OPOS=58010163;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:36:29:0:0:36:29:0:0
chr12	58017701	.	T	G	617.03	PASS	AF=1;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0262817;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.817;QD=61.7033;RBI=0.0263594;REFB=0;REVB=-0.00202262;RO=0;SAF=22;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.19993e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.08464e-05;OID=.;OPOS=58017701;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:40:0:0:40:40:1:18:22:0:0:18:22:0:0
chr12	58019472	.	T	G	411.11	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.037167;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.7572;QD=56.7051;RBI=0.119688;REFB=0;REVB=-0.113771;RO=0;SAF=9;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00307727;OID=.;OPOS=58019472;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:20:9:0:0:20:9:0:0
chr12	58022674	.	A	T	54.75	PASS	AF=0.118812;AO=12;DP=101;FAO=12;FDP=101;FR=.;FRO=89;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=47;FSRR=42;FWDB=-0.00627374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.789;QD=2.16826;RBI=0.00887247;REFB=-0.00455443;REVB=-0.00627383;RO=88;SAF=2;SAR=10;SRF=46;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.44161;STB=0.824364;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.0325756;OID=.;OPOS=58022674;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:101:101:88:89:12:12:0.118812:10:2:46:42:10:2:47:42
chr12	58119044	.	TG	T	86.26	PASS	AF=0.560976;AO=20;DP=40;FAO=23;FDP=41;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=0.0685333;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=10.2211;QD=8.41531;RBI=0.0987602;REFB=-0.071897;REVB=0.0711109;RO=16;SAF=6;SAR=14;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.221985;STB=0.644416;STBP=0.059;TYPE=del;VARB=0.0723942;OID=.;OPOS=58119045;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.560976:20:40:23:41:18:6:17:10:8:73:16:6:14:9:7
chr12	58163704	.	G	A	217.3	PASS	AF=0.346154;AO=27;DP=79;FAO=27;FDP=78;FR=.;FRO=51;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=34;FSRR=17;FWDB=-0.00488643;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.381;QD=11.1435;RBI=0.00853407;REFB=-0.00180551;REVB=0.00699665;RO=52;SAF=17;SAR=10;SRF=35;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0537278;STB=0.526297;STBP=0.758;TYPE=snp;VARB=0.0032341;OID=.;OPOS=58163704;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:78:52:51:27:27:0.346154:10:17:35:17:10:17:34:17
chr12	58174306	.	T	C,G	865.1	PASS	AF=0.918033,0.0819672;AO=53,6;DP=60;FAO=56,5;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=25,5;FSAR=31,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0086442,-0.0022747;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=132.971,164.138;QD=56.7277;RBI=0.0116215,0.0124488;REFB=0,0;REVB=-0.00776769,-0.0122392;RO=0;SAF=23,6;SAR=30,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.72004e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.0191936,0.0720044;OID=.,.;OPOS=58174306,58174306;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:17:60:61:0:0:53,6:56,5:0.918033,0.0819672:30,0:23,6:0:0:31,0:25,5:0:0
chr12	58176614	.	T	C	566.43	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0569437;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.6122;QD=59.6243;RBI=0.0745489;REFB=0;REVB=-0.048114;RO=0;SAF=17;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.53998e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00178614;OID=.;OPOS=58176614;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:21:17:0:0:21:17:0:0
chr12	58177437	.	C	T	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.063894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.32;QD=42.1826;RBI=0.0667436;REFB=0;REVB=-0.0192943;RO=0;SAF=6;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000898617;OID=.;OPOS=58177437;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:5:6:0:0:5:6:0:0
chr12	58203377	.	T	A	233.4	PASS	AF=0.383562;AO=28;DP=73;FAO=28;FDP=73;FR=.;FRO=45;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=30;FSRR=15;FWDB=-0.022687;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.133;QD=12.789;RBI=0.0239764;REFB=-0.00439119;REVB=0.00775677;RO=45;SAF=17;SAR=11;SRF=30;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0683627;STB=0.539076;STBP=0.65;TYPE=snp;VARB=0.00811993;OID=.;OPOS=58203377;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:45:45:28:28:0.383562:11:17:30:15:11:17:30:15
chr12	58204283	.	T	C	1106.83	PASS	AF=0.986667;AO=74;DP=76;FAO=74;FDP=75;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0717082;FXX=0.0131562;HRUN=4;LEN=1;MLLD=114.982;QD=59.0307;RBI=0.0719798;REFB=-0.136036;REVB=0.00624676;RO=0;SAF=32;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505881;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=0.000562151;OID=.;OPOS=58204283;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:76:75:0:1:74:74:0.986667:42:32:0:0:42:32:0:1
chr12	58220809	.	G	C	62.58	PASS	AF=0.181818;AO=10;DP=55;FAO=10;FDP=55;FR=.;FRO=45;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=24;FSRR=21;FWDB=-0.0429452;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.752;QD=4.55113;RBI=0.0429471;REFB=-0.00284472;REVB=-0.000405227;RO=45;SAF=5;SAR=5;SRF=24;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0410418;STB=0.527218;STBP=0.896;TYPE=snp;VARB=0.0198116;OID=.;OPOS=58220809;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:55:55:45:45:10:10:0.181818:5:5:24:21:5:5:24:21
chr12	58220816	.	A	G	62.58	PASS	AF=0.181818;AO=10;DP=55;FAO=10;FDP=55;FR=.;FRO=45;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=24;FSRR=21;FWDB=-0.00165876;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.267;QD=4.55119;RBI=0.0201574;REFB=0.00540827;REVB=0.020089;RO=45;SAF=5;SAR=5;SRF=24;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0410418;STB=0.527218;STBP=0.896;TYPE=snp;VARB=-0.0145893;OID=.;OPOS=58220816;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:55:55:45:45:10:10:0.181818:5:5:24:21:5:5:24:21
chr12	58220823	.	C	T	62.58	PASS	AF=0.181818;AO=10;DP=55;FAO=10;FDP=55;FR=.;FRO=45;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=24;FSRR=21;FWDB=-0.000175648;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.087;QD=4.55128;RBI=0.0049387;REFB=0.000395941;REVB=-0.00493557;RO=45;SAF=5;SAR=5;SRF=24;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0410418;STB=0.527218;STBP=0.896;TYPE=snp;VARB=-0.00299785;OID=.;OPOS=58220823;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:55:55:45:45:10:10:0.181818:5:5:24:21:5:5:24:21
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chr12	58220844	.	C	T	56.49	PASS	AF=0.173077;AO=9;DP=52;FAO=9;FDP=52;FR=.;FRO=43;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=25;FSRR=18;FWDB=0.0322825;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.2987;QD=4.34513;RBI=0.0406725;REFB=-0.00885725;REVB=0.0247405;RO=43;SAF=4;SAR=5;SRF=25;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166602;STB=0.611573;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.0451728;OID=.;OPOS=58220844;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:52:52:43:43:9:9:0.173077:5:4:25:18:5:4:25:18
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chr12	58350631	.	C	T	1025.28	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0267074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.4313;QD=59.4367;RBI=0.0270977;REFB=0;REVB=-0.00458229;RO=0;SAF=26;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000273764;OID=.;OPOS=58350631;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:43:26:0:0:43:26:0:0
chr12	59266312	.	CT	C	102.22	PASS	AF=0.375;AO=18;DP=48;FAO=18;FDP=48;FR=.;FRO=30;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=0.0478899;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=31.1832;QD=8.51835;RBI=0.0601957;REFB=0.00153539;REVB=-0.0364703;RO=29;SAF=9;SAR=9;SRF=9;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.202815;STB=0.604056;STBP=0.308;TYPE=del;VARB=-0.00273877;OID=.;OPOS=59266313;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.375:18:48:18:48:30:9:9:10:20:99:29:9:9:9:20
chr12	62104219	.	A	C	179.68	PASS	AF=0.413043;AO=19;DP=46;FAO=19;FDP=46;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=0.0594735;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.3491;QD=15.6246;RBI=0.059552;REFB=0.0135068;REVB=0.00305704;RO=27;SAF=13;SAR=6;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102876;STB=0.559429;STBP=0.537;TYPE=snp;VARB=-0.0246383;OID=.;OPOS=62104219;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:27:27:19:19:0.413043:6:13:16:11:6:13:16:11
chr12	62114671	.	T	C	175.13	PASS	AF=0.514286;AO=19;DP=35;FAO=18;FDP=35;FR=.;FRO=17;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=-0.0923762;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.4998;QD=20.0146;RBI=0.123538;REFB=0.0495788;REVB=0.0820258;RO=16;SAF=12;SAR=7;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.209928;STB=0.653674;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=-0.0478323;OID=.;OPOS=62114671;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:16:17:19:18:0.514286:7:12:6:10:6:12:6:11
chr12	62261186	.	C	T	312.03	PASS	AF=0.52381;AO=30;DP=61;FAO=33;FDP=63;FR=.;FRO=30;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=0.00128339;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=308.943;QD=19.8115;RBI=0.00303271;REFB=-0.0106842;REVB=0.00274778;RO=31;SAF=16;SAR=14;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0156743;STB=0.507214;STBP=0.966;TYPE=snp;VARB=0.0106165;OID=.;OPOS=62261186;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:63:31:30:30:33:0.52381:14:16:16:15:16:17:15:15
chr12	62778065	.	A	G	155.5	PASS	AF=0.414634;AO=17;DP=41;FAO=17;FDP=41;FR=.;FRO=24;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.0719347;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.3228;QD=15.1707;RBI=0.0731896;REFB=0.0120636;REVB=-0.0134951;RO=24;SAF=14;SAR=3;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.352808;STB=0.707305;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=-0.0153;OID=.;OPOS=62778065;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:24:24:17:17:0.414634:3:14:13:11:3:14:13:11
chr12	62810962	.	G	A	415.57	PASS	AF=0.381443;AO=22;DP=94;FAO=37;FDP=97;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=53;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=28;FSRR=25;FWDB=0.00450201;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.95;QD=17.1369;RBI=0.0343548;REFB=0.00254926;REVB=0.0340585;RO=41;SAF=10;SAR=12;SRF=26;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198736;STB=0.589694;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.0109223;OID=.;OPOS=62810962;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:97:41:53:22:37:0.381443:12:10:26:15:23:14:28:25
chr12	62938560	.	T	A,TA	186.67	PASS	AF=0,0.423077;AO=2,19;DP=54;FAO=0,22;FDP=52;FR=.;FRO=30;FSAF=0,11;FSAR=0,11;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=0.00934006,0.00181864;FXX=0;HRUN=2,1;LEN=1,1;MLLD=34.7627,27.8683;QD=14.3592;RBI=0.014501,0.0481365;REFB=0.0258774,0.0309339;REVB=0.0110924,0.0481022;RO=33;SAF=1,10;SAR=1,9;SRF=17;SRR=16;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0130622,0.0121719;STB=0.5,0.519213;STBP=1,0.838;TYPE=snp,ins;VARB=0,-0.0359019;OID=.,.;OPOS=62938560,62938561;OREF=T,-;OALT=A,A;OMAPALT=A,TA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:54:52:33:30:2,19:0,22:0,0.423077:1,9:1,10:17:16:0,11:0,11:16:14
chr12	62959137	.	A	G	342.78	PASS	AF=0.538462;AO=35;DP=65;FAO=35;FDP=65;FR=.;FRO=30;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=-0.000826872;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.048;QD=21.0941;RBI=0.00122329;REFB=-0.00798192;REVB=-0.000901513;RO=30;SAF=16;SAR=19;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00799084;STB=0.504422;STBP=0.965;TYPE=snp;VARB=0.00440383;OID=.;OPOS=62959137;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:30:30:35:35:0.538462:19:16:14:16:19:16:14:16
chr12	63083521	.	G	A	439.21	PASS	AF=0.5375;AO=42;DP=79;FAO=43;FDP=80;FR=.;FRO=37;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=-0.0133964;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.535;QD=21.9607;RBI=0.0155265;REFB=-0.0118243;REVB=-0.00784914;RO=37;SAF=26;SAR=16;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138055;STB=0.56819;STBP=0.217;TYPE=snp;VARB=0.0144847;OID=.;OPOS=63083521;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:80:37:37:42:43:0.5375:16:26:17:20:17:26:17:20
chr12	63544209	.	A	G	603.46	PASS	AF=0.530973;AO=60;DP=113;FAO=60;FDP=113;FR=.;FRO=53;FSAF=32;FSAR=28;FSRF=22;FSRR=31;FWDB=-0.0329016;FXX=0.0173898;HRUN=3;LEN=1;MLLD=75.6868;QD=21.3614;RBI=0.0402201;REFB=-0.00402935;REVB=0.0231332;RO=53;SAF=32;SAR=28;SRF=22;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100656;STB=0.555276;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=0.00368883;OID=.;OPOS=63544209;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:113:53:53:60:60:0.530973:28:32:22:31:28:32:22:31
chr12	63954300	.	C	T	377.68	PASS	AF=0.384615;AO=45;DP=116;FAO=45;FDP=117;FR=.;FRO=72;FSAF=27;FSAR=18;FSRF=47;FSRR=25;FWDB=0.00699064;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.182;QD=12.9122;RBI=0.0191313;REFB=-0.00806329;REVB=-0.0178084;RO=71;SAF=27;SAR=18;SRF=47;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0709132;STB=0.534281;STBP=0.582;TYPE=snp;VARB=0.0145482;OID=.;OPOS=63954300;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:116:117:71:72:45:45:0.384615:18:27:47:24:18:27:47:25
chr12	63954304	.	T	C	398.34	PASS	AF=0.385246;AO=47;DP=122;FAO=47;FDP=122;FR=.;FRO=75;FSAF=28;FSAR=19;FSRF=48;FSRR=27;FWDB=-0.0108875;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=117.774;QD=13.0602;RBI=0.0114804;REFB=-0.0168517;REVB=-0.00364165;RO=71;SAF=28;SAR=19;SRF=47;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0744943;STB=0.528539;STBP=0.668;TYPE=snp;VARB=0.0307928;OID=.;OPOS=63954304;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:122:122:71:75:47:47:0.385246:19:28:47:24:19:28:48:27
chr12	64020319	.	AAC	A,AAA	61.69	PASS	AF=0.142857,0.857143;AO=2,3;DP=6;FAO=1,6;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=0,1;FSAR=1,5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0392756,0.0741792;FXX=0;HRUN=10,1;LEN=2,1;MLLD=155.949,157.372;QD=35.2504;RBI=0.0403544,0.0742406;REFB=0,0;REVB=-0.00926867,-0.0030184;RO=0;SAF=0,1;SAR=2,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0527366,0.00609084;OID=.,.;OPOS=64020320,64020321;OREF=AC,C;OALT=-,A;OMAPALT=A,AAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.142857,0.857143:2,3:6:1,6:7:0:0,1:1,5:0:0:8:0:0,1:2,2:0:0
chr12	64062023	.	A	C	252.74	PASS	AF=0.5;AO=24;DP=48;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=4;FSAR=20;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=-0.0923737;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.888;QD=21.0612;RBI=0.0923912;REFB=-0.00942618;REVB=0.0017945;RO=23;SAF=4;SAR=20;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.231266;STB=0.649858;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=0.00828764;OID=.;OPOS=64062023;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:23:24:24:24:0.5:20:4:8:15:20:4:9:15
chr12	64062052	.	G	A	220.97	PASS	AF=0.44898;AO=22;DP=49;FAO=22;FDP=49;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=18;FWDB=0.0135695;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=132.715;QD=18.0386;RBI=0.0150786;REFB=-0.00936838;REVB=0.00657519;RO=26;SAF=6;SAR=16;SRF=8;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0410622;STB=0.540502;STBP=0.638;TYPE=snp;VARB=0.00616071;OID=.;OPOS=64062052;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:26:27:22:22:0.44898:16:6:8:18:16:6:9:18
chr12	64062065	.	T	C	236.45	PASS	AF=0.481481;AO=26;DP=54;FAO=26;FDP=54;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=20;FSRF=9;FSRR=19;FWDB=-0.0420405;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.609;QD=17.5149;RBI=0.0475574;REFB=-0.00909793;REVB=-0.0222328;RO=28;SAF=6;SAR=20;SRF=9;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10918;STB=0.561748;STBP=0.466;TYPE=snp;VARB=0.00978394;OID=.;OPOS=64062065;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:28:28:26:26:0.481481:20:6:9:19:20:6:9:19
chr12	64173807	.	G	A	564.95	PASS	AF=0.409396;AO=60;DP=149;FAO=61;FDP=149;FR=.;FRO=88;FSAF=28;FSAR=33;FSRF=60;FSRR=28;FWDB=-0.0136945;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.856;QD=15.1665;RBI=0.0147266;REFB=-0.029442;REVB=0.00541597;RO=86;SAF=27;SAR=33;SRF=58;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.232467;STB=0.629621;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.0516848;OID=.;OPOS=64173807;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:149:149:86:88:60:61:0.409396:33:27:58:28:33:28:60:28
chr12	64472803	.	A	T	1282.95	PASS	AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00161896;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.1093;QD=61.8291;RBI=0.00721858;REFB=0;REVB=0.00703469;RO=0;SAF=43;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.37048e-05;OID=.;OPOS=64472803;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:40:43:0:0:40:43:0:0
chr12	64519806	.	T	C	1066.16	PASS	AF=0.986301;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=73;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0155969;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.667;QD=58.4199;RBI=0.0313412;REFB=0.0360925;REVB=0.0271847;RO=0;SAF=39;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506327;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=1.75733e-05;OID=.;OPOS=64519806;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:72:73:0:1:72:72:0.986301:33:39:0:0:33:39:1:0
chr12	64587633	.	C	A	447.02	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00506415;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=290.595;QD=57.6804;RBI=0.00969324;REFB=0;REVB=-0.00826519;RO=0;SAF=18;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.33668e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.67897e-06;OID=.;OPOS=64587633;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:13:18:0:0:13:18:0:0
chr12	64609562	.	C	T	844.07	PASS	AF=1;AO=58;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0395011;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.495;QD=57.2252;RBI=0.0419817;REFB=0;REVB=0.014217;RO=0;SAF=32;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.09576e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000514695;OID=.;OPOS=64609562;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:58:59:1:26:32:0:0:26:33:0:0
chr12	64712511	.	A	G	429.02	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0245221;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.796;QD=57.2025;RBI=0.0291589;REFB=0;REVB=0.0157769;RO=0;SAF=20;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.00986e-05;OID=.;OPOS=64712511;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:10:20:0:0:10:20:0:0
chr12	64746833	.	C	T	194.34	PASS	AF=0.59375;AO=19;DP=32;FAO=19;FDP=32;FR=.;FRO=13;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=-0.0103661;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.165;QD=24.2925;RBI=0.0108981;REFB=0.0101755;REVB=-0.00336321;RO=12;SAF=14;SAR=5;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0118579;STB=0.522797;STBP=0.796;TYPE=snp;VARB=-0.0108186;OID=.;OPOS=64746833;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:12:13:19:19:0.59375:5:14:9:3:5:14:9:4
chr12	64749600	.	A	G	186.81	PASS	AF=0.5;AO=19;DP=38;FAO=19;FDP=38;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=0.0171672;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.854;QD=19.6642;RBI=0.0291561;REFB=-0.00818559;REVB=0.0235661;RO=19;SAF=6;SAR=13;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.325339;STB=0.684017;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=0.00792493;OID=.;OPOS=64749600;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:19:19:19:19:0.5:13:6:13:6:13:6:13:6
chr12	65108160	.	G	C	218.09	PASS	AF=0.461538;AO=24;DP=52;FAO=24;FDP=52;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=0.000350747;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.905;QD=16.7761;RBI=0.00158142;REFB=-0.011092;REVB=-0.00154204;RO=28;SAF=11;SAR=13;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0631938;STB=0.535685;STBP=0.673;TYPE=snp;VARB=0.0139734;OID=.;OPOS=65108160;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:28:28:24:24:0.461538:13:11:11:17:13:11:11:17
chr12	65146532	.	C	T	505.48	PASS	AF=0.509804;AO=52;DP=102;FAO=52;FDP=102;FR=.;FRO=50;FSAF=25;FSAR=27;FSRF=24;FSRR=26;FWDB=-0.0405755;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.4967;QD=19.8226;RBI=0.0406949;REFB=-0.00993716;REVB=-0.00311528;RO=47;SAF=25;SAR=27;SRF=23;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00741083;STB=0.500378;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00663483;OID=.;OPOS=65146532;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:47:50:52:52:0.509804:27:25:23:24:27:25:24:26
chr12	65150485	.	C	T	89.73	PASS	AF=0.25;AO=12;DP=48;FAO=12;FDP=48;FR=.;FRO=36;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=-0.00498851;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.6981;QD=7.47765;RBI=0.0281399;REFB=0.000313061;REVB=0.0276942;RO=36;SAF=9;SAR=3;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.257374;STB=0.662501;STBP=0.207;TYPE=snp;VARB=0.000314278;OID=.;OPOS=65150485;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:48:48:36:36:12:12:0.25:3:9:20:16:3:9:20:16
chr12	65154730	.	C	G	216.65	PASS	AF=0.4;AO=26;DP=65;FAO=26;FDP=65;FR=.;FRO=39;FSAF=6;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=-0.00795285;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.6948;QD=13.3324;RBI=0.00999802;REFB=0.00108419;REVB=-0.00605909;RO=39;SAF=6;SAR=20;SRF=18;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.278639;STB=0.661023;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=-0.00190556;OID=.;OPOS=65154730;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:39:39:26:26:0.4:20:6:18:21:20:6:18:21
chr12	65448986	.	G	A	298.77	PASS	AF=0.5;AO=32;DP=64;FAO=32;FDP=64;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=-0.00525755;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.3097;QD=18.6732;RBI=0.0168469;REFB=-0.0242619;REVB=-0.0160055;RO=32;SAF=14;SAR=18;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0564203;STB=0.531476;STBP=0.61;TYPE=snp;VARB=0.0300197;OID=.;OPOS=65448986;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:32:32:32:32:0.5:18:14:16:16:18:14:16:16
chr12	65514266	.	T	C	902.68	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0493757;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.2725;QD=58.2372;RBI=0.0641703;REFB=0;REVB=0.0409862;RO=0;SAF=41;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.99858e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000936664;OID=.;OPOS=65514266;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:21:41:0:0:21:41:0:0
chr12	65641020	.	G	T	213.53	PASS	AF=0.45283;AO=24;DP=53;FAO=24;FDP=53;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=22;FWDB=0.000209807;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.8068;QD=16.1153;RBI=0.0102385;REFB=0.000682815;REVB=0.0102363;RO=27;SAF=12;SAR=12;SRF=5;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.298842;STB=0.641401;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=-0.000597969;OID=.;OPOS=65641020;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:27:29:24:24:0.45283:12:12:5:22:12:12:7:22
chr12	65641985	.	C	T	643.24	PASS	AF=0.492424;AO=66;DP=132;FAO=65;FDP=132;FR=.;FRO=67;FSAF=47;FSAR=18;FSRF=25;FSRR=42;FWDB=0.0284611;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.2098;QD=19.4921;RBI=0.0284642;REFB=-0.0139782;REVB=0.000416056;RO=66;SAF=48;SAR=18;SRF=24;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.342702;STB=0.685072;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.012528;OID=.;OPOS=65641985;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:132:132:66:67:66:65:0.492424:18:48:24:42:18:47:25:42
chr12	65857555	.	T	A	351.67	PASS	AF=0.612245;AO=30;DP=47;FAO=30;FDP=49;FR=.;FRO=19;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.0339056;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.195;QD=28.7079;RBI=0.0395966;REFB=-0.0103354;REVB=-0.0204524;RO=17;SAF=19;SAR=11;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0720719;STB=0.564313;STBP=0.271;TYPE=snp;VARB=0.00772516;OID=.;OPOS=65857555;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:49:17:19:30:30:0.612245:11:19:9:8:11:19:9:10
chr12	66358347	.	C	T	318.41	PASS	AF=0.485714;AO=34;DP=70;FAO=34;FDP=70;FR=.;FRO=36;FSAF=10;FSAR=24;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=-0.0495227;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.694;QD=18.1946;RBI=0.0541594;REFB=-0.0143125;REVB=-0.0219257;RO=36;SAF=10;SAR=24;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180126;STB=0.601051;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.00906849;OID=.;OPOS=66358347;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:36:36:34:34:0.485714:24:10:17:19:24:10:17:19
chr12	66359752	.	C	A	397.55	PASS	AF=0.506329;AO=40;DP=81;FAO=40;FDP=79;FR=.;FRO=39;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=15;FSRR=24;FWDB=-0.0135563;FXX=0.0246883;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.502;QD=20.1292;RBI=0.0135673;REFB=-0.0136793;REVB=0.000545418;RO=41;SAF=18;SAR=22;SRF=17;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0326485;STB=0.532802;STBP=0.59;TYPE=snp;VARB=0.012497;OID=.;OPOS=66359752;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:79:41:39:40:40:0.506329:22:18:17:24:22:18:15:24
chr12	66546100	.	A	G	201.96	PASS	AF=0.526316;AO=20;DP=38;FAO=20;FDP=38;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=-0.0128709;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=148.726;QD=21.2591;RBI=0.0172834;REFB=0.00529892;REVB=-0.011535;RO=18;SAF=8;SAR=12;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0593334;STB=0.533301;STBP=0.7;TYPE=snp;VARB=-0.00496581;OID=.;OPOS=66546100;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:18:18:20:20:0.526316:12:8:6:12:12:8:6:12
chr12	66605228	.	A	G	606.63	PASS	AF=0.97619;AO=40;DP=42;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0581021;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.522;QD=57.7747;RBI=0.0590342;REFB=-0.083836;REVB=-0.010449;RO=1;SAF=20;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.022873;STB=0.511622;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.00960632;OID=.;OPOS=66605228;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:42:42:1:1:40:41:0.97619:20:20:0:1:21:20:0:1
chr12	66725160	.	C	T	1237.3	PASS	AF=1;AO=81;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0187638;FXX=0.0119033;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.887;QD=59.6288;RBI=0.0231192;REFB=-0.0467212;REVB=-0.0135062;RO=2;SAF=34;SAR=47;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0270364;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000110855;OID=.;OPOS=66725160;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:83:83:2:0:81:83:1:47:34:2:0:47:36:0:0
chr12	66725202	.	C	T	337.84	PASS	AF=0.467532;AO=36;DP=77;FAO=36;FDP=77;FR=.;FRO=41;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=-0.00859185;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.425;QD=17.5501;RBI=0.0220536;REFB=-0.0253799;REVB=-0.0203111;RO=40;SAF=14;SAR=22;SRF=18;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0595436;STB=0.540961;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=0.0322632;OID=.;OPOS=66725202;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:40:41:36:36:0.467532:22:14:18:22:22:14:19:22
chr12	66731864	.	C	A	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0404821;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.851;QD=55.6559;RBI=0.0444497;REFB=0;REVB=-0.0183568;RO=0;SAF=14;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.14271e-05;OID=.;OPOS=66731864;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:13:14:0:0:13:14:0:0
chr12	66739539	.	A	G	804.21	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00994078;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.24;QD=64.3369;RBI=0.0170844;REFB=0;REVB=-0.0138945;RO=0;SAF=33;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.56458e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000153129;OID=.;OPOS=66739539;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:17:33:0:0:17:33:0:0
chr12	66786091	.	G	C	174.12	PASS	AF=0.68;AO=9;DP=25;FAO=17;FDP=25;FR=.;FRO=8;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=0;FWDB=-0.0492845;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.518;QD=27.859;RBI=0.059432;REFB=-0.0178509;REVB=0.0332145;RO=8;SAF=0;SAR=9;SRF=8;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.848352;STB=0.666489;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=0.00417186;OID=.;OPOS=66786091;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:25:25:8:8:9:17:0.68:9:0:8:0:9:8:8:0
chr12	66814487	.	C	A	199.83	PASS	AF=0.357143;AO=25;DP=71;FAO=25;FDP=70;FR=.;FRO=45;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=21;FWDB=-0.001986;FXX=0.0140825;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.049;QD=11.4192;RBI=0.0185676;REFB=-0.00269668;REVB=-0.0184611;RO=45;SAF=11;SAR=14;SRF=24;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103493;STB=0.559952;STBP=0.484;TYPE=snp;VARB=0.00441872;OID=.;OPOS=66814487;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:70:45:45:25:25:0.357143:14:11:24:21:14:11:24:21
chr12	68052178	.	G	T	639.68	PASS	AF=0.934783;AO=43;DP=46;FAO=43;FDP=46;FR=.;FRO=3;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.00859964;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=119.054;QD=55.6247;RBI=0.0270438;REFB=-0.0684147;REVB=0.02564;RO=1;SAF=18;SAR=25;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0184156;STB=0.505721;STBP=0.79;TYPE=snp;VARB=0.000623131;OID=.;OPOS=68052178;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:46:46:1:3:43:43:0.934783:25:18:0:1:25:18:1:2
chr12	68595787	.	A	G	181.53	PASS	AF=0.6;AO=18;DP=30;FAO=18;FDP=30;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=0.0229079;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.662;QD=24.2041;RBI=0.0250077;REFB=-0.000951488;REVB=-0.0100306;RO=12;SAF=8;SAR=10;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157894;STB=0.588138;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=0.000751875;OID=.;OPOS=68595787;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:30:30:12:12:18:18:0.6:10:8:8:4:10:8:8:4
chr12	68595823	.	G	T	171.79	PASS	AF=0.428571;AO=18;DP=44;FAO=18;FDP=42;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=-0.0691682;FXX=0.0454442;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.8714;QD=16.3605;RBI=0.0764681;REFB=0.0349673;REVB=-0.0326055;RO=26;SAF=12;SAR=6;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215753;STB=0.599886;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=-0.0545808;OID=.;OPOS=68595823;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:42:26:24:18:18:0.428571:6:12:12:14:6:12:12:12
chr12	68708761	.	C	T	230.79	PASS	AF=0.421875;AO=27;DP=64;FAO=27;FDP=64;FR=.;FRO=37;FSAF=19;FSAR=8;FSRF=25;FSRR=12;FWDB=0.00711691;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.541;QD=14.4246;RBI=0.00763741;REFB=-0.0291736;REVB=-0.00277121;RO=36;SAF=19;SAR=8;SRF=24;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0436833;STB=0.519111;STBP=0.834;TYPE=snp;VARB=0.0301218;OID=.;OPOS=68708761;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:36:37:27:27:0.421875:8:19:24:12:8:19:25:12
chr12	68709892	.	C	T	289.35	PASS	AF=0.407407;AO=32;DP=79;FAO=33;FDP=81;FR=.;FRO=48;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=26;FWDB=0.00884746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.715;QD=14.2888;RBI=0.0109125;REFB=-0.00411466;REVB=-0.00638786;RO=47;SAF=15;SAR=17;SRF=22;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000698276;STB=0.515733;STBP=0.826;TYPE=snp;VARB=0.00769226;OID=.;OPOS=68709892;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:81:47:48:32:33:0.407407:17:15:22:25:17:16:22:26
chr12	68720627	.	G	A	422.89	PASS	AF=0.395161;AO=49;DP=124;FAO=49;FDP=124;FR=.;FRO=75;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=40;FSRR=35;FWDB=-0.0259833;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.08;QD=13.6414;RBI=0.0260583;REFB=-0.00874587;REVB=-0.00197594;RO=74;SAF=24;SAR=25;SRF=40;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0539704;STB=0.526305;STBP=0.677;TYPE=snp;VARB=0.0196389;OID=.;OPOS=68720627;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:124:124:74:75:49:49:0.395161:25:24:40:34:25:24:40:35
chr12	68724951	.	G	T	385.53	PASS	AF=0.423077;AO=44;DP=105;FAO=44;FDP=104;FR=.;FRO=60;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=29;FSRR=31;FWDB=0.00570889;FXX=0.0095229;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.061;QD=14.8283;RBI=0.00891217;REFB=-0.00908369;REVB=0.00684364;RO=60;SAF=24;SAR=20;SRF=29;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0637649;STB=0.535886;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.012895;OID=.;OPOS=68724951;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:104:60:60:44:44:0.423077:20:24:29:31:20:24:29:31
chr12	69187427	.	T	A,G	496.61	PASS	AF=0.970588,0.0294118;AO=30,3;DP=33;FAO=33,1;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=12,1;FSAR=21,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0192761,0.00450016;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=180.845,178.078;QD=58.4245;RBI=0.0328681,0.0117517;REFB=0,0;REVB=0.0266222,-0.0108559;RO=0;SAF=12,1;SAR=18,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00138077,0.0658577;OID=.,.;OPOS=69187427,69187427;OREF=T,T;OALT=A,G;OMAPALT=A,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:4:33:34:0:0:30,3:33,1:0.970588,0.0294118:18,2:12,1:0:0:21,0:12,1:0:0
chr12	69187585	.	G	A,GA	747.43	PASS	AF=0.0185185,0.981481;AO=2,51;DP=54;FAO=1,53;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=1,23;FSAR=0,30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0286544,-0.0398048;FXX=0.0181785;HRUN=1,0;LEN=1,1;MLLD=226.493,55.3718;QD=55.3649;RBI=0.0287426,0.0456016;REFB=0,0;REVB=-0.00224947,0.0222504;RO=0;SAF=1,23;SAR=1,28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.97956e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,ins;VARB=-0.0301383,-0.000852414;OID=.,.;OPOS=69187585,69187586;OREF=G,-;OALT=A,A;OMAPALT=A,GA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:4:54:54:0:0:2,51:1,53:0.0185185,0.981481:1,28:1,23:0:0:0,30:1,23:0:0
chr12	69265578	.	A	G	553.06	PASS	AF=0.566667;AO=51;DP=90;FAO=51;FDP=90;FR=.;FRO=39;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=0.0108641;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.364;QD=24.5803;RBI=0.0126096;REFB=-0.00895496;REVB=0.00640106;RO=39;SAF=29;SAR=22;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0242148;STB=0.513269;STBP=0.786;TYPE=snp;VARB=0.00594658;OID=.;OPOS=69265578;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:39:39:51:51:0.566667:22:29:21:18:22:29:21:18
chr12	69645864	.	A	G	136.81	PASS	AF=0.5;AO=12;DP=28;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=2;FSRR=13;FWDB=0.0146126;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.797;QD=18.2416;RBI=0.0146803;REFB=-0.0204795;REVB=-0.00140825;RO=13;SAF=3;SAR=9;SRF=2;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124735;STB=0.62148;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.0143844;OID=.;OPOS=69645864;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:30:13:15:12:15:0.5:9:3:2:11:10:5:2:13
chr12	69794856	.	G	A	600.41	PASS	AF=0.931818;AO=41;DP=44;FAO=41;FDP=44;FR=.;FRO=3;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0321393;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.2138;QD=54.5823;RBI=0.0331713;REFB=-0.0331706;REVB=0.00820986;RO=3;SAF=19;SAR=22;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0597911;STB=0.531899;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=0.0232636;OID=.;OPOS=69794856;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:44:44:3:3:41:41:0.931818:22:19:0:3:22:19:0:3
chr12	69971713	.	C	T	249.91	PASS	AF=0.466667;AO=28;DP=60;FAO=28;FDP=60;FR=.;FRO=32;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=-0.00318547;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=225.506;QD=16.6605;RBI=0.00465786;REFB=-0.021024;REVB=-0.0033983;RO=32;SAF=18;SAR=10;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0805686;STB=0.545421;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=0.0230772;OID=.;OPOS=69971713;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:32:32:28:28:0.466667:10:18:18:14:10:18:18:14
chr12	69972381	.	G	A	239.32	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00390001;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.2074;QD=50.3832;RBI=0.0202085;REFB=0;REVB=-0.0198286;RO=0;SAF=6;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.851e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000420278;OID=.;OPOS=69972381;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:13:6:0:0:13:6:0:0
chr12	69986788	.	A	G	214.37	PASS	AF=0.38806;AO=26;DP=67;FAO=26;FDP=67;FR=.;FRO=41;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=19;FWDB=0.00589084;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.261;QD=12.7979;RBI=0.00634437;REFB=-0.0139831;REVB=0.00235566;RO=41;SAF=14;SAR=12;SRF=22;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0020115;STB=0.501154;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0283669;OID=.;OPOS=69986788;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:41:41:26:26:0.38806:12:14:22:19:12:14:22:19
chr12	70064295	.	C	T	285.33	PASS	AF=0.415584;AO=32;DP=78;FAO=32;FDP=77;FR=.;FRO=45;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=27;FSRR=18;FWDB=0.0116791;FXX=0.0253133;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.793;QD=14.8225;RBI=0.0124661;REFB=-0.00637327;REVB=0.00435898;RO=43;SAF=16;SAR=16;SRF=26;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106209;STB=0.558406;STBP=0.388;TYPE=snp;VARB=0.00920547;OID=.;OPOS=70064295;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:77:43:45:32:32:0.415584:16:16:26:17:16:16:27:18
chr12	70091432	.	T	C	542.28	PASS	AF=1;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.027071;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.606;QD=60.2528;RBI=0.0951896;REFB=0;REVB=0.0912591;RO=0;SAF=19;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000440499;OID=.;OPOS=70091432;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:36:0:0:36:36:1:17:19:0:0:17:19:0:0
chr12	70190408	.	A	C	247.06	PASS	AF=0.575;AO=23;DP=40;FAO=23;FDP=40;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.0225574;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.3921;QD=24.7063;RBI=0.0704131;REFB=0.0368278;REVB=0.0667021;RO=17;SAF=8;SAR=15;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144898;STB=0.580794;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=-0.0249087;OID=.;OPOS=70190408;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:17:17:23:23:0.575:15:8:9:8:15:8:9:8
chr12	70321450	.	C	T	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0124136;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.48;QD=55.6561;RBI=0.013445;REFB=0;REVB=0.00516449;RO=0;SAF=15;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.085e-05;OID=.;OPOS=70321450;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:12:15:0:0:12:15:0:0
chr12	70330087	.	A	G	152.68	PASS	AF=0.551724;AO=14;DP=27;FAO=16;FDP=29;FR=.;FRO=13;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.028653;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.252;QD=21.059;RBI=0.0287888;REFB=-0.0128534;REVB=0.00279223;RO=13;SAF=10;SAR=4;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0967639;STB=0.57437;STBP=0.447;TYPE=snp;VARB=0.0116342;OID=.;OPOS=70330087;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:29:13:13:14:16:0.551724:4:10:8:5:4:12:8:5
chr12	70912510	.	C	T	884.14	PASS	AF=0.983871;AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0274903;FXX=0.0461467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.61;QD=57.0414;RBI=0.0318061;REFB=-0.100435;REVB=0.0159973;RO=1;SAF=31;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.014984;STB=0.507934;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.00144929;OID=.;OPOS=70912510;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:62:62:1:1:61:61:0.983871:30:31:1:0:30:31:1:0
chr12	70928724	.	A	G	582.44	PASS	AF=0.975;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0120515;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.104;QD=58.2437;RBI=0.0125485;REFB=-0.122264;REVB=0.00349665;RO=1;SAF=14;SAR=25;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0183853;STB=0.509799;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.000732167;OID=.;OPOS=70928724;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:40:40:1:1:39:39:0.975:25:14:0:1:25:14:0:1
chr12	71002865	.	T	A	479.37	PASS	AF=0.489583;AO=47;DP=96;FAO=47;FDP=96;FR=.;FRO=49;FSAF=21;FSAR=26;FSRF=28;FSRR=21;FWDB=-0.0373546;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.655;QD=19.9739;RBI=0.0373546;REFB=0.00148144;REVB=7.53064e-06;RO=49;SAF=21;SAR=26;SRF=28;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114375;STB=0.563441;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=-0.000913504;OID=.;OPOS=71002865;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:96:49:49:47:47:0.489583:26:21:28:21:26:21:28:21
chr12	71002893	.	C	T	503.38	PASS	AF=0.495327;AO=53;DP=107;FAO=53;FDP=107;FR=.;FRO=54;FSAF=21;FSAR=32;FSRF=27;FSRR=27;FWDB=-0.0420131;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.7524;QD=18.818;RBI=0.0437374;REFB=-0.0197989;REVB=0.01216;RO=53;SAF=21;SAR=32;SRF=27;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10427;STB=0.553493;STBP=0.256;TYPE=snp;VARB=0.0202347;OID=.;OPOS=71002893;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:107:53:54:53:53:0.495327:32:21:27:26:32:21:27:27
chr12	71002917	.	T	C	449.88	PASS	AF=0.446429;AO=50;DP=112;FAO=50;FDP=112;FR=.;FRO=62;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=29;FSRR=33;FWDB=0.0155918;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.5354;QD=16.0673;RBI=0.0192527;REFB=-0.0053216;REVB=-0.0112942;RO=62;SAF=27;SAR=23;SRF=29;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.071551;STB=0.539984;STBP=0.482;TYPE=snp;VARB=0.0142206;OID=.;OPOS=71002917;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:112:62:62:50:50:0.446429:23:27:29:33:23:27:29:33
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chr12	71029733	.	C	T	267.35	PASS	AF=0.5;AO=29;DP=58;FAO=29;FDP=58;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=0.0139342;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.0412;QD=18.438;RBI=0.0173622;REFB=0.0202165;REVB=0.0103578;RO=29;SAF=12;SAR=17;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.019419;OID=.;OPOS=71029733;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:29:29:29:29:0.5:17:12:12:17:17:12:12:17
chr12	71139664	.	T	C	1082.46	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00410534;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=192.692;QD=59.3127;RBI=0.0504623;REFB=0;REVB=0.050295;RO=0;SAF=40;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.05346e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000123182;OID=.;OPOS=71139664;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:73:0:0:72:73:1:32:40:0:0:33:40:0:0
chr12	71509652	.	T	A	680.83	PASS	AF=0.485714;AO=68;DP=141;FAO=68;FDP=140;FR=.;FRO=72;FSAF=25;FSAR=43;FSRF=33;FSRR=39;FWDB=0.00234499;FXX=0.0070917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.7893;QD=19.4523;RBI=0.0264333;REFB=-0.00938024;REVB=-0.0263291;RO=73;SAF=25;SAR=43;SRF=33;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0827679;STB=0.548841;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=0.00834604;OID=.;OPOS=71509652;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:141:140:73:72:68:68:0.485714:43:25:33:40:43:25:33:39
chr12	71519096	.	G	C	200.27	PASS	AF=0.413793;AO=24;DP=58;FAO=24;FDP=58;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=20;FWDB=-0.0044041;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.903;QD=13.8116;RBI=0.0114573;REFB=-0.00687162;REVB=-0.010577;RO=32;SAF=11;SAR=13;SRF=12;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0850273;STB=0.527593;STBP=0.735;TYPE=snp;VARB=0.0134189;OID=.;OPOS=71519096;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:32:34:24:24:0.413793:13:11:12:20:13:11:14:20
chr12	71523134	.	A	C	174.09	PASS	AF=0.5;AO=18;DP=36;FAO=18;FDP=36;FR=.;FRO=18;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=13;FWDB=0.00694355;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.145;QD=19.3435;RBI=0.0083226;REFB=-0.00122022;REVB=0.00458833;RO=18;SAF=13;SAR=5;SRF=5;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.391713;STB=0.721975;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.00235414;OID=.;OPOS=71523134;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:18:18:18:18:0.5:5:13:5:13:5:13:5:13
chr12	71532922	.	A	C	164.84	PASS	AF=0.280488;AO=22;DP=81;FAO=23;FDP=82;FR=.;FRO=59;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=31;FSRR=28;FWDB=0.0202338;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.254;QD=8.04114;RBI=0.0202352;REFB=-0.00968164;REVB=-0.000232766;RO=59;SAF=15;SAR=7;SRF=31;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197953;STB=0.629804;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=0.0238739;OID=.;OPOS=71532922;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:82:59:59:22:23:0.280488:7:15:31:28:7:16:31:28
chr12	71533534	.	C	G	376.0	PASS	AF=0.425532;AO=40;DP=94;FAO=40;FDP=94;FR=.;FRO=54;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=29;FSRR=25;FWDB=-0.00694523;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=246.734;QD=15.9999;RBI=0.00780801;REFB=0.00130138;REVB=0.00356773;RO=54;SAF=18;SAR=22;SRF=29;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0887242;STB=0.549975;STBP=0.466;TYPE=snp;VARB=-0.00185656;OID=.;OPOS=71533534;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:54:54:40:40:0.425532:22:18:29:25:22:18:29:25
chr12	71533622	.	C	T	249.21	PASS	AF=0.560976;AO=23;DP=42;FAO=23;FDP=41;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.0016381;FXX=0.0238039;HRUN=2;LEN=1;MLLD=274.82;QD=24.3136;RBI=0.00286172;REFB=-0.0125013;REVB=0.0023465;RO=16;SAF=11;SAR=12;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108071;STB=0.533869;STBP=0.641;TYPE=snp;VARB=0.00944837;OID=.;OPOS=71533622;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:41:16:18:23:23:0.560976:12:11:10:6:12:11:10:8
chr12	71960208	.	G	A,T	1020.18	PASS	AF=0.957143,0.0428571;AO=66,3;DP=69;FAO=67,3;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=48,1;FSAR=19,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0144068,-0.0166854;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=186.291,140.892;QD=58.2959;RBI=0.014436,0.0172795;REFB=0,0;REVB=-0.000918563,0.00449211;RO=0;SAF=48,1;SAR=18,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-2.99443e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-1.32972e-05,0.0766113;OID=.,.;OPOS=71960208,71960208;OREF=G,G;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:69:70:0:0:66,3:67,3:0.957143,0.0428571:18,2:48,1:0:0:19,2:48,1:0:0
chr12	72071045	.	A	G	801.33	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0180504;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.406;QD=57.2376;RBI=0.0216385;REFB=0;REVB=-0.0119335;RO=0;SAF=36;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.57266e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.35754e-06;OID=.;OPOS=72071045;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:20:36:0:0:20:36:0:0
chr12	72307616	.	A	G	519.99	PASS	AF=1;AO=34;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0631894;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.0673;QD=59.4279;RBI=0.0869676;REFB=0;REVB=0.0597534;RO=0;SAF=21;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.04814e-05;OID=.;OPOS=72307616;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:34:35:1:13:21:0:0:14:21:0:0
chr12	72372862	.	A	G	317.42	PASS	AF=0.52381;AO=32;DP=62;FAO=33;FDP=63;FR=.;FRO=30;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=-0.00425568;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.353;QD=20.1533;RBI=0.0128882;REFB=-0.000365509;REVB=0.0121653;RO=29;SAF=14;SAR=18;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0815867;STB=0.544883;STBP=0.48;TYPE=snp;VARB=0.000365616;OID=.;OPOS=72372862;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:63:29:30:32:33:0.52381:18:14:10:19:19:14:10:20
chr12	72416235	.	A	T	496.67	PASS	AF=0.510638;AO=47;DP=93;FAO=48;FDP=94;FR=.;FRO=46;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=28;FSRR=18;FWDB=-0.00413423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.71;QD=21.135;RBI=0.00427718;REFB=-0.00650742;REVB=0.00109653;RO=46;SAF=23;SAR=24;SRF=28;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106521;STB=0.55317;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=0.00530164;OID=.;OPOS=72416235;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:94:46:46:47:48:0.510638:24:23:28:18:24:24:28:18
chr12	73058186	.	G	A	2083.6	PASS	AF=1;AO=132;DP=133;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0151085;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.441;QD=62.6645;RBI=0.021738;REFB=0;REVB=0.0156292;RO=0;SAF=68;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.76615e-05;OID=.;OPOS=73058186;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:133:133:0:0:132:133:1:64:68:0:0:65:68:0:0
chr12	74932159	.	G	C	920.09	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159998;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.326;QD=58.4186;RBI=0.0287656;REFB=0;REVB=0.0239053;RO=0;SAF=33;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000111115;OID=.;OPOS=74932159;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:63:0:0:62:63:1:29:33:0:0:30:33:0:0
chr12	74932565	.	T	C	837.07	PASS	AF=0.983333;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0141616;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.9336;QD=55.8046;RBI=0.0270701;REFB=0.0526302;REVB=-0.0230703;RO=1;SAF=23;SAR=36;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0129277;STB=0.506847;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=-0.0137216;OID=.;OPOS=74932565;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:60:60:1:1:59:59:0.983333:36:23:0:1:36:23:0:1
chr12	74933166	.	G	A	803.43	PASS	AF=0.982759;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0146881;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.898;QD=55.4088;RBI=0.0168879;REFB=-0.0380312;REVB=0.00833429;RO=1;SAF=33;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0140785;STB=0.50746;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=5.88597e-05;OID=.;OPOS=74933166;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:58:58:1:1:57:57:0.982759:24:33:1:0:24:33:1:0
chr12	74934634	.	G	A	601.01	PASS	AF=1;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00526587;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.14;QD=61.6418;RBI=0.0248742;REFB=0;REVB=0.0243105;RO=0;SAF=21;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.34792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00027542;OID=.;OPOS=74934634;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:39:0:0:39:39:1:18:21:0:0:18:21:0:0
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chr12	74934743	.	G	T	152.79	PASS	AF=0.4;AO=17;DP=44;FAO=18;FDP=45;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=-0.0058667;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.391;QD=13.5809;RBI=0.0178567;REFB=-0.0107027;REVB=-0.0168654;RO=27;SAF=11;SAR=6;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.178843;STB=0.578859;STBP=0.399;TYPE=snp;VARB=0.0158272;OID=.;OPOS=74934743;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:45:27:27:17:18:0.4:6:11:13:14:7:11:13:14
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chr12	75824460	.	T	C	485.52	PASS	AF=0.567901;AO=46;DP=81;FAO=46;FDP=81;FR=.;FRO=35;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=-0.0162775;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=163.831;QD=23.9765;RBI=0.0164085;REFB=-0.00545772;REVB=-0.00206924;RO=33;SAF=20;SAR=26;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0386103;STB=0.522249;STBP=0.644;TYPE=snp;VARB=0.00360029;OID=.;OPOS=75824460;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:33:35:46:46:0.567901:26:20:16:17:26:20:17:18
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chr12	75893388	.	T	A	1246.04	PASS	AF=1;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00798274;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.631;QD=61.5331;RBI=0.0200432;REFB=0;REVB=0.0183849;RO=0;SAF=36;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.42691e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.84666e-05;OID=.;OPOS=75893388;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:81:0:0:81:81:1:45:36:0:0:45:36:0:0
chr12	75893399	.	T	G	280.29	PASS	AF=0.43662;AO=31;DP=70;FAO=31;FDP=71;FR=.;FRO=40;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=20;FSRR=20;FWDB=-0.0171591;FXX=0.0405351;HRUN=3;LEN=1;MLLD=123.691;QD=15.7911;RBI=0.0205931;REFB=-0.00733967;REVB=0.0113861;RO=39;SAF=10;SAR=21;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172375;STB=0.605699;STBP=0.125;TYPE=snp;VARB=0.00970066;OID=.;OPOS=75893399;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:71:39:40:31:31:0.43662:21:10:19:20:21:10:20:20
chr12	75893404	.	C	A	1008.46	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0393898;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.179;QD=59.3211;RBI=0.0396852;REFB=0;REVB=0.00483303;RO=0;SAF=29;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000132239;OID=.;OPOS=75893404;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:39:29:0:0:39:29:0:0
chr12	75893485	.	A	G	328.16	PASS	AF=0.675;AO=2;DP=40;FAO=27;FDP=40;FR=.,HEALED;FRO=13;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=-0.00843725;FXX=0;HRUN=13;LEN=1;MLLD=235.225;QD=32.8164;RBI=0.085263;REFB=-0.049982;REVB=-0.0848445;RO=2;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509427;STBP=0.855;TYPE=snp;VARB=0.0214814;OID=.;OPOS=75893485;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:60:40:40:2:13:2:27:0.675:2:0:0:2:18:9:4:9
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chr12	76351726	.	C	G	200.85	PASS	AF=0.512821;AO=20;DP=39;FAO=20;FDP=39;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=0.022691;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.8701;QD=20.6003;RBI=0.0397806;REFB=-0.0139112;REVB=0.0326743;RO=19;SAF=11;SAR=9;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111128;STB=0.562597;STBP=0.454;TYPE=snp;VARB=0.0171722;OID=.;OPOS=76351726;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:19:19:20:20:0.512821:9:11:8:11:9:11:8:11
chr12	76422999	.	T	C	785.63	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00793643;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=286.138;QD=64.1328;RBI=0.0106703;REFB=0;REVB=0.00713227;RO=0;SAF=24;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.03961e-05;OID=.;OPOS=76422999;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:49:0:0:48:49:1:24:24:0:0:24:25:0:0
chr12	76424937	.	TTGC	CTGT,T	267.85	PASS	AF=0.121212,0.727273;AO=9,16;DP=27;FAO=4,24;FDP=33;FR=.;FRO=5;FSAF=4,11;FSAR=0,13;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=-0.0573399,0.0874141;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=4,3;MLLD=204.123,124.133;QD=32.4671;RBI=0.0685531,0.0974728;REFB=-0.0885108,-0.0822142;REVB=0.037572,0.0431246;RO=0;SAF=4,8;SAR=5,8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.997219,0.545152;STBP=0.014,0.345;TYPE=mnp,del;VARB=0.0712951,0.0251065;OID=.,.;OPOS=76424937,76424938;OREF=TTGC,TGC;OALT=CTGT,-;OMAPALT=CTGT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:33:27:33:0:5:9,16:4,24:0.121212,0.727273:5,8:4,8:0:0:0,13:4,11:1:4
chr12	76425793	.	ACGGGGGCGCGGAGG	A	85.95	PASS	AF=0.9;AO=9;DP=10;FAO=9;FDP=10;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00265155;FXX=0.0908265;HRUN=1;LEN=14;MLLD=300.05;QD=34.3818;RBI=0.0122061;REFB=-0.00158457;REVB=0.0119147;RO=1;SAF=4;SAR=5;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.080744;STB=0.545355;STBP=0.528;TYPE=del;VARB=0.000250453;OID=.;OPOS=76425794;OREF=CGGGGGCGCGGAGG;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.9:9:10:9:10:1:4:5:0:1:7:1:4:5:0:1
chr12	76426626	.	A	G	109.77	PASS	AF=0.464286;AO=12;DP=29;FAO=13;FDP=28;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=0.00734124;FXX=0.0666445;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.183;QD=15.682;RBI=0.0128752;REFB=-0.000893072;REVB=0.0105772;RO=17;SAF=5;SAR=7;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00503811;STB=0.529367;STBP=0.782;TYPE=snp;VARB=0.00457039;OID=.;OPOS=76426626;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:28:17:15:12:13:0.464286:7:5:7:10:8:5:5:10
chr12	76427479	.	T	C	227.22	PASS	AF=0.65625;AO=21;DP=32;FAO=21;FDP=32;FR=.;FRO=11;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.0231908;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.527;QD=28.4026;RBI=0.0253902;REFB=-0.00248134;REVB=-0.0103367;RO=11;SAF=10;SAR=11;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0430355;STB=0.523787;STBP=0.758;TYPE=snp;VARB=0.00134062;OID=.;OPOS=76427479;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:32:32:11:11:21:21:0.65625:11:10:6:5:11:10:6:5
chr12	76427547	.	C	CTTAAT	53.08	PASS	AF=0.363636;AO=6;DP=23;FAO=8;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=12;FSRR=2;FWDB=-0.0245602;FXX=0.0434594;HRUN=2;LEN=5;MLLD=248.829;QD=9.65045;RBI=0.0295398;REFB=-0.00739058;REVB=0.0164134;RO=17;SAF=4;SAR=2;SRF=15;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.333477;STB=0.599781;STBP=0.654;TYPE=ins;VARB=0.0154298;OID=.;OPOS=76427548;OREF=-;OALT=TTAAT;OMAPALT=CTTAAT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.363636:6:23:8:22:14:6:2:12:2:53:17:4:2:15:2
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chr12	76449900	.	T	C	524.74	PASS	AF=0.974359;AO=35;DP=36;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0440125;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=47.7605;QD=53.819;RBI=0.0447815;REFB=0.0515687;REVB=0.00826351;RO=1;SAF=11;SAR=24;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0190966;STB=0.521727;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=0.00736927;OID=.;OPOS=76449900;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:36:39:1:1:35:38:0.974359:24:11:0:1:27:11:1:0
chr12	76709606	.	T	C	727.8	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00119749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=317.488;QD=63.2868;RBI=0.0201888;REFB=0;REVB=0.0201532;RO=0;SAF=22;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.64089e-05;OID=.;OPOS=76709606;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:24:22:0:0:24:22:0:0
chr12	76709610	.	T	C,G	755.17	PASS	AF=0.979167,0.0208333;AO=46,2;DP=48;FAO=47,1;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=24,0;FSAR=23,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0172097,-0.00935803;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=183.874,179.487;QD=62.9305;RBI=0.0191822,0.0103758;REFB=0,0;REVB=0.00847245,-0.00448157;RO=0;SAF=24,0;SAR=22,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000698103,0.00433305;OID=.,.;OPOS=76709610,76709610;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:5:48:48:0:0:46,2:47,1:0.979167,0.0208333:22,2:24,0:0:0:23,1:24,0:0:0
chr12	77417509	.	G	T	363.72	PASS	AF=0.580645;AO=36;DP=63;FAO=36;FDP=62;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=-0.0170491;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.935;QD=23.466;RBI=0.0220584;REFB=0.000267733;REVB=-0.0139965;RO=22;SAF=13;SAR=23;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194085;STB=0.577094;STBP=0.168;TYPE=snp;VARB=-0.000268131;OID=.;OPOS=77417509;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:62:22:26:36:36:0.580645:23:13:14:8:23:13:14:12
chr12	77424072	.	TTGA	T	54.98	PASS	AF=0.322581;AO=10;DP=32;FAO=10;FDP=31;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=18;FSRR=3;FWDB=0.00309383;FXX=0.0312402;HRUN=2;LEN=3;MLLD=319.133;QD=7.09411;RBI=0.0600556;REFB=-0.00527237;REVB=0.0599759;RO=19;SAF=7;SAR=3;SRF=16;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.206189;STB=0.640792;STBP=0.408;TYPE=del;VARB=0.011867;OID=.;OPOS=77424073;OREF=TGA;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.322581:10:32:10:31:21:7:3:18:3:54:19:7:3:16:3
chr12	77449790	.	A	G	1139.54	PASS	AF=0.987013;AO=76;DP=77;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00768461;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=272.688;QD=59.1969;RBI=0.00785021;REFB=-0.163634;REVB=0.00160391;RO=0;SAF=48;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.86654e-08;STB=0.505153;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=-0.000194335;OID=.;OPOS=77449790;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:77:77:0:1:76:76:0.987013:28:48:0:0:28:48:1:0
chr12	78225299	.	G	A	331.41	PASS	AF=0.486111;AO=35;DP=72;FAO=35;FDP=72;FR=.;FRO=37;FSAF=12;FSAR=23;FSRF=22;FSRR=15;FWDB=0.010395;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.1957;QD=18.4119;RBI=0.0204291;REFB=-0.00591137;REVB=0.0175867;RO=37;SAF=12;SAR=23;SRF=22;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.235484;STB=0.631588;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.0214738;OID=.;OPOS=78225299;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:37:37:35:35:0.486111:23:12:22:15:23:12:22:15
chr12	78225374	.	A	G	1175.29	PASS	AF=0.987342;AO=78;DP=79;FAO=78;FDP=79;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0267477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.8368;QD=59.5083;RBI=0.0408856;REFB=-0.0391575;REVB=-0.0309224;RO=1;SAF=40;SAR=38;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0122936;STB=0.506492;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=0.00626491;OID=.;OPOS=78225374;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:79:79:1:1:78:78:0.987342:38:40:0:1:38:40:0:1
chr12	78334194	.	A	G	541.92	PASS	AF=0.528846;AO=55;DP=104;FAO=55;FDP=104;FR=.;FRO=49;FSAF=28;FSAR=27;FSRF=24;FSRR=25;FWDB=0.030483;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.685;QD=20.8431;RBI=0.03323;REFB=-0.00743348;REVB=0.0132297;RO=49;SAF=28;SAR=27;SRF=24;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0165181;STB=0.509088;STBP=0.851;TYPE=snp;VARB=0.0064165;OID=.;OPOS=78334194;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:104:49:49:55:55:0.528846:27:28:24:25:27:28:24:25
chr12	78400884	.	G	A	263.52	PASS	AF=0.483333;AO=29;DP=60;FAO=29;FDP=60;FR=.;FRO=31;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=-0.0089202;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.692;QD=17.5682;RBI=0.0195026;REFB=0.000360624;REVB=-0.0173431;RO=31;SAF=14;SAR=15;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0900336;STB=0.550424;STBP=0.469;TYPE=snp;VARB=-0.000594455;OID=.;OPOS=78400884;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:31:31:29:29:0.483333:15:14:18:13:15:14:18:13
chr12	78530979	.	G	A	472.44	PASS	AF=1;AO=31;DP=32;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0224855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.931;QD=57.2654;RBI=0.0250797;REFB=0;REVB=0.0111083;RO=0;SAF=14;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00220037;OID=.;OPOS=78530979;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:33:0:0:31:33:1:17:14:0:0:18:15:0:0
chr12	78542699	.	T	C	189.05	PASS	AF=0.540541;AO=17;DP=36;FAO=20;FDP=37;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=0.0232097;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.711;QD=20.4376;RBI=0.0245977;REFB=-0.0168702;REVB=-0.00814589;RO=17;SAF=5;SAR=12;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.060353;STB=0.522705;STBP=0.8;TYPE=snp;VARB=0.0169839;OID=.;OPOS=78542699;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:37:17:17:17:20:0.540541:12:5:6:11:12:8:6:11
chr12	78598891	.	G	A	157.03	PASS	AF=0.435897;AO=17;DP=39;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=-0.0144623;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.454;QD=16.1055;RBI=0.0146153;REFB=-0.00300377;REVB=-0.00210907;RO=22;SAF=6;SAR=11;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0114288;STB=0.506571;STBP=0.971;TYPE=snp;VARB=0.00382897;OID=.;OPOS=78598891;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:22:22:17:17:0.435897:11:6:8:14:11:6:8:14
chr12	78605520	.	TGTTTTTTTA	GTTTTTTTTA,TGTTTTTTTT,TGTTTTTTTTA	31.23	PASS	AF=0.0204082,0,0.183673;AO=2,2,10;DP=52;FAO=1,0,9;FDP=49;FR=.;FRO=39;FSAF=1,0,3;FSAR=0,0,6;FSRF=11;FSRR=28;FWDB=-0.00382998,0.0551039,0.10146;FXX=0.039208;HRUN=5,2,7;LEN=2,1,1;MLLD=18.159,26.5158,8.03756;QD=2.54923;RBI=0.0155374,0.0773465,0.111989;REFB=-0.0393918,-0.0235047,-0.0422679;REVB=-0.0150579,-0.0542774,-0.0474071;RO=31;SAF=2,0,3;SAR=0,2,7;SRF=8;SRR=23;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.591043,-0.366325,0.0619816;STB=0.99406,0.5,0.548284;STBP=0.155,1,0.824;TYPE=mnp,snp,ins;VARB=0.0154932,0,-0.0250542;OID=.,.,.;OPOS=78605520,78605529,78605522;OREF=TG,A,-;OALT=GT,T,T;OMAPALT=GTTTTTTTTA,TGTTTTTTTT,TGTTTTTTTTA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/3:30:52:49:31:39:2,2,10:1,0,9:0.0204082,0,0.183673:0,2,7:2,0,3:8:23:0,0,6:1,0,3:11:28
chr12	79685913	.	C	A	447.02	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00839562;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.2266;QD=57.6801;RBI=0.00901541;REFB=0;REVB=0.00328499;RO=0;SAF=24;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.71661e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.16012e-05;OID=.;OPOS=79685913;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:7:24:0:0:7:24:0:0
chr12	80014907	.	A	C,T	1074.82	PASS	AF=0.368421,0.618421;AO=28,47;DP=76;FAO=28,47;FDP=76;FR=.;FRO=1;FSAF=11,31;FSAR=17,16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0094474,-0.000144161;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=114.884,179.092;QD=56.5693;RBI=0.0226593,0.00619183;REFB=-0.0726874,-0.0670118;REVB=0.0205959,0.00619015;RO=1;SAF=11,31;SAR=17,16;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0265944,0.0284823;STB=0.514276,0.515145;STBP=0.52,0.27;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00434077,0.00627706;OID=.,.;OPOS=80014907,80014907;OREF=A,A;OALT=C,T;OMAPALT=C,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:76:76:1:1:28,47:28,47:0.368421,0.618421:17,16:11,31:0:1:17,16:11,31:0:1
chr12	80190650	.	C	G	1399.28	PASS	AF=0.989011;AO=89;DP=92;FAO=90;FDP=91;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=42;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0120179;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.7001;QD=61.5067;RBI=0.0130103;REFB=-0.0335098;REVB=0.00498396;RO=0;SAF=48;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.30324e-08;STB=0.505153;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.000111844;OID=.;OPOS=80190650;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:92:91:0:1:89:90:0.989011:41:48:0:0:42:48:1:0
chr12	80712420	.	G	A	1282.0	PASS	AF=1;AO=82;DP=82;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0208762;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.317;QD=61.7832;RBI=0.0226583;REFB=0;REVB=0.0088081;RO=0;SAF=40;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.73412e-05;OID=.;OPOS=80712420;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:83:0:0:82:83:1:42:40:0:0:42:41:0:0
chr12	80735771	.	T	C	362.02	PASS	AF=1;AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00356461;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.52;QD=55.6949;RBI=0.00827524;REFB=0;REVB=0.00746815;RO=0;SAF=12;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.11106e-05;OID=.;OPOS=80735771;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:26:0:0:26:26:1:14:12:0:0:14:12:0:0
chr12	80737521	.	C	T	711.76	PASS	AF=0.962963;AO=51;DP=53;FAO=52;FDP=54;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00439156;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=178.747;QD=52.7233;RBI=0.006356;REFB=-0.0397199;REVB=0.00459488;RO=2;SAF=26;SAR=25;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000696368;STB=0.500713;STBP=0.884;TYPE=snp;VARB=3.32486e-07;OID=.;OPOS=80737521;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:53:54:2:2:51:52:0.962963:25:26:1:1:25:27:1:1
chr12	80747242	.	A	G	410.83	PASS	AF=1;AO=28;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0489847;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.2298;QD=56.6658;RBI=0.0501687;REFB=0;REVB=-0.010835;RO=0;SAF=8;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.75204e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000603349;OID=.;OPOS=80747242;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:28:29:1:20:8:0:0:20:9:0:0
chr12	80752660	.	A	G	820.14	PASS	AF=0.983051;AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0351627;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.669;QD=55.6029;RBI=0.0373099;REFB=-0.040309;REVB=-0.0124748;RO=1;SAF=33;SAR=25;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0184944;STB=0.509801;STBP=0.321;TYPE=snp;VARB=0.000435313;OID=.;OPOS=80752660;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:59:59:1:1:58:58:0.983051:25:33:0:1:25:33:0:1
chr12	80761430	.	G	A	834.4	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00851453;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.301;QD=57.545;RBI=0.00875214;REFB=0;REVB=-0.00202555;RO=0;SAF=30;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.43687e-05;OID=.;OPOS=80761430;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:28:30:0:0:28:30:0:0
chr12	80761465	.	G	A	902.62	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000309755;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=91.8836;QD=58.2336;RBI=0.0266746;REFB=0;REVB=-0.0266728;RO=0;SAF=33;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000127019;OID=.;OPOS=80761465;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:29:33:0:0:29:33:0:0
chr12	80765800	.	A	G	705.65	PASS	AF=0.978723;AO=45;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.000352057;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=259.313;QD=60.0553;RBI=0.0120361;REFB=-0.112206;REVB=0.012031;RO=1;SAF=21;SAR=24;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0191802;STB=0.511623;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.000324261;OID=.;OPOS=80765800;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:47:47:1:1:45:46:0.978723:24:21:0:1:25:21:1:0
chr12	80771813	.	G	A	664.04	PASS	AF=1;AO=42;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0160893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.471;QD=61.7713;RBI=0.0209028;REFB=0;REVB=0.013344;RO=0;SAF=15;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.13648e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000112914;OID=.;OPOS=80771813;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:42:43:1:27:15:0:0:27:16:0:0
chr12	80816492	.	C	T	689.36	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00753485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.2704;QD=62.6689;RBI=0.0355932;REFB=0;REVB=-0.0347865;RO=0;SAF=21;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000471465;OID=.;OPOS=80816492;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:23:21:0:0:23:21:0:0
chr12	80818876	.	A	G	2186.16	PASS	AF=0.985915;AO=141;DP=142;FAO=140;FDP=142;FR=.;FRO=2;FSAF=71;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0470707;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=53.606;QD=61.5819;RBI=0.048795;REFB=-0.0586501;REVB=-0.0128569;RO=1;SAF=71;SAR=70;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00674443;STB=0.507142;STBP=0.252;TYPE=snp;VARB=0.000434703;OID=.;OPOS=80818876;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:142:142:1:2:141:140:0.985915:70:71:0:1:69:71:0:2
chr12	80889829	.	T	A	501.1	PASS	AF=0.533333;AO=47;DP=89;FAO=48;FDP=90;FR=.;FRO=42;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=15;FSRR=27;FWDB=0.00621368;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.983;QD=22.2711;RBI=0.00893247;REFB=0.00251128;REVB=-0.00641711;RO=42;SAF=23;SAR=24;SRF=15;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113653;STB=0.566639;STBP=0.199;TYPE=snp;VARB=-0.00188025;OID=.;OPOS=80889829;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:90:42:42:47:48:0.533333:24:23:15:27:24:24:15:27
chr12	80899901	.	C	A	188.62	PASS	AF=0.527778;AO=18;DP=35;FAO=19;FDP=36;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=-0.00445533;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=297.604;QD=20.9581;RBI=0.00762655;REFB=-0.0118348;REVB=0.00618985;RO=16;SAF=5;SAR=13;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0956689;STB=0.583241;STBP=0.337;TYPE=snp;VARB=0.00998962;OID=.;OPOS=80899901;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:36:16:17:18:19:0.527778:13:5:6:10:14:5:7:10
chr12	80900397	.	C	G	200.38	PASS	AF=0.421053;AO=24;DP=57;FAO=24;FDP=57;FR=.;FRO=33;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=-0.0018699;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.4222;QD=14.0616;RBI=0.0611616;REFB=-0.0179025;REVB=-0.061133;RO=32;SAF=15;SAR=9;SRF=12;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.248844;STB=0.649228;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=0.0261153;OID=.;OPOS=80900397;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:32:33:24:24:0.421053:9:15:12:20:9:15:12:21
chr12	80935345	.	T	C	239.73	PASS	AF=0.3625;AO=29;DP=79;FAO=29;FDP=80;FR=.;FRO=51;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=31;FSRR=20;FWDB=0.0110929;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=100.476;QD=11.9865;RBI=0.0253137;REFB=-0.00193659;REVB=-0.0227537;RO=50;SAF=12;SAR=17;SRF=31;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.223905;STB=0.622045;STBP=0.11;TYPE=snp;VARB=0.00632893;OID=.;OPOS=80935345;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:80:50:51:29:29:0.3625:17:12:31:19:17:12:31:20
chr12	80936082	.	C	T	289.71	PASS	AF=0.508197;AO=31;DP=61;FAO=31;FDP=61;FR=.;FRO=30;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=0.00621809;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.774;QD=18.9973;RBI=0.00641088;REFB=0.00602366;REVB=0.00156038;RO=30;SAF=15;SAR=16;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0151978;STB=0.508469;STBP=0.909;TYPE=snp;VARB=-0.00375697;OID=.;OPOS=80936082;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:30:30:31:31:0.508197:16:15:14:16:16:15:14:16
chr12	81329536	.	A	C	244.07	PASS	AF=0.482143;AO=26;DP=55;FAO=27;FDP=56;FR=.;FRO=29;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=-0.0805649;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.7056;QD=17.4337;RBI=0.0961666;REFB=0.0051737;REVB=0.0525101;RO=28;SAF=17;SAR=9;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0813535;STB=0.523792;STBP=0.777;TYPE=snp;VARB=-0.00492628;OID=.;OPOS=81329536;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:56:28:29:26:27:0.482143:9:17:16:12:10:17:17:12
chr12	82783668	.	C	T	689.38	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00229088;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.486;QD=62.6708;RBI=0.0100147;REFB=0;REVB=-0.00974918;RO=0;SAF=20;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.30465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.67835e-05;OID=.;OPOS=82783668;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:24:20:0:0:24:20:0:0
chr12	82792787	.	C	A	574.98	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159991;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.002;QD=60.5244;RBI=0.0205507;REFB=0;REVB=0.0128981;RO=0;SAF=22;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.91122e-05;OID=.;OPOS=82792787;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:38:0:0:36:38:1:14:22:0:0:14:24:0:0
chr12	83290187	.	C	T	172.81	PASS	AF=0.8;AO=16;DP=21;FAO=16;FDP=20;FR=.;FRO=4;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0154086;FXX=0.0475964;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.51;QD=34.5616;RBI=0.0193035;REFB=0.00106648;REVB=-0.0116275;RO=5;SAF=9;SAR=7;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0702821;STB=0.562422;STBP=0.329;TYPE=snp;VARB=-0.000256019;OID=.;OPOS=83290187;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:21:20:5:4:16:16:0.8:7:9:2:3:7:9:1:3
chr12	83415719	.	G	C	86.3	PASS	AF=0.392857;AO=11;DP=28;FAO=11;FDP=28;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.0189359;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.1187;QD=12.3286;RBI=0.0313424;REFB=0.0178654;REVB=0.0249755;RO=17;SAF=9;SAR=2;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.298559;STB=0.680301;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=-0.0299029;OID=.;OPOS=83415719;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:28:28:17:17:11:11:0.392857:2:9:10:7:2:9:10:7
chr12	85277608	.	C	T	449.08	PASS	AF=0.52381;AO=44;DP=84;FAO=44;FDP=84;FR=.;FRO=40;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=-0.0365207;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.369;QD=21.3845;RBI=0.0563882;REFB=-0.00366544;REVB=-0.0429635;RO=40;SAF=24;SAR=20;SRF=18;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0822586;STB=0.545434;STBP=0.4;TYPE=snp;VARB=0.00403246;OID=.;OPOS=85277608;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:40:40:44:44:0.52381:20:24:18:22:20:24:18:22
chr12	85449465	.	T	A	45.35	PASS	AF=0.318182;AO=6;DP=22;FAO=7;FDP=22;FR=.;FRO=15;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=-0.00651799;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.681;QD=8.24619;RBI=0.017614;REFB=-0.0125905;REVB=0.0163636;RO=15;SAF=1;SAR=5;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.493865;STB=0.713674;STBP=0.21;TYPE=snp;VARB=0.0140824;OID=.;OPOS=85449465;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:22:22:15:15:6:7:0.318182:5:1:9:6:5:2:9:6
chr12	85556602	.	T	C	425.32	PASS	AF=0.477778;AO=43;DP=90;FAO=43;FDP=90;FR=.;FRO=47;FSAF=16;FSAR=27;FSRF=26;FSRR=21;FWDB=-0.0098909;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=193.088;QD=18.9032;RBI=0.0154017;REFB=-0.00633887;REVB=-0.011806;RO=47;SAF=16;SAR=27;SRF=26;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172514;STB=0.596169;STBP=0.098;TYPE=snp;VARB=0.00872902;OID=.;OPOS=85556602;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:47:47:43:43:0.477778:27:16:26:21:27:16:26:21
chr12	88440676	.	G	C	228.89	PASS	AF=0.358974;AO=28;DP=78;FAO=28;FDP=78;FR=.;FRO=50;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=29;FSRR=21;FWDB=-0.0123734;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.307;QD=11.7378;RBI=0.0162741;REFB=-0.0202429;REVB=-0.010571;RO=50;SAF=13;SAR=15;SRF=29;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127885;STB=0.573718;STBP=0.358;TYPE=snp;VARB=0.0223829;OID=.;OPOS=88440676;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:50:50:28:28:0.358974:15:13:29:21:15:13:29:21
chr12	88500847	.	T	C	290.67	PASS	AF=0.407407;AO=33;DP=81;FAO=33;FDP=81;FR=.;FRO=48;FSAF=22;FSAR=11;FSRF=25;FSRR=23;FWDB=0.047683;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=63.3681;QD=14.3539;RBI=0.0532014;REFB=-0.0135036;REVB=0.023595;RO=47;SAF=22;SAR=11;SRF=25;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147668;STB=0.591247;STBP=0.191;TYPE=snp;VARB=0.0226043;OID=.;OPOS=88500847;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:47:48:33:33:0.407407:11:22:25:22:11:22:25:23
chr12	88505078	.	T	C	508.24	PASS	AF=0.972222;AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00284389;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.0564;QD=56.4709;RBI=0.0229235;REFB=0.022149;REVB=0.0227464;RO=1;SAF=21;SAR=14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0217573;STB=0.511621;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=-0.000487247;OID=.;OPOS=88505078;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:36:36:1:1:35:35:0.972222:14:21:1:0:14:21:1:0
chr12	88508258	.	T	C	346.72	PASS	AF=0.564516;AO=34;DP=61;FAO=35;FDP=62;FR=.;FRO=27;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=-0.00578056;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.599;QD=22.3689;RBI=0.0170493;REFB=-0.0136895;REVB=0.0160394;RO=27;SAF=16;SAR=18;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0384274;STB=0.526787;STBP=0.667;TYPE=snp;VARB=0.00789414;OID=.;OPOS=88508258;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:62:27:27:34:35:0.564516:18:16:14:13:19:16:14:13
chr12	88547277	.	T	C	632.25	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0157207;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.909;QD=61.6826;RBI=0.0573262;REFB=0;REVB=0.0551286;RO=0;SAF=20;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00042077;OID=.;OPOS=88547277;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:21:20:0:0:21:20:0:0
chr12	89743223	.	G	A	1520.69	PASS	AF=1;AO=101;DP=102;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0114646;FXX=0.0192289;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.573;QD=59.635;RBI=0.0120314;REFB=0;REVB=-0.00364929;RO=0;SAF=59;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.99265e-05;OID=.;OPOS=89743223;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:102:102:0:0:101:102:1:42:59:0:0:43:59:0:0
chr12	89745477	.	C	A	219.2	PASS	AF=0.412698;AO=26;DP=63;FAO=26;FDP=63;FR=.;FRO=37;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=0.0524901;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.7988;QD=13.9172;RBI=0.0544414;REFB=-0.000514631;REVB=0.014445;RO=37;SAF=17;SAR=9;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150644;STB=0.586139;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.00228504;OID=.;OPOS=89745477;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:37:37:26:26:0.412698:9:17:19:18:9:17:19:18
chr12	89853408	.	G	A	110.52	PASS	AF=0.225;AO=17;DP=80;FAO=18;FDP=80;FR=.;FRO=62;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=31;FSRR=31;FWDB=-0.035623;FXX=0.0361402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.5577;QD=5.52607;RBI=0.0582787;REFB=-0.00731948;REVB=0.0461238;RO=58;SAF=4;SAR=13;SRF=26;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.290949;STB=0.680025;STBP=0.095;TYPE=snp;VARB=0.0176007;OID=.;OPOS=89853408;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:58:62:17:18:0.225:13:4:26:32:13:5:31:31
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chr12	89917518	.	A	G	159.47	PASS	AF=0.472222;AO=17;DP=36;FAO=17;FDP=36;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.0683548;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.9647;QD=17.7186;RBI=0.07046;REFB=-0.00946034;REVB=0.0170947;RO=19;SAF=10;SAR=7;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106788;STB=0.560984;STBP=0.473;TYPE=snp;VARB=0.0457466;OID=.;OPOS=89917518;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:19:19:17:17:0.472222:7:10:9:10:7:10:9:10
chr12	91348786	.	G	T	223.09	PASS	AF=0.462963;AO=25;DP=54;FAO=25;FDP=54;FR=.;FRO=29;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.000967884;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=190.442;QD=16.5253;RBI=0.0233439;REFB=-0.0336831;REVB=-0.0233238;RO=29;SAF=16;SAR=9;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153893;STB=0.587085;STBP=0.253;TYPE=snp;VARB=0.0263324;OID=.;OPOS=91348786;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:29:29:25:25:0.462963:9:16:14:15:9:16:14:15
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chr12	91449990	.	C	T	99.24	PASS	AF=0.444444;AO=12;DP=27;FAO=12;FDP=27;FR=.;FRO=15;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.018851;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.869;QD=14.7016;RBI=0.0188815;REFB=-0.0102585;REVB=0.00107358;RO=15;SAF=2;SAR=10;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.414557;STB=0.745806;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=0.0135799;OID=.;OPOS=91449990;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:15:15:12:12:0.444444:10:2:8:7:10:2:8:7
chr12	91502250	.	A	G	363.9	PASS	AF=0.469136;AO=38;DP=80;FAO=38;FDP=81;FR=.;FRO=43;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=16;FSRR=27;FWDB=0.00919683;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.062;QD=17.9702;RBI=0.0124363;REFB=0.0174652;REVB=-0.00837133;RO=42;SAF=14;SAR=24;SRF=15;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0114334;STB=0.502091;STBP=0.969;TYPE=snp;VARB=-0.016701;OID=.;OPOS=91502250;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:81:42:43:38:38:0.469136:24:14:15:27:24:14:16:27
chr12	92818482	.	C	T	175.78	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0120731;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.2032;QD=46.8759;RBI=0.0580761;REFB=0;REVB=-0.0568073;RO=0;SAF=10;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.63386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0029156;OID=.;OPOS=92818482;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:15:0:0:14:15:1:4:10:0:0:4:11:0:0
chr12	92818786	.	A	G	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0161444;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=257.002;QD=49.5992;RBI=0.0167919;REFB=0;REVB=-0.0046182;RO=0;SAF=11;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.46393e-05;OID=.;OPOS=92818786;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:7:11:0:0:7:11:0:0
chr12	92818999	.	G	T	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0904229;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.02;QD=51.9167;RBI=0.0913402;REFB=0;REVB=0.0129122;RO=0;SAF=5;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.78933e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000239738;OID=.;OPOS=92818999;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:16:5:0:0:16:5:0:0
chr12	92819139	.	A	C	429.05	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.104267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.8563;QD=57.2063;RBI=0.110064;REFB=0;REVB=0.0352503;RO=0;SAF=13;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00191253;OID=.;OPOS=92819139;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:30:0:0:29:30:1:16:13:0:0:16:14:0:0
chr12	92819699	.	A	G	217.4	PASS	AF=1;AO=17;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0760249;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.739;QD=48.3104;RBI=0.0810291;REFB=0;REVB=-0.0280342;RO=0;SAF=7;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000321637;OID=.;OPOS=92819699;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:17:18:1:10:7:0:0:11:7:0:0
chr12	92821860	.	CT	C,CC	1939.98	PASS	AF=0.984375,0.015625;AO=121,7;DP=128;FAO=126,2;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=51,2;FSAR=75,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00873215,0.00173225;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=104.073,87.19;QD=60.6244;RBI=0.0154884,0.00276872;REFB=0,0;REVB=0.0127921,-0.00215988;RO=0;SAF=48,5;SAR=73,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=2.99806e-08,3.27427e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.000765767,-0.00378399;OID=.,.;OPOS=92821861,92821861;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.984375,0.015625:121,7:128:126,2:128:0:51,2:75,0:0:0:3:0:48,5:73,2:0:0
chr12	92822903	.	G	C	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0553165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.989;QD=51.9156;RBI=0.0554661;REFB=0;REVB=0.00407006;RO=0;SAF=8;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000142534;OID=.;OPOS=92822903;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:13:8:0:0:13:8:0:0
chr12	93102295	.	G	A	1078.01	PASS	AF=1;AO=71;DP=73;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00519773;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.399;QD=59.8893;RBI=0.0106492;REFB=0;REVB=0.00929452;RO=0;SAF=33;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.68164e-05;OID=.;OPOS=93102295;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:72:0:0:71:72:1:38:33:0:0:39:33:0:0
chr12	93147907	.	A	T	1415.38	PASS	AF=1;AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0619117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.179;QD=62.9058;RBI=0.092244;REFB=0;REVB=0.0683806;RO=0;SAF=42;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000450936;OID=.;OPOS=93147907;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:90:90:0:0:90:90:1:48:42:0:0:48:42:0:0
chr12	93150102	.	T	C	619.27	PASS	AF=1;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00119714;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.152;QD=61.9268;RBI=0.0463518;REFB=0;REVB=0.0463363;RO=0;SAF=27;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000116291;OID=.;OPOS=93150102;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:40:0:0:40:40:1:13:27:0:0:13:27:0:0
chr12	93155535	.	G	A	785.0	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00549863;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.589;QD=57.091;RBI=0.00822457;REFB=0;REVB=0.00611626;RO=0;SAF=21;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.7502e-06;OID=.;OPOS=93155535;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:34:21:0:0:34:21:0:0
chr12	93166538	.	A	G	1231.58	PASS	AF=0.987805;AO=80;DP=81;FAO=81;FDP=82;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00883498;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=282.52;QD=60.0771;RBI=0.0170701;REFB=-0.117138;REVB=0.0146059;RO=1;SAF=20;SAR=60;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00782698;STB=0.504064;STBP=0.623;TYPE=snp;VARB=-7.7343e-06;OID=.;OPOS=93166538;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:81:82:1:1:80:81:0.987805:60:20:0:1:61:20:0:1
chr12	93196422	.	T	G	242.92	PASS	AF=0.807692;AO=21;DP=26;FAO=21;FDP=26;FR=.;FRO=5;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.0157473;FXX=0;HRUN=9;LEN=1;MLLD=219.565;QD=37.3715;RBI=0.0157968;REFB=-0.17625;REVB=0.00125003;RO=4;SAF=10;SAR=11;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00699796;STB=0.514692;STBP=0.783;TYPE=snp;VARB=0.0023893;OID=.;OPOS=93196422;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:27:26:26:4:5:21:21:0.807692:11:10:2:2:11:10:2:3
chr12	93202801	.	C	T	1417.69	PASS	AF=0.989247;AO=83;DP=84;FAO=92;FDP=93;FR=.;FRO=1;FSAF=49;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00534558;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.063;QD=60.9757;RBI=0.0501154;REFB=-0.0204054;REVB=0.0498294;RO=1;SAF=48;SAR=35;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0133394;STB=0.505746;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.00124145;OID=.;OPOS=93202801;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:84:93:1:1:83:92:0.989247:35:48:0:1:43:49:0:1
chr12	93692934	.	G	A	115.19	PASS	AF=0.325581;AO=14;DP=43;FAO=14;FDP=43;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=1.0432e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.615;QD=10.7151;RBI=0.0166312;REFB=-0.0139121;REVB=-0.0166311;RO=28;SAF=9;SAR=5;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124419;STB=0.587501;STBP=0.438;TYPE=snp;VARB=0.0195228;OID=.;OPOS=93692934;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:28:29:14:14:0.325581:5:9:15:13:5:9:15:14
chr12	93967035	.	A	G	772.73	PASS	AF=0.622807;AO=69;DP=112;FAO=71;FDP=114;FR=.;FRO=43;FSAF=29;FSAR=42;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=0.011904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.06;QD=27.1135;RBI=0.0267618;REFB=-0.023293;REVB=0.0239685;RO=43;SAF=28;SAR=41;SRF=22;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0763463;STB=0.539671;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.0139276;OID=.;OPOS=93967035;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:114:43:43:69:71:0.622807:41:28:22:21:42:29:22:21
chr12	93967755	.	T	C	74.36	PASS	AF=0.357143;AO=10;DP=28;FAO=10;FDP=28;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.00177102;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.995;QD=10.6228;RBI=0.0176354;REFB=-0.025474;REVB=0.0175463;RO=18;SAF=6;SAR=4;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0487512;STB=0.529352;STBP=0.832;TYPE=snp;VARB=0.0418216;OID=.;OPOS=93967755;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:28:28:18:18:10:10:0.357143:4:6:10:8:4:6:10:8
chr12	93968197	.	T	C	92.55	PASS	AF=0.3;AO=12;DP=40;FAO=12;FDP=40;FR=.;FRO=28;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=0.0374479;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.068;QD=9.25531;RBI=0.0422905;REFB=-0.0200381;REVB=0.0196505;RO=28;SAF=8;SAR=4;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116751;STB=0.571306;STBP=0.569;TYPE=snp;VARB=0.061445;OID=.;OPOS=93968197;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:40:40:28:28:12:12:0.3:4:8:16:12:4:8:16:12
chr12	93968256	.	G	A	89.78	PASS	AF=0.25;AO=12;DP=48;FAO=12;FDP=48;FR=.;FRO=36;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=0.0025931;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.728;QD=7.48152;RBI=0.0102868;REFB=-0.00058942;REVB=-0.00995458;RO=35;SAF=7;SAR=5;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0834237;STB=0.562832;STBP=0.646;TYPE=snp;VARB=0.00340498;OID=.;OPOS=93968256;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:48:48:35:36:12:12:0.25:5:7:18:17:5:7:18:18
chr12	93968288	.	C	A	71.69	PASS	AF=0.277778;AO=10;DP=36;FAO=10;FDP=36;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=0.0178487;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.343;QD=7.96563;RBI=0.0195868;REFB=0.00712638;REVB=0.00806638;RO=26;SAF=5;SAR=5;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0896548;STB=0.555446;STBP=0.7;TYPE=snp;VARB=-0.0132483;OID=.;OPOS=93968288;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:71:36:36:26:26:10:10:0.277778:5:5:11:15:5:5:11:15
chr12	93968353	.	C	CT,T	144.27	PASS	AF=0.369565,0;AO=15,2;DP=47;FAO=17,0;FDP=46;FR=.;FRO=29;FSAF=7,0;FSAR=10,0;FSRF=20;FSRR=9;FWDB=-0.0277722,-0.0333987;FXX=0;HRUN=0,3;LEN=1,1;MLLD=78.9353,82.113;QD=12.5449;RBI=0.0330817,0.0356634;REFB=-0.00765247,-0.00314121;REVB=0.0179752,0.0125063;RO=29;SAF=7,0;SAR=8,2;SRF=20;SRR=9;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.246639,-0.562737;STB=0.669787,0.5;STBP=0.1,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.0327209,0;OID=.,.;OPOS=93968354,93968353;OREF=-,C;OALT=T,T;OMAPALT=CT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:46:29:29:15,2:17,0:0.369565,0:8,2:7,0:20:9:10,0:7,0:20:9
chr12	94132186	.	T	A	428.39	PASS	AF=0.696429;AO=39;DP=56;FAO=39;FDP=56;FR=.;FRO=17;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.00741309;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.942;QD=30.5991;RBI=0.0134994;REFB=-0.0341747;REVB=-0.0112818;RO=16;SAF=23;SAR=16;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0492402;STB=0.536862;STBP=0.423;TYPE=snp;VARB=0.0109137;OID=.;OPOS=94132186;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:16:17:39:39:0.696429:16:23:8:8:16:23:8:9
chr12	94243853	.	C	T	140.76	PASS	AF=0.333333;AO=17;DP=54;FAO=18;FDP=54;FR=.;FRO=36;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=21;FSRR=15;FWDB=-0.0113311;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.676;QD=10.427;RBI=0.0121928;REFB=-0.0193302;REVB=-0.00450221;RO=36;SAF=10;SAR=7;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00577413;STB=0.518808;STBP=0.87;TYPE=snp;VARB=0.0285716;OID=.;OPOS=94243853;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:36:36:17:18:0.333333:7:10:21:15:8:10:21:15
chr12	94645255	.	A	G	363.07	PASS	AF=0.41;AO=41;DP=101;FAO=41;FDP=100;FR=.;FRO=59;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=30;FSRR=29;FWDB=0.00961895;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=309.779;QD=14.5227;RBI=0.0132863;REFB=-0.000480908;REVB=-0.00916531;RO=59;SAF=20;SAR=21;SRF=30;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0215717;STB=0.512189;STBP=0.864;TYPE=snp;VARB=0.000713973;OID=.;OPOS=94645255;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:100:59:59:41:41:0.41:21:20:30:29:21:20:30:29
chr12	94671743	.	G	C	1172.0	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0513913;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.778;QD=60.8829;RBI=0.0571103;REFB=0;REVB=0.0249103;RO=0;SAF=32;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.3492e-05;OID=.;OPOS=94671743;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:77:0:0:76:77:1:44:32:0:0:44:33:0:0
chr12	94673509	.	GC	G	44.27	PASS	AF=0.4375;AO=6;DP=17;FAO=7;FDP=16;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.0204862;FXX=0.0587889;HRUN=5;LEN=1;MLLD=18.1038;QD=11.0682;RBI=0.0629522;REFB=0.0400953;REVB=0.0595256;RO=8;SAF=4;SAR=2;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0.365854;SSSB=0.162008;STB=0.509065;STBP=0.952;TYPE=del;VARB=-0.0412527;OID=.;OPOS=94673510;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.4375:6:17:7:16:9:4:3:5:4:44:8:4:2:4:4
chr12	94769758	.	A	G	1116.95	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00415182;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=262.815;QD=60.3754;RBI=0.00662246;REFB=0;REVB=-0.0051594;RO=0;SAF=39;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.80413e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.80126e-07;OID=.;OPOS=94769758;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:35:39:0:0:35:39:0:0
chr12	94772742	.	C	T	99.5	PASS	AF=0.413793;AO=12;DP=30;FAO=12;FDP=29;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=-0.111322;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.345;QD=13.7246;RBI=0.112506;REFB=-0.00530008;REVB=-0.0162765;RO=18;SAF=5;SAR=7;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0292886;STB=0.538858;STBP=0.774;TYPE=snp;VARB=0.0071398;OID=.;OPOS=94772742;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:29:18:17:12:12:0.413793:7:5:7:11:7:5:6:11
chr12	94909304	.	A	G	207.06	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.113589;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.721;QD=48.7208;RBI=0.12027;REFB=0;REVB=0.0395277;RO=0;SAF=2;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00195678;OID=.;OPOS=94909304;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:17:0:0:16:17:1:14:2:0:0:14:3:0:0
chr12	94955644	.	G	T	166.49	PASS	AF=0.328358;AO=22;DP=67;FAO=22;FDP=67;FR=.;FRO=45;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=23;FSRR=22;FWDB=-0.00362884;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.447;QD=9.93969;RBI=0.00836617;REFB=-0.00190765;REVB=-0.00753819;RO=44;SAF=9;SAR=13;SRF=23;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129805;STB=0.56902;STBP=0.426;TYPE=snp;VARB=0.00315747;OID=.;OPOS=94955644;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:44:45:22:22:0.328358:13:9:23:21:13:9:23:22
chr12	94972290	.	C	T	685.11	PASS	AF=0.944444;AO=51;DP=54;FAO=51;FDP=54;FR=.;FRO=3;FSAF=28;FSAR=23;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.060043;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.5885;QD=50.749;RBI=0.0825279;REFB=-0.0702395;REVB=0.0566188;RO=3;SAF=28;SAR=23;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0124243;STB=0.506605;STBP=0.729;TYPE=snp;VARB=0.0247766;OID=.;OPOS=94972290;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:54:54:3:3:51:51:0.944444:23:28:2:1:23:28:2:1
chr12	94975799	.	G	A	762.24	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00289203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.541;QD=63.5196;RBI=0.00704776;REFB=0;REVB=0.00642705;RO=0;SAF=16;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.00708e-05;OID=.;OPOS=94975799;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:48:0:0:47:48:1:31:16:0:0:31:17:0:0
chr12	94976084	.	T	C	689.38	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00294835;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.305;QD=62.6711;RBI=0.0128613;REFB=0;REVB=0.0125188;RO=0;SAF=24;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.30465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.9811e-05;OID=.;OPOS=94976084;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:20:24:0:0:20:24:0:0
chr12	94976159	.	T	C	123.97	PASS	AF=0.482759;AO=14;DP=29;FAO=14;FDP=29;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=-0.0449933;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.232;QD=17.0991;RBI=0.0488419;REFB=0.000259601;REVB=-0.0190033;RO=13;SAF=6;SAR=8;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0930297;STB=0.58811;STBP=0.39;TYPE=snp;VARB=-0.000882259;OID=.;OPOS=94976159;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:13:15:14:14:0.482759:8:6:7:6:8:6:9:6
chr12	95456367	.	T	C	188.93	PASS	AF=0.352941;AO=24;DP=67;FAO=24;FDP=68;FR=.;FRO=44;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=29;FWDB=-0.019588;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=330.366;QD=11.1137;RBI=0.0197461;REFB=-0.00312558;REVB=-0.00249437;RO=43;SAF=10;SAR=14;SRF=15;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0785921;STB=0.55124;STBP=0.579;TYPE=snp;VARB=0.00524531;OID=.;OPOS=95456367;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:68:43:44:24:24:0.352941:14:10:15:28:14:10:15:29
chr12	95470600	.	A	ATCTT,T	1020.43	PASS	AF=1,0;AO=61,4;DP=87;FAO=69,0;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=32,0;FSAR=37,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0223891,0.00508499;FXX=0.0416609;HRUN=1,1;LEN=4,1;MLLD=197.833,86.2638;QD=59.1555;RBI=0.0242751,0.0168023;REFB=0,0;REVB=0.00938121,-0.0160144;RO=15;SAF=30,4;SAR=31,0;SRF=9;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.039906,0.643696;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=-0.000686188,0;OID=.,.;OPOS=95470601,95470600;OREF=-,A;OALT=TCTT,T;OMAPALT=ATCTT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:87:69:15:0:61,4:69,0:1,0:31,0:30,4:9:6:37,0:32,0:0:0
chr12	95500727	.	C	G	400.41	PASS	AF=0.966667;AO=29;DP=30;FAO=29;FDP=30;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0209057;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.3693;QD=53.3884;RBI=0.0828067;REFB=-0.0381621;REVB=0.0801243;RO=0;SAF=19;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.523793;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=0.00183158;OID=.;OPOS=95500727;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:30:30:0:1:29:29:0.966667:10:19:0:0:10:19:0:1
chr12	95604290	.	T	C	213.54	PASS	AF=0.45283;AO=24;DP=53;FAO=24;FDP=53;FR=.;FRO=29;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.00199415;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.869;QD=16.1159;RBI=0.00985489;REFB=0.00990438;REVB=-0.00965103;RO=28;SAF=14;SAR=10;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0802602;STB=0.555509;STBP=0.493;TYPE=snp;VARB=-0.00633029;OID=.;OPOS=95604290;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:28:29:24:24:0.45283:10:14:14:14:10:14:14:15
chr12	95637234	.	C	T	65.29	PASS	AF=0.391304;AO=9;DP=23;FAO=9;FDP=23;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.0301313;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.5003;QD=11.3542;RBI=0.0312181;REFB=-0.019905;REVB=0.00816549;RO=14;SAF=5;SAR=4;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0163296;STB=0.509782;STBP=0.951;TYPE=snp;VARB=0.0306326;OID=.;OPOS=95637234;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:23:23:14:14:9:9:0.391304:4:5:8:6:4:5:8:6
chr12	95637251	.	CT	C	38.36	PASS	AF=0.45;AO=9;DP=20;FAO=9;FDP=20;FR=.;FRO=11;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=-0.0440491;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=9.52461;QD=7.67294;RBI=0.155131;REFB=-0.0600943;REVB=0.148745;RO=10;SAF=7;SAR=2;SRF=3;SRR=7;SSEN=0.380435;SSEP=0;SSSB=0.43731;STB=0.77716;STBP=0.042;TYPE=del;VARB=0.115986;OID=.;OPOS=95637252;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.45:9:20:9:20:11:7:2:3:8:37:10:7:2:3:7
chr12	95693943	.	G	A	864.01	PASS	AF=0.518072;AO=85;DP=167;FAO=86;FDP=166;FR=.;FRO=80;FSAF=48;FSAR=38;FSRF=34;FSRR=46;FWDB=-0.00851845;FXX=0.0119041;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.127;QD=20.8194;RBI=0.00932193;REFB=-0.00115434;REVB=-0.00378607;RO=79;SAF=48;SAR=37;SRF=33;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128865;STB=0.564059;STBP=0.107;TYPE=snp;VARB=0.00132126;OID=.;OPOS=95693943;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:167:166:79:80:85:86:0.518072:37:48:33:46:38:48:34:46
chr12	95694394	.	G	A	613.36	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0193653;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.88;QD=61.336;RBI=0.0195924;REFB=0;REVB=-0.00297415;RO=0;SAF=16;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.67381e-05;OID=.;OPOS=95694394;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:24:16:0:0:24:16:0:0
chr12	95695804	.	C	A	99.23	PASS	AF=0.444444;AO=12;DP=27;FAO=12;FDP=27;FR=.;FRO=15;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=-0.0154308;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.88;QD=14.7013;RBI=0.0159271;REFB=-0.00762112;REVB=0.00394474;RO=15;SAF=3;SAR=9;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16979;STB=0.599822;STBP=0.399;TYPE=snp;VARB=0.0106438;OID=.;OPOS=95695804;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:15:15:12:12:0.444444:9:3:6:9:9:3:6:9
chr12	95927762	.	T	C	1106.73	PASS	AF=0.974359;AO=75;DP=78;FAO=76;FDP=78;FR=.;FRO=2;FSAF=41;FSAR=35;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0193087;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.6324;QD=56.7554;RBI=0.0506885;REFB=-0.115185;REVB=0.0468668;RO=2;SAF=41;SAR=34;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0225198;STB=0.511902;STBP=0.214;TYPE=snp;VARB=0.00397674;OID=.;OPOS=95927762;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:78:78:2:2:75:76:0.974359:34:41:2:0:35:41:2:0
chr12	96284650	.	A	G	805.16	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000447306;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.976;QD=64.4124;RBI=0.0404754;REFB=0;REVB=-0.0404729;RO=0;SAF=27;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000135677;OID=.;OPOS=96284650;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:23:27:0:0:23:27:0:0
chr12	96288860	.	T	C	1937.88	PASS	AF=0.992126;AO=126;DP=127;FAO=126;FDP=127;FR=.;FRO=1;FSAF=62;FSAR=64;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0588643;FXX=0.00781189;HRUN=3;LEN=1;MLLD=174.792;QD=61.0357;RBI=0.0627552;REFB=0.00992392;REVB=0.0217534;RO=1;SAF=62;SAR=64;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00760253;STB=0.503999;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=4.71323e-05;OID=.;OPOS=96288860;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:127:127:1:1:126:126:0.992126:64:62:1:0:64:62:1:0
chr12	96337225	.	C	T	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.035516;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.484;QD=33.4283;RBI=0.0459432;REFB=0;REVB=-0.0291443;RO=0;SAF=5;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000113551;OID=.;OPOS=96337225;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:1:5:0:0:1:5:0:0
chr12	96346594	.	T	C	538.55	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0187275;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.9834;QD=59.8389;RBI=0.0274906;REFB=0;REVB=-0.020125;RO=0;SAF=19;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0007108;OID=.;OPOS=96346594;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:17:19:0:0:17:19:0:0
chr12	96374562	.	T	TC	514.11	PASS	AF=1;AO=5;DP=50;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0232337;FXX=0.020404;HRUN=0;LEN=1;MLLD=207.319;QD=42.8422;RBI=0.113378;REFB=0;REVB=-0.110972;RO=45;SAF=1;SAR=4;SRF=22;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.332883;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00754264;OID=.;OPOS=96374563;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:5:50:48:48:0:21:27:0:0:3:45:1:4:22:23
chr12	96374563	.	T	C	619.89	PASS	AF=0.877551;AO=43;DP=49;FAO=43;FDP=49;FR=.;FRO=6;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.0025947;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=274.856;QD=50.6036;RBI=0.00584116;REFB=0.00945634;REVB=0.00523323;RO=5;SAF=21;SAR=22;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0563136;STB=0.539468;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=-0.00031254;OID=.;OPOS=96374563;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:32:49:49:5:6:43:43:0.877551:22:21:1:4:22:21:1:5
chr12	96374614	.	C	T	447.0	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0190219;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.362;QD=57.6776;RBI=0.0243047;REFB=0;REVB=0.0151289;RO=0;SAF=13;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.33668e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.16331e-05;OID=.;OPOS=96374614;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:18:13:0:0:18:13:0:0
chr12	96384249	.	T	C	419.37	PASS	AF=0.967742;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0134504;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.6129;QD=54.1122;RBI=0.0349732;REFB=-0.018032;REVB=0.0322833;RO=1;SAF=16;SAR=14;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0321345;STB=0.51723;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.00221032;OID=.;OPOS=96384249;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:31:31:1:1:30:30:0.967742:14:16:0:1:14:16:0:1
chr12	96387621	.	A	G	264.01	PASS	AF=0.434783;AO=30;DP=69;FAO=30;FDP=69;FR=.;FRO=39;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=-0.0246112;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.7086;QD=15.3052;RBI=0.0300511;REFB=0.0234133;REVB=-0.0172441;RO=39;SAF=14;SAR=16;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.071675;STB=0.540514;STBP=0.612;TYPE=snp;VARB=-0.0308912;OID=.;OPOS=96387621;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:39:39:30:30:0.434783:16:14:21:18:16:14:21:18
chr12	96387765	.	T	A	353.94	PASS	AF=0.431818;AO=38;DP=88;FAO=38;FDP=88;FR=.;FRO=50;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=24;FSRR=26;FWDB=-0.00618157;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.5365;QD=16.0881;RBI=0.00742324;REFB=-0.0150903;REVB=-0.00411009;RO=49;SAF=23;SAR=15;SRF=23;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137533;STB=0.57217;STBP=0.256;TYPE=snp;VARB=0.0105136;OID=.;OPOS=96387765;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:49:50:38:38:0.431818:15:23:23:26:15:23:24:26
chr12	96661610	.	TAAAAG	T	102.69	PASS	AF=0.4;AO=16;DP=40;FAO=16;FDP=40;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=-0.00660841;FXX=0;HRUN=4;LEN=5;MLLD=266.677;QD=10.2687;RBI=0.00883351;REFB=0.00146269;REVB=0.00586172;RO=17;SAF=8;SAR=8;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0796379;STB=0.524969;STBP=0.821;TYPE=del;VARB=-0.00192438;OID=.;OPOS=96661611;OREF=AAAAG;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.4:16:40:16:40:24:8:8:11:13:99:17:8:8:10:7
chr12	96821251	.	A	T	746.37	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.083804;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.6253;QD=63.521;RBI=0.104033;REFB=0;REVB=0.0616423;RO=0;SAF=18;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00200493;OID=.;OPOS=96821251;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:29:18:0:0:29:18:0:0
chr12	96900801	.	G	T	731.19	PASS	AF=1;AO=51;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=8.30028e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.509;QD=56.2455;RBI=0.00903499;REFB=0;REVB=-0.00903461;RO=0;SAF=30;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00211489;OID=.;OPOS=96900801;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:51:52:1:21:30:0:0:21:31:0:0
chr12	96992494	.	C	T	907.07	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0176839;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.479;QD=57.5916;RBI=0.0410967;REFB=0;REVB=-0.0370974;RO=0;SAF=31;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.73709e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.24974e-05;OID=.;OPOS=96992494;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:63:0:0:60:63:1:29:31:0:0:29:34:0:0
chr12	97098549	.	T	C	563.53	PASS	AF=0.974359;AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0115615;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.8103;QD=57.7983;RBI=0.0229387;REFB=-0.112374;REVB=-0.019812;RO=1;SAF=17;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0217908;STB=0.511622;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.00356117;OID=.;OPOS=97098549;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:39:39:1:1:38:38:0.974359:21:17:0:1:21:17:0:1
chr12	97102578	.	G	A	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0440998;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.5396;QD=51.1835;RBI=0.0441631;REFB=0;REVB=0.00236537;RO=0;SAF=7;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00144555;OID=.;OPOS=97102578;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:13:7:0:0:13:7:0:0
chr12	97114231	.	G	A	575.79	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0681488;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.6787;QD=60.6093;RBI=0.0689125;REFB=0;REVB=-0.0102313;RO=0;SAF=21;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.53998e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000557118;OID=.;OPOS=97114231;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:17:21:0:0:17:21:0:0
chr12	97136218	.	T	C	651.09	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0176045;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.383;QD=62.0088;RBI=0.0964228;REFB=0;REVB=0.0948021;RO=0;SAF=25;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.98888e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000790158;OID=.;OPOS=97136218;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:17:25:0:0:17:25:0:0
chr12	97136239	.	G	A	769.49	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0102649;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.929;QD=56.9989;RBI=0.0103194;REFB=0;REVB=0.0010594;RO=0;SAF=29;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.36022e-05;OID=.;OPOS=97136239;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:25:29:0:0:25:29:0:0
chr12	97254620	.	G	A	535.37	PASS	AF=0.459677;AO=56;DP=122;FAO=57;FDP=124;FR=.;FRO=67;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=36;FSRR=31;FWDB=-0.0447182;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.352;QD=17.2699;RBI=0.0447202;REFB=0.000546327;REVB=0.00042417;RO=66;SAF=31;SAR=25;SRF=36;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00796988;STB=0.513168;STBP=0.801;TYPE=snp;VARB=-0.00034056;OID=.;OPOS=97254620;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:122:124:66:67:56:57:0.459677:25:31:36:30:25:32:36:31
chr12	98115538	.	A	T	58.14	PASS	AF=0.470588;AO=8;DP=17;FAO=8;FDP=17;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.0379553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.9878;QD=13.6805;RBI=0.0697241;REFB=0.00261071;REVB=-0.058488;RO=9;SAF=6;SAR=2;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0926992;STB=0.55541;STBP=0.693;TYPE=snp;VARB=-0.00481509;OID=.;OPOS=98115538;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:17:17:9:9:8:8:0.470588:2:6:6:3:2:6:6:3
chr12	98332904	.	TCA	T	444.75	PASS	AF=1;AO=29;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00809588;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=2;MLLD=270.925;QD=57.3877;RBI=0.00860595;REFB=0;REVB=-0.00291875;RO=0;SAF=15;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00031578;OID=.;OPOS=98332905;OREF=CA;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:29:31:31:31:0:15:16:0:0:4:0:15:14:0:0
chr12	98897267	.	C	T	731.52	PASS	AF=1;AO=45;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0170333;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.2286;QD=63.6103;RBI=0.0233178;REFB=0;REVB=0.0159244;RO=0;SAF=18;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.94616e-05;OID=.;OPOS=98897267;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:45:46:1:27:18:0:0:28:18:0:0
chr12	98995408	.	C	A	351.0	PASS	AF=0.583333;AO=35;DP=60;FAO=35;FDP=60;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=23;FSRF=5;FSRR=20;FWDB=0.0234884;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.89;QD=23.3997;RBI=0.0239294;REFB=-0.0162129;REVB=0.00457277;RO=25;SAF=12;SAR=23;SRF=5;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125881;STB=0.568871;STBP=0.273;TYPE=snp;VARB=0.0117585;OID=.;OPOS=98995408;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:25:25:35:35:0.583333:23:12:5:20:23:12:5:20
chr12	99007623	.	C	T	297.64	PASS	AF=0.44;AO=33;DP=75;FAO=33;FDP=75;FR=.;FRO=42;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=26;FSRR=16;FWDB=-0.0040895;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.7749;QD=15.8739;RBI=0.00777895;REFB=-0.0316204;REVB=-0.00661726;RO=41;SAF=13;SAR=20;SRF=25;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.211259;STB=0.624925;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.0338056;OID=.;OPOS=99007623;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:41:42:33:33:0.44:20:13:25:16:20:13:26:16
chr12	99477625	.	T	C	772.51	PASS	AF=0.98;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0489033;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.0234;QD=61.8011;RBI=0.0600115;REFB=0.0218816;REVB=-0.034783;RO=1;SAF=19;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0241219;STB=0.512815;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=-0.00457002;OID=.;OPOS=99477625;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:50:50:1:1:49:49:0.98:30:19:1:0:30:19:1:0
chr12	99640428	.	T	C	1453.49	PASS	AF=1;AO=92;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00177386;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.603;QD=63.1954;RBI=0.00501893;REFB=0;REVB=0.004695;RO=0;SAF=47;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.9386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.08544e-06;OID=.;OPOS=99640428;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:92:92:0:0:92:92:1:45:47:0:0:45:47:0:0
chr12	99640557	.	T	C	1157.84	PASS	AF=1;AO=76;DP=77;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0384695;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.625;QD=60.9389;RBI=0.0385608;REFB=0;REVB=0.00265235;RO=0;SAF=39;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000113809;OID=.;OPOS=99640557;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:76:0:0:76:76:1:37:39:0:0:37:39:0:0
chr12	100453787	.	T	C	156.36	PASS	AF=0.615385;AO=16;DP=26;FAO=16;FDP=26;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.027206;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.509;QD=24.0556;RBI=0.0272215;REFB=-0.0182913;REVB=-0.000918384;RO=10;SAF=6;SAR=10;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.222788;STB=0.624844;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=0.0137667;OID=.;OPOS=100453787;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:26:26:10:10:16:16:0.615385:10:6:7:3:10:6:7:3
chr12	100795931	.	G	A	148.57	PASS	AF=0.31746;AO=20;DP=64;FAO=20;FDP=63;FR=.;FRO=43;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=-0.0516872;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.6896;QD=9.43302;RBI=0.103495;REFB=-0.0203891;REVB=-0.0896643;RO=43;SAF=14;SAR=6;SRF=22;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.229088;STB=0.636222;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=0.0398251;OID=.;OPOS=100795931;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:63:43:43:20:20:0.31746:6:14:22:21:6:14:22:21
chr12	100813976	.	A	C	327.28	PASS	AF=0.472973;AO=35;DP=74;FAO=35;FDP=74;FR=.;FRO=39;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=0.0225991;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.0705;QD=17.691;RBI=0.0579736;REFB=-0.0181793;REVB=-0.0533874;RO=39;SAF=16;SAR=19;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.052552;STB=0.529395;STBP=0.632;TYPE=snp;VARB=0.0196687;OID=.;OPOS=100813976;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:39:39:35:35:0.472973:19:16:20:19:19:16:20:19
chr12	101017445	.	T	C	1588.5	PASS	AF=1;AO=97;DP=97;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0061633;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.853;QD=64.1819;RBI=0.0280535;REFB=0;REVB=0.0273681;RO=0;SAF=54;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.50386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.25412e-05;OID=.;OPOS=101017445;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:97:99:0:0:97:99:1:43:54:0:0:44:55:0:0
chr12	101133644	.	C	T	303.87	PASS	AF=0.5;AO=32;DP=65;FAO=32;FDP=64;FR=.;FRO=32;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=0.00392602;FXX=0.0302984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.969;QD=18.9916;RBI=0.0157853;REFB=-0.0114076;REVB=0.0152893;RO=29;SAF=18;SAR=14;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0815867;STB=0.515926;STBP=0.819;TYPE=snp;VARB=0.0135971;OID=.;OPOS=101133644;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:64:29:32:32:32:0.5:14:18:19:10:14:18:19:13
chr12	101520689	.	A	G	266.98	PASS	AF=0.5;AO=28;DP=57;FAO=29;FDP=58;FR=.;FRO=29;FSAF=21;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=0.0308353;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.453;QD=18.4121;RBI=0.0313683;REFB=-0.00655624;REVB=-0.00575823;RO=29;SAF=21;SAR=7;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.32921;STB=0.66528;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.011379;OID=.;OPOS=101520689;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:58:29:29:28:29:0.5:7:21:12:17:8:21:12:17
chr12	101522078	.	C	G	362.64	PASS	AF=0.528571;AO=36;DP=69;FAO=37;FDP=70;FR=.;FRO=33;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=12;FWDB=-0.00259773;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.5145;QD=20.722;RBI=0.0321981;REFB=-0.00768747;REVB=0.0320931;RO=32;SAF=18;SAR=18;SRF=20;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106302;STB=0.570401;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.0103207;OID=.;OPOS=101522078;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:70:32:33:36:37:0.528571:18:18:20:12:19:18:21:12
chr12	101552075	.	G	A	1212.4	PASS	AF=1;AO=79;DP=80;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.04652;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.3039;QD=61.3876;RBI=0.0470496;REFB=0;REVB=0.00703968;RO=0;SAF=35;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.37809e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0004413;OID=.;OPOS=101552075;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:80:79:0:0:79:79:1:44:35:0:0:44:35:0:0
chr12	101680131	.	T	C	545.26	PASS	AF=0.588235;AO=50;DP=85;FAO=50;FDP=85;FR=.;FRO=35;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=0.00734135;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.632;QD=25.6592;RBI=0.0112025;REFB=0.0169935;REVB=0.00846168;RO=35;SAF=26;SAR=24;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0473207;STB=0.52586;STBP=0.592;TYPE=snp;VARB=-0.0049141;OID=.;OPOS=101680131;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:35:35:50:50:0.588235:24:26:16:19:24:26:16:19
chr12	101683929	.	C	T	543.63	PASS	AF=1;AO=36;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159661;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.084;QD=58.7708;RBI=0.0163855;REFB=0;REVB=0.00368338;RO=0;SAF=23;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.21415e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000137053;OID=.;OPOS=101683929;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:36:37:1:13:23:0:0:13:24:0:0
chr12	101685783	.	C	T	295.67	PASS	AF=0.423077;AO=33;DP=79;FAO=33;FDP=78;FR=.;FRO=45;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=23;FSRR=22;FWDB=0.0155969;FXX=0.0126566;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.077;QD=15.1625;RBI=0.017471;REFB=-0.00998664;REVB=0.00787221;RO=45;SAF=18;SAR=15;SRF=23;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0351645;STB=0.519894;STBP=0.8;TYPE=snp;VARB=0.013553;OID=.;OPOS=101685783;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:78:45:45:33:33:0.423077:15:18:23:22:15:18:23:22
chr12	101723197	.	C	T	164.38	PASS	AF=0.375;AO=18;DP=48;FAO=18;FDP=48;FR=.;FRO=30;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=0.00956663;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.707;QD=13.6987;RBI=0.014672;REFB=-0.00567306;REVB=-0.0111242;RO=30;SAF=9;SAR=9;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179866;STB=0.604056;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=0.0115028;OID=.;OPOS=101723197;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:30:30:18:18:0.375:9:9:10:20:9:9:10:20
chr12	101734349	.	G	A	109.93	PASS	AF=0.433333;AO=13;DP=30;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=-0.0340764;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.5989;QD=14.6579;RBI=0.0417806;REFB=-0.00451305;REVB=-0.0241747;RO=17;SAF=8;SAR=5;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0328858;STB=0.519097;STBP=0.878;TYPE=snp;VARB=0.0035323;OID=.;OPOS=101734349;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:17:17:13:13:0.433333:5:8:11:6:5:8:11:6
chr12	101750814	.	T	A	785.2	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00771235;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.661;QD=57.1053;RBI=0.0167995;REFB=0;REVB=-0.0149246;RO=0;SAF=27;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.4002e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.71302e-05;OID=.;OPOS=101750814;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:28:27:0:0:28:27:0:0
chr12	101755809	.	T	C	782.4	PASS	AF=1;AO=55;DP=56;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00920608;FXX=0.017854;HRUN=3;LEN=1;MLLD=284.327;QD=56.902;RBI=0.0236004;REFB=0;REVB=0.0217307;RO=0;SAF=27;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.4002e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000145563;OID=.;OPOS=101755809;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:55:0:0:55:55:1:28:27:0:0:28:27:0:0
chr12	101757446	.	T	C	374.3	PASS	AF=0.569231;AO=37;DP=65;FAO=37;FDP=65;FR=.;FRO=28;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=-0.0218562;FXX=0.0298463;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.943;QD=23.0338;RBI=0.0218738;REFB=0.0160228;REVB=0.00087753;RO=28;SAF=15;SAR=22;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0472572;STB=0.526032;STBP=0.642;TYPE=snp;VARB=-0.0126813;OID=.;OPOS=101757446;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:28:28:37:37:0.569231:22:15:13:15:22:15:13:15
chr12	101866174	.	C	A	789.22	PASS	AF=1;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0235789;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.0086;QD=64.4261;RBI=0.0421835;REFB=0;REVB=-0.0349783;RO=0;SAF=27;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.30731e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00067174;OID=.;OPOS=101866174;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:49:0:0:49:49:1:22:27:0:0:22:27:0:0
chr12	102036305	.	C	T	241.69	PASS	AF=0.522727;AO=23;DP=44;FAO=23;FDP=44;FR=.;FRO=21;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=0.0301901;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.87;QD=21.9713;RBI=0.0332359;REFB=-0.0216129;REVB=-0.0138992;RO=21;SAF=14;SAR=9;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.232382;STB=0.630025;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=0.0244548;OID=.;OPOS=102036305;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:21:21:23:23:0.522727:9:14:7:14:9:14:7:14
chr12	102045163	.	C	G	67.43	PASS	AF=0.45;AO=9;DP=20;FAO=9;FDP=20;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=9;FWDB=-0.0268552;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.482;QD=13.4859;RBI=0.0414705;REFB=0.00168741;REVB=-0.0316006;RO=11;SAF=6;SAR=3;SRF=2;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.428568;STB=0.749499;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=-0.00665013;OID=.;OPOS=102045163;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:20:20:11:11:9:9:0.45:3:6:2:9:3:6:2:9
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chr12	102079418	.	G	A	243.02	PASS	AF=0.473684;AO=27;DP=58;FAO=27;FDP=57;FR=.;FRO=30;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.0203955;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.061;QD=17.0537;RBI=0.0223626;REFB=-0.0199188;REVB=0.00917128;RO=29;SAF=10;SAR=17;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170017;STB=0.604665;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=0.0164103;OID=.;OPOS=102079418;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:57:29:30:27:27:0.473684:17:10:16:13:17:10:17:13
chr12	102108345	.	T	C	467.13	PASS	AF=0.485981;AO=40;DP=110;FAO=52;FDP=107;FR=.,HEALED;FRO=55;FSAF=28;FSAR=24;FSRF=29;FSRR=26;FWDB=0.0243957;FXX=0.0360328;HRUN=8;LEN=1;MLLD=29.221;QD=17.4627;RBI=0.0407597;REFB=-0.00269581;REVB=0.0326528;RO=31;SAF=21;SAR=19;SRF=22;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148529;STB=0.505778;STBP=0.9;TYPE=snp;VARB=-0.00370431;OID=.;OPOS=102108345;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:107:31:55:40:52:0.485981:19:21:22:9:24:28:29:26
chr12	102117589	.	C	T	1207.27	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00545325;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.6863;QD=61.1275;RBI=0.0280045;REFB=0;REVB=-0.0274684;RO=0;SAF=29;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.7687e-05;OID=.;OPOS=102117589;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:50:29:0:0:50:29:0:0
chr12	102140675	.	CCT	CC,C	78.58	PASS	AF=0.615385,0;AO=8,5;DP=25;FAO=16,0;FDP=26;FR=.;FRO=10;FSAF=5,0;FSAR=11,0;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.0377017,-0.0957595;FXX=0;HRUN=5,2;LEN=1,2;MLLD=12.37,16.5651;QD=12.0893;RBI=0.154195,0.120421;REFB=-0.0599258,0.0279741;REVB=0.149515,-0.0730157;RO=10;SAF=4,1;SAR=4,4;SRF=4;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0930819,-0.253419;STB=0.537995,0.5;STBP=0.673,1;TYPE=del,del;VARB=0.0789904,0;OID=.,.;OPOS=102140677,102140676;OREF=T,CT;OALT=-,-;OMAPALT=CC,C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.615385,0:8,5:25:16,0:26:10:5,0:11,0:4:6:45:10:4,1:4,4:4:6
chr12	102158763	.	T	C	575.8	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0348755;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.373;QD=60.61;RBI=0.0352138;REFB=0;REVB=0.00486915;RO=0;SAF=22;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000120208;OID=.;OPOS=102158763;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:16:22:0:0:16:22:0:0
chr12	102173654	.	T	C	659.36	PASS	AF=0.96;AO=48;DP=51;FAO=48;FDP=50;FR=.;FRO=2;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.01446;FXX=0.019604;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.6912;QD=52.7485;RBI=0.0444245;REFB=-0.146501;REVB=0.0420053;RO=1;SAF=25;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.020015;STB=0.520825;STBP=0.265;TYPE=snp;VARB=0.0022918;OID=.;OPOS=102173654;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:51:50:1:2:48:48:0.96:23:25:0:1:23:25:0:2
chr12	102279115	.	C	T	146.88	PASS	AF=0.484848;AO=16;DP=33;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.0249251;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.6108;QD=17.8034;RBI=0.0251282;REFB=0.0105406;REVB=-0.00318846;RO=17;SAF=7;SAR=9;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135474;STB=0.577262;STBP=0.402;TYPE=snp;VARB=-0.0126425;OID=.;OPOS=102279115;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:17:17:16:16:0.484848:9:7:10:7:9:7:10:7
chr12	102279193	.	G	A	613.32	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0117608;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.564;QD=61.332;RBI=0.0155878;REFB=0;REVB=-0.0102306;RO=0;SAF=24;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000237419;OID=.;OPOS=102279193;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:16:24:0:0:16:24:0:0
chr12	102315358	.	TG	T,TT	118.78	PASS	AF=0.424242,0;AO=5,8;DP=33;FAO=14,0;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=5,0;FSAR=9,0;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=-0.0165644,-0.017413;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=218.543,218.997;QD=14.3973;RBI=0.0165737,0.0177371;REFB=0.00581122,0.00551522;REVB=-0.000556761,-0.00337505;RO=19;SAF=0,5;SAR=5,3;SRF=12;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.728945,-0.00792354;STB=0.656431,0.5;STBP=0.139,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.00795974,0.0111199;OID=.,.;OPOS=102315359,102315359;OREF=G,G;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.424242,0:5,8:33:14,0:33:19:5,0:9,0:12:7:75:19:0,5:5,3:12:7
chr12	102321583	.	C	T	223.1	PASS	AF=0.462963;AO=25;DP=54;FAO=25;FDP=54;FR=.;FRO=29;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.0195696;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.1583;QD=16.5257;RBI=0.0206943;REFB=-0.0255795;REVB=-0.00672923;RO=29;SAF=14;SAR=11;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0409847;STB=0.52315;STBP=0.762;TYPE=snp;VARB=0.0229724;OID=.;OPOS=102321583;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:29:29:25:25:0.462963:11:14:15:14:11:14:15:14
chr12	102517753	.	T	C	214.61	PASS	AF=0.5;AO=21;DP=43;FAO=21;FDP=42;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.0271276;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.56;QD=20.4394;RBI=0.0273531;REFB=-0.0172492;REVB=0.00350509;RO=21;SAF=8;SAR=13;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129307;STB=0.573015;STBP=0.38;TYPE=snp;VARB=0.0133106;OID=.;OPOS=102517753;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:42:21:21:21:21:0.5:13:8:11:10:13:8:11:10
chr12	103237468	.	G	C	890.84	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0123495;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.397;QD=58.4157;RBI=0.0270539;REFB=0;REVB=-0.0240708;RO=0;SAF=33;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000152681;OID=.;OPOS=103237468;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:28:33:0:0:28:33:0:0
chr12	103246700	.	C	T	465.12	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0780152;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=269.16;QD=58.14;RBI=0.0856792;REFB=0;REVB=0.0354196;RO=0;SAF=16;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000369914;OID=.;OPOS=103246700;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:16:16:0:0:16:16:0:0
chr12	103558227	.	G	T	105.8	PASS	AF=0.351351;AO=13;DP=37;FAO=13;FDP=37;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=-0.0111111;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.916;QD=11.4381;RBI=0.01115;REFB=-0.00562031;REVB=0.000931101;RO=24;SAF=6;SAR=7;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177174;STB=0.604781;STBP=0.359;TYPE=snp;VARB=0.014651;OID=.;OPOS=103558227;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:24:24:13:13:0.351351:7:6:15:9:7:6:15:9
chr12	103558235	.	G	A	93.81	PASS	AF=0.324324;AO=12;DP=37;FAO=12;FDP=37;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=0.0123747;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.909;QD=10.1419;RBI=0.0130881;REFB=-0.00673894;REVB=-0.00426181;RO=25;SAF=5;SAR=7;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.203412;STB=0.622023;STBP=0.34;TYPE=snp;VARB=0.00703086;OID=.;OPOS=103558235;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:93:37:37:25:25:12:12:0.324324:7:5:15:10:7:5:15:10
chr12	103761909	.	C	T	177.51	PASS	AF=0.387755;AO=19;DP=49;FAO=19;FDP=49;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=22;FWDB=-0.00326272;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.7928;QD=14.4903;RBI=0.0703448;REFB=0.0135347;REVB=-0.0702691;RO=30;SAF=8;SAR=11;SRF=8;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174197;STB=0.599902;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=-0.0301961;OID=.;OPOS=103761909;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:30:30:19:19:0.387755:11:8:8:22:11:8:8:22
chr12	103872172	.	T	G	409.91	PASS	AF=0.9375;AO=30;DP=32;FAO=30;FDP=32;FR=.;FRO=2;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00305649;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.337;QD=51.2385;RBI=0.0483134;REFB=-0.0381618;REVB=0.0482167;RO=2;SAF=18;SAR=12;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0120839;STB=0.506489;STBP=0.866;TYPE=snp;VARB=0.000521534;OID=.;OPOS=103872172;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:32:32:2:2:30:30:0.9375:12:18:1:1:12:18:1:1
chr12	104067812	.	C	T	95.18	PASS	AF=0.352941;AO=12;DP=34;FAO=12;FDP=34;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.0201212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.092;QD=11.1978;RBI=0.0231103;REFB=-0.00884045;REVB=-0.0113676;RO=22;SAF=7;SAR=5;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0911075;STB=0.554364;STBP=0.672;TYPE=snp;VARB=0.0252986;OID=.;OPOS=104067812;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:34:34:22:22:12:12:0.352941:5:7:11:11:5:7:11:11
chr12	104086631	.	C	T	769.5	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0552635;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.665;QD=57.0002;RBI=0.0553286;REFB=0;REVB=-0.00268291;RO=0;SAF=24;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.03834e-05;OID=.;OPOS=104086631;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:30:24:0:0:30:24:0:0
chr12	104092996	.	T	C	584.77	PASS	AF=0.5;AO=60;DP=120;FAO=60;FDP=120;FR=.;FRO=60;FSAF=24;FSAR=36;FSRF=26;FSRR=34;FWDB=-0.00245861;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.8856;QD=19.4923;RBI=0.00319484;REFB=-0.022441;REVB=-0.00204017;RO=60;SAF=24;SAR=36;SRF=26;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0312039;STB=0.517236;STBP=0.725;TYPE=snp;VARB=0.0199133;OID=.;OPOS=104092996;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:120:60:60:60:60:0.5:36:24:26:34:36:24:26:34
chr12	104100617	.	C	T	935.95	PASS	AF=0.472362;AO=94;DP=198;FAO=94;FDP=199;FR=.;FRO=105;FSAF=50;FSAR=44;FSRF=54;FSRR=51;FWDB=0.00804946;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=104.249;QD=18.813;RBI=0.0252876;REFB=-0.0207461;REVB=-0.0239723;RO=104;SAF=50;SAR=44;SRF=54;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0121027;STB=0.509327;STBP=0.806;TYPE=snp;VARB=0.0258173;OID=.;OPOS=104100617;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:198:199:104:105:94:94:0.472362:44:50:54:50:44:50:54:51
chr12	104136316	.	C	T	497.35	PASS	AF=0.413534;AO=55;DP=134;FAO=55;FDP=133;FR=.;FRO=78;FSAF=36;FSAR=19;FSRF=37;FSRR=41;FWDB=-0.0119856;FXX=0.00746213;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.873;QD=14.9578;RBI=0.0134104;REFB=-0.0184278;REVB=0.0060154;RO=74;SAF=36;SAR=19;SRF=36;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177896;STB=0.608925;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.0276281;OID=.;OPOS=104136316;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:134:133:74:78:55:55:0.413534:19:36:36:38:19:36:37:41
chr12	104155075	.	T	C	1395.39	PASS	AF=1;AO=87;DP=88;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00560881;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.446;QD=62.7142;RBI=0.0154231;REFB=0;REVB=0.0143671;RO=0;SAF=44;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.07357e-06;OID=.;OPOS=104155075;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:88:89:0:0:87:89:1:43:44:0:0:44:45:0:0
chr12	104171742	.	C	T	670.49	PASS	AF=0.960784;AO=44;DP=46;FAO=49;FDP=51;FR=.;FRO=2;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0443878;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.386;QD=52.5873;RBI=0.090585;REFB=0.0617158;REVB=0.0789643;RO=1;SAF=21;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0199884;STB=0.502856;STBP=0.886;TYPE=snp;VARB=-0.00517496;OID=.;OPOS=104171742;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:46:51:1:2:44:49:0.960784:23:21:0:1:28:21:1:1
chr12	104186995	.	G	A	706.55	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0109272;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.8138;QD=62.8041;RBI=0.0109758;REFB=0;REVB=0.00103173;RO=0;SAF=26;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000126649;OID=.;OPOS=104186995;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:45:0:0:44:45:1:18:26:0:0:19:26:0:0
chr12	104187707	.	G	A	728.21	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0153265;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.123;QD=63.3228;RBI=0.0241884;REFB=0;REVB=0.0187131;RO=0;SAF=24;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.2834e-05;OID=.;OPOS=104187707;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:46:0:0:45:46:1:21:24:0:0:21:25:0:0
chr12	104235300	.	C	G	1469.54	PASS	AF=1;AO=91;DP=92;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0402066;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.7418;QD=63.2058;RBI=0.046677;REFB=0;REVB=-0.0237101;RO=0;SAF=60;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000129128;OID=.;OPOS=104235300;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:92:93:0:0:91:93:1:31:60:0:0:31:62:0:0
chr12	104254932	.	G	A	538.05	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0427651;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.8487;QD=59.7831;RBI=0.0652034;REFB=0;REVB=-0.0492202;RO=0;SAF=21;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.70552e-05;OID=.;OPOS=104254932;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:15:21:0:0:15:21:0:0
chr12	104254975	.	C	G	657.61	PASS	AF=0.977273;AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0127409;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.666;QD=59.7828;RBI=0.0138912;REFB=-0.0257883;REVB=-0.00553497;RO=1;SAF=24;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0240734;STB=0.512815;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=0.00460536;OID=.;OPOS=104254975;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:44:44:1:1:43:43:0.977273:19:24:0:1:19:24:0:1
chr12	104260208	.	C	T	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00254508;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.516;QD=56.1916;RBI=0.00807823;REFB=0;REVB=0.00766684;RO=0;SAF=14;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.31868e-05;OID=.;OPOS=104260208;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:14:14:0:0:14:14:0:0
chr12	104309383	.	C	T	712.09	PASS	AF=1;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.040985;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.601;QD=63.2969;RBI=0.0419663;REFB=0;REVB=-0.00902215;RO=0;SAF=33;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000195096;OID=.;OPOS=104309383;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:45:0:0:45:45:1:12:33:0:0:12:33:0:0
chr12	104327979	.	C	T	1513.42	PASS	AF=1;AO=101;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0128152;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=297.872;QD=59.9373;RBI=0.0150339;REFB=0;REVB=-0.00786049;RO=0;SAF=50;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.10484e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.72555e-05;OID=.;OPOS=104327979;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:101:101:0:0:101:101:1:51:50:0:0:51:50:0:0
chr12	104341187	.	TGAA	T	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.015616;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=334.341;QD=48.7373;RBI=0.0443126;REFB=0;REVB=0.0414699;RO=0;SAF=6;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000340163;OID=.;OPOS=104341188;OREF=GAA;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:17:17:17:17:0:6:11:0:0:4:0:6:11:0:0
chr12	104359779	.	C	T	93.03	PASS	AF=0.27907;AO=12;DP=43;FAO=12;FDP=43;FR=.;FRO=31;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=-0.0140652;FXX=0.0227221;HRUN=3;LEN=1;MLLD=132.756;QD=8.65388;RBI=0.0259683;REFB=-0.0113304;REVB=-0.0218295;RO=28;SAF=8;SAR=4;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.030363;STB=0.542301;STBP=0.76;TYPE=snp;VARB=0.0203968;OID=.;OPOS=104359779;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:93:43:43:28:31:12:12:0.27907:4:8:18:10:4:8:19:12
chr12	104366815	.	G	A	207.12	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00968026;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.554;QD=48.7349;RBI=0.0342341;REFB=0;REVB=-0.0328369;RO=0;SAF=15;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.95117e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000877831;OID=.;OPOS=104366815;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:2:15:0:0:2:15:0:0
chr12	104380734	.	G	A	588.83	PASS	AF=0.891304;AO=41;DP=46;FAO=41;FDP=46;FR=.;FRO=5;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.00937434;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.981;QD=51.2023;RBI=0.0239376;REFB=-0.0110212;REVB=0.0220256;RO=5;SAF=21;SAR=20;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10387;STB=0.555529;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.00218829;OID=.;OPOS=104380734;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:25:46:46:5:5:41:41:0.891304:20:21:0:5:20:21:0:5
chr12	104413436	.	C	T	1616.89	PASS	AF=0.990826;AO=108;DP=111;FAO=108;FDP=109;FR=.;FRO=1;FSAF=59;FSAR=49;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00310619;FXX=0.0267833;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.989;QD=59.3353;RBI=0.0179501;REFB=-0.00232027;REVB=0.0176793;RO=0;SAF=59;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.62579e-08;STB=0.504201;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=9.48537e-05;OID=.;OPOS=104413436;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:111:109:0:1:108:108:0.990826:49:59:0:0:49:59:1:0
chr12	104606719	.	A	C	87.46	PASS	AF=0.423077;AO=11;DP=26;FAO=11;FDP=26;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.117567;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.7589;QD=13.4556;RBI=0.153212;REFB=-0.0320948;REVB=0.0982447;RO=15;SAF=7;SAR=4;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.231583;STB=0.636116;STBP=0.26;TYPE=snp;VARB=0.0562918;OID=.;OPOS=104606719;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:26:26:15:15:11:11:0.423077:4:7:6:9:4:7:6:9
chr12	104645363	.	G	A	177.51	PASS	AF=0.387755;AO=19;DP=49;FAO=19;FDP=49;FR=.;FRO=30;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=11;FWDB=-0.0238871;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.21;QD=14.4905;RBI=0.0279821;REFB=-0.002766;REVB=0.0145741;RO=30;SAF=10;SAR=9;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114534;STB=0.566093;STBP=0.493;TYPE=snp;VARB=0.0040549;OID=.;OPOS=104645363;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:30:30:19:19:0.387755:9:10:19:11:9:10:19:11
chr12	104645405	.	T	C	636.3	PASS	AF=1;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000560248;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.982;QD=62.0783;RBI=0.00896394;REFB=0;REVB=0.00894642;RO=0;SAF=23;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.69601e-05;OID=.;OPOS=104645405;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:41:0:0:41:41:1:18:23:0:0:18:23:0:0
chr12	104684839	.	G	A	535.32	PASS	AF=0.491228;AO=55;DP=113;FAO=56;FDP=114;FR=.;FRO=58;FSAF=26;FSAR=30;FSRF=22;FSRR=36;FWDB=-0.00533605;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.376;QD=18.7832;RBI=0.00538987;REFB=0.00473369;REVB=-0.00075983;RO=58;SAF=26;SAR=29;SRF=22;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0873759;STB=0.543711;STBP=0.415;TYPE=snp;VARB=-0.0047731;OID=.;OPOS=104684839;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:114:58:58:55:56:0.491228:29:26:22:36:30:26:22:36
chr12	104985407	.	T	C	93.32	PASS	AF=0.578947;AO=11;DP=19;FAO=11;FDP=19;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.00746807;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.142;QD=19.6458;RBI=0.00759331;REFB=0.00594192;REVB=-0.00137342;RO=7;SAF=4;SAR=7;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0585073;STB=0.505145;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00644931;OID=.;OPOS=104985407;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:19:19:7:8:11:11:0.578947:7:4:2:5:7:4:3:5
chr12	104985443	.	G	A	60.3	PASS	AF=0.571429;AO=8;DP=14;FAO=8;FDP=14;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.00378568;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.434;QD=17.2293;RBI=0.0319286;REFB=0.000821523;REVB=-0.0317034;RO=6;SAF=3;SAR=5;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0946669;STB=0.555414;STBP=0.716;TYPE=snp;VARB=-0.00144824;OID=.;OPOS=104985443;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:14:14:6:6:8:8:0.571429:5:3:3:3:5:3:3:3
chr12	105245665	.	T	C	803.47	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.109577;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.3008;QD=57.3908;RBI=0.114214;REFB=0;REVB=0.0322142;RO=0;SAF=30;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000846164;OID=.;OPOS=105245665;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:57:56:0:0:57:56:1:27:30:0:0:27:29:0:0
chr12	105380143	.	G	A	215.26	PASS	AF=0.525;AO=21;DP=39;FAO=21;FDP=40;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=4;FSRR=15;FWDB=0.0290391;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=265.844;QD=21.5255;RBI=0.0291176;REFB=-0.00717204;REVB=-0.00213668;RO=18;SAF=8;SAR=13;SRF=3;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198786;STB=0.589395;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=0.0071485;OID=.;OPOS=105380143;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:40:18:19:21:21:0.525:13:8:3:15:13:8:4:15
chr12	105380152	.	A	C	278.1	PASS	AF=0.568182;AO=25;DP=44;FAO=25;FDP=44;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=4;FSRR=15;FWDB=-0.0188101;FXX=0.0222173;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.2488;QD=25.2819;RBI=0.0402008;REFB=0.00207386;REVB=-0.0355287;RO=19;SAF=9;SAR=16;SRF=4;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131927;STB=0.57284;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=-0.000936587;OID=.;OPOS=105380152;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:19:19:25:25:0.568182:16:9:4:15:16:9:4:15
chr12	105546172	.	G	A	1153.6	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00134505;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.764;QD=60.7155;RBI=0.00778597;REFB=0;REVB=0.00766891;RO=0;SAF=40;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60877e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.16659e-05;OID=.;OPOS=105546172;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:36:40:0:0:36:40:0:0
chr12	105561664	.	C	T	383.14	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00328733;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.6;QD=54.7343;RBI=0.014291;REFB=0;REVB=-0.0139077;RO=0;SAF=15;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000562733;OID=.;OPOS=105561664;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:28:0:0:27:28:1:12:15:0:0:13:15:0:0
chr12	105567068	.	T	A	732.84	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000735769;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.417;QD=63.7253;RBI=0.0185968;REFB=0;REVB=-0.0185822;RO=0;SAF=20;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000198922;OID=.;OPOS=105567068;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:26:20:0:0:26:20:0:0
chr12	105567070	.	T	A	747.08	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0166848;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.71;QD=63.5815;RBI=0.016846;REFB=0;REVB=0.00232496;RO=0;SAF=20;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.20198e-05;OID=.;OPOS=105567070;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:27:20:0:0:27:20:0:0
chr12	105567089	.	T	A	549.16	PASS	AF=0.906977;AO=39;DP=43;FAO=39;FDP=43;FR=.;FRO=4;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.048333;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=47.5549;QD=51.0846;RBI=0.0663084;REFB=-0.105167;REVB=0.0453952;RO=4;SAF=16;SAR=23;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0602771;STB=0.532261;STBP=0.197;TYPE=snp;VARB=0.00951718;OID=.;OPOS=105567089;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:18:43:43:4:4:39:39:0.906977:23:16:3:1:23:16:3:1
chr12	105567131	.	C	T	411.12	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0289297;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.235;QD=56.7066;RBI=0.0334742;REFB=0;REVB=0.0168403;RO=0;SAF=15;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.2747e-05;OID=.;OPOS=105567131;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:14:15:0:0:14:15:0:0
chr12	105568122	.	G	A,T	2391.45	PASS	AF=0.974684,0.0253165;AO=152,6;DP=158;FAO=154,4;FDP=158;FR=.;FRO=0;FSAF=79,1;FSAR=75,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.027835,-0.00362384;FXX=0.00628891;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=64.6414,103.136;QD=60.5431;RBI=0.027942,0.00457913;REFB=0,0;REVB=-0.00244333,-0.00279932;RO=0;SAF=77,3;SAR=75,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000135559,0.0969894;OID=.,.;OPOS=105568122,105568122;OREF=G,G;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:5:158:158:0:0:152,6:154,4:0.974684,0.0253165:75,3:77,3:0:0:75,3:79,1:0:0
chr12	105568176	.	G	A	1981.5	PASS	AF=1;AO=127;DP=128;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0041604;FXX=0.00775134;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.891;QD=61.9218;RBI=0.0343495;REFB=0;REVB=-0.0340966;RO=0;SAF=51;SAR=76;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.42534e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000160374;OID=.;OPOS=105568176;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:128:128:0:0:127:128:1:76:51:0:0:76:52:0:0
chr12	105583877	.	G	A	851.22	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0191503;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.813;QD=57.7095;RBI=0.0198344;REFB=0;REVB=-0.0051641;RO=0;SAF=35;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.38685e-05;OID=.;OPOS=105583877;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:24:35:0:0:24:35:0:0
chr12	105600935	.	G	A	727.65	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0293634;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.256;QD=63.2741;RBI=0.043882;REFB=0;REVB=0.0326101;RO=0;SAF=25;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.85991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000328287;OID=.;OPOS=105600935;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:21:25:0:0:21:25:0:0
chr12	106460938	.	G	C	174.24	PASS	AF=0.388889;AO=21;DP=53;FAO=21;FDP=54;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=-2.84224e-05;FXX=0.0181785;HRUN=3;LEN=1;MLLD=124.064;QD=12.9063;RBI=0.00477185;REFB=-0.0245259;REVB=-0.00477176;RO=32;SAF=11;SAR=10;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0902382;STB=0.542213;STBP=0.621;TYPE=snp;VARB=0.0290302;OID=.;OPOS=106460938;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:54:32:33:21:21:0.388889:10:11:14:18:10:11:15:18
chr12	106633569	.	C	T	657.88	PASS	AF=0.977273;AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0223545;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.2538;QD=59.807;RBI=0.0241764;REFB=-0.0564874;REVB=0.00920741;RO=1;SAF=20;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0199809;STB=0.510633;STBP=0.493;TYPE=snp;VARB=0.0013677;OID=.;OPOS=106633569;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:44:44:1:1:43:43:0.977273:23:20:0:1:23:20:0:1
chr12	106647842	.	C	T	575.57	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00875413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.3348;QD=60.5859;RBI=0.0124387;REFB=0;REVB=-0.00883672;RO=0;SAF=19;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.10535e-07;OID=.;OPOS=106647842;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:19:19:0:0:19:19:0:0
chr12	106704974	.	G	A	318.9	PASS	AF=0.492754;AO=34;DP=69;FAO=34;FDP=69;FR=.;FRO=35;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=0.0473;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.259;QD=18.4867;RBI=0.0478144;REFB=0.00496287;REVB=-0.00699482;RO=34;SAF=19;SAR=15;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0794179;STB=0.537253;STBP=0.557;TYPE=snp;VARB=-0.00643754;OID=.;OPOS=106704974;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:34:35:34:34:0.492754:15:19:16:18:15:19:17:18
chr12	106838340	.	T	C	834.34	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00844077;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.457;QD=57.5405;RBI=0.0113601;REFB=0;REVB=0.00760293;RO=0;SAF=26;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.09576e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.674e-05;OID=.;OPOS=106838340;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:32:26:0:0:32:26:0:0
chr12	106893863	.	G	T	639.06	PASS	AF=0.976744;AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0321546;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.72;QD=59.4476;RBI=0.0439613;REFB=-0.106384;REVB=0.029978;RO=0;SAF=25;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.98888e-08;STB=0.509799;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=0.00118352;OID=.;OPOS=106893863;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:43:43:0:1:42:42:0.976744:17:25:0:0:17:25:1:0
chr12	106893930	.	A	T	558.07	PASS	AF=1;AO=35;DP=36;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0604485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.124;QD=57.2383;RBI=0.0609092;REFB=-0.0460074;REVB=0.00747761;RO=1;SAF=20;SAR=15;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.022817;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00326809;OID=.;OPOS=106893930;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:36:39:1:0:35:39:1:15:20:1:0:16:23:0:0
chr12	106903321	.	T	C	651.23	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0253177;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.412;QD=62.0216;RBI=0.0397399;REFB=0;REVB=0.0306313;RO=0;SAF=20;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00014652;OID=.;OPOS=106903321;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:22:20:0:0:22:20:0:0
chr12	107083059	.	C	T	205.36	PASS	AF=0.428571;AO=24;DP=56;FAO=24;FDP=56;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=-0.0107023;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=292.565;QD=14.6688;RBI=0.0116504;REFB=-0.0102687;REVB=0.00460345;RO=32;SAF=12;SAR=12;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.062728;STB=0.535685;STBP=0.67;TYPE=snp;VARB=0.01248;OID=.;OPOS=107083059;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:32:32:24:24:0.428571:12:12:18:14:12:12:18:14
chr12	107395106	.	A	G	378.5	PASS	AF=1;AO=25;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000292379;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.3932;QD=56.074;RBI=0.0253344;REFB=0;REVB=-0.0253327;RO=0;SAF=13;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.4465e-05;OID=.;OPOS=107395106;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:25:27:1:12:13:0:0:12:15:0:0
chr12	107713696	.	G	A	501.66	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00514839;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.446;QD=59.0185;RBI=0.0594849;REFB=0;REVB=0.0592617;RO=0;SAF=19;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.40663e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000329641;OID=.;OPOS=107713696;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:15:19:0:0:15:19:0:0
chr12	108082253	.	G	A	279.95	PASS	AF=0.351064;AO=33;DP=94;FAO=33;FDP=94;FR=.;FRO=61;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=28;FSRR=33;FWDB=-0.0850161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.576;QD=11.9127;RBI=0.0858308;REFB=-0.00296164;REVB=0.0117977;RO=61;SAF=13;SAR=20;SRF=28;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0751133;STB=0.54338;STBP=0.566;TYPE=snp;VARB=0.0027545;OID=.;OPOS=108082253;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:61:61:33:33:0.351064:20:13:28:33:20:13:28:33
chr12	108170363	.	GT	G	57.45	PASS	AF=0.526316;AO=5;DP=19;FAO=10;FDP=19;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.127527;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=14.3636;QD=12.0941;RBI=0.214278;REFB=-0.0723553;REVB=0.172196;RO=10;SAF=4;SAR=1;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0.404762;SSSB=0.504079;STB=0.624753;STBP=0.307;TYPE=del;VARB=0.108921;OID=.;OPOS=108170364;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.526316:5:19:10:19:9:6:4:3:6:50:10:4:1:3:7
chr12	108618630	.	C	T	342.15	PASS	AF=0.386792;AO=41;DP=106;FAO=41;FDP=106;FR=.;FRO=65;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=30;FSRR=35;FWDB=-0.0175299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.639;QD=12.9113;RBI=0.0177161;REFB=-0.00577801;REVB=0.00256182;RO=64;SAF=20;SAR=21;SRF=30;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0204704;STB=0.516121;STBP=0.798;TYPE=snp;VARB=0.0111715;OID=.;OPOS=108618630;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:106:64:65:41:41:0.386792:21:20:30:34:21:20:30:35
chr12	108643553	.	C	T	358.14	PASS	AF=1;AO=25;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00163386;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=175.01;QD=55.0979;RBI=0.0425768;REFB=0;REVB=0.0425454;RO=0;SAF=14;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000154175;OID=.;OPOS=108643553;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:25:26:1:11:14:0:0:12:14:0:0
chr12	108918146	.	C	T	1867.0	PASS	AF=0.99187;AO=122;DP=124;FAO=122;FDP=123;FR=.;FRO=1;FSAF=55;FSAR=67;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0173933;FXX=0.00806387;HRUN=2;LEN=1;MLLD=281.112;QD=60.7154;RBI=0.0177315;REFB=-0.0577186;REVB=0.00344691;RO=0;SAF=55;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504504;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=4.8731e-05;OID=.;OPOS=108918146;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:124:123:0:1:122:122:0.99187:67:55:0:0:67:55:1:0
chr12	108923950	.	A	G	483.34	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0358878;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.574;QD=58.5862;RBI=0.0367071;REFB=0;REVB=0.00771228;RO=0;SAF=18;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.64315e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000382525;OID=.;OPOS=108923950;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:15:18:0:0:15:18:0:0
chr12	108954823	.	C	T	696.54	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0565423;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.7845;QD=54.6309;RBI=0.0567365;REFB=0;REVB=0.00468954;RO=0;SAF=22;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.30731e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00409929;OID=.;OPOS=108954823;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:51:0:0:49:51:1:27:22:0:0:29:22:0:0
chr12	108955106	.	C	CT	235.23	PASS	AF=0.958333;AO=22;DP=28;FAO=23;FDP=24;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00233916;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=25.7621;QD=39.2053;RBI=0.0573999;REFB=-0.0111314;REVB=0.0573522;RO=6;SAF=14;SAR=8;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123419;STB=0.526293;STBP=0.283;TYPE=ins;VARB=0.0124449;OID=.;OPOS=108955107;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.958333:22:28:23:24:1:14:9:0:1:3:6:14:8:2:4
chr12	108986112	.	G	C	95.18	PASS	AF=0.352941;AO=12;DP=34;FAO=12;FDP=34;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.0404367;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.759;QD=11.1978;RBI=0.0447345;REFB=-0.00548376;REVB=0.0191323;RO=22;SAF=6;SAR=6;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0492868;STB=0.529363;STBP=0.828;TYPE=snp;VARB=0.00988686;OID=.;OPOS=108986112;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:34:34:22:22:12:12:0.352941:6:6:12:10:6:6:12:10
chr12	109182049	.	T	C	255.49	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000960596;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.513;QD=51.0971;RBI=0.0340804;REFB=0;REVB=0.0340669;RO=0;SAF=11;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000260421;OID=.;OPOS=109182049;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:9:11:0:0:9:11:0:0
chr12	109186093	.	T	C	255.17	PASS	AF=0.521739;AO=24;DP=46;FAO=24;FDP=46;FR=.;FRO=22;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.0151863;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.041;QD=22.1888;RBI=0.0325024;REFB=-0.0163618;REVB=0.0287364;RO=22;SAF=13;SAR=11;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00325798;STB=0.501823;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.014205;OID=.;OPOS=109186093;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:22:22:24:24:0.521739:11:13:12:10:11:13:12:10
chr12	109277492	.	C	A	180.11	PASS	AF=0.580645;AO=18;DP=31;FAO=18;FDP=31;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.00240552;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=278.234;QD=23.2399;RBI=0.0030225;REFB=-0.00244241;REVB=-0.00183002;RO=12;SAF=7;SAR=11;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0817516;STB=0.56403;STBP=0.418;TYPE=snp;VARB=0.00159515;OID=.;OPOS=109277492;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:12:13:18:18:0.580645:11:7:6:6:11:7:7:6
chr12	109511256	.	T	C	785.2	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0230245;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.764;QD=57.1055;RBI=0.0275929;REFB=0;REVB=0.0152067;RO=0;SAF=29;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.40922e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.5298e-05;OID=.;OPOS=109511256;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:26:29:0:0:26:29:0:0
chr12	109605730	.	C	T	311.93	PASS	AF=0.397727;AO=35;DP=88;FAO=35;FDP=88;FR=.;FRO=53;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=26;FSRR=27;FWDB=0.00608167;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.985;QD=14.1788;RBI=0.00850791;REFB=-0.00906499;REVB=-0.00594961;RO=53;SAF=19;SAR=16;SRF=26;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0554755;STB=0.531537;STBP=0.64;TYPE=snp;VARB=0.0122594;OID=.;OPOS=109605730;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:53:53:35:35:0.397727:16:19:26:27:16:19:26:27
chr12	109617865	.	T	C	538.54	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0218069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.89;QD=59.8375;RBI=0.0264223;REFB=0;REVB=0.0149197;RO=0;SAF=14;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000133298;OID=.;OPOS=109617865;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:22:14:0:0:22:14:0:0
chr12	109623516	.	G	A	118.91	PASS	AF=0.388889;AO=14;DP=36;FAO=14;FDP=36;FR=.;FRO=22;FSAF=2;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=16;FWDB=-0.0800839;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.406;QD=13.2123;RBI=0.0812237;REFB=-0.0080018;REVB=-0.013559;RO=22;SAF=2;SAR=12;SRF=6;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.219594;STB=0.631363;STBP=0.343;TYPE=snp;VARB=0.0167043;OID=.;OPOS=109623516;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:22:22:14:14:0.388889:12:2:6:16:12:2:6:16
chr12	109629457	.	C	T	307.3	PASS	AF=0.376344;AO=35;DP=95;FAO=35;FDP=93;FR=.;FRO=58;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=34;FSRR=24;FWDB=-0.000775894;FXX=0.0210504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.9558;QD=13.2172;RBI=0.0619295;REFB=-0.0100605;REVB=-0.0619246;RO=58;SAF=21;SAR=14;SRF=34;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0156038;STB=0.508923;STBP=0.913;TYPE=snp;VARB=0.0162803;OID=.;OPOS=109629457;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:93:58:58:35:35:0.376344:14:21:34:24:14:21:34:24
chr12	109675029	.	T	C	676.67	PASS	AF=0.9375;AO=44;DP=48;FAO=45;FDP=48;FR=.;FRO=3;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.000567377;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.496;QD=56.3892;RBI=0.00168696;REFB=-0.0451524;REVB=-0.00158868;RO=3;SAF=23;SAR=21;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0226887;STB=0.511106;STBP=0.634;TYPE=snp;VARB=0.00394897;OID=.;OPOS=109675029;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:48:48:3:3:44:45:0.9375:21:23:1:2:22:23:1:2
chr12	109693982	.	C	T	157.42	PASS	AF=0.425;AO=17;DP=41;FAO=17;FDP=40;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=0.0113832;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.472;QD=15.7417;RBI=0.0125477;REFB=-0.00675869;REVB=-0.00527911;RO=22;SAF=9;SAR=8;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0158032;STB=0.520686;STBP=0.847;TYPE=snp;VARB=0.0137164;OID=.;OPOS=109693982;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:40:22:23:17:17:0.425:8:9:12:10:8:9:13:10
chr12	109696838	.	G	A	424.9	PASS	AF=0.457447;AO=43;DP=95;FAO=43;FDP=94;FR=.;FRO=51;FSAF=28;FSAR=15;FSRF=21;FSRR=30;FWDB=0.00829855;FXX=0.0208312;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.17;QD=18.0808;RBI=0.0164202;REFB=-0.0106402;REVB=0.0141689;RO=50;SAF=28;SAR=15;SRF=20;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.2439;STB=0.631517;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.0113047;OID=.;OPOS=109696838;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:94:50:51:43:43:0.457447:15:28:20:30:15:28:21:30
chr12	109717697	.	A	G	282.25	PASS	AF=0.52;AO=26;DP=50;FAO=26;FDP=50;FR=.;FRO=24;FSAF=19;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=-0.029741;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.9219;QD=22.5798;RBI=0.06222;REFB=-0.020874;REVB=0.0546516;RO=24;SAF=19;SAR=7;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.353143;STB=0.697926;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0210004;OID=.;OPOS=109717697;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:24:24:26:26:0.52:7:19:8:16:7:19:8:16
chr12	109826634	.	C	A	180.99	PASS	AF=0.403846;AO=21;DP=52;FAO=21;FDP=52;FR=.;FRO=31;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=-0.00192014;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.9505;QD=13.9222;RBI=0.00555438;REFB=-0.0213428;REVB=0.00521193;RO=31;SAF=6;SAR=15;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.314893;STB=0.68164;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.0223189;OID=.;OPOS=109826634;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:31:31:21:21:0.403846:15:6:18:13:15:6:18:13
chr12	109835590	.	A	G	130.94	PASS	AF=0.313725;AO=16;DP=51;FAO=16;FDP=51;FR=.;FRO=35;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=-0.0322121;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=148.367;QD=10.2701;RBI=0.0322126;REFB=-0.00667272;REVB=-0.000181933;RO=34;SAF=9;SAR=7;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170739;STB=0.610035;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=0.0129011;OID=.;OPOS=109835590;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:34:35:16:16:0.313725:7:9:14:20:7:9:14:21
chr12	109848567	.	T	C	129.42	PASS	AF=0.375;AO=15;DP=40;FAO=15;FDP=40;FR=.;FRO=25;FSAF=1;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=-0.00226463;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.523;QD=12.9421;RBI=0.0132537;REFB=-0.00084268;REVB=0.0130588;RO=25;SAF=1;SAR=14;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.60836;STB=0.870191;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.00130649;OID=.;OPOS=109848567;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:25:25:15:15:0.375:14:1:12:13:14:1:12:13
chr12	109883374	.	T	C	49.59	PASS	AF=0.538462;AO=7;DP=13;FAO=7;FDP=13;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.0168015;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.104;QD=15.2589;RBI=0.0183698;REFB=-0.0196368;REVB=0.00742711;RO=6;SAF=4;SAR=3;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0560707;STB=0.533237;STBP=0.934;TYPE=snp;VARB=0.018809;OID=.;OPOS=109883374;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:13:13:6:6:7:7:0.538462:3:4:3:3:3:4:3:3
chr12	109889427	.	AG	A	38.78	PASS	AF=0.533333;AO=6;DP=15;FAO=8;FDP=15;FR=.;FRO=7;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.0972528;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.9896;QD=10.341;RBI=0.110136;REFB=-0.107574;REVB=-0.0516899;RO=8;SAF=5;SAR=1;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0.588235;SSSB=0.373885;STB=0.666221;STBP=0.242;TYPE=del;VARB=0.130838;OID=.;OPOS=109889428;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.533333:6:15:8:15:7:6:2:3:4:36:8:5:1:4:4
chr12	109894028	.	A	G	313.85	PASS	AF=0.406977;AO=35;DP=85;FAO=35;FDP=86;FR=.;FRO=51;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=29;FSRR=22;FWDB=-0.0208236;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.579;QD=14.5978;RBI=0.0271451;REFB=-0.000596938;REVB=-0.0174137;RO=50;SAF=19;SAR=16;SRF=28;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0179601;STB=0.515427;STBP=0.817;TYPE=snp;VARB=0.000971056;OID=.;OPOS=109894028;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:86:50:51:35:35:0.406977:16:19:28:22:16:19:29:22
chr12	109937534	.	G	A	331.55	PASS	AF=0.492958;AO=35;DP=70;FAO=35;FDP=71;FR=.;FRO=36;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=-0.00307829;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=224.546;QD=18.6787;RBI=0.00775685;REFB=-0.00734855;REVB=0.00711989;RO=35;SAF=13;SAR=22;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.08037;STB=0.538829;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=0.00779981;OID=.;OPOS=109937534;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:71:35:36:35:35:0.492958:22:13:16:19:22:13:16:20
chr12	109973730	.	G	A	257.97	PASS	AF=0.5;AO=28;DP=56;FAO=28;FDP=56;FR=.;FRO=28;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=-0.00733542;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.0505;QD=18.4261;RBI=0.0172121;REFB=-0.000626492;REVB=0.0155707;RO=27;SAF=13;SAR=15;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144509;STB=0.571016;STBP=0.331;TYPE=snp;VARB=0.000545025;OID=.;OPOS=109973730;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:27:28:28:28:0.5:15:13:17:10:15:13:17:11
chr12	109994870	.	A	T	121.58	PASS	AF=0.4375;AO=14;DP=32;FAO=14;FDP=32;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=0.00756655;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.209;QD=15.1969;RBI=0.016933;REFB=-0.00255953;REVB=-0.0151484;RO=18;SAF=4;SAR=10;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.323285;STB=0.687798;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=0.0021084;OID=.;OPOS=109994870;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:18:18:14:14:0.4375:10:4:11:7:10:4:11:7
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chr12	110226796	.	A	G	213.93	PASS	AF=0.512195;AO=21;DP=41;FAO=21;FDP=41;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=-0.0290062;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.1488;QD=20.8714;RBI=0.0373326;REFB=0.00246553;REVB=-0.0235024;RO=20;SAF=10;SAR=11;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106966;STB=0.560128;STBP=0.464;TYPE=snp;VARB=-0.00993877;OID=.;OPOS=110226796;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:20:20:21:21:0.512195:11:10:12:8:11:10:12:8
chr12	110240838	.	T	G	239.45	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00289178;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.5098;QD=50.4108;RBI=0.037754;REFB=0;REVB=0.0376431;RO=0;SAF=10;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000550986;OID=.;OPOS=110240838;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:9:10:0:0:9:10:0:0
chr12	110304161	.	C	G	182.12	PASS	AF=0.44186;AO=19;DP=43;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=0.0599033;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.8161;QD=16.9411;RBI=0.0688102;REFB=0.00472719;REVB=-0.033859;RO=24;SAF=9;SAR=10;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0256938;STB=0.51469;STBP=0.832;TYPE=snp;VARB=-0.0101445;OID=.;OPOS=110304161;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:24:24:19:19:0.44186:10:9:12:12:10:9:12:12
chr12	110342598	.	G	A	122.14	PASS	AF=0.293103;AO=17;DP=58;FAO=17;FDP=58;FR=.;FRO=41;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=-0.0465609;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.5735;QD=8.42344;RBI=0.0608932;REFB=-0.00428615;REVB=0.0392436;RO=41;SAF=12;SAR=5;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.292276;STB=0.676197;STBP=0.087;TYPE=snp;VARB=0.0134131;OID=.;OPOS=110342598;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:41:41:17:17:0.293103:5:12:19:22:5:12:19:22
chr12	110390979	.	T	C	251.68	PASS	AF=0.37037;AO=30;DP=81;FAO=30;FDP=81;FR=.;FRO=51;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=22;FSRR=29;FWDB=0.00622144;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.078;QD=12.4287;RBI=0.00626876;REFB=-0.0116721;REVB=-0.000768752;RO=51;SAF=9;SAR=21;SRF=22;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157914;STB=0.591217;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=0.0185322;OID=.;OPOS=110390979;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:51:51:30:30:0.37037:21:9:22:29:21:9:22:29
chr12	111099243	.	C	T	671.18	PASS	AF=0.470199;AO=71;DP=151;FAO=71;FDP=151;FR=.;FRO=80;FSAF=35;FSAR=36;FSRF=44;FSRR=36;FWDB=0.0733769;FXX=0.00657851;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.0902;QD=17.7795;RBI=0.0735275;REFB=0.000964629;REVB=-0.00470321;RO=80;SAF=35;SAR=36;SRF=44;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0545215;STB=0.530193;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=-0.000966417;OID=.;OPOS=111099243;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:151:151:80:80:71:71:0.470199:36:35:44:36:36:35:44:36
chr12	111353556	.	A	G	115.08	PASS	AF=0.541667;AO=13;DP=24;FAO=13;FDP=24;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=0.00163784;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.996;QD=19.1803;RBI=0.0399186;REFB=-0.0126532;REVB=0.039885;RO=11;SAF=6;SAR=7;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139543;STB=0.579497;STBP=0.434;TYPE=snp;VARB=0.0101617;OID=.;OPOS=111353556;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:24:24:11:11:13:13:0.541667:7:6:7:4:7:6:7:4
chr12	111375170	.	A	G	557.67	PASS	AF=0.457364;AO=59;DP=129;FAO=59;FDP=129;FR=.;FRO=70;FSAF=21;FSAR=38;FSRF=27;FSRR=43;FWDB=0.0309791;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.53;QD=17.2922;RBI=0.0350549;REFB=-0.0118886;REVB=-0.0164057;RO=69;SAF=21;SAR=38;SRF=26;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0218984;STB=0.517441;STBP=0.758;TYPE=snp;VARB=0.00683557;OID=.;OPOS=111375170;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:129:129:69:70:59:59:0.457364:38:21:26:43:38:21:27:43
chr12	111375172	.	C	T	533.1	PASS	AF=0.449612;AO=56;DP=128;FAO=58;FDP=129;FR=.;FRO=71;FSAF=23;FSAR=35;FSRF=25;FSRR=46;FWDB=0.0295897;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=293.518;QD=16.5303;RBI=0.0296592;REFB=-0.00203157;REVB=-0.00202995;RO=71;SAF=22;SAR=34;SRF=25;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0432223;STB=0.525817;STBP=0.626;TYPE=snp;VARB=0.00245219;OID=.;OPOS=111375172;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:128:129:71:71:56:58:0.449612:34:22:25:46:35:23:25:46
chr12	111747963	.	C	T	708.96	PASS	AF=0.958333;AO=46;DP=49;FAO=46;FDP=48;FR=.;FRO=2;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00319974;FXX=0.020404;HRUN=4;LEN=1;MLLD=151.898;QD=59.0798;RBI=0.00614789;REFB=-0.0960989;REVB=-0.00524959;RO=2;SAF=24;SAR=22;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0375754;STB=0.519991;STBP=0.245;TYPE=snp;VARB=0.00284833;OID=.;OPOS=111747963;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:49:48:2:2:46:46:0.958333:22:24:2:0:22:24:2:0
chr12	111760251	.	G	C	465.14	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00658818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.503;QD=58.142;RBI=0.0271198;REFB=0;REVB=-0.0263074;RO=0;SAF=12;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000539363;OID=.;OPOS=111760251;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:20:12:0:0:20:12:0:0
chr12	111785586	.	T	C	635.7	PASS	AF=1;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0113664;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.405;QD=62.0194;RBI=0.0798479;REFB=0;REVB=0.0790348;RO=0;SAF=21;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000252584;OID=.;OPOS=111785586;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:41:0:0:41:41:1:20:21:0:0:20:21:0:0
chr12	111786082	.	G	C	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0229353;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.076;QD=40.7625;RBI=0.0234324;REFB=0;REVB=0.00480084;RO=0;SAF=4;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00088728;OID=.;OPOS=111786082;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:6:4:0:0:6:4:0:0
chr12	111786892	.	T	C	575.78	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0318628;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.356;QD=60.6082;RBI=0.0454739;REFB=0;REVB=0.0324444;RO=0;SAF=20;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.51048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000317293;OID=.;OPOS=111786892;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:18:20:0:0:18:20:0:0
chr12	111788303	.	TTA	T,TAA,TTT	39.37	PASS	AF=0.212121,0,0;AO=4,2,2;DP=35;FAO=7,0,0;FDP=33;FR=.;FRO=26;FSAF=2,0,0;FSAR=5,0,0;FSRF=20;FSRR=6;FWDB=0.282913,-0.0196658,0.0216505;FXX=0;HRUN=4,4,7;LEN=2,1,1;MLLD=20.7349,16.913,15.9806;QD=4.77153;RBI=0.286582,0.0766183,0.082854;REFB=-0.049577,0.00139614,-0.00376152;REVB=0.0457091,-0.0740515,0.0799753;RO=22;SAF=1,1,0;SAR=3,1,2;SRF=18;SRR=4;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.595278,-0.361578,-0.682681;STB=0.832593,0.5,0.5;STBP=0.099,1,1;TYPE=del,snp,snp;VARB=0.165449,0,0;OID=.,.,.;OPOS=111788304,111788304,111788305;OREF=TA,T,A;OALT=-,A,T;OMAPALT=T,TAA,TTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.212121,0,0:4,2,2:35:7,0,0:33:26:2,0,0:5,0,0:20:6:40:22:1,1,0:3,1,2:18:4
chr12	111798553	.	A	G	1490.56	PASS	AF=1;AO=93;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0261214;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.975;QD=63.4282;RBI=0.0265706;REFB=0;REVB=0.00486491;RO=0;SAF=50;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.7193e-05;OID=.;OPOS=111798553;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:94:94:0:0:93:94:1:43:50:0:0:44:50:0:0
chr12	111884608	.	T	C	689.38	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00113354;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.829;QD=62.6709;RBI=0.0103293;REFB=0;REVB=-0.0102669;RO=0;SAF=31;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.45779e-05;OID=.;OPOS=111884608;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:13:31:0:0:13:31:0:0
chr12	111886967	.	T	A	607.34	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00647039;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.311;QD=60.7343;RBI=0.0487119;REFB=0;REVB=0.0482802;RO=0;SAF=24;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000119789;OID=.;OPOS=111886967;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:40:0:0:39:40:1:15:24:0:0:16:24:0:0
chr12	111993712	.	C	T	868.25	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0488701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.868;QD=57.883;RBI=0.0489687;REFB=0;REVB=0.00310523;RO=0;SAF=24;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.9695e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000216203;OID=.;OPOS=111993712;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:36:24:0:0:36:24:0:0
chr12	112110489	.	T	C	172.02	PASS	AF=0.514286;AO=17;DP=34;FAO=18;FDP=35;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.0111481;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.55;QD=19.6592;RBI=0.0117217;REFB=-0.0116812;REVB=-0.00362177;RO=17;SAF=5;SAR=12;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.270647;STB=0.627306;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=0.0162946;OID=.;OPOS=112110489;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:35:17:17:17:18:0.514286:12:5:10:7:12:6:10:7
chr12	112191641	.	G	A	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0127491;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.354;QD=43.4861;RBI=0.0561492;REFB=0;REVB=0.0546826;RO=0;SAF=6;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0015664;OID=.;OPOS=112191641;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:6:6:0:0:6:6:0:0
chr12	112194727	.	C	T	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00419859;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.964;QD=37.4884;RBI=0.00567226;REFB=0;REVB=0.00381397;RO=0;SAF=2;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.58669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.92988e-05;OID=.;OPOS=112194727;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:6:2:0:0:6:2:0:0
chr12	112326707	.	T	C	318.84	PASS	AF=0.583333;AO=28;DP=48;FAO=28;FDP=48;FR=.;FRO=20;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=0.0117734;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.364;QD=26.5704;RBI=0.0269903;REFB=-0.00922812;REVB=-0.0242871;RO=20;SAF=19;SAR=9;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.254503;STB=0.641001;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.00378651;OID=.;OPOS=112326707;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:20:20:28:28:0.583333:9:19:7:13:9:19:7:13
chr12	112460147	.	T	G	613.36	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000491893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.162;QD=61.3362;RBI=0.0184501;REFB=0;REVB=-0.0184436;RO=0;SAF=26;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.0226e-05;OID=.;OPOS=112460147;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:14:26:0:0:14:26:0:0
chr12	112460749	.	A	G	1491.48	PASS	AF=1;AO=94;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.023144;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.096;QD=63.4672;RBI=0.0231918;REFB=0;REVB=-0.00148938;RO=0;SAF=46;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.73299e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.72291e-05;OID=.;OPOS=112460749;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:94:94:0:0:94:94:1:48:46:0:0:48:46:0:0
chr12	112477055	.	T	C	411.7	PASS	AF=1;AO=26;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00556681;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=284.519;QD=56.7861;RBI=0.0066821;REFB=0;REVB=0.00369608;RO=0;SAF=14;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000133574;OID=.;OPOS=112477055;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:26:29:1:12:14:0:0:12:17:0:0
chr12	112577990	.	T	C	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00538474;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.222;QD=43.4861;RBI=0.0219334;REFB=0;REVB=-0.0212621;RO=0;SAF=5;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000261827;OID=.;OPOS=112577990;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:7:5:0:0:7:5:0:0
chr12	112622678	.	G	A	244.45	PASS	AF=0.269231;AO=35;DP=130;FAO=35;FDP=130;FR=.;FRO=95;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=36;FSRR=59;FWDB=0.0483453;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.3979;QD=7.52157;RBI=0.0875032;REFB=-0.00356791;REVB=0.0729352;RO=94;SAF=20;SAR=15;SRF=36;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.227666;STB=0.637855;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=0.0122881;OID=.;OPOS=112622678;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:130:130:94:95:35:35:0.269231:15:20:36:58:15:20:36:59
chr12	112667675	.	T	G	538.55	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.033773;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.636;QD=59.8391;RBI=0.0525415;REFB=0;REVB=0.0402491;RO=0;SAF=19;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000439954;OID=.;OPOS=112667675;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:17:19:0:0:17:19:0:0
chr12	112703732	.	A	C,T	902.96	PASS	AF=0.952381,0.047619;AO=60,3;DP=63;FAO=60,3;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=29,0;FSAR=31,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00651708,0.0367418;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=172.543,99.6742;QD=57.3309;RBI=0.0210033,0.0392915;REFB=0,0;REVB=0.0199666,0.0139235;RO=0;SAF=29,0;SAR=31,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-5.73709e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00110896,0.0247105;OID=.,.;OPOS=112703732,112703732;OREF=A,A;OALT=C,T;OMAPALT=C,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:10:63:63:0:0:60,3:60,3:0.952381,0.047619:31,3:29,0:0:0:31,3:29,0:0:0
chr12	112704961	.	A	G	340.71	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00429233;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.908;QD=54.513;RBI=0.0319691;REFB=0;REVB=0.0316796;RO=0;SAF=10;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000192146;OID=.;OPOS=112704961;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:15:10:0:0:15:10:0:0
chr12	112705013	.	C	T	272.55	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0639945;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.7791;QD=51.9151;RBI=0.076919;REFB=0;REVB=0.042676;RO=0;SAF=13;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00184143;OID=.;OPOS=112705013;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:8:13:0:0:8:13:0:0
chr12	113313470	.	C	T	740.58	PASS	AF=0.425532;AO=80;DP=188;FAO=80;FDP=188;FR=.;FRO=108;FSAF=41;FSAR=39;FSRF=57;FSRR=51;FWDB=0.0123487;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.0451;QD=15.7569;RBI=0.0304867;REFB=-0.0071434;REVB=0.0278738;RO=107;SAF=41;SAR=39;SRF=57;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0207428;STB=0.508784;STBP=0.82;TYPE=snp;VARB=0.0109657;OID=.;OPOS=113313470;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:188:188:107:108:80:80:0.425532:39:41:57:50:39:41:57:51
chr12	113319600	.	C	T	223.58	PASS	AF=0.617647;AO=21;DP=34;FAO=21;FDP=34;FR=.;FRO=13;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=11;FWDB=-0.0306469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.5596;QD=26.3041;RBI=0.0362734;REFB=-0.00360491;REVB=-0.0194043;RO=13;SAF=12;SAR=9;SRF=2;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.281915;STB=0.655597;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.000354112;OID=.;OPOS=113319600;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:13:13:21:21:0.617647:9:12:2:11:9:12:2:11
chr12	113325629	.	T	C	280.87	PASS	AF=0.405063;AO=32;DP=79;FAO=32;FDP=79;FR=.;FRO=47;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=15;FSRR=32;FWDB=-0.0132103;FXX=0.0124984;HRUN=3;LEN=1;MLLD=224.069;QD=14.2212;RBI=0.0151659;REFB=-0.000767514;REVB=-0.00744935;RO=45;SAF=13;SAR=19;SRF=15;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.079395;STB=0.554779;STBP=0.465;TYPE=snp;VARB=0.00109758;OID=.;OPOS=113325629;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:45:47:32:32:0.405063:19:13:15:30:19:13:15:32
chr12	113348870	.	G	A	245.27	PASS	AF=0.391892;AO=29;DP=74;FAO=29;FDP=74;FR=.;FRO=45;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=29;FSRR=16;FWDB=-0.0406731;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.924;QD=13.258;RBI=0.0406836;REFB=-0.00902888;REVB=0.000921396;RO=45;SAF=19;SAR=10;SRF=29;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0125599;STB=0.507182;STBP=0.931;TYPE=snp;VARB=0.012597;OID=.;OPOS=113348870;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:45:45:29:29:0.391892:10:19:29:16:10:19:29:16
chr12	113357193	.	G	A	62.25	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0753257;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.4286;QD=35.5736;RBI=0.0827956;REFB=0;REVB=-0.0343679;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.010655;OID=.;OPOS=113357193;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:3:4:0:0:3:4:0:0
chr12	113357209	.	G	A	130.42	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00544384;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.8967;QD=43.4724;RBI=0.0169912;REFB=0;REVB=0.0160955;RO=0;SAF=5;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000605931;OID=.;OPOS=113357209;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:7:5:0:0:7:5:0:0
chr12	113357237	.	G	C	538.49	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000102087;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.2983;QD=59.8327;RBI=0.065539;REFB=0;REVB=-0.0655389;RO=0;SAF=20;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.9376e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000752472;OID=.;OPOS=113357237;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:16:20:0:0:16:20:0:0
chr12	113357442	.	G	A	753.97	PASS	AF=1;AO=52;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0890766;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.5617;QD=56.9035;RBI=0.110196;REFB=0;REVB=0.0648735;RO=1;SAF=21;SAR=31;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0149535;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00196624;OID=.;OPOS=113357442;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:1:0:52:53:1:31:21:0:1:32:21:0:0
chr12	113369715	.	TA	T	627.07	PASS	AF=1;AO=40;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0293932;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.256;QD=61.1772;RBI=0.0310315;REFB=0;REVB=0.00994939;RO=0;SAF=19;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-5.18282e-05;OID=.;OPOS=113369716;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:40:41:41:41:0:20:21:0:0:4:0:19:21:0:0
chr12	113369759	.	G	C	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0382303;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.155;QD=59.435;RBI=0.0448552;REFB=0;REVB=-0.0234614;RO=0;SAF=17;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000153575;OID=.;OPOS=113369759;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:18:17:0:0:18:17:0:0
chr12	113376388	.	G	A	737.27	PASS	AF=0.981481;AO=49;DP=50;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.077577;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.2194;QD=54.6126;RBI=0.109531;REFB=-0.0545746;REVB=0.0773237;RO=1;SAF=27;SAR=22;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0209097;STB=0.5098;STBP=0.33;TYPE=snp;VARB=0.00387289;OID=.;OPOS=113376388;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:50:54:1:1:49:53:0.981481:22:27:0:1:25:28:0:1
chr12	113376452	.	C	T	393.34	PASS	AF=1;AO=27;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0468397;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=145.323;QD=56.1913;RBI=0.0695421;REFB=0;REVB=0.0514018;RO=0;SAF=11;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000480066;OID=.;OPOS=113376452;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:27:28:1:16:11:0:0:17:11:0:0
chr12	113386950	.	T	C	724.08	PASS	AF=0.959184;AO=47;DP=49;FAO=47;FDP=49;FR=.;FRO=2;FSAF=13;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00690188;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.657;QD=59.1088;RBI=0.00881215;REFB=-0.124526;REVB=-0.00547888;RO=1;SAF=13;SAR=34;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0136345;STB=0.51428;STBP=0.421;TYPE=snp;VARB=0.000702992;OID=.;OPOS=113386950;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:49:49:1:2:47:47:0.959184:34:13:0:1:34:13:0:2
chr12	113398919	.	G	A	551.22	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0256305;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.467;QD=58.0228;RBI=0.0257828;REFB=0;REVB=0.00279739;RO=0;SAF=19;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00125591;OID=.;OPOS=113398919;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:38:0:0:36:38:1:17:19:0:0:17:21:0:0
chr12	113425154	.	C	G	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0241377;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=302.063;QD=44.6898;RBI=0.0271079;REFB=0;REVB=-0.0123374;RO=0;SAF=3;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.60818e-05;OID=.;OPOS=113425154;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:10:3:0:0:10:3:0:0
chr12	113435450	.	A	T	1358.61	PASS	AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00627722;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.139;QD=62.465;RBI=0.00875155;REFB=0;REVB=-0.00609804;RO=0;SAF=46;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.27506e-05;OID=.;OPOS=113435450;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:41:46:0:0:41:46:0:0
chr12	113448288	.	A	G	816.56	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00104753;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.929;QD=57.3026;RBI=0.02712;REFB=0;REVB=0.0270998;RO=0;SAF=32;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.89806e-05;OID=.;OPOS=113448288;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:56:57:0:0:56:57:1:24:32:0:0:25:32:0:0
chr12	113553481	.	C	T	428.98	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0286474;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.105;QD=57.1979;RBI=0.030127;REFB=0;REVB=0.00932547;RO=0;SAF=6;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000141586;OID=.;OPOS=113553481;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:24:6:0:0:24:6:0:0
chr12	113737736	.	AG	A	42.1	PASS	AF=0.409091;AO=7;DP=20;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.145606;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.4231;QD=7.65544;RBI=0.14646;REFB=-0.0678928;REVB=0.0157886;RO=13;SAF=6;SAR=1;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0.226804;SSSB=0.527602;STB=0.84619;STBP=0.019;TYPE=del;VARB=0.0682508;OID=.;OPOS=113737737;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.409091:7:20:9:22:13:8:1:5:8:42:13:6:1:5:8
chr12	113796566	.	A	C	557.13	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00249231;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.144;QD=60.2303;RBI=0.0296685;REFB=0;REVB=0.0295636;RO=0;SAF=23;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.91909e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000135486;OID=.;OPOS=113796566;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:14:23:0:0:14:23:0:0
chr12	114362483	.	C	T	785.21	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000486543;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=341.772;QD=57.1061;RBI=0.00258203;REFB=0;REVB=-0.00253578;RO=0;SAF=32;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.49259e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.28844e-06;OID=.;OPOS=114362483;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:23:32:0:0:23:32:0:0
chr12	114377899	.	G	C	1065.64	PASS	AF=1;AO=71;DP=72;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0150321;FXX=0.013887;HRUN=3;LEN=1;MLLD=181.826;QD=60.036;RBI=0.0607958;REFB=0;REVB=0.0589081;RO=0;SAF=40;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.18246e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000171472;OID=.;OPOS=114377899;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:71:0:0:71:71:1:31:40:0:0:31:40:0:0
chr12	114793240	.	C	T	146.37	PASS	AF=0.457143;AO=16;DP=35;FAO=16;FDP=35;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=17;FWDB=0.0128591;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.363;QD=16.7283;RBI=0.016401;REFB=-0.0127268;REVB=-0.0101802;RO=18;SAF=9;SAR=7;SRF=2;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.407938;STB=0.736957;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=0.00973803;OID=.;OPOS=114793240;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:18:19:16:16:0.457143:7:9:2:16:7:9:2:17
chr12	114793297	.	T	C	120.82	PASS	AF=0.411765;AO=13;DP=36;FAO=14;FDP=34;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.00509572;FXX=0.0810592;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.576;QD=14.2137;RBI=0.00946331;REFB=-0.0584395;REVB=-0.0079742;RO=23;SAF=3;SAR=10;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.380116;STB=0.636159;STBP=0.213;TYPE=snp;VARB=0.0641695;OID=.;OPOS=114793297;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:34:23:20:13:14:0.411765:10:3:13:10:10:4:10:10
chr12	115108136	.	T	C	65.74	PASS	AF=0.346154;AO=8;DP=26;FAO=9;FDP=26;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=0.037389;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.163;QD=10.1139;RBI=0.0394554;REFB=-0.0279457;REVB=-0.0126011;RO=18;SAF=5;SAR=3;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0504198;STB=0.514254;STBP=0.968;TYPE=snp;VARB=0.0724932;OID=.;OPOS=115108136;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:26:26:18:17:8:9:0.346154:3:5:12:6:3:6:11:6
chr12	116155595	.	G	A	1301.05	PASS	AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00757386;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.5415;QD=61.9548;RBI=0.0479384;REFB=0;REVB=0.0473363;RO=0;SAF=47;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.99643e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00045643;OID=.;OPOS=116155595;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:37:47:0:0:37:47:0:0
chr12	116421996	.	C	T	101.16	PASS	AF=0.270833;AO=13;DP=48;FAO=13;FDP=48;FR=.;FRO=35;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=-0.00351953;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.099;QD=8.42966;RBI=0.00374951;REFB=-0.00509397;REVB=-0.00129294;RO=35;SAF=9;SAR=4;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.312928;STB=0.692012;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=0.0202342;OID=.;OPOS=116421996;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:35:35:13:13:0.270833:4:9:15:20:4:9:15:20
chr12	116586414	.	CTATA	C	304.1	PASS	AF=0.742857;AO=19;DP=37;FAO=26;FDP=35;FR=.;FRO=9;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=0.0493275;FXX=0.124969;HRUN=1;LEN=4;MLLD=112.96;QD=34.7546;RBI=0.187661;REFB=-0.191528;REVB=0.181062;RO=5;SAF=4;SAR=15;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.193275;STB=0.627805;STBP=0.017;TYPE=del;VARB=0.0658539;OID=.;OPOS=116586415;OREF=TATA;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.742857:19:37:26:35:9:8:18:7:2:58:5:4:15:3:2
chr12	117014131	.	G	GA,GAA	250.83	PASS	AF=1,0;AO=33,5;DP=46;FAO=43,0;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=13,0;FSAR=30,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.162642,0.0881999;FXX=0.0227221;HRUN=6,6;LEN=1,2;MLLD=8.48818,9.00428;QD=23.3326;RBI=0.16671,0.0908112;REFB=0.0288328,0.0337641;REVB=-0.0366049,-0.0216206;RO=7;SAF=10,1;SAR=23,4;SRF=3;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0471711,-0.260267;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,ins;VARB=0.00338567,-0.0166986;OID=.,.;OPOS=117014132,117014132;OREF=-,-;OALT=A,AA;OMAPALT=GA,GAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1,0:33,5:46:43,0:43:0:13,0:30,0:0:0:4:7:10,1:23,4:3:4
chr12	117217141	.	T	C	358.12	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0349027;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.807;QD=55.0953;RBI=0.0357798;REFB=0;REVB=0.00787392;RO=0;SAF=11;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000247349;OID=.;OPOS=117217141;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:15:11:0:0:15:11:0:0
chr12	117289613	.	G	C	178.7	PASS	AF=0.5625;AO=18;DP=32;FAO=18;FDP=32;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.0195122;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.686;QD=22.3377;RBI=0.021338;REFB=0.00166799;REVB=0.00863629;RO=14;SAF=10;SAR=8;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153541;STB=0.586112;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=-0.000977242;OID=.;OPOS=117289613;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:14:14:18:18:0.5625:8:10:5:9:8:10:5:9
chr12	117290182	.	T	C,TTTCCCC	147.8	PASS	AF=0,0.432432;AO=2,15;DP=39;FAO=0,16;FDP=37;FR=.;FRO=21;FSAF=0,6;FSAR=0,10;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=-0.0199807,-0.00158932;FXX=0.0512689;HRUN=3,3;LEN=1,6;MLLD=52.6596,264.788;QD=15.978;RBI=0.0847584,0.00450552;REFB=-0.00715731,-0.0143288;REVB=-0.0823697,-0.0042159;RO=21;SAF=2,6;SAR=0,9;SRF=10;SRR=11;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.514114,-0.0781561;STB=0.5,0.559365;STBP=1,0.573;TYPE=snp,ins;VARB=0,0.0206988;OID=.,.;OPOS=117290182,117290183;OREF=T,-;OALT=C,TTCCCC;OMAPALT=C,TTTCCCC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:39:37:21:21:2,15:0,16:0,0.432432:0,9:2,6:10:11:0,10:0,6:10:11
chr12	117383320	.	G	A	520.05	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0388814;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.452;QD=59.4342;RBI=0.0542791;REFB=0;REVB=-0.0378743;RO=0;SAF=17;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000522931;OID=.;OPOS=117383320;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:18:17:0:0:18:17:0:0
chr12	117465857	.	T	C	972.87	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0154172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.001;QD=58.962;RBI=0.0185028;REFB=0;REVB=-0.0102304;RO=0;SAF=41;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.04816e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.53417e-05;OID=.;OPOS=117465857;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:25:41:0:0:25:41:0:0
chr12	117593387	.	G	A	2501.93	PASS	AF=0.944134;AO=169;DP=179;FAO=169;FDP=179;FR=.;FRO=10;FSAF=72;FSAR=97;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=-0.0030088;FXX=0.00555525;HRUN=3;LEN=1;MLLD=173.525;QD=55.9091;RBI=0.0152302;REFB=-0.109634;REVB=0.01493;RO=10;SAF=72;SAR=97;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0295782;STB=0.515574;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=0.000972425;OID=.;OPOS=117593387;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:20:179:179:10:10:169:169:0.944134:97:72:7:3:97:72:7:3
chr12	117593391	.	A	G	2814.25	PASS	AF=1;AO=179;DP=180;FAO=181;FDP=181;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=100;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0420712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.836;QD=62.1934;RBI=0.0452435;REFB=-0.0500598;REVB=-0.0166429;RO=1;SAF=79;SAR=100;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00598802;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000305395;OID=.;OPOS=117593391;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:180:181:1:0:179:181:1:100:79:1:0:100:81:0:0
chr12	117665264	.	A	G	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=9.28605e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.815;QD=59.4356;RBI=0.00922961;REFB=0;REVB=0.00922914;RO=0;SAF=20;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.7828e-05;OID=.;OPOS=117665264;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:15:20:0:0:15:20:0:0
chr12	117701714	.	A	G	318.42	PASS	AF=0.581818;AO=32;DP=55;FAO=32;FDP=55;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=-0.0113988;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.321;QD=23.158;RBI=0.048546;REFB=-0.0339704;REVB=-0.0471888;RO=23;SAF=12;SAR=20;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0581603;STB=0.532;STBP=0.596;TYPE=snp;VARB=0.0204158;OID=.;OPOS=117701714;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:23:23:32:32:0.581818:20:12:7:16:20:12:7:16
chr12	117890947	.	T	C	1179.7	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00491999;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.752;QD=60.4973;RBI=0.0349001;REFB=0;REVB=0.0345516;RO=0;SAF=44;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.58027e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.4168e-06;OID=.;OPOS=117890947;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:78:0:0:77:78:1:33:44:0:0:33:45:0:0
chr12	117894232	.	C	A	319.17	PASS	AF=0.382979;AO=35;DP=93;FAO=36;FDP=94;FR=.;FRO=58;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=34;FSRR=24;FWDB=0.000136119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=299.744;QD=13.5817;RBI=0.00626596;REFB=-0.00227911;REVB=0.00626448;RO=58;SAF=16;SAR=19;SRF=34;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140037;STB=0.586807;STBP=0.196;TYPE=snp;VARB=0.00321397;OID=.;OPOS=117894232;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:94:58:58:35:36:0.382979:19:16:34:24:20:16:34:24
chr12	118020115	.	G	A	632.45	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0116216;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.118;QD=61.7022;RBI=0.012638;REFB=0;REVB=0.00496559;RO=0;SAF=23;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.4817e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.48116e-05;OID=.;OPOS=118020115;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:41:0:0:40:41:1:17:23:0:0:18:23:0:0
chr12	118199286	.	C	G	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0336814;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.216;QD=52.613;RBI=0.0403751;REFB=0;REVB=0.0222646;RO=0;SAF=15;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.79751e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000133373;OID=.;OPOS=118199286;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:7:15:0:0:7:15:0:0
chr12	118467553	.	A	G	189.38	PASS	AF=0.415094;AO=22;DP=58;FAO=22;FDP=53;FR=.;FRO=31;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=-0.000701048;FXX=0.086192;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.281;QD=14.2927;RBI=0.0183552;REFB=0.0012839;REVB=0.0183418;RO=27;SAF=11;SAR=11;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0898222;STB=0.547127;STBP=0.59;TYPE=snp;VARB=-0.00130433;OID=.;OPOS=118467553;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:53:27:31:22:22:0.415094:11:11:16:11:11:11:18:13
chr12	118473054	.	T	C	234.95	PASS	AF=0.46;AO=23;DP=50;FAO=23;FDP=50;FR=.;FRO=27;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=0.00929235;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.316;QD=18.7956;RBI=0.0125893;REFB=-0.00857883;REVB=0.00849373;RO=27;SAF=17;SAR=6;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1637;STB=0.593343;STBP=0.261;TYPE=snp;VARB=0.0101257;OID=.;OPOS=118473054;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:27:27:23:23:0.46:6:17:16:11:6:17:16:11
chr12	118506186	.	A	T	225.71	PASS	AF=0.471698;AO=25;DP=53;FAO=25;FDP=53;FR=.;FRO=28;FSAF=18;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=-0.00654399;FXX=0.0185151;HRUN=2;LEN=1;MLLD=221.071;QD=17.0349;RBI=0.00691183;REFB=-0.00681963;REVB=0.00222477;RO=28;SAF=18;SAR=7;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122429;STB=0.569362;STBP=0.391;TYPE=snp;VARB=0.00833554;OID=.;OPOS=118506186;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:28:28:25:25:0.471698:7:18:17:11:7:18:17:11
chr12	118506348	.	C	T	41.13	PASS	AF=0.6;AO=6;DP=10;FAO=6;FDP=10;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.109036;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.8563;QD=16.4529;RBI=0.114347;REFB=-0.0574777;REVB=0.0344425;RO=4;SAF=4;SAR=2;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119263;STB=0.571183;STBP=0.714;TYPE=snp;VARB=0.0545878;OID=.;OPOS=118506348;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:10:10:4:4:6:6:0.6:2:4:2:2:2:4:2:2
chr12	118509191	.	G	A	177.46	PASS	AF=0.545455;AO=18;DP=33;FAO=18;FDP=33;FR=.;FRO=15;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=3;FWDB=-0.0476419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.864;QD=21.5098;RBI=0.0485843;REFB=-0.00792557;REVB=-0.00952267;RO=15;SAF=11;SAR=7;SRF=12;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168412;STB=0.593999;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.00468835;OID=.;OPOS=118509191;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:15:15:18:18:0.545455:7:11:12:3:7:11:12:3
chr12	118520170	.	G	A	163.65	PASS	AF=0.53125;AO=17;DP=32;FAO=17;FDP=32;FR=.;FRO=15;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.0192786;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.11;QD=20.456;RBI=0.0254241;REFB=-0.00772868;REVB=0.0165747;RO=15;SAF=10;SAR=7;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0464767;STB=0.526285;STBP=0.79;TYPE=snp;VARB=0.00714148;OID=.;OPOS=118520170;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:15:15:17:17:0.53125:7:10:8:7:7:10:8:7
chr12	118682751	.	C	T	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0460915;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.5422;QD=55.6557;RBI=0.0484031;REFB=0;REVB=-0.0147792;RO=0;SAF=13;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00102677;OID=.;OPOS=118682751;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:14:13:0:0:14:13:0:0
chr12	118827781	.	G	A	209.02	PASS	AF=0.477273;AO=20;DP=41;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.0632662;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.4638;QD=19.0016;RBI=0.0633669;REFB=-0.00511699;REVB=-0.00357147;RO=21;SAF=10;SAR=10;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0646361;STB=0.523787;STBP=0.799;TYPE=snp;VARB=0.0221616;OID=.;OPOS=118827781;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:44:21:23:20:21:0.477273:10:10:12:9:11:10:12:11
chr12	118828755	.	G	A	117.44	PASS	AF=0.590909;AO=13;DP=22;FAO=13;FDP=22;FR=.;FRO=9;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=-0.0206495;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.246;QD=21.352;RBI=0.0206571;REFB=-0.00487604;REVB=-0.000558299;RO=9;SAF=7;SAR=6;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.225945;STB=0.627399;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.00642998;OID=.;OPOS=118828755;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:22:22:9:9:13:13:0.590909:6:7:2:7:6:7:2:7
chr12	118855405	.	A	G	291.43	PASS	AF=0.463768;AO=32;DP=69;FAO=32;FDP=69;FR=.;FRO=37;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=-0.0159819;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.491;QD=16.8946;RBI=0.0199877;REFB=-0.00184899;REVB=0.0120036;RO=37;SAF=13;SAR=19;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0780232;STB=0.543832;STBP=0.547;TYPE=snp;VARB=0.00214881;OID=.;OPOS=118855405;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:37:37:32:32:0.463768:19:13:18:19:19:13:18:19
chr12	119431750	.	G	T	157.85	PASS	AF=0.447368;AO=17;DP=38;FAO=17;FDP=38;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0134711;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=256.861;QD=16.6157;RBI=0.0154619;REFB=-0.0134341;REVB=0.0075896;RO=21;SAF=10;SAR=7;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0631391;STB=0.536235;STBP=0.721;TYPE=snp;VARB=0.0177704;OID=.;OPOS=119431750;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:21:21:17:17:0.447368:7:10:11:10:7:10:11:10
chr12	119596765	.	A	G	165.11	PASS	AF=0.566667;AO=17;DP=30;FAO=17;FDP=30;FR=.;FRO=13;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=11;FWDB=0.00909184;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.307;QD=22.015;RBI=0.0189331;REFB=-0.00820066;REVB=0.0166072;RO=13;SAF=10;SAR=7;SRF=2;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.32558;STB=0.68162;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.00494317;OID=.;OPOS=119596765;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:13:13:17:17:0.566667:7:10:2:11:7:10:2:11
chr12	119871387	.	A	G	651.2	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.027251;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.8555;QD=62.0194;RBI=0.0381828;REFB=0;REVB=-0.0267452;RO=0;SAF=20;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0005278;OID=.;OPOS=119871387;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:22:20:0:0:22:20:0:0
chr12	120171995	.	T	C	210.65	PASS	AF=0.4;AO=26;DP=65;FAO=26;FDP=65;FR=.;FRO=39;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=23;FWDB=-0.0108828;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.8652;QD=12.9628;RBI=0.0370647;REFB=-0.000579127;REVB=-0.035431;RO=38;SAF=15;SAR=11;SRF=16;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161309;STB=0.599219;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=-0.000852674;OID=.;OPOS=120171995;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:38:39:26:26:0.4:11:15:16:22:11:15:16:23
chr12	120189879	.	A	G	95.68	PASS	AF=0.363636;AO=12;DP=33;FAO=12;FDP=33;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=-0.0142839;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.343;QD=11.5973;RBI=0.0157546;REFB=-0.0184241;REVB=-0.0066467;RO=21;SAF=7;SAR=5;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11507;STB=0.568413;STBP=0.572;TYPE=snp;VARB=0.027875;OID=.;OPOS=120189879;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:33:33:21:21:12:12:0.363636:5:7:10:11:5:7:10:11
chr12	120189888	.	T	C	95.42	PASS	AF=0.375;AO=11;DP=31;FAO=12;FDP=32;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=-0.0181147;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.677;QD=11.9272;RBI=0.0292941;REFB=-0.0186268;REVB=0.0230218;RO=20;SAF=7;SAR=4;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.202063;STB=0.583194;STBP=0.476;TYPE=snp;VARB=0.0479385;OID=.;OPOS=120189888;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:31:32:20:20:11:12:0.375:4:7:9:11:5:7:9:11
chr12	120263003	.	G	C	319.83	PASS	AF=0.485714;AO=34;DP=71;FAO=34;FDP=70;FR=.;FRO=36;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=-0.0500709;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.181;QD=18.276;RBI=0.0543027;REFB=0.00350022;REVB=-0.0210164;RO=36;SAF=22;SAR=12;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166183;STB=0.592988;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=-0.0111375;OID=.;OPOS=120263003;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:70:36:36:34:34:0.485714:12:22:17:19:12:22:17:19
chr12	120270638	.	G	A	105.82	PASS	AF=0.351351;AO=13;DP=37;FAO=13;FDP=37;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=-0.0200107;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.467;QD=11.4396;RBI=0.0200459;REFB=-0.00898727;REVB=0.00118746;RO=24;SAF=6;SAR=7;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0420088;STB=0.524961;STBP=0.802;TYPE=snp;VARB=0.0158859;OID=.;OPOS=120270638;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:24:24:13:13:0.351351:7:6:12:12:7:6:12:12
chr12	120457035	.	A	G	318.43	PASS	AF=0.581818;AO=32;DP=55;FAO=32;FDP=55;FR=.;FRO=23;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=5;FSRR=18;FWDB=0.023443;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.9691;QD=23.1586;RBI=0.0321237;REFB=0.0111375;REVB=0.0219626;RO=23;SAF=15;SAR=17;SRF=5;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194942;STB=0.606873;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=-0.00833418;OID=.;OPOS=120457035;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:23:23:32:32:0.581818:17:15:5:18:17:15:5:18
chr12	120575417	.	G	A	385.08	PASS	AF=0.575758;AO=38;DP=66;FAO=38;FDP=66;FR=.;FRO=28;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.00565676;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.2351;QD=23.3379;RBI=0.0671929;REFB=-0.0218595;REVB=0.0669544;RO=28;SAF=14;SAR=24;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105528;STB=0.558108;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.031881;OID=.;OPOS=120575417;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:28:28:38:38:0.575758:24:14:14:14:24:14:14:14
chr12	120575549	.	A	C	1026.37	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00786988;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.38;QD=59.4997;RBI=0.0310435;REFB=0;REVB=0.0300294;RO=0;SAF=30;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000120069;OID=.;OPOS=120575549;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:39:30:0:0:39:30:0:0
chr12	120589064	.	G	C	301.41	PASS	AF=0.404762;AO=33;DP=83;FAO=34;FDP=84;FR=.;FRO=50;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=30;FWDB=-0.00386102;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.3733;QD=14.353;RBI=0.0145119;REFB=0.000877821;REVB=0.0139889;RO=50;SAF=14;SAR=19;SRF=20;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0263866;STB=0.507242;STBP=0.908;TYPE=snp;VARB=-0.00214327;OID=.;OPOS=120589064;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:84:50:50:33:34:0.404762:19:14:20:30:20:14:20:30
chr12	120589160	.	A	G	435.68	PASS	AF=0.96875;AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0139779;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.498;QD=54.4597;RBI=0.0145223;REFB=0.0754703;REVB=-0.0039388;RO=1;SAF=13;SAR=18;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0252169;STB=0.513505;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=-0.00141681;OID=.;OPOS=120589160;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:32:32:1:1:31:31:0.96875:18:13:0:1:18:13:0:1
chr12	120591143	.	A	G	236.16	PASS	AF=0.469388;AO=23;DP=49;FAO=23;FDP=49;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.00782152;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.644;QD=19.2781;RBI=0.00782275;REFB=-0.0132697;REVB=-0.000138755;RO=26;SAF=7;SAR=16;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16086;STB=0.591357;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=0.0148137;OID=.;OPOS=120591143;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:26:26:23:23:0.469388:16:7:12:14:16:7:12:14
chr12	120608031	.	A	G	160.36	PASS	AF=0.459459;AO=17;DP=38;FAO=17;FDP=37;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.00887609;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.014;QD=17.3359;RBI=0.0215749;REFB=-0.0208001;REVB=-0.0196645;RO=21;SAF=12;SAR=5;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190792;STB=0.593524;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=0.0321342;OID=.;OPOS=120608031;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:37:21:20:17:17:0.459459:5:12:11:10:5:12:11:9
chr12	120636549	.	C	A	257.66	PASS	AF=0.545455;AO=24;DP=44;FAO=24;FDP=44;FR=.;FRO=20;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=-0.0243964;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.4601;QD=23.4231;RBI=0.072136;REFB=0.0267071;REVB=-0.0678854;RO=20;SAF=14;SAR=10;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149289;STB=0.583264;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=-0.0245745;OID=.;OPOS=120636549;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:20:20:24:24:0.545455:10:14:8:12:10:14:8:12
chr12	120649970	.	C	T	38.15	PASS	AF=0.4;AO=6;DP=15;FAO=6;FDP=15;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=-0.0187232;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.876;QD=10.1739;RBI=0.0435472;REFB=-0.0143792;REVB=-0.0393166;RO=9;SAF=4;SAR=2;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.012826;OID=.;OPOS=120649970;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:15:15:9:9:6:6:0.4:2:4:6:3:2:4:6:3
chr12	120661977	.	T	C	160.07	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0258078;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.513;QD=45.7342;RBI=0.0349511;REFB=0;REVB=-0.0235698;RO=0;SAF=10;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.0469e-05;OID=.;OPOS=120661977;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:14:0:0:13:14:1:3:10:0:0:3:11:0:0
chr12	120882217	.	G	T	215.11	PASS	AF=0.525;AO=21;DP=40;FAO=21;FDP=40;FR=.;FRO=19;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=5;FWDB=0.0258718;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.201;QD=21.5109;RBI=0.0264919;REFB=-0.0188311;REVB=0.00569848;RO=18;SAF=12;SAR=9;SRF=13;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129843;STB=0.582015;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.0106822;OID=.;OPOS=120882217;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:18:19:21:21:0.525:9:12:13:5:9:12:14:5
chr12	120882264	.	AAAG	A	86.47	PASS	AF=0.4;AO=12;DP=36;FAO=14;FDP=35;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=-0.0262185;FXX=0.0540395;HRUN=7;LEN=3;MLLD=196.136;QD=9.88248;RBI=0.0348683;REFB=0.0133484;REVB=0.0229867;RO=23;SAF=4;SAR=8;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.256455;STB=0.629443;STBP=0.232;TYPE=del;VARB=-0.0132094;OID=.;OPOS=120882265;OREF=AAG;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.4:12:36:14:35:21:5:9:12:9:86:23:4:8:13:10
chr12	120884328	.	C	T	99.22	PASS	AF=0.444444;AO=12;DP=27;FAO=12;FDP=27;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=-0.00249957;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.0388;QD=14.6993;RBI=0.0288279;REFB=-0.000160309;REVB=0.0287194;RO=15;SAF=8;SAR=4;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0692817;STB=0.540471;STBP=0.708;TYPE=snp;VARB=0.00174435;OID=.;OPOS=120884328;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:15:15:12:12:0.444444:4:8:9:6:4:8:9:6
chr12	120934407	.	C	T	263.86	PASS	AF=0.529412;AO=27;DP=50;FAO=27;FDP=51;FR=.;FRO=24;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.0411552;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=38.9928;QD=20.6948;RBI=0.12625;REFB=-0.0494898;REVB=0.119354;RO=23;SAF=14;SAR=13;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00266441;STB=0.510909;STBP=0.885;TYPE=snp;VARB=0.04595;OID=.;OPOS=120934407;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:51:23:24:27:27:0.529412:13:14:12:11:13:14:13:11
chr12	120934624	.	A	C	91.24	PASS	AF=0.52381;AO=11;DP=21;FAO=11;FDP=21;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=9;FWDB=-0.0193016;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.2982;QD=17.3782;RBI=0.020565;REFB=-0.00609438;REVB=-0.00709702;RO=10;SAF=4;SAR=7;SRF=1;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.25877;STB=0.646239;STBP=0.271;TYPE=snp;VARB=0.00547955;OID=.;OPOS=120934624;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:21:21:10:10:11:11:0.52381:7:4:1:9:7:4:1:9
chr12	120966921	.	A	G	82.45	PASS	AF=0.588235;AO=9;DP=16;FAO=10;FDP=17;FR=.;FRO=7;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.0702943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.302;QD=19.4006;RBI=0.0724493;REFB=-0.0127158;REVB=0.017539;RO=7;SAF=6;SAR=3;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.381184;STB=0.723701;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=0.0138575;OID=.;OPOS=120966921;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:16:17:7:7:9:10:0.588235:3:6:1:6:3:7:1:6
chr12	121017171	.	A	G	753.99	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0284045;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.5496;QD=56.9048;RBI=0.0426865;REFB=0;REVB=-0.0318642;RO=0;SAF=36;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.19417e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.86644e-05;OID=.;OPOS=121017171;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:17:36:0:0:17:36:0:0
chr12	121093629	.	CGTGCGT	C,CCAGTGCGT	179.31	PASS	AF=1,0;AO=13,2;DP=17;FAO=15,0;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=10,0;FSAR=5,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.03601,0.0912212;FXX=0.062461;HRUN=1,1;LEN=6,2;MLLD=214.88,59.1581;QD=47.8146;RBI=0.0673045,0.122467;REFB=0,0;REVB=0.056861,0.0817116;RO=2;SAF=9,2;SAR=4,0;SRF=1;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0529323,0.639851;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,ins;VARB=0.00112391,0;OID=.,.;OPOS=121093630,121093630;OREF=GTGCGT,-;OALT=-,CA;OMAPALT=C,CCAGTGCGT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1,0:13,2:17:15,0:15:0:10,0:5,0:0:0:4:2:9,2:4,0:1:1
chr12	121175221	.	G	A	591.44	PASS	AF=0.484127;AO=61;DP=126;FAO=61;FDP=126;FR=.;FRO=65;FSAF=34;FSAR=27;FSRF=38;FSRR=27;FWDB=0.00171709;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.538;QD=18.7758;RBI=0.0417572;REFB=-0.00413718;REVB=0.0417219;RO=65;SAF=34;SAR=27;SRF=38;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0258142;STB=0.514281;STBP=0.772;TYPE=snp;VARB=0.00480979;OID=.;OPOS=121175221;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:126:126:65:65:61:61:0.484127:27:34:38:27:27:34:38:27
chr12	121416622	.	C	G	754.65	PASS	AF=0.981818;AO=54;DP=55;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0148954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.33;QD=54.8833;RBI=0.0449492;REFB=-0.114667;REVB=0.0424094;RO=0;SAF=31;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.6027e-08;STB=0.507934;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.000910254;OID=.;OPOS=121416622;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:55:55:0:1:54:54:0.981818:23:31:0:0:23:31:1:0
chr12	121416650	.	A	C	225.7	PASS	AF=0.471698;AO=25;DP=54;FAO=25;FDP=53;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=9;FWDB=0.0196658;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.998;QD=17.0336;RBI=0.0208037;REFB=-0.0103472;REVB=0.00678585;RO=28;SAF=10;SAR=15;SRF=19;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.256829;STB=0.644332;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.0139504;OID=.;OPOS=121416650;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:53:28:28:25:25:0.471698:15:10:19:9:15:10:19:9
chr12	121434630	.	C	CTCATTCAT,T	272.26	PASS	AF=0.6875,0.0625;AO=21,3;DP=34;FAO=22,2;FDP=32;FR=.;FRO=8;FSAF=11,2;FSAR=11,0;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=0.00446804,-0.0119956;FXX=0.0588062;HRUN=1,1;LEN=8,1;MLLD=190.052,111.359;QD=34.0324;RBI=0.0153377,0.0246762;REFB=0.0116987,-0.00941657;REVB=0.0146724,0.0215643;RO=9;SAF=10,3;SAR=11,0;SRF=7;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.163524,0.587581;STB=0.566607,0.992036;STBP=0.272,0.392;TYPE=ins,snp;VARB=-0.00219344,0.0126932;OID=.,.;OPOS=121434631,121434630;OREF=-,C;OALT=TCATTCAT,T;OMAPALT=CTCATTCAT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:34:32:9:8:21,3:22,2:0.6875,0.0625:11,0:10,3:7:2:11,0:11,2:6:2
chr12	121435427	.	G	A	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0199608;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.361;QD=47.8223;RBI=0.0500518;REFB=0;REVB=0.0458993;RO=0;SAF=8;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000173782;OID=.;OPOS=121435427;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:8:8:0:0:8:8:0:0
chr12	121435475	.	G	A	296.36	PASS	AF=0.958333;AO=23;DP=24;FAO=23;FDP=24;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00382211;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.915;QD=49.3929;RBI=0.0703628;REFB=-0.110484;REVB=0.0702589;RO=1;SAF=14;SAR=9;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0486633;STB=0.526293;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.00130464;OID=.;OPOS=121435475;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:24:24:1:1:23:23:0.958333:9:14:0:1:9:14:0:1
chr12	121435586	.	TG	T,TT	415.98	PASS	AF=1,0;AO=7,22;DP=29;FAO=29,0;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=13,0;FSAR=16,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.156311,-0.152177;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=113.605,105.874;QD=57.3768;RBI=0.195526,0.209176;REFB=0,0;REVB=-0.117461,-0.143516;RO=0;SAF=0,13;SAR=7,9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-5.2029e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.00190256,0;OID=.,.;OPOS=121435587,121435587;OREF=G,G;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1,0:7,22:29:29,0:29:0:13,0:16,0:0:0:4:0:0,13:7,9:0:0
chr12	121437221	.	T	C	910.15	PASS	AF=0.984375;AO=63;DP=66;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0596286;FXX=0.0302984;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.7273;QD=56.8841;RBI=0.0673811;REFB=-0.084258;REVB=0.031379;RO=1;SAF=39;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119558;STB=0.506327;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=0.00158221;OID=.;OPOS=121437221;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:66:64:1:1:63:63:0.984375:24:39:1:0:24:39:1:0
chr12	121437382	.	A	G	341.53	PASS	AF=1;AO=23;DP=24;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.195485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.347;QD=54.6451;RBI=0.19577;REFB=0;REVB=0.0105724;RO=0;SAF=1;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.47154e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000695639;OID=.;OPOS=121437382;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:25:0:0:23:25:1:22:1:0:0:22:3:0:0
chr12	121454257	.	T	A	542.29	PASS	AF=1;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0348758;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.5543;QD=60.2542;RBI=0.0443529;REFB=0;REVB=0.0274018;RO=0;SAF=12;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000723255;OID=.;OPOS=121454257;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:36:0:0:36:36:1:24:12:0:0:24:12:0:0
chr12	121471337	.	G	A	1268.44	PASS	AF=0.988095;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=84;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0202301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.539;QD=60.402;RBI=0.0231251;REFB=-0.0665926;REVB=0.0112033;RO=0;SAF=43;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505746;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.000612496;OID=.;OPOS=121471337;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:83:84:0:1:83:83:0.988095:40:43:0:0:40:43:1:0
chr12	121600253	.	T	C	386.97	PASS	AF=0.584615;AO=38;DP=65;FAO=38;FDP=65;FR=.;FRO=27;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=19;FSRR=8;FWDB=-0.00235409;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.7703;QD=23.8135;RBI=0.0120416;REFB=-0.0251136;REVB=0.0118092;RO=27;SAF=17;SAR=21;SRF=19;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.192008;STB=0.60523;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.012371;OID=.;OPOS=121600253;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:27:27:38:38:0.584615:21:17:19:8:21:17:19:8
chr12	121605355	.	G	A	209.71	PASS	AF=0.466667;AO=21;DP=45;FAO=21;FDP=45;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=0.00515188;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.245;QD=18.641;RBI=0.00844784;REFB=-0.0077597;REVB=-0.00669508;RO=24;SAF=10;SAR=11;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0168346;STB=0.509545;STBP=0.933;TYPE=snp;VARB=0.00764058;OID=.;OPOS=121605355;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:24:24:21:21:0.466667:11:10:11:13:11:10:11:13
chr12	121622304	.	A	C	56.28	PASS	AF=0.4;AO=8;DP=20;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=-0.0768723;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.3489;QD=11.2557;RBI=0.0870612;REFB=-0.026026;REVB=0.0408694;RO=12;SAF=4;SAR=4;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.252187;STB=0.649658;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=0.0329377;OID=.;OPOS=121622304;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:20:20:12:12:8:8:0.4:4:4:9:3:4:4:9:3
chr12	121622520	.	A	T	293.44	PASS	AF=1;AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.024003;FXX=0.0434594;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.2;QD=53.3518;RBI=0.0241851;REFB=0;REVB=0.0029625;RO=0;SAF=13;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2029e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000397574;OID=.;OPOS=121622520;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:22:0:0:22:22:1:9:13:0:0:9:13:0:0
chr12	121660787	.	T	C	447.01	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0393143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.421;QD=57.6787;RBI=0.0419782;REFB=0;REVB=0.014716;RO=0;SAF=12;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.47712e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000392921;OID=.;OPOS=121660787;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:19:12:0:0:19:12:0:0
chr12	121666646	.	A	G	447.0	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00122017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.302;QD=57.6768;RBI=0.0325076;REFB=0;REVB=-0.0324847;RO=0;SAF=12;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.47712e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000134202;OID=.;OPOS=121666646;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:19:12:0:0:19:12:0:0
chr12	121691096	.	G	A	393.31	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0155948;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=202.794;QD=56.187;RBI=0.016855;REFB=0;REVB=-0.00639482;RO=0;SAF=11;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.31638e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.9965e-05;OID=.;OPOS=121691096;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:17:11:0:0:17:11:0:0
chr12	121853164	.	T	C	154.95	PASS	AF=0.592593;AO=16;DP=27;FAO=16;FDP=27;FR=.;FRO=11;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=2;FWDB=-0.0167669;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.5949;QD=22.955;RBI=0.0422727;REFB=0.00576414;REVB=0.0388053;RO=11;SAF=11;SAR=5;SRF=9;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116304;STB=0.564895;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=-0.00155959;OID=.;OPOS=121853164;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:27:27:11:11:16:16:0.592593:5:11:9:2:5:11:9:2
chr12	121870922	.	G	A	82.92	PASS	AF=0.366667;AO=10;DP=29;FAO=11;FDP=30;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.0148829;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.3283;QD=11.0557;RBI=0.136502;REFB=-0.0408121;REVB=0.135688;RO=19;SAF=5;SAR=5;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0856821;STB=0.578172;STBP=0.538;TYPE=snp;VARB=0.0798337;OID=.;OPOS=121870922;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:82:29:30:19:19:10:11:0.366667:5:5:11:8:6:5:11:8
chr12	121871006	.	A	C	45.66	PASS	AF=0.333333;AO=7;DP=21;FAO=7;FDP=21;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.0261146;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=143.733;QD=8.69746;RBI=0.0360309;REFB=0.00202384;REVB=-0.0248245;RO=14;SAF=3;SAR=4;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0769493;STB=0.547808;STBP=0.747;TYPE=snp;VARB=-0.00262392;OID=.;OPOS=121871006;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:21:21:14:14:7:7:0.333333:4:3:7:7:4:3:7:7
chr12	121878659	.	C	T	442.03	PASS	AF=0.494382;AO=44;DP=89;FAO=44;FDP=89;FR=.;FRO=45;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=12;FSRR=33;FWDB=-0.00250307;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.966;QD=19.8665;RBI=0.0025211;REFB=-0.00190901;REVB=-0.000300977;RO=45;SAF=20;SAR=24;SRF=12;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176553;STB=0.597442;STBP=0.087;TYPE=snp;VARB=0.00138745;OID=.;OPOS=121878659;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:45:45:44:44:0.494382:24:20:12:33:24:20:12:33
chr12	121880520	.	G	A	432.68	PASS	AF=0.464646;AO=46;DP=101;FAO=46;FDP=99;FR=.;FRO=53;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=30;FSRR=23;FWDB=0.0120344;FXX=0.0198;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.794;QD=17.4821;RBI=0.013058;REFB=-0.0159009;REVB=0.0050681;RO=51;SAF=20;SAR=26;SRF=30;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144408;STB=0.570145;STBP=0.2;TYPE=snp;VARB=0.013743;OID=.;OPOS=121880520;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:99:51:53:46:46:0.464646:26:20:30:21:26:20:30:23
chr12	121881848	.	G	A	264.96	PASS	AF=0.615385;AO=24;DP=39;FAO=24;FDP=39;FR=.;FRO=15;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=0.028048;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.499;QD=27.1753;RBI=0.0281165;REFB=0.00373855;REVB=-0.00196159;RO=15;SAF=12;SAR=12;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116021;STB=0.56405;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=-0.00294725;OID=.;OPOS=121881848;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:15:15:24:24:0.615385:12:12:5:10:12:12:5:10
chr12	122042844	.	A	G	110.48	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0782475;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.5668;QD=40.1751;RBI=0.147873;REFB=0;REVB=0.125474;RO=0;SAF=4;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0101609;OID=.;OPOS=122042844;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:11:0:0:10:11:1:6:4:0:0:7:4:0:0
chr12	122079189	.	C	T	255.16	PASS	AF=0.521739;AO=24;DP=46;FAO=24;FDP=46;FR=.;FRO=22;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=0.00104927;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.272;QD=22.188;RBI=0.0114262;REFB=-0.0227211;REVB=-0.011378;RO=22;SAF=16;SAR=8;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0287651;STB=0.516115;STBP=0.847;TYPE=snp;VARB=0.0272435;OID=.;OPOS=122079189;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:22:22:24:24:0.521739:8:16:14:8:8:16:14:8
chr12	122079441	.	T	C	42.23	PASS	AF=0.666667;AO=6;DP=9;FAO=6;FDP=9;FR=.;FRO=3;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0249485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.078;QD=18.767;RBI=0.0270448;REFB=0.0100687;REVB=-0.01044;RO=3;SAF=2;SAR=4;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00593663;OID=.;OPOS=122079441;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:9:9:3:3:6:6:0.666667:4:2:1:2:4:2:1:2
chr12	122079682	.	A	AT	76.04	PASS	AF=0.473684;AO=16;DP=38;FAO=18;FDP=38;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=-0.0257741;FXX=0.0256345;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.1877;QD=8.00407;RBI=0.028175;REFB=0.00270884;REVB=0.011381;RO=19;SAF=11;SAR=5;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.348167;STB=0.666481;STBP=0.059;TYPE=ins;VARB=-0.0127073;OID=.;OPOS=122079683;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.473684:16:38:18:38:20:12:6:7:13:72:19:11:5:6:13
chr12	122186268	.	C	T	128.04	PASS	AF=0.56;AO=14;DP=25;FAO=14;FDP=25;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=0.0374745;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.0936;QD=20.4857;RBI=0.051569;REFB=-0.0263648;REVB=0.0354264;RO=10;SAF=3;SAR=11;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.327439;STB=0.709352;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.0241414;OID=.;OPOS=122186268;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:25:25:10:11:14:14:0.56:11:3:6:4:11:3:7:4
chr12	122186317	.	G	A	87.44	PASS	AF=0.423077;AO=11;DP=26;FAO=11;FDP=26;FR=.;FRO=15;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.00715361;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.7013;QD=13.4529;RBI=0.00738871;REFB=-0.0031276;REVB=-0.00184906;RO=15;SAF=3;SAR=8;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.210453;STB=0.624759;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=0.00619642;OID=.;OPOS=122186317;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:26:26:15:15:11:11:0.423077:8:3:7:8:8:3:7:8
chr12	122234089	.	T	A	562.43	PASS	AF=1;AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0430248;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.9774;QD=60.8036;RBI=0.0502584;REFB=0;REVB=0.0259763;RO=0;SAF=18;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.68991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000508672;OID=.;OPOS=122234089;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:37:0:0:37:37:1:19:18:0:0:19:18:0:0
chr12	122234191	.	C	A	337.99	PASS	AF=0.617021;AO=29;DP=47;FAO=29;FDP=47;FR=.;FRO=18;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=-0.00987608;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.293;QD=28.765;RBI=0.0154092;REFB=0.00182224;REVB=-0.0118282;RO=18;SAF=13;SAR=16;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151069;STB=0.583034;STBP=0.141;TYPE=snp;VARB=-0.000933057;OID=.;OPOS=122234191;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:18:18:29:29:0.617021:16:13:12:6:16:13:12:6
chr12	122243905	.	C	T	1081.23	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0486074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.923;QD=60.0681;RBI=0.0514519;REFB=0;REVB=0.0168707;RO=0;SAF=25;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.61921e-05;OID=.;OPOS=122243905;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:72:0:0:70:72:1:45:25:0:0:45:27:0:0
chr12	122248582	.	C	G	152.45	PASS	AF=0.933333;AO=14;DP=15;FAO=14;FDP=15;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.104644;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=288.666;QD=40.6542;RBI=0.104644;REFB=-0.145449;REVB=-3.34755e-06;RO=1;SAF=1;SAR=13;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0337274;STB=0.518492;STBP=0.655;TYPE=snp;VARB=0.00133015;OID=.;OPOS=122248582;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:15:15:1:1:14:14:0.933333:13:1:0:1:13:1:0:1
chr12	122261456	.	G	A	897.32	PASS	AF=0.610687;AO=80;DP=124;FAO=80;FDP=131;FR=.;FRO=51;FSAF=47;FSAR=33;FSRF=23;FSRR=28;FWDB=-0.00150012;FXX=0.0150365;HRUN=3;LEN=1;MLLD=157.27;QD=27.399;RBI=0.00156587;REFB=-0.052591;REVB=-0.00044902;RO=44;SAF=47;SAR=33;SRF=17;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132795;STB=0.553782;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.0367148;OID=.;OPOS=122261456;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:124:131:44:51:80:80:0.610687:33:47:17:27:33:47:23:28
chr12	122295335	.	T	C	438.13	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0106756;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.651;QD=56.5324;RBI=0.0178772;REFB=0;REVB=0.0143397;RO=0;SAF=13;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.63861e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000294006;OID=.;OPOS=122295335;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:31:0:0:30:31:1:17:13:0:0:18:13:0:0
chr12	122326812	.	T	C	289.35	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0615435;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.7616;QD=52.609;RBI=0.0618499;REFB=0;REVB=-0.00614847;RO=0;SAF=16;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17051e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00210938;OID=.;OPOS=122326812;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:6:16:0:0:6:16:0:0
chr12	122353796	.	A	G	176.01	PASS	AF=0.4;AO=20;DP=55;FAO=22;FDP=55;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=-0.117975;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=28.7031;QD=12.8006;RBI=0.119628;REFB=-0.0731726;REVB=0.0198182;RO=28;SAF=9;SAR=11;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158565;STB=0.590083;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=0.077721;OID=.;OPOS=122353796;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:28:33:20:22:0.4:11:9:17:11:12:10:20:13
chr12	122355716	.	C	T	747.1	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0206754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.419;QD=63.583;RBI=0.0600917;REFB=0;REVB=0.0564229;RO=0;SAF=21;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000161955;OID=.;OPOS=122355716;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:26:21:0:0:26:21:0:0
chr12	122369762	.	C	T	192.41	PASS	AF=0.416667;AO=20;DP=48;FAO=20;FDP=48;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=0.0108695;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.8745;QD=16.0337;RBI=0.0126332;REFB=0.0193731;REVB=-0.00643843;RO=28;SAF=6;SAR=14;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.348157;STB=0.6998;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=-0.026189;OID=.;OPOS=122369762;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:28:28:20:20:0.416667:14:6:18:10:14:6:18:10
chr12	122392038	.	C	T	134.31	PASS	AF=0.428571;AO=15;DP=36;FAO=15;FDP=35;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.00230029;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.164;QD=15.3494;RBI=0.0180797;REFB=-0.0129385;REVB=0.0179328;RO=21;SAF=4;SAR=11;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185286;STB=0.618879;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=0.0114197;OID=.;OPOS=122392038;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:35:21:20:15:15:0.428571:11:4:9:12:11:4:9:11
chr12	122396395	.	C	T	433.7	PASS	AF=0.567568;AO=42;DP=74;FAO=42;FDP=74;FR=.;FRO=32;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=-0.00527703;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.801;QD=23.4431;RBI=0.0057924;REFB=0.004614;REVB=0.0023885;RO=31;SAF=25;SAR=17;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0626042;STB=0.54203;STBP=0.459;TYPE=snp;VARB=-0.00330137;OID=.;OPOS=122396395;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:31:32:42:42:0.567568:17:25:16:15:17:25:16:16
chr12	122405912	.	G	T	188.76	PASS	AF=0.527778;AO=19;DP=36;FAO=19;FDP=36;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.0800316;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.4091;QD=20.9729;RBI=0.0803485;REFB=0.0364881;REVB=-0.00712951;RO=16;SAF=8;SAR=11;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115419;STB=0.578864;STBP=0.335;TYPE=snp;VARB=-0.0379516;OID=.;OPOS=122405912;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:16:17:19:19:0.527778:11:8:9:7:11:8:10:7
chr12	122413196	.	T	C	441.98	PASS	AF=0.6;AO=41;DP=69;FAO=42;FDP=70;FR=.;FRO=28;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.0106094;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.461;QD=25.2562;RBI=0.0114873;REFB=-0.011957;REVB=0.00440458;RO=28;SAF=19;SAR=22;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0535844;STB=0.533408;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.00913761;OID=.;OPOS=122413196;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:70:28:28:41:42:0.6:22:19:15:13:23:19:15:13
chr12	122497001	.	T	C	1135.26	PASS	AF=1;AO=74;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00522226;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=299.337;QD=60.5472;RBI=0.00835919;REFB=0;REVB=0.00652718;RO=0;SAF=44;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.93382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.93746e-06;OID=.;OPOS=122497001;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:75:0:0:74:75:1:30:44:0:0:30:45:0:0
chr12	122617989	.	A	G	101.9	PASS	AF=0.282609;AO=12;DP=46;FAO=13;FDP=46;FR=.;FRO=33;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=-0.0216609;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.321;QD=8.86114;RBI=0.0251213;REFB=-0.0108662;REVB=-0.0127234;RO=32;SAF=5;SAR=7;SRF=12;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.051235;STB=0.571322;STBP=0.56;TYPE=snp;VARB=0.0301401;OID=.;OPOS=122617989;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:32:33:12:13:0.282609:7:5:12:20:7:6:12:21
chr12	122618131	.	A	G	158.95	PASS	AF=0.615385;AO=16;DP=27;FAO=16;FDP=26;FR=.;FRO=10;FSAF=0;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=10;FWDB=0;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.409;QD=24.4537;RBI=0.0186265;REFB=-0.0125331;REVB=0.0186265;RO=10;SAF=0;SAR=16;SRF=0;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00495684;OID=.;OPOS=122618131;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:27:26:10:10:16:16:0.615385:16:0:0:10:16:0:0:10
chr12	122623000	.	T	C	101.59	PASS	AF=0.5;AO=12;DP=24;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=0.012434;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.562;QD=16.9316;RBI=0.0246813;REFB=-0.0106488;REVB=-0.0213205;RO=12;SAF=6;SAR=6;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144848;STB=0.583198;STBP=0.49;TYPE=snp;VARB=0.00913946;OID=.;OPOS=122623000;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:24:24:12:12:12:12:0.5:6:6:8:4:6:6:8:4
chr12	122626842	.	G	A	638.7	PASS	AF=0.575758;AO=57;DP=99;FAO=57;FDP=99;FR=.;FRO=42;FSAF=37;FSAR=20;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=0.000758133;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.1119;QD=25.8058;RBI=0.0339988;REFB=0.00167481;REVB=0.0339903;RO=41;SAF=37;SAR=20;SRF=23;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0722546;STB=0.545954;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=-0.00115141;OID=.;OPOS=122626842;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:41:42:57:57:0.575758:20:37:23:18:20:37:23:19
chr12	122628219	.	T	C	295.74	PASS	AF=0.534483;AO=30;DP=57;FAO=31;FDP=58;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=7;FWDB=-0.0122717;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.831;QD=20.3958;RBI=0.0128148;REFB=-0.00569943;REVB=0.00369095;RO=26;SAF=14;SAR=16;SRF=19;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.218986;STB=0.618712;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=0.00357446;OID=.;OPOS=122628219;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:58:26:27:30:31:0.534483:16:14:19:7:16:15:20:7
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chr12	122674032	.	C	T	365.05	PASS	AF=0.964286;AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00407067;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.101;QD=52.15;RBI=0.0254473;REFB=0.0212814;REVB=0.0251196;RO=1;SAF=9;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0488676;STB=0.526296;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=-0.00132491;OID=.;OPOS=122674032;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:28:28:1:1:27:27:0.964286:18:9:1:0:18:9:1:0
chr12	122674758	.	G	A	708.52	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00172863;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.9359;QD=62.9799;RBI=0.0270642;REFB=0;REVB=0.0270089;RO=0;SAF=31;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000284725;OID=.;OPOS=122674758;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:14:31:0:0:14:31:0:0
chr12	122676013	.	A	C	878.37	PASS	AF=1;AO=60;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00107479;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.069;QD=57.5982;RBI=0.00418959;REFB=0;REVB=-0.00404938;RO=0;SAF=34;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.92795e-06;OID=.;OPOS=122676013;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:60:61:1:26:34:0:0:26:35:0:0
chr12	122689161	.	C	G	666.9	PASS	AF=0.956522;AO=44;DP=46;FAO=44;FDP=46;FR=.;FRO=2;FSAF=32;FSAR=12;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0062115;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.4417;QD=57.9916;RBI=0.0910581;REFB=0.0262563;REVB=0.090846;RO=2;SAF=32;SAR=12;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0284632;STB=0.515145;STBP=0.407;TYPE=snp;VARB=-0.0113115;OID=.;OPOS=122689161;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:46:46:2:2:44:44:0.956522:12:32:2:0:12:32:2:0
chr12	122689181	.	C	G	671.31	PASS	AF=0.960784;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=51;FR=.;FRO=2;FSAF=34;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0868333;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.6373;QD=52.6517;RBI=0.0976338;REFB=0.115756;REVB=-0.0446355;RO=0;SAF=34;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.01675e-08;STB=0.508883;STBP=0.591;TYPE=snp;VARB=-0.00935435;OID=.;OPOS=122689181;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:50:51:0:2:49:49:0.960784:15:34:0:0:15:34:1:1
chr12	122689244	.	C	T	228.25	PASS	AF=0.402985;AO=26;DP=65;FAO=27;FDP=67;FR=.;FRO=40;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=18;FWDB=0.0162463;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.63;QD=13.6266;RBI=0.0297954;REFB=-0.00311335;REVB=0.0249765;RO=39;SAF=13;SAR=13;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0403354;STB=0.540809;STBP=0.607;TYPE=snp;VARB=0.0089366;OID=.;OPOS=122689244;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:67:39:40:26:27:0.402985:13:13:21:18:14:13:22:18
chr12	122691738	.	C	A	195.5	PASS	AF=1;AO=16;DP=17;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0323839;FXX=0.0587889;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.577;QD=48.8758;RBI=0.0650346;REFB=0;REVB=0.0563985;RO=0;SAF=13;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.78418e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000824601;OID=.;OPOS=122691738;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:16:0:0:16:16:1:3:13:0:0:3:13:0:0
chr12	122692820	.	T	C	88.22	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0261456;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.018;QD=39.2067;RBI=0.0536946;REFB=0;REVB=0.046899;RO=0;SAF=4;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0010863;OID=.;OPOS=122692820;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:5:4:0:0:5:4:0:0
chr12	122756342	.	G	A	652.73	PASS	AF=1;AO=36;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0259937;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.766;QD=62.1644;RBI=0.0434157;REFB=0;REVB=0.0347743;RO=0;SAF=17;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00115495;OID=.;OPOS=122756342;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:36:42:1:19:17:0:0:23:19:0:0
chr12	122812503	.	G	C	48.86	PASS	AF=0.5;AO=6;DP=14;FAO=7;FDP=14;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.0499187;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.187;QD=13.9591;RBI=0.0830274;REFB=-0.0345194;REVB=-0.0663452;RO=6;SAF=2;SAR=4;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168138;STB=0.574264;STBP=0.688;TYPE=snp;VARB=0.0210213;OID=.;OPOS=122812503;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:14:14:6:7:6:7:0.5:4:2:1:5:4:3:2:5
chr12	122989235	.	A	C	515.01	PASS	AF=0.397351;AO=54;DP=144;FAO=60;FDP=151;FR=.;FRO=91;FSAF=30;FSAR=30;FSRF=60;FSRR=31;FWDB=0.014948;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.4535;QD=13.6427;RBI=0.0718079;REFB=-0.0144757;REVB=0.0702349;RO=89;SAF=29;SAR=25;SRF=60;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153873;STB=0.595996;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.0223498;OID=.;OPOS=122989235;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:144:151:89:91:54:60:0.397351:25:29:60:29:30:30:60:31
chr12	123087442	.	A	G	107.8	PASS	AF=0.481481;AO=8;DP=26;FAO=13;FDP=27;FR=.,HEALED;FRO=14;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.013405;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.574;QD=15.9705;RBI=0.0141614;REFB=-0.0148899;REVB=-0.00456642;RO=7;SAF=0;SAR=8;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.624791;STBP=0.262;TYPE=snp;VARB=0.0236996;OID=.;OPOS=123087442;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:27:7:14:8:13:0.481481:8:0:0:7:10:3:6:8
chr12	123186880	.	C	T	67.27	PASS	AF=0.152941;AO=12;DP=84;FAO=13;FDP=85;FR=.;FRO=72;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=56;FWDB=0.070296;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.6902;QD=3.16543;RBI=0.0702961;REFB=0.000929629;REVB=-2.43914e-05;RO=70;SAF=6;SAR=6;SRF=16;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.357349;STB=0.758438;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=-0.00228316;OID=.;OPOS=123186880;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:84:85:70:72:12:13:0.152941:6:6:16:54:6:7:16:56
chr12	123199327	.	A	G	850.68	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00170499;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=126.611;QD=57.6733;RBI=0.00779761;REFB=0;REVB=-0.00760892;RO=0;SAF=38;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.22967e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.12297e-05;OID=.;OPOS=123199327;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:21:38:0:0:21:38:0:0
chr12	123199395	.	G	A	385.64	PASS	AF=0.513158;AO=38;DP=75;FAO=39;FDP=76;FR=.;FRO=37;FSAF=31;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=22;FWDB=0.00336956;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.109;QD=20.2969;RBI=0.0358457;REFB=0.0182871;REVB=0.035687;RO=37;SAF=30;SAR=8;SRF=15;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.382497;STB=0.716366;STBP=0;TYPE=snp;VARB=-0.00787021;OID=.;OPOS=123199395;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:76:37:37:38:39:0.513158:8:30:15:22:8:31:15:22
chr12	123200247	.	G	C	1418.62	PASS	AF=1;AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0147576;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.814;QD=63.0496;RBI=0.0147905;REFB=0;REVB=-0.000985997;RO=0;SAF=56;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.483e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.05045e-05;OID=.;OPOS=123200247;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:90:90:0:0:90:90:1:34:56:0:0:34:56:0:0
chr12	123200334	.	T	C	91.11	PASS	AF=0.272727;AO=12;DP=44;FAO=12;FDP=44;FR=.;FRO=32;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=23;FWDB=-4.98494e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.418;QD=8.28272;RBI=0.0256632;REFB=-0.0181989;REVB=-0.0256632;RO=32;SAF=7;SAR=5;SRF=9;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.348464;STB=0.709835;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=0.0368214;OID=.;OPOS=123200334;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:91:44:44:32:32:12:12:0.272727:5:7:9:23:5:7:9:23
chr12	123200693	.	A	G	279.24	PASS	AF=0.956522;AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0297013;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.0591;QD=48.5637;RBI=0.0756806;REFB=-0.0368147;REVB=-0.0696088;RO=1;SAF=13;SAR=9;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0342405;STB=0.518502;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.0115085;OID=.;OPOS=123200693;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:23:23:1:1:22:22:0.956522:9:13:1:0:9:13:1:0
chr12	123200768	.	T	G	483.35	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0155231;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.096;QD=58.5873;RBI=0.0246783;REFB=0;REVB=0.0191846;RO=0;SAF=16;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.60901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.8218e-06;OID=.;OPOS=123200768;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:17:16:0:0:17:16:0:0
chr12	123200937	.	T	G	429.01	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0119945;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.348;QD=57.2019;RBI=0.0132951;REFB=0;REVB=-0.00573504;RO=0;SAF=12;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000288037;OID=.;OPOS=123200937;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:18:12:0:0:18:12:0:0
chr12	123201291	.	A	G	1313.73	PASS	AF=1;AO=82;DP=82;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0099557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.234;QD=61.8225;RBI=0.0353274;REFB=0;REVB=0.0338956;RO=0;SAF=44;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.11453e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000286309;OID=.;OPOS=123201291;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:85:0:0:82:85:1:38:44:0:0:40:45:0:0
chr12	123253852	.	T	C	41.51	PASS	AF=0.118421;AO=9;DP=76;FAO=9;FDP=76;FR=.;FRO=67;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=57;FSRR=10;FWDB=-0.0163622;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.1372;QD=2.1846;RBI=0.0973289;REFB=-0.00291189;REVB=0.0959437;RO=65;SAF=3;SAR=6;SRF=55;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.599286;STB=0.881879;STBP=0.134;TYPE=snp;VARB=0.043774;OID=.;OPOS=123253852;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:76:76:65:67:9:9:0.118421:6:3:55:10:6:3:57:10
chr12	123253856	.	C	CAT,T	1014.54	PASS	AF=0.759494,0.177215;AO=57,15;DP=79;FAO=60,14;FDP=79;FR=.;FRO=5;FSAF=52,7;FSAR=8,7;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0246945,-0.0289153;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=145.452,56.6022;QD=51.3691;RBI=0.0258062,0.0521117;REFB=-0.0698807,-0.0463079;REVB=0.00749258,-0.0433536;RO=5;SAF=50,7;SAR=7,8;SRF=3;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0901087,-0.0599997;STB=0.541652,0.526278;STBP=0.093,0.743;TYPE=ins,snp;VARB=0.0239039,0.00997051;OID=.,.;OPOS=123253857,123253856;OREF=-,C;OALT=AT,T;OMAPALT=CAT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:82:79:79:5:5:57,15:60,14:0.759494,0.177215:7,8:50,7:3:2:8,7:52,7:3:2
chr12	123333065	.	C	T	834.4	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0259031;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.668;QD=57.5445;RBI=0.0287626;REFB=0;REVB=-0.0125027;RO=0;SAF=29;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.03837e-05;OID=.;OPOS=123333065;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:29:29:0:0:29:29:0:0
chr12	123340453	.	G	GC	267.26	PASS	AF=1;AO=19;DP=29;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.080611;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=18.5059;QD=39.5944;RBI=0.100567;REFB=0;REVB=0.0601301;RO=10;SAF=10;SAR=9;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140035;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00212942;OID=.;OPOS=123340454;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:19:29:27:27:0:11:16:0:0:5:10:10:9:3:7
chr12	123345736	.	C	G	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00588579;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=258.833;QD=42.1826;RBI=0.0181239;REFB=0;REVB=0.0171416;RO=0;SAF=4;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000208522;OID=.;OPOS=123345736;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:7:4:0:0:7:4:0:0
chr12	123645803	.	G	A	438.15	PASS	AF=0.478261;AO=44;DP=92;FAO=44;FDP=92;FR=.;FRO=48;FSAF=16;FSAR=28;FSRF=19;FSRR=29;FWDB=0.0073397;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.753;QD=19.0501;RBI=0.0195563;REFB=-0.00460659;REVB=0.0181267;RO=47;SAF=16;SAR=28;SRF=19;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.040209;STB=0.517962;STBP=0.748;TYPE=snp;VARB=0.00419453;OID=.;OPOS=123645803;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:47:48:44:44:0.478261:28:16:19:28:28:16:19:29
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chr12	123705962	.	C	T	113.11	PASS	AF=0.5;AO=13;DP=26;FAO=13;FDP=26;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.0100619;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.715;QD=17.4016;RBI=0.012956;REFB=-0.00114149;REVB=0.00816185;RO=13;SAF=5;SAR=8;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135944;STB=0.578191;STBP=0.43;TYPE=snp;VARB=0.00158185;OID=.;OPOS=123705962;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:26:13:13:13:13:0.5:8:5:7:6:8:5:7:6
chr12	123746357	.	C	G	538.55	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0466;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.2982;QD=59.8393;RBI=0.0610968;REFB=0;REVB=-0.0395128;RO=0;SAF=20;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.9376e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00156282;OID=.;OPOS=123746357;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:16:20:0:0:16:20:0:0
chr12	123789056	.	T	G	298.78	PASS	AF=0.5;AO=31;DP=64;FAO=32;FDP=64;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=11;FSRR=21;FWDB=-0.00247999;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.755;QD=18.6734;RBI=0.0131815;REFB=-0.00926169;REVB=0.0129461;RO=32;SAF=14;SAR=17;SRF=11;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100226;STB=0.548163;STBP=0.486;TYPE=snp;VARB=0.00696522;OID=.;OPOS=123789056;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:32:32:31:32:0.5:17:14:11:21:18:14:11:21
chr12	123794104	.	G	T	453.69	PASS	AF=0.597222;AO=43;DP=72;FAO=43;FDP=72;FR=.;FRO=29;FSAF=30;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=0.00316399;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.7011;QD=25.2049;RBI=0.0202886;REFB=-0.0120639;REVB=-0.0200404;RO=29;SAF=30;SAR=13;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146804;STB=0.580606;STBP=0.131;TYPE=snp;VARB=0.0121583;OID=.;OPOS=123794104;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:29:29:43:43:0.597222:13:30:15:14:13:30:15:14
chr12	123798209	.	T	C	134.24	PASS	AF=0.454545;AO=15;DP=33;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.0111322;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.5968;QD=16.2716;RBI=0.0283956;REFB=0.0163313;REVB=0.0261224;RO=18;SAF=7;SAR=8;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0840217;STB=0.548323;STBP=0.612;TYPE=snp;VARB=-0.0191849;OID=.;OPOS=123798209;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:18:18:15:15:0.454545:8:7:10:8:8:7:10:8
chr12	123799938	.	C	T	226.03	PASS	AF=0.5;AO=22;DP=44;FAO=22;FDP=44;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=6;FWDB=-0.0117292;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.1545;QD=20.5481;RBI=0.0119189;REFB=0.00873145;REVB=-0.002118;RO=22;SAF=7;SAR=15;SRF=16;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.357831;STB=0.70104;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=-0.00644398;OID=.;OPOS=123799938;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:22:22:22:22:0.5:15:7:16:6:15:7:16:6
chr12	123799974	.	A	G	197.85	PASS	AF=0.466667;AO=20;DP=45;FAO=21;FDP=45;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=5;FWDB=0.00250715;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.9173;QD=17.5863;RBI=0.0106038;REFB=-0.019829;REVB=0.0103031;RO=24;SAF=5;SAR=15;SRF=18;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.46936;STB=0.785015;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0460249;OID=.;OPOS=123799974;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:24:24:20:21:0.466667:15:5:18:6:16:5:19:5
chr12	123875311	.	C	T	50.81	PASS	AF=0.122222;AO=11;DP=91;FAO=11;FDP=90;FR=.;FRO=79;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=27;FSRR=52;FWDB=0.00326173;FXX=0.0109878;HRUN=2;LEN=1;MLLD=317.809;QD=2.25815;RBI=0.00331883;REFB=-0.00313988;REVB=0.000613003;RO=79;SAF=4;SAR=7;SRF=27;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0291322;STB=0.520934;STBP=0.891;TYPE=snp;VARB=0.0370461;OID=.;OPOS=123875311;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:50:91:90:79:79:11:11:0.122222:7:4:27:52:7:4:27:52
chr12	123879666	.	A	G	265.27	PASS	AF=0.441176;AO=30;DP=68;FAO=30;FDP=68;FR=.;FRO=38;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=0.00515219;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=285.285;QD=15.6042;RBI=0.0228913;REFB=0.00115139;REVB=0.022304;RO=38;SAF=19;SAR=11;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10995;STB=0.562203;STBP=0.385;TYPE=snp;VARB=-0.00156199;OID=.;OPOS=123879666;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:38:38:30:30:0.441176:11:19:20:18:11:19:20:18
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chr12	123892186	.	T	C	139.27	PASS	AF=0.311475;AO=18;DP=60;FAO=19;FDP=61;FR=.;FRO=42;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=0.00426642;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.645;QD=9.13264;RBI=0.00949835;REFB=-0.00916168;REVB=-0.00848624;RO=41;SAF=12;SAR=6;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186482;STB=0.632289;STBP=0.187;TYPE=snp;VARB=0.0191827;OID=.;OPOS=123892186;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:61:41:42:18:19:0.311475:6:12:21:20:6:13:21:21
chr12	123892235	.	G	A	108.84	PASS	AF=0.382353;AO=13;DP=35;FAO=13;FDP=34;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=15;FWDB=0.0380177;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.008;QD=12.8052;RBI=0.0389243;REFB=-0.000941012;REVB=0.00835182;RO=21;SAF=7;SAR=6;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.26294;STB=0.653114;STBP=0.184;TYPE=snp;VARB=0.00554689;OID=.;OPOS=123892235;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:34:21:21:13:13:0.382353:6:7:6:15:6:7:6:15
chr12	123892590	.	C	T	229.41	PASS	AF=0.415385;AO=27;DP=65;FAO=27;FDP=65;FR=.;FRO=38;FSAF=6;FSAR=21;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=-0.0348571;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.737;QD=14.1178;RBI=0.0352468;REFB=-0.0207284;REVB=-0.00522693;RO=38;SAF=6;SAR=21;SRF=21;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.371038;STB=0.713038;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.0238291;OID=.;OPOS=123892590;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:38:38:27:27:0.415385:21:6:21:17:21:6:21:17
chr12	123892824	.	C	T	45.55	PASS	AF=0.857143;AO=6;DP=7;FAO=6;FDP=7;FR=.;FRO=1;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=140.617;QD=26.0266;RBI=0.022195;REFB=0.103594;REVB=0.022195;RO=1;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00345424;OID=.;OPOS=123892824;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:7:7:1:1:6:6:0.857143:6:0:0:1:6:0:0:1
chr12	124008073	.	A	G	769.5	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00857078;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=96.3781;QD=56.9997;RBI=0.0174293;REFB=0;REVB=-0.0151764;RO=0;SAF=21;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.70667e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00015174;OID=.;OPOS=124008073;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:33:21:0:0:33:21:0:0
chr12	124069213	.	T	C	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0460327;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.9892;QD=47.8214;RBI=0.0657635;REFB=0;REVB=-0.0469663;RO=0;SAF=10;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00361278;OID=.;OPOS=124069213;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:6:10:0:0:6:10:0:0
chr12	124090453	.	A	G	1080.56	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0135804;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.274;QD=60.0309;RBI=0.034341;REFB=0;REVB=-0.0315417;RO=0;SAF=30;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.1178e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.87986e-05;OID=.;OPOS=124090453;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:42:30:0:0:42:30:0:0
chr12	124097777	.	G	A	176.27	PASS	AF=0.529412;AO=18;DP=34;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.00681653;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2665;QD=20.7377;RBI=0.0260639;REFB=0.0415508;REVB=0.0251568;RO=16;SAF=6;SAR=12;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0384389;STB=0.521715;STBP=0.811;TYPE=snp;VARB=-0.0349633;OID=.;OPOS=124097777;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:16:16:18:18:0.529412:12:6:6:10:12:6:6:10
chr12	124209332	.	T	C	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0184019;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.431;QD=51.9162;RBI=0.0204225;REFB=0;REVB=0.00885699;RO=0;SAF=11;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000119398;OID=.;OPOS=124209332;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:10:11:0:0:10:11:0:0
chr12	124210782	.	T	C	337.23	PASS	AF=1;AO=25;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0387562;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.352;QD=51.8808;RBI=0.0829649;REFB=-0.0580948;REVB=0.0733562;RO=1;SAF=20;SAR=5;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0840195;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00445116;OID=.;OPOS=124210782;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:26:26:1:0:25:26:1:5:20:0:1:6:20:0:0
chr12	124229429	.	T	C	1302.13	PASS	AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00810389;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.793;QD=62.006;RBI=0.0212597;REFB=0;REVB=0.0196546;RO=0;SAF=37;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.99643e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.92867e-05;OID=.;OPOS=124229429;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:47:37:0:0:47:37:0:0
chr12	124243701	.	A	G	174.93	PASS	AF=0.486486;AO=18;DP=37;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=0.0251684;FXX=0.0263089;HRUN=5;LEN=1;MLLD=223.579;QD=18.9108;RBI=0.0287242;REFB=-0.000827573;REVB=-0.0138429;RO=18;SAF=8;SAR=10;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0499439;STB=0.539834;STBP=0.647;TYPE=snp;VARB=0.000964056;OID=.;OPOS=124243701;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:18:19:18:18:0.486486:10:8:7:11:10:8:7:12
chr12	124243707	.	T	C	542.36	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0157144;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.309;QD=60.2625;RBI=0.0206435;REFB=0;REVB=0.0133871;RO=0;SAF=13;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.21415e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.56375e-05;OID=.;OPOS=124243707;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:23:13:0:0:23:13:0:0
chr12	124265687	.	T	C	766.38	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0347987;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.553;QD=63.8652;RBI=0.0357698;REFB=0;REVB=0.00827811;RO=0;SAF=21;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000156235;OID=.;OPOS=124265687;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:27:21:0:0:27:21:0:0
chr12	124267703	.	T	C	919.93	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0014655;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.108;QD=58.4085;RBI=0.0216482;REFB=0;REVB=0.0215985;RO=0;SAF=31;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.94679e-05;OID=.;OPOS=124267703;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:32:31:0:0:32:31:0:0
chr12	124274474	.	A	G	1362.86	PASS	AF=1;AO=86;DP=89;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00836942;FXX=0.0439512;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.91;QD=62.6603;RBI=0.0215253;REFB=0;REVB=0.0198316;RO=0;SAF=35;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00033586;OID=.;OPOS=124274474;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:89:87:0:0:86:87:1:51:35:0:0:51:36:0:0
chr12	124325977	.	T	G	1136.65	PASS	AF=1;AO=75;DP=76;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.017706;FXX=0.0131562;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.847;QD=60.6211;RBI=0.0281501;REFB=0;REVB=-0.0218843;RO=0;SAF=33;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.94191e-05;OID=.;OPOS=124325977;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:75:0:0:75:75:1:42:33:0:0:42:33:0:0
chr12	124408320	.	G	A	146.37	PASS	AF=0.457143;AO=16;DP=35;FAO=16;FDP=35;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.00908711;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.403;QD=16.728;RBI=0.00911463;REFB=-0.0190635;REVB=0.000707734;RO=19;SAF=8;SAR=8;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.024879;STB=0.514268;STBP=0.935;TYPE=snp;VARB=0.0206978;OID=.;OPOS=124408320;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:19:19:16:16:0.457143:8:8:9:10:8:8:9:10
chr12	124798801	.	C	T	244.27	PASS	AF=0.482143;AO=27;DP=56;FAO=27;FDP=56;FR=.;FRO=29;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=-0.0380607;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=129.18;QD=17.4477;RBI=0.0385161;REFB=-0.0245915;REVB=0.00590552;RO=29;SAF=14;SAR=13;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.030689;STB=0.517229;STBP=0.806;TYPE=snp;VARB=0.0293294;OID=.;OPOS=124798801;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:29:29:27:27:0.482143:13:14:16:13:13:14:16:13
chr12	124821696	.	C	T	34.83	PASS	AF=0.833333;AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00170603;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=395.876;QD=23.2183;RBI=0.00170603;REFB=-0.0102739;REVB=0;RO=1;SAF=5;SAR=0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00262313;OID=.;OPOS=124821696;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:6:6:1:1:5:5:0.833333:0:5:1:0:0:5:1:0
chr12	124826598	.	T	C	33.48	PASS	AF=0.714286;AO=5;DP=7;FAO=5;FDP=7;FR=.;FRO=2;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0127739;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.1414;QD=19.1326;RBI=0.0127957;REFB=0.0109362;REVB=-0.000746262;RO=2;SAF=4;SAR=1;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171367;STB=0.59965;STBP=0.693;TYPE=snp;VARB=-0.0031243;OID=.;OPOS=124826598;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:7:7:2:2:5:5:0.714286:1:4:2:0:1:4:2:0
chr12	124829234	.	C	T	560.34	PASS	AF=0.417219;AO=62;DP=151;FAO=63;FDP=151;FR=.;FRO=88;FSAF=31;FSAR=32;FSRF=42;FSRR=46;FWDB=0.00876416;FXX=0.00657851;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.41;QD=14.8434;RBI=0.020463;REFB=-0.00891392;REVB=0.0184912;RO=87;SAF=31;SAR=31;SRF=42;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0179393;STB=0.508622;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=0.0191922;OID=.;OPOS=124829234;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:151:151:87:88:62:63:0.417219:31:31:42:45:32:31:42:46
chr12	124829255	.	A	G	301.89	PASS	AF=0.322581;AO=37;DP=121;FAO=40;FDP=124;FR=.;FRO=84;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=39;FSRR=45;FWDB=-0.0192691;FXX=0.0606015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.497;QD=9.7385;RBI=0.0195453;REFB=-0.011564;REVB=-0.00327438;RO=81;SAF=12;SAR=25;SRF=37;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164935;STB=0.562468;STBP=0.388;TYPE=snp;VARB=0.0306766;OID=.;OPOS=124829255;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:121:124:81:84:37:40:0.322581:25:12:37:44:25:15:39:45
chr12	124857101	.	G	A	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.706;QD=37.4879;RBI=0.0919379;REFB=0;REVB=0.0919379;RO=0;SAF=0;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00221077;OID=.;OPOS=124857101;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:8:0:0:0:8:0:0:0
chr12	124857103	.	C	T	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.755;QD=37.488;RBI=0.111184;REFB=0;REVB=0.111184;RO=0;SAF=0;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00345769;OID=.;OPOS=124857103;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:8:0:0:0:8:0:0:0
chr12	124968349	.	T	C	156.26	PASS	AF=0.425;AO=16;DP=40;FAO=17;FDP=40;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=-0.0557769;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.358;QD=15.6256;RBI=0.058931;REFB=-0.00597278;REVB=-0.0190209;RO=23;SAF=11;SAR=5;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.263702;STB=0.623733;STBP=0.204;TYPE=snp;VARB=0.00920015;OID=.;OPOS=124968349;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:23:23:16:17:0.425:5:11:10:13:6:11:10:13
chr12	124968359	.	C	T	209.53	PASS	AF=0.588235;AO=20;DP=35;FAO=20;FDP=34;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=0.0366438;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.849;QD=24.65;RBI=0.0384118;REFB=-0.00694661;REVB=-0.0115196;RO=14;SAF=6;SAR=14;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.264418;STB=0.647995;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.00516465;OID=.;OPOS=124968359;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:34:14:14:20:20:0.588235:14:6:9:5:14:6:9:5
chr12	125270773	.	A	G	754.43	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0177264;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.055;QD=56.9381;RBI=0.0466041;REFB=0;REVB=0.0431013;RO=0;SAF=25;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000101423;OID=.;OPOS=125270773;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:28:25:0:0:28:25:0:0
chr12	125284748	.	A	G	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.019578;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.444;QD=55.656;RBI=0.0229069;REFB=0;REVB=0.0118925;RO=0;SAF=14;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.72832e-05;OID=.;OPOS=125284748;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:13:14:0:0:13:14:0:0
chr12	125298877	.	G	A	281.13	PASS	AF=0.407407;AO=32;DP=80;FAO=33;FDP=81;FR=.;FRO=48;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=26;FWDB=-0.00552661;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.015;QD=13.8829;RBI=0.0597598;REFB=-0.00206632;REVB=0.0595037;RO=44;SAF=16;SAR=16;SRF=22;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.515733;STBP=0.826;TYPE=snp;VARB=0.00329268;OID=.;OPOS=125298877;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:81:44:48:32:33:0.407407:16:16:22:22:17:16:22:26
chr12	125324570	.	C	T	61.07	PASS	AF=0.727273;AO=8;DP=11;FAO=8;FDP=11;FR=.;FRO=3;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0459056;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.059;QD=22.2069;RBI=0.0601138;REFB=-0.0193058;REVB=0.0388117;RO=3;SAF=2;SAR=6;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.370397;STB=0.713728;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.0391516;OID=.;OPOS=125324570;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:11:11:3:3:8:8:0.727273:6:2:3:0:6:2:3:0
chr12	125386076	.	T	C	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0163884;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.478;QD=50.4134;RBI=0.0182077;REFB=0;REVB=-0.00793349;RO=0;SAF=10;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.67127e-05;OID=.;OPOS=125386076;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:9:10:0:0:9:10:0:0
chr12	125386091	.	A	G	45.8	PASS	AF=0.35;AO=7;DP=20;FAO=7;FDP=20;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.00407301;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.3349;QD=9.16065;RBI=0.0285202;REFB=0.0312072;REVB=0.0282279;RO=13;SAF=5;SAR=2;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.275446;STB=0.671134;STBP=0.262;TYPE=snp;VARB=-0.0552565;OID=.;OPOS=125386091;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:20:20:13:13:7:7:0.35:2:5:6:7:2:5:6:7
chr12	125386114	.	T	A	45.06	PASS	AF=0.304348;AO=7;DP=23;FAO=7;FDP=23;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=-0.0622645;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.318;QD=7.83706;RBI=0.0644474;REFB=-0.00331862;REVB=-0.0166314;RO=16;SAF=5;SAR=2;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.426633;STB=0.764002;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=0.0126378;OID=.;OPOS=125386114;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:23:23:16:16:7:7:0.304348:2:5:5:11:2:5:5:11
chr12	125397750	.	A	G	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0396361;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.6279;QD=48.7359;RBI=0.0410205;REFB=0;REVB=0.010567;RO=0;SAF=11;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00116873;OID=.;OPOS=125397750;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:6:11:0:0:6:11:0:0
chr12	125398500	.	G	A	71.66	PASS	AF=0.6;AO=9;DP=15;FAO=9;FDP=15;FR=.;FRO=6;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=-0.0336809;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.07;QD=19.1084;RBI=0.0339835;REFB=0.00266524;REVB=0.00452504;RO=6;SAF=8;SAR=1;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.58021;STB=0.84124;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=-0.00322745;OID=.;OPOS=125398500;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:15:15:6:6:9:9:0.6:1:8:1:5:1:8:1:5
chr12	125398517	.	G	A	40.96	PASS	AF=0.461538;AO=6;DP=14;FAO=6;FDP=13;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.0255392;FXX=0.0713776;HRUN=1;LEN=1;MLLD=326.051;QD=12.6024;RBI=0.0257192;REFB=0.0157971;REVB=-0.00303739;RO=8;SAF=2;SAR=4;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.271446;STB=0.631131;STBP=0.474;TYPE=snp;VARB=-0.012953;OID=.;OPOS=125398517;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:40:14:13:8:7:6:6:0.461538:4:2:5:3:4:2:4:3
chr12	125398733	.	C	T	35.38	PASS	AF=0.230769;AO=6;DP=26;FAO=6;FDP=26;FR=.;FRO=20;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=15;FWDB=-0.0267811;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=88.2446;QD=5.44249;RBI=0.0282396;REFB=-0.000426016;REVB=-0.00895789;RO=20;SAF=3;SAR=3;SRF=5;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.30106;STB=0.691761;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=-0.00153218;OID=.;OPOS=125398733;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:26:26:20:20:6:6:0.230769:3:3:5:15:3:3:5:15
chr12	125399068	.	C	T	221.42	PASS	AF=0.6;AO=21;DP=35;FAO=21;FDP=35;FR=.;FRO=14;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.0873768;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.8072;QD=25.3054;RBI=0.115167;REFB=0.0154569;REVB=0.0750247;RO=14;SAF=15;SAR=6;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172206;STB=0.596234;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=-0.0051736;OID=.;OPOS=125399068;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:14:14:21:21:0.6:6:15:7:7:6:15:7:7
chr12	125399150	.	G	A	523.28	PASS	AF=0.556818;AO=48;DP=88;FAO=49;FDP=88;FR=.;FRO=39;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=-0.0287214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.0344;QD=23.7855;RBI=0.0292442;REFB=-0.0216353;REVB=-0.0055052;RO=38;SAF=25;SAR=23;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0590625;STB=0.521549;STBP=0.686;TYPE=snp;VARB=0.0099867;OID=.;OPOS=125399150;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:38:39:48:49:0.556818:23:25:17:21:24:25:18:21
chr12	125399286	.	C	T	487.09	PASS	AF=0.545455;AO=43;DP=83;FAO=48;FDP=88;FR=.;FRO=40;FSAF=16;FSAR=32;FSRF=25;FSRR=15;FWDB=-0.00541794;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.3747;QD=22.1404;RBI=0.0283121;REFB=-0.0285557;REVB=0.0277888;RO=39;SAF=16;SAR=27;SRF=24;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.210542;STB=0.635601;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0256877;OID=.;OPOS=125399286;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:88:39:40:43:48:0.545455:27:16:24:15:32:16:25:15
chr12	125434580	.	C	T	747.1	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0334192;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=246.625;QD=63.5829;RBI=0.0518034;REFB=0;REVB=0.0395821;RO=0;SAF=32;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000136354;OID=.;OPOS=125434580;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:47:0:0:46:47:1:14:32:0:0:14:33:0:0
chr12	125434716	.	G	A	742.73	PASS	AF=0.964286;AO=54;DP=56;FAO=54;FDP=56;FR=.;FRO=2;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00953651;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=312.452;QD=53.0518;RBI=0.0244181;REFB=-0.00836007;REVB=0.0224788;RO=1;SAF=25;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0184775;STB=0.501329;STBP=0.877;TYPE=snp;VARB=9.12976e-05;OID=.;OPOS=125434716;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:56:56:1:2:54:54:0.964286:29:25:1:0:29:25:1:1
chr12	125437019	.	T	C	792.28	PASS	AF=1;AO=48;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0019794;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.6233;QD=63.3821;RBI=0.00714133;REFB=0;REVB=-0.00686153;RO=0;SAF=28;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.56477e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000602759;OID=.;OPOS=125437019;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:48:50:1:20:28:0:0:21:29:0:0
chr12	125438516	.	T	C	882.69	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00134261;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.473;QD=57.8816;RBI=0.00754507;REFB=0;REVB=0.00742466;RO=0;SAF=28;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.50684e-05;OID=.;OPOS=125438516;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:61:0:0:60:61:1:32:28:0:0:32:29:0:0
chr12	125438523	.	C	T	898.06	PASS	AF=0.984375;AO=61;DP=62;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0287678;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.301;QD=56.1286;RBI=0.0736063;REFB=-0.123966;REVB=0.0677518;RO=0;SAF=29;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50746;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=0.00130188;OID=.;OPOS=125438523;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:62:64:0:1:61:63:0.984375:32:29:0:0:33:30:0:1
chr12	125448960	.	C	G,T	717.8	PASS	AF=0.0392157,0.960784;AO=2,49;DP=51;FAO=2,49;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=2,29;FSAR=0,20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000479735,0.000247751;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=24.6268,266.756;QD=56.2984;RBI=0.0457242,0.0318688;REFB=0,0;REVB=0.0457217,0.0318678;RO=0;SAF=2,29;SAR=0,20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.190693,-0.000163863;OID=.,.;OPOS=125448960,125448960;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:51:51:0:0:2,49:2,49:0.0392157,0.960784:0,20:2,29:0:0:0,20:2,29:0:0
chr12	125467158	.	C	T	335.85	PASS	AF=0.566667;AO=34;DP=60;FAO=34;FDP=60;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=-0.01193;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.693;QD=22.3902;RBI=0.0230866;REFB=-0.0260787;REVB=-0.0197653;RO=26;SAF=13;SAR=21;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0303503;STB=0.516727;STBP=0.77;TYPE=snp;VARB=0.0161513;OID=.;OPOS=125467158;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:26:26:34:34:0.566667:21:13:9:17:21:13:9:17
chr12	125562809	.	G	A	636.0	PASS	AF=0.958333;AO=46;DP=48;FAO=46;FDP=48;FR=.;FRO=2;FSAF=31;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0267678;FXX=0.058812;HRUN=4;LEN=1;MLLD=142.79;QD=53.0003;RBI=0.0292506;REFB=-0.104963;REVB=-0.0117934;RO=2;SAF=31;SAR=15;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0586347;STB=0.531236;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.00102324;OID=.;OPOS=125562809;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:48:48:2:2:46:46:0.958333:15:31:0:2:15:31:0:2
chr12	125587278	.	G	A	167.77	PASS	AF=0.4;AO=18;DP=46;FAO=18;FDP=45;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=0.0470822;FXX=0.0217344;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.4146;QD=14.9124;RBI=0.0523906;REFB=-0.0181163;REVB=0.0229793;RO=28;SAF=6;SAR=12;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145256;STB=0.571347;STBP=0.446;TYPE=snp;VARB=0.0357413;OID=.;OPOS=125587278;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:45:28:27:18:18:0.4:12:6:13:15:12:6:12:15
chr12	125626685	.	C	T	422.19	PASS	AF=0.531646;AO=41;DP=78;FAO=42;FDP=79;FR=.;FRO=37;FSAF=29;FSAR=13;FSRF=26;FSRR=11;FWDB=0.0136855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.6452;QD=21.3765;RBI=0.0140561;REFB=-0.037266;REVB=0.00320623;RO=37;SAF=28;SAR=13;SRF=26;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0197543;STB=0.50673;STBP=0.927;TYPE=snp;VARB=0.035558;OID=.;OPOS=125626685;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:79:37:37:41:42:0.531646:13:28:26:11:13:29:26:11
chr12	125834395	.	T	C	523.56	PASS	AF=1;AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.042287;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.9327;QD=59.8352;RBI=0.0590509;REFB=0;REVB=0.0412168;RO=0;SAF=12;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.82567e-05;OID=.;OPOS=125834395;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:35:0:0:35:35:1:23:12:0:0:23:12:0:0
chr12	125900095	.	T	A	134.92	PASS	AF=0.321429;AO=18;DP=56;FAO=18;FDP=56;FR=.;FRO=38;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=-0.0174243;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.722;QD=9.63727;RBI=0.0186816;REFB=-0.0235938;REVB=0.00673767;RO=38;SAF=11;SAR=7;SRF=16;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.216102;STB=0.627812;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=0.0447207;OID=.;OPOS=125900095;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:38:38:18:18:0.321429:7:11:16:22:7:11:16:22
chr12	126068417	.	T	C	1659.61	PASS	AF=1;AO=110;DP=110;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0366599;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.458;QD=60.3495;RBI=0.0367065;REFB=0;REVB=-0.00184964;RO=0;SAF=57;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.58533e-05;OID=.;OPOS=126068417;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:110:110:0:0:110:110:1:53:57:0:0:53:57:0:0
chr12	126137060	.	C	T	208.64	PASS	AF=0.456522;AO=21;DP=46;FAO=21;FDP=46;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.0320312;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.3055;QD=18.1425;RBI=0.0415452;REFB=-0.00621181;REVB=0.0264575;RO=24;SAF=11;SAR=10;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0223937;STB=0.502073;STBP=0.963;TYPE=snp;VARB=0.0127187;OID=.;OPOS=126137060;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:24:25:21:21:0.456522:10:11:12:12:10:11:13:12
chr12	126141880	.	CCCG	C,CC,CCTG	200.57	PASS	AF=0.304348,0,0.521739;AO=7,6,5;DP=23;FAO=7,0,12;FDP=23;FR=.;FRO=4;FSAF=0,0,10;FSAR=7,0,2;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.0866267,-0.136656,-0.107627;FXX=0.0416493;HRUN=3,3,3;LEN=3,2,1;MLLD=59.1648,58.5242,31.8149;QD=34.8814;RBI=0.0924429,0.138005,0.120915;REFB=-0.0670658,-0.108503,-0.102204;REVB=0.0322723,0.0192473,0.055106;RO=3;SAF=0,6,4;SAR=7,0,1;SRF=3;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0.560811,0.560811,0;SSSB=-0.812474,0,-0.23409;STB=0.998177,0.5,0.583211;STBP=0,1,0.633;TYPE=del,del,snp;VARB=-0.0123251,0.0290729,0.0664451;OID=.,.,.;OPOS=126141881,126141882,126141882;OREF=CCG,CG,C;OALT=-,-,T;OMAPALT=C,CC,CCTG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/3:0.304348,0,0.521739:7,6,5:23:7,0,12:23:4:0,0,10:7,0,2:4:0:55:3:0,6,4:7,0,1:3:0
chr12	127067932	.	A	G	42.42	PASS	AF=0.666667;AO=3;DP=9;FAO=6;FDP=9;FR=.,HEALED;FRO=3;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.268915;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.0705;QD=18.8534;RBI=0.275439;REFB=-0.0128915;REVB=-0.0595919;RO=3;SAF=1;SAR=2;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.352427;STB=0.713603;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.0372621;OID=.;OPOS=127067932;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:9:9:3:3:3:6:0.666667:2:1:0:3:2:4:0:3
chr12	127068865	.	A	G	296.51	PASS	AF=0.958333;AO=23;DP=24;FAO=23;FDP=24;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00702816;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.555;QD=49.4184;RBI=0.0163698;REFB=-0.152936;REVB=0.0147843;RO=1;SAF=11;SAR=12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0402265;STB=0.52172;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.00239468;OID=.;OPOS=127068865;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:24:24:1:1:23:23:0.958333:12:11:1:0:12:11:1:0
chr12	127068892	.	C	T	780.13	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0297364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.8426;QD=63.6839;RBI=0.0712343;REFB=0;REVB=-0.0647308;RO=0;SAF=13;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.61818e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000282053;OID=.;OPOS=127068892;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:49:0:0:48:49:1:35:13:0:0:35:14:0:0
chr12	127650467	.	G	C	9568.41	PASS	AF=0.965839;AO=611;DP=633;FAO=622;FDP=644;FR=.;FRO=22;FSAF=265;FSAR=357;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.0123015;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.2833;QD=59.4311;RBI=0.01233;REFB=-0.0207099;REVB=0.000836751;RO=17;SAF=263;SAR=348;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00211415;STB=0.505748;STBP=0.131;TYPE=snp;VARB=0.000744793;OID=.;OPOS=127650467;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:633:644:17:22:611:622:0.965839:348:263:8:9:357:265:13:9
chr12	127650471	.	AT	GG	10546.1	PASS	AF=1;AO=636;DP=661;FAO=689;FDP=689;FR=.;FRO=0;FSAF=335;FSAR=354;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.030414;FXX=0.0336601;HRUN=1;LEN=2;MLLD=287.438;QD=61.2254;RBI=0.0308716;REFB=-0.00371955;REVB=0.00529522;RO=13;SAF=290;SAR=346;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00275072;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.0036606;OID=.;OPOS=127650471;OREF=AT;OALT=GG;OMAPALT=GG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:661:689:13:0:636:689:1:346:290:5:8:354:335:0:0
chr12	127650538	.	A	G	22790.0	PASS	AF=0.980027;AO=1467;DP=1500;FAO=1472;FDP=1502;FR=.;FRO=30;FSAF=618;FSAR=854;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=-0.00404383;FXX=0.000665332;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.7225;QD=60.6924;RBI=0.0587125;REFB=-0.00498566;REVB=-0.0585731;RO=28;SAF=617;SAR=850;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00160363;STB=0.50096;STBP=0.6;TYPE=snp;VARB=0.000590383;OID=.;OPOS=127650538;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:1500:1502:28:30:1467:1472:0.980027:850:617:13:15:854:618:14:16
chr12	127650583	.	T	G	19223.2	PASS	AF=0.988664;AO=1215;DP=1235;FAO=1221;FDP=1235;FR=.;FRO=14;FSAF=502;FSAR=719;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.0623375;FXX=0.00322838;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.1904;QD=62.2615;RBI=0.0624695;REFB=-0.0193007;REVB=0.00405849;RO=15;SAF=501;SAR=714;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00190023;STB=0.500632;STBP=0.699;TYPE=snp;VARB=0.000183653;OID=.;OPOS=127650583;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:32:1235:1235:15:14:1215:1221:0.988664:714:501:5:10:719:502:5:9
chr12	127650599	.	A	G	13396.2	PASS	AF=0.981797;AO=789;DP=802;FAO=863;FDP=879;FR=.;FRO=16;FSAF=370;FSAR=493;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=0.0374149;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.43;QD=60.9613;RBI=0.0374206;REFB=-0.016308;REVB=0.00065238;RO=13;SAF=305;SAR=484;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.35924e-05;STB=0.500999;STBP=0.671;TYPE=snp;VARB=0.000161912;OID=.;OPOS=127650599;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:802:879:13:16:789:863:0.981797:484:305:5:8:493:370:6:10
chr12	127650616	.	G	A	1786.27	PASS	AF=0.306892;AO=235;DP=765;FAO=236;FDP=769;FR=.;FRO=533;FSAF=106;FSAR=130;FSRF=197;FSRR=336;FWDB=-0.0259293;FXX=0.00129868;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.388;QD=9.2914;RBI=0.0307639;REFB=0.00327137;REVB=0.0165556;RO=530;SAF=106;SAR=129;SRF=194;SRR=336;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10488;STB=0.556344;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=-0.00616355;OID=.;OPOS=127650616;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:765:769:530:533:235:236:0.306892:129:106:194:336:130:106:197:336
chr12	127650639	.	A	G	6222.11	PASS	AF=0.98022;AO=305;DP=428;FAO=446;FDP=455;FR=.;FRO=9;FSAF=145;FSAR=301;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.0483752;FXX=0.00219293;HRUN=3;LEN=1;MLLD=179.854;QD=54.6999;RBI=0.0515364;REFB=-0.056683;REVB=0.0177721;RO=3;SAF=137;SAR=168;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00408068;STB=0.507656;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.00324988;OID=.;OPOS=127650639;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:428:455:3:9:305:446:0.98022:168:137:2:1:301:145:6:3
chr12	127650662	.	T	C	1084.8	PASS	AF=0.986667;AO=70;DP=73;FAO=74;FDP=75;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=56;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00749545;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.386;QD=57.856;RBI=0.00818813;REFB=0.0298643;REVB=-0.00329602;RO=1;SAF=18;SAR=52;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0255372;STB=0.51351;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=0.000216495;OID=.;OPOS=127650662;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:73:75:1:1:70:74:0.986667:52:18:1:0:56:18:1:0
chr12	127650669	.	A	G	262.98	PASS	AF=0.954545;AO=21;DP=22;FAO=21;FDP=22;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0283729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.355;QD=47.8145;RBI=0.0291353;REFB=0.0166615;REVB=0.00662159;RO=1;SAF=4;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102024;STB=0.555499;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=-3.83976e-06;OID=.;OPOS=127650669;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:22:22:1:1:21:21:0.954545:17:4:1:0:17:4:1:0
chr12	127650883	.	G	T	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00259368;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.468;QD=48.7373;RBI=0.0231294;REFB=0;REVB=0.0229835;RO=0;SAF=16;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000218879;OID=.;OPOS=127650883;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:1:16:0:0:1:16:0:0
chr12	127650890	.	G	C	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00928601;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=243.694;QD=51.1846;RBI=0.0099198;REFB=0;REVB=0.00348888;RO=0;SAF=19;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.97126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.69302e-05;OID=.;OPOS=127650890;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:1:19:0:0:1:19:0:0
chr12	128778703	.	G	A	766.36	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0225424;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.275;QD=63.8635;RBI=0.0573932;REFB=0;REVB=0.0527809;RO=0;SAF=34;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000342636;OID=.;OPOS=128778703;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:14:34:0:0:14:34:0:0
chr12	128900005	.	G	A	613.36	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0204416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.479;QD=61.3356;RBI=0.0223242;REFB=0;REVB=0.00897293;RO=0;SAF=20;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.25534e-05;OID=.;OPOS=128900005;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:20:20:0:0:20:20:0:0
chr12	129181810	.	A	G	2852.38	PASS	AF=1;AO=182;DP=183;FAO=182;FDP=182;FR=.;FRO=0;FSAF=99;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0171346;FXX=0.010869;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.705;QD=62.6897;RBI=0.0190299;REFB=-0.0390929;REVB=-0.00827903;RO=1;SAF=99;SAR=83;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00478504;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.98764e-05;OID=.;OPOS=129181810;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:183:182:1:0:182:182:1:83:99:1:0:83:99:0:0
chr12	129181834	.	A	G	3072.54	PASS	AF=1;AO=192;DP=193;FAO=193;FDP=193;FR=.;FRO=0;FSAF=103;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0136489;FXX=0.00515437;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.1102;QD=63.6795;RBI=0.0136684;REFB=0;REVB=0.000730147;RO=0;SAF=102;SAR=90;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.57103e-05;OID=.;OPOS=129181834;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:16:193:193:0:0:192:193:1:90:102:0:0:90:103:0:0
chr12	129189941	.	G	A	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00640422;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=274.591;QD=43.4862;RBI=0.00701586;REFB=0;REVB=0.002865;RO=0;SAF=5;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.04496e-05;OID=.;OPOS=129189941;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:7:5:0:0:7:5:0:0
chr12	129190021	.	A	G	239.43	PASS	AF=1;AO=18;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0416599;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.8366;QD=50.4072;RBI=0.0523936;REFB=0;REVB=0.0317734;RO=1;SAF=12;SAR=6;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0704612;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000343166;OID=.;OPOS=129190021;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:1:0:18:19:1:6:12:0:1:7:12:0:0
chr12	129190474	.	G	A	2093.47	PASS	AF=0.985507;AO=134;DP=139;FAO=136;FDP=138;FR=.;FRO=2;FSAF=78;FSAR=58;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0236813;FXX=0.0142847;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.438;QD=60.6802;RBI=0.0243971;REFB=-0.0993676;REVB=0.00586633;RO=2;SAF=78;SAR=56;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0120313;STB=0.506328;STBP=0.262;TYPE=snp;VARB=0.000261523;OID=.;OPOS=129190474;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:139:138:2:2:134:136:0.985507:56:78:2:0:58:78:2:0
chr12	129278864	.	A	G	174.67	PASS	AF=0.888889;AO=15;DP=17;FAO=16;FDP=18;FR=.;FRO=2;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0468387;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=55.9449;QD=38.8162;RBI=0.0471801;REFB=-0.00230619;REVB=-0.00566545;RO=2;SAF=2;SAR=13;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147635;STB=0.553121;STBP=0.378;TYPE=snp;VARB=0.000948979;OID=.;OPOS=129278864;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:17:18:2:2:15:16:0.888889:13:2:1:1:13:3:1:1
chr12	129293346	.	C	T	64.07	PASS	AF=0.333333;AO=9;DP=27;FAO=9;FDP=27;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=0.00695817;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.436;QD=9.49151;RBI=0.00766789;REFB=-0.00536627;REVB=0.00322185;RO=18;SAF=3;SAR=6;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.30003;STB=0.682526;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=0.0051224;OID=.;OPOS=129293346;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:27:27:18:18:9:9:0.333333:6:3:11:7:6:3:11:7
chr12	129298735	.	C	G	439.46	PASS	AF=0.413223;AO=50;DP=121;FAO=50;FDP=121;FR=.;FRO=71;FSAF=38;FSAR=12;FSRF=52;FSRR=19;FWDB=0.0723199;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.5306;QD=14.5275;RBI=0.0802914;REFB=-0.0429437;REVB=0.0348789;RO=70;SAF=38;SAR=12;SRF=51;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0434053;STB=0.521692;STBP=0.757;TYPE=snp;VARB=0.0659026;OID=.;OPOS=129298735;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:121:121:70:71:50:50:0.413223:12:38:51:19:12:38:52:19
chr12	129298779	.	C	T	149.53	PASS	AF=0.204918;AO=26;DP=122;FAO=25;FDP=122;FR=.;FRO=97;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=53;FSRR=44;FWDB=-0.0520848;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.1531;QD=4.90273;RBI=0.052537;REFB=-0.02052;REVB=-0.0068785;RO=92;SAF=18;SAR=8;SRF=50;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197778;STB=0.612096;STBP=0.236;TYPE=snp;VARB=0.0662955;OID=.;OPOS=129298779;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:122:122:92:97:26:25:0.204918:8:18:50:42:8:17:53:44
chr12	129298797	.	G	A	37.87	PASS	AF=0.0973451;AO=13;DP=113;FAO=11;FDP=113;FR=.;FRO=102;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=61;FSRR=41;FWDB=-0.0437559;FXX=0.00877116;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.9426;QD=1.34065;RBI=0.0441178;REFB=-0.0163739;REVB=0.00563885;RO=99;SAF=7;SAR=6;SRF=59;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0712847;STB=0.627353;STBP=0.402;TYPE=snp;VARB=0.0590007;OID=.;OPOS=129298797;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:113:113:99:102:13:11:0.0973451:6:7:59:40:6:5:61:41
chr12	129298799	.	T	C	41.94	PASS	AF=0.0956522;AO=12;DP=116;FAO=11;FDP=115;FR=.;FRO=104;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=60;FSRR=44;FWDB=-0.0148301;FXX=0.00861995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.5028;QD=1.45893;RBI=0.0521972;REFB=-0.015702;REVB=-0.0500461;RO=103;SAF=6;SAR=6;SRF=60;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0990522;STB=0.609182;STBP=0.452;TYPE=snp;VARB=0.0480507;OID=.;OPOS=129298799;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:116:115:103:104:12:11:0.0956522:6:6:60:43:6:5:60:44
chr12	129298819	.	C	T	280.44	PASS	AF=0.354839;AO=32;DP=92;FAO=33;FDP=93;FR=.;FRO=60;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=25;FSRR=35;FWDB=-0.0263518;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.1636;QD=12.0621;RBI=0.029923;REFB=-0.0411125;REVB=-0.0141762;RO=58;SAF=14;SAR=18;SRF=23;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.046868;STB=0.505007;STBP=0.935;TYPE=snp;VARB=0.0676775;OID=.;OPOS=129298819;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:93:58:60:32:33:0.354839:18:14:23:35:19:14:25:35
chr12	129348666	.	C	T	603.54	PASS	AF=1;AO=39;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00527207;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.685;QD=60.3542;RBI=0.0377352;REFB=0;REVB=0.0373651;RO=0;SAF=24;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000171065;OID=.;OPOS=129348666;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:39:40:1:15:24:0:0:16:24:0:0
chr12	129360498	.	G	A	740.62	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0498181;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.792;QD=56.9705;RBI=0.117381;REFB=0;REVB=0.106285;RO=0;SAF=36;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.746e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00190062;OID=.;OPOS=129360498;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:52:0:0:51:52:1:15:36:0:0:16:36:0:0
chr12	129559421	.	C	T	2259.99	PASS	AF=0.986301;AO=144;DP=146;FAO=144;FDP=146;FR=.;FRO=2;FSAF=78;FSAR=66;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.017541;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=231.471;QD=61.9174;RBI=0.0239022;REFB=-0.167398;REVB=0.0162366;RO=2;SAF=78;SAR=66;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0010929;STB=0.500575;STBP=0.858;TYPE=snp;VARB=0.000269777;OID=.;OPOS=129559421;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:146:146:2:2:144:144:0.986301:66:78:1:1:66:78:1:1
chr12	130649316	.	CTTTTTTTTTTTTTA	CTTCTTTTTTTTTTA,CTTTTTTTTTTA,CTTTTTTTTTTTTAT	415.23	PASS	AF=0.122449,0.877551,0;AO=9,7,2;DP=54;FAO=6,43,0;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=1,23,0;FSAR=5,20,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0535365,0.547345,0.527548;FXX=0.124978;HRUN=13,13,13;LEN=1,3,2;MLLD=143.795,19.6383,13.1809;QD=33.8964;RBI=0.0733092,0.548823,0.528825;REFB=-0.0371975,-0.026842,-0.0817101;REVB=-0.0500808,-0.0402589,-0.0367258;RO=6;SAF=1,1,2;SAR=8,6,0;SRF=6;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.643471,-0.637124,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=snp,del,mnp;VARB=-0.00443854,0.015994,0.186582;OID=.,.,.;OPOS=130649319,130649317,130649329;OREF=T,TTT,TA;OALT=C,-,AT;OMAPALT=CTTCTTTTTTTTTTA,CTTTTTTTTTTA,CTTTTTTTTTTTTAT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.122449,0.877551,0:9,7,2:54:6,43,0:49:0:1,23,0:5,20,0:0:0:33:6:1,1,2:8,6,0:6:0
chr12	130649543	.	C	G	1286.14	PASS	AF=0.977011;AO=84;DP=88;FAO=85;FDP=87;FR=.;FRO=2;FSAF=33;FSAR=52;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0068965;FXX=0.0113623;HRUN=3;LEN=1;MLLD=113.197;QD=59.1327;RBI=0.0137466;REFB=0.00383836;REVB=0.0118914;RO=2;SAF=33;SAR=51;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00493958;STB=0.502701;STBP=0.749;TYPE=snp;VARB=0.000758496;OID=.;OPOS=130649543;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:88:87:2:2:84:85:0.977011:51:33:1:1:52:33:1:1
chr12	130649687	.	T	C	146.64	PASS	AF=0.339286;AO=19;DP=56;FAO=19;FDP=56;FR=.;FRO=37;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=23;FSRR=14;FWDB=-0.0116083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.743;QD=10.474;RBI=0.0527995;REFB=-0.00423948;REVB=-0.0515076;RO=34;SAF=14;SAR=5;SRF=22;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117865;STB=0.5897;STBP=0.388;TYPE=snp;VARB=0.00567397;OID=.;OPOS=130649687;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:34:37:19:19:0.339286:5:14:22:12:5:14:23:14
chr12	130649770	.	C	T	236.26	PASS	AF=0.481481;AO=26;DP=54;FAO=26;FDP=54;FR=.;FRO=28;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=8;FWDB=0.0184723;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.172;QD=17.501;RBI=0.0249213;REFB=-0.0101441;REVB=0.0167286;RO=28;SAF=16;SAR=10;SRF=20;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0991601;STB=0.555514;STBP=0.464;TYPE=snp;VARB=0.0156783;OID=.;OPOS=130649770;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:28:28:26:26:0.481481:10:16:20:8:10:16:20:8
chr12	130649962	.	C	T	570.06	PASS	AF=0.621951;AO=51;DP=83;FAO=51;FDP=82;FR=.;FRO=31;FSAF=23;FSAR=28;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=-0.0291142;FXX=0.0120467;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.0436;QD=27.8077;RBI=0.0318062;REFB=-0.0180884;REVB=0.012806;RO=32;SAF=23;SAR=28;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0096411;STB=0.500241;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00933819;OID=.;OPOS=130649962;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:82:32:31:51:51:0.621951:28:23:14:18:28:23:14:17
chr12	130650016	.	G	C	923.57	PASS	AF=1;AO=59;DP=61;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0565198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.165;QD=56.8349;RBI=0.0655199;REFB=0;REVB=0.0331417;RO=0;SAF=24;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00543099;OID=.;OPOS=130650016;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:65:0:0:59:65:1:35:24:0:0:40:25:0:0
chr12	130650180	.	A	G	207.84	PASS	AF=0.446809;AO=21;DP=47;FAO=21;FDP=47;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=0.0100885;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.454;QD=17.6888;RBI=0.037805;REFB=-0.00816563;REVB=0.0364341;RO=25;SAF=8;SAR=13;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135467;STB=0.567502;STBP=0.44;TYPE=snp;VARB=0.0117872;OID=.;OPOS=130650180;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:25:26:21:21:0.446809:13:8:13:12:13:8:13:13
chr12	130841638	.	G	A	197.24	PASS	AF=0.575758;AO=18;DP=34;FAO=19;FDP=33;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=0.0119127;FXX=0.0571265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=305.901;QD=23.908;RBI=0.0234636;REFB=-0.00683767;REVB=0.0202145;RO=15;SAF=7;SAR=11;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.273237;STB=0.617239;STBP=0.127;TYPE=snp;VARB=0.00598595;OID=.;OPOS=130841638;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:33:15:14:18:19:0.575758:11:7:11:4:12:7:9:5
chr12	130847389	.	A	G	1028.61	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00380676;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.298;QD=59.6298;RBI=0.00898852;REFB=0;REVB=-0.00814261;RO=0;SAF=30;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000105007;OID=.;OPOS=130847389;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:68:69:0:0:68:69:1:38:30:0:0:38:31:0:0
chr12	130912757	.	C	T	157.83	PASS	AF=0.365385;AO=19;DP=52;FAO=19;FDP=52;FR=.;FRO=33;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=0.0105426;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.6126;QD=12.1409;RBI=0.0638116;REFB=-0.000715624;REVB=-0.0629346;RO=33;SAF=14;SAR=5;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.293532;STB=0.672298;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=0.00140028;OID=.;OPOS=130912757;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:33:33:19:19:0.365385:5:14:16:17:5:14:16:17
chr12	130941150	.	G	C	487.06	PASS	AF=1;AO=33;DP=34;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.012808;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.593;QD=59.0378;RBI=0.0128325;REFB=0;REVB=0.000792344;RO=0;SAF=12;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.09499e-05;OID=.;OPOS=130941150;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:33:0:0:33:33:1:21:12:0:0:21:12:0:0
chr12	131275484	.	G	A	1098.72	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0153249;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.343;QD=60.2037;RBI=0.0164428;REFB=0;REVB=-0.00595915;RO=0;SAF=41;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.83756e-05;OID=.;OPOS=131275484;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:32:41:0:0:32:41:0:0
chr12	131276448	.	G	T	1509.79	PASS	AF=1;AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0118412;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.286;QD=63.57;RBI=0.0162961;REFB=0;REVB=0.011196;RO=0;SAF=40;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.44713e-05;OID=.;OPOS=131276448;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:95:0:0:95:95:1:55:40:0:0:55:40:0:0
chr12	131296908	.	C	G	88.22	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00785318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=311.168;QD=39.2068;RBI=0.00785318;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=9;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.29863e-05;OID=.;OPOS=131296908;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:0:9:0:0:0:9:0:0
chr12	131299974	.	A	G	959.84	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0477736;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.0601;QD=58.1722;RBI=0.0484111;REFB=0;REVB=-0.0078307;RO=0;SAF=32;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000998569;OID=.;OPOS=131299974;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:66:0:0:64:66:1:32:32:0:0:32:34:0:0
chr12	131306314	.	C	G	1434.36	PASS	AF=1;AO=91;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0509466;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.7187;QD=63.0486;RBI=0.0673887;REFB=0;REVB=0.0441099;RO=0;SAF=45;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000729372;OID=.;OPOS=131306314;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:91:91:0:0:91:91:1:46:45:0:0:46:45:0:0
chr12	131466562	.	T	C	1116.94	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00539897;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.77;QD=60.3751;RBI=0.00540856;REFB=0;REVB=0.000321964;RO=0;SAF=38;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.79579e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.34055e-05;OID=.;OPOS=131466562;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:36:38:0:0:36:38:0:0
chr12	131590404	.	G	A	250.81	PASS	AF=0.313131;AO=31;DP=98;FAO=31;FDP=99;FR=.;FRO=68;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=38;FSRR=30;FWDB=-0.0208505;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=162.183;QD=10.1336;RBI=0.0209022;REFB=-0.0108259;REVB=-0.00146912;RO=67;SAF=12;SAR=19;SRF=37;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.193018;STB=0.61761;STBP=0.124;TYPE=snp;VARB=0.0261883;OID=.;OPOS=131590404;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:99:67:68:31:31:0.313131:19:12:37:30:19:12:38:30
chr12	131620588	.	A	G	965.85	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0319265;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.239;QD=56.8148;RBI=0.114158;REFB=0;REVB=0.109603;RO=0;SAF=31;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00325082;OID=.;OPOS=131620588;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:68:0:0:63:68:1:32:31:0:0:37:31:0:0
chr12	131622735	.	T	C	651.23	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00855959;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.603;QD=62.0218;RBI=0.012167;REFB=0;REVB=0.00864695;RO=0;SAF=21;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.60121e-07;OID=.;OPOS=131622735;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:21:21:0:0:21:21:0:0
chr12	131623730	.	A	C	653.04	PASS	AF=0.3375;AO=80;DP=240;FAO=81;FDP=240;FR=.;FRO=159;FSAF=45;FSAR=36;FSRF=85;FSRR=74;FWDB=-0.0290111;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.085;QD=10.884;RBI=0.0303692;REFB=-2.33786e-05;REVB=0.00898043;RO=158;SAF=44;SAR=36;SRF=85;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0140543;STB=0.514015;STBP=0.756;TYPE=snp;VARB=4.05506e-05;OID=.;OPOS=131623730;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:240:240:158:159:80:81:0.3375:36:44:85:73:36:45:85:74
chr12	132237848	.	T	C	358.11	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.061707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.105;QD=55.0941;RBI=0.0670084;REFB=0;REVB=0.0261223;RO=0;SAF=4;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.50493e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000376336;OID=.;OPOS=132237848;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:22:4:0:0:22:4:0:0
chr12	132271113	.	T	C	1268.67	PASS	AF=0.988095;AO=83;DP=84;FAO=83;FDP=84;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=47;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00646224;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.926;QD=60.4128;RBI=0.00646975;REFB=-0.186061;REVB=0.000311723;RO=1;SAF=36;SAR=47;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129742;STB=0.506848;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.00118829;OID=.;OPOS=132271113;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:84:84:1:1:83:83:0.988095:47:36:1:0:47:36:1:0
chr12	132325376	.	C	T	257.61	PASS	AF=0.320755;AO=34;DP=106;FAO=34;FDP=106;FR=.;FRO=72;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=51;FSRR=21;FWDB=0.0123114;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.323;QD=9.72109;RBI=0.0274785;REFB=-0.00432154;REVB=0.0245661;RO=72;SAF=13;SAR=21;SRF=51;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.3668;STB=0.710998;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0104319;OID=.;OPOS=132325376;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:106:72:72:34:34:0.320755:21:13:51:21:21:13:51:21
chr12	132326298	.	G	A	172.91	PASS	AF=0.266667;AO=24;DP=90;FAO=24;FDP=90;FR=.;FRO=66;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=31;FSRR=35;FWDB=0.00439473;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.518;QD=7.68493;RBI=0.00455515;REFB=-0.00808411;REVB=-0.00119819;RO=66;SAF=7;SAR=17;SRF=31;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.230165;STB=0.639483;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=0.0176758;OID=.;OPOS=132326298;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:66:66:24:24:0.266667:17:7:31:35:17:7:31:35
chr12	132393334	.	C	T	235.44	PASS	AF=0.394366;AO=28;DP=71;FAO=28;FDP=71;FR=.;FRO=43;FSAF=6;FSAR=22;FSRF=15;FSRR=28;FWDB=-0.0271705;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.437;QD=13.2644;RBI=0.027188;REFB=-0.013944;REVB=0.000975782;RO=43;SAF=6;SAR=22;SRF=15;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183822;STB=0.606217;STBP=0.216;TYPE=snp;VARB=0.0155981;OID=.;OPOS=132393334;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:43:43:28:28:0.394366:22:6:15:28:22:6:15:28
chr12	132396603	.	C	T	2792.82	PASS	AF=0.994444;AO=178;DP=180;FAO=179;FDP=180;FR=.;FRO=1;FSAF=85;FSAR=94;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0513081;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.001;QD=62.0627;RBI=0.0528171;REFB=-0.0731727;REVB=0.0125348;RO=0;SAF=84;SAR=94;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.35328e-08;STB=0.502924;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.000131843;OID=.;OPOS=132396603;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:180:180:0:1:178:179:0.994444:94:84:0:0:94:85:1:0
chr12	132401566	.	C	T	878.99	PASS	AF=0.926471;AO=63;DP=69;FAO=63;FDP=68;FR=.;FRO=5;FSAF=43;FSAR=20;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0568161;FXX=0.0285673;HRUN=3;LEN=1;MLLD=155.003;QD=51.7055;RBI=0.0582773;REFB=-0.198101;REVB=0.0129683;RO=2;SAF=43;SAR=20;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0121702;STB=0.510035;STBP=0.627;TYPE=snp;VARB=0.00186215;OID=.;OPOS=132401566;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:69:68:2:5:63:63:0.926471:20:43:1:1:20:43:4:1
chr12	132403161	.	A	G	819.82	PASS	AF=1;AO=55;DP=56;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0180482;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.021;QD=57.5314;RBI=0.01805;REFB=0;REVB=0.00025764;RO=0;SAF=18;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.85968e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.74715e-06;OID=.;OPOS=132403161;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:56:57:0:0:55:57:1:37:18:0:0:38:19:0:0
chr12	132446281	.	T	C	53.37	PASS	AF=0.135802;AO=11;DP=81;FAO=11;FDP=81;FR=.;FRO=70;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=34;FSRR=36;FWDB=-0.0132364;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.293;QD=2.6357;RBI=0.0153614;REFB=0.000308224;REVB=-0.00779565;RO=70;SAF=3;SAR=8;SRF=34;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.269519;STB=0.691229;STBP=0.199;TYPE=snp;VARB=-0.001919;OID=.;OPOS=132446281;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:81:81:70:70:11:11:0.135802:8:3:34:36:8:3:34:36
chr12	132589168	.	G	A	88.22	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.102795;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=185.987;QD=39.2068;RBI=0.104263;REFB=0;REVB=0.0174385;RO=0;SAF=5;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00116244;OID=.;OPOS=132589168;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:4:5:0:0:4:5:0:0
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chr12	132598995	.	C	T	132.4	PASS	AF=0.320755;AO=17;DP=53;FAO=17;FDP=53;FR=.;FRO=36;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=22;FWDB=-0.030526;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.9016;QD=9.99277;RBI=0.033623;REFB=0.00869123;REVB=0.0140949;RO=36;SAF=10;SAR=7;SRF=14;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.224985;STB=0.633035;STBP=0.184;TYPE=snp;VARB=-0.0192195;OID=.;OPOS=132598995;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:36:36:17:17:0.320755:7:10:14:22:7:10:14:22
chr12	132624252	.	G	A	123.92	PASS	AF=0.451613;AO=11;DP=28;FAO=14;FDP=31;FR=.;FRO=17;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=0.0622277;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.155;QD=15.99;RBI=0.07032;REFB=-0.0166308;REVB=-0.0327507;RO=17;SAF=8;SAR=3;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.431914;STB=0.774248;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.0243599;OID=.;OPOS=132624252;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:31:17:17:11:14:0.451613:3:8:5:12:3:11:5:12
chr12	132626425	.	G	A	416.05	PASS	AF=0.446602;AO=46;DP=103;FAO=46;FDP=103;FR=.;FRO=57;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=32;FSRR=25;FWDB=-0.0240512;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.3136;QD=16.1571;RBI=0.035492;REFB=-0.00537217;REVB=0.0261002;RO=55;SAF=23;SAR=23;SRF=31;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0620536;STB=0.533966;STBP=0.554;TYPE=snp;VARB=0.00995385;OID=.;OPOS=132626425;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:103:55:57:46:46:0.446602:23:23:31:24:23:23:32:25
chr12	132626668	.	T	C	207.31	PASS	AF=0.588235;AO=20;DP=34;FAO=20;FDP=34;FR=.;FRO=14;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.0143241;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.333;QD=24.3896;RBI=0.0345006;REFB=-0.0231049;REVB=0.0313865;RO=14;SAF=9;SAR=11;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0895656;STB=0.54995;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.0189883;OID=.;OPOS=132626668;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:14:14:20:20:0.588235:11:9:8:6:11:9:8:6
chr12	132627365	.	G	A	199.89	PASS	AF=0.40678;AO=24;DP=59;FAO=24;FDP=59;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=22;FSRR=13;FWDB=-0.0373371;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.481;QD=13.5521;RBI=0.0617383;REFB=-0.0122866;REVB=0.0491687;RO=35;SAF=13;SAR=11;SRF=22;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0916862;STB=0.552324;STBP=0.559;TYPE=snp;VARB=0.0149078;OID=.;OPOS=132627365;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:35:35:24:24:0.40678:11:13:22:13:11:13:22:13
chr12	132628281	.	C	T	75.13	PASS	AF=0.37037;AO=10;DP=27;FAO=10;FDP=27;FR=.;FRO=17;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=16;FWDB=0.0374778;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.386;QD=11.131;RBI=0.0382415;REFB=-0.00430161;REVB=0.00760448;RO=16;SAF=3;SAR=7;SRF=1;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.35438;STB=0.711042;STBP=0.221;TYPE=snp;VARB=0.0130832;OID=.;OPOS=132628281;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:27:27:16:17:10:10:0.37037:7:3:1:15:7:3:1:16
chr12	132628285	.	G	A	63.96	PASS	AF=0.333333;AO=9;DP=27;FAO=9;FDP=27;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=17;FWDB=-0.0265141;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=46.5996;QD=9.47605;RBI=0.0471749;REFB=-0.0311954;REVB=0.0390189;RO=17;SAF=3;SAR=6;SRF=1;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.40686;STB=0.741579;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=0.0608758;OID=.;OPOS=132628285;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:27:27:17:18:9:9:0.333333:6:3:1:16:6:3:1:17
chr12	132633449	.	C	T	1242.33	PASS	AF=0.97619;AO=82;DP=85;FAO=82;FDP=84;FR=.;FRO=2;FSAF=42;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0302188;FXX=0.0117633;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.9561;QD=59.1587;RBI=0.0303794;REFB=-0.131936;REVB=0.00311911;RO=2;SAF=42;SAR=40;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00055005;STB=0.50029;STBP=0.881;TYPE=snp;VARB=0.000765309;OID=.;OPOS=132633449;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:85:84:2:2:82:82:0.97619:40:42:1:1:40:42:1:1
chr12	132635521	.	T	C	240.05	PASS	AF=0.647059;AO=21;DP=33;FAO=22;FDP=34;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=-0.00850631;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.221;QD=28.2412;RBI=0.0172565;REFB=-0.0144839;REVB=0.0150143;RO=12;SAF=8;SAR=13;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188659;STB=0.608595;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=0.0116759;OID=.;OPOS=132635521;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:33:34:12:12:21:22:0.647059:13:8:8:4:14:8:8:4
chr12	132635581	.	C	T	91.83	PASS	AF=0.292683;AO=12;DP=41;FAO=12;FDP=41;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=24;FWDB=-0.00413127;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.4073;QD=8.9594;RBI=0.0209536;REFB=-0.0280475;REVB=-0.0205423;RO=28;SAF=6;SAR=6;SRF=5;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.38351;STB=0.731404;STBP=0.095;TYPE=snp;VARB=0.0651103;OID=.;OPOS=132635581;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:91:41:41:28:29:12:12:0.292683:6:6:5:23:6:6:5:24
chr12	132682481	.	T	G	222.32	PASS	AF=0.211429;AO=37;DP=176;FAO=37;FDP=175;FR=.;FRO=138;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=76;FSRR=62;FWDB=-0.0219262;FXX=0.0056815;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.525;QD=5.08158;RBI=0.0238055;REFB=-0.00492892;REVB=0.00927051;RO=137;SAF=19;SAR=18;SRF=76;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0527269;STB=0.529396;STBP=0.689;TYPE=snp;VARB=0.0117836;OID=.;OPOS=132682481;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:176:175:137:138:37:37:0.211429:18:19:76:61:18:19:76:62
chr12	132682484	.	A	G	232.69	PASS	AF=0.217877;AO=38;DP=179;FAO=39;FDP=179;FR=.;FRO=140;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=76;FSRR=64;FWDB=-0.0211555;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.531;QD=5.19969;RBI=0.0255159;REFB=-0.00871076;REVB=-0.0142655;RO=139;SAF=21;SAR=17;SRF=75;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0167811;STB=0.503458;STBP=0.973;TYPE=snp;VARB=0.0249261;OID=.;OPOS=132682484;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:179:179:139:140:38:39:0.217877:17:21:75:64:18:21:76:64
chr12	132688137	.	A	G	141.87	PASS	AF=0.333333;AO=17;DP=51;FAO=17;FDP=51;FR=.;FRO=34;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=0.000399559;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.236;QD=11.1267;RBI=0.0295315;REFB=-0.0140661;REVB=-0.0295288;RO=34;SAF=14;SAR=3;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.513918;STB=0.805383;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0257213;OID=.;OPOS=132688137;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:34:34:17:17:0.333333:3:14:13:21:3:14:13:21
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chr12	133102403	.	C	T	661.83	PASS	AF=0.384615;AO=71;DP=191;FAO=75;FDP=195;FR=.;FRO=120;FSAF=32;FSAR=43;FSRF=41;FSRR=79;FWDB=0.0474456;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.4917;QD=13.5761;RBI=0.0544943;REFB=-0.000580927;REVB=0.0268056;RO=119;SAF=28;SAR=43;SRF=40;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0686607;STB=0.554295;STBP=0.253;TYPE=snp;VARB=0.00116233;OID=.;OPOS=133102403;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:191:195:119:120:71:75:0.384615:43:28:40:79:43:32:41:79
chr12	133127964	.	G	A	206.38	PASS	AF=0.3;AO=26;DP=90;FAO=27;FDP=90;FR=.;FRO=63;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=33;FSRR=30;FWDB=4.05203e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.425;QD=9.1726;RBI=0.00737414;REFB=-0.0149082;REVB=-0.00737403;RO=63;SAF=11;SAR=15;SRF=33;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120347;STB=0.555514;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.0213301;OID=.;OPOS=133127964;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:63:63:26:27:0.3:15:11:33:30:15:12:33:30
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chr12	133196596	.	T	C	154.45	PASS	AF=0.695652;AO=15;DP=22;FAO=16;FDP=23;FR=.;FRO=7;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.0148475;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.393;QD=26.8614;RBI=0.0501391;REFB=0.00403375;REVB=0.0478902;RO=6;SAF=11;SAR=4;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140931;STB=0.61523;STBP=0.138;TYPE=snp;VARB=0.000509234;OID=.;OPOS=133196596;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:22:23:6:7:15:16:0.695652:4:11:3:3:4:12:3:4
chr12	133201947	.	T	C	219.27	PASS	AF=0.863636;AO=19;DP=22;FAO=19;FDP=22;FR=.;FRO=3;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0584499;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.782;QD=39.8679;RBI=0.0593909;REFB=-0.00397036;REVB=0.0105303;RO=3;SAF=6;SAR=13;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0971085;STB=0.553134;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=-0.000183008;OID=.;OPOS=133201947;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:22:22:3:3:19:19:0.863636:13:6:2:1:13:6:2:1
chr12	133202004	.	C	T	236.65	PASS	AF=0.75;AO=21;DP=28;FAO=21;FDP=28;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.00740812;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.791;QD=33.8068;RBI=0.0171158;REFB=-0.0227931;REVB=0.0154296;RO=6;SAF=5;SAR=16;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0515557;STB=0.561342;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.00576467;OID=.;OPOS=133202004;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:28:28:6:7:21:21:0.75:16:5:2:4:16:5:3:4
chr12	133208979	.	T	C	659.18	PASS	AF=0.640449;AO=57;DP=89;FAO=57;FDP=89;FR=.;FRO=32;FSAF=25;FSAR=32;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=-0.0286881;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.715;QD=29.6263;RBI=0.0326805;REFB=-0.00658729;REVB=-0.0156528;RO=32;SAF=25;SAR=32;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0202291;STB=0.510974;STBP=0.805;TYPE=snp;VARB=0.0036519;OID=.;OPOS=133208979;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:32:32:57:57:0.640449:32:25:15:17:32:25:15:17
chr12	133219831	.	T	C	617.51	PASS	AF=0.732394;AO=51;DP=70;FAO=52;FDP=71;FR=.;FRO=19;FSAF=31;FSAR=21;FSRF=15;FSRR=4;FWDB=-0.0168296;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.063;QD=34.7893;RBI=0.0363571;REFB=-0.010288;REVB=0.0322274;RO=19;SAF=30;SAR=21;SRF=15;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106957;STB=0.554833;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=0.00246073;OID=.;OPOS=133219831;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:71:19:19:51:52:0.732394:21:30:15:4:21:31:15:4
chr12	133236000	.	C	T	398.91	PASS	AF=0.633333;AO=38;DP=60;FAO=38;FDP=60;FR=.;FRO=22;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=-0.00287191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.62;QD=26.5943;RBI=0.00717577;REFB=0.0133658;REVB=-0.006576;RO=22;SAF=16;SAR=22;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114538;STB=0.562577;STBP=0.206;TYPE=snp;VARB=-0.00507859;OID=.;OPOS=133236000;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:22:22:38:38:0.633333:22:16:13:9:22:16:13:9
chr12	133295353	.	C	T	623.49	PASS	AF=0.582524;AO=60;DP=103;FAO=60;FDP=103;FR=.;FRO=43;FSAF=31;FSAR=29;FSRF=23;FSRR=20;FWDB=-0.00912011;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=229.009;QD=24.2133;RBI=0.0100779;REFB=-0.0021292;REVB=0.00428805;RO=42;SAF=31;SAR=29;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00539981;STB=0.507615;STBP=0.874;TYPE=snp;VARB=0.00154828;OID=.;OPOS=133295353;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:103:42:43:60:60:0.582524:29:31:22:20:29:31:23:20
chr12	133306589	.	C	T	153.55	PASS	AF=0.333333;AO=15;DP=65;FAO=21;FDP=63;FR=.,HEALED;FRO=41;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=27;FSRR=14;FWDB=0.0259114;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.343;QD=9.74896;RBI=0.0876781;REFB=-0.00554742;REVB=-0.0837619;RO=38;SAF=8;SAR=7;SRF=25;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150775;STB=0.619374;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.00763689;OID=.;OPOS=133306589;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:63:38:41:15:21:0.333333:7:8:25:13:11:10:27:14
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chr12	133318406	.	G	T	656.23	PASS	AF=0.604167;AO=58;DP=96;FAO=58;FDP=96;FR=.;FRO=38;FSAF=31;FSAR=27;FSRF=9;FSRR=29;FWDB=-0.0130969;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.1386;QD=27.343;RBI=0.0255456;REFB=-0.0213615;REVB=-0.0219329;RO=36;SAF=31;SAR=27;SRF=9;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.19882;STB=0.616439;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.00821836;OID=.;OPOS=133318406;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:96:36:38:58:58:0.604167:27:31:9:27:27:31:9:29
chr12	133331537	.	G	A	356.2	PASS	AF=0.44186;AO=38;DP=86;FAO=38;FDP=86;FR=.;FRO=48;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=30;FWDB=0.0092312;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.107;QD=16.5673;RBI=0.0134939;REFB=-0.0207636;REVB=-0.00984229;RO=46;SAF=21;SAR=17;SRF=16;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198054;STB=0.598131;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.0221686;OID=.;OPOS=133331537;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:46:48:38:38:0.44186:17:21:16:30:17:21:18:30
chr12	133363376	.	G	T	750.86	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0311045;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.873;QD=56.6687;RBI=0.0312156;REFB=0;REVB=-0.00263105;RO=0;SAF=25;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94283e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.96552e-05;OID=.;OPOS=133363376;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:53:0:0:51:53:1:26:25:0:0:26:27:0:0
chr12	133378440	.	C	T	851.33	PASS	AF=0.616;AO=77;DP=125;FAO=77;FDP=125;FR=.;FRO=48;FSAF=37;FSAR=40;FSRF=22;FSRR=26;FWDB=0.0245436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.812;QD=27.2427;RBI=0.0248711;REFB=-0.0103641;REVB=0.00402295;RO=48;SAF=37;SAR=40;SRF=22;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0157488;STB=0.508536;STBP=0.826;TYPE=snp;VARB=0.00514838;OID=.;OPOS=133378440;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:125:125:48:48:77:77:0.616:40:37:22:26:40:37:22:26
chr12	133393323	.	C	T	167.74	PASS	AF=0.2875;AO=23;DP=80;FAO=23;FDP=80;FR=.;FRO=57;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=34;FSRR=23;FWDB=-0.000100056;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=316.869;QD=8.38697;RBI=0.011186;REFB=0.000294272;REVB=0.0111856;RO=57;SAF=14;SAR=9;SRF=34;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0152284;STB=0.509083;STBP=0.96;TYPE=snp;VARB=-0.000726031;OID=.;OPOS=133393323;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:57:57:23:23:0.2875:9:14:34:23:9:14:34:23
chr12	133411987	.	G	C	1268.69	PASS	AF=0.988095;AO=83;DP=84;FAO=83;FDP=84;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0247999;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=285.981;QD=60.4139;RBI=0.0288783;REFB=-0.103657;REVB=-0.014796;RO=0;SAF=43;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505746;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.000192482;OID=.;OPOS=133411987;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:84:84:0:1:83:83:0.988095:40:43:0:0:40:43:1:0
chr12	133423695	.	A	G	89.54	PASS	AF=0.478261;AO=11;DP=23;FAO=11;FDP=23;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=-0.00762276;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=199.28;QD=15.5715;RBI=0.0175158;REFB=-0.00904564;REVB=0.0157701;RO=12;SAF=4;SAR=7;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.268832;STB=0.65597;STBP=0.173;TYPE=snp;VARB=0.0107421;OID=.;OPOS=133423695;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:23:23:12:12:11:11:0.478261:7:4:8:4:7:4:8:4
chr12	133433173	.	T	C	710.29	PASS	AF=0.978723;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0163697;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.6202;QD=60.45;RBI=0.0173578;REFB=-0.134928;REVB=-0.00577273;RO=0;SAF=27;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509087;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.00381943;OID=.;OPOS=133433173;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:47:47:0:1:46:46:0.978723:19:27:0:0:19:27:1:0
chr12	133435716	.	T	G	395.94	PASS	AF=0.512821;AO=40;DP=78;FAO=40;FDP=78;FR=.;FRO=38;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=14;FSRR=24;FWDB=0.00663049;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.209;QD=20.3045;RBI=0.0140352;REFB=-0.0157109;REVB=-0.0123703;RO=38;SAF=17;SAR=23;SRF=14;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0513547;STB=0.528425;STBP=0.645;TYPE=snp;VARB=0.012074;OID=.;OPOS=133435716;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:38:38:40:40:0.512821:23:17:14:24:23:17:14:24
chr12	133587980	.	C	G,T	758.02	PASS	AF=0.037037,0.962963;AO=2,52;DP=54;FAO=2,52;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=0,22;FSAR=2,30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=8.21974e-05,0.00434857;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=19.6593,156.547;QD=56.1496;RBI=0.00407615,0.0104117;REFB=0,0;REVB=-0.00407532,0.00946015;RO=0;SAF=0,22;SAR=2,30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0198058,-0.00494307;OID=.,.;OPOS=133587980,133587980;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:7:54:54:0:0:2,52:2,52:0.037037,0.962963:2,30:0,22:0:0:2,30:0,22:0:0
chr12	133660718	.	A	G	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00989162;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.068;QD=33.4285;RBI=0.0116572;REFB=0;REVB=-0.00616817;RO=0;SAF=3;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.1787e-05;OID=.;OPOS=133660718;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:3:3:0:0:3:3:0:0
chr12	133781231	.	GAAAC	GAAC,GAACT	568.83	PASS	AF=0.97619,0.0238095;AO=36,4;DP=42;FAO=41,1;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=18,0;FSAR=23,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0852053,0.0321399;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,2;MLLD=21.4176,5.9483;QD=54.1738;RBI=0.160869,0.0490807;REFB=0,0;REVB=0.136451,0.0370937;RO=0;SAF=18,0;SAR=18,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.00674032,-0.00751637;OID=.,.;OPOS=133781232,133781234;OREF=A,AC;OALT=-,CT;OMAPALT=GAAC,GAACT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.97619,0.0238095:36,4:42:41,1:42:0:18,0:23,1:0:0:4:0:18,0:18,4:0:0
chr12	133781428	.	A	C	1162.65	PASS	AF=0.951807;AO=78;DP=82;FAO=79;FDP=83;FR=.;FRO=4;FSAF=38;FSAR=41;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0196135;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=192.574;QD=56.0315;RBI=0.0214865;REFB=-0.0246847;REVB=-0.008774;RO=1;SAF=37;SAR=41;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0114055;STB=0.512966;STBP=0.264;TYPE=snp;VARB=0.000680151;OID=.;OPOS=133781428;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:82:83:1:4:78:79:0.951807:41:37:0:1:41:38:3:1
chr12	133781605	.	A	G	834.41	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0177528;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=270.244;QD=57.5453;RBI=0.0242875;REFB=0;REVB=0.0165747;RO=0;SAF=32;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.50612e-05;OID=.;OPOS=133781605;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:58:0:0:57:58:1:25:32:0:0:26:32:0:0
chr12	133795885	.	G	A	2705.88	PASS	AF=0.978022;AO=177;DP=183;FAO=178;FDP=182;FR=.;FRO=4;FSAF=84;FSAR=94;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0329569;FXX=0.00546418;HRUN=3;LEN=1;MLLD=191.29;QD=59.4698;RBI=0.0335546;REFB=-0.103116;REVB=0.00630535;RO=5;SAF=83;SAR=94;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0173489;STB=0.506126;STBP=0.265;TYPE=snp;VARB=0.000338889;OID=.;OPOS=133795885;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:183:182:5:4:177:178:0.978022:94:83:4:1:94:84:3:1
chr12	133795960	.	A	G	1438.38	PASS	AF=0.989247;AO=92;DP=93;FAO=92;FDP=93;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=57;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00165655;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=243.874;QD=61.8656;RBI=0.005794;REFB=-0.0339786;REVB=0.00555214;RO=1;SAF=35;SAR=57;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.013351;STB=0.507041;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=3.01386e-06;OID=.;OPOS=133795960;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:93:93:1:1:92:92:0.989247:57:35:1:0:57:35:1:0
chr13	19600126	.	G	A	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00461924;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.333;QD=55.0985;RBI=0.0081506;REFB=0;REVB=-0.00671528;RO=0;SAF=12;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.03146e-05;OID=.;OPOS=19600126;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:14:12:0:0:14:12:0:0
chr13	19600200	.	C	T	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.026598;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.262;QD=47.8213;RBI=0.0301734;REFB=0;REVB=-0.0142471;RO=0;SAF=7;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000249176;OID=.;OPOS=19600200;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:9:7:0:0:9:7:0:0
chr13	19600475	.	C	A	1475.88	PASS	AF=1;AO=93;DP=94;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.02571;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.4607;QD=63.4785;RBI=0.0361928;REFB=0;REVB=0.0254738;RO=0;SAF=52;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.90048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000338641;OID=.;OPOS=19600475;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:94:93:0:0:93:93:1:41:52:0:0:41:52:0:0
chr13	19751544	.	C	T	251.62	PASS	AF=0.489796;AO=23;DP=48;FAO=24;FDP=49;FR=.;FRO=25;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.0161931;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.1523;QD=20.5404;RBI=0.0273173;REFB=0.00172056;REVB=-0.0220005;RO=25;SAF=15;SAR=8;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128056;STB=0.555508;STBP=0.43;TYPE=snp;VARB=-0.00329218;OID=.;OPOS=19751544;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:49:25:25:23:24:0.489796:8:15:13:12:9:15:13:12
chr13	20000630	.	T	C	655.48	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0125797;FXX=0.0232504;HRUN=4;LEN=1;MLLD=193.127;QD=62.4264;RBI=0.0296426;REFB=0;REVB=-0.026841;RO=0;SAF=24;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.2194e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000172803;OID=.;OPOS=20000630;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:42:0:0:41:42:1:17:24:0:0:18:24:0:0
chr13	20038584	.	A	G	685.93	PASS	AF=0.957447;AO=45;DP=47;FAO=45;FDP=47;FR=.;FRO=2;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0123292;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=313.333;QD=58.3768;RBI=0.0154239;REFB=-0.0755488;REVB=-0.00926757;RO=1;SAF=24;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0218529;STB=0.501424;STBP=0.87;TYPE=snp;VARB=-3.17229e-06;OID=.;OPOS=20038584;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:47:47:1:2:45:45:0.957447:21:24:0:1:21:24:1:1
chr13	20048214	.	T	G	31.09	PASS	AF=0.0898876;AO=8;DP=89;FAO=8;FDP=89;FR=.;FRO=81;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=41;FSRR=40;FWDB=-0.0562775;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.4645;QD=1.39744;RBI=0.0564382;REFB=-0.00354846;REVB=-0.00425475;RO=81;SAF=3;SAR=5;SRF=41;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148852;STB=0.619419;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.0642843;OID=.;OPOS=20048214;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:31:89:89:81:81:8:8:0.0898876:5:3:41:40:5:3:41:40
chr13	20066994	.	T	C	34.44	PASS	AF=0.09;AO=9;DP=100;FAO=9;FDP=100;FR=.;FRO=91;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=39;FSRR=52;FWDB=-0.0107541;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=84.148;QD=1.37754;RBI=0.0109375;REFB=-0.000685734;REVB=-0.00199468;RO=91;SAF=5;SAR=4;SRF=39;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144444;STB=0.613789;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.0151512;OID=.;OPOS=20066994;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:100:100:91:91:9:9:0.09:4:5:39:52:4:5:39:52
chr13	20067011	.	AG	A,CG	934.38	PASS	AF=0.904255,0.0851064;AO=24,6;DP=93;FAO=85,8;FDP=94;FR=.;FRO=1;FSAF=35,4;FSAR=50,4;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.339128,-0.043621;FXX=0.0208312;HRUN=3,1;LEN=1,1;MLLD=13.3791,165.232;QD=39.7609;RBI=0.997838,0.0455053;REFB=0.0731053,-0.00620085;REVB=0.938441,-0.0129589;RO=49;SAF=24,2;SAR=0,4;SRF=1;SRR=48;SSEN=0,0;SSEP=0.570681,0;SSSB=0.894686,0.682893;STB=0.507041,0.555418;STBP=0.302,0.503;TYPE=del,snp;VARB=0.0460939,0.0626613;OID=.,.;OPOS=20067012,20067011;OREF=G,A;OALT=-,C;OMAPALT=A,CG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:29:93:94:49:1:24,6:85,8:0.904255,0.0851064:0,4:24,2:1:48:50,4:35,4:1:0
chr13	20277413	.	T	C	247.52	PASS	AF=0.348837;AO=30;DP=85;FAO=30;FDP=86;FR=.;FRO=56;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=37;FWDB=-0.0422779;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.542;QD=11.5124;RBI=0.0426024;REFB=-0.0148251;REVB=0.00524825;RO=55;SAF=17;SAR=13;SRF=18;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.263789;STB=0.644824;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.024294;OID=.;OPOS=20277413;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:86:55:56:30:30:0.348837:13:17:18:37:13:17:19:37
chr13	20398669	.	T	C	708.4	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0512844;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.2317;QD=62.9686;RBI=0.0886274;REFB=0;REVB=0.0722822;RO=0;SAF=20;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.09779e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00180352;OID=.;OPOS=20398669;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:25:20:0:0:25:20:0:0
chr13	20398742	.	C	T	358.11	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00854662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.1615;QD=55.0934;RBI=0.00855383;REFB=0;REVB=0.000351006;RO=0;SAF=12;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000119983;OID=.;OPOS=20398742;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:14:12:0:0:14:12:0:0
chr13	20409777	.	T	C	292.0	PASS	AF=0.516667;AO=30;DP=59;FAO=31;FDP=60;FR=.;FRO=29;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=0.0390296;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.662;QD=19.4668;RBI=0.0479757;REFB=-0.00517421;REVB=0.0278991;RO=29;SAF=17;SAR=13;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134379;STB=0.564803;STBP=0.334;TYPE=snp;VARB=0.00344937;OID=.;OPOS=20409777;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:60:29:29:30:31:0.516667:13:17:12:17:14:17:12:17
chr13	20716411	.	C	T	164.49	PASS	AF=0.515152;AO=17;DP=34;FAO=17;FDP=33;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=0.0175048;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.246;QD=19.9385;RBI=0.032483;REFB=-0.010861;REVB=0.0273629;RO=16;SAF=8;SAR=9;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0825894;STB=0.546708;STBP=0.587;TYPE=snp;VARB=0.0081469;OID=.;OPOS=20716411;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:33:16:16:17:17:0.515152:9:8:6:10:9:8:6:10
chr13	20716533	.	G	T	400.21	PASS	AF=0.966667;AO=29;DP=30;FAO=29;FDP=30;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0637642;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.8616;QD=53.3612;RBI=0.0656724;REFB=-0.185592;REVB=0.0157162;RO=1;SAF=16;SAR=13;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0282257;STB=0.515141;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=0.00710528;OID=.;OPOS=20716533;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:30:30:1:1:29:29:0.966667:13:16:1:0:13:16:1:0
chr13	20716558	.	GGCCCC	GCCC,GGCCC,GGCCCG,GGCCCT	84.37	PASS	AF=0.26087,0.130435,0.0869565,0.0869565;AO=5,4,2,2;DP=23;FAO=6,3,2,2;FDP=23;FR=.;FRO=10;FSAF=1,0,1,2;FSAR=5,3,1,0;FSRF=9;FSRR=1;FWDB=-0.0784909,-0.094506,-0.026502,-0.0449487;FXX=0;HRUN=4,4,4,4;LEN=2,1,1,1;MLLD=21.4452,13.8968,19.5907,158.193;QD=14.6733;RBI=0.118325,0.121278,0.0381112,0.0869722;REFB=-0.074774,-0.0948626,-0.0728251,-0.00704156;REVB=-0.0885442,-0.0760063,0.0273881,-0.0744566;RO=8;SAF=1,2,1,2;SAR=4,2,1,0;SRF=7;SRR=1;SSEN=0.594203,0.354839,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=-0.598683,-0.404244,-0.438176,0.490468;STB=0.891803,0.997945,0.83147,0.990788;STBP=0.044,0.004,0.747,0.513;TYPE=del,del,snp,snp;VARB=0.0502002,0.0843316,0.0970043,0.0211857;OID=.,.,.,.;OPOS=20716559,20716560,20716563,20716563;OREF=GC,C,C,C;OALT=-,-,G,T;OMAPALT=GCCC,GGCCC,GGCCCG,GGCCCT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.26087,0.130435,0.0869565,0.0869565:5,4,2,2:23:6,3,2,2:23:10:1,0,1,2:5,3,1,0:9:1:34:8:1,2,1,2:4,2,1,0:7:1
chr13	21205192	.	G	A,T	707.97	PASS	AF=0.934783,0.0652174;AO=43,3;DP=46;FAO=43,3;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=20,2;FSAR=23,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159328,-0.00343603;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=112.048,66.538;QD=61.5626;RBI=0.0273971,0.0124442;REFB=0,0;REVB=0.0222879,-0.0119604;RO=0;SAF=20,2;SAR=23,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00161888,0.114734;OID=.,.;OPOS=21205192,21205192;OREF=G,G;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:12:46:46:0:0:43,3:43,3:0.934783,0.0652174:23,1:20,2:0:0:23,1:20,2:0:0
chr13	21356650	.	T	A	2705.31	PASS	AF=1;AO=174;DP=176;FAO=174;FDP=174;FR=.;FRO=0;FSAF=90;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0243924;FXX=0.0169482;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.696;QD=62.191;RBI=0.039248;REFB=-0.0646614;REVB=-0.0307476;RO=1;SAF=90;SAR=84;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00525976;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.70145e-05;OID=.;OPOS=21356650;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:176:174:1:0:174:174:1:84:90:1:0:84:90:0:0
chr13	21555687	.	C	T	382.18	PASS	AF=0.506494;AO=39;DP=77;FAO=39;FDP=77;FR=.;FRO=38;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=23;FWDB=0.0190469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.536;QD=19.8534;RBI=0.0192644;REFB=-0.0199479;REVB=-0.00288685;RO=38;SAF=19;SAR=20;SRF=15;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0825018;STB=0.545735;STBP=0.412;TYPE=snp;VARB=0.0186765;OID=.;OPOS=21555687;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:38:38:39:39:0.506494:20:19:15:23:20:19:15:23
chr13	21562832	.	C	T	538.56	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00922899;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=208.911;QD=59.8394;RBI=0.0107601;REFB=0;REVB=0.00553229;RO=0;SAF=17;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.49304e-05;OID=.;OPOS=21562832;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:19:17:0:0:19:17:0:0
chr13	21562948	.	G	A	206.94	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0445574;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.222;QD=48.6908;RBI=0.0466271;REFB=0;REVB=0.0137376;RO=0;SAF=8;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000684804;OID=.;OPOS=21562948;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:9:8:0:0:9:8:0:0
chr13	21612791	.	G	A	773.64	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0058358;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.069;QD=57.3064;RBI=0.00607754;REFB=0;REVB=0.00169703;RO=0;SAF=26;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.52846e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000837597;OID=.;OPOS=21612791;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:28:26:0:0:28:26:0:0
chr13	21620085	.	T	C	803.41	PASS	AF=0.982759;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.010904;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=275.216;QD=55.4075;RBI=0.0181127;REFB=-0.119553;REVB=0.0144627;RO=1;SAF=30;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154619;STB=0.508194;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.000250304;OID=.;OPOS=21620085;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:58:58:1:1:57:57:0.982759:27:30:1:0:27:30:1:0
chr13	21714920	.	G	A	222.82	PASS	AF=0.462963;AO=25;DP=54;FAO=25;FDP=54;FR=.;FRO=29;FSAF=5;FSAR=20;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=0.000214532;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.7;QD=16.5054;RBI=0.00540478;REFB=-0.0133705;REVB=0.00540052;RO=27;SAF=5;SAR=20;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.280915;STB=0.666518;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=0.0203515;OID=.;OPOS=21714920;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:27:29:25:25:0.462963:20:5:12:15:20:5:13:16
chr13	21720956	.	C	T	205.94	PASS	AF=0.428571;AO=21;DP=49;FAO=21;FDP=49;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=-0.025295;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.7189;QD=16.811;RBI=0.025428;REFB=-0.0209544;REVB=0.00259729;RO=28;SAF=9;SAR=12;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.211651;STB=0.620578;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.0219633;OID=.;OPOS=21720956;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:28:28:21:21:0.428571:12:9:18:10:12:9:18:10
chr13	21729252	.	T	C	293.22	PASS	AF=0.361702;AO=34;DP=94;FAO=34;FDP=94;FR=.;FRO=60;FSAF=26;FSAR=8;FSRF=34;FSRR=26;FWDB=0.00403367;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=287.339;QD=12.4773;RBI=0.0090342;REFB=-0.00522819;REVB=-0.00808371;RO=60;SAF=26;SAR=8;SRF=34;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.254947;STB=0.648;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.00913517;OID=.;OPOS=21729252;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:60:60:34:34:0.361702:8:26:34:26:8:26:34:26
chr13	21729267	.	G	A	257.2	PASS	AF=0.344444;AO=31;DP=90;FAO=31;FDP=90;FR=.;FRO=59;FSAF=25;FSAR=6;FSRF=33;FSRR=26;FWDB=0.00250389;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.447;QD=11.4311;RBI=0.00281894;REFB=-0.00539408;REVB=0.00129498;RO=59;SAF=25;SAR=6;SRF=33;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.33478;STB=0.696723;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.00603343;OID=.;OPOS=21729267;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:59:59:31:31:0.344444:6:25:33:26:6:25:33:26
chr13	21732094	.	C	T	1033.3	PASS	AF=0.985915;AO=70;DP=72;FAO=70;FDP=71;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=44;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0113002;FXX=0.013887;HRUN=2;LEN=1;MLLD=305.405;QD=58.2143;RBI=0.0218766;REFB=-0.0317483;REVB=-0.018732;RO=0;SAF=26;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509431;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=6.31058e-05;OID=.;OPOS=21732094;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:72:71:0:1:70:70:0.985915:44:26:0:0:44:26:1:0
chr13	21735998	.	T	C	274.95	PASS	AF=0.43662;AO=31;DP=71;FAO=31;FDP=71;FR=.;FRO=40;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=25;FSRR=15;FWDB=-0.00669507;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.002;QD=15.4901;RBI=0.034794;REFB=-0.00798482;REVB=0.0341438;RO=40;SAF=11;SAR=20;SRF=25;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.268398;STB=0.651486;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.0175799;OID=.;OPOS=21735998;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:40:40:31:31:0.43662:20:11:25:15:20:11:25:15
chr13	21742311	.	C	T	643.7	PASS	AF=0.385417;AO=73;DP=191;FAO=74;FDP=192;FR=.;FRO=118;FSAF=41;FSAR=33;FSRF=49;FSRR=69;FWDB=-0.0197756;FXX=0.0103087;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.783;QD=13.4105;RBI=0.0405985;REFB=-0.0066057;REVB=-0.0354566;RO=114;SAF=41;SAR=32;SRF=49;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141969;STB=0.584709;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.0115405;OID=.;OPOS=21742311;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:191:192:114:118:73:74:0.385417:32:41:49:65:33:41:49:69
chr13	21746600	.	TG	T	71.66	PASS	AF=0.203704;AO=10;DP=56;FAO=11;FDP=54;FR=.;FRO=43;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=-0.00498975;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.841;QD=5.30829;RBI=0.00534544;REFB=-0.00240667;REVB=0.00191733;RO=44;SAF=7;SAR=3;SRF=20;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.301793;STB=0.618829;STBP=0.379;TYPE=del;VARB=0.00746197;OID=.;OPOS=21746601;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.203704:10:56:11:54:43:7:4:21:22:71:44:7:3:20:24
chr13	21750538	.	G	A	472.4	PASS	AF=0.377622;AO=54;DP=143;FAO=54;FDP=143;FR=.;FRO=89;FSAF=32;FSAR=22;FSRF=52;FSRR=37;FWDB=0.00497841;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.0705;QD=13.2139;RBI=0.083335;REFB=-0.0185148;REVB=0.0831862;RO=89;SAF=32;SAR=22;SRF=52;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00942706;STB=0.505351;STBP=0.947;TYPE=snp;VARB=0.0327982;OID=.;OPOS=21750538;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:143:143:89:89:54:54:0.377622:22:32:52:37:22:32:52:37
chr13	21751528	.	A	AC	396.73	PASS	AF=1;AO=45;DP=65;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0495802;FXX=0.0169463;HRUN=5;LEN=1;MLLD=9.96829;QD=27.3605;RBI=0.267214;REFB=0.0899013;REVB=0.262574;RO=16;SAF=23;SAR=22;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00540168;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.0142143;OID=.;OPOS=21751529;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:45:65:58:58:0:29:29:0:0:6:16:23:22:8:8
chr13	21752154	.	G	A	501.64	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.020672;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.059;QD=59.0159;RBI=0.0235534;REFB=0;REVB=0.0112885;RO=0;SAF=20;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.48532e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000171309;OID=.;OPOS=21752154;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:14:20:0:0:14:20:0:0
chr13	21949267	.	T	C	86.86	PASS	AF=0.407407;AO=11;DP=27;FAO=11;FDP=27;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=-0.016371;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.84;QD=12.8689;RBI=0.0184881;REFB=-0.00370112;REVB=0.00859077;RO=16;SAF=4;SAR=7;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.37343;STB=0.717584;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.00624505;OID=.;OPOS=21949267;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:27:27:16:16:11:11:0.407407:7:4:12:4:7:4:12:4
chr13	22275394	.	A	G	1533.85	PASS	AF=0.989796;AO=96;DP=97;FAO=97;FDP=98;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=50;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00640784;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.137;QD=62.6062;RBI=0.0369441;REFB=-0.0688855;REVB=0.0363842;RO=1;SAF=46;SAR=50;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.010198;STB=0.505262;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=0.000274229;OID=.;OPOS=22275394;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:97:98:1:1:96:97:0.989796:50:46:1:0:50:47:1:0
chr13	22275583	.	G	A	1120.99	PASS	AF=1;AO=73;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00849959;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.341;QD=60.5942;RBI=0.0116816;REFB=0;REVB=-0.00801347;RO=0;SAF=42;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.98661e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.43745e-05;OID=.;OPOS=22275583;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:0:0:73:74:1:31:42:0:0:31:43:0:0
chr13	22275925	.	C	T	106.34	PASS	AF=0.351351;AO=13;DP=37;FAO=13;FDP=37;FR=.;FRO=24;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=-0.0106722;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.625;QD=11.4956;RBI=0.0336343;REFB=-0.00745106;REVB=-0.0318962;RO=23;SAF=3;SAR=10;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.207999;STB=0.615193;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.00928481;OID=.;OPOS=22275925;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:23:24:13:13:0.351351:10:3:9:14:10:3:9:15
chr13	23253313	.	T	A,C	537.14	PASS	AF=0.0526316,0.947368;AO=4,34;DP=38;FAO=2,36;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=0,22;FSAR=2,14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00290426,0.00388708;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=76.8642,114.626;QD=56.541;RBI=0.0473245,0.0817366;REFB=0,0;REVB=-0.0472353,0.0816442;RO=0;SAF=0,22;SAR=4,12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,4.75716e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.250158,0.00529185;OID=.,.;OPOS=23253313,23253313;OREF=T,T;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:7:38:38:0:0:4,34:2,36:0.0526316,0.947368:4,12:0,22:0:0:2,14:0,22:0:0
chr13	23824783	.	T	G	358.39	PASS	AF=0.397959;AO=39;DP=98;FAO=39;FDP=98;FR=.;FRO=59;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=31;FSRR=28;FWDB=-0.0444828;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.668;QD=14.6281;RBI=0.0448896;REFB=-0.0296501;REVB=-0.00602956;RO=59;SAF=18;SAR=21;SRF=31;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0677722;STB=0.538442;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=0.0504883;OID=.;OPOS=23824783;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:59:59:39:39:0.397959:21:18:31:28:21:18:31:28
chr13	23898509	.	T	C	1825.8	PASS	AF=0.991736;AO=120;DP=121;FAO=120;FDP=121;FR=.;FRO=1;FSAF=65;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0110963;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.1658;QD=60.3569;RBI=0.0283564;REFB=-0.151057;REVB=0.0260951;RO=1;SAF=65;SAR=55;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00855836;STB=0.504504;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.00111894;OID=.;OPOS=23898509;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:121:121:1:1:120:120:0.991736:55:65:0:1:55:65:0:1
chr13	23898664	.	A	G	801.32	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0264374;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=260.622;QD=57.2373;RBI=0.0326039;REFB=0;REVB=-0.0190808;RO=0;SAF=35;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.61553e-05;OID=.;OPOS=23898664;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:21:35:0:0:21:35:0:0
chr13	23905711	.	A	G	476.91	PASS	AF=0.970588;AO=33;DP=35;FAO=33;FDP=34;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=6.97748e-05;FXX=0.0285633;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.1867;QD=56.1072;RBI=0.0332322;REFB=-0.187763;REVB=0.0332321;RO=0;SAF=16;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.60901e-08;STB=0.515142;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.00727025;OID=.;OPOS=23905711;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:35:34:0:1:33:33:0.970588:17:16:0:0:17:16:1:0
chr13	23907677	.	C	T	955.16	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0398711;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.495;QD=58.7792;RBI=0.0399035;REFB=0;REVB=-0.00160703;RO=0;SAF=35;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000133532;OID=.;OPOS=23907677;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:65:0:0:64:65:1:29:35:0:0:30:35:0:0
chr13	23907909	.	A	G	736.89	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000102426;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.871;QD=62.7141;RBI=0.00882422;REFB=0;REVB=0.00882362;RO=0;SAF=22;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00103526;OID=.;OPOS=23907909;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:47:0:0:46:47:1:24:22:0:0:25:22:0:0
chr13	23909162	.	A	G	323.47	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0147348;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.282;QD=53.9111;RBI=0.0147454;REFB=0;REVB=-0.000558118;RO=0;SAF=5;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.80049e-05;OID=.;OPOS=23909162;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:19:5:0:0:19:5:0:0
chr13	23911820	.	A	G	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0028178;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.7939;QD=40.7629;RBI=0.0970298;REFB=0;REVB=-0.0969889;RO=0;SAF=5;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00601061;OID=.;OPOS=23911820;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:5:5:0:0:5:5:0:0
chr13	23985391	.	T	C	322.76	PASS	AF=0.353982;AO=40;DP=115;FAO=40;FDP=113;FR=.;FRO=73;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=27;FSRR=46;FWDB=0.0202409;FXX=0.0258598;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.621;QD=11.425;RBI=0.0202424;REFB=-0.00750492;REVB=-0.000247826;RO=72;SAF=18;SAR=22;SRF=29;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0538381;STB=0.55282;STBP=0.4;TYPE=snp;VARB=0.0135217;OID=.;OPOS=23985391;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:113:72:73:40:40:0.353982:22:18:29:43:22:18:27:46
chr13	24167505	.	T	A	525.69	PASS	AF=0.495495;AO=53;DP=109;FAO=55;FDP=111;FR=.;FRO=56;FSAF=25;FSAR=30;FSRF=32;FSRR=24;FWDB=-0.00332035;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.696;QD=18.9439;RBI=0.00693698;REFB=-0.0179185;REVB=0.00609072;RO=56;SAF=25;SAR=28;SRF=32;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0922215;STB=0.558802;STBP=0.246;TYPE=snp;VARB=0.0199892;OID=.;OPOS=24167505;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:111:56:56:53:55:0.495495:28:25:32:24:30:25:32:24
chr13	24234517	.	A	G	1098.67	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0216185;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.9468;QD=60.2011;RBI=0.0217075;REFB=0;REVB=0.00196419;RO=0;SAF=35;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.90268e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000131781;OID=.;OPOS=24234517;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:38:35:0:0:38:35:0:0
chr13	24243200	.	T	C	310.29	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00902638;FXX=0.0416493;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.572;QD=53.9627;RBI=0.0244857;REFB=0;REVB=0.0227613;RO=0;SAF=10;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000159263;OID=.;OPOS=24243200;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:13:10:0:0:13:10:0:0
chr13	24384049	.	AT	A	142.85	PASS	AF=0.587302;AO=27;DP=63;FAO=37;FDP=63;FR=.;FRO=26;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=-0.103341;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=9.44225;QD=9.06971;RBI=0.277698;REFB=-0.151155;REVB=0.257753;RO=31;SAF=16;SAR=11;SRF=11;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.223039;STB=0.548389;STBP=0.389;TYPE=del;VARB=0.138699;OID=.;OPOS=24384050;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.587302:27:63:37:63:26:20:17:11:15:75:31:16:11:11:20
chr13	24411772	.	T	C	1283.8	PASS	AF=1;AO=82;DP=82;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00629782;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.058;QD=61.87;RBI=0.0230196;REFB=0;REVB=0.0221413;RO=0;SAF=39;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.10525e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.13221e-05;OID=.;OPOS=24411772;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:83:0:0:82:83:1:43:39:0:0:44:39:0:0
chr13	24465717	.	A	G	81.29	PASS	AF=0.275;AO=11;DP=40;FAO=11;FDP=40;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=0.0408381;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.1176;QD=8.12906;RBI=0.06408;REFB=0.00801628;REVB=-0.0493812;RO=29;SAF=10;SAR=1;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.602457;STB=0.880058;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=-0.0229435;OID=.;OPOS=24465717;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:81:40:40:29:29:11:11:0.275:1:10:13:16:1:10:13:16
chr13	24465743	.	A	G	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.025648;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.5139;QD=56.1914;RBI=0.0297721;REFB=0;REVB=0.0151181;RO=0;SAF=17;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.31638e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000634187;OID=.;OPOS=24465743;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:11:17:0:0:11:17:0:0
chr13	24468704	.	G	A	545.14	PASS	AF=0.390244;AO=64;DP=164;FAO=64;FDP=164;FR=.;FRO=100;FSAF=33;FSAR=31;FSRF=49;FSRR=51;FWDB=0.0351796;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.8234;QD=13.2961;RBI=0.0713807;REFB=-0.000417167;REVB=0.0621096;RO=100;SAF=33;SAR=31;SRF=49;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0276733;STB=0.51562;STBP=0.751;TYPE=snp;VARB=0.00173721;OID=.;OPOS=24468704;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:164:164:100:100:64:64:0.390244:31:33:49:51:31:33:49:51
chr13	24468711	.	G	C	256.7	PASS	AF=0.238095;AO=40;DP=168;FAO=40;FDP=168;FR=.;FRO=128;FSAF=14;FSAR=26;FSRF=68;FSRR=60;FWDB=-0.00530203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.34;QD=6.11192;RBI=0.0161044;REFB=-0.00521552;REVB=-0.0152066;RO=128;SAF=14;SAR=26;SRF=68;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.229378;STB=0.639019;STBP=0.056;TYPE=snp;VARB=0.0243182;OID=.;OPOS=24468711;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:168:168:128:128:40:40:0.238095:26:14:68:60:26:14:68:60
chr13	24468763	.	T	C	140.61	PASS	AF=0.183824;AO=25;DP=136;FAO=25;FDP=136;FR=.;FRO=111;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=56;FSRR=55;FWDB=0.00717648;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.341;QD=4.13559;RBI=0.00718765;REFB=-0.00724171;REVB=0.000400606;RO=111;SAF=10;SAR=15;SRF=56;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133924;STB=0.58573;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=0.0252533;OID=.;OPOS=24468763;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:136:136:111:111:25:25:0.183824:15:10:56:55:15:10:56:55
chr13	24471039	.	T	G	252.92	PASS	AF=0.291667;AO=35;DP=120;FAO=35;FDP=120;FR=.;FRO=85;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=31;FSRR=54;FWDB=-0.00824766;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=254.765;QD=8.43049;RBI=0.0255065;REFB=0.000970958;REVB=-0.0241363;RO=85;SAF=20;SAR=15;SRF=31;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.244761;STB=0.643278;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=-0.00300352;OID=.;OPOS=24471039;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:120:85:85:35:35:0.291667:15:20:31:54:15:20:31:54
chr13	24471048	.	C	T	286.77	PASS	AF=0.31405;AO=38;DP=121;FAO=38;FDP=121;FR=.;FRO=83;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=30;FSRR=53;FWDB=-0.0157698;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=192.079;QD=9.47985;RBI=0.0188691;REFB=-0.00542992;REVB=-0.0103614;RO=83;SAF=20;SAR=18;SRF=30;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.193272;STB=0.612012;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=0.00535295;OID=.;OPOS=24471048;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:121:121:83:83:38:38:0.31405:18:20:30:53:18:20:30:53
chr13	24876752	.	T	C	122.33	PASS	AF=0.451613;AO=14;DP=31;FAO=14;FDP=31;FR=.;FRO=17;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.00368929;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.667;QD=15.7842;RBI=0.0065165;REFB=-0.0421761;REVB=0.00537158;RO=17;SAF=12;SAR=2;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.453021;STB=0.767;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.0231043;OID=.;OPOS=24876752;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:17:17:14:14:0.451613:2:12:8:9:2:12:8:9
chr13	24890157	.	C	T	526.27	PASS	AF=0.509259;AO=54;DP=107;FAO=55;FDP=108;FR=.;FRO=53;FSAF=38;FSAR=17;FSRF=32;FSRR=21;FWDB=0.0118346;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.032;QD=19.4916;RBI=0.012031;REFB=-0.00887406;REVB=-0.0021649;RO=52;SAF=37;SAR=17;SRF=32;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0696708;STB=0.548198;STBP=0.328;TYPE=snp;VARB=0.0084826;OID=.;OPOS=24890157;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:108:52:53:54:55:0.509259:17:37:32:20:17:38:32:21
chr13	24890228	.	A	C	651.5	PASS	AF=0.60396;AO=61;DP=101;FAO=61;FDP=101;FR=.;FRO=40;FSAF=40;FSAR=21;FSRF=25;FSRR=15;FWDB=-0.00394125;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.713;QD=25.8022;RBI=0.0102589;REFB=-0.0154007;REVB=-0.00947162;RO=40;SAF=40;SAR=21;SRF=25;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0245471;STB=0.513365;STBP=0.768;TYPE=snp;VARB=0.00736193;OID=.;OPOS=24890228;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:101:40:40:61:61:0.60396:21:40:25:15:21:40:25:15
chr13	24895437	.	G	A	69.28	PASS	AF=0.888889;AO=8;DP=9;FAO=8;FDP=9;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00826112;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=273.127;QD=30.7904;RBI=0.0259825;REFB=-0.0336809;REVB=0.0246342;RO=1;SAF=6;SAR=2;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0679981;STB=0.538369;STBP=0.638;TYPE=snp;VARB=0.00454665;OID=.;OPOS=24895437;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:9:9:1:1:8:8:0.888889:2:6:1:0:2:6:1:0
chr13	24895559	.	A	G	72.25	PASS	AF=0.277778;AO=10;DP=35;FAO=10;FDP=36;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=-0.00516286;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.7824;QD=8.02793;RBI=0.00556189;REFB=-0.0196043;REVB=0.0020687;RO=25;SAF=6;SAR=4;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0474515;STB=0.545363;STBP=0.792;TYPE=snp;VARB=0.0305165;OID=.;OPOS=24895559;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:35:36:25:26:10:10:0.277778:4:6:14:11:4:6:14:12
chr13	24895684	.	A	G	870.84	PASS	AF=0.926471;AO=63;DP=68;FAO=63;FDP=68;FR=.;FRO=5;FSAF=34;FSAR=29;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=-0.013611;FXX=0.0144907;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.6239;QD=51.2256;RBI=0.0139914;REFB=0.0503394;REVB=0.0032404;RO=5;SAF=34;SAR=29;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0645421;STB=0.534236;STBP=0.06;TYPE=snp;VARB=-0.00375726;OID=.;OPOS=24895684;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:19:68:68:5:5:63:63:0.926471:29:34:5:0:29:34:5:0
chr13	25000617	.	C	G	276.34	PASS	AF=0.442857;AO=31;DP=70;FAO=31;FDP=70;FR=.;FRO=39;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=22;FSRR=17;FWDB=0.00475424;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.294;QD=15.7907;RBI=0.0176995;REFB=0.0136261;REVB=-0.0170491;RO=39;SAF=20;SAR=11;SRF=22;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0847769;STB=0.547914;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=-0.0148669;OID=.;OPOS=25000617;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:39:39:31:31:0.442857:11:20:22:17:11:20:22:17
chr13	25008588	.	A	G	1342.18	PASS	AF=1;AO=86;DP=87;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0178021;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.9956;QD=62.4268;RBI=0.0262076;REFB=0;REVB=0.0192334;RO=0;SAF=49;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.88564e-05;OID=.;OPOS=25008588;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:86:0:0:86:86:1:37:49:0:0:37:49:0:0
chr13	25008630	.	A	G	1512.26	PASS	AF=1;AO=100;DP=100;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00314369;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.977;QD=59.8916;RBI=0.016514;REFB=0;REVB=0.016212;RO=0;SAF=52;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.19274e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000187295;OID=.;OPOS=25008630;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:100:101:0:0:100:101:1:48:52:0:0:48:53:0:0
chr13	25008903	.	G	T	256.71	PASS	AF=0.913043;AO=21;DP=23;FAO=21;FDP=23;FR=.;FRO=2;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0736772;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.128;QD=44.6449;RBI=0.0743055;REFB=-0.204648;REVB=0.00964251;RO=2;SAF=8;SAR=13;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0658702;STB=0.535681;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.00557922;OID=.;OPOS=25008903;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:23:23:2:2:21:21:0.913043:13:8:0:2:13:8:0:2
chr13	25009099	.	A	C	555.82	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0248294;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.5291;QD=60.0887;RBI=0.0492152;REFB=0;REVB=-0.0424928;RO=0;SAF=17;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.71161e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000666442;OID=.;OPOS=25009099;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:20:17:0:0:20:17:0:0
chr13	25009297	.	G	T	189.19	PASS	AF=0.415094;AO=22;DP=52;FAO=22;FDP=53;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.00878037;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=64.1717;QD=14.2781;RBI=0.0608106;REFB=0.0060629;REVB=0.0601734;RO=30;SAF=10;SAR=12;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0123128;STB=0.517226;STBP=0.848;TYPE=snp;VARB=-0.0107915;OID=.;OPOS=25009297;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:53:30:31:22:22:0.415094:12:10:14:16:12:10:15:16
chr13	25009441	.	C	G	475.53	PASS	AF=0.474747;AO=47;DP=99;FAO=47;FDP=99;FR=.;FRO=52;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=32;FWDB=0.00739751;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.227;QD=19.2133;RBI=0.00748227;REFB=-0.0140792;REVB=0.00112301;RO=51;SAF=27;SAR=20;SRF=20;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169735;STB=0.598934;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.0122978;OID=.;OPOS=25009441;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:51:52:47:47:0.474747:20:27:20:31:20:27:20:32
chr13	25009485	.	C	G	261.79	PASS	AF=0.47541;AO=29;DP=61;FAO=29;FDP=61;FR=.;FRO=32;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=-0.0825903;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.8457;QD=17.1668;RBI=0.0926959;REFB=0.00388563;REVB=0.0420876;RO=32;SAF=17;SAR=12;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139251;STB=0.578177;STBP=0.251;TYPE=snp;VARB=-0.005273;OID=.;OPOS=25009485;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:32:32:29:29:0.47541:12:17:14:18:12:17:14:18
chr13	25016008	.	C	T	223.25	PASS	AF=0.329412;AO=28;DP=85;FAO=28;FDP=85;FR=.;FRO=57;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=33;FSRR=24;FWDB=0.0054131;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=296.909;QD=10.5058;RBI=0.00754351;REFB=-0.00235082;REVB=-0.00525385;RO=57;SAF=10;SAR=18;SRF=33;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.254207;STB=0.648136;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.00444104;OID=.;OPOS=25016008;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:57:57:28:28:0.329412:18:10:33:24:18:10:33:24
chr13	25016092	.	C	T	105.48	PASS	AF=0.269231;AO=14;DP=52;FAO=14;FDP=52;FR=.;FRO=38;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=-0.00673138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.635;QD=8.11408;RBI=0.0108253;REFB=-0.0211077;REVB=-0.0084779;RO=38;SAF=6;SAR=8;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0543318;STB=0.533285;STBP=0.815;TYPE=snp;VARB=0.0553457;OID=.;OPOS=25016092;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:38:38:14:14:0.269231:8:6:18:20:8:6:18:20
chr13	25016762	.	G	A	63.61	PASS	AF=0.134021;AO=13;DP=97;FAO=13;FDP=97;FR=.;FRO=84;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=37;FSRR=47;FWDB=-0.00442792;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.691;QD=2.62314;RBI=0.00819964;REFB=-0.00294987;REVB=-0.00690127;RO=83;SAF=8;SAR=5;SRF=37;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.207856;STB=0.648762;STBP=0.263;TYPE=snp;VARB=0.0229674;OID=.;OPOS=25016762;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:97:97:83:84:13:13:0.134021:5:8:37:46:5:8:37:47
chr13	25020863	.	G	A	689.38	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0216467;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.996;QD=62.671;RBI=0.0217395;REFB=0;REVB=-0.00200714;RO=0;SAF=22;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.81797e-05;OID=.;OPOS=25020863;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:22:22:0:0:22:22:0:0
chr13	25021200	.	A	C	282.71	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0170157;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.863;QD=51.4011;RBI=0.0221084;REFB=0;REVB=0.0141155;RO=0;SAF=14;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000320453;OID=.;OPOS=25021200;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:22:0:0:21:22:1:7:14:0:0:8:14:0:0
chr13	25021211	.	C	T	300.42	PASS	AF=0.888889;AO=24;DP=27;FAO=24;FDP=27;FR=.;FRO=3;FSAF=18;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0392413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.408;QD=44.507;RBI=0.0399311;REFB=-0.0190258;REVB=0.00739003;RO=3;SAF=18;SAR=6;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106938;STB=0.558089;STBP=0.175;TYPE=snp;VARB=0.00359876;OID=.;OPOS=25021211;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:27:27:3:3:24:24:0.888889:6:18:1:2:6:18:1:2
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chr13	25027744	.	A	G	1062.06	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.010286;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.229;QD=59.8341;RBI=0.0300156;REFB=0;REVB=0.0281981;RO=0;SAF=37;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.12261e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00019158;OID=.;OPOS=25027744;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:34:37:0:0:34:37:0:0
chr13	25029218	.	C	T	372.05	PASS	AF=0.587302;AO=37;DP=64;FAO=37;FDP=63;FR=.;FRO=26;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=0.00951097;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.4568;QD=23.6223;RBI=0.0354149;REFB=-0.0184131;REVB=-0.0341139;RO=26;SAF=21;SAR=16;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0221856;STB=0.512188;STBP=0.832;TYPE=snp;VARB=0.0126412;OID=.;OPOS=25029218;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:63:26:26:37:37:0.587302:16:21:14:12:16:21:14:12
chr13	25029295	.	C	T	94.3	PASS	AF=0.333333;AO=12;DP=36;FAO=12;FDP=36;FR=.;FRO=24;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=-0.00447572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.8371;QD=10.4778;RBI=0.00981299;REFB=-0.00229097;REVB=-0.00873285;RO=24;SAF=3;SAR=9;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.452009;STB=0.769833;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.00837189;OID=.;OPOS=25029295;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:36:36:24:24:12:12:0.333333:9:3:16:8:9:3:16:8
chr13	25049676	.	G	A	435.21	PASS	AF=0.45283;AO=48;DP=106;FAO=48;FDP=106;FR=.;FRO=58;FSAF=13;FSAR=35;FSRF=37;FSRR=21;FWDB=-0.0151694;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.2431;QD=16.4229;RBI=0.0177836;REFB=0.0279703;REVB=0.0092815;RO=58;SAF=13;SAR=35;SRF=37;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.368226;STB=0.706127;STBP=0;TYPE=snp;VARB=-0.0228639;OID=.;OPOS=25049676;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:106:58:58:48:48:0.45283:35:13:37:21:35:13:37:21
chr13	25052261	.	C	T	321.31	PASS	AF=0.5;AO=34;DP=68;FAO=34;FDP=68;FR=.;FRO=34;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=0.00251043;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.213;QD=18.9004;RBI=0.042897;REFB=-0.0158576;REVB=-0.0428235;RO=34;SAF=17;SAR=17;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0263904;STB=0.514697;STBP=0.832;TYPE=snp;VARB=0.011654;OID=.;OPOS=25052261;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:34:34:34:34:0.5:17:17:16:18:17:17:16:18
chr13	25075859	.	C	T	379.59	PASS	AF=0.43956;AO=40;DP=91;FAO=40;FDP=91;FR=.;FRO=51;FSAF=13;FSAR=27;FSRF=27;FSRR=24;FWDB=-0.0103606;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=202.59;QD=16.6854;RBI=0.0189407;REFB=-0.00799299;REVB=0.0158558;RO=51;SAF=13;SAR=27;SRF=27;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.212237;STB=0.61956;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.00885583;OID=.;OPOS=25075859;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:51:51:40:40:0.43956:27:13:27:24:27:13:27:24
chr13	25272870	.	C	T	475.04	PASS	AF=0.476636;AO=51;DP=107;FAO=51;FDP=107;FR=.;FRO=56;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=28;FSRR=28;FWDB=0.0473156;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2554;QD=17.7585;RBI=0.0603239;REFB=0.0110181;REVB=-0.0374193;RO=56;SAF=29;SAR=22;SRF=28;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0651946;STB=0.536228;STBP=0.44;TYPE=snp;VARB=-0.0125371;OID=.;OPOS=25272870;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:107:56:56:51:51:0.476636:22:29:28:28:22:29:28:28
chr13	25277795	.	A	G	46.36	PASS	AF=0.368421;AO=7;DP=19;FAO=7;FDP=19;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=-0.0128383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.075;QD=9.76019;RBI=0.0181048;REFB=-0.0221458;REVB=-0.0127657;RO=12;SAF=3;SAR=4;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0125019;STB=0.50767;STBP=0.993;TYPE=snp;VARB=0.03426;OID=.;OPOS=25277795;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:19:19:12:12:7:7:0.368421:4:3:5:7:4:3:5:7
chr13	25356053	.	T	C	249.99	PASS	AF=0.322917;AO=30;DP=95;FAO=31;FDP=96;FR=.;FRO=65;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=27;FSRR=38;FWDB=0.0118422;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=88.3316;QD=10.4162;RBI=0.0176148;REFB=-0.00104489;REVB=0.01304;RO=65;SAF=15;SAR=15;SRF=27;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0990773;STB=0.546529;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=0.00237172;OID=.;OPOS=25356053;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:96:65:65:30:31:0.322917:15:15:27:38:16:15:27:38
chr13	25367324	.	TC	AT	153.92	PASS	AF=0.358491;AO=19;DP=53;FAO=19;FDP=53;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=22;FSRR=12;FWDB=-0.0322519;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=102.642;QD=11.6168;RBI=0.0412075;REFB=-0.0147134;REVB=-0.0256491;RO=33;SAF=10;SAR=9;SRF=22;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155521;STB=0.578233;STBP=0.433;TYPE=mnp;VARB=0.0299846;OID=.;OPOS=25367324;OREF=TC;OALT=AT;OMAPALT=AT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:33:34:19:19:0.358491:9:10:22:11:9:10:22:12
chr13	25419176	.	A	G	759.28	PASS	AF=0.964912;AO=55;DP=57;FAO=55;FDP=57;FR=.;FRO=2;FSAF=28;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.02178;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.4054;QD=53.283;RBI=0.0224747;REFB=-0.187961;REVB=-0.00554483;RO=2;SAF=28;SAR=27;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.033641;STB=0.517851;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=0.0033977;OID=.;OPOS=25419176;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:57:57:2:2:55:55:0.964912:27:28:0:2:27:28:0:2
chr13	25424583	.	T	C	226.99	PASS	AF=0.448276;AO=26;DP=58;FAO=26;FDP=58;FR=.;FRO=32;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=0.0032783;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.126;QD=15.6542;RBI=0.00573781;REFB=-0.00431197;REVB=0.00470906;RO=32;SAF=17;SAR=9;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214997;STB=0.621856;STBP=0.109;TYPE=snp;VARB=0.00660823;OID=.;OPOS=25424583;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:32:32:26:26:0.448276:9:17:14:18:9:17:14:18
chr13	25428002	.	C	A	134.23	PASS	AF=0.454545;AO=15;DP=33;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=0.00256824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.4906;QD=16.2701;RBI=0.0128939;REFB=0.0223902;REVB=-0.0126356;RO=18;SAF=6;SAR=9;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148075;STB=0.585251;STBP=0.407;TYPE=snp;VARB=-0.0351394;OID=.;OPOS=25428002;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:18:18:15:15:0.454545:9:6:10:8:9:6:10:8
chr13	25453420	.	A	G	322.86	PASS	AF=0.692308;AO=26;DP=39;FAO=27;FDP=39;FR=.,HEALED;FRO=11;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.0102733;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.52;QD=33.1141;RBI=0.0138498;REFB=-0.0646926;REVB=-0.00928856;RO=8;SAF=13;SAR=13;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.544714;STBP=0.399;TYPE=snp;VARB=0.0176748;OID=.;OPOS=25453420;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:39:39:8:11:26:27:0.692308:13:13:4:4:13:14:4:7
chr13	25460428	.	A	G	708.81	PASS	AF=0.980769;AO=44;DP=52;FAO=51;FDP=52;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=33;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00643449;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.894;QD=54.5239;RBI=0.0218587;REFB=0.0328673;REVB=-0.0208901;RO=0;SAF=32;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.513508;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=-0.00046847;OID=.;OPOS=25460428;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:52:52:0:1:44:51:0.980769:12:32:0:0:18:33:0:1
chr13	25480145	.	G	A	53.16	PASS	AF=0.275862;AO=8;DP=29;FAO=8;FDP=29;FR=.;FRO=21;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.0290455;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.055;QD=7.33173;RBI=0.0392855;REFB=-0.00184779;REVB=0.026452;RO=21;SAF=4;SAR=4;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0273308;STB=0.517198;STBP=0.934;TYPE=snp;VARB=0.0109013;OID=.;OPOS=25480145;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:29:29:21:21:8:8:0.275862:4:4:11:10:4:4:11:10
chr13	25487096	.	T	C	185.6	PASS	AF=0.407407;AO=22;DP=54;FAO=22;FDP=54;FR=.;FRO=32;FSAF=1;FSAR=21;FSRF=12;FSRR=20;FWDB=0.0305851;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.668;QD=13.7477;RBI=0.0306476;REFB=-0.00475782;REVB=-0.00195518;RO=32;SAF=1;SAR=21;SRF=12;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.613369;STB=0.868962;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.00645172;OID=.;OPOS=25487096;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:32:32:22:22:0.407407:21:1:12:20:21:1:12:20
chr13	25487103	.	T	A	176.65	PASS	AF=0.38;AO=19;DP=50;FAO=19;FDP=50;FR=.;FRO=31;FSAF=1;FSAR=18;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=-0.0056774;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.782;QD=14.1319;RBI=0.0113702;REFB=0.00743533;REVB=-0.0098513;RO=31;SAF=1;SAR=18;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.596841;STB=0.862952;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=-0.0114621;OID=.;OPOS=25487103;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:31:31:19:19:0.38:18:1:12:19:18:1:12:19
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chr13	25670907	.	C	A	71.7	PASS	AF=0.118056;AO=17;DP=144;FAO=17;FDP=144;FR=.;FRO=127;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=58;FSRR=69;FWDB=0.00011814;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=300.517;QD=1.99163;RBI=0.00168112;REFB=0.000450419;REVB=0.00167696;RO=127;SAF=9;SAR=8;SRF=58;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0893833;STB=0.563799;STBP=0.616;TYPE=snp;VARB=-0.00374024;OID=.;OPOS=25670907;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:71:144:144:127:127:17:17:0.118056:8:9:58:69:8:9:58:69
chr13	25670919	.	A	G	63.85	PASS	AF=0.108844;AO=16;DP=147;FAO=16;FDP=147;FR=.;FRO=131;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=58;FSRR=73;FWDB=0.0184224;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.105;QD=1.73742;RBI=0.0185249;REFB=0.00024481;REVB=0.001946;RO=130;SAF=8;SAR=8;SRF=58;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0656105;STB=0.550957;STBP=0.675;TYPE=snp;VARB=-0.001745;OID=.;OPOS=25670919;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:147:147:130:131:16:16:0.108844:8:8:58:72:8:8:58:73
chr13	25670953	.	G	A	47.86	PASS	AF=0.0970149;AO=13;DP=134;FAO=13;FDP=134;FR=.;FRO=121;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=51;FSRR=70;FWDB=-0.0184035;FXX=0.00740686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.1731;QD=1.42852;RBI=0.0188773;REFB=-0.00453551;REVB=-0.00420295;RO=119;SAF=6;SAR=7;SRF=50;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0497096;STB=0.53653;STBP=0.8;TYPE=snp;VARB=0.0531794;OID=.;OPOS=25670953;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:134:134:119:121:13:13:0.0970149:7:6:50:69:7:6:51:70
chr13	25670955	.	C	T	53.82	PASS	AF=0.103704;AO=13;DP=135;FAO=14;FDP=135;FR=.;FRO=121;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=51;FSRR=70;FWDB=-0.0173437;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.8703;QD=1.59479;RBI=0.0312801;REFB=0.00365599;REVB=-0.0260315;RO=120;SAF=6;SAR=7;SRF=51;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0437811;STB=0.506484;STBP=0.972;TYPE=snp;VARB=-0.0458907;OID=.;OPOS=25670955;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:135:135:120:121:13:14:0.103704:7:6:51:69:8:6:51:70
chr13	25671027	.	A	G	32.8	PASS	AF=0.1;AO=5;DP=66;FAO=6;FDP=60;FR=.,HEALED;FRO=52;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=17;FSRR=35;FWDB=-0.03075;FXX=0.0476115;HRUN=3;LEN=1;MLLD=145.492;QD=2.18642;RBI=0.0315521;REFB=0.00101677;REVB=-0.00706881;RO=48;SAF=2;SAR=3;SRF=12;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.193444;STB=0.506472;STBP=0.962;TYPE=snp;VARB=-0.00838996;OID=.;OPOS=25671027;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:66:60:48:52:5:6:0.1:3:2:12:36:4:2:17:35
chr13	25671062	.	A	G	61.41	PASS	AF=0.178571;AO=10;DP=56;FAO=10;FDP=56;FR=.;FRO=46;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=29;FWDB=0.0692223;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.3095;QD=4.38642;RBI=0.0765747;REFB=-0.00156652;REVB=-0.0327409;RO=46;SAF=2;SAR=8;SRF=17;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.251607;STB=0.672183;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=0.0099231;OID=.;OPOS=25671062;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:56:56:46:46:10:10:0.178571:8:2:17:29:8:2:17:29
chr13	25671080	.	A	G	36.88	PASS	AF=0.122807;AO=7;DP=57;FAO=7;FDP=57;FR=.;FRO=50;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=18;FSRR=32;FWDB=-0.0110909;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.642;QD=2.58813;RBI=0.0250095;REFB=-0.00201014;REVB=-0.0224158;RO=49;SAF=2;SAR=5;SRF=18;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108511;STB=0.57449;STBP=0.74;TYPE=snp;VARB=0.0154341;OID=.;OPOS=25671080;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:57:57:49:50:7:7:0.122807:5:2:18:31:5:2:18:32
chr13	25671097	.	A	AT	30.83	PASS	AF=0.111111;AO=6;DP=54;FAO=6;FDP=54;FR=.;FRO=48;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=22;FSRR=26;FWDB=-0.000244226;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=147.671;QD=2.28334;RBI=0.0386562;REFB=-0.00455563;REVB=-0.0386554;RO=47;SAF=1;SAR=5;SRF=22;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.371937;STB=0.786633;STBP=0.191;TYPE=ins;VARB=0.0203944;OID=.;OPOS=25671098;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.111111:6:54:6:54:48:1:5:22:26:30:47:1:5:22:25
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chr13	25671210	.	C	T	64.88	PASS	AF=0.139785;AO=13;DP=93;FAO=13;FDP=93;FR=.;FRO=80;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=39;FSRR=41;FWDB=-0.0121811;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.682;QD=2.79042;RBI=0.0122547;REFB=0.00562429;REVB=0.00134135;RO=80;SAF=6;SAR=7;SRF=39;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0322573;STB=0.522354;STBP=0.846;TYPE=snp;VARB=-0.0337162;OID=.;OPOS=25671210;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:93:93:80:80:13:13:0.139785:7:6:39:41:7:6:39:41
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chr13	25671292	.	C	T	421.3	PASS	AF=0.248;AO=62;DP=250;FAO=62;FDP=250;FR=.;FRO=188;FSAF=33;FSAR=29;FSRF=88;FSRR=100;FWDB=-0.0135323;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.843;QD=6.74076;RBI=0.0682628;REFB=-0.0124054;REVB=-0.0669081;RO=186;SAF=33;SAR=29;SRF=86;SRR=100;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.08756;STB=0.548143;STBP=0.378;TYPE=snp;VARB=0.0514236;OID=.;OPOS=25671292;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:250:250:186:188:62:62:0.248:29:33:86:100:29:33:88:100
chr13	25671310	.	TTATGA	T	212.02	PASS	AF=0.236;AO=57;DP=252;FAO=59;FDP=250;FR=.;FRO=191;FSAF=33;FSAR=26;FSRF=90;FSRR=101;FWDB=-0.00185065;FXX=0.00793619;HRUN=2;LEN=5;MLLD=330.146;QD=3.39233;RBI=0.00198739;REFB=-0.00950008;REVB=-0.000724435;RO=187;SAF=32;SAR=25;SRF=88;SRR=99;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114954;STB=0.567172;STBP=0.252;TYPE=del;VARB=0.0275899;OID=.;OPOS=25671311;OREF=TATGA;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.236:57:252:59:250:191:33:26:90:101:99:187:32:25:88:99
chr13	25671320	.	A	G	370.09	PASS	AF=0.228137;AO=59;DP=262;FAO=60;FDP=263;FR=.;FRO=203;FSAF=33;FSAR=27;FSRF=99;FSRR=104;FWDB=-0.00754868;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.3084;QD=5.62878;RBI=0.0755908;REFB=-0.0239493;REVB=-0.075213;RO=201;SAF=33;SAR=26;SRF=99;SRR=102;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0851735;STB=0.548101;STBP=0.368;TYPE=snp;VARB=0.0859999;OID=.;OPOS=25671320;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:262:263:201:203:59:60:0.228137:26:33:99:102:27:33:99:104
chr13	25671332	.	CA	C	168.32	PASS	AF=0.212687;AO=57;DP=272;FAO=57;FDP=268;FR=.;FRO=211;FSAF=33;FSAR=24;FSRF=102;FSRR=109;FWDB=0.0230187;FXX=0.0147053;HRUN=3;LEN=1;MLLD=22.3852;QD=2.5122;RBI=0.0277766;REFB=0.0204878;REVB=0.015546;RO=201;SAF=33;SAR=24;SRF=97;SRR=104;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123179;STB=0.575278;STBP=0.197;TYPE=del;VARB=-0.0602879;OID=.;OPOS=25671333;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.212687:57:272:57:268:211:33:24:102:109:99:201:33:24:97:104
chr13	25671369	.	G	T	332.39	PASS	AF=0.211111;AO=56;DP=269;FAO=57;FDP=270;FR=.;FRO=213;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=99;FSRR=114;FWDB=-0.0156591;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.7124;QD=4.92433;RBI=0.0156667;REFB=-0.00159024;REVB=0.000487997;RO=211;SAF=31;SAR=25;SRF=99;SRR=112;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108069;STB=0.575915;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=0.00604224;OID=.;OPOS=25671369;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:269:270:211:213:56:57:0.211111:25:31:99:112:25:32:99:114
chr13	25671398	.	C	T	215.91	PASS	AF=0.181818;AO=40;DP=217;FAO=40;FDP=220;FR=.;FRO=180;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=84;FSRR=96;FWDB=-0.00781039;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.027;QD=3.92557;RBI=0.00917082;REFB=-0.00166663;REVB=0.00480643;RO=175;SAF=19;SAR=21;SRF=83;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000921674;STB=0.506837;STBP=0.919;TYPE=snp;VARB=0.00716478;OID=.;OPOS=25671398;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:217:220:175:180:40:40:0.181818:21:19:83:92:21:19:84:96
chr13	25671429	.	G	T	85.45	PASS	AF=0.127517;AO=19;DP=150;FAO=19;FDP=149;FR=.;FRO=130;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=52;FSRR=78;FWDB=-0.00545932;FXX=0.00666622;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.951;QD=2.29388;RBI=0.00938371;REFB=-0.00283877;REVB=-0.00763216;RO=130;SAF=9;SAR=10;SRF=53;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0834836;STB=0.564841;STBP=0.552;TYPE=snp;VARB=0.0159791;OID=.;OPOS=25671429;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:150:149:130:130:19:19:0.127517:10:9:53:77:10:9:52:78
chr13	25671667	.	A	T	42.36	PASS	AF=0.121622;AO=9;DP=74;FAO=9;FDP=74;FR=.;FRO=65;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=32;FSRR=33;FWDB=-0.0420866;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=279.288;QD=2.28987;RBI=0.042184;REFB=-0.00192407;REVB=-0.00286458;RO=65;SAF=5;SAR=4;SRF=32;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0759284;STB=0.555432;STBP=0.793;TYPE=snp;VARB=0.0159576;OID=.;OPOS=25671667;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:42:74:74:65:65:9:9:0.121622:4:5:32:33:4:5:32:33
chr13	25671672	.	A	G	36.71	PASS	AF=0.111111;AO=8;DP=74;FAO=8;FDP=72;FR=.;FRO=64;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=32;FSRR=32;FWDB=0.00920008;FXX=0.0399947;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.551;QD=2.03958;RBI=0.00947468;REFB=-0.00223315;REVB=0.00226452;RO=65;SAF=5;SAR=3;SRF=31;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173612;STB=0.611607;STBP=0.554;TYPE=snp;VARB=0.00846626;OID=.;OPOS=25671672;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:74:72:65:64:8:8:0.111111:3:5:31:34:3:5:32:32
chr13	25671679	.	T	C	36.12	PASS	AF=0.109589;AO=8;DP=73;FAO=8;FDP=73;FR=.;FRO=65;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=32;FSRR=33;FWDB=-0.00975484;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.99;QD=1.97939;RBI=0.0173715;REFB=-0.00185315;REVB=0.014374;RO=64;SAF=5;SAR=3;SRF=32;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1479;STB=0.61826;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.0198496;OID=.;OPOS=25671679;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:73:73:64:65:8:8:0.109589:3:5:32:32:3:5:32:33
chr13	25671688	.	G	C	33.4	PASS	AF=0.0987654;AO=8;DP=81;FAO=8;FDP=81;FR=.;FRO=73;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=39;FSRR=34;FWDB=-0.0440327;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.139;QD=1.64914;RBI=0.0441055;REFB=-0.000230614;REVB=0.00253395;RO=73;SAF=5;SAR=3;SRF=39;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106534;STB=0.583385;STBP=0.666;TYPE=snp;VARB=0.00204985;OID=.;OPOS=25671688;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:81:81:73:73:8:8:0.0987654:3:5:39:34:3:5:39:34
chr13	25671699	.	GT	CC	32.84	PASS	AF=0.0963855;AO=7;DP=82;FAO=8;FDP=83;FR=.;FRO=75;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=38;FSRR=37;FWDB=-0.0034677;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=219.338;QD=1.58278;RBI=0.00541813;REFB=-0.00239797;REVB=0.00416308;RO=75;SAF=5;SAR=2;SRF=38;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.233642;STB=0.607631;STBP=0.563;TYPE=mnp;VARB=0.0213709;OID=.;OPOS=25671699;OREF=GT;OALT=CC;OMAPALT=CC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:32:82:83:75:75:7:8:0.0963855:2:5:38:37:3:5:38:37
chr13	25802676	.	A	G	181.17	PASS	AF=0.359375;AO=23;DP=64;FAO=23;FDP=64;FR=.;FRO=41;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=25;FWDB=0.018148;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.083;QD=11.3228;RBI=0.0216411;REFB=-0.00427211;REVB=0.0117893;RO=40;SAF=14;SAR=9;SRF=16;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.226616;STB=0.637952;STBP=0.116;TYPE=snp;VARB=0.00705186;OID=.;OPOS=25802676;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:40:41:23:23:0.359375:9:14:16:24:9:14:16:25
chr13	25825889	.	T	C	1435.14	PASS	AF=1;AO=90;DP=90;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00611041;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.5326;QD=63.083;RBI=0.00722547;REFB=0;REVB=-0.00385621;RO=0;SAF=43;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.16558e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.24611e-05;OID=.;OPOS=25825889;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:90:91:0:0:90:91:1:47:43:0:0:47:44:0:0
chr13	25831888	.	T	C	1281.62	PASS	AF=0.945055;AO=86;DP=91;FAO=86;FDP=91;FR=.;FRO=5;FSAF=49;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.00407707;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.054;QD=56.3349;RBI=0.0177732;REFB=-0.134743;REVB=-0.0172992;RO=3;SAF=49;SAR=37;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0368712;STB=0.531638;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.00528426;OID=.;OPOS=25831888;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:91:91:3:5:86:86:0.945055:37:49:0:3:37:49:0:5
chr13	25876011	.	G	A	475.49	PASS	AF=0.436975;AO=52;DP=124;FAO=52;FDP=119;FR=.;FRO=67;FSAF=20;FSAR=32;FSRF=30;FSRR=37;FWDB=0.0467586;FXX=0.0403193;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.017;QD=15.9827;RBI=0.0468203;REFB=0.00332548;REVB=-0.00240233;RO=71;SAF=20;SAR=32;SRF=34;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0995403;STB=0.536898;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=-0.00337103;OID=.;OPOS=25876011;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:124:119:71:67:52:52:0.436975:32:20:34:37:32:20:30:37
chr13	26091358	.	G	A	192.44	PASS	AF=0.375;AO=16;DP=47;FAO=18;FDP=48;FR=.,HEALED;FRO=27;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=-0.0206711;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.5172;QD=16.0368;RBI=0.0283381;REFB=-0.0200006;REVB=-0.0193844;RO=26;SAF=7;SAR=9;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0574909;STB=0.522588;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=0.00716071;OID=.;OPOS=26091358;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:48:26:27:16:18:0.375:9:7:10:16:10:8:11:16
chr13	26273385	.	G	C	920.07	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0212729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.6685;QD=58.4174;RBI=0.0484228;REFB=0;REVB=-0.0434997;RO=0;SAF=33;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00022734;OID=.;OPOS=26273385;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:63:0:0:62:63:1:29:33:0:0:30:33:0:0
chr13	26518714	.	A	T	75.62	PASS	AF=0.384615;AO=10;DP=26;FAO=10;FDP=26;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.00284439;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.292;QD=11.6341;RBI=0.00343145;REFB=-0.00200178;REVB=0.00191946;RO=16;SAF=5;SAR=5;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00426667;OID=.;OPOS=26518714;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:26:26:16:16:10:10:0.384615:5:5:8:8:5:5:8:8
chr13	26518724	.	A	G	75.61	PASS	AF=0.384615;AO=10;DP=26;FAO=10;FDP=26;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.0102608;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.695;QD=11.6328;RBI=0.0127373;REFB=-0.00106653;REVB=0.00754692;RO=16;SAF=5;SAR=5;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00133782;OID=.;OPOS=26518724;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:26:26:16:16:10:10:0.384615:5:5:8:8:5:5:8:8
chr13	26518853	.	G	T	91.24	PASS	AF=0.52381;AO=11;DP=21;FAO=11;FDP=21;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=-0.0174353;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.878;QD=17.3781;RBI=0.0186;REFB=-0.00465308;REVB=0.00647846;RO=10;SAF=5;SAR=6;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13078;STB=0.575089;STBP=0.545;TYPE=snp;VARB=0.00455655;OID=.;OPOS=26518853;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:21:21:10:10:11:11:0.52381:6:5:3:7:6:5:3:7
chr13	26620777	.	G	A	340.12	PASS	AF=0.430233;AO=37;DP=86;FAO=37;FDP=86;FR=.;FRO=49;FSAF=24;FSAR=13;FSRF=22;FSRR=27;FWDB=-0.0235195;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.9;QD=15.8197;RBI=0.0279255;REFB=-0.014183;REVB=-0.0150554;RO=49;SAF=24;SAR=13;SRF=22;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.205693;STB=0.616111;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=0.0296758;OID=.;OPOS=26620777;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:49:49:37:37:0.430233:13:24:22:27:13:24:22:27
chr13	26620924	.	G	A	264.16	PASS	AF=0.434783;AO=29;DP=68;FAO=30;FDP=69;FR=.;FRO=39;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=11;FSRR=28;FWDB=0.0110295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.107;QD=15.3135;RBI=0.0254813;REFB=-0.00690978;REVB=0.0229706;RO=39;SAF=11;SAR=18;SRF=11;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108059;STB=0.571383;STBP=0.348;TYPE=snp;VARB=0.00809901;OID=.;OPOS=26620924;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:69:39:39:29:30:0.434783:18:11:11:28:18:12:11:28
chr13	26620978	.	G	T	449.81	PASS	AF=0.581081;AO=43;DP=74;FAO=43;FDP=74;FR=.;FRO=31;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=10;FSRR=21;FWDB=0.0289982;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.2017;QD=24.314;RBI=0.0507162;REFB=-0.00444762;REVB=0.0416081;RO=31;SAF=21;SAR=22;SRF=10;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12736;STB=0.569684;STBP=0.17;TYPE=snp;VARB=0.00411843;OID=.;OPOS=26620978;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:31:31:43:43:0.581081:22:21:10:21:22:21:10:21
chr13	27250823	.	T	C	106.33	PASS	AF=0.361111;AO=13;DP=36;FAO=13;FDP=36;FR=.;FRO=23;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=0.0534588;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.105;QD=11.8142;RBI=0.058175;REFB=0.00778672;REVB=0.0229452;RO=23;SAF=3;SAR=10;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.207999;STB=0.624792;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=-0.00647059;OID=.;OPOS=27250823;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:23:23:13:13:0.361111:10:3:9:14:10:3:9:14
chr13	27257004	.	C	T	150.33	PASS	AF=0.346939;AO=17;DP=49;FAO=17;FDP=49;FR=.;FRO=32;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=-0.0160695;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.519;QD=12.2717;RBI=0.0185826;REFB=-0.00566313;REVB=-0.00933186;RO=32;SAF=6;SAR=11;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200905;STB=0.61844;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=0.0157454;OID=.;OPOS=27257004;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:32:32:17:17:0.346939:11:6:17:15:11:6:17:15
chr13	27976692	.	C	T	162.55	PASS	AF=0.515152;AO=17;DP=33;FAO=17;FDP=33;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.0290193;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.92;QD=19.7025;RBI=0.0295604;REFB=-0.00804199;REVB=0.00562985;RO=16;SAF=4;SAR=13;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.312303;STB=0.678488;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.00499994;OID=.;OPOS=27976692;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:16:16:17:17:0.515152:13:4:9:7:13:4:9:7
chr13	28009031	.	G	C	292.43	PASS	AF=0.4125;AO=33;DP=80;FAO=33;FDP=80;FR=.;FRO=47;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=31;FSRR=16;FWDB=-0.0105527;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.057;QD=14.6214;RBI=0.0131952;REFB=-0.0105804;REVB=-0.00792168;RO=47;SAF=20;SAR=13;SRF=31;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0589767;STB=0.533367;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=0.015134;OID=.;OPOS=28009031;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:47:47:33:33:0.4125:13:20:31:16:13:20:31:16
chr13	28009920	.	G	C	1181.27	PASS	AF=1;AO=77;DP=78;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0030014;FXX=0.0253133;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.225;QD=61.3649;RBI=0.0201596;REFB=0;REVB=0.0199349;RO=0;SAF=38;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5078e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.76713e-06;OID=.;OPOS=28009920;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:77:0:0:77:77:1:39:38:0:0:39:38:0:0
chr13	28143229	.	A	G	240.24	PASS	AF=0.5;AO=26;DP=52;FAO=26;FDP=52;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.0192157;FXX=0.0188644;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.9717;QD=18.4802;RBI=0.0205527;REFB=-0.0239093;REVB=-0.00729158;RO=26;SAF=11;SAR=15;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0348936;STB=0.519563;STBP=0.797;TYPE=snp;VARB=0.0234922;OID=.;OPOS=28143229;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:26:26:26:26:0.5:15:11:12:14:15:11:12:14
chr13	28240945	.	C	T	172.99	PASS	AF=0.486486;AO=17;DP=36;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=0.0136182;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.751;QD=18.7013;RBI=0.0140054;REFB=-0.0256985;REVB=-0.00327045;RO=19;SAF=7;SAR=10;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00883899;STB=0.512182;STBP=0.906;TYPE=snp;VARB=0.0215018;OID=.;OPOS=28240945;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:37:19:19:17:18:0.486486:10:7:8:11:10:8:8:11
chr13	28537242	.	A	C	195.67	PASS	AF=0.454545;AO=20;DP=44;FAO=20;FDP=44;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=0.00202122;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.413;QD=17.7878;RBI=0.0565078;REFB=-0.00228236;REVB=-0.0564716;RO=23;SAF=9;SAR=11;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188537;STB=0.594502;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=0.00387748;OID=.;OPOS=28537242;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:23:24:20:20:0.454545:11:9:15:8:11:9:15:9
chr13	28537317	.	G	A	178.31	PASS	AF=0.431818;AO=18;DP=44;FAO=19;FDP=44;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=0.00216964;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.249;QD=16.21;RBI=0.064149;REFB=-0.00480792;REVB=0.0641123;RO=26;SAF=6;SAR=12;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0575692;STB=0.553134;STBP=0.55;TYPE=snp;VARB=0.00634775;OID=.;OPOS=28537317;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:26:25:18:19:0.431818:12:6:10:16:13:6:10:15
chr13	28562605	.	T	G	166.09	PASS	AF=0.362069;AO=20;DP=57;FAO=21;FDP=58;FR=.;FRO=37;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=-0.0127667;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.409;QD=11.4542;RBI=0.0382713;REFB=-0.00795427;REVB=0.0360792;RO=37;SAF=12;SAR=8;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.185452;STB=0.588152;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=0.0125397;OID=.;OPOS=28562605;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:58:37:37:20:21:0.362069:8:12:16:21:9:12:16:21
chr13	28610183	.	A	G	554.71	PASS	AF=0.95;AO=38;DP=40;FAO=38;FDP=40;FR=.;FRO=2;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0159254;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.334;QD=55.4711;RBI=0.0169397;REFB=-0.0420567;REVB=-0.00577368;RO=0;SAF=19;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.524987;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=0.00050729;OID=.;OPOS=28610183;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:40:40:0:2:38:38:0.95:19:19:0:0:19:19:0:2
chr13	28624294	.	G	A	1989.66	PASS	AF=1;AO=128;DP=128;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0713366;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.006;QD=62.1768;RBI=0.0714361;REFB=0;REVB=0.00376919;RO=0;SAF=64;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.21824e-05;OID=.;OPOS=28624294;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:128:128:0:0:128:128:1:64:64:0:0:64:64:0:0
chr13	28636084	.	G	A	990.65	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00778213;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.998;QD=59.1432;RBI=0.014649;REFB=0;REVB=0.0124109;RO=0;SAF=29;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.51494e-06;OID=.;OPOS=28636084;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:38:29:0:0:38:29:0:0
chr13	28835527	.	T	C,TC	2286.46	PASS	AF=0.0342466,0.965753;AO=6,137;DP=150;FAO=5,141;FDP=146;FR=.;FRO=0;FSAF=5,80;FSAR=0,61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00390564,0.00638158;FXX=0.0201329;HRUN=4,0;LEN=1,1;MLLD=233.255,254.891;QD=62.6428;RBI=0.015159,0.0152095;REFB=0,0;REVB=-0.0146472,-0.0138059;RO=5;SAF=6,79;SAR=0,58;SRF=4;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.731761,-0.0153361;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,ins;VARB=-0.0208456,0.00070458;OID=.,.;OPOS=28835527,28835528;OREF=T,-;OALT=C,C;OMAPALT=C,TC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:6:150:146:5:0:6,137:5,141:0.0342466,0.965753:0,58:6,79:4:1:0,61:5,80:0:0
chr13	28883061	.	G	A	465.14	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0153924;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.26;QD=58.1421;RBI=0.0165702;REFB=0;REVB=0.00613542;RO=0;SAF=14;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.84414e-05;OID=.;OPOS=28883061;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:18:14:0:0:18:14:0:0
chr13	28970917	.	C	T	88.09	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0289823;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.7538;QD=39.153;RBI=0.0554497;REFB=0;REVB=0.0472725;RO=0;SAF=6;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0034605;OID=.;OPOS=28970917;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:3:6:0:0:3:6:0:0
chr13	29274977	.	T	TA	462.7	PASS	AF=1;AO=42;DP=47;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.137635;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=17.2091;QD=40.2344;RBI=0.16564;REFB=0;REVB=-0.0921581;RO=1;SAF=24;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.019159;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00569974;OID=.;OPOS=29274978;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:42:47:46:46:0:26:20:0:0:9:1:24:18:1:0
chr13	29275102	.	T	C	501.63	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0133615;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.54;QD=59.015;RBI=0.0518577;REFB=0;REVB=-0.0501068;RO=0;SAF=11;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000170885;OID=.;OPOS=29275102;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:23:11:0:0:23:11:0:0
chr13	29275129	.	C	T	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0159905;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.879;QD=56.1912;RBI=0.0162106;REFB=0;REVB=-0.00266229;RO=0;SAF=9;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.62669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.99909e-05;OID=.;OPOS=29275129;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:19:9:0:0:19:9:0:0
chr13	29898768	.	A	C	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0155546;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.153;QD=49.5991;RBI=0.0232195;REFB=0;REVB=-0.0172395;RO=0;SAF=6;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.56501e-05;OID=.;OPOS=29898768;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:12:6:0:0:12:6:0:0
chr13	30084173	.	G	A	1253.78	PASS	AF=0.987952;AO=81;DP=83;FAO=82;FDP=83;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0258811;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.826;QD=60.4232;RBI=0.0315398;REFB=-0.0416264;REVB=-0.0180258;RO=0;SAF=40;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17427e-08;STB=0.506023;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.000709729;OID=.;OPOS=30084173;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:83:83:0:1:81:82:0.987952:41:40:0:0:41:41:1:0
chr13	30087768	.	C	T	118.95	PASS	AF=0.411765;AO=14;DP=34;FAO=14;FDP=34;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=0.0326466;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.9445;QD=13.9941;RBI=0.0338414;REFB=-0.0169817;REVB=-0.00891279;RO=20;SAF=4;SAR=10;SRF=6;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0174753;STB=0.510189;STBP=0.958;TYPE=snp;VARB=0.0294882;OID=.;OPOS=30087768;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:20:20:14:14:0.411765:10:4:6:14:10:4:6:14
chr13	30087778	.	T	A	501.65	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0281652;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.897;QD=59.0178;RBI=0.0326176;REFB=0;REVB=0.0164508;RO=0;SAF=10;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.23066e-05;OID=.;OPOS=30087778;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:24:10:0:0:24:10:0:0
chr13	30091714	.	G	A	1324.66	PASS	AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0121066;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.608;QD=62.3371;RBI=0.0220508;REFB=0;REVB=0.0184301;RO=0;SAF=40;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.79153e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000101679;OID=.;OPOS=30091714;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:45:40:0:0:45:40:0:0
chr13	30091817	.	AAG	A,AA,AAC	2003.48	PASS	AF=0.961538,0,0.0384615;AO=22,28,82;DP=134;FAO=125,0,5;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=57,0,3;FSAR=68,0,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.156654,0.0784048,0.0506825;FXX=0.00763301;HRUN=5,1,1;LEN=2,1,1;MLLD=181.396,174.869,165.211;QD=61.6455;RBI=0.181657,0.124547,0.124955;REFB=0,0,0;REVB=-0.0919725,-0.0967713,-0.114215;RO=0;SAF=22,28,10;SAR=0,0,72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,-3.61632e-08;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,del,snp;VARB=0.000447812,0,0.041051;OID=.,.,.;OPOS=30091818,30091819,30091819;OREF=AG,G,G;OALT=-,-,C;OMAPALT=A,AA,AAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/3:0.961538,0,0.0384615:22,28,82:134:125,0,5:130:0:57,0,3:68,0,2:0:0:10:0:22,28,10:0,0,72:0:0
chr13	30107067	.	G	C	1310.27	PASS	AF=0.988506;AO=85;DP=86;FAO=86;FDP=87;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00223393;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.751;QD=60.2424;RBI=0.0064369;REFB=0.0100217;REVB=0.00603682;RO=0;SAF=25;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.47492e-08;STB=0.504064;STBP=0.61;TYPE=snp;VARB=-1.32528e-05;OID=.;OPOS=30107067;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:86:87:0:1:85:86:0.988506:60:25:0:0:61:25:0:1
chr13	30438728	.	G	A	88.21	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00193347;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.346;QD=39.2062;RBI=0.144955;REFB=0;REVB=-0.144942;RO=0;SAF=5;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00268695;OID=.;OPOS=30438728;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:4:5:0:0:4:5:0:0
chr13	31036681	.	A	G	755.99	PASS	AF=1;AO=51;DP=52;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00257594;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.261;QD=57.0558;RBI=0.0146461;REFB=0;REVB=-0.0144178;RO=0;SAF=30;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.13274e-05;OID=.;OPOS=31036681;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:53:0:0:51:53:1:21:30:0:0:22:31:0:0
chr13	31211922	.	A	G	100.75	PASS	AF=0.48;AO=11;DP=25;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.00111228;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.649;QD=16.1192;RBI=0.0255189;REFB=-0.0154467;REVB=0.0254947;RO=13;SAF=3;SAR=8;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195771;STB=0.627678;STBP=0.273;TYPE=snp;VARB=0.0127059;OID=.;OPOS=31211922;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:25:13:13:11:12:0.48:8:3:6:7:9:3:6:7
chr13	31211972	.	GC	G	35.73	PASS	AF=0.380952;AO=6;DP=20;FAO=8;FDP=21;FR=.;FRO=13;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.183898;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=14.6416;QD=6.80659;RBI=0.18545;REFB=-0.0178288;REVB=0.0239388;RO=13;SAF=0;SAR=6;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0.339286;SSSB=-0.745917;STB=0.810699;STBP=0.05;TYPE=del;VARB=0.00541008;OID=.;OPOS=31211973;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.380952:6:20:8:21:13:1:7:7:6:35:13:0:6:7:6
chr13	31287979	.	G	GTA	200.22	PASS	AF=0.478261;AO=20;DP=62;FAO=22;FDP=46;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=-0.0457042;FXX=0.17854;HRUN=1;LEN=2;MLLD=137.155;QD=17.4104;RBI=0.0457663;REFB=-0.04853;REVB=-0.00238162;RO=42;SAF=7;SAR=13;SRF=16;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0384173;STB=0.526292;STBP=0.743;TYPE=ins;VARB=0.0577665;OID=.;OPOS=31287980;OREF=-;OALT=TA;OMAPALT=GTA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.478261:20:62:22:46:24:9:13:11:13:99:42:7:13:16:26
chr13	31287981	.	G	A	78.65	PASS	AF=0.203125;AO=13;DP=64;FAO=13;FDP=64;FR=.;FRO=51;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=33;FWDB=-0.0131772;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.254;QD=4.91555;RBI=0.0141436;REFB=0.00213068;REVB=0.00513849;RO=51;SAF=4;SAR=9;SRF=18;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0633974;STB=0.540919;STBP=0.762;TYPE=snp;VARB=-0.00733424;OID=.;OPOS=31287981;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:64:64:51:51:13:13:0.203125:9:4:18:33:9:4:18:33
chr13	31480827	.	A	G	88.22	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0363008;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.081;QD=39.2067;RBI=0.0495543;REFB=0;REVB=-0.0337325;RO=0;SAF=7;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.79785e-05;OID=.;OPOS=31480827;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:2:7:0:0:2:7:0:0
chr13	31728703	.	T	C	206.1	PASS	AF=0.428571;AO=21;DP=49;FAO=21;FDP=49;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=9;FWDB=-0.0103174;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.495;QD=16.8247;RBI=0.0217183;REFB=-0.00628992;REVB=0.0191111;RO=28;SAF=12;SAR=9;SRF=19;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111726;STB=0.563578;STBP=0.485;TYPE=snp;VARB=0.0121092;OID=.;OPOS=31728703;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:28:28:21:21:0.428571:9:12:19:9:9:12:19:9
chr13	31821240	.	C	T	723.18	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0164726;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.0486;QD=56.7201;RBI=0.0411244;REFB=0;REVB=-0.0376811;RO=0;SAF=25;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94283e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000156998;OID=.;OPOS=31821240;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:26:25:0:0:26:25:0:0
chr13	31821992	.	T	C	941.68	PASS	AF=0.956522;AO=66;DP=69;FAO=66;FDP=69;FR=.;FRO=3;FSAF=30;FSAR=36;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0206392;FXX=0.0142837;HRUN=5;LEN=1;MLLD=146.742;QD=54.5898;RBI=0.0207275;REFB=-0.115621;REVB=0.00191027;RO=3;SAF=30;SAR=36;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0175199;STB=0.509281;STBP=0.445;TYPE=snp;VARB=0.000868127;OID=.;OPOS=31821992;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:69:69:3:3:66:66:0.956522:36:30:2:1:36:30:2:1
chr13	31891746	.	G	A	1036.5	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0164822;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.4445;QD=59.2286;RBI=0.0301211;REFB=0;REVB=0.0252115;RO=0;SAF=31;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000307269;OID=.;OPOS=31891746;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:70:0:0:69:70:1:38:31:0:0:39:31:0:0
chr13	32335880	.	G	A	300.32	PASS	AF=0.55102;AO=27;DP=49;FAO=27;FDP=49;FR=.;FRO=22;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=-0.00893977;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.3522;QD=24.516;RBI=0.0106619;REFB=-0.0202921;REVB=-0.00581012;RO=22;SAF=14;SAR=13;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124776;STB=0.569227;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=0.0122528;OID=.;OPOS=32335880;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:22:22:27:27:0.55102:13:14:8:14:13:14:8:14
chr13	32360547	.	A	G	413.02	PASS	AF=0.588235;AO=40;DP=68;FAO=40;FDP=68;FR=.;FRO=28;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=-0.00269076;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=302.758;QD=24.2955;RBI=0.00311297;REFB=-0.00373198;REVB=0.00156536;RO=28;SAF=15;SAR=25;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150538;STB=0.582665;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.00319214;OID=.;OPOS=32360547;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:28:28:40:40:0.588235:25:15:16:12:25:15:16:12
chr13	32376718	.	A	G	193.81	PASS	AF=0.425532;AO=20;DP=47;FAO=20;FDP=47;FR=.;FRO=27;FSAF=16;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.00928897;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.1282;QD=16.4945;RBI=0.0103758;REFB=-0.00422959;REVB=0.00462298;RO=27;SAF=16;SAR=4;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.427958;STB=0.747398;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0068054;OID=.;OPOS=32376718;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:27:27:20:20:0.425532:4:16:11:16:4:16:11:16
chr13	32660137	.	T	G	304.1	PASS	AF=0.52459;AO=32;DP=61;FAO=32;FDP=61;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=22;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=-0.00521304;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=335.996;QD=19.941;RBI=0.00521726;REFB=-0.00411077;REVB=0.000209747;RO=29;SAF=10;SAR=22;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.298093;STB=0.665865;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.00419999;OID=.;OPOS=32660137;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:29:29:32:32:0.52459:22:10:19:10:22:10:19:10
chr13	32676096	.	C	T	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00571105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=313.301;QD=56.1916;RBI=0.0191568;REFB=0;REVB=0.0182857;RO=0;SAF=14;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.31472e-05;OID=.;OPOS=32676096;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:14:14:0:0:14:14:0:0
chr13	32776153	.	T	C	1026.39	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00351035;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.293;QD=59.5007;RBI=0.0108007;REFB=0;REVB=0.0102143;RO=0;SAF=28;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.81374e-05;OID=.;OPOS=32776153;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:41:28:0:0:41:28:0:0
chr13	32776616	.	T	A	1399.89	PASS	AF=1;AO=88;DP=88;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0526687;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.043;QD=62.9163;RBI=0.0546912;REFB=0;REVB=0.0147355;RO=0;SAF=31;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.90485e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000207333;OID=.;OPOS=32776616;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:88:89:0:0:88:89:1:57:31:0:0:58:31:0:0
chr13	32832149	.	T	C	270.35	PASS	AF=0.351648;AO=32;DP=92;FAO=32;FDP=91;FR=.;FRO=59;FSAF=22;FSAR=10;FSRF=28;FSRR=31;FWDB=-0.00838512;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.183;QD=11.8834;RBI=0.0256821;REFB=-0.00240964;REVB=0.0242747;RO=58;SAF=22;SAR=10;SRF=28;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.237824;STB=0.643274;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.00375746;OID=.;OPOS=32832149;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:91:58:59:32:32:0.351648:10:22:28:30:10:22:28:31
chr13	32885654	.	T	C	293.35	PASS	AF=1;AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0533933;FXX=0.0434594;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.3634;QD=53.3364;RBI=0.0564934;REFB=0;REVB=0.0184569;RO=0;SAF=15;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.79751e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000827168;OID=.;OPOS=32885654;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:22:0:0:22:22:1:7:15:0:0:7:15:0:0
chr13	32911888	.	A	G	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.017761;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=165.967;QD=59.4352;RBI=0.0203776;REFB=0;REVB=0.00998965;RO=0;SAF=15;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.69618e-05;OID=.;OPOS=32911888;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:20:15:0:0:20:15:0:0
chr13	32913055	.	A	G	1306.32	PASS	AF=1;AO=82;DP=85;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0189011;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.1753;QD=62.2058;RBI=0.0198173;REFB=0;REVB=-0.005956;RO=0;SAF=38;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.11453e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000112259;OID=.;OPOS=32913055;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:84:0:0:82:84:1:44:38:0:0:44:40:0:0
chr13	32915005	.	G	C	769.47	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00503228;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.9501;QD=56.998;RBI=0.0198599;REFB=0;REVB=-0.0192118;RO=0;SAF=38;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.22487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000203537;OID=.;OPOS=32915005;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:16:38:0:0:16:38:0:0
chr13	32929232	.	A	G	490.62	PASS	AF=0.971429;AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0765482;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.5378;QD=56.0705;RBI=0.0842071;REFB=-0.0799748;REVB=0.0350886;RO=1;SAF=17;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0267062;STB=0.514277;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=0.00383327;OID=.;OPOS=32929232;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:35:35:1:1:34:34:0.971429:17:17:1:0:17:17:1:0
chr13	32929387	.	T	C	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.027369;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.016;QD=49.5992;RBI=0.0305325;REFB=0;REVB=-0.013534;RO=0;SAF=4;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000411309;OID=.;OPOS=32929387;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:14:4:0:0:14:4:0:0
chr13	32976608	.	A	G	2641.02	PASS	AF=0.994186;AO=170;DP=171;FAO=171;FDP=172;FR=.;FRO=1;FSAF=109;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0472925;FXX=0.00578001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.226;QD=61.4191;RBI=0.0474736;REFB=-0.0900562;REVB=0.00414354;RO=0;SAF=108;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504;STBP=0.26;TYPE=snp;VARB=0.00308353;OID=.;OPOS=32976608;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:171:172:0:1:170:171:0.994186:62:108:0:0:62:109:0:1
chr13	32976640	.	TTTG	T,TAAA	661.33	PASS	AF=1,0;AO=37,2;DP=39;FAO=43,0;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=15,0;FSAR=28,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0103207,-0.0150141;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=3,3;MLLD=200.204,168.7;QD=61.5193;RBI=0.0133986,0.0381411;REFB=0,0;REVB=-0.00854434,-0.0350617;RO=0;SAF=13,0;SAR=24,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,mnp;VARB=-0.00198974,0;OID=.,.;OPOS=32976641,32976641;OREF=TTG,TTG;OALT=-,AAA;OMAPALT=T,TAAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1,0:37,2:39:43,0:43:0:15,0:28,0:0:0:4:0:13,0:24,2:0:0
chr13	32976645	.	T	A	670.27	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0128177;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=317.922;QD=62.3509;RBI=0.0131853;REFB=0;REVB=-0.0030913;RO=0;SAF=15;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.18568e-05;OID=.;OPOS=32976645;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:28:15:0:0:28:15:0:0
chr13	32976648	.	G	C	654.77	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0440242;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.3829;QD=62.3587;RBI=0.0471689;REFB=0;REVB=0.0169344;RO=0;SAF=14;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000438373;OID=.;OPOS=32976648;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:28:14:0:0:28:14:0:0
chr13	32981142	.	C	T	501.2	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0294781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.8531;QD=58.9647;RBI=0.0304333;REFB=0;REVB=-0.007565;RO=0;SAF=18;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000187781;OID=.;OPOS=32981142;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:16:18:0:0:16:18:0:0
chr13	32981279	.	T	A	902.71	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0126498;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=296.215;QD=58.2396;RBI=0.0161143;REFB=0;REVB=-0.00998274;RO=0;SAF=28;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.46023e-06;OID=.;OPOS=32981279;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:62:0:0:61:62:1:33:28:0:0:33:29:0:0
chr13	33349538	.	T	C	402.06	PASS	AF=0.428571;AO=41;DP=97;FAO=42;FDP=98;FR=.;FRO=56;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=21;FSRR=35;FWDB=0.0868825;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.5539;QD=16.4105;RBI=0.0918227;REFB=0.0124855;REVB=0.0297128;RO=56;SAF=16;SAR=25;SRF=21;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0164787;STB=0.517758;STBP=0.789;TYPE=snp;VARB=-0.0149589;OID=.;OPOS=33349538;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:98:56:56:41:42:0.428571:25:16:21:35:25:17:21:35
chr13	33590851	.	T	C	958.38	PASS	AF=1;AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0270009;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.274;QD=58.9771;RBI=0.0593566;REFB=0;REVB=-0.0528598;RO=0;SAF=24;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.25588e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00032044;OID=.;OPOS=33590851;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:65:0:0:65:65:1:41:24:0:0:41:24:0:0
chr13	33634983	.	C	T	803.84	PASS	AF=0.535211;AO=76;DP=142;FAO=76;FDP=142;FR=.;FRO=66;FSAF=34;FSAR=42;FSRF=35;FSRR=31;FWDB=-0.0151775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.335;QD=22.6433;RBI=0.0155753;REFB=0.000193201;REVB=0.00349759;RO=65;SAF=34;SAR=42;SRF=34;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0639675;STB=0.538652;STBP=0.357;TYPE=snp;VARB=-0.000214553;OID=.;OPOS=33634983;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:142:142:65:66:76:76:0.535211:42:34:34:31:42:34:35:31
chr13	33635463	.	T	C	1977.98	PASS	AF=1;AO=124;DP=125;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0024572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.812;QD=61.812;RBI=0.0226667;REFB=0;REVB=0.0225331;RO=0;SAF=54;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.41352e-05;OID=.;OPOS=33635463;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:125:128:0:0:124:128:1:70:54:0:0:73:55:0:0
chr13	33635835	.	T	C	594.5	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0244378;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.02;QD=60.9739;RBI=0.0289564;REFB=0;REVB=0.0155328;RO=0;SAF=16;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.43889e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.7481e-05;OID=.;OPOS=33635835;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:23:16:0:0:23:16:0:0
chr13	33703656	.	T	C	560.8	PASS	AF=0.495726;AO=58;DP=117;FAO=58;FDP=117;FR=.;FRO=59;FSAF=34;FSAR=24;FSRF=31;FSRR=28;FWDB=0.00137129;FXX=0.00847386;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.755;QD=19.1726;RBI=0.0116449;REFB=-0.00951374;REVB=0.0115639;RO=58;SAF=34;SAR=24;SRF=30;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0635053;STB=0.531239;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.00966413;OID=.;OPOS=33703656;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:117:117:58:59:58:58:0.495726:24:34:30:28:24:34:31:28
chr13	33704290	.	G	A	445.34	PASS	AF=0.431034;AO=50;DP=116;FAO=50;FDP=116;FR=.;FRO=66;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=38;FSRR=28;FWDB=-0.000239252;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.1164;QD=15.3566;RBI=0.0187814;REFB=-0.00898295;REVB=0.0187799;RO=65;SAF=24;SAR=26;SRF=38;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105289;STB=0.554311;STBP=0.335;TYPE=snp;VARB=0.0121901;OID=.;OPOS=33704290;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:116:116:65:66:50:50:0.431034:26:24:38:27:26:24:38:28
chr13	33741692	.	A	G	517.29	PASS	AF=0.585366;AO=48;DP=82;FAO=48;FDP=82;FR=.;FRO=34;FSAF=27;FSAR=21;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=-0.00921321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.765;QD=25.2335;RBI=0.0102741;REFB=-0.0132259;REVB=0.0045469;RO=34;SAF=27;SAR=21;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13612;STB=0.574437;STBP=0.109;TYPE=snp;VARB=0.0083555;OID=.;OPOS=33741692;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:34:34:48:48:0.585366:21:27:13:21:21:27:13:21
chr13	34013847	.	G	C	596.25	PASS	AF=1;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000763512;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.4646;QD=61.1538;RBI=0.0176522;REFB=0;REVB=-0.0176356;RO=0;SAF=24;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000214597;OID=.;OPOS=34013847;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:39:0:0:39:39:1:15:24:0:0:15:24:0:0
chr13	35745239	.	G	A	743.99	PASS	AF=0.486667;AO=52;DP=148;FAO=73;FDP=150;FR=.;FRO=77;FSAF=32;FSAR=41;FSRF=39;FSRR=38;FWDB=0.0180847;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.14;QD=19.8398;RBI=0.0248134;REFB=-0.0153853;REVB=0.0169897;RO=77;SAF=12;SAR=40;SRF=39;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.325866;STB=0.535199;STBP=0.425;TYPE=snp;VARB=0.0135972;OID=.;OPOS=35745239;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:148:150:77:77:52:73:0.486667:40:12:39:38:41:32:39:38
chr13	36048509	.	TTAAA	T	256.51	PASS	AF=0.581818;AO=31;DP=57;FAO=32;FDP=55;FR=.;FRO=23;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=0.0557701;FXX=0.0350816;HRUN=3;LEN=4;MLLD=215.544;QD=18.6554;RBI=0.0559106;REFB=-0.0226973;REVB=-0.00396089;RO=21;SAF=15;SAR=16;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0406445;STB=0.503988;STBP=0.951;TYPE=del;VARB=0.0170141;OID=.;OPOS=36048510;OREF=TAAA;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.581818:31:57:32:55:23:15:17:11:12:99:21:15:16:9:12
chr13	36639771	.	A	C	467.86	PASS	AF=0.594595;AO=44;DP=74;FAO=44;FDP=74;FR=.;FRO=30;FSAF=17;FSAR=27;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=0.0172016;FXX=0.0133316;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.5171;QD=25.2896;RBI=0.0770191;REFB=-0.0302661;REVB=0.0750736;RO=30;SAF=17;SAR=27;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1359;STB=0.574434;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=0.0231569;OID=.;OPOS=36639771;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:30:30:44:44:0.594595:27:17:17:13:27:17:17:13
chr13	36939688	.	C	T	334.25	PASS	AF=0.384615;AO=40;DP=104;FAO=40;FDP=104;FR=.;FRO=64;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=31;FSRR=33;FWDB=-0.00480943;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.4466;QD=12.8559;RBI=0.0311018;REFB=0.00296533;REVB=-0.0307277;RO=64;SAF=21;SAR=19;SRF=31;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0439179;STB=0.524988;STBP=0.681;TYPE=snp;VARB=-0.00735353;OID=.;OPOS=36939688;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:104:64:64:40:40:0.384615:19:21:31:33:19:21:31:33
chr13	36939758	.	A	G	470.22	PASS	AF=0.40458;AO=53;DP=131;FAO=53;FDP=131;FR=.;FRO=78;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=37;FSRR=41;FWDB=-0.00147522;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.193;QD=14.3578;RBI=0.00580382;REFB=-0.00224993;REVB=-0.0056132;RO=78;SAF=22;SAR=31;SRF=37;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0636025;STB=0.535879;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.00426828;OID=.;OPOS=36939758;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:131:131:78:78:53:53:0.40458:31:22:37:41:31:22:37:41
chr13	37269835	.	G	A	1139.06	PASS	AF=0.987013;AO=76;DP=77;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0251189;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.724;QD=59.172;RBI=0.03444;REFB=-0.14404;REVB=0.0235617;RO=1;SAF=40;SAR=36;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.011684;STB=0.506171;STBP=0.489;TYPE=snp;VARB=0.00337249;OID=.;OPOS=37269835;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:77:77:1:1:76:76:0.987013:36:40:1:0:36:40:1:0
chr13	37271163	.	C	A	654.34	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0634975;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.9979;QD=62.3181;RBI=0.0741204;REFB=0;REVB=0.0382348;RO=0;SAF=18;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000315738;OID=.;OPOS=37271163;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:24:18:0:0:24:18:0:0
chr13	37271428	.	GCA	G	86.47	PASS	AF=1;AO=7;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0340595;FXX=0.27248;HRUN=1;LEN=2;MLLD=90.1963;QD=43.2367;RBI=0.0458866;REFB=0;REVB=0.0307494;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.000175252;OID=.;OPOS=37271429;OREF=CA;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:7:8:8:8:0:5:3:0:0:3:0:4:3:0:0
chr13	37372429	.	T	C	223.19	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186909;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.2882;QD=49.5981;RBI=0.0591432;REFB=0;REVB=0.0561121;RO=0;SAF=12;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00131338;OID=.;OPOS=37372429;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:6:12:0:0:6:12:0:0
chr13	37393676	.	CCG	C,CGG	203.04	PASS	AF=0.6,0;AO=15,6;DP=47;FAO=21,0;FDP=35;FR=.;FRO=14;FSAF=18,0;FSAR=3,0;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=0.220548,0.00029407;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=2,1;MLLD=23.5313,12.8921;QD=23.2049;RBI=0.282185,0.0679459;REFB=-0.159706,0.0194266;REVB=-0.176032,0.0679453;RO=19;SAF=11,6;SAR=4,0;SRF=17;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.228826,0.630987;STB=0.599893,0.5;STBP=0.306,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0989177,0;OID=.,.;OPOS=37393677,37393677;OREF=CG,C;OALT=-,G;OMAPALT=C,CGG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.6,0:15,6:47:21,0:35:14:18,0:3,0:10:4:94:19:11,6:4,0:17:2
chr13	37580139	.	G	A	1329.53	PASS	AF=1;AO=85;DP=87;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00392735;FXX=0.0229859;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.769;QD=62.5663;RBI=0.0135963;REFB=0;REVB=0.0130167;RO=0;SAF=34;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000127832;OID=.;OPOS=37580139;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:85:0:0:85:85:1:51:34:0:0:51:34:0:0
chr13	37583831	.	G	A	684.74	PASS	AF=0.9375;AO=45;DP=48;FAO=45;FDP=48;FR=.;FRO=3;FSAF=10;FSAR=35;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0823784;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.227;QD=57.0615;RBI=0.0828436;REFB=-0.136894;REVB=0.00876771;RO=1;SAF=10;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0446822;STB=0.565187;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.00514009;OID=.;OPOS=37583831;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:48:48:1:3:45:45:0.9375:35:10:1:0:35:10:3:0
chr13	37625601	.	T	C	261.75	PASS	AF=0.954545;AO=19;DP=22;FAO=21;FDP=22;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00123911;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=77.8244;QD=47.5914;RBI=0.0348237;REFB=0.0543929;REVB=0.0348016;RO=0;SAF=11;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.41338e-08;STB=0.529383;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=-0.000891465;OID=.;OPOS=37625601;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:22:22:0:1:19:21:0.954545:8:11:0:0:8:13:0:1
chr13	37679268	.	G	T	749.37	PASS	AF=0.964912;AO=55;DP=57;FAO=55;FDP=57;FR=.;FRO=2;FSAF=29;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00859454;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.0517;QD=52.5874;RBI=0.0186598;REFB=-0.0444669;REVB=0.0165627;RO=0;SAF=29;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.40922e-08;STB=0.518512;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=0.0015159;OID=.;OPOS=37679268;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:57:57:0:2:55:55:0.964912:26:29:0:0:26:29:0:2
chr13	37679535	.	G	C	1396.43	PASS	AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000233712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.211;QD=62.7609;RBI=0.00310156;REFB=0;REVB=0.00309274;RO=0;SAF=45;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.36714e-06;OID=.;OPOS=37679535;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:44:45:0:0:44:45:0:0
chr13	37679729	.	C	T	414.84	PASS	AF=1;AO=29;DP=30;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.101496;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.9293;QD=57.2187;RBI=0.101516;REFB=0;REVB=-0.00198843;RO=0;SAF=14;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00162873;OID=.;OPOS=37679729;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:29:0:0:29:29:1:15:14:0:0:15:14:0:0
chr13	37679776	.	G	A	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0107538;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.256;QD=50.4134;RBI=0.0163845;REFB=0;REVB=0.0123616;RO=0;SAF=9;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.65335e-06;OID=.;OPOS=37679776;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:10:9:0:0:10:9:0:0
chr13	38924083	.	A	T	2083.7	PASS	AF=1;AO=132;DP=132;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00765183;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.8066;QD=62.6676;RBI=0.00781671;REFB=0;REVB=0.00159702;RO=0;SAF=70;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.84852e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.2797e-05;OID=.;OPOS=38924083;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:132:133:0:0:132:133:1:62:70:0:0:62:71:0:0
chr13	38924263	.	T	C	2184.55	PASS	AF=0.992958;AO=139;DP=141;FAO=141;FDP=142;FR=.;FRO=1;FSAF=67;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00896382;FXX=0.00699252;HRUN=4;LEN=1;MLLD=50.345;QD=61.5365;RBI=0.0300326;REFB=-0.00201295;REVB=-0.0286637;RO=2;SAF=66;SAR=73;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0128464;STB=0.503355;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.00104142;OID=.;OPOS=38924263;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:141:142:2:1:139:141:0.992958:73:66:0:2:74:67:0:1
chr13	38932207	.	TAT	TTA,TTT	250.45	PASS	AF=0.72549,0;AO=13,21;DP=119;FAO=37,0;FDP=51;FR=.,HEALED;FRO=13;FSAF=15,0;FSAR=22,0;FSRF=12;FSRR=1;FWDB=0.000241,-0.00720453;FXX=0.27139;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=16.0858,150.583;QD=19.6427;RBI=0.024952,0.168145;REFB=-0.0244193,0.00304455;REVB=0.0249509,0.167991;RO=55;SAF=12,20;SAR=1,1;SRF=34;SRR=21;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.511786,0.6154;STB=0.632518,0.5;STBP=0.003,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0104024,0.277533;OID=.,.;OPOS=38932208,38932208;OREF=AT,A;OALT=TA,T;OMAPALT=TTA,TTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.72549,0:13,21:119:37,0:51:13:15,0:22,0:12:1:82:55:12,20:1,1:34:21
chr13	38932210	.	T	A	73.06	PASS	AF=0.120567;AO=17;DP=140;FAO=17;FDP=141;FR=.;FRO=124;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=94;FSRR=30;FWDB=-0.00304015;FXX=0.00704176;HRUN=9;LEN=1;MLLD=178.573;QD=2.0726;RBI=0.0511053;REFB=0.000385607;REVB=0.0510148;RO=117;SAF=5;SAR=12;SRF=94;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.588895;STB=0.849491;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=-0.0074735;OID=.;OPOS=38932210;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:140:141:117:124:17:17:0.120567:12:5:94:23:12:5:94:30
chr13	39262057	.	G	A	1636.1	PASS	AF=1;AO=108;DP=108;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0244473;FXX=0.00909008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.787;QD=60.0404;RBI=0.0257325;REFB=0;REVB=0.00803058;RO=0;SAF=44;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.72235e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.28887e-05;OID=.;OPOS=39262057;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:108:109:0:0:108:109:1:64:44:0:0:64:45:0:0
chr13	39263713	.	GT	G,GC	644.33	PASS	AF=0.0454545,0.954545;AO=12,28;DP=44;FAO=2,42;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=2,24;FSAR=0,18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0680423,-0.014956;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=45.9996,53.1255;QD=58.5757;RBI=0.0697134,0.034313;REFB=0,0;REVB=0.0151726,-0.030882;RO=0;SAF=12,13;SAR=0,15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0579107,0.0374092;OID=.,.;OPOS=39263714,39263714;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=G,GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0454545,0.954545:12,28:44:2,42:44:0:2,24:0,18:0:0:8:0:12,13:0,15:0:0
chr13	39264690	.	T	C	465.14	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00831043;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=249.766;QD=58.1421;RBI=0.0123944;REFB=0;REVB=-0.00919551;RO=0;SAF=24;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.10749e-06;OID=.;OPOS=39264690;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:8:24:0:0:8:24:0:0
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chr13	39540589	.	TC	T	743.01	PASS	AF=1;AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00676397;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=286.262;QD=57.1544;RBI=0.0369178;REFB=0;REVB=0.0362928;RO=0;SAF=18;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.19096e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=7.42001e-05;OID=.;OPOS=39540590;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:52:53:52:52:0:18:34:0:0:4:0:18:34:0:0
chr13	41331026	.	C	G	307.21	PASS	AF=0.43038;AO=34;DP=79;FAO=34;FDP=79;FR=.;FRO=45;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=25;FSRR=20;FWDB=0.0321207;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.0542;QD=15.5548;RBI=0.0344047;REFB=-0.00419397;REVB=0.0123264;RO=44;SAF=20;SAR=14;SRF=24;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0437463;STB=0.519073;STBP=0.803;TYPE=snp;VARB=0.00718876;OID=.;OPOS=41331026;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:44:45:34:34:0.43038:14:20:24:20:14:20:25:20
chr13	41382711	.	A	T	276.27	PASS	AF=0.568182;AO=25;DP=45;FAO=25;FDP=44;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=5;FSRR=14;FWDB=-0.00581854;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=319.902;QD=25.1152;RBI=0.0121475;REFB=0.00478806;REVB=-0.0106633;RO=20;SAF=11;SAR=14;SRF=6;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115497;STB=0.578887;STBP=0.271;TYPE=snp;VARB=-0.00420081;OID=.;OPOS=41382711;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:44:20:19:25:25:0.568182:14:11:6:14:14:11:5:14
chr13	41634954	.	G	A	769.51	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0104964;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.385;QD=57.0005;RBI=0.0433486;REFB=0;REVB=-0.0420586;RO=0;SAF=28;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.52846e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000101076;OID=.;OPOS=41634954;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:26:28:0:0:26:28:0:0
chr13	41705495	.	A	G	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00242741;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=301.711;QD=55.6561;RBI=0.0387218;REFB=0;REVB=0.0386457;RO=0;SAF=11;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000163962;OID=.;OPOS=41705495;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:16:11:0:0:16:11:0:0
chr13	41705649	.	AT	A	44.92	PASS	AF=0.428571;AO=8;DP=19;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=-0.138373;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=12.7771;QD=8.5567;RBI=0.138421;REFB=-0.0730202;REVB=0.00365866;RO=10;SAF=6;SAR=2;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0.320833;SSSB=0.0594079;STB=0.555438;STBP=0.7;TYPE=del;VARB=0.0642117;OID=.;OPOS=41705650;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.428571:8:19:9:21:12:6:3:9:3:44:10:6:2:7:3
chr13	41706800	.	A	G	351.46	PASS	AF=0.962963;AO=26;DP=28;FAO=26;FDP=27;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00705952;FXX=0.0357015;HRUN=2;LEN=1;MLLD=225.367;QD=52.0679;RBI=0.00852856;REFB=-0.0495413;REVB=0.00478534;RO=1;SAF=9;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0488217;STB=0.526295;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.00186297;OID=.;OPOS=41706800;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:28:27:1:1:26:26:0.962963:17:9:1:0:17:9:1:0
chr13	41767338	.	A	G	166.08	PASS	AF=0.360656;AO=20;DP=59;FAO=22;FDP=61;FR=.;FRO=39;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=0.0200877;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.051;QD=10.8902;RBI=0.0236114;REFB=-0.0127125;REVB=-0.012409;RO=38;SAF=11;SAR=9;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114441;STB=0.540947;STBP=0.623;TYPE=snp;VARB=0.0318382;OID=.;OPOS=41767338;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:61:38:39:20:22:0.360656:9:11:17:21:11:11:17:22
chr13	41767341	.	A	G	177.69	PASS	AF=0.37931;AO=22;DP=59;FAO=22;FDP=58;FR=.;FRO=36;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=0.000880135;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.156;QD=12.2547;RBI=0.00550602;REFB=-0.0108235;REVB=-0.00543522;RO=37;SAF=11;SAR=11;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.073233;STB=0.551678;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=0.0164188;OID=.;OPOS=41767341;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:58:37:36:22:22:0.37931:11:11:16:21:11:11:15:21
chr13	41834744	.	C	T	231.04	PASS	AF=0.373333;AO=29;DP=74;FAO=28;FDP=75;FR=.;FRO=47;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=25;FWDB=-0.0367938;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.5031;QD=12.3223;RBI=0.046172;REFB=0.00555267;REVB=0.0278938;RO=45;SAF=14;SAR=15;SRF=20;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0408735;STB=0.502391;STBP=0.975;TYPE=snp;VARB=-0.0135274;OID=.;OPOS=41834744;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:75:45:47:29:28:0.373333:15:14:20:25:15:13:22:25
chr13	41902939	.	T	C	976.4	PASS	AF=0.985294;AO=66;DP=67;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0255122;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.2007;QD=57.4354;RBI=0.0291174;REFB=0.0613394;REVB=-0.0140339;RO=1;SAF=41;SAR=25;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0185226;STB=0.509801;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=-0.000760716;OID=.;OPOS=41902939;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:67:68:1:1:66:67:0.985294:25:41:0:1:25:42:0:1
chr13	42044968	.	TTATAA	T,TTATAT	361.7	PASS	AF=0.364486,0.0747664;AO=37,6;DP=114;FAO=39,8;FDP=107;FR=.;FRO=60;FSAF=25,0;FSAR=14,8;FSRF=37;FSRR=23;FWDB=0.00831736,0.0674283;FXX=0.0446389;HRUN=2,2;LEN=5,1;MLLD=258.276,37.6493;QD=13.5215;RBI=0.0348997,0.0679628;REFB=-0.0124455,-0.0688528;REVB=0.0338942,0.00850704;RO=56;SAF=25,0;SAR=12,6;SRF=35;SRR=21;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0596755,-0.65546;STB=0.515887,0.998861;STBP=0.818,0;TYPE=del,snp;VARB=0.0162295,0.345849;OID=.,.;OPOS=42044969,42044973;OREF=TATAA,A;OALT=-,T;OMAPALT=T,TTATAT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.364486,0.0747664:37,6:114:39,8:107:60:25,0:14,8:37:23:99:56:25,0:12,6:35:21
chr13	42264380	.	C	T	239.58	PASS	AF=0.4;AO=28;DP=73;FAO=28;FDP=70;FR=.;FRO=42;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=27;FSRR=15;FWDB=-0.0348783;FXX=0.0410903;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.614;QD=13.6903;RBI=0.0351472;REFB=0.0068716;REVB=-0.00433983;RO=45;SAF=10;SAR=18;SRF=30;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.325227;STB=0.668557;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=-0.00856511;OID=.;OPOS=42264380;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:70:45:42:28:28:0.4:18:10:30:15:18:10:27:15
chr13	42385446	.	T	C	271.81	PASS	AF=0.517857;AO=29;DP=55;FAO=29;FDP=56;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=-0.0104353;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.787;QD=19.4148;RBI=0.017013;REFB=0.00558865;REVB=-0.0134368;RO=26;SAF=15;SAR=14;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112359;STB=0.570504;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=-0.00408052;OID=.;OPOS=42385446;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:56:26:27:29:29:0.517857:14:15:10:16:14:15:10:17
chr13	42772681	.	C	T	1362.57	PASS	AF=0.988764;AO=88;DP=89;FAO=88;FDP=89;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00874855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.012;QD=61.2389;RBI=0.0208992;REFB=-0.0736525;REVB=0.01898;RO=0;SAF=47;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505262;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000193095;OID=.;OPOS=42772681;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:89:89:0:1:88:88:0.988764:41:47:0:0:41:47:1:0
chr13	42803341	.	T	C	2273.54	PASS	AF=1;AO=150;DP=151;FAO=151;FDP=151;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00213392;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.5249;QD=60.2263;RBI=0.00397034;REFB=-0.0770631;REVB=0.00334813;RO=0;SAF=58;SAR=92;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000868692;OID=.;OPOS=42803341;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:151:151:0:0:150:151:1:92:58:0:0:92:59:0:0
chr13	43462422	.	A	T	45.35	PASS	AF=0.318182;AO=7;DP=22;FAO=7;FDP=22;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.00596374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.096;QD=8.24625;RBI=0.0111312;REFB=-0.0119224;REVB=0.00939875;RO=15;SAF=5;SAR=2;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.342331;STB=0.713674;STBP=0.21;TYPE=snp;VARB=0.0158755;OID=.;OPOS=43462422;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:22:22:15:15:7:7:0.318182:2:5:6:9:2:5:6:9
chr13	43462434	.	T	TTCAGG	162.41	PASS	AF=0.666667;AO=16;DP=26;FAO=16;FDP=24;FR=.;FRO=8;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=-0.00201255;FXX=0.039984;HRUN=2;LEN=5;MLLD=268.336;QD=27.0685;RBI=0.0179025;REFB=-0.0192276;REVB=0.017789;RO=9;SAF=7;SAR=9;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146799;STB=0.562422;STBP=0.449;TYPE=ins;VARB=0.0110606;OID=.;OPOS=43462435;OREF=-;OALT=TCAGG;OMAPALT=TTCAGG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.666667:16:26:16:24:8:7:9:5:3:55:9:7:9:6:3
chr13	43463378	.	C	T	320.28	PASS	AF=0.432099;AO=34;DP=82;FAO=35;FDP=81;FR=.;FRO=46;FSAF=12;FSAR=23;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=-0.0206991;FXX=0.0121936;HRUN=3;LEN=1;MLLD=254.69;QD=15.8161;RBI=0.0211248;REFB=-0.0141732;REVB=-0.00421962;RO=46;SAF=11;SAR=23;SRF=22;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167089;STB=0.580933;STBP=0.204;TYPE=snp;VARB=0.0213032;OID=.;OPOS=43463378;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:81:46:46:34:35:0.432099:23:11:22:24:23:12:22:24
chr13	43788158	.	G	A	253.12	PASS	AF=0.432836;AO=29;DP=67;FAO=29;FDP=67;FR=.;FRO=38;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=-0.00180904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.73;QD=15.1115;RBI=0.0142084;REFB=-0.00111041;REVB=-0.0140928;RO=38;SAF=14;SAR=15;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00910152;STB=0.505151;STBP=0.952;TYPE=snp;VARB=0.00127316;OID=.;OPOS=43788158;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:38:38:29:29:0.432836:15:14:18:20:15:14:18:20
chr13	44411432	.	A	G	489.89	PASS	AF=0.48;AO=48;DP=100;FAO=48;FDP=100;FR=.;FRO=52;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=24;FSRR=28;FWDB=0.0176768;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.079;QD=19.5955;RBI=0.0282467;REFB=9.40102e-05;REVB=0.022032;RO=52;SAF=25;SAR=23;SRF=24;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0554359;STB=0.530795;STBP=0.589;TYPE=snp;VARB=-8.85171e-06;OID=.;OPOS=44411432;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:52:52:48:48:0.48:23:25:24:28:23:25:24:28
chr13	44457925	.	A	G	357.58	PASS	AF=0.447059;AO=37;DP=84;FAO=38;FDP=85;FR=.;FRO=47;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=24;FSRR=23;FWDB=0.0776949;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.037;QD=16.8272;RBI=0.0777504;REFB=-0.0235565;REVB=0.00293816;RO=47;SAF=18;SAR=19;SRF=24;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0240228;STB=0.505879;STBP=0.955;TYPE=snp;VARB=0.0269228;OID=.;OPOS=44457925;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:85:47:47:37:38:0.447059:19:18:24:23:19:19:24:23
chr13	45492138	.	G	A	141.94	PASS	AF=0.322034;AO=19;DP=59;FAO=19;FDP=59;FR=.;FRO=40;FSAF=4;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=-0.0158294;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.8;QD=9.62302;RBI=0.0200385;REFB=0.00534031;REVB=0.0122871;RO=40;SAF=4;SAR=15;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.342549;STB=0.705286;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=-0.0176802;OID=.;OPOS=45492138;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:40:40:19:19:0.322034:15:4:19:21:15:4:19:21
chr13	45492146	.	G	A	134.17	PASS	AF=0.315789;AO=18;DP=57;FAO=18;FDP=57;FR=.;FRO=39;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=-0.0338034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.59;QD=9.41563;RBI=0.043571;REFB=0.00615308;REVB=-0.0274912;RO=39;SAF=4;SAR=14;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.362823;STB=0.71769;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=-0.00782973;OID=.;OPOS=45492146;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:39:39:18:18:0.315789:14:4:20:19:14:4:20:19
chr13	45563464	.	G	C	2474.85	PASS	AF=1;AO=161;DP=161;FAO=161;FDP=161;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=96;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00185785;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.798;QD=61.4869;RBI=0.0323661;REFB=0;REVB=0.0323127;RO=0;SAF=65;SAR=96;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.57765e-05;OID=.;OPOS=45563464;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:161:161:0:0:161:161:1:96:65:0:0:96:65:0:0
chr13	45580336	.	GA	G	56.49	PASS	AF=0.5;AO=10;DP=29;FAO=14;FDP=28;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=-0.0548553;FXX=0.0344709;HRUN=4;LEN=1;MLLD=13.1741;QD=8.07065;RBI=0.193489;REFB=-0.0886163;REVB=-0.18555;RO=13;SAF=5;SAR=5;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185395;STB=0.642653;STBP=0.15;TYPE=del;VARB=0.0776487;OID=.;OPOS=45580337;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.5:10:29:14:28:14:5:9:9:5:56:13:5:5:9:4
chr13	45768759	.	G	A	508.39	PASS	AF=0.972222;AO=34;DP=36;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0413921;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.681;QD=56.4877;RBI=0.0421629;REFB=0.00871013;REVB=-0.00802549;RO=1;SAF=19;SAR=15;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0301451;STB=0.51612;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=-0.000294563;OID=.;OPOS=45768759;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:36:36:1:1:34:35:0.972222:15:19:0:1:15:20:0:1
chr13	45841502	.	G	A	533.7	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00463512;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.735;QD=59.3003;RBI=0.0206465;REFB=0;REVB=-0.0201195;RO=0;SAF=15;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000259284;OID=.;OPOS=45841502;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:36:0:0:35:36:1:20:15:0:0:21:15:0:0
chr13	46065668	.	GC	G,GT	212.75	PASS	AF=0.416667,0;AO=33,3;DP=85;FAO=35,0;FDP=84;FR=.;FRO=49;FSAF=21,0;FSAR=14,0;FSRF=8;FSRR=41;FWDB=-0.00420526,-0.060329;FXX=0.0117633;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=22.1551,147.104;QD=10.1308;RBI=0.128314,0.0803528;REFB=-0.101185,-0.00505473;REVB=-0.128245,-0.0530752;RO=46;SAF=18,3;SAR=15,0;SRF=8;SRR=38;SSEN=0.617143,0;SSEP=0,0;SSSB=0.376639,0.68842;STB=0.739794,0.5;STBP=0.002,1;TYPE=del,snp;VARB=0.132953,0;OID=.,.;OPOS=46065669,46065669;OREF=C,C;OALT=-,T;OMAPALT=G,GT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.416667,0:33,3:85:35,0:84:49:21,0:14,0:8:41:99:46:18,3:15,0:8:38
chr13	46067593	.	G	A	175.57	PASS	AF=0.392157;AO=20;DP=51;FAO=20;FDP=51;FR=.;FRO=31;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=23;FWDB=-0.0787455;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.9445;QD=13.7698;RBI=0.096674;REFB=-0.000234663;REVB=0.0560803;RO=31;SAF=8;SAR=12;SRF=8;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162832;STB=0.593134;STBP=0.344;TYPE=snp;VARB=-0.000364844;OID=.;OPOS=46067593;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:31:31:20:20:0.392157:12:8:8:23:12:8:8:23
chr13	46077381	.	G	A	46.76	PASS	AF=0.388889;AO=7;DP=18;FAO=7;FDP=18;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=0.00778091;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.901;QD=10.3903;RBI=0.0114257;REFB=-0.0112718;REVB=0.00836682;RO=11;SAF=3;SAR=4;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.205271;STB=0.624653;STBP=0.393;TYPE=snp;VARB=0.0143981;OID=.;OPOS=46077381;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:18:18:11:11:7:7:0.388889:4:3:7:4:4:3:7:4
chr13	46103935	.	A	G	203.06	PASS	AF=0.378788;AO=25;DP=66;FAO=25;FDP=66;FR=.;FRO=41;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=26;FSRR=15;FWDB=0.000728405;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.154;QD=12.3068;RBI=0.0674865;REFB=-0.00648593;REVB=0.0674826;RO=40;SAF=13;SAR=12;SRF=26;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140804;STB=0.571373;STBP=0.357;TYPE=snp;VARB=0.0123397;OID=.;OPOS=46103935;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:40:41:25:25:0.378788:12:13:26:14:12:13:26:15
chr13	46108853	.	TG	CA,CG	1262.86	PASS	AF=0.505882,0.494118;AO=43,42;DP=85;FAO=43,42;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=20,22;FSAR=23,20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0209726,-0.0468869;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=2,1;MLLD=151.21,77.2462;QD=59.4288;RBI=0.0211255,0.0476637;REFB=0,0;REVB=-0.00253653,0.00857;RO=0;SAF=20,22;SAR=23,20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=-0.000733395,0.0117804;OID=.,.;OPOS=46108853,46108853;OREF=TG,T;OALT=CA,C;OMAPALT=CA,CG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:85:85:0:0:43,42:43,42:0.505882,0.494118:23,20:20,22:0:0:23,20:20,22:0:0
chr13	46115731	.	C	A	436.08	PASS	AF=0.52439;AO=43;DP=81;FAO=43;FDP=82;FR=.;FRO=39;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=-0.0238716;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.1992;QD=21.2723;RBI=0.0423573;REFB=-0.0262651;REVB=0.0349898;RO=38;SAF=20;SAR=23;SRF=16;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0377437;STB=0.513986;STBP=0.806;TYPE=snp;VARB=0.0238979;OID=.;OPOS=46115731;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:82:38:39:43:43:0.52439:23:20:16:22:23:20:17:22
chr13	46137837	.	T	C	665.92	PASS	AF=0.390625;AO=74;DP=191;FAO=75;FDP=192;FR=.;FRO=117;FSAF=36;FSAR=39;FSRF=62;FSRR=55;FWDB=0.00439091;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.549;QD=13.8734;RBI=0.0148307;REFB=-0.00919245;REVB=0.0141657;RO=116;SAF=35;SAR=39;SRF=61;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0572356;STB=0.530383;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0120112;OID=.;OPOS=46137837;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:191:192:116:117:74:75:0.390625:39:35:61:55:39:36:62:55
chr13	46355296	.	G	T	524.19	PASS	AF=0.510204;AO=50;DP=98;FAO=50;FDP=98;FR=.;FRO=48;FSAF=21;FSAR=29;FSRF=20;FSRR=28;FWDB=0.0144235;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=213.798;QD=21.3954;RBI=0.0164622;REFB=-0.00894406;REVB=-0.00793505;RO=48;SAF=21;SAR=29;SRF=20;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00303353;STB=0.501676;STBP=0.986;TYPE=snp;VARB=0.00803598;OID=.;OPOS=46355296;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:48:48:50:50:0.510204:29:21:20:28:29:21:20:28
chr13	46541673	.	T	A	683.4	PASS	AF=0.961538;AO=50;DP=52;FAO=50;FDP=52;FR=.;FRO=2;FSAF=20;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0182286;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=293.695;QD=52.5693;RBI=0.0304559;REFB=-0.167649;REVB=0.0243984;RO=1;SAF=20;SAR=30;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0154349;STB=0.503998;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=0.000577193;OID=.;OPOS=46541673;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:52:52:1:2:50:50:0.961538:30:20:0:1:30:20:1:1
chr13	46559703	.	T	C	474.8	PASS	AF=0.397059;AO=51;DP=134;FAO=54;FDP=136;FR=.;FRO=82;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=49;FSRR=33;FWDB=0.00306069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.633;QD=13.9647;RBI=0.0266386;REFB=-0.0256998;REVB=0.0264622;RO=80;SAF=26;SAR=25;SRF=47;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0840715;STB=0.547875;STBP=0.371;TYPE=snp;VARB=0.0379202;OID=.;OPOS=46559703;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:134:136:80:82:51:54:0.397059:25:26:47:33:26:28:49:33
chr13	46562935	.	A	G	990.43	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0093158;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.518;QD=59.1299;RBI=0.0172882;REFB=0;REVB=0.0145635;RO=0;SAF=33;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.80547e-05;OID=.;OPOS=46562935;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:67:0:0:66:67:1:33:33:0:0:34:33:0:0
chr13	46629944	.	A	G	757.03	PASS	AF=0.981818;AO=54;DP=56;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0410757;FXX=0.017854;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.022;QD=55.0567;RBI=0.0419129;REFB=0.0434016;REVB=0.00833528;RO=1;SAF=24;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0192307;STB=0.5102;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=1.90454e-05;OID=.;OPOS=46629944;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:56:55:1:1:54:54:0.981818:30:24:1:0:30:24:1:0
chr13	46638826	.	G	A	317.24	PASS	AF=0.571429;AO=28;DP=49;FAO=28;FDP=49;FR=.;FRO=21;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=-0.0147898;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.187;QD=25.8972;RBI=0.0163953;REFB=-0.0115889;REVB=-0.00707584;RO=21;SAF=17;SAR=11;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139848;STB=0.577492;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=0.00608689;OID=.;OPOS=46638826;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:21:21:28:28:0.571429:11:17:9:12:11:17:9:12
chr13	46641481	.	T	C	1241.43	PASS	AF=1;AO=80;DP=81;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0238051;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.409;QD=60.5574;RBI=0.0268544;REFB=0;REVB=0.0124288;RO=0;SAF=53;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.91755e-05;OID=.;OPOS=46641481;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:82:0:0:80:82:1:27:53:0:0:28:54:0:0
chr13	46656669	.	A	G	1667.86	PASS	AF=0.99115;AO=110;DP=111;FAO=112;FDP=113;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=71;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0290786;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.573;QD=59.0393;RBI=0.0325867;REFB=0.0278887;REVB=-0.0147079;RO=1;SAF=40;SAR=70;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0117194;STB=0.506023;STBP=0.25;TYPE=snp;VARB=0.000309604;OID=.;OPOS=46656669;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:111:113:1:1:110:112:0.99115:70:40:1:0:71:41:1:0
chr13	46700642	.	G	T	239.3	PASS	AF=0.411765;AO=27;DP=67;FAO=28;FDP=68;FR=.;FRO=40;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=0.0104344;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.803;QD=14.0765;RBI=0.0259406;REFB=-0.00571074;REVB=0.0237494;RO=39;SAF=10;SAR=17;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176632;STB=0.601219;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.00838102;OID=.;OPOS=46700642;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:68:39:40:27:28:0.411765:17:10:21:18:18:10:21:19
chr13	46708291	.	T	C	1168.73	PASS	AF=0.975;AO=78;DP=81;FAO=78;FDP=80;FR=.;FRO=2;FSAF=41;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0107233;FXX=0.0123442;HRUN=3;LEN=1;MLLD=239.603;QD=58.4365;RBI=0.0251765;REFB=-0.168064;REVB=0.0227786;RO=0;SAF=41;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.4281e-08;STB=0.513155;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=0.000416706;OID=.;OPOS=46708291;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:81:80:0:2:78:78:0.975:37:41:0:0:37:41:0:2
chr13	46801970	.	A	G	142.19	PASS	AF=0.346939;AO=16;DP=48;FAO=17;FDP=49;FR=.;FRO=32;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=-0.0165021;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.152;QD=11.6074;RBI=0.0170652;REFB=-0.00231703;REVB=-0.00434771;RO=32;SAF=5;SAR=11;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186267;STB=0.578852;STBP=0.413;TYPE=snp;VARB=0.00752966;OID=.;OPOS=46801970;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:49:32:32:16:17:0.346939:11:5:15:17:11:6:15:17
chr13	46802177	.	A	G	221.08	PASS	AF=0.454545;AO=25;DP=56;FAO=25;FDP=55;FR=.;FRO=30;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=0.00236862;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.059;QD=16.0788;RBI=0.0041104;REFB=-0.00791064;REVB=0.00335932;RO=30;SAF=14;SAR=11;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0901225;STB=0.550979;STBP=0.486;TYPE=snp;VARB=0.0100749;OID=.;OPOS=46802177;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:55:30:30:25:25:0.454545:11:14:14:16:11:14:14:16
chr13	46946157	.	C	T	320.48	PASS	AF=0.595745;AO=27;DP=46;FAO=28;FDP=47;FR=.;FRO=19;FSAF=21;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.0369703;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=199.406;QD=27.2746;RBI=0.0370077;REFB=-0.0232202;REVB=0.0016642;RO=18;SAF=20;SAR=7;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158787;STB=0.584352;STBP=0.19;TYPE=snp;VARB=0.0170154;OID=.;OPOS=46946157;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:47:18:19:27:28:0.595745:7:20:10:8:7:21:11:8
chr13	46948548	.	G	A	157.86	PASS	AF=0.447368;AO=17;DP=38;FAO=17;FDP=38;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.00252212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.722;QD=16.6173;RBI=0.00692348;REFB=-0.00642204;REVB=0.00644775;RO=21;SAF=9;SAR=8;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00541022;STB=0.503102;STBP=0.951;TYPE=snp;VARB=0.006718;OID=.;OPOS=46948548;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:21:21:17:17:0.447368:8:9:11:10:8:9:11:10
chr13	46948660	.	A	G	64.86	PASS	AF=0.188679;AO=10;DP=53;FAO=10;FDP=53;FR=.;FRO=43;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=23;FSRR=20;FWDB=0.00533696;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.2846;QD=4.89512;RBI=0.00635829;REFB=-0.0151182;REVB=0.00345611;RO=43;SAF=5;SAR=5;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0428885;STB=0.528246;STBP=0.85;TYPE=snp;VARB=0.0361458;OID=.;OPOS=46948660;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:53:53:43:43:10:10:0.188679:5:5:23:20:5:5:23:20
chr13	47260054	.	T	C	1589.33	PASS	AF=0.990826;AO=107;DP=109;FAO=108;FDP=109;FR=.;FRO=1;FSAF=55;FSAR=53;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0321107;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.429;QD=58.3241;RBI=0.053491;REFB=-0.109167;REVB=-0.0427807;RO=1;SAF=54;SAR=53;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00870867;STB=0.504504;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.00162748;OID=.;OPOS=47260054;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:109:109:1:1:107:108:0.990826:53:54:1:0:53:55:1:0
chr13	47273458	.	G	C,T	1211.26	PASS	AF=0.962963,0.037037;AO=77,3;DP=80;FAO=78,3;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=39,2;FSAR=39,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00307872,0.00492544;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=177.07,195.153;QD=59.8152;RBI=0.0147092,0.00686532;REFB=0,0;REVB=0.0143834,-0.00478254;RO=0;SAF=39,2;SAR=38,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.5078e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.000831627,0.016018;OID=.,.;OPOS=47273458,47273458;OREF=G,G;OALT=C,T;OMAPALT=C,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:7:80:81:0:0:77,3:78,3:0.962963,0.037037:38,1:39,2:0:0:39,1:39,2:0:0
chr13	47279454	.	A	G	1116.96	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000550106;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.934;QD=60.376;RBI=0.00251924;REFB=0;REVB=-0.00245845;RO=0;SAF=24;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.61681e-06;OID=.;OPOS=47279454;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:50:24:0:0:50:24:0:0
chr13	47308109	.	A	G	2327.83	PASS	AF=0.993548;AO=153;DP=156;FAO=154;FDP=155;FR=.;FRO=1;FSAF=72;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0367351;FXX=0.00640985;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.139;QD=60.0731;RBI=0.0371645;REFB=-0.0479031;REVB=-0.00563309;RO=0;SAF=72;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.61649e-08;STB=0.50303;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=-0.0002511;OID=.;OPOS=47308109;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:156:155:0:1:153:154:0.993548:81:72:0:0:82:72:0:1
chr13	47315984	.	T	C	745.33	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0545204;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.161;QD=55.2094;RBI=0.0556519;REFB=0;REVB=-0.0111651;RO=0;SAF=31;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.13361e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00237803;OID=.;OPOS=47315984;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:54:0:0:51:54:1:20:31:0:0:20:34:0:0
chr13	47469940	.	G	A	366.2	PASS	AF=0.433333;AO=39;DP=90;FAO=39;FDP=90;FR=.;FRO=51;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=27;FSRR=24;FWDB=-0.002081;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=258.071;QD=16.2756;RBI=0.00889825;REFB=0.00255125;REVB=0.00865149;RO=51;SAF=24;SAR=15;SRF=27;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0891728;STB=0.550238;STBP=0.425;TYPE=snp;VARB=-0.00312095;OID=.;OPOS=47469940;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:51:51:39:39:0.433333:15:24:27:24:15:24:27:24
chr13	47470824	.	C	T	375.6	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0651883;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.3631;QD=55.645;RBI=0.12386;REFB=0;REVB=0.105318;RO=0;SAF=13;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00103229;OID=.;OPOS=47470824;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:14:13:0:0:14:13:0:0
chr13	48033224	.	G	A	741.28	PASS	AF=1;AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00315039;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.5521;QD=57.0214;RBI=0.0160623;REFB=0;REVB=-0.0157503;RO=0;SAF=29;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.84538e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000118321;OID=.;OPOS=48033224;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:52:0:0:52:52:1:23:29:0:0:23:29:0:0
chr13	48547467	.	A	T	786.14	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.102476;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.2179;QD=64.1745;RBI=0.108642;REFB=0;REVB=-0.0360774;RO=0;SAF=21;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000950684;OID=.;OPOS=48547467;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:49:0:0:47:49:1:26:21:0:0:26:23:0:0
chr13	49107241	.	T	C	357.61	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00632692;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.302;QD=55.0175;RBI=0.0204966;REFB=0;REVB=-0.0194957;RO=0;SAF=5;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.03521e-05;OID=.;OPOS=49107241;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:21:5:0:0:21:5:0:0
chr13	49840024	.	A	G	954.56	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0193055;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.9442;QD=58.7419;RBI=0.0226211;REFB=0;REVB=-0.0117903;RO=0;SAF=32;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000324311;OID=.;OPOS=49840024;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:33:32:0:0:33:32:0:0
chr13	50008301	.	A	G	671.85	PASS	AF=0.960784;AO=49;DP=51;FAO=49;FDP=51;FR=.;FRO=2;FSAF=22;FSAR=27;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0114254;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.267;QD=52.6942;RBI=0.0165106;REFB=-0.0414347;REVB=0.0119189;RO=1;SAF=22;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0209097;STB=0.52173;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.00285757;OID=.;OPOS=50008301;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:51:51:1:2:49:49:0.960784:27:22:1:0:27:22:2:0
chr13	50050620	.	A	G	651.15	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0798566;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=56.0821;QD=62.0139;RBI=0.0834069;REFB=0;REVB=-0.0240754;RO=0;SAF=25;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.98888e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00159229;OID=.;OPOS=50050620;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:17:25:0:0:17:25:0:0
chr13	50056960	.	CA	AC,C	43.25	PASS	AF=0.0238095,0.333333;AO=2,11;DP=38;FAO=1,14;FDP=42;FR=.;FRO=27;FSAF=0,1;FSAR=1,13;FSRF=7;FSRR=20;FWDB=-0.0237134,0.144616;FXX=0;HRUN=1,6;LEN=2,1;MLLD=118.296,9.02651;QD=4.1187;RBI=0.056907,0.157506;REFB=-0.00235822,-0.161545;REVB=-0.0517309,-0.0624044;RO=23;SAF=0,0;SAR=2,11;SRF=7;SRR=16;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.421418,-0.748267;STB=0.985389,0.758636;STBP=0.545,0.093;TYPE=mnp,del;VARB=-0.0478202,0.170628;OID=.,.;OPOS=50056960,50056961;OREF=CA,A;OALT=AC,-;OMAPALT=AC,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:40:38:42:23:27:2,11:1,14:0.0238095,0.333333:2,11:0,0:7:16:1,13:0,1:7:20
chr13	50057097	.	G	A	670.25	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0189062;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.833;QD=62.3492;RBI=0.0517503;REFB=0;REVB=-0.0481731;RO=0;SAF=17;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.75441e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000460573;OID=.;OPOS=50057097;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:26:17:0:0:26:17:0:0
chr13	50057633	.	A	G	782.2	PASS	AF=0.381356;AO=90;DP=237;FAO=90;FDP=236;FR=.;FRO=146;FSAF=51;FSAR=39;FSRF=93;FSRR=53;FWDB=-7.66278e-05;FXX=0.00421923;HRUN=2;LEN=1;MLLD=236.272;QD=13.2577;RBI=0.00278099;REFB=-0.0139117;REVB=-0.00277993;RO=145;SAF=51;SAR=39;SRF=92;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0765781;STB=0.54481;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=0.0240044;OID=.;OPOS=50057633;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:237:236:145:146:90:90:0.381356:39:51:92:53:39:51:93:53
chr13	50080847	.	A	G	594.2	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0655746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.092;QD=60.9438;RBI=0.0710561;REFB=0;REVB=-0.0273667;RO=0;SAF=20;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.3303e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000265188;OID=.;OPOS=50080847;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:19:20:0:0:19:20:0:0
chr13	50106550	.	GA	G	86.94	PASS	AF=0.521739;AO=12;DP=23;FAO=12;FDP=23;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.143332;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=34.5303;QD=15.1203;RBI=0.144642;REFB=0.0220613;REVB=0.0194274;RO=11;SAF=3;SAR=9;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116603;STB=0.567449;STBP=0.544;TYPE=del;VARB=-0.00337852;OID=.;OPOS=50106551;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.521739:12:23:12:23:11:3:9:4:7:76:11:3:9:4:7
chr13	50106584	.	G	A	115.08	PASS	AF=0.541667;AO=13;DP=24;FAO=13;FDP=24;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.0199696;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.287;QD=19.1804;RBI=0.0199876;REFB=-0.00931561;REVB=-0.000848155;RO=11;SAF=3;SAR=10;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136262;STB=0.578384;STBP=0.471;TYPE=snp;VARB=0.0079854;OID=.;OPOS=50106584;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:24:24:11:11:13:13:0.541667:10:3:4:7:10:3:4:7
chr13	50123622	.	G	C	189.16	PASS	AF=0.42;AO=21;DP=51;FAO=21;FDP=50;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=0.0046833;FXX=0.019604;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.5892;QD=15.1324;RBI=0.0432499;REFB=0.00828213;REVB=0.0429955;RO=30;SAF=13;SAR=8;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0559333;STB=0.540555;STBP=0.629;TYPE=snp;VARB=-0.0104359;OID=.;OPOS=50123622;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:50:30:29:21:21:0.42:8:13:17:13:8:13:16:13
chr13	50126382	.	G	A	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0646313;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.6761;QD=50.4132;RBI=0.0915976;REFB=0;REVB=0.0649069;RO=0;SAF=9;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.96335e-06;OID=.;OPOS=50126382;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:10:9:0:0:10:9:0:0
chr13	50141345	.	G	A	785.86	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0150391;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.551;QD=64.152;RBI=0.037112;REFB=0;REVB=0.0339283;RO=0;SAF=17;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.70321e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.75463e-05;OID=.;OPOS=50141345;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:32:17:0:0:32:17:0:0
chr13	50204880	.	G	A	199.5	PASS	AF=0.431373;AO=22;DP=51;FAO=22;FDP=51;FR=.;FRO=29;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=-0.0200271;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.584;QD=15.6467;RBI=0.0246204;REFB=-0.0180031;REVB=-0.0143206;RO=29;SAF=16;SAR=6;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196388;STB=0.612795;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.0230255;OID=.;OPOS=50204880;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:29:29:22:22:0.431373:6:16:16:13:6:16:16:13
chr13	50273831	.	T	C	142.64	PASS	AF=0.4;AO=16;DP=40;FAO=16;FDP=40;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=0.017922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.414;QD=14.2637;RBI=0.0258797;REFB=0.0073647;REVB=-0.0186698;RO=24;SAF=8;SAR=8;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172932;STB=0.59988;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=-0.0145745;OID=.;OPOS=50273831;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:24:24:16:16:0.4:8:8:8:16:8:8:8:16
chr13	50273970	.	C	T	246.85	PASS	AF=0.490909;AO=27;DP=55;FAO=27;FDP=55;FR=.;FRO=28;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=-0.0136813;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.2878;QD=17.9525;RBI=0.0389116;REFB=-0.00684209;REVB=-0.0364272;RO=26;SAF=15;SAR=12;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0826047;STB=0.564468;STBP=0.36;TYPE=snp;VARB=0.0054112;OID=.;OPOS=50273970;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:26:28:27:27:0.490909:12:15:12:14:12:15:12:16
chr13	50275515	.	C	T	463.85	PASS	AF=0.451327;AO=51;DP=113;FAO=51;FDP=113;FR=.;FRO=62;FSAF=20;FSAR=31;FSRF=28;FSRR=34;FWDB=-0.0117285;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.551;QD=16.4196;RBI=0.0373441;REFB=-0.00894915;REVB=-0.0354545;RO=61;SAF=20;SAR=31;SRF=28;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0672728;STB=0.533703;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=0.0119352;OID=.;OPOS=50275515;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:113:61:62:51:51:0.451327:31:20:28:33:31:20:28:34
chr13	50283819	.	T	C	467.7	PASS	AF=0.494624;AO=46;DP=93;FAO=46;FDP=93;FR=.;FRO=47;FSAF=14;FSAR=32;FSRF=21;FSRR=26;FWDB=-0.0040041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.396;QD=20.1159;RBI=0.0126881;REFB=-0.0273576;REVB=0.0120397;RO=47;SAF=14;SAR=32;SRF=21;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143127;STB=0.579674;STBP=0.163;TYPE=snp;VARB=0.0166234;OID=.;OPOS=50283819;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:47:47:46:46:0.494624:32:14:21:26:32:14:21:26
chr13	50296115	.	C	T	477.79	PASS	AF=1;AO=31;DP=32;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0328656;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.3927;QD=56.2107;RBI=0.0337544;REFB=0;REVB=0.00769504;RO=0;SAF=15;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0172038;OID=.;OPOS=50296115;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:34:0:0:31:34:1:16:15:0:0:18:16:0:0
chr13	50466911	.	G	A	85.77	PASS	AF=0.37931;AO=11;DP=29;FAO=11;FDP=29;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=-0.0214104;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.405;QD=11.8306;RBI=0.0431757;REFB=-0.000681056;REVB=-0.0374931;RO=18;SAF=7;SAR=4;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.309174;STB=0.682607;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.000216809;OID=.;OPOS=50466911;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:29:29:18:18:11:11:0.37931:4:7:6:12:4:7:6:12
chr13	50466990	.	T	G	50.36	PASS	AF=0.177778;AO=8;DP=46;FAO=8;FDP=45;FR=.;FRO=37;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=23;FWDB=-0.0306559;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.414;QD=4.47677;RBI=0.0439705;REFB=-0.00189291;REVB=0.0315217;RO=37;SAF=1;SAR=7;SRF=14;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.391038;STB=0.776956;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.0175366;OID=.;OPOS=50466990;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:50:46:45:37:37:8:8:0.177778:7:1:14:23:7:1:14:23
chr13	50467044	.	G	C	48.6	PASS	AF=0.173913;AO=7;DP=45;FAO=8;FDP=46;FR=.;FRO=38;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=25;FWDB=-0.0214614;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=302.786;QD=4.22615;RBI=0.0215133;REFB=-0.00643967;REVB=-0.00149344;RO=38;SAF=0;SAR=7;SRF=13;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.634121;STB=0.753086;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.0148014;OID=.;OPOS=50467044;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:48:45:46:38:38:7:8:0.173913:7:0:13:25:7:1:13:25
chr13	50588496	.	T	C	101.32	PASS	AF=0.5;AO=12;DP=24;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.0215004;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.7918;QD=16.8873;RBI=0.122821;REFB=-0.0768348;REVB=-0.120925;RO=12;SAF=10;SAR=2;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.425784;STB=0.749531;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.0386206;OID=.;OPOS=50588496;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:24:24:12:12:12:12:0.5:2:10:5:7:2:10:5:7
chr13	50590292	.	T	TCTC	317.78	PASS	AF=0.52381;AO=33;DP=67;FAO=33;FDP=63;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=-0.00952864;FXX=0.0307645;HRUN=1;LEN=3;MLLD=291.224;QD=20.1762;RBI=0.0106937;REFB=-0.0162769;REVB=0.00485389;RO=32;SAF=13;SAR=20;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150352;STB=0.567473;STBP=0.294;TYPE=ins;VARB=0.0129473;OID=.;OPOS=50590293;OREF=-;OALT=CTC;OMAPALT=TCTC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.52381:33:67:33:63:30:13:20:16:14:99:32:13:20:18:14
chr13	50590838	.	C	G	225.9	PASS	AF=0.397059;AO=27;DP=68;FAO=27;FDP=68;FR=.;FRO=41;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=26;FWDB=-0.00472384;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=229.727;QD=13.2881;RBI=0.0098435;REFB=-0.00892936;REVB=0.00863596;RO=41;SAF=11;SAR=16;SRF=15;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0458566;STB=0.526177;STBP=0.741;TYPE=snp;VARB=0.0121246;OID=.;OPOS=50590838;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:41:41:27:27:0.397059:16:11:15:26:16:11:15:26
chr13	50591342	.	T	A	188.37	PASS	AF=0.431373;AO=15;DP=47;FAO=22;FDP=51;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=0.00923114;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=52.1009;QD=14.774;RBI=0.0357634;REFB=-0.0674878;REVB=0.0345515;RO=17;SAF=7;SAR=8;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00364105;STB=0.529385;STBP=0.707;TYPE=snp;VARB=0.0268919;OID=.;OPOS=50591342;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:51:17:29:15:22:0.431373:8:7:8:9:11:11:13:16
chr13	50591480	.	T	C	501.62	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00385005;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.832;QD=59.0142;RBI=0.0837326;REFB=0;REVB=0.083644;RO=0;SAF=16;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000451902;OID=.;OPOS=50591480;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:18:16:0:0:18:16:0:0
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chr13	51594741	.	T	G	995.15	PASS	AF=0.971831;AO=69;DP=71;FAO=69;FDP=71;FR=.;FRO=2;FSAF=35;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00710427;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.7788;QD=56.0647;RBI=0.0210873;REFB=-0.0473273;REVB=0.0198546;RO=2;SAF=35;SAR=34;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000385837;STB=0.500204;STBP=0.878;TYPE=snp;VARB=0.0077705;OID=.;OPOS=51594741;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:71:71:2:2:69:69:0.971831:34:35:1:1:34:35:1:1
chr13	51603768	.	T	C	226.23	PASS	AF=0.391304;AO=27;DP=70;FAO=27;FDP=69;FR=.;FRO=42;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=22;FWDB=-0.0154153;FXX=0.028165;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.751;QD=13.1145;RBI=0.0189432;REFB=-0.0161386;REVB=-0.0110096;RO=42;SAF=14;SAR=13;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0449457;STB=0.525732;STBP=0.783;TYPE=snp;VARB=0.0238295;OID=.;OPOS=51603768;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:69:42:42:27:27:0.391304:13:14:20:22:13:14:20:22
chr13	51941943	.	T	C	236.44	PASS	AF=0.394366;AO=28;DP=72;FAO=28;FDP=71;FR=.;FRO=43;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=28;FWDB=0.0196543;FXX=0.013887;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.5874;QD=13.3204;RBI=0.0230035;REFB=-0.00702706;REVB=0.0119528;RO=43;SAF=11;SAR=17;SRF=15;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0495363;STB=0.528262;STBP=0.718;TYPE=snp;VARB=0.0118722;OID=.;OPOS=51941943;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:71:43:43:28:28:0.394366:17:11:15:28:17:11:15:28
chr13	51956225	.	T	G	192.87	PASS	AF=0.423077;AO=22;DP=52;FAO=22;FDP=52;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=0.0105846;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.48;QD=14.8357;RBI=0.0118128;REFB=-0.00102179;REVB=0.00524499;RO=30;SAF=11;SAR=11;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.067306;STB=0.538427;STBP=0.652;TYPE=snp;VARB=0.000955742;OID=.;OPOS=51956225;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:30:30:22:22:0.423077:11:11:17:13:11:11:17:13
chr13	51958756	.	C	T	148.56	PASS	AF=0.345455;AO=19;DP=56;FAO=19;FDP=55;FR=.;FRO=36;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=22;FSRR=14;FWDB=0.0218636;FXX=0.017854;HRUN=5;LEN=1;MLLD=44.0906;QD=10.8042;RBI=0.0724253;REFB=-0.0211438;REVB=0.0690464;RO=37;SAF=8;SAR=11;SRF=23;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.222534;STB=0.622515;STBP=0.214;TYPE=snp;VARB=0.0331878;OID=.;OPOS=51958756;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:55:37:36:19:19:0.345455:11:8:23:14:11:8:22:14
chr13	51958840	.	G	T	162.54	PASS	AF=0.515152;AO=17;DP=33;FAO=17;FDP=33;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.032749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.5798;QD=19.7014;RBI=0.0356728;REFB=-0.0444798;REVB=-0.0141441;RO=16;SAF=8;SAR=9;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0825894;STB=0.546708;STBP=0.587;TYPE=snp;VARB=0.0294617;OID=.;OPOS=51958840;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:16:16:17:17:0.515152:9:8:6:10:9:8:6:10
chr13	52313195	.	C	T	433.3	PASS	AF=0.458333;AO=43;DP=95;FAO=44;FDP=96;FR=.;FRO=52;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=14;FSRR=38;FWDB=0.00305631;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.525;QD=18.0543;RBI=0.0105661;REFB=-0.0110136;REVB=-0.0101144;RO=51;SAF=23;SAR=20;SRF=13;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.269317;STB=0.646777;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.0146083;OID=.;OPOS=52313195;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:96:51:52:43:44:0.458333:20:23:13:38:20:24:14:38
chr13	52440130	.	A	G	327.8	PASS	AF=0.925926;AO=25;DP=27;FAO=25;FDP=27;FR=.;FRO=2;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00594411;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.146;QD=48.5636;RBI=0.00850736;REFB=-0.00216507;REVB=0.00608628;RO=2;SAF=14;SAR=11;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0771382;STB=0.541633;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=0.000273086;OID=.;OPOS=52440130;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:27:27:2:2:25:25:0.925926:11:14:0:2:11:14:0:2
chr13	52511626	.	C	T	306.05	PASS	AF=0.533333;AO=32;DP=60;FAO=32;FDP=60;FR=.;FRO=28;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.0218818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.087;QD=20.4033;RBI=0.0441224;REFB=-0.0179885;REVB=-0.0383141;RO=28;SAF=21;SAR=11;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107822;STB=0.559962;STBP=0.341;TYPE=snp;VARB=0.01879;OID=.;OPOS=52511626;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:28:28:32:32:0.533333:11:21:15:13:11:21:15:13
chr13	52548140	.	A	C	346.45	PASS	AF=0.40404;AO=39;DP=99;FAO=40;FDP=99;FR=.;FRO=59;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=30;FSRR=29;FWDB=0.0190808;FXX=0.0388312;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.0492;QD=13.9978;RBI=0.023038;REFB=-0.00727104;REVB=0.0129101;RO=54;SAF=25;SAR=14;SRF=29;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111782;STB=0.571392;STBP=0.245;TYPE=snp;VARB=0.0181295;OID=.;OPOS=52548140;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:54:59:39:40:0.40404:14:25:29:25:15:25:30:29
chr13	52603194	.	G	T	474.07	PASS	AF=0.522727;AO=45;DP=87;FAO=46;FDP=88;FR=.;FRO=42;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=27;FSRR=15;FWDB=0.00703892;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=191.584;QD=21.5485;RBI=0.0129272;REFB=0.00349537;REVB=0.0108427;RO=42;SAF=20;SAR=25;SRF=27;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171948;STB=0.588198;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=-0.00162195;OID=.;OPOS=52603194;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:88:42:42:45:46:0.522727:25:20:27:15:25:21:27:15
chr13	52603775	.	C	T	59.4	PASS	AF=0.533333;AO=8;DP=15;FAO=8;FDP=15;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.0209448;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.307;QD=15.8391;RBI=0.0224442;REFB=-0.0332699;REVB=-0.00806581;RO=7;SAF=3;SAR=5;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158056;STB=0.592984;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=0.0187495;OID=.;OPOS=52603775;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:15:15:7:7:8:8:0.533333:5:3:4:3:5:3:4:3
chr13	52605675	.	A	G	36.61	PASS	AF=0.3;AO=6;DP=20;FAO=6;FDP=20;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=11;FSRR=3;FWDB=0.0159881;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.551;QD=7.32292;RBI=0.0289327;REFB=-0.00613644;REVB=0.0241139;RO=14;SAF=4;SAR=2;SRF=11;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159998;STB=0.599699;STBP=0.659;TYPE=snp;VARB=0.0154154;OID=.;OPOS=52605675;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:20:20:14:14:6:6:0.3:2:4:11:3:2:4:11:3
chr13	52607169	.	T	C	212.21	PASS	AF=0.645161;AO=20;DP=31;FAO=20;FDP=31;FR=.;FRO=11;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=-0.0179586;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.4665;QD=27.382;RBI=0.0265262;REFB=-0.027141;REVB=-0.0195224;RO=11;SAF=11;SAR=9;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118873;STB=0.565851;STBP=0.336;TYPE=snp;VARB=0.0100298;OID=.;OPOS=52607169;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:31:31:11:11:20:20:0.645161:9:11:4:7:9:11:4:7
chr13	52660486	.	T	G	134.68	PASS	AF=0.283582;AO=19;DP=67;FAO=19;FDP=67;FR=.;FRO=48;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=29;FWDB=-0.0194591;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.273;QD=8.04075;RBI=0.0508063;REFB=-0.00786569;REVB=0.0469321;RO=48;SAF=6;SAR=13;SRF=19;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104633;STB=0.56319;STBP=0.548;TYPE=snp;VARB=0.0194031;OID=.;OPOS=52660486;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:48:48:19:19:0.283582:13:6:19:29:13:6:19:29
chr13	52709938	.	A	C	315.57	PASS	AF=0.596154;AO=31;DP=52;FAO=31;FDP=52;FR=.;FRO=21;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=0.0129941;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.87;QD=24.2743;RBI=0.0133038;REFB=-0.0176219;REVB=0.00285398;RO=21;SAF=12;SAR=19;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0420038;STB=0.523103;STBP=0.714;TYPE=snp;VARB=0.00709979;OID=.;OPOS=52709938;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:21:21:31:31:0.596154:19:12:7:14:19:12:7:14
chr13	52971893	.	G	A	189.08	PASS	AF=0.527778;AO=19;DP=36;FAO=19;FDP=36;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=4;FWDB=-0.000133314;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.9212;QD=21.0084;RBI=0.0616734;REFB=0.0158775;REVB=0.0616732;RO=17;SAF=6;SAR=13;SRF=13;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.369444;STB=0.707523;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=-0.0244445;OID=.;OPOS=52971893;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:17:17:19:19:0.527778:13:6:13:4:13:6:13:4
chr13	53035783	.	T	C	271.46	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0549025;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.7561;QD=51.7057;RBI=0.0665491;REFB=0;REVB=0.0376098;RO=0;SAF=12;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000522319;OID=.;OPOS=53035783;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:9:12:0:0:9:12:0:0
chr13	53035925	.	A	G	470.08	PASS	AF=1;AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.036196;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.159;QD=58.7604;RBI=0.0367761;REFB=0;REVB=0.00650648;RO=0;SAF=11;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000807112;OID=.;OPOS=53035925;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:32:0:0:32:32:1:21:11:0:0:21:11:0:0
chr13	53050479	.	G	A	503.69	PASS	AF=0.5;AO=52;DP=108;FAO=53;FDP=106;FR=.;FRO=53;FSAF=20;FSAR=33;FSRF=27;FSRR=26;FWDB=-0.0235654;FXX=0.0185168;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.485;QD=19.0071;RBI=0.0249526;REFB=-0.0107951;REVB=-0.00820417;RO=52;SAF=20;SAR=32;SRF=27;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124258;STB=0.567898;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.0106006;OID=.;OPOS=53050479;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:106:52:53:52:53:0.5:32:20:27:25:33:20:27:26
chr13	53422553	.	A	G	786.89	PASS	AF=0.95;AO=57;DP=60;FAO=57;FDP=60;FR=.;FRO=3;FSAF=30;FSAR=27;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0227396;FXX=0.0163908;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.2318;QD=52.4592;RBI=0.0286437;REFB=-0.0458365;REVB=-0.0174177;RO=3;SAF=30;SAR=27;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.013264;STB=0.50704;STBP=0.722;TYPE=snp;VARB=0.00635931;OID=.;OPOS=53422553;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:60:60:3:3:57:57:0.95:27:30:2:1:27:30:2:1
chr13	53602970	.	A	G	307.2	PASS	AF=0.43038;AO=34;DP=79;FAO=34;FDP=79;FR=.;FRO=45;FSAF=25;FSAR=9;FSRF=30;FSRR=15;FWDB=-0.0198897;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.5509;QD=15.5546;RBI=0.020372;REFB=-0.0172985;REVB=0.0044066;RO=45;SAF=25;SAR=9;SRF=30;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0845412;STB=0.547916;STBP=0.495;TYPE=snp;VARB=0.0137582;OID=.;OPOS=53602970;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:45:45:34:34:0.43038:9:25:30:15:9:25:30:15
chr13	53608632	.	C	T	224.78	PASS	AF=0.511628;AO=22;DP=43;FAO=22;FDP=43;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=-0.063542;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.968;QD=20.9099;RBI=0.0736729;REFB=-0.000222236;REVB=-0.0372842;RO=18;SAF=11;SAR=11;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0447114;STB=0.511617;STBP=0.9;TYPE=snp;VARB=-0.000649522;OID=.;OPOS=53608632;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:18:21:22:22:0.511628:11:11:10:8:11:11:10:11
chr13	55748673	.	T	C	1695.13	PASS	AF=1;AO=112;DP=112;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112591;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.4108;QD=60.5404;RBI=0.10006;REFB=0;REVB=0.0994243;RO=0;SAF=63;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.39806e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000693814;OID=.;OPOS=55748673;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:112:112:0:0:112:112:1:49:63:0:0:49:63:0:0
chr13	60324979	.	G	A	406.96	PASS	AF=0.387097;AO=47;DP=121;FAO=48;FDP=124;FR=.;FRO=76;FSAF=28;FSAR=20;FSRF=33;FSRR=43;FWDB=-0.0753454;FXX=0.00799936;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.8799;QD=13.1279;RBI=0.075939;REFB=-0.00560089;REVB=-0.00947666;RO=74;SAF=28;SAR=19;SRF=32;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.175852;STB=0.591115;STBP=0.125;TYPE=snp;VARB=0.0063264;OID=.;OPOS=60324979;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:121:124:74:76:47:48:0.387097:19:28:32:42:20:28:33:43
chr13	61984043	.	T	C	131.29	PASS	AF=0.305085;AO=18;DP=59;FAO=18;FDP=59;FR=.;FRO=41;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=0.0070904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.038;QD=8.90112;RBI=0.0271146;REFB=-0.0104458;REVB=0.0261712;RO=41;SAF=13;SAR=5;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.286273;STB=0.671769;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=0.0195313;OID=.;OPOS=61984043;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:41:41:18:18:0.305085:5:13:20:21:5:13:20:21
chr13	61986918	.	C	A	556.6	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0310763;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.0573;QD=60.1728;RBI=0.0640762;REFB=0;REVB=-0.056036;RO=0;SAF=23;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.91909e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000458439;OID=.;OPOS=61986918;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:14:23:0:0:14:23:0:0
chr13	62232195	.	A	ATGATCCC	225.0	PASS	AF=0.95;AO=17;DP=21;FAO=19;FDP=20;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0256522;FXX=0;HRUN=1;LEN=7;MLLD=280.699;QD=44.9993;RBI=0.0256532;REFB=0.0159904;REVB=-0.000227742;RO=2;SAF=9;SAR=8;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00567123;STB=0.529381;STBP=0.288;TYPE=ins;VARB=-0.00104136;OID=.;OPOS=62232196;OREF=-;OALT=TGATCCC;OMAPALT=ATGATCCC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.95:17:21:19:20:1:11:8:0:1:6:2:9:8:1:1
chr13	64415020	.	G	A	118.62	PASS	AF=0.294118;AO=12;DP=48;FAO=15;FDP=51;FR=.;FRO=36;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=0.0964779;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.762;QD=9.3037;RBI=0.104734;REFB=-0.0192263;REVB=-0.0407583;RO=36;SAF=8;SAR=4;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140561;STB=0.639338;STBP=0.237;TYPE=snp;VARB=0.0544424;OID=.;OPOS=64415020;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:51:36:36:12:15:0.294118:4:8:20:16:4:11:20:16
chr13	64415079	.	TAG	CTA,TA,TGA	74.29	PASS	AF=0,0.161765,0.117647;AO=3,15,7;DP=71;FAO=0,11,8;FDP=68;FR=.;FRO=49;FSAF=0,7,8;FSAR=0,4,0;FSRF=21;FSRR=28;FWDB=-0.0115502,-0.0440486,-0.0150997;FXX=0.0422476;HRUN=1,5,1;LEN=3,1,2;MLLD=61.8222,10.9118,74.19;QD=4.36972;RBI=0.029735,0.0446428,0.0539128;REFB=-0.0280703,-0.1252,-0.0147359;REVB=-0.0274001,-0.00725942,-0.0517551;RO=39;SAF=3,9,7;SAR=0,6,0;SRF=14;SRR=25;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.578396,0.280356,0.726517;STB=0.5,0.666371,0.99873;STBP=1,0.262,0.001;TYPE=mnp,del,mnp;VARB=0,0.150156,0.127947;OID=.,.,.;OPOS=64415079,64415081,64415080;OREF=TAG,G,AG;OALT=CTA,-,GA;OMAPALT=CTA,TA,TGA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:32:71:68:39:49:3,15,7:0,11,8:0,0.161765,0.117647:0,6,0:3,9,7:14:25:0,4,0:0,7,8:21:28
chr13	64415160	.	GT	GTG,TG	40.91	PASS	AF=0.333333,0;AO=4,2;DP=34;FAO=11,0;FDP=33;FR=.;FRO=22;FSAF=6,0;FSAR=5,0;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=0.105805,0.00986976;FXX=0.0294031;HRUN=3,3;LEN=1,2;MLLD=13.4661,23.5744;QD=4.95856;RBI=0.122456,0.0388877;REFB=-0.0465773,-0.0148236;REVB=0.06165,0.0376143;RO=16;SAF=1,0;SAR=3,2;SRF=9;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.352936,-0.560396;STB=0.561688,0.5;STBP=0.659,1;TYPE=ins,mnp;VARB=0.0733367,0;OID=.,.;OPOS=64415162,64415160;OREF=-,GT;OALT=G,TG;OMAPALT=GTG,TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:34:33:16:22:4,2:11,0:0.333333,0:3,2:1,0:9:7:5,0:6,0:14:8
chr13	67800935	.	G	A	318.88	PASS	AF=0.428571;AO=35;DP=84;FAO=36;FDP=84;FR=.;FRO=48;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=22;FSRR=26;FWDB=-0.0104142;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.359;QD=15.1849;RBI=0.0106694;REFB=-0.00235242;REVB=-0.00231951;RO=48;SAF=16;SAR=19;SRF=22;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00122639;STB=0.507964;STBP=0.914;TYPE=snp;VARB=0.00380229;OID=.;OPOS=67800935;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:48:48:35:36:0.428571:19:16:22:26:19:17:22:26
chr13	67802339	.	A	T	1786.14	PASS	AF=0.991597;AO=117;DP=119;FAO=118;FDP=119;FR=.;FRO=1;FSAF=51;FSAR=67;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00365895;FXX=0.00833264;HRUN=3;LEN=1;MLLD=281.172;QD=60.0385;RBI=0.00408793;REFB=-0.105509;REVB=-0.00182299;RO=1;SAF=51;SAR=66;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00922126;STB=0.504854;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=7.769e-07;OID=.;OPOS=67802339;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:119:119:1:1:117:118:0.991597:66:51:1:0:67:51:1:0
chr13	69267981	.	T	C	501.66	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0239866;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=290.518;QD=59.0187;RBI=0.0239893;REFB=0;REVB=0.000363456;RO=0;SAF=28;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.73777e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.59727e-05;OID=.;OPOS=69267981;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:6:28:0:0:6:28:0:0
chr13	70377107	.	A	G	205.18	PASS	AF=0.390625;AO=25;DP=64;FAO=25;FDP=64;FR=.;FRO=39;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=17;FWDB=0.0324706;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.6157;QD=12.8239;RBI=0.0348382;REFB=0.00342307;REVB=0.0126238;RO=39;SAF=9;SAR=16;SRF=22;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.218276;STB=0.625372;STBP=0.111;TYPE=snp;VARB=-0.00342882;OID=.;OPOS=70377107;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:39:39:25:25:0.390625:16:9:22:17:16:9:22:17
chr13	70377165	.	C	T	149.41	PASS	AF=0.351852;AO=19;DP=56;FAO=19;FDP=54;FR=.;FRO=35;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=-0.0194162;FXX=0.0357079;HRUN=2;LEN=1;MLLD=232.256;QD=11.0673;RBI=0.0196465;REFB=-0.0140415;REVB=0.00299973;RO=34;SAF=7;SAR=12;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147759;STB=0.596319;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.0265488;OID=.;OPOS=70377165;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:54:34:35:19:19:0.351852:12:7:17:17:12:7:18:17
chr13	70681598	.	T	C	818.28	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0157331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.383;QD=57.4234;RBI=0.0292794;REFB=0;REVB=0.0246932;RO=0;SAF=34;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.97684e-05;OID=.;OPOS=70681598;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:55:57:0:0:55:57:1:21:34:0:0:22:35:0:0
chr13	71033601	.	T	C	78.64	PASS	AF=0.47619;AO=10;DP=21;FAO=10;FDP=21;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=-0.012444;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.764;QD=14.9786;RBI=0.0379582;REFB=0.00780534;REVB=0.0358604;RO=11;SAF=5;SAR=5;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122307;STB=0.571288;STBP=0.553;TYPE=snp;VARB=-0.00343606;OID=.;OPOS=71033601;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:21:21:11:11:10:10:0.47619:5:5:7:4:5:5:7:4
chr13	73280182	.	T	C	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00568746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.001;QD=56.1911;RBI=0.00692048;REFB=0;REVB=0.00394281;RO=0;SAF=9;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.62669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.54624e-05;OID=.;OPOS=73280182;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:19:9:0:0:19:9:0:0
chr13	73301655	.	A	C	501.66	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00869945;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=329.707;QD=59.0187;RBI=0.00871023;REFB=0;REVB=0.000433237;RO=0;SAF=19;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.40663e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.8772e-05;OID=.;OPOS=73301655;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:15:19:0:0:15:19:0:0
chr13	73301728	.	T	C	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0519805;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.969;QD=51.1845;RBI=0.0519973;REFB=0;REVB=-0.00132033;RO=0;SAF=9;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000903864;OID=.;OPOS=73301728;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:11:9:0:0:11:9:0:0
chr13	73302261	.	G	A	228.37	PASS	AF=0.409091;AO=27;DP=66;FAO=27;FDP=66;FR=.;FRO=39;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=0.086979;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.525;QD=13.8406;RBI=0.0871334;REFB=-0.0139682;REVB=0.00518516;RO=39;SAF=7;SAR=20;SRF=18;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.235316;STB=0.635217;STBP=0.098;TYPE=snp;VARB=0.0125386;OID=.;OPOS=73302261;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:39:39:27:27:0.409091:20:7:18:21:20:7:18:21
chr13	73320892	.	A	C	339.18	PASS	AF=0.473684;AO=36;DP=76;FAO=36;FDP=76;FR=.;FRO=40;FSAF=23;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=20;FWDB=0.00881214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.448;QD=17.8518;RBI=0.0136041;REFB=-0.0111343;REVB=-0.0103642;RO=40;SAF=23;SAR=13;SRF=20;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135397;STB=0.57583;STBP=0.244;TYPE=snp;VARB=0.0101569;OID=.;OPOS=73320892;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:40:40:36:36:0.473684:13:23:20:20:13:23:20:20
chr13	73329358	.	G	A	131.32	PASS	AF=0.405405;AO=15;DP=37;FAO=15;FDP=37;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=-0.00830722;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.378;QD=14.1967;RBI=0.0108373;REFB=-0.00675095;REVB=-0.00695969;RO=22;SAF=10;SAR=5;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0175409;STB=0.510191;STBP=0.935;TYPE=snp;VARB=0.0128898;OID=.;OPOS=73329358;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:22:22:15:15:0.405405:5:10:15:7:5:10:15:7
chr13	73343039	.	C	T	200.97	PASS	AF=0.512821;AO=20;DP=39;FAO=20;FDP=39;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.0113405;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.007;QD=20.6124;RBI=0.0113955;REFB=-0.017574;REVB=-0.00111831;RO=19;SAF=8;SAR=12;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.018852;STB=0.510628;STBP=0.907;TYPE=snp;VARB=0.0272362;OID=.;OPOS=73343039;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:19:19:20:20:0.512821:12:8:8:11:12:8:8:11
chr13	73348157	.	C	A	264.01	PASS	AF=0.434783;AO=30;DP=69;FAO=30;FDP=69;FR=.;FRO=39;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=27;FWDB=-0.0739498;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.0042;QD=15.3051;RBI=0.0794018;REFB=0.0166271;REVB=-0.028915;RO=39;SAF=15;SAR=15;SRF=12;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.193206;STB=0.608627;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=-0.0250778;OID=.;OPOS=73348157;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:39:39:30:30:0.434783:15:15:12:27:15:15:12:27
chr13	73350079	.	T	C	567.84	PASS	AF=0.423841;AO=63;DP=151;FAO=64;FDP=151;FR=.;FRO=87;FSAF=31;FSAR=33;FSRF=38;FSRR=49;FWDB=-0.00727942;FXX=0.00657851;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.7776;QD=15.042;RBI=0.0114348;REFB=-0.010905;REVB=-0.00881847;RO=87;SAF=31;SAR=32;SRF=38;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0573002;STB=0.527487;STBP=0.586;TYPE=snp;VARB=0.0137201;OID=.;OPOS=73350079;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:151:151:87:87:63:64:0.423841:32:31:38:49:33:31:38:49
chr13	73369642	.	A	G	339.1	PASS	AF=0.473684;AO=36;DP=76;FAO=36;FDP=76;FR=.;FRO=40;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=18;FWDB=0.025819;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.9102;QD=17.8475;RBI=0.0258763;REFB=0.0128485;REVB=0.00172193;RO=40;SAF=20;SAR=16;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00529046;STB=0.502957;STBP=0.972;TYPE=snp;VARB=-0.0124538;OID=.;OPOS=73369642;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:40:40:36:36:0.473684:16:20:22:18:16:20:22:18
chr13	73650112	.	C	A	399.74	PASS	AF=1;AO=23;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00452544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.435;QD=55.1358;RBI=0.030485;REFB=0;REVB=0.0301472;RO=0;SAF=16;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.15609e-05;OID=.;OPOS=73650112;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:23:29:1:7:16:0:0:9:20:0:0
chr13	73650117	.	G	A	411.11	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00521963;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.831;QD=56.7045;RBI=0.0165309;REFB=0;REVB=0.0156852;RO=0;SAF=19;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.1568e-05;OID=.;OPOS=73650117;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:10:19:0:0:10:19:0:0
chr13	74863339	.	C	A,T	619.62	PASS	AF=0.95122,0.0487805;AO=39,2;DP=41;FAO=39,2;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=17,0;FSAR=22,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00653208,0.0144332;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=199.019,23.1989;QD=60.4503;RBI=0.00683837,0.0251615;REFB=0,0;REVB=-0.00202365,-0.0206103;RO=0;SAF=17,0;SAR=22,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000650705,0.0534845;OID=.,.;OPOS=74863339,74863339;OREF=C,C;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:41:41:0:0:39,2:39,2:0.95122,0.0487805:22,2:17,0:0:0:22,2:17,0:0:0
chr13	74988714	.	C	T	4088.65	PASS	AF=0.954225;AO=270;DP=283;FAO=271;FDP=284;FR=.;FRO=13;FSAF=155;FSAR=116;FSRF=1;FSRR=12;FWDB=0.0263225;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.77;QD=57.5866;RBI=0.028371;REFB=-0.130697;REVB=0.0105849;RO=2;SAF=154;SAR=116;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00100645;STB=0.522984;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00202203;OID=.;OPOS=74988714;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:17:283:284:2:13:270:271:0.954225:116:154:1:1:116:155:1:12
chr13	75814018	.	C	T	162.52	PASS	AF=0.882353;AO=15;DP=17;FAO=15;FDP=17;FR=.;FRO=2;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.000657872;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=236.249;QD=38.2395;RBI=0.00727967;REFB=0.00309185;REVB=0.00724988;RO=2;SAF=10;SAR=5;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0828326;STB=0.545396;STBP=0.412;TYPE=snp;VARB=-0.000119884;OID=.;OPOS=75814018;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:17:17:2:2:15:15:0.882353:5:10:2:0:5:10:2:0
chr13	75814384	.	C	T	794.95	PASS	AF=0.966102;AO=57;DP=60;FAO=57;FDP=59;FR=.;FRO=2;FSAF=26;FSAR=31;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00537008;FXX=0.0166639;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.553;QD=53.8949;RBI=0.00612467;REFB=-0.0604966;REVB=-0.00294513;RO=1;SAF=26;SAR=31;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0177934;STB=0.518512;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=-0.000203744;OID=.;OPOS=75814384;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:60:59:1:2:57:57:0.966102:31:26:1:0:31:26:2:0
chr13	75876389	.	G	A	491.12	PASS	AF=0.484848;AO=48;DP=99;FAO=48;FDP=99;FR=.;FRO=51;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=28;FSRR=23;FWDB=-0.0209164;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.796;QD=19.843;RBI=0.0214908;REFB=0.00531902;REVB=0.00493537;RO=51;SAF=22;SAR=26;SRF=28;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0840624;STB=0.546658;STBP=0.374;TYPE=snp;VARB=-0.00530244;OID=.;OPOS=75876389;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:51:51:48:48:0.484848:26:22:28:23:26:22:28:23
chr13	75884216	.	C	T	275.21	PASS	AF=0.47619;AO=29;DP=62;FAO=30;FDP=63;FR=.;FRO=33;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=0.0237122;FXX=0.0735186;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.757;QD=17.4737;RBI=0.0403758;REFB=-0.0357953;REVB=-0.0326794;RO=32;SAF=14;SAR=15;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103485;STB=0.539656;STBP=0.567;TYPE=snp;VARB=0.0433684;OID=.;OPOS=75884216;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:63:32:33:29:30:0.47619:15:14:19:13:15:15:19:14
chr13	75884290	.	G	A	116.16	PASS	AF=0.341463;AO=14;DP=41;FAO=14;FDP=41;FR=.;FRO=27;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=9;FWDB=-0.0307875;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.545;QD=11.3329;RBI=0.0318173;REFB=-0.0217221;REVB=0.0080293;RO=27;SAF=5;SAR=9;SRF=18;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.333696;STB=0.696702;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=0.0335815;OID=.;OPOS=75884290;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:27:27:14:14:0.341463:9:5:18:9:9:5:18:9
chr13	75915261	.	A	C	223.12	PASS	AF=0.462963;AO=25;DP=54;FAO=25;FDP=54;FR=.;FRO=29;FSAF=20;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=-0.00890476;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.145;QD=16.5274;RBI=0.00989713;REFB=0.00419541;REVB=-0.00431956;RO=29;SAF=20;SAR=5;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.40885;STB=0.73313;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=-0.00363475;OID=.;OPOS=75915261;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:29:29:25:25:0.462963:5:20:12:17:5:20:12:17
chr13	75936519	.	C	G	340.74	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0217267;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=326.456;QD=54.5177;RBI=0.0238516;REFB=0;REVB=0.00984103;RO=0;SAF=12;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.76137e-05;OID=.;OPOS=75936519;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:13:12:0:0:13:12:0:0
chr13	76055602	.	G	A	311.73	PASS	AF=0.6;AO=30;DP=51;FAO=30;FDP=50;FR=.;FRO=20;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.0285063;FXX=0.019604;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.025;QD=24.9386;RBI=0.0291297;REFB=-0.00978069;REVB=0.00599386;RO=20;SAF=11;SAR=19;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100909;STB=0.555672;STBP=0.367;TYPE=snp;VARB=0.00442542;OID=.;OPOS=76055602;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:50:20:20:30:30:0.6:19:11:10:10:19:11:10:10
chr13	76124151	.	C	T	477.72	PASS	AF=0.534884;AO=46;DP=86;FAO=46;FDP=86;FR=.;FRO=40;FSAF=19;FSAR=27;FSRF=25;FSRR=15;FWDB=-0.00368413;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.7956;QD=22.2196;RBI=0.0730777;REFB=-0.0358674;REVB=-0.0729848;RO=38;SAF=19;SAR=27;SRF=24;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.178987;STB=0.598145;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.0224249;OID=.;OPOS=76124151;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:38:40:46:46:0.534884:27:19:24:14:27:19:25:15
chr13	76143572	.	T	C	215.49	PASS	AF=0.393939;AO=26;DP=66;FAO=26;FDP=66;FR=.;FRO=40;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=-0.00179971;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.8388;QD=13.0599;RBI=0.0023139;REFB=0.00305736;REVB=-0.00145437;RO=40;SAF=14;SAR=12;SRF=18;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0933606;STB=0.553447;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=-0.00325646;OID=.;OPOS=76143572;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:40:40:26:26:0.393939:12:14:18:22:12:14:18:22
chr13	76378459	.	T	C	1861.98	PASS	AF=0.99187;AO=122;DP=123;FAO=122;FDP=123;FR=.;FRO=1;FSAF=64;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0282563;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=145.724;QD=60.5521;RBI=0.0301598;REFB=-0.130512;REVB=0.0105449;RO=0;SAF=64;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504273;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.000364907;OID=.;OPOS=76378459;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:123:123:0:1:122:122:0.99187:58:64:0:0:58:64:0:1
chr13	76709108	.	G	A	501.66	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0175647;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.681;QD=59.0187;RBI=0.038481;REFB=0;REVB=0.0342384;RO=0;SAF=17;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000121569;OID=.;OPOS=76709108;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:17:17:0:0:17:17:0:0
chr13	76709223	.	C	A	1018.04	PASS	AF=0.972222;AO=40;DP=71;FAO=70;FDP=72;FR=.;FRO=2;FSAF=36;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0324073;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.6169;QD=56.558;RBI=0.0579125;REFB=-0.0378959;REVB=0.0479961;RO=0;SAF=36;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.3999e-08;STB=0.500397;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=0.00874175;OID=.;OPOS=76709223;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:71:72:0:2:40:70:0.972222:4:36:0:0:34:36:1:1
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chr13	77574983	.	A	G	236.12	PASS	AF=0.469388;AO=23;DP=49;FAO=23;FDP=49;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=0.0021669;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=218.784;QD=19.2752;RBI=0.0275159;REFB=-0.0171374;REVB=-0.0274304;RO=25;SAF=13;SAR=10;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0789875;STB=0.534853;STBP=0.618;TYPE=snp;VARB=0.0147133;OID=.;OPOS=77574983;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:25:26:23:23:0.469388:10:13:12:13:10:13:13:13
chr13	77751892	.	C	T	1212.84	PASS	AF=0.987654;AO=80;DP=81;FAO=80;FDP=81;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.010766;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=234.779;QD=59.8934;RBI=0.0120831;REFB=-0.0277005;REVB=0.0054857;RO=0;SAF=47;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.71057e-08;STB=0.505262;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=2.45226e-05;OID=.;OPOS=77751892;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:81:81:0:1:80:80:0.987654:33:47:0:0:33:47:1:0
chr13	77834627	.	A	C	387.83	PASS	AF=0.42268;AO=41;DP=97;FAO=41;FDP=97;FR=.;FRO=56;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=29;FSRR=27;FWDB=-0.00104358;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.769;QD=15.993;RBI=0.0119066;REFB=-0.0102109;REVB=0.0118608;RO=56;SAF=19;SAR=22;SRF=29;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0557996;STB=0.531439;STBP=0.586;TYPE=snp;VARB=0.0130271;OID=.;OPOS=77834627;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:56:56:41:41:0.42268:22:19:29:27:22:19:29:27
chr13	78146301	.	C	T	1418.97	PASS	AF=0.98913;AO=91;DP=92;FAO=91;FDP=92;FR=.;FRO=1;FSAF=49;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0621234;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2928;QD=61.6945;RBI=0.0829204;REFB=-0.0825502;REVB=-0.0549225;RO=1;SAF=49;SAR=42;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0111524;STB=0.505881;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.00563534;OID=.;OPOS=78146301;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:92:92:1:1:91:91:0.98913:42:49:0:1:42:49:0:1
chr13	78178550	.	G	A	745.85	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0855132;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.3068;QD=63.4769;RBI=0.0923021;REFB=0;REVB=0.0347444;RO=0;SAF=18;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.06241e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000593108;OID=.;OPOS=78178550;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:47:0:0:46:47:1:28:18:0:0:29:18:0:0
chr13	78477674	.	A	G	740.41	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0276584;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.429;QD=56.9546;RBI=0.0399843;REFB=0;REVB=-0.0288748;RO=0;SAF=21;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.93989e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.94834e-06;OID=.;OPOS=78477674;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:31:21:0:0:31:21:0:0
chr13	78521890	.	C	A	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0690246;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.845;QD=48.7369;RBI=0.0761224;REFB=0;REVB=-0.0320972;RO=0;SAF=9;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000646847;OID=.;OPOS=78521890;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:8:9:0:0:8:9:0:0
chr13	79174091	.	T	A	265.35	PASS	AF=0.491525;AO=29;DP=59;FAO=29;FDP=59;FR=.;FRO=30;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=0.00994687;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.77;QD=17.9895;RBI=0.00997429;REFB=-0.00426897;REVB=0.000738987;RO=30;SAF=19;SAR=10;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.086055;STB=0.548272;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.0059535;OID=.;OPOS=79174091;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:30:30:29:29:0.491525:10:19:17:13:10:19:17:13
chr13	79188534	.	T	A	1758.56	PASS	AF=1;AO=116;DP=116;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.014662;FXX=0.0170926;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.011;QD=61.1674;RBI=0.023113;REFB=0;REVB=0.0178672;RO=0;SAF=57;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.25502e-05;OID=.;OPOS=79188534;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:116:115:0:0:116:115:1:59:57:0:0:59:56:0:0
chr13	79194750	.	TGA	T	945.48	PASS	AF=1;AO=60;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00641412;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=305.809;QD=58.1834;RBI=0.00807249;REFB=0;REVB=0.00490144;RO=0;SAF=41;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.31043e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=7.31962e-06;OID=.;OPOS=79194751;OREF=GA;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:60:65:65:65:0:44:21:0:0:5:0:41:19:0:0
chr13	79940811	.	T	C	150.15	PASS	AF=0.681818;AO=15;DP=23;FAO=15;FDP=22;FR=.;FRO=7;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=0.00720585;FXX=0.0434594;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.326;QD=27.2998;RBI=0.0306789;REFB=-0.0217741;REVB=-0.0298206;RO=7;SAF=10;SAR=5;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128708;STB=0.571339;STBP=0.382;TYPE=snp;VARB=0.0160179;OID=.;OPOS=79940811;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:23:22:7:7:15:15:0.681818:5:10:6:1:5:10:6:1
chr13	80910786	.	C	A	545.22	PASS	AF=0.973684;AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0617281;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.6752;QD=57.3911;RBI=0.103442;REFB=-0.0361675;REVB=-0.0830057;RO=1;SAF=13;SAR=24;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0191166;STB=0.510199;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=-0.00106086;OID=.;OPOS=80910786;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:38:38:1:1:37:37:0.973684:24:13:0:1:24:13:0:1
chr13	80910851	.	A	C	219.33	PASS	AF=0.567568;AO=21;DP=37;FAO=21;FDP=37;FR=.;FRO=16;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=-0.00963835;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=266.075;QD=23.711;RBI=0.00965961;REFB=0.00832942;REVB=0.000640504;RO=16;SAF=11;SAR=10;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177992;STB=0.598869;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=-0.0047878;OID=.;OPOS=80910851;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:16:16:21:21:0.567568:10:11:12:4:10:11:12:4
chr13	80911525	.	G	A	125.23	PASS	AF=0.3125;AO=15;DP=48;FAO=15;FDP=48;FR=.;FRO=33;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=-0.00652676;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=259.327;QD=10.4362;RBI=0.0130298;REFB=-0.0140649;REVB=-0.0112773;RO=33;SAF=8;SAR=7;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124717;STB=0.574487;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.031096;OID=.;OPOS=80911525;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:33:33:15:15:0.3125:7:8:14:19:7:8:14:19
chr13	84455810	.	CG	CGC,GC	318.48	PASS	AF=0.267857,0.205357;AO=26,22;DP=114;FAO=30,23;FDP=112;FR=.;FRO=59;FSAF=26,23;FSAR=4,0;FSRF=31;FSRR=28;FWDB=0.0697682,0.0645145;FXX=0.0175423;HRUN=1,7;LEN=1,2;MLLD=14.3425,18.8686;QD=11.3744;RBI=0.0743742,0.0646908;REFB=-0.0984347,-0.0700451;REVB=-0.0257667,-0.00477217;RO=61;SAF=23,22;SAR=3,0;SRF=33;SRR=28;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.508811,0.783703;STB=0.784685,0.999427;STBP=0,0;TYPE=ins,mnp;VARB=0.168411,0.0898627;OID=.,.;OPOS=84455812,84455810;OREF=-,CG;OALT=C,GC;OMAPALT=CGC,GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:91:114:112:61:59:26,22:30,23:0.267857,0.205357:3,0:23,22:33:28:4,0:26,23:31:28
chr13	86367009	.	C	A	444.28	PASS	AF=0.471154;AO=45;DP=100;FAO=49;FDP=104;FR=.;FRO=55;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=25;FSRR=30;FWDB=0.0113584;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.621;QD=17.0877;RBI=0.017666;REFB=-0.00479985;REVB=0.0135305;RO=55;SAF=19;SAR=26;SRF=25;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0323624;STB=0.525141;STBP=0.638;TYPE=snp;VARB=0.00713412;OID=.;OPOS=86367009;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:104:55:55:45:49:0.471154:26:19:25:30:29:20:25:30
chr13	86367973	.	CT	C	36.51	PASS	AF=0.45;AO=9;DP=20;FAO=9;FDP=20;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.0644615;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=12.2147;QD=7.30106;RBI=0.0646656;REFB=0.0540256;REVB=0.00513395;RO=9;SAF=5;SAR=4;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0946172;STB=0.604168;STBP=0.436;TYPE=del;VARB=-0.0387632;OID=.;OPOS=86367974;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.45:9:20:9:20:11:5:4:4:7:36:9:5:4:4:5
chr13	86369120	.	C	T	200.95	PASS	AF=0.433962;AO=23;DP=53;FAO=23;FDP=53;FR=.;FRO=30;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=8;FWDB=-0.040642;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.482;QD=15.1662;RBI=0.0406571;REFB=-0.0178207;REVB=-0.00110564;RO=29;SAF=7;SAR=16;SRF=21;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.401301;STB=0.733983;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.0106308;OID=.;OPOS=86369120;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:29:30:23:23:0.433962:16:7:21:8:16:7:22:8
chr13	88331240	.	AT	A,ATTGTA	159.12	PASS	AF=0.1,0.7;AO=2,13;DP=20;FAO=2,14;FDP=20;FR=.;FRO=4;FSAF=2,11;FSAR=0,3;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0326594,-0.00479428;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,4;MLLD=26.052,265.209;QD=31.8242;RBI=0.0722525,0.0154167;REFB=0.0677062,-0.0029374;REVB=-0.0644498,-0.0146523;RO=4;SAF=2,10;SAR=0,3;SRF=3;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.569412,0.0113256;STB=0.991616,0.511611;STBP=0.422,0.984;TYPE=del,ins;VARB=-0.0632647,0.00257428;OID=.,.;OPOS=88331241,88331242;OREF=T,-;OALT=-,TGTA;OMAPALT=A,ATTGTA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0.1,0.7:2,13:20:2,14:20:4:2,11:0,3:3:1:22:4:2,10:0,3:3:1
chr13	92345579	.	C	T	538.25	PASS	AF=0.5;AO=56;DP=112;FAO=56;FDP=112;FR=.;FRO=56;FSAF=30;FSAR=26;FSRF=34;FSRR=22;FWDB=-0.013913;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.846;QD=19.223;RBI=0.0719283;REFB=-0.016105;REVB=-0.0705699;RO=55;SAF=30;SAR=26;SRF=34;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0748926;STB=0.53607;STBP=0.462;TYPE=snp;VARB=0.0178807;OID=.;OPOS=92345579;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:112:55:56:56:56:0.5:26:30:34:21:26:30:34:22
chr13	95034763	.	G	A	629.66	PASS	AF=1;AO=40;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.014508;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.713;QD=59.9673;RBI=0.049454;REFB=0;REVB=0.0472781;RO=0;SAF=15;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000477226;OID=.;OPOS=95034763;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:42:42:0:0:40:42:1:25:15:0:0:26:16:0:0
chr13	95097956	.	C	T	333.51	PASS	AF=0.48;AO=35;DP=74;FAO=36;FDP=75;FR=.;FRO=39;FSAF=27;FSAR=9;FSRF=22;FSRR=17;FWDB=0.0544373;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.6841;QD=17.7872;RBI=0.0553097;REFB=0.0053178;REVB=-0.009785;RO=39;SAF=26;SAR=9;SRF=22;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.195409;STB=0.614105;STBP=0.081;TYPE=snp;VARB=-0.0044441;OID=.;OPOS=95097956;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:75:39:39:35:36:0.48:9:26:22:17:9:27:22:17
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chr13	95279505	.	T	A	75.15	PASS	AF=0.37037;AO=10;DP=27;FAO=10;FDP=27;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.00524772;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.306;QD=11.1333;RBI=0.00600894;REFB=-0.00518764;REVB=-0.00292726;RO=16;SAF=4;SAR=6;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104401;STB=0.545363;STBP=0.772;TYPE=snp;VARB=0.00671167;OID=.;OPOS=95279505;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:27:27:16:17:10:10:0.37037:6:4:8:8:6:4:8:9
chr13	95280923	.	A	T	628.78	PASS	AF=0.543103;AO=61;DP=114;FAO=63;FDP=116;FR=.;FRO=53;FSAF=31;FSAR=32;FSRF=29;FSRR=24;FWDB=0.00867067;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.0701;QD=21.682;RBI=0.0491852;REFB=-0.0303518;REVB=0.0484149;RO=53;SAF=29;SAR=32;SRF=29;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0607071;STB=0.525156;STBP=0.598;TYPE=snp;VARB=0.0272172;OID=.;OPOS=95280923;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:114:116:53:53:61:63:0.543103:32:29:29:24:32:31:29:24
chr13	95364046	.	C	G	2351.14	PASS	AF=1;AO=147;DP=147;FAO=147;FDP=147;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00142344;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.996;QD=63.9765;RBI=0.0187263;REFB=0;REVB=0.0186721;RO=0;SAF=74;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.90204e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.99299e-05;OID=.;OPOS=95364046;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:147:147:0:0:147:147:1:73:74:0:0:73:74:0:0
chr13	95364337	.	T	G	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.019523;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.329;QD=35.5759;RBI=0.0209285;REFB=0;REVB=-0.00754009;RO=0;SAF=1;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000330293;OID=.;OPOS=95364337;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:6:1:0:0:6:1:0:0
chr13	95672950	.	A	G	183.88	PASS	AF=0.463415;AO=19;DP=40;FAO=19;FDP=41;FR=.;FRO=22;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.0682719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.651;QD=17.9398;RBI=0.0699457;REFB=-0.00747802;REVB=-0.01521;RO=21;SAF=11;SAR=8;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0516853;STB=0.542812;STBP=0.608;TYPE=snp;VARB=0.00470394;OID=.;OPOS=95672950;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:41:21:22:19:19:0.463415:8:11:11:10:8:11:11:11
chr13	95673135	.	C	T	188.71	PASS	AF=0.415094;AO=22;DP=53;FAO=22;FDP=53;FR=.;FRO=31;FSAF=5;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.0718495;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.6555;QD=14.242;RBI=0.0746894;REFB=0.010117;REVB=-0.0204002;RO=28;SAF=5;SAR=17;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.237141;STB=0.673096;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=-0.0210307;OID=.;OPOS=95673135;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:28:31:22:22:0.415094:17:5:12:16:17:5:15:16
chr13	95673518	.	T	C	844.23	PASS	AF=0.542484;AO=83;DP=154;FAO=83;FDP=153;FR=.;FRO=70;FSAF=37;FSAR=46;FSRF=32;FSRR=38;FWDB=-0.00727481;FXX=0.00649309;HRUN=3;LEN=1;MLLD=234.347;QD=22.0713;RBI=0.00932549;REFB=-0.00152389;REVB=-0.00583454;RO=69;SAF=37;SAR=46;SRF=32;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0150868;STB=0.505252;STBP=0.89;TYPE=snp;VARB=0.00127446;OID=.;OPOS=95673518;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:154:153:69:70:83:83:0.542484:46:37:32:37:46:37:32:38
chr13	95673938	.	TA	T,TG	1425.42	PASS	AF=0.204082,0.77551;AO=19,74;DP=98;FAO=20,76;FDP=98;FR=.;FRO=2;FSAF=9,20;FSAR=11,56;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00829022,0.00657967;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=129.955,146.912;QD=58.1806;RBI=0.0140916,0.0127967;REFB=-0.148351,-0.04923;REVB=0.0113949,0.0109756;RO=2;SAF=9,20;SAR=10,54;SRF=0;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0834716,0.0171998;STB=0.541626,0.50877;STBP=0.307,0.43;TYPE=del,snp;VARB=0.0232696,-0.00308456;OID=.,.;OPOS=95673939,95673939;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=T,TG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.204082,0.77551:19,74:98:20,76:98:2:9,20:11,56:0:2:99:2:9,20:10,54:0:2
chr13	95714976	.	C	T	278.92	PASS	AF=0.4;AO=32;DP=80;FAO=32;FDP=80;FR=.;FRO=48;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=27;FWDB=0.00102006;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.834;QD=13.9458;RBI=0.0206699;REFB=-0.000935698;REVB=-0.0206448;RO=48;SAF=18;SAR=14;SRF=21;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131357;STB=0.57472;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=0.00130666;OID=.;OPOS=95714976;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:48:48:32:32:0.4:14:18:21:27:14:18:21:27
chr13	95726541	.	A	G	304.94	PASS	AF=0.364583;AO=35;DP=96;FAO=35;FDP=96;FR=.;FRO=61;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=42;FSRR=19;FWDB=-0.00110222;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=243.99;QD=12.7056;RBI=0.00863945;REFB=-0.0127457;REVB=0.00856886;RO=61;SAF=18;SAR=17;SRF=42;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1957;STB=0.611451;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=0.0284779;OID=.;OPOS=95726541;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:96:61:61:35:35:0.364583:17:18:42:19:17:18:42:19
chr13	95727780	.	T	C	298.56	PASS	AF=0.5;AO=32;DP=64;FAO=32;FDP=64;FR=.;FRO=32;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=-0.0182852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.7094;QD=18.6599;RBI=0.019491;REFB=-0.00115519;REVB=-0.00674913;RO=32;SAF=15;SAR=17;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111659;STB=0.562218;STBP=0.337;TYPE=snp;VARB=0.00233072;OID=.;OPOS=95727780;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:32:32:32:32:0.5:17:15:19:13:17:15:19:13
chr13	95858978	.	T	C	75.62	PASS	AF=0.384615;AO=10;DP=26;FAO=10;FDP=26;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.0201532;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.521;QD=11.634;RBI=0.0218364;REFB=0.0118414;REVB=0.00840701;RO=16;SAF=5;SAR=5;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0644098;STB=0.538385;STBP=0.779;TYPE=snp;VARB=-0.0194023;OID=.;OPOS=95858978;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:26:26:16:16:10:10:0.384615:5:5:7:9:5:5:7:9
chr13	95858996	.	T	C	46.0	PASS	AF=0.35;AO=7;DP=20;FAO=7;FDP=20;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=-0.00132774;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.132;QD=9.19978;RBI=0.00133285;REFB=-0.0103421;REVB=-0.000116669;RO=13;SAF=3;SAR=4;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133873;STB=0.581866;STBP=0.638;TYPE=snp;VARB=0.0194554;OID=.;OPOS=95858996;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:20:20:13:13:7:7:0.35:4:3:4:9:4:3:4:9
chr13	95859035	.	C	A	31.81	PASS	AF=0.416667;AO=5;DP=13;FAO=5;FDP=12;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=-0.0171058;FXX=0.076864;HRUN=2;LEN=1;MLLD=231.093;QD=10.6049;RBI=0.0337318;REFB=0.00109151;REVB=0.0290727;RO=7;SAF=2;SAR=3;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115149;STB=0.571156;STBP=0.783;TYPE=snp;VARB=-0.00079138;OID=.;OPOS=95859035;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:31:13:12:7:7:5:5:0.416667:3:2:2:5:3:2:2:5
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chr13	96230279	.	T	G	370.99	PASS	AF=0.453488;AO=36;DP=83;FAO=39;FDP=86;FR=.;FRO=47;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=28;FWDB=0.0125112;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.8735;QD=17.2553;RBI=0.0145357;REFB=-0.0121056;REVB=0.00739966;RO=47;SAF=20;SAR=16;SRF=19;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151171;STB=0.586796;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=0.0177267;OID=.;OPOS=96230279;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:86:47:47:36:39:0.453488:16:20:19:28:17:22:19:28
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chr13	96540141	.	T	C	4638.05	PASS	AF=0.983333;AO=294;DP=300;FAO=295;FDP=300;FR=.;FRO=5;FSAF=136;FSAR=159;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.00979335;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=62.5838;QD=61.8407;RBI=0.0155843;REFB=-0.0375864;REVB=0.0121228;RO=5;SAF=135;SAR=159;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00189994;STB=0.501023;STBP=0.767;TYPE=snp;VARB=0.000935131;OID=.;OPOS=96540141;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:300:300:5:5:294:295:0.983333:159:135:2:3:159:136:2:3
chr13	96540143	.	T	C	4668.87	PASS	AF=1;AO=297;DP=298;FAO=301;FDP=301;FR=.;FRO=0;FSAF=139;FSAR=162;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000891413;FXX=0.00331115;HRUN=3;LEN=1;MLLD=205.089;QD=62.0448;RBI=0.0556113;REFB=-0.0475194;REVB=0.0556042;RO=1;SAF=138;SAR=159;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00299023;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.44794e-05;OID=.;OPOS=96540143;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:22:298:301:1:0:297:301:1:159:138:0:1:162:139:0:0
chr13	96540204	.	T	G	1928.45	PASS	AF=0.483627;AO=193;DP=398;FAO=192;FDP=397;FR=.;FRO=205;FSAF=76;FSAR=116;FSRF=96;FSRR=109;FWDB=0.00364815;FXX=0.00501241;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.319;QD=19.4302;RBI=0.0200424;REFB=-0.0110101;REVB=0.0197076;RO=205;SAF=77;SAR=116;SRF=96;SRR=109;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0667517;STB=0.538482;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.0115524;OID=.;OPOS=96540204;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:398:397:205:205:193:192:0.483627:116:77:96:109:116:76:96:109
chr13	96638636	.	A	C	523.0	PASS	AF=0.459016;AO=56;DP=121;FAO=56;FDP=122;FR=.;FRO=66;FSAF=28;FSAR=28;FSRF=36;FSRR=30;FWDB=0.0108691;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=255.688;QD=17.1476;RBI=0.0109185;REFB=-0.00116843;REVB=-0.0010373;RO=65;SAF=28;SAR=28;SRF=36;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0520069;STB=0.524581;STBP=0.63;TYPE=snp;VARB=0.00124622;OID=.;OPOS=96638636;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:121:122:65:66:56:56:0.459016:28:28:36:29:28:28:36:30
chr13	96821982	.	G	T	747.1	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0149686;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=292.979;QD=63.583;RBI=0.0197667;REFB=0;REVB=0.0129099;RO=0;SAF=22;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.54662e-06;OID=.;OPOS=96821982;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:25:22:0:0:25:22:0:0
chr13	97489457	.	G	A	663.54	PASS	AF=0.670588;AO=55;DP=84;FAO=57;FDP=85;FR=.;FRO=28;FSAF=27;FSAR=30;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=0.00165388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.721;QD=31.2253;RBI=0.0119001;REFB=0.0118931;REVB=-0.0117846;RO=28;SAF=25;SAR=30;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.006113;STB=0.503105;STBP=0.941;TYPE=snp;VARB=-0.00402402;OID=.;OPOS=97489457;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:85:28:28:55:57:0.670588:30:25:13:15:30:27:13:15
chr13	97639414	.	C	T	361.49	PASS	AF=0.653846;AO=34;DP=53;FAO=34;FDP=52;FR=.;FRO=18;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.0118957;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.937;QD=27.8071;RBI=0.0156592;REFB=0.00261012;REVB=-0.0101834;RO=18;SAF=12;SAR=22;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.203018;STB=0.59245;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=-0.000881563;OID=.;OPOS=97639414;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:52:18:18:34:34:0.653846:22:12:12:6:22:12:11:7
chr13	98829176	.	T	C	632.21	PASS	AF=1;AO=40;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0371032;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.211;QD=61.6788;RBI=0.0392099;REFB=0;REVB=0.0126795;RO=0;SAF=25;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.84569e-05;OID=.;OPOS=98829176;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:40:41:1:15:25:0:0:15:26:0:0
chr13	98896776	.	C	T	261.77	PASS	AF=0.47541;AO=29;DP=61;FAO=29;FDP=61;FR=.;FRO=32;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=-0.0165651;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.412;QD=17.1651;RBI=0.0165768;REFB=-0.0104407;REVB=-0.000623491;RO=32;SAF=17;SAR=12;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0227115;STB=0.512752;STBP=0.85;TYPE=snp;VARB=0.0155254;OID=.;OPOS=98896776;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:32:32:29:29:0.47541:12:17:18:14:12:17:18:14
chr13	99090040	.	T	G	276.05	PASS	AF=0.442857;AO=31;DP=70;FAO=31;FDP=70;FR=.;FRO=39;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=24;FWDB=0.0568822;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.1123;QD=15.7742;RBI=0.057745;REFB=0.000927481;REVB=0.00994515;RO=39;SAF=11;SAR=20;SRF=15;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0317368;STB=0.517917;STBP=0.819;TYPE=snp;VARB=-0.000403826;OID=.;OPOS=99090040;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:39:39:31:31:0.442857:20:11:15:24:20:11:15:24
chr13	99102477	.	GC	G	347.69	PASS	AF=0.437037;AO=59;DP=136;FAO=59;FDP=135;FR=.;FRO=76;FSAF=28;FSAR=31;FSRF=46;FSRR=30;FWDB=-0.0315219;FXX=0.0073524;HRUN=4;LEN=1;MLLD=22.6496;QD=10.3019;RBI=0.054659;REFB=0.0147315;REVB=-0.044654;RO=75;SAF=28;SAR=31;SRF=46;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0.377358;SSSB=-0.138548;STB=0.573189;STBP=0.151;TYPE=del;VARB=-0.0175684;OID=.;OPOS=99102478;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.437037:59:136:59:135:76:28:31:46:30:99:75:28:31:46:29
chr13	99102607	.	C	T	253.75	PASS	AF=0.510638;AO=25;DP=45;FAO=24;FDP=47;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=-0.11072;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.7434;QD=21.5956;RBI=0.110721;REFB=-0.0334806;REVB=-0.000401036;RO=19;SAF=15;SAR=10;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0587921;STB=0.51281;STBP=0.895;TYPE=snp;VARB=0.00855977;OID=.;OPOS=99102607;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:47:19:23:25:24:0.510638:10:15:10:9:10:14:14:9
chr13	99104947	.	T	G	497.33	PASS	AF=0.5;AO=50;DP=100;FAO=52;FDP=104;FR=.;FRO=52;FSAF=27;FSAR=25;FSRF=25;FSRR=27;FWDB=0.0218701;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.121;QD=19.1279;RBI=0.0513076;REFB=-0.0651379;REVB=-0.046413;RO=48;SAF=27;SAR=23;SRF=25;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0170682;STB=0.519223;STBP=0.718;TYPE=snp;VARB=0.0463675;OID=.;OPOS=99104947;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:104:48:52:50:52:0.5:23:27:25:23:25:27:25:27
chr13	99112680	.	C	T	358.07	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0425098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.9109;QD=55.0879;RBI=0.0608157;REFB=0;REVB=0.0434911;RO=0;SAF=14;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.46971e-05;OID=.;OPOS=99112680;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:12:14:0:0:12:14:0:0
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chr13	99376181	.	C	T	164.92	PASS	AF=0.382979;AO=18;DP=47;FAO=18;FDP=47;FR=.;FRO=29;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=0.00618053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.428;QD=14.0354;RBI=0.0265549;REFB=0.00332798;REVB=0.0258256;RO=29;SAF=4;SAR=14;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.436404;STB=0.754609;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=-0.0140535;OID=.;OPOS=99376181;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:29:29:18:18:0.382979:14:4:18:11:14:4:18:11
chr13	99447005	.	T	C	1679.3	PASS	AF=0.99115;AO=112;DP=113;FAO=112;FDP=113;FR=.;FRO=1;FSAF=60;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0288383;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.3791;QD=59.4442;RBI=0.0321519;REFB=-0.0575696;REVB=0.0142162;RO=1;SAF=60;SAR=52;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00904314;STB=0.504761;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=0.000349497;OID=.;OPOS=99447005;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:113:113:1:1:112:112:0.99115:52:60:0:1:52:60:0:1
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chr13	99540406	.	A	C	128.15	PASS	AF=0.736842;AO=8;DP=20;FAO=14;FDP=19;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=5;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.222706;FXX=0.049975;HRUN=9;LEN=1;MLLD=29.1037;QD=26.9781;RBI=0.232664;REFB=0.00820488;REVB=-0.0673399;RO=4;SAF=6;SAR=2;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171168;STB=0.566831;STBP=0.369;TYPE=snp;VARB=0.0150903;OID=.;OPOS=99540406;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:20:19:4:5:8:14:0.736842:2:6:2:2:5:9:2:3
chr13	99575568	.	G	A	245.21	PASS	AF=0.444444;AO=28;DP=63;FAO=28;FDP=63;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=-0.0004754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.9875;QD=15.5689;RBI=0.0317328;REFB=0.00149744;REVB=-0.0317292;RO=35;SAF=14;SAR=14;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0702261;STB=0.539654;STBP=0.582;TYPE=snp;VARB=-0.00263694;OID=.;OPOS=99575568;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:35:35:28:28:0.444444:14:14:15:20:14:14:15:20
chr13	99853443	.	T	G	340.6	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.011997;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.3069;QD=54.4967;RBI=0.0724668;REFB=0;REVB=-0.0714668;RO=0;SAF=4;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.661e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000852369;OID=.;OPOS=99853443;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:21:4:0:0:21:4:0:0
chr13	99857984	.	T	C	143.23	PASS	AF=0.410256;AO=16;DP=39;FAO=16;FDP=39;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=0.0118029;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.7927;QD=14.6907;RBI=0.0958312;REFB=-0.0247845;REVB=0.0951016;RO=23;SAF=5;SAR=11;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.089233;STB=0.551904;STBP=0.634;TYPE=snp;VARB=0.0448225;OID=.;OPOS=99857984;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:23:23:16:16:0.410256:11:5:9:14:11:5:9:14
chr13	99948097	.	A	G	389.07	PASS	AF=0.481928;AO=40;DP=83;FAO=40;FDP=83;FR=.;FRO=43;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=26;FWDB=0.0236899;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.924;QD=18.7502;RBI=0.0248379;REFB=0.00128424;REVB=-0.00746378;RO=43;SAF=22;SAR=18;SRF=17;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143054;STB=0.579601;STBP=0.167;TYPE=snp;VARB=-0.00187796;OID=.;OPOS=99948097;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:43:43:40:40:0.481928:18:22:17:26:18:22:17:26
chr13	99948178	.	C	A	205.09	PASS	AF=0.42;AO=21;DP=50;FAO=21;FDP=50;FR=.;FRO=29;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=0.017654;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.995;QD=16.4068;RBI=0.0421211;REFB=-0.0140121;REVB=-0.0382429;RO=29;SAF=14;SAR=7;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159149;STB=0.59146;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=0.0115791;OID=.;OPOS=99948178;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:29:29:21:21:0.42:7:14:15:14:7:14:15:14
chr13	100188585	.	A	T	320.48	PASS	AF=0.595745;AO=28;DP=47;FAO=28;FDP=47;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=-0.0303104;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=191.649;QD=27.2752;RBI=0.0310391;REFB=0.0135424;REVB=-0.00668642;RO=18;SAF=8;SAR=20;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0405259;STB=0.539539;STBP=0.555;TYPE=snp;VARB=-0.00899784;OID=.;OPOS=100188585;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:18:19:28:28:0.595745:20:8:6:12:20:8:7:12
chr13	100436131	.	CAT	C	346.0	PASS	AF=0.530303;AO=35;DP=68;FAO=35;FDP=66;FR=.;FRO=31;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=0.026523;FXX=0.0571347;HRUN=1;LEN=2;MLLD=204.144;QD=20.9699;RBI=0.0273619;REFB=0.00184578;REVB=0.00672323;RO=31;SAF=18;SAR=17;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00156318;STB=0.500866;STBP=0.986;TYPE=del;VARB=-0.0013415;OID=.;OPOS=100436132;OREF=AT;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.530303:35:68:35:66:31:18:17:16:15:99:31:18:17:16:15
chr13	100436228	.	G	C	446.31	PASS	AF=0.470588;AO=48;DP=103;FAO=48;FDP=102;FR=.;FRO=54;FSAF=27;FSAR=21;FSRF=27;FSRR=27;FWDB=-0.0173029;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.9618;QD=17.5024;RBI=0.0194444;REFB=-8.4257e-05;REVB=0.00887088;RO=54;SAF=27;SAR=21;SRF=27;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.059847;STB=0.533319;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=5.99855e-07;OID=.;OPOS=100436228;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:102:54:54:48:48:0.470588:21:27:27:27:21:27:27:27
chr13	100517189	.	CTTTTTCTGTGTGTGTGTGTG	CTTTTCTGTGTGTGTGTGTG,CTTTTTCTGTGTGTGTGTG,CTTTTTCTGTGTGTGTGTGTA	212.45	PASS	AF=0,0.396552,0.0689655;AO=9,17,4;DP=60;FAO=0,23,4;FDP=58;FR=.;FRO=31;FSAF=0,10,1;FSAR=0,13,3;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=-0.316218,-0.0653878,-0.0866798;FXX=0.0333278;HRUN=5,1,1;LEN=1,2,1;MLLD=9.44766,131.722,101.314;QD=14.6521;RBI=0.322994,0.0694337,0.0869299;REFB=-0.0515756,-0.0276831,-0.0249682;REVB=-0.0658126,-0.0233553,-0.00658923;RO=19;SAF=5,6,1;SAR=4,11,3;SRF=8;SRR=11;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.147874,-0.0671833,-0.213651;STB=0.5,0.509795,0.691297;STBP=1,0.916,0.501;TYPE=del,del,snp;VARB=0.0451504,0.0307742,0.077647;OID=.,.,.;OPOS=100517190,100517196,100517209;OREF=T,TG,G;OALT=-,-,A;OMAPALT=CTTTTCTGTGTGTGTGTGTG,CTTTTTCTGTGTGTGTGTG,CTTTTTCTGTGTGTGTGTGTA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,0.396552,0.0689655:9,17,4:60:0,23,4:58:31:0,10,1:0,13,3:14:17:99:19:5,6,1:4,11,3:8:11
chr13	100518580	.	A	G	1199.61	PASS	AF=0.987654;AO=79;DP=81;FAO=80;FDP=81;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0166368;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.2646;QD=59.2402;RBI=0.0252671;REFB=-0.0758156;REVB=-0.019017;RO=2;SAF=47;SAR=32;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0197175;STB=0.505153;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.00039729;OID=.;OPOS=100518580;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:81:81:2:1:79:80:0.987654:32:47:2:0:32:48:1:0
chr13	100537232	.	T	C	954.5	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0336762;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.181;QD=58.7385;RBI=0.0407219;REFB=0;REVB=0.0228951;RO=0;SAF=37;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.1743e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000172059;OID=.;OPOS=100537232;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:65:0:0:64:65:1:27:37:0:0:27:38:0:0
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chr13	101184775	.	G	T	78.61	PASS	AF=0.47619;AO=10;DP=21;FAO=10;FDP=21;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.0076809;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=156.709;QD=14.9738;RBI=0.0148538;REFB=-0.0351282;REVB=-0.0127138;RO=11;SAF=5;SAR=5;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122307;STB=0.571288;STBP=0.546;TYPE=snp;VARB=0.0333809;OID=.;OPOS=101184775;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:21:21:11:11:10:10:0.47619:5:5:4:7:5:5:4:7
chr13	101287365	.	T	C	632.25	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00672411;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.159;QD=61.6832;RBI=0.00686131;REFB=0;REVB=-0.00136525;RO=0;SAF=18;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.32306e-05;OID=.;OPOS=101287365;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:23:18:0:0:23:18:0:0
chr13	101287404	.	G	A	547.21	PASS	AF=0.926829;AO=37;DP=41;FAO=38;FDP=41;FR=.;FRO=3;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.00125175;FXX=0.0238039;HRUN=4;LEN=1;MLLD=213.474;QD=53.3866;RBI=0.035587;REFB=-0.154676;REVB=0.035565;RO=3;SAF=15;SAR=22;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0104975;STB=0.504708;STBP=0.922;TYPE=snp;VARB=0.00110732;OID=.;OPOS=101287404;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:41:41:3:3:37:38:0.926829:22:15:1:2:23:15:1:2
chr13	101289969	.	C	T	780.17	PASS	AF=1;AO=54;DP=58;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0254571;FXX=0.0344768;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.729;QD=55.7262;RBI=0.0378499;REFB=0;REVB=0.0280098;RO=1;SAF=17;SAR=37;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0125691;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.1183e-05;OID=.;OPOS=101289969;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:58:56:1:0:54:56:1:37:17:0:1:39:17:0:0
chr13	102220193	.	G	T	362.5	PASS	AF=0.653846;AO=34;DP=52;FAO=34;FDP=52;FR=.;FRO=18;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.00706636;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.864;QD=27.8848;RBI=0.0241984;REFB=-0.0377886;REVB=0.0231437;RO=18;SAF=20;SAR=14;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0570148;STB=0.531159;STBP=0.547;TYPE=snp;VARB=0.0194678;OID=.;OPOS=102220193;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:18:18:34:34:0.653846:14:20:9:9:14:20:9:9
chr13	102366825	.	A	G	625.28	PASS	AF=0.57732;AO=56;DP=97;FAO=56;FDP=97;FR=.;FRO=41;FSAF=42;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=19;FWDB=-0.0474149;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.5657;QD=25.7846;RBI=0.0737728;REFB=-0.00767598;REVB=-0.0565177;RO=41;SAF=42;SAR=14;SRF=22;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.195271;STB=0.607321;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.00567128;OID=.;OPOS=102366825;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:41:41:56:56:0.57732:14:42:22:19:14:42:22:19
chr13	102431351	.	G	C	251.88	PASS	AF=0.426471;AO=29;DP=68;FAO=29;FDP=68;FR=.;FRO=39;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=-0.00911676;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=285.263;QD=14.8164;RBI=0.0316997;REFB=-0.0101381;REVB=-0.0303604;RO=39;SAF=14;SAR=15;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.030399;STB=0.517229;STBP=0.853;TYPE=snp;VARB=0.0135919;OID=.;OPOS=102431351;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:39:39:29:29:0.426471:15:14:20:19:15:14:20:19
chr13	103275386	.	T	C	270.47	PASS	AF=0.447761;AO=30;DP=67;FAO=30;FDP=67;FR=.;FRO=37;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=0.0366892;FXX=0.0289813;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.0015;QD=16.1475;RBI=0.0453388;REFB=-0.01223;REVB=0.0266366;RO=37;SAF=12;SAR=18;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0863643;STB=0.548748;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=0.0191241;OID=.;OPOS=103275386;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:37:37:30:30:0.447761:18:12:18:19:18:12:18:19
chr13	103339365	.	A	G	225.02	PASS	AF=0.468085;AO=22;DP=48;FAO=22;FDP=47;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=0.0256794;FXX=0.020829;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.828;QD=19.151;RBI=0.0263248;REFB=-0.00716835;REVB=-0.00579341;RO=25;SAF=13;SAR=9;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105241;STB=0.559632;STBP=0.424;TYPE=snp;VARB=0.00999896;OID=.;OPOS=103339365;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:47:25:25:22:22:0.468085:9:13:12:13:9:13:12:13
chr13	103346806	.	C	G	306.29	PASS	AF=0.923077;AO=24;DP=26;FAO=24;FDP=26;FR=.;FRO=2;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00986964;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=306.426;QD=47.1221;RBI=0.0164536;REFB=-0.0238561;REVB=0.0131648;RO=2;SAF=8;SAR=16;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0264025;STB=0.514274;STBP=0.765;TYPE=snp;VARB=0.000141801;OID=.;OPOS=103346806;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:26:26:2:2:24:24:0.923077:16:8:1:1:16:8:1:1
chr13	103383417	.	T	C	330.04	PASS	AF=0.486111;AO=35;DP=72;FAO=35;FDP=72;FR=.;FRO=37;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=-0.00482566;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=269.84;QD=18.3356;RBI=0.00697185;REFB=-0.00212255;REVB=-0.00503187;RO=36;SAF=17;SAR=18;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.012995;STB=0.514278;STBP=0.845;TYPE=snp;VARB=0.0023227;OID=.;OPOS=103383417;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:36:37:35:35:0.486111:18:17:18:18:18:17:19:18
chr13	103384824	.	G	A	247.03	PASS	AF=0.490909;AO=27;DP=56;FAO=27;FDP=55;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=0.0101183;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.318;QD=17.9659;RBI=0.0135516;REFB=-0.00615522;REVB=-0.00901472;RO=28;SAF=10;SAR=17;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0217202;STB=0.512186;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=0.00603352;OID=.;OPOS=103384824;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:55:28:28:27:27:0.490909:17:10:11:17:17:10:11:17
chr13	103385015	.	A	G	1271.09	PASS	AF=1;AO=69;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=36;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0080196;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.278;QD=62.0042;RBI=0.0639188;REFB=0;REVB=0.0634137;RO=0;SAF=36;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.36169e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00026865;OID=.;OPOS=103385015;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:82:0:0:69:82:1:33:36:0:0:46:36:0:0
chr13	103385299	.	A	C	924.24	PASS	AF=1;AO=63;DP=65;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0151708;FXX=0.0153822;HRUN=3;LEN=1;MLLD=187.758;QD=57.7649;RBI=0.0165572;REFB=0;REVB=0.00663216;RO=0;SAF=27;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.31521e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000493845;OID=.;OPOS=103385299;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:64:0:0:63:64:1:36:27:0:0:37:27:0:0
chr13	103385798	.	T	C	1029.64	PASS	AF=0.985915;AO=69;DP=71;FAO=70;FDP=71;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0352957;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=88.5181;QD=58.008;RBI=0.0359244;REFB=-0.0217534;REVB=0.00669172;RO=1;SAF=29;SAR=40;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0160211;STB=0.508194;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.000355131;OID=.;OPOS=103385798;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:71:71:1:1:69:70:0.985915:40:29:1:0:40:30:1:0
chr13	103386116	.	C	G	594.54	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0281832;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=258.793;QD=60.9786;RBI=0.0355877;REFB=0;REVB=0.0217299;RO=0;SAF=17;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000178837;OID=.;OPOS=103386116;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:22:17:0:0:22:17:0:0
chr13	103386283	.	A	G	1897.36	PASS	AF=1;AO=122;DP=123;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.010238;FXX=0.00806387;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.578;QD=61.7027;RBI=0.0125415;REFB=0;REVB=0.00724375;RO=0;SAF=52;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.91403e-05;OID=.;OPOS=103386283;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:123:123:0:0:122:123:1:70:52:0:0:70:53:0:0
chr13	103388220	.	A	G	1001.91	PASS	AF=1;AO=67;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148549;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.657;QD=58.9357;RBI=0.020918;REFB=0;REVB=0.0147273;RO=0;SAF=34;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.61397e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.02854e-05;OID=.;OPOS=103388220;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:67:68:1:33:34:0:0:33:35:0:0
chr13	103389158	.	A	T	231.49	PASS	AF=0.373333;AO=28;DP=75;FAO=28;FDP=75;FR=.;FRO=47;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=28;FWDB=-0.0189594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.396;QD=12.3462;RBI=0.0193392;REFB=-0.0018151;REVB=-0.00381379;RO=47;SAF=13;SAR=15;SRF=19;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0661808;STB=0.53799;STBP=0.614;TYPE=snp;VARB=0.00271611;OID=.;OPOS=103389158;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:47:47:28:28:0.373333:15:13:19:28:15:13:19:28
chr13	103391634	.	C	T	289.36	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144976;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.1621;QD=52.6105;RBI=0.0310225;REFB=0;REVB=0.0274266;RO=0;SAF=18;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000633483;OID=.;OPOS=103391634;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:4:18:0:0:4:18:0:0
chr13	103394003	.	G	A	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0180212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.6;QD=35.5759;RBI=0.0181916;REFB=0;REVB=0.00248404;RO=0;SAF=2;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.27427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000266081;OID=.;OPOS=103394003;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:5:2:0:0:5:2:0:0
chr13	103394613	.	T	G	88.22	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00779527;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.1485;QD=39.2067;RBI=0.00779653;REFB=0;REVB=-0.00013997;RO=0;SAF=4;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000501706;OID=.;OPOS=103394613;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:5:4:0:0:5:4:0:0
chr13	103394716	.	T	A,C	890.16	PASS	AF=0.047619,0.952381;AO=6,57;DP=63;FAO=3,60;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=0,43;FSAR=3,17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0253233,0.00348802;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=164.26,114.753;QD=56.518;RBI=0.0254361,0.120596;REFB=0,0;REVB=0.00239347,0.120546;RO=0;SAF=1,42;SAR=5,15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.18042e-08,-4.08575e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.141011,0.00302109;OID=.,.;OPOS=103394716,103394716;OREF=T,T;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:63:63:0:0:6,57:3,60:0.047619,0.952381:5,15:1,42:0:0:3,17:0,43:0:0
chr13	103395819	.	C	T	1036.08	PASS	AF=0.972603;AO=71;DP=73;FAO=71;FDP=73;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00879332;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=142.657;QD=56.7716;RBI=0.0117151;REFB=0.0380169;REVB=-0.00774087;RO=2;SAF=27;SAR=44;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0210088;STB=0.511108;STBP=0.288;TYPE=snp;VARB=-0.00141803;OID=.;OPOS=103395819;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:73:73:2:2:71:71:0.972603:44:27:0:2:44:27:0:2
chr13	103396716	.	C	G	817.75	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00631825;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.579;QD=57.3857;RBI=0.0110159;REFB=0;REVB=0.00902381;RO=0;SAF=24;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.25003e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.74911e-06;OID=.;OPOS=103396716;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:33:24:0:0:33:24:0:0
chr13	103397583	.	C	G	1152.96	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.022668;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.5707;QD=60.6823;RBI=0.0283084;REFB=0;REVB=0.0169566;RO=0;SAF=30;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000357125;OID=.;OPOS=103397583;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:76:0:0:75:76:1:45:30:0:0:45:31:0:0
chr13	103400083	.	G	A	868.27	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00659827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.7039;QD=57.8846;RBI=0.00659847;REFB=0;REVB=5.196e-05;RO=0;SAF=33;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.00382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.50623e-05;OID=.;OPOS=103400083;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:60:0:0:59:60:1:26:33:0:0:26:34:0:0
chr13	103400729	.	G	A	483.34	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0148491;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=149.6;QD=58.587;RBI=0.0305183;REFB=0;REVB=0.0266621;RO=0;SAF=19;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.71297e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.24846e-05;OID=.;OPOS=103400729;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:14:19:0:0:14:19:0:0
chr13	103402522	.	C	T	1208.94	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00223099;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.085;QD=61.2123;RBI=0.0205796;REFB=0;REVB=0.0204583;RO=0;SAF=41;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.6826e-05;OID=.;OPOS=103402522;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:38:41:0:0:38:41:0:0
chr13	103410782	.	T	C	184.78	PASS	AF=0.475;AO=19;DP=40;FAO=19;FDP=40;FR=.;FRO=21;FSAF=3;FSAR=16;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.0160674;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.5217;QD=18.4777;RBI=0.0510549;REFB=0.0106783;REVB=0.0484607;RO=21;SAF=3;SAR=16;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.37935;STB=0.719456;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=-0.0108052;OID=.;OPOS=103410782;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:21:21:19:19:0.475:16:3:10:11:16:3:10:11
chr13	103410914	.	A	T	270.76	PASS	AF=0.46875;AO=30;DP=64;FAO=30;FDP=64;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=12;FSRR=22;FWDB=0.00682789;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.07;QD=16.9223;RBI=0.00792698;REFB=-0.0195989;REVB=0.00402701;RO=34;SAF=11;SAR=19;SRF=12;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0140364;STB=0.507878;STBP=0.917;TYPE=snp;VARB=0.0122831;OID=.;OPOS=103410914;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:34:34:30:30:0.46875:19:11:12:22:19:11:12:22
chr13	103493825	.	C	G	923.77	PASS	AF=1;AO=62;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00143573;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.874;QD=58.6523;RBI=0.00837903;REFB=0;REVB=0.00825511;RO=0;SAF=36;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51662e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.99254e-07;OID=.;OPOS=103493825;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:62:63:1:26:36:0:0:26:37:0:0
chr13	103504517	.	T	C	1808.43	PASS	AF=1;AO=118;DP=118;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00100273;FXX=0.0166653;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.208;QD=61.3027;RBI=0.0279254;REFB=0;REVB=0.0279074;RO=0;SAF=65;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000115521;OID=.;OPOS=103504517;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:118:118:0:0:118:118:1:53:65:0:0:53:65:0:0
chr13	103511301	.	T	C	728.93	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0167426;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=313.448;QD=57.1708;RBI=0.0177375;REFB=0;REVB=0.0058568;RO=0;SAF=18;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.58521e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.10843e-05;OID=.;OPOS=103511301;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:51:0:0:49:51:1:31:18:0:0:33:18:0:0
chr13	103527849	.	G	C	657.99	PASS	AF=0.943396;AO=49;DP=53;FAO=50;FDP=53;FR=.;FRO=3;FSAF=19;FSAR=31;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.00365983;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.195;QD=49.6598;RBI=0.0264372;REFB=-0.00697675;REVB=0.0261827;RO=3;SAF=18;SAR=31;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0345412;STB=0.51707;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=0.00135705;OID=.;OPOS=103527849;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:53:53:3:3:49:50:0.943396:31:18:2:1:31:19:2:1
chr13	103527930	.	G	C	534.77	PASS	AF=0.926829;AO=36;DP=40;FAO=38;FDP=41;FR=.;FRO=3;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.00797985;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.098;QD=52.1722;RBI=0.0519227;REFB=-0.0303548;REVB=0.0513059;RO=3;SAF=19;SAR=17;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0279652;STB=0.512189;STBP=0.705;TYPE=snp;VARB=0.00228716;OID=.;OPOS=103527930;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:40:41:3:3:36:38:0.926829:17:19:1:2:19:19:1:2
chr13	103528002	.	G	C	277.6	PASS	AF=0.537037;AO=29;DP=54;FAO=29;FDP=54;FR=.;FRO=25;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=-0.00140159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.5323;QD=20.5627;RBI=0.0287716;REFB=-0.00332994;REVB=0.0287375;RO=25;SAF=17;SAR=12;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18727;STB=0.60399;STBP=0.127;TYPE=snp;VARB=0.00343448;OID=.;OPOS=103528002;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:25:25:29:29:0.537037:12:17:9:16:12:17:9:16
chr13	103528337	.	G	A	421.73	PASS	AF=0.462366;AO=43;DP=93;FAO=43;FDP=93;FR=.;FRO=50;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=25;FSRR=25;FWDB=-0.0357461;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.619;QD=18.1389;RBI=0.0363419;REFB=0.00102317;REVB=0.00655371;RO=50;SAF=20;SAR=23;SRF=25;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0336471;STB=0.518788;STBP=0.731;TYPE=snp;VARB=-0.00148152;OID=.;OPOS=103528337;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:50:50:43:43:0.462366:23:20:25:25:23:20:25:25
chr13	103705044	.	A	C	326.18	PASS	AF=0.523077;AO=34;DP=65;FAO=34;FDP=65;FR=.;FRO=31;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=0.00897372;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=167.489;QD=20.0723;RBI=0.0115394;REFB=-0.00695578;REVB=-0.00725467;RO=31;SAF=14;SAR=20;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.035064;STB=0.519469;STBP=0.759;TYPE=snp;VARB=0.00638115;OID=.;OPOS=103705044;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:31:31:34:34:0.523077:20:14:14:17:20:14:14:17
chr13	106119446	.	G	A	284.06	PASS	AF=0.426667;AO=32;DP=74;FAO=32;FDP=75;FR=.;FRO=43;FSAF=22;FSAR=10;FSRF=28;FSRR=15;FWDB=-0.0467331;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.4264;QD=15.1496;RBI=0.0493772;REFB=0.028617;REVB=-0.0159414;RO=42;SAF=22;SAR=10;SRF=28;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0240704;STB=0.523794;STBP=0.754;TYPE=snp;VARB=-0.0446086;OID=.;OPOS=106119446;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:75:42:43:32:32:0.426667:10:22:28:14:10:22:28:15
chr13	107144320	.	G	A	937.6	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0113884;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.302;QD=58.6002;RBI=0.018712;REFB=0;REVB=0.0148473;RO=0;SAF=27;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.1743e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.7451e-05;OID=.;OPOS=107144320;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:37:27:0:0:37:27:0:0
chr13	107145463	.	G	C	1749.31	PASS	AF=1;AO=112;DP=112;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0244485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=286.8;QD=60.8456;RBI=0.0257078;REFB=0;REVB=0.00794745;RO=0;SAF=65;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.8673e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.93477e-05;OID=.;OPOS=107145463;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:112:115:0:0:112:115:1:47:65:0:0:47:68:0:0
chr13	108518715	.	C	T	38.52	PASS	AF=0.428571;AO=6;DP=14;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=-0.0227713;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.7636;QD=11.0067;RBI=0.0366863;REFB=-0.024987;REVB=0.0287638;RO=7;SAF=2;SAR=4;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.32987;STB=0.666111;STBP=0.364;TYPE=snp;VARB=0.0237301;OID=.;OPOS=108518715;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:14:14:7:8:6:6:0.428571:4:2:5:2:4:2:5:3
chr13	108518727	.	T	C	66.36	PASS	AF=0.529412;AO=8;DP=15;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=-0.023455;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.7037;QD=15.615;RBI=0.0838141;REFB=0.0212665;REVB=0.0804653;RO=7;SAF=5;SAR=3;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0775671;STB=0.53326;STBP=0.835;TYPE=snp;VARB=0.000109273;OID=.;OPOS=108518727;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:15:17:7:8:8:9:0.529412:3:5:5:2:4:5:5:3
chr13	108862436	.	GTAAAAAT	AGTAAAAT,GTAAAAT,GTAAAATA,GTAAAT,GTATAAAT	85.03	PASS	AF=0.0238095,0.357143,0,0,0.047619;AO=3,5,2,6,2;DP=44;FAO=1,15,0,0,2;FDP=42;FR=.;FRO=24;FSAF=0,1,0,0,0;FSAR=1,14,0,0,2;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=-0.00592911,0.0445739,0.0333581,0.0234149,0.0149085;FXX=0.0232504;HRUN=1,5,5,5,5;LEN=3,1,2,2,1;MLLD=59.9399,12.2167,21.9122,23.539,172.421;QD=8.09847;RBI=0.115539,0.240409,0.146971,0.129205,0.0835683;REFB=-0.00905747,0.0112664,-0.0196632,0.00413179,0.00957074;REVB=-0.115387,-0.236241,-0.143136,-0.127066,-0.0822277;RO=24;SAF=0,1,1,0,0;SAR=3,4,1,6,2;SRF=12;SRR=12;SSEN=0,0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0,0;SSSB=-0.574267,-0.367101,0,-0.699994,-0.487253;STB=0.990558,0.886249,0.5,0.5,0.995038;STBP=0.282,0.001,1,1,0.169;TYPE=mnp,del,mnp,del,snp;VARB=-0.157634,-0.0904164,0.0309006,0.0571067,0.159329;OID=.,.,.,.,.;OPOS=108862436,108862438,108862442,108862438,108862439;OREF=GTA,A,AT,AA,A;OALT=AGT,-,TA,-,T;OMAPALT=AGTAAAAT,GTAAAAT,GTAAAATA,GTAAAT,GTATAAAT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:66:44:42:24:24:3,5,2,6,2:1,15,0,0,2:0.0238095,0.357143,0,0,0.047619:3,4,1,6,2:0,1,1,0,0:12:12:1,14,0,0,2:0,1,0,0,0:13:11
chr13	109438084	.	T	A	1513.42	PASS	AF=1;AO=101;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00812208;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.692;QD=59.9376;RBI=0.0115294;REFB=0;REVB=0.00818283;RO=0;SAF=49;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.10807e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.47719e-06;OID=.;OPOS=109438084;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:101:101:0:0:101:101:1:52:49:0:0:52:49:0:0
chr13	109472733	.	G	A	244.1	PASS	AF=0.5;AO=26;DP=52;FAO=26;FDP=52;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=-0.0317771;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.7991;QD=18.7768;RBI=0.0346546;REFB=-0.0178182;REVB=-0.0138259;RO=26;SAF=11;SAR=15;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0353657;STB=0.519802;STBP=0.823;TYPE=snp;VARB=0.0114576;OID=.;OPOS=109472733;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:26:26:26:26:0.5:15:11:10:16:15:11:10:16
chr13	109717928	.	A	G	79.43	PASS	AF=0.333333;AO=8;DP=33;FAO=11;FDP=33;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.00287241;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.332;QD=9.62808;RBI=0.0129189;REFB=-0.00480198;REVB=0.0125955;RO=20;SAF=5;SAR=3;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144365;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.008752;OID=.;OPOS=109717928;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:79:33:33:20:22:8:11:0.333333:3:5:10:10:6:5:10:12
chr13	109777503	.	A	G	375.74	PASS	AF=0.535211;AO=38;DP=71;FAO=38;FDP=71;FR=.;FRO=33;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=0.0150373;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.376;QD=21.1683;RBI=0.0155224;REFB=-0.0146657;REVB=0.00385029;RO=33;SAF=21;SAR=17;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0572036;STB=0.531629;STBP=0.614;TYPE=snp;VARB=0.0124642;OID=.;OPOS=109777503;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:33:33:38:38:0.535211:17:21:16:17:17:21:16:17
chr13	109779906	.	C	T	312.08	PASS	AF=0.406977;AO=29;DP=85;FAO=35;FDP=86;FR=.,HEALED;FRO=51;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=23;FSRR=28;FWDB=0.079446;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.5121;QD=14.5152;RBI=0.16328;REFB=-0.0194769;REVB=-0.142649;RO=34;SAF=13;SAR=16;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105776;STB=0.531083;STBP=0.64;TYPE=snp;VARB=0.0277915;OID=.;OPOS=109779906;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:86:34:51:29:35:0.406977:16:13:19:15:21:14:23:28
chr13	109793474	.	T	C	669.25	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0358594;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.2359;QD=62.2559;RBI=0.0398031;REFB=0;REVB=-0.0172739;RO=0;SAF=23;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000608851;OID=.;OPOS=109793474;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:20:23:0:0:20:23:0:0
chr13	109793593	.	C	A	431.36	PASS	AF=0.61194;AO=41;DP=67;FAO=41;FDP=67;FR=.;FRO=26;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=-0.00843853;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=202.687;QD=25.7527;RBI=0.0118477;REFB=-0.021994;REVB=0.00831618;RO=26;SAF=21;SAR=20;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0904099;STB=0.549395;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.010141;OID=.;OPOS=109793593;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:26:26:41:41:0.61194:20:21:10:16:20:21:10:16
chr13	109793720	.	A	C	1869.08	PASS	AF=0.99187;AO=121;DP=125;FAO=122;FDP=123;FR=.;FRO=1;FSAF=55;FSAR=67;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.046094;FXX=0.0159987;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.373;QD=60.7831;RBI=0.0515172;REFB=-0.010764;REVB=0.0230079;RO=1;SAF=54;SAR=67;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0087158;STB=0.504504;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=3.16416e-05;OID=.;OPOS=109793720;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:125:123:1:1:121:122:0.99187:67:54:1:0:67:55:1:0
chr13	110408608	.	C	T	1135.23	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0218514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.392;QD=60.5458;RBI=0.030838;REFB=0;REVB=-0.02176;RO=0;SAF=31;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.43437e-05;OID=.;OPOS=110408608;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:44:31:0:0:44:31:0:0
chr13	110435953	.	A	G	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00736975;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.591;QD=51.9162;RBI=0.0256559;REFB=0;REVB=-0.0245746;RO=0;SAF=10;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000242813;OID=.;OPOS=110435953;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:11:10:0:0:11:10:0:0
chr13	110436232	.	G	A	289.37	PASS	AF=1;AO=18;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.129312;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.076;QD=52.6121;RBI=0.129895;REFB=0;REVB=-0.0122889;RO=0;SAF=1;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000463312;OID=.;OPOS=110436232;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:18:22:1:17:1:0:0:21:1:0:0
chr13	110813709	.	G	A	157.86	PASS	AF=0.365385;AO=19;DP=52;FAO=19;FDP=52;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=22;FSRR=11;FWDB=-0.0160454;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.452;QD=12.1431;RBI=0.0165417;REFB=-0.00278754;REVB=-0.00402143;RO=33;SAF=10;SAR=9;SRF=22;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155521;STB=0.590073;STBP=0.363;TYPE=snp;VARB=0.00628006;OID=.;OPOS=110813709;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:33:33:19:19:0.365385:9:10:22:11:9:10:22:11
chr13	110819586	.	G	A	972.88	PASS	AF=1;AO=65;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0328835;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.446;QD=58.9624;RBI=0.0417901;REFB=0;REVB=-0.0257893;RO=0;SAF=28;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.99207e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.1865e-05;OID=.;OPOS=110819586;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:65:66:1:37:28:0:0:37:29:0:0
chr13	110839550	.	T	G	1316.55	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0430939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.2081;QD=61.9553;RBI=0.0525641;REFB=0;REVB=0.0300983;RO=0;SAF=48;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000264797;OID=.;OPOS=110839550;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:79:85:0:0:79:85:1:31:48:0:0:31:54:0:0
chr13	110843985	.	T	C	782.75	PASS	AF=0.982456;AO=56;DP=58;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00987604;FXX=0.0172384;HRUN=3;LEN=1;MLLD=222.271;QD=54.93;RBI=0.011218;REFB=0.0191688;REVB=0.00532039;RO=0;SAF=22;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.43892e-08;STB=0.507244;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=8.61394e-05;OID=.;OPOS=110843985;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:58:57:0:1:56:56:0.982456:34:22:0:0:34:22:0:1
chr13	110857823	.	C	T	272.8	PASS	AF=0.424658;AO=31;DP=73;FAO=31;FDP=73;FR=.;FRO=42;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=29;FSRR=13;FWDB=-0.0138241;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.06;QD=14.9479;RBI=0.0139676;REFB=-0.00382135;REVB=0.00199703;RO=42;SAF=15;SAR=16;SRF=29;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.209634;STB=0.618014;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=0.00521905;OID=.;OPOS=110857823;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:42:42:31:31:0.424658:16:15:29:13:16:15:29:13
chr13	110857895	.	A	G	265.38	PASS	AF=0.491525;AO=29;DP=59;FAO=29;FDP=59;FR=.;FRO=30;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=10;FWDB=-0.0154781;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=141.516;QD=17.9915;RBI=0.0216686;REFB=-0.0181742;REVB=0.0151644;RO=30;SAF=15;SAR=14;SRF=20;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136958;STB=0.576419;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.0154279;OID=.;OPOS=110857895;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:30:30:29:29:0.491525:14:15:20:10:14:15:20:10
chr13	110859069	.	G	C	772.89	PASS	AF=0.590164;AO=71;DP=121;FAO=72;FDP=122;FR=.;FRO=50;FSAF=28;FSAR=44;FSRF=25;FSRR=25;FWDB=-0.0274755;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.6188;QD=25.3405;RBI=0.0334079;REFB=0.0173644;REVB=0.0190049;RO=50;SAF=27;SAR=44;SRF=25;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0939129;STB=0.546891;STBP=0.225;TYPE=snp;VARB=-0.010585;OID=.;OPOS=110859069;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:121:122:50:50:71:72:0.590164:44:27:25:25:44:28:25:25
chr13	110861785	.	C	G	1190.41	PASS	AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.01873;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.664;QD=61.0464;RBI=0.0293825;REFB=0;REVB=0.0226389;RO=0;SAF=38;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.42134e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000113462;OID=.;OPOS=110861785;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:40:38:0:0:40:38:0:0
chr13	110864225	.	A	T	828.37	PASS	AF=0.477528;AO=85;DP=178;FAO=85;FDP=178;FR=.;FRO=93;FSAF=34;FSAR=51;FSRF=42;FSRR=51;FWDB=0.000302747;FXX=0.00558628;HRUN=1;LEN=1;MLLD=290.88;QD=18.6151;RBI=0.0006627;REFB=-0.00488871;REVB=-0.000589504;RO=93;SAF=34;SAR=51;SRF=42;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0502464;STB=0.527771;STBP=0.49;TYPE=snp;VARB=0.00612578;OID=.;OPOS=110864225;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:178:178:93:93:85:85:0.477528:51:34:42:51:51:34:42:51
chr13	111077197	.	G	A	2242.65	PASS	AF=0.993007;AO=142;DP=143;FAO=142;FDP=143;FR=.;FRO=1;FSAF=64;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00462381;FXX=0.00694396;HRUN=3;LEN=1;MLLD=162.726;QD=62.7314;RBI=0.0239068;REFB=-0.0457646;REVB=0.0234554;RO=1;SAF=64;SAR=78;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00605755;STB=0.503184;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.000109891;OID=.;OPOS=111077197;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:143:143:1:1:142:142:0.993007:78:64:0:1:78:64:0:1
chr13	111098226	.	C	T	212.24	PASS	AF=0.376812;AO=26;DP=69;FAO=26;FDP=69;FR=.;FRO=43;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=0.00390167;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=195.616;QD=12.3035;RBI=0.0223937;REFB=-0.0136472;REVB=-0.0220512;RO=42;SAF=12;SAR=14;SRF=21;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.041406;STB=0.516766;STBP=0.9;TYPE=snp;VARB=0.0207396;OID=.;OPOS=111098226;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:42:43:26:26:0.376812:14:12:21:21:14:12:21:22
chr13	111102042	.	G	A	265.19	PASS	AF=0.441176;AO=30;DP=68;FAO=30;FDP=68;FR=.;FRO=38;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=-0.0261523;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=124.119;QD=15.5994;RBI=0.0268646;REFB=-0.00587872;REVB=-0.00614524;RO=38;SAF=14;SAR=16;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0330335;STB=0.518652;STBP=0.776;TYPE=snp;VARB=0.00643932;OID=.;OPOS=111102042;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:38:38:30:30:0.441176:16:14:19:19:16:14:19:19
chr13	111102126	.	C	T	187.31	PASS	AF=0.542857;AO=19;DP=35;FAO=19;FDP=35;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=3;FSRR=13;FWDB=0.0478786;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.425;QD=21.4066;RBI=0.0479549;REFB=-0.00891651;REVB=-0.00270414;RO=16;SAF=5;SAR=14;SRF=3;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0832325;STB=0.546512;STBP=0.618;TYPE=snp;VARB=0.00343982;OID=.;OPOS=111102126;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:16:16:19:19:0.542857:14:5:3:13:14:5:3:13
chr13	111109157	.	G	A	493.34	PASS	AF=0.580247;AO=46;DP=80;FAO=47;FDP=81;FR=.;FRO=34;FSAF=19;FSAR=28;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=0.0144974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.244;QD=24.3623;RBI=0.0184275;REFB=-0.0289014;REVB=0.0113753;RO=34;SAF=18;SAR=28;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131872;STB=0.565628;STBP=0.176;TYPE=snp;VARB=0.0252529;OID=.;OPOS=111109157;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:81:34:34:46:47:0.580247:28:18:19:15:28:19:19:15
chr13	111109618	.	G	C	73.37	PASS	AF=0.322581;AO=10;DP=31;FAO=10;FDP=31;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=6;FWDB=-0.0251423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.0372;QD=9.46707;RBI=0.0258492;REFB=-0.0256642;REVB=-0.00600381;RO=20;SAF=5;SAR=5;SRF=15;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.279999;STB=0.644895;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=0.0527887;OID=.;OPOS=111109618;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:31:31:20:21:10:10:0.322581:5:5:15:5:5:5:15:6
chr13	111109859	.	A	G	310.3	PASS	AF=0.384615;AO=35;DP=92;FAO=35;FDP=91;FR=.;FRO=56;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=29;FSRR=27;FWDB=0.00546425;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.3884;QD=13.6397;RBI=0.0114163;REFB=-0.00494875;REVB=-0.0100236;RO=55;SAF=15;SAR=20;SRF=28;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0868294;STB=0.555173;STBP=0.428;TYPE=snp;VARB=0.00778211;OID=.;OPOS=111109859;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:91:55:56:35:35:0.384615:20:15:28:27:20:15:29:27
chr13	111109882	.	A	G	192.22	PASS	AF=0.320513;AO=25;DP=78;FAO=25;FDP=78;FR=.;FRO=53;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=29;FSRR=24;FWDB=0.00277172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.5015;QD=9.85727;RBI=0.00464476;REFB=-0.0134354;REVB=-0.0037271;RO=49;SAF=13;SAR=12;SRF=28;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0586867;STB=0.518504;STBP=0.835;TYPE=snp;VARB=0.0280014;OID=.;OPOS=111109882;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:49:53:25:25:0.320513:12:13:28:21:12:13:29:24
chr13	111111173	.	G	A	235.68	PASS	AF=0.341176;AO=29;DP=85;FAO=29;FDP=85;FR=.;FRO=56;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=33;FSRR=23;FWDB=-0.00597369;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=250.704;QD=11.0907;RBI=0.00612571;REFB=-0.0061784;REVB=0.00135625;RO=56;SAF=16;SAR=13;SRF=33;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0433563;STB=0.525127;STBP=0.74;TYPE=snp;VARB=0.0114355;OID=.;OPOS=111111173;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:56:56:29:29:0.341176:13:16:33:23:13:16:33:23
chr13	111111235	.	G	A	131.29	PASS	AF=0.305085;AO=18;DP=59;FAO=18;FDP=59;FR=.;FRO=41;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=25;FSRR=16;FWDB=0.00212742;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.722;QD=8.90117;RBI=0.00860493;REFB=-0.0095739;REVB=0.0083378;RO=41;SAF=6;SAR=12;SRF=25;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.31751;STB=0.688683;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.013749;OID=.;OPOS=111111235;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:41:41:18:18:0.305085:12:6:25:16:12:6:25:16
chr13	111134858	.	T	C	212.26	PASS	AF=0.480769;AO=22;DP=48;FAO=25;FDP=52;FR=.;FRO=27;FSAF=19;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=-0.00157104;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.676;QD=16.3277;RBI=0.0181945;REFB=-0.0165349;REVB=0.0181266;RO=26;SAF=19;SAR=3;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.347647;STB=0.605913;STBP=0.185;TYPE=snp;VARB=0.0249469;OID=.;OPOS=111134858;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:52:26:27:22:25:0.480769:3:19:16:10:6:19:16:11
chr13	111154058	.	T	A	468.88	PASS	AF=1;AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0126637;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.94;QD=58.61;RBI=0.012765;REFB=0;REVB=0.00160542;RO=0;SAF=19;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.4247e-05;OID=.;OPOS=111154058;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:32:0:0:32:32:1:13:19:0:0:13:19:0:0
chr13	111154061	.	T	C	501.65	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0349622;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.0303;QD=59.0179;RBI=0.0349636;REFB=0;REVB=0.00030703;RO=0;SAF=21;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000288491;OID=.;OPOS=111154061;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:13:21:0:0:13:21:0:0
chr13	111155773	.	T	C,G	720.41	PASS	AF=0.980392,0.0196078;AO=49,2;DP=51;FAO=50,1;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=26,1;FSAR=24,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00997498,0.00475919;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=180.761,131.036;QD=56.5023;RBI=0.0123574,0.00942532;REFB=0,0;REVB=-0.00729427,-0.00813553;RO=0;SAF=26,1;SAR=23,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00113781,0.0254794;OID=.,.;OPOS=111155773,111155773;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:5:51:51:0:0:49,2:50,1:0.980392,0.0196078:23,1:26,1:0:0:24,0:26,1:0:0
chr13	111156499	.	C	T	1797.28	PASS	AF=0.983607;AO=114;DP=116;FAO=120;FDP=122;FR=.;FRO=2;FSAF=61;FSAR=59;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.053648;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.2474;QD=58.9273;RBI=0.0537475;REFB=-0.0119266;REVB=-0.00326905;RO=2;SAF=56;SAR=58;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000287216;STB=0.500137;STBP=0.87;TYPE=snp;VARB=0.00208152;OID=.;OPOS=111156499;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:116:122:2:2:114:120:0.983607:58:56:1:1:59:61:1:1
chr13	111176393	.	A	G	787.01	PASS	AF=0.982456;AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0177563;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=129.511;QD=55.2285;RBI=0.0399074;REFB=-0.0983731;REVB=-0.0357395;RO=1;SAF=22;SAR=34;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.020948;STB=0.511107;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=0.00043542;OID=.;OPOS=111176393;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:57:57:1:1:56:56:0.982456:34:22:1:0:34:22:1:0
chr13	111176519	.	G	T	108.85	PASS	AF=0.666667;AO=12;DP=18;FAO=12;FDP=18;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.028148;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.4874;QD=24.1879;RBI=0.0436491;REFB=0.0133731;REVB=0.0333606;RO=6;SAF=4;SAR=8;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0103585;OID=.;OPOS=111176519;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:18:18:6:6:12:12:0.666667:8:4:2:4:8:4:2:4
chr13	111315405	.	G	A	167.45	PASS	AF=0.9375;AO=15;DP=16;FAO=15;FDP=16;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0238909;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.2676;QD=41.8621;RBI=0.0786867;REFB=0.0548632;REVB=0.0749722;RO=1;SAF=8;SAR=7;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0536101;STB=0.529373;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=-0.00360423;OID=.;OPOS=111315405;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:16:16:1:1:15:15:0.9375:7:8:1:0:7:8:1:0
chr13	111319754	.	T	C	1070.24	PASS	AF=0.948718;AO=74;DP=78;FAO=74;FDP=78;FR=.;FRO=4;FSAF=41;FSAR=33;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.00163045;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=137.956;QD=54.884;RBI=0.0108955;REFB=-0.0634916;REVB=-0.0107728;RO=2;SAF=41;SAR=33;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00272103;STB=0.510187;STBP=0.459;TYPE=snp;VARB=0.00391692;OID=.;OPOS=111319754;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:78:78:2:4:74:74:0.948718:33:41:1:1:33:41:3:1
chr13	111340342	.	G	A	258.02	PASS	AF=0.518519;AO=27;DP=53;FAO=28;FDP=54;FR=.;FRO=26;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=0.0283426;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.641;QD=19.1124;RBI=0.0307798;REFB=-0.0183588;REVB=0.012004;RO=26;SAF=14;SAR=13;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0835679;STB=0.554051;STBP=0.449;TYPE=snp;VARB=0.0123927;OID=.;OPOS=111340342;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:54:26:26:27:28:0.518519:13:14:11:15:13:15:11:15
chr13	111365104	.	A	G	1396.27	PASS	AF=1;AO=86;DP=87;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0123838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.8731;QD=62.7537;RBI=0.0453155;REFB=0;REVB=0.0435905;RO=0;SAF=56;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.10353e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000150294;OID=.;OPOS=111365104;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:89:0:0:86:89:1:30:56:0:0:33:56:0:0
chr13	111368164	.	T	G	158.6	PASS	AF=1;AO=13;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.007271;FXX=0.0666222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.078;QD=45.3133;RBI=0.0165204;REFB=0;REVB=0.0148343;RO=0;SAF=7;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00065556;OID=.;OPOS=111368164;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:13:14:1:6:7:0:0:6:8:0:0
chr13	111531885	.	C	A	742.13	PASS	AF=1;AO=43;DP=44;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0303222;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.013;QD=63.1604;RBI=0.0304801;REFB=0;REVB=-0.003099;RO=0;SAF=15;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.97608e-05;OID=.;OPOS=111531885;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:47:0:0:43:47:1:28:15:0:0:28:19:0:0
chr13	111532288	.	G	A	396.58	PASS	AF=0.428571;AO=45;DP=105;FAO=45;FDP=105;FR=.;FRO=60;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=34;FSRR=26;FWDB=0.00356063;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=248.638;QD=15.1076;RBI=0.00602796;REFB=-0.0119082;REVB=0.00486398;RO=60;SAF=26;SAR=19;SRF=34;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0115507;STB=0.506491;STBP=0.908;TYPE=snp;VARB=0.018445;OID=.;OPOS=111532288;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:105:60:60:45:45:0.428571:19:26:34:26:19:26:34:26
chr13	111563052	.	C	T	746.48	PASS	AF=0.681319;AO=62;DP=91;FAO=62;FDP=91;FR=.;FRO=29;FSAF=29;FSAR=33;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.0189306;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.968;QD=32.8123;RBI=0.0197392;REFB=-0.0216411;REVB=0.00559194;RO=29;SAF=29;SAR=33;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00889505;STB=0.504801;STBP=0.893;TYPE=snp;VARB=0.00826411;OID=.;OPOS=111563052;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:29:29:62:62:0.681319:33:29:14:15:33:29:14:15
chr13	111806245	.	A	G	1023.53	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0299848;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.663;QD=59.3353;RBI=0.0452623;REFB=0;REVB=0.0339056;RO=0;SAF=26;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.36423e-05;OID=.;OPOS=111806245;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:68:69:0:0:68:69:1:42:26:0:0:42:27:0:0
chr13	111870037	.	T	C	401.11	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0460843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.754;QD=55.326;RBI=0.0692734;REFB=0;REVB=0.0517208;RO=0;SAF=17;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.31638e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0016157;OID=.;OPOS=111870037;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:29:0:0:28:29:1:11:17:0:0:11:18:0:0
chr13	111918006	.	TCCC	TCCA,TCC,TTCC	66.6	PASS	AF=0.0566038,0.226415,0;AO=2,7,2;DP=54;FAO=3,12,0;FDP=53;FR=.;FRO=38;FSAF=3,9,0;FSAR=0,3,0;FSRF=15;FSRR=23;FWDB=-0.0284063,0.157172,0.085538;FXX=0.0185151;HRUN=4,4,4;LEN=1,1,1;MLLD=175.952,16.2796,26.8727;QD=5.02645;RBI=0.0372108,0.16073,0.102395;REFB=-0.0116496,-0.0503148,-0.0163206;REVB=-0.0240359,-0.0336323,0.056284;RO=37;SAF=2,5,0;SAR=0,2,2;SRF=16;SRR=21;SSEN=0,0.320755,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.458159,0.33435,-0.398222;STB=0.997086,0.764274,0.5;STBP=0.049,0.053,1;TYPE=snp,del,snp;VARB=0.220154,0.124346,0;OID=.,.,.;OPOS=111918009,111918007,111918007;OREF=C,C,C;OALT=A,-,T;OMAPALT=TCCA,TCC,TTCC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0.0566038,0.226415,0:2,7,2:54:3,12,0:53:38:3,9,0:0,3,0:15:23:44:37:2,5,0:0,2,2:16:21
chr13	111980537	.	C	T	1396.41	PASS	AF=1;AO=88;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000332765;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.977;QD=62.7601;RBI=0.0176242;REFB=0;REVB=0.0176211;RO=0;SAF=43;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.39218e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.03543e-05;OID=.;OPOS=111980537;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:89:89:0:0:88:89:1:45:43:0:0:46:43:0:0
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chr13	113812962	.	G	A	194.34	PASS	AF=0.59375;AO=19;DP=32;FAO=19;FDP=32;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=2;FSRR=11;FWDB=0.0192089;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.8827;QD=24.2926;RBI=0.0693589;REFB=-0.0418104;REVB=0.0666459;RO=13;SAF=5;SAR=14;SRF=2;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109107;STB=0.560479;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.0177611;OID=.;OPOS=113812962;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:13:13:19:19:0.59375:14:5:2:11:14:5:2:11
chr13	113818900	.	A	G	1453.46	PASS	AF=1;AO=92;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0191779;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.1582;QD=63.1938;RBI=0.0209253;REFB=0;REVB=-0.00837097;RO=0;SAF=46;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.86188e-05;OID=.;OPOS=113818900;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:92:92:0:0:92:92:1:46:46:0:0:46:46:0:0
chr13	113839788	.	CAGA	C	131.51	PASS	AF=0.348837;AO=14;DP=43;FAO=15;FDP=43;FR=.;FRO=28;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.00671517;FXX=0.0652032;HRUN=1;LEN=3;MLLD=261.269;QD=12.2333;RBI=0.00695749;REFB=0.00655209;REVB=-0.00182022;RO=27;SAF=5;SAR=9;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.182015;STB=0.612749;STBP=0.266;TYPE=del;VARB=-0.0117401;OID=.;OPOS=113839789;OREF=AGA;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.348837:14:43:15:43:28:5:10:14:14:99:27:5:9:14:13
chr13	113965176	.	C	A	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00562271;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=254.222;QD=49.599;RBI=0.0105778;REFB=0;REVB=0.00895957;RO=0;SAF=9;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.55013e-05;OID=.;OPOS=113965176;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:9:9:0:0:9:9:0:0
chr13	114309226	.	G	A	211.45	PASS	AF=0.321429;AO=27;DP=84;FAO=27;FDP=84;FR=.;FRO=57;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=36;FSRR=21;FWDB=-0.0387261;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.839;QD=10.069;RBI=0.0499208;REFB=0.00317269;REVB=-0.031502;RO=57;SAF=14;SAR=13;SRF=36;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132492;STB=0.577209;STBP=0.321;TYPE=snp;VARB=-0.0071805;OID=.;OPOS=114309226;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:57:57:27:27:0.321429:13:14:36:21:13:14:36:21
chr13	114312354	.	T	G	557.08	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0105167;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.025;QD=60.2244;RBI=0.013803;REFB=0;REVB=0.00893984;RO=0;SAF=15;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.82408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.31741e-06;OID=.;OPOS=114312354;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:22:15:0:0:22:15:0:0
chr13	114322289	.	A	G	232.34	PASS	AF=0.510638;AO=20;DP=44;FAO=24;FDP=47;FR=.;FRO=23;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=-0.000432085;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.129;QD=19.7734;RBI=0.00872679;REFB=-0.0321513;REVB=-0.00871608;RO=23;SAF=15;SAR=5;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.390473;STB=0.657011;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.0340665;OID=.;OPOS=114322289;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:47:23:23:20:24:0.510638:5:15:8:15:8:16:8:15
chr13	114453605	.	C	CTGTGTGCACG	144.02	PASS	AF=0.421053;AO=16;DP=38;FAO=16;FDP=38;FR=.;FRO=22;FSAF=1;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.00961323;FXX=0;HRUN=1;LEN=10;MLLD=242.214;QD=15.1604;RBI=0.0101421;REFB=-0.0145856;REVB=0.00323235;RO=22;SAF=1;SAR=15;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.622685;STB=0.87319;STBP=0.005;TYPE=ins;VARB=0.0154753;OID=.;OPOS=114453606;OREF=-;OALT=TGTGTGCACG;OMAPALT=CTGTGTGCACG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.421053:16:38:16:38:22:1:15:11:11:99:22:1:15:11:11
chr13	114453873	.	G	C	46.43	PASS	AF=0.318182;AO=7;DP=23;FAO=7;FDP=22;FR=.;FRO=15;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=-0.0195594;FXX=0.0434594;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.2312;QD=8.4417;RBI=0.0222479;REFB=-0.00497434;REVB=0.0106019;RO=15;SAF=2;SAR=5;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0611001;STB=0.538348;STBP=0.844;TYPE=snp;VARB=0.00568382;OID=.;OPOS=114453873;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:23:22:15:15:7:7:0.318182:5:2:5:10:5:2:5:10
chr13	114453912	.	C	T	109.25	PASS	AF=0.419355;AO=13;DP=30;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.0201311;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.829;QD=14.0961;RBI=0.0201631;REFB=-0.0108066;REVB=0.00113613;RO=15;SAF=7;SAR=6;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.057665;STB=0.522354;STBP=0.785;TYPE=snp;VARB=0.0146604;OID=.;OPOS=114453912;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:31:15:18:13:13:0.419355:6:7:9:6:6:7:9:9
chr13	114535746	.	G	A	89.64	PASS	AF=0.266667;AO=12;DP=45;FAO=12;FDP=45;FR=.;FRO=33;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=-0.0127925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.418;QD=7.96787;RBI=0.0267458;REFB=-0.00402991;REVB=-0.0234881;RO=32;SAF=4;SAR=8;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.270386;STB=0.676179;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=0.00717855;OID=.;OPOS=114535746;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:45:45:32:33:12:12:0.266667:8:4:18:14:8:4:19:14
chr13	114622597	.	A	G	116.21	PASS	AF=0.565217;AO=12;DP=22;FAO=13;FDP=23;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=-0.01157;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=223.548;QD=20.2097;RBI=0.0115874;REFB=-0.011841;REVB=0.000634325;RO=10;SAF=3;SAR=9;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.371805;STB=0.673198;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.00650169;OID=.;OPOS=114622597;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:22:23:10:10:12:13:0.565217:9:3:7:3:9:4:7:3
chr13	114623880	.	G	A	689.33	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0193251;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.885;QD=62.6667;RBI=0.0197076;REFB=0;REVB=-0.00386361;RO=0;SAF=18;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000100701;OID=.;OPOS=114623880;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:26:18:0:0:26:18:0:0
chr13	114747187	.	G	C	111.58	PASS	AF=0.433333;AO=13;DP=31;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=-0.0337687;FXX=0.0322477;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.4044;QD=14.8769;RBI=0.0388365;REFB=0.00421992;REVB=0.019182;RO=18;SAF=2;SAR=11;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.374308;STB=0.732918;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=-0.00627081;OID=.;OPOS=114747187;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:30:18:17:13:13:0.433333:11:2:8:10:11:2:8:9
chr13	114780764	.	A	G	197.78	PASS	AF=0.425926;AO=23;DP=54;FAO=23;FDP=54;FR=.;FRO=31;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=-0.012955;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.333;QD=14.6505;RBI=0.0156823;REFB=0.000273979;REVB=-0.00883763;RO=31;SAF=8;SAR=15;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.205939;STB=0.617688;STBP=0.168;TYPE=snp;VARB=-0.000484842;OID=.;OPOS=114780764;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:31:31:23:23:0.425926:15:8:17:14:15:8:17:14
chr13	114781757	.	G	C	94.15	PASS	AF=0.333333;AO=12;DP=35;FAO=12;FDP=36;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=0.00427024;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.808;QD=10.4611;RBI=0.0185114;REFB=-0.00843766;REVB=-0.0180121;RO=23;SAF=8;SAR=4;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0693119;STB=0.53056;STBP=0.83;TYPE=snp;VARB=0.0196172;OID=.;OPOS=114781757;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:35:36:23:24:12:12:0.333333:4:8:14:9:4:8:15:9
chr14	19378030	.	T	A	97.63	PASS	AF=0.6875;AO=11;DP=16;FAO=11;FDP=16;FR=.;FRO=5;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.00610725;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.745;QD=24.4079;RBI=0.0380487;REFB=-0.00762103;REVB=0.0375553;RO=5;SAF=8;SAR=3;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.084233;STB=0.547855;STBP=0.668;TYPE=snp;VARB=0.00324087;OID=.;OPOS=19378030;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:16:16:5:5:11:11:0.6875:3:8:3:2:3:8:3:2
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chr14	20002286	.	A	G	55.41	PASS	AF=0.363636;AO=8;DP=22;FAO=8;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=-0.00117067;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=274.378;QD=10.0752;RBI=0.0188102;REFB=-0.000359325;REVB=0.0187738;RO=14;SAF=3;SAR=5;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.19274;STB=0.615126;STBP=0.488;TYPE=snp;VARB=0.00061489;OID=.;OPOS=20002286;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:22:22:14:14:8:8:0.363636:5:3:3:11:5:3:3:11
chr14	20181502	.	C	T	138.42	PASS	AF=0.340426;AO=16;DP=47;FAO=16;FDP=47;FR=.;FRO=31;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=22;FSRR=9;FWDB=-0.0143898;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.8439;QD=11.7802;RBI=0.0333899;REFB=-0.00312865;REVB=-0.03013;RO=31;SAF=8;SAR=8;SRF=22;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.236561;STB=0.638138;STBP=0.184;TYPE=snp;VARB=0.00288577;OID=.;OPOS=20181502;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:31:31:16:16:0.340426:8:8:22:9:8:8:22:9
chr14	20216298	.	T	C	2044.8	PASS	AF=1;AO=129;DP=130;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142299;FXX=0.00757518;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.8168;QD=62.4365;RBI=0.0311817;REFB=0;REVB=0.0277454;RO=0;SAF=60;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000381205;OID=.;OPOS=20216298;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:130:131:0:0:129:131:1:69:60:0:0:71:60:0:0
chr14	20216352	.	G	A	238.84	PASS	AF=0.246479;AO=35;DP=141;FAO=35;FDP=142;FR=.;FRO=107;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=47;FSRR=60;FWDB=-0.0219939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.282;QD=6.72798;RBI=0.0223437;REFB=-0.00946585;REVB=0.00393828;RO=106;SAF=16;SAR=19;SRF=46;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0292124;STB=0.513605;STBP=0.846;TYPE=snp;VARB=0.0312488;OID=.;OPOS=20216352;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:141:142:106:107:35:35:0.246479:19:16:46:60:19:16:47:60
chr14	20295834	.	T	C	212.51	PASS	AF=0.217391;AO=35;DP=160;FAO=35;FDP=161;FR=.;FRO=126;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=46;FSRR=80;FWDB=0.00873433;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.902;QD=5.27983;RBI=0.0110576;REFB=-0.000373779;REVB=0.00678098;RO=125;SAF=14;SAR=21;SRF=46;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0428561;STB=0.52878;STBP=0.725;TYPE=snp;VARB=0.00154813;OID=.;OPOS=20295834;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:160:161:125:126:35:35:0.217391:21:14:46:79:21:14:46:80
chr14	20296278	.	G	A	259.87	PASS	AF=0.253247;AO=39;DP=154;FAO=39;FDP=154;FR=.;FRO=115;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=72;FSRR=43;FWDB=-0.0107903;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.1565;QD=6.74974;RBI=0.0130925;REFB=-0.0158542;REVB=-0.00741505;RO=115;SAF=23;SAR=16;SRF=72;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0473012;STB=0.528314;STBP=0.684;TYPE=snp;VARB=0.0447716;OID=.;OPOS=20296278;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:154:154:115:115:39:39:0.253247:16:23:72:43:16:23:72:43
chr14	20345346	.	A	T	779.04	PASS	AF=0.552239;AO=74;DP=135;FAO=74;FDP=134;FR=.;FRO=60;FSAF=34;FSAR=40;FSRF=25;FSRR=35;FWDB=0.0187114;FXX=0.00740686;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.1869;QD=23.2549;RBI=0.0299887;REFB=-0.0626014;REVB=0.0234351;RO=53;SAF=34;SAR=40;SRF=21;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0490234;STB=0.519343;STBP=0.624;TYPE=snp;VARB=0.0297383;OID=.;OPOS=20345346;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:135:134:53:60:74:74:0.552239:40:34:21:32:40:34:25:35
chr14	20389606	.	G	A	95.4	PASS	AF=0.166667;AO=17;DP=102;FAO=17;FDP=102;FR=.;FRO=85;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=69;FWDB=-0.03454;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.323;QD=3.74136;RBI=0.0346226;REFB=-0.00706109;REVB=-0.00239063;RO=85;SAF=6;SAR=11;SRF=16;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.261532;STB=0.664662;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=0.0254206;OID=.;OPOS=20389606;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:102:102:85:85:17:17:0.166667:11:6:16:69:11:6:16:69
chr14	20389628	.	C	T	168.41	PASS	AF=0.291139;AO=23;DP=79;FAO=23;FDP=79;FR=.;FRO=56;FSAF=2;FSAR=21;FSRF=19;FSRR=37;FWDB=-0.0199404;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.17;QD=8.52704;RBI=0.0367546;REFB=-0.00443199;REVB=-0.0308752;RO=56;SAF=2;SAR=21;SRF=19;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.46922;STB=0.791418;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.0128857;OID=.;OPOS=20389628;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:56:56:23:23:0.291139:21:2:19:37:21:2:19:37
chr14	20389721	.	G	A	44.49	PASS	AF=0.25;AO=6;DP=28;FAO=7;FDP=28;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=-0.000731154;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.732;QD=6.3552;RBI=0.0277731;REFB=-0.00873481;REVB=-0.0277635;RO=22;SAF=4;SAR=2;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.248483;STB=0.683671;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.0231791;OID=.;OPOS=20389721;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:28:28:22:21:6:7:0.25:2:4:10:12:2:5:10:11
chr14	20403909	.	T	C	286.94	PASS	AF=0.248555;AO=43;DP=173;FAO=43;FDP=173;FR=.;FRO=130;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=62;FSRR=68;FWDB=-0.00196498;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=198.711;QD=6.6345;RBI=0.00399108;REFB=-0.00180839;REVB=0.00347384;RO=126;SAF=17;SAR=26;SRF=59;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0925505;STB=0.562402;STBP=0.356;TYPE=snp;VARB=0.00367558;OID=.;OPOS=20403909;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:173:173:126:130:43:43:0.248555:26:17:59:67:26:17:62:68
chr14	20404238	.	G	A	371.96	PASS	AF=0.62069;AO=36;DP=58;FAO=36;FDP=58;FR=.;FRO=22;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.02028;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.358;QD=25.6527;RBI=0.0228323;REFB=0.00640409;REVB=0.0104897;RO=22;SAF=21;SAR=15;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0268385;STB=0.514698;STBP=0.788;TYPE=snp;VARB=-0.0043864;OID=.;OPOS=20404238;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:22:22:36:36:0.62069:15:21:12:10:15:21:12:10
chr14	20404736	.	G	A	538.46	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0215035;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.807;QD=59.8286;RBI=0.0230239;REFB=0;REVB=0.00822801;RO=0;SAF=11;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.58193e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000151819;OID=.;OPOS=20404736;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:25:11:0:0:25:11:0:0
chr14	20404767	.	A	G	465.14	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0191327;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.765;QD=58.1418;RBI=0.0312541;REFB=0;REVB=0.0247136;RO=0;SAF=11;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000147888;OID=.;OPOS=20404767;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:21:11:0:0:21:11:0:0
chr14	20444490	.	C	T	795.5	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0251388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.066;QD=56.8212;RBI=0.0368623;REFB=0;REVB=0.0269605;RO=0;SAF=32;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.49259e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000124488;OID=.;OPOS=20444490;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:56:0:0:55:56:1:23:32:0:0:24:32:0:0
chr14	20470737	.	G	A	876.82	PASS	AF=0.914286;AO=64;DP=70;FAO=64;FDP=70;FR=.;FRO=6;FSAF=28;FSAR=36;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.0255236;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=198.642;QD=50.1038;RBI=0.028093;REFB=-0.108565;REVB=0.0117374;RO=6;SAF=28;SAR=36;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0373747;STB=0.519849;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=0.00117485;OID=.;OPOS=20470737;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:24:70:70:6:6:64:64:0.914286:36:28:4:2:36:28:4:2
chr14	20470852	.	CT	C	346.14	PASS	AF=1;AO=45;DP=69;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00722951;FXX=0.102551;HRUN=8;LEN=1;MLLD=7.26686;QD=19.7792;RBI=0.0076807;REFB=0.0253897;REVB=-0.00259372;RO=9;SAF=8;SAR=37;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0779696;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.010636;OID=.;OPOS=20470853;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:45:69:70:70:0:20:50:0:0:6:9:8:37:3:6
chr14	20470903	.	T	C	876.97	PASS	AF=0.96875;AO=62;DP=64;FAO=62;FDP=64;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0160957;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=230.851;QD=54.8103;RBI=0.0162488;REFB=0.0169149;REVB=-0.00222476;RO=1;SAF=27;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0171646;STB=0.502048;STBP=0.89;TYPE=snp;VARB=-5.49217e-06;OID=.;OPOS=20470903;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:64:64:1:2:62:62:0.96875:35:27:1:0:35:27:1:1
chr14	20482919	.	A	C	107.42	PASS	AF=0.382353;AO=13;DP=34;FAO=13;FDP=34;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=-0.00712466;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.164;QD=12.6375;RBI=0.00837533;REFB=0.00418092;REVB=-0.00440287;RO=21;SAF=9;SAR=4;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.28183;STB=0.666405;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=-0.00787671;OID=.;OPOS=20482919;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:21:21:13:13:0.382353:4:9:9:12:4:9:9:12
chr14	20502331	.	T	C	108.86	PASS	AF=0.666667;AO=12;DP=18;FAO=12;FDP=18;FR=.;FRO=6;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0346194;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.66;QD=24.1899;RBI=0.0363567;REFB=-0.00200726;REVB=0.0111042;RO=6;SAF=7;SAR=5;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0510973;STB=0.528799;STBP=0.747;TYPE=snp;VARB=0.00115444;OID=.;OPOS=20502331;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:18:18:6:6:12:12:0.666667:5:7:4:2:5:7:4:2
chr14	20528207	.	G	A	696.2	PASS	AF=0.938776;AO=46;DP=49;FAO=46;FDP=49;FR=.;FRO=3;FSAF=19;FSAR=27;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.103842;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.2108;QD=56.8323;RBI=0.104291;REFB=-0.201392;REVB=-0.00966522;RO=3;SAF=19;SAR=27;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0686254;STB=0.536569;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.0174177;OID=.;OPOS=20528207;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:49:49:3:3:46:46:0.938776:27:19:3:0:27:19:3:0
chr14	20528321	.	A	G	358.11	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0379504;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.402;QD=55.0943;RBI=0.0380151;REFB=0;REVB=0.00221718;RO=0;SAF=6;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.14057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000264763;OID=.;OPOS=20528321;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:20:6:0:0:20:6:0:0
chr14	20528359	.	G	T	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.016187;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.4577;QD=44.6887;RBI=0.048853;REFB=0;REVB=-0.0460933;RO=0;SAF=3;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0014186;OID=.;OPOS=20528359;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:10:3:0:0:10:3:0:0
chr14	20528362	.	A	G	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00452666;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.9;QD=42.1819;RBI=0.0279581;REFB=0;REVB=0.0275892;RO=0;SAF=3;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00024895;OID=.;OPOS=20528362;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:8:3:0:0:8:3:0:0
chr14	20528448	.	TCATAGATTTGCTCACTGAC	T	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00996155;FXX=0;HRUN=1;LEN=19;MLLD=639.503;QD=47.8223;RBI=0.0180031;REFB=0;REVB=0.014996;RO=0;SAF=9;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=5.18762e-05;OID=.;OPOS=20528449;OREF=CATAGATTTGCTCACTGAC;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:16:16:16:16:0:9:7:0:0:4:0:9:7:0:0
chr14	20528505	.	T	A	538.53	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0201066;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.231;QD=59.8368;RBI=0.0273396;REFB=0;REVB=0.0185251;RO=0;SAF=15;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.33347e-06;OID=.;OPOS=20528505;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:21:15:0:0:21:15:0:0
chr14	20528528	.	G	A	638.88	PASS	AF=0.976744;AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0398205;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=267.659;QD=59.4304;RBI=0.040174;REFB=-0.143432;REVB=0.00531793;RO=0;SAF=18;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.513507;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.000424698;OID=.;OPOS=20528528;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:43:43:0:1:42:42:0.976744:24:18:0:0:24:18:1:0
chr14	20529019	.	C	T	1153.57	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00432149;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.795;QD=60.7143;RBI=0.00574051;REFB=0;REVB=-0.00377865;RO=0;SAF=46;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.39666e-05;OID=.;OPOS=20529019;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:30:46:0:0:30:46:0:0
chr14	20529043	.	C	G	806.03	PASS	AF=0.982759;AO=57;DP=59;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0637633;FXX=0.0169463;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.4549;QD=55.5886;RBI=0.0833638;REFB=-0.104231;REVB=0.0537007;RO=0;SAF=32;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5098;STBP=0.331;TYPE=snp;VARB=0.0034218;OID=.;OPOS=20529043;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:59:58:0:1:57:57:0.982759:25:32:0:0:25:32:0:1
chr14	20586042	.	G	C	1164.18	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00993334;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.009;QD=60.477;RBI=0.010553;REFB=0;REVB=-0.00356308;RO=0;SAF=27;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.1792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.51667e-06;OID=.;OPOS=20586042;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:77:0:0:73:77:1:46:27:0:0:49:28:0:0
chr14	20586432	.	C	T	1208.77	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00648616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.41;QD=61.2034;RBI=0.0457032;REFB=0;REVB=0.0452406;RO=0;SAF=33;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.20672e-05;OID=.;OPOS=20586432;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:46:33:0:0:46:33:0:0
chr14	20665887	.	G	C	607.2	PASS	AF=1;AO=38;DP=39;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0048985;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.368;QD=60.7197;RBI=0.00901969;REFB=0;REVB=-0.00757361;RO=0;SAF=19;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.7661e-05;OID=.;OPOS=20665887;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:40:0:0:38:40:1:19:19:0:0:20:20:0:0
chr14	20666175	.	C	CA	30.42	PASS	AF=0.188406;AO=20;DP=73;FAO=13;FDP=69;FR=.;FRO=56;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=26;FSRR=30;FWDB=0.0552659;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=9.08768;QD=1.76375;RBI=0.132523;REFB=-0.0857317;REVB=-0.120449;RO=51;SAF=7;SAR=13;SRF=23;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126111;STB=0.706977;STBP=0.11;TYPE=ins;VARB=0.0877441;OID=.;OPOS=20666176;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.188406:20:73:13:69:56:3:10:26:30:30:51:7:13:23:28
chr14	20697600	.	T	G	1470.24	PASS	AF=0.969388;AO=95;DP=98;FAO=95;FDP=98;FR=.;FRO=3;FSAF=58;FSAR=37;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.00151082;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.0475;QD=60.0096;RBI=0.0108567;REFB=-0.0315732;REVB=-0.0107511;RO=3;SAF=58;SAR=37;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00342684;STB=0.501808;STBP=0.916;TYPE=snp;VARB=0.000843801;OID=.;OPOS=20697600;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:98:98:3:3:95:95:0.969388:37:58:2:1:37:58:2:1
chr14	20764585	.	A	C	426.69	PASS	AF=0.538462;AO=42;DP=78;FAO=42;FDP=78;FR=.;FRO=36;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=-0.0217746;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.7142;QD=21.8815;RBI=0.0217951;REFB=-0.0310036;REVB=0.000943889;RO=36;SAF=17;SAR=25;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0341734;STB=0.518859;STBP=0.76;TYPE=snp;VARB=0.0257776;OID=.;OPOS=20764585;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:36:36:42:42:0.538462:25:17:16:20:25:17:16:20
chr14	20770036	.	T	C	1268.35	PASS	AF=0.988095;AO=83;DP=84;FAO=83;FDP=84;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0111602;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.657;QD=60.3977;RBI=0.0117084;REFB=-0.014418;REVB=0.00354052;RO=0;SAF=43;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506171;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.000318148;OID=.;OPOS=20770036;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:84:84:0:1:83:83:0.988095:40:43:0:0:40:43:0:1
chr14	20784431	.	G	A	390.38	PASS	AF=0.487805;AO=40;DP=82;FAO=40;FDP=82;FR=.;FRO=42;FSAF=10;FSAR=30;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=-0.00979906;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.563;QD=19.043;RBI=0.0106036;REFB=0.00824099;REVB=0.00405144;RO=42;SAF=10;SAR=30;SRF=21;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.260077;STB=0.645755;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=-0.00702385;OID=.;OPOS=20784431;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:42:42:40:40:0.487805:30:10:21:21:30:10:21:21
chr14	20784718	.	G	T	35.24	PASS	AF=0.5;AO=5;DP=11;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.0423582;FXX=0.0908265;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.242;QD=14.0969;RBI=0.0429241;REFB=-0.0203332;REVB=-0.00694734;RO=5;SAF=2;SAR=3;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.052449;OID=.;OPOS=20784718;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:11:10:5:5:5:5:0.5:3:2:2:3:3:2:2:3
chr14	20811442	.	C	T	472.01	PASS	AF=0.485437;AO=50;DP=103;FAO=50;FDP=103;FR=.;FRO=53;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=29;FSRR=24;FWDB=-0.0048839;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=237.068;QD=18.3305;RBI=0.00562726;REFB=-0.0154214;REVB=0.00279527;RO=52;SAF=28;SAR=22;SRF=29;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00215207;STB=0.506685;STBP=0.89;TYPE=snp;VARB=0.0187802;OID=.;OPOS=20811442;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:103:52:53:50:50:0.485437:22:28:29:23:22:28:29:24
chr14	20815013	.	C	T	68.09	PASS	AF=0.473684;AO=9;DP=19;FAO=9;FDP=19;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.00820824;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=273.668;QD=14.3343;RBI=0.00820828;REFB=-0.0102571;REVB=2.68073e-05;RO=10;SAF=6;SAR=3;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.322491;STB=0.689242;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.0136838;OID=.;OPOS=20815013;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:19:19:10:10:9:9:0.473684:3:6:3:7:3:6:3:7
chr14	20824181	.	T	C	107.99	PASS	AF=0.393939;AO=13;DP=33;FAO=13;FDP=33;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.0290995;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.652;QD=13.0894;RBI=0.0305643;REFB=-0.0176124;REVB=-0.0093486;RO=20;SAF=8;SAR=5;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0697263;STB=0.540999;STBP=0.709;TYPE=snp;VARB=0.0193691;OID=.;OPOS=20824181;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:20:20:13:13:0.393939:5:8:11:9:5:8:11:9
chr14	20837701	.	G	C	152.59	PASS	AF=0.404762;AO=16;DP=42;FAO=17;FDP=42;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=-0.0106974;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=272.439;QD=14.5323;RBI=0.0135525;REFB=-0.0152294;REVB=-0.00832085;RO=25;SAF=5;SAR=11;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101299;STB=0.571341;STBP=0.483;TYPE=snp;VARB=0.0199439;OID=.;OPOS=20837701;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:25:25:16:17:0.404762:11:5:10:15:12:5:10:15
chr14	20841707	.	C	T	131.99	PASS	AF=0.416667;AO=15;DP=36;FAO=15;FDP=36;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=6;FWDB=-0.0298691;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.35;QD=14.6656;RBI=0.0326577;REFB=-0.0212373;REVB=-0.0132047;RO=21;SAF=9;SAR=6;SRF=15;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123809;STB=0.571338;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.0446908;OID=.;OPOS=20841707;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:21:21:15:15:0.416667:6:9:15:6:6:9:15:6
chr14	20847202	.	A	G	125.3	PASS	AF=0.303571;AO=17;DP=56;FAO=17;FDP=56;FR=.;FRO=39;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=-0.00377336;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.147;QD=8.95011;RBI=0.0083628;REFB=-0.00380677;REVB=0.00746312;RO=37;SAF=6;SAR=11;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127635;STB=0.578852;STBP=0.4;TYPE=snp;VARB=0.00904475;OID=.;OPOS=20847202;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:37:39:17:17:0.303571:11:6:17:20:11:6:18:21
chr14	20852029	.	A	G	447.0	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00413784;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.768;QD=57.677;RBI=0.00988621;REFB=0;REVB=0.00897861;RO=0;SAF=16;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.94635e-05;OID=.;OPOS=20852029;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:15:16:0:0:15:16:0:0
chr14	20852770	.	G	T	204.17	PASS	AF=0.428571;AO=20;DP=48;FAO=21;FDP=49;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=0.0040319;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.803;QD=16.6666;RBI=0.0200152;REFB=-0.0178617;REVB=-0.0196049;RO=28;SAF=10;SAR=10;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0362745;STB=0.506816;STBP=0.952;TYPE=snp;VARB=0.0252891;OID=.;OPOS=20852770;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:49:28:28:20:21:0.428571:10:10:13:15:11:10:13:15
chr14	20852817	.	G	A	657.9	PASS	AF=0.977778;AO=42;DP=43;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0113749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.6003;QD=58.4803;RBI=0.0114114;REFB=-0.00362056;REVB=-0.000911616;RO=1;SAF=17;SAR=25;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0184086;STB=0.50943;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=0.00138445;OID=.;OPOS=20852817;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:43:45:1:1:42:44:0.977778:25:17:0:1:26:18:0:1
chr14	20854734	.	A	G	853.91	PASS	AF=0.983607;AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0052426;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.833;QD=55.9938;RBI=0.00833215;REFB=0.0652229;REVB=0.0064761;RO=1;SAF=25;SAR=35;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0132943;STB=0.50704;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=-0.00273055;OID=.;OPOS=20854734;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:61:61:1:1:60:60:0.983607:35:25:0:1:35:25:0:1
chr14	20863677	.	C	A	501.36	PASS	AF=0.681818;AO=42;DP=64;FAO=45;FDP=66;FR=.;FRO=21;FSAF=25;FSAR=20;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=-0.0140906;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.457;QD=30.3852;RBI=0.0140927;REFB=0.0188948;REVB=0.00023987;RO=21;SAF=23;SAR=19;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0439868;STB=0.525412;STBP=0.565;TYPE=snp;VARB=-0.00931351;OID=.;OPOS=20863677;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:66:21:21:42:45:0.681818:19:23:10:11:20:25:10:11
chr14	20876305	.	A	G	134.24	PASS	AF=0.454545;AO=15;DP=33;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=0.0109071;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=199.979;QD=16.2711;RBI=0.012292;REFB=-0.0342677;REVB=-0.00566816;RO=18;SAF=11;SAR=4;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0769795;STB=0.544493;STBP=0.654;TYPE=snp;VARB=0.0536538;OID=.;OPOS=20876305;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:18:18:15:15:0.454545:4:11:12:6:4:11:12:6
chr14	20897064	.	C	T	328.03	PASS	AF=1;AO=23;DP=24;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.692;QD=50.4656;RBI=0.0445843;REFB=0;REVB=0.0405006;RO=0;SAF=13;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00345824;OID=.;OPOS=20897064;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:26:0:0:23:26:1:10:13:0:0:13:13:0:0
chr14	20898308	.	C	G,T	256.59	PASS	AF=0.0909091,0.863636;AO=2,19;DP=22;FAO=2,19;FDP=22;FR=.;FRO=1;FSAF=1,6;FSAR=1,13;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0135825,-0.0139613;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=28.9831,120.659;QD=46.6532;RBI=0.0574812,0.0170204;REFB=-0.123097,-0.059492;REVB=0.0558534,0.00973541;RO=0;SAF=1,6;SAR=1,13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-3.851e-08;STB=0.665164,0.53842;STBP=0.662,0.297;TYPE=snp,snp;VARB=0.18362,0.000291727;OID=.,.;OPOS=20898308,20898308;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:22:22:0:1:2,19:2,19:0.0909091,0.863636:1,13:1,6:0:0:1,13:1,6:1:0
chr14	20925154	.	T	G	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00375707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.67;QD=46.8478;RBI=0.0300781;REFB=0;REVB=0.0298425;RO=0;SAF=3;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00026035;OID=.;OPOS=20925154;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:12:3:0:0:12:3:0:0
chr14	20928359	.	C	A	801.33	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0149634;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.601;QD=57.2375;RBI=0.0202682;REFB=0;REVB=0.0136709;RO=0;SAF=38;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.97918e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.64028e-06;OID=.;OPOS=20928359;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:56:0:0:55:56:1:17:38:0:0:17:39:0:0
chr14	21024619	.	A	G	1339.74	PASS	AF=1;AO=85;DP=85;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0333354;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.7217;QD=62.3136;RBI=0.0356242;REFB=0;REVB=-0.0125633;RO=0;SAF=45;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.79153e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000101305;OID=.;OPOS=21024619;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:86:0:0:85:86:1:40:45:0:0:40:46:0:0
chr14	21024786	.	A	G	1804.17	PASS	AF=1;AO=117;DP=117;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0076852;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=277.436;QD=61.1582;RBI=0.0114885;REFB=0;REVB=0.00853948;RO=0;SAF=56;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.08891e-05;OID=.;OPOS=21024786;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:117:118:0:0:117:118:1:61:56:0:0:61:57:0:0
chr14	21058902	.	G	A	403.14	PASS	AF=0.6;AO=39;DP=65;FAO=39;FDP=65;FR=.;FRO=26;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.00630221;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.3297;QD=24.8089;RBI=0.00879289;REFB=-0.029399;REVB=-0.00613163;RO=26;SAF=23;SAR=16;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0947916;STB=0.551973;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=0.0219043;OID=.;OPOS=21058902;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:26:26:39:39:0.6:16:23:12:14:16:23:12:14
chr14	21081996	.	C	T	1452.22	PASS	AF=0.980769;AO=100;DP=105;FAO=102;FDP=104;FR=.;FRO=2;FSAF=50;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0312847;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.032;QD=55.8547;RBI=0.0482733;REFB=-0.146284;REVB=0.0367638;RO=3;SAF=50;SAR=50;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0276106;STB=0.509432;STBP=0.238;TYPE=snp;VARB=0.000998113;OID=.;OPOS=21081996;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:105:104:3:2:100:102:0.980769:50:50:0:3:52:50:0:2
chr14	21099400	.	G	A	315.57	PASS	AF=0.596154;AO=31;DP=52;FAO=31;FDP=52;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=-0.00128907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.954;QD=24.2743;RBI=0.00285624;REFB=-0.027236;REVB=-0.0025488;RO=21;SAF=10;SAR=21;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.192337;STB=0.606228;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.0180791;OID=.;OPOS=21099400;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:21:21:31:31:0.596154:21:10:12:9:21:10:12:9
chr14	21101155	.	C	T	358.34	PASS	AF=0.452381;AO=36;DP=82;FAO=38;FDP=84;FR=.;FRO=46;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=20;FSRR=26;FWDB=0.00950089;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=293.571;QD=17.0639;RBI=0.0187259;REFB=-0.00194484;REVB=-0.0161367;RO=46;SAF=15;SAR=21;SRF=20;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0184958;STB=0.506976;STBP=0.914;TYPE=snp;VARB=0.00227425;OID=.;OPOS=21101155;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:84:46:46:36:38:0.452381:21:15:20:26:21:17:20:26
chr14	21109141	.	C	T	613.21	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0162647;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.5517;QD=61.3213;RBI=0.100896;REFB=0;REVB=0.0995762;RO=0;SAF=18;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.19993e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000677419;OID=.;OPOS=21109141;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:22:18:0:0:22:18:0:0
chr14	21109170	.	T	A	789.2	PASS	AF=1;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00691653;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.6106;QD=64.4245;RBI=0.0104413;REFB=0;REVB=0.00782189;RO=0;SAF=21;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.31869e-06;OID=.;OPOS=21109170;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:49:0:0:49:49:1:28:21:0:0:28:21:0:0
chr14	21149930	.	T	C	273.92	PASS	AF=0.430556;AO=31;DP=72;FAO=31;FDP=72;FR=.;FRO=41;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=16;FSRR=25;FWDB=-0.032247;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.092;QD=15.2179;RBI=0.0325857;REFB=-0.00635283;REVB=-0.00468594;RO=41;SAF=10;SAR=21;SRF=16;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0753389;STB=0.542715;STBP=0.552;TYPE=snp;VARB=0.0108063;OID=.;OPOS=21149930;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:41:41:31:31:0.430556:21:10:16:25:21:10:16:25
chr14	21151483	.	T	G	929.74	PASS	AF=0.427966;AO=100;DP=235;FAO=101;FDP=236;FR=.;FRO=135;FSAF=49;FSAR=52;FSRF=69;FSRR=66;FWDB=0.0190414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.309;QD=15.7584;RBI=0.0219081;REFB=-0.0219008;REVB=-0.0108346;RO=135;SAF=49;SAR=51;SRF=69;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0217517;STB=0.514849;STBP=0.703;TYPE=snp;VARB=0.0288243;OID=.;OPOS=21151483;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:235:236:135:135:100:101:0.427966:51:49:69:66:52:49:69:66
chr14	21168055	.	T	C	506.46	PASS	AF=0.505051;AO=48;DP=97;FAO=50;FDP=99;FR=.;FRO=49;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=22;FSRR=27;FWDB=0.0119758;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.073;QD=20.4632;RBI=0.0213293;REFB=-0.0106742;REVB=-0.01765;RO=48;SAF=28;SAR=20;SRF=21;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132061;STB=0.554994;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=0.00659228;OID=.;OPOS=21168055;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:99:48:49:48:50:0.505051:20:28:21:27:22:28:22:27
chr14	21168084	.	C	T	285.95	PASS	AF=0.5;AO=31;DP=62;FAO=31;FDP=62;FR=.;FRO=31;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=-0.00803462;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.7801;QD=18.4482;RBI=0.0140627;REFB=-0.0354058;REVB=0.0115414;RO=31;SAF=16;SAR=15;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0241483;OID=.;OPOS=21168084;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:31:31:31:31:0.5:15:16:16:15:15:16:16:15
chr14	21215923	.	G	T	526.76	PASS	AF=0.972973;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0236832;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.032;QD=56.9473;RBI=0.0236882;REFB=-0.0618128;REVB=0.000484018;RO=1;SAF=10;SAR=26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0176666;STB=0.509429;STBP=0.599;TYPE=snp;VARB=0.000838353;OID=.;OPOS=21215923;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:37:37:1:1:36:36:0.972973:26:10:0:1:26:10:0:1
chr14	21216499	.	C	T	526.85	PASS	AF=0.972973;AO=35;DP=36;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0189492;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.0133;QD=56.9572;RBI=0.0225192;REFB=-0.0917488;REVB=-0.0121673;RO=1;SAF=10;SAR=25;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0183486;STB=0.509429;STBP=0.599;TYPE=snp;VARB=0.00224177;OID=.;OPOS=21216499;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:36:37:1:1:35:36:0.972973:25:10:0:1:26:10:0:1
chr14	21238318	.	G	A	57.32	PASS	AF=0.444444;AO=8;DP=18;FAO=8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=-0.0267174;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.9408;QD=12.7381;RBI=0.035532;REFB=-0.034674;REVB=-0.0234244;RO=10;SAF=6;SAR=2;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.258322;STB=0.655832;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=0.0311104;OID=.;OPOS=21238318;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:18:18:10:10:8:8:0.444444:2:6:5:5:2:6:5:5
chr14	21238322	.	C	G	80.27	PASS	AF=0.526316;AO=10;DP=19;FAO=10;FDP=19;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=-0.00993791;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.9849;QD=16.8983;RBI=0.0469579;REFB=-0.0135304;REVB=0.0458942;RO=9;SAF=5;SAR=5;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136379;STB=0.578793;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.0172866;OID=.;OPOS=21238322;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:19:19:9:9:10:10:0.526316:5:5:6:3:5:5:6:3
chr14	21238767	.	A	G	377.89	PASS	AF=0.542857;AO=38;DP=70;FAO=38;FDP=70;FR=.;FRO=32;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=22;FSRR=10;FWDB=0.0318659;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.219;QD=21.5939;RBI=0.0352209;REFB=-0.01029;REVB=0.0150026;RO=32;SAF=17;SAR=21;SRF=22;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196801;STB=0.608414;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=0.00985409;OID=.;OPOS=21238767;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:32:32:38:38:0.542857:21:17:22:10:21:17:22:10
chr14	21238862	.	A	G	315.66	PASS	AF=0.465753;AO=34;DP=74;FAO=34;FDP=73;FR=.;FRO=39;FSAF=9;FSAR=25;FSRF=22;FSRR=17;FWDB=-0.0343173;FXX=0.0135117;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.901;QD=17.2963;RBI=0.0417264;REFB=0.00154156;REVB=0.0237364;RO=38;SAF=9;SAR=25;SRF=21;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.292738;STB=0.672053;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=-0.000909329;OID=.;OPOS=21238862;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:73:38:39:34:34:0.465753:25:9:21:17:25:9:22:17
chr14	21239007	.	A	T	320.72	PASS	AF=0.583333;AO=27;DP=48;FAO=28;FDP=48;FR=.;FRO=20;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=0.0392798;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.8086;QD=26.7268;RBI=0.0394739;REFB=-0.0131423;REVB=-0.00390973;RO=21;SAF=17;SAR=10;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.268465;STB=0.642755;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.0172949;OID=.;OPOS=21239007;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:21:20:27:28:0.583333:10:17:6:15:10:18:6:14
chr14	21250366	.	T	C	1197.21	PASS	AF=0.987654;AO=78;DP=79;FAO=80;FDP=81;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.000328587;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.7;QD=59.1216;RBI=0.0268166;REFB=-0.0431434;REVB=0.0268146;RO=0;SAF=37;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.4281e-08;STB=0.505746;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.000277194;OID=.;OPOS=21250366;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:79:81:0:1:78:80:0.987654:41:37:0:0:43:37:0:1
chr14	21360344	.	G	C	505.37	PASS	AF=1;AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103023;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.5773;QD=59.4552;RBI=0.0103459;REFB=0;REVB=-0.00094822;RO=0;SAF=11;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000183565;OID=.;OPOS=21360344;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:34:0:0:34:34:1:23:11:0:0:23:11:0:0
chr14	21458320	.	CCCCG	C	287.1	PASS	AF=0.337278;AO=55;DP=175;FAO=57;FDP=169;FR=.;FRO=112;FSAF=22;FSAR=35;FSRF=56;FSRR=56;FWDB=0.0253053;FXX=0.0231201;HRUN=5;LEN=4;MLLD=268.578;QD=6.79537;RBI=0.0253063;REFB=-0.000645918;REVB=-0.000216618;RO=108;SAF=21;SAR=34;SRF=52;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117573;STB=0.576896;STBP=0.151;TYPE=del;VARB=0.00124981;OID=.;OPOS=21458321;OREF=CCCG;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.337278:55:175:57:169:112:22:35:56:56:99:108:21:34:52:56
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chr14	21486137	.	G	C	1059.32	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0138013;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.1103;QD=59.6799;RBI=0.0515617;REFB=0;REVB=-0.0496803;RO=0;SAF=33;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00053433;OID=.;OPOS=21486137;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:71:0:0:70:71:1:37:33:0:0:37:34:0:0
chr14	21500121	.	G	T	171.21	PASS	AF=0.461538;AO=18;DP=39;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=6;FWDB=0.0039569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.075;QD=17.5598;RBI=0.0225691;REFB=-0.00792906;REVB=0.0222195;RO=21;SAF=11;SAR=7;SRF=15;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105572;STB=0.559936;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=0.00781402;OID=.;OPOS=21500121;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:21:21:18:18:0.461538:7:11:15:6:7:11:15:6
chr14	21500541	.	T	TA,TAA	84.51	PASS	AF=0.6,0;AO=13,4;DP=34;FAO=18,0;FDP=30;FR=.;FRO=12;FSAF=5,0;FSAR=13,0;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=0.0940155,0.0567944;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=1,2;MLLD=11.3022,16.2273;QD=11.2683;RBI=0.176761,0.096457;REFB=-0.0470249,-0.0255806;REVB=-0.149685,-0.0779638;RO=17;SAF=4,0;SAR=9,4;SRF=7;SRR=10;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.112273,-0.636236;STB=0.526996,0.5;STBP=0.758,1;TYPE=ins,ins;VARB=-0.00235995,0.0615919;OID=.,.;OPOS=21500542,21500542;OREF=-,-;OALT=A,AA;OMAPALT=TA,TAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.6,0:13,4:34:18,0:30:12:5,0:13,0:4:8:45:17:4,0:9,4:7:10
chr14	21501095	.	T	C	208.83	PASS	AF=0.606061;AO=20;DP=33;FAO=20;FDP=33;FR=.;FRO=13;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.00131834;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.98;QD=25.3121;RBI=0.00660308;REFB=-0.0156553;REVB=0.00647014;RO=13;SAF=9;SAR=11;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0627317;STB=0.534919;STBP=0.668;TYPE=snp;VARB=0.0148532;OID=.;OPOS=21501095;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:13:13:20:20:0.606061:11:9:7:6:11:9:7:6
chr14	21501195	.	G	A	135.58	PASS	AF=0.441176;AO=14;DP=34;FAO=15;FDP=34;FR=.;FRO=19;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.03748;FXX=0.0285633;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.5321;QD=15.9501;RBI=0.0769318;REFB=-0.0146193;REVB=0.0671844;RO=20;SAF=11;SAR=3;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.28183;STB=0.685439;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=0.0218376;OID=.;OPOS=21501195;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:20:19:14:15:0.441176:3:11:11:9:3:12:10:9
chr14	21502345	.	A	G	268.7	PASS	AF=0.520833;AO=25;DP=48;FAO=25;FDP=48;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=-0.0467056;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.6668;QD=22.3914;RBI=0.0720475;REFB=-0.00502386;REVB=0.0548582;RO=23;SAF=11;SAR=14;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00453611;STB=0.502536;STBP=0.992;TYPE=snp;VARB=0.00510612;OID=.;OPOS=21502345;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:23:23:25:25:0.520833:14:11:10:13:14:11:10:13
chr14	21511458	.	G	C	234.58	PASS	AF=0.952381;AO=19;DP=21;FAO=20;FDP=21;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0509322;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=35.1831;QD=44.6815;RBI=0.0634867;REFB=-0.0173766;REVB=-0.0379008;RO=2;SAF=15;SAR=4;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0723358;STB=0.516113;STBP=0.64;TYPE=snp;VARB=0.00195459;OID=.;OPOS=21511458;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:21:21:2:1:19:20:0.952381:4:15:1:1:5:15:1:0
chr14	21511497	.	C	T	557.19	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00973059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.964;QD=60.2363;RBI=0.0178619;REFB=0;REVB=-0.0149788;RO=0;SAF=19;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.60092e-05;OID=.;OPOS=21511497;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:37:0:0:36:37:1:17:19:0:0:17:20:0:0
chr14	21526079	.	C	T	101.97	PASS	AF=0.5;AO=12;DP=24;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=0.0179937;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=208.213;QD=16.9945;RBI=0.0533078;REFB=1.59077e-06;REVB=-0.0501791;RO=12;SAF=7;SAR=5;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.282867;STB=0.661906;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=-0.000395694;OID=.;OPOS=21526079;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:24:24:12:12:12:12:0.5:5:7:3:9:5:7:3:9
chr14	21542753	.	G	A	676.97	PASS	AF=0.977778;AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0105454;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.753;QD=60.1753;RBI=0.0333686;REFB=-0.0479618;REVB=0.0316585;RO=1;SAF=29;SAR=15;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0302851;STB=0.516122;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=0.000274924;OID=.;OPOS=21542753;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:45:45:1:1:44:44:0.977778:15:29:0:1:15:29:0:1
chr14	21623290	.	T	C	264.64	PASS	AF=0.382716;AO=31;DP=81;FAO=31;FDP=81;FR=.;FRO=50;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=28;FWDB=0.00688048;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.239;QD=13.0687;RBI=0.0160343;REFB=-0.00410282;REVB=0.014483;RO=50;SAF=16;SAR=15;SRF=22;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0819924;STB=0.54687;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.00666314;OID=.;OPOS=21623290;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:50:50:31:31:0.382716:15:16:22:28:15:16:22:28
chr14	21623489	.	C	A,T	438.9	PASS	AF=0.0625,0.9375;AO=2,29;DP=31;FAO=2,30;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=1,16;FSAR=1,14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0178245,0.0337936;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=90.3763,138.601;QD=54.8619;RBI=0.024282,0.0339766;REFB=0,0;REVB=-0.0164894,-0.00352128;RO=0;SAF=1,15;SAR=1,14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,5.92057e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.240746,-0.00202087;OID=.,.;OPOS=21623489,21623489;OREF=C,C;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:7:31:32:0:0:2,29:2,30:0.0625,0.9375:1,14:1,15:0:0:1,14:1,16:0:0
chr14	21623836	.	G	A	273.88	PASS	AF=0.430556;AO=31;DP=71;FAO=31;FDP=72;FR=.;FRO=41;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=22;FSRR=19;FWDB=-0.00520212;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.9024;QD=15.2156;RBI=0.0349514;REFB=-0.0317453;REVB=-0.0345621;RO=40;SAF=13;SAR=18;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130524;STB=0.567013;STBP=0.343;TYPE=snp;VARB=0.038811;OID=.;OPOS=21623836;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:72:40:41:31:31:0.430556:18:13:22:18:18:13:22:19
chr14	21624197	.	T	C	57.93	PASS	AF=0.470588;AO=8;DP=17;FAO=8;FDP=17;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.0191327;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=288.838;QD=13.631;RBI=0.0294773;REFB=-0.00322589;REVB=0.0224243;RO=9;SAF=2;SAR=6;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200579;STB=0.620366;STBP=0.423;TYPE=snp;VARB=0.00330903;OID=.;OPOS=21624197;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:17:17:9:9:8:8:0.470588:6:2:4:5:6:2:4:5
chr14	21770730	.	A	G	245.27	PASS	AF=0.391892;AO=29;DP=73;FAO=29;FDP=74;FR=.;FRO=45;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=26;FWDB=0.0195075;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=163.674;QD=13.2577;RBI=0.0310248;REFB=-0.0128131;REVB=-0.0241247;RO=44;SAF=14;SAR=15;SRF=19;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0539794;STB=0.536925;STBP=0.598;TYPE=snp;VARB=0.0129002;OID=.;OPOS=21770730;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:74:44:45:29:29:0.391892:15:14:19:25:15:14:19:26
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chr14	21778792	.	T	C	126.49	PASS	AF=0.319149;AO=15;DP=46;FAO=15;FDP=47;FR=.;FRO=32;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=-0.00209432;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=236.771;QD=10.7654;RBI=0.0169931;REFB=-0.0184771;REVB=-0.0168636;RO=31;SAF=7;SAR=8;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0559098;STB=0.543851;STBP=0.702;TYPE=snp;VARB=0.0281652;OID=.;OPOS=21778792;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:47:31:32:15:15:0.319149:8:7:16:15:8:7:17:15
chr14	21785790	.	G	A	84.71	PASS	AF=0.354839;AO=11;DP=31;FAO=11;FDP=31;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=0.0130625;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.3514;QD=10.9306;RBI=0.0654877;REFB=-0.0154616;REVB=-0.0641717;RO=19;SAF=6;SAR=5;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131313;STB=0.592857;STBP=0.455;TYPE=snp;VARB=0.0244881;OID=.;OPOS=21785790;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:31:31:19:20:11:11:0.354839:5:6:8:11:5:6:8:12
chr14	21796784	.	G	C	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0595533;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.364;QD=48.7367;RBI=0.0599239;REFB=0;REVB=0.00665414;RO=0;SAF=5;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000924652;OID=.;OPOS=21796784;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:12:5:0:0:12:5:0:0
chr14	21829129	.	C	G	1033.55	PASS	AF=0.972603;AO=71;DP=73;FAO=71;FDP=73;FR=.;FRO=2;FSAF=35;FSAR=36;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0169937;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=109.795;QD=56.633;RBI=0.0196986;REFB=-0.103332;REVB=-0.00996233;RO=2;SAF=35;SAR=36;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0262533;STB=0.513885;STBP=0.244;TYPE=snp;VARB=0.000816342;OID=.;OPOS=21829129;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:73:73:2:2:71:71:0.972603:36:35:2:0:36:35:2:0
chr14	21831052	.	T	C	592.06	PASS	AF=0.952381;AO=40;DP=42;FAO=40;FDP=42;FR=.;FRO=2;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00394879;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.75;QD=56.387;RBI=0.0271215;REFB=-0.130548;REVB=0.0268325;RO=0;SAF=21;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17587e-08;STB=0.522716;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=0.00111569;OID=.;OPOS=21831052;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:42:42:0:2:40:40:0.952381:19:21:0:0:19:21:2:0
chr14	21871653	.	C	T	1283.42	PASS	AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00300194;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.6285;QD=61.8518;RBI=0.0194348;REFB=0;REVB=-0.0192015;RO=0;SAF=45;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.04629e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.64027e-05;OID=.;OPOS=21871653;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:38:45:0:0:38:45:0:0
chr14	21945415	.	A	G	134.14	PASS	AF=0.292308;AO=18;DP=64;FAO=19;FDP=65;FR=.;FRO=46;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=26;FSRR=20;FWDB=0.00405586;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.5015;QD=8.25453;RBI=0.0263764;REFB=-0.00225594;REVB=-0.0260627;RO=45;SAF=9;SAR=9;SRF=26;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0924998;STB=0.564449;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.00549359;OID=.;OPOS=21945415;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:65:45:46:18:19:0.292308:9:9:26:19:10:9:26:20
chr14	21960816	.	T	C	233.47	PASS	AF=0.472727;AO=26;DP=55;FAO=26;FDP=55;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=-0.00820417;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=255.259;QD=16.9797;RBI=0.00919014;REFB=-0.0142049;REVB=-0.00414129;RO=28;SAF=9;SAR=17;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180445;STB=0.611423;STBP=0.118;TYPE=snp;VARB=0.0137168;OID=.;OPOS=21960816;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:28:29:26:26:0.472727:17:9:15:13:17:9:16:13
chr14	21960969	.	G	A	187.09	PASS	AF=0.415094;AO=21;DP=53;FAO=22;FDP=53;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=0.0248518;FXX=0.0185151;HRUN=5;LEN=1;MLLD=224.324;QD=14.1199;RBI=0.0252512;REFB=-0.0039527;REVB=-0.00447353;RO=20;SAF=11;SAR=10;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106966;STB=0.554745;STBP=0.552;TYPE=snp;VARB=0.00741393;OID=.;OPOS=21960969;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:20:31:21:22:0.415094:10:11:8:12:10:12:14:17
chr14	21967438	.	G	A	212.24	PASS	AF=0.376812;AO=26;DP=69;FAO=26;FDP=69;FR=.;FRO=43;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=-0.00909076;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=322.267;QD=12.3036;RBI=0.0142316;REFB=-0.00775585;REVB=0.0109498;RO=43;SAF=8;SAR=18;SRF=22;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.231314;STB=0.633696;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=0.011002;OID=.;OPOS=21967438;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:43:43:26:26:0.376812:18:8:22:21:18:8:22:21
chr14	21967916	.	A	G	214.73	PASS	AF=0.382353;AO=26;DP=69;FAO=26;FDP=68;FR=.;FRO=42;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=30;FSRR=12;FWDB=0.00574832;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.366;QD=12.6314;RBI=0.00765876;REFB=-0.00358927;REVB=0.00506097;RO=39;SAF=17;SAR=9;SRF=27;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0453563;STB=0.542276;STBP=0.634;TYPE=snp;VARB=0.00379928;OID=.;OPOS=21967916;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:68:39:42:26:26:0.382353:9:17:27:12:9:17:30:12
chr14	21993498	.	G	A	256.48	PASS	AF=0.913043;AO=21;DP=23;FAO=21;FDP=23;FR=.;FRO=2;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0479363;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.5295;QD=44.6057;RBI=0.04821;REFB=-0.027508;REVB=-0.00512916;RO=2;SAF=15;SAR=6;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13106;STB=0.571357;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.0043061;OID=.;OPOS=21993498;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:23:23:2:2:21:21:0.913043:6:15:0:2:6:15:0:2
chr14	22102745	.	C	A	53.69	PASS	AF=0.296296;AO=8;DP=27;FAO=8;FDP=27;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=15;FWDB=0.0347055;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.659;QD=7.95462;RBI=0.0496453;REFB=0.00284115;REVB=-0.035499;RO=19;SAF=7;SAR=1;SRF=4;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.677418;STB=0.909699;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=-0.0131241;OID=.;OPOS=22102745;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:27:27:19:19:8:8:0.296296:1:7:4:15:1:7:4:15
chr14	22111660	.	C	T	501.34	PASS	AF=0.426357;AO=55;DP=130;FAO=55;FDP=129;FR=.;FRO=74;FSAF=32;FSAR=23;FSRF=42;FSRR=32;FWDB=-0.0120773;FXX=0.00769172;HRUN=3;LEN=1;MLLD=187.146;QD=15.5455;RBI=0.0177471;REFB=-9.91588e-05;REVB=0.0130038;RO=74;SAF=32;SAR=23;SRF=42;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0149352;STB=0.508374;STBP=0.871;TYPE=snp;VARB=0.000152636;OID=.;OPOS=22111660;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:130:129:74:74:55:55:0.426357:23:32:42:32:23:32:42:32
chr14	22133416	.	A	G	169.52	PASS	AF=0.395833;AO=18;DP=47;FAO=19;FDP=48;FR=.;FRO=29;FSAF=4;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=0.0033188;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.842;QD=14.1264;RBI=0.00331905;REFB=-0.00340224;REVB=-4.08301e-05;RO=29;SAF=4;SAR=14;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.279865;STB=0.672623;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.00402317;OID=.;OPOS=22133416;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:48:29:29:18:19:0.395833:14:4:13:16:15:4:13:16
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chr14	22133997	.	A	G	262.89	PASS	AF=0.453125;AO=30;DP=65;FAO=29;FDP=64;FR=.;FRO=35;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=12;FSRR=23;FWDB=0.00502092;FXX=0.0447694;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.887;QD=16.4308;RBI=0.0050286;REFB=0.00435238;REVB=0.000277717;RO=35;SAF=11;SAR=19;SRF=12;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.024735;STB=0.521373;STBP=0.781;TYPE=snp;VARB=-0.00415243;OID=.;OPOS=22133997;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:64:35:35:30:29:0.453125:19:11:12:23:18:11:12:23
chr14	22236756	.	G	C	206.69	PASS	AF=0.396825;AO=25;DP=63;FAO=25;FDP=63;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=23;FSRR=15;FWDB=-0.0115386;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.6131;QD=13.1229;RBI=0.0440352;REFB=0.00342114;REVB=0.0424966;RO=38;SAF=15;SAR=10;SRF=23;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00577642;STB=0.503309;STBP=0.985;TYPE=snp;VARB=-0.00505458;OID=.;OPOS=22236756;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:38:38:25:25:0.396825:10:15:23:15:10:15:23:15
chr14	22237070	.	C	T	471.02	PASS	AF=0.46789;AO=51;DP=109;FAO=51;FDP=109;FR=.;FRO=58;FSAF=18;FSAR=33;FSRF=29;FSRR=29;FWDB=-0.0138231;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=247.871;QD=17.285;RBI=0.0138775;REFB=-0.0255744;REVB=0.00122711;RO=58;SAF=18;SAR=33;SRF=29;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1462;STB=0.58152;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=0.0276883;OID=.;OPOS=22237070;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:109:58:58:51:51:0.46789:33:18:29:29:33:18:29:29
chr14	22237127	.	C	T	1302.17	PASS	AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0133668;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=214.403;QD=62.0083;RBI=0.0134462;REFB=0;REVB=0.00145925;RO=0;SAF=36;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.38503e-05;OID=.;OPOS=22237127;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:48:36:0:0:48:36:0:0
chr14	22309847	.	T	C	211.45	PASS	AF=0.466667;AO=21;DP=46;FAO=21;FDP=45;FR=.;FRO=24;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=-0.00235682;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.531;QD=18.7957;RBI=0.0108238;REFB=0.000285681;REVB=-0.0105641;RO=24;SAF=14;SAR=7;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164593;STB=0.593658;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=-0.0003974;OID=.;OPOS=22309847;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:45:24:24:21:21:0.466667:7:14:12:12:7:14:12:12
chr14	22309948	.	T	C	180.65	PASS	AF=0.44186;AO=19;DP=43;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.0242086;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.311;QD=16.8043;RBI=0.0263171;REFB=-0.018838;REVB=-0.0103215;RO=24;SAF=8;SAR=11;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00439071;STB=0.50251;STBP=0.99;TYPE=snp;VARB=0.0256109;OID=.;OPOS=22309948;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:24:24:19:19:0.44186:11:8:10:14:11:8:10:14
chr14	22314985	.	T	C	1153.61	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0545983;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=302.583;QD=60.7162;RBI=0.0547583;REFB=0;REVB=-0.00418381;RO=0;SAF=30;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.35965e-05;OID=.;OPOS=22314985;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:46:30:0:0:46:30:0:0
chr14	22315212	.	A	G	1453.2	PASS	AF=1;AO=88;DP=88;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0685918;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.729;QD=63.1826;RBI=0.0723543;REFB=0;REVB=0.0230283;RO=0;SAF=52;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.57365e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000126734;OID=.;OPOS=22315212;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:88:92:0:0:88:92:1:36:52:0:0:36:56:0:0
chr14	22315296	.	C	T	523.8	PASS	AF=0.514286;AO=54;DP=105;FAO=54;FDP=105;FR=.;FRO=51;FSAF=23;FSAR=31;FSRF=26;FSRR=25;FWDB=0.00350022;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.72;QD=19.9543;RBI=0.00353829;REFB=-0.0082102;REVB=0.000517682;RO=50;SAF=23;SAR=31;SRF=26;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0827066;STB=0.541132;STBP=0.402;TYPE=snp;VARB=0.0118723;OID=.;OPOS=22315296;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:105:50:51:54:54:0.514286:31:23:26:24:31:23:26:25
chr14	22315394	.	T	C	37.93	PASS	AF=0.127273;AO=7;DP=54;FAO=7;FDP=55;FR=.;FRO=48;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=35;FWDB=-0.026588;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.934;QD=2.75819;RBI=0.0337431;REFB=-0.00941152;REVB=-0.0207767;RO=47;SAF=4;SAR=3;SRF=13;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.352973;STB=0.748193;STBP=0.244;TYPE=snp;VARB=0.0514538;OID=.;OPOS=22315394;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:54:55:47:48:7:7:0.127273:3:4:13:34:3:4:13:35
chr14	22320728	.	T	C	353.97	PASS	AF=0.431818;AO=38;DP=88;FAO=38;FDP=88;FR=.;FRO=50;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=29;FSRR=21;FWDB=-0.00701787;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=215.237;QD=16.0894;RBI=0.00814928;REFB=-0.00362568;REVB=0.00414248;RO=50;SAF=15;SAR=23;SRF=29;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186873;STB=0.605208;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.00460766;OID=.;OPOS=22320728;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:50:50:38:38:0.431818:23:15:29:21:23:15:29:21
chr14	22321124	.	T	C	311.41	PASS	AF=0.453333;AO=34;DP=75;FAO=34;FDP=75;FR=.;FRO=41;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=-0.000458397;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.414;QD=16.6086;RBI=0.00763421;REFB=-0.00048283;REVB=-0.00762044;RO=41;SAF=17;SAR=17;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0118626;STB=0.506663;STBP=0.952;TYPE=snp;VARB=0.000574939;OID=.;OPOS=22321124;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:41:41:34:34:0.453333:17:17:20:21:17:17:20:21
chr14	22322690	.	G	A	241.93	PASS	AF=0.381579;AO=29;DP=76;FAO=29;FDP=76;FR=.;FRO=47;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=28;FSRR=19;FWDB=-0.033777;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.7766;QD=12.7331;RBI=0.0601505;REFB=-0.0118125;REVB=0.0497715;RO=46;SAF=13;SAR=16;SRF=28;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170556;STB=0.590398;STBP=0.238;TYPE=snp;VARB=0.018939;OID=.;OPOS=22322690;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:46:47:29:29:0.381579:16:13:28:18:16:13:28:19
chr14	22337393	.	G	A	555.36	PASS	AF=0.525253;AO=51;DP=98;FAO=52;FDP=99;FR=.;FRO=47;FSAF=21;FSAR=31;FSRF=21;FSRR=26;FWDB=0.000945002;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.0204;QD=22.4389;RBI=0.0204259;REFB=0.0226368;REVB=-0.020404;RO=47;SAF=21;SAR=30;SRF=21;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0312411;STB=0.521;STBP=0.696;TYPE=snp;VARB=-0.0130118;OID=.;OPOS=22337393;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:99:47:47:51:52:0.525253:30:21:21:26:31:21:21:26
chr14	22356491	.	G	T	360.66	PASS	AF=0.493671;AO=37;DP=79;FAO=39;FDP=79;FR=.;FRO=40;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=-0.00493917;FXX=0.0246883;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.739;QD=18.2612;RBI=0.0564086;REFB=-0.0270087;REVB=0.056192;RO=33;SAF=15;SAR=22;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145715;STB=0.547259;STBP=0.416;TYPE=snp;VARB=0.0258761;OID=.;OPOS=22356491;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:33:40:37:39:0.493671:22:15:19:14:24:15:19:21
chr14	22356551	.	T	C	219.69	PASS	AF=0.369863;AO=27;DP=73;FAO=27;FDP=73;FR=.;FRO=46;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=26;FWDB=0.0119884;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.1353;QD=12.0376;RBI=0.035258;REFB=-0.011635;REVB=0.0331573;RO=45;SAF=12;SAR=15;SRF=20;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506168;STBP=0.955;TYPE=snp;VARB=0.0216244;OID=.;OPOS=22356551;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:45:46:27:27:0.369863:15:12:20:25:15:12:20:26
chr14	22362971	.	A	G	645.83	PASS	AF=0.52459;AO=64;DP=122;FAO=64;FDP=122;FR=.;FRO=58;FSAF=30;FSAR=34;FSRF=22;FSRR=36;FWDB=0.0198064;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.0793;QD=21.1748;RBI=0.031098;REFB=-0.0243187;REVB=-0.0239748;RO=54;SAF=30;SAR=34;SRF=19;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0987774;STB=0.542903;STBP=0.347;TYPE=snp;VARB=0.0186527;OID=.;OPOS=22362971;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:122:122:54:58:64:64:0.52459:34:30:19:35:34:30:22:36
chr14	22386449	.	C	T	644.15	PASS	AF=0.438272;AO=70;DP=161;FAO=71;FDP=162;FR=.;FRO=91;FSAF=25;FSAR=46;FSRF=43;FSRR=48;FWDB=-0.00818494;FXX=0.00613459;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.061;QD=15.905;RBI=0.0091033;REFB=0.00062312;REVB=-0.00398456;RO=87;SAF=25;SAR=45;SRF=41;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118732;STB=0.570991;STBP=0.141;TYPE=snp;VARB=-0.000384911;OID=.;OPOS=22386449;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:161:162:87:91:70:71:0.438272:45:25:41:46:46:25:43:48
chr14	22392304	.	G	A	58.84	PASS	AF=0.172414;AO=10;DP=58;FAO=10;FDP=58;FR=.;FRO=48;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=25;FSRR=23;FWDB=0.0331144;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.0649;QD=4.05814;RBI=0.0337104;REFB=0.0070751;REVB=0.00631075;RO=48;SAF=5;SAR=5;SRF=25;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0256689;STB=0.517207;STBP=0.933;TYPE=snp;VARB=-0.0460857;OID=.;OPOS=22392304;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:58:58:58:48:48:10:10:0.172414:5:5:25:23:5:5:25:23
chr14	22392366	.	C	T	196.37	PASS	AF=0.337838;AO=25;DP=75;FAO=25;FDP=74;FR=.;FRO=49;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=27;FSRR=22;FWDB=0.0082072;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.346;QD=10.6147;RBI=0.0134713;REFB=0.00169804;REVB=-0.0106825;RO=47;SAF=16;SAR=9;SRF=26;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101923;STB=0.561671;STBP=0.447;TYPE=snp;VARB=-0.00278624;OID=.;OPOS=22392366;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:74:47:49:25:25:0.337838:9:16:26:21:9:16:27:22
chr14	22392626	.	A	C	236.93	PASS	AF=0.45;AO=27;DP=61;FAO=27;FDP=60;FR=.;FRO=33;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=11;FWDB=-0.0448908;FXX=0.0163908;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.633;QD=15.7951;RBI=0.0453066;REFB=-0.00343791;REVB=-0.00612341;RO=34;SAF=17;SAR=10;SRF=23;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0502649;STB=0.522072;STBP=0.769;TYPE=snp;VARB=0.00241506;OID=.;OPOS=22392626;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:60:34:33:27:27:0.45:10:17:23:11:10:17:22:11
chr14	22392703	.	G	C	251.02	PASS	AF=0.42029;AO=28;DP=69;FAO=29;FDP=69;FR=.;FRO=40;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=18;FWDB=-0.0125376;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.147;QD=14.552;RBI=0.0125929;REFB=-0.00820546;REVB=-0.00117835;RO=40;SAF=14;SAR=14;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0516604;STB=0.538895;STBP=0.622;TYPE=snp;VARB=0.0115563;OID=.;OPOS=22392703;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:40:40:28:29:0.42029:14:14:22:18:15:14:22:18
chr14	22509188	.	T	C	770.1	PASS	AF=1;AO=48;DP=49;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00307383;FXX=0.020404;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.6962;QD=64.1751;RBI=0.0388902;REFB=0;REVB=-0.0387686;RO=0;SAF=10;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.36352e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000305605;OID=.;OPOS=22509188;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:48:0:0:48:48:1:38:10:0:0:38:10:0:0
chr14	22521051	.	G	A	296.35	PASS	AF=0.634146;AO=26;DP=41;FAO=26;FDP=41;FR=.;FRO=15;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.0174068;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.238;QD=28.9123;RBI=0.0222534;REFB=0.00846933;REVB=0.0138642;RO=15;SAF=10;SAR=16;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101466;STB=0.555941;STBP=0.397;TYPE=snp;VARB=-0.00293564;OID=.;OPOS=22521051;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:15:15:26:26:0.634146:16:10:8:7:16:10:8:7
chr14	22555013	.	T	C	378.15	PASS	AF=0.481481;AO=39;DP=82;FAO=39;FDP=81;FR=.;FRO=42;FSAF=26;FSAR=13;FSRF=26;FSRR=16;FWDB=-0.0302124;FXX=0.0121936;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.1683;QD=18.6741;RBI=0.0510403;REFB=-0.0152709;REVB=-0.0411379;RO=40;SAF=26;SAR=13;SRF=26;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0169453;STB=0.527259;STBP=0.668;TYPE=snp;VARB=0.0160249;OID=.;OPOS=22555013;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:81:40:42:39:39:0.481481:13:26:26:14:13:26:26:16
chr14	22591988	.	C	A	594.54	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0235216;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=188.425;QD=60.9786;RBI=0.0301279;REFB=0;REVB=0.0188261;RO=0;SAF=25;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.24623e-06;OID=.;OPOS=22591988;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:14:25:0:0:14:25:0:0
chr14	22600863	.	G	A	740.42	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=4.25214e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=362.542;QD=56.9554;RBI=0.00611171;REFB=0;REVB=-0.00611156;RO=0;SAF=29;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.76236e-06;OID=.;OPOS=22600863;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:52:0:0:51:52:1:22:29:0:0:23:29:0:0
chr14	22739862	.	A	T	202.44	PASS	AF=0.5;AO=20;DP=41;FAO=20;FDP=40;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.0130881;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.0426;QD=20.2439;RBI=0.023198;REFB=-0.0312602;REVB=-0.0191534;RO=20;SAF=10;SAR=10;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0442434;STB=0.524975;STBP=0.802;TYPE=snp;VARB=0.0300829;OID=.;OPOS=22739862;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:40:20:20:20:20:0.5:10:10:11:9:10:10:11:9
chr14	22740245	.	A	G	348.85	PASS	AF=0.507042;AO=36;DP=73;FAO=36;FDP=71;FR=.;FRO=35;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=8;FSRR=27;FWDB=0.0203426;FXX=0.0273935;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.156;QD=19.6535;RBI=0.0338062;REFB=-0.00736821;REVB=0.0270007;RO=35;SAF=18;SAR=18;SRF=8;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.242395;STB=0.633734;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.00657811;OID=.;OPOS=22740245;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:71:35:35:36:36:0.507042:18:18:8:27:18:18:8:27
chr14	22740270	.	G	A	386.91	PASS	AF=0.513158;AO=38;DP=77;FAO=39;FDP=76;FR=.;FRO=37;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=13;FSRR=24;FWDB=-0.0284819;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.14;QD=20.3636;RBI=0.0295125;REFB=0.00642975;REVB=-0.00773099;RO=36;SAF=17;SAR=21;SRF=12;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102558;STB=0.554387;STBP=0.329;TYPE=snp;VARB=-0.00593852;OID=.;OPOS=22740270;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:76:36:37:38:39:0.513158:21:17:12:24:21:18:13:24
chr14	22887459	.	CG	C	188.2	PASS	AF=0.484375;AO=30;DP=64;FAO=31;FDP=64;FR=.;FRO=33;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=0.0512965;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=21.4823;QD=11.7625;RBI=0.0675943;REFB=-0.00469071;REVB=0.0440189;RO=33;SAF=13;SAR=17;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0.492754;SSSB=-0.0485816;STB=0.534266;STBP=0.625;TYPE=del;VARB=0.00827606;OID=.;OPOS=22887460;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.484375:30:64:31:64:33:13:18:16:17:99:33:13:17:16:17
chr14	22891883	.	G	C	179.74	PASS	AF=0.545455;AO=18;DP=34;FAO=18;FDP=33;FR=.;FRO=15;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.0201335;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.48;QD=21.7865;RBI=0.0244356;REFB=-0.00418588;REVB=0.0138471;RO=15;SAF=14;SAR=4;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.239574;STB=0.636198;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=0.00413937;OID=.;OPOS=22891883;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:33:15:15:18:18:0.545455:4:14:8:7:4:14:8:7
chr14	22942890	.	G	T	2178.65	PASS	AF=1;AO=137;DP=138;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-4.42934e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.108;QD=63.1492;RBI=0.0188276;REFB=0;REVB=0.0188275;RO=0;SAF=77;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.77245e-05;OID=.;OPOS=22942890;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:138:138:0:0:137:138:1:60:77:0:0:60:78:0:0
chr14	22961854	.	A	G	849.9	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0509428;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=84.7782;QD=57.6205;RBI=0.0694775;REFB=0;REVB=-0.0472435;RO=0;SAF=32;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.96591e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000548105;OID=.;OPOS=22961854;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:27:32:0:0:27:32:0:0
chr14	22972742	.	G	A	1434.44	PASS	AF=1;AO=91;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0111864;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.771;QD=63.0521;RBI=0.0123905;REFB=0;REVB=0.00532814;RO=0;SAF=47;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.04952e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.35366e-05;OID=.;OPOS=22972742;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:91:91:0:0:91:91:1:44:47:0:0:44:47:0:0
chr14	22972783	.	ACC	AC,ACA	1130.22	PASS	AF=0.961538,0.0384615;AO=72,4;DP=78;FAO=75,3;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=40,0;FSAR=35,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0654205,-0.00904602;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=28.2703,9.55075;QD=57.9601;RBI=0.134384,0.0617366;REFB=0,0;REVB=-0.117384,-0.0610702;RO=0;SAF=39,0;SAR=33,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0061115,0.00780532;OID=.,.;OPOS=22972784,22972785;OREF=C,C;OALT=-,A;OMAPALT=AC,ACA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.961538,0.0384615:72,4:78:75,3:78:0:40,0:35,3:0:0:7:0:39,0:33,4:0:0
chr14	22972815	.	C	A,T	732.69	PASS	AF=0.0425532,0.957447;AO=2,45;DP=47;FAO=2,45;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=2,25;FSAR=0,20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.02968,0.00212083;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=23.3057,292.134;QD=62.3565;RBI=0.0370914,0.00863146;REFB=0,0;REVB=0.0222457,0.00836685;RO=0;SAF=2,25;SAR=0,20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,5.09779e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.173254,-0.000428959;OID=.,.;OPOS=22972815,22972815;OREF=C,C;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:47:47:0:0:2,45:2,45:0.0425532,0.957447:0,20:2,25:0:0:0,20:2,25:0:0
chr14	22975700	.	T	G	1400.5	PASS	AF=0.989011;AO=90;DP=91;FAO=90;FDP=91;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=44;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0215058;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=208.678;QD=61.5606;RBI=0.0215224;REFB=-0.0219247;REVB=-0.000844315;RO=1;SAF=46;SAR=44;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0101926;STB=0.505375;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=1.79725e-06;OID=.;OPOS=22975700;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:91:91:1:1:90:90:0.989011:44:46:1:0:44:46:1:0
chr14	22978335	.	C	T	1794.63	PASS	AF=0.991597;AO=118;DP=120;FAO=118;FDP=119;FR=.;FRO=1;FSAF=54;FSAR=64;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0151541;FXX=0.0165276;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.4428;QD=60.3239;RBI=0.0344779;REFB=-0.0557;REVB=0.030969;RO=1;SAF=54;SAR=64;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00871445;STB=0.504586;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.000191877;OID=.;OPOS=22978335;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:120:119:1:1:118:118:0.991597:64:54:1:0:64:54:1:0
chr14	22984586	.	A	C	436.45	PASS	AF=0.490385;AO=45;DP=98;FAO=51;FDP=104;FR=.;FRO=53;FSAF=30;FSAR=21;FSRF=27;FSRR=26;FWDB=-0.014727;FXX=0.0188661;HRUN=3;LEN=1;MLLD=149.793;QD=16.7866;RBI=0.0194114;REFB=-0.0146313;REVB=0.0126459;RO=52;SAF=30;SAR=15;SRF=27;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149973;STB=0.540835;STBP=0.401;TYPE=snp;VARB=0.01214;OID=.;OPOS=22984586;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:104:52:53:45:51:0.490385:15:30:27:25:21:30:27:26
chr14	22988972	.	G	C	260.16	PASS	AF=0.467742;AO=29;DP=62;FAO=29;FDP=62;FR=.;FRO=33;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=-0.0115334;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=335.055;QD=16.7848;RBI=0.0152424;REFB=0.0111248;REVB=-0.00996556;RO=33;SAF=18;SAR=11;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102916;STB=0.557939;STBP=0.441;TYPE=snp;VARB=-0.0115597;OID=.;OPOS=22988972;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:33:33:29:29:0.467742:11:18:17:16:11:18:17:16
chr14	22993278	.	A	AG	734.77	PASS	AF=1;AO=66;DP=75;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0224785;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=17.3333;QD=40.8205;RBI=0.0833477;REFB=0;REVB=-0.0802593;RO=6;SAF=36;SAR=30;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.045783;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00134618;OID=.;OPOS=22993279;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:66:75:72:72:0:38:34:0:0:14:6:36:30:5:1
chr14	22995872	.	CAAGT	C	232.34	PASS	AF=0.440476;AO=37;DP=86;FAO=37;FDP=84;FR=.;FRO=47;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=19;FSRR=28;FWDB=-0.00970354;FXX=0.0117633;HRUN=2;LEN=4;MLLD=303.449;QD=11.064;RBI=0.0101521;REFB=-0.00134778;REVB=0.00298447;RO=47;SAF=14;SAR=23;SRF=19;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0271343;STB=0.515267;STBP=0.826;TYPE=del;VARB=0.00173535;OID=.;OPOS=22995873;OREF=AAGT;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.440476:37:86:37:84:47:14:23:19:28:99:47:14:23:19:28
chr14	22997524	.	A	G	1582.76	PASS	AF=1;AO=98;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0310268;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.8726;QD=63.9498;RBI=0.0428051;REFB=0;REVB=-0.0294892;RO=0;SAF=49;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000366843;OID=.;OPOS=22997524;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:99:99:0:0:98:99:1:49:49:0:0:49:50:0:0
chr14	22998590	.	AG	A	787.5	PASS	AF=1;AO=64;DP=67;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00127912;FXX=0.0149231;HRUN=3;LEN=1;MLLD=30.7366;QD=47.7269;RBI=0.00312527;REFB=0;REVB=0.00285152;RO=0;SAF=29;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=3.32811e-05;OID=.;OPOS=22998591;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:64:67:66:66:0:31:35:0:0:14:0:29:35:0:0
chr14	22998619	.	AC	AA,A	754.08	PASS	AF=0.0545455,0.945455;AO=3,51;DP=57;FAO=3,52;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=1,22;FSAR=2,30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0235127,-0.00141814;FXX=0.0350816;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=6.17707,28.2178;QD=54.8421;RBI=0.0294103,0.0210177;REFB=0,0;REVB=0.017667,0.0209698;RO=0;SAF=1,21;SAR=2,30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,del;VARB=0.0626113,-0.00319029;OID=.,.;OPOS=22998620,22998620;OREF=C,C;OALT=A,-;OMAPALT=AA,A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0545455,0.945455:3,51:57:3,52:55:0:1,22:2,30:0:0:8:0:1,21:2,30:0:0
chr14	23000062	.	T	C	747.09	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0273574;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.508;QD=63.5822;RBI=0.0273641;REFB=0;REVB=0.000607626;RO=0;SAF=18;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.06241e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00012735;OID=.;OPOS=23000062;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:47:0:0:46:47:1:28:18:0:0:28:19:0:0
chr14	23025932	.	A	T	2278.89	PASS	AF=0.993103;AO=142;DP=144;FAO=144;FDP=145;FR=.;FRO=1;FSAF=59;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0366388;FXX=0.00684885;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.174;QD=62.866;RBI=0.0398477;REFB=-0.196915;REVB=0.0156665;RO=1;SAF=58;SAR=84;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00562757;STB=0.502924;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.000600052;OID=.;OPOS=23025932;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:144:145:1:1:142:144:0.993103:84:58:0:1:85:59:0:1
chr14	23044002	.	G	T	538.51	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000749194;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.027;QD=59.8339;RBI=0.00084024;REFB=0;REVB=-0.00038041;RO=0;SAF=18;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.70609e-06;OID=.;OPOS=23044002;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:18:18:0:0:18:18:0:0
chr14	23067042	.	A	G	362.23	PASS	AF=0.580645;AO=36;DP=62;FAO=36;FDP=62;FR=.;FRO=26;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=0.0261136;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.162;QD=23.3698;RBI=0.0261552;REFB=-0.00880457;REVB=0.00147597;RO=25;SAF=24;SAR=12;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0547158;STB=0.541153;STBP=0.457;TYPE=snp;VARB=0.010967;OID=.;OPOS=23067042;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:25:26:36:36:0.580645:12:24:15:10:12:24:15:11
chr14	23081223	.	T	C	669.43	PASS	AF=0.960784;AO=48;DP=50;FAO=49;FDP=51;FR=.;FRO=2;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0588643;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.21;QD=52.5045;RBI=0.0761691;REFB=-0.0400716;REVB=0.0483397;RO=0;SAF=20;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.56477e-08;STB=0.51666;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=0.00996792;OID=.;OPOS=23081223;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:50:51:0:2:48:49:0.960784:28:20:0:0:29:20:0:2
chr14	23102784	.	AA	CG,GA	186.36	PASS	AF=0,0.527778;AO=2,15;DP=33;FAO=0,19;FDP=36;FR=.;FRO=17;FSAF=0,11;FSAR=0,8;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=-0.011907,-0.00264936;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=2,1;MLLD=127.737,128.428;QD=20.7064;RBI=0.0164337,0.00300755;REFB=-0.0271802,-0.0252906;REVB=-0.0113265,0.00142347;RO=15;SAF=1,8;SAR=1,7;SRF=9;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.10165,-0.0589223;STB=0.5,0.533299;STBP=1,0.705;TYPE=mnp,snp;VARB=0,0.0223514;OID=.,.;OPOS=23102784,23102784;OREF=AA,A;OALT=CG,G;OMAPALT=CG,GA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:33:36:15:17:2,15:0,19:0,0.527778:1,7:1,8:9:6:0,8:0,11:11:6
chr14	23102882	.	C	A	106.55	PASS	AF=0.521739;AO=12;DP=25;FAO=12;FDP=23;FR=.;FRO=11;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.00815183;FXX=0.079968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.557;QD=18.5299;RBI=0.0398807;REFB=0.0112203;REVB=-0.0390386;RO=12;SAF=8;SAR=4;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152196;STB=0.562393;STBP=0.583;TYPE=snp;VARB=-0.00996672;OID=.;OPOS=23102882;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:93:25:23:12:11:12:12:0.521739:4:8:6:6:4:8:6:5
chr14	23102896	.	A	G	116.24	PASS	AF=0.565217;AO=12;DP=22;FAO=13;FDP=23;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.0140705;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=88.5254;QD=20.2151;RBI=0.0418641;REFB=0.00409114;REVB=-0.0394287;RO=10;SAF=6;SAR=6;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0793454;STB=0.559908;STBP=0.552;TYPE=snp;VARB=-0.00611921;OID=.;OPOS=23102896;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:22:23:10:10:12:13:0.565217:6:6:4:6:6:7:4:6
chr14	23102969	.	G	A	145.48	PASS	AF=0.444444;AO=16;DP=36;FAO=16;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=-0.0169989;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.7829;QD=16.1644;RBI=0.0892954;REFB=0.0150708;REVB=0.0876625;RO=19;SAF=11;SAR=5;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.259379;STB=0.662913;STBP=0.095;TYPE=snp;VARB=-0.0202471;OID=.;OPOS=23102969;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:19:20:16:16:0.444444:5:11:8:11:5:11:8:12
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chr14	23103282	.	T	C	94.56	PASS	AF=0.611111;AO=11;DP=18;FAO=11;FDP=18;FR=.;FRO=7;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.0615443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.8769;QD=21.0138;RBI=0.0615904;REFB=0.0181789;REVB=0.00238084;RO=7;SAF=7;SAR=4;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0585073;STB=0.533274;STBP=0.767;TYPE=snp;VARB=-0.0157132;OID=.;OPOS=23103282;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:18:18:7:7:11:11:0.611111:4:7:5:2:4:7:5:2
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chr14	23103354	.	AC	GT	156.53	PASS	AF=0.551724;AO=16;DP=31;FAO=16;FDP=29;FR=.;FRO=13;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.032253;FXX=0.0644953;HRUN=2;LEN=2;MLLD=176.177;QD=21.5906;RBI=0.0554655;REFB=-0.028899;REVB=0.0451239;RO=13;SAF=10;SAR=6;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132778;STB=0.575126;STBP=0.42;TYPE=mnp;VARB=0.0199683;OID=.;OPOS=23103354;OREF=AC;OALT=GT;OMAPALT=GT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:29:13:13:16:16:0.551724:6:10:6:7:6:10:6:7
chr14	23103441	.	G	A	216.31	PASS	AF=0.538462;AO=21;DP=39;FAO=21;FDP=39;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=-0.0313226;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.2051;QD=22.1853;RBI=0.0448596;REFB=-0.0144534;REVB=0.0321136;RO=18;SAF=9;SAR=12;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.081208;STB=0.545412;STBP=0.548;TYPE=snp;VARB=0.0124092;OID=.;OPOS=23103441;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:18:18:21:21:0.538462:12:9:6:12:12:9:6:12
chr14	23235808	.	G	A	377.92	PASS	AF=0.596774;AO=37;DP=62;FAO=37;FDP=62;FR=.;FRO=25;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.011902;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.3;QD=24.3822;RBI=0.0187812;REFB=-0.0265449;REVB=-0.0145285;RO=25;SAF=17;SAR=20;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0445811;STB=0.524462;STBP=0.643;TYPE=snp;VARB=0.0167064;OID=.;OPOS=23235808;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:25:25:37:37:0.596774:20:17:13:12:20:17:13:12
chr14	23236524	.	C	T	398.92	PASS	AF=0.633333;AO=38;DP=60;FAO=38;FDP=60;FR=.;FRO=22;FSAF=27;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=3;FWDB=-0.00119701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.143;QD=26.595;RBI=0.00632045;REFB=-0.0109158;REVB=0.00620607;RO=22;SAF=27;SAR=11;SRF=19;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133366;STB=0.572363;STBP=0.231;TYPE=snp;VARB=0.00568898;OID=.;OPOS=23236524;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:22:22:38:38:0.633333:11:27:19:3:11:27:19:3
chr14	23242828	.	T	C	530.4	PASS	AF=0.972973;AO=36;DP=38;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0109311;FXX=0.0263089;HRUN=3;LEN=1;MLLD=90.5255;QD=57.3402;RBI=0.0181519;REFB=0.0221551;REVB=0.0144914;RO=1;SAF=15;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.021769;STB=0.511621;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=-5.41284e-06;OID=.;OPOS=23242828;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:38:37:1:1:36:36:0.972973:21:15:0:1:21:15:0:1
chr14	23248112	.	A	G	268.67	PASS	AF=0.510204;AO=25;DP=49;FAO=25;FDP=49;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.0317194;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.0571;QD=21.9326;RBI=0.0408055;REFB=-0.0116398;REVB=0.0256704;RO=23;SAF=10;SAR=15;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.178711;STB=0.590092;STBP=0.205;TYPE=snp;VARB=0.0103911;OID=.;OPOS=23248112;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:23:24:25:25:0.510204:15:10:14:9:15:10:14:10
chr14	23282110	.	A	G	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0341321;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=212.222;QD=52.6132;RBI=0.0381203;REFB=0;REVB=0.0169751;RO=0;SAF=10;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000228257;OID=.;OPOS=23282110;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:12:10:0:0:12:10:0:0
chr14	23282449	.	C	T	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0259362;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=185.125;QD=47.8224;RBI=0.0280172;REFB=0;REVB=0.0105961;RO=0;SAF=8;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000268348;OID=.;OPOS=23282449;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:8:8:0:0:8:8:0:0
chr14	23299135	.	G	T	364.55	PASS	AF=0.481013;AO=38;DP=79;FAO=38;FDP=79;FR=.;FRO=41;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=24;FWDB=-0.0206083;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=174.23;QD=18.4583;RBI=0.0266153;REFB=0.00527918;REVB=0.0168426;RO=40;SAF=20;SAR=18;SRF=16;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115888;STB=0.557739;STBP=0.341;TYPE=snp;VARB=-0.00497596;OID=.;OPOS=23299135;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:40:41:38:38:0.481013:18:20:16:24:18:20:17:24
chr14	23299286	.	T	C	654.27	PASS	AF=0.960784;AO=48;DP=50;FAO=49;FDP=51;FR=.;FRO=2;FSAF=22;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00820484;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.968;QD=51.3156;RBI=0.0280251;REFB=-0.0991769;REVB=0.0267972;RO=1;SAF=22;SAR=26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0177516;STB=0.51785;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=0.0016989;OID=.;OPOS=23299286;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:50:51:1:2:48:49:0.960784:26:22:0:1:27:22:0:2
chr14	23303641	.	A	C	655.32	PASS	AF=0.960784;AO=48;DP=50;FAO=49;FDP=51;FR=.;FRO=2;FSAF=31;FSAR=18;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0156319;FXX=0.0377287;HRUN=5;LEN=1;MLLD=150.317;QD=51.3972;RBI=0.027253;REFB=-0.104921;REVB=0.0223241;RO=1;SAF=30;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154257;STB=0.515619;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=0.0010508;OID=.;OPOS=23303641;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:50:51:1:2:48:49:0.960784:18:30:1:0:18:31:2:0
chr14	23306048	.	C	T	374.83	PASS	AF=0.933333;AO=28;DP=30;FAO=28;FDP=30;FR=.;FRO=2;FSAF=2;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00238764;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=306.988;QD=49.9768;RBI=0.0178868;REFB=0.0563007;REVB=0.0177267;RO=2;SAF=2;SAR=26;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167163;STB=0.590834;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=-0.000200282;OID=.;OPOS=23306048;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:30:30:2:2:28:28:0.933333:26:2:1:1:26:2:1:1
chr14	23312554	.	C	G	283.64	PASS	AF=0.526316;AO=30;DP=57;FAO=30;FDP=57;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=22;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.00234923;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=161.167;QD=19.9046;RBI=0.0412203;REFB=0.00536916;REVB=-0.0411533;RO=26;SAF=8;SAR=22;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152881;STB=0.597757;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=-0.00981607;OID=.;OPOS=23312554;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:26:27:30:30:0.526316:22:8:11:15:22:8:12:15
chr14	23321900	.	G	A	465.13	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.034149;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.183;QD=58.1418;RBI=0.0348939;REFB=0;REVB=0.00717126;RO=0;SAF=18;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000200308;OID=.;OPOS=23321900;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:14:18:0:0:14:18:0:0
chr14	23341951	.	C	T	117.43	PASS	AF=0.590909;AO=13;DP=22;FAO=13;FDP=22;FR=.;FRO=9;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=-0.00917108;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.0828;QD=21.3517;RBI=0.0127589;REFB=-0.006938;REVB=-0.00887028;RO=9;SAF=9;SAR=4;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0214541;STB=0.512176;STBP=0.973;TYPE=snp;VARB=0.0014344;OID=.;OPOS=23341951;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:22:22:9:9:13:13:0.590909:4:9:6:3:4:9:6:3
chr14	23374435	.	G	A	247.72	PASS	AF=0.411765;AO=20;DP=68;FAO=28;FDP=68;FR=.,HEALED;FRO=39;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=-0.0132543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.405;QD=14.5718;RBI=0.0140117;REFB=-0.0283603;REVB=-0.00454456;RO=39;SAF=14;SAR=6;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.19529;STB=0.522372;STBP=0.79;TYPE=snp;VARB=0.0542669;OID=.;OPOS=23374435;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:39:39:20:28:0.411765:6:14:21:18:14:14:21:18
chr14	23374862	.	C	T	43.21	PASS	AF=0.225806;AO=7;DP=31;FAO=7;FDP=31;FR=.;FRO=24;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=-0.00665273;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=223.239;QD=5.57593;RBI=0.0459584;REFB=-0.00620659;REVB=-0.0454744;RO=23;SAF=4;SAR=3;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00743092;STB=0.523297;STBP=0.951;TYPE=snp;VARB=0.0244814;OID=.;OPOS=23374862;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:31:31:23:24:7:7:0.225806:3:4:13:10:3:4:13:11
chr14	23398900	.	T	C	224.62	PASS	AF=0.470588;AO=24;DP=51;FAO=24;FDP=51;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=-0.0241703;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.422;QD=17.6169;RBI=0.0246479;REFB=-0.00552522;REVB=0.00482855;RO=27;SAF=12;SAR=12;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121745;STB=0.568571;STBP=0.38;TYPE=snp;VARB=0.00904911;OID=.;OPOS=23398900;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:27:27:24:24:0.470588:12:12:17:10:12:12:17:10
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chr14	23398990	.	T	G	193.21	PASS	AF=0.425532;AO=20;DP=47;FAO=20;FDP=47;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=0.0128298;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.284;QD=16.4436;RBI=0.024666;REFB=0.0104005;REVB=-0.0210668;RO=27;SAF=11;SAR=9;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0815356;STB=0.546592;STBP=0.595;TYPE=snp;VARB=-0.010764;OID=.;OPOS=23398990;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:27:27:20:20:0.425532:9:11:17:10:9:11:17:10
chr14	23398995	.	G	A	193.2	PASS	AF=0.425532;AO=20;DP=47;FAO=20;FDP=47;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=0.0122209;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.8137;QD=16.4425;RBI=0.0519378;REFB=-0.0187117;REVB=0.0504795;RO=27;SAF=11;SAR=9;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0815356;STB=0.546592;STBP=0.595;TYPE=snp;VARB=0.0216526;OID=.;OPOS=23398995;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:27:27:20:20:0.425532:9:11:17:10:9:11:17:10
chr14	23426182	.	C	A	118.35	PASS	AF=0.52;AO=13;DP=25;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.0868389;FXX=0.0740466;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.835;QD=18.9358;RBI=0.0880464;REFB=-0.0387462;REVB=0.0145317;RO=11;SAF=8;SAR=5;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.201895;STB=0.596124;STBP=0.341;TYPE=snp;VARB=0.0347198;OID=.;OPOS=23426182;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:25:11:12:13:13:0.52:5:8:4:7:5:8:5:7
chr14	23440742	.	A	G	168.91	PASS	AF=0.586207;AO=16;DP=28;FAO=17;FDP=29;FR=.;FRO=12;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.00696953;FXX=0.0333222;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.182;QD=23.2972;RBI=0.0305854;REFB=-0.0194178;REVB=0.0297807;RO=12;SAF=8;SAR=8;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512181;STBP=0.948;TYPE=snp;VARB=0.00913239;OID=.;OPOS=23440742;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:29:12:12:16:17:0.586207:8:8:6:6:8:9:6:6
chr14	23441179	.	G	A	111.52	PASS	AF=0.464286;AO=12;DP=27;FAO=13;FDP=28;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=0.0159226;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.057;QD=15.9316;RBI=0.0428235;REFB=-0.0206988;REVB=-0.0397533;RO=15;SAF=7;SAR=5;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.234756;STB=0.648425;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.0135657;OID=.;OPOS=23441179;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:28:15:15:12:13:0.464286:5:7:5:10:5:8:5:10
chr14	23512922	.	G	A	158.04	PASS	AF=0.64;AO=15;DP=24;FAO=16;FDP=25;FR=.;FRO=9;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.0372507;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.9328;QD=25.2859;RBI=0.0395653;REFB=-0.0279732;REVB=-0.0133339;RO=9;SAF=11;SAR=4;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139671;STB=0.553004;STBP=0.561;TYPE=snp;VARB=0.0106764;OID=.;OPOS=23512922;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:24:25:9:9:15:16:0.64:4:11:5:4:5:11:5:4
chr14	23535239	.	GA	G,GG	43.07	PASS	AF=0.15,0.1;AO=5,4;DP=37;FAO=6,4;FDP=40;FR=.;FRO=30;FSAF=3,3;FSAR=3,1;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=0.114128,0.0723403;FXX=0.0243843;HRUN=8,8;LEN=1,1;MLLD=7.04825,17.8798;QD=4.30676;RBI=0.152565,0.123295;REFB=-0.0274699,-0.0309616;REVB=-0.101248,0.0998421;RO=22;SAF=3,3;SAR=2,1;SRF=12;SRR=10;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0647329,0.247236;STB=0.555373,0.770119;STBP=0.787,0.352;TYPE=del,snp;VARB=-0.029293,-0.0249947;OID=.,.;OPOS=23535240,23535240;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.15,0.1:5,4:37:6,4:40:30:3,3:3,1:13:17:20:22:3,3:2,1:12:10
chr14	23548783	.	A	AGAACGT,T	383.24	PASS	AF=0.391304,0.0652174;AO=35,6;DP=92;FAO=36,6;FDP=92;FR=.;FRO=50;FSAF=25,3;FSAR=11,3;FSRF=26;FSRR=24;FWDB=0.0206722,-0.0308296;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=6,1;MLLD=216.38,95.046;QD=16.6624;RBI=0.0370649,0.0317025;REFB=2.28777e-05,-0.00938285;REVB=-0.0307647,-0.00738796;RO=50;SAF=24,3;SAR=11,3;SRF=26;SRR=24;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.183265,-0.0229386;STB=0.609268,0.517798;STBP=0.096,0.931;TYPE=ins,snp;VARB=-0.000131871,0.0294967;OID=.,.;OPOS=23548784,23548783;OREF=-,A;OALT=GAACGT,T;OMAPALT=AGAACGT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:50:50:35,6:36,6:0.391304,0.0652174:11,3:24,3:26:24:11,3:25,3:26:24
chr14	23549285	.	G	A	150.88	PASS	AF=0.351852;AO=18;DP=53;FAO=19;FDP=54;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=0.00863852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=300.918;QD=11.1762;RBI=0.00939918;REFB=-0.00125601;REVB=-0.00370413;RO=35;SAF=14;SAR=4;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.410249;STB=0.749722;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.00230549;OID=.;OPOS=23549285;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:54:35:35:18:19:0.351852:4:14:15:20:4:15:15:20
chr14	23549319	.	A	G	152.9	PASS	AF=0.352941;AO=18;DP=51;FAO=18;FDP=51;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=-0.0051886;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.536;QD=11.9922;RBI=0.0183723;REFB=0.000558754;REVB=0.0176244;RO=33;SAF=11;SAR=7;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.205391;STB=0.620257;STBP=0.205;TYPE=snp;VARB=-0.00110434;OID=.;OPOS=23549319;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:33:33:18:18:0.352941:7:11:14:19:7:11:14:19
chr14	23549379	.	C	G	721.86	PASS	AF=1;AO=40;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00307664;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.339;QD=62.7701;RBI=0.027907;REFB=0;REVB=0.0277368;RO=0;SAF=19;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00152929;OID=.;OPOS=23549379;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:40:46:1:21:19:0:0:26:20:0:0
chr14	23549383	.	G	T	236.12	PASS	AF=0.469388;AO=23;DP=49;FAO=23;FDP=49;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=0.00461611;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=282.331;QD=19.2751;RBI=0.00978385;REFB=-0.00201194;REVB=-0.00862642;RO=25;SAF=10;SAR=13;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00489109;STB=0.506324;STBP=0.948;TYPE=snp;VARB=0.00177368;OID=.;OPOS=23549383;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:25:26:23:23:0.469388:13:10:11:14:13:10:11:15
chr14	23549785	.	T	C	414.25	PASS	AF=0.477273;AO=42;DP=89;FAO=42;FDP=88;FR=.;FRO=46;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=31;FSRR=15;FWDB=-0.00601564;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.735;QD=18.8293;RBI=0.0148738;REFB=-0.0285933;REVB=0.0136031;RO=46;SAF=21;SAR=21;SRF=31;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163692;STB=0.590867;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.0411272;OID=.;OPOS=23549785;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:88:46:46:42:42:0.477273:21:21:31:15:21:21:31:15
chr14	23549878	.	TTCCTCCTCCTCCTCCTCC	TTCCTCCTCCTCCTCC,TTCCTCCTCCTCCTCCTCT	165.54	PASS	AF=0.411765,0.117647;AO=11,5;DP=35;FAO=14,4;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=8,4;FSAR=6,0;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.0249412,0.0490027;FXX=0.0285633;HRUN=1,2;LEN=3,1;MLLD=117.535,38.769;QD=19.4753;RBI=0.0539112,0.0494891;REFB=-0.0581882,-0.0527336;REVB=-0.0477949,-0.00692147;RO=15;SAF=7,5;SAR=4,0;SRF=8;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.105065,0.697662;STB=0.504847,0.99676;STBP=0.976,0.05;TYPE=del,snp;VARB=0.0883403,0.100726;OID=.,.;OPOS=23549879,23549896;OREF=TCC,C;OALT=-,T;OMAPALT=TTCCTCCTCCTCCTCC,TTCCTCCTCCTCCTCCTCT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.411765,0.117647:11,5:35:14,4:34:16:8,4:6,0:9:7:99:15:7,5:4,0:8:7
chr14	23567369	.	C	T	30.99	PASS	AF=0.5;AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0663406;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.538;QD=12.3958;RBI=0.066445;REFB=-0.0328681;REVB=0.00372225;RO=5;SAF=1;SAR=4;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.487487;STB=0.798798;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=0.013525;OID=.;OPOS=23567369;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:27:10:10:5:5:5:5:0.5:4:1:4:1:4:1:4:1
chr14	23568286	.	A	G	110.85	PASS	AF=0.419355;AO=13;DP=31;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.00496814;FXX=0.0312402;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.624;QD=14.3032;RBI=0.0248433;REFB=-0.00681322;REVB=0.0243415;RO=17;SAF=8;SAR=5;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0276679;STB=0.502614;STBP=0.993;TYPE=snp;VARB=0.00949864;OID=.;OPOS=23568286;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:17:18:13:13:0.419355:5:8:10:7:5:8:11:7
chr14	23568376	.	G	A	251.74	PASS	AF=0.489796;AO=24;DP=49;FAO=24;FDP=49;FR=.;FRO=25;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.0195133;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=149.767;QD=20.5498;RBI=0.0200567;REFB=-0.00790054;REVB=-0.0046369;RO=25;SAF=15;SAR=9;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0985021;STB=0.555508;STBP=0.43;TYPE=snp;VARB=0.00785128;OID=.;OPOS=23568376;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:25:25:24:24:0.489796:9:15:13:12:9:15:13:12
chr14	23569026	.	C	G	171.18	PASS	AF=0.461538;AO=18;DP=39;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=0.0483575;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.5221;QD=17.5572;RBI=0.0506133;REFB=-0.0203836;REVB=-0.0149418;RO=20;SAF=12;SAR=6;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0673223;STB=0.52827;STBP=0.762;TYPE=snp;VARB=0.0207127;OID=.;OPOS=23569026;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:20:21:18:18:0.461538:6:12:12:8:6:12:13:8
chr14	23569105	.	C	CG	417.74	PASS	AF=1;AO=5;DP=49;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0298139;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=120.807;QD=36.3255;RBI=0.118808;REFB=0;REVB=-0.115007;RO=44;SAF=0;SAR=5;SRF=28;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.658574;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.000162845;OID=.;OPOS=23569106;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:5:49:46:46:0:25:21:0:0:9:44:0:5:28:16
chr14	23569106	.	A	G	612.92	PASS	AF=0.913043;AO=42;DP=46;FAO=42;FDP=46;FR=.;FRO=4;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0192595;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=224.267;QD=53.2974;RBI=0.0223659;REFB=0.0298057;REVB=-0.0113712;RO=4;SAF=25;SAR=17;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0984373;STB=0.552606;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=-0.0031051;OID=.;OPOS=23569106;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:18:46:46:4:4:42:42:0.913043:17:25:0:4:17:25:0:4
chr14	23571371	.	G	A	210.88	PASS	AF=0.45283;AO=23;DP=52;FAO=24;FDP=53;FR=.;FRO=29;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=-0.00392644;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.324;QD=15.9154;RBI=0.0649498;REFB=-0.0167907;REVB=0.064831;RO=29;SAF=15;SAR=8;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.267562;STB=0.633692;STBP=0.107;TYPE=snp;VARB=0.0304533;OID=.;OPOS=23571371;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:53:29:29:23:24:0.45283:8:15:11:18:9:15:11:18
chr14	23571609	.	G	A	194.91	PASS	AF=0.444444;AO=20;DP=45;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=16;FSAR=4;FSRF=20;FSRR=5;FWDB=0.0530433;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.9229;QD=17.3253;RBI=0.0944963;REFB=0.00997158;REVB=0.0782046;RO=25;SAF=16;SAR=4;SRF=20;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00801998;OID=.;OPOS=23571609;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:25:25:20:20:0.444444:4:16:20:5:4:16:20:5
chr14	23571671	.	A	T	465.13	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00810822;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.784;QD=58.1414;RBI=0.00860784;REFB=0;REVB=-0.00288992;RO=0;SAF=23;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02243e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.81976e-05;OID=.;OPOS=23571671;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:9:23:0:0:9:23:0:0
chr14	23595721	.	A	G	139.24	PASS	AF=0.347826;AO=15;DP=46;FAO=16;FDP=46;FR=.;FRO=30;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=-0.044981;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.1925;QD=12.1075;RBI=0.0455521;REFB=0.00348729;REVB=-0.00719027;RO=30;SAF=9;SAR=6;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.076315;STB=0.519207;STBP=0.825;TYPE=snp;VARB=-0.0123752;OID=.;OPOS=23595721;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:30:30:15:16:0.347826:6:9:16:14:7:9:16:14
chr14	23596243	.	T	A,TCA	358.57	PASS	AF=0.102564,0.397436;AO=9,31;DP=78;FAO=8,31;FDP=78;FR=.;FRO=39;FSAF=0,17;FSAR=8,14;FSRF=12;FSRR=27;FWDB=-0.0632138,-0.0292874;FXX=0.0249969;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=54.3685,150.293;QD=18.3881;RBI=0.0652866,0.0419934;REFB=-0.0714714,-0.0320514;REVB=-0.0163204,-0.0300948;RO=37;SAF=0,17;SAR=9,14;SRF=12;SRR=25;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.678414,0.214418;STB=0.998142,0.631832;STBP=0.016,0.066;TYPE=snp,ins;VARB=0.0623569,0.0433401;OID=.,.;OPOS=23596243,23596244;OREF=T,-;OALT=A,CA;OMAPALT=A,TCA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:78:78:37:39:9,31:8,31:0.102564,0.397436:9,14:0,17:12:25:8,14:0,17:12:27
chr14	23598952	.	A	G	1393.27	PASS	AF=1;AO=85;DP=86;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0231873;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.348;QD=62.6187;RBI=0.0343644;REFB=0;REVB=0.0253626;RO=0;SAF=45;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.79153e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.2778e-05;OID=.;OPOS=23598952;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:89:0:0:85:89:1:40:45:0:0:43:46:0:0
chr14	23744800	.	ACATCATCATCATCATCATCATCA	ACATCATCATCATCATCA,ACATCATCATCATCATCATCA,ACATCATCATCATCATCATCATCT	95.88	PASS	AF=0.2,0.6,0.2;AO=2,5,2;DP=11;FAO=2,6,2;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0,1;FSAR=2,6,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.010616,0.0576915,0.0324363;FXX=0.0908265;HRUN=1,1,1;LEN=6,3,1;MLLD=87.646,67.0994,137.223;QD=38.354;RBI=0.0165544,0.0578893,0.0332971;REFB=0,0,0;REVB=-0.0127023,0.00478159,0.00752207;RO=0;SAF=0,0,1;SAR=2,5,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,del,snp;VARB=0.0820108,-0.0125431,-0.0529145;OID=.,.,.;OPOS=23744801,23744801,23744823;OREF=CATCAT,CAT,A;OALT=-,-,T;OMAPALT=ACATCATCATCATCATCA,ACATCATCATCATCATCATCA,ACATCATCATCATCATCATCATCT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.2,0.6,0.2:2,5,2:11:2,6,2:10:0:0,0,1:2,6,1:0:0:13:0:0,0,1:2,5,1:0:0
chr14	23746269	.	C	G	435.98	PASS	AF=0.511905;AO=43;DP=84;FAO=43;FDP=84;FR=.;FRO=41;FSAF=28;FSAR=15;FSRF=25;FSRR=16;FWDB=-0.00147996;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.874;QD=20.761;RBI=0.0207746;REFB=-0.0380564;REVB=0.0207218;RO=41;SAF=28;SAR=15;SRF=25;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0395877;STB=0.521938;STBP=0.71;TYPE=snp;VARB=0.0273846;OID=.;OPOS=23746269;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:41:41:43:43:0.511905:15:28:25:16:15:28:25:16
chr14	23777099	.	G	A	407.08	PASS	AF=0.597015;AO=39;DP=67;FAO=40;FDP=67;FR=.;FRO=27;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=-0.00273263;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.661;QD=24.3033;RBI=0.056859;REFB=-0.0137902;REVB=0.0567933;RO=27;SAF=19;SAR=20;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0233621;STB=0.517542;STBP=0.751;TYPE=snp;VARB=0.0116803;OID=.;OPOS=23777099;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:27:27:39:40:0.597015:20:19:14:13:21:19:14:13
chr14	23777374	.	A	G	1624.42	PASS	AF=1;AO=108;DP=108;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0281835;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.59;QD=60.1636;RBI=0.0307231;REFB=0;REVB=-0.0122309;RO=0;SAF=35;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.1026e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.1081e-05;OID=.;OPOS=23777374;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:108:108:0:0:108:108:1:73:35:0:0:73:35:0:0
chr14	23780569	.	TTA	T,TT,TTT	151.11	PASS	AF=0.73913,0.0434783,0;AO=9,5,2;DP=23;FAO=17,1,0;FDP=23;FR=.;FRO=5;FSAF=9,1,0;FSAR=8,0,0;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=-0.0499261,-0.0834379,-0.0291778;FXX=0;HRUN=6,6,6;LEN=2,1,1;MLLD=21.5239,10.8418,9.95532;QD=26.2803;RBI=0.260841,0.115809,0.16437;REFB=-0.0618062,-0.0744912,-0.0172765;REVB=0.256019,0.0803111,-0.161759;RO=5;SAF=7,2,0;SAR=2,3,2;SRF=4;SRR=1;SSEN=0.391304,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.0202228,-0.317065,-0.705406;STB=0.608575,0.5,0.5;STBP=0.097,1,1;TYPE=del,del,snp;VARB=0.0331829,0.134782,0;OID=.,.,.;OPOS=23780570,23780571,23780571;OREF=TA,A,A;OALT=-,-,T;OMAPALT=T,TT,TTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.73913,0.0434783,0:9,5,2:23:17,1,0:23:5:9,1,0:8,0,0:5:0:25:5:7,2,0:2,3,2:4:1
chr14	23817491	.	G	A	142.69	PASS	AF=0.6;AO=15;DP=25;FAO=15;FDP=25;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=9;FWDB=-0.00755664;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=250.974;QD=22.831;RBI=0.00824637;REFB=-0.0122864;REVB=-0.00330149;RO=10;SAF=7;SAR=8;SRF=1;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.269943;STB=0.650094;STBP=0.103;TYPE=snp;VARB=0.00646071;OID=.;OPOS=23817491;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:25:25:10:10:15:15:0.6:8:7:1:9:8:7:1:9
chr14	23821361	.	G	A	94.57	PASS	AF=0.611111;AO=11;DP=18;FAO=11;FDP=18;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.00758134;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=294.242;QD=21.0151;RBI=0.00962598;REFB=-0.0198105;REVB=-0.00593151;RO=6;SAF=3;SAR=8;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.263925;STB=0.628965;STBP=0.187;TYPE=snp;VARB=0.0109679;OID=.;OPOS=23821361;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:18:18:6:7:11:11:0.611111:8:3:4:2:8:3:4:3
chr14	23826792	.	G	A	534.97	PASS	AF=0.491228;AO=56;DP=115;FAO=56;FDP=114;FR=.;FRO=58;FSAF=36;FSAR=20;FSRF=24;FSRR=34;FWDB=-0.0763587;FXX=0.0086949;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.2171;QD=18.7708;RBI=0.125951;REFB=-0.0488026;REVB=0.100165;RO=57;SAF=36;SAR=20;SRF=24;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.205642;STB=0.618278;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.0517223;OID=.;OPOS=23826792;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:114:57:58:56:56:0.491228:20:36:24:33:20:36:24:34
chr14	23826822	.	C	T	1514.92	PASS	AF=1;AO=95;DP=96;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000118848;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.934;QD=63.7863;RBI=0.0159827;REFB=0;REVB=-0.0159823;RO=0;SAF=47;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.72596e-05;OID=.;OPOS=23826822;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:96:95:0:0:95:95:1:48:47:0:0:48:47:0:0
chr14	23830042	.	T	C	143.72	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0355231;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.398;QD=44.2219;RBI=0.0360555;REFB=0;REVB=-0.00617321;RO=0;SAF=9;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000706047;OID=.;OPOS=23830042;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:13:0:0:12:13:1:3:9:0:0:4:9:0:0
chr14	23844979	.	C	A	374.23	PASS	AF=0.46988;AO=39;DP=83;FAO=39;FDP=83;FR=.;FRO=44;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=27;FSRR=17;FWDB=-0.0238146;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.22;QD=18.0351;RBI=0.0300253;REFB=-0.0241796;REVB=-0.0182861;RO=42;SAF=19;SAR=20;SRF=26;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122476;STB=0.566818;STBP=0.261;TYPE=snp;VARB=0.024591;OID=.;OPOS=23844979;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:42:44:39:39:0.46988:20:19:26:16:20:19:27:17
chr14	23845244	.	G	A	253.06	PASS	AF=0.520833;AO=23;DP=47;FAO=25;FDP=48;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=5;FSRR=18;FWDB=0.0221672;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.23;QD=21.0883;RBI=0.0223668;REFB=-0.0135427;REVB=-0.00298119;RO=23;SAF=8;SAR=15;SRF=5;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134548;STB=0.594524;STBP=0.237;TYPE=snp;VARB=0.00444849;OID=.;OPOS=23845244;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:48:23:23:23:25:0.520833:15:8:5:18:15:10:5:18
chr14	23848311	.	C	T	191.05	PASS	AF=0.403509;AO=23;DP=57;FAO=23;FDP=57;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=0.0269081;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.909;QD=13.4068;RBI=0.0331576;REFB=0.00399214;REVB=0.0193747;RO=33;SAF=10;SAR=13;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0519687;STB=0.521586;STBP=0.826;TYPE=snp;VARB=-0.0060741;OID=.;OPOS=23848311;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:33:34:23:23:0.403509:13:10:16:17:13:10:16:18
chr14	23855569	.	A	G	333.12	PASS	AF=0.444444;AO=36;DP=81;FAO=36;FDP=81;FR=.;FRO=45;FSAF=25;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=30;FWDB=0.00745456;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.578;QD=16.4505;RBI=0.00755243;REFB=-0.0114928;REVB=0.0012119;RO=45;SAF=25;SAR=11;SRF=15;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.355229;STB=0.699548;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.00910329;OID=.;OPOS=23855569;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:45:45:36:36:0.444444:11:25:15:30:11:25:15:30
chr14	23859610	.	C	T	66.81	PASS	AF=0.428571;AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.065639;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.1954;QD=12.7263;RBI=0.0981825;REFB=-0.0175207;REVB=0.0730159;RO=12;SAF=5;SAR=4;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0535863;STB=0.531844;STBP=0.771;TYPE=snp;VARB=0.034252;OID=.;OPOS=23859610;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:21:21:12:12:9:9:0.428571:4:5:6:6:4:5:6:6
chr14	23902753	.	G	A	209.33	PASS	AF=0.409836;AO=25;DP=60;FAO=25;FDP=61;FR=.;FRO=36;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=27;FSRR=9;FWDB=-0.00910847;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=253.011;QD=13.7268;RBI=0.0248114;REFB=-0.00777432;REVB=-0.023079;RO=35;SAF=15;SAR=10;SRF=26;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158902;STB=0.595674;STBP=0.263;TYPE=snp;VARB=0.0110138;OID=.;OPOS=23902753;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:61:35:36:25:25:0.409836:10:15:26:9:10:15:27:9
chr14	23944505	.	G	A	754.36	PASS	AF=0.979592;AO=47;DP=48;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0198122;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.3664;QD=61.58;RBI=0.0706126;REFB=0.00753822;REVB=0.0677762;RO=1;SAF=21;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0218674;STB=0.511623;STBP=0.342;TYPE=snp;VARB=0.000609796;OID=.;OPOS=23944505;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:48:49:1:1:47:48:0.979592:26:21:1:0:27:21:1:0
chr14	23944514	.	C	A	651.23	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00212843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.951;QD=62.022;RBI=0.00531694;REFB=0;REVB=-0.00487233;RO=0;SAF=20;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.29993e-05;OID=.;OPOS=23944514;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:42:0:0:41:42:1:21:20:0:0:22:20:0:0
chr14	23947374	.	G	A	1247.8	PASS	AF=1;AO=79;DP=85;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0247279;FXX=0.0804505;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.482;QD=62.3901;RBI=0.0296776;REFB=0;REVB=0.0164102;RO=0;SAF=29;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000428635;OID=.;OPOS=23947374;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:80:0:0:79:80:1:50:29:0:0:51:29:0:0
chr14	24028906	.	GGC	G,GG,GGG	591.99	PASS	AF=0,0.985915,0;AO=9,37,7;DP=73;FAO=0,70,0;FDP=71;FR=.;FRO=1;FSAF=0,38,0;FSAR=0,32,0;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.176548,0.096069,-0.0849128;FXX=0.013887;HRUN=4,5,5;LEN=2,1,1;MLLD=9.23794,12.1421,6.34339;QD=33.3516;RBI=0.179356,0.285953,0.319315;REFB=0.0471327,-0.0286723,-0.081998;REVB=-0.0316107,0.269332,0.307818;RO=16;SAF=0,21,7;SAR=9,16,0;SRF=9;SRR=7;SSEN=0.466667,0,0;SSEP=0,0.30137,0;SSSB=-0.78666,0.00286664,0.735273;STB=0.5,0.50769,0.5;STBP=1,0.343,1;TYPE=del,del,snp;VARB=-0.0413524,0.0207976,0;OID=.,.,.;OPOS=24028907,24028908,24028908;OREF=GC,C,C;OALT=-,-,G;OMAPALT=G,GG,GGG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,0.985915,0:9,37,7:73:0,70,0:71:1:0,38,0:0,32,0:0:1:5:16:0,21,7:9,16,0:9:7
chr14	24261219	.	T	C	279.65	PASS	AF=0.405063;AO=32;DP=79;FAO=32;FDP=79;FR=.;FRO=47;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=26;FSRR=21;FWDB=-0.0251503;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.3083;QD=14.1596;RBI=0.0352541;REFB=-0.0179808;REVB=0.0247045;RO=47;SAF=14;SAR=18;SRF=26;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120856;STB=0.568678;STBP=0.354;TYPE=snp;VARB=0.0332031;OID=.;OPOS=24261219;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:47:47:32:32:0.405063:18:14:26:21:18:14:26:21
chr14	24261273	.	G	C	151.0	PASS	AF=0.351852;AO=19;DP=54;FAO=19;FDP=54;FR=.;FRO=35;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=0.00951514;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.524;QD=11.1851;RBI=0.0367461;REFB=-0.0120731;REVB=0.0354928;RO=34;SAF=9;SAR=10;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00340865;STB=0.507804;STBP=0.96;TYPE=snp;VARB=0.0171562;OID=.;OPOS=24261273;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:34:35:19:19:0.351852:10:9:16:18:10:9:17:18
chr14	24261275	.	C	T	153.93	PASS	AF=0.358491;AO=19;DP=53;FAO=19;FDP=53;FR=.;FRO=34;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=-0.0133705;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.738;QD=11.6171;RBI=0.0397521;REFB=-0.000199805;REVB=-0.0374361;RO=33;SAF=9;SAR=10;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0451219;STB=0.516881;STBP=0.839;TYPE=snp;VARB=-8.60178e-05;OID=.;OPOS=24261275;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:33:34:19:19:0.358491:10:9:17:16:10:9:17:17
chr14	24261340	.	A	G	110.83	PASS	AF=0.419355;AO=13;DP=32;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=13;FWDB=0.0838954;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.699;QD=14.3004;RBI=0.0848015;REFB=0.0116356;REVB=-0.0123639;RO=19;SAF=6;SAR=7;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151548;STB=0.60898;STBP=0.338;TYPE=snp;VARB=-0.0201743;OID=.;OPOS=24261340;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:31:19:18:13:13:0.419355:7:6:6:13:7:6:5:13
chr14	24435157	.	A	G	711.21	PASS	AF=0.486301;AO=70;DP=145;FAO=71;FDP=146;FR=.;FRO=75;FSAF=30;FSAR=41;FSRF=37;FSRR=38;FWDB=-0.0289601;FXX=0.00680226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.413;QD=19.4853;RBI=0.0303178;REFB=-0.00685615;REVB=-0.00897123;RO=74;SAF=30;SAR=40;SRF=36;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0544825;STB=0.536828;STBP=0.387;TYPE=snp;VARB=0.00671245;OID=.;OPOS=24435157;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:145:146:74:75:70:71:0.486301:40:30:36:38:41:30:37:38
chr14	24458162	.	G	C	535.26	PASS	AF=1;AO=35;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0320438;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.8003;QD=57.8658;RBI=0.0440687;REFB=0;REVB=-0.0302529;RO=0;SAF=20;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00205973;OID=.;OPOS=24458162;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:35:37:1:15:20:0:0:15:22:0:0
chr14	24459493	.	G	A	227.21	PASS	AF=0.904762;AO=20;DP=21;FAO=19;FDP=21;FR=.;FRO=2;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.02292;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=41.823;QD=43.2779;RBI=0.0237104;REFB=-0.217916;REVB=0.0060709;RO=1;SAF=11;SAR=9;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0400637;STB=0.545407;STBP=0.217;TYPE=snp;VARB=0.0276976;OID=.;OPOS=24459493;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:21:21:1:2:20:19:0.904762:9:11:1:0:9:10:2:0
chr14	24459520	.	T	C	175.62	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0196154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.817;QD=46.8309;RBI=0.0440964;REFB=0;REVB=-0.0394934;RO=0;SAF=9;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000477927;OID=.;OPOS=24459520;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:6:9:0:0:6:9:0:0
chr14	24470138	.	C	T	909.13	PASS	AF=1;AO=61;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00416574;FXX=0.0312451;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.006;QD=58.6533;RBI=0.0402491;REFB=0;REVB=0.040033;RO=0;SAF=40;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000143011;OID=.;OPOS=24470138;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:61:62:1:21:40:0:0:22:40:0:0
chr14	24470690	.	T	TA	106.14	PASS	AF=0.916667;AO=7;DP=15;FAO=11;FDP=12;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.000588401;FXX=0.199867;HRUN=0;LEN=1;MLLD=149.078;QD=35.3786;RBI=0.0103983;REFB=-0.149048;REVB=0.0103817;RO=5;SAF=1;SAR=6;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0763028;STB=0.52936;STBP=0.664;TYPE=ins;VARB=0.00368873;OID=.;OPOS=24470691;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.916667:7:15:11:12:1:3:8:0:1:7:5:1:6:1:4
chr14	24505722	.	C	G	1227.51	PASS	AF=1;AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0175374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.187;QD=61.3756;RBI=0.0176383;REFB=0;REVB=0.00188429;RO=0;SAF=32;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.58754e-05;OID=.;OPOS=24505722;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:80:80:0:0:80:80:1:48:32:0:0:48:32:0:0
chr14	24507010	.	C	A	902.5	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.015422;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.5436;QD=58.2256;RBI=0.0155396;REFB=0;REVB=0.00190769;RO=0;SAF=19;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.32015e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.38783e-05;OID=.;OPOS=24507010;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:43:19:0:0:43:19:0:0
chr14	24526206	.	T	C	462.32	PASS	AF=1;AO=24;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0674322;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.982;QD=57.7902;RBI=0.0819206;REFB=0;REVB=0.0465175;RO=0;SAF=11;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000855563;OID=.;OPOS=24526206;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:24:32:1:13:11:0:0:13:19:0:0
chr14	24529890	.	A	G	239.3	PASS	AF=1;AO=18;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00320392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.118;QD=50.3786;RBI=0.021152;REFB=0;REVB=0.0209079;RO=0;SAF=2;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000176417;OID=.;OPOS=24529890;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:18:19:1:16:2:0:0:16:3:0:0
chr14	24543808	.	G	C	212.76	PASS	AF=0.5;AO=21;DP=42;FAO=21;FDP=42;FR=.;FRO=21;FSAF=16;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.0203061;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.155;QD=20.2631;RBI=0.0239114;REFB=-0.0145672;REVB=0.0126261;RO=21;SAF=16;SAR=5;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.245846;STB=0.639856;STBP=0.095;TYPE=snp;VARB=0.0177903;OID=.;OPOS=24543808;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:21:21:21:21:0.5:5:16:11:10:5:16:11:10
chr14	24545375	.	C	T	138.59	PASS	AF=0.928571;AO=13;DP=14;FAO=13;FDP=14;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0127754;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.9301;QD=39.5957;RBI=0.031898;REFB=-0.10201;REVB=0.0292279;RO=1;SAF=3;SAR=10;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0431971;STB=0.523774;STBP=0.657;TYPE=snp;VARB=0.00876294;OID=.;OPOS=24545375;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:14:14:1:1:13:13:0.928571:10:3:0:1:10:3:0:1
chr14	24546717	.	C	T	266.55	PASS	AF=0.447761;AO=30;DP=66;FAO=30;FDP=67;FR=.;FRO=37;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=-0.00691142;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=160.763;QD=15.9136;RBI=0.0069118;REFB=-0.0274538;REVB=7.21231e-05;RO=34;SAF=18;SAR=12;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0683792;STB=0.53372;STBP=0.663;TYPE=snp;VARB=0.0410497;OID=.;OPOS=24546717;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:67:34:37:30:30:0.447761:12:18:18:16:12:18:20:17
chr14	24567498	.	A	C	1748.56	PASS	AF=1;AO=114;DP=115;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00165276;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.7545;QD=60.8195;RBI=0.0710119;REFB=0;REVB=-0.0709927;RO=0;SAF=61;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.24572e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00039363;OID=.;OPOS=24567498;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:115:115:0:0:114:115:1:53:61:0:0:54:61:0:0
chr14	24587639	.	G	A	233.4	PASS	AF=0.428571;AO=27;DP=64;FAO=27;FDP=63;FR=.;FRO=36;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=22;FSRR=14;FWDB=-0.00168911;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.503;QD=14.8192;RBI=0.00616901;REFB=-0.0104523;REVB=0.00593326;RO=36;SAF=16;SAR=11;SRF=22;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0193842;STB=0.510994;STBP=0.896;TYPE=snp;VARB=0.0110183;OID=.;OPOS=24587639;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:63:36:36:27:27:0.428571:11:16:22:14:11:16:22:14
chr14	24587667	.	C	T	261.65	PASS	AF=0.422535;AO=30;DP=71;FAO=30;FDP=71;FR=.;FRO=41;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=23;FSRR=18;FWDB=-0.00655581;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.098;QD=14.7406;RBI=0.00915627;REFB=-0.00453014;REVB=-0.00639207;RO=41;SAF=15;SAR=15;SRF=23;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0621136;STB=0.535188;STBP=0.633;TYPE=snp;VARB=0.0051691;OID=.;OPOS=24587667;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:41:41:30:30:0.422535:15:15:23:18:15:15:23:18
chr14	24614361	.	T	G	1490.83	PASS	AF=1;AO=93;DP=93;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0085154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.939;QD=63.4397;RBI=0.0448702;REFB=0;REVB=0.0440548;RO=0;SAF=48;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.51614e-05;OID=.;OPOS=24614361;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:93:94:0:0:93:94:1:45:48:0:0:46:48:0:0
chr14	24615435	.	T	C	497.86	PASS	AF=0.510638;AO=48;DP=94;FAO=48;FDP=94;FR=.;FRO=46;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=19;FSRR=27;FWDB=-0.0119914;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.2819;QD=21.1855;RBI=0.012328;REFB=-0.00273002;REVB=-0.00286126;RO=46;SAF=25;SAR=23;SRF=19;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0952018;STB=0.552587;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.00306627;OID=.;OPOS=24615435;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:46:46:48:48:0.510638:23:25:19:27:23:25:19:27
chr14	24617238	.	C	T	329.13	PASS	AF=0.539683;AO=34;DP=62;FAO=34;FDP=63;FR=.;FRO=29;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=0.0160577;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.774;QD=20.8973;RBI=0.0211726;REFB=-0.0258763;REVB=0.0137996;RO=28;SAF=14;SAR=20;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0438448;STB=0.517231;STBP=0.782;TYPE=snp;VARB=0.0219131;OID=.;OPOS=24617238;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:63:28:29:34:34:0.539683:20:14:13:15:20:14:13:16
chr14	24646406	.	G	A,GGAA	543.7	PASS	AF=0.05,0.9;AO=2,36;DP=42;FAO=2,36;FDP=40;FR=.;FRO=2;FSAF=2,18;FSAR=0,18;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0409819,-0.00399243;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,3;MLLD=57.8822,241.403;QD=54.3699;RBI=0.0518679,0.00734154;REFB=0.00469111,-0.113393;REVB=0.0317925,0.00616106;RO=4;SAF=2,18;SAR=0,18;SRF=1;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.687939,0.0466295;STB=0.992443,0.5;STBP=0.312,1;TYPE=snp,ins;VARB=0.0574661,0.00410239;OID=.,.;OPOS=24646406,24646407;OREF=G,-;OALT=A,GAA;OMAPALT=A,GGAA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:42:40:4:2:2,36:2,36:0.05,0.9:0,18:2,18:1:3:0,18:2,18:1:1
chr14	24647814	.	T	C	673.81	PASS	AF=1;AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0721172;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.223;QD=62.6804;RBI=0.0738367;REFB=0;REVB=0.0158421;RO=0;SAF=23;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000340115;OID=.;OPOS=24647814;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:43:0:0:43:43:1:20:23:0:0:20:23:0:0
chr14	24653523	.	G	C	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00219339;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=276.914;QD=51.9167;RBI=0.0109748;REFB=0;REVB=0.0107533;RO=0;SAF=15;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.11905e-05;OID=.;OPOS=24653523;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:6:15:0:0:6:15:0:0
chr14	24653954	.	G	A	330.44	PASS	AF=0.961538;AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0249567;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.948;QD=50.8366;RBI=0.0471916;REFB=-0.105656;REVB=0.0400526;RO=1;SAF=6;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0238057;STB=0.51281;STBP=0.635;TYPE=snp;VARB=0.00560003;OID=.;OPOS=24653954;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:26:26:1:1:25:25:0.961538:19:6:0:1:19:6:0:1
chr14	24654489	.	T	C	885.38	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00817771;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.556;QD=58.0578;RBI=0.0209379;REFB=0;REVB=-0.0192749;RO=0;SAF=30;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.33476e-05;OID=.;OPOS=24654489;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:31:30:0:0:31:30:0:0
chr14	24656750	.	G	T	95.68	PASS	AF=0.363636;AO=12;DP=33;FAO=12;FDP=33;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=-0.00646842;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=233.961;QD=11.5972;RBI=0.0158564;REFB=-0.0113135;REVB=-0.014477;RO=21;SAF=6;SAR=6;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127763;STB=0.575634;STBP=0.478;TYPE=snp;VARB=0.0207096;OID=.;OPOS=24656750;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:33:33:21:21:12:12:0.363636:6:6:13:8:6:6:13:8
chr14	24657407	.	T	G	913.0	PASS	AF=1;AO=34;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=32;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0500441;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.716;QD=58.903;RBI=0.133398;REFB=0;REVB=0.123655;RO=0;SAF=26;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000488235;OID=.;OPOS=24657407;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:34:62:1:8:26:0:0:30:32:0:0
chr14	24679877	.	C	T	228.05	PASS	AF=0.511628;AO=22;DP=43;FAO=22;FDP=43;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=-0.00652157;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=254.194;QD=21.2139;RBI=0.0163091;REFB=-0.0239013;REVB=0.0149485;RO=20;SAF=13;SAR=9;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00798932;STB=0.514273;STBP=0.876;TYPE=snp;VARB=0.0186572;OID=.;OPOS=24679877;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:20:21:22:22:0.511628:9:13:12:8:9:13:13:8
chr14	24736027	.	G	A	295.69	PASS	AF=0.534483;AO=31;DP=58;FAO=31;FDP=58;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=4;FSRR=23;FWDB=-0.0260958;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.5837;QD=20.3921;RBI=0.0582579;REFB=0.0262145;REVB=0.0520864;RO=27;SAF=15;SAR=16;SRF=4;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.287662;STB=0.657952;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=-0.0173556;OID=.;OPOS=24736027;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:27:27:31:31:0.534483:16:15:4:23:16:15:4:23
chr14	24736961	.	T	C	356.13	PASS	AF=0.44186;AO=38;DP=86;FAO=38;FDP=86;FR=.;FRO=48;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=19;FSRR=29;FWDB=0.00207602;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=243.391;QD=16.5643;RBI=0.017475;REFB=-0.0102305;REVB=-0.0173512;RO=48;SAF=17;SAR=21;SRF=19;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0521204;STB=0.52925;STBP=0.654;TYPE=snp;VARB=0.0113149;OID=.;OPOS=24736961;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:48:48:38:38:0.44186:21:17:19:29:21:17:19:29
chr14	24771256	.	T	C	2138.24	PASS	AF=1;AO=136;DP=136;FAO=136;FDP=136;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0161126;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.376;QD=62.8895;RBI=0.0450719;REFB=0;REVB=0.0420934;RO=0;SAF=57;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.53503e-05;OID=.;OPOS=24771256;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:136:136:0:0:136:136:1:79:57:0:0:79:57:0:0
chr14	24786293	.	T	G	308.91	PASS	AF=0.888889;AO=22;DP=27;FAO=24;FDP=27;FR=.;FRO=3;FSAF=4;FSAR=20;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0301066;FXX=0.0689417;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.031;QD=45.7637;RBI=0.0327317;REFB=9.32498e-05;REVB=0.0128436;RO=0;SAF=4;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.636235;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.000781335;OID=.;OPOS=24786293;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:27:27:0:3:22:24:0.888889:18:4:0:0:20:4:3:0
chr14	24786976	.	T	C	557.06	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000411079;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.008;QD=60.2227;RBI=0.0243595;REFB=0;REVB=0.024356;RO=0;SAF=13;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000124916;OID=.;OPOS=24786976;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:24:13:0:0:24:13:0:0
chr14	24793600	.	G	A	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0262128;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.759;QD=55.6559;RBI=0.0302365;REFB=0;REVB=-0.0150711;RO=0;SAF=9;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000100628;OID=.;OPOS=24793600;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:18:9:0:0:18:9:0:0
chr14	24795281	.	G	T	218.05	PASS	AF=0.446429;AO=25;DP=56;FAO=25;FDP=56;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.00914238;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.452;QD=15.5751;RBI=0.00939711;REFB=-0.0111773;REVB=-0.00217313;RO=31;SAF=12;SAR=13;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00378517;STB=0.502144;STBP=0.959;TYPE=snp;VARB=0.0149936;OID=.;OPOS=24795281;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:31:31:25:25:0.446429:13:12:15:16:13:12:15:16
chr14	24795495	.	G	A	77.93	PASS	AF=0.454545;AO=10;DP=22;FAO=10;FDP=22;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.0363505;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.706;QD=14.1693;RBI=0.0363542;REFB=0.00447559;REVB=-0.000524683;RO=12;SAF=2;SAR=8;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.393982;STB=0.734184;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=-0.00814917;OID=.;OPOS=24795495;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:22:22:12:12:10:10:0.454545:8:2:7:5:8:2:7:5
chr14	24801960	.	G	C	313.71	PASS	AF=0.397727;AO=34;DP=87;FAO=35;FDP=88;FR=.;FRO=53;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=25;FSRR=28;FWDB=-0.0235236;FXX=0.0112347;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.9267;QD=14.2596;RBI=0.0571091;REFB=-0.00928967;REVB=0.0520392;RO=53;SAF=17;SAR=17;SRF=25;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0302493;STB=0.508448;STBP=0.917;TYPE=snp;VARB=0.0100384;OID=.;OPOS=24801960;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:88:53:53:34:35:0.397727:17:17:25:28:18:17:25:28
chr14	24836815	.	C	G	202.29	PASS	AF=0.42;AO=21;DP=50;FAO=21;FDP=50;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.0119997;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.793;QD=16.1829;RBI=0.0204342;REFB=-0.00522909;REVB=0.0165398;RO=27;SAF=9;SAR=12;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0891061;STB=0.551675;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.00614754;OID=.;OPOS=24836815;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:27:29:21:21:0.42:12:9:14:13:12:9:15:14
chr14	24839165	.	C	T	1139.35	PASS	AF=0.987013;AO=74;DP=75;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0145085;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.6169;QD=59.187;RBI=0.0528921;REFB=-0.147486;REVB=-0.0508633;RO=0;SAF=41;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505746;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.000914379;OID=.;OPOS=24839165;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:75:77:0:1:74:76:0.987013:33:41:0:0:33:43:1:0
chr14	24846757	.	A	G	501.65	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0067283;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.039;QD=59.018;RBI=0.022358;REFB=0;REVB=0.0213216;RO=0;SAF=21;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.97575e-05;OID=.;OPOS=24846757;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:13:21:0:0:13:21:0:0
chr14	24846961	.	G	T	129.59	PASS	AF=0.666667;AO=13;DP=21;FAO=14;FDP=21;FR=.;FRO=7;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.0172212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.524;QD=24.6835;RBI=0.0172931;REFB=-0.0347259;REVB=0.00157503;RO=7;SAF=6;SAR=7;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0206184;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.01414;OID=.;OPOS=24846961;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:21:21:7:7:13:14:0.666667:7:6:3:4:8:6:3:4
chr14	24868619	.	AGGGGC	ACGGGG,AGGG,AGGGC,CGGGGC,GACGGG	141.1	PASS	AF=0,0.415094,0.0188679,0.0377358,0.0188679;AO=2,9,7,3,2;DP=54;FAO=0,22,1,2,1;FDP=53;FR=.;FRO=27;FSAF=0,6,1,0,0;FSAR=0,16,0,2,1;FSRF=19;FSRR=8;FWDB=-0.0556103,-0.211178,-0.303642,0.00309659,-0.084994;FXX=0.0185151;HRUN=4,4,4,1,1;LEN=5,2,1,1,6;MLLD=33.7362,17.6319,10.7775,39.6286,50.5063;QD=10.649;RBI=0.0818783,0.232904,0.321044,0.213374,0.101072;REFB=-0.0600362,-0.10978,-0.0617325,-0.00375727,-0.0505562;REVB=-0.0600962,0.0982248,0.104263,-0.213352,-0.0546952;RO=19;SAF=0,4,5,0,0;SAR=2,5,2,3,2;SRF=14;SRR=5;SSEN=0,0.509542,0.509542,0,0;SSEP=0,0,0,0,0;SSSB=-0.636236,-0.319811,-0.03226,-0.700525,-0.636236;STB=0.5,0.735082,0.986071,0.996567,0.993636;STBP=1,0.002,0.506,0.054,0.173;TYPE=mnp,del,del,snp,mnp;VARB=0,0.095376,-0.0328257,0.212794,0.192852;OID=.,.,.,.,.;OPOS=24868620,24868623,24868620,24868619,24868619;OREF=GGGGC,GC,G,A,AGGGGC;OALT=CGGGG,-,-,C,GACGGG;OMAPALT=ACGGGG,AGGG,AGGGC,CGGGGC,GACGGG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:54:53:19:27:2,9,7,3,2:0,22,1,2,1:0,0.415094,0.0188679,0.0377358,0.0188679:2,5,2,3,2:0,4,5,0,0:14:5:0,16,0,2,1:0,6,1,0,0:19:8
chr14	24877699	.	A	G	211.05	PASS	AF=0.416667;AO=24;DP=60;FAO=25;FDP=60;FR=.;FRO=35;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=23;FWDB=0.0251263;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.958;QD=14.0699;RBI=0.02541;REFB=-0.0130145;REVB=0.00378603;RO=36;SAF=10;SAR=14;SRF=13;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.060597;STB=0.558254;STBP=0.477;TYPE=snp;VARB=0.0247134;OID=.;OPOS=24877699;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:36:35:24:25:0.416667:14:10:13:23:14:11:12:23
chr14	24878370	.	C	T	177.31	PASS	AF=0.37931;AO=22;DP=58;FAO=22;FDP=58;FR=.;FRO=36;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=25;FWDB=-0.00993843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.826;QD=12.2283;RBI=0.0101623;REFB=-0.0014412;REVB=-0.00212121;RO=36;SAF=8;SAR=14;SRF=11;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0690857;STB=0.539757;STBP=0.655;TYPE=snp;VARB=0.00172693;OID=.;OPOS=24878370;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:36:36:22:22:0.37931:14:8:11:25:14:8:11:25
chr14	24888335	.	T	C	477.91	PASS	AF=0.484536;AO=47;DP=97;FAO=47;FDP=97;FR=.;FRO=50;FSAF=6;FSAR=41;FSRF=11;FSRR=39;FWDB=0.00556038;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.7268;QD=19.7077;RBI=0.032209;REFB=-0.00768323;REVB=-0.0317254;RO=50;SAF=6;SAR=41;SRF=11;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163973;STB=0.59214;STBP=0.197;TYPE=snp;VARB=0.00919149;OID=.;OPOS=24888335;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:50:50:47:47:0.484536:41:6:11:39:41:6:11:39
chr14	24898556	.	G	C	447.62	PASS	AF=0.517647;AO=44;DP=85;FAO=44;FDP=85;FR=.;FRO=41;FSAF=16;FSAR=28;FSRF=17;FSRR=24;FWDB=-0.0140552;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=223.043;QD=21.0646;RBI=0.0140653;REFB=-0.016788;REVB=-0.000532423;RO=41;SAF=16;SAR=28;SRF=17;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0473088;STB=0.526184;STBP=0.659;TYPE=snp;VARB=0.0185964;OID=.;OPOS=24898556;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:41:41:44:44:0.517647:28:16:17:24:28:16:17:24
chr14	24898558	.	C	T	357.26	PASS	AF=0.447059;AO=38;DP=85;FAO=38;FDP=85;FR=.;FRO=47;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=18;FSRR=29;FWDB=0.0358587;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.118;QD=16.8122;RBI=0.0358609;REFB=-0.0093076;REVB=0.000393065;RO=46;SAF=14;SAR=24;SRF=17;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00119975;STB=0.508605;STBP=0.915;TYPE=snp;VARB=0.0045819;OID=.;OPOS=24898558;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:46:47:38:38:0.447059:24:14:17:29:24:14:18:29
chr14	24901249	.	A	C	65.78	PASS	AF=0.391304;AO=9;DP=23;FAO=9;FDP=23;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=1;FWDB=-0.0221085;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=222.045;QD=11.4398;RBI=0.048835;REFB=0.00352368;REVB=0.043544;RO=14;SAF=4;SAR=5;SRF=13;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.487739;STB=0.77936;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=-0.00617166;OID=.;OPOS=24901249;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:23:23:14:14:9:9:0.391304:5:4:13:1:5:4:13:1
chr14	24901273	.	A	AT	149.99	PASS	AF=1;AO=2;DP=18;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0177273;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=19.0479;QD=39.9974;RBI=0.106493;REFB=0;REVB=0.105007;RO=16;SAF=2;SAR=0;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.468799;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.0155944;OID=.;OPOS=24901274;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:2:18:15:15:0:11:4:0:0:4:16:2:0:11:5
chr14	24901276	.	G	T	154.51	PASS	AF=0.933333;AO=14;DP=15;FAO=14;FDP=15;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0767824;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=35.7724;QD=41.2027;RBI=0.0775022;REFB=-0.144096;REVB=0.0105381;RO=1;SAF=10;SAR=4;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0433252;STB=0.523776;STBP=0.622;TYPE=snp;VARB=0.0189512;OID=.;OPOS=24901276;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:15:15:1:1:14:14:0.933333:4:10:1:0:4:10:1:0
chr14	24909362	.	T	C	853.35	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0183305;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.774;QD=56.8902;RBI=0.0185315;REFB=0;REVB=-0.00272259;RO=0;SAF=29;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000835698;OID=.;OPOS=24909362;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:60:0:0:58:60:1:29:29:0:0:29:31:0:0
chr14	24909475	.	C	G	508.37	PASS	AF=0.972222;AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0153382;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=213.491;QD=56.485;RBI=0.0241776;REFB=0.104953;REVB=-0.0186895;RO=1;SAF=27;SAR=8;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0549101;STB=0.529394;STBP=0.131;TYPE=snp;VARB=-0.000637908;OID=.;OPOS=24909475;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:36:36:1:1:35:35:0.972222:8:27:0:1:8:27:0:1
chr14	24909731	.	C	T	557.09	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0985705;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.3576;QD=60.2257;RBI=0.100405;REFB=0;REVB=-0.0191033;RO=0;SAF=7;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.00464e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00151782;OID=.;OPOS=24909731;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:30:7:0:0:30:7:0:0
chr14	24910210	.	C	A	1593.76	PASS	AF=0.973214;AO=108;DP=112;FAO=109;FDP=112;FR=.;FRO=3;FSAF=57;FSAR=52;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.000729798;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.75;QD=56.9198;RBI=0.0229442;REFB=-0.147619;REVB=0.0229326;RO=3;SAF=57;SAR=51;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00999444;STB=0.503859;STBP=0.697;TYPE=snp;VARB=0.000477772;OID=.;OPOS=24910210;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:112:112:3:3:108:109:0.973214:51:57:1:2:52:57:2:1
chr14	24910973	.	TT	GA	777.77	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00152817;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=91.2745;QD=63.4917;RBI=0.0779995;REFB=0;REVB=0.0779845;RO=0;SAF=26;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000568758;OID=.;OPOS=24910973;OREF=TT;OALT=GA;OMAPALT=GA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:49:0:0:47:49:1:21:26:0:0:23:26:0:0
chr14	24970942	.	A	G	350.68	PASS	AF=0.9;AO=27;DP=30;FAO=27;FDP=30;FR=.;FRO=3;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0141062;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.7784;QD=46.7575;RBI=0.0250814;REFB=-0.0158484;REVB=-0.0207387;RO=2;SAF=11;SAR=16;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0772824;STB=0.526562;STBP=0.438;TYPE=snp;VARB=0.00287053;OID=.;OPOS=24970942;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:30:30:2:3:27:27:0.9:16:11:2:0:16:11:2:1
chr14	24975435	.	G	T	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0278806;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=202.148;QD=40.7629;RBI=0.0289206;REFB=0;REVB=-0.00768595;RO=0;SAF=5;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000229207;OID=.;OPOS=24975435;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:5:5:0:0:5:5:0:0
chr14	25043671	.	T	C	47.19	PASS	AF=0.411765;AO=7;DP=17;FAO=7;FDP=17;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=0.0189873;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.8;QD=11.1036;RBI=0.0360823;REFB=-0.0179506;REVB=-0.0306826;RO=10;SAF=3;SAR=4;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164676;STB=0.599717;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.031682;OID=.;OPOS=25043671;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:17:17:10:10:7:7:0.411765:4:3:6:4:4:3:6:4
chr14	25102160	.	C	T	813.57	PASS	AF=1;AO=56;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0345474;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.4545;QD=57.0928;RBI=0.0667287;REFB=0;REVB=0.0570894;RO=0;SAF=22;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.43892e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000178835;OID=.;OPOS=25102160;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:56:57:1:34:22:0:0:34:23:0:0
chr14	30066929	.	A	G	146.36	PASS	AF=0.457143;AO=16;DP=35;FAO=16;FDP=35;FR=.;FRO=19;FSAF=2;FSAR=14;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=-0.0134986;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.0733;QD=16.7271;RBI=0.0682304;REFB=0.00691515;REVB=0.0668818;RO=19;SAF=2;SAR=14;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.296927;STB=0.674439;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=-0.0070707;OID=.;OPOS=30066929;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:19:19:16:16:0.457143:14:2:6:13:14:2:6:13
chr14	30125660	.	A	G	271.37	PASS	AF=0.543478;AO=25;DP=46;FAO=25;FDP=46;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=0.0292851;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.6421;QD=23.5973;RBI=0.0564066;REFB=-0.0131066;REVB=-0.0482088;RO=21;SAF=11;SAR=14;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145906;STB=0.58125;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=0.00753006;OID=.;OPOS=30125660;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:21:21:25:25:0.543478:14:11:13:8:14:11:13:8
chr14	31059969	.	G	A	287.96	PASS	AF=0.565217;AO=26;DP=46;FAO=26;FDP=46;FR=.;FRO=20;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=15;FWDB=0.0134782;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.1394;QD=25.0396;RBI=0.0135828;REFB=-0.0258806;REVB=0.00168231;RO=20;SAF=14;SAR=12;SRF=5;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.223757;STB=0.623671;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.0169337;OID=.;OPOS=31059969;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:20:20:26:26:0.565217:12:14:5:15:12:14:5:15
chr14	31099738	.	A	G	359.39	PASS	AF=0.457831;AO=38;DP=83;FAO=38;FDP=83;FR=.;FRO=45;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=27;FSRR=18;FWDB=0.0320847;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.0099;QD=17.3201;RBI=0.0361369;REFB=-0.0196004;REVB=-0.0166267;RO=45;SAF=20;SAR=18;SRF=27;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0718853;STB=0.540209;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.0194948;OID=.;OPOS=31099738;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:45:45:38:38:0.457831:18:20:27:18:18:20:27:18
chr14	31108977	.	T	C	257.73	PASS	AF=0.519231;AO=27;DP=52;FAO=27;FDP=52;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=0.00620474;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=230.742;QD=19.8256;RBI=0.0102806;REFB=-0.00468053;REVB=0.00819713;RO=25;SAF=11;SAR=16;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0637919;STB=0.535636;STBP=0.646;TYPE=snp;VARB=0.0050326;OID=.;OPOS=31108977;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:25:25:27:27:0.519231:16:11:12:13:16:11:12:13
chr14	31191772	.	T	C	525.6	PASS	AF=0.515464;AO=50;DP=97;FAO=50;FDP=97;FR=.;FRO=47;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=22;FSRR=25;FWDB=0.000460498;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=273.983;QD=21.6743;RBI=0.0028753;REFB=-0.00201984;REVB=-0.00283818;RO=47;SAF=26;SAR=24;SRF=22;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0455366;STB=0.525134;STBP=0.651;TYPE=snp;VARB=0.00188699;OID=.;OPOS=31191772;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:47:47:50:50:0.515464:24:26:22:25:24:26:22:25
chr14	31355096	.	C	G	771.6	PASS	AF=1;AO=54;DP=55;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0353118;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.685;QD=57.1552;RBI=0.0369526;REFB=0;REVB=0.010889;RO=0;SAF=25;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000649188;OID=.;OPOS=31355096;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:54:0:0:54:54:1:29:25:0:0:29:25:0:0
chr14	31359847	.	T	A	769.5	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.017319;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.207;QD=56.9996;RBI=0.041673;REFB=0;REVB=0.0379037;RO=0;SAF=23;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6027e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000302674;OID=.;OPOS=31359847;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:31:23:0:0:31:23:0:0
chr14	31381351	.	T	C	670.19	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0377127;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.448;QD=62.3431;RBI=0.0398904;REFB=0;REVB=0.0129999;RO=0;SAF=19;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000121595;OID=.;OPOS=31381351;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:24:19:0:0:24:19:0:0
chr14	31578762	.	C	T	741.29	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0212761;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.109;QD=57.0222;RBI=0.0219168;REFB=0;REVB=0.0052609;RO=0;SAF=22;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.44858e-05;OID=.;OPOS=31578762;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:30:22:0:0:30:22:0:0
chr14	31582380	.	A	G	847.5	PASS	AF=0.983871;AO=59;DP=61;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0408593;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.8023;QD=54.6772;RBI=0.0437058;REFB=-0.0684002;REVB=0.0155151;RO=2;SAF=34;SAR=25;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00482397;STB=0.509801;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.00430371;OID=.;OPOS=31582380;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:61:62:2:1:59:61:0.983871:25:34:1:1:25:36:0:1
chr14	31582526	.	T	C	2409.02	PASS	AF=1;AO=150;DP=150;FAO=150;FDP=150;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0220682;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.176;QD=64.2406;RBI=0.0240446;REFB=0;REVB=0.00954644;RO=0;SAF=82;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.78142e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.04538e-05;OID=.;OPOS=31582526;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:150:150:0:0:150:150:1:68:82:0:0:68:82:0:0
chr14	31583173	.	G	A	1080.79	PASS	AF=1;AO=72;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00105651;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.264;QD=59.2213;RBI=0.00798433;REFB=0;REVB=0.00791412;RO=0;SAF=36;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.64837e-05;OID=.;OPOS=31583173;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:72:73:1:36:36:0:0:37:36:0:0
chr14	31598248	.	A	G	747.1	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0330442;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.1208;QD=63.5826;RBI=0.0871237;REFB=0;REVB=-0.080614;RO=0;SAF=29;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00163585;OID=.;OPOS=31598248;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:18:29:0:0:18:29:0:0
chr14	31619392	.	T	C	632.26	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0444599;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.329;QD=61.684;RBI=0.0451786;REFB=0;REVB=0.00802669;RO=0;SAF=17;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.2194e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000165919;OID=.;OPOS=31619392;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:24:17:0:0:24:17:0:0
chr14	31647241	.	G	A	801.32	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0143353;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.4148;QD=57.2371;RBI=0.0188447;REFB=0;REVB=-0.0122319;RO=0;SAF=23;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000191569;OID=.;OPOS=31647241;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:33:23:0:0:33:23:0:0
chr14	31763142	.	T	G	769.48	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0368053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.575;QD=56.9982;RBI=0.0415698;REFB=0;REVB=0.0193242;RO=0;SAF=30;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000109189;OID=.;OPOS=31763142;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:24:30:0:0:24:30:0:0
chr14	31819047	.	C	T	935.63	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0427139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.473;QD=57.5773;RBI=0.0430432;REFB=0;REVB=-0.0053141;RO=0;SAF=38;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000851476;OID=.;OPOS=31819047;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:65:0:0:62:65:1:24:38:0:0:25:40:0:0
chr14	31819913	.	A	G	483.34	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00757521;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.589;QD=58.5869;RBI=0.0653513;REFB=0;REVB=0.0649108;RO=0;SAF=16;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.60901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000886349;OID=.;OPOS=31819913;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:17:16:0:0:17:16:0:0
chr14	31864485	.	G	C	1785.79	PASS	AF=1;AO=117;DP=117;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000250241;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.033;QD=61.0526;RBI=0.0162326;REFB=0;REVB=0.0162307;RO=0;SAF=73;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.26857e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.89165e-05;OID=.;OPOS=31864485;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:117:117:0:0:117:117:1:44:73:0:0:44:73:0:0
chr14	32071665	.	G	A	2076.62	PASS	AF=1;AO=132;DP=133;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0227401;FXX=0.00746213;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.436;QD=62.4549;RBI=0.0266453;REFB=0;REVB=-0.0138875;RO=0;SAF=60;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.87096e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.67524e-06;OID=.;OPOS=32071665;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:133:133:0:0:132:133:1:72:60:0:0:73:60:0:0
chr14	32414145	.	C	A	731.32	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0236306;FXX=0.0212721;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.378;QD=63.5934;RBI=0.0335742;REFB=0;REVB=0.02385;RO=0;SAF=25;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.85991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.80825e-06;OID=.;OPOS=32414145;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:21:25:0:0:21:25:0:0
chr14	32414265	.	A	G	89.54	PASS	AF=0.478261;AO=11;DP=23;FAO=11;FDP=23;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=-0.00448429;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.688;QD=15.5714;RBI=0.00547033;REFB=-0.00850179;REVB=0.00313298;RO=12;SAF=4;SAR=7;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.268832;STB=0.65597;STBP=0.173;TYPE=snp;VARB=0.00606901;OID=.;OPOS=32414265;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:23:23:12:12:11:11:0.478261:7:4:8:4:7:4:8:4
chr14	32419331	.	C	T	1149.18	PASS	AF=1;AO=74;DP=75;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0139884;FXX=0.0253133;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.237;QD=59.6975;RBI=0.042138;REFB=0;REVB=0.0397484;RO=1;SAF=34;SAR=40;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0137108;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000312659;OID=.;OPOS=32419331;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:77:1:0:74:77:1:40:34:1:0:41:36:0:0
chr14	32960254	.	G	A	1754.39	PASS	AF=1;AO=115;DP=115;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00223505;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.3902;QD=60.4962;RBI=0.00514155;REFB=0;REVB=-0.00463034;RO=0;SAF=50;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.22929e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000290942;OID=.;OPOS=32960254;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:115:116:0:0:115:116:1:65:50:0:0:65:51:0:0
chr14	33014869	.	C	T	112.23	PASS	AF=0.481481;AO=13;DP=27;FAO=13;FDP=27;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=2;FWDB=0.00865717;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=316.918;QD=16.627;RBI=0.0245273;REFB=-0.00358994;REVB=-0.0229487;RO=14;SAF=8;SAR=5;SRF=12;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.248928;STB=0.640838;STBP=0.25;TYPE=snp;VARB=0.00456689;OID=.;OPOS=33014869;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:14:14:13:13:0.481481:5:8:12:2:5:8:12:2
chr14	33015014	.	G	A	34.83	PASS	AF=0.833333;AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.010382;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.587;QD=23.2183;RBI=0.0109977;REFB=-0.0140178;REVB=0.00362818;RO=1;SAF=4;SAR=1;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0951258;STB=0.555346;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=0.000960581;OID=.;OPOS=33015014;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:6:6:1:1:5:5:0.833333:1:4:1:0:1:4:1:0
chr14	33015082	.	A	G	77.29	PASS	AF=0.434783;AO=10;DP=23;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=0.0110501;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=209.145;QD=13.4414;RBI=0.0344046;REFB=-0.00459509;REVB=-0.0325818;RO=13;SAF=8;SAR=2;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.426955;STB=0.754173;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.00486914;OID=.;OPOS=33015082;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:23:23:13:13:10:10:0.434783:2:8:5:8:2:8:5:8
chr14	33046388	.	A	G	620.97	PASS	AF=0.933333;AO=42;DP=45;FAO=42;FDP=45;FR=.;FRO=3;FSAF=28;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.00397082;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=247.793;QD=55.1972;RBI=0.0316708;REFB=0.0686027;REVB=0.0314209;RO=3;SAF=28;SAR=14;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0460241;STB=0.524578;STBP=0.27;TYPE=snp;VARB=-0.000730472;OID=.;OPOS=33046388;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:45:45:3:3:42:42:0.933333:14:28:1:2:14:28:1:2
chr14	33292743	.	A	C	82.32	PASS	AF=0.588235;AO=10;DP=17;FAO=10;FDP=17;FR=.;FRO=7;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.0120228;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=293.276;QD=19.3689;RBI=0.0121595;REFB=0.006055;REVB=0.00181775;RO=6;SAF=6;SAR=4;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.066985;STB=0.571284;STBP=0.554;TYPE=snp;VARB=-0.00333323;OID=.;OPOS=33292743;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:17:17:6:7:10:10:0.588235:4:6:3:3:4:6:3:4
chr14	33293122	.	A	G	127.73	PASS	AF=0.348837;AO=15;DP=43;FAO=15;FDP=43;FR=.;FRO=28;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=-0.00289236;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.37;QD=11.8818;RBI=0.0404224;REFB=-0.00480831;REVB=0.0403188;RO=28;SAF=4;SAR=11;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.311061;STB=0.684988;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=0.0146432;OID=.;OPOS=33293122;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:28:28:15:15:0.348837:11:4:15:13:11:4:15:13
chr14	33293531	.	T	A	367.38	PASS	AF=0.493506;AO=38;DP=77;FAO=38;FDP=77;FR=.;FRO=39;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=0.00194618;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=120.61;QD=19.0846;RBI=0.00364771;REFB=-0.0170303;REVB=-0.00308515;RO=38;SAF=17;SAR=21;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0238554;STB=0.507243;STBP=0.89;TYPE=snp;VARB=0.0218966;OID=.;OPOS=33293531;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:38:39:38:38:0.493506:21:17:18:20:21:17:18:21
chr14	33294042	.	G	A	153.71	PASS	AF=0.369565;AO=17;DP=47;FAO=17;FDP=46;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=-0.0249692;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.753;QD=13.3658;RBI=0.0257976;REFB=-0.00891414;REVB=0.00648481;RO=29;SAF=9;SAR=8;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124217;STB=0.572435;STBP=0.476;TYPE=snp;VARB=0.0177088;OID=.;OPOS=33294042;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:46:29:29:17:17:0.369565:8:9:12:17:8:9:12:17
chr14	34047414	.	T	C	70.57	PASS	AF=0.5625;AO=9;DP=16;FAO=9;FDP=16;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=-0.0313086;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.0281;QD=17.6428;RBI=0.0348161;REFB=0.022504;REVB=0.0152293;RO=7;SAF=2;SAR=7;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0657708;STB=0.538372;STBP=0.805;TYPE=snp;VARB=-0.0187501;OID=.;OPOS=34047414;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:16:16:7:7:9:9:0.5625:7:2:2:5:7:2:2:5
chr14	34393602	.	A	G	152.26	PASS	AF=0.933333;AO=14;DP=15;FAO=14;FDP=15;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0188925;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.2939;QD=40.6022;RBI=0.0274925;REFB=-0.0262928;REVB=0.0199727;RO=0;SAF=6;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.538406;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=0.0155019;OID=.;OPOS=34393602;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:15:15:0:1:14:14:0.933333:8:6:0:0:8:6:1:0
chr14	34394733	.	C	T	285.87	PASS	AF=0.535714;AO=30;DP=56;FAO=30;FDP=56;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.000123173;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.284;QD=20.4191;RBI=0.00848261;REFB=-0.00271819;REVB=-0.00848172;RO=26;SAF=11;SAR=19;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115585;STB=0.564313;STBP=0.344;TYPE=snp;VARB=0.00183225;OID=.;OPOS=34394733;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:26:26:30:30:0.535714:19:11:13:13:19:11:13:13
chr14	34395148	.	GA	G,GG	269.77	PASS	AF=0.449275,0;AO=26,4;DP=69;FAO=31,0;FDP=69;FR=.;FRO=38;FSAF=16,0;FSAR=15,0;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=0.00328015,0.0045811;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=269.819,268.884;QD=15.6391;RBI=0.0076756,0.0093155;REFB=-0.00886345,-0.00647241;REVB=-0.00693941,-0.00811123;RO=38;SAF=15,0;SAR=11,4;SRF=20;SRR=18;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0533183,-0.585658;STB=0.505614,0.5;STBP=0.958,1;TYPE=del,snp;VARB=0.00813559,0;OID=.,.;OPOS=34395149,34395149;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.449275,0:26,4:69:31,0:69:38:16,0:15,0:20:18:99:38:15,0:11,4:20:18
chr14	34561575	.	C	T	543.14	PASS	AF=0.53125;AO=51;DP=96;FAO=51;FDP=96;FR=.;FRO=45;FSAF=17;FSAR=34;FSRF=20;FSRR=25;FWDB=0.0200456;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.492;QD=22.6307;RBI=0.0243485;REFB=-0.00386;REVB=-0.0138211;RO=45;SAF=17;SAR=34;SRF=20;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102149;STB=0.556368;STBP=0.249;TYPE=snp;VARB=0.00390541;OID=.;OPOS=34561575;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:96:45:45:51:51:0.53125:34:17:20:25:34:17:20:25
chr14	35099099	.	A	G	740.22	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.105812;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.3298;QD=56.9397;RBI=0.123018;REFB=0;REVB=-0.0627476;RO=0;SAF=25;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00221862;OID=.;OPOS=35099099;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:27:25:0:0:27:25:0:0
chr14	35222242	.	T	A	52.85	PASS	AF=0.266667;AO=8;DP=28;FAO=8;FDP=30;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.0204651;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.222;QD=7.04664;RBI=0.0503647;REFB=-0.0143725;REVB=-0.0460193;RO=20;SAF=5;SAR=3;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0881715;STB=0.592984;STBP=0.584;TYPE=snp;VARB=0.0383838;OID=.;OPOS=35222242;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:28:30:20:22:8:8:0.266667:3:5:11:9:3:5:11:11
chr14	35222732	.	C	T	456.71	PASS	AF=0.47619;AO=46;DP=101;FAO=50;FDP=105;FR=.;FRO=55;FSAF=30;FSAR=20;FSRF=37;FSRR=18;FWDB=0.00178938;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.9281;QD=17.3984;RBI=0.00179212;REFB=-0.0102559;REVB=9.91413e-05;RO=55;SAF=27;SAR=19;SRF=37;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0879133;STB=0.540307;STBP=0.447;TYPE=snp;VARB=0.00897797;OID=.;OPOS=35222732;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:105:55:55:46:50:0.47619:19:27:37:18:20:30:37:18
chr14	35242828	.	G	A	197.8	PASS	AF=0.425926;AO=23;DP=53;FAO=23;FDP=54;FR=.;FRO=31;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=-0.0120504;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.433;QD=14.652;RBI=0.04747;REFB=-0.0307681;REVB=-0.045915;RO=30;SAF=15;SAR=8;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0559092;STB=0.524454;STBP=0.773;TYPE=snp;VARB=0.0498234;OID=.;OPOS=35242828;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:54:30:31:23:23:0.425926:8:15:18:12:8:15:19:12
chr14	35586368	.	T	C	92.98	PASS	AF=0.307692;AO=12;DP=39;FAO=12;FDP=39;FR=.;FRO=27;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=0.0036825;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.278;QD=9.53615;RBI=0.00503125;REFB=0.00047674;REVB=0.00342822;RO=27;SAF=5;SAR=7;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116635;STB=0.570697;STBP=0.553;TYPE=snp;VARB=-0.00105788;OID=.;OPOS=35586368;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:39:39:27:27:12:12:0.307692:7:5:14:13:7:5:14:13
chr14	36003547	.	GGCCCCA	GCCCA,GGCCC,GGCCCA	187.64	PASS	AF=0.28,0,0.72;AO=8,5,5;DP=25;FAO=7,0,18;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0,9;FSAR=7,0,9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0588148,0.00158736,0.15921;FXX=0;HRUN=4,4,4;LEN=2,2,1;MLLD=14.1411,112.097,11.399;QD=30.022;RBI=0.067333,0.00545565,0.260836;REFB=-0.0257108,-0.0470657,-0.0318404;REVB=0.0327803,-0.00521962,0.20661;RO=5;SAF=1,5,1;SAR=7,0,4;SRF=2;SRR=3;SSEN=0.5,0,0;SSEP=0,0.533333,0.533333;SSSB=-0.2967,0.755783,-0.20967;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,del,del;VARB=0.00742282,0,0.0594381;OID=.,.,.;OPOS=36003548,36003552,36003549;OREF=GC,CA,C;OALT=-,-,-;OMAPALT=GCCCA,GGCCC,GGCCCA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/3:0.28,0,0.72:8,5,5:25:7,0,18:25:0:0,0,9:7,0,9:0:0:25:5:1,5,1:7,0,4:2:3
chr14	36004075	.	A	G	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00346972;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.8658;QD=45.8063;RBI=0.00429657;REFB=0;REVB=0.00253408;RO=0;SAF=8;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.10506e-05;OID=.;OPOS=36004075;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:6:8:0:0:6:8:0:0
chr14	36005659	.	T	C	47.19	PASS	AF=0.411765;AO=7;DP=17;FAO=7;FDP=17;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.0370716;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.77;QD=11.1041;RBI=0.0690477;REFB=-0.00156709;REVB=0.0582519;RO=10;SAF=3;SAR=4;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.258458;STB=0.655317;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=0.0155864;OID=.;OPOS=36005659;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:17:17:10:10:7:7:0.411765:4:3:7:3:4:3:7:3
chr14	36096362	.	G	A	322.6	PASS	AF=0.592593;AO=32;DP=53;FAO=32;FDP=54;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=23;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=-0.0115736;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.3287;QD=23.8965;RBI=0.0182744;REFB=0.00629584;REVB=-0.0141423;RO=21;SAF=9;SAR=23;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0849079;STB=0.540029;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=-0.00406545;OID=.;OPOS=36096362;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:54:21:22:32:32:0.592593:23:9:8:13:23:9:8:14
chr14	36153177	.	T	C	242.34	PASS	AF=0.430769;AO=28;DP=64;FAO=28;FDP=65;FR=.;FRO=37;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=0.000985702;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.368;QD=14.9131;RBI=0.0178484;REFB=-0.017478;REVB=-0.0178211;RO=36;SAF=15;SAR=13;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0630661;STB=0.528033;STBP=0.722;TYPE=snp;VARB=0.0214192;OID=.;OPOS=36153177;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:65:36:37:28:28:0.430769:13:15:17:19:13:15:18:19
chr14	36191030	.	A	G	306.16	PASS	AF=0.425;AO=34;DP=80;FAO=34;FDP=80;FR=.;FRO=46;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=26;FWDB=-0.00971322;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=298.274;QD=15.3079;RBI=0.0153608;REFB=-0.011962;REVB=0.0118999;RO=46;SAF=21;SAR=13;SRF=20;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186969;STB=0.605707;STBP=0.125;TYPE=snp;VARB=0.0148557;OID=.;OPOS=36191030;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:46:46:34:34:0.425:13:21:20:26:13:21:20:26
chr14	36194269	.	ATTTTTTTT	ATTTTTTT,ATTTTTTTC	43.73	PASS	AF=0.215686,0.0392157;AO=8,2;DP=51;FAO=11,2;FDP=51;FR=.;FRO=38;FSAF=4,1;FSAR=7,1;FSRF=22;FSRR=16;FWDB=0.282379,0.19751;FXX=0;HRUN=8,8;LEN=1,1;MLLD=9.46789,26.132;QD=3.42962;RBI=0.287924,0.198475;REFB=-0.0438746,-0.039655;REVB=0.0562326,-0.0195448;RO=33;SAF=2,1;SAR=6,1;SRF=18;SRR=15;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.360451,-0.0393263;STB=0.663941,0.574273;STBP=0.255,0.841;TYPE=del,snp;VARB=0.0529011,0.116704;OID=.,.;OPOS=36194270,36194277;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=ATTTTTTT,ATTTTTTTC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.215686,0.0392157:8,2:51:11,2:51:38:4,1:7,1:22:16:38:33:2,1:6,1:18:15
chr14	36400983	.	T	G	1026.41	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0411086;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=219.293;QD=59.5018;RBI=0.0438557;REFB=0;REVB=-0.0152776;RO=0;SAF=38;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.40398e-05;OID=.;OPOS=36400983;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:31:38:0:0:31:38:0:0
chr14	36789729	.	T	G	1374.87	PASS	AF=1;AO=84;DP=84;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0631066;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.163;QD=62.494;RBI=0.0634689;REFB=0;REVB=-0.0067719;RO=0;SAF=47;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.99643e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.54749e-05;OID=.;OPOS=36789729;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:88:0:0:84:88:1:37:47:0:0:37:51:0:0
chr14	36789775	.	A	T	753.48	PASS	AF=0.979592;AO=48;DP=49;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00227972;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.237;QD=61.5084;RBI=0.0202902;REFB=-0.0479047;REVB=-0.0201617;RO=1;SAF=27;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0218744;STB=0.511623;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=0.000304152;OID=.;OPOS=36789775;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:49:49:1:1:48:48:0.979592:21:27:0:1:21:27:0:1
chr14	36789795	.	G	A	323.24	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.084406;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.9397;QD=53.8727;RBI=0.0928252;REFB=0;REVB=-0.0386284;RO=0;SAF=14;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000794263;OID=.;OPOS=36789795;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:24:0:0:22:24:1:8:14:0:0:8:16:0:0
chr14	36840650	.	A	T	1498.42	PASS	AF=1;AO=94;DP=96;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00195387;FXX=0.0208312;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.383;QD=63.7627;RBI=0.0123919;REFB=0;REVB=0.0122369;RO=0;SAF=48;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.73299e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.93106e-05;OID=.;OPOS=36840650;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:96:94:0:0:94:94:1:46:48:0:0:46:48:0:0
chr14	37135752	.	C	T	348.64	PASS	AF=0.4625;AO=36;DP=79;FAO=37;FDP=80;FR=.;FRO=43;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=13;FSRR=30;FWDB=0.0363481;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.3124;QD=17.4322;RBI=0.0364149;REFB=-0.0184592;REVB=0.00220534;RO=42;SAF=14;SAR=22;SRF=13;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0820963;STB=0.558709;STBP=0.357;TYPE=snp;VARB=0.0211967;OID=.;OPOS=37135752;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:80:42:43:36:37:0.4625:22:14:13:29:22:15:13:30
chr14	37180685	.	T	C	405.64	PASS	AF=0.446809;AO=42;DP=94;FAO=42;FDP=94;FR=.;FRO=52;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=21;FSRR=31;FWDB=0.0190136;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.845;QD=17.2613;RBI=0.0190688;REFB=-0.012789;REVB=-0.00145001;RO=52;SAF=20;SAR=22;SRF=21;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0719152;STB=0.540246;STBP=0.489;TYPE=snp;VARB=0.0172923;OID=.;OPOS=37180685;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:52:52:42:42:0.446809:22:20:21:31:22:20:21:31
chr14	37203697	.	G	A	157.11	PASS	AF=0.323077;AO=21;DP=65;FAO=21;FDP=65;FR=.;FRO=44;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=-0.0432996;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.9685;QD=9.66858;RBI=0.0472658;REFB=-0.00650579;REVB=-0.0189527;RO=44;SAF=12;SAR=9;SRF=22;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0825111;STB=0.548626;STBP=0.598;TYPE=snp;VARB=0.0167791;OID=.;OPOS=37203697;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:44:44:21:21:0.323077:9:12:22:22:9:12:22:22
chr14	37641880	.	C	A	340.68	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.148915;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=74.9984;QD=54.508;RBI=0.162059;REFB=0;REVB=-0.063934;RO=0;SAF=4;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.661e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00179007;OID=.;OPOS=37641880;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:21:4:0:0:21:4:0:0
chr14	38061742	.	C	T	583.29	PASS	AF=1;AO=26;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0174645;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.984;QD=59.8242;RBI=0.067462;REFB=0;REVB=0.0651622;RO=0;SAF=16;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.71087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00052854;OID=.;OPOS=38061742;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:26:39:1:10:16:0:0:22:17:0:0
chr14	38218343	.	A	G	214.91	PASS	AF=0.431034;AO=25;DP=59;FAO=25;FDP=58;FR=.;FRO=33;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=0.0147363;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.96;QD=14.8216;RBI=0.0147525;REFB=-0.0061123;REVB=-0.000690799;RO=33;SAF=14;SAR=11;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0147307;STB=0.508373;STBP=0.935;TYPE=snp;VARB=0.00901681;OID=.;OPOS=38218343;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:58:33:33:25:25:0.431034:11:14:18:15:11:14:18:15
chr14	38218986	.	A	G	961.2	PASS	AF=0.413793;AO=106;DP=256;FAO=108;FDP=261;FR=.;FRO=153;FSAF=54;FSAR=54;FSRF=69;FSRR=84;FWDB=0.00574262;FXX=0.00381665;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.088;QD=14.7311;RBI=0.0450418;REFB=-0.0118237;REVB=0.0446742;RO=145;SAF=54;SAR=52;SRF=66;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0561772;STB=0.52873;STBP=0.425;TYPE=snp;VARB=0.0163251;OID=.;OPOS=38218986;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:256:261:145:153:106:108:0.413793:52:54:66:79:54:54:69:84
chr14	38266074	.	C	T	389.47	PASS	AF=0.47619;AO=40;DP=84;FAO=40;FDP=84;FR=.;FRO=44;FSAF=14;FSAR=26;FSRF=21;FSRR=23;FWDB=0.000142575;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.319;QD=18.5463;RBI=0.0485657;REFB=-0.00319242;REVB=-0.0485655;RO=44;SAF=14;SAR=26;SRF=21;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125494;STB=0.57014;STBP=0.216;TYPE=snp;VARB=0.00459483;OID=.;OPOS=38266074;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:44:44:40:40:0.47619:26:14:21:23:26:14:21:23
chr14	38277999	.	C	T	170.32	PASS	AF=0.45;AO=18;DP=40;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.0477113;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.4043;QD=17.0323;RBI=0.0529809;REFB=0.00776872;REVB=-0.023035;RO=22;SAF=5;SAR=13;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.23275;STB=0.633989;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=-0.0121684;OID=.;OPOS=38277999;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:22:22:18:18:0.45:13:5:11:11:13:5:11:11
chr14	38680648	.	A	G	161.5	PASS	AF=0.5;AO=17;DP=34;FAO=17;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=-0.0221498;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.6687;QD=18.9996;RBI=0.0243244;REFB=-0.0152171;REVB=-0.0100531;RO=17;SAF=14;SAR=3;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1556;STB=0.589358;STBP=0.401;TYPE=snp;VARB=0.0130072;OID=.;OPOS=38680648;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:17:17:17:17:0.5:3:14:12:5:3:14:12:5
chr14	38681113	.	G	A	321.26	PASS	AF=0.443038;AO=35;DP=79;FAO=35;FDP=79;FR=.;FRO=44;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=23;FSRR=21;FWDB=-0.0322357;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=241.928;QD=16.2662;RBI=0.0325021;REFB=-0.00608409;REVB=-0.00415312;RO=40;SAF=15;SAR=20;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0447744;STB=0.552697;STBP=0.436;TYPE=snp;VARB=0.00642844;OID=.;OPOS=38681113;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:40:44:35:35:0.443038:20:15:19:21:20:15:23:21
chr14	38681269	.	C	T	291.44	PASS	AF=0.463768;AO=32;DP=69;FAO=32;FDP=69;FR=.;FRO=37;FSAF=5;FSAR=27;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=-0.0754901;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.7866;QD=16.8953;RBI=0.076167;REFB=-0.0187;REVB=-0.010132;RO=36;SAF=5;SAR=27;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.387251;STB=0.716369;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.00949953;OID=.;OPOS=38681269;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:36:37:32:32:0.463768:27:5:17:19:27:5:17:20
chr14	38725285	.	G	A	75.57	PASS	AF=0.384615;AO=10;DP=26;FAO=10;FDP=26;FR=.;FRO=16;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.0329266;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.419;QD=11.6259;RBI=0.0386426;REFB=-0.0127818;REVB=0.0202261;RO=16;SAF=2;SAR=8;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.294572;STB=0.678847;STBP=0.2;TYPE=snp;VARB=0.0450777;OID=.;OPOS=38725285;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:26:26:16:16:10:10:0.384615:8:2:7:9:8:2:7:9
chr14	39556185	.	G	C	407.34	PASS	AF=0.408696;AO=47;DP=115;FAO=47;FDP=115;FR=.;FRO=68;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=28;FSRR=40;FWDB=0.0693154;FXX=0.00861995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.9403;QD=14.1684;RBI=0.0693499;REFB=0.000231633;REVB=0.00218788;RO=67;SAF=27;SAR=20;SRF=28;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162475;STB=0.595548;STBP=0.103;TYPE=snp;VARB=0.00042179;OID=.;OPOS=39556185;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:115:67:68:47:47:0.408696:20:27:28:39:20:27:28:40
chr14	39703324	.	A	G	1556.28	PASS	AF=0.990566;AO=105;DP=106;FAO=105;FDP=106;FR=.;FRO=1;FSAF=49;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00702787;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=134.982;QD=58.7275;RBI=0.0113789;REFB=-0.0715003;REVB=-0.00894921;RO=1;SAF=49;SAR=56;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00839944;STB=0.504424;STBP=0.491;TYPE=snp;VARB=-1.04271e-05;OID=.;OPOS=39703324;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:106:106:1:1:105:105:0.990566:56:49:0:1:56:49:0:1
chr14	39716201	.	A	G	324.77	PASS	AF=0.460526;AO=35;DP=76;FAO=35;FDP=76;FR=.;FRO=41;FSAF=9;FSAR=26;FSRF=24;FSRR=17;FWDB=0.00921016;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.322;QD=17.0933;RBI=0.00972908;REFB=0.0027805;REVB=0.00313497;RO=41;SAF=9;SAR=26;SRF=24;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.335436;STB=0.689043;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=-0.00214451;OID=.;OPOS=39716201;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:41:41:35:35:0.460526:26:9:24:17:26:9:24:17
chr14	39722023	.	G	C	108.61	PASS	AF=0.40625;AO=13;DP=32;FAO=13;FDP=32;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.0115346;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.7137;QD=13.5762;RBI=0.0206894;REFB=-0.0200841;REVB=-0.0171758;RO=18;SAF=11;SAR=2;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.421697;STB=0.741902;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.0243798;OID=.;OPOS=39722023;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:18:19:13:13:0.40625:2:11:9:9:2:11:10:9
chr14	39736680	.	T	C	464.1	PASS	AF=0.970588;AO=32;DP=33;FAO=33;FDP=34;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0220716;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.156;QD=54.5994;RBI=0.0254505;REFB=-0.0188499;REVB=0.0126716;RO=0;SAF=15;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.515142;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.000518908;OID=.;OPOS=39736680;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:33:34:0:1:32:33:0.970588:17:15:0:0:17:16:1:0
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chr14	39818028	.	A	G	1250.46	PASS	AF=0.987952;AO=82;DP=83;FAO=82;FDP=83;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0220723;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.611;QD=60.2632;RBI=0.0435717;REFB=-0.104025;REVB=0.0375674;RO=1;SAF=41;SAR=41;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0114108;STB=0.506023;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.000582615;OID=.;OPOS=39818028;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:83:83:1:1:82:82:0.987952:41:41:1:0:41:41:1:0
chr14	39819734	.	T	G	1495.95	PASS	AF=0.989583;AO=95;DP=96;FAO=95;FDP=96;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=48;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.016597;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=219.936;QD=62.3313;RBI=0.0221264;REFB=-0.119557;REVB=0.0146328;RO=0;SAF=47;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505262;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=-2.31471e-05;OID=.;OPOS=39819734;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:96:96:0:1:95:95:0.989583:48:47:0:0:48:47:1:0
chr14	39868646	.	C	A	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00549266;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.399;QD=52.6128;RBI=0.0077321;REFB=0;REVB=0.00544207;RO=0;SAF=8;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.92391e-05;OID=.;OPOS=39868646;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:14:8:0:0:14:8:0:0
chr14	42360633	.	T	C	296.72	PASS	AF=0.434211;AO=33;DP=76;FAO=33;FDP=76;FR=.;FRO=43;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=25;FWDB=-8.71223e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=298.647;QD=15.617;RBI=0.0252205;REFB=-0.00935305;REVB=0.0252203;RO=43;SAF=18;SAR=15;SRF=18;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126627;STB=0.571386;STBP=0.273;TYPE=snp;VARB=0.0103707;OID=.;OPOS=42360633;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:43:43:33:33:0.434211:15:18:18:25:15:18:18:25
chr14	42997963	.	A	G	740.43	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0504796;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.933;QD=56.9564;RBI=0.0506379;REFB=0;REVB=0.0040001;RO=0;SAF=29;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.84538e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000221262;OID=.;OPOS=42997963;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:23:29:0:0:23:29:0:0
chr14	42998026	.	T	C	850.61	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0270413;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.8344;QD=57.6685;RBI=0.0403152;REFB=0;REVB=0.0299012;RO=0;SAF=36;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000320307;OID=.;OPOS=42998026;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:23:36:0:0:23:36:0:0
chr14	44974966	.	G	A	1078.07	PASS	AF=1;AO=72;DP=73;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00582288;FXX=0.0136968;HRUN=4;LEN=1;MLLD=256.51;QD=59.8929;RBI=0.0229394;REFB=0;REVB=0.0221881;RO=0;SAF=43;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.16073e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.99931e-06;OID=.;OPOS=44974966;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:72:0:0:72:72:1:29:43:0:0:29:43:0:0
chr14	44975052	.	A	G	640.55	PASS	AF=0.976744;AO=42;DP=44;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0267054;FXX=0.0227221;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.8303;QD=59.5863;RBI=0.0362478;REFB=-0.153711;REVB=0.0245097;RO=1;SAF=23;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.024064;STB=0.512814;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.0237952;OID=.;OPOS=44975052;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:44:43:1:1:42:42:0.976744:19:23:0:1:19:23:0:1
chr14	44975606	.	G	T	1208.79	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0194172;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=62.3654;QD=61.2047;RBI=0.0770683;REFB=0;REVB=0.0745822;RO=0;SAF=41;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000448174;OID=.;OPOS=44975606;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:38:41:0:0:38:41:0:0
chr14	45393712	.	A	G	170.99	PASS	AF=0.439024;AO=18;DP=41;FAO=18;FDP=41;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=0.000118424;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.9655;QD=16.6817;RBI=0.00303261;REFB=-0.00320627;REVB=-0.0030303;RO=23;SAF=5;SAR=13;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173098;STB=0.599883;STBP=0.325;TYPE=snp;VARB=0.00521503;OID=.;OPOS=45393712;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:23:23:18:18:0.439024:13:5:10:13:13:5:10:13
chr14	45400736	.	C	T	83.9	PASS	AF=0.333333;AO=11;DP=33;FAO=11;FDP=33;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.0153018;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.413;QD=10.1695;RBI=0.0300585;REFB=-2.76324e-05;REVB=0.0258721;RO=22;SAF=7;SAR=4;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.202168;STB=0.621998;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.00212102;OID=.;OPOS=45400736;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:33:33:22:22:11:11:0.333333:4:7:10:12:4:7:10:12
chr14	45432870	.	G	C	46.75	PASS	AF=0.388889;AO=7;DP=18;FAO=7;FDP=18;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.0461688;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.6024;QD=10.3895;RBI=0.0523334;REFB=-0.0100663;REVB=-0.0246418;RO=10;SAF=5;SAR=2;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125396;STB=0.613693;STBP=0.419;TYPE=snp;VARB=0.0170236;OID=.;OPOS=45432870;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:18:18:10:11:7:7:0.388889:2:5:6:4:2:5:6:5
chr14	45433155	.	C	G	298.42	PASS	AF=0.492308;AO=32;DP=66;FAO=32;FDP=65;FR=.;FRO=33;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=0.0329;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.5325;QD=18.3646;RBI=0.041332;REFB=-0.00183314;REVB=-0.0250185;RO=31;SAF=13;SAR=19;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154398;STB=0.601087;STBP=0.134;TYPE=snp;VARB=0.00197541;OID=.;OPOS=45433155;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:65:31:33:32:32:0.492308:19:13:18:13:19:13:20:13
chr14	45515838	.	A	G	179.67	PASS	AF=0.413043;AO=19;DP=45;FAO=19;FDP=46;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=0.00779101;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=173.665;QD=15.6235;RBI=0.0143709;REFB=0.00473508;REVB=-0.0120757;RO=26;SAF=8;SAR=11;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0801459;STB=0.535925;STBP=0.743;TYPE=snp;VARB=-0.00981776;OID=.;OPOS=45515838;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:46:26:27:19:19:0.413043:11:8:13:13:11:8:13:14
chr14	45606287	.	C	T	505.12	PASS	AF=0.527473;AO=48;DP=90;FAO=48;FDP=91;FR=.;FRO=43;FSAF=27;FSAR=21;FSRF=26;FSRR=17;FWDB=-0.00711844;FXX=0.0108684;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.7051;QD=22.2028;RBI=0.0310234;REFB=-0.00538292;REVB=0.0301956;RO=42;SAF=27;SAR=21;SRF=25;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0282872;STB=0.520328;STBP=0.7;TYPE=snp;VARB=0.0100634;OID=.;OPOS=45606287;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:91:42:43:48:48:0.527473:21:27:25:17:21:27:26:17
chr14	47309496	.	G	T	1308.56	PASS	AF=1;AO=57;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=31;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0161595;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.457;QD=60.8635;RBI=0.0226614;REFB=0;REVB=-0.0158874;RO=0;SAF=24;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.25003e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000235337;OID=.;OPOS=47309496;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:86:0:0:57:86:1:33:24:0:0:55:31:0:0
chr14	47341131	.	C	G	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0152583;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.174;QD=42.1826;RBI=0.0486391;REFB=0;REVB=-0.0461838;RO=0;SAF=4;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00136971;OID=.;OPOS=47341131;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:7:4:0:0:7:4:0:0
chr14	47528470	.	T	C	895.36	PASS	AF=0.969231;AO=63;DP=65;FAO=63;FDP=65;FR=.;FRO=2;FSAF=28;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00309783;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=93.257;QD=55.099;RBI=0.0245429;REFB=-0.0809659;REVB=0.0243466;RO=1;SAF=28;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0165659;STB=0.50173;STBP=0.871;TYPE=snp;VARB=0.00170443;OID=.;OPOS=47528470;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:65:65:1:2:63:63:0.969231:35:28:1:0:35:28:1:1
chr14	47528551	.	T	A	1320.84	PASS	AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0262891;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.664;QD=62.1572;RBI=0.0315058;REFB=0;REVB=0.0173638;RO=0;SAF=37;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.57045e-05;OID=.;OPOS=47528551;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:48:37:0:0:48:37:0:0
chr14	50079250	.	TTA	T,TT	30.86	PASS	AF=0,0.444444;AO=3,8;DP=18;FAO=0,8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=0,7;FSAR=0,1;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=-0.189893,-0.219892;FXX=0;HRUN=6,6;LEN=2,1;MLLD=14.6659,9.10656;QD=6.85766;RBI=0.203408,0.224556;REFB=-0.0101046,-0.125776;REVB=-0.0729071,0.045525;RO=7;SAF=3,7;SAR=0,1;SRF=3;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.684179,0.45905;STB=0.5,0.728476;STBP=1,0.142;TYPE=del,del;VARB=0,0.11765;OID=.,.;OPOS=50079251,50079252;OREF=TA,A;OALT=-,-;OMAPALT=T,TT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,0.444444:3,8:18:0,8:18:10:0,7:0,1:6:4:29:7:3,7:0,1:3:4
chr14	50195679	.	A	G	2008.41	PASS	AF=1;AO=129;DP=129;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.013903;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.221;QD=62.2762;RBI=0.0166346;REFB=0;REVB=0.00913316;RO=0;SAF=76;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.19869e-05;OID=.;OPOS=50195679;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:129:129:0:0:129:129:1:53:76:0:0:53:76:0:0
chr14	50251369	.	A	G,T	816.45	PASS	AF=0.931034,0.0689655;AO=54,4;DP=58;FAO=54,4;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=26,4;FSAR=28,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000400274,0.0151397;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=171.908,142.022;QD=56.3065;RBI=0.0194284,0.0176039;REFB=0,0;REVB=-0.0194243,-0.00898265;RO=0;SAF=26,4;SAR=28,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.52846e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00045308,0.0811498;OID=.,.;OPOS=50251369,50251369;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:16:58:58:0:0:54,4:54,4:0.931034,0.0689655:28,0:26,4:0:0:28,0:26,4:0:0
chr14	50298962	.	T	A	748.41	PASS	AF=1;AO=52;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0277356;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.517;QD=56.4837;RBI=0.0287056;REFB=0;REVB=0.00739917;RO=1;SAF=17;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0268968;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.98908e-05;OID=.;OPOS=50298962;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:1:0:52:53:1:35:17:1:0:35:18:0:0
chr14	50320391	.	A	G	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00510466;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.3;QD=33.4285;RBI=0.0493458;REFB=0;REVB=-0.0490811;RO=0;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00126043;OID=.;OPOS=50320391;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:2:4:0:0:2:4:0:0
chr14	50477643	.	G	C	429.02	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0335584;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.667;QD=57.2021;RBI=0.0753286;REFB=0;REVB=-0.0674406;RO=0;SAF=17;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.63861e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000357304;OID=.;OPOS=50477643;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:13:17:0:0:13:17:0:0
chr14	50575408	.	C	T	85.27	PASS	AF=0.366667;AO=11;DP=30;FAO=11;FDP=30;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.0154061;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.3673;QD=11.3693;RBI=0.0341903;REFB=-0.0140594;REVB=-0.0305227;RO=19;SAF=4;SAR=7;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120689;STB=0.572193;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.027224;OID=.;OPOS=50575408;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:30:30:19:19:11:11:0.366667:7:4:9:10:7:4:9:10
chr14	50575411	.	A	G	44.05	PASS	AF=0.259259;AO=7;DP=27;FAO=7;FDP=27;FR=.;FRO=20;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.00280248;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=305.81;QD=6.52646;RBI=0.00796756;REFB=-0.00294969;REVB=-0.00745843;RO=20;SAF=3;SAR=4;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0826548;STB=0.553039;STBP=0.77;TYPE=snp;VARB=0.0102558;OID=.;OPOS=50575411;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:27:27:20:20:7:7:0.259259:4:3:10:10:4:3:10:10
chr14	50583083	.	G	T	137.06	PASS	AF=0.5;AO=15;DP=29;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.0205893;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.5721;QD=18.274;RBI=0.0278239;REFB=-0.0675006;REVB=-0.018715;RO=14;SAF=12;SAR=3;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.414277;STB=0.726942;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.0567917;OID=.;OPOS=50583083;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:30:14:15:15:15:0.5:3:12:5:9:3:12:6:9
chr14	50585248	.	C	T	678.37	PASS	AF=0.580357;AO=65;DP=112;FAO=65;FDP=112;FR=.;FRO=47;FSAF=41;FSAR=24;FSRF=27;FSRR=20;FWDB=0.0322322;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.36;QD=24.2275;RBI=0.033953;REFB=-0.017968;REVB=0.0106722;RO=47;SAF=41;SAR=24;SRF=27;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0458489;STB=0.525021;STBP=0.568;TYPE=snp;VARB=0.023605;OID=.;OPOS=50585248;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:112:47:47:65:65:0.580357:24:41:27:20:24:41:27:20
chr14	50623657	.	G	A	638.63	PASS	AF=0.520325;AO=63;DP=123;FAO=64;FDP=123;FR=.;FRO=59;FSAF=32;FSAR=32;FSRF=26;FSRR=33;FWDB=-0.0346484;FXX=0.00806387;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.538;QD=20.7686;RBI=0.0437435;REFB=-0.0240294;REVB=-0.0267017;RO=57;SAF=32;SAR=31;SRF=26;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0447363;STB=0.528446;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.0137687;OID=.;OPOS=50623657;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:123:123:57:59:63:64:0.520325:31:32:26:31:32:32:26:33
chr14	50623669	.	G	A	36.95	PASS	AF=0.0869565;AO=11;DP=115;FAO=10;FDP=115;FR=.;FRO=105;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=44;FSRR=61;FWDB=-0.111308;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.926;QD=1.28508;RBI=0.115002;REFB=-0.00191528;REVB=-0.028916;RO=103;SAF=8;SAR=3;SRF=43;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.352783;STB=0.744961;STBP=0.125;TYPE=snp;VARB=0.0424852;OID=.;OPOS=50623669;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:115:115:103:105:11:10:0.0869565:3:8:43:60:3:7:44:61
chr14	50623679	.	G	A	370.84	PASS	AF=0.417476;AO=43;DP=103;FAO=43;FDP=103;FR=.;FRO=60;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=27;FSRR=33;FWDB=-0.0235664;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.5802;QD=14.4017;RBI=0.0246043;REFB=-0.0376337;REVB=-0.00707071;RO=60;SAF=26;SAR=17;SRF=27;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160648;STB=0.590598;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=0.0748559;OID=.;OPOS=50623679;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:103:60:60:43:43:0.417476:17:26:27:33:17:26:27:33
chr14	50623683	.	A	G	350.29	PASS	AF=0.393939;AO=39;DP=98;FAO=39;FDP=99;FR=.;FRO=60;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=27;FSRR=33;FWDB=0.0334694;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.5346;QD=14.153;RBI=0.0359484;REFB=-0.037607;REVB=-0.0131181;RO=58;SAF=23;SAR=16;SRF=27;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131681;STB=0.584803;STBP=0.19;TYPE=snp;VARB=0.0814843;OID=.;OPOS=50623683;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:99:58:60:39:39:0.393939:16:23:27:31:16:23:27:33
chr14	50704331	.	C	T	137.9	PASS	AF=0.517241;AO=15;DP=29;FAO=15;FDP=29;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.0175409;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.5772;QD=19.0203;RBI=0.0223653;REFB=-0.0213191;REVB=-0.0138754;RO=14;SAF=10;SAR=5;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0874813;STB=0.549932;STBP=0.623;TYPE=snp;VARB=0.0142307;OID=.;OPOS=50704331;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:14:14:15:15:0.517241:5:10:8:6:5:10:8:6
chr14	50713679	.	T	A,G	399.78	PASS	AF=0.137931,0.862069;AO=4,25;DP=29;FAO=4,25;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=4,15;FSAR=0,10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0133098,0.0274089;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=220.772,233.746;QD=55.142;RBI=0.0137427,0.0277643;REFB=0,0;REVB=0.00342189,-0.00442791;RO=0;SAF=4,15;SAR=0,10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0726445,-0.0115893;OID=.,.;OPOS=50713679,50713679;OREF=T,T;OALT=A,G;OMAPALT=A,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:19:29:29:0:0:4,25:4,25:0.137931,0.862069:0,10:4,15:0:0:0,10:4,15:0:0
chr14	50769717	.	G	A	68.08	PASS	AF=0.473684;AO=9;DP=19;FAO=9;FDP=19;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=0.0927691;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.9026;QD=14.3336;RBI=0.093165;REFB=0.0347415;REVB=-0.00857932;RO=10;SAF=4;SAR=5;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.230887;STB=0.633877;STBP=0.36;TYPE=snp;VARB=-0.0318943;OID=.;OPOS=50769717;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:19:19:10:10:9:9:0.473684:5:4:2:8:5:4:2:8
chr14	50778816	.	A	C	208.18	PASS	AF=0.488372;AO=21;DP=41;FAO=21;FDP=43;FR=.;FRO=22;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.0206028;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=156.759;QD=19.3658;RBI=0.0206076;REFB=-0.0248267;REVB=0.000447795;RO=19;SAF=13;SAR=8;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125635;STB=0.585503;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.0338458;OID=.;OPOS=50778816;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:43:19:22:21:21:0.488372:8:13:9:10:8:13:10:12
chr14	50788213	.	C	T	209.73	PASS	AF=0.466667;AO=21;DP=45;FAO=21;FDP=45;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=-0.000367904;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=262.012;QD=18.6423;RBI=0.0499265;REFB=5.35718e-05;REVB=-0.0499252;RO=24;SAF=12;SAR=9;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0284033;STB=0.516114;STBP=0.848;TYPE=snp;VARB=-0.000112749;OID=.;OPOS=50788213;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:24:24:21:21:0.466667:9:12:13:11:9:12:13:11
chr14	50789476	.	G	A	112.31	PASS	AF=0.481481;AO=13;DP=27;FAO=13;FDP=27;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=-0.00956637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.459;QD=16.6378;RBI=0.0195339;REFB=-0.0195591;REVB=-0.0170311;RO=14;SAF=4;SAR=9;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0234553;STB=0.513493;STBP=0.891;TYPE=snp;VARB=0.0164978;OID=.;OPOS=50789476;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:14:14:13:13:0.481481:9:4:4:10:9:4:4:10
chr14	50798743	.	G	A	120.86	PASS	AF=0.358974;AO=14;DP=41;FAO=14;FDP=39;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=22;FWDB=0.0145822;FXX=0.0487686;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.35;QD=12.3961;RBI=0.0146141;REFB=-0.027369;REVB=0.000965525;RO=24;SAF=5;SAR=9;SRF=3;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.307351;STB=0.682614;STBP=0.189;TYPE=snp;VARB=0.0269107;OID=.;OPOS=50798743;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:39:24:25:14:14:0.358974:9:5:3:21:9:5:3:22
chr14	50799126	.	G	C	219.62	PASS	AF=0.454545;AO=25;DP=55;FAO=25;FDP=55;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=0.0243031;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.8243;QD=15.9726;RBI=0.0271666;REFB=-0.00735726;REVB=0.01214;RO=30;SAF=12;SAR=13;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115384;STB=0.565166;STBP=0.4;TYPE=snp;VARB=0.00983948;OID=.;OPOS=50799126;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:30:30:25:25:0.454545:13:12:18:12:13:12:18:12
chr14	50802727	.	A	C	247.34	PASS	AF=0.509804;AO=26;DP=51;FAO=26;FDP=51;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.00377552;FXX=0.0192271;HRUN=3;LEN=1;MLLD=94.9354;QD=19.3994;RBI=0.0265673;REFB=-0.00724497;REVB=0.0262977;RO=25;SAF=13;SAR=13;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0525473;STB=0.529389;STBP=0.707;TYPE=snp;VARB=0.0103931;OID=.;OPOS=50802727;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:25:25:26:26:0.509804:13:13:14:11:13:13:14:11
chr14	50802840	.	A	G	51.88	PASS	AF=0.235294;AO=8;DP=34;FAO=8;FDP=34;FR=.;FRO=26;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=21;FWDB=-0.010893;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.6908;QD=6.10311;RBI=0.0218042;REFB=0.00736676;REVB=0.0188882;RO=26;SAF=3;SAR=5;SRF=5;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.259371;STB=0.660683;STBP=0.384;TYPE=snp;VARB=-0.0298033;OID=.;OPOS=50802840;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:51:34:34:26:26:8:8:0.235294:5:3:5:21:5:3:5:21
chr14	50824839	.	G	A	280.14	PASS	AF=0.508475;AO=30;DP=59;FAO=30;FDP=59;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=24;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=-0.0361833;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.9283;QD=18.9927;RBI=0.0382922;REFB=-0.0299035;REVB=0.0125325;RO=29;SAF=6;SAR=24;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.24309;STB=0.637067;STBP=0.06;TYPE=snp;VARB=0.0182827;OID=.;OPOS=50824839;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:29:29:30:30:0.508475:24:6:12:17:24:6:12:17
chr14	50844367	.	G	GA	150.62	PASS	AF=0.4375;AO=21;DP=81;FAO=35;FDP=80;FR=.;FRO=45;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=25;FSRR=20;FWDB=0.101064;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=17.3448;QD=7.53109;RBI=0.160262;REFB=-0.0968335;REVB=0.124378;RO=58;SAF=19;SAR=2;SRF=24;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.634558;STB=0.5072;STBP=0.912;TYPE=ins;VARB=0.139447;OID=.;OPOS=50844368;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.4375:21:81:35:80:45:19:16:25:20:99:58:19:2:24:34
chr14	50935150	.	A	G	766.46	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0216038;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=217.66;QD=63.8719;RBI=0.0259061;REFB=0;REVB=0.0142969;RO=0;SAF=24;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.52747e-05;OID=.;OPOS=50935150;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:24:24:0:0:24:24:0:0
chr14	51057727	.	G	A	868.27	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0247015;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.565;QD=57.8847;RBI=0.0373527;REFB=0;REVB=0.0280189;RO=0;SAF=37;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.03034e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000157861;OID=.;OPOS=51057727;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:23:37:0:0:23:37:0:0
chr14	51202311	.	G	C	483.35	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.010721;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.187;QD=58.5874;RBI=0.0109179;REFB=0;REVB=0.0020644;RO=0;SAF=16;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.60901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.30616e-05;OID=.;OPOS=51202311;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:17:16:0:0:17:16:0:0
chr14	51223789	.	C	T	527.2	PASS	AF=0.972973;AO=35;DP=36;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0145436;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=219.153;QD=56.9944;RBI=0.0165966;REFB=-0.188709;REVB=0.00799565;RO=1;SAF=20;SAR=15;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0301623;STB=0.515143;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.000787407;OID=.;OPOS=51223789;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:36:37:1:1:35:36:0.972973:15:20:0:1:16:20:0:1
chr14	51224374	.	T	G	613.33	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00750114;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.82;QD=61.3331;RBI=0.0555536;REFB=0;REVB=0.0550448;RO=0;SAF=17;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.4817e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00031488;OID=.;OPOS=51224374;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:23:17:0:0:23:17:0:0
chr14	51224658	.	T	A	223.19	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00990026;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.318;QD=49.5979;RBI=0.0301791;REFB=0;REVB=0.028509;RO=0;SAF=6;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000177153;OID=.;OPOS=51224658;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:12:6:0:0:12:6:0:0
chr14	51225132	.	G	T	785.21	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0304115;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=254.052;QD=57.1062;RBI=0.0318294;REFB=0;REVB=0.00939419;RO=0;SAF=22;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.14049e-05;OID=.;OPOS=51225132;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:33:22:0:0:33:22:0:0
chr14	51237701	.	A	G	1158.59	PASS	AF=0.987179;AO=75;DP=76;FAO=77;FDP=78;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0870257;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.58;QD=59.4148;RBI=0.087562;REFB=-0.0348406;REVB=0.00967576;RO=1;SAF=32;SAR=43;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0108773;STB=0.505746;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.000741619;OID=.;OPOS=51237701;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:76:78:1:1:75:77:0.987179:43:32:0:1:43:34:0:1
chr14	51239067	.	C	G	728.67	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0122753;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.0669;QD=57.1509;RBI=0.0127586;REFB=0;REVB=-0.00347805;RO=0;SAF=27;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000104283;OID=.;OPOS=51239067;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:24:27:0:0:24:27:0:0
chr14	51370852	.	C	G	208.32	PASS	AF=0.4375;AO=21;DP=49;FAO=21;FDP=48;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=9;FWDB=-0.00367335;FXX=0.020404;HRUN=2;LEN=1;MLLD=235.417;QD=17.3603;RBI=0.0107734;REFB=-0.0129767;REVB=-0.0101278;RO=27;SAF=10;SAR=11;SRF=18;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187016;STB=0.606202;STBP=0.214;TYPE=snp;VARB=0.0182294;OID=.;OPOS=51370852;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:48:27:27:21:21:0.4375:11:10:18:9:11:10:18:9
chr14	51371081	.	A	C	258.83	PASS	AF=0.348315;AO=31;DP=90;FAO=31;FDP=89;FR=.;FRO=58;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=32;FSRR=26;FWDB=-0.00244168;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.1355;QD=11.6328;RBI=0.0159986;REFB=-0.00380717;REVB=0.0158112;RO=58;SAF=11;SAR=20;SRF=32;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.223793;STB=0.629491;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=0.00524585;OID=.;OPOS=51371081;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:89:58:58:31:31:0.348315:20:11:32:26:20:11:32:26
chr14	51376678	.	A	G	397.71	PASS	AF=0.465909;AO=41;DP=88;FAO=41;FDP=88;FR=.;FRO=47;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=25;FWDB=0.0390312;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.881;QD=18.0778;RBI=0.0392077;REFB=-0.00733571;REVB=0.00371598;RO=46;SAF=24;SAR=17;SRF=21;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122728;STB=0.563097;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=0.00790397;OID=.;OPOS=51376678;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:46:47:41:41:0.465909:17:24:21:25:17:24:22:25
chr14	51378590	.	CT	C	319.12	PASS	AF=0.548387;AO=42;DP=90;FAO=51;FDP=93;FR=.;FRO=42;FSAF=35;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=22;FWDB=-0.00109008;FXX=0.0106372;HRUN=3;LEN=1;MLLD=18.8281;QD=13.7257;RBI=0.0196898;REFB=0.00629566;REVB=0.0196596;RO=38;SAF=35;SAR=7;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.368421;STB=0.601768;STBP=0.04;TYPE=del;VARB=0.00798008;OID=.;OPOS=51378591;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.548387:42:90:51:93:42:35:16:20:22:99:38:35:7:19:19
chr14	51446216	.	T	G	1524.37	PASS	AF=0.981132;AO=104;DP=106;FAO=104;FDP=106;FR=.;FRO=2;FSAF=44;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0080845;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=123.251;QD=57.5234;RBI=0.0134272;REFB=-0.0932689;REVB=-0.0107206;RO=2;SAF=44;SAR=60;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0155537;STB=0.508195;STBP=0.239;TYPE=snp;VARB=0.000317492;OID=.;OPOS=51446216;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:106:106:2:2:104:104:0.981132:60:44:0:2:60:44:0:2
chr14	51710861	.	A	G	553.67	PASS	AF=0.547368;AO=51;DP=95;FAO=52;FDP=95;FR=.;FRO=43;FSAF=24;FSAR=28;FSRF=18;FSRR=25;FWDB=-0.00756541;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.027;QD=23.3124;RBI=0.0102553;REFB=0.0149377;REVB=0.00692362;RO=43;SAF=23;SAR=28;SRF=18;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0272864;STB=0.5196;STBP=0.697;TYPE=snp;VARB=-0.0100649;OID=.;OPOS=51710861;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:43:43:51:52:0.547368:28:23:18:25:28:24:18:25
chr14	51716188	.	T	G	321.59	PASS	AF=0.548387;AO=33;DP=61;FAO=34;FDP=62;FR=.;FRO=28;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.0278584;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.362;QD=20.7477;RBI=0.0282876;REFB=-0.00330745;REVB=-0.00490851;RO=28;SAF=14;SAR=19;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0929786;STB=0.542832;STBP=0.479;TYPE=snp;VARB=0.00241025;OID=.;OPOS=51716188;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:62:28:28:33:34:0.548387:19:14:15:13:19:15:15:13
chr14	51716467	.	G	A	164.13	PASS	AF=0.372549;AO=19;DP=51;FAO=19;FDP=51;FR=.;FRO=32;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=-0.065245;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.899;QD=12.8731;RBI=0.0652636;REFB=-0.0022182;REVB=-0.00155927;RO=32;SAF=9;SAR=10;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0283973;STB=0.516511;STBP=0.818;TYPE=snp;VARB=0.00331369;OID=.;OPOS=51716467;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:32:32:19:19:0.372549:10:9:16:16:10:9:16:16
chr14	51722690	.	T	C	466.43	PASS	AF=0.542169;AO=45;DP=83;FAO=45;FDP=83;FR=.;FRO=38;FSAF=25;FSAR=20;FSRF=22;FSRR=16;FWDB=0.0342139;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.5286;QD=22.4787;RBI=0.037111;REFB=-0.0209002;REVB=0.0143747;RO=38;SAF=25;SAR=20;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0197356;STB=0.510865;STBP=0.866;TYPE=snp;VARB=0.0184388;OID=.;OPOS=51722690;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:38:38:45:45:0.542169:20:25:22:16:20:25:22:16
chr14	52182081	.	T	A	801.32	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0110193;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.201;QD=57.2369;RBI=0.0176145;REFB=0;REVB=0.0137421;RO=0;SAF=28;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.66385e-05;OID=.;OPOS=52182081;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:28:28:0:0:28:28:0:0
chr14	52186972	.	A	G	1098.65	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0183571;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.855;QD=60.2;RBI=0.021103;REFB=0;REVB=-0.0104094;RO=0;SAF=34;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.59116e-05;OID=.;OPOS=52186972;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:39:34:0:0:39:34:0:0
chr14	52195290	.	G	A	320.29	PASS	AF=0.925926;AO=24;DP=27;FAO=25;FDP=27;FR=.;FRO=2;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00787029;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=223.554;QD=47.4506;RBI=0.0189807;REFB=-0.0664222;REVB=0.0172721;RO=2;SAF=10;SAR=14;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0617183;STB=0.531225;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.00429647;OID=.;OPOS=52195290;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:27:27:2:2:24:25:0.925926:14:10:0:2:15:10:0:2
chr14	52195320	.	A	G	447.02	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.071112;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.087;QD=57.6806;RBI=0.0724624;REFB=0;REVB=0.0139238;RO=0;SAF=14;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000480491;OID=.;OPOS=52195320;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:17:14:0:0:17:14:0:0
chr14	52418655	.	G	A	154.1	PASS	AF=0.395349;AO=17;DP=43;FAO=17;FDP=43;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.0545161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.008;QD=14.3348;RBI=0.0548295;REFB=-0.0143319;REVB=-0.00585411;RO=25;SAF=7;SAR=10;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112032;STB=0.553953;STBP=0.573;TYPE=snp;VARB=0.0194837;OID=.;OPOS=52418655;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:25:26:17:17:0.395349:10:7:13:12:10:7:13:13
chr14	52478315	.	A	G	198.87	PASS	AF=0.40678;AO=23;DP=58;FAO=24;FDP=59;FR=.;FRO=35;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=23;FSRR=12;FWDB=0.0260886;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.737;QD=13.483;RBI=0.026093;REFB=-0.00661799;REVB=-0.000477144;RO=35;SAF=10;SAR=13;SRF=23;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.230433;STB=0.616364;STBP=0.161;TYPE=snp;VARB=0.00706998;OID=.;OPOS=52478315;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:59:35:35:23:24:0.40678:13:10:23:12:13:11:23:12
chr14	52481917	.	C	T	261.65	PASS	AF=0.422535;AO=29;DP=71;FAO=30;FDP=71;FR=.;FRO=41;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=30;FWDB=0.0109564;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=204.683;QD=14.7407;RBI=0.0113589;REFB=-0.000797551;REVB=-0.00299704;RO=41;SAF=15;SAR=14;SRF=11;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.256426;STB=0.63372;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=0.000680488;OID=.;OPOS=52481917;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:41:41:29:30:0.422535:14:15:11:30:15:15:11:30
chr14	52496387	.	C	A	1080.9	PASS	AF=0.986486;AO=73;DP=74;FAO=73;FDP=74;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00829003;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=315.707;QD=58.4269;RBI=0.0166106;REFB=-0.0378879;REVB=0.014394;RO=1;SAF=24;SAR=49;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.009557;STB=0.505049;STBP=0.587;TYPE=snp;VARB=7.04518e-05;OID=.;OPOS=52496387;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:74:74:1:1:73:73:0.986486:49:24:0:1:49:24:0:1
chr14	52496407	.	C	T	820.14	PASS	AF=0.983051;AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0103151;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.1779;QD=55.6026;RBI=0.0173325;REFB=-0.0584185;REVB=0.0139289;RO=1;SAF=19;SAR=39;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0241769;STB=0.512816;STBP=0.255;TYPE=snp;VARB=0.00245017;OID=.;OPOS=52496407;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:59:59:1:1:58:58:0.983051:39:19:1:0:39:19:1:0
chr14	52505517	.	G	A	170.69	PASS	AF=0.343284;AO=21;DP=65;FAO=23;FDP=67;FR=.;FRO=44;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=27;FSRR=17;FWDB=-0.00693394;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.15;QD=10.1905;RBI=0.00723073;REFB=-0.00369581;REVB=-0.00205036;RO=44;SAF=11;SAR=10;SRF=27;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104317;STB=0.588312;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=0.00324742;OID=.;OPOS=52505517;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:67:44:44:21:23:0.343284:10:11:27:17:12:11:27:17
chr14	52507429	.	A	G	2593.89	PASS	AF=1;AO=166;DP=166;FAO=168;FDP=168;FR=.;FRO=0;FSAF=89;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0285618;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.637;QD=61.7593;RBI=0.0379205;REFB=0;REVB=-0.0249437;RO=0;SAF=88;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.6902e-06;OID=.;OPOS=52507429;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:166:168:0:0:166:168:1:78:88:0:0:79:89:0:0
chr14	52509501	.	T	C	442.97	PASS	AF=0.454545;AO=45;DP=99;FAO=45;FDP=99;FR=.;FRO=54;FSAF=31;FSAR=14;FSRF=30;FSRR=24;FWDB=-0.0275692;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.3017;QD=17.8979;RBI=0.0494791;REFB=-0.0144573;REVB=-0.0410867;RO=54;SAF=31;SAR=14;SRF=30;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14206;STB=0.579688;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=0.0165446;OID=.;OPOS=52509501;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:54:54:45:45:0.454545:14:31:30:24:14:31:30:24
chr14	52520368	.	C	T	180.41	PASS	AF=0.404255;AO=19;DP=48;FAO=19;FDP=47;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=0.0199761;FXX=0.020829;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.116;QD=15.3538;RBI=0.0327195;REFB=-0.0206808;REVB=0.0259137;RO=28;SAF=7;SAR=12;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102745;STB=0.559377;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.0289378;OID=.;OPOS=52520368;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:47:28:28:19:19:0.404255:12:7:13:15:12:7:13:15
chr14	52520853	.	A	G	1446.71	PASS	AF=0.989362;AO=90;DP=92;FAO=93;FDP=94;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=47;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0266418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.578;QD=61.5622;RBI=0.0268362;REFB=-0.0672541;REVB=0.00322437;RO=1;SAF=43;SAR=47;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0108952;STB=0.505375;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=-6.42931e-06;OID=.;OPOS=52520853;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:92:94:1:1:90:93:0.989362:47:43:1:0:47:46:1:0
chr14	52535648	.	G	T	673.83	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00194676;FXX=0.0227221;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.47;QD=62.6816;RBI=0.00348563;REFB=0;REVB=0.00289132;RO=0;SAF=20;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.66134e-05;OID=.;OPOS=52535648;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:23:20:0:0:23:20:0:0
chr14	52536512	.	T	C	868.1	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0128469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.1569;QD=57.8732;RBI=0.0267739;REFB=0;REVB=0.0234904;RO=0;SAF=33;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.7886e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.74361e-05;OID=.;OPOS=52536512;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:27:33:0:0:27:33:0:0
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chr14	52906081	.	T	G	263.53	PASS	AF=0.483333;AO=29;DP=60;FAO=29;FDP=60;FR=.;FRO=31;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=21;FSRR=10;FWDB=-0.0109085;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.879;QD=17.5685;RBI=0.0109709;REFB=-0.00643265;REVB=-0.00116811;RO=31;SAF=8;SAR=21;SRF=21;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.374961;STB=0.710471;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.00521008;OID=.;OPOS=52906081;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:31:31:29:29:0.483333:21:8:21:10:21:8:21:10
chr14	52907353	.	C	T	453.64	PASS	AF=0.55;AO=43;DP=80;FAO=44;FDP=80;FR=.;FRO=36;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=10;FSRR=26;FWDB=-0.024916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.646;QD=22.6821;RBI=0.031558;REFB=-0.00145631;REVB=-0.0193675;RO=36;SAF=18;SAR=25;SRF=10;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122677;STB=0.562473;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=0.000927726;OID=.;OPOS=52907353;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:36:36:43:44:0.55:25:18:10:26:26:18:10:26
chr14	52937255	.	C	T	215.46	PASS	AF=0.393939;AO=26;DP=66;FAO=26;FDP=66;FR=.;FRO=40;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=25;FSRR=15;FWDB=0.0146354;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.188;QD=13.0584;RBI=0.0146403;REFB=-0.0034047;REVB=0.000376678;RO=39;SAF=13;SAR=13;SRF=25;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148394;STB=0.575701;STBP=0.321;TYPE=snp;VARB=0.00550161;OID=.;OPOS=52937255;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:39:40:26:26:0.393939:13:13:25:14:13:13:25:15
chr14	52978071	.	GA	G	32.86	PASS	AF=0.315789;AO=12;DP=40;FAO=12;FDP=38;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=18;FWDB=-0.144268;FXX=0.0499875;HRUN=6;LEN=1;MLLD=13.8967;QD=3.45891;RBI=0.184689;REFB=-0.0415436;REVB=0.115312;RO=24;SAF=10;SAR=2;SRF=7;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0.473684;SSSB=0.583218;STB=0.8469;STBP=0.004;TYPE=del;VARB=0.0520681;OID=.;OPOS=52978072;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.315789:12:40:12:38:26:10:2:8:18:32:24:10:2:7:17
chr14	53098902	.	G	A	1540.6	PASS	AF=1;AO=103;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0165846;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.344;QD=59.829;RBI=0.0179393;REFB=0;REVB=-0.00683869;RO=0;SAF=59;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.03381e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.00627e-05;OID=.;OPOS=53098902;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:103:103:0:0:103:103:1:44:59:0:0:44:59:0:0
chr14	53130507	.	T	C	658.18	PASS	AF=0.977273;AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0190672;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.916;QD=59.8345;RBI=0.0947403;REFB=-0.0826336;REVB=0.0928017;RO=1;SAF=16;SAR=27;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0170778;STB=0.509087;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.000850135;OID=.;OPOS=53130507;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:44:44:1:1:43:43:0.977273:27:16:0:1:27:16:0:1
chr14	53145132	.	C	T	247.15	PASS	AF=0.490909;AO=26;DP=54;FAO=27;FDP=55;FR=.;FRO=28;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.0117289;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.087;QD=17.9743;RBI=0.0167277;REFB=-0.0120852;REVB=0.0119269;RO=28;SAF=13;SAR=13;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509427;STBP=0.853;TYPE=snp;VARB=0.0119063;OID=.;OPOS=53145132;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:55:28:28:26:27:0.490909:13:13:14:14:14:13:14:14
chr14	53244637	.	A	G	131.99	PASS	AF=0.416667;AO=15;DP=36;FAO=15;FDP=36;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.00539849;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.306;QD=14.6656;RBI=0.00592206;REFB=-0.00517424;REVB=0.00243456;RO=21;SAF=7;SAR=8;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.057395;STB=0.533289;STBP=0.779;TYPE=snp;VARB=0.00812957;OID=.;OPOS=53244637;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:21:21:15:15:0.416667:8:7:11:10:8:7:11:10
chr14	53331278	.	C	T	429.02	PASS	AF=0.488636;AO=42;DP=87;FAO=43;FDP=88;FR=.;FRO=45;FSAF=27;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=31;FWDB=0.0220452;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.831;QD=19.5007;RBI=0.0237772;REFB=-0.00556036;REVB=-0.0089087;RO=44;SAF=27;SAR=15;SRF=14;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.29521;STB=0.659148;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.00432504;OID=.;OPOS=53331278;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:88:44:45:42:43:0.488636:15:27:14:30:16:27:14:31
chr14	53345378	.	G	A	429.01	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0557688;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.503;QD=57.2016;RBI=0.0571319;REFB=0;REVB=0.0124054;RO=0;SAF=12;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000675374;OID=.;OPOS=53345378;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:18:12:0:0:18:12:0:0
chr14	53529669	.	A	T	1098.33	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0209747;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.254;QD=60.1825;RBI=0.0211265;REFB=0;REVB=0.00252762;RO=0;SAF=33;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.93225e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.80985e-05;OID=.;OPOS=53529669;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:40:33:0:0:40:33:0:0
chr14	53619463	.	G	A	411.11	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0246586;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=138.276;QD=56.7053;RBI=0.0846477;REFB=0;REVB=0.0809764;RO=0;SAF=21;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.4007e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000943737;OID=.;OPOS=53619463;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:8:21:0:0:8:21:0:0
chr14	53619480	.	T	C,TGCCGCC	482.51	PASS	AF=0.217391,0.608696;AO=10,26;DP=46;FAO=10,28;FDP=46;FR=.;FRO=8;FSAF=10,21;FSAR=0,7;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=-0.0236811,-0.0201008;FXX=0.0212721;HRUN=1,1;LEN=1,6;MLLD=102.998,144.98;QD=41.9577;RBI=0.0272222,0.0398251;REFB=-0.02309,-0.0765116;REVB=0.0134259,0.0343802;RO=7;SAF=10,20;SAR=0,6;SRF=6;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.77756,-0.0498153;STB=0.998073,0.538435;STBP=0.215,0.49;TYPE=snp,ins;VARB=-0.000530896,0.00233607;OID=.,.;OPOS=53619480,53619481;OREF=T,-;OALT=C,GCCGCC;OMAPALT=C,TGCCGCC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:77:46:46:7:8:10,26:10,28:0.217391,0.608696:0,6:10,20:6:1:0,7:10,21:7:1
chr14	53619500	.	C	G	231.42	PASS	AF=0.373333;AO=28;DP=75;FAO=28;FDP=75;FR=.;FRO=47;FSAF=21;FSAR=7;FSRF=27;FSRR=20;FWDB=0.00579191;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=126.12;QD=12.3424;RBI=0.0216879;REFB=-0.00263241;REVB=-0.0209002;RO=47;SAF=21;SAR=7;SRF=27;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.220272;STB=0.627809;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.00322384;OID=.;OPOS=53619500;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:47:47:28:28:0.373333:7:21:27:20:7:21:27:20
chr14	53619544	.	G	A	1394.24	PASS	AF=0.960784;AO=96;DP=100;FAO=98;FDP=102;FR=.;FRO=4;FSAF=53;FSAR=45;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0495884;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.656;QD=54.6761;RBI=0.0551999;REFB=-0.122737;REVB=0.0242491;RO=2;SAF=51;SAR=45;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0182322;STB=0.518178;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.00159959;OID=.;OPOS=53619544;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:100:102:2:4:96:98:0.960784:45:51:2:0:45:53:4:0
chr14	54417522	.	A	G	173.08	PASS	AF=0.486486;AO=18;DP=37;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=-0.102459;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.467;QD=18.7111;RBI=0.102904;REFB=0.00817118;REVB=0.00956464;RO=19;SAF=7;SAR=11;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0708919;STB=0.540149;STBP=0.677;TYPE=snp;VARB=-0.0106166;OID=.;OPOS=54417522;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:19:19:18:18:0.486486:11:7:6:13:11:7:6:13
chr14	54875276	.	C	A	773.63	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00117992;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.353;QD=63.1535;RBI=0.0190451;REFB=0;REVB=-0.0190085;RO=0;SAF=13;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.61818e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000276758;OID=.;OPOS=54875276;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:49:0:0:48:49:1:35:13:0:0:36:13:0:0
chr14	54875514	.	A	G	375.67	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0571652;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.2353;QD=55.655;RBI=0.0722109;REFB=0;REVB=0.0441198;RO=0;SAF=18;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00213856;OID=.;OPOS=54875514;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:9:18:0:0:9:18:0:0
chr14	55255673	.	C	T	2007.57	PASS	AF=1;AO=127;DP=127;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0777356;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.195;QD=62.2504;RBI=0.0861671;REFB=0;REVB=0.0371746;RO=0;SAF=65;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.21802e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000143577;OID=.;OPOS=55255673;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:127:129:0:0:127:129:1:62:65:0:0:63:66:0:0
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chr14	55511368	.	C	T	46.02	PASS	AF=0.0984848;AO=11;DP=136;FAO=13;FDP=132;FR=.;FRO=119;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=57;FSRR=62;FWDB=-0.00654041;FXX=0.0294096;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.1279;QD=1.39449;RBI=0.0366391;REFB=-0.0120213;REVB=0.0360506;RO=124;SAF=7;SAR=4;SRF=60;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171444;STB=0.553406;STBP=0.727;TYPE=snp;VARB=0.0462188;OID=.;OPOS=55511368;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:136:132:124:119:11:13:0.0984848:4:7:60:64:6:7:57:62
chr14	55512273	.	C	A	36.38	PASS	AF=0.285714;AO=6;DP=21;FAO=6;FDP=21;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=-0.0546694;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.2913;QD=6.92892;RBI=0.0583061;REFB=0.011564;REVB=-0.0202696;RO=15;SAF=4;SAR=2;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0800118;STB=0.551548;STBP=0.765;TYPE=snp;VARB=-0.0333757;OID=.;OPOS=55512273;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:21:21:15:15:6:6:0.285714:2:4:9:6:2:4:9:6
chr14	55513848	.	G	C	127.8	PASS	AF=0.518519;AO=14;DP=28;FAO=14;FDP=27;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.0307291;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.818;QD=18.9333;RBI=0.0813231;REFB=-0.01387;REVB=0.0752939;RO=13;SAF=4;SAR=10;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.290292;STB=0.66642;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=0.0237194;OID=.;OPOS=55513848;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:27:13:13:14:14:0.518519:10:4:8:5:10:4:8:5
chr14	55535064	.	G	C	325.79	PASS	AF=0.603774;AO=32;DP=53;FAO=32;FDP=53;FR=.;FRO=21;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=-0.00361306;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=256.46;QD=24.5876;RBI=0.011501;REFB=0.00788088;REVB=-0.0109187;RO=21;SAF=16;SAR=16;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0514611;STB=0.528284;STBP=0.633;TYPE=snp;VARB=-0.00560807;OID=.;OPOS=55535064;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:21:21:32:32:0.603774:16:16:12:9:16:16:12:9
chr14	55604935	.	C	A	467.72	PASS	AF=0.489362;AO=46;DP=95;FAO=46;FDP=94;FR=.;FRO=48;FSAF=18;FSAR=28;FSRF=17;FSRR=31;FWDB=-0.0351596;FXX=0.0105252;HRUN=3;LEN=1;MLLD=173.099;QD=19.903;RBI=0.0360883;REFB=-0.0144464;REVB=0.00813478;RO=48;SAF=18;SAR=28;SRF=17;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0361975;STB=0.52007;STBP=0.717;TYPE=snp;VARB=0.0146004;OID=.;OPOS=55604935;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:94:48:48:46:46:0.489362:28:18:17:31:28:18:17:31
chr14	55605036	.	A	C	400.53	PASS	AF=0.494118;AO=37;DP=81;FAO=42;FDP=85;FR=.;FRO=43;FSAF=16;FSAR=26;FSRF=19;FSRR=24;FWDB=0.0261302;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.05;QD=18.8484;RBI=0.0323184;REFB=-0.0221928;REVB=-0.0190183;RO=43;SAF=11;SAR=26;SRF=19;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153675;STB=0.532148;STBP=0.607;TYPE=snp;VARB=0.0260978;OID=.;OPOS=55605036;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:85:43:43:37:42:0.494118:26:11:19:24:26:16:19:24
chr14	55619311	.	A	G	30.93	PASS	AF=0.277778;AO=5;DP=18;FAO=5;FDP=18;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.0706162;FXX=0.0526039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.4014;QD=6.87243;RBI=0.0740918;REFB=-0.0259631;REVB=0.0224265;RO=13;SAF=4;SAR=1;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.247161;STB=0.665926;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.0929369;OID=.;OPOS=55619311;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:18:18:13:13:5:5:0.277778:1:4:8:5:1:4:8:5
chr14	55817708	.	T	C	89.54	PASS	AF=0.478261;AO=11;DP=23;FAO=11;FDP=23;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.00435097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.866;QD=15.5715;RBI=0.00436423;REFB=0.022057;REVB=-0.000339835;RO=12;SAF=6;SAR=5;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0408741;STB=0.523766;STBP=0.781;TYPE=snp;VARB=-0.0221419;OID=.;OPOS=55817708;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:23:23:12:12:11:11:0.478261:5:6:6:6:5:6:6:6
chr14	55818517	.	T	A	221.61	PASS	AF=0.419355;AO=25;DP=61;FAO=26;FDP=62;FR=.;FRO=36;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=-0.02815;FXX=0.0158705;HRUN=4;LEN=1;MLLD=55.5418;QD=14.2972;RBI=0.0434026;REFB=0.017023;REVB=0.0330357;RO=36;SAF=15;SAR=10;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161102;STB=0.576864;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=-0.00757333;OID=.;OPOS=55818517;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:62:36:36:25:26:0.419355:10:15:16:20:11:15:16:20
chr14	55818706	.	T	C	210.03	PASS	AF=0.444444;AO=24;DP=55;FAO=24;FDP=54;FR=.;FRO=30;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=-0.00774335;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.45;QD=15.5575;RBI=0.00838027;REFB=-0.00709346;REVB=-0.0032046;RO=30;SAF=9;SAR=15;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00872152;STB=0.504946;STBP=0.965;TYPE=snp;VARB=0.00857564;OID=.;OPOS=55818706;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:54:30:30:24:24:0.444444:15:9:11:19:15:9:11:19
chr14	55834828	.	T	A,TAAA	146.07	PASS	AF=0.0322581,0.290323;AO=5,13;DP=71;FAO=2,18;FDP=62;FR=.;FRO=42;FSAF=2,10;FSAR=0,8;FSRF=20;FSRR=22;FWDB=0.0105808,-0.00426142;FXX=0.0605969;HRUN=1,3;LEN=1,3;MLLD=180.578,43.714;QD=9.42357;RBI=0.0141289,0.0230034;REFB=0.00191156,-0.0165919;REVB=-0.00936333,-0.0226052;RO=46;SAF=3,7;SAR=2,6;SRF=22;SRR=24;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.134983,0.0739621;STB=0.995043,0.555494;STBP=0.172,0.603;TYPE=snp,ins;VARB=0.000792725,0.0486837;OID=.,.;OPOS=55834828,55834829;OREF=T,-;OALT=A,AAA;OMAPALT=A,TAAA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:71:62:46:42:5,13:2,18:0.0322581,0.290323:2,6:3,7:22:24:0,8:2,10:20:22
chr14	55835762	.	C	T	159.79	PASS	AF=0.363636;AO=20;DP=55;FAO=20;FDP=55;FR=.;FRO=35;FSAF=16;FSAR=4;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=-0.00817903;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.342;QD=11.6207;RBI=0.0347843;REFB=-0.0144633;REVB=-0.0338091;RO=35;SAF=16;SAR=4;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.385207;STB=0.727025;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.0218206;OID=.;OPOS=55835762;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:35:35:20:20:0.363636:4:16:17:18:4:16:17:18
chr14	55835773	.	A	AAAT	271.73	PASS	AF=0.543478;AO=22;DP=49;FAO=25;FDP=46;FR=.;FRO=21;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=6;FWDB=-0.00736512;FXX=0.0212721;HRUN=4;LEN=3;MLLD=238.303;QD=23.6283;RBI=0.0102922;REFB=0.000370576;REVB=-0.0071892;RO=24;SAF=11;SAR=11;SRF=17;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19324;STB=0.572655;STBP=0.307;TYPE=ins;VARB=-0.000356415;OID=.;OPOS=55835774;OREF=-;OALT=AAT;OMAPALT=AAAT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.543478:22:49:25:46:21:14:11:15:6:99:24:11:11:17:7
chr14	55907172	.	C	G	659.95	PASS	AF=0.463576;AO=70;DP=151;FAO=70;FDP=151;FR=.;FRO=81;FSAF=46;FSAR=24;FSRF=42;FSRR=39;FWDB=-0.016564;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.6581;QD=17.4822;RBI=0.0233587;REFB=0.00148449;REVB=-0.01647;RO=81;SAF=46;SAR=24;SRF=42;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141013;STB=0.57842;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=-0.00312938;OID=.;OPOS=55907172;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:151:151:81:81:70:70:0.463576:24:46:42:39:24:46:42:39
chr14	56125318	.	CAAA	CAA,CAAC	174.63	PASS	AF=0.804878,0.121951;AO=5,4;DP=42;FAO=33,5;FDP=41;FR=.;FRO=3;FSAF=23,0;FSAR=10,5;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.936904,0.163191;FXX=0.0238039;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=7.57292,171.782;QD=17.0369;RBI=1.05814,0.195256;REFB=-0.142365,-0.0359251;REVB=-0.491803,-0.107208;RO=22;SAF=0,0;SAR=5,4;SRF=20;SRR=2;SSEN=0.402985,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.828103,-0.815993;STB=0.565176,0.5;STBP=0.038,1;TYPE=del,snp;VARB=0.00830167,0.105506;OID=.,.;OPOS=56125319,56125321;OREF=A,A;OALT=-,C;OMAPALT=CAA,CAAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.804878,0.121951:5,4:42:33,5:41:3:23,0:10,5:0:3:29:22:0,0:5,4:20:2
chr14	57052511	.	G	T	1936.86	PASS	AF=1;AO=125;DP=126;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00440297;FXX=0.00793588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.643;QD=61.9794;RBI=0.0054759;REFB=0;REVB=0.00325567;RO=0;SAF=49;SAR=76;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.1058e-06;OID=.;OPOS=57052511;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:126:125:0:0:125:125:1:76:49:0:0:76:49:0:0
chr14	57099859	.	G	A	870.96	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159969;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.731;QD=57.1118;RBI=0.0389475;REFB=0;REVB=-0.0355106;RO=0;SAF=21;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.3149e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.51218e-05;OID=.;OPOS=57099859;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:61:0:0:58:61:1:37:21:0:0:38:23:0:0
chr14	57101682	.	A	G	1626.55	PASS	AF=1;AO=107;DP=109;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0375102;FXX=0.00917347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.9207;QD=60.2427;RBI=0.0377531;REFB=0;REVB=0.0042757;RO=0;SAF=49;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000121013;OID=.;OPOS=57101682;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:109:108:0:0:107:108:1:58:49:0:0:58:50:0:0
chr14	57102533	.	AG	A,AA	1202.01	PASS	AF=0.0375,0.9625;AO=9,72;DP=81;FAO=3,77;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=1,37;FSAR=2,40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00668078,0.00503623;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=170.478,183.075;QD=60.1005;RBI=0.0131187,0.0118991;REFB=0,0;REVB=0.0112902,0.0107807;RO=0;SAF=5,33;SAR=4,39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0399403,0.00181126;OID=.,.;OPOS=57102534,57102534;OREF=G,G;OALT=-,A;OMAPALT=A,AA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0375,0.9625:9,72:81:3,77:80:0:1,37:2,40:0:0:7:0:5,33:4,39:0:0
chr14	57115622	.	C	G	276.24	PASS	AF=0.568182;AO=25;DP=45;FAO=25;FDP=44;FR=.;FRO=19;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.0221788;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.791;QD=25.113;RBI=0.0275792;REFB=-0.0173603;REVB=-0.0163925;RO=20;SAF=12;SAR=13;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0240149;STB=0.50273;STBP=0.968;TYPE=snp;VARB=0.00777199;OID=.;OPOS=57115622;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:44:20:19:25:25:0.568182:13:12:9:11:13:12:9:10
chr14	57866623	.	A	G	328.48	PASS	AF=0.472973;AO=35;DP=75;FAO=35;FDP=74;FR=.;FRO=39;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=10;FSRR=29;FWDB=0.00068283;FXX=0.0133316;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.3979;QD=17.7557;RBI=0.0155993;REFB=0.00409658;REVB=0.0155844;RO=39;SAF=16;SAR=19;SRF=10;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.195343;STB=0.6085;STBP=0.109;TYPE=snp;VARB=-0.000871345;OID=.;OPOS=57866623;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:74:39:39:35:35:0.472973:19:16:10:29:19:16:10:29
chr14	57876265	.	G	A	426.12	PASS	AF=0.451923;AO=47;DP=104;FAO=47;FDP=104;FR=.;FRO=57;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=27;FSRR=30;FWDB=-0.036626;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.6794;QD=16.3892;RBI=0.0488346;REFB=-0.0114406;REVB=-0.032301;RO=57;SAF=26;SAR=21;SRF=27;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0781092;STB=0.543647;STBP=0.427;TYPE=snp;VARB=0.0134008;OID=.;OPOS=57876265;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:104:57:57:47:47:0.451923:21:26:27:30:21:26:27:30
chr14	57876575	.	T	C	212.39	PASS	AF=0.376812;AO=24;DP=61;FAO=26;FDP=69;FR=.;FRO=43;FSAF=21;FSAR=5;FSRF=24;FSRR=19;FWDB=0.0253305;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.7552;QD=12.3127;RBI=0.0262411;REFB=-0.00927506;REVB=-0.00685273;RO=31;SAF=19;SAR=5;SRF=24;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0257466;STB=0.691194;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.0589613;OID=.;OPOS=57876575;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:69:31:43:24:26:0.376812:5:19:24:7:5:21:24:19
chr14	57938124	.	C	T	575.59	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0276113;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.78;QD=60.5879;RBI=0.0319658;REFB=0;REVB=-0.0161068;RO=0;SAF=25;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000794242;OID=.;OPOS=57938124;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:13:25:0:0:13:25:0:0
chr14	57938260	.	T	C	650.97	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0270155;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.2267;QD=61.9971;RBI=0.0378581;REFB=0;REVB=0.0265217;RO=0;SAF=19;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000360285;OID=.;OPOS=57938260;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:23:19:0:0:23:19:0:0
chr14	57945689	.	G	A	708.06	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0704614;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.871;QD=62.9385;RBI=0.0734772;REFB=0;REVB=0.0208346;RO=0;SAF=28;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000146506;OID=.;OPOS=57945689;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:17:28:0:0:17:28:0:0
chr14	57948380	.	T	C	1039.78	PASS	AF=1;AO=69;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0562155;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.361;QD=59.4161;RBI=0.0590746;REFB=0;REVB=0.0181557;RO=0;SAF=25;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.52383e-05;OID=.;OPOS=57948380;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:69:70:1:44:25:0:0:45:25:0:0
chr14	57957664	.	T	A	1629.49	PASS	AF=0.982143;AO=110;DP=112;FAO=110;FDP=112;FR=.;FRO=2;FSAF=62;FSAR=48;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.011935;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=350.859;QD=58.1961;RBI=0.0168313;REFB=-0.00045631;REVB=-0.011868;RO=1;SAF=62;SAR=48;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00759585;STB=0.501155;STBP=0.865;TYPE=snp;VARB=-1.49948e-05;OID=.;OPOS=57957664;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:112:112:1:2:110:110:0.982143:48:62:1:0:48:62:1:1
chr14	58478873	.	GA	G	34.21	PASS	AF=0.253968;AO=14;DP=63;FAO=16;FDP=63;FR=.;FRO=47;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=30;FWDB=-0.271026;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=7.78236;QD=2.17207;RBI=0.291318;REFB=-0.0158571;REVB=0.106823;RO=38;SAF=5;SAR=9;SRF=11;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0913578;STB=0.558211;STBP=0.614;TYPE=del;VARB=-0.105919;OID=.;OPOS=58478874;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.253968:14:63:16:63:47:7:9:17:30:34:38:5:9:11:27
chr14	58669651	.	TAAAAAAAAAT	TAAAAAAAAAA,TAAAAAAAAA,TAAAAAAAA,TAAAAAAAAT	179.8	PASS	AF=0.0277778,0.5,0,0;AO=3,10,4,6;DP=36;FAO=1,18,0,0;FDP=36;FR=.;FRO=17;FSAF=0,4,0,0;FSAR=1,14,0,0;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.00212645,-0.00181187,-0.0016466,0.030418;FXX=0;HRUN=1,1,9,9;LEN=1,1,2,1;MLLD=261.708,260.88,254.605,5.35181;QD=19.9773;RBI=0.00212931,0.00183561,0.0016547,0.0387127;REFB=-0.00569229,-0.00623466,-0.0068622,-0.0418817;REVB=0.000110362,0.000294306,0.000163525,-0.0239461;RO=9;SAF=0,4,0,3;SAR=3,6,4,3;SRF=6;SRR=3;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=-0.703681,-0.215579,-0.738373,-0.162993;STB=0.991237,0.69976,0.5,0.5;STBP=0.242,0.033,1,1;TYPE=snp,del,del,del;VARB=-0.0237215,0.00587604,0.000291527,0.0577132;OID=.,.,.,.;OPOS=58669661,58669661,58669660,58669652;OREF=T,T,AT,A;OALT=A,-,-,-;OMAPALT=TAAAAAAAAAA,TAAAAAAAAA,TAAAAAAAA,TAAAAAAAAT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0.0277778,0.5,0,0:3,10,4,6:36:1,18,0,0:36:17:0,4,0,0:1,14,0,0:10:7:90:9:0,4,0,3:3,6,4,3:6:3
chr14	58706609	.	C	T	698.46	PASS	AF=0.535433;AO=68;DP=127;FAO=68;FDP=127;FR=.;FRO=59;FSAF=34;FSAR=34;FSRF=26;FSRR=33;FWDB=-0.00420559;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=272.518;QD=21.9986;RBI=0.0102445;REFB=-0.00265889;REVB=-0.00934147;RO=59;SAF=34;SAR=34;SRF=26;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0502636;STB=0.527551;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.00236656;OID=.;OPOS=58706609;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:127:127:59:59:68:68:0.535433:34:34:26:33:34:34:26:33
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chr14	58839339	.	A	C	564.74	PASS	AF=0.974359;AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00266758;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=224.142;QD=57.9224;RBI=0.0083188;REFB=-0.18212;REVB=0.00787949;RO=1;SAF=16;SAR=22;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0283818;STB=0.515144;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.00060309;OID=.;OPOS=58839339;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:39:39:1:1:38:38:0.974359:22:16:1:0:22:16:1:0
chr14	58917454	.	G	A	906.53	PASS	AF=1;AO=62;DP=63;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0204418;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.1551;QD=58.4858;RBI=0.0213521;REFB=0;REVB=0.00616808;RO=0;SAF=22;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000198916;OID=.;OPOS=58917454;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:62:0:0:62:62:1:40:22:0:0:40:22:0:0
chr14	58937416	.	T	C	1044.39	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.044696;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.3936;QD=59.6792;RBI=0.0528672;REFB=0;REVB=-0.0282349;RO=0;SAF=26;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00069757;OID=.;OPOS=58937416;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:44:26:0:0:44:26:0:0
chr14	58953746	.	C	G	741.51	PASS	AF=0.964286;AO=54;DP=56;FAO=54;FDP=56;FR=.;FRO=2;FSAF=36;FSAR=18;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.004787;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.3255;QD=52.9651;RBI=0.0654987;REFB=0.0382057;REVB=-0.0653236;RO=2;SAF=36;SAR=18;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0254644;STB=0.513509;STBP=0.423;TYPE=snp;VARB=-0.0109188;OID=.;OPOS=58953746;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:56:56:2:2:54:54:0.964286:18:36:2:0:18:36:2:0
chr14	58958923	.	A	G	236.58	PASS	AF=0.45;AO=27;DP=60;FAO=27;FDP=60;FR=.;FRO=33;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=-0.0105872;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.476;QD=15.7722;RBI=0.0388659;REFB=0.0102588;REVB=0.0373961;RO=33;SAF=9;SAR=18;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21288;STB=0.620598;STBP=0.111;TYPE=snp;VARB=-0.0151683;OID=.;OPOS=58958923;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:33:33:27:27:0.45:18:9:18:15:18:9:18:15
chr14	59730422	.	AAGG	A,AAGA	778.84	PASS	AF=0.929825,0.0526316;AO=55,3;DP=60;FAO=53,3;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=30,1;FSAR=23,2;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0109123,0.0102456;FXX=0.0499917;HRUN=2,2;LEN=3,1;MLLD=261.873,49.0113;QD=54.6551;RBI=0.0250725,0.039359;REFB=-0.0351581,-0.00449507;REVB=0.0225733,0.0380021;RO=1;SAF=30,1;SAR=25,2;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0154549,-0.266641;STB=0.508194,0.665547;STBP=0.522,0.558;TYPE=del,snp;VARB=0.00416549,-0.0128365;OID=.,.;OPOS=59730423,59730425;OREF=AGG,G;OALT=-,A;OMAPALT=A,AAGA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.929825,0.0526316:55,3:60:53,3:57:1:30,1:23,2:1:0:12:1:30,1:25,2:1:0
chr14	59797235	.	A	G	368.06	PASS	AF=0.62;AO=31;DP=50;FAO=31;FDP=50;FR=.;FRO=19;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.0238738;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.967;QD=29.4451;RBI=0.028489;REFB=-0.0172192;REVB=-0.0155456;RO=17;SAF=20;SAR=11;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.079492;STB=0.547914;STBP=0.43;TYPE=snp;VARB=0.0126063;OID=.;OPOS=59797235;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:17:19:31:31:0.62:11:20:9:8:11:20:10:9
chr14	59835972	.	A	C	57.14	PASS	AF=0.875;AO=7;DP=8;FAO=7;FDP=8;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0266825;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=240.627;QD=28.568;RBI=0.028188;REFB=-0.168773;REVB=0.00908885;RO=1;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0971198;STB=0.5554;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.00270977;OID=.;OPOS=59835972;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:8:8:1:1:7:7:0.875:4:3:0:1:4:3:0:1
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chr14	60031996	.	G	A	1534.02	PASS	AF=0.989796;AO=97;DP=98;FAO=97;FDP=98;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00336859;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=257.217;QD=62.6131;RBI=0.00668954;REFB=-0.0645433;REVB=0.00577949;RO=1;SAF=39;SAR=58;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00810761;STB=0.504273;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=9.37606e-05;OID=.;OPOS=60031996;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:98:98:1:1:97:97:0.989796:58:39:0:1:58:39:0:1
chr14	60043422	.	A	G	1479.66	PASS	AF=0.990099;AO=100;DP=100;FAO=100;FDP=101;FR=.;FRO=1;FSAF=54;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0429483;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.129;QD=58.6002;RBI=0.043262;REFB=-0.0192884;REVB=-0.00520039;RO=0;SAF=54;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.21299e-08;STB=0.505375;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=0.000260768;OID=.;OPOS=60043422;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:100:101:0:1:100:100:0.990099:46:54:0:0:46:54:0:1
chr14	60063472	.	A	G	1623.64	PASS	AF=1;AO=108;DP=108;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0463266;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.7615;QD=60.135;RBI=0.0497073;REFB=0;REVB=0.0180186;RO=0;SAF=48;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000369369;OID=.;OPOS=60063472;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:108:108:0:0:108:108:1:60:48:0:0:60:48:0:0
chr14	60574539	.	A	G	701.09	PASS	AF=1;AO=44;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00169583;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.4256;QD=62.3189;RBI=0.0041316;REFB=0;REVB=0.00376753;RO=0;SAF=22;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.94143e-06;OID=.;OPOS=60574539;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:44:45:1:22:22:0:0:23:22:0:0
chr14	60575240	.	T	C	657.35	PASS	AF=0.942308;AO=49;DP=52;FAO=49;FDP=52;FR=.;FRO=3;FSAF=6;FSAR=43;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.00420044;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.8104;QD=50.565;RBI=0.0256905;REFB=-0.0104829;REVB=0.0253448;RO=3;SAF=6;SAR=43;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186398;STB=0.599954;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0151571;OID=.;OPOS=60575240;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:52:52:3:3:49:49:0.942308:43:6:3:0:43:6:3:0
chr14	60575512	.	G	A	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000648182;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.846;QD=50.4134;RBI=0.01109;REFB=0;REVB=0.011071;RO=0;SAF=7;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.74274e-05;OID=.;OPOS=60575512;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:12:7:0:0:12:7:0:0
chr14	60575869	.	A	G	1108.59	PASS	AF=0.974026;AO=75;DP=77;FAO=75;FDP=77;FR=.;FRO=2;FSAF=40;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0296019;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.922;QD=57.5893;RBI=0.0326699;REFB=-0.120458;REVB=-0.013822;RO=2;SAF=40;SAR=35;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0262676;STB=0.513885;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=0.000874429;OID=.;OPOS=60575869;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:77:77:2:2:75:75:0.974026:35:40:0:2:35:40:0:2
chr14	60576241	.	G	C	207.12	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0128764;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.476;QD=48.734;RBI=0.0149505;REFB=0;REVB=-0.00759705;RO=0;SAF=4;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.13967e-05;OID=.;OPOS=60576241;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:13:4:0:0:13:4:0:0
chr14	60576637	.	A	T	1347.78	PASS	AF=0.988636;AO=87;DP=88;FAO=87;FDP=88;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.000988565;FXX=0.0112347;HRUN=3;LEN=1;MLLD=264.18;QD=61.2626;RBI=0.00195882;REFB=-0.160118;REVB=0.00169107;RO=0;SAF=45;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.519e-08;STB=0.505881;STBP=0.325;TYPE=snp;VARB=-0.000103378;OID=.;OPOS=60576637;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:88:88:0:1:87:87:0.988636:42:45:0:0:42:45:0:1
chr14	60576861	.	A	G	401.99	PASS	AF=0.565217;AO=38;DP=70;FAO=39;FDP=69;FR=.;FRO=30;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=-0.00107419;FXX=0.028165;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.711;QD=23.3035;RBI=0.0499999;REFB=-0.00540453;REVB=0.0499883;RO=29;SAF=15;SAR=23;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0983556;STB=0.566176;STBP=0.216;TYPE=snp;VARB=0.00875263;OID=.;OPOS=60576861;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:69:29:30:38:39:0.565217:23:15:15:14:24:15:16:14
chr14	60576951	.	A	G	651.23	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00426288;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.212;QD=62.0217;RBI=0.011888;REFB=0;REVB=0.0110974;RO=0;SAF=14;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.43634e-05;OID=.;OPOS=60576951;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:42:0:0:41:42:1:27:14:0:0:28:14:0:0
chr14	60581863	.	G	A	685.86	PASS	AF=0.944444;AO=51;DP=54;FAO=51;FDP=54;FR=.;FRO=3;FSAF=22;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.00419788;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.906;QD=50.8041;RBI=0.00912975;REFB=0.00805191;REVB=0.00810742;RO=2;SAF=22;SAR=29;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0313711;STB=0.505557;STBP=0.805;TYPE=snp;VARB=-0.000235471;OID=.;OPOS=60581863;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:54:54:2:3:51:51:0.944444:29:22:0:2:29:22:1:2
chr14	60581935	.	C	T	1165.04	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0018275;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.073;QD=60.5217;RBI=0.00550275;REFB=0;REVB=0.00519042;RO=0;SAF=28;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94731e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.84448e-05;OID=.;OPOS=60581935;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:77:0:0:75:77:1:47:28:0:0:49:28:0:0
chr14	60582053	.	G	A	602.1	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00359546;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.809;QD=60.2102;RBI=0.0141047;REFB=0;REVB=0.0136388;RO=0;SAF=15;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000357635;OID=.;OPOS=60582053;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:40:0:0:38:40:1:23:15:0:0:25:15:0:0
chr14	60864583	.	G	T	1480.79	PASS	AF=0.980583;AO=101;DP=105;FAO=101;FDP=103;FR=.;FRO=2;FSAF=48;FSAR=53;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00180367;FXX=0.0190458;HRUN=3;LEN=1;MLLD=270.71;QD=57.5063;RBI=0.0114853;REFB=-0.0356872;REVB=0.0113428;RO=1;SAF=48;SAR=53;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00978143;STB=0.510202;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=-4.67761e-05;OID=.;OPOS=60864583;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:105:103:1:2:101:101:0.980583:53:48:1:0:53:48:2:0
chr14	60900113	.	C	T	2046.07	PASS	AF=1;AO=131;DP=131;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0218183;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=242.856;QD=62.4755;RBI=0.021834;REFB=0;REVB=-0.000828627;RO=0;SAF=47;SAR=84;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.43388e-06;OID=.;OPOS=60900113;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:131:131:0:0:131:131:1:84:47:0:0:84:47:0:0
chr14	60903757	.	G	A	323.46	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0732916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.087;QD=53.9104;RBI=0.0744572;REFB=0;REVB=-0.0131232;RO=0;SAF=11;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000731074;OID=.;OPOS=60903757;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:13:11:0:0:13:11:0:0
chr14	60923783	.	C	T	178.93	PASS	AF=0.404255;AO=19;DP=46;FAO=19;FDP=47;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=-0.068739;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.4588;QD=15.2278;RBI=0.0755014;REFB=0.000929431;REVB=-0.0312316;RO=27;SAF=7;SAR=12;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119036;STB=0.559377;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=-0.00575463;OID=.;OPOS=60923783;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:47:27:28:19:19:0.404255:12:7:13:14:12:7:13:15
chr14	60932752	.	G	A	360.06	PASS	AF=0.571429;AO=36;DP=63;FAO=36;FDP=63;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=25;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.00530172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.4934;QD=22.8609;RBI=0.0265638;REFB=0.00258279;REVB=-0.0260294;RO=26;SAF=11;SAR=25;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131676;STB=0.566464;STBP=0.238;TYPE=snp;VARB=-0.00214456;OID=.;OPOS=60932752;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:26:27:36:36:0.571429:25:11:12:14:25:11:12:15
chr14	61124940	.	A	G	280.8	PASS	AF=0.625;AO=25;DP=40;FAO=25;FDP=40;FR=.;FRO=15;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=0.0141592;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.618;QD=28.0796;RBI=0.0351185;REFB=0.00998961;REVB=-0.0321376;RO=15;SAF=12;SAR=13;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0813678;STB=0.544874;STBP=0.476;TYPE=snp;VARB=-0.00672286;OID=.;OPOS=61124940;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:15:15:25:25:0.625:13:12:9:6:13:12:9:6
chr14	61176485	.	T	C	130.2	PASS	AF=0.636364;AO=12;DP=20;FAO=14;FDP=22;FR=.;FRO=8;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.0252212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.8461;QD=23.6725;RBI=0.0269083;REFB=-0.00371881;REVB=0.00937804;RO=8;SAF=8;SAR=4;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0324761;STB=0.538405;STBP=0.735;TYPE=snp;VARB=0.00454284;OID=.;OPOS=61176485;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:20:22:8:8:12:14:0.636364:4:8:5:3:4:10:5:3
chr14	61180657	.	T	G	295.7	PASS	AF=0.373626;AO=34;DP=91;FAO=34;FDP=91;FR=.;FRO=57;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=23;FSRR=34;FWDB=0.0193586;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.985;QD=12.9978;RBI=0.0214702;REFB=-0.00437189;REVB=-0.00928505;RO=57;SAF=12;SAR=22;SRF=23;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0592114;STB=0.53396;STBP=0.614;TYPE=snp;VARB=0.00661303;OID=.;OPOS=61180657;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:57:57:34:34:0.373626:22:12:23:34:22:12:23:34
chr14	61445967	.	A	G	613.36	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0233728;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.533;QD=61.3363;RBI=0.0233901;REFB=0;REVB=-0.000898095;RO=0;SAF=27;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000108988;OID=.;OPOS=61445967;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:13:27:0:0:13:27:0:0
chr14	61449328	.	T	A	1669.14	PASS	AF=0.928;AO=116;DP=125;FAO=116;FDP=125;FR=.;FRO=9;FSAF=60;FSAR=56;FSRF=8;FSRR=1;FWDB=-0.0019322;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=247.846;QD=53.4126;RBI=0.0048473;REFB=-0.154834;REVB=-0.00444555;RO=3;SAF=60;SAR=56;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0231501;STB=0.526835;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.00110636;OID=.;OPOS=61449328;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:23:125:125:3:9:116:116:0.928:56:60:3:0:56:60:8:1
chr14	61509924	.	T	C	729.61	PASS	AF=1;AO=52;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0268947;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=184.603;QD=55.0647;RBI=0.0374523;REFB=-0.079483;REVB=0.0260643;RO=1;SAF=19;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0140615;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000649525;OID=.;OPOS=61509924;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:53:53:1:0:52:53:1:33:19:0:1:34:19:0:0
chr14	61746967	.	T	A	124.04	PASS	AF=0.272727;AO=18;DP=65;FAO=18;FDP=66;FR=.;FRO=48;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=23;FSRR=25;FWDB=-0.0252645;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.734;QD=7.5178;RBI=0.0313443;REFB=-0.00502096;REVB=-0.0185518;RO=47;SAF=4;SAR=14;SRF=23;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.348414;STB=0.707617;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=0.0225682;OID=.;OPOS=61746967;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:66:47:48:18:18:0.272727:14:4:23:24:14:4:23:25
chr14	61747644	.	A	G	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00290987;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.516;QD=40.7629;RBI=0.00696262;REFB=0;REVB=0.0063254;RO=0;SAF=1;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.8593e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000129765;OID=.;OPOS=61747644;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:9:1:0:0:9:1:0:0
chr14	61924239	.	G	A	216.68	PASS	AF=0.4;AO=26;DP=65;FAO=26;FDP=65;FR=.;FRO=39;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=-0.00760144;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.417;QD=13.3341;RBI=0.014304;REFB=-0.0119004;REVB=-0.012117;RO=39;SAF=15;SAR=11;SRF=18;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121228;STB=0.569342;STBP=0.385;TYPE=snp;VARB=0.0147103;OID=.;OPOS=61924239;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:39:39:26:26:0.4:11:15:18:21:11:15:18:21
chr14	61924241	.	A	C	204.28	PASS	AF=0.384615;AO=25;DP=64;FAO=25;FDP=65;FR=.;FRO=40;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=-0.0111853;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=149.744;QD=12.5709;RBI=0.0165804;REFB=-0.00267985;REVB=0.0122392;RO=39;SAF=14;SAR=11;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.077537;STB=0.552362;STBP=0.546;TYPE=snp;VARB=0.00855096;OID=.;OPOS=61924241;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:65:39:40:25:25:0.384615:11:14:19:20:11:14:19:21
chr14	61997226	.	C	T	500.77	PASS	AF=0.486239;AO=53;DP=109;FAO=53;FDP=109;FR=.;FRO=56;FSAF=23;FSAR=30;FSRF=23;FSRR=33;FWDB=-0.000105911;FXX=0.00909008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.725;QD=18.3767;RBI=0.0273536;REFB=-0.0110295;REVB=-0.0273534;RO=55;SAF=23;SAR=30;SRF=22;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0319417;STB=0.512191;STBP=0.823;TYPE=snp;VARB=0.00927808;OID=.;OPOS=61997226;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:109:55:56:53:53:0.486239:30:23:22:33:30:23:23:33
chr14	62213848	.	T	C	772.31	PASS	AF=0.98;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00611386;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.868;QD=61.7847;RBI=0.0294542;REFB=0.0514358;REVB=0.0288127;RO=1;SAF=24;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0192048;STB=0.5102;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=-0.00230684;OID=.;OPOS=62213848;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:50:50:1:1:49:49:0.98:25:24:1:0:25:24:1:0
chr14	62462766	.	T	C	237.68	PASS	AF=0.490196;AO=25;DP=51;FAO=25;FDP=51;FR=.;FRO=26;FSAF=4;FSAR=21;FSRF=8;FSRR=18;FWDB=-0.00830273;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.912;QD=18.6416;RBI=0.0141956;REFB=-0.00818386;REVB=-0.0115143;RO=26;SAF=4;SAR=21;SRF=8;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.206366;STB=0.617541;STBP=0.17;TYPE=snp;VARB=0.0153903;OID=.;OPOS=62462766;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:26:26:25:25:0.490196:21:4:8:18:21:4:8:18
chr14	62463129	.	G	T	169.49	PASS	AF=0.439024;AO=18;DP=41;FAO=18;FDP=41;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=0.00951837;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.73;QD=16.5353;RBI=0.0450524;REFB=-0.00618706;REVB=-0.0440354;RO=23;SAF=6;SAR=12;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.015833;STB=0.509081;STBP=0.955;TYPE=snp;VARB=0.0091482;OID=.;OPOS=62463129;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:23:23:18:18:0.439024:12:6:8:15:12:6:8:15
chr14	62463214	.	C	T	37.18	PASS	AF=0.333333;AO=6;DP=18;FAO=6;FDP=18;FR=.;FRO=12;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=-0.0076334;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.53;QD=8.26269;RBI=0.00824405;REFB=0.000137872;REVB=-0.00311379;RO=10;SAF=1;SAR=5;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0568762;STB=0.657294;STBP=0.452;TYPE=snp;VARB=-0.00275439;OID=.;OPOS=62463214;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:18:18:10:12:6:6:0.333333:5:1:2:8:5:1:4:8
chr14	63174616	.	T	C	1632.5	PASS	AF=0.991071;AO=110;DP=112;FAO=111;FDP=112;FR=.;FRO=1;FSAF=59;FSAR=52;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00588941;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=52.8968;QD=58.3036;RBI=0.0612842;REFB=-0.158159;REVB=-0.0610006;RO=1;SAF=58;SAR=52;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00811506;STB=0.504201;STBP=0.483;TYPE=snp;VARB=0.00292367;OID=.;OPOS=63174616;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:112:112:1:1:110:111:0.991071:52:58:1:0:52:59:1:0
chr14	63174960	.	C	T	237.12	PASS	AF=0.479167;AO=23;DP=47;FAO=23;FDP=48;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=18;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=0.0159781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.444;QD=19.7596;RBI=0.0185255;REFB=-0.0194974;REVB=0.00937522;RO=24;SAF=5;SAR=18;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.335125;STB=0.702068;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.0188914;OID=.;OPOS=63174960;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:48:24:25:23:23:0.479167:18:5:13:11:18:5:14:11
chr14	63784407	.	A	AG,G	708.6	PASS	AF=0.82,0.18;AO=35,12;DP=51;FAO=41,9;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=30,1;FSAR=11,8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0162493,-0.0517482;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=1,1;MLLD=24.2136,16.1803;QD=56.688;RBI=0.137175,0.0827329;REFB=0,0;REVB=-0.136209,-0.0645511;RO=4;SAF=28,1;SAR=7,11;SRF=2;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0844256,-0.376194;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.014096,-0.0494091;OID=.,.;OPOS=63784408,63784407;OREF=-,A;OALT=G,G;OMAPALT=AG,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:45:51:50:4:0:35,12:41,9:0.82,0.18:7,11:28,1:2:2:11,8:30,1:0:0
chr14	63841402	.	ATTTTG	A,AT,ATTT,ATTTTT	179.72	PASS	AF=0,0.684211,0.0526316,0.157895;AO=4,8,2,2;DP=19;FAO=0,13,1,3;FDP=19;FR=.;FRO=2;FSAF=0,11,1,2;FSAR=0,2,0,1;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0134389,0.0149858,0.0161493,0.0157607;FXX=0;HRUN=4,4,4,1;LEN=5,4,2,1;MLLD=267.058,272.456,265.028,258.529;QD=37.8362;RBI=0.0205724,0.0155795,0.0216105,0.0261035;REFB=-0.00454297,-0.00267,-0.00152381,-0.000103307;REVB=0.0155763,0.00425983,-0.0143601,-0.0208084;RO=1;SAF=3,7,2,1;SAR=1,1,0,1;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=-0.119989,-0.0589957,0,-0.25849;STB=0.5,0.541606,0.5,0.665762;STBP=1,0.664,1,0.695;TYPE=del,del,del,snp;VARB=-0.0196882,0.00567766,-0.00785175,0.0480578;OID=.,.,.,.;OPOS=63841403,63841404,63841406,63841407;OREF=TTTTG,TTTG,TG,G;OALT=-,-,-,T;OMAPALT=A,AT,ATTT,ATTTTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	2/4:0,0.684211,0.0526316,0.157895:4,8,2,2:19:0,13,1,3:19:2:0,11,1,2:0,2,0,1:2:0:13:1:3,7,2,1:1,1,0,1:1:0
chr14	63842235	.	T	C	53.89	PASS	AF=0.307692;AO=8;DP=26;FAO=8;FDP=26;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.00181987;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.04;QD=8.29067;RBI=0.00258617;REFB=-0.01058;REVB=-0.00183749;RO=18;SAF=4;SAR=4;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0618928;STB=0.538366;STBP=0.801;TYPE=snp;VARB=0.105668;OID=.;OPOS=63842235;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:26:26:18:18:8:8:0.307692:4:4:8:10:4:4:8:10
chr14	64421533	.	C	G	156.85	PASS	AF=0.435897;AO=17;DP=39;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.0363249;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.0944;QD=16.0871;RBI=0.0614188;REFB=-0.00504717;REVB=-0.0495254;RO=22;SAF=13;SAR=4;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.292634;STB=0.669887;STBP=0.101;TYPE=snp;VARB=0.00344507;OID=.;OPOS=64421533;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:22:22:17:17:0.435897:4:13:11:11:4:13:11:11
chr14	64423187	.	C	A	747.07	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0106474;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.679;QD=63.5804;RBI=0.019844;REFB=0;REVB=-0.0167456;RO=0;SAF=21;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000153519;OID=.;OPOS=64423187;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:26:21:0:0:26:21:0:0
chr14	64491695	.	T	C	834.82	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0101216;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.781;QD=57.5736;RBI=0.0451008;REFB=0;REVB=0.0439504;RO=0;SAF=32;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.97142e-05;OID=.;OPOS=64491695;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:58:0:0:57:58:1:25:32:0:0:26:32:0:0
chr14	64494278	.	C	T	1314.73	PASS	AF=1;AO=84;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0053555;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.899;QD=61.8695;RBI=0.0437938;REFB=0;REVB=-0.0434651;RO=0;SAF=42;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000116654;OID=.;OPOS=64494278;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:85:0:0:84:85:1:42:42:0:0:43:42:0:0
chr14	64496749	.	C	T	135.07	PASS	AF=0.46875;AO=15;DP=32;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.02962;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.916;QD=16.8837;RBI=0.0418238;REFB=-0.00901157;REVB=-0.0295278;RO=17;SAF=8;SAR=7;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00364105;STB=0.502089;STBP=0.965;TYPE=snp;VARB=0.0207756;OID=.;OPOS=64496749;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:17:17:15:15:0.46875:7:8:9:8:7:8:9:8
chr14	64496763	.	T	C	112.23	PASS	AF=0.481481;AO=13;DP=27;FAO=13;FDP=27;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.0107947;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.28;QD=16.6272;RBI=0.0267;REFB=-0.012468;REVB=0.0244206;RO=14;SAF=5;SAR=8;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169167;STB=0.59755;STBP=0.355;TYPE=snp;VARB=0.0162185;OID=.;OPOS=64496763;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:14:14:13:13:0.481481:8:5:8:6:8:5:8:6
chr14	64497930	.	G	A	65.31	PASS	AF=0.375;AO=9;DP=24;FAO=9;FDP=24;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=-0.0221786;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.58;QD=10.8848;RBI=0.0235524;REFB=-0.00161296;REVB=0.00792618;RO=15;SAF=5;SAR=4;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119127;STB=0.571275;STBP=0.632;TYPE=snp;VARB=0.00239809;OID=.;OPOS=64497930;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:24:24:15:15:9:9:0.375:4:5:10:5:4:5:10:5
chr14	64498037	.	G	A	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00816955;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.066;QD=47.8224;RBI=0.00891707;REFB=0;REVB=0.00357387;RO=0;SAF=4;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.07465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.98405e-05;OID=.;OPOS=64498037;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:12:4:0:0:12:4:0:0
chr14	64519035	.	A	G	126.28	PASS	AF=0.518519;AO=13;DP=26;FAO=14;FDP=27;FR=.;FRO=13;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.0840361;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.411;QD=18.7082;RBI=0.084178;REFB=-0.00983669;REVB=-0.00488479;RO=13;SAF=9;SAR=4;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.212182;STB=0.590032;STBP=0.373;TYPE=snp;VARB=0.0117685;OID=.;OPOS=64519035;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:27:13:13:13:14:0.518519:4:9:6:7:5:9:6:7
chr14	64522674	.	G	C	161.5	PASS	AF=0.5;AO=17;DP=34;FAO=17;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.00945501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.3;QD=19.0005;RBI=0.00945804;REFB=-0.001393;REVB=0.000239425;RO=17;SAF=8;SAR=9;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0517331;STB=0.529377;STBP=0.756;TYPE=snp;VARB=0.00104545;OID=.;OPOS=64522674;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:17:17:17:17:0.5:9:8:9:8:9:8:9:8
chr14	64522843	.	A	G	276.88	PASS	AF=0.491803;AO=29;DP=61;FAO=30;FDP=61;FR=.;FRO=31;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=10;FWDB=0.0226064;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.7285;QD=18.156;RBI=0.056421;REFB=-0.0226642;REVB=0.0516941;RO=31;SAF=16;SAR=13;SRF=21;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119058;STB=0.574231;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=0.024156;OID=.;OPOS=64522843;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:31:31:29:30:0.491803:13:16:21:10:14:16:21:10
chr14	64540823	.	A	G	329.05	PASS	AF=0.492958;AO=33;DP=70;FAO=35;FDP=71;FR=.;FRO=36;FSAF=10;FSAR=25;FSRF=9;FSRR=27;FWDB=0.0169603;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.814;QD=18.5378;RBI=0.0169862;REFB=-0.00818309;REVB=-0.000936905;RO=36;SAF=9;SAR=24;SRF=9;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0271116;STB=0.5226;STBP=0.789;TYPE=snp;VARB=0.00743032;OID=.;OPOS=64540823;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:71:36:36:33:35:0.492958:24:9:9:27:25:10:9:27
chr14	64551688	.	C	T	302.07	PASS	AF=0.404762;AO=34;DP=84;FAO=34;FDP=84;FR=.;FRO=50;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=35;FSRR=15;FWDB=0.0170737;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.284;QD=14.3844;RBI=0.0193515;REFB=0.000861951;REVB=-0.0091086;RO=50;SAF=15;SAR=19;SRF=35;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.267106;STB=0.650601;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=-0.00126552;OID=.;OPOS=64551688;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:50:50:34:34:0.404762:19:15:35:15:19:15:35:15
chr14	64560091	.	TG	CA	337.54	PASS	AF=0.397849;AO=37;DP=95;FAO=37;FDP=93;FR=.;FRO=56;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=20;FSRR=36;FWDB=-0.00761302;FXX=0.0210504;HRUN=1;LEN=2;MLLD=224.167;QD=14.5179;RBI=0.0148035;REFB=-0.0048038;REVB=-0.0126959;RO=55;SAF=15;SAR=22;SRF=19;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0665933;STB=0.530472;STBP=0.65;TYPE=mnp;VARB=0.00755117;OID=.;OPOS=64560091;OREF=TG;OALT=CA;OMAPALT=CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:93:55:56:37:37:0.397849:22:15:19:36:22:15:20:36
chr14	64565582	.	T	C	233.69	PASS	AF=0.578947;AO=22;DP=38;FAO=22;FDP=38;FR=.;FRO=16;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.0124017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.593;QD=24.5989;RBI=0.0249224;REFB=-0.0120248;REVB=0.0216177;RO=16;SAF=11;SAR=11;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0472435;STB=0.526292;STBP=0.721;TYPE=snp;VARB=0.00739776;OID=.;OPOS=64565582;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:16:16:22:22:0.578947:11:11:9:7:11:11:9:7
chr14	64657684	.	C	A	557.8	PASS	AF=0.538462;AO=56;DP=106;FAO=56;FDP=104;FR=.;FRO=48;FSAF=39;FSAR=17;FSRF=25;FSRR=23;FWDB=-0.00873323;FXX=0.0188661;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.097;QD=21.4537;RBI=0.0109125;REFB=-0.00380895;REVB=0.00654317;RO=48;SAF=39;SAR=17;SRF=25;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161604;STB=0.589091;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=0.00368787;OID=.;OPOS=64657684;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:104:48:48:56:56:0.538462:17:39:25:23:17:39:25:23
chr14	64691744	.	G	A	224.06	PASS	AF=0.488889;AO=22;DP=45;FAO=22;FDP=45;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=0.00829702;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.506;QD=19.916;RBI=0.0575125;REFB=-0.0144211;REVB=0.0569109;RO=23;SAF=11;SAR=11;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0196827;STB=0.511101;STBP=0.892;TYPE=snp;VARB=0.0140187;OID=.;OPOS=64691744;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:23:23:22:22:0.488889:11:11:11:12:11:11:11:12
chr14	64724051	.	C	T	206.88	PASS	AF=0.4375;AO=21;DP=48;FAO=21;FDP=48;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=22;FWDB=0.0721354;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.348;QD=17.2401;RBI=0.0722017;REFB=0.00456033;REVB=-0.00309524;RO=27;SAF=12;SAR=9;SRF=5;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.370938;STB=0.708397;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=-0.0125346;OID=.;OPOS=64724051;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:27:27:21:21:0.4375:9:12:5:22:9:12:5:22
chr14	64726854	.	A	T	320.06	PASS	AF=0.595745;AO=28;DP=47;FAO=28;FDP=47;FR=.;FRO=19;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=0.0307089;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.216;QD=27.2391;RBI=0.0338677;REFB=-0.0191903;REVB=0.0142825;RO=19;SAF=13;SAR=15;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160028;STB=0.588173;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=0.00846776;OID=.;OPOS=64726854;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:19:19:28:28:0.595745:15:13:13:6:15:13:13:6
chr14	64805001	.	A	G	92.7	PASS	AF=0.363636;AO=11;DP=32;FAO=12;FDP=33;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=-5.69165e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.985;QD=11.2358;RBI=0.00219971;REFB=-0.0225142;REVB=-0.00219898;RO=19;SAF=4;SAR=7;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0559997;STB=0.555466;STBP=0.695;TYPE=snp;VARB=0.0315613;OID=.;OPOS=64805001;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:32:33:19:21:11:12:0.363636:7:4:6:13:7:5:7:14
chr14	64855041	.	T	C	2102.6	PASS	AF=0.992647;AO=130;DP=132;FAO=135;FDP=136;FR=.;FRO=1;FSAF=76;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0121919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.431;QD=61.8413;RBI=0.0192021;REFB=0.00607176;REVB=0.0148349;RO=1;SAF=74;SAR=56;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00841113;STB=0.504201;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=-5.86409e-06;OID=.;OPOS=64855041;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:132:136:1:1:130:135:0.992647:56:74:0:1:59:76:0:1
chr14	64882380	.	A	G	632.26	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00828641;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=281.909;QD=61.684;RBI=0.0262811;REFB=0;REVB=0.0249406;RO=0;SAF=21;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.69506e-05;OID=.;OPOS=64882380;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:20:21:0:0:20:21:0:0
chr14	64935720	.	C	T	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00489587;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.314;QD=42.1826;RBI=0.00525445;REFB=0;REVB=-0.00190782;RO=0;SAF=5;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.8681e-05;OID=.;OPOS=64935720;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:6:5:0:0:6:5:0:0
chr14	64990626	.	T	C	196.7	PASS	AF=0.465116;AO=20;DP=43;FAO=20;FDP=43;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=0.084493;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.901;QD=18.2975;RBI=0.0876545;REFB=-0.00980038;REVB=0.0233291;RO=23;SAF=11;SAR=9;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.228511;STB=0.629167;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=0.0165251;OID=.;OPOS=64990626;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:23:23:20:20:0.465116:9:11:7:16:9:11:7:16
chr14	65008251	.	C	T	157.04	PASS	AF=0.435897;AO=17;DP=39;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.0087628;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.665;QD=16.1064;RBI=0.0147093;REFB=-0.0221203;REVB=0.0118143;RO=22;SAF=14;SAR=3;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.298379;STB=0.674465;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=0.0417165;OID=.;OPOS=65008251;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:22:22:17:17:0.435897:3:14:13:9:3:14:13:9
chr14	65016702	.	T	G	595.23	PASS	AF=0.97561;AO=39;DP=41;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00139766;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.901;QD=58.071;RBI=0.00240532;REFB=-0.0937768;REVB=-0.00195758;RO=0;SAF=26;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.518509;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=0.00331757;OID=.;OPOS=65016702;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:41:41:0:1:39:40:0.97561:13:26:0:0:13:27:0:1
chr14	65031534	.	C	T	234.95	PASS	AF=0.46;AO=23;DP=50;FAO=23;FDP=50;FR=.;FRO=27;FSAF=5;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=0.000382174;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.631;QD=18.7957;RBI=0.00273431;REFB=-0.00347609;REVB=-0.00270747;RO=27;SAF=5;SAR=18;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.389769;STB=0.722546;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.00234863;OID=.;OPOS=65031534;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:27:27:23:23:0.46:18:5:16:11:18:5:16:11
chr14	65054858	.	T	C	239.96	PASS	AF=0.465517;AO=26;DP=58;FAO=27;FDP=58;FR=.;FRO=31;FSAF=19;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=-0.0292515;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.753;QD=16.5491;RBI=0.0292796;REFB=5.89896e-05;REVB=-0.00128382;RO=32;SAF=19;SAR=7;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.275694;STB=0.626276;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=-0.000266252;OID=.;OPOS=65054858;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:32:31:26:27:0.465517:7:19:15:17:8:19:15:16
chr14	65194446	.	C	T	471.51	PASS	AF=0.511111;AO=46;DP=90;FAO=46;FDP=90;FR=.;FRO=44;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=0.0248789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.6316;QD=20.9561;RBI=0.026297;REFB=0.00224034;REVB=0.00851897;RO=44;SAF=26;SAR=20;SRF=22;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0581097;STB=0.53215;STBP=0.547;TYPE=snp;VARB=-0.00157958;OID=.;OPOS=65194446;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:44:44:46:46:0.511111:20:26:22:22:20:26:22:22
chr14	65241228	.	A	G	525.68	PASS	AF=0.515464;AO=50;DP=97;FAO=50;FDP=97;FR=.;FRO=47;FSAF=29;FSAR=21;FSRF=27;FSRR=20;FWDB=0.00731012;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.6835;QD=21.6774;RBI=0.00749288;REFB=-0.0176847;REVB=0.00164479;RO=47;SAF=29;SAR=21;SRF=27;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00497679;STB=0.502747;STBP=0.969;TYPE=snp;VARB=0.0161554;OID=.;OPOS=65241228;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:47:47:50:50:0.515464:21:29:27:20:21:29:27:20
chr14	65242044	.	C	T	85.77	PASS	AF=0.37931;AO=11;DP=29;FAO=11;FDP=29;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=13;FWDB=0.0525078;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.057;QD=11.8306;RBI=0.0623009;REFB=-0.00825543;REVB=-0.0335311;RO=18;SAF=4;SAR=7;SRF=5;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100581;STB=0.559337;STBP=0.672;TYPE=snp;VARB=0.0120448;OID=.;OPOS=65242044;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:29:29:18:18:11:11:0.37931:7:4:5:13:7:4:5:13
chr14	65260227	.	T	G	95.65	PASS	AF=0.363636;AO=12;DP=33;FAO=12;FDP=33;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.0159372;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=152.29;QD=11.5934;RBI=0.017933;REFB=-0.000540152;REVB=0.00822177;RO=21;SAF=8;SAR=4;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.256805;STB=0.652804;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.00141759;OID=.;OPOS=65260227;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:33:33:21:21:12:12:0.363636:4:8:9:12:4:8:9:12
chr14	65263300	.	C	T	402.25	PASS	AF=0.456522;AO=41;DP=92;FAO=42;FDP=92;FR=.;FRO=50;FSAF=15;FSAR=27;FSRF=24;FSRR=26;FWDB=0.0050065;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.166;QD=17.4891;RBI=0.00527227;REFB=-0.0121961;REVB=0.00165282;RO=50;SAF=15;SAR=26;SRF=24;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116159;STB=0.569771;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=0.0114556;OID=.;OPOS=65263300;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:50:50:41:42:0.456522:26:15:24:26:27:15:24:26
chr14	65263347	.	C	T	589.92	PASS	AF=0.512821;AO=60;DP=117;FAO=60;FDP=117;FR=.;FRO=57;FSAF=28;FSAR=32;FSRF=23;FSRR=34;FWDB=0.000409743;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=252.817;QD=20.1682;RBI=0.00297484;REFB=-0.00624687;REVB=0.00294649;RO=57;SAF=28;SAR=32;SRF=23;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0563553;STB=0.531024;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.00745425;OID=.;OPOS=65263347;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:117:117:57:57:60:60:0.512821:32:28:23:34:32:28:23:34
chr14	65268100	.	A	G	151.54	PASS	AF=0.361702;AO=17;DP=47;FAO=17;FDP=47;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=-0.0246398;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=134.519;QD=12.8969;RBI=0.0429405;REFB=-0.016185;REVB=-0.0351676;RO=30;SAF=8;SAR=9;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152462;STB=0.588732;STBP=0.381;TYPE=snp;VARB=0.0330045;OID=.;OPOS=65268100;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:30:30:17:17:0.361702:9:8:10:20:9:8:10:20
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chr14	65417070	.	C	A	421.99	PASS	AF=0.531646;AO=42;DP=79;FAO=42;FDP=79;FR=.;FRO=37;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=0.0847597;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.088;QD=21.3668;RBI=0.0880131;REFB=-0.0145217;REVB=0.0237087;RO=37;SAF=19;SAR=23;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0171035;STB=0.509441;STBP=0.856;TYPE=snp;VARB=0.00886351;OID=.;OPOS=65417070;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:37:37:42:42:0.531646:23:19:16:21:23:19:16:21
chr14	65419293	.	A	G	150.06	PASS	AF=0.516129;AO=16;DP=31;FAO=16;FDP=31;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.0604447;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2833;QD=19.3631;RBI=0.0660002;REFB=0.00543768;REVB=-0.0265041;RO=15;SAF=6;SAR=10;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0225385;STB=0.512804;STBP=0.934;TYPE=snp;VARB=-0.00347928;OID=.;OPOS=65419293;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:15:15:16:16:0.516129:10:6:6:9:10:6:6:9
chr14	65544371	.	A	C	110.94	PASS	AF=0.481481;AO=12;DP=26;FAO=13;FDP=27;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.0458108;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=36.3544;QD=16.4348;RBI=0.0725566;REFB=-0.0487498;REVB=0.0562657;RO=14;SAF=7;SAR=5;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0113119;STB=0.517215;STBP=0.868;TYPE=snp;VARB=0.0502236;OID=.;OPOS=65544371;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:27:14:14:12:13:0.481481:5:7:8:6:6:7:8:6
chr14	65878909	.	C	T	117.71	PASS	AF=0.368421;AO=14;DP=38;FAO=14;FDP=38;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=-0.0145233;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.771;QD=12.3903;RBI=0.0156305;REFB=-0.0101262;REVB=0.00577803;RO=24;SAF=8;SAR=6;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.251089;STB=0.646858;STBP=0.197;TYPE=snp;VARB=0.0224558;OID=.;OPOS=65878909;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:24:24:14:14:0.368421:6:8:8:16:6:8:8:16
chr14	66028446	.	A	G	705.99	PASS	AF=1;AO=40;DP=47;FAO=45;FDP=45;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=13;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.13372;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=252.154;QD=62.7546;RBI=0.133911;REFB=0;REVB=0.007149;RO=2;SAF=8;SAR=32;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1037;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000610009;OID=.;OPOS=66028446;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:45:2:0:40:45:1:32:8:2:0:32:13:0:0
chr14	66974474	.	T	C	50.47	PASS	AF=0.583333;AO=7;DP=12;FAO=7;FDP=12;FR=.;FRO=5;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.412;QD=16.8229;RBI=0.0143997;REFB=-0.00902763;REVB=0.0143997;RO=5;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00600525;OID=.;OPOS=66974474;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:12:12:5:5:7:7:0.583333:7:0:0:5:7:0:0:5
chr14	67147816	.	T	C	106.27	PASS	AF=0.40625;AO=13;DP=32;FAO=13;FDP=32;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.0447166;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.797;QD=13.2834;RBI=0.0501023;REFB=-0.0180339;REVB=0.0225979;RO=19;SAF=5;SAR=8;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196894;STB=0.615207;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.0268342;OID=.;OPOS=67147816;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:19:19:13:13:0.40625:8:5:11:8:8:5:11:8
chr14	67667019	.	C	T	40.29	PASS	AF=0.545455;AO=6;DP=11;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.025438;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=107.397;QD=14.6524;RBI=0.0815138;REFB=0.0100848;REVB=-0.077443;RO=5;SAF=3;SAR=3;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.229845;STB=0.635942;STBP=0.376;TYPE=snp;VARB=-0.00653264;OID=.;OPOS=67667019;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:11:11:5:5:6:6:0.545455:3:3:4:1:3:3:4:1
chr14	67671701	.	C	T	93.33	PASS	AF=0.578947;AO=11;DP=19;FAO=11;FDP=19;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.00171654;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.0392;QD=19.6478;RBI=0.0301286;REFB=-0.0619521;REVB=0.0300797;RO=8;SAF=3;SAR=8;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0897445;STB=0.551626;STBP=0.692;TYPE=snp;VARB=0.0423451;OID=.;OPOS=67671701;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:19:19:8:8:11:11:0.578947:8:3:3:5:8:3:3:5
chr14	67769177	.	A	C	958.08	PASS	AF=0.439655;AO=102;DP=231;FAO=102;FDP=232;FR=.;FRO=130;FSAF=47;FSAR=55;FSRF=73;FSRR=57;FWDB=0.0109543;FXX=0.00854664;HRUN=4;LEN=1;MLLD=164.245;QD=16.5187;RBI=0.0179045;REFB=-0.0112792;REVB=-0.0141625;RO=129;SAF=47;SAR=55;SRF=73;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105392;STB=0.556294;STBP=0.137;TYPE=snp;VARB=0.0106757;OID=.;OPOS=67769177;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:231:232:129:130:102:102:0.439655:55:47:73:56:55:47:73:57
chr14	67800316	.	G	A	805.19	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0257329;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.844;QD=64.4154;RBI=0.0271511;REFB=0;REVB=-0.0086602;RO=0;SAF=26;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.10374e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.52617e-05;OID=.;OPOS=67800316;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:24:26:0:0:24:26:0:0
chr14	67800815	.	G	A	772.33	PASS	AF=0.98;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0373908;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=64.2872;QD=61.7861;RBI=0.0467736;REFB=-0.0333033;REVB=0.0281016;RO=1;SAF=21;SAR=28;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0165122;STB=0.508768;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.00903667;OID=.;OPOS=67800815;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:50:50:1:1:49:49:0.98:28:21:0:1:28:21:0:1
chr14	67815761	.	A	G	250.37	PASS	AF=0.48;AO=24;DP=50;FAO=24;FDP=50;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=0.00169077;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.528;QD=20.0295;RBI=0.00855138;REFB=-0.0165597;REVB=-0.00838257;RO=25;SAF=13;SAR=11;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0167601;STB=0.518503;STBP=0.806;TYPE=snp;VARB=0.0190903;OID=.;OPOS=67815761;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:25:26:24:24:0.48:11:13:14:11:11:13:15:11
chr14	67850106	.	A	G	321.81	PASS	AF=0.507463;AO=35;DP=67;FAO=34;FDP=67;FR=.;FRO=33;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=-0.0129279;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.2303;QD=19.2124;RBI=0.0145686;REFB=-0.0192938;REVB=0.0067167;RO=32;SAF=18;SAR=17;SRF=20;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0957787;STB=0.538031;STBP=0.568;TYPE=snp;VARB=0.026807;OID=.;OPOS=67850106;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:32:33:35:34:0.507463:17:18:20:12:16:18:20:13
chr14	67938818	.	G	A	94.25	PASS	AF=0.333333;AO=12;DP=36;FAO=12;FDP=36;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=-0.0151284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.674;QD=10.4723;RBI=0.0151657;REFB=-0.00517583;REVB=0.00106313;RO=24;SAF=8;SAR=4;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0181975;OID=.;OPOS=67938818;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:36:36:24:24:12:12:0.333333:4:8:16:8:4:8:16:8
chr14	67939483	.	T	C	221.97	PASS	AF=0.6;AO=21;DP=35;FAO=21;FDP=35;FR=.;FRO=14;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.0726581;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.7102;QD=25.3683;RBI=0.0744336;REFB=-0.0281858;REVB=0.0161608;RO=14;SAF=11;SAR=10;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119429;STB=0.566333;STBP=0.344;TYPE=snp;VARB=0.0158974;OID=.;OPOS=67939483;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:14:14:21:21:0.6:10:11:5:9:10:11:5:9
chr14	68022571	.	G	A	42.23	PASS	AF=0.666667;AO=6;DP=9;FAO=6;FDP=9;FR=.;FRO=3;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0125722;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.809;QD=18.7669;RBI=0.0328616;REFB=0.00941915;REVB=0.0303616;RO=3;SAF=5;SAR=1;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200664;STB=0.615062;STBP=0.687;TYPE=snp;VARB=-0.00294614;OID=.;OPOS=68022571;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:9:9:3:3:6:6:0.666667:1:5:3:0:1:5:3:0
chr14	68029118	.	C	A	255.35	PASS	AF=0.38961;AO=30;DP=77;FAO=30;FDP=77;FR=.;FRO=47;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=27;FWDB=-0.0377922;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.408;QD=13.2648;RBI=0.040513;REFB=0.000960009;REVB=0.0145964;RO=46;SAF=18;SAR=12;SRF=19;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197273;STB=0.606147;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=-0.00226696;OID=.;OPOS=68029118;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:46:47:30:30:0.38961:12:18:19:27:12:18:20:27
chr14	68053802	.	T	C	140.08	PASS	AF=0.555556;AO=15;DP=26;FAO=15;FDP=27;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=-0.0303375;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.062;QD=20.7529;RBI=0.0339843;REFB=-0.012366;REVB=-0.0153156;RO=11;SAF=5;SAR=10;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.232282;STB=0.649798;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=0.0105475;OID=.;OPOS=68053802;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:27:11:12:15:15:0.555556:10:5:7:4:10:5:8:4
chr14	68053977	.	A	C	1696.68	PASS	AF=1;AO=109;DP=111;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0614759;FXX=0.00884877;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.5661;QD=60.5957;RBI=0.0618806;REFB=0;REVB=-0.00706576;RO=1;SAF=36;SAR=73;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00645907;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000341918;OID=.;OPOS=68053977;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:111:112:1:0:109:112:1:73:36:0:1:75:37:0:0
chr14	68118132	.	C	T	324.64	PASS	AF=0.5;AO=34;DP=70;FAO=35;FDP=70;FR=.;FRO=35;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=23;FWDB=0.00758306;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.542;QD=18.551;RBI=0.0235905;REFB=0.00255806;REVB=-0.0223385;RO=35;SAF=20;SAR=14;SRF=12;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.220665;STB=0.627047;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=-0.00134811;OID=.;OPOS=68118132;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:35:35:34:35:0.5:14:20:12:23:14:21:12:23
chr14	68172894	.	C	T	61.81	PASS	AF=0.264706;AO=9;DP=34;FAO=9;FDP=34;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=-0.0101432;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.2056;QD=7.27141;RBI=0.0446328;REFB=0.00458271;REVB=-0.043465;RO=24;SAF=5;SAR=4;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0828821;STB=0.53326;STBP=0.858;TYPE=snp;VARB=-0.00851916;OID=.;OPOS=68172894;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:34:34:24:25:9:9:0.264706:4:5:15:9:4:5:15:10
chr14	68213744	.	G	A	770.5	PASS	AF=0.982143;AO=55;DP=56;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0141549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.427;QD=55.0356;RBI=0.0163152;REFB=-0.0930933;REVB=-0.00811329;RO=0;SAF=34;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.511624;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.000926515;OID=.;OPOS=68213744;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:56:56:0:1:55:55:0.982143:21:34:0:0:21:34:0:1
chr14	68213792	.	A	G	268.72	PASS	AF=0.520833;AO=25;DP=48;FAO=25;FDP=48;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=0.0184268;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.317;QD=22.3929;RBI=0.0311092;REFB=-0.0195674;REVB=0.0250647;RO=23;SAF=11;SAR=14;SRF=16;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.216381;STB=0.620596;STBP=0.098;TYPE=snp;VARB=0.0133246;OID=.;OPOS=68213792;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:23:23:25:25:0.520833:14:11:16:7:14:11:16:7
chr14	68214788	.	T	C	191.13	PASS	AF=0.423077;AO=22;DP=53;FAO=22;FDP=52;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=20;FSRR=10;FWDB=0.00508292;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.313;QD=14.7026;RBI=0.00535755;REFB=0.000732574;REVB=-0.0016933;RO=30;SAF=13;SAR=9;SRF=20;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0806116;STB=0.545915;STBP=0.609;TYPE=snp;VARB=-0.000568962;OID=.;OPOS=68214788;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:52:30:30:22:22:0.423077:9:13:20:10:9:13:20:10
chr14	68218165	.	G	A	115.08	PASS	AF=0.541667;AO=13;DP=24;FAO=13;FDP=24;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=-0.0490735;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.84;QD=19.1806;RBI=0.0508504;REFB=0.0105135;REVB=0.0133248;RO=11;SAF=3;SAR=10;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136262;STB=0.578384;STBP=0.471;TYPE=snp;VARB=-0.00687956;OID=.;OPOS=68218165;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:24:24:11:11:13:13:0.541667:10:3:4:7:10:3:4:7
chr14	68234539	.	T	C	1044.38	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0157544;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=213.48;QD=59.6789;RBI=0.0402666;REFB=0;REVB=0.0370567;RO=0;SAF=21;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.0379e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.26078e-05;OID=.;OPOS=68234539;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:49:21:0:0:49:21:0:0
chr14	68264867	.	A	G	238.84	PASS	AF=1;AO=16;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0565936;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.98;QD=50.2814;RBI=0.0582966;REFB=0;REVB=0.0139879;RO=0;SAF=4;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.07465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0011345;OID=.;OPOS=68264867;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:16:19:1:12:4:0:0:12:7:0:0
chr14	68616597	.	G	A	145.04	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0215177;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.1487;QD=44.6262;RBI=0.070972;REFB=0;REVB=-0.0676314;RO=0;SAF=8;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00441955;OID=.;OPOS=68616597;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:5:8:0:0:5:8:0:0
chr14	68935789	.	T	C	902.69	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.024282;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.1736;QD=58.2383;RBI=0.0463615;REFB=0;REVB=-0.0394939;RO=0;SAF=30;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000124374;OID=.;OPOS=68935789;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:32:30:0:0:32:30:0:0
chr14	69012355	.	C	G	266.48	PASS	AF=0.447761;AO=30;DP=67;FAO=30;FDP=67;FR=.;FRO=37;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=24;FWDB=0.0598517;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.062;QD=15.9093;RBI=0.0608115;REFB=0.0103108;REVB=0.0107618;RO=37;SAF=12;SAR=18;SRF=13;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0502478;STB=0.528283;STBP=0.704;TYPE=snp;VARB=-0.0116141;OID=.;OPOS=69012355;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:37:37:30:30:0.447761:18:12:13:24:18:12:13:24
chr14	69117512	.	T	C	195.42	PASS	AF=0.337838;AO=25;DP=74;FAO=25;FDP=74;FR=.;FRO=49;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=30;FSRR=19;FWDB=0.0258817;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=96.2706;QD=10.5631;RBI=0.0272862;REFB=-0.00424365;REVB=0.00864156;RO=47;SAF=14;SAR=11;SRF=30;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.090588;STB=0.53537;STBP=0.66;TYPE=snp;VARB=0.0102486;OID=.;OPOS=69117512;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:47:49:25:25:0.337838:11:14:30:17:11:14:30:19
chr14	69257858	.	C	T	132.7	PASS	AF=0.428571;AO=14;DP=35;FAO=15;FDP=35;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.0284388;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=240.56;QD=15.1652;RBI=0.0306764;REFB=-0.0106825;REVB=-0.0115011;RO=20;SAF=4;SAR=10;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.27918;STB=0.627277;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=0.011341;OID=.;OPOS=69257858;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:20:20:14:15:0.428571:10:4:11:9:10:5:11:9
chr14	69262441	.	A	G	1091.14	PASS	AF=0.949367;AO=75;DP=80;FAO=75;FDP=79;FR=.;FRO=4;FSAF=31;FSAR=44;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.00307318;FXX=0.0124984;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.3926;QD=55.2476;RBI=0.0392666;REFB=-0.0132553;REVB=-0.0391462;RO=4;SAF=31;SAR=44;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0161583;STB=0.508549;STBP=0.56;TYPE=snp;VARB=0.00173569;OID=.;OPOS=69262441;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:80:79:4:4:75:75:0.949367:44:31:1:3:44:31:1:3
chr14	69263074	.	G	A	175.66	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0853821;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.86;QD=46.8432;RBI=0.0957446;REFB=0;REVB=0.0433234;RO=0;SAF=2;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00511163;OID=.;OPOS=69263074;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:13:2:0:0:13:2:0:0
chr14	69695792	.	G	A	698.14	PASS	AF=0.980392;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.000562827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.0974;QD=54.7564;RBI=0.00462269;REFB=-0.075792;REVB=0.0045883;RO=1;SAF=28;SAR=22;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0209158;STB=0.511107;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.013302;OID=.;OPOS=69695792;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:51:51:1:1:50:50:0.980392:22:28:0:1:22:28:0:1
chr14	69703158	.	A	G	2165.57	PASS	AF=0.979167;AO=139;DP=145;FAO=141;FDP=144;FR=.;FRO=3;FSAF=66;FSAR=75;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0148862;FXX=0.0136977;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.547;QD=60.1547;RBI=0.014888;REFB=-0.0813399;REVB=-0.000229322;RO=4;SAF=65;SAR=74;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0150545;STB=0.504151;STBP=0.455;TYPE=snp;VARB=0.00067442;OID=.;OPOS=69703158;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:145:144:4:3:139:141:0.979167:74:65:3:1:75:66:2:1
chr14	69704553	.	G	T	1231.41	PASS	AF=0.987805;AO=81;DP=82;FAO=81;FDP=82;FR=.;FRO=1;FSAF=50;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0247596;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.28;QD=60.0686;RBI=0.0385393;REFB=-0.0432161;REVB=0.0295337;RO=0;SAF=50;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.35858e-08;STB=0.504949;STBP=0.496;TYPE=snp;VARB=0.000354909;OID=.;OPOS=69704553;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:82:82:0:1:81:81:0.987805:31:50:0:0:31:50:1:0
chr14	69799892	.	A	G	161.5	PASS	AF=0.5;AO=17;DP=34;FAO=17;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.00951067;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.58;QD=19.0004;RBI=0.0229374;REFB=-0.0214514;REVB=-0.0208727;RO=17;SAF=8;SAR=9;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0261143;OID=.;OPOS=69799892;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:17:17:17:17:0.5:9:8:8:9:9:8:8:9
chr14	69820946	.	C	A	117.75	PASS	AF=0.368421;AO=14;DP=38;FAO=14;FDP=38;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=-0.0184363;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.044;QD=12.3945;RBI=0.023353;REFB=-0.00997911;REVB=-0.0143341;RO=22;SAF=8;SAR=6;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12178;STB=0.545389;STBP=0.682;TYPE=snp;VARB=0.0304535;OID=.;OPOS=69820946;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:22:24:14:14:0.368421:6:8:10:12:6:8:12:12
chr14	70037611	.	A	T	1142.9	PASS	AF=0.95122;AO=78;DP=82;FAO=78;FDP=82;FR=.;FRO=4;FSAF=44;FSAR=34;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.00492295;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=276.758;QD=55.7512;RBI=0.0165108;REFB=-0.0343942;REVB=0.0157598;RO=3;SAF=44;SAR=34;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00731153;STB=0.509239;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.000553162;OID=.;OPOS=70037611;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:82:82:3:4:78:78:0.95122:34:44:2:1:34:44:3:1
chr14	70038786	.	A	G	785.82	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0376347;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.1246;QD=64.1481;RBI=0.0474412;REFB=0;REVB=-0.0288842;RO=0;SAF=17;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.70321e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000684922;OID=.;OPOS=70038786;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:32:17:0:0:32:17:0:0
chr14	70180778	.	C	G	1044.72	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.019506;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.469;QD=59.6985;RBI=0.0207011;REFB=0;REVB=0.00693202;RO=0;SAF=28;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.25749e-05;OID=.;OPOS=70180778;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:70:0:0:69:70:1:41:28:0:0:42:28:0:0
chr14	70238017	.	A	AGGAGCC,C	152.44	PASS	AF=0.191489,0.0319149;AO=22,6;DP=97;FAO=18,3;FDP=94;FR=.;FRO=73;FSAF=5,1;FSAR=13,2;FSRF=35;FSRR=38;FWDB=-0.0124185,-0.0452783;FXX=0;HRUN=2,1;LEN=6,1;MLLD=191.977,234.05;QD=6.48687;RBI=0.0270281,0.0495987;REFB=-0.00377288,-0.0140648;REVB=-0.0240062,-0.0202462;RO=67;SAF=12,1;SAR=10,5;SRF=29;SRR=38;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.13825,-0.315846;STB=0.67077,0.641896;STBP=0.118,0.673;TYPE=ins,snp;VARB=0.00815271,0.0145752;OID=.,.;OPOS=70238018,70238017;OREF=-,A;OALT=GGAGCC,C;OMAPALT=AGGAGCC,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:94:67:73:22,6:18,3:0.191489,0.0319149:10,5:12,1:29:38:13,2:5,1:35:38
chr14	70245193	.	G	A	179.7	PASS	AF=0.413043;AO=19;DP=46;FAO=19;FDP=46;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=-0.0110406;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.5712;QD=15.6258;RBI=0.012241;REFB=-0.0199103;REVB=-0.00528665;RO=27;SAF=11;SAR=8;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.210268;STB=0.620643;STBP=0.191;TYPE=snp;VARB=0.0253522;OID=.;OPOS=70245193;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:27:27:19:19:0.413043:8:11:10:17:8:11:10:17
chr14	70634087	.	A	G	1590.86	PASS	AF=1;AO=99;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112866;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.776;QD=64.2772;RBI=0.0434989;REFB=0;REVB=-0.0420091;RO=0;SAF=48;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.35963e-05;OID=.;OPOS=70634087;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:99:99:0:0:99:99:1:51:48:0:0:51:48:0:0
chr14	70712880	.	A	C	182.82	PASS	AF=0.941176;AO=16;DP=17;FAO=16;FDP=17;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0137311;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=273.255;QD=43.016;RBI=0.0388294;REFB=-0.0226073;REVB=-0.0363205;RO=0;SAF=9;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.526283;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.000247;OID=.;OPOS=70712880;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:17:17:0:1:16:16:0.941176:7:9:0:0:7:9:1:0
chr14	70713586	.	T	G	260.54	PASS	AF=0.3125;AO=35;DP=112;FAO=35;FDP=112;FR=.;FRO=77;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=42;FSRR=35;FWDB=0.00484355;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=220.08;QD=9.30489;RBI=0.0154616;REFB=-0.00527672;REVB=-0.0146833;RO=75;SAF=20;SAR=15;SRF=42;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0136083;STB=0.518124;STBP=0.807;TYPE=snp;VARB=0.00933615;OID=.;OPOS=70713586;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:112:75:77:35:35:0.3125:15:20:42:33:15:20:42:35
chr14	70713720	.	AATC	A	269.0	PASS	AF=0.412844;AO=44;DP=112;FAO=45;FDP=109;FR=.;FRO=64;FSAF=27;FSAR=18;FSRF=33;FSRR=31;FWDB=-0.00917258;FXX=0.00909008;HRUN=3;LEN=3;MLLD=292.121;QD=9.87159;RBI=0.0128532;REFB=-0.00689002;REVB=-0.00900383;RO=65;SAF=26;SAR=18;SRF=32;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105105;STB=0.550539;STBP=0.362;TYPE=del;VARB=0.00883474;OID=.;OPOS=70713721;OREF=ATC;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.412844:44:112:45:109:64:27:18:33:31:99:65:26:18:32:33
chr14	70713858	.	T	C	408.47	PASS	AF=0.432432;AO=36;DP=101;FAO=48;FDP=111;FR=.;FRO=63;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=26;FSRR=37;FWDB=0.0319684;FXX=0.00892777;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.86;QD=14.7196;RBI=0.033829;REFB=-0.0204418;REVB=0.0110644;RO=63;SAF=10;SAR=26;SRF=26;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16912;STB=0.526185;STBP=0.657;TYPE=snp;VARB=0.0268468;OID=.;OPOS=70713858;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:111:63:63:36:48:0.432432:26:10:26:37:26:22:26:37
chr14	70827773	.	T	C	955.08	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.05942;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.8132;QD=58.7743;RBI=0.0670883;REFB=0;REVB=0.0311466;RO=0;SAF=37;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.99207e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000950903;OID=.;OPOS=70827773;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:28:37:0:0:28:37:0:0
chr14	70839389	.	A	C	139.87	PASS	AF=0.517241;AO=16;DP=30;FAO=15;FDP=29;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.00366892;FXX=0.0333222;HRUN=6;LEN=1;MLLD=226.75;QD=19.2922;RBI=0.014416;REFB=-0.00610724;REVB=-0.0139413;RO=14;SAF=8;SAR=8;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.516107;STBP=0.957;TYPE=snp;VARB=0.00462046;OID=.;OPOS=70839389;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:29:14:14:16:15:0.517241:8:8:7:7:7:8:7:7
chr14	70924249	.	A	G	429.28	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0198172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.708;QD=57.2374;RBI=0.0613776;REFB=0;REVB=0.0580903;RO=0;SAF=18;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000150271;OID=.;OPOS=70924249;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:30:0:0:29:30:1:11:18:0:0:12:18:0:0
chr14	70924450	.	C	T	54.0	PASS	AF=0.307692;AO=8;DP=26;FAO=8;FDP=26;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=0.000715233;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.305;QD=8.30751;RBI=0.0125028;REFB=-0.00531417;REVB=-0.0124824;RO=17;SAF=3;SAR=5;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.351886;STB=0.693987;STBP=0.21;TYPE=snp;VARB=0.00690233;OID=.;OPOS=70924450;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:26:26:17:18:8:8:0.307692:5:3:12:5:5:3:12:6
chr14	70924462	.	A	G	54.0	PASS	AF=0.307692;AO=8;DP=26;FAO=8;FDP=26;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=5;FWDB=-0.00471748;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.143;QD=8.30791;RBI=0.0120417;REFB=-0.00117822;REVB=-0.0110792;RO=18;SAF=3;SAR=5;SRF=13;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.372986;STB=0.726764;STBP=0.163;TYPE=snp;VARB=0.00242723;OID=.;OPOS=70924462;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:26:26:18:18:8:8:0.307692:5:3:13:5:5:3:13:5
chr14	70924501	.	C	G	307.62	PASS	AF=0.833333;AO=25;DP=30;FAO=25;FDP=30;FR=.;FRO=5;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.00026652;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.242;QD=41.0158;RBI=0.00357461;REFB=-0.0033295;REVB=-0.00356466;RO=5;SAF=14;SAR=11;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0124821;STB=0.50677;STBP=0.928;TYPE=snp;VARB=0.000644804;OID=.;OPOS=70924501;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:26:30:30:5:5:25:25:0.833333:11:14:3:2:11:14:3:2
chr14	70924566	.	CA	GT	34.15	PASS	AF=0.176471;AO=6;DP=34;FAO=6;FDP=34;FR=.;FRO=28;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=-0.030488;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=195.715;QD=4.01764;RBI=0.0378293;REFB=-0.00558685;REVB=-0.0223951;RO=28;SAF=4;SAR=2;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.240096;STB=0.666112;STBP=0.428;TYPE=mnp;VARB=0.0251593;OID=.;OPOS=70924566;OREF=CA;OALT=GT;OMAPALT=GT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:34:34:28:28:6:6:0.176471:2:4:13:15:2:4:13:15
chr14	70924693	.	T	C	41.83	PASS	AF=0.179487;AO=7;DP=39;FAO=7;FDP=39;FR=.;FRO=32;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=20;FSRR=12;FWDB=-0.034425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.8622;QD=4.29031;RBI=0.036617;REFB=-0.00491448;REVB=-0.012479;RO=32;SAF=1;SAR=6;SRF=20;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.557646;STB=0.873991;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.0396662;OID=.;OPOS=70924693;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:39:39:32:32:7:7:0.179487:6:1:20:12:6:1:20:12
chr14	70924852	.	A	C	71.06	PASS	AF=0.190476;AO=12;DP=63;FAO=12;FDP=63;FR=.;FRO=51;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=25;FSRR=26;FWDB=0.0144199;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.4781;QD=4.51188;RBI=0.0293151;REFB=-0.00713561;REVB=-0.0255233;RO=51;SAF=10;SAR=2;SRF=25;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.452506;STB=0.799467;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.0200547;OID=.;OPOS=70924852;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:71:63:63:51:51:12:12:0.190476:2:10:25:26:2:10:25:26
chr14	70924955	.	A	C	251.86	PASS	AF=0.426471;AO=29;DP=68;FAO=29;FDP=68;FR=.;FRO=39;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=26;FSRR=13;FWDB=0.00170388;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.7199;QD=14.8153;RBI=0.0179755;REFB=-0.012532;REVB=0.0178946;RO=39;SAF=12;SAR=17;SRF=26;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.251622;STB=0.642052;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.0195805;OID=.;OPOS=70924955;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:39:39:29:29:0.426471:17:12:26:13:17:12:26:13
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chr14	71109153	.	C	G	191.63	PASS	AF=0.408163;AO=20;DP=49;FAO=20;FDP=49;FR=.;FRO=29;FSAF=4;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=-0.00986673;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=253.306;QD=15.6428;RBI=0.0130495;REFB=-0.0148022;REVB=0.00854028;RO=29;SAF=4;SAR=16;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.308253;STB=0.6798;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.0286056;OID=.;OPOS=71109153;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:29:29:20:20:0.408163:16:4:13:16:16:4:13:16
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chr14	71374702	.	G	A	813.66	PASS	AF=0.461957;AO=84;DP=184;FAO=85;FDP=184;FR=.;FRO=99;FSAF=40;FSAR=45;FSRF=53;FSRR=46;FWDB=-0.0191131;FXX=0.00540511;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.4567;QD=17.6882;RBI=0.0297383;REFB=-0.0151314;REVB=0.0227829;RO=94;SAF=39;SAR=45;SRF=50;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0645793;STB=0.534816;STBP=0.381;TYPE=snp;VARB=0.022842;OID=.;OPOS=71374702;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:184:184:94:99:84:85:0.461957:45:39:50:44:45:40:53:46
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chr14	71576640	.	G	A	340.79	PASS	AF=0.425287;AO=37;DP=87;FAO=37;FDP=87;FR=.;FRO=50;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=25;FSRR=25;FWDB=0.017149;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=197.836;QD=15.6684;RBI=0.0268036;REFB=-0.00751491;REVB=-0.0205997;RO=50;SAF=15;SAR=22;SRF=25;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0977164;STB=0.555175;STBP=0.387;TYPE=snp;VARB=0.00809419;OID=.;OPOS=71576640;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:50:50:37:37:0.425287:22:15:25:25:22:15:25:25
chr14	71577480	.	G	A	261.65	PASS	AF=0.422535;AO=30;DP=71;FAO=30;FDP=71;FR=.;FRO=41;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=-0.0144394;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.999;QD=14.7407;RBI=0.0150792;REFB=-0.0107642;REVB=-0.00434568;RO=41;SAF=19;SAR=11;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176005;STB=0.599932;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.0160829;OID=.;OPOS=71577480;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:41:41:30:30:0.422535:11:19:19:22:11:19:19:22
chr14	71581398	.	C	CT	52.74	PASS	AF=0.422222;AO=20;DP=51;FAO=19;FDP=45;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=0.0239455;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=8.57385;QD=4.68797;RBI=0.288752;REFB=-0.0891855;REVB=-0.287758;RO=26;SAF=6;SAR=14;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.247383;STB=0.51391;STBP=0.878;TYPE=ins;VARB=0.0595814;OID=.;OPOS=71581399;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.422222:20:51:19:45:26:7:12:9:17:52:26:6:14:14:12
chr14	71915413	.	GTT	GT,GTG,GTTGTG	72.73	PASS	AF=0,0.125,0.291667;AO=3,3,7;DP=24;FAO=0,3,7;FDP=24;FR=.;FRO=14;FSAF=0,1,1;FSAR=0,2,6;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=-0.340917,-0.154054,-0.0460048;FXX=0;HRUN=2,2,1;LEN=1,1,3;MLLD=21.3215,46.5497,229.732;QD=12.1214;RBI=0.341349,0.16367,0.0460166;REFB=-0.0778437,-0.0246038,-0.011539;REVB=0.0171796,0.0552731,0.00104045;RO=11;SAF=3,1,1;SAR=0,2,6;SRF=6;SRR=5;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.630413,-0.228941,-0.466707;STB=0.5,0.739276,0.844052;STBP=1,0.432,0.047;TYPE=del,snp,ins;VARB=0,-0.0301365,0.0154577;OID=.,.,.;OPOS=71915414,71915415,71915416;OREF=T,T,-;OALT=-,G,GTG;OMAPALT=GT,GTG,GTTGTG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/3:0,0.125,0.291667:3,3,7:24:0,3,7:24:14:0,1,1:0,2,6:9:5:49:11:3,1,1:0,2,6:6:5
chr14	72055468	.	A	C	372.91	PASS	AF=1;AO=26;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0141172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.368;QD=55.2453;RBI=0.0477044;REFB=0;REVB=0.0455677;RO=0;SAF=17;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000441719;OID=.;OPOS=72055468;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:26:27:1:9:17:0:0:10:17:0:0
chr14	72117156	.	T	C	678.94	PASS	AF=0.977778;AO=44;DP=46;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0694578;FXX=0.0217344;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.5171;QD=60.3501;RBI=0.0894672;REFB=-0.0121401;REVB=0.0563915;RO=2;SAF=22;SAR=22;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.511106;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.000228459;OID=.;OPOS=72117156;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:46:45:2:1:44:44:0.977778:22:22:1:1:22:22:1:0
chr14	73032711	.	C	G	92.2	PASS	AF=0.292683;AO=12;DP=41;FAO=12;FDP=41;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=0.0166459;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.5288;QD=8.99478;RBI=0.0168647;REFB=-0.00391298;REVB=-0.00270782;RO=29;SAF=9;SAR=3;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.393415;STB=0.740335;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=0.0195465;OID=.;OPOS=73032711;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:41:41:29:29:12:12:0.292683:3:9:12:17:3:9:12:17
chr14	73079291	.	G	GA,GAA	229.17	PASS	AF=0,1;AO=4,16;DP=22;FAO=0,20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=0,12;FSAR=0,8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.252809,0.139404;FXX=0.0475964;HRUN=3,3;LEN=1,2;MLLD=21.1574,36.4824;QD=45.8336;RBI=0.25922,0.142753;REFB=0,0;REVB=0.0572952,0.0307356;RO=2;SAF=3,9;SAR=1,7;SRF=1;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.161039,0.012825;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,ins;VARB=0,0.00915516;OID=.,.;OPOS=73079292,73079292;OREF=-,-;OALT=A,AA;OMAPALT=GA,GAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	2/2:0,1:4,16:22:0,20:20:0:0,12:0,8:0:0:4:2:3,9:1,7:1:1
chr14	73220020	.	A	G	357.46	PASS	AF=0.931034;AO=27;DP=29;FAO=27;FDP=29;FR=.;FRO=2;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0906881;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.5319;QD=49.3045;RBI=0.10006;REFB=0.0254387;REVB=-0.0422814;RO=2;SAF=16;SAR=11;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0772824;STB=0.541636;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=-0.003864;OID=.;OPOS=73220020;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:29:29:2:2:27:27:0.931034:11:16:0:2:11:16:0:2
chr14	73358945	.	A	C	1762.96	PASS	AF=0.952756;AO=119;DP=125;FAO=121;FDP=127;FR=.;FRO=6;FSAF=50;FSAR=71;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.0237086;FXX=0.00781189;HRUN=4;LEN=1;MLLD=155.752;QD=55.5262;RBI=0.0240536;REFB=-0.110857;REVB=-0.00405944;RO=2;SAF=49;SAR=70;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0189892;STB=0.520316;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.000656492;OID=.;OPOS=73358945;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:125:127:2:6:119:121:0.952756:70:49:2:0:71:50:5:1
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chr14	73404752	.	G	C	45.35	PASS	AF=0.318182;AO=7;DP=22;FAO=7;FDP=22;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.00338549;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=234.201;QD=8.24621;RBI=0.0136901;REFB=0.0104293;REVB=0.0132649;RO=15;SAF=6;SAR=1;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.425239;STB=0.773293;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=-0.0189053;OID=.;OPOS=73404752;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:22:22:15:15:7:7:0.318182:1:6:8:7:1:6:8:7
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chr14	73440864	.	C	T	429.02	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00457137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.375;QD=57.2022;RBI=0.0321472;REFB=0;REVB=0.0318205;RO=0;SAF=9;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000237987;OID=.;OPOS=73440864;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:21:9:0:0:21:9:0:0
chr14	73448583	.	G	A	52.06	PASS	AF=0.25;AO=8;DP=32;FAO=8;FDP=32;FR=.;FRO=24;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.0114135;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.7767;QD=6.50744;RBI=0.0565158;REFB=-0.00233287;REVB=-0.0553513;RO=24;SAF=4;SAR=4;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0980232;STB=0.562346;STBP=0.749;TYPE=snp;VARB=0.00365068;OID=.;OPOS=73448583;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:32:32:24:24:8:8:0.25:4:4:10:14:4:4:10:14
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chr14	73465003	.	A	G	138.37	PASS	AF=0.327273;AO=18;DP=56;FAO=18;FDP=55;FR=.;FRO=37;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=0.00717664;FXX=0.017854;HRUN=3;LEN=1;MLLD=144.519;QD=10.0631;RBI=0.00781894;REFB=-0.00520719;REVB=-0.0031035;RO=37;SAF=11;SAR=7;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0824155;STB=0.548802;STBP=0.624;TYPE=snp;VARB=0.0194493;OID=.;OPOS=73465003;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:55:37:37:18:18:0.327273:7:11:20:17:7:11:20:17
chr14	73716774	.	G	A	283.64	PASS	AF=0.526316;AO=30;DP=57;FAO=30;FDP=57;FR=.;FRO=27;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=21;FSRR=6;FWDB=-0.0303235;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.6171;QD=19.9046;RBI=0.0344147;REFB=-0.0290026;REVB=0.0162744;RO=25;SAF=17;SAR=13;SRF=19;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166079;STB=0.604586;STBP=0.116;TYPE=snp;VARB=0.025695;OID=.;OPOS=73716774;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:25:27:30:30:0.526316:13:17:19:6:13:17:21:6
chr14	73727509	.	T	G	55.42	PASS	AF=0.363636;AO=8;DP=22;FAO=8;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.00442935;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.642;QD=10.0762;RBI=0.0100199;REFB=-0.0262851;REVB=-0.00898773;RO=13;SAF=2;SAR=6;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162774;STB=0.583112;STBP=0.619;TYPE=snp;VARB=0.029716;OID=.;OPOS=73727509;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:22:22:13:14:8:8:0.363636:6:2:5:8:6:2:5:9
chr14	73731313	.	C	T	587.14	PASS	AF=0.472868;AO=59;DP=127;FAO=61;FDP=129;FR=.;FRO=68;FSAF=23;FSAR=38;FSRF=32;FSRR=36;FWDB=-0.0150936;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.582;QD=18.206;RBI=0.0273909;REFB=-0.00775386;REVB=0.0228571;RO=67;SAF=23;SAR=36;SRF=32;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0863507;STB=0.551143;STBP=0.288;TYPE=snp;VARB=0.00992814;OID=.;OPOS=73731313;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:127:129:67:68:59:61:0.472868:36:23:32:35:38:23:32:36
chr14	73739369	.	G	A	45.92	PASS	AF=0.291667;AO=7;DP=24;FAO=7;FDP=24;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=-0.0142874;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.281;QD=7.65354;RBI=0.0185005;REFB=0.0060426;REVB=0.0117533;RO=17;SAF=6;SAR=1;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.433736;STB=0.809831;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=-0.0171637;OID=.;OPOS=73739369;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:24:24:17:17:7:7:0.291667:1:6:9:8:1:6:8:9
chr14	73957772	.	A	G	130.34	PASS	AF=1;AO=8;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.122576;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.5505;QD=43.4473;RBI=0.237252;REFB=0;REVB=0.203134;RO=0;SAF=6;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.58669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0196121;OID=.;OPOS=73957772;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:8:12:1:2:6:0:0:4:8:0:0
chr14	73958375	.	T	C	361.1	PASS	AF=1;AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.01706;FXX=0.0370233;HRUN=4;LEN=1;MLLD=267.111;QD=55.5542;RBI=0.0185762;REFB=0;REVB=-0.00735046;RO=0;SAF=9;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.40387e-05;OID=.;OPOS=73958375;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:26:0:0:26:26:1:17:9:0:0:17:9:0:0
chr14	73958812	.	T	C	612.92	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.035904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.955;QD=61.2917;RBI=0.0430204;REFB=0;REVB=-0.0236993;RO=0;SAF=15;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.40611e-05;OID=.;OPOS=73958812;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:40:0:0:39:40:1:24:15:0:0:24:16:0:0
chr14	73963383	.	T	C	754.43	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0132703;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.114;QD=56.9383;RBI=0.0503686;REFB=0;REVB=0.048589;RO=0;SAF=25;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000102384;OID=.;OPOS=73963383;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:28:25:0:0:28:25:0:0
chr14	73969610	.	G	A	243.7	PASS	AF=0.534884;AO=22;DP=42;FAO=23;FDP=43;FR=.;FRO=20;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.0221265;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.775;QD=22.6699;RBI=0.0398723;REFB=-0.0123166;REVB=0.0331695;RO=20;SAF=13;SAR=9;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0356034;STB=0.507181;STBP=0.935;TYPE=snp;VARB=0.010399;OID=.;OPOS=73969610;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:43:20:20:22:23:0.534884:9:13:11:9:10:13:11:9
chr14	73989859	.	C	T	803.31	PASS	AF=0.982759;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00847379;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.164;QD=55.401;RBI=0.0137452;REFB=0.0815595;REVB=0.0108224;RO=1;SAF=22;SAR=35;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0132859;STB=0.50704;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=-0.000499493;OID=.;OPOS=73989859;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:58:58:1:1:57:57:0.982759:35:22:0:1:35:22:0:1
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chr14	74061968	.	T	C	91.23	PASS	AF=0.52381;AO=11;DP=21;FAO=11;FDP=21;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=-0.0227727;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.791;QD=17.3779;RBI=0.0270907;REFB=-0.00699651;REVB=0.0146734;RO=10;SAF=5;SAR=6;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13078;STB=0.575089;STBP=0.545;TYPE=snp;VARB=0.0073732;OID=.;OPOS=74061968;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:21:21:10:10:11:11:0.52381:6:5:3:7:6:5:3:7
chr14	74083846	.	C	T	364.98	PASS	AF=0.697674;AO=30;DP=43;FAO=30;FDP=43;FR=.;FRO=13;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=0.0206711;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.072;QD=33.9512;RBI=0.0349215;REFB=-0.0283401;REVB=0.0281463;RO=13;SAF=14;SAR=16;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124508;STB=0.567856;STBP=0.195;TYPE=snp;VARB=0.0170834;OID=.;OPOS=74083846;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:13:13:30:30:0.697674:16:14:9:4:16:14:9:4
chr14	74168625	.	G	A	241.77	PASS	AF=0.451613;AO=27;DP=61;FAO=28;FDP=62;FR=.;FRO=34;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=0.00908261;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=264.231;QD=15.5982;RBI=0.0201923;REFB=-0.00428745;REVB=-0.0180343;RO=34;SAF=9;SAR=18;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113912;STB=0.571376;STBP=0.342;TYPE=snp;VARB=0.00592973;OID=.;OPOS=74168625;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:62:34:34:27:28:0.451613:18:9:15:19:19:9:15:19
chr14	74196686	.	T	C	421.22	PASS	AF=0.459184;AO=44;DP=100;FAO=45;FDP=98;FR=.;FRO=53;FSAF=17;FSAR=28;FSRF=22;FSRR=31;FWDB=0.0111229;FXX=0.0297;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.0549;QD=17.1925;RBI=0.0171225;REFB=-0.0250652;REVB=0.0130178;RO=55;SAF=17;SAR=27;SRF=24;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0515295;STB=0.521232;STBP=0.731;TYPE=snp;VARB=0.0206264;OID=.;OPOS=74196686;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:98:55:53:44:45:0.459184:27:17:24:31:28:17:22:31
chr14	74196792	.	T	C	253.68	PASS	AF=0.47619;AO=23;DP=56;FAO=30;FDP=63;FR=.;FRO=33;FSAF=8;FSAR=22;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=0.0442942;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.339;QD=16.1064;RBI=0.0506695;REFB=-0.054598;REVB=0.0246053;RO=33;SAF=2;SAR=21;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.519819;STB=0.595991;STBP=0.204;TYPE=snp;VARB=0.0495171;OID=.;OPOS=74196792;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:63:33:33:23:30:0.47619:21:2:14:19:22:8:14:19
chr14	74196844	.	T	C	220.58	PASS	AF=0.419355;AO=26;DP=62;FAO=26;FDP=62;FR=.;FRO=36;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=10;FSRR=26;FWDB=-0.0206754;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=233.663;QD=14.231;RBI=0.0226518;REFB=-0.00325487;REVB=0.00925368;RO=34;SAF=10;SAR=16;SRF=10;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0982658;STB=0.567518;STBP=0.392;TYPE=snp;VARB=0.00426952;OID=.;OPOS=74196844;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:34:36:26:26:0.419355:16:10:10:24:16:10:10:26
chr14	74206481	.	T	C	120.06	PASS	AF=0.411765;AO=14;DP=34;FAO=14;FDP=34;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=-0.0411568;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.1003;QD=14.1245;RBI=0.0426388;REFB=-0.0171269;REVB=-0.0111439;RO=20;SAF=6;SAR=8;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.220592;STB=0.627922;STBP=0.244;TYPE=snp;VARB=0.0208971;OID=.;OPOS=74206481;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:20:20:14:14:0.411765:8:6:13:7:8:6:13:7
chr14	74324807	.	G	A	220.19	PASS	AF=0.419355;AO=26;DP=62;FAO=26;FDP=62;FR=.;FRO=36;FSAF=6;FSAR=20;FSRF=13;FSRR=23;FWDB=0.0191457;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=47.0112;QD=14.2057;RBI=0.0313851;REFB=-0.00544335;REVB=-0.0248689;RO=36;SAF=6;SAR=20;SRF=13;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166341;STB=0.595532;STBP=0.248;TYPE=snp;VARB=0.00788638;OID=.;OPOS=74324807;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:36:36:26:26:0.419355:20:6:13:23:20:6:13:23
chr14	74441684	.	G	A	124.13	PASS	AF=0.722222;AO=12;DP=18;FAO=13;FDP=18;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.00644133;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.636;QD=27.5842;RBI=0.0308135;REFB=-0.0259753;REVB=-0.0301328;RO=6;SAF=4;SAR=8;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116132;STB=0.536029;STBP=0.651;TYPE=snp;VARB=0.00915314;OID=.;OPOS=74441684;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:18:18:6:5:12:13:0.722222:8:4:1:5:9:4:1:4
chr14	74489735	.	G	A	198.34	PASS	AF=0.4;AO=24;DP=60;FAO=24;FDP=60;FR=.;FRO=36;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=-0.0192484;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.625;QD=13.2229;RBI=0.0193561;REFB=-0.0143408;REVB=0.0020388;RO=36;SAF=9;SAR=15;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162279;STB=0.593142;STBP=0.261;TYPE=snp;VARB=0.0178103;OID=.;OPOS=74489735;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:36:36:24:24:0.4:15:9:19:17:15:9:19:17
chr14	74514674	.	A	T	1008.4	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000788792;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.546;QD=59.3174;RBI=0.0157054;REFB=0;REVB=-0.0156856;RO=0;SAF=28;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.964e-05;OID=.;OPOS=74514674;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:40:28:0:0:40:28:0:0
chr14	74516497	.	G	A	57.93	PASS	AF=0.470588;AO=8;DP=17;FAO=8;FDP=17;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.042845;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.172;QD=13.631;RBI=0.0471497;REFB=-0.00878906;REVB=-0.0196824;RO=9;SAF=3;SAR=5;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162764;STB=0.596769;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=0.00957635;OID=.;OPOS=74516497;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:17:17:9:9:8:8:0.470588:5:3:5:4:5:3:5:4
chr14	74826563	.	A	G	256.44	PASS	AF=0.533333;AO=24;DP=45;FAO=24;FDP=45;FR=.;FRO=21;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.0149778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.141;QD=22.7947;RBI=0.0190374;REFB=0.00271596;REVB=-0.0117511;RO=18;SAF=16;SAR=8;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179248;STB=0.571367;STBP=0.327;TYPE=snp;VARB=-0.00262231;OID=.;OPOS=74826563;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:18:21:24:24:0.533333:8:16:8:10:8:16:11:10
chr14	74991855	.	A	G	64.46	PASS	AF=0.346154;AO=9;DP=26;FAO=9;FDP=26;FR=.;FRO=17;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.0040167;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.24;QD=9.91651;RBI=0.042673;REFB=-0.0203855;REVB=-0.0424836;RO=17;SAF=3;SAR=6;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154634;STB=0.594378;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.0478186;OID=.;OPOS=74991855;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:26:26:17:17:9:9:0.346154:6:3:8:9:6:3:8:9
chr14	74992800	.	A	G	197.31	PASS	AF=0.425926;AO=22;DP=54;FAO=23;FDP=54;FR=.;FRO=31;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=21;FSRR=10;FWDB=-0.00684711;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.449;QD=14.6156;RBI=0.00949242;REFB=-0.0105784;REVB=-0.00657444;RO=32;SAF=16;SAR=6;SRF=21;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0877487;STB=0.51223;STBP=0.901;TYPE=snp;VARB=0.0148113;OID=.;OPOS=74992800;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:32:31:22:23:0.425926:6:16:21:11:7:16:21:10
chr14	75018993	.	C	T	1209.7	PASS	AF=0.566502;AO=115;DP=208;FAO=115;FDP=203;FR=.;FRO=88;FSAF=60;FSAR=55;FSRF=38;FSRR=50;FWDB=0.0264884;FXX=0.0240373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.8056;QD=23.8364;RBI=0.0301865;REFB=-0.030661;REVB=-0.0144772;RO=80;SAF=60;SAR=55;SRF=33;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0825325;STB=0.538915;STBP=0.206;TYPE=snp;VARB=0.0266485;OID=.;OPOS=75018993;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:208:203:80:88:115:115:0.566502:55:60:33:47:55:60:38:50
chr14	75128989	.	G	C	184.82	PASS	AF=0.475;AO=19;DP=40;FAO=19;FDP=40;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=-0.00683009;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.0404;QD=18.4817;RBI=0.0604475;REFB=-0.0137152;REVB=-0.0600604;RO=21;SAF=8;SAR=11;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0516853;STB=0.529381;STBP=0.698;TYPE=snp;VARB=0.0277226;OID=.;OPOS=75128989;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:21:21:19:19:0.475:11:8:10:11:11:8:10:11
chr14	75159007	.	G	A	373.66	PASS	AF=0.415842;AO=42;DP=100;FAO=42;FDP=101;FR=.;FRO=59;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=40;FSRR=19;FWDB=-0.0559589;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.1194;QD=14.7982;RBI=0.0830856;REFB=-0.00276883;REVB=0.0614151;RO=58;SAF=24;SAR=18;SRF=39;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108287;STB=0.564676;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.00445999;OID=.;OPOS=75159007;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:101:58:59:42:42:0.415842:18:24:39:19:18:24:40:19
chr14	75179734	.	C	G	262.67	PASS	AF=0.428571;AO=30;DP=70;FAO=30;FDP=70;FR=.;FRO=40;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=24;FWDB=0.108416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.0861;QD=15.0099;RBI=0.108897;REFB=-0.0110821;REVB=-0.0102233;RO=39;SAF=20;SAR=10;SRF=15;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.283029;STB=0.653743;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.0223556;OID=.;OPOS=75179734;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:39:40:30:30:0.428571:10:20:15:24:10:20:16:24
chr14	75245368	.	C	T	159.39	PASS	AF=0.472222;AO=17;DP=35;FAO=17;FDP=36;FR=.;FRO=19;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=0.120058;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.3524;QD=17.7096;RBI=0.120525;REFB=-0.0089974;REVB=0.010596;RO=18;SAF=13;SAR=4;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.364222;STB=0.721948;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.0159375;OID=.;OPOS=75245368;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:36:18:19:17:17:0.472222:4:13:7:11:4:13:7:12
chr14	75248669	.	G	T	172.18	PASS	AF=0.653846;AO=17;DP=26;FAO=17;FDP=26;FR=.;FRO=9;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=0.00258464;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=122.942;QD=26.4891;RBI=0.00607791;REFB=-0.00831488;REVB=-0.00550096;RO=9;SAF=14;SAR=3;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.433853;STB=0.74436;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.00653624;OID=.;OPOS=75248669;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:26:26:9:9:17:17:0.653846:3:14:2:7:3:14:2:7
chr14	75279395	.	T	A	278.94	PASS	AF=0.457143;AO=30;DP=71;FAO=32;FDP=70;FR=.;FRO=38;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=-0.00549924;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.03;QD=15.9391;RBI=0.0071068;REFB=-0.0171884;REVB=0.00450167;RO=38;SAF=18;SAR=12;SRF=21;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0482317;STB=0.541019;STBP=0.566;TYPE=snp;VARB=0.0184537;OID=.;OPOS=75279395;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:70:38:38:30:32:0.457143:12:18:21:17:12:20:21:17
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chr14	75367807	.	C	T	680.45	PASS	AF=0.445783;AO=74;DP=166;FAO=74;FDP=166;FR=.;FRO=92;FSAF=35;FSAR=39;FSRF=51;FSRR=41;FWDB=-0.0300464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.1408;QD=16.3964;RBI=0.0457823;REFB=-0.00520683;REVB=-0.0345432;RO=90;SAF=35;SAR=39;SRF=50;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0813923;STB=0.544999;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.00670181;OID=.;OPOS=75367807;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:166:166:90:92:74:74:0.445783:39:35:50:40:39:35:51:41
chr14	75373245	.	A	G	269.49	PASS	AF=0.508772;AO=29;DP=55;FAO=29;FDP=57;FR=.;FRO=28;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=6;FWDB=-0.00851245;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.304;QD=18.9117;RBI=0.0140669;REFB=-0.00982379;REVB=0.011199;RO=26;SAF=15;SAR=14;SRF=20;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.217391;STB=0.633167;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.00667064;OID=.;OPOS=75373245;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:57:26:28:29:29:0.508772:14:15:20:6:14:15:22:6
chr14	75373475	.	T	C	322.56	PASS	AF=0.507463;AO=32;DP=65;FAO=34;FDP=67;FR=.;FRO=33;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=0.0223342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.778;QD=19.2574;RBI=0.0223992;REFB=0.000271518;REVB=0.00170437;RO=30;SAF=19;SAR=13;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168439;STB=0.580938;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=-0.000211082;OID=.;OPOS=75373475;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:67:30:33:32:34:0.507463:13:19:12:18:14:20:14:19
chr14	75386576	.	G	A	478.23	PASS	AF=0.693548;AO=43;DP=60;FAO=43;FDP=62;FR=.;FRO=19;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=-0.00344931;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.417;QD=30.8538;RBI=0.00561748;REFB=-0.060882;REVB=0.00443378;RO=16;SAF=25;SAR=18;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0552706;STB=0.532695;STBP=0.456;TYPE=snp;VARB=0.0285464;OID=.;OPOS=75386576;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:62:16:19:43:43:0.693548:18:25:11:5:18:25:13:6
chr14	75388183	.	C	T	159.58	PASS	AF=0.472222;AO=17;DP=36;FAO=17;FDP=36;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=14;FWDB=-0.003756;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.31;QD=17.7315;RBI=0.013909;REFB=-0.0244943;REVB=-0.0133923;RO=19;SAF=5;SAR=12;SRF=5;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0350876;STB=0.519977;STBP=0.842;TYPE=snp;VARB=0.0293018;OID=.;OPOS=75388183;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:19:19:17:17:0.472222:12:5:5:14:12:5:5:14
chr14	75412908	.	A	G	1440.37	PASS	AF=1;AO=90;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0137715;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.228;QD=61.9515;RBI=0.0319621;REFB=0;REVB=-0.0288431;RO=0;SAF=47;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.16558e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00106366;OID=.;OPOS=75412908;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:93:93:0:0:90:93:1:43:47:0:0:43:50:0:0
chr14	75483812	.	T	C	1492.61	PASS	AF=0.990196;AO=101;DP=103;FAO=101;FDP=102;FR=.;FRO=1;FSAF=49;FSAR=52;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0145958;FXX=0.0097078;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.479;QD=58.5336;RBI=0.0363927;REFB=-0.017364;REVB=0.0333375;RO=1;SAF=49;SAR=52;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00958391;STB=0.505049;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=0.000312034;OID=.;OPOS=75483812;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:103:102:1:1:101:101:0.990196:52:49:1:0:52:49:1:0
chr14	75513883	.	T	C	1014.53	PASS	AF=0.985714;AO=69;DP=70;FAO=69;FDP=70;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0257334;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.656;QD=57.9734;RBI=0.0457971;REFB=-0.0120754;REVB=0.0378836;RO=1;SAF=32;SAR=37;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0145434;STB=0.50769;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=0.000403654;OID=.;OPOS=75513883;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:70:70:1:1:69:69:0.985714:37:32:1:0:37:32:1:0
chr14	75514444	.	G	T	104.84	PASS	AF=0.333333;AO=13;DP=39;FAO=13;FDP=39;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=-0.0498855;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.3607;QD=10.7528;RBI=0.0840508;REFB=0.00940462;REVB=-0.0676459;RO=26;SAF=7;SAR=6;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0433123;STB=0.525857;STBP=0.83;TYPE=snp;VARB=-0.0232737;OID=.;OPOS=75514444;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:26:26:13:13:0.333333:6:7:15:11:6:7:15:11
chr14	75537381	.	C	T	268.76	PASS	AF=0.520833;AO=25;DP=48;FAO=25;FDP=48;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=0.0117137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.498;QD=22.3967;RBI=0.013325;REFB=-0.0045211;REVB=-0.00635167;RO=23;SAF=11;SAR=14;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0425862;STB=0.523791;STBP=0.751;TYPE=snp;VARB=0.00360791;OID=.;OPOS=75537381;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:23:23:25:25:0.520833:14:11:9:14:14:11:9:14
chr14	75538217	.	G	T	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0287461;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.985;QD=48.737;RBI=0.0375031;REFB=0;REVB=-0.0240863;RO=0;SAF=4;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00207031;OID=.;OPOS=75538217;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:13:4:0:0:13:4:0:0
chr14	75544470	.	T	A	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00939195;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=277.323;QD=49.5992;RBI=0.0115153;REFB=0;REVB=-0.00666277;RO=0;SAF=6;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.51316e-05;OID=.;OPOS=75544470;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:12:6:0:0:12:6:0:0
chr14	75574087	.	C	T	766.12	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0347339;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.01;QD=63.8432;RBI=0.0348461;REFB=0;REVB=-0.00279466;RO=0;SAF=19;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000132523;OID=.;OPOS=75574087;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:29:19:0:0:29:19:0:0
chr14	75590822	.	G	A	861.07	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0922511;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.8272;QD=57.4043;RBI=0.0927513;REFB=0;REVB=0.00961949;RO=0;SAF=38;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000699183;OID=.;OPOS=75590822;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:22:38:0:0:22:38:0:0
chr14	75600697	.	C	T	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0463381;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.994;QD=50.4132;RBI=0.0611102;REFB=0;REVB=0.0398402;RO=0;SAF=10;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.36058e-05;OID=.;OPOS=75600697;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:9:10:0:0:9:10:0:0
chr14	75746690	.	C	T	177.16	PASS	AF=0.545455;AO=18;DP=33;FAO=18;FDP=33;FR=.;FRO=15;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=0.0230016;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.1804;QD=21.4742;RBI=0.0317718;REFB=0.000797271;REVB=0.0219175;RO=15;SAF=10;SAR=8;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0364952;STB=0.520525;STBP=0.831;TYPE=snp;VARB=0.000141318;OID=.;OPOS=75746690;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:15:15:18:18:0.545455:8:10:9:6:8:10:9:6
chr14	75758885	.	A	G	820.37	PASS	AF=1;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0511461;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.2247;QD=57.5696;RBI=0.0532499;REFB=0;REVB=0.01482;RO=0;SAF=36;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000444089;OID=.;OPOS=75758885;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:57:0:0:57:57:1:21:36:0:0:21:36:0:0
chr14	75904660	.	A	G	1973.46	PASS	AF=0.992248;AO=127;DP=128;FAO=128;FDP=129;FR=.;FRO=1;FSAF=81;FSAR=47;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0392353;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.983;QD=61.1925;RBI=0.0469687;REFB=-0.223788;REVB=-0.0258196;RO=1;SAF=80;SAR=47;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00590336;STB=0.503067;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.00128335;OID=.;OPOS=75904660;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:128:129:1:1:127:128:0.992248:47:80:1:0:47:81:1:0
chr14	75937022	.	G	A	140.1	PASS	AF=0.363636;AO=16;DP=44;FAO=16;FDP=44;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=-0.052087;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.615;QD=12.7361;RBI=0.0521198;REFB=0.00201607;REVB=-0.00184956;RO=27;SAF=10;SAR=6;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0366029;STB=0.535669;STBP=0.733;TYPE=snp;VARB=-0.00467797;OID=.;OPOS=75937022;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:27:28:16:16:0.363636:6:10:16:11:6:10:16:12
chr14	76330181	.	G	A	508.55	PASS	AF=0.972222;AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00650831;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=246.089;QD=56.5056;RBI=0.012949;REFB=-0.0914619;REVB=0.0111945;RO=1;SAF=18;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0267214;STB=0.514278;STBP=0.539;TYPE=snp;VARB=-0.000263598;OID=.;OPOS=76330181;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:36:36:1:1:35:35:0.972222:17:18:0:1:17:18:0:1
chr14	76368544	.	T	C	239.34	PASS	AF=0.5;AO=23;DP=46;FAO=23;FDP=46;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=4.16222e-05;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=243.081;QD=20.8117;RBI=0.00837636;REFB=0.00140638;REVB=0.00837626;RO=23;SAF=5;SAR=18;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.414229;STB=0.734477;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=-0.00114328;OID=.;OPOS=76368544;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:23:23:23:23:0.5:18:5:15:8:18:5:15:8
chr14	76452480	.	C	T	756.4	PASS	AF=0.45977;AO=80;DP=174;FAO=80;FDP=174;FR=.;FRO=94;FSAF=38;FSAR=42;FSRF=62;FSRR=32;FWDB=0.0510666;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.9215;QD=17.3885;RBI=0.0571014;REFB=-0.0164789;REVB=0.0255496;RO=94;SAF=38;SAR=42;SRF=62;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.178998;STB=0.598949;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.0194666;OID=.;OPOS=76452480;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:174:174:94:94:80:80:0.45977:42:38:62:32:42:38:62:32
chr14	76549647	.	G	A	168.64	PASS	AF=0.428571;AO=18;DP=42;FAO=18;FDP=42;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=6;FWDB=0.0318198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.035;QD=16.0612;RBI=0.0395621;REFB=-0.00778581;REVB=-0.0235086;RO=23;SAF=10;SAR=8;SRF=18;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.23433;STB=0.615266;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.00645382;OID=.;OPOS=76549647;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:23:24:18:18:0.428571:8:10:18:5:8:10:18:6
chr14	76619167	.	A	C	885.73	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.013173;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=113.445;QD=58.0804;RBI=0.0351762;REFB=0;REVB=0.0326165;RO=0;SAF=34;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000106696;OID=.;OPOS=76619167;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:61:0:0:60:61:1:26:34:0:0:27:34:0:0
chr14	76662446	.	C	T	851.19	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0718526;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.1397;QD=57.7081;RBI=0.0730107;REFB=0;REVB=-0.0129525;RO=0;SAF=24;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000334847;OID=.;OPOS=76662446;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:35:24:0:0:35:24:0:0
chr14	76668158	.	T	A,TTA	38.64	PASS	AF=0,0.186047;AO=3,8;DP=49;FAO=0,8;FDP=43;FR=.;FRO=35;FSAF=0,2;FSAR=0,6;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=-0.0209168,0.0198266;FXX=0.0444346;HRUN=6,6;LEN=1,2;MLLD=23.6915,25.0948;QD=3.59419;RBI=0.0522227,0.0804202;REFB=-0.0233813,-0.038475;REVB=-0.0478508,-0.0779379;RO=38;SAF=1,2;SAR=2,6;SRF=16;SRR=22;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0902188,-0.228832;STB=0.5,0.683059;STBP=1,0.283;TYPE=snp,ins;VARB=0,0.156936;OID=.,.;OPOS=76668158,76668159;OREF=T,-;OALT=A,TA;OMAPALT=A,TTA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:39:49:43:38:35:3,8:0,8:0,0.186047:2,6:1,2:16:22:0,6:0,2:16:19
chr14	76905777	.	C	A	291.6	PASS	AF=0.516667;AO=31;DP=60;FAO=31;FDP=60;FR=.;FRO=29;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.0170057;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.128;QD=19.44;RBI=0.0214151;REFB=-0.0150827;REVB=-0.0130159;RO=29;SAF=16;SAR=15;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0289608;STB=0.516119;STBP=0.818;TYPE=snp;VARB=0.0140033;OID=.;OPOS=76905777;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:29:29:31:31:0.516667:15:16:14:15:15:16:14:15
chr14	76957887	.	T	C	1064.96	PASS	AF=1;AO=71;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.016282;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.7595;QD=59.1643;RBI=0.0258602;REFB=0;REVB=0.0200909;RO=0;SAF=39;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00013285;OID=.;OPOS=76957887;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:72:0:0:71:72:1:32:39:0:0:33:39:0:0
chr14	77236380	.	C	T	459.41	PASS	AF=0.719298;AO=41;DP=57;FAO=41;FDP=57;FR=.;FRO=16;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=0.0185624;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.156;QD=32.2391;RBI=0.0185729;REFB=0.00167432;REVB=-0.000626397;RO=16;SAF=20;SAR=21;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0912547;STB=0.549332;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=-0.000382109;OID=.;OPOS=77236380;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:16:16:41:41:0.719298:21:20:5:11:21:20:5:11
chr14	77245286	.	C	T	2906.01	PASS	AF=1;AO=181;DP=184;FAO=184;FDP=184;FR=.;FRO=0;FSAF=94;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0715938;FXX=0.0160419;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.8673;QD=63.1742;RBI=0.0778627;REFB=0;REVB=0.0306092;RO=1;SAF=91;SAR=90;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00520317;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000299643;OID=.;OPOS=77245286;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:16:184:184:1:0:181:184:1:90:91:1:0:90:94:0:0
chr14	77269788	.	A	C	471.92	PASS	AF=0.970588;AO=33;DP=34;FAO=33;FDP=34;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0364003;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=197.939;QD=55.5205;RBI=0.041823;REFB=0.0779002;REVB=0.0205957;RO=1;SAF=18;SAR=15;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0252499;STB=0.513505;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000392043;OID=.;OPOS=77269788;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:34:34:1:1:33:33:0.970588:15:18:1:0:15:18:1:0
chr14	77293072	.	C	A	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0310127;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.463;QD=37.4885;RBI=0.0486163;REFB=0;REVB=0.0374401;RO=0;SAF=3;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000800838;OID=.;OPOS=77293072;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:5:3:0:0:5:3:0:0
chr14	77294876	.	T	C	618.53	PASS	AF=1;AO=40;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.015582;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.708;QD=60.3442;RBI=0.0903908;REFB=0;REVB=0.0890377;RO=0;SAF=17;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.4817e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000461598;OID=.;OPOS=77294876;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:40:41:1:23:17:0:0:24:17:0:0
chr14	77332367	.	C	T	1234.65	PASS	AF=0.987805;AO=80;DP=81;FAO=81;FDP=82;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00526145;FXX=0.0120467;HRUN=4;LEN=1;MLLD=153.605;QD=60.2269;RBI=0.015179;REFB=-0.118722;REVB=0.014238;RO=0;SAF=32;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505153;STBP=0.488;TYPE=snp;VARB=-3.1612e-05;OID=.;OPOS=77332367;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:81:82:0:1:80:81:0.987805:48:32:0:0:48:33:0:1
chr14	77336521	.	G	A	120.18	PASS	AF=0.411765;AO=14;DP=34;FAO=14;FDP=34;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.00581737;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.645;QD=14.1384;RBI=0.00603674;REFB=-0.00163854;REVB=-0.00161256;RO=20;SAF=4;SAR=10;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.232219;STB=0.636159;STBP=0.213;TYPE=snp;VARB=0.00206383;OID=.;OPOS=77336521;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:20:20:14:14:0.411765:10:4:10:10:10:4:10:10
chr14	77492891	.	G	A	234.99	PASS	AF=0.442623;AO=27;DP=60;FAO=27;FDP=61;FR=.;FRO=34;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=0.00343855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.651;QD=15.409;RBI=0.0183186;REFB=-0.0101311;REVB=0.017993;RO=32;SAF=14;SAR=13;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0477918;STB=0.526679;STBP=0.727;TYPE=snp;VARB=0.0105126;OID=.;OPOS=77492891;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:61:32:34:27:27:0.442623:13:14:15:17:13:14:16:18
chr14	77494180	.	GC	CT	308.67	PASS	AF=0.642857;AO=26;DP=43;FAO=27;FDP=42;FR=.;FRO=15;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.0515967;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=2;MLLD=268.734;QD=29.3969;RBI=0.0516944;REFB=-0.0288327;REVB=-0.00317687;RO=15;SAF=14;SAR=12;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00342387;STB=0.508015;STBP=0.909;TYPE=mnp;VARB=0.0151063;OID=.;OPOS=77494180;OREF=GC;OALT=CT;OMAPALT=CT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:42:15:15:26:27:0.642857:12:14:8:7:12:15:8:7
chr14	77494557	.	C	T	332.33	PASS	AF=0.467532;AO=36;DP=77;FAO=36;FDP=77;FR=.;FRO=41;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=24;FWDB=0.0209251;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.0041;QD=17.2637;RBI=0.0406041;REFB=-0.0272413;REVB=0.034797;RO=41;SAF=20;SAR=16;SRF=17;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13354;STB=0.574671;STBP=0.225;TYPE=snp;VARB=0.0484135;OID=.;OPOS=77494557;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:41:41:36:36:0.467532:16:20:17:24:16:20:17:24
chr14	77494682	.	G	A	373.41	PASS	AF=0.46988;AO=38;DP=82;FAO=39;FDP=83;FR=.;FRO=44;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=0.0409729;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.5111;QD=17.9957;RBI=0.0713286;REFB=-0.00732857;REVB=0.0583866;RO=44;SAF=16;SAR=22;SRF=22;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.076523;STB=0.548281;STBP=0.432;TYPE=snp;VARB=0.0058971;OID=.;OPOS=77494682;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:83:44:44:38:39:0.46988:22:16:22:22:23:16:22:22
chr14	77697967	.	A	G	782.7	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0621968;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.567;QD=56.9233;RBI=0.0708667;REFB=0;REVB=-0.0339652;RO=0;SAF=30;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000289914;OID=.;OPOS=77697967;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:55:0:0:54:55:1:24:30:0:0:24:31:0:0
chr14	77703057	.	A	G	371.96	PASS	AF=1;AO=25;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156828;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.492;QD=55.1054;RBI=0.021129;REFB=0;REVB=0.0141592;RO=0;SAF=20;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000101204;OID=.;OPOS=77703057;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:25:27:1:5:20:0:0:6:21:0:0
chr14	77723259	.	G	C	483.27	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0267809;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=110.77;QD=58.5776;RBI=0.0396795;REFB=0;REVB=0.0292788;RO=0;SAF=14;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.71297e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.26982e-06;OID=.;OPOS=77723259;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:19:14:0:0:19:14:0:0
chr14	77745193	.	A	C	676.77	PASS	AF=0.977778;AO=43;DP=45;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00668678;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.841;QD=60.1576;RBI=0.00738071;REFB=-0.026137;REVB=0.00312439;RO=1;SAF=24;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0240734;STB=0.51219;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.000355552;OID=.;OPOS=77745193;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:45:45:1:1:43:44:0.977778:19:24:0:1:20:24:0:1
chr14	77751925	.	C	T	1905.37	PASS	AF=0.984375;AO=124;DP=126;FAO=126;FDP=128;FR=.;FRO=2;FSAF=72;FSAR=54;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.028336;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.8536;QD=59.5428;RBI=0.0360368;REFB=-0.0208419;REVB=-0.0222647;RO=2;SAF=71;SAR=53;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00223499;STB=0.501139;STBP=0.88;TYPE=snp;VARB=0.000185757;OID=.;OPOS=77751925;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:126:128:2:2:124:126:0.984375:53:71:1:1:54:72:1:1
chr14	77794283	.	T	C	1491.83	PASS	AF=1;AO=93;DP=93;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.016457;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.2328;QD=63.4822;RBI=0.0190773;REFB=0;REVB=0.00964941;RO=0;SAF=56;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.47923e-05;OID=.;OPOS=77794283;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:93:94:0:0:93:94:1:37:56:0:0:37:57:0:0
chr14	77844999	.	G	A	248.47	PASS	AF=0.589744;AO=23;DP=39;FAO=23;FDP=39;FR=.;FRO=16;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=-0.109689;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.6023;QD=25.4843;RBI=0.110473;REFB=-0.0161216;REVB=-0.0131306;RO=16;SAF=14;SAR=9;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.217594;STB=0.620738;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=0.00787204;OID=.;OPOS=77844999;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:16:16:23:23:0.589744:9:14:5:11:9:14:5:11
chr14	77926011	.	C	T	854.05	PASS	AF=0.983607;AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0745546;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.0281;QD=56.0032;RBI=0.0817094;REFB=0.0281773;REVB=-0.0334369;RO=1;SAF=23;SAR=37;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0125858;STB=0.506664;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=-0.00559094;OID=.;OPOS=77926011;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:61:61:1:1:60:60:0.983607:37:23:0:1:37:23:0:1
chr14	77928525	.	A	G,T	766.74	PASS	AF=0.96,0.04;AO=46,2;DP=50;FAO=48,2;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=20,1;FSAR=28,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0259766,0.0446167;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=79.1378,13.4842;QD=61.3396;RBI=0.0326464,0.0487137;REFB=0,0;REVB=0.0197738,-0.0195544;RO=1;SAF=20,1;SAR=26,1;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0177403,0.25849;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00158145,0.043487;OID=.,.;OPOS=77928525,77928525;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:50:50:1:0:46,2:48,2:0.96,0.04:26,1:20,1:0:1:28,1:20,1:0:0
chr14	77935520	.	G	A	980.24	PASS	AF=0.985294;AO=67;DP=69;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0367684;FXX=0.0285673;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.473;QD=57.6611;RBI=0.0371076;REFB=-0.0979267;REVB=0.00500627;RO=1;SAF=34;SAR=33;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0136967;STB=0.507244;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00515067;OID=.;OPOS=77935520;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:69:68:1:1:67:67:0.985294:33:34:1:0:33:34:1:0
chr14	77951124	.	C	T	771.37	PASS	AF=0.98;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0122391;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.198;QD=61.7096;RBI=0.0184083;REFB=-0.120387;REVB=0.0137503;RO=1;SAF=15;SAR=34;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0303352;STB=0.516122;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=0.000450672;OID=.;OPOS=77951124;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:50:50:1:1:49:49:0.98:34:15:1:0:34:15:1:0
chr14	77976325	.	T	C	483.05	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00121938;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.021;QD=58.5515;RBI=0.0165743;REFB=0;REVB=-0.0165293;RO=0;SAF=8;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.93727e-05;OID=.;OPOS=77976325;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:25:8:0:0:25:8:0:0
chr14	77987958	.	C	A	698.99	PASS	AF=0.980392;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.036787;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.376;QD=54.8228;RBI=0.0453398;REFB=0.00554443;REVB=-0.0265032;RO=1;SAF=25;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0184579;STB=0.5098;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=-1.0329e-05;OID=.;OPOS=77987958;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:51:51:1:1:50:50:0.980392:25:25:1:0:25:25:1:0
chr14	78014103	.	G	A	87.46	PASS	AF=0.423077;AO=11;DP=26;FAO=11;FDP=26;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=-0.0335217;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.377;QD=13.4559;RBI=0.0353718;REFB=-0.0162575;REVB=-0.0112899;RO=15;SAF=8;SAR=3;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.330769;STB=0.695286;STBP=0.125;TYPE=snp;VARB=0.0241247;OID=.;OPOS=78014103;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:26:26:15:15:11:11:0.423077:3:8:6:9:3:8:6:9
chr14	78028803	.	A	G	429.02	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0226156;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.357;QD=57.2025;RBI=0.0247884;REFB=0;REVB=-0.0101487;RO=0;SAF=18;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.03602e-05;OID=.;OPOS=78028803;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:12:18:0:0:12:18:0:0
chr14	78140355	.	T	A	155.51	PASS	AF=0.414634;AO=17;DP=41;FAO=17;FDP=41;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=0.0184584;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=338.56;QD=15.172;RBI=0.0238061;REFB=-0.00143449;REVB=-0.0150339;RO=24;SAF=8;SAR=9;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0298214;STB=0.517221;STBP=0.848;TYPE=snp;VARB=0.00208266;OID=.;OPOS=78140355;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:24:24:17:17:0.414634:9:8:12:12:9:8:12:12
chr14	78174473	.	A	C	817.68	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00752077;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.1231;QD=57.3811;RBI=0.0118664;REFB=0;REVB=0.00917878;RO=0;SAF=23;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.71739e-05;OID=.;OPOS=78174473;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:34:23:0:0:34:23:0:0
chr14	78184566	.	C	A	889.82	PASS	AF=1;AO=60;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00652238;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.043;QD=58.3491;RBI=0.0115981;REFB=0;REVB=-0.00959033;RO=0;SAF=30;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000161429;OID=.;OPOS=78184566;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:60:61:1:30:30:0:0:31:30:0:0
chr14	78184661	.	T	G	261.78	PASS	AF=0.47541;AO=29;DP=61;FAO=29;FDP=61;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=0.00782609;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=115.988;QD=17.1656;RBI=0.00813335;REFB=0.00705199;REVB=-0.00221444;RO=32;SAF=12;SAR=17;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110572;STB=0.562101;STBP=0.366;TYPE=snp;VARB=-0.00368758;OID=.;OPOS=78184661;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:32:32:29:29:0.47541:17:12:17:15:17:12:17:15
chr14	78197365	.	C	T	96.2	PASS	AF=0.375;AO=12;DP=32;FAO=12;FDP=32;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=-0.000563772;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.474;QD=12.0248;RBI=0.00698319;REFB=-0.0263441;REVB=-0.0069604;RO=20;SAF=6;SAR=6;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105621;STB=0.562397;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=0.0334409;OID=.;OPOS=78197365;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:32:32:20:20:12:12:0.375:6:6:12:8:6:6:12:8
chr14	78234796	.	C	T	37.41	PASS	AF=0.352941;AO=6;DP=17;FAO=6;FDP=17;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=-0.0212222;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.1668;QD=8.80228;RBI=0.0754547;REFB=-0.0274595;REVB=-0.0724088;RO=11;SAF=3;SAR=3;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141704;STB=0.58795;STBP=0.577;TYPE=snp;VARB=0.0454821;OID=.;OPOS=78234796;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:17:17:11:11:6:6:0.352941:3:3:7:4:3:3:7:4
chr14	78287414	.	T	C	1019.97	PASS	AF=1;AO=68;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0554914;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.896;QD=59.1285;RBI=0.0629959;REFB=0;REVB=0.0298193;RO=0;SAF=28;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000316329;OID=.;OPOS=78287414;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:68:69:1:40:28:0:0:40:29:0:0
chr14	78366933	.	G	GAAC	102.14	PASS	AF=1;AO=8;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00543098;FXX=0;HRUN=2;LEN=3;MLLD=327.593;QD=40.8567;RBI=0.0197437;REFB=0;REVB=0.0189821;RO=2;SAF=6;SAR=2;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108557;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=7.09504e-05;OID=.;OPOS=78366934;OREF=-;OALT=AAC;OMAPALT=GAAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:8:10:10:10:0:7:3:0:0:4:2:6:2:1:1
chr14	78366967	.	A	G	121.89	PASS	AF=1;AO=11;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0118201;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.2346;QD=40.6291;RBI=0.142885;REFB=0;REVB=-0.142395;RO=1;SAF=6;SAR=5;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0690901;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00536009;OID=.;OPOS=78366967;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:1:0:11:12:1:5:6:1:0:5:7:0:0
chr14	78390880	.	T	C	58.39	PASS	AF=0.290323;AO=8;DP=31;FAO=9;FDP=31;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=-0.0353872;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.323;QD=7.5348;RBI=0.0368717;REFB=-0.00285003;REVB=0.0103573;RO=21;SAF=6;SAR=2;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.229673;STB=0.657736;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=0.0404106;OID=.;OPOS=78390880;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:58:31:31:21:22:8:9:0.290323:2:6:12:9:2:7:13:9
chr14	78710044	.	G	A	120.86	PASS	AF=0.424242;AO=14;DP=33;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=0.0154053;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.899;QD=14.6497;RBI=0.0444883;REFB=0.00186499;REVB=0.041736;RO=18;SAF=9;SAR=5;SRF=5;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.344277;STB=0.683291;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=-0.00153309;OID=.;OPOS=78710044;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:18:19:14:14:0.424242:5:9:5:13:5:9:6:13
chr14	79081400	.	T	C	607.51	PASS	AF=0.44;AO=66;DP=151;FAO=66;FDP=150;FR=.;FRO=84;FSAF=30;FSAR=36;FSRF=45;FSRR=39;FWDB=0.048494;FXX=0.00662208;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.695;QD=16.2003;RBI=0.0490968;REFB=-0.00414214;REVB=0.00767003;RO=84;SAF=30;SAR=36;SRF=45;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0814833;STB=0.545441;STBP=0.341;TYPE=snp;VARB=0.00616102;OID=.;OPOS=79081400;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:151:150:84:84:66:66:0.44:36:30:45:39:36:30:45:39
chr14	80963383	.	A	AGC,C	637.49	PASS	AF=0.928571,0.0714286;AO=33,2;DP=54;FAO=39,3;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=21,2;FSAR=18,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00546643,-0.0149465;FXX=0.124974;HRUN=0,4;LEN=2,1;MLLD=241.623,93.7682;QD=60.7131;RBI=0.0108671,0.0177099;REFB=-0.0206612,-0.0822825;REVB=-0.00939211,-0.00949963;RO=12;SAF=20,1;SAR=13,1;SRF=8;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0314104,-0.175485;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.000376079,0.0246536;OID=.,.;OPOS=80963384,80963383;OREF=-,A;OALT=GC,C;OMAPALT=AGC,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:15:54:42:12:0:33,2:39,3:0.928571,0.0714286:13,1:20,1:8:4:18,1:21,2:0:0
chr14	81574959	.	A	G	702.04	PASS	AF=1;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00868498;FXX=0.039208;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.843;QD=57.3096;RBI=0.00913108;REFB=0;REVB=0.0028192;RO=0;SAF=16;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.74098e-05;OID=.;OPOS=81574959;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:49:0:0:49:49:1:33:16:0:0:33:16:0:0
chr14	81575005	.	C	A	598.54	PASS	AF=1;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0287951;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=355.021;QD=61.3883;RBI=0.0299268;REFB=0;REVB=-0.00815206;RO=0;SAF=12;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.57162e-05;OID=.;OPOS=81575005;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:39:0:0:39:39:1:27:12:0:0:27:12:0:0
chr14	81610583	.	G	C	323.44	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0458809;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.6006;QD=53.9064;RBI=0.0459176;REFB=0;REVB=-0.00183442;RO=0;SAF=6;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00102129;OID=.;OPOS=81610583;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:18:6:0:0:18:6:0:0
chr14	81737076	.	A	C	606.91	PASS	AF=0.525862;AO=61;DP=116;FAO=61;FDP=116;FR=.;FRO=55;FSAF=31;FSAR=30;FSRF=27;FSRR=28;FWDB=0.0109024;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.5547;QD=20.9278;RBI=0.0112348;REFB=-0.0130176;REVB=0.00271269;RO=55;SAF=31;SAR=30;SRF=27;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0149061;STB=0.508194;STBP=0.884;TYPE=snp;VARB=0.00948898;OID=.;OPOS=81737076;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:116:116:55:55:61:61:0.525862:30:31:27:28:30:31:27:28
chr14	81744736	.	A	G	328.04	PASS	AF=0.428571;AO=35;DP=81;FAO=36;FDP=84;FR=.;FRO=48;FSAF=12;FSAR=24;FSRF=27;FSRR=21;FWDB=-0.0712372;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.3437;QD=15.6208;RBI=0.0812556;REFB=-0.0464495;REVB=-0.0390862;RO=46;SAF=12;SAR=23;SRF=26;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.227857;STB=0.63407;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.0577288;OID=.;OPOS=81744736;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:84:46:48:35:36:0.428571:23:12:26:20:24:12:27:21
chr14	84642753	.	G	A	481.47	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0473082;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.744;QD=58.3595;RBI=0.0500459;REFB=0;REVB=0.0163257;RO=0;SAF=19;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000176513;OID=.;OPOS=84642753;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:33:0:0:32:33:1:13:19:0:0:13:20:0:0
chr14	86088056	.	T	C	902.26	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0239833;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.75;QD=58.2104;RBI=0.0239833;REFB=0;REVB=3.25815e-05;RO=0;SAF=23;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.75648e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.86185e-05;OID=.;OPOS=86088056;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:39:23:0:0:39:23:0:0
chr14	86088125	.	G	A	85.27	PASS	AF=0.366667;AO=11;DP=30;FAO=11;FDP=30;FR=.;FRO=19;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=4;FWDB=-0.0186222;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=244.685;QD=11.3692;RBI=0.0225061;REFB=-0.00733728;REVB=0.0126389;RO=19;SAF=3;SAR=8;SRF=15;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.512193;STB=0.79952;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.0163815;OID=.;OPOS=86088125;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:30:30:19:19:11:11:0.366667:8:3:15:4:8:3:15:4
chr14	86091415	.	G	A	538.23	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0115066;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.7049;QD=59.8033;RBI=0.0146062;REFB=0;REVB=-0.00899661;RO=0;SAF=13;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.21415e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00022247;OID=.;OPOS=86091415;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:23:13:0:0:23:13:0:0
chr14	86092246	.	A	G	408.41	PASS	AF=0.506173;AO=41;DP=82;FAO=41;FDP=81;FR=.;FRO=40;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=-0.0038352;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.953;QD=20.1683;RBI=0.0331329;REFB=-0.00610085;REVB=0.0329102;RO=40;SAF=19;SAR=22;SRF=21;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0548668;STB=0.530425;STBP=0.587;TYPE=snp;VARB=0.0102396;OID=.;OPOS=86092246;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:81:40:40:41:41:0.506173:22:19:21:19:22:19:21:19
chr14	86093344	.	C	T	228.72	PASS	AF=0.358974;AO=28;DP=78;FAO=28;FDP=78;FR=.;FRO=50;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=29;FSRR=21;FWDB=-0.0141027;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.547;QD=11.7294;RBI=0.0429964;REFB=-0.00837035;REVB=-0.0406178;RO=50;SAF=12;SAR=16;SRF=29;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167018;STB=0.596295;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=0.0194676;OID=.;OPOS=86093344;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:50:50:28:28:0.358974:16:12:29:21:16:12:29:21
chr14	86093378	.	C	T	254.96	PASS	AF=0.333333;AO=31;DP=93;FAO=31;FDP=93;FR=.;FRO=62;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=30;FSRR=32;FWDB=-0.0041051;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=238.163;QD=10.9661;RBI=0.00446601;REFB=-0.00472489;REVB=0.00175882;RO=62;SAF=14;SAR=17;SRF=30;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0371795;STB=0.521604;STBP=0.801;TYPE=snp;VARB=0.00768473;OID=.;OPOS=86093378;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:62:62:31:31:0.333333:17:14:30:32:17:14:30:32
chr14	86094035	.	G	A	246.83	PASS	AF=0.490909;AO=27;DP=55;FAO=27;FDP=55;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=-0.00108248;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.7388;QD=17.9515;RBI=0.0019336;REFB=0.0258726;REVB=0.0016022;RO=28;SAF=10;SAR=17;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0217202;STB=0.512186;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=-0.0273985;OID=.;OPOS=86094035;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:28:28:27:27:0.490909:17:10:11:17:17:10:11:17
chr14	88400353	.	C	T	145.55	PASS	AF=0.444444;AO=16;DP=36;FAO=16;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=17;FWDB=-0.0119506;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.022;QD=16.1724;RBI=0.0419482;REFB=-0.00081834;REVB=-0.0402099;RO=20;SAF=7;SAR=9;SRF=3;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.299673;STB=0.668938;STBP=0.131;TYPE=snp;VARB=-0.000384066;OID=.;OPOS=88400353;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:20:20:16:16:0.444444:9:7:3:17:9:7:3:17
chr14	88400449	.	TG	CA	306.07	PASS	AF=0.533333;AO=32;DP=60;FAO=32;FDP=60;FR=.;FRO=28;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=9;FSRR=19;FWDB=0.00130752;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=216.07;QD=20.4043;RBI=0.0055101;REFB=-0.0244855;REVB=-0.00535272;RO=28;SAF=15;SAR=17;SRF=9;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125756;STB=0.569578;STBP=0.31;TYPE=mnp;VARB=0.0200077;OID=.;OPOS=88400449;OREF=TG;OALT=CA;OMAPALT=CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:28:28:32:32:0.533333:17:15:9:19:17:15:9:19
chr14	88401213	.	T	C	296.41	PASS	AF=0.563636;AO=31;DP=55;FAO=31;FDP=55;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=-0.0318765;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.2859;QD=21.557;RBI=0.0983101;REFB=-0.0503881;REVB=0.0929987;RO=24;SAF=12;SAR=19;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124324;STB=0.568817;STBP=0.26;TYPE=snp;VARB=0.0429339;OID=.;OPOS=88401213;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:24:24:31:31:0.563636:19:12:13:11:19:12:13:11
chr14	88407875	.	T	A	446.31	PASS	AF=0.431034;AO=49;DP=115;FAO=50;FDP=116;FR=.;FRO=66;FSAF=33;FSAR=17;FSRF=32;FSRR=34;FWDB=0.00765818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.326;QD=15.3899;RBI=0.00875313;REFB=-0.00983011;REVB=0.00423906;RO=65;SAF=32;SAR=17;SRF=31;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.184482;STB=0.603616;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=0.0150269;OID=.;OPOS=88407875;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:116:65:66:49:50:0.431034:17:32:31:34:17:33:32:34
chr14	88407888	.	A	G	404.17	PASS	AF=0.425926;AO=46;DP=108;FAO=46;FDP=108;FR=.;FRO=62;FSAF=29;FSAR=17;FSRF=30;FSRR=32;FWDB=0.0447509;FXX=0.00917347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.7916;QD=14.9692;RBI=0.0498243;REFB=-0.0150796;REVB=0.0219049;RO=62;SAF=29;SAR=17;SRF=30;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153095;STB=0.586183;STBP=0.149;TYPE=snp;VARB=0.0166384;OID=.;OPOS=88407888;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:108:62:62:46:46:0.425926:17:29:30:32:17:29:30:32
chr14	88411947	.	T	C	450.2	PASS	AF=0.442478;AO=50;DP=112;FAO=50;FDP=113;FR=.;FRO=63;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=37;FSRR=26;FWDB=-0.00824328;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.952;QD=15.9363;RBI=0.00829949;REFB=-0.00485912;REVB=0.000964282;RO=62;SAF=27;SAR=23;SRF=36;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0406784;STB=0.526644;STBP=0.632;TYPE=snp;VARB=0.00580197;OID=.;OPOS=88411947;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:113:62:63:50:50:0.442478:23:27:36:26:23:27:37:26
chr14	88414211	.	G	A	203.02	PASS	AF=0.378788;AO=25;DP=66;FAO=25;FDP=66;FR=.;FRO=41;FSAF=7;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=24;FWDB=-0.0725582;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.8969;QD=12.3042;RBI=0.075256;REFB=0.00357471;REVB=-0.0199694;RO=40;SAF=7;SAR=18;SRF=17;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174112;STB=0.594961;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=-0.00877358;OID=.;OPOS=88414211;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:40:41:25:25:0.378788:18:7:17:23:18:7:17:24
chr14	88453422	.	AGGA	AG,AGA,AGAA	310.79	PASS	AF=0,1,0;AO=5,16,9;DP=34;FAO=0,29,0;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=0,10,0;FSAR=0,19,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.132452,0.0185325,0.133275;FXX=0;HRUN=2,2,2;LEN=2,1,1;MLLD=12.9994,14.2895,11.4996;QD=42.8674;RBI=0.137142,0.0835576,0.15186;REFB=0,0,0;REVB=-0.0355599,-0.0814765,-0.0727962;RO=0;SAF=1,6,4;SAR=4,10,5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,del,snp;VARB=-0.0414181,0.00627535,-0.13482;OID=.,.,.;OPOS=88453424,88453423,88453424;OREF=GA,G,G;OALT=-,-,A;OMAPALT=AG,AGA,AGAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	2/2:0,1,0:5,16,9:34:0,29,0:29:0:0,10,0:0,19,0:0:0:3:0:1,6,4:4,10,5:0:0
chr14	88459795	.	C	T	298.08	PASS	AF=0.54386;AO=31;DP=57;FAO=31;FDP=57;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=0.00211911;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.246;QD=20.918;RBI=0.00213883;REFB=0.00225405;REVB=0.000289813;RO=26;SAF=13;SAR=18;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00314054;STB=0.501741;STBP=0.998;TYPE=snp;VARB=-0.00115256;OID=.;OPOS=88459795;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:26:26:31:31:0.54386:18:13:11:15:18:13:11:15
chr14	88477413	.	C	T	1283.39	PASS	AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0424054;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.8184;QD=61.8499;RBI=0.0456668;REFB=0;REVB=-0.0169479;RO=0;SAF=38;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.04629e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000392027;OID=.;OPOS=88477413;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:45:38:0:0:45:38:0:0
chr14	88477882	.	A	C	277.54	PASS	AF=0.442857;AO=31;DP=71;FAO=31;FDP=70;FR=.;FRO=39;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=0.0200697;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.516;QD=15.8591;RBI=0.0248606;REFB=-0.00726168;REVB=-0.0146716;RO=40;SAF=13;SAR=18;SRF=21;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105994;STB=0.552524;STBP=0.45;TYPE=snp;VARB=0.00673751;OID=.;OPOS=88477882;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:70:40:39:31:31:0.442857:18:13:21:19:18:13:20:19
chr14	88792816	.	T	G	1310.52	PASS	AF=1;AO=84;DP=86;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00247476;FXX=0.0232531;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.462;QD=62.4056;RBI=0.0142693;REFB=0;REVB=0.0140531;RO=0;SAF=48;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.36784e-05;OID=.;OPOS=88792816;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:84:0:0:84:84:1:36:48:0:0:36:48:0:0
chr14	88852166	.	G	A	73.36	PASS	AF=0.322581;AO=10;DP=31;FAO=10;FDP=31;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=18;FSRR=3;FWDB=0.0130541;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.8405;QD=9.466;RBI=0.0166173;REFB=0.00441524;REVB=0.0102822;RO=21;SAF=5;SAR=5;SRF=18;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.414375;STB=0.741564;STBP=0.113;TYPE=snp;VARB=-0.00777331;OID=.;OPOS=88852166;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:31:31:21:21:10:10:0.322581:5:5:18:3:5:5:18:3
chr14	88852279	.	TGGGG	TGGG,TGGGT,TTGGG	759.08	PASS	AF=1,0,0;AO=48,2,6;DP=57;FAO=57,0,0;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=34,0,0;FSAR=23,0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0239942,0.0165975,0.00388326;FXX=0;HRUN=4,4,4;LEN=1,1,1;MLLD=23.2286,20.893,4.68547;QD=53.2687;RBI=0.0644583,0.0478227,0.00761006;REFB=0,0,0;REVB=-0.059826,-0.0448502,0.00654472;RO=0;SAF=29,0,5;SAR=19,2,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0.289157,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,-3.18042e-08;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,snp,snp;VARB=-0.00256483,0.0226517,0;OID=.,.,.;OPOS=88852280,88852283,88852280;OREF=G,G,G;OALT=-,T,T;OMAPALT=TGGG,TGGGT,TTGGG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1,0,0:48,2,6:57:57,0,0:57:0:34,0,0:23,0,0:0:0:4:0:29,0,5:19,2,1:0:0
chr14	88862529	.	G	A	232.07	PASS	AF=0.428571;AO=27;DP=63;FAO=27;FDP=63;FR=.;FRO=36;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=-0.00822749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.8975;QD=14.7344;RBI=0.0280876;REFB=0.00850033;REVB=-0.0268556;RO=36;SAF=14;SAR=13;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0186436;STB=0.51058;STBP=0.879;TYPE=snp;VARB=-0.0070796;OID=.;OPOS=88862529;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:36:36:27:27:0.428571:13:14:18:18:13:14:18:18
chr14	88935925	.	A	G	582.36	PASS	AF=0.458647;AO=61;DP=133;FAO=61;FDP=133;FR=.;FRO=72;FSAF=22;FSAR=39;FSRF=30;FSRR=42;FWDB=-0.0133245;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.077;QD=17.5146;RBI=0.0182283;REFB=0.00055544;REVB=-0.012439;RO=72;SAF=22;SAR=39;SRF=30;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0579567;STB=0.532273;STBP=0.495;TYPE=snp;VARB=-0.000659186;OID=.;OPOS=88935925;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:133:133:72:72:61:61:0.458647:39:22:30:42:39:22:30:42
chr14	88938652	.	A	G	349.98	PASS	AF=0.404255;AO=38;DP=95;FAO=38;FDP=94;FR=.;FRO=56;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=26;FSRR=30;FWDB=-0.000560088;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.432;QD=14.8928;RBI=0.0179996;REFB=-0.0188977;REVB=0.0179909;RO=56;SAF=21;SAR=17;SRF=26;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.092843;STB=0.552604;STBP=0.425;TYPE=snp;VARB=0.0222393;OID=.;OPOS=88938652;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:94:56:56:38:38:0.404255:17:21:26:30:17:21:26:30
chr14	88945591	.	A	G	84.73	PASS	AF=0.615385;AO=7;DP=13;FAO=8;FDP=13;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=3;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0155617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.283;QD=26.0717;RBI=0.0219219;REFB=-0.0422112;REVB=-0.0154404;RO=2;SAF=5;SAR=2;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0955799;STB=0.529336;STBP=0.878;TYPE=snp;VARB=0.0161083;OID=.;OPOS=88945591;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:16:13:13:2:3:7:8:0.615385:2:5:1:1:2:6:2:1
chr14	89037482	.	C	CA,CAT,CATT	790.25	PASS	AF=0.257576,0.742424,0;AO=17,23,10;DP=81;FAO=17,49,0;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=7,33,0;FSAR=10,16,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00326904,0.00124846,0.000463931;FXX=0.043472;HRUN=0,0,0;LEN=1,2,3;MLLD=27.1471,28.7382,27.1388;QD=47.8938;RBI=0.0342855,0.228375,0.242403;REFB=0,0,0;REVB=-0.0341293,0.228372,0.242402;RO=23;SAF=8,17,8;SAR=9,6,2;SRF=11;SRR=12;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.00767178,0.256868,0.396124;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=ins,ins,ins;VARB=0.00788449,0.0141894,-0.0333973;OID=.,.,.;OPOS=89037483,89037483,89037483;OREF=-,-,-;OALT=A,AT,ATT;OMAPALT=CA,CAT,CATT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.257576,0.742424,0:17,23,10:81:17,49,0:66:0:7,33,0:10,16,0:0:0:20:23:8,17,8:9,6,2:11:12
chr14	89037483	.	T	A	174.29	PASS	AF=0.316456;AO=21;DP=75;FAO=25;FDP=79;FR=.;FRO=54;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=36;FSRR=18;FWDB=0.0124274;FXX=0.0124984;HRUN=10;LEN=1;MLLD=52.9896;QD=8.82473;RBI=0.0505934;REFB=-0.0121413;REVB=0.0490434;RO=53;SAF=8;SAR=13;SRF=36;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.345553;STB=0.701602;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.0179624;OID=.;OPOS=89037483;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:79:53:54:21:25:0.316456:13:8:36:17:16:9:36:18
chr14	89088266	.	C	T	101.59	PASS	AF=0.5;AO=12;DP=24;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.00247231;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.455;QD=16.9316;RBI=0.0116989;REFB=-0.00513782;REVB=-0.0114347;RO=12;SAF=7;SAR=5;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0731013;STB=0.542183;STBP=0.633;TYPE=snp;VARB=0.00571082;OID=.;OPOS=89088266;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:24:24:12:12:12:12:0.5:5:7:6:6:5:7:6:6
chr14	89094243	.	G	C	727.0	PASS	AF=1;AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00955252;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.7008;QD=57.0196;RBI=0.0101623;REFB=0;REVB=-0.00346723;RO=0;SAF=33;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-8.62909e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00013443;OID=.;OPOS=89094243;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:51:0:0:51:51:1:18:33:0:0:18:33:0:0
chr14	89205265	.	T	C	388.55	PASS	AF=0.47619;AO=39;DP=83;FAO=40;FDP=84;FR=.;FRO=44;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=0.0106519;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.0247;QD=18.5022;RBI=0.0129096;REFB=-0.0081059;REVB=0.00729357;RO=44;SAF=16;SAR=23;SRF=22;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.086382;STB=0.553371;STBP=0.345;TYPE=snp;VARB=0.0069298;OID=.;OPOS=89205265;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:84:44:44:39:40:0.47619:23:16:22:22:24:16:22:22
chr14	89306550	.	T	C	408.35	PASS	AF=0.5125;AO=41;DP=80;FAO=41;FDP=80;FR=.;FRO=39;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=0.00700957;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.597;QD=20.4177;RBI=0.0135289;REFB=-3.11732e-05;REVB=-0.0115714;RO=39;SAF=22;SAR=19;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0435341;STB=0.524118;STBP=0.675;TYPE=snp;VARB=1.91159e-05;OID=.;OPOS=89306550;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:39:39:41:41:0.5125:19:22:19:20:19:22:19:20
chr14	89306572	.	T	G	311.04	PASS	AF=0.5;AO=33;DP=66;FAO=33;FDP=66;FR=.;FRO=33;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=0.0113473;FXX=0.0149231;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.597;QD=18.8508;RBI=0.018232;REFB=-0.0151165;REVB=0.0142704;RO=32;SAF=17;SAR=16;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.013399;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0171085;OID=.;OPOS=89306572;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:32:33:33:33:0.5:16:17:16:16:16:17:17:16
chr14	89343992	.	G	A	308.37	PASS	AF=0.492537;AO=33;DP=67;FAO=33;FDP=67;FR=.;FRO=34;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=10;FWDB=-0.0201934;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.6886;QD=18.4102;RBI=0.0618953;REFB=0.00108181;REVB=-0.0585086;RO=33;SAF=19;SAR=14;SRF=23;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113773;STB=0.568958;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=-0.00406181;OID=.;OPOS=89343992;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:33:34:33:33:0.492537:14:19:23:10:14:19:24:10
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chr14	89750819	.	A	G	267.06	PASS	AF=0.528302;AO=28;DP=53;FAO=28;FDP=53;FR=.;FRO=25;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.00361177;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.646;QD=20.1553;RBI=0.0157099;REFB=-0.00158107;REVB=-0.0152891;RO=25;SAF=16;SAR=12;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0441036;STB=0.524572;STBP=0.741;TYPE=snp;VARB=0.00162597;OID=.;OPOS=89750819;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:25:25:28:28:0.528302:12:16:13:12:12:16:13:12
chr14	89867978	.	T	C	1822.45	PASS	AF=1;AO=117;DP=119;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00405397;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.3258;QD=61.2589;RBI=0.0114466;REFB=0;REVB=-0.0107047;RO=0;SAF=57;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.65939e-05;OID=.;OPOS=89867978;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:119:119:0:0:117:119:1:60:57:0:0:60:59:0:0
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chr14	90178992	.	G	A	36.62	PASS	AF=0.3;AO=6;DP=20;FAO=6;FDP=20;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.000541338;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.29;QD=7.32321;RBI=0.0350193;REFB=-0.0103209;REVB=-0.0350152;RO=13;SAF=3;SAR=3;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.210359;STB=0.59968;STBP=0.589;TYPE=snp;VARB=0.0195885;OID=.;OPOS=90178992;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:20:20:13:14:6:6:0.3:3:3:4:9:3:3:5:9
chr14	90303383	.	A	G	801.71	PASS	AF=1;AO=47;DP=55;FAO=56;FDP=56;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=33;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112864;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.899;QD=57.2653;RBI=0.0676375;REFB=0;REVB=0.0666892;RO=0;SAF=32;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000119157;OID=.;OPOS=90303383;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:56:0:0:47:56:1:15:32:0:0:23:33:0:0
chr14	90303435	.	T	A	851.26	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0196163;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=348.793;QD=57.7124;RBI=0.0215276;REFB=0;REVB=0.00886776;RO=0;SAF=33;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.00382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.36455e-06;OID=.;OPOS=90303435;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:26:33:0:0:26:33:0:0
chr14	90303445	.	T	C	871.38	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00600149;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.166;QD=58.0919;RBI=0.0171444;REFB=0;REVB=0.0160597;RO=0;SAF=35;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.955e-05;OID=.;OPOS=90303445;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:60:0:0:61:60:1:26:35:0:0:25:35:0:0
chr14	90341494	.	G	A	755.67	PASS	AF=1;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.030798;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.3897;QD=57.0315;RBI=0.0340872;REFB=0;REVB=-0.014609;RO=0;SAF=26;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.38865e-05;OID=.;OPOS=90341494;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:53:0:0:53:53:1:27:26:0:0:27:26:0:0
chr14	90730071	.	C	T	619.05	PASS	AF=0.57732;AO=55;DP=96;FAO=56;FDP=97;FR=.;FRO=41;FSAF=18;FSAR=38;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=-0.0442439;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.5691;QD=25.5277;RBI=0.044553;REFB=0.0071498;REVB=0.00523917;RO=41;SAF=18;SAR=37;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153951;STB=0.586666;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=-0.00698538;OID=.;OPOS=90730071;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:97:41:41:55:56:0.57732:37:18:21:20:38:18:21:20
chr14	90745422	.	T	C	354.22	PASS	AF=0.401961;AO=41;DP=102;FAO=41;FDP=102;FR=.;FRO=61;FSAF=11;FSAR=30;FSRF=35;FSRR=26;FWDB=-0.00353519;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.815;QD=13.8908;RBI=0.00368776;REFB=-0.0116758;REVB=-0.00104977;RO=61;SAF=11;SAR=30;SRF=35;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.336387;STB=0.691286;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0175513;OID=.;OPOS=90745422;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:61:61:41:41:0.401961:30:11:35:26:30:11:35:26
chr14	90767607	.	C	T	1197.5	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0271332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.1516;QD=59.8749;RBI=0.0327988;REFB=0;REVB=0.0184269;RO=0;SAF=43;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.11157e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000477223;OID=.;OPOS=90767607;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:80:0:0:77:80:1:34:43:0:0:36:44:0:0
chr14	90865462	.	C	G	785.21	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112679;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.035;QD=57.1061;RBI=0.0113672;REFB=0;REVB=0.00149931;RO=0;SAF=23;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.49259e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.04043e-05;OID=.;OPOS=90865462;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:32:23:0:0:32:23:0:0
chr14	90871478	.	T	C	207.85	PASS	AF=0.446809;AO=21;DP=47;FAO=21;FDP=47;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=0.000715086;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=307.659;QD=17.6896;RBI=0.00267128;REFB=-0.00504966;REVB=-0.00257379;RO=26;SAF=10;SAR=11;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.097583;STB=0.555503;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.0069831;OID=.;OPOS=90871478;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:26:26:21:21:0.446809:11:10:15:11:11:10:15:11
chr14	91123575	.	T	C,G	218.87	PASS	AF=0.888889,0.111111;AO=16,2;DP=18;FAO=16,2;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=2,1;FSAR=14,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0456083,0.039393;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=85.5212,45.5541;QD=48.6376;RBI=0.0525427,0.078868;REFB=0,0;REVB=-0.0260886,-0.0683254;RO=0;SAF=2,1;SAR=14,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00948905,0.0982962;OID=.,.;OPOS=91123575,91123575;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:18:18:0:0:16,2:16,2:0.888889,0.111111:14,1:2,1:0:0:14,1:2,1:0:0
chr14	91161862	.	C	T	9074.13	PASS	AF=1;AO=569;DP=571;FAO=571;FDP=571;FR=.;FRO=0;FSAF=340;FSAR=231;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0151716;FXX=0.00174822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.033;QD=63.5666;RBI=0.0200913;REFB=0;REVB=0.0131713;RO=0;SAF=339;SAR=230;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.57345e-06;OID=.;OPOS=91161862;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:49:571:571:0:0:569:571:1:230:339:0:0:231:340:0:0
chr14	91165572	.	G	A	1246.09	PASS	AF=1;AO=80;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00912429;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.918;QD=61.5352;RBI=0.0123329;REFB=0;REVB=0.00829753;RO=0;SAF=40;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.11604e-06;OID=.;OPOS=91165572;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:81:0:0:80:81:1:40:40:0:0:41:40:0:0
chr14	91700846	.	G	A	364.3	PASS	AF=0.536232;AO=37;DP=69;FAO=37;FDP=69;FR=.;FRO=32;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=-0.0144536;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.314;QD=21.119;RBI=0.126578;REFB=-0.0258076;REVB=0.12575;RO=32;SAF=17;SAR=20;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00783326;STB=0.504332;STBP=0.961;TYPE=snp;VARB=0.0372191;OID=.;OPOS=91700846;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:32:32:37:37:0.536232:20:17:15:17:20:17:15:17
chr14	91717214	.	C	T	344.01	PASS	AF=0.440476;AO=37;DP=84;FAO=37;FDP=84;FR=.;FRO=47;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=20;FSRR=27;FWDB=0.0256716;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.973;QD=16.3815;RBI=0.0257703;REFB=-0.000284413;REVB=-0.00225352;RO=47;SAF=20;SAR=17;SRF=20;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114032;STB=0.564068;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=0.000607792;OID=.;OPOS=91717214;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:47:47:37:37:0.440476:17:20:20:27:17:20:20:27
chr14	91739081	.	A	G	345.62	PASS	AF=0.392523;AO=39;DP=106;FAO=42;FDP=107;FR=.;FRO=65;FSAF=32;FSAR=10;FSRF=46;FSRR=19;FWDB=-0.00340395;FXX=0.0183469;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.416;QD=12.9205;RBI=0.0203339;REFB=-0.0125756;REVB=0.0200469;RO=65;SAF=31;SAR=8;SRF=45;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152699;STB=0.543304;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.0192935;OID=.;OPOS=91739081;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:107:65:65:39:42:0.392523:8:31:45:20:10:32:46:19
chr14	91760522	.	C	T	329.79	PASS	AF=0.428571;AO=36;DP=84;FAO=36;FDP=84;FR=.;FRO=48;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=23;FSRR=25;FWDB=0.00759885;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.76;QD=15.7042;RBI=0.0312456;REFB=-0.0119793;REVB=0.0303075;RO=48;SAF=17;SAR=19;SRF=23;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00705094;STB=0.503977;STBP=0.961;TYPE=snp;VARB=0.00960528;OID=.;OPOS=91760522;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:48:48:36:36:0.428571:19:17:23:25:19:17:23:25
chr14	91883499	.	G	A	650.9	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0538093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.66;QD=61.9906;RBI=0.0703774;REFB=0;REVB=-0.04536;RO=0;SAF=12;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.52854e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.4506e-05;OID=.;OPOS=91883499;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:30:12:0:0:30:12:0:0
chr14	91924895	.	C	G	158.15	PASS	AF=0.404762;AO=17;DP=42;FAO=17;FDP=42;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=-0.0205129;FXX=0.0666519;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.024;QD=15.062;RBI=0.0269336;REFB=-0.0138745;REVB=-0.0174539;RO=25;SAF=12;SAR=5;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.245167;STB=0.642682;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=0.0158786;OID=.;OPOS=91924895;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:25:25:17:17:0.404762:5:12:12:13:5:12:12:13
chr14	91942086	.	AAG	A,AA,AAA	335.51	PASS	AF=0,1,0;AO=3,19,4;DP=26;FAO=0,25,0;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=0,15,0;FSAR=0,10,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0107817,-0.0306294,-0.0545755;FXX=0;HRUN=4,1,1;LEN=2,1,1;MLLD=40.1256,56.8915,43.8258;QD=53.6809;RBI=0.10237,0.0324227,0.12203;REFB=0,0,0;REVB=-0.1018,0.0106336,0.109146;RO=0;SAF=0,13,2;SAR=3,6,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,3.851e-08,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,del,snp;VARB=0,-0.00149312,0;OID=.,.,.;OPOS=91942087,91942088,91942088;OREF=AG,G,G;OALT=-,-,A;OMAPALT=A,AA,AAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	2/2:0,1,0:3,19,4:26:0,25,0:25:0:0,15,0:0,10,0:0:0:4:0:0,13,2:3,6,2:0:0
chr14	92040793	.	C	G	1426.03	PASS	AF=0.989247;AO=92;DP=93;FAO=92;FDP=93;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=48;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00482029;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.2131;QD=61.3348;RBI=0.0366757;REFB=0.00615963;REVB=0.0363576;RO=1;SAF=44;SAR=48;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0106524;STB=0.505617;STBP=0.33;TYPE=snp;VARB=-0.000604668;OID=.;OPOS=92040793;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:93:93:1:1:92:92:0.989247:48:44:1:0:48:44:1:0
chr14	92084004	.	C	G	766.46	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00557828;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.7402;QD=63.8716;RBI=0.0137262;REFB=0;REVB=0.0125416;RO=0;SAF=24;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000205381;OID=.;OPOS=92084004;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:24:24:0:0:24:24:0:0
chr14	92088016	.	G	A	651.2	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00591151;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.707;QD=62.0192;RBI=0.0113945;REFB=0;REVB=-0.00974107;RO=0;SAF=20;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.29943e-05;OID=.;OPOS=92088016;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:22:20:0:0:22:20:0:0
chr14	92181405	.	G	A	772.64	PASS	AF=0.98;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0100601;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.28;QD=61.8115;RBI=0.0267177;REFB=0.00784737;REVB=0.0247513;RO=1;SAF=25;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0184525;STB=0.5098;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=7.74136e-05;OID=.;OPOS=92181405;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:50:50:1:1:49:49:0.98:24:25:1:0:24:25:1:0
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chr14	92251587	.	A	G	760.92	PASS	AF=0.52518;AO=73;DP=138;FAO=73;FDP=139;FR=.;FRO=66;FSAF=47;FSAR=26;FSRF=32;FSRR=34;FWDB=0.0279809;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.967;QD=21.897;RBI=0.0349899;REFB=-0.0159103;REVB=-0.0210085;RO=65;SAF=47;SAR=26;SRF=32;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135511;STB=0.578558;STBP=0.056;TYPE=snp;VARB=0.0105113;OID=.;OPOS=92251587;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:138:139:65:66:73:73:0.52518:26:47:32:33:26:47:32:34
chr14	92268615	.	T	G	619.94	PASS	AF=0.97619;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0123822;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=231.079;QD=59.0422;RBI=0.0288462;REFB=0.115258;REVB=0.0260534;RO=1;SAF=28;SAR=13;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0164662;STB=0.508768;STBP=0.611;TYPE=snp;VARB=-0.000549919;OID=.;OPOS=92268615;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:42:42:1:1:41:41:0.97619:13:28:1:0:13:28:1:0
chr14	92280037	.	T	C	109.85	PASS	AF=0.5;AO=12;DP=26;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.00604548;FXX=0.142806;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.558;QD=18.3076;RBI=0.0104698;REFB=-0.00192569;REVB=0.00854807;RO=11;SAF=6;SAR=6;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0377853;STB=0.541598;STBP=0.737;TYPE=snp;VARB=0.00489275;OID=.;OPOS=92280037;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:24:11:12:12:12:0.5:6:6:6:5:6:6:7:5
chr14	92347680	.	A	G	591.53	PASS	AF=0.97561;AO=39;DP=40;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0359103;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.2442;QD=57.7106;RBI=0.0370913;REFB=-0.0762607;REVB=0.00928534;RO=1;SAF=13;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0346908;STB=0.517233;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=0.0017105;OID=.;OPOS=92347680;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:40:41:1:1:39:40:0.97561:26:13:1:0:26:14:1:0
chr14	92361310	.	C	T	332.91	PASS	AF=0.5;AO=35;DP=70;FAO=35;FDP=70;FR=.;FRO=35;FSAF=24;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=15;FWDB=0.0175541;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.424;QD=19.0233;RBI=0.0194008;REFB=-0.00634546;REVB=0.0082609;RO=35;SAF=24;SAR=11;SRF=20;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113055;STB=0.56314;STBP=0.356;TYPE=snp;VARB=0.00898006;OID=.;OPOS=92361310;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:35:35:35:35:0.5:11:24:20:15:11:24:20:15
chr14	92441066	.	C	T	258.58	PASS	AF=0.460317;AO=29;DP=63;FAO=29;FDP=63;FR=.;FRO=34;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=0.00491422;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.918;QD=16.4177;RBI=0.0171133;REFB=-0.0264508;REVB=-0.0163925;RO=34;SAF=19;SAR=10;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.182716;STB=0.603102;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.0226337;OID=.;OPOS=92441066;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:34:34:29:29:0.460317:10:19:16:18:10:19:16:18
chr14	92488083	.	A	G	228.91	PASS	AF=0.45614;AO=26;DP=57;FAO=26;FDP=57;FR=.;FRO=31;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=21;FWDB=-0.0169479;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.59;QD=16.0637;RBI=0.0174403;REFB=0.00264364;REVB=0.00411475;RO=31;SAF=14;SAR=12;SRF=10;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206098;STB=0.615914;STBP=0.134;TYPE=snp;VARB=-0.00728857;OID=.;OPOS=92488083;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:31:31:26:26:0.45614:12:14:10:21:12:14:10:21
chr14	92530513	.	C	T	266.9	PASS	AF=0.491803;AO=29;DP=61;FAO=30;FDP=61;FR=.;FRO=31;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=-0.0298549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.924;QD=17.5013;RBI=0.0321904;REFB=-0.0296455;REVB=-0.0120377;RO=32;SAF=15;SAR=14;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0743881;STB=0.557696;STBP=0.388;TYPE=snp;VARB=0.013202;OID=.;OPOS=92530513;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:32:31:29:30:0.491803:14:15:14:18:14:16:13:18
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chr14	92548785	.	C	T	215.99	PASS	AF=0.438596;AO=25;DP=57;FAO=25;FDP=57;FR=.;FRO=32;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=-0.0152881;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.181;QD=15.1569;RBI=0.0220984;REFB=0.0100648;REVB=-0.0159566;RO=31;SAF=13;SAR=12;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0278056;STB=0.506324;STBP=0.948;TYPE=snp;VARB=-0.0196723;OID=.;OPOS=92548785;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:31:32:25:25:0.438596:12:13:17:14:12:13:17:15
chr14	92549586	.	G	A	710.28	PASS	AF=0.980769;AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00574795;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.246;QD=54.6368;RBI=0.00574993;REFB=0.0515067;REVB=-0.000150982;RO=1;SAF=23;SAR=28;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0200325;STB=0.510634;STBP=0.327;TYPE=snp;VARB=-1.31213e-05;OID=.;OPOS=92549586;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:52:52:1:1:51:51:0.980769:28:23:1:0:28:23:1:0
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chr14	92588002	.	T	G	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0438697;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.105;QD=48.7357;RBI=0.0475667;REFB=0;REVB=-0.0183859;RO=0;SAF=13;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000292636;OID=.;OPOS=92588002;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:4:13:0:0:4:13:0:0
chr14	92792255	.	G	A	1008.47	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0521896;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.8413;QD=59.3221;RBI=0.0544654;REFB=0;REVB=-0.0155796;RO=0;SAF=26;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00052205;OID=.;OPOS=92792255;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:42:26:0:0:42:26:0:0
chr14	92909073	.	T	C	896.82	PASS	AF=1;AO=61;DP=64;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00552777;FXX=0.0454477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.039;QD=56.9411;RBI=0.115437;REFB=0;REVB=0.115304;RO=0;SAF=33;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000995136;OID=.;OPOS=92909073;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:64:63:0:0:61:63:1:28:33:0:0:30:33:0:0
chr14	92920371	.	C	T	520.07	PASS	AF=0.482456;AO=55;DP=114;FAO=55;FDP=114;FR=.;FRO=59;FSAF=26;FSAR=29;FSRF=26;FSRR=33;FWDB=-0.00445815;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=169.185;QD=18.2482;RBI=0.0219535;REFB=-0.0148783;REVB=0.0214961;RO=59;SAF=26;SAR=29;SRF=26;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0300656;STB=0.516661;STBP=0.763;TYPE=snp;VARB=0.0211814;OID=.;OPOS=92920371;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:114:114:59:59:55:55:0.482456:29:26:26:33:29:26:26:33
chr14	92922900	.	G	A	160.45	PASS	AF=0.485714;AO=17;DP=35;FAO=17;FDP=35;FR=.;FRO=18;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=0.0244162;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.427;QD=18.3372;RBI=0.0665157;REFB=0.000558171;REVB=0.0618723;RO=17;SAF=12;SAR=5;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.362131;STB=0.693647;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.00123989;OID=.;OPOS=92922900;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:17:18:17:17:0.485714:5:12:5:12:5:12:6:12
chr14	92958522	.	A	C	164.13	PASS	AF=0.372549;AO=19;DP=51;FAO=19;FDP=51;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=-0.00997314;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.579;QD=12.8729;RBI=0.0245179;REFB=-0.0076043;REVB=-0.0223978;RO=32;SAF=10;SAR=9;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0733497;STB=0.542575;STBP=0.66;TYPE=snp;VARB=0.0128944;OID=.;OPOS=92958522;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:32:32:19:19:0.372549:9:10:19:13:9:10:19:13
chr14	93118038	.	A	G	402.72	PASS	AF=0.488095;AO=40;DP=84;FAO=41;FDP=84;FR=.;FRO=43;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=23;FSRR=20;FWDB=0.0177536;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.498;QD=19.1773;RBI=0.0180354;REFB=-0.0108133;REVB=0.00317602;RO=43;SAF=17;SAR=23;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102668;STB=0.54919;STBP=0.393;TYPE=snp;VARB=0.0108432;OID=.;OPOS=93118038;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:43:43:40:41:0.488095:23:17:23:20:23:18:23:20
chr14	93118668	.	C	T	45.07	PASS	AF=0.304348;AO=6;DP=22;FAO=7;FDP=23;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=0.0266287;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.905;QD=7.83772;RBI=0.0365483;REFB=-0.0141468;REVB=-0.0250339;RO=16;SAF=2;SAR=4;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.38307;STB=0.674237;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.0298174;OID=.;OPOS=93118668;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:22:23:16:16:6:7:0.304348:4:2:11:5:4:3:11:5
chr14	93118669	.	G	A	134.16	PASS	AF=0.636364;AO=14;DP=23;FAO=14;FDP=22;FR=.;FRO=8;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.00357268;FXX=0.0434594;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.111;QD=24.3927;RBI=0.00819678;REFB=-0.0420281;REVB=0.0073772;RO=7;SAF=10;SAR=4;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187933;STB=0.588103;STBP=0.325;TYPE=snp;VARB=0.0126155;OID=.;OPOS=93118669;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:23:22:7:8:14:14:0.636364:4:10:3:4:4:10:4:4
chr14	93119407	.	C	T	226.43	PASS	AF=0.471698;AO=25;DP=53;FAO=25;FDP=53;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=19;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=-0.00902102;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=227.53;QD=17.0892;RBI=0.00904758;REFB=-0.0263425;REVB=-0.000692738;RO=27;SAF=6;SAR=19;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.289303;STB=0.674977;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.0259242;OID=.;OPOS=93119407;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:27:28:25:25:0.471698:19:6:14:13:19:6:15:13
chr14	93178191	.	A	G	1066.15	PASS	AF=0.986301;AO=72;DP=73;FAO=72;FDP=73;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0382085;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.7977;QD=58.4192;RBI=0.0382358;REFB=-0.104691;REVB=-0.00144497;RO=0;SAF=32;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.05346e-08;STB=0.506171;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.00119468;OID=.;OPOS=93178191;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:73:73:0:1:72:72:0.986301:40:32:0:0:40:32:0:1
chr14	93180727	.	A	G	699.34	PASS	AF=0.980392;AO=49;DP=50;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0179562;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.64;QD=54.85;RBI=0.0180678;REFB=-0.0561104;REVB=0.00200438;RO=1;SAF=27;SAR=22;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0209097;STB=0.511107;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.000490698;OID=.;OPOS=93180727;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:50:51:1:1:49:50:0.980392:22:27:0:1:22:28:0:1
chr14	93276654	.	T	C	279.6	PASS	AF=0.956522;AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00388602;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=258.455;QD=48.626;RBI=0.0115078;REFB=-0.0708707;REVB=-0.0108318;RO=1;SAF=9;SAR=13;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0342405;STB=0.518502;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=-5.6875e-05;OID=.;OPOS=93276654;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:23:23:1:1:22:22:0.956522:13:9:0:1:13:9:0:1
chr14	93399169	.	G	A	441.47	PASS	AF=0.416667;AO=49;DP=119;FAO=50;FDP=120;FR=.;FRO=70;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=34;FSRR=36;FWDB=0.0399797;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.3369;QD=14.7157;RBI=0.077247;REFB=-0.0114194;REVB=0.0660964;RO=70;SAF=27;SAR=22;SRF=34;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0683335;STB=0.54349;STBP=0.458;TYPE=snp;VARB=0.0170017;OID=.;OPOS=93399169;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:120:70:70:49:50:0.416667:22:27:34:36:22:28:34:36
chr14	93401178	.	A	G	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0724494;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.1868;QD=47.8218;RBI=0.074647;REFB=0;REVB=-0.0179795;RO=0;SAF=6;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00357195;OID=.;OPOS=93401178;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:10:6:0:0:10:6:0:0
chr14	93407062	.	A	G	775.24	PASS	AF=0.965517;AO=56;DP=58;FAO=56;FDP=58;FR=.;FRO=2;FSAF=31;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0278819;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=225.142;QD=53.4648;RBI=0.0363417;REFB=-0.0638771;REVB=0.0233092;RO=2;SAF=31;SAR=25;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00351986;STB=0.501867;STBP=0.886;TYPE=snp;VARB=0.00408308;OID=.;OPOS=93407062;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:58:58:2:2:56:56:0.965517:25:31:1:1:25:31:1:1
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chr14	93693831	.	C	T	485.7	PASS	AF=0.516484;AO=47;DP=91;FAO=47;FDP=91;FR=.;FRO=44;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=0.0317902;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.4464;QD=21.3494;RBI=0.0594927;REFB=-0.00719714;REVB=0.0502869;RO=44;SAF=24;SAR=23;SRF=22;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00931;STB=0.505143;STBP=0.962;TYPE=snp;VARB=0.00775986;OID=.;OPOS=93693831;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:44:44:47:47:0.516484:23:24:22:22:23:24:22:22
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chr14	94103602	.	G	A	157.29	PASS	AF=0.435897;AO=17;DP=38;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.00311816;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.524;QD=16.1325;RBI=0.0132493;REFB=-0.0154946;REVB=0.0128772;RO=21;SAF=7;SAR=10;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108793;STB=0.550399;STBP=0.557;TYPE=snp;VARB=0.0197478;OID=.;OPOS=94103602;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:39:21:22:17:17:0.435897:10:7:11:10:10:7:11:11
chr14	94184980	.	TA	T	121.35	PASS	AF=0.736842;AO=2;DP=16;FAO=14;FDP=19;FR=.;FRO=5;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.103371;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.1558;QD=25.5474;RBI=0.270757;REFB=-0.26834;REVB=0.250247;RO=13;SAF=2;SAR=0;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.468324;STB=0.599873;STBP=0.261;TYPE=del;VARB=0.0982661;OID=.;OPOS=94184981;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.736842:2:16:14:19:5:10:4:5:0:27:13:2:0:10:3
chr14	94187832	.	C	T	195.88	PASS	AF=0.612903;AO=19;DP=31;FAO=19;FDP=31;FR=.;FRO=12;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=1;FWDB=-0.00644292;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.083;QD=25.2745;RBI=0.0317667;REFB=0.00398313;REVB=0.0311065;RO=12;SAF=9;SAR=10;SRF=11;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.305985;STB=0.668736;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=-0.00857004;OID=.;OPOS=94187832;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:31:31:12:12:19:19:0.612903:10:9:11:1:10:9:11:1
chr14	94391699	.	G	A	57.33	PASS	AF=0.444444;AO=8;DP=18;FAO=8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=-0.023087;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=81.3658;QD=12.7389;RBI=0.0264178;REFB=-0.0137165;REVB=-0.0128409;RO=10;SAF=6;SAR=2;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1654;STB=0.599733;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=0.0196743;OID=.;OPOS=94391699;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:18:18:10:10:8:8:0.444444:2:6:6:4:2:6:6:4
chr14	94405871	.	G	C	42.21	PASS	AF=0.666667;AO=6;DP=9;FAO=6;FDP=9;FR=.;FRO=3;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0102633;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=143.874;QD=18.7584;RBI=0.0242065;REFB=-0.115484;REVB=-0.021923;RO=3;SAF=5;SAR=1;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200664;STB=0.615062;STBP=0.687;TYPE=snp;VARB=0.0095671;OID=.;OPOS=94405871;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:9:9:3:3:6:6:0.666667:1:5:3:0:1:5:3:0
chr14	94410275	.	CA	C	248.05	PASS	AF=0.462366;AO=41;DP=95;FAO=43;FDP=93;FR=.;FRO=50;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=32;FWDB=0.00699516;FXX=0.0210504;HRUN=4;LEN=1;MLLD=19.7053;QD=10.6686;RBI=0.0555514;REFB=0.0224208;REVB=0.0551092;RO=49;SAF=22;SAR=19;SRF=18;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163633;STB=0.593212;STBP=0.115;TYPE=del;VARB=-0.0182874;OID=.;OPOS=94410276;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.462366:41:95:43:93:50:23:20:18:32:99:49:22:19:18:31
chr14	94417421	.	G	A	1792.87	PASS	AF=0.991667;AO=117;DP=120;FAO=119;FDP=120;FR=.;FRO=1;FSAF=62;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0131572;FXX=0.0163921;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.641;QD=59.7625;RBI=0.022509;REFB=-0.0219699;REVB=0.0182631;RO=0;SAF=60;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504347;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.000432382;OID=.;OPOS=94417421;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:120:120:0:1:117:119:0.991667:57:60:0:0:57:62:0:1
chr14	94417541	.	A	G	468.97	PASS	AF=1;AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0402806;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.024;QD=58.6218;RBI=0.0414107;REFB=0;REVB=-0.00960822;RO=0;SAF=16;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000266095;OID=.;OPOS=94417541;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:32:0:0:32:32:1:16:16:0:0:16:16:0:0
chr14	94417586	.	G	A	239.45	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0577854;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.034;QD=50.4108;RBI=0.0601589;REFB=0;REVB=0.0167316;RO=0;SAF=11;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.41338e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00113739;OID=.;OPOS=94417586;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:8:11:0:0:8:11:0:0
chr14	94467549	.	C	G,T	527.45	PASS	AF=0.0555556,0.944444;AO=2,34;DP=36;FAO=2,34;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=1,22;FSAR=1,12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00964034,-0.010681;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=128.18,260.23;QD=58.6051;RBI=0.012053,0.0240565;REFB=0,0;REVB=0.00723448,0.0215553;RO=0;SAF=1,22;SAR=1,12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,4.75716e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0156129,0.000672884;OID=.,.;OPOS=94467549,94467549;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:36:36:0:0:2,34:2,34:0.0555556,0.944444:1,12:1,22:0:0:1,12:1,22:0:0
chr14	94564035	.	A	G	465.14	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0216487;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.5889;QD=58.1419;RBI=0.029184;REFB=0;REVB=-0.0195713;RO=0;SAF=20;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000534092;OID=.;OPOS=94564035;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:12:20:0:0:12:20:0:0
chr14	94564039	.	A	G	428.77	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0632612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.1579;QD=57.1687;RBI=0.0709717;REFB=0;REVB=-0.0321715;RO=0;SAF=19;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000707349;OID=.;OPOS=94564039;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:11:19:0:0:11:19:0:0
chr14	94564058	.	G	A	312.65	PASS	AF=0.96;AO=23;DP=24;FAO=24;FDP=25;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0639761;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.9958;QD=50.0232;RBI=0.068738;REFB=-0.0331667;REVB=0.0251391;RO=1;SAF=15;SAR=8;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0543643;STB=0.529387;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=0.0191538;OID=.;OPOS=94564058;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:24:25:1:1:23:24:0.96:8:15:0:1:8:16:0:1
chr14	94582130	.	T	C,TGGCCATGGC	108.82	PASS	AF=0.0697674,0.255814;AO=3,10;DP=43;FAO=3,11;FDP=43;FR=.;FRO=29;FSAF=3,4;FSAR=0,7;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=-0.0170707,-0.00825916;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=1,9;MLLD=233.821,329.112;QD=10.1226;RBI=0.0187574,0.0145494;REFB=-0.0158837,-0.0127286;REVB=-0.00777364,-0.0119779;RO=29;SAF=3,3;SAR=0,7;SRF=13;SRR=16;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.572889,-0.18748;STB=0.996683,0.563863;STBP=0.077,0.677;TYPE=snp,ins;VARB=0.0824239,0.0346138;OID=.,.;OPOS=94582130,94582131;OREF=T,-;OALT=C,GGCCATGGC;OMAPALT=C,TGGCCATGGC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:85:43:43:29:29:3,10:3,11:0.0697674,0.255814:0,7:3,3:13:16:0,7:3,4:13:16
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chr14	94776221	.	A	C	1306.21	PASS	AF=0.988372;AO=85;DP=86;FAO=85;FDP=86;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00522913;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.758;QD=60.7539;RBI=0.0113969;REFB=-0.0835303;REVB=0.0101264;RO=0;SAF=39;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506328;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=-0.000131983;OID=.;OPOS=94776221;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:86:86:0:1:85:85:0.988372:46:39:0:0:46:39:1:0
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chr14	94933473	.	C	A	258.53	PASS	AF=0.460317;AO=29;DP=63;FAO=29;FDP=63;FR=.;FRO=34;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=0.00194598;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.751;QD=16.4144;RBI=0.00581953;REFB=-0.00417807;REVB=-0.00548453;RO=34;SAF=13;SAR=16;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0778604;STB=0.543829;STBP=0.554;TYPE=snp;VARB=0.00501307;OID=.;OPOS=94933473;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:34:34:29:29:0.460317:16:13:18:16:16:13:18:16
chr14	94933640	.	A	T	181.92	PASS	AF=0.416667;AO=20;DP=51;FAO=20;FDP=48;FR=.;FRO=28;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=0.038123;FXX=0.058812;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.523;QD=15.16;RBI=0.0390121;REFB=-0.00390346;REVB=-0.00828155;RO=31;SAF=8;SAR=12;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0210901;STB=0.538423;STBP=0.647;TYPE=snp;VARB=0.00527228;OID=.;OPOS=94933640;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:48:31:28:20:20:0.416667:12:8:13:18:12:8:13:15
chr14	94933695	.	G	A	143.78	PASS	AF=0.410256;AO=16;DP=38;FAO=16;FDP=39;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=0.0142127;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=71.3926;QD=14.7464;RBI=0.058151;REFB=-0.00232965;REVB=0.0563874;RO=22;SAF=9;SAR=7;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.241158;STB=0.624455;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=0.00300442;OID=.;OPOS=94933695;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:39:22:23:16:16:0.410256:7:9:7:15:7:9:8:15
chr14	94935566	.	G	A	182.99	PASS	AF=0.452381;AO=19;DP=42;FAO=19;FDP=42;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=0.00508344;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.413;QD=17.4277;RBI=0.0133794;REFB=0.0118106;REVB=0.0123761;RO=23;SAF=10;SAR=9;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.079722;STB=0.545407;STBP=0.615;TYPE=snp;VARB=-0.0178713;OID=.;OPOS=94935566;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:23:23:19:19:0.452381:9:10:14:9:9:10:14:9
chr14	94935901	.	G	C	860.16	PASS	AF=0.494318;AO=86;DP=175;FAO=87;FDP=176;FR=.;FRO=89;FSAF=43;FSAR=44;FSRF=41;FSRR=48;FWDB=0.0210292;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.9112;QD=19.549;RBI=0.0412267;REFB=-0.0252684;REVB=0.0354601;RO=89;SAF=43;SAR=43;SRF=41;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0363028;STB=0.516985;STBP=0.675;TYPE=snp;VARB=0.0245453;OID=.;OPOS=94935901;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:175:176:89:89:86:87:0.494318:43:43:41:48:44:43:41:48
chr14	94936107	.	G	A	33.63	PASS	AF=0.714286;AO=5;DP=7;FAO=5;FDP=7;FR=.;FRO=2;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00644976;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.9535;QD=19.218;RBI=0.0105675;REFB=-0.121966;REVB=0.00837088;RO=2;SAF=2;SAR=3;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0491618;STB=0.529293;STBP=0.911;TYPE=snp;VARB=0.0143277;OID=.;OPOS=94936107;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:7:7:2:2:5:5:0.714286:3:2:1:1:3:2:1:1
chr14	95033356	.	C	T	157.78	PASS	AF=0.35;AO=20;DP=59;FAO=21;FDP=60;FR=.;FRO=39;FSAF=16;FSAR=5;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=0.0282532;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.687;QD=10.5186;RBI=0.0294595;REFB=0.00122056;REVB=0.00834393;RO=39;SAF=16;SAR=4;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.391532;STB=0.695454;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=-0.00238884;OID=.;OPOS=95033356;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:60:39:39:20:21:0.35:4:16:19:20:5:16:19:20
chr14	95053849	.	T	C	260.03	PASS	AF=0.467742;AO=29;DP=62;FAO=29;FDP=62;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=-0.00798469;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=70.284;QD=16.7763;RBI=0.0110589;REFB=0.0164697;REVB=0.00765147;RO=33;SAF=16;SAR=13;SRF=12;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176609;STB=0.599052;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=-0.0263277;OID=.;OPOS=95053849;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:33:33:29:29:0.467742:13:16:12:21:13:16:12:21
chr14	95053863	.	C	T	267.95	PASS	AF=0.454545;AO=30;DP=65;FAO=30;FDP=66;FR=.;FRO=36;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=22;FWDB=-0.0144276;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=226.205;QD=16.2395;RBI=0.0144312;REFB=-0.00510774;REVB=-0.000320983;RO=35;SAF=17;SAR=13;SRF=13;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.185281;STB=0.596129;STBP=0.17;TYPE=snp;VARB=0.00602446;OID=.;OPOS=95053863;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:66:35:36:30:30:0.454545:13:17:13:22:13:17:14:22
chr14	95053890	.	GC	AC,AT	913.37	PASS	AF=0.484375,0.515625;AO=30,33;DP=66;FAO=31,33;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=8,20;FSAR=23,13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0305964,0.0357788;FXX=0.0447694;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=172.634,180.202;QD=57.0856;RBI=0.0305987,0.0358311;REFB=0,0;REVB=0.000375266,-0.00193619;RO=0;SAF=7,20;SAR=23,13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,4.82173e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.00493024,-0.00747514;OID=.,.;OPOS=95053890,95053890;OREF=G,GC;OALT=A,AT;OMAPALT=AC,AT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:66:64:0:0:30,33:31,33:0.484375,0.515625:23,13:7,20:0:0:23,13:8,20:0:0
chr14	95054012	.	A	G	238.84	PASS	AF=0.479167;AO=23;DP=49;FAO=23;FDP=48;FR=.;FRO=25;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=-0.00956461;FXX=0.020404;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.9265;QD=19.9036;RBI=0.0420916;REFB=0.0248115;REVB=0.0409905;RO=25;SAF=16;SAR=7;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.314153;STB=0.677559;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=-0.0253465;OID=.;OPOS=95054012;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:48:25:25:23:23:0.479167:7:16:9:16:7:16:9:16
chr14	95054176	.	T	C	727.76	PASS	AF=1;AO=45;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0122356;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.249;QD=63.2835;RBI=0.0242414;REFB=0;REVB=0.0209268;RO=0;SAF=27;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.90909e-05;OID=.;OPOS=95054176;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:45:46:1:18:27:0:0:19:27:0:0
chr14	95080803	.	G	A	68.99	PASS	AF=0.473684;AO=9;DP=19;FAO=9;FDP=19;FR=.,HEALED;FRO=10;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.0310379;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.4786;QD=14.524;RBI=0.0343608;REFB=-0.0207654;REVB=-0.0147415;RO=8;SAF=4;SAR=5;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0450094;STB=0.523757;STBP=0.869;TYPE=snp;VARB=0.0771849;OID=.;OPOS=95080803;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:19:19:8:10:9:9:0.473684:5:4:4:4:5:4:4:6
chr14	95110017	.	G	T	789.95	PASS	AF=1;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0127604;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.208;QD=64.486;RBI=0.0374349;REFB=0;REVB=0.035193;RO=0;SAF=28;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000175401;OID=.;OPOS=95110017;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:49:0:0:49:49:1:21:28:0:0:21:28:0:0
chr14	95555205	.	C	T	1026.38	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00890573;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.2399;QD=59.5004;RBI=0.0179589;REFB=0;REVB=-0.0155952;RO=0;SAF=44;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.46362e-05;OID=.;OPOS=95555205;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:25:44:0:0:25:44:0:0
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chr14	95912426	.	T	C	115.08	PASS	AF=0.541667;AO=13;DP=24;FAO=13;FDP=24;FR=.;FRO=11;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=-0.0144487;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.38;QD=19.1804;RBI=0.0263522;REFB=-0.0058985;REVB=-0.0220381;RO=11;SAF=9;SAR=4;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.271432;STB=0.655383;STBP=0.114;TYPE=snp;VARB=0.00433097;OID=.;OPOS=95912426;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:24:24:11:11:13:13:0.541667:4:9:4:7:4:9:4:7
chr14	95916397	.	C	T	495.54	PASS	AF=0.446281;AO=54;DP=121;FAO=54;FDP=121;FR=.;FRO=67;FSAF=18;FSAR=36;FSRF=27;FSRR=40;FWDB=-0.00380048;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.2766;QD=16.3816;RBI=0.0379775;REFB=-0.00791888;REVB=0.0377868;RO=67;SAF=18;SAR=36;SRF=27;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0753378;STB=0.542153;STBP=0.439;TYPE=snp;VARB=0.00956729;OID=.;OPOS=95916397;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:121:121:67:67:54:54:0.446281:36:18:27:40:36:18:27:40
chr14	95918625	.	T	C	196.32	PASS	AF=0.387097;AO=24;DP=63;FAO=24;FDP=62;FR=.;FRO=38;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=25;FWDB=-0.0184592;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.8948;QD=12.6658;RBI=0.032108;REFB=-0.00639137;REVB=0.0262713;RO=38;SAF=10;SAR=14;SRF=13;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0832539;STB=0.547714;STBP=0.579;TYPE=snp;VARB=0.0117879;OID=.;OPOS=95918625;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:62:38:38:24:24:0.387097:14:10:13:25:14:10:13:25
chr14	95921741	.	C	T	270.6	PASS	AF=0.538462;AO=27;DP=51;FAO=28;FDP=52;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=7;FWDB=0.00229387;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.916;QD=20.8155;RBI=0.00525135;REFB=-0.0129943;REVB=0.00472386;RO=24;SAF=11;SAR=16;SRF=17;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.250096;STB=0.626939;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.011857;OID=.;OPOS=95921741;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:52:24:24:27:28:0.538462:16:11:17:7:16:12:17:7
chr14	95923670	.	A	C	614.64	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0606954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.007;QD=61.4637;RBI=0.0622414;REFB=0;REVB=0.0137863;RO=0;SAF=21;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.53998e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000248505;OID=.;OPOS=95923670;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:40:0:0:38:40:1:17:21:0:0:17:23:0:0
chr14	95983975	.	G	A	360.25	PASS	AF=0.666667;AO=30;DP=45;FAO=30;FDP=45;FR=.;FRO=15;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=0.0109614;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.69;QD=32.0218;RBI=0.0111067;REFB=0.00423687;REVB=0.00179098;RO=15;SAF=15;SAR=15;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101611;STB=0.555519;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=-0.00233216;OID=.;OPOS=95983975;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:15:15:30:30:0.666667:15:15:10:5:15:15:10:5
chr14	95999820	.	T	C	492.4	PASS	AF=0.489796;AO=48;DP=98;FAO=48;FDP=98;FR=.;FRO=50;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=26;FSRR=24;FWDB=-0.0214078;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.476;QD=20.098;RBI=0.0214372;REFB=-0.00616118;REVB=0.00112221;RO=50;SAF=25;SAR=23;SRF=26;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000767545;STB=0.500426;STBP=0.989;TYPE=snp;VARB=0.00665919;OID=.;OPOS=95999820;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:50:50:48:48:0.489796:23:25:26:24:23:25:26:24
chr14	96131432	.	A	G	192.9	PASS	AF=0.575758;AO=19;DP=33;FAO=19;FDP=33;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.0233167;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.372;QD=23.3814;RBI=0.0287233;REFB=-0.0270751;REVB=-0.0167737;RO=14;SAF=6;SAR=13;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0356576;STB=0.519979;STBP=0.807;TYPE=snp;VARB=0.0162195;OID=.;OPOS=96131432;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:14:14:19:19:0.575758:13:6:5:9:13:6:5:9
chr14	96136794	.	A	G	108.61	PASS	AF=0.40625;AO=13;DP=32;FAO=13;FDP=32;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=0.0366259;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.1688;QD=13.5761;RBI=0.0373655;REFB=0.00235076;REVB=0.00739731;RO=19;SAF=7;SAR=6;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118539;STB=0.569272;STBP=0.544;TYPE=snp;VARB=-0.00280628;OID=.;OPOS=96136794;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:19:19:13:13:0.40625:6:7:8:11:6:7:8:11
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chr14	96558881	.	C	G	1139.49	PASS	AF=0.9625;AO=77;DP=81;FAO=77;FDP=80;FR=.;FRO=3;FSAF=46;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0117838;FXX=0.0123442;HRUN=3;LEN=1;MLLD=158.999;QD=56.9745;RBI=0.0179004;REFB=-0.0881622;REVB=0.0134747;RO=3;SAF=46;SAR=31;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0193814;STB=0.510249;STBP=0.427;TYPE=snp;VARB=0.000861401;OID=.;OPOS=96558881;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:81:80:3:3:77:77:0.9625:31:46:1:2:31:46:1:2
chr14	96559250	.	C	T	175.15	PASS	AF=0.514286;AO=18;DP=35;FAO=18;FDP=35;FR=.;FRO=17;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.020859;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.703;QD=20.0175;RBI=0.025569;REFB=0.0012609;REVB=-0.0147876;RO=17;SAF=12;SAR=6;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125776;STB=0.571347;STBP=0.444;TYPE=snp;VARB=-0.00121054;OID=.;OPOS=96559250;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:17:17:18:18:0.514286:6:12:9:8:6:12:9:8
chr14	96559459	.	C	A	256.42	PASS	AF=0.533333;AO=24;DP=45;FAO=24;FDP=45;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=-0.0148758;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.272;QD=22.7932;RBI=0.014946;REFB=-0.00100059;REVB=0.00144649;RO=21;SAF=10;SAR=14;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.010198;STB=0.505699;STBP=0.968;TYPE=snp;VARB=0.000898381;OID=.;OPOS=96559459;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:21:21:24:24:0.533333:14:10:9:12:14:10:9:12
chr14	96559723	.	G	A	300.33	PASS	AF=0.55102;AO=27;DP=49;FAO=27;FDP=49;FR=.;FRO=22;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.00102211;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=250.654;QD=24.5169;RBI=0.0040372;REFB=-0.0314587;REVB=-0.00390568;RO=22;SAF=13;SAR=14;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0882175;STB=0.548984;STBP=0.465;TYPE=snp;VARB=0.0158264;OID=.;OPOS=96559723;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:22:22:27:27:0.55102:14:13:13:9:14:13:13:9
chr14	96559732	.	G	C	140.6	PASS	AF=0.372093;AO=16;DP=43;FAO=16;FDP=43;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=0.00164892;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.5381;QD=13.079;RBI=0.00918979;REFB=-0.00999698;REVB=0.00904065;RO=27;SAF=9;SAR=7;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0475257;STB=0.527824;STBP=0.807;TYPE=snp;VARB=0.0208703;OID=.;OPOS=96559732;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:27:27:16:16:0.372093:7:9:14:13:7:9:14:13
chr14	96559791	.	C	T	89.53	PASS	AF=0.478261;AO=11;DP=23;FAO=11;FDP=23;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.0174388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.508;QD=15.5708;RBI=0.0174535;REFB=-0.00519461;REVB=-0.00071526;RO=12;SAF=5;SAR=6;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115026;STB=0.566808;STBP=0.566;TYPE=snp;VARB=0.0289014;OID=.;OPOS=96559791;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:23:23:12:12:11:11:0.478261:6:5:7:5:6:5:7:5
chr14	96560083	.	A	T	281.66	PASS	AF=0.469697;AO=31;DP=66;FAO=31;FDP=66;FR=.;FRO=35;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=23;FWDB=-0.00690484;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=278.168;QD=17.0703;RBI=0.0069183;REFB=-0.0043233;REVB=-0.000431278;RO=35;SAF=17;SAR=14;SRF=12;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192457;STB=0.607662;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.00500185;OID=.;OPOS=96560083;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:35:35:31:31:0.469697:14:17:12:23:14:17:12:23
chr14	96560092	.	G	A	346.81	PASS	AF=0.564516;AO=35;DP=62;FAO=35;FDP=62;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=23;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=-0.00133477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.8282;QD=22.375;RBI=0.0109875;REFB=-0.0071089;REVB=-0.0109062;RO=27;SAF=12;SAR=23;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145699;STB=0.580535;STBP=0.187;TYPE=snp;VARB=0.0065271;OID=.;OPOS=96560092;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:27:27:35:35:0.564516:23:12:14:13:23:12:14:13
chr14	96671207	.	GGGTGGGGAC	G	610.39	PASS	AF=0.77381;AO=56;DP=71;FAO=65;FDP=84;FR=.;FRO=19;FSAF=37;FSAR=28;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.025102;FXX=0.0561735;HRUN=4;LEN=9;MLLD=256.954;QD=29.0661;RBI=0.0490872;REFB=-0.0337781;REVB=0.0421835;RO=0;SAF=30;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.29784e-08;STB=0.514431;STBP=0.628;TYPE=del;VARB=0.00810547;OID=.;OPOS=96671208;OREF=GGTGGGGAC;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.77381:56:71:65:84:19:37:28:12:7:74:0:30:26:0:0
chr14	96707457	.	A	G	465.12	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0155289;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.393;QD=58.1395;RBI=0.0227091;REFB=0;REVB=-0.0165697;RO=0;SAF=14;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.44125e-05;OID=.;OPOS=96707457;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:18:14:0:0:18:14:0:0
chr14	96708667	.	T	C	340.72	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0328446;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.059;QD=54.5149;RBI=0.0332963;REFB=0;REVB=0.00546637;RO=0;SAF=12;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000283503;OID=.;OPOS=96708667;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:13:12:0:0:13:12:0:0
chr14	96708782	.	A	T	1098.7	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00296731;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.93;QD=60.2025;RBI=0.0249103;REFB=0;REVB=0.024733;RO=0;SAF=38;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.90268e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.10015e-05;OID=.;OPOS=96708782;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:35:38:0:0:35:38:0:0
chr14	96709359	.	A	AC	273.74	PASS	AF=1;AO=23;DP=28;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0127372;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=26.2454;QD=43.7983;RBI=0.0699238;REFB=0;REVB=0.068754;RO=4;SAF=12;SAR=11;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.005935;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00280586;OID=.;OPOS=96709360;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:23:28:25:25:0:14:11:0:0:5:4:12:11:2:2
chr14	96710266	.	C	CG	39.13	PASS	AF=0.235294;AO=7;DP=34;FAO=8;FDP=34;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=0.032438;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=44.5697;QD=4.60302;RBI=0.032446;REFB=-0.01833;REVB=0.000722422;RO=26;SAF=6;SAR=1;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.32222;STB=0.743946;STBP=0.192;TYPE=ins;VARB=0.14773;OID=.;OPOS=96710267;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.235294:7:34:8:34:26:7:1:17:9:39:26:6:1:17:9
chr14	96730142	.	A	G	1973.47	PASS	AF=0.992248;AO=128;DP=129;FAO=128;FDP=129;FR=.;FRO=1;FSAF=62;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00203226;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.965;QD=61.193;RBI=0.0125448;REFB=0.00388529;REVB=-0.0123791;RO=1;SAF=62;SAR=66;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00714602;STB=0.503759;STBP=0.494;TYPE=snp;VARB=-3.72578e-05;OID=.;OPOS=96730142;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:129:129:1:1:128:128:0.992248:66:62:0:1:66:62:0:1
chr14	96742603	.	G	A	306.43	PASS	AF=0.43038;AO=34;DP=79;FAO=34;FDP=79;FR=.;FRO=45;FSAF=10;FSAR=24;FSRF=16;FSRR=29;FWDB=0.0287162;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.4349;QD=15.5153;RBI=0.0715663;REFB=0.0109674;REVB=0.0655524;RO=45;SAF=10;SAR=24;SRF=16;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0718953;STB=0.540703;STBP=0.583;TYPE=snp;VARB=-0.00992353;OID=.;OPOS=96742603;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:45:45:34:34:0.43038:24:10:16:29:24:10:16:29
chr14	96751010	.	T	C	127.68	PASS	AF=0.348837;AO=15;DP=43;FAO=15;FDP=43;FR=.;FRO=28;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.015805;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.4649;QD=11.8776;RBI=0.0322715;REFB=-0.0128359;REVB=-0.0281363;RO=27;SAF=8;SAR=7;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0243762;STB=0.501556;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.024342;OID=.;OPOS=96751010;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:27:28:15:15:0.348837:7:8:15:12:7:8:15:13
chr14	96771959	.	A	G	402.56	PASS	AF=0.436893;AO=45;DP=103;FAO=45;FDP=103;FR=.;FRO=58;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=36;FSRR=22;FWDB=0.0169683;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.881;QD=15.6334;RBI=0.0253991;REFB=-0.00256172;REVB=0.0188995;RO=58;SAF=21;SAR=24;SRF=36;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153804;STB=0.586081;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=0.00673306;OID=.;OPOS=96771959;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:103:58:58:45:45:0.436893:24:21:36:22:24:21:36:22
chr14	96777468	.	G	C	208.96	PASS	AF=0.396825;AO=25;DP=64;FAO=25;FDP=63;FR=.;FRO=38;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=27;FSRR=11;FWDB=-0.0160007;FXX=0.0307645;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.322;QD=13.2672;RBI=0.0172538;REFB=-0.0150986;REVB=0.00645525;RO=36;SAF=10;SAR=15;SRF=26;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.323841;STB=0.680846;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.0208301;OID=.;OPOS=96777468;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:63:36:38:25:25:0.396825:15:10:26:10:15:10:27:11
chr14	96781912	.	T	C	272.43	PASS	AF=0.367816;AO=32;DP=87;FAO=32;FDP=87;FR=.;FRO=55;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=33;FWDB=-0.0163944;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.6741;QD=12.5255;RBI=0.022784;REFB=0.00157802;REVB=-0.0158219;RO=54;SAF=15;SAR=17;SRF=22;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0678208;STB=0.543845;STBP=0.546;TYPE=snp;VARB=-0.00331992;OID=.;OPOS=96781912;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:54:55:32:32:0.367816:17:15:22:32:17:15:22:33
chr14	96797724	.	G	A	307.84	PASS	AF=0.37234;AO=35;DP=95;FAO=35;FDP=94;FR=.;FRO=59;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=32;FSRR=27;FWDB=8.70779e-05;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.569;QD=13.0995;RBI=0.00504848;REFB=-0.0098515;REVB=0.00504773;RO=59;SAF=17;SAR=18;SRF=32;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0620528;STB=0.535499;STBP=0.629;TYPE=snp;VARB=0.016003;OID=.;OPOS=96797724;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:94:59:59:35:35:0.37234:18:17:32:27:18:17:32:27
chr14	96829290	.	G	A	512.75	PASS	AF=0.5;AO=49;DP=99;FAO=50;FDP=100;FR=.;FRO=50;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=23;FSRR=27;FWDB=-0.00854021;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.913;QD=20.5098;RBI=0.0232387;REFB=-0.0184033;REVB=-0.0216125;RO=50;SAF=24;SAR=25;SRF=23;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0271856;STB=0.519992;STBP=0.703;TYPE=snp;VARB=0.0199703;OID=.;OPOS=96829290;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:100:50:50:49:50:0.5:25:24:23:27:25:25:23:27
chr14	96922752	.	C	G	1153.6	PASS	AF=1;AO=75;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00906919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.416;QD=60.7157;RBI=0.0322252;REFB=0;REVB=0.0309227;RO=0;SAF=36;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.6999e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.50331e-05;OID=.;OPOS=96922752;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:75:76:1:39:36:0:0:39:37:0:0
chr14	97104758	.	A	G	357.04	PASS	AF=0.506667;AO=31;DP=69;FAO=38;FDP=75;FR=.;FRO=37;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=0.00508318;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.056;QD=19.0418;RBI=0.0386413;REFB=-0.0171567;REVB=0.0383055;RO=38;SAF=19;SAR=12;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138132;STB=0.559739;STBP=0.334;TYPE=snp;VARB=0.0197584;OID=.;OPOS=97104758;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:75:38:37:31:38:0.506667:12:19:18:20:15:23:18:19
chr14	97321689	.	C	T	1556.36	PASS	AF=1;AO=104;DP=104;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144879;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.6306;QD=59.8602;RBI=0.0330205;REFB=0;REVB=-0.0296725;RO=0;SAF=49;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.2427e-05;OID=.;OPOS=97321689;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:104:104:0:0:104:104:1:55:49:0:0:55:49:0:0
chr14	98112541	.	T	G	521.0	PASS	AF=0.419118;AO=56;DP=135;FAO=57;FDP=136;FR=.;FRO=79;FSAF=35;FSAR=22;FSRF=47;FSRR=32;FWDB=0.0228853;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.242;QD=15.3236;RBI=0.023899;REFB=-0.00651734;REVB=0.00688673;RO=79;SAF=34;SAR=22;SRF=47;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0132728;STB=0.511636;STBP=0.82;TYPE=snp;VARB=0.00737056;OID=.;OPOS=98112541;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:135:136:79:79:56:57:0.419118:22:34:47:32:22:35:47:32
chr14	98218281	.	C	T	67.43	PASS	AF=0.45;AO=9;DP=20;FAO=9;FDP=20;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=0.0170816;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.2235;QD=13.4852;RBI=0.0207669;REFB=-0.00824921;REVB=-0.0118102;RO=11;SAF=5;SAR=4;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166393;STB=0.597497;STBP=0.473;TYPE=snp;VARB=0.0075406;OID=.;OPOS=98218281;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:20:20:11:11:9:9:0.45:4:5:8:3:4:5:8:3
chr14	98435696	.	T	C	2223.05	PASS	AF=0.992958;AO=139;DP=141;FAO=141;FDP=142;FR=.;FRO=1;FSAF=57;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0140577;FXX=0.00699252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.3;QD=62.6212;RBI=0.0446613;REFB=-0.116757;REVB=0.0423912;RO=0;SAF=57;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.502958;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.000201597;OID=.;OPOS=98435696;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:141:142:0:1:139:141:0.992958:82:57:0:0:84:57:0:1
chr14	98444369	.	T	C	1052.45	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00699879;FXX=0.0277739;HRUN=3;LEN=1;MLLD=225.676;QD=60.1398;RBI=0.0160271;REFB=0;REVB=0.0144182;RO=0;SAF=33;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.75569e-05;OID=.;OPOS=98444369;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:37:33:0:0:37:33:0:0
chr14	98817896	.	T	C	766.39	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00168023;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.9975;QD=63.8654;RBI=0.00681452;REFB=0;REVB=0.00660413;RO=0;SAF=27;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000111674;OID=.;OPOS=98817896;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:21:27:0:0:21:27:0:0
chr14	99182535	.	C	T	251.63	PASS	AF=0.489796;AO=24;DP=49;FAO=24;FDP=49;FR=.;FRO=25;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=0.00299792;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.577;QD=20.5413;RBI=0.0267795;REFB=0.00583584;REVB=0.0266112;RO=25;SAF=15;SAR=9;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0239863;STB=0.513502;STBP=0.851;TYPE=snp;VARB=-0.00524702;OID=.;OPOS=99182535;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:25:25:24:24:0.489796:9:15:15:10:9:15:15:10
chr14	99182559	.	G	A	236.26	PASS	AF=0.481481;AO=26;DP=54;FAO=26;FDP=54;FR=.;FRO=28;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=0.06665;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.8265;QD=17.5004;RBI=0.0675193;REFB=0.0107502;REVB=0.0107998;RO=28;SAF=14;SAR=12;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0641081;STB=0.535996;STBP=0.636;TYPE=snp;VARB=-0.00942704;OID=.;OPOS=99182559;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:28:28:26:26:0.481481:12:14:17:11:12:14:17:11
chr14	99864181	.	C	T	386.87	PASS	AF=0.409091;AO=45;DP=110;FAO=45;FDP=110;FR=.;FRO=65;FSAF=27;FSAR=18;FSRF=37;FSRR=28;FWDB=0.0609641;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.1527;QD=14.0679;RBI=0.0725217;REFB=-0.00256458;REVB=0.0392783;RO=65;SAF=27;SAR=18;SRF=37;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0332698;STB=0.518789;STBP=0.753;TYPE=snp;VARB=0.00510097;OID=.;OPOS=99864181;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:110:65:65:45:45:0.409091:18:27:37:28:18:27:37:28
chr14	99876505	.	A	G	36.87	PASS	AF=0.315789;AO=6;DP=19;FAO=6;FDP=19;FR=.;FRO=13;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.0295917;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.86;QD=7.76204;RBI=0.0319648;REFB=-0.000508641;REVB=0.0120862;RO=12;SAF=2;SAR=4;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181968;STB=0.642374;STBP=0.438;TYPE=snp;VARB=0.000857806;OID=.;OPOS=99876505;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:19:19:12:13:6:6:0.315789:4:2:6:6:4:2:7:6
chr14	100039109	.	C	G	365.41	PASS	AF=0.423913;AO=39;DP=92;FAO=39;FDP=92;FR=.;FRO=53;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=26;FSRR=27;FWDB=0.00403585;FXX=0.0107515;HRUN=2;LEN=1;MLLD=265.458;QD=15.8874;RBI=0.00700865;REFB=-0.0114043;REVB=-0.00573001;RO=52;SAF=19;SAR=20;SRF=26;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0130062;STB=0.501951;STBP=0.971;TYPE=snp;VARB=0.0134694;OID=.;OPOS=100039109;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:52:53:39:39:0.423913:20:19:26:26:20:19:26:27
chr14	100049433	.	C	G	35.92	PASS	AF=0.26087;AO=6;DP=23;FAO=6;FDP=23;FR=.;FRO=17;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.0319596;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.3421;QD=6.24645;RBI=0.0324402;REFB=-0.0108739;REVB=0.00556367;RO=17;SAF=1;SAR=5;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.338286;STB=0.726411;STBP=0.273;TYPE=snp;VARB=0.034079;OID=.;OPOS=100049433;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:23:23:17:17:6:6:0.26087:5:1:7:10:5:1:7:10
chr14	100070030	.	G	A	131.4	PASS	AF=0.416667;AO=14;DP=35;FAO=15;FDP=36;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0184406;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.323;QD=14.6001;RBI=0.0411658;REFB=-0.0298712;REVB=0.0368045;RO=21;SAF=7;SAR=7;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.024428;STB=0.505569;STBP=0.955;TYPE=snp;VARB=0.0492825;OID=.;OPOS=100070030;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:36:21:21:14:15:0.416667:7:7:11:10:7:8:11:10
chr14	100141689	.	T	C	470.09	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0165197;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.5016;QD=56.9803;RBI=0.0553938;REFB=0;REVB=0.0528732;RO=0;SAF=22;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00246906;OID=.;OPOS=100141689;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:33:0:0:32:33:1:10:22:0:0:11:22:0:0
chr14	100411737	.	C	A	168.32	PASS	AF=0.409091;AO=18;DP=44;FAO=18;FDP=44;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=0.0277894;FXX=0.0222173;HRUN=4;LEN=1;MLLD=42.5061;QD=15.3022;RBI=0.0361721;REFB=0.000207004;REVB=-0.0231554;RO=26;SAF=14;SAR=4;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.285067;STB=0.687635;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=-0.000396032;OID=.;OPOS=100411737;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:26:26:18:18:0.409091:4:14:14:12:4:14:13:13
chr14	100411767	.	C	T	115.66	PASS	AF=0.333333;AO=14;DP=41;FAO=14;FDP=42;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=-0.0398055;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.445;QD=11.0153;RBI=0.0437716;REFB=-0.0106431;REVB=-0.0182063;RO=27;SAF=10;SAR=4;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.342794;STB=0.694162;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=0.0444942;OID=.;OPOS=100411767;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:42:27:28:14:14:0.333333:4:10:11:16:4:10:12:16
chr14	100411771	.	T	G	114.86	PASS	AF=0.333333;AO=15;DP=42;FAO=14;FDP=42;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=0.00602158;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.012;QD=10.9391;RBI=0.0239798;REFB=-0.00579748;REVB=0.0232115;RO=27;SAF=11;SAR=4;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.362042;STB=0.694162;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=0.0271126;OID=.;OPOS=100411771;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:27:28:15:14:0.333333:4:11:11:16:4:10:12:16
chr14	100411774	.	G	A	651.1	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0125792;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.019;QD=62.0094;RBI=0.0159756;REFB=0;REVB=-0.00984809;RO=0;SAF=22;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.07237e-06;OID=.;OPOS=100411774;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:20:22:0:0:20:22:0:0
chr14	100615665	.	T	C	1494.43	PASS	AF=1;AO=94;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0143627;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.184;QD=63.5927;RBI=0.0309248;REFB=0;REVB=0.0273871;RO=0;SAF=60;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.12276e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.14836e-05;OID=.;OPOS=100615665;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:94:94:0:0:94:94:1:34:60:0:0:34:60:0:0
chr14	100615961	.	C	T	112.89	PASS	AF=0.75;AO=12;DP=16;FAO=12;FDP=16;FR=.;FRO=4;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0691732;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.1032;QD=28.2216;RBI=0.0693965;REFB=-0.0382717;REVB=0.00556329;RO=4;SAF=7;SAR=5;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.255539;STB=0.642627;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.0192101;OID=.;OPOS=100615961;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:16:16:4:4:12:12:0.75:5:7:0:4:5:7:0:4
chr14	100625902	.	C	T	264.97	PASS	AF=0.520833;AO=24;DP=46;FAO=25;FDP=48;FR=.;FRO=23;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=-0.0208025;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.2681;QD=22.0806;RBI=0.0208259;REFB=-0.0119899;REVB=-0.000986658;RO=22;SAF=15;SAR=9;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.223165;STB=0.620476;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=0.00883161;OID=.;OPOS=100625902;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:48:22:23:24:25:0.520833:9:15:8:14:9:16:9:14
chr14	100758502	.	G	A	1339.72	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130106;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.528;QD=62.3125;RBI=0.0257808;REFB=0;REVB=-0.022257;RO=0;SAF=51;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.05377e-05;OID=.;OPOS=100758502;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:35:51:0:0:35:51:0:0
chr14	100758854	.	CG	C	62.69	PASS	AF=0.625;AO=10;DP=16;FAO=10;FDP=16;FR=.;FRO=6;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.0154799;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=13.055;QD=15.6723;RBI=0.102731;REFB=-0.126892;REVB=-0.101558;RO=6;SAF=6;SAR=4;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.066985;STB=0.538384;STBP=0.73;TYPE=del;VARB=0.104794;OID=.;OPOS=100758855;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.625:10:16:10:16:6:6:4:3:3:25:6:6:4:3:3
chr14	100792482	.	C	A	1026.37	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144396;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.993;QD=59.4996;RBI=0.0181269;REFB=0;REVB=0.0109582;RO=0;SAF=37;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.28678e-05;OID=.;OPOS=100792482;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:32:37:0:0:32:37:0:0
chr14	100808813	.	GCC	GC,GCG	117.74	PASS	AF=0.483871,0.0645161;AO=14,2;DP=32;FAO=15,2;FDP=31;FR=.;FRO=14;FSAF=12,2;FSAR=3,0;FSRF=2;FSRR=12;FWDB=0.0193495,-0.050309;FXX=0.0312402;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=17.0143,232.641;QD=15.1919;RBI=0.0395209,0.0526491;REFB=-0.0397719,0.00878693;REVB=0.0344601,-0.0155222;RO=13;SAF=12,2;SAR=2,0;SRF=2;SRR=11;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.606678,0.72547;STB=0.810405,0.997498;STBP=0.002,0.016;TYPE=del,snp;VARB=0.053203,0.0929381;OID=.,.;OPOS=100808814,100808815;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=GC,GCG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.483871,0.0645161:14,2:32:15,2:31:14:12,2:3,0:2:12:99:13:12,2:2,0:2:11
chr14	100808845	.	G	A	871.24	PASS	AF=0.983871;AO=60;DP=62;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0357463;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.088;QD=56.2089;RBI=0.0591093;REFB=-0.0699845;REVB=0.0470756;RO=1;SAF=18;SAR=42;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0111061;STB=0.505745;STBP=0.614;TYPE=snp;VARB=0.00221452;OID=.;OPOS=100808845;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:62:62:1:1:60:61:0.983871:42:18:0:1:43:18:0:1
chr14	100832391	.	T	C	1135.18	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0223822;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.838;QD=60.5432;RBI=0.0398794;REFB=0;REVB=0.0330061;RO=0;SAF=39;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6999e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000152653;OID=.;OPOS=100832391;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:36:39:0:0:36:39:0:0
chr14	100847523	.	T	C	260.11	PASS	AF=1;AO=20;DP=21;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0228554;FXX=0.0475964;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.8721;QD=52.0213;RBI=0.0229111;REFB=0;REVB=0.00159598;RO=0;SAF=7;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00131188;OID=.;OPOS=100847523;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:20:0:0:20:20:1:13:7:0:0:13:7:0:0
chr14	100996312	.	T	C	785.87	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.436;QD=64.1524;RBI=0.0333244;REFB=0;REVB=-0.0292567;RO=0;SAF=19;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.48867e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.09233e-05;OID=.;OPOS=100996312;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:30:19:0:0:30:19:0:0
chr14	101005215	.	T	C	632.81	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.040636;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.71;QD=61.7374;RBI=0.070642;REFB=0;REVB=0.0577841;RO=0;SAF=18;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.51048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000344924;OID=.;OPOS=101005215;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:41:0:0:38:41:1:20:18:0:0:23:18:0:0
chr14	101005236	.	A	G	397.19	PASS	AF=1;AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000465704;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.713;QD=56.7417;RBI=0.0291806;REFB=0;REVB=-0.0291769;RO=0;SAF=13;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00023063;OID=.;OPOS=101005236;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:28:0:0:28:28:1:15:13:0:0:15:13:0:0
chr14	101138230	.	A	C	256.69	PASS	AF=0.382716;AO=31;DP=82;FAO=31;FDP=81;FR=.;FRO=50;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=30;FWDB=0.0189354;FXX=0.0121936;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.9945;QD=12.6762;RBI=0.0689491;REFB=-0.00567444;REVB=0.0662981;RO=49;SAF=17;SAR=14;SRF=20;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149392;STB=0.59078;STBP=0.189;TYPE=snp;VARB=0.0109712;OID=.;OPOS=101138230;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:81:49:50:31:31:0.382716:14:17:20:29:14:17:20:30
chr14	101198417	.	A	G	1281.51	PASS	AF=1;AO=82;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000604269;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.009;QD=61.7597;RBI=0.00326512;REFB=0;REVB=-0.00320871;RO=0;SAF=42;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.07895e-06;OID=.;OPOS=101198417;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:83:0:0:82:83:1:40:42:0:0:40:43:0:0
chr14	101200645	.	T	C	276.21	PASS	AF=0.916667;AO=22;DP=24;FAO=22;FDP=24;FR=.;FRO=2;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0116866;FXX=0.039984;HRUN=2;LEN=1;MLLD=213.796;QD=46.0353;RBI=0.03387;REFB=-0.0600378;REVB=0.0317899;RO=1;SAF=6;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0709088;STB=0.57136;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=0.000869642;OID=.;OPOS=101200645;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:24:24:1:2:22:22:0.916667:16:6:1:0:16:6:2:0
chr14	101301038	.	C	G	121.58	PASS	AF=0.4375;AO=14;DP=32;FAO=14;FDP=32;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.0459219;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.506;QD=15.1972;RBI=0.0512812;REFB=0.00386917;REVB=0.0228241;RO=17;SAF=8;SAR=6;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0403838;STB=0.540482;STBP=0.675;TYPE=snp;VARB=-0.00625837;OID=.;OPOS=101301038;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:17:18:14:14:0.4375:6:8:9:8:6:8:9:9
chr14	101507727	.	C	T	785.1	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.027551;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.033;QD=57.0984;RBI=0.0284546;REFB=0;REVB=0.00711364;RO=0;SAF=22;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.54637e-05;OID=.;OPOS=101507727;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:33:22:0:0:33:22:0:0
chr14	101522556	.	T	C	1339.7	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=3.62177e-06;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.179;QD=62.3115;RBI=0.0269151;REFB=0;REVB=0.0269151;RO=0;SAF=42;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.18833e-05;OID=.;OPOS=101522556;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:44:42:0:0:44:42:0:0
chr14	102446161	.	G	A	732.09	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00262468;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.8735;QD=56.3144;RBI=0.0280316;REFB=0;REVB=-0.0279085;RO=0;SAF=22;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.08337e-05;OID=.;OPOS=102446161;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:52:0:0:51:52:1:29:22:0:0:29:23:0:0
chr14	102550803	.	G	A	406.35	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.026589;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.0165;QD=56.0485;RBI=0.0397422;REFB=0;REVB=-0.0295376;RO=0;SAF=20;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.75204e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000181036;OID=.;OPOS=102550803;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:29:0:0:28:29:1:8:20:0:0:8:21:0:0
chr14	102568296	.	G	A	850.87	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00943887;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.5026;QD=57.6859;RBI=0.0505906;REFB=0;REVB=-0.0497023;RO=0;SAF=27;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.96591e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000454328;OID=.;OPOS=102568296;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:32:27:0:0:32:27:0:0
chr14	102568367	.	T	A	729.01	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0396235;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.316;QD=57.1774;RBI=0.039624;REFB=0;REVB=-0.000192431;RO=0;SAF=19;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.2152e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00013353;OID=.;OPOS=102568367;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:32:19:0:0:32:19:0:0
chr14	102792686	.	C	T	82.37	PASS	AF=0.818182;AO=9;DP=12;FAO=9;FDP=11;FR=.;FRO=2;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.015175;FXX=0.0832639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.9308;QD=29.9537;RBI=0.015722;REFB=-0.065747;REVB=-0.00411089;RO=2;SAF=6;SAR=3;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12691;STB=0.571279;STBP=0.399;TYPE=snp;VARB=0.0170291;OID=.;OPOS=102792686;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:12:11:2:2:9:9:0.818182:3:6:2:0:3:6:2:0
chr14	102965367	.	TCACCA	T	248.05	PASS	AF=0.84;AO=20;DP=23;FAO=21;FDP=25;FR=.;FRO=4;FSAF=17;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0673477;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=5;MLLD=162.692;QD=39.6886;RBI=0.104404;REFB=-0.147473;REVB=0.0797774;RO=0;SAF=17;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.552585;STBP=0.377;TYPE=del;VARB=0.0288908;OID=.;OPOS=102965368;OREF=CACCA;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.84:20:23:21:25:4:17:4:4:0:21:0:17:3:0:0
chr14	102965435	.	A	G	639.15	PASS	AF=0.976744;AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0202434;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.655;QD=59.4555;RBI=0.0827381;REFB=-0.0746742;REVB=0.0802234;RO=0;SAF=24;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.513507;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=0.00125065;OID=.;OPOS=102965435;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:43:43:0:1:42:42:0.976744:18:24:0:0:18:24:0:1
chr14	102965437	.	A	T	651.96	PASS	AF=1;AO=42;DP=44;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0320554;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.476;QD=60.6477;RBI=0.0384596;REFB=0;REVB=-0.0212508;RO=1;SAF=23;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.024064;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00020952;OID=.;OPOS=102965437;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:44:43:1:0:42:43:1:19:23:0:1:20:23:0:0
chr14	103161736	.	A	AG	519.26	PASS	AF=1;AO=45;DP=47;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.021838;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=26.5172;QD=46.1561;RBI=0.097982;REFB=0;REVB=-0.0955174;RO=2;SAF=28;SAR=17;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0103566;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00218035;OID=.;OPOS=103161737;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:45:47:45:45:0:28:17:0:0:10:2:28:17:1:1
chr14	103193028	.	G	A	330.94	PASS	AF=0.75;AO=27;DP=37;FAO=27;FDP=36;FR=.;FRO=9;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=-0.000142366;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.4518;QD=36.7705;RBI=0.020978;REFB=-0.0331662;REVB=0.0209776;RO=8;SAF=14;SAR=13;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0448969;STB=0.537163;STBP=0.496;TYPE=snp;VARB=0.016009;OID=.;OPOS=103193028;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:37:36:8:9:27:27:0.75:13:14:5:3:13:14:6:3
chr14	103195365	.	G	C	304.14	PASS	AF=0.360825;AO=35;DP=97;FAO=35;FDP=97;FR=.;FRO=62;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=41;FSRR=21;FWDB=0.00521464;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=272.371;QD=12.5418;RBI=0.026009;REFB=-0.015199;REVB=-0.0254809;RO=62;SAF=15;SAR=20;SRF=41;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.254776;STB=0.645454;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.0212799;OID=.;OPOS=103195365;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:62:62:35:35:0.360825:20:15:41:21:20:15:41:21
chr14	103196434	.	A	G	446.15	PASS	AF=0.511628;AO=44;DP=86;FAO=44;FDP=86;FR=.;FRO=42;FSAF=17;FSAR=27;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=-0.00425562;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.961;QD=20.7513;RBI=0.00426988;REFB=-0.00172353;REVB=-0.000348669;RO=41;SAF=17;SAR=27;SRF=22;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13335;STB=0.579985;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.00876862;OID=.;OPOS=103196434;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:41:42:44:44:0.511628:27:17:22:19:27:17:23:19
chr14	103338324	.	T	A	1272.72	PASS	AF=1;AO=76;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=52;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0478547;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=29.3141;QD=57.8507;RBI=0.163723;REFB=-0.0697195;REVB=0.156573;RO=1;SAF=49;SAR=27;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0172021;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00318651;OID=.;OPOS=103338324;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:88:88:1:0:76:88:1:27:49:0:1:36:52:0:0
chr14	103342049	.	T	C	818.25	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0136602;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.45;QD=57.4208;RBI=0.0136684;REFB=0;REVB=-0.000475176;RO=0;SAF=22;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.43892e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.24811e-05;OID=.;OPOS=103342049;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:56:57:0:0:56:57:1:34:22:0:0:35:22:0:0
chr14	103370119	.	C	T	673.26	PASS	AF=1;AO=37;DP=44;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0583251;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.328;QD=62.6284;RBI=0.0686629;REFB=0;REVB=0.0362322;RO=0;SAF=21;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.7558e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00017814;OID=.;OPOS=103370119;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:43:0:0:37:43:1:16:21:0:0:20:23:0:0
chr14	103370163	.	C	T	816.27	PASS	AF=0.923077;AO=60;DP=65;FAO=60;FDP=65;FR=.;FRO=5;FSAF=28;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.0120126;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.996;QD=50.232;RBI=0.0388033;REFB=-0.163597;REVB=0.0368971;RO=2;SAF=28;SAR=32;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.028583;STB=0.53622;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=0.00336804;OID=.;OPOS=103370163;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:18:65:65:2:5:60:60:0.923077:32:28:0:2:32:28:0:5
chr14	103440473	.	G	C	272.44	PASS	AF=0.517857;AO=29;DP=57;FAO=29;FDP=56;FR=.;FRO=27;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.0219923;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.184;QD=19.46;RBI=0.0262467;REFB=-0.0134635;REVB=0.0143259;RO=28;SAF=14;SAR=15;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0162796;STB=0.518506;STBP=0.776;TYPE=snp;VARB=0.011829;OID=.;OPOS=103440473;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:56:28:27:29:29:0.517857:15:14:13:15:15:14:12:15
chr14	103566785	.	C	T	624.79	PASS	AF=0.508065;AO=63;DP=124;FAO=63;FDP=124;FR=.;FRO=61;FSAF=33;FSAR=30;FSRF=32;FSRR=29;FWDB=0.00852205;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=225.766;QD=20.1545;RBI=0.0182095;REFB=-0.0094638;REVB=0.0160922;RO=61;SAF=33;SAR=30;SRF=32;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000698346;STB=0.500385;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00905947;OID=.;OPOS=103566785;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:124:124:61:61:63:63:0.508065:30:33:32:29:30:33:32:29
chr14	103566835	.	C	G	651.23	PASS	AF=0.52;AO=58;DP=118;FAO=65;FDP=125;FR=.;FRO=60;FSAF=42;FSAR=23;FSRF=33;FSRR=27;FWDB=0.016984;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.58;QD=20.8393;RBI=0.0198109;REFB=-0.0356922;REVB=-0.0101988;RO=60;SAF=35;SAR=23;SRF=33;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0506812;STB=0.549004;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=0.0253232;OID=.;OPOS=103566835;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:118:125:60:60:58:65:0.52:23:35:33:27:23:42:33:27
chr14	103566904	.	G	A	384.95	PASS	AF=0.419048;AO=45;DP=108;FAO=44;FDP=105;FR=.;FRO=61;FSAF=27;FSAR=17;FSRF=44;FSRR=17;FWDB=-0.0014685;FXX=0.0366939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.352;QD=14.6648;RBI=0.0174506;REFB=-0.00507497;REVB=0.0173887;RO=61;SAF=27;SAR=18;SRF=44;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133896;STB=0.567971;STBP=0.277;TYPE=snp;VARB=0.00641669;OID=.;OPOS=103566904;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:105:61:61:45:44:0.419048:18:27:44:17:17:27:44:17
chr14	103568614	.	T	A	711.14	PASS	AF=0.489933;AO=73;DP=150;FAO=73;FDP=149;FR=.;FRO=76;FSAF=26;FSAR=47;FSRF=46;FSRR=30;FWDB=0.00407457;FXX=0.0132442;HRUN=3;LEN=1;MLLD=244.984;QD=19.091;RBI=0.0238523;REFB=-0.00991108;REVB=0.0235017;RO=75;SAF=26;SAR=47;SRF=46;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.237925;STB=0.62826;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.013028;OID=.;OPOS=103568614;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:150:149:75:76:73:73:0.489933:47:26:46:29:47:26:46:30
chr14	103568981	.	A	C	87.48	PASS	AF=0.434783;AO=8;DP=23;FAO=10;FDP=23;FR=.,HEALED;FRO=12;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=-0.0444568;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.374;QD=15.2142;RBI=0.0444936;REFB=-0.00109528;REVB=-0.00180961;RO=12;SAF=4;SAR=4;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0829008;STB=0.509415;STBP=0.944;TYPE=snp;VARB=0.0456718;OID=.;OPOS=103568981;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:23:23:12:12:8:10:0.434783:4:4:5:7:6:4:5:7
chr14	103576395	.	G	A	643.43	PASS	AF=0.47482;AO=66;DP=139;FAO=66;FDP=139;FR=.;FRO=73;FSAF=35;FSAR=31;FSRF=49;FSRR=24;FWDB=-0.0374904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.7609;QD=18.516;RBI=0.0539626;REFB=-0.0103094;REVB=0.0388128;RO=72;SAF=35;SAR=31;SRF=48;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130462;STB=0.574939;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.0101139;OID=.;OPOS=103576395;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:139:139:72:73:66:66:0.47482:31:35:48:24:31:35:49:24
chr14	103576415	.	A	G	549.37	PASS	AF=0.5;AO=56;DP=113;FAO=57;FDP=114;FR=.;FRO=57;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=32;FSRR=25;FWDB=-0.0471563;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.1774;QD=19.2761;RBI=0.049795;REFB=-0.0167487;REVB=0.0159945;RO=55;SAF=32;SAR=24;SRF=31;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00712756;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0314535;OID=.;OPOS=103576415;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:114:55:57:56:57:0.5:24:32:31:24:25:32:32:25
chr14	103576443	.	TC	CG	369.0	PASS	AF=0.415842;AO=42;DP=101;FAO=42;FDP=101;FR=.;FRO=59;FSAF=26;FSAR=16;FSRF=27;FSRR=32;FWDB=-0.00864486;FXX=0.0194156;HRUN=1;LEN=2;MLLD=171.671;QD=14.6137;RBI=0.0121381;REFB=-0.00792527;REVB=-0.00852058;RO=59;SAF=26;SAR=16;SRF=27;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168907;STB=0.595374;STBP=0.126;TYPE=mnp;VARB=0.0140146;OID=.;OPOS=103576443;OREF=TC;OALT=CG;OMAPALT=CG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:101:59:59:42:42:0.415842:16:26:27:32:16:26:27:32
chr14	103576775	.	C	T	186.49	PASS	AF=0.377049;AO=23;DP=62;FAO=23;FDP=61;FR=.;FRO=38;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=24;FSRR=14;FWDB=-0.018097;FXX=0.0161264;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.866;QD=12.2291;RBI=0.0288745;REFB=-0.0141746;REVB=-0.0224997;RO=38;SAF=12;SAR=11;SRF=24;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119775;STB=0.568907;STBP=0.417;TYPE=snp;VARB=0.0379634;OID=.;OPOS=103576775;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:61:38:38:23:23:0.377049:11:12:24:14:11:12:24:14
chr14	103593950	.	C	G	56.28	PASS	AF=0.4;AO=8;DP=20;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=-0.0142566;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.624;QD=11.257;RBI=0.0153644;REFB=-0.011625;REVB=0.00572826;RO=12;SAF=4;SAR=4;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.252187;STB=0.649658;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=0.012492;OID=.;OPOS=103593950;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:20:20:12:12:8:8:0.4:4:4:9:3:4:4:9:3
chr14	103602278	.	A	G	153.61	PASS	AF=0.571429;AO=16;DP=28;FAO=16;FDP=28;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.0116767;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.539;QD=21.9446;RBI=0.0297793;REFB=-0.0425976;REVB=-0.0273945;RO=12;SAF=8;SAR=8;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0633569;STB=0.53567;STBP=0.697;TYPE=snp;VARB=0.0208996;OID=.;OPOS=103602278;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:28:28:12:12:16:16:0.571429:8:8:5:7:8:8:5:7
chr14	103808153	.	A	G	313.33	PASS	AF=0.361111;AO=39;DP=108;FAO=39;FDP=108;FR=.;FRO=69;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=36;FSRR=33;FWDB=-0.000798089;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.206;QD=11.6049;RBI=0.0223079;REFB=-0.021998;REVB=0.0222936;RO=69;SAF=18;SAR=21;SRF=36;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0670813;STB=0.538442;STBP=0.56;TYPE=snp;VARB=0.0312127;OID=.;OPOS=103808153;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:108:69:69:39:39:0.361111:21:18:36:33:21:18:36:33
chr14	103808199	.	T	TAAAC	184.63	PASS	AF=0.284091;AO=24;DP=89;FAO=25;FDP=88;FR=.;FRO=63;FSAF=7;FSAR=18;FSRF=34;FSRR=29;FWDB=-0.0118779;FXX=0.0112347;HRUN=2;LEN=4;MLLD=256.849;QD=8.39217;RBI=0.02627;REFB=-0.00202202;REVB=-0.0234313;RO=63;SAF=6;SAR=18;SRF=34;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.362614;STB=0.691501;STBP=0.028;TYPE=ins;VARB=0.00514989;OID=.;OPOS=103808200;OREF=-;OALT=AAAC;OMAPALT=TAAAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.284091:24:89:25:88:63:7:18:34:29:99:63:6:18:34:29
chr14	103808472	.	C	T	45.98	PASS	AF=0.35;AO=7;DP=20;FAO=7;FDP=20;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=-0.013135;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.4013;QD=9.19577;RBI=0.0625405;REFB=0.000429696;REVB=0.0611456;RO=13;SAF=6;SAR=1;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.260866;STB=0.66611;STBP=0.398;TYPE=snp;VARB=0.00386557;OID=.;OPOS=103808472;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:20:20:13:13:7:7:0.35:1:6:9:4:1:6:9:4
chr14	103852725	.	C	T	336.74	PASS	AF=0.455696;AO=36;DP=78;FAO=36;FDP=79;FR=.;FRO=43;FSAF=12;FSAR=24;FSRF=20;FSRR=23;FWDB=0.0331935;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.512;QD=17.0499;RBI=0.0350394;REFB=0.010286;REVB=-0.011223;RO=42;SAF=12;SAR=24;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145523;STB=0.576533;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=-0.014158;OID=.;OPOS=103852725;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:79:42:43:36:36:0.455696:24:12:20:22:24:12:20:23
chr14	103923475	.	A	G	121.49	PASS	AF=0.4375;AO=14;DP=32;FAO=14;FDP=32;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.0103975;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.161;QD=15.1861;RBI=0.0306079;REFB=-0.0233603;REVB=0.0287878;RO=17;SAF=5;SAR=9;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112472;STB=0.551811;STBP=0.626;TYPE=snp;VARB=0.0163111;OID=.;OPOS=103923475;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:17:18:14:14:0.4375:9:5:8:9:9:5:8:10
chr14	103934488	.	T	C	1358.6	PASS	AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00844764;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=250.783;QD=62.4644;RBI=0.00846979;REFB=0;REVB=-0.000612128;RO=0;SAF=43;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.23343e-06;OID=.;OPOS=103934488;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:44:43:0:0:44:43:0:0
chr14	103979762	.	G	A	48.82	PASS	AF=0.5;AO=7;DP=14;FAO=7;FDP=14;FR=.;FRO=7;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.0857991;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.0735;QD=13.9476;RBI=0.0904905;REFB=-0.00477656;REVB=0.0287583;RO=7;SAF=1;SAR=6;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0148983;OID=.;OPOS=103979762;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:14:14:7:7:7:7:0.5:6:1:1:6:6:1:1:6
chr14	103986255	.	C	T	386.56	PASS	AF=0.470588;AO=40;DP=85;FAO=40;FDP=85;FR=.;FRO=45;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=25;FSRR=20;FWDB=0.0230815;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.899;QD=18.1912;RBI=0.0237914;REFB=-0.0168503;REVB=-0.00576848;RO=45;SAF=20;SAR=20;SRF=25;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0526896;STB=0.529397;STBP=0.624;TYPE=snp;VARB=0.0197945;OID=.;OPOS=103986255;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:45:45:40:40:0.470588:20:20:25:20:20:20:25:20
chr14	103996396	.	G	A	1008.18	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0254824;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.664;QD=59.3047;RBI=0.0297773;REFB=0;REVB=0.0154056;RO=0;SAF=23;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00011069;OID=.;OPOS=103996396;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:45:23:0:0:45:23:0:0
chr14	104001517	.	G	A	187.93	PASS	AF=0.513514;AO=19;DP=37;FAO=19;FDP=37;FR=.;FRO=18;FSAF=15;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=0.00193446;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=186.326;QD=20.3172;RBI=0.00512596;REFB=-0.0175939;REVB=-0.00474693;RO=18;SAF=15;SAR=4;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.249963;STB=0.642691;STBP=0.101;TYPE=snp;VARB=0.0109193;OID=.;OPOS=104001517;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:18:18:19:19:0.513514:4:15:10:8:4:15:10:8
chr14	104165753	.	G	A	142.69	PASS	AF=0.6;AO=15;DP=25;FAO=15;FDP=25;FR=.;FRO=10;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=-0.0185056;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.545;QD=22.831;RBI=0.0194308;REFB=0.00742528;REVB=-0.00592444;RO=10;SAF=9;SAR=6;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00645088;OID=.;OPOS=104165753;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:25:25:10:10:15:15:0.6:6:9:6:4:6:9:6:4
chr14	104167075	.	C	T	214.45	PASS	AF=0.42623;AO=25;DP=60;FAO=26;FDP=61;FR=.;FRO=35;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=0.0883755;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.9901;QD=14.0626;RBI=0.0885652;REFB=-0.0217209;REVB=-0.00579331;RO=33;SAF=11;SAR=14;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0754648;STB=0.546564;STBP=0.565;TYPE=snp;VARB=0.0182017;OID=.;OPOS=104167075;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:61:33:35:25:26:0.42623:14:11:17:16:14:12:19:16
chr14	104167545	.	G	A	117.2	PASS	AF=0.358974;AO=14;DP=39;FAO=14;FDP=39;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=-0.0170772;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.5035;QD=12.0203;RBI=0.0416565;REFB=-0.0118834;REVB=0.0379951;RO=25;SAF=7;SAR=7;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108647;STB=0.564012;STBP=0.56;TYPE=snp;VARB=0.0246253;OID=.;OPOS=104167545;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:25:25:14:14:0.358974:7:7:15:10:7:7:15:10
chr14	104167564	.	A	G	74.21	PASS	AF=0.30303;AO=11;DP=34;FAO=10;FDP=33;FR=.;FRO=23;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.00144743;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.783;QD=8.99491;RBI=0.0032907;REFB=-0.00924051;REVB=-0.00295528;RO=23;SAF=5;SAR=6;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123092;STB=0.614231;STBP=0.409;TYPE=snp;VARB=0.021121;OID=.;OPOS=104167564;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:34:33:23:23:11:10:0.30303:6:5:13:10:6:4:13:10
chr14	104178445	.	G	GGCCCGGCGTGGA	142.31	PASS	AF=1;AO=11;DP=18;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00323484;FXX=0.0713776;HRUN=2;LEN=12;MLLD=431.788;QD=43.7882;RBI=0.00593986;REFB=0;REVB=0.00498174;RO=4;SAF=6;SAR=5;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.223563;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-3.90381e-06;OID=.;OPOS=104178446;OREF=-;OALT=GCCCGGCGTGGA;OMAPALT=GGCCCGGCGTGGA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:11:18:13:13:0:6:7:0:0:4:4:6:5:4:0
chr14	104194196	.	C	G	2389.28	PASS	AF=1;AO=149;DP=149;FAO=149;FDP=149;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0172603;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.077;QD=64.1417;RBI=0.0222049;REFB=0;REVB=0.0139692;RO=0;SAF=81;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.65545e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.84786e-06;OID=.;OPOS=104194196;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:149:149:0:0:149:149:1:68:81:0:0:68:81:0:0
chr14	104199356	.	C	T	264.68	PASS	AF=0.529412;AO=27;DP=51;FAO=27;FDP=51;FR=.;FRO=24;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=0.000150419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.0934;QD=20.7595;RBI=0.00901828;REFB=0.00745367;REVB=0.00901703;RO=24;SAF=16;SAR=11;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.216722;STB=0.620601;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=-0.00676628;OID=.;OPOS=104199356;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:24:24:27:27:0.529412:11:16:8:16:11:16:8:16
chr14	104199477	.	C	T	228.42	PASS	AF=0.469388;AO=22;DP=48;FAO=23;FDP=49;FR=.;FRO=26;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=-0.00533976;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.2056;QD=18.6469;RBI=0.00633942;REFB=-0.0141794;REVB=0.00341691;RO=26;SAF=14;SAR=8;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.205612;STB=0.62376;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=0.0127099;OID=.;OPOS=104199477;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:49:26:26:22:23:0.469388:8:14:11:15:8:15:11:15
chr14	104429453	.	A	G	1530.03	PASS	AF=1;AO=96;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0189235;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.418;QD=63.7511;RBI=0.048396;REFB=0;REVB=0.0445429;RO=0;SAF=43;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.69058e-05;OID=.;OPOS=104429453;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:96:96:0:0:96:96:1:53:43:0:0:53:43:0:0
chr14	104465037	.	T	C	1016.92	PASS	AF=0.923077;AO=72;DP=78;FAO=72;FDP=78;FR=.;FRO=6;FSAF=33;FSAR=39;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=0.0539928;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.4591;QD=52.1497;RBI=0.0629131;REFB=0.0186174;REVB=0.0322931;RO=6;SAF=33;SAR=39;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0785823;STB=0.541655;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=-0.0146842;OID=.;OPOS=104465037;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:78:78:6:6:72:72:0.923077:39:33:6:0:39:33:6:0
chr14	104480071	.	G	A	140.7	PASS	AF=0.372093;AO=16;DP=43;FAO=16;FDP=43;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=20;FWDB=0.00460431;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.59;QD=13.0885;RBI=0.0348302;REFB=-0.00589042;REVB=0.0345245;RO=26;SAF=6;SAR=10;SRF=7;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124825;STB=0.580551;STBP=0.481;TYPE=snp;VARB=0.0100285;OID=.;OPOS=104480071;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:26:27:16:16:0.372093:10:6:7:19:10:6:7:20
chr14	104480201	.	C	A	1007.33	PASS	AF=1;AO=68;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00633582;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.2001;QD=58.3961;RBI=0.0134279;REFB=0;REVB=-0.0118392;RO=1;SAF=20;SAR=48;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00974672;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.96586e-05;OID=.;OPOS=104480201;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:69:69:1:0:68:69:1:48:20:0:1:49:20:0:0
chr14	104571054	.	C	G	1364.14	PASS	AF=0.957447;AO=90;DP=94;FAO=90;FDP=94;FR=.;FRO=4;FSAF=33;FSAR=57;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0252346;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.5949;QD=58.0487;RBI=0.0414147;REFB=0.0809676;REVB=-0.0328389;RO=4;SAF=33;SAR=57;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0101483;STB=0.505359;STBP=0.663;TYPE=snp;VARB=-0.0295458;OID=.;OPOS=104571054;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:94:94:4:4:90:90:0.957447:57:33:1:3:57:33:1:3
chr14	104641792	.	C	T	221.85	PASS	AF=0.458333;AO=22;DP=48;FAO=22;FDP=48;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=-0.00670333;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.164;QD=18.4875;RBI=0.0102086;REFB=-0.0164263;REVB=0.00769939;RO=26;SAF=13;SAR=9;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0511632;STB=0.529043;STBP=0.724;TYPE=snp;VARB=0.0119969;OID=.;OPOS=104641792;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:26:26:22:22:0.458333:9:13:14:12:9:13:14:12
chr14	104642341	.	A	G	684.32	PASS	AF=0.554622;AO=66;DP=120;FAO=66;FDP=119;FR=.;FRO=53;FSAF=12;FSAR=54;FSRF=11;FSRR=42;FWDB=-0.0129202;FXX=0.0165276;HRUN=1;LEN=1;MLLD=295.854;QD=23.0024;RBI=0.0129721;REFB=-0.0138635;REVB=-0.00115993;RO=53;SAF=12;SAR=54;SRF=10;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00931967;STB=0.518791;STBP=0.756;TYPE=snp;VARB=0.0106206;OID=.;OPOS=104642341;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:119:53:53:66:66:0.554622:54:12:10:43:54:12:11:42
chr14	104643721	.	C	A	66.28	PASS	AF=0.409091;AO=9;DP=22;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=0.0016105;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.846;QD=12.0516;RBI=0.0155787;REFB=-0.00495874;REVB=0.0154952;RO=13;SAF=3;SAR=6;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.346427;STB=0.705442;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=0.00631453;OID=.;OPOS=104643721;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:22:22:13:13:9:9:0.409091:6:3:9:4:6:3:9:4
chr14	104643859	.	A	G	115.78	PASS	AF=0.388889;AO=13;DP=36;FAO=14;FDP=36;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=-0.00595703;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.189;QD=12.8646;RBI=0.0185967;REFB=-0.0229695;REVB=0.0176168;RO=22;SAF=6;SAR=7;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.232535;STB=0.650958;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=0.0268768;OID=.;OPOS=104643859;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:22:22:13:14:0.388889:7:6:15:7:8:6:15:7
chr14	104646326	.	A	C	310.13	PASS	AF=0.627907;AO=27;DP=43;FAO=27;FDP=43;FR=.;FRO=16;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=0.000208854;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.021;QD=28.8493;RBI=0.0103268;REFB=-0.0390493;REVB=-0.0103247;RO=15;SAF=16;SAR=11;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0967584;STB=0.561999;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.0189206;OID=.;OPOS=104646326;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:15:16:27:27:0.627907:11:16:11:4:11:16:12:4
chr14	104646771	.	T	C	265.4	PASS	AF=0.530612;AO=24;DP=45;FAO=26;FDP=49;FR=.;FRO=23;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=0.00137659;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.2365;QD=21.6653;RBI=0.0311456;REFB=-0.00712932;REVB=-0.0311151;RO=21;SAF=16;SAR=8;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0863188;STB=0.544449;STBP=0.557;TYPE=snp;VARB=0.00968208;OID=.;OPOS=104646771;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:49:21:23:24:26:0.530612:8:16:12:9:8:18:14:9
chr14	104647224	.	C	T	186.22	PASS	AF=0.284091;AO=25;DP=88;FAO=25;FDP=88;FR=.;FRO=63;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=34;FSRR=29;FWDB=-0.0394822;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.3445;QD=8.46474;RBI=0.0503182;REFB=-0.00461411;REVB=-0.0311943;RO=63;SAF=10;SAR=15;SRF=34;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16773;STB=0.59992;STBP=0.256;TYPE=snp;VARB=0.0100536;OID=.;OPOS=104647224;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:63:63:25:25:0.284091:15:10:34:29:15:10:34:29
chr14	105054934	.	A	G	82.34	PASS	AF=0.588235;AO=10;DP=17;FAO=10;FDP=17;FR=.;FRO=7;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=-0.00208004;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.431;QD=19.3734;RBI=0.0223278;REFB=-0.0210967;REVB=-0.0222307;RO=7;SAF=7;SAR=3;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.302492;STB=0.674342;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=0.00503315;OID=.;OPOS=105054934;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:17:17:7:7:10:10:0.588235:3:7:2:5:3:7:2:5
chr14	105055118	.	TGACGGGCAG	T	188.73	PASS	AF=0.389831;AO=23;DP=51;FAO=23;FDP=59;FR=.;FRO=36;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=23;FSRR=13;FWDB=0.0193794;FXX=0.0327815;HRUN=1;LEN=9;MLLD=256.784;QD=12.7952;RBI=0.0435696;REFB=-0.018719;REVB=0.0390224;RO=16;SAF=13;SAR=10;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00204022;STB=0.546243;STBP=0.604;TYPE=del;VARB=0.0266624;OID=.;OPOS=105055119;OREF=GACGGGCAG;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.389831:23:51:23:59:36:13:10:23:13:99:16:13:10:9:7
chr14	105058498	.	A	G	256.41	PASS	AF=0.533333;AO=24;DP=45;FAO=24;FDP=45;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=-0.00795146;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.847;QD=22.7915;RBI=0.0187352;REFB=-0.0507715;REVB=-0.0169642;RO=21;SAF=13;SAR=11;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106358;STB=0.559274;STBP=0.397;TYPE=snp;VARB=0.0427974;OID=.;OPOS=105058498;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:21:21:24:24:0.533333:11:13:14:7:11:13:14:7
chr14	105070791	.	G	T	94.55	PASS	AF=0.611111;AO=11;DP=18;FAO=11;FDP=18;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0612438;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.2222;QD=21.0107;RBI=0.0719067;REFB=-0.0390929;REVB=0.0376798;RO=7;SAF=5;SAR=6;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0795615;STB=0.545372;STBP=0.688;TYPE=snp;VARB=0.0288052;OID=.;OPOS=105070791;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:18:18:7:7:11:11:0.611111:6:5:4:3:6:5:4:3
chr14	105167807	.	C	T	854.86	PASS	AF=0.983607;AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.000533791;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=173.921;QD=56.0566;RBI=0.00244479;REFB=-0.0882025;REVB=0.00238581;RO=1;SAF=22;SAR=38;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0209661;STB=0.511107;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=-7.10064e-05;OID=.;OPOS=105167807;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:61:61:1:1:60:60:0.983607:38:22:1:0:38:22:1:0
chr14	105173653	.	C	T	410.34	PASS	AF=0.466667;AO=42;DP=90;FAO=42;FDP=90;FR=.;FRO=48;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=26;FSRR=22;FWDB=0.021939;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.43;QD=18.2374;RBI=0.0267025;REFB=-0.00608626;REVB=0.0152219;RO=48;SAF=21;SAR=21;SRF=26;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0398083;STB=0.522212;STBP=0.709;TYPE=snp;VARB=0.0052879;OID=.;OPOS=105173653;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:48:48:42:42:0.466667:21:21:26:22:21:21:26:22
chr14	105177351	.	CAG	C,CG,CGG	1537.34	PASS	AF=0,1,0;AO=12,78,11;DP=103;FAO=0,98,0;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=0,38,0;FSAR=0,60,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0181456,0.0255283,0.0274149;FXX=0.0101;HRUN=1,1,1;LEN=2,1,1;MLLD=68.8745,84.5734,70.6787;QD=62.7485;RBI=0.0494595,0.031185,0.0332791;REFB=0,0,0;REVB=-0.0460107,-0.0179112,0.0188659;RO=0;SAF=5,32,3;SAR=7,46,8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,-3.5329e-08,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,del,snp;VARB=0.0434288,0.00219698,0.0480297;OID=.,.,.;OPOS=105177352,105177352,105177352;OREF=AG,A,A;OALT=-,-,G;OMAPALT=C,CG,CGG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	2/2:0,1,0:12,78,11:103:0,98,0:98:0:0,38,0:0,60,0:0:0:8:0:5,32,3:7,46,8:0:0
chr14	105179194	.	T	C	1527.13	PASS	AF=1;AO=102;DP=103;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0144392;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.242;QD=59.8876;RBI=0.0169779;REFB=0;REVB=0.0089307;RO=0;SAF=56;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000280613;OID=.;OPOS=105179194;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:103:102:0:0:102:102:1:46:56:0:0:46:56:0:0
chr14	105180565	.	T	C	915.53	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0398154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.0887;QD=58.1289;RBI=0.0469885;REFB=0;REVB=-0.024953;RO=0;SAF=17;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.89926e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000109628;OID=.;OPOS=105180565;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:63:0:0:61:63:1:44:17:0:0:45:18:0:0
chr14	105180706	.	A	C	483.35	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00748561;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.658;QD=58.5878;RBI=0.00926222;REFB=0;REVB=0.00545476;RO=0;SAF=19;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.71297e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.79651e-05;OID=.;OPOS=105180706;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:14:19:0:0:14:19:0:0
chr14	105196230	.	A	C	253.64	PASS	AF=0.952381;AO=11;DP=22;FAO=20;FDP=21;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.100111;FXX=0.0454339;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.197;QD=48.3134;RBI=0.136885;REFB=0.00634479;REVB=0.0933558;RO=1;SAF=8;SAR=3;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.052924;STB=0.526289;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.000602568;OID=.;OPOS=105196230;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:22:21:1:1:11:20:0.952381:3:8:1:0:11:9:1:0
chr14	105196235	.	G	A	323.46	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0245613;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=165.391;QD=53.9091;RBI=0.0269816;REFB=0;REVB=0.0111693;RO=0;SAF=12;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000138116;OID=.;OPOS=105196235;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:12:12:0:0:12:12:0:0
chr14	105196365	.	T	C	1540.57	PASS	AF=1;AO=103;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0218371;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.7507;QD=59.828;RBI=0.026119;REFB=0;REVB=-0.0143299;RO=0;SAF=50;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.95161e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000113728;OID=.;OPOS=105196365;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:103:103:0:0:103:103:1:53:50:0:0:53:50:0:0
chr14	105205649	.	T	TC	39.71	PASS	AF=0.159091;AO=8;DP=44;FAO=7;FDP=44;FR=.;FRO=37;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=29;FSRR=8;FWDB=0.00588038;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=24.2376;QD=3.60993;RBI=0.0120655;REFB=-0.00848763;REVB=-0.0105355;RO=35;SAF=1;SAR=7;SRF=29;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.722039;STB=0.926993;STBP=0.103;TYPE=ins;VARB=0.0308335;OID=.;OPOS=105205650;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.159091:8:44:7:44:37:1:6:29:8:39:35:1:7:29:6
chr14	105211221	.	C	G,T	752.63	PASS	AF=0.0555556,0.944444;AO=3,51;DP=54;FAO=3,51;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=0,22;FSAR=3,29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0285662,0.0111761;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=63.6055,195.105;QD=55.7506;RBI=0.0376081,0.0259806;REFB=0,0;REVB=0.0244609,0.023454;RO=0;SAF=0,22;SAR=3,29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.170353,0.000353518;OID=.,.;OPOS=105211221,105211221;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:12:54:54:0:0:3,51:3,51:0.0555556,0.944444:3,29:0,22:0:0:3,29:0,22:0:0
chr14	105213343	.	A	G	1026.25	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0932357;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.9851;QD=59.4925;RBI=0.0933689;REFB=0;REVB=0.00498453;RO=0;SAF=24;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000430084;OID=.;OPOS=105213343;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:45:24:0:0:45:24:0:0
chr14	105220209	.	G	GA	1456.71	PASS	AF=1;AO=22;DP=124;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0883645;FXX=0.0991654;HRUN=0;LEN=1;MLLD=167.681;QD=53.4572;RBI=0.101744;REFB=-0.0342194;REVB=-0.0504342;RO=101;SAF=16;SAR=6;SRF=41;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.398923;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.000610736;OID=.;OPOS=105220210;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:22:124:109:109:0:53:56:0:0:7:101:16:6:41:60
chr14	105220210	.	G	A	1261.23	PASS	AF=0.803279;AO=98;DP=122;FAO=98;FDP=122;FR=.;FRO=24;FSAF=38;FSAR=60;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=0.0297295;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.263;QD=41.3518;RBI=0.048041;REFB=-0.16653;REVB=0.0377371;RO=24;SAF=38;SAR=60;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10569;STB=0.556307;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.00394928;OID=.;OPOS=105220210;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:122:122:24:24:98:98:0.803279:60:38:16:8:60:38:16:8
chr14	105222037	.	C	T	2975.71	PASS	AF=1;AO=189;DP=192;FAO=191;FDP=191;FR=.;FRO=0;FSAF=89;FSAR=102;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0235755;FXX=0.00520806;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.534;QD=62.3186;RBI=0.0300357;REFB=-0.163648;REVB=0.0186102;RO=1;SAF=89;SAR=100;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00473819;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000927239;OID=.;OPOS=105222037;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:192:191:1:0:189:191:1:100:89:0:1:102:89:0:0
chr14	105233129	.	C	T	294.16	PASS	AF=0.735294;AO=25;DP=34;FAO=25;FDP=34;FR=.;FRO=9;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.011256;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=209.225;QD=34.6072;RBI=0.0172486;REFB=-0.024087;REVB=-0.0130697;RO=9;SAF=10;SAR=15;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0223027;STB=0.512185;STBP=0.798;TYPE=snp;VARB=0.0063335;OID=.;OPOS=105233129;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:34:34:9:9:25:25:0.735294:15:10:4:5:15:10:4:5
chr14	105239894	.	C	T	421.26	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0152836;FXX=0.0644953;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.009;QD=58.1051;RBI=0.0157062;REFB=0;REVB=0.00361887;RO=0;SAF=9;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00260445;OID=.;OPOS=105239894;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:20:9:0:0:20:9:0:0
chr14	105246550	.	TC	T	64.95	PASS	AF=0.395349;AO=17;DP=43;FAO=17;FDP=43;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.215143;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=13.8734;QD=6.04208;RBI=0.215251;REFB=-0.043112;REVB=-0.00681773;RO=22;SAF=15;SAR=2;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.52289;STB=0.734117;STBP=0.025;TYPE=del;VARB=0.0404175;OID=.;OPOS=105246551;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.395349:17:43:17:43:26:14:3:13:13:64:22:15:2:10:12
chr14	105393556	.	G	C	269.44	PASS	AF=0.531915;AO=25;DP=47;FAO=25;FDP=47;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.024442;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.0108;QD=22.9311;RBI=0.0244423;REFB=-0.0211101;REVB=-0.000124572;RO=22;SAF=12;SAR=13;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0927583;STB=0.551741;STBP=0.473;TYPE=snp;VARB=0.0238605;OID=.;OPOS=105393556;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:22:22:25:25:0.531915:13:12:13:9:13:12:13:9
chr14	105405599	.	G	C	260.17	PASS	AF=0.467742;AO=29;DP=62;FAO=29;FDP=62;FR=.;FRO=33;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=-0.0029414;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=269.967;QD=16.785;RBI=0.00757005;REFB=-0.00399153;REVB=-0.00697523;RO=33;SAF=17;SAR=12;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153275;STB=0.586147;STBP=0.22;TYPE=snp;VARB=0.00425536;OID=.;OPOS=105405599;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:33:33:29:29:0.467742:12:17:14:19:12:17:14:19
chr14	105405942	.	G	A	251.18	PASS	AF=0.48;AO=23;DP=49;FAO=24;FDP=50;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=0.052929;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.209;QD=20.0941;RBI=0.0529343;REFB=-0.0322075;REVB=-0.000749459;RO=24;SAF=13;SAR=10;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0595413;STB=0.543882;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=0.031679;OID=.;OPOS=105405942;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:50:24:26:23:24:0.48:10:13:12:12:10:14:13:13
chr14	105406238	.	A	C	102.51	PASS	AF=0.521739;AO=12;DP=23;FAO=12;FDP=23;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.00908911;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.524;QD=17.8285;RBI=0.0532383;REFB=-0.0135205;REVB=-0.0524567;RO=11;SAF=5;SAR=7;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107737;STB=0.56194;STBP=0.572;TYPE=snp;VARB=0.0111136;OID=.;OPOS=105406238;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:23:23:11:11:12:12:0.521739:7:5:6:5:7:5:6:5
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chr14	105408030	.	A	G	176.28	PASS	AF=0.529412;AO=18;DP=34;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=0.00774146;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.5;QD=20.7385;RBI=0.0162567;REFB=-0.00902411;REVB=0.0142951;RO=16;SAF=9;SAR=9;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104329;STB=0.558759;STBP=0.473;TYPE=snp;VARB=0.00871914;OID=.;OPOS=105408030;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:16:16:18:18:0.529412:9:9:10:6:9:9:10:6
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chr14	105408805	.	A	G	150.79	PASS	AF=0.352941;AO=18;DP=51;FAO=18;FDP=51;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=27;FSRR=6;FWDB=0.0547824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.0385;QD=11.8264;RBI=0.0548039;REFB=-0.0345785;REVB=-0.00153809;RO=33;SAF=10;SAR=8;SRF=27;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.312436;STB=0.678732;STBP=0.114;TYPE=snp;VARB=0.0826918;OID=.;OPOS=105408805;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:33:33:18:18:0.352941:8:10:27:6:8:10:27:6
chr14	105408811	.	A	G	165.18	PASS	AF=0.377358;AO=20;DP=53;FAO=20;FDP=53;FR=.;FRO=33;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=27;FSRR=6;FWDB=0.0186867;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.7471;QD=12.4666;RBI=0.0195714;REFB=-0.00144851;REVB=0.00581778;RO=33;SAF=12;SAR=8;SRF=27;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.263688;STB=0.649871;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.00345912;OID=.;OPOS=105408811;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:33:33:20:20:0.377358:8:12:27:6:8:12:27:6
chr14	105408827	.	A	C	175.54	PASS	AF=0.372881;AO=22;DP=59;FAO=22;FDP=59;FR=.;FRO=37;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=29;FSRR=8;FWDB=0.0322122;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.413;QD=11.9009;RBI=0.037057;REFB=-0.00967961;REVB=0.0183193;RO=37;SAF=14;SAR=8;SRF=29;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18483;STB=0.605547;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=0.0200291;OID=.;OPOS=105408827;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:37:37:22:22:0.372881:8:14:29:8:8:14:29:8
chr14	105408955	.	A	G	313.23	PASS	AF=0.515625;AO=33;DP=64;FAO=33;FDP=64;FR=.;FRO=31;FSAF=23;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=-0.00245515;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.288;QD=19.5771;RBI=0.0728645;REFB=-0.0172904;REVB=-0.0728232;RO=30;SAF=23;SAR=10;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.182997;STB=0.611382;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.0118057;OID=.;OPOS=105408955;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:30:31:33:33:0.515625:10:23:15:15:10:23:15:16
chr14	105409959	.	G	T	354.23	PASS	AF=0.493333;AO=37;DP=75;FAO=37;FDP=75;FR=.;FRO=38;FSAF=12;FSAR=25;FSRF=23;FSRR=15;FWDB=0.0429208;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.6513;QD=18.8922;RBI=0.0591408;REFB=-0.0289536;REVB=0.040687;RO=38;SAF=12;SAR=25;SRF=23;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.261175;STB=0.645676;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0316102;OID=.;OPOS=105409959;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:38:38:37:37:0.493333:25:12:23:15:25:12:23:15
chr14	105410183	.	T	C	158.7	PASS	AF=0.459459;AO=17;DP=37;FAO=17;FDP=37;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.0214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.722;QD=17.1565;RBI=0.0233771;REFB=-0.00414436;REVB=0.00940904;RO=20;SAF=10;SAR=7;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0844149;STB=0.54833;STBP=0.576;TYPE=snp;VARB=0.00419932;OID=.;OPOS=105410183;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:20:20:17:17:0.459459:7:10:10:10:7:10:10:10
chr14	105410411	.	C	T	144.94	PASS	AF=0.410256;AO=16;DP=40;FAO=16;FDP=39;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=0.000591417;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.155;QD=14.866;RBI=0.00720066;REFB=-0.00127194;REVB=0.00717633;RO=23;SAF=6;SAR=10;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.236307;STB=0.636773;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=0.00128656;OID=.;OPOS=105410411;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:39:23:23:16:16:0.410256:10:6:14:9:10:6:14:9
chr14	105410775	.	A	G	172.13	PASS	AF=0.473684;AO=18;DP=38;FAO=18;FDP=38;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=0.0294094;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.735;QD=18.1189;RBI=0.0294267;REFB=0.00927756;REVB=-0.00100818;RO=19;SAF=8;SAR=10;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0702603;STB=0.523783;STBP=0.749;TYPE=snp;VARB=-0.00832948;OID=.;OPOS=105410775;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:19:20:18:18:0.473684:10:8:7:12:10:8:8:12
chr14	105410827	.	C	T	207.32	PASS	AF=0.588235;AO=20;DP=34;FAO=20;FDP=34;FR=.;FRO=14;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.00190502;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=304.432;QD=24.3902;RBI=0.0149392;REFB=-0.0140198;REVB=0.0148173;RO=14;SAF=12;SAR=8;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0754591;STB=0.542126;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.00890505;OID=.;OPOS=105410827;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:14:14:20:20:0.588235:8:12:7:7:8:12:7:7
chr14	105411700	.	A	G	340.48	PASS	AF=0.586207;AO=34;DP=58;FAO=34;FDP=58;FR=.;FRO=24;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.0233588;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.8783;QD=23.4814;RBI=0.0347036;REFB=-0.0741825;REVB=-0.0256653;RO=24;SAF=18;SAR=16;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00924882;STB=0.505089;STBP=0.958;TYPE=snp;VARB=0.0354237;OID=.;OPOS=105411700;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:24:24:34:34:0.586207:16:18:13:11:16:18:13:11
chr14	105411781	.	G	A	391.11	PASS	AF=0.649123;AO=37;DP=57;FAO=37;FDP=57;FR=.;FRO=20;FSAF=24;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.00811622;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.049;QD=27.4464;RBI=0.0128704;REFB=-0.0116917;REVB=0.00998867;RO=20;SAF=24;SAR=13;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0679298;STB=0.537111;STBP=0.478;TYPE=snp;VARB=0.0088536;OID=.;OPOS=105411781;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:20:20:37:37:0.649123:13:24:11:9:13:24:11:9
chr14	105412259	.	GG	CC	362.65	PASS	AF=0.681818;AO=30;DP=44;FAO=30;FDP=44;FR=.;FRO=14;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=-0.00828376;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=97.8882;QD=32.9682;RBI=0.0113095;REFB=-0.0199523;REVB=0.00769968;RO=14;SAF=19;SAR=11;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123507;STB=0.567564;STBP=0.236;TYPE=mnp;VARB=0.0102835;OID=.;OPOS=105412259;OREF=GG;OALT=CC;OMAPALT=CC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:14:14:30:30:0.681818:11:19:6:8:11:19:6:8
chr14	105413204	.	G	T	222.83	PASS	AF=0.42623;AO=26;DP=62;FAO=26;FDP=61;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=-0.00837615;FXX=0.0161264;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.936;QD=14.6121;RBI=0.015463;REFB=-0.00437818;REVB=0.0129979;RO=35;SAF=14;SAR=12;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0532731;STB=0.53028;STBP=0.702;TYPE=snp;VARB=0.00607813;OID=.;OPOS=105413204;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:61:35:35:26:26:0.42623:12:14:17:18:12:14:17:18
chr14	105413223	.	A	G	232.06	PASS	AF=0.428571;AO=27;DP=62;FAO=27;FDP=63;FR=.;FRO=36;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=-0.0140859;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.761;QD=14.7341;RBI=0.017564;REFB=-0.00343894;REVB=-0.0104919;RO=34;SAF=13;SAR=14;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0471589;STB=0.51058;STBP=0.863;TYPE=snp;VARB=0.00685827;OID=.;OPOS=105413223;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:63:34:36:27:27:0.428571:14:13:18:16:14:13:18:18
chr14	105414238	.	C	A	161.35	PASS	AF=0.472222;AO=17;DP=37;FAO=17;FDP=36;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.00532405;FXX=0.0270197;HRUN=3;LEN=1;MLLD=237.973;QD=17.9274;RBI=0.0170581;REFB=-0.0228068;REVB=0.016206;RO=19;SAF=10;SAR=7;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106788;STB=0.560984;STBP=0.473;TYPE=snp;VARB=0.0213956;OID=.;OPOS=105414238;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:36:19:19:17:17:0.472222:7:10:9:10:7:10:9:10
chr14	105414252	.	C	T	145.89	PASS	AF=0.457143;AO=16;DP=35;FAO=16;FDP=35;FR=.,HEALED;FRO=19;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.18605;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.9569;QD=16.6732;RBI=0.187184;REFB=0.0549398;REVB=-0.0205677;RO=15;SAF=8;SAR=8;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.08522;STB=0.514268;STBP=0.923;TYPE=snp;VARB=-0.0605203;OID=.;OPOS=105414252;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:15:19:16:16:0.457143:8:8:6:9:8:8:10:9
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chr14	105414629	.	G	A	204.52	PASS	AF=0.555556;AO=20;DP=36;FAO=20;FDP=36;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.000991099;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=313.1;QD=22.7239;RBI=0.0320536;REFB=0.000409001;REVB=0.0320383;RO=16;SAF=7;SAR=13;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173878;STB=0.597601;STBP=0.208;TYPE=snp;VARB=-0.000227467;OID=.;OPOS=105414629;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:16:16:20:20:0.555556:13:7:9:7:13:7:9:7
chr14	105414790	.	A	G	185.23	PASS	AF=0.407407;AO=22;DP=54;FAO=22;FDP=54;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=0.0361368;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.3851;QD=13.7206;RBI=0.044956;REFB=-0.0110107;REVB=-0.0267427;RO=31;SAF=11;SAR=11;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0494202;STB=0.518502;STBP=0.835;TYPE=snp;VARB=0.0202027;OID=.;OPOS=105414790;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:31:32:22:22:0.407407:11:11:14:17:11:11:15:17
chr14	105414810	.	C	G	175.6	PASS	AF=0.392157;AO=20;DP=51;FAO=20;FDP=51;FR=.;FRO=31;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.038877;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.306;QD=13.7726;RBI=0.0443994;REFB=-0.0130761;REVB=0.0214449;RO=31;SAF=11;SAR=9;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0696766;STB=0.540235;STBP=0.634;TYPE=snp;VARB=0.0450539;OID=.;OPOS=105414810;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:31:31:20:20:0.392157:9:11:15:16:9:11:15:16
chr14	105415352	.	G	C	385.95	PASS	AF=0.423077;AO=44;DP=104;FAO=44;FDP=104;FR=.;FRO=60;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=38;FSRR=22;FWDB=0.00268339;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.305;QD=14.8441;RBI=0.0329875;REFB=-0.0190843;REVB=0.0328782;RO=60;SAF=24;SAR=20;SRF=38;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0918665;STB=0.551578;STBP=0.373;TYPE=snp;VARB=0.0319182;OID=.;OPOS=105415352;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:104:60:60:44:44:0.423077:20:24:38:22:20:24:38:22
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chr14	105415431	.	C	G	34.03	PASS	AF=0.0826446;AO=10;DP=121;FAO=10;FDP=121;FR=.;FRO=111;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=66;FSRR=45;FWDB=0.0140452;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.191;QD=1.12505;RBI=0.0163467;REFB=0.00111291;REVB=-0.00836353;RO=111;SAF=7;SAR=3;SRF=66;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127077;STB=0.605186;STBP=0.466;TYPE=snp;VARB=-0.0270643;OID=.;OPOS=105415431;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:121:121:111:111:10:10:0.0826446:3:7:66:45:3:7:66:45
chr14	105415433	.	T	C	45.56	PASS	AF=0.0983607;AO=12;DP=122;FAO=12;FDP=122;FR=.;FRO=110;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=65;FSRR=45;FWDB=-0.00760242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.927;QD=1.49372;RBI=0.0421601;REFB=-0.00107989;REVB=-0.041469;RO=110;SAF=9;SAR=3;SRF=65;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.205013;STB=0.660265;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=0.00714848;OID=.;OPOS=105415433;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:122:122:110:110:12:12:0.0983607:3:9:65:45:3:9:65:45
chr14	105415469	.	T	C	692.48	PASS	AF=0.584071;AO=66;DP=113;FAO=66;FDP=113;FR=.;FRO=47;FSAF=40;FSAR=26;FSRF=31;FSRR=16;FWDB=-0.0182813;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=96.4375;QD=24.5126;RBI=0.0183531;REFB=-0.0189129;REVB=-0.00162196;RO=47;SAF=40;SAR=26;SRF=31;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0432289;STB=0.523532;STBP=0.588;TYPE=snp;VARB=0.00909906;OID=.;OPOS=105415469;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:113:47:47:66:66:0.584071:26:40:31:16:26:40:31:16
chr14	105415497	.	T	C	148.94	PASS	AF=0.231579;AO=22;DP=95;FAO=22;FDP=95;FR=.;FRO=73;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=52;FSRR=21;FWDB=0.0262757;FXX=0.0104156;HRUN=3;LEN=1;MLLD=129.718;QD=6.27107;RBI=0.0353619;REFB=0.00496028;REVB=-0.0236655;RO=73;SAF=15;SAR=7;SRF=52;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0448893;STB=0.527535;STBP=0.795;TYPE=snp;VARB=-0.0101002;OID=.;OPOS=105415497;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:73:73:22:22:0.231579:7:15:52:21:7:15:52:21
chr14	105415577	.	G	A	109.69	PASS	AF=0.236111;AO=17;DP=72;FAO=17;FDP=72;FR=.;FRO=55;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=32;FSRR=23;FWDB=0.0507248;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.2468;QD=6.09361;RBI=0.0850812;REFB=-0.000140675;REVB=0.0683066;RO=55;SAF=11;SAR=6;SRF=32;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0849244;STB=0.552796;STBP=0.642;TYPE=snp;VARB=0.00514512;OID=.;OPOS=105415577;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:55:55:17:17:0.236111:6:11:32:23:6:11:32:23
chr14	105415587	.	G	A	96.47	PASS	AF=0.234375;AO=15;DP=64;FAO=15;FDP=64;FR=.;FRO=49;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=28;FSRR=21;FWDB=-0.00834253;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.731;QD=6.02934;RBI=0.0107114;REFB=-0.00833522;REVB=-0.0067183;RO=49;SAF=9;SAR=6;SRF=28;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0361504;STB=0.52255;STBP=0.881;TYPE=snp;VARB=0.0175392;OID=.;OPOS=105415587;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:64:64:49:49:15:15:0.234375:6:9:28:21:6:9:28:21
chr14	105415607	.	C	G	59.39	PASS	AF=0.204545;AO=9;DP=44;FAO=9;FDP=44;FR=.;FRO=35;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=20;FSRR=15;FWDB=-0.0161435;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.78;QD=5.39913;RBI=0.0183647;REFB=-0.00664543;REVB=-0.00875483;RO=34;SAF=7;SAR=2;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.294527;STB=0.687409;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=0.0160911;OID=.;OPOS=105415607;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:59:44:44:34:35:9:9:0.204545:2:7:19:15:2:7:20:15
chr14	105415608	.	G	C	102.19	PASS	AF=0.325;AO=12;DP=40;FAO=13;FDP=40;FR=.;FRO=27;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=-0.00369221;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.956;QD=10.219;RBI=0.0193633;REFB=-0.0206364;REVB=0.0190081;RO=28;SAF=6;SAR=6;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123711;STB=0.536909;STBP=0.763;TYPE=snp;VARB=0.0542264;OID=.;OPOS=105415608;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:28:27:12:13:0.325:6:6:17:11:6:7:16:11
chr14	105415659	.	G	A	174.49	PASS	AF=0.5;AO=17;DP=35;FAO=18;FDP=36;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=-0.00843857;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.551;QD=19.3881;RBI=0.025569;REFB=-0.0175282;REVB=0.0241364;RO=18;SAF=10;SAR=7;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.227217;STB=0.609637;STBP=0.207;TYPE=snp;VARB=0.0107124;OID=.;OPOS=105415659;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:36:18:18:17:18:0.5:7:10:6:12:8:10:6:12
chr14	105416010	.	T	C	390.77	PASS	AF=0.666667;AO=32;DP=48;FAO=32;FDP=48;FR=.;FRO=16;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=0.000159824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.915;QD=32.5642;RBI=0.017199;REFB=-0.0145057;REVB=-0.0171983;RO=16;SAF=18;SAR=14;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151775;STB=0.58285;STBP=0.109;TYPE=snp;VARB=0.00648461;OID=.;OPOS=105416010;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:16:16:32:32:0.666667:14:18:5:11:14:18:5:11
chr14	105416087	.	C	T	254.71	PASS	AF=0.521739;AO=24;DP=46;FAO=24;FDP=46;FR=.;FRO=22;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=17;FWDB=-0.0686706;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.6445;QD=22.1486;RBI=0.0689933;REFB=-0.0052526;REVB=0.00666532;RO=21;SAF=16;SAR=8;SRF=5;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.35087;STB=0.704061;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.00579474;OID=.;OPOS=105416087;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:21:22:24:24:0.521739:8:16:5:16:8:16:5:17
chr14	105416220	.	T	A	198.36	PASS	AF=0.4;AO=24;DP=60;FAO=24;FDP=60;FR=.;FRO=36;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=-0.0166297;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.651;QD=13.2241;RBI=0.0268399;REFB=-0.00643195;REVB=0.0210673;RO=36;SAF=11;SAR=13;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0726495;STB=0.541632;STBP=0.635;TYPE=snp;VARB=0.0119128;OID=.;OPOS=105416220;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:36:36:24:24:0.4:13:11:19:17:13:11:19:17
chr14	105416230	.	A	G	199.53	PASS	AF=0.409836;AO=24;DP=61;FAO=25;FDP=61;FR=.;FRO=36;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=0.0467622;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.002;QD=13.0838;RBI=0.0467834;REFB=-0.0126813;REVB=0.00140965;RO=37;SAF=10;SAR=14;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131106;STB=0.551864;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=0.0250093;OID=.;OPOS=105416230;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:37:36:24:25:0.409836:14:10:20:17:14:11:19:17
chr14	105416685	.	C	G	35.04	PASS	AF=0.214286;AO=6;DP=28;FAO=6;FDP=28;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=0.0372737;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.2645;QD=5.00532;RBI=0.0684828;REFB=-0.00656389;REVB=-0.0574505;RO=22;SAF=5;SAR=1;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.496966;STB=0.832224;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=0.0212777;OID=.;OPOS=105416685;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:28:28:22:22:6:6:0.214286:1:5:9:13:1:5:9:13
chr14	105417036	.	G	C	323.45	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0318487;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.5925;QD=53.909;RBI=0.0320359;REFB=0;REVB=0.00345795;RO=0;SAF=10;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000641017;OID=.;OPOS=105417036;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:14:10:0:0:14:10:0:0
chr14	105417585	.	C	A	41.5	PASS	AF=0.170732;AO=7;DP=40;FAO=7;FDP=41;FR=.;FRO=34;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=-0.0301774;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.656;QD=4.04867;RBI=0.0339881;REFB=-0.00196645;REVB=-0.015637;RO=33;SAF=2;SAR=5;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.280358;STB=0.682916;STBP=0.362;TYPE=snp;VARB=0.0793631;OID=.;OPOS=105417585;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:40:41:33:34:7:7:0.170732:5:2:17:16:5:2:17:17
chr14	105417587	.	C	G	41.66	PASS	AF=0.175;AO=7;DP=40;FAO=7;FDP=40;FR=.;FRO=33;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=-0.00529581;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.309;QD=4.16631;RBI=0.0266494;REFB=-0.00608721;REVB=-0.0261179;RO=33;SAF=2;SAR=5;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.247774;STB=0.671135;STBP=0.35;TYPE=snp;VARB=0.0476912;OID=.;OPOS=105417587;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:40:40:33:33:7:7:0.175:5:2:16:17:5:2:16:17
chr14	105417597	.	T	C	83.1	PASS	AF=0.314286;AO=12;DP=35;FAO=11;FDP=35;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=-0.0251058;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.035;QD=9.49659;RBI=0.0253936;REFB=-0.0227411;REVB=0.00381188;RO=22;SAF=7;SAR=5;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139567;STB=0.559478;STBP=0.666;TYPE=snp;VARB=0.0259834;OID=.;OPOS=105417597;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:35:35:22:24:12:11:0.314286:5:7:10:12:5:6:11:13
chr14	105417611	.	C	T	142.16	PASS	AF=0.390244;AO=16;DP=39;FAO=16;FDP=41;FR=.;FRO=25;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=0.014082;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.4127;QD=13.869;RBI=0.0724724;REFB=-0.0397184;REVB=0.0710912;RO=23;SAF=8;SAR=8;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110759;STB=0.53654;STBP=0.723;TYPE=snp;VARB=0.0571047;OID=.;OPOS=105417611;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:41:23:25:16:16:0.390244:8:8:9:14:8:8:11:14
chr14	105417614	.	A	C	130.71	PASS	AF=0.365854;AO=15;DP=42;FAO=15;FDP=41;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=0.0023643;FXX=0.0238039;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.462;QD=12.7524;RBI=0.00512546;REFB=0.00322847;REVB=-0.00454758;RO=26;SAF=7;SAR=8;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0474041;STB=0.527832;STBP=0.819;TYPE=snp;VARB=-0.00578377;OID=.;OPOS=105417614;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:41:26:26:15:15:0.365854:8:7:11:15:8:7:11:15
chr14	105417629	.	G	C	142.62	PASS	AF=0.4;AO=16;DP=40;FAO=16;FDP=40;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=-0.00550147;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.039;QD=14.262;RBI=0.00918617;REFB=-0.0231045;REVB=0.0073566;RO=24;SAF=8;SAR=8;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172932;STB=0.59988;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=0.0289597;OID=.;OPOS=105417629;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:24:24:16:16:0.4:8:8:8:16:8:8:8:16
chr14	105417639	.	A	G	180.48	PASS	AF=0.422222;AO=19;DP=45;FAO=19;FDP=45;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=18;FWDB=0.00244562;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.396;QD=16.0426;RBI=0.0648335;REFB=0.00282363;REVB=-0.0647874;RO=26;SAF=11;SAR=8;SRF=8;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.267812;STB=0.652815;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=-0.00297176;OID=.;OPOS=105417639;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:26:26:19:19:0.422222:8:11:8:18:8:11:8:18
chr14	105417641	.	T	C	194.05	PASS	AF=0.434783;AO=20;DP=46;FAO=20;FDP=46;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=18;FWDB=-0.0159468;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.0412;QD=16.8737;RBI=0.035427;REFB=0.00293226;REVB=-0.0316349;RO=26;SAF=12;SAR=8;SRF=8;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.282923;STB=0.660863;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=-0.00581072;OID=.;OPOS=105417641;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:26:26:20:20:0.434783:8:12:8:18:8:12:8:18
chr14	105417650	.	G	A	178.0	PASS	AF=0.395833;AO=19;DP=48;FAO=19;FDP=48;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=22;FWDB=-0.0134599;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=100.926;QD=14.833;RBI=0.0199441;REFB=-0.00744007;REVB=-0.0147172;RO=29;SAF=12;SAR=7;SRF=7;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.391355;STB=0.723279;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.00446432;OID=.;OPOS=105417650;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:29:29:19:19:0.395833:7:12:7:22:7:12:7:22
chr14	105417894	.	C	G	137.88	PASS	AF=0.517241;AO=15;DP=29;FAO=15;FDP=29;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.0170769;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.581;QD=19.0179;RBI=0.0174431;REFB=-0.00692292;REVB=-0.00355521;RO=14;SAF=6;SAR=9;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0381971;STB=0.52171;STBP=0.874;TYPE=snp;VARB=0.00833003;OID=.;OPOS=105417894;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:14:14:15:15:0.517241:9:6:5:9:9:6:5:9
chr14	105418264	.	G	A	331.67	PASS	AF=0.548387;AO=34;DP=62;FAO=34;FDP=62;FR=.;FRO=28;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=8;FSRR=20;FWDB=0.00199075;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.484;QD=21.3982;RBI=0.01005;REFB=-0.0128618;REVB=0.00985091;RO=27;SAF=13;SAR=21;SRF=7;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107709;STB=0.547201;STBP=0.441;TYPE=snp;VARB=0.0109919;OID=.;OPOS=105418264;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:27:28:34:34:0.548387:21:13:7:20:21:13:8:20
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chr14	105418391	.	C	T	128.11	PASS	AF=0.483871;AO=14;DP=31;FAO=15;FDP=31;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.00473648;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.679;QD=16.5303;RBI=0.0156659;REFB=-0.0120847;REVB=0.0149328;RO=16;SAF=5;SAR=9;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0786514;STB=0.55806;STBP=0.584;TYPE=snp;VARB=0.00829996;OID=.;OPOS=105418391;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:16:16:14:15:0.483871:9:5:7:9:10:5:7:9
chr14	105418502	.	G	T	52.12	PASS	AF=0.242424;AO=8;DP=33;FAO=8;FDP=33;FR=.;FRO=25;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=-0.0218228;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=162.129;QD=6.31778;RBI=0.0343855;REFB=-0.00369817;REVB=-0.0265731;RO=25;SAF=3;SAR=5;SRF=17;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.348611;STB=0.718927;STBP=0.193;TYPE=snp;VARB=0.0114199;OID=.;OPOS=105418502;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:33:33:25:25:8:8:0.242424:5:3:17:8:5:3:17:8
chr14	105418504	.	G	T	95.67	PASS	AF=0.363636;AO=12;DP=33;FAO=12;FDP=33;FR=.;FRO=21;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=6;FWDB=-0.010344;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=125.298;QD=11.5961;RBI=0.0280901;REFB=-0.00909848;REVB=-0.0261162;RO=21;SAF=4;SAR=8;SRF=15;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.39214;STB=0.730411;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=0.0285462;OID=.;OPOS=105418504;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:33:33:21:21:12:12:0.363636:8:4:15:6:8:4:15:6
chr14	105418521	.	G	C	34.83	PASS	AF=0.206897;AO=6;DP=29;FAO=6;FDP=29;FR=.;FRO=23;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=-0.0676572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.5448;QD=4.80351;RBI=0.0699688;REFB=-0.0159568;REVB=0.0178364;RO=22;SAF=1;SAR=5;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.532018;STB=0.841583;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.0278601;OID=.;OPOS=105418521;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:29:29:22:23:6:6:0.206897:5:1:14:8:5:1:14:9
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chr14	105418638	.	A	G	291.85	PASS	AF=0.619048;AO=24;DP=40;FAO=26;FDP=42;FR=.;FRO=16;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.00893759;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.935;QD=27.7951;RBI=0.0402081;REFB=-0.0317016;REVB=0.0392022;RO=16;SAF=16;SAR=8;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.081814;STB=0.521056;STBP=0.737;TYPE=snp;VARB=0.01431;OID=.;OPOS=105418638;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:42:16:16:24:26:0.619048:8:16:9:7:10:16:9:7
chr14	105419234	.	T	C	178.93	PASS	AF=0.404255;AO=19;DP=47;FAO=19;FDP=47;FR=.;FRO=28;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=0.0102799;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.0198;QD=15.228;RBI=0.0221225;REFB=-0.000740999;REVB=-0.019589;RO=28;SAF=8;SAR=11;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0686689;STB=0.539494;STBP=0.679;TYPE=snp;VARB=0.0016629;OID=.;OPOS=105419234;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:28:28:19:19:0.404255:11:8:10:18:11:8:10:18
chr14	105419557	.	G	A	144.78	PASS	AF=0.432432;AO=16;DP=37;FAO=16;FDP=37;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=-0.0078921;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=299.881;QD=15.6516;RBI=0.0152583;REFB=-0.0138697;REVB=0.0130588;RO=21;SAF=8;SAR=8;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0234155;STB=0.513497;STBP=0.918;TYPE=snp;VARB=0.0122946;OID=.;OPOS=105419557;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:21:21:16:16:0.432432:8:8:10:11:8:8:10:11
chr14	105419568	.	A	G	170.33	PASS	AF=0.45;AO=18;DP=40;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.0149021;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.74;QD=17.0325;RBI=0.0444586;REFB=-0.00529454;REVB=-0.0418867;RO=22;SAF=10;SAR=8;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0536527;STB=0.530692;STBP=0.713;TYPE=snp;VARB=0.0220554;OID=.;OPOS=105419568;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:22:22:18:18:0.45:8:10:11:11:8:10:11:11
chr14	105420215	.	T	C	226.43	PASS	AF=0.471698;AO=25;DP=53;FAO=25;FDP=53;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=20;FWDB=0.0132875;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.529;QD=17.089;RBI=0.0146883;REFB=0.014969;REVB=-0.00626023;RO=28;SAF=12;SAR=13;SRF=8;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.184807;STB=0.60358;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=-0.0149328;OID=.;OPOS=105420215;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:28:28:25:25:0.471698:13:12:8:20:13:12:8:20
chr14	105461067	.	C	T	207.85	PASS	AF=0.446809;AO=21;DP=47;FAO=21;FDP=47;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=0.00178919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.663;QD=17.6894;RBI=0.0119966;REFB=-0.0249762;REVB=0.0118624;RO=26;SAF=8;SAR=13;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0362158;STB=0.520588;STBP=0.818;TYPE=snp;VARB=0.0181084;OID=.;OPOS=105461067;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:26:26:21:21:0.446809:13:8:9:17:13:8:9:17
chr14	105477180	.	A	G	137.47	PASS	AF=0.321429;AO=18;DP=55;FAO=18;FDP=56;FR=.;FRO=38;FSAF=3;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=-0.0347507;FXX=0.0175408;HRUN=4;LEN=1;MLLD=65.8424;QD=9.81956;RBI=0.040048;REFB=-0.0125646;REVB=0.0199056;RO=37;SAF=3;SAR=15;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.423728;STB=0.763563;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.027551;OID=.;OPOS=105477180;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:56:37:38:18:18:0.321429:15:3:18:19:15:3:19:19
chr14	105477613	.	T	C	125.44	PASS	AF=0.636364;AO=12;DP=22;FAO=14;FDP=22;FR=.;FRO=8;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.00900238;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.631;QD=22.8071;RBI=0.0155372;REFB=-0.0129627;REVB=-0.0126635;RO=7;SAF=6;SAR=6;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.233815;STB=0.615223;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=0.013801;OID=.;OPOS=105477613;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:22:22:7:8:12:14:0.636364:6:6:1:6:6:8:2:6
chr14	105518336	.	G	T	249.95	PASS	AF=1;AO=19;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.032812;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.608;QD=49.9908;RBI=0.0499039;REFB=0;REVB=0.0376002;RO=0;SAF=7;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000552185;OID=.;OPOS=105518336;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:19:20:1:12:7:0:0:12:8:0:0
chr14	105609335	.	A	G	722.96	PASS	AF=0.981132;AO=51;DP=52;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00537902;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.665;QD=54.5628;RBI=0.0296095;REFB=0.073231;REVB=-0.0291168;RO=1;SAF=22;SAR=29;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.015962;STB=0.508194;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=-0.000106538;OID=.;OPOS=105609335;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:52:53:1:1:51:52:0.981132:29:22:0:1:30:22:0:1
chr14	105611282	.	A	G	801.33	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0166168;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.009;QD=57.2376;RBI=0.0240149;REFB=0;REVB=0.0173378;RO=0;SAF=30;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.29784e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.26175e-05;OID=.;OPOS=105611282;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:26:30:0:0:26:30:0:0
chr14	105617042	.	C	T	665.03	PASS	AF=0.977778;AO=43;DP=45;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00801512;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.442;QD=59.1137;RBI=0.0190082;REFB=-0.0653286;REVB=0.0172358;RO=1;SAF=16;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0284424;STB=0.514279;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=-0.000708403;OID=.;OPOS=105617042;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:45:45:1:1:43:44:0.977778:27:16:1:0:27:17:1:0
chr14	105639491	.	A	G	192.98	PASS	AF=0.410714;AO=23;DP=56;FAO=23;FDP=56;FR=.;FRO=33;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=-0.0242241;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.5401;QD=13.7846;RBI=0.0248885;REFB=-0.0105066;REVB=-0.00571217;RO=32;SAF=9;SAR=14;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.205313;STB=0.608601;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=0.0140947;OID=.;OPOS=105639491;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:32:33:23:23:0.410714:14:9:19:13:14:9:19:14
chr14	105643619	.	G	A	323.14	PASS	AF=0.925926;AO=25;DP=27;FAO=25;FDP=27;FR=.;FRO=2;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00887786;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=165.811;QD=47.8723;RBI=0.0270396;REFB=-0.0710738;REVB=0.0255406;RO=1;SAF=11;SAR=14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0403161;STB=0.541633;STBP=0.163;TYPE=snp;VARB=0.000646557;OID=.;OPOS=105643619;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:27:27:1:2:25:25:0.925926:14:11:1:0:14:11:2:0
chr14	105643652	.	A	C	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0182823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.3472;QD=45.8051;RBI=0.0924918;REFB=0;REVB=0.0906669;RO=0;SAF=7;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00341497;OID=.;OPOS=105643652;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:7:7:0:0:7:7:0:0
chr14	105916420	.	C	T	1194.19	PASS	AF=0.9875;AO=79;DP=80;FAO=79;FDP=80;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0126854;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=98.4085;QD=59.7093;RBI=0.0237083;REFB=-0.0408373;REVB=0.0200291;RO=1;SAF=46;SAR=33;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.010181;STB=0.505375;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.000399995;OID=.;OPOS=105916420;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:80:80:1:1:79:79:0.9875:33:46:1:0:33:46:1:0
chr14	105930406	.	G	A	317.52	PASS	AF=0.571429;AO=28;DP=49;FAO=28;FDP=49;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=0.00250172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.677;QD=25.9202;RBI=0.01449;REFB=-0.0148743;REVB=-0.0142724;RO=21;SAF=11;SAR=17;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175679;STB=0.597295;STBP=0.127;TYPE=snp;VARB=0.0144954;OID=.;OPOS=105930406;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:21:21:28:28:0.571429:17:11:13:8:17:11:13:8
chr14	105935824	.	G	A	501.66	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0231171;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.235;QD=59.0187;RBI=0.0305154;REFB=0;REVB=0.0199197;RO=0;SAF=17;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.73796e-05;OID=.;OPOS=105935824;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:17:17:0:0:17:17:0:0
chr14	105953595	.	T	C	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0619025;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.071;QD=49.5989;RBI=0.0628256;REFB=0;REVB=-0.0107298;RO=0;SAF=11;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000806984;OID=.;OPOS=105953595;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:7:11:0:0:7:11:0:0
chr14	105962234	.	T	C	1007.94	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00156448;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.737;QD=59.2905;RBI=0.0375633;REFB=0;REVB=-0.0375307;RO=0;SAF=36;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.49594e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.15804e-05;OID=.;OPOS=105962234;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:32:36:0:0:32:36:0:0
chr14	105962369	.	A	G	1120.65	PASS	AF=1;AO=72;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00185395;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.175;QD=60.5757;RBI=0.00626783;REFB=0;REVB=-0.00598737;RO=0;SAF=30;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.1178e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.88791e-06;OID=.;OPOS=105962369;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:0:0:72:74:1:42:30:0:0:43:31:0:0
chr14	105995534	.	G	A	76.23	PASS	AF=0.37037;AO=10;DP=27;FAO=10;FDP=27;FR=.;FRO=17;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.0233191;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.988;QD=11.2936;RBI=0.0750076;REFB=-0.00857869;REVB=0.0712907;RO=16;SAF=3;SAR=7;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.277675;STB=0.65085;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=0.0216479;OID=.;OPOS=105995534;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:27:27:16:17:10:10:0.37037:7:3:9:7:7:3:9:8
chr14	106053491	.	C	T	373.53	PASS	AF=0.828571;AO=29;DP=36;FAO=29;FDP=35;FR=.;FRO=6;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.017556;FXX=0.0277701;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.022;QD=42.689;RBI=0.0338007;REFB=-0.0150479;REVB=0.0288839;RO=5;SAF=20;SAR=9;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145965;STB=0.567637;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.00306418;OID=.;OPOS=106053491;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:36:35:5:6:29:29:0.828571:9:20:1:4:9:20:2:4
chr14	106053975	.	G	A	282.42	PASS	AF=0.410256;AO=32;DP=78;FAO=32;FDP=78;FR=.;FRO=46;FSAF=8;FSAR=24;FSRF=21;FSRR=25;FWDB=0.010416;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.4601;QD=14.4829;RBI=0.0305225;REFB=-0.00645126;REVB=0.0286902;RO=46;SAF=8;SAR=24;SRF=21;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.243862;STB=0.639612;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=0.00437301;OID=.;OPOS=106053975;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:46:46:32:32:0.410256:24:8:21:25:24:8:21:25
chr14	106054428	.	C	G	37.15	PASS	AF=0.333333;AO=6;DP=18;FAO=6;FDP=18;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=-0.0261614;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.2506;QD=8.25561;RBI=0.0265201;REFB=0.0200827;REVB=-0.00434709;RO=12;SAF=2;SAR=4;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104655;STB=0.565012;STBP=0.783;TYPE=snp;VARB=-0.0192451;OID=.;OPOS=106054428;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:18:18:12:12:6:6:0.333333:4:2:3:9:4:2:3:9
chr14	106054456	.	A	G	72.13	PASS	AF=0.294118;AO=10;DP=34;FAO=10;FDP=34;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=-0.0356056;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.9654;QD=8.48608;RBI=0.0577117;REFB=0.00152544;REVB=-0.0454189;RO=23;SAF=5;SAR=5;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.225143;STB=0.617425;STBP=0.417;TYPE=snp;VARB=-0.00899341;OID=.;OPOS=106054456;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:34:34:23:24:10:10:0.294118:5:5:7:16:5:5:8:16
chr14	106054568	.	A	G	817.11	PASS	AF=0.567164;AO=76;DP=134;FAO=76;FDP=134;FR=.;FRO=58;FSAF=36;FSAR=40;FSRF=30;FSRR=28;FWDB=-0.0126255;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.897;QD=24.3913;RBI=0.0134606;REFB=-0.040319;REVB=0.00466743;RO=57;SAF=36;SAR=40;SRF=29;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0276163;STB=0.518863;STBP=0.647;TYPE=snp;VARB=0.0300459;OID=.;OPOS=106054568;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:134:134:57:58:76:76:0.567164:40:36:29:28:40:36:30:28
chr14	106066454	.	T	C	1080.55	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00747722;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.334;QD=60.0304;RBI=0.0165037;REFB=0;REVB=0.0147127;RO=0;SAF=30;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.1178e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.85879e-05;OID=.;OPOS=106066454;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:42:30:0:0:42:30:0:0
chr14	106066690	.	A	C	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0217956;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.996;QD=35.5759;RBI=0.0274762;REFB=0;REVB=-0.01673;RO=0;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.74862e-05;OID=.;OPOS=106066690;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:4:3:0:0:4:3:0:0
chr14	106067298	.	T	C	145.77	PASS	AF=0.4;AO=16;DP=41;FAO=16;FDP=40;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.0255189;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.063;QD=14.5765;RBI=0.0316677;REFB=-0.00892992;REVB=-0.0187518;RO=24;SAF=5;SAR=11;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118024;STB=0.568876;STBP=0.473;TYPE=snp;VARB=0.0162129;OID=.;OPOS=106067298;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:40:24:24:16:16:0.4:11:5:10:14:11:5:10:14
chr14	106067958	.	C	T	548.3	PASS	AF=0.416107;AO=62;DP=153;FAO=62;FDP=149;FR=.;FRO=87;FSAF=28;FSAR=34;FSRF=37;FSRR=50;FWDB=0.00256162;FXX=0.0261421;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.094;QD=14.7195;RBI=0.0206151;REFB=-0.0127734;REVB=-0.0204553;RO=85;SAF=28;SAR=34;SRF=37;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0170306;STB=0.515558;STBP=0.776;TYPE=snp;VARB=0.0159795;OID=.;OPOS=106067958;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:153:149:85:87:62:62:0.416107:34:28:37:48:34:28:37:50
chr14	106090846	.	T	C	546.24	PASS	AF=0.41844;AO=59;DP=141;FAO=59;FDP=141;FR=.;FRO=82;FSAF=37;FSAR=22;FSRF=54;FSRR=28;FWDB=0.0133063;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.092;QD=15.4961;RBI=0.0157155;REFB=-0.00419622;REVB=-0.00836186;RO=81;SAF=37;SAR=22;SRF=54;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0442381;STB=0.519723;STBP=0.726;TYPE=snp;VARB=0.00643635;OID=.;OPOS=106090846;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:141:141:81:82:59:59:0.41844:22:37:54:27:22:37:54:28
chr14	106090927	.	G	T	3722.43	PASS	AF=1;AO=234;DP=234;FAO=235;FDP=235;FR=.;FRO=0;FSAF=147;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0229682;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.542;QD=63.3604;RBI=0.0234095;REFB=0;REVB=-0.00452406;RO=0;SAF=147;SAR=87;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.03545e-05;OID=.;OPOS=106090927;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:20:234:235:0:0:234:235:1:87:147:0:0:88:147:0:0
chr14	106091329	.	G	C	1011.21	PASS	AF=0.582822;AO=95;DP=163;FAO=95;FDP=163;FR=.;FRO=68;FSAF=52;FSAR=43;FSRF=32;FSRR=36;FWDB=0.0027185;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.3272;QD=24.8149;RBI=0.0114457;REFB=-0.0132708;REVB=-0.0111182;RO=67;SAF=52;SAR=43;SRF=31;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0646341;STB=0.532118;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=0.0130406;OID=.;OPOS=106091329;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:163:163:67:68:95:95:0.582822:43:52:31:36:43:52:32:36
chr14	106091504	.	A	G	161.52	PASS	AF=0.344262;AO=21;DP=61;FAO=21;FDP=61;FR=.;FRO=40;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=24;FWDB=-0.00247417;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.21;QD=10.5912;RBI=0.00604775;REFB=-8.16796e-06;REVB=0.0055185;RO=38;SAF=9;SAR=12;SRF=16;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00849409;STB=0.519213;STBP=0.865;TYPE=snp;VARB=2.23283e-05;OID=.;OPOS=106091504;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:38:40:21:21:0.344262:12:9:16:22:12:9:16:24
chr14	106091555	.	C	T	196.83	PASS	AF=0.487805;AO=16;DP=44;FAO=20;FDP=41;FR=.,HEALED;FRO=21;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.0107305;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.142;QD=19.203;RBI=0.0161426;REFB=-0.0222125;REVB=0.0120599;RO=17;SAF=6;SAR=10;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.243709;STB=0.598827;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=0.0297921;OID=.;OPOS=106091555;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:41:17:21:16:20:0.487805:10:6:11:6:14:6:10:11
chr14	106091697	.	T	C	98.79	PASS	AF=0.3;AO=12;DP=46;FAO=12;FDP=40;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=-0.0103377;FXX=0.130406;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.4959;QD=9.87901;RBI=0.0231726;REFB=-0.0216406;REVB=0.0207388;RO=28;SAF=9;SAR=3;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.343282;STB=0.710161;STBP=0.107;TYPE=snp;VARB=0.0468385;OID=.;OPOS=106091697;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:46:40:28:28:12:12:0.3:3:9:13:15:3:9:13:15
chr14	106091743	.	CA	C	144.27	PASS	AF=0.4;AO=15;DP=41;FAO=16;FDP=40;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=-0.0161552;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.289;QD=14.4265;RBI=0.0399059;REFB=-0.0114956;REVB=-0.0364896;RO=25;SAF=12;SAR=3;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.480987;STB=0.796392;STBP=0.008;TYPE=del;VARB=0.00972755;OID=.;OPOS=106091744;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.4:15:41:16:40:24:13:3:8:16:99:25:12:3:9:16
chr14	106092152	.	G	A	564.15	PASS	AF=0.416667;AO=64;DP=158;FAO=65;FDP=156;FR=.;FRO=91;FSAF=36;FSAR=29;FSRF=39;FSRR=52;FWDB=-0.0057414;FXX=0.0188667;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.7124;QD=14.4653;RBI=0.0221324;REFB=-0.00999178;REVB=0.0213748;RO=91;SAF=35;SAR=29;SRF=39;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123276;STB=0.572753;STBP=0.116;TYPE=snp;VARB=0.00940729;OID=.;OPOS=106092152;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:158:156:91:91:64:65:0.416667:29:35:39:52:29:36:39:52
chr14	106092383	.	C	G	95.33	PASS	AF=0.909091;AO=10;DP=11;FAO=10;FDP=11;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0174243;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.6566;QD=34.6648;RBI=0.0502302;REFB=0.00465329;REVB=0.0471112;RO=1;SAF=1;SAR=9;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.290714;STB=0.666259;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.00122774;OID=.;OPOS=106092383;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:11:11:1:1:10:10:0.909091:9:1:1:0:9:1:1:0
chr14	106109573	.	T	C	129.6	PASS	AF=0.314815;AO=17;DP=54;FAO=17;FDP=54;FR=.;FRO=37;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=0.00349258;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.586;QD=9.60019;RBI=0.00392119;REFB=-0.00899773;REVB=-0.00178258;RO=37;SAF=5;SAR=12;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.291146;STB=0.673947;STBP=0.11;TYPE=snp;VARB=0.0168747;OID=.;OPOS=106109573;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:37:37:17:17:0.314815:12:5:20:17:12:5:20:17
chr14	106109752	.	A	C	1549.25	PASS	AF=1;AO=96;DP=97;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0489174;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.804;QD=63.8866;RBI=0.05034;REFB=0;REVB=-0.011883;RO=0;SAF=40;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000129153;OID=.;OPOS=106109752;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:97:97:0:0:96:97:1:56:40:0:0:56:41:0:0
chr14	106110057	.	G	A	1115.28	PASS	AF=0.532995;AO=105;DP=196;FAO=105;FDP=197;FR=.;FRO=92;FSAF=48;FSAR=57;FSRF=43;FSRR=49;FWDB=0.0273091;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.1167;QD=22.6453;RBI=0.0273261;REFB=-0.00426311;REVB=0.00096303;RO=90;SAF=48;SAR=57;SRF=43;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0175378;STB=0.504817;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=0.00353317;OID=.;OPOS=106110057;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:196:197:90:92:105:105:0.532995:57:48:43:47:57:48:43:49
chr14	106110137	.	C	T	438.62	PASS	AF=0.409836;AO=50;DP=122;FAO=50;FDP=122;FR=.;FRO=72;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=37;FSRR=35;FWDB=0.00224395;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.081;QD=14.3808;RBI=0.0059319;REFB=0.00130299;REVB=0.00549109;RO=72;SAF=27;SAR=23;SRF=37;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0274452;STB=0.515464;STBP=0.761;TYPE=snp;VARB=-0.00196459;OID=.;OPOS=106110137;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:122:122:72:72:50:50:0.409836:23:27:37:35:23:27:37:35
chr14	106110180	.	G	A	274.09	PASS	AF=0.376471;AO=32;DP=85;FAO=32;FDP=85;FR=.;FRO=53;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=32;FSRR=21;FWDB=0.0357338;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.4553;QD=12.8984;RBI=0.039476;REFB=0.00739968;REVB=0.0167763;RO=53;SAF=21;SAR=11;SRF=32;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0617424;STB=0.535436;STBP=0.65;TYPE=snp;VARB=-0.0101872;OID=.;OPOS=106110180;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:53:53:32:32:0.376471:11:21:32:21:11:21:32:21
chr14	106110914	.	G	T	516.47	PASS	AF=0.410072;AO=57;DP=139;FAO=57;FDP=139;FR=.;FRO=82;FSAF=23;FSAR=34;FSRF=38;FSRR=44;FWDB=-0.00157149;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=142.133;QD=14.8625;RBI=0.034204;REFB=-0.0212412;REVB=-0.0341679;RO=80;SAF=23;SAR=34;SRF=37;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0627623;STB=0.536182;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=0.0396098;OID=.;OPOS=106110914;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:139:139:80:82:57:57:0.410072:34:23:37:43:34:23:38:44
chr14	106110966	.	C	T	752.25	PASS	AF=0.568;AO=71;DP=126;FAO=71;FDP=125;FR=.;FRO=54;FSAF=35;FSAR=36;FSRF=19;FSRR=35;FWDB=0.0398164;FXX=0.00793588;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.387;QD=24.0719;RBI=0.0400358;REFB=-0.0111793;REVB=-0.00418533;RO=52;SAF=35;SAR=36;SRF=18;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11424;STB=0.561058;STBP=0.139;TYPE=snp;VARB=0.00968825;OID=.;OPOS=106110966;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:126:125:52:54:71:71:0.568:36:35:18:34:36:35:19:35
chr14	106173790	.	A	G	205.35	PASS	AF=0.428571;AO=24;DP=56;FAO=24;FDP=56;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=24;FWDB=-0.0892603;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.5753;QD=14.6675;RBI=0.0949643;REFB=-0.0104043;REVB=-0.0324163;RO=32;SAF=10;SAR=14;SRF=8;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179338;STB=0.601187;STBP=0.243;TYPE=snp;VARB=0.0228721;OID=.;OPOS=106173790;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:32:32:24:24:0.428571:14:10:8:24:14:10:8:24
chr14	106174261	.	C	G	193.13	PASS	AF=0.5;AO=19;DP=39;FAO=20;FDP=40;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=0.000345382;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.356;QD=19.313;RBI=0.0179636;REFB=-0.00504221;REVB=-0.0179603;RO=20;SAF=9;SAR=10;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113833;STB=0.54995;STBP=0.569;TYPE=snp;VARB=0.0101038;OID=.;OPOS=106174261;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:40:20:20:19:20:0.5:10:9:12:8:10:10:12:8
chr14	106188230	.	C	T	64.66	PASS	AF=0.179104;AO=11;DP=66;FAO=12;FDP=67;FR=.;FRO=55;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=30;FSRR=25;FWDB=0.0723736;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.881;QD=3.86034;RBI=0.0725149;REFB=-0.00421993;REVB=0.00452428;RO=55;SAF=5;SAR=6;SRF=30;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112226;STB=0.537252;STBP=0.796;TYPE=snp;VARB=0.0252759;OID=.;OPOS=106188230;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:66:67:55:55:11:12:0.179104:6:5:30:25:6:6:30:25
chr14	106204113	.	C	T	789.2	PASS	AF=0.564885;AO=74;DP=131;FAO=74;FDP=131;FR=.;FRO=57;FSAF=38;FSAR=36;FSRF=29;FSRR=28;FWDB=0.00402059;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=232.416;QD=24.0977;RBI=0.00444812;REFB=-0.0204213;REVB=0.00190279;RO=55;SAF=38;SAR=36;SRF=29;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0107731;STB=0.502064;STBP=0.977;TYPE=snp;VARB=0.0114145;OID=.;OPOS=106204113;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:131:131:55:57:74:74:0.564885:36:38:29:26:36:38:29:28
chr14	106207843	.	T	C	483.35	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0307345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.494;QD=58.5878;RBI=0.0583597;REFB=0;REVB=0.049611;RO=0;SAF=16;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.60901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000421697;OID=.;OPOS=106207843;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:17:16:0:0:17:16:0:0
chr14	106207862	.	G	C	137.93	PASS	AF=0.327273;AO=17;DP=54;FAO=18;FDP=55;FR=.;FRO=37;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=24;FWDB=-0.0200895;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.567;QD=10.0312;RBI=0.0258526;REFB=-0.0161045;REVB=-0.0162718;RO=34;SAF=7;SAR=10;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0344991;STB=0.526852;STBP=0.834;TYPE=snp;VARB=0.033941;OID=.;OPOS=106207862;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:55:34:37:17:18:0.327273:10:7:13:21:11:7:13:24
chr14	106209119	.	T	C	1080.56	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.011913;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=275.91;QD=60.0309;RBI=0.0193157;REFB=0;REVB=0.0152045;RO=0;SAF=53;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.15237e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.65831e-05;OID=.;OPOS=106209119;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:19:53:0:0:19:53:0:0
chr14	106209340	.	T	C	1265.21	PASS	AF=1;AO=81;DP=81;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0144595;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.158;QD=61.7177;RBI=0.0354217;REFB=0;REVB=0.032336;RO=0;SAF=37;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.05344e-05;OID=.;OPOS=106209340;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:82:0:0:81:82:1:44:37:0:0:45:37:0:0
chr14	106235611	.	A	T	248.51	PASS	AF=0.357143;AO=30;DP=83;FAO=30;FDP=84;FR=.;FRO=54;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=30;FWDB=-0.00590341;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.2386;QD=11.8338;RBI=0.0461628;REFB=-0.00938476;REVB=-0.0457838;RO=53;SAF=13;SAR=17;SRF=23;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000709335;STB=0.507253;STBP=0.917;TYPE=snp;VARB=0.0254389;OID=.;OPOS=106235611;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:84:53:54:30:30:0.357143:17:13:23:30:17:13:24:30
chr14	106235766	.	GC	AT	71.33	PASS	AF=0.141414;AO=14;DP=101;FAO=14;FDP=99;FR=.;FRO=85;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=34;FSRR=51;FWDB=-5.12564e-05;FXX=0.0198;HRUN=1;LEN=2;MLLD=157.8;QD=2.88213;RBI=0.00417616;REFB=-0.00454043;REVB=-0.00417584;RO=85;SAF=6;SAR=8;SRF=34;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.036668;STB=0.525187;STBP=0.854;TYPE=mnp;VARB=0.0232384;OID=.;OPOS=106235766;OREF=GC;OALT=AT;OMAPALT=AT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:71:101:99:85:85:14:14:0.141414:8:6:34:51:8:6:34:51
chr14	106236143	.	G	A	525.57	PASS	AF=0.491071;AO=55;DP=114;FAO=55;FDP=112;FR=.;FRO=57;FSAF=31;FSAR=24;FSRF=22;FSRR=35;FWDB=0.00229809;FXX=0.0175423;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.02;QD=18.7704;RBI=0.0143733;REFB=-0.00597945;REVB=0.0141884;RO=57;SAF=31;SAR=24;SRF=22;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162358;STB=0.589777;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=0.00614987;OID=.;OPOS=106236143;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:114:112:57:57:55:55:0.491071:24:31:22:35:24:31:22:35
chr14	106237624	.	C	T	104.63	PASS	AF=0.571429;AO=12;DP=21;FAO=12;FDP=21;FR=.;FRO=9;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=-0.00117801;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.925;QD=19.9285;RBI=0.0175104;REFB=-0.00206151;REVB=0.0174707;RO=8;SAF=9;SAR=3;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.290321;STB=0.691969;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=0.00191418;OID=.;OPOS=106237624;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:21:21:8:9:12:12:0.571429:3:9:3:5:3:9:3:6
chr14	106237642	.	T	G	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00491053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=287.736;QD=51.9167;RBI=0.0151783;REFB=0;REVB=-0.014362;RO=0;SAF=15;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.97343e-05;OID=.;OPOS=106237642;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:6:15:0:0:6:15:0:0
chr14	106303846	.	C	T	902.09	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0302241;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.838;QD=58.1994;RBI=0.0420305;REFB=0;REVB=0.0292072;RO=0;SAF=41;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.99858e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.33089e-06;OID=.;OPOS=106303846;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:21:41:0:0:21:41:0:0
chr14	106307418	.	G	A	883.19	PASS	AF=0.456853;AO=90;DP=199;FAO=90;FDP=197;FR=.;FRO=107;FSAF=50;FSAR=40;FSRF=56;FSRR=51;FWDB=0.0122804;FXX=0.0149993;HRUN=2;LEN=1;MLLD=235.359;QD=17.9327;RBI=0.0165786;REFB=-0.0100584;REVB=0.0111374;RO=105;SAF=50;SAR=40;SRF=55;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0311253;STB=0.51763;STBP=0.63;TYPE=snp;VARB=0.0113072;OID=.;OPOS=106307418;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:199:197:105:107:90:90:0.456853:40:50:55:50:40:50:56:51
chr14	106321330	.	G	A	83.43	PASS	AF=0.323529;AO=11;DP=34;FAO=11;FDP=34;FR=.;FRO=23;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=-0.0154036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.808;QD=9.81503;RBI=0.0179434;REFB=-0.0158909;REVB=0.00920282;RO=23;SAF=4;SAR=7;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0736464;STB=0.5443;STBP=0.766;TYPE=snp;VARB=0.0374977;OID=.;OPOS=106321330;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:34:34:23:23:11:11:0.323529:7:4:7:16:7:4:7:16
chr14	106321590	.	C	A	1390.9	PASS	AF=0.960396;AO=95;DP=99;FAO=97;FDP=101;FR=.;FRO=4;FSAF=52;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0113689;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.431;QD=55.0852;RBI=0.047255;REFB=0.0369076;REVB=0.045867;RO=3;SAF=52;SAR=43;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0319341;STB=0.521272;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=-0.000189447;OID=.;OPOS=106321590;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:99:101:3:4:95:97:0.960396:43:52:0:3:45:52:0:4
chr14	106321663	.	T	C	307.23	PASS	AF=0.43038;AO=34;DP=79;FAO=34;FDP=79;FR=.;FRO=45;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=29;FWDB=-0.0183983;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.286;QD=15.5562;RBI=0.0196092;REFB=-0.00641862;REVB=-0.00678386;RO=45;SAF=16;SAR=18;SRF=16;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117687;STB=0.566227;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.0095895;OID=.;OPOS=106321663;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:45:45:34:34:0.43038:18:16:16:29:18:16:16:29
chr14	106321913	.	G	A	56.29	PASS	AF=0.4;AO=8;DP=20;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=0.0197362;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.401;QD=11.2579;RBI=0.0203162;REFB=-0.0313861;REVB=0.00481948;RO=12;SAF=4;SAR=4;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.252187;STB=0.649658;STBP=0.354;TYPE=snp;VARB=0.0392565;OID=.;OPOS=106321913;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:20:20:12:12:8:8:0.4:4:4:3:9:4:4:3:9
chr14	106324349	.	C	T	98.78	PASS	AF=0.5;AO=12;DP=24;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=0.0325418;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=248.68;QD=16.4626;RBI=0.0336044;REFB=-0.0239512;REVB=0.00838395;RO=12;SAF=2;SAR=10;SRF=2;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0222311;OID=.;OPOS=106324349;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:24:24:12:12:12:12:0.5:10:2:2:10:10:2:2:10
chr14	106329435	.	T	G	918.14	PASS	AF=0.957143;AO=65;DP=70;FAO=67;FDP=70;FR=.;FRO=3;FSAF=21;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.115194;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.4384;QD=52.4649;RBI=0.115447;REFB=-0.106865;REVB=-0.00763519;RO=4;SAF=19;SAR=46;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0588196;STB=0.50099;STBP=0.955;TYPE=snp;VARB=0.00814086;OID=.;OPOS=106329435;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:70:70:4:3:65:67:0.957143:46:19:3:1:46:21:1:2
chr14	106329451	.	GTA	ACC	817.75	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.01629;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=193.054;QD=57.3858;RBI=0.0229722;REFB=0;REVB=0.0161975;RO=0;SAF=21;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=7.3615e-05;OID=.;OPOS=106329451;OREF=GTA;OALT=ACC;OMAPALT=ACC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:36:21:0:0:36:21:0:0
chr14	106346915	.	C	A	2647.13	PASS	AF=0.465753;AO=272;DP=587;FAO=272;FDP=584;FR=.;FRO=312;FSAF=168;FSAR=104;FSRF=171;FSRR=141;FWDB=-0.00862701;FXX=0.00511065;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.4341;QD=18.131;RBI=0.0173918;REFB=0.013046;REVB=0.0151013;RO=304;SAF=168;SAR=104;SRF=169;SRR=135;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0616779;STB=0.538628;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=-0.0103475;OID=.;OPOS=106346915;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:587:584:304:312:272:272:0.465753:104:168:169:135:104:168:171:141
chr14	106370603	.	G	C	923.29	PASS	AF=0.984615;AO=64;DP=65;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0628818;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.6078;QD=56.818;RBI=0.0649107;REFB=-0.0603596;REVB=0.0161023;RO=1;SAF=31;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0140981;STB=0.50746;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=0.00917556;OID=.;OPOS=106370603;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:65:65:1:1:64:64:0.984615:33:31:0:1:33:31:0:1
chr14	106385332	.	G	C	1863.54	PASS	AF=1;AO=121;DP=121;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0555396;FXX=0.00819605;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.612;QD=61.6045;RBI=0.0561863;REFB=0;REVB=-0.00850054;RO=0;SAF=70;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000194184;OID=.;OPOS=106385332;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:121:121:0:0:121:121:1:51:70:0:0:51:70:0:0
chr14	106436780	.	A	G	415.05	PASS	AF=1;AO=29;DP=30;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0145304;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.564;QD=57.249;RBI=0.0233615;REFB=0;REVB=0.0182928;RO=0;SAF=22;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000105001;OID=.;OPOS=106436780;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:29:0:0:29:29:1:7:22:0:0:7:22:0:0
chr14	106452690	.	G	A	100.74	PASS	AF=0.48;AO=12;DP=25;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=-0.012747;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.1468;QD=16.118;RBI=0.0514187;REFB=-0.0115703;REVB=-0.0498136;RO=11;SAF=7;SAR=5;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126749;STB=0.559345;STBP=0.615;TYPE=snp;VARB=0.0101988;OID=.;OPOS=106452690;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:25:11:13:12:12:0.48:5:7:8:3:5:7:9:4
chr14	106452766	.	T	A	331.89	PASS	AF=0.492958;AO=34;DP=70;FAO=35;FDP=71;FR=.;FRO=36;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=0.0102794;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.228;QD=18.698;RBI=0.0289358;REFB=-0.026359;REVB=0.0270484;RO=35;SAF=16;SAR=18;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0384442;STB=0.50649;STBP=0.92;TYPE=snp;VARB=0.0325964;OID=.;OPOS=106452766;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:71:35:36:34:35:0.492958:18:16:15:20:19:16:16:20
chr14	106452817	.	A	G	318.97	PASS	AF=0.432099;AO=35;DP=80;FAO=35;FDP=81;FR=.;FRO=46;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=26;FWDB=0.0137206;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.0883;QD=15.7516;RBI=0.0346915;REFB=-0.00197964;REVB=-0.0318629;RO=45;SAF=15;SAR=20;SRF=20;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.016129;STB=0.503595;STBP=0.971;TYPE=snp;VARB=0.00436527;OID=.;OPOS=106452817;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:81:45:46:35:35:0.432099:20:15:20:25:20:15:20:26
chr14	106471268	.	A	G	805.19	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00273323;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.577;QD=64.4149;RBI=0.0236376;REFB=0;REVB=0.0234791;RO=0;SAF=19;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000198966;OID=.;OPOS=106471268;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:31:19:0:0:31:19:0:0
chr14	106471273	.	C	T	671.69	PASS	AF=0.960784;AO=49;DP=51;FAO=49;FDP=51;FR=.;FRO=2;FSAF=18;FSAR=31;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00478384;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.8926;QD=52.6813;RBI=0.0115901;REFB=-0.0394649;REVB=0.0105567;RO=2;SAF=18;SAR=31;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.049451;STB=0.526305;STBP=0.109;TYPE=snp;VARB=0.00927123;OID=.;OPOS=106471273;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:51:51:2:2:49:49:0.960784:31:18:2:0:31:18:2:0
chr14	106471353	.	C	T	1400.32	PASS	AF=0.989011;AO=90;DP=91;FAO=90;FDP=91;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=54;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0169261;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.8691;QD=61.5527;RBI=0.0171352;REFB=-0.06038;REVB=-0.00266898;RO=1;SAF=36;SAR=54;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129832;STB=0.506848;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=0.000810503;OID=.;OPOS=106471353;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:91:91:1:1:90:90:0.989011:54:36:1:0:54:36:1:0
chr14	106471388	.	C	A	1422.53	PASS	AF=1;AO=90;DP=92;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0181698;FXX=0.0217368;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.531;QD=63.2235;RBI=0.0268845;REFB=0;REVB=0.019815;RO=0;SAF=37;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.83177e-05;OID=.;OPOS=106471388;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:92:90:0:0:90:90:1:53:37:0:0:53:37:0:0
chr14	106471528	.	C	A	330.36	PASS	AF=0.961538;AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.108209;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.4418;QD=50.8241;RBI=0.11392;REFB=-0.0320428;REVB=-0.0356168;RO=1;SAF=9;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0487725;STB=0.526294;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=0.00869571;OID=.;OPOS=106471528;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:26:26:1:1:25:25:0.961538:16:9:1:0:16:9:1:0
chr14	106471534	.	A	G	246.52	PASS	AF=0.952381;AO=20;DP=21;FAO=20;FDP=21;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0264615;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.4007;QD=46.956;RBI=0.0609238;REFB=-0.0992297;REVB=-0.0548771;RO=1;SAF=7;SAR=13;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.061324;STB=0.533299;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.00524933;OID=.;OPOS=106471534;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:21:21:1:1:20:20:0.952381:13:7:1:0:13:7:1:0
chr14	106471547	.	A	G	115.87	PASS	AF=1;AO=9;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00658105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.185;QD=42.1357;RBI=0.100124;REFB=0;REVB=0.0999076;RO=0;SAF=4;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0040793;OID=.;OPOS=106471547;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:9:11:1:5:4:0:0:7:4:0:0
chr14	106471685	.	G	A	210.29	PASS	AF=0.444444;AO=24;DP=54;FAO=24;FDP=54;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=11;FWDB=-0.0434098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.002;QD=15.5772;RBI=0.0514819;REFB=-0.00719498;REVB=0.0276764;RO=30;SAF=11;SAR=13;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170092;STB=0.596252;STBP=0.253;TYPE=snp;VARB=0.0079302;OID=.;OPOS=106471685;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:30:30:24:24:0.444444:13:11:19:11:13:11:19:11
chr14	106471689	.	A	C	291.48	PASS	AF=0.555556;AO=30;DP=54;FAO=30;FDP=54;FR=.;FRO=24;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=0.00524543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.939;QD=21.5911;RBI=0.0192184;REFB=-0.0155067;REVB=0.0184887;RO=24;SAF=19;SAR=11;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144367;STB=0.580098;STBP=0.208;TYPE=snp;VARB=0.01154;OID=.;OPOS=106471689;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:24:24:30:30:0.555556:11:19:11:13:11:19:11:13
chr14	106478354	.	T	C	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00815974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=349.835;QD=37.4885;RBI=0.0256066;REFB=0;REVB=0.0242717;RO=0;SAF=6;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.58669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.19468e-05;OID=.;OPOS=106478354;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:2:6:0:0:2:6:0:0
chr14	106478401	.	G	A	182.84	PASS	AF=0.941176;AO=16;DP=17;FAO=16;FDP=17;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00865166;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=210.021;QD=43.0209;RBI=0.0495518;REFB=-0.0893059;REVB=-0.0487906;RO=1;SAF=8;SAR=8;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.053738;STB=0.529375;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.000808988;OID=.;OPOS=106478401;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:17:17:1:1:16:16:0.941176:8:8:0:1:8:8:0:1
chr14	106478513	.	C	G	689.38	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0301633;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.006;QD=62.6708;RBI=0.0315829;REFB=0;REVB=0.00936261;RO=0;SAF=13;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.89436e-05;OID=.;OPOS=106478513;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:31:13:0:0:31:13:0:0
chr14	106478556	.	T	C	142.61	PASS	AF=0.4;AO=16;DP=40;FAO=16;FDP=40;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=0.0415192;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.9347;QD=14.2607;RBI=0.0419258;REFB=-0.0189675;REVB=0.00582451;RO=24;SAF=5;SAR=11;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0247079;STB=0.51437;STBP=0.89;TYPE=snp;VARB=0.0320584;OID=.;OPOS=106478556;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:24:24:16:16:0.4:11:5:8:16:11:5:8:16
chr14	106494269	.	T	C	981.34	PASS	AF=0.898734;AO=71;DP=79;FAO=71;FDP=79;FR=.;FRO=8;FSAF=21;FSAR=50;FSRF=8;FSRR=0;FWDB=0.0376534;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.3324;QD=49.6881;RBI=0.0385603;REFB=-0.0278496;REVB=-0.00831387;RO=8;SAF=21;SAR=50;SRF=8;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150293;STB=0.579976;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0201145;OID=.;OPOS=106494269;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:79:79:8:8:71:71:0.898734:50:21:8:0:50:21:8:0
chr14	106539280	.	A	G	379.02	PASS	AF=0.642857;AO=36;DP=57;FAO=36;FDP=56;FR=.;FRO=20;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=0.0235562;FXX=0.0175408;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.1109;QD=27.0729;RBI=0.0348322;REFB=-0.00707834;REVB=-0.0256591;RO=20;SAF=20;SAR=16;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0630389;STB=0.534394;STBP=0.48;TYPE=snp;VARB=0.00664716;OID=.;OPOS=106539280;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:56:20:20:36:36:0.642857:16:20:13:7:16:20:13:7
chr14	106552667	.	A	G	152.36	PASS	AF=0.551724;AO=16;DP=29;FAO=16;FDP=29;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.0543914;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.835;QD=21.0154;RBI=0.0574211;REFB=-0.0201465;REVB=0.0184052;RO=12;SAF=6;SAR=10;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.098321;STB=0.540489;STBP=0.676;TYPE=snp;VARB=0.0135525;OID=.;OPOS=106552667;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:12:13:16:16:0.551724:10:6:6:6:10:6:6:7
chr14	106573251	.	G	A	46.78	PASS	AF=0.35;AO=7;DP=20;FAO=7;FDP=20;FR=.;FRO=13;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=3;FWDB=-0.00414253;FXX=0.0475964;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.861;QD=9.35539;RBI=0.00659598;REFB=-0.0154984;REVB=0.00513287;RO=12;SAF=2;SAR=5;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.453553;STB=0.788742;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.0226514;OID=.;OPOS=106573251;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:20:20:12:13:7:7:0.35:5:2:9:3:5:2:10:3
chr14	106573662	.	A	G	192.03	PASS	AF=0.369231;AO=24;DP=65;FAO=24;FDP=65;FR=.;FRO=41;FSAF=19;FSAR=5;FSRF=29;FSRR=12;FWDB=0.0122876;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.0601;QD=11.817;RBI=0.0503776;REFB=0.034087;REVB=0.0488561;RO=41;SAF=19;SAR=5;SRF=29;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126261;STB=0.573646;STBP=0.405;TYPE=snp;VARB=-0.0429626;OID=.;OPOS=106573662;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:41:41:24:24:0.369231:5:19:29:12:5:19:29:12
chr14	106667592	.	G	A	186.05	PASS	AF=0.5;AO=19;DP=38;FAO=19;FDP=38;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=-0.0265947;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.209;QD=19.5845;RBI=0.0393434;REFB=-0.0215629;REVB=0.0289935;RO=19;SAF=8;SAR=11;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184613;STB=0.604287;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=0.0194799;OID=.;OPOS=106667592;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:19:19:19:19:0.5:11:8:12:7:11:8:12:7
chr14	106667786	.	T	C	100.29	PASS	AF=0.461538;AO=12;DP=25;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.0115113;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.049;QD=15.4294;RBI=0.0157521;REFB=-0.0342407;REVB=0.0107527;RO=13;SAF=4;SAR=8;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0261872;STB=0.514262;STBP=0.924;TYPE=snp;VARB=0.0225578;OID=.;OPOS=106667786;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:26:13:14:12:12:0.461538:8:4:4:9:8:4:5:9
chr14	106733520	.	C	A	192.4	PASS	AF=0.416667;AO=20;DP=48;FAO=20;FDP=48;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=21;FWDB=0.00830465;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.812;QD=16.0335;RBI=0.0565076;REFB=0.0139636;REVB=0.055894;RO=28;SAF=11;SAR=9;SRF=7;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.300532;STB=0.670575;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=-0.0124944;OID=.;OPOS=106733520;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:28:28:20:20:0.416667:9:11:7:21:9:11:7:21
chr14	106733593	.	G	A	156.15	PASS	AF=0.328125;AO=21;DP=64;FAO=21;FDP=64;FR=.;FRO=43;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=28;FWDB=0.00596078;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.802;QD=9.75927;RBI=0.0268104;REFB=0.00294706;REVB=0.0261394;RO=41;SAF=13;SAR=8;SRF=15;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.280493;STB=0.67614;STBP=0.06;TYPE=snp;VARB=-0.00172657;OID=.;OPOS=106733593;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:41:43:21:21:0.328125:8:13:15:26:8:13:15:28
chr14	106780634	.	G	A	409.56	PASS	AF=0.387097;AO=48;DP=124;FAO=48;FDP=124;FR=.;FRO=76;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=43;FSRR=33;FWDB=-0.0101433;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=270.693;QD=13.2116;RBI=0.0145804;REFB=-0.0104835;REVB=0.0104739;RO=76;SAF=23;SAR=25;SRF=43;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0934278;STB=0.552927;STBP=0.381;TYPE=snp;VARB=0.0183512;OID=.;OPOS=106780634;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:124:124:76:76:48:48:0.387097:25:23:43:33:25:23:43:33
chr14	106780816	.	CA	C,CC	409.02	PASS	AF=0.0344828,0.965517;AO=7,22;DP=29;FAO=1,28;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=0,16;FSAR=1,12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.127638,0.141866;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=201.993,224.473;QD=56.4167;RBI=0.128332,0.142472;REFB=0,0;REVB=0.0133243,0.0131221;RO=0;SAF=6,10;SAR=1,12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0792241,-0.00223445;OID=.,.;OPOS=106780817,106780817;OREF=A,A;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0344828,0.965517:7,22:29:1,28:29:0:0,16:1,12:0:0:4:0:6,10:1,12:0:0
chr14	106780956	.	AG	A	176.67	PASS	AF=0.444444;AO=28;DP=64;FAO=28;FDP=63;FR=.;FRO=35;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=23;FWDB=-0.0363492;FXX=0.0156226;HRUN=2;LEN=1;MLLD=32.4207;QD=11.2169;RBI=0.0553812;REFB=0.00759486;REVB=0.041783;RO=35;SAF=11;SAR=17;SRF=12;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0522334;STB=0.529462;STBP=0.712;TYPE=del;VARB=-0.00892333;OID=.;OPOS=106780957;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.444444:28:64:28:63:35:11:17:12:23:99:35:11:17:12:23
chr14	106791006	.	C	T	322.29	PASS	AF=0.666667;AO=27;DP=41;FAO=28;FDP=42;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=21;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=-0.00187018;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.553;QD=30.6943;RBI=0.0113503;REFB=-0.0242482;REVB=-0.0111952;RO=14;SAF=7;SAR=20;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1272;STB=0.573474;STBP=0.202;TYPE=snp;VARB=0.0131417;OID=.;OPOS=106791006;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:42:14:14:27:28:0.666667:20:7:6:8:21:7:6:8
chr14	106791117	.	G	A	228.39	PASS	AF=0.345679;AO=28;DP=82;FAO=28;FDP=81;FR=.;FRO=53;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=37;FWDB=-0.0387102;FXX=0.0240935;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.668;QD=11.2786;RBI=0.038734;REFB=-0.0243094;REVB=0.00135624;RO=53;SAF=9;SAR=19;SRF=16;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0255684;STB=0.514801;STBP=0.86;TYPE=snp;VARB=0.0246705;OID=.;OPOS=106791117;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:81:53:53:28:28:0.345679:19:9:16:37:19:9:16:37
chr14	106791119	.	A	G	239.92	PASS	AF=0.349398;AO=29;DP=82;FAO=29;FDP=83;FR=.;FRO=54;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=17;FSRR=37;FWDB=0.0186523;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.165;QD=11.5623;RBI=0.0186591;REFB=-0.0125597;REVB=-0.000503464;RO=53;SAF=10;SAR=19;SRF=17;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0301479;STB=0.521886;STBP=0.775;TYPE=snp;VARB=0.0170643;OID=.;OPOS=106791119;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:83:53:54:29:29:0.349398:19:10:17:36:19:10:17:37
chr14	106791200	.	GC	AG	117.75	PASS	AF=0.368421;AO=14;DP=38;FAO=14;FDP=38;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=-0.011671;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=204.648;QD=12.3945;RBI=0.0163792;REFB=-0.0163549;REVB=-0.011492;RO=24;SAF=7;SAR=7;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179668;STB=0.605119;STBP=0.344;TYPE=mnp;VARB=0.0224264;OID=.;OPOS=106791200;OREF=GC;OALT=AG;OMAPALT=AG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:24:24:14:14:0.368421:7:7:8:16:7:7:8:16
chr14	106805440	.	A	G	956.8	PASS	AF=1;AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00613374;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.74;QD=58.8799;RBI=0.00925222;REFB=0;REVB=0.00692682;RO=0;SAF=21;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000498615;OID=.;OPOS=106805440;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:65:0:0:65:65:1:44:21:0:0:44:21:0:0
chr14	106805508	.	G	A	406.54	PASS	AF=0.909091;AO=30;DP=33;FAO=30;FDP=33;FR=.;FRO=3;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0137442;FXX=0.0294031;HRUN=4;LEN=1;MLLD=48.018;QD=49.2782;RBI=0.0417045;REFB=-0.0710964;REVB=-0.0393747;RO=2;SAF=20;SAR=10;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0216314;STB=0.533311;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=0.00543391;OID=.;OPOS=106805508;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:33:33:2:3:30:30:0.909091:10:20:1:1:10:20:1:2
chr14	106815723	.	C	T	44.53	PASS	AF=0.28;AO=7;DP=25;FAO=7;FDP=25;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.00795207;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.234;QD=7.12516;RBI=0.00799466;REFB=-0.00461127;REVB=0.00082418;RO=18;SAF=3;SAR=4;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143116;STB=0.590651;STBP=0.574;TYPE=snp;VARB=0.00878946;OID=.;OPOS=106815723;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:25:25:18:18:7:7:0.28:4:3:10:8:4:3:10:8
chr14	106845487	.	C	G	294.53	PASS	AF=0.423077;AO=33;DP=78;FAO=33;FDP=78;FR=.;FRO=45;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=24;FSRR=21;FWDB=-0.00423121;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=196.491;QD=15.1043;RBI=0.00516471;REFB=-0.00165059;REVB=-0.0029616;RO=44;SAF=18;SAR=15;SRF=24;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507038;STBP=0.939;TYPE=snp;VARB=0.00194287;OID=.;OPOS=106845487;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:44:45:33:33:0.423077:15:18:24:20:15:18:24:21
chr14	106866427	.	G	A	38.87	PASS	AF=0.0887097;AO=11;DP=124;FAO=11;FDP=124;FR=.;FRO=113;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=55;FSRR=58;FWDB=-0.00367541;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.689;QD=1.25383;RBI=0.011298;REFB=-0.00036483;REVB=-0.0106834;RO=113;SAF=6;SAR=5;SRF=55;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0674147;STB=0.553344;STBP=0.715;TYPE=snp;VARB=0.00530971;OID=.;OPOS=106866427;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:124:124:113:113:11:11:0.0887097:5:6:55:58:5:6:55:58
chr14	106866434	.	C	T	83.43	PASS	AF=0.137405;AO=18;DP=126;FAO=18;FDP=131;FR=.;FRO=113;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=54;FSRR=59;FWDB=-0.0359325;FXX=0.00757518;HRUN=3;LEN=1;MLLD=93.827;QD=2.54735;RBI=0.100146;REFB=-0.00697628;REVB=-0.0934776;RO=108;SAF=10;SAR=8;SRF=54;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0699464;STB=0.566762;STBP=0.573;TYPE=snp;VARB=0.0367772;OID=.;OPOS=106866434;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:126:131:108:113:18:18:0.137405:8:10:54:54:8:10:54:59
chr14	106866449	.	T	C	142.9	PASS	AF=0.174497;AO=25;DP=147;FAO=26;FDP=149;FR=.;FRO=123;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=59;FSRR=64;FWDB=0.0171669;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.2252;QD=3.83625;RBI=0.0486355;REFB=-0.00103611;REVB=-0.045505;RO=122;SAF=17;SAR=8;SRF=59;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.253226;STB=0.644563;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.00208595;OID=.;OPOS=106866449;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:147:149:122:123:25:26:0.174497:8:17:59:63:9:17:59:64
chr14	106866465	.	A	G	194.32	PASS	AF=0.196532;AO=34;DP=173;FAO=34;FDP=173;FR=.;FRO=139;FSAF=24;FSAR=10;FSRF=67;FSRR=72;FWDB=0.00155244;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.033;QD=4.49291;RBI=0.01739;REFB=-0.00515491;REVB=-0.0173206;RO=139;SAF=24;SAR=10;SRF=67;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.291708;STB=0.683698;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.0292116;OID=.;OPOS=106866465;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:173:173:139:139:34:34:0.196532:10:24:67:72:10:24:67:72
chr14	106866565	.	C	A	386.44	PASS	AF=0.302326;AO=52;DP=169;FAO=52;FDP=172;FR=.;FRO=120;FSAF=33;FSAR=19;FSRF=52;FSRR=68;FWDB=-0.0377744;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=183.493;QD=8.98702;RBI=0.043054;REFB=-0.0193173;REVB=0.0206577;RO=117;SAF=33;SAR=19;SRF=49;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.255121;STB=0.639937;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0303434;OID=.;OPOS=106866565;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:169:172:117:120:52:52:0.302326:19:33:49:68:19:33:52:68
chr14	106866588	.	T	C	332.31	PASS	AF=0.309353;AO=40;DP=136;FAO=43;FDP=139;FR=.;FRO=96;FSAF=27;FSAR=16;FSRF=43;FSRR=53;FWDB=0.0158344;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.65;QD=9.56284;RBI=0.0199281;REFB=-0.024703;REVB=-0.0120996;RO=95;SAF=24;SAR=16;SRF=42;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188619;STB=0.624481;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.0449105;OID=.;OPOS=106866588;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:136:139:95:96:40:43:0.309353:16:24:42:53:16:27:43:53
chr14	106866654	.	T	C	126.05	PASS	AF=0.313725;AO=13;DP=49;FAO=16;FDP=51;FR=.;FRO=35;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=0.0262014;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.111;QD=9.88596;RBI=0.027536;REFB=-0.0127468;REVB=-0.00846873;RO=36;SAF=4;SAR=9;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.237266;STB=0.533292;STBP=0.704;TYPE=snp;VARB=0.00559207;OID=.;OPOS=106866654;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:51:36:35:13:16:0.313725:9:4:18:18:9:7:17:18
chr14	106866668	.	C	A	157.84	PASS	AF=0.365385;AO=19;DP=51;FAO=19;FDP=52;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=-0.00386954;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.39;QD=12.1417;RBI=0.00575805;REFB=-0.00512236;REVB=-0.00426401;RO=32;SAF=10;SAR=9;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0733497;STB=0.531535;STBP=0.731;TYPE=snp;VARB=0.0130482;OID=.;OPOS=106866668;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:52:32:33:19:19:0.365385:9:10:19:13:9:10:19:14
chr14	106866675	.	C	G	120.15	PASS	AF=0.294118;AO=15;DP=51;FAO=15;FDP=51;FR=.;FRO=36;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=0.038282;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=62.2444;QD=9.42358;RBI=0.0459939;REFB=-0.00598548;REVB=0.0254937;RO=35;SAF=9;SAR=6;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0679271;STB=0.55193;STBP=0.606;TYPE=snp;VARB=0.00580328;OID=.;OPOS=106866675;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:35:36:15:15:0.294118:6:9:19:16:6:9:19:17
chr14	106866810	.	C	T	76.3	PASS	AF=0.210526;AO=12;DP=57;FAO=12;FDP=57;FR=.;FRO=45;FSAF=11;FSAR=1;FSRF=33;FSRR=12;FWDB=-0.00554643;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.06;QD=5.35461;RBI=0.0200185;REFB=-0.000271305;REVB=-0.0192348;RO=45;SAF=11;SAR=1;SRF=33;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.388121;STB=0.764138;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.00371248;OID=.;OPOS=106866810;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:57:57:45:45:12:12:0.210526:1:11:33:12:1:11:33:12
chr14	106866822	.	C	G	82.2	PASS	AF=0.216667;AO=13;DP=60;FAO=13;FDP=60;FR=.;FRO=47;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=33;FSRR=14;FWDB=-0.00181758;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.202;QD=5.48025;RBI=0.0105506;REFB=-0.00214705;REVB=-0.0103929;RO=47;SAF=11;SAR=2;SRF=33;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.253731;STB=0.66637;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=0.0133647;OID=.;OPOS=106866822;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:82:60:60:47:47:13:13:0.216667:2:11:33:14:2:11:33:14
chr14	106866869	.	G	A	31.5	PASS	AF=0.115385;AO=6;DP=52;FAO=6;FDP=52;FR=.;FRO=46;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=31;FSRR=15;FWDB=0.0121229;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.384;QD=2.42302;RBI=0.0408525;REFB=-0.00322228;REVB=-0.0390123;RO=45;SAF=5;SAR=1;SRF=31;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.220351;STB=0.688932;STBP=0.476;TYPE=snp;VARB=0.0197737;OID=.;OPOS=106866869;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:31:52:52:45:46:6:6:0.115385:1:5:31:14:1:5:31:15
chr14	106877390	.	C	G	1340.23	PASS	AF=0.608911;AO=121;DP=205;FAO=123;FDP=202;FR=.;FRO=79;FSAF=70;FSAR=53;FSRF=52;FSRR=27;FWDB=0.00615564;FXX=0.0146334;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.315;QD=26.5392;RBI=0.0200695;REFB=-0.00566185;REVB=0.0191022;RO=78;SAF=69;SAR=52;SRF=51;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0624661;STB=0.53588;STBP=0.237;TYPE=snp;VARB=0.00354014;OID=.;OPOS=106877390;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:205:202:78:79:121:123:0.608911:52:69:51:27:53:70:52:27
chr14	106877445	.	C	T	1492.56	PASS	AF=0.61086;AO=133;DP=220;FAO=135;FDP=221;FR=.;FRO=86;FSAF=76;FSAR=59;FSRF=58;FSRR=28;FWDB=-0.00534838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.2929;QD=27.0147;RBI=0.0169568;REFB=-0.0223737;REVB=-0.0160912;RO=84;SAF=74;SAR=59;SRF=57;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0897892;STB=0.544559;STBP=0.115;TYPE=snp;VARB=0.0158828;OID=.;OPOS=106877445;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:220:221:84:86:133:135:0.61086:59:74:57:27:59:76:58:28
chr14	106877447	.	A	ATGATCT	1418.2	PASS	AF=0.6;AO=126;DP=218;FAO=129;FDP=215;FR=.;FRO=86;FSAF=73;FSAR=56;FSRF=57;FSRR=29;FWDB=0.0167831;FXX=0.0315301;HRUN=0;LEN=6;MLLD=270.999;QD=26.3851;RBI=0.0339645;REFB=-0.0165365;REVB=0.0295282;RO=84;SAF=72;SAR=54;SRF=54;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0544011;STB=0.539853;STBP=0.173;TYPE=ins;VARB=0.0108106;OID=.;OPOS=106877448;OREF=-;OALT=TGATCT;OMAPALT=ATGATCT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.6:126:218:129:215:86:73:56:57:29:99:84:72:54:54:30
chr14	106877519	.	A	G	1106.64	PASS	AF=0.639456;AO=94;DP=147;FAO=94;FDP=147;FR=.;FRO=53;FSAF=51;FSAR=43;FSRF=31;FSRR=22;FWDB=-0.00444683;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.798;QD=30.1125;RBI=0.00462063;REFB=-0.00719036;REVB=-0.00125536;RO=52;SAF=51;SAR=43;SRF=31;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0357641;STB=0.515418;STBP=0.619;TYPE=snp;VARB=0.00463319;OID=.;OPOS=106877519;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:147:147:52:53:94:94:0.639456:43:51:31:21:43:51:31:22
chr14	106877535	.	C	G	204.37	PASS	AF=0.27619;AO=29;DP=105;FAO=29;FDP=105;FR=.;FRO=76;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=44;FSRR=32;FWDB=0.0001753;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=92.3178;QD=7.78566;RBI=0.0019945;REFB=-0.0317395;REVB=-0.00198679;RO=75;SAF=16;SAR=13;SRF=43;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0265561;STB=0.519986;STBP=0.796;TYPE=snp;VARB=0.0510045;OID=.;OPOS=106877535;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:105:75:76:29:29:0.27619:13:16:43:32:13:16:44:32
chr14	106877551	.	A	C	224.61	PASS	AF=0.492308;AO=29;DP=61;FAO=32;FDP=65;FR=.;FRO=33;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=0.0179924;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=46.9873;QD=13.8224;RBI=0.03871;REFB=-0.099324;REVB=0.0342745;RO=30;SAF=13;SAR=16;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107321;STB=0.554137;STBP=0.423;TYPE=snp;VARB=0.0936681;OID=.;OPOS=106877551;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:65:30:33:29:32:0.492308:16:13:17:13:17:15:19:14
chr14	106877555	.	C	T	58.0	PASS	AF=0.166667;AO=10;DP=58;FAO=10;FDP=60;FR=.;FRO=50;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=29;FSRR=21;FWDB=0.00734791;FXX=0.0322529;HRUN=5;LEN=1;MLLD=110.176;QD=3.86674;RBI=0.0518641;REFB=-0.0247422;REVB=-0.0513409;RO=45;SAF=2;SAR=8;SRF=27;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.480665;STB=0.80985;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.0662345;OID=.;OPOS=106877555;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:58:58:60:45:50:10:10:0.166667:8:2:27:18:8:2:29:21
chr14	106877556	.	C	G	216.73	PASS	AF=0.438596;AO=24;DP=57;FAO=25;FDP=57;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=-0.000158925;FXX=0.0338926;HRUN=5;LEN=1;MLLD=157.622;QD=15.2092;RBI=0.0132901;REFB=-0.0389703;REVB=-0.0132892;RO=32;SAF=14;SAR=10;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176723;STB=0.585706;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=0.0316494;OID=.;OPOS=106877556;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:32:32:24:25:0.438596:10:14:13:19:11:14:13:19
chr14	106877618	.	G	C	109.25	PASS	AF=0.27451;AO=14;DP=51;FAO=14;FDP=51;FR=.;FRO=37;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=-0.0142843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.5327;QD=8.56842;RBI=0.0143998;REFB=-0.00127506;REVB=0.00182027;RO=36;SAF=9;SAR=5;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.264727;STB=0.651595;STBP=0.209;TYPE=snp;VARB=0.00333847;OID=.;OPOS=106877618;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:36:37:14:14:0.27451:5:9:15:21:5:9:16:21
chr14	106877637	.	A	G	262.41	PASS	AF=0.428571;AO=30;DP=70;FAO=30;FDP=70;FR=.;FRO=40;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=-0.024145;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.6;QD=14.9948;RBI=0.0270783;REFB=-0.00160017;REVB=0.0122578;RO=40;SAF=14;SAR=16;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00843808;STB=0.504777;STBP=0.969;TYPE=snp;VARB=0.00136287;OID=.;OPOS=106877637;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:40:40:30:30:0.428571:16:14:19:21:16:14:19:21
chr14	106877646	.	T	C	195.86	PASS	AF=0.288889;AO=26;DP=90;FAO=26;FDP=90;FR=.;FRO=64;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=30;FSRR=34;FWDB=-0.00236405;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.519;QD=8.70499;RBI=0.0243405;REFB=-0.0149232;REVB=-0.0242255;RO=63;SAF=11;SAR=15;SRF=29;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0450898;STB=0.532903;STBP=0.685;TYPE=snp;VARB=0.0299305;OID=.;OPOS=106877646;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:63:64:26:26:0.288889:15:11:29:34:15:11:30:34
chr14	106877700	.	G	T	1358.08	PASS	AF=0.653631;AO=117;DP=180;FAO=117;FDP=179;FR=.;FRO=62;FSAF=54;FSAR=63;FSRF=30;FSRR=32;FWDB=0.0133377;FXX=0.00555525;HRUN=2;LEN=1;MLLD=221.455;QD=30.3482;RBI=0.0142077;REFB=-0.0116176;REVB=-0.00489531;RO=62;SAF=54;SAR=63;SRF=30;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.014438;STB=0.507771;STBP=0.781;TYPE=snp;VARB=0.00635685;OID=.;OPOS=106877700;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:180:179:62:62:117:117:0.653631:63:54:30:32:63:54:30:32
chr14	106877753	.	A	G	475.19	PASS	AF=0.292793;AO=65;DP=216;FAO=65;FDP=222;FR=.;FRO=157;FSAF=29;FSAR=36;FSRF=69;FSRR=88;FWDB=-0.00734834;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.1434;QD=8.56205;RBI=0.0397407;REFB=-0.00559375;REVB=-0.0390555;RO=151;SAF=29;SAR=36;SRF=67;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00297376;STB=0.504771;STBP=0.933;TYPE=snp;VARB=0.0141595;OID=.;OPOS=106877753;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:216:222:151:157:65:65:0.292793:36:29:67:84:36:29:69:88
chr14	106877796	.	G	C	392.78	PASS	AF=0.315152;AO=52;DP=165;FAO=52;FDP=165;FR=.;FRO=113;FSAF=21;FSAR=31;FSRF=36;FSRR=77;FWDB=-0.0124848;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.7451;QD=9.52191;RBI=0.0128648;REFB=0.0252939;REVB=0.00310377;RO=110;SAF=21;SAR=31;SRF=34;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119216;STB=0.562059;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=-0.0377758;OID=.;OPOS=106877796;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:165:165:110:113:52:52:0.315152:31:21:34:76:31:21:36:77
chr14	106877836	.	CC	TA	241.21	PASS	AF=0.3125;AO=30;DP=97;FAO=30;FDP=96;FR=.;FRO=66;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=23;FSRR=43;FWDB=0.0058139;FXX=0.0103082;HRUN=2;LEN=2;MLLD=206.046;QD=10.0503;RBI=0.0109372;REFB=0.000754562;REVB=0.0092639;RO=66;SAF=9;SAR=21;SRF=23;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.06536;STB=0.538435;STBP=0.64;TYPE=mnp;VARB=-0.00146871;OID=.;OPOS=106877836;OREF=CC;OALT=TA;OMAPALT=TA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:96:66:66:30:30:0.3125:21:9:23:43:21:9:23:43
chr14	106878020	.	C	T	48.32	PASS	AF=0.156863;AO=8;DP=51;FAO=8;FDP=51;FR=.;FRO=43;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=27;FSRR=16;FWDB=-0.0299941;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.868;QD=3.79003;RBI=0.0319583;REFB=-0.00163525;REVB=-0.0110312;RO=43;SAF=1;SAR=7;SRF=27;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.581123;STB=0.894067;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.0160491;OID=.;OPOS=106878020;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:48:51:51:43:43:8:8:0.156863:7:1:27:16:7:1:27:16
chr14	106878038	.	G	A	48.72	PASS	AF=0.16;AO=8;DP=50;FAO=8;FDP=50;FR=.;FRO=42;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=26;FSRR=16;FWDB=0.0172066;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.24;QD=3.89779;RBI=0.018664;REFB=-0.00122911;REVB=0.00723035;RO=41;SAF=1;SAR=7;SRF=25;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.570271;STB=0.890593;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.00862499;OID=.;OPOS=106878038;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:48:50:50:41:42:8:8:0.16:7:1:25:16:7:1:26:16
chr14	106878056	.	T	G	344.05	PASS	AF=0.659091;AO=29;DP=44;FAO=29;FDP=44;FR=.;FRO=15;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=0.00632963;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=233.734;QD=31.2777;RBI=0.024068;REFB=-0.016885;REVB=0.0232208;RO=15;SAF=12;SAR=17;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157264;STB=0.586147;STBP=0.118;TYPE=snp;VARB=0.0075584;OID=.;OPOS=106878056;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:15:15:29:29:0.659091:17:12:10:5:17:12:10:5
chr14	106878067	.	T	G	360.26	PASS	AF=0.666667;AO=30;DP=44;FAO=30;FDP=45;FR=.;FRO=15;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=0.00486247;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.89;QD=32.0232;RBI=0.00621777;REFB=-0.0344368;REVB=-0.00387518;RO=14;SAF=12;SAR=18;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142591;STB=0.589226;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=0.00630762;OID=.;OPOS=106878067;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:45:14:15:30:30:0.666667:18:12:9:5:18:12:10:5
chr14	106878071	.	A	G	387.08	PASS	AF=0.72093;AO=28;DP=41;FAO=31;FDP=43;FR=.;FRO=12;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.0184267;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.123;QD=36.0077;RBI=0.0213465;REFB=-0.0367129;REVB=0.0107762;RO=13;SAF=13;SAR=15;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0873854;STB=0.546252;STBP=0.373;TYPE=snp;VARB=0.00579639;OID=.;OPOS=106878071;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:41:43:13:12:28:31:0.72093:15:13:8:5:18:13:7:5
chr14	106922272	.	CATT	C	79.27	PASS	AF=0.22449;AO=11;DP=48;FAO=11;FDP=49;FR=.;FRO=38;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=0.00986792;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=3;MLLD=225.362;QD=6.47084;RBI=0.0124291;REFB=-0.000240982;REVB=-0.00755696;RO=35;SAF=7;SAR=4;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116411;STB=0.567442;STBP=0.679;TYPE=del;VARB=0.000570417;OID=.;OPOS=106922273;OREF=ATT;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.22449:11:48:11:49:38:7:4:21:17:79:35:7:4:19:16
chr14	106926200	.	G	C	184.71	PASS	AF=0.25;AO=28;DP=112;FAO=28;FDP=112;FR=.;FRO=84;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=43;FSRR=41;FWDB=0.0343156;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.6579;QD=6.59682;RBI=0.0466149;REFB=-0.0207658;REVB=-0.0315498;RO=82;SAF=14;SAR=14;SRF=41;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508922;STBP=0.929;TYPE=snp;VARB=0.0358657;OID=.;OPOS=106926200;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:112:82:84:28:28:0.25:14:14:41:41:14:14:43:41
chr14	106926223	.	T	C	328.18	PASS	AF=0.325581;AO=42;DP=129;FAO=42;FDP=129;FR=.;FRO=87;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=43;FSRR=44;FWDB=-0.000858826;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.889;QD=10.1762;RBI=0.014282;REFB=-0.00988565;REVB=-0.0142561;RO=87;SAF=21;SAR=21;SRF=43;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00668845;STB=0.503874;STBP=0.967;TYPE=snp;VARB=0.0275423;OID=.;OPOS=106926223;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:129:129:87:87:42:42:0.325581:21:21:43:44:21:21:43:44
chr14	106926287	.	G	A	339.2	PASS	AF=0.328244;AO=43;DP=131;FAO=43;FDP=131;FR=.;FRO=88;FSAF=14;FSAR=29;FSRF=44;FSRR=44;FWDB=-0.022465;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.815;QD=10.3574;RBI=0.022484;REFB=-0.00615301;REVB=-0.000924654;RO=85;SAF=14;SAR=29;SRF=42;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.201975;STB=0.621983;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=0.012736;OID=.;OPOS=106926287;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:131:131:85:88:43:43:0.328244:29:14:42:43:29:14:44:44
chr14	106926311	.	T	G	251.32	PASS	AF=0.286885;AO=35;DP=122;FAO=35;FDP=122;FR=.;FRO=87;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=41;FSRR=46;FWDB=-0.0107303;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.907;QD=8.23994;RBI=0.0107312;REFB=-0.015685;REVB=-0.000139191;RO=87;SAF=16;SAR=19;SRF=41;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0171364;STB=0.510121;STBP=0.904;TYPE=snp;VARB=0.0390833;OID=.;OPOS=106926311;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:122:122:87:87:35:35:0.286885:19:16:41:46:19:16:41:46
chr14	106926388	.	T	C	108.76	PASS	AF=0.262295;AO=16;DP=60;FAO=16;FDP=61;FR=.;FRO=45;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=26;FWDB=-0.0108757;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.762;QD=7.13171;RBI=0.0199925;REFB=-0.00403589;REVB=0.0167755;RO=44;SAF=8;SAR=8;SRF=18;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109589;STB=0.557306;STBP=0.607;TYPE=snp;VARB=0.0102016;OID=.;OPOS=106926388;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:61:44:45:16:16:0.262295:8:8:18:26:8:8:19:26
chr14	106926649	.	C	A	95.18	PASS	AF=0.352941;AO=12;DP=34;FAO=12;FDP=34;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=0.072635;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.238;QD=11.1972;RBI=0.0729333;REFB=-0.00129241;REVB=-0.00658968;RO=22;SAF=5;SAR=7;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0599784;STB=0.535656;STBP=0.799;TYPE=snp;VARB=0.0106397;OID=.;OPOS=106926649;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:34:34:22:22:12:12:0.352941:7:5:8:14:7:5:8:14
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chr14	107048702	.	G	A	184.39	PASS	AF=0.328767;AO=24;DP=73;FAO=24;FDP=73;FR=.;FRO=49;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=22;FSRR=27;FWDB=-0.0074014;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.308;QD=10.1034;RBI=0.0266631;REFB=-0.00701896;REVB=-0.0256152;RO=49;SAF=17;SAR=7;SRF=22;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.304744;STB=0.679048;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.0200729;OID=.;OPOS=107048702;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:49:49:24:24:0.328767:7:17:22:27:7:17:22:27
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chr14	107048767	.	G	T	165.24	PASS	AF=0.237624;AO=24;DP=101;FAO=24;FDP=101;FR=.;FRO=77;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=41;FSRR=36;FWDB=-0.00874294;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.586;QD=6.54433;RBI=0.0132073;REFB=-0.00636414;REVB=0.00989913;RO=77;SAF=14;SAR=10;SRF=41;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0641782;STB=0.53933;STBP=0.714;TYPE=snp;VARB=0.0234461;OID=.;OPOS=107048767;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:101:77:77:24:24:0.237624:10:14:41:36:10:14:41:36
chr14	107048804	.	G	A	244.03	PASS	AF=0.31;AO=32;DP=101;FAO=31;FDP=100;FR=.;FRO=69;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=31;FSRR=38;FWDB=-0.0164498;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.397;QD=9.76128;RBI=0.01645;REFB=-0.0164137;REVB=-7.76249e-05;RO=69;SAF=20;SAR=12;SRF=31;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.205856;STB=0.61283;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.0233931;OID=.;OPOS=107048804;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:100:69:69:32:31:0.31:12:20:31:38:12:19:31:38
chr14	107048885	.	C	T	59.46	PASS	AF=0.533333;AO=8;DP=15;FAO=8;FDP=15;FR=.;FRO=7;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0422987;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=62.2679;QD=15.8559;RBI=0.0625607;REFB=-0.135105;REVB=-0.046094;RO=7;SAF=6;SAR=2;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168179;STB=0.599733;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.0396924;OID=.;OPOS=107048885;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:15:15:7:7:8:8:0.533333:2:6:4:3:2:6:4:3
chr14	107078567	.	T	C	243.41	PASS	AF=0.4375;AO=28;DP=64;FAO=28;FDP=64;FR=.;FRO=36;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=21;FSRR=15;FWDB=-0.000758481;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.221;QD=15.2132;RBI=0.0147624;REFB=-0.0192416;REVB=0.0147429;RO=36;SAF=18;SAR=10;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.062951;STB=0.535688;STBP=0.641;TYPE=snp;VARB=0.0277583;OID=.;OPOS=107078567;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:36:36:28:28:0.4375:10:18:21:15:10:18:21:15
chr14	107078790	.	C	T	1455.34	PASS	AF=0.969072;AO=94;DP=97;FAO=94;FDP=97;FR=.;FRO=3;FSAF=54;FSAR=40;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0254994;FXX=0.010203;HRUN=3;LEN=1;MLLD=201.073;QD=60.014;RBI=0.0267937;REFB=-0.087795;REVB=-0.00822689;RO=2;SAF=54;SAR=40;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0030062;STB=0.502918;STBP=0.791;TYPE=snp;VARB=0.000335722;OID=.;OPOS=107078790;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:97:97:2:3:94:94:0.969072:40:54:1:1:40:54:2:1
chr14	107083424	.	T	C	521.58	PASS	AF=0.32;AO=58;DP=222;FAO=72;FDP=225;FR=.;FRO=153;FSAF=29;FSAR=43;FSRF=70;FSRR=83;FWDB=0.00477724;FXX=0.0217382;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.9984;QD=9.27251;RBI=0.0103243;REFB=-0.0130749;REVB=0.00915251;RO=125;SAF=27;SAR=31;SRF=56;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0208136;STB=0.538101;STBP=0.439;TYPE=snp;VARB=0.032447;OID=.;OPOS=107083424;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:222:225:125:153:58:72:0.32:31:27:56:69:43:29:70:83
chr14	107083633	.	T	C	779.34	PASS	AF=0.605042;AO=71;DP=118;FAO=72;FDP=119;FR=.;FRO=47;FSAF=40;FSAR=32;FSRF=23;FSRR=24;FWDB=0.00125433;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.2317;QD=26.1962;RBI=0.0188483;REFB=-0.0176908;REVB=-0.0188065;RO=46;SAF=40;SAR=31;SRF=22;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0620614;STB=0.526308;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.00806069;OID=.;OPOS=107083633;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:118:119:46:47:71:72:0.605042:31:40:22:24:32:40:23:24
chr14	107095326	.	C	T	1182.31	PASS	AF=0.975309;AO=79;DP=81;FAO=79;FDP=81;FR=.;FRO=2;FSAF=35;FSAR=44;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0385987;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.252;QD=58.3857;RBI=0.0400204;REFB=-0.161514;REVB=-0.0105723;RO=2;SAF=35;SAR=44;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0262805;STB=0.513885;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.000985549;OID=.;OPOS=107095326;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:81:81:2:2:79:79:0.975309:44:35:2:0:44:35:2:0
chr14	107113851	.	C	T	251.78	PASS	AF=0.466667;AO=28;DP=62;FAO=28;FDP=60;FR=.;FRO=32;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=12;FWDB=-0.000444745;FXX=0.0322529;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.019;QD=16.7854;RBI=0.0106241;REFB=-0.0249955;REVB=0.0106148;RO=34;SAF=13;SAR=15;SRF=22;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176402;STB=0.585047;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=0.0245413;OID=.;OPOS=107113851;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:60:34:32:28:28:0.466667:15:13:22:12:15:13:20:12
chr14	107114193	.	A	G	197.99	PASS	AF=0.454545;AO=20;DP=44;FAO=20;FDP=44;FR=.;FRO=24;FSAF=16;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=0.0451157;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.551;QD=17.9992;RBI=0.0465521;REFB=-0.0115529;REVB=0.0114747;RO=24;SAF=16;SAR=4;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.338911;STB=0.695436;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.0303403;OID=.;OPOS=107114193;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:24:24:20:20:0.454545:4:16:12:12:4:16:12:12
chr14	107131410	.	A	G	78.74	PASS	AF=0.47619;AO=8;DP=20;FAO=10;FDP=21;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.0383045;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.1568;QD=14.9984;RBI=0.0586824;REFB=0.0190484;REVB=0.0444565;RO=11;SAF=5;SAR=3;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.249111;STB=0.571288;STBP=0.546;TYPE=snp;VARB=-0.00847912;OID=.;OPOS=107131410;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:20:21:11:11:8:10:0.47619:3:5:4:7:5:5:4:7
chr14	107170005	.	T	C	356.13	PASS	AF=0.553846;AO=36;DP=65;FAO=36;FDP=65;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=0.000287279;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=166.064;QD=21.9157;RBI=0.0123715;REFB=-0.0158854;REVB=-0.0123682;RO=29;SAF=13;SAR=23;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0744519;STB=0.541153;STBP=0.496;TYPE=snp;VARB=0.01409;OID=.;OPOS=107170005;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:29:29:36:36:0.553846:23:13:13:16:23:13:13:16
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chr14	107170077	.	C	T	201.49	PASS	AF=0.373134;AO=25;DP=67;FAO=25;FDP=67;FR=.;FRO=42;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=24;FWDB=0.0335346;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.8156;QD=12.0292;RBI=0.0435549;REFB=-0.0175124;REVB=-0.0277932;RO=41;SAF=11;SAR=14;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00106759;STB=0.507276;STBP=0.931;TYPE=snp;VARB=0.0287231;OID=.;OPOS=107170077;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:41:42:25:25:0.373134:14:11:18:23:14:11:18:24
chr14	107170219	.	C	G	77.93	PASS	AF=0.454545;AO=10;DP=22;FAO=10;FDP=22;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.00492855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.114;QD=14.1699;RBI=0.00552;REFB=-0.000821242;REVB=-0.00248592;RO=12;SAF=6;SAR=4;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0943118;STB=0.555443;STBP=0.618;TYPE=snp;VARB=0.00123786;OID=.;OPOS=107170219;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:22:22:12:12:10:10:0.454545:4:6:6:6:4:6:6:6
chr14	107178832	.	A	G	1883.59	PASS	AF=0.991935;AO=123;DP=125;FAO=123;FDP=124;FR=.;FRO=1;FSAF=57;FSAR=66;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0208041;FXX=0.00799936;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.2606;QD=60.7609;RBI=0.0693172;REFB=-0.0173674;REVB=-0.0661216;RO=1;SAF=57;SAR=66;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00826211;STB=0.504347;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=-3.7231e-05;OID=.;OPOS=107178832;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:125:124:1:1:123:123:0.991935:66:57:1:0:66:57:1:0
chr14	107178965	.	A	C	409.93	PASS	AF=0.47191;AO=42;DP=89;FAO=42;FDP=89;FR=.;FRO=47;FSAF=11;FSAR=31;FSRF=23;FSRR=24;FWDB=0.0116837;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.821;QD=18.4238;RBI=0.0121859;REFB=0.00572149;REVB=0.00346242;RO=47;SAF=11;SAR=31;SRF=23;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.241005;STB=0.635254;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=-0.00395271;OID=.;OPOS=107178965;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:47:47:42:42:0.47191:31:11:23:24:31:11:23:24
chr14	107179268	.	A	G	270.53	PASS	AF=0.455882;AO=29;DP=66;FAO=31;FDP=68;FR=.;FRO=37;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=-0.00932512;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.694;QD=15.9135;RBI=0.0132345;REFB=-0.0109517;REVB=-0.00939116;RO=37;SAF=16;SAR=13;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0111888;STB=0.513299;STBP=0.863;TYPE=snp;VARB=0.0123973;OID=.;OPOS=107179268;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:68:37:37:29:31:0.455882:13:16:20:17:15:16:20:17
chr14	107211211	.	G	A	59.81	PASS	AF=0.533333;AO=8;DP=14;FAO=8;FDP=15;FR=.;FRO=7;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=0.0457265;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.593;QD=15.949;RBI=0.0683776;REFB=0.00234439;REVB=0.0508389;RO=5;SAF=7;SAR=1;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.233315;STB=0.518471;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000161809;OID=.;OPOS=107211211;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:14:15:5:7:8:8:0.533333:1:7:5:0:1:7:6:1
chr14	107282846	.	G	A	36.41	PASS	AF=0.0769231;AO=12;DP=156;FAO=12;FDP=156;FR=.;FRO=144;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=70;FSRR=74;FWDB=-0.0104067;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=249.472;QD=0.93368;RBI=0.0144501;REFB=-0.00235749;REVB=-0.0100252;RO=141;SAF=7;SAR=5;SRF=70;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0972557;STB=0.589404;STBP=0.564;TYPE=snp;VARB=0.0285841;OID=.;OPOS=107282846;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:156:156:141:144:12:12:0.0769231:5:7:70:71:5:7:70:74
chr14	107282852	.	T	C	51.38	PASS	AF=0.0914634;AO=15;DP=163;FAO=15;FDP=164;FR=.;FRO=149;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=74;FSRR=75;FWDB=-0.0185118;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.751;QD=1.25324;RBI=0.0326618;REFB=-0.00193491;REVB=-0.0269092;RO=148;SAF=8;SAR=7;SRF=73;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0470047;STB=0.533289;STBP=0.821;TYPE=snp;VARB=0.0280678;OID=.;OPOS=107282852;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:51:163:164:148:149:15:15:0.0914634:7:8:73:75:7:8:74:75
chr14	107282859	.	G	A	49.24	PASS	AF=0.0882353;AO=15;DP=170;FAO=15;FDP=170;FR=.;FRO=155;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=79;FSRR=76;FWDB=0.0233537;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.1371;QD=1.15848;RBI=0.0253849;REFB=-0.00595017;REVB=-0.00994978;RO=155;SAF=8;SAR=7;SRF=79;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0275148;STB=0.521574;STBP=0.849;TYPE=snp;VARB=0.0663051;OID=.;OPOS=107282859;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:49:170:170:155:155:15:15:0.0882353:7:8:79:76:7:8:79:76
chr14	107282872	.	T	A	45.58	PASS	AF=0.0819672;AO=15;DP=184;FAO=15;FDP=183;FR=.;FRO=168;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=89;FSRR=79;FWDB=0.0011653;FXX=0.00543449;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.088;QD=0.996301;RBI=0.0123492;REFB=-0.0019336;REVB=-0.0122941;RO=168;SAF=8;SAR=7;SRF=89;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00409097;STB=0.503287;STBP=0.991;TYPE=snp;VARB=0.0241069;OID=.;OPOS=107282872;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:184:183:168:168:15:15:0.0819672:7:8:89:79:7:8:89:79
chr14	107282909	.	T	C	52.33	PASS	AF=0.0893855;AO=16;DP=178;FAO=16;FDP=179;FR=.;FRO=163;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=90;FSRR=73;FWDB=-0.00932616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.98;QD=1.16949;RBI=0.0134539;REFB=-0.000356098;REVB=-0.00969697;RO=162;SAF=8;SAR=8;SRF=89;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0579056;STB=0.547427;STBP=0.703;TYPE=snp;VARB=0.0124347;OID=.;OPOS=107282909;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:178:179:162:163:16:16:0.0893855:8:8:89:73:8:8:90:73
chr14	107282926	.	A	T	40.74	PASS	AF=0.0807453;AO=13;DP=161;FAO=13;FDP=161;FR=.;FRO=148;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=78;FSRR=70;FWDB=-0.000324052;FXX=0.00617246;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.492;QD=1.01212;RBI=0.0168293;REFB=-0.00138198;REVB=-0.0168262;RO=147;SAF=7;SAR=6;SRF=79;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00119223;STB=0.51054;STBP=0.957;TYPE=snp;VARB=0.0356668;OID=.;OPOS=107282926;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:40:161:161:147:148:13:13:0.0807453:6:7:79:68:6:7:78:70
chr14	107282935	.	A	T	37.68	PASS	AF=0.0794702;AO=12;DP=151;FAO=12;FDP=151;FR=.;FRO=139;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=74;FSRR=65;FWDB=-0.0381295;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.2467;QD=0.998115;RBI=0.0381398;REFB=1.49082e-05;REVB=-0.000886327;RO=138;SAF=6;SAR=6;SRF=74;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0408146;STB=0.529752;STBP=0.858;TYPE=snp;VARB=-0.002468;OID=.;OPOS=107282935;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:151:151:138:139:12:12:0.0794702:6:6:74:64:6:6:74:65
chr14	107282973	.	G	C	36.18	PASS	AF=0.0967742;AO=9;DP=92;FAO=9;FDP=93;FR=.;FRO=84;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=49;FSRR=35;FWDB=-0.0910283;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.826;QD=1.55592;RBI=0.0910286;REFB=-0.0043658;REVB=0.00022489;RO=83;SAF=4;SAR=5;SRF=49;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168907;STB=0.623265;STBP=0.462;TYPE=snp;VARB=0.0188338;OID=.;OPOS=107282973;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:92:93:83:84:9:9:0.0967742:5:4:49:34:5:4:49:35
chr14	107283076	.	G	A	34.41	PASS	AF=0.1875;AO=6;DP=32;FAO=6;FDP=32;FR=.;FRO=26;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=-0.0145443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.574;QD=4.30145;RBI=0.0184385;REFB=-0.00711144;REVB=-0.0113333;RO=25;SAF=4;SAR=2;SRF=17;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0179101;STB=0.511589;STBP=0.961;TYPE=snp;VARB=0.0326809;OID=.;OPOS=107283076;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:32:32:25:26:6:6:0.1875:2:4:17:8:2:4:17:9
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chr14	107283160	.	C	T	195.62	PASS	AF=0.282609;AO=26;DP=92;FAO=26;FDP=92;FR=.;FRO=66;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=39;FSRR=27;FWDB=0.00803839;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=182.013;QD=8.50517;RBI=0.0182831;REFB=-0.0079737;REVB=-0.0164212;RO=66;SAF=15;SAR=11;SRF=39;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0173073;STB=0.510301;STBP=0.917;TYPE=snp;VARB=0.0311371;OID=.;OPOS=107283160;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:66:66:26:26:0.282609:11:15:39:27:11:15:39:27
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chr15	20476906	.	T	C	32.68	PASS	AF=0.0841121;AO=9;DP=106;FAO=9;FDP=107;FR=.;FRO=98;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=61;FSRR=37;FWDB=-0.0102589;FXX=0.0092584;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.785;QD=1.22181;RBI=0.0134323;REFB=0.000132691;REVB=0.00867074;RO=94;SAF=5;SAR=4;SRF=57;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0593777;STB=0.562764;STBP=0.706;TYPE=snp;VARB=-0.0022783;OID=.;OPOS=20476906;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:32:106:107:94:98:9:9:0.0841121:4:5:57:37:4:5:61:37
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chr15	20588685	.	A	G	34.61	PASS	AF=0.102564;AO=8;DP=74;FAO=8;FDP=78;FR=.;FRO=70;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=26;FSRR=44;FWDB=-0.00705109;FXX=0.0126566;HRUN=5;LEN=1;MLLD=115.62;QD=1.77495;RBI=0.00926621;REFB=0.00128512;REVB=-0.00601205;RO=65;SAF=4;SAR=4;SRF=23;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.175784;STB=0.615112;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=-0.0212997;OID=.;OPOS=20588685;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:74:78:65:70:8:8:0.102564:4:4:23:42:4:4:26:44
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chr15	20645827	.	A	G	253.9	PASS	AF=0.510638;AO=24;DP=47;FAO=24;FDP=47;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=2;FSRR=21;FWDB=0.0329891;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.9898;QD=21.6082;RBI=0.0332793;REFB=-0.0121759;REVB=0.00438513;RO=23;SAF=8;SAR=16;SRF=2;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.270827;STB=0.64902;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=0.0103184;OID=.;OPOS=20645827;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:23:23:24:24:0.510638:16:8:2:21:16:8:2:21
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chr15	20874897	.	A	G	434.35	PASS	AF=0.25;AO=65;DP=264;FAO=66;FDP=264;FR=.;FRO=198;FSAF=31;FSAR=35;FSRF=97;FSRR=101;FWDB=0.00741161;FXX=0.00377344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.077;QD=6.58099;RBI=0.0230567;REFB=-0.00872433;REVB=-0.021833;RO=198;SAF=31;SAR=34;SRF=97;SRR=101;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0163473;STB=0.515175;STBP=0.733;TYPE=snp;VARB=0.0242035;OID=.;OPOS=20874897;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:264:264:198:198:65:66:0.25:34:31:97:101:35:31:97:101
chr15	20876515	.	A	G	303.51	PASS	AF=0.254237;AO=45;DP=177;FAO=45;FDP=177;FR=.;FRO=132;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=65;FSRR=67;FWDB=0.0222122;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.08;QD=6.85908;RBI=0.0231652;REFB=-0.00879272;REVB=0.00657613;RO=132;SAF=22;SAR=23;SRF=65;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00440692;STB=0.502636;STBP=0.975;TYPE=snp;VARB=0.019994;OID=.;OPOS=20876515;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:177:177:132:132:45:45:0.254237:23:22:65:67:23:22:65:67
chr15	22368862	.	G	A	229.35	PASS	AF=0.212291;AO=38;DP=179;FAO=38;FDP=179;FR=.;FRO=141;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=70;FSRR=71;FWDB=0.0217433;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.3278;QD=5.12516;RBI=0.0218565;REFB=0.000329725;REVB=-0.00222146;RO=141;SAF=17;SAR=21;SRF=70;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0627415;STB=0.538759;STBP=0.575;TYPE=snp;VARB=-0.000858862;OID=.;OPOS=22368862;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:179:179:141:141:38:38:0.212291:21:17:70:71:21:17:70:71
chr15	22368905	.	G	A	139.74	PASS	AF=0.213592;AO=22;DP=103;FAO=22;FDP=103;FR=.;FRO=81;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=35;FSRR=46;FWDB=-0.00492556;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.683;QD=5.42693;RBI=0.00536381;REFB=-0.00200308;REVB=-0.00212353;RO=81;SAF=14;SAR=8;SRF=35;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.254497;STB=0.658395;STBP=0.114;TYPE=snp;VARB=0.00847495;OID=.;OPOS=22368905;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:103:81:81:22:22:0.213592:8:14:35:46:8:14:35:46
chr15	22369175	.	CT	GG	162.2	PASS	AF=0.37037;AO=20;DP=54;FAO=20;FDP=54;FR=.;FRO=34;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=21;FSRR=13;FWDB=-0.0193313;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=280.843;QD=12.0148;RBI=0.0193487;REFB=-0.0152914;REVB=-0.000818715;RO=34;SAF=15;SAR=5;SRF=21;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170423;STB=0.599893;STBP=0.308;TYPE=mnp;VARB=0.0267589;OID=.;OPOS=22369175;OREF=CT;OALT=GG;OMAPALT=GG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:34:34:20:20:0.37037:5:15:21:13:5:15:21:13
chr15	22369248	.	T	C	538.53	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00770523;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.708;QD=59.8361;RBI=0.00857165;REFB=0;REVB=0.00375535;RO=0;SAF=15;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.50692e-05;OID=.;OPOS=22369248;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:21:15:0:0:21:15:0:0
chr15	22369279	.	C	G	131.24	PASS	AF=0.271429;AO=19;DP=70;FAO=19;FDP=70;FR=.;FRO=51;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=23;FSRR=28;FWDB=0.0129262;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.657;QD=7.49953;RBI=0.014447;REFB=-0.00406539;REVB=-0.00645194;RO=51;SAF=11;SAR=8;SRF=23;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153571;STB=0.592717;STBP=0.381;TYPE=snp;VARB=0.0107676;OID=.;OPOS=22369279;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:51:51:19:19:0.271429:8:11:23:28:8:11:23:28
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chr15	22383066	.	A	G	1044.23	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00957462;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.9583;QD=59.6705;RBI=0.0198685;REFB=0;REVB=0.0174093;RO=0;SAF=47;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.79556e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000159119;OID=.;OPOS=22383066;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:23:47:0:0:23:47:0:0
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chr15	22413940	.	T	C	596.66	PASS	AF=0.337838;AO=75;DP=222;FAO=75;FDP=222;FR=.;FRO=147;FSAF=38;FSAR=37;FSRF=85;FSRR=62;FWDB=0.00351866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.728;QD=10.7506;RBI=0.0147835;REFB=-0.0120753;REVB=-0.0143586;RO=146;SAF=38;SAR=37;SRF=85;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0874185;STB=0.547443;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=0.0261396;OID=.;OPOS=22413940;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:222:222:146:147:75:75:0.337838:37:38:85:61:37:38:85:62
chr15	22414190	.	T	C	239.32	PASS	AF=0.307692;AO=32;DP=104;FAO=32;FDP=104;FR=.;FRO=72;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=37;FSRR=35;FWDB=0.000855217;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.181;QD=9.20475;RBI=0.0518621;REFB=0.000688944;REVB=0.0518551;RO=72;SAF=13;SAR=19;SRF=37;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127859;STB=0.575013;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=-0.000512468;OID=.;OPOS=22414190;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:104:72:72:32:32:0.307692:19:13:37:35:19:13:37:35
chr15	22414262	.	C	T	270.83	PASS	AF=0.359551;AO=32;DP=89;FAO=32;FDP=89;FR=.;FRO=57;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=31;FSRR=26;FWDB=-0.014846;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.435;QD=12.172;RBI=0.0149645;REFB=0.00237581;REVB=0.00187906;RO=57;SAF=16;SAR=16;SRF=31;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0487989;STB=0.528072;STBP=0.685;TYPE=snp;VARB=-0.00767191;OID=.;OPOS=22414262;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:57:57:32:32:0.359551:16:16:31:26:16:16:31:26
chr15	22414353	.	A	G	126.69	PASS	AF=0.333333;AO=15;DP=45;FAO=15;FDP=45;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=0.00360075;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.217;QD=11.261;RBI=0.0137927;REFB=-0.00662371;REVB=0.0133144;RO=30;SAF=11;SAR=4;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.437304;STB=0.758288;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.00718733;OID=.;OPOS=22414353;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:30:30:15:15:0.333333:4:11:10:20:4:11:10:20
chr15	22440297	.	A	G	393.3	PASS	AF=0.756757;AO=27;DP=37;FAO=28;FDP=37;FR=.,HEALED;FRO=6;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0150554;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.06;QD=42.5186;RBI=0.0270385;REFB=-0.0545697;REVB=0.0224591;RO=6;SAF=13;SAR=14;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0620295;STB=0.529391;STBP=0.479;TYPE=snp;VARB=0.0162354;OID=.;OPOS=22440297;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:37:37:6:6:27:28:0.756757:14:13:4:2:14:14:4:2
chr15	22440322	.	A	G	229.58	PASS	AF=0.536585;AO=22;DP=41;FAO=22;FDP=41;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=5;FWDB=-0.0124254;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.511;QD=22.3983;RBI=0.0555438;REFB=-0.0211212;REVB=-0.0541362;RO=19;SAF=10;SAR=12;SRF=14;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.230991;STB=0.628709;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=0.0206948;OID=.;OPOS=22440322;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:19:19:22:22:0.536585:12:10:14:5:12:10:14:5
chr15	22440816	.	A	G	516.46	PASS	AF=0.5;AO=53;DP=107;FAO=54;FDP=108;FR=.;FRO=54;FSAF=32;FSAR=22;FSRF=28;FSRR=26;FWDB=0.0131662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.085;QD=19.1283;RBI=0.029232;REFB=-0.0266998;REVB=-0.0260991;RO=53;SAF=31;SAR=22;SRF=28;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0521379;STB=0.537801;STBP=0.461;TYPE=snp;VARB=0.0249242;OID=.;OPOS=22440816;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:108:53:54:53:54:0.5:22:31:28:25:22:32:28:26
chr15	22840279	.	G	T	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148302;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.206;QD=46.848;RBI=0.0148598;REFB=0;REVB=0.000936433;RO=0;SAF=9;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000115644;OID=.;OPOS=22840279;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:6:9:0:0:6:9:0:0
chr15	22873784	.	C	T	785.68	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0029074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.481;QD=64.1369;RBI=0.0387302;REFB=0;REVB=0.0386209;RO=0;SAF=22;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.30731e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000232837;OID=.;OPOS=22873784;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:27:22:0:0:27:22:0:0
chr15	22926229	.	G	A	670.26	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.039255;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.8377;QD=62.3501;RBI=0.0531849;REFB=0;REVB=-0.0358842;RO=0;SAF=29;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.13233e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000512701;OID=.;OPOS=22926229;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:14:29:0:0:14:29:0:0
chr15	22960868	.	G	C	52.86	PASS	AF=0.266667;AO=8;DP=30;FAO=8;FDP=30;FR=.;FRO=22;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.0130457;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.055;QD=7.04773;RBI=0.018835;REFB=-0.00207994;REVB=-0.0135856;RO=22;SAF=2;SAR=6;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.394364;STB=0.749375;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=0.00324926;OID=.;OPOS=22960868;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:30:30:22:22:8:8:0.266667:6:2:13:9:6:2:13:9
chr15	23052632	.	T	C	465.13	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0374435;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.965;QD=58.1412;RBI=0.0391862;REFB=0;REVB=0.0115559;RO=0;SAF=20;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000287456;OID=.;OPOS=23052632;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:12:20:0:0:12:20:0:0
chr15	23059394	.	C	T	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00725876;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=104.846;QD=53.277;RBI=0.0341553;REFB=0;REVB=0.0333751;RO=0;SAF=16;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00029267;OID=.;OPOS=23059394;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:7:16:0:0:7:16:0:0
chr15	23098401	.	C	T	144.59	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0435459;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.969;QD=44.4877;RBI=0.118746;REFB=0;REVB=0.110473;RO=0;SAF=11;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.23983e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00207454;OID=.;OPOS=23098401;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:13:0:0:12:13:1:1:11:0:0:2:11:0:0
chr15	23098449	.	C	T	376.41	PASS	AF=0.769231;AO=30;DP=39;FAO=30;FDP=39;FR=.;FRO=9;FSAF=23;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.00269197;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.389;QD=38.6063;RBI=0.00407805;REFB=-0.03001;REVB=-0.00306329;RO=9;SAF=23;SAR=7;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171403;STB=0.593481;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.0109376;OID=.;OPOS=23098449;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:60:39:39:9:9:30:30:0.769231:7:23:4:5:7:23:4:5
chr15	23158293	.	A	C	219.01	PASS	AF=0.307692;AO=28;DP=90;FAO=28;FDP=91;FR=.;FRO=63;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=31;FSRR=32;FWDB=0.0261639;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.723;QD=9.62691;RBI=0.036059;REFB=-0.00813952;REVB=-0.0248133;RO=62;SAF=19;SAR=9;SRF=31;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.217114;STB=0.633751;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=0.0260632;OID=.;OPOS=23158293;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:91:62:63:28:28:0.307692:9:19:31:31:9:19:31:32
chr15	23158339	.	G	C	878.22	PASS	AF=0.666667;AO=77;DP=113;FAO=78;FDP=117;FR=.;FRO=39;FSAF=35;FSAR=43;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=-0.0294742;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.8767;QD=30.0245;RBI=0.0815621;REFB=-0.0566482;REVB=-0.0760503;RO=36;SAF=35;SAR=42;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0598813;STB=0.530038;STBP=0.362;TYPE=snp;VARB=0.0243806;OID=.;OPOS=23158339;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:117:36:39:77:78:0.666667:42:35:20:16:43:35:21:18
chr15	23261950	.	A	G	306.26	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00668997;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.6386;QD=53.2632;RBI=0.0373413;REFB=0;REVB=-0.0367372;RO=0;SAF=7;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00082114;OID=.;OPOS=23261950;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:16:7:0:0:16:7:0:0
chr15	23326356	.	G	C	170.33	PASS	AF=0.45;AO=18;DP=40;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=4;FWDB=0.00842756;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.205;QD=17.0333;RBI=0.0186024;REFB=-0.005327;REVB=0.0165839;RO=22;SAF=10;SAR=8;SRF=18;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.268161;STB=0.651015;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=0.00403947;OID=.;OPOS=23326356;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:22:22:18:18:0.45:8:10:18:4:8:10:18:4
chr15	23406722	.	C	T	34.83	PASS	AF=0.833333;AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00527417;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=235.477;QD=23.2183;RBI=0.00527417;REFB=-0.0352092;REVB=0;RO=1;SAF=5;SAR=0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0106965;OID=.;OPOS=23406722;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:6:6:1:1:5:5:0.833333:0:5:1:0:0:5:1:0
chr15	23441118	.	T	A	71.0	PASS	AF=0.5625;AO=7;DP=16;FAO=9;FDP=16;FR=.,HEALED;FRO=7;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.00437438;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.556;QD=17.7508;RBI=0.031395;REFB=-0.00313281;REVB=0.0310887;RO=6;SAF=2;SAR=5;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.304739;STB=0.676989;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=0.010752;OID=.;OPOS=23441118;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:16:16:6:7:7:9:0.5625:5:2:4:2:7:2:4:3
chr15	23444020	.	A	T	70.58	PASS	AF=0.5625;AO=9;DP=16;FAO=9;FDP=16;FR=.;FRO=7;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.0393758;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.316;QD=17.6438;RBI=0.0415443;REFB=-0.0341607;REVB=0.0132467;RO=7;SAF=1;SAR=8;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.249071;STB=0.648255;STBP=0.359;TYPE=snp;VARB=0.0388875;OID=.;OPOS=23444020;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:16:16:7:7:9:9:0.5625:8:1:2:5:8:1:2:5
chr15	23686598	.	T	C	109.02	PASS	AF=0.916667;AO=11;DP=12;FAO=11;FDP=12;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0151366;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.8399;QD=36.3391;RBI=0.0151366;REFB=-0.0514604;REVB=0;RO=1;SAF=11;SAR=0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.027186;OID=.;OPOS=23686598;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:12:12:1:1:11:11:0.916667:0:11:1:0:0:11:1:0
chr15	23686633	.	A	G	53.24	PASS	AF=0.583333;AO=6;DP=13;FAO=7;FDP=12;FR=.,HEALED;FRO=5;FSAF=7;FSAR=0;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.055156;FXX=0.076864;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.6138;QD=17.7479;RBI=0.055156;REFB=-0.121113;REVB=0;RO=5;SAF=6;SAR=0;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.111429;OID=.;OPOS=23686633;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:31:13:12:5:5:6:7:0.583333:0:6:5:0:0:7:5:0
chr15	23687214	.	C	G	1121.79	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00250953;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.7489;QD=60.6373;RBI=0.0164812;REFB=0;REVB=-0.016289;RO=0;SAF=39;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.80413e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.82509e-05;OID=.;OPOS=23687214;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:35:39:0:0:35:39:0:0
chr15	23688944	.	A	G	754.32	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142704;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.6694;QD=56.9299;RBI=0.0150381;REFB=0;REVB=0.00474341;RO=0;SAF=33;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.88914e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000146261;OID=.;OPOS=23688944;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:20:33:0:0:20:33:0:0
chr15	23690543	.	T	C	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0241238;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.259;QD=37.4885;RBI=0.045767;REFB=0;REVB=0.038893;RO=0;SAF=6;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.58669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000212641;OID=.;OPOS=23690543;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:2:6:0:0:2:6:0:0
chr15	23889033	.	G	T	86.81	PASS	AF=0.714286;AO=10;DP=14;FAO=10;FDP=14;FR=.;FRO=4;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0416621;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.441;QD=24.8028;RBI=0.0460152;REFB=0.00307545;REVB=-0.0195363;RO=4;SAF=6;SAR=4;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.175933;STB=0.5998;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=-0.002142;OID=.;OPOS=23889033;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:14:14:4:4:10:10:0.714286:4:6:1:3:4:6:1:3
chr15	23889739	.	G	T	1205.34	PASS	AF=0.682759;AO=99;DP=145;FAO=99;FDP=145;FR=.;FRO=46;FSAF=37;FSAR=62;FSRF=24;FSRR=22;FWDB=0.00265252;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=279.388;QD=33.2509;RBI=0.00297517;REFB=-0.00199064;REVB=0.00134751;RO=45;SAF=37;SAR=62;SRF=24;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0964635;STB=0.548901;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=0.000944724;OID=.;OPOS=23889739;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:145:145:45:46:99:99:0.682759:62:37:24:21:62:37:24:22
chr15	24921771	.	G	C	620.88	PASS	AF=0.933333;AO=42;DP=45;FAO=42;FDP=45;FR=.;FRO=3;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0203317;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.1121;QD=55.1896;RBI=0.0327862;REFB=-0.0333469;REVB=-0.0257207;RO=0;SAF=19;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.536568;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.00138682;OID=.;OPOS=24921771;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:45:45:0:3:42:42:0.933333:23:19:0:0:23:19:3:0
chr15	25307562	.	A	G	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0222764;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=315.768;QD=59.4356;RBI=0.0248031;REFB=0;REVB=0.0109065;RO=0;SAF=16;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.1382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.45646e-05;OID=.;OPOS=25307562;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:19:16:0:0:19:16:0:0
chr15	25924539	.	T	C	2858.0	PASS	AF=0.989247;AO=180;DP=181;FAO=184;FDP=186;FR=.;FRO=2;FSAF=111;FSAR=73;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0120343;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.8705;QD=61.4623;RBI=0.0475166;REFB=-0.132602;REVB=0.0459674;RO=1;SAF=109;SAR=71;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00434789;STB=0.501159;STBP=0.769;TYPE=snp;VARB=0.00330783;OID=.;OPOS=25924539;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:181:186:1:2:180:184:0.989247:71:109:1:0:73:111:1:1
chr15	25926179	.	C	T	740.24	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0405985;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.685;QD=56.9416;RBI=0.0407716;REFB=0;REVB=0.00375307;RO=0;SAF=26;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000194638;OID=.;OPOS=25926179;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:26:26:0:0:26:26:0:0
chr15	25926186	.	G	A	772.62	PASS	AF=0.98;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0232798;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.43;QD=61.8094;RBI=0.0233204;REFB=-0.0419463;REVB=-0.00137573;RO=1;SAF=26;SAR=23;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.017757;STB=0.50943;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.000111787;OID=.;OPOS=25926186;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:50:50:1:1:49:49:0.98:23:26:1:0:23:26:1:0
chr15	25961964	.	A	G	594.53	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00541148;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.399;QD=60.9777;RBI=0.0153274;REFB=0;REVB=0.0143403;RO=0;SAF=16;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.43889e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.4557e-05;OID=.;OPOS=25961964;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:23:16:0:0:23:16:0:0
chr15	26327370	.	A	G	90.7	PASS	AF=0.240741;AO=12;DP=53;FAO=13;FDP=54;FR=.;FRO=41;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=0.0259727;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.6537;QD=6.71818;RBI=0.0374035;REFB=0.0110083;REVB=0.0269155;RO=41;SAF=8;SAR=4;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.193749;STB=0.642631;STBP=0.246;TYPE=snp;VARB=-0.0188856;OID=.;OPOS=26327370;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:90:53:54:41:41:12:13:0.240741:4:8:21:20:4:9:21:20
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chr15	26327466	.	C	T	708.56	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00461199;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.365;QD=62.9828;RBI=0.0157469;REFB=0;REVB=-0.0150563;RO=0;SAF=20;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.09779e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.82398e-05;OID=.;OPOS=26327466;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:25:20:0:0:25:20:0:0
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chr15	27182357	.	T	C	318.91	PASS	AF=0.675;AO=27;DP=41;FAO=27;FDP=40;FR=.;FRO=13;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=-0.00948322;FXX=0.0243843;HRUN=3;LEN=1;MLLD=239.893;QD=31.8912;RBI=0.00948837;REFB=-0.0194771;REVB=0.000312313;RO=13;SAF=14;SAR=13;SRF=3;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170033;STB=0.592935;STBP=0.104;TYPE=snp;VARB=0.00687451;OID=.;OPOS=27182357;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:40:13:13:27:27:0.675:13:14:3:10:13:14:3:10
chr15	27184435	.	C	T	183.32	PASS	AF=0.370968;AO=23;DP=63;FAO=23;FDP=62;FR=.;FRO=39;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=28;FWDB=0.00521462;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.3434;QD=11.8268;RBI=0.00926045;REFB=0.0128841;REVB=0.00765269;RO=39;SAF=13;SAR=10;SRF=11;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.30219;STB=0.672886;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=-0.0202576;OID=.;OPOS=27184435;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:62:39:39:23:23:0.370968:10:13:11:28:10:13:11:28
chr15	27184482	.	C	T	159.6	PASS	AF=0.363636;AO=19;DP=54;FAO=20;FDP=55;FR=.;FRO=35;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=0.0156862;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.445;QD=11.6069;RBI=0.0236742;REFB=-0.00392174;REVB=-0.0177316;RO=35;SAF=12;SAR=7;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.224678;STB=0.608587;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=0.00930762;OID=.;OPOS=27184482;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:55:35:35:19:20:0.363636:7:12:15:20:8:12:15:20
chr15	27184517	.	G	A	114.2	PASS	AF=0.311111;AO=14;DP=45;FAO=14;FDP=45;FR=.;FRO=31;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=0.00451884;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.836;QD=10.1514;RBI=0.0155127;REFB=-0.00849088;REVB=-0.01484;RO=31;SAF=11;SAR=3;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.4337;STB=0.761988;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.0101839;OID=.;OPOS=27184517;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:31:31:14:14:0.311111:3:11:13:18:3:11:13:18
chr15	27188459	.	C	T	51.45	PASS	AF=0.222222;AO=8;DP=36;FAO=8;FDP=36;FR=.;FRO=28;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=-0.0797903;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=224.873;QD=5.71701;RBI=0.0817969;REFB=-0.00576895;REVB=0.018007;RO=28;SAF=1;SAR=7;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.374047;STB=0.754139;STBP=0.183;TYPE=snp;VARB=0.0170769;OID=.;OPOS=27188459;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:51:36:36:28:28:8:8:0.222222:7:1:10:18:7:1:10:18
chr15	27216746	.	C	T	319.02	PASS	AF=0.83871;AO=24;DP=29;FAO=26;FDP=31;FR=.;FRO=5;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0508286;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.4424;QD=41.1643;RBI=0.0850604;REFB=-0.0845726;REVB=0.0682035;RO=5;SAF=9;SAR=15;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138187;STB=0.568474;STBP=0.103;TYPE=snp;VARB=0.0193551;OID=.;OPOS=27216746;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:27:29:31:5:5:24:26:0.83871:15:9:4:1:16:10:4:1
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chr15	28235773	.	C	T	35.38	PASS	AF=0.230769;AO=6;DP=26;FAO=6;FDP=26;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=-0.00840442;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.27;QD=5.44258;RBI=0.0237374;REFB=-0.013251;REVB=-0.0221997;RO=20;SAF=4;SAR=2;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.251436;STB=0.666112;STBP=0.409;TYPE=snp;VARB=0.0285732;OID=.;OPOS=28235773;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:26:26:20:20:6:6:0.230769:2:4:9:11:2:4:9:11
chr15	28356557	.	G	A,GA,GAA	184.26	PASS	AF=0.0263158,0.921053,0.0526316;AO=3,22,8;DP=42;FAO=1,35,2;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=1,17,1;FSAR=0,18,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00660353,0.00393491,0.00429733;FXX=0;HRUN=1,8,8;LEN=1,1,2;MLLD=236.395,6.75712,8.83269;QD=19.3961;RBI=0.00834496,0.10506,0.0533316;REFB=-0.0215047,0.047313,0.0482135;REVB=-0.00510213,-0.104986,-0.0531582;RO=8;SAF=3,9,3;SAR=0,13,5;SRF=7;SRR=1;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.576989,-0.224043,-0.404954;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=snp,ins,ins;VARB=0.0438794,-0.0541995,0.013948;OID=.,.,.;OPOS=28356557,28356558,28356558;OREF=G,-,-;OALT=A,A,AA;OMAPALT=A,GA,GAA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	2/3:10:42:38:8:0:3,22,8:1,35,2:0.0263158,0.921053,0.0526316:0,13,5:3,9,3:7:1:0,18,1:1,17,1:0:0
chr15	28362459	.	G	A	410.74	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0110001;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.74;QD=56.6535;RBI=0.0127181;REFB=0;REVB=0.00638341;RO=0;SAF=13;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.00209e-05;OID=.;OPOS=28362459;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:16:13:0:0:16:13:0:0
chr15	28412872	.	G	A	868.27	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00904463;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=232.463;QD=57.8844;RBI=0.0115685;REFB=0;REVB=-0.00721279;RO=0;SAF=44;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6631e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.90138e-06;OID=.;OPOS=28412872;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:16:44:0:0:16:44:0:0
chr15	28414665	.	T	C	885.28	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0245657;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.1215;QD=58.0512;RBI=0.0670513;REFB=0;REVB=0.0623891;RO=0;SAF=38;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000542369;OID=.;OPOS=28414665;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:23:38:0:0:23:38:0:0
chr15	28419746	.	G	A	158.53	PASS	AF=0.368421;AO=20;DP=57;FAO=21;FDP=57;FR=.;FRO=36;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=0.00256406;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.404;QD=11.1251;RBI=0.0115121;REFB=-0.00809941;REVB=0.0112229;RO=36;SAF=7;SAR=13;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109554;STB=0.541626;STBP=0.668;TYPE=snp;VARB=0.0112088;OID=.;OPOS=28419746;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:36:36:20:21:0.368421:13:7:16:20:13:8:16:20
chr15	28517436	.	T	C	371.73	PASS	AF=0.42;AO=42;DP=102;FAO=42;FDP=100;FR=.;FRO=58;FSAF=31;FSAR=11;FSRF=37;FSRR=21;FWDB=0.0112786;FXX=0.0196059;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.0048;QD=14.8691;RBI=0.011279;REFB=-0.00493095;REVB=8.56719e-05;RO=55;SAF=31;SAR=11;SRF=36;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102477;STB=0.57008;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.010409;OID=.;OPOS=28517436;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:100:55:58:42:42:0.42:11:31:36:19:11:31:37:21
chr15	28632820	.	T	C	71.01	PASS	AF=0.294118;AO=9;DP=34;FAO=10;FDP=34;FR=.;FRO=24;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=-0.0340766;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.718;QD=8.35447;RBI=0.0350288;REFB=-0.012824;REVB=-0.0081119;RO=23;SAF=4;SAR=5;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138392;STB=0.5998;STBP=0.491;TYPE=snp;VARB=0.0221215;OID=.;OPOS=28632820;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:71:34:34:23:24:9:10:0.294118:5:4:13:10:6:4:13:11
chr15	29346924	.	G	A	197.52	PASS	AF=0.633333;AO=19;DP=29;FAO=19;FDP=30;FR=.;FRO=11;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=-0.0256169;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.064;QD=26.3363;RBI=0.0267656;REFB=0.000282799;REVB=-0.007757;RO=10;SAF=9;SAR=10;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172976;STB=0.574392;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=-0.000496679;OID=.;OPOS=29346924;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:29:30:10:11:19:19:0.633333:10:9:2:8:10:9:3:8
chr15	29347019	.	T	C	76.14	PASS	AF=0.4;AO=10;DP=25;FAO=10;FDP=25;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.0379174;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.227;QD=12.1823;RBI=0.0460022;REFB=-0.00857992;REVB=-0.0260476;RO=15;SAF=4;SAR=6;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13532;STB=0.580483;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.0141125;OID=.;OPOS=29347019;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:25:25:15:15:10:10:0.4:6:4:8:7:6:4:8:7
chr15	29394009	.	C	T	115.19	PASS	AF=0.325581;AO=14;DP=43;FAO=14;FDP=43;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=-0.0308923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.985;QD=10.7151;RBI=0.0353929;REFB=0.00145371;REVB=-0.0172719;RO=29;SAF=6;SAR=8;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0573915;STB=0.534198;STBP=0.765;TYPE=snp;VARB=-0.00308926;OID=.;OPOS=29394009;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:29:29:14:14:0.325581:8:6:11:18:8:6:11:18
chr15	29415698	.	A	G	476.23	PASS	AF=0.765957;AO=36;DP=47;FAO=36;FDP=47;FR=.;FRO=11;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.0226762;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.752;QD=40.5303;RBI=0.0242655;REFB=-0.0359509;REVB=0.00863742;RO=11;SAF=19;SAR=17;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0317331;STB=0.51715;STBP=0.688;TYPE=snp;VARB=0.0105783;OID=.;OPOS=29415698;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:79:47:47:11:11:36:36:0.765957:17:19:5:6:17:19:5:6
chr15	29416901	.	A	G	527.26	PASS	AF=0.623377;AO=48;DP=77;FAO=48;FDP=77;FR=.;FRO=29;FSAF=30;FSAR=18;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=-0.00629433;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.478;QD=27.3901;RBI=0.00641885;REFB=-0.0572774;REVB=0.00125818;RO=28;SAF=30;SAR=18;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129399;STB=0.501729;STBP=0.979;TYPE=snp;VARB=0.0417343;OID=.;OPOS=29416901;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:28:29:48:48:0.623377:18:30:18:10:18:30:18:11
chr15	29421014	.	G	C	192.89	PASS	AF=0.575758;AO=19;DP=33;FAO=19;FDP=33;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=15;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=-0.00210859;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.826;QD=23.38;RBI=0.00620039;REFB=2.21433e-05;REVB=-0.00583084;RO=14;SAF=4;SAR=15;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00427005;STB=0.50239;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000127179;OID=.;OPOS=29421014;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:14:14:19:19:0.575758:15:4:3:11:15:4:3:11
chr15	29421054	.	C	T	168.89	PASS	AF=0.607143;AO=17;DP=28;FAO=17;FDP=28;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.0103175;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=224.661;QD=24.1271;RBI=0.0103383;REFB=0.00666114;REVB=-0.000655285;RO=11;SAF=4;SAR=13;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11571;STB=0.565136;STBP=0.436;TYPE=snp;VARB=-0.0045062;OID=.;OPOS=29421054;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:28:28:11:11:17:17:0.607143:13:4:4:7:13:4:4:7
chr15	29544656	.	T	C	61.38	PASS	AF=0.615385;AO=8;DP=13;FAO=8;FDP=13;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0305027;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.914;QD=18.8864;RBI=0.0316232;REFB=-0.0353138;REVB=-0.00834307;RO=5;SAF=2;SAR=6;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0453777;STB=0.526251;STBP=0.896;TYPE=snp;VARB=0.0204161;OID=.;OPOS=29544656;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:13:13:5:5:8:8:0.615385:6:2:1:4:6:2:1:4
chr15	30008856	.	C	A,G	729.3	PASS	AF=0.961538,0.0384615;AO=50,2;DP=52;FAO=50,2;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=29,1;FSAR=21,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0257529,-0.0331973;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=158.148,159.246;QD=56.1001;RBI=0.03295,0.0333991;REFB=0,0;REVB=0.0205546,0.00366584;RO=0;SAF=29,1;SAR=21,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.20481e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000621855,0.0095383;OID=.,.;OPOS=30008856,30008856;OREF=C,C;OALT=A,G;OMAPALT=A,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:52:52:0:0:50,2:50,2:0.961538,0.0384615:21,1:29,1:0:0:21,1:29,1:0:0
chr15	30008889	.	G	A	885.13	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0151129;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.229;QD=58.0414;RBI=0.0152385;REFB=0;REVB=0.0019529;RO=0;SAF=31;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.88965e-05;OID=.;OPOS=30008889;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:30:31:0:0:30:31:0:0
chr15	30664453	.	C	T	94.71	PASS	AF=0.342857;AO=12;DP=35;FAO=12;FDP=35;FR=.;FRO=23;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=-0.000681363;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.889;QD=10.8235;RBI=0.0191418;REFB=-0.0145764;REVB=-0.0191296;RO=23;SAF=4;SAR=8;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.211998;STB=0.627234;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.0295271;OID=.;OPOS=30664453;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:35:35:23:23:12:12:0.342857:8:4:12:11:8:4:12:11
chr15	31197564	.	G	A	490.02	PASS	AF=0.971429;AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0574351;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.1094;QD=56.0021;RBI=0.0656696;REFB=-0.0847198;REVB=-0.0318387;RO=1;SAF=14;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.022804;STB=0.512188;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=0.0131927;OID=.;OPOS=31197564;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:35:35:1:1:34:34:0.971429:20:14:0:1:20:14:0:1
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chr15	31231190	.	T	C	393.33	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0128423;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.967;QD=56.1905;RBI=0.018264;REFB=0;REVB=-0.0129865;RO=0;SAF=17;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.31638e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.66134e-06;OID=.;OPOS=31231190;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:11:17:0:0:11:17:0:0
chr15	31267147	.	C	T	447.03	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000675705;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=295.125;QD=57.6807;RBI=0.00353139;REFB=0;REVB=-0.00346614;RO=0;SAF=20;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.34338e-06;OID=.;OPOS=31267147;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:11:20:0:0:11:20:0:0
chr15	31330280	.	A	G,T	1535.04	PASS	AF=0.959184,0.0408163;AO=94,4;DP=98;FAO=94,4;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=54,1;FSAR=40,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00952269,-0.00286278;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=168.432,107.511;QD=62.6547;RBI=0.0112019,0.0300531;REFB=0,0;REVB=0.00589925,0.0299165;RO=0;SAF=54,1;SAR=40,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-4.86674e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.000430969,0.0572917;OID=.,.;OPOS=31330280,31330280;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:98:98:0:0:94,4:94,4:0.959184,0.0408163:40,3:54,1:0:0:40,3:54,1:0:0
chr15	31341666	.	C	T	185.84	PASS	AF=0.487179;AO=19;DP=39;FAO=19;FDP=39;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=-0.00814903;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.667;QD=19.0606;RBI=0.0142595;REFB=-0.0257065;REVB=-0.0117016;RO=20;SAF=8;SAR=11;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0667811;STB=0.537776;STBP=0.648;TYPE=snp;VARB=0.0281119;OID=.;OPOS=31341666;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:20:20:19:19:0.487179:11:8:7:13:11:8:7:13
chr15	31342744	.	C	T	757.49	PASS	AF=0.981818;AO=54;DP=56;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0234393;FXX=0.017854;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.137;QD=55.0902;RBI=0.0537521;REFB=-0.104123;REVB=-0.0483723;RO=0;SAF=35;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.86274e-08;STB=0.512816;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=0.000585823;OID=.;OPOS=31342744;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:56:55:0:1:54:54:0.981818:19:35:0:0:19:35:0:1
chr15	31358340	.	G	A	820.2	PASS	AF=0.755814;AO=65;DP=86;FAO=65;FDP=86;FR=.;FRO=21;FSAF=39;FSAR=26;FSRF=17;FSRR=4;FWDB=0.000935526;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.724;QD=38.1489;RBI=0.0100054;REFB=-0.00824137;REVB=0.00996159;RO=21;SAF=39;SAR=26;SRF=17;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101767;STB=0.554439;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=0.0031617;OID=.;OPOS=31358340;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:21:21:65:65:0.755814:26:39:17:4:26:39:17:4
chr15	31362352	.	C	T	468.13	PASS	AF=1;AO=25;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0594535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.373;QD=58.5164;RBI=0.0632324;REFB=0;REVB=0.0215315;RO=0;SAF=9;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000314331;OID=.;OPOS=31362352;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:25:32:1:16:9:0:0:20:12:0:0
chr15	31369123	.	A	G	817.72	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0438241;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.3821;QD=57.3839;RBI=0.0467234;REFB=0;REVB=0.0162026;RO=0;SAF=27;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0005022;OID=.;OPOS=31369123;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:30:27:0:0:30:27:0:0
chr15	31669122	.	G	A	507.63	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.02046;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=208.682;QD=58.015;RBI=0.0219098;REFB=0;REVB=0.00783752;RO=0;SAF=19;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.40663e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000210226;OID=.;OPOS=31669122;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:35:0:0:34:35:1:15:19:0:0:15:20:0:0
chr15	31942001	.	G	A	269.13	PASS	AF=0.705882;AO=23;DP=33;FAO=24;FDP=34;FR=.;FRO=10;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.0222884;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=185.061;QD=31.6629;RBI=0.0232958;REFB=-0.0315503;REVB=-0.00677639;RO=10;SAF=17;SAR=6;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156033;STB=0.569772;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=0.00880239;OID=.;OPOS=31942001;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:33:34:10:10:23:24:0.705882:6:17:5:5:7:17:5:5
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chr15	33023670	.	C	T	501.41	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0275751;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.9243;QD=58.9889;RBI=0.0795518;REFB=0;REVB=0.0746197;RO=0;SAF=13;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00212955;OID=.;OPOS=33023670;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:21:13:0:0:21:13:0:0
chr15	33023685	.	A	C	695.86	PASS	AF=0.978261;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.000278274;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.2988;QD=60.5095;RBI=0.0142856;REFB=-0.07968;REVB=-0.0142829;RO=1;SAF=21;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0218529;STB=0.511623;STBP=0.324;TYPE=snp;VARB=0.0162262;OID=.;OPOS=33023685;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:46:46:1:1:45:45:0.978261:24:21:1:0:24:21:1:0
chr15	33023689	.	C	A	69.44	PASS	AF=0.212766;AO=10;DP=47;FAO=10;FDP=47;FR=.;FRO=37;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=-0.00106015;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.7313;QD=5.90951;RBI=0.0439684;REFB=-0.0017389;REVB=-0.0439556;RO=37;SAF=4;SAR=6;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0737948;STB=0.54773;STBP=0.815;TYPE=snp;VARB=0.00309572;OID=.;OPOS=33023689;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:69:47:47:37:37:10:10:0.212766:6:4:17:20:6:4:17:20
chr15	33023951	.	T	C	557.11	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0524978;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.953;QD=60.2278;RBI=0.0857963;REFB=0;REVB=0.06786;RO=0;SAF=18;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.68991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00138633;OID=.;OPOS=33023951;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:19:18:0:0:19:18:0:0
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chr15	33024767	.	A	G	125.71	PASS	AF=0.319149;AO=15;DP=47;FAO=15;FDP=47;FR=.;FRO=32;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=22;FWDB=-0.0346597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.186;QD=10.6984;RBI=0.0405168;REFB=-0.015243;REVB=-0.0209838;RO=32;SAF=4;SAR=11;SRF=10;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0640199;STB=0.538409;STBP=0.806;TYPE=snp;VARB=0.0273349;OID=.;OPOS=33024767;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:32:32:15:15:0.319149:11:4:10:22:11:4:10:22
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chr15	33261232	.	G	A	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00722075;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=287.366;QD=40.7629;RBI=0.00722075;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=10;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.36053e-05;OID=.;OPOS=33261232;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:0:10:0:0:0:10:0:0
chr15	33359574	.	C	A	116.08	PASS	AF=0.318182;AO=13;DP=44;FAO=14;FDP=44;FR=.;FRO=30;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=0.0600142;FXX=0.0222173;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.9134;QD=10.553;RBI=0.0600165;REFB=0.00025174;REVB=-0.000524396;RO=30;SAF=2;SAR=11;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.328273;STB=0.630942;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=0.00253934;OID=.;OPOS=33359574;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:30:30:13:14:0.318182:11:2:11:19:11:3:11:19
chr15	33840414	.	A	G	379.84	PASS	AF=0.526316;AO=29;DP=57;FAO=30;FDP=57;FR=.,HEALED;FRO=17;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=0.04415;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=38.0735;QD=26.6555;RBI=0.0601211;REFB=-0.0476489;REVB=-0.0408085;RO=16;SAF=14;SAR=15;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172618;STB=0.574419;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.0100304;OID=.;OPOS=33840414;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:16:17:29:30:0.526316:15:14:12:4:15:15:12:5
chr15	33872177	.	C	T	181.36	PASS	AF=0.772727;AO=17;DP=22;FAO=17;FDP=22;FR=.;FRO=5;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.0295122;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.8917;QD=32.9748;RBI=0.044274;REFB=0.0135966;REVB=-0.0330033;RO=5;SAF=7;SAR=10;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0787256;STB=0.543427;STBP=0.545;TYPE=snp;VARB=-0.00802753;OID=.;OPOS=33872177;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:27:22:22:5:5:17:17:0.772727:10:7:3:2:10:7:3:2
chr15	33954652	.	C	T	370.3	PASS	AF=0.731707;AO=30;DP=41;FAO=30;FDP=41;FR=.;FRO=11;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.0203254;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.915;QD=36.1264;RBI=0.02948;REFB=-0.0159061;REVB=0.0213529;RO=11;SAF=17;SAR=13;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10039;STB=0.554613;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=0.00362777;OID=.;OPOS=33954652;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:80:41:41:11:11:30:30:0.731707:13:17:4:7:13:17:4:7
chr15	34014753	.	T	C	304.98	PASS	AF=0.702703;AO=26;DP=37;FAO=26;FDP=37;FR=.;FRO=11;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=-0.0318832;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.5932;QD=32.9711;RBI=0.0355654;REFB=0.0138007;REVB=0.0157594;RO=11;SAF=10;SAR=16;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0653529;STB=0.535687;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=-0.00625408;OID=.;OPOS=34014753;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:82:37:37:11:11:26:26:0.702703:16:10:3:8:16:10:3:8
chr15	34015013	.	G	A	47.97	PASS	AF=0.388889;AO=7;DP=18;FAO=7;FDP=18;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=2;FWDB=0.0297668;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=33.2518;QD=10.6598;RBI=0.0407159;REFB=-0.0329246;REVB=0.0277799;RO=9;SAF=3;SAR=4;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.318742;STB=0.726721;STBP=0.188;TYPE=snp;VARB=0.0458882;OID=.;OPOS=34015013;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:18:18:9:11:7:7:0.388889:4:3:7:2:4:3:9:2
chr15	34016274	.	G	A	554.84	PASS	AF=0.95;AO=38;DP=40;FAO=38;FDP=40;FR=.;FRO=2;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0101585;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=225.984;QD=55.4837;RBI=0.0167466;REFB=-0.103397;REVB=0.0133136;RO=1;SAF=18;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0253186;STB=0.501319;STBP=0.866;TYPE=snp;VARB=0.000785169;OID=.;OPOS=34016274;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:40:40:1:2:38:38:0.95:20:18:1:0:20:18:1:1
chr15	34113536	.	A	G	868.25	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0310117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.333;QD=57.8832;RBI=0.0310764;REFB=0;REVB=-0.00200436;RO=0;SAF=29;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.73709e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000126923;OID=.;OPOS=34113536;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:31:29:0:0:31:29:0:0
chr15	34158266	.	A	G	1135.23	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0354998;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.1557;QD=60.5456;RBI=0.0481084;REFB=0;REVB=0.0324682;RO=0;SAF=39;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6999e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000407013;OID=.;OPOS=34158266;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:36:39:0:0:36:39:0:0
chr15	34356988	.	G	A	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0429234;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.35;QD=55.0986;RBI=0.0452507;REFB=0;REVB=0.0143252;RO=0;SAF=13;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000312396;OID=.;OPOS=34356988;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:13:13:0:0:13:13:0:0
chr15	34357259	.	T	A	638.68	PASS	AF=0.976744;AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0111021;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=273.934;QD=59.4123;RBI=0.0134115;REFB=-0.0673137;REVB=-0.00752414;RO=1;SAF=17;SAR=25;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0184086;STB=0.509799;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.000158965;OID=.;OPOS=34357259;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:43:43:1:1:42:42:0.976744:25:17:0:1:25:17:0:1
chr15	34517929	.	T	C	1525.87	PASS	AF=1;AO=101;DP=102;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00358358;FXX=0.0097078;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.016;QD=59.8379;RBI=0.0329667;REFB=0;REVB=0.0327714;RO=0;SAF=52;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.10807e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.43866e-05;OID=.;OPOS=34517929;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:102:102:0:0:101:102:1:49:52:0:0:50:52:0:0
chr15	34522108	.	ACTC	AC,ACTT	773.88	PASS	AF=0.92,0.08;AO=40,4;DP=50;FAO=46,4;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=19,0;FSAR=27,4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144611,0.00739586;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=275.912,250.596;QD=61.9106;RBI=0.0236022,0.0315131;REFB=0,0;REVB=0.0186531,0.030633;RO=0;SAF=15,0;SAR=25,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.00103993,-0.000944848;OID=.,.;OPOS=34522109,34522111;OREF=CT,C;OALT=-,T;OMAPALT=AC,ACTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.92,0.08:40,4:50:46,4:50:0:19,0:27,4:0:0:18:0:15,0:25,4:0:0
chr15	34522935	.	GAGAC	G	643.91	PASS	AF=0.942308;AO=48;DP=51;FAO=49;FDP=52;FR=.;FRO=3;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0506544;FXX=0.0545355;HRUN=1;LEN=4;MLLD=271.824;QD=49.5316;RBI=0.050748;REFB=-0.0022094;REVB=-0.00308016;RO=0;SAF=22;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46901e-08;STB=0.511404;STBP=0.478;TYPE=del;VARB=4.50157e-05;OID=.;OPOS=34522936;OREF=AGAC;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.942308:48:51:49:52:3:23:26:2:1:13:0:22:26:0:0
chr15	34522985	.	C	G	855.53	PASS	AF=1;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0153519;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.4519;QD=58.002;RBI=0.0374966;REFB=0;REVB=0.0342098;RO=0;SAF=24;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00264927;OID=.;OPOS=34522985;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:59:0:0:59:59:1:35:24:0:0:35:24:0:0
chr15	34524995	.	G	T	933.86	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00401125;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.103;QD=58.3661;RBI=0.00434594;REFB=0;REVB=-0.00167245;RO=0;SAF=31;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.6027e-05;OID=.;OPOS=34524995;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:64:0:0:63:64:1:32:31:0:0:32:32:0:0
chr15	34542872	.	C	G	501.11	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.023574;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.8491;QD=58.9546;RBI=0.0527371;REFB=0;REVB=-0.0471749;RO=0;SAF=18;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.64315e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00110612;OID=.;OPOS=34542872;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:34:0:0:33:34:1:15:18:0:0:15:19:0:0
chr15	34544468	.	C	T	538.55	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0467325;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.9732;QD=59.8388;RBI=0.0504712;REFB=0;REVB=-0.0190636;RO=0;SAF=17;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000651965;OID=.;OPOS=34544468;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:19:17:0:0:19:17:0:0
chr15	34551082	.	G	A	483.77	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0118097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.051;QD=58.6391;RBI=0.0139626;REFB=0;REVB=0.00744878;RO=0;SAF=13;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.33668e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.29818e-05;OID=.;OPOS=34551082;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:33:0:0:31:33:1:18:13:0:0:20:13:0:0
chr15	34635863	.	G	C	632.23	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00733564;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.4071;QD=61.6812;RBI=0.015634;REFB=0;REVB=0.0138062;RO=0;SAF=25;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.1719e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.04214e-05;OID=.;OPOS=34635863;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:16:25:0:0:16:25:0:0
chr15	34638198	.	A	G	447.23	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0301283;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=295.722;QD=57.7077;RBI=0.0406752;REFB=0;REVB=-0.0273269;RO=0;SAF=11;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.71179e-06;OID=.;OPOS=34638198;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:31:0:0:30:31:1:19:11:0:0:19:12:0:0
chr15	34640218	.	C	T	1169.64	PASS	AF=0.963415;AO=79;DP=82;FAO=79;FDP=82;FR=.;FRO=3;FSAF=42;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0539774;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=87.7429;QD=57.0557;RBI=0.0570248;REFB=-0.222096;REVB=0.0183918;RO=1;SAF=42;SAR=37;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0111386;STB=0.507276;STBP=0.459;TYPE=snp;VARB=0.00291307;OID=.;OPOS=34640218;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:82:82:1:3:79:79:0.963415:37:42:1:0:37:42:1:2
chr15	34640378	.	T	C	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0903103;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.455;QD=37.488;RBI=0.0911742;REFB=0;REVB=-0.0125214;RO=0;SAF=1;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.78849e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000868152;OID=.;OPOS=34640378;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:7:1:0:0:7:1:0:0
chr15	34649211	.	C	A	69.42	PASS	AF=0.227273;AO=9;DP=44;FAO=10;FDP=44;FR=.;FRO=34;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=-0.000761753;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.995;QD=6.31116;RBI=0.0117052;REFB=-0.00171769;REVB=0.0116804;RO=34;SAF=4;SAR=5;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0674498;STB=0.577825;STBP=0.586;TYPE=snp;VARB=0.00348691;OID=.;OPOS=34649211;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:69:44:44:34:34:9:10:0.227273:5:4:17:17:6:4:17:17
chr15	34649247	.	C	G	42.47	PASS	AF=0.2;AO=7;DP=35;FAO=7;FDP=35;FR=.;FRO=28;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=-0.0210451;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.9185;QD=4.85329;RBI=0.022214;REFB=-0.00896658;REVB=-0.0071109;RO=28;SAF=2;SAR=5;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.338253;STB=0.72517;STBP=0.252;TYPE=snp;VARB=0.00814347;OID=.;OPOS=34649247;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:42:35:35:28:28:7:7:0.2:5:2:16:12:5:2:16:12
chr15	34673722	.	C	T	188.69	PASS	AF=0.692308;AO=18;DP=26;FAO=18;FDP=26;FR=.;FRO=8;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.0346088;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.151;QD=29.0287;RBI=0.0360465;REFB=0.0160607;REVB=0.0100787;RO=8;SAF=11;SAR=7;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0637946;STB=0.535358;STBP=0.601;TYPE=snp;VARB=-0.006223;OID=.;OPOS=34673722;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:26:26:8:8:18:18:0.692308:7:11:4:4:7:11:4:4
chr15	35045057	.	G	A	300.59	PASS	AF=0.576923;AO=29;DP=52;FAO=30;FDP=52;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=7.41657e-05;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=276.083;QD=23.1222;RBI=0.0109306;REFB=-0.012382;REVB=0.0109303;RO=22;SAF=9;SAR=20;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160314;STB=0.593156;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=0.0103712;OID=.;OPOS=35045057;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:22:22:29:30:0.576923:20:9:11:11:21:9:11:11
chr15	35045312	.	T	A	158.27	PASS	AF=0.833333;AO=15;DP=18;FAO=15;FDP=18;FR=.;FRO=3;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0611781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.785;QD=35.1708;RBI=0.0641487;REFB=-0.0181315;REVB=0.019295;RO=3;SAF=3;SAR=12;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190336;STB=0.605905;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=0.0047545;OID=.;OPOS=35045312;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:18:18:3:3:15:15:0.833333:12:3:2:1:12:3:2:1
chr15	35080931	.	T	C	500.52	PASS	AF=0.767857;AO=43;DP=56;FAO=43;FDP=56;FR=.;FRO=13;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.00477972;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.186;QD=35.751;RBI=0.012345;REFB=0.00986627;REVB=0.0113822;RO=13;SAF=24;SAR=19;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00858298;STB=0.504624;STBP=0.94;TYPE=snp;VARB=-0.00245878;OID=.;OPOS=35080931;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:56:56:13:13:43:43:0.767857:19:24:7:6:19:24:7:6
chr15	35082141	.	A	G	34.88	PASS	AF=0.206897;AO=6;DP=28;FAO=6;FDP=29;FR=.;FRO=23;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=-0.0269636;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=112.142;QD=4.81104;RBI=0.0561992;REFB=-0.00695126;REVB=-0.0493084;RO=22;SAF=3;SAR=3;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.217505;STB=0.620311;STBP=0.571;TYPE=snp;VARB=0.0275825;OID=.;OPOS=35082141;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:28:29:22:23:6:6:0.206897:3:3:15:7:3:3:15:8
chr15	35149008	.	C	T	822.07	PASS	AF=0.952381;AO=59;DP=63;FAO=60;FDP=63;FR=.;FRO=3;FSAF=25;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0061625;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.677;QD=52.1951;RBI=0.00758503;REFB=0.00554224;REVB=0.00442224;RO=3;SAF=24;SAR=35;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0387403;STB=0.520541;STBP=0.204;TYPE=snp;VARB=-0.000215531;OID=.;OPOS=35149008;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:63:63:3:3:59:60:0.952381:35:24:0:3:35:25:0:3
chr15	35230934	.	A	ATAGT	102.64	PASS	AF=0.48;AO=12;DP=26;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.00506602;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=4;MLLD=234.892;QD=16.4231;RBI=0.00800864;REFB=0.0074859;REVB=-0.00620272;RO=12;SAF=7;SAR=5;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0755114;STB=0.517213;STBP=0.893;TYPE=ins;VARB=-0.00916403;OID=.;OPOS=35230935;OREF=-;OALT=TAGT;OMAPALT=ATAGT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.48:12:26:12:25:13:7:5:8:5:99:12:7:5:8:4
chr15	35256624	.	C	G	383.86	PASS	AF=0.704545;AO=31;DP=45;FAO=31;FDP=44;FR=.;FRO=13;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.0132213;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.86;QD=34.8959;RBI=0.0363861;REFB=0.00122153;REVB=-0.0338991;RO=13;SAF=13;SAR=18;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0233736;STB=0.512735;STBP=0.83;TYPE=snp;VARB=-0.000451716;OID=.;OPOS=35256624;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:44:13:13:31:31:0.704545:18:13:6:7:18:13:6:7
chr15	35273620	.	C	T	37.15	PASS	AF=0.333333;AO=6;DP=18;FAO=6;FDP=18;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=0.00761947;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.186;QD=8.25462;RBI=0.00827202;REFB=-0.000530604;REVB=0.00322025;RO=12;SAF=5;SAR=1;SRF=2;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.636412;STB=0.886028;STBP=0.06;TYPE=snp;VARB=0.00182004;OID=.;OPOS=35273620;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:18:18:12:12:6:6:0.333333:1:5:2:10:1:5:2:10
chr15	36946303	.	C	G	1437.8	PASS	AF=1;AO=91;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00826287;FXX=0.0108684;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.209;QD=63.2;RBI=0.0342667;REFB=0;REVB=0.0332555;RO=0;SAF=38;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.41055e-05;OID=.;OPOS=36946303;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:91:91:0:0:91:91:1:53:38:0:0:53:38:0:0
chr15	36983962	.	T	C	902.71	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0218983;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=331.187;QD=58.2396;RBI=0.022489;REFB=0;REVB=0.00512026;RO=0;SAF=21;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.43387e-05;OID=.;OPOS=36983962;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:62:0:0:61:62:1:40:21:0:0:41:21:0:0
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chr15	37343040	.	C	G	648.15	PASS	AF=1;AO=36;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=11;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00531424;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.0829;QD=61.7283;RBI=0.0225449;REFB=0;REVB=-0.0219096;RO=0;SAF=9;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000246339;OID=.;OPOS=37343040;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:36:42:1:27:9:0:0:31:11:0:0
chr15	38230437	.	GA	G	35.8	PASS	AF=0.34;AO=16;DP=51;FAO=17;FDP=50;FR=.;FRO=33;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=-0.0929688;FXX=0.019604;HRUN=7;LEN=1;MLLD=10.8151;QD=2.8639;RBI=0.0955176;REFB=-0.0163514;REVB=0.0219182;RO=29;SAF=5;SAR=11;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.232782;STB=0.570286;STBP=0.51;TYPE=del;VARB=-0.0418848;OID=.;OPOS=38230438;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.34:16:51:17:50:33:6:11:15:18:35:29:5:11:15:14
chr15	38233869	.	T	C	687.55	PASS	AF=0.978261;AO=44;DP=46;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00252507;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=364.004;QD=59.7869;RBI=0.011281;REFB=-0.00860079;REVB=0.0109948;RO=0;SAF=19;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5098;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.000341206;OID=.;OPOS=38233869;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:46:46:0:1:44:45:0.978261:25:19:0:0:25:20:0:1
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chr15	38614525	.	G	A	682.89	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0192024;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=315.153;QD=62.0811;RBI=0.0197381;REFB=0;REVB=0.004567;RO=0;SAF=14;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.13233e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.21698e-05;OID=.;OPOS=38614525;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:44:0:0:43:44:1:29:14:0:0:30:14:0:0
chr15	38643574	.	T	C	435.68	PASS	AF=0.96875;AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0147671;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.107;QD=54.4602;RBI=0.0219842;REFB=0.043021;REVB=0.0162861;RO=1;SAF=13;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0345339;STB=0.518507;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=1.08231e-05;OID=.;OPOS=38643574;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:32:32:1:1:31:31:0.96875:18:13:1:0:18:13:1:0
chr15	39545032	.	T	G	710.37	PASS	AF=0.980769;AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0220713;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=181.852;QD=54.6439;RBI=0.022794;REFB=-0.0855274;REVB=0.00569427;RO=0;SAF=25;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94283e-08;STB=0.50943;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.00044226;OID=.;OPOS=39545032;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:52:52:0:1:51:51:0.980769:26:25:0:0:26:25:0:1
chr15	39545268	.	G	A	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0102663;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.482;QD=53.2766;RBI=0.0208037;REFB=0;REVB=-0.0180942;RO=0;SAF=12;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.9051e-05;OID=.;OPOS=39545268;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:11:12:0:0:11:12:0:0
chr15	39546259	.	C	G	83.76	PASS	AF=0.305556;AO=11;DP=36;FAO=11;FDP=36;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=0.0121529;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.7482;QD=9.30671;RBI=0.0156027;REFB=0.00191674;REVB=-0.00978528;RO=25;SAF=5;SAR=6;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119597;STB=0.572733;STBP=0.608;TYPE=snp;VARB=-0.00368013;OID=.;OPOS=39546259;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:36:36:25:25:11:11:0.305556:6:5:14:11:6:5:14:11
chr15	39879717	.	G	A	50.84	PASS	AF=0.205128;AO=8;DP=39;FAO=8;FDP=39;FR=.;FRO=31;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=-0.000189051;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.014;QD=5.21425;RBI=0.0106321;REFB=0.0063207;REVB=-0.0106304;RO=31;SAF=2;SAR=6;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.297214;STB=0.698109;STBP=0.233;TYPE=snp;VARB=-0.0248308;OID=.;OPOS=39879717;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:50:39:39:31:31:8:8:0.205128:6:2:15:16:6:2:15:16
chr15	39880358	.	C	T	113.61	PASS	AF=0.280702;AO=16;DP=57;FAO=16;FDP=57;FR=.;FRO=41;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=25;FWDB=-0.0107917;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.487;QD=7.97266;RBI=0.0379616;REFB=0.000348282;REVB=-0.0363954;RO=41;SAF=3;SAR=13;SRF=16;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.297588;STB=0.683952;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=-0.00310547;OID=.;OPOS=39880358;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:41:41:16:16:0.280702:13:3:16:25:13:3:16:25
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chr15	40226495	.	T	C	1050.89	PASS	AF=1;AO=70;DP=72;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0131779;FXX=0.0277739;HRUN=3;LEN=1;MLLD=260.683;QD=60.0506;RBI=0.0161174;REFB=0;REVB=0.00927976;RO=0;SAF=35;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.88005e-06;OID=.;OPOS=40226495;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:70:0:0:70:70:1:35:35:0:0:35:35:0:0
chr15	40327290	.	A	G	2907.13	PASS	AF=1;AO=184;DP=189;FAO=184;FDP=184;FR=.;FRO=0;FSAF=94;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0203276;FXX=0.0264536;HRUN=3;LEN=1;MLLD=274.013;QD=63.1984;RBI=0.0204053;REFB=0;REVB=0.00177827;RO=0;SAF=94;SAR=90;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.791e-05;OID=.;OPOS=40327290;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:15:189:184:0:0:184:184:1:90:94:0:0:90:94:0:0
chr15	40327301	.	G	A	2888.97	PASS	AF=1;AO=182;DP=185;FAO=184;FDP=184;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=99;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0156647;FXX=0.00540511;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.2794;QD=62.8038;RBI=0.0251509;REFB=0;REVB=-0.019677;RO=0;SAF=85;SAR=97;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.12811e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000128934;OID=.;OPOS=40327301;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:16:185:184:0:0:182:184:1:97:85:0:0:99:85:0:0
chr15	40328575	.	G	C	773.37	PASS	AF=0.98;AO=48;DP=50;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0281543;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.257;QD=61.8694;RBI=0.049191;REFB=-0.171248;REVB=0.0403371;RO=1;SAF=27;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0218744;STB=0.511623;STBP=0.325;TYPE=snp;VARB=0.00145731;OID=.;OPOS=40328575;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:50:50:1:1:48:49:0.98:21:27:0:1:21:28:0:1
chr15	40330564	.	C	T	61.35	PASS	AF=0.615385;AO=8;DP=13;FAO=8;FDP=13;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.011183;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.2687;QD=18.8779;RBI=0.126879;REFB=-0.00868044;REVB=-0.126386;RO=5;SAF=4;SAR=4;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199671;STB=0.615111;STBP=0.345;TYPE=snp;VARB=-0.0044095;OID=.;OPOS=40330564;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:13:13:5:5:8:8:0.615385:4:4:4:1:4:4:4:1
chr15	40383347	.	T	C	557.14	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00785397;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.402;QD=60.2308;RBI=0.0295578;REFB=0;REVB=0.0284952;RO=0;SAF=22;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.82408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.71165e-05;OID=.;OPOS=40383347;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:15:22:0:0:15:22:0:0
chr15	40383779	.	A	C	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0185855;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=332.368;QD=40.7629;RBI=0.0197981;REFB=0;REVB=0.00682218;RO=0;SAF=3;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.73146e-05;OID=.;OPOS=40383779;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:7:3:0:0:7:3:0:0
chr15	40426913	.	C	A	262.7	PASS	AF=0.69697;AO=23;DP=34;FAO=23;FDP=33;FR=.;FRO=10;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=-0.00606617;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.613;QD=31.8428;RBI=0.00829884;REFB=-0.0211418;REVB=-0.00566324;RO=10;SAF=11;SAR=12;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0670433;STB=0.53681;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.00272314;OID=.;OPOS=40426913;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:34:33:10:10:23:23:0.69697:12:11:6:4:12:11:6:4
chr15	40477831	.	G	A	489.89	PASS	AF=0.897436;AO=35;DP=40;FAO=35;FDP=39;FR=.;FRO=4;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0109042;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.3759;QD=50.2454;RBI=0.0380792;REFB=-0.0351221;REVB=0.0364846;RO=4;SAF=20;SAR=15;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0350455;STB=0.518786;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=0.00587961;OID=.;OPOS=40477831;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:19:40:39:4:4:35:35:0.897436:15:20:3:1:15:20:3:1
chr15	40488851	.	G	A	190.95	PASS	AF=0.72;AO=18;DP=25;FAO=18;FDP=25;FR=.;FRO=7;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.0350448;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.18;QD=30.5521;RBI=0.0356957;REFB=0.0135285;REVB=0.00678552;RO=7;SAF=6;SAR=12;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0531051;STB=0.529378;STBP=0.714;TYPE=snp;VARB=-0.00661515;OID=.;OPOS=40488851;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:25:25:7:7:18:18:0.72:12:6:3:4:12:6:3:4
chr15	40558087	.	G	A	604.81	PASS	AF=0.955556;AO=39;DP=41;FAO=43;FDP=45;FR=.;FRO=2;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0289849;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=97.7179;QD=53.7605;RBI=0.0553261;REFB=-0.137874;REVB=0.0471259;RO=1;SAF=18;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0253303;STB=0.500517;STBP=0.868;TYPE=snp;VARB=0.00288046;OID=.;OPOS=40558087;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:41:45:1:2:39:43:0.955556:21:18:1:0:21:22:1:1
chr15	40573675	.	G	T	183.26	PASS	AF=0.4;AO=22;DP=55;FAO=22;FDP=55;FR=.;FRO=33;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=23;FWDB=8.90254e-05;FXX=0.017854;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.868;QD=13.328;RBI=0.0324056;REFB=-0.0310722;REVB=-0.0324055;RO=33;SAF=9;SAR=13;SRF=10;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117903;STB=0.567367;STBP=0.457;TYPE=snp;VARB=0.0598309;OID=.;OPOS=40573675;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:33:33:22:22:0.4:13:9:10:23:13:9:10:23
chr15	40573716	.	A	G	950.91	PASS	AF=1;AO=64;DP=66;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.010511;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.4382;QD=58.5176;RBI=0.0218472;REFB=0;REVB=-0.0191525;RO=0;SAF=23;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000145388;OID=.;OPOS=40573716;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:65:0:0:64:65:1:41:23:0:0:42:23:0:0
chr15	40581543	.	T	C	152.15	PASS	AF=0.369565;AO=17;DP=46;FAO=17;FDP=46;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=-0.00984162;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.673;QD=13.2308;RBI=0.011417;REFB=-0.0130154;REVB=-0.00578716;RO=29;SAF=7;SAR=10;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.257927;STB=0.64983;STBP=0.138;TYPE=snp;VARB=0.0222578;OID=.;OPOS=40581543;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:29:29:17:17:0.369565:10:7:19:10:10:7:19:10
chr15	40583876	.	T	G	115.91	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0276423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.029;QD=42.1499;RBI=0.0503005;REFB=0;REVB=0.0420243;RO=0;SAF=9;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000300056;OID=.;OPOS=40583876;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:2:9:0:0:2:9:0:0
chr15	40589002	.	A	G	109.24	PASS	AF=0.27451;AO=14;DP=51;FAO=14;FDP=51;FR=.;FRO=37;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=24;FWDB=0.0123426;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.479;QD=8.56753;RBI=0.0124385;REFB=-0.000339681;REVB=-0.00154187;RO=37;SAF=5;SAR=9;SRF=13;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0075077;STB=0.504581;STBP=0.968;TYPE=snp;VARB=0.00105868;OID=.;OPOS=40589002;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:37:37:14:14:0.27451:9:5:13:24:9:5:13:24
chr15	40590134	.	G	A	766.31	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0120092;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.487;QD=63.859;RBI=0.0122893;REFB=0;REVB=0.00260864;RO=0;SAF=26;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.91265e-05;OID=.;OPOS=40590134;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:22:26:0:0:22:26:0:0
chr15	40633138	.	A	T	1014.32	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0835309;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.6086;QD=58.8011;RBI=0.0835657;REFB=0;REVB=0.00241285;RO=0;SAF=31;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000763863;OID=.;OPOS=40633138;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:68:69:0:0:68:69:1:37:31:0:0:37:32:0:0
chr15	40646520	.	CT	C	33.74	PASS	AF=0.2;AO=25;DP=65;FAO=13;FDP=65;FR=.;FRO=52;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=27;FSRR=25;FWDB=-0.231746;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=6.88719;QD=2.07639;RBI=0.255526;REFB=-0.0225876;REVB=-0.107645;RO=28;SAF=12;SAR=13;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.05214;STB=0.607909;STBP=0.418;TYPE=del;VARB=0.0197201;OID=.;OPOS=40646521;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.2:25:65:13:65:52:5:8:27:25:33:28:12:13:15:13
chr15	40656141	.	T	C	36.87	PASS	AF=0.315789;AO=6;DP=19;FAO=6;FDP=19;FR=.;FRO=13;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.0387564;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.566;QD=7.76204;RBI=0.0392442;REFB=-0.00233663;REVB=-0.00616884;RO=13;SAF=1;SAR=5;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.375164;STB=0.74376;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=0.00390826;OID=.;OPOS=40656141;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:19:19:13:13:6:6:0.315789:5:1:6:7:5:1:6:7
chr15	40662501	.	G	A	153.43	PASS	AF=0.386364;AO=17;DP=44;FAO=17;FDP=44;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=0.0110618;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.904;QD=13.9485;RBI=0.0126593;REFB=-0.0289323;REVB=-0.00615585;RO=27;SAF=9;SAR=8;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.089381;STB=0.551939;STBP=0.604;TYPE=snp;VARB=0.0396627;OID=.;OPOS=40662501;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:27:27:17:17:0.386364:8:9:12:15:8:9:12:15
chr15	40708484	.	C	T	284.36	PASS	AF=0.774194;AO=24;DP=31;FAO=24;FDP=31;FR=.;FRO=7;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.00849464;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=154.848;QD=36.6918;RBI=0.012009;REFB=-0.022932;REVB=-0.00848866;RO=6;SAF=11;SAR=13;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0765026;STB=0.525585;STBP=0.599;TYPE=snp;VARB=0.0063234;OID=.;OPOS=40708484;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:31:31:6:7:24:24:0.774194:13:11:4:2:13:11:4:3
chr15	40710723	.	G	A	678.98	PASS	AF=0.944444;AO=51;DP=54;FAO=51;FDP=54;FR=.;FRO=3;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0128943;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.3893;QD=50.2944;RBI=0.0517713;REFB=-0.0450958;REVB=0.0501399;RO=3;SAF=25;SAR=26;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0532155;STB=0.528291;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=0.0364656;OID=.;OPOS=40710723;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:54:54:3:3:51:51:0.944444:26:25:3:0:26:25:3:0
chr15	40751555	.	C	A	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0585939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.7745;QD=47.8223;RBI=0.060187;REFB=0;REVB=-0.0137558;RO=0;SAF=12;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.07465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000836384;OID=.;OPOS=40751555;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:4:12:0:0:4:12:0:0
chr15	40764549	.	G	A	168.45	PASS	AF=0.338462;AO=22;DP=65;FAO=22;FDP=65;FR=.;FRO=43;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=23;FSRR=20;FWDB=0.00573466;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=305.132;QD=10.3664;RBI=0.00586946;REFB=-0.0063047;REVB=-0.00125068;RO=43;SAF=15;SAR=7;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176027;STB=0.603479;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=0.0109539;OID=.;OPOS=40764549;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:43:43:22:22:0.338462:7:15:23:20:7:15:23:20
chr15	40849408	.	C	T	316.31	PASS	AF=0.675;AO=27;DP=40;FAO=27;FDP=40;FR=.;FRO=13;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.0240762;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.5664;QD=31.631;RBI=0.0300978;REFB=0.000814487;REVB=-0.0180613;RO=13;SAF=17;SAR=10;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0569306;STB=0.531227;STBP=0.576;TYPE=snp;VARB=-0.00140839;OID=.;OPOS=40849408;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:13:13:27:27:0.675:10:17:7:6:10:17:7:6
chr15	40856989	.	C	T	142.69	PASS	AF=0.6;AO=15;DP=25;FAO=15;FDP=25;FR=.;FRO=10;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.00874865;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=236.461;QD=22.8297;RBI=0.0131265;REFB=-0.0138463;REVB=0.00978602;RO=9;SAF=8;SAR=7;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206195;STB=0.592472;STBP=0.271;TYPE=snp;VARB=0.00659527;OID=.;OPOS=40856989;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:25:25:9:10:15:15:0.6:7:8:2:7:7:8:3:7
chr15	40886017	.	C	T	52.86	PASS	AF=0.266667;AO=8;DP=30;FAO=8;FDP=30;FR=.;FRO=22;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=6;FWDB=0.00579374;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.069;QD=7.04796;RBI=0.0252793;REFB=-0.00117899;REVB=-0.0246064;RO=22;SAF=3;SAR=5;SRF=16;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.392758;STB=0.74166;STBP=0.184;TYPE=snp;VARB=0.00507781;OID=.;OPOS=40886017;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:30:30:22:22:8:8:0.266667:5:3:16:6:5:3:16:6
chr15	40886020	.	C	G	53.13	PASS	AF=0.275862;AO=8;DP=29;FAO=8;FDP=29;FR=.;FRO=21;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=6;FWDB=-0.0037347;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.6781;QD=7.32768;RBI=0.00375129;REFB=0.0224783;REVB=0.00035243;RO=21;SAF=3;SAR=5;SRF=15;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.375939;STB=0.731193;STBP=0.17;TYPE=snp;VARB=-0.033898;OID=.;OPOS=40886020;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:29:29:21:21:8:8:0.275862:5:3:15:6:5:3:15:6
chr15	40898643	.	G	C	61.26	PASS	AF=0.25;AO=9;DP=36;FAO=9;FDP=36;FR=.;FRO=27;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=-0.000219718;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.013;QD=6.80713;RBI=0.0258771;REFB=0.0109345;REVB=0.0258762;RO=27;SAF=5;SAR=4;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0875417;STB=0.555432;STBP=0.735;TYPE=snp;VARB=-0.0175143;OID=.;OPOS=40898643;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:36:36:27:27:9:9:0.25:4:5:13:14:4:5:13:14
chr15	40903684	.	A	G	140.63	PASS	AF=0.215686;AO=22;DP=103;FAO=22;FDP=102;FR=.;FRO=80;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=31;FSRR=49;FWDB=0.00996986;FXX=0.0097078;HRUN=3;LEN=1;MLLD=200.524;QD=5.51506;RBI=0.014017;REFB=0.00177855;REVB=-0.00985287;RO=80;SAF=12;SAR=10;SRF=31;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197299;STB=0.622037;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=-0.00456443;OID=.;OPOS=40903684;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:102:80:80:22:22:0.215686:10:12:31:49:10:12:31:49
chr15	40913840	.	G	T	122.32	PASS	AF=0.293103;AO=17;DP=58;FAO=17;FDP=58;FR=.;FRO=41;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=25;FWDB=-0.0177137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.701;QD=8.43578;RBI=0.01803;REFB=0.0015729;REVB=-0.00336256;RO=41;SAF=7;SAR=10;SRF=16;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0262961;STB=0.515771;STBP=0.901;TYPE=snp;VARB=-0.00283222;OID=.;OPOS=40913840;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:41:41:17:17:0.293103:10:7:16:25:10:7:16:25
chr15	40914177	.	T	C	69.64	PASS	AF=0.529412;AO=9;DP=17;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.00458062;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.286;QD=16.3859;RBI=0.0450437;REFB=-0.00819301;REVB=0.0448102;RO=8;SAF=6;SAR=3;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14199;STB=0.583142;STBP=0.564;TYPE=snp;VARB=0.0061379;OID=.;OPOS=40914177;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:17:17:8:8:9:9:0.529412:3:6:4:4:3:6:4:4
chr15	40915894	.	T	C	92.5	PASS	AF=0.307692;AO=12;DP=39;FAO=12;FDP=39;FR=.;FRO=27;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=19;FWDB=0.011098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.791;QD=9.48747;RBI=0.0132441;REFB=-0.00430356;REVB=-0.00722788;RO=27;SAF=3;SAR=9;SRF=8;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0671222;STB=0.540913;STBP=0.746;TYPE=snp;VARB=0.00891778;OID=.;OPOS=40915894;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:39:39:27:27:12:12:0.307692:9:3:8:19:9:3:8:19
chr15	41105926	.	T	G	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0305829;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.044;QD=50.4135;RBI=0.0338376;REFB=0;REVB=0.0144799;RO=0;SAF=4;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.00629e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000258088;OID=.;OPOS=41105926;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:15:4:0:0:15:4:0:0
chr15	41146880	.	T	C	136.84	PASS	AF=0.666667;AO=14;DP=21;FAO=14;FDP=21;FR=.;FRO=7;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.0220206;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.019;QD=26.0655;RBI=0.0237451;REFB=-0.0265504;REVB=0.00888376;RO=7;SAF=10;SAR=4;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187933;STB=0.605901;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=0.0189318;OID=.;OPOS=41146880;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:21:21:7:7:14:14:0.666667:4:10:3:4:4:10:3:4
chr15	41148199	.	C	T	179.79	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0085646;FXX=0.062461;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.706;QD=47.9427;RBI=0.0169583;REFB=0;REVB=-0.0146367;RO=0;SAF=8;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.57876e-05;OID=.;OPOS=41148199;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:7:8:0:0:7:8:0:0
chr15	41148516	.	G	A	203.21	PASS	AF=0.540541;AO=20;DP=36;FAO=20;FDP=37;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=-0.0157517;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.585;QD=21.9687;RBI=0.022486;REFB=-0.0119585;REVB=0.0160469;RO=16;SAF=8;SAR=12;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0736356;STB=0.551674;STBP=0.55;TYPE=snp;VARB=0.00881568;OID=.;OPOS=41148516;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:37:16:17:20:20:0.540541:12:8:5:11:12:8:5:12
chr15	41149161	.	G	C	92.45	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0277676;FXX=0.0999001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.534;QD=41.0879;RBI=0.0444486;REFB=0;REVB=-0.034708;RO=0;SAF=3;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.9241e-05;OID=.;OPOS=41149161;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:9:0:0:10:9:1:7:3:0:0:6:3:0:0
chr15	41190989	.	A	G	76.4	PASS	AF=0.75;AO=9;DP=12;FAO=9;FDP=12;FR=.;FRO=3;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.020287;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.966;QD=25.4672;RBI=0.0254381;REFB=0.00692792;REVB=0.0153471;RO=3;SAF=2;SAR=7;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.236511;STB=0.636032;STBP=0.168;TYPE=snp;VARB=-0.000372995;OID=.;OPOS=41190989;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:12:12:3:3:9:9:0.75:7:2:2:1:7:2:2:1
chr15	41245676	.	G	A	328.81	PASS	AF=0.866667;AO=26;DP=30;FAO=26;FDP=30;FR=.;FRO=4;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0423419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.392;QD=43.8412;RBI=0.0423492;REFB=0.0142419;REVB=-0.00078461;RO=4;SAF=10;SAR=16;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0353662;STB=0.519111;STBP=0.683;TYPE=snp;VARB=-0.00180809;OID=.;OPOS=41245676;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:20:30:30:4:4:26:26:0.866667:16:10:1:3:16:10:1:3
chr15	41271718	.	C	T	1005.92	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0111536;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.383;QD=59.1718;RBI=0.0203375;REFB=0;REVB=0.0170062;RO=0;SAF=34;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.61397e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.89711e-06;OID=.;OPOS=41271718;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:68:0:0:67:68:1:33:34:0:0:33:35:0:0
chr15	41476209	.	T	C	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0133142;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.4884;QD=53.276;RBI=0.0158741;REFB=0;REVB=-0.00864411;RO=0;SAF=9;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.84921e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000378276;OID=.;OPOS=41476209;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:14:9:0:0:14:9:0:0
chr15	41476465	.	G	A	150.12	PASS	AF=0.516129;AO=16;DP=31;FAO=16;FDP=31;FR=.;FRO=15;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.00560094;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=222.348;QD=19.37;RBI=0.00643327;REFB=-0.00296158;REVB=0.00316488;RO=15;SAF=11;SAR=5;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142741;STB=0.581392;STBP=0.388;TYPE=snp;VARB=0.00287324;OID=.;OPOS=41476465;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:15:15:16:16:0.516129:5:11:8:7:5:11:8:7
chr15	41483682	.	A	G	295.28	PASS	AF=0.666667;AO=23;DP=36;FAO=26;FDP=39;FR=.;FRO=13;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.0328732;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.132;QD=30.2849;RBI=0.0845172;REFB=-0.0228114;REVB=0.0778621;RO=13;SAF=15;SAR=8;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0262373;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00477283;OID=.;OPOS=41483682;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:39:13:13:23:26:0.666667:8:15:8:5:10:16:8:5
chr15	41484287	.	C	A	214.2	PASS	AF=0.666667;AO=20;DP=30;FAO=20;FDP=30;FR=.;FRO=10;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=-0.00511102;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=313.373;QD=28.5602;RBI=0.0052062;REFB=-0.018774;REVB=-0.000990984;RO=10;SAF=11;SAR=9;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0903223;STB=0.54995;STBP=0.488;TYPE=snp;VARB=0.00784263;OID=.;OPOS=41484287;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:30:30:10:10:20:20:0.666667:9:11:4:6:9:11:4:6
chr15	41508037	.	A	G	135.77	PASS	AF=0.7;AO=14;DP=20;FAO=14;FDP=20;FR=.;FRO=6;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0360929;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.8237;QD=27.154;RBI=0.0616204;REFB=-0.0109543;REVB=-0.0499437;RO=6;SAF=8;SAR=6;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0526313;STB=0.52937;STBP=0.705;TYPE=snp;VARB=0.0038557;OID=.;OPOS=41508037;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:20:20:6:6:14:14:0.7:6:8:4:2:6:8:4:2
chr15	41509288	.	T	A	54.74	PASS	AF=0.777778;AO=7;DP=9;FAO=7;FDP=9;FR=.;FRO=2;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0476817;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.735;QD=24.3284;RBI=0.0502907;REFB=-0.0615584;REVB=-0.0159877;RO=2;SAF=6;SAR=1;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.223089;STB=0.631145;STBP=0.367;TYPE=snp;VARB=0.0133076;OID=.;OPOS=41509288;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:9:9:2:2:7:7:0.777778:1:6:1:1:1:6:1:1
chr15	41564393	.	A	G	152.4	PASS	AF=0.933333;AO=14;DP=15;FAO=14;FDP=15;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0300401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.064;QD=40.6387;RBI=0.0310082;REFB=0.0140847;REVB=-0.00768761;RO=1;SAF=10;SAR=4;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0433252;STB=0.523776;STBP=0.622;TYPE=snp;VARB=-0.000200704;OID=.;OPOS=41564393;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:15:15:1:1:14:14:0.933333:4:10:1:0:4:10:1:0
chr15	41574051	.	C	T	613.34	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0220293;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.8604;QD=61.3339;RBI=0.025638;REFB=0;REVB=0.0131155;RO=0;SAF=20;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000374192;OID=.;OPOS=41574051;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:20:20:0:0:20:20:0:0
chr15	41634586	.	A	AG	384.52	PASS	AF=1;AO=6;DP=37;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0596024;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=165.023;QD=40.4759;RBI=0.0598704;REFB=0;REVB=-0.00565838;RO=31;SAF=1;SAR=5;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.345628;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000753523;OID=.;OPOS=41634587;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:6:37:38:38:0:14:24:0:0:3:31:1:5:13:18
chr15	41634587	.	AC	GA	416.15	PASS	AF=0.861111;AO=31;DP=38;FAO=31;FDP=36;FR=.;FRO=5;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.000883903;FXX=0.0526177;HRUN=2;LEN=2;MLLD=239.563;QD=46.2383;RBI=0.00424352;REFB=0.0142166;REVB=0.00415044;RO=5;SAF=13;SAR=18;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113388;STB=0.560938;STBP=0.091;TYPE=mnp;VARB=-0.00288387;OID=.;OPOS=41634587;OREF=AC;OALT=GA;OMAPALT=GA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:27:38:36:5:5:31:31:0.861111:18:13:0:5:18:13:0:5
chr15	41672356	.	G	A	310.13	PASS	AF=0.627907;AO=27;DP=42;FAO=27;FDP=43;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=21;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=-6.8457e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.537;QD=28.8491;RBI=0.0501;REFB=-0.00859175;REVB=-0.0500999;RO=15;SAF=6;SAR=21;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0976427;STB=0.546064;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.00414119;OID=.;OPOS=41672356;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:43:15:16:27:27:0.627907:21:6:5:10:21:6:5:11
chr15	41679717	.	C	T	520.05	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.045063;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.814;QD=59.4348;RBI=0.05024;REFB=0;REVB=0.0222121;RO=0;SAF=19;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.1382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000475424;OID=.;OPOS=41679717;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:16:19:0:0:16:19:0:0
chr15	41805237	.	C	T	69.18	PASS	AF=0.615385;AO=8;DP=16;FAO=8;FDP=13;FR=.;FRO=5;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.00386653;FXX=0.187383;HRUN=3;LEN=1;MLLD=173.658;QD=21.2853;RBI=0.00398701;REFB=-0.0317085;REVB=0.000972749;RO=5;SAF=7;SAR=1;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.428999;STB=0.755986;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.0146393;OID=.;OPOS=41805237;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:16:13:5:5:8:8:0.615385:1:7:2:3:1:7:2:3
chr15	41815516	.	G	C	834.41	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0318722;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.763;QD=57.5452;RBI=0.0390123;REFB=0;REVB=0.0224971;RO=0;SAF=29;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000113472;OID=.;OPOS=41815516;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:29:29:0:0:29:29:0:0
chr15	41820200	.	C	T	104.63	PASS	AF=0.571429;AO=12;DP=21;FAO=12;FDP=21;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.0140914;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.101;QD=19.9286;RBI=0.0315841;REFB=-0.0338013;REVB=-0.0282664;RO=8;SAF=4;SAR=8;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0324761;STB=0.551636;STBP=0.625;TYPE=snp;VARB=0.0266167;OID=.;OPOS=41820200;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:21:21:8:9:12:12:0.571429:8:4:3:5:8:4:4:5
chr15	41829230	.	A	G	44.29	PASS	AF=0.269231;AO=7;DP=26;FAO=7;FDP=26;FR=.;FRO=19;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.0114827;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=225.831;QD=6.81346;RBI=0.0219208;REFB=-0.0118412;REVB=-0.0186727;RO=19;SAF=1;SAR=6;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.48202;STB=0.813829;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=0.0201073;OID=.;OPOS=41829230;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:26:26:19:19:7:7:0.269231:6:1:10:9:6:1:10:9
chr15	41991315	.	A	T	575.77	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00575551;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.471;QD=60.6072;RBI=0.00604039;REFB=0;REVB=-0.00183312;RO=0;SAF=14;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.76123e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.95224e-05;OID=.;OPOS=41991315;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:24:14:0:0:24:14:0:0
chr15	42026764	.	C	T	1339.58	PASS	AF=1;AO=84;DP=84;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0104522;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.88;QD=62.3059;RBI=0.0375371;REFB=0;REVB=0.0360526;RO=0;SAF=29;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.50837e-05;OID=.;OPOS=42026764;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:86:0:0:84:86:1:55:29:0:0:56:30:0:0
chr15	42041712	.	G	A	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0204941;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.94;QD=37.4885;RBI=0.0256231;REFB=0;REVB=0.0153797;RO=0;SAF=4;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000390585;OID=.;OPOS=42041712;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:4:4:0:0:4:4:0:0
chr15	42134097	.	C	T	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0253914;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.909;QD=46.8479;RBI=0.0255643;REFB=0;REVB=-0.00296792;RO=0;SAF=7;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0002408;OID=.;OPOS=42134097;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:8:7:0:0:8:7:0:0
chr15	42134786	.	C	G	82.43	PASS	AF=0.297297;AO=11;DP=37;FAO=11;FDP=37;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=-0.016942;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.232;QD=8.91132;RBI=0.0193144;REFB=-0.0136087;REVB=0.00927442;RO=26;SAF=6;SAR=5;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0080845;STB=0.504942;STBP=0.974;TYPE=snp;VARB=0.0320777;OID=.;OPOS=42134786;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:82:37:37:26:26:11:11:0.297297:5:6:14:12:5:6:14:12
chr15	42135988	.	C	T	2251.79	PASS	AF=1;AO=140;DP=142;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0241887;FXX=0.0138879;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.666;QD=63.4306;RBI=0.0317814;REFB=0;REVB=0.0206146;RO=0;SAF=71;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.29942e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.51057e-05;OID=.;OPOS=42135988;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:142:142:0:0:140:142:1:69:71:0:0:70:72:0:0
chr15	42138321	.	A	G	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0117653;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.572;QD=42.1811;RBI=0.0160738;REFB=0;REVB=-0.0109519;RO=0;SAF=5;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.90015e-06;OID=.;OPOS=42138321;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:6:5:0:0:6:5:0:0
chr15	42139642	.	C	T	465.14	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0332916;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.855;QD=58.142;RBI=0.044997;REFB=0;REVB=0.0302722;RO=0;SAF=3;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000217193;OID=.;OPOS=42139642;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:29:3:0:0:29:3:0:0
chr15	42149472	.	T	C	775.36	PASS	AF=0.965517;AO=56;DP=58;FAO=56;FDP=58;FR=.;FRO=2;FSAF=32;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00417612;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=293.609;QD=53.4727;RBI=0.0185438;REFB=-0.0639551;REVB=0.0180675;RO=2;SAF=32;SAR=24;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0376775;STB=0.519993;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=-4.1586e-06;OID=.;OPOS=42149472;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:58:58:2:2:56:56:0.965517:24:32:0:2:24:32:0:2
chr15	42149506	.	G	C	575.79	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00264923;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=123.178;QD=60.6098;RBI=0.0175993;REFB=0;REVB=0.0173988;RO=0;SAF=14;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.76123e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.57297e-05;OID=.;OPOS=42149506;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:24:14:0:0:24:14:0:0
chr15	42154738	.	G	A	546.58	PASS	AF=0.636364;AO=49;DP=78;FAO=49;FDP=77;FR=.;FRO=28;FSAF=30;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=9;FWDB=0.0432836;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.4709;QD=28.3939;RBI=0.0627584;REFB=-0.0181947;REVB=0.0454439;RO=28;SAF=30;SAR=19;SRF=19;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.047285;STB=0.525681;STBP=0.569;TYPE=snp;VARB=0.00520213;OID=.;OPOS=42154738;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:77:28:28:49:49:0.636364:19:30:19:9:19:30:19:9
chr15	42166500	.	C	T	443.37	PASS	AF=0.636364;AO=41;DP=65;FAO=42;FDP=66;FR=.;FRO=24;FSAF=29;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=7;FWDB=-0.00684352;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.675;QD=26.8709;RBI=0.0233388;REFB=-0.0603287;REVB=0.0223129;RO=24;SAF=28;SAR=13;SRF=17;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0200147;STB=0.507636;STBP=0.888;TYPE=snp;VARB=0.0317056;OID=.;OPOS=42166500;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:66:24:24:41:42:0.636364:13:28:17:7:13:29:17:7
chr15	42168368	.	C	T	92.19	PASS	AF=0.292683;AO=12;DP=41;FAO=12;FDP=41;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=0.0152446;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.07;QD=8.99444;RBI=0.0156583;REFB=-0.0171659;REVB=-0.00357534;RO=28;SAF=7;SAR=5;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.096537;STB=0.547246;STBP=0.701;TYPE=snp;VARB=0.0380103;OID=.;OPOS=42168368;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:41:41:28:29:12:12:0.292683:5:7:14:14:5:7:15:14
chr15	42171537	.	A	G	1028.7	PASS	AF=0.777778;AO=82;DP=106;FAO=84;FDP=108;FR=.;FRO=24;FSAF=53;FSAR=31;FSRF=18;FSRR=6;FWDB=0.0321816;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.819;QD=38.1;RBI=0.0435116;REFB=-0.0146956;REVB=0.0292849;RO=24;SAF=52;SAR=30;SRF=18;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.053777;STB=0.528826;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.00513584;OID=.;OPOS=42171537;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:108:24:24:82:84:0.777778:30:52:18:6:31:53:18:6
chr15	42178155	.	T	C	397.43	PASS	AF=0.519481;AO=40;DP=77;FAO=40;FDP=77;FR=.;FRO=37;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=-0.0435908;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.7536;QD=20.6458;RBI=0.0488389;REFB=-0.0167903;REVB=0.0220245;RO=37;SAF=20;SAR=20;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0586463;STB=0.532451;STBP=0.564;TYPE=snp;VARB=0.01371;OID=.;OPOS=42178155;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:37:37:40:40:0.519481:20:20:21:16:20:20:21:16
chr15	42287578	.	G	A	435.82	PASS	AF=0.96875;AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0220413;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.1611;QD=54.4778;RBI=0.0263879;REFB=-0.00435913;REVB=0.0145087;RO=1;SAF=12;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0239259;STB=0.512812;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.000721373;OID=.;OPOS=42287578;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:32:32:1:1:31:31:0.96875:19:12:0:1:19:12:0:1
chr15	42375978	.	C	T	68.35	PASS	AF=0.208333;AO=10;DP=48;FAO=10;FDP=48;FR=.;FRO=38;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=27;FSRR=11;FWDB=0.0322543;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.9471;QD=5.69595;RBI=0.0448046;REFB=-0.0161106;REVB=-0.0310984;RO=38;SAF=5;SAR=5;SRF=27;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.263562;STB=0.66637;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=0.0555;OID=.;OPOS=42375978;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:68:48:48:38:38:10:10:0.208333:5:5:27:11:5:5:27:11
chr15	42433802	.	A	G	600.92	PASS	AF=0.97561;AO=39;DP=40;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0184728;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.586;QD=58.6262;RBI=0.0296807;REFB=-0.00879238;REVB=-0.0232315;RO=0;SAF=15;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.515144;STBP=0.291;TYPE=snp;VARB=0.000450504;OID=.;OPOS=42433802;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:40:41:0:1:39:40:0.97561:24:15:0:0:24:16:1:0
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chr15	42434837	.	T	C	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0221831;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.486;QD=50.4133;RBI=0.0308664;REFB=0;REVB=0.0214626;RO=0;SAF=8;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.41338e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.05092e-06;OID=.;OPOS=42434837;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:11:8:0:0:11:8:0:0
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chr15	42565588	.	C	A	411.12	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0170363;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.49;QD=56.7062;RBI=0.0219338;REFB=0;REVB=0.0138151;RO=0;SAF=9;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000200337;OID=.;OPOS=42565588;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:20:9:0:0:20:9:0:0
chr15	42568547	.	C	G,T	776.21	PASS	AF=0.959184,0.0408163;AO=47,2;DP=50;FAO=47,2;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=26,2;FSAR=21,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00254462,-0.00819494;FXX=0.019996;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=148.496,71.2423;QD=63.3645;RBI=0.0396102,0.0119711;REFB=0,0;REVB=0.0395284,0.00872637;RO=0;SAF=26,2;SAR=21,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=6.91832e-05,0.052988;OID=.,.;OPOS=42568547,42568547;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:50:49:0:0:47,2:47,2:0.959184,0.0408163:21,0:26,2:0:0:21,0:26,2:0:0
chr15	42570718	.	A	G	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0346619;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.343;QD=50.4135;RBI=0.0439122;REFB=0;REVB=0.0269598;RO=0;SAF=8;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.41338e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000485576;OID=.;OPOS=42570718;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:11:8:0:0:11:8:0:0
chr15	42575963	.	A	G	223.19	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0289206;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.651;QD=49.5987;RBI=0.028947;REFB=0;REVB=-0.0012352;RO=0;SAF=11;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000370769;OID=.;OPOS=42575963;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:7:11:0:0:7:11:0:0
chr15	42579948	.	T	C	616.25	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0334289;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.441;QD=60.1219;RBI=0.0335125;REFB=0;REVB=-0.00236539;RO=0;SAF=19;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.97925e-05;OID=.;OPOS=42579948;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:41:0:0:40:41:1:21:19:0:0:22:19:0:0
chr15	42834962	.	C	T	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.015666;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=304.13;QD=47.8224;RBI=0.0202707;REFB=0;REVB=0.0128638;RO=0;SAF=12;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.07465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000136369;OID=.;OPOS=42834962;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:4:12:0:0:4:12:0:0
chr15	42977056	.	A	C	58.09	PASS	AF=0.777778;AO=7;DP=10;FAO=7;FDP=9;FR=.;FRO=2;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0142288;FXX=0.0999001;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.162;QD=25.818;RBI=0.0467984;REFB=-0.123223;REVB=-0.0445829;RO=2;SAF=5;SAR=2;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.28674;STB=0.666171;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.00249281;OID=.;OPOS=42977056;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:10:9:2:2:7:7:0.777778:2:5:0:2:2:5:0:2
chr15	43170793	.	A	G	40.29	PASS	AF=0.545455;AO=6;DP=11;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0058516;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.677;QD=14.6525;RBI=0.032259;REFB=-0.0225543;REVB=-0.0317238;RO=5;SAF=4;SAR=2;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.207272;STB=0.624573;STBP=0.423;TYPE=snp;VARB=0.00984283;OID=.;OPOS=43170793;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:11:11:5:5:6:6:0.545455:2:4:2:3:2:4:2:3
chr15	43170823	.	C	T	40.3	PASS	AF=0.545455;AO=6;DP=11;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.00428127;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.4176;QD=14.6528;RBI=0.0106634;REFB=-0.0608108;REVB=0.00976626;RO=5;SAF=4;SAR=2;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.207272;STB=0.624573;STBP=0.423;TYPE=snp;VARB=0.0528091;OID=.;OPOS=43170823;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:11:11:5:5:6:6:0.545455:2:4:2:3:2:4:2:3
chr15	43531411	.	G	C	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00169411;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.867;QD=50.4132;RBI=0.0431385;REFB=0;REVB=0.0431052;RO=0;SAF=11;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.41338e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000196128;OID=.;OPOS=43531411;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:8:11:0:0:8:11:0:0
chr15	43545728	.	G	A	279.67	PASS	AF=0.956522;AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00994126;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.533;QD=48.6383;RBI=0.0495836;REFB=-0.127735;REVB=0.0485768;RO=1;SAF=14;SAR=8;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0542958;STB=0.529385;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.00329613;OID=.;OPOS=43545728;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:23:23:1:1:22:22:0.956522:8:14:0:1:8:14:0:1
chr15	43571390	.	C	G	792.12	PASS	AF=0.966102;AO=57;DP=59;FAO=57;FDP=59;FR=.;FRO=2;FSAF=21;FSAR=36;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0837292;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.4877;QD=53.7032;RBI=0.0856438;REFB=-0.199716;REVB=-0.0180079;RO=2;SAF=21;SAR=36;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0428118;STB=0.522719;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=0.00676077;OID=.;OPOS=43571390;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:59:59:2:2:57:57:0.966102:36:21:2:0:36:21:2:0
chr15	43579566	.	A	G	160.16	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00849218;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.344;QD=45.7609;RBI=0.0295725;REFB=0;REVB=0.0283269;RO=0;SAF=10;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.63386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000232519;OID=.;OPOS=43579566;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:4:10:0:0:4:10:0:0
chr15	43621947	.	A	G	1062.44	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0212172;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=226.088;QD=59.8559;RBI=0.030324;REFB=0;REVB=0.0216651;RO=0;SAF=33;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.94806e-05;OID=.;OPOS=43621947;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:38:33:0:0:38:33:0:0
chr15	43632549	.	T	C	667.69	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100207;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.886;QD=62.1111;RBI=0.0231025;REFB=0;REVB=0.0208161;RO=0;SAF=27;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.13648e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000184584;OID=.;OPOS=43632549;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:43:0:0:42:43:1:15:27:0:0:15:28:0:0
chr15	43650383	.	TG	T,TA	86.92	PASS	AF=0.222222,0.777778;AO=2,7;DP=9;FAO=2,7;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=1,5;FSAR=1,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00588312,-0.0356435;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=53.8044,69.5931;QD=38.6292;RBI=0.0398072,0.0487172;REFB=0,0;REVB=0.0393701,0.03321;RO=0;SAF=1,5;SAR=1,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.27427e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0268934,-0.0402432;OID=.,.;OPOS=43650384,43650384;OREF=G,G;OALT=-,A;OMAPALT=T,TA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.222222,0.777778:2,7:9:2,7:9:0:1,5:1,2:0:0:10:0:1,5:1,2:0:0
chr15	43661802	.	T	C	246.54	PASS	AF=0.952381;AO=20;DP=21;FAO=20;FDP=21;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00243723;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.032;QD=46.96;RBI=0.00963143;REFB=-0.0839126;REVB=-0.00931796;RO=1;SAF=8;SAR=12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0541413;STB=0.529382;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=0.00376424;OID=.;OPOS=43661802;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:21:21:1:1:20:20:0.952381:12:8:1:0:12:8:1:0
chr15	43724646	.	T	G	108.76	PASS	AF=0.262295;AO=16;DP=61;FAO=16;FDP=61;FR=.;FRO=45;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=24;FSRR=21;FWDB=-0.0310443;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.8878;QD=7.13175;RBI=0.0315741;REFB=0.00632391;REVB=0.00575969;RO=45;SAF=9;SAR=7;SRF=24;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0355142;STB=0.521712;STBP=0.842;TYPE=snp;VARB=-0.0385478;OID=.;OPOS=43724646;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:45:45:16:16:0.262295:7:9:24:21:7:9:24:21
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chr15	43762196	.	C	T	87.38	PASS	AF=0.21875;AO=14;DP=64;FAO=14;FDP=64;FR=.;FRO=50;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=25;FSRR=25;FWDB=0.00491661;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.109;QD=5.46107;RBI=0.0157276;REFB=-7.40037e-05;REVB=-0.0149393;RO=48;SAF=7;SAR=7;SRF=25;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0256346;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000241235;OID=.;OPOS=43762196;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:64:64:48:50:14:14:0.21875:7:7:25:23:7:7:25:25
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chr15	44038899	.	C	T	661.5	PASS	AF=0.647727;AO=57;DP=88;FAO=57;FDP=88;FR=.;FRO=31;FSAF=24;FSAR=33;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=0.0109983;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=223.859;QD=30.068;RBI=0.0111306;REFB=-0.0375899;REVB=-0.00171144;RO=30;SAF=24;SAR=33;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0357372;STB=0.512311;STBP=0.764;TYPE=snp;VARB=0.0144339;OID=.;OPOS=44038899;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:30:31:57:57:0.647727:33:24:11:19:33:24:12:19
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chr15	44061802	.	C	T	307.51	PASS	AF=0.833333;AO=25;DP=30;FAO=25;FDP=30;FR=.;FRO=5;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.00265105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.6542;QD=41.0014;RBI=0.0353199;REFB=-0.0122095;REVB=0.0352203;RO=4;SAF=8;SAR=17;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0515075;STB=0.515139;STBP=0.734;TYPE=snp;VARB=0.00338657;OID=.;OPOS=44061802;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:26:30:30:4:5:25:25:0.833333:17:8:2:2:17:8:2:3
chr15	44069069	.	G	C	155.97	PASS	AF=0.318182;AO=21;DP=66;FAO=21;FDP=66;FR=.;FRO=45;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=23;FSRR=22;FWDB=0.0111142;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.6919;QD=9.45242;RBI=0.0129892;REFB=-0.0179671;REVB=0.00672265;RO=45;SAF=8;SAR=13;SRF=23;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152213;STB=0.589957;STBP=0.335;TYPE=snp;VARB=0.0372043;OID=.;OPOS=44069069;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:45:45:21:21:0.318182:13:8:23:22:13:8:23:22
chr15	44089414	.	A	AAG	44.92	PASS	AF=0.25;AO=7;DP=31;FAO=7;FDP=28;FR=.;FRO=21;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=-0.0244905;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=2;MLLD=87.239;QD=6.41654;RBI=0.0312522;REFB=-0.00481408;REVB=-0.0194142;RO=23;SAF=3;SAR=4;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00743092;STB=0.5;STBP=0.999;TYPE=ins;VARB=0.00669785;OID=.;OPOS=44089415;OREF=-;OALT=AG;OMAPALT=AAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.25:7:31:7:28:21:3:4:9:12:44:23:3:4:10:13
chr15	44093927	.	T	C	79.78	PASS	AF=0.244444;AO=11;DP=44;FAO=11;FDP=45;FR=.;FRO=34;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=-0.0125746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.768;QD=7.09174;RBI=0.0168445;REFB=-0.00635871;REVB=0.0112078;RO=33;SAF=7;SAR=4;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148171;STB=0.604745;STBP=0.419;TYPE=snp;VARB=0.0142824;OID=.;OPOS=44093927;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:79:44:45:33:34:11:11:0.244444:4:7:17:16:4:7:17:17
chr15	44102010	.	A	C	157.29	PASS	AF=0.232323;AO=23;DP=99;FAO=23;FDP=99;FR=.;FRO=76;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=44;FSRR=32;FWDB=0.00806191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.904;QD=6.35495;RBI=0.00806349;REFB=-0.00309721;REVB=0.000159765;RO=76;SAF=14;SAR=9;SRF=44;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0384852;STB=0.523702;STBP=0.827;TYPE=snp;VARB=0.0104937;OID=.;OPOS=44102010;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:76:76:23:23:0.232323:9:14:44:32:9:14:44:32
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chr15	44966389	.	T	C	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0367103;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.6806;QD=42.1825;RBI=0.0388222;REFB=0;REVB=-0.0126301;RO=0;SAF=5;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00278575;OID=.;OPOS=44966389;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:6:5:0:0:6:5:0:0
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chr15	45047573	.	C	G,T	408.96	PASS	AF=0.0645161,0.903226;AO=2,28;DP=31;FAO=2,28;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=0,15;FSAR=2,13;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0191222,-0.0978878;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=156.285,150.503;QD=52.769;RBI=0.0237419,0.100107;REFB=-0.0939678,-0.132728;REVB=0.014072,0.0209628;RO=1;SAF=0,15;SAR=2,13;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.697199,-0.0300185;STB=0.993266,0.516118;STBP=0.232,0.501;TYPE=snp,snp;VARB=0.0131282,0.00430235;OID=.,.;OPOS=45047573,45047573;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:31:31:1:1:2,28:2,28:0.0645161,0.903226:2,13:0,15:1:0:2,13:0,15:1:0
chr15	45392075	.	G	A	639.86	PASS	AF=0.934783;AO=42;DP=44;FAO=43;FDP=46;FR=.;FRO=3;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0973082;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.362;QD=55.6396;RBI=0.0974045;REFB=-0.132533;REVB=0.00433091;RO=0;SAF=24;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.538444;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=0.0237085;OID=.;OPOS=45392075;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:44:46:0:3:42:43:0.934783:18:24:0:0:18:25:0:3
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chr15	45404066	.	G	A	1177.24	PASS	AF=0.901099;AO=82;DP=91;FAO=82;FDP=91;FR=.;FRO=9;FSAF=53;FSAR=29;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.021295;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=250.97;QD=51.7466;RBI=0.0337096;REFB=-0.11589;REVB=0.0261317;RO=7;SAF=53;SAR=29;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0121195;STB=0.502201;STBP=0.928;TYPE=snp;VARB=0.000985049;OID=.;OPOS=45404066;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:91:91:7:9:82:82:0.901099:29:53:4:3:29:53:6:3
chr15	45404774	.	G	T	98.24	PASS	AF=0.241935;AO=15;DP=62;FAO=15;FDP=62;FR=.;FRO=47;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=39;FWDB=-0.00398871;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.886;QD=6.33814;RBI=0.0236123;REFB=-0.00578676;REVB=0.023273;RO=47;SAF=7;SAR=8;SRF=8;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.393337;STB=0.732504;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=0.0153779;OID=.;OPOS=45404774;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:62:62:47:47:15:15:0.241935:8:7:8:39:8:7:8:39
chr15	45408412	.	TCC	TC,TCG	283.55	PASS	AF=0.0454545,0.954545;AO=7,13;DP=21;FAO=1,21;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=1,13;FSAR=0,8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0119974,-0.0248078;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=26.0726,48.2751;QD=51.555;RBI=0.108096,0.234331;REFB=0,0;REVB=-0.107428,0.233014;RO=0;SAF=1,12;SAR=6,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-3.00075e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0799234,0.00451959;OID=.,.;OPOS=45408413,45408414;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=TC,TCG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0454545,0.954545:7,13:21:1,21:22:0:1,13:0,8:0:0:6:0:1,12:6,1:0:0
chr15	45408933	.	T	C	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0210192;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.198;QD=55.0986;RBI=0.0299388;REFB=0;REVB=0.0213196;RO=0;SAF=11;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.5769e-06;OID=.;OPOS=45408933;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:15:11:0:0:15:11:0:0
chr15	45444518	.	A	G	105.51	PASS	AF=0.333333;AO=13;DP=39;FAO=13;FDP=39;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=0.00825839;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.435;QD=10.8219;RBI=0.011812;REFB=0.00444214;REVB=0.00844521;RO=25;SAF=7;SAR=6;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114311;STB=0.578197;STBP=0.545;TYPE=snp;VARB=-0.00525958;OID=.;OPOS=45444518;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:25:26:13:13:0.333333:6:7:16:9:6:7:17:9
chr15	45446156	.	C	T	358.89	PASS	AF=0.653846;AO=33;DP=51;FAO=34;FDP=52;FR=.;FRO=18;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.000549011;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.9039;QD=27.6071;RBI=0.0489686;REFB=-0.0138143;REVB=0.0489655;RO=18;SAF=18;SAR=15;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0294699;STB=0.510198;STBP=0.845;TYPE=snp;VARB=0.005674;OID=.;OPOS=45446156;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:52:18:18:33:34:0.653846:15:18:9:9:16:18:9:9
chr15	45457519	.	T	G	642.87	PASS	AF=0.714286;AO=54;DP=76;FAO=55;FDP=77;FR=.;FRO=22;FSAF=18;FSAR=37;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=0.0202106;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.0559;QD=33.3959;RBI=0.021939;REFB=-0.0662081;REVB=0.00853529;RO=21;SAF=17;SAR=37;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0391536;STB=0.511698;STBP=0.78;TYPE=snp;VARB=0.0206865;OID=.;OPOS=45457519;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:77:21:22:54:55:0.714286:37:17:8:13:37:18:8:14
chr15	45467540	.	C	G	324.24	PASS	AF=0.83871;AO=26;DP=31;FAO=26;FDP=31;FR=.;FRO=5;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0160748;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.265;QD=41.8377;RBI=0.0288202;REFB=-0.0475872;REVB=0.0239208;RO=4;SAF=10;SAR=16;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0353662;STB=0.502616;STBP=0.996;TYPE=snp;VARB=0.0101712;OID=.;OPOS=45467540;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:26:31:31:4:5:26:26:0.83871:16:10:1:3:16:10:2:3
chr15	45545478	.	C	T	149.93	PASS	AF=0.516129;AO=16;DP=31;FAO=16;FDP=31;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=0.00423327;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=152.877;QD=19.3454;RBI=0.00816036;REFB=-0.00957832;REVB=0.00697645;RO=15;SAF=7;SAR=9;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0915042;STB=0.551804;STBP=0.605;TYPE=snp;VARB=0.0156134;OID=.;OPOS=45545478;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:15:15:16:16:0.516129:9:7:5:10:9:7:5:10
chr15	45554267	.	C	A	631.01	PASS	AF=0.736111;AO=53;DP=72;FAO=53;FDP=72;FR=.;FRO=19;FSAF=21;FSAR=32;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.0122712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.946;QD=35.0562;RBI=0.0130594;REFB=0.00395441;REVB=-0.00446836;RO=19;SAF=21;SAR=32;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0915867;STB=0.549337;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=-0.00124039;OID=.;OPOS=45554267;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:19:19:53:53:0.736111:32:21:11:8:32:21:11:8
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chr15	45654327	.	A	G	98.24	PASS	AF=0.241935;AO=15;DP=62;FAO=15;FDP=62;FR=.;FRO=47;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=24;FSRR=23;FWDB=0.024413;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.5313;QD=6.33834;RBI=0.0269685;REFB=0.0127457;REVB=0.0114589;RO=47;SAF=7;SAR=8;SRF=24;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0537025;STB=0.533289;STBP=0.809;TYPE=snp;VARB=-0.038668;OID=.;OPOS=45654327;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:62:62:47:47:15:15:0.241935:8:7:24:23:8:7:24:23
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chr15	45695695	.	G	A	181.98	PASS	AF=0.315789;AO=24;DP=76;FAO=24;FDP=76;FR=.;FRO=52;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=29;FSRR=23;FWDB=0.0074415;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.5711;QD=9.57771;RBI=0.0624522;REFB=-0.0167598;REVB=0.0620073;RO=50;SAF=11;SAR=13;SRF=29;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139408;STB=0.56763;STBP=0.45;TYPE=snp;VARB=0.0303695;OID=.;OPOS=45695695;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:50:52:24:24:0.315789:13:11:29:21:13:11:29:23
chr15	45777344	.	T	C	101.83	PASS	AF=0.282609;AO=13;DP=46;FAO=13;FDP=46;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=-0.0177083;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.1049;QD=8.85485;RBI=0.0342638;REFB=0.0093041;REVB=-0.0293329;RO=32;SAF=10;SAR=3;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.427926;STB=0.768817;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=-0.0244326;OID=.;OPOS=45777344;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:32:33:13:13:0.282609:3:10:13:19:3:10:13:20
chr15	45779810	.	G	A	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00699922;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=148.442;QD=59.4353;RBI=0.00784153;REFB=0;REVB=0.00353561;RO=0;SAF=19;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.1382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.02541e-05;OID=.;OPOS=45779810;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:16:19:0:0:16:19:0:0
chr15	45814306	.	A	G	120.18	PASS	AF=0.411765;AO=14;DP=34;FAO=14;FDP=34;FR=.;FRO=20;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.00938503;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=264.696;QD=14.1388;RBI=0.0123904;REFB=-0.0117276;REVB=-0.00808967;RO=20;SAF=11;SAR=3;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.328654;STB=0.693872;STBP=0.087;TYPE=snp;VARB=0.0197029;OID=.;OPOS=45814306;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:20:20:14:14:0.411765:3:11:10:10:3:11:10:10
chr15	45968435	.	T	C	216.31	PASS	AF=0.689655;AO=20;DP=29;FAO=20;FDP=29;FR=.;FRO=9;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.0139104;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.347;QD=29.8361;RBI=0.0145953;REFB=-0.0173867;REVB=0.00441853;RO=9;SAF=11;SAR=9;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121361;STB=0.566944;STBP=0.35;TYPE=snp;VARB=0.00355461;OID=.;OPOS=45968435;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:29:29:9:9:20:20:0.689655:9:11:3:6:9:11:3:6
chr15	48053229	.	C	A	464.81	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00334465;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.9932;QD=58.1018;RBI=0.0229469;REFB=0;REVB=-0.0227019;RO=0;SAF=14;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000574822;OID=.;OPOS=48053229;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:18:14:0:0:18:14:0:0
chr15	48058071	.	G	A	465.13	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0267406;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.784;QD=58.1407;RBI=0.0267719;REFB=0;REVB=0.00129228;RO=0;SAF=13;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000115487;OID=.;OPOS=48058071;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:19:13:0:0:19:13:0:0
chr15	48063076	.	T	C	972.87	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00403787;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.505;QD=58.9615;RBI=0.0262765;REFB=0;REVB=0.0259644;RO=0;SAF=47;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.53321e-05;OID=.;OPOS=48063076;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:19:47:0:0:19:47:0:0
chr15	48426484	.	A	G	616.85	PASS	AF=1;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0145598;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.802;QD=61.6852;RBI=0.0311789;REFB=0;REVB=0.0275705;RO=0;SAF=19;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000132188;OID=.;OPOS=48426484;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:40:0:0:40:40:1:21:19:0:0:21:19:0:0
chr15	48443699	.	T	C	632.24	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0124116;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.4067;QD=61.6814;RBI=0.0147875;REFB=0;REVB=0.00803876;RO=0;SAF=23;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000206135;OID=.;OPOS=48443699;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:18:23:0:0:18:23:0:0
chr15	48460927	.	C	T	1008.3	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0161101;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.424;QD=59.3118;RBI=0.0306618;REFB=0;REVB=-0.0260885;RO=0;SAF=35;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.62221e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000149659;OID=.;OPOS=48460927;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:68:0:0:67:68:1:32:35:0:0:32:36:0:0
chr15	48495508	.	C	T	632.18	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0110986;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.176;QD=61.6758;RBI=0.0128545;REFB=0;REVB=-0.00648532;RO=0;SAF=16;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.40185e-05;OID=.;OPOS=48495508;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:41:0:0:40:41:1:24:16:0:0:24:17:0:0
chr15	48539587	.	T	C	110.02	PASS	AF=0.266667;AO=16;DP=62;FAO=16;FDP=60;FR=.;FRO=44;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=21;FSRR=23;FWDB=-0.00898892;FXX=0.0322529;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.8473;QD=7.33478;RBI=0.0302201;REFB=-0.00287813;REVB=0.0288523;RO=43;SAF=9;SAR=7;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.088891;STB=0.562422;STBP=0.574;TYPE=snp;VARB=0.0105131;OID=.;OPOS=48539587;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:60:43:44:16:16:0.266667:7:9:21:22:7:9:21:23
chr15	48580627	.	C	T	129.28	PASS	AF=0.583333;AO=14;DP=24;FAO=14;FDP=24;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=0.0189364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.684;QD=21.5459;RBI=0.0197368;REFB=-0.00398992;REVB=0.00556354;RO=9;SAF=4;SAR=10;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0555298;STB=0.545392;STBP=0.689;TYPE=snp;VARB=0.00275856;OID=.;OPOS=48580627;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:24:24:9:10:14:14:0.583333:10:4:2:7:10:4:2:8
chr15	48580713	.	T	C	312.01	PASS	AF=1;AO=23;DP=24;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00176593;FXX=0.0416493;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.544;QD=54.2629;RBI=0.00609143;REFB=0;REVB=0.00582983;RO=0;SAF=7;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000179402;OID=.;OPOS=48580713;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:23:0:0:23:23:1:16:7:0:0:16:7:0:0
chr15	48595192	.	G	T	357.46	PASS	AF=0.931034;AO=27;DP=29;FAO=27;FDP=29;FR=.;FRO=2;FSAF=20;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0254484;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.6435;QD=49.3053;RBI=0.0835479;REFB=0.0745945;REVB=-0.0795778;RO=2;SAF=20;SAR=7;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115601;STB=0.562451;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=-0.00887023;OID=.;OPOS=48595192;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:29:29:2:2:27:27:0.931034:7:20:0:2:7:20:0:2
chr15	48623812	.	G	A	116.35	PASS	AF=0.341463;AO=14;DP=41;FAO=14;FDP=41;FR=.;FRO=27;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=0.00109256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.584;QD=11.3507;RBI=0.0412638;REFB=-0.0158148;REVB=0.0412493;RO=25;SAF=3;SAR=11;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.467181;STB=0.759614;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.0516935;OID=.;OPOS=48623812;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:25:27:14:14:0.341463:11:3:16:9:11:3:16:11
chr15	48701029	.	C	T	182.79	PASS	AF=0.941176;AO=16;DP=17;FAO=16;FDP=17;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00954757;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=255.588;QD=43.0099;RBI=0.0212008;REFB=0.0290038;REVB=0.0189292;RO=1;SAF=7;SAR=9;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0608641;STB=0.533291;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=-0.00100457;OID=.;OPOS=48701029;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:17:17:1:1:16:16:0.941176:9:7:1:0:9:7:1:0
chr15	48702457	.	C	A	724.12	PASS	AF=0.981132;AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0175832;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.727;QD=54.6505;RBI=0.0178516;REFB=-0.170931;REVB=0.00308406;RO=1;SAF=18;SAR=34;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0254452;STB=0.513508;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=0.00169845;OID=.;OPOS=48702457;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:53:53:1:1:52:52:0.981132:34:18:1:0:34:18:1:0
chr15	48807637	.	C	T	972.82	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0317872;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.8505;QD=58.9586;RBI=0.0323925;REFB=0;REVB=0.00623298;RO=0;SAF=30;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000306244;OID=.;OPOS=48807637;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:36:30:0:0:36:30:0:0
chr15	48818356	.	TAAAAA	TAAAA,TAAAAC	67.71	PASS	AF=0.375,0.0416667;AO=16,2;DP=48;FAO=18,2;FDP=48;FR=.;FRO=28;FSAF=3,0;FSAR=15,2;FSRF=19;FSRR=9;FWDB=0.0426153,0.0597689;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=1,1;MLLD=11.1026,25.9103;QD=5.64274;RBI=0.205578,0.0638013;REFB=-0.0856446,-0.05707;REVB=-0.201112,-0.0223222;RO=27;SAF=2,0;SAR=14,2;SRF=19;SRR=8;SSEN=0.369565,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.62966,-0.580472;STB=0.820529,0.996352;STBP=0.004,0.051;TYPE=del,snp;VARB=0.0249035,0.204177;OID=.,.;OPOS=48818357,48818361;OREF=A,A;OALT=-,C;OMAPALT=TAAAA,TAAAAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.375,0.0416667:16,2:48:18,2:48:28:3,0:15,2:19:9:60:27:2,0:14,2:19:8
chr15	49048705	.	G	C	125.85	PASS	AF=0.518519;AO=14;DP=27;FAO=14;FDP=27;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=0.0309787;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.938;QD=18.6439;RBI=0.0363222;REFB=-0.0124372;REVB=-0.0189637;RO=13;SAF=4;SAR=10;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0224043;STB=0.512802;STBP=0.941;TYPE=snp;VARB=0.00722821;OID=.;OPOS=49048705;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:13:13:14:14:0.518519:10:4:4:9:10:4:4:9
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chr15	50311135	.	C	A	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0366876;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.2209;QD=59.4355;RBI=0.0392593;REFB=0;REVB=-0.0139755;RO=0;SAF=16;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.1382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000294276;OID=.;OPOS=50311135;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:19:16:0:0:19:16:0:0
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chr15	51294832	.	G	A	660.93	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0129;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.0946;QD=61.4821;RBI=0.0138831;REFB=0;REVB=-0.00513115;RO=0;SAF=21;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00267402;OID=.;OPOS=51294832;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:43:0:0:42:43:1:21:21:0:0:22:21:0:0
chr15	51502844	.	A	C	1346.53	PASS	AF=0.98913;AO=88;DP=92;FAO=91;FDP=92;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00866198;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.2539;QD=58.545;RBI=0.175252;REFB=-0.169407;REVB=0.175038;RO=4;SAF=41;SAR=47;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0386343;STB=0.504949;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.00680668;OID=.;OPOS=51502844;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:92:92:4:1:88:91:0.98913:47:41:0:4:50:41:0:1
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chr15	51503881	.	T	A	443.98	PASS	AF=1;AO=25;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00013081;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.672;QD=57.2878;RBI=0.169519;REFB=0;REVB=0.169519;RO=0;SAF=14;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000836719;OID=.;OPOS=51503881;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:25:31:1:11:14:0:0:17:14:0:0
chr15	51503897	.	G	A	447.02	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0215085;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=264.206;QD=57.6802;RBI=0.0224147;REFB=0;REVB=-0.00630873;RO=0;SAF=14;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.4847e-05;OID=.;OPOS=51503897;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:17:14:0:0:17:14:0:0
chr15	51529112	.	T	C	851.05	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0276549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.7469;QD=57.698;RBI=0.0426371;REFB=0;REVB=0.032452;RO=0;SAF=34;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.03209e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.54247e-05;OID=.;OPOS=51529112;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:25:34:0:0:25:34:0:0
chr15	51689772	.	G	A	2383.05	PASS	AF=0.993671;AO=156;DP=158;FAO=157;FDP=158;FR=.;FRO=1;FSAF=50;FSAR=107;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0319424;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.02;QD=60.3305;RBI=0.0320001;REFB=-0.0257422;REVB=0.00192053;RO=1;SAF=50;SAR=106;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00446743;STB=0.502325;STBP=0.584;TYPE=snp;VARB=0.000420995;OID=.;OPOS=51689772;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:158:158:1:1:156:157:0.993671:106:50:0:1:107:50:0:1
chr15	51698867	.	T	C	375.67	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0405098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.23;QD=55.6542;RBI=0.0636486;REFB=0;REVB=0.0490927;RO=0;SAF=21;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000637424;OID=.;OPOS=51698867;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:6:21:0:0:6:21:0:0
chr15	51698922	.	C	T	745.97	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0200114;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.097;QD=56.2994;RBI=0.0205317;REFB=0;REVB=-0.00459275;RO=0;SAF=20;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.00761e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00021615;OID=.;OPOS=51698922;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:53:0:0:52:53:1:32:20:0:0:32:21:0:0
chr15	51783820	.	T	C	1182.7	PASS	AF=0.9875;AO=74;DP=75;FAO=79;FDP=80;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0656219;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.728;QD=59.135;RBI=0.066222;REFB=-0.0850875;REVB=0.00889448;RO=0;SAF=23;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504853;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.000518212;OID=.;OPOS=51783820;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:75:80:0:1:74:79:0.9875:51:23:0:0:51:28:0:1
chr15	51791559	.	A	G	305.85	PASS	AF=1;AO=22;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0475019;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.2598;QD=53.1905;RBI=0.0525969;REFB=0;REVB=0.0225832;RO=0;SAF=13;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2029e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00168366;OID=.;OPOS=51791559;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:22:23:1:9:13:0:0:9:14:0:0
chr15	51795172	.	G	A	782.26	PASS	AF=1;AO=48;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0251933;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.162;QD=63.8576;RBI=0.0253625;REFB=0;REVB=0.00292466;RO=0;SAF=17;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.79493e-05;OID=.;OPOS=51795172;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:48:49:1:31:17:0:0:32:17:0:0
chr15	51868373	.	A	G	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00554081;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.396;QD=45.8067;RBI=0.0341462;REFB=0;REVB=-0.0336937;RO=0;SAF=9;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000738014;OID=.;OPOS=51868373;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:5:9:0:0:5:9:0:0
chr15	52539673	.	C	T	968.32	PASS	AF=1;AO=64;DP=65;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0196724;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.8791;QD=58.6857;RBI=0.0322486;REFB=0;REVB=0.0255533;RO=0;SAF=27;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.1743e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.75197e-05;OID=.;OPOS=52539673;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:66:0:0:64:66:1:37:27:0:0:37:29:0:0
chr15	52556429	.	A	G,T	582.39	PASS	AF=0.948718,0.0512821;AO=37,2;DP=39;FAO=37,2;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=20,2;FSAR=17,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00475425,0.00251385;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=103.483,118.897;QD=59.7319;RBI=0.0191655,0.00887376;REFB=0,0;REVB=-0.0185664,-0.00851024;RO=0;SAF=20,2;SAR=17,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.71161e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.000525493,0.0408606;OID=.,.;OPOS=52556429,52556429;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:39:39:0:0:37,2:37,2:0.948718,0.0512821:17,0:20,2:0:0:17,0:20,2:0:0
chr15	52601033	.	T	C	750.31	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0244941;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=288.477;QD=56.6273;RBI=0.0265282;REFB=0;REVB=0.0101876;RO=0;SAF=31;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000111414;OID=.;OPOS=52601033;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:53:0:0:50:53:1:19:31:0:0:19:34:0:0
chr15	52604136	.	A	ATTTGTCATT	279.75	PASS	AF=1;AO=18;DP=25;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0103332;FXX=0.0869187;HRUN=3;LEN=9;MLLD=303.766;QD=53.2852;RBI=0.01042;REFB=0;REVB=0.00134264;RO=4;SAF=5;SAR=13;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0875116;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-1.7336e-05;OID=.;OPOS=52604137;OREF=-;OALT=TTTGTCATT;OMAPALT=ATTTGTCATT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:18:25:21:21:0:5:16:0:0:4:4:5:13:2:2
chr15	52643564	.	G	A	1213.22	PASS	AF=0.987654;AO=79;DP=80;FAO=80;FDP=81;FR=.;FRO=1;FSAF=51;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00254981;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.6357;QD=59.912;RBI=0.0246217;REFB=0.0282909;REVB=0.0244893;RO=1;SAF=51;SAR=28;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00919304;STB=0.504853;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=-0.000231465;OID=.;OPOS=52643564;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:80:81:1:1:79:80:0.987654:28:51:1:0:29:51:1:0
chr15	52667552	.	G	A	612.04	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0246037;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.887;QD=61.2042;RBI=0.0356348;REFB=0;REVB=-0.0257778;RO=0;SAF=20;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.14388e-06;OID=.;OPOS=52667552;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:20:20:0:0:20:20:0:0
chr15	52689526	.	T	C	518.91	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0982824;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=75.8508;QD=59.3038;RBI=0.0982993;REFB=0;REVB=0.00182273;RO=0;SAF=16;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.1382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000998389;OID=.;OPOS=52689526;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:19:16:0:0:19:16:0:0
chr15	52689631	.	T	G	613.73	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0107199;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.2465;QD=61.3734;RBI=0.112614;REFB=0;REVB=-0.112103;RO=0;SAF=16;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.43889e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00181175;OID=.;OPOS=52689631;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:40:0:0:39:40:1:23:16:0:0:23:17:0:0
chr15	52901283	.	TT	CC	537.41	PASS	AF=1;AO=35;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0205978;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=97.7994;QD=59.7125;RBI=0.0328109;REFB=0;REVB=0.0255398;RO=0;SAF=14;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.27896e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000217788;OID=.;OPOS=52901283;OREF=TT;OALT=CC;OMAPALT=CC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:35:36:1:21:14:0:0:22:14:0:0
chr15	52901914	.	T	C	86.81	PASS	AF=0.714286;AO=10;DP=14;FAO=10;FDP=14;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0762746;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.3063;QD=24.8029;RBI=0.0762755;REFB=0.00325277;REVB=0.000358915;RO=4;SAF=2;SAR=8;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179009;STB=0.599827;STBP=0.445;TYPE=snp;VARB=0.00324691;OID=.;OPOS=52901914;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:14:14:4:4:10:10:0.714286:8:2:0:4:8:2:0:4
chr15	53907948	.	G	A	154.31	PASS	AF=0.592593;AO=16;DP=27;FAO=16;FDP=27;FR=.;FRO=11;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.0511998;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.5542;QD=22.8608;RBI=0.0553828;REFB=-0.0140279;REVB=-0.0211148;RO=11;SAF=8;SAR=8;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0329238;STB=0.518495;STBP=0.845;TYPE=snp;VARB=0.00605416;OID=.;OPOS=53907948;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:27:27:11:11:16:16:0.592593:8:8:5:6:8:8:5:6
chr15	53994493	.	A	G	843.32	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0401636;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.594;QD=57.1744;RBI=0.0553298;REFB=0;REVB=0.0380561;RO=0;SAF=30;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000281411;OID=.;OPOS=53994493;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:59:0:0:58:59:1:28:30:0:0:28:31:0:0
chr15	54008795	.	T	C	325.79	PASS	AF=0.603774;AO=32;DP=53;FAO=32;FDP=53;FR=.;FRO=21;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=0.0433059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.7424;QD=24.5875;RBI=0.0573055;REFB=-0.0102606;REVB=0.0375303;RO=21;SAF=16;SAR=16;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120232;STB=0.565997;STBP=0.264;TYPE=snp;VARB=0.0103701;OID=.;OPOS=54008795;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:21:21:32:32:0.603774:16:16:14:7:16:16:14:7
chr15	54008845	.	T	C	727.79	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00464308;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.631;QD=63.2864;RBI=0.00848835;REFB=0;REVB=-0.0071059;RO=0;SAF=26;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.71255e-05;OID=.;OPOS=54008845;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:20:26:0:0:20:26:0:0
chr15	54306925	.	G	A	740.07	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0182634;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.8344;QD=56.9286;RBI=0.0446725;REFB=0;REVB=-0.0407686;RO=0;SAF=25;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94283e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000295185;OID=.;OPOS=54306925;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:52:0:0:51:52:1:26:25:0:0:26:26:0:0
chr15	54624313	.	T	A	270.04	PASS	AF=0.531915;AO=25;DP=47;FAO=25;FDP=47;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.00285837;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.47;QD=22.9822;RBI=0.00969909;REFB=0.00776531;REVB=0.00926833;RO=22;SAF=10;SAR=15;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0470681;STB=0.526295;STBP=0.727;TYPE=snp;VARB=-0.00872999;OID=.;OPOS=54624313;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:22:22:25:25:0.531915:15:10:10:12:15:10:10:12
chr15	54847677	.	C	T	140.32	PASS	AF=0.277778;AO=20;DP=72;FAO=20;FDP=72;FR=.;FRO=52;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=30;FSRR=22;FWDB=-0.0147951;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.171;QD=7.79574;RBI=0.0173701;REFB=0.00773803;REVB=-0.00910081;RO=52;SAF=9;SAR=11;SRF=30;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151408;STB=0.59082;STBP=0.378;TYPE=snp;VARB=-0.0187737;OID=.;OPOS=54847677;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:52:52:20:20:0.277778:11:9:30:22:11:9:30:22
chr15	54919047	.	A	G	80.01	PASS	AF=0.25;AO=11;DP=44;FAO=11;FDP=44;FR=.;FRO=33;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=0.0141574;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.988;QD=7.27372;RBI=0.0215239;REFB=0.0114799;REVB=0.0162126;RO=32;SAF=6;SAR=5;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0912041;STB=0.567779;STBP=0.614;TYPE=snp;VARB=-0.016081;OID=.;OPOS=54919047;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:80:44:44:32:33:11:11:0.25:5:6:15:17:5:6:15:18
chr15	55619796	.	T	C	451.18	PASS	AF=1;AO=30;DP=32;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0232958;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.746;QD=58.217;RBI=0.0285854;REFB=0;REVB=-0.016566;RO=0;SAF=15;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000318987;OID=.;OPOS=55619796;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:31:0:0:30:31:1:15:15:0:0:15:16:0:0
chr15	55632859	.	G	T	846.12	PASS	AF=0.968254;AO=60;DP=63;FAO=61;FDP=63;FR=.;FRO=2;FSAF=34;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0333215;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=53.882;QD=53.7218;RBI=0.0423197;REFB=-0.0575916;REVB=0.0260889;RO=3;SAF=34;SAR=26;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0513911;STB=0.517851;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=0.00285513;OID=.;OPOS=55632859;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:63:63:3:2:60:61:0.968254:26:34:0:3:27:34:0:2
chr15	55759193	.	T	C	64.09	PASS	AF=0.333333;AO=9;DP=27;FAO=9;FDP=27;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=-0.0168595;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.9506;QD=9.4943;RBI=0.0338226;REFB=-0.0287661;REVB=0.029321;RO=18;SAF=6;SAR=3;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0649014;OID=.;OPOS=55759193;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:27:27:18:18:9:9:0.333333:3:6:12:6:3:6:12:6
chr15	55911872	.	C	T	371.69	PASS	AF=0.660377;AO=34;DP=52;FAO=35;FDP=53;FR=.;FRO=18;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=0.00639699;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.5425;QD=28.0523;RBI=0.0454354;REFB=0.0335479;REVB=-0.0449828;RO=18;SAF=14;SAR=20;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127071;STB=0.572477;STBP=0.168;TYPE=snp;VARB=-0.0177702;OID=.;OPOS=55911872;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:53:18:18:34:35:0.660377:20:14:11:7:21:14:11:7
chr15	55970041	.	A	G	72.7	PASS	AF=0.30303;AO=10;DP=33;FAO=10;FDP=33;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=0.0035005;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.558;QD=8.81172;RBI=0.0300054;REFB=0.00231437;REVB=0.0298005;RO=23;SAF=6;SAR=4;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.28045;STB=0.670265;STBP=0.225;TYPE=snp;VARB=-0.00221078;OID=.;OPOS=55970041;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:33:33:23:23:10:10:0.30303:4:6:8:15:4:6:8:15
chr15	55972797	.	T	C	231.38	PASS	AF=0.277311;AO=33;DP=119;FAO=33;FDP=119;FR=.;FRO=86;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=44;FSRR=42;FWDB=0.0184045;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.41;QD=7.77756;RBI=0.0185986;REFB=-0.0032138;REVB=-0.00268037;RO=86;SAF=13;SAR=20;SRF=44;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144238;STB=0.585765;STBP=0.273;TYPE=snp;VARB=0.00945835;OID=.;OPOS=55972797;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:119:86:86:33:33:0.277311:20:13:44:42:20:13:44:42
chr15	56120962	.	T	C	262.99	PASS	AF=0.954545;AO=21;DP=22;FAO=21;FDP=22;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0432768;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.462;QD=47.8161;RBI=0.0432772;REFB=-0.0121655;REVB=0.000191557;RO=0;SAF=7;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.517225;STBP=0.592;TYPE=snp;VARB=0.000329869;OID=.;OPOS=56120962;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:22:22:0:1:21:21:0.954545:14:7:0:0:14:7:0:1
chr15	56139153	.	T	C	45.64	PASS	AF=0.333333;AO=7;DP=21;FAO=7;FDP=21;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=0.0296631;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.215;QD=8.69418;RBI=0.0458931;REFB=-0.00820998;REVB=0.0350182;RO=13;SAF=3;SAR=4;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.351603;STB=0.68373;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=0.075748;OID=.;OPOS=56139153;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:21:21:13:14:7:7:0.333333:4:3:10:3:4:3:10:4
chr15	56207811	.	T	G	116.3	PASS	AF=0.35;AO=14;DP=40;FAO=14;FDP=40;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=20;FSRR=6;FWDB=-0.00180726;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.635;QD=11.63;RBI=0.00234267;REFB=-0.0113196;REVB=0.00149061;RO=24;SAF=12;SAR=2;SRF=18;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.191712;STB=0.59984;STBP=0.481;TYPE=snp;VARB=0.028547;OID=.;OPOS=56207811;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:24:26:14:14:0.35:2:12:18:6:2:12:20:6
chr15	56207983	.	C	T	390.22	PASS	AF=0.756098;AO=31;DP=41;FAO=31;FDP=41;FR=.;FRO=10;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=-0.00226043;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.545;QD=38.0698;RBI=0.0119406;REFB=0.00583824;REVB=-0.0117247;RO=10;SAF=19;SAR=12;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.09827;STB=0.553363;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=-0.00297608;OID=.;OPOS=56207983;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:68:41:41:10:10:31:31:0.756098:12:19:4:6:12:19:4:6
chr15	56208535	.	G	A	111.41	PASS	AF=0.464286;AO=13;DP=28;FAO=13;FDP=28;FR=.;FRO=15;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=-0.0161621;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.655;QD=15.9153;RBI=0.0258394;REFB=-0.0127412;REVB=0.0201609;RO=15;SAF=3;SAR=10;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191832;STB=0.612058;STBP=0.337;TYPE=snp;VARB=0.0207367;OID=.;OPOS=56208535;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:28:15:15:13:13:0.464286:10:3:6:9:10:3:6:9
chr15	56258659	.	A	T	126.67	PASS	AF=0.333333;AO=15;DP=44;FAO=15;FDP=45;FR=.;FRO=30;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=0.0327838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.752;QD=11.2597;RBI=0.0418941;REFB=-0.0173159;REVB=-0.0260833;RO=29;SAF=6;SAR=9;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0550721;STB=0.522905;STBP=0.831;TYPE=snp;VARB=0.0243397;OID=.;OPOS=56258659;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:45:29:30:15:15:0.333333:9:6:13:16:9:6:13:17
chr15	56322148	.	C	T	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0436949;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.5447;QD=37.4879;RBI=0.0455618;REFB=0;REVB=-0.0129086;RO=0;SAF=2;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.58669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00342942;OID=.;OPOS=56322148;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:6:2:0:0:6:2:0:0
chr15	56322156	.	T	C	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0489067;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.6605;QD=35.5759;RBI=0.0685398;REFB=0;REVB=0.0480191;RO=0;SAF=2;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.27427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00784355;OID=.;OPOS=56322156;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:5:2:0:0:5:2:0:0
chr15	56386577	.	T	G	708.55	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00628401;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.647;QD=62.9817;RBI=0.0117989;REFB=0;REVB=-0.00998627;RO=0;SAF=22;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.34908e-05;OID=.;OPOS=56386577;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:45:0:0:44:45:1:22:22:0:0:22:23:0:0
chr15	56387142	.	G	A	308.25	PASS	AF=0.571429;AO=31;DP=55;FAO=32;FDP=56;FR=.;FRO=24;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=17;FWDB=-0.00836511;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.437;QD=22.0178;RBI=0.00837009;REFB=-0.0165941;REVB=-0.000288522;RO=24;SAF=18;SAR=13;SRF=7;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.225131;STB=0.627675;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=0.0168801;OID=.;OPOS=56387142;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:56:24:24:31:32:0.571429:13:18:7:17:13:19:7:17
chr15	56387606	.	C	G	102.4	PASS	AF=0.264151;AO=14;DP=53;FAO=14;FDP=53;FR=.;FRO=39;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=-0.0383732;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.3696;QD=7.72811;RBI=0.0626989;REFB=0.00410075;REVB=0.0495848;RO=39;SAF=4;SAR=10;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.253729;STB=0.656909;STBP=0.196;TYPE=snp;VARB=-0.0133222;OID=.;OPOS=56387606;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:39:39:14:14:0.264151:10:4:19:20:10:4:19:20
chr15	56387931	.	C	T	598.13	PASS	AF=1;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.017243;FXX=0.0249938;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.7582;QD=61.3463;RBI=0.0172921;REFB=0;REVB=0.00130319;RO=1;SAF=14;SAR=25;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0183853;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000225422;OID=.;OPOS=56387931;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:39:1:0:39:39:1:25:14:0:1:25:14:0:0
chr15	56721264	.	G	A	379.48	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0129784;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.341;QD=56.2196;RBI=0.0216656;REFB=0;REVB=-0.0173481;RO=0;SAF=18;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000439137;OID=.;OPOS=56721264;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:9:18:0:0:9:18:0:0
chr15	56923714	.	G	A	727.19	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00646961;FXX=0.0377287;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.277;QD=57.0347;RBI=0.00812705;REFB=0;REVB=-0.00491865;RO=0;SAF=35;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.87758e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000156039;OID=.;OPOS=56923714;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:51:0:0:50:51:1:15:35:0:0:16:35:0:0
chr15	56946980	.	T	G	358.68	PASS	AF=0.74359;AO=29;DP=40;FAO=29;FDP=39;FR=.;FRO=10;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=-0.0318677;FXX=0.0249938;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.391;QD=36.7875;RBI=0.0458784;REFB=7.00537e-05;REVB=0.0330043;RO=10;SAF=15;SAR=14;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0552007;STB=0.530015;STBP=0.552;TYPE=snp;VARB=0.00133843;OID=.;OPOS=56946980;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:71:40:39:10:10:29:29:0.74359:14:15:4:6:14:15:4:6
chr15	56959028	.	C	T	142.6	PASS	AF=0.289855;AO=20;DP=69;FAO=20;FDP=69;FR=.;FRO=49;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=33;FWDB=-0.0269171;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.356;QD=8.2667;RBI=0.0352065;REFB=-0.0128657;REVB=-0.022693;RO=49;SAF=15;SAR=5;SRF=16;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.48279;STB=0.785937;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.026325;OID=.;OPOS=56959028;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:49:49:20:20:0.289855:5:15:16:33:5:15:16:33
chr15	57731335	.	A	C	306.31	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0474507;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.1269;QD=53.2715;RBI=0.0479784;REFB=0;REVB=-0.00709621;RO=0;SAF=8;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000519881;OID=.;OPOS=57731335;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:15:8:0:0:15:8:0:0
chr15	57731728	.	A	G	613.35	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112014;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.865;QD=61.3352;RBI=0.0113133;REFB=0;REVB=0.0015867;RO=0;SAF=21;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.72865e-05;OID=.;OPOS=57731728;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:19:21:0:0:19:21:0:0
chr15	57918069	.	A	G	104.07	PASS	AF=0.263158;AO=15;DP=57;FAO=15;FDP=57;FR=.;FRO=42;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=0.0123221;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=294.718;QD=7.30285;RBI=0.0189546;REFB=0.0107332;REVB=-0.0144029;RO=42;SAF=7;SAR=8;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.097069;STB=0.559362;STBP=0.609;TYPE=snp;VARB=-0.0289758;OID=.;OPOS=57918069;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:42:42:15:15:0.263158:8:7:23:19:8:7:23:19
chr15	57918090	.	A	G	712.69	PASS	AF=0.980769;AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00580578;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.2172;QD=54.822;RBI=0.0179216;REFB=-0.12062;REVB=-0.0169552;RO=1;SAF=25;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0184631;STB=0.5098;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=0.0034218;OID=.;OPOS=57918090;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:52:52:1:1:51:51:0.980769:26:25:1:0:26:25:1:0
chr15	57925836	.	C	T	436.89	PASS	AF=0.755556;AO=33;DP=44;FAO=34;FDP=45;FR=.;FRO=11;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.0119654;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.8431;QD=38.8344;RBI=0.0148276;REFB=-0.00900209;REVB=0.00875708;RO=11;SAF=19;SAR=14;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0566315;STB=0.525677;STBP=0.567;TYPE=snp;VARB=0.00312604;OID=.;OPOS=57925836;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:79:44:45:11:11:33:34:0.755556:14:19:5:6:15:19:5:6
chr15	57967219	.	T	C	1048.1	PASS	AF=0.986111;AO=71;DP=72;FAO=71;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0173058;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.497;QD=58.2277;RBI=0.0193082;REFB=-0.0798561;REVB=-0.00856258;RO=1;SAF=36;SAR=35;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0133193;STB=0.50704;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=0.00031356;OID=.;OPOS=57967219;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:72:72:1:1:71:71:0.986111:35:36:0:1:35:36:0:1
chr15	58256127	.	C	T	174.43	PASS	AF=0.323944;AO=23;DP=71;FAO=23;FDP=71;FR=.;FRO=48;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=31;FWDB=0.00505659;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.887;QD=9.82678;RBI=0.0278392;REFB=-0.00920931;REVB=-0.0273761;RO=48;SAF=16;SAR=7;SRF=17;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.38412;STB=0.724483;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.0114088;OID=.;OPOS=58256127;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:48:48:23:23:0.323944:7:16:17:31:7:16:17:31
chr15	58444720	.	A	T	141.85	PASS	AF=0.241379;AO=21;DP=87;FAO=21;FDP=87;FR=.;FRO=66;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=25;FSRR=41;FWDB=-0.0142524;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.6;QD=6.52183;RBI=0.0250333;REFB=0.00311274;REVB=-0.0205799;RO=66;SAF=9;SAR=12;SRF=25;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.06375;STB=0.538947;STBP=0.728;TYPE=snp;VARB=-0.00994124;OID=.;OPOS=58444720;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:66:66:21:21:0.241379:12:9:25:41:12:9:25:41
chr15	58471368	.	C	T	1014.91	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0107035;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.776;QD=58.8354;RBI=0.0206551;REFB=0;REVB=0.0176654;RO=0;SAF=29;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.62746e-05;OID=.;OPOS=58471368;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:65:69:0:0:65:69:1:36:29:0:0:38:31:0:0
chr15	58476281	.	A	G	754.43	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0155468;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.254;QD=56.9381;RBI=0.0155568;REFB=0;REVB=0.000557658;RO=0;SAF=20;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.88914e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.4451e-05;OID=.;OPOS=58476281;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:33:20:0:0:33:20:0:0
chr15	58833993	.	G	A	92.87	PASS	AF=0.285714;AO=12;DP=43;FAO=12;FDP=42;FR=.;FRO=30;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=20;FSRR=10;FWDB=-0.0174603;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.9937;QD=8.84474;RBI=0.0176986;REFB=-0.0255502;REVB=-0.00289452;RO=30;SAF=7;SAR=5;SRF=20;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102706;STB=0.5624;STBP=0.648;TYPE=snp;VARB=0.0596817;OID=.;OPOS=58833993;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:43:42:30:30:12:12:0.285714:5:7:20:10:5:7:20:10
chr15	58838010	.	A	G	1225.8	PASS	AF=0.87619;AO=90;DP=106;FAO=92;FDP=105;FR=.;FRO=13;FSAF=63;FSAR=29;FSRF=10;FSRR=3;FWDB=0.0107983;FXX=0.00943307;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.289;QD=46.6972;RBI=0.0114123;REFB=-0.00542575;REVB=0.00369299;RO=0;SAF=61;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512216;STBP=0.57;TYPE=snp;VARB=0.00225942;OID=.;OPOS=58838010;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:59:106:105:0:13:90:92:0.87619:29:61:0:0:29:63:10:3
chr15	58853079	.	C	A	504.18	PASS	AF=0.972222;AO=33;DP=35;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0195494;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.873;QD=56.0201;RBI=0.0689142;REFB=-0.101758;REVB=0.0660832;RO=1;SAF=17;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0266901;STB=0.514278;STBP=0.539;TYPE=snp;VARB=0.0010597;OID=.;OPOS=58853079;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:35:36:1:1:33:35:0.972222:16:17:1:0:18:17:1:0
chr15	58853109	.	A	G	630.91	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0413237;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.9173;QD=61.5525;RBI=0.0970141;REFB=0;REVB=0.0877729;RO=0;SAF=15;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000610892;OID=.;OPOS=58853109;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:26:15:0:0:26:15:0:0
chr15	58860963	.	C	A	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00903083;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=328.645;QD=55.0987;RBI=0.0100054;REFB=0;REVB=-0.00430729;RO=0;SAF=10;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.71087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.83999e-06;OID=.;OPOS=58860963;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:16:10:0:0:16:10:0:0
chr15	58892410	.	T	C	375.63	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0110438;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.6532;QD=55.6493;RBI=0.0500523;REFB=0;REVB=0.0488187;RO=0;SAF=11;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000677485;OID=.;OPOS=58892410;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:16:11:0:0:16:11:0:0
chr15	58947625	.	A	G	62.22	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0535861;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.0798;QD=35.5569;RBI=0.0970493;REFB=0;REVB=0.0809142;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0027099;OID=.;OPOS=58947625;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:3:4:0:0:3:4:0:0
chr15	58983425	.	G	C	538.54	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0586888;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.097;QD=59.8381;RBI=0.0586961;REFB=0;REVB=0.000924711;RO=0;SAF=23;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.21415e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00014121;OID=.;OPOS=58983425;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:13:23:0:0:13:23:0:0
chr15	58983588	.	T	A	1080.55	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.027973;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.645;QD=60.0307;RBI=0.030842;REFB=0;REVB=-0.0129901;RO=0;SAF=38;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.79159e-05;OID=.;OPOS=58983588;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:34:38:0:0:34:38:0:0
chr15	59147037	.	A	T	358.09	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0591175;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.873;QD=55.0912;RBI=0.0603821;REFB=0;REVB=0.0122931;RO=0;SAF=13;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000681322;OID=.;OPOS=59147037;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:13:13:0:0:13:13:0:0
chr15	59147413	.	T	A	365.1	PASS	AF=0.964286;AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00478888;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=217.278;QD=52.1575;RBI=0.0271226;REFB=-0.140219;REVB=0.0266965;RO=0;SAF=13;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.39874e-08;STB=0.517229;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.00138752;OID=.;OPOS=59147413;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:28:28:0:1:27:27:0.964286:14:13:0:0:14:13:0:1
chr15	59347929	.	C	A	559.34	PASS	AF=0.690141;AO=49;DP=71;FAO=49;FDP=71;FR=.;FRO=22;FSAF=15;FSAR=34;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=-0.0276011;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.1749;QD=31.5122;RBI=0.0276311;REFB=0.000826666;REVB=0.00128752;RO=22;SAF=15;SAR=34;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00809733;STB=0.504381;STBP=0.936;TYPE=snp;VARB=-0.0007295;OID=.;OPOS=59347929;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:22:22:49:49:0.690141:34:15:7:15:34:15:7:15
chr15	59368167	.	G	A	370.76	PASS	AF=0.610169;AO=36;DP=59;FAO=36;FDP=59;FR=.;FRO=23;FSAF=26;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.0279108;FXX=0.0166639;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.4924;QD=25.136;RBI=0.0543832;REFB=-0.00218862;REVB=0.0466747;RO=23;SAF=26;SAR=10;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194582;STB=0.607156;STBP=0.056;TYPE=snp;VARB=0.000857154;OID=.;OPOS=59368167;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:23:23:36:36:0.610169:10:26:11:12:10:26:11:12
chr15	59499179	.	G	A	93.38	PASS	AF=0.315789;AO=12;DP=38;FAO=12;FDP=38;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=0.0314861;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.318;QD=9.8298;RBI=0.0341806;REFB=-0.0230389;REVB=0.0133018;RO=26;SAF=6;SAR=6;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.04353;STB=0.526272;STBP=0.826;TYPE=snp;VARB=0.0371606;OID=.;OPOS=59499179;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:93:38:38:26:26:12:12:0.315789:6:6:14:12:6:6:14:12
chr15	59499228	.	C	T	125.71	PASS	AF=0.319149;AO=15;DP=47;FAO=15;FDP=47;FR=.;FRO=32;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=0.0112275;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.44;QD=10.6984;RBI=0.0166383;REFB=-0.00346017;REVB=-0.0122792;RO=31;SAF=9;SAR=6;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0963259;STB=0.568873;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.00529246;OID=.;OPOS=59499228;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:31:32:15:15:0.319149:6:9:16:15:6:9:16:16
chr15	59499274	.	C	A	118.52	PASS	AF=0.358974;AO=14;DP=40;FAO=14;FDP=39;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.0050074;FXX=0.0249938;HRUN=5;LEN=1;MLLD=278.059;QD=12.1559;RBI=0.018197;REFB=-0.00607524;REVB=0.0174945;RO=25;SAF=7;SAR=7;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0216762;STB=0.512802;STBP=0.951;TYPE=snp;VARB=0.0124916;OID=.;OPOS=59499274;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:39:25:25:14:14:0.358974:7:7:13:12:7:7:13:12
chr15	59499472	.	G	A	135.77	PASS	AF=0.7;AO=14;DP=20;FAO=14;FDP=20;FR=.;FRO=6;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0333351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.728;QD=27.1536;RBI=0.051941;REFB=-0.00756148;REVB=-0.0398326;RO=6;SAF=6;SAR=8;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0526313;STB=0.52937;STBP=0.71;TYPE=snp;VARB=0.00364235;OID=.;OPOS=59499472;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:20:20:6:6:14:14:0.7:8:6:2:4:8:6:2:4
chr15	59500116	.	T	C	93.38	PASS	AF=0.315789;AO=12;DP=38;FAO=12;FDP=38;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=-0.00316312;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.409;QD=9.82981;RBI=0.0143402;REFB=0.00067412;REVB=-0.0139869;RO=25;SAF=5;SAR=7;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0193011;STB=0.52269;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=-0.00420142;OID=.;OPOS=59500116;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:93:38:38:25:26:12:12:0.315789:7:5:10:15:7:5:10:16
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chr15	59500255	.	C	T	129.47	PASS	AF=0.8125;AO=13;DP=16;FAO=13;FDP=16;FR=.;FRO=3;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.00374705;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=331.561;QD=32.3683;RBI=0.0353709;REFB=-0.00471344;REVB=0.0351719;RO=3;SAF=8;SAR=5;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.018345;STB=0.510188;STBP=0.974;TYPE=snp;VARB=0.00147503;OID=.;OPOS=59500255;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:16:16:3:3:13:13:0.8125:5:8:2:1:5:8:2:1
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chr15	59682486	.	G	GT,T	49.12	PASS	AF=0.216216,0;AO=6,2;DP=37;FAO=8,0;FDP=37;FR=.;FRO=29;FSAF=5,0;FSAR=3,0;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=-0.00603285,-0.00837342;FXX=0;HRUN=2,1;LEN=1,1;MLLD=26.6124,261.225;QD=5.30999;RBI=0.0275102,0.011896;REFB=-0.0056779,0.00247389;REVB=-0.0268406,-0.00844993;RO=29;SAF=4,1;SAR=2,1;SRF=14;SRR=15;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.219846,0.0154067;STB=0.611963,0.5;STBP=0.52,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.0129971,0;OID=.,.;OPOS=59682487,59682486;OREF=-,G;OALT=T,T;OMAPALT=GT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:49:37:37:29:29:6,2:8,0:0.216216,0:2,1:4,1:14:15:3,0:5,0:14:15
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chr15	59784493	.	C	T	255.17	PASS	AF=0.521739;AO=24;DP=46;FAO=24;FDP=46;FR=.;FRO=22;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=0.00271807;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=300.557;QD=22.1888;RBI=0.00975486;REFB=-0.0174138;REVB=-0.00936853;RO=22;SAF=13;SAR=11;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112857;STB=0.563125;STBP=0.382;TYPE=snp;VARB=0.0132929;OID=.;OPOS=59784493;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:22:22:24:24:0.521739:11:13:9:13:11:13:9:13
chr15	59911892	.	G	T	868.25	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0119278;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.289;QD=57.883;RBI=0.0287288;REFB=0;REVB=0.0261357;RO=0;SAF=32;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000123644;OID=.;OPOS=59911892;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:28:32:0:0:28:32:0:0
chr15	59912253	.	A	C	465.11	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.005798;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.2181;QD=58.1385;RBI=0.0375192;REFB=0;REVB=0.0370685;RO=0;SAF=17;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000320985;OID=.;OPOS=59912253;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:15:17:0:0:15:17:0:0
chr15	59912625	.	G	A	196.04	PASS	AF=1;AO=14;DP=17;FAO=16;FDP=16;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0218473;FXX=0.0587889;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.3484;QD=49.0102;RBI=0.108439;REFB=0;REVB=0.106215;RO=0;SAF=6;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0011462;OID=.;OPOS=59912625;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:16:0:0:14:16:1:8:6:0:0:10:6:0:0
chr15	60298221	.	C	A	405.17	PASS	AF=0.9375;AO=29;DP=32;FAO=30;FDP=32;FR=.;FRO=2;FSAF=4;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.205047;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=52.432;QD=50.6468;RBI=0.205079;REFB=-0.137624;REVB=-0.00364609;RO=1;SAF=3;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132075;STB=0.518506;STBP=0.647;TYPE=snp;VARB=0.0115731;OID=.;OPOS=60298221;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:32:32:1:2:29:30:0.9375:26:3:1:0:26:4:0:2
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chr15	60690089	.	A	G	85.72	PASS	AF=1;AO=8;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0709322;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.6114;QD=38.0994;RBI=0.0710609;REFB=0;REVB=0.00427365;RO=0;SAF=3;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0027285;OID=.;OPOS=60690089;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:8:9:1:5:3:0:0:6:3:0:0
chr15	60715798	.	T	TG	358.04	PASS	AF=1;AO=4;DP=34;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0715542;FXX=0.0588062;HRUN=1;LEN=1;MLLD=23.8771;QD=44.7545;RBI=0.249613;REFB=0;REVB=0.239137;RO=30;SAF=1;SAR=3;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.347118;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.012462;OID=.;OPOS=60715799;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:4:34:32:32:0:16:16:0:0:7:30:1:3:17:13
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chr15	62244117	.	G	A	327.99	PASS	AF=0.651163;AO=27;DP=43;FAO=28;FDP=43;FR=.;FRO=15;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=-0.000330469;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.829;QD=30.5105;RBI=0.0316951;REFB=0.029972;REVB=-0.0316933;RO=16;SAF=13;SAR=14;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0297906;STB=0.534859;STBP=0.552;TYPE=snp;VARB=-0.0169746;OID=.;OPOS=62244117;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:16:15:27:28:0.651163:14:13:7:9:14:14:6:9
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chr15	62299603	.	T	G	125.4	PASS	AF=0.303571;AO=17;DP=56;FAO=17;FDP=56;FR=.;FRO=39;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=-0.0400892;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=67.1298;QD=8.95684;RBI=0.0422241;REFB=-0.000257035;REVB=-0.0132563;RO=37;SAF=14;SAR=3;SRF=22;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.328693;STB=0.705297;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=-2.18542e-06;OID=.;OPOS=62299603;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:37:39:17:17:0.303571:3:14:22:15:3:14:23:16
chr15	62539781	.	A	G	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0187693;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.409;QD=53.277;RBI=0.0212914;REFB=0;REVB=-0.0100516;RO=0;SAF=13;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00030233;OID=.;OPOS=62539781;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:10:13:0:0:10:13:0:0
chr15	63009804	.	C	T	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0516441;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.18;QD=51.1846;RBI=0.055031;REFB=0;REVB=0.0190078;RO=0;SAF=9;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000670382;OID=.;OPOS=63009804;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:11:9:0:0:11:9:0:0
chr15	63047778	.	C	T	861.19	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.054731;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.843;QD=57.4128;RBI=0.0712008;REFB=0;REVB=0.0455419;RO=0;SAF=31;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000409128;OID=.;OPOS=63047778;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:60:0:0:59:60:1:28:31:0:0:29:31:0:0
chr15	63335907	.	C	G	148.13	PASS	AF=0.484848;AO=16;DP=33;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.0157147;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.6539;QD=17.9556;RBI=0.0159912;REFB=-0.0675835;REVB=-0.00296039;RO=16;SAF=5;SAR=11;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.229204;STB=0.61832;STBP=0.2;TYPE=snp;VARB=0.0115778;OID=.;OPOS=63335907;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:16:17:16:16:0.484848:11:5:9:7:11:5:9:8
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chr15	63351840	.	C	A	86.81	PASS	AF=0.714286;AO=10;DP=14;FAO=10;FDP=14;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.0339735;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.801;QD=24.802;RBI=0.0360575;REFB=0.00773159;REVB=0.0120809;RO=4;SAF=2;SAR=8;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0381322;STB=0.521694;STBP=0.909;TYPE=snp;VARB=-0.00429891;OID=.;OPOS=63351840;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:14:14:4:4:10:10:0.714286:8:2:1:3:8:2:1:3
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chr15	63954029	.	C	T	90.76	PASS	AF=0.266667;AO=12;DP=45;FAO=12;FDP=45;FR=.;FRO=33;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=0.00200493;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.798;QD=8.06779;RBI=0.0100166;REFB=-0.00277171;REVB=0.00981392;RO=33;SAF=6;SAR=6;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0539548;STB=0.533278;STBP=0.79;TYPE=snp;VARB=0.0101773;OID=.;OPOS=63954029;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:90:45:45:33:33:12:12:0.266667:6:6:18:15:6:6:18:15
chr15	63970456	.	T	C	84.34	PASS	AF=0.34375;AO=11;DP=32;FAO=11;FDP=32;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.024285;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.025;QD=10.5421;RBI=0.0245673;REFB=-0.000194598;REVB=-0.00371313;RO=21;SAF=8;SAR=3;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.333904;STB=0.701378;STBP=0.109;TYPE=snp;VARB=0.000680489;OID=.;OPOS=63970456;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:32:32:21:21:11:11:0.34375:3:8:9:12:3:8:9:12
chr15	63988357	.	C	G	89.48	PASS	AF=0.244898;AO=12;DP=49;FAO=12;FDP=49;FR=.;FRO=37;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=0.108362;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.3187;QD=7.30408;RBI=0.110341;REFB=0.00247774;REVB=-0.0208049;RO=37;SAF=5;SAR=7;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180683;STB=0.612609;STBP=0.395;TYPE=snp;VARB=-0.00264308;OID=.;OPOS=63988357;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:49:49:37:37:12:12:0.244898:7:5:21:16:7:5:21:16
chr15	64215375	.	G	C	508.36	PASS	AF=0.972222;AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00381742;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.338;QD=56.4849;RBI=0.0145855;REFB=-0.0543052;REVB=0.014077;RO=1;SAF=15;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0301623;STB=0.51612;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.00179909;OID=.;OPOS=64215375;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:36:36:1:1:35:35:0.972222:20:15:1:0:20:15:1:0
chr15	64367745	.	T	C	52.35	PASS	AF=0.7;AO=7;DP=10;FAO=7;FDP=10;FR=.;FRO=3;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.126875;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.1705;QD=20.9413;RBI=0.134081;REFB=0.0473146;REVB=0.0433629;RO=3;SAF=4;SAR=3;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122639;STB=0.571224;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=-0.00365138;OID=.;OPOS=64367745;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:10:10:3:3:7:7:0.7:3:4:1:2:3:4:1:2
chr15	64385851	.	T	C	393.22	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0429748;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.017;QD=56.174;RBI=0.0488795;REFB=0;REVB=-0.023289;RO=0;SAF=14;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00165584;OID=.;OPOS=64385851;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:14:14:0:0:14:14:0:0
chr15	64418397	.	G	A	52.35	PASS	AF=0.25;AO=8;DP=32;FAO=8;FDP=32;FR=.;FRO=24;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=-0.0278593;FXX=0.0588062;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.0358;QD=6.54398;RBI=0.0347789;REFB=-0.0301006;REVB=0.020819;RO=21;SAF=3;SAR=5;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114488;STB=0.533815;STBP=0.873;TYPE=snp;VARB=0.0686774;OID=.;OPOS=64418397;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:32:32:21:24:8:8:0.25:5:3:6:15:5:3:8:16
chr15	64430607	.	T	C	53.79	PASS	AF=0.470588;AO=2;DP=17;FAO=8;FDP=17;FR=.,HEALED;FRO=9;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=-0.0312382;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.382;QD=12.6553;RBI=0.0313361;REFB=-0.0523395;REVB=-0.00247548;RO=6;SAF=2;SAR=0;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.794076;STB=0.703751;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.110522;OID=.;OPOS=64430607;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:17:17:6:9:2:8:0.470588:0:2:0:6:3:5:2:7
chr15	64634884	.	C	A	259.35	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0335562;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.2659;QD=47.1551;RBI=0.0643637;REFB=-0.16608;REVB=-0.0549241;RO=0;SAF=14;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5931e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0130961;OID=.;OPOS=64634884;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:20:22:0:0:20:22:1:6:14:0:0:7:15:0:0
chr15	64737225	.	G	A	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00783685;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.485;QD=48.7372;RBI=0.0207092;REFB=0;REVB=0.0191691;RO=0;SAF=12;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000110485;OID=.;OPOS=64737225;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:5:12:0:0:5:12:0:0
chr15	64792896	.	G	A	791.03	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0147744;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.809;QD=63.2825;RBI=0.0322712;REFB=0;REVB=-0.0286905;RO=0;SAF=22;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000150706;OID=.;OPOS=64792896;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:50:0:0:48:50:1:26:22:0:0:26:24:0:0
chr15	64793617	.	A	G	428.91	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0225862;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.961;QD=57.1884;RBI=0.022629;REFB=0;REVB=0.00139076;RO=0;SAF=16;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.56309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000130064;OID=.;OPOS=64793617;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:14:16:0:0:14:16:0:0
chr15	64794955	.	A	G	577.86	PASS	AF=0.854167;AO=41;DP=48;FAO=41;FDP=48;FR=.;FRO=7;FSAF=16;FSAR=25;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.0214541;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.7232;QD=48.1551;RBI=0.0272825;REFB=-0.0124787;REVB=-0.0168539;RO=7;SAF=16;SAR=25;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0905234;STB=0.548565;STBP=0.136;TYPE=snp;VARB=0.00164798;OID=.;OPOS=64794955;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:40:48:48:7:7:41:41:0.854167:25:16:5:2:25:16:5:2
chr15	64915106	.	C	T	522.57	PASS	AF=0.972973;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0166417;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.3323;QD=56.4942;RBI=0.0170984;REFB=-0.148083;REVB=-0.00392559;RO=1;SAF=21;SAR=15;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0301788;STB=0.51612;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=0.00672221;OID=.;OPOS=64915106;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:37:37:1:1:36:36:0.972973:15:21:0:1:15:21:0:1
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chr15	64962630	.	A	C	718.81	PASS	AF=0.888889;AO=48;DP=63;FAO=56;FDP=63;FR=.,HEALED;FRO=7;FSAF=20;FSAR=36;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.0279218;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=39.0456;QD=45.6388;RBI=0.0313977;REFB=-0.0730574;REVB=0.0143593;RO=6;SAF=14;SAR=34;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0104414;STB=0.508596;STBP=0.717;TYPE=snp;VARB=0.015923;OID=.;OPOS=64962630;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:63:63:6:7:48:56:0.888889:34:14:2:4:36:20:3:4
chr15	64977358	.	GTTTTTT	GTTTTTA,GTTTTT	82.3	PASS	AF=0.097561,0.463415;AO=3,10;DP=47;FAO=4,19;FDP=41;FR=.;FRO=18;FSAF=3,10;FSAR=1,9;FSRF=4;FSRR=14;FWDB=-0.0942931,-0.222563;FXX=0.163232;HRUN=7,7;LEN=1,1;MLLD=158.621,7.21666;QD=8.02927;RBI=0.0943146,0.27746;REFB=-0.00435588,-0.1634;REVB=-0.00201302,0.165679;RO=19;SAF=2,5;SAR=1,5;SRF=3;SRR=16;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.55105,0.38397;STB=0.864043,0.645924;STBP=0.276,0.111;TYPE=snp,del;VARB=0.0898514,-0.0643864;OID=.,.;OPOS=64977364,64977359;OREF=T,T;OALT=A,-;OMAPALT=GTTTTTA,GTTTTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0.097561,0.463415:3,10:47:4,19:41:18:3,10:1,9:4:14:51:19:2,5:1,5:3:16
chr15	65108479	.	T	C	53.37	PASS	AF=0.285714;AO=8;DP=28;FAO=8;FDP=28;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.0147372;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.0543;QD=7.62441;RBI=0.0177075;REFB=-0.00941431;REVB=0.00981679;RO=20;SAF=5;SAR=3;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144365;STB=0.590679;STBP=0.552;TYPE=snp;VARB=0.0255066;OID=.;OPOS=65108479;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:28:28:20:20:8:8:0.285714:3:5:10:10:3:5:10:10
chr15	65108504	.	A	T	203.9	PASS	AF=0.689655;AO=18;DP=28;FAO=20;FDP=29;FR=.;FRO=9;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.059581;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.724;QD=28.1236;RBI=0.0598321;REFB=-0.0551572;REVB=-0.00547589;RO=7;SAF=9;SAR=9;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108655;STB=0.532839;STBP=0.66;TYPE=snp;VARB=0.0194318;OID=.;OPOS=65108504;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:28:29:7:9:18:20:0.689655:9:9:5:2:11:9:5:4
chr15	65110254	.	T	G	99.54	PASS	AF=0.219178;AO=16;DP=73;FAO=16;FDP=73;FR=.;FRO=57;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=32;FSRR=25;FWDB=-0.0146589;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.04;QD=5.45443;RBI=0.0163082;REFB=-0.0023425;REVB=-0.00714657;RO=57;SAF=7;SAR=9;SRF=32;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152942;STB=0.595807;STBP=0.416;TYPE=snp;VARB=0.010038;OID=.;OPOS=65110254;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:57:57:16:16:0.219178:9:7:32:25:9:7:32:25
chr15	65153685	.	G	A	61.77	PASS	AF=0.264706;AO=9;DP=34;FAO=9;FDP=34;FR=.;FRO=25;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.0819761;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.0696;QD=7.26729;RBI=0.133837;REFB=0.0169946;REVB=0.105793;RO=25;SAF=3;SAR=6;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.221667;STB=0.639684;STBP=0.355;TYPE=snp;VARB=-0.0321175;OID=.;OPOS=65153685;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:34:34:25:25:9:9:0.264706:6:3:13:12:6:3:13:12
chr15	65347405	.	G	A	100.73	PASS	AF=0.48;AO=12;DP=25;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.0386494;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.057;QD=16.1173;RBI=0.0392824;REFB=-0.0149524;REVB=-0.00702395;RO=13;SAF=8;SAR=4;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122788;STB=0.571306;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.0187629;OID=.;OPOS=65347405;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:25:13:13:12:12:0.48:4:8:7:6:4:8:7:6
chr15	65350940	.	A	AG	36.06	PASS	AF=0.272727;AO=6;DP=35;FAO=9;FDP=33;FR=.;FRO=24;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=0.0167659;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=17.398;QD=4.37109;RBI=0.0184499;REFB=-0.0121687;REVB=-0.00770083;RO=26;SAF=1;SAR=5;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.388095;STB=0.837849;STBP=0.034;TYPE=ins;VARB=0.031829;OID=.;OPOS=65350941;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.272727:6:35:9:33:24:1:8:12:12:36:26:1:5:12:14
chr15	65370353	.	T	C	920.0	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0454853;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.8346;QD=58.413;RBI=0.0522478;REFB=0;REVB=0.0257084;RO=0;SAF=40;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000442977;OID=.;OPOS=65370353;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:23:40:0:0:23:40:0:0
chr15	65449169	.	C	T	763.01	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00398022;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.636;QD=63.5845;RBI=0.0240856;REFB=0;REVB=0.0237545;RO=0;SAF=27;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.06572e-05;OID=.;OPOS=65449169;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:48:0:0:46:48:1:19:27:0:0:20:28:0:0
chr15	65489128	.	C	T	465.14	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0404178;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=277.676;QD=58.1421;RBI=0.046679;REFB=0;REVB=0.0233523;RO=0;SAF=13;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00020084;OID=.;OPOS=65489128;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:19:13:0:0:19:13:0:0
chr15	65489688	.	T	C	689.38	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.006593;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.03;QD=62.6705;RBI=0.0510586;REFB=0;REVB=-0.0506312;RO=0;SAF=20;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.30465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000207733;OID=.;OPOS=65489688;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:24:20:0:0:24:20:0:0
chr15	65490901	.	T	C	499.62	PASS	AF=0.945946;AO=35;DP=37;FAO=35;FDP=37;FR=.;FRO=2;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00336092;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=208.976;QD=54.013;RBI=0.00656232;REFB=0.0628043;REVB=-0.00563633;RO=2;SAF=21;SAR=14;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0424896;STB=0.522714;STBP=0.325;TYPE=snp;VARB=-0.0011126;OID=.;OPOS=65490901;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:37:37:2:2:35:35:0.945946:14:21:2:0:14:21:2:0
chr15	65577890	.	G	A	52.6	PASS	AF=0.258065;AO=8;DP=31;FAO=8;FDP=31;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=-0.0127532;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=287.498;QD=6.78772;RBI=0.0196798;REFB=-0.00126788;REVB=-0.0149884;RO=23;SAF=5;SAR=3;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122879;STB=0.578313;STBP=0.653;TYPE=snp;VARB=0.00315551;OID=.;OPOS=65577890;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:31:31:23:23:8:8:0.258065:3:5:12:11:3:5:12:11
chr15	65619427	.	T	A	53.34	PASS	AF=1;AO=5;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0849108;FXX=0.142653;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.78;QD=35.5621;RBI=0.0896388;REFB=0;REVB=0.0287276;RO=0;SAF=1;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00193926;OID=.;OPOS=65619427;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:6:6:0:0:5:6:1:4:1:0:0:4:2:0:0
chr15	65620156	.	C	T	239.44	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0366937;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.672;QD=50.4077;RBI=0.0390849;REFB=0;REVB=-0.0134612;RO=0;SAF=5;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000247446;OID=.;OPOS=65620156;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:14:5:0:0:14:5:0:0
chr15	65621441	.	C	A	222.36	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.027208;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.434;QD=49.4137;RBI=0.108954;REFB=0;REVB=0.105502;RO=0;SAF=10;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00145167;OID=.;OPOS=65621441;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:18:0:0:17:18:1:7:10:0:0:8:10:0:0
chr15	65621857	.	T	C	284.05	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0124464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.1554;QD=51.6462;RBI=0.0471139;REFB=0;REVB=0.0454401;RO=0;SAF=10;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00215497;OID=.;OPOS=65621857;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:22:0:0:21:22:1:11:10:0:0:11:11:0:0
chr15	65667724	.	A	G	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0319576;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.987;QD=56.191;RBI=0.0411739;REFB=0;REVB=0.0259616;RO=0;SAF=12;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000298461;OID=.;OPOS=65667724;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:16:12:0:0:16:12:0:0
chr15	65676617	.	T	C	79.27	PASS	AF=0.625;AO=9;DP=16;FAO=10;FDP=16;FR=.;FRO=6;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.0200084;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.382;QD=19.8178;RBI=0.111838;REFB=-0.0385188;REVB=-0.110033;RO=6;SAF=6;SAR=3;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137772;STB=0.562382;STBP=0.646;TYPE=snp;VARB=0.0163114;OID=.;OPOS=65676617;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:16:16:6:6:9:10:0.625:3:6:5:1:3:7:5:1
chr15	65676726	.	C	T	110.71	PASS	AF=0.705882;AO=12;DP=17;FAO=12;FDP=17;FR=.;FRO=5;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.00408942;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.969;QD=26.0488;RBI=0.00692243;REFB=-0.0648198;REVB=-0.00558539;RO=5;SAF=7;SAR=5;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.096601;STB=0.554364;STBP=0.54;TYPE=snp;VARB=0.0129804;OID=.;OPOS=65676726;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:17:17:5:5:12:12:0.705882:5:7:2:3:5:7:2:3
chr15	65916527	.	A	T	948.68	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0125442;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.474;QD=58.38;RBI=0.0156462;REFB=0;REVB=0.00935134;RO=0;SAF=28;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000200829;OID=.;OPOS=65916527;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:65:0:0:64:65:1:36:28:0:0:36:29:0:0
chr15	66011630	.	A	G	1544.29	PASS	AF=1;AO=94;DP=94;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0176051;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.408;QD=63.6821;RBI=0.0345854;REFB=0;REVB=0.0297693;RO=0;SAF=44;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.15732e-05;OID=.;OPOS=66011630;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:94:97:0:0:94:97:1:50:44:0:0:53:44:0:0
chr15	66023799	.	G	A,T	283.48	PASS	AF=0.0909091,0.909091;AO=2,20;DP=22;FAO=2,20;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=0,10;FSAR=2,10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00596702,0.00158474;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=227.965,73.8734;QD=51.5415;RBI=0.00625238,0.00478043;REFB=0,0;REVB=-0.00186732,0.00451011;RO=0;SAF=0,10;SAR=2,10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0593996,0.00548775;OID=.,.;OPOS=66023799,66023799;OREF=G,G;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:22:22:0:0:2,20:2,20:0.0909091,0.909091:2,10:0,10:0:0:2,10:0,10:0:0
chr15	66257408	.	T	C	575.66	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0788098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.9737;QD=60.5956;RBI=0.0866255;REFB=0;REVB=0.0359583;RO=0;SAF=27;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000540565;OID=.;OPOS=66257408;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:11:27:0:0:11:27:0:0
chr15	66274690	.	T	C	272.54	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000867367;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.3872;QD=51.9127;RBI=0.0338627;REFB=0;REVB=0.0338516;RO=0;SAF=12;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000567955;OID=.;OPOS=66274690;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:9:12:0:0:9:12:0:0
chr15	66411441	.	C	T	401.68	PASS	AF=0.644068;AO=38;DP=59;FAO=38;FDP=59;FR=.;FRO=21;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.00104477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.505;QD=27.2323;RBI=0.0225683;REFB=-0.0177314;REVB=0.0225441;RO=21;SAF=19;SAR=19;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0465877;STB=0.52541;STBP=0.638;TYPE=snp;VARB=0.00943332;OID=.;OPOS=66411441;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:21:21:38:38:0.644068:19:19:9:12:19:19:9:12
chr15	66618342	.	A	G	293.3	PASS	AF=1;AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.010267;FXX=0.0434594;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.064;QD=53.3281;RBI=0.0109387;REFB=0;REVB=-0.00377395;RO=0;SAF=7;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.79751e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00010272;OID=.;OPOS=66618342;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:22:0:0:22:22:1:15:7:0:0:15:7:0:0
chr15	66640619	.	C	A	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0104122;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=308.201;QD=50.4133;RBI=0.0114273;REFB=0;REVB=0.00470849;RO=0;SAF=8;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.41338e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.36717e-05;OID=.;OPOS=66640619;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:11:8:0:0:11:8:0:0
chr15	66644521	.	C	G	195.84	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.011232;FXX=0.0587889;HRUN=1;LEN=1;MLLD=310.635;QD=48.961;RBI=0.0377639;REFB=0;REVB=0.0360549;RO=0;SAF=12;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.07465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000274786;OID=.;OPOS=66644521;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:4:12:0:0:4:12:0:0
chr15	67234251	.	A	G	837.16	PASS	AF=0.983333;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0289461;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=258.337;QD=55.8109;RBI=0.037697;REFB=-0.0908663;REVB=0.0241492;RO=1;SAF=30;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154685;STB=0.508194;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.000290791;OID=.;OPOS=67234251;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:60:60:1:1:59:59:0.983333:29:30:1:0:29:30:1:0
chr15	67457335	.	A	G	613.34	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00240674;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.995;QD=61.3339;RBI=0.00262335;REFB=0;REVB=0.00104382;RO=0;SAF=16;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.07348e-05;OID=.;OPOS=67457335;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:24:16:0:0:24:16:0:0
chr15	67484297	.	C	T	428.76	PASS	AF=0.689655;AO=39;DP=57;FAO=40;FDP=58;FR=.;FRO=18;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=0.0190051;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=297.196;QD=29.5699;RBI=0.0226068;REFB=-0.0128163;REVB=0.0122423;RO=18;SAF=24;SAR=15;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00262093;STB=0.504585;STBP=0.937;TYPE=snp;VARB=0.00539872;OID=.;OPOS=67484297;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:58:18:18:39:40:0.689655:15:24:11:7:15:25:11:7
chr15	67486775	.	T	C	34.73	PASS	AF=0.2;AO=6;DP=30;FAO=6;FDP=30;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=-0.00270932;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.437;QD=4.63016;RBI=0.0445305;REFB=0.000927038;REVB=0.044448;RO=24;SAF=5;SAR=1;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.555674;STB=0.866243;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=-0.00104841;OID=.;OPOS=67486775;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:30:30:24:24:6:6:0.2:1:5:8:16:1:5:8:16
chr15	67494304	.	T	G	213.94	PASS	AF=0.512195;AO=21;DP=41;FAO=21;FDP=41;FR=.;FRO=20;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=-0.0178777;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=319.327;QD=20.8719;RBI=0.0216129;REFB=0.000560365;REVB=0.0121453;RO=19;SAF=11;SAR=10;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130898;STB=0.560128;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=-0.00052669;OID=.;OPOS=67494304;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:19:20:21:21:0.512195:10:11:7:12:10:11:8:12
chr15	67528374	.	T	G	524.7	PASS	AF=0.78;AO=39;DP=50;FAO=39;FDP=50;FR=.;FRO=11;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.0397827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.5002;QD=41.9763;RBI=0.042192;REFB=-0.00592343;REVB=0.0140533;RO=10;SAF=20;SAR=19;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00485881;STB=0.512814;STBP=0.756;TYPE=snp;VARB=0.00139689;OID=.;OPOS=67528374;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:50:50:10:11:39:39:0.78:19:20:5:5:19:20:5:6
chr15	67547301	.	C	A	557.11	PASS	AF=0.530612;AO=52;DP=97;FAO=52;FDP=98;FR=.;FRO=46;FSAF=35;FSAR=17;FSRF=29;FSRR=17;FWDB=-0.0343766;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=125.116;QD=22.7393;RBI=0.0346497;REFB=-0.0141023;REVB=-0.00434193;RO=45;SAF=35;SAR=17;SRF=28;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0477613;STB=0.522379;STBP=0.653;TYPE=snp;VARB=0.010184;OID=.;OPOS=67547301;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:98:45:46:52:52:0.530612:17:35:28:17:17:35:29:17
chr15	67574440	.	C	G	135.86	PASS	AF=0.7;AO=14;DP=20;FAO=14;FDP=20;FR=.;FRO=6;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.0645171;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.034;QD=27.1724;RBI=0.0646762;REFB=-0.00634417;REVB=-0.00453477;RO=6;SAF=7;SAR=7;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0894563;STB=0.549929;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.000934224;OID=.;OPOS=67574440;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:20:20:6:6:14:14:0.7:7:7:4:2:7:7:4:2
chr15	67692502	.	T	C	976.6	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00843774;FXX=0.0149231;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.966;QD=59.1878;RBI=0.00930319;REFB=0;REVB=-0.00391839;RO=0;SAF=41;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.04816e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.22432e-05;OID=.;OPOS=67692502;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:25:41:0:0:25:41:0:0
chr15	67768151	.	G	C	689.37	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0097574;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.602;QD=62.6701;RBI=0.0609024;REFB=0;REVB=0.0601157;RO=0;SAF=18;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000263193;OID=.;OPOS=67768151;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:26:18:0:0:26:18:0:0
chr15	67814542	.	G	A	766.0	PASS	AF=1;AO=48;DP=49;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.027825;FXX=0.020404;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.5751;QD=63.8333;RBI=0.0713968;REFB=0;REVB=-0.0657516;RO=0;SAF=25;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000380485;OID=.;OPOS=67814542;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:48:0:0:48:48:1:23:25:0:0:23:25:0:0
chr15	67962763	.	A	G	107.16	PASS	AF=0.2125;AO=17;DP=80;FAO=17;FDP=80;FR=.;FRO=63;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=29;FSRR=34;FWDB=-0.00268136;FXX=0.0361402;HRUN=3;LEN=1;MLLD=212.101;QD=5.35827;RBI=0.00710383;REFB=-0.00169836;REVB=0.00657835;RO=63;SAF=10;SAR=7;SRF=29;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159179;STB=0.600175;STBP=0.368;TYPE=snp;VARB=0.010777;OID=.;OPOS=67962763;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:63:63:17:17:0.2125:7:10:29:34:7:10:29:34
chr15	68112037	.	C	T	83.51	PASS	AF=0.226415;AO=12;DP=53;FAO=12;FDP=53;FR=.;FRO=41;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=27;FSRR=14;FWDB=0.0383833;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.813;QD=6.30296;RBI=0.038593;REFB=-0.000807931;REVB=0.00401847;RO=40;SAF=5;SAR=7;SRF=26;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.279179;STB=0.680572;STBP=0.191;TYPE=snp;VARB=0.00352491;OID=.;OPOS=68112037;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:53:53:40:41:12:12:0.226415:7:5:26:14:7:5:27:14
chr15	68112096	.	A	G	60.34	PASS	AF=0.209302;AO=9;DP=44;FAO=9;FDP=43;FR=.;FRO=34;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=24;FWDB=-0.0704747;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.6524;QD=5.61256;RBI=0.0746383;REFB=-0.0153114;REVB=0.0245803;RO=34;SAF=2;SAR=7;SRF=10;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113673;STB=0.575164;STBP=0.659;TYPE=snp;VARB=0.0410205;OID=.;OPOS=68112096;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:60:44:43:34:34:9:9:0.209302:7:2:10:24:7:2:10:24
chr15	68120014	.	C	T	38.57	PASS	AF=0.428571;AO=6;DP=14;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.0167487;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.789;QD=11.0197;RBI=0.0207181;REFB=-0.0415787;REVB=-0.0121951;RO=7;SAF=5;SAR=1;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.413635;STB=0.788428;STBP=0.118;TYPE=snp;VARB=0.0287764;OID=.;OPOS=68120014;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:14:14:7:8:6:6:0.428571:1:5:3:4:1:5:3:5
chr15	68583175	.	T	C	508.38	PASS	AF=0.972222;AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0250876;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.907;QD=56.487;RBI=0.0268473;REFB=0.0247674;REVB=0.0095598;RO=1;SAF=12;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0199081;STB=0.510632;STBP=0.614;TYPE=snp;VARB=0.000202834;OID=.;OPOS=68583175;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:36:36:1:1:35:35:0.972222:23:12:0:1:23:12:0:1
chr15	68603625	.	C	T	727.8	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.051799;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.498;QD=63.2868;RBI=0.0595577;REFB=0;REVB=0.0293936;RO=0;SAF=18;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.06241e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000297851;OID=.;OPOS=68603625;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:28:18:0:0:28:18:0:0
chr15	68605169	.	G	A	340.74	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0272914;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=262.833;QD=54.5177;RBI=0.0421059;REFB=0;REVB=0.0320639;RO=0;SAF=21;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.661e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000215952;OID=.;OPOS=68605169;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:4:21:0:0:4:21:0:0
chr15	68612556	.	T	C	606.85	PASS	AF=0.75;AO=49;DP=66;FAO=51;FDP=68;FR=.;FRO=17;FSAF=28;FSAR=23;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=-0.0202835;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.483;QD=35.6968;RBI=0.0220569;REFB=-0.0186765;REVB=0.00866541;RO=16;SAF=27;SAR=22;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0343234;STB=0.524859;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.00400938;OID=.;OPOS=68612556;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:68:16:17:49:51:0.75:22:27:10:6:23:28:11:6
chr15	68624290	.	G	A	704.5	PASS	AF=0.734177;AO=58;DP=79;FAO=58;FDP=79;FR=.;FRO=21;FSAF=17;FSAR=41;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=-0.0681205;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.317;QD=35.6711;RBI=0.0682558;REFB=-0.0347292;REVB=0.00429558;RO=21;SAF=17;SAR=41;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.178291;STB=0.596184;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0089496;OID=.;OPOS=68624290;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:21:21:58:58:0.734177:41:17:13:8:41:17:13:8
chr15	68624396	.	A	C	349.74	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0355271;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=305.923;QD=53.8066;RBI=0.0427754;REFB=0;REVB=0.0238235;RO=0;SAF=14;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00096472;OID=.;OPOS=68624396;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:12:14:0:0:12:14:0:0
chr15	68628143	.	C	T	786.96	PASS	AF=0.982456;AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0277041;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=162.473;QD=55.2249;RBI=0.0285153;REFB=-0.102209;REVB=-0.00675324;RO=1;SAF=26;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0177894;STB=0.509431;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.000573788;OID=.;OPOS=68628143;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:57:57:1:1:56:56:0.982456:30:26:1:0:30:26:1:0
chr15	68649587	.	G	A	582.43	PASS	AF=0.975;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0329692;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.767;QD=58.2428;RBI=0.0371788;REFB=-0.0620424;REVB=-0.0171841;RO=0;SAF=21;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.34792e-08;STB=0.513507;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=0.000771861;OID=.;OPOS=68649587;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:40:40:0:1:39:39:0.975:18:21:0:0:18:21:0:1
chr15	69325581	.	C	T	740.18	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0606988;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.3639;QD=56.937;RBI=0.0766517;REFB=0;REVB=0.0468097;RO=0;SAF=28;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00140968;OID=.;OPOS=69325581;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:24:28:0:0:24:28:0:0
chr15	69327825	.	C	T	483.35	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.015489;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.317;QD=58.5878;RBI=0.0186501;REFB=0;REVB=0.0103883;RO=0;SAF=25;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.25644e-05;OID=.;OPOS=69327825;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:8:25:0:0:8:25:0:0
chr15	69542968	.	G	A	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00123068;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.158;QD=45.8044;RBI=0.0688423;REFB=0;REVB=0.0688313;RO=0;SAF=7;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00300531;OID=.;OPOS=69542968;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:7:7:0:0:7:7:0:0
chr15	69561518	.	G	A	160.31	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00259711;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.538;QD=45.8041;RBI=0.00908566;REFB=0;REVB=-0.00870656;RO=0;SAF=6;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.11167e-05;OID=.;OPOS=69561518;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:8:6:0:0:8:6:0:0
chr15	69564343	.	C	T	766.44	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.101623;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=63.7844;QD=63.87;RBI=0.103729;REFB=0;REVB=-0.020797;RO=0;SAF=25;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00100719;OID=.;OPOS=69564343;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:23:25:0:0:23:25:0:0
chr15	69652451	.	G	A	549.23	PASS	AF=0.653333;AO=49;DP=75;FAO=49;FDP=75;FR=.;FRO=26;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=19;FSRR=7;FWDB=0.00674332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.023;QD=29.2924;RBI=0.0246449;REFB=-0.00539443;REVB=-0.0237044;RO=26;SAF=27;SAR=22;SRF=19;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117739;STB=0.563763;STBP=0.149;TYPE=snp;VARB=0.00228332;OID=.;OPOS=69652451;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:26:26:49:49:0.653333:22:27:19:7:22:27:19:7
chr15	69684050	.	C	T	500.17	PASS	AF=1;AO=33;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00436669;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.2053;QD=58.8435;RBI=0.00492081;REFB=0;REVB=0.00226856;RO=0;SAF=10;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.70001e-05;OID=.;OPOS=69684050;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:33:34:1:23:10:0:0:24:10:0:0
chr15	69697756	.	G	A	538.56	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0135987;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.241;QD=59.8394;RBI=0.0310313;REFB=0;REVB=0.027893;RO=0;SAF=15;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.49281e-05;OID=.;OPOS=69697756;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:21:15:0:0:21:15:0:0
chr15	69709748	.	C	A	330.93	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00548836;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.906;QD=52.948;RBI=0.00550323;REFB=0;REVB=0.000404152;RO=0;SAF=13;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00169816;OID=.;OPOS=69709748;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:25:0:0:24:25:1:11:13:0:0:11:14:0:0
chr15	70345626	.	C	T	54.91	PASS	AF=0.15625;AO=10;DP=64;FAO=10;FDP=64;FR=.;FRO=54;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=26;FSRR=28;FWDB=0.016576;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.492;QD=3.43188;RBI=0.0290778;REFB=-0.00263181;REVB=-0.0238905;RO=54;SAF=3;SAR=7;SRF=26;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.230175;STB=0.658764;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.0111168;OID=.;OPOS=70345626;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:64:64:54:54:10:10:0.15625:7:3:26:28:7:3:26:28
chr15	70346923	.	C	T	54.66	PASS	AF=0.333333;AO=8;DP=24;FAO=8;FDP=24;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=-0.0205621;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.4277;QD=9.11043;RBI=0.0300937;REFB=-0.0288509;REVB=-0.0219734;RO=14;SAF=3;SAR=5;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.19274;STB=0.592808;STBP=0.547;TYPE=snp;VARB=0.0545275;OID=.;OPOS=70346923;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:24:24:14:16:8:8:0.333333:5:3:3:11:5:3:4:12
chr15	70347362	.	C	A	88.22	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0371417;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.138;QD=39.2068;RBI=0.0554997;REFB=0;REVB=0.0412396;RO=0;SAF=6;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00327685;OID=.;OPOS=70347362;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:3:6:0:0:3:6:0:0
chr15	70347816	.	A	AG	178.6	PASS	AF=1;AO=15;DP=16;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00293909;FXX=0.062461;HRUN=0;LEN=1;MLLD=182.976;QD=47.6258;RBI=0.0140425;REFB=0;REVB=0.0137315;RO=0;SAF=9;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000173658;OID=.;OPOS=70347817;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:15:16:15:15:0:9:6:0:0:4:0:9:6:0:0
chr15	70347920	.	T	C	137.38	PASS	AF=0.326531;AO=16;DP=49;FAO=16;FDP=49;FR=.;FRO=33;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=12;FWDB=-0.00881369;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.061;QD=11.2145;RBI=0.0156694;REFB=-0.00433043;REVB=0.0129557;RO=33;SAF=5;SAR=11;SRF=21;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.36014;STB=0.712957;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.0109027;OID=.;OPOS=70347920;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:33:33:16:16:0.326531:11:5:21:12:11:5:21:12
chr15	70350607	.	C	T	296.81	PASS	AF=0.568627;AO=28;DP=55;FAO=29;FDP=51;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=21;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=-0.0389736;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.7917;QD=23.2788;RBI=0.22128;REFB=-0.102565;REVB=-0.217821;RO=13;SAF=16;SAR=12;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0723916;STB=0.531834;STBP=0.613;TYPE=snp;VARB=0.0620312;OID=.;OPOS=70350607;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:51:13:21:28:29:0.568627:12:16:9:4:13:16:10:11
chr15	70351788	.	T	C	661.09	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.036967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.915;QD=61.4965;RBI=0.0370797;REFB=0;REVB=0.00288835;RO=0;SAF=23;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00118339;OID=.;OPOS=70351788;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:43:0:0:41:43:1:18:23:0:0:18:25:0:0
chr15	70371777	.	C	G	154.89	PASS	AF=0.789474;AO=15;DP=19;FAO=15;FDP=19;FR=.;FRO=4;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.00212809;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.6038;QD=32.6077;RBI=0.00212911;REFB=0.0457431;REVB=-6.58228e-05;RO=4;SAF=7;SAR=8;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0127122;STB=0.507033;STBP=0.914;TYPE=snp;VARB=-0.00740691;OID=.;OPOS=70371777;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:20:19:19:4:4:15:15:0.789474:8:7:2:2:8:7:2:2
chr15	70960068	.	G	A	133.49	PASS	AF=0.866667;AO=11;DP=15;FAO=13;FDP=15;FR=.,HEALED;FRO=2;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00675187;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.24;QD=35.5966;RBI=0.00912925;REFB=-0.0192665;REVB=-0.00614454;RO=2;SAF=6;SAR=5;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.012578;STB=0.505147;STBP=0.881;TYPE=snp;VARB=0.00630482;OID=.;OPOS=70960068;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:15:15:2:2:11:13:0.866667:5:6:1:1:7:6:1:1
chr15	70991925	.	G	C	728.06	PASS	AF=0.647059;AO=66;DP=102;FAO=66;FDP=102;FR=.;FRO=36;FSAF=34;FSAR=32;FSRF=24;FSRR=12;FWDB=0.00920579;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=242.202;QD=28.5513;RBI=0.0141875;REFB=-0.0175378;REVB=-0.0107954;RO=36;SAF=34;SAR=32;SRF=24;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0993204;STB=0.553683;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.00933741;OID=.;OPOS=70991925;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:36:36:66:66:0.647059:32:34:24:12:32:34:24:12
chr15	71125093	.	G	A	262.75	PASS	AF=0.846154;AO=22;DP=26;FAO=22;FDP=26;FR=.;FRO=4;FSAF=17;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0088033;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.138;QD=40.4235;RBI=0.0161448;REFB=-0.0164146;REVB=-0.0135336;RO=4;SAF=17;SAR=5;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102567;STB=0.556021;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=0.000791953;OID=.;OPOS=71125093;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:20:26:26:4:4:22:22:0.846154:5:17:2:2:5:17:2:2
chr15	71125204	.	A	G	199.06	PASS	AF=0.740741;AO=15;DP=26;FAO=20;FDP=27;FR=.;FRO=7;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.0292453;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=51.6575;QD=29.4908;RBI=0.0385788;REFB=0.0464257;REVB=0.0251602;RO=6;SAF=10;SAR=5;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.260162;STB=0.638149;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=-0.0018886;OID=.;OPOS=71125204;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:26:27:6:7:15:20:0.740741:5:10:1:5:5:15:2:5
chr15	71184278	.	G	T	383.0	PASS	AF=1;AO=27;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0996925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.4354;QD=54.7144;RBI=0.106718;REFB=0;REVB=0.0380806;RO=0;SAF=6;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00591126;OID=.;OPOS=71184278;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:27:28:1:21:6:0:0:21:7:0:0
chr15	71184495	.	A	G	880.36	PASS	AF=0.890411;AO=65;DP=73;FAO=65;FDP=73;FR=.;FRO=8;FSAF=39;FSAR=26;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=0.0343485;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.011;QD=48.2391;RBI=0.0358781;REFB=-0.0499957;REVB=-0.0103641;RO=7;SAF=39;SAR=26;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0495624;STB=0.531782;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.00382204;OID=.;OPOS=71184495;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:73:73:7:8:65:65:0.890411:26:39:6:1:26:39:7:1
chr15	71403406	.	T	C	300.21	PASS	AF=0.78125;AO=25;DP=32;FAO=25;FDP=32;FR=.;FRO=7;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=0.00345088;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.45;QD=37.5264;RBI=0.0118114;REFB=-0.027666;REVB=0.0112961;RO=7;SAF=10;SAR=15;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183576;STB=0.59992;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.00771039;OID=.;OPOS=71403406;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:32:32:7:7:25:25:0.78125:15:10:6:1:15:10:6:1
chr15	71433909	.	CTTTTTTTAA	ATTTAATTTT,CTTTTTTAA,CTTTTTTAAA	48.97	PASS	AF=0.272727,0.454545,0;AO=2,3,3;DP=19;FAO=3,5,0;FDP=11;FR=.;FRO=3;FSAF=0,4,0;FSAR=3,1,0;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0926666,-0.134402,0.134896;FXX=0.352734;HRUN=1,7,7;LEN=10,1,1;MLLD=137.911,7.52657,4.85975;QD=17.8077;RBI=0.0970222,0.158764,0.200205;REFB=-0.0076326,-0.0480386,-0.0526733;REVB=-0.0287437,-0.0845122,0.147937;RO=2;SAF=0,3,3;SAR=2,0,0;SRF=0;SRR=2;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0.74993,0.74993;STB=0.5,0.798796,0.5;STBP=1,0.078,1;TYPE=mnp,del,snp;VARB=0.0471941,0.105904,0;OID=.,.,.;OPOS=71433909,71433910,71433916;OREF=CTTTTTTTAA,T,T;OALT=ATTTAATTTT,-,A;OMAPALT=ATTTAATTTT,CTTTTTTAA,CTTTTTTAAA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:23:19:11:2:3:2,3,3:3,5,0:0.272727,0.454545,0:2,0,0:0,3,3:0:2:3,1,0:0,4,0:0:3
chr15	71953045	.	G	A	446.03	PASS	AF=0.714286;AO=35;DP=49;FAO=35;FDP=49;FR=.;FRO=14;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.0321271;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=281.784;QD=36.4104;RBI=0.0355655;REFB=0.000768619;REVB=0.0152563;RO=14;SAF=22;SAR=13;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0318776;STB=0.517317;STBP=0.73;TYPE=snp;VARB=-0.000166155;OID=.;OPOS=71953045;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:14:14:35:35:0.714286:13:22:8:6:13:22:8:6
chr15	72070067	.	A	G	55.83	PASS	AF=0.380952;AO=8;DP=21;FAO=8;FDP=21;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.0243943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.405;QD=10.6336;RBI=0.0296242;REFB=-0.000555607;REVB=-0.0168081;RO=13;SAF=5;SAR=3;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168369;STB=0.602151;STBP=0.473;TYPE=snp;VARB=-0.000120326;OID=.;OPOS=72070067;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:21:21:13:13:8:8:0.380952:3:5:6:7:3:5:6:7
chr15	72070075	.	G	A	159.83	PASS	AF=0.666667;AO=16;DP=24;FAO=16;FDP=24;FR=.;FRO=8;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.00454435;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.469;QD=26.6377;RBI=0.0133743;REFB=-0.0483194;REVB=-0.0125785;RO=8;SAF=9;SAR=7;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0381514;STB=0.52125;STBP=0.789;TYPE=snp;VARB=0.0213565;OID=.;OPOS=72070075;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:24:24:8:8:16:16:0.666667:7:9:5:3:7:9:5:3
chr15	72073003	.	C	T	87.66	PASS	AF=0.229167;AO=7;DP=48;FAO=11;FDP=48;FR=.,HEALED;FRO=36;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=21;FSRR=15;FWDB=-0.017037;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=214.311;QD=7.30471;RBI=0.0189846;REFB=-0.00543447;REVB=-0.0083759;RO=36;SAF=3;SAR=4;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184596;STB=0.542778;STBP=0.765;TYPE=snp;VARB=0.0251084;OID=.;OPOS=72073003;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:70:48:48:36:36:7:11:0.229167:4:3:21:15:4:7:21:15
chr15	72105928	.	AC	A	706.1	PASS	AF=1;AO=59;DP=64;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0192112;FXX=0.0307645;HRUN=5;LEN=1;MLLD=22.2848;QD=44.8316;RBI=0.0192114;REFB=0;REVB=9.30224e-05;RO=1;SAF=29;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159925;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.00030638;OID=.;OPOS=72105929;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:59:64:63:63:0:33:30:0:0:13:1:29:30:1:0
chr15	72191266	.	C	T	754.03	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0292175;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.0033;QD=56.9075;RBI=0.0322886;REFB=0;REVB=0.0137439;RO=0;SAF=23;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.72004e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000204999;OID=.;OPOS=72191266;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:30:23:0:0:30:23:0:0
chr15	72197347	.	C	A	48.72	PASS	AF=0.16;AO=8;DP=50;FAO=8;FDP=50;FR=.;FRO=42;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=26;FSRR=16;FWDB=-0.0335499;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.465;QD=3.89791;RBI=0.0400374;REFB=0.00707662;REVB=-0.0218493;RO=42;SAF=5;SAR=3;SRF=26;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00768245;STB=0.505306;STBP=0.991;TYPE=snp;VARB=-0.0394628;OID=.;OPOS=72197347;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:48:50:50:42:42:8:8:0.16:3:5:26:16:3:5:26:16
chr15	72302777	.	C	T	122.48	PASS	AF=0.264706;AO=18;DP=68;FAO=18;FDP=68;FR=.;FRO=50;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=26;FSRR=24;FWDB=-0.00942817;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.302;QD=7.20439;RBI=0.010011;REFB=-0.0109072;REVB=0.00336604;RO=48;SAF=11;SAR=7;SRF=24;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135006;STB=0.568256;STBP=0.552;TYPE=snp;VARB=0.0383614;OID=.;OPOS=72302777;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:48:50:18:18:0.264706:7:11:24:24:7:11:26:24
chr15	72432583	.	A	G	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00164782;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.2;QD=45.8068;RBI=0.030501;REFB=0;REVB=0.0304564;RO=0;SAF=6;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000538782;OID=.;OPOS=72432583;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:8:6:0:0:8:6:0:0
chr15	72433182	.	C	T	805.19	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0193355;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.036;QD=64.4154;RBI=0.0214452;REFB=0;REVB=-0.00927564;RO=0;SAF=22;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.15703e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.32163e-05;OID=.;OPOS=72433182;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:28:22:0:0:28:22:0:0
chr15	72637795	.	T	C	365.05	PASS	AF=0.964286;AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00917871;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.491;QD=52.1499;RBI=0.0109555;REFB=0.0374431;REVB=0.00598111;RO=1;SAF=17;SAR=10;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0442286;STB=0.523792;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=-0.00291678;OID=.;OPOS=72637795;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:28:28:1:1:27:27:0.964286:10:17:0:1:10:17:0:1
chr15	72638892	.	T	C	364.62	PASS	AF=0.964286;AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.010091;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.836;QD=52.0881;RBI=0.0101418;REFB=-0.017219;REVB=0.0010136;RO=0;SAF=11;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5146e-08;STB=0.51514;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=-0.000277708;OID=.;OPOS=72638892;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:28:28:0:1:27:27:0.964286:16:11:0:0:16:11:0:1
chr15	72879653	.	A	ATTG	441.52	PASS	AF=0.868421;AO=32;DP=38;FAO=33;FDP=38;FR=.;FRO=5;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=-0.00451152;FXX=0;HRUN=2;LEN=3;MLLD=286.887;QD=46.4761;RBI=0.00459284;REFB=0.018987;REVB=-0.000860432;RO=5;SAF=15;SAR=17;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132732;STB=0.567527;STBP=0.043;TYPE=ins;VARB=-0.000540826;OID=.;OPOS=72879654;OREF=-;OALT=TTG;OMAPALT=ATTG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.868421:32:38:33:38:5:16:17:5:0:26:5:15:17:5:0
chr15	72987588	.	G	T	572.98	PASS	AF=0.95122;AO=39;DP=41;FAO=39;FDP=41;FR=.;FRO=2;FSAF=12;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.157833;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.9822;QD=55.9009;RBI=0.158194;REFB=0.0102202;REVB=0.0106726;RO=2;SAF=12;SAR=27;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0334695;STB=0.517848;STBP=0.405;TYPE=snp;VARB=-0.0101874;OID=.;OPOS=72987588;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:41:41:2:2:39:39:0.95122:27:12:0:2:27:12:0:2
chr15	73002035	.	G	A	247.49	PASS	AF=1;AO=19;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0042242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.908;QD=49.4976;RBI=0.0252103;REFB=0;REVB=0.0248539;RO=0;SAF=14;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00166833;OID=.;OPOS=73002035;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:19:20:1:5:14:0:0:5:15:0:0
chr15	73023937	.	T	C	769.28	PASS	AF=0.982143;AO=55;DP=56;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0267212;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=67.7559;QD=54.9488;RBI=0.028468;REFB=-0.083988;REVB=0.00981864;RO=0;SAF=29;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.40922e-08;STB=0.509431;STBP=0.339;TYPE=snp;VARB=0.0014013;OID=.;OPOS=73023937;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:56:56:0:1:55:55:0.982143:26:29:0:0:26:29:0:1
chr15	73067233	.	AT	AC,CG	595.48	PASS	AF=0.95,0.05;AO=36,2;DP=41;FAO=38,2;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=25,0;FSAR=13,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00835523,0.00167066;FXX=0.0243843;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=164.399,155.91;QD=59.5482;RBI=0.0399678,0.0022821;REFB=0,0;REVB=0.0390847,0.00155463;RO=0;SAF=25,0;SAR=11,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.58193e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.00018668,0.118643;OID=.,.;OPOS=73067234,73067233;OREF=T,AT;OALT=C,CG;OMAPALT=AC,CG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:10:41:40:0:0:36,2:38,2:0.95,0.05:11,2:25,0:0:0:13,2:25,0:0:0
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chr15	73545732	.	T	C	105.13	PASS	AF=0.846154;AO=11;DP=13;FAO=11;FDP=13;FR=.;FRO=2;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0310602;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=164.704;QD=32.3465;RBI=0.0313602;REFB=-0.0249027;REVB=0.00432692;RO=2;SAF=5;SAR=6;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149061;STB=0.583183;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=0.00366072;OID=.;OPOS=73545732;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:13:13:2:2:11:11:0.846154:6:5:2:0:6:5:2:0
chr15	73564881	.	C	T	41.51	PASS	AF=0.170732;AO=7;DP=41;FAO=7;FDP=41;FR=.;FRO=34;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=-0.00933331;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=229.888;QD=4.04946;RBI=0.0464244;REFB=-0.00862632;REVB=-0.0454766;RO=34;SAF=3;SAR=4;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12097;STB=0.583097;STBP=0.692;TYPE=snp;VARB=0.0504303;OID=.;OPOS=73564881;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:41:41:34:34:7:7:0.170732:4:3:18:16:4:3:18:16
chr15	73614114	.	T	C	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0230907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.45;QD=49.5992;RBI=0.0263799;REFB=0;REVB=-0.0127561;RO=0;SAF=11;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000572449;OID=.;OPOS=73614114;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:7:11:0:0:7:11:0:0
chr15	73994806	.	C	T	341.01	PASS	AF=0.84375;AO=27;DP=32;FAO=27;FDP=32;FR=.;FRO=5;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0264254;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=172.8;QD=42.6268;RBI=0.0328805;REFB=-0.0470114;REVB=0.019566;RO=5;SAF=16;SAR=11;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0568646;STB=0.530783;STBP=0.423;TYPE=snp;VARB=0.0084209;OID=.;OPOS=73994806;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:26:32:32:5:5:27:27:0.84375:11:16:2:3:11:16:2:3
chr15	73994847	.	C	A	125.27	PASS	AF=0.823529;AO=13;DP=17;FAO=14;FDP=17;FR=.;FRO=3;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0976613;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.455;QD=29.4743;RBI=0.102006;REFB=-0.0348916;REVB=0.0294541;RO=3;SAF=5;SAR=8;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142717;STB=0.57884;STBP=0.216;TYPE=snp;VARB=0.010173;OID=.;OPOS=73994847;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:16:17:17:3:3:13:14:0.823529:8:5:0:3:8:6:0:3
chr15	73995165	.	A	C	170.1	PASS	AF=0.888889;AO=15;DP=18;FAO=16;FDP=18;FR=.;FRO=2;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0173819;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.2773;QD=37.7997;RBI=0.0178724;REFB=-0.0426053;REVB=0.00415867;RO=2;SAF=12;SAR=3;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.224876;STB=0.599866;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.0147701;OID=.;OPOS=73995165;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:18:18:2:2:15:16:0.888889:3:12:0:2:4:12:0:2
chr15	73995173	.	C	T	166.01	PASS	AF=0.882353;AO=15;DP=18;FAO=15;FDP=17;FR=.;FRO=2;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.000299272;FXX=0.0555247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.943;QD=39.0622;RBI=0.0345285;REFB=-0.116793;REVB=0.0345272;RO=2;SAF=9;SAR=6;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129617;STB=0.571332;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=0.00587215;OID=.;OPOS=73995173;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:18:17:2:2:15:15:0.882353:6:9:0:2:6:9:0:2
chr15	73996066	.	G	A	33.48	PASS	AF=0.714286;AO=5;DP=7;FAO=5;FDP=7;FR=.;FRO=2;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00494164;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.301;QD=19.1341;RBI=0.017514;REFB=-0.006456;REVB=0.0168024;RO=2;SAF=1;SAR=4;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190062;STB=0.614874;STBP=0.568;TYPE=snp;VARB=0.00589971;OID=.;OPOS=73996066;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:7:7:2:2:5:5:0.714286:4:1:1:1:4:1:1:1
chr15	73996101	.	G	A	126.56	PASS	AF=0.764706;AO=13;DP=17;FAO=13;FDP=17;FR=.;FRO=4;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.000416052;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.5081;QD=29.7798;RBI=0.0339877;REFB=0.00219938;REVB=-0.0339852;RO=4;SAF=7;SAR=6;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0905253;STB=0.550382;STBP=0.537;TYPE=snp;VARB=-0.00360089;OID=.;OPOS=73996101;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:17:17:4:4:13:13:0.764706:6:7:3:1:6:7:3:1
chr15	74000729	.	G	C	602.18	PASS	AF=0.593407;AO=54;DP=91;FAO=54;FDP=91;FR=.;FRO=37;FSAF=22;FSAR=32;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=0.0177461;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.923;QD=26.4692;RBI=0.0408794;REFB=-0.028368;REVB=0.0368267;RO=37;SAF=22;SAR=32;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0192237;STB=0.510491;STBP=0.83;TYPE=snp;VARB=0.0191381;OID=.;OPOS=74000729;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:37:37:54:54:0.593407:32:22:16:21:32:22:16:21
chr15	74001993	.	T	C	159.83	PASS	AF=0.666667;AO=16;DP=24;FAO=16;FDP=24;FR=.;FRO=8;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.00131031;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.656;QD=26.6376;RBI=0.0253239;REFB=-0.0185713;REVB=0.02529;RO=7;SAF=8;SAR=8;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.039064;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00862383;OID=.;OPOS=74001993;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:24:24:7:8:16:16:0.666667:8:8:3:4:8:8:4:4
chr15	74002006	.	G	A	114.49	PASS	AF=0.52;AO=13;DP=24;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.00217851;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=201.967;QD=18.3181;RBI=0.0051768;REFB=-0.0225377;REVB=0.0046961;RO=11;SAF=6;SAR=7;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00564475;STB=0.51849;STBP=0.948;TYPE=snp;VARB=0.0268403;OID=.;OPOS=74002006;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:24:25:11:12:13:13:0.52:7:6:5:6:7:6:6:6
chr15	74003533	.	G	A	125.69	PASS	AF=0.482759;AO=14;DP=30;FAO=14;FDP=29;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.00319567;FXX=0.0333222;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.657;QD=17.3368;RBI=0.00797821;REFB=-0.00276494;REVB=-0.00731023;RO=14;SAF=4;SAR=10;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.264028;STB=0.638091;STBP=0.206;TYPE=snp;VARB=0.00506501;OID=.;OPOS=74003533;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:29:14:15:14:14:0.482759:10:4:8:6:10:4:8:7
chr15	74032783	.	A	G	239.44	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0310532;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.34;QD=50.4091;RBI=0.034428;REFB=0;REVB=0.0148657;RO=0;SAF=4;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.00629e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000105502;OID=.;OPOS=74032783;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:15:4:0:0:15:4:0:0
chr15	74244344	.	C	T	188.27	PASS	AF=0.85;AO=17;DP=20;FAO=17;FDP=20;FR=.;FRO=3;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0161046;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.142;QD=37.6541;RBI=0.0185215;REFB=-0.0130658;REVB=-0.00914817;RO=3;SAF=7;SAR=10;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0708443;STB=0.538876;STBP=0.483;TYPE=snp;VARB=0.00130735;OID=.;OPOS=74244344;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:20:20:3:3:17:17:0.85:10:7:2:1:10:7:2:1
chr15	74275676	.	A	G	43.68	PASS	AF=0.75;AO=6;DP=8;FAO=6;FDP=8;FR=.;FRO=2;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00902435;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.761;QD=21.8421;RBI=0.0476936;REFB=-0.0580755;REVB=0.0468321;RO=2;SAF=2;SAR=4;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.284202;STB=0.666109;STBP=0.205;TYPE=snp;VARB=0.0116455;OID=.;OPOS=74275676;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:8:8:2:2:6:6:0.75:4:2:2:0:4:2:2:0
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chr15	75130093	.	T	C	167.45	PASS	AF=0.586207;AO=17;DP=28;FAO=17;FDP=29;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=-0.0958262;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.0238;QD=23.0965;RBI=0.1003;REFB=-0.00190932;REVB=-0.02962;RO=11;SAF=4;SAR=13;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.314641;STB=0.696182;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=-0.00306695;OID=.;OPOS=75130093;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:28:29:11:12:17:17:0.586207:13:4:7:4:13:4:8:4
chr15	75131661	.	A	G	145.22	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00109529;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.177;QD=44.6817;RBI=0.0261342;REFB=0;REVB=0.0261112;RO=0;SAF=6;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000402593;OID=.;OPOS=75131661;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:7:6:0:0:7:6:0:0
chr15	75131959	.	A	G	383.63	PASS	AF=0.810811;AO=30;DP=37;FAO=30;FDP=37;FR=.;FRO=7;FSAF=22;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=-0.00427815;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=270.821;QD=41.4729;RBI=0.0110939;REFB=-0.0115989;REVB=-0.0102358;RO=6;SAF=22;SAR=8;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111588;STB=0.568585;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=0.00185161;OID=.;OPOS=75131959;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:37:37:6:7:30:30:0.810811:8:22:6:0:8:22:7:0
chr15	75189930	.	A	G	427.48	PASS	AF=0.785714;AO=33;DP=42;FAO=33;FDP=42;FR=.;FRO=9;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=-0.00227418;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.275;QD=40.7122;RBI=0.00975623;REFB=0.0285147;REVB=0.00948747;RO=9;SAF=17;SAR=16;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0602238;STB=0.532542;STBP=0.452;TYPE=snp;VARB=-0.00500366;OID=.;OPOS=75189930;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:59:42:42:9:9:33:33:0.785714:16:17:6:3:16:17:6:3
chr15	75336729	.	A	G	538.51	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0264977;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.967;QD=59.8344;RBI=0.0274989;REFB=0;REVB=-0.00735259;RO=0;SAF=16;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.9376e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.79288e-05;OID=.;OPOS=75336729;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:20:16:0:0:20:16:0:0
chr15	75498548	.	A	G	429.02	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0280004;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.937;QD=57.2026;RBI=0.0293794;REFB=0;REVB=0.00889533;RO=0;SAF=16;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.56309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000131745;OID=.;OPOS=75498548;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:14:16:0:0:14:16:0:0
chr15	75499602	.	C	A	444.51	PASS	AF=1;AO=29;DP=30;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0722024;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.521;QD=55.5642;RBI=0.0742034;REFB=0;REVB=0.0171161;RO=0;SAF=6;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000715885;OID=.;OPOS=75499602;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:32:0:0:29:32:1:23:6:0:0:23:9:0:0
chr15	75499619	.	T	C	411.12	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0166744;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.412;QD=56.7066;RBI=0.0197896;REFB=0;REVB=-0.0106581;RO=0;SAF=7;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.7348e-05;OID=.;OPOS=75499619;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:22:7:0:0:22:7:0:0
chr15	75499861	.	G	A	358.12	PASS	AF=1;AO=23;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0181381;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=75.5146;QD=55.095;RBI=0.0450832;REFB=0;REVB=0.0412735;RO=0;SAF=19;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000978551;OID=.;OPOS=75499861;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:23:26:1:4:19:0:0:5:21:0:0
chr15	75499995	.	T	G	94.41	PASS	AF=0.192771;AO=16;DP=83;FAO=16;FDP=83;FR=.;FRO=67;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=42;FSRR=25;FWDB=-0.00962448;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.443;QD=4.54982;RBI=0.0131925;REFB=-0.00772141;REVB=-0.0090229;RO=66;SAF=10;SAR=6;SRF=42;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0152948;STB=0.501606;STBP=0.996;TYPE=snp;VARB=0.0286036;OID=.;OPOS=75499995;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:83:83:66:67:16:16:0.192771:6:10:42:24:6:10:42:25
chr15	75503147	.	G	A	485.04	PASS	AF=0.944444;AO=34;DP=37;FAO=34;FDP=36;FR=.;FRO=2;FSAF=6;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0282406;FXX=0.0270197;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.729;QD=53.8927;RBI=0.0325875;REFB=-0.0567884;REVB=0.0162608;RO=2;SAF=6;SAR=28;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0553699;STB=0.529712;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=0.00595141;OID=.;OPOS=75503147;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:37:36:2:2:34:34:0.944444:28:6:1:1:28:6:1:1
chr15	75650836	.	G	A	220.44	PASS	AF=0.583333;AO=21;DP=36;FAO=21;FDP=36;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.006973;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.893;QD=24.493;RBI=0.0093428;REFB=-0.0110064;REVB=-0.00621814;RO=15;SAF=8;SAR=13;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116766;STB=0.565154;STBP=0.343;TYPE=snp;VARB=0.00684969;OID=.;OPOS=75650836;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:15:15:21:21:0.583333:13:8:8:7:13:8:8:7
chr15	75950602	.	T	C	53.82	PASS	AF=0.216216;AO=8;DP=37;FAO=8;FDP=37;FR=.;FRO=29;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=0.0107298;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.093;QD=5.81885;RBI=0.0150467;REFB=-0.00737439;REVB=0.0105487;RO=29;SAF=2;SAR=6;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.398662;STB=0.75936;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=0.0188266;OID=.;OPOS=75950602;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:37:37:29:29:8:8:0.216216:6:2:17:12:6:2:17:12
chr15	75982072	.	G	A	350.1	PASS	AF=0.281609;AO=49;DP=174;FAO=49;FDP=174;FR=.;FRO=125;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=52;FSRR=73;FWDB=-0.0213365;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.1827;QD=8.0483;RBI=0.0238957;REFB=0.00491986;REVB=0.0107591;RO=124;SAF=23;SAR=26;SRF=52;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0615175;STB=0.538664;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=-0.0137387;OID=.;OPOS=75982072;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:174:174:124:125:49:49:0.281609:26:23:52:72:26:23:52:73
chr15	76017452	.	C	T	68.22	PASS	AF=0.204082;AO=10;DP=49;FAO=10;FDP=49;FR=.;FRO=39;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=26;FWDB=-0.0110773;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=273.058;QD=5.56875;RBI=0.0116046;REFB=-0.00475948;REVB=-0.00345835;RO=37;SAF=4;SAR=6;SRF=11;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136745;STB=0.556413;STBP=0.708;TYPE=snp;VARB=0.0147709;OID=.;OPOS=76017452;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:68:49:49:37:39:10:10:0.204082:6:4:11:26:6:4:13:26
chr15	76136768	.	C	T	152.81	PASS	AF=0.226415;AO=24;DP=106;FAO=24;FDP=106;FR=.;FRO=82;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=38;FSRR=44;FWDB=-0.0161184;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=241.69;QD=5.76623;RBI=0.0199126;REFB=-0.00361454;REVB=-0.0116922;RO=79;SAF=9;SAR=15;SRF=37;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119376;STB=0.570329;STBP=0.435;TYPE=snp;VARB=0.0126307;OID=.;OPOS=76136768;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:106:79:82:24:24:0.226415:15:9:37:42:15:9:38:44
chr15	76191802	.	G	A	702.37	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0137914;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.7502;QD=62.4329;RBI=0.0138083;REFB=0;REVB=0.000683475;RO=0;SAF=22;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.30297e-05;OID=.;OPOS=76191802;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:23:22:0:0:23:22:0:0
chr15	76298132	.	A	G	51.84	PASS	AF=0.538462;AO=7;DP=14;FAO=7;FDP=13;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0.0104156;FXX=0.0713776;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.2065;QD=15.9496;RBI=0.0142904;REFB=-0.024666;REVB=-0.00978429;RO=6;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.374419;STB=0.713812;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.00416245;OID=.;OPOS=76298132;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:40:14:13:6:6:7:7:0.538462:4:3:0:6:4:3:0:6
chr15	76496232	.	G	A	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.113127;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.8765;QD=47.8223;RBI=0.114037;REFB=0;REVB=0.0143711;RO=0;SAF=7;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0049942;OID=.;OPOS=76496232;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:9:7:0:0:9:7:0:0
chr15	76496977	.	G	C	1062.44	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0180882;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=304.48;QD=59.8559;RBI=0.0183061;REFB=0;REVB=0.00281548;RO=0;SAF=30;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.21646e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.42348e-05;OID=.;OPOS=76496977;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:41:30:0:0:41:30:0:0
chr15	76630303	.	T	C	1365.41	PASS	AF=1;AO=87;DP=89;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.076561;FXX=0.0224694;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.247;QD=62.7773;RBI=0.0772675;REFB=0;REVB=0.0104256;RO=0;SAF=33;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000303714;OID=.;OPOS=76630303;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:89:87:0:0:87:87:1:54:33:0:0:54:33:0:0
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chr15	77176158	.	T	C	108.83	PASS	AF=0.666667;AO=12;DP=18;FAO=12;FDP=18;FR=.;FRO=6;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0588974;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.0737;QD=24.1837;RBI=0.0620058;REFB=-0.000751834;REVB=0.0193862;RO=6;SAF=10;SAR=2;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154316;STB=0.588073;STBP=0.405;TYPE=snp;VARB=0.0052671;OID=.;OPOS=77176158;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:18:18:6:6:12:12:0.666667:2:10:4:2:2:10:4:2
chr15	77176200	.	A	T	71.66	PASS	AF=0.6;AO=9;DP=15;FAO=9;FDP=15;FR=.;FRO=6;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.00999066;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=220.271;QD=19.1091;RBI=0.0220973;REFB=-0.0219386;REVB=0.0197098;RO=6;SAF=8;SAR=1;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.409156;STB=0.743518;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=0.0112822;OID=.;OPOS=77176200;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:15:15:6:6:9:9:0.6:1:8:3:3:1:8:3:3
chr15	77324880	.	A	G	351.2	PASS	AF=0.674419;AO=29;DP=44;FAO=29;FDP=43;FR=.;FRO=14;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.00402358;FXX=0.0444346;HRUN=1;LEN=1;MLLD=293.833;QD=32.6699;RBI=0.0144563;REFB=-0.0158722;REVB=0.013885;RO=13;SAF=12;SAR=17;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0277107;STB=0.504947;STBP=0.948;TYPE=snp;VARB=0.00651216;OID=.;OPOS=77324880;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:43:13:14:29:29:0.674419:17:12:6:7:17:12:6:8
chr15	77344793	.	T	A	517.82	PASS	AF=0.811321;AO=43;DP=52;FAO=43;FDP=53;FR=.;FRO=10;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.00488763;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.897;QD=39.0806;RBI=0.0330778;REFB=-0.00342213;REVB=0.0327147;RO=9;SAF=17;SAR=26;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0533438;STB=0.520464;STBP=0.567;TYPE=snp;VARB=0.000755638;OID=.;OPOS=77344793;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:60:52:53:9:10:43:43:0.811321:26:17:5:4:26:17:5:5
chr15	77404160	.	G	C	123.09	PASS	AF=0.764706;AO=10;DP=17;FAO=13;FDP=17;FR=.;FRO=4;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0244715;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.9589;QD=28.9615;RBI=0.029393;REFB=-0.0723329;REVB=-0.0162816;RO=4;SAF=6;SAR=4;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0516928;STB=0.550939;STBP=0.464;TYPE=snp;VARB=0.0399283;OID=.;OPOS=77404160;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:18:17:17:4:4:10:13:0.764706:4:6:2:2:4:9:2:2
chr15	77450964	.	C	T	612.26	PASS	AF=0.627907;AO=54;DP=86;FAO=54;FDP=86;FR=.;FRO=32;FSAF=32;FSAR=22;FSRF=11;FSRR=21;FWDB=-0.0208327;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=61.891;QD=28.4772;RBI=0.0655284;REFB=0.0182131;REVB=0.0621286;RO=32;SAF=32;SAR=22;SRF=11;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170304;STB=0.592558;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=-0.0196219;OID=.;OPOS=77450964;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:32:32:54:54:0.627907:22:32:11:21:22:32:11:21
chr15	77907145	.	G	A	501.64	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00638819;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.72;QD=59.0165;RBI=0.0298722;REFB=0;REVB=0.0291811;RO=0;SAF=16;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000120827;OID=.;OPOS=77907145;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:18:16:0:0:18:16:0:0
chr15	77907535	.	C	G	651.16	PASS	AF=1;AO=41;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0288478;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.759;QD=62.0148;RBI=0.0313003;REFB=0;REVB=-0.0121456;RO=0;SAF=20;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000275452;OID=.;OPOS=77907535;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:41:42:1:21:20:0:0:22:20:0:0
chr15	77907775	.	T	C	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00972524;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.885;QD=55.0986;RBI=0.0132638;REFB=0;REVB=0.00901937;RO=0;SAF=10;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.71087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000172271;OID=.;OPOS=77907775;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:16:10:0:0:16:10:0:0
chr15	77907784	.	G	A	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00753879;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.632;QD=56.1914;RBI=0.010334;REFB=0;REVB=0.00706805;RO=0;SAF=11;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.31638e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.22313e-05;OID=.;OPOS=77907784;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:17:11:0:0:17:11:0:0
chr15	78207601	.	G	A	77.61	PASS	AF=0.75;AO=9;DP=12;FAO=9;FDP=12;FR=.;FRO=3;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.026462;FXX=0.076864;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.512;QD=25.869;RBI=0.060206;REFB=-0.0872011;REVB=0.0540789;RO=3;SAF=6;SAR=3;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154191;STB=0.588033;STBP=0.288;TYPE=snp;VARB=0.0115804;OID=.;OPOS=78207601;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:17:12:12:3:3:9:9:0.75:3:6:1:2:3:6:1:2
chr15	78207625	.	A	G	38.57	PASS	AF=0.428571;AO=6;DP=14;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.026932;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.5742;QD=11.0207;RBI=0.0628707;REFB=-0.00722754;REVB=0.0568101;RO=7;SAF=4;SAR=2;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215036;STB=0.599657;STBP=0.552;TYPE=snp;VARB=0.0121061;OID=.;OPOS=78207625;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:14:14:7:8:6:6:0.428571:2:4:3:4:2:4:4:4
chr15	78208880	.	G	A	239.5	PASS	AF=0.777778;AO=21;DP=27;FAO=21;FDP=27;FR=.;FRO=6;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.0320889;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=63.762;QD=35.4814;RBI=0.0464547;REFB=-0.0957461;REVB=0.0335907;RO=6;SAF=7;SAR=14;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0271978;OID=.;OPOS=78208880;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:27:27:6:6:21:21:0.777778:14:7:2:4:14:7:2:4
chr15	78208916	.	C	G	279.6	PASS	AF=0.956522;AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00611594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.446;QD=48.6259;RBI=0.00620918;REFB=-0.0518291;REVB=-0.00107198;RO=1;SAF=6;SAR=16;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0280287;STB=0.515138;STBP=0.615;TYPE=snp;VARB=0.00358781;OID=.;OPOS=78208916;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:23:23:1:1:22:22:0.956522:16:6:0:1:16:6:0:1
chr15	78209436	.	C	G,T	416.78	PASS	AF=0.0909091,0.878788;AO=3,29;DP=33;FAO=3,29;FDP=33;FR=.;FRO=1;FSAF=3,8;FSAR=0,21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0257194,0.0221399;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=69.3291,153.393;QD=50.5187;RBI=0.0330513,0.0221401;REFB=-0.0160021,-0.0112247;REVB=-0.0207582,-8.13943e-05;RO=0;SAF=3,8;SAR=0,21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-7.4007e-08;STB=0.5,0.529391;STBP=1,0.17;TYPE=snp,snp;VARB=0.232406,-0.00121171;OID=.,.;OPOS=78209436,78209436;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:12:33:33:0:1:3,29:3,29:0.0909091,0.878788:0,21:3,8:0:0:0,21:3,8:1:0
chr15	78211345	.	A	G	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0096079;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.712;QD=45.8068;RBI=0.0182888;REFB=0;REVB=-0.0155617;RO=0;SAF=5;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.45065e-05;OID=.;OPOS=78211345;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:9:5:0:0:9:5:0:0
chr15	78211393	.	A	T	51.89	PASS	AF=0.235294;AO=8;DP=34;FAO=8;FDP=34;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=0.0112124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.499;QD=6.10435;RBI=0.06641;REFB=-0.0055649;REVB=-0.0654566;RO=25;SAF=6;SAR=2;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.246785;STB=0.676948;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.0141576;OID=.;OPOS=78211393;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:51:34:34:25:26:8:8:0.235294:2:6:14:11:2:6:14:12
chr15	78276660	.	A	G	375.66	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00446264;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.509;QD=55.6531;RBI=0.00666317;REFB=0;REVB=0.004948;RO=0;SAF=14;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.34061e-06;OID=.;OPOS=78276660;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:13:14:0:0:13:14:0:0
chr15	78403004	.	A	G	392.31	PASS	AF=0.935484;AO=29;DP=31;FAO=29;FDP=31;FR=.;FRO=2;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.032991;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.668;QD=50.6211;RBI=0.056255;REFB=-0.123615;REVB=0.0455656;RO=0;SAF=18;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.541638;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=0.00292177;OID=.;OPOS=78403004;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:31:31:0:2:29:29:0.935484:11:18:0:0:11:18:0:2
chr15	78574393	.	G	T	480.35	PASS	AF=0.693548;AO=43;DP=63;FAO=43;FDP=62;FR=.;FRO=19;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=0.00925216;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.579;QD=30.9903;RBI=0.0317694;REFB=-0.0193913;REVB=-0.0303923;RO=19;SAF=20;SAR=23;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0250836;STB=0.513589;STBP=0.747;TYPE=snp;VARB=0.00853488;OID=.;OPOS=78574393;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:62:19:19:43:43:0.693548:23:20:8:11:23:20:8:11
chr15	78587910	.	A	G	1116.3	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0511993;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.651;QD=60.3405;RBI=0.0544928;REFB=0;REVB=0.0186574;RO=0;SAF=23;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.42014e-05;OID=.;OPOS=78587910;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:74:0:0:72:74:1:49:23:0:0:51:23:0:0
chr15	78587970	.	T	C	448.85	PASS	AF=0.729167;AO=35;DP=48;FAO=35;FDP=48;FR=.;FRO=13;FSAF=12;FSAR=23;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=-0.0390711;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.3827;QD=37.4043;RBI=0.0466452;REFB=0.0483177;REVB=-0.0254799;RO=13;SAF=12;SAR=23;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0196191;STB=0.510632;STBP=0.865;TYPE=snp;VARB=-0.0201221;OID=.;OPOS=78587970;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:13:13:35:35:0.729167:23:12:4:9:23:12:4:9
chr15	78632830	.	C	G	368.76	PASS	AF=0.648148;AO=35;DP=54;FAO=35;FDP=54;FR=.;FRO=19;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=0.00184693;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.5391;QD=27.3157;RBI=0.00723007;REFB=-0.0645728;REVB=0.00699019;RO=19;SAF=16;SAR=19;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145419;STB=0.579345;STBP=0.125;TYPE=snp;VARB=0.0352152;OID=.;OPOS=78632830;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:19:19:35:35:0.648148:19:16:13:6:19:16:13:6
chr15	78633595	.	T	G	227.0	PASS	AF=0.7;AO=20;DP=29;FAO=21;FDP=30;FR=.;FRO=9;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=0.00303627;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.601;QD=30.2669;RBI=0.0290526;REFB=-0.0285634;REVB=0.0288935;RO=9;SAF=12;SAR=8;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106858;STB=0.564297;STBP=0.325;TYPE=snp;VARB=0.0141211;OID=.;OPOS=78633595;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:29:30:9:9:20:21:0.7:8:12:7:2:9:12:7:2
chr15	78640331	.	T	A	89.78	PASS	AF=0.25;AO=12;DP=48;FAO=12;FDP=48;FR=.;FRO=36;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=-0.0240878;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.77;QD=7.48138;RBI=0.027709;REFB=-0.00247378;REVB=-0.0136955;RO=36;SAF=9;SAR=3;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.400584;STB=0.749583;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.00778638;OID=.;OPOS=78640331;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:48:48:36:36:12:12:0.25:3:9:15:21:3:9:15:21
chr15	78758677	.	G	C	632.84	PASS	AF=1;AO=40;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.041891;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.592;QD=60.2703;RBI=0.0463034;REFB=0;REVB=0.0197268;RO=0;SAF=15;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00135936;OID=.;OPOS=78758677;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:40:42:1:25:15:0:0:25:17:0:0
chr15	78780104	.	T	C	632.26	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0303985;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=237.696;QD=61.6838;RBI=0.0310467;REFB=0;REVB=-0.00631118;RO=0;SAF=21;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.08613e-05;OID=.;OPOS=78780104;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:20:21:0:0:20:21:0:0
chr15	78841220	.	T	C	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0306668;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.936;QD=47.8215;RBI=0.0481451;REFB=0;REVB=-0.0371147;RO=0;SAF=8;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.5604e-05;OID=.;OPOS=78841220;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:8:8:0:0:8:8:0:0
chr15	78885574	.	T	A	729.24	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0155046;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.418;QD=57.195;RBI=0.0315457;REFB=0;REVB=0.0274725;RO=0;SAF=25;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.79777e-05;OID=.;OPOS=78885574;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:51:0:0:50:51:1:25:25:0:0:25:26:0:0
chr15	78887709	.	G	GTCTC	469.26	PASS	AF=0.745455;AO=41;DP=56;FAO=41;FDP=55;FR=.;FRO=14;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=0.0368296;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=4;MLLD=263.951;QD=34.1279;RBI=0.0383343;REFB=-0.00866726;REVB=0.0106349;RO=14;SAF=17;SAR=24;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0633735;STB=0.53418;STBP=0.434;TYPE=ins;VARB=0.00383582;OID=.;OPOS=78887710;OREF=-;OALT=TCTC;OMAPALT=GTCTC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.745455:41:56:41:55:14:17:24:4:10:97:14:17:24:4:10
chr15	78911181	.	T	C	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0185805;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.236;QD=51.9154;RBI=0.0564395;REFB=0;REVB=0.0532934;RO=0;SAF=7;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000383642;OID=.;OPOS=78911181;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:14:7:0:0:14:7:0:0
chr15	79054900	.	C	G	190.12	PASS	AF=1;AO=9;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.221889;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=32.7944;QD=47.5291;RBI=0.222053;REFB=0;REVB=0.00853711;RO=0;SAF=4;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0152796;OID=.;OPOS=79054900;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:9:16:1:5:4:0:0:7:9:0:0
chr15	79058572	.	T	G	50.13	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0716104;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.4167;QD=33.4218;RBI=0.10062;REFB=0;REVB=0.0706845;RO=0;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.93271e-05;OID=.;OPOS=79058572;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:2:4:0:0:2:4:0:0
chr15	79058923	.	G	A	375.65	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0227398;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=145.474;QD=55.6525;RBI=0.0318284;REFB=0;REVB=0.0222699;RO=0;SAF=22;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000172097;OID=.;OPOS=79058923;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:5:22:0:0:5:22:0:0
chr15	79066581	.	G	A	698.65	PASS	AF=0.978261;AO=44;DP=45;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0341196;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.202;QD=60.7525;RBI=0.0410928;REFB=-0.0825088;REVB=0.0229014;RO=1;SAF=20;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0229092;STB=0.51219;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.000891337;OID=.;OPOS=79066581;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:45:46:1:1:44:45:0.978261:24:20:1:0:25:20:1:0
chr15	79082108	.	C	T	519.42	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0010717;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.318;QD=57.7137;RBI=0.0434135;REFB=0;REVB=0.0434003;RO=0;SAF=17;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000180618;OID=.;OPOS=79082108;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:36:0:0:35:36:1:18:17:0:0:18:18:0:0
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chr15	79189580	.	C	CTT,T	237.45	PASS	AF=0.684211,0.315789;AO=6,6;DP=29;FAO=13,6;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=11,3;FSAR=2,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.08222,0.00340092;FXX=0.366544;HRUN=2,1;LEN=2,1;MLLD=32.386,232.283;QD=49.9905;RBI=0.439507,0.0898807;REFB=0,0;REVB=0.431748,0.0898164;RO=15;SAF=6,5;SAR=0,1;SRF=8;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.724028,0.385775;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.0145447,0.0247633;OID=.,.;OPOS=79189581,79189580;OREF=-,C;OALT=TT,T;OMAPALT=CTT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:32:29:19:15:0:6,6:13,6:0.684211,0.315789:0,1:6,5:8:7:2,3:11,3:0:0
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chr15	79189585	.	T	C	52.36	PASS	AF=0.25;AO=8;DP=32;FAO=8;FDP=32;FR=.;FRO=24;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=19;FSRR=5;FWDB=-0.0101042;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=303.727;QD=6.54516;RBI=0.0237706;REFB=0.000763696;REVB=-0.0215162;RO=24;SAF=4;SAR=4;SRF=19;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.356832;STB=0.718307;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=-0.00379149;OID=.;OPOS=79189585;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:32:32:24:24:8:8:0.25:4:4:19:5:4:4:19:5
chr15	79191209	.	C	T	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0188404;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.164;QD=55.6561;RBI=0.0201478;REFB=0;REVB=0.00713934;RO=0;SAF=11;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.45053e-05;OID=.;OPOS=79191209;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:16:11:0:0:16:11:0:0
chr15	79217690	.	G	C	175.72	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0552469;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.2833;QD=46.8585;RBI=0.0596738;REFB=0;REVB=0.0225552;RO=0;SAF=4;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.63386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00352631;OID=.;OPOS=79217690;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:15:0:0:14:15:1:10:4:0:0:11:4:0:0
chr15	79230092	.	A	G	224.03	PASS	AF=0.740741;AO=20;DP=28;FAO=20;FDP=27;FR=.;FRO=7;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.0637248;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.9789;QD=33.1902;RBI=0.0798742;REFB=0.0142384;REVB=0.0481564;RO=7;SAF=6;SAR=14;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00804707;STB=0.50442;STBP=0.971;TYPE=snp;VARB=-0.00242532;OID=.;OPOS=79230092;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:28:27:7:7:20:20:0.740741:14:6:2:5:14:6:2:5
chr15	79231518	.	A	G	44.75	PASS	AF=0.2;AO=8;DP=40;FAO=8;FDP=40;FR=.;FRO=32;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=23;FWDB=-0.0115219;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=267.48;QD=4.47514;RBI=0.0116344;REFB=-0.00380313;REVB=-0.0016143;RO=31;SAF=3;SAR=5;SRF=8;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161584;STB=0.583139;STBP=0.658;TYPE=snp;VARB=0.0256639;OID=.;OPOS=79231518;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:40:40:31:32:8:8:0.2:5:3:8:23:5:3:9:23
chr15	79231523	.	GAAA	GAAAA,GAA,GAAAG	43.97	PASS	AF=0,0.0357143,0.214286;AO=8,5,5;DP=31;FAO=0,1,6;FDP=28;FR=.;FRO=21;FSAF=0,0,3;FSAR=0,1,3;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=0.0392013,-0.0862973,-0.0129422;FXX=0.0666445;HRUN=10,10,0;LEN=1,1,1;MLLD=4.6855,4.82638,227.329;QD=6.28193;RBI=0.270481,0.273689,0.0394708;REFB=-0.0465482,-0.0279546,-0.0063418;REVB=-0.267625,0.259727,0.0372886;RO=10;SAF=1,2,3;SAR=7,3,2;SRF=4;SRR=6;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.3708,0,0.205781;STB=0.5,0.986681,0.629227;STBP=1,0.482,0.554;TYPE=ins,del,ins;VARB=0,-0.133466,0.0230928;OID=.,.,.;OPOS=79231524,79231524,79231527;OREF=-,A,-;OALT=A,-,G;OMAPALT=GAAAA,GAA,GAAAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/3:0,0.0357143,0.214286:8,5,5:31:0,1,6:28:21:0,0,3:0,1,3:7:14:38:10:1,2,3:7,3,2:4:6
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chr15	79277247	.	A	C	1546.34	PASS	AF=1;AO=103;DP=104;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0302695;FXX=0.0186898;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.718;QD=58.9083;RBI=0.0307806;REFB=0;REVB=0.0055862;RO=0;SAF=43;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000589779;OID=.;OPOS=79277247;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:104:105:0:0:103:105:1:60:43:0:0:60:45:0:0
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chr15	79585989	.	A	G	42.55	PASS	AF=0.166667;AO=7;DP=44;FAO=7;FDP=42;FR=.;FRO=35;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=23;FSRR=12;FWDB=0.020259;FXX=0.0454442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.479;QD=4.05206;RBI=0.0355411;REFB=0.000914375;REVB=0.0292018;RO=37;SAF=4;SAR=3;SRF=23;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0627151;STB=0.574265;STBP=0.726;TYPE=snp;VARB=-0.0104555;OID=.;OPOS=79585989;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:42:44:42:37:35:7:7:0.166667:3:4:23:14:3:4:23:12
chr15	79586159	.	A	G	42.47	PASS	AF=0.2;AO=7;DP=35;FAO=7;FDP=35;FR=.;FRO=28;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=0.00934398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.486;QD=4.8534;RBI=0.0232726;REFB=-0.00936366;REVB=0.0213145;RO=28;SAF=3;SAR=4;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.043134;STB=0.528843;STBP=0.953;TYPE=snp;VARB=0.0612516;OID=.;OPOS=79586159;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:42:35:35:28:28:7:7:0.2:4:3:13:15:4:3:13:15
chr15	79586361	.	T	C	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0183335;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=317.802;QD=40.7629;RBI=0.0373211;REFB=0;REVB=0.0325076;RO=0;SAF=6;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.16312e-05;OID=.;OPOS=79586361;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:4:6:0:0:4:6:0:0
chr15	79589174	.	C	G	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0174628;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=333.69;QD=42.1826;RBI=0.0389695;REFB=0;REVB=0.0348378;RO=0;SAF=10;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000115799;OID=.;OPOS=79589174;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:1:10:0:0:1:10:0:0
chr15	79590208	.	A	G	193.49	PASS	AF=0.75;AO=18;DP=24;FAO=18;FDP=24;FR=.;FRO=6;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0024192;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.063;QD=32.2487;RBI=0.0100931;REFB=0.00842546;REVB=-0.00979893;RO=6;SAF=9;SAR=9;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00171295;OID=.;OPOS=79590208;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:24:24:6:6:18:18:0.75:9:9:3:3:9:9:3:3
chr15	79603653	.	C	T	130.62	PASS	AF=0.384615;AO=14;DP=37;FAO=15;FDP=39;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=0.0242497;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.0209;QD=13.3972;RBI=0.0453876;REFB=-0.00778281;REVB=-0.0383665;RO=23;SAF=10;SAR=4;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.219817;STB=0.656496;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=0.0168457;OID=.;OPOS=79603653;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:39:23:24:14:15:0.384615:4:10:12:11:4:11:12:12
chr15	79606137	.	G	A	411.67	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00579597;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.449;QD=56.7817;RBI=0.0404263;REFB=0;REVB=0.0400087;RO=0;SAF=9;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.62669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000145355;OID=.;OPOS=79606137;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:29:0:0:28:29:1:19:9:0:0:20:9:0:0
chr15	79614418	.	A	G	1274.42	PASS	AF=1;AO=82;DP=82;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00172789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.112;QD=61.4181;RBI=0.00826344;REFB=0;REVB=0.00808077;RO=0;SAF=37;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.2894e-05;OID=.;OPOS=79614418;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:83:0:0:82:83:1:45:37:0:0:45:38:0:0
chr15	79750307	.	T	C	223.13	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00162061;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.283;QD=49.5845;RBI=0.00318813;REFB=0;REVB=-0.0027455;RO=0;SAF=13;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.38919e-06;OID=.;OPOS=79750307;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:5:13:0:0:5:13:0:0
chr15	79762525	.	A	C	108.47	PASS	AF=0.276596;AO=11;DP=47;FAO=13;FDP=47;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=33;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=-0.0206704;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=97.1238;QD=9.23104;RBI=0.0341757;REFB=-0.00134405;REVB=-0.027216;RO=17;SAF=5;SAR=6;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136212;STB=0.549078;STBP=0.713;TYPE=snp;VARB=0.0286446;OID=.;OPOS=79762525;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:17:33:11:13:0.276596:6:5:10:7:6:7:20:13
chr15	79764056	.	G	T	78.21	PASS	AF=0.30303;AO=5;DP=31;FAO=10;FDP=33;FR=.,HEALED;FRO=23;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=0.000143478;FXX=0.0571265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.179;QD=9.48004;RBI=0.0998621;REFB=-0.000374797;REVB=0.099862;RO=9;SAF=5;SAR=0;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.718987;STB=0.746137;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=0.000316811;OID=.;OPOS=79764056;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:31:33:9:23:5:10:0.30303:0:5:5:4:2:8:11:12
chr15	80191343	.	G	A	233.43	PASS	AF=0.329545;AO=29;DP=88;FAO=29;FDP=88;FR=.;FRO=59;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=36;FSRR=23;FWDB=0.020158;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.385;QD=10.6104;RBI=0.0228888;REFB=0.00648649;REVB=0.0108421;RO=59;SAF=15;SAR=14;SRF=36;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107777;STB=0.562605;STBP=0.443;TYPE=snp;VARB=-0.0164536;OID=.;OPOS=80191343;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:59:59:29:29:0.329545:14:15:36:23:14:15:36:23
chr15	80215300	.	T	C	135.77	PASS	AF=0.7;AO=14;DP=20;FAO=14;FDP=20;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.0130932;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.774;QD=27.1542;RBI=0.0154766;REFB=-0.00873056;REVB=0.00825199;RO=6;SAF=4;SAR=10;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0307691;STB=0.517216;STBP=0.84;TYPE=snp;VARB=0.00379151;OID=.;OPOS=80215300;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:20:20:6:6:14:14:0.7:10:4:2:4:10:4:2:4
chr15	80216532	.	A	T	344.27	PASS	AF=0.644444;AO=29;DP=46;FAO=29;FDP=45;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=-0.0115731;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.98;QD=30.6016;RBI=0.0151961;REFB=0.0122586;REVB=-0.00984806;RO=17;SAF=9;SAR=20;SRF=4;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0605733;STB=0.52553;STBP=0.685;TYPE=snp;VARB=-0.00377517;OID=.;OPOS=80216532;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:45:17:16:29:29:0.644444:20:9:4:13:20:9:4:12
chr15	80217100	.	A	G	432.25	PASS	AF=0.709091;AO=39;DP=55;FAO=39;FDP=55;FR=.;FRO=16;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=0.035595;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.9638;QD=31.4364;RBI=0.0362775;REFB=0.00382829;REVB=0.0070036;RO=16;SAF=21;SAR=18;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0875746;STB=0.547462;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=-0.000777458;OID=.;OPOS=80217100;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:16:16:39:39:0.709091:18:21:6:10:18:21:6:10
chr15	80259964	.	C	T	447.02	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0391318;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.8444;QD=57.6794;RBI=0.0395262;REFB=0;REVB=0.00556956;RO=0;SAF=21;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000661209;OID=.;OPOS=80259964;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:10:21:0:0:10:21:0:0
chr15	80260014	.	T	C	340.62	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0929555;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.1912;QD=54.4985;RBI=0.0980555;REFB=0;REVB=-0.0312117;RO=0;SAF=15;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00137616;OID=.;OPOS=80260014;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:10:15:0:0:10:15:0:0
chr15	80263217	.	C	T	58.89	PASS	AF=0.157895;AO=11;DP=73;FAO=12;FDP=76;FR=.;FRO=64;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=31;FSRR=33;FWDB=-0.0147119;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.7222;QD=3.09957;RBI=0.0147465;REFB=-0.0101426;REVB=-0.00100877;RO=62;SAF=6;SAR=5;SRF=30;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0760156;STB=0.513136;STBP=0.954;TYPE=snp;VARB=0.0708824;OID=.;OPOS=80263217;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:58:73:76:62:64:11:12:0.157895:5:6:30:32:6:6:31:33
chr15	80263345	.	A	C,T	800.79	PASS	AF=0.929825,0.0701754;AO=53,4;DP=57;FAO=53,4;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=29,4;FSAR=24,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0165757,-0.0165495;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=263.864,232.582;QD=56.1957;RBI=0.0254721,0.0295119;REFB=0,0;REVB=-0.0193409,-0.0244349;RO=0;SAF=29,4;SAR=24,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00618667,0.0626861;OID=.,.;OPOS=80263345,80263345;OREF=A,A;OALT=C,T;OMAPALT=C,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:13:57:57:0:0:53,4:53,4:0.929825,0.0701754:24,0:29,4:0:0:24,0:29,4:0:0
chr15	80263406	.	C	T	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0196916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.6148;QD=59.4352;RBI=0.0250193;REFB=0;REVB=0.0154339;RO=0;SAF=17;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000545932;OID=.;OPOS=80263406;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:18:17:0:0:18:17:0:0
chr15	80454707	.	G	A	738.75	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0762704;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.0778;QD=62.8719;RBI=0.0765134;REFB=0;REVB=0.00609323;RO=0;SAF=19;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000761761;OID=.;OPOS=80454707;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:47:0:0:44:47:1:25:19:0:0:26:21:0:0
chr15	80873642	.	C	G	70.78	PASS	AF=0.25641;AO=10;DP=39;FAO=10;FDP=39;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=0.0199599;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.336;QD=7.2596;RBI=0.0279438;REFB=0.00363372;REVB=-0.0195565;RO=29;SAF=9;SAR=1;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.485553;STB=0.817411;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=-0.0324206;OID=.;OPOS=80873642;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:70:39:39:29:29:10:10:0.25641:1:9:17:12:1:9:17:12
chr15	80889548	.	G	A	34.73	PASS	AF=0.2;AO=6;DP=30;FAO=6;FDP=30;FR=.;FRO=24;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=18;FWDB=-0.0126203;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.17;QD=4.63037;RBI=0.025897;REFB=0.00621446;REVB=-0.0226138;RO=24;SAF=1;SAR=5;SRF=6;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148146;STB=0.603066;STBP=0.716;TYPE=snp;VARB=-0.0270307;OID=.;OPOS=80889548;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:30:30:24:24:6:6:0.2:5:1:6:18:5:1:6:18
chr15	80890101	.	T	C	136.97	PASS	AF=0.25974;AO=20;DP=77;FAO=20;FDP=77;FR=.;FRO=57;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=23;FSRR=34;FWDB=0.00657491;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.7125;QD=7.11511;RBI=0.0105465;REFB=-0.00388023;REVB=-0.00824611;RO=57;SAF=12;SAR=8;SRF=23;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.236171;STB=0.642718;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=0.0121704;OID=.;OPOS=80890101;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:57:57:20:20:0.25974:8:12:23:34:8:12:23:34
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chr15	81592802	.	A	G	51.67	PASS	AF=0.228571;AO=8;DP=35;FAO=8;FDP=35;FR=.;FRO=27;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=0.0284835;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.571;QD=5.90509;RBI=0.0286774;REFB=-0.00223954;REVB=-0.00332945;RO=26;SAF=3;SAR=5;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.32155;STB=0.689207;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.00484873;OID=.;OPOS=81592802;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:51:35:35:26:27:8:8:0.228571:5:3:17:9:5:3:17:10
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chr15	81600995	.	A	G	374.98	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.019525;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.493;QD=55.5521;RBI=0.0345538;REFB=0;REVB=-0.0285086;RO=0;SAF=12;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.35987e-05;OID=.;OPOS=81600995;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:15:12:0:0:15:12:0:0
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chr15	82443939	.	G	A	145.01	PASS	AF=0.714286;AO=14;DP=20;FAO=15;FDP=21;FR=.;FRO=6;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.00929458;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.2797;QD=27.6215;RBI=0.0370047;REFB=-0.0439814;REVB=0.0358185;RO=6;SAF=7;SAR=7;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0894563;STB=0.556886;STBP=0.463;TYPE=snp;VARB=0.0345886;OID=.;OPOS=82443939;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:20:21:6:6:14:15:0.714286:7:7:2:4:7:8:2:4
chr15	82444437	.	A	G	573.76	PASS	AF=0.974359;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0682806;FXX=0.0487686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.6147;QD=58.8466;RBI=0.0690861;REFB=-0.232348;REVB=0.0105193;RO=0;SAF=17;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.53998e-08;STB=0.511622;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.00108796;OID=.;OPOS=82444437;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:38:39:0:1:38:38:0.974359:21:17:0:0:21:17:0:1
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chr15	82637079	.	C	T	203.82	PASS	AF=0.857143;AO=18;DP=21;FAO=18;FDP=21;FR=.;FRO=3;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0532677;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=187.332;QD=38.8227;RBI=0.056499;REFB=-0.0360843;REVB=0.018833;RO=2;SAF=7;SAR=11;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0212765;STB=0.508371;STBP=0.911;TYPE=snp;VARB=0.00509307;OID=.;OPOS=82637079;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:21:21:2:3:18:18:0.857143:11:7:1:1:11:7:1:2
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chr15	83502065	.	AC	CG	169.61	PASS	AF=0.548387;AO=16;DP=31;FAO=17;FDP=31;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.0186086;FXX=0.0605877;HRUN=1;LEN=2;MLLD=232.417;QD=21.8847;RBI=0.0191652;REFB=-0.0348199;REVB=0.00458512;RO=14;SAF=7;SAR=9;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0518517;STB=0.513292;STBP=0.954;TYPE=mnp;VARB=0.0279918;OID=.;OPOS=83502065;OREF=AC;OALT=CG;OMAPALT=CG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:14:14:16:17:0.548387:9:7:7:7:9:8:7:7
chr15	83680287	.	A	G	921.66	PASS	AF=0.728972;AO=78;DP=106;FAO=78;FDP=107;FR=.;FRO=29;FSAF=35;FSAR=43;FSRF=21;FSRR=8;FWDB=0.0136736;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=183.687;QD=34.4546;RBI=0.0137294;REFB=-0.0294699;REVB=-0.00123588;RO=27;SAF=35;SAR=43;SRF=19;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122046;STB=0.574272;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.0182276;OID=.;OPOS=83680287;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:107:27:29:78:78:0.728972:43:35:19:8:43:35:21:8
chr15	84488636	.	A	G	756.41	PASS	AF=1;AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0253443;FXX=0.040808;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.144;QD=64.3752;RBI=0.0259689;REFB=0;REVB=-0.00566145;RO=0;SAF=18;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000425822;OID=.;OPOS=84488636;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:47:0:0:47:47:1:29:18:0:0:29:18:0:0
chr15	84493651	.	T	C	1448.79	PASS	AF=0.980198;AO=99;DP=101;FAO=99;FDP=101;FR=.;FRO=2;FSAF=46;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0174775;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.1982;QD=57.3778;RBI=0.0324363;REFB=-0.0798996;REVB=-0.027325;RO=2;SAF=46;SAR=53;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0175617;STB=0.509257;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=0.00827233;OID=.;OPOS=84493651;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:101:101:2:2:99:99:0.980198:53:46:0:2:53:46:0:2
chr15	84539619	.	C	G	866.62	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00957329;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.5699;QD=57.7745;RBI=0.0195574;REFB=0;REVB=0.0170541;RO=0;SAF=30;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00013198;OID=.;OPOS=84539619;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:30:30:0:0:30:30:0:0
chr15	84581904	.	T	C	411.06	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0519557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.9771;QD=56.6982;RBI=0.127232;REFB=0;REVB=0.116141;RO=0;SAF=17;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.0947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00144707;OID=.;OPOS=84581904;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:12:17:0:0:12:17:0:0
chr15	84582124	.	G	T	557.08	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00855417;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.036;QD=60.2251;RBI=0.00856487;REFB=0;REVB=-0.000428107;RO=0;SAF=17;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.71161e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.14624e-05;OID=.;OPOS=84582124;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:20:17:0:0:20:17:0:0
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chr15	84909385	.	G	A	66.51	PASS	AF=0.8;AO=8;DP=10;FAO=8;FDP=10;FR=.;FRO=2;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00789142;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.8558;QD=26.6022;RBI=0.0465942;REFB=-0.00545052;REVB=-0.0459211;RO=2;SAF=6;SAR=2;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.288883;STB=0.666221;STBP=0.124;TYPE=snp;VARB=-0.0021458;OID=.;OPOS=84909385;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:10:10:2:2:8:8:0.8:2:6:0:2:2:6:0:2
chr15	84958495	.	G	A	34.83	PASS	AF=0.833333;AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0739108;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.963;QD=23.2183;RBI=0.146723;REFB=-0.0065017;REVB=0.126747;RO=1;SAF=4;SAR=1;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0951258;STB=0.555346;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=0.00704884;OID=.;OPOS=84958495;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:6:6:1:1:5:5:0.833333:1:4:1:0:1:4:1:0
chr15	85149771	.	G	T	306.3	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0137208;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.4953;QD=53.2696;RBI=0.0197297;REFB=0;REVB=-0.0141774;RO=0;SAF=8;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000626175;OID=.;OPOS=85149771;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:15:8:0:0:15:8:0:0
chr15	85163998	.	G	C	323.47	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0061553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.875;QD=53.9111;RBI=0.0395436;REFB=0;REVB=0.0390616;RO=0;SAF=13;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.23319e-05;OID=.;OPOS=85163998;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:11:13:0:0:11:13:0:0
chr15	85188994	.	T	C	358.13	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0214815;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.101;QD=55.097;RBI=0.0317098;REFB=0;REVB=0.023325;RO=0;SAF=6;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.14057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000295053;OID=.;OPOS=85188994;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:20:6:0:0:20:6:0:0
chr15	85198362	.	G	T	88.22	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0257974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.565;QD=39.2068;RBI=0.0386893;REFB=0;REVB=-0.0288333;RO=0;SAF=2;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.45011e-05;OID=.;OPOS=85198362;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:7:2:0:0:7:2:0:0
chr15	85333953	.	A	G	747.1	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000411735;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=287.218;QD=63.583;RBI=0.00986752;REFB=0;REVB=0.00985893;RO=0;SAF=29;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.95493e-05;OID=.;OPOS=85333953;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:18:29:0:0:18:29:0:0
chr15	85341859	.	G	A	595.09	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0651937;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.658;QD=61.0344;RBI=0.0767094;REFB=0;REVB=0.0404242;RO=0;SAF=22;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000301884;OID=.;OPOS=85341859;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:39:0:0:38:39:1:16:22:0:0:16:23:0:0
chr15	85360101	.	T	C	955.2	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0450685;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.29;QD=58.7816;RBI=0.0547654;REFB=0;REVB=0.031114;RO=0;SAF=24;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.25588e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000232476;OID=.;OPOS=85360101;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:41:24:0:0:41:24:0:0
chr15	85383839	.	G	A	885.43	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00967108;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=281.531;QD=58.0611;RBI=0.0180195;REFB=0;REVB=0.0152043;RO=0;SAF=14;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.92147e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.24706e-05;OID=.;OPOS=85383839;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:47:14:0:0:47:14:0:0
chr15	85401259	.	C	T	1034.6	PASS	AF=0.972973;AO=71;DP=74;FAO=72;FDP=74;FR=.;FRO=2;FSAF=31;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0503701;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=43.5557;QD=55.9242;RBI=0.0658842;REFB=-0.154151;REVB=0.0424686;RO=2;SAF=30;SAR=41;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0304803;STB=0.501912;STBP=0.868;TYPE=snp;VARB=0.00759815;OID=.;OPOS=85401259;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:74:74:2:2:71:72:0.972973:41:30:2:0:41:31:1:1
chr15	85401419	.	T	C	1008.57	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0328856;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.032;QD=59.3279;RBI=0.0528991;REFB=0;REVB=0.0414349;RO=0;SAF=30;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.15347e-05;OID=.;OPOS=85401419;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:68:0:0:66:68:1:36:30:0:0:38:30:0:0
chr15	85411941	.	A	G	715.46	PASS	AF=1;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0410598;FXX=0.019604;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.613;QD=57.2365;RBI=0.0413963;REFB=0;REVB=-0.00526722;RO=0;SAF=25;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000198754;OID=.;OPOS=85411941;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:50:0:0:50:50:1:25:25:0:0:25:25:0:0
chr15	85447431	.	G	A	58.48	PASS	AF=0.169492;AO=10;DP=59;FAO=10;FDP=59;FR=.;FRO=49;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=27;FSRR=22;FWDB=-0.010209;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.862;QD=3.96487;RBI=0.0102893;REFB=-0.00722135;REVB=-0.00128268;RO=49;SAF=7;SAR=3;SRF=27;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.193442;STB=0.631495;STBP=0.392;TYPE=snp;VARB=0.0333658;OID=.;OPOS=85447431;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:58:59:59:49:49:10:10:0.169492:3:7:27:22:3:7:27:22
chr15	85448875	.	C	A	105.92	PASS	AF=0.25;AO=16;DP=64;FAO=16;FDP=64;FR=.;FRO=48;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=28;FWDB=-0.0232152;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.741;QD=6.62028;RBI=0.0238843;REFB=-0.018785;REVB=-0.00561368;RO=42;SAF=6;SAR=10;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123496;STB=0.532745;STBP=0.794;TYPE=snp;VARB=0.0490665;OID=.;OPOS=85448875;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:42:48:16:16:0.25:10:6:20:22:10:6:20:28
chr15	85467275	.	C	T	122.32	PASS	AF=0.293103;AO=17;DP=58;FAO=17;FDP=58;FR=.;FRO=41;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=0.0166069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.336;QD=8.43574;RBI=0.0186677;REFB=0.000309446;REVB=0.008526;RO=41;SAF=5;SAR=12;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.266374;STB=0.660821;STBP=0.125;TYPE=snp;VARB=-0.000218881;OID=.;OPOS=85467275;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:41:41:17:17:0.293103:12:5:21:20:12:5:21:20
chr15	85476441	.	G	A	499.47	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0595436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.472;QD=58.7608;RBI=0.0617446;REFB=0;REVB=0.0163387;RO=0;SAF=3;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000341092;OID=.;OPOS=85476441;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:34:0:0:33:34:1:30:3:0:0:30:4:0:0
chr15	85478410	.	A	G	329.21	PASS	AF=0.961538;AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0327462;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.857;QD=50.6477;RBI=0.0961604;REFB=-0.0168937;REVB=-0.090413;RO=1;SAF=18;SAR=7;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0250902;STB=0.513503;STBP=0.609;TYPE=snp;VARB=0.00821813;OID=.;OPOS=85478410;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:26:26:1:1:25:25:0.961538:7:18:1:0:7:18:1:0
chr15	85478696	.	C	T	32.59	PASS	AF=0.12766;AO=6;DP=47;FAO=6;FDP=47;FR=.;FRO=41;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=-0.0042057;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.601;QD=2.77358;RBI=0.0156121;REFB=-0.000294394;REVB=0.0150349;RO=41;SAF=3;SAR=3;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0429342;STB=0.531809;STBP=0.92;TYPE=snp;VARB=0.00510285;OID=.;OPOS=85478696;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:32:47:47:41:41:6:6:0.12766:3:3:19:22:3:3:19:22
chr15	86087309	.	T	C	514.92	PASS	AF=0.77193;AO=44;DP=57;FAO=44;FDP=57;FR=.;FRO=13;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.00559707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.912;QD=36.1348;RBI=0.0227044;REFB=-0.0180512;REVB=0.0220037;RO=13;SAF=20;SAR=24;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.068217;STB=0.536724;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=0.00561314;OID=.;OPOS=86087309;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:57:57:13:13:44:44:0.77193:24:20:8:5:24:20:8:5
chr15	86122779	.	T	C	113.4	PASS	AF=0.297872;AO=14;DP=47;FAO=14;FDP=47;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=0.00658837;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=162.056;QD=9.65094;RBI=0.0146317;REFB=-0.00681046;REVB=-0.0130645;RO=33;SAF=10;SAR=4;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.308783;STB=0.687226;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=0.021795;OID=.;OPOS=86122779;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:33:33:14:14:0.297872:4:10:15:18:4:10:15:18
chr15	86122916	.	T	C	87.73	PASS	AF=0.235294;AO=12;DP=51;FAO=12;FDP=51;FR=.;FRO=39;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=26;FWDB=0.00820678;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.856;QD=6.8808;RBI=0.0141432;REFB=-0.0151227;REVB=0.0115187;RO=39;SAF=4;SAR=8;SRF=13;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0354938;OID=.;OPOS=86122916;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:51:51:39:39:12:12:0.235294:8:4:13:26:8:4:13:26
chr15	86123924	.	C	T	43.79	PASS	AF=0.25;AO=7;DP=28;FAO=7;FDP=28;FR=.;FRO=21;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=-0.00607853;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=199.967;QD=6.25586;RBI=0.0189053;REFB=-0.010695;REVB=0.0179014;RO=20;SAF=3;SAR=4;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195617;STB=0.639616;STBP=0.454;TYPE=snp;VARB=0.0384382;OID=.;OPOS=86123924;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:28:28:20:21:7:7:0.25:4:3:12:8:4:3:13:8
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chr15	86124419	.	C	T	54.66	PASS	AF=0.333333;AO=8;DP=24;FAO=8;FDP=24;FR=.;FRO=16;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.0398651;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.4942;QD=9.11001;RBI=0.0557058;REFB=0.0113931;REVB=-0.038909;RO=16;SAF=2;SAR=6;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160269;STB=0.599733;STBP=0.545;TYPE=snp;VARB=-0.0131489;OID=.;OPOS=86124419;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:24:24:16:16:8:8:0.333333:6:2:6:10:6:2:6:10
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chr15	86284342	.	C	T	424.0	PASS	AF=0.767442;AO=33;DP=43;FAO=33;FDP=43;FR=.;FRO=10;FSAF=24;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.00204497;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.722;QD=39.4418;RBI=0.0374089;REFB=0.000678589;REVB=0.037353;RO=10;SAF=24;SAR=9;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0146451;STB=0.507932;STBP=0.921;TYPE=snp;VARB=3.44732e-05;OID=.;OPOS=86284342;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:69:43:43:10:10:33:33:0.767442:9:24:7:3:9:24:7:3
chr15	86288518	.	G	C	55.95	PASS	AF=0.204545;AO=7;DP=41;FAO=9;FDP=44;FR=.;FRO=35;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=20;FSRR=15;FWDB=0.00734171;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=47.5519;QD=5.08656;RBI=0.0578278;REFB=-0.0199075;REVB=-0.0573599;RO=34;SAF=3;SAR=4;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155672;STB=0.599782;STBP=0.554;TYPE=snp;VARB=0.071127;OID=.;OPOS=86288518;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:41:44:34:35:7:9:0.204545:4:3:19:15:5:4:20:15
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chr15	87217613	.	A	G	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0211364;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.42;QD=53.2761;RBI=0.0657308;REFB=0;REVB=-0.0622398;RO=0;SAF=11;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000385462;OID=.;OPOS=87217613;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:12:11:0:0:12:11:0:0
chr15	87531281	.	A	C	839.57	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0255029;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.116;QD=55.0534;RBI=0.0928384;REFB=0;REVB=0.0892669;RO=0;SAF=28;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00189616;OID=.;OPOS=87531281;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:61:0:0:58:61:1:30:28:0:0:33:28:0:0
chr15	88474492	.	GAAAAGT	GAAAGT,GAAAGTG	209.57	PASS	AF=0.738095,0;AO=13,5;DP=43;FAO=31,0;FDP=42;FR=.;FRO=11;FSAF=24,0;FSAR=7,0;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=0.188756,-0.0952725;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=1,3;MLLD=11.6264,49.2227;QD=19.9592;RBI=0.284922,0.102847;REFB=-0.211399,-0.0465764;REVB=0.213428,0.0387377;RO=20;SAF=12,5;SAR=1,0;SRF=12;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.518867,0.658473;STB=0.51723,0.5;STBP=0.727,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.164685,0;OID=.,.;OPOS=88474493,88474496;OREF=A,AGT;OALT=-,GTG;OMAPALT=GAAAGT,GAAAGTG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.738095,0:13,5:43:31,0:42:11:24,0:7,0:8:3:38:20:12,5:1,0:12:8
chr15	88576185	.	G	C	895.0	PASS	AF=0.722222;AO=74;DP=104;FAO=78;FDP=108;FR=.;FRO=30;FSAF=37;FSAR=41;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=0.0682118;FXX=0.00917347;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.4427;QD=33.1482;RBI=0.0952856;REFB=-0.0283831;REVB=0.066532;RO=30;SAF=35;SAR=39;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0145362;STB=0.507134;STBP=0.771;TYPE=snp;VARB=0.0232678;OID=.;OPOS=88576185;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:108:30:30:74:78:0.722222:39:35:15:15:41:37:15:15
chr15	88679785	.	G	A	920.1	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00144156;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.403;QD=58.4189;RBI=0.0323191;REFB=0;REVB=0.0322869;RO=0;SAF=37;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.92661e-05;OID=.;OPOS=88679785;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:26:37:0:0:26:37:0:0
chr15	88690628	.	C	G	114.25	PASS	AF=0.311111;AO=14;DP=45;FAO=14;FDP=45;FR=.;FRO=31;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=-0.033205;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.1465;QD=10.1554;RBI=0.0357859;REFB=-0.00671532;REVB=-0.013344;RO=30;SAF=6;SAR=8;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0816695;STB=0.538406;STBP=0.728;TYPE=snp;VARB=0.0160126;OID=.;OPOS=88690628;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:30:31:14:14:0.311111:8:6:15:15:8:6:15:16
chr15	89172558	.	G	C	80.95	PASS	AF=0.268293;AO=11;DP=41;FAO=11;FDP=41;FR=.;FRO=30;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=-0.0123176;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.962;QD=7.89762;RBI=0.0124276;REFB=-0.00828133;REVB=-0.00164997;RO=29;SAF=7;SAR=4;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143044;STB=0.577837;STBP=0.582;TYPE=snp;VARB=0.0216084;OID=.;OPOS=89172558;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:80:41:41:29:30:11:11:0.268293:4:7:15:14:4:7:16:14
chr15	89173657	.	A	T	85.67	PASS	AF=0.34375;AO=11;DP=33;FAO=11;FDP=32;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=-0.0191912;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.984;QD=10.709;RBI=0.0250261;REFB=0.00144979;REVB=-0.0160626;RO=19;SAF=9;SAR=2;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.532606;STB=0.798253;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=-0.00237835;OID=.;OPOS=89173657;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:33:32:19:21:11:11:0.34375:2:9:6:13:2:9:8:13
chr15	89173732	.	T	C	769.32	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0298078;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.5136;QD=56.9864;RBI=0.036583;REFB=0;REVB=-0.0212087;RO=0;SAF=18;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000113051;OID=.;OPOS=89173732;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:36:18:0:0:36:18:0:0
chr15	89193497	.	A	T	366.03	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0202943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.9031;QD=54.2267;RBI=0.0424968;REFB=0;REVB=0.0373379;RO=0;SAF=13;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00295804;OID=.;OPOS=89193497;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:27:0:0:26:27:1:13:13:0:0:14:13:0:0
chr15	89195178	.	G	C	795.25	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00277183;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.501;QD=63.6203;RBI=0.0285886;REFB=0;REVB=0.0284539;RO=0;SAF=31;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.58521e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000397057;OID=.;OPOS=89195178;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:50:0:0:49:50:1:18:31:0:0:18:32:0:0
chr15	89195245	.	C	T	632.14	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0312811;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.8618;QD=61.6724;RBI=0.0709237;REFB=0;REVB=0.0636527;RO=0;SAF=32;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.40541e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000882523;OID=.;OPOS=89195245;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:9:32:0:0:9:32:0:0
chr15	89195526	.	A	G	613.34	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0703483;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.219;QD=61.3344;RBI=0.0703569;REFB=0;REVB=-0.00110317;RO=0;SAF=19;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000470107;OID=.;OPOS=89195526;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:21:19:0:0:21:19:0:0
chr15	89392745	.	T	C	1691.17	PASS	AF=0.982609;AO=112;DP=116;FAO=113;FDP=115;FR=.;FRO=2;FSAF=46;FSAR=67;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0060861;FXX=0.0170926;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.3279;QD=58.8231;RBI=0.0158898;REFB=0.0781472;REVB=0.0146781;RO=1;SAF=46;SAR=66;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00714006;STB=0.501673;STBP=0.852;TYPE=snp;VARB=0.0009528;OID=.;OPOS=89392745;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:116:115:1:2:112:113:0.982609:66:46:0:1:67:46:1:1
chr15	89402596	.	T	G	856.63	PASS	AF=1;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0113306;FXX=0.0327815;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.775;QD=58.0766;RBI=0.0140031;REFB=0;REVB=0.00822835;RO=0;SAF=30;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000193973;OID=.;OPOS=89402596;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:59:0:0:59:59:1:29:30:0:0:29:30:0:0
chr15	89421249	.	G	A	917.63	PASS	AF=0.893333;AO=67;DP=75;FAO=67;FDP=75;FR=.;FRO=8;FSAF=26;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=-0.00984071;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=224.435;QD=48.9404;RBI=0.0112546;REFB=-0.213334;REVB=0.00546127;RO=7;SAF=26;SAR=41;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0741446;STB=0.544432;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.00248506;OID=.;OPOS=89421249;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:75:75:7:8:67:67:0.893333:41:26:0:7:41:26:0:8
chr15	89739259	.	G	C	520.04	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0310303;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.8685;QD=59.433;RBI=0.0310303;REFB=0;REVB=-4.2359e-05;RO=0;SAF=20;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000297015;OID=.;OPOS=89739259;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:15:20:0:0:15:20:0:0
chr15	89740616	.	G	A	1189.5	PASS	AF=1;AO=75;DP=77;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00884384;FXX=0.0249969;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.7544;QD=60.9999;RBI=0.0265498;REFB=0;REVB=0.0250335;RO=0;SAF=42;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000503693;OID=.;OPOS=89740616;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:78:0:0:75:78:1:33:42:0:0:36:42:0:0
chr15	89744476	.	G	T	1452.34	PASS	AF=1;AO=91;DP=91;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0596933;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.059;QD=63.1454;RBI=0.0599124;REFB=0;REVB=0.00511934;RO=0;SAF=37;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.1371e-05;OID=.;OPOS=89744476;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:91:92:0:0:91:92:1:54:37:0:0:54:38:0:0
chr15	89838236	.	G	A	631.49	PASS	AF=0.941176;AO=45;DP=47;FAO=48;FDP=51;FR=.;FRO=3;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0422291;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.9292;QD=49.5285;RBI=0.0447402;REFB=-0.0253976;REVB=0.014778;RO=1;SAF=25;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.018429;STB=0.527261;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.0120025;OID=.;OPOS=89838236;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:47:51:1:3:45:48:0.941176:20:25:1:0:22:26:3:0
chr15	89870237	.	C	T	297.89	PASS	AF=0.65;AO=25;DP=39;FAO=26;FDP=40;FR=.;FRO=14;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.0119078;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=318.311;QD=29.7886;RBI=0.0180535;REFB=-0.00307575;REVB=0.0135696;RO=14;SAF=9;SAR=16;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142542;STB=0.582596;STBP=0.151;TYPE=snp;VARB=0.00148515;OID=.;OPOS=89870237;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:40:14:14:25:26:0.65:16:9:8:6:17:9:8:6
chr15	89878377	.	A	T	1036.09	PASS	AF=0.972603;AO=71;DP=73;FAO=71;FDP=73;FR=.;FRO=2;FSAF=30;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0276594;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.677;QD=56.7721;RBI=0.0543071;REFB=0.0263342;REVB=-0.0467356;RO=2;SAF=30;SAR=41;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0225076;STB=0.511901;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=-0.00036228;OID=.;OPOS=89878377;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:73:73:2:2:71:71:0.972603:41:30:0:2:41:30:0:2
chr15	90126121	.	C	T	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0242605;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.469;QD=55.0978;RBI=0.0300102;REFB=0;REVB=0.0176645;RO=0;SAF=7;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.63811e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000152565;OID=.;OPOS=90126121;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:19:7:0:0:19:7:0:0
chr15	90128966	.	C	T	583.46	PASS	AF=0.626506;AO=52;DP=83;FAO=52;FDP=83;FR=.;FRO=31;FSAF=30;FSAR=22;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=-0.0121869;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.422;QD=28.1186;RBI=0.0697106;REFB=-0.00979087;REVB=-0.068637;RO=31;SAF=30;SAR=22;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13054;STB=0.571003;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=0.00437549;OID=.;OPOS=90128966;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:31:31:52:52:0.626506:22:30:12:19:22:30:12:19
chr15	90138670	.	C	T	754.39	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00349327;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.013;QD=56.9352;RBI=0.00838985;REFB=0;REVB=-0.00762802;RO=0;SAF=24;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.90327e-05;OID=.;OPOS=90138670;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:29:24:0:0:29:24:0:0
chr15	90168108	.	C	T	386.81	PASS	AF=0.738095;AO=31;DP=42;FAO=31;FDP=42;FR=.;FRO=11;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.0174561;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=79.6608;QD=36.8386;RBI=0.0400501;REFB=-0.0367133;REVB=0.0360458;RO=10;SAF=12;SAR=19;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00609936;STB=0.518447;STBP=0.725;TYPE=snp;VARB=0.0145081;OID=.;OPOS=90168108;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:42:42:10:11:31:31:0.738095:19:12:4:6:19:12:5:6
chr15	90168693	.	T	A	108.85	PASS	AF=0.666667;AO=12;DP=18;FAO=12;FDP=18;FR=.;FRO=6;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=-0.0180507;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.238;QD=24.1899;RBI=0.0278914;REFB=-0.00447612;REVB=0.0212627;RO=6;SAF=6;SAR=6;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.298628;STB=0.666419;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.0031219;OID=.;OPOS=90168693;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:18:18:6:6:12:12:0.666667:6:6:6:0:6:6:6:0
chr15	90176432	.	T	G	805.83	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.86;QD=64.466;RBI=0.013119;REFB=0;REVB=-0.00683144;RO=0;SAF=26;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.35865e-06;OID=.;OPOS=90176432;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:50:0:0:49:50:1:23:26:0:0:23:27:0:0
chr15	90191827	.	T	C	101.89	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.156542;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.7983;QD=40.7541;RBI=0.160526;REFB=0;REVB=0.035541;RO=0;SAF=8;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00591772;OID=.;OPOS=90191827;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:2:8:0:0:2:8:0:0
chr15	90195967	.	C	G	883.76	PASS	AF=1;AO=61;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.021428;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=53.0798;QD=57.017;RBI=0.0214805;REFB=0;REVB=-0.00150167;RO=1;SAF=29;SAR=32;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159989;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000419821;OID=.;OPOS=90195967;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:1:0:61:62:1:32:29:1:0:32:30:0:0
chr15	90210257	.	G	A	204.6	PASS	AF=0.284211;AO=27;DP=95;FAO=27;FDP=95;FR=.;FRO=68;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=33;FSRR=35;FWDB=-0.00273847;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.969;QD=8.6149;RBI=0.00750791;REFB=-0.00790856;REVB=0.00699067;RO=68;SAF=11;SAR=16;SRF=33;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.094871;STB=0.55648;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.0217001;OID=.;OPOS=90210257;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:68:68:27:27:0.284211:16:11:33:35:16:11:33:35
chr15	90213229	.	G	C	93.44	PASS	AF=0.578947;AO=10;DP=18;FAO=11;FDP=19;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.0342149;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.921;QD=19.6719;RBI=0.0422698;REFB=-0.0684934;REVB=-0.0248209;RO=8;SAF=6;SAR=4;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0201161;STB=0.533919;STBP=0.785;TYPE=snp;VARB=0.0225453;OID=.;OPOS=90213229;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:18:19:8:8:10:11:0.578947:4:6:5:3:5:6:5:3
chr15	90226947	.	CA	AA,AG	273.72	PASS	AF=0.568182,0;AO=25,2;DP=44;FAO=25,0;FDP=44;FR=.;FRO=19;FSAF=9,0;FSAR=16,0;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.00386103,0.00618829;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,2;MLLD=72.9952,39.7582;QD=24.8832;RBI=0.0591332,0.0165974;REFB=-0.00192518,-0.00567038;REVB=-0.059007,-0.0154006;RO=17;SAF=9,2;SAR=16,0;SRF=7;SRR=10;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0404775,0.566117;STB=0.551682,0.5;STBP=0.472,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.0031305,0;OID=.,.;OPOS=90226947,90226947;OREF=C,CA;OALT=A,AG;OMAPALT=AA,AG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:17:19:25,2:25,0:0.568182,0:16,0:9,2:7:10:16,0:9,0:9:10
chr15	90245174	.	T	A	296.35	PASS	AF=0.634146;AO=26;DP=41;FAO=26;FDP=41;FR=.;FRO=15;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.00963044;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.577;QD=28.9124;RBI=0.0202065;REFB=0.0410858;REVB=-0.0177639;RO=15;SAF=10;SAR=16;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101466;STB=0.555941;STBP=0.397;TYPE=snp;VARB=-0.0203337;OID=.;OPOS=90245174;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:15:15:26:26:0.634146:16:10:8:7:16:10:8:7
chr15	90245253	.	C	T	30.1	PASS	AF=0.416667;AO=5;DP=12;FAO=5;FDP=12;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.0092984;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.027;QD=10.0339;RBI=0.0183649;REFB=0.0236968;REVB=0.0158369;RO=7;SAF=2;SAR=3;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.286688;STB=0.676751;STBP=0.431;TYPE=snp;VARB=-0.0169699;OID=.;OPOS=90245253;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:12:12:7:7:5:5:0.416667:3:2:5:2:3:2:5:2
chr15	90246336	.	A	G	546.85	PASS	AF=0.926829;AO=37;DP=40;FAO=38;FDP=41;FR=.;FRO=3;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.00752068;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.096;QD=53.3516;RBI=0.0194148;REFB=-0.0263455;REVB=0.017899;RO=3;SAF=16;SAR=21;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141753;STB=0.508448;STBP=0.714;TYPE=snp;VARB=0.0022353;OID=.;OPOS=90246336;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:40:41:3:3:37:38:0.926829:21:16:1:2:21:17:1:2
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chr15	90260145	.	T	A	212.27	PASS	AF=0.645161;AO=20;DP=31;FAO=20;FDP=31;FR=.;FRO=11;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.0115464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.3605;QD=27.3893;RBI=0.01546;REFB=-0.0331291;REVB=0.0102806;RO=11;SAF=10;SAR=10;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0290777;STB=0.516113;STBP=0.824;TYPE=snp;VARB=0.0114409;OID=.;OPOS=90260145;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:31:31:11:11:20:20:0.645161:10:10:5:6:10:10:5:6
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chr15	90709545	.	G	A	140.05	PASS	AF=0.555556;AO=15;DP=27;FAO=15;FDP=27;FR=.;FRO=12;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=1;FWDB=-0.0482574;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.6496;QD=20.7488;RBI=0.0731407;REFB=-0.0506576;REVB=0.0549617;RO=12;SAF=10;SAR=5;SRF=11;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.244988;STB=0.636209;STBP=0.202;TYPE=snp;VARB=0.0346795;OID=.;OPOS=90709545;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:12:12:15:15:0.555556:5:10:11:1:5:10:11:1
chr15	90764219	.	G	A	262.43	PASS	AF=0.71875;AO=23;DP=32;FAO=23;FDP=32;FR=.;FRO=9;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=0.00811539;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=246.213;QD=32.8032;RBI=0.0265783;REFB=0.0156122;REVB=0.0253091;RO=9;SAF=11;SAR=12;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153001;STB=0.583712;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=-0.00673262;OID=.;OPOS=90764219;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:32:32:9:9:23:23:0.71875:12:11:7:2:12:11:7:2
chr15	90768320	.	C	T	689.38	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00204452;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.612;QD=62.6705;RBI=0.0628034;REFB=0;REVB=0.0627701;RO=0;SAF=6;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000384238;OID=.;OPOS=90768320;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:38:6:0:0:38:6:0:0
chr15	90771749	.	GT	G,GC,GG	559.58	PASS	AF=0.615385,0,0.384615;AO=7,11,21;DP=39;FAO=24,0,15;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=9,0,10;FSAR=15,0,5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0149169,0.00897926,0.0032272;FXX=0;HRUN=1,1,1;LEN=1,1,1;MLLD=102.958,88.8289,101.462;QD=57.3927;RBI=0.0391639,0.033255,0.0355767;REFB=0,0,0;REVB=0.0362118,0.0320198,0.03543;RO=0;SAF=0,8,11;SAR=7,3,10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,5.51176e-08;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,snp,snp;VARB=-0.00710236,0,0.00532531;OID=.,.,.;OPOS=90771750,90771750,90771750;OREF=T,T,T;OALT=-,C,G;OMAPALT=G,GC,GG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/3:0.615385,0,0.384615:7,11,21:39:24,0,15:39:0:9,0,10:15,0,5:0:0:84:0:0,8,11:7,3,10:0:0
chr15	90772200	.	G	A	429.02	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0134559;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=299.366;QD=57.2026;RBI=0.0258566;REFB=0;REVB=0.0220795;RO=0;SAF=10;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000105941;OID=.;OPOS=90772200;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:20:10:0:0:20:10:0:0
chr15	90772831	.	C	T	658.06	PASS	AF=1;AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0124233;FXX=0.0454442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.6023;QD=62.6722;RBI=0.0195193;REFB=0;REVB=0.0150554;RO=0;SAF=20;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000164005;OID=.;OPOS=90772831;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:42:0:0:42:42:1:22:20:0:0:22:20:0:0
chr15	90774259	.	G	C	162.39	PASS	AF=0.882353;AO=13;DP=17;FAO=15;FDP=17;FR=.;FRO=2;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0362626;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=189.771;QD=38.2098;RBI=0.0481994;REFB=-0.0877583;REVB=0.0317523;RO=0;SAF=5;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60098e-08;STB=0.503932;STBP=0.881;TYPE=snp;VARB=0.00876315;OID=.;OPOS=90774259;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:17:17:0:2:13:15:0.882353:8:5:0:0:8:7:1:1
chr15	90774447	.	TAGAG	T	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.019971;FXX=0;HRUN=1;LEN=4;MLLD=310.081;QD=48.7373;RBI=0.0206661;REFB=0;REVB=0.00531474;RO=0;SAF=4;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00016278;OID=.;OPOS=90774448;OREF=AGAG;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:17:17:17:17:0:4:13:0:0:4:0:4:13:0:0
chr15	90784207	.	A	G	970.78	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0216351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.683;QD=58.8353;RBI=0.0393671;REFB=0;REVB=0.0328891;RO=0;SAF=37;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.11327e-05;OID=.;OPOS=90784207;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:66:0:0:62:66:1:25:37:0:0:29:37:0:0
chr15	90784250	.	T	C	947.23	PASS	AF=1;AO=64;DP=66;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00408612;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.946;QD=58.2909;RBI=0.0150773;REFB=0;REVB=0.014513;RO=0;SAF=33;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000192048;OID=.;OPOS=90784250;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:65:0:0:64:65:1:31:33:0:0:31:34:0:0
chr15	90794102	.	G	A	270.72	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.020916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.509;QD=51.5655;RBI=0.0329466;REFB=0;REVB=0.0254557;RO=0;SAF=12;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000183852;OID=.;OPOS=90794102;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:21:0:0:19:21:1:7:12:0:0:8:13:0:0
chr15	90794757	.	T	G	267.89	PASS	AF=0.954545;AO=21;DP=23;FAO=21;FDP=22;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0128334;FXX=0.0434594;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.269;QD=48.7063;RBI=0.027004;REFB=-0.209806;REVB=0.0237596;RO=1;SAF=11;SAR=10;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0439301;STB=0.523787;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.00266269;OID=.;OPOS=90794757;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:23:22:1:1:21:21:0.954545:10:11:0:1:10:11:0:1
chr15	90794845	.	G	A	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.062437;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.459;QD=51.9165;RBI=0.0697127;REFB=0;REVB=0.0310078;RO=0;SAF=10;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00134196;OID=.;OPOS=90794845;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:11:10:0:0:11:10:0:0
chr15	90796558	.	G	A	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0189836;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.155;QD=52.6132;RBI=0.0445174;REFB=0;REVB=-0.0402669;RO=0;SAF=15;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.79751e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00105685;OID=.;OPOS=90796558;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:7:15:0:0:7:15:0:0
chr15	90800408	.	C	G	501.61	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00739583;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.672;QD=59.0131;RBI=0.0470943;REFB=0;REVB=0.04651;RO=0;SAF=23;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000734698;OID=.;OPOS=90800408;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:11:23:0:0:11:23:0:0
chr15	90800449	.	C	T	346.46	PASS	AF=1;AO=24;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0236002;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.973;QD=53.3019;RBI=0.0504661;REFB=0;REVB=-0.0446079;RO=0;SAF=16;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00736858;OID=.;OPOS=90800449;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:24:26:1:8:16:0:0:9:17:0:0
chr15	90809633	.	G	A	255.83	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0438133;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.349;QD=51.1661;RBI=0.0509709;REFB=0;REVB=-0.0260466;RO=0;SAF=5;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000257536;OID=.;OPOS=90809633;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:20:0:0:19:20:1:14:5:0:0:14:6:0:0
chr15	90818400	.	A	T	175.67	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0389563;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.732;QD=46.8463;RBI=0.0488865;REFB=0;REVB=0.0295347;RO=0;SAF=10;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000144543;OID=.;OPOS=90818400;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:5:10:0:0:5:10:0:0
chr15	90818469	.	C	T	34.69	PASS	AF=0.2;AO=6;DP=30;FAO=6;FDP=30;FR=.;FRO=24;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.0110247;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.961;QD=4.62512;RBI=0.0169035;REFB=-0.00408973;REVB=0.0128134;RO=24;SAF=1;SAR=5;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.491224;STB=0.832224;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=0.0276501;OID=.;OPOS=90818469;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:30:30:24:24:6:6:0.2:5:1:14:10:5:1:14:10
chr15	90818827	.	G	A	153.09	PASS	AF=0.933333;AO=14;DP=15;FAO=14;FDP=15;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.028866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.226;QD=40.8233;RBI=0.0470405;REFB=-0.0814701;REVB=0.0371425;RO=0;SAF=7;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.533286;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.00325537;OID=.;OPOS=90818827;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:15:15:0:1:14:14:0.933333:7:7:0:0:7:7:0:1
chr15	90819132	.	C	T	330.17	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0415037;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.374;QD=52.8278;RBI=0.0424093;REFB=0;REVB=0.00871728;RO=0;SAF=6;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.9951e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000158954;OID=.;OPOS=90819132;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:25:0:0:23:25:1:17:6:0:0:18:7:0:0
chr15	90819641	.	A	C	651.2	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0191559;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.7961;QD=62.0194;RBI=0.0612454;REFB=0;REVB=-0.0581726;RO=0;SAF=31;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.72514e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000287445;OID=.;OPOS=90819641;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:11:31:0:0:11:31:0:0
chr15	90819876	.	T	C	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0409893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.9702;QD=35.5758;RBI=0.0587277;REFB=0;REVB=0.0420574;RO=0;SAF=2;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.27427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00687796;OID=.;OPOS=90819876;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:5:2:0:0:5:2:0:0
chr15	90820063	.	T	C	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0125629;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=296.665;QD=37.4885;RBI=0.0198764;REFB=0;REVB=-0.0154028;RO=0;SAF=3;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000340769;OID=.;OPOS=90820063;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:5:3:0:0:5:3:0:0
chr15	90820721	.	C	T	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00337807;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.77;QD=43.4861;RBI=0.00383818;REFB=0;REVB=0.00182217;RO=0;SAF=6;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.63358e-05;OID=.;OPOS=90820721;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:6:6:0:0:6:6:0:0
chr15	90892293	.	C	T	817.73	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0152523;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.208;QD=57.3847;RBI=0.0215723;REFB=0;REVB=0.0152555;RO=0;SAF=20;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.57266e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.77588e-07;OID=.;OPOS=90892293;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:56:57:0:0:56:57:1:36:20:0:0:36:21:0:0
chr15	90903311	.	A	G	262.91	PASS	AF=0.954545;AO=21;DP=22;FAO=21;FDP=22;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.006361;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.411;QD=47.8009;RBI=0.04249;REFB=-0.0487206;REVB=0.0420112;RO=0;SAF=13;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.529383;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=0.000679098;OID=.;OPOS=90903311;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:22:22:0:1:21:21:0.954545:8:13:0:0:8:13:0:1
chr15	91185994	.	C	T	472.09	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00571576;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.08;QD=57.2227;RBI=0.0101793;REFB=0;REVB=-0.00842307;RO=0;SAF=20;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00232145;OID=.;OPOS=91185994;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:33:0:0:32:33:1:12:20:0:0:12:21:0:0
chr15	91337479	.	G	A	133.19	PASS	AF=0.198276;AO=23;DP=114;FAO=23;FDP=116;FR=.;FRO=93;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=56;FSRR=37;FWDB=-0.00334076;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.787;QD=4.59262;RBI=0.0098093;REFB=0.00164318;REVB=-0.00922289;RO=91;SAF=10;SAR=13;SRF=55;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.212575;STB=0.631701;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=-0.00864788;OID=.;OPOS=91337479;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:114:116:91:93:23:23:0.198276:13:10:55:36:13:10:56:37
chr15	91424574	.	G	C	204.47	PASS	AF=0.202312;AO=18;DP=175;FAO=35;FDP=173;FR=.;FRO=138;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=78;FSRR=60;FWDB=0.0011619;FXX=0.0114279;HRUN=3;LEN=1;MLLD=284.437;QD=4.72767;RBI=0.0247619;REFB=-0.00384281;REVB=-0.0247347;RO=119;SAF=0;SAR=18;SRF=73;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.732296;STB=0.630064;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=0.0173052;OID=.;OPOS=91424574;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:175:173:119:138:18:35:0.202312:18:0:73:46:21:14:78:60
chr15	91428290	.	C	T	188.27	PASS	AF=0.85;AO=17;DP=20;FAO=17;FDP=20;FR=.;FRO=3;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0418028;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=238.709;QD=37.6542;RBI=0.0502394;REFB=-0.0673725;REVB=0.0278662;RO=3;SAF=12;SAR=5;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0128205;STB=0.507034;STBP=0.956;TYPE=snp;VARB=0.0136065;OID=.;OPOS=91428290;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:20:20:3:3:17:17:0.85:5:12:2:1:5:12:2:1
chr15	91428521	.	CT	C	114.75	PASS	AF=0.261538;AO=17;DP=67;FAO=17;FDP=65;FR=.;FRO=48;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=24;FSRR=24;FWDB=-0.00784109;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.009;QD=7.06149;RBI=0.0398856;REFB=-0.00786515;REVB=-0.0391072;RO=48;SAF=9;SAR=8;SRF=22;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0858125;STB=0.521714;STBP=0.859;TYPE=del;VARB=0.031184;OID=.;OPOS=91428522;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.261538:17:67:17:65:48:9:8:24:24:99:48:9:8:22:26
chr15	91428589	.	T	G	486.24	PASS	AF=0.755102;AO=37;DP=49;FAO=37;FDP=49;FR=.;FRO=12;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=0.0105945;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.099;QD=39.6933;RBI=0.0136172;REFB=-0.0234263;REVB=0.00855482;RO=12;SAF=18;SAR=19;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107628;STB=0.558109;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=0.012789;OID=.;OPOS=91428589;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:49:49:12:12:37:37:0.755102:19:18:3:9:19:18:3:9
chr15	91428636	.	G	A	479.57	PASS	AF=0.8;AO=36;DP=45;FAO=36;FDP=45;FR=.;FRO=9;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.00468318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.684;QD=42.628;RBI=0.0588882;REFB=-0.0342536;REVB=0.0587017;RO=9;SAF=18;SAR=18;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0618124;STB=0.533315;STBP=0.394;TYPE=snp;VARB=0.0104026;OID=.;OPOS=91428636;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:59:45:45:9:9:36:36:0.8:18:18:3:6:18:18:3:6
chr15	91430436	.	T	C	848.62	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0158783;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.073;QD=57.5337;RBI=0.0348054;REFB=0;REVB=0.0309725;RO=0;SAF=22;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.51619e-05;OID=.;OPOS=91430436;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:59:0:0:58:59:1:36:22:0:0:37:22:0:0
chr15	91449654	.	T	C	1362.04	PASS	AF=1;AO=87;DP=88;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000365426;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.547;QD=62.6223;RBI=0.0402905;REFB=0;REVB=0.0402888;RO=0;SAF=51;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.35096e-06;OID=.;OPOS=91449654;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:88:87:0:0:87:87:1:36:51:0:0:36:51:0:0
chr15	91449702	.	A	T	1098.24	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.022497;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.668;QD=60.1776;RBI=0.0234587;REFB=0;REVB=0.00664794;RO=0;SAF=36;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.89682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.75754e-05;OID=.;OPOS=91449702;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:37:36:0:0:37:36:0:0
chr15	91452595	.	A	G	785.84	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0378847;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.564;QD=64.15;RBI=0.0406006;REFB=0;REVB=-0.0146001;RO=0;SAF=20;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.78409e-05;OID=.;OPOS=91452595;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:29:20:0:0:29:20:0:0
chr15	91492877	.	C	T	246.71	PASS	AF=0.84;AO=21;DP=25;FAO=21;FDP=25;FR=.;FRO=4;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0199662;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=238.138;QD=39.4735;RBI=0.027941;REFB=-0.0566408;REVB=-0.019546;RO=3;SAF=12;SAR=9;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102305;STB=0.571363;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.00109695;OID=.;OPOS=91492877;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:20:25:25:3:4:21:21:0.84:9:12:3:0:9:12:4:0
chr15	91499986	.	G	T	410.95	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.019368;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=159.866;QD=56.6833;RBI=0.0302052;REFB=0;REVB=0.0231783;RO=0;SAF=20;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000182596;OID=.;OPOS=91499986;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:9:20:0:0:9:20:0:0
chr15	91503195	.	C	T	35.38	PASS	AF=0.230769;AO=6;DP=26;FAO=6;FDP=26;FR=.;FRO=20;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.0210679;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.8777;QD=5.44261;RBI=0.0614982;REFB=0.0128966;REVB=0.0577769;RO=20;SAF=3;SAR=3;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0581081;STB=0.538334;STBP=0.836;TYPE=snp;VARB=-0.0512665;OID=.;OPOS=91503195;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:26:26:20:20:6:6:0.230769:3:3:9:11:3:3:9:11
chr15	91509592	.	T	C	501.26	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0648816;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.1986;QD=58.9716;RBI=0.0650805;REFB=0;REVB=-0.00508461;RO=0;SAF=15;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.64315e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000815545;OID=.;OPOS=91509592;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:34:0:0:33:34:1:18:15:0:0:18:16:0:0
chr15	91517479	.	G	A	483.24	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0147754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.5093;QD=58.5748;RBI=0.0421592;REFB=0;REVB=0.0394852;RO=0;SAF=17;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00074108;OID=.;OPOS=91517479;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:33:0:0:32:33:1:15:17:0:0:15:18:0:0
chr15	91524841	.	G	T	837.42	PASS	AF=1;AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00481162;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.69;QD=57.7532;RBI=0.0128785;REFB=0;REVB=0.0119459;RO=0;SAF=39;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.47594e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000100671;OID=.;OPOS=91524841;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:58:0:0:58:58:1:19:39:0:0:19:39:0:0
chr15	91543761	.	C	T	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0389978;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.784;QD=50.4134;RBI=0.0501345;REFB=0;REVB=0.0315062;RO=0;SAF=11;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.41338e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000871294;OID=.;OPOS=91543761;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:8:11:0:0:8:11:0:0
chr15	91825009	.	C	T	356.6	PASS	AF=0.74359;AO=29;DP=39;FAO=29;FDP=39;FR=.;FRO=10;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=-0.042256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.017;QD=36.5745;RBI=0.0429716;REFB=0.0135521;REVB=-0.00780917;RO=10;SAF=12;SAR=17;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0559032;STB=0.530366;STBP=0.552;TYPE=snp;VARB=-0.00533506;OID=.;OPOS=91825009;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:70:39:39:10:10:29:29:0.74359:17:12:3:7:17:12:3:7
chr15	91836683	.	T	C	708.52	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00136078;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.414;QD=62.9794;RBI=0.0536646;REFB=0;REVB=0.0536473;RO=0;SAF=24;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000192429;OID=.;OPOS=91836683;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:21:24:0:0:21:24:0:0
chr15	92647645	.	G	C	323.32	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.013631;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.937;QD=53.8858;RBI=0.0240774;REFB=0;REVB=-0.0198473;RO=0;SAF=6;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.9951e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.00778e-05;OID=.;OPOS=92647645;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:24:0:0:23:24:1:17:6:0:0:17:7:0:0
chr15	93015427	.	G	A	292.74	PASS	AF=0.604651;AO=26;DP=43;FAO=26;FDP=43;FR=.;FRO=17;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=3;FWDB=0.00389466;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.2592;QD=27.232;RBI=0.0255966;REFB=0.00818034;REVB=-0.0252986;RO=17;SAF=17;SAR=9;SRF=14;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141366;STB=0.577584;STBP=0.25;TYPE=snp;VARB=-0.00493966;OID=.;OPOS=93015427;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:17:17:26:26:0.604651:9:17:14:3:9:17:14:3
chr15	93198671	.	A	G	801.26	PASS	AF=1;AO=55;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0378259;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.7503;QD=57.2327;RBI=0.0394945;REFB=0;REVB=-0.0113584;RO=0;SAF=24;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000420271;OID=.;OPOS=93198671;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:55:56:1:31:24:0:0:32:24:0:0
chr15	93198678	.	TTGGAGCTGGA	TTGGA,TTGGAGCTGCC	599.05	PASS	AF=0.833333,0.166667;AO=28,6;DP=39;FAO=35,7;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=16,2;FSAR=19,5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00139334,-0.0274177;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=6,2;MLLD=198.795,128.044;QD=57.0527;RBI=0.00928146,0.0285504;REFB=0,0;REVB=0.00917629,-0.00796205;RO=0;SAF=12,2;SAR=16,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.00119036,0.0325306;OID=.,.;OPOS=93198679,93198687;OREF=TGGAGC,GA;OALT=-,CC;OMAPALT=TTGGA,TTGGAGCTGCC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.833333,0.166667:28,6:39:35,7:42:0:16,2:19,5:0:0:38:0:12,2:16,4:0:0
chr15	93447631	.	T	G	77.99	PASS	AF=0.23913;AO=9;DP=43;FAO=11;FDP=46;FR=.,HEALED;FRO=35;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=20;FSRR=15;FWDB=-0.00867756;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.624;QD=6.78186;RBI=0.0103131;REFB=-0.00280039;REVB=-0.00557309;RO=24;SAF=3;SAR=6;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198496;STB=0.804309;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.00808165;OID=.;OPOS=93447631;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:43:46:24:35:9:11:0.23913:6:3:12:12:9:2:20:15
chr15	93447681	.	G	C	137.98	PASS	AF=0.27027;AO=20;DP=74;FAO=20;FDP=74;FR=.;FRO=54;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=32;FSRR=22;FWDB=-0.0216576;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.9432;QD=7.45818;RBI=0.0226069;REFB=0.0097348;REVB=0.00648247;RO=54;SAF=6;SAR=14;SRF=32;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.35026;STB=0.711021;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=-0.0273972;OID=.;OPOS=93447681;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:54:54:20:20:0.27027:14:6:32:22:14:6:32:22
chr15	93510603	.	A	G	695.87	PASS	AF=0.978261;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0162328;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=283.309;QD=60.5101;RBI=0.0223201;REFB=-0.0153439;REVB=0.0153193;RO=1;SAF=28;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0164911;STB=0.508768;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=4.11485e-05;OID=.;OPOS=93510603;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:46:46:1:1:45:45:0.978261:17:28:1:0:17:28:1:0
chr15	93521604	.	A	G	710.27	PASS	AF=0.980769;AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00235512;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=239.514;QD=54.6363;RBI=0.0193013;REFB=0.103499;REVB=-0.0191571;RO=1;SAF=23;SAR=28;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0200325;STB=0.510634;STBP=0.327;TYPE=snp;VARB=-0.000402785;OID=.;OPOS=93521604;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:52:52:1:1:51:51:0.980769:28:23:1:0:28:23:1:0
chr15	93570241	.	T	C	1583.38	PASS	AF=1;AO=99;DP=100;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00411304;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=204.444;QD=63.3351;RBI=0.00714523;REFB=0;REVB=0.00584271;RO=0;SAF=42;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.37041e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.98606e-06;OID=.;OPOS=93570241;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:100:100:0:0:99:100:1:57:42:0:0:58:42:0:0
chr15	93586633	.	G	A	166.42	PASS	AF=0.4;AO=18;DP=45;FAO=18;FDP=45;FR=.;FRO=27;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=18;FSRR=9;FWDB=-0.0375215;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.1079;QD=14.7928;RBI=0.0437604;REFB=-0.00373533;REVB=0.0225191;RO=27;SAF=14;SAR=4;SRF=18;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148963;STB=0.586993;STBP=0.402;TYPE=snp;VARB=0.00540112;OID=.;OPOS=93586633;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:27:27:18:18:0.4:4:14:18:9:4:14:18:9
chr15	93587825	.	AGGGGGC	AGGGG,AGGGGC,GAGGGGC	127.41	PASS	AF=0,0.627907,0;AO=9,14,2;DP=46;FAO=0,27,0;FDP=43;FR=.;FRO=16;FSAF=0,4,0;FSAR=0,23,0;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.00714268,0.2857,-0.0391959;FXX=0.0444346;HRUN=5,5,1;LEN=2,1,2;MLLD=17.3579,10.4932,77.4329;QD=11.8524;RBI=0.130626,0.294041,0.101157;REFB=-0.00760018,-0.124852,-0.00759269;REVB=-0.130431,-0.0695366,-0.0932549;RO=13;SAF=1,1,0;SAR=8,13,2;SRF=6;SRR=7;SSEN=0.30137,0.30137,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.466795,-0.538867,-0.540126;STB=0.5,0.663901,0.5;STBP=1,0.022,1;TYPE=del,del,mnp;VARB=0.0266993,0.136611,0;OID=.,.,.;OPOS=93587830,93587826,93587825;OREF=GC,G,AG;OALT=-,-,GA;OMAPALT=AGGGG,AGGGGC,GAGGGGC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:79:46:43:13:16:9,14,2:0,27,0:0,0.627907,0:8,13,2:1,1,0:6:7:0,23,0:0,4,0:7:9
chr15	93588289	.	G	A	30.1	PASS	AF=0.416667;AO=5;DP=12;FAO=5;FDP=12;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.0261439;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=123.873;QD=10.0343;RBI=0.0997913;REFB=-0.0329263;REVB=-0.0963057;RO=7;SAF=3;SAR=2;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.286688;STB=0.676751;STBP=0.436;TYPE=snp;VARB=0.0157633;OID=.;OPOS=93588289;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:12:12:7:7:5:5:0.416667:2:3:2:5:2:3:2:5
chr15	93588336	.	A	C	557.12	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100917;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.159;QD=60.2287;RBI=0.0261657;REFB=0;REVB=-0.0241413;RO=0;SAF=18;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.68991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000127112;OID=.;OPOS=93588336;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:19:18:0:0:19:18:0:0
chr15	93609460	.	A	T	108.54	PASS	AF=0.258065;AO=16;DP=61;FAO=16;FDP=62;FR=.;FRO=46;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=24;FSRR=22;FWDB=-0.0154705;FXX=0.0158705;HRUN=3;LEN=1;MLLD=127.975;QD=7.00242;RBI=0.0154982;REFB=-0.00498288;REVB=0.000926016;RO=45;SAF=9;SAR=7;SRF=23;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0623124;STB=0.53045;STBP=0.845;TYPE=snp;VARB=0.0147412;OID=.;OPOS=93609460;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:62:45:46:16:16:0.258065:7:9:23:22:7:9:24:22
chr15	93616933	.	C	G	1359.05	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0454073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.242;QD=62.4853;RBI=0.0563962;REFB=0;REVB=0.0334471;RO=0;SAF=34;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.45958e-05;OID=.;OPOS=93616933;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:87:0:0:86:87:1:52:34:0:0:53:34:0:0
chr15	93616975	.	A	G	733.95	PASS	AF=1;AO=46;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0137352;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.89;QD=62.4638;RBI=0.0139012;REFB=0;REVB=-0.00214232;RO=0;SAF=12;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.12678e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000226063;OID=.;OPOS=93616975;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:46:47:1:34:12:0:0:35:12:0:0
chr15	93750256	.	G	T	411.11	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00891138;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.791;QD=56.7049;RBI=0.0147972;REFB=0;REVB=0.0118129;RO=0;SAF=8;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.4007e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.82393e-05;OID=.;OPOS=93750256;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:21:8:0:0:21:8:0:0
chr15	94304132	.	C	T	367.4	PASS	AF=0.714286;AO=30;DP=42;FAO=30;FDP=42;FR=.;FRO=12;FSAF=22;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=1;FWDB=0.0260631;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.1263;QD=34.99;RBI=0.0261115;REFB=-0.00580321;REVB=-0.00158838;RO=11;SAF=22;SAR=8;SRF=10;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118054;STB=0.571385;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=0.00199549;OID=.;OPOS=94304132;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:91:42:42:11:12:30:30:0.714286:8:22:10:1:8:22:11:1
chr15	94304167	.	C	T	94.72	PASS	AF=0.245614;AO=14;DP=57;FAO=14;FDP=57;FR=.;FRO=43;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=28;FSRR=15;FWDB=0.00631603;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.4686;QD=6.64689;RBI=0.114956;REFB=0.00411714;REVB=-0.114783;RO=43;SAF=11;SAR=3;SRF=28;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.203239;STB=0.62837;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=-0.0152502;OID=.;OPOS=94304167;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:57:57:43:43:14:14:0.245614:3:11:28:15:3:11:28:15
chr15	94304189	.	T	C	507.27	PASS	AF=0.796296;AO=42;DP=54;FAO=43;FDP=54;FR=.;FRO=11;FSAF=29;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=0.0358945;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.114;QD=37.5754;RBI=0.0392321;REFB=-0.0936774;REVB=0.0158348;RO=11;SAF=28;SAR=14;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0130808;STB=0.508768;STBP=0.81;TYPE=snp;VARB=0.0284784;OID=.;OPOS=94304189;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:54:54:11:11:42:43:0.796296:14:28:7:4:14:29:7:4
chr15	94841691	.	G	A	670.23	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0277247;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.046;QD=62.3472;RBI=0.0294198;REFB=0;REVB=0.00984213;RO=0;SAF=5;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.59716e-05;OID=.;OPOS=94841691;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:38:5:0:0:38:5:0:0
chr15	94884108	.	G	C	555.27	PASS	AF=0.625;AO=50;DP=80;FAO=50;FDP=80;FR=.;FRO=30;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=9;FSRR=21;FWDB=0.0432197;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.7067;QD=27.7637;RBI=0.0432346;REFB=0.00257805;REVB=-0.00113563;RO=30;SAF=25;SAR=25;SRF=9;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138008;STB=0.574971;STBP=0.103;TYPE=snp;VARB=-0.000772524;OID=.;OPOS=94884108;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:30:30:50:50:0.625:25:25:9:21:25:25:9:21
chr15	94945719	.	G	T	40.79	PASS	AF=0.152174;AO=7;DP=46;FAO=7;FDP=46;FR=.;FRO=39;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=-0.0227608;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.195;QD=3.54653;RBI=0.0311349;REFB=-0.00220699;REVB=-0.0212445;RO=38;SAF=3;SAR=4;SRF=21;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14824;STB=0.592331;STBP=0.616;TYPE=snp;VARB=0.0119599;OID=.;OPOS=94945719;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:40:46:46:38:39:7:7:0.152174:4:3:21:17:4:3:21:18
chr15	96289064	.	T	A	465.13	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0424708;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.077;QD=58.1413;RBI=0.046198;REFB=0;REVB=0.0181792;RO=0;SAF=15;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000298278;OID=.;OPOS=96289064;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:17:15:0:0:17:15:0:0
chr15	96289074	.	GT	G	44.74	PASS	AF=0.307692;AO=11;DP=39;FAO=12;FDP=39;FR=.;FRO=27;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=0.0390263;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=13.3843;QD=4.58914;RBI=0.0560477;REFB=-0.0678219;REVB=0.040228;RO=26;SAF=3;SAR=8;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.389423;STB=0.759067;STBP=0.048;TYPE=del;VARB=0.160242;OID=.;OPOS=96289075;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.307692:11:39:12:39:27:3:9:17:10:44:26:3:8:16:10
chr15	97970963	.	T	C	190.95	PASS	AF=0.72;AO=18;DP=25;FAO=18;FDP=25;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=-0.0244941;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=202.804;QD=30.5523;RBI=0.0304135;REFB=-0.0218618;REVB=0.0180284;RO=7;SAF=5;SAR=13;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.308678;STB=0.671163;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.0044261;OID=.;OPOS=97970963;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:25:25:7:7:18:18:0.72:13:5:6:1:13:5:6:1
chr15	98015489	.	A	G	393.32	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0793906;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.901;QD=56.1888;RBI=0.0814298;REFB=0;REVB=0.0181092;RO=0;SAF=15;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00153719;OID=.;OPOS=98015489;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:13:15:0:0:13:15:0:0
chr15	98301845	.	C	T	273.31	PASS	AF=1;AO=14;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000200115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.684;QD=52.0586;RBI=0.208407;REFB=0;REVB=0.208407;RO=0;SAF=12;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00143254;OID=.;OPOS=98301845;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:14:21:1:2:12:0:0:9:12:0:0
chr15	98513845	.	T	C	441.16	PASS	AF=0.772727;AO=34;DP=44;FAO=34;FDP=44;FR=.;FRO=10;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.0197862;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.789;QD=40.1051;RBI=0.0239445;REFB=-0.0164249;REVB=0.013485;RO=10;SAF=14;SAR=20;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00510575;STB=0.502761;STBP=0.985;TYPE=snp;VARB=0.00462666;OID=.;OPOS=98513845;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:69:44:44:10:10:34:34:0.772727:20:14:4:6:20:14:4:6
chr15	98995081	.	A	G	740.77	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0240689;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.096;QD=56.9822;RBI=0.0316154;REFB=0;REVB=0.0204993;RO=0;SAF=26;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94283e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.74476e-05;OID=.;OPOS=98995081;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:52:0:0:51:52:1:25:26:0:0:25:27:0:0
chr15	99023968	.	T	G	458.35	PASS	AF=0.777778;AO=35;DP=45;FAO=35;FDP=45;FR=.;FRO=10;FSAF=24;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=2;FWDB=-0.00310561;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=161.846;QD=40.7422;RBI=0.00607675;REFB=-0.0215905;REVB=-0.00522323;RO=10;SAF=24;SAR=11;SRF=8;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0558265;STB=0.530104;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=0.010036;OID=.;OPOS=99023968;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:69:45:45:10:10:35:35:0.777778:11:24:8:2:11:24:8:2
chr15	99465473	.	C	T	50.89	PASS	AF=0.228571;AO=8;DP=35;FAO=8;FDP=35;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=-0.00937915;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.618;QD=5.81599;RBI=0.0194484;REFB=-0.0127623;REVB=-0.0170374;RO=23;SAF=6;SAR=2;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189669;STB=0.666223;STBP=0.367;TYPE=snp;VARB=0.0452747;OID=.;OPOS=99465473;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:50:35:35:23:27:8:8:0.228571:2:6:14:9:2:6:15:12
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chr15	99503199	.	GGT	G	164.23	PASS	AF=0.730769;AO=14;DP=20;FAO=19;FDP=26;FR=.;FRO=7;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0329274;FXX=0;HRUN=3;LEN=2;MLLD=184.566;QD=25.2665;RBI=0.0537558;REFB=-0.0680094;REVB=0.0424908;RO=0;SAF=7;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.526288;STBP=0.699;TYPE=del;VARB=0.0228121;OID=.;OPOS=99503200;OREF=GT;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.730769:14:20:19:26:7:9:10:4:3:36:0:7:7:0:0
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chr15	99504671	.	C	T	187.27	PASS	AF=0.513514;AO=19;DP=37;FAO=19;FDP=37;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.0293516;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.1594;QD=20.2449;RBI=0.0294222;REFB=-0.00612974;REVB=-0.00203757;RO=17;SAF=7;SAR=12;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.233393;STB=0.618785;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.0066229;OID=.;OPOS=99504671;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:17:18:19:19:0.513514:12:7:11:6:12:7:11:7
chr15	99653800	.	T	C	104.0	PASS	AF=0.333333;AO=13;DP=39;FAO=13;FDP=39;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=0.00225739;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.9136;QD=10.6661;RBI=0.126203;REFB=-0.00999093;REVB=0.126183;RO=24;SAF=8;SAR=5;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0827774;STB=0.552763;STBP=0.682;TYPE=snp;VARB=0.028018;OID=.;OPOS=99653800;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:24:26:13:13:0.333333:5:8:13:11:5:8:14:12
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chr15	99826027	.	C	G	75.54	PASS	AF=0.344828;AO=10;DP=30;FAO=10;FDP=29;FR=.;FRO=19;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=-0.00376118;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.977;QD=10.4195;RBI=0.0112237;REFB=-0.0229777;REVB=-0.0105748;RO=19;SAF=2;SAR=8;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168862;STB=0.603547;STBP=0.459;TYPE=snp;VARB=0.0388156;OID=.;OPOS=99826027;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:30:29:19:19:10:10:0.344828:8:2:6:13:8:2:6:13
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chr15	100246942	.	G	A	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00536584;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.721;QD=59.4356;RBI=0.00632804;REFB=0;REVB=0.00335437;RO=0;SAF=23;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.29377e-05;OID=.;OPOS=100246942;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:12:23:0:0:12:23:0:0
chr15	100257596	.	T	G	666.91	PASS	AF=0.956522;AO=44;DP=46;FAO=44;FDP=46;FR=.;FRO=2;FSAF=15;FSAR=29;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00499655;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.9626;QD=57.992;RBI=0.0143407;REFB=0.00278892;REVB=0.0134421;RO=1;SAF=15;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0302851;STB=0.531236;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=-0.000337641;OID=.;OPOS=100257596;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:46:46:1:2:44:44:0.956522:29:15:1:0:29:15:2:0
chr15	100269796	.	A	G	164.18	PASS	AF=1;AO=14;DP=15;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0575692;FXX=0.0666222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.9303;QD=46.9093;RBI=0.0702047;REFB=0;REVB=-0.0401808;RO=0;SAF=8;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00309585;OID=.;OPOS=100269796;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:14:0:0:14:14:1:6:8:0:0:6:8:0:0
chr15	100332743	.	A	G	99.64	PASS	AF=0.733333;AO=11;DP=15;FAO=11;FDP=15;FR=.;FRO=4;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0169592;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.837;QD=26.5702;RBI=0.018277;REFB=-0.0323895;REVB=-0.00681427;RO=4;SAF=10;SAR=1;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150097;STB=0.583201;STBP=0.664;TYPE=snp;VARB=0.0126939;OID=.;OPOS=100332743;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:15:15:4:4:11:11:0.733333:1:10:4:0:1:10:4:0
chr15	100332799	.	A	C	70.57	PASS	AF=0.5625;AO=9;DP=16;FAO=9;FDP=16;FR=.;FRO=7;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.00590657;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.7909;QD=17.6416;RBI=0.038626;REFB=-0.045788;REVB=0.0381717;RO=7;SAF=7;SAR=2;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0657708;STB=0.538372;STBP=0.821;TYPE=snp;VARB=0.0372013;OID=.;OPOS=100332799;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:16:16:7:7:9:9:0.5625:2:7:5:2:2:7:5:2
chr15	100332807	.	C	T	59.4	PASS	AF=0.533333;AO=8;DP=15;FAO=8;FDP=15;FR=.;FRO=7;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.0659907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.8532;QD=15.839;RBI=0.0931703;REFB=-0.0171991;REVB=-0.0657719;RO=6;SAF=7;SAR=1;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.260084;STB=0.635965;STBP=0.401;TYPE=snp;VARB=0.0145017;OID=.;OPOS=100332807;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:15:15:6:7:8:8:0.533333:1:7:4:2:1:7:5:2
chr15	100332877	.	T	C	39.7	PASS	AF=0.5;AO=6;DP=12;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.0347121;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.3905;QD=13.2334;RBI=0.0838684;REFB=-0.0360387;REVB=-0.0763477;RO=6;SAF=4;SAR=2;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168138;STB=0.599699;STBP=0.611;TYPE=snp;VARB=0.0801298;OID=.;OPOS=100332877;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:12:12:6:6:6:6:0.5:2:4:5:1:2:4:5:1
chr15	100333075	.	C	T	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0495;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=230.826;QD=37.4885;RBI=0.0495;REFB=0;REVB=-7.7154e-05;RO=0;SAF=2;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.58669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000565622;OID=.;OPOS=100333075;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:6:2:0:0:6:2:0:0
chr15	100340413	.	C	T	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00307403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.569;QD=33.4285;RBI=0.00699182;REFB=0;REVB=-0.0062798;RO=0;SAF=5;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000124357;OID=.;OPOS=100340413;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:1:5:0:0:1:5:0:0
chr15	100345096	.	C	T	54.74	PASS	AF=0.777778;AO=7;DP=9;FAO=7;FDP=9;FR=.;FRO=2;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0213488;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.51;QD=24.3281;RBI=0.0238501;REFB=-0.0230992;REVB=-0.0106329;RO=2;SAF=5;SAR=2;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0955799;STB=0.55539;STBP=0.597;TYPE=snp;VARB=0.00466891;OID=.;OPOS=100345096;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:9:9:2:2:7:7:0.777778:2:5:1:1:2:5:1:1
chr15	100512047	.	A	G	130.77	PASS	AF=0.8125;AO=13;DP=16;FAO=13;FDP=16;FR=.;FRO=3;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0395239;FXX=0.0587889;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.246;QD=32.6933;RBI=0.0409514;REFB=-0.068864;REVB=-0.0107182;RO=3;SAF=7;SAR=6;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0436406;STB=0.524235;STBP=0.707;TYPE=snp;VARB=0.00543203;OID=.;OPOS=100512047;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:16:16:16:3:3:13:13:0.8125:6:7:2:1:6:7:2:1
chr15	100512079	.	A	G	43.68	PASS	AF=0.75;AO=6;DP=8;FAO=6;FDP=8;FR=.;FRO=2;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00376716;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.745;QD=21.8421;RBI=0.0167167;REFB=-0.00819069;REVB=0.0162867;RO=2;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173071;STB=0.599697;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=0.00690833;OID=.;OPOS=100512079;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:8:8:2:2:6:6:0.75:4:2:0:2:4:2:0:2
chr15	100513117	.	G	A	229.58	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0252857;FXX=0.0526039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.027;QD=51.017;RBI=0.0276837;REFB=0;REVB=0.0112702;RO=0;SAF=9;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000811256;OID=.;OPOS=100513117;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:18:0:0:19:18:1:10:9:0:0:9:9:0:0
chr15	100514417	.	CC	TG	799.11	PASS	AF=1;AO=55;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0167678;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=189.884;QD=57.0793;RBI=0.0236293;REFB=0;REVB=-0.0166489;RO=0;SAF=25;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=-6.31895e-05;OID=.;OPOS=100514417;OREF=CC;OALT=TG;OMAPALT=TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:55:56:1:30:25:0:0:30:26:0:0
chr15	100514614	.	T	C	358.11	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.016152;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=215.393;QD=55.0931;RBI=0.0556978;REFB=0;REVB=0.0533043;RO=0;SAF=13;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000384978;OID=.;OPOS=100514614;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:13:13:0:0:13:13:0:0
chr15	100636586	.	G	A	281.0	PASS	AF=0.75;AO=24;DP=32;FAO=24;FDP=32;FR=.;FRO=8;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.00166634;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.7702;QD=35.1253;RBI=0.0292465;REFB=-0.0924494;REVB=0.0291989;RO=8;SAF=13;SAR=11;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0385332;STB=0.521035;STBP=0.729;TYPE=snp;VARB=0.0289248;OID=.;OPOS=100636586;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:32:32:8:8:24:24:0.75:11:13:5:3:11:13:5:3
chr15	100672237	.	T	G	323.45	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0187114;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.633;QD=53.9082;RBI=0.0315046;REFB=0;REVB=-0.025346;RO=0;SAF=11;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.38856e-05;OID=.;OPOS=100672237;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:13:11:0:0:13:11:0:0
chr15	100794363	.	C	T	279.35	PASS	AF=0.956522;AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0526262;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.9003;QD=48.5824;RBI=0.0906987;REFB=0.0184286;REVB=0.0738698;RO=1;SAF=11;SAR=11;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0401764;STB=0.521719;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=-0.00120111;OID=.;OPOS=100794363;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:23:23:1:1:22:22:0.956522:11:11:1:0:11:11:1:0
chr15	100801698	.	G	A	103.02	PASS	AF=0.288889;AO=13;DP=45;FAO=13;FDP=45;FR=.;FRO=32;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=0.0141727;FXX=0.0217344;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.04;QD=9.1571;RBI=0.0151737;REFB=-0.00454935;REVB=-0.00541988;RO=32;SAF=7;SAR=6;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0449609;STB=0.527355;STBP=0.808;TYPE=snp;VARB=0.0106252;OID=.;OPOS=100801698;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:32:32:13:13:0.288889:6:7:16:16:6:7:16:16
chr15	100821467	.	G	A	184.33	PASS	AF=0.247788;AO=28;DP=108;FAO=28;FDP=113;FR=.;FRO=85;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=36;FSRR=49;FWDB=-0.0748224;FXX=0.0173898;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.77;QD=6.52495;RBI=0.0789068;REFB=-0.012943;REVB=0.0250577;RO=78;SAF=9;SAR=19;SRF=29;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0683857;STB=0.582761;STBP=0.329;TYPE=snp;VARB=0.0626519;OID=.;OPOS=100821467;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:113:78:85:28:28:0.247788:19:9:29:49:19:9:36:49
chr15	100821576	.	G	A	111.21	PASS	AF=0.239437;AO=17;DP=70;FAO=17;FDP=71;FR=.,HEALED;FRO=54;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=26;FSRR=28;FWDB=-0.0324688;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.694;QD=6.26526;RBI=0.0856445;REFB=-0.00361508;REVB=0.0792513;RO=35;SAF=6;SAR=11;SRF=24;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.365131;STB=0.600562;STBP=0.362;TYPE=snp;VARB=0.0134793;OID=.;OPOS=100821576;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:71:35:54:17:17:0.239437:11:6:24:11:11:6:26:28
chr15	100882113	.	G	A	48.72	PASS	AF=0.16;AO=8;DP=50;FAO=8;FDP=50;FR=.;FRO=42;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=19;FSRR=23;FWDB=-0.0277019;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=298.596;QD=3.8978;RBI=0.0359782;REFB=-0.00534355;REVB=-0.0229574;RO=42;SAF=2;SAR=6;SRF=19;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.262761;STB=0.684294;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=0.0240635;OID=.;OPOS=100882113;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:48:50:50:42:42:8:8:0.16:6:2:19:23:6:2:19:23
chr15	100942962	.	T	C	174.0	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0963093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.404;QD=46.4011;RBI=0.0977195;REFB=0;REVB=0.0165412;RO=0;SAF=7;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000879675;OID=.;OPOS=100942962;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:15:0:0:14:15:1:7:7:0:0:7:8:0:0
chr15	101041896	.	T	C	483.34	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000159716;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.328;QD=58.5868;RBI=0.0303095;REFB=0;REVB=0.0303091;RO=0;SAF=19;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.71297e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000278742;OID=.;OPOS=101041896;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:14:19:0:0:14:19:0:0
chr15	101109677	.	C	A	184.42	PASS	AF=0.642857;AO=18;DP=26;FAO=18;FDP=28;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=-0.0483225;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.8574;QD=26.3459;RBI=0.0780883;REFB=-0.0303423;REVB=-0.061341;RO=8;SAF=7;SAR=11;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.265901;STB=0.610988;STBP=0.136;TYPE=snp;VARB=0.0123541;OID=.;OPOS=101109677;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:26:28:8:10:18:18:0.642857:11:7:7:1:11:7:7:3
chr15	101109794	.	C	G	172.19	PASS	AF=0.653846;AO=17;DP=26;FAO=17;FDP=26;FR=.;FRO=9;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.012666;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.265;QD=26.4912;RBI=0.0280525;REFB=-0.0226125;REVB=-0.0250303;RO=9;SAF=9;SAR=8;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0861345;STB=0.54789;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.0116335;OID=.;OPOS=101109794;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:26:26:9:9:17:17:0.653846:8:9:6:3:8:9:6:3
chr15	101109818	.	G	A	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0143075;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.365;QD=51.1846;RBI=0.0561902;REFB=0;REVB=0.0543382;RO=0;SAF=9;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000480907;OID=.;OPOS=101109818;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:11:9:0:0:11:9:0:0
chr15	101109893	.	C	A	220.44	PASS	AF=0.583333;AO=21;DP=36;FAO=21;FDP=36;FR=.;FRO=15;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.0161084;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=244.042;QD=24.493;RBI=0.0179007;REFB=-0.0228809;REVB=-0.0078073;RO=15;SAF=10;SAR=11;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00713466;STB=0.503975;STBP=0.952;TYPE=snp;VARB=0.0162736;OID=.;OPOS=101109893;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:15:15:21:21:0.583333:11:10:7:8:11:10:7:8
chr15	101110096	.	T	C	85.65	PASS	AF=0.230769;AO=12;DP=52;FAO=12;FDP=52;FR=.;FRO=40;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=26;FWDB=0.0238122;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.868;QD=6.58816;RBI=0.0260942;REFB=0.00177438;REVB=-0.0106719;RO=40;SAF=8;SAR=4;SRF=14;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.372302;STB=0.731349;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=-0.00418257;OID=.;OPOS=101110096;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:52:52:40:40:12:12:0.230769:4:8:14:26:4:8:14:26
chr15	101110265	.	T	A	195.89	PASS	AF=0.612903;AO=19;DP=31;FAO=19;FDP=31;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.0271706;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.711;QD=25.2766;RBI=0.0361833;REFB=-0.0159316;REVB=0.0238954;RO=12;SAF=6;SAR=13;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196737;STB=0.609988;STBP=0.116;TYPE=snp;VARB=0.0121347;OID=.;OPOS=101110265;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:31:31:12:12:19:19:0.612903:13:6:7:5:13:6:7:5
chr15	101110302	.	C	G	237.42	PASS	AF=0.7;AO=21;DP=32;FAO=21;FDP=30;FR=.;FRO=9;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.00276142;FXX=0.0624805;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.23;QD=31.6558;RBI=0.0089763;REFB=-0.0131234;REVB=-0.00854099;RO=9;SAF=9;SAR=12;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0697673;STB=0.538425;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.00645844;OID=.;OPOS=101110302;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:32:30:9:9:21:21:0.7:12:9:5:4:12:9:5:4
chr15	101113862	.	C	T	1589.22	PASS	AF=1;AO=106;DP=106;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0115117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.828;QD=59.9706;RBI=0.0182604;REFB=0;REVB=0.0141747;RO=0;SAF=52;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.6709e-05;OID=.;OPOS=101113862;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:106:106:0:0:106:106:1:54:52:0:0:54:52:0:0
chr15	101113950	.	A	G	285.99	PASS	AF=0.545455;AO=15;DP=35;FAO=18;FDP=33;FR=.,HEALED;FRO=8;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=0.0156693;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.672;QD=34.6655;RBI=0.0384333;REFB=-0.0565973;REVB=0.0350941;RO=8;SAF=6;SAR=9;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.288641;STB=0.615263;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=0.0583516;OID=.;OPOS=101113950;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:58:35:33:8:8:15:18:0.545455:9:6:7:1:9:9:7:1
chr15	101114418	.	G	A	216.1	PASS	AF=0.714286;AO=20;DP=28;FAO=20;FDP=28;FR=.;FRO=8;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=-0.0524113;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.7288;QD=30.8715;RBI=0.0533394;REFB=-0.0685629;REVB=-0.00990707;RO=8;SAF=13;SAR=7;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.211544;STB=0.616669;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.0107736;OID=.;OPOS=101114418;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:28:28:8:8:20:20:0.714286:7:13:2:6:7:13:2:6
chr15	101120963	.	T	C	365.19	PASS	AF=0.636364;AO=35;DP=55;FAO=35;FDP=55;FR=.;FRO=20;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=0.0116401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.636;QD=26.559;RBI=0.0132909;REFB=-0.0176905;REVB=0.00641544;RO=19;SAF=19;SAR=16;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0784229;STB=0.551838;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.00810638;OID=.;OPOS=101120963;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:19:20:35:35:0.636364:16:19:8:11:16:19:8:12
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chr15	101464915	.	T	C	932.2	PASS	AF=0.788889;AO=71;DP=91;FAO=71;FDP=90;FR=.;FRO=19;FSAF=31;FSAR=40;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.0237771;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.928;QD=41.4312;RBI=0.0382413;REFB=-0.0363574;REVB=0.0299508;RO=19;SAF=31;SAR=40;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0566779;STB=0.530294;STBP=0.261;TYPE=snp;VARB=0.00950682;OID=.;OPOS=101464915;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:90:19:19:71:71:0.788889:40:31:11:8:40:31:11:8
chr15	101562793	.	G	A	76.07	PASS	AF=0.75;AO=8;DP=11;FAO=9;FDP=12;FR=.;FRO=3;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0242766;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.5261;QD=25.3562;RBI=0.0349274;REFB=0.000759977;REVB=0.0251112;RO=3;SAF=5;SAR=3;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0212058;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00338881;OID=.;OPOS=101562793;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:11:12:3:3:8:9:0.75:3:5:2:1:3:6:2:1
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chr15	101591923	.	A	G	805.14	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0106397;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.078;QD=64.4109;RBI=0.0108046;REFB=0;REVB=0.00188027;RO=0;SAF=18;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.66271e-05;OID=.;OPOS=101591923;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:32:18:0:0:32:18:0:0
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chr15	101607450	.	T	C	60.75	PASS	AF=0.236842;AO=9;DP=38;FAO=9;FDP=38;FR=.;FRO=29;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=-0.00292388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.913;QD=6.3946;RBI=0.00346837;REFB=-0.00873955;REVB=-0.00186562;RO=29;SAF=5;SAR=4;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0868355;STB=0.555432;STBP=0.746;TYPE=snp;VARB=0.0230422;OID=.;OPOS=101607450;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:60:38:38:29:29:9:9:0.236842:4:5:14:15:4:5:14:15
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chr15	101717680	.	G	T	740.64	PASS	AF=1;AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0254945;FXX=0.0188644;HRUN=3;LEN=1;MLLD=227.444;QD=56.9724;RBI=0.0262168;REFB=0;REVB=0.0061118;RO=0;SAF=25;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.78069e-05;OID=.;OPOS=101717680;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:52:0:0:52:52:1:27:25:0:0:27:25:0:0
chr15	101910550	.	G	A	123.8	PASS	AF=0.583333;AO=14;DP=24;FAO=14;FDP=24;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.0290332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.994;QD=20.6333;RBI=0.030538;REFB=-0.00543061;REVB=-0.00946785;RO=10;SAF=4;SAR=10;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0976611;STB=0.555473;STBP=0.615;TYPE=snp;VARB=0.00462406;OID=.;OPOS=101910550;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:24:24:10:10:14:14:0.583333:10:4:4:6:10:4:4:6
chr15	101924546	.	C	T	774.54	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00430357;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.474;QD=56.3299;RBI=0.00504095;REFB=0;REVB=0.00262497;RO=0;SAF=33;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.70667e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000221087;OID=.;OPOS=101924546;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:55:0:0:54:55:1:21:33:0:0:21:34:0:0
chr15	102192548	.	A	C	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.111689;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.9078;QD=43.4859;RBI=0.128327;REFB=0;REVB=-0.0631935;RO=0;SAF=1;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.23983e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0018775;OID=.;OPOS=102192548;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:11:1:0:0:11:1:0:0
chr15	102223771	.	G	A	90.68	PASS	AF=0.240741;AO=13;DP=54;FAO=13;FDP=54;FR=.;FRO=41;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=22;FSRR=19;FWDB=0.00150475;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.252;QD=6.71704;RBI=0.00151271;REFB=-0.00259378;REVB=0.000154992;RO=39;SAF=8;SAR=5;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125686;STB=0.561308;STBP=0.595;TYPE=snp;VARB=0.0110562;OID=.;OPOS=102223771;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:90:54:54:39:41:13:13:0.240741:5:8:20:19:5:8:22:19
chr15	102224341	.	G	A	125.11	PASS	AF=0.303571;AO=17;DP=56;FAO=17;FDP=56;FR=.;FRO=39;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=-0.0247822;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.583;QD=8.93659;RBI=0.0267137;REFB=-0.00949728;REVB=0.00997318;RO=39;SAF=8;SAR=9;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0788689;STB=0.547114;STBP=0.63;TYPE=snp;VARB=0.0210324;OID=.;OPOS=102224341;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:39:39:17:17:0.303571:9:8:21:18:9:8:21:18
chr15	102284706	.	G	A	222.01	PASS	AF=0.380282;AO=27;DP=71;FAO=27;FDP=71;FR=.;FRO=44;FSAF=19;FSAR=8;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=0.0325091;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=48.1967;QD=12.5077;RBI=0.0325463;REFB=-0.0224389;REVB=0.00155611;RO=43;SAF=19;SAR=8;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.243496;STB=0.63464;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=0.0426661;OID=.;OPOS=102284706;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:43:44:27:27:0.380282:8:19:21:22:8:19:22:22
chr15	102389423	.	C	G	796.79	PASS	AF=0.735632;AO=64;DP=87;FAO=64;FDP=87;FR=.;FRO=23;FSAF=36;FSAR=28;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.0051906;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.318;QD=36.6341;RBI=0.00519311;REFB=-0.00495174;REVB=0.000161712;RO=23;SAF=36;SAR=28;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0203182;STB=0.510914;STBP=0.718;TYPE=snp;VARB=0.0021727;OID=.;OPOS=102389423;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:23:23:64:64:0.735632:28:36:12:11:28:36:12:11
chr15	102506321	.	A	G	130.34	PASS	AF=0.0903614;AO=45;DP=498;FAO=45;FDP=498;FR=.;FRO=453;FSAF=19;FSAR=26;FSRF=239;FSRR=214;FWDB=0.0154007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.487;QD=1.04693;RBI=0.0326117;REFB=-0.00161798;REVB=-0.0287462;RO=452;SAF=19;SAR=26;SRF=238;SRR=214;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124431;STB=0.595272;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=0.0131516;OID=.;OPOS=102506321;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:498:498:452:453:45:45:0.0903614:26:19:238:214:26:19:239:214
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chr15	102515257	.	C	T	50.69	PASS	AF=0.140845;AO=10;DP=71;FAO=10;FDP=71;FR=.;FRO=61;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=36;FSRR=25;FWDB=0.00425155;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.942;QD=2.85565;RBI=0.0255442;REFB=0.00434224;REVB=-0.0251879;RO=59;SAF=6;SAR=4;SRF=35;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00863635;STB=0.508754;STBP=0.955;TYPE=snp;VARB=-0.0152302;OID=.;OPOS=102515257;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:50:71:71:59:61:10:10:0.140845:4:6:35:24:4:6:36:25
chr15	102516350	.	G	A	365.94	PASS	AF=0.558824;AO=35;DP=65;FAO=38;FDP=68;FR=.;FRO=30;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=0.0812567;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=38.5892;QD=21.5261;RBI=0.0880019;REFB=-0.0319092;REVB=0.033789;RO=30;SAF=17;SAR=18;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0674126;STB=0.517875;STBP=0.774;TYPE=snp;VARB=0.0422925;OID=.;OPOS=102516350;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:68:30:30:35:38:0.558824:18:17:17:13:18:20:17:13
chr15	102516411	.	C	G	62.08	PASS	AF=0.104575;AO=16;DP=154;FAO=16;FDP=153;FR=.;FRO=137;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=79;FSRR=58;FWDB=-0.00578044;FXX=0.00649309;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.8368;QD=1.62295;RBI=0.0887924;REFB=-0.0069407;REVB=0.0886041;RO=137;SAF=7;SAR=9;SRF=79;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166818;STB=0.622539;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.0557556;OID=.;OPOS=102516411;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:154:153:137:137:16:16:0.104575:9:7:79:58:9:7:79:58
chr16	103517	.	A	C	1029.69	PASS	AF=1;AO=69;DP=70;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00704979;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.564;QD=59.6924;RBI=0.0311043;REFB=0;REVB=-0.0302949;RO=0;SAF=33;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.36169e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.76893e-05;OID=.;OPOS=103517;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:69:0:0:69:69:1:36:33:0:0:36:33:0:0
chr16	108585	.	T	C	554.22	PASS	AF=0.716418;AO=43;DP=63;FAO=48;FDP=67;FR=.;FRO=19;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.0298061;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.431;QD=33.088;RBI=0.0298953;REFB=-0.0372284;REVB=0.00230821;RO=18;SAF=20;SAR=23;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0794646;STB=0.534232;STBP=0.394;TYPE=snp;VARB=0.011119;OID=.;OPOS=108585;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:67:18:19:43:48:0.716418:23:20:11:7:26:22:11:8
chr16	112659	.	G	A	551.29	PASS	AF=0.653333;AO=49;DP=75;FAO=49;FDP=75;FR=.;FRO=26;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=-0.00260513;FXX=0.0131562;HRUN=3;LEN=1;MLLD=302.235;QD=29.4019;RBI=0.00466962;REFB=0.00707009;REVB=-0.00387538;RO=26;SAF=27;SAR=22;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0167442;STB=0.509087;STBP=0.856;TYPE=snp;VARB=-0.00420101;OID=.;OPOS=112659;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:26:26:49:49:0.653333:22:27:15:11:22:27:15:11
chr16	113883	.	G	GCC	344.99	PASS	AF=1;AO=29;DP=33;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0829738;FXX=0.0644953;HRUN=1;LEN=2;MLLD=51.7195;QD=47.5849;RBI=0.0942851;REFB=0;REVB=0.0447775;RO=4;SAF=15;SAR=14;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.052492;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.000446354;OID=.;OPOS=113884;OREF=-;OALT=CC;OMAPALT=GCC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:29:33:29:29:0:15:14:0:0:6:4:15:14:3:1
chr16	113886	.	GC	G	318.41	PASS	AF=1;AO=29;DP=30;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.166268;FXX=0.0333222;HRUN=5;LEN=1;MLLD=19.6047;QD=43.9188;RBI=0.182999;REFB=0;REVB=0.0764433;RO=0;SAF=15;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.0105424;OID=.;OPOS=113887;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:29:30:29:29:0:15:14:0:0:6:0:15:14:0:0
chr16	322934	.	C	T	627.98	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0539184;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.299;QD=61.2663;RBI=0.0583263;REFB=0;REVB=0.0222432;RO=0;SAF=20;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000286265;OID=.;OPOS=322934;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:41:0:0:40:41:1:20:20:0:0:21:20:0:0
chr16	324052	.	A	G	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00819;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=302.271;QD=52.6132;RBI=0.0168544;REFB=0;REVB=0.0147307;RO=0;SAF=16;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17051e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.00719e-05;OID=.;OPOS=324052;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:6:16:0:0:6:16:0:0
chr16	336660	.	G	A	330.43	PASS	AF=0.961538;AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0124822;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.198;QD=50.8359;RBI=0.0161127;REFB=-0.0577854;REVB=0.0101889;RO=1;SAF=14;SAR=11;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0403161;STB=0.521722;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.00585824;OID=.;OPOS=336660;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:26:26:1:1:25:25:0.961538:11:14:0:1:11:14:0:1
chr16	419092	.	A	G	214.37	PASS	AF=0.38806;AO=26;DP=67;FAO=26;FDP=67;FR=.;FRO=41;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=25;FSRR=16;FWDB=0.0131918;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.248;QD=12.7981;RBI=0.0154389;REFB=0.00558641;REVB=-0.0080211;RO=41;SAF=15;SAR=11;SRF=25;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0361152;STB=0.520694;STBP=0.804;TYPE=snp;VARB=-0.00571649;OID=.;OPOS=419092;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:41:41:26:26:0.38806:11:15:25:16:11:15:25:16
chr16	419154	.	G	A	240.59	PASS	AF=0.367089;AO=29;DP=78;FAO=29;FDP=79;FR=.;FRO=50;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=28;FSRR=22;FWDB=-0.0344166;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.2746;QD=12.1819;RBI=0.0385608;REFB=0.0124401;REVB=-0.0173906;RO=49;SAF=18;SAR=11;SRF=27;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0789;STB=0.539972;STBP=0.625;TYPE=snp;VARB=-0.0216081;OID=.;OPOS=419154;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:79:49:50:29:29:0.367089:11:18:27:22:11:18:28:22
chr16	420140	.	G	A	292.57	PASS	AF=0.349057;AO=37;DP=104;FAO=37;FDP=106;FR=.;FRO=69;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=32;FSRR=37;FWDB=-0.00969495;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.233;QD=11.0402;RBI=0.0109231;REFB=-0.0233784;REVB=0.00503218;RO=67;SAF=20;SAR=17;SRF=30;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103714;STB=0.549871;STBP=0.447;TYPE=snp;VARB=0.0411847;OID=.;OPOS=420140;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:106:67:69:37:37:0.349057:17:20:30:37:17:20:32:37
chr16	420179	.	G	A	257.77	PASS	AF=0.348315;AO=31;DP=89;FAO=31;FDP=89;FR=.;FRO=58;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=25;FSRR=33;FWDB=-0.00187082;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.208;QD=11.5852;RBI=0.00657545;REFB=-0.0137421;REVB=0.0063037;RO=58;SAF=14;SAR=17;SRF=25;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0234807;STB=0.513564;STBP=0.873;TYPE=snp;VARB=0.0214924;OID=.;OPOS=420179;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:58:58:31:31:0.348315:17:14:25:33:17:14:25:33
chr16	426432	.	T	C	111.91	PASS	AF=0.318182;AO=14;DP=44;FAO=14;FDP=44;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=-0.0164721;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.142;QD=10.1734;RBI=0.0199231;REFB=-0.00849694;REVB=0.0112071;RO=30;SAF=8;SAR=6;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0333863;STB=0.519972;STBP=0.891;TYPE=snp;VARB=0.0218278;OID=.;OPOS=426432;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:30:30:14:14:0.318182:6:8:18:12:6:8:18:12
chr16	427479	.	T	C	115.19	PASS	AF=0.325581;AO=14;DP=43;FAO=14;FDP=43;FR=.;FRO=29;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=0.00857314;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.59;QD=10.7151;RBI=0.0148424;REFB=-0.0057638;REVB=-0.0121161;RO=29;SAF=5;SAR=9;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1074;STB=0.564366;STBP=0.559;TYPE=snp;VARB=0.00914821;OID=.;OPOS=427479;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:29:29:14:14:0.325581:9:5:13:16:9:5:13:16
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chr16	427820	.	C	T	143.57	PASS	AF=0.34;AO=17;DP=51;FAO=17;FDP=50;FR=.;FRO=33;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=0.0326187;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.2623;QD=11.4852;RBI=0.0340154;REFB=-0.0121864;REVB=0.00964715;RO=33;SAF=7;SAR=10;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0143504;STB=0.508465;STBP=0.953;TYPE=snp;VARB=0.0448645;OID=.;OPOS=427820;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:50:33:33:17:17:0.34:10:7:14:19:10:7:14:19
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chr16	547297	.	T	C	136.12	PASS	AF=0.296875;AO=19;DP=64;FAO=19;FDP=64;FR=.;FRO=45;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=26;FWDB=-0.00840506;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.978;QD=8.50752;RBI=0.0199485;REFB=-0.0107757;REVB=-0.0180913;RO=45;SAF=8;SAR=11;SRF=19;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00141059;STB=0.500842;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0200385;OID=.;OPOS=547297;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:45:45:19:19:0.296875:11:8:19:26:11:8:19:26
chr16	570557	.	T	C	447.03	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0189679;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.341;QD=57.6807;RBI=0.01944;REFB=0;REVB=-0.00425842;RO=0;SAF=16;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.18324e-05;OID=.;OPOS=570557;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:15:16:0:0:15:16:0:0
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chr16	624114	.	A	G	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.136434;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.8866;QD=35.5758;RBI=0.198408;REFB=0;REVB=-0.144054;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0242415;OID=.;OPOS=624114;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:3:4:0:0:3:4:0:0
chr16	624713	.	C	T	1268.61	PASS	AF=0.988095;AO=82;DP=83;FAO=83;FDP=84;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=69;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0439334;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=251.825;QD=60.41;RBI=0.0456973;REFB=-0.0267381;REVB=0.0125736;RO=1;SAF=14;SAR=68;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0326201;STB=0.517237;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=9.07051e-05;OID=.;OPOS=624713;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:83:84:1:1:82:83:0.988095:68:14:1:0:69:14:1:0
chr16	630902	.	C	G	197.28	PASS	AF=0.425926;AO=23;DP=55;FAO=23;FDP=54;FR=.;FRO=31;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=0.0421755;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.197;QD=14.6134;RBI=0.0429124;REFB=-0.00861725;REVB=0.00791861;RO=32;SAF=7;SAR=16;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.271428;STB=0.663204;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.0111618;OID=.;OPOS=630902;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:54:32:31:23:23:0.425926:16:7:18:14:16:7:18:13
chr16	632073	.	C	T	613.34	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.007816;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.674;QD=61.3344;RBI=0.010658;REFB=0;REVB=0.00724591;RO=0;SAF=27;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.36635e-05;OID=.;OPOS=632073;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:13:27:0:0:13:27:0:0
chr16	632115	.	G	A	804.69	PASS	AF=0.983051;AO=48;DP=59;FAO=58;FDP=59;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=38;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0164621;FXX=0.0166639;HRUN=4;LEN=1;MLLD=218.571;QD=54.5549;RBI=0.0394916;REFB=-0.144636;REVB=0.0358969;RO=2;SAF=32;SAR=16;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0552325;STB=0.512191;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=0.00304078;OID=.;OPOS=632115;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:59:59:2:1:48:58:0.983051:16:32:0:2:20:38:0:1
chr16	632138	.	C	T	784.76	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0510371;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.159;QD=57.0735;RBI=0.0545129;REFB=0;REVB=0.0191538;RO=0;SAF=27;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000151769;OID=.;OPOS=632138;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:55:0:0:53:55:1:26:27:0:0:28:27:0:0
chr16	632180	.	G	C	885.43	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00755066;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.025;QD=58.0608;RBI=0.0112994;REFB=0;REVB=0.00840615;RO=0;SAF=26;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.37424e-05;OID=.;OPOS=632180;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:35:26:0:0:35:26:0:0
chr16	632198	.	T	A	828.04	PASS	AF=1;AO=48;DP=60;FAO=58;FDP=58;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=23;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.047076;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.573;QD=57.1059;RBI=0.0553841;REFB=0;REVB=0.0291761;RO=0;SAF=15;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000239892;OID=.;OPOS=632198;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:58:0:0:48:58:1:33:15:0:0:35:23:0:0
chr16	632199	.	G	A	35.38	PASS	AF=0.116667;AO=7;DP=60;FAO=7;FDP=60;FR=.;FRO=53;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=19;FSRR=34;FWDB=-0.0171439;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=81.5745;QD=2.35848;RBI=0.0570623;REFB=-0.0151622;REVB=0.054426;RO=53;SAF=6;SAR=1;SRF=19;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.547431;STB=0.892641;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.0183421;OID=.;OPOS=632199;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:60:60:53:53:7:7:0.116667:1:6:19:34:1:6:19:34
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chr16	632233	.	T	C	684.99	PASS	AF=0.978261;AO=39;DP=46;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0414794;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.7399;QD=59.5646;RBI=0.0417995;REFB=-0.0229528;REVB=-0.00516326;RO=7;SAF=13;SAR=26;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11617;STB=0.509087;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.0100579;OID=.;OPOS=632233;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:46:46:7:1:39:45:0.978261:26:13:5:2:27:18:0:1
chr16	632234	.	TG	GC	32.15	PASS	AF=0.122449;AO=6;DP=49;FAO=6;FDP=49;FR=.;FRO=43;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=13;FSRR=30;FWDB=-0.0878803;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=221.46;QD=2.6243;RBI=0.0880117;REFB=-0.00207377;REVB=-0.00480646;RO=43;SAF=5;SAR=1;SRF=13;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.566402;STB=0.894912;STBP=0.105;TYPE=mnp;VARB=0.0456874;OID=.;OPOS=632234;OREF=TG;OALT=GC;OMAPALT=GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:32:49:49:43:43:6:6:0.122449:1:5:13:30:1:5:13:30
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chr16	633125	.	T	C	3070.02	PASS	AF=1;AO=187;DP=188;FAO=193;FDP=193;FR=.;FRO=0;FSAF=108;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00711448;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.71;QD=63.6273;RBI=0.0283178;REFB=0;REVB=0.0274095;RO=0;SAF=105;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.91233e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.71532e-05;OID=.;OPOS=633125;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:16:188:193:0:0:187:193:1:82:105:0:0:85:108:0:0
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chr16	720986	.	G	A	259.99	PASS	AF=0.69697;AO=23;DP=33;FAO=23;FDP=33;FR=.;FRO=10;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.0378709;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.589;QD=31.5139;RBI=0.043832;REFB=-0.0693879;REVB=0.0220691;RO=10;SAF=9;SAR=14;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0619103;STB=0.53403;STBP=0.561;TYPE=snp;VARB=0.0155715;OID=.;OPOS=720986;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:33:33:10:10:23:23:0.69697:14:9:5:5:14:9:5:5
chr16	721053	.	TG	CT,T	313.91	PASS	AF=0,0.578947;AO=5,27;DP=57;FAO=0,33;FDP=57;FR=.;FRO=24;FSAF=0,26;FSAR=0,7;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=0.0105813,0.0295759;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=2,1;MLLD=23.0337,24.6824;QD=22.0288;RBI=0.0374964,0.150822;REFB=0.00457228,0.000943449;REVB=0.0359725,0.147894;RO=23;SAF=5,21;SAR=0,6;SRF=12;SRR=11;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.667745,0.25485;STB=0.5,0.6499;STBP=1,0.017;TYPE=mnp,del;VARB=0,0.0221054;OID=.,.;OPOS=721053,721054;OREF=TG,G;OALT=CT,-;OMAPALT=CT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:57:57:23:24:5,27:0,33:0,0.578947:0,6:5,21:12:11:0,7:0,26:12:12
chr16	722288	.	A	G	61.86	PASS	AF=0.28125;AO=9;DP=32;FAO=9;FDP=32;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=-0.0498913;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.7172;QD=7.73295;RBI=0.05145;REFB=0.0113088;REVB=-0.012568;RO=23;SAF=6;SAR=3;SRF=16;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0382767;STB=0.523758;STBP=0.901;TYPE=snp;VARB=-0.0341303;OID=.;OPOS=722288;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:32:32:23:23:9:9:0.28125:3:6:16:7:3:6:16:7
chr16	722331	.	C	T	385.02	PASS	AF=1;AO=27;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.050582;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=195.443;QD=55.0024;RBI=0.0579816;REFB=0;REVB=0.0283431;RO=0;SAF=23;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000781046;OID=.;OPOS=722331;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:27:28:1:4:23:0:0:5:23:0:0
chr16	722548	.	A	G	255.34	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0189537;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.9;QD=51.068;RBI=0.0270874;REFB=0;REVB=-0.0193516;RO=0;SAF=6;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5931e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.54354e-06;OID=.;OPOS=722548;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:14:6:0:0:14:6:0:0
chr16	733604	.	G	A	164.99	PASS	AF=0.382979;AO=18;DP=47;FAO=18;FDP=47;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=-0.0340443;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.6717;QD=14.042;RBI=0.0726855;REFB=-0.00685339;REVB=0.0642197;RO=29;SAF=11;SAR=7;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.208556;STB=0.621042;STBP=0.215;TYPE=snp;VARB=0.0227713;OID=.;OPOS=733604;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:29:29:18:18:0.382979:7:11:12:17:7:11:12:17
chr16	735921	.	T	C	102.07	PASS	AF=0.785714;AO=11;DP=14;FAO=11;FDP=14;FR=.;FRO=3;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0241625;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.3915;QD=29.1641;RBI=0.042832;REFB=-0.0260484;REVB=0.035366;RO=3;SAF=5;SAR=6;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0468493;STB=0.526268;STBP=0.809;TYPE=snp;VARB=0.0122618;OID=.;OPOS=735921;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:14:14:3:3:11:11:0.785714:6:5:1:2:6:5:1:2
chr16	740404	.	C	G	392.65	PASS	AF=0.590909;AO=38;DP=65;FAO=39;FDP=66;FR=.;FRO=27;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.0489017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.9983;QD=23.7969;RBI=0.0541159;REFB=-0.012473;REVB=0.0231765;RO=23;SAF=18;SAR=20;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0571606;STB=0.532694;STBP=0.552;TYPE=snp;VARB=0.00763156;OID=.;OPOS=740404;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:66:23:27:38:39:0.590909:20:18:9:14:20:19:11:16
chr16	745618	.	G	T	215.62	PASS	AF=0.393939;AO=25;DP=65;FAO=26;FDP=66;FR=.;FRO=40;FSAF=7;FSAR=19;FSRF=10;FSRR=30;FWDB=-0.0063005;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.976;QD=13.0681;RBI=0.00916942;REFB=-0.0177438;REVB=0.00666198;RO=39;SAF=7;SAR=18;SRF=10;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0316063;STB=0.515004;STBP=0.86;TYPE=snp;VARB=0.0282453;OID=.;OPOS=745618;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:66:39:40:25:26:0.393939:18:7:10:29:19:7:10:30
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chr16	746914	.	G	A	1516.06	PASS	AF=0.572614;AO=136;DP=241;FAO=138;FDP=241;FR=.;FRO=103;FSAF=79;FSAR=59;FSRF=57;FSRR=46;FWDB=-0.00183113;FXX=0.00413206;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.084;QD=25.1628;RBI=0.00305331;REFB=-0.000400838;REVB=0.00244329;RO=102;SAF=78;SAR=58;SRF=56;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0197136;STB=0.508302;STBP=0.781;TYPE=snp;VARB=0.000336947;OID=.;OPOS=746914;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:241:241:102:103:136:138:0.572614:58:78:56:46:59:79:57:46
chr16	772061	.	C	T	741.8	PASS	AF=0.635514;AO=68;DP=107;FAO=68;FDP=107;FR=.;FRO=39;FSAF=39;FSAR=29;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=0.00237723;FXX=0.0092584;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.287;QD=27.7308;RBI=0.0118813;REFB=-0.0271857;REVB=-0.0116411;RO=32;SAF=39;SAR=29;SRF=20;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0313798;STB=0.522461;STBP=0.537;TYPE=snp;VARB=0.00973612;OID=.;OPOS=772061;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:107:32:39:68:68:0.635514:29:39:20:12:29:39:20:19
chr16	772141	.	G	C	696.4	PASS	AF=0.594595;AO=65;DP=111;FAO=66;FDP=111;FR=.;FRO=45;FSAF=32;FSAR=34;FSRF=25;FSRR=20;FWDB=-0.0055469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.501;QD=25.0955;RBI=0.00555249;REFB=-0.0196138;REVB=-0.000248992;RO=46;SAF=31;SAR=34;SRF=26;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0670577;STB=0.528633;STBP=0.477;TYPE=snp;VARB=0.018685;OID=.;OPOS=772141;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:111:46:45:65:66:0.594595:34:31:26:20:34:32:25:20
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chr16	773572	.	C	T	190.19	PASS	AF=0.542857;AO=19;DP=35;FAO=19;FDP=35;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=0.0376519;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.7178;QD=21.736;RBI=0.0458961;REFB=-0.0266656;REVB=0.0262447;RO=16;SAF=3;SAR=16;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.492465;STB=0.780159;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0248266;OID=.;OPOS=773572;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:16:16:19:19:0.542857:16:3:11:5:16:3:11:5
chr16	774692	.	A	G	693.55	PASS	AF=0.612245;AO=60;DP=98;FAO=60;FDP=98;FR=.;FRO=38;FSAF=29;FSAR=31;FSRF=23;FSRR=15;FWDB=0.0077072;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.1756;QD=28.3081;RBI=0.0578561;REFB=-0.00595268;REVB=-0.0573404;RO=38;SAF=29;SAR=31;SRF=23;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0867919;STB=0.547167;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=0.00531127;OID=.;OPOS=774692;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:38:38:60:60:0.612245:31:29:23:15:31:29:23:15
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chr16	778820	.	G	A	473.27	PASS	AF=0.516854;AO=45;DP=89;FAO=46;FDP=89;FR=.;FRO=43;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=30;FSRR=13;FWDB=-0.00130191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.4624;QD=21.2704;RBI=0.0173844;REFB=0.00924572;REVB=0.0173355;RO=43;SAF=26;SAR=19;SRF=30;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110905;STB=0.566201;STBP=0.218;TYPE=snp;VARB=-0.00752661;OID=.;OPOS=778820;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:43:43:45:46:0.516854:19:26:30:13:20:26:30:13
chr16	778953	.	GT	TG	40.53	PASS	AF=0.3125;AO=5;DP=16;FAO=5;FDP=16;FR=.,HEALED;FRO=7;FSAF=5;FSAR=0;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=0.0404251;FXX=0;HRUN=4;LEN=2;MLLD=31.5981;QD=10.1334;RBI=0.0404251;REFB=-0.0754939;REVB=0;RO=4;SAF=5;SAR=0;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.00530613;OID=.;OPOS=778953;OREF=GT;OALT=TG;OMAPALT=TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:16:16:4:7:5:5:0.3125:0:5:4:0:0:5:7:0
chr16	781633	.	G	A	351.11	PASS	AF=0.583333;AO=35;DP=60;FAO=35;FDP=60;FR=.;FRO=25;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=5;FSRR=20;FWDB=0.033392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.1717;QD=23.4072;RBI=0.0357716;REFB=-0.0316355;REVB=-0.0128288;RO=25;SAF=17;SAR=18;SRF=5;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.21923;STB=0.619897;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.0226579;OID=.;OPOS=781633;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:25:25:35:35:0.583333:18:17:5:20:18:17:5:20
chr16	784765	.	C	T	140.58	PASS	AF=0.777778;AO=14;DP=18;FAO=14;FDP=18;FR=.;FRO=4;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.112398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.4442;QD=31.2402;RBI=0.11363;REFB=-0.0284691;REVB=-0.0166893;RO=4;SAF=7;SAR=7;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200828;STB=0.61096;STBP=0.115;TYPE=snp;VARB=0.00625538;OID=.;OPOS=784765;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:18:18:4:4:14:14:0.777778:7:7:4:0:7:7:4:0
chr16	832910	.	TC	T	51.59	PASS	AF=0.371429;AO=7;DP=35;FAO=13;FDP=35;FR=.;FRO=22;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.0868429;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=13.6926;QD=5.89579;RBI=0.172487;REFB=-0.076394;REVB=-0.14903;RO=20;SAF=4;SAR=3;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0826548;STB=0.654301;STBP=0.2;TYPE=del;VARB=0.0774964;OID=.;OPOS=832911;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.371429:7:35:13:35:22:4:9:12:10:51:20:4:3:10:10
chr16	837402	.	C	T	224.69	PASS	AF=0.337349;AO=28;DP=83;FAO=28;FDP=83;FR=.;FRO=55;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=23;FSRR=32;FWDB=0.0109586;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.165;QD=10.8286;RBI=0.028285;REFB=-0.0089906;REVB=0.0260759;RO=52;SAF=12;SAR=16;SRF=23;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0156862;STB=0.507037;STBP=0.94;TYPE=snp;VARB=0.0172264;OID=.;OPOS=837402;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:52:55:28:28:0.337349:16:12:23:29:16:12:23:32
chr16	839262	.	A	G	2445.01	PASS	AF=1;AO=157;DP=157;FAO=160;FDP=160;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.138372;FXX=0.00621079;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.787;QD=61.1254;RBI=0.138698;REFB=0;REVB=-0.00950646;RO=0;SAF=66;SAR=91;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.51302e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000283626;OID=.;OPOS=839262;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:157:160:0:0:157:160:1:91:66:0:0:91:69:0:0
chr16	845730	.	G	T	273.79	PASS	AF=0.527273;AO=29;DP=55;FAO=29;FDP=55;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=-0.00278555;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.0761;QD=19.9121;RBI=0.0477424;REFB=-0.0234655;REVB=0.0476611;RO=25;SAF=14;SAR=15;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102898;STB=0.564899;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=0.0282892;OID=.;OPOS=845730;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:25:26:29:29:0.527273:15:14:9:16:15:14:9:17
chr16	855743	.	G	A	315.55	PASS	AF=0.56;AO=28;DP=50;FAO=28;FDP=50;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=-0.0151415;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.5593;QD=25.2442;RBI=0.0228305;REFB=-0.015732;REVB=0.0170871;RO=22;SAF=8;SAR=20;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112945;STB=0.562867;STBP=0.396;TYPE=snp;VARB=0.0109039;OID=.;OPOS=855743;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:22:22:28:28:0.56:20:8:9:13:20:8:9:13
chr16	863336	.	T	C	101.85	PASS	AF=0.5;AO=11;DP=23;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=0.0167393;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.007;QD=16.9745;RBI=0.0502699;REFB=-0.0153786;REVB=-0.047401;RO=12;SAF=5;SAR=6;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188581;STB=0.583198;STBP=0.49;TYPE=snp;VARB=0.0138974;OID=.;OPOS=863336;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:23:24:12:12:11:12:0.5:6:5:8:4:6:6:8:4
chr16	863498	.	G	C	491.81	PASS	AF=0.490566;AO=52;DP=106;FAO=52;FDP=106;FR=.;FRO=54;FSAF=20;FSAR=32;FSRF=30;FSRR=24;FWDB=-0.00414395;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.743;QD=18.5588;RBI=0.00441229;REFB=0.00644423;REVB=0.00151525;RO=54;SAF=20;SAR=32;SRF=30;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159074;STB=0.588201;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=-0.00600809;OID=.;OPOS=863498;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:106:54:54:52:52:0.490566:32:20:30:24:32:20:30:24
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chr16	952552	.	G	A	37.78	PASS	AF=0.375;AO=6;DP=16;FAO=6;FDP=16;FR=.;FRO=10;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.0170068;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.318;QD=9.44484;RBI=0.019019;REFB=0.0040048;REVB=0.00851404;RO=10;SAF=2;SAR=4;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0726992;STB=0.545299;STBP=0.827;TYPE=snp;VARB=-0.00498607;OID=.;OPOS=952552;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:16:16:10:10:6:6:0.375:4:2:4:6:4:2:4:6
chr16	952559	.	G	T	57.32	PASS	AF=0.444444;AO=8;DP=18;FAO=8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=-0.0145945;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.9249;QD=12.7388;RBI=0.0427141;REFB=-0.0120715;REVB=-0.0401435;RO=10;SAF=4;SAR=4;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187303;STB=0.610847;STBP=0.463;TYPE=snp;VARB=0.0106959;OID=.;OPOS=952559;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:18:18:10:10:8:8:0.444444:4:4:3:7:4:4:3:7
chr16	961051	.	C	T	377.17	PASS	AF=0.642857;AO=35;DP=54;FAO=36;FDP=56;FR=.;FRO=20;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=0.0065929;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=147.652;QD=26.9409;RBI=0.0148284;REFB=0.00500231;REVB=0.0132821;RO=19;SAF=13;SAR=22;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00207483;STB=0.504164;STBP=0.943;TYPE=snp;VARB=-0.00243682;OID=.;OPOS=961051;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:56:19:20:35:36:0.642857:22:13:7:12:22:14:8:12
chr16	984113	.	C	A	125.84	PASS	AF=0.518519;AO=14;DP=27;FAO=14;FDP=27;FR=.;FRO=13;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.0293298;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=109.237;QD=18.643;RBI=0.0296909;REFB=-0.0308463;REVB=0.00461666;RO=13;SAF=12;SAR=2;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.428521;STB=0.749583;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0383567;OID=.;OPOS=984113;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:13:13:14:14:0.518519:2:12:6:7:2:12:6:7
chr16	1034834	.	T	C	1029.26	PASS	AF=1;AO=69;DP=70;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0122917;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.9798;QD=59.667;RBI=0.0268594;REFB=0;REVB=-0.0238819;RO=0;SAF=31;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000316268;OID=.;OPOS=1034834;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:69:0:0:69:69:1:38:31:0:0:38:31:0:0
chr16	1035456	.	A	G	417.51	PASS	AF=0.544304;AO=40;DP=77;FAO=43;FDP=79;FR=.;FRO=36;FSAF=37;FSAR=6;FSRF=33;FSRR=3;FWDB=-0.0183636;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.499;QD=21.14;RBI=0.0363874;REFB=-0.010005;REVB=0.0314137;RO=34;SAF=37;SAR=3;SRF=33;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159154;STB=0.557744;STBP=0.473;TYPE=snp;VARB=0.0117107;OID=.;OPOS=1035456;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:79:34:36:40:43:0.544304:3:37:33:1:6:37:33:3
chr16	1116444	.	GA	G,GG	143.99	PASS	AF=0.0769231,0.923077;AO=2,11;DP=13;FAO=1,12;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=1,10;FSAR=0,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.042034,0.0329274;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=211.469,230.99;QD=44.3036;RBI=0.151324,0.149711;REFB=0,0;REVB=0.145369,0.146045;RO=0;SAF=1,10;SAR=1,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0364035,0.00587806;OID=.,.;OPOS=1116445,1116445;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0769231,0.923077:2,11:13:1,12:13:0:1,10:0,2:0:0:4:0:1,10:1,1:0:0
chr16	1129620	.	T	C	528.01	PASS	AF=0.972973;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00706647;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.617;QD=57.082;RBI=0.104034;REFB=-0.177184;REVB=0.103794;RO=1;SAF=19;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0267359;STB=0.514278;STBP=0.325;TYPE=snp;VARB=0.00581712;OID=.;OPOS=1129620;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:37:37:1:1:36:36:0.972973:17:19:0:1:17:19:0:1
chr16	1129912	.	A	G	74.97	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00418967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.422;QD=37.4873;RBI=0.03533;REFB=0;REVB=-0.0350808;RO=0;SAF=6;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.58669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000330633;OID=.;OPOS=1129912;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:2:6:0:0:2:6:0:0
chr16	1252369	.	C	T	536.31	PASS	AF=0.948718;AO=37;DP=39;FAO=37;FDP=39;FR=.;FRO=2;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00689897;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=213.812;QD=55.0063;RBI=0.0839937;REFB=-0.114528;REVB=0.0837099;RO=2;SAF=21;SAR=16;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0549974;STB=0.529396;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.00126694;OID=.;OPOS=1252369;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:39:39:2:2:37:37:0.948718:16:21:0:2:16:21:0:2
chr16	1259090	.	G	A	269.85	PASS	AF=0.355556;AO=32;DP=90;FAO=32;FDP=90;FR=.;FRO=58;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=24;FSRR=34;FWDB=0.00877148;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.7686;QD=11.9932;RBI=0.0132478;REFB=-0.00646596;REVB=0.00992799;RO=57;SAF=16;SAR=16;SRF=24;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0879199;STB=0.555521;STBP=0.44;TYPE=snp;VARB=0.022459;OID=.;OPOS=1259090;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:57:58:32:32:0.355556:16:16:24:33:16:16:24:34
chr16	1260481	.	T	C	538.55	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0167256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.627;QD=59.8387;RBI=0.0263939;REFB=0;REVB=-0.0204179;RO=0;SAF=19;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000144811;OID=.;OPOS=1260481;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:17:19:0:0:17:19:0:0
chr16	1261219	.	A	G	955.2	PASS	AF=1;AO=64;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0541557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.937;QD=58.7816;RBI=0.0543957;REFB=0;REVB=-0.00510432;RO=0;SAF=32;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000193809;OID=.;OPOS=1261219;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:64:65:1:32:32:0:0:32:33:0:0
chr16	1261222	.	A	G	940.67	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130893;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.2816;QD=58.7918;RBI=0.0132634;REFB=0;REVB=-0.00214181;RO=0;SAF=32;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00011703;OID=.;OPOS=1261222;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:32:32:0:0:32:32:0:0
chr16	1261282	.	T	C	803.46	PASS	AF=0.982759;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0179506;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=297.793;QD=55.4107;RBI=0.0184888;REFB=0.0126597;REVB=0.00442865;RO=1;SAF=26;SAR=31;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0177934;STB=0.509431;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=-3.10678e-05;OID=.;OPOS=1261282;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:58:58:1:1:57:57:0.982759:31:26:1:0:31:26:1:0
chr16	1268494	.	C	T	316.79	PASS	AF=0.96;AO=24;DP=26;FAO=24;FDP=25;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0208909;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.271;QD=50.6861;RBI=0.0229718;REFB=-0.0756427;REVB=0.0095537;RO=0;SAF=9;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.526294;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.0068434;OID=.;OPOS=1268494;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:26:25:0:1:24:24:0.96:15:9:0:0:15:9:1:0
chr16	1269029	.	T	C	620.27	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0197681;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.719;QD=60.514;RBI=0.0237315;REFB=0;REVB=-0.0131303;RO=0;SAF=18;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.19993e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00272458;OID=.;OPOS=1269029;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:41:0:0:40:41:1:22:18:0:0:22:19:0:0
chr16	1270162	.	G	A	1135.17	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0144348;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.1286;QD=60.5421;RBI=0.0591407;REFB=0;REVB=0.057352;RO=0;SAF=31;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000347946;OID=.;OPOS=1270162;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:44:31:0:0:44:31:0:0
chr16	1270349	.	T	C	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.055144;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.586;QD=55.6559;RBI=0.0553623;REFB=0;REVB=0.00491158;RO=0;SAF=12;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000402436;OID=.;OPOS=1270349;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:15:12:0:0:15:12:0:0
chr16	1271890	.	G	T	541.79	PASS	AF=1;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0314521;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.007;QD=60.1989;RBI=0.17088;REFB=0;REVB=0.167961;RO=0;SAF=24;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00121077;OID=.;OPOS=1271890;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:36:0:0:36:36:1:12:24:0:0:12:24:0:0
chr16	1272038	.	G	A	519.83	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0638683;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.3544;QD=59.4088;RBI=0.0641501;REFB=0;REVB=0.00600564;RO=0;SAF=12;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.75716e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000757374;OID=.;OPOS=1272038;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:35:0:0:34:35:1:22:12:0:0:22:13:0:0
chr16	1272865	.	G	A	3023.05	PASS	AF=1;AO=191;DP=191;FAO=192;FDP=192;FR=.;FRO=0;FSAF=99;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0101736;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.573;QD=62.9801;RBI=0.0114768;REFB=0.00409915;REVB=-0.00531173;RO=0;SAF=99;SAR=92;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.64491e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.76547e-05;OID=.;OPOS=1272865;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:191:192:0:0:191:192:1:92:99:0:0:93:99:0:0
chr16	1291188	.	C	T	69.49	PASS	AF=0.4;AO=7;DP=27;FAO=10;FDP=25;FR=.,HEALED;FRO=15;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.0238713;FXX=0.107105;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.7341;QD=11.119;RBI=0.031176;REFB=-0.0201652;REVB=-0.0200525;RO=13;SAF=3;SAR=4;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115383;STB=0.51996;STBP=0.916;TYPE=snp;VARB=0.0290715;OID=.;OPOS=1291188;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:69:27:25:13:15:7:10:0.4:4:3:7:6:5:5:7:8
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chr16	1306346	.	C	T	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.045657;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=208.857;QD=51.9167;RBI=0.0526012;REFB=0;REVB=0.0261213;RO=0;SAF=15;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000299602;OID=.;OPOS=1306346;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:6:15:0:0:6:15:0:0
chr16	1306355	.	T	C	259.75	PASS	AF=1;AO=20;DP=21;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0152782;FXX=0.0475964;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.3202;QD=51.9508;RBI=0.0698701;REFB=0;REVB=0.0681792;RO=0;SAF=14;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5931e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000460707;OID=.;OPOS=1306355;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:20:0:0:20:20:1:6:14:0:0:6:14:0:0
chr16	1306559	.	AG	A,GA	210.17	PASS	AF=0.512195,0.0243902;AO=16,6;DP=43;FAO=21,1;FDP=41;FR=.;FRO=19;FSAF=10,0;FSAR=11,1;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.0539121,-0.00751671;FXX=0.0465008;HRUN=2,1;LEN=1,2;MLLD=23.8129,128.658;QD=20.504;RBI=0.0794578,0.0997988;REFB=0.0547379,0.000870697;REVB=-0.0583698,-0.0995154;RO=18;SAF=10,0;SAR=6,6;SRF=10;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0670294,-0.734475;STB=0.548647,0.991133;STBP=0.533,0.272;TYPE=del,mnp;VARB=-0.0476489,0.0355941;OID=.,.;OPOS=1306560,1306559;OREF=G,AG;OALT=-,GA;OMAPALT=A,GA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:41:18:19:16,6:21,1:0.512195,0.0243902:6,6:10,0:10:8:11,1:10,0:11:8
chr16	1306671	.	G	A	88.77	PASS	AF=0.236364;AO=13;DP=55;FAO=13;FDP=55;FR=.;FRO=42;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=27;FWDB=0.00218944;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.943;QD=6.45632;RBI=0.0114819;REFB=0.0145636;REVB=0.0112712;RO=42;SAF=3;SAR=10;SRF=15;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186024;STB=0.618359;STBP=0.393;TYPE=snp;VARB=-0.0179722;OID=.;OPOS=1306671;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:55:55:42:42:13:13:0.236364:10:3:15:27:10:3:15:27
chr16	1306680	.	C	T	489.43	PASS	AF=0.770833;AO=37;DP=48;FAO=37;FDP=48;FR=.;FRO=11;FSAF=11;FSAR=26;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=0.0632198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.309;QD=40.7857;RBI=0.0640138;REFB=0.00903666;REVB=-0.0100508;RO=11;SAF=11;SAR=26;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.012546;STB=0.506771;STBP=0.903;TYPE=snp;VARB=-0.00190768;OID=.;OPOS=1306680;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:48:48:11:11:37:37:0.770833:26:11:3:8:26:11:3:8
chr16	1306681	.	G	A	78.59	PASS	AF=0.22449;AO=11;DP=49;FAO=11;FDP=49;FR=.;FRO=38;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=27;FWDB=0.0505436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.25;QD=6.4154;RBI=0.0551896;REFB=-0.000538446;REVB=0.022164;RO=38;SAF=3;SAR=8;SRF=11;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0252267;STB=0.516099;STBP=0.94;TYPE=snp;VARB=0.00338452;OID=.;OPOS=1306681;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:49:49:38:38:11:11:0.22449:8:3:11:27:8:3:11:27
chr16	1306981	.	G	A	397.42	PASS	AF=0.565217;AO=39;DP=69;FAO=39;FDP=69;FR=.;FRO=30;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=-0.0207511;FXX=0.0142837;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.567;QD=23.0388;RBI=0.0405882;REFB=-0.0279375;REVB=0.0348825;RO=30;SAF=17;SAR=22;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0510805;STB=0.528118;STBP=0.622;TYPE=snp;VARB=0.0150014;OID=.;OPOS=1306981;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:30:30:39:39:0.565217:22:17:15:15:22:17:15:15
chr16	1311333	.	A	G	418.1	PASS	AF=0.525;AO=41;DP=79;FAO=42;FDP=80;FR=.;FRO=38;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=0.0271629;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.184;QD=20.9051;RBI=0.0272021;REFB=-0.0389658;REVB=0.0014607;RO=38;SAF=19;SAR=22;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0318703;STB=0.511318;STBP=0.881;TYPE=snp;VARB=0.0301463;OID=.;OPOS=1311333;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:80:38:38:41:42:0.525:22:19:19:19:22:20:19:19
chr16	1311361	.	C	T	352.3	PASS	AF=0.480519;AO=37;DP=76;FAO=37;FDP=77;FR=.;FRO=40;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=0.0339718;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.299;QD=18.301;RBI=0.0339811;REFB=-0.014341;REVB=-0.000795353;RO=39;SAF=18;SAR=19;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0466771;STB=0.518977;STBP=0.75;TYPE=snp;VARB=0.0151838;OID=.;OPOS=1311361;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:77:39:40:37:37:0.480519:19:18:17:22:19:18:18:22
chr16	1312546	.	T	A	163.01	PASS	AF=0.309859;AO=22;DP=71;FAO=22;FDP=71;FR=.;FRO=49;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=26;FSRR=23;FWDB=-0.0146715;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.723;QD=9.18381;RBI=0.0155186;REFB=-0.00501577;REVB=-0.00505695;RO=49;SAF=14;SAR=8;SRF=26;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127392;STB=0.575527;STBP=0.395;TYPE=snp;VARB=0.0101835;OID=.;OPOS=1312546;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:49:49:22:22:0.309859:8:14:26:23:8:14:26:23
chr16	1312826	.	A	G	367.06	PASS	AF=0.411765;AO=42;DP=102;FAO=42;FDP=102;FR=.;FRO=60;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=33;FSRR=27;FWDB=0.0244344;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.711;QD=14.3944;RBI=0.04194;REFB=-0.0183044;REVB=-0.034087;RO=60;SAF=22;SAR=20;SRF=33;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0273841;STB=0.515457;STBP=0.788;TYPE=snp;VARB=0.0202265;OID=.;OPOS=1312826;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:60:60:42:42:0.411765:20:22:33:27:20:22:33:27
chr16	1370597	.	G	C	689.38	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0258052;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=276.987;QD=62.6706;RBI=0.031319;REFB=0;REVB=0.0177475;RO=0;SAF=27;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.54734e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.20721e-05;OID=.;OPOS=1370597;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:17:27:0:0:17:27:0:0
chr16	1370614	.	C	G	483.12	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0291332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.987;QD=58.5597;RBI=0.0292014;REFB=0;REVB=-0.00199458;RO=0;SAF=21;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.86861e-05;OID=.;OPOS=1370614;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:12:21:0:0:12:21:0:0
chr16	1370630	.	A	G	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000287153;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.1672;QD=51.1845;RBI=0.00974346;REFB=0;REVB=-0.00973923;RO=0;SAF=12;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000141834;OID=.;OPOS=1370630;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:8:12:0:0:8:12:0:0
chr16	1374818	.	A	G	490.11	PASS	AF=0.971429;AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00194902;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=284.969;QD=56.0125;RBI=0.0108307;REFB=-0.102518;REVB=0.0106539;RO=1;SAF=20;SAR=14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.022804;STB=0.512188;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.000599808;OID=.;OPOS=1374818;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:35:35:1:1:34:34:0.971429:14:20:1:0:14:20:1:0
chr16	1374951	.	C	G	707.62	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0167576;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.169;QD=62.8991;RBI=0.0472697;REFB=0;REVB=0.0441996;RO=0;SAF=22;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000436341;OID=.;OPOS=1374951;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:45:0:0:44:45:1:22:22:0:0:23:22:0:0
chr16	1389153	.	C	A	911.28	PASS	AF=0.942857;AO=65;DP=70;FAO=66;FDP=70;FR=.;FRO=4;FSAF=37;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0517531;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=45.4786;QD=52.0732;RBI=0.0873064;REFB=-0.198059;REVB=0.0703138;RO=4;SAF=37;SAR=28;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0353856;STB=0.51793;STBP=0.273;TYPE=snp;VARB=0.0125375;OID=.;OPOS=1389153;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:70:70:4:4:65:66:0.942857:28:37:1:3:29:37:1:3
chr16	1391871	.	C	G	695.87	PASS	AF=0.962264;AO=51;DP=53;FAO=51;FDP=53;FR=.;FRO=2;FSAF=22;FSAR=29;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0219633;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.464;QD=52.5186;RBI=0.0268208;REFB=-0.138187;REVB=-0.0153938;RO=0;SAF=22;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.521731;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.00182474;OID=.;OPOS=1391871;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:53:53:0:2:51:51:0.962264:29:22:0:0:29:22:2:0
chr16	1394507	.	A	C	1328.53	PASS	AF=1;AO=82;DP=82;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156661;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.9;QD=61.7919;RBI=0.0243533;REFB=0;REVB=0.0186456;RO=0;SAF=42;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.573e-05;OID=.;OPOS=1394507;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:86:0:0:82:86:1:40:42:0:0:44:42:0:0
chr16	1419947	.	A	G	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0187065;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.452;QD=50.4124;RBI=0.0240939;REFB=0;REVB=-0.0151849;RO=0;SAF=8;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.41338e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000196621;OID=.;OPOS=1419947;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:11:8:0:0:11:8:0:0
chr16	1433766	.	T	C	1674.75	PASS	AF=1;AO=110;DP=110;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0120143;FXX=0.00892777;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.851;QD=60.3512;RBI=0.026795;REFB=0;REVB=0.0239506;RO=0;SAF=52;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.4768e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000108698;OID=.;OPOS=1433766;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:110:111:0:0:110:111:1:58:52:0:0:59:52:0:0
chr16	1447278	.	A	G	714.23	PASS	AF=1;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0319499;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.889;QD=63.4872;RBI=0.0384221;REFB=0;REVB=-0.0213415;RO=0;SAF=16;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.49331e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.7519e-05;OID=.;OPOS=1447278;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:45:0:0:45:45:1:29:16:0:0:29:16:0:0
chr16	1479250	.	C	T	883.74	PASS	AF=0.655462;AO=78;DP=119;FAO=78;FDP=119;FR=.;FRO=41;FSAF=37;FSAR=41;FSRF=22;FSRR=19;FWDB=0.0174791;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.547;QD=29.7057;RBI=0.0194843;REFB=0.00559228;REVB=-0.00860931;RO=41;SAF=37;SAR=41;SRF=22;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0397265;STB=0.521443;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=-0.00246277;OID=.;OPOS=1479250;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:119:41:41:78:78:0.655462:41:37:22:19:41:37:22:19
chr16	1484392	.	G	C	1008.47	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0111382;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.585;QD=59.322;RBI=0.0457023;REFB=0;REVB=0.0443242;RO=0;SAF=34;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000212717;OID=.;OPOS=1484392;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:34:34:0:0:34:34:0:0
chr16	1484473	.	A	G	1208.96	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00908172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.627;QD=61.2131;RBI=0.019728;REFB=0;REVB=-0.0175134;RO=0;SAF=35;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.37809e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.04743e-06;OID=.;OPOS=1484473;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:44:35:0:0:44:35:0:0
chr16	1503879	.	T	A	2140.6	PASS	AF=1;AO=136;DP=136;FAO=136;FDP=136;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0186461;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.487;QD=62.9589;RBI=0.0214224;REFB=0;REVB=0.0105471;RO=0;SAF=58;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.65362e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.85535e-05;OID=.;OPOS=1503879;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:136:136:0:0:136:136:1:78:58:0:0:78:58:0:0
chr16	1536372	.	G	A	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00731308;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=135.022;QD=50.4134;RBI=0.0230648;REFB=0;REVB=0.0218747;RO=0;SAF=10;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000204542;OID=.;OPOS=1536372;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:9:10:0:0:9:10:0:0
chr16	1536535	.	C	T	526.59	PASS	AF=0.972973;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0134402;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.985;QD=56.9287;RBI=0.029898;REFB=-0.0939896;REVB=-0.0267068;RO=1;SAF=24;SAR=12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0191068;STB=0.510198;STBP=0.594;TYPE=snp;VARB=0.0162045;OID=.;OPOS=1536535;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:37:37:1:1:36:36:0.972973:12:24:1:0:12:24:1:0
chr16	1537454	.	CT	C,CC,CG	175.2	PASS	AF=0.6875,0.25,0.0625;AO=3,11,2;DP=16;FAO=11,4,1;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=6,0,1;FSAR=5,4,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0224639,0.00829856,-0.0872521;FXX=0;HRUN=1,1,1;LEN=1,1,1;MLLD=112.05,104.217,98.9193;QD=43.7988;RBI=0.0326387,0.0253802,0.0907283;REFB=0,0,0;REVB=0.0236782,0.0239851,0.0248735;RO=0;SAF=1,4,2;SAR=2,7,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,snp,snp;VARB=0.00640467,-0.0179476,0.0130162;OID=.,.,.;OPOS=1537455,1537455,1537455;OREF=T,T,T;OALT=-,C,G;OMAPALT=C,CC,CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.6875,0.25,0.0625:3,11,2:16:11,4,1:16:0:6,0,1:5,4,0:0:0:16:0:1,4,2:2,7,0:0:0
chr16	1537839	.	G	A	1453.28	PASS	AF=1;AO=92;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0196657;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.467;QD=63.186;RBI=0.0462996;REFB=0;REVB=0.0419156;RO=0;SAF=58;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000169604;OID=.;OPOS=1537839;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:92:92:0:0:92:92:1:34:58:0:0:34:58:0:0
chr16	1538363	.	C	A	1647.47	PASS	AF=0.982301;AO=111;DP=113;FAO=111;FDP=113;FR=.;FRO=2;FSAF=68;FSAR=43;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0337781;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=260.741;QD=58.3175;RBI=0.0455229;REFB=0.00216267;REVB=0.0305184;RO=1;SAF=68;SAR=43;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0069312;STB=0.507245;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=1.52208e-05;OID=.;OPOS=1538363;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:113:113:1:2:111:111:0.982301:43:68:1:0:43:68:2:0
chr16	1538433	.	A	G	1186.34	PASS	AF=0.963855;AO=80;DP=83;FAO=80;FDP=83;FR=.;FRO=3;FSAF=48;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0356609;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.8583;QD=57.1729;RBI=0.0403358;REFB=-0.109209;REVB=0.0188488;RO=3;SAF=48;SAR=32;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0423346;STB=0.522382;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.0102806;OID=.;OPOS=1538433;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:83:83:3:3:80:80:0.963855:32:48:0:3:32:48:0:3
chr16	1538464	.	C	T	698.99	PASS	AF=0.980392;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0161274;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=267.476;QD=54.8231;RBI=0.0217696;REFB=0.0751217;REVB=0.0146227;RO=1;SAF=29;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0218873;STB=0.511623;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=-0.000178311;OID=.;OPOS=1538464;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:51:51:1:1:50:50:0.980392:21:29:0:1:21:29:0:1
chr16	1544301	.	GA	CG,GG	674.57	PASS	AF=0.954545,0.0454545;AO=42,2;DP=44;FAO=42,2;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=34,1;FSAR=8,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00318635,0.01258;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=195.967,206.559;QD=61.3248;RBI=0.00653533,0.0223204;REFB=0,0;REVB=-0.00570593,-0.0184376;RO=0;SAF=34,1;SAR=8,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=4.67012e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=-0.000164203,0.0331557;OID=.,.;OPOS=1544301,1544302;OREF=GA,A;OALT=CG,G;OMAPALT=CG,GG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:44:44:0:0:42,2:42,2:0.954545,0.0454545:8,1:34,1:0:0:8,1:34,1:0:0
chr16	1545448	.	A	G	2530.71	PASS	AF=1;AO=163;DP=163;FAO=164;FDP=164;FR=.;FRO=0;FSAF=97;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00775284;FXX=0.00606024;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.9416;QD=61.7247;RBI=0.0177655;REFB=0;REVB=0.0159846;RO=0;SAF=97;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.29745e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00018064;OID=.;OPOS=1545448;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:163:164:0:0:163:164:1:66:97:0:0:67:97:0:0
chr16	1547477	.	T	C	179.04	PASS	AF=0.348485;AO=23;DP=66;FAO=23;FDP=66;FR=.;FRO=43;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=24;FSRR=19;FWDB=-0.0190942;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.132;QD=10.8508;RBI=0.0214464;REFB=-0.00637721;REVB=0.00976531;RO=43;SAF=13;SAR=10;SRF=24;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0080395;STB=0.504681;STBP=0.97;TYPE=snp;VARB=0.0185321;OID=.;OPOS=1547477;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:43:43:23:23:0.348485:10:13:24:19:10:13:24:19
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chr16	1574863	.	G	A	813.38	PASS	AF=0.651786;AO=71;DP=110;FAO=73;FDP=112;FR=.;FRO=39;FSAF=35;FSAR=38;FSRF=28;FSRR=11;FWDB=0.0335313;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.3624;QD=29.0492;RBI=0.0338368;REFB=-0.00632089;REVB=0.0045368;RO=39;SAF=34;SAR=37;SRF=28;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156112;STB=0.582601;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.00308999;OID=.;OPOS=1574863;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:112:39:39:71:73:0.651786:37:34:28:11:38:35:28:11
chr16	1591962	.	G	A	835.4	PASS	AF=0.549296;AO=78;DP=142;FAO=78;FDP=142;FR=.;FRO=64;FSAF=26;FSAR=52;FSRF=40;FSRR=24;FWDB=-0.0174264;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.797;QD=23.5324;RBI=0.0182944;REFB=-0.0196824;REVB=0.00556839;RO=64;SAF=26;SAR=52;SRF=40;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.245877;STB=0.63458;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0129673;OID=.;OPOS=1591962;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:142:142:64:64:78:78:0.549296:52:26:40:24:52:26:40:24
chr16	1608082	.	A	G	386.41	PASS	AF=0.481928;AO=37;DP=81;FAO=40;FDP=83;FR=.;FRO=43;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=20;FSRR=23;FWDB=0.000146855;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.451;QD=18.6219;RBI=0.0203077;REFB=-0.00883344;REVB=-0.0203072;RO=43;SAF=16;SAR=21;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0317848;STB=0.507894;STBP=0.892;TYPE=snp;VARB=0.0102184;OID=.;OPOS=1608082;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:83:43:43:37:40:0.481928:21:16:20:23:22:18:20:23
chr16	1614097	.	A	G	1586.18	PASS	AF=1;AO=105;DP=106;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0387121;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.855;QD=59.8559;RBI=0.0388242;REFB=0;REVB=-0.00294821;RO=0;SAF=56;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.8178e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.1959e-05;OID=.;OPOS=1614097;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:106:106:0:0:105:106:1:49:56:0:0:50:56:0:0
chr16	1616201	.	C	T	236.6	PASS	AF=0.45;AO=27;DP=60;FAO=27;FDP=60;FR=.;FRO=33;FSAF=20;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=22;FWDB=0.00561881;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.262;QD=15.7732;RBI=0.0151245;REFB=-0.00102016;REVB=-0.014042;RO=33;SAF=20;SAR=7;SRF=11;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.402098;STB=0.727558;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.00128514;OID=.;OPOS=1616201;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:33:33:27:27:0.45:7:20:11:22:7:20:11:22
chr16	1682281	.	A	G	375.65	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0486692;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.7659;QD=55.6525;RBI=0.064539;REFB=0;REVB=0.0423862;RO=0;SAF=17;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00193531;OID=.;OPOS=1682281;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:10:17:0:0:10:17:0:0
chr16	1812972	.	G	C	158.95	PASS	AF=0.472222;AO=17;DP=36;FAO=17;FDP=36;FR=.;FRO=19;FSAF=3;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=-0.0992844;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.1451;QD=17.6607;RBI=0.102697;REFB=-0.0156397;REVB=-0.0262533;RO=19;SAF=3;SAR=14;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.466068;STB=0.768885;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.0142207;OID=.;OPOS=1812972;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:19:19:17:17:0.472222:14:3:12:7:14:3:12:7
chr16	1814391	.	T	C	253.91	PASS	AF=0.510638;AO=24;DP=47;FAO=24;FDP=47;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=-0.0368261;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.715;QD=21.6091;RBI=0.0398197;REFB=0.00539471;REVB=0.0151477;RO=22;SAF=14;SAR=10;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0330443;STB=0.53066;STBP=0.707;TYPE=snp;VARB=-0.00638802;OID=.;OPOS=1814391;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:22:23:24:24:0.510638:10:14:12:10:10:14:12:11
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chr16	1823024	.	G	T	32.4	PASS	AF=0.625;AO=5;DP=8;FAO=5;FDP=8;FR=.;FRO=3;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0228517;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.9679;QD=16.2002;RBI=0.0354402;REFB=-0.149485;REVB=-0.0270888;RO=3;SAF=3;SAR=2;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0436878;STB=0.526212;STBP=0.986;TYPE=snp;VARB=0.0384574;OID=.;OPOS=1823024;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:8:8:3:3:5:5:0.625:2:3:2:1:2:3:2:1
chr16	1827836	.	T	C	689.97	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0276204;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.359;QD=62.7244;RBI=0.0445465;REFB=0;REVB=0.03495;RO=0;SAF=22;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0001773;OID=.;OPOS=1827836;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:44:0:0:43:44:1:21:22:0:0:22:22:0:0
chr16	1836796	.	C	A	174.45	PASS	AF=0.422222;AO=14;DP=46;FAO=19;FDP=45;FR=.,HEALED;FRO=25;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=-0.0298112;FXX=0.0217344;HRUN=5;LEN=1;MLLD=117.341;QD=15.5065;RBI=0.0303991;REFB=-0.0109554;REVB=0.00594956;RO=18;SAF=9;SAR=5;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.295851;STB=0.643409;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.0292633;OID=.;OPOS=1836796;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:45:18:25:14:19:0.422222:5:9:6:12:6:13:11:14
chr16	1838037	.	C	G	250.38	PASS	AF=0.48;AO=24;DP=50;FAO=24;FDP=50;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=-0.00512258;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.465;QD=20.0307;RBI=0.0150923;REFB=-0.0268787;REVB=0.0141963;RO=26;SAF=11;SAR=13;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144062;STB=0.581059;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=0.0256539;OID=.;OPOS=1838037;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:26:26:24:24:0.48:13:11:16:10:13:11:16:10
chr16	1838640	.	T	C	2318.97	PASS	AF=1;AO=143;DP=147;FAO=146;FDP=146;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0272683;FXX=0.00680226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=306.502;QD=63.5333;RBI=0.0311094;REFB=0;REVB=0.0149745;RO=0;SAF=88;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.44321e-05;OID=.;OPOS=1838640;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:147:146:0:0:143:146:1:55:88:0:0:58:88:0:0
chr16	1840853	.	C	T	41.14	PASS	AF=0.6;AO=6;DP=10;FAO=6;FDP=10;FR=.;FRO=4;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.037822;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.735;QD=16.4545;RBI=0.037926;REFB=-0.0263228;REVB=-0.00280605;RO=4;SAF=1;SAR=5;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0921951;STB=0.555356;STBP=0.845;TYPE=snp;VARB=0.0130919;OID=.;OPOS=1840853;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:10:10:4:4:6:6:0.6:5:1:1:3:5:1:1:3
chr16	1841618	.	C	T	252.96	PASS	AF=0.733333;AO=22;DP=31;FAO=22;FDP=30;FR=.;FRO=8;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.0371564;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.8289;QD=33.7278;RBI=0.0523852;REFB=-0.0478279;REVB=0.0369271;RO=8;SAF=11;SAR=11;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121691;STB=0.566607;STBP=0.262;TYPE=snp;VARB=0.0201502;OID=.;OPOS=1841618;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:31:30:8:8:22:22:0.733333:11:11:2:6:11:11:2:6
chr16	1842130	.	G	A	232.37	PASS	AF=0.378378;AO=28;DP=73;FAO=28;FDP=74;FR=.;FRO=46;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=14;FSRR=32;FWDB=-0.00613711;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.759;QD=12.5605;RBI=0.0209345;REFB=-0.0139419;REVB=0.0200147;RO=45;SAF=10;SAR=18;SRF=14;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.054982;STB=0.536455;STBP=0.669;TYPE=snp;VARB=0.0301802;OID=.;OPOS=1842130;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:74:45:46:28:28:0.378378:18:10:14:31:18:10:14:32
chr16	1842209	.	A	G	885.41	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00412955;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.132;QD=58.0595;RBI=0.0187213;REFB=0;REVB=-0.0182602;RO=0;SAF=39;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.01474e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.70297e-05;OID=.;OPOS=1842209;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:22:39:0:0:22:39:0:0
chr16	1843672	.	T	C	478.14	PASS	AF=0.307692;AO=63;DP=207;FAO=64;FDP=208;FR=.;FRO=144;FSAF=37;FSAR=27;FSRF=64;FSRR=80;FWDB=-0.00464551;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.507;QD=9.19505;RBI=0.00857444;REFB=-0.023501;REVB=-0.00720696;RO=142;SAF=36;SAR=27;SRF=63;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151856;STB=0.592104;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=0.0529398;OID=.;OPOS=1843672;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:207:208:142:144:63:64:0.307692:27:36:63:79:27:37:64:80
chr16	1859432	.	G	C	409.39	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0548981;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.6683;QD=56.467;RBI=0.0593932;REFB=0;REVB=0.0226661;RO=0;SAF=18;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00159958;OID=.;OPOS=1859432;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:29:0:0:28:29:1:10:18:0:0:10:19:0:0
chr16	1859440	.	C	A	75.61	PASS	AF=0.384615;AO=10;DP=26;FAO=10;FDP=26;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=-0.0375692;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.1416;QD=11.633;RBI=0.0381624;REFB=-0.0210521;REVB=0.00670288;RO=16;SAF=5;SAR=5;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.261436;STB=0.653567;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=0.0305748;OID=.;OPOS=1859440;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:26:26:16:16:10:10:0.384615:5:5:12:4:5:5:12:4
chr16	1869078	.	C	T	102.53	PASS	AF=0.295455;AO=12;DP=44;FAO=13;FDP=44;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.032502;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.366;QD=9.32075;RBI=0.0368626;REFB=-0.00653837;REVB=0.0173917;RO=28;SAF=9;SAR=3;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.343282;STB=0.651933;STBP=0.204;TYPE=snp;VARB=0.00503609;OID=.;OPOS=1869078;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:28:31:12:13:0.295455:3:9:13:15:4:9:15:16
chr16	1872312	.	G	A	103.66	PASS	AF=0.269231;AO=14;DP=53;FAO=14;FDP=52;FR=.;FRO=38;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=-0.00387016;FXX=0.0188644;HRUN=3;LEN=1;MLLD=239.563;QD=7.97417;RBI=0.0130406;REFB=-0.0179956;REVB=-0.0124531;RO=37;SAF=11;SAR=3;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.380867;STB=0.743749;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.0383079;OID=.;OPOS=1872312;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:52:37:38:14:14:0.269231:3:11:18:19:3:11:18:20
chr16	1872922	.	C	G	224.21	PASS	AF=0.385714;AO=27;DP=69;FAO=27;FDP=70;FR=.;FRO=43;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=26;FSRR=17;FWDB=0.0245748;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.21;QD=12.8119;RBI=0.0246365;REFB=-0.00641825;REVB=-0.0017425;RO=42;SAF=10;SAR=17;SRF=26;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.261661;STB=0.642752;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.00924122;OID=.;OPOS=1872922;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:70:42:43:27:27:0.385714:17:10:26:16:17:10:26:17
chr16	1888037	.	G	A	117.89	PASS	AF=0.35;AO=14;DP=41;FAO=14;FDP=40;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=0.0277841;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.8154;QD=11.7885;RBI=0.0277854;REFB=-0.00246904;REVB=-0.000268143;RO=25;SAF=5;SAR=9;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.261592;STB=0.642653;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=0.014737;OID=.;OPOS=1888037;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:40:25:26:14:14:0.35:9:5:15:10:9:5:15:11
chr16	1894912	.	C	T	72.0	PASS	AF=0.285714;AO=10;DP=35;FAO=10;FDP=35;FR=.;FRO=25;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=-0.0031958;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.888;QD=8.22851;RBI=0.0541664;REFB=0.0025612;REVB=-0.054072;RO=24;SAF=4;SAR=6;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0300877;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0152919;OID=.;OPOS=1894912;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:71:35:35:24:25:10:10:0.285714:6:4:9:15:6:4:10:15
chr16	1912021	.	T	G	155.48	PASS	AF=0.318182;AO=20;DP=65;FAO=21;FDP=66;FR=.;FRO=45;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=25;FWDB=-0.016662;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.3065;QD=9.42302;RBI=0.016662;REFB=-0.000194752;REVB=8.48533e-06;RO=45;SAF=12;SAR=8;SRF=20;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18085;STB=0.618934;STBP=0.197;TYPE=snp;VARB=0.000461776;OID=.;OPOS=1912021;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:66:45:45:20:21:0.318182:8:12:20:25:8:13:20:25
chr16	1918125	.	T	G	1449.79	PASS	AF=1;AO=92;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0694797;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.272;QD=63.0343;RBI=0.0697929;REFB=0;REVB=0.00660511;RO=0;SAF=48;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.00699e-05;OID=.;OPOS=1918125;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:92:92:0:0:92:92:1:44:48:0:0:44:48:0:0
chr16	1961674	.	G	C	746.86	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0162782;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=164.566;QD=63.5627;RBI=0.0162803;REFB=0;REVB=-0.000256845;RO=0;SAF=18;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.65071e-05;OID=.;OPOS=1961674;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:29:18:0:0:29:18:0:0
chr16	1961725	.	G	A	171.62	PASS	AF=0.461538;AO=18;DP=36;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=-0.025069;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=114.024;QD=17.6021;RBI=0.0263312;REFB=-0.0381622;REVB=0.00805459;RO=18;SAF=13;SAR=5;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.350505;STB=0.667479;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.0215139;OID=.;OPOS=1961725;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:39:18:21:18:18:0.461538:5:13:6:12:5:13:9:12
chr16	1962046	.	CG	TA	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0396752;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=103.494;QD=51.1846;RBI=0.08289;REFB=0;REVB=0.072778;RO=0;SAF=10;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.00183913;OID=.;OPOS=1962046;OREF=CG;OALT=TA;OMAPALT=TA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:10:10:0:0:10:10:0:0
chr16	1962132	.	G	A	214.47	PASS	AF=0.947368;AO=16;DP=19;FAO=18;FDP=19;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0636922;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=89.5733;QD=45.1518;RBI=0.0712538;REFB=-0.180384;REVB=0.0319438;RO=0;SAF=7;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.529379;STBP=0.331;TYPE=snp;VARB=0.00114892;OID=.;OPOS=1962132;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:19:19:0:1:16:18:0.947368:9:7:0:0:10:8:1:0
chr16	1990994	.	T	C	112.16	PASS	AF=0.283019;AO=15;DP=53;FAO=15;FDP=53;FR=.;FRO=38;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=0.00598604;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.389;QD=8.46464;RBI=0.00658087;REFB=-0.00703442;REVB=0.00273409;RO=38;SAF=5;SAR=10;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142056;STB=0.586548;STBP=0.402;TYPE=snp;VARB=0.0217955;OID=.;OPOS=1990994;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:38:38:15:15:0.283019:10:5:17:21:10:5:17:21
chr16	2013198	.	A	G	376.4	PASS	AF=0.535211;AO=38;DP=70;FAO=38;FDP=71;FR=.;FRO=33;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=22;FSRR=11;FWDB=-0.0159341;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.3125;QD=21.2058;RBI=0.0171559;REFB=-0.019865;REVB=0.00635848;RO=32;SAF=19;SAR=19;SRF=21;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129542;STB=0.577425;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.00793216;OID=.;OPOS=2013198;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:71:32:33:38:38:0.535211:19:19:21:11:19:19:22:11
chr16	2014283	.	A	G	102.13	PASS	AF=0.521739;AO=10;DP=21;FAO=12;FDP=23;FR=.;FRO=11;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=-0.0181946;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.693;QD=17.762;RBI=0.0466167;REFB=-0.0302531;REVB=0.0429194;RO=11;SAF=7;SAR=3;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151801;STB=0.518487;STBP=0.907;TYPE=snp;VARB=0.0289142;OID=.;OPOS=2014283;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:21:23:11:11:10:12:0.521739:3:7:6:5:5:7:6:5
chr16	2025657	.	C	T	42.23	PASS	AF=0.666667;AO=6;DP=9;FAO=6;FDP=9;FR=.;FRO=3;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0462332;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.414;QD=18.767;RBI=0.0565799;REFB=0.0758079;REVB=0.0326155;RO=3;SAF=3;SAR=3;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0941184;STB=0.555372;STBP=0.703;TYPE=snp;VARB=-0.0119525;OID=.;OPOS=2025657;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:9:9:3:3:6:6:0.666667:3:3:2:1:3:3:2:1
chr16	2088285	.	G	A	156.26	PASS	AF=0.425;AO=17;DP=40;FAO=17;FDP=40;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=18;FWDB=-0.0216573;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.79;QD=15.6259;RBI=0.040661;REFB=-0.015223;REVB=0.0344133;RO=23;SAF=8;SAR=9;SRF=5;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.261363;STB=0.648492;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.00670179;OID=.;OPOS=2088285;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:23:23:17:17:0.425:9:8:5:18:9:8:5:18
chr16	2143955	.	C	T	217.55	PASS	AF=0.552632;AO=21;DP=38;FAO=21;FDP=38;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=0.00408994;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=112.197;QD=22.8995;RBI=0.0297711;REFB=-0.0123777;REVB=0.0294888;RO=17;SAF=6;SAR=15;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00818939;STB=0.504583;STBP=0.978;TYPE=snp;VARB=0.00768923;OID=.;OPOS=2143955;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:17:17:21:21:0.552632:15:6:5:12:15:6:5:12
chr16	2257105	.	C	G	1108.3	PASS	AF=0.974026;AO=75;DP=77;FAO=75;FDP=77;FR=.;FRO=2;FSAF=36;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00206293;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=124.3;QD=57.5741;RBI=0.00803997;REFB=-0.0291139;REVB=-0.00777081;RO=2;SAF=36;SAR=39;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0236442;STB=0.512497;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=5.23688e-05;OID=.;OPOS=2257105;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:77:77:2:2:75:75:0.974026:39:36:0:2:39:36:0:2
chr16	2260567	.	C	T	1506.27	PASS	AF=0.980952;AO=101;DP=104;FAO=103;FDP=105;FR=.;FRO=2;FSAF=42;FSAR=61;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0225221;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=104.829;QD=57.3815;RBI=0.0386895;REFB=-0.0881039;REVB=0.0314584;RO=3;SAF=40;SAR=61;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154153;STB=0.501817;STBP=0.85;TYPE=snp;VARB=0.00074973;OID=.;OPOS=2260567;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:104:105:3:2:101:103:0.980952:61:40:2:1:61:42:1:1
chr16	2260612	.	T	C	655.67	PASS	AF=0.894737;AO=50;DP=56;FAO=51;FDP=57;FR=.;FRO=6;FSAF=20;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=-0.00951185;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.344;QD=46.012;RBI=0.00957108;REFB=-0.0130713;REVB=-0.00106311;RO=1;SAF=20;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0229535;STB=0.525154;STBP=0.26;TYPE=snp;VARB=0.000544891;OID=.;OPOS=2260612;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:56:57:1:6:50:51:0.894737:30:20:1:0:31:20:1:5
chr16	2263146	.	A	G	775.07	PASS	AF=1;AO=40;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=29;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0612563;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.7755;QD=63.2708;RBI=0.203782;REFB=0;REVB=0.194358;RO=0;SAF=28;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00274235;OID=.;OPOS=2263146;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:40:49:1:12:28:0:0:20:29:0:0
chr16	2263516	.	A	G	323.44	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0459282;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.4477;QD=53.9066;RBI=0.0469439;REFB=0;REVB=0.00971253;RO=0;SAF=6;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00150895;OID=.;OPOS=2263516;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:18:6:0:0:18:6:0:0
chr16	2282256	.	G	A	417.73	PASS	AF=0.967742;AO=12;DP=31;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.059369;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.8438;QD=53.9;RBI=0.28506;REFB=-0.0782193;REVB=0.278809;RO=0;SAF=5;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.523793;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=0.00552083;OID=.;OPOS=2282256;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:31:31:0:1:12:30:0.967742:7:5:0:0:10:20:0:1
chr16	2285357	.	C	T	651.82	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0131298;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.963;QD=62.0781;RBI=0.0529031;REFB=0;REVB=0.0512479;RO=0;SAF=22;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000119694;OID=.;OPOS=2285357;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:42:0:0:41:42:1:19:22:0:0:20:22:0:0
chr16	2305693	.	G	A	66.82	PASS	AF=0.428571;AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=-0.0259661;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.0416;QD=12.728;RBI=0.0412528;REFB=-0.0121813;REVB=0.0320554;RO=12;SAF=6;SAR=3;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.315875;STB=0.687091;STBP=0.148;TYPE=snp;VARB=0.0204917;OID=.;OPOS=2305693;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:21:21:12:12:9:9:0.428571:3:6:4:8:3:6:4:8
chr16	2331430	.	A	G	751.19	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00667128;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.941;QD=56.6935;RBI=0.00685363;REFB=0;REVB=-0.00157042;RO=0;SAF=33;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.0907e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.66169e-06;OID=.;OPOS=2331430;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:53:0:0:52:53:1:19:33:0:0:19:34:0:0
chr16	2358553	.	G	A	355.46	PASS	AF=0.62963;AO=34;DP=55;FAO=34;FDP=54;FR=.;FRO=20;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.0277872;FXX=0.0357079;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.068;QD=26.3307;RBI=0.0285262;REFB=-0.0215894;REVB=0.006451;RO=20;SAF=18;SAR=16;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0199255;STB=0.507654;STBP=0.906;TYPE=snp;VARB=0.017947;OID=.;OPOS=2358553;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:54:20:20:34:34:0.62963:16:18:10:10:16:18:11:9
chr16	2512523	.	G	A	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0498235;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.679;QD=46.848;RBI=0.105232;REFB=0;REVB=0.0926892;RO=0;SAF=5;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00203133;OID=.;OPOS=2512523;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:10:5:0:0:10:5:0:0
chr16	2581279	.	G	C	49.04	PASS	AF=0.333333;AO=5;DP=21;FAO=7;FDP=21;FR=.,HEALED;FRO=13;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=0.17967;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=26.4307;QD=9.34125;RBI=0.197818;REFB=-0.0291247;REVB=-0.0827689;RO=13;SAF=1;SAR=4;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.324286;STB=0.529329;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=0.0564947;OID=.;OPOS=2581279;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:21:21:13:13:5:7:0.333333:4:1:6:7:4:3:5:8
chr16	2766484	.	G	C	60.82	PASS	AF=0.333333;AO=8;DP=26;FAO=9;FDP=27;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.0366642;FXX=0.0689417;HRUN=3;LEN=1;MLLD=61.852;QD=9.01094;RBI=0.0403124;REFB=-0.00234778;REVB=-0.0167578;RO=17;SAF=3;SAR=5;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107891;STB=0.615122;STBP=0.412;TYPE=snp;VARB=0.00441732;OID=.;OPOS=2766484;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:60:26:27:17:18:8:9:0.333333:5:3:8:9:6:3:9:9
chr16	2766485	.	GGC	G	137.6	PASS	AF=0.9375;AO=10;DP=27;FAO=15;FDP=16;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.245389;FXX=0.359856;HRUN=3;LEN=2;MLLD=24.0851;QD=34.4009;RBI=0.290026;REFB=-0.133064;REVB=0.154594;RO=15;SAF=3;SAR=7;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.03914;STB=0.533289;STBP=0.559;TYPE=del;VARB=0.0785869;OID=.;OPOS=2766486;OREF=GC;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.9375:10:27:15:16:1:7:8:1:0:4:15:3:7:5:10
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chr16	2812939	.	C	A	117.62	PASS	AF=0.4375;AO=13;DP=31;FAO=14;FDP=32;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=14;FWDB=0.0814241;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.1935;QD=14.703;RBI=0.0921222;REFB=-0.0157112;REVB=0.0430887;RO=18;SAF=4;SAR=9;SRF=4;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105266;STB=0.545392;STBP=0.732;TYPE=snp;VARB=0.0246976;OID=.;OPOS=2812939;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:32:18:18:13:14:0.4375:9:4:4:14:10:4:4:14
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chr16	2821988	.	TC	T	137.82	PASS	AF=0.580645;AO=16;DP=29;FAO=18;FDP=31;FR=.;FRO=13;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.0598206;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=39.1189;QD=17.7832;RBI=0.0983452;REFB=0.0225795;REVB=-0.0780595;RO=13;SAF=11;SAR=5;SRF=8;SRR=5;SSEN=0.228917;SSEP=0;SSSB=0.0645261;STB=0.523783;STBP=0.793;TYPE=del;VARB=-0.0254536;OID=.;OPOS=2821989;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.580645:16:29:18:31:13:12:6:8:5:81:13:11:5:8:5
chr16	2871555	.	G	A	707.96	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0138675;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.535;QD=62.9293;RBI=0.0249681;REFB=0;REVB=0.0207629;RO=0;SAF=29;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.49331e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.34416e-05;OID=.;OPOS=2871555;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:16:29:0:0:16:29:0:0
chr16	2902974	.	CAGAGGT	C	175.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=18;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0226009;FXX=0.222099;HRUN=1;LEN=6;MLLD=232.3;QD=50.1315;RBI=0.0270164;REFB=0;REVB=0.0148014;RO=0;SAF=5;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000136606;OID=.;OPOS=2902975;OREF=AGAGGT;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:12:18:14:14:0:6:8:0:0:3:0:5:7:0:0
chr16	3064060	.	G	A	72.23	PASS	AF=0.692308;AO=7;DP=13;FAO=9;FDP=13;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.00277572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.088;QD=22.2243;RBI=0.0347889;REFB=-0.0537702;REVB=0.034678;RO=2;SAF=3;SAR=4;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.216951;STB=0.517203;STBP=0.907;TYPE=snp;VARB=0.0218609;OID=.;OPOS=3064060;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:13:13:2:4:7:9:0.692308:4:3:2:0:5:4:2:2
chr16	3065450	.	C	G	35.97	PASS	AF=0.0851064;AO=14;DP=143;FAO=12;FDP=141;FR=.;FRO=129;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=80;FSRR=49;FWDB=-0.0728416;FXX=0.0208319;HRUN=3;LEN=1;MLLD=83.9471;QD=1.02039;RBI=0.0830262;REFB=-0.00189821;REVB=-0.0398429;RO=122;SAF=1;SAR=13;SRF=79;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.631983;STB=0.936276;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0134103;OID=.;OPOS=3065450;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:143:141:122:129:14:12:0.0851064:13:1:79:43:11:1:80:49
chr16	3065455	.	ACCCCCCCG	ACCCCCCCC,ACCCCCCG,GACCCCCCG	104.93	PASS	AF=0,0.469027,0;AO=4,45,4;DP=108;FAO=0,53,0;FDP=113;FR=.;FRO=60;FSAF=0,26,0;FSAR=0,27,0;FSRF=33;FSRR=27;FWDB=-0.0395025,0.0251285,0.0616048;FXX=0.0173898;HRUN=1,7,1;LEN=1,1,2;MLLD=124.227,6.54919,17.6804;QD=3.71443;RBI=0.0414256,0.129244,0.102973;REFB=0.00851513,-0.140753,-0.0491366;REVB=-0.0124754,-0.126777,-0.0825121;RO=46;SAF=2,24,1;SAR=2,21,3;SRF=29;SRR=17;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.139264,-0.0895739,-0.381087;STB=0.5,0.53152,0.5;STBP=1,0.56,1;TYPE=snp,del,mnp;VARB=0,0.137057,0.0145596;OID=.,.,.;OPOS=3065463,3065456,3065455;OREF=G,C,AC;OALT=C,-,GA;OMAPALT=ACCCCCCCC,ACCCCCCG,GACCCCCCG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:108:113:46:60:4,45,4:0,53,0:0,0.469027,0:2,21,3:2,24,1:29:17:0,27,0:0,26,0:33:27
chr16	3065596	.	T	C	167.43	PASS	AF=0.586207;AO=17;DP=29;FAO=17;FDP=29;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=-0.0641569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.737;QD=23.0936;RBI=0.0649614;REFB=-0.00265908;REVB=0.010192;RO=12;SAF=8;SAR=9;SRF=2;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.230086;STB=0.62796;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.00118405;OID=.;OPOS=3065596;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:29:29:12:12:17:17:0.586207:9:8:2:10:9:8:2:10
chr16	3075999	.	C	G	514.38	PASS	AF=0.495413;AO=54;DP=109;FAO=54;FDP=109;FR=.;FRO=55;FSAF=26;FSAR=28;FSRF=20;FSRR=35;FWDB=0.00784554;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.653;QD=18.8763;RBI=0.0113736;REFB=-0.0202547;REVB=-0.00823441;RO=55;SAF=26;SAR=28;SRF=20;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108269;STB=0.559787;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=0.019186;OID=.;OPOS=3075999;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:109:55:55:54:54:0.495413:28:26:20:35:28:26:20:35
chr16	3079685	.	T	C	174.07	PASS	AF=0.68;AO=17;DP=24;FAO=17;FDP=25;FR=.;FRO=8;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=-0.0423463;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.2964;QD=27.8515;RBI=0.0425832;REFB=-0.0210129;REVB=-0.00448582;RO=7;SAF=11;SAR=6;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126622;STB=0.583692;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.00519204;OID=.;OPOS=3079685;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:24:25:7:8:17:17:0.68:6:11:6:1:6:11:7:1
chr16	3081085	.	G	A	63.02	PASS	AF=0.3;AO=9;DP=29;FAO=9;FDP=30;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.000968795;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=185.702;QD=8.40289;RBI=0.0148107;REFB=-0.0319212;REVB=-0.014779;RO=20;SAF=5;SAR=4;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00628668;STB=0.522338;STBP=0.945;TYPE=snp;VARB=0.046245;OID=.;OPOS=3081085;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:29:30:20:21:9:9:0.3:4:5:11:9:4:5:11:10
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chr16	3085375	.	G	A	655.73	PASS	AF=0.455782;AO=67;DP=148;FAO=67;FDP=147;FR=.;FRO=80;FSAF=31;FSAR=36;FSRF=42;FSRR=38;FWDB=0.0091293;FXX=0.0067563;HRUN=3;LEN=1;MLLD=173.206;QD=17.843;RBI=0.00913266;REFB=-0.0154202;REVB=0.000247839;RO=71;SAF=31;SAR=36;SRF=34;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0151264;STB=0.533919;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=0.0166623;OID=.;OPOS=3085375;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:148:147:71:80:67:67:0.455782:36:31:34:37:36:31:42:38
chr16	3086447	.	C	G	420.9	PASS	AF=0.602941;AO=35;DP=62;FAO=41;FDP=68;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=28;FSRF=9;FSRR=18;FWDB=0.0764279;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.067;QD=24.7587;RBI=0.0764306;REFB=-0.0148839;REVB=0.000636314;RO=26;SAF=8;SAR=27;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119063;STB=0.50741;STBP=0.909;TYPE=snp;VARB=0.00539497;OID=.;OPOS=3086447;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:68:26:27:35:41:0.602941:27:8:9:17:28:13:9:18
chr16	3108627	.	AG	A	49.52	PASS	AF=0.470588;AO=7;DP=16;FAO=8;FDP=17;FR=.;FRO=9;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=-0.0638405;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=21.2157;QD=11.6521;RBI=0.172859;REFB=-0.0220244;REVB=0.160639;RO=9;SAF=6;SAR=1;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0.313253;SSSB=0.590354;STB=0.860595;STBP=0.013;TYPE=del;VARB=0.0532433;OID=.;OPOS=3108628;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.470588:7:16:8:17:9:7:1:2:7:49:9:6:1:2:7
chr16	3163446	.	C	T	278.76	PASS	AF=0.54902;AO=28;DP=51;FAO=28;FDP=51;FR=.;FRO=23;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=0.00742102;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.756;QD=21.8638;RBI=0.0313972;REFB=-0.0265145;REVB=0.0305076;RO=23;SAF=18;SAR=10;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0298791;STB=0.516604;STBP=0.811;TYPE=snp;VARB=0.0150666;OID=.;OPOS=3163446;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:23:23:28:28:0.54902:10:18:14:9:10:18:14:9
chr16	3170188	.	C	T	82.56	PASS	AF=1;AO=8;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0639475;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=37.254;QD=36.6926;RBI=0.200491;REFB=0;REVB=0.19002;RO=0;SAF=2;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.58669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0217006;OID=.;OPOS=3170188;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:8:9:1:6:2:0:0:7:2:0:0
chr16	3200668	.	G	A	274.9	PASS	AF=0.336634;AO=33;DP=100;FAO=34;FDP=101;FR=.;FRO=67;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=27;FSRR=40;FWDB=0.024402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.983;QD=10.8873;RBI=0.0291877;REFB=-0.00426358;REVB=-0.0160145;RO=66;SAF=14;SAR=19;SRF=27;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0178748;STB=0.525832;STBP=0.725;TYPE=snp;VARB=0.00744313;OID=.;OPOS=3200668;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:101:66:67:33:34:0.336634:19:14:27:39:19:15:27:40
chr16	3207446	.	G	A	1415.43	PASS	AF=1;AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0304493;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=310.119;QD=62.9081;RBI=0.0311726;REFB=0;REVB=0.00667615;RO=0;SAF=47;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.16558e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.22902e-05;OID=.;OPOS=3207446;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:90:90:0:0:90:90:1:43:47:0:0:43:47:0:0
chr16	3208911	.	G	A	414.16	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0189137;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.088;QD=57.1254;RBI=0.029014;REFB=0;REVB=0.022002;RO=0;SAF=15;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00115168;OID=.;OPOS=3208911;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:14:15:0:0:14:15:0:0
chr16	3208914	.	T	C	421.45	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00557595;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=178.169;QD=56.1935;RBI=0.00782425;REFB=0;REVB=0.00548887;RO=0;SAF=16;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.56309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.56805e-05;OID=.;OPOS=3208914;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:14:16:0:0:14:16:0:0
chr16	3230588	.	G	A	410.85	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00155591;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.866;QD=56.6694;RBI=0.0059961;REFB=0;REVB=0.00579071;RO=0;SAF=17;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.31638e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.43161e-05;OID=.;OPOS=3230588;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:29:0:0:28:29:1:11:17:0:0:12:17:0:0
chr16	3241544	.	G	A	645.39	PASS	AF=0.412429;AO=71;DP=172;FAO=73;FDP=177;FR=.;FRO=104;FSAF=37;FSAR=36;FSRF=63;FSRR=41;FWDB=-0.000331063;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.5757;QD=14.5852;RBI=0.0407495;REFB=-0.0183117;REVB=-0.0407482;RO=101;SAF=36;SAR=35;SRF=63;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12275;STB=0.55821;STBP=0.206;TYPE=snp;VARB=0.0193671;OID=.;OPOS=3241544;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:172:177:101:104:71:73:0.412429:35:36:63:38:36:37:63:41
chr16	3254470	.	T	C	453.8	PASS	AF=0.969697;AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=33;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0205526;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.8368;QD=55.0058;RBI=0.0849468;REFB=0.00672059;REVB=-0.082423;RO=1;SAF=17;SAR=15;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0266731;STB=0.514277;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=-0.00184768;OID=.;OPOS=3254470;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:33:33:1:1:32:32:0.969697:15:17:1:0:15:17:1:0
chr16	3254972	.	T	C	1047.42	PASS	AF=0.986111;AO=70;DP=72;FAO=71;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0157539;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.225;QD=58.19;RBI=0.0192019;REFB=-0.023975;REVB=-0.0109785;RO=1;SAF=33;SAR=37;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0141118;STB=0.507244;STBP=0.331;TYPE=snp;VARB=0.000672346;OID=.;OPOS=3254972;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:72:72:1:1:70:71:0.986111:37:33:1:0:37:34:1:0
chr16	3266071	.	A	G	446.97	PASS	AF=1;AO=30;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103144;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.6238;QD=57.6734;RBI=0.0451554;REFB=0;REVB=-0.0439616;RO=0;SAF=14;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.56309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000595806;OID=.;OPOS=3266071;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:30:31:1:16:14:0:0:17:14:0:0
chr16	3297073	.	A	G	696.66	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0230547;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.23;QD=61.925;RBI=0.0239741;REFB=0;REVB=0.00657542;RO=0;SAF=25;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.65211e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000448912;OID=.;OPOS=3297073;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:45:0:0:43:45:1:18:25:0:0:20:25:0:0
chr16	3297175	.	T	C	1358.57	PASS	AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0244432;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.6619;QD=62.463;RBI=0.0426183;REFB=0;REVB=-0.0349119;RO=0;SAF=42;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.519e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000426935;OID=.;OPOS=3297175;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:45:42:0:0:45:42:0:0
chr16	3297181	.	C	T	1302.14	PASS	AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.02266;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.4567;QD=62.0066;RBI=0.0375182;REFB=0;REVB=0.0299022;RO=0;SAF=42;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000184283;OID=.;OPOS=3297181;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:42:42:0:0:42:42:0:0
chr16	3299749	.	G	A	1507.12	PASS	AF=0.990291;AO=102;DP=102;FAO=102;FDP=103;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.000257057;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.198;QD=58.5289;RBI=0.0396863;REFB=-0.0390068;REVB=0.0396854;RO=0;SAF=40;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.503999;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.000228867;OID=.;OPOS=3299749;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:102:103:0:1:102:102:0.990291:62:40:0:0:62:40:0:1
chr16	3304654	.	T	C	268.47	PASS	AF=0.355556;AO=31;DP=90;FAO=32;FDP=90;FR=.;FRO=58;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=31;FSRR=27;FWDB=0.0120931;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.23;QD=11.9322;RBI=0.0188981;REFB=-0.022748;REVB=-0.0145222;RO=58;SAF=17;SAR=14;SRF=31;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0157855;STB=0.518247;STBP=0.809;TYPE=snp;VARB=0.0450624;OID=.;OPOS=3304654;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:58:58:31:32:0.355556:14:17:31:27:14:18:31:27
chr16	3304762	.	A	G	377.58	PASS	AF=0.384615;AO=45;DP=117;FAO=45;FDP=117;FR=.;FRO=72;FSAF=19;FSAR=26;FSRF=38;FSRR=34;FWDB=-0.00492374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.034;QD=12.9086;RBI=0.00628964;REFB=-0.00428849;REVB=-0.00391362;RO=72;SAF=19;SAR=26;SRF=38;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114746;STB=0.565188;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=0.00830989;OID=.;OPOS=3304762;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:117:117:72:72:45:45:0.384615:26:19:38:34:26:19:38:34
chr16	3339435	.	G	C	229.68	PASS	AF=0.363636;AO=28;DP=77;FAO=28;FDP=77;FR=.;FRO=49;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=23;FSRR=26;FWDB=-0.00656131;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.273;QD=11.9315;RBI=0.00987085;REFB=-0.0128718;REVB=-0.00737447;RO=49;SAF=14;SAR=14;SRF=23;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0337734;STB=0.519467;STBP=0.794;TYPE=snp;VARB=0.0259398;OID=.;OPOS=3339435;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:49:49:28:28:0.363636:14:14:23:26:14:14:23:26
chr16	3340845	.	C	T	270.43	PASS	AF=0.355556;AO=32;DP=88;FAO=32;FDP=90;FR=.;FRO=58;FSAF=26;FSAR=6;FSRF=35;FSRR=23;FWDB=0.0225165;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.7416;QD=12.0189;RBI=0.0924553;REFB=-0.00648099;REVB=-0.0896716;RO=56;SAF=26;SAR=6;SRF=35;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.269223;STB=0.673093;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.00580281;OID=.;OPOS=3340845;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:90:56:58:32:32:0.355556:6:26:35:21:6:26:35:23
chr16	3367229	.	T	C	104.62	PASS	AF=0.571429;AO=12;DP=21;FAO=12;FDP=21;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.0141193;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.6193;QD=19.9283;RBI=0.0145086;REFB=0.0143129;REVB=-0.0033385;RO=9;SAF=4;SAR=8;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0902331;STB=0.551636;STBP=0.625;TYPE=snp;VARB=-0.0157316;OID=.;OPOS=3367229;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:21:21:9:9:12:12:0.571429:8:4:4:5:8:4:4:5
chr16	3405994	.	A	G	651.23	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0425375;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.377;QD=62.022;RBI=0.0435136;REFB=0;REVB=-0.009165;RO=0;SAF=20;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000200334;OID=.;OPOS=3405994;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:22:20:0:0:22:20:0:0
chr16	3406387	.	C	G	492.31	PASS	AF=1;AO=29;DP=35;FAO=36;FDP=36;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=0;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0331808;FXX=0.0526177;HRUN=2;LEN=1;MLLD=37.24;QD=54.7016;RBI=0.130567;REFB=0;REVB=-0.12628;RO=0;SAF=22;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0120892;OID=.;OPOS=3406387;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:35:36:0:0:29:36:1:7:22:0:0:14:22:0:0
chr16	3406454	.	C	T	229.96	PASS	AF=0.52381;AO=22;DP=43;FAO=22;FDP=42;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=0.0248096;FXX=0.0232504;HRUN=2;LEN=1;MLLD=253.153;QD=21.901;RBI=0.0262384;REFB=-0.0266568;REVB=-0.00854032;RO=20;SAF=10;SAR=12;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0469145;STB=0.526292;STBP=0.724;TYPE=snp;VARB=0.0229562;OID=.;OPOS=3406454;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:42:20:20:22:22:0.52381:12:10:8:12:12:10:8:12
chr16	3419934	.	G	T	786.92	PASS	AF=0.982456;AO=57;DP=57;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0238691;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.549;QD=55.2225;RBI=0.0239641;REFB=0.0324132;REVB=-0.00213194;RO=0;SAF=35;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507244;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=2.9124e-05;OID=.;OPOS=3419934;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:57:57:0:1:57:56:0.982456:22:35:0:0:22:34:1:0
chr16	3452193	.	T	G	724.13	PASS	AF=0.981132;AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00883297;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.2074;QD=54.6512;RBI=0.0465408;REFB=-0.0555807;REVB=0.0456949;RO=1;SAF=31;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0218994;STB=0.511623;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=0.0015563;OID=.;OPOS=3452193;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:53:53:1:1:52:52:0.981132:21:31:0:1:21:31:0:1
chr16	3486285	.	C	A	1989.62	PASS	AF=1;AO=127;DP=128;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00715644;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.566;QD=62.1757;RBI=0.0124771;REFB=0;REVB=0.0102208;RO=0;SAF=63;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.21543e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.82795e-06;OID=.;OPOS=3486285;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:128:128:0:0:127:128:1:64:63:0:0:64:64:0:0
chr16	3490922	.	G	C	487.51	PASS	AF=1;AO=33;DP=34;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0276236;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.8717;QD=59.0916;RBI=0.0355017;REFB=0;REVB=-0.0223004;RO=0;SAF=10;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000394608;OID=.;OPOS=3490922;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:33:0:0:33:33:1:23:10:0:0:23:10:0:0
chr16	3533577	.	C	G	377.74	PASS	AF=0.518987;AO=28;DP=81;FAO=41;FDP=79;FR=.,HEALED;FRO=38;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=24;FSRR=14;FWDB=0.0769148;FXX=0.0246883;HRUN=2;LEN=1;MLLD=32.5572;QD=19.126;RBI=0.108148;REFB=-0.0749699;REVB=0.0760263;RO=37;SAF=10;SAR=18;SRF=23;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.264447;STB=0.603631;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=0.103263;OID=.;OPOS=3533577;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:79:37:38:28:41:0.518987:18:10:23:14:24:17:24:14
chr16	3535028	.	G	A	234.0	PASS	AF=0.489362;AO=23;DP=47;FAO=23;FDP=47;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=0.0120201;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.102;QD=19.9146;RBI=0.0180403;REFB=-0.027115;REVB=0.0134524;RO=24;SAF=9;SAR=14;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0155675;STB=0.508764;STBP=0.899;TYPE=snp;VARB=0.0203164;OID=.;OPOS=3535028;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:24:24:23:23:0.489362:14:9:9:15:14:9:9:15
chr16	3535116	.	T	C	1896.39	PASS	AF=1;AO=123;DP=123;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0321884;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.8727;QD=61.6711;RBI=0.0334482;REFB=0;REVB=-0.00909337;RO=0;SAF=74;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.79611e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000114968;OID=.;OPOS=3535116;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:123:123:0:0:123:123:1:49:74:0:0:49:74:0:0
chr16	3536872	.	G	A	502.46	PASS	AF=1;AO=32;DP=33;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0287485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.828;QD=59.1125;RBI=0.0561349;REFB=0;REVB=0.0482147;RO=0;SAF=15;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000277174;OID=.;OPOS=3536872;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:34:0:0:32:34:1:17:15:0:0:18:16:0:0
chr16	3602227	.	AG	A	711.91	PASS	AF=0.984375;AO=60;DP=64;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.133531;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=24.656;QD=44.4942;RBI=0.224045;REFB=-0.019827;REVB=-0.179905;RO=1;SAF=25;SAR=35;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0132943;STB=0.506491;STBP=0.522;TYPE=del;VARB=-0.00363049;OID=.;OPOS=3602228;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:0.984375:60:64:63:64:1:25:38:0:1:9:1:25:35:0:1
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chr16	3781313	.	G	A	330.02	PASS	AF=0.486111;AO=35;DP=72;FAO=35;FDP=72;FR=.;FRO=37;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=0.0193035;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.236;QD=18.3347;RBI=0.031397;REFB=-0.0145561;REVB=0.0247617;RO=37;SAF=17;SAR=18;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0491867;STB=0.527431;STBP=0.678;TYPE=snp;VARB=0.0129576;OID=.;OPOS=3781313;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:37:37:35:35:0.486111:18:17:16:21:18:17:16:21
chr16	3795292	.	G	T	166.83	PASS	AF=0.409091;AO=18;DP=44;FAO=18;FDP=44;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=0.0383024;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.158;QD=15.1666;RBI=0.0396886;REFB=0.00105071;REVB=-0.0103978;RO=26;SAF=8;SAR=10;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134978;STB=0.577803;STBP=0.42;TYPE=snp;VARB=-0.00237371;OID=.;OPOS=3795292;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:26:26:18:18:0.409091:10:8:15:11:10:8:15:11
chr16	3795363	.	G	A	119.53	PASS	AF=0.4;AO=14;DP=35;FAO=14;FDP=35;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=6;FWDB=-0.0335047;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.983;QD=13.6606;RBI=0.0432742;REFB=-0.0152635;REVB=0.0273878;RO=21;SAF=5;SAR=9;SRF=15;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.35504;STB=0.705605;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=0.0208792;OID=.;OPOS=3795363;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:21:21:14:14:0.4:9:5:15:6:9:5:15:6
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chr16	4013467	.	C	T	449.66	PASS	AF=0.626866;AO=42;DP=68;FAO=42;FDP=67;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=29;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.00883921;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.624;QD=26.8454;RBI=0.0104793;REFB=-0.00180419;REVB=0.00562892;RO=25;SAF=13;SAR=29;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184287;STB=0.600871;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.00138131;OID=.;OPOS=4013467;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:67:25:25:42:42:0.626866:29:13:14:11:29:13:14:11
chr16	4015313	.	A	G	167.91	PASS	AF=0.418605;AO=18;DP=43;FAO=18;FDP=43;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=0.0079916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.168;QD=15.6194;RBI=0.00824254;REFB=-0.0129491;REVB=0.0020184;RO=24;SAF=12;SAR=6;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0456741;STB=0.517222;STBP=0.873;TYPE=snp;VARB=0.0129991;OID=.;OPOS=4015313;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:24:25:18:18:0.418605:6:12:15:9:6:12:16:9
chr16	4015316	.	A	G	156.04	PASS	AF=0.414634;AO=17;DP=42;FAO=17;FDP=41;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=-0.0178174;FXX=0.0238039;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.4216;QD=15.2238;RBI=0.0329822;REFB=-0.0104811;REVB=-0.0277554;RO=25;SAF=12;SAR=5;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0781197;STB=0.554389;STBP=0.578;TYPE=snp;VARB=0.0123885;OID=.;OPOS=4015316;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:41:25:24:17:17:0.414634:5:12:16:9:5:12:15:9
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chr16	4027605	.	C	T	145.59	PASS	AF=0.421053;AO=17;DP=39;FAO=16;FDP=38;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=0.0394326;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.0289;QD=15.3249;RBI=0.0397836;REFB=-0.0198568;REVB=-0.00527271;RO=21;SAF=5;SAR=12;SRF=15;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.39717;STB=0.709421;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.0344859;OID=.;OPOS=4027605;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:38:21:22:17:16:0.421053:12:5:15:6:11:5:15:7
chr16	4033436	.	T	C	38.57	PASS	AF=0.428571;AO=6;DP=14;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=-0.0403447;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=145.454;QD=11.0197;RBI=0.0404387;REFB=0.00527552;REVB=-0.00275631;RO=8;SAF=3;SAR=3;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.361323;STB=0.713701;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=-0.0060185;OID=.;OPOS=4033436;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:14:14:8:8:6:6:0.428571:3:3:1:7:3:3:1:7
chr16	4165432	.	T	C	339.69	PASS	AF=1;AO=24;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0241026;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.2792;QD=54.3508;RBI=0.109035;REFB=0;REVB=0.106337;RO=0;SAF=12;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00189991;OID=.;OPOS=4165432;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:24:25:1:12:12:0:0:13:12:0:0
chr16	4242005	.	GCCCCG	GCCCG,GCCCGC	50.4	PASS	AF=0.352941,0.0294118;AO=12,2;DP=33;FAO=12,1;FDP=34;FR=.;FRO=21;FSAF=8,1;FSAR=4,0;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=0.0460762,-0.0477836;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=1,2;MLLD=11.8048,149.493;QD=5.92924;RBI=0.112067,0.0745859;REFB=-0.135802,-0.00154293;REVB=-0.102156,-0.0572694;RO=16;SAF=5,2;SAR=7,0;SRF=7;SRR=9;SSEN=0,0;SSEP=0.340845,0;SSSB=-0.0208227,0.560396;STB=0.679703,0.991927;STBP=0.127,0.248;TYPE=del,mnp;VARB=0.171251,0.113124;OID=.,.;OPOS=4242006,4242009;OREF=C,CG;OALT=-,GC;OMAPALT=GCCCG,GCCCGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.352941,0.0294118:12,2:33:12,1:34:21:8,1:4,0:8:13:46:16:5,2:7,0:7:9
chr16	4245693	.	A	G	1026.39	PASS	AF=1;AO=68;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.03076;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.241;QD=59.501;RBI=0.0529065;REFB=0;REVB=0.0430455;RO=0;SAF=42;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000131942;OID=.;OPOS=4245693;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:68:69:1:26:42:0:0:27:42:0:0
chr16	4253261	.	C	T	257.76	PASS	AF=0.545455;AO=24;DP=44;FAO=24;FDP=44;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.0153259;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.038;QD=23.433;RBI=0.0274862;REFB=-0.0187081;REVB=-0.0228168;RO=20;SAF=12;SAR=12;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0407239;STB=0.522708;STBP=0.752;TYPE=snp;VARB=0.0159791;OID=.;OPOS=4253261;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:20:20:24:24:0.545455:12:12:11:9:12:12:11:9
chr16	4307646	.	A	G	1414.81	PASS	AF=1;AO=89;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103029;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.164;QD=62.8805;RBI=0.065115;REFB=0;REVB=0.0642947;RO=1;SAF=38;SAR=51;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.012308;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000533162;OID=.;OPOS=4307646;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:90:90:1:0:89:90:1:51:38:1:0:51:39:0:0
chr16	4310468	.	C	G	1488.58	PASS	AF=1;AO=91;DP=92;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0182441;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.133;QD=63.3439;RBI=0.0336368;REFB=0;REVB=0.0282593;RO=0;SAF=47;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.04952e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000259171;OID=.;OPOS=4310468;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:92:94:0:0:91:94:1:44:47:0:0:45:49:0:0
chr16	4386814	.	T	C	1246.02	PASS	AF=1;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00572906;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=288.558;QD=61.5321;RBI=0.00828722;REFB=0;REVB=0.00598798;RO=0;SAF=49;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.32002e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.20731e-07;OID=.;OPOS=4386814;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:81:0:0:81:81:1:32:49:0:0:32:49:0:0
chr16	4431202	.	A	G	2420.75	PASS	AF=1;AO=158;DP=158;FAO=158;FDP=158;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0496336;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.928;QD=61.2849;RBI=0.0496374;REFB=0;REVB=-0.000616045;RO=0;SAF=72;SAR=86;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.4078e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.04316e-05;OID=.;OPOS=4431202;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:158:158:0:0:158:158:1:86:72:0:0:86:72:0:0
chr16	4432029	.	A	C	785.87	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0519223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.545;QD=64.1523;RBI=0.0521234;REFB=0;REVB=-0.0045743;RO=0;SAF=6;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.49102e-05;OID=.;OPOS=4432029;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:43:6:0:0:43:6:0:0
chr16	4445327	.	C	G,T	770.44	PASS	AF=0.0545455,0.945455;AO=3,52;DP=55;FAO=3,52;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=3,32;FSAR=0,20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0101482,-0.00363483;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=14.2123,211.989;QD=56.032;RBI=0.0200426,0.00742019;REFB=0,0;REVB=-0.0172835,0.00646895;RO=0;SAF=3,32;SAR=0,20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-4.00761e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.110965,0.000394996;OID=.,.;OPOS=4445327,4445327;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:12:55:55:0:0:3,52:3,52:0.0545455,0.945455:0,20:3,32:0:0:0,20:3,32:0:0
chr16	4476089	.	T	C	745.5	PASS	AF=0.964286;AO=54;DP=57;FAO=54;FDP=56;FR=.;FRO=2;FSAF=26;FSAR=28;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0136515;FXX=0.0175408;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.151;QD=53.2499;RBI=0.0236652;REFB=-0.078817;REVB=0.0193307;RO=2;SAF=26;SAR=28;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0348761;STB=0.518512;STBP=0.245;TYPE=snp;VARB=0.00010734;OID=.;OPOS=4476089;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:57:56:2:2:54:54:0.964286:28:26:2:0:28:26:2:0
chr16	4484396	.	A	T	357.26	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0211608;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.0182;QD=54.9631;RBI=0.0358529;REFB=0;REVB=-0.0289422;RO=0;SAF=16;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00124037;OID=.;OPOS=4484396;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:26:0:0:25:26:1:9:16:0:0:9:17:0:0
chr16	4496973	.	T	A	1433.96	PASS	AF=1;AO=91;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0167663;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.849;QD=63.0312;RBI=0.0173245;REFB=0;REVB=-0.00436236;RO=0;SAF=41;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.20794e-06;OID=.;OPOS=4496973;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:91:91:0:0:91:91:1:50:41:0:0:50:41:0:0
chr16	4513722	.	G	A	451.24	PASS	AF=0.636364;AO=42;DP=66;FAO=42;FDP=66;FR=.;FRO=24;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=0.00548198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.392;QD=27.3476;RBI=0.0116033;REFB=-0.0281289;REVB=0.0102267;RO=22;SAF=23;SAR=19;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0276826;STB=0.528537;STBP=0.563;TYPE=snp;VARB=0.014714;OID=.;OPOS=4513722;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:22:24:42:42:0.636364:19:23:13:9:19:23:15:9
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chr16	4790273	.	G	A	230.37	PASS	AF=0.428571;AO=26;DP=62;FAO=27;FDP=63;FR=.;FRO=36;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=14;FSRR=22;FWDB=0.0227636;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.017;QD=14.6269;RBI=0.0846702;REFB=0.0124398;REVB=0.0815528;RO=36;SAF=9;SAR=17;SRF=14;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0472378;STB=0.534857;STBP=0.678;TYPE=snp;VARB=-0.0102655;OID=.;OPOS=4790273;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:63:36:36:26:27:0.428571:17:9:14:22:18:9:14:22
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chr16	4796393	.	A	G	296.43	PASS	AF=0.373626;AO=34;DP=92;FAO=34;FDP=91;FR=.;FRO=57;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=31;FSRR=26;FWDB=0.00222121;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.192;QD=13.0297;RBI=0.0303752;REFB=-0.00679032;REVB=0.0302938;RO=52;SAF=21;SAR=13;SRF=31;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0239898;STB=0.547798;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.0088357;OID=.;OPOS=4796393;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:91:52:57:34:34:0.373626:13:21:31:21:13:21:31:26
chr16	4797457	.	C	T	441.67	PASS	AF=0.420168;AO=50;DP=120;FAO=50;FDP=119;FR=.;FRO=69;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=35;FSRR=34;FWDB=0.0504638;FXX=0.00833264;HRUN=4;LEN=1;MLLD=50.5676;QD=14.8461;RBI=0.0518535;REFB=0.0188403;REVB=-0.0119247;RO=68;SAF=24;SAR=26;SRF=35;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0356014;STB=0.515797;STBP=0.762;TYPE=snp;VARB=-0.0267182;OID=.;OPOS=4797457;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:119:68:69:50:50:0.420168:26:24:35:33:26:24:35:34
chr16	4802386	.	G	T	482.95	PASS	AF=0.381944;AO=52;DP=141;FAO=55;FDP=144;FR=.;FRO=89;FSAF=19;FSAR=36;FSRF=37;FSRR=52;FWDB=0.0680061;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.0317;QD=13.4153;RBI=0.0782604;REFB=-0.0173524;REVB=0.0387281;RO=89;SAF=17;SAR=35;SRF=37;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10674;STB=0.54662;STBP=0.388;TYPE=snp;VARB=0.0304191;OID=.;OPOS=4802386;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:141:144:89:89:52:55:0.381944:35:17:37:52:36:19:37:52
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chr16	4930100	.	C	G,T	1454.15	PASS	AF=0.0531915,0.946809;AO=5,89;DP=94;FAO=5,89;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=1,47;FSAR=4,42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00163853,0.025287;FXX=0.0105252;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=27.4325,76.9209;QD=61.8786;RBI=0.0276931,0.0274851;REFB=0,0;REVB=-0.0276446,-0.0107704;RO=0;SAF=1,47;SAR=4,42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-5.28712e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0422736,0.0029916;OID=.,.;OPOS=4930100,4930100;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:13:94:94:0:0:5,89:5,89:0.0531915,0.946809:4,42:1,47:0:0:4,42:1,47:0:0
chr16	4935146	.	C	T	486.03	PASS	AF=0.567901;AO=46;DP=81;FAO=46;FDP=81;FR=.;FRO=35;FSAF=34;FSAR=12;FSRF=21;FSRR=14;FWDB=0.0245184;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.444;QD=24.0012;RBI=0.0415182;REFB=-0.0135533;REVB=-0.0335053;RO=35;SAF=34;SAR=12;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131568;STB=0.572506;STBP=0.203;TYPE=snp;VARB=0.00889446;OID=.;OPOS=4935146;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:35:35:46:46:0.567901:12:34:21:14:12:34:21:14
chr16	4935636	.	G	A	74.68	PASS	AF=0.357143;AO=10;DP=28;FAO=10;FDP=28;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=14;FWDB=-0.0653733;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.6781;QD=10.6681;RBI=0.0670402;REFB=0.000383401;REVB=-0.0148567;RO=18;SAF=3;SAR=7;SRF=4;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104859;STB=0.562383;STBP=0.715;TYPE=snp;VARB=-0.00618711;OID=.;OPOS=4935636;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:28:28:18:18:10:10:0.357143:7:3:4:14:7:3:4:14
chr16	4938160	.	T	G	1012.3	PASS	AF=0.985714;AO=69;DP=70;FAO=69;FDP=70;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0079092;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.503;QD=57.846;RBI=0.01375;REFB=0.0213049;REVB=-0.0112475;RO=0;SAF=37;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50769;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=-0.000211677;OID=.;OPOS=4938160;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:70:70:0:1:69:69:0.985714:32:37:0:0:32:37:0:1
chr16	4940809	.	A	G	1975.6	PASS	AF=1;AO=127;DP=128;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00794587;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.9477;QD=60.7878;RBI=0.0548636;REFB=0;REVB=-0.0542852;RO=0;SAF=51;SAR=76;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.42534e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.44092e-05;OID=.;OPOS=4940809;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:128:130:0:0:127:130:1:76:51:0:0:77:53:0:0
chr16	4944518	.	C	G	662.13	PASS	AF=1;AO=42;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0208293;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.399;QD=61.5938;RBI=0.0241674;REFB=0;REVB=-0.0122557;RO=0;SAF=25;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.98888e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000268696;OID=.;OPOS=4944518;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:42:43:1:17:25:0:0:18:25:0:0
chr16	4945687	.	G	T	654.92	PASS	AF=0.524194;AO=65;DP=124;FAO=65;FDP=124;FR=.;FRO=59;FSAF=37;FSAR=28;FSRF=35;FSRR=24;FWDB=0.0279444;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.227;QD=21.1265;RBI=0.045796;REFB=-0.0401944;REVB=-0.036282;RO=59;SAF=37;SAR=28;SRF=35;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0212493;STB=0.511672;STBP=0.787;TYPE=snp;VARB=0.0309883;OID=.;OPOS=4945687;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:124:124:59:59:65:65:0.524194:28:37:35:24:28:37:35:24
chr16	5074952	.	C	T	705.27	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00354042;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.814;QD=62.6906;RBI=0.0307876;REFB=0;REVB=0.0305833;RO=0;SAF=16;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.78016e-05;OID=.;OPOS=5074952;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:45:0:0:43:45:1:27:16:0:0:28:17:0:0
chr16	5075542	.	G	A	1419.62	PASS	AF=1;AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0166666;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.633;QD=63.0943;RBI=0.0199002;REFB=0;REVB=-0.010874;RO=0;SAF=43;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.16558e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.86668e-06;OID=.;OPOS=5075542;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:90:90:0:0:90:90:1:47:43:0:0:47:43:0:0
chr16	5128817	.	G	A	286.79	PASS	AF=0.476923;AO=30;DP=64;FAO=31;FDP=65;FR=.;FRO=34;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=0.0224303;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.098;QD=17.6483;RBI=0.0267013;REFB=-0.0178227;REVB=-0.014486;RO=34;SAF=17;SAR=13;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.063531;STB=0.542686;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.0204971;OID=.;OPOS=5128817;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:65:34:34:30:31:0.476923:13:17:17:17:13:18:17:17
chr16	5132636	.	C	T	431.47	PASS	AF=0.650794;AO=40;DP=62;FAO=41;FDP=63;FR=.;FRO=22;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=0.00705355;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.202;QD=27.395;RBI=0.0154297;REFB=-0.0379113;REVB=-0.013723;RO=19;SAF=16;SAR=24;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0450026;STB=0.510633;STBP=0.827;TYPE=snp;VARB=0.0181423;OID=.;OPOS=5132636;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:63:19:22:40:41:0.650794:24:16:9:10:23:18:9:13
chr16	5139186	.	G	C	340.73	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00287405;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.337;QD=54.5168;RBI=0.03433;REFB=0;REVB=0.0342095;RO=0;SAF=11;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000206547;OID=.;OPOS=5139186;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:14:11:0:0:14:11:0:0
chr16	5139217	.	C	G	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0124922;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=309.827;QD=53.2772;RBI=0.0134481;REFB=0;REVB=-0.00497971;RO=0;SAF=8;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.29341e-05;OID=.;OPOS=5139217;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:15:8:0:0:15:8:0:0
chr16	5140561	.	C	T	145.7	PASS	AF=0.333333;AO=19;DP=57;FAO=19;FDP=57;FR=.;FRO=38;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=26;FWDB=-0.011693;FXX=0.0338926;HRUN=3;LEN=1;MLLD=144.895;QD=10.2247;RBI=0.0121014;REFB=-0.00200776;REVB=-0.00311742;RO=36;SAF=8;SAR=11;SRF=12;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10274;STB=0.573569;STBP=0.466;TYPE=snp;VARB=0.00426319;OID=.;OPOS=5140561;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:36:38:19:19:0.333333:11:8:12:24:11:8:12:26
chr16	5649140	.	T	A,TTAGGAAA	446.75	PASS	AF=0,1;AO=2,29;DP=40;FAO=0,31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=0,11;FSAR=0,20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.006516,0.0199551;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,7;MLLD=42.1607,264.319;QD=57.6448;RBI=0.0100878,0.0243526;REFB=0,0;REVB=0.00770096,0.0139587;RO=9;SAF=0,11;SAR=2,18;SRF=9;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.819737,-0.267471;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,ins;VARB=0,6.70915e-05;OID=.,.;OPOS=5649140,5649141;OREF=T,-;OALT=A,TAGGAAA;OMAPALT=A,TTAGGAAA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	2/2:4:40:31:9:0:2,29:0,31:0,1:2,18:0,11:9:0:0,20:0,11:0:0
chr16	6923966	.	A	G	1208.83	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.031372;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.216;QD=61.2065;RBI=0.0320679;REFB=0;REVB=0.0066443;RO=0;SAF=44;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.37809e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000152186;OID=.;OPOS=6923966;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:35:44:0:0:35:44:0:0
chr16	7102036	.	CTTC	CCTC,CTC,CTCA	1434.21	PASS	AF=0.0176991,0.982301,0;AO=13,87,4;DP=111;FAO=2,111,0;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=0,61,0;FSAR=2,50,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0192369,-0.0486222,0.0154884;FXX=0.00877116;HRUN=2,2,2;LEN=1,1,2;MLLD=9.17679,20.7049,6.08362;QD=50.7685;RBI=0.0946687,0.108007,0.0467866;REFB=0,0,0;REVB=0.0926936,0.0964441,0.0441486;RO=4;SAF=1,54,0;SAR=12,33,4;SRF=2;SRR=2;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.382555,0.0106299,-0.719948;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=snp,del,mnp;VARB=0.0429276,7.9888e-05,0;OID=.,.,.;OPOS=7102037,7102037,7102038;OREF=T,T,TC;OALT=C,-,CA;OMAPALT=CCTC,CTC,CTCA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	2/2:0.0176991,0.982301,0:13,87,4:111:2,111,0:113:0:0,61,0:2,50,0:0:0:3:4:1,54,0:12,33,4:2:2
chr16	7760884	.	T	G	980.05	PASS	AF=1;AO=67;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00287152;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.2503;QD=57.6502;RBI=0.0174293;REFB=-0.0834846;REVB=0.0171912;RO=1;SAF=36;SAR=31;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129467;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.18482e-06;OID=.;OPOS=7760884;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:68:68:1:0:67:68:1:31:36:1:0:31:37:0:0
chr16	7761529	.	C	T	754.41	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00556965;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.201;QD=56.9362;RBI=0.0241544;REFB=0;REVB=0.0235035;RO=0;SAF=21;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.81969e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.60074e-05;OID=.;OPOS=7761529;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:32:21:0:0:32:21:0:0
chr16	8728953	.	C	T	1804.15	PASS	AF=1;AO=118;DP=118;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0167144;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.223;QD=61.1577;RBI=0.0195464;REFB=0;REVB=0.0101338;RO=0;SAF=42;SAR=76;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.28958e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.79818e-05;OID=.;OPOS=8728953;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:118:118:0:0:118:118:1:76:42:0:0:76:42:0:0
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chr16	8738499	.	G	A	1249.01	PASS	AF=1;AO=81;DP=82;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0132032;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.264;QD=61.6793;RBI=0.0139781;REFB=0;REVB=0.00458928;RO=0;SAF=50;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.35858e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.74897e-05;OID=.;OPOS=8738499;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:81:0:0:81:81:1:31:50:0:0:31:50:0:0
chr16	8738579	.	A	G	613.36	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0449316;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=235.467;QD=61.3363;RBI=0.0501415;REFB=0;REVB=0.0222559;RO=0;SAF=26;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000172997;OID=.;OPOS=8738579;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:14:26:0:0:14:26:0:0
chr16	8739954	.	G	A	1184.28	PASS	AF=1;AO=75;DP=77;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0170891;FXX=0.0246883;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.9948;QD=59.9637;RBI=0.0185979;REFB=0;REVB=0.00733786;RO=0;SAF=48;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.00823e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00505645;OID=.;OPOS=8739954;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:79:0:0:75:79:1:27:48:0:0:27:52:0:0
chr16	8740015	.	A	C	1150.05	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0114811;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.8411;QD=60.5289;RBI=0.0119711;REFB=0;REVB=-0.00338992;RO=0;SAF=51;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.14644e-05;OID=.;OPOS=8740015;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:25:51:0:0:25:51:0:0
chr16	8740418	.	T	C	1402.16	PASS	AF=0.989011;AO=90;DP=91;FAO=90;FDP=91;FR=.;FRO=1;FSAF=50;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0175462;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.629;QD=61.6335;RBI=0.0190741;REFB=-0.138191;REVB=0.00748011;RO=0;SAF=50;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.21981e-08;STB=0.506172;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=0.000330437;OID=.;OPOS=8740418;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:91:91:0:1:90:90:0.989011:40:50:0:0:40:50:0:1
chr16	8740503	.	G	A	884.26	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0412787;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.243;QD=57.9841;RBI=0.0551642;REFB=0;REVB=0.0365945;RO=0;SAF=34;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.31293e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.36397e-05;OID=.;OPOS=8740503;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:61:0:0:58:61:1:24:34:0:0:25:36:0:0
chr16	8839954	.	A	G	120.86	PASS	AF=0.424242;AO=14;DP=33;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.0160785;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.648;QD=14.6497;RBI=0.0348971;REFB=-0.00156109;REVB=-0.0309724;RO=19;SAF=6;SAR=8;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.045221;STB=0.526278;STBP=0.819;TYPE=snp;VARB=0.00185378;OID=.;OPOS=8839954;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:19:19:14:14:0.424242:8:6:9:10:8:6:9:10
chr16	8841960	.	T	C	317.15	PASS	AF=0.367347;AO=36;DP=97;FAO=36;FDP=98;FR=.;FRO=62;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=40;FWDB=0.00532098;FXX=0.0101;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.87;QD=12.9448;RBI=0.0124907;REFB=-0.0138627;REVB=0.0113007;RO=61;SAF=19;SAR=17;SRF=21;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.200656;STB=0.608369;STBP=0.128;TYPE=snp;VARB=0.0288545;OID=.;OPOS=8841960;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:98:61:62:36:36:0.367347:17:19:21:40:17:19:22:40
chr16	8844389	.	C	T	592.85	PASS	AF=0.595506;AO=53;DP=89;FAO=53;FDP=89;FR=.;FRO=36;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=0.0207117;FXX=0.0111099;HRUN=4;LEN=1;MLLD=52.6567;QD=26.6448;RBI=0.0208226;REFB=0.00660111;REVB=-0.00214607;RO=36;SAF=24;SAR=29;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0762042;STB=0.54158;STBP=0.331;TYPE=snp;VARB=-0.00277953;OID=.;OPOS=8844389;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:36:36:53:53:0.595506:29:24:20:16:29:24:20:16
chr16	8868776	.	C	A	1172.0	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0161675;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.716;QD=60.8831;RBI=0.0249691;REFB=0;REVB=0.0190281;RO=0;SAF=43;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.11157e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.54086e-06;OID=.;OPOS=8868776;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:34:43:0:0:34:43:0:0
chr16	8877832	.	C	T	143.54	PASS	AF=0.34;AO=14;DP=47;FAO=17;FDP=50;FR=.;FRO=33;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=-0.00787805;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.451;QD=11.483;RBI=0.00802499;REFB=0.00448911;REVB=-0.00152866;RO=31;SAF=11;SAR=3;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.4337;STB=0.70564;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=-0.00608112;OID=.;OPOS=8877832;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:50:31:33:14:17:0.34:3:11:13:18:5:12:13:20
chr16	8877854	.	C	G	692.79	PASS	AF=1;AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0318975;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.261;QD=62.9806;RBI=0.0399287;REFB=0;REVB=-0.0240177;RO=0;SAF=21;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.53419e-05;OID=.;OPOS=8877854;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:44:0:0:44:44:1:23:21:0:0:23:21:0:0
chr16	8948433	.	C	T	57.19	PASS	AF=0.571429;AO=7;DP=14;FAO=8;FDP=14;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.0339395;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.9081;QD=16.3404;RBI=0.0350118;REFB=-0.0189088;REVB=-0.00859855;RO=6;SAF=5;SAR=2;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.414385;STB=0.689206;STBP=0.168;TYPE=snp;VARB=0.0364677;OID=.;OPOS=8948433;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:14:14:6:6:7:8:0.571429:2:5:1:5:3:5:1:5
chr16	8952248	.	A	G	689.38	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00831021;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.64;QD=62.6711;RBI=0.00940144;REFB=0;REVB=0.0043963;RO=0;SAF=18;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.52154e-06;OID=.;OPOS=8952248;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:26:18:0:0:26:18:0:0
chr16	8953081	.	C	G	2315.58	PASS	AF=0.993197;AO=146;DP=147;FAO=146;FDP=147;FR=.;FRO=1;FSAF=77;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.014688;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=297.436;QD=63.0089;RBI=0.0217028;REFB=-0.030562;REVB=0.0159773;RO=1;SAF=77;SAR=69;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00684268;STB=0.503597;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=9.93229e-05;OID=.;OPOS=8953081;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:147:147:1:1:146:146:0.993197:69:77:0:1:69:77:0:1
chr16	8979046	.	A	G	1151.94	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00936515;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.794;QD=60.6283;RBI=0.0570161;REFB=0;REVB=-0.0562417;RO=0;SAF=42;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.6391e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000169076;OID=.;OPOS=8979046;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:34:42:0:0:34:42:0:0
chr16	9030444	.	C	G	874.4	PASS	AF=0.983871;AO=61;DP=63;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0190433;FXX=0.0158705;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.3174;QD=56.4128;RBI=0.0695675;REFB=-0.0477362;REVB=0.0669103;RO=0;SAF=35;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509431;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.000939863;OID=.;OPOS=9030444;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:63:62:0:1:61:61:0.983871:26:35:0:0:26:35:0:1
chr16	10524656	.	GGAC	G	141.88	PASS	AF=0.44898;AO=21;DP=49;FAO=22;FDP=49;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.0178095;FXX=0.019996;HRUN=2;LEN=3;MLLD=217.539;QD=11.5817;RBI=0.0178696;REFB=-0.0218583;REVB=-0.0014643;RO=25;SAF=12;SAR=9;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162969;STB=0.555505;STBP=0.479;TYPE=del;VARB=0.0253192;OID=.;OPOS=10524657;OREF=GAC;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.44898:21:49:22:49:27:12:10:12:15:99:25:12:9:10:15
chr16	10574796	.	C	T	116.16	PASS	AF=0.341463;AO=14;DP=41;FAO=14;FDP=41;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=-0.00594943;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=316.743;QD=11.3329;RBI=0.0223762;REFB=-0.000490832;REVB=-0.0215708;RO=27;SAF=9;SAR=5;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.296713;STB=0.675523;STBP=0.139;TYPE=snp;VARB=0.00105302;OID=.;OPOS=10574796;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:27:27:14:14:0.341463:5:9:10:17:5:9:10:17
chr16	10574813	.	G	A	154.82	PASS	AF=0.386364;AO=17;DP=44;FAO=17;FDP=44;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=18;FWDB=0.0122818;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.081;QD=14.0741;RBI=0.0125988;REFB=-0.00455544;REVB=-0.00280848;RO=27;SAF=12;SAR=5;SRF=9;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.386586;STB=0.724151;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.0115107;OID=.;OPOS=10574813;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:27:27:17:17:0.386364:5:12:9:18:5:12:9:18
chr16	10576102	.	C	T	39.05	PASS	AF=0.461538;AO=6;DP=13;FAO=6;FDP=13;FR=.;FRO=7;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.0301378;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.166;QD=12.0156;RBI=0.0600344;REFB=-0.00613126;REVB=-0.0519215;RO=7;SAF=1;SAR=5;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160904;STB=0.599629;STBP=0.636;TYPE=snp;VARB=0.00505244;OID=.;OPOS=10576102;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:13:13:7:7:6:6:0.461538:5:1:2:5:5:1:2:5
chr16	10590226	.	AT	A	50.02	PASS	AF=0.372093;AO=14;DP=44;FAO=16;FDP=43;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=0.0205112;FXX=0.0444346;HRUN=7;LEN=1;MLLD=7.73973;QD=4.65311;RBI=0.0633462;REFB=-0.0975617;REVB=0.0599336;RO=23;SAF=4;SAR=10;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.263109;STB=0.5916;STBP=0.363;TYPE=del;VARB=0.116595;OID=.;OPOS=10590227;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.372093:14:44:16:43:27:6:10:14:13:50:23:4:10:12:11
chr16	10989219	.	C	G	177.44	PASS	AF=0.37931;AO=22;DP=58;FAO=22;FDP=58;FR=.;FRO=36;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=0.0218581;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=59.9347;QD=12.2373;RBI=0.0302923;REFB=0.0238269;REVB=0.0209725;RO=36;SAF=10;SAR=12;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0786234;STB=0.545413;STBP=0.615;TYPE=snp;VARB=-0.0121296;OID=.;OPOS=10989219;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:36:36:22:22:0.37931:12:10:19:17:12:10:19:17
chr16	10995933	.	A	G	704.58	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0147752;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.651;QD=62.629;RBI=0.0614416;REFB=0;REVB=0.0596386;RO=0;SAF=22;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000193459;OID=.;OPOS=10995933;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:45:0:0:43:45:1:21:22:0:0:23:22:0:0
chr16	11002133	.	C	G	729.0	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0165721;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.582;QD=57.1762;RBI=0.0183964;REFB=0;REVB=-0.00798707;RO=0;SAF=30;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.0963e-05;OID=.;OPOS=11002133;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:21:30:0:0:21:30:0:0
chr16	11002904	.	G	A	1244.12	PASS	AF=1;AO=80;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0175605;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.5081;QD=60.6889;RBI=0.0670495;REFB=0;REVB=0.064709;RO=1;SAF=49;SAR=31;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0150268;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000399392;OID=.;OPOS=11002904;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:82:82:1:0:80:82:1:31:49:0:1:32:50:0:0
chr16	11002927	.	A	G	1232.7	PASS	AF=0.976471;AO=83;DP=85;FAO=83;FDP=85;FR=.;FRO=2;FSAF=50;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00410711;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.079;QD=58.0094;RBI=0.031824;REFB=-0.0213281;REVB=0.0315579;RO=2;SAF=50;SAR=33;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0278364;STB=0.514702;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=0.000497439;OID=.;OPOS=11002927;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:85:85:2:2:83:83:0.976471:33:50:0:2:33:50:0:2
chr16	11016045	.	C	T	351.37	PASS	AF=0.545455;AO=36;DP=66;FAO=36;FDP=66;FR=.;FRO=30;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=-0.00843204;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.208;QD=21.2949;RBI=0.0325486;REFB=-0.0367503;REVB=-0.0314374;RO=30;SAF=20;SAR=16;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0184544;STB=0.510198;STBP=0.88;TYPE=snp;VARB=0.0296942;OID=.;OPOS=11016045;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:30:30:36:36:0.545455:16:20:16:14:16:20:16:14
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chr16	11154770	.	G	A	279.89	PASS	AF=0.405063;AO=32;DP=79;FAO=32;FDP=79;FR=.;FRO=47;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=29;FSRR=18;FWDB=-0.00696483;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.224;QD=14.1716;RBI=0.0246324;REFB=-0.00791443;REVB=0.0236272;RO=47;SAF=18;SAR=14;SRF=29;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0585093;STB=0.533205;STBP=0.669;TYPE=snp;VARB=0.00732925;OID=.;OPOS=11154770;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:47:47:32:32:0.405063:14:18:29:18:14:18:29:18
chr16	11272388	.	G	C	99.96	PASS	AF=0.461538;AO=12;DP=26;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=3;FWDB=0.0251536;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.223;QD=15.3789;RBI=0.0405312;REFB=-0.0148767;REVB=-0.0317816;RO=14;SAF=8;SAR=4;SRF=11;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131584;STB=0.57564;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.0203119;OID=.;OPOS=11272388;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:26:14:14:12:12:0.461538:4:8:11:3:4:8:11:3
chr16	11367143	.	G	A	785.86	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0344309;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=312.154;QD=64.1519;RBI=0.0432255;REFB=0;REVB=0.0261334;RO=0;SAF=30;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.48867e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.2159e-05;OID=.;OPOS=11367143;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:19:30:0:0:19:30:0:0
chr16	11367154	.	C	T	747.1	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00206793;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.434;QD=63.5829;RBI=0.019576;REFB=0;REVB=0.0194665;RO=0;SAF=28;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000125443;OID=.;OPOS=11367154;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:19:28:0:0:19:28:0:0
chr16	11387117	.	A	G	1896.26	PASS	AF=1;AO=121;DP=123;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112471;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=227.146;QD=61.6671;RBI=0.0150553;REFB=0;REVB=-0.0100083;RO=0;SAF=36;SAR=85;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.1033e-06;OID=.;OPOS=11387117;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:123:123:0:0:121:123:1:85:36:0:0:85:38:0:0
chr16	11387164	.	T	C	1387.95	PASS	AF=0.988889;AO=88;DP=89;FAO=89;FDP=90;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0219711;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.187;QD=61.6866;RBI=0.0394046;REFB=-0.0400358;REVB=0.0327107;RO=0;SAF=25;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.503936;STBP=0.604;TYPE=snp;VARB=0.000138366;OID=.;OPOS=11387164;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:89:90:0:1:88:89:0.988889:63:25:0:0:63:26:0:1
chr16	11540712	.	T	C	753.15	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0866059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.746;QD=56.8411;RBI=0.0866074;REFB=0;REVB=-0.000506327;RO=0;SAF=17;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000244577;OID=.;OPOS=11540712;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:53:0:0:48:53:1:31:17:0:0:31:22:0:0
chr16	11541896	.	G	A	519.94	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0709163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.6654;QD=59.4212;RBI=0.0709242;REFB=0;REVB=-0.00105902;RO=0;SAF=18;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00129396;OID=.;OPOS=11541896;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:17:18:0:0:17:18:0:0
chr16	11542894	.	C	T	489.87	PASS	AF=0.489796;AO=48;DP=98;FAO=48;FDP=98;FR=.;FRO=50;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=20;FSRR=30;FWDB=0.0329567;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.257;QD=19.9946;RBI=0.0333369;REFB=-0.0197871;REVB=0.00502051;RO=50;SAF=24;SAR=24;SRF=20;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0920477;STB=0.550999;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.0236394;OID=.;OPOS=11542894;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:50:50:48:48:0.489796:24:24:20:30:24:24:20:30
chr16	11544509	.	C	G	297.43	PASS	AF=0.54;AO=27;DP=49;FAO=27;FDP=50;FR=.;FRO=23;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=-0.00565005;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=148.459;QD=23.7946;RBI=0.00679736;REFB=-0.0334994;REVB=0.00377903;RO=22;SAF=17;SAR=10;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0331718;STB=0.510261;STBP=0.886;TYPE=snp;VARB=0.0114875;OID=.;OPOS=11544509;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:50:22:23:27:27:0.54:10:17:13:9:10:17:14:9
chr16	11553883	.	C	G	358.26	PASS	AF=0.397959;AO=39;DP=98;FAO=39;FDP=98;FR=.;FRO=59;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=27;FSRR=32;FWDB=0.00847132;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=234.238;QD=14.6228;RBI=0.0150333;REFB=-0.0164935;REVB=-0.0124192;RO=59;SAF=17;SAR=22;SRF=27;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0233498;STB=0.513249;STBP=0.843;TYPE=snp;VARB=0.0239266;OID=.;OPOS=11553883;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:59:59:39:39:0.397959:22:17:27:32:22:17:27:32
chr16	11556014	.	G	C	538.39	PASS	AF=0.401361;AO=59;DP=146;FAO=59;FDP=147;FR=.;FRO=88;FSAF=31;FSAR=28;FSRF=42;FSRR=46;FWDB=-0.0224092;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.296;QD=14.6502;RBI=0.0234144;REFB=-0.0163993;REVB=0.00678688;RO=87;SAF=31;SAR=28;SRF=42;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.045145;STB=0.528805;STBP=0.583;TYPE=snp;VARB=0.0256673;OID=.;OPOS=11556014;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:146:147:87:88:59:59:0.401361:28:31:42:45:28:31:42:46
chr16	11556121	.	A	G	363.48	PASS	AF=0.407767;AO=42;DP=103;FAO=42;FDP=103;FR=.;FRO=61;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=27;FSRR=34;FWDB=-0.0331621;FXX=0.0190458;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.06;QD=14.1156;RBI=0.0379025;REFB=-0.0265142;REVB=-0.0183541;RO=60;SAF=22;SAR=20;SRF=26;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0940243;STB=0.547948;STBP=0.445;TYPE=snp;VARB=0.0343798;OID=.;OPOS=11556121;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:103:60:61:42:42:0.407767:20:22:26:34:20:22:27:34
chr16	11658459	.	A	AT	1025.48	PASS	AF=1;AO=65;DP=70;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.014319;FXX=0.0142837;HRUN=0;LEN=1;MLLD=166.702;QD=59.4481;RBI=0.0456504;REFB=0;REVB=-0.0433465;RO=1;SAF=29;SAR=36;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0129424;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-7.51746e-05;OID=.;OPOS=11658460;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:65:70:69:69:0:32:37:0:0:6:1:29:36:0:1
chr16	11770304	.	G	C	79.49	PASS	AF=0.5;AO=10;DP=19;FAO=10;FDP=20;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=-0.0952862;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.0363;QD=15.8978;RBI=0.110222;REFB=-0.0766371;REVB=-0.0554034;RO=9;SAF=6;SAR=4;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.300918;STB=0.646773;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=0.0333643;OID=.;OPOS=11770304;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:19:20:9:10:10:10:0.5:4:6:2:7:4:6:3:7
chr16	11770777	.	A	G	283.23	PASS	AF=0.609756;AO=25;DP=41;FAO=25;FDP=41;FR=.;FRO=16;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.0111848;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.756;QD=27.6317;RBI=0.0340776;REFB=-0.00158682;REVB=-0.0321898;RO=15;SAF=17;SAR=8;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155615;STB=0.576208;STBP=0.245;TYPE=snp;VARB=0.00066449;OID=.;OPOS=11770777;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:15:16:25:25:0.609756:8:17:7:8:8:17:8:8
chr16	11771094	.	C	G	195.07	PASS	AF=0.575758;AO=19;DP=34;FAO=19;FDP=33;FR=.;FRO=14;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=-0.0426142;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.3568;QD=23.6453;RBI=0.0439161;REFB=-0.0115538;REVB=-0.0106139;RO=14;SAF=12;SAR=7;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.309741;STB=0.672721;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.00638424;OID=.;OPOS=11771094;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:33:14:14:19:19:0.575758:7:12:3:11:7:12:3:11
chr16	11771353	.	C	A	163.57	PASS	AF=0.53125;AO=17;DP=32;FAO=17;FDP=32;FR=.;FRO=15;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=-0.00188369;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=167.068;QD=20.4458;RBI=0.0150596;REFB=-0.00893252;REVB=0.0149413;RO=12;SAF=10;SAR=7;SRF=10;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195298;STB=0.538417;STBP=0.693;TYPE=snp;VARB=0.00772262;OID=.;OPOS=11771353;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:12:15:17:17:0.53125:7:10:10:2:7:10:10:5
chr16	11772086	.	C	CAG,G	317.15	PASS	AF=0.5,0.08;AO=24,4;DP=51;FAO=25,4;FDP=50;FR=.;FRO=21;FSAF=16,3;FSAR=9,1;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=0.00457777,-0.0140198;FXX=0;HRUN=2,1;LEN=2,1;MLLD=183.001,137.039;QD=25.3718;RBI=0.00469833,0.0275374;REFB=-0.00866169,-0.00573734;REVB=0.00105752,0.0237013;RO=22;SAF=15,3;SAR=9,1;SRF=9;SRR=13;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.186198,0.378521;STB=0.619622,0.791096;STBP=0.082,0.288;TYPE=ins,snp;VARB=0.00451695,0.0330827;OID=.,.;OPOS=11772087,11772086;OREF=-,C;OALT=AG,G;OMAPALT=CAG,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:50:22:21:24,4:25,4:0.5,0.08:9,1:15,3:9:13:9,1:16,3:8:13
chr16	11772213	.	A	G	677.7	PASS	AF=0.554622;AO=66;DP=119;FAO=66;FDP=119;FR=.;FRO=53;FSAF=30;FSAR=36;FSRF=20;FSRR=33;FWDB=0.0255834;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.0646;QD=22.7799;RBI=0.0260578;REFB=-0.0168909;REVB=-0.00494992;RO=53;SAF=30;SAR=36;SRF=20;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0638172;STB=0.534873;STBP=0.421;TYPE=snp;VARB=0.0140228;OID=.;OPOS=11772213;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:119:53:53:66:66:0.554622:36:30:20:33:36:30:20:33
chr16	11772230	.	C	A	678.5	PASS	AF=0.55;AO=66;DP=120;FAO=66;FDP=120;FR=.;FRO=54;FSAF=31;FSAR=35;FSRF=21;FSRR=33;FWDB=0.00640086;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.423;QD=22.6165;RBI=0.00918312;REFB=-0.0148583;REVB=0.00658473;RO=54;SAF=31;SAR=35;SRF=21;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0670167;STB=0.536649;STBP=0.389;TYPE=snp;VARB=0.0132122;OID=.;OPOS=11772230;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:120:54:54:66:66:0.55:35:31:21:33:35:31:21:33
chr16	11772600	.	T	A,TTCTGA	210.81	PASS	AF=0.133333,0.355556;AO=6,15;DP=47;FAO=6,16;FDP=45;FR=.;FRO=23;FSAF=3,12;FSAR=3,4;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.000572893,0.0012584;FXX=0;HRUN=6,6;LEN=1,5;MLLD=77.07,248.27;QD=18.7389;RBI=0.0172556,0.0134657;REFB=-0.0159953,-0.00974271;REVB=-0.0172461,-0.0134067;RO=26;SAF=3,11;SAR=3,4;SRF=12;SRR=14;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0455768,0.308481;STB=0.517184,0.675822;STBP=0.936,0.093;TYPE=snp,ins;VARB=-0.00995716,0.0177306;OID=.,.;OPOS=11772600,11772601;OREF=T,-;OALT=A,TCTGA;OMAPALT=A,TTCTGA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:47:45:26:23:6,15:6,16:0.133333,0.355556:3,4:3,11:12:14:3,4:3,12:11:12
chr16	11772854	.	A	G	275.63	PASS	AF=0.531915;AO=25;DP=47;FAO=25;FDP=47;FR=.;FRO=22;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=0.0449611;FXX=0.040808;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.9468;QD=23.458;RBI=0.0449653;REFB=-0.0289024;REVB=-0.000611047;RO=21;SAF=11;SAR=14;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0689383;STB=0.549448;STBP=0.477;TYPE=snp;VARB=0.027632;OID=.;OPOS=11772854;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:21:22:25:25:0.531915:14:11:11:10:14:11:12:10
chr16	11773662	.	C	G	181.53	PASS	AF=0.6;AO=18;DP=30;FAO=18;FDP=30;FR=.;FRO=12;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.00117681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.482;QD=24.2043;RBI=0.0621451;REFB=-0.00936879;REVB=-0.0621339;RO=12;SAF=10;SAR=8;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0201631;STB=0.511266;STBP=0.911;TYPE=snp;VARB=0.00401446;OID=.;OPOS=11773662;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:30:30:12:12:18:18:0.6:8:10:7:5:8:10:7:5
chr16	11782223	.	G	A	752.48	PASS	AF=0.496599;AO=73;DP=150;FAO=73;FDP=147;FR=.;FRO=74;FSAF=47;FSAR=26;FSRF=39;FSRR=35;FWDB=-0.0132569;FXX=0.0199987;HRUN=3;LEN=1;MLLD=90.398;QD=20.4757;RBI=0.0169171;REFB=-0.0401757;REVB=-0.0105092;RO=74;SAF=47;SAR=26;SRF=39;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111916;STB=0.561809;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=0.0392347;OID=.;OPOS=11782223;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:150:147:74:74:73:73:0.496599:26:47:39:35:26:47:39:35
chr16	11844655	.	C	A	38.15	PASS	AF=0.4;AO=6;DP=15;FAO=6;FDP=15;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=8;FWDB=0.0208626;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=54.5504;QD=10.1728;RBI=0.0593323;REFB=0.00303477;REVB=0.0555434;RO=9;SAF=2;SAR=4;SRF=1;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.280298;STB=0.66622;STBP=0.4;TYPE=snp;VARB=0.00286856;OID=.;OPOS=11844655;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:15:15:9:9:6:6:0.4:4:2:1:8:4:2:1:8
chr16	11852354	.	A	C	144.87	PASS	AF=0.432432;AO=16;DP=37;FAO=16;FDP=37;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=3;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=0.0424628;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.0893;QD=15.6618;RBI=0.0453243;REFB=0.0207195;REVB=0.0158492;RO=21;SAF=13;SAR=3;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198346;STB=0.615953;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=-0.0248477;OID=.;OPOS=11852354;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:21:21:16:16:0.432432:3:13:14:7:3:13:14:7
chr16	11940390	.	T	C	336.74	PASS	AF=0.625;AO=28;DP=46;FAO=30;FDP=48;FR=.;FRO=18;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=5;FSRR=13;FWDB=-4.34946e-05;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.307;QD=28.0615;RBI=8.50035e-05;REFB=-0.0117288;REVB=7.3033e-05;RO=18;SAF=13;SAR=15;SRF=5;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134817;STB=0.583279;STBP=0.151;TYPE=snp;VARB=0.011966;OID=.;OPOS=11940390;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:48:18:18:28:30:0.625:15:13:5:13:15:15:5:13
chr16	11969724	.	G	C	275.93	PASS	AF=0.330275;AO=36;DP=109;FAO=36;FDP=109;FR=.;FRO=73;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=26;FSRR=47;FWDB=-0.019143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.214;QD=10.1259;RBI=0.0286786;REFB=-0.00532774;REVB=-0.0213543;RO=71;SAF=16;SAR=20;SRF=25;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109102;STB=0.560637;STBP=0.416;TYPE=snp;VARB=0.0151082;OID=.;OPOS=11969724;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:109:71:73:36:36:0.330275:20:16:25:46:20:16:26:47
chr16	12009279	.	A	G	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0114189;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.704;QD=37.4885;RBI=0.0340854;REFB=0;REVB=0.0321157;RO=0;SAF=6;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.58669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000323921;OID=.;OPOS=12009279;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:2:6:0:0:2:6:0:0
chr16	12009304	.	C	A	126.57	PASS	AF=0.764706;AO=13;DP=17;FAO=13;FDP=17;FR=.;FRO=4;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0316265;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=227.704;QD=29.7802;RBI=0.0316347;REFB=-0.052567;REVB=0.000720537;RO=4;SAF=7;SAR=6;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0162773;STB=0.509077;STBP=0.928;TYPE=snp;VARB=0.0184747;OID=.;OPOS=12009304;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:17:17:4:4:13:13:0.764706:6:7:2:2:6:7:2:2
chr16	12027474	.	CAT	C,CGT	287.54	PASS	AF=1,0;AO=20,2;DP=23;FAO=22,0;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=5,0;FSAR=17,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0756373,0.0634354;FXX=0.0434594;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=228.691,51.5592;QD=52.2793;RBI=0.0771167,0.0778138;REFB=0,0;REVB=0.0150325,-0.045066;RO=0;SAF=3,1;SAR=17,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.000192116,0;OID=.,.;OPOS=12027475,12027475;OREF=AT,A;OALT=-,G;OMAPALT=C,CGT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1,0:20,2:23:22,0:22:0:5,0:17,0:0:0:4:0:3,1:17,1:0:0
chr16	12060163	.	A	G	1048.1	PASS	AF=0.986111;AO=71;DP=72;FAO=71;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0255822;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=212.524;QD=58.2279;RBI=0.0327555;REFB=-0.129647;REVB=0.0204566;RO=1;SAF=30;SAR=41;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0155009;STB=0.508194;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=0.000462458;OID=.;OPOS=12060163;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:72:72:1:1:71:71:0.986111:41:30:1:0:41:30:1:0
chr16	12061606	.	G	A	529.24	PASS	AF=0.730159;AO=46;DP=63;FAO=46;FDP=63;FR=.;FRO=17;FSAF=29;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=-0.0390546;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.0225;QD=33.6026;RBI=0.0557161;REFB=-0.0296175;REVB=0.039737;RO=17;SAF=29;SAR=17;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00894024;STB=0.504823;STBP=0.911;TYPE=snp;VARB=0.00868577;OID=.;OPOS=12061606;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:17:17:46:46:0.730159:17:29:11:6:17:29:11:6
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chr16	15091601	.	G	C	59.4	PASS	AF=0.533333;AO=8;DP=15;FAO=8;FDP=15;FR=.;FRO=7;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=-0.00626695;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.441;QD=15.839;RBI=0.00629858;REFB=-0.00679004;REVB=-0.000630439;RO=7;SAF=6;SAR=2;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.379034;STB=0.72356;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=0.00751907;OID=.;OPOS=15091601;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:15:15:7:7:8:8:0.533333:2:6:2:5:2:6:2:5
chr16	15095675	.	C	A	269.51	PASS	AF=0.508772;AO=29;DP=56;FAO=29;FDP=57;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=-0.0103216;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.7661;QD=18.9132;RBI=0.0264904;REFB=-0.0261932;REVB=-0.0243968;RO=27;SAF=9;SAR=20;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.283059;STB=0.66655;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.0142057;OID=.;OPOS=15095675;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:57:27:28:29:29:0.508772:20:9:17:10:20:9:18:10
chr16	15098047	.	C	G	526.7	PASS	AF=0.569767;AO=49;DP=86;FAO=49;FDP=86;FR=.;FRO=37;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=15;FSRR=22;FWDB=0.00973323;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=287.261;QD=24.4975;RBI=0.0123217;REFB=-0.00420563;REVB=-0.00755572;RO=37;SAF=27;SAR=22;SRF=15;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11405;STB=0.562475;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.00264241;OID=.;OPOS=15098047;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:37:37:49:49:0.569767:22:27:15:22:22:27:15:22
chr16	15110077	.	C	T	133.45	PASS	AF=0.441176;AO=15;DP=34;FAO=15;FDP=34;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=0.046398;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.9675;QD=15.7004;RBI=0.0467187;REFB=0.000217109;REVB=0.00546523;RO=19;SAF=6;SAR=9;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.269944;STB=0.654973;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=0.000866071;OID=.;OPOS=15110077;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:19:19:15:15:0.441176:9:6:13:6:9:6:13:6
chr16	15111218	.	C	T	546.27	PASS	AF=0.685714;AO=48;DP=70;FAO=48;FDP=70;FR=.;FRO=22;FSAF=29;FSAR=19;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.00211728;FXX=0.0140825;HRUN=3;LEN=1;MLLD=116.249;QD=31.2153;RBI=0.0288744;REFB=-0.00430903;REVB=-0.0287967;RO=22;SAF=29;SAR=19;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0888771;STB=0.54815;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=0.00212416;OID=.;OPOS=15111218;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:22:22:48:48:0.685714:19:29:10:12:19:29:10:12
chr16	15116625	.	G	T	852.56	PASS	AF=1;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159044;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.326;QD=57.8005;RBI=0.0159307;REFB=0;REVB=-0.000913755;RO=0;SAF=20;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000335548;OID=.;OPOS=15116625;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:59:0:0:59:59:1:39:20:0:0:39:20:0:0
chr16	15129970	.	A	G	744.36	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0233404;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.032;QD=63.3495;RBI=0.0248361;REFB=0;REVB=-0.0084888;RO=0;SAF=20;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000102492;OID=.;OPOS=15129970;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:47:0:0:46:47:1:26:20:0:0:26:21:0:0
chr16	15131962	.	A	G	713.33	PASS	AF=1;AO=46;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0268159;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=51.0568;QD=54.8715;RBI=0.0269888;REFB=0;REVB=-0.00305046;RO=0;SAF=18;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.06241e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00160365;OID=.;OPOS=15131962;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:46:52:1:28:18:0:0:29:23:0:0
chr16	15131974	.	G	T	708.3	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.015095;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.9994;QD=62.9601;RBI=0.0177611;REFB=0;REVB=-0.00935948;RO=0;SAF=18;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000261109;OID=.;OPOS=15131974;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:27:18:0:0:27:18:0:0
chr16	15133889	.	T	G	2318.36	PASS	AF=0.993197;AO=144;DP=146;FAO=146;FDP=147;FR=.;FRO=1;FSAF=77;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0307339;FXX=0.0067563;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.665;QD=63.0845;RBI=0.0362501;REFB=0.00825313;REVB=0.0192222;RO=0;SAF=76;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.503597;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=2.8936e-05;OID=.;OPOS=15133889;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:146:147:0:1:144:146:0.993197:68:76:0:0:69:77:0:1
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chr16	15221225	.	G	A	34.83	PASS	AF=0.833333;AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.000599172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.817;QD=23.2172;RBI=0.149953;REFB=-0.0234526;REVB=0.149952;RO=1;SAF=3;SAR=2;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169284;STB=0.599598;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.00677878;OID=.;OPOS=15221225;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:6:6:1:1:5:5:0.833333:2:3:0:1:2:3:0:1
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chr16	15971028	.	C	A,G	820.52	PASS	AF=0.0517241,0.948276;AO=3,56;DP=59;FAO=3,55;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=0,20;FSAR=3,35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0269643,-0.0173725;FXX=0.0169463;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=35.5359,64.0752;QD=56.5874;RBI=0.0276259,0.0272605;REFB=0,0;REVB=0.00600959,0.0210078;RO=0;SAF=0,21;SAR=3,35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.129394,0.000226076;OID=.,.;OPOS=15971028,15971028;OREF=C,C;OALT=A,G;OMAPALT=A,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:10:59:58:0:0:3,56:3,55:0.0517241,0.948276:3,35:0,21:0:0:3,35:0,20:0:0
chr16	15973653	.	TG	AT,TT	694.51	PASS	AF=0.4375,0.5625;AO=18,28;DP=48;FAO=21,27;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=11,11;FSAR=10,16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0413688,0.0149614;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=142.043,148.707;QD=57.8755;RBI=0.0781434,0.0348892;REFB=0,0;REVB=0.0662948,0.0315185;RO=0;SAF=10,11;SAR=8,17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.31638e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0630258,-0.00192332;OID=.,.;OPOS=15973653,15973654;OREF=TG,G;OALT=AT,T;OMAPALT=AT,TT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:48:48:0:0:18,28:21,27:0.4375,0.5625:8,17:10,11:0:0:10,16:11,11:0:0
chr16	16162019	.	T	C	1121.42	PASS	AF=1;AO=71;DP=72;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0386863;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.0526;QD=59.809;RBI=0.117732;REFB=0;REVB=0.111194;RO=1;SAF=49;SAR=22;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0210058;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00158764;OID=.;OPOS=16162019;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:75:1:0:71:75:1:22:49:0:1:25:50:0:0
chr16	16271357	.	T	C	1695.22	PASS	AF=1;AO=112;DP=112;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00777742;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.992;QD=60.5435;RBI=0.0125221;REFB=0;REVB=-0.00981396;RO=0;SAF=63;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.39806e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.41934e-05;OID=.;OPOS=16271357;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:112:112:0:0:112:112:1:49:63:0:0:49:63:0:0
chr16	16272670	.	T	C	1167.4	PASS	AF=0.987342;AO=60;DP=79;FAO=78;FDP=79;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=41;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0348241;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.8558;QD=59.1087;RBI=0.17865;REFB=-0.0964875;REVB=0.175224;RO=1;SAF=41;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.024187;STB=0.506665;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=0.0040121;OID=.;OPOS=16272670;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:79:79:1:1:60:78:0.987342:19:41:0:1:37:41:0:1
chr16	16291983	.	A	G	701.59	PASS	AF=0.44186;AO=76;DP=171;FAO=76;FDP=172;FR=.;FRO=96;FSAF=28;FSAR=48;FSRF=50;FSRR=46;FWDB=-0.00310353;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.107;QD=16.316;RBI=0.00866326;REFB=-0.0025396;REVB=-0.00808827;RO=94;SAF=28;SAR=48;SRF=50;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165876;STB=0.587179;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=0.00266379;OID=.;OPOS=16291983;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:171:172:94:96:76:76:0.44186:48:28:50:44:48:28:50:46
chr16	16468294	.	C	T	317.62	PASS	AF=0.371134;AO=36;DP=97;FAO=36;FDP=97;FR=.;FRO=61;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=33;FSRR=28;FWDB=0.0108396;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.918;QD=13.0976;RBI=0.0146029;REFB=-0.0112413;REVB=0.00978517;RO=61;SAF=20;SAR=16;SRF=33;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0161697;STB=0.509254;STBP=0.886;TYPE=snp;VARB=0.0210911;OID=.;OPOS=16468294;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:61:61:36:36:0.371134:16:20:33:28:16:20:33:28
chr16	17196433	.	G	C	195.89	PASS	AF=0.612903;AO=19;DP=31;FAO=19;FDP=31;FR=.;FRO=12;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.014098;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.294;QD=25.2762;RBI=0.0141722;REFB=0.0410328;REVB=-0.00144826;RO=12;SAF=10;SAR=9;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0760094;STB=0.542328;STBP=0.556;TYPE=snp;VARB=-0.00271674;OID=.;OPOS=17196433;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:31:31:12:12:19:19:0.612903:9:10:5:7:9:10:5:7
chr16	17196621	.	A	AT,ATTC	165.39	PASS	AF=0.037037,0.592593;AO=3,3;DP=29;FAO=1,16;FDP=27;FR=.;FRO=10;FSAF=0,13;FSAR=1,3;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.103887,0.0548724;FXX=0.0357015;HRUN=8,8;LEN=1,3;MLLD=3.93032,254.644;QD=24.5016;RBI=0.20252,0.055592;REFB=-0.1258,-0.0460988;REVB=0.173845,-0.00891536;RO=21;SAF=0,2;SAR=3,1;SRF=14;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.659434,0;STB=0.985759,0.730018;STBP=0.542,0.01;TYPE=ins,ins;VARB=0.0850581,0.0235687;OID=.,.;OPOS=17196622,17196622;OREF=-,-;OALT=T,TTC;OMAPALT=AT,ATTC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0.037037,0.592593:3,3:29:1,16:27:10:0,13:1,3:3:7:48:21:0,2:3,1:14:7
chr16	17196622	.	T	TTC	109.78	PASS	AF=0.481481;AO=9;DP=27;FAO=13;FDP=27;FR=.;FRO=14;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.0106136;FXX=0.0357015;HRUN=8;LEN=2;MLLD=302.891;QD=16.264;RBI=0.0132058;REFB=-0.0196709;REVB=-0.00785781;RO=17;SAF=8;SAR=1;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.533097;STB=0.790354;STBP=0.012;TYPE=ins;VARB=0.0137378;OID=.;OPOS=17196623;OREF=-;OALT=TC;OMAPALT=TTC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.481481:9:27:13:27:14:11:2:5:9:99:17:8:1:8:9
chr16	17196623	.	T	TC	38.9	PASS	AF=0.269231;AO=5;DP=30;FAO=7;FDP=26;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.0154607;FXX=0.0714031;HRUN=0;LEN=1;MLLD=287.727;QD=5.98488;RBI=0.0206101;REFB=5.46587e-05;REVB=0.0136288;RO=25;SAF=4;SAR=1;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.309732;STB=0.64662;STBP=0.402;TYPE=ins;VARB=-0.00604444;OID=.;OPOS=17196624;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.269231:5:30:7:26:19:5:2:10:9:38:25:4:1:14:11
chr16	18819968	.	A	T	440.53	PASS	AF=0.650794;AO=41;DP=63;FAO=41;FDP=63;FR=.;FRO=22;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.020423;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.8808;QD=27.9704;RBI=0.0446927;REFB=0.0240963;REVB=0.0397535;RO=20;SAF=17;SAR=24;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112694;STB=0.56203;STBP=0.216;TYPE=snp;VARB=-0.0112061;OID=.;OPOS=18819968;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:20:22:41:41:0.650794:24:17:12:8:24:17:13:9
chr16	18823379	.	T	C	1354.86	PASS	AF=0.967391;AO=79;DP=95;FAO=89;FDP=92;FR=.,HEALED;FRO=3;FSAF=42;FSAR=47;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0241998;FXX=0.0212743;HRUN=7;LEN=1;MLLD=187.649;QD=58.9071;RBI=0.0242636;REFB=-0.149715;REVB=-0.00175936;RO=4;SAF=35;SAR=44;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00525418;STB=0.506365;STBP=0.467;TYPE=snp;VARB=0.0001765;OID=.;OPOS=18823379;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:95:92:4:3:79:89:0.967391:44:35:2:2:47:42:2:1
chr16	19041595	.	G	A	1108.71	PASS	AF=0.974026;AO=75;DP=77;FAO=75;FDP=77;FR=.;FRO=2;FSAF=32;FSAR=43;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0112546;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=260.423;QD=57.5952;RBI=0.0154045;REFB=-0.101592;REVB=0.0105182;RO=2;SAF=32;SAR=43;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0286516;STB=0.515147;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.00120756;OID=.;OPOS=19041595;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:77:77:2:2:75:75:0.974026:43:32:2:0:43:32:2:0
chr16	19067933	.	G	A	1378.57	PASS	AF=1;AO=88;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00753521;FXX=0.0111099;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.0057;QD=61.9581;RBI=0.0235715;REFB=0;REVB=0.0223346;RO=0;SAF=41;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000174124;OID=.;OPOS=19067933;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:89:89:0:0:88:89:1:47:41:0:0:47:42:0:0
chr16	19080184	.	C	T	1475.96	PASS	AF=0.989474;AO=94;DP=95;FAO=94;FDP=95;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00705003;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.6333;QD=62.1455;RBI=0.0115014;REFB=-0.0162771;REVB=-0.00908737;RO=1;SAF=39;SAR=55;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00854356;STB=0.504504;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.000838644;OID=.;OPOS=19080184;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:95:95:1:1:94:94:0.989474:55:39:0:1:55:39:0:1
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chr16	19085298	.	C	T	1481.06	PASS	AF=0.990099;AO=99;DP=101;FAO=100;FDP=101;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=68;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00271713;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.923;QD=58.656;RBI=0.0150083;REFB=-0.032409;REVB=-0.0147603;RO=0;SAF=32;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=9.76003e-08;STB=0.507691;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=3.83396e-05;OID=.;OPOS=19085298;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:101:101:0:1:99:100:0.990099:67:32:0:0:68:32:1:0
chr16	19128048	.	G	A	179.04	PASS	AF=0.348485;AO=23;DP=66;FAO=23;FDP=66;FR=.;FRO=43;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=30;FSRR=13;FWDB=-0.00354649;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.491;QD=10.8509;RBI=0.0642511;REFB=-0.00231246;REVB=-0.0641531;RO=42;SAF=14;SAR=9;SRF=29;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0982096;STB=0.562448;STBP=0.484;TYPE=snp;VARB=0.00448891;OID=.;OPOS=19128048;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:42:43:23:23:0.348485:9:14:29:13:9:14:30:13
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chr16	19128775	.	G	A	71.66	PASS	AF=0.6;AO=9;DP=15;FAO=9;FDP=15;FR=.;FRO=6;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.00532702;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.6002;QD=19.1085;RBI=0.00685358;REFB=-0.0247839;REVB=0.00431212;RO=6;SAF=6;SAR=3;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122922;STB=0.571265;STBP=0.539;TYPE=snp;VARB=0.00650551;OID=.;OPOS=19128775;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:15:15:6:6:9:9:0.6:3:6:3:3:3:6:3:3
chr16	19128995	.	C	A	603.62	PASS	AF=0.567308;AO=59;DP=104;FAO=59;FDP=104;FR=.;FRO=45;FSAF=28;FSAR=31;FSRF=18;FSRR=27;FWDB=0.00911896;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.9155;QD=23.216;RBI=0.0700735;REFB=-0.0221704;REVB=-0.0694776;RO=45;SAF=28;SAR=31;SRF=18;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0593842;STB=0.532448;STBP=0.471;TYPE=snp;VARB=0.0102374;OID=.;OPOS=19128995;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:104:45:45:59:59:0.567308:31:28:18:27:31:28:18:27
chr16	19129513	.	GT	AC	299.17	PASS	AF=0.613636;AO=26;DP=44;FAO=27;FDP=44;FR=.;FRO=17;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.0393644;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=206.952;QD=27.1969;RBI=0.0395296;REFB=-0.0214452;REVB=0.00361019;RO=16;SAF=10;SAR=16;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0381501;STB=0.516982;STBP=0.779;TYPE=mnp;VARB=0.0151243;OID=.;OPOS=19129513;OREF=GT;OALT=AC;OMAPALT=AC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:16:17:26:27:0.613636:16:10:7:9:17:10:7:10
chr16	19130011	.	T	G	103.49	PASS	AF=0.545455;AO=12;DP=22;FAO=12;FDP=22;FR=.;FRO=10;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=-0.00814586;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=213.129;QD=18.8159;RBI=0.0274149;REFB=-0.0194272;REVB=0.0261768;RO=10;SAF=9;SAR=3;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.302688;STB=0.674689;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=0.0119342;OID=.;OPOS=19130011;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:22:22:10:10:12:12:0.545455:3:9:4:6:3:9:4:6
chr16	19131435	.	A	G	67.43	PASS	AF=0.45;AO=9;DP=20;FAO=9;FDP=20;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.00448791;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.864;QD=13.4859;RBI=0.0112138;REFB=-0.0186236;REVB=-0.0102766;RO=11;SAF=4;SAR=5;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00947861;STB=0.505605;STBP=0.965;TYPE=snp;VARB=0.0189049;OID=.;OPOS=19131435;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:20:20:11:11:9:9:0.45:5:4:5:6:5:4:5:6
chr16	19132447	.	A	C	51.54	PASS	AF=0.636364;AO=7;DP=11;FAO=7;FDP=11;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.024238;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=133.316;QD=18.7421;RBI=0.0582145;REFB=-0.0209556;REVB=-0.0529287;RO=4;SAF=2;SAR=5;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149414;STB=0.58797;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=0.0173327;OID=.;OPOS=19132447;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:11:11:4:4:7:7:0.636364:5:2:2:2:5:2:2:2
chr16	19132780	.	T	C	537.97	PASS	AF=0.561798;AO=50;DP=89;FAO=50;FDP=89;FR=.;FRO=39;FSAF=21;FSAR=29;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=0.0109233;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.894;QD=24.1786;RBI=0.0320645;REFB=0.00017195;REVB=0.0301465;RO=39;SAF=21;SAR=29;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0954395;STB=0.55236;STBP=0.273;TYPE=snp;VARB=4.92248e-05;OID=.;OPOS=19132780;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:39:39:50:50:0.561798:29:21:21:18:29:21:21:18
chr16	19310092	.	T	C	756.69	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0399961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.548;QD=63.0575;RBI=0.0429326;REFB=0;REVB=0.0156051;RO=0;SAF=19;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000735622;OID=.;OPOS=19310092;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:48:0:0:47:48:1:28:19:0:0:28:20:0:0
chr16	19509938	.	G	A,GCA	1181.8	PASS	AF=0.0561798,0.876404;AO=5,78;DP=89;FAO=5,78;FDP=89;FR=.;FRO=6;FSAF=5,40;FSAR=0,38;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0.00953443,0.0128461;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=149.61,153.418;QD=53.1148;RBI=0.0120549,0.0323525;REFB=-0.00131106,-0.0978587;REVB=-0.0073767,0.0296928;RO=6;SAF=5,40;SAR=0,38;SRF=0;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.819749,0.0690866;STB=0.998178,0.536576;STBP=0,0.019;TYPE=snp,ins;VARB=-0.0127047,0.00153058;OID=.,.;OPOS=19509938,19509939;OREF=G,-;OALT=A,CA;OMAPALT=A,GCA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:21:89:89:6:6:5,78:5,78:0.0561798,0.876404:0,38:5,40:0:6:0,38:5,40:0:6
chr16	19514483	.	C	T	708.18	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0138617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.6007;QD=62.9495;RBI=0.0141278;REFB=0;REVB=0.0027289;RO=0;SAF=19;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.15971e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.6725e-05;OID=.;OPOS=19514483;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:26:19:0:0:26:19:0:0
chr16	19548740	.	A	G	483.27	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0267145;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=63.8431;QD=58.5782;RBI=0.0396736;REFB=0;REVB=-0.0293313;RO=0;SAF=12;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000640685;OID=.;OPOS=19548740;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:21:12:0:0:21:12:0:0
chr16	19868687	.	G	C	1509.13	PASS	AF=0.954545;AO=103;DP=109;FAO=105;FDP=110;FR=.;FRO=5;FSAF=44;FSAR=61;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0164984;FXX=0.0090082;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.391;QD=54.8776;RBI=0.0179505;REFB=-0.0131108;REVB=0.00707275;RO=4;SAF=42;SAR=61;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.011601;STB=0.500889;STBP=0.961;TYPE=snp;VARB=0.000943109;OID=.;OPOS=19868687;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:109:110:4:5:103:105:0.954545:61:42:1:3:61:44:2:3
chr16	20043330	.	T	C	784.06	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00491126;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.976;QD=57.0227;RBI=0.0364539;REFB=0;REVB=0.0361216;RO=0;SAF=26;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.52846e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000199593;OID=.;OPOS=20043330;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:55:0:0:54:55:1:28:26:0:0:29:26:0:0
chr16	20334679	.	C	T	1595.73	PASS	AF=1;AO=104;DP=104;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.014663;FXX=0.0183469;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.795;QD=59.6533;RBI=0.0340687;REFB=0;REVB=0.0307518;RO=0;SAF=62;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00050019;OID=.;OPOS=20334679;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:104:107:0:0:104:107:1:42:62:0:0:43:64:0:0
chr16	20410488	.	G	A	391.9	PASS	AF=0.396552;AO=46;DP=116;FAO=46;FDP=116;FR=.;FRO=70;FSAF=17;FSAR=29;FSRF=30;FSRR=40;FWDB=0.0397565;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.2429;QD=13.5138;RBI=0.0438755;REFB=0.0162295;REVB=0.0185603;RO=70;SAF=17;SAR=29;SRF=30;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0660567;STB=0.537444;STBP=0.539;TYPE=snp;VARB=-0.0239599;OID=.;OPOS=20410488;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:116:116:70:70:46:46:0.396552:29:17:30:40:29:17:30:40
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chr16	20441053	.	C	G	276.18	PASS	AF=0.333333;AO=33;DP=99;FAO=33;FDP=99;FR=.;FRO=66;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=32;FSRR=34;FWDB=-0.0687101;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=164.884;QD=11.1586;RBI=0.0716341;REFB=-0.00671781;REVB=-0.0202576;RO=65;SAF=18;SAR=15;SRF=31;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0783987;STB=0.540417;STBP=0.565;TYPE=snp;VARB=0.0109773;OID=.;OPOS=20441053;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:65:66:33:33:0.333333:15:18:31:34:15:18:32:34
chr16	20441084	.	T	C	191.69	PASS	AF=0.273684;AO=25;DP=94;FAO=26;FDP=95;FR=.;FRO=69;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=31;FSRR=38;FWDB=-0.0414238;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.98;QD=8.07116;RBI=0.0448474;REFB=-0.0057003;REVB=0.017186;RO=69;SAF=14;SAR=11;SRF=31;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134555;STB=0.564467;STBP=0.456;TYPE=snp;VARB=0.0115915;OID=.;OPOS=20441084;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:95:69:69:25:26:0.273684:11:14:31:38:12:14:31:38
chr16	20471450	.	G	A	84.18	PASS	AF=0.366667;AO=10;DP=29;FAO=11;FDP=30;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.00633268;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.245;QD=11.2236;RBI=0.0158974;REFB=-0.0199646;REVB=0.0145816;RO=19;SAF=6;SAR=4;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0236005;STB=0.538391;STBP=0.782;TYPE=snp;VARB=0.0241409;OID=.;OPOS=20471450;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:29:30:19:19:10:11:0.366667:4:6:11:8:4:7:11:8
chr16	20476852	.	T	C	140.32	PASS	AF=0.277778;AO=20;DP=72;FAO=20;FDP=72;FR=.;FRO=52;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=30;FSRR=22;FWDB=-0.00694115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.419;QD=7.79574;RBI=0.02392;REFB=-0.00268814;REVB=-0.0228908;RO=51;SAF=11;SAR=9;SRF=30;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0464984;STB=0.519699;STBP=0.834;TYPE=snp;VARB=0.00750614;OID=.;OPOS=20476852;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:51:52:20:20:0.277778:9:11:30:21:9:11:30:22
chr16	20552075	.	G	T	2105.75	PASS	AF=0.992647;AO=135;DP=136;FAO=135;FDP=136;FR=.;FRO=1;FSAF=79;FSAR=56;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00811056;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=229.173;QD=61.9338;RBI=0.00877266;REFB=-0.0828155;REVB=-0.00334341;RO=0;SAF=79;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.503144;STBP=0.495;TYPE=snp;VARB=8.45847e-05;OID=.;OPOS=20552075;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:136:136:0:1:135:135:0.992647:56:79:0:0:56:79:1:0
chr16	20576048	.	C	A	50.45	PASS	AF=0.195122;AO=8;DP=41;FAO=8;FDP=41;FR=.;FRO=33;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=21;FSRR=12;FWDB=0.00746486;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.385;QD=4.92232;RBI=0.0153004;REFB=0.00842416;REVB=-0.0133558;RO=33;SAF=1;SAR=7;SRF=21;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.594356;STB=0.889255;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=-0.0221953;OID=.;OPOS=20576048;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:50:41:41:33:33:8:8:0.195122:7:1:21:12:7:1:21:12
chr16	20638576	.	A	T	462.96	PASS	AF=0.471698;AO=50;DP=105;FAO=50;FDP=106;FR=.;FRO=56;FSAF=21;FSAR=29;FSRF=23;FSRR=33;FWDB=-0.0060828;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.3836;QD=17.4703;RBI=0.00696666;REFB=-0.0129925;REVB=-0.00339616;RO=55;SAF=21;SAR=29;SRF=22;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0194167;STB=0.505041;STBP=0.926;TYPE=snp;VARB=0.0270526;OID=.;OPOS=20638576;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:106:55:56:50:50:0.471698:29:21:22:33:29:21:23:33
chr16	20648702	.	G	A	258.75	PASS	AF=0.352273;AO=31;DP=88;FAO=31;FDP=88;FR=.;FRO=57;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=32;FSRR=25;FWDB=0.00185144;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.951;QD=11.7614;RBI=0.00433655;REFB=-0.00149217;REVB=0.00392145;RO=56;SAF=17;SAR=14;SRF=32;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.026043;STB=0.508519;STBP=0.899;TYPE=snp;VARB=0.00238495;OID=.;OPOS=20648702;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:56:57:31:31:0.352273:14:17:32:24:14:17:32:25
chr16	20748331	.	C	A	479.92	PASS	AF=0.4;AO=54;DP=135;FAO=54;FDP=135;FR=.;FRO=81;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=34;FSRR=47;FWDB=-0.0447908;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.7184;QD=14.2198;RBI=0.0451584;REFB=-0.0214496;REVB=0.0057506;RO=79;SAF=28;SAR=26;SRF=33;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106039;STB=0.559059;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=0.032325;OID=.;OPOS=20748331;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:135:135:79:81:54:54:0.4:26:28:33:46:26:28:34:47
chr16	20753123	.	T	C	2140.25	PASS	AF=1;AO=136;DP=136;FAO=136;FDP=136;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.023345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.131;QD=62.9486;RBI=0.0237896;REFB=0;REVB=0.00457773;RO=0;SAF=55;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.39697e-05;OID=.;OPOS=20753123;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:136:136:0:0:136:136:1:81:55:0:0:81:55:0:0
chr16	20796387	.	G	C	244.86	PASS	AF=0.313725;AO=32;DP=102;FAO=32;FDP=102;FR=.;FRO=70;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=33;FSRR=37;FWDB=0.0301341;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.7182;QD=9.60253;RBI=0.0312357;REFB=-0.0118772;REVB=0.0082224;RO=68;SAF=15;SAR=17;SRF=31;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0150688;STB=0.501844;STBP=0.975;TYPE=snp;VARB=0.0385012;OID=.;OPOS=20796387;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:68:70:32:32:0.313725:17:15:31:37:17:15:33:37
chr16	20809283	.	C	A	426.74	PASS	AF=0.404959;AO=49;DP=119;FAO=49;FDP=121;FR=.;FRO=72;FSAF=29;FSAR=20;FSRF=40;FSRR=32;FWDB=-0.0134549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.822;QD=14.1069;RBI=0.0246328;REFB=-0.00702126;REVB=-0.0206335;RO=70;SAF=29;SAR=20;SRF=40;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0219378;STB=0.522152;STBP=0.686;TYPE=snp;VARB=0.0138508;OID=.;OPOS=20809283;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:121:70:72:49:49:0.404959:20:29:40:30:20:29:40:32
chr16	20810067	.	T	C	677.46	PASS	AF=0.617647;AO=63;DP=102;FAO=63;FDP=102;FR=.;FRO=39;FSAF=27;FSAR=36;FSRF=24;FSRR=15;FWDB=0.0232102;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.8389;QD=26.567;RBI=0.0434209;REFB=-0.0473447;REVB=0.0366969;RO=39;SAF=27;SAR=36;SRF=24;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131486;STB=0.571406;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.0261539;OID=.;OPOS=20810067;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:39:39:63:63:0.617647:36:27:24:15:36:27:24:15
chr16	20811681	.	C	T	1062.16	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00665368;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.144;QD=59.84;RBI=0.0579041;REFB=0;REVB=0.0575206;RO=0;SAF=46;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.00341e-05;OID=.;OPOS=20811681;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:68:71:0:0:68:71:1:22:46:0:0:25:46:0:0
chr16	20855309	.	A	G	1696.99	PASS	AF=0.982759;AO=113;DP=115;FAO=114;FDP=116;FR=.;FRO=2;FSAF=55;FSAR=59;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0137328;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.5219;QD=58.517;RBI=0.0154581;REFB=-0.0769217;REVB=0.00709662;RO=2;SAF=55;SAR=58;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000438591;STB=0.500303;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=0.00696097;OID=.;OPOS=20855309;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:115:116:2:2:113:114:0.982759:58:55:1:1:59:55:1:1
chr16	20873767	.	T	G	538.46	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0117727;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.011;QD=59.8291;RBI=0.0708648;REFB=0;REVB=0.0698801;RO=0;SAF=14;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000464079;OID=.;OPOS=20873767;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:22:14:0:0:22:14:0:0
chr16	20959918	.	G	A	151.33	PASS	AF=0.327869;AO=20;DP=61;FAO=20;FDP=61;FR=.;FRO=41;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=0.00201457;FXX=0.0161264;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.47;QD=9.9233;RBI=0.0176427;REFB=-0.0033068;REVB=0.0175273;RO=41;SAF=10;SAR=10;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0417373;STB=0.524566;STBP=0.809;TYPE=snp;VARB=0.00552173;OID=.;OPOS=20959918;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:41:41:20:20:0.327869:10:10:19:22:10:10:19:22
chr16	20966273	.	G	A	357.21	PASS	AF=0.393939;AO=39;DP=99;FAO=39;FDP=99;FR=.;FRO=60;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=32;FSRR=28;FWDB=-0.00242771;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.164;QD=14.4327;RBI=0.0353616;REFB=-0.00680395;REVB=0.0352781;RO=59;SAF=22;SAR=17;SRF=31;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0414472;STB=0.518858;STBP=0.787;TYPE=snp;VARB=0.0109157;OID=.;OPOS=20966273;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:59:60:39:39:0.393939:17:22:31:28:17:22:32:28
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chr16	20975069	.	G	A	211.99	PASS	AF=0.456522;AO=21;DP=48;FAO=21;FDP=46;FR=.;FRO=25;FSAF=16;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.00453395;FXX=0.041658;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.889;QD=18.4338;RBI=0.0231347;REFB=0.000972611;REVB=0.022686;RO=27;SAF=16;SAR=5;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.307322;STB=0.652122;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=-0.000837853;OID=.;OPOS=20975069;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:46:27:25:21:21:0.456522:5:16:13:14:5:16:13:12
chr16	20975303	.	A	G	224.79	PASS	AF=0.391304;AO=27;DP=69;FAO=27;FDP=69;FR=.;FRO=42;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=26;FWDB=-0.00475573;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.682;QD=13.0314;RBI=0.0113714;REFB=-0.0139851;REVB=-0.0103292;RO=42;SAF=13;SAR=14;SRF=16;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107697;STB=0.56151;STBP=0.47;TYPE=snp;VARB=0.0240503;OID=.;OPOS=20975303;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:42:42:27:27:0.391304:14:13:16:26:14:13:16:26
chr16	20975522	.	A	G	37.78	PASS	AF=0.375;AO=6;DP=16;FAO=6;FDP=16;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.0159606;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=314.299;QD=9.44485;RBI=0.0165078;REFB=-0.00877463;REVB=-0.00421504;RO=10;SAF=4;SAR=2;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.267756;STB=0.666111;STBP=0.358;TYPE=snp;VARB=0.0135091;OID=.;OPOS=20975522;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:16:16:10:10:6:6:0.375:2:4:4:6:2:4:4:6
chr16	20976360	.	T	G	192.78	PASS	AF=0.369231;AO=24;DP=65;FAO=24;FDP=65;FR=.;FRO=41;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=0.0181219;FXX=0.0151492;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.5987;QD=11.8634;RBI=0.0289324;REFB=-0.000269688;REVB=0.022554;RO=41;SAF=13;SAR=11;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0588155;STB=0.53399;STBP=0.697;TYPE=snp;VARB=0.00135834;OID=.;OPOS=20976360;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:41:41:24:24:0.369231:11:13:20:21:11:13:20:21
chr16	20981162	.	T	C	507.95	PASS	AF=0.509615;AO=52;DP=104;FAO=53;FDP=104;FR=.;FRO=51;FSAF=29;FSAR=24;FSRF=23;FSRR=28;FWDB=-0.0205565;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.396;QD=19.5363;RBI=0.0259159;REFB=-0.00454592;REVB=0.0157818;RO=50;SAF=29;SAR=23;SRF=23;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0868745;STB=0.547152;STBP=0.344;TYPE=snp;VARB=0.0046751;OID=.;OPOS=20981162;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:104:50:51:52:53:0.509615:23:29:23:27:24:29:23:28
chr16	21008690	.	T	C	1444.43	PASS	AF=0.978947;AO=93;DP=95;FAO=93;FDP=95;FR=.;FRO=2;FSAF=35;FSAR=58;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00488835;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=250.833;QD=60.818;RBI=0.00491978;REFB=0.0412168;REVB=-0.000555213;RO=2;SAF=35;SAR=58;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0263174;STB=0.513886;STBP=0.104;TYPE=snp;VARB=-8.08023e-05;OID=.;OPOS=21008690;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:95:95:2:2:93:93:0.978947:58:35:2:0:58:35:2:0
chr16	21045369	.	A	G	51.8	PASS	AF=0.235294;AO=8;DP=34;FAO=8;FDP=34;FR=.;FRO=26;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=0.0014647;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.6805;QD=6.09452;RBI=0.0186732;REFB=-0.00532832;REVB=0.0186157;RO=26;SAF=4;SAR=4;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0913963;STB=0.558679;STBP=0.736;TYPE=snp;VARB=0.0308947;OID=.;OPOS=21045369;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:51:34:34:26:26:8:8:0.235294:4:4:11:15:4:4:11:15
chr16	21078693	.	T	G	154.01	PASS	AF=0.395349;AO=17;DP=43;FAO=17;FDP=43;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=-0.0129626;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.818;QD=14.3266;RBI=0.0181657;REFB=-0.0268812;REVB=-0.0127265;RO=26;SAF=10;SAR=7;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.209896;STB=0.621481;STBP=0.188;TYPE=snp;VARB=0.0333988;OID=.;OPOS=21078693;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:26:26:17:17:0.395349:7:10:10:16:7:10:10:16
chr16	21190853	.	A	C	766.4	PASS	AF=1;AO=47;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00832185;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.161;QD=63.8667;RBI=0.0106681;REFB=0;REVB=-0.00667496;RO=0;SAF=30;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.56281e-06;OID=.;OPOS=21190853;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:47:48:1:17:30:0:0:18:30:0:0
chr16	21215672	.	A	G	689.29	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00699909;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.014;QD=62.6625;RBI=0.00901689;REFB=0;REVB=0.00568481;RO=0;SAF=17;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.75441e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.40968e-06;OID=.;OPOS=21215672;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:44:0:0:43:44:1:26:17:0:0:26:18:0:0
chr16	21222672	.	C	A	621.49	PASS	AF=0.611111;AO=55;DP=90;FAO=55;FDP=90;FR=.;FRO=35;FSAF=29;FSAR=26;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=-0.00102285;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=242.575;QD=27.6215;RBI=0.0069992;REFB=-0.0174573;REVB=-0.00692406;RO=35;SAF=29;SAR=26;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0704111;STB=0.538323;STBP=0.377;TYPE=snp;VARB=0.0102323;OID=.;OPOS=21222672;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:35:35:55:55:0.611111:26:29:15:20:26:29:15:20
chr16	21222941	.	C	A	236.42	PASS	AF=0.45;AO=27;DP=60;FAO=27;FDP=60;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=0.0249644;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.585;QD=15.7611;RBI=0.0309354;REFB=-0.00770494;REVB=0.0182696;RO=33;SAF=10;SAR=17;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144324;STB=0.581688;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=0.00942303;OID=.;OPOS=21222941;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:33:33:27:27:0.45:17:10:17:16:17:10:17:16
chr16	21517416	.	T	C	41.66	PASS	AF=0.175;AO=7;DP=40;FAO=7;FDP=40;FR=.;FRO=33;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=-0.00947285;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=77.0597;QD=4.16625;RBI=0.0096914;REFB=-0.00766672;REVB=-0.00204655;RO=33;SAF=4;SAR=3;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139864;STB=0.595474;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=0.0196054;OID=.;OPOS=21517416;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:40:40:33:33:7:7:0.175:3:4:15:18:3:4:15:18
chr16	21531220	.	A	T	120.22	PASS	AF=0.253521;AO=18;DP=71;FAO=18;FDP=71;FR=.;FRO=53;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=30;FSRR=23;FWDB=0.0127996;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.027;QD=6.77318;RBI=0.0241379;REFB=-0.00331842;REVB=-0.0204649;RO=53;SAF=12;SAR=6;SRF=30;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130015;STB=0.579908;STBP=0.446;TYPE=snp;VARB=0.00934097;OID=.;OPOS=21531220;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:53:53:18:18:0.253521:6:12:30:23:6:12:30:23
chr16	21531464	.	C	T	41.77	PASS	AF=0.162791;AO=7;DP=44;FAO=7;FDP=43;FR=.;FRO=36;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=22;FSRR=14;FWDB=0.0103864;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.149;QD=3.88537;RBI=0.0106045;REFB=-0.00419767;REVB=-0.00213947;RO=36;SAF=5;SAR=2;SRF=22;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137417;STB=0.596724;STBP=0.653;TYPE=snp;VARB=0.00750486;OID=.;OPOS=21531464;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:44:43:36:36:7:7:0.162791:2:5:22:14:2:5:22:14
chr16	21531494	.	T	C	754.43	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0430566;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.762;QD=56.9383;RBI=0.043693;REFB=0;REVB=0.00743011;RO=0;SAF=33;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.88914e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000103619;OID=.;OPOS=21531494;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:20:33:0:0:20:33:0:0
chr16	21531609	.	C	T	193.62	PASS	AF=0.434783;AO=20;DP=46;FAO=20;FDP=46;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=-0.00757283;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.262;QD=16.8368;RBI=0.0125163;REFB=-0.0142682;REVB=-0.00996545;RO=25;SAF=10;SAR=10;SRF=8;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176008;STB=0.586872;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.0174731;OID=.;OPOS=21531609;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:25:26:20:20:0.434783:10:10:8:17:10:10:9:17
chr16	21531681	.	C	G	94.54	PASS	AF=0.611111;AO=11;DP=18;FAO=11;FDP=18;FR=.;FRO=7;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.0508948;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=62.3353;QD=21.01;RBI=0.0562961;REFB=-0.016568;REVB=0.0240618;RO=7;SAF=8;SAR=3;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.397807;STB=0.726859;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.0101408;OID=.;OPOS=21531681;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:18:18:7:7:11:11:0.611111:3:8:1:6:3:8:1:6
chr16	21658389	.	G	A	708.32	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0312355;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.6051;QD=62.962;RBI=0.0322511;REFB=0;REVB=-0.00802972;RO=0;SAF=20;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.09779e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000389663;OID=.;OPOS=21658389;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:25:20:0:0:25:20:0:0
chr16	21690559	.	G	A	513.86	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0384368;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.159;QD=57.095;RBI=0.0899547;REFB=0;REVB=0.0813293;RO=0;SAF=18;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00276396;OID=.;OPOS=21690559;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:36:0:0:32:36:1:14:18:0:0:17:19:0:0
chr16	21994411	.	G	A	243.74	PASS	AF=0.32967;AO=30;DP=91;FAO=30;FDP=91;FR=.;FRO=61;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=25;FSRR=36;FWDB=-0.0184684;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.418;QD=10.7137;RBI=0.0250611;REFB=-0.0083618;REVB=-0.0169404;RO=61;SAF=18;SAR=12;SRF=25;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.216905;STB=0.626004;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=0.0212521;OID=.;OPOS=21994411;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:61:61:30:30:0.32967:12:18:25:36:12:18:25:36
chr16	22111704	.	G	A	85.77	PASS	AF=0.37931;AO=11;DP=29;FAO=11;FDP=29;FR=.;FRO=18;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=0.00273863;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=308.816;QD=11.8306;RBI=0.00631361;REFB=0.00098998;REVB=-0.00568873;RO=18;SAF=2;SAR=9;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.474686;STB=0.784685;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=-0.00114735;OID=.;OPOS=22111704;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:29:29:18:18:11:11:0.37931:9:2:11:7:9:2:11:7
chr16	22144318	.	C	T	354.25	PASS	AF=1;AO=24;DP=27;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.201234;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=44.3096;QD=50.6067;RBI=0.201237;REFB=0;REVB=0.00106175;RO=3;SAF=16;SAR=8;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0793291;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0133833;OID=.;OPOS=22144318;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:27:28:3:0:24:28:1:8:16:3:0:8:20:0:0
chr16	22155629	.	A	G	238.3	PASS	AF=0.457627;AO=27;DP=59;FAO=27;FDP=59;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=0.0290641;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.953;QD=16.1558;RBI=0.0322708;REFB=-0.00152862;REVB=0.0140244;RO=32;SAF=14;SAR=13;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0726809;STB=0.540954;STBP=0.581;TYPE=snp;VARB=0.00130134;OID=.;OPOS=22155629;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:32:32:27:27:0.457627:13:14:19:13:13:14:19:13
chr16	22161136	.	T	C	744.08	PASS	AF=1;AO=31;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.19196;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=97.0914;QD=63.3263;RBI=0.192083;REFB=0;REVB=-0.00688034;RO=0;SAF=6;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.16261e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00133963;OID=.;OPOS=22161136;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:31:47:1:25:6:0:0:25:22:0:0
chr16	22178256	.	G	A	876.28	PASS	AF=0.984127;AO=60;DP=62;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00191098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.077;QD=55.6369;RBI=0.103001;REFB=-0.123112;REVB=0.102983;RO=1;SAF=29;SAR=31;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.014981;STB=0.50769;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=0.00196723;OID=.;OPOS=22178256;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:62:63:1:1:60:62:0.984127:31:29:0:1:32:30:0:1
chr16	22262514	.	C	A	411.11	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0784252;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.506;QD=56.705;RBI=0.0786016;REFB=0;REVB=-0.00526212;RO=0;SAF=19;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000615142;OID=.;OPOS=22262514;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:10:19:0:0:10:19:0:0
chr16	22269867	.	A	G	732.48	PASS	AF=0.947368;AO=54;DP=57;FAO=54;FDP=57;FR=.;FRO=3;FSAF=31;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0171598;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.301;QD=51.402;RBI=0.0173472;REFB=-0.135334;REVB=0.00254312;RO=2;SAF=31;SAR=23;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0392253;STB=0.512901;STBP=0.449;TYPE=snp;VARB=0.00118563;OID=.;OPOS=22269867;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:57:57:2:3:54:54:0.947368:23:31:0:2:23:31:1:2
chr16	22357850	.	C	CAG	1110.13	PASS	AF=1;AO=70;DP=79;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0175961;FXX=0.0759398;HRUN=0;LEN=2;MLLD=199.479;QD=60.8291;RBI=0.0231505;REFB=0;REVB=0.015044;RO=4;SAF=35;SAR=35;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=3.50313e-05;OID=.;OPOS=22357851;OREF=-;OALT=AG;OMAPALT=CAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:70:79:73:73:0:37:36:0:0:6:4:35:35:2:2
chr16	23072833	.	C	T	201.76	PASS	AF=0.27;AO=26;DP=99;FAO=27;FDP=100;FR=.;FRO=73;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=39;FSRR=34;FWDB=-0.0118287;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.675;QD=8.07026;RBI=0.0143439;REFB=-0.00146283;REVB=-0.00811346;RO=73;SAF=11;SAR=15;SRF=39;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135963;STB=0.565362;STBP=0.456;TYPE=snp;VARB=0.00455974;OID=.;OPOS=23072833;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:100:73:73:26:27:0.27:15:11:39:34:15:12:39:34
chr16	23073531	.	C	G	128.83	PASS	AF=0.365854;AO=15;DP=41;FAO=15;FDP=41;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=0.0253556;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.8492;QD=12.5688;RBI=0.0547506;REFB=-0.00236951;REVB=0.0485255;RO=26;SAF=8;SAR=7;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0772636;STB=0.545394;STBP=0.715;TYPE=snp;VARB=0.00875865;OID=.;OPOS=23073531;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:26:26:15:15:0.365854:7:8:12:14:7:8:12:14
chr16	23098422	.	A	G	563.69	PASS	AF=0.375691;AO=66;DP=182;FAO=68;FDP=181;FR=.;FRO=113;FSAF=35;FSAR=33;FSRF=46;FSRR=67;FWDB=0.0152558;FXX=0.0054942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.4721;QD=12.4571;RBI=0.0169807;REFB=0.000622068;REVB=0.00745688;RO=112;SAF=34;SAR=32;SRF=46;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115624;STB=0.566966;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=0.000128977;OID=.;OPOS=23098422;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:182:181:112:113:66:68:0.375691:32:34:46:66:33:35:46:67
chr16	23200761	.	T	C	197.78	PASS	AF=0.425926;AO=23;DP=54;FAO=23;FDP=54;FR=.;FRO=31;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=20;FWDB=-0.0157529;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.495;QD=14.6503;RBI=0.0183246;REFB=0.00225723;REVB=0.00936153;RO=30;SAF=8;SAR=15;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0204658;STB=0.504421;STBP=0.964;TYPE=snp;VARB=-0.00456079;OID=.;OPOS=23200761;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:30:31:23:23:0.425926:15:8:11:19:15:8:11:20
chr16	23200848	.	T	C	295.65	PASS	AF=0.377778;AO=35;DP=90;FAO=34;FDP=90;FR=.;FRO=56;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=25;FSRR=31;FWDB=-0.0219734;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.0943;QD=13.1399;RBI=0.0416051;REFB=-0.0113269;REVB=-0.0353292;RO=53;SAF=16;SAR=19;SRF=23;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0247996;STB=0.503309;STBP=0.961;TYPE=snp;VARB=0.0216901;OID=.;OPOS=23200848;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:53:56:35:34:0.377778:19:16:23:30:19:15:25:31
chr16	23315377	.	G	A	513.65	PASS	AF=0.571429;AO=48;DP=84;FAO=48;FDP=84;FR=.;FRO=36;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=21;FSRR=15;FWDB=-0.0111304;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.461;QD=24.4597;RBI=0.0117126;REFB=-0.0168408;REVB=-0.00364674;RO=36;SAF=23;SAR=25;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0813045;STB=0.544536;STBP=0.374;TYPE=snp;VARB=0.00939838;OID=.;OPOS=23315377;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:36:36:48:48:0.571429:25:23:21:15:25:23:21:15
chr16	23360199	.	T	C	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.119865;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=305.222;QD=43.4862;RBI=0.120491;REFB=0;REVB=0.0122607;RO=0;SAF=6;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000641928;OID=.;OPOS=23360199;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:6:6:0:0:6:6:0:0
chr16	23387163	.	C	T	123.16	PASS	AF=0.518519;AO=11;DP=24;FAO=14;FDP=27;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.0448423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.4927;QD=18.2466;RBI=0.0473055;REFB=-0.0142015;REVB=0.0150659;RO=13;SAF=5;SAR=6;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0065293;STB=0.516106;STBP=0.916;TYPE=snp;VARB=0.0198575;OID=.;OPOS=23387163;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:24:27:13:13:11:14:0.518519:6:5:6:7:8:6:6:7
chr16	23489711	.	C	G	601.14	PASS	AF=0.97561;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00444862;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.387;QD=58.6481;RBI=0.0316183;REFB=0.00575664;REVB=-0.0313038;RO=0;SAF=20;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512189;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=-0.0003628;OID=.;OPOS=23489711;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:41:41:0:1:40:40:0.97561:20:20:0:0:20:20:0:1
chr16	23490352	.	CT	C,CG	218.3	PASS	AF=0.166667,0.833333;AO=3,15;DP=18;FAO=3,15;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=0,4;FSAR=3,11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00203669,-0.00349516;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=248.546,267.058;QD=48.5119;RBI=0.0117811,0.0130805;REFB=0,0;REVB=0.0116037,0.0126049;RO=0;SAF=0,4;SAR=3,11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.33019e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0157206,0.00329254;OID=.,.;OPOS=23490353,23490353;OREF=T,T;OALT=-,G;OMAPALT=C,CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.166667,0.833333:3,15:18:3,15:18:0:0,4:3,11:0:0:14:0:0,4:3,11:0:0
chr16	23536684	.	T	C	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0323904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.596;QD=51.9167;RBI=0.0359246;REFB=0;REVB=0.0155384;RO=0;SAF=10;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000292944;OID=.;OPOS=23536684;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:11:10:0:0:11:10:0:0
chr16	23546561	.	G	C	465.01	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00967848;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.6503;QD=58.1256;RBI=0.0101074;REFB=0;REVB=0.00291327;RO=0;SAF=13;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000183279;OID=.;OPOS=23546561;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:19:13:0:0:19:13:0:0
chr16	23563501	.	C	T	3690.95	PASS	AF=0.991561;AO=235;DP=237;FAO=235;FDP=237;FR=.;FRO=2;FSAF=90;FSAR=145;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0296244;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.346;QD=62.2945;RBI=0.0323376;REFB=-0.00878807;REVB=0.0129659;RO=1;SAF=90;SAR=145;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00327564;STB=0.503424;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=5.74696e-05;OID=.;OPOS=23563501;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:237:237:1:2:235:235:0.991561:145:90:0:1:145:90:0:2
chr16	23585061	.	T	C	772.55	PASS	AF=0.98;AO=47;DP=50;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0124857;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.508;QD=61.8037;RBI=0.0129719;REFB=-0.0191953;REVB=0.00351834;RO=1;SAF=15;SAR=32;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0303164;STB=0.516122;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=8.56812e-05;OID=.;OPOS=23585061;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:50:50:1:1:47:49:0.98:32:15:1:0:34:15:1:0
chr16	23677006	.	A	G	628.96	PASS	AF=0.575472;AO=61;DP=106;FAO=61;FDP=106;FR=.;FRO=45;FSAF=37;FSAR=24;FSRF=30;FSRR=15;FWDB=0.0130728;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.554;QD=23.7344;RBI=0.0132237;REFB=-0.0168655;REVB=-0.00199237;RO=45;SAF=37;SAR=24;SRF=30;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0495703;STB=0.527032;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=0.0124319;OID=.;OPOS=23677006;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:106:45:45:61:61:0.575472:24:37:30:15:24:37:30:15
chr16	23701538	.	A	G	43.83	PASS	AF=0.25;AO=7;DP=28;FAO=7;FDP=28;FR=.;FRO=21;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=-0.0348137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.2806;QD=6.26155;RBI=0.0411273;REFB=-0.0163761;REVB=-0.0218965;RO=21;SAF=4;SAR=3;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=0.998;TYPE=snp;VARB=0.035291;OID=.;OPOS=23701538;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:28:28:21:21:7:7:0.25:3:4:12:9:3:4:12:9
chr16	23711925	.	C	G	489.57	PASS	AF=0.582278;AO=46;DP=79;FAO=46;FDP=79;FR=.;FRO=33;FSAF=18;FSAR=28;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=-0.0048701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.051;QD=24.7882;RBI=0.0497887;REFB=-0.00672708;REVB=-0.04955;RO=33;SAF=18;SAR=28;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0734844;STB=0.540277;STBP=0.393;TYPE=snp;VARB=0.00813381;OID=.;OPOS=23711925;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:33:33:46:46:0.582278:28:18:16:17:28:18:16:17
chr16	24226934	.	G	A	141.23	PASS	AF=0.316667;AO=19;DP=61;FAO=19;FDP=60;FR=.;FRO=41;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=19;FWDB=-0.0186839;FXX=0.0163908;HRUN=4;LEN=1;MLLD=262.594;QD=9.41513;RBI=0.0205311;REFB=-0.00834879;REVB=-0.00851117;RO=40;SAF=9;SAR=10;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0872837;STB=0.542862;STBP=0.668;TYPE=snp;VARB=0.0186884;OID=.;OPOS=24226934;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:60:40:41:19:19:0.316667:10:9:22:18:10:9:22:19
chr16	24564879	.	GTA	G	219.7	PASS	AF=0.583333;AO=19;DP=35;FAO=21;FDP=36;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.0163539;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=2;MLLD=201.887;QD=24.4112;RBI=0.0309185;REFB=-0.10187;REVB=0.0262394;RO=14;SAF=7;SAR=12;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0481957;STB=0.530583;STBP=0.668;TYPE=del;VARB=0.0636046;OID=.;OPOS=24564880;OREF=TA;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.583333:19:35:21:36:15:7:14:6:9:99:14:7:12:6:8
chr16	24834233	.	C	T	268.72	PASS	AF=0.520833;AO=25;DP=48;FAO=25;FDP=48;FR=.;FRO=23;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=0.00254622;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.616;QD=22.3932;RBI=0.0164394;REFB=0.014006;REVB=0.016241;RO=23;SAF=16;SAR=9;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0287996;STB=0.516116;STBP=0.846;TYPE=snp;VARB=-0.0113889;OID=.;OPOS=24834233;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:23:23:25:25:0.520833:9:16:14:9:9:16:14:9
chr16	24902194	.	T	C	2022.71	PASS	AF=0.963768;AO=133;DP=139;FAO=133;FDP=138;FR=.;FRO=5;FSAF=72;FSAR=61;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=-0.00434305;FXX=0.0142847;HRUN=4;LEN=1;MLLD=132.272;QD=58.6292;RBI=0.0157148;REFB=-0.185978;REVB=0.0151027;RO=1;SAF=72;SAR=61;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00655629;STB=0.512426;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=0.00133586;OID=.;OPOS=24902194;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:139:138:1:5:133:133:0.963768:61:72:1:0:61:72:1:4
chr16	25137289	.	G	C	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0533889;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.212;QD=52.6132;RBI=0.053389;REFB=0;REVB=-3.924e-05;RO=0;SAF=13;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2029e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0002711;OID=.;OPOS=25137289;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:9:13:0:0:9:13:0:0
chr16	25137385	.	G	A	430.58	PASS	AF=0.5;AO=43;DP=86;FAO=43;FDP=86;FR=.;FRO=43;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=25;FSRR=18;FWDB=-0.0106831;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.0796;QD=20.0271;RBI=0.0109589;REFB=0.00188042;REVB=-0.00244308;RO=43;SAF=22;SAR=21;SRF=25;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0630456;STB=0.534943;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=-0.00195065;OID=.;OPOS=25137385;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:43:43:43:43:0.5:21:22:25:18:21:22:25:18
chr16	25239805	.	G	C	271.86	PASS	AF=0.517857;AO=29;DP=56;FAO=29;FDP=56;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=0.00633327;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.3607;QD=19.4189;RBI=0.0691405;REFB=-0.00770939;REVB=0.0688498;RO=27;SAF=13;SAR=16;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0289143;STB=0.516118;STBP=0.824;TYPE=snp;VARB=0.00910638;OID=.;OPOS=25239805;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:27:27:29:29:0.517857:16:13:13:14:16:13:13:14
chr16	25255506	.	C	T	255.58	PASS	AF=0.519231;AO=27;DP=55;FAO=27;FDP=52;FR=.;FRO=25;FSAF=22;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=0.0004783;FXX=0.0545355;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.602;QD=19.6601;RBI=0.00257086;REFB=-0.0054686;REVB=0.00252597;RO=28;SAF=22;SAR=5;SRF=20;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135347;STB=0.594518;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=0.00568461;OID=.;OPOS=25255506;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:52:28:25:27:27:0.519231:5:22:20:8:5:22:17:8
chr16	25258035	.	A	G	75.14	PASS	AF=0.37037;AO=10;DP=27;FAO=10;FDP=27;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=0.00423448;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.286;QD=11.1312;RBI=0.047729;REFB=-0.0241718;REVB=-0.0475407;RO=17;SAF=9;SAR=1;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.414426;STB=0.758388;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=0.0300272;OID=.;OPOS=25258035;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:27:27:17:17:10:10:0.37037:1:9:11:6:1:9:11:6
chr16	25263278	.	G	A	222.87	PASS	AF=0.385714;AO=27;DP=70;FAO=27;FDP=70;FR=.;FRO=43;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=-0.036468;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.3612;QD=12.7357;RBI=0.0493373;REFB=-0.0126785;REVB=-0.0332304;RO=43;SAF=17;SAR=10;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154348;STB=0.588678;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=0.0177847;OID=.;OPOS=25263278;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:43:43:27:27:0.385714:10:17:21:22:10:17:21:22
chr16	25268368	.	A	G	67.43	PASS	AF=0.45;AO=9;DP=20;FAO=9;FDP=20;FR=.;FRO=11;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.0370021;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=306.105;QD=13.486;RBI=0.0414658;REFB=0.00108451;REVB=-0.0187152;RO=11;SAF=1;SAR=8;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.447363;STB=0.77345;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=-0.00154899;OID=.;OPOS=25268368;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:20:20:11:11:9:9:0.45:8:1:5:6:8:1:5:6
chr16	27226106	.	G	A	785.88	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00266834;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.915;QD=64.1537;RBI=0.00902582;REFB=0;REVB=0.00862238;RO=0;SAF=23;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.04066e-06;OID=.;OPOS=27226106;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:26:23:0:0:26:23:0:0
chr16	27246617	.	T	C	868.26	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00733506;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.39;QD=57.8841;RBI=0.0227557;REFB=0;REVB=-0.0215411;RO=0;SAF=30;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000230833;OID=.;OPOS=27246617;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:30:30:0:0:30:30:0:0
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chr16	27371158	.	C	T	923.55	PASS	AF=0.984615;AO=64;DP=65;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00267527;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.4379;QD=56.8337;RBI=0.00732253;REFB=-0.11646;REVB=0.00681633;RO=0;SAF=32;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50769;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=0.00096569;OID=.;OPOS=27371158;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:65:65:0:1:64:64:0.984615:32:32:0:0:32:32:0:1
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chr16	27772901	.	G	A	826.39	PASS	AF=0.910448;AO=61;DP=67;FAO=61;FDP=67;FR=.;FRO=6;FSAF=22;FSAR=39;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0339671;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=172.518;QD=49.3369;RBI=0.0343401;REFB=-0.034324;REVB=-0.00504744;RO=4;SAF=22;SAR=39;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0482075;STB=0.513424;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.00031067;OID=.;OPOS=27772901;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:23:67:67:4:6:61:61:0.910448:39:22:3:1:39:22:3:3
chr16	27974487	.	T	C	785.21	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.031929;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.3211;QD=57.1059;RBI=0.0364288;REFB=0;REVB=0.0175385;RO=0;SAF=23;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.49259e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.79378e-05;OID=.;OPOS=27974487;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:32:23:0:0:32:23:0:0
chr16	28506872	.	A	G	50.41	PASS	AF=0.583333;AO=7;DP=12;FAO=7;FDP=12;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.00190774;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.4678;QD=16.8043;RBI=0.152364;REFB=-0.0435782;REVB=-0.152352;RO=4;SAF=5;SAR=2;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149414;STB=0.55539;STBP=0.694;TYPE=snp;VARB=0.0488689;OID=.;OPOS=28506872;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:12:12:4:5:7:7:0.583333:2:5:2:2:2:5:3:2
chr16	28508447	.	A	G	87.46	PASS	AF=0.423077;AO=10;DP=26;FAO=11;FDP=26;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.0386394;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.144;QD=13.4559;RBI=0.0386394;REFB=-0.00358992;REVB=-6.03931e-06;RO=15;SAF=6;SAR=4;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13532;STB=0.599815;STBP=0.404;TYPE=snp;VARB=0.00493043;OID=.;OPOS=28508447;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:26:26:15:15:10:11:0.423077:4:6:7:8:4:7:7:8
chr16	28508716	.	T	C,G	300.26	PASS	AF=0.913043,0.0869565;AO=21,2;DP=23;FAO=21,2;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=6,2;FSAR=15,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142551,-0.0138414;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=146.565,80.6615;QD=52.2189;RBI=0.0371085,0.0138486;REFB=0,0;REVB=0.0342613,-0.000446447;RO=0;SAF=6,2;SAR=15,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-3.65878e-05,0.148094;OID=.,.;OPOS=28508716,28508716;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:23:23:0:0:21,2:21,2:0.913043,0.0869565:15,0:6,2:0:0:15,0:6,2:0:0
chr16	28513403	.	A	G	210.26	PASS	AF=0.366197;AO=26;DP=71;FAO=26;FDP=71;FR=.;FRO=45;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=23;FSRR=22;FWDB=0.0113798;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.563;QD=11.8456;RBI=0.011466;REFB=-0.011271;REVB=0.00140381;RO=45;SAF=13;SAR=13;SRF=23;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0121934;STB=0.507037;STBP=0.949;TYPE=snp;VARB=0.017357;OID=.;OPOS=28513403;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:45:45:26:26:0.366197:13:13:23:22:13:13:23:22
chr16	28603393	.	T	C	147.56	PASS	AF=0.875;AO=14;DP=16;FAO=14;FDP=16;FR=.;FRO=2;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0159886;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.3743;QD=36.8899;RBI=0.0163835;REFB=-0.0206337;REVB=-0.00357526;RO=1;SAF=8;SAR=6;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0534678;STB=0.555478;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=0.0117743;OID=.;OPOS=28603393;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:16:16:1:2:14:14:0.875:6:8:1:0:6:8:2:0
chr16	28603655	.	T	G	509.86	PASS	AF=0.317972;AO=64;DP=214;FAO=69;FDP=217;FR=.;FRO=148;FSAF=29;FSAR=40;FSRF=73;FSRR=75;FWDB=0.0383319;FXX=0.009132;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.6742;QD=9.39827;RBI=0.0462434;REFB=-0.00714513;REVB=0.0258674;RO=149;SAF=24;SAR=40;SRF=74;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148885;STB=0.550221;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.0194572;OID=.;OPOS=28603655;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:214:217:149:148:64:69:0.317972:40:24:74:75:40:29:73:75
chr16	28617485	.	C	T	867.7	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00231785;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.238;QD=57.8467;RBI=0.0223146;REFB=0;REVB=0.0221939;RO=0;SAF=26;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.03115e-05;OID=.;OPOS=28617485;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:34:26:0:0:34:26:0:0
chr16	28617514	.	C	T	95.33	PASS	AF=0.197531;AO=15;DP=81;FAO=16;FDP=81;FR=.;FRO=65;FSAF=13;FSAR=3;FSRF=24;FSRR=41;FWDB=0.018046;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.1202;QD=4.70746;RBI=0.0279883;REFB=-0.00950602;REVB=-0.0213936;RO=65;SAF=12;SAR=3;SRF=24;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.517241;STB=0.837085;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.0247792;OID=.;OPOS=28617514;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:81:81:65:65:15:16:0.197531:3:12:24:41:3:13:24:41
chr16	28617552	.	C	G	101.06	PASS	AF=0.188889;AO=17;DP=91;FAO=17;FDP=90;FR=.;FRO=73;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=28;FSRR=45;FWDB=-0.00666145;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=288.315;QD=4.49149;RBI=0.0136949;REFB=-0.00120855;REVB=-0.0119656;RO=73;SAF=14;SAR=3;SRF=28;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.536575;STB=0.841721;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.00662736;OID=.;OPOS=28617552;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:90:73:73:17:17:0.188889:3:14:28:45:3:14:28:45
chr16	28619911	.	T	C	98.21	PASS	AF=0.168224;AO=18;DP=107;FAO=18;FDP=107;FR=.;FRO=89;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=48;FSRR=41;FWDB=-0.00202027;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.734;QD=3.67131;RBI=0.00771601;REFB=7.64064e-05;REVB=-0.00744683;RO=86;SAF=11;SAR=7;SRF=46;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0982194;STB=0.561036;STBP=0.554;TYPE=snp;VARB=-0.000606316;OID=.;OPOS=28619911;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:107:107:86:89:18:18:0.168224:7:11:46:40:7:11:48:41
chr16	28619920	.	A	G	97.04	PASS	AF=0.17;AO=17;DP=101;FAO=17;FDP=100;FR=.;FRO=83;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=47;FSRR=36;FWDB=-0.0189728;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.689;QD=3.8818;RBI=0.0190566;REFB=-0.00470652;REVB=-0.001785;RO=82;SAF=10;SAR=7;SRF=47;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0195188;STB=0.518675;STBP=0.889;TYPE=snp;VARB=0.0270222;OID=.;OPOS=28619920;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:101:100:82:83:17:17:0.17:7:10:47:35:7:10:47:36
chr16	28621311	.	T	C	102.27	PASS	AF=0.144828;AO=21;DP=145;FAO=21;FDP=145;FR=.;FRO=124;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=62;FSRR=62;FWDB=0.0148084;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.469;QD=2.82128;RBI=0.0455369;REFB=-0.00362309;REVB=-0.0430618;RO=123;SAF=13;SAR=8;SRF=62;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146586;STB=0.602551;STBP=0.331;TYPE=snp;VARB=0.0144962;OID=.;OPOS=28621311;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:145:145:123:124:21:21:0.144828:8:13:62:61:8:13:62:62
chr16	28734477	.	G	T	82.7	PASS	AF=0.305556;AO=11;DP=36;FAO=11;FDP=36;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=20;FSRR=5;FWDB=0.00566865;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.706;QD=9.18859;RBI=0.0335584;REFB=-0.002877;REVB=0.0330761;RO=25;SAF=9;SAR=2;SRF=20;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0337091;STB=0.520623;STBP=0.921;TYPE=snp;VARB=0.00672556;OID=.;OPOS=28734477;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:82:36:36:25:25:11:11:0.305556:2:9:20:5:2:9:20:5
chr16	28842311	.	A	G	632.26	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0152634;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=271.018;QD=61.684;RBI=0.0190058;REFB=0;REVB=0.0113247;RO=0;SAF=26;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.29418e-06;OID=.;OPOS=28842311;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:15:26:0:0:15:26:0:0
chr16	28883241	.	A	G	60.3	PASS	AF=0.571429;AO=8;DP=14;FAO=8;FDP=14;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=-0.0267336;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.075;QD=17.2298;RBI=0.0316113;REFB=-0.000321824;REVB=0.0168696;RO=6;SAF=1;SAR=7;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0651668;STB=0.538359;STBP=0.894;TYPE=snp;VARB=0.000277491;OID=.;OPOS=28883241;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:14:14:6:6:8:8:0.571429:7:1:1:5:7:1:1:5
chr16	28893137	.	G	A	50.86	PASS	AF=0.5;AO=7;DP=15;FAO=7;FDP=14;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.00395325;FXX=0.124922;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.137;QD=14.5327;RBI=0.00925167;REFB=0.0193693;REVB=-0.00836452;RO=8;SAF=2;SAR=5;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.206125;STB=0.713673;STBP=0.192;TYPE=snp;VARB=-0.00594443;OID=.;OPOS=28893137;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:48:15:14:8:7:7:7:0.5:5:2:4:4:5:2:5:2
chr16	28898793	.	T	C	220.43	PASS	AF=0.454545;AO=25;DP=55;FAO=25;FDP=55;FR=.;FRO=30;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=10;FWDB=-0.00628742;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.336;QD=16.0309;RBI=0.0316874;REFB=-0.0110416;REVB=0.0310574;RO=30;SAF=14;SAR=11;SRF=20;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106146;STB=0.559834;STBP=0.448;TYPE=snp;VARB=0.014012;OID=.;OPOS=28898793;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:30:30:25:25:0.454545:11:14:20:10:11:14:20:10
chr16	28913651	.	G	C	150.07	PASS	AF=0.516129;AO=15;DP=30;FAO=16;FDP=31;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=-0.000769962;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.628;QD=19.364;RBI=0.0056956;REFB=-0.000700687;REVB=-0.00564331;RO=13;SAF=4;SAR=11;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114985;STB=0.588118;STBP=0.351;TYPE=snp;VARB=0.00087107;OID=.;OPOS=28913651;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:31:13:15:15:16:0.516129:11:4:5:8:12:4:6:9
chr16	28915527	.	G	A	493.74	PASS	AF=0.642857;AO=45;DP=71;FAO=45;FDP=70;FR=.;FRO=25;FSAF=17;FSAR=28;FSRF=6;FSRR=19;FWDB=-0.00696705;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.355;QD=28.2138;RBI=0.0131286;REFB=-0.0151108;REVB=0.0111274;RO=24;SAF=17;SAR=28;SRF=6;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0892121;STB=0.553685;STBP=0.265;TYPE=snp;VARB=0.00884897;OID=.;OPOS=28915527;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:70:24:25:45:45:0.642857:28:17:6:18:28:17:6:19
chr16	28944396	.	C	G	327.89	PASS	AF=0.651163;AO=28;DP=43;FAO=28;FDP=43;FR=.;FRO=15;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=4;FWDB=-0.0146203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.4039;QD=30.5017;RBI=0.0226783;REFB=-0.0214701;REVB=0.0173364;RO=15;SAF=17;SAR=11;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0859452;STB=0.547037;STBP=0.403;TYPE=snp;VARB=0.0137542;OID=.;OPOS=28944396;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:15:15:28:28:0.651163:11:17:11:4:11:17:11:4
chr16	28944700	.	G	T	735.47	PASS	AF=0.653465;AO=64;DP=99;FAO=66;FDP=101;FR=.;FRO=35;FSAF=43;FSAR=23;FSRF=22;FSRR=13;FWDB=0.0156537;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.811;QD=29.1276;RBI=0.0247707;REFB=-0.00451437;REVB=0.0191976;RO=35;SAF=41;SAR=23;SRF=22;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00852175;STB=0.508706;STBP=0.826;TYPE=snp;VARB=0.00167432;OID=.;OPOS=28944700;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:101:35:35:64:66:0.653465:23:41:22:13:23:43:22:13
chr16	28995757	.	C	A	654.83	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00611501;FXX=0.0232504;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.187;QD=62.365;RBI=0.00927165;REFB=0;REVB=0.00696923;RO=0;SAF=18;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.42877e-05;OID=.;OPOS=28995757;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:24:18:0:0:24:18:0:0
chr16	29057392	.	A	G	385.25	PASS	AF=0.575758;AO=38;DP=66;FAO=38;FDP=66;FR=.;FRO=28;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=0.0293543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.629;QD=23.3482;RBI=0.0337408;REFB=0.00614647;REVB=0.0166363;RO=28;SAF=22;SAR=16;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0510552;STB=0.528038;STBP=0.638;TYPE=snp;VARB=-0.00251493;OID=.;OPOS=29057392;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:28:28:38:38:0.575758:16:22:18:10:16:22:18:10
chr16	29097556	.	C	CAT	33.39	PASS	AF=0.15;AO=6;DP=40;FAO=6;FDP=40;FR=.;FRO=34;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=25;FWDB=-0.0308221;FXX=0;HRUN=0;LEN=2;MLLD=115.346;QD=3.33867;RBI=0.0339666;REFB=0.00534425;REVB=0.0142735;RO=34;SAF=3;SAR=3;SRF=9;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.292992;STB=0.69944;STBP=0.372;TYPE=ins;VARB=-0.0456675;OID=.;OPOS=29097557;OREF=-;OALT=AT;OMAPALT=CAT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.15:6:40:6:40:34:3:3:9:25:33:34:3:3:9:25
chr16	29124421	.	T	C	1396.27	PASS	AF=1;AO=88;DP=88;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0225657;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.965;QD=62.7535;RBI=0.023084;REFB=0;REVB=0.00486411;RO=0;SAF=46;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.80135e-05;OID=.;OPOS=29124421;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:88:89:0:0:88:89:1:42:46:0:0:43:46:0:0
chr16	29580611	.	G	A	323.44	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0659599;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.3755;QD=53.9067;RBI=0.0659887;REFB=0;REVB=-0.00194848;RO=0;SAF=12;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.001314;OID=.;OPOS=29580611;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:12:12:0:0:12:12:0:0
chr16	29624931	.	G	A	66.35	PASS	AF=0.529412;AO=8;DP=17;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.0522599;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.0717;QD=15.6117;RBI=0.0523333;REFB=-0.000599226;REVB=0.00277232;RO=8;SAF=4;SAR=4;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105859;STB=0.53326;STBP=0.858;TYPE=snp;VARB=0.0079149;OID=.;OPOS=29624931;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:17:17:8:8:8:9:0.529412:4:4:3:5:5:4:3:5
chr16	29675886	.	G	A	370.17	PASS	AF=0.632653;AO=31;DP=49;FAO=31;FDP=49;FR=.;FRO=18;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=4;FSRR=14;FWDB=0.0169436;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.0496;QD=30.2182;RBI=0.0650533;REFB=-0.0261764;REVB=0.062808;RO=18;SAF=18;SAR=13;SRF=4;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.236596;STB=0.629452;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0171149;OID=.;OPOS=29675886;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:18:18:31:31:0.632653:13:18:4:14:13:18:4:14
chr16	29675928	.	C	T	310.29	PASS	AF=1;AO=23;DP=24;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0484629;FXX=0.0416493;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.029;QD=53.9628;RBI=0.0775717;REFB=0;REVB=0.0605699;RO=0;SAF=9;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.84921e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00055199;OID=.;OPOS=29675928;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:23:0:0:23:23:1:14:9:0:0:14:9:0:0
chr16	29677841	.	T	A	39.97	PASS	AF=0.75;AO=5;DP=8;FAO=6;FDP=8;FR=.;FRO=2;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=23.6962;QD=19.9871;RBI=0.134087;REFB=-0.137719;REVB=0.134087;RO=3;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.10144;OID=.;OPOS=29677841;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:8:8:3:2:5:6:0.75:5:0:0:3:6:0:0:2
chr16	29677843	.	T	A	57.01	PASS	AF=0.875;AO=7;DP=8;FAO=7;FDP=8;FR=.;FRO=1;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.3011;QD=28.5067;RBI=0.188867;REFB=-0.152453;REVB=0.188867;RO=1;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0282508;OID=.;OPOS=29677843;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:8:8:1:1:7:7:0.875:7:0:0:1:7:0:0:1
chr16	29677845	.	T	A	57.07	PASS	AF=0.875;AO=7;DP=8;FAO=7;FDP=8;FR=.;FRO=1;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.0125;QD=28.5365;RBI=0.0133078;REFB=-0.029604;REVB=0.0133078;RO=1;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00495479;OID=.;OPOS=29677845;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:8:8:1:1:7:7:0.875:7:0:0:1:7:0:0:1
chr16	29679989	.	A	G	83.28	PASS	AF=0.9;AO=9;DP=10;FAO=9;FDP=10;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0871584;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.8202;QD=33.3129;RBI=0.0927867;REFB=-0.204525;REVB=-0.0318245;RO=1;SAF=6;SAR=3;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0684198;STB=0.538378;STBP=0.622;TYPE=snp;VARB=0.0450709;OID=.;OPOS=29679989;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:10:10:1:1:9:9:0.9:3:6:1:0:3:6:1:0
chr16	29680036	.	T	A,TGGGATTATAGGTGTGAGCCA	89.01	PASS	AF=0.178571,0.357143;AO=5,5;DP=29;FAO=5,10;FDP=28;FR=.;FRO=13;FSAF=5,8;FSAR=0,2;FSRF=11;FSRR=2;FWDB=-0.000887173,-0.0349322;FXX=0.0344709;HRUN=1,3;LEN=1,20;MLLD=208.873,188.128;QD=12.7163;RBI=0.00827419,0.0350118;REFB=-0.019302,-0.0232416;REVB=0.0082265,-0.00236032;RO=15;SAF=5,4;SAR=0,1;SRF=13;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.624967,-0.13333;STB=0.996428,0.542776;STBP=0.24,0.806;TYPE=snp,ins;VARB=0.0155719,0.0246524;OID=.,.;OPOS=29680036,29680037;OREF=T,-;OALT=A,GGGATTATAGGTGTGAGCCA;OMAPALT=A,TGGGATTATAGGTGTGAGCCA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:49:29:28:15:13:5,5:5,10:0.178571,0.357143:0,1:5,4:13:2:0,2:5,8:11:2
chr16	29680256	.	T	G	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0762215;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.176;QD=33.4285;RBI=0.0767912;REFB=0;REVB=-0.00933629;RO=0;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00161087;OID=.;OPOS=29680256;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:5:1:0:0:5:1:0:0
chr16	29680389	.	A	C	1514.83	PASS	AF=0.989691;AO=96;DP=97;FAO=96;FDP=97;FR=.;FRO=1;FSAF=72;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0142789;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.31;QD=62.4671;RBI=0.0416239;REFB=0.0117805;REVB=0.0390981;RO=1;SAF=72;SAR=24;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0193458;STB=0.510202;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=3.20819e-05;OID=.;OPOS=29680389;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:97:97:1:1:96:96:0.989691:24:72:0:1:24:72:0:1
chr16	29708350	.	A	G	520.04	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.02694;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.5165;QD=59.4326;RBI=0.0790414;REFB=0;REVB=-0.0743086;RO=0;SAF=18;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00198198;OID=.;OPOS=29708350;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:17:18:0:0:17:18:0:0
chr16	29790864	.	G	A	1540.19	PASS	AF=1;AO=102;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00242765;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.0793;QD=59.8131;RBI=0.0527782;REFB=0;REVB=0.0527223;RO=1;SAF=61;SAR=41;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0114312;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000362578;OID=.;OPOS=29790864;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:103:103:1:0:102:103:1:41:61:0:1:42:61:0:0
chr16	29791561	.	T	G	1556.35	PASS	AF=1;AO=104;DP=104;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0292759;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.4853;QD=59.8597;RBI=0.0391183;REFB=0;REVB=-0.0259454;RO=0;SAF=49;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.26393e-05;OID=.;OPOS=29791561;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:104:104:0:0:104:104:1:55:49:0:0:55:49:0:0
chr16	29791721	.	G	C	429.01	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=2.37402e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.8216;QD=57.2019;RBI=0.0217843;REFB=0;REVB=-0.0217843;RO=0;SAF=10;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000440497;OID=.;OPOS=29791721;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:20:10:0:0:20:10:0:0
chr16	29811319	.	C	T	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0274107;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.506;QD=40.7629;RBI=0.0306815;REFB=0;REVB=-0.0137843;RO=0;SAF=5;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000386984;OID=.;OPOS=29811319;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:5:5:0:0:5:5:0:0
chr16	29814234	.	G	A	1259.73	PASS	AF=0.976471;AO=83;DP=86;FAO=83;FDP=85;FR=.;FRO=2;FSAF=39;FSAR=44;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0176479;FXX=0.0116266;HRUN=2;LEN=1;MLLD=255.053;QD=59.2815;RBI=0.025504;REFB=-0.221109;REVB=0.0184122;RO=2;SAF=39;SAR=44;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00134667;STB=0.500711;STBP=0.848;TYPE=snp;VARB=0.00120012;OID=.;OPOS=29814234;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:86:85:2:2:83:83:0.976471:44:39:1:1:44:39:1:1
chr16	29818053	.	GC	G,GG	67.19	PASS	AF=0.347826,0.0869565;AO=10,4;DP=46;FAO=16,4;FDP=46;FR=.;FRO=26;FSAF=10,0;FSAR=6,4;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=-0.0485328,0.0419029;FXX=0;HRUN=8,8;LEN=1,1;MLLD=7.18995,16.7186;QD=5.84228;RBI=0.0997768,0.201921;REFB=-0.114408,-0.0488381;REVB=0.0871779,0.197525;RO=24;SAF=6,0;SAR=4,4;SRF=11;SRR=13;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.162206,-0.616534;STB=0.555485,0.997342;STBP=0.591,0.028;TYPE=del,snp;VARB=0.0659021,0.0622506;OID=.,.;OPOS=29818054,29818054;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.347826,0.0869565:10,4:46:16,4:46:26:10,0:6,4:14:12:37:24:6,0:4,4:11:13
chr16	29821744	.	G	A	711.9	PASS	AF=1;AO=50;DP=53;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0314696;FXX=0.0565931;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.569;QD=56.952;RBI=0.0315717;REFB=0;REVB=0.00253638;RO=0;SAF=26;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.10374e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000179221;OID=.;OPOS=29821744;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:50:0:0:50:50:1:24:26:0:0:24:26:0:0
chr16	29825014	.	GGCC	GCCC,GC,GGC,GG	161.61	PASS	AF=0,0.84,0,0;AO=2,8,3,3;DP=27;FAO=0,21,0,0;FDP=25;FR=.;FRO=4;FSAF=0,8,0,0;FSAR=0,13,0,0;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.711467,0.0878138,-0.63349,-0.350427;FXX=0;HRUN=4,4,9,9;LEN=1,2,1,2;MLLD=6.35421,15.4565,6.47792,10.1504;QD=25.8571;RBI=0.720862,0.266309,0.726721,0.39882;REFB=-0.19557,-0.00812554,0.168386,0.103287;REVB=-0.116003,0.251414,0.356108,0.190415;RO=5;SAF=0,0,2,3;SAR=2,8,1,0;SRF=0;SRR=5;SSEN=0,0.435374,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=0,0,0.584388,0.794084;STB=0.5,0.566606,0.5,0.5;STBP=1,0.206,1,1;TYPE=snp,del,del,del;VARB=0,0.0167552,0,0;OID=.,.,.,.;OPOS=29825015,29825015,29825016,29825016;OREF=G,GC,C,CC;OALT=C,-,-,-;OMAPALT=GCCC,GC,GGC,GG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,0.84,0,0:2,8,3,3:27:0,21,0,0:25:4:0,8,0,0:0,13,0,0:0:4:18:5:0,0,2,3:2,8,1,0:0:5
chr16	29825126	.	T	C	1109.53	PASS	AF=0.95;AO=76;DP=80;FAO=76;FDP=80;FR=.;FRO=4;FSAF=24;FSAR=52;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.00799246;FXX=0.0123442;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.7326;QD=55.4767;RBI=0.0289171;REFB=0.0246546;REVB=-0.0277907;RO=4;SAF=24;SAR=52;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0465609;STB=0.524657;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=-0.00424819;OID=.;OPOS=29825126;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:80:80:4:4:76:76:0.95:52:24:3:1:52:24:3:1
chr16	29826538	.	T	C	145.24	PASS	AF=1;AO=10;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0058997;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.426;QD=44.6898;RBI=0.0154448;REFB=0;REVB=0.0142736;RO=0;SAF=8;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.44463e-05;OID=.;OPOS=29826538;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:10:13:1:2:8:0:0:2:11:0:0
chr16	29882490	.	C	T	91.61	PASS	AF=0.292683;AO=12;DP=41;FAO=12;FDP=41;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=-0.0562967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.1647;QD=8.93791;RBI=0.0570245;REFB=0.00516557;REVB=0.00908155;RO=28;SAF=8;SAR=4;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.273809;STB=0.655476;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=-0.0144236;OID=.;OPOS=29882490;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:91:41:41:28:29:12:12:0.292683:4:8:12:16:4:8:13:16
chr16	29899123	.	G	T	138.52	PASS	AF=0.340426;AO=16;DP=47;FAO=16;FDP=47;FR=.;FRO=31;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=0.042173;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.0193;QD=11.7885;RBI=0.0562311;REFB=-0.0130099;REVB=0.0371937;RO=31;SAF=7;SAR=9;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19371;STB=0.614034;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.0254978;OID=.;OPOS=29899123;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:31:31:16:16:0.340426:9:7:19:12:9:7:19:12
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chr16	30021402	.	C	T	216.34	PASS	AF=0.538462;AO=21;DP=39;FAO=21;FDP=39;FR=.;FRO=18;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=0.00255023;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=275.842;QD=22.1886;RBI=0.00364458;REFB=-0.0117924;REVB=0.00260371;RO=18;SAF=13;SAR=8;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0420569;STB=0.523538;STBP=0.803;TYPE=snp;VARB=0.0074812;OID=.;OPOS=30021402;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:18:18:21:21:0.538462:8:13:12:6:8:13:12:6
chr16	30034986	.	G	A	102.4	PASS	AF=0.545455;AO=12;DP=22;FAO=12;FDP=22;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.017418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.905;QD=18.6178;RBI=0.0251634;REFB=-0.0277491;REVB=0.0181607;RO=10;SAF=7;SAR=5;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0972526;STB=0.555466;STBP=0.642;TYPE=snp;VARB=0.0175586;OID=.;OPOS=30034986;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:22:22:10:10:12:12:0.545455:5:7:7:3:5:7:7:3
chr16	30037128	.	A	C	150.98	PASS	AF=0.533333;AO=15;DP=29;FAO=16;FDP=30;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.0377425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.718;QD=20.1299;RBI=0.0515752;REFB=-0.0445862;REVB=-0.0351497;RO=14;SAF=7;SAR=8;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0325116;STB=0.533292;STBP=0.732;TYPE=snp;VARB=0.0273055;OID=.;OPOS=30037128;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:30:14:14:15:16:0.533333:8:7:6:8:8:8:6:8
chr16	30100451	.	G	A	420.77	PASS	AF=0.75;AO=33;DP=44;FAO=33;FDP=44;FR=.;FRO=11;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.00974376;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=235.49;QD=38.252;RBI=0.0115746;REFB=-0.0110016;REVB=-0.00624741;RO=11;SAF=18;SAR=15;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.46743e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0047432;OID=.;OPOS=30100451;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:80:44:44:11:11:33:33:0.75:15:18:6:5:15:18:6:5
chr16	30106221	.	G	A	111.02	PASS	AF=0.40625;AO=13;DP=32;FAO=13;FDP=32;FR=.;FRO=19;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.0948564;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.8883;QD=13.8773;RBI=0.096256;REFB=0.0115427;REVB=0.0163552;RO=18;SAF=3;SAR=10;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.396217;STB=0.745878;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=-0.00249245;OID=.;OPOS=30106221;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:18:19:13:13:0.40625:10:3:11:7:10:3:12:7
chr16	30119525	.	C	A	729.01	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0222059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.045;QD=57.1775;RBI=0.022677;REFB=0;REVB=0.0045983;RO=0;SAF=22;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.48987e-05;OID=.;OPOS=30119525;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:29:22:0:0:29:22:0:0
chr16	30124727	.	G	A	231.25	PASS	AF=0.464286;AO=26;DP=56;FAO=26;FDP=56;FR=.;FRO=30;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=-0.0131019;FXX=0.0175408;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.6922;QD=16.5181;RBI=0.0554605;REFB=-0.0485882;REVB=-0.0538907;RO=29;SAF=9;SAR=17;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134233;STB=0.56826;STBP=0.369;TYPE=snp;VARB=0.054138;OID=.;OPOS=30124727;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:29:30:26:26:0.464286:17:9:14:15:17:9:14:16
chr16	30198151	.	A	G	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00349582;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.602;QD=52.6132;RBI=0.00671153;REFB=0;REVB=-0.00572922;RO=0;SAF=14;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.29766e-05;OID=.;OPOS=30198151;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:8:14:0:0:8:14:0:0
chr16	30393660	.	G	A	538.56	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0167742;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=298.734;QD=59.8394;RBI=0.0255994;REFB=0;REVB=0.0193378;RO=0;SAF=28;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.31307e-05;OID=.;OPOS=30393660;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:8:28:0:0:8:28:0:0
chr16	30408765	.	C	T	817.75	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0418265;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.3656;QD=57.3856;RBI=0.0418438;REFB=0;REVB=-0.00120237;RO=0;SAF=36;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000278167;OID=.;OPOS=30408765;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:21:36:0:0:21:36:0:0
chr16	30671670	.	C	G	48.27	PASS	AF=0.0779221;AO=18;DP=231;FAO=18;FDP=231;FR=.;FRO=213;FSAF=3;FSAR=15;FSRF=140;FSRR=73;FWDB=0.00703504;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.503;QD=0.83579;RBI=0.0230774;REFB=-0.000570826;REVB=-0.0219789;RO=202;SAF=3;SAR=15;SRF=134;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.527691;STB=0.890058;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0589787;OID=.;OPOS=30671670;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:48:231:231:202:213:18:18:0.0779221:15:3:134:68:15:3:140:73
chr16	30724070	.	G	T	1324.48	PASS	AF=0.988506;AO=86;DP=87;FAO=86;FDP=87;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0208883;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.4372;QD=60.8958;RBI=0.027002;REFB=-0.0574947;REVB=0.0171111;RO=1;SAF=47;SAR=39;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0119932;STB=0.506328;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=0.00056483;OID=.;OPOS=30724070;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:87:87:1:1:86:86:0.988506:39:47:0:1:39:47:0:1
chr16	30734963	.	C	A	530.67	PASS	AF=0.925;AO=37;DP=40;FAO=37;FDP=40;FR=.;FRO=3;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0280625;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=283.385;QD=53.0673;RBI=0.0280718;REFB=-0.223245;REVB=-0.000722108;RO=1;SAF=23;SAR=14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.019929;STB=0.530596;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=0.00121019;OID=.;OPOS=30734963;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:40:40:1:3:37:37:0.925:14:23:1:0:14:23:3:0
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chr16	30768908	.	C	G	308.83	PASS	AF=0.448718;AO=34;DP=73;FAO=35;FDP=78;FR=.;FRO=43;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=-0.0404189;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=44.2883;QD=15.8374;RBI=0.0424988;REFB=-0.0501845;REVB=-0.0131326;RO=39;SAF=13;SAR=21;SRF=18;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0781175;STB=0.562464;STBP=0.348;TYPE=snp;VARB=0.0506778;OID=.;OPOS=30768908;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:78:39:43:34:35:0.448718:21:13:18:21:21:14:22:21
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chr16	30780828	.	A	G	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0110751;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.269;QD=43.4862;RBI=0.0303842;REFB=0;REVB=0.0282939;RO=0;SAF=5;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000389998;OID=.;OPOS=30780828;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:7:5:0:0:7:5:0:0
chr16	30793621	.	C	T	456.48	PASS	AF=0.425;AO=50;DP=120;FAO=51;FDP=120;FR=.;FRO=69;FSAF=19;FSAR=32;FSRF=41;FSRR=28;FWDB=-0.0139778;FXX=0.00826378;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.39;QD=15.216;RBI=0.0169436;REFB=-0.000845031;REVB=-0.00957638;RO=68;SAF=18;SAR=32;SRF=41;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.24921;STB=0.627401;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.00110012;OID=.;OPOS=30793621;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:120:68:69:50:51:0.425:32:18:41:27:32:19:41:28
chr16	30886643	.	T	C	229.62	PASS	AF=0.8;AO=20;DP=25;FAO=20;FDP=25;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=-0.0996429;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.5031;QD=36.7399;RBI=0.100862;REFB=-0.00129511;REVB=0.015631;RO=5;SAF=5;SAR=15;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131402;STB=0.571363;STBP=0.264;TYPE=snp;VARB=-0.00642981;OID=.;OPOS=30886643;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:25:25:5:5:20:20:0.8:15:5:0:5:15:5:0:5
chr16	30964940	.	A	G	788.16	PASS	AF=0.935484;AO=58;DP=62;FAO=58;FDP=62;FR=.;FRO=4;FSAF=40;FSAR=18;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0747167;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.0804;QD=50.8493;RBI=0.0747381;REFB=-0.086078;REVB=0.00178653;RO=4;SAF=40;SAR=18;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0085919;STB=0.504562;STBP=0.854;TYPE=snp;VARB=0.019707;OID=.;OPOS=30964940;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:62:62:4:4:58:58:0.935484:18:40:3:1:18:40:3:1
chr16	30977316	.	GC	G,GG	51.73	PASS	AF=0.416667,0.125;AO=10,3;DP=25;FAO=10,3;FDP=24;FR=.;FRO=11;FSAF=7,0;FSAR=3,3;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.0529821,0.0500004;FXX=0.039984;HRUN=7,7;LEN=1,1;MLLD=9.21877,30.4979;QD=8.62239;RBI=0.179329,0.105221;REFB=0.0325926,0.0140545;REVB=0.171324,0.0925821;RO=8;SAF=6,0;SAR=4,3;SRF=4;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0784731,-0.660908;STB=0.63608,0.99573;STBP=0.27,0.109;TYPE=del,snp;VARB=-0.0124291,-0.061252;OID=.,.;OPOS=30977317,30977317;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.416667,0.125:10,3:25:10,3:24:11:7,0:3,3:5:6:33:8:6,0:4,3:4:4
chr16	30999142	.	A	G	221.19	PASS	AF=0.567568;AO=21;DP=38;FAO=21;FDP=37;FR=.;FRO=16;FSAF=17;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=16;FWDB=0.0111871;FXX=0.0263089;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.9715;QD=23.9123;RBI=0.0111872;REFB=-0.0379057;REVB=-4.56047e-05;RO=0;SAF=17;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.45803e-08;STB=0.833033;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0191759;OID=.;OPOS=30999142;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:37:0:16:21:21:0.567568:4:17:0:0:4:17:0:16
chr16	30999462	.	T	C	837.13	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0340745;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.867;QD=57.7334;RBI=0.0352857;REFB=0;REVB=-0.00916567;RO=0;SAF=29;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000395037;OID=.;OPOS=30999462;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:29:29:0:0:29:29:0:0
chr16	31075175	.	G	A,C	751.94	PASS	AF=0.925926,0.0740741;AO=49,5;DP=54;FAO=50,4;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=23,0;FSAR=27,4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0243319,-0.0246425;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=111.373,63.5375;QD=55.699;RBI=0.0673093,0.029562;REFB=0,0;REVB=0.0627574,-0.0163298;RO=0;SAF=23,0;SAR=26,5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.003965,0.1734;OID=.,.;OPOS=31075175,31075175;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:54:54:0:0:49,5:50,4:0.925926,0.0740741:26,5:23,0:0:0:27,4:23,0:0:0
chr16	31075708	.	C	G	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0417231;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.105;QD=51.1841;RBI=0.0421795;REFB=0;REVB=0.00618839;RO=0;SAF=4;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000328107;OID=.;OPOS=31075708;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:16:4:0:0:16:4:0:0
chr16	31088347	.	G	A	885.25	PASS	AF=1;AO=60;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0292722;FXX=0.0161264;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.2694;QD=58.0495;RBI=0.048632;REFB=0;REVB=0.0388358;RO=0;SAF=33;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.7886e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000890422;OID=.;OPOS=31088347;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:60:61:1:27:33:0:0:28:33:0:0
chr16	31088625	.	A	G	288.34	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0147324;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.764;QD=52.4253;RBI=0.0415819;REFB=0;REVB=0.0388846;RO=0;SAF=14;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000122333;OID=.;OPOS=31088625;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:22:0:0:21:22:1:7:14:0:0:8:14:0:0
chr16	31093892	.	A	G	804.23	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0101163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.459;QD=64.338;RBI=0.0616642;REFB=0;REVB=0.0608287;RO=0;SAF=25;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000333139;OID=.;OPOS=31093892;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:50:0:0:49:50:1:24:25:0:0:25:25:0:0
chr16	31099011	.	T	C	280.81	PASS	AF=0.625;AO=25;DP=40;FAO=25;FDP=40;FR=.;FRO=15;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.0141223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.315;QD=28.0807;RBI=0.0206043;REFB=-0.00679009;REVB=0.0150033;RO=15;SAF=17;SAR=8;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155615;STB=0.586136;STBP=0.165;TYPE=snp;VARB=0.00454145;OID=.;OPOS=31099011;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:15:15:25:25:0.625:8:17:7:8:8:17:7:8
chr16	31104713	.	T	C	588.51	PASS	AF=0.557692;AO=58;DP=103;FAO=58;FDP=104;FR=.;FRO=46;FSAF=34;FSAR=24;FSRF=23;FSRR=23;FWDB=-0.0248292;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.825;QD=22.6349;RBI=0.0256156;REFB=-0.00947511;REVB=-0.00629858;RO=44;SAF=34;SAR=24;SRF=21;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0870339;STB=0.538759;STBP=0.406;TYPE=snp;VARB=0.00782188;OID=.;OPOS=31104713;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:104:44:46:58:58:0.557692:24:34:21:23:24:34:23:23
chr16	31121793	.	G	A	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0134697;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.633;QD=45.8068;RBI=0.0515448;REFB=0;REVB=0.0497537;RO=0;SAF=11;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000309809;OID=.;OPOS=31121793;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:3:11:0:0:3:11:0:0
chr16	31141826	.	A	G	411.11	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00577296;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.19;QD=56.7044;RBI=0.00986489;REFB=0;REVB=-0.00799931;RO=0;SAF=15;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000144769;OID=.;OPOS=31141826;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:14:15:0:0:14:15:0:0
chr16	31141880	.	A	G	429.02	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0239751;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.868;QD=57.2022;RBI=0.0491545;REFB=0;REVB=0.042911;RO=0;SAF=15;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.08046e-05;OID=.;OPOS=31141880;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:15:15:0:0:15:15:0:0
chr16	31153105	.	A	G	1084.14	PASS	AF=0.986486;AO=73;DP=74;FAO=73;FDP=74;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0315759;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.356;QD=58.6019;RBI=0.0588833;REFB=0.0343462;REVB=-0.0497012;RO=1;SAF=36;SAR=37;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129584;STB=0.506847;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=-0.000539335;OID=.;OPOS=31153105;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:74:74:1:1:73:73:0.986486:37:36:1:0:37:36:1:0
chr16	31154146	.	G	A	101.89	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0472483;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.872;QD=40.7566;RBI=0.0477343;REFB=0;REVB=0.00679427;RO=0;SAF=7;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00116469;OID=.;OPOS=31154146;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:3:7:0:0:3:7:0:0
chr16	31195279	.	C	T	868.27	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0294106;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=262.231;QD=57.8849;RBI=0.0478225;REFB=0;REVB=0.0377096;RO=0;SAF=37;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.03034e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.39465e-05;OID=.;OPOS=31195279;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:23:37:0:0:23:37:0:0
chr16	31230463	.	C	G,T	759.72	PASS	AF=0.0408163,0.959184;AO=2,46;DP=48;FAO=2,47;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=2,22;FSAR=0,25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00746546,0.0146331;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=92.0843,129.885;QD=62.0184;RBI=0.0148541,0.0519278;REFB=0,0;REVB=0.0128418,0.0498234;RO=0;SAF=2,22;SAR=0,24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.113362,-0.00297569;OID=.,.;OPOS=31230463,31230463;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:48:49:0:0:2,46:2,47:0.0408163,0.959184:0,24:2,22:0:0:0,25:2,22:0:0
chr16	31336719	.	G	A	270.05	PASS	AF=0.531915;AO=25;DP=47;FAO=25;FDP=47;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=6;FSRR=16;FWDB=-0.00502434;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.569;QD=22.9826;RBI=0.012329;REFB=0.00107481;REVB=0.0112588;RO=22;SAF=9;SAR=16;SRF=6;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.081648;STB=0.545419;STBP=0.55;TYPE=snp;VARB=-0.00121101;OID=.;OPOS=31336719;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:22:22:25:25:0.531915:16:9:6:16:16:9:6:16
chr16	31374256	.	A	C	111.42	PASS	AF=0.464286;AO=13;DP=28;FAO=13;FDP=28;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=0.0245273;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.08;QD=15.9167;RBI=0.0360047;REFB=-0.0496194;REVB=-0.0263581;RO=15;SAF=6;SAR=7;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188592;STB=0.608534;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=0.0416284;OID=.;OPOS=31374256;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:28:15:15:13:13:0.464286:7:6:10:5:7:6:10:5
chr16	31374535	.	C	G	72.94	PASS	AF=0.642857;AO=9;DP=14;FAO=9;FDP=14;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0293704;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=204.346;QD=20.8388;RBI=0.0315977;REFB=-0.0130421;REVB=-0.011653;RO=5;SAF=4;SAR=5;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157607;STB=0.589973;STBP=0.446;TYPE=snp;VARB=0.00826983;OID=.;OPOS=31374535;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:14:14:5:5:9:9:0.642857:5:4:1:4:5:4:1:4
chr16	31422429	.	T	C	1247.55	PASS	AF=1;AO=81;DP=82;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-2.0276e-05;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.345;QD=61.6076;RBI=0.0343511;REFB=0;REVB=0.0343511;RO=0;SAF=44;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000323977;OID=.;OPOS=31422429;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:81:0:0:81:81:1:37:44:0:0:37:44:0:0
chr16	31476458	.	C	T	1062.41	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0231119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.255;QD=59.8543;RBI=0.0242422;REFB=0;REVB=-0.00731579;RO=0;SAF=35;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11607e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.30483e-05;OID=.;OPOS=31476458;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:36:35:0:0:36:35:0:0
chr16	31926619	.	G	A	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0473031;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=302.975;QD=48.7373;RBI=0.0487268;REFB=0;REVB=-0.0116926;RO=0;SAF=6;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000119358;OID=.;OPOS=31926619;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:11:6:0:0:11:6:0:0
chr16	32077537	.	G	T	540.89	PASS	AF=0.359116;AO=64;DP=181;FAO=65;FDP=181;FR=.;FRO=116;FSAF=35;FSAR=30;FSRF=68;FSRR=48;FWDB=-0.00310281;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.252;QD=11.9534;RBI=0.00619333;REFB=0.00139701;REVB=-0.00536003;RO=116;SAF=34;SAR=30;SRF=68;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0626959;STB=0.530918;STBP=0.554;TYPE=snp;VARB=-0.00377098;OID=.;OPOS=32077537;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:181:181:116:116:64:65:0.359116:30:34:68:48:30:35:68:48
chr16	32077580	.	A	G	589.38	PASS	AF=0.356436;AO=73;DP=202;FAO=72;FDP=202;FR=.;FRO=130;FSAF=36;FSAR=36;FSRF=70;FSRR=60;FWDB=-0.00188138;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.2255;QD=11.6708;RBI=0.025258;REFB=-0.0179137;REVB=0.0251879;RO=126;SAF=36;SAR=37;SRF=68;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0518945;STB=0.524746;STBP=0.601;TYPE=snp;VARB=0.0312867;OID=.;OPOS=32077580;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:202:202:126:130:73:72:0.356436:37:36:68:58:36:36:70:60
chr16	32077650	.	G	T	395.84	PASS	AF=0.40708;AO=46;DP=113;FAO=46;FDP=113;FR=.;FRO=67;FSAF=19;FSAR=27;FSRF=27;FSRR=40;FWDB=0.0135315;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.35;QD=14.012;RBI=0.013566;REFB=-0.0115983;REVB=-0.000966599;RO=67;SAF=19;SAR=27;SRF=27;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0109172;STB=0.50616;STBP=0.917;TYPE=snp;VARB=0.0134775;OID=.;OPOS=32077650;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:113:67:67:46:46:0.40708:27:19:27:40:27:19:27:40
chr16	32191941	.	C	T	69.17	PASS	AF=0.222222;AO=10;DP=45;FAO=10;FDP=45;FR=.;FRO=35;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=0.00526694;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.174;QD=6.14833;RBI=0.0342714;REFB=-0.00471921;REVB=-0.0338643;RO=35;SAF=7;SAR=3;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.233722;STB=0.650851;STBP=0.325;TYPE=snp;VARB=0.017036;OID=.;OPOS=32191941;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:69:45:45:35:35:10:10:0.222222:3:7:18:17:3:7:18:17
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chr16	33629973	.	G	A	303.0	PASS	AF=0.35514;AO=38;DP=107;FAO=38;FDP=107;FR=.;FRO=69;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=52;FSRR=17;FWDB=-0.0186163;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=172.798;QD=11.327;RBI=0.021946;REFB=-0.0208071;REVB=-0.0116216;RO=69;SAF=14;SAR=24;SRF=52;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.41307;STB=0.733903;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0241799;OID=.;OPOS=33629973;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:107:69:69:38:38:0.35514:24:14:52:17:24:14:52:17
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chr16	33961658	.	AG	AA,GA	31.35	PASS	AF=0.0555556,0.111111;AO=2,4;DP=36;FAO=2,4;FDP=36;FR=.;FRO=30;FSAF=1,1;FSAR=1,3;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=-0.101795,-0.106626;FXX=0.0270197;HRUN=4,1;LEN=1,2;MLLD=45.0388,95.0656;QD=3.48306;RBI=0.102128,0.116507;REFB=-0.01282,-0.00385688;REVB=-0.0082381,-0.0469548;RO=29;SAF=1,1;SAR=1,3;SRF=14;SRR=15;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0154067,-0.269021;STB=0.5,0.72611;STBP=1,0.419;TYPE=snp,mnp;VARB=0.0987954,0.00425333;OID=.,.;OPOS=33961659,33961658;OREF=G,AG;OALT=A,GA;OMAPALT=AA,GA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:21:36:36:29:30:2,4:2,4:0.0555556,0.111111:1,3:1,1:14:15:1,3:1,1:15:15
chr16	33961671	.	CT	AG,CG	39.53	PASS	AF=0.147059,0.0588235;AO=5,2;DP=34;FAO=5,2;FDP=34;FR=.;FRO=27;FSAF=2,1;FSAR=3,1;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.0657959,-0.156353;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=2,1;MLLD=126.509,60.0622;QD=4.65021;RBI=0.0802996,0.165776;REFB=-0.0182611,-0.0357472;REVB=-0.0460318,-0.055094;RO=24;SAF=2,1;SAR=3,1;SRF=9;SRR=15;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0307313,0.119873;STB=0.538307,0.551216;STBP=0.946,0.858;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0645239,0.0162757;OID=.,.;OPOS=33961671,33961672;OREF=CT,T;OALT=AG,G;OMAPALT=AG,CG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:27:34:34:24:27:5,2:5,2:0.147059,0.0588235:3,1:2,1:9:15:3,1:2,1:12:15
chr16	33961810	.	T	C	46.82	PASS	AF=0.368421;AO=7;DP=19;FAO=7;FDP=19;FR=.;FRO=12;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.00021255;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.808;QD=9.85595;RBI=0.0321199;REFB=-0.00481273;REVB=-0.0321192;RO=12;SAF=1;SAR=6;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.369272;STB=0.733907;STBP=0.188;TYPE=snp;VARB=0.00116256;OID=.;OPOS=33961810;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:19:19:12:12:7:7:0.368421:6:1:5:7:6:1:5:7
chr16	33961873	.	G	A	47.51	PASS	AF=0.466667;AO=6;DP=14;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=0.213649;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.793;QD=12.6689;RBI=0.214583;REFB=-0.0326366;REVB=0.0200019;RO=8;SAF=0;SAR=6;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.702488;STB=0.519944;STBP=0.907;TYPE=snp;VARB=0.0473301;OID=.;OPOS=33961873;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:14:15:8:8:6:7:0.466667:6:0:1:7:6:1:1:7
chr16	33961881	.	A	G	64.51	PASS	AF=0.727273;AO=8;DP=11;FAO=8;FDP=11;FR=.;FRO=3;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.11741;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.695;QD=23.4575;RBI=0.117413;REFB=-0.108614;REVB=0.000783222;RO=3;SAF=1;SAR=7;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185472;STB=0.608384;STBP=0.402;TYPE=snp;VARB=0.0131007;OID=.;OPOS=33961881;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:11:11:3:3:8:8:0.727273:7:1:1:2:7:1:1:2
chr16	33961902	.	C	G	45.55	PASS	AF=0.857143;AO=6;DP=7;FAO=6;FDP=7;FR=.;FRO=1;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=198.098;QD=26.0276;RBI=0.0117981;REFB=-0.161486;REVB=-0.0117981;RO=1;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00430975;OID=.;OPOS=33961902;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:7:7:1:1:6:6:0.857143:6:0:0:1:6:0:0:1
chr16	33962412	.	A	C	43.68	PASS	AF=0.75;AO=6;DP=8;FAO=6;FDP=8;FR=.;FRO=2;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0180179;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.657;QD=21.8419;RBI=0.0921579;REFB=0.00559685;REVB=-0.0903794;RO=2;SAF=3;SAR=3;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.215133;STB=0.624607;STBP=0.324;TYPE=snp;VARB=-0.00824339;OID=.;OPOS=33962412;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:8:8:2:2:6:6:0.75:3:3:2:0:3:3:2:0
chr16	33962416	.	G	A	49.35	PASS	AF=0.857143;AO=6;DP=7;FAO=6;FDP=7;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.018533;FXX=0.124844;HRUN=3;LEN=1;MLLD=203.874;QD=28.1978;RBI=0.0412721;REFB=-0.0521519;REVB=0.0368771;RO=1;SAF=3;SAR=3;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123249;STB=0.571194;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.00234027;OID=.;OPOS=33962416;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:7:7:1:1:6:6:0.857143:3:3:1:0:3:3:1:0
chr16	33962422	.	C	A	41.14	PASS	AF=0.6;AO=6;DP=10;FAO=6;FDP=10;FR=.;FRO=4;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.00293762;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=69.3757;QD=16.454;RBI=0.0831798;REFB=-0.0356117;REVB=0.0831279;RO=4;SAF=3;SAR=3;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168827;STB=0.599679;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=0.0259143;OID=.;OPOS=33962422;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:10:10:4:4:6:6:0.6:3:3:3:1:3:3:3:1
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chr16	33962617	.	TGG	CAT,TGA	313.88	PASS	AF=0.0769231,0.538462;AO=3,28;DP=54;FAO=4,28;FDP=52;FR=.;FRO=20;FSAF=3,13;FSAR=1,15;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=-0.0185982,-0.0199382;FXX=0.0370302;HRUN=4,2;LEN=3,1;MLLD=176.146,209.323;QD=24.1445;RBI=0.0187207,0.0199413;REFB=-0.00683638,-0.00559838;REVB=0.0021382,0.000347253;RO=20;SAF=3,13;SAR=0,15;SRF=6;SRR=14;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.679095,0.125963;STB=0.831946,0.569438;STBP=0.242,0.281;TYPE=mnp,snp;VARB=-0.0220456,0.00679428;OID=.,.;OPOS=33962617,33962619;OREF=TGG,G;OALT=CAT,A;OMAPALT=CAT,TGA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:54:52:20:20:3,28:4,28:0.0769231,0.538462:0,15:3,13:6:14:1,15:3,13:6:14
chr16	33962641	.	G	T	225.94	PASS	AF=0.5;AO=22;DP=44;FAO=22;FDP=44;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=0.0215474;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.1603;QD=20.5399;RBI=0.0219271;REFB=-0.00732703;REVB=0.00406292;RO=22;SAF=9;SAR=13;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0421225;STB=0.523686;STBP=0.779;TYPE=snp;VARB=0.0150822;OID=.;OPOS=33962641;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:22:22:22:22:0.5:13:9:8:14:13:9:8:14
chr16	33962682	.	T	C	194.34	PASS	AF=0.59375;AO=19;DP=32;FAO=19;FDP=32;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=-0.0648632;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.997;QD=24.2927;RBI=0.0653838;REFB=-0.00785293;REVB=0.008234;RO=13;SAF=8;SAR=11;SRF=3;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146285;STB=0.581234;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.00840942;OID=.;OPOS=33962682;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:13:13:19:19:0.59375:11:8:3:10:11:8:3:10
chr16	33962697	.	C	T	54.5	PASS	AF=0.275862;AO=8;DP=30;FAO=8;FDP=29;FR=.;FRO=21;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.0610245;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.7027;QD=7.51702;RBI=0.0834168;REFB=-0.0116744;REVB=-0.0568716;RO=19;SAF=4;SAR=4;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0296329;STB=0.517198;STBP=0.929;TYPE=snp;VARB=0.0306172;OID=.;OPOS=33962697;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:30:29:19:21:8:8:0.275862:4:4:9:10:4:4:10:11
chr16	33962709	.	C	G	66.28	PASS	AF=0.409091;AO=9;DP=22;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.0691107;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.853;QD=12.0516;RBI=0.0691179;REFB=0.0080395;REVB=0.000997668;RO=13;SAF=3;SAR=6;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.278721;STB=0.666296;STBP=0.217;TYPE=snp;VARB=-0.0074699;OID=.;OPOS=33962709;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:22:22:13:13:9:9:0.409091:6:3:8:5:6:3:8:5
chr16	33962891	.	A	T	263.66	PASS	AF=0.6;AO=24;DP=40;FAO=24;FDP=40;FR=.;FRO=16;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.00318396;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.89;QD=26.3655;RBI=0.0219971;REFB=0.0015765;REVB=0.0217655;RO=16;SAF=12;SAR=12;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000725615;OID=.;OPOS=33962891;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:16:16:24:24:0.6:12:12:8:8:12:12:8:8
chr16	33962907	.	AGGA	CGGG,TGGG	251.27	PASS	AF=0.116279,0.395349;AO=5,17;DP=44;FAO=5,17;FDP=43;FR=.,HEALED;FRO=18;FSAF=2,11;FSAR=3,6;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=0.00245398,-0.00770558;FXX=0.0227221;HRUN=2,2;LEN=4,4;MLLD=138.602,188.783;QD=23.3741;RBI=0.0133576,0.0167686;REFB=-0.0201268,-0.0200877;REVB=0.0131303,0.0148933;RO=18;SAF=2,11;SAR=3,6;SRF=10;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.177683,0.08752;STB=0.620213,0.54994;STBP=0.612,0.6;TYPE=mnp,mnp;VARB=-0.00245762,0.0182461;OID=.,.;OPOS=33962907,33962907;OREF=AGGA,AGGA;OALT=CGGG,TGGG;OMAPALT=CGGG,TGGG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:44:43:18:18:5,17:5,17:0.116279,0.395349:3,6:2,11:10:8:3,6:2,11:10:8
chr16	33962918	.	G	A	38.9	PASS	AF=0.132075;AO=7;DP=53;FAO=7;FDP=53;FR=.;FRO=46;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=0.0061368;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=249.326;QD=2.93559;RBI=0.0332011;REFB=-0.00586999;REVB=-0.032629;RO=45;SAF=2;SAR=5;SRF=21;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.224301;STB=0.673644;STBP=0.366;TYPE=snp;VARB=0.0276955;OID=.;OPOS=33962918;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:53:53:45:46:7:7:0.132075:5:2:21:24:5:2:22:24
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chr16	33962930	.	G	T	154.33	PASS	AF=0.344828;AO=20;DP=58;FAO=20;FDP=58;FR=.;FRO=38;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=25;FWDB=-0.00861245;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.568;QD=10.6432;RBI=0.017817;REFB=-0.010146;REVB=-0.0155971;RO=38;SAF=12;SAR=8;SRF=13;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.282503;STB=0.664273;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.032254;OID=.;OPOS=33962930;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:38:38:20:20:0.344828:8:12:13:25:8:12:13:25
chr16	33962978	.	AT	GC	54.48	PASS	AF=0.139241;AO=11;DP=79;FAO=11;FDP=79;FR=.;FRO=68;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=32;FSRR=36;FWDB=0.0239439;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=192.984;QD=2.7587;RBI=0.0251932;REFB=0.000389594;REVB=0.0078351;RO=68;SAF=2;SAR=9;SRF=32;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.381367;STB=0.772194;STBP=0.068;TYPE=mnp;VARB=-0.00423387;OID=.;OPOS=33962978;OREF=AT;OALT=GC;OMAPALT=GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:79:79:68:68:11:11:0.139241:9:2:32:36:9:2:32:36
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chr16	33963000	.	T	C	473.95	PASS	AF=0.592105;AO=42;DP=74;FAO=45;FDP=76;FR=.;FRO=31;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=-0.0207193;FXX=0.0256377;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.297;QD=24.9447;RBI=0.0306762;REFB=-0.0168138;REVB=0.0226217;RO=32;SAF=21;SAR=21;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0245875;STB=0.50617;STBP=0.897;TYPE=snp;VARB=0.0133949;OID=.;OPOS=33963000;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:76:32:31:42:45:0.592105:21:21:15:17:24:21:14:17
chr16	33963002	.	G	A	204.97	PASS	AF=0.337662;AO=26;DP=77;FAO=26;FDP=77;FR=.;FRO=51;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=21;FSRR=30;FWDB=-0.0024978;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.127;QD=10.6476;RBI=0.00953835;REFB=0.00880367;REVB=-0.00920549;RO=43;SAF=14;SAR=12;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0542658;STB=0.58327;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=-0.0463419;OID=.;OPOS=33963002;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:43:51:26:26:0.337662:12:14:21:22:12:14:21:30
chr16	33963003	.	A	G	156.42	PASS	AF=0.291139;AO=15;DP=71;FAO=23;FDP=79;FR=.;FRO=56;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=28;FSRR=28;FWDB=-0.0119184;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.17;QD=7.91979;RBI=0.0377714;REFB=-0.00901358;REVB=0.0358418;RO=56;SAF=7;SAR=8;SRF=28;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0414725;STB=0.645031;STBP=0.104;TYPE=snp;VARB=0.00830576;OID=.;OPOS=33963003;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:79:56:56:15:23:0.291139:8:7:28:28:16:7:28:28
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chr16	33963020	.	C	A	1977.12	PASS	AF=0.76699;AO=137;DP=207;FAO=158;FDP=206;FR=.,HEALED;FRO=47;FSAF=48;FSAR=110;FSRF=22;FSRR=25;FWDB=0.0300902;FXX=0.00483068;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.978;QD=38.3907;RBI=0.0327255;REFB=-0.0111466;REVB=0.0128662;RO=48;SAF=39;SAR=98;SRF=22;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0987158;STB=0.543013;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=0.00559071;OID=.;OPOS=33963020;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:207:206:48:47:137:158:0.76699:98:39:22:26:110:48:22:25
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chr16	33963046	.	T	C	9389.62	PASS	AF=0.917847;AO=619;DP=679;FAO=648;FDP=706;FR=.;FRO=58;FSAF=267;FSAR=381;FSRF=27;FSRR=31;FWDB=-0.011067;FXX=0.00282482;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.727;QD=53.199;RBI=0.0552637;REFB=-0.0128651;REVB=0.0541442;RO=56;SAF=263;SAR=356;SRF=27;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00923617;STB=0.504526;STBP=0.451;TYPE=snp;VARB=0.00216019;OID=.;OPOS=33963046;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:679:706:56:58:619:648:0.917847:356:263:27:29:381:267:27:31
chr16	33963086	.	A	G	12684.0	PASS	AF=0.95553;AO=840;DP=877;FAO=838;FDP=877;FR=.;FRO=39;FSAF=333;FSAR=505;FSRF=13;FSRR=26;FWDB=0.0267351;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.0917;QD=57.8517;RBI=0.0287844;REFB=-0.0242428;REVB=0.0106665;RO=31;SAF=334;SAR=506;SRF=8;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0099146;STB=0.502977;STBP=0.438;TYPE=snp;VARB=0.00482422;OID=.;OPOS=33963086;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:877:877:31:39:840:838:0.95553:506:334:8:23:505:333:13:26
chr16	33963106	.	T	C	13565.8	PASS	AF=0.976484;AO=869;DP=892;FAO=872;FDP=893;FR=.;FRO=21;FSAF=340;FSAR=532;FSRF=17;FSRR=4;FWDB=0.0150905;FXX=0.00111856;HRUN=3;LEN=1;MLLD=289.288;QD=60.765;RBI=0.0163768;REFB=-0.0508498;REVB=0.00636233;RO=17;SAF=339;SAR=530;SRF=14;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0166212;STB=0.510323;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.000589424;OID=.;OPOS=33963106;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:892:893:17:21:869:872:0.976484:530:339:14:3:532:340:17:4
chr16	33963108	.	A	G	13289.6	PASS	AF=0.967489;AO=855;DP=884;FAO=863;FDP=892;FR=.;FRO=29;FSAF=346;FSAR=517;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=0.00612544;FXX=0.00111981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.246;QD=59.5944;RBI=0.00702083;REFB=-0.0133251;REVB=-0.00343091;RO=28;SAF=340;SAR=515;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00195172;STB=0.501601;STBP=0.602;TYPE=snp;VARB=0.000873067;OID=.;OPOS=33963108;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:884:892:28:29:855:863:0.967489:515:340:12:16:517:346:13:16
chr16	33963175	.	C	G	11754.5	PASS	AF=1;AO=749;DP=761;FAO=753;FDP=753;FR=.;FRO=0;FSAF=297;FSAR=456;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0202583;FXX=0.0143977;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.753;QD=62.441;RBI=0.0311593;REFB=0.020992;REVB=-0.023675;RO=10;SAF=295;SAR=454;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00279509;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.06547e-07;OID=.;OPOS=33963175;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:20:761:753:10:0:749:753:1:454:295:5:5:456:297:0:0
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chr16	33963279	.	T	C	3561.19	PASS	AF=0.955466;AO=238;DP=247;FAO=236;FDP=247;FR=.;FRO=11;FSAF=94;FSAR=142;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=-0.00310873;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.4775;QD=57.6711;RBI=0.0352262;REFB=0.00949325;REVB=0.0350887;RO=9;SAF=96;SAR=142;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0188965;STB=0.515187;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=-0.00181476;OID=.;OPOS=33963279;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:16:247:247:9:11:238:236:0.955466:142:96:6:3:142:94:8:3
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chr16	33963289	.	A	G	3578.4	PASS	AF=0.982979;AO=225;DP=235;FAO=231;FDP=235;FR=.;FRO=4;FSAF=95;FSAR=136;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.00467967;FXX=0.0167357;HRUN=3;LEN=1;MLLD=137.393;QD=60.909;RBI=0.0146042;REFB=-0.0883683;REVB=0.0138342;RO=4;SAF=89;SAR=136;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0138059;STB=0.507246;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=0.000224823;OID=.;OPOS=33963289;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:235:235:4:4:225:231:0.982979:136:89:0:4:136:95:0:4
chr16	33963329	.	T	C	3441.34	PASS	AF=0.970213;AO=225;DP=234;FAO=228;FDP=235;FR=.;FRO=7;FSAF=108;FSAR=120;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.0240021;FXX=0.00843846;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.4301;QD=58.576;RBI=0.0263875;REFB=-0.00721242;REVB=0.0109636;RO=6;SAF=107;SAR=118;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00947019;STB=0.502918;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=0.000555191;OID=.;OPOS=33963329;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:234:235:6:7:225:228:0.970213:118:107:4:2:120:108:4:3
chr16	33963332	.	A	G	3642.4	PASS	AF=0.983193;AO=233;DP=239;FAO=234;FDP=238;FR=.;FRO=4;FSAF=111;FSAR=123;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.020842;FXX=0.00418393;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.438;QD=61.2168;RBI=0.021414;REFB=-0.0614736;REVB=-0.00491632;RO=4;SAF=111;SAR=122;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00881358;STB=0.504642;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=1.32512e-05;OID=.;OPOS=33963332;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:239:238:4:4:233:234:0.983193:122:111:3:1:123:111:3:1
chr16	33963395	.	AT	TC,TT	2411.46	PASS	AF=0.11828,0.811828;AO=139,8;DP=186;FAO=22,151;FDP=186;FR=.;FRO=13;FSAF=7,79;FSAR=15,72;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=0.0514868,0.0911987;FXX=0.0106377;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=221.533,227.836;QD=51.8594;RBI=0.108766,0.134758;REFB=-0.089909,-0.104198;REVB=0.0958081,0.0992101;RO=11;SAF=72,4;SAR=67,4;SRF=3;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0340983,0.221468;STB=0.5045,0.517089;STBP=0.972,0.143;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0129937,0.0180505;OID=.,.;OPOS=33963395,33963395;OREF=AT,A;OALT=TC,T;OMAPALT=TC,TT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:93:186:186:11:13:139,8:22,151:0.11828,0.811828:67,4:72,4:3:8:15,72:7,79:4:9
chr16	33963424	.	A	G	1242.26	PASS	AF=0.822034;AO=84;DP=105;FAO=97;FDP=118;FR=.;FRO=21;FSAF=48;FSAR=49;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.0157214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.811;QD=42.1104;RBI=0.0183569;REFB=0.00175759;REVB=-0.00947703;RO=21;SAF=36;SAR=48;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0181789;STB=0.50332;STBP=0.862;TYPE=snp;VARB=-7.53041e-05;OID=.;OPOS=33963424;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:118:21:21:84:97:0.822034:48:36:10:11:49:48:10:11
chr16	33963426	.	CT	CC,GC	984.09	PASS	AF=0.648649,0;AO=64,8;DP=114;FAO=72,0;FDP=111;FR=.,HEALED;FRO=27;FSAF=36,0;FSAR=36,0;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=0.0049702,0.00367559;FXX=0.0347796;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=137.718,111.253;QD=35.4626;RBI=0.0786037,0.0301748;REFB=-0.00399406,0.00104221;REVB=0.0784464,0.0299501;RO=25;SAF=33,4;SAR=31,4;SRF=13;SRR=12;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.00228694,-0.0235792;STB=0.505049,0.5;STBP=0.87,1;TYPE=snp,mnp;VARB=-0.000799369,0;OID=.,.;OPOS=33963427,33963426;OREF=T,CT;OALT=C,GC;OMAPALT=CC,GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:114:111:25:27:64,8:72,0:0.648649,0:31,4:33,4:13:12:36,0:36,0:14:13
chr16	33963437	.	T	C	1795.26	PASS	AF=0.836364;AO=136;DP=165;FAO=138;FDP=165;FR=.;FRO=27;FSAF=55;FSAR=83;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.00802364;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=73.4675;QD=43.5215;RBI=0.00813959;REFB=0.000128073;REVB=0.00136898;RO=27;SAF=53;SAR=83;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0299151;STB=0.50151;STBP=0.936;TYPE=snp;VARB=-0.000186371;OID=.;OPOS=33963437;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:165:165:27:27:136:138:0.836364:83:53:13:14:83:55:11:16
chr16	33963445	.	A	G	2010.4	PASS	AF=0.845714;AO=148;DP=175;FAO=148;FDP=175;FR=.;FRO=27;FSAF=62;FSAR=86;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.000753609;FXX=0.0112988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.3949;QD=45.952;RBI=0.038629;REFB=-0.00270882;REVB=-0.0386217;RO=27;SAF=62;SAR=86;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00344608;STB=0.501825;STBP=0.92;TYPE=snp;VARB=0.000513927;OID=.;OPOS=33963445;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:175:175:27:27:148:148:0.845714:86:62:11:16:86:62:11:16
chr16	33963468	.	A	G	33.86	PASS	AF=0.0691489;AO=13;DP=188;FAO=13;FDP=188;FR=.;FRO=175;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=74;FSRR=101;FWDB=-0.0309567;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.076;QD=0.720351;RBI=0.0317123;REFB=-0.00312349;REVB=-0.00688131;RO=174;SAF=7;SAR=6;SRF=74;SRR=100;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122858;STB=0.606319;STBP=0.434;TYPE=snp;VARB=0.0303067;OID=.;OPOS=33963468;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:188:188:174:175:13:13:0.0691489:6:7:74:100:6:7:74:101
chr16	33963477	.	GTTT	AGAC,GTTC	1533.51	PASS	AF=0.677632,0.138158;AO=101,21;DP=157;FAO=103,21;FDP=152;FR=.;FRO=28;FSAF=32,11;FSAR=71,10;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=-0.00188277,0.00323833;FXX=0.0379723;HRUN=1,3;LEN=4,1;MLLD=193.54,96.7107;QD=40.3556;RBI=0.0180725,0.019959;REFB=-0.00313732,-0.0107968;REVB=0.0179742,0.0196946;RO=27;SAF=32,11;SAR=69,10;SRF=15;SRR=12;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.104502,-0.0314148;STB=0.561993,0.527318;STBP=0.013,0.757;TYPE=mnp,snp;VARB=-3.54327e-05,-0.00279665;OID=.,.;OPOS=33963477,33963480;OREF=GTTT,T;OALT=AGAC,C;OMAPALT=AGAC,GTTC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:157:152:27:28:101,21:103,21:0.677632,0.138158:69,10:32,11:15:12:71,10:32,11:16:12
chr16	33963490	.	T	C	1222.29	PASS	AF=0.687075;AO=100;DP=147;FAO=101;FDP=147;FR=.;FRO=46;FSAF=35;FSAR=66;FSRF=24;FSRR=22;FWDB=-0.047499;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.8147;QD=33.2595;RBI=0.0854973;REFB=0.0124416;REVB=0.071089;RO=46;SAF=35;SAR=65;SRF=24;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106699;STB=0.558348;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=-0.00471593;OID=.;OPOS=33963490;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:147:147:46:46:100:101:0.687075:65:35:24:22:66:35:24:22
chr16	33963528	.	T	C	1006.68	PASS	AF=0.702479;AO=84;DP=119;FAO=85;FDP=121;FR=.;FRO=36;FSAF=33;FSAR=52;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=0.00425852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.739;QD=33.2788;RBI=0.0278345;REFB=0.000385798;REVB=0.0275068;RO=35;SAF=33;SAR=51;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0685521;STB=0.534454;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=-0.000122128;OID=.;OPOS=33963528;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:121:35:36:84:85:0.702479:51:33:18:17:52:33:18:18
chr16	33963563	.	G	C	581.45	PASS	AF=0.569892;AO=52;DP=93;FAO=53;FDP=93;FR=.;FRO=40;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=24;FSRR=16;FWDB=0.00626162;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.98;QD=25.0086;RBI=0.00652281;REFB=0.00719595;REVB=0.00182732;RO=40;SAF=22;SAR=30;SRF=24;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14037;STB=0.579645;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=-0.0032754;OID=.;OPOS=33963563;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:40:40:52:53:0.569892:30:22:24:16:31:22:24:16
chr16	33963571	.	T	C	453.75	PASS	AF=0.54321;AO=44;DP=81;FAO=44;FDP=81;FR=.;FRO=37;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=0.00164071;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.231;QD=22.4071;RBI=0.00987126;REFB=0.000136099;REVB=0.00973395;RO=36;SAF=23;SAR=21;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0269322;STB=0.520554;STBP=0.695;TYPE=snp;VARB=-7.98089e-05;OID=.;OPOS=33963571;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:36:37:44:44:0.54321:21:23:20:16:21:23:21:16
chr16	33963588	.	G	A	33.06	PASS	AF=0.107692;AO=7;DP=65;FAO=7;FDP=65;FR=.;FRO=58;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=39;FSRR=19;FWDB=-0.00655122;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.762;QD=2.03467;RBI=0.0255992;REFB=-0.000934295;REVB=0.0247467;RO=58;SAF=5;SAR=2;SRF=39;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0566935;STB=0.543912;STBP=0.866;TYPE=snp;VARB=0.00846079;OID=.;OPOS=33963588;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:65:65:58:58:7:7:0.107692:2:5:39:19:2:5:39:19
chr16	33963591	.	T	C	101.43	PASS	AF=0.254237;AO=15;DP=59;FAO=15;FDP=59;FR=.;FRO=44;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=28;FSRR=16;FWDB=0.00203625;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.758;QD=6.87665;RBI=0.032006;REFB=-0.006759;REVB=-0.0319412;RO=44;SAF=12;SAR=3;SRF=28;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.246718;STB=0.654943;STBP=0.199;TYPE=snp;VARB=0.0212671;OID=.;OPOS=33963591;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:44:44:15:15:0.254237:3:12:28:16:3:12:28:16
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chr16	33963708	.	GT	AC	70.29	PASS	AF=0.1875;AO=12;DP=64;FAO=12;FDP=64;FR=.;FRO=52;FSAF=11;FSAR=1;FSRF=25;FSRR=27;FWDB=-0.0135073;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=231.211;QD=4.39341;RBI=0.0141588;REFB=-0.00595589;REVB=0.00424551;RO=52;SAF=11;SAR=1;SRF=25;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.590084;STB=0.894625;STBP=0.003;TYPE=mnp;VARB=0.0328804;OID=.;OPOS=33963708;OREF=GT;OALT=AC;OMAPALT=AC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:70:64:64:52:52:12:12:0.1875:1:11:25:27:1:11:25:27
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chr16	33963732	.	A	C	239.94	PASS	AF=0.41791;AO=27;DP=67;FAO=28;FDP=67;FR=.;FRO=39;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=-0.0136433;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.974;QD=14.3246;RBI=0.0348893;REFB=-0.00313583;REVB=-0.0321111;RO=39;SAF=12;SAR=15;SRF=23;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149695;STB=0.593154;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=0.00203671;OID=.;OPOS=33963732;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:39:39:27:28:0.41791:15:12:23:16:16:12:23:16
chr16	33963737	.	GC	AT	240.23	PASS	AF=0.435484;AO=27;DP=69;FAO=27;FDP=62;FR=.;FRO=35;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=24;FSRR=11;FWDB=-0.00618884;FXX=0.101435;HRUN=1;LEN=2;MLLD=190.211;QD=15.4987;RBI=0.00750398;REFB=-0.00333413;REVB=-0.00424357;RO=35;SAF=11;SAR=16;SRF=24;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.271867;STB=0.653333;STBP=0.04;TYPE=mnp;VARB=0.00267109;OID=.;OPOS=33963737;OREF=GC;OALT=AT;OMAPALT=AT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:62:35:35:27:27:0.435484:16:11:24:11:16:11:24:11
chr16	33963758	.	T	C	85.83	PASS	AF=0.212121;AO=14;DP=66;FAO=14;FDP=66;FR=.;FRO=52;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=23;FSRR=29;FWDB=0.00881181;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.725;QD=5.20174;RBI=0.0172551;REFB=-0.00328371;REVB=0.0148354;RO=52;SAF=11;SAR=3;SRF=23;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.431461;STB=0.774931;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.0131162;OID=.;OPOS=33963758;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:66:66:52:52:14:14:0.212121:3:11:23:29:3:11:23:29
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chr16	33963772	.	CGGG	CGG,CGGC	349.13	PASS	AF=0.318182,0.431818;AO=13,18;DP=55;FAO=14,19;FDP=44;FR=.;FRO=11;FSAF=8,4;FSAR=6,15;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=0.0254987,0.00120824;FXX=0.214247;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=23.5028,29.0027;QD=31.7394;RBI=0.0478423,0.0291191;REFB=0.0467007,0.0243656;REVB=0.0404808,0.029094;RO=11;SAF=8,4;SAR=5,14;SRF=7;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.017866,-0.322048;STB=0.52937,0.684434;STBP=0.769,0.019;TYPE=del,snp;VARB=0.0161537,-0.0300128;OID=.,.;OPOS=33963773,33963775;OREF=G,G;OALT=-,C;OMAPALT=CGG,CGGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.318182,0.431818:13,18:55:14,19:44:11:8,4:6,15:7:4:99:11:8,4:5,14:7:4
chr16	33963783	.	G	C,T	801.75	PASS	AF=0.375,0.4375;AO=30,35;DP=80;FAO=30,35;FDP=80;FR=.;FRO=15;FSAF=6,17;FSAR=24,18;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.0192726,0.01868;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=139.843,159.036;QD=40.0875;RBI=0.0248874,0.0188138;REFB=0.00254186,-0.000830133;REVB=0.0157463,0.00224021;RO=15;SAF=6,17;SAR=24,18;SRF=8;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.260066,-0.0262673;STB=0.643572,0.514278;STBP=0.019,0.794;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00170349,0.00349112;OID=.,.;OPOS=33963783,33963783;OREF=G,G;OALT=C,T;OMAPALT=C,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:80:80:15:15:30,35:30,35:0.375,0.4375:24,18:6,17:8:7:24,18:6,17:8:7
chr16	33963788	.	A	C	42.78	PASS	AF=0.0973451;AO=11;DP=113;FAO=11;FDP=113;FR=.;FRO=102;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=26;FSRR=76;FWDB=0.000917218;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.589;QD=1.51421;RBI=0.0107226;REFB=-0.00383332;REVB=-0.0106833;RO=100;SAF=5;SAR=6;SRF=26;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.252421;STB=0.687636;STBP=0.271;TYPE=snp;VARB=0.0356071;OID=.;OPOS=33963788;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:42:113:113:100:102:11:11:0.0973451:6:5:26:74:6:5:26:76
chr16	33963809	.	G	C	1729.12	PASS	AF=0.830189;AO=130;DP=159;FAO=132;FDP=159;FR=.;FRO=27;FSAF=25;FSAR=107;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=0.000632805;FXX=0.00624961;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.928;QD=43.4998;RBI=0.0935363;REFB=-0.0191648;REVB=0.0935342;RO=27;SAF=25;SAR=105;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120657;STB=0.564835;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.00293529;OID=.;OPOS=33963809;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:159:159:27:27:130:132:0.830189:105:25:12:15:107:25:12:15
chr16	33963816	.	TG	GA	1490.59	PASS	AF=0.712644;AO=122;DP=174;FAO=124;FDP=174;FR=.;FRO=50;FSAF=19;FSAR=105;FSRF=25;FSRR=25;FWDB=-0.00995854;FXX=0.011363;HRUN=1;LEN=2;MLLD=123.562;QD=34.2663;RBI=0.0127813;REFB=-0.0219509;REVB=-0.00801176;RO=50;SAF=19;SAR=103;SRF=25;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.278901;STB=0.651594;STBP=0;TYPE=mnp;VARB=0.0118923;OID=.;OPOS=33963816;OREF=TG;OALT=GA;OMAPALT=GA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:174:174:50:50:122:124:0.712644:103:19:25:25:105:19:25:25
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chr16	33963855	.	T	C	8130.71	PASS	AF=0.91954;AO=559;DP=609;FAO=560;FDP=609;FR=.;FRO=49;FSAF=193;FSAR=367;FSRF=24;FSRR=25;FWDB=-0.000345475;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.9348;QD=53.4037;RBI=0.0377166;REFB=0.00715043;REVB=0.037715;RO=48;SAF=193;SAR=366;SRF=24;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0255327;STB=0.512824;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=-0.000359494;OID=.;OPOS=33963855;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:609:609:48:49:559:560:0.91954:366:193:24:24:367:193:24:25
chr16	33963875	.	A	G	12618.5	PASS	AF=0.984166;AO=804;DP=819;FAO=808;FDP=821;FR=.;FRO=13;FSAF=326;FSAR=482;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=-0.0036303;FXX=0.00484843;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.3771;QD=61.4789;RBI=0.0821633;REFB=-0.00191764;REVB=-0.082083;RO=13;SAF=323;SAR=481;SRF=3;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00541071;STB=0.502843;STBP=0.196;TYPE=snp;VARB=-2.20634e-05;OID=.;OPOS=33963875;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:819:821:13:13:804:808:0.984166:481:323:3:10:482:326:3:10
chr16	33963881	.	C	G	12174.9	PASS	AF=0.943221;AO=813;DP=866;FAO=814;FDP=863;FR=.;FRO=49;FSAF=322;FSAR=492;FSRF=22;FSRR=27;FWDB=0.00204422;FXX=0.00346416;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.472;QD=56.4304;RBI=0.0539612;REFB=0.00917195;REVB=-0.0539225;RO=49;SAF=322;SAR=491;SRF=22;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00598451;STB=0.503166;STBP=0.448;TYPE=snp;VARB=-0.000505983;OID=.;OPOS=33963881;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:71:866:863:49:49:813:814:0.943221:491:322:22:27:492:322:22:27
chr16	33963912	.	T	C	16524.6	PASS	AF=0.981464;AO=1057;DP=1081;FAO=1059;FDP=1079;FR=.;FRO=20;FSAF=440;FSAR=619;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.00330656;FXX=0.00277262;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.179;QD=61.2588;RBI=0.0258366;REFB=-0.0342992;REVB=0.0256242;RO=19;SAF=438;SAR=619;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00388669;STB=0.502564;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=0.000474872;OID=.;OPOS=33963912;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:1081:1079:19:20:1057:1059:0.981464:619:438:10:9:619:440:11:9
chr16	33963961	.	C	G	17599.9	PASS	AF=0.964824;AO=1150;DP=1201;FAO=1152;FDP=1194;FR=.;FRO=42;FSAF=471;FSAR=681;FSRF=26;FSRR=16;FWDB=0.0392663;FXX=0.00582843;HRUN=2;LEN=1;MLLD=238.764;QD=58.9611;RBI=0.0397449;REFB=-0.0434018;REVB=-0.00614962;RO=37;SAF=470;SAR=680;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00976113;STB=0.507626;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.000773313;OID=.;OPOS=33963961;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:19:1201:1194:37:42:1150:1152:0.964824:680:470:21:16:681:471:26:16
chr16	33963975	.	A	G	16583.1	PASS	AF=0.948365;AO=1102;DP=1162;FAO=1102;FDP=1162;FR=.;FRO=60;FSAF=449;FSAR=653;FSRF=36;FSRR=24;FWDB=-0.0100327;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=329.825;QD=57.0846;RBI=0.0120865;REFB=-0.00791607;REVB=0.00674001;RO=56;SAF=449;SAR=653;SRF=36;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0223845;STB=0.510256;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.000315515;OID=.;OPOS=33963975;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:69:1162:1162:56:60:1102:1102:0.948365:653:449:36:20:653:449:36:24
chr16	33963991	.	A	G	15782.1	PASS	AF=0.966229;AO=1026;DP=1065;FAO=1030;FDP=1066;FR=.;FRO=36;FSAF=418;FSAR=612;FSRF=23;FSRR=13;FWDB=0.0305118;FXX=0.00280633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.8;QD=59.2199;RBI=0.0308757;REFB=-0.0136043;REVB=-0.00472623;RO=36;SAF=417;SAR=609;SRF=23;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0155363;STB=0.508135;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.000475954;OID=.;OPOS=33963991;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:1065:1066:36:36:1026:1030:0.966229:609:417:23:13:612:418:23:13
chr16	33964017	.	A	G	12034.5	PASS	AF=0.947991;AO=782;DP=829;FAO=802;FDP=846;FR=.;FRO=44;FSAF=339;FSAR=463;FSRF=28;FSRR=16;FWDB=0.00114518;FXX=0.00353353;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.948;QD=56.9007;RBI=0.00844681;REFB=-0.0024358;REVB=-0.00836882;RO=44;SAF=331;SAR=451;SRF=28;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0220802;STB=0.511345;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=5.817e-05;OID=.;OPOS=33964017;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:829:846:44:44:782:802:0.947991:451:331:28:16:463:339:28:16
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chr16	33964062	.	C	T	50.07	PASS	AF=0.0600414;AO=29;DP=483;FAO=29;FDP=483;FR=.;FRO=454;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=114;FSRR=340;FWDB=-0.0648386;FXX=0.00206607;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.517;QD=0.414663;RBI=0.0651184;REFB=-0.00720377;REVB=-0.00602918;RO=452;SAF=17;SAR=12;SRF=114;SRR=338;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.369541;STB=0.791806;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.074077;OID=.;OPOS=33964062;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:50:483:483:452:454:29:29:0.0600414:12:17:114:338:12:17:114:340
chr16	33964064	.	TG	CC,CG	4883.93	PASS	AF=0.0433839,0.774403;AO=20,355;DP=463;FAO=20,357;FDP=461;FR=.;FRO=84;FSAF=2,68;FSAR=18,289;FSRF=51;FSRR=33;FWDB=0.0114549,0.0214787;FXX=0.00431956;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=62.0326,89.976;QD=42.3768;RBI=0.0149264,0.0264955;REFB=-0.0306705,-0.0439504;REVB=0.00956992,0.0155138;RO=82;SAF=2,68;SAR=18,287;SRF=50;SRR=32;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.636342,-0.205914;STB=0.903012,0.610987;STBP=0,0;TYPE=mnp,snp;VARB=-0.00305251,0.00877666;OID=.,.;OPOS=33964064,33964064;OREF=TG,T;OALT=CC,C;OMAPALT=CC,CG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:463:461:82:84:20,355:20,357:0.0433839,0.774403:18,287:2,68:50:32:18,289:2,68:51:33
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chr16	33964154	.	C	T	89.1	PASS	AF=0.128205;AO=19;DP=157;FAO=20;FDP=156;FR=.;FRO=136;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=58;FSRR=78;FWDB=-0.00133662;FXX=0.00636902;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.5;QD=2.28457;RBI=0.00981416;REFB=-0.0042686;REVB=-0.00972271;RO=132;SAF=6;SAR=13;SRF=58;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161424;STB=0.570104;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.0272172;OID=.;OPOS=33964154;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:157:156:132:136:19:20:0.128205:13:6:58:74:13:7:58:78
chr16	33964168	.	G	A	86.13	PASS	AF=0.144;AO=18;DP=126;FAO=18;FDP=125;FR=.;FRO=107;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=49;FSRR=58;FWDB=-0.0158412;FXX=0.0157468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.591;QD=2.75619;RBI=0.0182027;REFB=-0.0123532;REVB=-0.00896626;RO=107;SAF=5;SAR=13;SRF=49;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.238403;STB=0.663953;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=0.0505606;OID=.;OPOS=33964168;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:126:125:107:107:18:18:0.144:13:5:49:58:13:5:49:58
chr16	33964196	.	T	C	182.78	PASS	AF=0.32;AO=24;DP=75;FAO=24;FDP=75;FR=.;FRO=51;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=23;FSRR=28;FWDB=6.9676e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.354;QD=9.74824;RBI=0.00793275;REFB=-0.0028757;REVB=0.00793245;RO=51;SAF=10;SAR=14;SRF=23;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0404693;STB=0.52379;STBP=0.794;TYPE=snp;VARB=0.00676757;OID=.;OPOS=33964196;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:51:51:24:24:0.32:14:10:23:28:14:10:23:28
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chr16	33965553	.	CAG	CA,CG,CGG	1394.64	PASS	AF=0.441441,0.558559,0;AO=21,24,36;DP=113;FAO=49,62,0;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=24,30,0;FSAR=25,32,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00892008,-0.0306514,-0.0316812;FXX=0.0263135;HRUN=3,1,1;LEN=1,1,1;MLLD=13.7682,124.518,124.282;QD=50.2571;RBI=1.08252,0.0351388,0.12865;REFB=0,0,0;REVB=1.08248,-0.017182,-0.124689;RO=24;SAF=21,24,5;SAR=0,0,31;SRF=1;SRR=23;SSEN=0.396318,0,0;SSEP=0.346804,0,0;SSSB=0.883216,0.885536,0.17;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,del,snp;VARB=0.0162133,-0.00341527,0;OID=.,.,.;OPOS=33965555,33965554,33965554;OREF=G,A,A;OALT=-,-,G;OMAPALT=CA,CG,CGG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.441441,0.558559,0:21,24,36:113:49,62,0:111:0:24,30,0:25,32,0:0:0:99:24:21,24,5:0,0,31:1:23
chr16	33965560	.	TT	AC,AT	793.04	PASS	AF=0.548673,0.106195;AO=61,12;DP=114;FAO=62,12;FDP=113;FR=.;FRO=39;FSAF=30,10;FSAR=32,2;FSRF=16;FSRR=23;FWDB=-0.0140282,0.00275507;FXX=0.00877116;HRUN=3,3;LEN=2,1;MLLD=236.984,244.87;QD=28.0721;RBI=0.0165268,0.0104194;REFB=-0.00308969,-0.00423336;REVB=0.00873755,0.0100485;RO=38;SAF=29,10;SAR=32,2;SRF=15;SRR=23;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0573149,0.530849;STB=0.528498,0.827261;STBP=0.473,0.018;TYPE=mnp,snp;VARB=0.00138505,0.00549253;OID=.,.;OPOS=33965560,33965560;OREF=TT,T;OALT=AC,A;OMAPALT=AC,AT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:114:113:38:39:61,12:62,12:0.548673,0.106195:32,2:29,10:15:23:32,2:30,10:16:23
chr16	34682251	.	G	T	581.55	PASS	AF=0.522124;AO=59;DP=113;FAO=59;FDP=113;FR=.;FRO=54;FSAF=31;FSAR=28;FSRF=22;FSRR=32;FWDB=0.0198522;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.852;QD=20.5858;RBI=0.0229299;REFB=-0.000832838;REVB=-0.0114749;RO=54;SAF=31;SAR=28;SRF=22;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102205;STB=0.556201;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=0.000723758;OID=.;OPOS=34682251;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:113:54:54:59:59:0.522124:28:31:22:32:28:31:22:32
chr16	46565019	.	T	G	1620.19	PASS	AF=0.973451;AO=108;DP=115;FAO=110;FDP=113;FR=.;FRO=3;FSAF=47;FSAR=63;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0102931;FXX=0.0173898;HRUN=5;LEN=1;MLLD=226.504;QD=57.3519;RBI=0.0103647;REFB=-0.12138;REVB=0.00121621;RO=2;SAF=46;SAR=62;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0201871;STB=0.515461;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=3.3918e-05;OID=.;OPOS=46565019;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:115:113:2:3:108:110:0.973451:62:46:2:0:63:47:3:0
chr16	46590024	.	T	C	805.18	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0171793;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=68.582;QD=64.4146;RBI=0.069504;REFB=0;REVB=-0.0673474;RO=0;SAF=24;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000631609;OID=.;OPOS=46590024;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:50:0:0:49:50:1:25:24:0:0:26:24:0:0
chr16	46651583	.	GCC	GC,G	41.44	PASS	AF=0.163265,0.102041;AO=10,6;DP=49;FAO=8,5;FDP=49;FR=.;FRO=36;FSAF=1,0;FSAR=7,5;FSRF=22;FSRR=14;FWDB=-0.149683,-0.0784613;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,2;MLLD=19.0189,37.0602;QD=3.3826;RBI=0.23817,0.124191;REFB=-0.0468588,-0.0241353;REVB=-0.185257,-0.0962666;RO=33;SAF=2,0;SAR=8,6;SRF=21;SRR=12;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.509223,-0.717249;STB=0.883688,0.99815;STBP=0.034,0.006;TYPE=del,del;VARB=0.0830857,0.00091149;OID=.,.;OPOS=46651584,46651584;OREF=C,CC;OALT=-,-;OMAPALT=GC,G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.163265,0.102041:10,6:49:8,5:49:36:1,0:7,5:22:14:18:33:2,0:8,6:21:12
chr16	46655210	.	A	G	1102.44	PASS	AF=1;AO=73;DP=74;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0131907;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.46;QD=60.4076;RBI=0.0139361;REFB=0;REVB=0.00449675;RO=0;SAF=36;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.89682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.02064e-05;OID=.;OPOS=46655210;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:73:0:0:73:73:1:37:36:0:0:37:36:0:0
chr16	46696284	.	G	A	918.58	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0166102;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.34;QD=58.3227;RBI=0.0298744;REFB=0;REVB=-0.024831;RO=0;SAF=22;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000141661;OID=.;OPOS=46696284;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:63:0:0:62:63:1:40:22:0:0:40:23:0:0
chr16	47538774	.	C	G	246.59	PASS	AF=0.451613;AO=25;DP=59;FAO=28;FDP=62;FR=.;FRO=34;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=0.000974044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.8596;QD=15.9089;RBI=0.015607;REFB=0.00251474;REVB=0.0155765;RO=33;SAF=14;SAR=11;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105494;STB=0.535689;STBP=0.648;TYPE=snp;VARB=-0.00350805;OID=.;OPOS=47538774;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:62:33:34:25:28:0.451613:11:14:15:18:13:15:16:18
chr16	48122582	.	G	A	1934.24	PASS	AF=0.992126;AO=126;DP=127;FAO=126;FDP=127;FR=.;FRO=1;FSAF=54;FSAR=72;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.062971;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.8436;QD=60.921;RBI=0.0680061;REFB=-0.067696;REVB=0.0256804;RO=1;SAF=54;SAR=72;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00871795;STB=0.504586;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=0.000559078;OID=.;OPOS=48122582;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:127:127:1:1:126:126:0.992126:72:54:1:0:72:54:1:0
chr16	48234327	.	C	T	167.07	PASS	AF=0.409091;AO=18;DP=44;FAO=18;FDP=44;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=-0.00340787;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.543;QD=15.1881;RBI=0.0210823;REFB=-0.00527716;REVB=0.020805;RO=26;SAF=9;SAR=9;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0393585;STB=0.522702;STBP=0.837;TYPE=snp;VARB=0.00819399;OID=.;OPOS=48234327;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:26:26:18:18:0.409091:9:9:14:12:9:9:14:12
chr16	48234330	.	C	T	143.29	PASS	AF=0.410256;AO=16;DP=39;FAO=16;FDP=39;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=0.0396984;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.359;QD=14.6961;RBI=0.0415342;REFB=0.00685623;REVB=0.0122119;RO=22;SAF=9;SAR=7;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0290181;STB=0.501627;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00433857;OID=.;OPOS=48234330;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:22:23:16:16:0.410256:7:9:13:9:7:9:13:10
chr16	48258198	.	C	T	310.6	PASS	AF=1;AO=23;DP=24;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0154752;FXX=0.0416493;HRUN=3;LEN=1;MLLD=187.557;QD=54.0174;RBI=0.0170815;REFB=0;REVB=0.00723161;RO=0;SAF=12;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000105324;OID=.;OPOS=48258198;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:23:0:0:23:23:1:11:12:0:0:11:12:0:0
chr16	49670525	.	G	T	385.33	PASS	AF=0.627119;AO=37;DP=59;FAO=37;FDP=59;FR=.;FRO=22;FSAF=11;FSAR=26;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.00678662;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=338.223;QD=26.1243;RBI=0.0265007;REFB=0.00184298;REVB=-0.0256169;RO=22;SAF=11;SAR=26;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.215666;STB=0.618367;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=-0.0013017;OID=.;OPOS=49670525;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:22:22:37:37:0.627119:26:11:13:9:26:11:13:9
chr16	49672520	.	A	G	130.28	PASS	AF=0.608696;AO=14;DP=23;FAO=14;FDP=23;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.0923646;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.2985;QD=22.6565;RBI=0.10749;REFB=-0.0643989;REVB=-0.0549817;RO=9;SAF=6;SAR=8;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.011206;STB=0.50632;STBP=0.959;TYPE=snp;VARB=0.0331248;OID=.;OPOS=49672520;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:23:23:9:9:14:14:0.608696:8:6:4:5:8:6:4:5
chr16	50059279	.	C	A	438.99	PASS	AF=1;AO=31;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0207383;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=238.887;QD=54.8735;RBI=0.0210824;REFB=-0.211223;REVB=0.00379356;RO=0;SAF=16;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000595678;OID=.;OPOS=50059279;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:32:32:0:0:31:32:1:15:16:0:0:16:16:0:0
chr16	50069312	.	C	G	265.26	PASS	AF=0.47541;AO=29;DP=64;FAO=29;FDP=61;FR=.;FRO=32;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=-0.0179417;FXX=0.0468677;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.517;QD=17.3942;RBI=0.0257623;REFB=-0.00675608;REVB=0.0184876;RO=29;SAF=19;SAR=10;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160612;STB=0.585248;STBP=0.227;TYPE=snp;VARB=0.00696127;OID=.;OPOS=50069312;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:61:29:32:29:29:0.47541:10:19:14:15:10:19:16:16
chr16	50069772	.	A	G	1283.39	PASS	AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00177554;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.815;QD=61.8503;RBI=0.0223767;REFB=0;REVB=-0.0223061;RO=0;SAF=37;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.12122e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.77602e-05;OID=.;OPOS=50069772;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:46:37:0:0:46:37:0:0
chr16	50071011	.	C	CTTTAG,G	305.12	PASS	AF=0.595238,0.0714286;AO=23,2;DP=42;FAO=25,3;FDP=42;FR=.;FRO=14;FSAF=16,3;FSAR=9,0;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=0.0245568,-0.0216848;FXX=0.0232504;HRUN=3,1;LEN=5,1;MLLD=165.034,113.176;QD=29.0586;RBI=0.024753,0.0222101;REFB=-0.014323,-0.00844076;REVB=-0.00311041,0.00480195;RO=15;SAF=14,2;SAR=9,0;SRF=10;SRR=5;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0438122,0.482498;STB=0.501113,0.995316;STBP=1,0.163;TYPE=ins,snp;VARB=0.00751401,0.0413284;OID=.,.;OPOS=50071012,50071011;OREF=-,C;OALT=TTTAG,G;OMAPALT=CTTTAG,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:15:14:23,2:25,3:0.595238,0.0714286:9,0:14,2:10:5:9,0:16,3:9:5
chr16	50106594	.	T	C	726.18	PASS	AF=0.575;AO=69;DP=120;FAO=69;FDP=120;FR=.;FRO=51;FSAF=19;FSAR=50;FSRF=25;FSRR=26;FWDB=0.0438924;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.3261;QD=24.206;RBI=0.0682074;REFB=-0.00615485;REVB=-0.0522082;RO=50;SAF=19;SAR=50;SRF=24;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179379;STB=0.6037;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.00327401;OID=.;OPOS=50106594;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:120:50:51:69:69:0.575:50:19:24:26:50:19:25:26
chr16	50263762	.	G	A	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00372685;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.975;QD=46.848;RBI=0.004722;REFB=0;REVB=0.00289964;RO=0;SAF=11;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33019e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.97228e-06;OID=.;OPOS=50263762;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:4:11:0:0:4:11:0:0
chr16	50265818	.	C	T	199.26	PASS	AF=0.555556;AO=19;DP=35;FAO=20;FDP=36;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=-0.0341265;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.2936;QD=22.1394;RBI=0.0410983;REFB=-0.0459072;REVB=-0.0229009;RO=16;SAF=9;SAR=10;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172991;STB=0.583252;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=0.0382394;OID=.;OPOS=50265818;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:36:16:16:19:20:0.555556:10:9:11:5:10:10:11:5
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chr16	51173559	.	G	A	87.84	PASS	AF=0.26;AO=12;DP=50;FAO=13;FDP=50;FR=.;FRO=37;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=0.0209115;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.41;QD=7.02756;RBI=0.0210507;REFB=-0.00469656;REVB=0.00241735;RO=38;SAF=4;SAR=8;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144931;STB=0.619481;STBP=0.354;TYPE=snp;VARB=0.0312802;OID=.;OPOS=51173559;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:50:50:38:37:12:13:0.26:8:4:17:21:9:4:17:20
chr16	51175324	.	G	A	226.31	PASS	AF=0.471698;AO=25;DP=53;FAO=25;FDP=53;FR=.;FRO=28;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=-0.00658855;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.1137;QD=17.0799;RBI=0.0192798;REFB=-0.00398008;REVB=0.0181191;RO=28;SAF=16;SAR=9;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.232531;STB=0.631154;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=0.00626377;OID=.;OPOS=51175324;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:28:28:25:25:0.471698:9:16:11:17:9:16:11:17
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chr16	51705448	.	C	T	122.13	PASS	AF=0.684211;AO=13;DP=19;FAO=13;FDP=19;FR=.;FRO=6;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0137597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.956;QD=25.7109;RBI=0.0237643;REFB=-0.0042143;REVB=0.0193756;RO=6;SAF=7;SAR=6;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114837;STB=0.564417;STBP=0.449;TYPE=snp;VARB=0.00335327;OID=.;OPOS=51705448;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:19:19:6:6:13:13:0.684211:6:7:2:4:6:7:2:4
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chr16	55806409	.	T	C	951.32	PASS	AF=1;AO=64;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0267165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.7972;QD=58.5424;RBI=0.0449774;REFB=0;REVB=0.0361828;RO=0;SAF=33;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.31364e-05;OID=.;OPOS=55806409;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:64:65:1:31:33:0:0:32:33:0:0
chr16	55853545	.	C	A	240.52	PASS	AF=0.41791;AO=28;DP=67;FAO=28;FDP=67;FR=.;FRO=39;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=-0.00907021;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.974;QD=14.3591;RBI=0.0366601;REFB=-0.00643897;REVB=-0.0355204;RO=39;SAF=14;SAR=14;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0131215;STB=0.507457;STBP=0.943;TYPE=snp;VARB=0.0119933;OID=.;OPOS=55853545;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:39:39:28:28:0.41791:14:14:19:20:14:14:19:20
chr16	55855361	.	G	T	505.51	PASS	AF=0.374233;AO=58;DP=161;FAO=61;FDP=163;FR=.;FRO=102;FSAF=29;FSAR=32;FSRF=60;FSRR=42;FWDB=-0.0101264;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=302.929;QD=12.4052;RBI=0.0218501;REFB=-0.000975523;REVB=0.0193619;RO=102;SAF=29;SAR=29;SRF=60;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0988823;STB=0.570262;STBP=0.168;TYPE=snp;VARB=0.00174928;OID=.;OPOS=55855361;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:161:163:102:102:58:61:0.374233:29:29:60:42:32:29:60:42
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chr16	55862836	.	G	A	73.93	PASS	AF=0.138211;AO=14;DP=120;FAO=17;FDP=123;FR=.;FRO=106;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=58;FSRR=48;FWDB=-0.00994748;FXX=0.0159987;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.396;QD=2.40428;RBI=0.0128695;REFB=-0.00458136;REVB=-0.00816535;RO=106;SAF=5;SAR=9;SRF=58;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.229795;STB=0.565638;STBP=0.555;TYPE=snp;VARB=0.0605564;OID=.;OPOS=55862836;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:120:123:106:106:14:17:0.138211:9:5:58:48:9:8:58:48
chr16	55862883	.	C	A	51.93	PASS	AF=0.127907;AO=11;DP=86;FAO=11;FDP=86;FR=.;FRO=75;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=41;FSRR=34;FWDB=-0.00874749;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=243.901;QD=2.41512;RBI=0.0262337;REFB=-0.00220548;REVB=-0.0247323;RO=75;SAF=5;SAR=6;SRF=41;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11211;STB=0.579689;STBP=0.614;TYPE=snp;VARB=0.0148296;OID=.;OPOS=55862883;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:51:86:86:75:75:11:11:0.127907:6:5:41:34:6:5:41:34
chr16	55880480	.	A	C	294.59	PASS	AF=0.684211;AO=26;DP=38;FAO=26;FDP=38;FR=.;FRO=12;FSAF=21;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.0853153;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=49.5256;QD=31.0099;RBI=0.0862081;REFB=-0.0512354;REVB=0.0123749;RO=10;SAF=21;SAR=5;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.269706;STB=0.631035;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.0227454;OID=.;OPOS=55880480;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:38:38:10:12:26:26:0.684211:5:21:4:6:5:21:6:6
chr16	55880534	.	G	C	334.78	PASS	AF=0.7;AO=28;DP=40;FAO=28;FDP=40;FR=.;FRO=12;FSAF=20;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=-0.00812715;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.042;QD=33.4783;RBI=0.00865895;REFB=0.00398138;REVB=-0.00298778;RO=12;SAF=20;SAR=8;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.182178;STB=0.599925;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=-0.00138987;OID=.;OPOS=55880534;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:40:40:12:12:28:28:0.7:8:20:5:7:8:20:5:7
chr16	55883618	.	T	C	1097.45	PASS	AF=1;AO=72;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00612974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.873;QD=60.1341;RBI=0.0170785;REFB=0;REVB=0.0159405;RO=0;SAF=34;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.12389e-05;OID=.;OPOS=55883618;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:72:73:1:38:34:0:0:39:34:0:0
chr16	55897289	.	C	T	400.22	PASS	AF=0.264706;AO=29;DP=137;FAO=36;FDP=136;FR=.,HEALED;FRO=84;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=43;FSRR=41;FWDB=0.0995108;FXX=0.00729874;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.7392;QD=11.7711;RBI=0.108799;REFB=0.00424088;REVB=0.0439866;RO=83;SAF=9;SAR=20;SRF=43;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.261925;STB=0.547284;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.048812;OID=.;OPOS=55897289;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:137:136:83:84:29:36:0.264706:20:9:43:40:20:16:43:41
chr16	55905636	.	A	G	1396.31	PASS	AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0261622;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.5993;QD=62.7553;RBI=0.0261961;REFB=0;REVB=-0.00133326;RO=0;SAF=44;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000101214;OID=.;OPOS=55905636;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:45:44:0:0:45:44:0:0
chr16	55907811	.	C	T	527.9	PASS	AF=0.701493;AO=44;DP=66;FAO=47;FDP=67;FR=.;FRO=20;FSAF=15;FSAR=32;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.00317471;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.271;QD=31.5163;RBI=0.00401642;REFB=0.0058247;REVB=-0.00246025;RO=20;SAF=15;SAR=29;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0682117;STB=0.543505;STBP=0.337;TYPE=snp;VARB=-0.00215251;OID=.;OPOS=55907811;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:67:20:20:44:47:0.701493:29:15:9:11:32:15:9:11
chr16	56228066	.	A	G	905.75	PASS	AF=1;AO=61;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0526121;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.309;QD=58.4354;RBI=0.0550125;REFB=0;REVB=-0.016073;RO=0;SAF=36;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0001165;OID=.;OPOS=56228066;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:61:62:1:25:36:0:0:25:37:0:0
chr16	56368689	.	C	T	506.08	PASS	AF=0.647887;AO=46;DP=71;FAO=46;FDP=71;FR=.;FRO=25;FSAF=31;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=0.0193625;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.071;QD=28.5114;RBI=0.0194572;REFB=-0.0160779;REVB=0.00191814;RO=25;SAF=31;SAR=15;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186973;STB=0.601896;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.0136548;OID=.;OPOS=56368689;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:25:25:46:46:0.647887:15:31:10:15:15:31:10:15
chr16	56395610	.	G	A	108.45	PASS	AF=0.191489;AO=18;DP=93;FAO=18;FDP=94;FR=.;FRO=76;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=40;FSRR=36;FWDB=0.000641926;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.676;QD=4.61476;RBI=0.00119595;REFB=-0.00330864;REVB=-0.00100907;RO=75;SAF=8;SAR=10;SRF=40;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11173;STB=0.565965;STBP=0.568;TYPE=snp;VARB=0.0183863;OID=.;OPOS=56395610;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:94:75:76:18:18:0.191489:10:8:40:35:10:8:40:36
chr16	56396486	.	C	T	188.42	PASS	AF=0.513514;AO=18;DP=36;FAO=19;FDP=37;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.00407139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.323;QD=20.3701;RBI=0.0241197;REFB=-0.00822605;REVB=-0.0237736;RO=18;SAF=10;SAR=8;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0492501;STB=0.538864;STBP=0.693;TYPE=snp;VARB=0.0129268;OID=.;OPOS=56396486;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:37:18:18:18:19:0.513514:8:10:9:9:8:11:9:9
chr16	56510299	.	A	C	105.7	PASS	AF=0.351351;AO=13;DP=37;FAO=13;FDP=37;FR=.;FRO=24;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=0.0854952;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.6412;QD=11.4271;RBI=0.0856506;REFB=0.00606346;REVB=-0.00515603;RO=24;SAF=3;SAR=10;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.399437;STB=0.738748;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=-0.0049221;OID=.;OPOS=56510299;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:24:24:13:13:0.351351:10:3:14:10:10:3:14:10
chr16	56545175	.	T	C	157.5	PASS	AF=0.357143;AO=20;DP=56;FAO=20;FDP=56;FR=.;FRO=36;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=22;FWDB=-0.0131167;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.758;QD=11.2501;RBI=0.0142765;REFB=-0.00563652;REVB=0.00563657;RO=36;SAF=10;SAR=10;SRF=14;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122742;STB=0.571359;STBP=0.434;TYPE=snp;VARB=0.0112871;OID=.;OPOS=56545175;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:36:36:20:20:0.357143:10:10:14:22:10:10:14:22
chr16	56548501	.	C	T	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0115213;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.487;QD=55.0979;RBI=0.0377065;REFB=0;REVB=0.0359033;RO=0;SAF=12;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000148046;OID=.;OPOS=56548501;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:14:12:0:0:14:12:0:0
chr16	56601720	.	A	G	721.87	PASS	AF=1;AO=50;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.018418;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.001;QD=56.6169;RBI=0.0222966;REFB=0;REVB=-0.0125665;RO=0;SAF=19;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000487062;OID=.;OPOS=56601720;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:50:51:1:31:19:0:0:31:20:0:0
chr16	56601722	.	T	C	740.22	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00706608;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.522;QD=56.9399;RBI=0.0106918;REFB=0;REVB=0.00802405;RO=0;SAF=19;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.2152e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.89722e-06;OID=.;OPOS=56601722;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:52:0:0:51:52:1:32:19:0:0:32:20:0:0
chr16	56667282	.	C	A	557.14	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.002638;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.93;QD=60.2308;RBI=0.0178529;REFB=0;REVB=0.017657;RO=0;SAF=13;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.15893e-05;OID=.;OPOS=56667282;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:24:13:0:0:24:13:0:0
chr16	56672671	.	C	T	717.44	PASS	AF=0.565574;AO=68;DP=122;FAO=69;FDP=122;FR=.;FRO=53;FSAF=37;FSAR=32;FSRF=29;FSRR=24;FWDB=0.0378407;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.8319;QD=23.5227;RBI=0.0433823;REFB=-0.029822;REVB=0.0212157;RO=53;SAF=36;SAR=32;SRF=30;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0295245;STB=0.504779;STBP=0.921;TYPE=snp;VARB=0.0191218;OID=.;OPOS=56672671;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:122:122:53:53:68:69:0.565574:32:36:30:23:32:37:29:24
chr16	56673227	.	C	A	108.69	PASS	AF=0.464286;AO=13;DP=27;FAO=13;FDP=28;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=-0.0679907;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.4305;QD=15.5278;RBI=0.0953522;REFB=-0.00976394;REVB=-0.0668529;RO=14;SAF=7;SAR=6;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0985294;STB=0.573658;STBP=0.486;TYPE=snp;VARB=0.00548217;OID=.;OPOS=56673227;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:28:14:15:13:13:0.464286:6:7:6:8:6:7:6:9
chr16	56673249	.	T	C	79.39	PASS	AF=0.5;AO=10;DP=20;FAO=10;FDP=20;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=-0.0303024;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.5744;QD=15.8782;RBI=0.098915;REFB=-0.034983;REVB=0.0941591;RO=9;SAF=6;SAR=4;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215579;STB=0.5998;STBP=0.41;TYPE=snp;VARB=0.0542253;OID=.;OPOS=56673249;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:20:20:9:10:10:10:0.5:4:6:3:6:4:6:4:6
chr16	56686471	.	G	T	510.06	PASS	AF=0.602564;AO=47;DP=79;FAO=47;FDP=78;FR=.;FRO=31;FSAF=30;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=20;FWDB=-0.0101079;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.127;QD=26.1571;RBI=0.0104681;REFB=-0.00162604;REVB=0.00272237;RO=31;SAF=30;SAR=17;SRF=11;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.208974;STB=0.614229;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.022454;OID=.;OPOS=56686471;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:78:31:31:47:47:0.602564:17:30:11:20:17:30:11:20
chr16	56709728	.	GA	CG	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00350254;FXX=0;HRUN=5;LEN=2;MLLD=100.159;QD=37.4885;RBI=0.00350254;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=8;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=-0.000150458;OID=.;OPOS=56709728;OREF=GA;OALT=CG;OMAPALT=CG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:0:8:0:0:0:8:0:0
chr16	56839439	.	C	T	368.68	PASS	AF=0.660377;AO=34;DP=50;FAO=35;FDP=53;FR=.;FRO=18;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=0.0144162;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.455;QD=27.8253;RBI=0.0563706;REFB=-0.0382966;REVB=-0.054496;RO=16;SAF=15;SAR=19;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0396132;STB=0.533315;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=0.0190107;OID=.;OPOS=56839439;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:53:16:18:34:35:0.660377:19:15:6:10:20:15:6:12
chr16	56855496	.	C	G	1026.38	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00235021;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.064;QD=59.5004;RBI=0.0615514;REFB=0;REVB=0.0615065;RO=0;SAF=30;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000243075;OID=.;OPOS=56855496;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:39:30:0:0:39:30:0:0
chr16	56868700	.	A	G	200.86	PASS	AF=0.367647;AO=25;DP=68;FAO=25;FDP=68;FR=.;FRO=43;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=28;FWDB=-0.0349251;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=113.662;QD=11.8151;RBI=0.0419666;REFB=-0.00880776;REVB=-0.0232687;RO=43;SAF=15;SAR=10;SRF=15;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.269831;STB=0.655053;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.0177984;OID=.;OPOS=56868700;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:43:43:25:25:0.367647:10:15:15:28:10:15:15:28
chr16	56904587	.	C	G	850.71	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0280069;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.268;QD=57.6755;RBI=0.0313952;REFB=0;REVB=-0.0141869;RO=0;SAF=34;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.03209e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000150312;OID=.;OPOS=56904587;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:25:34:0:0:25:34:0:0
chr16	56919235	.	G	A	471.5	PASS	AF=0.5625;AO=45;DP=80;FAO=45;FDP=80;FR=.;FRO=35;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=0.00494589;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.308;QD=23.575;RBI=0.00533517;REFB=-0.0215799;REVB=-0.00200058;RO=35;SAF=22;SAR=23;SRF=14;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0709939;STB=0.538958;STBP=0.432;TYPE=snp;VARB=0.0142106;OID=.;OPOS=56919235;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:35:35:45:45:0.5625:23:22:14:21:23:22:14:21
chr16	56920969	.	C	T	121.58	PASS	AF=0.4375;AO=13;DP=31;FAO=14;FDP=32;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.0254557;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.462;QD=15.1969;RBI=0.0261441;REFB=-0.00133291;REVB=0.00595991;RO=18;SAF=7;SAR=6;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147914;STB=0.562412;STBP=0.55;TYPE=snp;VARB=0.00137586;OID=.;OPOS=56920969;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:32:18:18:13:14:0.4375:6:7:7:11:7:7:7:11
chr16	56928519	.	C	T	201.16	PASS	AF=0.333333;AO=25;DP=78;FAO=26;FDP=78;FR=.;FRO=52;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=25;FSRR=27;FWDB=-0.029449;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.1548;QD=10.3161;RBI=0.0389802;REFB=-0.027375;REVB=-0.0255384;RO=52;SAF=12;SAR=13;SRF=25;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000887637;STB=0.512861;STBP=0.866;TYPE=snp;VARB=0.0887282;OID=.;OPOS=56928519;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:52:52:25:26:0.333333:13:12:25:27:14:12:25:27
chr16	56933519	.	G	A	443.72	PASS	AF=0.575342;AO=42;DP=72;FAO=42;FDP=73;FR=.;FRO=31;FSAF=14;FSAR=28;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=-0.0155663;FXX=0.0266631;HRUN=3;LEN=1;MLLD=257.995;QD=24.3133;RBI=0.0158886;REFB=-0.0214577;REVB=0.00318432;RO=30;SAF=14;SAR=28;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135023;STB=0.568594;STBP=0.188;TYPE=snp;VARB=0.0152122;OID=.;OPOS=56933519;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:73:30:31:42:42:0.575342:28:14:15:15:28:14:15:16
chr16	56938387	.	C	T	295.75	PASS	AF=0.534483;AO=31;DP=58;FAO=31;FDP=58;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=-0.0103366;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=74.2699;QD=20.3967;RBI=0.0470547;REFB=0.00352466;REVB=-0.0459053;RO=27;SAF=10;SAR=21;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.204661;STB=0.613959;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=-0.00366519;OID=.;OPOS=56938387;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:27:27:31:31:0.534483:21:10:15:12:21:10:15:12
chr16	56947275	.	C	T	44.05	PASS	AF=0.259259;AO=7;DP=27;FAO=7;FDP=27;FR=.;FRO=20;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=0.109856;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.8666;QD=6.5263;RBI=0.110337;REFB=0.00842611;REVB=0.0102861;RO=20;SAF=2;SAR=5;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.357767;STB=0.728523;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=-0.0128705;OID=.;OPOS=56947275;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:27:27:20:20:7:7:0.259259:5:2:12:8:5:2:12:8
chr16	56966011	.	G	A	1652.06	PASS	AF=0.982301;AO=111;DP=113;FAO=111;FDP=113;FR=.;FRO=2;FSAF=70;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0156779;FXX=0.00877116;HRUN=3;LEN=1;MLLD=150.155;QD=58.4801;RBI=0.0453944;REFB=-0.0941445;REVB=0.0426012;RO=2;SAF=70;SAR=41;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0047039;STB=0.502478;STBP=0.766;TYPE=snp;VARB=0.000393244;OID=.;OPOS=56966011;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:113:113:2:2:111:111:0.982301:41:70:1:1:41:70:1:1
chr16	56966071	.	T	G	990.65	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00840969;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.213;QD=59.1432;RBI=0.0185659;REFB=0;REVB=0.016552;RO=0;SAF=26;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.92946e-05;OID=.;OPOS=56966071;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:41:26:0:0:41:26:0:0
chr16	57016092	.	G	A	1062.42	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00510704;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.5615;QD=59.8545;RBI=0.0402503;REFB=0;REVB=0.039925;RO=0;SAF=36;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11607e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000196819;OID=.;OPOS=57016092;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:35:36:0:0:35:36:0:0
chr16	57060340	.	T	C	135.06	PASS	AF=0.46875;AO=15;DP=32;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.0881447;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.1697;QD=16.883;RBI=0.0898008;REFB=0.0082179;REVB=0.0171665;RO=17;SAF=9;SAR=6;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0668581;STB=0.53841;STBP=0.676;TYPE=snp;VARB=-0.0124318;OID=.;OPOS=57060340;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:17:17:15:15:0.46875:6:9:9:8:6:9:9:8
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chr16	57068106	.	AC	GT	181.18	PASS	AF=0.359375;AO=23;DP=64;FAO=23;FDP=64;FR=.;FRO=41;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=30;FSRR=11;FWDB=0.0227098;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=117.665;QD=11.3237;RBI=0.0228195;REFB=-0.00345915;REVB=0.00223544;RO=40;SAF=12;SAR=11;SRF=29;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.228048;STB=0.636255;STBP=0.132;TYPE=mnp;VARB=0.00638052;OID=.;OPOS=57068106;OREF=AC;OALT=GT;OMAPALT=GT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:40:41:23:23:0.359375:11:12:29:11:11:12:30:11
chr16	57070004	.	C	CT,T	64.35	PASS	AF=0.375,0.1875;AO=4,4;DP=16;FAO=6,3;FDP=16;FR=.;FRO=7;FSAF=5,1;FSAR=1,2;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.0137261,0.0749337;FXX=0;HRUN=0,6;LEN=1,1;MLLD=81.2229,82.0896;QD=16.0883;RBI=0.0294947,0.0820109;REFB=-0.0776833,-0.0696893;REVB=0.0261061,0.0333278;RO=6;SAF=4,1;SAR=0,3;SRF=1;SRR=5;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.776095,0.113038;STB=0.809724,0.538213;STBP=0.075,0.968;TYPE=ins,snp;VARB=0.070119,0.0196869;OID=.,.;OPOS=57070005,57070004;OREF=-,C;OALT=T,T;OMAPALT=CT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:24:16:16:6:7:4,4:6,3:0.375,0.1875:0,3:4,1:1:5:1,2:5,1:2:5
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chr16	57073683	.	G	C	1190.38	PASS	AF=1;AO=59;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00579807;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.721;QD=61.0449;RBI=0.0623293;REFB=0;REVB=-0.062059;RO=0;SAF=31;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000271044;OID=.;OPOS=57073683;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:78:0:0:59:78:1:28:31:0:0:31:47:0:0
chr16	57085465	.	C	T	247.27	PASS	AF=0.39726;AO=29;DP=74;FAO=29;FDP=73;FR=.;FRO=44;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=32;FSRR=12;FWDB=-0.0705989;FXX=0.0135117;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.13;QD=13.5489;RBI=0.0784174;REFB=-0.00279352;REVB=-0.0341334;RO=45;SAF=13;SAR=16;SRF=33;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.298754;STB=0.664102;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.00156693;OID=.;OPOS=57085465;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:73:45:44:29:29:0.39726:16:13:33:12:16:13:32:12
chr16	57111232	.	C	T	175.45	PASS	AF=0.473684;AO=18;DP=39;FAO=18;FDP=38;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.00618472;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.666;QD=18.4688;RBI=0.0122636;REFB=-0.0239678;REVB=0.0105899;RO=20;SAF=8;SAR=10;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.05159;STB=0.529379;STBP=0.685;TYPE=snp;VARB=0.0254381;OID=.;OPOS=57111232;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:38:20:20:18:18:0.473684:10:8:10:10:10:8:10:10
chr16	57180158	.	C	A	496.66	PASS	AF=0.546512;AO=48;DP=86;FAO=47;FDP=86;FR=.;FRO=39;FSAF=17;FSAR=30;FSRF=16;FSRR=23;FWDB=0.0190692;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.86;QD=23.1003;RBI=0.0194567;REFB=-0.00444661;REVB=0.00386366;RO=38;SAF=17;SAR=31;SRF=16;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0576581;STB=0.523522;STBP=0.661;TYPE=snp;VARB=0.00275892;OID=.;OPOS=57180158;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:38:39:48:47:0.546512:31:17:16:22:30:17:16:23
chr16	57392733	.	A	C	214.26	PASS	AF=0.947368;AO=18;DP=19;FAO=18;FDP=19;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.029493;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.4729;QD=45.1071;RBI=0.030461;REFB=-0.12678;REVB=-0.00761797;RO=0;SAF=5;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.545402;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=0.00636546;OID=.;OPOS=57392733;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:19:19:0:1:18:18:0.947368:13:5:0:0:13:5:1:0
chr16	57499902	.	T	C	989.74	PASS	AF=0.958333;AO=69;DP=71;FAO=69;FDP=72;FR=.;FRO=3;FSAF=29;FSAR=40;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0485777;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.7296;QD=54.9854;RBI=0.0721582;REFB=0.0781105;REVB=0.0533573;RO=2;SAF=29;SAR=40;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0314852;STB=0.524583;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=-0.0136311;OID=.;OPOS=57499902;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:71:72:2:3:69:69:0.958333:40:29:2:0:40:29:3:0
chr16	57503213	.	C	T	1829.71	PASS	AF=0.991667;AO=115;DP=122;FAO=119;FDP=120;FR=.;FRO=1;FSAF=53;FSAR=66;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0168479;FXX=0.0476153;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.41;QD=60.9903;RBI=0.0175165;REFB=-0.0435306;REVB=0.00479362;RO=1;SAF=53;SAR=62;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00887576;STB=0.504672;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=0.00156098;OID=.;OPOS=57503213;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:122:120:1:1:115:119:0.991667:62:53:1:0:66:53:1:0
chr16	57595999	.	A	G	162.2	PASS	AF=0.37037;AO=20;DP=54;FAO=20;FDP=54;FR=.;FRO=34;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=20;FWDB=0.0123757;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.257;QD=12.0147;RBI=0.0425359;REFB=-0.0100329;REVB=-0.0406958;RO=34;SAF=14;SAR=6;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.316262;STB=0.684024;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.0108035;OID=.;OPOS=57595999;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:34:34:20:20:0.37037:6:14:14:20:6:14:14:20
chr16	57601792	.	C	T	79.41	PASS	AF=0.5;AO=10;DP=20;FAO=10;FDP=20;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=2;FWDB=0.00102321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.858;QD=15.8821;RBI=0.0230293;REFB=-0.0258853;REVB=-0.0230066;RO=10;SAF=6;SAR=4;SRF=8;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188678;STB=0.608497;STBP=0.397;TYPE=snp;VARB=0.019936;OID=.;OPOS=57601792;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:20:20:10:10:10:10:0.5:4:6:8:2:4:6:8:2
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chr16	57689883	.	T	C	728.55	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0877637;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.3656;QD=57.1414;RBI=0.0897258;REFB=0;REVB=-0.0186617;RO=0;SAF=28;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.97956e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00146963;OID=.;OPOS=57689883;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:23:28:0:0:23:28:0:0
chr16	57698931	.	A	G	139.43	PASS	AF=0.355556;AO=16;DP=45;FAO=16;FDP=45;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=0.0156264;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.9828;QD=12.3939;RBI=0.0195796;REFB=-0.00943862;REVB=-0.0117972;RO=29;SAF=7;SAR=9;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119587;STB=0.507033;STBP=0.955;TYPE=snp;VARB=0.0218442;OID=.;OPOS=57698931;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:29:29:16:16:0.355556:9:7:13:16:9:7:13:16
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chr16	58542901	.	G	A	1711.34	PASS	AF=1;AO=110;DP=110;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0613827;FXX=0.0086949;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.0557;QD=60.0469;RBI=0.0715427;REFB=0;REVB=0.0367496;RO=0;SAF=70;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.74501e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000504159;OID=.;OPOS=58542901;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:110:114:0:0:110:114:1:40:70:0:0:40:74:0:0
chr16	58545426	.	A	G	1859.36	PASS	AF=1;AO=121;DP=121;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0272966;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.238;QD=61.4664;RBI=0.0273221;REFB=0;REVB=-0.00117857;RO=0;SAF=67;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.79322e-05;OID=.;OPOS=58545426;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:121:121:0:0:121:121:1:54:67:0:0:54:67:0:0
chr16	58549932	.	T	C	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0296698;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.8731;QD=45.8054;RBI=0.0296971;REFB=0;REVB=0.00127266;RO=0;SAF=6;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000737086;OID=.;OPOS=58549932;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:8:6:0:0:8:6:0:0
chr16	58552921	.	G	A	717.19	PASS	AF=1;AO=50;DP=53;FAO=51;FDP=51;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=32;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.042327;FXX=0.0377287;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.499;QD=56.2502;RBI=0.0466759;REFB=0;REVB=0.019674;RO=0;SAF=31;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000171461;OID=.;OPOS=58552921;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:51:0:0:50:51:1:19:31:0:0:19:32:0:0
chr16	58575489	.	G	A	955.18	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0034621;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.8;QD=58.7805;RBI=0.0119994;REFB=0;REVB=0.0114891;RO=0;SAF=39;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.10038e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.37668e-05;OID=.;OPOS=58575489;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:26:39:0:0:26:39:0:0
chr16	58577421	.	C	T	712.05	PASS	AF=1;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112619;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.373;QD=63.293;RBI=0.0133638;REFB=0;REVB=0.00719439;RO=0;SAF=24;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.19128e-05;OID=.;OPOS=58577421;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:45:0:0:45:45:1:21:24:0:0:21:24:0:0
chr16	58582410	.	C	T	63.35	PASS	AF=0.310345;AO=9;DP=29;FAO=9;FDP=29;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=15;FSRR=5;FWDB=-0.0125873;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.8358;QD=8.73751;RBI=0.0572451;REFB=0.0185048;REVB=0.0558441;RO=20;SAF=8;SAR=1;SRF=15;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.274883;STB=0.675584;STBP=0.357;TYPE=snp;VARB=-0.0362175;OID=.;OPOS=58582410;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:29:29:20:20:9:9:0.310345:1:8:15:5:1:8:15:5
chr16	58587737	.	C	T	989.73	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00481457;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.686;QD=59.0885;RBI=0.054517;REFB=0;REVB=0.0543039;RO=0;SAF=33;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000180826;OID=.;OPOS=58587737;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:67:0:0:66:67:1:33:33:0:0:33:34:0:0
chr16	58743454	.	A	C	293.93	PASS	AF=0.484848;AO=31;DP=65;FAO=32;FDP=66;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=-0.0108198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.714;QD=17.8136;RBI=0.0175235;REFB=-0.00366271;REVB=0.0137842;RO=34;SAF=11;SAR=20;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0853445;STB=0.535692;STBP=0.608;TYPE=snp;VARB=0.0031899;OID=.;OPOS=58743454;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:66:34:34:31:32:0.484848:20:11:15:19:20:12:15:19
chr16	58750604	.	G	A	153.61	PASS	AF=0.571429;AO=16;DP=28;FAO=16;FDP=28;FR=.;FRO=12;FSAF=13;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.0234649;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.0521;QD=21.9445;RBI=0.0236177;REFB=-0.00513797;REVB=-0.00268175;RO=12;SAF=13;SAR=3;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.234772;STB=0.633959;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.0039342;OID=.;OPOS=58750604;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:28:28:12:12:16:16:0.571429:3:13:7:5:3:13:7:5
chr16	58757668	.	A	C	210.81	PASS	AF=0.416667;AO=25;DP=60;FAO=25;FDP=60;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=21;FSRR=14;FWDB=-0.0116691;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.874;QD=14.0542;RBI=0.0119497;REFB=-0.000644147;REVB=0.00257437;RO=35;SAF=15;SAR=10;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000668461;OID=.;OPOS=58757668;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:35:35:25:25:0.416667:10:15:21:14:10:15:21:14
chr16	58757683	.	A	G	300.26	PASS	AF=0.452055;AO=33;DP=73;FAO=33;FDP=73;FR=.;FRO=40;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=18;FWDB=0.00586767;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=360.379;QD=16.4527;RBI=0.00610671;REFB=0.00348972;REVB=0.00169183;RO=40;SAF=17;SAR=16;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0340277;STB=0.519123;STBP=0.771;TYPE=snp;VARB=-0.00390904;OID=.;OPOS=58757683;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:40:40:33:33:0.452055:16:17:22:18:16:17:22:18
chr16	58804449	.	T	C	203.14	PASS	AF=0.703704;AO=19;DP=27;FAO=19;FDP=27;FR=.;FRO=8;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=-0.027089;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.2595;QD=30.094;RBI=0.02709;REFB=-0.0124208;REVB=0.000229971;RO=8;SAF=11;SAR=8;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0254457;STB=0.514041;STBP=0.851;TYPE=snp;VARB=0.00443298;OID=.;OPOS=58804449;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:27:27:8:8:19:19:0.703704:8:11:5:3:8:11:5:3
chr16	61777269	.	C	A	333.06	PASS	AF=0.389474;AO=37;DP=95;FAO=37;FDP=95;FR=.;FRO=58;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=28;FSRR=30;FWDB=-0.0195466;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=244.165;QD=14.0235;RBI=0.0248907;REFB=-0.0151432;REVB=-0.0154103;RO=58;SAF=19;SAR=18;SRF=28;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0329736;STB=0.518761;STBP=0.773;TYPE=snp;VARB=0.0194089;OID=.;OPOS=61777269;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:58:58:37:37:0.389474:18:19:28:30:18:19:28:30
chr16	61777311	.	C	A	410.02	PASS	AF=0.629032;AO=39;DP=62;FAO=39;FDP=62;FR=.;FRO=23;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=-0.026199;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.2851;QD=26.453;RBI=0.0265891;REFB=-0.00899668;REVB=-0.00453752;RO=23;SAF=19;SAR=20;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0234626;STB=0.512814;STBP=0.81;TYPE=snp;VARB=0.00367147;OID=.;OPOS=61777311;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:23:23:39:39:0.629032:20:19:12:11:20:19:12:11
chr16	61777330	.	C	A	388.57	PASS	AF=0.653061;AO=32;DP=49;FAO=32;FDP=49;FR=.;FRO=17;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=0.00460549;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=273.767;QD=31.7198;RBI=0.0133138;REFB=-0.0214117;REVB=-0.0124918;RO=17;SAF=14;SAR=18;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0549192;STB=0.530007;STBP=0.555;TYPE=snp;VARB=0.00948638;OID=.;OPOS=61777330;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:17:17:32:32:0.653061:18:14:6:11:18:14:6:11
chr16	64980818	.	C	T	1358.62	PASS	AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00645387;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.549;QD=62.4654;RBI=0.00660938;REFB=0;REVB=-0.00142528;RO=0;SAF=50;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.37708e-06;OID=.;OPOS=64980818;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:37:50:0:0:37:50:0:0
chr16	65016087	.	A	C	1712.9	PASS	AF=1;AO=113;DP=113;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0543839;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.3393;QD=60.6336;RBI=0.0560611;REFB=0;REVB=0.0136102;RO=0;SAF=49;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.34554e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00035443;OID=.;OPOS=65016087;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:113:113:0:0:113:113:1:64:49:0:0:64:49:0:0
chr16	65022114	.	C	T	614.39	PASS	AF=0.544643;AO=61;DP=112;FAO=61;FDP=112;FR=.;FRO=51;FSAF=22;FSAR=39;FSRF=29;FSRR=22;FWDB=-0.0156757;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.664;QD=21.9423;RBI=0.0223716;REFB=-0.0351127;REVB=-0.0159612;RO=51;SAF=22;SAR=39;SRF=29;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176824;STB=0.597086;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.0394494;OID=.;OPOS=65022114;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:112:51:51:61:61:0.544643:39:22:29:22:39:22:29:22
chr16	65025718	.	G	A	712.4	PASS	AF=0.609091;AO=67;DP=110;FAO=67;FDP=110;FR=.;FRO=43;FSAF=22;FSAR=45;FSRF=14;FSRR=29;FWDB=0.0110983;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.9386;QD=25.9055;RBI=0.0124728;REFB=-0.021675;REVB=-0.00569186;RO=43;SAF=22;SAR=45;SRF=14;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00226655;STB=0.501231;STBP=0.986;TYPE=snp;VARB=0.0160551;OID=.;OPOS=65025718;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:110:43:43:67:67:0.609091:45:22:14:29:45:22:14:29
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chr16	66420885	.	C	T	562.97	PASS	AF=0.553191;AO=52;DP=94;FAO=52;FDP=94;FR=.;FRO=42;FSAF=21;FSAR=31;FSRF=10;FSRR=32;FWDB=0.00849738;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.1519;QD=23.9562;RBI=0.00850916;REFB=-0.0119506;REVB=-0.000447535;RO=42;SAF=21;SAR=31;SRF=10;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145076;STB=0.579218;STBP=0.114;TYPE=snp;VARB=0.0117326;OID=.;OPOS=66420885;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:42:42:52:52:0.553191:31:21:10:32:31:21:10:32
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chr16	66527192	.	G	A	38.44	PASS	AF=0.428571;AO=6;DP=14;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=-0.00172603;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=200.725;QD=10.984;RBI=0.0102231;REFB=-0.0136039;REVB=0.0100763;RO=8;SAF=5;SAR=1;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.074933;STB=0.545312;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=0.0193637;OID=.;OPOS=66527192;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:14:14:8:8:6:6:0.428571:1:5:7:1:1:5:7:1
chr16	66584002	.	T	C	302.39	PASS	AF=0.360825;AO=35;DP=97;FAO=35;FDP=97;FR=.;FRO=62;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=24;FSRR=38;FWDB=-0.0985191;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.918;QD=12.4696;RBI=0.107626;REFB=0.00262053;REVB=-0.0433281;RO=62;SAF=14;SAR=21;SRF=24;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0150109;STB=0.508616;STBP=0.92;TYPE=snp;VARB=-0.00825861;OID=.;OPOS=66584002;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:62:62:35:35:0.360825:21:14:24:38:21:14:24:38
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chr16	66613525	.	G	A	125.44	PASS	AF=0.240506;AO=19;DP=79;FAO=19;FDP=79;FR=.;FRO=60;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=40;FSRR=20;FWDB=-0.00306371;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.217;QD=6.35128;RBI=0.0362166;REFB=-0.00977795;REVB=-0.0360868;RO=60;SAF=10;SAR=9;SRF=40;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177487;STB=0.608001;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.0233031;OID=.;OPOS=66613525;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:60:60:19:19:0.240506:9:10:40:20:9:10:40:20
chr16	66614008	.	T	C	191.1	PASS	AF=0.408163;AO=20;DP=49;FAO=20;FDP=49;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=8;FWDB=0.0334472;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.0107;QD=15.5998;RBI=0.0469613;REFB=-0.0195793;REVB=0.0329643;RO=29;SAF=6;SAR=14;SRF=21;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.421723;STB=0.740947;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0304718;OID=.;OPOS=66614008;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:29:29:20:20:0.408163:14:6:21:8:14:6:21:8
chr16	66656102	.	C	T	118.32	PASS	AF=0.378378;AO=14;DP=37;FAO=14;FDP=37;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.0215231;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.163;QD=12.7914;RBI=0.0288976;REFB=-0.017058;REVB=-0.0192829;RO=23;SAF=8;SAR=6;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00669221;STB=0.503931;STBP=0.999;TYPE=snp;VARB=0.02664;OID=.;OPOS=66656102;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:23:23:14:14:0.378378:6:8:13:10:6:8:13:10
chr16	66765067	.	G	A	1098.73	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0124176;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=255.398;QD=60.2046;RBI=0.0361978;REFB=0;REVB=0.0340013;RO=0;SAF=35;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.90268e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.23477e-05;OID=.;OPOS=66765067;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:38:35:0:0:38:35:0:0
chr16	66792714	.	T	C	501.65	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0211196;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.8316;QD=59.018;RBI=0.0266364;REFB=0;REVB=-0.0162314;RO=0;SAF=21;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.18385e-05;OID=.;OPOS=66792714;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:13:21:0:0:13:21:0:0
chr16	66812797	.	C	T	739.67	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0326652;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.882;QD=56.8974;RBI=0.0340006;REFB=0;REVB=0.00943519;RO=0;SAF=21;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.93989e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.20994e-05;OID=.;OPOS=66812797;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:31:21:0:0:31:21:0:0
chr16	66919929	.	G	C	146.37	PASS	AF=0.457143;AO=16;DP=35;FAO=16;FDP=35;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=-0.0115689;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.39;QD=16.728;RBI=0.0202929;REFB=0.00368092;REVB=-0.0166722;RO=19;SAF=5;SAR=11;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00361203;STB=0.502072;STBP=0.976;TYPE=snp;VARB=-0.00612588;OID=.;OPOS=66919929;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:19:19:16:16:0.457143:11:5:6:13:11:5:6:13
chr16	66920510	.	A	G	251.65	PASS	AF=0.489796;AO=24;DP=49;FAO=24;FDP=49;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=-0.000541658;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.061;QD=20.5425;RBI=0.00522149;REFB=0.00530634;REVB=0.00519332;RO=25;SAF=12;SAR=12;SRF=8;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163737;STB=0.591763;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=-0.00489813;OID=.;OPOS=66920510;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:25:25:24:24:0.489796:12:12:8:17:12:12:8:17
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chr16	67037054	.	A	C	187.69	PASS	AF=0.389831;AO=23;DP=59;FAO=23;FDP=59;FR=.;FRO=36;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=27;FSRR=9;FWDB=-0.0368304;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.056;QD=12.7245;RBI=0.057695;REFB=-0.0215959;REVB=-0.0444098;RO=35;SAF=14;SAR=9;SRF=26;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154872;STB=0.594127;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.0385029;OID=.;OPOS=67037054;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:35:36:23:23:0.389831:9:14:26:9:9:14:27:9
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chr16	68088461	.	C	A	389.27	PASS	AF=0.59375;AO=37;DP=63;FAO=38;FDP=64;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=29;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.00511763;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.1572;QD=24.3291;RBI=0.00541539;REFB=-0.00283973;REVB=-0.00177094;RO=26;SAF=9;SAR=28;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.226605;STB=0.62788;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.00466946;OID=.;OPOS=68088461;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:64:26:26:37:38:0.59375:28:9:13:13:29:9:13:13
chr16	68344696	.	C	T	909.44	PASS	AF=0.942029;AO=64;DP=69;FAO=65;FDP=69;FR=.;FRO=4;FSAF=34;FSAR=31;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.00971402;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=89.6285;QD=52.7214;RBI=0.0270419;REFB=0.0070873;REVB=0.0252369;RO=4;SAF=34;SAR=30;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00347829;STB=0.50134;STBP=0.9;TYPE=snp;VARB=-0.000198951;OID=.;OPOS=68344696;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:69:69:4:4:64:65:0.942029:30:34:2:2:31:34:2:2
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chr16	68771372	.	C	T	105.19	PASS	AF=0.846154;AO=11;DP=13;FAO=11;FDP=13;FR=.;FRO=2;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00750149;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=237.782;QD=32.3654;RBI=0.0234453;REFB=-0.0983629;REVB=0.0222129;RO=2;SAF=3;SAR=8;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0754271;STB=0.542293;STBP=0.536;TYPE=snp;VARB=0.00221093;OID=.;OPOS=68771372;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:13:13:2:2:11:11:0.846154:8:3:1:1:8:3:1:1
chr16	68776416	.	G	A	30.5	PASS	AF=0.454545;AO=5;DP=11;FAO=5;FDP=11;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.0575935;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.013;QD=11.0923;RBI=0.0580259;REFB=-0.0259687;REVB=-0.00707103;RO=6;SAF=1;SAR=4;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.308675;STB=0.694785;STBP=0.366;TYPE=snp;VARB=0.0277787;OID=.;OPOS=68776416;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:11:11:6:6:5:5:0.454545:4:1:3:3:4:1:3:3
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chr16	69704122	.	C	CTG	324.75	PASS	AF=1;AO=21;DP=25;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0260243;FXX=0.039984;HRUN=5;LEN=2;MLLD=230.186;QD=54.1242;RBI=0.0586235;REFB=0;REVB=0.0525305;RO=3;SAF=9;SAR=12;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0224139;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00024108;OID=.;OPOS=69704123;OREF=-;OALT=TG;OMAPALT=CTG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:21:25:24:24:0:10:14:0:0:4:3:9:12:1:2
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chr16	69814950	.	G	A	50.47	PASS	AF=0.583333;AO=7;DP=12;FAO=7;FDP=12;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0227561;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.908;QD=16.8229;RBI=0.02787;REFB=0.00733732;REVB=0.0160903;RO=5;SAF=4;SAR=3;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.335683;STB=0.691862;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=-0.00221864;OID=.;OPOS=69814950;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:12:12:5:5:7:7:0.583333:3:4:5:0:3:4:5:0
chr16	69814953	.	G	A	49.59	PASS	AF=0.538462;AO=7;DP=13;FAO=7;FDP=13;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.0203536;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=236.858;QD=15.2589;RBI=0.0234889;REFB=0.00422752;REVB=0.0117243;RO=6;SAF=4;SAR=3;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.218735;STB=0.627576;STBP=0.445;TYPE=snp;VARB=-0.00220838;OID=.;OPOS=69814953;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:13:13:6:6:7:7:0.538462:3:4:5:1:3:4:5:1
chr16	69963355	.	G	A	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0207966;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.365;QD=53.2772;RBI=0.0228911;REFB=0;REVB=0.00956575;RO=0;SAF=9;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.84921e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00012051;OID=.;OPOS=69963355;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:14:9:0:0:14:9:0:0
chr16	69967897	.	T	C	850.49	PASS	AF=1;AO=59;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00992097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.612;QD=56.6996;RBI=0.0120899;REFB=0;REVB=0.00690944;RO=0;SAF=22;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00012599;OID=.;OPOS=69967897;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:59:60:1:37:22:0:0:38:22:0:0
chr16	69970329	.	A	G	501.92	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0391361;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.333;QD=59.0499;RBI=0.0494928;REFB=0;REVB=0.030297;RO=0;SAF=21;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.45131e-05;OID=.;OPOS=69970329;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:34:0:0:33:34:1:12:21:0:0:13:21:0:0
chr16	69988373	.	T	C	785.04	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0596254;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.8399;QD=57.0939;RBI=0.0741013;REFB=0;REVB=0.043998;RO=0;SAF=27;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.4002e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000191358;OID=.;OPOS=69988373;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:28:27:0:0:28:27:0:0
chr16	69988472	.	C	T	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0244341;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.51;QD=53.277;RBI=0.0245973;REFB=0;REVB=-0.00282908;RO=0;SAF=14;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.84921e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000164194;OID=.;OPOS=69988472;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:9:14:0:0:9:14:0:0
chr16	70010516	.	ATGT	A	39.62	PASS	AF=0.5;AO=6;DP=13;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=-0.0388443;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=180.573;QD=13.2053;RBI=0.0462116;REFB=-0.0121984;REVB=-0.0250328;RO=7;SAF=5;SAR=1;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.505451;STB=0.83222;STBP=0.055;TYPE=del;VARB=0.0133536;OID=.;OPOS=70010517;OREF=TGT;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.5:6:13:6:12:6:5:1:1:5:36:7:5:1:2:5
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chr16	70010610	.	C	T	310.73	PASS	AF=0.447368;AO=34;DP=76;FAO=34;FDP=76;FR=.;FRO=42;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=14;FSRR=28;FWDB=0.0281112;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.143;QD=16.354;RBI=0.0293788;REFB=0.00160073;REVB=-0.00853689;RO=41;SAF=13;SAR=21;SRF=14;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0426422;STB=0.529053;STBP=0.681;TYPE=snp;VARB=-0.00208919;OID=.;OPOS=70010610;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:41:42:34:34:0.447368:21:13:14:27:21:13:14:28
chr16	70016573	.	G	A	2403.42	PASS	AF=1;AO=157;DP=157;FAO=157;FDP=157;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0261543;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.591;QD=61.2337;RBI=0.0433733;REFB=0;REVB=0.0346005;RO=0;SAF=76;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.28963e-05;OID=.;OPOS=70016573;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:157:157:0:0:157:157:1:81:76:0:0:81:76:0:0
chr16	70165914	.	T	C	45.06	PASS	AF=0.304348;AO=7;DP=23;FAO=7;FDP=23;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.0563945;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.276;QD=7.83714;RBI=0.0563964;REFB=-0.0288481;REVB=0.000467024;RO=16;SAF=3;SAR=4;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147359;STB=0.59233;STBP=0.59;TYPE=snp;VARB=0.0484715;OID=.;OPOS=70165914;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:23:23:16:16:7:7:0.304348:4:3:9:7:4:3:9:7
chr16	70180088	.	A	T	346.27	PASS	AF=0.777778;AO=28;DP=36;FAO=28;FDP=36;FR=.;FRO=8;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=-0.00511215;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=316.653;QD=38.4746;RBI=0.0139069;REFB=-0.0128277;REVB=0.0129332;RO=8;SAF=9;SAR=19;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13453;STB=0.573222;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=0.00462122;OID=.;OPOS=70180088;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:51:36:36:8:8:28:28:0.777778:19:9:5:3:19:9:5:3
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chr16	70191333	.	T	C	137.88	PASS	AF=0.333333;AO=16;DP=48;FAO=16;FDP=48;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=20;FWDB=0.0204247;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.542;QD=11.4898;RBI=0.0204249;REFB=-0.0145664;REVB=8.66591e-05;RO=32;SAF=10;SAR=6;SRF=12;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.27647;STB=0.663067;STBP=0.131;TYPE=snp;VARB=0.0355798;OID=.;OPOS=70191333;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:32:32:16:16:0.333333:6:10:12:20:6:10:12:20
chr16	70191566	.	A	G	335.38	PASS	AF=0.455696;AO=36;DP=79;FAO=36;FDP=79;FR=.;FRO=43;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=17;FSRR=26;FWDB=0.0863714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.5251;QD=16.9814;RBI=0.0866686;REFB=0.00313567;REVB=-0.0071716;RO=42;SAF=15;SAR=21;SRF=17;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0117932;STB=0.511976;STBP=0.855;TYPE=snp;VARB=-0.00403961;OID=.;OPOS=70191566;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:42:43:36:36:0.455696:21:15:17:25:21:15:17:26
chr16	70287177	.	A	G	255.75	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0847319;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.5107;QD=51.15;RBI=0.103624;REFB=0;REVB=-0.0596533;RO=0;SAF=6;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5931e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00460629;OID=.;OPOS=70287177;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:14:6:0:0:14:6:0:0
chr16	70500084	.	C	T	289.07	PASS	AF=0.694444;AO=25;DP=36;FAO=25;FDP=36;FR=.;FRO=11;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.00303832;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=256.909;QD=32.1189;RBI=0.0147452;REFB=-0.00417719;REVB=0.0144288;RO=11;SAF=11;SAR=14;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00821222;STB=0.504501;STBP=0.935;TYPE=snp;VARB=0.00173587;OID=.;OPOS=70500084;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:82:36:36:11:11:25:25:0.694444:14:11:5:6:14:11:5:6
chr16	70506907	.	T	C	67.61	PASS	AF=0.196078;AO=10;DP=51;FAO=10;FDP=51;FR=.;FRO=41;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=25;FSRR=16;FWDB=-0.0350328;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.712;QD=5.30254;RBI=0.0371069;REFB=-0.00419537;REVB=-0.0122322;RO=41;SAF=6;SAR=4;SRF=25;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0125091;STB=0.50818;STBP=0.978;TYPE=snp;VARB=0.0158494;OID=.;OPOS=70506907;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:51:51:41:41:10:10:0.196078:4:6:25:16:4:6:25:16
chr16	70546234	.	G	A	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0179833;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=331.272;QD=47.8224;RBI=0.0220482;REFB=0;REVB=0.0127564;RO=0;SAF=7;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000101218;OID=.;OPOS=70546234;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:9:7:0:0:9:7:0:0
chr16	70548297	.	G	A	712.31	PASS	AF=1;AO=37;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0359223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.8399;QD=61.9402;RBI=0.076317;REFB=0;REVB=0.067334;RO=0;SAF=26;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0203983;OID=.;OPOS=70548297;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:37:46:1:11:26:0:0:20:26:0:0
chr16	70569215	.	A	T	754.43	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0197313;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.033;QD=56.9383;RBI=0.0212751;REFB=0;REVB=0.00795657;RO=0;SAF=22;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.76368e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.57171e-05;OID=.;OPOS=70569215;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:31:22:0:0:31:22:0:0
chr16	70602221	.	C	T	785.08	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0197663;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.2012;QD=57.0968;RBI=0.0579811;REFB=0;REVB=-0.0545078;RO=0;SAF=32;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.49259e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000823852;OID=.;OPOS=70602221;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:23:32:0:0:23:32:0:0
chr16	70690989	.	G	C	540.37	PASS	AF=0.948718;AO=37;DP=40;FAO=37;FDP=39;FR=.;FRO=2;FSAF=13;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0492103;FXX=0.0249938;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.465;QD=55.4229;RBI=0.0554033;REFB=0.0131685;REVB=0.0254534;RO=0;SAF=13;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.519989;STBP=0.436;TYPE=snp;VARB=0.000135471;OID=.;OPOS=70690989;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:40:39:0:2:37:37:0.948718:24:13:0:0:24:13:0:2
chr16	70796515	.	G	A	364.32	PASS	AF=0.536232;AO=37;DP=69;FAO=37;FDP=69;FR=.;FRO=32;FSAF=13;FSAR=24;FSRF=11;FSRR=21;FWDB=0.0278802;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=269.476;QD=21.1201;RBI=0.0322364;REFB=-0.0238973;REVB=-0.0161827;RO=32;SAF=13;SAR=24;SRF=11;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00700719;STB=0.503874;STBP=0.969;TYPE=snp;VARB=0.016801;OID=.;OPOS=70796515;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:32:32:37:37:0.536232:24:13:11:21:24:13:11:21
chr16	70884524	.	C	G	360.03	PASS	AF=0.513889;AO=36;DP=71;FAO=37;FDP=72;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=24;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=0.00787726;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.373;QD=20.0018;RBI=0.0157493;REFB=-0.000641181;REVB=-0.0136378;RO=35;SAF=12;SAR=24;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168672;STB=0.58257;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=0.000516699;OID=.;OPOS=70884524;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:72:35:35:36:37:0.513889:24:12:18:17:24:13:18:17
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chr16	70886630	.	C	T	417.85	PASS	AF=0.661017;AO=37;DP=57;FAO=39;FDP=59;FR=.;FRO=20;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=4;FWDB=0.0389818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.9361;QD=28.3286;RBI=0.0626028;REFB=-0.016918;REVB=0.048985;RO=19;SAF=21;SAR=16;SRF=15;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144172;STB=0.590381;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=0.0112312;OID=.;OPOS=70886630;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:59:19:20:37:39:0.661017:16:21:15:4:18:21:16:4
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chr16	71149660	.	G	A	411.59	PASS	AF=0.25974;AO=60;DP=231;FAO=60;FDP=231;FR=.;FRO=171;FSAF=28;FSAR=32;FSRF=80;FSRR=91;FWDB=0.00284777;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.515;QD=7.12701;RBI=0.0107566;REFB=-0.00105195;REVB=0.0103728;RO=171;SAF=28;SAR=32;SRF=80;SRR=91;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00146309;STB=0.500869;STBP=0.989;TYPE=snp;VARB=0.0031766;OID=.;OPOS=71149660;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:231:231:171:171:60:60:0.25974:32:28:80:91:32:28:80:91
chr16	71163579	.	C	T	426.99	PASS	AF=0.545455;AO=39;DP=74;FAO=42;FDP=77;FR=.;FRO=35;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=20;FSRR=15;FWDB=-0.00351554;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.51;QD=22.1812;RBI=0.0648067;REFB=-0.00571215;REVB=0.0647113;RO=35;SAF=22;SAR=17;SRF=20;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00637151;STB=0.510939;STBP=0.832;TYPE=snp;VARB=0.00359862;OID=.;OPOS=71163579;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:77:35:35:39:42:0.545455:17:22:20:15:19:23:20:15
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chr16	71163693	.	A	G	117.71	PASS	AF=0.24;AO=18;DP=75;FAO=18;FDP=75;FR=.;FRO=57;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=38;FSRR=19;FWDB=0.0074253;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.636;QD=6.27783;RBI=0.012959;REFB=-0.00649302;REVB=0.0106207;RO=57;SAF=12;SAR=6;SRF=38;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0276788;OID=.;OPOS=71163693;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:57:57:18:18:0.24:6:12:38:19:6:12:38:19
chr16	71237702	.	C	T	255.17	PASS	AF=0.785714;AO=22;DP=28;FAO=22;FDP=28;FR=.;FRO=6;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=-0.0124682;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.242;QD=36.4533;RBI=0.0196157;REFB=0.0163158;REVB=0.0151433;RO=6;SAF=11;SAR=11;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130914;STB=0.571365;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=-0.0057773;OID=.;OPOS=71237702;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:28:28:6:6:22:22:0.785714:11:11:5:1:11:11:5:1
chr16	71264523	.	T	A	174.69	PASS	AF=0.653846;AO=17;DP=27;FAO=17;FDP=26;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=15;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=-0.0501945;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.2733;QD=26.8749;RBI=0.050218;REFB=-0.0128627;REVB=0.00153744;RO=9;SAF=2;SAR=15;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.248522;STB=0.64083;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=0.0123104;OID=.;OPOS=71264523;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:27:26:9:9:17:17:0.653846:15:2:3:6:15:2:3:6
chr16	71264561	.	A	G	242.57	PASS	AF=0.777778;AO=21;DP=28;FAO=21;FDP=27;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=-0.00652827;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.056;QD=35.9357;RBI=0.0071909;REFB=-0.00632776;REVB=0.00301509;RO=6;SAF=3;SAR=18;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0193998;STB=0.510628;STBP=0.932;TYPE=snp;VARB=0.000803338;OID=.;OPOS=71264561;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:28:27:6:6:21:21:0.777778:18:3:1:5:18:3:1:5
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chr16	71660310	.	G	A	317.21	PASS	AF=0.961538;AO=24;DP=27;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0332334;FXX=0.0370233;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.5446;QD=48.8014;RBI=0.0662121;REFB=-0.145812;REVB=0.0572677;RO=3;SAF=15;SAR=9;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131699;STB=0.52379;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=0.0160719;OID=.;OPOS=71660310;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:27:26:3:1:24:25:0.961538:9:15:0:3:10:15:0:1
chr16	71668634	.	T	G	140.66	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00802961;FXX=0.142755;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.816;QD=46.8869;RBI=0.00983858;REFB=0;REVB=0.00568533;RO=0;SAF=2;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000759727;OID=.;OPOS=71668634;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:12:12:0:0:12:12:1:10:2:0:0:10:2:0:0
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chr16	71678932	.	T	C	375.58	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0119075;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.254;QD=55.6417;RBI=0.0123304;REFB=0;REVB=-0.00320174;RO=0;SAF=10;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.16378e-05;OID=.;OPOS=71678932;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:17:10:0:0:17:10:0:0
chr16	71679057	.	C	T	99.97	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00167286;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.108;QD=39.9865;RBI=0.0619431;REFB=0;REVB=0.0619205;RO=0;SAF=4;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00152557;OID=.;OPOS=71679057;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:10:0:0:9:10:1:5:4:0:0:6:4:0:0
chr16	71800384	.	T	A	272.47	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00619791;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=220.18;QD=51.8982;RBI=0.0119972;REFB=0;REVB=-0.0102722;RO=0;SAF=9;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.43187e-05;OID=.;OPOS=71800384;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:12:9:0:0:12:9:0:0
chr16	71886530	.	T	A	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00947594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.969;QD=51.9166;RBI=0.024378;REFB=0;REVB=-0.0224609;RO=0;SAF=14;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000100214;OID=.;OPOS=71886530;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:7:14:0:0:7:14:0:0
chr16	71887103	.	GT	G	54.11	PASS	AF=0.333333;AO=10;DP=30;FAO=10;FDP=30;FR=.;FRO=20;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=15;FWDB=-0.034476;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=26.5794;QD=7.21523;RBI=0.117762;REFB=0.0246829;REVB=0.112602;RO=20;SAF=1;SAR=9;SRF=5;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.304345;STB=0.691834;STBP=0.256;TYPE=del;VARB=-0.0357083;OID=.;OPOS=71887104;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.333333:10:30:10:30:20:1:9:5:15:54:20:1:9:5:15
chr16	71889173	.	C	T	747.1	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00787599;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=369.616;QD=63.583;RBI=0.00876907;REFB=0;REVB=0.00385555;RO=0;SAF=22;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.13611e-05;OID=.;OPOS=71889173;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:25:22:0:0:25:22:0:0
chr16	71890489	.	C	G	1253.88	PASS	AF=1;AO=80;DP=82;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00849766;FXX=0.0240935;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.89;QD=61.9201;RBI=0.021527;REFB=0;REVB=0.0197789;RO=0;SAF=37;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.17687e-06;OID=.;OPOS=71890489;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:81:0:0:80:81:1:43:37:0:0:43:38:0:0
chr16	71981414	.	C	CTTTG	622.35	PASS	AF=0.895833;AO=39;DP=49;FAO=43;FDP=48;FR=.;FRO=5;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.0136607;FXX=0.020404;HRUN=3;LEN=4;MLLD=285.374;QD=51.8622;RBI=0.0220724;REFB=0.00850298;REVB=-0.0173371;RO=5;SAF=24;SAR=15;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0476499;STB=0.519279;STBP=0.43;TYPE=ins;VARB=-0.00121582;OID=.;OPOS=71981415;OREF=-;OALT=TTTG;OMAPALT=CTTTG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.895833:39:49:43:48:5:25:18:2:3:25:5:24:15:2:3
chr16	71983772	.	G	C	689.31	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0109139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.795;QD=62.6649;RBI=0.0195235;REFB=0;REVB=0.0161881;RO=0;SAF=27;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.54734e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.90196e-05;OID=.;OPOS=71983772;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:17:27:0:0:17:27:0:0
chr16	71986946	.	A	G	557.12	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.015728;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.0845;QD=60.2288;RBI=0.015733;REFB=0;REVB=0.000396506;RO=0;SAF=18;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.68991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000206842;OID=.;OPOS=71986946;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:19:18:0:0:19:18:0:0
chr16	71986995	.	G	A	289.1	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0288483;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.006;QD=52.5642;RBI=0.0291639;REFB=0;REVB=-0.0042783;RO=0;SAF=9;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.09268e-05;OID=.;OPOS=71986995;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:22:0:0:21:22:1:12:9:0:0:13:9:0:0
chr16	71988106	.	C	T	708.56	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00198118;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=138.728;QD=62.9827;RBI=0.0217671;REFB=0;REVB=0.0216767;RO=0;SAF=27;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.73059e-05;OID=.;OPOS=71988106;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:18:27:0:0:18:27:0:0
chr16	72007232	.	G	A	564.04	PASS	AF=0.974359;AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00190232;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.443;QD=57.8506;RBI=0.0123927;REFB=-0.130075;REVB=0.0122458;RO=1;SAF=19;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0240222;STB=0.512814;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=-0.000331698;OID=.;OPOS=72007232;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:39:39:1:1:38:38:0.974359:19:19:0:1:19:19:0:1
chr16	72032231	.	T	A	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00624496;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.717;QD=56.1913;RBI=0.0209105;REFB=0;REVB=0.0199561;RO=0;SAF=16;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.88473e-05;OID=.;OPOS=72032231;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:12:16:0:0:12:16:0:0
chr16	72042682	.	A	C	80.62	PASS	AF=0.261905;AO=11;DP=42;FAO=11;FDP=42;FR=.;FRO=31;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=20;FSRR=11;FWDB=-0.00181629;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=211.236;QD=7.67831;RBI=0.0124907;REFB=-0.00560868;REVB=-0.012358;RO=31;SAF=4;SAR=7;SRF=20;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.324797;STB=0.699657;STBP=0.139;TYPE=snp;VARB=0.0147165;OID=.;OPOS=72042682;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:80:42:42:31:31:11:11:0.261905:7:4:20:11:7:4:20:11
chr16	72818965	.	T	TA	99.75	PASS	AF=0.322581;AO=19;DP=65;FAO=20;FDP=62;FR=.;FRO=42;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=25;FSRR=17;FWDB=-0.0156809;FXX=0.0158705;HRUN=2;LEN=1;MLLD=29.9692;QD=6.43574;RBI=0.0419439;REFB=-0.00349364;REVB=-0.0389024;RO=44;SAF=13;SAR=6;SRF=26;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119091;STB=0.579054;STBP=0.429;TYPE=ins;VARB=0.00712483;OID=.;OPOS=72818966;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.322581:19:65:20:62:42:14:6:25:17:99:44:13:6:26:18
chr16	72827758	.	T	C	537.33	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00287455;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.406;QD=59.7036;RBI=0.0289376;REFB=0;REVB=0.0287945;RO=0;SAF=20;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.48532e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.57882e-05;OID=.;OPOS=72827758;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:36:0:0:34:36:1:14:20:0:0:15:21:0:0
chr16	72829630	.	A	G	54.97	PASS	AF=0.296296;AO=8;DP=28;FAO=8;FDP=27;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.00478356;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.418;QD=8.14397;RBI=0.0411626;REFB=-0.0262058;REVB=-0.0408837;RO=19;SAF=5;SAR=3;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113905;STB=0.571247;STBP=0.593;TYPE=snp;VARB=0.0231816;OID=.;OPOS=72829630;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:28:27:19:19:8:8:0.296296:3:5:10:9:3:5:10:9
chr16	72832135	.	T	A	157.04	PASS	AF=0.435897;AO=17;DP=39;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.00688869;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.916;QD=16.1065;RBI=0.0101461;REFB=-3.63795e-05;REVB=0.00744907;RO=22;SAF=8;SAR=9;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0288764;STB=0.516597;STBP=0.798;TYPE=snp;VARB=0.000141958;OID=.;OPOS=72832135;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:22:22:17:17:0.435897:9:8:11:11:9:8:11:11
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chr16	72991715	.	A	G	54.74	PASS	AF=0.777778;AO=7;DP=9;FAO=7;FDP=9;FR=.;FRO=2;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0166831;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.975;QD=24.3281;RBI=0.0166832;REFB=0.032669;REVB=4.73138e-05;RO=2;SAF=6;SAR=1;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.223089;STB=0.631145;STBP=0.367;TYPE=snp;VARB=-0.00835024;OID=.;OPOS=72991715;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:9:9:2:2:7:7:0.777778:1:6:1:1:1:6:1:1
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chr16	74425447	.	C	T	395.12	PASS	AF=0.201183;AO=68;DP=338;FAO=68;FDP=338;FR=.;FRO=270;FSAF=43;FSAR=25;FSRF=159;FSRR=111;FWDB=-0.00359502;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=246.78;QD=4.67601;RBI=0.0100419;REFB=-0.0103462;REVB=-0.00937637;RO=263;SAF=43;SAR=25;SRF=158;SRR=105;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0430633;STB=0.536601;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.0448917;OID=.;OPOS=74425447;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:338:338:263:270:68:68:0.201183:25:43:158:105:25:43:159:111
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chr16	74425769	.	C	T	193.07	PASS	AF=0.221429;AO=31;DP=141;FAO=31;FDP=140;FR=.;FRO=109;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=73;FSRR=36;FWDB=-0.0173039;FXX=0.0070917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.2428;QD=5.5164;RBI=0.017502;REFB=-0.0175317;REVB=-0.00262626;RO=109;SAF=15;SAR=16;SRF=73;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.236327;STB=0.643424;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.108438;OID=.;OPOS=74425769;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:141:140:109:109:31:31:0.221429:16:15:73:36:16:15:73:36
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chr16	74537591	.	C	T	126.9	PASS	AF=0.538462;AO=14;DP=26;FAO=14;FDP=26;FR=.;FRO=12;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.00992683;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=299.182;QD=19.5232;RBI=0.027949;REFB=-0.0242359;REVB=0.0261267;RO=12;SAF=11;SAR=3;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.34056;STB=0.695897;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.01615;OID=.;OPOS=74537591;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:26:12:12:14:14:0.538462:3:11:5:7:3:11:5:7
chr16	74664743	.	T	C	320.21	PASS	AF=0.8125;AO=26;DP=32;FAO=26;FDP=32;FR=.;FRO=6;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.0440253;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.9436;QD=40.0264;RBI=0.0447477;REFB=-0.0378566;REVB=0.00800806;RO=6;SAF=12;SAR=14;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.04472;STB=0.524253;STBP=0.589;TYPE=snp;VARB=0.00688704;OID=.;OPOS=74664743;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:32:32:6:6:26:26:0.8125:14:12:2:4:14:12:2:4
chr16	74664810	.	A	T	396.78	PASS	AF=0.794872;AO=31;DP=39;FAO=31;FDP=39;FR=.;FRO=8;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0948582;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.3845;QD=40.6953;RBI=0.0975493;REFB=-0.0351139;REVB=0.0227553;RO=8;SAF=20;SAR=11;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0588903;STB=0.531894;STBP=0.465;TYPE=snp;VARB=0.0203622;OID=.;OPOS=74664810;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:50:39:39:8:8:31:31:0.794872:11:20:4:4:11:20:4:4
chr16	74670458	.	C	T	164.05	PASS	AF=0.727273;AO=16;DP=22;FAO=16;FDP=22;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=14;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.0544282;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.2319;QD=29.8276;RBI=0.115889;REFB=-0.081417;REVB=-0.102313;RO=6;SAF=2;SAR=14;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.193157;STB=0.60854;STBP=0.244;TYPE=snp;VARB=0.0152404;OID=.;OPOS=74670458;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:22:22:6:6:16:16:0.727273:14:2:2:4:14:2:2:4
chr16	74695079	.	G	T	455.26	PASS	AF=0.65625;AO=42;DP=64;FAO=42;FDP=64;FR=.;FRO=22;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.0144787;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.797;QD=28.4536;RBI=0.0244885;REFB=-0.008231;REVB=-0.0197497;RO=22;SAF=20;SAR=22;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0137142;STB=0.507459;STBP=0.864;TYPE=snp;VARB=0.00381073;OID=.;OPOS=74695079;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:22:22:42:42:0.65625:22:20:10:12:22:20:10:12
chr16	74750405	.	G	A	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0220481;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=107.705;QD=48.7369;RBI=0.0220622;REFB=0;REVB=0.000790538;RO=0;SAF=10;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000263349;OID=.;OPOS=74750405;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:7:10:0:0:7:10:0:0
chr16	75150542	.	G	A	249.37	PASS	AF=0.733333;AO=22;DP=30;FAO=22;FDP=30;FR=.;FRO=8;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=-0.0490363;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.581;QD=33.2494;RBI=0.0537758;REFB=-0.000546034;REVB=0.0220743;RO=8;SAF=10;SAR=12;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101449;STB=0.555506;STBP=0.321;TYPE=snp;VARB=0.000166494;OID=.;OPOS=75150542;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:30:30:8:8:22:22:0.733333:12:10:2:6:12:10:2:6
chr16	75238103	.	C	T	645.83	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0833631;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.9444;QD=61.508;RBI=0.0867304;REFB=0;REVB=-0.0239322;RO=0;SAF=18;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00167064;OID=.;OPOS=75238103;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:42:0:0:41:42:1:23:18:0:0:23:19:0:0
chr16	75258617	.	C	T	323.47	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00640001;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=172.488;QD=53.9109;RBI=0.00708593;REFB=0;REVB=0.00304143;RO=0;SAF=12;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.30023e-05;OID=.;OPOS=75258617;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:12:12:0:0:12:12:0:0
chr16	75269267	.	A	G	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0259654;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.573;QD=51.9155;RBI=0.0259733;REFB=0;REVB=-0.000638528;RO=0;SAF=12;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000224782;OID=.;OPOS=75269267;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:9:12:0:0:9:12:0:0
chr16	75269534	.	C	T	274.16	PASS	AF=0.916667;AO=19;DP=24;FAO=22;FDP=24;FR=.,HEALED;FRO=2;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0366411;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.217;QD=45.6933;RBI=0.140693;REFB=-0.139812;REVB=0.135838;RO=1;SAF=8;SAR=11;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0540538;STB=0.512184;STBP=0.771;TYPE=snp;VARB=0.00287445;OID=.;OPOS=75269534;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:24:24:1:2:19:22:0.916667:11:8:1:0:14:8:1:1
chr16	75271146	.	CCG	CC,C	127.97	PASS	AF=0,0.521739;AO=8,9;DP=52;FAO=0,24;FDP=46;FR=.;FRO=22;FSAF=0,10;FSAR=0,14;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=0.082608,0.0406551;FXX=0.0212721;HRUN=4,4;LEN=1,2;MLLD=10.4511,18.3929;QD=11.1279;RBI=0.0828167,0.136578;REFB=-0.0963616,-0.138827;REVB=-0.00587577,0.130387;RO=29;SAF=0,7;SAR=8,2;SRF=11;SRR=18;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.697422,0.464966;STB=0.5,0.503728;STBP=1,0.983;TYPE=del,del;VARB=0,0.143897;OID=.,.;OPOS=75271148,75271147;OREF=G,CG;OALT=-,-;OMAPALT=CC,C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,0.521739:8,9:52:0,24:46:22:0,10:0,14:9:13:99:29:0,7:8,2:11:18
chr16	75565284	.	G	A	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0300316;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.169;QD=45.8068;RBI=0.0492463;REFB=0;REVB=0.0390295;RO=0;SAF=9;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000592638;OID=.;OPOS=75565284;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:5:9:0:0:5:9:0:0
chr16	75565420	.	A	G	289.5	PASS	AF=0.92;AO=23;DP=25;FAO=23;FDP=25;FR=.;FRO=2;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0269268;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.21;QD=46.3207;RBI=0.0567468;REFB=0.0128037;REVB=-0.0499514;RO=1;SAF=15;SAR=8;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0298695;STB=0.531223;STBP=0.434;TYPE=snp;VARB=-0.00145427;OID=.;OPOS=75565420;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:25:25:1:2:23:23:0.92:8:15:1:0:8:15:2:0
chr16	75574030	.	C	T	594.52	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0126774;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.714;QD=60.9765;RBI=0.0127663;REFB=0;REVB=-0.00150343;RO=0;SAF=21;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.34792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.48063e-05;OID=.;OPOS=75574030;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:18:21:0:0:18:21:0:0
chr16	75590092	.	G	C	1113.34	PASS	AF=1;AO=67;DP=69;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000916052;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.7573;QD=58.5967;RBI=0.216089;REFB=-0.0627044;REVB=0.216087;RO=0;SAF=40;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00354485;OID=.;OPOS=75590092;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:69:76:0:0:67:76:1:27:40:0:0:36:40:0:0
chr16	75646576	.	G	T	1212.15	PASS	AF=1;AO=79;DP=80;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00139326;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.424;QD=61.3748;RBI=0.00861924;REFB=0;REVB=-0.00850589;RO=0;SAF=41;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.18125e-05;OID=.;OPOS=75646576;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:80:79:0:0:79:79:1:38:41:0:0:38:41:0:0
chr16	75646685	.	G	T	191.24	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.082084;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.6135;QD=47.8098;RBI=0.08429;REFB=0;REVB=-0.0191579;RO=0;SAF=8;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00403289;OID=.;OPOS=75646685;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:8:8:0:0:8:8:0:0
chr16	75728368	.	A	G	374.68	PASS	AF=0.673913;AO=30;DP=45;FAO=31;FDP=46;FR=.;FRO=15;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=3;FSRR=12;FWDB=0.00371417;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.5695;QD=32.5809;RBI=0.00675469;REFB=-0.0438691;REVB=-0.00564187;RO=15;SAF=16;SAR=14;SRF=3;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.201518;STB=0.602447;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.0154382;OID=.;OPOS=75728368;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:46:15:15:30:31:0.673913:14:16:3:12:15:16:3:12
chr16	76311602	.	G	GT	363.7	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0538281;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=29.8463;QD=46.9292;RBI=0.0868145;REFB=0;REVB=0.0681124;RO=0;SAF=9;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.15349e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00514824;OID=.;OPOS=76311603;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:31:31:31:31:0:9:22:0:0:7:0:9:22:0:0
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chr16	76587202	.	T	G	266.33	PASS	AF=0.6;AO=24;DP=41;FAO=24;FDP=40;FR=.;FRO=16;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=0.0348746;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.827;QD=26.6328;RBI=0.112833;REFB=-0.0289516;REVB=-0.107308;RO=16;SAF=13;SAR=11;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107262;STB=0.559274;STBP=0.361;TYPE=snp;VARB=0.0149395;OID=.;OPOS=76587202;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:40:16:16:24:24:0.6:11:13:11:5:11:13:11:5
chr16	76587331	.	T	C	895.33	PASS	AF=0.71;AO=71;DP=100;FAO=71;FDP=100;FR=.;FRO=29;FSAF=36;FSAR=35;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=-0.054006;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.233;QD=35.8131;RBI=0.0541812;REFB=-0.00433137;REVB=-0.00435466;RO=29;SAF=36;SAR=35;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0874312;STB=0.546976;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.0017232;OID=.;OPOS=76587331;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:29:29:71:71:0.71:35:36:10:19:35:36:10:19
chr16	76902847	.	T	C	625.4	PASS	AF=1;AO=41;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0346583;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.455;QD=59.562;RBI=0.0518289;REFB=-0.0491481;REVB=0.0385362;RO=0;SAF=25;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.1719e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000836936;OID=.;OPOS=76902847;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:42:42:0:0:41:42:1:16:25:0:0:17:25:0:0
chr16	76902850	.	G	A	643.1	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00046409;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.875;QD=61.2474;RBI=0.0110212;REFB=0;REVB=-0.0110115;RO=0;SAF=24;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.2194e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000435322;OID=.;OPOS=76902850;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:42:0:0:41:42:1:17:24:0:0:17:25:0:0
chr16	77228629	.	A	G	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0123853;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.3409;QD=42.1823;RBI=0.0481351;REFB=0;REVB=-0.0465145;RO=0;SAF=6;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00189245;OID=.;OPOS=77228629;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:5:6:0:0:5:6:0:0
chr16	77228866	.	T	C	557.13	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.083366;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.089;QD=60.23;RBI=0.0850981;REFB=0;REVB=0.0170822;RO=0;SAF=17;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.71161e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000273306;OID=.;OPOS=77228866;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:20:17:0:0:20:17:0:0
chr16	77228971	.	C	T	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.030138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.556;QD=49.5992;RBI=0.069387;REFB=0;REVB=0.0625;RO=0;SAF=5;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000742002;OID=.;OPOS=77228971;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:13:5:0:0:13:5:0:0
chr16	77233394	.	A	G	3088.91	PASS	AF=1;AO=192;DP=192;FAO=194;FDP=194;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=111;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0112335;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.821;QD=63.6888;RBI=0.0262283;REFB=0;REVB=0.023701;RO=0;SAF=82;SAR=110;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.69051e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.45072e-05;OID=.;OPOS=77233394;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:17:192:194:0:0:192:194:1:110:82:0:0:111:83:0:0
chr16	77246795	.	C	G	538.11	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00734848;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.9594;QD=59.7899;RBI=0.0198635;REFB=0;REVB=0.0184542;RO=0;SAF=20;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.9376e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000175027;OID=.;OPOS=77246795;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:16:20:0:0:16:20:0:0
chr16	77323235	.	C	G	261.67	PASS	AF=0.543478;AO=24;DP=45;FAO=25;FDP=46;FR=.;FRO=21;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.00380557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.434;QD=22.7537;RBI=0.0143494;REFB=-0.00680273;REVB=-0.0138355;RO=21;SAF=11;SAR=13;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0149847;STB=0.501741;STBP=0.971;TYPE=snp;VARB=0.0155031;OID=.;OPOS=77323235;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:46:21:21:24:25:0.543478:13:11:10:11:13:12:10:11
chr16	77353973	.	G	T	676.76	PASS	AF=0.977778;AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0170167;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.752;QD=60.1564;RBI=0.0172084;REFB=-0.0480242;REVB=0.0025615;RO=0;SAF=19;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509799;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.000775696;OID=.;OPOS=77353973;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:45:45:0:1:44:44:0.977778:25:19:0:0:25:19:0:1
chr16	77359919	.	A	T	545.35	PASS	AF=0.973684;AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0105772;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.194;QD=57.4054;RBI=0.0175781;REFB=-0.051787;REVB=-0.0140397;RO=0;SAF=15;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.82408e-08;STB=0.51612;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.000367533;OID=.;OPOS=77359919;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:38:38:0:1:37:37:0.973684:22:15:0:0:22:15:1:0
chr16	77389956	.	A	G	399.18	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0445854;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.166;QD=57.0255;RBI=0.046497;REFB=0;REVB=0.0131952;RO=0;SAF=18;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00132103;OID=.;OPOS=77389956;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:10:18:0:0:10:18:0:0
chr16	77401545	.	A	G	1510.84	PASS	AF=1;AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0261287;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.584;QD=63.6144;RBI=0.0314492;REFB=0;REVB=-0.0175027;RO=0;SAF=61;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.04002e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.41956e-05;OID=.;OPOS=77401545;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:95:0:0:95:95:1:34:61:0:0:34:61:0:0
chr16	77769369	.	C	T	2045.64	PASS	AF=1;AO=128;DP=129;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0584363;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.948;QD=62.4623;RBI=0.0586354;REFB=0;REVB=0.00482717;RO=0;SAF=54;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.31514e-05;OID=.;OPOS=77769369;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:129:131:0:0:128:131:1:74:54:0:0:74:57:0:0
chr16	77769834	.	G	A	537.86	PASS	AF=0.712121;AO=47;DP=66;FAO=47;FDP=66;FR=.;FRO=19;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=0.0153191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.784;QD=32.5977;RBI=0.0153215;REFB=0.0111666;REVB=0.00027406;RO=19;SAF=25;SAR=22;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114739;STB=0.561952;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=-0.00449366;OID=.;OPOS=77769834;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:19:19:47:47:0.712121:22:25:6:13:22:25:6:13
chr16	78013112	.	T	A	383.83	PASS	AF=0.666667;AO=35;DP=53;FAO=36;FDP=54;FR=.;FRO=18;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=0.023471;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.772;QD=28.4319;RBI=0.0267037;REFB=-0.0579601;REVB=0.0127357;RO=18;SAF=21;SAR=14;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0286133;STB=0.509488;STBP=0.86;TYPE=snp;VARB=0.030904;OID=.;OPOS=78013112;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:54:18:18:35:36:0.666667:14:21:10:8:15:21:10:8
chr16	78013123	.	C	T	785.63	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0338413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.231;QD=64.1332;RBI=0.0376878;REFB=0;REVB=-0.0165871;RO=0;SAF=26;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000192727;OID=.;OPOS=78013123;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:23:26:0:0:23:26:0:0
chr16	78013882	.	A	T	702.51	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0149207;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.434;QD=62.4449;RBI=0.025861;REFB=0;REVB=-0.0211226;RO=0;SAF=27;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.54734e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000258841;OID=.;OPOS=78013882;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:45:0:0:44:45:1:17:27:0:0:17:28:0:0
chr16	78063000	.	T	C	231.41	PASS	AF=0.7;AO=21;DP=30;FAO=21;FDP=30;FR=.;FRO=9;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.0510061;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.6171;QD=30.8547;RBI=0.0548276;REFB=-0.0122021;REVB=0.0201107;RO=9;SAF=12;SAR=9;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00880871;STB=0.50485;STBP=0.939;TYPE=snp;VARB=0.00680696;OID=.;OPOS=78063000;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:30:30:9:9:21:21:0.7:9:12:5:4:9:12:5:4
chr16	78063064	.	G	T	59.38	PASS	AF=0.533333;AO=8;DP=15;FAO=8;FDP=15;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.00503948;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=46.0864;QD=15.8343;RBI=0.120698;REFB=0.000229126;REVB=-0.120593;RO=7;SAF=5;SAR=3;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0775671;STB=0.545344;STBP=0.763;TYPE=snp;VARB=-0.00956793;OID=.;OPOS=78063064;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:15:15:7:7:8:8:0.533333:3:5:5:2:3:5:5:2
chr16	78064351	.	C	G	37.15	PASS	AF=0.333333;AO=6;DP=18;FAO=6;FDP=18;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=0.00202862;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=228.299;QD=8.25465;RBI=0.0178801;REFB=-0.00131052;REVB=-0.0177647;RO=12;SAF=4;SAR=2;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104655;STB=0.565012;STBP=0.779;TYPE=snp;VARB=0.00165221;OID=.;OPOS=78064351;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:18:18:12:12:6:6:0.333333:2:4:9:3:2:4:9:3
chr16	78065139	.	A	G	747.1	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00261129;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=289.049;QD=63.583;RBI=0.00271549;REFB=0;REVB=0.000745009;RO=0;SAF=31;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.23771e-06;OID=.;OPOS=78065139;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:16:31:0:0:16:31:0:0
chr16	78065972	.	A	G	138.35	PASS	AF=0.209091;AO=23;DP=110;FAO=23;FDP=110;FR=.;FRO=87;FSAF=18;FSAR=5;FSRF=42;FSRR=45;FWDB=-0.0264757;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.6797;QD=5.03096;RBI=0.048733;REFB=0.00392715;REVB=0.0409138;RO=87;SAF=18;SAR=5;SRF=42;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.395498;STB=0.749773;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=-0.0188152;OID=.;OPOS=78065972;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:110:87:87:23:23:0.209091:5:18:42:45:5:18:42:45
chr16	78066018	.	A	C	119.93	PASS	AF=0.211111;AO=19;DP=89;FAO=19;FDP=90;FR=.;FRO=71;FSAF=15;FSAR=4;FSRF=31;FSRR=40;FWDB=-0.00961178;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.345;QD=5.33002;RBI=0.0146283;REFB=-0.0021144;REVB=0.0110273;RO=70;SAF=15;SAR=4;SRF=31;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.441225;STB=0.78169;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0136868;OID=.;OPOS=78066018;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:90:70:71:19:19:0.211111:4:15:31:39:4:15:31:40
chr16	78142308	.	G	T	96.03	PASS	AF=0.342857;AO=10;DP=33;FAO=12;FDP=35;FR=.,HEALED;FRO=23;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=-0.00539527;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.879;QD=10.9752;RBI=0.00760804;REFB=-0.00134207;REVB=-0.00536407;RO=18;SAF=7;SAR=3;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106424;STB=0.540994;STBP=0.814;TYPE=snp;VARB=0.0063988;OID=.;OPOS=78142308;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:33:35:18:23:10:12:0.342857:3:7:11:7:5:7:12:11
chr16	78312497	.	C	A	33.27	PASS	AF=0.146341;AO=6;DP=41;FAO=6;FDP=41;FR=.;FRO=35;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=20;FSRR=15;FWDB=0.00722462;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.033;QD=3.24566;RBI=0.0146401;REFB=2.60654e-06;REVB=0.0127333;RO=35;SAF=3;SAR=3;SRF=20;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0849288;STB=0.560776;STBP=0.799;TYPE=snp;VARB=0.000172804;OID=.;OPOS=78312497;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:41:41:35:35:6:6:0.146341:3:3:20:15:3:3:20:15
chr16	78458915	.	C	G	248.07	PASS	AF=0.314286;AO=33;DP=105;FAO=33;FDP=105;FR=.;FRO=72;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=39;FSRR=33;FWDB=-2.35818e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.183;QD=9.45035;RBI=0.0105525;REFB=-0.0158997;REVB=0.0105525;RO=72;SAF=15;SAR=18;SRF=39;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101971;STB=0.55955;STBP=0.403;TYPE=snp;VARB=0.0255777;OID=.;OPOS=78458915;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:105:72:72:33:33:0.314286:18:15:39:33:18:15:39:33
chr16	78466437	.	C	G	207.07	PASS	AF=0.296703;AO=27;DP=90;FAO=27;FDP=91;FR=.;FRO=64;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=38;FSRR=26;FWDB=0.0135861;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.729;QD=9.10202;RBI=0.0140217;REFB=-0.000810202;REVB=0.00346788;RO=63;SAF=16;SAR=11;SRF=37;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00648144;STB=0.500843;STBP=0.994;TYPE=snp;VARB=0.00331014;OID=.;OPOS=78466437;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:91:63:64:27:27:0.296703:11:16:37:26:11:16:38:26
chr16	78586531	.	T	C	1102.33	PASS	AF=0.986667;AO=74;DP=75;FAO=74;FDP=75;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0265982;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.9819;QD=58.7912;RBI=0.0288492;REFB=0.0955924;REVB=0.0111718;RO=1;SAF=31;SAR=43;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0150156;STB=0.507934;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=-0.0010092;OID=.;OPOS=78586531;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:75:75:1:1:74:74:0.986667:43:31:1:0:43:31:1:0
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chr16	79245961	.	T	C	68.71	PASS	AF=0.156627;AO=14;DP=84;FAO=13;FDP=83;FR=.;FRO=70;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=47;FSRR=23;FWDB=0.0119377;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.77;QD=3.31123;RBI=0.0135491;REFB=-0.000533189;REVB=0.00640862;RO=70;SAF=8;SAR=6;SRF=47;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132842;STB=0.551026;STBP=0.719;TYPE=snp;VARB=0.00478753;OID=.;OPOS=79245961;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:68:84:83:70:70:14:13:0.156627:6:8:47:23:5:8:47:23
chr16	79633805	.	TGCC	T	61.96	PASS	AF=1;AO=4;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0723668;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=249.979;QD=35.407;RBI=0.0746115;REFB=0;REVB=0.0181639;RO=0;SAF=1;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.86674e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00129299;OID=.;OPOS=79633806;OREF=GCC;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:4:7:7:7:0:2:5:0:0:4:0:1:3:0:0
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chr16	81062171	.	C	T	43.93	PASS	AF=0.259259;AO=7;DP=27;FAO=7;FDP=27;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=-0.0293343;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.841;QD=6.50759;RBI=0.0412415;REFB=0.0173356;REVB=0.028989;RO=19;SAF=4;SAR=3;SRF=14;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20437;STB=0.599733;STBP=0.605;TYPE=snp;VARB=-0.02247;OID=.;OPOS=81062171;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:27:27:19:20:7:7:0.259259:3:4:14:5:3:4:14:6
chr16	81077915	.	T	C	175.97	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0934297;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.105;QD=46.9245;RBI=0.0943278;REFB=0;REVB=-0.0129856;RO=0;SAF=5;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000956922;OID=.;OPOS=81077915;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:15:0:0:14:15:1:9:5:0:0:9:6:0:0
chr16	81095072	.	C	T	239.43	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00322179;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.786;QD=50.4068;RBI=0.00506597;REFB=0;REVB=0.0039095;RO=0;SAF=12;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.9123e-06;OID=.;OPOS=81095072;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:7:12:0:0:7:12:0:0
chr16	81095363	.	C	T	109.39	PASS	AF=0.916667;AO=11;DP=12;FAO=11;FDP=12;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0143041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.424;QD=36.4626;RBI=0.0147693;REFB=-0.167173;REVB=-0.00367784;RO=1;SAF=7;SAR=4;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0599362;STB=0.533274;STBP=0.64;TYPE=snp;VARB=0.00503657;OID=.;OPOS=81095363;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:12:12:1:1:11:11:0.916667:4:7:1:0:4:7:1:0
chr16	81142257	.	T	C	323.47	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0229115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.098;QD=53.9111;RBI=0.0307335;REFB=0;REVB=0.0204844;RO=0;SAF=9;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000498139;OID=.;OPOS=81142257;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:15:9:0:0:15:9:0:0
chr16	81145807	.	C	G	1157.38	PASS	AF=0.987179;AO=77;DP=78;FAO=77;FDP=78;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0241161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.897;QD=59.3528;RBI=0.0310133;REFB=-0.00369121;REVB=-0.0194997;RO=1;SAF=36;SAR=41;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129652;STB=0.506848;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=-0.000279906;OID=.;OPOS=81145807;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:78:78:1:1:77:77:0.987179:41:36:1:0:41:36:1:0
chr16	81151122	.	A	C	708.52	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00126898;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.079;QD=62.9797;RBI=0.0117274;REFB=0;REVB=-0.0116585;RO=0;SAF=24;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.02334e-05;OID=.;OPOS=81151122;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:21:24:0:0:21:24:0:0
chr16	81157324	.	G	A	313.32	PASS	AF=0.96;AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=25;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0162122;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.6869;QD=50.1309;RBI=0.0162155;REFB=-0.0269555;REVB=0.000325935;RO=1;SAF=8;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0544279;STB=0.529387;STBP=0.288;TYPE=snp;VARB=0.00585049;OID=.;OPOS=81157324;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:25:25:1:1:24:24:0.96:16:8:1:0:16:8:1:0
chr16	81173136	.	T	C	708.43	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00825384;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.89;QD=62.9717;RBI=0.0278066;REFB=0;REVB=0.0265533;RO=0;SAF=29;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.49331e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000282262;OID=.;OPOS=81173136;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:16:29:0:0:16:29:0:0
chr16	81173193	.	C	T	136.7	PASS	AF=0.32;AO=16;DP=50;FAO=16;FDP=50;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=22;FSRR=12;FWDB=-0.00282796;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=196.293;QD=10.9359;RBI=0.0109039;REFB=-0.0193135;REVB=0.0105308;RO=34;SAF=10;SAR=6;SRF=22;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0271041;STB=0.516109;STBP=0.886;TYPE=snp;VARB=0.0308738;OID=.;OPOS=81173193;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:34:34:16:16:0.32:6:10:22:12:6:10:22:12
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chr16	81181783	.	T	C	174.12	PASS	AF=0.68;AO=17;DP=25;FAO=17;FDP=25;FR=.;FRO=8;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=-0.0250371;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.769;QD=27.8589;RBI=0.0273912;REFB=0.012908;REVB=-0.0111094;RO=8;SAF=9;SAR=8;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0886834;STB=0.549238;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=-0.00585873;OID=.;OPOS=81181783;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:25:25:8:8:17:17:0.68:8:9:3:5:8:9:3:5
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chr16	81183325	.	T	A	127.01	PASS	AF=0.319149;AO=15;DP=48;FAO=15;FDP=47;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=0.00525483;FXX=0.020829;HRUN=2;LEN=1;MLLD=278.72;QD=10.8091;RBI=0.00753184;REFB=-0.00136667;REVB=-0.00539586;RO=30;SAF=11;SAR=4;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171153;STB=0.630388;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=0.00244341;OID=.;OPOS=81183325;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:47:30:32:15:15:0.319149:4:11:18:12:4:11:18:14
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chr16	81185416	.	A	G	483.29	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0503735;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.111;QD=58.5801;RBI=0.050426;REFB=0;REVB=0.00230024;RO=0;SAF=16;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.60901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000362685;OID=.;OPOS=81185416;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:17:16:0:0:17:16:0:0
chr16	81185419	.	G	C	294.14	PASS	AF=0.735294;AO=25;DP=34;FAO=25;FDP=34;FR=.;FRO=9;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=-0.0310334;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.88;QD=34.6052;RBI=0.0315881;REFB=0.0183721;REVB=-0.00589414;RO=9;SAF=10;SAR=15;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130584;STB=0.571371;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=-0.00181829;OID=.;OPOS=81185419;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:34:34:9:9:25:25:0.735294:15:10:6:3:15:10:6:3
chr16	81190598	.	T	C	370.3	PASS	AF=0.731707;AO=30;DP=41;FAO=30;FDP=41;FR=.;FRO=11;FSAF=8;FSAR=22;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=0.00409234;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.678;QD=36.1271;RBI=0.0159866;REFB=-0.0210728;REVB=0.0154539;RO=11;SAF=8;SAR=22;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00381143;STB=0.502073;STBP=0.99;TYPE=snp;VARB=0.0142327;OID=.;OPOS=81190598;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:80:41:41:11:11:30:30:0.731707:22:8:3:8:22:8:3:8
chr16	81190601	.	T	C,G	624.8	PASS	AF=0.97561,0.0243902;AO=38,3;DP=41;FAO=40,1;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=11,0;FSAR=29,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0168275,-0.149749;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=84.4534,8.64784;QD=60.9558;RBI=0.0324543,0.150125;REFB=0,0;REVB=0.027751,0.0106283;RO=0;SAF=9,2;SAR=29,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00287671,0.134577;OID=.,.;OPOS=81190601,81190601;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:5:41:41:0:0:38,3:40,1:0.97561,0.0243902:29,1:9,2:0:0:29,1:11,0:0:0
chr16	81190613	.	A	G	101.87	PASS	AF=0.282609;AO=13;DP=46;FAO=13;FDP=46;FR=.;FRO=33;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=24;FWDB=-0.0388603;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.2083;QD=8.85832;RBI=0.0473298;REFB=-0.0201785;REVB=-0.0270183;RO=33;SAF=4;SAR=9;SRF=9;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0495328;STB=0.530075;STBP=0.839;TYPE=snp;VARB=0.0423117;OID=.;OPOS=81190613;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:33:33:13:13:0.282609:9:4:9:24:9:4:9:24
chr16	81194382	.	T	C	189.88	PASS	AF=0.358209;AO=24;DP=67;FAO=24;FDP=67;FR=.;FRO=43;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=29;FWDB=-0.0191146;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.781;QD=11.3359;RBI=0.019297;REFB=-0.00867174;REVB=-0.00264729;RO=43;SAF=9;SAR=15;SRF=14;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0594886;STB=0.534385;STBP=0.69;TYPE=snp;VARB=0.0128087;OID=.;OPOS=81194382;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:43:43:24:24:0.358209:15:9:14:29:15:9:14:29
chr16	81198306	.	C	A	326.63	PASS	AF=0.75;AO=26;DP=35;FAO=27;FDP=36;FR=.;FRO=9;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=8;FWDB=0.0304651;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.423;QD=36.2921;RBI=0.0311923;REFB=-0.0200109;REVB=0.00669601;RO=8;SAF=16;SAR=10;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.21179;STB=0.629534;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.00957813;OID=.;OPOS=81198306;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:35:36:8:9:26:27:0.75:10:16:1:7:10:17:1:8
chr16	81199520	.	T	C	207.12	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0185662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.7484;QD=48.7348;RBI=0.0382309;REFB=0;REVB=0.03342;RO=0;SAF=7;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00052998;OID=.;OPOS=81199520;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:10:7:0:0:10:7:0:0
chr16	81199538	.	T	C	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.024778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.6562;QD=47.8216;RBI=0.0281766;REFB=0;REVB=0.0134153;RO=0;SAF=7;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000414283;OID=.;OPOS=81199538;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:9:7:0:0:9:7:0:0
chr16	81199544	.	G	A	175.67	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0188687;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.409;QD=46.8449;RBI=0.0259894;REFB=0;REVB=-0.0178724;RO=0;SAF=6;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.51125e-05;OID=.;OPOS=81199544;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:9:6:0:0:9:6:0:0
chr16	81199554	.	CA	TG	106.17	PASS	AF=1;AO=10;DP=11;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.050156;FXX=0.0908265;HRUN=1;LEN=2;MLLD=212.664;QD=42.4667;RBI=0.0504594;REFB=0;REVB=-0.00552545;RO=0;SAF=4;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.00058281;OID=.;OPOS=81199554;OREF=CA;OALT=TG;OMAPALT=TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:10:0:0:10:10:1:6:4:0:0:6:4:0:0
chr16	81208203	.	G	T	124.15	PASS	AF=0.3;AO=15;DP=50;FAO=15;FDP=50;FR=.;FRO=35;FSAF=1;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=-0.0161439;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=278.548;QD=9.93192;RBI=0.0285609;REFB=0.0034637;REVB=-0.0235606;RO=35;SAF=1;SAR=14;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.603126;STB=0.877602;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=-0.00963094;OID=.;OPOS=81208203;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:35:35:15:15:0.3:14:1:16:19:14:1:16:19
chr16	81209207	.	T	C	227.58	PASS	AF=1;AO=18;DP=19;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0106453;FXX=0.0526039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.941;QD=50.5742;RBI=0.0410991;REFB=0;REVB=-0.0396965;RO=0;SAF=17;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000996492;OID=.;OPOS=81209207;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:18:0:0:18:18:1:1:17:0:0:1:17:0:0
chr16	81213378	.	A	G	323.47	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00619437;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.92;QD=53.9112;RBI=0.031873;REFB=0;REVB=0.0312653;RO=0;SAF=13;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.67681e-05;OID=.;OPOS=81213378;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:11:13:0:0:11:13:0:0
chr16	81232275	.	G	A	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143278;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=252.288;QD=35.5758;RBI=0.0313189;REFB=0;REVB=0.0278493;RO=0;SAF=2;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.27427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000657338;OID=.;OPOS=81232275;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:5:2:0:0:5:2:0:0
chr16	81232564	.	T	G	1015.37	PASS	AF=0.985714;AO=69;DP=71;FAO=69;FDP=70;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0103622;FXX=0.0140825;HRUN=3;LEN=1;MLLD=81.1797;QD=58.021;RBI=0.0326501;REFB=0.0963996;REVB=-0.0309621;RO=0;SAF=27;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.56939e-08;STB=0.505881;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=-0.00124877;OID=.;OPOS=81232564;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:71:70:0:1:69:69:0.985714:42:27:0:0:42:27:0:1
chr16	81241098	.	C	T	501.66	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0101673;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.392;QD=59.0183;RBI=0.0181798;REFB=0;REVB=0.0150709;RO=0;SAF=16;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.00624e-05;OID=.;OPOS=81241098;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:18:16:0:0:18:16:0:0
chr16	81241100	.	G	C	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00224874;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=341.753;QD=59.4357;RBI=0.0240057;REFB=0;REVB=0.0239002;RO=0;SAF=17;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.91624e-05;OID=.;OPOS=81241100;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:18:17:0:0:18:17:0:0
chr16	81242102	.	G	A	727.78	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00876165;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.383;QD=63.2848;RBI=0.0226375;REFB=0;REVB=-0.0208731;RO=0;SAF=26;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000180706;OID=.;OPOS=81242102;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:20:26:0:0:20:26:0:0
chr16	81242194	.	T	C	718.32	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.053005;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.756;QD=62.4629;RBI=0.0540744;REFB=0;REVB=0.0107011;RO=0;SAF=18;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000270728;OID=.;OPOS=81242194;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:46:0:0:44:46:1:26:18:0:0:26:20:0:0
chr16	81279120	.	T	C	231.44	PASS	AF=0.7;AO=21;DP=30;FAO=21;FDP=30;FR=.;FRO=9;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.0194199;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.3088;QD=30.8588;RBI=0.0213682;REFB=-0.0314061;REVB=0.00891449;RO=9;SAF=9;SAR=12;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0697673;STB=0.538425;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.00758436;OID=.;OPOS=81279120;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:30:30:9:9:21:21:0.7:12:9:5:4:12:9:5:4
chr16	81295902	.	T	C	164.05	PASS	AF=0.727273;AO=16;DP=22;FAO=16;FDP=22;FR=.;FRO=6;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.010775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.872;QD=29.8274;RBI=0.018019;REFB=-0.00903951;REVB=0.0144424;RO=6;SAF=7;SAR=9;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0310499;STB=0.51722;STBP=0.774;TYPE=snp;VARB=0.00240494;OID=.;OPOS=81295902;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:22:22:6:6:16:16:0.727273:9:7:3:3:9:7:3:3
chr16	81413523	.	T	G	630.86	PASS	AF=0.351145;AO=20;DP=140;FAO=46;FDP=131;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=40;FSAF=16;FSAR=30;FSRF=36;FSRR=4;FWDB=0.00924453;FXX=0.0902715;HRUN=12;LEN=1;MLLD=226.664;QD=19.2628;RBI=0.0383712;REFB=0.00056469;REVB=-0.0372409;RO=27;SAF=6;SAR=14;SRF=25;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.571056;STB=0.74135;STBP=0;TYPE=snp;VARB=-0.0144317;OID=.;OPOS=81413523;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:140:131:27:40:20:46:0.351145:14:6:25:2:30:16:36:4
chr16	81497952	.	A	G	140.07	PASS	AF=0.555556;AO=15;DP=27;FAO=15;FDP=27;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=-0.00750353;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.475;QD=20.7508;RBI=0.0136305;REFB=-0.00565869;REVB=0.0113792;RO=12;SAF=6;SAR=9;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.207806;STB=0.617491;STBP=0.191;TYPE=snp;VARB=0.00424528;OID=.;OPOS=81497952;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:12:12:15:15:0.555556:9:6:8:4:9:6:8:4
chr16	81819768	.	T	C	417.97	PASS	AF=0.967742;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0168947;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.382;QD=53.9321;RBI=0.0372868;REFB=0.00643324;REVB=0.0332396;RO=0;SAF=17;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.63861e-08;STB=0.514276;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=3.06168e-06;OID=.;OPOS=81819768;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:30:31:0:1:30:30:0.967742:13:17:0:0:13:17:1:0
chr16	81892708	.	T	A	191.29	PASS	AF=1;AO=15;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0192319;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.216;QD=47.8223;RBI=0.034779;REFB=0;REVB=0.0289778;RO=0;SAF=7;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000224619;OID=.;OPOS=81892708;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:15:16:1:8:7:0:0:8:8:0:0
chr16	81902079	.	T	C	397.01	PASS	AF=1;AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00136736;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.007;QD=56.7157;RBI=0.00363223;REFB=0;REVB=0.00336503;RO=0;SAF=11;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.31638e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.59809e-05;OID=.;OPOS=81902079;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:28:0:0:28:28:1:17:11:0:0:17:11:0:0
chr16	81902283	.	A	G	74.89	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0129197;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=206.96;QD=37.446;RBI=0.034041;REFB=0;REVB=0.031494;RO=0;SAF=5;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000744403;OID=.;OPOS=81902283;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:3:5:0:0:3:5:0:0
chr16	81914583	.	C	T	63.9	PASS	AF=0.212766;AO=9;DP=47;FAO=10;FDP=47;FR=.;FRO=37;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=14;FSRR=23;FWDB=0.0310692;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.645;QD=5.4387;RBI=0.0353772;REFB=-0.00968835;REVB=-0.0169188;RO=35;SAF=6;SAR=3;SRF=13;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.3479;STB=0.742397;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=0.0526407;OID=.;OPOS=81914583;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:47:47:35:37:9:10:0.212766:3:6:13:22:3:7:14:23
chr16	81929488	.	C	T	654.85	PASS	AF=0.619565;AO=57;DP=93;FAO=57;FDP=92;FR=.;FRO=35;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=0.00758411;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.846;QD=28.4716;RBI=0.00872854;REFB=-0.0449216;REVB=-0.00432073;RO=35;SAF=32;SAR=25;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0733115;STB=0.539863;STBP=0.33;TYPE=snp;VARB=0.0185906;OID=.;OPOS=81929488;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:92:35:35:57:57:0.619565:25:32:16:19:25:32:16:19
chr16	81941319	.	C	T	323.47	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00129129;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=275.012;QD=53.9112;RBI=0.00796942;REFB=0;REVB=0.00786411;RO=0;SAF=11;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.04227e-05;OID=.;OPOS=81941319;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:13:11:0:0:13:11:0:0
chr16	81971403	.	T	C	40.32	PASS	AF=0.545455;AO=6;DP=11;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.00805189;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.319;QD=14.6621;RBI=0.0228576;REFB=-0.0347597;REVB=0.0213925;RO=5;SAF=5;SAR=1;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.247547;STB=0.651594;STBP=0.396;TYPE=snp;VARB=0.0477928;OID=.;OPOS=81971403;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:11:11:5:5:6:6:0.545455:1:5:3:2:1:5:3:2
chr16	81995543	.	G	T	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0502338;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.62;QD=44.6896;RBI=0.0606542;REFB=0;REVB=0.0339927;RO=0;SAF=9;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0015362;OID=.;OPOS=81995543;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:4:9:0:0:4:9:0:0
chr16	82182354	.	G	A	801.33	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00137323;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=313.595;QD=57.2377;RBI=0.00917681;REFB=0;REVB=0.00907348;RO=0;SAF=33;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.93366e-06;OID=.;OPOS=82182354;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:23:33:0:0:23:33:0:0
chr16	82203705	.	A	C	130.45	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0238266;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.964;QD=43.4843;RBI=0.0336203;REFB=0;REVB=0.0237196;RO=0;SAF=7;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000487614;OID=.;OPOS=82203705;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:12:0:0:11:12:1:4:7:0:0:4:8:0:0
chr16	82203711	.	G	T	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.088817;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.4023;QD=44.6896;RBI=0.120386;REFB=0;REVB=0.0812665;RO=0;SAF=8;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00841996;OID=.;OPOS=82203711;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:5:8:0:0:5:8:0:0
chr16	82203742	.	T	C	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00091399;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.717;QD=45.8068;RBI=0.0299924;REFB=0;REVB=0.0299784;RO=0;SAF=8;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000680897;OID=.;OPOS=82203742;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:6:8:0:0:6:8:0:0
chr16	82203758	.	C	T	160.31	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0347106;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.9816;QD=45.8027;RBI=0.0347189;REFB=0;REVB=0.000757238;RO=0;SAF=6;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00162867;OID=.;OPOS=82203758;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:8:6:0:0:8:6:0:0
chr16	82203768	.	G	T	160.27	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.113544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.199;QD=45.7925;RBI=0.113552;REFB=0;REVB=0.00133374;RO=0;SAF=6;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00131293;OID=.;OPOS=82203768;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:8:6:0:0:8:6:0:0
chr16	82673047	.	C	T	801.33	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0274347;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=297.924;QD=57.2377;RBI=0.0341949;REFB=0;REVB=0.0204114;RO=0;SAF=22;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.43892e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.46804e-05;OID=.;OPOS=82673047;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:34:22:0:0:34:22:0:0
chr16	82903030	.	A	C	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0757391;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.237;QD=44.6881;RBI=0.0783908;REFB=0;REVB=0.0202164;RO=0;SAF=4;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00108073;OID=.;OPOS=82903030;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:9:4:0:0:9:4:0:0
chr16	83065664	.	G	A	130.52	PASS	AF=0.222222;AO=19;DP=89;FAO=20;FDP=90;FR=.;FRO=70;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=41;FSRR=29;FWDB=-0.0287004;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.267;QD=5.80097;RBI=0.0370207;REFB=-0.0153728;REVB=0.0233841;RO=70;SAF=9;SAR=10;SRF=41;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140069;STB=0.604294;STBP=0.343;TYPE=snp;VARB=0.043442;OID=.;OPOS=83065664;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:90:70:70:19:20:0.222222:10:9:41:29:11:9:41:29
chr16	83817019	.	A	G	284.49	PASS	AF=1;AO=19;DP=20;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0202133;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.343;QD=51.7258;RBI=0.0259947;REFB=0;REVB=0.0163447;RO=0;SAF=8;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.41338e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000340699;OID=.;OPOS=83817019;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:22:0:0:19:22:1:11:8:0:0:13:9:0:0
chr16	83940604	.	G	A	397.06	PASS	AF=0.573529;AO=39;DP=68;FAO=39;FDP=68;FR=.;FRO=29;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=-0.00379557;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=114.684;QD=23.3566;RBI=0.00546844;REFB=-0.0124361;REVB=-0.00393669;RO=28;SAF=19;SAR=20;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0911457;STB=0.556781;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.00461995;OID=.;OPOS=83940604;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:28:29:39:39:0.573529:20:19:17:11:20:19:18:11
chr16	83983071	.	C	T	436.57	PASS	AF=1;AO=30;DP=32;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00150596;FXX=0.0624805;HRUN=2;LEN=1;MLLD=224.103;QD=58.2089;RBI=0.0479796;REFB=0;REVB=0.0479559;RO=0;SAF=12;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000164069;OID=.;OPOS=83983071;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:30:0:0:30:30:1:18:12:0:0:18:12:0:0
chr16	83984776	.	A	C	678.76	PASS	AF=0.961538;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=52;FR=.;FRO=2;FSAF=6;FSAR=44;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0510696;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.2576;QD=52.2123;RBI=0.0513476;REFB=-0.0112052;REVB=-0.00533633;RO=1;SAF=7;SAR=43;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0625874;STB=0.571397;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0016315;OID=.;OPOS=83984776;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:51:52:1:2:50:50:0.961538:43:7:1:0:44:6:2:0
chr16	83984844	.	A	C	937.61	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00669792;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.763;QD=58.6005;RBI=0.0137488;REFB=0;REVB=0.012007;RO=0;SAF=29;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.73009e-06;OID=.;OPOS=83984844;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:35:29:0:0:35:29:0:0
chr16	83984850	.	C	G	990.62	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000189377;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=245.199;QD=59.1414;RBI=0.0181684;REFB=0;REVB=0.0181674;RO=0;SAF=32;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.62221e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.9447e-05;OID=.;OPOS=83984850;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:35:32:0:0:35:32:0:0
chr16	83999033	.	A	G	74.68	PASS	AF=0.357143;AO=10;DP=28;FAO=10;FDP=28;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=13;FWDB=-0.00717476;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=346.335;QD=10.6682;RBI=0.0283088;REFB=-0.0132773;REVB=-0.0273845;RO=18;SAF=6;SAR=4;SRF=5;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.334551;STB=0.698267;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.0233399;OID=.;OPOS=83999033;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:28:28:18:18:10:10:0.357143:4:6:5:13:4:6:5:13
chr16	84035446	.	C	G	1380.12	PASS	AF=0.988889;AO=89;DP=90;FAO=89;FDP=90;FR=.;FRO=1;FSAF=58;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0525262;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=116.794;QD=61.3387;RBI=0.0551776;REFB=0.0952205;REVB=0.0168988;RO=0;SAF=58;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504273;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=-0.000279271;OID=.;OPOS=84035446;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:90:90:0:1:89:89:0.988889:31:58:0:0:31:58:1:0
chr16	84035919	.	T	C	119.78	PASS	AF=0.283333;AO=17;DP=60;FAO=17;FDP=60;FR=.;FRO=43;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=25;FWDB=-0.0172029;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=290.443;QD=7.985;RBI=0.0190883;REFB=-0.000604337;REVB=0.00827191;RO=43;SAF=9;SAR=8;SRF=18;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131105;STB=0.578856;STBP=0.462;TYPE=snp;VARB=0.00142827;OID=.;OPOS=84035919;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:43:43:17:17:0.283333:8:9:18:25:8:9:18:25
chr16	84070500	.	C	G	357.99	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0306679;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.282;QD=55.0751;RBI=0.0465758;REFB=0;REVB=-0.0350541;RO=0;SAF=12;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.29665e-05;OID=.;OPOS=84070500;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:14:12:0:0:14:12:0:0
chr16	84115483	.	G	A	888.57	PASS	AF=0.984127;AO=62;DP=63;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0398605;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=192.885;QD=56.417;RBI=0.0405854;REFB=0.0374863;REVB=0.00763662;RO=1;SAF=29;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0140928;STB=0.50746;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=-0.000230636;OID=.;OPOS=84115483;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:63:63:1:1:62:62:0.984127:33:29:0:1:33:29:0:1
chr16	84203612	.	A	G	50.47	PASS	AF=0.583333;AO=7;DP=12;FAO=7;FDP=12;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0212026;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=58.1229;QD=16.8249;RBI=0.0385951;REFB=-0.0230987;REVB=-0.0322495;RO=5;SAF=2;SAR=5;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0775494;STB=0.54533;STBP=0.803;TYPE=snp;VARB=0.0120982;OID=.;OPOS=84203612;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:12:12:5:5:7:7:0.583333:5:2:1:4:5:2:1:4
chr16	84203939	.	C	T	69.28	PASS	AF=0.888889;AO=8;DP=9;FAO=8;FDP=9;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0122269;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.399;QD=30.7901;RBI=0.0123293;REFB=-0.0397077;REVB=0.0015862;RO=0;SAF=1;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.78849e-08;STB=0.666169;STBP=0.104;TYPE=snp;VARB=0.000792102;OID=.;OPOS=84203939;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:9:9:0:1:8:8:0.888889:7:1:0:0:7:1:1:0
chr16	84208335	.	G	T	519.74	PASS	AF=0.69697;AO=46;DP=66;FAO=46;FDP=66;FR=.;FRO=20;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=-0.0348461;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.8021;QD=31.4995;RBI=0.0364382;REFB=0.0210256;REVB=-0.0106531;RO=20;SAF=24;SAR=22;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0722288;STB=0.539056;STBP=0.335;TYPE=snp;VARB=-0.00986184;OID=.;OPOS=84208335;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:20:20:46:46:0.69697:22:24:13:7:22:24:13:7
chr16	84209634	.	C	G	405.89	PASS	AF=0.8;AO=31;DP=39;FAO=32;FDP=40;FR=.;FRO=8;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.0339006;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=222.761;QD=40.5894;RBI=0.0348714;REFB=-0.0129073;REVB=0.00817075;RO=8;SAF=11;SAR=20;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0440368;STB=0.52701;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=0.00425526;OID=.;OPOS=84209634;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:50:39:40:8:8:31:32:0.8:20:11:2:6:20:12:2:6
chr16	84209738	.	T	C	152.13	PASS	AF=0.75;AO=14;DP=19;FAO=15;FDP=20;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0290956;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.0271;QD=30.4259;RBI=0.0672186;REFB=0.036329;REVB=-0.0605952;RO=5;SAF=4;SAR=10;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.050881;STB=0.538412;STBP=0.663;TYPE=snp;VARB=-0.00690625;OID=.;OPOS=84209738;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:19:20:5:5:14:15:0.75:10:4:1:4:10:5:1:4
chr16	84209816	.	T	C	54.62	PASS	AF=0.777778;AO=6;DP=8;FAO=7;FDP=9;FR=.;FRO=2;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0539533;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.656;QD=24.2752;RBI=0.0749199;REFB=-0.0293026;REVB=0.0519811;RO=2;SAF=2;SAR=4;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0772509;STB=0.516083;STBP=0.902;TYPE=snp;VARB=0.012146;OID=.;OPOS=84209816;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:8:9:2:2:6:7:0.777778:4:2:1:1:4:3:1:1
chr16	84212571	.	C	A	157.98	PASS	AF=0.64;AO=16;DP=25;FAO=16;FDP=25;FR=.;FRO=9;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.012395;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.027;QD=25.2764;RBI=0.0191105;REFB=-0.0261453;REVB=0.0145456;RO=9;SAF=7;SAR=9;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0763025;STB=0.54266;STBP=0.627;TYPE=snp;VARB=0.0147125;OID=.;OPOS=84212571;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:25:25:9:9:16:16:0.64:9:7:5:4:9:7:5:4
chr16	84213114	.	C	T	373.98	PASS	AF=0.828571;AO=29;DP=35;FAO=29;FDP=35;FR=.;FRO=6;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.00588615;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.247;QD=42.7404;RBI=0.0357805;REFB=-0.0728056;REVB=0.035293;RO=6;SAF=17;SAR=12;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.081288;STB=0.543969;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.00736707;OID=.;OPOS=84213114;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:35:35:6:6:29:29:0.828571:12:17:2:4:12:17:2:4
chr16	84213434	.	A	T	122.4	PASS	AF=0.52;AO=13;DP=29;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=0.00496674;FXX=0.137883;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.311;QD=19.584;RBI=0.0345142;REFB=-0.0133666;REVB=-0.0341549;RO=12;SAF=7;SAR=6;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.239512;STB=0.636165;STBP=0.182;TYPE=snp;VARB=0.018438;OID=.;OPOS=84213434;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:25:12:12:13:13:0.52:6:7:3:9:6:7:3:9
chr16	84215390	.	T	C	260.57	PASS	AF=0.785714;AO=22;DP=29;FAO=22;FDP=28;FR=.;FRO=6;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.00531139;FXX=0.0344709;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.666;QD=37.224;RBI=0.053305;REFB=-0.0333693;REVB=0.0530397;RO=4;SAF=13;SAR=9;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0469716;STB=0.554746;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.00591745;OID=.;OPOS=84215390;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:29:28:4:6:22:22:0.785714:9:13:3:1:9:13:5:1
chr16	84217062	.	C	T	331.27	PASS	AF=0.961538;AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0162938;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.586;QD=50.9651;RBI=0.0162938;REFB=-0.155295;REVB=4.26329e-05;RO=1;SAF=9;SAR=16;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0281249;STB=0.515139;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.00227137;OID=.;OPOS=84217062;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:26:26:1:1:25:25:0.961538:16:9:0:1:16:9:0:1
chr16	84224967	.	G	A	34.83	PASS	AF=0.833333;AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0100828;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=248.536;QD=23.2183;RBI=0.0150628;REFB=-0.0445307;REVB=-0.0111903;RO=1;SAF=4;SAR=1;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.277405;STB=0.66592;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=0.017865;OID=.;OPOS=84224967;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:6:6:1:1:5:5:0.833333:1:4:0:1:1:4:0:1
chr16	84228237	.	A	C	79.39	PASS	AF=0.5;AO=10;DP=20;FAO=10;FDP=20;FR=.;FRO=10;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=-0.0220552;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.446;QD=15.8781;RBI=0.0685332;REFB=-0.020625;REVB=0.0648873;RO=10;SAF=2;SAR=8;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121211;STB=0.571275;STBP=0.631;TYPE=snp;VARB=0.00607695;OID=.;OPOS=84228237;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:20:20:10:10:10:10:0.5:8:2:3:7:8:2:3:7
chr16	84228748	.	C	T	173.14	PASS	AF=0.842105;AO=16;DP=19;FAO=16;FDP=19;FR=.;FRO=3;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.000720391;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.818;QD=36.4494;RBI=0.0258982;REFB=-0.0117167;REVB=0.0258882;RO=3;SAF=5;SAR=11;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00693073;STB=0.503812;STBP=0.962;TYPE=snp;VARB=0.00342384;OID=.;OPOS=84228748;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:19:19:3:3:16:16:0.842105:11:5:1:2:11:5:1:2
chr16	84229436	.	G	A	50.47	PASS	AF=0.583333;AO=7;DP=12;FAO=7;FDP=12;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0069413;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.36;QD=16.8229;RBI=0.0317951;REFB=0.00938666;REVB=0.0310281;RO=5;SAF=1;SAR=6;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.518377;STB=0.809829;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=-0.0032463;OID=.;OPOS=84229436;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:12:12:5:5:7:7:0.583333:6:1:4:1:6:1:4:1
chr16	84229559	.	T	C	203.51	PASS	AF=0.703704;AO=19;DP=27;FAO=19;FDP=27;FR=.;FRO=8;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=-0.0158432;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.1117;QD=30.1492;RBI=0.0260397;REFB=-0.0198639;REVB=0.0206654;RO=8;SAF=11;SAR=8;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0958681;STB=0.552791;STBP=0.444;TYPE=snp;VARB=0.0136899;OID=.;OPOS=84229559;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:27:27:8:8:19:19:0.703704:8:11:6:2:8:11:6:2
chr16	84229580	.	C	T	214.2	PASS	AF=0.666667;AO=20;DP=30;FAO=20;FDP=30;FR=.;FRO=10;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.0099453;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=243.046;QD=28.5595;RBI=0.00999565;REFB=-0.0398261;REVB=-0.00100202;RO=10;SAF=13;SAR=7;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0334927;STB=0.5185;STBP=0.833;TYPE=snp;VARB=0.0165668;OID=.;OPOS=84229580;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:30:30:10:10:20:20:0.666667:7:13:7:3:7:13:7:3
chr16	84270381	.	G	A	191.06	PASS	AF=0.259259;AO=28;DP=109;FAO=28;FDP=108;FR=.;FRO=80;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=48;FSRR=32;FWDB=0.00306442;FXX=0.00917347;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.7171;QD=7.07633;RBI=0.0352598;REFB=-0.010605;REVB=0.0351264;RO=79;SAF=15;SAR=13;SRF=48;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0896731;STB=0.548159;STBP=0.615;TYPE=snp;VARB=0.0362338;OID=.;OPOS=84270381;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:108:79:80:28:28:0.259259:13:15:48:31:13:15:48:32
chr16	84438505	.	C	T	356.59	PASS	AF=0.74359;AO=29;DP=39;FAO=29;FDP=39;FR=.;FRO=10;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.0221716;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.99;QD=36.573;RBI=0.133498;REFB=0.00149195;REVB=-0.131644;RO=10;SAF=16;SAR=13;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0716689;STB=0.53898;STBP=0.434;TYPE=snp;VARB=-0.0025347;OID=.;OPOS=84438505;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:70:39:39:10:10:29:29:0.74359:13:16:4:6:13:16:4:6
chr16	84438512	.	G	A	651.22	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00159457;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.1976;QD=62.0208;RBI=0.0437805;REFB=0;REVB=-0.0437515;RO=0;SAF=20;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000478251;OID=.;OPOS=84438512;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:22:20:0:0:22:20:0:0
chr16	84444349	.	A	C	465.14	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00518498;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=302.714;QD=58.1421;RBI=0.0095981;REFB=0;REVB=0.0080771;RO=0;SAF=9;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02243e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.67352e-05;OID=.;OPOS=84444349;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:23:9:0:0:23:9:0:0
chr16	84476200	.	A	T	91.78	PASS	AF=0.833333;AO=10;DP=12;FAO=10;FDP=12;FR=.;FRO=2;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00302774;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.747;QD=30.5926;RBI=0.0256;REFB=-0.00737709;REVB=0.0254203;RO=2;SAF=2;SAR=8;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125826;STB=0.571275;STBP=0.366;TYPE=snp;VARB=0.0017038;OID=.;OPOS=84476200;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:12:12:2:2:10:10:0.833333:8:2:1:1:8:2:1:1
chr16	84485573	.	C	A	676.66	PASS	AF=1;AO=41;DP=42;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.035411;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.3908;QD=61.5148;RBI=0.103552;REFB=0;REVB=0.0973089;RO=0;SAF=25;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.1719e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00172979;OID=.;OPOS=84485573;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:44:0:0:41:44:1:16:25:0:0:18:26:0:0
chr16	84488444	.	G	A	69.99	PASS	AF=0.473684;AO=9;DP=19;FAO=9;FDP=19;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.0169451;FXX=0.049975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.994;QD=14.7357;RBI=0.0446293;REFB=-0.010365;REVB=0.0412872;RO=10;SAF=4;SAR=5;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0498364;STB=0.529346;STBP=0.781;TYPE=snp;VARB=0.00767745;OID=.;OPOS=84488444;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:69:19:19:10:10:9:9:0.473684:5:4:5:5:5:4:5:5
chr16	84493144	.	C	G	483.35	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00538266;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=313.994;QD=58.5878;RBI=0.0302674;REFB=0;REVB=0.029785;RO=0;SAF=18;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.64315e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.9214e-05;OID=.;OPOS=84493144;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:15:18:0:0:15:18:0:0
chr16	84494020	.	G	T	380.55	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0246981;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=132.535;QD=54.3636;RBI=0.0420458;REFB=0;REVB=0.0340273;RO=0;SAF=11;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000553155;OID=.;OPOS=84494020;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:28:0:0:27:28:1:16:11:0:0:17:11:0:0
chr16	84494275	.	C	T	375.61	PASS	AF=1;AO=26;DP=27;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0048941;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=147.026;QD=53.6582;RBI=0.0282295;REFB=0;REVB=0.027802;RO=0;SAF=14;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000524636;OID=.;OPOS=84494275;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:28:0:0:26:28:1:12:14:0:0:12:16:0:0
chr16	84516309	.	G	A	694.5	PASS	AF=1;AO=37;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=19;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0424473;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.1713;QD=61.7333;RBI=0.0425537;REFB=0;REVB=-0.0030076;RO=0;SAF=11;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000695912;OID=.;OPOS=84516309;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:37:45:1:26:11:0:0:26:19:0:0
chr16	84520325	.	T	C	99.38	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0392119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.072;QD=39.7525;RBI=0.0544104;REFB=0;REVB=0.0377216;RO=0;SAF=3;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000709386;OID=.;OPOS=84520325;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:10:0:0:8:10:1:5:3:0:0:6:4:0:0
chr16	84520396	.	A	G	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.019721;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.553;QD=47.8223;RBI=0.0285777;REFB=0;REVB=-0.0206825;RO=0;SAF=8;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.63776e-06;OID=.;OPOS=84520396;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:8:8:0:0:8:8:0:0
chr16	84520537	.	T	C	635.8	PASS	AF=1;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0468984;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.495;QD=62.029;RBI=0.0473067;REFB=0;REVB=0.00620156;RO=0;SAF=24;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.2194e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000238268;OID=.;OPOS=84520537;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:41:0:0:41:41:1:17:24:0:0:17:24:0:0
chr16	84522897	.	G	C	255.91	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0355419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.1104;QD=51.1825;RBI=0.0607606;REFB=0;REVB=0.0492811;RO=0;SAF=13;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00285617;OID=.;OPOS=84522897;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:7:13:0:0:7:13:0:0
chr16	84600347	.	T	C	203.51	PASS	AF=0.703704;AO=19;DP=27;FAO=19;FDP=27;FR=.;FRO=8;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=0.00441675;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=247.695;QD=30.1492;RBI=0.00821687;REFB=-0.00277408;REVB=-0.00692888;RO=8;SAF=12;SAR=7;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147096;STB=0.580706;STBP=0.249;TYPE=snp;VARB=0.00161666;OID=.;OPOS=84600347;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:27:27:8:8:19:19:0.703704:7:12:7:1:7:12:7:1
chr16	84778762	.	C	T	57.08	PASS	AF=0.875;AO=7;DP=8;FAO=7;FDP=8;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.006044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.601;QD=28.5377;RBI=0.0160609;REFB=0.0509707;REVB=0.0148803;RO=1;SAF=4;SAR=3;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0971198;STB=0.5554;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=-0.00768253;OID=.;OPOS=84778762;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:8:8:1:1:7:7:0.875:3:4:1:0:3:4:1:0
chr16	84779248	.	T	G	89.0	PASS	AF=0.769231;AO=10;DP=13;FAO=10;FDP=13;FR=.;FRO=3;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0336849;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=285.638;QD=27.3838;RBI=0.0423411;REFB=0.0281633;REVB=-0.0256533;RO=3;SAF=3;SAR=7;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163937;STB=0.593025;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=-0.00985812;OID=.;OPOS=84779248;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:13:13:3:3:10:10:0.769231:7:3:2:1:7:3:2:1
chr16	84796603	.	A	G	670.26	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0206952;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.8212;QD=62.3501;RBI=0.0347961;REFB=0;REVB=-0.0279728;RO=0;SAF=18;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.65211e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000844311;OID=.;OPOS=84796603;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:25:18:0:0:25:18:0:0
chr16	84808824	.	C	G	304.89	PASS	AF=0.586957;AO=27;DP=46;FAO=27;FDP=46;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.0212055;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.411;QD=26.5123;RBI=0.030045;REFB=-0.00691635;REVB=-0.0212845;RO=19;SAF=11;SAR=16;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0506519;STB=0.528032;STBP=0.64;TYPE=snp;VARB=0.00491654;OID=.;OPOS=84808824;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:19:19:27:27:0.586957:16:11:9:10:16:11:9:10
chr16	84906098	.	C	G	1525.5	PASS	AF=1;AO=95;DP=97;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000625104;FXX=0.0204061;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.652;QD=63.5623;RBI=0.0113979;REFB=0;REVB=-0.0113807;RO=0;SAF=55;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.0133e-05;OID=.;OPOS=84906098;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:97:96:0:0:95:96:1:40:55:0:0:40:56:0:0
chr16	84922859	.	C	T	411.11	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0353892;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.789;QD=56.7054;RBI=0.0401209;REFB=0;REVB=0.0189021;RO=0;SAF=16;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000529915;OID=.;OPOS=84922859;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:13:16:0:0:13:16:0:0
chr16	85100976	.	G	A	91.52	PASS	AF=0.208333;AO=14;DP=71;FAO=15;FDP=72;FR=.;FRO=57;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=24;FSRR=33;FWDB=-0.010116;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.861;QD=5.08451;RBI=0.0247759;REFB=-0.0102102;REVB=0.0226166;RO=57;SAF=6;SAR=8;SRF=24;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0095887;STB=0.517218;STBP=0.893;TYPE=snp;VARB=0.034869;OID=.;OPOS=85100976;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:91:71:72:57:57:14:15:0.208333:8:6:24:33:9:6:24:33
chr16	85705880	.	C	T	238.09	PASS	AF=0.489362;AO=23;DP=47;FAO=23;FDP=47;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=-0.0363022;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.4618;QD=20.2626;RBI=0.0434298;REFB=0.0092778;REVB=0.0238389;RO=24;SAF=12;SAR=11;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0197085;STB=0.511101;STBP=0.814;TYPE=snp;VARB=-0.00626391;OID=.;OPOS=85705880;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:24:24:23:23:0.489362:11:12:12:12:11:12:12:12
chr16	85705901	.	G	A	234.95	PASS	AF=0.46;AO=23;DP=50;FAO=23;FDP=50;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.0112913;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=212.27;QD=18.7956;RBI=0.0112992;REFB=-0.00594149;REVB=0.000421362;RO=27;SAF=11;SAR=12;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0679379;STB=0.538428;STBP=0.668;TYPE=snp;VARB=0.006529;OID=.;OPOS=85705901;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:27:27:23:23:0.46:12:11:11:16:12:11:11:16
chr16	85706047	.	A	C,G	712.07	PASS	AF=0.956522,0.0434783;AO=44,2;DP=46;FAO=44,2;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=28,1;FSAR=16,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0280742,0.0445021;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=81.0849,27.3774;QD=61.9194;RBI=0.04199,0.046895;REFB=0,0;REVB=0.031225,0.0147889;RO=0;SAF=28,1;SAR=16,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000646404,-0.000858027;OID=.,.;OPOS=85706047,85706047;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:46:46:0:0:44,2:44,2:0.956522,0.0434783:16,1:28,1:0:0:16,1:28,1:0:0
chr16	85707289	.	C	G	42.83	PASS	AF=0.212121;AO=7;DP=33;FAO=7;FDP=33;FR=.;FRO=26;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.00427929;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=237.604;QD=5.19184;RBI=0.0154635;REFB=-0.00221029;REVB=-0.0148596;RO=26;SAF=3;SAR=4;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0396396;STB=0.52624;STBP=0.946;TYPE=snp;VARB=0.00805231;OID=.;OPOS=85707289;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:42:33:33:26:26:7:7:0.212121:4:3:12:14:4:3:12:14
chr16	85711860	.	C	T	498.96	PASS	AF=0.745763;AO=42;DP=58;FAO=44;FDP=59;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=38;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=0.000785571;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.051;QD=33.8277;RBI=0.0181882;REFB=-0.0350124;REVB=0.0181713;RO=15;SAF=5;SAR=37;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.204256;STB=0.592021;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=0.00982322;OID=.;OPOS=85711860;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:59:15:15:42:44:0.745763:37:5:5:10:38:6:5:10
chr16	85814899	.	T	TAGTC	346.69	PASS	AF=0.962963;AO=25;DP=27;FAO=26;FDP=27;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.009827;FXX=0;HRUN=1;LEN=4;MLLD=277.647;QD=51.3619;RBI=0.0165349;REFB=-0.0119561;REVB=-0.0132978;RO=1;SAF=14;SAR=11;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0319949;STB=0.517228;STBP=0.515;TYPE=ins;VARB=-7.18722e-05;OID=.;OPOS=85814900;OREF=-;OALT=AGTC;OMAPALT=TAGTC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.962963:25:27:26:27:1:14:12:1:0:5:1:14:11:1:0
chr16	85834818	.	G	A	87.22	PASS	AF=0.189873;AO=15;DP=79;FAO=15;FDP=79;FR=.;FRO=64;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=38;FSRR=26;FWDB=-0.0215711;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.1213;QD=4.4161;RBI=0.0241929;REFB=0.00215834;REVB=0.0109538;RO=62;SAF=9;SAR=6;SRF=36;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.025031;STB=0.505256;STBP=0.988;TYPE=snp;VARB=-0.0202348;OID=.;OPOS=85834818;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:79:79:62:64:15:15:0.189873:6:9:36:26:6:9:38:26
chr16	85838653	.	T	C	560.1	PASS	AF=1;AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0084707;FXX=0.0263089;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.1966;QD=60.5517;RBI=0.015051;REFB=0;REVB=0.0124411;RO=0;SAF=25;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000111552;OID=.;OPOS=85838653;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:37:0:0:37:37:1:12:25:0:0:12:25:0:0
chr16	85948098	.	G	A	60.13	PASS	AF=0.175439;AO=10;DP=58;FAO=10;FDP=57;FR=.;FRO=47;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=32;FWDB=-0.00327722;FXX=0.0172384;HRUN=4;LEN=1;MLLD=182.712;QD=4.21932;RBI=0.021891;REFB=-0.00476458;REVB=0.0216443;RO=44;SAF=6;SAR=4;SRF=14;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.338839;STB=0.719611;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.0267148;OID=.;OPOS=85948098;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:60:58:57:44:47:10:10:0.175439:4:6:14:30:4:6:15:32
chr16	86069722	.	A	G	164.44	PASS	AF=1;AO=14;DP=15;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.132953;FXX=0.0666222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=46.5333;QD=46.9829;RBI=0.134737;REFB=0;REVB=-0.0218581;RO=0;SAF=3;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0037522;OID=.;OPOS=86069722;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:14:0:0:14:14:1:11:3:0:0:11:3:0:0
chr16	86069738	.	C	G	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0240513;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.5296;QD=46.8479;RBI=0.0240824;REFB=0;REVB=0.00122437;RO=0;SAF=4;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33019e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000467314;OID=.;OPOS=86069738;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:11:4:0:0:11:4:0:0
chr16	86069788	.	GT	TG	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.022469;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=107.129;QD=42.1826;RBI=0.0300059;REFB=0;REVB=-0.0198871;RO=0;SAF=2;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=5.36573e-05;OID=.;OPOS=86069788;OREF=GT;OALT=TG;OMAPALT=TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:9:2:0:0:9:2:0:0
chr16	86069827	.	A	G	272.56	PASS	AF=1;AO=20;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0213609;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=244.738;QD=51.9166;RBI=0.0230086;REFB=0;REVB=0.00855026;RO=0;SAF=8;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000161415;OID=.;OPOS=86069827;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:20:21:1:12:8:0:0:13:8:0:0
chr16	86547496	.	C	T	465.0	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00364482;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=62.2607;QD=58.1247;RBI=0.00369359;REFB=0;REVB=-0.000598277;RO=0;SAF=14;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.54266e-05;OID=.;OPOS=86547496;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:18:14:0:0:18:14:0:0
chr16	86565826	.	C	G	537.97	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0147356;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=57.7574;QD=59.7746;RBI=0.0285472;REFB=0;REVB=-0.0244501;RO=0;SAF=23;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.21415e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000127488;OID=.;OPOS=86565826;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:13:23:0:0:13:23:0:0
chr16	86574818	.	C	G	262.98	PASS	AF=0.954545;AO=21;DP=22;FAO=21;FDP=22;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0105355;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=228.627;QD=47.8146;RBI=0.0154474;REFB=-0.0240241;REVB=0.0112971;RO=1;SAF=5;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0835989;STB=0.545409;STBP=0.187;TYPE=snp;VARB=0.000859443;OID=.;OPOS=86574818;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:22:22:1:1:21:21:0.954545:16:5:1:0:16:5:1:0
chr16	87350773	.	C	A	511.07	PASS	AF=0.860465;AO=37;DP=43;FAO=37;FDP=43;FR=.;FRO=6;FSAF=13;FSAR=24;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.0692847;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.449;QD=47.5416;RBI=0.0742244;REFB=-0.0641178;REVB=0.0266251;RO=6;SAF=13;SAR=24;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131368;STB=0.570635;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.00254629;OID=.;OPOS=87350773;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:31:43:43:6:6:37:37:0.860465:24:13:5:1:24:13:5:1
chr16	87417621	.	G	A	111.23	PASS	AF=0.197802;AO=18;DP=91;FAO=18;FDP=91;FR=.;FRO=73;FSAF=17;FSAR=1;FSRF=41;FSRR=32;FWDB=0.000745409;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.117;QD=4.88902;RBI=0.0126007;REFB=0.00178634;REVB=0.0125786;RO=67;SAF=17;SAR=1;SRF=37;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.618258;STB=0.905749;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=-0.0125172;OID=.;OPOS=87417621;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:67:73:18:18:0.197802:1:17:37:30:1:17:41:32
chr16	87436720	.	G	T	594.35	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.02015;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.7171;QD=60.9587;RBI=0.0243316;REFB=0;REVB=-0.0136384;RO=0;SAF=19;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.3303e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.98355e-05;OID=.;OPOS=87436720;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:20:19:0:0:20:19:0:0
chr16	87436764	.	A	G	757.95	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0322916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.64;QD=63.1624;RBI=0.0328079;REFB=0;REVB=-0.00579776;RO=0;SAF=30;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.73384e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.36748e-05;OID=.;OPOS=87436764;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:18:30:0:0:18:30:0:0
chr16	87446368	.	C	T	240.96	PASS	AF=0.628571;AO=22;DP=36;FAO=22;FDP=35;FR=.;FRO=13;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=0.0213502;FXX=0.0277701;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.388;QD=27.5383;RBI=0.022576;REFB=-0.0168736;REVB=-0.00733791;RO=13;SAF=13;SAR=9;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138969;STB=0.576953;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=0.0157047;OID=.;OPOS=87446368;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:35:13:13:22:22:0.628571:9:13:5:8:9:13:5:8
chr16	87678144	.	T	C	188.9	PASS	AF=0.692308;AO=18;DP=25;FAO=18;FDP=26;FR=.;FRO=8;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.00181592;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.402;QD=29.062;RBI=0.0121803;REFB=-0.0413664;REVB=-0.0120442;RO=7;SAF=8;SAR=10;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00814684;STB=0.521715;STBP=0.788;TYPE=snp;VARB=0.0179418;OID=.;OPOS=87678144;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:25:26:7:8:18:18:0.692308:10:8:3:4:10:8:3:5
chr16	87678165	.	G	A	159.83	PASS	AF=0.666667;AO=16;DP=24;FAO=16;FDP=24;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0328955;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.94;QD=26.6377;RBI=0.0498754;REFB=-0.00437215;REVB=-0.0374893;RO=8;SAF=5;SAR=11;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12313;STB=0.568876;STBP=0.36;TYPE=snp;VARB=0.00274858;OID=.;OPOS=87678165;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:24:24:8:8:16:16:0.666667:11:5:4:4:11:5:4:4
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chr16	87738709	.	GCTTCCT	G	48.45	PASS	AF=0.153846;AO=8;DP=52;FAO=8;FDP=52;FR=.;FRO=44;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=20;FSRR=24;FWDB=-0.0377134;FXX=0;HRUN=1;LEN=6;MLLD=308.413;QD=3.7268;RBI=0.0408387;REFB=-0.00546295;REVB=-0.0156684;RO=37;SAF=3;SAR=5;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104994;STB=0.569131;STBP=0.668;TYPE=del;VARB=0.0272103;OID=.;OPOS=87738710;OREF=CTTCCT;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.153846:8:52:8:52:44:3:5:20:24:48:37:3:5:17:20
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chr16	88052161	.	C	A	143.0	PASS	AF=0.339623;AO=18;DP=53;FAO=18;FDP=53;FR=.;FRO=35;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=23;FWDB=0.0163528;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.465;QD=10.7927;RBI=0.0409418;REFB=0.000420712;REVB=-0.0375342;RO=35;SAF=11;SAR=7;SRF=12;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.294152;STB=0.671915;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=-0.000773953;OID=.;OPOS=88052161;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:35:35:18:18:0.339623:7:11:12:23:7:11:12:23
chr16	88061150	.	C	T	297.38	PASS	AF=0.65;AO=25;DP=39;FAO=26;FDP=40;FR=.;FRO=14;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.0596633;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.0585;QD=29.7379;RBI=0.0701655;REFB=-0.0206165;REVB=0.0369256;RO=14;SAF=8;SAR=17;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127451;STB=0.557332;STBP=0.343;TYPE=snp;VARB=0.0145834;OID=.;OPOS=88061150;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:40:14:14:25:26:0.65:17:8:7:7:17:9:7:7
chr16	88105053	.	T	A	119.78	PASS	AF=0.283333;AO=17;DP=60;FAO=17;FDP=60;FR=.;FRO=43;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=38;FWDB=0.0295694;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.814;QD=7.98502;RBI=0.0295886;REFB=-0.00840439;REVB=-0.00106525;RO=43;SAF=8;SAR=9;SRF=5;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.458502;STB=0.76246;STBP=0.069;TYPE=snp;VARB=0.0157339;OID=.;OPOS=88105053;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:43:43:17:17:0.283333:9:8:5:38:9:8:5:38
chr16	88123598	.	C	G	272.28	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0581989;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.2053;QD=51.8625;RBI=0.0603325;REFB=0;REVB=-0.0159028;RO=0;SAF=13;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00143717;OID=.;OPOS=88123598;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:8:13:0:0:8:13:0:0
chr16	88123697	.	C	A	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.028361;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.111;QD=44.6893;RBI=0.0851933;REFB=0;REVB=0.080334;RO=0;SAF=7;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0024525;OID=.;OPOS=88123697;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:6:7:0:0:6:7:0:0
chr16	88124525	.	A	G	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00649452;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.344;QD=35.5758;RBI=0.0834495;REFB=0;REVB=-0.0831964;RO=0;SAF=5;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.27427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00225004;OID=.;OPOS=88124525;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:2:5:0:0:2:5:0:0
chr16	88134285	.	A	G	625.34	PASS	AF=0.976744;AO=41;DP=42;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.13477;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=45.0535;QD=58.1713;RBI=0.134778;REFB=0.00754155;REVB=-0.00145874;RO=1;SAF=29;SAR=12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159086;STB=0.508471;STBP=0.594;TYPE=snp;VARB=-0.00127241;OID=.;OPOS=88134285;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:42:43:1:1:41:42:0.976744:12:29:1:0:13:29:1:0
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chr16	88494976	.	A	C	441.69	PASS	AF=0.683333;AO=39;DP=58;FAO=41;FDP=60;FR=.;FRO=19;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.0214498;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.087;QD=29.4457;RBI=0.0230057;REFB=-0.0422606;REVB=0.00831666;RO=18;SAF=18;SAR=21;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0868029;STB=0.553097;STBP=0.236;TYPE=snp;VARB=0.0235683;OID=.;OPOS=88494976;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:60:18:19:39:41:0.683333:21:18:11:7:22:19:12:7
chr16	88495654	.	A	G	47.04	PASS	AF=0.5;AO=6;DP=14;FAO=7;FDP=14;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.0587735;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.2641;QD=13.4408;RBI=0.0591415;REFB=-0.00824518;REVB=0.00658772;RO=7;SAF=2;SAR=4;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.32987;STB=0.713673;STBP=0.192;TYPE=snp;VARB=0.00591982;OID=.;OPOS=88495654;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:14:14:7:7:6:7:0.5:4:2:5:2:5:2:5:2
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chr16	88498297	.	T	G	102.07	PASS	AF=0.785714;AO=11;DP=14;FAO=11;FDP=14;FR=.;FRO=3;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0527045;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.744;QD=29.1641;RBI=0.0570658;REFB=-0.0163864;REVB=-0.0218802;RO=3;SAF=1;SAR=10;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21804;STB=0.62473;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=0.00560283;OID=.;OPOS=88498297;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:14:14:3:3:11:11:0.785714:10:1:1:2:10:1:1:2
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chr16	88499539	.	C	G	665.42	PASS	AF=0.794118;AO=54;DP=68;FAO=54;FDP=68;FR=.;FRO=14;FSAF=23;FSAR=31;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=0.00944155;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=282.02;QD=39.1423;RBI=0.0120166;REFB=-0.0105608;REVB=0.00743345;RO=14;SAF=23;SAR=31;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0840164;STB=0.545038;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.00258107;OID=.;OPOS=88499539;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:68:68:14:14:54:54:0.794118:31:23:9:5:31:23:9:5
chr16	88502090	.	G	A	52.86	PASS	AF=0.266667;AO=8;DP=30;FAO=8;FDP=30;FR=.;FRO=22;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.0415143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.772;QD=7.04801;RBI=0.0420101;REFB=-0.0112168;REVB=0.00643528;RO=22;SAF=3;SAR=5;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146666;STB=0.592984;STBP=0.558;TYPE=snp;VARB=0.0289842;OID=.;OPOS=88502090;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:30:30:22:22:8:8:0.266667:5:3:11:11:5:3:11:11
chr16	88502482	.	C	T	164.05	PASS	AF=0.727273;AO=16;DP=22;FAO=16;FDP=22;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.00107363;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.468;QD=29.8274;RBI=0.0151076;REFB=0.00459311;REVB=-0.0150694;RO=5;SAF=5;SAR=11;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.220785;STB=0.603524;STBP=0.138;TYPE=snp;VARB=-0.00263547;OID=.;OPOS=88502482;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:22:22:5:6:16:16:0.727273:11:5:4:1:11:5:4:2
chr16	88502505	.	A	G	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0276575;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.155;QD=43.486;RBI=0.0773375;REFB=0;REVB=-0.0722229;RO=0;SAF=6;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0014699;OID=.;OPOS=88502505;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:6:6:0:0:6:6:0:0
chr16	88504851	.	AGG	AGA,AG	327.8	PASS	AF=0.404255,0.595745;AO=10,7;DP=50;FAO=19,28;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=2,19;FSAR=17,9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0208526,0.318107;FXX=0.129606;HRUN=7,7;LEN=1,1;MLLD=232.426,6.04485;QD=27.8982;RBI=0.0581989,0.446483;REFB=0.0172401,0.0620816;REVB=-0.054335,-0.313296;RO=14;SAF=2,7;SAR=8,0;SRF=10;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.505935,0.715958;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,del;VARB=-0.0039675,0.090019;OID=.,.;OPOS=88504853,88504852;OREF=G,G;OALT=A,-;OMAPALT=AGA,AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.404255,0.595745:10,7:50:19,28:47:0:2,19:17,9:0:0:99:14:2,7:8,0:10:4
chr16	88504868	.	A	G	920.01	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0402899;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.661;QD=58.4136;RBI=0.0455892;REFB=0;REVB=-0.0213332;RO=0;SAF=16;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.30823e-05;OID=.;OPOS=88504868;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:47:16:0:0:47:16:0:0
chr16	88505277	.	GGC	G	54.19	PASS	AF=0.409091;AO=7;DP=24;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=0.0520542;FXX=0;HRUN=4;LEN=2;MLLD=24.8476;QD=9.85324;RBI=0.0664413;REFB=-0.126662;REVB=0.0412892;RO=15;SAF=5;SAR=2;SRF=5;SRR=10;SSEN=0.625;SSEP=0;SSSB=0.403073;STB=0.666296;STBP=0.217;TYPE=del;VARB=0.180759;OID=.;OPOS=88505278;OREF=GC;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.409091:7:24:9:22:13:6:3:5:8:54:15:5:2:5:10
chr16	88505635	.	A	G	246.84	PASS	AF=0.709677;AO=22;DP=31;FAO=22;FDP=31;FR=.;FRO=9;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.0735993;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.7529;QD=31.8501;RBI=0.0820323;REFB=-0.0442991;REVB=0.0362276;RO=8;SAF=15;SAR=7;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0313901;STB=0.540945;STBP=0.491;TYPE=snp;VARB=0.0209332;OID=.;OPOS=88505635;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:31:31:8:9:22:22:0.709677:7:15:5:3:7:15:5:4
chr16	88505734	.	C	T	88.22	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0994829;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.283;QD=39.2067;RBI=0.101458;REFB=0;REVB=-0.019923;RO=0;SAF=3;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0030843;OID=.;OPOS=88505734;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:6:3:0:0:6:3:0:0
chr16	88594567	.	C	T	227.54	PASS	AF=0.6875;AO=19;DP=31;FAO=22;FDP=32;FR=.;FRO=10;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.134662;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=77.5711;QD=28.4429;RBI=0.135497;REFB=-0.106378;REVB=0.015015;RO=11;SAF=5;SAR=14;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.211577;STB=0.512184;STBP=0.878;TYPE=snp;VARB=0.0338626;OID=.;OPOS=88594567;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:31:32:11:10:19:22:0.6875:14:5:6:5:14:8:4:6
chr16	88633052	.	G	C	51.04	PASS	AF=0.210526;AO=8;DP=38;FAO=8;FDP=38;FR=.;FRO=30;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=-0.0103562;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.845;QD=5.37248;RBI=0.0106727;REFB=0.00201093;REVB=0.0025797;RO=30;SAF=3;SAR=5;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.26565;STB=0.67266;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=-0.00726421;OID=.;OPOS=88633052;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:51:38:38:30:30:8:8:0.210526:5:3:18:12:5:3:18:12
chr16	88643727	.	C	T	83.82	PASS	AF=0.333333;AO=11;DP=33;FAO=11;FDP=33;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=0.0111725;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.159;QD=10.1602;RBI=0.097487;REFB=0.019306;REVB=0.0968447;RO=22;SAF=6;SAR=5;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.0833e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0290075;OID=.;OPOS=88643727;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:33:33:22:22:11:11:0.333333:5:6:12:10:5:6:12:10
chr16	88644005	.	A	G	309.53	PASS	AF=0.923077;AO=24;DP=27;FAO=24;FDP=26;FR=.;FRO=2;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0375219;FXX=0.0370233;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.561;QD=47.62;RBI=0.0379317;REFB=0.0816561;REVB=-0.00556083;RO=2;SAF=12;SAR=12;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00878253;OID=.;OPOS=88644005;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:27:26:2:2:24:24:0.923077:12:12:1:1:12:12:1:1
chr16	88709828	.	A	G	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00628996;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.521;QD=37.4885;RBI=0.0578163;REFB=0;REVB=-0.0574731;RO=0;SAF=2;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.58669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00116576;OID=.;OPOS=88709828;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:6:2:0:0:6:2:0:0
chr16	88713236	.	A	G	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00654435;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=305.234;QD=51.1845;RBI=0.0107178;REFB=0;REVB=-0.00848781;RO=0;SAF=10;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.91642e-05;OID=.;OPOS=88713236;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:10:10:0:0:10:10:0:0
chr16	88717386	.	T	C	801.32	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0358745;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.748;QD=57.2369;RBI=0.0361744;REFB=0;REVB=0.00464819;RO=0;SAF=28;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000130584;OID=.;OPOS=88717386;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:28:28:0:0:28:28:0:0
chr16	88724347	.	G	T	599.04	PASS	AF=1;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0348897;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.917;QD=61.4397;RBI=0.0364367;REFB=0;REVB=0.0105044;RO=0;SAF=16;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.43889e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000251275;OID=.;OPOS=88724347;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:39:0:0:39:39:1:23:16:0:0:23:16:0:0
chr16	88778615	.	G	A	104.27	PASS	AF=0.242424;AO=16;DP=66;FAO=16;FDP=66;FR=.;FRO=50;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=34;FWDB=-0.00420232;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.519;QD=6.31947;RBI=0.0212881;REFB=-0.00487795;REVB=-0.0208692;RO=50;SAF=8;SAR=8;SRF=16;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.223531;STB=0.636206;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=0.0203244;OID=.;OPOS=88778615;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:50:50:16:16:0.242424:8:8:16:34:8:8:16:34
chr16	88779739	.	A	G	698.97	PASS	AF=0.980392;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0118562;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.326;QD=54.8213;RBI=0.0132392;REFB=-0.0321196;REVB=0.00589133;RO=0;SAF=22;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.15703e-08;STB=0.508768;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.000428841;OID=.;OPOS=88779739;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:51:51:0:1:50:50:0.980392:28:22:0:0:28:22:0:1
chr16	88781040	.	A	G	801.75	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0128818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.174;QD=57.2678;RBI=0.0206235;REFB=0;REVB=0.0161055;RO=0;SAF=38;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.97918e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.51869e-05;OID=.;OPOS=88781040;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:56:0:0:55:56:1:17:38:0:0:17:39:0:0
chr16	88781125	.	T	C	207.12	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.122548;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.789;QD=48.735;RBI=0.133034;REFB=0;REVB=0.0517687;RO=0;SAF=6;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000645093;OID=.;OPOS=88781125;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:11:6:0:0:11:6:0:0
chr16	88781522	.	G	A	199.72	PASS	AF=0.818182;AO=18;DP=22;FAO=18;FDP=22;FR=.;FRO=4;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0186336;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=194.787;QD=36.3121;RBI=0.0263212;REFB=-0.051802;REVB=0.0185902;RO=4;SAF=9;SAR=9;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0828586;STB=0.545404;STBP=0.369;TYPE=snp;VARB=0.0155405;OID=.;OPOS=88781522;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:20:22:22:4:4:18:18:0.818182:9:9:3:1:9:9:3:1
chr16	88782676	.	A	G	632.26	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00206123;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.351;QD=61.6839;RBI=0.00917218;REFB=0;REVB=0.00893757;RO=0;SAF=18;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.13947e-06;OID=.;OPOS=88782676;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:23:18:0:0:23:18:0:0
chr16	88783449	.	C	G	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0453448;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.2602;QD=55.6558;RBI=0.0454073;REFB=0;REVB=0.00238322;RO=0;SAF=11;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000941463;OID=.;OPOS=88783449;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:16:11:0:0:16:11:0:0
chr16	88783521	.	T	C	425.57	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0691299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.0454;QD=56.7422;RBI=0.0695504;REFB=0;REVB=-0.00763624;RO=0;SAF=9;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00172964;OID=.;OPOS=88783521;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:21:9:0:0:21:9:0:0
chr16	88787704	.	G	C	851.13	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0115104;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.854;QD=57.7036;RBI=0.024497;REFB=0;REVB=0.0216243;RO=0;SAF=21;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.22967e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000107092;OID=.;OPOS=88787704;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:38:21:0:0:38:21:0:0
chr16	88788696	.	CGGGG	CGGGC,CGGG	47.14	PASS	AF=0.00877193,0.27193;AO=5,29;DP=111;FAO=1,31;FDP=114;FR=.;FRO=82;FSAF=0,9;FSAR=1,22;FSRF=47;FSRR=35;FWDB=-0.0393175,-0.00732369;FXX=0.0172399;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=51.6986,9.89132;QD=1.6541;RBI=0.0393501,0.0199279;REFB=-0.011662,-0.114466;REVB=0.00160078,-0.0185333;RO=67;SAF=4,4;SAR=1,25;SRF=44;SRR=23;SSEN=0,0.409091;SSEP=0,0;SSSB=0.174849,-0.614489;STB=0.991464,0.705884;STBP=0.287,0.01;TYPE=snp,del;VARB=0.123515,0.110075;OID=.,.;OPOS=88788700,88788697;OREF=G,G;OALT=C,-;OMAPALT=CGGGC,CGGG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0.00877193,0.27193:5,29:111:1,31:114:82:0,9:1,22:47:35:44:67:4,4:1,25:44:23
chr16	88792047	.	A	G	528.36	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00967816;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.6982;QD=58.7063;RBI=0.0244787;REFB=0;REVB=-0.0224843;RO=0;SAF=25;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.03206e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00263826;OID=.;OPOS=88792047;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:36:0:0:35:36:1:10:25:0:0:11:25:0:0
chr16	88792097	.	A	G	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00314777;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.147;QD=55.0985;RBI=0.0446187;REFB=0;REVB=0.0445075;RO=0;SAF=15;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.84803e-05;OID=.;OPOS=88792097;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:11:15:0:0:11:15:0:0
chr16	88803124	.	T	C	592.59	PASS	AF=0.746269;AO=50;DP=66;FAO=50;FDP=67;FR=.;FRO=17;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=0.0114244;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.3623;QD=35.3783;RBI=0.0231102;REFB=-0.0213374;REVB=-0.020089;RO=15;SAF=26;SAR=24;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108483;STB=0.55712;STBP=0.114;TYPE=snp;VARB=0.00504322;OID=.;OPOS=88803124;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:67:15:17:50:50:0.746269:24:26:4:11:24:26:5:12
chr16	88803982	.	C	G	400.11	PASS	AF=0.966667;AO=29;DP=30;FAO=29;FDP=30;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0728202;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.2877;QD=53.348;RBI=0.0817336;REFB=-0.151177;REVB=0.037116;RO=0;SAF=18;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.521724;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=0.0106602;OID=.;OPOS=88803982;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:30:30:0:1:29:29:0.966667:11:18:0:0:11:18:0:1
chr16	88804734	.	A	G	207.12	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0515872;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.001;QD=48.7341;RBI=0.0650651;REFB=0;REVB=-0.0396513;RO=0;SAF=5;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000208131;OID=.;OPOS=88804734;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:12:5:0:0:12:5:0:0
chr16	88804924	.	TC	T	231.77	PASS	AF=1;AO=20;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.253118;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=16.2476;QD=37.0827;RBI=0.255738;REFB=-0.0276987;REVB=-0.0365116;RO=3;SAF=10;SAR=10;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0398736;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.0155004;OID=.;OPOS=88804925;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:20:25:25:25:0:13:12:0:0:4:3:10:10:2:1
chr16	88808743	.	A	G	289.34	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0157574;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.919;QD=52.6077;RBI=0.0381433;REFB=0;REVB=0.0347364;RO=0;SAF=12;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000185551;OID=.;OPOS=88808743;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:10:12:0:0:10:12:0:0
chr16	88809368	.	G	T	77.02	PASS	AF=0.210526;AO=12;DP=57;FAO=12;FDP=57;FR=.;FRO=45;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=28;FSRR=17;FWDB=0.0223899;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.521;QD=5.40509;RBI=0.022617;REFB=0.0114527;REVB=-0.00319732;RO=44;SAF=8;SAR=4;SRF=28;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0410216;STB=0.538396;STBP=0.776;TYPE=snp;VARB=-0.0319684;OID=.;OPOS=88809368;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:57:57:44:45:12:12:0.210526:4:8:28:16:4:8:28:17
chr16	88809434	.	A	G	111.81	PASS	AF=0.239437;AO=17;DP=72;FAO=17;FDP=71;FR=.;FRO=54;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=26;FSRR=28;FWDB=-0.0193949;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.3;QD=6.29932;RBI=0.0735327;REFB=-0.00962541;REVB=-0.0709288;RO=53;SAF=6;SAR=11;SRF=25;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150126;STB=0.600562;STBP=0.362;TYPE=snp;VARB=0.0461059;OID=.;OPOS=88809434;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:71:53:54:17:17:0.239437:11:6:25:28:11:6:26:28
chr16	88809454	.	G	A	125.21	PASS	AF=0.276923;AO=18;DP=66;FAO=18;FDP=65;FR=.;FRO=47;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=27;FWDB=-0.0280705;FXX=0.0151492;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.334;QD=7.70547;RBI=0.0295096;REFB=-0.0104162;REVB=-0.00910316;RO=47;SAF=7;SAR=11;SRF=20;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0454776;STB=0.5275;STBP=0.805;TYPE=snp;VARB=0.028094;OID=.;OPOS=88809454;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:65:47:47:18:18:0.276923:11:7:20:27:11:7:20:27
chr16	88809480	.	A	G	110.79	PASS	AF=0.28;AO=14;DP=51;FAO=14;FDP=50;FR=.;FRO=36;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=24;FWDB=-0.0676237;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.8152;QD=8.86315;RBI=0.0719821;REFB=-0.0164998;REVB=-0.0246671;RO=36;SAF=4;SAR=10;SRF=12;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0661507;STB=0.540481;STBP=0.764;TYPE=snp;VARB=0.0607395;OID=.;OPOS=88809480;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:50:36:36:14:14:0.28:10:4:12:24:10:4:12:24
chr16	88809686	.	T	C	172.85	PASS	AF=0.266667;AO=24;DP=90;FAO=24;FDP=90;FR=.;FRO=66;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=45;FSRR=21;FWDB=0.016087;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.7101;QD=7.68217;RBI=0.0298568;REFB=0.000914132;REVB=-0.0251522;RO=66;SAF=11;SAR=13;SRF=45;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.27036;STB=0.660494;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=-0.00387415;OID=.;OPOS=88809686;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:66:66:24:24:0.266667:13:11:45:21:13:11:45:21
chr16	88809773	.	G	C	1214.19	PASS	AF=1;AO=78;DP=78;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0390048;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.88;QD=61.478;RBI=0.0565064;REFB=0;REVB=0.0408853;RO=0;SAF=38;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.42134e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00011214;OID=.;OPOS=88809773;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:79:0:0:78:79:1:40:38:0:0:40:39:0:0
chr16	88872145	.	T	C	670.24	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0268508;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.8108;QD=62.3476;RBI=0.029979;REFB=0;REVB=-0.0133333;RO=0;SAF=18;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.65211e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00065474;OID=.;OPOS=88872145;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:25:18:0:0:25:18:0:0
chr16	88872229	.	A	G	280.97	PASS	AF=0.75;AO=24;DP=32;FAO=24;FDP=32;FR=.;FRO=8;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=0.0246449;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.743;QD=35.1218;RBI=0.0250512;REFB=0.00581551;REVB=-0.00449374;RO=8;SAF=8;SAR=16;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1984;STB=0.608603;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=-0.00115823;OID=.;OPOS=88872229;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:32:32:8:8:24:24:0.75:16:8:6:2:16:8:6:2
chr16	88872511	.	T	C	617.11	PASS	AF=1;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0451314;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.5;QD=61.7112;RBI=0.0574328;REFB=0;REVB=0.0355202;RO=0;SAF=25;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000734097;OID=.;OPOS=88872511;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:40:0:0:40:40:1:15:25:0:0:15:25:0:0
chr16	88874632	.	C	G	1013.86	PASS	AF=0.714286;AO=85;DP=118;FAO=85;FDP=119;FR=.;FRO=34;FSAF=43;FSAR=42;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=0.0204758;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.5017;QD=34.0794;RBI=0.0205203;REFB=0.0103679;REVB=-0.00135066;RO=33;SAF=43;SAR=42;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0583477;STB=0.535261;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=-0.00381696;OID=.;OPOS=88874632;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:118:119:33:34:85:85:0.714286:42:43:13:20:42:43:13:21
chr16	88884466	.	C	T	193.16	PASS	AF=0.59375;AO=19;DP=32;FAO=19;FDP=32;FR=.;FRO=13;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.031624;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.667;QD=24.1448;RBI=0.0328887;REFB=0.0204574;REVB=-0.00903274;RO=13;SAF=10;SAR=9;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.065238;STB=0.536386;STBP=0.67;TYPE=snp;VARB=-0.00978257;OID=.;OPOS=88884466;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:13:13:19:19:0.59375:9:10:8:5:9:10:8:5
chr16	88902183	.	G	A	208.6	PASS	AF=0.76;AO=19;DP=25;FAO=19;FDP=25;FR=.;FRO=6;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.0470311;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.842;QD=33.3758;RBI=0.0599997;REFB=-0.0480394;REVB=0.0372564;RO=6;SAF=9;SAR=10;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135721;STB=0.574392;STBP=0.215;TYPE=snp;VARB=0.00892883;OID=.;OPOS=88902183;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:25:25:6:6:19:19:0.76:10:9:1:5:10:9:1:5
chr16	88921634	.	C	A,G	512.9	PASS	AF=0.027027,0.945946;AO=2,34;DP=36;FAO=1,35;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=1,16;FSAR=0,19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0283701,0.0361941;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=24.4372,154.907;QD=55.4485;RBI=0.032443,0.0363141;REFB=-0.0222795,0.0929698;REVB=-0.0157379,0.00294991;RO=0;SAF=2,15;SAR=0,19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,4.40663e-08;STB=0.5,0.515143;STBP=1,0.311;TYPE=snp,snp;VARB=0.00338658,-0.000614012;OID=.,.;OPOS=88921634,88921634;OREF=C,C;OALT=A,G;OMAPALT=A,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:5:36:37:0:1:2,34:1,35:0.027027,0.945946:0,19:2,15:0:0:0,19:1,16:1:0
chr16	88951554	.	C	T	323.95	PASS	AF=0.622222;AO=28;DP=45;FAO=28;FDP=45;FR=.;FRO=17;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=0.0239854;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.1745;QD=28.7956;RBI=0.0446545;REFB=-0.0274921;REVB=-0.0376659;RO=17;SAF=14;SAR=14;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141547;STB=0.577724;STBP=0.204;TYPE=snp;VARB=0.019402;OID=.;OPOS=88951554;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:17:17:28:28:0.622222:14:14:5:12:14:14:5:12
chr16	88952474	.	G	C	41.36	PASS	AF=0.166667;AO=8;DP=42;FAO=7;FDP=42;FR=.;FRO=35;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=-0.00744629;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.5655;QD=3.93953;RBI=0.023008;REFB=-0.0115796;REVB=-0.0217697;RO=34;SAF=4;SAR=4;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0356191;STB=0.547808;STBP=0.8;TYPE=snp;VARB=0.0506805;OID=.;OPOS=88952474;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:42:42:34:35:8:7:0.166667:4:4:16:18:4:3:17:18
chr16	88964504	.	ATTTT	ATTT,ATTTC	31.1	PASS	AF=0.25,0;AO=10,2;DP=40;FAO=11,0;FDP=44;FR=.;FRO=33;FSAF=1,0;FSAR=10,0;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=-0.0448192,-0.0260959;FXX=0.0222173;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=13.2136,89.2727;QD=2.82739;RBI=0.116546,0.0472985;REFB=-0.144607,-0.0177843;REVB=-0.107584,-0.0394481;RO=25;SAF=1,0;SAR=9,2;SRF=10;SRR=15;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.472135,-0.44242;STB=0.806754,0.5;STBP=0.061,1;TYPE=del,snp;VARB=0.174594,0.111787;OID=.,.;OPOS=88964505,88964508;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=ATTT,ATTTC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.25,0:10,2:40:11,0:44:33:1,0:10,0:12:21:29:25:1,0:9,2:10:15
chr16	89167094	.	T	C	99.96	PASS	AF=0.461538;AO=12;DP=26;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=12;FWDB=0.0126097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.929;QD=15.3789;RBI=0.0411507;REFB=0.0232505;REVB=-0.0391711;RO=14;SAF=7;SAR=5;SRF=2;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.39572;STB=0.725286;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=-0.00961263;OID=.;OPOS=89167094;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:26:14:14:12:12:0.461538:5:7:2:12:5:7:2:12
chr16	89167138	.	G	C	111.93	PASS	AF=0.464286;AO=13;DP=29;FAO=13;FDP=28;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=12;FWDB=-0.0162673;FXX=0.0344709;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.1532;QD=15.9905;RBI=0.111478;REFB=-0.0274122;REVB=0.110285;RO=15;SAF=8;SAR=5;SRF=2;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.426609;STB=0.711745;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.0343511;OID=.;OPOS=89167138;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:28:15:15:13:13:0.464286:5:8:2:13:5:8:3:12
chr16	89167140	.	G	C	124.88	PASS	AF=0.5;AO=14;DP=28;FAO=14;FDP=28;FR=.;FRO=14;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=12;FWDB=0.0648339;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.4788;QD=17.8393;RBI=0.09993;REFB=-0.0164776;REVB=0.0760433;RO=14;SAF=9;SAR=5;SRF=2;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.416372;STB=0.735274;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.0101491;OID=.;OPOS=89167140;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:28:14:14:14:14:0.5:5:9:2:12:5:9:2:12
chr16	89167395	.	C	T	244.14	PASS	AF=0.547619;AO=23;DP=42;FAO=23;FDP=42;FR=.;FRO=19;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=0.0161081;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.4623;QD=23.2513;RBI=0.0252382;REFB=-0.00338625;REVB=0.0194292;RO=19;SAF=17;SAR=6;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.281565;STB=0.658168;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.00230757;OID=.;OPOS=89167395;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:19:19:23:23:0.547619:6:17:8:11:6:17:8:11
chr16	89167404	.	T	C	231.46	PASS	AF=0.564103;AO=21;DP=39;FAO=22;FDP=39;FR=.;FRO=17;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=-0.00726533;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.089;QD=23.7391;RBI=0.010345;REFB=-0.00471556;REVB=0.00736444;RO=17;SAF=16;SAR=5;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.2677;STB=0.62488;STBP=0.103;TYPE=snp;VARB=0.0043432;OID=.;OPOS=89167404;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:17:17:21:22:0.564103:5:16:8:9:6:16:8:9
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chr16	89238215	.	C	T	114.89	PASS	AF=0.225;AO=18;DP=80;FAO=18;FDP=80;FR=.;FRO=62;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=32;FSRR=30;FWDB=-0.0126757;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=274.71;QD=5.74447;RBI=0.0252067;REFB=-0.00600353;REVB=-0.0217877;RO=62;SAF=11;SAR=7;SRF=32;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119804;STB=0.574775;STBP=0.478;TYPE=snp;VARB=0.0210942;OID=.;OPOS=89238215;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:62:62:18:18:0.225:7:11:32:30:7:11:32:30
chr16	89245890	.	G	T	64.75	PASS	AF=0.310345;AO=8;DP=29;FAO=9;FDP=29;FR=.,HEALED;FRO=20;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.0141843;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.5385;QD=8.93132;RBI=0.08887;REFB=-0.0459196;REVB=-0.0877308;RO=14;SAF=4;SAR=4;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149874;STB=0.503867;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0977785;OID=.;OPOS=89245890;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:29:29:14:20:8:9:0.310345:4:4:9:5:4:5:11:9
chr16	89245955	.	C	T	189.15	PASS	AF=0.666667;AO=18;DP=28;FAO=18;FDP=27;FR=.;FRO=9;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=-0.016529;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.9443;QD=28.0214;RBI=0.0171077;REFB=-0.0230677;REVB=0.00441212;RO=9;SAF=10;SAR=8;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132849;STB=0.573689;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.0167574;OID=.;OPOS=89245955;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:28:27:9:9:18:18:0.666667:8:10:3:6:8:10:3:6
chr16	89246670	.	T	C	306.28	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00470102;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.954;QD=53.2662;RBI=0.00522953;REFB=0;REVB=0.00229094;RO=0;SAF=14;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.84921e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.20584e-05;OID=.;OPOS=89246670;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:9:14:0:0:9:14:0:0
chr16	89251776	.	G	A	51.49	PASS	AF=0.222222;AO=8;DP=36;FAO=8;FDP=36;FR=.;FRO=28;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=21;FWDB=0.0110427;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.578;QD=5.72056;RBI=0.0138218;REFB=-0.0012134;REVB=0.00831265;RO=28;SAF=4;SAR=4;SRF=7;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.309358;STB=0.694032;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=0.00428844;OID=.;OPOS=89251776;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:51:36:36:28:28:8:8:0.222222:4:4:7:21:4:4:7:21
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chr16	89251832	.	C	T	240.25	PASS	AF=0.909091;AO=20;DP=22;FAO=20;FDP=22;FR=.;FRO=2;FSAF=2;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00306125;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.439;QD=43.682;RBI=0.010796;REFB=-0.0191509;REVB=-0.0103529;RO=2;SAF=2;SAR=18;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158199;STB=0.586858;STBP=0.127;TYPE=snp;VARB=0.00545884;OID=.;OPOS=89251832;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:22:22:2:2:20:20:0.909091:18:2:1:1:18:2:1:1
chr16	89251851	.	A	G	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0520852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.2406;QD=46.8479;RBI=0.0607373;REFB=0;REVB=-0.0312433;RO=0;SAF=2;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00338638;OID=.;OPOS=89251851;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:13:2:0:0:13:2:0:0
chr16	89259993	.	A	G	728.88	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0446955;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.4349;QD=57.1672;RBI=0.0941579;REFB=0;REVB=-0.0828736;RO=0;SAF=20;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.13361e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00156412;OID=.;OPOS=89259993;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:31:20:0:0:31:20:0:0
chr16	89261482	.	C	A	218.57	PASS	AF=0.714286;AO=20;DP=28;FAO=20;FDP=28;FR=.;FRO=8;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.0149902;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.053;QD=31.224;RBI=0.0820019;REFB=-0.0406169;REVB=0.0806202;RO=7;SAF=11;SAR=9;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0574354;STB=0.54995;STBP=0.441;TYPE=snp;VARB=0.0101013;OID=.;OPOS=89261482;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:28:28:7:8:20:20:0.714286:9:11:3:4:9:11:3:5
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chr16	89265095	.	C	T	280.85	PASS	AF=0.625;AO=25;DP=40;FAO=25;FDP=40;FR=.;FRO=15;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=4;FWDB=0.0084361;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=289.723;QD=28.0853;RBI=0.0214275;REFB=-0.00610995;REVB=0.0196969;RO=14;SAF=17;SAR=8;SRF=11;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.081954;STB=0.523346;STBP=0.719;TYPE=snp;VARB=0.00328115;OID=.;OPOS=89265095;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:14:15:25:25:0.625:8:17:11:3:8:17:11:4
chr16	89265101	.	C	A,T	553.0	PASS	AF=0.684211,0.315789;AO=26,12;DP=38;FAO=26,12;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=17,10;FSAR=9,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0135437,0.00875935;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=114.408,124.557;QD=58.211;RBI=0.0296652,0.0193197;REFB=0,0;REVB=0.026393,0.0172199;RO=0;SAF=17,10;SAR=9,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00481667,0.0113786;OID=.,.;OPOS=89265101,89265101;OREF=C,C;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:93:38:38:0:0:26,12:26,12:0.684211,0.315789:9,2:17,10:0:0:9,2:17,10:0:0
chr16	89265466	.	A	G	260.41	PASS	AF=1;AO=20;DP=21;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0574962;FXX=0.0475964;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.5414;QD=52.0821;RBI=0.0575448;REFB=0;REVB=-0.00236613;RO=0;SAF=7;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000982005;OID=.;OPOS=89265466;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:20:0:0:20:20:1:13:7:0:0:13:7:0:0
chr16	89291210	.	G	GGTGA	274.87	PASS	AF=0.821429;AO=23;DP=28;FAO=23;FDP=28;FR=.;FRO=5;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0162496;FXX=0;HRUN=2;LEN=4;MLLD=338.88;QD=39.2673;RBI=0.016534;REFB=0.0209265;REVB=0.00305354;RO=5;SAF=15;SAR=8;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154717;STB=0.58434;STBP=0.077;TYPE=ins;VARB=-0.00662797;OID=.;OPOS=89291211;OREF=-;OALT=GTGA;OMAPALT=GGTGA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.821429:23:28:23:28:5:15:8:1:4:27:5:15:8:1:4
chr16	89291951	.	C	T	501.66	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0254214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.629;QD=59.0187;RBI=0.025471;REFB=0;REVB=-0.00158966;RO=0;SAF=17;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.86455e-05;OID=.;OPOS=89291951;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:17:17:0:0:17:17:0:0
chr16	89293271	.	A	C	127.2	PASS	AF=0.340909;AO=15;DP=44;FAO=15;FDP=44;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.0174327;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=209.959;QD=11.5638;RBI=0.0249096;REFB=-0.00885587;REVB=-0.017793;RO=29;SAF=9;SAR=6;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13133;STB=0.577877;STBP=0.454;TYPE=snp;VARB=0.0180666;OID=.;OPOS=89293271;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:29:29:15:15:0.340909:6:9:14:15:6:9:14:15
chr16	89293614	.	A	G	689.38	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0210294;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=365.388;QD=62.6711;RBI=0.0223717;REFB=0;REVB=-0.00763242;RO=0;SAF=27;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.54734e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.05744e-05;OID=.;OPOS=89293614;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:17:27:0:0:17:27:0:0
chr16	89293730	.	C	T	69.28	PASS	AF=0.888889;AO=8;DP=9;FAO=8;FDP=9;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0200301;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.741;QD=30.7904;RBI=0.0646921;REFB=-0.0561571;REVB=-0.0615131;RO=1;SAF=6;SAR=2;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174483;STB=0.599732;STBP=0.245;TYPE=snp;VARB=0.00109461;OID=.;OPOS=89293730;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:9:9:1:1:8:8:0.888889:2:6:0:1:2:6:0:1
chr16	89294184	.	G	A	358.13	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0221026;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.013;QD=55.097;RBI=0.0222687;REFB=0;REVB=0.00271505;RO=0;SAF=9;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000154324;OID=.;OPOS=89294184;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:17:9:0:0:17:9:0:0
chr16	89294511	.	C	T	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00472089;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=264.954;QD=40.7629;RBI=0.00996219;REFB=0;REVB=0.00877259;RO=0;SAF=3;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.74118e-05;OID=.;OPOS=89294511;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:7:3:0:0:7:3:0:0
chr16	89294595	.	C	T	56.68	PASS	AF=0.307692;AO=8;DP=27;FAO=8;FDP=26;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.00373784;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.068;QD=8.72063;RBI=0.0283767;REFB=-0.0178364;REVB=0.0281294;RO=18;SAF=6;SAR=2;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.298001;STB=0.687004;STBP=0.236;TYPE=snp;VARB=0.0403455;OID=.;OPOS=89294595;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:27:26:18:18:8:8:0.307692:2:6:9:9:2:6:9:9
chr16	89294697	.	C	T	54.85	PASS	AF=0.296296;AO=8;DP=28;FAO=8;FDP=27;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.0528679;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.9897;QD=8.12557;RBI=0.054773;REFB=0.0210959;REVB=-0.0143203;RO=19;SAF=5;SAR=3;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171661;STB=0.607206;STBP=0.484;TYPE=snp;VARB=-0.0221044;OID=.;OPOS=89294697;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:28:27:19:19:8:8:0.296296:3:5:9:10:3:5:9:10
chr16	89294827	.	A	G	239.52	PASS	AF=0.777778;AO=21;DP=27;FAO=21;FDP=27;FR=.;FRO=6;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=-0.0319702;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.0887;QD=35.4846;RBI=0.0356289;REFB=-0.0550347;REVB=-0.0157267;RO=6;SAF=12;SAR=9;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110662;STB=0.560384;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=0.0159982;OID=.;OPOS=89294827;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:27:27:6:6:21:21:0.777778:9:12:5:1:9:12:5:1
chr16	89300008	.	AT	GC	33.48	PASS	AF=0.714286;AO=5;DP=7;FAO=5;FDP=7;FR=.;FRO=2;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0821066;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=168.531;QD=19.1341;RBI=0.128722;REFB=-0.026582;REVB=-0.099135;RO=2;SAF=2;SAR=3;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0491618;STB=0.529293;STBP=0.911;TYPE=mnp;VARB=0.00553561;OID=.;OPOS=89300008;OREF=AT;OALT=GC;OMAPALT=GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:7:7:2:2:5:5:0.714286:3:2:1:1:3:2:1:1
chr16	89300015	.	A	G	82.12	PASS	AF=0.9;AO=9;DP=10;FAO=9;FDP=10;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00685439;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.451;QD=32.8465;RBI=0.0436699;REFB=-0.126469;REVB=0.0431286;RO=1;SAF=6;SAR=3;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0684198;STB=0.538378;STBP=0.622;TYPE=snp;VARB=0.00748113;OID=.;OPOS=89300015;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:10:10:1:1:9:9:0.9:3:6:1:0:3:6:1:0
chr16	89300029	.	TCA	T	43.68	PASS	AF=0.75;AO=6;DP=8;FAO=6;FDP=8;FR=.;FRO=2;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0594011;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=265.429;QD=21.8421;RBI=0.0805708;REFB=-0.0222879;REVB=0.054435;RO=2;SAF=4;SAR=2;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0772509;STB=0.545299;STBP=0.798;TYPE=del;VARB=0.00982661;OID=.;OPOS=89300030;OREF=CA;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.75:6:8:6:8:2:4:2:1:1:10:2:4:2:1:1
chr16	89300147	.	A	G	54.74	PASS	AF=0.777778;AO=7;DP=9;FAO=7;FDP=9;FR=.;FRO=2;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.137085;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.4528;QD=24.3275;RBI=0.139531;REFB=-0.0442611;REVB=0.0260084;RO=2;SAF=2;SAR=5;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145918;STB=0.583115;STBP=0.62;TYPE=snp;VARB=0.0382265;OID=.;OPOS=89300147;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:9:9:2:2:7:7:0.777778:5:2:0:2:5:2:0:2
chr16	89300182	.	A	G	35.03	PASS	AF=0.833333;AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0291156;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.085;QD=23.3524;RBI=0.0830543;REFB=-0.195791;REVB=0.0777836;RO=1;SAF=1;SAR=4;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0951258;STB=0.555346;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=0.0248674;OID=.;OPOS=89300182;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:6:6:1:1:5:5:0.833333:4:1:0:1:4:1:0:1
chr16	89350178	.	G	A	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.013775;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=242.744;QD=55.6561;RBI=0.0141919;REFB=0;REVB=-0.00341476;RO=0;SAF=11;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.733e-05;OID=.;OPOS=89350178;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:16:11:0:0:16:11:0:0
chr16	89590168	.	T	C,TATCTC	612.71	PASS	AF=0.0816327,0.836735;AO=5,38;DP=50;FAO=4,41;FDP=49;FR=.;FRO=4;FSAF=2,23;FSAR=2,18;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.00582753,-0.0134399;FXX=0;HRUN=2,1;LEN=1,5;MLLD=92.0528,233.669;QD=50.0171;RBI=0.015366,0.0148018;REFB=-0.0388638,-0.0818585;REVB=-0.0142181,-0.00620188;RO=7;SAF=2,21;SAR=3,17;SRF=5;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.286688,-0.0476005;STB=0.624412,0.517119;STBP=0.615,0.54;TYPE=snp,ins;VARB=0.0136687,0.00113867;OID=.,.;OPOS=89590168,89590169;OREF=T,-;OALT=C,ATCTC;OMAPALT=C,TATCTC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:20:50:49:7:4:5,38:4,41:0.0816327,0.836735:3,17:2,21:5:2:2,18:2,23:3:1
chr16	89590243	.	G	A	454.04	PASS	AF=0.969697;AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=33;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0140233;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.126;QD=55.0353;RBI=0.0217497;REFB=-0.141537;REVB=0.0166252;RO=1;SAF=18;SAR=14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0252339;STB=0.513505;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.00144402;OID=.;OPOS=89590243;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:33:33:1:1:32:32:0.969697:14:18:1:0:14:18:1:0
chr16	89653999	.	TTGAG	T	217.84	PASS	AF=0.705882;AO=23;DP=35;FAO=24;FDP=34;FR=.;FRO=10;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=0;FWDB=-0.016536;FXX=0.0285633;HRUN=3;LEN=4;MLLD=256.145;QD=25.6288;RBI=0.0253847;REFB=-0.0246749;REVB=0.01926;RO=9;SAF=9;SAR=14;SRF=9;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.304917;STB=0.666536;STBP=0.007;TYPE=del;VARB=0.00776987;OID=.;OPOS=89654000;OREF=TGAG;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.705882:23:35:24:34:10:10:14:10:0:51:9:9:14:9:0
chr16	89662990	.	T	C	429.01	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0314538;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.4046;QD=57.2016;RBI=0.0462166;REFB=0;REVB=-0.033862;RO=0;SAF=9;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00146358;OID=.;OPOS=89662990;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:21:9:0:0:21:9:0:0
chr16	89663025	.	C	T	218.43	PASS	AF=0.826087;AO=19;DP=24;FAO=19;FDP=23;FR=.;FRO=4;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.00163685;FXX=0.0416493;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.99;QD=37.9885;RBI=0.0356913;REFB=-0.0745543;REVB=-0.0356537;RO=4;SAF=6;SAR=13;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.065758;STB=0.536044;STBP=0.486;TYPE=snp;VARB=0.0163541;OID=.;OPOS=89663025;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:24:23:4:4:19:19:0.826087:13:6:2:2:13:6:2:2
chr16	89712374	.	A	C	71.67	PASS	AF=0.6;AO=9;DP=15;FAO=9;FDP=15;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0117443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.901;QD=19.1115;RBI=0.0117796;REFB=-0.021329;REVB=0.00091113;RO=4;SAF=5;SAR=4;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0300734;STB=0.588041;STBP=0.464;TYPE=snp;VARB=0.0126814;OID=.;OPOS=89712374;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:15:15:4:6:9:9:0.6:4:5:2:2:4:5:2:4
chr16	89712380	.	G	A	71.66	PASS	AF=0.6;AO=9;DP=15;FAO=9;FDP=15;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.00758248;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.028;QD=19.1084;RBI=0.0434423;REFB=-0.0526492;REVB=-0.0427754;RO=6;SAF=5;SAR=4;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152681;STB=0.588041;STBP=0.464;TYPE=snp;VARB=0.0205673;OID=.;OPOS=89712380;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:15:15:6:6:9:9:0.6:4:5:2:4:4:5:2:4
chr16	89713563	.	C	G	250.19	PASS	AF=0.605263;AO=23;DP=38;FAO=23;FDP=38;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.0496057;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.484;QD=26.3358;RBI=0.0496065;REFB=-0.0342852;REVB=-0.000267382;RO=15;SAF=6;SAR=17;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171482;STB=0.595599;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=0.0186623;OID=.;OPOS=89713563;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:15:15:23:23:0.605263:17:6:7:8:17:6:7:8
chr16	89724313	.	C	G	96.64	PASS	AF=0.647059;AO=6;DP=18;FAO=11;FDP=17;FR=.,HEALED;FRO=6;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.00619816;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.669;QD=22.7399;RBI=0.286495;REFB=-0.0232048;REVB=0.286428;RO=7;SAF=3;SAR=3;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191087;STB=0.650873;STBP=0.137;TYPE=snp;VARB=0.0345024;OID=.;OPOS=89724313;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:18:17:7:6:6:11:0.647059:3:3:5:2:8:3:4:2
chr16	89760652	.	C	T	94.71	PASS	AF=0.342857;AO=12;DP=35;FAO=12;FDP=35;FR=.;FRO=23;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.0243446;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.906;QD=10.8245;RBI=0.024803;REFB=-0.015529;REVB=0.0047463;RO=23;SAF=4;SAR=8;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.211998;STB=0.627234;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.0289931;OID=.;OPOS=89760652;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:35:35:23:23:12:12:0.342857:8:4:12:11:8:4:12:11
chr16	89760691	.	G	C	85.77	PASS	AF=0.37931;AO=11;DP=29;FAO=11;FDP=29;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=0.017241;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.629;QD=11.8305;RBI=0.0182906;REFB=-0.0238705;REVB=-0.00610692;RO=17;SAF=5;SAR=6;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195548;STB=0.596102;STBP=0.456;TYPE=snp;VARB=0.0211642;OID=.;OPOS=89760691;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:29:29:17:18:11:11:0.37931:6:5:11:6:6:5:11:7
chr16	89760712	.	G	A	108.0	PASS	AF=0.393939;AO=13;DP=33;FAO=13;FDP=33;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.00740425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.765;QD=13.0911;RBI=0.01138;REFB=-0.0203411;REVB=-0.00864182;RO=20;SAF=6;SAR=7;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0910385;STB=0.553406;STBP=0.634;TYPE=snp;VARB=0.0263761;OID=.;OPOS=89760712;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:20:20:13:13:0.393939:7:6:11:9:7:6:11:9
chr16	89762432	.	C	G	473.2	PASS	AF=0.788462;AO=30;DP=52;FAO=41;FDP=52;FR=.,HEALED;FRO=11;FSAF=15;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=11;FWDB=0.00306929;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=185.183;QD=36.4004;RBI=0.0373002;REFB=-0.0739583;REVB=-0.0371737;RO=5;SAF=14;SAR=16;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125464;STB=0.587262;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.00717729;OID=.;OPOS=89762432;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:52:52:5:11:30:41:0.788462:16:14:0:5:26:15:0:11
chr16	89763214	.	T	C	84.96	PASS	AF=0.235294;AO=11;DP=50;FAO=12;FDP=51;FR=.;FRO=39;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=26;FSRR=13;FWDB=-0.00702546;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.9481;QD=6.66357;RBI=0.0165569;REFB=-0.00594818;REVB=-0.0149925;RO=38;SAF=5;SAR=6;SRF=26;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.27836;STB=0.68426;STBP=0.184;TYPE=snp;VARB=0.0269957;OID=.;OPOS=89763214;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:50:51:38:39:11:12:0.235294:6:5:26:12:7:5:26:13
chr16	89777761	.	C	T	93.39	PASS	AF=0.315789;AO=12;DP=38;FAO=12;FDP=38;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.0185858;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.017;QD=9.8303;RBI=0.0194518;REFB=-0.011175;REVB=0.00573953;RO=26;SAF=6;SAR=6;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.04353;STB=0.526272;STBP=0.845;TYPE=snp;VARB=0.0230993;OID=.;OPOS=89777761;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:93:38:38:26:26:12:12:0.315789:6:6:12:14:6:6:12:14
chr16	89782989	.	A	G	43.4	PASS	AF=0.233333;AO=7;DP=30;FAO=7;FDP=30;FR=.;FRO=23;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.128086;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.2453;QD=5.78722;RBI=0.136977;REFB=-0.0117147;REVB=-0.0485449;RO=23;SAF=3;SAR=4;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0588231;STB=0.538351;STBP=0.775;TYPE=snp;VARB=0.0178353;OID=.;OPOS=89782989;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:30:30:23:23:7:7:0.233333:4:3:11:12:4:3:11:12
chr16	89783187	.	C	T	441.4	PASS	AF=1;AO=30;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00966482;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.2587;QD=56.9549;RBI=0.0155933;REFB=0;REVB=0.012237;RO=0;SAF=15;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000614867;OID=.;OPOS=89783187;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:30:31:1:15:15:0:0:15:16:0:0
chr16	89785603	.	A	C	271.21	PASS	AF=0.793103;AO=23;DP=29;FAO=23;FDP=29;FR=.;FRO=6;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0104588;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.788;QD=37.408;RBI=0.0246302;REFB=-0.0426169;REVB=-0.0222994;RO=6;SAF=8;SAR=15;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127356;STB=0.569558;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=0.00951965;OID=.;OPOS=89785603;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:29:29:6:6:23:23:0.793103:15:8:4:2:15:8:4:2
chr16	89789898	.	T	C	162.21	PASS	AF=0.305556;AO=22;DP=72;FAO=22;FDP=72;FR=.;FRO=50;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=28;FSRR=22;FWDB=-0.0420184;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.748;QD=9.01167;RBI=0.0458452;REFB=-0.00618992;REVB=-0.0183367;RO=47;SAF=9;SAR=13;SRF=26;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166117;STB=0.604177;STBP=0.246;TYPE=snp;VARB=0.00963892;OID=.;OPOS=89789898;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:47:50:22:22:0.305556:13:9:26:21:13:9:28:22
chr16	89799804	.	A	C	41.82	PASS	AF=0.179487;AO=7;DP=39;FAO=7;FDP=39;FR=.;FRO=32;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=0.0310864;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.482;QD=4.28888;RBI=0.0317329;REFB=0.0058525;REVB=-0.00637292;RO=32;SAF=4;SAR=3;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196656;STB=0.632727;STBP=0.456;TYPE=snp;VARB=-0.0169852;OID=.;OPOS=89799804;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:39:39:32:32:7:7:0.179487:3:4:13:19:3:4:13:19
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chr16	89805914	.	T	C	539.05	PASS	AF=0.803571;AO=45;DP=56;FAO=45;FDP=56;FR=.;FRO=11;FSAF=17;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=10;FWDB=-0.0447236;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.8878;QD=38.5035;RBI=0.045751;REFB=0.0325322;REVB=-0.0096411;RO=11;SAF=17;SAR=28;SRF=1;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115284;STB=0.561713;STBP=0.081;TYPE=snp;VARB=-0.00973453;OID=.;OPOS=89805914;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:69:56:56:11:11:45:45:0.803571:28:17:1:10:28:17:1:10
chr16	89806343	.	C	A	176.25	PASS	AF=0.708333;AO=17;DP=24;FAO=17;FDP=24;FR=.;FRO=7;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=-0.00483242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=354.387;QD=29.3742;RBI=0.0136307;REFB=0.00156612;REVB=-0.0127453;RO=7;SAF=10;SAR=7;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159073;STB=0.588131;STBP=0.214;TYPE=snp;VARB=-0.000640131;OID=.;OPOS=89806343;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:24:24:7:7:17:17:0.708333:7:10:2:5:7:10:2:5
chr16	89806347	.	A	T	306.31	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0133472;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.7893;QD=53.2718;RBI=0.0180723;REFB=0;REVB=-0.0121843;RO=0;SAF=11;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000395063;OID=.;OPOS=89806347;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:12:11:0:0:12:11:0:0
chr16	89807233	.	C	G	437.84	PASS	AF=0.755556;AO=34;DP=45;FAO=34;FDP=45;FR=.;FRO=11;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=0.005054;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.942;QD=38.919;RBI=0.00811021;REFB=-0.0269787;REVB=0.00634291;RO=11;SAF=14;SAR=20;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102487;STB=0.555523;STBP=0.22;TYPE=snp;VARB=0.0081733;OID=.;OPOS=89807233;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:79:45:45:11:11:34:34:0.755556:20:14:7:4:20:14:7:4
chr16	89809319	.	T	C	49.77	PASS	AF=0.4375;AO=7;DP=17;FAO=7;FDP=16;FR=.,HEALED;FRO=9;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=1;FWDB=0.00450802;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.6911;QD=12.4433;RBI=0.0968015;REFB=-0.0809941;REVB=0.0966965;RO=8;SAF=5;SAR=2;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196457;STB=0.633826;STBP=0.471;TYPE=snp;VARB=0.014933;OID=.;OPOS=89809319;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:17:16:8:9:7:7:0.4375:2:5:7:1:2:5:8:1
chr16	89825065	.	G	A	447.36	PASS	AF=1;AO=25;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0192211;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.9054;QD=57.7242;RBI=0.188107;REFB=0;REVB=0.187122;RO=0;SAF=19;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.003567;OID=.;OPOS=89825065;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:25:31:1:6:19:0:0:11:20:0:0
chr16	89828437	.	A	G	447.03	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0387377;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=219.739;QD=57.6807;RBI=0.0671166;REFB=0;REVB=0.054809;RO=0;SAF=14;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000366048;OID=.;OPOS=89828437;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:17:14:0:0:17:14:0:0
chr16	89836323	.	C	T	88.22	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0234074;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.57;QD=39.2068;RBI=0.0336865;REFB=0;REVB=0.0242255;RO=0;SAF=3;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00108637;OID=.;OPOS=89836323;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:6:3:0:0:6:3:0:0
chr16	89839766	.	G	C	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00213891;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=245.899;QD=45.8068;RBI=0.00321989;REFB=0;REVB=-0.00240682;RO=0;SAF=3;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.46986e-05;OID=.;OPOS=89839766;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:11:3:0:0:11:3:0:0
chr16	89845194	.	A	G	289.35	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00772054;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.781;QD=52.6095;RBI=0.0325819;REFB=0;REVB=-0.031654;RO=0;SAF=11;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000262924;OID=.;OPOS=89845194;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:11:11:0:0:11:11:0:0
chr16	89849480	.	C	T	105.86	PASS	AF=0.6;AO=12;DP=20;FAO=12;FDP=20;FR=.;FRO=8;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.00321952;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.3775;QD=21.1719;RBI=0.0770126;REFB=-0.0370081;REVB=-0.0769452;RO=8;SAF=10;SAR=2;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.216214;STB=0.624765;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=0.0324681;OID=.;OPOS=89849480;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:20:20:8:8:12:12:0.6:2:10:5:3:2:10:5:3
chr16	89857935	.	G	A	103.51	PASS	AF=0.545455;AO=12;DP=22;FAO=12;FDP=22;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=9;FWDB=0.0149161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.4422;QD=18.8207;RBI=0.0238918;REFB=-0.0116055;REVB=-0.0186635;RO=10;SAF=3;SAR=9;SRF=1;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177265;STB=0.599854;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.0194427;OID=.;OPOS=89857935;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:22:22:10:10:12:12:0.545455:9:3:1:9:9:3:1:9
chr16	89858417	.	C	A	135.77	PASS	AF=0.7;AO=14;DP=20;FAO=14;FDP=20;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.00351617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=295.519;QD=27.1542;RBI=0.00523767;REFB=0.0112596;REVB=0.00388197;RO=6;SAF=4;SAR=10;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0816321;STB=0.545392;STBP=0.648;TYPE=snp;VARB=-0.00435175;OID=.;OPOS=89858417;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:20:20:6:6:14:14:0.7:10:4:1:5:10:4:1:5
chr16	89866043	.	T	C	429.0	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0645217;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.701;QD=57.2003;RBI=0.0758961;REFB=0;REVB=0.0399645;RO=0;SAF=14;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.56309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000556295;OID=.;OPOS=89866043;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:16:14:0:0:16:14:0:0
chr16	89916879	.	C	CGAG	158.22	PASS	AF=0.592593;AO=14;DP=36;FAO=16;FDP=27;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.0491537;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=3;MLLD=228.976;QD=23.4395;RBI=0.0493656;REFB=-0.00796249;REVB=0.0045692;RO=21;SAF=3;SAR=11;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.26417;STB=0.523779;STBP=0.782;TYPE=ins;VARB=0.00701119;OID=.;OPOS=89916880;OREF=-;OALT=GAG;OMAPALT=CGAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.592593:14:36:16:27:11:5:11:4:7:87:21:3:11:9:12
chr16	89920957	.	A	G	177.43	PASS	AF=0.888889;AO=16;DP=18;FAO=16;FDP=18;FR=.;FRO=2;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00652793;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.3571;QD=39.4284;RBI=0.0467921;REFB=0.0136636;REVB=-0.0463345;RO=2;SAF=6;SAR=10;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0267697;STB=0.514687;STBP=0.772;TYPE=snp;VARB=-0.00418266;OID=.;OPOS=89920957;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:18:18:2:2:16:16:0.888889:10:6:1:1:10:6:1:1
chr16	89954138	.	G	C	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0706743;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.8615;QD=52.6129;RBI=0.072809;REFB=0;REVB=-0.0175012;RO=0;SAF=8;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00144669;OID=.;OPOS=89954138;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:14:8:0:0:14:8:0:0
chr16	89965055	.	G	A	594.53	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0123083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.187;QD=60.9779;RBI=0.0128618;REFB=0;REVB=0.00373257;RO=0;SAF=19;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.3303e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000116672;OID=.;OPOS=89965055;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:20:19:0:0:20:19:0:0
chr16	89985940	.	G	A	715.63	PASS	AF=1;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0287149;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.282;QD=57.2506;RBI=0.0289289;REFB=0;REVB=-0.00351207;RO=0;SAF=29;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.20481e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00011707;OID=.;OPOS=89985940;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:50:0:0:50:50:1:21:29:0:0:21:29:0:0
chr16	89986608	.	A	G	635.91	PASS	AF=1;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00428614;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.454;QD=62.0403;RBI=0.0137813;REFB=0;REVB=-0.0130978;RO=0;SAF=13;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000156472;OID=.;OPOS=89986608;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:41:0:0:41:41:1:28:13:0:0:28:13:0:0
chr16	89986760	.	A	G	1063.63	PASS	AF=0.973333;AO=47;DP=74;FAO=73;FDP=75;FR=.;FRO=2;FSAF=17;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00557935;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.4149;QD=56.7271;RBI=0.0398546;REFB=-0.15314;REVB=-0.0394622;RO=0;SAF=17;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50877;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.00329487;OID=.;OPOS=89986760;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:74:75:0:2:47:73:0.973333:30:17:0:0:56:17:0:2
chr16	89987201	.	A	G	288.77	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00769842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.7203;QD=52.503;RBI=0.00784519;REFB=0;REVB=0.0015104;RO=0;SAF=15;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.79751e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000128829;OID=.;OPOS=89987201;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:7:15:0:0:7:15:0:0
chr16	90025640	.	G	C	95.35	PASS	AF=0.909091;AO=10;DP=11;FAO=10;FDP=11;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0191071;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.181;QD=34.6737;RBI=0.0226065;REFB=-0.109059;REVB=0.0120819;RO=0;SAF=5;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.545364;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.00664321;OID=.;OPOS=90025640;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:11:11:0:1:10:10:0.909091:5:5:0:0:5:5:1:0
chr16	90038369	.	A	G	465.06	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00434757;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.1039;QD=58.1323;RBI=0.0226988;REFB=0;REVB=0.0222786;RO=0;SAF=13;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000286044;OID=.;OPOS=90038369;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:19:13:0:0:19:13:0:0
chr16	90038647	.	A	G	520.03	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0461894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.104;QD=59.4321;RBI=0.0478792;REFB=0;REVB=-0.0126076;RO=0;SAF=18;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000171351;OID=.;OPOS=90038647;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:17:18:0:0:17:18:0:0
chr16	90038786	.	C	A	483.35	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.017417;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=279.425;QD=58.5878;RBI=0.0174398;REFB=0;REVB=0.000891189;RO=0;SAF=3;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.29681e-05;OID=.;OPOS=90038786;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:30:3:0:0:30:3:0:0
chr16	90048327	.	G	A	728.98	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0173269;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.273;QD=57.1748;RBI=0.0227115;REFB=0;REVB=0.0146831;RO=0;SAF=20;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.13361e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.32027e-06;OID=.;OPOS=90048327;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:31:20:0:0:31:20:0:0
chr16	90075226	.	C	T	236.85	PASS	AF=0.292035;AO=33;DP=113;FAO=33;FDP=113;FR=.;FRO=80;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=31;FSRR=49;FWDB=0.000944108;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=256.052;QD=8.38415;RBI=0.00591029;REFB=-0.00815045;REVB=-0.0058344;RO=80;SAF=14;SAR=19;SRF=31;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0455563;STB=0.526824;STBP=0.73;TYPE=snp;VARB=0.0202995;OID=.;OPOS=90075226;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:113:80:80:33:33:0.292035:19:14:31:49:19:14:31:49
chr16	90095484	.	C	T	463.79	PASS	AF=0.688525;AO=42;DP=61;FAO=42;FDP=61;FR=.;FRO=19;FSAF=15;FSAR=27;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=-0.010586;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=209.186;QD=30.4123;RBI=0.0106439;REFB=-0.0373241;REVB=0.00110896;RO=17;SAF=15;SAR=27;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00243657;STB=0.503815;STBP=0.949;TYPE=snp;VARB=0.0174456;OID=.;OPOS=90095484;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:17:19:42:42:0.688525:27:15:6:11:27:15:7:12
chr16	90096052	.	CCTT	C	360.94	PASS	AF=0.730769;AO=37;DP=58;FAO=38;FDP=52;FR=.;FRO=14;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=0.0123066;FXX=0.10343;HRUN=2;LEN=3;MLLD=231.649;QD=27.7647;RBI=0.0157094;REFB=-0.0105384;REVB=0.00976378;RO=11;SAF=15;SAR=22;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0184507;STB=0.537796;STBP=0.383;TYPE=del;VARB=0.00328922;OID=.;OPOS=90096053;OREF=CTT;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.730769:37:58:38:52:14:16:22:4:10:65:11:15:22:4:7
chr16	90097748	.	C	T	71.63	PASS	AF=0.6;AO=9;DP=15;FAO=9;FDP=15;FR=.;FRO=6;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0160569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.0479;QD=19.1011;RBI=0.0253793;REFB=0.0551571;REVB=-0.0196541;RO=6;SAF=7;SAR=2;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102872;STB=0.559859;STBP=0.666;TYPE=snp;VARB=-0.0245523;OID=.;OPOS=90097748;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:15:15:6:6:9:9:0.6:2:7:4:2:2:7:4:2
chr16	90103087	.	C	T	114.27	PASS	AF=0.311111;AO=14;DP=45;FAO=14;FDP=45;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=22;FWDB=-0.0340693;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=265.876;QD=10.1573;RBI=0.0343119;REFB=-0.0225849;REVB=-0.00407284;RO=31;SAF=10;SAR=4;SRF=9;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.461905;STB=0.773452;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.0308224;OID=.;OPOS=90103087;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:31:31:14:14:0.311111:4:10:9:22:4:10:9:22
chr16	90103117	.	G	A	82.6	PASS	AF=0.234043;AO=11;DP=48;FAO=11;FDP=47;FR=.;FRO=36;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=24;FWDB=0.00869642;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.455;QD=7.02977;RBI=0.015024;REFB=-0.00727619;REVB=0.0122512;RO=34;SAF=7;SAR=4;SRF=11;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.36297;STB=0.720221;STBP=0.125;TYPE=snp;VARB=0.00853183;OID=.;OPOS=90103117;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:82:48:47:34:36:11:11:0.234043:4:7:11:23:4:7:12:24
chr16	90103659	.	G	A	60.27	PASS	AF=0.225;AO=9;DP=40;FAO=9;FDP=40;FR=.;FRO=31;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=-0.0187621;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.824;QD=6.02724;RBI=0.0203529;REFB=-0.00720656;REVB=0.00788821;RO=31;SAF=6;SAR=3;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.32821;STB=0.709231;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=0.0223947;OID=.;OPOS=90103659;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:60:40:40:31:31:9:9:0.225:3:6:12:19:3:6:12:19
chr16	90106746	.	C	T	41.21	PASS	AF=0.162791;AO=7;DP=43;FAO=7;FDP=43;FR=.;FRO=36;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=27;FSRR=9;FWDB=0.0506588;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.33;QD=3.83306;RBI=0.0510144;REFB=0.000749952;REVB=0.00601261;RO=36;SAF=4;SAR=3;SRF=27;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.238678;STB=0.659183;STBP=0.412;TYPE=snp;VARB=-0.00165933;OID=.;OPOS=90106746;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:43:43:36:36:7:7:0.162791:3:4:27:9:3:4:27:9
chr16	90109711	.	A	G	115.97	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0992453;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.256;QD=42.1691;RBI=0.102935;REFB=0;REVB=-0.0273123;RO=0;SAF=3;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00373694;OID=.;OPOS=90109711;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:8:3:0:0:8:3:0:0
chr16	90110027	.	G	A	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00917746;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.312;QD=51.9167;RBI=0.0224257;REFB=0;REVB=0.0204618;RO=0;SAF=12;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.73926e-05;OID=.;OPOS=90110027;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:9:12:0:0:9:12:0:0
chr16	90110284	.	G	A	74.47	PASS	AF=0.692308;AO=9;DP=13;FAO=9;FDP=13;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0233388;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=266.765;QD=22.9152;RBI=0.0235048;REFB=-0.0073245;REVB=0.00278881;RO=4;SAF=4;SAR=5;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0300734;STB=0.517203;STBP=0.907;TYPE=snp;VARB=0.00470182;OID=.;OPOS=90110284;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:13:13:4:4:9:9:0.692308:5:4:2:2:5:4:2:2
chr16	90110289	.	C	A	101.62	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0266126;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.477;QD=40.6493;RBI=0.042134;REFB=0;REVB=0.0326656;RO=0;SAF=4;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000468081;OID=.;OPOS=90110289;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:10:0:0:9:10:1:5:4:0:0:5:5:0:0
chr16	90110681	.	T	C	87.92	PASS	AF=0.34375;AO=8;DP=32;FAO=11;FDP=32;FR=.,HEALED;FRO=20;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=15;FWDB=0.036691;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.142;QD=10.9897;RBI=0.0381178;REFB=-0.0377948;REVB=-0.0103312;RO=14;SAF=1;SAR=7;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.354271;STB=0.567435;STBP=0.693;TYPE=snp;VARB=0.0608028;OID=.;OPOS=90110681;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:32:32:14:20:8:11:0.34375:7:1:5:9:9:2:5:15
chr16	90124871	.	G	T	91.61	PASS	AF=0.245283;AO=12;DP=53;FAO=13;FDP=53;FR=.;FRO=40;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=16;FSRR=24;FWDB=0.00409487;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.632;QD=6.91433;RBI=0.0113192;REFB=-0.00465212;REVB=-0.0105526;RO=41;SAF=8;SAR=4;SRF=17;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.303368;STB=0.715585;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=0.0125937;OID=.;OPOS=90124871;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:91:53:53:41:40:12:13:0.245283:4:8:17:24:4:9:16:24
chr16	90130136	.	C	T	708.56	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0193011;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.511;QD=62.9829;RBI=0.0193567;REFB=0;REVB=-0.00146586;RO=0;SAF=18;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.44739e-05;OID=.;OPOS=90130136;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:27:18:0:0:27:18:0:0
chr16	90160793	.	G	C	124.16	PASS	AF=0.722222;AO=13;DP=18;FAO=13;FDP=18;FR=.;FRO=5;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.0604292;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.0371;QD=27.5917;RBI=0.076196;REFB=-0.00956973;REVB=0.0464127;RO=5;SAF=9;SAR=4;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157777;STB=0.588643;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=0.00682195;OID=.;OPOS=90160793;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:18:18:5:5:13:13:0.722222:4:9:2:3:4:9:2:3
chr16	90160953	.	T	C	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00982893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.392;QD=43.4862;RBI=0.0342997;REFB=0;REVB=0.0328612;RO=0;SAF=7;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000241182;OID=.;OPOS=90160953;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:5:7:0:0:5:7:0:0
chr16	90161034	.	C	A	167.49	PASS	AF=0.461538;AO=16;DP=37;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=-0.0139752;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.962;QD=17.1782;RBI=0.0242556;REFB=-0.01079;REVB=-0.019825;RO=21;SAF=8;SAR=8;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0234155;STB=0.512806;STBP=0.903;TYPE=snp;VARB=0.0111886;OID=.;OPOS=90161034;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:39:21:21:16:18:0.461538:8:8:10:11:9:9:10:11
chr16	90161065	.	A	T	259.46	PASS	AF=0.533333;AO=24;DP=44;FAO=24;FDP=45;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.0232189;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.0558;QD=23.0631;RBI=0.048046;REFB=-0.0614881;REVB=-0.0420631;RO=19;SAF=11;SAR=13;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0540033;STB=0.508373;STBP=0.947;TYPE=snp;VARB=0.0434459;OID=.;OPOS=90161065;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:45:19:21:24:24:0.533333:13:11:10:9:13:11:10:11
chr16	90161231	.	T	C	89.0	PASS	AF=0.769231;AO=10;DP=13;FAO=10;FDP=13;FR=.;FRO=3;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0184776;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.1901;QD=27.3834;RBI=0.0531913;REFB=-0.0579244;REVB=0.0498788;RO=3;SAF=6;SAR=4;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110339;STB=0.562373;STBP=0.464;TYPE=snp;VARB=0.0218451;OID=.;OPOS=90161231;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:13:13:3:3:10:10:0.769231:4:6:1:2:4:6:1:2
chr16	90232872	.	C	T	176.65	PASS	AF=0.38;AO=19;DP=50;FAO=19;FDP=50;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=23;FSRR=8;FWDB=0.0131523;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=168.259;QD=14.1321;RBI=0.0374763;REFB=-0.0127994;REVB=0.0350926;RO=31;SAF=10;SAR=9;SRF=23;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.236986;STB=0.635844;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=0.0164355;OID=.;OPOS=90232872;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:31:31:19:19:0.38:9:10:23:8:9:10:23:8
chr16	90232893	.	C	A	57.09	PASS	AF=0.18;AO=9;DP=49;FAO=9;FDP=50;FR=.;FRO=41;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=25;FSRR=16;FWDB=0.15173;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=44.6344;QD=4.56753;RBI=0.151733;REFB=-0.00859975;REVB=0.000948517;RO=40;SAF=8;SAR=1;SRF=24;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.442272;STB=0.803925;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=0.0523378;OID=.;OPOS=90232893;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:49:50:40:41:9:9:0.18:1:8:24:16:1:8:25:16
chr17	6115	.	G	C	785.21	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0106615;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=235.674;QD=57.1063;RBI=0.0306008;REFB=0;REVB=0.0286835;RO=0;SAF=31;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.28837e-05;OID=.;OPOS=6115;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:24:31:0:0:24:31:0:0
chr17	6157	.	A	G	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0423025;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.656;QD=59.4356;RBI=0.0452622;REFB=0;REVB=0.0160986;RO=0;SAF=19;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.1382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00022913;OID=.;OPOS=6157;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:16:19:0:0:16:19:0:0
chr17	171098	.	T	G	367.73	PASS	AF=0.632653;AO=30;DP=48;FAO=31;FDP=49;FR=.;FRO=18;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=-0.012347;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.734;QD=30.0186;RBI=0.0140607;REFB=-0.0236985;REVB=-0.00672717;RO=18;SAF=14;SAR=16;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135853;STB=0.566887;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=0.0168718;OID=.;OPOS=171098;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:49:18:18:30:31:0.632653:16:14:12:6:16:15:12:6
chr17	171137	.	C	A	336.25	PASS	AF=0.604167;AO=29;DP=48;FAO=29;FDP=48;FR=.;FRO=19;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.00494447;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.209;QD=28.0206;RBI=0.0257084;REFB=-0.0111744;REVB=0.0252284;RO=19;SAF=13;SAR=16;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0562569;STB=0.531003;STBP=0.624;TYPE=snp;VARB=0.00823278;OID=.;OPOS=171137;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:19:19:29:29:0.604167:16:13:10:9:16:13:10:9
chr17	181474	.	T	C	740.16	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0476198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.416;QD=56.9351;RBI=0.0541104;REFB=0;REVB=0.0256961;RO=0;SAF=28;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.31627e-05;OID=.;OPOS=181474;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:24:28:0:0:24:28:0:0
chr17	465775	.	G	A	90.68	PASS	AF=0.240741;AO=13;DP=54;FAO=13;FDP=54;FR=.;FRO=41;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=26;FSRR=15;FWDB=-0.00187398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.285;QD=6.71692;RBI=0.00191339;REFB=-0.0146486;REVB=-0.000386329;RO=41;SAF=6;SAR=7;SRF=26;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.208689;STB=0.629024;STBP=0.337;TYPE=snp;VARB=0.050136;OID=.;OPOS=465775;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:90:54:54:41:41:13:13:0.240741:7:6:26:15:7:6:26:15
chr17	600735	.	A	G	80.94	PASS	AF=0.268293;AO=10;DP=40;FAO=11;FDP=41;FR=.;FRO=30;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=-0.000558961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.3329;QD=7.89645;RBI=0.0385302;REFB=0.0112455;REVB=0.0385261;RO=30;SAF=3;SAR=7;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0894938;STB=0.580157;STBP=0.545;TYPE=snp;VARB=-0.0186011;OID=.;OPOS=600735;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:80:40:41:30:30:10:11:0.268293:7:3:11:19:8:3:11:19
chr17	636320	.	T	TCTC	92.77	PASS	AF=0.578947;AO=10;DP=19;FAO=11;FDP=19;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.0167974;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=249.571;QD=19.5309;RBI=0.0251023;REFB=-0.0176498;REVB=0.018654;RO=8;SAF=5;SAR=5;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.096204;STB=0.571299;STBP=0.545;TYPE=ins;VARB=0.0108993;OID=.;OPOS=636321;OREF=-;OALT=CTC;OMAPALT=TCTC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.578947:10:19:11:19:8:6:5:3:5:56:8:5:5:3:5
chr17	644986	.	A	C	481.86	PASS	AF=0.74;AO=37;DP=50;FAO=37;FDP=50;FR=.;FRO=13;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.00941451;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=237.8;QD=38.5484;RBI=0.0100732;REFB=-0.00822864;REVB=-0.00358278;RO=12;SAF=19;SAR=18;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00612206;STB=0.513506;STBP=0.78;TYPE=snp;VARB=0.00413317;OID=.;OPOS=644986;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:50:50:12:13:37:37:0.74:18:19:6:6:18:19:6:7
chr17	648157	.	G	A	190.95	PASS	AF=0.72;AO=18;DP=25;FAO=18;FDP=25;FR=.;FRO=7;FSAF=16;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.00913237;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.448;QD=30.5522;RBI=0.0203366;REFB=-0.0094369;REVB=-0.0181707;RO=7;SAF=16;SAR=2;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.185163;STB=0.603641;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=0.00118563;OID=.;OPOS=648157;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:25:25:7:7:18:18:0.72:2:16:5:2:2:16:5:2
chr17	648186	.	G	A	62.39	PASS	AF=0.28125;AO=9;DP=32;FAO=9;FDP=32;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=17;FSRR=6;FWDB=-0.0250516;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.689;QD=7.79845;RBI=0.0306275;REFB=-0.0207853;REVB=0.0176198;RO=23;SAF=7;SAR=2;SRF=17;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0611436;STB=0.538373;STBP=0.848;TYPE=snp;VARB=0.0300863;OID=.;OPOS=648186;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:32:32:23:23:9:9:0.28125:2:7:17:6:2:7:17:6
chr17	648498	.	C	T	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0155107;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.437;QD=37.4885;RBI=0.0415161;REFB=0;REVB=0.0385098;RO=0;SAF=4;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00165065;OID=.;OPOS=648498;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:4:4:0:0:4:4:0:0
chr17	649232	.	C	T	93.38	PASS	AF=0.315789;AO=12;DP=37;FAO=12;FDP=38;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=0.00738454;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.124;QD=9.82986;RBI=0.00968293;REFB=-0.00251233;REVB=-0.00626321;RO=25;SAF=8;SAR=4;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0331058;STB=0.509787;STBP=0.971;TYPE=snp;VARB=0.00855879;OID=.;OPOS=649232;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:93:37:38:25:26:12:12:0.315789:4:8:16:9:4:8:17:9
chr17	649505	.	T	A	164.05	PASS	AF=0.727273;AO=16;DP=22;FAO=16;FDP=22;FR=.;FRO=6;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.00832421;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.289;QD=29.8271;RBI=0.013724;REFB=-0.00459813;REVB=0.0109113;RO=6;SAF=6;SAR=10;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0219834;STB=0.51218;STBP=0.856;TYPE=snp;VARB=0.00165691;OID=.;OPOS=649505;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:22:22:6:6:16:16:0.727273:10:6:2:4:10:6:2:4
chr17	649547	.	G	C	37.67	PASS	AF=0.352941;AO=5;DP=17;FAO=6;FDP=17;FR=.,HEALED;FRO=11;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=-0.145182;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.7897;QD=8.86454;RBI=0.211974;REFB=-0.0244;REVB=0.154451;RO=10;SAF=2;SAR=3;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.236266;STB=0.545308;STBP=0.89;TYPE=snp;VARB=0.0411383;OID=.;OPOS=649547;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:17:17:10:11:5:6:0.352941:3:2:2:8:4:2:3:8
chr17	649935	.	G	C	190.73	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.010299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.7636;QD=47.6833;RBI=0.0294754;REFB=0;REVB=0.0276175;RO=0;SAF=8;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00124793;OID=.;OPOS=649935;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:8:8:0:0:8:8:0:0
chr17	650206	.	C	T	55.41	PASS	AF=0.363636;AO=8;DP=22;FAO=8;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.0311568;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.3364;QD=10.0752;RBI=0.0385577;REFB=0.0125064;REVB=-0.0227146;RO=14;SAF=5;SAR=3;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133032;STB=0.581189;STBP=0.6;TYPE=snp;VARB=-0.0269066;OID=.;OPOS=650206;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:22:22:14:14:8:8:0.363636:3:5:7:7:3:5:7:7
chr17	685752	.	G	A	117.32	PASS	AF=0.590909;AO=13;DP=22;FAO=13;FDP=22;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.0455967;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.4352;QD=21.3311;RBI=0.0736095;REFB=-0.0202455;REVB=0.0577867;RO=9;SAF=5;SAR=8;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0394853;STB=0.522354;STBP=0.856;TYPE=snp;VARB=0.0308245;OID=.;OPOS=685752;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:22:22:9:9:13:13:0.590909:8:5:3:6:8:5:3:6
chr17	767315	.	A	G	76.21	PASS	AF=0.434783;AO=9;DP=23;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=12;FWDB=0.021977;FXX=0.0416493;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.161;QD=13.2542;RBI=0.0266059;REFB=-0.0210555;REVB=0.0149962;RO=13;SAF=2;SAR=7;SRF=1;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.249493;STB=0.624795;STBP=0.434;TYPE=snp;VARB=0.0250495;OID=.;OPOS=767315;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:23:23:13:13:9:10:0.434783:7:2:1:12:8:2:1:12
chr17	800125	.	C	T	77.94	PASS	AF=0.454545;AO=10;DP=22;FAO=10;FDP=22;FR=.;FRO=12;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=-0.0222476;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.718;QD=14.17;RBI=0.0306005;REFB=-0.0112684;REVB=0.0210104;RO=12;SAF=1;SAR=9;SRF=2;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14509;STB=0.58676;STBP=0.656;TYPE=snp;VARB=0.0239457;OID=.;OPOS=800125;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:22:22:12:12:10:10:0.454545:9:1:2:10:9:1:2:10
chr17	908502	.	A	G	105.14	PASS	AF=0.846154;AO=11;DP=13;FAO=11;FDP=13;FR=.;FRO=2;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0507847;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.8174;QD=32.3506;RBI=0.0575299;REFB=-0.0824918;REVB=-0.0270298;RO=2;SAF=7;SAR=4;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112219;STB=0.562391;STBP=0.464;TYPE=snp;VARB=0.0162637;OID=.;OPOS=908502;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:13:13:2:2:11:11:0.846154:4:7:2:0:4:7:2:0
chr17	908529	.	A	G	95.05	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.042121;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.075;QD=38.0211;RBI=0.0775544;REFB=0;REVB=0.0651191;RO=0;SAF=5;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00591466;OID=.;OPOS=908529;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:10:0:0:9:10:1:4:5:0:0:4:6:0:0
chr17	925764	.	A	G	369.21	PASS	AF=0.610169;AO=36;DP=59;FAO=36;FDP=59;FR=.;FRO=23;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=-0.0111557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.315;QD=25.0312;RBI=0.0111744;REFB=0.00713751;REVB=-0.000646831;RO=23;SAF=24;SAR=12;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173227;STB=0.595184;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=-0.00847715;OID=.;OPOS=925764;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:23:23:36:36:0.610169:12:24:10:13:12:24:10:13
chr17	970413	.	C	T	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0191516;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.108;QD=40.7621;RBI=0.0673536;REFB=0;REVB=0.0645734;RO=0;SAF=2;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000783361;OID=.;OPOS=970413;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:8:2:0:0:8:2:0:0
chr17	1183354	.	T	C	145.2	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0494966;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.8159;QD=44.6768;RBI=0.112152;REFB=0;REVB=0.100639;RO=0;SAF=10;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00141128;OID=.;OPOS=1183354;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:3:10:0:0:3:10:0:0
chr17	1183464	.	A	G	465.14	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00830165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.128;QD=58.1421;RBI=0.0124736;REFB=0;REVB=0.00930988;RO=0;SAF=19;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.91196e-06;OID=.;OPOS=1183464;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:13:19:0:0:13:19:0:0
chr17	1201721	.	C	T	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0259015;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=253.083;QD=43.4862;RBI=0.0649631;REFB=0;REVB=0.0595762;RO=0;SAF=5;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000530941;OID=.;OPOS=1201721;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:7:5:0:0:7:5:0:0
chr17	1209747	.	A	G	63.19	PASS	AF=0.615385;AO=8;DP=13;FAO=8;FDP=13;FR=.;FRO=5;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0660511;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.6776;QD=19.4435;RBI=0.0670158;REFB=-0.057847;REVB=-0.01133;RO=5;SAF=6;SAR=2;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.258785;STB=0.651766;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=0.0221206;OID=.;OPOS=1209747;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:25:13:13:5:5:8:8:0.615385:2:6:2:3:2:6:2:3
chr17	1359363	.	T	G	397.37	PASS	AF=0.622951;AO=38;DP=61;FAO=38;FDP=61;FR=.;FRO=23;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=5;FSRR=18;FWDB=0.0058607;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.157;QD=26.0569;RBI=0.0102235;REFB=-0.0230789;REVB=-0.00837692;RO=20;SAF=17;SAR=21;SRF=4;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161775;STB=0.589289;STBP=0.101;TYPE=snp;VARB=0.00529106;OID=.;OPOS=1359363;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:20:23:38:38:0.622951:21:17:4:16:21:17:5:18
chr17	1371123	.	T	C	203.16	PASS	AF=0.678571;AO=16;DP=29;FAO=19;FDP=28;FR=.,HEALED;FRO=9;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=-0.0272179;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.8663;QD=29.0221;RBI=0.0471826;REFB=-0.0127279;REVB=0.0385408;RO=8;SAF=10;SAR=6;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.529153;STBP=0.711;TYPE=snp;VARB=0.0201042;OID=.;OPOS=1371123;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:29:28:8:9:16:19:0.678571:6:10:5:3:8:11:6:3
chr17	1373518	.	T	C	149.58	PASS	AF=0.652174;AO=15;DP=23;FAO=15;FDP=23;FR=.;FRO=8;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.0183311;FXX=0.0416493;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.76;QD=26.0145;RBI=0.0199332;REFB=-0.0274419;REVB=0.00782966;RO=7;SAF=10;SAR=5;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143879;STB=0.605915;STBP=0.197;TYPE=snp;VARB=0.0275084;OID=.;OPOS=1373518;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:23:23:7:8:15:15:0.652174:5:10:3:4:5:10:3:5
chr17	1373612	.	C	T	32.86	PASS	AF=0.5;AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0127068;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.071;QD=13.1424;RBI=0.0127206;REFB=0.00694167;REVB=-0.00059278;RO=5;SAF=3;SAR=2;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00685869;OID=.;OPOS=1373612;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:24:10:10:5:5:5:5:0.5:2:3:3:2:2:3:3:2
chr17	1384066	.	A	C,G	321.58	PASS	AF=0.269231,0.730769;AO=4,18;DP=22;FAO=7,19;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=5,14;FSAR=2,5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00530777,0.00167812;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=107.149,107.216;QD=49.4745;RBI=0.0428736,0.0186965;REFB=0,0;REVB=0.0425438,-0.018621;RO=0;SAF=2,13;SAR=2,5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.083858,-0.00164077;OID=.,.;OPOS=1384066,1384066;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:35:22:26:0:0:4,18:7,19:0.269231,0.730769:2,5:2,13:0:0:2,5:5,14:0:0
chr17	1423566	.	A	G	49.58	PASS	AF=0.538462;AO=7;DP=13;FAO=7;FDP=13;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.00521963;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.692;QD=15.2548;RBI=0.00535222;REFB=-0.0150265;REVB=0.00118395;RO=6;SAF=4;SAR=3;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0767769;STB=0.545327;STBP=0.828;TYPE=snp;VARB=0.010153;OID=.;OPOS=1423566;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:13:13:6:6:7:7:0.538462:3:4:4:2:3:4:4:2
chr17	1424948	.	A	G	373.39	PASS	AF=0.660377;AO=35;DP=53;FAO=35;FDP=53;FR=.;FRO=18;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=-0.00829425;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=243.176;QD=28.1807;RBI=0.0152962;REFB=-0.00846416;REVB=-0.0128522;RO=18;SAF=18;SAR=17;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112397;STB=0.561256;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=0.00241298;OID=.;OPOS=1424948;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:18:18:35:35:0.660377:17:18:6:12:17:18:6:12
chr17	1489088	.	C	G	654.63	PASS	AF=1;AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.059102;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.6128;QD=62.3453;RBI=0.0710238;REFB=0;REVB=-0.039387;RO=0;SAF=20;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000135311;OID=.;OPOS=1489088;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:42:0:0:42:42:1:22:20:0:0:22:20:0:0
chr17	1494567	.	G	A	34.09	PASS	AF=0.176471;AO=6;DP=34;FAO=6;FDP=34;FR=.;FRO=28;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=-0.00806556;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.28;QD=4.01047;RBI=0.0255252;REFB=-0.00368161;REVB=0.0242174;RO=28;SAF=4;SAR=2;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119068;STB=0.583048;STBP=0.777;TYPE=snp;VARB=0.0324253;OID=.;OPOS=1494567;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:34:34:28:28:6:6:0.176471:2:4:16:12:2:4:16:12
chr17	1516480	.	T	C	562.58	PASS	AF=0.974359;AO=35;DP=36;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0467624;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.43;QD=57.7006;RBI=0.0470925;REFB=-0.225282;REVB=-0.00556612;RO=0;SAF=22;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.39865e-08;STB=0.518509;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=0.0014316;OID=.;OPOS=1516480;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:36:39:0:1:35:38:0.974359:13:22:0:0:13:25:0:1
chr17	1538546	.	C	T	984.3	PASS	AF=0.945946;AO=67;DP=74;FAO=70;FDP=74;FR=.;FRO=4;FSAF=39;FSAR=31;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0107685;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.185;QD=53.2052;RBI=0.0295674;REFB=0.0315643;REVB=0.0275367;RO=4;SAF=36;SAR=31;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0496621;STB=0.524383;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=-0.00371643;OID=.;OPOS=1538546;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:74:74:4:4:67:70:0.945946:31:36:4:0:31:39:4:0
chr17	1538628	.	C	G	769.47	PASS	AF=1;AO=53;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0287661;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.341;QD=56.9977;RBI=0.036202;REFB=0;REVB=0.0219794;RO=0;SAF=32;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.81969e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000155507;OID=.;OPOS=1538628;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:53:54:1:21:32:0:0:22:32:0:0
chr17	1542153	.	G	A	246.54	PASS	AF=0.952381;AO=20;DP=21;FAO=20;FDP=21;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0610101;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.0181;QD=46.9595;RBI=0.0610392;REFB=0.0399804;REVB=0.00188625;RO=1;SAF=11;SAR=9;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0484648;STB=0.526289;STBP=0.336;TYPE=snp;VARB=-0.00779621;OID=.;OPOS=1542153;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:21:21:1:1:20:20:0.952381:9:11:0:1:9:11:0:1
chr17	1542190	.	G	A	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0481437;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.705;QD=48.7368;RBI=0.0506937;REFB=0;REVB=0.0158759;RO=0;SAF=11;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000678938;OID=.;OPOS=1542190;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:6:11:0:0:6:11:0:0
chr17	1630992	.	G	A	138.36	PASS	AF=0.736842;AO=13;DP=18;FAO=14;FDP=19;FR=.;FRO=5;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0273897;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.0015;QD=29.1293;RBI=0.128117;REFB=0.0156564;REVB=0.125155;RO=4;SAF=8;SAR=5;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0609767;STB=0.507681;STBP=0.947;TYPE=snp;VARB=0.00148454;OID=.;OPOS=1630992;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:26:18:19:4:5:13:14:0.736842:5:8:3:1:6:8:3:2
chr17	1634104	.	C	T	437.85	PASS	AF=0.755556;AO=34;DP=45;FAO=34;FDP=45;FR=.;FRO=11;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=0.0106062;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.685;QD=38.92;RBI=0.0406825;REFB=0.00380296;REVB=0.0392756;RO=11;SAF=15;SAR=19;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0882853;STB=0.547809;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=-0.00133475;OID=.;OPOS=1634104;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:79:45:45:11:11:34:34:0.755556:19:15:7:4:19:15:7:4
chr17	1637302	.	A	G	485.22	PASS	AF=0.788462;AO=41;DP=51;FAO=41;FDP=52;FR=.;FRO=11;FSAF=27;FSAR=14;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.00837118;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.8682;QD=37.3247;RBI=0.0095619;REFB=-0.0486549;REVB=0.00462096;RO=10;SAF=27;SAR=14;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0235158;STB=0.526141;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=0.00809765;OID=.;OPOS=1637302;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:51:52:10:11:41:41:0.788462:14:27:6:4:14:27:6:5
chr17	1637458	.	G	A	409.66	PASS	AF=0.6875;AO=33;DP=48;FAO=33;FDP=48;FR=.;FRO=15;FSAF=11;FSAR=22;FSRF=2;FSRR=13;FWDB=-0.0171067;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.028;QD=34.1383;RBI=0.0915754;REFB=-0.0408717;REVB=0.0899634;RO=15;SAF=11;SAR=22;SRF=2;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13609;STB=0.573729;STBP=0.189;TYPE=snp;VARB=0.0220232;OID=.;OPOS=1637458;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:15:15:33:33:0.6875:22:11:2:13:22:11:2:13
chr17	1639458	.	A	G	431.75	PASS	AF=0.722222;AO=38;DP=53;FAO=39;FDP=54;FR=.;FRO=15;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=0.0187287;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.448;QD=31.9814;RBI=0.0192604;REFB=0.0111933;REVB=0.00449426;RO=15;SAF=24;SAR=14;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0176142;STB=0.512289;STBP=0.777;TYPE=snp;VARB=-0.00193576;OID=.;OPOS=1639458;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:54:15:15:38:39:0.722222:14:24:9:6:14:25:9:6
chr17	1640793	.	C	T	193.49	PASS	AF=0.75;AO=18;DP=24;FAO=18;FDP=24;FR=.;FRO=6;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.0785465;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.6303;QD=32.2487;RBI=0.0980169;REFB=0.00935738;REVB=0.0586323;RO=6;SAF=7;SAR=11;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109174;STB=0.559936;STBP=0.354;TYPE=snp;VARB=0.00127671;OID=.;OPOS=1640793;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:24:24:6:6:18:18:0.75:11:7:1:5:11:7:1:5
chr17	1641806	.	G	A	445.89	PASS	AF=0.714286;AO=35;DP=49;FAO=35;FDP=49;FR=.;FRO=14;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=-0.00405126;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=57.6345;QD=36.3992;RBI=0.0430969;REFB=0.0416564;REVB=-0.042906;RO=14;SAF=19;SAR=16;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134642;STB=0.573044;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=-0.0137536;OID=.;OPOS=1641806;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:14:14:35:35:0.714286:16:19:4:10:16:19:4:10
chr17	1648502	.	C	T	120.4	PASS	AF=0.619048;AO=13;DP=22;FAO=13;FDP=21;FR=.;FRO=8;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.0162007;FXX=0.0454339;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.369;QD=22.933;RBI=0.0166073;REFB=-0.0205097;REVB=-0.00365222;RO=8;SAF=9;SAR=4;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0518484;STB=0.529366;STBP=0.752;TYPE=snp;VARB=0.0122423;OID=.;OPOS=1648502;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:58:22:21:8:8:13:13:0.619048:4:9:5:3:4:9:5:3
chr17	1657653	.	G	A	398.12	PASS	AF=0.711111;AO=32;DP=45;FAO=32;FDP=45;FR=.;FRO=13;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.0183225;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.6235;QD=35.3888;RBI=0.0187192;REFB=0.00598849;REVB=-0.00383347;RO=13;SAF=14;SAR=18;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0540115;STB=0.529393;STBP=0.572;TYPE=snp;VARB=-0.00205219;OID=.;OPOS=1657653;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:13:13:32:32:0.711111:18:14:7:6:18:14:7:6
chr17	1674429	.	T	C	650.59	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0437593;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.7946;QD=61.9614;RBI=0.0457404;REFB=0;REVB=0.0133157;RO=0;SAF=19;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000252731;OID=.;OPOS=1674429;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:23:19:0:0:23:19:0:0
chr17	1680002	.	T	C	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0160986;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.778;QD=49.599;RBI=0.0161467;REFB=0;REVB=-0.00124497;RO=0;SAF=11;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000313248;OID=.;OPOS=1680002;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:7:11:0:0:7:11:0:0
chr17	1686410	.	T	C	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0192609;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.278;QD=51.9167;RBI=0.0214184;REFB=0;REVB=0.0093682;RO=0;SAF=12;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.32426e-05;OID=.;OPOS=1686410;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:9:12:0:0:9:12:0:0
chr17	1690752	.	G	A	689.29	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0634278;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.9293;QD=62.6623;RBI=0.0823325;REFB=0;REVB=0.0524935;RO=0;SAF=24;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.30465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000164352;OID=.;OPOS=1690752;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:20:24:0:0:20:24:0:0
chr17	1782957	.	C	T	164.59	PASS	AF=0.695652;AO=15;DP=23;FAO=16;FDP=23;FR=.;FRO=7;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.0290873;FXX=0.0416493;HRUN=2;LEN=1;MLLD=263.747;QD=28.6248;RBI=0.0402255;REFB=-0.014372;REVB=0.0277853;RO=7;SAF=10;SAR=5;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143879;STB=0.561719;STBP=0.46;TYPE=snp;VARB=0.0060533;OID=.;OPOS=1782957;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:23:23:7:7:15:16:0.695652:5:10:3:4:6:10:3:4
chr17	1795180	.	T	C	728.65	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0658942;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.171;QD=63.3605;RBI=0.0791663;REFB=0;REVB=0.0438777;RO=0;SAF=21;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000302183;OID=.;OPOS=1795180;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:46:0:0:45:46:1:24:21:0:0:24:22:0:0
chr17	1839674	.	G	C	834.4	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0278185;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.2875;QD=57.5445;RBI=0.0298048;REFB=0;REVB=-0.0106983;RO=0;SAF=31;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.07727e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000443947;OID=.;OPOS=1839674;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:27:31:0:0:27:31:0:0
chr17	1840468	.	C	T	976.41	PASS	AF=0.985294;AO=67;DP=68;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0252557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.317;QD=57.4358;RBI=0.0338235;REFB=-0.0210107;REVB=0.0224985;RO=1;SAF=26;SAR=41;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0178273;STB=0.509431;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=0.000139888;OID=.;OPOS=1840468;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:68:68:1:1:67:67:0.985294:41:26:1:0:41:26:1:0
chr17	1943888	.	T	C	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0594227;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.524;QD=46.848;RBI=0.0660403;REFB=0;REVB=0.0288143;RO=0;SAF=1;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000163213;OID=.;OPOS=1943888;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:14:1:0:0:14:1:0:0
chr17	1962394	.	C	T	73.1	PASS	AF=0.3125;AO=10;DP=32;FAO=10;FDP=32;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.00321;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=66.9824;QD=9.13753;RBI=0.00901691;REFB=-0.0101073;REVB=-0.00842619;RO=22;SAF=7;SAR=3;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186273;STB=0.614625;STBP=0.432;TYPE=snp;VARB=0.0460747;OID=.;OPOS=1962394;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:32:32:22:22:10:10:0.3125:3:7:12:10:3:7:12:10
chr17	2091765	.	C	T	428.29	PASS	AF=0.696429;AO=39;DP=56;FAO=39;FDP=56;FR=.;FRO=17;FSAF=13;FSAR=26;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=0.0238978;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.772;QD=30.5919;RBI=0.0241041;REFB=-0.0299958;REVB=0.00314731;RO=17;SAF=13;SAR=26;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183782;STB=0.599947;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.0128046;OID=.;OPOS=2091765;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:17:17:39:39:0.696429:26:13:11:6:26:13:11:6
chr17	2186100	.	C	T	479.59	PASS	AF=0.8;AO=36;DP=45;FAO=36;FDP=45;FR=.;FRO=9;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.0275522;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.612;QD=42.6303;RBI=0.0310644;REFB=-0.0490543;REVB=0.0143483;RO=9;SAF=16;SAR=20;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.13953e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00976451;OID=.;OPOS=2186100;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:59:45:45:9:9:36:36:0.8:20:16:4:5:20:16:4:5
chr17	2202943	.	T	C	59.84	PASS	AF=0.272727;AO=9;DP=33;FAO=9;FDP=33;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=-0.0197703;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.55;QD=7.25329;RBI=0.0312429;REFB=-0.0262433;REVB=0.024192;RO=24;SAF=5;SAR=4;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0646411;STB=0.54045;STBP=0.783;TYPE=snp;VARB=0.0674504;OID=.;OPOS=2202943;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:59:33:33:24:24:9:9:0.272727:4:5:12:12:4:5:12:12
chr17	2203453	.	A	G	46.17	PASS	AF=0.35;AO=6;DP=19;FAO=7;FDP=20;FR=.;FRO=13;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.00113712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.108;QD=9.23375;RBI=0.00135339;REFB=-0.0132055;REVB=0.000733908;RO=13;SAF=1;SAR=5;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.375164;STB=0.624625;STBP=0.44;TYPE=snp;VARB=0.0270541;OID=.;OPOS=2203453;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:19:20:13:13:6:7:0.35:5:1:6:7:5:2:6:7
chr17	2236404	.	T	C	54.66	PASS	AF=0.333333;AO=8;DP=24;FAO=8;FDP=24;FR=.;FRO=16;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=-0.0981207;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.5697;QD=9.10998;RBI=0.104315;REFB=-0.0135406;REVB=0.0354116;RO=16;SAF=1;SAR=7;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.312772;STB=0.699399;STBP=0.253;TYPE=snp;VARB=0.0187357;OID=.;OPOS=2236404;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:24:24:16:16:8:8:0.333333:7:1:5:11:7:1:5:11
chr17	2266799	.	G	A	1012.15	PASS	AF=0.985714;AO=68;DP=69;FAO=69;FDP=70;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0803732;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.0808;QD=57.8369;RBI=0.143284;REFB=-0.0232099;REVB=0.118619;RO=1;SAF=36;SAR=32;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0145412;STB=0.50769;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.0025816;OID=.;OPOS=2266799;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:69:70:1:1:68:69:0.985714:32:36:0:1:32:37:0:1
chr17	2266812	.	T	C	1052.73	PASS	AF=1;AO=70;DP=72;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0504365;FXX=0.0277739;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.817;QD=60.1562;RBI=0.0551251;REFB=0;REVB=0.0222473;RO=0;SAF=36;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000929059;OID=.;OPOS=2266812;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:70:0:0:70:70:1:34:36:0:0:34:36:0:0
chr17	2268311	.	G	A	994.94	PASS	AF=0.910256;AO=71;DP=78;FAO=71;FDP=78;FR=.;FRO=7;FSAF=48;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.0175149;FXX=0.0126566;HRUN=4;LEN=1;MLLD=114.414;QD=51.0224;RBI=0.033361;REFB=-0.146166;REVB=0.0283934;RO=2;SAF=48;SAR=23;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0103653;STB=0.552585;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.00460963;OID=.;OPOS=2268311;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:78:78:2:7:71:71:0.910256:23:48:1:1:23:48:1:6
chr17	2279155	.	G	A	132.15	PASS	AF=0.636364;AO=14;DP=22;FAO=14;FDP=22;FR=.;FRO=8;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=-0.00898997;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.693;QD=24.0274;RBI=0.0228134;REFB=0.0155781;REVB=0.0209674;RO=8;SAF=8;SAR=6;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126876;STB=0.571326;STBP=0.428;TYPE=snp;VARB=-0.00374354;OID=.;OPOS=2279155;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:22:22:8:8:14:14:0.636364:6:8:3:5:6:8:3:5
chr17	2606715	.	G	A	1558.27	PASS	AF=1;AO=104;DP=105;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0011516;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.027;QD=59.9334;RBI=0.00675041;REFB=0;REVB=0.00665145;RO=0;SAF=48;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.73438e-05;OID=.;OPOS=2606715;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:105:104:0:0:104:104:1:56:48:0:0:56:48:0:0
chr17	2868935	.	T	C	156.43	PASS	AF=0.615385;AO=16;DP=26;FAO=16;FDP=26;FR=.;FRO=10;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.0205791;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.085;QD=24.0668;RBI=0.0295325;REFB=-0.0223531;REVB=-0.0211818;RO=10;SAF=11;SAR=5;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.208329;STB=0.617195;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.0222917;OID=.;OPOS=2868935;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:26:26:10:10:16:16:0.615385:5:11:4:6:5:11:4:6
chr17	2929392	.	G	A	44.29	PASS	AF=0.269231;AO=7;DP=26;FAO=7;FDP=26;FR=.;FRO=19;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.0333414;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.347;QD=6.81331;RBI=0.0398089;REFB=-0.00558615;REVB=0.0217508;RO=19;SAF=1;SAR=6;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.521321;STB=0.836197;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.0225084;OID=.;OPOS=2929392;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:26:26:19:19:7:7:0.269231:6:1:11:8:6:1:11:8
chr17	2929674	.	T	C	52.87	PASS	AF=0.149254;AO=10;DP=67;FAO=10;FDP=67;FR=.;FRO=57;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=20;FSRR=37;FWDB=-0.060999;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.601;QD=3.15665;RBI=0.0610502;REFB=-0.00470019;REVB=-0.00249911;RO=56;SAF=4;SAR=6;SRF=20;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.056048;STB=0.544217;STBP=0.779;TYPE=snp;VARB=0.0247711;OID=.;OPOS=2929674;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:67:67:56:57:10:10:0.149254:6:4:20:36:6:4:20:37
chr17	2930339	.	G	A	64.46	PASS	AF=0.346154;AO=9;DP=26;FAO=9;FDP=26;FR=.;FRO=17;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=-0.046827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.548;QD=9.91633;RBI=0.0468769;REFB=-0.00581835;REVB=-0.0021643;RO=17;SAF=2;SAR=7;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.502527;STB=0.802636;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.00704917;OID=.;OPOS=2930339;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:26:26:17:17:9:9:0.346154:7:2:12:5:7:2:12:5
chr17	2940759	.	A	G	96.22	PASS	AF=0.25;AO=14;DP=56;FAO=14;FDP=56;FR=.;FRO=42;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=19;FSRR=23;FWDB=-0.0335912;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.088;QD=6.87301;RBI=0.039917;REFB=-0.0053197;REVB=-0.0215639;RO=42;SAF=10;SAR=4;SRF=19;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.321123;STB=0.699193;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=0.0187894;OID=.;OPOS=2940759;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:56:56:42:42:14:14:0.25:4:10:19:23:4:10:19:23
chr17	3101076	.	G	C	526.79	PASS	AF=0.972973;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.01146;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=225.164;QD=56.9503;RBI=0.0186465;REFB=-0.0387122;REVB=0.0147093;RO=1;SAF=18;SAR=18;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0252932;STB=0.513506;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.000184504;OID=.;OPOS=3101076;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:37:37:1:1:36:36:0.972973:18:18:0:1:18:18:0:1
chr17	3101578	.	G	T	151.56	PASS	AF=0.333333;AO=20;DP=60;FAO=20;FDP=60;FR=.;FRO=40;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=25;FWDB=-0.0329805;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=233.49;QD=10.1038;RBI=0.0510502;REFB=-0.0049349;REVB=-0.0389667;RO=40;SAF=10;SAR=10;SRF=15;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142259;STB=0.583252;STBP=0.402;TYPE=snp;VARB=0.0124149;OID=.;OPOS=3101578;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:40:40:20:20:0.333333:10:10:15:25:10:10:15:25
chr17	3119008	.	T	C	613.29	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00878858;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.8495;QD=61.3286;RBI=0.0135717;REFB=0;REVB=-0.0103417;RO=0;SAF=24;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.0832e-05;OID=.;OPOS=3119008;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:16:24:0:0:16:24:0:0
chr17	3119767	.	C	T	205.77	PASS	AF=0.571429;AO=20;DP=35;FAO=20;FDP=35;FR=.;FRO=15;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=-0.0271803;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.6825;QD=23.5166;RBI=0.0310141;REFB=0.0217669;REVB=0.0149367;RO=15;SAF=10;SAR=10;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0766705;STB=0.542815;STBP=0.561;TYPE=snp;VARB=-0.0164296;OID=.;OPOS=3119767;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:15:15:20:20:0.571429:10:10:6:9:10:10:6:9
chr17	3195503	.	C	T	450.55	PASS	AF=1;AO=30;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0757413;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.789;QD=58.1355;RBI=0.0767458;REFB=0;REVB=0.0123763;RO=0;SAF=14;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.56309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0014718;OID=.;OPOS=3195503;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:30:31:1:16:14:0:0:16:15:0:0
chr17	3214181	.	T	G	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0381493;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.465;QD=48.7372;RBI=0.0413052;REFB=0;REVB=0.015835;RO=0;SAF=10;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00042283;OID=.;OPOS=3214181;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:7:10:0:0:7:10:0:0
chr17	3301549	.	G	A	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0334764;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.832;QD=50.4133;RBI=0.0419889;REFB=0;REVB=0.0253456;RO=0;SAF=11;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.41338e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000374734;OID=.;OPOS=3301549;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:8:11:0:0:8:11:0:0
chr17	3324810	.	A	G	96.19	PASS	AF=0.733333;AO=10;DP=14;FAO=11;FDP=15;FR=.;FRO=4;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.0696736;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.3677;QD=25.6508;RBI=0.080513;REFB=-0.0448549;REVB=-0.0403476;RO=4;SAF=6;SAR=4;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0802204;STB=0.555457;STBP=0.547;TYPE=snp;VARB=0.0166235;OID=.;OPOS=3324810;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:20:14:15:4:4:10:11:0.733333:4:6:3:1:5:6:3:1
chr17	3343519	.	T	C	68.43	PASS	AF=0.208333;AO=10;DP=48;FAO=10;FDP=48;FR=.;FRO=38;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=0.0209949;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.2886;QD=5.70288;RBI=0.0315176;REFB=0.00247873;REVB=-0.0235068;RO=38;SAF=4;SAR=6;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0591408;STB=0.538384;STBP=0.817;TYPE=snp;VARB=-0.0199409;OID=.;OPOS=3343519;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:68:48:48:38:38:10:10:0.208333:6:4:17:21:6:4:17:21
chr17	3343534	.	C	T	386.27	PASS	AF=0.64;AO=32;DP=50;FAO=32;FDP=50;FR=.;FRO=18;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.0046261;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=263.757;QD=30.9019;RBI=0.0063115;REFB=0.00864591;REVB=0.00429351;RO=18;SAF=13;SAR=19;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135534;STB=0.574261;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=-0.00445838;OID=.;OPOS=3343534;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:18:18:32:32:0.64:19:13:11:7:19:13:11:7
chr17	3352294	.	A	G	75.8	PASS	AF=0.206897;AO=12;DP=58;FAO=12;FDP=58;FR=.;FRO=46;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=21;FSRR=25;FWDB=-0.0076683;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.352;QD=5.22762;RBI=0.0387201;REFB=-0.00807021;REVB=-0.0379532;RO=46;SAF=4;SAR=8;SRF=21;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158214;STB=0.602234;STBP=0.463;TYPE=snp;VARB=0.0244245;OID=.;OPOS=3352294;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:58:58:46:46:12:12:0.206897:8:4:21:25:8:4:21:25
chr17	3352331	.	C	T	119.83	PASS	AF=0.283333;AO=17;DP=60;FAO=17;FDP=60;FR=.;FRO=43;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=28;FWDB=-0.0509177;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.505;QD=7.98843;RBI=0.0509403;REFB=0.0116671;REVB=0.00151717;RO=43;SAF=5;SAR=12;SRF=15;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0748898;STB=0.545399;STBP=0.718;TYPE=snp;VARB=-0.0284536;OID=.;OPOS=3352331;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:43:43:17:17:0.283333:12:5:15:28:12:5:15:28
chr17	3352438	.	C	G	176.24	PASS	AF=0.708333;AO=17;DP=24;FAO=17;FDP=24;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=-0.0562453;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.4263;QD=29.3739;RBI=0.0595086;REFB=-0.0164517;REVB=0.0194356;RO=7;SAF=5;SAR=12;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100709;STB=0.555494;STBP=0.489;TYPE=snp;VARB=0.00767029;OID=.;OPOS=3352438;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:24:24:7:7:17:17:0.708333:12:5:1:6:12:5:1:6
chr17	3416555	.	C	A	75.13	PASS	AF=0.37037;AO=10;DP=27;FAO=10;FDP=27;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.00113275;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.977;QD=11.131;RBI=0.0245717;REFB=-0.00448193;REVB=-0.0245456;RO=17;SAF=6;SAR=4;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0756198;STB=0.545363;STBP=0.789;TYPE=snp;VARB=0.0146751;OID=.;OPOS=3416555;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:27:27:17:17:10:10:0.37037:4:6:9:8:4:6:9:8
chr17	3422032	.	G	A	740.44	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00541545;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=263.845;QD=56.9569;RBI=0.0109042;REFB=0;REVB=0.00946439;RO=0;SAF=34;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.85199e-05;OID=.;OPOS=3422032;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:52:0:0:51:52:1:17:34:0:0:17:35:0:0
chr17	3422073	.	C	T	374.39	PASS	AF=0.659574;AO=31;DP=47;FAO=31;FDP=47;FR=.;FRO=16;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=-0.00031299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.3875;QD=31.8631;RBI=0.0111686;REFB=0.00272512;REVB=0.0111642;RO=16;SAF=17;SAR=14;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0883056;STB=0.548221;STBP=0.364;TYPE=snp;VARB=-0.000826017;OID=.;OPOS=3422073;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:16:16:31:31:0.659574:14:17:11:5:14:17:11:5
chr17	3422077	.	G	A	114.26	PASS	AF=0.311111;AO=14;DP=45;FAO=14;FDP=45;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=-0.0279707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.5997;QD=10.1565;RBI=0.0305551;REFB=-0.00758678;REVB=0.0122984;RO=31;SAF=10;SAR=4;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206102;STB=0.624812;STBP=0.263;TYPE=snp;VARB=0.0168374;OID=.;OPOS=3422077;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:31:31:14:14:0.311111:4:10:17:14:4:10:17:14
chr17	3446885	.	T	C	170.23	PASS	AF=0.73913;AO=14;DP=20;FAO=17;FDP=23;FR=.;FRO=6;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.00906735;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.141;QD=29.6045;RBI=0.028617;REFB=-0.0163314;REVB=-0.0271425;RO=6;SAF=5;SAR=9;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170491;STB=0.550961;STBP=0.439;TYPE=snp;VARB=0.00820242;OID=.;OPOS=3446885;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:20:23:6:6:14:17:0.73913:9:5:4:2:9:8:4:2
chr17	3458072	.	T	C	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0194028;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.015;QD=56.1909;RBI=0.0217732;REFB=0;REVB=0.00987929;RO=0;SAF=15;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.61275e-05;OID=.;OPOS=3458072;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:13:15:0:0:13:15:0:0
chr17	3493200	.	C	G	404.86	PASS	AF=0.66;AO=33;DP=50;FAO=33;FDP=50;FR=.;FRO=17;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.0123765;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.457;QD=32.3884;RBI=0.0175026;REFB=0.00546706;REVB=-0.0123758;RO=17;SAF=20;SAR=13;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0493238;STB=0.52696;STBP=0.627;TYPE=snp;VARB=-0.00181327;OID=.;OPOS=3493200;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:17:17:33:33:0.66:13:20:9:8:13:20:9:8
chr17	3514028	.	G	C	289.33	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0220586;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.8204;QD=52.606;RBI=0.0249239;REFB=0;REVB=0.0116026;RO=0;SAF=9;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2029e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000238105;OID=.;OPOS=3514028;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:13:9:0:0:13:9:0:0
chr17	3553526	.	A	G	393.3	PASS	AF=1;AO=27;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0427761;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.5592;QD=56.186;RBI=0.0749692;REFB=0;REVB=-0.0615677;RO=0;SAF=15;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000445719;OID=.;OPOS=3553526;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:27:28:1:12:15:0:0:13:15:0:0
chr17	3559823	.	G	A	213.37	PASS	AF=0.625;AO=20;DP=31;FAO=20;FDP=32;FR=.;FRO=12;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=2;FWDB=-0.00368017;FXX=0.0302939;HRUN=3;LEN=1;MLLD=110.79;QD=26.6716;RBI=0.0100288;REFB=-0.0123397;REVB=0.00932919;RO=11;SAF=11;SAR=9;SRF=10;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.240364;STB=0.609575;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=0.00787705;OID=.;OPOS=3559823;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:93:31:32:11:12:20:20:0.625:9:11:10:1:9:11:10:2
chr17	3561396	.	C	T	729.01	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00394873;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=223.813;QD=57.1769;RBI=0.0329185;REFB=0;REVB=0.0326808;RO=0;SAF=30;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.75465e-05;OID=.;OPOS=3561396;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:21:30:0:0:21:30:0:0
chr17	3563963	.	C	G	52.61	PASS	AF=0.258065;AO=8;DP=31;FAO=8;FDP=31;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=-0.0190541;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.358;QD=6.78852;RBI=0.0462829;REFB=-0.0114178;REVB=-0.0421788;RO=23;SAF=5;SAR=3;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.220255;STB=0.639653;STBP=0.411;TYPE=snp;VARB=0.0380643;OID=.;OPOS=3563963;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:31:31:23:23:8:8:0.258065:3:5:10:13:3:5:10:13
chr17	3564068	.	G	A	57.68	PASS	AF=0.666667;AO=8;DP=12;FAO=8;FDP=12;FR=.;FRO=4;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0288476;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.6606;QD=19.2282;RBI=0.0577792;REFB=-0.058943;REVB=0.0500625;RO=4;SAF=3;SAR=5;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0749496;STB=0.543368;STBP=0.686;TYPE=snp;VARB=0.0456882;OID=.;OPOS=3564068;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:12:12:4:4:8:8:0.666667:5:3:2:2:5:3:2:2
chr17	3564073	.	A	G	49.61	PASS	AF=0.538462;AO=7;DP=13;FAO=7;FDP=13;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0194761;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.6164;QD=15.264;RBI=0.0316066;REFB=-0.0136059;REVB=-0.0248929;RO=6;SAF=3;SAR=4;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0560707;STB=0.533237;STBP=0.935;TYPE=snp;VARB=0.0404979;OID=.;OPOS=3564073;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:13:13:6:6:7:7:0.538462:4:3:3:3:4:3:3:3
chr17	3564084	.	T	C	41.14	PASS	AF=0.6;AO=6;DP=10;FAO=6;FDP=10;FR=.;FRO=4;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.026453;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.83;QD=16.4544;RBI=0.0264731;REFB=-0.0165074;REVB=-0.00103131;RO=4;SAF=3;SAR=3;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00719948;OID=.;OPOS=3564084;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:10:10:4:4:6:6:0.6:3:3:2:2:3:3:2:2
chr17	3564378	.	C	T	130.64	PASS	AF=0.608696;AO=14;DP=23;FAO=14;FDP=23;FR=.;FRO=9;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.0110621;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.541;QD=22.7198;RBI=0.0214228;REFB=-0.0551757;REVB=0.0183458;RO=9;SAF=9;SAR=5;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0643851;STB=0.536371;STBP=0.72;TYPE=snp;VARB=0.0346445;OID=.;OPOS=3564378;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:23:23:9:9:14:14:0.608696:5:9:5:4:5:9:5:4
chr17	3564400	.	TT	AG,TG	313.44	PASS	AF=0.375,0.625;AO=9,15;DP=24;FAO=9,15;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=4,10;FSAR=5,5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0314109,-0.0284058;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=2,1;MLLD=48.7966,87.8281;QD=52.2406;RBI=0.0543444,0.0384682;REFB=0,0;REVB=0.0443472,0.0259405;RO=0;SAF=4,10;SAR=5,5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0262649,0.034269;OID=.,.;OPOS=3564400,3564401;OREF=TT,T;OALT=AG,G;OMAPALT=AG,TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:65:24:24:0:0:9,15:9,15:0.375,0.625:5,5:4,10:0:0:5,5:4,10:0:0
chr17	3568012	.	A	G	33.76	PASS	AF=0.162162;AO=6;DP=37;FAO=6;FDP=37;FR=.;FRO=31;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=0.0202518;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.69;QD=3.64933;RBI=0.0212553;REFB=-0.000228776;REVB=0.00645379;RO=31;SAF=1;SAR=5;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.313816;STB=0.729466;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.00156403;OID=.;OPOS=3568012;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:37:37:31:31:6:6:0.162162:5:1:12:19:5:1:12:19
chr17	3577146	.	C	T	221.34	PASS	AF=0.714286;AO=20;DP=29;FAO=20;FDP=28;FR=.;FRO=8;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=0.0395393;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=311.243;QD=31.6199;RBI=0.0397829;REFB=0.00494187;REVB=-0.00439549;RO=8;SAF=7;SAR=13;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.211544;STB=0.616669;STBP=0.056;TYPE=snp;VARB=-0.00161301;OID=.;OPOS=3577146;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:29:28:8:8:20:20:0.714286:13:7:6:2:13:7:6:2
chr17	3594276	.	TG	T	194.59	PASS	AF=1;AO=18;DP=20;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.275924;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=17.0064;QD=37.0656;RBI=0.278667;REFB=0;REVB=-0.0390032;RO=2;SAF=2;SAR=16;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.299998;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.017931;OID=.;OPOS=3594277;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:18:20:21:21:0:5:16:0:0:3:2:2:16:2:0
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chr17	3657159	.	C	T	81.96	PASS	AF=0.289474;AO=11;DP=38;FAO=11;FDP=38;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=0.0124397;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=256.704;QD=8.62781;RBI=0.0135292;REFB=0.0076147;REVB=-0.00531924;RO=27;SAF=6;SAR=5;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.201073;STB=0.622427;STBP=0.372;TYPE=snp;VARB=-0.0233015;OID=.;OPOS=3657159;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:81:38:38:27:27:11:11:0.289474:5:6:10:17:5:6:10:17
chr17	3657175	.	T	C	43.22	PASS	AF=0.2;AO=7;DP=35;FAO=7;FDP=35;FR=.;FRO=28;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=0.00248423;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.751;QD=4.93922;RBI=0.00682763;REFB=-0.00594485;REVB=0.00635965;RO=27;SAF=5;SAR=2;SRF=9;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.432753;STB=0.768521;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=0.0279697;OID=.;OPOS=3657175;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:35:35:27:28:7:7:0.2:2:5:9:18:2:5:10:18
chr17	3749411	.	T	G	117.23	PASS	AF=0.65;AO=12;DP=20;FAO=13;FDP=20;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.0188868;FXX=0.0475964;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.7189;QD=23.4451;RBI=0.0407871;REFB=-0.0648975;REVB=-0.0361508;RO=6;SAF=3;SAR=9;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175522;STB=0.54775;STBP=0.624;TYPE=snp;VARB=0.0488159;OID=.;OPOS=3749411;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:20:20:6:7:12:13:0.65:9:3:3:3:9:4:3:4
chr17	3775848	.	T	C	497.9	PASS	AF=0.758621;AO=39;DP=53;FAO=44;FDP=58;FR=.;FRO=14;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=11;FSRR=3;FWDB=0.0160522;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=286.778;QD=34.3379;RBI=0.0296073;REFB=-0.0276455;REVB=0.0248781;RO=14;SAF=19;SAR=20;SRF=11;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145466;STB=0.563953;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=0.0125577;OID=.;OPOS=3775848;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:93:53:58:14:14:39:44:0.758621:20:19:11:3:21:23:11:3
chr17	3775916	.	T	C	420.4	PASS	AF=0.716981;AO=37;DP=52;FAO=38;FDP=53;FR=.;FRO=15;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=12;FSRR=3;FWDB=0.0138943;FXX=0.036357;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.9962;QD=31.7286;RBI=0.0211109;REFB=0.00480317;REVB=0.015894;RO=13;SAF=17;SAR=20;SRF=11;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184222;STB=0.598769;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.00338707;OID=.;OPOS=3775916;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:53:13:15:37:38:0.716981:20:17:11:2:21:17:12:3
chr17	3787725	.	T	TA	96.5	PASS	AF=0.733333;AO=2;DP=15;FAO=11;FDP=15;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0937317;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=162.854;QD=25.7333;RBI=0.0999111;REFB=-0.0669592;REVB=0.034592;RO=13;SAF=0;SAR=2;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.540126;STB=0.53839;STBP=0.673;TYPE=ins;VARB=0.0379197;OID=.;OPOS=3787726;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.733333:2:15:11:15:4:4:7:2:2:21:13:0:2:6:7
chr17	3787726	.	G	A	59.4	PASS	AF=0.533333;AO=8;DP=15;FAO=8;FDP=15;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.0271752;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=176.833;QD=15.8401;RBI=0.0371999;REFB=-0.0208666;REVB=0.0254035;RO=6;SAF=3;SAR=5;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.032898;STB=0.526249;STBP=0.917;TYPE=snp;VARB=0.015914;OID=.;OPOS=3787726;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:15:15:6:7:8:8:0.533333:5:3:2:4:5:3:3:4
chr17	3818788	.	G	A	501.66	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0481482;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.906;QD=59.0186;RBI=0.0544635;REFB=0;REVB=0.0254563;RO=0;SAF=17;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000205037;OID=.;OPOS=3818788;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:17:17:0:0:17:17:0:0
chr17	3818830	.	A	G	429.02	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0413769;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.019;QD=57.202;RBI=0.0430084;REFB=0;REVB=0.0117336;RO=0;SAF=10;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000408865;OID=.;OPOS=3818830;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:20:10:0:0:20:10:0:0
chr17	3819002	.	T	C	255.92	PASS	AF=1;AO=14;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0172109;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.841;QD=51.1845;RBI=0.0194537;REFB=0;REVB=0.00906816;RO=0;SAF=8;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.8024e-05;OID=.;OPOS=3819002;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:14:20:1:6:8:0:0:9:11:0:0
chr17	3828086	.	C	G	349.84	PASS	AF=0.6;AO=30;DP=50;FAO=30;FDP=50;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=0.131742;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.8131;QD=27.9875;RBI=0.132672;REFB=-0.0340905;REVB=0.0156805;RO=20;SAF=12;SAR=18;SRF=6;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0770478;STB=0.542345;STBP=0.486;TYPE=snp;VARB=0.0163598;OID=.;OPOS=3828086;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:20:20:30:30:0.6:18:12:6:14:18:12:6:14
chr17	3909404	.	C	A	92.89	PASS	AF=0.245283;AO=13;DP=53;FAO=13;FDP=53;FR=.;FRO=40;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=17;FSRR=23;FWDB=0.0277698;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.087;QD=7.01044;RBI=0.027851;REFB=-0.012712;REVB=-0.00212479;RO=40;SAF=7;SAR=6;SRF=17;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136809;STB=0.584886;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.0479936;OID=.;OPOS=3909404;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:53:53:40:40:13:13:0.245283:6:7:17:23:6:7:17:23
chr17	3921203	.	G	C	120.09	PASS	AF=0.294118;AO=15;DP=51;FAO=15;FDP=51;FR=.;FRO=36;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=-0.0353281;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=253.929;QD=9.41878;RBI=0.035749;REFB=-0.0102809;REVB=-0.0054693;RO=36;SAF=7;SAR=8;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0261609;STB=0.515768;STBP=0.888;TYPE=snp;VARB=0.0259725;OID=.;OPOS=3921203;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:36:36:15:15:0.294118:8:7:16:20:8:7:16:20
chr17	3947644	.	T	C	109.3	PASS	AF=0.266667;AO=16;DP=59;FAO=16;FDP=60;FR=.;FRO=44;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=25;FSRR=19;FWDB=-0.0805577;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.4152;QD=7.28696;RBI=0.0838726;REFB=-0.0169555;REVB=-0.0233465;RO=43;SAF=10;SAR=6;SRF=24;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0829764;STB=0.543423;STBP=0.698;TYPE=snp;VARB=0.0530402;OID=.;OPOS=3947644;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:60:43:44:16:16:0.266667:6:10:24:19:6:10:25:19
chr17	3953083	.	T	C	55.79	PASS	AF=0.169811;AO=10;DP=54;FAO=9;FDP=53;FR=.;FRO=44;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=-0.00525091;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.493;QD=4.21086;RBI=0.0229504;REFB=-0.00130218;REVB=-0.0223417;RO=44;SAF=3;SAR=7;SRF=22;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.251876;STB=0.640708;STBP=0.372;TYPE=snp;VARB=0.00721142;OID=.;OPOS=3953083;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:54:53:44:44:10:9:0.169811:7:3:22:22:6:3:22:22
chr17	3953102	.	A	G	63.73	PASS	AF=0.185185;AO=10;DP=54;FAO=10;FDP=54;FR=.;FRO=44;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=21;FSRR=23;FWDB=-0.00358799;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.166;QD=4.72063;RBI=0.00958462;REFB=-0.00533858;REVB=-0.0088877;RO=42;SAF=3;SAR=7;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.22484;STB=0.650851;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=0.0349702;OID=.;OPOS=3953102;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:54:54:42:44:10:10:0.185185:7:3:20:22:7:3:21:23
chr17	3966064	.	A	G	68.75	PASS	AF=0.204082;AO=10;DP=50;FAO=10;FDP=49;FR=.;FRO=39;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=23;FWDB=-0.0147684;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.918;QD=5.61238;RBI=0.0150522;REFB=-0.00261403;REVB=-0.00290916;RO=39;SAF=5;SAR=5;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.078537;STB=0.571289;STBP=0.643;TYPE=snp;VARB=0.00904504;OID=.;OPOS=3966064;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:68:50:49:39:39:10:10:0.204082:5:5:17:22:5:5:16:23
chr17	4088291	.	C	T	159.79	PASS	AF=0.666667;AO=16;DP=24;FAO=16;FDP=24;FR=.;FRO=8;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.0464963;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.968;QD=26.6308;RBI=0.0465373;REFB=-0.0181078;REVB=0.00195304;RO=8;SAF=8;SAR=8;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149749;STB=0.583232;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=0.0170766;OID=.;OPOS=4088291;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:24:24:8:8:16:16:0.666667:8:8:2:6:8:8:2:6
chr17	4337412	.	C	G	290.05	PASS	AF=0.694444;AO=25;DP=36;FAO=25;FDP=36;FR=.;FRO=11;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.0169091;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.962;QD=32.2282;RBI=0.0199241;REFB=-0.0362831;REVB=-0.0105381;RO=10;SAF=11;SAR=14;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0316266;STB=0.504501;STBP=0.935;TYPE=snp;VARB=0.0119126;OID=.;OPOS=4337412;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:36:36:10:11:25:25:0.694444:14:11:5:5:14:11:5:6
chr17	4440907	.	A	G	72.34	PASS	AF=0.294118;AO=10;DP=34;FAO=10;FDP=34;FR=.;FRO=24;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=21;FWDB=-0.0940749;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.5391;QD=8.5103;RBI=0.102006;REFB=-0.00253664;REVB=-0.039435;RO=24;SAF=2;SAR=8;SRF=3;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152705;STB=0.591676;STBP=0.656;TYPE=snp;VARB=-0.00348413;OID=.;OPOS=4440907;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:34:34:24:24:10:10:0.294118:8:2:3:21:8:2:3:21
chr17	4446457	.	G	A	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100254;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=274.646;QD=55.0987;RBI=0.0149375;REFB=0;REVB=0.0110733;RO=0;SAF=13;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.46568e-05;OID=.;OPOS=4446457;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:13:13:0:0:13:13:0:0
chr17	4448133	.	G	A	183.62	PASS	AF=0.202703;AO=30;DP=148;FAO=30;FDP=148;FR=.;FRO=118;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=70;FSRR=48;FWDB=0.00038217;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.483;QD=4.96273;RBI=0.0412459;REFB=-0.00328028;REVB=0.0412441;RO=118;SAF=13;SAR=17;SRF=70;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.201712;STB=0.625362;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.0127614;OID=.;OPOS=4448133;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:148:148:118:118:30:30:0.202703:17:13:70:48:17:13:70:48
chr17	4455500	.	T	C	651.21	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0211656;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.731;QD=62.0204;RBI=0.0215671;REFB=0;REVB=-0.00414191;RO=0;SAF=22;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.43916e-05;OID=.;OPOS=4455500;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:20:22:0:0:20:22:0:0
chr17	4458598	.	G	C	108.0	PASS	AF=0.393939;AO=13;DP=33;FAO=13;FDP=33;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=0.00437637;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=153.032;QD=13.0907;RBI=0.0184734;REFB=-0.0162223;REVB=-0.0179476;RO=20;SAF=7;SAR=6;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.064306;STB=0.537678;STBP=0.753;TYPE=snp;VARB=0.0324195;OID=.;OPOS=4458598;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:20:20:13:13:0.393939:6:7:12:8:6:7:12:8
chr17	4463023	.	G	A	743.89	PASS	AF=0.673913;AO=62;DP=92;FAO=62;FDP=92;FR=.;FRO=30;FSAF=45;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=0.00730718;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=237.673;QD=32.3429;RBI=0.0176401;REFB=-0.0301606;REVB=-0.0160555;RO=30;SAF=45;SAR=17;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199266;STB=0.608071;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.00719797;OID=.;OPOS=4463023;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:30:30:62:62:0.673913:17:45:13:17:17:45:13:17
chr17	4463699	.	G	A	195.83	PASS	AF=0.347222;AO=25;DP=72;FAO=25;FDP=72;FR=.;FRO=47;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=25;FSRR=22;FWDB=0.00723503;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=147.539;QD=10.8792;RBI=0.0174204;REFB=-0.00293154;REVB=0.0158469;RO=47;SAF=16;SAR=9;SRF=25;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125866;STB=0.57335;STBP=0.357;TYPE=snp;VARB=0.00259745;OID=.;OPOS=4463699;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:47:47:25:25:0.347222:9:16:25:22:9:16:25:22
chr17	4495682	.	G	A	49.71	PASS	AF=0.177778;AO=8;DP=45;FAO=8;FDP=45;FR=.;FRO=37;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=0.00663259;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.0359;QD=4.41858;RBI=0.037052;REFB=-0.0122473;REVB=0.0364535;RO=37;SAF=6;SAR=2;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.241783;STB=0.666223;STBP=0.331;TYPE=snp;VARB=0.072252;OID=.;OPOS=4495682;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:49:45:45:37:37:8:8:0.177778:2:6:21:16:2:6:21:16
chr17	4495740	.	G	A	353.02	PASS	AF=0.828571;AO=27;DP=35;FAO=29;FDP=35;FR=.;FRO=6;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0255071;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=158.549;QD=40.345;RBI=0.157859;REFB=-0.0362229;REVB=0.155785;RO=8;SAF=13;SAR=14;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0448969;STB=0.50894;STBP=0.841;TYPE=snp;VARB=0.0081608;OID=.;OPOS=4495740;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:35:35:8:6:27:29:0.828571:14:13:3:5:16:13:3:3
chr17	4497160	.	T	C	227.13	PASS	AF=0.8;AO=19;DP=25;FAO=20;FDP=25;FR=.;FRO=5;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.00807649;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.852;QD=36.3409;RBI=0.0212467;REFB=-0.0167271;REVB=0.0196518;RO=3;SAF=7;SAR=12;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00943599;STB=0.542331;STBP=0.47;TYPE=snp;VARB=0.00687378;OID=.;OPOS=4497160;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:27:25:25:3:5:19:20:0.8:12:7:1:2:12:8:1:4
chr17	4544904	.	A	G	130.04	PASS	AF=0.3;AO=18;DP=60;FAO=18;FDP=60;FR=.;FRO=42;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=27;FSRR=15;FWDB=-0.00868548;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.789;QD=8.66919;RBI=0.0101935;REFB=-0.00427482;REVB=-0.00533578;RO=41;SAF=7;SAR=11;SRF=26;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.280047;STB=0.672479;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=0.0162132;OID=.;OPOS=4544904;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:41:42:18:18:0.3:11:7:26:15:11:7:27:15
chr17	4545581	.	C	T	147.59	PASS	AF=0.875;AO=14;DP=16;FAO=14;FDP=16;FR=.;FRO=2;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.148515;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.368;QD=36.8982;RBI=0.148902;REFB=-0.159426;REVB=0.0107296;RO=2;SAF=4;SAR=10;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180146;STB=0.59985;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=0.0055966;OID=.;OPOS=4545581;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:16:16:2:2:14:14:0.875:10:4:2:0:10:4:2:0
chr17	4575283	.	A	G	375.67	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0111037;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.139;QD=55.6543;RBI=0.0167061;REFB=0;REVB=0.0124821;RO=0;SAF=15;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.79625e-05;OID=.;OPOS=4575283;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:12:15:0:0:12:15:0:0
chr17	4620497	.	C	T	330.39	PASS	AF=0.961538;AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0637386;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.4829;QD=50.8298;RBI=0.0637553;REFB=0.0113042;REVB=0.00145969;RO=1;SAF=11;SAR=14;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0319949;STB=0.517228;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=-0.00103476;OID=.;OPOS=4620497;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:26:26:1:1:25:25:0.961538:14:11:0:1:14:11:0:1
chr17	4622638	.	C	T	175.67	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0211307;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.461;QD=46.8463;RBI=0.0363891;REFB=0;REVB=0.0296253;RO=0;SAF=5;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0010478;OID=.;OPOS=4622638;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:10:5:0:0:10:5:0:0
chr17	4637886	.	G	A	234.43	PASS	AF=0.611111;AO=21;DP=35;FAO=22;FDP=36;FR=.;FRO=14;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.0152026;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.811;QD=26.0482;RBI=0.0154317;REFB=-0.00811806;REVB=0.00264956;RO=14;SAF=13;SAR=8;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0359042;STB=0.526857;STBP=0.734;TYPE=snp;VARB=0.00410369;OID=.;OPOS=4637886;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:36:14:14:21:22:0.611111:8:13:8:6:8:14:8:6
chr17	4638484	.	T	C	231.75	PASS	AF=0.7;AO=20;DP=29;FAO=21;FDP=30;FR=.;FRO=9;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.0165567;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.457;QD=30.8997;RBI=0.0290993;REFB=-0.0127368;REVB=0.02393;RO=9;SAF=9;SAR=11;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.059495;STB=0.538425;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.00646742;OID=.;OPOS=4638484;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:29:30:9:9:20:21:0.7:11:9:5:4:12:9:5:4
chr17	4638563	.	G	A	288.79	PASS	AF=0.577778;AO=26;DP=45;FAO=26;FDP=45;FR=.;FRO=19;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.0015495;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.4246;QD=25.6704;RBI=0.00631121;REFB=-0.00375232;REVB=-0.00611804;RO=19;SAF=17;SAR=9;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0185948;STB=0.510311;STBP=0.902;TYPE=snp;VARB=0.00313067;OID=.;OPOS=4638563;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:19:19:26:26:0.577778:9:17:12:7:9:17:12:7
chr17	4638737	.	A	G	151.94	PASS	AF=0.75;AO=15;DP=19;FAO=15;FDP=20;FR=.;FRO=5;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=-0.0106468;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=108.053;QD=30.3869;RBI=0.0952543;REFB=0.0111513;REVB=-0.0946575;RO=4;SAF=7;SAR=8;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.201273;STB=0.582673;STBP=0.225;TYPE=snp;VARB=-0.00617355;OID=.;OPOS=4638737;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:19:20:4:5:15:15:0.75:8:7:4:0:8:7:4:1
chr17	4641755	.	C	T	284.02	PASS	AF=0.774194;AO=24;DP=31;FAO=24;FDP=31;FR=.;FRO=7;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.0041488;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=288.354;QD=36.6471;RBI=0.00417634;REFB=0.0216303;REVB=0.000478783;RO=7;SAF=16;SAR=8;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106323;STB=0.55809;STBP=0.263;TYPE=snp;VARB=-0.00787998;OID=.;OPOS=4641755;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:31:31:7:7:24:24:0.774194:8:16:3:4:8:16:3:4
chr17	4686414	.	A	C	415.48	PASS	AF=0.690909;AO=37;DP=54;FAO=38;FDP=55;FR=.;FRO=17;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.00549357;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.733;QD=30.2167;RBI=0.0156107;REFB=-0.0345287;REVB=0.0146121;RO=17;SAF=13;SAR=24;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10886;STB=0.551972;STBP=0.273;TYPE=snp;VARB=0.0141552;OID=.;OPOS=4686414;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:55:17:17:37:38:0.690909:24:13:9:8:24:14:9:8
chr17	4689572	.	T	C	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0279427;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.746;QD=51.1844;RBI=0.0343479;REFB=0;REVB=-0.0199745;RO=0;SAF=8;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000101274;OID=.;OPOS=4689572;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:12:8:0:0:12:8:0:0
chr17	4692559	.	G	T	174.6	PASS	AF=1;AO=11;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0332884;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.496;QD=46.5599;RBI=0.0435253;REFB=0;REVB=0.0280416;RO=0;SAF=2;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0112264;OID=.;OPOS=4692559;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:11:15:1:9:2:0:0:11:4:0:0
chr17	4693170	.	T	C	215.47	PASS	AF=1;AO=16;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0239255;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.114;QD=47.8816;RBI=0.0338366;REFB=0;REVB=0.0239266;RO=0;SAF=2;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000253678;OID=.;OPOS=4693170;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:16:18:1:14:2:0:0:14:4:0:0
chr17	4699552	.	G	A	112.71	PASS	AF=0.291667;AO=14;DP=48;FAO=14;FDP=48;FR=.;FRO=34;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=0.0205734;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.389;QD=9.39255;RBI=0.0259966;REFB=-0.00740385;REVB=0.0158922;RO=33;SAF=5;SAR=9;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.219768;STB=0.642653;STBP=0.238;TYPE=snp;VARB=0.0241851;OID=.;OPOS=4699552;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:33:34:14:14:0.291667:9:5:18:15:9:5:19:15
chr17	4712395	.	A	T	88.84	PASS	AF=0.769231;AO=9;DP=12;FAO=10;FDP=13;FR=.;FRO=3;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.00310361;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.596;QD=27.334;RBI=0.00370967;REFB=-0.01717;REVB=0.00203205;RO=2;SAF=5;SAR=4;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0179867;STB=0.538385;STBP=0.694;TYPE=snp;VARB=0.0100264;OID=.;OPOS=4712395;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:12:13:2:3:9:10:0.769231:4:5:1:1:5:5:2:1
chr17	4718776	.	G	A	45.48	PASS	AF=0.333333;AO=7;DP=21;FAO=7;FDP=21;FR=.;FRO=14;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=0.0568528;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.5019;QD=8.66339;RBI=0.0660259;REFB=-0.011789;REVB=0.0335735;RO=14;SAF=2;SAR=5;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0999021;STB=0.561239;STBP=0.743;TYPE=snp;VARB=0.0332441;OID=.;OPOS=4718776;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:21:21:14:14:7:7:0.333333:5:2:3:11:5:2:3:11
chr17	4722133	.	C	T	34.83	PASS	AF=0.833333;AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.110962;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.69;QD=23.2184;RBI=0.11097;REFB=0.0143324;REVB=0.00134258;RO=1;SAF=1;SAR=4;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0951258;STB=0.555346;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=0.00132845;OID=.;OPOS=4722133;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:6:6:1:1:5:5:0.833333:4:1:0:1:4:1:0:1
chr17	4790903	.	A	G	30.03	PASS	AF=0.0860215;AO=8;DP=92;FAO=8;FDP=93;FR=.;FRO=85;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=31;FSRR=54;FWDB=-0.0113337;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.8082;QD=1.29153;RBI=0.0210081;REFB=-0.00329072;REVB=-0.0176886;RO=83;SAF=7;SAR=1;SRF=31;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.530291;STB=0.909295;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.0628896;OID=.;OPOS=4790903;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:92:93:83:85:8:8:0.0860215:1:7:31:52:1:7:31:54
chr17	4796274	.	T	C	805.14	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0234008;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.049;QD=64.4108;RBI=0.0327261;REFB=0;REVB=0.0228779;RO=0;SAF=29;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.20481e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.96946e-06;OID=.;OPOS=4796274;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:21:29:0:0:21:29:0:0
chr17	4796286	.	C	T	743.66	PASS	AF=0.96;AO=48;DP=50;FAO=48;FDP=50;FR=.;FRO=2;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.048813;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.885;QD=59.4927;RBI=0.0547275;REFB=-0.180145;REVB=0.0247466;RO=2;SAF=26;SAR=22;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0348198;STB=0.518511;STBP=0.249;TYPE=snp;VARB=0.00167926;OID=.;OPOS=4796286;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:50:50:2:2:48:48:0.96:22:26:2:0:22:26:2:0
chr17	4797305	.	G	A	154.95	PASS	AF=0.789474;AO=15;DP=19;FAO=15;FDP=19;FR=.;FRO=4;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.00470965;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.2424;QD=32.622;RBI=0.0225525;REFB=-0.0414902;REVB=-0.0220552;RO=3;SAF=6;SAR=9;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0822223;STB=0.52171;STBP=0.729;TYPE=snp;VARB=0.0173501;OID=.;OPOS=4797305;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:20:19:19:3:4:15:15:0.789474:9:6:2:1:9:6:2:2
chr17	4801163	.	C	A	137.52	PASS	AF=0.928571;AO=13;DP=14;FAO=13;FDP=14;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0471739;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=238.303;QD=39.2901;RBI=0.047174;REFB=-0.04854;REVB=8.91396e-05;RO=0;SAF=1;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.00075e-08;STB=0.51997;STBP=0.663;TYPE=snp;VARB=0.000274505;OID=.;OPOS=4801163;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:14:14:0:1:13:13:0.928571:12:1:0:0:12:1:0:1
chr17	4801286	.	C	T	104.24	PASS	AF=0.625;AO=8;DP=20;FAO=10;FDP=16;FR=.,HEALED;FRO=5;FSAF=0;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=-0.000196202;FXX=0.1999;HRUN=8;LEN=1;MLLD=279.434;QD=26.0598;RBI=0.00706299;REFB=0.0130786;REVB=0.00706026;RO=9;SAF=0;SAR=8;SRF=1;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.736597;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0119384;OID=.;OPOS=4801286;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:20:16:9:5:8:10:0.625:8:0:1:8:10:0:0:5
chr17	4863410	.	A	G	37.14	PASS	AF=0.333333;AO=6;DP=18;FAO=6;FDP=18;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.0183996;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.7028;QD=8.25342;RBI=0.0442317;REFB=-0.00171328;REVB=0.0402231;RO=12;SAF=3;SAR=3;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0883056;STB=0.555373;STBP=0.753;TYPE=snp;VARB=0.00889867;OID=.;OPOS=4863410;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:18:18:12:12:6:6:0.333333:3:3:5:7:3:3:5:7
chr17	4904564	.	T	C	145.55	PASS	AF=0.444444;AO=16;DP=36;FAO=16;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=4;FSRR=16;FWDB=-0.0191059;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.4312;QD=16.1723;RBI=0.0748581;REFB=0.00171499;REVB=-0.0723789;RO=20;SAF=4;SAR=12;SRF=4;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0671832;STB=0.538415;STBP=0.754;TYPE=snp;VARB=-0.00346194;OID=.;OPOS=4904564;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:20:20:16:16:0.444444:12:4:4:16:12:4:4:16
chr17	4926882	.	A	G	871.88	PASS	AF=0.72549;AO=74;DP=105;FAO=74;FDP=102;FR=.;FRO=28;FSAF=44;FSAR=30;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=0.00251959;FXX=0.0285687;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.5;QD=34.1912;RBI=0.0129112;REFB=-0.048985;REVB=-0.012663;RO=28;SAF=44;SAR=30;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0681126;STB=0.536575;STBP=0.238;TYPE=snp;VARB=0.0115008;OID=.;OPOS=4926882;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:102:28:28:74:74:0.72549:30:44:13:15:30:44:13:15
chr17	4927026	.	GCCCCC	GCCCC,GCCCCG,GGCCCC	62.54	PASS	AF=0.333333,0,0;AO=13,2,2;DP=50;FAO=17,0,0;FDP=51;FR=.;FRO=34;FSAF=3,0,0;FSAR=14,0,0;FSRF=27;FSRR=7;FWDB=0.0377972,-0.0387335,0.0456111;FXX=0.0192271;HRUN=5,5,5;LEN=1,1,1;MLLD=11.6628,90.9019,24.824;QD=4.90476;RBI=0.156204,0.0424326,0.0559789;REFB=-0.0914085,-0.0141805,-0.0598407;REVB=-0.151562,-0.0173274,0.032454;RO=30;SAF=3,1,0;SAR=10,1,2;SRF=24;SRR=6;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.594846,-0.318791,-0.641372;STB=0.869187,0.5,0.5;STBP=0.004,1,1;TYPE=del,snp,snp;VARB=0.123323,0.0023976,0;OID=.,.,.;OPOS=4927027,4927031,4927027;OREF=C,C,C;OALT=-,G,G;OMAPALT=GCCCC,GCCCCG,GGCCCC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.333333,0,0:13,2,2:50:17,0,0:51:34:3,0,0:14,0,0:27:7:62:30:3,1,0:10,1,2:24:6
chr17	4936898	.	C	T	64.38	PASS	AF=0.727273;AO=8;DP=10;FAO=8;FDP=11;FR=.;FRO=3;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0424281;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.3448;QD=23.4108;RBI=0.104132;REFB=-0.042103;REVB=-0.0950967;RO=2;SAF=6;SAR=2;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12621;STB=0.529336;STBP=0.878;TYPE=snp;VARB=0.00836931;OID=.;OPOS=4936898;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:10:11:2:3:8:8:0.727273:2:6:2:0:2:6:2:1
chr17	4937575	.	T	C	217.16	PASS	AF=1;AO=17;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0409735;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.101;QD=48.2586;RBI=0.0416617;REFB=0;REVB=-0.00754096;RO=0;SAF=8;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000785826;OID=.;OPOS=4937575;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:17:18:1:9:8:0:0:9:9:0:0
chr17	4996915	.	AC	A	74.91	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0463536;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.977;QD=37.4544;RBI=0.0509053;REFB=0;REVB=0.0210403;RO=0;SAF=3;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000901995;OID=.;OPOS=4996916;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:8:8:8:8:0:3:5:0:0:4:0:3:5:0:0
chr17	4997039	.	G	C	188.24	PASS	AF=0.85;AO=17;DP=20;FAO=17;FDP=20;FR=.;FRO=3;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0350224;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.222;QD=37.648;RBI=0.0409023;REFB=0.0220881;REVB=-0.0211288;RO=3;SAF=10;SAR=7;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119205;STB=0.565144;STBP=0.2;TYPE=snp;VARB=-0.00687035;OID=.;OPOS=4997039;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:20:20:3:3:17:17:0.85:7:10:3:0:7:10:3:0
chr17	4997433	.	G	A	255.66	PASS	AF=0.657143;AO=23;DP=35;FAO=23;FDP=35;FR=.;FRO=12;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=11;FWDB=0.00295625;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.0654;QD=29.2189;RBI=0.0144405;REFB=-0.0249947;REVB=0.0141347;RO=12;SAF=12;SAR=11;SRF=1;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.271398;STB=0.648529;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.0080897;OID=.;OPOS=4997433;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:35:35:12:12:23:23:0.657143:11:12:1:11:11:12:1:11
chr17	4997787	.	A	G	330.41	PASS	AF=0.961538;AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0234475;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.882;QD=50.8325;RBI=0.0322041;REFB=-0.0227647;REVB=0.0220753;RO=0;SAF=14;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.99383e-08;STB=0.517228;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.000150517;OID=.;OPOS=4997787;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:26:26:0:1:25:25:0.961538:11:14:0:0:11:14:1:0
chr17	4998030	.	G	C	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00646074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.1052;QD=33.4285;RBI=0.00960847;REFB=0;REVB=-0.00711207;RO=0;SAF=3;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.66067e-05;OID=.;OPOS=4998030;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:3:3:0:0:3:3:0:0
chr17	4998586	.	G	A	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0114194;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.243;QD=37.4885;RBI=0.0152152;REFB=0;REVB=0.0100548;RO=0;SAF=4;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000379573;OID=.;OPOS=4998586;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:4:4:0:0:4:4:0:0
chr17	4998852	.	G	C	102.07	PASS	AF=0.785714;AO=11;DP=14;FAO=11;FDP=14;FR=.;FRO=3;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0105549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.668;QD=29.1618;RBI=0.0203318;REFB=-0.019467;REVB=-0.0173775;RO=3;SAF=7;SAR=4;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0125323;STB=0.507029;STBP=0.969;TYPE=snp;VARB=0.00693438;OID=.;OPOS=4998852;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:14:14:3:3:11:11:0.785714:4:7:2:1:4:7:2:1
chr17	5036205	.	A	C	36.16	PASS	AF=0.230769;AO=6;DP=25;FAO=6;FDP=26;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=15;FWDB=-0.00654066;FXX=0.0370233;HRUN=4;LEN=1;MLLD=211.762;QD=5.56232;RBI=0.0102285;REFB=-0.00370182;REVB=-0.00786395;RO=18;SAF=4;SAR=2;SRF=4;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.480808;STB=0.789902;STBP=0.127;TYPE=snp;VARB=0.0176524;OID=.;OPOS=5036205;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:25:26:18:20:6:6:0.230769:2:4:4:14:2:4:5:15
chr17	5036210	.	TC	GT	36.27	PASS	AF=0.230769;AO=6;DP=27;FAO=6;FDP=26;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=15;FWDB=-0.0152327;FXX=0.0370233;HRUN=2;LEN=2;MLLD=142.079;QD=5.57973;RBI=0.0246232;REFB=-0.010643;REVB=-0.0193459;RO=20;SAF=4;SAR=2;SRF=5;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.458712;STB=0.789902;STBP=0.127;TYPE=mnp;VARB=0.0148691;OID=.;OPOS=5036210;OREF=TC;OALT=GT;OMAPALT=GT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:27:26:20:20:6:6:0.230769:2:4:5:15:2:4:5:15
chr17	5036214	.	C	T	34.72	PASS	AF=0.2;AO=6;DP=30;FAO=6;FDP=30;FR=.;FRO=24;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=0.000630737;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.61;QD=4.62991;RBI=0.00351254;REFB=-0.00416539;REVB=0.00345545;RO=23;SAF=4;SAR=2;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.362177;STB=0.749251;STBP=0.225;TYPE=snp;VARB=0.0184148;OID=.;OPOS=5036214;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:30:30:23:24:6:6:0.2:2:4:8:15:2:4:8:16
chr17	5036224	.	C	G	72.7	PASS	AF=0.30303;AO=10;DP=33;FAO=10;FDP=33;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=-0.0129858;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.188;QD=8.81169;RBI=0.0136288;REFB=-0.0158819;REVB=0.00413672;RO=22;SAF=6;SAR=4;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.309184;STB=0.670265;STBP=0.225;TYPE=snp;VARB=0.0517281;OID=.;OPOS=5036224;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:33:33:22:23:10:10:0.30303:4:6:7:15:4:6:8:15
chr17	5036274	.	C	A	106.84	PASS	AF=0.371429;AO=13;DP=35;FAO=13;FDP=35;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=0.0375806;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.769;QD=12.2105;RBI=0.0411517;REFB=0.00791494;REVB=0.0167678;RO=21;SAF=8;SAR=5;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.242909;STB=0.628624;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=-0.0132388;OID=.;OPOS=5036274;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:21:22:13:13:0.371429:5:8:8:13:5:8:9:13
chr17	5036281	.	G	C	107.42	PASS	AF=0.382353;AO=13;DP=34;FAO=13;FDP=34;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.0281236;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.996;QD=12.6376;RBI=0.0282476;REFB=0.0057451;REVB=-0.00264361;RO=21;SAF=8;SAR=5;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.195695;STB=0.615207;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=-0.00900992;OID=.;OPOS=5036281;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:21:21:13:13:0.382353:5:8:9:12:5:8:9:12
chr17	5036748	.	G	T	30.57	PASS	AF=0.0879121;AO=8;DP=90;FAO=8;FDP=91;FR=.;FRO=83;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=61;FSRR=22;FWDB=-0.0378821;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.822;QD=1.34391;RBI=0.0402498;REFB=-0.00109756;REVB=0.0136013;RO=81;SAF=4;SAR=4;SRF=60;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.29402;STB=0.713849;STBP=0.243;TYPE=snp;VARB=0.0105326;OID=.;OPOS=5036748;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:90:91:81:83:8:8:0.0879121:4:4:60:21:4:4:61:22
chr17	5036761	.	A	C	38.07	PASS	AF=0.125;AO=9;DP=76;FAO=9;FDP=72;FR=.,HEALED;FRO=63;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=42;FSRR=21;FWDB=-0.147696;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.462;QD=2.11487;RBI=0.147872;REFB=-0.0144052;REVB=-0.00719856;RO=44;SAF=5;SAR=4;SRF=21;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0956831;STB=0.600429;STBP=0.59;TYPE=snp;VARB=0.0681748;OID=.;OPOS=5036761;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:76:72:44:63:9:9:0.125:4:5:21:23:4:5:42:21
chr17	5036784	.	C	T	53.56	PASS	AF=0.138889;AO=9;DP=67;FAO=10;FDP=72;FR=.,HEALED;FRO=62;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=44;FSRR=18;FWDB=-0.0394334;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=92.2974;QD=2.97528;RBI=0.0975327;REFB=-0.0348233;REVB=-0.0892056;RO=34;SAF=5;SAR=4;SRF=27;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.3202;STB=0.602221;STBP=0.566;TYPE=snp;VARB=0.0631063;OID=.;OPOS=5036784;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:50:67:72:34:62:9:10:0.138889:4:5:27:7:4:6:44:18
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chr17	5036838	.	G	A	49.53	PASS	AF=0.135135;AO=10;DP=76;FAO=10;FDP=74;FR=.;FRO=64;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=24;FSRR=40;FWDB=-0.0120681;FXX=0.0263123;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.948;QD=2.67727;RBI=0.0154906;REFB=-0.00126594;REVB=0.00971178;RO=66;SAF=5;SAR=5;SRF=24;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1689;STB=0.607902;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0119593;OID=.;OPOS=5036838;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:49:76:74:66:64:10:10:0.135135:5:5:24:42:5:5:24:40
chr17	5036843	.	C	A	50.21	PASS	AF=0.138889;AO=10;DP=72;FAO=10;FDP=72;FR=.;FRO=62;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=23;FSRR=39;FWDB=-0.051655;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.9458;QD=2.7892;RBI=0.0553235;REFB=0.0134372;REVB=0.0198103;RO=62;SAF=5;SAR=5;SRF=23;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160132;STB=0.6109;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=-0.0848528;OID=.;OPOS=5036843;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:50:72:72:62:62:10:10:0.138889:5:5:23:39:5:5:23:39
chr17	5039172	.	G	A	75.62	PASS	AF=0.384615;AO=10;DP=26;FAO=10;FDP=26;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=-0.0299679;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.926;QD=11.634;RBI=0.0345973;REFB=-0.00847982;REVB=0.0172886;RO=16;SAF=5;SAR=5;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.261436;STB=0.653567;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=0.0132796;OID=.;OPOS=5039172;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:26:26:16:16:10:10:0.384615:5:5:12:4:5:5:12:4
chr17	5042422	.	G	A	289.31	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0290679;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.165;QD=52.602;RBI=0.0359964;REFB=0;REVB=0.0212319;RO=0;SAF=7;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.79751e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000414969;OID=.;OPOS=5042422;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:15:7:0:0:15:7:0:0
chr17	5042894	.	T	C	972.88	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00551224;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.068;QD=58.9624;RBI=0.00884014;REFB=0;REVB=-0.0069111;RO=0;SAF=39;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.91393e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.5642e-05;OID=.;OPOS=5042894;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:27:39:0:0:27:39:0:0
chr17	5078152	.	A	T	184.77	PASS	AF=0.642857;AO=18;DP=28;FAO=18;FDP=28;FR=.;FRO=10;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=-0.0626113;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.7333;QD=26.3952;RBI=0.0775042;REFB=-0.000940538;REVB=-0.0456806;RO=10;SAF=11;SAR=7;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.260071;STB=0.644374;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=-0.00355373;OID=.;OPOS=5078152;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:28:28:10:10:18:18:0.642857:7:11:2:8:7:11:2:8
chr17	5084763	.	G	A	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0532066;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.0705;QD=51.1841;RBI=0.0539338;REFB=0;REVB=-0.00882693;RO=0;SAF=9;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000914271;OID=.;OPOS=5084763;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:11:9:0:0:11:9:0:0
chr17	5085857	.	C	T	623.66	PASS	AF=1;AO=37;DP=38;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0435432;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.165;QD=60.8451;RBI=0.0473365;REFB=0;REVB=-0.018567;RO=0;SAF=10;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.67388e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.93113e-05;OID=.;OPOS=5085857;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:41:0:0:37:41:1:27:10:0:0:27:14:0:0
chr17	5280440	.	T	C	323.47	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0239913;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.64;QD=53.9109;RBI=0.0354726;REFB=0;REVB=0.026129;RO=0;SAF=12;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000770376;OID=.;OPOS=5280440;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:12:12:0:0:12:12:0:0
chr17	5284698	.	A	G	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142784;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=361.821;QD=45.8068;RBI=0.0216758;REFB=0;REVB=0.0163085;RO=0;SAF=6;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000142476;OID=.;OPOS=5284698;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:8:6:0:0:8:6:0:0
chr17	5284719	.	T	C	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0138684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.604;QD=47.8221;RBI=0.0573806;REFB=0;REVB=0.0556794;RO=0;SAF=7;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000520567;OID=.;OPOS=5284719;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:9:7:0:0:9:7:0:0
chr17	5284770	.	G	A	266.68	PASS	AF=1;AO=20;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.010443;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=250.157;QD=48.4871;RBI=0.0109484;REFB=-0.157277;REVB=-0.00328785;RO=0;SAF=9;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000902962;OID=.;OPOS=5284770;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:22:22:0:0:20:22:1:11:9:0:0:11:11:0:0
chr17	5287297	.	AG	A	381.03	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.147005;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=32.3832;QD=47.6284;RBI=0.168659;REFB=0;REVB=-0.0826766;RO=0;SAF=17;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0.537815;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.00937363;OID=.;OPOS=5287298;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:32:32:32:32:0:17:15:0:0:7:0:17:15:0:0
chr17	5288760	.	A	G	286.82	PASS	AF=1;AO=20;DP=21;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.103382;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.155;QD=52.1489;RBI=0.103442;REFB=0;REVB=0.00352791;RO=0;SAF=11;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00118241;OID=.;OPOS=5288760;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:22:0:0:20:22:1:9:11:0:0:9:13:0:0
chr17	5288769	.	CA	C	212.84	PASS	AF=1;AO=20;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0521878;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.7742;QD=40.5406;RBI=0.0534149;REFB=0;REVB=0.0113835;RO=0;SAF=11;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.0018096;OID=.;OPOS=5288770;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:20:21:21:21:0:12:9:0:0:3:0:11:9:0:0
chr17	5288794	.	G	C	255.9	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00983393;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.8631;QD=51.1796;RBI=0.0772451;REFB=0;REVB=-0.0766166;RO=0;SAF=13;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00107479;OID=.;OPOS=5288794;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:7:13:0:0:7:13:0:0
chr17	5289580	.	A	G	670.25	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0375286;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141;QD=62.349;RBI=0.0396729;REFB=0;REVB=-0.0128663;RO=0;SAF=22;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00012326;OID=.;OPOS=5289580;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:21:22:0:0:21:22:0:0
chr17	5290033	.	T	C	358.13	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0427333;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=74.578;QD=55.0968;RBI=0.0701249;REFB=0;REVB=0.0556001;RO=0;SAF=16;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.71087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000206583;OID=.;OPOS=5290033;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:10:16:0:0:10:16:0:0
chr17	5290703	.	G	A	693.24	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0176107;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.957;QD=63.0219;RBI=0.0251409;REFB=0;REVB=-0.0179423;RO=0;SAF=19;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.97367e-05;OID=.;OPOS=5290703;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:25:19:0:0:25:19:0:0
chr17	5294976	.	T	A	651.23	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0161154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.671;QD=62.0215;RBI=0.0164216;REFB=0;REVB=-0.00315605;RO=0;SAF=17;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.98888e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.97337e-05;OID=.;OPOS=5294976;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:25:17:0:0:25:17:0:0
chr17	5326089	.	C	T	411.06	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00546299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.152;QD=56.6974;RBI=0.0263088;REFB=0;REVB=0.0257354;RO=0;SAF=18;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.98499e-05;OID=.;OPOS=5326089;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:11:18:0:0:11:18:0:0
chr17	5326145	.	C	G	364.38	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0273928;FXX=0.0370233;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.044;QD=56.0586;RBI=0.0273931;REFB=0;REVB=-0.000139586;RO=0;SAF=14;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00283005;OID=.;OPOS=5326145;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:12:14:0:0:12:14:0:0
chr17	5326162	.	G	A	323.42	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0360021;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.026;QD=53.904;RBI=0.0375162;REFB=0;REVB=-0.0105506;RO=0;SAF=12;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000429766;OID=.;OPOS=5326162;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:12:12:0:0:12:12:0:0
chr17	5328633	.	G	A	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0015726;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.116;QD=49.5992;RBI=0.00814978;REFB=0;REVB=-0.00799662;RO=0;SAF=5;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.14922e-05;OID=.;OPOS=5328633;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:13:5:0:0:13:5:0:0
chr17	5334850	.	G	A	375.66	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00675638;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.9124;QD=55.6536;RBI=0.00812342;REFB=0;REVB=0.00451013;RO=0;SAF=9;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.7519e-05;OID=.;OPOS=5334850;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:18:9:0:0:18:9:0:0
chr17	5334873	.	GA	G	395.15	PASS	AF=1;AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00994213;FXX=0.0285633;HRUN=3;LEN=1;MLLD=26.0384;QD=46.4886;RBI=0.026833;REFB=0;REVB=-0.0249232;RO=0;SAF=14;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.48532e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.000345145;OID=.;OPOS=5334874;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:34:35:34:34:0:14:20:0:0:7:0:14:20:0:0
chr17	5347576	.	G	A	689.11	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0246795;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.498;QD=62.646;RBI=0.0486861;REFB=0;REVB=0.0419673;RO=0;SAF=20;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.30465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000685287;OID=.;OPOS=5347576;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:24:20:0:0:24:20:0:0
chr17	5356913	.	C	T	64.94	PASS	AF=0.321429;AO=9;DP=29;FAO=9;FDP=28;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=14;FWDB=-0.0120539;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.91;QD=9.27745;RBI=0.0226503;REFB=-0.00879983;REVB=-0.0191765;RO=19;SAF=4;SAR=5;SRF=5;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.212292;STB=0.62784;STBP=0.408;TYPE=snp;VARB=0.018948;OID=.;OPOS=5356913;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:29:28:19:19:9:9:0.321429:5:4:5:14:5:4:5:14
chr17	5359324	.	GC	G,GG	204.24	PASS	AF=0.846154,0.0769231;AO=14,3;DP=23;FAO=22,2;FDP=26;FR=.;FRO=2;FSAF=14,1;FSAR=8,1;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0597081,0.0304874;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=13.8837,8.91961;QD=31.4207;RBI=0.221067,0.331441;REFB=0.133891,0.0991701;REVB=0.212851,0.330035;RO=5;SAF=12,2;SAR=2,1;SRF=2;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0.466357,0;SSSB=0.320249,0.247694;STB=0.533304,0.748096;STBP=0.417,0.689;TYPE=del,snp;VARB=-0.00867288,0.010102;OID=.,.;OPOS=5359325,5359325;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.846154,0.0769231:14,3:23:22,2:26:2:14,1:8,1:2:0:10:5:12,2:2,1:2:3
chr17	5393461	.	T	C	144.69	PASS	AF=0.333333;AO=19;DP=57;FAO=19;FDP=57;FR=.;FRO=38;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=0.0278826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.1546;QD=10.1538;RBI=0.028278;REFB=0.000799106;REVB=0.00471204;RO=38;SAF=13;SAR=6;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.245191;STB=0.644882;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=-0.000753158;OID=.;OPOS=5393461;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:38:38:19:19:0.333333:6:13:18:20:6:13:18:20
chr17	5393784	.	T	TTTAA	45.57	PASS	AF=0.28;AO=6;DP=30;FAO=7;FDP=25;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=14;FSRR=4;FWDB=0.0294146;FXX=0.0384468;HRUN=3;LEN=4;MLLD=222.08;QD=7.29125;RBI=0.0326898;REFB=-0.00974218;REVB=-0.0142621;RO=24;SAF=5;SAR=1;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.258062;STB=0.558666;STBP=0.753;TYPE=ins;VARB=0.0269462;OID=.;OPOS=5393785;OREF=-;OALT=TTAA;OMAPALT=TTTAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.28:6:30:7:25:18:5:2:14:4:45:24:5:1:16:8
chr17	5404011	.	T	C	122.67	PASS	AF=0.326087;AO=14;DP=45;FAO=15;FDP=46;FR=.;FRO=31;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=-0.0241356;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.816;QD=10.6668;RBI=0.0274505;REFB=-0.00915992;REVB=0.0130767;RO=31;SAF=6;SAR=8;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0108006;STB=0.513495;STBP=0.926;TYPE=snp;VARB=0.00998351;OID=.;OPOS=5404011;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:46:31:31:14:15:0.326087:8:6:13:18:9:6:13:18
chr17	5418107	.	G	A	109.24	PASS	AF=0.27451;AO=14;DP=51;FAO=14;FDP=51;FR=.;FRO=37;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=-0.0197398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.47;QD=8.56749;RBI=0.0209962;REFB=-0.00413043;REVB=0.00715391;RO=36;SAF=5;SAR=9;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17214;STB=0.596401;STBP=0.406;TYPE=snp;VARB=0.00658652;OID=.;OPOS=5418107;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:36:37:14:14:0.27451:9:5:18:18:9:5:18:19
chr17	5424886	.	G	A	50.26	PASS	AF=0.190476;AO=8;DP=42;FAO=8;FDP=42;FR=.;FRO=34;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=0.0204587;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.763;QD=4.78647;RBI=0.0722024;REFB=-0.00278456;REVB=0.0692433;RO=34;SAF=5;SAR=3;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186893;STB=0.624688;STBP=0.485;TYPE=snp;VARB=0.0186761;OID=.;OPOS=5424886;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:50:42:42:34:34:8:8:0.190476:3:5:16:18:3:5:16:18
chr17	5425077	.	T	C	71.07	PASS	AF=0.263158;AO=10;DP=38;FAO=10;FDP=38;FR=.;FRO=28;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=-0.000761846;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=136.825;QD=7.48128;RBI=0.0212346;REFB=4.04991e-05;REVB=-0.0212209;RO=28;SAF=1;SAR=9;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.524438;STB=0.839199;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=-0.00050484;OID=.;OPOS=5425077;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:71:38:38:28:28:10:10:0.263158:9:1:13:15:9:1:13:15
chr17	5440197	.	T	C	68.6	PASS	AF=0.192982;AO=11;DP=57;FAO=11;FDP=57;FR=.;FRO=46;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=25;FSRR=21;FWDB=-0.0121587;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=233.235;QD=4.81375;RBI=0.0222047;REFB=0.00128697;REVB=-0.01858;RO=46;SAF=10;SAR=1;SRF=25;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.533696;STB=0.861977;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=-0.00508822;OID=.;OPOS=5440197;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:68:57:57:46:46:11:11:0.192982:1:10:25:21:1:10:25:21
chr17	5487164	.	C	G	1183.19	PASS	AF=0.671233;AO=98;DP=146;FAO=98;FDP=146;FR=.;FRO=48;FSAF=45;FSAR=53;FSRF=22;FSRR=26;FWDB=-0.0185054;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.0856;QD=32.4161;RBI=0.0557283;REFB=-0.0261598;REVB=0.0525661;RO=47;SAF=45;SAR=53;SRF=21;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00751416;STB=0.500281;STBP=0.999;TYPE=snp;VARB=0.0143565;OID=.;OPOS=5487164;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:146:146:47:48:98:98:0.671233:53:45:21:26:53:45:22:26
chr17	5991344	.	C	T	885.29	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0283017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.878;QD=58.0521;RBI=0.0384574;REFB=0;REVB=0.0260382;RO=0;SAF=33;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00020371;OID=.;OPOS=5991344;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:28:33:0:0:28:33:0:0
chr17	6014176	.	A	G	670.07	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.025489;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.032;QD=62.3322;RBI=0.0383073;REFB=0;REVB=-0.0285965;RO=0;SAF=20;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.77819e-05;OID=.;OPOS=6014176;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:23:20:0:0:23:20:0:0
chr17	6110583	.	C	A	127.56	PASS	AF=0.5;AO=11;DP=22;FAO=11;FDP=22;FR=.,HEALED;FRO=8;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-6.24011e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=311.878;QD=23.193;RBI=0.000372365;REFB=0.00165526;REVB=-0.000367099;RO=8;SAF=7;SAR=4;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104359;STB=0.559889;STBP=0.597;TYPE=snp;VARB=-0.000621807;OID=.;OPOS=6110583;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:60:22:22:8:8:11:11:0.5:4:7:4:4:4:7:4:4
chr17	6330068	.	T	C	398.65	PASS	AF=1;AO=27;DP=29;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0301098;FXX=0.0666445;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.547;QD=56.9503;RBI=0.0307486;REFB=0;REVB=0.00623473;RO=0;SAF=8;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.06954e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00061881;OID=.;OPOS=6330068;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:28:0:0:27:28:1:19:8:0:0:19:9:0:0
chr17	6331803	.	T	C	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0385249;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.4033;QD=51.9159;RBI=0.0385322;REFB=0;REVB=0.000750554;RO=0;SAF=9;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000672378;OID=.;OPOS=6331803;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:12:9:0:0:12:9:0:0
chr17	6337247	.	C	G	358.06	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0110753;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.407;QD=55.0862;RBI=0.0903837;REFB=0;REVB=0.0897025;RO=0;SAF=19;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.63811e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00108152;OID=.;OPOS=6337247;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:7:19:0:0:7:19:0:0
chr17	6353679	.	A	C	158.05	PASS	AF=0.64;AO=16;DP=25;FAO=16;FDP=25;FR=.;FRO=9;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=1;FWDB=0.0167424;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=343.737;QD=25.2873;RBI=0.0204939;REFB=-0.0166455;REVB=-0.0118191;RO=9;SAF=10;SAR=6;SRF=8;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.192677;STB=0.60662;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=0.00963079;OID=.;OPOS=6353679;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:25:25:9:9:16:16:0.64:6:10:8:1:6:10:8:1
chr17	6364753	.	A	G	666.46	PASS	AF=0.708861;AO=48;DP=79;FAO=56;FDP=79;FR=.;FRO=23;FSAF=18;FSAR=38;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=0.0327514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.643;QD=33.745;RBI=0.0520501;REFB=-0.0306008;REVB=-0.0404544;RO=20;SAF=11;SAR=37;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.243071;STB=0.602268;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0173281;OID=.;OPOS=6364753;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:20:23:48:56:0.708861:37:11:12:8:38:18:15:8
chr17	6376130	.	C	T	55.14	PASS	AF=0.166667;AO=9;DP=53;FAO=9;FDP=54;FR=.;FRO=45;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=22;FSRR=23;FWDB=0.0275886;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.9885;QD=4.08433;RBI=0.0305643;REFB=-0.001676;REVB=-0.0131547;RO=44;SAF=3;SAR=6;SRF=22;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.207063;STB=0.632611;STBP=0.412;TYPE=snp;VARB=0.00464684;OID=.;OPOS=6376130;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:53:54:44:45:9:9:0.166667:6:3:22:22:6:3:22:23
chr17	6406883	.	C	T	46.16	PASS	AF=0.136364;AO=9;DP=66;FAO=9;FDP=66;FR=.;FRO=57;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=24;FSRR=33;FWDB=-0.0152702;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.905;QD=2.79771;RBI=0.0368644;REFB=-0.000436128;REVB=-0.033553;RO=56;SAF=1;SAR=8;SRF=23;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.435413;STB=0.829026;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=0.00511627;OID=.;OPOS=6406883;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:66:66:56:57:9:9:0.136364:8:1:23:33:8:1:24:33
chr17	6483046	.	T	C	772.78	PASS	AF=0.98;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00251977;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.107;QD=61.8227;RBI=0.00300846;REFB=-0.0949983;REVB=-0.00164365;RO=1;SAF=22;SAR=27;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0171119;STB=0.509087;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=-6.48391e-05;OID=.;OPOS=6483046;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:50:50:1:1:49:49:0.98:27:22:0:1:27:22:0:1
chr17	6493198	.	T	C	1514.78	PASS	AF=1;AO=95;DP=96;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00520535;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.4547;QD=63.78;RBI=0.00756169;REFB=0;REVB=-0.00548484;RO=0;SAF=46;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000235006;OID=.;OPOS=6493198;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:96:95:0:0:95:95:1:49:46:0:0:49:46:0:0
chr17	6511781	.	A	G	875.01	PASS	AF=0.984127;AO=59;DP=61;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.031262;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.019;QD=55.5563;RBI=0.0313138;REFB=-0.0211369;REVB=-0.00180001;RO=0;SAF=32;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.96591e-08;STB=0.50746;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.000435083;OID=.;OPOS=6511781;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:61:63:0:1:59:62:0.984127:27:32:0:0:29:33:1:0
chr17	6515387	.	A	G	784.96	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143067;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.651;QD=64.0786;RBI=0.0165929;REFB=0;REVB=0.00840497;RO=0;SAF=16;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.22468e-05;OID=.;OPOS=6515387;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:49:0:0:48:49:1:32:16:0:0:33:16:0:0
chr17	6515454	.	C	T	319.28	PASS	AF=1;AO=20;DP=26;FAO=24;FDP=24;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00185514;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.281;QD=53.2126;RBI=0.0127325;REFB=0;REVB=0.0125966;RO=0;SAF=9;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.98396e-05;OID=.;OPOS=6515454;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:24:0:0:20:24:1:11:9:0:0:15:9:0:0
chr17	6531648	.	A	G	1748.77	PASS	AF=1;AO=114;DP=115;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0453815;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.645;QD=60.8268;RBI=0.046141;REFB=0;REVB=0.00833731;RO=0;SAF=64;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.2792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.19811e-05;OID=.;OPOS=6531648;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:115:115:0:0:114:115:1:50:64:0:0:51:64:0:0
chr17	6546259	.	T	C	591.76	PASS	AF=0.952381;AO=40;DP=42;FAO=40;FDP=42;FR=.;FRO=2;FSAF=14;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0192868;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=290.707;QD=56.3581;RBI=0.0225206;REFB=-0.0454981;REVB=0.0116274;RO=0;SAF=14;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507809;STBP=0.793;TYPE=snp;VARB=0.0010253;OID=.;OPOS=6546259;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:42:42:0:2:40:40:0.952381:26:14:0:0:26:14:1:1
chr17	6556022	.	A	G	848.37	PASS	AF=1;AO=53;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=26;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0433141;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.722;QD=57.5165;RBI=0.0443635;REFB=0;REVB=0.00959228;RO=0;SAF=23;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.72004e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000452819;OID=.;OPOS=6556022;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:53:59:1:30:23:0:0:33:26:0:0
chr17	6556194	.	T	TAGAAG	581.05	PASS	AF=0.753846;AO=48;DP=66;FAO=49;FDP=65;FR=.;FRO=16;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=-0.0158587;FXX=0.0298463;HRUN=1;LEN=5;MLLD=284.581;QD=35.7567;RBI=0.0199997;REFB=-0.00730079;REVB=0.0121857;RO=16;SAF=26;SAR=22;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106108;STB=0.553516;STBP=0.138;TYPE=ins;VARB=0.00368672;OID=.;OPOS=6556195;OREF=-;OALT=AGAAG;OMAPALT=TAGAAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.753846:48:66:49:65:16:26:23:5:11:99:16:26:22:5:11
chr17	6556326	.	G	A	600.62	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00257281;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.255;QD=61.6021;RBI=0.0103101;REFB=0;REVB=-0.00998391;RO=0;SAF=17;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.97712e-05;OID=.;OPOS=6556326;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:22:17:0:0:22:17:0:0
chr17	6556538	.	G	C	920.1	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0218182;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.3872;QD=58.4188;RBI=0.0255429;REFB=0;REVB=0.0132819;RO=0;SAF=33;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000263349;OID=.;OPOS=6556538;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:30:33:0:0:30:33:0:0
chr17	6556541	.	A	T	888.77	PASS	AF=0.984127;AO=62;DP=63;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0253831;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=309.365;QD=56.43;RBI=0.0257246;REFB=-0.135589;REVB=0.00417771;RO=0;SAF=32;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50769;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.000370127;OID=.;OPOS=6556541;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:63:63:0:1:62:62:0.984127:30:32:0:0:30:32:1:0
chr17	6558768	.	C	T	175.67	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0126046;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.6368;QD=46.8464;RBI=0.0509345;REFB=0;REVB=-0.0493502;RO=0;SAF=6;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.002613;OID=.;OPOS=6558768;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:9:6:0:0:9:6:0:0
chr17	6683215	.	C	T	231.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00669149;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=95.277;QD=48.6746;RBI=0.0394084;REFB=0;REVB=-0.0388361;RO=0;SAF=8;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000384923;OID=.;OPOS=6683215;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:19:0:0:18:19:1:10:8:0:0:11:8:0:0
chr17	6683848	.	T	A	115.57	PASS	AF=0.8;AO=12;DP=15;FAO=12;FDP=15;FR=.;FRO=3;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0376108;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.9564;QD=30.8195;RBI=0.0385196;REFB=-0.08168;REVB=-0.00831796;RO=3;SAF=8;SAR=4;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00918415;OID=.;OPOS=6683848;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:15:15:3:3:12:12:0.8:4:8:2:1:4:8:2:1
chr17	6690161	.	C	T	133.64	PASS	AF=0.283582;AO=19;DP=67;FAO=19;FDP=67;FR=.;FRO=48;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=27;FSRR=21;FWDB=0.00871554;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.579;QD=7.97861;RBI=0.0188428;REFB=0.00743772;REVB=-0.016706;RO=48;SAF=13;SAR=6;SRF=27;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155218;STB=0.593806;STBP=0.387;TYPE=snp;VARB=-0.011778;OID=.;OPOS=6690161;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:48:48:19:19:0.283582:6:13:27:21:6:13:27:21
chr17	6716242	.	G	A	35.04	PASS	AF=0.214286;AO=6;DP=28;FAO=6;FDP=28;FR=.;FRO=22;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=17;FWDB=-0.021384;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.806;QD=5.00505;RBI=0.0496733;REFB=-0.0198493;REVB=-0.0448349;RO=22;SAF=4;SAR=2;SRF=5;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.487292;STB=0.807709;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=0.0616308;OID=.;OPOS=6716242;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:28:28:22:22:6:6:0.214286:2:4:5:17:2:4:5:17
chr17	6733672	.	T	C	102.59	PASS	AF=0.258621;AO=15;DP=59;FAO=15;FDP=58;FR=.;FRO=43;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=25;FWDB=0.0136257;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.9749;QD=7.0753;RBI=0.0256478;REFB=-0.0155114;REVB=0.0217291;RO=43;SAF=7;SAR=8;SRF=18;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0586236;STB=0.535915;STBP=0.752;TYPE=snp;VARB=0.0454478;OID=.;OPOS=6733672;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:58:43:43:15:15:0.258621:8:7:18:25:8:7:18:25
chr17	6899559	.	C	G	101.87	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0378054;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.0646;QD=40.7478;RBI=0.0796944;REFB=0;REVB=-0.0701566;RO=0;SAF=4;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0020365;OID=.;OPOS=6899559;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:6:4:0:0:6:4:0:0
chr17	6904934	.	A	G	623.69	PASS	AF=0.97619;AO=41;DP=43;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0319482;FXX=0.0232504;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.328;QD=59.3991;RBI=0.0338172;REFB=0.010822;REVB=0.0110867;RO=1;SAF=23;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0199652;STB=0.510633;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=-0.000229321;OID=.;OPOS=6904934;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:43:42:1:1:41:41:0.97619:18:23:1:0:18:23:1:0
chr17	6913652	.	G	A	630.5	PASS	AF=1;AO=40;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00152418;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.251;QD=61.5118;RBI=0.0302608;REFB=0;REVB=0.0302224;RO=0;SAF=16;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000130608;OID=.;OPOS=6913652;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:40:41:1:24:16:0:0:25:16:0:0
chr17	6919093	.	T	C	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0165766;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.538;QD=46.8479;RBI=0.0330013;REFB=0;REVB=0.0285359;RO=0;SAF=10;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000263002;OID=.;OPOS=6919093;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:5:10:0:0:5:10:0:0
chr17	6929924	.	T	C	632.26	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00231528;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.392;QD=61.684;RBI=0.0338561;REFB=0;REVB=-0.0337769;RO=0;SAF=21;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000107913;OID=.;OPOS=6929924;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:20:21:0:0:20:21:0:0
chr17	6931174	.	GCT	G	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00151974;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=208.163;QD=50.4134;RBI=0.0421444;REFB=0;REVB=0.042117;RO=0;SAF=14;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000219125;OID=.;OPOS=6931175;OREF=CT;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:19:19:19:19:0:14:5:0:0:4:0:14:5:0:0
chr17	7011129	.	C	T	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0318746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.1339;QD=51.9166;RBI=0.0783384;REFB=0;REVB=0.0715605;RO=0;SAF=14;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00324062;OID=.;OPOS=7011129;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:7:14:0:0:7:14:0:0
chr17	7011225	.	T	G	60.3	PASS	AF=0.571429;AO=8;DP=14;FAO=8;FDP=14;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0233433;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.498;QD=17.2298;RBI=0.0276018;REFB=-0.00248251;REVB=0.0147293;RO=6;SAF=4;SAR=4;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122361;STB=0.571253;STBP=0.585;TYPE=snp;VARB=0.00262276;OID=.;OPOS=7011225;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:14:14:6:6:8:8:0.571429:4:4:4:2:4:4:4:2
chr17	7097340	.	T	C	71.66	PASS	AF=0.6;AO=9;DP=15;FAO=9;FDP=15;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.0120176;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.649;QD=19.1086;RBI=0.0167188;REFB=-0.0267315;REVB=0.0116231;RO=6;SAF=2;SAR=7;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.232701;STB=0.636032;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=0.0264488;OID=.;OPOS=7097340;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:15:15:6:6:9:9:0.6:7:2:3:3:7:2:3:3
chr17	7127718	.	T	C	229.23	PASS	AF=0.677419;AO=21;DP=31;FAO=21;FDP=31;FR=.;FRO=10;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.000560312;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.939;QD=29.5781;RBI=0.00453745;REFB=0.0109625;REVB=0.00450272;RO=10;SAF=12;SAR=9;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100585;STB=0.555502;STBP=0.4;TYPE=snp;VARB=-0.00394878;OID=.;OPOS=7127718;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:31:31:10:10:21:21:0.677419:9:12:4:6:9:12:4:6
chr17	7129840	.	T	C	118.92	PASS	AF=0.857143;AO=12;DP=14;FAO=12;FDP=14;FR=.;FRO=2;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0327061;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.183;QD=33.9781;RBI=0.0332369;REFB=-0.0526618;REVB=0.00591612;RO=2;SAF=8;SAR=4;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179011;STB=0.599828;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.0166743;OID=.;OPOS=7129840;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:14:14:2:2:12:12:0.857143:4:8:0:2:4:8:0:2
chr17	7132556	.	C	T	214.31	PASS	AF=0.666667;AO=20;DP=30;FAO=20;FDP=30;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=0.0153417;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.613;QD=28.5741;RBI=0.0207139;REFB=-0.0412916;REVB=0.0139175;RO=10;SAF=7;SAR=13;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156459;STB=0.586717;STBP=0.217;TYPE=snp;VARB=0.0283202;OID=.;OPOS=7132556;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:30:30:10:10:20:20:0.666667:13:7:6:4:13:7:6:4
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chr17	7163739	.	A	G	249.37	PASS	AF=0.733333;AO=22;DP=30;FAO=22;FDP=30;FR=.;FRO=8;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=-0.0073192;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.058;QD=33.2498;RBI=0.00787312;REFB=-0.00518166;REVB=0.00290091;RO=8;SAF=13;SAR=9;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.017199;STB=0.509425;STBP=0.879;TYPE=snp;VARB=0.00148496;OID=.;OPOS=7163739;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:30:30:8:8:22:22:0.733333:9:13:5:3:9:13:5:3
chr17	7185788	.	T	C	305.8	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0688588;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.381;QD=53.1819;RBI=0.068875;REFB=0;REVB=0.00149331;RO=0;SAF=5;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.78933e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.53155e-05;OID=.;OPOS=7185788;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:23:0:0:21:23:1:16:5:0:0:17:6:0:0
chr17	7187123	.	T	C	255.67	PASS	AF=0.657143;AO=23;DP=35;FAO=23;FDP=35;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.0121809;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.2752;QD=29.2192;RBI=0.020142;REFB=0.0150194;REVB=0.0160414;RO=12;SAF=7;SAR=16;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187381;STB=0.60368;STBP=0.087;TYPE=snp;VARB=-0.00716721;OID=.;OPOS=7187123;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:35:35:12:12:23:23:0.657143:16:7:7:5:16:7:7:5
chr17	7188153	.	GGT	GG,G	44.2	PASS	AF=0.380952,0;AO=6,2;DP=19;FAO=8,0;FDP=21;FR=.;FRO=13;FSAF=7,0;FSAR=1,0;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=0.0649154,-0.119523;FXX=0;HRUN=4,2;LEN=1,2;MLLD=19.6881,29.4858;QD=8.41837;RBI=0.100846,0.150053;REFB=-0.0148589,0.0113697;REVB=-0.0771746,-0.0907198;RO=11;SAF=5,2;SAR=1,0;SRF=3;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0.414286,0;SSSB=0.561709,0.663928;STB=0.863255,0.5;STBP=0.016,1;TYPE=del,del;VARB=0.0269374,0;OID=.,.;OPOS=7188155,7188154;OREF=T,GT;OALT=-,-;OMAPALT=GG,G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.380952,0:6,2:19:8,0:21:13:7,0:1,0:4:9:43:11:5,2:1,0:3:8
chr17	7192091	.	C	T	315.48	PASS	AF=0.571429;AO=32;DP=56;FAO=32;FDP=56;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.0294358;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.794;QD=22.5343;RBI=0.0313476;REFB=-0.0201953;REVB=0.0107799;RO=24;SAF=13;SAR=19;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0083621;STB=0.504616;STBP=0.95;TYPE=snp;VARB=0.0169945;OID=.;OPOS=7192091;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:24:24:32:32:0.571429:19:13:10:14:19:13:10:14
chr17	7213560	.	C	G	297.03	PASS	AF=0.757576;AO=25;DP=33;FAO=25;FDP=33;FR=.;FRO=8;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=0;FWDB=0.0320395;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.868;QD=36.0038;RBI=0.0335082;REFB=-0.0270808;REVB=0.00981174;RO=8;SAF=14;SAR=11;SRF=8;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.204895;STB=0.611029;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.0109249;OID=.;OPOS=7213560;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:33:33:8:8:25:25:0.757576:11:14:8:0:11:14:8:0
chr17	7213694	.	C	A	545.25	PASS	AF=0.973684;AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0126829;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.32;QD=57.3943;RBI=0.0319014;REFB=-0.0707145;REVB=0.0292719;RO=1;SAF=14;SAR=23;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0322723;STB=0.517232;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=0.00120977;OID=.;OPOS=7213694;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:38:38:1:1:37:37:0.973684:23:14:1:0:23:14:1:0
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chr17	7219230	.	A	G	239.45	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0942558;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.5769;QD=50.4114;RBI=0.106794;REFB=0;REVB=-0.0502071;RO=0;SAF=2;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.41729e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00140263;OID=.;OPOS=7219230;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:17:2:0:0:17:2:0:0
chr17	7221385	.	G	A	340.1	PASS	AF=1;AO=24;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0010065;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=254.02;QD=54.4154;RBI=0.0392198;REFB=0;REVB=0.0392068;RO=0;SAF=17;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000354242;OID=.;OPOS=7221385;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:24:25:1:7:17:0:0:8:17:0:0
chr17	7224921	.	C	G	43.61	PASS	AF=0.241379;AO=7;DP=29;FAO=7;FDP=29;FR=.;FRO=22;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.0136527;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.618;QD=6.01565;RBI=0.022557;REFB=0.0030563;REVB=0.0179561;RO=22;SAF=2;SAR=5;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.306855;STB=0.699421;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=-0.00738596;OID=.;OPOS=7224921;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:29:29:22:22:7:7:0.241379:5:2:12:10:5:2:12:10
chr17	7292107	.	G	A	575.45	PASS	AF=1;AO=34;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0164771;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.983;QD=60.5739;RBI=0.0993936;REFB=0;REVB=0.0980183;RO=0;SAF=16;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000864674;OID=.;OPOS=7292107;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:34:38:1:18:16:0:0:21:17:0:0
chr17	7318396	.	C	T	482.99	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0244448;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.234;QD=58.5446;RBI=0.0485952;REFB=0;REVB=0.0419993;RO=0;SAF=23;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000639955;OID=.;OPOS=7318396;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:10:23:0:0:10:23:0:0
chr17	7318935	.	C	T	36.89	PASS	AF=0.122807;AO=7;DP=57;FAO=7;FDP=57;FR=.;FRO=50;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=22;FSRR=28;FWDB=-0.00914524;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.804;QD=2.58902;RBI=0.0195105;REFB=-0.00228886;REVB=0.0172343;RO=49;SAF=3;SAR=4;SRF=21;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.510175;STBP=0.973;TYPE=snp;VARB=0.0146816;OID=.;OPOS=7318935;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:57:57:49:50:7:7:0.122807:4:3:21:28:4:3:22:28
chr17	7322245	.	A	G	154.94	PASS	AF=0.789474;AO=15;DP=19;FAO=15;FDP=19;FR=.;FRO=4;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0138932;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.839;QD=32.6186;RBI=0.033449;REFB=-0.0246404;REVB=0.0304272;RO=4;SAF=9;SAR=6;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.225948;STB=0.624835;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.00496239;OID=.;OPOS=7322245;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:20:19:19:4:4:15:15:0.789474:6:9:0:4:6:9:0:4
chr17	7339627	.	C	T	251.91	PASS	AF=0.621622;AO=23;DP=37;FAO=23;FDP=37;FR=.;FRO=14;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=0.0362983;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=80.6082;QD=27.2339;RBI=0.0440905;REFB=-0.0410557;REVB=0.0250282;RO=14;SAF=17;SAR=6;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0813266;STB=0.545149;STBP=0.48;TYPE=snp;VARB=0.0284622;OID=.;OPOS=7339627;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:14:14:23:23:0.621622:6:17:9:5:6:17:9:5
chr17	7386055	.	C	T	875.43	PASS	AF=1;AO=60;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0157657;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=223.678;QD=56.4791;RBI=0.0264282;REFB=0;REVB=0.0212108;RO=0;SAF=24;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.9695e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000208871;OID=.;OPOS=7386055;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:62:62:0:0:60:62:1:36:24:0:0:36:26:0:0
chr17	7400137	.	T	C	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112759;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.5182;QD=51.9167;RBI=0.0295781;REFB=0;REVB=0.0273445;RO=0;SAF=9;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000618794;OID=.;OPOS=7400137;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:12:9:0:0:12:9:0:0
chr17	7400815	.	T	C	261.91	PASS	AF=0.585366;AO=24;DP=41;FAO=24;FDP=41;FR=.;FRO=17;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.0413378;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.6273;QD=25.552;RBI=0.0418896;REFB=0.00231045;REVB=0.00677622;RO=16;SAF=11;SAR=13;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0151615;STB=0.505108;STBP=0.966;TYPE=snp;VARB=-0.000214009;OID=.;OPOS=7400815;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:16:17:24:24:0.585366:13:11:7:9:13:11:8:9
chr17	7402600	.	T	C	45.35	PASS	AF=0.318182;AO=7;DP=22;FAO=7;FDP=22;FR=.;FRO=15;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.0303754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.776;QD=8.24541;RBI=0.0313165;REFB=-0.0107739;REVB=-0.0076197;RO=15;SAF=2;SAR=5;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.278858;STB=0.675158;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.0334076;OID=.;OPOS=7402600;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:22:22:15:15:7:7:0.318182:5:2:8:7:5:2:8:7
chr17	7404107	.	T	C	747.09	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00235158;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.2766;QD=63.5823;RBI=0.01015;REFB=0;REVB=-0.0098738;RO=0;SAF=28;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.06241e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.20012e-05;OID=.;OPOS=7404107;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:47:0:0:46:47:1:18:28:0:0:19:28:0:0
chr17	7404991	.	T	C	32.92	PASS	AF=0.136364;AO=6;DP=44;FAO=6;FDP=44;FR=.;FRO=38;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=-0.00606966;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.7178;QD=2.99281;RBI=0.0213259;REFB=-0.00461433;REVB=-0.0204439;RO=38;SAF=1;SAR=5;SRF=21;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.454872;STB=0.832224;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.0158253;OID=.;OPOS=7404991;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:32:44:44:38:38:6:6:0.136364:5:1:21:17:5:1:21:17
chr17	7416683	.	A	G	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0498136;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.002;QD=43.4854;RBI=0.05779;REFB=0;REVB=0.0292966;RO=0;SAF=10;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00112311;OID=.;OPOS=7416683;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:2:10:0:0:2:10:0:0
chr17	7460517	.	G	C	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0397912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.568;QD=55.0985;RBI=0.0838951;REFB=0;REVB=-0.0738583;RO=0;SAF=9;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000306502;OID=.;OPOS=7460517;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:17:9:0:0:17:9:0:0
chr17	7460559	.	T	G	323.42	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0220497;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.601;QD=53.9026;RBI=0.0379512;REFB=0;REVB=0.0308885;RO=0;SAF=7;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000239072;OID=.;OPOS=7460559;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:17:7:0:0:17:7:0:0
chr17	7462555	.	G	A	216.73	PASS	AF=0.4;AO=26;DP=65;FAO=26;FDP=65;FR=.;FRO=39;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=27;FSRR=12;FWDB=0.00442247;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=236.663;QD=13.337;RBI=0.0246868;REFB=-0.0214906;REVB=0.0242874;RO=37;SAF=14;SAR=12;SRF=25;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144585;STB=0.594134;STBP=0.248;TYPE=snp;VARB=0.0321335;OID=.;OPOS=7462555;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:37:39:26:26:0.4:12:14:25:12:12:14:27:12
chr17	7462969	.	A	G	69.74	PASS	AF=0.238095;AO=9;DP=42;FAO=10;FDP=42;FR=.;FRO=32;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=-0.0286002;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.024;QD=6.64213;RBI=0.0311969;REFB=-0.00223133;REVB=-0.0124608;RO=32;SAF=6;SAR=3;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132251;STB=0.529352;STBP=0.834;TYPE=snp;VARB=0.00481563;OID=.;OPOS=7462969;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:69:42:42:32:32:9:10:0.238095:3:6:18:14:4:6:18:14
chr17	7470285	.	CA	C	735.33	PASS	AF=1;AO=61;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0514984;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=22.7407;QD=45.2513;RBI=0.0555617;REFB=0;REVB=-0.0208571;RO=0;SAF=26;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000691448;OID=.;OPOS=7470286;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:61:65:65:65:0:27:38:0:0:14:0:26:35:0:0
chr17	7483377	.	C	G	116.51	PASS	AF=0.8125;AO=12;DP=16;FAO=13;FDP=16;FR=.;FRO=3;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.147457;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.866;QD=29.1276;RBI=0.147597;REFB=-0.140969;REVB=-0.00642599;RO=4;SAF=7;SAR=5;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0776539;STB=0.510188;STBP=0.974;TYPE=snp;VARB=0.0150428;OID=.;OPOS=7483377;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:16:16:4:3:12:13:0.8125:5:7:3:1:5:8:2:1
chr17	7484101	.	C	A	142.6	PASS	AF=0.289855;AO=20;DP=69;FAO=20;FDP=69;FR=.;FRO=49;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=23;FSRR=26;FWDB=0.0170307;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.387;QD=8.26646;RBI=0.0177335;REFB=-0.0128508;REVB=-0.00494289;RO=49;SAF=7;SAR=13;SRF=23;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146861;STB=0.588145;STBP=0.371;TYPE=snp;VARB=0.023772;OID=.;OPOS=7484101;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:49:49:20:20:0.289855:13:7:23:26:13:7:23:26
chr17	7490810	.	G	A	50.71	PASS	AF=0.5;AO=7;DP=15;FAO=7;FDP=14;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.0203658;FXX=0.0666222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.51;QD=14.4875;RBI=0.0575127;REFB=-0.0167924;REVB=-0.0537861;RO=6;SAF=2;SAR=5;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0441607;STB=0.581152;STBP=0.618;TYPE=snp;VARB=0.0238217;OID=.;OPOS=7490810;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:15:14:6:7:7:7:0.5:5:2:2:4:5:2:3:4
chr17	7536527	.	G	A	47.19	PASS	AF=0.411765;AO=7;DP=17;FAO=7;FDP=17;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.0166603;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.111;QD=11.1041;RBI=0.036186;REFB=-0.00095347;REVB=-0.0321226;RO=10;SAF=4;SAR=3;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0695696;STB=0.542251;STBP=0.752;TYPE=snp;VARB=0.00117006;OID=.;OPOS=7536527;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:17:17:10:10:7:7:0.411765:3:4:5:5:3:4:5:5
chr17	7557419	.	A	G	37.69	PASS	AF=0.179487;AO=6;DP=39;FAO=7;FDP=39;FR=.;FRO=32;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=21;FWDB=0.0834069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.641;QD=3.86594;RBI=0.083581;REFB=-0.000718239;REVB=-0.00539249;RO=32;SAF=1;SAR=5;SRF=11;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.267052;STB=0.555391;STBP=0.783;TYPE=snp;VARB=0.0237878;OID=.;OPOS=7557419;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:39:39:32:32:6:7:0.179487:5:1:11:21:5:2:11:21
chr17	7560835	.	T	G	323.4	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0810333;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.899;QD=53.8996;RBI=0.0909585;REFB=0;REVB=0.0413164;RO=0;SAF=16;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000847555;OID=.;OPOS=7560835;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:8:16:0:0:8:16:0:0
chr17	7578115	.	T	C	115.99	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0198141;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.037;QD=42.1783;RBI=0.0211768;REFB=0;REVB=-0.00747366;RO=0;SAF=5;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000279055;OID=.;OPOS=7578115;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:6:5:0:0:6:5:0:0
chr17	7578263	.	G	A	174.11	PASS	AF=0.5;AO=18;DP=35;FAO=18;FDP=36;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=-0.0260836;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.05;QD=19.3452;RBI=0.0265316;REFB=-0.00852506;REVB=-0.00485488;RO=17;SAF=8;SAR=10;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.221765;STB=0.609637;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=0.0122928;OID=.;OPOS=7578263;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:36:17:18:18:18:0.5:10:8:12:5:10:8:12:6
chr17	7592560	.	C	T	42.65	PASS	AF=0.205882;AO=7;DP=34;FAO=7;FDP=34;FR=.;FRO=27;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=0.0102882;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=302.767;QD=5.01791;RBI=0.0159248;REFB=0.00365721;REVB=-0.0121553;RO=26;SAF=2;SAR=5;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0830257;STB=0.576694;STBP=0.724;TYPE=snp;VARB=-0.014581;OID=.;OPOS=7592560;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:42:34:34:26:27:7:7:0.205882:5:2:9:17:5:2:10:17
chr17	7606722	.	C	G	286.91	PASS	AF=1;AO=16;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.108783;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.853;QD=52.1654;RBI=0.109608;REFB=0;REVB=0.0134201;RO=0;SAF=6;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00353557;OID=.;OPOS=7606722;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:16:22:1:10:6:0:0:13:9:0:0
chr17	7637789	.	C	T	126.85	PASS	AF=0.538462;AO=13;DP=26;FAO=14;FDP=26;FR=.,HEALED;FRO=12;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.0734997;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.4575;QD=19.5151;RBI=0.075584;REFB=-0.0974104;REVB=-0.0176278;RO=8;SAF=9;SAR=4;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15565;STB=0.529369;STBP=0.789;TYPE=snp;VARB=0.0757999;OID=.;OPOS=7637789;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:26:26:8:12:13:14:0.538462:4:9:7:1:5:9:7:5
chr17	7674784	.	C	T	34.85	PASS	AF=0.833333;AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0415898;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=271.094;QD=23.2326;RBI=0.0427344;REFB=-0.134616;REVB=-0.00982412;RO=1;SAF=2;SAR=3;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169284;STB=0.599598;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.00555043;OID=.;OPOS=7674784;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:6:6:1:1:5:5:0.833333:3:2:1:0:3:2:1:0
chr17	7681412	.	C	G	501.65	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148039;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.4422;QD=59.018;RBI=0.0216154;REFB=0;REVB=0.0157503;RO=0;SAF=15;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.64315e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000465823;OID=.;OPOS=7681412;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:34:0:0:33:34:1:18:15:0:0:18:16:0:0
chr17	7722365	.	C	T	70.2	PASS	AF=0.243902;AO=10;DP=41;FAO=10;FDP=41;FR=.;FRO=31;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=21;FSRR=10;FWDB=-0.0256885;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.531;QD=6.84867;RBI=0.0316309;REFB=-0.00671423;REVB=0.0184557;RO=31;SAF=3;SAR=7;SRF=21;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.430398;STB=0.766638;STBP=0.095;TYPE=snp;VARB=0.0280009;OID=.;OPOS=7722365;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:70:41:41:31:31:10:10:0.243902:7:3:21:10:7:3:21:10
chr17	7722643	.	C	T	102.43	PASS	AF=0.264151;AO=14;DP=53;FAO=14;FDP=53;FR=.;FRO=39;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=0.000280108;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.365;QD=7.73061;RBI=0.00699839;REFB=-0.0119109;REVB=-0.00699278;RO=39;SAF=11;SAR=3;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.382151;STB=0.737249;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.0414014;OID=.;OPOS=7722643;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:39:39:14:14:0.264151:3:11:19:20:3:11:19:20
chr17	7735063	.	T	G	314.95	PASS	AF=0.642857;AO=27;DP=43;FAO=27;FDP=42;FR=.;FRO=15;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=-0.0697841;FXX=0.0232504;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.6776;QD=29.9955;RBI=0.0716651;REFB=-0.013256;REVB=0.0163116;RO=15;SAF=14;SAR=13;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0768494;STB=0.565857;STBP=0.253;TYPE=snp;VARB=0.00596183;OID=.;OPOS=7735063;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:42:15:15:27:27:0.642857:13:14:6:9:13:14:5:10
chr17	7750232	.	T	C	75.06	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0453536;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.58;QD=37.5322;RBI=0.122878;REFB=0;REVB=0.114202;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00221126;OID=.;OPOS=7750232;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:8:0:0:7:8:1:3:4:0:0:4:4:0:0
chr17	7760397	.	G	A	513.86	PASS	AF=0.725806;AO=45;DP=62;FAO=45;FDP=62;FR=.;FRO=17;FSAF=31;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.0245631;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.0877;QD=33.1522;RBI=0.0307069;REFB=0.00333088;REVB=-0.0184274;RO=17;SAF=31;SAR=14;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122454;STB=0.566292;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=-0.00150901;OID=.;OPOS=7760397;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:17:17:45:45:0.725806:14:31:8:9:14:31:8:9
chr17	7760704	.	A	G	499.81	PASS	AF=0.621622;AO=43;DP=73;FAO=46;FDP=74;FR=.;FRO=28;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=0.0417366;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.864;QD=27.0168;RBI=0.0418504;REFB=-0.00882359;REVB=0.0030834;RO=28;SAF=21;SAR=22;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0173869;STB=0.52173;STBP=0.648;TYPE=snp;VARB=0.010416;OID=.;OPOS=7760704;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:74:28:28:43:46:0.621622:22:21:13:15:22:24:13:15
chr17	7761512	.	C	A	406.93	PASS	AF=0.761905;AO=32;DP=42;FAO=32;FDP=42;FR=.;FRO=10;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.0108296;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.691;QD=38.7551;RBI=0.0110105;REFB=-0.00523271;REVB=-0.00198773;RO=10;SAF=13;SAR=19;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130086;STB=0.570526;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=0.00422498;OID=.;OPOS=7761512;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:69:42:42:10:10:32:32:0.761905:19:13:7:3:19:13:7:3
chr17	7843053	.	C	T	86.69	PASS	AF=1;AO=8;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.06702;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.974;QD=38.5285;RBI=0.0933703;REFB=0;REVB=0.0650102;RO=0;SAF=4;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00324234;OID=.;OPOS=7843053;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:8:9:1:4:4:0:0:4:5:0:0
chr17	7847955	.	C	A	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.3566;QD=35.5759;RBI=0.0149342;REFB=0;REVB=-0.0149342;RO=0;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00123507;OID=.;OPOS=7847955;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:7:0:0:0:7:0:0:0
chr17	7849087	.	C	G	792.12	PASS	AF=1;AO=56;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00285272;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.7536;QD=55.5877;RBI=0.0528651;REFB=0.00736741;REVB=0.0527881;RO=0;SAF=26;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.29784e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00287915;OID=.;OPOS=7849087;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:57:57:0:0:56:57:1:30:26:0:0:31:26:0:0
chr17	7910025	.	C	T	365.1	PASS	AF=0.964286;AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0494946;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.501;QD=52.1564;RBI=0.0497764;REFB=-0.089657;REVB=-0.00528909;RO=1;SAF=9;SAR=18;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0251379;STB=0.513504;STBP=0.628;TYPE=snp;VARB=0.00107384;OID=.;OPOS=7910025;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:28:28:1:1:27:27:0.964286:18:9:0:1:18:9:0:1
chr17	7951819	.	A	G	138.32	PASS	AF=0.306452;AO=19;DP=62;FAO=19;FDP=62;FR=.;FRO=43;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=-0.000197546;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.75;QD=8.9239;RBI=0.00350681;REFB=0.00281377;REVB=-0.00350124;RO=42;SAF=10;SAR=9;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00291208;STB=0.510193;STBP=0.96;TYPE=snp;VARB=-0.00665074;OID=.;OPOS=7951819;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:42:43:19:19:0.306452:9:10:22:20:9:10:22:21
chr17	7983681	.	G	A	76.11	PASS	AF=0.215686;AO=11;DP=53;FAO=11;FDP=51;FR=.;FRO=40;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=-0.0521531;FXX=0.0377287;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.6579;QD=5.96905;RBI=0.0528088;REFB=-0.00919882;REVB=-0.00829598;RO=42;SAF=5;SAR=6;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113834;STB=0.55506;STBP=0.698;TYPE=snp;VARB=0.0259552;OID=.;OPOS=7983681;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:53:51:42:40:11:11:0.215686:6:5:23:19:6:5:21:19
chr17	7983799	.	A	G	83.42	PASS	AF=0.297297;AO=11;DP=38;FAO=11;FDP=37;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=-0.0239619;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.691;QD=9.01878;RBI=0.0248615;REFB=-0.00112518;REVB=0.00662755;RO=27;SAF=7;SAR=4;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.301211;STB=0.696344;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=0.00177537;OID=.;OPOS=7983799;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:38:37:27:26:11:11:0.297297:4:7:10:17:4:7:9:17
chr17	7983969	.	G	C	213.99	PASS	AF=0.333333;AO=27;DP=81;FAO=27;FDP=81;FR=.;FRO=54;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=25;FSRR=29;FWDB=-0.00401663;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.521;QD=10.5674;RBI=0.0107161;REFB=-0.00852976;REVB=-0.00993484;RO=54;SAF=18;SAR=9;SRF=25;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.237191;STB=0.638551;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.0159679;OID=.;OPOS=7983969;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:54:54:27:27:0.333333:9:18:25:29:9:18:25:29
chr17	7999957	.	G	A	255.91	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0066368;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.7897;QD=51.1825;RBI=0.0102814;REFB=0;REVB=-0.00785236;RO=0;SAF=18;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.19193e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000468219;OID=.;OPOS=7999957;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:2:18:0:0:2:18:0:0
chr17	8023057	.	A	C	59.7	PASS	AF=0.529412;AO=9;DP=17;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=0;FWDB=0.0647009;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.528;QD=14.0475;RBI=0.266569;REFB=-0.0553886;REVB=0.258598;RO=8;SAF=5;SAR=4;SRF=8;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.393626;STB=0.721843;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=0.0553645;OID=.;OPOS=8023057;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:17:17:8:8:9:9:0.529412:4:5:8:0:4:5:8:0
chr17	8023059	.	A	C	69.64	PASS	AF=0.529412;AO=9;DP=17;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=0;FWDB=0.0107291;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.237;QD=16.3859;RBI=0.0240985;REFB=-0.00892341;REVB=0.0215784;RO=8;SAF=5;SAR=4;SRF=8;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.393626;STB=0.721843;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=0.0104858;OID=.;OPOS=8023059;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:17:17:8:8:9:9:0.529412:4:5:8:0:4:5:8:0
chr17	8023061	.	C	T	69.64	PASS	AF=0.529412;AO=9;DP=17;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=0;FWDB=0.0217069;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.9887;QD=16.3859;RBI=0.0234762;REFB=-0.0191278;REVB=0.008941;RO=8;SAF=5;SAR=4;SRF=8;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.393626;STB=0.721843;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=0.00295719;OID=.;OPOS=8023061;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:17:17:8:8:9:9:0.529412:4:5:8:0:4:5:8:0
chr17	8023143	.	G	A	168.87	PASS	AF=0.607143;AO=17;DP=28;FAO=17;FDP=28;FR=.;FRO=11;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=2;FWDB=-0.035876;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.4347;QD=24.1245;RBI=0.0419028;REFB=0.0123955;REVB=0.0216508;RO=11;SAF=8;SAR=9;SRF=9;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.242206;STB=0.634705;STBP=0.098;TYPE=snp;VARB=-0.0039913;OID=.;OPOS=8023143;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:28:28:11:11:17:17:0.607143:9:8:9:2:9:8:9:2
chr17	8024237	.	T	C	747.09	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0655724;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.4929;QD=63.5819;RBI=0.0674671;REFB=0;REVB=-0.015877;RO=0;SAF=21;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000748159;OID=.;OPOS=8024237;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:26:21:0:0:26:21:0:0
chr17	8026364	.	C	T	343.12	PASS	AF=0.297468;AO=45;DP=156;FAO=47;FDP=158;FR=.;FRO=111;FSAF=23;FSAR=24;FSRF=70;FSRR=41;FWDB=0.0108326;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.189;QD=8.68659;RBI=0.0159304;REFB=-0.0283691;REVB=-0.0116803;RO=111;SAF=22;SAR=23;SRF=70;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171805;STB=0.598832;STBP=0.127;TYPE=snp;VARB=0.0589293;OID=.;OPOS=8026364;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:156:158:111:111:45:47:0.297468:23:22:70:41:24:23:70:41
chr17	8135061	.	T	C	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00620313;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.244;QD=50.4132;RBI=0.0086485;REFB=0;REVB=0.00602643;RO=0;SAF=9;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000155985;OID=.;OPOS=8135061;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:10:9:0:0:10:9:0:0
chr17	8141707	.	T	C	465.14	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0161345;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.104;QD=58.1419;RBI=0.0176968;REFB=0;REVB=-0.00727007;RO=0;SAF=19;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.54052e-05;OID=.;OPOS=8141707;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:13:19:0:0:13:19:0:0
chr17	8215534	.	C	T	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0067187;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=212.474;QD=33.4285;RBI=0.0458436;REFB=0;REVB=0.0453486;RO=0;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000535905;OID=.;OPOS=8215534;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:4:2:0:0:4:2:0:0
chr17	8216468	.	T	C	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0128005;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=325.101;QD=44.6898;RBI=0.0470324;REFB=0;REVB=0.045257;RO=0;SAF=8;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00015278;OID=.;OPOS=8216468;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:5:8:0:0:5:8:0:0
chr17	8249116	.	C	T	347.69	PASS	AF=0.962963;AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=27;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00010526;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=248.27;QD=51.5093;RBI=0.0133957;REFB=-0.14873;REVB=0.0133953;RO=1;SAF=14;SAR=12;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0371368;STB=0.519985;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=0.00101586;OID=.;OPOS=8249116;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:27:27:1:1:26:26:0.962963:12:14:0:1:12:14:0:1
chr17	8339283	.	C	T	328.55	PASS	AF=0.72973;AO=27;DP=38;FAO=27;FDP=37;FR=.;FRO=10;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.0506551;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.285;QD=35.5184;RBI=0.0714063;REFB=-0.0569425;REVB=0.0503282;RO=10;SAF=11;SAR=16;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0470055;STB=0.525648;STBP=0.626;TYPE=snp;VARB=0.0171026;OID=.;OPOS=8339283;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:71:38:37:10:10:27:27:0.72973:16:11:5:5:16:11:5:5
chr17	8339307	.	G	A	520.04	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.018549;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.292;QD=59.4331;RBI=0.0460175;REFB=0;REVB=0.0421135;RO=0;SAF=14;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.27896e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000282533;OID=.;OPOS=8339307;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:21:14:0:0:21:14:0:0
chr17	8378932	.	A	G	493.33	PASS	AF=0.787234;AO=37;DP=47;FAO=37;FDP=47;FR=.;FRO=10;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=-0.0133652;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.519;QD=41.9855;RBI=0.0148713;REFB=-0.00172303;REVB=0.00652126;RO=10;SAF=21;SAR=16;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0130524;STB=0.507038;STBP=0.874;TYPE=snp;VARB=0.000216204;OID=.;OPOS=8378932;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:68:47:47:10:10:37:37:0.787234:16:21:6:4:16:21:6:4
chr17	8383894	.	A	G	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0656778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.3549;QD=48.7372;RBI=0.0663507;REFB=0;REVB=0.00942522;RO=0;SAF=6;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00175943;OID=.;OPOS=8383894;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:11:6:0:0:11:6:0:0
chr17	8416901	.	C	T	504.55	PASS	AF=0.807692;AO=42;DP=52;FAO=42;FDP=52;FR=.;FRO=10;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=8;FSRR=2;FWDB=0.0524129;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.6878;QD=38.8117;RBI=0.0563696;REFB=0.0576252;REVB=0.0207467;RO=10;SAF=25;SAR=17;SRF=8;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0773202;STB=0.541486;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=-0.00717338;OID=.;OPOS=8416901;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:52:52:10:10:42:42:0.807692:17:25:8:2:17:25:8:2
chr17	8424270	.	G	A	447.02	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0219225;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.542;QD=57.6801;RBI=0.0221437;REFB=0;REVB=-0.00312236;RO=0;SAF=16;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000158265;OID=.;OPOS=8424270;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:15:16:0:0:15:16:0:0
chr17	8450357	.	C	A	351.06	PASS	AF=0.707317;AO=29;DP=40;FAO=29;FDP=41;FR=.;FRO=12;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=-0.0258964;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=258.55;QD=34.2492;RBI=0.025999;REFB=-0.0345256;REVB=-0.00230814;RO=11;SAF=11;SAR=18;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177587;STB=0.609061;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.0218389;OID=.;OPOS=8450357;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:90:40:41:11:12:29:29:0.707317:18:11:8:3:18:11:9:3
chr17	8701116	.	G	A	103.6	PASS	AF=0.545455;AO=11;DP=21;FAO=12;FDP=22;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=-0.00321015;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.492;QD=18.8359;RBI=0.0581444;REFB=-0.0199509;REVB=0.0580557;RO=10;SAF=7;SAR=4;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0320029;STB=0.5078;STBP=0.989;TYPE=snp;VARB=0.015016;OID=.;OPOS=8701116;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:21:22:10:10:11:12:0.545455:4:7:6:4:5:7:6:4
chr17	8701799	.	G	T	177.45	PASS	AF=0.888889;AO=16;DP=18;FAO=16;FDP=18;FR=.;FRO=2;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0198389;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.3121;QD=39.4329;RBI=0.0357713;REFB=0.0196221;REVB=0.0297658;RO=2;SAF=9;SAR=7;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113838;STB=0.562422;STBP=0.249;TYPE=snp;VARB=-0.0170265;OID=.;OPOS=8701799;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:18:18:2:2:16:16:0.888889:7:9:0:2:7:9:0:2
chr17	8725214	.	A	AG	268.59	PASS	AF=1;AO=23;DP=27;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.042651;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=21.5105;QD=41.3216;RBI=0.0942423;REFB=0;REVB=-0.0840387;RO=3;SAF=7;SAR=16;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0874123;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00128153;OID=.;OPOS=8725215;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:23:27:26:26:0:9:17:0:0:5:3:7:16:2:1
chr17	9066254	.	T	C	463.56	PASS	AF=0.732143;AO=41;DP=56;FAO=41;FDP=56;FR=.;FRO=15;FSAF=27;FSAR=14;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=-0.0400568;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.1554;QD=33.1112;RBI=0.0510709;REFB=0.0186207;REVB=-0.0316811;RO=15;SAF=27;SAR=14;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135469;STB=0.57337;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=-0.0116175;OID=.;OPOS=9066254;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:15:15:41:41:0.732143:14:27:6:9:14:27:6:9
chr17	9395231	.	G	A	48.75	PASS	AF=0.5;AO=6;DP=13;FAO=7;FDP=14;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.0506959;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.775;QD=13.9281;RBI=0.0514987;REFB=-0.0208818;REVB=0.00905753;RO=7;SAF=4;SAR=2;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.32987;STB=0.713673;STBP=0.192;TYPE=snp;VARB=0.0333993;OID=.;OPOS=9395231;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:13:14:7:7:6:7:0.5:2:4:2:5:2:5:2:5
chr17	9471711	.	T	G	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00103746;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=233.06;QD=49.5988;RBI=0.0133088;REFB=0;REVB=0.0132683;RO=0;SAF=10;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.90798e-05;OID=.;OPOS=9471711;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:8:10:0:0:8:10:0:0
chr17	9479098	.	C	A	583.75	PASS	AF=0.930233;AO=40;DP=43;FAO=40;FDP=43;FR=.;FRO=3;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0100904;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=212.449;QD=54.3019;RBI=0.0566223;REFB=-0.0189556;REVB=0.0557159;RO=3;SAF=21;SAR=19;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0250534;STB=0.513381;STBP=0.472;TYPE=snp;VARB=0.00131609;OID=.;OPOS=9479098;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:43:43:3:3:40:40:0.930233:19:21:1:2:19:21:1:2
chr17	9515777	.	G	A	42.65	PASS	AF=0.205882;AO=7;DP=34;FAO=7;FDP=34;FR=.;FRO=27;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=-0.00508533;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.129;QD=5.01773;RBI=0.0125763;REFB=0.014985;REVB=-0.0115023;RO=27;SAF=2;SAR=5;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.359193;STB=0.737045;STBP=0.183;TYPE=snp;VARB=-0.0328068;OID=.;OPOS=9515777;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:42:34:34:27:27:7:7:0.205882:5:2:16:11:5:2:16:11
chr17	9586165	.	C	T	337.32	PASS	AF=0.717949;AO=28;DP=39;FAO=28;FDP=39;FR=.;FRO=11;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=0.0106809;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=265.964;QD=34.5971;RBI=0.0213546;REFB=0.00677762;REVB=0.0184916;RO=11;SAF=15;SAR=13;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0525294;STB=0.52863;STBP=0.6;TYPE=snp;VARB=-0.00265305;OID=.;OPOS=9586165;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:81:39:39:11:11:28:28:0.717949:13:15:7:4:13:15:7:4
chr17	9712255	.	G	A	392.65	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0106515;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.382;QD=56.0933;RBI=0.0248968;REFB=0;REVB=0.0225032;RO=0;SAF=13;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000123833;OID=.;OPOS=9712255;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:28:0:0:27:28:1:14:13:0:0:15:13:0:0
chr17	9725338	.	G	A	68.37	PASS	AF=0.208333;AO=10;DP=47;FAO=10;FDP=48;FR=.;FRO=38;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=-0.0167009;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.427;QD=5.6973;RBI=0.0439078;REFB=-0.00572954;REVB=0.0406076;RO=37;SAF=2;SAR=8;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.402605;STB=0.756211;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=0.0256564;OID=.;OPOS=9725338;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:68:47:48:37:38:10:10:0.208333:8:2:19:18:8:2:19:19
chr17	9725347	.	A	G	33.47	PASS	AF=0.15;AO=6;DP=40;FAO=6;FDP=40;FR=.;FRO=34;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=-0.00971374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.575;QD=3.3465;RBI=0.0460044;REFB=-0.00669404;REVB=-0.0449672;RO=32;SAF=2;SAR=4;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165316;STB=0.620278;STBP=0.575;TYPE=snp;VARB=0.0507515;OID=.;OPOS=9725347;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:40:40:32:34:6:6:0.15:4:2:15:17:4:2:16:18
chr17	9764531	.	A	G	352.6	PASS	AF=0.62963;AO=34;DP=54;FAO=34;FDP=54;FR=.;FRO=20;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.0128489;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.907;QD=26.1184;RBI=0.0215088;REFB=0.00582971;REVB=-0.0172492;RO=20;SAF=14;SAR=20;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0946266;STB=0.551846;STBP=0.354;TYPE=snp;VARB=-0.00294743;OID=.;OPOS=9764531;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:20:20:34:34:0.62963:20:14:11:9:20:14:11:9
chr17	9769199	.	T	C	326.23	PASS	AF=0.7;AO=27;DP=39;FAO=28;FDP=40;FR=.;FRO=12;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.040151;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.6159;QD=32.6227;RBI=0.080686;REFB=0.0203961;REVB=0.0699866;RO=12;SAF=18;SAR=9;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.051626;STB=0.519217;STBP=0.72;TYPE=snp;VARB=-0.00584275;OID=.;OPOS=9769199;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:39:40:12:12:27:28:0.7:9:18:7:5:10:18:7:5
chr17	10206595	.	T	C	84.57	PASS	AF=0.230769;AO=12;DP=52;FAO=12;FDP=52;FR=.;FRO=40;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=-0.02881;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.164;QD=6.50549;RBI=0.0290015;REFB=-0.000367064;REVB=-0.00332764;RO=38;SAF=7;SAR=5;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163747;STB=0.583194;STBP=0.539;TYPE=snp;VARB=-0.000223116;OID=.;OPOS=10206595;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:52:52:38:40:12:12:0.230769:5:7:17:21:5:7:19:21
chr17	10216510	.	G	A	624.19	PASS	AF=0.564815;AO=60;DP=107;FAO=61;FDP=108;FR=.;FRO=47;FSAF=29;FSAR=32;FSRF=17;FSRR=30;FWDB=0.0129315;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.526;QD=23.1183;RBI=0.0172259;REFB=-0.02062;REVB=0.0113801;RO=47;SAF=29;SAR=31;SRF=17;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0982045;STB=0.549831;STBP=0.255;TYPE=snp;VARB=0.01626;OID=.;OPOS=10216510;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:108:47:47:60:61:0.564815:31:29:17:30:32:29:17:30
chr17	10222149	.	A	G	75.23	PASS	AF=0.188406;AO=13;DP=69;FAO=13;FDP=69;FR=.;FRO=56;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=29;FSRR=27;FWDB=-0.00720949;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.332;QD=4.36095;RBI=0.0154453;REFB=-0.00366868;REVB=-0.0136594;RO=56;SAF=10;SAR=3;SRF=29;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.332321;STB=0.719068;STBP=0.11;TYPE=snp;VARB=0.0181514;OID=.;OPOS=10222149;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:69:69:56:56:13:13:0.188406:3:10:29:27:3:10:29:27
chr17	10223697	.	G	T	674.53	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00565867;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.197;QD=61.3209;RBI=0.0167467;REFB=0;REVB=0.0157617;RO=0;SAF=14;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.13233e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000931228;OID=.;OPOS=10223697;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:44:0:0:43:44:1:29:14:0:0:29:15:0:0
chr17	10231417	.	C	T	616.3	PASS	AF=1;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0123446;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.1003;QD=61.6299;RBI=0.0268049;REFB=0;REVB=0.0237932;RO=0;SAF=16;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000147674;OID=.;OPOS=10231417;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:40:0:0:40:40:1:24:16:0:0:24:16:0:0
chr17	10243717	.	G	A	501.57	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0554011;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.2134;QD=59.008;RBI=0.0571341;REFB=0;REVB=-0.013965;RO=0;SAF=7;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.32246e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000584842;OID=.;OPOS=10243717;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:27:7:0:0:27:7:0:0
chr17	10318635	.	CA	C,CG	702.47	PASS	AF=0.108696,0.891304;AO=5,40;DP=45;FAO=5,41;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=5,21;FSAR=0,20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0174339,0.0207624;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=123.715,143.584;QD=61.0847;RBI=0.0261607,0.0241569;REFB=0,0;REVB=0.0195049,0.0123483;RO=0;SAF=5,21;SAR=0,19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-3.17587e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0157712,-0.000722109;OID=.,.;OPOS=10318636,10318636;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=C,CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.108696,0.891304:5,40:45:5,41:46:0:5,21:0,20:0:0:20:0:5,21:0,19:0:0
chr17	10319008	.	T	C	227.22	PASS	AF=0.65625;AO=21;DP=32;FAO=21;FDP=32;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=-0.00354499;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.498;QD=28.4025;RBI=0.0332672;REFB=-0.00905247;REVB=0.0330778;RO=11;SAF=6;SAR=15;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0575533;STB=0.531884;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=0.00575962;OID=.;OPOS=10319008;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:32:32:11:11:21:21:0.65625:15:6:4:7:15:6:4:7
chr17	10346781	.	T	C	738.72	PASS	AF=0.981481;AO=52;DP=53;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0294566;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.09;QD=54.7201;RBI=0.0343634;REFB=0.00617691;REVB=0.0176962;RO=1;SAF=20;SAR=32;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0229661;STB=0.511624;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=8.38294e-06;OID=.;OPOS=10346781;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:53:54:1:1:52:53:0.981481:32:20:1:0:32:21:1:0
chr17	10348354	.	T	C	556.96	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00907111;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.855;QD=60.2119;RBI=0.0270585;REFB=0;REVB=-0.0254927;RO=0;SAF=21;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.7558e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.15909e-05;OID=.;OPOS=10348354;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:16:21:0:0:16:21:0:0
chr17	10355371	.	C	T	429.02	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0341522;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=44.9388;QD=57.2022;RBI=0.116783;REFB=0;REVB=0.111677;RO=0;SAF=20;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00288639;OID=.;OPOS=10355371;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:30:0:0:29:30:1:9:20:0:0:10:20:0:0
chr17	10355763	.	T	C	1116.88	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=1.73444e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.38;QD=60.3718;RBI=0.0371825;REFB=0;REVB=0.0371825;RO=0;SAF=32;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.04773e-05;OID=.;OPOS=10355763;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:42:32:0:0:42:32:0:0
chr17	10357915	.	G	A	187.29	PASS	AF=0.642857;AO=18;DP=29;FAO=18;FDP=28;FR=.;FRO=10;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=0.00877818;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.209;QD=26.7559;RBI=0.012723;REFB=0.00172794;REVB=0.0092097;RO=10;SAF=8;SAR=10;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0997564;STB=0.555494;STBP=0.458;TYPE=snp;VARB=-0.00138097;OID=.;OPOS=10357915;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:29:28:10:10:18:18:0.642857:10:8:6:4:10:8:6:4
chr17	10363410	.	A	G	2340.01	PASS	AF=0.993243;AO=144;DP=147;FAO=147;FDP=148;FR=.;FRO=1;FSAF=65;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0286844;FXX=0.0133324;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.303;QD=63.2436;RBI=0.0373076;REFB=-0.110911;REVB=-0.0238551;RO=0;SAF=63;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-8.25873e-08;STB=0.50303;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=0.00108754;OID=.;OPOS=10363410;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:147:148:0:1:144:147:0.993243:81:63:0:0:82:65:0:1
chr17	10368847	.	C	T	817.73	PASS	AF=0.709677;AO=66;DP=93;FAO=66;FDP=93;FR=.;FRO=27;FSAF=36;FSAR=30;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=0.00960259;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.467;QD=35.1712;RBI=0.0112994;REFB=-0.0159947;REVB=-0.00595536;RO=27;SAF=36;SAR=30;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0546445;STB=0.529403;STBP=0.379;TYPE=snp;VARB=0.00611672;OID=.;OPOS=10368847;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:27:27:66:66:0.709677:30:36:12:15:30:36:12:15
chr17	10415840	.	A	G	339.72	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0153983;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=198.353;QD=54.3556;RBI=0.0156077;REFB=0;REVB=0.00254807;RO=0;SAF=11;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.63172e-05;OID=.;OPOS=10415840;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:14:11:0:0:14:11:0:0
chr17	10427924	.	G	A	594.54	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.038248;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.182;QD=60.978;RBI=0.0408689;REFB=0;REVB=0.0143999;RO=0;SAF=16;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.43889e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000199875;OID=.;OPOS=10427924;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:23:16:0:0:23:16:0:0
chr17	10448769	.	A	T	1029.89	PASS	AF=1;AO=69;DP=70;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.01914;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.012;QD=59.7035;RBI=0.0300931;REFB=0;REVB=-0.0232219;RO=0;SAF=33;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.36169e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000289925;OID=.;OPOS=10448769;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:69:0:0:69:69:1:36:33:0:0:36:33:0:0
chr17	10450816	.	T	C	1285.78	PASS	AF=1;AO=83;DP=84;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00041986;FXX=0.0119033;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.031;QD=61.9651;RBI=0.0101046;REFB=0;REVB=0.0100959;RO=0;SAF=40;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.1121e-06;OID=.;OPOS=10450816;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:83:0:0:83:83:1:43:40:0:0:43:40:0:0
chr17	10541741	.	A	G	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0210381;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.766;QD=45.8052;RBI=0.0534132;REFB=0;REVB=-0.0490955;RO=0;SAF=5;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00140635;OID=.;OPOS=10541741;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:9:5:0:0:9:5:0:0
chr17	11166782	.	G	A	291.07	PASS	AF=0.590909;AO=26;DP=44;FAO=26;FDP=44;FR=.;FRO=18;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=14;FWDB=-0.0110439;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.4281;QD=26.4607;RBI=0.03568;REFB=0.00842013;REVB=-0.0339278;RO=18;SAF=17;SAR=9;SRF=4;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.314968;STB=0.674006;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=-0.00639037;OID=.;OPOS=11166782;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:18:18:26:26:0.590909:9:17:4:14:9:17:4:14
chr17	11502125	.	C	T	112.83	PASS	AF=0.253731;AO=18;DP=67;FAO=17;FDP=67;FR=.;FRO=50;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=30;FSRR=20;FWDB=0.0173207;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.7262;QD=6.73593;RBI=0.0378242;REFB=0.0103874;REVB=0.0336253;RO=49;SAF=10;SAR=8;SRF=30;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.070016;STB=0.50908;STBP=0.944;TYPE=snp;VARB=-0.0279182;OID=.;OPOS=11502125;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:49:50:18:17:0.253731:8:10:30:19:7:10:30:20
chr17	11523082	.	A	G	512.78	PASS	AF=0.972973;AO=34;DP=35;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00264155;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.727;QD=55.4355;RBI=0.0202823;REFB=0.0966756;REVB=-0.0201095;RO=1;SAF=14;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.022804;STB=0.512188;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=-0.00204799;OID=.;OPOS=11523082;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:35:37:1:1:34:36:0.972973:20:14:0:1:20:16:0:1
chr17	11583089	.	T	C	785.2	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0238291;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.956;QD=57.1051;RBI=0.0374304;REFB=0;REVB=0.0288654;RO=0;SAF=28;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.4002e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.47905e-06;OID=.;OPOS=11583089;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:27:28:0:0:27:28:0:0
chr17	11642231	.	A	G	102.68	PASS	AF=0.295455;AO=13;DP=44;FAO=13;FDP=44;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.00383534;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.8397;QD=9.33448;RBI=0.04051;REFB=0.0087824;REVB=-0.0403281;RO=31;SAF=10;SAR=3;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.3535;STB=0.716628;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=-0.0271823;OID=.;OPOS=11642231;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:31:31:13:13:0.295455:3:10:15:16:3:10:15:16
chr17	11648332	.	C	T	585.03	PASS	AF=0.952381;AO=39;DP=41;FAO=40;FDP=42;FR=.;FRO=2;FSAF=10;FSAR=30;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.123656;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.9538;QD=55.7173;RBI=0.123744;REFB=-0.078732;REVB=0.00465901;RO=0;SAF=9;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.68708e-08;STB=0.545431;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=0.00236296;OID=.;OPOS=11648332;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:41:42:0:2:39:40:0.952381:30:9:0:0:30:10:2:0
chr17	11671913	.	G	C	153.06	PASS	AF=0.255814;AO=22;DP=86;FAO=22;FDP=86;FR=.;FRO=64;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=35;FSRR=29;FWDB=-0.026896;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.445;QD=7.11922;RBI=0.0322813;REFB=0.00043301;REVB=-0.017852;RO=59;SAF=13;SAR=9;SRF=35;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00289402;STB=0.533447;STBP=0.745;TYPE=snp;VARB=-0.00189461;OID=.;OPOS=11671913;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:59:64:22:22:0.255814:9:13:35:24:9:13:35:29
chr17	11786951	.	T	C	411.12	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0101982;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.756;QD=56.7066;RBI=0.01885;REFB=0;REVB=-0.0158531;RO=0;SAF=19;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000140596;OID=.;OPOS=11786951;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:10:19:0:0:10:19:0:0
chr17	11787936	.	A	G	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0323044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.584;QD=45.8068;RBI=0.0324257;REFB=0;REVB=0.00280266;RO=0;SAF=6;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00048145;OID=.;OPOS=11787936;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:8:6:0:0:8:6:0:0
chr17	12820632	.	A	C	416.45	PASS	AF=0.703704;AO=37;DP=53;FAO=38;FDP=54;FR=.;FRO=16;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=0.0374553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.351;QD=30.8483;RBI=0.0379925;REFB=0.00146121;REVB=-0.00636607;RO=15;SAF=22;SAR=15;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00298159;STB=0.506132;STBP=0.909;TYPE=snp;VARB=-0.00016784;OID=.;OPOS=12820632;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:54:15:16:37:38:0.703704:15:22:9:6:15:23:10:6
chr17	12820646	.	G	C	99.98	PASS	AF=0.259259;AO=14;DP=54;FAO=14;FDP=54;FR=.;FRO=40;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=24;FSRR=16;FWDB=-0.0141059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.1096;QD=7.40606;RBI=0.0274493;REFB=-0.0184743;REVB=-0.0235475;RO=40;SAF=8;SAR=6;SRF=24;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.035332;STB=0.521708;STBP=0.878;TYPE=snp;VARB=0.0391706;OID=.;OPOS=12820646;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:40:40:14:14:0.259259:6:8:24:16:6:8:24:16
chr17	12894832	.	A	G	60.3	PASS	AF=0.571429;AO=8;DP=14;FAO=8;FDP=14;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.0110443;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.3348;QD=17.2293;RBI=0.0346157;REFB=0.0181498;REVB=0.0328066;RO=6;SAF=3;SAR=5;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.326506;STB=0.689206;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=-0.0107314;OID=.;OPOS=12894832;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:14:14:6:6:8:8:0.571429:5:3:5:1:5:3:5:1
chr17	13399616	.	A	T	419.14	PASS	AF=1;AO=29;DP=30;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0300927;FXX=0.0644953;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.016;QD=57.8123;RBI=0.0308207;REFB=0;REVB=0.00665932;RO=0;SAF=18;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000344949;OID=.;OPOS=13399616;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:29:0:0:29:29:1:11:18:0:0:11:18:0:0
chr17	13980350	.	G	A	33.48	PASS	AF=0.714286;AO=5;DP=7;FAO=5;FDP=7;FR=.;FRO=2;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00318684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.328;QD=19.1329;RBI=0.121318;REFB=-0.0106764;REVB=-0.121276;RO=2;SAF=1;SAR=4;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190062;STB=0.614874;STBP=0.568;TYPE=snp;VARB=-0.000247977;OID=.;OPOS=13980350;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:7:7:2:2:5:5:0.714286:4:1:1:1:4:1:1:1
chr17	14005439	.	G	A	438.09	PASS	AF=0.722222;AO=38;DP=53;FAO=39;FDP=54;FR=.;FRO=15;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.00735841;FXX=0.0181785;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.2101;QD=32.4512;RBI=0.0570958;REFB=0.00643694;REVB=0.0566197;RO=15;SAF=21;SAR=17;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0451304;STB=0.51999;STBP=0.606;TYPE=snp;VARB=-0.0018473;OID=.;OPOS=14005439;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:54:15:15:38:39:0.722222:17:21:7:8:18:21:7:8
chr17	14095309	.	A	G	1175.22	PASS	AF=1;AO=77;DP=78;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0513953;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.926;QD=61.0502;RBI=0.0515378;REFB=0;REVB=-0.00383044;RO=0;SAF=36;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.52206e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000134811;OID=.;OPOS=14095309;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:77:0:0:77:77:1:41:36:0:0:41:36:0:0
chr17	14111176	.	C	A	427.86	PASS	AF=0.939394;AO=31;DP=33;FAO=31;FDP=33;FR=.;FRO=2;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0301017;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=236.861;QD=51.8618;RBI=0.0304175;REFB=-0.132477;REVB=0.00437214;RO=2;SAF=10;SAR=21;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0845287;STB=0.545424;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=0.000681807;OID=.;OPOS=14111176;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:33:33:2:2:31:31:0.939394:21:10:2:0:21:10:2:0
chr17	14140103	.	AT	GC,GT,TT	643.32	PASS	AF=0.0465116,0.906977,0.0465116;AO=2,39,2;DP=43;FAO=2,39,2;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=2,13,1;FSAR=0,26,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0331696,0.0031059,0.0134529;FXX=0;HRUN=1,1,1;LEN=2,1,1;MLLD=164.153,112.919,44.3566;QD=59.844;RBI=0.0369241,0.0101056,0.0193719;REFB=0,0,0;REVB=-0.0162223,-0.00961646,-0.0139388;RO=0;SAF=2,13,1;SAR=0,26,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=mnp,snp,snp;VARB=0.0784355,-0.00259782,0.101759;OID=.,.,.;OPOS=14140103,14140103,14140103;OREF=AT,A,A;OALT=GC,G,T;OMAPALT=GC,GT,TT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:43:43:0:0:2,39,2:2,39,2:0.0465116,0.906977,0.0465116:0,26,1:2,13,1:0:0:0,26,1:2,13,1:0:0
chr17	14248423	.	T	C	144.56	PASS	AF=1;AO=9;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.121578;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.41;QD=44.4807;RBI=0.124832;REFB=0;REVB=0.0283159;RO=0;SAF=1;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00599393;OID=.;OPOS=14248423;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:9:13:1:8:1:0:0:8:5:0:0
chr17	14249167	.	C	T	575.96	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00550862;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.784;QD=60.6275;RBI=0.0301968;REFB=0;REVB=0.0296901;RO=0;SAF=23;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.91909e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.23162e-05;OID=.;OPOS=14249167;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:38:0:0:37:38:1:14:23:0:0:15:23:0:0
chr17	15154966	.	T	A	286.49	PASS	AF=0.553191;AO=26;DP=47;FAO=26;FDP=47;FR=.;FRO=21;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=17;FWDB=-0.0153338;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.608;QD=24.3821;RBI=0.0206224;REFB=-0.00950793;REVB=0.0137898;RO=21;SAF=16;SAR=10;SRF=4;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.331725;STB=0.683411;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.0127966;OID=.;OPOS=15154966;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:21:21:26:26:0.553191:10:16:4:17:10:16:4:17
chr17	15207364	.	T	G	557.61	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0229226;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=296.603;QD=60.2823;RBI=0.0428616;REFB=0;REVB=0.036217;RO=0;SAF=16;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.9376e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000164507;OID=.;OPOS=15207364;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:37:0:0:36:37:1:20:16:0:0:21:16:0:0
chr17	15217437	.	C	G	272.53	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0439551;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.2333;QD=51.9113;RBI=0.115078;REFB=0;REVB=-0.106352;RO=0;SAF=9;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00211474;OID=.;OPOS=15217437;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:12:9:0:0:12:9:0:0
chr17	15311975	.	G	A	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0278315;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.2793;QD=44.6896;RBI=0.061776;REFB=0;REVB=-0.0551514;RO=0;SAF=6;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00116867;OID=.;OPOS=15311975;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:7:6:0:0:7:6:0:0
chr17	15343524	.	C	CCTT	362.24	PASS	AF=1;AO=25;DP=27;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0960105;FXX=0.0370233;HRUN=2;LEN=3;MLLD=188.933;QD=55.7292;RBI=0.100243;REFB=0;REVB=-0.0288205;RO=1;SAF=1;SAR=24;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.018954;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000338633;OID=.;OPOS=15343525;OREF=-;OALT=CTT;OMAPALT=CCTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:25:27:26:26:0:1:25:0:0:4:1:1:24:0:1
chr17	15477417	.	A	G	50.47	PASS	AF=0.583333;AO=7;DP=12;FAO=7;FDP=12;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-8.92469e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.101;QD=16.8229;RBI=0.0711108;REFB=-0.00715124;REVB=0.0711108;RO=5;SAF=3;SAR=4;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121017;STB=0.571224;STBP=0.651;TYPE=snp;VARB=0.00626902;OID=.;OPOS=15477417;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:12:12:5:5:7:7:0.583333:4:3:3:2:4:3:3:2
chr17	15492409	.	T	C	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0183895;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.975;QD=44.6898;RBI=0.0185123;REFB=0;REVB=0.0021292;RO=0;SAF=12;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.00075e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000229952;OID=.;OPOS=15492409;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:1:12:0:0:1:12:0:0
chr17	15496727	.	T	G	708.22	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0401441;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.9969;QD=62.9533;RBI=0.0450422;REFB=0;REVB=0.0204266;RO=0;SAF=20;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.09779e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000882577;OID=.;OPOS=15496727;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:25:20:0:0:25:20:0:0
chr17	15496730	.	A	G	746.98	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00462238;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.6347;QD=63.5723;RBI=0.0292407;REFB=0;REVB=-0.028873;RO=0;SAF=24;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000138025;OID=.;OPOS=15496730;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:23:24:0:0:23:24:0:0
chr17	15498181	.	A	G	393.7	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00832645;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.74;QD=56.2433;RBI=0.0282195;REFB=0;REVB=0.0269632;RO=0;SAF=16;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.48632e-05;OID=.;OPOS=15498181;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:28:0:0:27:28:1:11:16:0:0:12:16:0:0
chr17	15510888	.	G	A	1320.59	PASS	AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00634823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.939;QD=62.1454;RBI=0.00984888;REFB=0;REVB=0.00752997;RO=0;SAF=42;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.53291e-05;OID=.;OPOS=15510888;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:43:42:0:0:43:42:0:0
chr17	15510988	.	T	C	602.38	PASS	AF=0.931818;AO=41;DP=44;FAO=41;FDP=44;FR=.;FRO=3;FSAF=16;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0360838;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.399;QD=54.7621;RBI=0.0384924;REFB=-0.114683;REVB=0.0134024;RO=3;SAF=16;SAR=25;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0076479;STB=0.504082;STBP=0.923;TYPE=snp;VARB=0.00205557;OID=.;OPOS=15510988;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:44:44:3:3:41:41:0.931818:25:16:1:2:25:16:1:2
chr17	15531942	.	C	A	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.027558;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=226.209;QD=42.1827;RBI=0.0282076;REFB=0;REVB=-0.00601876;RO=0;SAF=5;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000287576;OID=.;OPOS=15531942;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:6:5:0:0:6:5:0:0
chr17	15532208	.	G	A	542.09	PASS	AF=1;AO=35;DP=36;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0303624;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.78;QD=55.5993;RBI=0.0304458;REFB=-0.0867886;REVB=-0.00225155;RO=1;SAF=14;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0217573;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00113096;OID=.;OPOS=15532208;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:36:39:1:0:35:39:1:21:14:0:1:22:17:0:0
chr17	15554504	.	G	A	374.25	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0569373;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.1417;QD=55.4437;RBI=0.0927772;REFB=0;REVB=0.0732513;RO=0;SAF=9;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00251656;OID=.;OPOS=15554504;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:27:0:0:25:27:1:16:9:0:0:17:10:0:0
chr17	15611495	.	T	C	837.41	PASS	AF=1;AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00147067;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.602;QD=57.7527;RBI=0.0434296;REFB=0;REVB=0.0434047;RO=0;SAF=29;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.34166e-05;OID=.;OPOS=15611495;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:58:0:0:58:58:1:29:29:0:0:29:29:0:0
chr17	15620647	.	G	A	594.49	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00626869;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.463;QD=60.9737;RBI=0.00689867;REFB=0;REVB=-0.00288013;RO=0;SAF=16;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.43889e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000156053;OID=.;OPOS=15620647;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:23:16:0:0:23:16:0:0
chr17	15644506	.	C	T	754.98	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00518137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.53;QD=62.9152;RBI=0.00693497;REFB=0;REVB=0.00460947;RO=0;SAF=20;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000133557;OID=.;OPOS=15644506;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:48:0:0:47:48:1:27:20:0:0:28:20:0:0
chr17	15645289	.	G	A	161.3	PASS	AF=0.882353;AO=15;DP=17;FAO=15;FDP=17;FR=.;FRO=2;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00709569;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.7816;QD=37.9523;RBI=0.0144765;REFB=-0.0706006;REVB=-0.0126183;RO=2;SAF=7;SAR=8;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00714946;STB=0.503932;STBP=0.881;TYPE=snp;VARB=0.0420085;OID=.;OPOS=15645289;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:17:17:2:2:15:15:0.882353:8:7:1:1:8:7:1:1
chr17	15690281	.	C	T	461.58	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0138121;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.2988;QD=57.6969;RBI=0.122065;REFB=0;REVB=0.121281;RO=0;SAF=16;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00220515;OID=.;OPOS=15690281;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:32:0:0:31:32:1:15:16:0:0:16:16:0:0
chr17	15690793	.	T	C	1320.95	PASS	AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0412598;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.221;QD=62.1621;RBI=0.0422347;REFB=0;REVB=0.00902217;RO=0;SAF=31;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.11373e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.73466e-05;OID=.;OPOS=15690793;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:54:31:0:0:54:31:0:0
chr17	15878109	.	CCAA	C	46.62	PASS	AF=0.22449;AO=11;DP=50;FAO=11;FDP=49;FR=.;FRO=38;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=24;FSRR=14;FWDB=-0.024661;FXX=0.0754575;HRUN=2;LEN=3;MLLD=252.626;QD=3.80603;RBI=0.0326843;REFB=-0.0117776;REVB=-0.02145;RO=36;SAF=6;SAR=5;SRF=23;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116305;STB=0.568062;STBP=0.613;TYPE=del;VARB=0.0353783;OID=.;OPOS=15878110;OREF=CAA;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.22449:11:50:11:49:38:6:5:24:14:46:36:6:5:23:13
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chr17	16068343	.	G	A	146.88	PASS	AF=0.203125;AO=24;DP=126;FAO=26;FDP=128;FR=.;FRO=102;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=59;FSRR=43;FWDB=-0.00594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.2607;QD=4.59007;RBI=0.0147848;REFB=-0.0193636;REVB=-0.0135391;RO=102;SAF=16;SAR=8;SRF=59;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119127;STB=0.598357;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.028987;OID=.;OPOS=16068343;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:126:128:102:102:24:26:0.203125:8:16:59:43:8:18:59:43
chr17	16068362	.	C	T	213.06	PASS	AF=0.244275;AO=32;DP=132;FAO=32;FDP=131;FR=.;FRO=99;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=57;FSRR=42;FWDB=0.00412534;FXX=0.00757518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.254;QD=6.50575;RBI=0.0131617;REFB=-0.0135822;REVB=-0.0124985;RO=100;SAF=18;SAR=14;SRF=57;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00953345;STB=0.510198;STBP=0.905;TYPE=snp;VARB=0.0358681;OID=.;OPOS=16068362;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:132:131:100:99:32:32:0.244275:14:18:57:43:14:18:57:42
chr17	16068377	.	C	G	192.17	PASS	AF=0.225564;AO=30;DP=135;FAO=30;FDP=133;FR=.;FRO=103;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=58;FSRR=45;FWDB=0.00554434;FXX=0.0220572;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.738;QD=5.77947;RBI=0.0100895;REFB=0.00484848;REVB=-0.00842958;RO=101;SAF=18;SAR=12;SRF=56;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0587247;STB=0.529392;STBP=0.727;TYPE=snp;VARB=-0.0137357;OID=.;OPOS=16068377;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:135:133:101:103:30:30:0.225564:12:18:56:45:12:18:58:45
chr17	16068383	.	G	A	199.03	PASS	AF=0.22963;AO=30;DP=134;FAO=31;FDP=135;FR=.;FRO=104;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=59;FSRR=45;FWDB=-0.00819155;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=313.306;QD=5.89709;RBI=0.00889047;REFB=-0.00284681;REVB=0.00345528;RO=104;SAF=19;SAR=11;SRF=59;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0868374;STB=0.53638;STBP=0.641;TYPE=snp;VARB=0.010051;OID=.;OPOS=16068383;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:134:135:104:104:30:31:0.22963:11:19:59:45:12:19:59:45
chr17	16068396	.	G	A	228.84	PASS	AF=0.253731;AO=32;DP=132;FAO=34;FDP=134;FR=.;FRO=100;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=58;FSRR=42;FWDB=-0.00913832;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.474;QD=6.83109;RBI=0.0218356;REFB=-0.00231667;REVB=0.0198314;RO=98;SAF=18;SAR=14;SRF=57;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0243238;STB=0.516076;STBP=0.842;TYPE=snp;VARB=0.0153043;OID=.;OPOS=16068396;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:132:134:98:100:32:34:0.253731:14:18:57:41:15:19:58:42
chr17	16097825	.	T	G	51.52	PASS	AF=0.111111;AO=12;DP=108;FAO=12;FDP=108;FR=.;FRO=96;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=38;FSRR=58;FWDB=-0.0286519;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.3328;QD=1.90815;RBI=0.0469003;REFB=-0.00644841;REVB=-0.037131;RO=93;SAF=2;SAR=10;SRF=37;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.32419;STB=0.745806;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.0556629;OID=.;OPOS=16097825;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:51:108:108:93:96:12:12:0.111111:10:2:37:56:10:2:38:58
chr17	16097870	.	C	A	70.71	PASS	AF=0.14;AO=14;DP=100;FAO=14;FDP=100;FR=.;FRO=86;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=32;FSRR=54;FWDB=0.00371698;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.1989;QD=2.82834;RBI=0.0119743;REFB=0.00206092;REVB=-0.0113828;RO=86;SAF=5;SAR=9;SRF=32;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0200501;STB=0.513869;STBP=0.927;TYPE=snp;VARB=-0.0127508;OID=.;OPOS=16097870;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:70:100:100:86:86:14:14:0.14:9:5:32:54:9:5:32:54
chr17	16285404	.	C	T	54.14	PASS	AF=0.307692;AO=7;DP=25;FAO=8;FDP=26;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=0.139971;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.5794;QD=8.32891;RBI=0.140355;REFB=-0.0184237;REVB=0.010373;RO=18;SAF=2;SAR=5;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.363483;STB=0.659986;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.0492476;OID=.;OPOS=16285404;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:25:26:18:18:7:8:0.307692:5:2:11:7:5:3:11:7
chr17	16524929	.	C	A	173.72	PASS	AF=0.388889;AO=21;DP=54;FAO=21;FDP=54;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=23;FSRR=10;FWDB=-0.0170223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.126;QD=12.8684;RBI=0.0207521;REFB=0.00205742;REVB=-0.0118697;RO=33;SAF=10;SAR=11;SRF=23;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.233046;STB=0.633388;STBP=0.141;TYPE=snp;VARB=-0.00154387;OID=.;OPOS=16524929;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:33:33:21:21:0.388889:11:10:23:10:11:10:23:10
chr17	16537207	.	C	T	551.67	PASS	AF=0.662162;AO=49;DP=74;FAO=49;FDP=74;FR=.;FRO=25;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.00523871;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.609;QD=29.82;RBI=0.00524645;REFB=-0.0212279;REVB=0.000284916;RO=25;SAF=21;SAR=28;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0575751;STB=0.531237;STBP=0.438;TYPE=snp;VARB=0.0193427;OID=.;OPOS=16537207;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:25:25:49:49:0.662162:28:21:13:12:28:21:13:12
chr17	16640908	.	G	A	42.22	PASS	AF=0.666667;AO=6;DP=9;FAO=6;FDP=9;FR=.;FRO=3;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0167872;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.554;QD=18.7664;RBI=0.0714103;REFB=0.00751982;REVB=-0.0694091;RO=3;SAF=3;SAR=3;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.28674;STB=0.66617;STBP=0.199;TYPE=snp;VARB=-0.00627101;OID=.;OPOS=16640908;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:9:9:3:3:6:6:0.666667:3:3:3:0:3:3:3:0
chr17	16664991	.	G	A	105.25	PASS	AF=0.846154;AO=11;DP=13;FAO=11;FDP=13;FR=.;FRO=2;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0627311;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.1511;QD=32.384;RBI=0.0729455;REFB=0.0778088;REVB=-0.037227;RO=2;SAF=5;SAR=6;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149061;STB=0.583183;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=-0.0131662;OID=.;OPOS=16664991;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:13:13:2:2:11:11:0.846154:6:5:2:0:6:5:2:0
chr17	16692262	.	C	T	113.11	PASS	AF=0.5;AO=13;DP=26;FAO=13;FDP=26;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=0.0662908;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.3254;QD=17.4012;RBI=0.0710493;REFB=-0.0163427;REVB=0.0255643;RO=13;SAF=6;SAR=7;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199178;STB=0.613866;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.0218133;OID=.;OPOS=16692262;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:26:13:13:13:13:0.5:7:6:9:4:7:6:9:4
chr17	16735618	.	G	A	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0260608;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.413;QD=46.848;RBI=0.0430598;REFB=0;REVB=0.034278;RO=0;SAF=6;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000850849;OID=.;OPOS=16735618;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:9:6:0:0:9:6:0:0
chr17	16746358	.	G	A	191.27	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0437244;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.2821;QD=47.8176;RBI=0.0445598;REFB=0;REVB=-0.00858795;RO=0;SAF=11;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.36667e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000939305;OID=.;OPOS=16746358;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:5:11:0:0:5:11:0:0
chr17	16828665	.	GT	G	49.58	PASS	AF=0.368421;AO=21;DP=58;FAO=21;FDP=57;FR=.;FRO=36;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=24;FWDB=0.00900522;FXX=0.0338926;HRUN=7;LEN=1;MLLD=9.08014;QD=3.47911;RBI=0.067791;REFB=-0.0718449;REVB=-0.0671902;RO=35;SAF=7;SAR=14;SRF=12;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0114941;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.0727702;OID=.;OPOS=16828666;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.368421:21:58:21:57:36:7:14:12:24:49:35:7:14:12:23
chr17	16828713	.	A	T	937.57	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00161917;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.8465;QD=58.5981;RBI=0.0275482;REFB=0;REVB=0.0275006;RO=0;SAF=18;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.12145e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000174084;OID=.;OPOS=16828713;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:46:18:0:0:46:18:0:0
chr17	16828790	.	TG	CA	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00666933;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=116.011;QD=59.4356;RBI=0.0734382;REFB=0;REVB=0.0731347;RO=0;SAF=9;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000643088;OID=.;OPOS=16828790;OREF=TG;OALT=CA;OMAPALT=CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:26:9:0:0:26:9:0:0
chr17	16836425	.	G	A	888.6	PASS	AF=1;AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00683435;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.042;QD=58.2689;RBI=0.0410317;REFB=0;REVB=0.0404585;RO=0;SAF=26;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.99247e-05;OID=.;OPOS=16836425;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:61:0:0:61:61:1:35:26:0:0:35:26:0:0
chr17	16842912	.	A	G	648.41	PASS	AF=1;AO=40;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=33;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00335269;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.956;QD=61.753;RBI=0.051937;REFB=0;REVB=0.0518287;RO=0;SAF=32;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000315925;OID=.;OPOS=16842912;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:40:42:1:8:32:0:0:9:33:0:0
chr17	16842991	.	G	A	688.53	PASS	AF=0.92;AO=46;DP=50;FAO=46;FDP=50;FR=.;FRO=4;FSAF=33;FSAR=13;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.00593324;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=296.322;QD=55.0827;RBI=0.0233068;REFB=-0.129725;REVB=-0.0225389;RO=4;SAF=33;SAR=13;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0394293;STB=0.521043;STBP=0.422;TYPE=snp;VARB=0.000834811;OID=.;OPOS=16842991;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:18:50:50:4:4:46:46:0.92:13:33:2:2:13:33:2:2
chr17	16855878	.	C	T	246.3	PASS	AF=0.952381;AO=20;DP=21;FAO=20;FDP=21;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.104541;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=78.4482;QD=46.9139;RBI=0.10777;REFB=-0.141258;REVB=0.0261864;RO=1;SAF=15;SAR=5;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0834715;STB=0.545407;STBP=0.175;TYPE=snp;VARB=0.00486601;OID=.;OPOS=16855878;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:21:21:1:1:20:20:0.952381:5:15:0:1:5:15:0:1
chr17	17046024	.	C	A	30.5	PASS	AF=0.454545;AO=5;DP=11;FAO=5;FDP=11;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0519798;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.5506;QD=11.0922;RBI=0.0951146;REFB=0.0614606;REVB=-0.0796548;RO=6;SAF=3;SAR=2;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0621951;STB=0.538311;STBP=0.816;TYPE=snp;VARB=-0.0760367;OID=.;OPOS=17046024;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:11:11:6:6:5:5:0.454545:2:3:4:2:2:3:4:2
chr17	17062241	.	C	G	347.9	PASS	AF=0.276836;AO=49;DP=177;FAO=49;FDP=177;FR=.;FRO=128;FSAF=19;FSAR=30;FSRF=72;FSRR=56;FWDB=-0.0277688;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=199.585;QD=7.86223;RBI=0.0359951;REFB=-0.00710943;REVB=-0.0229028;RO=128;SAF=19;SAR=30;SRF=72;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.212907;STB=0.625522;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.0178863;OID=.;OPOS=17062241;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:177:177:128:128:49:49:0.276836:30:19:72:56:30:19:72:56
chr17	17168164	.	G	A	483.64	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0493183;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=288.142;QD=58.6226;RBI=0.0493541;REFB=0;REVB=-0.00187867;RO=0;SAF=17;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000108017;OID=.;OPOS=17168164;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:33:0:0:32:33:1:15:17:0:0:15:18:0:0
chr17	17179481	.	G	A	586.01	PASS	AF=0.975;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.043704;FXX=0.0243843;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.895;QD=58.6006;RBI=0.0438055;REFB=0.0175791;REVB=0.00298061;RO=1;SAF=16;SAR=23;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.028395;STB=0.515144;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=-0.00352751;OID=.;OPOS=17179481;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:40:40:1:1:39:39:0.975:23:16:1:0:23:16:1:0
chr17	17326363	.	G	A	236.09	PASS	AF=1;AO=9;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0268662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.074;QD=47.2174;RBI=0.027942;REFB=0;REVB=0.00767856;RO=0;SAF=2;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000574682;OID=.;OPOS=17326363;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:9:20:1:7:2:0:0:7:13:0:0
chr17	17326604	.	CA	TG	487.22	PASS	AF=1;AO=33;DP=34;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0324223;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=2;MLLD=150.643;QD=59.0574;RBI=0.0539478;REFB=0;REVB=0.043118;RO=0;SAF=16;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.60901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000172842;OID=.;OPOS=17326604;OREF=CA;OALT=TG;OMAPALT=TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:33:0:0:33:33:1:17:16:0:0:17:16:0:0
chr17	17363784	.	A	C	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.124422;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.495;QD=47.8218;RBI=0.125143;REFB=0;REVB=0.013413;RO=0;SAF=5;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.36667e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000999341;OID=.;OPOS=17363784;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:11:5:0:0:11:5:0:0
chr17	17397982	.	T	C	844.24	PASS	AF=0.953846;AO=61;DP=65;FAO=62;FDP=65;FR=.;FRO=3;FSAF=32;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0892264;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=107.906;QD=51.9534;RBI=0.0892686;REFB=-0.11099;REVB=0.00274649;RO=3;SAF=31;SAR=30;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0154529;STB=0.523802;STBP=0.137;TYPE=snp;VARB=0.00290094;OID=.;OPOS=17397982;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:65:65:3:3:61:62:0.953846:30:31:1:2:30:32:0:3
chr17	17682484	.	G	A	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0314826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.671;QD=50.4135;RBI=0.0316804;REFB=0;REVB=0.00353444;RO=0;SAF=7;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000118555;OID=.;OPOS=17682484;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:12:7:0:0:12:7:0:0
chr17	17696531	.	G	C	347.56	PASS	AF=0.962963;AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=27;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0440054;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.7162;QD=51.491;RBI=0.0861167;REFB=0.00727276;REVB=0.0740244;RO=1;SAF=17;SAR=9;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0265471;STB=0.514275;STBP=0.618;TYPE=snp;VARB=0.000147429;OID=.;OPOS=17696531;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:27:27:1:1:26:26:0.962963:9:17:1:0:9:17:1:0
chr17	17696755	.	C	A	772.55	PASS	AF=0.98;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0197407;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=118.496;QD=61.8038;RBI=0.0463507;REFB=0.0683799;REVB=-0.0419368;RO=1;SAF=20;SAR=29;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.015953;STB=0.508471;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=-0.000489518;OID=.;OPOS=17696755;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:50:50:1:1:49:49:0.98:29:20:0:1:29:20:0:1
chr17	17715101	.	G	A	584.03	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0120767;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.1287;QD=59.9006;RBI=0.0122097;REFB=0;REVB=0.00179716;RO=0;SAF=14;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00207609;OID=.;OPOS=17715101;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:25:14:0:0:25:14:0:0
chr17	17896205	.	C	T	697.92	PASS	AF=0.962264;AO=51;DP=54;FAO=51;FDP=53;FR=.;FRO=2;FSAF=24;FSAR=27;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0380797;FXX=0.0185151;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.814;QD=52.6729;RBI=0.0437646;REFB=0.0340696;REVB=0.0215703;RO=2;SAF=24;SAR=27;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.037631;STB=0.519992;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=-0.000367556;OID=.;OPOS=17896205;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:54:53:2:2:51:51:0.962264:27:24:2:0:27:24:2:0
chr17	18003671	.	T	G	212.93	PASS	AF=0.625;AO=20;DP=33;FAO=20;FDP=32;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=0.00629436;FXX=0.0302939;HRUN=2;LEN=1;MLLD=235.828;QD=26.6165;RBI=0.00631028;REFB=-0.0223667;REVB=-0.000447928;RO=11;SAF=8;SAR=12;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0243745;STB=0.52629;STBP=0.745;TYPE=snp;VARB=0.0132595;OID=.;OPOS=18003671;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:33:32:11:12:20:20:0.625:12:8:4:7:12:8:4:8
chr17	18052867	.	T	C	639.02	PASS	AF=0.977273;AO=42;DP=44;FAO=43;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0777295;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=71.0018;QD=58.0928;RBI=0.0822016;REFB=-0.083944;REVB=0.0267439;RO=0;SAF=29;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.36943e-08;STB=0.51851;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.000940747;OID=.;OPOS=18052867;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:44:44:0:1:42:43:0.977273:13:29:0:0:13:30:0:1
chr17	18077175	.	T	C	105.97	PASS	AF=0.25;AO=16;DP=64;FAO=16;FDP=64;FR=.;FRO=48;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=33;FWDB=-0.0190692;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.525;QD=6.62334;RBI=0.019188;REFB=-0.00279595;REVB=0.00213179;RO=48;SAF=7;SAR=9;SRF=15;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160212;STB=0.597446;STBP=0.399;TYPE=snp;VARB=0.00780481;OID=.;OPOS=18077175;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:48:48:16:16:0.25:9:7:15:33:9:7:15:33
chr17	18137141	.	A	G	1465.98	PASS	AF=1;AO=91;DP=92;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0268822;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.936;QD=63.0529;RBI=0.028708;REFB=0;REVB=0.0100746;RO=0;SAF=53;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.60758e-05;OID=.;OPOS=18137141;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:92:93:0:0:91:93:1:38:53:0:0:38:55:0:0
chr17	18141043	.	C	T	283.69	PASS	AF=0.530612;AO=26;DP=49;FAO=26;FDP=49;FR=.;FRO=23;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=0.0106646;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.087;QD=23.1584;RBI=0.047632;REFB=0.00436105;REVB=-0.0464227;RO=22;SAF=17;SAR=9;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0559869;STB=0.544653;STBP=0.538;TYPE=snp;VARB=-0.00357303;OID=.;OPOS=18141043;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:22:23:26:26:0.530612:9:17:13:9:9:17:13:10
chr17	18193941	.	G	A	36.38	PASS	AF=0.285714;AO=6;DP=21;FAO=6;FDP=21;FR=.;FRO=15;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.013583;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.864;QD=6.929;RBI=0.0291978;REFB=0.00033492;REVB=-0.0258459;RO=15;SAF=2;SAR=4;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.225087;STB=0.644671;STBP=0.408;TYPE=snp;VARB=-0.000537683;OID=.;OPOS=18193941;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:21:21:15:15:6:6:0.285714:4:2:8:7:4:2:8:7
chr17	18221134	.	C	T	45.35	PASS	AF=0.318182;AO=7;DP=22;FAO=7;FDP=22;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.000478992;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.052;QD=8.24622;RBI=0.0219211;REFB=-0.000743025;REVB=-0.0219159;RO=15;SAF=4;SAR=3;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.185114;STB=0.615062;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.000774394;OID=.;OPOS=18221134;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:22:22:15:15:7:7:0.318182:3:4:6:9:3:4:6:9
chr17	18226177	.	G	T	68.82	PASS	AF=0.5;AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=-0.0119844;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.306;QD=15.2931;RBI=0.021995;REFB=-0.0264812;REVB=-0.0184433;RO=9;SAF=5;SAR=4;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198782;STB=0.615147;STBP=0.406;TYPE=snp;VARB=0.031457;OID=.;OPOS=18226177;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:18:18:9:9:9:9:0.5:4:5:7:2:4:5:7:2
chr17	18230380	.	T	C	135.78	PASS	AF=0.321429;AO=18;DP=56;FAO=18;FDP=56;FR=.;FRO=38;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=-0.0262803;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.866;QD=9.69829;RBI=0.0266295;REFB=-0.0134476;REVB=-0.00429826;RO=37;SAF=8;SAR=10;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0480702;STB=0.519978;STBP=0.834;TYPE=snp;VARB=0.0343223;OID=.;OPOS=18230380;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:37:38:18:18:0.321429:10:8:18:19:10:8:18:20
chr17	18232096	.	G	A	198.41	PASS	AF=0.302326;AO=26;DP=86;FAO=26;FDP=86;FR=.;FRO=60;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=35;FSRR=25;FWDB=-0.0055777;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.586;QD=9.2285;RBI=0.00558944;REFB=-0.0119475;REVB=-0.000362102;RO=60;SAF=12;SAR=14;SRF=35;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143165;STB=0.584306;STBP=0.34;TYPE=snp;VARB=0.0262235;OID=.;OPOS=18232096;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:60:60:26:26:0.302326:14:12:35:25:14:12:35:25
chr17	18284262	.	G	A	35.95	PASS	AF=0.26087;AO=6;DP=23;FAO=6;FDP=23;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=-0.0569621;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.19;QD=6.25132;RBI=0.0569871;REFB=0.00249519;REVB=0.00168747;RO=17;SAF=4;SAR=2;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0515186;STB=0.533225;STBP=0.894;TYPE=snp;VARB=-0.0104052;OID=.;OPOS=18284262;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:23:23:17:17:6:6:0.26087:2:4:12:5:2:4:12:5
chr17	18291544	.	A	G	55.93	PASS	AF=0.144737;AO=11;DP=77;FAO=11;FDP=76;FR=.;FRO=65;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=26;FSRR=39;FWDB=-0.0159654;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.128;QD=2.9436;RBI=0.0182113;REFB=-0.00173547;REVB=-0.00876115;RO=64;SAF=7;SAR=4;SRF=26;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.278435;STB=0.694814;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=0.0179057;OID=.;OPOS=18291544;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:77:76:64:65:11:11:0.144737:4:7:26:38:4:7:26:39
chr17	18380154	.	A	G	302.15	PASS	AF=0.362745;AO=37;DP=103;FAO=37;FDP=102;FR=.;FRO=65;FSAF=25;FSAR=12;FSRF=43;FSRR=22;FWDB=-0.0148098;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.741;QD=11.8491;RBI=0.0294306;REFB=-0.00490114;REVB=-0.0254329;RO=65;SAF=25;SAR=12;SRF=42;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0367968;STB=0.510199;STBP=0.895;TYPE=snp;VARB=0.0126208;OID=.;OPOS=18380154;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:102:65:65:37:37:0.362745:12:25:42:23:12:25:43:22
chr17	18390993	.	C	T	63.21	PASS	AF=0.346154;AO=8;DP=26;FAO=9;FDP=26;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=14;FWDB=0.026804;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.13;QD=9.72498;RBI=0.0339759;REFB=-0.00757627;REVB=0.0208785;RO=18;SAF=6;SAR=2;SRF=3;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.587409;STB=0.847835;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.0104526;OID=.;OPOS=18390993;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:26:26:18:17:8:9:0.346154:2:6:3:15:2:7:3:14
chr17	18391003	.	G	A	118.93	PASS	AF=0.388889;AO=14;DP=35;FAO=14;FDP=36;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=17;FWDB=-0.00199151;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.65;QD=13.2146;RBI=0.0278998;REFB=0.000741672;REVB=-0.0278286;RO=21;SAF=9;SAR=5;SRF=5;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.398091;STB=0.738501;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=-0.00169695;OID=.;OPOS=18391003;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:36:21:22:14:14:0.388889:5:9:5:16:5:9:5:17
chr17	18528623	.	A	G	503.3	PASS	AF=0.733333;AO=44;DP=60;FAO=44;FDP=60;FR=.;FRO=16;FSAF=30;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.0215185;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.6193;QD=33.5531;RBI=0.0259619;REFB=0.00504284;REVB=-0.0145249;RO=16;SAF=30;SAR=14;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0660194;STB=0.535698;STBP=0.39;TYPE=snp;VARB=-0.0051479;OID=.;OPOS=18528623;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:16:16:44:44:0.733333:14:30:9:7:14:30:9:7
chr17	18542519	.	T	G	63.46	PASS	AF=0.28125;AO=9;DP=33;FAO=9;FDP=32;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=-0.0712034;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.1415;QD=7.93201;RBI=0.0720843;REFB=-0.00929175;REVB=-0.011235;RO=23;SAF=5;SAR=4;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.236878;STB=0.645951;STBP=0.331;TYPE=snp;VARB=0.030904;OID=.;OPOS=18542519;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:33:32:23:23:9:9:0.28125:4:5:8:15:4:5:8:15
chr17	18565350	.	G	C	451.75	PASS	AF=0.683333;AO=41;DP=61;FAO=41;FDP=60;FR=.;FRO=19;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=0.00663796;FXX=0.0163908;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.337;QD=30.1168;RBI=0.00664508;REFB=-0.0315738;REVB=0.000307685;RO=19;SAF=22;SAR=19;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128223;STB=0.569546;STBP=0.118;TYPE=snp;VARB=0.013554;OID=.;OPOS=18565350;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:60:19:19:41:41:0.683333:19:22:6:13:19:22:6:13
chr17	18610134	.	T	G	395.52	PASS	AF=0.695652;AO=32;DP=46;FAO=32;FDP=46;FR=.;FRO=14;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.0495976;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.0232;QD=34.3927;RBI=0.0556071;REFB=-0.0169664;REVB=-0.0251442;RO=14;SAF=18;SAR=14;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.03527;STB=0.519219;STBP=0.718;TYPE=snp;VARB=0.00839869;OID=.;OPOS=18610134;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:14:14:32:32:0.695652:14:18:7:7:14:18:7:7
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chr17	18647625	.	T	A	52.91	PASS	AF=0.583333;AO=7;DP=13;FAO=7;FDP=12;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0135699;FXX=0.076864;HRUN=1;LEN=1;MLLD=296.828;QD=17.6377;RBI=0.0193614;REFB=0.00603783;REVB=-0.0138102;RO=5;SAF=3;SAR=4;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121017;STB=0.571224;STBP=0.651;TYPE=snp;VARB=-0.00629757;OID=.;OPOS=18647625;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:31:13:12:5:5:7:7:0.583333:4:3:3:2:4:3:3:2
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chr17	18653145	.	C	G	92.98	PASS	AF=0.307692;AO=12;DP=39;FAO=12;FDP=39;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=-0.0439095;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.045;QD=9.53621;RBI=0.0441921;REFB=-0.00480967;REVB=-0.00498972;RO=27;SAF=6;SAR=6;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0634537;STB=0.538398;STBP=0.76;TYPE=snp;VARB=0.00690669;OID=.;OPOS=18653145;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:39:39:27:27:12:12:0.307692:6:6:15:12:6:6:15:12
chr17	18671961	.	C	T	91.45	PASS	AF=0.27907;AO=12;DP=43;FAO=12;FDP=43;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=23;FWDB=0.0441993;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.965;QD=8.50707;RBI=0.0452085;REFB=-0.0005635;REVB=-0.00949876;RO=30;SAF=9;SAR=3;SRF=8;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.526206;STB=0.820589;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.00411888;OID=.;OPOS=18671961;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:91:43:43:30:31:12:12:0.27907:3:9:8:22:3:9:8:23
chr17	18694277	.	G	A	417.98	PASS	AF=0.967742;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0109415;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=265.268;QD=53.9325;RBI=0.012035;REFB=0.117337;REVB=0.00501259;RO=1;SAF=11;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0239088;STB=0.512812;STBP=0.539;TYPE=snp;VARB=-0.000968811;OID=.;OPOS=18694277;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:31:31:1:1:30:30:0.967742:19:11:0:1:19:11:0:1
chr17	18702220	.	T	C	890.97	PASS	AF=0.955224;AO=63;DP=66;FAO=64;FDP=67;FR=.;FRO=3;FSAF=18;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0148118;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=54.4882;QD=53.1925;RBI=0.0407942;REFB=-0.187749;REVB=0.0380103;RO=3;SAF=17;SAR=46;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0298065;STB=0.515785;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=0.0102888;OID=.;OPOS=18702220;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:66:67:3:3:63:64:0.955224:46:17:0:3:46:18:0:3
chr17	18708830	.	G	T	31.01	PASS	AF=0.285714;AO=3;DP=14;FAO=4;FDP=14;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=6;FSAF=4;FSAR=0;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=-0.00374837;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.9221;QD=8.85932;RBI=0.0609459;REFB=-0.214516;REVB=0.0608305;RO=4;SAF=3;SAR=0;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00751694;OID=.;OPOS=18708830;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:17:14:14:4:6:3:4:0.285714:0:3:4:0:0:4:6:0
chr17	18775900	.	A	G	125.68	PASS	AF=0.319149;AO=15;DP=47;FAO=15;FDP=47;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=0.034256;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.808;QD=10.6959;RBI=0.0352138;REFB=-0.0154817;REVB=0.00815703;RO=32;SAF=11;SAR=4;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.216285;STB=0.630388;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=0.0338429;OID=.;OPOS=18775900;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:32:32:15:15:0.319149:4:11:18:14:4:11:18:14
chr17	18834021	.	T	C	81.96	PASS	AF=0.289474;AO=11;DP=38;FAO=11;FDP=38;FR=.;FRO=27;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.00331124;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=189.5;QD=8.62771;RBI=0.0181998;REFB=-0.00579882;REVB=0.017896;RO=26;SAF=4;SAR=7;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116253;STB=0.559889;STBP=0.662;TYPE=snp;VARB=0.012383;OID=.;OPOS=18834021;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:81:38:38:26:27:11:11:0.289474:7:4:12:14:7:4:12:15
chr17	18874685	.	C	CGGT	270.7	PASS	AF=0.88;AO=21;DP=26;FAO=22;FDP=25;FR=.;FRO=3;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.00498112;FXX=0.0384468;HRUN=2;LEN=3;MLLD=307.563;QD=43.3122;RBI=0.00570142;REFB=-0.0263099;REVB=0.00277394;RO=3;SAF=15;SAR=6;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0133074;STB=0.50209;STBP=0.959;TYPE=ins;VARB=0.00294004;OID=.;OPOS=18874686;OREF=-;OALT=GGT;OMAPALT=CGGT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.88:21:26:22:25:3:15:7:2:1:14:3:15:6:2:1
chr17	18874720	.	C	G	575.54	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0249116;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.7223;QD=60.5834;RBI=0.0297853;REFB=0;REVB=0.0163272;RO=0;SAF=30;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.26572e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000146272;OID=.;OPOS=18874720;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:8:30:0:0:8:30:0:0
chr17	18880268	.	C	A	718.8	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0359836;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.15;QD=62.5044;RBI=0.0775105;REFB=0;REVB=0.0686517;RO=0;SAF=18;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00085157;OID=.;OPOS=18880268;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:46:0:0:45:46:1:27:18:0:0:27:19:0:0
chr17	18907029	.	A	G	34.8	PASS	AF=0.176471;AO=6;DP=35;FAO=6;FDP=34;FR=.;FRO=28;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=0.0109904;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.799;QD=4.09427;RBI=0.0284896;REFB=-0.00156713;REVB=-0.0262844;RO=28;SAF=2;SAR=4;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0312052;STB=0.521666;STBP=0.95;TYPE=snp;VARB=0.0274974;OID=.;OPOS=18907029;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:35:34:28:28:6:6:0.176471:4:2:10:18:4:2:10:18
chr17	18918396	.	G	C	60.72	PASS	AF=0.236842;AO=9;DP=38;FAO=9;FDP=38;FR=.;FRO=29;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=-0.00380262;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.386;QD=6.39138;RBI=0.0232645;REFB=-0.0128823;REVB=0.0229516;RO=29;SAF=2;SAR=7;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.262475;STB=0.670818;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.0405543;OID=.;OPOS=18918396;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:60:38:38:29:29:9:9:0.236842:7:2:12:17:7:2:12:17
chr17	18923124	.	G	A	152.88	PASS	AF=0.338983;AO=20;DP=59;FAO=20;FDP=59;FR=.;FRO=39;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=-0.00814055;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.241;QD=10.3647;RBI=0.0229537;REFB=-0.00171;REVB=0.0214616;RO=39;SAF=9;SAR=11;SRF=23;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156378;STB=0.591506;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.00729579;OID=.;OPOS=18923124;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:39:39:20:20:0.338983:11:9:23:16:11:9:23:16
chr17	18997015	.	T	C	62.24	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0488199;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.2847;QD=35.5654;RBI=0.0488199;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=7;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00501969;OID=.;OPOS=18997015;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:0:7:0:0:0:7:0:0
chr17	19232078	.	T	C	575.8	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0219283;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.9383;QD=60.6101;RBI=0.0520738;REFB=0;REVB=-0.0472317;RO=0;SAF=22;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00022034;OID=.;OPOS=19232078;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:16:22:0:0:16:22:0:0
chr17	19238179	.	G	A	49.11	PASS	AF=0.147541;AO=9;DP=63;FAO=9;FDP=61;FR=.;FRO=52;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=23;FSRR=29;FWDB=-0.0280468;FXX=0.031741;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.23;QD=3.22046;RBI=0.0294723;REFB=-0.000978428;REVB=-0.00905496;RO=50;SAF=4;SAR=5;SRF=22;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00550484;STB=0.501841;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00639296;OID=.;OPOS=19238179;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:49:63:61:50:52:9:9:0.147541:5:4:22:28:5:4:23:29
chr17	19265992	.	C	T	117.58	PASS	AF=0.274194;AO=17;DP=62;FAO=17;FDP=62;FR=.;FRO=45;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=27;FSRR=18;FWDB=-0.0259743;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.194;QD=7.58601;RBI=0.0301712;REFB=-0.00224591;REVB=0.0153505;RO=45;SAF=8;SAR=9;SRF=27;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154353;STB=0.593113;STBP=0.393;TYPE=snp;VARB=0.00726938;OID=.;OPOS=19265992;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:45:45:17:17:0.274194:9:8:27:18:9:8:27:18
chr17	19284071	.	G	C	137.35	PASS	AF=0.207207;AO=23;DP=111;FAO=23;FDP=111;FR=.;FRO=88;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=46;FSRR=42;FWDB=0.0336839;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.0733;QD=4.94946;RBI=0.0374461;REFB=-0.00115047;REVB=-0.0163586;RO=87;SAF=8;SAR=15;SRF=46;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.229461;STB=0.639688;STBP=0.137;TYPE=snp;VARB=0.00557988;OID=.;OPOS=19284071;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:111:87:88:23:23:0.207207:15:8:46:41:15:8:46:42
chr17	19286463	.	C	T	41.05	PASS	AF=0.159091;AO=6;DP=44;FAO=7;FDP=44;FR=.;FRO=37;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=25;FWDB=0.0268277;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.471;QD=3.73183;RBI=0.0291362;REFB=-0.0100237;REVB=-0.0113663;RO=36;SAF=1;SAR=5;SRF=12;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.252641;STB=0.714873;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=0.0612322;OID=.;OPOS=19286463;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:44:44:36:37:6:7:0.159091:5:1:12:24:6:1:12:25
chr17	19290440	.	T	TC	132.08	PASS	AF=0.441441;AO=26;DP=122;FAO=49;FDP=111;FR=.;FRO=62;FSAF=15;FSAR=34;FSRF=26;FSRR=36;FWDB=-0.160101;FXX=0.0901565;HRUN=5;LEN=1;MLLD=9.71419;QD=4.75978;RBI=0.2248;REFB=-0.116877;REVB=-0.157806;RO=92;SAF=16;SAR=10;SRF=32;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.327901;STB=0.570347;STBP=0.236;TYPE=ins;VARB=0.0925473;OID=.;OPOS=19290441;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.441441:26:122:49:111:62:15:34:26:36:99:92:16:10:32:60
chr17	19290446	.	GAC	CAC,CGA	322.37	PASS	AF=0.341463,0;AO=39,6;DP=122;FAO=42,0;FDP=123;FR=.;FRO=81;FSAF=10,0;FSAR=32,0;FSRF=41;FSRR=40;FWDB=-0.0329985,-0.142786;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,3;MLLD=132.234,22.3325;QD=10.4837;RBI=0.0662375,0.145612;REFB=-0.00828198,-0.0252281;REVB=-0.0574326,-0.0285482;RO=66;SAF=8,6;SAR=31,0;SRF=29;SRR=37;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.307863,0.602075;STB=0.693779,0.5;STBP=0.007,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.0275846,0;OID=.,.;OPOS=19290446,19290446;OREF=G,GAC;OALT=C,CGA;OMAPALT=CAC,CGA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:122:123:66:81:39,6:42,0:0.341463,0:31,0:8,6:29:37:32,0:10,0:41:40
chr17	19411482	.	C	T	188.27	PASS	AF=0.85;AO=17;DP=20;FAO=17;FDP=20;FR=.;FRO=3;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.00515259;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=315.572;QD=37.6542;RBI=0.0244727;REFB=0.024141;REVB=0.0239241;RO=3;SAF=11;SAR=6;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00587659;STB=0.503222;STBP=0.956;TYPE=snp;VARB=-0.00498631;OID=.;OPOS=19411482;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:20:20:3:3:17:17:0.85:6:11:2:1:6:11:2:1
chr17	19454733	.	G	A	80.63	PASS	AF=0.261905;AO=11;DP=42;FAO=11;FDP=42;FR=.;FRO=31;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=-0.00437172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.771;QD=7.67879;RBI=0.0165337;REFB=-0.0101146;REVB=-0.0159452;RO=31;SAF=2;SAR=9;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.301174;STB=0.691913;STBP=0.204;TYPE=snp;VARB=0.0302814;OID=.;OPOS=19454733;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:80:42:42:31:31:11:11:0.261905:9:2:12:19:9:2:12:19
chr17	19458972	.	C	T	94.31	PASS	AF=0.245614;AO=13;DP=57;FAO=14;FDP=57;FR=.;FRO=43;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=23;FWDB=0.00651109;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.7449;QD=6.61798;RBI=0.03064;REFB=-0.0199669;REVB=0.0299402;RO=42;SAF=3;SAR=10;SRF=21;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.34811;STB=0.712347;STBP=0.081;TYPE=snp;VARB=0.042305;OID=.;OPOS=19458972;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:57:57:42:43:13:14:0.245614:10:3:21:21:11:3:20:23
chr17	19460972	.	G	A	250.22	PASS	AF=0.605263;AO=23;DP=38;FAO=23;FDP=38;FR=.;FRO=15;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=4;FWDB=0.00554785;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=312.549;QD=26.3387;RBI=0.00590171;REFB=-0.00443223;REVB=-0.00201287;RO=15;SAF=12;SAR=11;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152501;STB=0.584225;STBP=0.21;TYPE=snp;VARB=0.00269802;OID=.;OPOS=19460972;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:15:15:23:23:0.605263:11:12:11:4:11:12:11:4
chr17	19578873	.	A	T	594.54	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00995701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.515;QD=60.9786;RBI=0.0139777;REFB=0;REVB=-0.00980984;RO=0;SAF=14;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000123727;OID=.;OPOS=19578873;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:25:14:0:0:25:14:0:0
chr17	19608773	.	G	A	504.18	PASS	AF=0.807692;AO=42;DP=52;FAO=42;FDP=52;FR=.;FRO=10;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=-0.00238732;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.012;QD=38.7827;RBI=0.035137;REFB=-0.0551972;REVB=0.0350558;RO=10;SAF=20;SAR=22;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0273568;STB=0.514699;STBP=0.711;TYPE=snp;VARB=0.00967014;OID=.;OPOS=19608773;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:52:52:10:10:42:42:0.807692:22:20:4:6:22:20:4:6
chr17	19618108	.	G	A	165.05	PASS	AF=0.695652;AO=16;DP=23;FAO=16;FDP=23;FR=.;FRO=7;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=-0.00351332;FXX=0.0416493;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.138;QD=28.7041;RBI=0.0103527;REFB=-0.0236315;REVB=0.00973831;RO=7;SAF=10;SAR=6;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187384;STB=0.604264;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.0180812;OID=.;OPOS=19618108;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:23:23:7:7:16:16:0.695652:6:10:2:5:6:10:2:5
chr17	19641744	.	G	A	123.15	PASS	AF=0.923077;AO=12;DP=13;FAO=12;FDP=13;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0050479;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=213.753;QD=37.893;RBI=0.0201714;REFB=-0.0248589;REVB=-0.0195296;RO=1;SAF=5;SAR=7;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0818676;STB=0.545378;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.00187507;OID=.;OPOS=19641744;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:13:13:1:1:12:12:0.923077:7:5:1:0:7:5:1:0
chr17	19644472	.	A	T	119.42	PASS	AF=0.296296;AO=15;DP=53;FAO=16;FDP=54;FR=.;FRO=38;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=24;FWDB=-0.00304476;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.941;QD=8.84567;RBI=0.0207404;REFB=0.00264083;REVB=-0.0205157;RO=37;SAF=5;SAR=10;SRF=14;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.05797;STB=0.544214;STBP=0.706;TYPE=snp;VARB=-0.0066876;OID=.;OPOS=19644472;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:54:37:38:15:16:0.296296:10:5:14:23:11:5:14:24
chr17	19645938	.	A	C	689.35	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0328667;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.955;QD=62.6683;RBI=0.0695843;REFB=0;REVB=-0.0613331;RO=0;SAF=17;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.54734e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.89572e-05;OID=.;OPOS=19645938;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:27:17:0:0:27:17:0:0
chr17	19651611	.	C	T	336.27	PASS	AF=0.604167;AO=29;DP=48;FAO=29;FDP=48;FR=.;FRO=19;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=0.0278878;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.419;QD=28.0224;RBI=0.0308465;REFB=-0.0134819;REVB=-0.0131825;RO=18;SAF=15;SAR=14;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0891404;STB=0.537994;STBP=0.537;TYPE=snp;VARB=0.00908255;OID=.;OPOS=19651611;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:18:19:29:29:0.604167:14:15:7:11:14:15:8:11
chr17	19678475	.	G	A	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0168474;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.29;QD=50.4133;RBI=0.0237456;REFB=0;REVB=-0.0167337;RO=0;SAF=7;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.79538e-07;OID=.;OPOS=19678475;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:12:7:0:0:12:7:0:0
chr17	19713740	.	C	T	1171.8	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.052155;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.2691;QD=60.8727;RBI=0.0549907;REFB=0;REVB=0.0174309;RO=0;SAF=43;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.11157e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000352503;OID=.;OPOS=19713740;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:34:43:0:0:34:43:0:0
chr17	19729495	.	T	C	715.48	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00171152;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.765;QD=57.2385;RBI=0.0580192;REFB=0;REVB=0.057994;RO=0;SAF=27;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000212831;OID=.;OPOS=19729495;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:23:27:0:0:23:27:0:0
chr17	20107773	.	T	C	647.57	PASS	AF=0.955556;AO=43;DP=45;FAO=43;FDP=45;FR=.;FRO=2;FSAF=29;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0170621;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.1245;QD=57.5617;RBI=0.0477523;REFB=0.065128;REVB=-0.0446001;RO=1;SAF=29;SAR=14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159212;STB=0.508768;STBP=0.599;TYPE=snp;VARB=-0.0325152;OID=.;OPOS=20107773;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:45:45:1:2:43:43:0.955556:14:29:1:0:14:29:1:1
chr17	20108239	.	A	T	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000993731;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.939;QD=48.7373;RBI=0.0156175;REFB=0;REVB=0.0155859;RO=0;SAF=5;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.34084e-05;OID=.;OPOS=20108239;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:12:5:0:0:12:5:0:0
chr17	20109189	.	C	T	428.91	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142237;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.8332;QD=57.1884;RBI=0.0255655;REFB=0;REVB=0.0212434;RO=0;SAF=17;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.63861e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000265898;OID=.;OPOS=20109189;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:13:17:0:0:13:17:0:0
chr17	20163529	.	A	G	387.62	PASS	AF=1;AO=20;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=0;FSAF=20;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.165466;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.557;QD=55.3749;RBI=0.165693;REFB=0;REVB=0.00865841;RO=0;SAF=12;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00885021;OID=.;OPOS=20163529;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:20:28:1:8:12:0:0:8:20:0:0
chr17	20361493	.	T	C	100.71	PASS	AF=0.48;AO=12;DP=25;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=-0.0112629;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.106;QD=16.1141;RBI=0.0745459;REFB=0.00837667;REVB=-0.0736902;RO=13;SAF=6;SAR=6;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173529;STB=0.59984;STBP=0.391;TYPE=snp;VARB=-0.00801579;OID=.;OPOS=20361493;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:25:13:13:12:12:0.48:6:6:4:9:6:6:4:9
chr17	20769862	.	T	A	79.41	PASS	AF=0.5;AO=10;DP=20;FAO=10;FDP=20;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=-0.00888311;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.83;QD=15.8821;RBI=0.0151981;REFB=-0.00776622;REVB=-0.0123317;RO=10;SAF=5;SAR=5;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0858363;STB=0.549901;STBP=0.708;TYPE=snp;VARB=0.0214311;OID=.;OPOS=20769862;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:20:20:10:10:10:10:0.5:5:5:4:6:5:5:4:6
chr17	20769866	.	G	A	78.61	PASS	AF=0.5;AO=10;DP=20;FAO=10;FDP=20;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=-0.0159171;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.7137;QD=15.7223;RBI=0.018999;REFB=-0.0164648;REVB=-0.0103734;RO=10;SAF=5;SAR=5;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0858363;STB=0.549901;STBP=0.708;TYPE=snp;VARB=0.0160185;OID=.;OPOS=20769866;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:20:20:10:10:10:10:0.5:5:5:4:6:5:5:4:6
chr17	20769896	.	G	T	117.44	PASS	AF=0.590909;AO=13;DP=22;FAO=13;FDP=22;FR=.;FRO=9;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.0214097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.507;QD=21.3532;RBI=0.021653;REFB=0.0304183;REVB=-0.00323707;RO=9;SAF=8;SAR=5;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.203205;STB=0.615207;STBP=0.244;TYPE=snp;VARB=-0.0150957;OID=.;OPOS=20769896;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:22:22:9:9:13:13:0.590909:5:8:3:6:5:8:3:6
chr17	20769899	.	G	T	117.44	PASS	AF=0.590909;AO=13;DP=22;FAO=13;FDP=22;FR=.;FRO=9;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.0304564;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.889;QD=21.3528;RBI=0.0443593;REFB=-0.00102454;REVB=-0.0322514;RO=9;SAF=8;SAR=5;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.203205;STB=0.615207;STBP=0.244;TYPE=snp;VARB=0.000718157;OID=.;OPOS=20769899;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:22:22:9:9:13:13:0.590909:5:8:3:6:5:8:3:6
chr17	20769904	.	G	A	172.21	PASS	AF=0.653846;AO=17;DP=26;FAO=17;FDP=26;FR=.;FRO=9;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=-0.0174983;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.3515;QD=26.4934;RBI=0.027183;REFB=-0.0210674;REVB=0.0208021;RO=9;SAF=10;SAR=7;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158275;STB=0.588131;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=0.0116221;OID=.;OPOS=20769904;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:26:26:9:9:17:17:0.653846:7:10:3:6:7:10:3:6
chr17	20769954	.	T	G	190.95	PASS	AF=0.72;AO=18;DP=25;FAO=18;FDP=25;FR=.;FRO=7;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.00121126;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.476;QD=30.5522;RBI=0.00337322;REFB=-0.00358801;REVB=-0.00314825;RO=7;SAF=10;SAR=8;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0645688;STB=0.535674;STBP=0.619;TYPE=snp;VARB=0.00117946;OID=.;OPOS=20769954;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:25:25:7:7:18:18:0.72:8:10:3:4:8:10:3:4
chr17	20769964	.	C	A	164.05	PASS	AF=0.727273;AO=16;DP=22;FAO=16;FDP=22;FR=.;FRO=6;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0742053;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.5727;QD=29.8266;RBI=0.0968615;REFB=0.0269331;REVB=-0.0622553;RO=6;SAF=9;SAR=7;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0310499;STB=0.51722;STBP=0.75;TYPE=snp;VARB=-0.0105861;OID=.;OPOS=20769964;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:22:22:6:6:16:16:0.727273:7:9:3:3:7:9:3:3
chr17	20769968	.	G	A	169.59	PASS	AF=0.8;AO=16;DP=20;FAO=16;FDP=20;FR=.;FRO=4;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.00719872;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.51;QD=33.9179;RBI=0.0117546;REFB=-0.00552038;REVB=-0.0092924;RO=4;SAF=9;SAR=7;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0229225;STB=0.512642;STBP=0.893;TYPE=snp;VARB=0.00236004;OID=.;OPOS=20769968;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:20:20:20:4:4:16:16:0.8:7:9:2:2:7:9:2:2
chr17	20769995	.	C	T	78.88	PASS	AF=0.769231;AO=9;DP=13;FAO=10;FDP=13;FR=.;FRO=3;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.162051;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.7133;QD=24.2697;RBI=0.162066;REFB=-0.0873603;REVB=0.0022023;RO=4;SAF=5;SAR=4;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0300734;STB=0.562373;STBP=0.464;TYPE=snp;VARB=0.0537744;OID=.;OPOS=20769995;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:13:13:4:3:9:10:0.769231:4:5:2:2:4:6:1:2
chr17	20770002	.	CC	AG	89.0	PASS	AF=0.769231;AO=10;DP=13;FAO=10;FDP=13;FR=.;FRO=3;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0347876;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=265.749;QD=27.3838;RBI=0.0378245;REFB=0.00589355;REVB=0.0148496;RO=3;SAF=6;SAR=4;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110339;STB=0.562373;STBP=0.464;TYPE=mnp;VARB=-0.000846492;OID=.;OPOS=20770002;OREF=CC;OALT=AG;OMAPALT=AG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:13:13:3:3:10:10:0.769231:4:6:1:2:4:6:1:2
chr17	20796694	.	A	G	340.74	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.013137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=306.259;QD=54.5177;RBI=0.0139007;REFB=0;REVB=0.00454407;RO=0;SAF=8;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.2133e-05;OID=.;OPOS=20796694;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:17:8:0:0:17:8:0:0
chr17	20798992	.	C	T	340.74	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.010651;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=334.389;QD=54.5177;RBI=0.0217219;REFB=0;REVB=0.0189314;RO=0;SAF=14;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.75939e-05;OID=.;OPOS=20798992;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:11:14:0:0:11:14:0:0
chr17	20799118	.	GA	G,GG	627.48	PASS	AF=0.0243902,0.97561;AO=5,36;DP=41;FAO=1,40;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=0,17;FSAR=1,23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.112786,0.1051;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=193.454,213.23;QD=61.2172;RBI=0.124524,0.114884;REFB=0,0;REVB=0.0527788,0.0463944;RO=0;SAF=4,13;SAR=1,23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-4.21415e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0295335,0.00257005;OID=.,.;OPOS=20799119,20799119;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0243902,0.97561:5,36:41:1,40:41:0:0,17:1,23:0:0:3:0:4,13:1,23:0:0
chr17	20903068	.	C	A	42.78	PASS	AF=0.212121;AO=7;DP=33;FAO=7;FDP=33;FR=.;FRO=26;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=-0.0123288;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.958;QD=5.18534;RBI=0.0383875;REFB=-0.00221023;REVB=-0.0363538;RO=26;SAF=4;SAR=3;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00667511;STB=0.504412;STBP=0.999;TYPE=snp;VARB=0.0202145;OID=.;OPOS=20903068;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:42:33:33:26:26:7:7:0.212121:3:4:15:11:3:4:15:11
chr17	20903080	.	C	A	51.88	PASS	AF=0.235294;AO=7;DP=33;FAO=8;FDP=34;FR=.;FRO=26;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=-0.0153466;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.341;QD=6.10345;RBI=0.015936;REFB=-0.00979308;REVB=0.00429372;RO=25;SAF=4;SAR=3;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0137716;STB=0.529339;STBP=0.857;TYPE=snp;VARB=0.0250729;OID=.;OPOS=20903080;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:51:33:34:25:26:7:8:0.235294:3:4:14:11:4:4:14:12
chr17	20911204	.	G	T	280.61	PASS	AF=0.625;AO=25;DP=40;FAO=25;FDP=40;FR=.;FRO=15;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=-0.0130073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.076;QD=28.0609;RBI=0.0155704;REFB=-0.0216403;REVB=0.00855853;RO=15;SAF=13;SAR=12;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126433;STB=0.569666;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=0.0101606;OID=.;OPOS=20911204;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:15:15:25:25:0.625:12:13:5:10:12:13:5:10
chr17	20924523	.	G	A	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0263725;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.968;QD=55.0986;RBI=0.0364762;REFB=0;REVB=0.0251992;RO=0;SAF=10;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.71087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.42821e-06;OID=.;OPOS=20924523;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:16:10:0:0:16:10:0:0
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chr17	21144074	.	G	A	68.44	PASS	AF=0.208333;AO=10;DP=48;FAO=10;FDP=48;FR=.;FRO=38;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=30;FSRR=8;FWDB=-0.0111559;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.05;QD=5.70365;RBI=0.0229992;REFB=0.00206453;REVB=-0.0201124;RO=38;SAF=5;SAR=5;SRF=30;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.371044;STB=0.728805;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=-0.00719692;OID=.;OPOS=21144074;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:68:48:48:38:38:10:10:0.208333:5:5:30:8:5:5:30:8
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chr17	21194769	.	C	T	33.49	PASS	AF=0.153846;AO=6;DP=39;FAO=6;FDP=39;FR=.;FRO=33;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=0.0214341;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.5708;QD=3.43496;RBI=0.0282049;REFB=-0.0143765;REVB=-0.0183329;RO=33;SAF=3;SAR=3;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126998;STB=0.589455;STBP=0.635;TYPE=snp;VARB=0.0265462;OID=.;OPOS=21194769;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:39:39:33:33:6:6:0.153846:3:3:20:13:3:3:20:13
chr17	21194771	.	A	T	33.38	PASS	AF=0.15;AO=6;DP=40;FAO=6;FDP=40;FR=.;FRO=34;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=21;FSRR=13;FWDB=-0.0389973;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.2401;QD=3.33767;RBI=0.0694059;REFB=-0.00986434;REVB=-0.0574142;RO=34;SAF=3;SAR=3;SRF=21;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141104;STB=0.599681;STBP=0.648;TYPE=snp;VARB=0.0525161;OID=.;OPOS=21194771;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:40:40:34:34:6:6:0.15:3:3:21:13:3:3:21:13
chr17	21199022	.	A	T	109.73	PASS	AF=0.419355;AO=13;DP=31;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=5;FWDB=0.00960974;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.574;QD=14.1587;RBI=0.00968203;REFB=-0.00125118;REVB=0.00118091;RO=18;SAF=7;SAR=6;SRF=13;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188529;STB=0.60898;STBP=0.325;TYPE=snp;VARB=-0.00188678;OID=.;OPOS=21199022;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:18:18:13:13:0.419355:6:7:13:5:6:7:13:5
chr17	21199037	.	G	A	110.18	PASS	AF=0.448276;AO=13;DP=29;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=-0.0291079;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.3293;QD=15.1977;RBI=0.0298039;REFB=-0.0270564;REVB=-0.0064032;RO=15;SAF=7;SAR=6;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185962;STB=0.619395;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=0.021718;OID=.;OPOS=21199037;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:15:16:13:13:0.448276:6:7:11:4:6:7:12:4
chr17	21199083	.	T	A	59.37	PASS	AF=0.533333;AO=8;DP=15;FAO=8;FDP=15;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.00991426;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.4315;QD=15.8308;RBI=0.0245168;REFB=-0.0136728;REVB=0.0224227;RO=6;SAF=3;SAR=5;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.213494;STB=0.655356;STBP=0.244;TYPE=snp;VARB=0.00438657;OID=.;OPOS=21199083;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:15:15:6:7:8:8:0.533333:5:3:4:2:5:3:5:2
chr17	21199390	.	C	T	162.81	PASS	AF=0.35;AO=21;DP=60;FAO=21;FDP=60;FR=.;FRO=39;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=25;FSRR=14;FWDB=-0.0181083;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.0236;QD=10.8538;RBI=0.0197197;REFB=0.0124715;REVB=0.00780732;RO=39;SAF=12;SAR=9;SRF=25;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0803815;STB=0.546754;STBP=0.619;TYPE=snp;VARB=-0.0216284;OID=.;OPOS=21199390;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:39:39:21:21:0.35:9:12:25:14:9:12:25:14
chr17	21199403	.	C	T	170.61	PASS	AF=0.349206;AO=22;DP=63;FAO=22;FDP=63;FR=.;FRO=41;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=26;FSRR=15;FWDB=-0.00313071;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.251;QD=10.8323;RBI=0.0764618;REFB=-0.00992049;REVB=-0.0763976;RO=41;SAF=12;SAR=10;SRF=26;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10119;STB=0.558771;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=0.018031;OID=.;OPOS=21199403;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:41:41:22:22:0.349206:10:12:26:15:10:12:26:15
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chr17	21204210	.	C	T	203.03	PASS	AF=0.378788;AO=25;DP=66;FAO=25;FDP=66;FR=.;FRO=41;FSAF=18;FSAR=7;FSRF=29;FSRR=12;FWDB=0.0156719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.0164;QD=12.3046;RBI=0.0365157;REFB=0.00821885;REVB=0.0329816;RO=41;SAF=18;SAR=7;SRF=29;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.016797;STB=0.509679;STBP=0.924;TYPE=snp;VARB=-0.0136578;OID=.;OPOS=21204210;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:41:41:25:25:0.378788:7:18:29:12:7:18:29:12
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chr17	21206556	.	C	T	298.74	PASS	AF=0.54;AO=27;DP=50;FAO=27;FDP=50;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=3;FSRR=20;FWDB=0.0066613;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=135.854;QD=23.8992;RBI=0.0276294;REFB=-0.0125792;REVB=0.0268144;RO=23;SAF=9;SAR=18;SRF=3;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.205211;STB=0.612829;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=0.0117916;OID=.;OPOS=21206556;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:23:23:27:27:0.54:18:9:3:20:18:9:3:20
chr17	21207813	.	T	G	143.37	PASS	AF=0.216981;AO=23;DP=106;FAO=23;FDP=106;FR=.;FRO=83;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=37;FSRR=46;FWDB=-0.0383719;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.0591;QD=5.41003;RBI=0.0410061;REFB=0.00649598;REVB=-0.0144601;RO=83;SAF=12;SAR=11;SRF=37;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0954118;STB=0.559229;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=-0.0192957;OID=.;OPOS=21207813;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:106:83:83:23:23:0.216981:11:12:37:46:11:12:37:46
chr17	21207835	.	G	A	160.82	PASS	AF=0.233645;AO=25;DP=107;FAO=25;FDP=107;FR=.;FRO=82;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=40;FSRR=42;FWDB=0.0255345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.871;QD=6.01198;RBI=0.0319713;REFB=-0.00466374;REVB=-0.0192394;RO=82;SAF=12;SAR=13;SRF=40;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00975941;STB=0.505983;STBP=0.962;TYPE=snp;VARB=0.0121226;OID=.;OPOS=21207835;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:107:82:82:25:25:0.233645:13:12:40:42:13:12:40:42
chr17	21207844	.	C	T	380.66	PASS	AF=0.421569;AO=43;DP=102;FAO=43;FDP=102;FR=.;FRO=59;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=28;FSRR=31;FWDB=-0.0046553;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.184;QD=14.9278;RBI=0.00466189;REFB=-0.00433975;REVB=-0.000247725;RO=59;SAF=21;SAR=22;SRF=28;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.014179;STB=0.507984;STBP=0.894;TYPE=snp;VARB=0.0041653;OID=.;OPOS=21207844;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:59:59:43:43:0.421569:22:21:28:31:22:21:28:31
chr17	21208413	.	C	T	141.87	PASS	AF=0.333333;AO=17;DP=51;FAO=17;FDP=51;FR=.;FRO=34;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=-0.00394385;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.86;QD=11.1268;RBI=0.0252344;REFB=-0.00915252;REVB=-0.0249243;RO=34;SAF=8;SAR=9;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132116;STB=0.577891;STBP=0.445;TYPE=snp;VARB=0.0173345;OID=.;OPOS=21208413;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:34:34:17:17:0.333333:9:8:20:14:9:8:20:14
chr17	21208449	.	G	T	106.33	PASS	AF=0.361111;AO=13;DP=36;FAO=13;FDP=36;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.00110798;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=224.384;QD=11.8144;RBI=0.0245618;REFB=-0.00856515;REVB=-0.0245368;RO=23;SAF=7;SAR=6;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0290827;STB=0.517215;STBP=0.868;TYPE=snp;VARB=0.0124903;OID=.;OPOS=21208449;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:23:23:13:13:0.361111:6:7:13:10:6:7:13:10
chr17	21215483	.	C	T	751.64	PASS	AF=0.819444;AO=59;DP=72;FAO=59;FDP=72;FR=.;FRO=13;FSAF=32;FSAR=27;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.00962382;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.274;QD=41.7579;RBI=0.0137731;REFB=-0.033527;REVB=0.00985296;RO=13;SAF=32;SAR=27;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0534045;STB=0.528542;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=0.00607841;OID=.;OPOS=21215483;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:72:72:13:13:59:59:0.819444:27:32:5:8:27:32:5:8
chr17	21215537	.	C	A	218.94	PASS	AF=0.36;AO=27;DP=75;FAO=27;FDP=75;FR=.;FRO=48;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=24;FSRR=24;FWDB=-0.00249011;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=248.662;QD=11.677;RBI=0.0108627;REFB=-0.00775106;REVB=0.0105735;RO=47;SAF=16;SAR=11;SRF=24;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0914457;STB=0.559955;STBP=0.453;TYPE=snp;VARB=0.0120398;OID=.;OPOS=21215537;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:47:48:27:27:0.36:11:16:24:23:11:16:24:24
chr17	21215552	.	C	T	194.83	PASS	AF=0.333333;AO=25;DP=75;FAO=25;FDP=75;FR=.;FRO=50;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=25;FSRR=25;FWDB=0.0121692;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.984;QD=10.3908;RBI=0.0138218;REFB=-0.00235076;REVB=-0.00655386;RO=49;SAF=13;SAR=12;SRF=25;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0111297;STB=0.51333;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=0.00458345;OID=.;OPOS=21215552;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:49:50:25:25:0.333333:12:13:25:24:12:13:25:25
chr17	21215557	.	G	A	210.59	PASS	AF=0.351351;AO=26;DP=74;FAO=26;FDP=74;FR=.;FRO=48;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=25;FSRR=23;FWDB=-0.00456829;FXX=0.0263123;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.031;QD=11.383;RBI=0.0103251;REFB=0.00113471;REVB=-0.00925947;RO=45;SAF=13;SAR=13;SRF=24;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0365881;STB=0.513503;STBP=0.853;TYPE=snp;VARB=-0.00223945;OID=.;OPOS=21215557;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:45:48:26:26:0.351351:13:13:24:21:13:13:25:23
chr17	21216788	.	C	T	171.21	PASS	AF=0.461538;AO=18;DP=39;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.00661472;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.237;QD=17.56;RBI=0.0212491;REFB=0.00389171;REVB=-0.0201933;RO=21;SAF=12;SAR=6;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.229785;STB=0.63143;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=-0.00353549;OID=.;OPOS=21216788;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:21:21:18:18:0.461538:6:12:9:12:6:12:9:12
chr17	21216846	.	G	C	112.23	PASS	AF=0.481481;AO=13;DP=27;FAO=13;FDP=27;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=0.0696004;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.7101;QD=16.6259;RBI=0.0863113;REFB=0.00432584;REVB=0.0510434;RO=14;SAF=10;SAR=3;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144167;STB=0.583803;STBP=0.467;TYPE=snp;VARB=0.000974479;OID=.;OPOS=21216846;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:14:14:13:13:0.481481:3:10:9:5:3:10:9:5
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chr17	21217547	.	T	C	277.41	PASS	AF=0.5;AO=30;DP=60;FAO=30;FDP=60;FR=.;FRO=30;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=11;FWDB=-0.0105058;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.302;QD=18.4942;RBI=0.0141434;REFB=-0.00949765;REVB=-0.00946913;RO=30;SAF=17;SAR=13;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0613718;STB=0.534224;STBP=0.619;TYPE=snp;VARB=0.014508;OID=.;OPOS=21217547;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:30:30:30:30:0.5:13:17:19:11:13:17:19:11
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chr17	21217690	.	C	T	230.92	PASS	AF=0.464286;AO=26;DP=56;FAO=26;FDP=56;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=0.0831366;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.3342;QD=16.4942;RBI=0.0965992;REFB=-0.0377725;REVB=0.0491907;RO=30;SAF=11;SAR=15;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0225367;STB=0.512702;STBP=0.881;TYPE=snp;VARB=0.0515271;OID=.;OPOS=21217690;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:30:30:26:26:0.464286:15:11:12:18:15:11:12:18
chr17	21217727	.	T	C	154.1	PASS	AF=0.395349;AO=16;DP=41;FAO=17;FDP=43;FR=.;FRO=26;FSAF=3;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=-0.057716;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.612;QD=14.335;RBI=0.0607562;REFB=-0.00702451;REVB=0.0189786;RO=17;SAF=3;SAR=13;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.366325;STB=0.786622;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.00742984;OID=.;OPOS=21217727;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:43:17:26:16:17:0.395349:13:3:9:8:14:3:16:10
chr17	21217749	.	G	C	125.27	PASS	AF=0.5;AO=14;DP=28;FAO=14;FDP=28;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.0159728;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.173;QD=17.8962;RBI=0.0160114;REFB=-0.00725491;REVB=0.00111227;RO=12;SAF=4;SAR=10;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191435;STB=0.6178;STBP=0.238;TYPE=snp;VARB=0.00529733;OID=.;OPOS=21217749;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:28:12:14:14:14:0.5:10:4:6:6:10:4:7:7
chr17	21318663	.	G	A	47.68	PASS	AF=0.4375;AO=7;DP=16;FAO=7;FDP=16;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.0215737;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.395;QD=11.9195;RBI=0.0217713;REFB=-0.0156502;REVB=0.00292712;RO=9;SAF=5;SAR=2;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163877;STB=0.5997;STBP=0.569;TYPE=snp;VARB=0.029389;OID=.;OPOS=21318663;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:16:16:9:9:7:7:0.4375:2:5:5:4:2:5:5:4
chr17	21318770	.	G	A	83.03	PASS	AF=0.314286;AO=10;DP=34;FAO=11;FDP=35;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=-0.00977777;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.141;QD=9.4897;RBI=0.0109263;REFB=-0.0252448;REVB=0.00487643;RO=24;SAF=7;SAR=3;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.324412;STB=0.649215;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=0.0316474;OID=.;OPOS=21318770;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:34:35:24:24:10:11:0.314286:3:7:10:14:4:7:10:14
chr17	21318773	.	G	A	85.92	PASS	AF=0.3;AO=12;DP=40;FAO=12;FDP=40;FR=.;FRO=28;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=0.0144321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.741;QD=8.59209;RBI=0.014459;REFB=-0.00714646;REVB=0.00088045;RO=28;SAF=8;SAR=4;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.347068;STB=0.709343;STBP=0.107;TYPE=snp;VARB=0.00783965;OID=.;OPOS=21318773;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:40:40:28:28:12:12:0.3:4:8:10:18:4:8:10:18
chr17	21318782	.	G	A	151.5	PASS	AF=0.361702;AO=17;DP=47;FAO=17;FDP=47;FR=.;FRO=30;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=0.00766097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.8142;QD=12.8937;RBI=0.06394;REFB=-0.0263438;REVB=0.0634794;RO=30;SAF=6;SAR=11;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129068;STB=0.575825;STBP=0.396;TYPE=snp;VARB=0.0396064;OID=.;OPOS=21318782;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:30:30:17:17:0.361702:11:6:14:16:11:6:14:16
chr17	21318867	.	G	A	163.46	PASS	AF=0.264368;AO=23;DP=87;FAO=23;FDP=87;FR=.;FRO=64;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=30;FSRR=34;FWDB=0.0223829;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.9383;QD=7.51546;RBI=0.0248395;REFB=0.00626399;REVB=0.0107706;RO=64;SAF=12;SAR=11;SRF=30;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0645165;STB=0.538888;STBP=0.681;TYPE=snp;VARB=-0.0125559;OID=.;OPOS=21318867;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:64:64:23:23:0.264368:11:12:30:34:11:12:30:34
chr17	21318897	.	G	C	280.01	PASS	AF=0.351064;AO=33;DP=94;FAO=33;FDP=94;FR=.;FRO=61;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=30;FSRR=31;FWDB=-0.0123892;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.543;QD=11.9151;RBI=0.0477139;REFB=-0.0110655;REVB=-0.0460774;RO=61;SAF=17;SAR=16;SRF=30;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0262581;STB=0.515142;STBP=0.86;TYPE=snp;VARB=0.0239806;OID=.;OPOS=21318897;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:61:61:33:33:0.351064:16:17:30:31:16:17:30:31
chr17	21318912	.	C	A	139.84	PASS	AF=0.230769;AO=21;DP=91;FAO=21;FDP=91;FR=.;FRO=70;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=29;FSRR=41;FWDB=0.00688368;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.1728;QD=6.14671;RBI=0.0307797;REFB=0.00439311;REVB=0.0300001;RO=70;SAF=14;SAR=7;SRF=29;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.30984;STB=0.69047;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=-0.00644113;OID=.;OPOS=21318912;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:70:70:21:21:0.230769:7:14:29:41:7:14:29:41
chr17	21318918	.	G	A	120.83	PASS	AF=0.215909;AO=19;DP=88;FAO=19;FDP=88;FR=.;FRO=69;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=29;FSRR=40;FWDB=0.0249522;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.35;QD=5.49223;RBI=0.0310642;REFB=0.00723196;REVB=0.0185033;RO=67;SAF=13;SAR=6;SRF=28;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.328026;STB=0.703319;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=-0.0224799;OID=.;OPOS=21318918;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:67:69:19:19:0.215909:6:13:28:39:6:13:29:40
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chr17	21318951	.	CA	CG,TG	492.74	PASS	AF=0.432432,0.202703;AO=32,16;DP=75;FAO=32,15;FDP=74;FR=.;FRO=27;FSAF=14,14;FSAR=18,1;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=-0.0448577,-0.025243;FXX=0.0133316;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=79.3199,156.503;QD=26.6344;RBI=0.0534057,0.0307816;REFB=-0.00318578,-0.00704535;REVB=-0.028982,-0.0176152;RO=27;SAF=14,15;SAR=18,1;SRF=11;SRR=16;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0253319,0.678551;STB=0.51403,0.90432;STBP=0.82,0.001;TYPE=snp,mnp;VARB=-0.00310574,0.0340375;OID=.,.;OPOS=21318952,21318951;OREF=A,CA;OALT=G,TG;OMAPALT=CG,TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:74:27:27:32,16:32,15:0.432432,0.202703:18,1:14,15:11:16:18,1:14,14:11:16
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chr17	21318981	.	C	T	171.09	PASS	AF=0.294872;AO=23;DP=79;FAO=23;FDP=78;FR=.;FRO=55;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=19;FSRR=36;FWDB=-0.00698802;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.8361;QD=8.77381;RBI=0.00709889;REFB=-0.0130195;REVB=-0.00124973;RO=54;SAF=17;SAR=6;SRF=19;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.44614;STB=0.767519;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0274394;OID=.;OPOS=21318981;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:78:54:55:23:23:0.294872:6:17:19:35:6:17:19:36
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chr17	21319171	.	G	A	89.84	PASS	AF=0.229508;AO=14;DP=61;FAO=14;FDP=61;FR=.;FRO=47;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=24;FSRR=23;FWDB=-0.0089066;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.9937;QD=5.89135;RBI=0.0269136;REFB=-0.0165001;REVB=-0.0253972;RO=47;SAF=12;SAR=2;SRF=24;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.477487;STB=0.805966;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0562492;OID=.;OPOS=21319171;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:61:61:47:47:14:14:0.229508:2:12:24:23:2:12:24:23
chr17	21319208	.	C	T	92.89	PASS	AF=0.245283;AO=13;DP=53;FAO=13;FDP=53;FR=.;FRO=40;FSAF=12;FSAR=1;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=0.0211662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.4215;QD=7.01019;RBI=0.0318001;REFB=-0.00154132;REVB=-0.0237326;RO=40;SAF=12;SAR=1;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.617113;STB=0.894227;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.00985998;OID=.;OPOS=21319208;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:53:53:40:40:13:13:0.245283:1:12:19:21:1:12:19:21
chr17	21319230	.	G	C	137.83	PASS	AF=0.327273;AO=18;DP=55;FAO=18;FDP=55;FR=.;FRO=37;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=0.070388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.9104;QD=10.0243;RBI=0.0715669;REFB=-0.0250607;REVB=-0.0129366;RO=37;SAF=10;SAR=8;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0138581;STB=0.508188;STBP=0.932;TYPE=snp;VARB=0.0586169;OID=.;OPOS=21319230;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:37:37:18:18:0.327273:8:10:21:16:8:10:21:16
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chr17	21319470	.	T	C	91.06	PASS	AF=0.233333;AO=14;DP=60;FAO=14;FDP=60;FR=.;FRO=46;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=32;FWDB=0.0141658;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.112;QD=6.07084;RBI=0.014191;REFB=-0.00360378;REVB=-0.000844946;RO=46;SAF=10;SAR=4;SRF=14;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.473417;STB=0.789108;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.0108761;OID=.;OPOS=21319470;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:91:60:60:46:46:14:14:0.233333:4:10:14:32:4:10:14:32
chr17	21319473	.	G	A	165.1	PASS	AF=0.362069;AO=20;DP=57;FAO=21;FDP=58;FR=.;FRO=37;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=0.0186622;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.3;QD=11.386;RBI=0.0194311;REFB=-0.00808038;REVB=0.00541203;RO=37;SAF=5;SAR=15;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.287797;STB=0.677535;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.0140762;OID=.;OPOS=21319473;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:58:37:37:20:21:0.362069:15:5:18:19:16:5:18:19
chr17	21319488	.	C	T	78.15	PASS	AF=0.22;AO=11;DP=50;FAO=11;FDP=50;FR=.;FRO=39;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=26;FWDB=-0.0185209;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=159.92;QD=6.2519;RBI=0.0185264;REFB=-0.00475005;REVB=-0.000451881;RO=39;SAF=6;SAR=5;SRF=13;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.257546;STB=0.66165;STBP=0.27;TYPE=snp;VARB=0.0202576;OID=.;OPOS=21319488;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:50:50:39:39:11:11:0.22:5:6:13:26:5:6:13:26
chr17	21319543	.	G	A	79.68	PASS	AF=0.244444;AO=11;DP=45;FAO=11;FDP=45;FR=.;FRO=34;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=0.0072343;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.167;QD=7.08271;RBI=0.0154092;REFB=-0.0131612;REVB=-0.0136054;RO=34;SAF=3;SAR=8;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.253121;STB=0.660563;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=0.0337971;OID=.;OPOS=21319543;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:79:45:45:34:34:11:11:0.244444:8:3:16:18:8:3:16:18
chr17	21319560	.	G	T	84.42	PASS	AF=0.224138;AO=13;DP=58;FAO=13;FDP=58;FR=.;FRO=45;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=26;FWDB=0.00988099;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.5023;QD=5.82201;RBI=0.0497744;REFB=0.0130645;REVB=0.0487838;RO=45;SAF=4;SAR=9;SRF=19;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151438;STB=0.596387;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=-0.0454202;OID=.;OPOS=21319560;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:58:58:45:45:13:13:0.224138:9:4:19:26:9:4:19:26
chr17	21319650	.	CGAG	C	119.47	PASS	AF=0.208791;AO=17;DP=90;FAO=19;FDP=91;FR=.;FRO=72;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=35;FSRR=37;FWDB=-0.0144963;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=201.192;QD=5.2515;RBI=0.0147195;REFB=-0.00757512;REVB=0.00255321;RO=70;SAF=6;SAR=11;SRF=33;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152925;STB=0.55187;STBP=0.622;TYPE=del;VARB=0.0265243;OID=.;OPOS=21319651;OREF=GAG;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.208791:17:90:19:91:72:8:11:35:37:99:70:6:11:33:37
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chr17	21319716	.	G	A	74.31	PASS	AF=0.183099;AO=13;DP=71;FAO=13;FDP=71;FR=.;FRO=58;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=28;FSRR=30;FWDB=-0.00814705;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.6613;QD=4.18646;RBI=0.017139;REFB=-0.00260655;REVB=0.0150788;RO=53;SAF=6;SAR=7;SRF=27;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0595086;STB=0.517365;STBP=0.954;TYPE=snp;VARB=0.0183521;OID=.;OPOS=21319716;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:71:71:53:58:13:13:0.183099:7:6:27:26:7:6:28:30
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chr17	21319989	.	C	A	62.16	PASS	AF=0.428571;AO=6;DP=20;FAO=6;FDP=14;FR=.,HEALED;FRO=6;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.0473597;FXX=0.29985;HRUN=5;LEN=1;MLLD=89.5821;QD=17.759;RBI=0.047575;REFB=0.0102207;REVB=-0.00452142;RO=6;SAF=2;SAR=4;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168138;STB=0.599699;STBP=0.621;TYPE=snp;VARB=-0.00333057;OID=.;OPOS=21319989;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:49:20:14:6:6:6:6:0.428571:4:2:1:5:4:2:1:5
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chr17	21320012	.	C	T	41.12	PASS	AF=0.368421;AO=6;DP=18;FAO=7;FDP=19;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.00414558;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.182;QD=8.65699;RBI=0.0180268;REFB=-0.00803314;REVB=0.0175436;RO=12;SAF=3;SAR=3;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.545324;STBP=0.763;TYPE=snp;VARB=0.00807768;OID=.;OPOS=21320012;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:18:19:12:12:6:7:0.368421:3:3:6:6:4:3:6:6
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chr17	21320993	.	G	T	462.3	PASS	AF=0.571429;AO=44;DP=78;FAO=44;FDP=77;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=28;FSRF=6;FSRR=27;FWDB=0.0382881;FXX=0.0128189;HRUN=3;LEN=1;MLLD=251.749;QD=24.0158;RBI=0.0383904;REFB=-0.00863546;REVB=0.00280035;RO=33;SAF=16;SAR=28;SRF=6;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161827;STB=0.588198;STBP=0.118;TYPE=snp;VARB=0.00721791;OID=.;OPOS=21320993;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:77:33:33:44:44:0.571429:28:16:6:27:28:16:6:27
chr17	21321005	.	C	A	85.04	PASS	AF=0.208955;AO=14;DP=67;FAO=14;FDP=67;FR=.;FRO=53;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=40;FWDB=0.0171592;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.5667;QD=5.07724;RBI=0.0410975;REFB=-0.00932927;REVB=0.0373439;RO=53;SAF=4;SAR=10;SRF=13;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0641452;STB=0.540485;STBP=0.79;TYPE=snp;VARB=0.0386779;OID=.;OPOS=21321005;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:67:67:53:53:14:14:0.208955:10:4:13:40:10:4:13:40
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chr17	21322972	.	GT	CC	129.16	PASS	AF=0.5;AO=13;DP=28;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=-0.0101124;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=232.976;QD=17.2212;RBI=0.0166176;REFB=-0.0129994;REVB=0.0131865;RO=14;SAF=7;SAR=6;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0298971;STB=0.566284;STBP=0.518;TYPE=mnp;VARB=0.0189397;OID=.;OPOS=21322972;OREF=GT;OALT=CC;OMAPALT=CC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:30:14:15:13:15:0.5:6:7:8:6:8:7:9:6
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chr17	25909850	.	G	T	192.84	PASS	AF=0.423077;AO=22;DP=52;FAO=22;FDP=52;FR=.;FRO=30;FSAF=2;FSAR=20;FSRF=4;FSRR=26;FWDB=-0.0328604;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.807;QD=14.8335;RBI=0.0329879;REFB=-0.0230339;REVB=0.00289657;RO=28;SAF=2;SAR=20;SRF=4;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133099;STB=0.565971;STBP=0.662;TYPE=snp;VARB=0.0312332;OID=.;OPOS=25909850;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:28:30:22:22:0.423077:20:2:4:24:20:2:4:26
chr17	25972311	.	C	T	201.18	PASS	AF=0.317073;AO=26;DP=82;FAO=26;FDP=82;FR=.;FRO=56;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=31;FSRR=25;FWDB=0.00645786;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.041;QD=9.81356;RBI=0.0071488;REFB=0.00814652;REVB=0.00306618;RO=55;SAF=10;SAR=16;SRF=30;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186715;STB=0.615296;STBP=0.188;TYPE=snp;VARB=-0.0117556;OID=.;OPOS=25972311;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:55:56:26:26:0.317073:16:10:30:25:16:10:31:25
chr17	26089867	.	T	C	475.2	PASS	AF=0.472222;AO=51;DP=109;FAO=51;FDP=108;FR=.;FRO=57;FSAF=34;FSAR=17;FSRF=37;FSRR=20;FWDB=0.00832336;FXX=0.00917347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.522;QD=17.6002;RBI=0.0121558;REFB=-0.0082587;REVB=-0.00885918;RO=56;SAF=34;SAR=17;SRF=36;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0249743;STB=0.510341;STBP=0.855;TYPE=snp;VARB=0.0121472;OID=.;OPOS=26089867;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:108:56:57:51:51:0.472222:17:34:36:20:17:34:37:20
chr17	26092631	.	A	G	375.32	PASS	AF=0.421053;AO=39;DP=94;FAO=40;FDP=95;FR=.;FRO=55;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=27;FSRR=28;FWDB=-0.00914777;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.379;QD=15.8028;RBI=0.0192189;REFB=-0.00207109;REVB=-0.0169022;RO=54;SAF=23;SAR=16;SRF=27;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0934749;STB=0.56407;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=0.00326316;OID=.;OPOS=26092631;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:95:54:55:39:40:0.421053:16:23:27:27:16:24:27:28
chr17	26096597	.	G	A	115.06	PASS	AF=0.5;AO=13;DP=27;FAO=13;FDP=26;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=-0.0070898;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.123;QD=17.7013;RBI=0.0176446;REFB=0.012163;REVB=0.0161576;RO=14;SAF=8;SAR=5;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.290292;STB=0.650935;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=-0.00792674;OID=.;OPOS=26096597;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:26:14:13:13:13:0.5:5:8:4:10:5:8:4:9
chr17	26105932	.	G	A	320.78	PASS	AF=0.432099;AO=35;DP=81;FAO=35;FDP=81;FR=.;FRO=46;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=-0.0108734;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.376;QD=15.8408;RBI=0.0278727;REFB=-0.00203729;REVB=0.0256643;RO=45;SAF=15;SAR=20;SRF=21;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0385604;STB=0.528555;STBP=0.689;TYPE=snp;VARB=0.00332744;OID=.;OPOS=26105932;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:45:46:35:35:0.432099:20:15:21:24:20:15:22:24
chr17	26671945	.	A	AG	802.24	PASS	AF=1;AO=60;DP=77;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.253487;FXX=0.0131562;HRUN=2;LEN=1;MLLD=17.9808;QD=42.7862;RBI=0.29158;REFB=0;REVB=0.144093;RO=14;SAF=30;SAR=30;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0505508;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00703252;OID=.;OPOS=26671946;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:60:77:75:75:0:39:36:0:0:15:14:30:30:9:5
chr17	26676135	.	C	T	813.4	PASS	AF=1;AO=57;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0410907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.0547;QD=56.0963;RBI=0.0458546;REFB=0;REVB=0.0203518;RO=0;SAF=23;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00367442;OID=.;OPOS=26676135;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:58:58:0:0:57:58:1:34:23:0:0:35:23:0:0
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chr17	26684394	.	T	G	272.56	PASS	AF=0.956522;AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0416467;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.9322;QD=47.4013;RBI=0.0498672;REFB=-0.084569;REVB=0.027428;RO=1;SAF=13;SAR=9;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0342405;STB=0.518502;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.00325376;OID=.;OPOS=26684394;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:23:23:1:1:22:22:0.956522:9:13:1:0:9:13:1:0
chr17	26684449	.	G	C	101.89	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0102365;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=50.0653;QD=40.7577;RBI=0.0185006;REFB=0;REVB=-0.0154106;RO=0;SAF=7;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00140118;OID=.;OPOS=26684449;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:3:7:0:0:3:7:0:0
chr17	26694861	.	G	A	817.34	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000884774;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.311;QD=57.357;RBI=0.0778537;REFB=0;REVB=0.0778487;RO=0;SAF=32;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000311585;OID=.;OPOS=26694861;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:25:32:0:0:25:32:0:0
chr17	26699367	.	G	GC	194.45	PASS	AF=1;AO=16;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0553759;FXX=0.0555247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=27.4279;QD=45.7526;RBI=0.0690948;REFB=0;REVB=0.0413232;RO=1;SAF=8;SAR=8;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.053738;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00309167;OID=.;OPOS=26699368;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:16:17:17:17:0:8:9:0:0:3:1:8:8:0:1
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chr17	26708302	.	G	T	1493.88	PASS	AF=0.980769;AO=102;DP=105;FAO=102;FDP=104;FR=.;FRO=2;FSAF=51;FSAR=51;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0286629;FXX=0.0095229;HRUN=3;LEN=1;MLLD=224.699;QD=57.4568;RBI=0.041684;REFB=0.0833553;REVB=0.0302653;RO=2;SAF=51;SAR=51;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00027531;OID=.;OPOS=26708302;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:105:104:2:2:102:102:0.980769:51:51:1:1:51:51:1:1
chr17	26708547	.	CTTTC	CTTCG	1456.53	PASS	AF=1;AO=54;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=52;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.277095;FXX=0;HRUN=3;LEN=2;MLLD=46.2188;QD=64.0235;RBI=0.298293;REFB=0;REVB=-0.110441;RO=0;SAF=18;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.00131947;OID=.;OPOS=26708550;OREF=TC;OALT=CG;OMAPALT=CTTCG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:54:91:91:91:0:52:39:0:0:8:0:18:36:0:0
chr17	26727721	.	GA	G	868.2	PASS	AF=1;AO=69;DP=70;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0106171;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=28.9184;QD=48.2335;RBI=0.0596436;REFB=0;REVB=-0.058691;RO=0;SAF=29;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.00115643;OID=.;OPOS=26727722;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:69:70:72:72:0:30:42:0:0:15:0:29:40:0:0
chr17	26817537	.	G	A	352.86	PASS	AF=0.426966;AO=38;DP=89;FAO=38;FDP=89;FR=.;FRO=51;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=27;FSRR=24;FWDB=-0.00688638;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.488;QD=15.859;RBI=0.00930845;REFB=-0.0202187;REVB=-0.00626299;RO=51;SAF=17;SAR=21;SRF=27;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.083463;STB=0.547044;STBP=0.449;TYPE=snp;VARB=0.0249588;OID=.;OPOS=26817537;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:51:51:38:38:0.426966:21:17:27:24:21:17:27:24
chr17	26824156	.	A	G	84.98	PASS	AF=0.666667;AO=10;DP=15;FAO=10;FDP=15;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0378059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.319;QD=22.6617;RBI=0.0440178;REFB=-0.0243295;REVB=0.022545;RO=5;SAF=3;SAR=7;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0721239;STB=0.540904;STBP=0.749;TYPE=snp;VARB=0.0101077;OID=.;OPOS=26824156;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:15:15:5:5:10:10:0.666667:7:3:1:4:7:3:1:4
chr17	26864302	.	G	C	55.95	PASS	AF=0.421053;AO=7;DP=18;FAO=8;FDP=19;FR=.,HEALED;FRO=11;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=-0.00673415;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.493;QD=11.7788;RBI=0.0290649;REFB=0.00100364;REVB=0.028274;RO=9;SAF=3;SAR=4;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0922775;STB=0.507025;STBP=0.98;TYPE=snp;VARB=0.0012873;OID=.;OPOS=26864302;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:18:19:9:11:7:8:0.421053:4:3:3:6:5:3:4:7
chr17	26925922	.	G	A	477.8	PASS	AF=0.541176;AO=46;DP=85;FAO=46;FDP=85;FR=.;FRO=39;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=16;FSRR=23;FWDB=-0.00156743;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=171.177;QD=22.4848;RBI=0.00178363;REFB=-0.00939727;REVB=0.00085119;RO=39;SAF=21;SAR=25;SRF=16;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0389988;STB=0.52146;STBP=0.697;TYPE=snp;VARB=0.00688109;OID=.;OPOS=26925922;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:39:39:46:46:0.541176:25:21:16:23:25:21:16:23
chr17	26955330	.	A	C	248.23	PASS	AF=0.459016;AO=28;DP=61;FAO=28;FDP=61;FR=.;FRO=33;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=-0.0433357;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.979;QD=16.2773;RBI=0.0768479;REFB=-0.000310984;REVB=-0.0634635;RO=33;SAF=15;SAR=13;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0197961;STB=0.511155;STBP=0.845;TYPE=snp;VARB=-0.00210617;OID=.;OPOS=26955330;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:33:33:28:28:0.459016:13:15:17:16:13:15:17:16
chr17	27014396	.	C	T	593.16	PASS	AF=0.602273;AO=52;DP=88;FAO=53;FDP=88;FR=.;FRO=35;FSAF=18;FSAR=35;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=-0.0168873;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.7628;QD=26.962;RBI=0.0253885;REFB=-0.0407147;REVB=-0.0189578;RO=35;SAF=18;SAR=34;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0655261;STB=0.538447;STBP=0.411;TYPE=snp;VARB=0.0350503;OID=.;OPOS=27014396;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:35:35:52:53:0.602273:34:18:15:20:35:18:15:20
chr17	27014483	.	C	A	335.9	PASS	AF=0.627451;AO=32;DP=51;FAO=32;FDP=51;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=23;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=-0.0365891;FXX=0.0555453;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.024;QD=26.3449;RBI=0.0371702;REFB=-0.00680453;REVB=-0.00654723;RO=19;SAF=9;SAR=23;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0705318;STB=0.538774;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.00652311;OID=.;OPOS=27014483;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:19:19:32:32:0.627451:23:9:7:12:23:9:7:12
chr17	27018096	.	A	G	174.52	PASS	AF=0.6;AO=17;DP=29;FAO=18;FDP=30;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=0.0465822;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.52;QD=23.2696;RBI=0.0465923;REFB=0.00377999;REVB=-0.000973843;RO=12;SAF=4;SAR=13;SRF=2;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0737045;STB=0.558192;STBP=0.566;TYPE=snp;VARB=-0.00170433;OID=.;OPOS=27018096;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:29:30:12:12:17:18:0.6:13:4:2:10:13:5:2:10
chr17	27050697	.	T	C	710.37	PASS	AF=0.598214;AO=66;DP=111;FAO=67;FDP=112;FR=.;FRO=45;FSAF=36;FSAR=31;FSRF=24;FSRR=21;FWDB=-0.0204458;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.0213;QD=25.3705;RBI=0.038826;REFB=-0.00841448;REVB=0.0330065;RO=45;SAF=35;SAR=31;SRF=24;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00226541;STB=0.501607;STBP=0.966;TYPE=snp;VARB=0.0104401;OID=.;OPOS=27050697;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:112:45:45:66:67:0.598214:31:35:24:21:31:36:24:21
chr17	27052358	.	C	T	215.8	PASS	AF=0.438596;AO=24;DP=56;FAO=25;FDP=57;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=0.0167429;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.7393;QD=15.144;RBI=0.027176;REFB=-0.00504528;REVB=-0.0214058;RO=32;SAF=11;SAR=13;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0419086;STB=0.511227;STBP=0.854;TYPE=snp;VARB=0.00670669;OID=.;OPOS=27052358;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:57:32:32:24:25:0.438596:13:11:16:16:13:12:16:16
chr17	27065211	.	T	C	937.6	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0145882;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.971;QD=58.6;RBI=0.0200344;REFB=0;REVB=0.0137318;RO=0;SAF=32;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000106652;OID=.;OPOS=27065211;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:32:32:0:0:32:32:0:0
chr17	27068477	.	A	C	249.53	PASS	AF=0.414286;AO=29;DP=70;FAO=29;FDP=70;FR=.;FRO=41;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=0.00913581;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.631;QD=14.2588;RBI=0.0308017;REFB=-0.0116308;REVB=-0.0294157;RO=41;SAF=19;SAR=10;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.226212;STB=0.628796;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.0133684;OID=.;OPOS=27068477;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:41:41:29:29:0.414286:10:19:18:23:10:19:18:23
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chr17	27075423	.	C	T	290.22	PASS	AF=0.477612;AO=32;DP=67;FAO=32;FDP=67;FR=.;FRO=35;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=-0.00764157;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.779;QD=17.3268;RBI=0.00784516;REFB=-0.0122009;REVB=-0.00177566;RO=34;SAF=17;SAR=15;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00169909;STB=0.506088;STBP=0.932;TYPE=snp;VARB=0.0114734;OID=.;OPOS=27075423;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:34:35:32:32:0.477612:15:17:18:16:15:17:19:16
chr17	27084364	.	T	C	148.14	PASS	AF=0.484848;AO=16;DP=33;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=0.0228129;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.321;QD=17.9558;RBI=0.0396086;REFB=0.00874512;REVB=0.0323792;RO=17;SAF=9;SAR=7;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134542;STB=0.576379;STBP=0.448;TYPE=snp;VARB=-0.0140383;OID=.;OPOS=27084364;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:17:17:16:16:0.484848:7:9:12:5:7:9:12:5
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chr17	27185827	.	C	T	138.95	PASS	AF=0.347826;AO=16;DP=46;FAO=16;FDP=46;FR=.;FRO=30;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=-0.00643597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.619;QD=12.0822;RBI=0.0309002;REFB=-0.0226056;REVB=-0.0302225;RO=30;SAF=10;SAR=6;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140886;STB=0.583228;STBP=0.411;TYPE=snp;VARB=0.0280187;OID=.;OPOS=27185827;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:30:30:16:16:0.347826:6:10:15:15:6:10:15:15
chr17	27207571	.	C	T	937.61	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0171161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.888;QD=58.6005;RBI=0.0238695;REFB=0;REVB=-0.016637;RO=0;SAF=16;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.36531e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.44007e-06;OID=.;OPOS=27207571;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:48:16:0:0:48:16:0:0
chr17	27225586	.	A	T	138.46	PASS	AF=0.625;AO=14;DP=23;FAO=15;FDP=24;FR=.;FRO=9;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=-0.0166861;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.913;QD=23.0767;RBI=0.0396101;REFB=-0.0119358;REVB=0.035924;RO=9;SAF=10;SAR=4;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.278298;STB=0.662422;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.00322093;OID=.;OPOS=27225586;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:23:24:9:9:14:15:0.625:4:10:3:6:4:11:3:6
chr17	27286750	.	G	A	181.26	PASS	AF=0.311688;AO=24;DP=77;FAO=24;FDP=77;FR=.;FRO=53;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=26;FSRR=27;FWDB=-0.00401535;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=176.803;QD=9.41613;RBI=0.0172785;REFB=-0.00500678;REVB=0.0168054;RO=53;SAF=10;SAR=14;SRF=26;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0871067;STB=0.551379;STBP=0.549;TYPE=snp;VARB=0.0135441;OID=.;OPOS=27286750;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:53:53:24:24:0.311688:14:10:26:27:14:10:26:27
chr17	27286851	.	T	C	372.72	PASS	AF=0.413462;AO=43;DP=104;FAO=43;FDP=104;FR=.;FRO=61;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=37;FSRR=24;FWDB=-0.0209372;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.4757;QD=14.3353;RBI=0.0215415;REFB=-0.00522608;REVB=-0.00506653;RO=61;SAF=22;SAR=21;SRF=37;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0991307;STB=0.555829;STBP=0.354;TYPE=snp;VARB=0.00673967;OID=.;OPOS=27286851;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:104:61:61:43:43:0.413462:21:22:37:24:21:22:37:24
chr17	27290969	.	T	G,TG	661.81	PASS	AF=0.0144928,0.971014;AO=6,45;DP=69;FAO=1,67;FDP=69;FR=.;FRO=1;FSAF=1,35;FSAR=0,32;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0105977,0.192941;FXX=0;HRUN=1,3;LEN=1,1;MLLD=59.0783,17.8984;QD=38.3658;RBI=0.0113546,0.203778;REFB=0.0121922,-0.0480736;REVB=-0.00407634,0.0655706;RO=16;SAF=3,17;SAR=3,28;SRF=14;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.452109,-0.240751;STB=0.989913,0.50769;STBP=0.496,0.326;TYPE=snp,ins;VARB=0.0896227,0.0798055;OID=.,.;OPOS=27290969,27290970;OREF=T,-;OALT=G,G;OMAPALT=G,TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:4:69:69:16:1:6,45:1,67:0.0144928,0.971014:3,28:3,17:14:2:0,32:1,35:0:1
chr17	27422053	.	C	T	449.8	PASS	AF=1;AO=31;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.162701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.236;QD=56.2251;RBI=0.162845;REFB=0;REVB=0.00684727;RO=1;SAF=15;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0300873;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00136892;OID=.;OPOS=27422053;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:1:0:31:32:1:16:15:1:0:16:16:0:0
chr17	27424316	.	G	A	121.58	PASS	AF=0.4375;AO=14;DP=32;FAO=14;FDP=32;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=-0.00701752;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.608;QD=15.1968;RBI=0.0146691;REFB=-0.00653007;REVB=0.0128817;RO=18;SAF=6;SAR=8;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0395996;STB=0.522903;STBP=0.821;TYPE=snp;VARB=0.00789243;OID=.;OPOS=27424316;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:18:18:14:14:0.4375:8:6:7:11:8:6:7:11
chr17	27425175	.	T	G	364.94	PASS	AF=0.697674;AO=30;DP=43;FAO=30;FDP=43;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=12;FWDB=-0.0301404;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.8058;QD=33.9477;RBI=0.0314608;REFB=-0.00153208;REVB=0.00901892;RO=13;SAF=3;SAR=27;SRF=1;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0367443;STB=0.519987;STBP=0.812;TYPE=snp;VARB=0.000252172;OID=.;OPOS=27425175;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:13:13:30:30:0.697674:27:3:1:12:27:3:1:12
chr17	27438469	.	G	A	631.94	PASS	AF=0.934783;AO=43;DP=46;FAO=43;FDP=46;FR=.;FRO=3;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0299303;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=92.8585;QD=54.9514;RBI=0.0350177;REFB=-0.152616;REVB=0.0181773;RO=2;SAF=24;SAR=19;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0049111;STB=0.507183;STBP=0.715;TYPE=snp;VARB=0.00140961;OID=.;OPOS=27438469;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:46:46:2:3:43:43:0.934783:19:24:1:1:19:24:2:1
chr17	27441077	.	C	G	677.16	PASS	AF=1;AO=33;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0679264;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.363;QD=61.5604;RBI=0.0736682;REFB=0;REVB=0.0285133;RO=0;SAF=16;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.60901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000533966;OID=.;OPOS=27441077;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:44:0:0:33:44:1:17:16:0:0:23:21:0:0
chr17	27580756	.	C	T	206.1	PASS	AF=0.428571;AO=21;DP=49;FAO=21;FDP=49;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=0.0145524;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.983;QD=16.8247;RBI=0.014556;REFB=-0.0193087;REVB=-0.000324369;RO=28;SAF=11;SAR=10;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0594165;STB=0.533948;STBP=0.703;TYPE=snp;VARB=0.0253104;OID=.;OPOS=27580756;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:28:28:21:21:0.428571:10:11:13:15:10:11:13:15
chr17	27582926	.	GTTTTTTTTC	GTTTTTTTTT,TGTTTTTTTC	114.15	PASS	AF=0.270833,0;AO=8,2;DP=48;FAO=13,0;FDP=48;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=30;FSAF=7,0;FSAR=6,0;FSRF=20;FSRR=10;FWDB=-0.00483344,0.0277264;FXX=0.020404;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=178.854,64.1654;QD=9.51214;RBI=0.032415,0.156231;REFB=-0.0271863,-0.00693065;REVB=0.0320527,0.153751;RO=17;SAF=5,2;SAR=3,0;SRF=10;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0424152,0.494586;STB=0.591107,0.5;STBP=0.438,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.0244938,0.0949985;OID=.,.;OPOS=27582935,27582926;OREF=C,GT;OALT=T,TG;OMAPALT=GTTTTTTTTT,TGTTTTTTTC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:17:30:8,2:13,0:0.270833,0:3,0:5,2:10:7:6,0:7,0:20:10
chr17	27588806	.	C	A	256.75	PASS	AF=0.545455;AO=24;DP=42;FAO=24;FDP=44;FR=.;FRO=20;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=4;FWDB=-0.072811;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=55.1366;QD=23.3407;RBI=0.0871831;REFB=-0.0391084;REVB=-0.0479526;RO=18;SAF=14;SAR=10;SRF=14;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159567;STB=0.604758;STBP=0.163;TYPE=snp;VARB=0.0289953;OID=.;OPOS=27588806;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:44:18:20:24:24:0.545455:10:14:14:4:10:14:16:4
chr17	27588980	.	CAG	C	116.52	PASS	AF=0.541667;AO=12;DP=25;FAO=13;FDP=24;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=-0.0176027;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=2;MLLD=234.682;QD=19.4204;RBI=0.0177283;REFB=-0.0177354;REVB=0.00210604;RO=11;SAF=5;SAR=7;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.253906;STB=0.620075;STBP=0.248;TYPE=del;VARB=0.0123348;OID=.;OPOS=27588981;OREF=AG;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.541667:12:25:13:24:11:6:7:8:3:90:11:5:7:8:3
chr17	27835138	.	C	T	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00253874;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=225.404;QD=40.7629;RBI=0.0375142;REFB=0;REVB=-0.0374282;RO=0;SAF=4;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000508081;OID=.;OPOS=27835138;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:6:4:0:0:6:4:0:0
chr17	27889578	.	T	C	1231.41	PASS	AF=0.987805;AO=81;DP=82;FAO=81;FDP=82;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00960725;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=269.565;QD=60.0685;RBI=0.0220785;REFB=0.0166597;REVB=0.0198787;RO=1;SAF=44;SAR=37;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0106407;STB=0.505617;STBP=0.496;TYPE=snp;VARB=-0.000217547;OID=.;OPOS=27889578;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:82:82:1:1:81:81:0.987805:37:44:1:0:37:44:1:0
chr17	27889986	.	T	C	740.36	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00399421;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.201;QD=56.951;RBI=0.0661459;REFB=0;REVB=0.0660251;RO=0;SAF=28;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000189121;OID=.;OPOS=27889986;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:24:28:0:0:24:28:0:0
chr17	27901975	.	A	G	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00289144;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.282;QD=59.435;RBI=0.0376585;REFB=0;REVB=-0.0375473;RO=0;SAF=18;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000242124;OID=.;OPOS=27901975;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:17:18:0:0:17:18:0:0
chr17	27904711	.	G	A	964.59	PASS	AF=0.971014;AO=67;DP=69;FAO=67;FDP=69;FR=.;FRO=2;FSAF=26;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0189981;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.323;QD=55.9183;RBI=0.0315407;REFB=-0.0576006;REVB=0.0251771;RO=2;SAF=26;SAR=41;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00644175;STB=0.50341;STBP=0.76;TYPE=snp;VARB=0.0026923;OID=.;OPOS=27904711;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:69:69:2:2:67:67:0.971014:41:26:1:1:41:26:1:1
chr17	28268800	.	A	C	711.46	PASS	AF=0.962963;AO=53;DP=54;FAO=52;FDP=54;FR=.;FRO=2;FSAF=29;FSAR=23;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.014738;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.3893;QD=52.7006;RBI=0.0225989;REFB=-0.0168194;REVB=0.0171319;RO=1;SAF=30;SAR=23;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154473;STB=0.51666;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=0.00124975;OID=.;OPOS=28268800;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:54:54:1:2:53:52:0.962963:23:30:1:0:23:29:2:0
chr17	28296327	.	T	G	538.29	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.106976;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.2663;QD=59.8096;RBI=0.115673;REFB=0;REVB=-0.0440048;RO=0;SAF=18;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00127744;OID=.;OPOS=28296327;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:18:18:0:0:18:18:0:0
chr17	28320248	.	T	A	817.56	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=7.88287e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=315.364;QD=57.3726;RBI=0.00027426;REFB=0;REVB=-0.000262687;RO=0;SAF=30;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.29784e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.45845e-07;OID=.;OPOS=28320248;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:56:57:0:0:56:57:1:26:30:0:0:26:31:0:0
chr17	28405273	.	C	T	199.76	PASS	AF=0.5;AO=20;DP=40;FAO=20;FDP=40;FR=.;FRO=20;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=0.0469649;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.68;QD=19.9758;RBI=0.0481158;REFB=-0.024562;REVB=-0.0104608;RO=19;SAF=11;SAR=9;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0718662;STB=0.55097;STBP=0.547;TYPE=snp;VARB=0.030365;OID=.;OPOS=28405273;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:19:20:20:20:0.5:9:11:12:7:9:11:13:7
chr17	28444183	.	A	C	374.83	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0806944;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.8442;QD=55.5309;RBI=0.109415;REFB=0;REVB=-0.073892;RO=0;SAF=16;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00338134;OID=.;OPOS=28444183;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:11:16:0:0:11:16:0:0
chr17	28511978	.	G	A	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-3.09884e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.522;QD=44.6898;RBI=0.000892853;REFB=0;REVB=0.000892315;RO=0;SAF=7;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.92649e-06;OID=.;OPOS=28511978;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:6:7:0:0:6:7:0:0
chr17	28794020	.	A	G	1590.76	PASS	AF=0.990741;AO=107;DP=108;FAO=107;FDP=108;FR=.;FRO=1;FSAF=63;FSAR=44;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0268292;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.4546;QD=58.9171;RBI=0.0411743;REFB=-0.103456;REVB=0.0312333;RO=0;SAF=63;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.78072e-08;STB=0.503936;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.00151322;OID=.;OPOS=28794020;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:108:108:0:1:107:107:0.990741:44:63:0:0:44:63:1:0
chr17	28853530	.	A	C	352.31	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.05087;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.147;QD=54.2008;RBI=0.0578287;REFB=0;REVB=0.0275028;RO=0;SAF=14;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000393756;OID=.;OPOS=28853530;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:26:0:0:25:26:1:11:14:0:0:11:15:0:0
chr17	28900708	.	G	T	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00698027;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=240.309;QD=49.5992;RBI=0.0493685;REFB=0;REVB=0.0488726;RO=0;SAF=14;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000191638;OID=.;OPOS=28900708;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:4:14:0:0:4:14:0:0
chr17	29220797	.	T	G	144.02	PASS	AF=0.421053;AO=16;DP=38;FAO=16;FDP=38;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=-0.000250229;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=252.918;QD=15.1604;RBI=0.0110393;REFB=-0.00229663;REVB=-0.0110365;RO=22;SAF=9;SAR=7;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0290181;STB=0.516758;STBP=0.881;TYPE=snp;VARB=0.00407622;OID=.;OPOS=29220797;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:22:22:16:16:0.421053:7:9:13:9:7:9:13:9
chr17	29486152	.	G	A	264.64	PASS	AF=0.390244;AO=30;DP=81;FAO=32;FDP=82;FR=.;FRO=50;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=28;FWDB=0.0158677;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.634;QD=12.909;RBI=0.0194438;REFB=-0.0102811;REVB=-0.0112373;RO=50;SAF=14;SAR=16;SRF=22;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0292398;STB=0.536563;STBP=0.627;TYPE=snp;VARB=0.0132234;OID=.;OPOS=29486152;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:82:50:50:30:32:0.390244:16:14:22:28:16:16:22:28
chr17	29496819	.	C	T	149.91	PASS	AF=0.516129;AO=16;DP=31;FAO=16;FDP=31;FR=.;FRO=15;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.0249598;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.5691;QD=19.3427;RBI=0.0545975;REFB=-0.0204555;REVB=-0.0485581;RO=15;SAF=11;SAR=5;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.253096;STB=0.644166;STBP=0.125;TYPE=snp;VARB=0.0160842;OID=.;OPOS=29496819;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:15:15:16:16:0.516129:5:11:6:9:5:11:6:9
chr17	29508775	.	G	A	342.86	PASS	AF=0.546875;AO=35;DP=64;FAO=35;FDP=64;FR=.;FRO=29;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=-0.060507;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.254;QD=21.429;RBI=0.0605338;REFB=0.00136862;REVB=0.00180281;RO=29;SAF=18;SAR=17;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116174;STB=0.56409;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=-0.000972609;OID=.;OPOS=29508775;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:29:29:35:35:0.546875:17:18:19:10:17:18:19:10
chr17	29553485	.	G	A	393.31	PASS	AF=0.59375;AO=21;DP=65;FAO=38;FDP=64;FR=.;FRO=26;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=6;FSRR=20;FWDB=0.0276449;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.4646;QD=24.5816;RBI=0.0280612;REFB=-0.0212865;REVB=0.00481592;RO=19;SAF=8;SAR=13;SRF=5;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109104;STB=0.571773;STBP=0.203;TYPE=snp;VARB=0.0108602;OID=.;OPOS=29553485;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:64:19:26:21:38:0.59375:13:8:5:14:23:15:6:20
chr17	29630965	.	A	AG	106.13	PASS	AF=0.642857;AO=3;DP=29;FAO=18;FDP=28;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=-0.10816;FXX=0.0344709;HRUN=4;LEN=1;MLLD=14.1838;QD=15.1611;RBI=0.12707;REFB=0.026993;REVB=-0.0666942;RO=26;SAF=1;SAR=2;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0993083;STB=0.504162;STBP=0.989;TYPE=ins;VARB=-0.0557558;OID=.;OPOS=29630966;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.642857:3:29:18:28:10:7:11:4:6:47:26:1:2:11:15
chr17	29859506	.	G	T	162.77	PASS	AF=0.36;AO=18;DP=50;FAO=18;FDP=50;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=23;FSRR=9;FWDB=-0.0153283;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.0574;QD=13.022;RBI=0.0874704;REFB=-0.0187053;REVB=0.0861168;RO=32;SAF=10;SAR=8;SRF=23;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186918;STB=0.608183;STBP=0.271;TYPE=snp;VARB=0.0547353;OID=.;OPOS=29859506;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:32:32:18:18:0.36:8:10:23:9:8:10:23:9
chr17	29890870	.	C	G	170.32	PASS	AF=0.45;AO=18;DP=39;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=-0.0433495;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.742;QD=17.0318;RBI=0.0567332;REFB=-0.00155361;REVB=-0.0365988;RO=21;SAF=8;SAR=10;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155444;STB=0.571352;STBP=0.4;TYPE=snp;VARB=0.00153831;OID=.;OPOS=29890870;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:40:21:22:18:18:0.45:10:8:6:15:10:8:7:15
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chr17	30222002	.	T	C	172.2	PASS	AF=0.653846;AO=17;DP=26;FAO=17;FDP=26;FR=.;FRO=9;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.0427242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.441;QD=26.4918;RBI=0.0428906;REFB=-0.0245146;REVB=0.00377547;RO=9;SAF=7;SAR=10;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158275;STB=0.588131;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=0.0133986;OID=.;OPOS=30222002;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:26:26:9:9:17:17:0.653846:10:7:6:3:10:7:6:3
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chr17	30625205	.	G	A	475.07	PASS	AF=0.476636;AO=51;DP=107;FAO=51;FDP=107;FR=.;FRO=56;FSAF=21;FSAR=30;FSRF=32;FSRR=24;FWDB=0.00246131;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.244;QD=17.7598;RBI=0.0313769;REFB=-0.00534882;REVB=0.0312802;RO=56;SAF=21;SAR=30;SRF=32;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150612;STB=0.583668;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=0.007212;OID=.;OPOS=30625205;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:107:56:56:51:51:0.476636:30:21:32:24:30:21:32:24
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chr17	31091978	.	C	T	672.02	PASS	AF=0.565217;AO=65;DP=115;FAO=65;FDP=115;FR=.;FRO=50;FSAF=27;FSAR=38;FSRF=20;FSRR=30;FWDB=-0.0257501;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.305;QD=23.3746;RBI=0.030933;REFB=-0.0277243;REVB=-0.0171401;RO=50;SAF=27;SAR=38;SRF=20;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0126334;STB=0.5069;STBP=0.856;TYPE=snp;VARB=0.016702;OID=.;OPOS=31091978;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:115:50:50:65:65:0.565217:38:27:20:30:38:27:20:30
chr17	31268378	.	C	T	219.72	PASS	AF=0.311111;AO=28;DP=90;FAO=28;FDP=90;FR=.;FRO=62;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=37;FSRR=25;FWDB=-0.0013129;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.143;QD=9.76546;RBI=0.0106184;REFB=-0.00843406;REVB=-0.0105369;RO=61;SAF=16;SAR=12;SRF=36;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0224415;STB=0.517903;STBP=0.827;TYPE=snp;VARB=0.0149163;OID=.;OPOS=31268378;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:61:62:28:28:0.311111:12:16:36:25:12:16:37:25
chr17	31340682	.	C	T	713.04	PASS	AF=0.639175;AO=60;DP=96;FAO=62;FDP=97;FR=.;FRO=35;FSAF=30;FSAR=32;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=0.0201793;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.1021;QD=29.4036;RBI=0.0497753;REFB=-0.0295323;REVB=-0.0455014;RO=34;SAF=30;SAR=30;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0785033;STB=0.540708;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=0.0186846;OID=.;OPOS=31340682;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:97:34:35:60:62:0.639175:30:30:13:21:32:30:13:22
chr17	31618732	.	A	G	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00536148;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=315.891;QD=37.4885;RBI=0.034622;REFB=0;REVB=0.0342044;RO=0;SAF=5;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000340213;OID=.;OPOS=31618732;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:3:5:0:0:3:5:0:0
chr17	32583269	.	T	C	122.46	PASS	AF=0.264706;AO=18;DP=68;FAO=18;FDP=68;FR=.;FRO=50;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=31;FSRR=19;FWDB=-0.00364313;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=268.609;QD=7.20346;RBI=0.00538926;REFB=-0.00821415;REVB=0.00397136;RO=50;SAF=11;SAR=7;SRF=31;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0113455;STB=0.506889;STBP=0.966;TYPE=snp;VARB=0.0259371;OID=.;OPOS=32583269;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:50:50:18:18:0.264706:7:11:31:19:7:11:31:19
chr17	32583911	.	C	T	203.28	PASS	AF=0.393939;AO=25;DP=66;FAO=26;FDP=66;FR=.,HEALED;FRO=40;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=24;FWDB=-0.219036;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=39.1548;QD=12.3201;RBI=0.219311;REFB=-0.0441006;REVB=-0.0109951;RO=30;SAF=16;SAR=9;SRF=6;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.405844;STB=0.629531;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=0.063684;OID=.;OPOS=32583911;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:30:40:25:26:0.393939:9:16:6:24:10:16:16:24
chr17	32904586	.	C	T	1098.5	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0134876;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.6638;QD=60.1918;RBI=0.0386346;REFB=0;REVB=-0.0362038;RO=0;SAF=34;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000471108;OID=.;OPOS=32904586;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:39:34:0:0:39:34:0:0
chr17	32906008	.	C	G	798.17	PASS	AF=0.680412;AO=66;DP=97;FAO=66;FDP=97;FR=.;FRO=31;FSAF=38;FSAR=28;FSRF=5;FSRR=26;FWDB=-0.0394719;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=47.9185;QD=32.9142;RBI=0.0404493;REFB=0.00114056;REVB=-0.00883836;RO=30;SAF=38;SAR=28;SRF=5;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.233855;STB=0.630183;STBP=0;TYPE=snp;VARB=-0.000984262;OID=.;OPOS=32906008;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:30:31:66:66:0.680412:28:38:5:25:28:38:5:26
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chr17	33806841	.	AG	A	735.71	PASS	AF=0.701149;AO=61;DP=87;FAO=61;FDP=87;FR=.;FRO=26;FSAF=30;FSAR=31;FSRF=19;FSRR=7;FWDB=0.00933813;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.229;QD=33.8257;RBI=0.0172536;REFB=-0.0089425;REVB=0.0145082;RO=26;SAF=30;SAR=31;SRF=19;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132382;STB=0.571244;STBP=0.055;TYPE=del;VARB=0.00276651;OID=.;OPOS=33806842;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.701149:61:87:61:87:26:30:31:19:7:99:26:30:31:19:7
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chr17	33881718	.	G	A	507.47	PASS	AF=0.602564;AO=47;DP=78;FAO=47;FDP=78;FR=.;FRO=31;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=0.0711574;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.1361;QD=26.0238;RBI=0.0738235;REFB=-0.00511906;REVB=-0.0196605;RO=31;SAF=20;SAR=27;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0193386;STB=0.510563;STBP=0.826;TYPE=snp;VARB=0.00543585;OID=.;OPOS=33881718;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:31:31:47:47:0.602564:27:20:14:17:27:20:14:17
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chr17	34093681	.	G	A	701.98	PASS	AF=0.631579;AO=60;DP=96;FAO=60;FDP=95;FR=.;FRO=35;FSAF=32;FSAR=28;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=0.0346053;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.818;QD=29.5569;RBI=0.035056;REFB=-0.00829794;REVB=-0.00560358;RO=35;SAF=32;SAR=28;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0129746;STB=0.50704;STBP=0.876;TYPE=snp;VARB=0.00337893;OID=.;OPOS=34093681;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:95:35:35:60:60:0.631579:28:32:18:17:28:32:18:17
chr17	34100350	.	G	GC	709.39	PASS	AF=1;AO=47;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0182845;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=227.12;QD=55.6388;RBI=0.0427926;REFB=0;REVB=0.0386896;RO=2;SAF=17;SAR=30;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0303261;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000190998;OID=.;OPOS=34100351;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:47:51:51:51:0:18:33:0:0:4:2:17:30:0:2
chr17	34182341	.	G	A	417.18	PASS	AF=0.702128;AO=33;DP=47;FAO=33;FDP=47;FR=.;FRO=14;FSAF=23;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.00167831;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=326.691;QD=35.5043;RBI=0.00956549;REFB=-0.00696304;REVB=0.00941711;RO=14;SAF=23;SAR=10;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0783905;STB=0.542746;STBP=0.394;TYPE=snp;VARB=0.00209782;OID=.;OPOS=34182341;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:14:14:33:33:0.702128:10:23:8:6:10:23:8:6
chr17	34195739	.	T	C	376.47	PASS	AF=0.673913;AO=31;DP=46;FAO=31;FDP=46;FR=.;FRO=15;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=-0.0450341;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.077;QD=32.7368;RBI=0.0499257;REFB=-0.00280366;REVB=0.0215522;RO=15;SAF=12;SAR=19;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129433;STB=0.570769;STBP=0.19;TYPE=snp;VARB=0.000631357;OID=.;OPOS=34195739;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:15:15:31:31:0.673913:19:12:9:6:19:12:9:6
chr17	34215825	.	T	C	679.68	PASS	AF=0.523438;AO=67;DP=128;FAO=67;FDP=128;FR=.;FRO=61;FSAF=28;FSAR=39;FSRF=30;FSRR=31;FWDB=0.00380393;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.684;QD=21.2401;RBI=0.0120091;REFB=-0.0145301;REVB=-0.0113908;RO=61;SAF=28;SAR=39;SRF=30;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0650472;STB=0.535754;STBP=0.42;TYPE=snp;VARB=0.0117298;OID=.;OPOS=34215825;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:128:128:61:61:67:67:0.523438:39:28:30:31:39:28:30:31
chr17	34216624	.	G	C	192.89	PASS	AF=0.575758;AO=18;DP=32;FAO=19;FDP=33;FR=.;FRO=14;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.0175054;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.4332;QD=23.3808;RBI=0.0385734;REFB=-0.00289796;REVB=0.0343725;RO=14;SAF=10;SAR=8;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0435261;STB=0.533945;STBP=0.648;TYPE=snp;VARB=0.00418543;OID=.;OPOS=34216624;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:33:14:14:18:19:0.575758:8:10:7:7:8:11:7:7
chr17	34257637	.	T	C	487.12	PASS	AF=0.676923;AO=44;DP=65;FAO=44;FDP=65;FR=.;FRO=21;FSAF=26;FSAR=18;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=-0.0246442;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.102;QD=29.9768;RBI=0.0276063;REFB=-0.0224861;REVB=0.0124406;RO=21;SAF=26;SAR=18;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125983;STB=0.568375;STBP=0.107;TYPE=snp;VARB=0.0176445;OID=.;OPOS=34257637;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:21:21:44:44:0.676923:18:26:8:13:18:26:8:13
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chr17	34303771	.	T	C	506.63	PASS	AF=0.55814;AO=47;DP=85;FAO=48;FDP=86;FR=.;FRO=38;FSAF=19;FSAR=29;FSRF=6;FSRR=32;FWDB=0.0566689;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.126;QD=23.5639;RBI=0.0566774;REFB=-0.00943027;REVB=-0.000981111;RO=38;SAF=18;SAR=29;SRF=6;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20563;STB=0.615137;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.0106405;OID=.;OPOS=34303771;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:86:38:38:47:48:0.55814:29:18:6:32:29:19:6:32
chr17	34328461	.	A	G	740.75	PASS	AF=1;AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0339006;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.405;QD=56.9809;RBI=0.0354941;REFB=0;REVB=0.0105158;RO=0;SAF=33;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.0907e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000174065;OID=.;OPOS=34328461;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:52:0:0:52:52:1:19:33:0:0:19:33:0:0
chr17	34340284	.	C	T	1472.54	PASS	AF=1;AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00361717;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.305;QD=63.335;RBI=0.0120276;REFB=0;REVB=0.0114708;RO=0;SAF=48;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.42086e-05;OID=.;OPOS=34340284;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:93:93:0:0:93:93:1:45:48:0:0:45:48:0:0
chr17	34416537	.	G	A	572.55	PASS	AF=0.548077;AO=57;DP=104;FAO=57;FDP=104;FR=.;FRO=47;FSAF=31;FSAR=26;FSRF=19;FSRR=28;FWDB=-0.00294831;FXX=0.0095229;HRUN=3;LEN=1;MLLD=166.37;QD=22.0212;RBI=0.0187834;REFB=-0.000756807;REVB=0.0185505;RO=47;SAF=31;SAR=26;SRF=19;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114667;STB=0.562856;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.000294073;OID=.;OPOS=34416537;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:104:47:47:57:57:0.548077:26:31:19:28:26:31:19:28
chr17	34431287	.	G	T	1785.93	PASS	AF=1;AO=116;DP=116;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00394823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.534;QD=61.0575;RBI=0.0201366;REFB=0;REVB=0.0197457;RO=0;SAF=57;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.21403e-05;OID=.;OPOS=34431287;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:116:117:0:0:116:117:1:59:57:0:0:59:58:0:0
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chr17	35478362	.	T	C	785.84	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0174523;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.173;QD=64.1505;RBI=0.0226961;REFB=0;REVB=0.0145096;RO=0;SAF=22;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.30731e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000157856;OID=.;OPOS=35478362;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:27:22:0:0:27:22:0:0
chr17	35609866	.	C	T	128.84	PASS	AF=0.365854;AO=15;DP=41;FAO=15;FDP=41;FR=.;FRO=26;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.0155762;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.685;QD=12.5695;RBI=0.0204662;REFB=-0.0100153;REVB=-0.0132759;RO=26;SAF=4;SAR=11;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.231845;STB=0.637486;STBP=0.215;TYPE=snp;VARB=0.0165239;OID=.;OPOS=35609866;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:26:26:15:15:0.365854:11:4:12:14:11:4:12:14
chr17	35696804	.	G	A	43.39	PASS	AF=0.21875;AO=5;DP=31;FAO=7;FDP=32;FR=.;FRO=25;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=19;FWDB=-0.0180037;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.705;QD=5.42353;RBI=0.0187736;REFB=-0.00531037;REVB=0.00532121;RO=24;SAF=2;SAR=3;SRF=6;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199371;STB=0.656756;STBP=0.45;TYPE=snp;VARB=0.0250901;OID=.;OPOS=35696804;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:31:32:24:25:5:7:0.21875:3:2:6:18:4:3:6:19
chr17	35771468	.	C	T	136.83	PASS	AF=0.5;AO=15;DP=30;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.079485;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.4276;QD=18.2443;RBI=0.0795301;REFB=-0.0296352;REVB=0.00267768;RO=15;SAF=8;SAR=7;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0252013;OID=.;OPOS=35771468;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:15:15:15:15:0.5:7:8:8:7:7:8:8:7
chr17	35873324	.	T	C	226.32	PASS	AF=0.345679;AO=28;DP=81;FAO=28;FDP=81;FR=.;FRO=53;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=29;FWDB=0.0112226;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=300.595;QD=11.1764;RBI=0.0142709;REFB=-0.00409987;REVB=-0.00881544;RO=52;SAF=14;SAR=14;SRF=24;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0431654;STB=0.530842;STBP=0.662;TYPE=snp;VARB=0.00732046;OID=.;OPOS=35873324;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:52:53:28:28:0.345679:14:14:24:28:14:14:24:29
chr17	35873399	.	TA	T	1155.04	PASS	AF=1;AO=92;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00750806;FXX=0.0105252;HRUN=2;LEN=1;MLLD=30.6621;QD=49.1508;RBI=0.0111678;REFB=0;REVB=-0.0082673;RO=1;SAF=44;SAR=48;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00977435;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-1.63927e-05;OID=.;OPOS=35873400;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:92:94:94:94:0:44:50:0:0:20:1:44:48:0:1
chr17	35896123	.	T	C	1525.7	PASS	AF=1;AO=102;DP=102;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00228736;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.434;QD=59.8315;RBI=0.00400845;REFB=0;REVB=0.00329176;RO=0;SAF=46;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.14693e-06;OID=.;OPOS=35896123;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:102:102:0:0:102:102:1:56:46:0:0:56:46:0:0
chr17	35956391	.	G	C	239.44	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0216852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.395;QD=50.409;RBI=0.0405806;REFB=0;REVB=-0.0343007;RO=0;SAF=8;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.41338e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000637229;OID=.;OPOS=35956391;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:11:8:0:0:11:8:0:0
chr17	35984410	.	T	C	695.41	PASS	AF=1;AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0113493;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.333;QD=63.219;RBI=0.0299533;REFB=0;REVB=0.02772;RO=0;SAF=14;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000129954;OID=.;OPOS=35984410;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:44:0:0:44:44:1:30:14:0:0:30:14:0:0
chr17	35988672	.	C	T	1035.77	PASS	AF=0.972603;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=73;FR=.;FRO=2;FSAF=36;FSAR=35;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0160722;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.846;QD=56.7544;RBI=0.0160757;REFB=0.0239259;REVB=-0.000333505;RO=0;SAF=36;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11607e-08;STB=0.51351;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=-0.000835031;OID=.;OPOS=35988672;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:71:73:0:2:71:71:0.972603:35:36:0:0:35:36:2:0
chr17	35995638	.	T	A	1510.85	PASS	AF=1;AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0293907;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=252.625;QD=63.6148;RBI=0.0325066;REFB=0;REVB=0.0138876;RO=0;SAF=38;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.51254e-05;OID=.;OPOS=35995638;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:95:0:0:95:95:1:57:38:0:0:57:38:0:0
chr17	36003359	.	A	G	852.96	PASS	AF=1;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00296626;FXX=0.0166639;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.925;QD=57.8278;RBI=0.00520428;REFB=0;REVB=-0.00427619;RO=0;SAF=24;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.14431e-06;OID=.;OPOS=36003359;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:59:0:0:59:59:1:35:24:0:0:35:24:0:0
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chr17	36365172	.	C	T	205.42	PASS	AF=0.22069;AO=32;DP=145;FAO=32;FDP=145;FR=.;FRO=113;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=71;FSRR=42;FWDB=-0.0227774;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=220.925;QD=5.66683;RBI=0.0230116;REFB=-0.00479795;REVB=-0.00327417;RO=110;SAF=16;SAR=16;SRF=69;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161842;STB=0.59994;STBP=0.213;TYPE=snp;VARB=0.0185568;OID=.;OPOS=36365172;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:145:145:110:113:32:32:0.22069:16:16:69:41:16:16:71:42
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chr17	36478388	.	G	T	215.15	PASS	AF=0.826087;AO=19;DP=23;FAO=19;FDP=23;FR=.;FRO=4;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0070026;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.663;QD=37.4175;RBI=0.0200446;REFB=-0.000139514;REVB=0.0187816;RO=4;SAF=11;SAR=8;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0255889;STB=0.514004;STBP=0.839;TYPE=snp;VARB=0.000113657;OID=.;OPOS=36478388;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:20:23:23:4:4:19:19:0.826087:8:11:2:2:8:11:2:2
chr17	36485753	.	G	C	186.62	PASS	AF=0.513514;AO=18;DP=36;FAO=19;FDP=37;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=0.00477118;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.141;QD=20.1747;RBI=0.035907;REFB=-0.0291093;REVB=0.0355886;RO=18;SAF=11;SAR=7;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0507894;STB=0.511616;STBP=0.924;TYPE=snp;VARB=0.0268468;OID=.;OPOS=36485753;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:37:18:18:18:19:0.513514:7:11:10:8:8:11:10:8
chr17	36493598	.	A	G	216.83	PASS	AF=0.52381;AO=21;DP=41;FAO=22;FDP=42;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=5;FWDB=-0.0361601;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=40.7728;QD=20.6504;RBI=0.0477096;REFB=-0.00422643;REVB=-0.0311233;RO=20;SAF=11;SAR=10;SRF=15;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199785;STB=0.599914;STBP=0.203;TYPE=snp;VARB=0.00240095;OID=.;OPOS=36493598;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:42:20:20:21:22:0.52381:10:11:15:5:10:12:15:5
chr17	36617210	.	A	G	948.27	PASS	AF=0.643411;AO=83;DP=129;FAO=83;FDP=129;FR=.;FRO=46;FSAF=40;FSAR=43;FSRF=27;FSRR=19;FWDB=-0.0100519;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.226;QD=29.4037;RBI=0.0259593;REFB=-0.0288573;REVB=-0.0239342;RO=46;SAF=40;SAR=43;SRF=27;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0692439;STB=0.537391;STBP=0.252;TYPE=snp;VARB=0.0100912;OID=.;OPOS=36617210;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:129:129:46:46:83:83:0.643411:43:40:27:19:43:40:27:19
chr17	36635721	.	C	T	777.49	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.013336;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.9495;QD=56.5447;RBI=0.015774;REFB=0;REVB=0.00842434;RO=0;SAF=32;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.49259e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.3182e-05;OID=.;OPOS=36635721;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:23:32:0:0:23:32:0:0
chr17	36646386	.	A	G	3017.48	PASS	AF=1;AO=190;DP=190;FAO=190;FDP=190;FR=.;FRO=0;FSAF=101;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00293082;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.18;QD=63.5258;RBI=0.0287221;REFB=0;REVB=0.0285722;RO=0;SAF=101;SAR=89;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.42451e-05;OID=.;OPOS=36646386;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:16:190:190:0:0:190:190:1:89:101:0:0:89:101:0:0
chr17	36666189	.	GC	G,GG	73.86	PASS	AF=0.349206,0.047619;AO=17,6;DP=62;FAO=22,3;FDP=63;FR=.;FRO=38;FSAF=3,0;FSAR=19,3;FSRF=24;FSRR=14;FWDB=-0.138453,0.00294947;FXX=0.0156226;HRUN=5,5;LEN=1,1;MLLD=12.6374,21.1814;QD=4.68981;RBI=0.219205,0.0961297;REFB=-0.0666385,-0.0433161;REVB=-0.169946,-0.0960844;RO=35;SAF=2,0;SAR=15,6;SRF=22;SRR=13;SSEN=0,0;SSEP=0.305263,0;SSSB=-0.610772,-0.709156;STB=0.837907,0.997247;STBP=0,0.025;TYPE=del,snp;VARB=-0.000642598,0.0132084;OID=.,.;OPOS=36666190,36666190;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.349206,0.047619:17,6:62:22,3:63:38:3,0:19,3:24:14:60:35:2,0:15,6:22:13
chr17	36861983	.	T	C	1377.47	PASS	AF=1;AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0273177;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.2341;QD=62.6121;RBI=0.0273545;REFB=0;REVB=-0.00141724;RO=0;SAF=25;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000181363;OID=.;OPOS=36861983;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:88:88:0:0:88:88:1:63:25:0:0:63:25:0:0
chr17	36906401	.	T	A	212.82	PASS	AF=0.5;AO=21;DP=42;FAO=21;FDP=42;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=6;FWDB=-0.0411832;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.129;QD=20.2681;RBI=0.0413085;REFB=-0.0107988;REVB=-0.00321498;RO=21;SAF=11;SAR=10;SRF=15;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1716;STB=0.596243;STBP=0.226;TYPE=snp;VARB=0.0106914;OID=.;OPOS=36906401;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:21:21:21:21:0.5:10:11:15:6:10:11:15:6
chr17	36906480	.	G	A	149.11	PASS	AF=0.529412;AO=14;DP=32;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.1582;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=35.3436;QD=17.5423;RBI=0.163335;REFB=-0.037622;REVB=0.04063;RO=18;SAF=7;SAR=7;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.582689;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=0.0381874;OID=.;OPOS=36906480;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:34:18:16:14:18:0.529412:7:7:9:9:7:11:7:9
chr17	36909061	.	A	G	738.06	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0579445;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.24;QD=62.8133;RBI=0.0579561;REFB=0;REVB=-0.0011596;RO=0;SAF=18;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.06241e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000183493;OID=.;OPOS=36909061;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:47:0:0:46:47:1:28:18:0:0:28:19:0:0
chr17	36909499	.	A	T	440.93	PASS	AF=0.650794;AO=41;DP=63;FAO=41;FDP=63;FR=.;FRO=22;FSAF=15;FSAR=26;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.0233618;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.171;QD=27.9954;RBI=0.027105;REFB=-0.00112283;REVB=-0.0137445;RO=20;SAF=15;SAR=26;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115472;STB=0.565185;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=0.000361106;OID=.;OPOS=36909499;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:20:22:41:41:0.650794:26:15:11:9:26:15:12:10
chr17	36922839	.	C	G	115.66	PASS	AF=0.333333;AO=14;DP=42;FAO=14;FDP=42;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.00259751;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.505;QD=11.0156;RBI=0.07927;REFB=-0.00338401;REVB=-0.0792275;RO=28;SAF=9;SAR=5;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124419;STB=0.574359;STBP=0.459;TYPE=snp;VARB=0.00950748;OID=.;OPOS=36922839;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:28:28:14:14:0.333333:5:9:15:13:5:9:15:13
chr17	36926731	.	T	G	84.7	PASS	AF=0.178571;AO=15;DP=84;FAO=15;FDP=84;FR=.;FRO=69;FSAF=2;FSAR=13;FSRF=30;FSRR=39;FWDB=0.0240361;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.5436;QD=4.03341;RBI=0.0291385;REFB=0.0077569;REVB=0.0164718;RO=69;SAF=2;SAR=13;SRF=30;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.443608;STB=0.799543;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=-0.031989;OID=.;OPOS=36926731;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:84:84:69:69:15:15:0.178571:13:2:30:39:13:2:30:39
chr17	36926767	.	G	A	65.89	PASS	AF=0.169014;AO=13;DP=71;FAO=12;FDP=71;FR=.;FRO=59;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=28;FSRR=31;FWDB=-0.00976465;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.819;QD=3.71184;RBI=0.0135177;REFB=0.00175959;REVB=-0.00934771;RO=57;SAF=2;SAR=11;SRF=28;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.457281;STB=0.784823;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=-0.00732262;OID=.;OPOS=36926767;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:71:71:57:59:13:12:0.169014:11:2:28:29:10:2:28:31
chr17	36927523	.	G	A	61.38	PASS	AF=0.615385;AO=8;DP=13;FAO=8;FDP=13;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.00725179;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.107;QD=18.8866;RBI=0.013487;REFB=-0.0107491;REVB=0.0113715;RO=5;SAF=3;SAR=5;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151251;STB=0.588011;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.00718204;OID=.;OPOS=36927523;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:13:13:5:5:8:8:0.615385:5:3:3:2:5:3:3:2
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chr17	37023896	.	G	A	144.02	PASS	AF=0.421053;AO=16;DP=38;FAO=16;FDP=38;FR=.;FRO=22;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=18;FWDB=-0.00216518;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.566;QD=15.1604;RBI=0.0169217;REFB=-0.00106557;REVB=0.0167826;RO=22;SAF=11;SAR=5;SRF=4;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.476336;STB=0.771041;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.000671128;OID=.;OPOS=37023896;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:22:22:16:16:0.421053:5:11:4:18:5:11:4:18
chr17	37070658	.	A	G	67.71	PASS	AF=0.2;AO=10;DP=50;FAO=10;FDP=50;FR=.;FRO=40;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=20;FSRR=20;FWDB=-0.051713;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=48.3839;QD=5.41707;RBI=0.0605973;REFB=-0.00392923;REVB=-0.0315881;RO=40;SAF=7;SAR=3;SRF=20;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.251364;STB=0.66495;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=0.00902505;OID=.;OPOS=37070658;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:50:50:40:40:10:10:0.2:3:7:20:20:3:7:20:20
chr17	37074932	.	C	T	139.52	PASS	AF=0.355556;AO=16;DP=45;FAO=16;FDP=45;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=0.0190946;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.578;QD=12.4016;RBI=0.0197184;REFB=0.00396302;REVB=0.00492052;RO=28;SAF=7;SAR=9;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106419;STB=0.573316;STBP=0.486;TYPE=snp;VARB=-0.00631728;OID=.;OPOS=37074932;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:28:29:16:16:0.355556:9:7:15:13:9:7:16:13
chr17	37076331	.	G	A	96.72	PASS	AF=0.387097;AO=12;DP=31;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=0.00739477;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.095;QD=12.4805;RBI=0.0355636;REFB=-0.0484384;REVB=0.0347863;RO=19;SAF=6;SAR=6;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192474;STB=0.612725;STBP=0.346;TYPE=snp;VARB=0.0454307;OID=.;OPOS=37076331;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:31:31:19:19:12:12:0.387097:6:6:6:13:6:6:6:13
chr17	37101380	.	T	C	659.23	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0248907;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=185.027;QD=61.324;RBI=0.0287428;REFB=0;REVB=0.0143736;RO=0;SAF=17;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.98888e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000155105;OID=.;OPOS=37101380;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:43:0:0:42:43:1:25:17:0:0:26:17:0:0
chr17	37313176	.	A	G	150.1	PASS	AF=0.516129;AO=16;DP=31;FAO=16;FDP=31;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=0.0308951;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.4414;QD=19.3678;RBI=0.0580161;REFB=0.0170074;REVB=-0.0491056;RO=15;SAF=8;SAR=8;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142319;STB=0.580547;STBP=0.378;TYPE=snp;VARB=-0.028536;OID=.;OPOS=37313176;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:15:15:16:16:0.516129:8:8:5:10:8:8:5:10
chr17	37316988	.	T	C	729.01	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00516655;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.18;QD=57.1775;RBI=0.00970927;REFB=0;REVB=-0.0082205;RO=0;SAF=27;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.82217e-06;OID=.;OPOS=37316988;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:24:27:0:0:24:27:0:0
chr17	37319029	.	T	G	594.53	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0315427;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.868;QD=60.9777;RBI=0.0417373;REFB=0;REVB=0.0273323;RO=0;SAF=13;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000174709;OID=.;OPOS=37319029;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:26:13:0:0:26:13:0:0
chr17	37319065	.	C	T	638.9	PASS	AF=0.976744;AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0101232;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.1177;QD=59.4327;RBI=0.0547019;REFB=-0.12293;REVB=0.053757;RO=1;SAF=12;SAR=30;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0153937;STB=0.508193;STBP=0.596;TYPE=snp;VARB=0.0021384;OID=.;OPOS=37319065;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:43:43:1:1:42:42:0.976744:30:12:0:1:30:12:0:1
chr17	37319103	.	T	C	632.25	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.004613;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=237.266;QD=61.6826;RBI=0.0165922;REFB=0;REVB=0.0159381;RO=0;SAF=13;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.66374e-05;OID=.;OPOS=37319103;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:28:13:0:0:28:13:0:0
chr17	37321961	.	C	T	292.79	PASS	AF=0.470588;AO=32;DP=68;FAO=32;FDP=68;FR=.;FRO=36;FSAF=8;FSAR=24;FSRF=7;FSRR=29;FWDB=-0.0261201;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=294.579;QD=17.2231;RBI=0.0272711;REFB=-0.00573621;REVB=0.00783948;RO=36;SAF=8;SAR=24;SRF=7;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0731349;STB=0.540792;STBP=0.635;TYPE=snp;VARB=0.00627385;OID=.;OPOS=37321961;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:36:36:32:32:0.470588:24:8:7:29:24:8:7:29
chr17	37334243	.	G	A	303.49	PASS	AF=0.563636;AO=31;DP=55;FAO=31;FDP=55;FR=.;FRO=24;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=0.00578593;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=81.2786;QD=22.0721;RBI=0.140926;REFB=0.0017676;REVB=0.140807;RO=22;SAF=19;SAR=12;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121586;STB=0.568817;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=0.000273617;OID=.;OPOS=37334243;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:22:24:31:31:0.563636:12:19:10:12:12:19:11:13
chr17	37349710	.	C	G	2649.0	PASS	AF=0.978022;AO=167;DP=172;FAO=178;FDP=182;FR=.;FRO=4;FSAF=22;FSAR=156;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0884572;FXX=0.00546418;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.134;QD=58.2198;RBI=0.0987808;REFB=-0.134729;REVB=0.0439656;RO=2;SAF=17;SAR=150;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0240055;STB=0.53032;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.00410063;OID=.;OPOS=37349710;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:172:182:2:4:167:178:0.978022:150:17:1:1:156:22:3:1
chr17	37410892	.	C	G	124.07	PASS	AF=0.272727;AO=18;DP=66;FAO=18;FDP=66;FR=.;FRO=48;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=34;FSRR=14;FWDB=-0.0409045;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.267;QD=7.51906;RBI=0.0450968;REFB=0.00398816;REVB=-0.0189878;RO=48;SAF=8;SAR=10;SRF=34;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.313099;STB=0.686089;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=-0.0151722;OID=.;OPOS=37410892;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:48:48:18:18:0.272727:10:8:34:14:10:8:34:14
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chr17	37830900	.	A	G	90.61	PASS	AF=0.266667;AO=11;DP=44;FAO=12;FDP=45;FR=.;FRO=33;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=-0.0370182;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=239.624;QD=8.05408;RBI=0.0452237;REFB=-0.000621616;REVB=0.0259776;RO=33;SAF=3;SAR=8;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.331843;STB=0.723753;STBP=0.081;TYPE=snp;VARB=0.00119474;OID=.;OPOS=37830900;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:90:44:45:33:33:11:12:0.266667:8:3:18:15:9:3:18:15
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chr17	38031674	.	C	T	150.35	PASS	AF=0.346939;AO=16;DP=48;FAO=17;FDP=49;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=0.0204368;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.574;QD=12.2732;RBI=0.0222636;REFB=-0.0076603;REVB=-0.00883205;RO=32;SAF=10;SAR=6;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.210769;STB=0.637518;STBP=0.168;TYPE=snp;VARB=0.0144903;OID=.;OPOS=38031674;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:49:32:32:16:17:0.346939:6:10:14:18:6:11:14:18
chr17	38033277	.	A	C	139.53	PASS	AF=0.355556;AO=11;DP=45;FAO=16;FDP=45;FR=.;FRO=29;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=0.00531937;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.901;QD=12.4024;RBI=0.00558292;REFB=-0.0239036;REVB=0.00169511;RO=26;SAF=5;SAR=6;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.227044;STB=0.677647;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=0.0303282;OID=.;OPOS=38033277;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:26:29:11:16:0.355556:6:5:17:9:11:5:17:12
chr17	38062196	.	G	A	122.13	PASS	AF=0.301887;AO=16;DP=53;FAO=16;FDP=53;FR=.;FRO=37;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=0.00256384;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=239.598;QD=9.21743;RBI=0.00414296;REFB=-0.00214259;REVB=-0.00325436;RO=37;SAF=4;SAR=12;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.325316;STB=0.696711;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.00372252;OID=.;OPOS=38062196;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:37:37:16:16:0.301887:12:4:19:18:12:4:19:18
chr17	38062217	.	C	T	107.27	PASS	AF=0.27451;AO=14;DP=52;FAO=14;FDP=51;FR=.;FRO=37;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=0.0188084;FXX=0.0192271;HRUN=4;LEN=1;MLLD=116.988;QD=8.41336;RBI=0.0195328;REFB=0.000807197;REVB=0.00527005;RO=35;SAF=4;SAR=10;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.279078;STB=0.654531;STBP=0.187;TYPE=snp;VARB=-0.00118773;OID=.;OPOS=38062217;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:51:35:37:14:14:0.27451:10:4:18:17:10:4:18:19
chr17	38064405	.	C	T	75.83	PASS	AF=0.211538;AO=11;DP=52;FAO=11;FDP=52;FR=.;FRO=41;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=-0.00832452;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.309;QD=5.83278;RBI=0.0213444;REFB=0.00436578;REVB=-0.0196541;RO=41;SAF=8;SAR=3;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.353052;STB=0.72686;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=-0.0100026;OID=.;OPOS=38064405;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:52:52:41:41:11:11:0.211538:3:8:18:23:3:8:18:23
chr17	38064469	.	T	C	83.51	PASS	AF=0.226415;AO=12;DP=53;FAO=12;FDP=53;FR=.;FRO=41;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=-0.0157421;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.598;QD=6.3024;RBI=0.028769;REFB=-0.011402;REVB=0.0240799;RO=38;SAF=8;SAR=4;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.236158;STB=0.640787;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.0382383;OID=.;OPOS=38064469;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:53:53:38:41:12:12:0.226415:4:8:18:20:4:8:20:21
chr17	38122680	.	G	T	41.82	PASS	AF=0.179487;AO=7;DP=39;FAO=7;FDP=39;FR=.;FRO=32;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=20;FWDB=0.00479605;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.796;QD=4.28888;RBI=0.00512532;REFB=-0.0123419;REVB=-0.00180741;RO=32;SAF=3;SAR=4;SRF=12;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0669247;STB=0.545328;STBP=0.896;TYPE=snp;VARB=0.0349719;OID=.;OPOS=38122680;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:39:39:32:32:7:7:0.179487:4:3:12:20:4:3:12:20
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chr17	38246286	.	A	G	594.54	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0146321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.17;QD=60.9785;RBI=0.014634;REFB=0;REVB=-0.000238938;RO=0;SAF=13;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.00615e-05;OID=.;OPOS=38246286;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:26:13:0:0:26:13:0:0
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chr17	38457151	.	G	A	58.27	PASS	AF=0.15493;AO=10;DP=70;FAO=11;FDP=71;FR=.;FRO=60;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=28;FSRR=32;FWDB=-0.0194693;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.224;QD=3.28307;RBI=0.0196309;REFB=-0.00825195;REVB=0.00251333;RO=57;SAF=7;SAR=3;SRF=25;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.317211;STB=0.642599;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=0.0350764;OID=.;OPOS=38457151;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:58:70:71:57:60:10:11:0.15493:3:7:25:32:4:7:28:32
chr17	38506139	.	G	A	492.31	PASS	AF=0.54023;AO=47;DP=87;FAO=47;FDP=87;FR=.;FRO=40;FSAF=31;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=18;FWDB=0.00353042;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.3863;QD=22.635;RBI=0.0282809;REFB=-0.0139711;REVB=-0.0280596;RO=40;SAF=31;SAR=16;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0981254;STB=0.55413;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.00781202;OID=.;OPOS=38506139;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:40:40:47:47:0.54023:16:31:22:18:16:31:22:18
chr17	38600092	.	G	A	105.86	PASS	AF=0.6;AO=12;DP=20;FAO=12;FDP=20;FR=.;FRO=8;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=-0.0146615;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.334;QD=21.1725;RBI=0.0230705;REFB=-0.00481352;REVB=0.0178125;RO=8;SAF=8;SAR=4;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177776;STB=0.59985;STBP=0.382;TYPE=snp;VARB=0.00139273;OID=.;OPOS=38600092;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:20:20:8:8:12:12:0.6:4:8:7:1:4:8:7:1
chr17	38784927	.	G	A	91.23	PASS	AF=0.52381;AO=11;DP=21;FAO=11;FDP=21;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=-0.00175279;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.446;QD=17.3771;RBI=0.0131353;REFB=-0.0130737;REVB=-0.0130178;RO=10;SAF=6;SAR=5;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0455781;STB=0.526268;STBP=0.865;TYPE=snp;VARB=0.0194149;OID=.;OPOS=38784927;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:21:21:10:10:11:11:0.52381:5:6:6:4:5:6:6:4
chr17	38855772	.	T	C	801.3	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00448488;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.402;QD=57.2355;RBI=0.042944;REFB=0;REVB=0.0427092;RO=0;SAF=31;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000199677;OID=.;OPOS=38855772;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:25:31:0:0:25:31:0:0
chr17	38857446	.	C	A	1395.9	PASS	AF=1;AO=88;DP=88;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0181015;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.743;QD=62.7369;RBI=0.0216785;REFB=0;REVB=0.0119287;RO=0;SAF=37;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.65065e-05;OID=.;OPOS=38857446;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:88:89:0:0:88:89:1:51:37:0:0:51:38:0:0
chr17	38858134	.	CA	C	1051.81	PASS	AF=1;AO=70;DP=72;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0672226;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.848;QD=56.8545;RBI=0.067785;REFB=0;REVB=-0.00871394;RO=0;SAF=10;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=7.34814e-05;OID=.;OPOS=38858135;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:70:72:74:74:0:11:63:0:0:6:0:10:60:0:0
chr17	38911212	.	G	A	804.65	PASS	AF=1;AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0152024;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.223;QD=57.4749;RBI=0.0158505;REFB=0;REVB=-0.00448613;RO=0;SAF=25;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.49943e-05;OID=.;OPOS=38911212;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:57:56:0:0:56:56:1:31:25:0:0:31:25:0:0
chr17	38911327	.	C	G	310.59	PASS	AF=0.584906;AO=31;DP=53;FAO=31;FDP=53;FR=.;FRO=22;FSAF=21;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.0351716;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.465;QD=23.4407;RBI=0.0355722;REFB=0.0335644;REVB=0.00532352;RO=22;SAF=21;SAR=10;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0721972;STB=0.539892;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=-0.0253532;OID=.;OPOS=38911327;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:22:22:31:31:0.584906:10:21:13:9:10:21:13:9
chr17	38911363	.	G	A	72.72	PASS	AF=0.277778;AO=10;DP=37;FAO=10;FDP=36;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=0.00545372;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.9954;QD=8.07982;RBI=0.0599892;REFB=0.0102914;REVB=0.0597407;RO=27;SAF=5;SAR=5;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108765;STB=0.583171;STBP=0.584;TYPE=snp;VARB=-0.026625;OID=.;OPOS=38911363;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:37:36:27:26:10:10:0.277778:5:5:16:11:5:5:16:10
chr17	38928014	.	A	G	862.69	PASS	AF=0.666667;AO=75;DP=114;FAO=76;FDP=114;FR=.;FRO=38;FSAF=27;FSAR=49;FSRF=11;FSRR=27;FWDB=0.00128399;FXX=0.0086949;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.979;QD=30.2699;RBI=0.00344152;REFB=0.0133643;REVB=-0.00319302;RO=39;SAF=26;SAR=49;SRF=11;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0459333;STB=0.524266;STBP=0.496;TYPE=snp;VARB=-0.00900379;OID=.;OPOS=38928014;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:114:114:39:38:75:76:0.666667:49:26:11:28:49:27:11:27
chr17	38935812	.	A	G,T	686.57	PASS	AF=0.941176,0.0392157;AO=48,2;DP=51;FAO=48,2;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=23,1;FSAR=25,1;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0395218,0.0568525;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=82.9375,32.8044;QD=53.8487;RBI=0.0434116,0.0589506;REFB=-0.183706,-0.211432;REVB=-0.0179609,-0.0155874;RO=0;SAF=23,1;SAR=25,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5098,0.665164;STBP=0.516,0.662;TYPE=snp,snp;VARB=0.0115435,0.18178;OID=.,.;OPOS=38935812,38935812;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:51:51:0:1:48,2:48,2:0.941176,0.0392157:25,1:23,1:0:0:25,1:23,1:0:1
chr17	38936659	.	C	T	135.82	PASS	AF=0.292308;AO=19;DP=65;FAO=19;FDP=65;FR=.;FRO=46;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=25;FSRR=21;FWDB=0.0279435;FXX=0.0151492;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.081;QD=8.35835;RBI=0.028847;REFB=0.000316361;REVB=0.00716277;RO=46;SAF=12;SAR=7;SRF=25;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107721;STB=0.564637;STBP=0.581;TYPE=snp;VARB=-0.000660593;OID=.;OPOS=38936659;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:46:46:19:19:0.292308:7:12:25:21:7:12:25:21
chr17	38938316	.	C	T	65.78	PASS	AF=0.391304;AO=9;DP=23;FAO=9;FDP=23;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.0354136;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.556;QD=11.4402;RBI=0.0355436;REFB=0.00193731;REVB=-0.0030371;RO=14;SAF=4;SAR=5;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0910242;STB=0.554337;STBP=0.76;TYPE=snp;VARB=-0.00266519;OID=.;OPOS=38938316;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:23:23:14:14:9:9:0.391304:5:4:5:9:5:4:5:9
chr17	38938591	.	C	G	181.52	PASS	AF=0.6;AO=18;DP=30;FAO=18;FDP=30;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=0.00218089;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.737;QD=24.2024;RBI=0.0196045;REFB=-0.0152282;REVB=0.0194828;RO=12;SAF=6;SAR=12;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0689653;STB=0.53842;STBP=0.673;TYPE=snp;VARB=0.005654;OID=.;OPOS=38938591;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:30:30:12:12:18:18:0.6:12:6:3:9:12:6:3:9
chr17	38950272	.	T	C	356.18	PASS	AF=0.553846;AO=36;DP=65;FAO=36;FDP=65;FR=.;FRO=29;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=0.00812897;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.876;QD=21.9191;RBI=0.0122151;REFB=-0.0158304;REVB=-0.00911748;RO=29;SAF=16;SAR=20;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0868134;STB=0.547918;STBP=0.431;TYPE=snp;VARB=0.00960037;OID=.;OPOS=38950272;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:29:29:36:36:0.553846:20:16:16:13:20:16:16:13
chr17	38955961	.	G	A	208.6	PASS	AF=0.76;AO=19;DP=25;FAO=19;FDP=25;FR=.;FRO=6;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.0177693;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.956;QD=33.3755;RBI=0.0182506;REFB=0.024489;REVB=0.00416358;RO=6;SAF=9;SAR=10;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0115032;STB=0.506322;STBP=0.928;TYPE=snp;VARB=-0.00776296;OID=.;OPOS=38955961;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:25:25:6:6:19:19:0.76:10:9:3:3:10:9:3:3
chr17	38978536	.	A	C	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0107546;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.064;QD=47.8223;RBI=0.0118013;REFB=0;REVB=-0.00485884;RO=0;SAF=7;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.2683e-05;OID=.;OPOS=38978536;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:9:7:0:0:9:7:0:0
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chr17	38991003	.	T	C	857.11	PASS	AF=0.533333;AO=80;DP=150;FAO=80;FDP=150;FR=.;FRO=70;FSAF=40;FSAR=40;FSRF=23;FSRR=47;FWDB=0.0119864;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.647;QD=22.8563;RBI=0.01256;REFB=-0.0132906;REVB=0.00375235;RO=70;SAF=40;SAR=40;SRF=23;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146387;STB=0.579981;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=0.00971639;OID=.;OPOS=38991003;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:150:150:70:70:80:80:0.533333:40:40:23:47:40:40:23:47
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chr17	39140272	.	A	G	305.06	PASS	AF=0.357143;AO=35;DP=96;FAO=35;FDP=98;FR=.;FRO=63;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=35;FSRR=28;FWDB=-0.0397312;FXX=0.0101;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.618;QD=12.4514;RBI=0.0471087;REFB=-0.0197803;REVB=-0.0253112;RO=61;SAF=18;SAR=17;SRF=34;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0478503;STB=0.526578;STBP=0.71;TYPE=snp;VARB=0.0333227;OID=.;OPOS=39140272;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:98:61:63:35:35:0.357143:17:18:34:27:17:18:35:28
chr17	39150284	.	A	G	83.5	PASS	AF=0.226415;AO=12;DP=53;FAO=12;FDP=53;FR=.;FRO=41;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=26;FWDB=-0.00996917;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.873;QD=6.30197;RBI=0.0735171;REFB=-0.016546;REVB=-0.072838;RO=40;SAF=6;SAR=6;SRF=15;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153383;STB=0.603608;STBP=0.439;TYPE=snp;VARB=0.044287;OID=.;OPOS=39150284;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:53:53:40:41:12:12:0.226415:6:6:15:25:6:6:15:26
chr17	39150357	.	A	G	102.29	PASS	AF=0.288889;AO=13;DP=45;FAO=13;FDP=45;FR=.;FRO=32;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=-0.0356042;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.872;QD=9.0926;RBI=0.0369449;REFB=-0.00563371;REVB=-0.00986218;RO=32;SAF=8;SAR=5;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171896;STB=0.604649;STBP=0.376;TYPE=snp;VARB=0.0195709;OID=.;OPOS=39150357;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:32:32:13:13:0.288889:5:8:15:17:5:8:15:17
chr17	39155881	.	C	T	67.06	PASS	AF=0.196078;AO=10;DP=51;FAO=10;FDP=51;FR=.;FRO=41;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=33;FSRR=8;FWDB=0.00942662;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=117.193;QD=5.25999;RBI=0.0213305;REFB=-0.010547;REVB=-0.0191345;RO=41;SAF=4;SAR=6;SRF=33;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.486373;STB=0.798125;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=0.024975;OID=.;OPOS=39155881;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:51:51:41:41:10:10:0.196078:6:4:33:8:6:4:33:8
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chr17	39274518	.	C	T	215.88	PASS	AF=0.281818;AO=31;DP=110;FAO=31;FDP=110;FR=.;FRO=79;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=31;FSRR=48;FWDB=-0.0150745;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.78;QD=7.85029;RBI=0.0153007;REFB=-0.0109313;REVB=0.00262111;RO=79;SAF=11;SAR=20;SRF=31;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0486809;STB=0.528948;STBP=0.713;TYPE=snp;VARB=0.0284471;OID=.;OPOS=39274518;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:110:79:79:31:31:0.281818:20:11:31:48:20:11:31:48
chr17	39279841	.	G	A	271.56	PASS	AF=0.517857;AO=29;DP=56;FAO=29;FDP=56;FR=.;FRO=27;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.0109375;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.308;QD=19.3972;RBI=0.0122005;REFB=-0.0147814;REVB=-0.00540598;RO=27;SAF=17;SAR=12;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154579;STB=0.586147;STBP=0.218;TYPE=snp;VARB=0.0221932;OID=.;OPOS=39279841;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:27:27:29:29:0.517857:12:17:11:16:12:17:11:16
chr17	39279921	.	A	G	81.62	PASS	AF=0.555556;AO=8;DP=20;FAO=10;FDP=18;FR=.,HEALED;FRO=8;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=0.133464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.999;QD=18.1388;RBI=0.133848;REFB=-0.072006;REVB=0.0101332;RO=10;SAF=4;SAR=4;SRF=1;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.38401;STB=0.701759;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=0.0361291;OID=.;OPOS=39279921;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:20:18:10:8:8:10:0.555556:4:4:1:9:4:6:1:7
chr17	39296125	.	G	A	101.9	PASS	AF=0.282609;AO=13;DP=46;FAO=13;FDP=46;FR=.;FRO=33;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=-0.0296081;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.733;QD=8.86109;RBI=0.0395051;REFB=-0.0173299;REVB=-0.0261536;RO=33;SAF=2;SAR=11;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.420387;STB=0.762805;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.0353083;OID=.;OPOS=39296125;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:33:33:13:13:0.282609:11:2:15:18:11:2:15:18
chr17	39305956	.	G	A	144.77	PASS	AF=0.432432;AO=16;DP=37;FAO=16;FDP=37;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=-0.0314444;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.214;QD=15.6506;RBI=0.109919;REFB=-0.0365371;REVB=0.105325;RO=21;SAF=10;SAR=6;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0552059;STB=0.531874;STBP=0.762;TYPE=snp;VARB=0.025488;OID=.;OPOS=39305956;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:21:21:16:16:0.432432:6:10:12:9:6:10:12:9
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chr17	39340707	.	C	T	598.85	PASS	AF=1;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0446406;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.145;QD=61.4204;RBI=0.0495106;REFB=0;REVB=-0.0214128;RO=0;SAF=24;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000116624;OID=.;OPOS=39340707;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:39:0:0:39:39:1:15:24:0:0:15:24:0:0
chr17	39340812	.	T	C	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0410737;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.36;QD=35.5757;RBI=0.0463109;REFB=0;REVB=0.0213928;RO=0;SAF=2;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.27427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00214843;OID=.;OPOS=39340812;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:5:2:0:0:5:2:0:0
chr17	39340910	.	T	C	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0274349;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.893;QD=40.7629;RBI=0.0312034;REFB=0;REVB=0.0148653;RO=0;SAF=4;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000112793;OID=.;OPOS=39340910;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:6:4:0:0:6:4:0:0
chr17	39341158	.	G	A	575.75	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0146841;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.3846;QD=60.6052;RBI=0.0178183;REFB=0;REVB=-0.010093;RO=0;SAF=18;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.51048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000125219;OID=.;OPOS=39341158;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:20:18:0:0:20:18:0:0
chr17	39341266	.	A	G	340.73	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0166171;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.646;QD=54.517;RBI=0.0251001;REFB=0;REVB=0.0188119;RO=0;SAF=17;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.48543e-05;OID=.;OPOS=39341266;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:8:17:0:0:8:17:0:0
chr17	39341293	.	AT	A,AA	319.74	PASS	AF=0.0833333,0.916667;AO=7,17;DP=24;FAO=2,22;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=2,12;FSAR=0,10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0109203,0.0329882;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=278.157,289.583;QD=53.2901;RBI=0.0113319,0.0330674;REFB=0,0;REVB=-0.00302647,-0.00228793;RO=0;SAF=6,8;SAR=1,9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-4.126e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0237884,0.0027148;OID=.,.;OPOS=39341294,39341294;OREF=T,T;OALT=-,A;OMAPALT=A,AA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0833333,0.916667:7,17:24:2,22:24:0:2,12:0,10:0:0:6:0:6,8:1,9:0:0
chr17	39341473	.	G	C	198.41	PASS	AF=0.465116;AO=20;DP=44;FAO=20;FDP=43;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.002746;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.3939;QD=18.4567;RBI=0.0149199;REFB=-0.00726579;REVB=0.014665;RO=23;SAF=9;SAR=11;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108155;STB=0.561424;STBP=0.468;TYPE=snp;VARB=0.00857375;OID=.;OPOS=39341473;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:43:23:23:20:20:0.465116:11:9:13:10:11:9:13:10
chr17	39346518	.	T	C	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0631047;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.405;QD=47.8215;RBI=0.0632245;REFB=0;REVB=0.00389036;RO=0;SAF=8;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000672717;OID=.;OPOS=39346518;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:8:8:0:0:8:8:0:0
chr17	39383335	.	C	G	64.88	PASS	AF=0.375;AO=9;DP=24;FAO=9;FDP=24;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=3;FWDB=-0.00123371;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.4191;QD=10.8133;RBI=0.0389265;REFB=-0.0529357;REVB=0.0389069;RO=15;SAF=6;SAR=3;SRF=12;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168645;STB=0.5998;STBP=0.564;TYPE=snp;VARB=0.0530783;OID=.;OPOS=39383335;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:24:24:15:15:9:9:0.375:3:6:12:3:3:6:12:3
chr17	39388852	.	T	C	74.97	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.012667;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.5428;QD=37.4874;RBI=0.037744;REFB=0;REVB=0.035555;RO=0;SAF=1;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.78849e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00360128;OID=.;OPOS=39388852;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:7:1:0:0:7:1:0:0
chr17	39389422	.	C	G	1101.43	PASS	AF=0.641379;AO=93;DP=148;FAO=93;FDP=145;FR=.;FRO=52;FSAF=53;FSAR=40;FSRF=35;FSRR=17;FWDB=0.0180022;FXX=0.0202689;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.112;QD=30.3842;RBI=0.0183337;REFB=-0.0247605;REVB=-0.0034706;RO=49;SAF=53;SAR=40;SRF=33;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0683942;STB=0.538136;STBP=0.239;TYPE=snp;VARB=0.0116547;OID=.;OPOS=39389422;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:148:145:49:52:93:93:0.641379:40:53:33:16:40:53:35:17
chr17	39394674	.	A	G	104.38	PASS	AF=0.325;AO=13;DP=40;FAO=13;FDP=40;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=18;FWDB=-0.00614495;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.543;QD=10.4383;RBI=0.0262239;REFB=0.00665637;REVB=0.0254938;RO=26;SAF=8;SAR=5;SRF=8;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.332952;STB=0.683747;STBP=0.149;TYPE=snp;VARB=-0.02436;OID=.;OPOS=39394674;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:26:27:13:13:0.325:5:8:8:18:5:8:9:18
chr17	39406409	.	C	A	453.42	PASS	AF=0.421488;AO=51;DP=120;FAO=51;FDP=121;FR=.;FRO=70;FSAF=30;FSAR=21;FSRF=27;FSRR=43;FWDB=-0.00688333;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.988;QD=14.9891;RBI=0.0458396;REFB=-0.00631027;REVB=0.0453198;RO=69;SAF=30;SAR=21;SRF=26;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214382;STB=0.615932;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.00832252;OID=.;OPOS=39406409;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:121:69:70:51:51:0.421488:21:30:26:43:21:30:27:43
chr17	39406447	.	A	G	478.16	PASS	AF=0.424;AO=53;DP=124;FAO=53;FDP=125;FR=.;FRO=72;FSAF=31;FSAR=22;FSRF=33;FSRR=39;FWDB=0.0117782;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.394;QD=15.301;RBI=0.0120837;REFB=-0.0151376;REVB=-0.00270004;RO=71;SAF=31;SAR=22;SRF=33;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123243;STB=0.573176;STBP=0.191;TYPE=snp;VARB=0.0170662;OID=.;OPOS=39406447;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:124:125:71:72:53:53:0.424:22:31:33:38:22:31:33:39
chr17	39406567	.	C	A	217.1	PASS	AF=0.279279;AO=31;DP=111;FAO=31;FDP=111;FR=.;FRO=80;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=35;FSRR=45;FWDB=-0.0115844;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.453;QD=7.82328;RBI=0.0118461;REFB=-0.00600792;REVB=0.00247659;RO=79;SAF=13;SAR=18;SRF=34;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0136505;STB=0.51336;STBP=0.877;TYPE=snp;VARB=0.0170438;OID=.;OPOS=39406567;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:111:79:80:31:31:0.279279:18:13:34:45:18:13:35:45
chr17	39406589	.	A	G	1677.01	PASS	AF=1;AO=110;DP=110;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0179936;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.088;QD=60.4328;RBI=0.0185685;REFB=0;REVB=0.00458478;RO=0;SAF=44;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6109e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.14434e-05;OID=.;OPOS=39406589;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:110:111:0:0:110:111:1:66:44:0:0:66:45:0:0
chr17	39406673	.	T	G	917.07	PASS	AF=0.576389;AO=83;DP=144;FAO=83;FDP=144;FR=.;FRO=61;FSAF=25;FSAR=58;FSRF=27;FSRR=34;FWDB=0.0120417;FXX=0.00689608;HRUN=4;LEN=1;MLLD=101.993;QD=25.4743;RBI=0.0120941;REFB=-0.0140507;REVB=0.00112478;RO=59;SAF=25;SAR=58;SRF=25;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105801;STB=0.567327;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.017078;OID=.;OPOS=39406673;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:144:144:59:61:83:83:0.576389:58:25:25:34:58:25:27:34
chr17	39412372	.	G	C	247.52	PASS	AF=0.348837;AO=30;DP=86;FAO=30;FDP=86;FR=.;FRO=56;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=32;FWDB=-0.0203478;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.2715;QD=11.5127;RBI=0.0233993;REFB=0.008102;REVB=-0.011554;RO=56;SAF=16;SAR=14;SRF=24;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117497;STB=0.567856;STBP=0.362;TYPE=snp;VARB=-0.0138665;OID=.;OPOS=39412372;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:56:56:30:30:0.348837:14:16:24:32:14:16:24:32
chr17	39422677	.	C	T	1132.6	PASS	AF=1;AO=75;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0753753;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.266;QD=58.8364;RBI=0.0762564;REFB=0;REVB=-0.0115586;RO=1;SAF=35;SAR=40;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133266;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00133406;OID=.;OPOS=39422677;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:77:1:0:75:77:1:40:35:1:0:40:37:0:0
chr17	39432562	.	A	T	129.87	PASS	AF=0.384615;AO=15;DP=39;FAO=15;FDP=39;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=-0.0104333;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=163.345;QD=13.3197;RBI=0.0254682;REFB=-0.00776594;REVB=0.023233;RO=23;SAF=11;SAR=4;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.362328;STB=0.722882;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.0124683;OID=.;OPOS=39432562;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:23:24:15:15:0.384615:4:11:9:14:4:11:9:15
chr17	39458476	.	A	T	725.55	PASS	AF=0.60177;AO=68;DP=113;FAO=68;FDP=113;FR=.;FRO=45;FSAF=37;FSAR=31;FSRF=15;FSRR=30;FWDB=0.0160403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.751;QD=25.6831;RBI=0.0358896;REFB=-0.0107527;REVB=-0.0321056;RO=45;SAF=37;SAR=31;SRF=15;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153461;STB=0.583331;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.00851863;OID=.;OPOS=39458476;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:113:45:45:68:68:0.60177:31:37:15:30:31:37:15:30
chr17	39458573	.	TGTACAGATGGTTG	T	346.5	PASS	AF=0.507042;AO=36;DP=73;FAO=36;FDP=71;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=-0.0126906;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=13;MLLD=366.505;QD=19.5208;RBI=0.013421;REFB=-0.0103479;REVB=-0.00436723;RO=35;SAF=13;SAR=23;SRF=13;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00987902;STB=0.505491;STBP=0.941;TYPE=del;VARB=0.00990384;OID=.;OPOS=39458574;OREF=GTACAGATGGTTG;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.507042:36:73:36:71:35:13:23:13:22:99:35:13:23:13:22
chr17	39458765	.	A	G	45.06	PASS	AF=0.304348;AO=7;DP=23;FAO=7;FDP=23;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=-0.00268148;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.336;QD=7.83716;RBI=0.021248;REFB=-0.00164552;REVB=-0.0210781;RO=16;SAF=4;SAR=3;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0613202;STB=0.538354;STBP=0.868;TYPE=snp;VARB=0.00589611;OID=.;OPOS=39458765;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:23:23:16:16:7:7:0.304348:3:4:10:6:3:4:10:6
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chr17	39464487	.	G	C	282.67	PASS	AF=0.641026;AO=25;DP=39;FAO=25;FDP=39;FR=.;FRO=14;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.0204927;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.725;QD=28.9918;RBI=0.0751154;REFB=-0.0228144;REVB=0.0722659;RO=14;SAF=9;SAR=16;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0958234;STB=0.552873;STBP=0.378;TYPE=snp;VARB=0.0130056;OID=.;OPOS=39464487;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:14:14:25:25:0.641026:16:9:7:7:16:9:7:7
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chr17	39471929	.	G	A	72.93	PASS	AF=0.642857;AO=9;DP=14;FAO=9;FDP=14;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.00373417;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=250.645;QD=20.8374;RBI=0.0152728;REFB=-0.0196857;REVB=-0.0148093;RO=5;SAF=3;SAR=6;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.289354;STB=0.666296;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.0127429;OID=.;OPOS=39471929;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:14:14:5:5:9:9:0.642857:6:3:4:1:6:3:4:1
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chr17	39578424	.	G	T	198.7	PASS	AF=0.487805;AO=20;DP=41;FAO=20;FDP=41;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=0.0362821;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=224.758;QD=19.3852;RBI=0.0364906;REFB=-0.0213203;REVB=-0.00389524;RO=21;SAF=11;SAR=9;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0196241;STB=0.5111;STBP=0.89;TYPE=snp;VARB=0.0207194;OID=.;OPOS=39578424;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:21:21:20:20:0.487805:9:11:12:9:9:11:12:9
chr17	39579059	.	G	A	116.66	PASS	AF=0.35;AO=14;DP=40;FAO=14;FDP=40;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.0367533;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.444;QD=11.6655;RBI=0.0483791;REFB=-0.000828127;REVB=0.0314599;RO=26;SAF=6;SAR=8;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0366241;STB=0.521708;STBP=0.824;TYPE=snp;VARB=0.000993283;OID=.;OPOS=39579059;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:26:26:14:14:0.35:8:6:12:14:8:6:12:14
chr17	39579112	.	G	A	206.02	PASS	AF=0.428571;AO=21;DP=49;FAO=21;FDP=49;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=0.0620492;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.2397;QD=16.818;RBI=0.0704241;REFB=0.03239;REVB=0.0333083;RO=28;SAF=9;SAR=12;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.073897;STB=0.542129;STBP=0.63;TYPE=snp;VARB=-0.0148548;OID=.;OPOS=39579112;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:28:28:21:21:0.428571:12:9:10:18:12:9:10:18
chr17	39580559	.	T	A	504.98	PASS	AF=0.661765;AO=45;DP=68;FAO=45;FDP=68;FR=.;FRO=23;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=6;FSRR=17;FWDB=0.0122781;FXX=0.0285673;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.833;QD=29.7045;RBI=0.0122785;REFB=-0.0134509;REVB=-0.000106416;RO=23;SAF=21;SAR=24;SRF=6;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130208;STB=0.570546;STBP=0.118;TYPE=snp;VARB=0.00347971;OID=.;OPOS=39580559;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:23:23:45:45:0.661765:24:21:6:17:24:21:6:17
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chr17	39580660	.	T	C	134.96	PASS	AF=0.636364;AO=14;DP=23;FAO=14;FDP=22;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=-0.00535957;FXX=0.0434594;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.245;QD=24.5373;RBI=0.026096;REFB=-0.00557598;REVB=-0.0255397;RO=8;SAF=6;SAR=8;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120515;STB=0.567474;STBP=0.424;TYPE=snp;VARB=0.00217328;OID=.;OPOS=39580660;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:23:22:8:8:14:14:0.636364:8:6:2:6:8:6:2:6
chr17	39593768	.	A	G	811.38	PASS	AF=0.966667;AO=58;DP=60;FAO=58;FDP=60;FR=.;FRO=2;FSAF=19;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0247793;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.348;QD=54.0922;RBI=0.0275691;REFB=0.0449783;REVB=-0.0120846;RO=0;SAF=19;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.47594e-08;STB=0.506491;STBP=0.601;TYPE=snp;VARB=-0.0101684;OID=.;OPOS=39593768;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:60:60:0:2:58:58:0.966667:39:19:0:0:39:19:1:1
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chr17	39619093	.	GT	AC	598.21	PASS	AF=1;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0281059;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=2;MLLD=276.838;QD=61.3548;RBI=0.0323874;REFB=0;REVB=0.0160935;RO=0;SAF=24;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000131502;OID=.;OPOS=39619093;OREF=GT;OALT=AC;OMAPALT=AC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:39:0:0:39:39:1:15:24:0:0:15:24:0:0
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chr17	39619219	.	G	A	1270.35	PASS	AF=1;AO=81;DP=81;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00810335;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.644;QD=61.9683;RBI=0.0518866;REFB=0;REVB=0.0512499;RO=0;SAF=43;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18592e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000202155;OID=.;OPOS=39619219;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:82:0:0:81:82:1:38:43:0:0:38:44:0:0
chr17	39622068	.	G	T	1766.27	PASS	AF=1;AO=116;DP=116;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000216803;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=80.8603;QD=60.9059;RBI=0.0171478;REFB=0;REVB=-0.0171465;RO=0;SAF=53;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.14374e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.1152e-05;OID=.;OPOS=39622068;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:116:116:0:0:116:116:1:63:53:0:0:63:53:0:0
chr17	39633317	.	A	G	326.16	PASS	AF=0.961538;AO=23;DP=24;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0131656;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.4898;QD=50.1776;RBI=0.0215274;REFB=-0.0619271;REVB=0.0170321;RO=1;SAF=15;SAR=8;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0543643;STB=0.52379;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=0.00678445;OID=.;OPOS=39633317;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:24:26:1:1:23:25:0.961538:8:15:0:1:10:15:0:1
chr17	39633354	.	C	T	517.34	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0145606;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.586;QD=59.1246;RBI=0.0201967;REFB=0;REVB=-0.0139963;RO=0;SAF=17;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.63692e-06;OID=.;OPOS=39633354;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:35:0:0:34:35:1:17:17:0:0:18:17:0:0
chr17	39646021	.	A	G	648.02	PASS	AF=0.955556;AO=43;DP=45;FAO=43;FDP=45;FR=.;FRO=2;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0456947;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.207;QD=57.6021;RBI=0.0466123;REFB=-0.122727;REVB=0.00920304;RO=2;SAF=18;SAR=25;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.036096;STB=0.519222;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.00230134;OID=.;OPOS=39646021;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:45:45:2:2:43:43:0.955556:25:18:0:2:25:18:0:2
chr17	39659194	.	T	C	1008.33	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0079392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.727;QD=59.3133;RBI=0.012983;REFB=0;REVB=0.0102727;RO=0;SAF=43;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.14061e-06;OID=.;OPOS=39659194;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:25:43:0:0:25:43:0:0
chr17	39659913	.	G	A	729.0	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.018681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.828;QD=57.1768;RBI=0.0214108;REFB=0;REVB=0.0104616;RO=0;SAF=26;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94283e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000357974;OID=.;OPOS=39659913;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:25:26:0:0:25:26:0:0
chr17	39661689	.	G	A	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0379934;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.736;QD=35.5759;RBI=0.0431637;REFB=0;REVB=0.0204844;RO=0;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000450949;OID=.;OPOS=39661689;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:4:3:0:0:4:3:0:0
chr17	39670912	.	G	C	708.38	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0362855;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.9072;QD=62.9673;RBI=0.0405899;REFB=0;REVB=-0.0181907;RO=0;SAF=10;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.64128e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00082101;OID=.;OPOS=39670912;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:35:10:0:0:35:10:0:0
chr17	39674641	.	T	C	1476.54	PASS	AF=0.989474;AO=94;DP=95;FAO=94;FDP=95;FR=.;FRO=1;FSAF=54;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00401222;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.759;QD=62.1703;RBI=0.0136321;REFB=0.0130169;REVB=-0.0130283;RO=1;SAF=54;SAR=40;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0117059;STB=0.506171;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=-0.000112161;OID=.;OPOS=39674641;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:95:95:1:1:94:94:0.989474:40:54:0:1:40:54:0:1
chr17	39681475	.	A	G	572.35	PASS	AF=1;AO=37;DP=39;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0319012;FXX=0.0499875;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.85;QD=60.2472;RBI=0.0516793;REFB=0;REVB=0.0406579;RO=0;SAF=13;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000976123;OID=.;OPOS=39681475;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:38:0:0:37:38:1:24:13:0:0:25:13:0:0
chr17	39684321	.	G	C	69.9	PASS	AF=0.888889;AO=8;DP=9;FAO=8;FDP=9;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0916263;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=40.1481;QD=31.0679;RBI=0.0973377;REFB=-0.100723;REVB=-0.032852;RO=1;SAF=4;SAR=4;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0978599;STB=0.555418;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.00918592;OID=.;OPOS=39684321;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:9:9:1:1:8:8:0.888889:4:4:1:0:4:4:1:0
chr17	39684409	.	AG	AA,A	114.12	PASS	AF=0.909091,0.0909091;AO=8,3;DP=11;FAO=10,1;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=5,0;FSAR=5,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.125886,-0.0622758;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=43.8219,31.4142;QD=41.4964;RBI=0.142103,0.0772854;REFB=0,0;REVB=-0.0659245,-0.0457685;RO=0;SAF=3,2;SAR=5,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.46938e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,del;VARB=0.0136764,0.00490304;OID=.,.;OPOS=39684410,39684410;OREF=G,G;OALT=A,-;OMAPALT=AA,A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.909091,0.0909091:8,3:11:10,1:11:0:5,0:5,1:0:0:5:0:3,2:5,1:0:0
chr17	39723990	.	T	A	175.42	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000956734;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.7621;QD=46.7789;RBI=0.00450982;REFB=0;REVB=0.00440717;RO=0;SAF=7;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000213084;OID=.;OPOS=39723990;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:8:7:0:0:8:7:0:0
chr17	39727816	.	T	G	389.11	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.096346;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.211;QD=55.5875;RBI=0.103512;REFB=0;REVB=0.0378452;RO=0;SAF=13;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00132725;OID=.;OPOS=39727816;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:15:13:0:0:15:13:0:0
chr17	39728050	.	G	A	221.91	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=47.0092;QD=49.3133;RBI=0.0452979;REFB=0;REVB=-0.0452979;RO=0;SAF=0;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00150978;OID=.;OPOS=39728050;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:18:0:0:0:18:0:0:0
chr17	39742718	.	A	G	786.12	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0134604;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.582;QD=64.1734;RBI=0.0157696;REFB=0;REVB=-0.00821568;RO=0;SAF=22;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.59084e-05;OID=.;OPOS=39742718;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:49:0:0:48:49:1:26:22:0:0:26:23:0:0
chr17	39742894	.	G	A	111.68	PASS	AF=1;AO=10;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0105309;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=306.777;QD=40.6119;RBI=0.018688;REFB=0;REVB=0.0154384;RO=0;SAF=4;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000121302;OID=.;OPOS=39742894;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:10:11:1:6:4:0:0:7:4:0:0
chr17	39742898	.	GC	AT	106.12	PASS	AF=1;AO=10;DP=11;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0915707;FXX=0.0908265;HRUN=1;LEN=2;MLLD=112.442;QD=42.4477;RBI=0.132106;REFB=0;REVB=0.0952198;RO=0;SAF=3;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.00474205;OID=.;OPOS=39742898;OREF=GC;OALT=AT;OMAPALT=AT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:10:0:0:10:10:1:7:3:0:0:7:3:0:0
chr17	39743081	.	G	A	994.59	PASS	AF=0.985507;AO=68;DP=69;FAO=68;FDP=69;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.045575;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.621;QD=57.6571;RBI=0.0654802;REFB=-0.15061;REVB=0.0470168;RO=1;SAF=26;SAR=42;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0111219;STB=0.505881;STBP=0.537;TYPE=snp;VARB=0.000602212;OID=.;OPOS=39743081;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:69:69:1:1:68:68:0.985507:42:26:0:1:42:26:0:1
chr17	39766504	.	A	G	322.46	PASS	AF=1;AO=20;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0410063;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=37.9222;QD=53.7436;RBI=0.133054;REFB=0;REVB=-0.126577;RO=0;SAF=11;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00409025;OID=.;OPOS=39766504;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:20:24:1:9:11:0:0:9:15:0:0
chr17	39767744	.	A	G	358.13	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0287969;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.157;QD=55.097;RBI=0.0375101;REFB=0;REVB=-0.0240364;RO=0;SAF=13;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.09568e-05;OID=.;OPOS=39767744;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:13:13:0:0:13:13:0:0
chr17	39768737	.	A	AC,C	44.33	PASS	AF=0.5,0;AO=5,3;DP=20;FAO=9,0;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=1,0;FSAR=8,0;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.0304837,0.00770372;FXX=0;HRUN=0,1;LEN=1,1;MLLD=40.8536,155.309;QD=9.85126;RBI=0.100952,0.00840133;REFB=-0.0153531,-0.0153146;REVB=0.0962397,0.00335187;RO=12;SAF=1,0;SAR=4,3;SRF=5;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.27779,-0.613239;STB=0.799199,0.5;STBP=0.046,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.14632,0;OID=.,.;OPOS=39768738,39768737;OREF=-,A;OALT=C,C;OMAPALT=AC,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:20:18:12:9:5,3:9,0:0.5,0:4,3:1,0:5:7:8,0:1,0:5:4
chr17	39780386	.	CCG	C,CCC	62.03	PASS	AF=0.3,0;AO=8,2;DP=43;FAO=12,0;FDP=40;FR=.;FRO=28;FSAF=7,0;FSAR=5,0;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=-0.0316461,0.105954;FXX=0.0243843;HRUN=4,4;LEN=2,1;MLLD=26.7336,23.1004;QD=6.20297;RBI=0.121044,0.111972;REFB=-0.0828235,-0.0150976;REVB=-0.116834,-0.0362137;RO=31;SAF=4,1;SAR=4,1;SRF=13;SRR=18;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0974917,0.0716227;STB=0.654226,0.5;STBP=0.226,1;TYPE=del,snp;VARB=0.186248,0;OID=.,.;OPOS=39780387,39780388;OREF=CG,G;OALT=-,C;OMAPALT=C,CCC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.3,0:8,2:43:12,0:40:28:7,0:5,0:10:18:62:31:4,1:4,1:13:18
chr17	39786864	.	CG	C,CA,CC	626.63	PASS	AF=0.95122,0.0487805,0;AO=23,17,2;DP=42;FAO=39,2,0;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=25,2,0;FSAR=14,0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0134384,0.0038575,-0.00513433;FXX=0.0238039;HRUN=1,1,1;LEN=1,1,1;MLLD=152.62,135.349,135.578;QD=61.1341;RBI=0.0250644,0.509059,0.055107;REFB=0,0,0;REVB=-0.0211573,-0.509044,0.0548673;RO=0;SAF=23,3,2;SAR=0,14,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,-3.53656e-08,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,snp,snp;VARB=-0.00171253,0.0270415,0;OID=.,.,.;OPOS=39786865,39786865,39786865;OREF=G,G,G;OALT=-,A,C;OMAPALT=C,CA,CC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.95122,0.0487805,0:23,17,2:42:39,2,0:41:0:25,2,0:14,0,0:0:0:9:0:23,3,2:0,14,0:0:0
chr17	39871700	.	G	A	632.26	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0356839;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.928;QD=61.6835;RBI=0.0547519;REFB=0;REVB=-0.0415263;RO=0;SAF=23;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.21061e-05;OID=.;OPOS=39871700;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:18:23:0:0:18:23:0:0
chr17	39874267	.	T	A	1208.93	PASS	AF=1;AO=78;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00704504;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.48;QD=61.2117;RBI=0.0133356;REFB=0;REVB=0.0113228;RO=0;SAF=47;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.78145e-06;OID=.;OPOS=39874267;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:79:0:0:78:79:1:31:47:0:0:32:47:0:0
chr17	39874283	.	T	A	1029.98	PASS	AF=0.985915;AO=69;DP=70;FAO=70;FDP=71;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0214541;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.6404;QD=58.027;RBI=0.0241874;REFB=-0.0554011;REVB=0.0111693;RO=1;SAF=40;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0116725;STB=0.506171;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.00115929;OID=.;OPOS=39874283;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:70:71:1:1:69:70:0.985915:29:40:1:0:30:40:1:0
chr17	39879729	.	CAGA	C,CAGC	454.16	PASS	AF=0.875,0.125;AO=25,4;DP=32;FAO=28,4;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=17,0;FSAR=11,4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0125876,-0.0449559;FXX=0.0302939;HRUN=1,2;LEN=3,1;MLLD=235.703,80.1739;QD=56.7704;RBI=0.0169668,0.045322;REFB=0,0;REVB=0.0113764,0.00574892;RO=0;SAF=16,0;SAR=9,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.00151536,-0.0277293;OID=.,.;OPOS=39879730,39879732;OREF=AGA,A;OALT=-,C;OMAPALT=C,CAGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.875,0.125:25,4:32:28,4:32:0:17,0:11,4:0:0:17:0:16,0:9,4:0:0
chr17	39880340	.	A	C	411.12	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00239891;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=312.539;QD=56.7066;RBI=0.00808505;REFB=0;REVB=0.00772096;RO=0;SAF=23;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.5029e-05;OID=.;OPOS=39880340;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:6:23:0:0:6:23:0:0
chr17	39880545	.	C	T	1487.77	PASS	AF=1;AO=94;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0464302;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=195.025;QD=62.643;RBI=0.0464319;REFB=0;REVB=-0.000396123;RO=1;SAF=19;SAR=75;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0242957;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.44439e-05;OID=.;OPOS=39880545;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:95:95:1:0:94:95:1:75:19:1:0:75:20:0:0
chr17	39880573	.	G	A	967.68	PASS	AF=1;AO=65;DP=67;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0121635;FXX=0.0149231;HRUN=3;LEN=1;MLLD=188.532;QD=58.647;RBI=0.0122048;REFB=0;REVB=0.0010028;RO=0;SAF=4;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.29895e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000216407;OID=.;OPOS=39880573;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:66:0:0:65:66:1:61:4:0:0:61:5:0:0
chr17	39881289	.	G	C	709.6	PASS	AF=0.962963;AO=53;DP=54;FAO=52;FDP=54;FR=.;FRO=2;FSAF=33;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0164023;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.837;QD=52.5631;RBI=0.0245847;REFB=-0.0190191;REVB=-0.0183132;RO=1;SAF=33;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0140652;STB=0.505358;STBP=0.786;TYPE=snp;VARB=0.000885087;OID=.;OPOS=39881289;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:54:54:1:2:53:52:0.962963:20:33:1:0:19:33:1:1
chr17	39883559	.	G	A	411.11	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0193403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.669;QD=56.7046;RBI=0.137668;REFB=0;REVB=0.136303;RO=0;SAF=13;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000825365;OID=.;OPOS=39883559;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:16:13:0:0:16:13:0:0
chr17	39883595	.	T	C	660.8	PASS	AF=1;AO=41;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0107191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.485;QD=61.4695;RBI=0.014962;REFB=0;REVB=0.0104385;RO=0;SAF=20;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000382157;OID=.;OPOS=39883595;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:41:43:1:21:20:0:0:22:21:0:0
chr17	39884065	.	C	A	105.06	PASS	AF=0.571429;AO=11;DP=20;FAO=12;FDP=21;FR=.;FRO=9;FSAF=11;FSAR=1;FSRF=9;FSRR=0;FWDB=-0.00522406;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.147;QD=20.0118;RBI=0.190761;REFB=-0.0116631;REVB=0.19069;RO=9;SAF=11;SAR=0;SRF=9;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.644979;STBP=0.725;TYPE=snp;VARB=0.00925618;OID=.;OPOS=39884065;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:20:21:9:9:11:12:0.571429:0:11:9:0:1:11:9:0
chr17	39884091	.	G	C	464.91	PASS	AF=1;AO=31;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0195185;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=262.557;QD=58.1134;RBI=0.0202091;REFB=0;REVB=0.00523818;RO=0;SAF=13;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.33668e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.10099e-05;OID=.;OPOS=39884091;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:31:32:1:18:13:0:0:19:13:0:0
chr17	39884583	.	G	A	744.89	PASS	AF=0.964912;AO=54;DP=57;FAO=55;FDP=57;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.071667;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.1546;QD=52.2733;RBI=0.113216;REFB=-0.060576;REVB=0.0876449;RO=1;SAF=27;SAR=27;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.017135;STB=0.517235;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=0.00480487;OID=.;OPOS=39884583;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:57:57:1:2:54:55:0.964912:27:27:0:1:28:27:0:2
chr17	39890715	.	A	T	1455.63	PASS	AF=1;AO=90;DP=90;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0258857;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.343;QD=63.2882;RBI=0.0337727;REFB=0;REVB=0.0216915;RO=0;SAF=31;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.97135e-06;OID=.;OPOS=39890715;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:90:92:0:0:90:92:1:59:31:0:0:61:31:0:0
chr17	39959189	.	C	G	606.78	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0174001;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=286.647;QD=60.6775;RBI=0.0331411;REFB=0;REVB=0.0282059;RO=0;SAF=17;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.71161e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.465e-05;OID=.;OPOS=39959189;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:40:0:0:37:40:1:20:17:0:0:21:19:0:0
chr17	39967442	.	T	C	102.29	PASS	AF=0.288889;AO=13;DP=45;FAO=13;FDP=45;FR=.;FRO=32;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=12;FWDB=-0.024477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.815;QD=9.09232;RBI=0.0244867;REFB=0.00783215;REVB=-0.00068611;RO=32;SAF=5;SAR=8;SRF=20;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.2754;STB=0.66642;STBP=0.151;TYPE=snp;VARB=-0.0139368;OID=.;OPOS=39967442;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:32:32:13:13:0.288889:8:5:20:12:8:5:20:12
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chr17	39983820	.	G	A	484.28	PASS	AF=0.560976;AO=46;DP=82;FAO=46;FDP=82;FR=.;FRO=36;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=-0.00493542;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.463;QD=23.6236;RBI=0.0109788;REFB=-0.00813123;REVB=-0.00980697;RO=36;SAF=21;SAR=25;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00973613;STB=0.505345;STBP=0.933;TYPE=snp;VARB=0.00465257;OID=.;OPOS=39983820;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:36:36:46:46:0.560976:25:21:16:20:25:21:16:20
chr17	39983849	.	G	C	392.74	PASS	AF=0.59375;AO=38;DP=66;FAO=38;FDP=64;FR=.;FRO=26;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=0.0322771;FXX=0.0302984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.6555;QD=24.5461;RBI=0.0417724;REFB=-0.017515;REVB=0.0265164;RO=26;SAF=15;SAR=23;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0510873;STB=0.528046;STBP=0.607;TYPE=snp;VARB=0.0128347;OID=.;OPOS=39983849;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:64:26:26:38:38:0.59375:23:15:12:14:23:15:12:14
chr17	39987130	.	T	C	368.84	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00274328;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.1509;QD=54.6425;RBI=0.00838843;REFB=0;REVB=0.00792718;RO=0;SAF=4;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000140597;OID=.;OPOS=39987130;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:23:4:0:0:23:4:0:0
chr17	39991867	.	A	ATATC	550.11	PASS	AF=0.6;AO=48;DP=88;FAO=51;FDP=85;FR=.;FRO=34;FSAF=15;FSAR=36;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=-0.00803359;FXX=0;HRUN=0;LEN=4;MLLD=307.069;QD=25.8874;RBI=0.0105203;REFB=-0.00371584;REVB=-0.00679254;RO=36;SAF=13;SAR=35;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180266;STB=0.579407;STBP=0.096;TYPE=ins;VARB=0.00189569;OID=.;OPOS=39991868;OREF=-;OALT=TATC;OMAPALT=ATATC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.6:48:88:51:85:34:15:36:16:18:99:36:13:35:17:19
chr17	39998141	.	C	T	234.02	PASS	AF=0.7;AO=21;DP=31;FAO=21;FDP=30;FR=.;FRO=9;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.0664574;FXX=0.0322477;HRUN=3;LEN=1;MLLD=187.066;QD=31.203;RBI=0.0680041;REFB=-0.0233336;REVB=0.014421;RO=8;SAF=8;SAR=13;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0710907;STB=0.51524;STBP=0.853;TYPE=snp;VARB=0.0111375;OID=.;OPOS=39998141;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:31:30:8:9:21:21:0.7:13:8:2:6:13:8:3:6
chr17	40010979	.	G	A	373.28	PASS	AF=0.578125;AO=35;DP=62;FAO=37;FDP=64;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=27;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=-0.00686802;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.62;QD=23.3297;RBI=0.0144636;REFB=0.000981622;REVB=-0.0127289;RO=26;SAF=10;SAR=25;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.214134;STB=0.618253;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=-0.000560599;OID=.;OPOS=40010979;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:64:26:27:35:37:0.578125:25:10:14:12:27:10:14:13
chr17	40048613	.	A	G	754.43	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000781084;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.357;QD=56.9382;RBI=0.00748518;REFB=0;REVB=0.00744431;RO=0;SAF=25;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.40594e-05;OID=.;OPOS=40048613;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:28:25:0:0:28:25:0:0
chr17	40094835	.	C	T	150.96	PASS	AF=0.354167;AO=17;DP=48;FAO=17;FDP=48;FR=.;FRO=31;FSAF=3;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=0.00740371;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.379;QD=12.5796;RBI=0.0222056;REFB=-0.0143397;REVB=-0.020935;RO=29;SAF=3;SAR=14;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.28718;STB=0.679372;STBP=0.107;TYPE=snp;VARB=0.0165089;OID=.;OPOS=40094835;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:29:31:17:17:0.354167:14:3:11:18:14:3:12:19
chr17	40125864	.	G	A	178.62	PASS	AF=0.73913;AO=17;DP=23;FAO=17;FDP=23;FR=.;FRO=6;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.025117;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=189.99;QD=31.065;RBI=0.0281177;REFB=0.00373196;REVB=0.012639;RO=6;SAF=7;SAR=10;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121047;STB=0.566931;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=-0.00122253;OID=.;OPOS=40125864;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:23:23:6:6:17:17:0.73913:10:7:4:2:10:7:4:2
chr17	40126133	.	G	A	271.9	PASS	AF=0.321429;AO=36;DP=112;FAO=36;FDP=112;FR=.;FRO=76;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=51;FSRR=25;FWDB=-0.0258149;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.368;QD=9.71059;RBI=0.0308034;REFB=-0.00419677;REVB=-0.0168061;RO=75;SAF=16;SAR=20;SRF=50;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.254938;STB=0.650407;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.0106434;OID=.;OPOS=40126133;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:112:75:76:36:36:0.321429:20:16:50:25:20:16:51:25
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chr17	40274873	.	A	C	125.66	PASS	AF=0.583333;AO=12;DP=22;FAO=14;FDP=24;FR=.;FRO=10;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=9;FWDB=0.0220007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.446;QD=20.9437;RBI=0.0295414;REFB=-0.05616;REVB=0.0197146;RO=10;SAF=7;SAR=5;SRF=1;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.371902;STB=0.689409;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.0242022;OID=.;OPOS=40274873;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:22:24:10:10:12:14:0.583333:5:7:1:9:6:8:1:9
chr17	40277701	.	C	G	540.33	PASS	AF=0.766667;AO=46;DP=60;FAO=46;FDP=60;FR=.;FRO=14;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.01117;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=261.139;QD=36.0219;RBI=0.011311;REFB=-0.0144308;REVB=-0.00178022;RO=14;SAF=20;SAR=26;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0597253;STB=0.53215;STBP=0.437;TYPE=snp;VARB=0.00396911;OID=.;OPOS=40277701;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:91:60:60:14:14:46:46:0.766667:26:20:8:6:26:20:8:6
chr17	40280291	.	G	A	355.26	PASS	AF=0.571429;AO=36;DP=62;FAO=36;FDP=63;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=-0.0946969;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.274;QD=22.5563;RBI=0.0950141;REFB=-0.0269003;REVB=-0.00775834;RO=26;SAF=15;SAR=21;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0645053;STB=0.544211;STBP=0.427;TYPE=snp;VARB=0.0196882;OID=.;OPOS=40280291;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:63:26:27:36:36:0.571429:21:15:13:13:21:15:14:13
chr17	40344455	.	C	T	87.72	PASS	AF=0.44;AO=11;DP=25;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.0538604;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.9167;QD=14.0357;RBI=0.0539753;REFB=-0.0136932;REVB=0.00352115;RO=14;SAF=4;SAR=7;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0654098;STB=0.538391;STBP=0.792;TYPE=snp;VARB=0.0294009;OID=.;OPOS=40344455;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:25:25:14:14:11:11:0.44:7:4:6:8:7:4:6:8
chr17	40459562	.	A	G	670.25	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00943109;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.67;QD=62.3487;RBI=0.0152144;REFB=0;REVB=0.0119387;RO=0;SAF=24;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.90146e-05;OID=.;OPOS=40459562;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:19:24:0:0:19:24:0:0
chr17	40459737	.	C	T	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0167515;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.847;QD=46.8476;RBI=0.0543071;REFB=0;REVB=0.0516589;RO=0;SAF=8;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000844183;OID=.;OPOS=40459737;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:7:8:0:0:7:8:0:0
chr17	40475650	.	G	GA	438.77	PASS	AF=1;AO=38;DP=57;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0319473;FXX=0.09802;HRUN=3;LEN=1;MLLD=15.3451;QD=38.1536;RBI=0.0320382;REFB=0;REVB=-0.00241139;RO=18;SAF=19;SAR=19;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0656753;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00148319;OID=.;OPOS=40475651;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:38:57:46:46:0:23:23:0:0:9:18:19:19:7:11
chr17	40689455	.	T	C	1231.35	PASS	AF=0.97619;AO=80;DP=83;FAO=82;FDP=84;FR=.;FRO=2;FSAF=37;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0267623;FXX=0.0117633;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.267;QD=58.6359;RBI=0.0390728;REFB=-0.121391;REVB=0.0284687;RO=1;SAF=34;SAR=46;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0101822;STB=0.501172;STBP=0.881;TYPE=snp;VARB=0.00353931;OID=.;OPOS=40689455;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:83:84:1:2:80:82:0.97619:46:34:0:1:45:37:1:1
chr17	40696233	.	C	G	277.82	PASS	AF=0.851852;AO=23;DP=27;FAO=23;FDP=27;FR=.;FRO=4;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.124338;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=38.8978;QD=41.1584;RBI=0.124378;REFB=-0.193469;REVB=0.00317221;RO=2;SAF=8;SAR=15;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10243;STB=0.563084;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=0.0393968;OID=.;OPOS=40696233;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:18:27:27:2:4:23:23:0.851852:15:8:2:0:15:8:3:1
chr17	40699291	.	G	A	613.29	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00883022;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.066;QD=61.3288;RBI=0.0574257;REFB=0;REVB=0.0567428;RO=0;SAF=22;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.19993e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0002754;OID=.;OPOS=40699291;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:18:22:0:0:18:22:0:0
chr17	40699332	.	T	C	766.46	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00697387;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.255;QD=63.8718;RBI=0.00892027;REFB=0;REVB=0.00556204;RO=0;SAF=23;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.65274e-06;OID=.;OPOS=40699332;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:25:23:0:0:25:23:0:0
chr17	40705100	.	C	T	157.85	PASS	AF=0.447368;AO=17;DP=38;FAO=17;FDP=38;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=0.00130327;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.385;QD=16.6155;RBI=0.0286009;REFB=-0.0154339;REVB=-0.0285712;RO=21;SAF=8;SAR=9;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0968596;STB=0.555491;STBP=0.558;TYPE=snp;VARB=0.0205239;OID=.;OPOS=40705100;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:21:21:17:17:0.447368:9:8:12:9:9:8:12:9
chr17	40706906	.	G	A	37.78	PASS	AF=0.375;AO=6;DP=16;FAO=6;FDP=16;FR=.;FRO=10;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.0373245;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.942;QD=9.44482;RBI=0.0403099;REFB=-0.011952;REVB=0.0152242;RO=10;SAF=2;SAR=4;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.357304;STB=0.719306;STBP=0.207;TYPE=snp;VARB=0.0165771;OID=.;OPOS=40706906;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:16:16:10:10:6:6:0.375:4:2:7:3:4:2:7:3
chr17	40714804	.	C	A	45.35	PASS	AF=0.318182;AO=7;DP=22;FAO=7;FDP=22;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=-0.0495246;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.5543;QD=8.24532;RBI=0.0528199;REFB=0.000960969;REVB=-0.0183646;RO=15;SAF=4;SAR=3;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0319978;STB=0.519943;STBP=0.935;TYPE=snp;VARB=-0.0135253;OID=.;OPOS=40714804;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:22:22:15:15:7:7:0.318182:3:4:9:6:3:4:9:6
chr17	40716520	.	A	G	189.88	PASS	AF=0.358209;AO=24;DP=67;FAO=24;FDP=67;FR=.;FRO=43;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=26;FWDB=0.00936367;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.361;QD=11.336;RBI=0.019667;REFB=-0.00810984;REVB=-0.0172949;RO=43;SAF=8;SAR=16;SRF=17;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0747075;STB=0.543441;STBP=0.603;TYPE=snp;VARB=0.015999;OID=.;OPOS=40716520;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:43:43:24:24:0.358209:16:8:17:26:16:8:17:26
chr17	40719159	.	C	T	61.75	PASS	AF=0.264706;AO=9;DP=32;FAO=9;FDP=34;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=22;FSRR=3;FWDB=-0.0336357;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.487;QD=7.26454;RBI=0.0435086;REFB=-0.00473752;REVB=-0.0275978;RO=23;SAF=6;SAR=3;SRF=20;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.309262;STB=0.69967;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=0.017283;OID=.;OPOS=40719159;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:32:34:23:25:9:9:0.264706:3:6:20:3:3:6:22:3
chr17	40722029	.	A	G	231.13	PASS	AF=0.4;AO=26;DP=68;FAO=28;FDP=70;FR=.;FRO=42;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=32;FSRR=10;FWDB=0.00483018;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=288.132;QD=13.2076;RBI=0.0065794;REFB=-0.000655459;REVB=-0.00446742;RO=42;SAF=15;SAR=11;SRF=32;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.213735;STB=0.620611;STBP=0.149;TYPE=snp;VARB=0.00118463;OID=.;OPOS=40722029;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:70:42:42:26:28:0.4:11:15:32:10:12:16:32:10
chr17	40731597	.	T	A	264.89	PASS	AF=0.330097;AO=34;DP=102;FAO=34;FDP=103;FR=.;FRO=69;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=26;FSRR=43;FWDB=-0.00597518;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.2966;QD=10.2871;RBI=0.00808829;REFB=-0.0223014;REVB=0.00545139;RO=68;SAF=19;SAR=15;SRF=25;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.217238;STB=0.620078;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=0.0249881;OID=.;OPOS=40731597;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:103:68:69:34:34:0.330097:15:19:25:43:15:19:26:43
chr17	40766546	.	C	G	30.5	PASS	AF=0.454545;AO=5;DP=11;FAO=5;FDP=11;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0255663;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.246;QD=11.0924;RBI=0.0282464;REFB=-0.0231618;REVB=0.0120092;RO=6;SAF=1;SAR=4;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158244;STB=0.599562;STBP=0.665;TYPE=snp;VARB=0.0243202;OID=.;OPOS=40766546;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:11:11:6:6:5:5:0.454545:4:1:2:4:4:1:2:4
chr17	40811919	.	A	G	62.09	PASS	AF=0.272727;AO=9;DP=33;FAO=9;FDP=33;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=-0.0136332;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.8356;QD=7.52574;RBI=0.049673;REFB=-0.0140302;REVB=-0.0477655;RO=24;SAF=5;SAR=4;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112516;STB=0.570314;STBP=0.652;TYPE=snp;VARB=0.0488035;OID=.;OPOS=40811919;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:33:33:24:24:9:9:0.272727:4:5:11:13:4:5:11:13
chr17	40818451	.	G	A	72.36	PASS	AF=0.294118;AO=10;DP=34;FAO=10;FDP=34;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=-0.0323552;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.373;QD=8.51287;RBI=0.0335939;REFB=-0.0135414;REVB=0.00903851;RO=24;SAF=5;SAR=5;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0956655;STB=0.558707;STBP=0.697;TYPE=snp;VARB=0.0350588;OID=.;OPOS=40818451;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:34:34:24:24:10:10:0.294118:5:5:10:14:5:5:10:14
chr17	40818699	.	A	G	269.42	PASS	AF=0.407895;AO=31;DP=76;FAO=31;FDP=76;FR=.;FRO=45;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=24;FWDB=0.00820191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.403;QD=14.18;RBI=0.0185048;REFB=-0.00932553;REVB=-0.0165879;RO=45;SAF=12;SAR=19;SRF=21;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0852442;STB=0.548525;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.0193156;OID=.;OPOS=40818699;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:45:45:31:31:0.407895:19:12:21:24:19:12:21:24
chr17	40822678	.	C	T	612.32	PASS	AF=0.627907;AO=54;DP=86;FAO=54;FDP=86;FR=.;FRO=32;FSAF=23;FSAR=31;FSRF=20;FSRR=12;FWDB=0.00329213;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=175.133;QD=28.4801;RBI=0.0393531;REFB=0.00822806;REVB=0.0392152;RO=32;SAF=23;SAR=31;SRF=20;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136243;STB=0.574047;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=-0.00564468;OID=.;OPOS=40822678;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:32:32:54:54:0.627907:31:23:20:12:31:23:20:12
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chr17	41116234	.	G	A	483.32	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0163107;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.1996;QD=58.584;RBI=0.0164249;REFB=0;REVB=-0.00193328;RO=0;SAF=9;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000285341;OID=.;OPOS=41116234;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:24:9:0:0:24:9:0:0
chr17	41121208	.	GGGC	G,GG,GGG,GGGG	580.8	PASS	AF=0.487179,0.333333,0.153846,0.025641;AO=8,11,8,12;DP=40;FAO=19,13,6,1;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=8,8,1,1;FSAR=11,5,5,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0212095,-0.0259154,-0.0292498,-0.0314007;FXX=0.0249938;HRUN=5,5,1,1;LEN=3,2,1,1;MLLD=220.067,221.667,219.034,214.018;QD=59.5694;RBI=0.0213481,0.027577,0.0326158,0.0360187;REFB=0,0,0,0;REVB=-0.00242834,-0.00942768,-0.0144306,-0.017645;RO=0;SAF=1,5,5,6;SAR=7,6,3,6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=-4.78849e-08,0,4.46938e-08,0;STB=0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1,1;TYPE=del,del,del,snp;VARB=-0.0107309,-0.0155809,-0.0113406,0.0326711;OID=.,.,.,.;OPOS=41121209,41121210,41121211,41121211;OREF=GGC,GC,C,C;OALT=-,-,-,G;OMAPALT=G,GG,GGG,GGGG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.487179,0.333333,0.153846,0.025641:8,11,8,12:40:19,13,6,1:39:0:8,8,1,1:11,5,5,0:0:0:21:0:1,5,5,6:7,6,3,6:0:0
chr17	41121216	.	G	A	43.69	PASS	AF=0.212121;AO=7;DP=34;FAO=7;FDP=33;FR=.;FRO=26;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=-0.00742738;FXX=0.0294031;HRUN=7;LEN=1;MLLD=115.196;QD=5.29524;RBI=0.00807002;REFB=0.00656979;REVB=0.00315582;RO=27;SAF=1;SAR=6;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.508233;STB=0.832324;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=-0.0028639;OID=.;OPOS=41121216;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:34:33:27:26:7:7:0.212121:6:1:15:12:6:1:14:12
chr17	41121217	.	G	A	177.51	PASS	AF=0.545455;AO=18;DP=33;FAO=18;FDP=33;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=0.0153161;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=208.702;QD=21.5158;RBI=0.0153411;REFB=-0.00546995;REVB=0.000875924;RO=15;SAF=6;SAR=12;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.221291;STB=0.624858;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=0.00182447;OID=.;OPOS=41121217;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:15:15:18:18:0.545455:12:6:9:6:12:6:9:6
chr17	41133071	.	T	C	340.74	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00287416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.985;QD=54.5177;RBI=0.00888412;REFB=0;REVB=-0.00840635;RO=0;SAF=11;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.70374e-05;OID=.;OPOS=41133071;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:14:11:0:0:14:11:0:0
chr17	41165493	.	A	G	786.99	PASS	AF=1;AO=52;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=33;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0322816;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.502;QD=57.2358;RBI=0.0379639;REFB=0;REVB=0.0199788;RO=0;SAF=33;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.0907e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000425608;OID=.;OPOS=41165493;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:52:55:1:19:33:0:0:22:33:0:0
chr17	41165878	.	C	T	505.16	PASS	AF=1;AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00712506;FXX=0.0555401;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.3207;QD=59.4311;RBI=0.0454965;REFB=0;REVB=-0.0449351;RO=0;SAF=17;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00147678;OID=.;OPOS=41165878;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:35:34:0:0:34:34:1:17:17:0:0:17:17:0:0
chr17	41174025	.	A	C	66.83	PASS	AF=0.428571;AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.00580651;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.31;QD=12.729;RBI=0.0252528;REFB=-0.0077559;REVB=-0.0245761;RO=11;SAF=6;SAR=3;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119999;STB=0.551606;STBP=0.695;TYPE=snp;VARB=0.0218058;OID=.;OPOS=41174025;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:21:21:11:12:9:9:0.428571:3:6:6:5:3:6:7:5
chr17	41196407	.	TG	GT,TA	294.21	PASS	AF=0,0.557692;AO=2,24;DP=54;FAO=0,29;FDP=52;FR=.,HEALED;FRO=22;FSAF=0,23;FSAR=0,6;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=0.0259824,0.0176978;FXX=0;HRUN=1,7;LEN=2,1;MLLD=74.0921,88.644;QD=22.6312;RBI=0.0350157,0.0181117;REFB=0.0555926,0.0254692;REVB=0.0234736,0.00384986;RO=15;SAF=2,20;SAR=0,4;SRF=8;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.528044,0.289954;STB=0.5,0.636574;STBP=1,0.054;TYPE=mnp,snp;VARB=0,-0.00502441;OID=.,.;OPOS=41196407,41196408;OREF=TG,G;OALT=GT,A;OMAPALT=GT,TA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:54:52:15:22:2,24:0,29:0,0.557692:0,4:2,20:8:7:0,6:0,23:12:10
chr17	41223094	.	T	C	735.46	PASS	AF=0.701149;AO=56;DP=83;FAO=61;FDP=87;FR=.;FRO=26;FSAF=29;FSAR=32;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=0.00593562;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.307;QD=33.8142;RBI=0.0186111;REFB=-0.0239452;REVB=0.0176392;RO=26;SAF=26;SAR=30;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00162015;STB=0.504156;STBP=0.915;TYPE=snp;VARB=0.0110031;OID=.;OPOS=41223094;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:87:26:26:56:61:0.701149:30:26:12:14:32:29:12:14
chr17	41234470	.	A	G	741.25	PASS	AF=0.709302;AO=59;DP=84;FAO=61;FDP=86;FR=.;FRO=25;FSAF=31;FSAR=30;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=0.0422611;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.4282;QD=34.4769;RBI=0.0433745;REFB=0.00378602;REVB=-0.00976418;RO=24;SAF=30;SAR=29;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0269031;STB=0.508194;STBP=0.795;TYPE=snp;VARB=-0.00102481;OID=.;OPOS=41234470;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:86:24:25:59:61:0.709302:29:30:11:13:30:31:12:13
chr17	41244000	.	T	C	195.8	PASS	AF=0.454545;AO=20;DP=44;FAO=20;FDP=44;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=0.00443394;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=274.923;QD=17.8004;RBI=0.0234413;REFB=-0.00742046;REVB=0.0230181;RO=24;SAF=6;SAR=14;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165835;STB=0.594901;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=0.0114051;OID=.;OPOS=41244000;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:24:24:20:20:0.454545:14:6:11:13:14:6:11:13
chr17	41244435	.	T	C	199.37	PASS	AF=0.655172;AO=19;DP=29;FAO=19;FDP=29;FR=.;FRO=10;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.0849133;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.949;QD=27.4988;RBI=0.0852352;REFB=0.00194623;REVB=-0.0074015;RO=10;SAF=8;SAR=11;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.049823;STB=0.527646;STBP=0.721;TYPE=snp;VARB=0.00176527;OID=.;OPOS=41244435;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:29:29:10:10:19:19:0.655172:11:8:5:5:11:8:5:5
chr17	41244936	.	G	A	294.71	PASS	AF=0.604651;AO=26;DP=43;FAO=26;FDP=43;FR=.;FRO=17;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=-0.035271;FXX=0.0227221;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.153;QD=27.415;RBI=0.0352877;REFB=-0.0073595;REVB=0.00108581;RO=17;SAF=11;SAR=15;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20039;STB=0.610536;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.00229136;OID=.;OPOS=41244936;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:17:17:26:26:0.604651:15:11:12:5:15:11:12:5
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chr17	41245466	.	G	A	711.7	PASS	AF=0.710843;AO=59;DP=83;FAO=59;FDP=83;FR=.;FRO=24;FSAF=26;FSAR=33;FSRF=6;FSRR=18;FWDB=-0.0068419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.0775;QD=34.2987;RBI=0.015843;REFB=-0.00726306;REVB=-0.0142895;RO=24;SAF=26;SAR=33;SRF=6;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105379;STB=0.556656;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=0.0023909;OID=.;OPOS=41245466;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:24:24:59:59:0.710843:33:26:6:18:33:26:6:18
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chr17	41362272	.	C	G	339.27	PASS	AF=0.586207;AO=34;DP=58;FAO=34;FDP=58;FR=.;FRO=24;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=-7.57853e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.1256;QD=23.3982;RBI=0.00654807;REFB=-0.0100871;REVB=-0.00654763;RO=24;SAF=14;SAR=20;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19055;STB=0.604777;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=0.00850933;OID=.;OPOS=41362272;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:24:24:34:34:0.586207:20:14:16:8:20:14:16:8
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chr17	41454935	.	T	C	86.81	PASS	AF=0.714286;AO=10;DP=14;FAO=10;FDP=14;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=-0.0538391;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=181.754;QD=24.8015;RBI=0.054036;REFB=-0.00957178;REVB=-0.0046087;RO=4;SAF=4;SAR=6;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.222789;STB=0.624776;STBP=0.216;TYPE=snp;VARB=0.00333903;OID=.;OPOS=41454935;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:14:14:4:4:10:10:0.714286:6:4:0:4:6:4:0:4
chr17	41477710	.	A	G	72.89	PASS	AF=0.642857;AO=9;DP=14;FAO=9;FDP=14;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=-0.00479564;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.82;QD=20.826;RBI=0.0169433;REFB=-0.0096448;REVB=0.0162504;RO=5;SAF=2;SAR=7;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0202228;STB=0.511602;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00793283;OID=.;OPOS=41477710;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:14:14:5:5:9:9:0.642857:7:2:1:4:7:2:1:4
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chr17	41489846	.	T	C	173.14	PASS	AF=0.842105;AO=16;DP=19;FAO=16;FDP=19;FR=.;FRO=3;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.00755951;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.839;QD=36.4503;RBI=0.0270301;REFB=-0.0475193;REVB=0.0259515;RO=3;SAF=9;SAR=7;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0661342;STB=0.536378;STBP=0.469;TYPE=snp;VARB=0.00310296;OID=.;OPOS=41489846;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:19:19:3:3:16:16:0.842105:7:9:1:2:7:9:1:2
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chr17	41846508	.	A	G	165.22	PASS	AF=0.323529;AO=22;DP=68;FAO=22;FDP=68;FR=.;FRO=46;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=27;FSRR=19;FWDB=-0.00414044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.826;QD=9.71851;RBI=0.023726;REFB=-0.0159036;REVB=0.0233619;RO=43;SAF=15;SAR=7;SRF=25;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123273;STB=0.570109;STBP=0.456;TYPE=snp;VARB=0.0347845;OID=.;OPOS=41846508;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:43:46:22:22:0.323529:7:15:25:18:7:15:27:19
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chr17	41959808	.	T	C	4299.39	PASS	AF=1;AO=273;DP=274;FAO=274;FDP=274;FR=.;FRO=0;FSAF=131;FSAR=143;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00280208;FXX=0.00363623;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.85;QD=62.7648;RBI=0.00974097;REFB=-0.0752828;REVB=-0.00932924;RO=1;SAF=130;SAR=143;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00365373;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000200237;OID=.;OPOS=41959808;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:18:274:274:1:0:273:274:1:143:130:1:0:143:131:0:0
chr17	41960343	.	T	C	239.42	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0424524;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.5277;QD=50.4035;RBI=0.0595266;REFB=0;REVB=-0.0417278;RO=0;SAF=4;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.00629e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00111859;OID=.;OPOS=41960343;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:15:4:0:0:15:4:0:0
chr17	41960633	.	CG	GC	1556.8	PASS	AF=0.990566;AO=105;DP=106;FAO=105;FDP=106;FR=.;FRO=1;FSAF=61;FSAR=44;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.020116;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=182.389;QD=58.7472;RBI=0.0201324;REFB=-0.0806307;REVB=0.0008114;RO=1;SAF=61;SAR=44;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00771683;STB=0.504064;STBP=0.489;TYPE=mnp;VARB=0.000139496;OID=.;OPOS=41960633;OREF=CG;OALT=GC;OMAPALT=GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:106:106:1:1:105:105:0.990566:44:61:1:0:44:61:1:0
chr17	41961451	.	T	C	340.74	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00378218;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.427;QD=54.5176;RBI=0.00403433;REFB=0;REVB=-0.00140389;RO=0;SAF=12;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.71065e-06;OID=.;OPOS=41961451;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:25:0:0:24:25:1:12:12:0:0:13:12:0:0
chr17	41994794	.	C	T	74.7	PASS	AF=0.20339;AO=12;DP=59;FAO=12;FDP=59;FR=.;FRO=47;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=23;FSRR=24;FWDB=0.0184233;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.535;QD=5.06448;RBI=0.0232218;REFB=0.00723815;REVB=-0.0141362;RO=47;SAF=9;SAR=3;SRF=23;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.333312;STB=0.71644;STBP=0.113;TYPE=snp;VARB=-0.0176264;OID=.;OPOS=41994794;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:59:59:47:47:12:12:0.20339:3:9:23:24:3:9:23:24
chr17	42030531	.	G	C	483.34	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0093913;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.512;QD=58.5868;RBI=0.0114355;REFB=0;REVB=0.00652493;RO=0;SAF=13;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.82173e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.15624e-06;OID=.;OPOS=42030531;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:20:13:0:0:20:13:0:0
chr17	42030743	.	G	C	870.34	PASS	AF=0.940299;AO=61;DP=65;FAO=63;FDP=67;FR=.;FRO=4;FSAF=37;FSAR=26;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.00429773;FXX=0.0147037;HRUN=4;LEN=1;MLLD=44.5681;QD=51.9608;RBI=0.0599238;REFB=-0.0969688;REVB=0.0597695;RO=4;SAF=37;SAR=24;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0174943;STB=0.510051;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.00698211;OID=.;OPOS=42030743;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:65:67:4:4:61:63:0.940299:24:37:3:1:26:37:3:1
chr17	42085972	.	C	T	97.3	PASS	AF=0.4;AO=12;DP=30;FAO=12;FDP=30;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=4;FWDB=0.0313956;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=62.217;QD=12.9738;RBI=0.052921;REFB=-0.016876;REVB=0.0426023;RO=18;SAF=5;SAR=7;SRF=14;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.358031;STB=0.707139;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=0.0394491;OID=.;OPOS=42085972;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:30:30:18:18:12:12:0.4:7:5:14:4:7:5:14:4
chr17	42152103	.	G	A	310.16	PASS	AF=0.742857;AO=26;DP=35;FAO=26;FDP=35;FR=.;FRO=9;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.0104256;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.369;QD=35.4468;RBI=0.015659;REFB=-0.0129419;REVB=-0.0116838;RO=9;SAF=9;SAR=17;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157649;STB=0.586139;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=0.00260673;OID=.;OPOS=42152103;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:35:35:9:9:26:26:0.742857:17:9:6:3:17:9:6:3
chr17	42154470	.	A	G	65.31	PASS	AF=0.375;AO=9;DP=24;FAO=9;FDP=24;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=-0.0184892;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.111;QD=10.8848;RBI=0.0186038;REFB=-0.0268478;REVB=-0.0020618;RO=15;SAF=5;SAR=4;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.227806;STB=0.636074;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=0.0511718;OID=.;OPOS=42154470;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:24:24:15:15:9:9:0.375:4:5:5:10:4:5:5:10
chr17	42155403	.	CGGGGG	CGGGGA,CGGG,CGGGG	245.31	PASS	AF=0.428571,0.171429,0.285714;AO=15,7,8;DP=36;FAO=15,6,10;FDP=35;FR=.;FRO=4;FSAF=5,0,4;FSAR=10,6,6;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.0034916,-0.00435359,-0.00862846;FXX=0.0277701;HRUN=6,6,6;LEN=1,2,1;MLLD=212.649,13.0951,6.41613;QD=28.0349;RBI=0.0156714,0.0162168,0.0321501;REFB=-0.0229537,-0.114669,-0.18901;REVB=-0.0152775,-0.0156214,-0.0309706;RO=4;SAF=5,0,3;SAR=10,7,5;SRF=4;SRR=0;SSEN=0,0.611111,0.611111;SSEP=0,0.408163,0.408163;SSSB=-0.257519,-0.819748,-0.348619;STB=0.642663,0.997995,0.666348;STBP=0.029,0.002,0.083;TYPE=snp,del,del;VARB=0.0167432,0.121068,-0.0410611;OID=.,.,.;OPOS=42155408,42155404,42155404;OREF=G,GG,G;OALT=A,-,-;OMAPALT=CGGGGA,CGGG,CGGGG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/3:0.428571,0.171429,0.285714:15,7,8:36:15,6,10:35:4:5,0,4:10,6,6:4:0:55:4:5,0,3:10,7,5:4:0
chr17	42164885	.	G	C	223.46	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0120253;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.676;QD=49.658;RBI=0.0201915;REFB=0;REVB=0.01622;RO=0;SAF=4;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.59341e-05;OID=.;OPOS=42164885;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:18:0:0:17:18:1:13:4:0:0:13:5:0:0
chr17	42213347	.	G	A	624.64	PASS	AF=0.716216;AO=52;DP=73;FAO=53;FDP=74;FR=.;FRO=21;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=17;FSRR=4;FWDB=-0.00232303;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.406;QD=33.7641;RBI=0.0100002;REFB=-0.0112643;REVB=0.00972662;RO=21;SAF=25;SAR=27;SRF=17;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1746;STB=0.595107;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.0113522;OID=.;OPOS=42213347;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:74:21:21:52:53:0.716216:27:25:17:4:28:25:17:4
chr17	42225547	.	A	C	107.24	PASS	AF=0.631579;AO=12;DP=19;FAO=12;FDP=19;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=-0.012661;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.556;QD=22.576;RBI=0.0159467;REFB=0.00354828;REVB=-0.00969518;RO=7;SAF=4;SAR=8;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0353093;STB=0.519967;STBP=0.851;TYPE=snp;VARB=-0.0025046;OID=.;OPOS=42225547;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:19:19:7:7:12:12:0.631579:8:4:2:5:8:4:2:5
chr17	42248346	.	A	T	776.45	PASS	AF=0.965517;AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=58;FR=.;FRO=2;FSAF=28;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0229401;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.409;QD=53.5485;RBI=0.0371429;REFB=-0.0523134;REVB=-0.0292121;RO=1;SAF=28;SAR=28;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0165422;STB=0.517235;STBP=0.236;TYPE=snp;VARB=-0.0010919;OID=.;OPOS=42248346;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:57:58:1:2:56:56:0.965517:28:28:0:1:28:28:0:2
chr17	42254417	.	A	G	105.14	PASS	AF=0.846154;AO=11;DP=13;FAO=11;FDP=13;FR=.;FRO=2;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0193445;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.425;QD=32.352;RBI=0.019467;REFB=-0.00650331;REVB=-0.0021808;RO=2;SAF=5;SAR=6;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149061;STB=0.583183;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=0.00132964;OID=.;OPOS=42254417;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:13:13:2:2:11:11:0.846154:6:5:2:0:6:5:2:0
chr17	42254527	.	T	G	385.32	PASS	AF=0.654545;AO=35;DP=60;FAO=36;FDP=55;FR=.;FRO=19;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.0333961;FXX=0.140603;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.019;QD=28.0235;RBI=0.0427101;REFB=-0.0127587;REVB=-0.0266243;RO=17;SAF=17;SAR=18;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0799496;STB=0.517757;STBP=0.723;TYPE=snp;VARB=0.0239188;OID=.;OPOS=42254527;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:55:17:19:35:36:0.654545:18:17:6:11:19:17:8:11
chr17	42255097	.	T	C	212.82	PASS	AF=0.5;AO=21;DP=42;FAO=21;FDP=42;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=-0.0281659;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=247.841;QD=20.2683;RBI=0.0282956;REFB=-0.00780831;REVB=-0.00270608;RO=21;SAF=6;SAR=15;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18687;STB=0.605954;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=0.00786621;OID=.;OPOS=42255097;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:21:21:21:21:0.5:15:6:10:11:15:6:10:11
chr17	42270291	.	A	G	295.76	PASS	AF=0.566038;AO=30;DP=53;FAO=30;FDP=53;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=6;FWDB=0.00524766;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.387;QD=22.3213;RBI=0.0125003;REFB=-0.0151158;REVB=-0.0113455;RO=22;SAF=12;SAR=18;SRF=16;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.247216;STB=0.644351;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.0124591;OID=.;OPOS=42270291;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:22:23:30:30:0.566038:18:12:16:6:18:12:17:6
chr17	42270828	.	TGGGGC	TGGG,TGGGC	50.54	PASS	AF=0.1,0.375;AO=8,11;DP=42;FAO=4,15;FDP=40;FR=.;FRO=21;FSAF=4,3;FSAR=0,12;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=-0.130365,-0.0696476;FXX=0.0476077;HRUN=4,4;LEN=2,1;MLLD=18.5972,10.6153;QD=5.05407;RBI=0.18505,0.130563;REFB=-0.0760188,-0.168466;REVB=-0.131334,-0.110435;RO=19;SAF=6,1;SAR=2,10;SRF=9;SRR=10;SSEN=0.555556,0.555556;SSEP=0,0;SSSB=0.326369,-0.538458;STB=0.997209,0.693048;STBP=0.026,0.078;TYPE=del,del;VARB=0.0176176,0.149628;OID=.,.;OPOS=42270832,42270829;OREF=GC,G;OALT=-,-;OMAPALT=TGGG,TGGGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0.1,0.375:8,11:42:4,15:40:21:4,3:0,12:10:11:33:19:6,1:2,10:9:10
chr17	42287519	.	C	T	440.13	PASS	AF=0.650794;AO=41;DP=63;FAO=41;FDP=63;FR=.;FRO=22;FSAF=25;FSAR=16;FSRF=6;FSRR=16;FWDB=0.00410207;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.1362;QD=27.945;RBI=0.047676;REFB=-0.0240199;REVB=-0.0474992;RO=22;SAF=25;SAR=16;SRF=6;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215377;STB=0.617227;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.0195265;OID=.;OPOS=42287519;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:22:22:41:41:0.650794:16:25:6:16:16:25:6:16
chr17	42392622	.	T	C	2441.45	PASS	AF=1;AO=158;DP=159;FAO=160;FDP=160;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00239528;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.289;QD=61.0362;RBI=0.0131509;REFB=0;REVB=0.0129309;RO=0;SAF=81;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.38322e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000188348;OID=.;OPOS=42392622;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:159:160:0:0:158:160:1:77:81:0:0:78:82:0:0
chr17	42398052	.	A	G	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142873;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=265.666;QD=44.6898;RBI=0.0189177;REFB=0;REVB=-0.0123996;RO=0;SAF=5;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.9004e-06;OID=.;OPOS=42398052;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:8:5:0:0:8:5:0:0
chr17	42398757	.	C	A	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0933536;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=251.947;QD=53.2772;RBI=0.0997455;REFB=0;REVB=0.0351323;RO=0;SAF=3;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00029534;OID=.;OPOS=42398757;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:20:3:0:0:20:3:0:0
chr17	42400886	.	C	A	52.64	PASS	AF=0.0845771;AO=17;DP=200;FAO=17;FDP=201;FR=.;FRO=184;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=81;FSRR=103;FWDB=0.0863569;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.4837;QD=1.04754;RBI=0.0984434;REFB=0.00641792;REVB=-0.0472607;RO=179;SAF=9;SAR=8;SRF=78;SRR=101;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108848;STB=0.581058;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=-0.0833036;OID=.;OPOS=42400886;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:200:201:179:184:17:17:0.0845771:8:9:78:101:8:9:81:103
chr17	42427630	.	T	C	728.97	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0570051;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.4171;QD=57.1744;RBI=0.0570494;REFB=0;REVB=-0.00224896;RO=0;SAF=34;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00055322;OID=.;OPOS=42427630;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:17:34:0:0:17:34:0:0
chr17	42449789	.	G	A	306.15	PASS	AF=0.923077;AO=24;DP=26;FAO=24;FDP=26;FR=.;FRO=2;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00196097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.348;QD=47.0994;RBI=0.0321448;REFB=-0.144344;REVB=-0.032085;RO=0;SAF=14;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.545416;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=0.000764345;OID=.;OPOS=42449789;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:26:26:0:2:24:24:0.923077:10:14:0:0:10:14:0:2
chr17	42453065	.	A	C	654.69	PASS	AF=1;AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00549903;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.347;QD=62.3518;RBI=0.0478222;REFB=0;REVB=0.047505;RO=0;SAF=35;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.63446e-05;OID=.;OPOS=42453065;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:42:0:0:42:42:1:7:35:0:0:7:35:0:0
chr17	42454463	.	G	C	785.87	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108876;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.9167;QD=64.1525;RBI=0.0111655;REFB=0;REVB=0.00247581;RO=0;SAF=27;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.30731e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.04257e-05;OID=.;OPOS=42454463;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:22:27:0:0:22:27:0:0
chr17	42826579	.	GGC	G	88.66	PASS	AF=0.4;AO=16;DP=46;FAO=16;FDP=40;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=18;FWDB=0.112788;FXX=0;HRUN=3;LEN=2;MLLD=20.1091;QD=8.86619;RBI=0.152468;REFB=-0.11236;REVB=-0.102594;RO=24;SAF=7;SAR=9;SRF=10;SRR=14;SSEN=0.3349;SSEP=0;SSSB=0.0219177;STB=0.617512;STBP=0.263;TYPE=del;VARB=0.157508;OID=.;OPOS=42826580;OREF=GC;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.4:16:46:16:40:24:7:9:6:18:88:24:7:9:10:14
chr17	42851729	.	C	T	306.33	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0195492;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.806;QD=53.275;RBI=0.0241442;REFB=0;REVB=0.0141695;RO=0;SAF=10;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000130913;OID=.;OPOS=42851729;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:23:0:0:22:23:1:12:10:0:0:12:11:0:0
chr17	42852604	.	G	T	754.38	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000479561;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.3473;QD=56.9345;RBI=0.00782454;REFB=0;REVB=0.00780983;RO=0;SAF=27;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.91724e-05;OID=.;OPOS=42852604;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:26:27:0:0:26:27:0:0
chr17	42852610	.	T	C	785.21	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144013;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.346;QD=57.1061;RBI=0.0215823;REFB=0;REVB=-0.0160748;RO=0;SAF=28;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.4002e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.53737e-06;OID=.;OPOS=42852610;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:27:28:0:0:27:28:0:0
chr17	42854610	.	T	C	714.2	PASS	AF=1;AO=50;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00443067;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.2259;QD=56.0156;RBI=0.0427839;REFB=0;REVB=0.0425539;RO=0;SAF=24;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.10374e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00131518;OID=.;OPOS=42854610;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:50:51:1:26:24:0:0:27:24:0:0
chr17	42855554	.	T	C	613.26	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0137221;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.895;QD=61.3255;RBI=0.0530383;REFB=0;REVB=0.0512325;RO=0;SAF=25;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000259205;OID=.;OPOS=42855554;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:15:25:0:0:15:25:0:0
chr17	42857430	.	G	A	1050.98	PASS	AF=0.973333;AO=71;DP=74;FAO=73;FDP=75;FR=.;FRO=2;FSAF=31;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00860362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.282;QD=56.0524;RBI=0.0324862;REFB=-0.181756;REVB=0.0313262;RO=2;SAF=31;SAR=40;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0230558;STB=0.511625;STBP=0.233;TYPE=snp;VARB=0.00287076;OID=.;OPOS=42857430;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:74:75:2:2:71:73:0.973333:40:31:0:2:42:31:0:2
chr17	42857517	.	C	T	714.34	PASS	AF=0.947368;AO=53;DP=57;FAO=54;FDP=57;FR=.;FRO=3;FSAF=32;FSAR=22;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0272028;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.37;QD=50.1288;RBI=0.0299533;REFB=-0.0286236;REVB=0.0125384;RO=2;SAF=31;SAR=22;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00597873;STB=0.504042;STBP=0.789;TYPE=snp;VARB=0.00119397;OID=.;OPOS=42857517;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:57:57:2:3:53:54:0.947368:22:31:1:1:22:32:2:1
chr17	42925559	.	C	T	789.27	PASS	AF=1;AO=55;DP=56;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0117459;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.659;QD=57.4012;RBI=0.014494;REFB=0;REVB=0.00849178;RO=0;SAF=30;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000255753;OID=.;OPOS=42925559;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:55:0:0:55:55:1:25:30:0:0:25:30:0:0
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chr17	42953409	.	A	G	113.16	PASS	AF=0.291667;AO=14;DP=48;FAO=14;FDP=48;FR=.;FRO=34;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=0.00880418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.747;QD=9.43035;RBI=0.048578;REFB=-0.00695708;REVB=-0.0477735;RO=32;SAF=9;SAR=5;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133245;STB=0.603508;STBP=0.379;TYPE=snp;VARB=0.0164195;OID=.;OPOS=42953409;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:32:34:14:14:0.291667:5:9:17:15:5:9:17:17
chr17	42961009	.	C	T	740.44	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000648776;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.432;QD=56.9567;RBI=0.0215403;REFB=0;REVB=-0.0215306;RO=0;SAF=24;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000102865;OID=.;OPOS=42961009;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:28:24:0:0:28:24:0:0
chr17	42983095	.	G	A	255.25	PASS	AF=0.785714;AO=22;DP=28;FAO=22;FDP=28;FR=.;FRO=6;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0725373;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.0663;QD=36.4637;RBI=0.138294;REFB=0.0687316;REVB=0.117743;RO=6;SAF=9;SAR=13;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102244;STB=0.55587;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=-0.0140863;OID=.;OPOS=42983095;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:28:28:6:6:22:22:0.785714:13:9:4:2:13:9:4:2
chr17	42989063	.	C	T	99.97	PASS	AF=0.25;AO=15;DP=60;FAO=15;FDP=60;FR=.;FRO=45;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=24;FSRR=21;FWDB=-0.00378049;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.9761;QD=6.66442;RBI=0.0181223;REFB=-0.0147379;REVB=-0.0177236;RO=45;SAF=10;SAR=5;SRF=24;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168539;STB=0.604508;STBP=0.376;TYPE=snp;VARB=0.0340801;OID=.;OPOS=42989063;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:45:45:15:15:0.25:5:10:24:21:5:10:24:21
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chr17	43111688	.	G	A	271.38	PASS	AF=0.543478;AO=25;DP=46;FAO=25;FDP=46;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.0071284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.227;QD=23.598;RBI=0.00843204;REFB=-0.0347207;REVB=0.0045039;RO=21;SAF=11;SAR=14;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0689383;STB=0.538431;STBP=0.6;TYPE=snp;VARB=0.0206764;OID=.;OPOS=43111688;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:21:21:25:25:0.543478:14:11:11:10:14:11:11:10
chr17	43159060	.	ACAAAAAAAG	ACAAAAAAAAG,ACAAAAAAAGA,CAAAAGAAAG	68.22	PASS	AF=0.0731707,0.292683,0;AO=5,5,4;DP=46;FAO=3,12,0;FDP=41;FR=.;FRO=26;FSAF=0,9,0;FSAR=3,3,0;FSRF=7;FSRR=19;FWDB=1.3402,0.0137703,-0.13047;FXX=0;HRUN=7,2,3;LEN=1,1,6;MLLD=7.13314,15.5603,177.31;QD=6.65598;RBI=1.34451,0.0769832,0.133356;REFB=-0.199773,-0.0923266,0.0324378;REVB=0.107595,-0.0757416,-0.0275935;RO=20;SAF=1,0,4;SAR=4,5,0;SRF=5;SRR=15;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.0827942,-0.621039,0.741506;STB=0.994977,0.804419,0.5;STBP=0.216,0.019,1;TYPE=ins,ins,mnp;VARB=-0.0203621,0.156044,0;OID=.,.,.;OPOS=43159062,43159070,43159060;OREF=-,-,ACAAAA;OALT=A,A,CAAAAG;OMAPALT=ACAAAAAAAAG,ACAAAAAAAGA,CAAAAGAAAG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:59:46:41:20:26:5,5,4:3,12,0:0.0731707,0.292683,0:4,5,0:1,0,4:5:15:3,3,0:0,9,0:7:19
chr17	43176804	.	C	T	79.87	PASS	AF=0.218182;AO=12;DP=55;FAO=12;FDP=55;FR=.;FRO=43;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=20;FSRR=23;FWDB=0.00150069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.91;QD=5.80898;RBI=0.0151019;REFB=0.00101327;REVB=0.0150271;RO=43;SAF=10;SAR=2;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.474999;STB=0.805913;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=-0.00435547;OID=.;OPOS=43176804;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:79:55:55:43:43:12:12:0.218182:2:10:20:23:2:10:20:23
chr17	43181287	.	A	G	613.36	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0011766;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.113;QD=61.3364;RBI=0.0157366;REFB=0;REVB=0.0156925;RO=0;SAF=25;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.44709e-05;OID=.;OPOS=43181287;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:15:25:0:0:15:25:0:0
chr17	43181325	.	A	G	501.25	PASS	AF=0.822222;AO=37;DP=45;FAO=37;FDP=45;FR=.;FRO=8;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0190697;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.286;QD=44.5556;RBI=0.022034;REFB=-0.025368;REVB=0.0110385;RO=8;SAF=21;SAR=16;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0226473;STB=0.512188;STBP=0.759;TYPE=snp;VARB=0.00710397;OID=.;OPOS=43181325;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:49:45:45:8:8:37:37:0.822222:16:21:4:4:16:21:4:4
chr17	43183028	.	G	A	266.37	PASS	AF=0.333333;AO=32;DP=97;FAO=32;FDP=96;FR=.;FRO=64;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=36;FSRR=28;FWDB=0.00032259;FXX=0.0103082;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.405;QD=11.0986;RBI=0.00501688;REFB=-0.00100985;REVB=0.0050065;RO=64;SAF=14;SAR=18;SRF=36;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142861;STB=0.58285;STBP=0.263;TYPE=snp;VARB=0.00105278;OID=.;OPOS=43183028;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:96:64:64:32:32:0.333333:18:14:36:28:18:14:36:28
chr17	43183108	.	G	A	254.55	PASS	AF=0.29661;AO=35;DP=118;FAO=35;FDP=118;FR=.;FRO=83;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=54;FSRR=29;FWDB=-0.0338893;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.461;QD=8.62866;RBI=0.0352674;REFB=-0.00408603;REVB=-0.00976258;RO=83;SAF=20;SAR=15;SRF=54;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0986736;STB=0.557757;STBP=0.457;TYPE=snp;VARB=0.00845828;OID=.;OPOS=43183108;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:118:118:83:83:35:35:0.29661:15:20:54:29:15:20:54:29
chr17	43192821	.	A	G	109.05	PASS	AF=0.916667;AO=11;DP=12;FAO=11;FDP=12;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00693174;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.395;QD=36.3494;RBI=0.0194893;REFB=-0.0549413;REVB=-0.018215;RO=0;SAF=6;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.538392;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=0.00208859;OID=.;OPOS=43192821;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:12:12:0:1:11:11:0.916667:5:6:0:0:5:6:1:0
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chr17	43227214	.	T	C	149.67	PASS	AF=0.283784;AO=22;DP=74;FAO=21;FDP=74;FR=.;FRO=53;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=27;FSRR=26;FWDB=0.00312452;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.099;QD=8.09037;RBI=0.0123736;REFB=-0.00798451;REVB=-0.0119727;RO=52;SAF=13;SAR=9;SRF=27;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0858381;STB=0.579975;STBP=0.418;TYPE=snp;VARB=0.0132222;OID=.;OPOS=43227214;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:52:53:22:21:0.283784:9:13:27:25:8:13:27:26
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chr17	43319770	.	C	T	248.79	PASS	AF=0.357143;AO=29;DP=83;FAO=30;FDP=84;FR=.;FRO=54;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=21;FSRR=33;FWDB=0.0196773;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.998;QD=11.8471;RBI=0.0232192;REFB=-0.00943791;REVB=-0.0123262;RO=53;SAF=11;SAR=18;SRF=20;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00231858;STB=0.507458;STBP=0.929;TYPE=snp;VARB=0.0136576;OID=.;OPOS=43319770;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:84:53:54:29:30:0.357143:18:11:20:33:18:12:21:33
chr17	43333125	.	C	T	162.5	PASS	AF=0.367347;AO=18;DP=49;FAO=18;FDP=49;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=0.0110585;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.869;QD=13.2649;RBI=0.0244034;REFB=-0.00203331;REVB=-0.021754;RO=31;SAF=9;SAR=9;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0524461;STB=0.530578;STBP=0.767;TYPE=snp;VARB=0.002479;OID=.;OPOS=43333125;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:31:31:18:18:0.367347:9:9:17:14:9:9:17:14
chr17	43340936	.	G	A	182.12	PASS	AF=0.44186;AO=19;DP=43;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=0.000225095;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.289;QD=16.9412;RBI=0.0155361;REFB=-0.0221429;REVB=0.0155345;RO=22;SAF=6;SAR=13;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141531;STB=0.586113;STBP=0.331;TYPE=snp;VARB=0.0414817;OID=.;OPOS=43340936;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:22:24:19:19:0.44186:13:6:10:12:13:6:11:13
chr17	43342141	.	G	C	885.35	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00991098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.842;QD=58.0558;RBI=0.0288813;REFB=0;REVB=0.0271275;RO=0;SAF=33;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000124798;OID=.;OPOS=43342141;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:28:33:0:0:28:33:0:0
chr17	43364293	.	C	CG	456.51	PASS	AF=1;AO=37;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0301773;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=24.0732;QD=48.0534;RBI=0.0604562;REFB=0;REVB=-0.0523859;RO=0;SAF=16;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.7558e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00283688;OID=.;OPOS=43364294;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:37:38:38:38:0:16:22:0:0:8:0:16:21:0:0
chr17	43923180	.	G	A	594.54	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.025392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.937;QD=60.9782;RBI=0.0558289;REFB=0;REVB=0.0497204;RO=0;SAF=30;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.68708e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000276707;OID=.;OPOS=43923180;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:9:30:0:0:9:30:0:0
chr17	43923898	.	A	G	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0408711;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.5161;QD=46.8479;RBI=0.0458378;REFB=0;REVB=-0.0207522;RO=0;SAF=9;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000570629;OID=.;OPOS=43923898;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:6:9:0:0:6:9:0:0
chr17	43924412	.	T	C	901.01	PASS	AF=1;AO=61;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.011899;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.014;QD=58.1297;RBI=0.0124125;REFB=0;REVB=0.00353328;RO=0;SAF=29;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.90152e-05;OID=.;OPOS=43924412;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:61:62:1:32:29:0:0:33:29:0:0
chr17	44061025	.	C	T	729.77	PASS	AF=0.60177;AO=68;DP=113;FAO=68;FDP=113;FR=.;FRO=45;FSAF=42;FSAR=26;FSRF=25;FSRR=20;FWDB=0.0103297;FXX=0.0173898;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.582;QD=25.8325;RBI=0.0244223;REFB=-0.0136859;REVB=0.0221302;RO=45;SAF=42;SAR=26;SRF=25;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0475173;STB=0.52585;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=0.0100926;OID=.;OPOS=44061025;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:113:45:45:68:68:0.60177:26:42:25:20:26:42:25:20
chr17	44067382	.	T	C	393.32	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0757478;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.3115;QD=56.1886;RBI=0.0766551;REFB=0;REVB=0.0117588;RO=0;SAF=10;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00087509;OID=.;OPOS=44067382;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:18:10:0:0:18:10:0:0
chr17	44077044	.	T	C	61.29	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0397826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.68;QD=35.0237;RBI=0.0960937;REFB=0;REVB=0.087472;RO=0;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00148231;OID=.;OPOS=44077044;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:7:0:0:6:7:1:2:4:0:0:3:4:0:0
chr17	44109474	.	G	A	475.72	PASS	AF=0.784314;AO=40;DP=51;FAO=40;FDP=51;FR=.;FRO=11;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=0.0120709;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.179;QD=37.3114;RBI=0.0299968;REFB=-0.055223;REVB=0.0274609;RO=10;SAF=21;SAR=19;SRF=8;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103113;STB=0.543907;STBP=0.245;TYPE=snp;VARB=0.0114057;OID=.;OPOS=44109474;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:51:51:10:11:40:40:0.784314:19:21:8:2:19:21:8:3
chr17	44144993	.	C	G	411.02	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00486136;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.239;QD=56.6921;RBI=0.0326195;REFB=0;REVB=0.0322552;RO=0;SAF=17;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.0947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000140828;OID=.;OPOS=44144993;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:12:17:0:0:12:17:0:0
chr17	44408406	.	A	G	54.42	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0342372;FXX=0.142653;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.839;QD=36.2817;RBI=0.0342591;REFB=0;REVB=0.00122702;RO=0;SAF=3;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0010466;OID=.;OPOS=44408406;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:6:6:0:0:6:6:1:3:3:0:0:3:3:0:0
chr17	44950122	.	T	C	78.63	PASS	AF=0.47619;AO=10;DP=21;FAO=10;FDP=21;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.0197287;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.314;QD=14.9781;RBI=0.0200467;REFB=-0.000340514;REVB=-0.00355628;RO=10;SAF=4;SAR=6;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0873356;STB=0.529352;STBP=0.786;TYPE=snp;VARB=0.000147782;OID=.;OPOS=44950122;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:21:21:10:11:10:10:0.47619:6:4:5:5:6:4:5:6
chr17	45000529	.	G	C	1409.45	PASS	AF=1;AO=89;DP=89;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00174755;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.133;QD=62.6423;RBI=0.0180332;REFB=0;REVB=0.0179484;RO=0;SAF=34;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.58117e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.81107e-05;OID=.;OPOS=45000529;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:89:90:0:0:89:90:1:55:34:0:0:56:34:0:0
chr17	45000547	.	G	C	1349.91	PASS	AF=0.977778;AO=88;DP=90;FAO=88;FDP=90;FR=.;FRO=2;FSAF=35;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0151742;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=57.894;QD=59.9959;RBI=0.0213768;REFB=-0.240699;REVB=-0.0150569;RO=2;SAF=35;SAR=53;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0175454;STB=0.509257;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=0.00463138;OID=.;OPOS=45000547;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:90:90:2:2:88:88:0.977778:53:35:0:2:53:35:0:2
chr17	45008570	.	G	A	73.84	PASS	AF=0.30303;AO=10;DP=34;FAO=10;FDP=33;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=0.0239659;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.635;QD=8.95007;RBI=0.0242669;REFB=0.00340931;REVB=-0.00381062;RO=24;SAF=6;SAR=4;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115678;STB=0.585194;STBP=0.562;TYPE=snp;VARB=-0.00614196;OID=.;OPOS=45008570;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:34:33:24:23:10:10:0.30303:4:6:12:12:4:6:11:12
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chr17	45214523	.	A	C	43.83	PASS	AF=0.25;AO=7;DP=28;FAO=7;FDP=28;FR=.;FRO=21;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.0130426;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.263;QD=6.26132;RBI=0.0131033;REFB=-0.00328145;REVB=0.00125982;RO=21;SAF=4;SAR=3;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0557603;STB=0.535979;STBP=0.787;TYPE=snp;VARB=0.00371094;OID=.;OPOS=45214523;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:28:28:21:21:7:7:0.25:3:4:11:10:3:4:11:10
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chr17	45214544	.	T	C	71.21	PASS	AF=0.25641;AO=8;DP=38;FAO=10;FDP=39;FR=.;FRO=29;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.026341;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.868;QD=7.30362;RBI=0.0447538;REFB=-0.0217409;REVB=-0.0361809;RO=30;SAF=3;SAR=5;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112662;STB=0.512795;STBP=0.945;TYPE=snp;VARB=0.0648071;OID=.;OPOS=45214544;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:71:38:39:30:29:8:10:0.25641:5:3:14:16:5:5:14:15
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chr17	45214582	.	A	G	57.48	PASS	AF=0.176471;AO=9;DP=51;FAO=9;FDP=51;FR=.;FRO=42;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=-0.0149123;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=231.717;QD=4.50854;RBI=0.0174135;REFB=-7.37576e-05;REVB=0.00899198;RO=42;SAF=6;SAR=3;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151532;STB=0.602505;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=0.000845325;OID=.;OPOS=45214582;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:51:51:42:42:9:9:0.176471:3:6:23:19:3:6:23:19
chr17	45214606	.	G	T	35.27	PASS	AF=0.159091;AO=6;DP=44;FAO=7;FDP=44;FR=.;FRO=37;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=-0.00601772;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.102;QD=3.20631;RBI=0.011409;REFB=-0.00470685;REVB=-0.00969293;RO=34;SAF=4;SAR=2;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0987119;STB=0.52624;STBP=0.955;TYPE=snp;VARB=0.0156078;OID=.;OPOS=45214606;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:44:44:34:37:6:7:0.159091:2:4:20:14:3:4:20:17
chr17	45214631	.	G	A	72.7	PASS	AF=0.30303;AO=10;DP=33;FAO=10;FDP=33;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=0.00226198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.845;QD=8.81223;RBI=0.0150291;REFB=-0.00726464;REVB=-0.0148579;RO=21;SAF=7;SAR=3;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.304965;STB=0.712155;STBP=0.138;TYPE=snp;VARB=0.0139064;OID=.;OPOS=45214631;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:33:33:21:23:10:10:0.30303:3:7:9:12:3:7:9:14
chr17	45214643	.	A	C,T	66.72	PASS	AF=0.142857,0.142857;AO=5,5;DP=35;FAO=5,5;FDP=35;FR=.;FRO=25;FSAF=3,3;FSAR=2,2;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=0.0334268,-0.021654;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=52.0212,242.528;QD=7.62476;RBI=0.0890771,0.0229276;REFB=0.000287903,-0.00272563;REVB=0.0825674,0.00753534;RO=25;SAF=3,3;SAR=2,2;SRF=10;SRR=15;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.230261,0.230261;STB=0.661718,0.661718;STBP=0.502,0.502;TYPE=snp,snp;VARB=0.0515138,0.00784696;OID=.,.;OPOS=45214643,45214643;OREF=A,A;OALT=C,T;OMAPALT=C,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:29:35:35:25:25:5,5:5,5:0.142857,0.142857:2,2:3,3:10:15:2,2:3,3:10:15
chr17	45214682	.	A	G	55.03	PASS	AF=0.347826;AO=8;DP=23;FAO=8;FDP=23;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.0204557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.937;QD=9.56961;RBI=0.0206658;REFB=-0.00207697;REVB=-0.00293906;RO=15;SAF=5;SAR=3;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169958;STB=0.604132;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.00124987;OID=.;OPOS=45214682;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:23:23:15:15:8:8:0.347826:3:5:7:8:3:5:7:8
chr17	45216172	.	A	G	43.41	PASS	AF=0.233333;AO=7;DP=30;FAO=7;FDP=30;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.00527035;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.7196;QD=5.78804;RBI=0.0309652;REFB=0.0104818;REVB=-0.0305134;RO=23;SAF=6;SAR=1;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.446805;STB=0.799041;STBP=0.098;TYPE=snp;VARB=-0.0145213;OID=.;OPOS=45216172;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:30:30:23:23:7:7:0.233333:1:6:12:11:1:6:12:11
chr17	45216210	.	A	G	100.75	PASS	AF=0.48;AO=12;DP=25;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=-0.00403282;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.4779;QD=16.1191;RBI=0.00799391;REFB=-0.0203708;REVB=0.0069021;RO=13;SAF=10;SAR=2;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.507764;STB=0.796571;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.00778403;OID=.;OPOS=45216210;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:25:13:13:12:12:0.48:2:10:4:9:2:10:4:9
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chr17	45216231	.	T	C	78.61	PASS	AF=0.47619;AO=10;DP=21;FAO=10;FDP=21;FR=.;FRO=11;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=-0.000701831;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.9068;QD=14.9742;RBI=0.00170273;REFB=0.00292212;REVB=-0.00155136;RO=11;SAF=9;SAR=1;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.578494;STB=0.846249;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=-0.00361819;OID=.;OPOS=45216231;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:21:21:11:11:10:10:0.47619:1:9:4:7:1:9:4:7
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chr17	45234343	.	T	G	327.87	PASS	AF=0.578947;AO=33;DP=57;FAO=33;FDP=57;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=-0.000173939;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=282.697;QD=23.0081;RBI=0.00405972;REFB=-0.00906105;REVB=-0.00405599;RO=24;SAF=12;SAR=21;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140409;STB=0.57751;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.00615412;OID=.;OPOS=45234343;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:24:24:33:33:0.578947:21:12:13:11:21:12:13:11
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chr17	45234417	.	A	G	32.5	PASS	AF=0.125;AO=6;DP=48;FAO=6;FDP=48;FR=.;FRO=42;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=16;FSRR=26;FWDB=0.000410024;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.3;QD=2.70866;RBI=0.0186576;REFB=0.00230735;REVB=-0.0186531;RO=42;SAF=4;SAR=2;SRF=16;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.325071;STB=0.736116;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=-0.0270159;OID=.;OPOS=45234417;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:32:48:48:42:42:6:6:0.125:2:4:16:26:2:4:16:26
chr17	45234420	.	T	G	217.25	PASS	AF=0.478261;AO=21;DP=46;FAO=22;FDP=46;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=0.0181393;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.7652;QD=18.8911;RBI=0.0197203;REFB=-0.0314355;REVB=-0.00773662;RO=23;SAF=11;SAR=10;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20174;STB=0.609278;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=0.0253928;OID=.;OPOS=45234420;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:23:24:21:22:0.478261:10:11:7:16:10:12:8:16
chr17	45234430	.	A	G	130.22	PASS	AF=0.348837;AO=15;DP=45;FAO=15;FDP=43;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=19;FWDB=0.00519476;FXX=0.0444346;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.845;QD=12.1131;RBI=0.0079478;REFB=-0.00529567;REVB=-0.00601514;RO=30;SAF=7;SAR=8;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114115;STB=0.596092;STBP=0.391;TYPE=snp;VARB=0.00960066;OID=.;OPOS=45234430;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:43:30:28:15:15:0.348837:8:7:11:19:8:7:9:19
chr17	45234434	.	A	G	103.07	PASS	AF=0.302326;AO=13;DP=43;FAO=13;FDP=43;FR=.;FRO=30;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=0.0133413;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.478;QD=9.58765;RBI=0.029931;REFB=-0.0206059;REVB=-0.0267932;RO=30;SAF=6;SAR=7;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151881;STB=0.591107;STBP=0.461;TYPE=snp;VARB=0.0427249;OID=.;OPOS=45234434;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:30:30:13:13:0.302326:7:6:10:20:7:6:10:20
chr17	45249316	.	T	C	34.29	PASS	AF=0.181818;AO=6;DP=33;FAO=6;FDP=33;FR=.;FRO=27;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.0234927;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.749;QD=4.15619;RBI=0.0341032;REFB=-0.00108268;REVB=0.0247208;RO=27;SAF=3;SAR=3;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0659999;STB=0.545305;STBP=0.843;TYPE=snp;VARB=0.00598325;OID=.;OPOS=45249316;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:33:33:27:27:6:6:0.181818:3:3:12:15:3:3:12:15
chr17	45249330	.	T	G	34.31	PASS	AF=0.146341;AO=6;DP=43;FAO=6;FDP=41;FR=.;FRO=35;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=0.00348712;FXX=0.0465008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.005;QD=3.34775;RBI=0.00659717;REFB=0.00194257;REVB=-0.00560024;RO=37;SAF=3;SAR=3;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0479275;STB=0.512155;STBP=0.922;TYPE=snp;VARB=-0.0109002;OID=.;OPOS=45249330;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:43:41:37:35:6:6:0.146341:3:3:17:20:3:3:17:18
chr17	45258971	.	A	G	34.88	PASS	AF=0.114754;AO=7;DP=61;FAO=7;FDP=61;FR=.;FRO=54;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=23;FSRR=31;FWDB=-0.0223548;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.1725;QD=2.2874;RBI=0.0522128;REFB=-0.000451492;REVB=0.0471852;RO=54;SAF=6;SAR=1;SRF=23;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.494266;STB=0.867765;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.00494033;OID=.;OPOS=45258971;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:61:61:54:54:7:7:0.114754:1:6:23:31:1:6:23:31
chr17	45266522	.	T	C	155.26	PASS	AF=0.328125;AO=21;DP=64;FAO=21;FDP=64;FR=.;FRO=43;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=26;FWDB=0.0170158;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=40.1664;QD=9.70396;RBI=0.0483756;REFB=-0.0391677;REVB=-0.0452842;RO=43;SAF=8;SAR=13;SRF=17;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0173305;STB=0.510194;STBP=0.902;TYPE=snp;VARB=0.0771319;OID=.;OPOS=45266522;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:43:43:21:21:0.328125:13:8:17:26:13:8:17:26
chr17	45266535	.	T	C	240.12	PASS	AF=0.41791;AO=27;DP=66;FAO=28;FDP=67;FR=.;FRO=39;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=-0.0198587;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.684;QD=14.3355;RBI=0.0277292;REFB=-0.00535948;REVB=-0.0193531;RO=39;SAF=12;SAR=15;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00897579;STB=0.504345;STBP=0.96;TYPE=snp;VARB=0.0102042;OID=.;OPOS=45266535;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:67:39:39:27:28:0.41791:15:12:17:22:16:12:17:22
chr17	45266571	.	T	A	270.64	PASS	AF=0.517857;AO=29;DP=58;FAO=29;FDP=56;FR=.;FRO=27;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=-0.0114104;FXX=0.0344768;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.459;QD=19.3314;RBI=0.0241248;REFB=-0.0142626;REVB=0.0212558;RO=26;SAF=14;SAR=15;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0837786;STB=0.53644;STBP=0.574;TYPE=snp;VARB=0.0123743;OID=.;OPOS=45266571;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:56:26:27:29:29:0.517857:15:14:10:16:15:14:11:16
chr17	45368337	.	A	C	1687.9	PASS	AF=1;AO=111;DP=111;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0285552;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.3947;QD=60.282;RBI=0.0293713;REFB=0;REVB=0.0068755;RO=0;SAF=52;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.41849e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000124121;OID=.;OPOS=45368337;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:111:112:0:0:111:112:1:59:52:0:0:59:53:0:0
chr17	45369777	.	A	G	727.69	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00670856;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.747;QD=57.0735;RBI=0.00915018;REFB=0;REVB=-0.00622262;RO=0;SAF=10;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.12541e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.78298e-06;OID=.;OPOS=45369777;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:41:10:0:0:41:10:0:0
chr17	45369789	.	G	A	716.4	PASS	AF=0.978723;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0636933;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=277.753;QD=60.9699;RBI=0.0638899;REFB=-0.142185;REVB=-0.00500817;RO=1;SAF=7;SAR=39;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0625072;STB=0.533318;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=0.000222634;OID=.;OPOS=45369789;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:47:47:1:1:46:46:0.978723:39:7:1:0:39:7:1:0
chr17	45388586	.	T	A	1504.31	PASS	AF=1;AO=94;DP=95;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00399137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.5862;QD=62.0334;RBI=0.0725429;REFB=0;REVB=0.072433;RO=1;SAF=54;SAR=40;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0117059;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000661394;OID=.;OPOS=45388586;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:95:97:1:0:94:97:1:40:54:0:1:43:54:0:0
chr17	45425287	.	C	T	1325.87	PASS	AF=0.988506;AO=86;DP=87;FAO=86;FDP=87;FR=.;FRO=1;FSAF=51;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00700314;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.7396;QD=60.9597;RBI=0.0110802;REFB=-0.101389;REVB=-0.00858643;RO=1;SAF=51;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00920002;STB=0.504853;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.00139501;OID=.;OPOS=45425287;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:87:87:1:1:86:86:0.988506:35:51:1:0:35:51:1:0
chr17	45700384	.	C	A,CCTA	461.14	PASS	AF=0.0188679,0.754717;AO=2,37;DP=54;FAO=1,40;FDP=53;FR=.;FRO=12;FSAF=1,21;FSAR=0,19;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=-0.0248078,0.0317472;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,3;MLLD=70.8191,189.057;QD=34.8033;RBI=0.0252628,0.0317473;REFB=0.0051527,-0.0232922;REVB=0.00477267,0.000100745;RO=13;SAF=1,19;SAR=1,18;SRF=9;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.204413,-0.0862025;STB=0.98645,0.532866;STBP=0.52,0.397;TYPE=snp,ins;VARB=-0.0460023,0.00889779;OID=.,.;OPOS=45700384,45700385;OREF=C,-;OALT=A,CTA;OMAPALT=A,CCTA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:84:54:53:13:12:2,37:1,40:0.0188679,0.754717:1,18:1,19:9:4:0,19:1,21:8:4
chr17	45700388	.	A	C	39.33	PASS	AF=0.134615;AO=7;DP=52;FAO=7;FDP=52;FR=.;FRO=45;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=22;FSRR=23;FWDB=-0.0237517;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.186;QD=3.02506;RBI=0.0248621;REFB=-0.00237893;REVB=0.00734714;RO=45;SAF=4;SAR=3;SRF=22;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0984039;STB=0.571225;STBP=0.74;TYPE=snp;VARB=0.0338865;OID=.;OPOS=45700388;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:39:52:52:45:45:7:7:0.134615:3:4:22:23:3:4:22:23
chr17	45760349	.	T	C	1003.59	PASS	AF=0.971831;AO=67;DP=70;FAO=69;FDP=71;FR=.;FRO=2;FSAF=46;FSAR=23;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0301955;FXX=0.013887;HRUN=4;LEN=1;MLLD=251.758;QD=56.5401;RBI=0.0310849;REFB=-0.178241;REVB=0.00738281;RO=0;SAF=45;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.510635;STBP=0.436;TYPE=snp;VARB=0.000694468;OID=.;OPOS=45760349;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:70:71:0:2:67:69:0.971831:22:45:0:0:23:46:2:0
chr17	45760429	.	T	C	551.57	PASS	AF=1;AO=37;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0230192;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=191.281;QD=58.0597;RBI=0.0250592;REFB=-0.02574;REVB=0.00990351;RO=1;SAF=22;SAR=15;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0208135;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.37025e-06;OID=.;OPOS=45760429;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:38:38:1:0:37:38:1:15:22:1:0:15:23:0:0
chr17	45760433	.	T	C	557.13	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00444471;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=268.836;QD=60.2307;RBI=0.0221999;REFB=0;REVB=0.0217504;RO=0;SAF=22;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.71015e-05;OID=.;OPOS=45760433;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:37:0:0:36:37:1:14:22:0:0:15:22:0:0
chr17	45885687	.	A	G	1116.96	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156674;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.731;QD=60.3764;RBI=0.0203006;REFB=0;REVB=-0.0129091;RO=0;SAF=39;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.80413e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.33331e-06;OID=.;OPOS=45885687;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:35:39:0:0:35:39:0:0
chr17	45885756	.	C	T	215.24	PASS	AF=0.285714;AO=30;DP=105;FAO=30;FDP=105;FR=.;FRO=75;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=28;FSRR=47;FWDB=0.0292675;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.37;QD=8.1996;RBI=0.0318596;REFB=-0.00898138;REVB=-0.0125874;RO=74;SAF=17;SAR=13;SRF=27;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.239158;STB=0.635427;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.0190531;OID=.;OPOS=45885756;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:105:74:75:30:30:0.285714:13:17:27:47:13:17:28:47
chr17	45887951	.	G	T	173.03	PASS	AF=0.515152;AO=17;DP=32;FAO=17;FDP=33;FR=.;FRO=16;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=-0.0146998;FXX=0.0571265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.688;QD=20.9735;RBI=0.0323974;REFB=-0.0358434;REVB=0.0288706;RO=14;SAF=14;SAR=3;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134204;STB=0.556747;STBP=0.577;TYPE=snp;VARB=0.0392589;OID=.;OPOS=45887951;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:33:14:16:17:17:0.515152:3:14:10:4:3:14:12:4
chr17	45914329	.	C	G	738.51	PASS	AF=0.416244;AO=77;DP=192;FAO=82;FDP=197;FR=.;FRO=115;FSAF=46;FSAR=36;FSRF=67;FSRR=48;FWDB=0.120353;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.8799;QD=14.9952;RBI=0.121108;REFB=-0.0130966;REVB=0.0135011;RO=115;SAF=43;SAR=34;SRF=67;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0262161;STB=0.512856;STBP=0.778;TYPE=snp;VARB=0.0201353;OID=.;OPOS=45914329;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:192:197:115:115:77:82:0.416244:34:43:67:48:36:46:67:48
chr17	45915788	.	T	C	474.57	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0441306;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.633;QD=57.523;RBI=0.0510685;REFB=0;REVB=0.0256997;RO=0;SAF=9;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.15349e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.52523e-05;OID=.;OPOS=45915788;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:33:0:0:31:33:1:22:9:0:0:24:9:0:0
chr17	45994044	.	C	T	834.39	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00395679;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.3996;QD=57.5438;RBI=0.0748544;REFB=0;REVB=0.0747498;RO=0;SAF=30;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000732644;OID=.;OPOS=45994044;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:28:30:0:0:28:30:0:0
chr17	45994094	.	T	C	1358.6	PASS	AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0240619;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.861;QD=62.4646;RBI=0.0240638;REFB=0;REVB=0.000303368;RO=0;SAF=53;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.94041e-05;OID=.;OPOS=45994094;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:34:53:0:0:34:53:0:0
chr17	45994116	.	G	T	272.54	PASS	AF=0.322581;AO=24;DP=84;FAO=30;FDP=93;FR=.,HEALED;FRO=55;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=35;FSRR=20;FWDB=0.00678737;FXX=0.0312467;HRUN=4;LEN=1;MLLD=49.0354;QD=11.7223;RBI=0.00822104;REFB=-0.0156884;REVB=-0.00463866;RO=32;SAF=11;SAR=13;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0529259;STB=0.546453;STBP=0.559;TYPE=snp;VARB=0.0618566;OID=.;OPOS=45994116;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:93:32:55:24:30:0.322581:13:11:13:19:13:17:35:20
chr17	45994154	.	G	A	804.26	PASS	AF=1;AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0458644;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.686;QD=57.4468;RBI=0.0471828;REFB=0;REVB=0.0110757;RO=0;SAF=11;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000203823;OID=.;OPOS=45994154;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:57:56:0:0:56:56:1:45:11:0:0:45:11:0:0
chr17	46002744	.	G	T	1044.16	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103908;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.167;QD=59.6665;RBI=0.0132374;REFB=0;REVB=0.00820132;RO=0;SAF=26;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.0129e-05;OID=.;OPOS=46002744;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:68:70:0:0:68:70:1:42:26:0:0:43:27:0:0
chr17	46005792	.	A	ACT	1232.11	PASS	AF=0.943182;AO=82;DP=90;FAO=83;FDP=88;FR=.;FRO=5;FSAF=35;FSAR=48;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0128913;FXX=0.0222198;HRUN=1;LEN=2;MLLD=242.611;QD=56.0049;RBI=0.0135342;REFB=-0.0508934;REVB=0.00412182;RO=6;SAF=34;SAR=48;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0549789;STB=0.521879;STBP=0.1;TYPE=ins;VARB=0.00231883;OID=.;OPOS=46005793;OREF=-;OALT=CT;OMAPALT=ACT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.943182:82:90:83:88:5:35:48:4:1:15:6:34:48:5:1
chr17	46026156	.	A	G	708.51	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00607615;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.726;QD=62.9787;RBI=0.0309248;REFB=0;REVB=-0.030322;RO=0;SAF=20;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.09779e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.5916e-05;OID=.;OPOS=46026156;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:25:20:0:0:25:20:0:0
chr17	46136133	.	G	C	245.49	PASS	AF=0.560976;AO=23;DP=39;FAO=23;FDP=41;FR=.;FRO=18;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=14;FWDB=-0.0399728;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.652;QD=23.9503;RBI=0.0401193;REFB=-0.013666;REVB=0.00342557;RO=16;SAF=16;SAR=7;SRF=3;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.371818;STB=0.705705;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.00820709;OID=.;OPOS=46136133;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:41:16:18:23:23:0.560976:7:16:3:13:7:16:4:14
chr17	46137055	.	GCTGGAC	G	382.71	PASS	AF=0.686275;AO=35;DP=53;FAO=35;FDP=51;FR=.;FRO=16;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.00394959;FXX=0.0555453;HRUN=1;LEN=6;MLLD=308.306;QD=30.0166;RBI=0.0170135;REFB=-0.0167016;REVB=0.0165487;RO=15;SAF=20;SAR=15;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0161327;STB=0.542349;STBP=0.391;TYPE=del;VARB=0.00668618;OID=.;OPOS=46137056;OREF=CTGGAC;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.686275:35:53:35:51:16:20:15:7:9:99:15:20:15:9:6
chr17	46147945	.	G	A	66.28	PASS	AF=0.409091;AO=9;DP=22;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.0320057;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.831;QD=12.0517;RBI=0.0391303;REFB=-0.00277121;REVB=0.0225124;RO=13;SAF=4;SAR=5;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0170594;STB=0.510181;STBP=0.951;TYPE=snp;VARB=0.00360523;OID=.;OPOS=46147945;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:22:22:13:13:9:9:0.409091:5:4:6:7:5:4:6:7
chr17	46166073	.	G	A	661.5	PASS	AF=0.465278;AO=67;DP=144;FAO=67;FDP=144;FR=.;FRO=77;FSAF=33;FSAR=34;FSRF=37;FSRR=40;FWDB=-0.0183678;FXX=0.00689608;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.602;QD=18.375;RBI=0.018368;REFB=-0.011222;REVB=8.86313e-05;RO=76;SAF=33;SAR=34;SRF=37;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00545946;STB=0.506427;STBP=0.896;TYPE=snp;VARB=0.0084479;OID=.;OPOS=46166073;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:144:144:76:77:67:67:0.465278:34:33:37:39:34:33:37:40
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chr17	46507417	.	G	A	1076.08	PASS	AF=0.64;AO=97;DP=151;FAO=96;FDP=150;FR=.;FRO=54;FSAF=42;FSAR=54;FSRF=23;FSRR=31;FWDB=-0.00660475;FXX=0.00662208;HRUN=5;LEN=1;MLLD=268.743;QD=28.6956;RBI=0.00831955;REFB=-0.000293161;REVB=0.00505887;RO=54;SAF=42;SAR=55;SRF=23;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0047707;STB=0.504236;STBP=0.906;TYPE=snp;VARB=0.000166604;OID=.;OPOS=46507417;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:151:150:54:54:97:96:0.64:55:42:23:31:54:42:23:31
chr17	46607021	.	T	C	2252.11	PASS	AF=0.986842;AO=150;DP=152;FAO=150;FDP=152;FR=.;FRO=2;FSAF=87;FSAR=63;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0352461;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.027;QD=59.2661;RBI=0.0353001;REFB=-0.00814672;REVB=0.0019518;RO=2;SAF=87;SAR=63;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00205398;STB=0.50108;STBP=0.86;TYPE=snp;VARB=0.000638847;OID=.;OPOS=46607021;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:152:152:2:2:150:150:0.986842:63:87:1:1:63:87:1:1
chr17	46626811	.	G	GGACA	140.97	PASS	AF=0.736842;AO=14;DP=19;FAO=14;FDP=19;FR=.;FRO=5;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0106636;FXX=0.049975;HRUN=3;LEN=4;MLLD=385.983;QD=29.6776;RBI=0.0109468;REFB=0.0205602;REVB=-0.00247387;RO=5;SAF=6;SAR=8;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112433;STB=0.562413;STBP=0.404;TYPE=ins;VARB=-0.00535617;OID=.;OPOS=46626812;OREF=-;OALT=GACA;OMAPALT=GGACA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.736842:14:19:14:19:5:6:8:1:4:29:5:6:8:1:4
chr17	46629593	.	G	T	716.34	PASS	AF=0.946429;AO=53;DP=56;FAO=53;FDP=56;FR=.;FRO=3;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0725045;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=103.347;QD=51.1671;RBI=0.0758502;REFB=-0.221304;REVB=0.022279;RO=1;SAF=26;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0177765;STB=0.527262;STBP=0.11;TYPE=snp;VARB=0.00252698;OID=.;OPOS=46629593;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:56:56:1:3:53:53:0.946429:27:26:1:0:27:26:3:0
chr17	46653036	.	AAT	A,AA,AAA	1177.06	PASS	AF=0,0.648485,0;AO=28,57,28;DP=173;FAO=0,107,0;FDP=165;FR=.;FRO=58;FSAF=0,42,0;FSAR=0,65,0;FSRF=31;FSRR=27;FWDB=0.0411605,0.0773497,0.0896967;FXX=0.0178561;HRUN=7,1,1;LEN=2,1,1;MLLD=198.287,203.785,202.617;QD=28.5347;RBI=0.0422294,0.0778643,0.0900976;REFB=0.00718799,0.00651744,0.00582775;REVB=-0.0094409,-0.00893698,-0.00848947;RO=59;SAF=21,15,8;SAR=7,42,20;SRF=30;SRR=29;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.303635,-0.250739,-0.271401;STB=0.5,0.551158,0.5;STBP=1,0.086,1;TYPE=del,del,snp;VARB=0.00106944,-0.00681059,-0.006336;OID=.,.,.;OPOS=46653037,46653038,46653038;OREF=AT,T,T;OALT=-,-,A;OMAPALT=A,AA,AAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,0.648485,0:28,57,28:173:0,107,0:165:58:0,42,0:0,65,0:31:27:99:59:21,15,8:7,42,20:30:29
chr17	46670520	.	T	C	825.51	PASS	AF=0.967213;AO=59;DP=61;FAO=59;FDP=61;FR=.;FRO=2;FSAF=43;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00542546;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=200.81;QD=54.1317;RBI=0.0194128;REFB=-0.0194491;REVB=-0.0186392;RO=2;SAF=43;SAR=16;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0177319;STB=0.509404;STBP=0.553;TYPE=snp;VARB=0.000323067;OID=.;OPOS=46670520;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:61:61:2:2:59:59:0.967213:16:43:1:1:16:43:1:1
chr17	46684929	.	A	G	410.09	PASS	AF=0.629032;AO=39;DP=62;FAO=39;FDP=62;FR=.;FRO=23;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=0.0565166;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.633;QD=26.4576;RBI=0.056827;REFB=-0.00466363;REVB=0.00593089;RO=23;SAF=18;SAR=21;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0183038;STB=0.509995;STBP=0.846;TYPE=snp;VARB=0.00452503;OID=.;OPOS=46684929;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:23:23:39:39:0.629032:21:18:10:13:21:18:10:13
chr17	46688089	.	GC	CG,G	64.57	PASS	AF=0.125,0.46875;AO=5,12;DP=32;FAO=4,15;FDP=32;FR=.;FRO=13;FSAF=0,6;FSAR=4,9;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=-0.0199097,0.243955;FXX=0;HRUN=1,8;LEN=2,1;MLLD=159.629,6.52474;QD=8.07076;RBI=0.0584877,0.251106;REFB=-0.0164742,-0.0843812;REVB=-0.0549947,-0.0595004;RO=11;SAF=0,4;SAR=5,8;SRF=5;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.712192,-0.10822;STB=0.996184,0.545395;STBP=0.128,0.669;TYPE=mnp,del;VARB=0.0914545,0.142068;OID=.,.;OPOS=46688089,46688090;OREF=GC,C;OALT=CG,-;OMAPALT=CG,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:32:32:32:11:13:5,12:4,15:0.125,0.46875:5,8:0,4:5:6:4,9:0,6:4:9
chr17	46688135	.	G	A	100.73	PASS	AF=0.48;AO=12;DP=25;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.00722088;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.941;QD=16.1159;RBI=0.00724322;REFB=-0.0173354;REVB=0.000568363;RO=13;SAF=4;SAR=8;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122788;STB=0.571306;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.0372507;OID=.;OPOS=46688135;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:25:13:13:12:12:0.48:8:4:6:7:8:4:6:7
chr17	46688256	.	T	C	617.03	PASS	AF=1;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0587355;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.1991;QD=61.703;RBI=0.076874;REFB=0;REVB=0.049596;RO=0;SAF=25;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00123209;OID=.;OPOS=46688256;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:40:0:0:40:40:1:15:25:0:0:15:25:0:0
chr17	46689680	.	C	A	305.99	PASS	AF=0.722222;AO=24;DP=34;FAO=26;FDP=36;FR=.;FRO=10;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.0316721;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.046;QD=33.9987;RBI=0.0321483;REFB=-0.0151954;REVB=0.00551296;RO=8;SAF=9;SAR=15;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.40172e-08;STB=0.504501;STBP=0.932;TYPE=snp;VARB=0.00545878;OID=.;OPOS=46689680;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:71:34:36:8:10:24:26:0.722222:15:9:3:5:16:10:4:6
chr17	46842983	.	T	C	508.33	PASS	AF=0.972222;AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0220453;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.93;QD=56.4815;RBI=0.0272781;REFB=-0.018021;REVB=0.0160654;RO=1;SAF=19;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0239852;STB=0.512813;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.00126158;OID=.;OPOS=46842983;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:36:36:1:1:35:35:0.972222:16:19:1:0:16:19:1:0
chr17	46881748	.	T	C	708.56	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00150336;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=300.282;QD=62.9828;RBI=0.0167691;REFB=0;REVB=0.0167016;RO=0;SAF=22;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.19305e-05;OID=.;OPOS=46881748;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:23:22:0:0:23:22:0:0
chr17	46923384	.	G	A	1359.28	PASS	AF=0.988764;AO=86;DP=90;FAO=88;FDP=89;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0340355;FXX=0.0219756;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.605;QD=61.0913;RBI=0.0382154;REFB=0.0220742;REVB=-0.0173783;RO=0;SAF=41;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505375;STBP=0.492;TYPE=snp;VARB=-0.000622823;OID=.;OPOS=46923384;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:90:89:0:1:86:88:0.988764:45:41:0:0:46:42:0:1
chr17	46926615	.	G	A	689.24	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00409731;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.0943;QD=62.6581;RBI=0.0874029;REFB=0;REVB=0.0873068;RO=0;SAF=28;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00100427;OID=.;OPOS=46926615;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:16:28:0:0:16:28:0:0
chr17	46934007	.	A	C	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000279236;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.722;QD=46.8478;RBI=0.029455;REFB=0;REVB=0.0294537;RO=0;SAF=8;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000321723;OID=.;OPOS=46934007;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:7:8:0:0:7:8:0:0
chr17	46939603	.	T	G	73.06	PASS	AF=0.3125;AO=10;DP=32;FAO=10;FDP=32;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=22;FSRR=0;FWDB=0.00577376;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=193.435;QD=9.13237;RBI=0.0317116;REFB=-0.00132453;REVB=0.0311815;RO=22;SAF=6;SAR=4;SRF=22;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.580257;STB=0.823195;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=0.00230371;OID=.;OPOS=46939603;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:32:32:22:22:10:10:0.3125:4:6:22:0:4:6:22:0
chr17	46970836	.	A	G	955.2	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00684125;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.326;QD=58.7817;RBI=0.0175691;REFB=0;REVB=0.0161825;RO=0;SAF=34;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.32845e-05;OID=.;OPOS=46970836;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:65:0:0:64:65:1:30:34:0:0:30:35:0:0
chr17	46971140	.	G	A	223.15	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0443947;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.8243;QD=49.589;RBI=0.0449475;REFB=0;REVB=0.00702793;RO=0;SAF=11;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00211779;OID=.;OPOS=46971140;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:7:11:0:0:7:11:0:0
chr17	46972479	.	ATCTC	A	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0269356;FXX=0;HRUN=1;LEN=4;MLLD=248.997;QD=45.8068;RBI=0.0273585;REFB=0;REVB=-0.00479158;RO=0;SAF=9;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00021012;OID=.;OPOS=46972480;OREF=TCTC;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:14:14:14:14:0:9:5:0:0:4:0:9:5:0:0
chr17	47000251	.	C	T	1302.17	PASS	AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.015123;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.109;QD=62.0082;RBI=0.0185738;REFB=0;REVB=-0.0107834;RO=0;SAF=40;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.123e-05;OID=.;OPOS=47000251;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:44:40:0:0:44:40:0:0
chr17	47014675	.	C	T	447.03	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00328188;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.818;QD=57.6806;RBI=0.0055877;REFB=0;REVB=-0.00452236;RO=0;SAF=19;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.47712e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.94841e-06;OID=.;OPOS=47014675;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:12:19:0:0:12:19:0:0
chr17	47026836	.	G	C	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00577498;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.88;QD=50.4133;RBI=0.00582728;REFB=0;REVB=0.000778928;RO=0;SAF=11;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.41338e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.16196e-05;OID=.;OPOS=47026836;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:8:11:0:0:8:11:0:0
chr17	47039132	.	T	C	435.66	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0304827;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.201;QD=58.088;RBI=0.0386972;REFB=0;REVB=-0.0238387;RO=0;SAF=9;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00160667;OID=.;OPOS=47039132;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:21:9:0:0:21:9:0:0
chr17	47210429	.	A	G	132.05	PASS	AF=0.275362;AO=19;DP=69;FAO=19;FDP=69;FR=.;FRO=50;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=25;FSRR=25;FWDB=-0.048478;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.8491;QD=7.65478;RBI=0.0908261;REFB=0.0169289;REVB=-0.0768067;RO=49;SAF=8;SAR=11;SRF=24;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0829015;STB=0.557543;STBP=0.564;TYPE=snp;VARB=-0.0717039;OID=.;OPOS=47210429;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:49:50:19:19:0.275362:11:8:24:25:11:8:25:25
chr17	47210506	.	C	A	131.26	PASS	AF=0.305085;AO=18;DP=59;FAO=18;FDP=59;FR=.;FRO=41;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=28;FWDB=0.00906712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.1514;QD=8.89866;RBI=0.00985155;REFB=-0.0185679;REVB=0.00385233;RO=41;SAF=7;SAR=11;SRF=13;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0905815;STB=0.553695;STBP=0.609;TYPE=snp;VARB=0.0157575;OID=.;OPOS=47210506;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:41:41:18:18:0.305085:11:7:13:28:11:7:13:28
chr17	47241604	.	T	C	809.88	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00187865;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.842;QD=56.8337;RBI=0.0171013;REFB=0;REVB=0.0169978;RO=0;SAF=30;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000711471;OID=.;OPOS=47241604;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:57:57:0:0:57:57:1:27:30:0:0:27:30:0:0
chr17	47293906	.	G	A	625.44	PASS	AF=0.57732;AO=56;DP=97;FAO=56;FDP=97;FR=.;FRO=41;FSAF=26;FSAR=30;FSRF=17;FSRR=24;FWDB=-0.042439;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.001;QD=25.7913;RBI=0.042439;REFB=-0.00270244;REVB=-3.25548e-05;RO=41;SAF=26;SAR=30;SRF=17;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0387238;STB=0.521151;STBP=0.646;TYPE=snp;VARB=0.00192277;OID=.;OPOS=47293906;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:41:41:56:56:0.57732:30:26:17:24:30:26:17:24
chr17	47297297	.	T	C	1739.48	PASS	AF=0.944444;AO=119;DP=127;FAO=119;FDP=126;FR=.;FRO=7;FSAF=52;FSAR=67;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.005369;FXX=0.0078734;HRUN=4;LEN=1;MLLD=212.455;QD=55.2215;RBI=0.00658524;REFB=0.011474;REVB=-0.00381302;RO=6;SAF=52;SAR=67;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00582509;STB=0.500474;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000234267;OID=.;OPOS=47297297;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:17:127:126:6:7:119:119:0.944444:67:52:3:3:67:52:3:4
chr17	47300823	.	G	A	132.12	PASS	AF=0.636364;AO=14;DP=22;FAO=14;FDP=22;FR=.;FRO=8;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=-0.00494771;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=242.263;QD=24.0223;RBI=0.0174486;REFB=-0.00611916;REVB=0.0167324;RO=8;SAF=10;SAR=4;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13675;STB=0.576171;STBP=0.486;TYPE=snp;VARB=0.00262199;OID=.;OPOS=47300823;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:22:22:8:8:14:14:0.636364:4:10:7:1:4:10:7:1
chr17	47676982	.	G	A	87.5	PASS	AF=0.423077;AO=11;DP=26;FAO=11;FDP=26;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=-0.0278673;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.1905;QD=13.4609;RBI=0.0448169;REFB=-0.0169532;REVB=-0.0350994;RO=15;SAF=8;SAR=3;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0716086;STB=0.542293;STBP=0.729;TYPE=snp;VARB=0.0315413;OID=.;OPOS=47676982;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:26:26:15:15:11:11:0.423077:3:8:10:5:3:8:10:5
chr17	47888852	.	A	G	428.92	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0612166;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.033;QD=57.1895;RBI=0.06363;REFB=0;REVB=0.0173581;RO=0;SAF=15;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000400244;OID=.;OPOS=47888852;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:15:15:0:0:15:15:0:0
chr17	48067439	.	G	A	152.39	PASS	AF=0.571429;AO=16;DP=28;FAO=16;FDP=28;FR=.;FRO=12;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=0.000388327;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=91.5215;QD=21.7696;RBI=0.0434668;REFB=-0.0302664;REVB=0.0434651;RO=12;SAF=9;SAR=7;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14855;STB=0.583234;STBP=0.339;TYPE=snp;VARB=0.0217891;OID=.;OPOS=48067439;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:28:28:12:12:16:16:0.571429:7:9:9:3:7:9:9:3
chr17	48067953	.	T	C	429.61	PASS	AF=0.46;AO=46;DP=101;FAO=46;FDP=100;FR=.;FRO=54;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=34;FSRR=20;FWDB=0.0101286;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.952;QD=17.1844;RBI=0.027277;REFB=-0.00373193;REVB=0.0253268;RO=53;SAF=22;SAR=24;SRF=34;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156177;STB=0.58128;STBP=0.149;TYPE=snp;VARB=0.00580067;OID=.;OPOS=48067953;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:100:53:54:46:46:0.46:24:22:34:19:24:22:34:20
chr17	48070878	.	C	T	1034.32	PASS	AF=0.671756;AO=87;DP=130;FAO=88;FDP=131;FR=.;FRO=43;FSAF=50;FSAR=38;FSRF=24;FSRR=19;FWDB=0.000753782;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=308.988;QD=31.5823;RBI=0.00454973;REFB=-0.00169395;REVB=0.00448685;RO=43;SAF=50;SAR=37;SRF=24;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.010391;STB=0.503355;STBP=0.932;TYPE=snp;VARB=0.00082304;OID=.;OPOS=48070878;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:130:131:43:43:87:88:0.671756:37:50:24:19:38:50:24:19
chr17	48072225	.	G	A	234.91	PASS	AF=0.337209;AO=29;DP=86;FAO=29;FDP=86;FR=.;FRO=57;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=37;FWDB=-0.00291866;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=232.959;QD=10.9261;RBI=0.007367;REFB=-0.00605026;REVB=-0.00676418;RO=57;SAF=13;SAR=16;SRF=20;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114272;STB=0.566102;STBP=0.408;TYPE=snp;VARB=0.0115965;OID=.;OPOS=48072225;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:57:57:29:29:0.337209:16:13:20:37:16:13:20:37
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chr17	48155425	.	G	A	386.91	PASS	AF=0.584615;AO=38;DP=65;FAO=38;FDP=65;FR=.;FRO=27;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=23;FSRR=4;FWDB=-0.00314588;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.7553;QD=23.8101;RBI=0.0236599;REFB=-0.0195193;REVB=0.0234498;RO=27;SAF=18;SAR=20;SRF=23;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.284083;STB=0.654877;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.00976658;OID=.;OPOS=48155425;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:27:27:38:38:0.584615:20:18:23:4:20:18:23:4
chr17	48156557	.	G	A	477.71	PASS	AF=0.736842;AO=42;DP=57;FAO=42;FDP=57;FR=.;FRO=15;FSAF=15;FSAR=27;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.00807652;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=260.046;QD=33.5232;RBI=0.0145192;REFB=-0.0318924;REVB=0.0120656;RO=15;SAF=15;SAR=27;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.022557;STB=0.512189;STBP=0.784;TYPE=snp;VARB=0.0138156;OID=.;OPOS=48156557;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:15:15:42:42:0.736842:27:15:6:9:27:15:6:9
chr17	48166980	.	C	T	205.83	PASS	AF=0.571429;AO=20;DP=35;FAO=20;FDP=35;FR=.;FRO=15;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.000722729;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.464;QD=23.5235;RBI=0.00601801;REFB=-0.00847266;REVB=0.00597446;RO=11;SAF=13;SAR=7;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0716039;STB=0.582006;STBP=0.278;TYPE=snp;VARB=0.00484633;OID=.;OPOS=48166980;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:11:15:20:20:0.571429:7:13:6:5:7:13:7:8
chr17	48174908	.	C	T	843.22	PASS	AF=0.592308;AO=77;DP=131;FAO=77;FDP=130;FR=.;FRO=53;FSAF=40;FSAR=37;FSRF=28;FSRR=25;FWDB=0.0232315;FXX=0.00763301;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.663;QD=25.9453;RBI=0.0272371;REFB=-0.0271501;REVB=0.0142182;RO=53;SAF=40;SAR=37;SRF=28;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00662722;STB=0.503602;STBP=0.938;TYPE=snp;VARB=0.0260338;OID=.;OPOS=48174908;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:131:130:53:53:77:77:0.592308:37:40:28:25:37:40:28:25
chr17	48193184	.	C	A	45.35	PASS	AF=0.318182;AO=7;DP=22;FAO=7;FDP=22;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=0.0108214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.195;QD=8.24585;RBI=0.0135525;REFB=-0.0106971;REVB=-0.0081589;RO=15;SAF=5;SAR=2;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0611001;STB=0.538348;STBP=0.856;TYPE=snp;VARB=0.0341545;OID=.;OPOS=48193184;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:22:22:15:15:7:7:0.318182:2:5:10:5:2:5:10:5
chr17	48194991	.	CG	C	73.57	PASS	AF=0.6;AO=7;DP=20;FAO=12;FDP=20;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.292797;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=12.7533;QD=14.713;RBI=0.297382;REFB=-0.109686;REVB=-0.0520176;RO=11;SAF=1;SAR=6;SRF=8;SRR=3;SSEN=0.333333;SSEP=0;SSSB=-0.583505;STB=0.583194;STBP=0.412;TYPE=del;VARB=0.0997831;OID=.;OPOS=48194992;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.6:7:20:12:20:8:5:7:5:3:35:11:1:6:8:3
chr17	48211533	.	T	G	39.62	PASS	AF=0.5;AO=6;DP=12;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=0.0141698;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.521;QD=13.2053;RBI=0.0141698;REFB=-0.0308218;REVB=0;RO=6;SAF=6;SAR=0;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0306392;OID=.;OPOS=48211533;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:12:12:6:6:6:6:0.5:0:6:6:0:0:6:6:0
chr17	48226811	.	C	T	483.08	PASS	AF=0.74;AO=37;DP=50;FAO=37;FDP=50;FR=.;FRO=13;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.0358462;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.897;QD=38.6464;RBI=0.0393233;REFB=-0.0266381;REVB=0.0161668;RO=13;SAF=14;SAR=23;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117085;STB=0.56344;STBP=0.139;TYPE=snp;VARB=0.00750441;OID=.;OPOS=48226811;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:13:13:37:37:0.74:23:14:8:5:23:14:8:5
chr17	48258140	.	T	C	740.44	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0442411;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=263.249;QD=56.9569;RBI=0.0611972;REFB=0;REVB=0.0422827;RO=0;SAF=30;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000121089;OID=.;OPOS=48258140;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:22:30:0:0:22:30:0:0
chr17	48258321	.	C	T	358.09	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00853693;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.635;QD=55.0908;RBI=0.0112591;REFB=0;REVB=-0.0073409;RO=0;SAF=15;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.78979e-05;OID=.;OPOS=48258321;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:11:15:0:0:11:15:0:0
chr17	48265495	.	T	C	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00419136;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.12;QD=50.4134;RBI=0.0434448;REFB=0;REVB=0.0432421;RO=0;SAF=10;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000180679;OID=.;OPOS=48265495;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:9:10:0:0:9:10:0:0
chr17	48267291	.	G	C	175.51	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0432332;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.17;QD=46.8034;RBI=0.0432892;REFB=0;REVB=0.00220239;RO=0;SAF=12;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00116159;OID=.;OPOS=48267291;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:3:12:0:0:3:12:0:0
chr17	48268223	.	A	G	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00465643;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.956;QD=55.6561;RBI=0.00888073;REFB=0;REVB=-0.00756207;RO=0;SAF=16;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.20082e-06;OID=.;OPOS=48268223;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:11:16:0:0:11:16:0:0
chr17	48276971	.	G	C	360.42	PASS	AF=0.652174;AO=30;DP=47;FAO=30;FDP=46;FR=.;FRO=16;FSAF=22;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=0.00649516;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.854;QD=31.3408;RBI=0.0113175;REFB=-0.02262;REVB=-0.00926813;RO=16;SAF=22;SAR=8;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0364341;STB=0.519986;STBP=0.767;TYPE=snp;VARB=0.012205;OID=.;OPOS=48276971;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:46:16:16:30:30:0.652174:8:22:11:5:8:22:11:5
chr17	48356260	.	G	C	153.66	PASS	AF=0.304348;AO=20;DP=68;FAO=21;FDP=69;FR=.;FRO=48;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=28;FSRR=20;FWDB=0.00343708;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.293;QD=8.90786;RBI=0.0277762;REFB=-0.00213172;REVB=0.0275628;RO=45;SAF=10;SAR=10;SRF=25;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0648148;STB=0.541627;STBP=0.66;TYPE=snp;VARB=0.0081838;OID=.;OPOS=48356260;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:69:45:48:20:21:0.304348:10:10:25:20:10:11:28:20
chr17	48435664	.	CGGGGC	CGAGGC,CGGGC,CGGGG	101.53	PASS	AF=0.0357143,0,0.339286;AO=2,7,16;DP=57;FAO=2,0,19;FDP=56;FR=.;FRO=35;FSAF=2,0,15;FSAR=0,0,4;FSRF=12;FSRR=23;FWDB=-0.0431522,-0.0948222,-0.126127;FXX=0.0508388;HRUN=4,4,4;LEN=1,1,1;MLLD=288.18,18.9646,15.195;QD=7.25201;RBI=0.0613795,0.302495,0.135196;REFB=-0.0100601,-0.0264811,-0.106695;REVB=-0.0436501,-0.287249,-0.0486832;RO=27;SAF=2,0,14;SAR=0,7,2;SRF=11;SRR=16;SSEN=0,0.439024,0;SSEP=0,0,0.445946;SSSB=0.515582,-0.689494,0.561882;STB=0.996238,0.5,0.789169;STBP=0.062,1,0.002;TYPE=snp,del,del;VARB=0.0585604,0.0342285,0.166545;OID=.,.,.;OPOS=48435666,48435665,48435669;OREF=G,G,C;OALT=A,-,-;OMAPALT=CGAGGC,CGGGC,CGGGG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/3:0.0357143,0,0.339286:2,7,16:57:2,0,19:56:35:2,0,15:0,0,4:12:23:93:27:2,0,14:0,7,2:11:16
chr17	48456496	.	C	T	471.68	PASS	AF=0.75;AO=36;DP=49;FAO=36;FDP=48;FR=.;FRO=12;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.0472842;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.352;QD=39.3062;RBI=0.0603656;REFB=-0.0132433;REVB=0.0375261;RO=12;SAF=24;SAR=12;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0425837;STB=0.523064;STBP=0.606;TYPE=snp;VARB=0.00573365;OID=.;OPOS=48456496;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:90:49:48:12:12:36:36:0.75:12:24:7:5:12:24:7:5
chr17	48545596	.	G	A	222.12	PASS	AF=0.42623;AO=26;DP=61;FAO=26;FDP=61;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=-0.0102158;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.893;QD=14.5652;RBI=0.0251422;REFB=-0.00146275;REVB=0.0229732;RO=34;SAF=14;SAR=12;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0384718;STB=0.513913;STBP=0.886;TYPE=snp;VARB=0.00148269;OID=.;OPOS=48545596;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:34:35:26:26:0.42623:12:14:17:17:12:14:18:17
chr17	48549791	.	C	G	192.01	PASS	AF=0.369231;AO=24;DP=65;FAO=24;FDP=65;FR=.;FRO=41;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=23;FSRR=18;FWDB=0.00661991;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=311.746;QD=11.816;RBI=0.0139665;REFB=-0.00202391;REVB=-0.0122979;RO=41;SAF=15;SAR=9;SRF=23;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0727774;STB=0.542133;STBP=0.638;TYPE=snp;VARB=0.00353566;OID=.;OPOS=48549791;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:41:41:24:24:0.369231:9:15:23:18:9:15:23:18
chr17	48598785	.	G	A	1172.01	PASS	AF=1;AO=76;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0665794;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.639;QD=60.8834;RBI=0.0669669;REFB=0;REVB=-0.00719387;RO=0;SAF=27;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00011885;OID=.;OPOS=48598785;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:77:0:0:76:77:1:49:27:0:0:49:28:0:0
chr17	48599450	.	A	T	221.24	PASS	AF=1;AO=18;DP=19;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0154395;FXX=0.0526039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.46;QD=49.1641;RBI=0.0208736;REFB=-0.0220233;REVB=0.0140474;RO=0;SAF=9;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000647319;OID=.;OPOS=48599450;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:19:18:0:0:18:18:1:9:9:0:0:9:9:0:0
chr17	48603503	.	C	T	471.76	PASS	AF=0.970588;AO=33;DP=34;FAO=33;FDP=34;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00407782;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.117;QD=55.5008;RBI=0.00944627;REFB=-0.0992702;REVB=0.00852076;RO=1;SAF=13;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0227903;STB=0.512188;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.00185957;OID=.;OPOS=48603503;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:34:34:1:1:33:33:0.970588:20:13:0:1:20:13:0:1
chr17	48606537	.	C	G	393.16	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0131728;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.9511;QD=56.1652;RBI=0.0132116;REFB=0;REVB=0.00101255;RO=0;SAF=13;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000330766;OID=.;OPOS=48606537;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:15:13:0:0:15:13:0:0
chr17	48607614	.	G	A	279.56	PASS	AF=0.956522;AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0165354;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=245.505;QD=48.6188;RBI=0.0269817;REFB=-0.167936;REVB=0.0213212;RO=1;SAF=15;SAR=7;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0298327;STB=0.516115;STBP=0.615;TYPE=snp;VARB=0.00137501;OID=.;OPOS=48607614;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:23:23:1:1:22:22:0.956522:7:15:1:0:7:15:1:0
chr17	48608717	.	T	C	1190.46	PASS	AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00695997;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=300.702;QD=61.0492;RBI=0.0189663;REFB=0;REVB=0.0176431;RO=0;SAF=40;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.42134e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.62572e-05;OID=.;OPOS=48608717;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:38:40:0:0:38:40:0:0
chr17	48610272	.	G	C	1282.28	PASS	AF=1;AO=76;DP=78;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0114115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.216;QD=61.7965;RBI=0.0631108;REFB=0;REVB=0.0620705;RO=0;SAF=52;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.16397e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.36536e-05;OID=.;OPOS=48610272;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:78:83:0:0:76:83:1:24:52:0:0:31:52:0:0
chr17	48613837	.	A	G	1475.98	PASS	AF=0.989474;AO=94;DP=95;FAO=94;FDP=95;FR=.;FRO=1;FSAF=52;FSAR=42;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0326779;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.458;QD=62.1465;RBI=0.0329099;REFB=-0.104552;REVB=-0.00390058;RO=1;SAF=52;SAR=42;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00903154;STB=0.504761;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.000968186;OID=.;OPOS=48613837;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:95:95:1:1:94:94:0.989474:42:52:1:0:42:52:1:0
chr17	48629458	.	A	G	1324.61	PASS	AF=0.988506;AO=85;DP=87;FAO=86;FDP=87;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=42;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0617792;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.2368;QD=60.9015;RBI=0.0638422;REFB=-0.0811154;REVB=-0.0160982;RO=1;SAF=44;SAR=41;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0106453;STB=0.505617;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.00132832;OID=.;OPOS=48629458;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:87:87:1:1:85:86:0.988506:41:44:1:0:42:44:1:0
chr17	48653354	.	C	A	737.63	PASS	AF=1;AO=47;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0509545;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.504;QD=61.4689;RBI=0.0569681;REFB=-0.104339;REVB=0.0254755;RO=0;SAF=23;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00104301;OID=.;OPOS=48653354;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:48:48:0:0:47:48:1:24:23:0:0:25:23:0:0
chr17	48712705	.	G	A	821.54	PASS	AF=0.983051;AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0459862;FXX=0.0166639;HRUN=3;LEN=1;MLLD=108.31;QD=55.6978;RBI=0.0476903;REFB=0.0173305;REVB=0.0126347;RO=1;SAF=21;SAR=37;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0125806;STB=0.506664;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.000685183;OID=.;OPOS=48712705;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:59:59:1:1:58:58:0.983051:37:21:0:1:37:21:0:1
chr17	48712711	.	C	G	844.54	PASS	AF=0.967742;AO=60;DP=62;FAO=60;FDP=62;FR=.;FRO=2;FSAF=21;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0232617;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.916;QD=54.4866;RBI=0.0353339;REFB=-0.188768;REVB=0.0265965;RO=0;SAF=21;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512496;STBP=0.35;TYPE=snp;VARB=0.00224621;OID=.;OPOS=48712711;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:62:62:0:2:60:60:0.967742:39:21:0:0:39:21:0:2
chr17	48741060	.	C	T	803.32	PASS	AF=0.654545;AO=71;DP=110;FAO=72;FDP=110;FR=.;FRO=38;FSAF=46;FSAR=26;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=0.013769;FXX=0.0090082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.118;QD=29.2118;RBI=0.0248441;REFB=-0.0267072;REVB=0.0206796;RO=39;SAF=46;SAR=25;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0765635;STB=0.541165;STBP=0.277;TYPE=snp;VARB=0.0134819;OID=.;OPOS=48741060;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:110:39:38:71:72:0.654545:25:46:21:18:26:46:20:18
chr17	48753423	.	C	T	134.44	PASS	AF=0.287879;AO=19;DP=66;FAO=19;FDP=66;FR=.;FRO=47;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=27;FSRR=20;FWDB=-0.0277013;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.8978;QD=8.14773;RBI=0.0277308;REFB=-0.00196891;REVB=-0.00127863;RO=44;SAF=10;SAR=9;SRF=24;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0225105;STB=0.534474;STBP=0.742;TYPE=snp;VARB=0.0042169;OID=.;OPOS=48753423;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:44:47:19:19:0.287879:9:10:24:20:9:10:27:20
chr17	48755388	.	C	T	258.45	PASS	AF=0.347368;AO=29;DP=92;FAO=33;FDP=95;FR=.;FRO=62;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=27;FSRR=35;FWDB=0.0497367;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=36.5055;QD=10.8821;RBI=0.0816514;REFB=-0.0290266;REVB=0.064755;RO=63;SAF=16;SAR=13;SRF=28;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124904;STB=0.611009;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.0521673;OID=.;OPOS=48755388;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:95:63:62:29:33:0.347368:13:16:28:35:13:20:27:35
chr17	48823974	.	G	A	36.18	PASS	AF=0.272727;AO=6;DP=22;FAO=6;FDP=22;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.0270165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.1077;QD=6.57765;RBI=0.131837;REFB=-0.0596359;REVB=-0.129039;RO=16;SAF=4;SAR=2;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192221;STB=0.624574;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.0268532;OID=.;OPOS=48823974;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:22:22:16:16:6:6:0.272727:2:4:8:8:2:4:8:8
chr17	48834023	.	A	G	30.5	PASS	AF=0.454545;AO=5;DP=11;FAO=5;FDP=11;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.0165747;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.979;QD=11.0915;RBI=0.0213265;REFB=-0.00904013;REVB=0.0134201;RO=6;SAF=4;SAR=1;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.308675;STB=0.694785;STBP=0.342;TYPE=snp;VARB=0.0120344;OID=.;OPOS=48834023;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:11:11:6:6:5:5:0.454545:1:4:3:3:1:4:3:3
chr17	48917333	.	C	T	363.56	PASS	AF=0.632653;AO=29;DP=47;FAO=31;FDP=49;FR=.;FRO=18;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=0.000684034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.44;QD=29.6786;RBI=0.0342372;REFB=-0.00510597;REVB=0.0342303;RO=17;SAF=16;SAR=13;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133107;STB=0.566887;STBP=0.216;TYPE=snp;VARB=0.00468797;OID=.;OPOS=48917333;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:49:17:18:29:31:0.632653:13:16:6:11:15:16:6:12
chr17	48940422	.	T	C	147.59	PASS	AF=0.681818;AO=15;DP=21;FAO=15;FDP=22;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.0172028;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=120.713;QD=26.8346;RBI=0.0292969;REFB=-0.00771739;REVB=-0.0237144;RO=6;SAF=4;SAR=11;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.229316;STB=0.610954;STBP=0.137;TYPE=snp;VARB=0.00217573;OID=.;OPOS=48940422;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:21:22:6:7:15:15:0.681818:11:4:4:2:11:4:4:3
chr17	49350802	.	A	C	990.64	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0192299;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=236.251;QD=59.1427;RBI=0.0192549;REFB=0;REVB=0.000980633;RO=0;SAF=37;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.16471e-05;OID=.;OPOS=49350802;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:30:37:0:0:30:37:0:0
chr17	51901084	.	A	G	461.49	PASS	AF=1;AO=28;DP=38;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00713034;FXX=0.23071;HRUN=3;LEN=1;MLLD=204.11;QD=61.5315;RBI=0.0178218;REFB=0;REVB=-0.0163332;RO=0;SAF=14;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00567196;OID=.;OPOS=51901084;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:38:30:0:0:28:30:1:14:14:0:0:16:14:0:0
chr17	51901385	.	C	T	1391.26	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000263206;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.601;QD=62.5283;RBI=0.00637423;REFB=0;REVB=-0.0063688;RO=0;SAF=30;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.10353e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.2313e-06;OID=.;OPOS=51901385;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:89:0:0:86:89:1:56:30:0:0:58:31:0:0
chr17	51901643	.	C	T	785.86	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00947829;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.664;QD=64.1516;RBI=0.0193534;REFB=0;REVB=-0.0168735;RO=0;SAF=19;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.48867e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.60154e-05;OID=.;OPOS=51901643;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:30:19:0:0:30:19:0:0
chr17	51901703	.	C	G	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00862895;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.532;QD=50.4132;RBI=0.00948165;REFB=0;REVB=-0.00392975;RO=0;SAF=5;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000107679;OID=.;OPOS=51901703;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:14:5:0:0:14:5:0:0
chr17	51902252	.	C	T	1510.8	PASS	AF=1;AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000577588;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.816;QD=63.6128;RBI=0.0283632;REFB=0;REVB=0.0283573;RO=0;SAF=42;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.69587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.73934e-05;OID=.;OPOS=51902252;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:95:0:0:95:95:1:53:42:0:0:53:42:0:0
chr17	51902492	.	A	AAAT	56.88	PASS	AF=0.875;AO=6;DP=12;FAO=7;FDP=8;FR=.;FRO=1;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0144158;FXX=0;HRUN=3;LEN=3;MLLD=218.834;QD=28.4406;RBI=0.0150635;REFB=0.00289545;REVB=0.00436973;RO=6;SAF=1;SAR=5;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202122;STB=0.54533;STBP=0.649;TYPE=ins;VARB=-0.000621921;OID=.;OPOS=51902493;OREF=-;OALT=AAT;OMAPALT=AAAT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.875:6:12:7:8:1:2:5:0:1:6:6:1:5:2:4
chr17	52993174	.	T	C	213.28	PASS	AF=0.382353;AO=26;DP=68;FAO=26;FDP=68;FR=.;FRO=42;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=23;FWDB=0.0121637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.835;QD=12.546;RBI=0.0192903;REFB=-0.00380519;REVB=0.014972;RO=42;SAF=13;SAR=13;SRF=19;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.051181;STB=0.529389;STBP=0.725;TYPE=snp;VARB=0.00602329;OID=.;OPOS=52993174;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:42:42:26:26:0.382353:13:13:19:23:13:13:19:23
chr17	53076799	.	G	A	689.38	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00442035;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.413;QD=62.671;RBI=0.0044941;REFB=0;REVB=0.000810805;RO=0;SAF=25;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.66413e-05;OID=.;OPOS=53076799;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:19:25:0:0:19:25:0:0
chr17	53076986	.	G	A	350.38	PASS	AF=1;AO=25;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0479179;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.7785;QD=53.9039;RBI=0.0480011;REFB=0;REVB=-0.00282501;RO=0;SAF=16;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00139222;OID=.;OPOS=53076986;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:25:26:1:9:16:0:0:9:17:0:0
chr17	53121020	.	A	G	186.49	PASS	AF=0.262136;AO=27;DP=105;FAO=27;FDP=103;FR=.;FRO=76;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=42;FSRR=34;FWDB=0.00334689;FXX=0.0190458;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.4403;QD=7.24218;RBI=0.0211795;REFB=-0.000272588;REVB=-0.0209134;RO=72;SAF=15;SAR=12;SRF=40;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.502182;STBP=0.984;TYPE=snp;VARB=0.00142961;OID=.;OPOS=53121020;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:103:72:76:27:27:0.262136:12:15:40:32:12:15:42:34
chr17	53158492	.	G	A	270.57	PASS	AF=0.413333;AO=31;DP=75;FAO=31;FDP=75;FR=.;FRO=44;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=26;FWDB=-0.00886771;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.577;QD=14.4304;RBI=0.00926537;REFB=6.86481e-06;REVB=-0.00268532;RO=44;SAF=14;SAR=17;SRF=18;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0445914;STB=0.525289;STBP=0.741;TYPE=snp;VARB=-0.00016023;OID=.;OPOS=53158492;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:44:44:31:31:0.413333:17:14:18:26:17:14:18:26
chr17	53471105	.	T	G	1560.57	PASS	AF=0.981481;AO=106;DP=108;FAO=106;FDP=108;FR=.;FRO=2;FSAF=47;FSAR=59;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0148424;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=257.887;QD=57.7988;RBI=0.0148425;REFB=-0.177935;REVB=-7.45081e-05;RO=0;SAF=47;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.501061;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=0.000361489;OID=.;OPOS=53471105;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:108:108:0:2:106:106:0.981481:59:47:0:0:59:47:1:1
chr17	53485186	.	C	T	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0317679;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.8142;QD=37.4885;RBI=0.0603118;REFB=0;REVB=0.0512671;RO=0;SAF=5;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00174068;OID=.;OPOS=53485186;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:3:5:0:0:3:5:0:0
chr17	53851228	.	C	T	1343.37	PASS	AF=1;AO=85;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.040976;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.5104;QD=62.4823;RBI=0.0443022;REFB=0;REVB=0.016842;RO=0;SAF=41;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000292375;OID=.;OPOS=53851228;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:86:0:0:85:86:1:44:41:0:0:45:41:0:0
chr17	54450038	.	C	A	448.93	PASS	AF=1;AO=31;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00941011;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.961;QD=56.1165;RBI=0.0212572;REFB=0;REVB=0.019061;RO=0;SAF=15;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000174238;OID=.;OPOS=54450038;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:31:32:1:16:15:0:0:17:15:0:0
chr17	54450134	.	G	A	501.65	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0830606;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.38;QD=59.018;RBI=0.0850184;REFB=0;REVB=0.01814;RO=0;SAF=13;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000355964;OID=.;OPOS=54450134;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:21:13:0:0:21:13:0:0
chr17	54534634	.	G	A,T	656.93	PASS	AF=0.953488,0.0465116;AO=41,2;DP=43;FAO=41,2;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=29,0;FSAR=12,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0125252,-0.00707653;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=185.877,120.737;QD=61.1101;RBI=0.0732232,0.0190184;REFB=0,0;REVB=-0.072144,-0.0176529;RO=0;SAF=29,0;SAR=12,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000293811,-0.0236912;OID=.,.;OPOS=54534634,54534634;OREF=G,G;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:43:43:0:0:41,2:41,2:0.953488,0.0465116:12,2:29,0:0:0:12,2:29,0:0:0
chr17	54921494	.	A	C	785.21	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000647448;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.468;QD=57.106;RBI=0.011828;REFB=0;REVB=-0.0118103;RO=0;SAF=33;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.70022e-05;OID=.;OPOS=54921494;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:22:33:0:0:22:33:0:0
chr17	55027850	.	T	C	465.14	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0163701;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.752;QD=58.1418;RBI=0.0314442;REFB=0;REVB=0.0268469;RO=0;SAF=15;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000107088;OID=.;OPOS=55027850;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:17:15:0:0:17:15:0:0
chr17	55182811	.	CT	AC,C	767.68	PASS	AF=0,1;AO=2,46;DP=49;FAO=0,49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=0,32;FSAR=0,17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.104473,0.0847447;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=2,1;MLLD=4.41175,28.1533;QD=62.6678;RBI=0.115898,0.106081;REFB=0,0;REVB=0.0501761,0.0638089;RO=0;SAF=2,29;SAR=0,17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,del;VARB=0,0.00393554;OID=.,.;OPOS=55182811,55182812;OREF=CT,T;OALT=AC,-;OMAPALT=AC,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	2/2:4:49:49:0:0:2,46:0,49:0,1:0,17:2,29:0:0:0,17:0,32:0:0
chr17	55183203	.	T	C	339.52	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0221675;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.221;QD=54.3231;RBI=0.0275472;REFB=0;REVB=0.0163539;RO=0;SAF=15;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000295232;OID=.;OPOS=55183203;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:25:0:0:24:25:1:9:15:0:0:10:15:0:0
chr17	55183716	.	T	C	1044.32	PASS	AF=1;AO=69;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00465485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.233;QD=59.6753;RBI=0.0205671;REFB=0;REVB=0.0200334;RO=0;SAF=48;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.73866e-05;OID=.;OPOS=55183716;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:69:70:1:21:48:0:0:21:49:0:0
chr17	55198420	.	C	T	215.75	PASS	AF=0.689655;AO=18;DP=27;FAO=20;FDP=29;FR=.;FRO=9;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.029214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.716;QD=29.7584;RBI=0.0292391;REFB=-0.0293694;REVB=0.00121084;RO=9;SAF=7;SAR=11;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102393;STB=0.567204;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.0103905;OID=.;OPOS=55198420;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:27:29:9:9:18:20:0.689655:11:7:5:4:13:7:5:4
chr17	55822171	.	T	C	851.26	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0132012;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=269.548;QD=57.7124;RBI=0.018614;REFB=0;REVB=0.0131228;RO=0;SAF=29;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.05294e-05;OID=.;OPOS=55822171;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:30:29:0:0:30:29:0:0
chr17	55822214	.	T	A	989.61	PASS	AF=1;AO=57;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=29;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0157214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.6812;QD=59.081;RBI=0.0570894;REFB=0;REVB=0.054882;RO=0;SAF=21;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00032684;OID=.;OPOS=55822214;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:57:67:1:36:21:0:0:38:29:0:0
chr17	55822467	.	G	A	1047.79	PASS	AF=0.986111;AO=71;DP=72;FAO=71;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0483151;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.7739;QD=58.2103;RBI=0.0515116;REFB=0.0553381;REVB=-0.0178632;RO=0;SAF=44;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509088;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=-0.00038457;OID=.;OPOS=55822467;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:72:72:0:1:71:71:0.986111:27:44:0:0:27:44:0:1
chr17	56282986	.	G	A	72.52	PASS	AF=0.203704;AO=11;DP=54;FAO=11;FDP=54;FR=.;FRO=43;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=0.0134943;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.3109;QD=5.37165;RBI=0.0511734;REFB=-0.0121625;REVB=-0.0493622;RO=43;SAF=6;SAR=5;SRF=22;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0416949;STB=0.526978;STBP=0.818;TYPE=snp;VARB=0.0580053;OID=.;OPOS=56282986;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:54:54:43:43:11:11:0.203704:5:6:22:21:5:6:22:21
chr17	56296601	.	GACGCGCCGCGACTGCGCCGGAAA	G	92.45	PASS	AF=1;AO=9;DP=10;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.047001;FXX=0.0999001;HRUN=1;LEN=23;MLLD=541.677;QD=41.0879;RBI=0.0498062;REFB=0;REVB=0.0164793;RO=0;SAF=2;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000306366;OID=.;OPOS=56296602;OREF=ACGCGCCGCGACTGCGCCGGAAA;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:9:10:9:9:0:2:7:0:0:4:0:2:7:0:0
chr17	56448297	.	C	T	937.06	PASS	AF=0.984615;AO=44;DP=68;FAO=64;FDP=65;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=0;FSAF=36;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0432966;FXX=0.0441112;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.155;QD=57.6655;RBI=0.0441574;REFB=0;REVB=0.00867624;RO=1;SAF=26;SAR=18;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.025382;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.12868e-06;OID=.;OPOS=56448297;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:68:65:1:0:44:64:0.984615:18:26:0:1:28:36:0:0
chr17	56448298	.	G	T	75.87	PASS	AF=0.191176;AO=11;DP=66;FAO=13;FDP=68;FR=.;FRO=55;FSAF=1;FSAR=12;FSRF=37;FSRR=18;FWDB=-0.00642197;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=114.859;QD=4.46276;RBI=0.0382884;REFB=-0.00468526;REVB=0.037746;RO=55;SAF=1;SAR=10;SRF=37;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.663325;STB=0.937667;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00924184;OID=.;OPOS=56448298;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:66:68:55:55:11:13:0.191176:10:1:37:18:12:1:37:18
chr17	56492800	.	T	C	1026.4	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0383345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.379;QD=59.5015;RBI=0.0395116;REFB=0;REVB=0.00957255;RO=0;SAF=35;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000129032;OID=.;OPOS=56492800;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:68:69:0:0:68:69:1:33:35:0:0:33:36:0:0
chr17	56544280	.	T	G	657.74	PASS	AF=0.977273;AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.000394903;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.3771;QD=59.7948;RBI=0.0051272;REFB=-0.0363536;REVB=0.00511197;RO=1;SAF=14;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0323574;STB=0.517233;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=0.00722604;OID=.;OPOS=56544280;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:44:44:1:1:43:43:0.977273:29:14:1:0:29:14:1:0
chr17	56584205	.	A	C	726.42	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0391644;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.49;QD=63.1669;RBI=0.041233;REFB=0;REVB=0.0128959;RO=0;SAF=23;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000108307;OID=.;OPOS=56584205;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:46:0:0:45:46:1:22:23:0:0:22:24:0:0
chr17	56585872	.	G	C	1320.91	PASS	AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0101012;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.682;QD=62.1603;RBI=0.0130103;REFB=0;REVB=-0.00819949;RO=0;SAF=30;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.07985e-06;OID=.;OPOS=56585872;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:55:30:0:0:55:30:0:0
chr17	56598439	.	T	C	1453.36	PASS	AF=1;AO=92;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0146517;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.181;QD=63.1894;RBI=0.0253439;REFB=0;REVB=0.0206795;RO=0;SAF=50;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.86102e-05;OID=.;OPOS=56598439;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:92:92:0:0:92:92:1:42:50:0:0:42:50:0:0
chr17	56621286	.	G	T	794.68	PASS	AF=0.882353;AO=60;DP=68;FAO=60;FDP=68;FR=.;FRO=8;FSAF=28;FSAR=32;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.00604307;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.4696;QD=46.746;RBI=0.0180465;REFB=-0.0833991;REVB=0.0170046;RO=5;SAF=28;SAR=32;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00970203;STB=0.518658;STBP=0.4;TYPE=snp;VARB=0.010193;OID=.;OPOS=56621286;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:68:68:5:8:60:60:0.882353:32:28:2:3:32:28:5:3
chr17	56621359	.	T	C,G	1192.89	PASS	AF=0.95,0.05;AO=73,4;DP=77;FAO=76,4;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=49,4;FSAR=27,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00183927,-0.00246464;FXX=0.0123442;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=145.564,90.4116;QD=59.6447;RBI=0.094881,0.0989776;REFB=0,0;REVB=0.0948632,0.0989469;RO=0;SAF=47,4;SAR=26,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=4.2476e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.000290159,0.063383;OID=.,.;OPOS=56621359,56621359;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:11:77:80:0:0:73,4:76,4:0.95,0.05:26,0:47,4:0:0:27,0:49,4:0:0
chr17	56636854	.	T	C	769.51	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000181046;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=288.936;QD=57.0008;RBI=0.0155794;REFB=0;REVB=0.0155783;RO=0;SAF=34;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.77753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.33973e-05;OID=.;OPOS=56636854;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:20:34:0:0:20:34:0:0
chr17	56693677	.	G	T	602.09	PASS	AF=0.97619;AO=40;DP=42;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0286547;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=246.495;QD=57.3423;RBI=0.0287086;REFB=-0.0788375;REVB=-0.00175768;RO=2;SAF=22;SAR=18;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0407438;STB=0.510633;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.00114629;OID=.;OPOS=56693677;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:42:42:2:1:40:41:0.97619:18:22:2:0:18:23:1:0
chr17	56755092	.	TA	T	410.33	PASS	AF=1;AO=33;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.120675;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=31.3288;QD=48.2738;RBI=0.121186;REFB=0;REVB=-0.0111227;RO=0;SAF=15;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.64315e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.00524268;OID=.;OPOS=56755093;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:33:34:34:34:0:16:18:0:0:7:0:15:18:0:0
chr17	57059119	.	GAAA	GAA,GAAT,GGAA	1076.59	PASS	AF=0.987179,0,0;AO=54,16,3;DP=78;FAO=77,0,0;FDP=78;FR=.;FRO=1;FSAF=38,0,0;FSAR=39,0,0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0785991,-0.0577221,-0.018727;FXX=0;HRUN=3,3,3;LEN=1,1,1;MLLD=24.2987,13.3257,5.32515;QD=55.21;RBI=0.0852764,0.179095,0.0212987;REFB=-0.00419118,-0.126633,0.0629529;REVB=0.0330794,-0.169539,0.0101456;RO=1;SAF=33,3,1;SAR=21,13,2;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.0140687,-0.129617,-0.266641;STB=0.506492,0.5,0.5;STBP=0.553,1,1;TYPE=del,snp,snp;VARB=-0.00151187,0,0;OID=.,.,.;OPOS=57059120,57059122,57059120;OREF=A,A,A;OALT=-,T,G;OMAPALT=GAA,GAAT,GGAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:0.987179,0,0:54,16,3:78:77,0,0:78:1:38,0,0:39,0,0:1:0:3:1:33,3,1:21,13,2:1:0
chr17	57963537	.	A	G	274.96	PASS	AF=0.555556;AO=25;DP=46;FAO=25;FDP=45;FR=.;FRO=20;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.0270423;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.01;QD=24.4413;RBI=0.0320167;REFB=-0.0162196;REVB=0.01714;RO=17;SAF=14;SAR=11;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0226004;STB=0.52686;STBP=0.714;TYPE=snp;VARB=0.0200748;OID=.;OPOS=57963537;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:45:17:20:25:25:0.555556:11:14:9:8:11:14:10:10
chr17	58031412	.	A	G	205.91	PASS	AF=0.730769;AO=19;DP=26;FAO=19;FDP=26;FR=.;FRO=7;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.0203491;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=325.601;QD=31.6788;RBI=0.0273741;REFB=-0.021131;REVB=-0.0183099;RO=7;SAF=9;SAR=10;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0221193;STB=0.512182;STBP=0.834;TYPE=snp;VARB=0.00847718;OID=.;OPOS=58031412;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:26:26:7:7:19:19:0.730769:10:9:3:4:10:9:3:4
chr17	58256327	.	A	T	794.47	PASS	AF=0.582677;AO=74;DP=127;FAO=74;FDP=127;FR=.;FRO=53;FSAF=30;FSAR=44;FSRF=25;FSRR=28;FWDB=-0.0506147;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.9155;QD=25.0225;RBI=0.0517455;REFB=-0.0278579;REVB=-0.0107585;RO=51;SAF=30;SAR=44;SRF=23;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0351836;STB=0.528377;STBP=0.462;TYPE=snp;VARB=0.0169799;OID=.;OPOS=58256327;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:127:127:51:53:74:74:0.582677:44:30:23:28:44:30:25:28
chr17	58734321	.	A	G	111.73	PASS	AF=0.246377;AO=17;DP=69;FAO=17;FDP=69;FR=.;FRO=52;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=35;FSRR=17;FWDB=0.0290046;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=65.1938;QD=6.47724;RBI=0.0290092;REFB=0.00545348;REVB=-0.00051884;RO=50;SAF=10;SAR=7;SRF=33;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0924795;STB=0.567491;STBP=0.54;TYPE=snp;VARB=-0.0193615;OID=.;OPOS=58734321;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:50:52:17:17:0.246377:7:10:33:17:7:10:35:17
chr17	58786625	.	A	G	1235.32	PASS	AF=0.954023;AO=83;DP=87;FAO=83;FDP=87;FR=.;FRO=4;FSAF=38;FSAR=45;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0170333;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.2699;QD=56.7964;RBI=0.0200148;REFB=-0.0814715;REVB=-0.01051;RO=3;SAF=38;SAR=45;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.013867;STB=0.501952;STBP=0.881;TYPE=snp;VARB=0.0168414;OID=.;OPOS=58786625;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:87:87:3:4:83:83:0.954023:45:38:2:1:45:38:2:2
chr17	58824567	.	T	C	1083.92	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0118011;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.7759;QD=60.218;RBI=0.0517712;REFB=0;REVB=0.0504082;RO=0;SAF=30;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.1178e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000463811;OID=.;OPOS=58824567;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:42:30:0:0:42:30:0:0
chr17	59490235	.	C	T	36.15	PASS	AF=0.272727;AO=6;DP=22;FAO=6;FDP=22;FR=.;FRO=16;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.000415625;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.465;QD=6.57359;RBI=0.0196189;REFB=-0.00549154;REVB=-0.0196145;RO=16;SAF=2;SAR=4;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123829;STB=0.580369;STBP=0.758;TYPE=snp;VARB=0.019794;OID=.;OPOS=59490235;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:22:22:16:16:6:6:0.272727:4:2:7:9:4:2:7:9
chr17	59760174	.	G	A	692.98	PASS	AF=1;AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00860838;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.459;QD=62.9982;RBI=0.0151185;REFB=0;REVB=0.0124284;RO=0;SAF=23;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.78109e-05;OID=.;OPOS=59760174;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:44:0:0:44:44:1:21:23:0:0:21:23:0:0
chr17	59760996	.	A	G	272.91	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0184074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.383;QD=51.9831;RBI=0.0255499;REFB=0;REVB=0.0177191;RO=0;SAF=7;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000496169;OID=.;OPOS=59760996;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:21:0:0:20:21:1:13:7:0:0:13:8:0:0
chr17	59763114	.	A	T	400.16	PASS	AF=0.966667;AO=29;DP=30;FAO=29;FDP=30;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0667439;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.6589;QD=53.3552;RBI=0.0667959;REFB=0.0445762;REVB=-0.00263464;RO=1;SAF=14;SAR=15;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.03211;STB=0.517229;STBP=0.548;TYPE=snp;VARB=-0.0032663;OID=.;OPOS=59763114;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:30:30:1:1:29:29:0.966667:15:14:1:0:15:14:1:0
chr17	59763347	.	A	G	817.75	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00526107;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=288.297;QD=57.3858;RBI=0.00889713;REFB=0;REVB=-0.00717496;RO=0;SAF=25;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.44341e-06;OID=.;OPOS=59763347;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:32:25:0:0:32:25:0:0
chr17	59763465	.	T	C	754.41	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000669167;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.956;QD=56.9363;RBI=0.0312274;REFB=0;REVB=0.0312202;RO=0;SAF=24;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.67273e-05;OID=.;OPOS=59763465;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:29:24:0:0:29:24:0:0
chr17	59955426	.	T	G	724.74	PASS	AF=0.981132;AO=52;DP=54;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0177092;FXX=0.0185151;HRUN=2;LEN=1;MLLD=245.839;QD=54.6976;RBI=0.0224723;REFB=-0.0652129;REVB=0.0138344;RO=1;SAF=28;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.016526;STB=0.508769;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000239763;OID=.;OPOS=59955426;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:54:53:1:1:52:52:0.981132:24:28:1:0:24:28:1:0
chr17	60040329	.	C	T	666.73	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00373881;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.605;QD=62.0211;RBI=0.00909207;REFB=0;REVB=0.00828776;RO=0;SAF=16;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000124525;OID=.;OPOS=60040329;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:43:0:0:42:43:1:26:16:0:0:27:16:0:0
chr17	60043884	.	G	A	1044.2	PASS	AF=1;AO=69;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0287241;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.015;QD=59.6687;RBI=0.029289;REFB=0;REVB=0.00572473;RO=0;SAF=28;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.22683e-05;OID=.;OPOS=60043884;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:69:70:1:41:28:0:0:41:29:0:0
chr17	60043929	.	T	C	1043.73	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00196216;FXX=0.0140825;HRUN=3;LEN=1;MLLD=213.768;QD=59.6417;RBI=0.00940053;REFB=0;REVB=-0.00919347;RO=0;SAF=28;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.40816e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.44042e-05;OID=.;OPOS=60043929;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:42:28:0:0:42:28:0:0
chr17	60083208	.	G	T	465.09	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0428206;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.5793;QD=58.1364;RBI=0.0459399;REFB=0;REVB=0.0166394;RO=0;SAF=22;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000444569;OID=.;OPOS=60083208;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:10:22:0:0:10:22:0:0
chr17	60345508	.	A	G	123.15	PASS	AF=0.923077;AO=12;DP=13;FAO=12;FDP=13;FR=.;FRO=1;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0525693;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=215.22;QD=37.893;RBI=0.0529835;REFB=-0.0113752;REVB=-0.00661207;RO=1;SAF=2;SAR=10;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0430526;STB=0.523771;STBP=0.669;TYPE=snp;VARB=0.00153273;OID=.;OPOS=60345508;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:13:13:1:1:12:12:0.923077:10:2:0:1:10:2:0:1
chr17	60348325	.	G	A	977.42	PASS	AF=0.585987;AO=92;DP=158;FAO=92;FDP=157;FR=.;FRO=65;FSAF=54;FSAR=38;FSRF=34;FSRR=31;FWDB=-0.0401418;FXX=0.00632871;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.2115;QD=24.9023;RBI=0.0525872;REFB=-0.00467534;REVB=0.0339713;RO=64;SAF=54;SAR=38;SRF=33;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0549695;STB=0.52701;STBP=0.446;TYPE=snp;VARB=0.00326467;OID=.;OPOS=60348325;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:158:157:64:65:92:92:0.585987:38:54:33:31:38:54:34:31
chr17	60351457	.	G	A	1128.68	PASS	AF=0.54359;AO=103;DP=195;FAO=106;FDP=195;FR=.;FRO=89;FSAF=41;FSAR=65;FSRF=37;FSRR=52;FWDB=0.00387167;FXX=0.0151508;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.011;QD=23.1524;RBI=0.00624165;REFB=-0.0259748;REVB=0.00489575;RO=88;SAF=39;SAR=64;SRF=37;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0370897;STB=0.513831;STBP=0.683;TYPE=snp;VARB=0.0199296;OID=.;OPOS=60351457;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:195:195:88:89:103:106:0.54359:64:39:37:51:65:41:37:52
chr17	60503892	.	A	G	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0652372;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=69.863;QD=37.4883;RBI=0.0740019;REFB=0;REVB=-0.034934;RO=0;SAF=2;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.58669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00141177;OID=.;OPOS=60503892;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:6:2:0:0:6:2:0:0
chr17	60525047	.	C	T	365.13	PASS	AF=0.428571;AO=39;DP=91;FAO=39;FDP=91;FR=.;FRO=52;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=23;FSRR=29;FWDB=-0.00177096;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.358;QD=16.0498;RBI=0.0634899;REFB=0.0108614;REVB=-0.0634652;RO=52;SAF=21;SAR=18;SRF=23;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0973138;STB=0.554778;STBP=0.394;TYPE=snp;VARB=-0.0121595;OID=.;OPOS=60525047;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:52:52:39:39:0.428571:18:21:23:29:18:21:23:29
chr17	60683503	.	A	G	575.04	PASS	AF=0.64557;AO=51;DP=79;FAO=51;FDP=79;FR=.;FRO=28;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=0.0157173;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.472;QD=29.116;RBI=0.0186142;REFB=-0.0191;REVB=0.00997261;RO=28;SAF=27;SAR=24;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0657617;STB=0.5357;STBP=0.406;TYPE=snp;VARB=0.0109663;OID=.;OPOS=60683503;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:28:28:51:51:0.64557:24:27:12:16:24:27:12:16
chr17	60753904	.	A	C	153.09	PASS	AF=0.414634;AO=16;DP=42;FAO=17;FDP=41;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=-0.0106966;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.382;QD=14.9351;RBI=0.0124875;REFB=-0.0216193;REVB=-0.00644358;RO=24;SAF=6;SAR=10;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173892;STB=0.576279;STBP=0.451;TYPE=snp;VARB=0.0314928;OID=.;OPOS=60753904;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:41:24:24:16:17:0.414634:10:6:13:11:10:7:13:11
chr17	60758273	.	G	C	522.75	PASS	AF=0.691176;AO=47;DP=68;FAO=47;FDP=68;FR=.;FRO=21;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=-0.013107;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.7788;QD=30.7502;RBI=0.0131198;REFB=-0.0102773;REVB=-0.000580834;RO=21;SAF=24;SAR=23;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0347222;STB=0.518789;STBP=0.683;TYPE=snp;VARB=0.00474685;OID=.;OPOS=60758273;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:21:21:47:47:0.691176:23:24:12:9:23:24:12:9
chr17	60766224	.	A	G	776.44	PASS	AF=0.680851;AO=64;DP=93;FAO=64;FDP=94;FR=.;FRO=30;FSAF=33;FSAR=31;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=-0.0150958;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.076;QD=33.0401;RBI=0.0161723;REFB=-0.041161;REVB=-0.00580191;RO=29;SAF=33;SAR=31;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0389258;STB=0.51562;STBP=0.68;TYPE=snp;VARB=0.0138043;OID=.;OPOS=60766224;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:94:29:30:64:64:0.680851:31:33:13:16:31:33:14:16
chr17	60767015	.	G	A	592.8	PASS	AF=0.658228;AO=52;DP=79;FAO=52;FDP=79;FR=.;FRO=27;FSAF=18;FSAR=34;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.0150511;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.531;QD=30.0154;RBI=0.0550973;REFB=-0.028372;REVB=0.0530017;RO=27;SAF=18;SAR=34;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.042003;STB=0.522791;STBP=0.603;TYPE=snp;VARB=0.0135064;OID=.;OPOS=60767015;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:27:27:52:52:0.658228:34:18:11:16:34:18:11:16
chr17	60813627	.	G	A	432.37	PASS	AF=0.655738;AO=40;DP=62;FAO=40;FDP=61;FR=.;FRO=21;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.0126916;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.9754;QD=28.3524;RBI=0.0148836;REFB=-0.0403826;REVB=-0.0077746;RO=20;SAF=18;SAR=22;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0308306;STB=0.509086;STBP=0.857;TYPE=snp;VARB=0.00985426;OID=.;OPOS=60813627;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:61:20:21:40:40:0.655738:22:18:10:10:22:18:10:11
chr17	60814273	.	A	G	450.26	PASS	AF=0.636364;AO=42;DP=66;FAO=42;FDP=66;FR=.;FRO=24;FSAF=15;FSAR=27;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.0111419;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=201.041;QD=27.2882;RBI=0.022153;REFB=-0.00817258;REVB=0.0191472;RO=24;SAF=15;SAR=27;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155983;STB=0.58516;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=0.003006;OID=.;OPOS=60814273;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:24:24:42:42:0.636364:27:15:14:10:27:15:14:10
chr17	61315272	.	G	A	477.73	PASS	AF=0.693548;AO=43;DP=62;FAO=43;FDP=62;FR=.;FRO=19;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=15;FSRR=4;FWDB=0.0165801;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.8917;QD=30.8212;RBI=0.0211578;REFB=-0.0291674;REVB=0.0131436;RO=18;SAF=21;SAR=22;SRF=14;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15745;STB=0.591887;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.0185173;OID=.;OPOS=61315272;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:18:19:43:43:0.693548:22:21:14:4:22:21:15:4
chr17	61557142	.	T	A	300.65	PASS	AF=0.553571;AO=31;DP=56;FAO=31;FDP=56;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=0.00208732;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.616;QD=21.4746;RBI=0.00585684;REFB=-0.024189;REVB=-0.00547226;RO=25;SAF=11;SAR=20;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0730586;STB=0.540514;STBP=0.539;TYPE=snp;VARB=0.0198708;OID=.;OPOS=61557142;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:25:25:31:31:0.553571:20:11:11:14:20:11:11:14
chr17	61559923	.	C	T	823.43	PASS	AF=0.952381;AO=59;DP=63;FAO=60;FDP=63;FR=.;FRO=3;FSAF=25;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.011484;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=143.659;QD=52.2811;RBI=0.0163545;REFB=-0.205868;REVB=0.0116441;RO=1;SAF=24;SAR=35;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0132917;STB=0.504086;STBP=0.785;TYPE=snp;VARB=0.00183545;OID=.;OPOS=61559923;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:63:63:1:3:59:60:0.952381:35:24:0:1:35:25:1:2
chr17	61562309	.	C	T	358.07	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0538246;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=247.062;QD=55.088;RBI=0.0538458;REFB=0;REVB=-0.00150795;RO=0;SAF=14;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000118107;OID=.;OPOS=61562309;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:12:14:0:0:12:14:0:0
chr17	61562774	.	T	C	429.02	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00515209;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.847;QD=57.2021;RBI=0.0388987;REFB=0;REVB=0.038556;RO=0;SAF=15;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000439386;OID=.;OPOS=61562774;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:15:15:0:0:15:15:0:0
chr17	61564052	.	A	G	632.23	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0461988;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.372;QD=61.6813;RBI=0.0474195;REFB=0;REVB=0.0106903;RO=0;SAF=16;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.1719e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000423496;OID=.;OPOS=61564052;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:25:16:0:0:25:16:0:0
chr17	61566031	.	G	A	651.22	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00163019;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.618;QD=62.021;RBI=0.0516238;REFB=0;REVB=0.0515981;RO=0;SAF=30;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.52854e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000165843;OID=.;OPOS=61566031;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:12:30:0:0:12:30:0:0
chr17	61573761	.	T	C	417.96	PASS	AF=0.967742;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.073025;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=63.9608;QD=53.9298;RBI=0.0741302;REFB=0.0623195;REVB=-0.0127528;RO=1;SAF=19;SAR=11;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0404935;STB=0.521724;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=-0.00532839;OID=.;OPOS=61573761;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:31:31:1:1:30:30:0.967742:11:19:0:1:11:19:0:1
chr17	61611423	.	T	C	232.23	PASS	AF=0.564103;AO=22;DP=39;FAO=22;FDP=39;FR=.;FRO=17;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=-0.0668374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.361;QD=23.8188;RBI=0.0684687;REFB=-0.0253807;REVB=-0.0148572;RO=17;SAF=14;SAR=8;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00904992;STB=0.505046;STBP=0.971;TYPE=snp;VARB=0.0186559;OID=.;OPOS=61611423;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:17:17:22:22:0.564103:8:14:11:6:8:14:11:6
chr17	61910167	.	G	A	785.36	PASS	AF=1;AO=48;DP=49;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00396392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=316.742;QD=62.829;RBI=0.0193563;REFB=0;REVB=0.0189461;RO=0;SAF=24;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000912584;OID=.;OPOS=61910167;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:50:0:0:48:50:1:24:24:0:0:26:24:0:0
chr17	61986988	.	A	G	805.04	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0283767;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.899;QD=64.4032;RBI=0.0284357;REFB=0;REVB=0.00183063;RO=0;SAF=26;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.10374e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000276613;OID=.;OPOS=61986988;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:24:26:0:0:24:26:0:0
chr17	61987570	.	G	T	841.68	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.771;QD=57.063;RBI=0.0200649;REFB=0;REVB=0.00742686;RO=0;SAF=25;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00173953;OID=.;OPOS=61987570;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:59:0:0:58:59:1:33:25:0:0:34:25:0:0
chr17	61987576	.	G	A	834.25	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0333911;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.4339;QD=57.5347;RBI=0.0334006;REFB=0;REVB=-0.000795301;RO=0;SAF=25;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000389348;OID=.;OPOS=61987576;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:33:25:0:0:33:25:0:0
chr17	61988014	.	G	A	594.51	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0310237;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.1345;QD=60.9753;RBI=0.032615;REFB=0;REVB=-0.0100635;RO=0;SAF=16;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.43889e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000674823;OID=.;OPOS=61988014;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:23:16:0:0:23:16:0:0
chr17	61988103	.	ACCC	A	278.87	PASS	AF=0.66;AO=33;DP=51;FAO=33;FDP=50;FR=.;FRO=17;FSAF=22;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.00692931;FXX=0.019604;HRUN=3;LEN=3;MLLD=225.527;QD=22.3094;RBI=0.00694963;REFB=-0.00358453;REVB=0.000531088;RO=17;SAF=22;SAR=11;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0537413;STB=0.529394;STBP=0.595;TYPE=del;VARB=0.00116092;OID=.;OPOS=61988104;OREF=CCC;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.66:33:51:33:50:17:22:11:10:7:91:17:22:11:10:7
chr17	62007498	.	A	G	571.19	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00907924;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.1202;QD=60.1255;RBI=0.0328345;REFB=0;REVB=0.0315542;RO=0;SAF=28;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000838715;OID=.;OPOS=62007498;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:38:0:0:36:38:1:8:28:0:0:10:28:0:0
chr17	62018773	.	T	C	1552.63	PASS	AF=1;AO=97;DP=98;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0190926;FXX=0.010203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.18;QD=64.0261;RBI=0.0216172;REFB=0;REVB=0.0101379;RO=0;SAF=50;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.91749e-05;OID=.;OPOS=62018773;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:97:0:0:97:97:1:47:50:0:0:47:50:0:0
chr17	62020348	.	T	C	1383.97	PASS	AF=0.958333;AO=89;DP=95;FAO=92;FDP=96;FR=.;FRO=4;FSAF=46;FSAR=46;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0279513;FXX=0.0103082;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.95;QD=57.6656;RBI=0.0280621;REFB=-0.0892354;REVB=0.00249218;RO=5;SAF=46;SAR=43;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0083796;STB=0.510414;STBP=0.418;TYPE=snp;VARB=0.0017791;OID=.;OPOS=62020348;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:95:96:5:4:89:92:0.958333:43:46:3:2:46:46:3:1
chr17	62041068	.	T	C	1770.66	PASS	AF=1;AO=116;DP=117;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000653236;FXX=0.00854628;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.606;QD=61.0573;RBI=0.0685379;REFB=0;REVB=0.0685348;RO=0;SAF=65;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000148626;OID=.;OPOS=62041068;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:117:116:0:0:116:116:1:51:65:0:0:51:65:0:0
chr17	62078449	.	C	A	54.64	PASS	AF=0.333333;AO=8;DP=24;FAO=8;FDP=24;FR=.;FRO=16;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.0107254;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.0972;QD=9.10723;RBI=0.0321901;REFB=-0.00559019;REVB=-0.0303508;RO=16;SAF=2;SAR=6;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.350398;STB=0.716828;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.00853468;OID=.;OPOS=62078449;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:24:24:16:16:8:8:0.333333:6:2:9:7:6:2:9:7
chr17	62079286	.	G	A	338.05	PASS	AF=0.566667;AO=34;DP=60;FAO=34;FDP=60;FR=.;FRO=26;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=8;FWDB=-0.0115926;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.226;QD=22.5364;RBI=0.0139044;REFB=-0.00559555;REVB=-0.00767762;RO=25;SAF=22;SAR=12;SRF=18;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0627691;STB=0.521726;STBP=0.753;TYPE=snp;VARB=0.00182247;OID=.;OPOS=62079286;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:25:26:34:34:0.566667:12:22:18:7:12:22:18:8
chr17	62121480	.	T	C	208.6	PASS	AF=0.76;AO=19;DP=25;FAO=19;FDP=25;FR=.;FRO=6;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=-0.0026491;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189;QD=33.3759;RBI=0.0578688;REFB=-0.0373501;REVB=0.0578082;RO=6;SAF=10;SAR=9;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.210965;STB=0.615271;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.0106296;OID=.;OPOS=62121480;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:25:25:6:6:19:19:0.76:9:10:6:0:9:10:6:0
chr17	62125272	.	A	G	1558.37	PASS	AF=0.990566;AO=105;DP=107;FAO=105;FDP=106;FR=.;FRO=1;FSAF=60;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0100448;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.406;QD=58.8065;RBI=0.0112403;REFB=-0.0566053;REVB=0.00504446;RO=1;SAF=60;SAR=45;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.010429;STB=0.505493;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=2.21043e-05;OID=.;OPOS=62125272;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:107:106:1:1:105:105:0.990566:45:60:0:1:45:60:0:1
chr17	62141455	.	A	G	1455.05	PASS	AF=0.969072;AO=94;DP=98;FAO=94;FDP=97;FR=.;FRO=3;FSAF=46;FSAR=48;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0335331;FXX=0.010203;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.8681;QD=60.0023;RBI=0.0394097;REFB=-0.0173859;REVB=-0.020704;RO=3;SAF=46;SAR=48;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0103925;STB=0.505484;STBP=0.485;TYPE=snp;VARB=0.000712574;OID=.;OPOS=62141455;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:98:97:3:3:94:94:0.969072:48:46:2:1:48:46:2:1
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chr17	62854941	.	TC	CG,TG	77.99	PASS	AF=0,0.30303;AO=2,10;DP=36;FAO=0,10;FDP=33;FR=.;FRO=23;FSAF=0,5;FSAR=0,5;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=0.0191106,0.00015417;FXX=0.0833102;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=155.372,163.311;QD=9.45303;RBI=0.0203905,0.00287758;REFB=-0.0134413,-0.0164101;REVB=-0.00711048,-0.00287345;RO=23;SAF=0,5;SAR=2,5;SRF=15;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.567298,-0.174147;STB=0.5,0.605858;STBP=1,0.428;TYPE=mnp,snp;VARB=0,0.0250034;OID=.,.;OPOS=62854941,62854942;OREF=TC,C;OALT=CG,G;OMAPALT=CG,TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:78:36:33:23:23:2,10:0,10:0,0.30303:2,5:0,5:15:8:0,5:0,5:15:8
chr17	63221147	.	CA	AC,CAC	49.46	PASS	AF=0.111111,0.133333;AO=6,5;DP=45;FAO=5,6;FDP=45;FR=.;FRO=34;FSAF=5,5;FSAR=0,1;FSRF=11;FSRR=23;FWDB=-0.0790286,-0.0636445;FXX=0;HRUN=5,0;LEN=2,1;MLLD=51.587,42.7545;QD=4.39633;RBI=0.0805021,0.064984;REFB=-0.0161381,-0.0160683;REVB=-0.015332,-0.013126;RO=34;SAF=6,4;SAR=0,1;SRF=11;SRR=23;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.730155,0.511667;STB=0.998362,0.881275;STBP=0.001,0.098;TYPE=mnp,ins;VARB=0.173754,0.100355;OID=.,.;OPOS=63221147,63221149;OREF=CA,-;OALT=AC,C;OMAPALT=AC,CAC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:21:45:45:34:34:6,5:5,6:0.111111,0.133333:0,1:6,4:11:23:0,1:5,5:11:23
chr17	63533768	.	G	A	149.75	PASS	AF=0.714286;AO=15;DP=21;FAO=15;FDP=21;FR=.;FRO=6;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.0176717;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=230.778;QD=28.5247;RBI=0.050103;REFB=-0.0328221;REVB=0.046883;RO=6;SAF=10;SAR=5;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100199;STB=0.555485;STBP=0.496;TYPE=snp;VARB=0.0103764;OID=.;OPOS=63533768;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:21:21:6:6:15:15:0.714286:5:10:5:1:5:10:5:1
chr17	63533789	.	T	C	310.3	PASS	AF=1;AO=23;DP=24;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00770915;FXX=0.0416493;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.94;QD=53.9649;RBI=0.0324664;REFB=0;REVB=0.0315378;RO=0;SAF=14;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.84921e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000228527;OID=.;OPOS=63533789;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:23:0:0:23:23:1:9:14:0:0:9:14:0:0
chr17	63534250	.	T	C	735.13	PASS	AF=1;AO=46;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0134872;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.327;QD=62.5643;RBI=0.0538316;REFB=0;REVB=0.0521146;RO=0;SAF=31;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000111671;OID=.;OPOS=63534250;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:46:47:1:15:31:0:0:15:32:0:0
chr17	63554591	.	G	A	148.16	PASS	AF=0.533333;AO=16;DP=30;FAO=16;FDP=30;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=0.00684226;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.6079;QD=19.7543;RBI=0.03108;REFB=-0.0220182;REVB=0.0303174;RO=14;SAF=8;SAR=8;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117832;STB=0.566585;STBP=0.467;TYPE=snp;VARB=0.00579719;OID=.;OPOS=63554591;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:14:14:16:16:0.533333:8:8:9:5:8:8:9:5
chr17	64023642	.	A	G	2214.82	PASS	AF=0.97931;AO=142;DP=145;FAO=142;FDP=145;FR=.;FRO=3;FSAF=72;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0260068;FXX=0.00684885;HRUN=3;LEN=1;MLLD=248.957;QD=61.0986;RBI=0.0268663;REFB=-0.0474762;REVB=0.00674105;RO=3;SAF=72;SAR=70;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0199391;STB=0.510488;STBP=0.151;TYPE=snp;VARB=0.000611847;OID=.;OPOS=64023642;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:145:145:3:3:142:142:0.97931:70:72:0:3:70:72:0:3
chr17	64026031	.	T	A	175.51	PASS	AF=0.275862;AO=24;DP=87;FAO=24;FDP=87;FR=.;FRO=63;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=27;FSRR=36;FWDB=0.00723626;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.599;QD=8.06959;RBI=0.0145929;REFB=0.00124163;REVB=0.0126724;RO=63;SAF=16;SAR=8;SRF=27;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.286804;STB=0.671613;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=-0.00277565;OID=.;OPOS=64026031;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:63:63:24:24:0.275862:8:16:27:36:8:16:27:36
chr17	64208230	.	G	A	885.42	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0214807;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.137;QD=58.0601;RBI=0.0254912;REFB=0;REVB=-0.0137252;RO=0;SAF=25;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.1948e-05;OID=.;OPOS=64208230;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:36:25:0:0:36:25:0:0
chr17	64210757	.	C	A	151.72	PASS	AF=0.365385;AO=18;DP=50;FAO=19;FDP=52;FR=.;FRO=33;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=-0.0166042;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.8258;QD=11.6705;RBI=0.0187209;REFB=-0.0284163;REVB=0.00864715;RO=31;SAF=7;SAR=11;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13954;STB=0.59494;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=0.0373136;OID=.;OPOS=64210757;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:52:31:33:18:19:0.365385:11:7:16:15:12:7:17:16
chr17	64216709	.	C	T	251.89	PASS	AF=0.426471;AO=29;DP=68;FAO=29;FDP=68;FR=.;FRO=39;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=23;FWDB=-0.0475868;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.005;QD=14.8171;RBI=0.0558922;REFB=-0.0120766;REVB=-0.0293162;RO=39;SAF=20;SAR=9;SRF=16;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.288321;STB=0.663785;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.0231513;OID=.;OPOS=64216709;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:39:39:29:29:0.426471:9:20:16:23:9:20:16:23
chr17	64783081	.	G	A,T	1461.23	PASS	AF=0.957447,0.0425532;AO=90,4;DP=94;FAO=90,4;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=31,4;FSAR=59,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0324018,-0.00253968;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=63.214,206.869;QD=62.18;RBI=0.0389035,0.00467535;REFB=0,0;REVB=-0.0215314,0.00392542;RO=0;SAF=31,4;SAR=59,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00163927,0.135793;OID=.,.;OPOS=64783081,64783081;OREF=G,G;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:10:94:94:0:0:90,4:90,4:0.957447,0.0425532:59,0:31,4:0:0:59,0:31,4:0:0
chr17	64801021	.	A	G	651.22	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0601476;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.0322;QD=62.021;RBI=0.0613672;REFB=0;REVB=0.0121737;RO=0;SAF=20;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000544918;OID=.;OPOS=64801021;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:22:20:0:0:22:20:0:0
chr17	65066879	.	A	G	785.67	PASS	AF=1;AO=53;DP=54;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00771794;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.949;QD=57.1394;RBI=0.0250877;REFB=0;REVB=0.023871;RO=0;SAF=16;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.33586e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.4605e-05;OID=.;OPOS=65066879;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:55:0:0:53:55:1:37:16:0:0:38:17:0:0
chr17	65104666	.	T	G	1570.16	PASS	AF=0.99;AO=98;DP=99;FAO=99;FDP=100;FR=.;FRO=1;FSAF=62;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0190977;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.189;QD=62.8064;RBI=0.0470693;REFB=-0.132767;REVB=0.0430209;RO=1;SAF=61;SAR=37;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00771294;STB=0.503999;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.000762447;OID=.;OPOS=65104666;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:99:100:1:1:98:99:0.99:37:61:1:0:37:62:1:0
chr17	65104743	.	G	A	1272.28	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0468561;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.34;QD=61.3149;RBI=0.0639501;REFB=0;REVB=0.0435215;RO=0;SAF=43;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.11157e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000198761;OID=.;OPOS=65104743;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:77:83:0:0:77:83:1:34:43:0:0:38:45:0:0
chr17	65110436	.	A	G	242.76	PASS	AF=0.371795;AO=29;DP=79;FAO=29;FDP=78;FR=.;FRO=49;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=25;FSRR=24;FWDB=0.0129594;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.655;QD=12.4491;RBI=0.0136493;REFB=-0.0030695;REVB=0.00428438;RO=49;SAF=14;SAR=15;SRF=25;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0299822;STB=0.517229;STBP=0.834;TYPE=snp;VARB=0.0057723;OID=.;OPOS=65110436;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:78:49:49:29:29:0.371795:15:14:25:24:15:14:25:24
chr17	65146031	.	T	A	34.35	PASS	AF=0.08;AO=10;DP=119;FAO=10;FDP=125;FR=.;FRO=115;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=44;FSRR=71;FWDB=-0.114252;FXX=0.0157468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.638;QD=1.09905;RBI=0.114348;REFB=-0.00518467;REVB=0.00470459;RO=109;SAF=2;SAR=8;SRF=38;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20037;STB=0.699179;STBP=0.207;TYPE=snp;VARB=0.0525987;OID=.;OPOS=65146031;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:119:125:109:115:10:10:0.08:8:2:38:71:8:2:44:71
chr17	65212042	.	C	T	47.19	PASS	AF=0.411765;AO=7;DP=17;FAO=7;FDP=17;FR=.;FRO=10;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.00944854;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.49;QD=11.1041;RBI=0.0528463;REFB=0.00284991;REVB=0.0519948;RO=10;SAF=2;SAR=5;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0167433;STB=0.510175;STBP=0.977;TYPE=snp;VARB=-0.00243885;OID=.;OPOS=65212042;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:17:17:10:10:7:7:0.411765:5:2:3:7:5:2:3:7
chr17	65453288	.	C	T	482.5	PASS	AF=0.554217;AO=46;DP=83;FAO=46;FDP=83;FR=.;FRO=37;FSAF=27;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=-0.025067;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.286;QD=23.2529;RBI=0.0265985;REFB=0.0138633;REVB=0.00889527;RO=36;SAF=27;SAR=19;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136637;STB=0.56929;STBP=0.184;TYPE=snp;VARB=-0.00932822;OID=.;OPOS=65453288;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:36:37:46:46:0.554217:19:27:15:21:19:27:16:21
chr17	65574283	.	A	G	747.06	PASS	AF=0.964286;AO=53;DP=56;FAO=54;FDP=56;FR=.;FRO=2;FSAF=21;FSAR=33;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00361673;FXX=0.0175408;HRUN=4;LEN=1;MLLD=138.644;QD=53.3611;RBI=0.0126841;REFB=-0.033635;REVB=0.0121575;RO=0;SAF=21;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.81969e-08;STB=0.522719;STBP=0.137;TYPE=snp;VARB=5.89364e-05;OID=.;OPOS=65574283;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:56:56:0:2:53:54:0.964286:32:21:0:0:33:21:2:0
chr17	65717525	.	T	C	575.78	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0245014;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.07;QD=60.6087;RBI=0.0368173;REFB=0;REVB=0.0274809;RO=0;SAF=18;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.51048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000168706;OID=.;OPOS=65717525;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:20:18:0:0:20:18:0:0
chr17	65978851	.	T	G	728.96	PASS	AF=1;AO=52;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0604655;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.6233;QD=55.0157;RBI=0.0606555;REFB=-0.0866109;REVB=-0.00479606;RO=1;SAF=37;SAR=15;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.030361;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00314685;OID=.;OPOS=65978851;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:53:53:1:0:52:53:1:15:37:0:1:16:37:0:0
chr17	65988049	.	T	C	463.99	PASS	AF=0.586667;AO=44;DP=75;FAO=44;FDP=75;FR=.;FRO=31;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=23;FSRR=8;FWDB=-0.00831989;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.7204;QD=24.7459;RBI=0.00941002;REFB=-0.023117;REVB=0.00439636;RO=31;SAF=19;SAR=25;SRF=23;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.230791;STB=0.626062;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.011311;OID=.;OPOS=65988049;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:31:31:44:44:0.586667:25:19:23:8:25:19:23:8
chr17	65989048	.	T	C	312.19	PASS	AF=0.862069;AO=27;DP=29;FAO=25;FDP=29;FR=.;FRO=4;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0178513;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.8473;QD=43.0608;RBI=0.0371288;REFB=-0.155004;REVB=-0.0325558;RO=2;SAF=13;SAR=14;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.061895;STB=0.571372;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=0.01164;OID=.;OPOS=65989048;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:17:29:29:2:4:27:25:0.862069:14:13:0:2:12:13:0:4
chr17	66016006	.	T	C	182.33	PASS	AF=0.365079;AO=23;DP=63;FAO=23;FDP=63;FR=.;FRO=40;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=30;FSRR=10;FWDB=-0.0242083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.079;QD=11.5764;RBI=0.0273451;REFB=-0.0125925;REVB=-0.0127167;RO=40;SAF=14;SAR=9;SRF=30;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171206;STB=0.598109;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=0.0185791;OID=.;OPOS=66016006;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:40:40:23:23:0.365079:9:14:30:10:9:14:30:10
chr17	66016096	.	C	T	117.86	PASS	AF=0.301887;AO=14;DP=51;FAO=16;FDP=53;FR=.;FRO=37;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=0.0648769;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.2076;QD=8.89483;RBI=0.0650472;REFB=-0.0158333;REVB=-0.00470383;RO=37;SAF=8;SAR=6;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00467322;STB=0.541819;STBP=0.702;TYPE=snp;VARB=0.0411424;OID=.;OPOS=66016096;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:53:37:37:14:16:0.301887:6:8:21:16:6:10:21:16
chr17	66039350	.	A	G	679.41	PASS	AF=0.651685;AO=58;DP=89;FAO=58;FDP=89;FR=.;FRO=31;FSAF=31;FSAR=27;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=0.036375;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.0042;QD=30.5354;RBI=0.0389955;REFB=0.0256886;REVB=-0.0140538;RO=31;SAF=31;SAR=27;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0118433;STB=0.506415;STBP=0.894;TYPE=snp;VARB=-0.00868498;OID=.;OPOS=66039350;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:31:31:58:58:0.651685:27:31:16:15:27:31:16:15
chr17	66195795	.	G	A	387.02	PASS	AF=0.666667;AO=36;DP=54;FAO=36;FDP=54;FR=.;FRO=18;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.00420681;FXX=0.0357079;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.12;QD=28.668;RBI=0.0365327;REFB=-0.0107497;REVB=0.0362897;RO=18;SAF=20;SAR=16;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0681986;STB=0.537169;STBP=0.43;TYPE=snp;VARB=0.00240297;OID=.;OPOS=66195795;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:18:18:36:36:0.666667:16:20:8:10:16:20:8:10
chr17	66246416	.	A	G	356.57	PASS	AF=0.5;AO=37;DP=74;FAO=37;FDP=74;FR=.;FRO=37;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=0.00424869;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=286.958;QD=19.2741;RBI=0.0201991;REFB=-0.00717307;REVB=-0.0197472;RO=37;SAF=18;SAR=19;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0485505;STB=0.526993;STBP=0.663;TYPE=snp;VARB=0.00620228;OID=.;OPOS=66246416;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:37:37:37:37:0.5:19:18:20:17:19:18:20:17
chr17	66264542	.	A	T	848.09	PASS	AF=0.44898;AO=88;DP=196;FAO=88;FDP=196;FR=.;FRO=108;FSAF=48;FSAR=40;FSRF=39;FSRR=69;FWDB=-0.0416459;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.4839;QD=17.308;RBI=0.0630221;REFB=0.00359822;REVB=0.0473012;RO=108;SAF=48;SAR=40;SRF=39;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181492;STB=0.600529;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=-0.00489351;OID=.;OPOS=66264542;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:196:196:108:108:88:88:0.44898:40:48:39:69:40:48:39:69
chr17	66264567	.	TTA	T	165.92	PASS	AF=0.276596;AO=33;DP=93;FAO=39;FDP=141;FR=.;FRO=102;FSAF=7;FSAR=32;FSRF=35;FSRR=67;FWDB=-0.0483045;FXX=0.180222;HRUN=2;LEN=2;MLLD=119.152;QD=4.70707;RBI=0.0495943;REFB=-0.0490068;REVB=-0.011237;RO=44;SAF=6;SAR=27;SRF=14;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196128;STB=0.659701;STBP=0.038;TYPE=del;VARB=0.113681;OID=.;OPOS=66264568;OREF=TA;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.276596:33:93:39:141:102:7:32:35:67:99:44:6:27:14:30
chr17	66265072	.	C	A,CA	47.87	PASS	AF=0.0333333,0.366667;AO=2,4;DP=30;FAO=1,11;FDP=30;FR=.;FRO=18;FSAF=0,3;FSAR=1,8;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.0352083,0.0172596;FXX=0.0322477;HRUN=1,4;LEN=1,1;MLLD=139.188,10.8805;QD=6.38207;RBI=0.0438318,0.18658;REFB=-0.00669062,-0.108023;REVB=0.0261075,0.18578;RO=23;SAF=0,1;SAR=2,3;SRF=9;SRR=14;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.450372,-0.180041;STB=0.987637,0.583781;STBP=0.476,0.525;TYPE=snp,ins;VARB=0.158302,0.0626803;OID=.,.;OPOS=66265072,66265073;OREF=C,-;OALT=A,A;OMAPALT=A,CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:43:30:30:23:18:2,4:1,11:0.0333333,0.366667:2,3:0,1:9:14:1,8:0,3:7:11
chr17	66267691	.	A	T	122.47	PASS	AF=0.264706;AO=18;DP=68;FAO=18;FDP=68;FR=.;FRO=50;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=29;FWDB=-0.0129219;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=115.192;QD=7.20408;RBI=0.0146938;REFB=-0.0024244;REVB=-0.00699514;RO=50;SAF=7;SAR=11;SRF=21;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0390879;STB=0.523783;STBP=0.838;TYPE=snp;VARB=0.00674995;OID=.;OPOS=66267691;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:50:50:18:18:0.264706:11:7:21:29:11:7:21:29
chr17	66391016	.	G	A	80.39	PASS	AF=0.209677;AO=13;DP=62;FAO=13;FDP=62;FR=.;FRO=49;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=17;FSRR=32;FWDB=-0.0280191;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.062;QD=5.1866;RBI=0.0301192;REFB=-0.00505706;REVB=-0.0110495;RO=49;SAF=11;SAR=2;SRF=17;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.58758;STB=0.869239;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0117769;OID=.;OPOS=66391016;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:80:62:62:49:49:13:13:0.209677:2:11:17:32:2:11:17:32
chr17	66391276	.	G	A	138.26	PASS	AF=0.266667;AO=20;DP=75;FAO=20;FDP=75;FR=.;FRO=55;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=31;FSRR=24;FWDB=0.00456443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.514;QD=7.37392;RBI=0.00757077;REFB=-0.0125247;REVB=-0.00604008;RO=54;SAF=9;SAR=11;SRF=30;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12697;STB=0.5827;STBP=0.404;TYPE=snp;VARB=0.0349958;OID=.;OPOS=66391276;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:54:55:20:20:0.266667:11:9:30:24:11:9:31:24
chr17	66449122	.	G	A	551.73	PASS	AF=0.544554;AO=54;DP=100;FAO=55;FDP=101;FR=.;FRO=46;FSAF=33;FSAR=22;FSRF=25;FSRR=21;FWDB=-0.00831865;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.354;QD=21.8505;RBI=0.0122401;REFB=-0.00368127;REVB=0.00897883;RO=46;SAF=33;SAR=21;SRF=25;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0586387;STB=0.526521;STBP=0.587;TYPE=snp;VARB=0.00367235;OID=.;OPOS=66449122;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:101:46:46:54:55:0.544554:21:33:25:21:22:33:25:21
chr17	66537003	.	G	A	435.94	PASS	AF=0.544304;AO=42;DP=78;FAO=43;FDP=79;FR=.;FRO=36;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=0.00141832;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.1676;QD=22.0727;RBI=0.0491244;REFB=-0.00504245;REVB=0.0491039;RO=35;SAF=22;SAR=20;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0314288;STB=0.517943;STBP=0.764;TYPE=snp;VARB=0.00589552;OID=.;OPOS=66537003;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:79:35:36:42:43:0.544304:20:22:17:18:21:22:17:19
chr17	66596463	.	C	T	1257.97	PASS	AF=0.643275;AO=110;DP=174;FAO=110;FDP=171;FR=.;FRO=61;FSAF=59;FSAR=51;FSRF=38;FSRR=23;FWDB=0.00875867;FXX=0.0172404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.833;QD=29.4262;RBI=0.0627145;REFB=-0.00841731;REVB=0.0620999;RO=61;SAF=59;SAR=51;SRF=38;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.057902;STB=0.531187;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=0.00560685;OID=.;OPOS=66596463;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:174:171:61:61:110:110:0.643275:51:59:38:23:51:59:38:23
chr17	66871837	.	C	T	184.91	PASS	AF=0.206897;AO=30;DP=145;FAO=30;FDP=145;FR=.;FRO=115;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=52;FSRR=63;FWDB=-0.013107;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=306.148;QD=5.1009;RBI=0.0168235;REFB=-0.00496915;REVB=-0.0105468;RO=115;SAF=12;SAR=18;SRF=52;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0678315;STB=0.542344;STBP=0.611;TYPE=snp;VARB=0.0178248;OID=.;OPOS=66871837;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:145:145:115:115:30:30:0.206897:18:12:52:63:18:12:52:63
chr17	66871864	.	G	A	199.34	PASS	AF=0.227941;AO=31;DP=135;FAO=31;FDP=136;FR=.;FRO=105;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=45;FSRR=60;FWDB=-0.0121406;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=268.977;QD=5.86295;RBI=0.0122625;REFB=-0.00531609;REVB=-0.00172526;RO=104;SAF=12;SAR=19;SRF=44;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0470087;STB=0.533213;STBP=0.7;TYPE=snp;VARB=0.0185303;OID=.;OPOS=66871864;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:135:136:104:105:31:31:0.227941:19:12:44:60:19:12:45:60
chr17	66872802	.	G	C	1459.6	PASS	AF=1;AO=92;DP=92;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0287707;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.8364;QD=62.7786;RBI=0.033739;REFB=0;REVB=-0.017623;RO=0;SAF=48;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00038894;OID=.;OPOS=66872802;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:92:93:0:0:92:93:1:44:48:0:0:44:49:0:0
chr17	66873743	.	G	A	1145.2	PASS	AF=0.987013;AO=76;DP=79;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0216076;FXX=0.0253133;HRUN=3;LEN=1;MLLD=165.464;QD=59.491;RBI=0.0328239;REFB=-0.112723;REVB=0.0247086;RO=1;SAF=21;SAR=55;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00852763;STB=0.504503;STBP=0.603;TYPE=snp;VARB=7.93569e-05;OID=.;OPOS=66873743;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:79:77:1:1:76:76:0.987013:55:21:0:1:55:21:0:1
chr17	66928434	.	C	T	86.31	PASS	AF=0.215385;AO=14;DP=65;FAO=14;FDP=65;FR=.;FRO=51;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=26;FSRR=25;FWDB=0.0335053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.021;QD=5.31114;RBI=0.0372013;REFB=-0.00616421;REVB=-0.0161658;RO=51;SAF=4;SAR=10;SRF=26;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.284987;STB=0.681551;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.021274;OID=.;OPOS=66928434;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:65:65:51:51:14:14:0.215385:10:4:26:25:10:4:26:25
chr17	66985992	.	T	G	123.25	PASS	AF=0.268657;AO=18;DP=67;FAO=18;FDP=67;FR=.;FRO=49;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=21;FSRR=28;FWDB=0.0050423;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=293.004;QD=7.35789;RBI=0.00706979;REFB=-0.0039271;REVB=0.00495552;RO=49;SAF=6;SAR=12;SRF=21;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122071;STB=0.574383;STBP=0.452;TYPE=snp;VARB=0.0128488;OID=.;OPOS=66985992;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:49:49:18:18:0.268657:12:6:21:28:12:6:21:28
chr17	67028260	.	T	C	165.2	PASS	AF=0.27381;AO=23;DP=83;FAO=23;FDP=84;FR=.;FRO=61;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=32;FSRR=29;FWDB=-0.0452301;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.4445;QD=7.8666;RBI=0.0459923;REFB=-0.000805576;REVB=-0.00833874;RO=60;SAF=8;SAR=15;SRF=31;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.206846;STB=0.630137;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.000523403;OID=.;OPOS=67028260;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:84:60:61:23:23:0.27381:15:8:31:29:15:8:32:29
chr17	67031457	.	C	T	1029.7	PASS	AF=1;AO=69;DP=70;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00637467;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.062;QD=59.6927;RBI=0.00915112;REFB=0;REVB=-0.00656557;RO=0;SAF=34;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.93962e-05;OID=.;OPOS=67031457;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:69:0:0:69:69:1:35:34:0:0:35:34:0:0
chr17	67101718	.	C	T	1005.07	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0492322;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.5826;QD=59.1216;RBI=0.0492548;REFB=0;REVB=-0.00149077;RO=0;SAF=36;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.49594e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000331902;OID=.;OPOS=67101718;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:32:36:0:0:32:36:0:0
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chr17	67260926	.	A	G	579.68	PASS	AF=0.56383;AO=53;DP=94;FAO=53;FDP=94;FR=.;FRO=41;FSAF=30;FSAR=23;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=0.0222294;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.6544;QD=24.6673;RBI=0.0813298;REFB=-0.00838851;REVB=0.078233;RO=41;SAF=30;SAR=23;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0627781;STB=0.5344;STBP=0.438;TYPE=snp;VARB=0.00881847;OID=.;OPOS=67260926;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:41:41:53:53:0.56383:23:30:20:21:23:30:20:21
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chr17	67273882	.	C	A	1695.06	PASS	AF=1;AO=112;DP=112;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.015697;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.193;QD=60.5379;RBI=0.0345927;REFB=0;REVB=0.0308262;RO=0;SAF=62;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000119664;OID=.;OPOS=67273882;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:112:112:0:0:112:112:1:50:62:0:0:50:62:0:0
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chr17	71027782	.	G	A	51.09	PASS	AF=0.25;AO=7;DP=32;FAO=8;FDP=32;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=0.000176128;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.692;QD=6.38664;RBI=0.048275;REFB=-0.0169917;REVB=0.0482747;RO=25;SAF=5;SAR=2;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149757;STB=0.5;STBP=0.999;TYPE=snp;VARB=0.0534668;OID=.;OPOS=71027782;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:51:32:32:25:24:7:8:0.25:2:5:15:10:3:5:15:9
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chr17	71197748	.	G	A	45.66	PASS	AF=0.333333;AO=7;DP=21;FAO=7;FDP=21;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.0427316;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.6931;QD=8.69783;RBI=0.0508268;REFB=-0.00153144;REVB=-0.0275204;RO=14;SAF=4;SAR=3;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.226678;STB=0.639616;STBP=0.418;TYPE=snp;VARB=-0.00332345;OID=.;OPOS=71197748;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:21:21:14:14:7:7:0.333333:3:4:5:9:3:4:5:9
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chr17	71365314	.	A	G	1967.07	PASS	AF=1;AO=125;DP=127;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0330393;FXX=0.00781189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.11;QD=61.9551;RBI=0.0340347;REFB=0;REVB=-0.00817077;RO=0;SAF=52;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00042348;OID=.;OPOS=71365314;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:127:127:0:0:125:127:1:73:52:0:0:74:53:0:0
chr17	71375642	.	G	A	191.07	PASS	AF=0.72;AO=18;DP=23;FAO=18;FDP=25;FR=.;FRO=7;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.00278235;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.4231;QD=30.5713;RBI=0.0142329;REFB=-0.112913;REVB=-0.0139583;RO=5;SAF=11;SAR=7;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0857877;STB=0.511615;STBP=0.9;TYPE=snp;VARB=0.0326774;OID=.;OPOS=71375642;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:23:25:5:7:18:18:0.72:7:11:2:3:7:11:4:3
chr17	71382022	.	C	T	253.73	PASS	AF=0.638889;AO=23;DP=36;FAO=23;FDP=36;FR=.;FRO=13;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.0061975;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.13;QD=28.1925;RBI=0.0064912;REFB=-0.0237272;REVB=0.00193047;RO=13;SAF=13;SAR=10;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0335267;STB=0.518502;STBP=0.777;TYPE=snp;VARB=0.00674597;OID=.;OPOS=71382022;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:13:13:23:23:0.638889:10:13:8:5:10:13:8:5
chr17	71382049	.	A	G	131.95	PASS	AF=0.636364;AO=14;DP=22;FAO=14;FDP=22;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.00494001;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.046;QD=23.9906;RBI=0.0186321;REFB=-0.0168339;REVB=-0.0179652;RO=7;SAF=5;SAR=9;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132373;STB=0.554715;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.0140019;OID=.;OPOS=71382049;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:22:22:7:8:14:14:0.636364:9:5:4:3:9:5:4:4
chr17	71383998	.	A	G	279.32	PASS	AF=0.508475;AO=30;DP=59;FAO=30;FDP=59;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=20;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.011285;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.071;QD=18.937;RBI=0.0131618;REFB=-0.013837;REVB=-0.0067737;RO=29;SAF=10;SAR=20;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139906;STB=0.57826;STBP=0.238;TYPE=snp;VARB=0.0104328;OID=.;OPOS=71383998;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:29:29:30:30:0.508475:20:10:14:15:20:10:14:15
chr17	71384016	.	C	T	252.83	PASS	AF=0.509434;AO=27;DP=54;FAO=27;FDP=53;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=-0.0279074;FXX=0.0185151;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.288;QD=19.0817;RBI=0.0279081;REFB=-0.0247184;REVB=0.00019359;RO=26;SAF=12;SAR=15;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0884214;STB=0.54932;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=0.0303806;OID=.;OPOS=71384016;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:53:26:26:27:27:0.509434:15:12:9:17:15:12:9:17
chr17	71384080	.	G	C	233.7	PASS	AF=0.578947;AO=22;DP=38;FAO=22;FDP=38;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.0122552;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=255.395;QD=24.5996;RBI=0.0126163;REFB=-0.0186843;REVB=0.00299699;RO=16;SAF=10;SAR=12;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0610537;STB=0.53395;STBP=0.631;TYPE=snp;VARB=0.0132904;OID=.;OPOS=71384080;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:16:16:22:22:0.578947:12:10:6:10:12:10:6:10
chr17	71397286	.	G	A	989.97	PASS	AF=0.669291;AO=84;DP=126;FAO=85;FDP=127;FR=.;FRO=42;FSAF=75;FSAR=10;FSRF=32;FSRR=10;FWDB=-0.00972471;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.318;QD=31.1801;RBI=0.0606163;REFB=-0.0109197;REVB=0.0598311;RO=42;SAF=74;SAR=10;SRF=32;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152166;STB=0.583636;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.00415379;OID=.;OPOS=71397286;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:126:127:42:42:84:85:0.669291:10:74:32:10:10:75:32:10
chr17	71410891	.	C	T	33.51	PASS	AF=0.153846;AO=6;DP=39;FAO=6;FDP=39;FR=.;FRO=33;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=-0.0125636;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.03;QD=3.43665;RBI=0.0125818;REFB=-0.00265329;REVB=0.000677413;RO=33;SAF=2;SAR=4;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.250098;STB=0.677379;STBP=0.389;TYPE=snp;VARB=0.020442;OID=.;OPOS=71410891;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:39:39:33:33:6:6:0.153846:4:2:18:15:4:2:18:15
chr17	71412029	.	G	A	704.65	PASS	AF=0.734177;AO=58;DP=79;FAO=58;FDP=79;FR=.;FRO=21;FSAF=28;FSAR=30;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=0.00590527;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.726;QD=35.6783;RBI=0.0225303;REFB=-0.0087611;REVB=0.0217427;RO=21;SAF=28;SAR=30;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0672745;STB=0.536169;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=0.00434206;OID=.;OPOS=71412029;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:21:21:58:58:0.734177:30:28:13:8:30:28:13:8
chr17	71746427	.	G	A	890.19	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0680871;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.681;QD=57.4314;RBI=0.0687686;REFB=0;REVB=0.00965754;RO=0;SAF=31;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000857301;OID=.;OPOS=71746427;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:62:0:0:59:62:1:28:31:0:0:28:34:0:0
chr17	71746435	.	C	T	920.29	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0345168;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.088;QD=58.4309;RBI=0.0349312;REFB=0;REVB=-0.00536477;RO=0;SAF=35;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000177258;OID=.;OPOS=71746435;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:28:35:0:0:28:35:0:0
chr17	71746479	.	C	G	1227.44	PASS	AF=1;AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0236648;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.7387;QD=61.3722;RBI=0.0334666;REFB=0;REVB=0.0236641;RO=0;SAF=45;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.30416e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000339952;OID=.;OPOS=71746479;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:80:80:0:0:80:80:1:35:45:0:0:35:45:0:0
chr17	71746508	.	T	C	1333.12	PASS	AF=0.988636;AO=84;DP=85;FAO=87;FDP=88;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0294452;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.086;QD=60.5962;RBI=0.0318301;REFB=0.0112691;REVB=0.0120885;RO=0;SAF=48;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506328;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.000766833;OID=.;OPOS=71746508;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:85:88:0:1:84:87:0.988636:36:48:0:0:39:48:0:1
chr17	71746796	.	A	G	817.73	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0260039;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.4159;QD=57.3848;RBI=0.0304503;REFB=0;REVB=0.0158435;RO=0;SAF=31;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.19358e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000105876;OID=.;OPOS=71746796;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:26:31:0:0:26:31:0:0
chr17	71747278	.	G	C	1788.35	PASS	AF=0.991597;AO=118;DP=119;FAO=118;FDP=119;FR=.;FRO=1;FSAF=67;FSAR=51;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.016302;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=197.599;QD=60.1127;RBI=0.0163359;REFB=-0.108024;REVB=-0.00105173;RO=1;SAF=67;SAR=51;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00703672;STB=0.503703;STBP=0.494;TYPE=snp;VARB=0.000274187;OID=.;OPOS=71747278;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:119:119:1:1:118:118:0.991597:51:67:1:0:51:67:1:0
chr17	71747323	.	T	C	1128.48	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0106154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.365;QD=60.1855;RBI=0.0128772;REFB=0;REVB=0.00728947;RO=0;SAF=39;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.19774e-05;OID=.;OPOS=71747323;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:75:0:0:73:75:1:34:39:0:0:35:40:0:0
chr17	71747336	.	G	A	990.46	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00636438;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.1439;QD=59.1318;RBI=0.0148773;REFB=0;REVB=0.0134473;RO=0;SAF=39;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.10038e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.78231e-05;OID=.;OPOS=71747336;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:67:0:0:65:67:1:26:39:0:0:27:40:0:0
chr17	71747394	.	C	T	723.67	PASS	AF=0.981132;AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.000354422;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=87.269;QD=54.6166;RBI=0.0367617;REFB=-0.0031666;REVB=0.03676;RO=1;SAF=24;SAR=28;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.016526;STB=0.508769;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=0.000226137;OID=.;OPOS=71747394;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:53:53:1:1:52:52:0.981132:28:24:0:1:28:24:0:1
chr17	71747397	.	G	A	740.37	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00365938;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.9929;QD=56.9511;RBI=0.0337691;REFB=0;REVB=-0.0335703;RO=0;SAF=24;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000155506;OID=.;OPOS=71747397;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:28:24:0:0:28:24:0:0
chr17	71752500	.	C	CT	1921.67	PASS	AF=1;AO=122;DP=129;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0286289;FXX=0.023254;HRUN=0;LEN=1;MLLD=189.884;QD=61.0053;RBI=0.0508013;REFB=0;REVB=0.0419662;RO=3;SAF=67;SAR=55;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0207935;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000200496;OID=.;OPOS=71752501;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:122:129:126:126:0:67:59:0:0:11:3:67:55:3:0
chr17	72209858	.	A	G	1140.71	PASS	AF=0.987013;AO=76;DP=78;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=42;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0588439;FXX=0.0128189;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.352;QD=59.2578;RBI=0.0611688;REFB=0.064781;REVB=-0.0167038;RO=0;SAF=34;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6391e-08;STB=0.507244;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=-0.00153738;OID=.;OPOS=72209858;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:78:77:0:1:76:76:0.987013:42:34:0:0:42:34:1:0
chr17	72257755	.	G	A	136.7	PASS	AF=0.32;AO=16;DP=50;FAO=16;FDP=50;FR=.;FRO=34;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=-0.024429;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.944;QD=10.9363;RBI=0.0264471;REFB=-0.00404702;REVB=0.0101326;RO=34;SAF=4;SAR=12;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177824;STB=0.607;STBP=0.337;TYPE=snp;VARB=0.00754779;OID=.;OPOS=72257755;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:34:34:16:16:0.32:12:4:13:21:12:4:13:21
chr17	72301432	.	A	G	480.77	PASS	AF=0.6;AO=45;DP=75;FAO=45;FDP=75;FR=.;FRO=30;FSAF=25;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=-0.0224225;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=232.444;QD=25.6409;RBI=0.0228107;REFB=0.00520667;REVB=-0.00419025;RO=30;SAF=25;SAR=20;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0330633;STB=0.518064;STBP=0.726;TYPE=snp;VARB=-0.00406558;OID=.;OPOS=72301432;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:30:30:45:45:0.6:20:25:18:12:20:25:18:12
chr17	72303449	.	G	A	1140.72	PASS	AF=0.644295;AO=96;DP=149;FAO=96;FDP=149;FR=.;FRO=53;FSAF=42;FSAR=54;FSRF=26;FSRR=27;FWDB=0.0194219;FXX=0.00666622;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.797;QD=30.6234;RBI=0.0302324;REFB=-0.0197607;REVB=0.0231687;RO=53;SAF=42;SAR=54;SRF=26;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.035363;STB=0.51908;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=0.00823931;OID=.;OPOS=72303449;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:149:149:53:53:96:96:0.644295:54:42:26:27:54:42:26:27
chr17	72305534	.	C	T	990.94	PASS	AF=0.604167;AO=87;DP=144;FAO=87;FDP=144;FR=.;FRO=57;FSAF=51;FSAR=36;FSRF=29;FSRR=28;FWDB=0.0162442;FXX=0.00689608;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.072;QD=27.5261;RBI=0.016686;REFB=-0.00623631;REVB=-0.00381443;RO=57;SAF=51;SAR=36;SRF=29;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0575929;STB=0.531243;STBP=0.377;TYPE=snp;VARB=0.0039654;OID=.;OPOS=72305534;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:144:144:57:57:87:87:0.604167:36:51:29:28:36:51:29:28
chr17	72305688	.	T	C	231.45	PASS	AF=0.7;AO=21;DP=30;FAO=21;FDP=30;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=0.0226112;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=78.703;QD=30.8604;RBI=0.0534455;REFB=0.04124;REVB=0.0484268;RO=9;SAF=6;SAR=15;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0432989;STB=0.523787;STBP=0.742;TYPE=snp;VARB=-0.00953354;OID=.;OPOS=72305688;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:30:30:9:9:21:21:0.7:15:6:2:7:15:6:2:7
chr17	72308319	.	G	A	803.78	PASS	AF=1;AO=55;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0501019;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.1216;QD=57.4131;RBI=0.0523898;REFB=0;REVB=0.015313;RO=0;SAF=28;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.4002e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000629473;OID=.;OPOS=72308319;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:55:56:1:27:28:0:0:28:28:0:0
chr17	72324649	.	G	GC	96.4	PASS	AF=0.571429;AO=12;DP=24;FAO=12;FDP=21;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=-0.153327;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=29.8752;QD=18.3612;RBI=0.154448;REFB=0.0417401;REVB=0.0185708;RO=12;SAF=4;SAR=8;SRF=2;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.175524;STB=0.555467;STBP=0.615;TYPE=ins;VARB=-0.0464181;OID=.;OPOS=72324650;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.571429:12:24:12:21:9:4:8:2:7:60:12:4:8:2:10
chr17	72338765	.	G	A	726.52	PASS	AF=0.981132;AO=52;DP=54;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0126251;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.0151;QD=54.832;RBI=0.0425992;REFB=-0.140909;REVB=0.0406853;RO=0;SAF=32;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.00761e-08;STB=0.51219;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.00539685;OID=.;OPOS=72338765;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:54:53:0:1:52:52:0.981132:20:32:0:0:20:32:0:1
chr17	72346855	.	T	C	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-8.52058e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.049;QD=51.1845;RBI=0.033129;REFB=0;REVB=0.0331289;RO=0;SAF=10;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00033588;OID=.;OPOS=72346855;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:10:10:0:0:10:10:0:0
chr17	72346868	.	C	T	103.56	PASS	AF=0.545455;AO=12;DP=22;FAO=12;FDP=22;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.00644977;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.5376;QD=18.8285;RBI=0.00905345;REFB=-0.0189901;REVB=-0.00635338;RO=10;SAF=7;SAR=5;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0670073;STB=0.538397;STBP=0.762;TYPE=snp;VARB=0.0385761;OID=.;OPOS=72346868;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:22:22:10:10:12:12:0.545455:5:7:5:5:5:7:5:5
chr17	72350362	.	G	A	1375.89	PASS	AF=0.968085;AO=90;DP=95;FAO=91;FDP=94;FR=.;FRO=3;FSAF=43;FSAR=48;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0840049;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=45.2793;QD=58.5484;RBI=0.114433;REFB=-0.224827;REVB=0.0777051;RO=3;SAF=43;SAR=47;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00884638;STB=0.506209;STBP=0.47;TYPE=snp;VARB=0.0199191;OID=.;OPOS=72350362;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:95:94:3:3:90:91:0.968085:47:43:1:2:48:43:2:1
chr17	72351406	.	C	T	1476.09	PASS	AF=0.885246;AO=105;DP=119;FAO=108;FDP=122;FR=.;FRO=14;FSAF=40;FSAR=68;FSRF=14;FSRR=0;FWDB=0.0381267;FXX=0.0239981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.9781;QD=48.3962;RBI=0.0729517;REFB=-0.152582;REVB=0.0621958;RO=5;SAF=39;SAR=66;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0570448;STB=0.574454;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00895923;OID=.;OPOS=72351406;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:119:122:5:14:105:108:0.885246:66:39:5:0:68:40:14:0
chr17	72351761	.	A	G	1319.8	PASS	AF=1;AO=84;DP=84;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=301.842;QD=62.1081;RBI=0.0160659;REFB=0;REVB=-0.00197218;RO=0;SAF=36;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.60438e-06;OID=.;OPOS=72351761;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:85:0:0:84:85:1:48:36:0:0:48:37:0:0
chr17	72366695	.	C	A	649.6	PASS	AF=0.941176;AO=48;DP=51;FAO=48;FDP=51;FR=.;FRO=3;FSAF=27;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0095655;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=48.1094;QD=50.9489;RBI=0.00963841;REFB=-0.0445007;REVB=-0.00118329;RO=2;SAF=27;SAR=21;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0427126;STB=0.513642;STBP=0.489;TYPE=snp;VARB=0.00747124;OID=.;OPOS=72366695;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:51:51:2:3:48:48:0.941176:21:27:0:2:21:27:1:2
chr17	72368550	.	T	C	88.97	PASS	AF=0.24;AO=12;DP=50;FAO=12;FDP=50;FR=.;FRO=38;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=29;FWDB=-0.0465237;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.086;QD=7.11767;RBI=0.0506631;REFB=-0.00915664;REVB=-0.0200573;RO=38;SAF=4;SAR=8;SRF=9;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141447;STB=0.587168;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=0.0208044;OID=.;OPOS=72368550;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:50:50:38:38:12:12:0.24:8:4:9:29:8:4:9:29
chr17	72439700	.	T	G	88.1	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0145987;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.088;QD=39.1567;RBI=0.0145993;REFB=0;REVB=-0.000123008;RO=0;SAF=5;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.75771e-05;OID=.;OPOS=72439700;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:9:0:0:8:9:1:3:5:0:0:3:6:0:0
chr17	72439808	.	TGG	TG,TGC,TTG	1323.03	PASS	AF=0.911111,0.0111111,0.0777778;AO=74,6,7;DP=91;FAO=82,1,7;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=44,1,7;FSAR=38,0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.159351,-0.115926,-0.0823515;FXX=0.0109878;HRUN=2,2,2;LEN=1,1,1;MLLD=25.9909,4.63421,6.78935;QD=58.8015;RBI=0.167672,0.117462,0.0824292;REFB=0,0,0;REVB=-0.0521639,-0.0189336,-0.00357771;RO=0;SAF=37,6,7;SAR=37,0,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,snp,snp;VARB=-0.0210261,0.0168241,0.046198;OID=.,.,.;OPOS=72439809,72439810,72439809;OREF=G,G,G;OALT=-,C,T;OMAPALT=TG,TGC,TTG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/3:0.911111,0.0111111,0.0777778:74,6,7:91:82,1,7:90:0:44,1,7:38,0,0:0:0:24:0:37,6,7:37,0,0:0:0
chr17	72469958	.	A	G	2107.49	PASS	AF=1;AO=134;DP=134;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0145029;FXX=0.00740686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.0386;QD=62.9101;RBI=0.0246134;REFB=0;REVB=-0.0198868;RO=0;SAF=54;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.87219e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000171953;OID=.;OPOS=72469958;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:134:134:0:0:134:134:1:80:54:0:0:80:54:0:0
chr17	72519798	.	C	T	740.35	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00643908;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.9315;QD=56.9498;RBI=0.0113839;REFB=0;REVB=0.00938782;RO=0;SAF=19;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.0907e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000152034;OID=.;OPOS=72519798;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:33:19:0:0:33:19:0:0
chr17	72521897	.	G	A	713.19	PASS	AF=1;AO=49;DP=51;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00899172;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.523;QD=57.0551;RBI=0.0205;REFB=0;REVB=-0.0184227;RO=0;SAF=29;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000485235;OID=.;OPOS=72521897;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:50:0:0:49:50:1:20:29:0:0:20:30:0:0
chr17	72588326	.	A	C	538.56	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00366096;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.035;QD=59.8394;RBI=0.0278931;REFB=0;REVB=0.0276518;RO=0;SAF=19;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.56743e-05;OID=.;OPOS=72588326;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:17:19:0:0:17:19:0:0
chr17	72589178	.	AT	A	71.27	PASS	AF=0.558824;AO=16;DP=33;FAO=19;FDP=34;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=0.136316;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=8.42703;QD=8.38528;RBI=0.150594;REFB=-0.09739;REVB=-0.0640054;RO=13;SAF=2;SAR=14;SRF=4;SRR=9;SSEN=0.33042;SSEP=0;SSSB=-0.253422;STB=0.525521;STBP=0.796;TYPE=del;VARB=0.0968752;OID=.;OPOS=72589179;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.558824:16:33:19:34:15:6:13:4:11:40:13:2:14:4:9
chr17	72589196	.	T	C	526.6	PASS	AF=0.972973;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.016637;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=159.954;QD=56.9296;RBI=0.0217859;REFB=0.0163328;REVB=0.0140654;RO=0;SAF=12;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.519989;STBP=0.25;TYPE=snp;VARB=-1.94994e-05;OID=.;OPOS=72589196;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:37:37:0:1:36:36:0.972973:24:12:0:0:24:12:1:0
chr17	72589264	.	G	T	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00715116;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.831;QD=56.1916;RBI=0.0159524;REFB=0;REVB=0.0142597;RO=0;SAF=13;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.96459e-05;OID=.;OPOS=72589264;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:15:13:0:0:15:13:0:0
chr17	72590267	.	T	C	557.1	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0174376;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.699;QD=60.2272;RBI=0.0241757;REFB=0;REVB=0.016745;RO=0;SAF=11;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.92789e-05;OID=.;OPOS=72590267;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:26:11:0:0:26:11:0:0
chr17	72613589	.	T	G	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0191817;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.089;QD=51.9155;RBI=0.0249529;REFB=0;REVB=-0.0159595;RO=0;SAF=9;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.95014e-05;OID=.;OPOS=72613589;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:12:9:0:0:12:9:0:0
chr17	72615293	.	C	T	358.12	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.109974;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.0207;QD=55.0946;RBI=0.120319;REFB=0;REVB=-0.0488114;RO=0;SAF=9;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00156437;OID=.;OPOS=72615293;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:17:9:0:0:17:9:0:0
chr17	72691039	.	G	A	40.88	PASS	AF=0.6;AO=5;DP=10;FAO=6;FDP=10;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.00314942;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.561;QD=16.354;RBI=0.0128806;REFB=0.0149258;REVB=-0.0124897;RO=4;SAF=2;SAR=3;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.422723;STB=0.749247;STBP=0.109;TYPE=snp;VARB=-0.00223689;OID=.;OPOS=72691039;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:10:10:4:4:5:6:0.6:3:2:4:0:4:2:4:0
chr17	72691263	.	G	T	165.54	PASS	AF=0.323529;AO=22;DP=68;FAO=22;FDP=68;FR=.;FRO=46;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=23;FSRR=23;FWDB=-0.0101519;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.342;QD=9.73756;RBI=0.0566331;REFB=-0.0052998;REVB=0.0557158;RO=46;SAF=7;SAR=15;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.217333;STB=0.628371;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.0151062;OID=.;OPOS=72691263;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:46:46:22:22:0.323529:15:7:23:23:15:7:23:23
chr17	72691885	.	C	T	316.89	PASS	AF=0.421687;AO=35;DP=83;FAO=35;FDP=83;FR=.;FRO=48;FSAF=24;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=28;FWDB=0.0219687;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.854;QD=15.2717;RBI=0.0247254;REFB=-0.00652844;REVB=-0.0113456;RO=48;SAF=24;SAR=11;SRF=20;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.280843;STB=0.659062;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.0123921;OID=.;OPOS=72691885;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:48:48:35:35:0.421687:11:24:20:28:11:24:20:28
chr17	72691928	.	T	C	1493.56	PASS	AF=0.990196;AO=101;DP=104;FAO=101;FDP=102;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=54;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0201906;FXX=0.0192289;HRUN=4;LEN=1;MLLD=64.7083;QD=58.5708;RBI=0.0220215;REFB=-0.0788761;REVB=-0.00879126;RO=0;SAF=47;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505262;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=-0.000200893;OID=.;OPOS=72691928;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:104:102:0:1:101:101:0.990196:54:47:0:0:54:47:1:0
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chr17	72744798	.	G	C	340.74	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0324825;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.809;QD=54.5177;RBI=0.0620025;REFB=0;REVB=0.0528129;RO=0;SAF=9;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00045641;OID=.;OPOS=72744798;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:16:9:0:0:16:9:0:0
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chr17	72851133	.	A	G	139.72	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00267834;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.094;QD=42.9895;RBI=0.0355632;REFB=0;REVB=0.0354622;RO=0;SAF=7;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00305929;OID=.;OPOS=72851133;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:13:0:0:12:13:1:5:7:0:0:6:7:0:0
chr17	72860253	.	A	G	645.28	PASS	AF=0.581633;AO=57;DP=100;FAO=57;FDP=98;FR=.;FRO=41;FSAF=25;FSAR=32;FSRF=17;FSRR=24;FWDB=0.0191314;FXX=0.019998;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.348;QD=26.3381;RBI=0.020302;REFB=-0.0114132;REVB=0.00679421;RO=42;SAF=25;SAR=32;SRF=18;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00790931;STB=0.510201;STBP=0.813;TYPE=snp;VARB=0.0099673;OID=.;OPOS=72860253;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:98:42:41:57:57:0.581633:32:25:18:24:32:25:17:24
chr17	72862593	.	C	T	1269.35	PASS	AF=0.622222;AO=112;DP=181;FAO=112;FDP=180;FR=.;FRO=68;FSAF=55;FSAR=57;FSRF=32;FSRR=36;FWDB=0.0089127;FXX=0.00552456;HRUN=3;LEN=1;MLLD=110.642;QD=28.2079;RBI=0.0360673;REFB=-0.0132063;REVB=0.0349487;RO=65;SAF=55;SAR=57;SRF=31;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00963448;STB=0.507741;STBP=0.771;TYPE=snp;VARB=0.0076616;OID=.;OPOS=72862593;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:181:180:65:68:112:112:0.622222:57:55:31:34:57:55:32:36
chr17	72863030	.	T	C	103.51	PASS	AF=0.545455;AO=12;DP=22;FAO=12;FDP=22;FR=.;FRO=10;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=2;FWDB=-0.0217397;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.0335;QD=18.8204;RBI=0.0297109;REFB=0.0425051;REVB=0.0202514;RO=10;SAF=9;SAR=3;SRF=8;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0547311;STB=0.5312;STBP=0.838;TYPE=snp;VARB=-0.0371276;OID=.;OPOS=72863030;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:22:22:10:10:12:12:0.545455:3:9:8:2:3:9:8:2
chr17	72889685	.	G	A	591.22	PASS	AF=0.480315;AO=61;DP=125;FAO=61;FDP=127;FR=.;FRO=66;FSAF=35;FSAR=26;FSRF=18;FSRR=48;FWDB=0.0408097;FXX=0.00781189;HRUN=3;LEN=1;MLLD=94.8821;QD=18.621;RBI=0.0408865;REFB=-0.0462138;REVB=-0.00250456;RO=52;SAF=35;SAR=26;SRF=6;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.373121;STB=0.652674;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0113886;OID=.;OPOS=72889685;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:125:127:52:66:61:61:0.480315:26:35:6:46:26:35:18:48
chr17	72889696	.	A	G	568.82	PASS	AF=0.556701;AO=52;DP=95;FAO=54;FDP=97;FR=.;FRO=43;FSAF=41;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=43;FWDB=-0.00021184;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.4995;QD=23.4565;RBI=0.0272617;REFB=-0.0382805;REVB=-0.0272609;RO=42;SAF=41;SAR=11;SRF=0;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.602302;STB=0.81149;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0284017;OID=.;OPOS=72889696;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:97:42:43:52:54:0.556701:11:41:0:42:13:41:0:43
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chr17	72927123	.	G	T	212.41	PASS	AF=0.477273;AO=21;DP=44;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=4;FSAR=17;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=-0.0323249;FXX=0.0222173;HRUN=3;LEN=1;MLLD=178.8;QD=19.3102;RBI=0.03373;REFB=-0.00858103;REVB=-0.00963387;RO=22;SAF=4;SAR=17;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163897;STB=0.614337;STBP=0.221;TYPE=snp;VARB=0.0114901;OID=.;OPOS=72927123;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:22:23:21:21:0.477273:17:4:7:15:17:4:8:15
chr17	72937605	.	G	A	754.63	PASS	AF=0.981818;AO=54;DP=55;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0196338;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.126;QD=54.8821;RBI=0.024455;REFB=0.0212971;REVB=0.0145795;RO=1;SAF=38;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0122428;STB=0.506491;STBP=0.63;TYPE=snp;VARB=-2.3024e-05;OID=.;OPOS=72937605;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:55:55:1:1:54:54:0.981818:16:38:1:0:16:38:1:0
chr17	72938100	.	T	C	501.66	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00686799;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.09;QD=59.0187;RBI=0.0219176;REFB=0;REVB=0.0208138;RO=0;SAF=13;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000111926;OID=.;OPOS=72938100;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:21:13:0:0:21:13:0:0
chr17	72947697	.	C	T	149.74	PASS	AF=0.714286;AO=15;DP=21;FAO=15;FDP=21;FR=.;FRO=6;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0226029;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.0056;QD=28.5212;RBI=0.0242621;REFB=-0.0226924;REVB=-0.00881803;RO=6;SAF=10;SAR=5;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00685363;OID=.;OPOS=72947697;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:21:21:6:6:15:15:0.714286:5:10:4:2:5:10:4:2
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chr17	72949167	.	T	C	62.09	PASS	AF=0.272727;AO=9;DP=33;FAO=9;FDP=33;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.00505589;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.794;QD=7.52616;RBI=0.0151601;REFB=-0.0188052;REVB=-0.0142922;RO=24;SAF=6;SAR=3;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.287784;STB=0.679605;STBP=0.239;TYPE=snp;VARB=0.0587198;OID=.;OPOS=72949167;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:33:33:24:24:9:9:0.272727:3:6:10:14:3:6:10:14
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chr17	72952017	.	A	G	670.26	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0277767;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.452;QD=62.3498;RBI=0.0285339;REFB=0;REVB=-0.00652958;RO=0;SAF=23;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.54561e-05;OID=.;OPOS=72952017;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:20:23:0:0:20:23:0:0
chr17	72999773	.	C	T	496.55	PASS	AF=0.767857;AO=43;DP=56;FAO=43;FDP=56;FR=.;FRO=13;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=0.0120449;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.058;QD=35.4678;RBI=0.0340657;REFB=-0.0271107;REVB=0.0318653;RO=13;SAF=23;SAR=20;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0685479;STB=0.536896;STBP=0.343;TYPE=snp;VARB=0.00757971;OID=.;OPOS=72999773;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:56:56:13:13:43:43:0.767857:20:23:9:4:20:23:9:4
chr17	73000061	.	A	G	358.4	PASS	AF=0.452381;AO=38;DP=84;FAO=38;FDP=84;FR=.;FRO=46;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=17;FSRR=29;FWDB=0.00298332;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.89;QD=17.0666;RBI=0.0056406;REFB=-0.00692667;REVB=0.00478708;RO=46;SAF=18;SAR=20;SRF=17;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10277;STB=0.557492;STBP=0.35;TYPE=snp;VARB=0.00988242;OID=.;OPOS=73000061;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:46:46:38:38:0.452381:20:18:17:29:20:18:17:29
chr17	73016621	.	C	T	212.28	PASS	AF=0.645161;AO=20;DP=31;FAO=20;FDP=31;FR=.;FRO=11;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=0.00342386;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.106;QD=27.3906;RBI=0.0125383;REFB=-0.0177735;REVB=-0.0120618;RO=11;SAF=12;SAR=8;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.208149;STB=0.61527;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.0124939;OID=.;OPOS=73016621;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:31:31:11:11:20:20:0.645161:8:12:3:8:8:12:3:8
chr17	73037868	.	C	G	465.12	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00471778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.899;QD=58.1404;RBI=0.0122729;REFB=0;REVB=0.0113299;RO=0;SAF=12;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.47521e-05;OID=.;OPOS=73037868;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:20:12:0:0:20:12:0:0
chr17	73038746	.	T	C	992.71	PASS	AF=0.910256;AO=70;DP=77;FAO=71;FDP=78;FR=.;FRO=7;FSAF=35;FSAR=36;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.00431845;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=269.652;QD=50.9082;RBI=0.00528755;REFB=-0.0373822;REVB=0.00305109;RO=7;SAF=35;SAR=35;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0367058;STB=0.51985;STBP=0.277;TYPE=snp;VARB=0.000620112;OID=.;OPOS=73038746;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:27:77:78:7:7:70:71:0.910256:35:35:5:2:36:35:5:2
chr17	73059820	.	C	G	1504.51	PASS	AF=0.963303;AO=104;DP=109;FAO=105;FDP=109;FR=.;FRO=4;FSAF=42;FSAR=63;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0298761;FXX=0.00909008;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.194;QD=55.2113;RBI=0.0407577;REFB=-0.158544;REVB=0.0277238;RO=4;SAF=41;SAR=63;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0259905;STB=0.503816;STBP=0.736;TYPE=snp;VARB=0.000881645;OID=.;OPOS=73059820;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:109:109:4:4:104:105:0.963303:63:41:3:1:63:42:2:2
chr17	73060073	.	T	C	779.1	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.013302;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.471;QD=56.6616;RBI=0.0192362;REFB=0;REVB=0.0138957;RO=0;SAF=29;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.70616e-05;OID=.;OPOS=73060073;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:55:0:0:54:55:1:25:29:0:0:26:29:0:0
chr17	73060111	.	G	A	422.96	PASS	AF=0.939394;AO=29;DP=32;FAO=31;FDP=33;FR=.;FRO=2;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0298855;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.0414;QD=51.2679;RBI=0.0545364;REFB=0.0517356;REVB=0.0456188;RO=2;SAF=13;SAR=16;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00626798;STB=0.505007;STBP=0.86;TYPE=snp;VARB=-0.00289809;OID=.;OPOS=73060111;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:32:33:2:2:29:31:0.939394:16:13:1:1:18:13:1:1
chr17	73085975	.	G	A	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00515634;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.448;QD=59.4356;RBI=0.0269242;REFB=0;REVB=0.0264259;RO=0;SAF=14;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.27896e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.56567e-05;OID=.;OPOS=73085975;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:21:14:0:0:21:14:0:0
chr17	73127217	.	G	C	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00833721;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.2556;QD=50.4125;RBI=0.0186878;REFB=0;REVB=0.016725;RO=0;SAF=10;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000275931;OID=.;OPOS=73127217;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:9:10:0:0:9:10:0:0
chr17	73214322	.	A	C	75.54	PASS	AF=0.162791;AO=14;DP=86;FAO=14;FDP=86;FR=.;FRO=72;FSAF=1;FSAR=13;FSRF=26;FSRR=46;FWDB=-0.0302757;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.449;QD=3.51366;RBI=0.0317412;REFB=-0.0106023;REVB=-0.00953338;RO=71;SAF=1;SAR=13;SRF=25;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.493229;STB=0.855454;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.047026;OID=.;OPOS=73214322;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:86:86:71:72:14:14:0.162791:13:1:25:46:13:1:26:46
chr17	73221439	.	C	T	843.08	PASS	AF=1;AO=59;DP=63;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0571477;FXX=0.031741;HRUN=3;LEN=1;MLLD=169.302;QD=55.2842;RBI=0.0589013;REFB=-0.131624;REVB=0.0142652;RO=1;SAF=22;SAR=37;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0209618;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00115211;OID=.;OPOS=73221439;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:63:61:1:0:59:61:1:37:22:1:0:38:23:0:0
chr17	73222847	.	C	A,T	767.49	PASS	AF=0.0181818,0.981818;AO=2,52;DP=54;FAO=1,54;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=1,26;FSAR=0,28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0133583,0.0228514;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=124.133,170.219;QD=55.8176;RBI=0.0151973,0.0281187;REFB=0,0;REVB=0.00724663,0.0163852;RO=0;SAF=1,25;SAR=1,27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.13209,0.000887951;OID=.,.;OPOS=73222847,73222847;OREF=C,C;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:4:54:55:0:0:2,52:1,54:0.0181818,0.981818:1,27:1,25:0:0:0,28:1,26:0:0
chr17	73222865	.	G	A	727.8	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.01425;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=222.863;QD=63.2868;RBI=0.0187591;REFB=0;REVB=0.0122;RO=0;SAF=22;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.8425e-05;OID=.;OPOS=73222865;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:24:22:0:0:24:22:0:0
chr17	73230856	.	C	T	1814.53	PASS	AF=1;AO=117;DP=118;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.036985;FXX=0.00833264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.969;QD=60.9925;RBI=0.0504426;REFB=0;REVB=0.034301;RO=0;SAF=58;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00050135;OID=.;OPOS=73230856;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:118:119:0:0:117:119:1:59:58:0:0:59:60:0:0
chr17	73238509	.	C	G	265.6	PASS	AF=0.3875;AO=31;DP=80;FAO=31;FDP=80;FR=.;FRO=49;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=27;FSRR=22;FWDB=0.0134295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.31;QD=13.2801;RBI=0.015231;REFB=0.00335254;REVB=-0.00718549;RO=49;SAF=16;SAR=15;SRF=27;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0374882;STB=0.521409;STBP=0.79;TYPE=snp;VARB=-0.00439871;OID=.;OPOS=73238509;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:49:49:31:31:0.3875:15:16:27:22:15:16:27:22
chr17	73257986	.	C	T	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.234;QD=37.488;RBI=0.0216346;REFB=0;REVB=0.0216346;RO=0;SAF=0;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000406032;OID=.;OPOS=73257986;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:8:0:0:0:8:0:0:0
chr17	73258479	.	C	T	743.17	PASS	AF=0.96;AO=48;DP=50;FAO=48;FDP=50;FR=.;FRO=2;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00789753;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=235.012;QD=59.4535;RBI=0.0301529;REFB=-0.0249462;REVB=0.0291003;RO=2;SAF=25;SAR=23;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00156907;STB=0.500834;STBP=0.874;TYPE=snp;VARB=0.000468163;OID=.;OPOS=73258479;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:50:50:2:2:48:48:0.96:23:25:1:1:23:25:1:1
chr17	73268202	.	C	T	45.29	PASS	AF=0.318182;AO=7;DP=22;FAO=7;FDP=22;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=12;FWDB=0.0354218;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=63.9238;QD=8.2342;RBI=0.0786357;REFB=0.00719883;REVB=0.0702059;RO=15;SAF=4;SAR=3;SRF=3;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.398639;STB=0.740173;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=-0.0014947;OID=.;OPOS=73268202;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:22:22:15:15:7:7:0.318182:3:4:3:12:3:4:3:12
chr17	73269530	.	A	G	817.66	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0266487;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.866;QD=57.3796;RBI=0.0768352;REFB=0;REVB=-0.0720659;RO=0;SAF=24;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.25003e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000476877;OID=.;OPOS=73269530;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:33:24:0:0:33:24:0:0
chr17	73269676	.	C	T	708.55	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0208623;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.03;QD=62.982;RBI=0.0572004;REFB=0;REVB=0.0532602;RO=0;SAF=22;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000714091;OID=.;OPOS=73269676;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:23:22:0:0:23:22:0:0
chr17	73279624	.	A	G	544.45	PASS	AF=1;AO=35;DP=36;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0832342;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.64;QD=58.8593;RBI=0.0857696;REFB=0;REVB=-0.0206997;RO=0;SAF=13;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.39865e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000802295;OID=.;OPOS=73279624;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:37:0:0:35:37:1:22:13:0:0:22:15:0:0
chr17	73315368	.	C	T	690.99	PASS	AF=0.980392;AO=47;DP=49;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0220512;FXX=0.0192271;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.823;QD=54.1954;RBI=0.0236602;REFB=-0.040246;REVB=0.00857609;RO=1;SAF=30;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0268575;STB=0.513508;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.00109871;OID=.;OPOS=73315368;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:49:51:1:1:47:50:0.980392:17:30:0:1:18:32:0:1
chr17	73566145	.	C	T	43.66	PASS	AF=0.126761;AO=9;DP=71;FAO=9;FDP=71;FR=.;FRO=62;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=29;FSRR=33;FWDB=0.0136269;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.895;QD=2.45965;RBI=0.0157857;REFB=-0.00193601;REVB=0.00796856;RO=62;SAF=7;SAR=2;SRF=29;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.375967;STB=0.77226;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.0223362;OID=.;OPOS=73566145;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:71:71:62:62:9:9:0.126761:2:7:29:33:2:7:29:33
chr17	73590830	.	T	G	920.28	PASS	AF=0.984848;AO=64;DP=66;FAO=65;FDP=66;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0479301;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=244.641;QD=55.7747;RBI=0.0483027;REFB=-0.125592;REVB=-0.00598843;RO=2;SAF=40;SAR=24;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0076112;STB=0.510201;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=0.000386908;OID=.;OPOS=73590830;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:66:66:2:1:64:65:0.984848:24:40:1:1:24:41:0:1
chr17	73609139	.	C	T	538.55	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0101706;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.325;QD=59.8393;RBI=0.0374237;REFB=0;REVB=0.0360151;RO=0;SAF=13;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.21415e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.63484e-05;OID=.;OPOS=73609139;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:23:13:0:0:23:13:0:0
chr17	73612642	.	A	AT	185.77	PASS	AF=1;AO=14;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00897819;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=21.5397;QD=43.711;RBI=0.138047;REFB=0;REVB=0.137755;RO=2;SAF=10;SAR=4;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0576353;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00455837;OID=.;OPOS=73612643;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:14:17:17:17:0:11:6:0:0:4:2:10:4:1:1
chr17	73625430	.	G	A	728.59	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0665107;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.007;QD=57.1443;RBI=0.0683824;REFB=0;REVB=0.0158893;RO=0;SAF=21;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000260023;OID=.;OPOS=73625430;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:30:21:0:0:30:21:0:0
chr17	73625478	.	T	C	972.88	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0353134;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=263.878;QD=58.9626;RBI=0.0364421;REFB=0;REVB=0.00899974;RO=0;SAF=34;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.75585e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.18267e-05;OID=.;OPOS=73625478;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:32:34:0:0:32:34:0:0
chr17	73627565	.	A	G	1415.39	PASS	AF=1;AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0062356;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.935;QD=62.9062;RBI=0.0287875;REFB=0;REVB=-0.028104;RO=0;SAF=36;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000116922;OID=.;OPOS=73627565;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:90:90:0:0:90:90:1:54:36:0:0:54:36:0:0
chr17	73698557	.	C	T	676.74	PASS	AF=0.977778;AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0229257;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.592;QD=60.1552;RBI=0.0699012;REFB=-0.0359648;REVB=0.0660348;RO=0;SAF=20;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.30465e-08;STB=0.51219;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=0.000977391;OID=.;OPOS=73698557;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:45:45:0:1:44:44:0.977778:24:20:0:0:24:20:1:0
chr17	73750859	.	C	G	123.16	PASS	AF=0.923077;AO=12;DP=13;FAO=12;FDP=13;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0173805;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=135.406;QD=37.896;RBI=0.0320177;REFB=-0.0263176;REVB=0.0268897;RO=0;SAF=5;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.545378;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.00130953;OID=.;OPOS=73750859;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:13:13:0:1:12:12:0.923077:7:5:0:0:7:5:1:0
chr17	73751278	.	G	A	268.99	PASS	AF=0.454545;AO=30;DP=67;FAO=30;FDP=66;FR=.;FRO=36;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=24;FSRR=12;FWDB=-0.00887502;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.0764;QD=16.3024;RBI=0.0756871;REFB=-0.013318;REVB=0.075165;RO=36;SAF=20;SAR=10;SRF=24;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0430314;OID=.;OPOS=73751278;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:66:36:36:30:30:0.454545:10:20:24:12:10:20:24:12
chr17	73753503	.	T	C	575.79	PASS	AF=1;AO=37;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0279175;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.313;QD=60.6097;RBI=0.0284133;REFB=0;REVB=-0.00528476;RO=0;SAF=18;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.68991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.29514e-05;OID=.;OPOS=73753503;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:37:38:1:19:18:0:0:19:19:0:0
chr17	73812909	.	A	G	772.66	PASS	AF=0.354015;AO=91;DP=266;FAO=97;FDP=274;FR=.;FRO=177;FSAF=54;FSAR=43;FSRF=77;FSRR=100;FWDB=0.00586245;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.834;QD=11.2797;RBI=0.00758559;REFB=-0.013267;REVB=-0.00481382;RO=173;SAF=51;SAR=40;SRF=76;SRR=97;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138621;STB=0.578194;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.0277947;OID=.;OPOS=73812909;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:266:274:173:177:91:97:0.354015:40:51:76:97:43:54:77:100
chr17	73816026	.	A	G	74.48	PASS	AF=0.692308;AO=9;DP=13;FAO=9;FDP=13;FR=.;FRO=4;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0131967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.983;QD=22.9159;RBI=0.0368091;REFB=-0.0108125;REVB=-0.0343621;RO=4;SAF=5;SAR=4;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107529;STB=0.561271;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.010837;OID=.;OPOS=73816026;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:13:13:4:4:9:9:0.692308:4:5:3:1:4:5:3:1
chr17	73819525	.	C	T	955.81	PASS	AF=0.74;AO=74;DP=100;FAO=74;FDP=100;FR=.;FRO=26;FSAF=37;FSAR=37;FSRF=8;FSRR=18;FWDB=0.0326542;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.44;QD=38.2324;RBI=0.04191;REFB=-0.0181433;REVB=0.0262707;RO=26;SAF=37;SAR=37;SRF=8;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0933123;STB=0.549987;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.00514792;OID=.;OPOS=73819525;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:26:26:74:74:0.74:37:37:8:18:37:37:8:18
chr17	73824121	.	T	C	1134.12	PASS	AF=0.609467;AO=103;DP=169;FAO=103;FDP=169;FR=.;FRO=66;FSAF=34;FSAR=69;FSRF=31;FSRR=35;FWDB=-0.0867866;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.5967;QD=26.843;RBI=0.0901336;REFB=-0.0145675;REVB=-0.0243342;RO=65;SAF=35;SAR=68;SRF=30;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.093691;STB=0.559145;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=0.0122533;OID=.;OPOS=73824121;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:169:169:65:66:103:103:0.609467:68:35:30:35:69:34:31:35
chr17	73827205	.	T	C	1073.78	PASS	AF=0.558011;AO=100;DP=182;FAO=101;FDP=181;FR=.;FRO=80;FSAF=41;FSAR=60;FSRF=32;FSRR=48;FWDB=-0.0460969;FXX=0.0163035;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.894;QD=23.73;RBI=0.0463842;REFB=-0.0264286;REVB=0.00515438;RO=77;SAF=40;SAR=60;SRF=31;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00216127;STB=0.502724;STBP=0.93;TYPE=snp;VARB=0.0202758;OID=.;OPOS=73827205;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:182:181:77:80:100:101:0.558011:60:40:31:46:60:41:32:48
chr17	73831594	.	G	A	53.36	PASS	AF=0.421053;AO=7;DP=18;FAO=8;FDP=19;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.04379;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.628;QD=11.234;RBI=0.0730355;REFB=-0.036132;REVB=0.0584518;RO=11;SAF=1;SAR=6;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.396358;STB=0.635998;STBP=0.331;TYPE=snp;VARB=0.0584852;OID=.;OPOS=73831594;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:18:19:11:11:7:8:0.421053:6:1:5:6:6:2:5:6
chr17	73836162	.	C	G	51.55	PASS	AF=0.636364;AO=7;DP=11;FAO=7;FDP=11;FR=.;FRO=4;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.0866517;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.007;QD=18.7442;RBI=0.0883739;REFB=-0.0499525;REVB=-0.0173617;RO=4;SAF=3;SAR=4;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115856;STB=0.567381;STBP=0.653;TYPE=snp;VARB=0.0265296;OID=.;OPOS=73836162;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:11:11:4:4:7:7:0.636364:4:3:1:3:4:3:1:3
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chr17	73886888	.	A	G	287.38	PASS	AF=0.8;AO=24;DP=30;FAO=24;FDP=30;FR=.;FRO=6;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0416397;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.809;QD=38.3174;RBI=0.0578102;REFB=-0.0184651;REVB=0.0401019;RO=6;SAF=14;SAR=10;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0927833;STB=0.550519;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.00577967;OID=.;OPOS=73886888;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:30:30:6:6:24:24:0.8:10:14:2:4:10:14:2:4
chr17	73888354	.	G	A	68.05	PASS	AF=0.473684;AO=9;DP=19;FAO=9;FDP=19;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=-0.00418;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.233;QD=14.3259;RBI=0.0237417;REFB=-0.00358233;REVB=0.0233709;RO=10;SAF=5;SAR=4;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.225517;STB=0.631902;STBP=0.331;TYPE=snp;VARB=0.00489296;OID=.;OPOS=73888354;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:19:19:10:10:9:9:0.473684:4:5:3:7:4:5:3:7
chr17	73888423	.	A	G	259.99	PASS	AF=0.69697;AO=23;DP=33;FAO=23;FDP=33;FR=.;FRO=10;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.0436759;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=192.908;QD=31.5136;RBI=0.0459123;REFB=0.00639498;REVB=-0.0141546;RO=10;SAF=10;SAR=13;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.019569;STB=0.510743;STBP=0.849;TYPE=snp;VARB=-0.00216287;OID=.;OPOS=73888423;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:33:33:10:10:23:23:0.69697:13:10:4:6:13:10:4:6
chr17	73888427	.	A	C	259.82	PASS	AF=0.69697;AO=23;DP=33;FAO=23;FDP=33;FR=.;FRO=10;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.0282016;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.9737;QD=31.4927;RBI=0.0341458;REFB=-0.0483039;REVB=-0.0192511;RO=9;SAF=10;SAR=13;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0533634;STB=0.510743;STBP=0.849;TYPE=snp;VARB=0.0167901;OID=.;OPOS=73888427;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:33:33:9:10:23:23:0.69697:13:10:3:6:13:10:4:6
chr17	73900688	.	T	C	1541.84	PASS	AF=0.588477;AO=122;DP=222;FAO=143;FDP=243;FR=.;FRO=100;FSAF=68;FSAR=75;FSRF=50;FSRR=50;FWDB=0.0342277;FXX=0.00409819;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.958;QD=25.3801;RBI=0.0397913;REFB=-0.0482088;REVB=0.0202932;RO=100;SAF=51;SAR=71;SRF=50;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0687604;STB=0.510085;STBP=0.703;TYPE=snp;VARB=0.0360149;OID=.;OPOS=73900688;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:222:243:100:100:122:143:0.588477:71:51:50:50:75:68:50:50
chr17	73917372	.	A	G	417.19	PASS	AF=0.606061;AO=40;DP=66;FAO=40;FDP=66;FR=.;FRO=26;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=-0.00559887;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.082;QD=25.2846;RBI=0.00560007;REFB=-0.0101873;REVB=0.000115916;RO=26;SAF=15;SAR=25;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148462;STB=0.581354;STBP=0.109;TYPE=snp;VARB=0.00862477;OID=.;OPOS=73917372;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:26:26:40:40:0.606061:25:15:15:11:25:15:15:11
chr17	73922941	.	T	C	385.95	PASS	AF=0.686275;AO=35;DP=52;FAO=35;FDP=51;FR=.;FRO=16;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=0.0116292;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.956;QD=30.2708;RBI=0.0128833;REFB=-0.00216434;REVB=0.00554454;RO=17;SAF=13;SAR=22;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0119143;STB=0.501198;STBP=0.998;TYPE=snp;VARB=0.00100805;OID=.;OPOS=73922941;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:51:17:16:35:35:0.686275:22:13:6:11:22:13:6:10
chr17	73949540	.	G	C	169.51	PASS	AF=0.34375;AO=22;DP=64;FAO=22;FDP=64;FR=.;FRO=42;FSAF=17;FSAR=5;FSRF=29;FSRR=13;FWDB=-0.0211261;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.9646;QD=10.5943;RBI=0.0306343;REFB=-0.0113299;REVB=-0.0221844;RO=42;SAF=17;SAR=5;SRF=29;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12024;STB=0.570827;STBP=0.493;TYPE=snp;VARB=0.0160337;OID=.;OPOS=73949540;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:42:42:22:22:0.34375:5:17:29:13:5:17:29:13
chr17	73997474	.	G	A	214.24	PASS	AF=0.947368;AO=18;DP=19;FAO=18;FDP=19;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0180581;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.931;QD=45.1033;RBI=0.0205094;REFB=-0.029925;REVB=0.00972317;RO=1;SAF=10;SAR=8;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0437188;STB=0.523783;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.000361599;OID=.;OPOS=73997474;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:19:19:1:1:18:18:0.947368:8:10:1:0:8:10:1:0
chr17	74014228	.	G	A	323.16	PASS	AF=0.55;AO=32;DP=62;FAO=33;FDP=60;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=-0.0157141;FXX=0.0322529;HRUN=3;LEN=1;MLLD=154.621;QD=21.5441;RBI=0.0158506;REFB=-0.0184404;REVB=-0.00207595;RO=27;SAF=12;SAR=20;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.210983;STB=0.605996;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.0218292;OID=.;OPOS=74014228;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:60:27:27:32:33:0.55:20:12:17:10:20:13:17:10
chr17	74014628	.	G	A	976.34	PASS	AF=0.985294;AO=67;DP=68;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0115486;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.7208;QD=57.4318;RBI=0.0115854;REFB=-0.0696165;REVB=0.000922545;RO=1;SAF=30;SAR=37;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154913;STB=0.508194;STBP=0.291;TYPE=snp;VARB=0.00743361;OID=.;OPOS=74014628;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:68:68:1:1:67:67:0.985294:37:30:1:0:37:30:1:0
chr17	74014668	.	T	C,G	735.39	PASS	AF=0.981132,0.0188679;AO=50,2;DP=52;FAO=52,1;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=23,0;FSAR=29,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00416609,0.0150712;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=92.6328,47.4244;QD=55.5011;RBI=0.00419104,0.0282707;REFB=0,0;REVB=-0.000456596,0.0239185;RO=0;SAF=22,0;SAR=28,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.15703e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.000243822,0.147084;OID=.,.;OPOS=74014668,74014668;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:5:52:53:0:0:50,2:52,1:0.981132,0.0188679:28,2:22,0:0:0:29,1:23,0:0:0
chr17	74017554	.	G	T	117.42	PASS	AF=0.171875;AO=22;DP=128;FAO=22;FDP=128;FR=.;FRO=106;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=44;FSRR=62;FWDB=0.0217404;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=213.56;QD=3.66935;RBI=0.0359097;REFB=0.0012765;REVB=0.0285808;RO=106;SAF=13;SAR=9;SRF=44;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.220972;STB=0.642632;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=-0.00738983;OID=.;OPOS=74017554;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:128:128:106:106:22:22:0.171875:9:13:44:62:9:13:44:62
chr17	74017573	.	C	G	107.15	PASS	AF=0.159091;AO=21;DP=132;FAO=21;FDP=132;FR=.;FRO=111;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=46;FSRR=65;FWDB=-0.0227562;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.301;QD=3.24697;RBI=0.0232278;REFB=-0.00613541;REVB=-0.00465646;RO=111;SAF=12;SAR=9;SRF=46;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197497;STB=0.629668;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=0.0308953;OID=.;OPOS=74017573;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:132:132:111:111:21:21:0.159091:9:12:46:65:9:12:46:65
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chr17	74056413	.	C	T	138.11	PASS	AF=0.5;AO=15;DP=30;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=4;FWDB=0.0100101;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.2477;QD=18.4153;RBI=0.0455701;REFB=-0.00180206;REVB=0.0444571;RO=15;SAF=7;SAR=8;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.231787;STB=0.631413;STBP=0.183;TYPE=snp;VARB=0.00716567;OID=.;OPOS=74056413;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:15:15:15:15:0.5:8:7:11:4:8:7:11:4
chr17	74066447	.	T	A	353.55	PASS	AF=0.59322;AO=35;DP=59;FAO=35;FDP=59;FR=.;FRO=24;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=0.00984156;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.002;QD=23.9692;RBI=0.0172496;REFB=-0.0152084;REVB=0.0141667;RO=24;SAF=21;SAR=14;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167;STB=0.591784;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=0.00964486;OID=.;OPOS=74066447;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:24:24:35:35:0.59322:14:21:9:15:14:21:9:15
chr17	74076415	.	G	A	34.13	PASS	AF=0.3;AO=5;DP=20;FAO=6;FDP=20;FR=.;FRO=14;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.0458702;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.3364;QD=6.82592;RBI=0.0520635;REFB=-0.0239233;REVB=0.0246279;RO=14;SAF=1;SAR=4;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.423947;STB=0.666111;STBP=0.365;TYPE=snp;VARB=0.0552125;OID=.;OPOS=74076415;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:20:20:14:14:5:6:0.3:4:1:8:6:4:2:8:6
chr17	74076642	.	G	A	73.0	PASS	AF=0.322581;AO=10;DP=31;FAO=10;FDP=31;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=-0.0307471;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.306;QD=9.41888;RBI=0.0491211;REFB=-0.00789616;REVB=-0.0383079;RO=21;SAF=6;SAR=4;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138367;STB=0.584246;STBP=0.552;TYPE=snp;VARB=0.017691;OID=.;OPOS=74076642;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:31:31:21:21:10:10:0.322581:4:6:10:11:4:6:10:11
chr17	74077797	.	C	T	441.95	PASS	AF=0.701754;AO=40;DP=57;FAO=40;FDP=57;FR=.;FRO=17;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.00720736;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.405;QD=31.0141;RBI=0.00796712;REFB=-0.0289258;REVB=-0.00339544;RO=16;SAF=19;SAR=21;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.013206;STB=0.516234;STBP=0.743;TYPE=snp;VARB=0.0133407;OID=.;OPOS=74077797;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:16:17:40:40:0.701754:21:19:8:8:21:19:9:8
chr17	74080443	.	C	T	405.35	PASS	AF=0.6;AO=39;DP=66;FAO=39;FDP=65;FR=.;FRO=26;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=0.0316114;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.851;QD=24.9447;RBI=0.0316888;REFB=-0.011108;REVB=0.00221317;RO=26;SAF=16;SAR=23;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0096464;STB=0.505286;STBP=0.946;TYPE=snp;VARB=0.0102349;OID=.;OPOS=74080443;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:65:26:26:39:39:0.6:23:16:11:15:23:16:11:15
chr17	74286082	.	C	T	304.66	PASS	AF=1;AO=20;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0440027;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.175;QD=52.9846;RBI=0.0462352;REFB=0;REVB=0.0141936;RO=0;SAF=9;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00138586;OID=.;OPOS=74286082;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:20:23:1:11:9:0:0:12:11:0:0
chr17	74286106	.	C	T	411.11	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0228183;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.9149;QD=56.7045;RBI=0.0384134;REFB=0;REVB=0.0309017;RO=0;SAF=16;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000164565;OID=.;OPOS=74286106;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:13:16:0:0:13:16:0:0
chr17	74287204	.	C	G	594.5	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0425187;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.042;QD=60.9739;RBI=0.043932;REFB=0;REVB=0.0110535;RO=0;SAF=21;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.34792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000691167;OID=.;OPOS=74287204;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:18:21:0:0:18:21:0:0
chr17	74287389	.	T	C	632.18	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0556004;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.161;QD=61.676;RBI=0.0567753;REFB=0;REVB=0.0114902;RO=0;SAF=20;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000245334;OID=.;OPOS=74287389;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:21:20:0:0:21:20:0:0
chr17	74287594	.	G	A	636.15	PASS	AF=1;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0291977;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.0159;QD=62.063;RBI=0.0354858;REFB=0;REVB=0.0201677;RO=0;SAF=17;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.2194e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.06541e-05;OID=.;OPOS=74287594;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:41:0:0:41:41:1:24:17:0:0:24:17:0:0
chr17	74289500	.	G	A	175.66	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00042034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.607;QD=46.8424;RBI=0.00614097;REFB=0;REVB=0.00612657;RO=0;SAF=5;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.48181e-05;OID=.;OPOS=74289500;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:10:5:0:0:10:5:0:0
chr17	74289705	.	A	G	123.15	PASS	AF=0.923077;AO=12;DP=13;FAO=12;FDP=13;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0129701;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=249.023;QD=37.8929;RBI=0.0581511;REFB=0.0982715;REVB=0.0566862;RO=1;SAF=7;SAR=5;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0818676;STB=0.545378;STBP=0.331;TYPE=snp;VARB=-0.00350863;OID=.;OPOS=74289705;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:13:13:1:1:12:12:0.923077:5:7:0:1:5:7:0:1
chr17	74289839	.	G	A	524.09	PASS	AF=1;AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0145649;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.11;QD=59.8962;RBI=0.0496807;REFB=0;REVB=0.0474977;RO=0;SAF=18;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.00412e-05;OID=.;OPOS=74289839;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:35:0:0:35:35:1:17:18:0:0:17:18:0:0
chr17	74289875	.	C	T	772.71	PASS	AF=0.98;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0855714;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.4335;QD=61.817;RBI=0.0930144;REFB=-0.124039;REVB=0.0364582;RO=1;SAF=28;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0165122;STB=0.508768;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.00410352;OID=.;OPOS=74289875;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:50:50:1:1:49:49:0.98:21:28:1:0:21:28:1:0
chr17	74289908	.	A	G	868.14	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0146516;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.19;QD=57.8757;RBI=0.0191371;REFB=0;REVB=-0.0123109;RO=0;SAF=31;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.73709e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.19086e-05;OID=.;OPOS=74289908;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:29:31:0:0:29:31:0:0
chr17	74290097	.	T	A	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0328277;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.462;QD=56.1916;RBI=0.0397467;REFB=0;REVB=0.0224085;RO=0;SAF=15;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00016443;OID=.;OPOS=74290097;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:13:15:0:0:13:15:0:0
chr17	74307737	.	T	C	347.68	PASS	AF=0.962963;AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=27;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.000537361;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=266.701;QD=51.5087;RBI=0.0352097;REFB=-0.0200181;REVB=0.0352056;RO=1;SAF=10;SAR=16;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0281527;STB=0.51514;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=0.00113864;OID=.;OPOS=74307737;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:27:27:1:1:26:26:0.962963:16:10:0:1:16:10:0:1
chr17	74320317	.	G	A	130.65	PASS	AF=0.394737;AO=15;DP=38;FAO=15;FDP=38;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=-0.0078572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.358;QD=13.7527;RBI=0.00888313;REFB=-0.0176847;REVB=0.00414421;RO=23;SAF=5;SAR=10;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112654;STB=0.565947;STBP=0.553;TYPE=snp;VARB=0.0294061;OID=.;OPOS=74320317;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:23:23:15:15:0.394737:10:5:10:13:10:5:10:13
chr17	74381555	.	G	A	34.83	PASS	AF=0.833333;AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0109142;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.7442;QD=23.2183;RBI=0.0959801;REFB=-0.0388092;REVB=0.0953575;RO=1;SAF=4;SAR=1;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0951258;STB=0.555346;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=0.0190192;OID=.;OPOS=74381555;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:6:6:1:1:5:5:0.833333:1:4:1:0:1:4:1:0
chr17	74381567	.	G	A	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0202932;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.091;QD=33.4285;RBI=0.114791;REFB=0;REVB=0.112983;RO=0;SAF=5;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00593398;OID=.;OPOS=74381567;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:1:5:0:0:1:5:0:0
chr17	74383475	.	T	C	122.33	PASS	AF=0.451613;AO=14;DP=31;FAO=14;FDP=31;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=0.0436038;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.723;QD=15.7843;RBI=0.0436189;REFB=-0.0180615;REVB=0.0011498;RO=17;SAF=4;SAR=10;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00971003;STB=0.50561;STBP=0.975;TYPE=snp;VARB=0.0214243;OID=.;OPOS=74383475;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:17:17:14:14:0.451613:10:4:5:12:10:4:5:12
chr17	74383705	.	G	T	183.55	PASS	AF=0.370968;AO=23;DP=62;FAO=23;FDP=62;FR=.;FRO=39;FSAF=4;FSAR=19;FSRF=10;FSRR=29;FWDB=-0.016764;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.504;QD=11.8416;RBI=0.0212482;REFB=-0.00930307;REVB=0.0130559;RO=38;SAF=4;SAR=19;SRF=9;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107391;STB=0.58071;STBP=0.409;TYPE=snp;VARB=0.0233187;OID=.;OPOS=74383705;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:38:39:23:23:0.370968:19:4:9:29:19:4:10:29
chr17	74387284	.	C	T	424.2	PASS	AF=0.634921;AO=40;DP=63;FAO=40;FDP=63;FR=.;FRO=23;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=0.00173073;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=289.642;QD=26.9331;RBI=0.0165342;REFB=-0.0192241;REVB=0.0164434;RO=23;SAF=17;SAR=23;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0944193;STB=0.551533;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=0.01136;OID=.;OPOS=74387284;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:23:23:40:40:0.634921:23:17:13:10:23:17:13:10
chr17	74467017	.	G	C	557.13	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00601925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.827;QD=60.2304;RBI=0.0114019;REFB=0;REVB=0.00968361;RO=0;SAF=15;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.82408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.08334e-05;OID=.;OPOS=74467017;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:22:15:0:0:22:15:0:0
chr17	74475024	.	G	A	294.23	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00948915;FXX=0.0434594;HRUN=4;LEN=1;MLLD=161.035;QD=53.4968;RBI=0.122153;REFB=0;REVB=0.121784;RO=0;SAF=15;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.79751e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000817579;OID=.;OPOS=74475024;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:7:15:0:0:7:15:0:0
chr17	74475975	.	C	A	1062.23	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0677389;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.812;QD=59.8439;RBI=0.113981;REFB=0;REVB=0.0916683;RO=0;SAF=32;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.75585e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000217213;OID=.;OPOS=74475975;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:66:71:0:0:66:71:1:34:32:0:0:38:33:0:0
chr17	74732507	.	A	G	785.87	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00593497;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.709;QD=64.1529;RBI=0.0302159;REFB=0;REVB=-0.0296273;RO=0;SAF=22;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.30731e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000235132;OID=.;OPOS=74732507;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:27:22:0:0:27:22:0:0
chr17	74733099	.	G	A	4718.24	PASS	AF=1;AO=295;DP=295;FAO=295;FDP=295;FR=.;FRO=0;FSAF=159;FSAR=136;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0203872;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.991;QD=63.9761;RBI=0.0414009;REFB=0;REVB=0.0360333;RO=0;SAF=159;SAR=136;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.73665e-05;OID=.;OPOS=74733099;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:25:295:295:0:0:295:295:1:136:159:0:0:136:159:0:0
chr17	74857676	.	A	G	374.36	PASS	AF=0.659574;AO=31;DP=47;FAO=31;FDP=47;FR=.;FRO=16;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=-0.00627227;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.697;QD=31.8601;RBI=0.0132172;REFB=0.0252956;REVB=-0.0116341;RO=16;SAF=16;SAR=15;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0679995;STB=0.537166;STBP=0.454;TYPE=snp;VARB=-0.00958913;OID=.;OPOS=74857676;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:16:16:31:31:0.659574:15:16:10:6:15:16:10:6
chr17	74922706	.	C	T	950.43	PASS	AF=0.58871;AO=69;DP=127;FAO=73;FDP=124;FR=.,HEALED;FRO=31;FSAF=31;FSAR=42;FSRF=6;FSRR=25;FWDB=0.0050506;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=45.8265;QD=30.6591;RBI=0.0477741;REFB=0.0556716;REVB=0.0475064;RO=30;SAF=29;SAR=40;SRF=7;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110245;STB=0.572;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=-0.0157901;OID=.;OPOS=74922706;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:127:124:30:31:69:73:0.58871:40:29:7:23:42:31:6:25
chr17	74928758	.	C	T	431.31	PASS	AF=0.709091;AO=38;DP=54;FAO=39;FDP=55;FR=.;FRO=16;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.00639291;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.614;QD=31.3679;RBI=0.00643652;REFB=-0.0229794;REVB=-0.000748033;RO=16;SAF=18;SAR=20;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0143918;STB=0.503729;STBP=0.952;TYPE=snp;VARB=0.00919646;OID=.;OPOS=74928758;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:55:16:16:38:39:0.709091:20:18:8:8:20:19:8:8
chr17	74936576	.	G	A	360.19	PASS	AF=0.660714;AO=20;DP=59;FAO=37;FDP=56;FR=.;FRO=19;FSAF=25;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=0.0271817;FXX=0.0508388;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.3784;QD=25.7279;RBI=0.0385686;REFB=-0.0208579;REVB=0.0273623;RO=14;SAF=8;SAR=12;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0332026;STB=0.592121;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.00959488;OID=.;OPOS=74936576;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:56:14:19:20:37:0.660714:12:8:5:9:12:25:8:11
chr17	74942478	.	C	T	1459.09	PASS	AF=0.962617;AO=100;DP=106;FAO=103;FDP=107;FR=.;FRO=4;FSAF=47;FSAR=56;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0566743;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.308;QD=54.5456;RBI=0.0574432;REFB=-0.157335;REVB=0.00936691;RO=1;SAF=46;SAR=54;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00870439;STB=0.520404;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.000815277;OID=.;OPOS=74942478;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:106:107:1:4:100:103:0.962617:54:46:0:1:56:47:4:0
chr17	75085434	.	G	A	852.8	PASS	AF=0.586466;AO=78;DP=133;FAO=78;FDP=133;FR=.;FRO=55;FSAF=43;FSAR=35;FSRF=24;FSRR=31;FWDB=-0.000113707;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=220.208;QD=25.648;RBI=0.0050728;REFB=-0.0165191;REVB=0.00507153;RO=55;SAF=43;SAR=35;SRF=24;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0874235;STB=0.547547;STBP=0.193;TYPE=snp;VARB=0.0101244;OID=.;OPOS=75085434;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:133:133:55:55:78:78:0.586466:35:43:24:31:35:43:24:31
chr17	75158213	.	T	G	435.32	PASS	AF=0.567568;AO=42;DP=75;FAO=42;FDP=74;FR=.;FRO=32;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=-0.00081113;FXX=0.0133316;HRUN=3;LEN=1;MLLD=255.727;QD=23.5308;RBI=0.00689517;REFB=-0.0224955;REVB=-0.00684729;RO=32;SAF=19;SAR=23;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0866358;STB=0.547596;STBP=0.382;TYPE=snp;VARB=0.0151161;OID=.;OPOS=75158213;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:74:32:32:42:42:0.567568:23:19:18:14:23:19:18:14
chr17	75158261	.	C	G	169.49	PASS	AF=0.439024;AO=18;DP=41;FAO=18;FDP=41;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.0341357;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.762;QD=16.536;RBI=0.0489396;REFB=-0.0160856;REVB=-0.0350691;RO=23;SAF=9;SAR=9;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0638092;STB=0.536545;STBP=0.697;TYPE=snp;VARB=0.0212684;OID=.;OPOS=75158261;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:23:23:18:18:0.439024:9:9:13:10:9:9:13:10
chr17	75190846	.	A	C	817.71	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00516341;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.513;QD=57.3834;RBI=0.0189392;REFB=0;REVB=0.0182218;RO=0;SAF=35;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.11777e-05;OID=.;OPOS=75190846;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:22:35:0:0:22:35:0:0
chr17	75190962	.	C	T	200.81	PASS	AF=0.433962;AO=23;DP=53;FAO=23;FDP=53;FR=.;FRO=30;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=0.0789413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.225;QD=15.1553;RBI=0.0791926;REFB=-0.02433;REVB=-0.00630407;RO=30;SAF=9;SAR=14;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0433118;STB=0.52468;STBP=0.789;TYPE=snp;VARB=0.0209207;OID=.;OPOS=75190962;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:30:30:23:23:0.433962:14:9:13:17:14:9:13:17
chr17	75303298	.	T	C	685.92	PASS	AF=0.957447;AO=46;DP=47;FAO=45;FDP=47;FR=.;FRO=2;FSAF=34;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0243572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=301.387;QD=58.3762;RBI=0.0486104;REFB=-0.0120533;REVB=0.0420678;RO=1;SAF=35;SAR=11;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0408209;STB=0.514495;STBP=0.536;TYPE=snp;VARB=0.00024222;OID=.;OPOS=75303298;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:47:47:1:2:46:45:0.957447:11:35:0:1:11:34:1:1
chr17	75401191	.	C	T	618.05	PASS	AF=0.697368;AO=53;DP=76;FAO=53;FDP=76;FR=.;FRO=23;FSAF=32;FSAR=21;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.00310843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.602;QD=32.5289;RBI=0.00500511;REFB=-0.0158256;REVB=-0.00392285;RO=23;SAF=32;SAR=21;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0722332;STB=0.539036;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.00708494;OID=.;OPOS=75401191;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:23:23:53:53:0.697368:21:32:11:12:21:32:11:12
chr17	75425078	.	G	C	509.16	PASS	AF=0.652778;AO=45;DP=71;FAO=47;FDP=72;FR=.;FRO=25;FSAF=21;FSAR=26;FSRF=5;FSRR=20;FWDB=0.000798928;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.699;QD=28.2864;RBI=0.017738;REFB=-0.0271947;REVB=0.01772;RO=26;SAF=20;SAR=25;SRF=6;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148551;STB=0.588271;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=0.0173686;OID=.;OPOS=75425078;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:72:26:25:45:47:0.652778:25:20:6:20:26:21:5:20
chr17	75425206	.	A	G	286.89	PASS	AF=0.492063;AO=31;DP=64;FAO=31;FDP=63;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=8;FSRR=24;FWDB=-0.0647599;FXX=0.0156226;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.8905;QD=18.2152;RBI=0.0677965;REFB=0.0076954;REVB=-0.0200628;RO=31;SAF=10;SAR=21;SRF=7;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103753;STB=0.543451;STBP=0.575;TYPE=snp;VARB=-0.00889796;OID=.;OPOS=75425206;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:63:31:32:31:31:0.492063:21:10:7:24:21:10:8:24
chr17	75425456	.	A	G	114.48	PASS	AF=0.565217;AO=12;DP=23;FAO=13;FDP=23;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.0158097;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=191.973;QD=19.9101;RBI=0.0251053;REFB=-0.023684;REVB=0.0195021;RO=8;SAF=7;SAR=5;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0594792;STB=0.559908;STBP=0.552;TYPE=snp;VARB=0.0226952;OID=.;OPOS=75425456;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:23:23:8:10:12:13:0.565217:5:7:4:4:6:7:4:6
chr17	75426849	.	A	G	107.26	PASS	AF=0.631579;AO=12;DP=19;FAO=12;FDP=19;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=-0.0780172;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.1823;QD=22.5809;RBI=0.0793556;REFB=0.0396319;REVB=-0.0145132;RO=7;SAF=4;SAR=8;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148255;STB=0.583205;STBP=0.449;TYPE=snp;VARB=-0.0283937;OID=.;OPOS=75426849;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:19:19:7:7:12:12:0.631579:8:4:1:6:8:4:1:6
chr17	75494705	.	A	G	1407.71	PASS	AF=1;AO=88;DP=91;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0231236;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.1591;QD=62.565;RBI=0.0410568;REFB=0;REVB=0.0339258;RO=0;SAF=46;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000588737;OID=.;OPOS=75494705;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:91:90:0:0:88:90:1:42:46:0:0:43:47:0:0
chr17	75495065	.	T	C	468.87	PASS	AF=1;AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.01;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.308;QD=58.609;RBI=0.0104659;REFB=0;REVB=0.00308771;RO=0;SAF=9;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02243e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.74483e-05;OID=.;OPOS=75495065;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:32:0:0:32:32:1:23:9:0:0:23:9:0:0
chr17	75495219	.	C	A	40.59	PASS	AF=0.6;AO=5;DP=9;FAO=6;FDP=10;FR=.;FRO=4;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0827063;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.1528;QD=16.2369;RBI=0.147499;REFB=0.00637798;REVB=0.12213;RO=4;SAF=1;SAR=4;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.554117;STB=0.832219;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.0085088;OID=.;OPOS=75495219;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:9:10:4:4:5:6:0.6:4:1:4:0:5:1:4:0
chr17	75495397	.	T	C	417.91	PASS	AF=0.967742;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0347357;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.321;QD=53.9235;RBI=0.0386397;REFB=-0.21906;REVB=0.016925;RO=1;SAF=11;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0239088;STB=0.512812;STBP=0.539;TYPE=snp;VARB=0.00818665;OID=.;OPOS=75495397;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:31:31:1:1:30:30:0.967742:19:11:0:1:19:11:0:1
chr17	75496342	.	T	C	223.13	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0138129;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.951;QD=49.5843;RBI=0.0348562;REFB=0;REVB=0.0320024;RO=0;SAF=2;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000462947;OID=.;OPOS=75496342;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:16:2:0:0:16:2:0:0
chr17	75496361	.	A	G	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0192802;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.0685;QD=50.413;RBI=0.0324127;REFB=0;REVB=-0.0260548;RO=0;SAF=3;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000149544;OID=.;OPOS=75496361;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:16:3:0:0:16:3:0:0
chr17	75548687	.	G	A	283.98	PASS	AF=0.541667;AO=26;DP=48;FAO=26;FDP=48;FR=.;FRO=22;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=4;FWDB=-0.0277656;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.526;QD=23.6654;RBI=0.0335809;REFB=0.0212082;REVB=-0.0188878;RO=21;SAF=14;SAR=12;SRF=17;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.224963;STB=0.631487;STBP=0.06;TYPE=snp;VARB=-0.0363857;OID=.;OPOS=75548687;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:21:22:26:26:0.541667:12:14:17:4:12:14:18:4
chr17	75558676	.	A	T	42.23	PASS	AF=0.666667;AO=6;DP=9;FAO=6;FDP=9;FR=.;FRO=3;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0329283;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.049;QD=18.767;RBI=0.0689816;REFB=-0.0283992;REVB=0.0606151;RO=3;SAF=3;SAR=3;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.28674;STB=0.66617;STBP=0.209;TYPE=snp;VARB=0.0136359;OID=.;OPOS=75558676;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:9:9:3:3:6:6:0.666667:3:3:0:3:3:3:0:3
chr17	75559019	.	C	T	290.4	PASS	AF=0.553191;AO=26;DP=49;FAO=26;FDP=47;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=-0.0035503;FXX=0.040808;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.187;QD=24.7149;RBI=0.00902345;REFB=-0.0277794;REVB=-0.00829566;RO=21;SAF=13;SAR=13;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134144;STB=0.574412;STBP=0.245;TYPE=snp;VARB=0.0180868;OID=.;OPOS=75559019;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:47:21:21:26:26:0.553191:13:13:7:14:13:13:7:14
chr17	76060866	.	C	G	1895.39	PASS	AF=0.992;AO=123;DP=125;FAO=124;FDP=125;FR=.;FRO=1;FSAF=57;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00979799;FXX=0.00793588;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.4864;QD=60.6525;RBI=0.0164166;REFB=-0.127865;REVB=-0.0131721;RO=1;SAF=56;SAR=67;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00703848;STB=0.503703;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.000452884;OID=.;OPOS=76060866;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:125:125:1:1:123:124:0.992:67:56:0:1:67:57:0:1
chr17	76060954	.	A	C	1110.22	PASS	AF=1;AO=72;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00268913;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.8121;QD=60.0117;RBI=0.0335418;REFB=0;REVB=0.0334339;RO=0;SAF=41;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000849771;OID=.;OPOS=76060954;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:0:0:72:74:1:31:41:0:0:33:41:0:0
chr17	76063047	.	A	G	483.35	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00907108;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.944;QD=58.5874;RBI=0.046009;REFB=0;REVB=0.0451059;RO=0;SAF=15;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.64315e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000315562;OID=.;OPOS=76063047;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:18:15:0:0:18:15:0:0
chr17	76093866	.	T	C	657.34	PASS	AF=0.977273;AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0256192;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.8262;QD=59.7584;RBI=0.0270319;REFB=-0.0526738;REVB=-0.00862449;RO=1;SAF=15;SAR=28;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0302739;STB=0.516121;STBP=0.264;TYPE=snp;VARB=0.0110378;OID=.;OPOS=76093866;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:44:44:1:1:43:43:0.977273:28:15:1:0:28:15:1:0
chr17	76105731	.	C	T	1532.87	PASS	AF=1;AO=95;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00580695;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.143;QD=62.5662;RBI=0.0347303;REFB=0;REVB=0.0342414;RO=0;SAF=61;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.04002e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.88917e-05;OID=.;OPOS=76105731;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:98:0:0:95:98:1:34:61:0:0:36:62:0:0
chr17	76105754	.	G	A	1647.21	PASS	AF=0.990991;AO=110;DP=113;FAO=110;FDP=111;FR=.;FRO=1;FSAF=70;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00525708;FXX=0.0263135;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.527;QD=59.3589;RBI=0.0218464;REFB=-0.104865;REVB=0.0212045;RO=1;SAF=70;SAR=40;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00673428;STB=0.503545;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.000171227;OID=.;OPOS=76105754;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:113:111:1:1:110:110:0.990991:40:70:1:0:40:70:1:0
chr17	76134797	.	CT	CC,TC	48.78	PASS	AF=0,0.163934;AO=3,7;DP=61;FAO=0,10;FDP=61;FR=.;FRO=51;FSAF=0,9;FSAR=0,1;FSRF=14;FSRR=37;FWDB=-0.0327598,0.0308901;FXX=0;HRUN=1,5;LEN=1,2;MLLD=244.499,38.1501;QD=3.1984;RBI=0.0332347,0.0349227;REFB=0.00207537,0.000840644;REVB=-0.00559812,0.0162911;RO=46;SAF=2,7;SAR=1,0;SRF=10;SRR=36;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.440322,0.772792;STB=0.5,0.9363;STBP=1,0.01;TYPE=snp,mnp;VARB=0,-0.00269192;OID=.,.;OPOS=76134798,76134797;OREF=T,CT;OALT=C,TC;OMAPALT=CC,TC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:48:61:61:46:51:3,7:0,10:0,0.163934:1,0:2,7:10:36:0,1:0,9:14:37
chr17	76157266	.	T	C	65.22	PASS	AF=0.164384;AO=12;DP=73;FAO=12;FDP=73;FR=.;FRO=61;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=37;FSRR=24;FWDB=-0.0324838;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.018;QD=3.57347;RBI=0.0384059;REFB=-0.00312984;REVB=-0.0204894;RO=52;SAF=2;SAR=10;SRF=29;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.493237;STB=0.850971;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.00810024;OID=.;OPOS=76157266;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:73:73:52:61:12:12:0.164384:10:2:29:23:10:2:37:24
chr17	76178748	.	T	C	154.79	PASS	AF=0.404762;AO=17;DP=42;FAO=17;FDP=42;FR=.;FRO=25;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=-0.0981966;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.269;QD=14.7418;RBI=0.0981967;REFB=-0.0070616;REVB=-0.000176297;RO=25;SAF=8;SAR=9;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0316138;STB=0.518288;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=0.00868812;OID=.;OPOS=76178748;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:25:25:17:17:0.404762:9:8:11:14:9:8:11:14
chr17	76183043	.	A	G	74.24	PASS	AF=0.344828;AO=10;DP=29;FAO=10;FDP=29;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.0129935;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.505;QD=10.2402;RBI=0.0133746;REFB=-0.00851071;REVB=0.00316998;RO=19;SAF=4;SAR=6;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13765;STB=0.583166;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.0311007;OID=.;OPOS=76183043;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:29:29:19:19:10:10:0.344828:6:4:10:9:6:4:10:9
chr17	76198677	.	G	A	76.4	PASS	AF=0.75;AO=9;DP=12;FAO=9;FDP=12;FR=.;FRO=3;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.00295868;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.481;QD=25.4666;RBI=0.0156141;REFB=0.105885;REVB=0.0153312;RO=3;SAF=1;SAR=8;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198601;STB=0.615086;STBP=0.39;TYPE=snp;VARB=-0.00772304;OID=.;OPOS=76198677;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:12:12:3:3:9:9:0.75:8:1:1:2:8:1:1:2
chr17	76219591	.	G	A	747.09	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0384542;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.9319;QD=63.5819;RBI=0.0631245;REFB=0;REVB=0.0500597;RO=0;SAF=26;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000955038;OID=.;OPOS=76219591;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:21:26:0:0:21:26:0:0
chr17	76230729	.	T	C	376.03	PASS	AF=0.535211;AO=38;DP=71;FAO=38;FDP=71;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=11;FSRR=22;FWDB=-0.0197641;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.4999;QD=21.185;RBI=0.022512;REFB=-0.039366;REVB=-0.0107782;RO=33;SAF=16;SAR=22;SRF=11;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0767638;STB=0.542351;STBP=0.475;TYPE=snp;VARB=0.0487173;OID=.;OPOS=76230729;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:33:33:38:38:0.535211:22:16:11:22:22:16:11:22
chr17	76267779	.	A	C	165.98	PASS	AF=0.882353;AO=15;DP=18;FAO=15;FDP=17;FR=.;FRO=2;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.009675;FXX=0.0555247;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.053;QD=39.0534;RBI=0.0514456;REFB=0.0141262;REVB=0.0505277;RO=2;SAF=9;SAR=6;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0910485;STB=0.549935;STBP=0.331;TYPE=snp;VARB=-0.00136337;OID=.;OPOS=76267779;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:18:17:2:2:15:15:0.882353:6:9:2:0:6:9:2:0
chr17	76395430	.	C	T	871.26	PASS	AF=0.983871;AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00656335;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.646;QD=56.2107;RBI=0.0212142;REFB=-0.0443795;REVB=-0.0201733;RO=1;SAF=37;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0125883;STB=0.506664;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.000391512;OID=.;OPOS=76395430;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:62:62:1:1:61:61:0.983871:24:37:1:0:24:37:1:0
chr17	76423097	.	G	A	1331.88	PASS	AF=1;AO=84;DP=85;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00970757;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.514;QD=61.9481;RBI=0.0273515;REFB=0;REVB=0.0255708;RO=0;SAF=53;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17151e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000111159;OID=.;OPOS=76423097;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:86:0:0:84:86:1:31:53:0:0:32:54:0:0
chr17	76433898	.	T	C	658.1	PASS	AF=0.977273;AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0123281;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.303;QD=59.8273;RBI=0.0284178;REFB=-0.134493;REVB=0.0256044;RO=0;SAF=18;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.65211e-08;STB=0.509799;STBP=0.49;TYPE=snp;VARB=0.00157419;OID=.;OPOS=76433898;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:44:44:0:1:43:43:0.977273:25:18:0:0:25:18:0:1
chr17	76449505	.	G	C	962.48	PASS	AF=1;AO=65;DP=67;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00495372;FXX=0.0298463;HRUN=2;LEN=1;MLLD=274.81;QD=59.2297;RBI=0.00507981;REFB=0;REVB=-0.0011248;RO=0;SAF=31;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.90682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.57792e-05;OID=.;OPOS=76449505;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:65:0:0:65:65:1:34:31:0:0:34:31:0:0
chr17	76451921	.	A	G	1194.2	PASS	AF=0.9875;AO=78;DP=80;FAO=79;FDP=80;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=51;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0215892;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=143.197;QD=59.7099;RBI=0.0228993;REFB=-0.086327;REVB=-0.0076344;RO=1;SAF=27;SAR=51;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0172063;STB=0.50877;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.000346951;OID=.;OPOS=76451921;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:80:80:1:1:78:79:0.9875:51:27:1:0:51:28:1:0
chr17	76455168	.	G	A	154.06	PASS	AF=0.377778;AO=17;DP=46;FAO=17;FDP=45;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=0.0159308;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.076;QD=13.6944;RBI=0.0193686;REFB=-0.0073256;REVB=-0.0110159;RO=28;SAF=11;SAR=6;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0854415;STB=0.54994;STBP=0.632;TYPE=snp;VARB=0.010444;OID=.;OPOS=76455168;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:45:28:28:17:17:0.377778:6:11:16:12:6:11:16:12
chr17	76462770	.	G	A	1552.94	PASS	AF=0.989899;AO=98;DP=99;FAO=98;FDP=99;FR=.;FRO=1;FSAF=54;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0232014;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.982;QD=62.7449;RBI=0.0289628;REFB=-0.126606;REVB=0.0173361;RO=1;SAF=54;SAR=44;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0106577;STB=0.505617;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=0.000396605;OID=.;OPOS=76462770;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:99:99:1:1:98:98:0.989899:44:54:0:1:44:54:0:1
chr17	76468839	.	C	T	35.59	PASS	AF=0.24;AO=6;DP=25;FAO=6;FDP=25;FR=.;FRO=19;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=15;FWDB=-0.0393021;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=235.924;QD=5.69403;RBI=0.0426889;REFB=-0.014781;REVB=-0.0166639;RO=18;SAF=3;SAR=3;SRF=4;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.331721;STB=0.719408;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=0.0619913;OID=.;OPOS=76468839;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:25:25:18:19:6:6:0.24:3:3:4:14:3:3:4:15
chr17	76468843	.	C	T	54.3	PASS	AF=0.32;AO=8;DP=25;FAO=8;FDP=25;FR=.;FRO=17;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=13;FWDB=-0.0271696;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=225.948;QD=8.68744;RBI=0.0303858;REFB=-0.0115648;REVB=-0.0136056;RO=16;SAF=3;SAR=5;SRF=3;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.238253;STB=0.606499;STBP=0.574;TYPE=snp;VARB=0.0565532;OID=.;OPOS=76468843;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:25:25:16:17:8:8:0.32:5:3:3:13:5:3:4:13
chr17	76471366	.	G	A	114.26	PASS	AF=0.311111;AO=14;DP=45;FAO=14;FDP=45;FR=.;FRO=31;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=-0.00956418;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.974;QD=10.1567;RBI=0.0241613;REFB=-0.0117675;REVB=0.0221877;RO=30;SAF=7;SAR=7;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.511095;STBP=0.945;TYPE=snp;VARB=0.0275648;OID=.;OPOS=76471366;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:30:31:14:14:0.311111:7:7:15:15:7:7:15:16
chr17	76472768	.	G	A	198.25	PASS	AF=0.4;AO=24;DP=60;FAO=24;FDP=60;FR=.;FRO=36;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=-0.00559332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.307;QD=13.2163;RBI=0.0180021;REFB=0.0016976;REVB=0.0171112;RO=36;SAF=16;SAR=8;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181818;STB=0.604562;STBP=0.205;TYPE=snp;VARB=-0.00424336;OID=.;OPOS=76472768;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:36:36:24:24:0.4:8:16:18:18:8:16:18:18
chr17	76481693	.	C	G	1301.81	PASS	AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.023485;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.1435;QD=61.991;RBI=0.0234872;REFB=0;REVB=-0.000319456;RO=0;SAF=45;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.93822e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000186684;OID=.;OPOS=76481693;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:39:45:0:0:39:45:0:0
chr17	76482432	.	A	G	695.58	PASS	AF=0.978261;AO=44;DP=46;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0114595;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.7051;QD=60.4851;RBI=0.0169136;REFB=-0.00615186;REVB=-0.0124398;RO=2;SAF=18;SAR=26;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0347746;STB=0.509087;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=-0.000358181;OID=.;OPOS=76482432;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:46:46:2:1:44:45:0.978261:26:18:0:2:27:18:0:1
chr17	76491127	.	TG	CC	1246.11	PASS	AF=1;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0133341;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=250.9;QD=61.5363;RBI=0.0182602;REFB=0;REVB=-0.0124755;RO=0;SAF=44;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=-3.20428e-05;OID=.;OPOS=76491127;OREF=TG;OALT=CC;OMAPALT=CC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:81:0:0:81:81:1:37:44:0:0:37:44:0:0
chr17	76496492	.	A	G	2412.82	PASS	AF=1;AO=144;DP=145;FAO=159;FDP=159;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=113;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0279023;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.453;QD=60.7;RBI=0.0404919;REFB=0;REVB=0.0293438;RO=0;SAF=41;SAR=103;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.98985e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.59158e-05;OID=.;OPOS=76496492;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:145:159:0:0:144:159:1:103:41:0:0:113:46:0:0
chr17	76497920	.	C	A	1055.57	PASS	AF=0.972973;AO=72;DP=74;FAO=72;FDP=74;FR=.;FRO=2;FSAF=32;FSAR=40;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0240049;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=45.7234;QD=57.0581;RBI=0.0263556;REFB=-0.165645;REVB=0.0108804;RO=1;SAF=32;SAR=40;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0145499;STB=0.515147;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=0.00547842;OID=.;OPOS=76497920;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:74:74:1:2:72:72:0.972973:40:32:1:0:40:32:2:0
chr17	76498406	.	A	G	242.66	PASS	AF=0.376623;AO=29;DP=78;FAO=29;FDP=77;FR=.;FRO=48;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=19;FSRR=29;FWDB=0.0159681;FXX=0.0128189;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.814;QD=12.6056;RBI=0.0191633;REFB=0.0101054;REVB=0.0105949;RO=47;SAF=8;SAR=21;SRF=19;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158031;STB=0.586287;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=-0.00382274;OID=.;OPOS=76498406;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:77:47:48:29:29:0.376623:21:8:19:28:21:8:19:29
chr17	76498692	.	C	T	804.9	PASS	AF=1;AO=50;DP=58;FAO=56;FDP=56;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=29;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.079509;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.101;QD=57.4927;RBI=0.0796295;REFB=0;REVB=0.00438038;RO=1;SAF=23;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0200269;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00146349;OID=.;OPOS=76498692;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:58:56:1:0:50:56:1:27:23:1:0:27:29:0:0
chr17	76503593	.	T	C	182.15	PASS	AF=0.254717;AO=27;DP=106;FAO=27;FDP=106;FR=.;FRO=79;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=36;FSRR=43;FWDB=0.0213962;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.9163;QD=6.87364;RBI=0.0247188;REFB=0.00260371;REVB=0.0123783;RO=76;SAF=10;SAR=17;SRF=33;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0815574;STB=0.565797;STBP=0.454;TYPE=snp;VARB=-0.00794739;OID=.;OPOS=76503593;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:106:76:79:27:27:0.254717:17:10:33:43:17:10:36:43
chr17	76503624	.	C	T	848.34	PASS	AF=0.715789;AO=65;DP=92;FAO=68;FDP=95;FR=.;FRO=27;FSAF=30;FSAR=38;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.0188584;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.477;QD=35.7194;RBI=0.023935;REFB=-0.0405448;REVB=0.0147393;RO=27;SAF=28;SAR=37;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0130104;STB=0.509752;STBP=0.776;TYPE=snp;VARB=0.0153138;OID=.;OPOS=76503624;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:95:27:27:65:68:0.715789:37:28:11:16:38:30:11:16
chr17	76525565	.	A	G	411.03	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0126587;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.2038;QD=56.6933;RBI=0.0486732;REFB=0;REVB=-0.0469983;RO=0;SAF=17;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.0947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000809765;OID=.;OPOS=76525565;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:12:17:0:0:12:17:0:0
chr17	76528790	.	A	G	403.49	PASS	AF=0.4375;AO=42;DP=96;FAO=42;FDP=96;FR=.;FRO=54;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=25;FSRR=29;FWDB=-0.0181569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.739;QD=16.8121;RBI=0.0189852;REFB=-0.0128854;REVB=-0.00554645;RO=54;SAF=20;SAR=22;SRF=25;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0132895;STB=0.507459;STBP=0.9;TYPE=snp;VARB=0.014974;OID=.;OPOS=76528790;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:96:54:54:42:42:0.4375:22:20:25:29:22:20:25:29
chr17	76535948	.	T	C	60.04	PASS	AF=0.219512;AO=9;DP=41;FAO=9;FDP=41;FR=.;FRO=32;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=12;FWDB=-0.0219322;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.135;QD=5.85741;RBI=0.030108;REFB=-0.0010306;REVB=-0.0206269;RO=32;SAF=1;SAR=8;SRF=20;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.610572;STB=0.89276;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.00176652;OID=.;OPOS=76535948;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:60:41:41:32:32:9:9:0.219512:8:1:20:12:8:1:20:12
chr17	76557862	.	T	C	1495.2	PASS	AF=0.971698;AO=103;DP=106;FAO=103;FDP=106;FR=.;FRO=3;FSAF=46;FSAR=57;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0130116;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=122.934;QD=56.4226;RBI=0.0130125;REFB=-0.0383879;REVB=0.000150061;RO=3;SAF=46;SAR=57;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119303;STB=0.50629;STBP=0.463;TYPE=snp;VARB=0.000232417;OID=.;OPOS=76557862;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:106:106:3:3:103:103:0.971698:57:46:2:1:57:46:2:1
chr17	76557943	.	G	A	820.69	PASS	AF=0.717391;AO=66;DP=92;FAO=66;FDP=92;FR=.;FRO=26;FSAF=31;FSAR=35;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=0.0143081;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.05;QD=35.6821;RBI=0.0172867;REFB=-0.0417019;REVB=0.00970086;RO=26;SAF=31;SAR=35;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159646;STB=0.508584;STBP=0.772;TYPE=snp;VARB=0.0183725;OID=.;OPOS=76557943;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:26:26:66:66:0.717391:35:31:13:13:35:31:13:13
chr17	76567707	.	T	C	520.04	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0640748;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.0302;QD=59.4327;RBI=0.0681303;REFB=0;REVB=0.023155;RO=0;SAF=20;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000483222;OID=.;OPOS=76567707;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:15:20:0:0:15:20:0:0
chr17	76795805	.	G	C	244.52	PASS	AF=0.6875;AO=22;DP=32;FAO=22;FDP=32;FR=.;FRO=10;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=0.00995308;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.2387;QD=30.5649;RBI=0.0349497;REFB=-0.0131263;REVB=-0.0335025;RO=9;SAF=10;SAR=12;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125611;STB=0.581324;STBP=0.205;TYPE=snp;VARB=0.00676879;OID=.;OPOS=76795805;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:32:32:9:10:22:22:0.6875:12:10:2:7:12:10:2:8
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chr17	76799835	.	C	A	472.27	PASS	AF=0.566265;AO=44;DP=80;FAO=47;FDP=83;FR=.;FRO=36;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=10;FSRR=26;FWDB=0.079642;FXX=0.0348797;HRUN=1;LEN=1;MLLD=47.8395;QD=22.7599;RBI=0.106396;REFB=-0.0141574;REVB=0.0705493;RO=26;SAF=25;SAR=19;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150702;STB=0.609092;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.0138713;OID=.;OPOS=76799835;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:83:26:36:44:47:0.566265:19:25:9:17:22:25:10:26
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chr17	76799898	.	A	G	455.38	PASS	AF=0.55;AO=44;DP=80;FAO=44;FDP=80;FR=.;FRO=36;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=10;FSRR=26;FWDB=0.00773561;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=303.913;QD=22.7688;RBI=0.0239896;REFB=-0.0122059;REVB=-0.0227082;RO=36;SAF=22;SAR=22;SRF=10;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18232;STB=0.599956;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.0106471;OID=.;OPOS=76799898;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:36:36:44:44:0.55:22:22:10:26:22:22:10:26
chr17	76817090	.	C	T	100.45	PASS	AF=0.387097;AO=12;DP=31;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.00854077;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.8;QD=12.9608;RBI=0.026699;REFB=-0.0173136;REVB=-0.025296;RO=19;SAF=4;SAR=8;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0979377;STB=0.55804;STBP=0.666;TYPE=snp;VARB=0.0238921;OID=.;OPOS=76817090;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:19:19:12:12:0.387097:8:4:8:11:8:4:8:11
chr17	76823227	.	T	G	190.91	PASS	AF=0.59375;AO=17;DP=30;FAO=19;FDP=32;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=3;FWDB=-0.0390835;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.927;QD=23.8634;RBI=0.0540335;REFB=-0.011189;REVB=0.0373109;RO=13;SAF=7;SAR=10;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.270019;STB=0.660029;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.00863184;OID=.;OPOS=76823227;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:32:13:13:17:19:0.59375:10:7:10:3:12:7:10:3
chr17	76823260	.	A	C	158.04	PASS	AF=0.64;AO=16;DP=25;FAO=16;FDP=25;FR=.;FRO=9;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=1;FWDB=0.0102123;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.4478;QD=25.2869;RBI=0.0231472;REFB=-0.00552195;REVB=0.0207726;RO=9;SAF=7;SAR=9;SRF=8;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.285235;STB=0.658351;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.00247968;OID=.;OPOS=76823260;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:25:25:9:9:16:16:0.64:9:7:8:1:9:7:8:1
chr17	76867017	.	C	T	105.32	PASS	AF=0.342105;AO=13;DP=38;FAO=13;FDP=38;FR=.;FRO=25;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=0.000105631;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.625;QD=11.0865;RBI=0.0114162;REFB=-0.0051727;REVB=0.0114157;RO=25;SAF=2;SAR=11;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.52484;STB=0.816074;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.0104864;OID=.;OPOS=76867017;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:25:25:13:13:0.342105:11:2:15:10:11:2:15:10
chr17	76970879	.	A	G	1250.01	PASS	AF=1;AO=80;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.022617;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.523;QD=61.7291;RBI=0.0292123;REFB=0;REVB=0.0184886;RO=0;SAF=41;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000156469;OID=.;OPOS=76970879;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:81:0:0:80:81:1:39:41:0:0:39:42:0:0
chr17	76988785	.	G	A	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0725697;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.707;QD=59.4356;RBI=0.0755748;REFB=0;REVB=0.0210998;RO=0;SAF=13;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.39865e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000150127;OID=.;OPOS=76988785;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:22:13:0:0:22:13:0:0
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chr17	77039835	.	G	A	777.75	PASS	AF=0.982456;AO=54;DP=56;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00647233;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.2199;QD=54.5788;RBI=0.0696955;REFB=-0.117368;REVB=0.0693944;RO=2;SAF=29;SAR=25;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0362146;STB=0.509088;STBP=0.336;TYPE=snp;VARB=0.00117598;OID=.;OPOS=77039835;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:56:57:2:1:54:56:0.982456:25:29:0:2:27:29:0:1
chr17	77039852	.	G	A	1305.89	PASS	AF=1;AO=84;DP=85;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0340511;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.89;QD=62.1851;RBI=0.0851315;REFB=0;REVB=0.078025;RO=0;SAF=41;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.74538e-05;OID=.;OPOS=77039852;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:84:0:0:84:84:1:43:41:0:0:43:41:0:0
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chr17	77042718	.	C	T	638.81	PASS	AF=0.976744;AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00479398;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=113.999;QD=59.4238;RBI=0.00563226;REFB=-0.0176753;REVB=-0.00295638;RO=0;SAF=14;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508768;STBP=0.602;TYPE=snp;VARB=0.000144938;OID=.;OPOS=77042718;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:43:43:0:1:42:42:0.976744:28:14:0:0:28:14:0:1
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chr17	77075673	.	A	G	1049.34	PASS	AF=0.986111;AO=68;DP=71;FAO=71;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0444185;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.384;QD=58.2964;RBI=0.0460215;REFB=-0.0575043;REVB=-0.0120404;RO=1;SAF=29;SAR=39;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0160186;STB=0.507934;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.000132786;OID=.;OPOS=77075673;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:71:72:1:1:68:71:0.986111:39:29:1:0:40:31:1:0
chr17	77076440	.	G	T	726.7	PASS	AF=1;AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0109539;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.79;QD=56.9963;RBI=0.0113102;REFB=0;REVB=-0.00281659;RO=0;SAF=17;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.52195e-05;OID=.;OPOS=77076440;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:51:0:0:51:51:1:34:17:0:0:34:17:0:0
chr17	77078109	.	A	G	2032.42	PASS	AF=1;AO=118;DP=119;FAO=132;FDP=132;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112187;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.88;QD=61.5885;RBI=0.0577236;REFB=0;REVB=0.056623;RO=0;SAF=68;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.08833e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.49909e-05;OID=.;OPOS=77078109;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:119:132:0:0:118:132:1:50:68:0:0:60:72:0:0
chr17	77087005	.	C	CA	1527.86	PASS	AF=1;AO=83;DP=102;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0154175;FXX=0.010203;HRUN=0;LEN=1;MLLD=196.21;QD=63.0044;RBI=0.0347764;REFB=0;REVB=0.0311721;RO=10;SAF=20;SAR=63;SRF=8;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14228;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000165558;OID=.;OPOS=77087006;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:83:102:97:97:0:27:70:0:0:8:10:20:63:8:2
chr17	77093768	.	T	C	894.73	PASS	AF=1;AO=57;DP=59;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0921471;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=57.3495;QD=56.8084;RBI=0.107466;REFB=0;REVB=-0.0552984;RO=1;SAF=16;SAR=41;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.028559;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00225538;OID=.;OPOS=77093768;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:63:1:0:57:63:1:41:16:1:0:42:21:0:0
chr17	77758691	.	G	A	679.08	PASS	AF=0.614583;AO=59;DP=96;FAO=59;FDP=96;FR=.;FRO=37;FSAF=17;FSAR=42;FSRF=12;FSRR=25;FWDB=-0.0258816;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.249;QD=28.2948;RBI=0.0283728;REFB=-0.00404919;REVB=-0.0116259;RO=36;SAF=17;SAR=42;SRF=11;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0146967;STB=0.516753;STBP=0.708;TYPE=snp;VARB=0.00239793;OID=.;OPOS=77758691;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:96:36:37:59:59:0.614583:42:17:11:25:42:17:12:25
chr17	77768653	.	C	CA	554.67	PASS	AF=0.742857;AO=12;DP=116;FAO=78;FDP=105;FR=.;FRO=27;FSAF=45;FSAR=33;FSRF=23;FSRR=4;FWDB=0.0147347;FXX=0.0789404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.076;QD=21.1302;RBI=0.0625887;REFB=-0.0161759;REVB=-0.0608295;RO=101;SAF=0;SAR=12;SRF=73;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.740183;STB=0.574042;STBP=0.016;TYPE=ins;VARB=0.00856245;OID=.;OPOS=77768654;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.742857:12:116:78:105:27:45:33:23:4:99:101:0:12:73:28
chr17	77768654	.	C	A	660.1	PASS	AF=0.616822;AO=61;DP=114;FAO=66;FDP=107;FR=.;FRO=41;FSAF=40;FSAR=26;FSRF=33;FSRR=8;FWDB=0.00338372;FXX=0.0695592;HRUN=8;LEN=1;MLLD=241.509;QD=24.6768;RBI=0.0034765;REFB=-0.0138275;REVB=0.000797797;RO=29;SAF=40;SAR=21;SRF=24;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118508;STB=0.582542;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=0.00631721;OID=.;OPOS=77768654;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:114:107:29:41:61:66:0.616822:21:40:24:5:26:40:33:8
chr17	77772068	.	G	A	373.61	PASS	AF=0.578125;AO=37;DP=64;FAO=37;FDP=64;FR=.;FRO=27;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=0.00795574;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=205.134;QD=23.3504;RBI=0.0142135;REFB=-0.0364174;REVB=0.0117784;RO=27;SAF=16;SAR=21;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0488716;STB=0.526849;STBP=0.633;TYPE=snp;VARB=0.0275557;OID=.;OPOS=77772068;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:27:27:37:37:0.578125:21:16:10:17:21:16:10:17
chr17	77808957	.	AG	A,GA	105.66	PASS	AF=0.413043,0;AO=17,2;DP=46;FAO=19,0;FDP=46;FR=.;FRO=27;FSAF=6,0;FSAR=13,0;FSRF=25;FSRR=2;FWDB=-0.0157666,-0.0231639;FXX=0;HRUN=4,1;LEN=1,2;MLLD=17.113,57.8819;QD=9.18784;RBI=0.116648,0.110062;REFB=-0.0681833,-0.00376692;REVB=-0.115577,-0.107596;RO=26;SAF=7,0;SAR=10,2;SRF=24;SRR=2;SSEN=0.344136,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.511847,-0.773574;STB=0.817184,0.5;STBP=0.004,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.0881139,0;OID=.,.;OPOS=77808958,77808957;OREF=G,AG;OALT=-,GA;OMAPALT=A,GA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:26:27:17,2:19,0:0.413043,0:10,2:7,0:24:2:13,0:6,0:25:2
chr17	77926491	.	G	A	414.96	PASS	AF=0.690909;AO=38;DP=55;FAO=38;FDP=55;FR=.;FRO=17;FSAF=11;FSAR=27;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=-0.00913042;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=264.982;QD=30.1785;RBI=0.0116963;REFB=-0.0193856;REVB=0.00731015;RO=17;SAF=11;SAR=27;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118053;STB=0.564321;STBP=0.17;TYPE=snp;VARB=0.00977301;OID=.;OPOS=77926491;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:17:17:38:38:0.690909:27:11:8:9:27:11:8:9
chr17	77984141	.	C	T	255.74	PASS	AF=0.314815;AO=34;DP=109;FAO=34;FDP=108;FR=.;FRO=74;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=26;FSRR=48;FWDB=0.0161342;FXX=0.0270246;HRUN=4;LEN=1;MLLD=127.444;QD=9.47177;RBI=0.039692;REFB=-0.00347369;REVB=-0.0362649;RO=72;SAF=12;SAR=22;SRF=25;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0073175;STB=0.501193;STBP=0.99;TYPE=snp;VARB=0.0110897;OID=.;OPOS=77984141;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:108:72:74:34:34:0.314815:22:12:25:47:22:12:26:48
chr17	78013724	.	G	C	618.36	PASS	AF=0.97619;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0377833;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.2626;QD=58.8911;RBI=0.0543429;REFB=-0.06116;REVB=0.0390586;RO=1;SAF=24;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0267986;STB=0.514279;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.00103725;OID=.;OPOS=78013724;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:42:42:1:1:41:41:0.97619:17:24:0:1:17:24:0:1
chr17	78023722	.	C	T	161.83	PASS	AF=0.314286;AO=21;DP=69;FAO=22;FDP=70;FR=.;FRO=48;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=28;FWDB=-0.00384821;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.9472;QD=9.24753;RBI=0.0555757;REFB=0.00526105;REVB=0.0554423;RO=48;SAF=8;SAR=13;SRF=20;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.043734;STB=0.538426;STBP=0.677;TYPE=snp;VARB=-0.0095003;OID=.;OPOS=78023722;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:70:48:48:21:22:0.314286:13:8:20:28:14:8:20:28
chr17	78055758	.	T	G	60.27	PASS	AF=0.225;AO=10;DP=40;FAO=9;FDP=40;FR=.;FRO=31;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=-0.00736234;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.261;QD=6.02722;RBI=0.0536169;REFB=-0.00631096;REVB=-0.053109;RO=30;SAF=5;SAR=5;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159944;STB=0.545355;STBP=0.795;TYPE=snp;VARB=0.0170432;OID=.;OPOS=78055758;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:60:40:40:30:31:10:9:0.225:5:5:19:11:4:5:19:12
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chr17	78071052	.	T	C	890.89	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0194513;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.485;QD=58.4192;RBI=0.0205348;REFB=0;REVB=-0.00658216;RO=0;SAF=30;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.82008e-05;OID=.;OPOS=78071052;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:31:30:0:0:31:30:0:0
chr17	78073355	.	A	G	907.48	PASS	AF=1;AO=62;DP=63;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0114912;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.0706;QD=58.5473;RBI=0.0314187;REFB=0;REVB=-0.0292419;RO=0;SAF=34;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000321998;OID=.;OPOS=78073355;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:62:0:0:62:62:1:28:34:0:0:28:34:0:0
chr17	78073562	.	A	G	393.39	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0089148;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.669;QD=56.1987;RBI=0.0142895;REFB=0;REVB=0.0111677;RO=0;SAF=16;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000144858;OID=.;OPOS=78073562;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:28:0:0:27:28:1:11:16:0:0:12:16:0:0
chr17	78078709	.	T	C	834.22	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.012028;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=225.779;QD=57.5324;RBI=0.017688;REFB=0;REVB=0.0129689;RO=0;SAF=29;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.96467e-05;OID=.;OPOS=78078709;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:29:29:0:0:29:29:0:0
chr17	78079597	.	A	G	905.73	PASS	AF=1;AO=62;DP=63;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.023229;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.7686;QD=58.4344;RBI=0.0306945;REFB=0;REVB=-0.020064;RO=0;SAF=34;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.03972e-05;OID=.;OPOS=78079597;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:62:0:0:62:62:1:28:34:0:0:28:34:0:0
chr17	78079669	.	G	A	766.36	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0162576;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.51;QD=63.8632;RBI=0.0674078;REFB=0;REVB=0.0654179;RO=0;SAF=17;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000472791;OID=.;OPOS=78079669;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:31:17:0:0:31:17:0:0
chr17	78082504	.	G	A	1377.24	PASS	AF=1;AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.013235;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.46;QD=62.6018;RBI=0.0140673;REFB=0;REVB=-0.004767;RO=0;SAF=34;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.68294e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.10881e-05;OID=.;OPOS=78082504;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:88:88:0:0:88:88:1:54:34:0:0:54:34:0:0
chr17	78087041	.	G	A	447.03	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00877618;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.777;QD=57.6806;RBI=0.0478611;REFB=0;REVB=0.0470496;RO=0;SAF=15;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000145768;OID=.;OPOS=78087041;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:16:15:0:0:16:15:0:0
chr17	78087109	.	A	G	632.21	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0243136;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.973;QD=61.6792;RBI=0.0518824;REFB=0;REVB=-0.0458327;RO=0;SAF=16;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.1719e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000124717;OID=.;OPOS=78087109;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:25:16:0:0:25:16:0:0
chr17	78091405	.	G	A	1358.2	PASS	AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.017309;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.664;QD=62.4459;RBI=0.0298684;REFB=0;REVB=0.0243418;RO=0;SAF=42;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.519e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.84949e-05;OID=.;OPOS=78091405;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:45:42:0:0:45:42:0:0
chr17	78162170	.	G	A	1047.27	PASS	AF=1;AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0664926;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.9751;QD=59.8442;RBI=0.0684135;REFB=0;REVB=0.0160976;RO=0;SAF=41;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000594335;OID=.;OPOS=78162170;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:70:0:0:70:70:1:29:41:0:0:29:41:0:0
chr17	78171942	.	AGG	AG,AGC	459.56	PASS	AF=0.03125,0.96875;AO=10,21;DP=31;FAO=1,31;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=1,9;FSAR=0,22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.093129,0.0284529;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=18.9293,37.5117;QD=57.4446;RBI=0.127044,0.120848;REFB=0,0;REVB=-0.0864124,0.117451;RO=0;SAF=2,8;SAR=8,13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0.278378,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0460586,0.00721377;OID=.,.;OPOS=78171943,78171944;OREF=G,G;OALT=-,C;OMAPALT=AG,AGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.03125,0.96875:10,21:31:1,31:32:0:1,9:0,22:0:0:4:0:2,8:8,13:0:0
chr17	78178893	.	C	T	397.51	PASS	AF=0.590909;AO=39;DP=66;FAO=39;FDP=66;FR=.;FRO=27;FSAF=2;FSAR=37;FSRF=3;FSRR=24;FWDB=0.00793926;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.7887;QD=24.0917;RBI=0.00881346;REFB=-0.0262835;REVB=0.0038269;RO=27;SAF=2;SAR=37;SRF=3;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184123;STB=0.602544;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.0347323;OID=.;OPOS=78178893;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:27:27:39:39:0.590909:37:2:3:24:37:2:3:24
chr17	78178916	.	C	T	268.54	PASS	AF=0.402597;AO=31;DP=77;FAO=31;FDP=77;FR=.;FRO=46;FSAF=5;FSAR=26;FSRF=9;FSRR=37;FWDB=0.0193447;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=374.464;QD=13.9502;RBI=0.0204392;REFB=-0.00487095;REVB=-0.00659871;RO=46;SAF=5;SAR=26;SRF=9;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.063008;STB=0.536058;STBP=0.707;TYPE=snp;VARB=0.00646874;OID=.;OPOS=78178916;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:46:46:31:31:0.402597:26:5:9:37:26:5:9:37
chr17	78179408	.	G	A	462.7	PASS	AF=0.688525;AO=42;DP=60;FAO=42;FDP=61;FR=.;FRO=19;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=15;FSRR=4;FWDB=-0.0148665;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.116;QD=30.3412;RBI=0.0232606;REFB=0.0116001;REVB=0.0178898;RO=18;SAF=23;SAR=19;SRF=14;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130619;STB=0.577103;STBP=0.095;TYPE=snp;VARB=-0.00847884;OID=.;OPOS=78179408;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:61:18:19:42:42:0.688525:19:23:14:4:19:23:15:4
chr17	78219065	.	C	A,T	637.14	PASS	AF=0.952381,0.047619;AO=40,2;DP=42;FAO=40,2;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=22,1;FSAR=18,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00441185,-0.0276239;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=106.333,17.8818;QD=60.6802;RBI=0.00790437,0.0350316;REFB=0,0;REVB=-0.00655855,-0.0215438;RO=0;SAF=22,1;SAR=18,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.19993e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-3.84423e-05,0.0735213;OID=.,.;OPOS=78219065,78219065;OREF=C,C;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:42:42:0:0:40,2:40,2:0.952381,0.047619:18,1:22,1:0:0:18,1:22,1:0:0
chr17	78293189	.	A	T	1347.2	PASS	AF=0.988636;AO=87;DP=89;FAO=87;FDP=88;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0136581;FXX=0.0112347;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.963;QD=61.2361;RBI=0.0137473;REFB=0.0235971;REVB=0.00156362;RO=1;SAF=40;SAR=47;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00997538;STB=0.505262;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=-9.91873e-05;OID=.;OPOS=78293189;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:89:88:1:1:87:87:0.988636:47:40:0:1:47:40:0:1
chr17	78298938	.	A	G	1084.29	PASS	AF=0.986486;AO=73;DP=74;FAO=73;FDP=74;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00835772;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.6777;QD=58.6103;RBI=0.0385998;REFB=-0.0898608;REVB=-0.0376841;RO=1;SAF=12;SAR=61;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00769302;STB=0.504064;STBP=0.628;TYPE=snp;VARB=0.00154616;OID=.;OPOS=78298938;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:74:74:1:1:73:73:0.986486:61:12:0:1:61:12:0:1
chr17	78302157	.	C	A	546.55	PASS	AF=0.56044;AO=47;DP=87;FAO=51;FDP=91;FR=.;FRO=40;FSAF=17;FSAR=34;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=0.0166912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.258;QD=24.0239;RBI=0.0167477;REFB=-0.0102112;REVB=0.0013739;RO=40;SAF=15;SAR=32;SRF=18;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11935;STB=0.555533;STBP=0.252;TYPE=snp;VARB=0.00662133;OID=.;OPOS=78302157;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:91:40:40:47:51:0.56044:32:15:18:22:34:17:18:22
chr17	78305871	.	G	A	69.28	PASS	AF=0.888889;AO=8;DP=9;FAO=8;FDP=9;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0495562;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.3482;QD=30.7902;RBI=0.0643445;REFB=-0.00678787;REVB=0.0410415;RO=1;SAF=6;SAR=2;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0679981;STB=0.538369;STBP=0.638;TYPE=snp;VARB=0.000612386;OID=.;OPOS=78305871;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:9:9:1:1:8:8:0.888889:2:6:1:0:2:6:1:0
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chr17	78306280	.	A	G	80.44	PASS	AF=0.526316;AO=8;DP=19;FAO=10;FDP=19;FR=.,HEALED;FRO=9;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=9;FWDB=0.0603649;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.0709;QD=16.9344;RBI=0.0639088;REFB=0.0185446;REVB=-0.0209858;RO=9;SAF=0;SAR=8;SRF=0;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.666427;STBP=0.735;TYPE=snp;VARB=-0.0367451;OID=.;OPOS=78306280;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:19:19:9:9:8:10:0.526316:8:0:0:9:9:1:0:9
chr17	78306308	.	C	G	60.3	PASS	AF=0.571429;AO=8;DP=14;FAO=8;FDP=14;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=-0.0667953;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.612;QD=17.2298;RBI=0.0681323;REFB=-0.00741316;REVB=0.013431;RO=6;SAF=1;SAR=7;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.266181;STB=0.649715;STBP=0.72;TYPE=snp;VARB=0.00584707;OID=.;OPOS=78306308;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:14:14:6:6:8:8:0.571429:7:1:0:6:7:1:0:6
chr17	78311508	.	G	A	366.94	PASS	AF=0.673913;AO=30;DP=45;FAO=31;FDP=46;FR=.;FRO=15;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.0183989;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.959;QD=31.908;RBI=0.0387236;REFB=-0.035743;REVB=0.0340734;RO=14;SAF=17;SAR=13;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0392732;STB=0.504947;STBP=0.943;TYPE=snp;VARB=0.0168665;OID=.;OPOS=78311508;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:46:14:15:30:31:0.673913:13:17:7:7:14:17:8:7
chr17	78319136	.	G	A	201.59	PASS	AF=0.555556;AO=19;DP=35;FAO=20;FDP=36;FR=.;FRO=16;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=-0.0039174;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.662;QD=22.3984;RBI=0.00507983;REFB=-0.00276754;REVB=-0.00323399;RO=16;SAF=12;SAR=7;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0496376;STB=0.5185;STBP=0.852;TYPE=snp;VARB=0.00898779;OID=.;OPOS=78319136;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:36:16:16:19:20:0.555556:7:12:11:5:7:13:11:5
chr17	78319380	.	G	C	452.74	PASS	AF=0.523256;AO=43;DP=85;FAO=45;FDP=86;FR=.;FRO=41;FSAF=29;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=0.021275;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.3571;QD=21.0575;RBI=0.0255564;REFB=0.0100571;REVB=0.01416;RO=41;SAF=27;SAR=16;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12715;STB=0.577778;STBP=0.161;TYPE=snp;VARB=-0.00894489;OID=.;OPOS=78319380;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:86:41:41:43:45:0.523256:16:27:20:21:16:29:20:21
chr17	78327358	.	G	A	464.05	PASS	AF=0.614286;AO=42;DP=70;FAO=43;FDP=70;FR=.;FRO=27;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=0.003818;FXX=0.0277739;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.386;QD=26.517;RBI=0.0132094;REFB=-0.0276852;REVB=0.0126456;RO=26;SAF=25;SAR=17;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.014678;STB=0.504441;STBP=0.952;TYPE=snp;VARB=0.0175481;OID=.;OPOS=78327358;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:26:27:42:43:0.614286:17:25:16:10:18:25:16:11
chr17	78341776	.	G	A	164.13	PASS	AF=0.372549;AO=19;DP=51;FAO=19;FDP=51;FR=.;FRO=32;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=-0.0410242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.649;QD=12.8729;RBI=0.048809;REFB=-0.00977295;REVB=0.0264449;RO=32;SAF=8;SAR=11;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.018117;STB=0.510537;STBP=0.911;TYPE=snp;VARB=0.0216718;OID=.;OPOS=78341776;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:32:32:19:19:0.372549:11:8:14:18:11:8:14:18
chr17	78354661	.	C	T	271.65	PASS	AF=0.543478;AO=24;DP=45;FAO=25;FDP=46;FR=.;FRO=21;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=0.00374906;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.428;QD=23.6218;RBI=0.0311636;REFB=-0.0300165;REVB=-0.0309372;RO=21;SAF=14;SAR=10;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0726545;STB=0.549961;STBP=0.453;TYPE=snp;VARB=0.0238275;OID=.;OPOS=78354661;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:46:21:21:24:25:0.543478:10:14:14:7:11:14:14:7
chr17	78395694	.	C	T	419.32	PASS	AF=0.615385;AO=40;DP=65;FAO=40;FDP=65;FR=.;FRO=25;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=7;FSRR=18;FWDB=0.0235629;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=224.282;QD=25.8044;RBI=0.023563;REFB=-0.0184677;REVB=-6.58861e-05;RO=25;SAF=21;SAR=19;SRF=7;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171471;STB=0.593537;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.0136575;OID=.;OPOS=78395694;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:25:25:40:40:0.615385:19:21:7:18:19:21:7:18
chr17	78444658	.	T	G	579.95	PASS	AF=1;AO=37;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0211978;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.981;QD=61.0474;RBI=0.0734972;REFB=0;REVB=0.0703739;RO=0;SAF=22;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.82408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00031479;OID=.;OPOS=78444658;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:37:38:1:15:22:0:0:15:23:0:0
chr17	78444679	.	T	C	200.92	PASS	AF=0.433962;AO=23;DP=50;FAO=23;FDP=53;FR=.;FRO=30;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=-0.0289357;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.56;QD=15.1639;RBI=0.0290899;REFB=-0.0248555;REVB=-0.00299165;RO=27;SAF=16;SAR=7;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146629;STB=0.599909;STBP=0.233;TYPE=snp;VARB=0.0388958;OID=.;OPOS=78444679;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:53:27:30:23:23:0.433962:7:16:15:12:7:16:16:14
chr17	78445702	.	A	G	834.4	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112603;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.232;QD=57.545;RBI=0.0136822;REFB=0;REVB=-0.00777227;RO=0;SAF=17;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.79507e-06;OID=.;OPOS=78445702;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:41:17:0:0:41:17:0:0
chr17	78820329	.	C	T	744.77	PASS	AF=0.616071;AO=69;DP=112;FAO=69;FDP=112;FR=.;FRO=43;FSAF=32;FSAR=37;FSRF=25;FSRR=18;FWDB=0.00888885;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.034;QD=26.5989;RBI=0.00922882;REFB=-0.0160154;REVB=0.00248182;RO=43;SAF=32;SAR=37;SRF=25;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0831046;STB=0.545089;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=0.0093741;OID=.;OPOS=78820329;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:112:43:43:69:69:0.616071:37:32:25:18:37:32:25:18
chr17	78854223	.	A	G	289.43	PASS	AF=0.577778;AO=26;DP=45;FAO=26;FDP=45;FR=.;FRO=19;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.007425;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.116;QD=25.7273;RBI=0.0385364;REFB=0.06385;REVB=-0.0378143;RO=19;SAF=15;SAR=11;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0793635;STB=0.544007;STBP=0.496;TYPE=snp;VARB=-0.0391125;OID=.;OPOS=78854223;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:19:19:26:26:0.577778:11:15:9:10:11:15:9:10
chr17	78896529	.	C	T	197.11	PASS	AF=0.347222;AO=25;DP=72;FAO=25;FDP=72;FR=.;FRO=47;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=23;FSRR=24;FWDB=0.0448328;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.378;QD=10.9504;RBI=0.0454432;REFB=-0.00858906;REVB=-0.00742288;RO=46;SAF=15;SAR=10;SRF=22;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136863;STB=0.572975;STBP=0.379;TYPE=snp;VARB=0.0175596;OID=.;OPOS=78896529;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:46:47:25:25:0.347222:10:15:22:24:10:15:23:24
chr17	78921117	.	C	T	165.08	PASS	AF=0.27381;AO=23;DP=84;FAO=23;FDP=84;FR=.;FRO=61;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=32;FSRR=29;FWDB=-0.0290018;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.4457;QD=7.86081;RBI=0.0349506;REFB=0.000372604;REVB=-0.0195049;RO=61;SAF=13;SAR=10;SRF=32;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0495502;STB=0.529755;STBP=0.789;TYPE=snp;VARB=-0.0022476;OID=.;OPOS=78921117;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:61:61:23:23:0.27381:10:13:32:29:10:13:32:29
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chr17	79082862	.	G	A	505.46	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0406347;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.873;QD=59.4663;RBI=0.0465921;REFB=0;REVB=0.0227959;RO=0;SAF=11;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000588825;OID=.;OPOS=79082862;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:23:11:0:0:23:11:0:0
chr17	79091102	.	TG	T,TT	422.75	PASS	AF=0.0333333,0.966667;AO=5,25;DP=30;FAO=1,29;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=1,18;FSAR=0,11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0164645,0.0255308;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=281.227,292.724;QD=56.3662;RBI=0.0194459,0.0272054;REFB=0,0;REVB=0.0103471,0.00939755;RO=0;SAF=3,16;SAR=2,9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.02814,0.00397228;OID=.,.;OPOS=79091103,79091103;OREF=G,G;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0333333,0.966667:5,25:30:1,29:30:0:1,18:0,11:0:0:5:0:3,16:2,9:0:0
chr17	79093822	.	A	G	62.12	PASS	AF=0.28125;AO=9;DP=32;FAO=9;FDP=32;FR=.;FRO=23;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=-0.0613997;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=40.9315;QD=7.76544;RBI=0.08666;REFB=-0.0218346;REVB=-0.0611559;RO=23;SAF=2;SAR=7;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.231342;STB=0.646702;STBP=0.396;TYPE=snp;VARB=0.0458452;OID=.;OPOS=79093822;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:32:32:23:23:9:9:0.28125:7:2:9:14:7:2:9:14
chr17	79095144	.	G	A	685.4	PASS	AF=0.944444;AO=51;DP=54;FAO=51;FDP=54;FR=.;FRO=3;FSAF=35;FSAR=16;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0195113;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.554;QD=50.7703;RBI=0.0499423;REFB=-0.0434561;REVB=0.0459732;RO=3;SAF=35;SAR=16;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00237571;STB=0.501263;STBP=0.953;TYPE=snp;VARB=0.00326126;OID=.;OPOS=79095144;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:54:54:3:3:51:51:0.944444:16:35:2:1:16:35:2:1
chr17	79139473	.	C	G	51.67	PASS	AF=0.228571;AO=8;DP=35;FAO=8;FDP=35;FR=.;FRO=27;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.0143678;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=222.905;QD=5.90507;RBI=0.0222695;REFB=-0.00736625;REVB=0.0170146;RO=27;SAF=3;SAR=5;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0853525;STB=0.555415;STBP=0.817;TYPE=snp;VARB=0.0235502;OID=.;OPOS=79139473;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:51:35:35:27:27:8:8:0.228571:5:3:12:15:5:3:12:15
chr17	79140505	.	C	CG,G	707.7	PASS	AF=0.410714,0.553571;AO=14,26;DP=57;FAO=23,31;FDP=56;FR=.;FRO=2;FSAF=18,22;FSAR=5,9;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0243539,0.0223089;FXX=0.0175408;HRUN=0,7;LEN=1,1;MLLD=154.056,148.806;QD=50.5502;RBI=0.0498625,0.122377;REFB=-0.0698787,-0.170975;REVB=-0.0435104,-0.120326;RO=0;SAF=14,20;SAR=0,6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,5.14057e-08;STB=0.526294,0.521725;STBP=0.62,0.414;TYPE=ins,snp;VARB=-0.00287379,0.0171029;OID=.,.;OPOS=79140506,79140505;OREF=-,C;OALT=G,G;OMAPALT=CG,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:65:57:56:0:2:14,26:23,31:0.410714,0.553571:0,6:14,20:0:0:5,9:18,22:2:0
chr17	79171967	.	A	G	626.01	PASS	AF=1;AO=40;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0139214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.648;QD=61.0742;RBI=0.0574998;REFB=0;REVB=-0.055789;RO=0;SAF=22;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.19993e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00016622;OID=.;OPOS=79171967;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:40:41:1:18:22:0:0:19:22:0:0
chr17	79173184	.	T	C	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00239702;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.3079;QD=53.2762;RBI=0.00696231;REFB=0;REVB=0.00653667;RO=0;SAF=15;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.2912e-05;OID=.;OPOS=79173184;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:8:15:0:0:8:15:0:0
chr17	79173224	.	T	C,G	372.26	PASS	AF=0.896552,0.0689655;AO=27,2;DP=29;FAO=26,2;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=14,1;FSAR=12,1;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0258835,-0.0270783;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=99.5903,165.368;QD=51.3463;RBI=0.0275554,0.0272495;REFB=-0.00490625,0.071899;REVB=0.0094522,0.00304991;RO=0;SAF=14,1;SAR=13,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.39874e-08,0;STB=0.519985,0.665164;STBP=0.31,0.662;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00162722,0.195685;OID=.,.;OPOS=79173224,79173224;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:29:29:0:1:27,2:26,2:0.896552,0.0689655:13,1:14,1:0:0:12,1:14,1:0:1
chr17	79174221	.	T	C	2263.87	PASS	AF=0.993377;AO=149;DP=151;FAO=150;FDP=151;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=103;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0238136;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.271;QD=59.9701;RBI=0.0344158;REFB=-0.0909465;REVB=0.0248467;RO=1;SAF=47;SAR=102;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00464071;STB=0.502415;STBP=0.596;TYPE=snp;VARB=0.000214679;OID=.;OPOS=79174221;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:151:151:1:1:149:150:0.993377:102:47:0:1:103:47:0:1
chr17	79182778	.	T	C	689.37	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0347085;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.4565;QD=62.67;RBI=0.0403533;REFB=0;REVB=-0.0205841;RO=0;SAF=19;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000849987;OID=.;OPOS=79182778;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:25:19:0:0:25:19:0:0
chr17	79202956	.	T	C	891.95	PASS	AF=1;AO=56;DP=57;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0324384;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.344;QD=57.5453;RBI=0.03366;REFB=0;REVB=0.00898605;RO=0;SAF=12;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.73653e-05;OID=.;OPOS=79202956;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:62:0:0:56:62:1:44:12:0:0:49:13:0:0
chr17	79219417	.	G	GC	30.35	PASS	AF=0.150794;AO=22;DP=132;FAO=19;FDP=126;FR=.;FRO=107;FSAF=3;FSAR=16;FSRF=66;FSRR=41;FWDB=-0.0337389;FXX=0.0454511;HRUN=1;LEN=1;MLLD=18.3707;QD=0.96334;RBI=0.0427411;REFB=-0.0442679;REVB=0.0262391;RO=108;SAF=3;SAR=19;SRF=66;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.584633;STB=0.865524;STBP=0.001;TYPE=ins;VARB=0.0841986;OID=.;OPOS=79219418;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.150794:22:132:19:126:107:3:16:66:41:30:108:3:19:66:42
chr17	79219500	.	AATG	A	1609.46	PASS	AF=0.851648;AO=155;DP=177;FAO=155;FDP=182;FR=.;FRO=27;FSAF=63;FSAR=92;FSRF=21;FSRR=6;FWDB=-0.0077498;FXX=0.0370351;HRUN=2;LEN=3;MLLD=284.615;QD=35.3728;RBI=0.0100995;REFB=0.000941397;REVB=-0.00647621;RO=0;SAF=63;SAR=92;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.63964e-08;STB=0.555884;STBP=0;TYPE=del;VARB=-0.000182558;OID=.;OPOS=79219501;OREF=ATG;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.851648:155:177:155:182:27:63:92:21:6:58:0:63:92:0:0
chr17	79220224	.	G	C	589.75	PASS	AF=0.87037;AO=47;DP=54;FAO=47;FDP=54;FR=.;FRO=7;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0.0303563;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.6312;QD=43.6854;RBI=0.0747348;REFB=-0.0657017;REVB=0.0682919;RO=6;SAF=27;SAR=20;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122081;STB=0.574436;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.0232164;OID=.;OPOS=79220224;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:54:54:6:7:47:47:0.87037:20:27:0:6:20:27:0:7
chr17	79402514	.	C	T	135.77	PASS	AF=0.7;AO=14;DP=20;FAO=14;FDP=20;FR=.;FRO=6;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.014481;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.133;QD=27.1538;RBI=0.014539;REFB=-0.0116608;REVB=-0.00129713;RO=5;SAF=7;SAR=7;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141904;STB=0.599863;STBP=0.187;TYPE=snp;VARB=0.0125172;OID=.;OPOS=79402514;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:20:20:5:6:14:14:0.7:7:7:1:4:7:7:1:5
chr17	79409309	.	A	G	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0196323;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.589;QD=40.7626;RBI=0.0204271;REFB=0;REVB=-0.00564239;RO=0;SAF=7;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.54882e-05;OID=.;OPOS=79409309;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:3:7:0:0:3:7:0:0
chr17	79409434	.	A	G	134.24	PASS	AF=0.454545;AO=15;DP=33;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=14;FWDB=0.0349038;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.973;QD=16.272;RBI=0.065388;REFB=-0.0376494;REVB=-0.055293;RO=18;SAF=10;SAR=5;SRF=4;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.404299;STB=0.730483;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.0214591;OID=.;OPOS=79409434;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:18:18:15:15:0.454545:5:10:4:14:5:10:4:14
chr17	79410256	.	G	A	156.65	PASS	AF=0.35;AO=20;DP=60;FAO=21;FDP=60;FR=.;FRO=39;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=0.00919746;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.1425;QD=10.4431;RBI=0.0290186;REFB=-0.00650561;REVB=-0.0275225;RO=39;SAF=14;SAR=6;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.302719;STB=0.651539;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=0.0178605;OID=.;OPOS=79410256;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:39:39:20:21:0.35:6:14:17:22:7:14:17:22
chr17	79414307	.	A	G	251.61	PASS	AF=0.489796;AO=24;DP=49;FAO=24;FDP=49;FR=.;FRO=25;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=0.00472465;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.625;QD=20.5399;RBI=0.0112132;REFB=0.000190583;REVB=0.0101692;RO=25;SAF=8;SAR=16;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.246224;STB=0.638771;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=-0.000204464;OID=.;OPOS=79414307;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:25:25:24:24:0.489796:16:8:15:10:16:8:15:10
chr17	79424516	.	A	G	36.87	PASS	AF=0.315789;AO=6;DP=19;FAO=6;FDP=19;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=0.012876;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.821;QD=7.76188;RBI=0.0419783;REFB=-0.000664083;REVB=-0.0399548;RO=13;SAF=4;SAR=2;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0316032;STB=0.519934;STBP=0.954;TYPE=snp;VARB=0.00573695;OID=.;OPOS=79424516;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:19:19:13:13:6:6:0.315789:2:4:9:4:2:4:9:4
chr17	79424537	.	C	T	37.45	PASS	AF=0.352941;AO=6;DP=17;FAO=6;FDP=17;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=2;FWDB=0.0157818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.028;QD=8.81109;RBI=0.0297398;REFB=-0.00303031;REVB=0.025207;RO=11;SAF=4;SAR=2;SRF=9;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194949;STB=0.6187;STBP=0.573;TYPE=snp;VARB=0.006181;OID=.;OPOS=79424537;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:17:17:11:11:6:6:0.352941:2:4:9:2:2:4:9:2
chr17	79429852	.	C	T	496.06	PASS	AF=0.709677;AO=44;DP=62;FAO=44;FDP=62;FR=.;FRO=18;FSAF=29;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=5;FWDB=-0.00844387;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.035;QD=32.0036;RBI=0.00931136;REFB=-0.0230077;REVB=0.00392461;RO=18;SAF=29;SAR=15;SRF=13;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0382228;STB=0.520652;STBP=0.664;TYPE=snp;VARB=0.00985216;OID=.;OPOS=79429852;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:18:18:44:44:0.709677:15:29:13:5:15:29:13:5
chr17	79478019	.	G	A	118.32	PASS	AF=0.378378;AO=14;DP=37;FAO=14;FDP=37;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=0.00982868;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=146.113;QD=12.7913;RBI=0.0176061;REFB=-0.00146372;REVB=-0.0146072;RO=23;SAF=10;SAR=4;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127032;STB=0.575109;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.00251744;OID=.;OPOS=79478019;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:23:23:14:14:0.378378:4:10:14:9:4:10:14:9
chr17	79496289	.	G	A	191.63	PASS	AF=0.408163;AO=20;DP=49;FAO=20;FDP=49;FR=.;FRO=29;FSAF=4;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=-0.0156635;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.009;QD=15.643;RBI=0.020713;REFB=-0.011365;REVB=0.0135529;RO=29;SAF=4;SAR=16;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.430289;STB=0.749732;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0165718;OID=.;OPOS=79496289;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:29:29:20:20:0.408163:16:4:17:12:16:4:17:12
chr17	79507170	.	T	C,G	605.85	PASS	AF=0.926829,0.0731707;AO=35,3;DP=38;FAO=38,3;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=24,3;FSAR=14,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0174787,-0.0200838;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=119.473,87.2993;QD=59.107;RBI=0.0673424,0.065533;REFB=0,0;REVB=0.0650346,0.0623797;RO=0;SAF=24,3;SAR=11,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00462894,0.154583;OID=.,.;OPOS=79507170,79507170;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:12:38:41:0:0:35,3:38,3:0.926829,0.0731707:11,0:24,3:0:0:14,0:24,3:0:0
chr17	79507272	.	G	A	347.85	PASS	AF=0.644444;AO=29;DP=47;FAO=29;FDP=45;FR=.;FRO=16;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.0132387;FXX=0.0425441;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.997;QD=30.9203;RBI=0.07031;REFB=-0.00447645;REVB=0.0690524;RO=15;SAF=18;SAR=11;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0567647;STB=0.544555;STBP=0.428;TYPE=snp;VARB=0.00245085;OID=.;OPOS=79507272;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:45:15:16:29:29:0.644444:11:18:8:7:11:18:8:8
chr17	79508400	.	T	C	785.21	PASS	AF=1;AO=55;DP=56;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0535468;FXX=0.0350816;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.551;QD=57.1063;RBI=0.0560076;REFB=0;REVB=0.0164192;RO=0;SAF=25;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000105416;OID=.;OPOS=79508400;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:55:0:0:55:55:1:30:25:0:0:30:25:0:0
chr17	79511135	.	A	G	139.44	PASS	AF=0.311475;AO=19;DP=61;FAO=19;FDP=61;FR=.;FRO=42;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=-0.0360298;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.368;QD=9.1435;RBI=0.0383079;REFB=-0.0227011;REVB=-0.0130135;RO=41;SAF=13;SAR=6;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20743;STB=0.616661;STBP=0.233;TYPE=snp;VARB=0.0357566;OID=.;OPOS=79511135;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:41:42:19:19:0.311475:6:13:21:20:6:13:22:20
chr17	79514028	.	C	G	199.26	PASS	AF=0.5;AO=16;DP=40;FAO=20;FDP=40;FR=.,HEALED;FRO=20;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=0.0132409;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.185;QD=19.9258;RBI=0.0385069;REFB=-0.00910307;REVB=0.0361588;RO=20;SAF=7;SAR=9;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0871019;STB=0.52629;STBP=0.756;TYPE=snp;VARB=0.0114048;OID=.;OPOS=79514028;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:20:20:16:20:0.5:9:7:7:13:12:8:7:13
chr17	79525118	.	T	G	199.36	PASS	AF=0.655172;AO=19;DP=29;FAO=19;FDP=29;FR=.;FRO=10;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.0025179;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.146;QD=27.4984;RBI=0.0272995;REFB=-0.00889937;REVB=-0.0271831;RO=10;SAF=8;SAR=11;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172439;STB=0.595568;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=0.00282342;OID=.;OPOS=79525118;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:29:29:10:10:19:19:0.655172:11:8:7:3:11:8:7:3
chr17	79589242	.	G	A	1320.95	PASS	AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.029611;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=280.005;QD=62.1623;RBI=0.0335272;REFB=0;REVB=0.0157246;RO=0;SAF=44;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.11679e-05;OID=.;OPOS=79589242;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:41:44:0:0:41:44:0:0
chr17	79596811	.	C	G,T	479.35	PASS	AF=0.0571429,0.914286;AO=2,32;DP=35;FAO=2,32;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=2,24;FSAR=0,8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0221522,0.00511644;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=23.3968,287.381;QD=54.7833;RBI=0.0687851,0.0146145;REFB=0.0217699,-0.011894;REVB=-0.0651204,-0.0136896;RO=1;SAF=2,24;SAR=0,8;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.697199,0.0548081;STB=0.993266,0.529393;STBP=0.227,0.151;TYPE=snp,snp;VARB=0.203195,-0.000160829;OID=.,.;OPOS=79596811,79596811;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:35:35:1:1:2,32:2,32:0.0571429,0.914286:0,8:2,24:0:1:0,8:2,24:0:1
chr17	79609410	.	G	T	340.73	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0151727;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.615;QD=54.5175;RBI=0.0221173;REFB=0;REVB=0.0160923;RO=0;SAF=7;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.94997e-05;OID=.;OPOS=79609410;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:18:7:0:0:18:7:0:0
chr17	79612161	.	C	T	1020.28	PASS	AF=0.946667;AO=71;DP=76;FAO=71;FDP=75;FR=.;FRO=4;FSAF=39;FSAR=32;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.00280052;FXX=0.0131562;HRUN=5;LEN=1;MLLD=246.332;QD=54.4152;RBI=0.0250913;REFB=-0.18312;REVB=0.0249345;RO=3;SAF=39;SAR=32;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.034992;STB=0.524383;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=0.000783892;OID=.;OPOS=79612161;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:76:75:3:4:71:71:0.946667:32:39:3:0:32:39:4:0
chr17	79612333	.	G	A	332.47	PASS	AF=1;AO=24;DP=26;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00746317;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.334;QD=53.1952;RBI=0.0403174;REFB=0;REVB=0.0396206;RO=1;SAF=11;SAR=13;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0343222;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.9851e-05;OID=.;OPOS=79612333;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:25:1:0:24:25:1:13:11:0:1:14:11:0:0
chr17	79612382	.	T	C	175.64	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0223655;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.1221;QD=46.8362;RBI=0.0372869;REFB=0;REVB=-0.0298345;RO=0;SAF=6;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00217058;OID=.;OPOS=79612382;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:9:6:0:0:9:6:0:0
chr17	79612397	.	A	G	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00168882;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.02;QD=45.8066;RBI=0.0233866;REFB=0;REVB=-0.0233255;RO=0;SAF=7;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000332378;OID=.;OPOS=79612397;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:7:7:0:0:7:7:0:0
chr17	79612413	.	T	C	296.39	PASS	AF=0.958333;AO=23;DP=24;FAO=23;FDP=24;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00379383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.387;QD=49.398;RBI=0.0196182;REFB=-0.0591631;REVB=0.0192478;RO=1;SAF=13;SAR=10;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0342828;STB=0.518502;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00226862;OID=.;OPOS=79612413;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:24:24:1:1:23:23:0.958333:10:13:1:0:10:13:1:0
chr17	79612443	.	T	C	713.63	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00525782;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.342;QD=60.7342;RBI=0.0649073;REFB=0;REVB=0.064694;RO=0;SAF=27;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.54734e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000596203;OID=.;OPOS=79612443;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:47:0:0:44:47:1:17:27:0:0:19:28:0:0
chr17	79612621	.	G	A	223.71	PASS	AF=0.385714;AO=27;DP=70;FAO=27;FDP=70;FR=.;FRO=43;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=32;FWDB=0.0171173;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.439;QD=12.7834;RBI=0.0201319;REFB=-0.00820719;REVB=0.0105968;RO=43;SAF=17;SAR=10;SRF=11;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.38476;STB=0.718162;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0226378;OID=.;OPOS=79612621;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:43:43:27:27:0.385714:10:17:11:32:10:17:11:32
chr17	79614481	.	A	G	359.42	PASS	AF=1;AO=23;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0468116;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.875;QD=55.2953;RBI=0.0621486;REFB=0;REVB=0.0408794;RO=0;SAF=10;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00046138;OID=.;OPOS=79614481;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:23:26:1:13:10:0:0:13:13:0:0
chr17	79614932	.	TTAAC	T	271.04	PASS	AF=0.961538;AO=21;DP=24;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00115602;FXX=0;HRUN=3;LEN=4;MLLD=282.095;QD=41.6986;RBI=0.0159224;REFB=-0.0405038;REVB=-0.0158804;RO=0;SAF=11;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51176e-08;STB=0.518504;STBP=0.502;TYPE=del;VARB=0.0033268;OID=.;OPOS=79614933;OREF=TAAC;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.961538:21:24:25:26:1:13:12:1:0:4:0:11:10:0:0
chr17	79637349	.	T	C	2274.25	PASS	AF=1;AO=143;DP=143;FAO=143;FDP=143;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0235809;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.741;QD=63.6154;RBI=0.0241855;REFB=0;REVB=0.00537404;RO=0;SAF=61;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.21229e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.43513e-06;OID=.;OPOS=79637349;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:143:143:0:0:143:143:1:82:61:0:0:82:61:0:0
chr17	79657194	.	A	G	194.21	PASS	AF=0.59375;AO=19;DP=32;FAO=19;FDP=32;FR=.;FRO=13;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=3;FWDB=-0.00926636;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.9808;QD=24.2761;RBI=0.0332999;REFB=0.00169087;REVB=-0.0319846;RO=13;SAF=13;SAR=6;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0739602;STB=0.541135;STBP=0.615;TYPE=snp;VARB=-0.00254708;OID=.;OPOS=79657194;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:13:13:19:19:0.59375:6:13:10:3:6:13:10:3
chr17	79671378	.	AC	A,ACC	32.27	PASS	AF=0.470588,0.0294118;AO=12,7;DP=34;FAO=16,1;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=14,0;FSAR=2,1;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=-0.208203,0.185808;FXX=0;HRUN=7,7;LEN=1,1;MLLD=7.47401,7.70079;QD=3.79678;RBI=0.287403,0.275764;REFB=0.0479286,-0.0568487;REVB=0.198121,-0.203767;RO=10;SAF=11,0;SAR=1,7;SRF=4;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.569681,-0.75076;STB=0.819366,0.986962;STBP=0.003,0.454;TYPE=del,ins;VARB=0.108528,0.173013;OID=.,.;OPOS=79671379,79671379;OREF=C,-;OALT=-,C;OMAPALT=A,ACC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.470588,0.0294118:12,7:34:16,1:34:17:14,0:2,1:6:11:36:10:11,0:1,7:4:6
chr17	79769466	.	T	C	195.93	PASS	AF=1;AO=15;DP=18;FAO=17;FDP=17;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.06663;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.1411;QD=46.1021;RBI=0.127736;REFB=0;REVB=0.108981;RO=1;SAF=8;SAR=7;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0607183;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00520467;OID=.;OPOS=79769466;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:17:1:0:15:17:1:7:8:0:1:11:6:0:0
chr17	79770740	.	C	T	358.09	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0328048;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.564;QD=55.0909;RBI=0.0422156;REFB=0;REVB=0.0265708;RO=0;SAF=16;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.71087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000256848;OID=.;OPOS=79770740;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:10:16:0:0:10:16:0:0
chr17	79784105	.	A	G	259.62	PASS	AF=0.913043;AO=21;DP=24;FAO=21;FDP=23;FR=.;FRO=2;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0396911;FXX=0.0416493;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.8309;QD=45.1512;RBI=0.151685;REFB=-0.0815747;REVB=0.1464;RO=2;SAF=15;SAR=6;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0411632;STB=0.522366;STBP=0.54;TYPE=snp;VARB=0.00871049;OID=.;OPOS=79784105;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:24:23:2:2:21:21:0.913043:6:15:1:1:6:15:1:1
chr17	79803101	.	A	G	802.39	PASS	AF=1;AO=55;DP=56;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0622972;FXX=0.0172384;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.8803;QD=56.3083;RBI=0.0624078;REFB=0;REVB=-0.00371363;RO=1;SAF=30;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154549;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00138531;OID=.;OPOS=79803101;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:57:1:0:55:57:1:25:30:1:0:25:32:0:0
chr17	79805134	.	G	A	712.85	PASS	AF=0.978723;AO=45;DP=46;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00890909;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.437;QD=60.6678;RBI=0.00907762;REFB=0.0142603;REVB=-0.00174105;RO=0;SAF=23;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.510634;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=-0.000428264;OID=.;OPOS=79805134;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:46:47:0:1:45:46:0.978723:22:23:0:0:23:23:1:0
chr17	79818260	.	G	T	538.55	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0135711;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.579;QD=59.8393;RBI=0.0700301;REFB=0;REVB=0.0687026;RO=0;SAF=11;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.58193e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00100569;OID=.;OPOS=79818260;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:25:11:0:0:25:11:0:0
chr17	79825897	.	A	G	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0280406;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=326.022;QD=55.0987;RBI=0.0307774;REFB=0;REVB=0.0126876;RO=0;SAF=23;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000119554;OID=.;OPOS=79825897;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:3:23:0:0:3:23:0:0
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chr17	79872241	.	A	G	729.01	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0350078;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=284.681;QD=57.1775;RBI=0.0373898;REFB=0;REVB=0.0131322;RO=0;SAF=29;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.15047e-05;OID=.;OPOS=79872241;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:22:29:0:0:22:29:0:0
chr17	79891147	.	T	C	785.21	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0194459;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.068;QD=57.1061;RBI=0.0299736;REFB=0;REVB=0.0228095;RO=0;SAF=35;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.67221e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00020197;OID=.;OPOS=79891147;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:20:35:0:0:20:35:0:0
chr17	79899272	.	A	G	391.01	PASS	AF=0.536232;AO=30;DP=70;FAO=37;FDP=69;FR=.,HEALED;FRO=29;FSAF=25;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=0.0323347;FXX=0.0142837;HRUN=2;LEN=1;MLLD=37.7582;QD=22.6674;RBI=0.0324547;REFB=-0.00830384;REVB=-0.00278892;RO=29;SAF=21;SAR=9;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.263682;STB=0.620121;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=0.022391;OID=.;OPOS=79899272;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:69:29:29:30:37:0.536232:9:21:12:17:12:25:12:17
chr17	79899495	.	G	A	566.97	PASS	AF=0.666667;AO=50;DP=75;FAO=50;FDP=75;FR=.;FRO=25;FSAF=22;FSAR=28;FSRF=4;FSRR=21;FWDB=0.0193757;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=269.704;QD=30.2383;RBI=0.0195464;REFB=-0.0145451;REVB=0.00257776;RO=24;SAF=22;SAR=28;SRF=3;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197279;STB=0.596863;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.00789514;OID=.;OPOS=79899495;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:24:25:50:50:0.666667:28:22:3:21:28:22:4:21
chr17	79899698	.	G	A	354.03	PASS	AF=0.625;AO=30;DP=47;FAO=30;FDP=48;FR=.;FRO=18;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.0547251;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.941;QD=29.5025;RBI=0.0647411;REFB=-0.0612847;REVB=0.0345914;RO=17;SAF=12;SAR=18;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.087057;STB=0.559282;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.0365053;OID=.;OPOS=79899698;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:48:17:18:30:30:0.625:18:12:9:8:18:12:10:8
chr17	79954543	.	CTG	CAG,GCA	751.4	PASS	AF=0.670213,0;AO=50,4;DP=95;FAO=63,0;FDP=94;FR=.;FRO=31;FSAF=27,0;FSAR=36,0;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=0.0103025,0.00474046;FXX=0.0105252;HRUN=1,1;LEN=1,3;MLLD=146.29,211.712;QD=31.9746;RBI=0.0295037,0.0108747;REFB=-0.0150062,-0.00789829;REVB=0.0276464,-0.00978705;RO=30;SAF=20,4;SAR=30,0;SRF=17;SRR=13;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.116454,0.581544;STB=0.550443,0.5;STBP=0.172,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.014689,0;OID=.,.;OPOS=79954544,79954543;OREF=T,CTG;OALT=A,GCA;OMAPALT=CAG,GCA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:94:30:31:50,4:63,0:0.670213,0:30,0:20,4:17:13:36,0:27,0:18:13
chr17	79974731	.	T	C	235.22	PASS	AF=0.594595;AO=22;DP=37;FAO=22;FDP=37;FR=.;FRO=15;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=0.0146916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.661;QD=25.4292;RBI=0.0355344;REFB=-0.0288932;REVB=0.0323551;RO=15;SAF=12;SAR=10;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0402817;STB=0.522368;STBP=0.75;TYPE=snp;VARB=0.0194344;OID=.;OPOS=79974731;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:15:15:22:22:0.594595:10:12:9:6:10:12:9:6
chr17	79980756	.	C	A	237.14	PASS	AF=0.560976;AO=22;DP=41;FAO=23;FDP=41;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=0.0270266;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.442;QD=23.1352;RBI=0.0530474;REFB=-0.0678365;REVB=0.0456463;RO=19;SAF=7;SAR=15;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0468796;STB=0.507036;STBP=0.97;TYPE=snp;VARB=0.030304;OID=.;OPOS=79980756;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:19:18:22:23:0.560976:15:7:7:12:15:8:6:12
chr17	79993919	.	C	T	52.11	PASS	AF=0.242424;AO=8;DP=33;FAO=8;FDP=33;FR=.;FRO=25;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=0.142877;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.3237;QD=6.31661;RBI=0.143248;REFB=0.00205595;REVB=-0.0103006;RO=24;SAF=1;SAR=7;SRF=7;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.299514;STB=0.723464;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=0.00074828;OID=.;OPOS=79993919;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:33:33:24:25:8:8:0.242424:7:1:7:17:7:1:8:17
chr17	80006957	.	A	C	344.01	PASS	AF=0.659091;AO=29;DP=44;FAO=29;FDP=44;FR=.;FRO=15;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.0179016;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.7789;QD=31.2738;RBI=0.0216354;REFB=-0.0393625;REVB=-0.0121502;RO=15;SAF=15;SAR=14;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0314528;STB=0.517229;STBP=0.775;TYPE=snp;VARB=0.023894;OID=.;OPOS=80006957;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:15:15:29:29:0.659091:14:15:7:8:14:15:7:8
chr17	80007887	.	A	G	823.08	PASS	AF=0.643478;AO=74;DP=115;FAO=74;FDP=115;FR=.;FRO=41;FSAF=35;FSAR=39;FSRF=13;FSRR=28;FWDB=-0.0520626;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.1801;QD=28.6288;RBI=0.0546425;REFB=-0.0323955;REVB=-0.0165919;RO=41;SAF=35;SAR=39;SRF=13;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103845;STB=0.556068;STBP=0.107;TYPE=snp;VARB=0.0183209;OID=.;OPOS=80007887;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:115:41:41:74:74:0.643478:39:35:13:28:39:35:13:28
chr17	80008392	.	G	T	702.48	PASS	AF=0.64;AO=63;DP=100;FAO=64;FDP=100;FR=.;FRO=36;FSAF=38;FSAR=26;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=-0.0486613;FXX=0.00990001;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.6834;QD=28.0991;RBI=0.0611509;REFB=0.0298053;REVB=0.0370339;RO=37;SAF=37;SAR=26;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0138429;STB=0.514171;STBP=0.702;TYPE=snp;VARB=-0.0167799;OID=.;OPOS=80008392;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:37:36:63:64:0.64:26:37:21:16:26:38:20:16
chr17	80009156	.	T	G	130.26	PASS	AF=0.46875;AO=14;DP=31;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=14;FSAR=1;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=0.0131202;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.566;QD=16.2823;RBI=0.017284;REFB=-0.0148479;REVB=-0.0112515;RO=15;SAF=13;SAR=1;SRF=12;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.295227;STB=0.763168;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.0117663;OID=.;OPOS=80009156;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:32:15:17:14:15:0.46875:1:13:12:3:1:14:12:5
chr17	80013235	.	A	G	958.77	PASS	AF=0.985075;AO=66;DP=67;FAO=66;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.026066;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.513;QD=57.24;RBI=0.0341223;REFB=-0.112784;REVB=-0.0220203;RO=1;SAF=33;SAR=33;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0141028;STB=0.50746;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.000692895;OID=.;OPOS=80013235;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:67:67:1:1:66:66:0.985075:33:33:1:0:33:33:1:0
chr17	80039481	.	G	A	851.2	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00480309;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.0095;QD=57.7085;RBI=0.0329346;REFB=0;REVB=-0.0325825;RO=0;SAF=27;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.96591e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000328407;OID=.;OPOS=80039481;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:32:27:0:0:32:27:0:0
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chr17	80085633	.	A	G	180.83	PASS	AF=0.403846;AO=21;DP=52;FAO=21;FDP=52;FR=.;FRO=31;FSAF=17;FSAR=4;FSRF=23;FSRR=8;FWDB=0.00277581;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.52;QD=13.9103;RBI=0.0192571;REFB=0.0043389;REVB=-0.019056;RO=31;SAF=17;SAR=4;SRF=23;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104172;STB=0.560378;STBP=0.58;TYPE=snp;VARB=-0.0094157;OID=.;OPOS=80085633;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:31:31:21:21:0.403846:4:17:23:8:4:17:23:8
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chr17	80086389	.	C	T	94.85	PASS	AF=0.195122;AO=16;DP=82;FAO=16;FDP=82;FR=.;FRO=66;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=47;FWDB=0.0130931;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.8366;QD=4.62697;RBI=0.0263284;REFB=-0.00568115;REVB=0.022842;RO=65;SAF=7;SAR=9;SRF=19;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194202;STB=0.626055;STBP=0.344;TYPE=snp;VARB=0.0205449;OID=.;OPOS=80086389;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:82:82:65:66:16:16:0.195122:9:7:19:46:9:7:19:47
chr17	80086395	.	T	C	111.44	PASS	AF=0.206897;AO=18;DP=87;FAO=18;FDP=87;FR=.;FRO=69;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=22;FSRR=47;FWDB=-0.0128878;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.549;QD=5.12356;RBI=0.0265871;REFB=-0.00494562;REVB=-0.0232547;RO=69;SAF=7;SAR=11;SRF=22;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0956873;STB=0.559936;STBP=0.634;TYPE=snp;VARB=0.0195697;OID=.;OPOS=80086395;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:69:69:18:18:0.206897:11:7:22:47:11:7:22:47
chr17	80099639	.	C	A	301.78	PASS	AF=0.5625;AO=27;DP=48;FAO=27;FDP=48;FR=.;FRO=21;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=0.0492832;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.9554;QD=25.1483;RBI=0.051552;REFB=0.0584783;REVB=0.0151253;RO=21;SAF=12;SAR=15;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100073;STB=0.555514;STBP=0.39;TYPE=snp;VARB=-0.0388971;OID=.;OPOS=80099639;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:21:21:27:27:0.5625:15:12:12:9:15:12:12:9
chr17	80103737	.	T	C	629.96	PASS	AF=0.639535;AO=55;DP=86;FAO=55;FDP=86;FR=.;FRO=31;FSAF=21;FSAR=34;FSRF=9;FSRR=22;FWDB=-0.0126159;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.614;QD=29.3003;RBI=0.0137452;REFB=-0.00709681;REVB=0.00545619;RO=30;SAF=21;SAR=34;SRF=8;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0811772;STB=0.535506;STBP=0.411;TYPE=snp;VARB=0.00428653;OID=.;OPOS=80103737;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:30:31:55:55:0.639535:34:21:8:22:34:21:9:22
chr17	80136418	.	C	T	419.04	PASS	AF=0.615385;AO=40;DP=65;FAO=40;FDP=65;FR=.;FRO=25;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=0.0884912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.4773;QD=25.7869;RBI=0.0917101;REFB=-0.0230365;REVB=-0.0240843;RO=24;SAF=24;SAR=16;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155318;STB=0.592546;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.0246887;OID=.;OPOS=80136418;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:24:25:40:40:0.615385:16:24:9:15:16:24:9:16
chr17	80151881	.	G	A	837.38	PASS	AF=0.672727;AO=74;DP=110;FAO=74;FDP=110;FR=.;FRO=36;FSAF=37;FSAR=37;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=0.00545903;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.582;QD=30.4501;RBI=0.0443103;REFB=-0.00916305;REVB=0.0439727;RO=35;SAF=37;SAR=37;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00851109;STB=0.509088;STBP=0.809;TYPE=snp;VARB=0.00621898;OID=.;OPOS=80151881;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:110:35:36:74:74:0.672727:37:37:18:17:37:37:19:17
chr17	80159566	.	T	C	866.66	PASS	AF=1;AO=59;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0105833;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.6569;QD=57.777;RBI=0.05875;REFB=0;REVB=-0.0577888;RO=0;SAF=25;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.03209e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000500385;OID=.;OPOS=80159566;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:59:60:1:34:25:0:0:34:26:0:0
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chr17	80195582	.	T	C	582.42	PASS	AF=0.975;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00252229;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.166;QD=58.2416;RBI=0.0167869;REFB=-0.0308138;REVB=0.0165964;RO=1;SAF=22;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0267753;STB=0.514278;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=0.000274129;OID=.;OPOS=80195582;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:40:40:1:1:39:39:0.975:17:22:0:1:17:22:0:1
chr17	80280865	.	G	A	336.92	PASS	AF=0.611111;AO=32;DP=54;FAO=33;FDP=54;FR=.;FRO=21;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=-0.00892381;FXX=0.0181785;HRUN=5;LEN=1;MLLD=123.45;QD=24.9571;RBI=0.0404876;REFB=-0.00995694;REVB=0.039492;RO=20;SAF=15;SAR=17;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0219275;STB=0.503369;STBP=0.968;TYPE=snp;VARB=0.0114818;OID=.;OPOS=80280865;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:20:21:32:33:0.611111:17:15:10:10:17:16:10:11
chr17	80373452	.	C	T	738.35	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0662647;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.322;QD=56.7959;RBI=0.0864789;REFB=0;REVB=0.0555661;RO=0;SAF=22;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.30731e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00105354;OID=.;OPOS=80373452;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:52:0:0:49:52:1:27:22:0:0:30:22:0:0
chr17	80377690	.	T	G	446.47	PASS	AF=1;AO=31;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0256136;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.5419;QD=55.8084;RBI=0.0691436;REFB=0;REVB=0.0642245;RO=0;SAF=14;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00178071;OID=.;OPOS=80377690;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:31:32:1:17:14:0:0:18:14:0:0
chr17	80391684	.	A	G	1377.36	PASS	AF=1;AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.014281;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.9686;QD=62.6072;RBI=0.0420922;REFB=0;REVB=-0.0395956;RO=0;SAF=30;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000281052;OID=.;OPOS=80391684;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:88:88:0:0:88:88:1:58:30:0:0:58:30:0:0
chr17	80394530	.	G	T	214.25	PASS	AF=0.947368;AO=18;DP=19;FAO=18;FDP=19;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0300062;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.2745;QD=45.1059;RBI=0.0436905;REFB=-0.0965663;REVB=0.0317567;RO=1;SAF=9;SAR=9;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0483018;STB=0.526287;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.00929971;OID=.;OPOS=80394530;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:19:19:1:1:18:18:0.947368:9:9:0:1:9:9:0:1
chr17	80404547	.	G	A	249.37	PASS	AF=0.414286;AO=28;DP=69;FAO=29;FDP=70;FR=.;FRO=41;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=28;FWDB=-0.00675985;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.981;QD=14.2499;RBI=0.0200051;REFB=-0.0047477;REVB=-0.0188283;RO=40;SAF=15;SAR=13;SRF=13;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.216051;STB=0.616362;STBP=0.114;TYPE=snp;VARB=0.00715853;OID=.;OPOS=80404547;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:70:40:41:28:29:0.414286:13:15:13:27:14:15:13:28
chr17	80452592	.	G	C	223.19	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.107874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.043;QD=49.5982;RBI=0.111779;REFB=0;REVB=0.0292863;RO=0;SAF=5;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000794237;OID=.;OPOS=80452592;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:13:5:0:0:13:5:0:0
chr17	80481088	.	T	C	412.68	PASS	AF=0.711538;AO=37;DP=52;FAO=37;FDP=52;FR=.;FRO=15;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.000236801;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.321;QD=31.7443;RBI=0.00601821;REFB=-0.0418591;REVB=0.00601355;RO=15;SAF=17;SAR=20;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0319111;STB=0.517304;STBP=0.736;TYPE=snp;VARB=0.0132763;OID=.;OPOS=80481088;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:15:15:37:37:0.711538:20:17:6:9:20:17:6:9
chr17	80573681	.	A	G	130.57	PASS	AF=0.608696;AO=14;DP=23;FAO=14;FDP=23;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=0.00818904;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.6363;QD=22.7075;RBI=0.0300608;REFB=0.0406758;REVB=0.0289239;RO=9;SAF=5;SAR=9;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105825;STB=0.559359;STBP=0.562;TYPE=snp;VARB=-0.0240122;OID=.;OPOS=80573681;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:23:23:9:9:14:14:0.608696:9:5:2:7:9:5:2:7
chr17	80614933	.	T	C	538.41	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0243175;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.2156;QD=59.8234;RBI=0.0397413;REFB=0;REVB=0.031433;RO=0;SAF=16;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.9376e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000680685;OID=.;OPOS=80614933;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:20:16:0:0:20:16:0:0
chr17	80615040	.	A	C	972.82	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0131786;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.76;QD=58.9587;RBI=0.0139072;REFB=0;REVB=-0.00444259;RO=0;SAF=31;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.769e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.79903e-05;OID=.;OPOS=80615040;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:35:31:0:0:35:31:0:0
chr17	80674643	.	C	G	613.35	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0260426;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=221.081;QD=61.3348;RBI=0.0578281;REFB=0;REVB=-0.0516321;RO=0;SAF=32;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.98625e-05;OID=.;OPOS=80674643;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:8:32:0:0:8:32:0:0
chr17	80696410	.	A	C	750.64	PASS	AF=1;AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.025906;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.349;QD=63.8843;RBI=0.0596046;REFB=0;REVB=0.0536804;RO=0;SAF=26;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.24503e-05;OID=.;OPOS=80696410;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:47:0:0:47:47:1:21:26:0:0:21:26:0:0
chr17	80700592	.	T	C	1231.41	PASS	AF=0.987805;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=82;FR=.;FRO=1;FSAF=49;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0552031;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=313.462;QD=60.0686;RBI=0.0562123;REFB=-0.0370438;REVB=0.0106036;RO=0;SAF=49;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.32002e-08;STB=0.50769;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.000117834;OID=.;OPOS=80700592;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:81:82:0:1:81:81:0.987805:32:49:0:0:32:49:0:1
chr17	80788465	.	T	C,G	870.64	PASS	AF=0.967213,0.0327869;AO=58,3;DP=61;FAO=59,2;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=30,2;FSAR=29,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186118,0.00363104;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=208.09,159.792;QD=57.0911;RBI=0.0188005,0.00435989;REFB=0,0;REVB=-0.00265718,-0.00241334;RO=0;SAF=30,2;SAR=28,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00207912,0.0995331;OID=.,.;OPOS=80788465,80788465;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:7:61:61:0:0:58,3:59,2:0.967213,0.0327869:28,1:30,2:0:0:29,0:30,2:0:0
chr17	80788492	.	A	G	1079.94	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00195044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.614;QD=59.9968;RBI=0.0104715;REFB=0;REVB=0.0102883;RO=0;SAF=38;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.20805e-05;OID=.;OPOS=80788492;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:34:38:0:0:34:38:0:0
chr17	80895932	.	GA	G,GG	318.13	PASS	AF=0.125,0.875;AO=7,17;DP=24;FAO=3,21;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=0,9;FSAR=3,12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000834669,-0.00974129;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=222.302,240.917;QD=53.0223;RBI=0.0772234,0.082693;REFB=0,0;REVB=0.0772189,0.0821172;RO=0;SAF=0,9;SAR=7,8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,4.126e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.050446,-0.00015965;OID=.,.;OPOS=80895933,80895933;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.125,0.875:7,17:24:3,21:24:0:0,9:3,12:0:0:10:0:0,9:7,8:0:0
chr17	80923536	.	C	T	577.24	PASS	AF=1;AO=32;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.22723;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.527;QD=60.7624;RBI=0.227279;REFB=0;REVB=0.00467923;RO=0;SAF=14;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0039808;OID=.;OPOS=80923536;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:32:38:1:18:14:0:0:18:20:0:0
chr17	80992932	.	A	C	115.68	PASS	AF=0.265625;AO=17;DP=64;FAO=17;FDP=64;FR=.;FRO=47;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=25;FSRR=22;FWDB=0.00374165;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.307;QD=7.23007;RBI=0.0415375;REFB=-0.00945569;REVB=-0.0413687;RO=47;SAF=11;SAR=6;SRF=25;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143537;STB=0.587681;STBP=0.435;TYPE=snp;VARB=0.0148375;OID=.;OPOS=80992932;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:47:47:17:17:0.265625:6:11:25:22:6:11:25:22
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chr17	81006629	.	C	T	271.64	PASS	AF=0.363636;AO=31;DP=87;FAO=32;FDP=88;FR=.;FRO=56;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=33;FSRR=23;FWDB=0.0208437;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.327;QD=12.3474;RBI=0.0211423;REFB=-0.000779888;REVB=0.00354081;RO=55;SAF=16;SAR=15;SRF=32;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0732913;STB=0.556783;STBP=0.44;TYPE=snp;VARB=0.00140818;OID=.;OPOS=81006629;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:88:55:56:31:32:0.363636:15:16:32:23:16:16:33:23
chr17	81009595	.	C	T	82.28	PASS	AF=0.588235;AO=10;DP=17;FAO=10;FDP=17;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.0464793;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.4459;QD=19.3594;RBI=0.0569731;REFB=-0.00469308;REVB=-0.0329486;RO=7;SAF=5;SAR=5;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.051088;STB=0.529353;STBP=0.765;TYPE=snp;VARB=0.00384654;OID=.;OPOS=81009595;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:17:17:7:7:10:10:0.588235:5:5:3:4:5:5:3:4
chr17	81043039	.	A	G	677.67	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0163375;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.864;QD=61.6062;RBI=0.0183307;REFB=0;REVB=0.00831267;RO=0;SAF=4;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=8.15207e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.44477e-05;OID=.;OPOS=81043039;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:44:0:0:43:44:1:39:4:0:0:40:4:0:0
chr18	47492	.	G	A	203.96	PASS	AF=1;AO=17;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0104408;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.624;QD=45.3245;RBI=0.0597759;REFB=-0.11023;REVB=0.058857;RO=0;SAF=8;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00235922;OID=.;OPOS=47492;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:18:18:0:0:17:18:1:9:8:0:0:10:8:0:0
chr18	47649	.	C	T	282.44	PASS	AF=0.259259;AO=42;DP=162;FAO=42;FDP=162;FR=.;FRO=120;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=81;FSRR=39;FWDB=-0.0115966;FXX=0.00613459;HRUN=5;LEN=1;MLLD=222.51;QD=6.97394;RBI=0.016844;REFB=-0.00377785;REVB=-0.0122163;RO=111;SAF=22;SAR=20;SRF=78;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.225137;STB=0.61341;STBP=0.101;TYPE=snp;VARB=0.013545;OID=.;OPOS=47649;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:162:162:111:120:42:42:0.259259:20:22:78:33:20:22:81:39
chr18	48104	.	T	C	174.6	PASS	AF=0.323944;AO=23;DP=71;FAO=23;FDP=71;FR=.;FRO=48;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=21;FSRR=27;FWDB=-0.0135084;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.4933;QD=9.83677;RBI=0.0737573;REFB=-0.0174031;REVB=0.0725097;RO=46;SAF=15;SAR=8;SRF=21;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.225311;STB=0.645629;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=0.0361879;OID=.;OPOS=48104;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:46:48:23:23:0.323944:8:15:21:25:8:15:21:27
chr18	49034	.	G	A	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0226969;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=209.147;QD=44.6898;RBI=0.0303277;REFB=0;REVB=-0.0201152;RO=0;SAF=7;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000340335;OID=.;OPOS=49034;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:6:7:0:0:6:7:0:0
chr18	49169	.	C	T	203.65	PASS	AF=0.857143;AO=18;DP=21;FAO=18;FDP=21;FR=.;FRO=3;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.00822246;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.287;QD=38.7912;RBI=0.0692843;REFB=-0.0279657;REVB=0.0687946;RO=3;SAF=7;SAR=11;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161;STB=0.588136;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.00736605;OID=.;OPOS=49169;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:21:21:3:3:18:18:0.857143:11:7:3:0:11:7:3:0
chr18	252559	.	G	A	708.46	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0230729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.393;QD=62.9737;RBI=0.0230929;REFB=0;REVB=0.000962088;RO=0;SAF=22;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.91932e-05;OID=.;OPOS=252559;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:23:22:0:0:23:22:0:0
chr18	319446	.	C	A	1194.38	PASS	AF=0.666667;AO=97;DP=146;FAO=100;FDP=150;FR=.;FRO=50;FSAF=52;FSAR=48;FSRF=26;FSRR=24;FWDB=0.0729759;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.0087;QD=31.8501;RBI=0.076108;REFB=-0.023771;REVB=0.0216091;RO=49;SAF=51;SAR=46;SRF=26;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00302496;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0127618;OID=.;OPOS=319446;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:146:150:49:50:97:100:0.666667:46:51:26:23:48:52:26:24
chr18	334742	.	C	T	117.71	PASS	AF=0.24;AO=18;DP=75;FAO=18;FDP=75;FR=.;FRO=57;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=30;FSRR=27;FWDB=0.043364;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.397;QD=6.27787;RBI=0.0466059;REFB=-0.00480408;REVB=0.0170783;RO=56;SAF=6;SAR=12;SRF=29;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.230241;STB=0.648482;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=0.0124719;OID=.;OPOS=334742;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:56:57:18:18:0.24:12:6:29:27:12:6:30:27
chr18	334758	.	T	C	922.34	PASS	AF=1;AO=62;DP=64;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0340124;FXX=0.0454477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.4276;QD=58.5611;RBI=0.0849275;REFB=0;REVB=0.0778193;RO=0;SAF=25;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0012304;OID=.;OPOS=334758;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:63:0:0:62:63:1:37:25:0:0:38:25:0:0
chr18	334994	.	A	G	59.41	PASS	AF=0.172414;AO=10;DP=58;FAO=10;FDP=58;FR=.;FRO=48;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=30;FSRR=18;FWDB=-0.0274828;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=311.808;QD=4.09689;RBI=0.029662;REFB=-0.00735746;REVB=-0.0111594;RO=46;SAF=8;SAR=2;SRF=30;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.225362;STB=0.677571;STBP=0.26;TYPE=snp;VARB=0.038704;OID=.;OPOS=334994;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:59:58:58:46:48:10:10:0.172414:2:8:30:16:2:8:30:18
chr18	346821	.	C	T	475.85	PASS	AF=0.782609;AO=36;DP=46;FAO=36;FDP=46;FR=.;FRO=10;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=-0.00194554;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.9509;QD=41.3786;RBI=0.0167208;REFB=-0.0162834;REVB=0.0166073;RO=10;SAF=20;SAR=16;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0629036;STB=0.533962;STBP=0.428;TYPE=snp;VARB=0.00525482;OID=.;OPOS=346821;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:68:46:46:10:10:36:36:0.782609:16:20:4:6:16:20:4:6
chr18	580498	.	G	A	273.31	PASS	AF=0.685714;AO=24;DP=35;FAO=24;FDP=35;FR=.;FRO=11;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=0.0130393;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.617;QD=31.2355;RBI=0.0135509;REFB=0.0114458;REVB=-0.00368854;RO=11;SAF=11;SAR=13;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101609;STB=0.555773;STBP=0.33;TYPE=snp;VARB=-0.00752748;OID=.;OPOS=580498;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:35:35:11:11:24:24:0.685714:13:11:7:4:13:11:7:4
chr18	580623	.	T	C	559.16	PASS	AF=0.974359;AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0201252;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.6234;QD=57.3492;RBI=0.0309774;REFB=-0.0378068;REVB=0.0235494;RO=1;SAF=20;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0228522;STB=0.512189;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=0.000599663;OID=.;OPOS=580623;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:39:39:1:1:38:38:0.974359:18:20:1:0:18:20:1:0
chr18	581201	.	T	A	1899.43	PASS	AF=1;AO=122;DP=122;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0278182;FXX=0.00806387;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.1605;QD=61.7702;RBI=0.0663516;REFB=0;REVB=0.0602385;RO=0;SAF=58;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000303087;OID=.;OPOS=581201;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:122:123:0:0:122:123:1:64:58:0:0:65:58:0:0
chr18	581203	.	TT	GA	1881.11	PASS	AF=1;AO=122;DP=123;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00275529;FXX=0.00812942;HRUN=2;LEN=2;MLLD=223.071;QD=61.6757;RBI=0.022081;REFB=0;REVB=0.0219085;RO=0;SAF=59;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.65337e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=2.35802e-05;OID=.;OPOS=581203;OREF=TT;OALT=GA;OMAPALT=GA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:123:122:0:0:122:122:1:63:59:0:0:63:59:0:0
chr18	586736	.	C	T	470.18	PASS	AF=1;AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00179189;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.68;QD=58.7727;RBI=0.0188084;REFB=0;REVB=-0.0187228;RO=0;SAF=12;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000591931;OID=.;OPOS=586736;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:32:0:0:32:32:1:20:12:0:0:20:12:0:0
chr18	658064	.	G	C	153.92	PASS	AF=0.227723;AO=23;DP=101;FAO=23;FDP=101;FR=.;FRO=78;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=40;FSRR=38;FWDB=-0.0103772;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.646;QD=6.09582;RBI=0.028614;REFB=-0.00718306;REVB=-0.026666;RO=78;SAF=15;SAR=8;SRF=40;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.178486;STB=0.610521;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=0.0224259;OID=.;OPOS=658064;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:101:78:78:23:23:0.227723:8:15:40:38:8:15:40:38
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chr18	706558	.	C	T	84.34	PASS	AF=0.34375;AO=11;DP=32;FAO=11;FDP=32;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=0.0305336;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.157;QD=10.5421;RBI=0.0325057;REFB=-0.00271381;REVB=-0.01115;RO=21;SAF=6;SAR=5;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.178214;STB=0.606553;STBP=0.468;TYPE=snp;VARB=0.00707861;OID=.;OPOS=706558;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:32:32:21:21:11:11:0.34375:5:6:8:13:5:6:8:13
chr18	722009	.	TAA	T	483.92	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00057836;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=123.487;QD=47.2116;RBI=0.033999;REFB=0;REVB=0.0339941;RO=0;SAF=24;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.2194e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000151244;OID=.;OPOS=722010;OREF=AA;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:41:41:41:41:0:24:17:0:0:9:0:24:17:0:0
chr18	722402	.	T	C	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0260428;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.58;QD=52.6129;RBI=0.0420327;REFB=0;REVB=0.0329928;RO=0;SAF=9;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2029e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000510332;OID=.;OPOS=722402;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:13:9:0:0:13:9:0:0
chr18	724612	.	A	G	223.19	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0390403;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.4216;QD=49.5982;RBI=0.0406543;REFB=0;REVB=0.0113416;RO=0;SAF=10;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00163948;OID=.;OPOS=724612;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:8:10:0:0:8:10:0:0
chr18	907675	.	G	A	815.51	PASS	AF=0.951613;AO=58;DP=62;FAO=59;FDP=62;FR=.;FRO=3;FSAF=24;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0558598;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.2774;QD=52.6133;RBI=0.0671033;REFB=-0.117048;REVB=0.0371824;RO=3;SAF=23;SAR=35;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00612781;STB=0.503686;STBP=0.793;TYPE=snp;VARB=0.00389465;OID=.;OPOS=907675;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:62:62:3:3:58:59:0.951613:35:23:1:2:35:24:1:2
chr18	2538644	.	G	A	465.09	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0265581;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.1802;QD=58.1358;RBI=0.0526947;REFB=0;REVB=-0.0455126;RO=0;SAF=9;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02243e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000853139;OID=.;OPOS=2538644;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:23:9:0:0:23:9:0:0
chr18	2539016	.	C	G	805.13	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00488504;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.0377;QD=64.4103;RBI=0.067827;REFB=0;REVB=0.0676509;RO=0;SAF=33;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.56458e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00088854;OID=.;OPOS=2539016;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:17:33:0:0:17:33:0:0
chr18	2595443	.	G	T	519.93	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00248817;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.4063;QD=59.4203;RBI=0.0274645;REFB=0;REVB=-0.0273516;RO=0;SAF=16;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.1382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000389171;OID=.;OPOS=2595443;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:19:16:0:0:19:16:0:0
chr18	2705700	.	A	G	176.23	PASS	AF=0.708333;AO=17;DP=24;FAO=17;FDP=24;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=-0.0333229;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.0288;QD=29.371;RBI=0.0333352;REFB=0.0306877;REVB=-0.000903571;RO=7;SAF=5;SAR=12;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100709;STB=0.555494;STBP=0.489;TYPE=snp;VARB=-0.0221413;OID=.;OPOS=2705700;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:24:24:7:7:17:17:0.708333:12:5:1:6:12:5:1:6
chr18	2707619	.	G	A	753.75	PASS	AF=0.743902;AO=61;DP=82;FAO=61;FDP=82;FR=.;FRO=21;FSAF=23;FSAR=38;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=-0.00867591;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.574;QD=36.7682;RBI=0.00871665;REFB=-0.00747472;REVB=-0.000841701;RO=21;SAF=23;SAR=38;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00197947;STB=0.501063;STBP=0.985;TYPE=snp;VARB=0.00215731;OID=.;OPOS=2707619;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:21:21:61:61:0.743902:38:23:8:13:38:23:8:13
chr18	2740714	.	A	G	665.33	PASS	AF=0.794118;AO=54;DP=68;FAO=54;FDP=68;FR=.;FRO=14;FSAF=32;FSAR=22;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.032345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.611;QD=39.1373;RBI=0.0609138;REFB=-0.0211279;REVB=0.0516168;RO=14;SAF=32;SAR=22;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0365422;STB=0.51959;STBP=0.56;TYPE=snp;VARB=0.00554381;OID=.;OPOS=2740714;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:68:68:14:14:54:54:0.794118:22:32:7:7:22:32:7:7
chr18	2750477	.	A	G	184.66	PASS	AF=0.642857;AO=17;DP=28;FAO=18;FDP=28;FR=.;FRO=10;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.087079;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.854;QD=26.3796;RBI=0.0962472;REFB=-0.015279;REVB=0.040997;RO=10;SAF=8;SAR=9;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0195324;STB=0.519978;STBP=0.797;TYPE=snp;VARB=0.0159993;OID=.;OPOS=2750477;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:28:28:10:10:17:18:0.642857:9:8:5:5:10:8:5:5
chr18	2778979	.	G	T	1101.44	PASS	AF=0.986667;AO=73;DP=74;FAO=74;FDP=75;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.131165;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.6466;QD=58.7434;RBI=0.132618;REFB=0.0436636;REVB=0.019584;RO=1;SAF=34;SAR=39;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.013709;STB=0.507244;STBP=0.324;TYPE=snp;VARB=-0.00180484;OID=.;OPOS=2778979;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:74:75:1:1:73:74:0.986667:39:34:1:0:40:34:1:0
chr18	2946291	.	C	T	1606.85	PASS	AF=1;AO=100;DP=100;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0174486;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.0982;QD=64.2741;RBI=0.0276744;REFB=0;REVB=-0.0214806;RO=0;SAF=33;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.73319e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000268233;OID=.;OPOS=2946291;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:100:100:0:0:100:100:1:67:33:0:0:67:33:0:0
chr18	3025464	.	A	G	310.54	PASS	AF=0.595745;AO=26;DP=46;FAO=28;FDP=47;FR=.;FRO=19;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.122877;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.687;QD=26.4292;RBI=0.123409;REFB=-0.0122059;REVB=-0.0114392;RO=18;SAF=11;SAR=15;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0985168;STB=0.546249;STBP=0.46;TYPE=snp;VARB=0.00862565;OID=.;OPOS=3025464;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:47:18:19:26:28:0.595745:15:11:10:8:15:13:11:8
chr18	3075503	.	C	CAAA	585.09	PASS	AF=1;AO=36;DP=43;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0144988;FXX=0.116252;HRUN=0;LEN=3;MLLD=233.974;QD=61.5886;RBI=0.0364702;REFB=0;REVB=0.0334643;RO=3;SAF=22;SAR=14;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00841154;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.000121661;OID=.;OPOS=3075504;OREF=-;OALT=AAA;OMAPALT=CAAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:36:43:38:38:0:22:16:0:0:3:3:22:14:2:1
chr18	3089522	.	G	T	563.68	PASS	AF=0.974359;AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00919707;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.724;QD=57.8135;RBI=0.0157556;REFB=0.0239849;REVB=-0.0127927;RO=1;SAF=19;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0240222;STB=0.512814;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=-0.000717438;OID=.;OPOS=3089522;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:39:39:1:1:38:38:0.974359:19:19:0:1:19:19:0:1
chr18	3116436	.	C	T	69.42	PASS	AF=0.227273;AO=10;DP=44;FAO=10;FDP=44;FR=.;FRO=34;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=0.00220389;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=148.404;QD=6.31112;RBI=0.0207315;REFB=-0.00807188;REVB=-0.020614;RO=34;SAF=7;SAR=3;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.249127;STB=0.660047;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.0278949;OID=.;OPOS=3116436;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:69:44:44:34:34:10:10:0.227273:3:7:17:17:3:7:17:17
chr18	3168816	.	G	A	456.36	PASS	AF=0.623188;AO=42;DP=68;FAO=43;FDP=69;FR=.;FRO=26;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=0.0150287;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.929;QD=26.4559;RBI=0.016173;REFB=-0.0176684;REVB=-0.00597525;RO=25;SAF=23;SAR=19;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0464137;STB=0.522084;STBP=0.656;TYPE=snp;VARB=0.0136074;OID=.;OPOS=3168816;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:69:25:26:42:43:0.623188:19:23:12:13:19:24:13:13
chr18	3188976	.	A	G	1449.42	PASS	AF=1;AO=91;DP=91;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0317699;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.759;QD=63.0183;RBI=0.0322582;REFB=0;REVB=-0.00559117;RO=0;SAF=31;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.16249e-05;OID=.;OPOS=3188976;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:91:92:0:0:91:92:1:60:31:0:0:60:32:0:0
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chr18	3457607	.	C	T	114.84	PASS	AF=0.261538;AO=17;DP=64;FAO=17;FDP=65;FR=.;FRO=48;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=23;FSRR=25;FWDB=0.00923005;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=194.872;QD=7.06676;RBI=0.0104722;REFB=-0.000516491;REVB=-0.00494694;RO=47;SAF=14;SAR=3;SRF=23;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.44139;STB=0.77897;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.00111843;OID=.;OPOS=3457607;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:65:47:48:17:17:0.261538:3:14:23:24:3:14:23:25
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chr18	5292030	.	A	G	768.86	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00475326;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.8801;QD=56.9524;RBI=0.0235965;REFB=0;REVB=-0.0231128;RO=0;SAF=33;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.70667e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000209447;OID=.;OPOS=5292030;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:21:33:0:0:21:33:0:0
chr18	5410574	.	A	G	805.19	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0275605;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.215;QD=64.4152;RBI=0.031669;REFB=0;REVB=-0.0155995;RO=0;SAF=29;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.20481e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.08069e-05;OID=.;OPOS=5410574;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:21:29:0:0:21:29:0:0
chr18	5630531	.	G	A	1424.99	PASS	AF=0.952381;AO=100;DP=106;FAO=100;FDP=105;FR=.;FRO=5;FSAF=56;FSAR=44;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0220769;FXX=0.00943307;HRUN=4;LEN=1;MLLD=216.481;QD=54.2852;RBI=0.0504636;REFB=-0.00895823;REVB=0.0453782;RO=4;SAF=56;SAR=44;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0044344;STB=0.501933;STBP=0.918;TYPE=snp;VARB=0.000254024;OID=.;OPOS=5630531;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:106:105:4:5:100:100:0.952381:44:56:2:2:44:56:3:2
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chr18	5955932	.	G	A	242.05	PASS	AF=0.666667;AO=22;DP=33;FAO=22;FDP=33;FR=.;FRO=11;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=10;FWDB=-0.0069021;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.0909;QD=29.339;RBI=0.0359408;REFB=-0.0534646;REVB=0.0352719;RO=11;SAF=14;SAR=8;SRF=1;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.322452;STB=0.677263;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.0250986;OID=.;OPOS=5955932;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:33:33:11:11:22:22:0.666667:8:14:1:10:8:14:1:10
chr18	5956145	.	T	C	202.64	PASS	AF=0.633333;AO=19;DP=30;FAO=19;FDP=30;FR=.;FRO=11;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=0.0289261;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.014;QD=27.0185;RBI=0.0300662;REFB=-0.00767927;REVB=0.00820125;RO=11;SAF=12;SAR=7;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0693067;STB=0.538422;STBP=0.66;TYPE=snp;VARB=0.00493346;OID=.;OPOS=5956145;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:30:30:11:11:19:19:0.633333:7:12:8:3:7:12:8:3
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chr18	8252454	.	CT	CC,C	50.33	PASS	AF=0.0945946,0.162162;AO=7,18;DP=73;FAO=7,12;FDP=74;FR=.;FRO=55;FSAF=7,7;FSAR=0,5;FSRF=31;FSRR=24;FWDB=0.00255796,-0.0174919;FXX=0;HRUN=6,6;LEN=1,1;MLLD=27.6904,9.60972;QD=2.72055;RBI=0.0277858,0.0186224;REFB=-0.0589295,-0.0877759;REVB=0.0276678,-0.00638948;RO=44;SAF=7,11;SAR=0,7;SRF=24;SRR=20;SSEN=0,0.448276;SSEP=0,0;SSSB=0.648849,0.0797075;STB=0.998253,0.516512;STBP=0.005,0.921;TYPE=snp,del;VARB=0.0882703,0.134281;OID=.,.;OPOS=8252455,8252455;OREF=T,T;OALT=C,-;OMAPALT=CC,C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0.0945946,0.162162:7,18:73:7,12:74:55:7,7:0,5:31:24:28:44:7,11:0,7:24:20
chr18	8387195	.	G	A	272.84	PASS	AF=0.581395;AO=25;DP=43;FAO=25;FDP=43;FR=.;FRO=18;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=-0.00377572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.475;QD=25.3804;RBI=0.0142344;REFB=-0.0123078;REVB=0.0137245;RO=18;SAF=14;SAR=11;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169778;STB=0.594022;STBP=0.136;TYPE=snp;VARB=0.00991698;OID=.;OPOS=8387195;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:18:18:25:25:0.581395:11:14:6:12:11:14:6:12
chr18	8387219	.	G	C	538.53	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0366133;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.6002;QD=59.837;RBI=0.048586;REFB=0;REVB=-0.0319385;RO=0;SAF=16;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.9376e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00123414;OID=.;OPOS=8387219;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:20:16:0:0:20:16:0:0
chr18	8471976	.	A	G	393.11	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0136709;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.2602;QD=56.1586;RBI=0.0356794;REFB=0;REVB=-0.0329564;RO=0;SAF=10;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000462446;OID=.;OPOS=8471976;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:18:10:0:0:18:10:0:0
chr18	8720368	.	C	T	55.05	PASS	AF=0.166667;AO=9;DP=54;FAO=9;FDP=54;FR=.;FRO=45;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=25;FSRR=20;FWDB=0.0206163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.89;QD=4.07769;RBI=0.0289489;REFB=0.00122845;REVB=-0.0203226;RO=44;SAF=8;SAR=1;SRF=24;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.483377;STB=0.834964;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=-0.012478;OID=.;OPOS=8720368;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:54:54:44:45:9:9:0.166667:1:8:24:20:1:8:25:20
chr18	8783835	.	T	C	42.3	PASS	AF=0.194444;AO=7;DP=35;FAO=7;FDP=36;FR=.;FRO=29;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=0.00780929;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.4279;QD=4.70054;RBI=0.0594663;REFB=-0.0172658;REVB=-0.0589513;RO=28;SAF=4;SAR=3;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127616;STB=0.598147;STBP=0.623;TYPE=snp;VARB=0.0241818;OID=.;OPOS=8783835;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:42:35:36:28:29:7:7:0.194444:3:4:13:15:3:4:13:16
chr18	8784370	.	A	G	40.38	PASS	AF=0.142857;AO=7;DP=49;FAO=7;FDP=49;FR=.;FRO=42;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=20;FSRR=22;FWDB=-0.0124621;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=294.668;QD=3.29624;RBI=0.0440752;REFB=0.00158702;REVB=-0.0422767;RO=42;SAF=3;SAR=4;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0574207;STB=0.541058;STBP=0.797;TYPE=snp;VARB=-0.00972382;OID=.;OPOS=8784370;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:40:49:49:42:42:7:7:0.142857:4:3:20:22:4:3:20:22
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chr18	9117867	.	T	C	888.56	PASS	AF=0.984127;AO=62;DP=63;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00954795;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.67;QD=56.4168;RBI=0.0203225;REFB=-0.0292609;REVB=0.01794;RO=1;SAF=24;SAR=38;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.019264;STB=0.510201;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=7.00472e-05;OID=.;OPOS=9117867;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:63:63:1:1:62:62:0.984127:38:24:1:0:38:24:1:0
chr18	9255982	.	A	G	798.73	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0290864;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=48.7107;QD=63.8987;RBI=0.0545066;REFB=0;REVB=-0.0460972;RO=0;SAF=20;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000963712;OID=.;OPOS=9255982;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:30:20:0:0:30:20:0:0
chr18	9518126	.	G	A	91.02	PASS	AF=0.172043;AO=16;DP=93;FAO=16;FDP=93;FR=.;FRO=77;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=39;FSRR=38;FWDB=-0.00112455;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.3392;QD=3.91496;RBI=0.0288662;REFB=-0.00149418;REVB=0.0288443;RO=77;SAF=9;SAR=7;SRF=39;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0707679;STB=0.5465;STBP=0.69;TYPE=snp;VARB=0.00949387;OID=.;OPOS=9518126;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:91:93:93:77:77:16:16:0.172043:7:9:39:38:7:9:39:38
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chr18	9955897	.	CTCT	AATC,CCCT,CCT	311.19	PASS	AF=0,0.025641,0.666667;AO=2,2,15;DP=34;FAO=0,1,26;FDP=39;FR=.;FRO=12;FSAF=0,0,8;FSAR=0,1,18;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=-0.0410227,0.0856166,0.059841;FXX=0.0714116;HRUN=5,1,1;LEN=4,1,1;MLLD=151.466,204.615,207.048;QD=31.9172;RBI=0.0418115,0.0858574,0.0600953;REFB=-0.00180004,-0.0168946,-0.012911;REVB=0.00808369,0.00642484,0.00552159;RO=12;SAF=0,0,1;SAR=2,2,14;SRF=4;SRR=8;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.505787,-0.505787,-0.443172;STB=0.5,0.98645,0.509427;STBP=1,0.516,0.885;TYPE=mnp,snp,del;VARB=0,-0.000797095,0.00269953;OID=.,.,.;OPOS=9955897,9955898,9955898;OREF=CTCT,T,T;OALT=AATC,C,-;OMAPALT=AATC,CCCT,CCT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/3:98:34:39:12:12:2,2,15:0,1,26:0,0.025641,0.666667:2,2,14:0,0,1:4:8:0,1,18:0,0,8:4:8
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chr18	12760740	.	T	A	465.11	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0545334;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.9421;QD=58.139;RBI=0.0872302;REFB=0;REVB=-0.0680824;RO=0;SAF=17;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000292723;OID=.;OPOS=12760740;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:32:0:0:31:32:1:14:17:0:0:15:17:0:0
chr18	12984144	.	C	A	62.69	PASS	AF=0.290323;AO=9;DP=31;FAO=9;FDP=31;FR=.;FRO=22;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=0.0169242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.246;QD=8.08937;RBI=0.029503;REFB=-0.00189142;REVB=-0.024166;RO=22;SAF=4;SAR=5;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0951184;STB=0.558696;STBP=0.655;TYPE=snp;VARB=0.0248439;OID=.;OPOS=12984144;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:31:31:22:22:9:9:0.290323:5:4:8:14:5:4:8:14
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chr18	14543139	.	T	C	282.81	PASS	AF=0.577778;AO=22;DP=41;FAO=26;FDP=45;FR=.;FRO=19;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=14;FWDB=0.0582342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.5065;QD=25.139;RBI=0.0586456;REFB=-0.0192474;REVB=-0.00693427;RO=19;SAF=10;SAR=12;SRF=5;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163095;STB=0.61478;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.0135265;OID=.;OPOS=14543139;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:45:19:19:22:26:0.577778:12:10:5:14:12:14:5:14
chr18	14752957	.	G	A	696.62	PASS	AF=0.978261;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.02992;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.0347;QD=60.5756;RBI=0.0328994;REFB=-0.108001;REVB=0.0136807;RO=0;SAF=23;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.511106;STBP=0.54;TYPE=snp;VARB=0.00116835;OID=.;OPOS=14752957;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:46:46:0:1:45:45:0.978261:22:23:0:0:22:23:0:1
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chr18	14848820	.	C	T	1230.43	PASS	AF=0.97619;AO=81;DP=83;FAO=82;FDP=84;FR=.;FRO=2;FSAF=46;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0128171;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.502;QD=58.5918;RBI=0.0130814;REFB=0.0232047;REVB=-0.00261641;RO=2;SAF=45;SAR=36;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00256496;STB=0.501473;STBP=0.879;TYPE=snp;VARB=-0.00039475;OID=.;OPOS=14848820;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:83:84:2:2:81:82:0.97619:36:45:1:1:36:46:1:1
chr18	19034556	.	T	C	1313.25	PASS	AF=1;AO=84;DP=84;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0542661;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.129;QD=61.7999;RBI=0.0554156;REFB=0;REVB=-0.0112285;RO=0;SAF=35;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.41353e-05;OID=.;OPOS=19034556;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:85:0:0:84:85:1:49:35:0:0:49:36:0:0
chr18	19048751	.	T	G	133.86	PASS	AF=0.666667;AO=14;DP=21;FAO=14;FDP=21;FR=.;FRO=7;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.033776;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=212.089;QD=25.4971;RBI=0.0381988;REFB=-0.00750228;REVB=0.0178418;RO=7;SAF=10;SAR=4;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187933;STB=0.605901;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=0.0037586;OID=.;OPOS=19048751;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:21:21:7:7:14:14:0.666667:4:10:3:4:4:10:3:4
chr18	19079853	.	A	G	740.44	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00271501;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.867;QD=56.9568;RBI=0.00479004;REFB=0;REVB=0.00394629;RO=0;SAF=23;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.84538e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.62642e-05;OID=.;OPOS=19079853;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:29:23:0:0:29:23:0:0
chr18	19100758	.	A	ATCT	139.28	PASS	AF=0.5;AO=14;DP=34;FAO=16;FDP=32;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=0;FWDB=-0.0248538;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=163.608;QD=17.4101;RBI=0.0308976;REFB=-0.0182469;REVB=-0.0183561;RO=19;SAF=2;SAR=12;SRF=18;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.708656;STB=0.863243;STBP=0.002;TYPE=ins;VARB=0.0274752;OID=.;OPOS=19100759;OREF=-;OALT=TCT;OMAPALT=ATCT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.5:14:34:16:32:16:3:13:16:0:99:19:2:12:18:1
chr18	19119974	.	GATATATATATATATATAT	GATATATATATATATAT,GATATATATATATATATAC	515.72	PASS	AF=0.756757,0.243243;AO=22,10;DP=38;FAO=28,9;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=15,6;FSAR=13,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.256751,0.0165086;FXX=0.0263089;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=55.9387,58.6662;QD=55.7533;RBI=0.270488,0.0478186;REFB=-0.033107,-0.0331463;REVB=0.0851057,0.0448785;RO=1;SAF=11,7;SAR=11,3;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0401764,-0.0596689;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0580855,0.105274;OID=.,.;OPOS=19119975,19119992;OREF=AT,T;OALT=-,C;OMAPALT=GATATATATATATATAT,GATATATATATATATATAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.756757,0.243243:22,10:38:28,9:37:0:15,6:13,3:0:0:58:1:11,7:11,3:1:0
chr18	19153494	.	C	T	805.18	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0146729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.5763;QD=64.4145;RBI=0.0168709;REFB=0;REVB=0.0083266;RO=0;SAF=27;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.98462e-05;OID=.;OPOS=19153494;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:23:27:0:0:23:27:0:0
chr18	19154143	.	G	A	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0154577;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.267;QD=45.8067;RBI=0.0212469;REFB=0;REVB=-0.014577;RO=0;SAF=5;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.17887e-05;OID=.;OPOS=19154143;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:9:5:0:0:9:5:0:0
chr18	19373962	.	T	TATG	557.14	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0293788;FXX=0;HRUN=0;LEN=3;MLLD=220.478;QD=60.2308;RBI=0.0301277;REFB=0;REVB=-0.00667603;RO=0;SAF=10;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.67388e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-9.22864e-05;OID=.;OPOS=19373963;OREF=-;OALT=ATG;OMAPALT=TATG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:37:37:37:37:0:10:27:0:0:4:0:10:27:0:0
chr18	19445976	.	T	C	346.26	PASS	AF=0.674419;AO=29;DP=43;FAO=29;FDP=43;FR=.;FRO=14;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.0131022;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.019;QD=32.2105;RBI=0.0241133;REFB=-0.0136001;REVB=0.0202431;RO=14;SAF=19;SAR=10;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183536;STB=0.600594;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.0165344;OID=.;OPOS=19445976;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:14:14:29:29:0.674419:10:19:5:9:10:19:5:9
chr18	19450385	.	A	AC	309.23	PASS	AF=1;AO=3;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0817388;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=101.662;QD=51.5378;RBI=0.0844004;REFB=0;REVB=0.0210283;RO=21;SAF=1;SAR=2;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.253568;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000748221;OID=.;OPOS=19450386;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:3:24:24:24:0:13:11:0:0:4:21:1:2:12:9
chr18	19450386	.	T	C	258.82	PASS	AF=0.916667;AO=21;DP=24;FAO=22;FDP=24;FR=.;FRO=2;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00154885;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=125.145;QD=43.1361;RBI=0.0590365;REFB=-0.164268;REVB=0.0590162;RO=3;SAF=12;SAR=9;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0553188;STB=0.503813;STBP=0.878;TYPE=snp;VARB=0.00794949;OID=.;OPOS=19450386;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:24:24:3:2:21:22:0.916667:9:12:1:2:10:12:1:1
chr18	19508949	.	G	A	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0206198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.408;QD=51.9164;RBI=0.0336643;REFB=0;REVB=-0.0266103;RO=0;SAF=9;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.70769e-05;OID=.;OPOS=19508949;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:12:9:0:0:12:9:0:0
chr18	19840623	.	A	G	594.94	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0803101;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.0845;QD=61.0191;RBI=0.0805344;REFB=0;REVB=0.00600608;RO=0;SAF=20;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.51048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000998078;OID=.;OPOS=19840623;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:39:0:0:38:39:1:18:20:0:0:19:20:0:0
chr18	20838286	.	G	T	275.65	PASS	AF=0.705882;AO=23;DP=33;FAO=24;FDP=34;FR=.;FRO=10;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=-0.052294;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.6604;QD=32.4298;RBI=0.0636282;REFB=-0.0322051;REVB=-0.0362476;RO=10;SAF=8;SAR=15;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145433;STB=0.583262;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.00837486;OID=.;OPOS=20838286;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:68:33:34:10:10:23:24:0.705882:15:8:6:4:16:8:6:4
chr18	20965034	.	G	A	83.34	PASS	AF=0.666667;AO=10;DP=14;FAO=10;FDP=15;FR=.;FRO=5;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.00966329;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.107;QD=22.224;RBI=0.0101412;REFB=-0.00833612;REVB=-0.00307644;RO=4;SAF=6;SAR=4;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0516928;STB=0.567431;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.00219664;OID=.;OPOS=20965034;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:14:15:4:5:10:10:0.666667:4:6:2:2:4:6:2:3
chr18	21017836	.	T	C	632.26	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00305358;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=295.166;QD=61.684;RBI=0.00694075;REFB=0;REVB=0.00623295;RO=0;SAF=12;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.20796e-06;OID=.;OPOS=21017836;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:29:12:0:0:29:12:0:0
chr18	21100240	.	C	T	1462.37	PASS	AF=0.971154;AO=101;DP=104;FAO=101;FDP=104;FR=.;FRO=3;FSAF=55;FSAR=46;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0260489;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=194.615;QD=56.245;RBI=0.0260803;REFB=-0.207831;REVB=-0.00127853;RO=1;SAF=55;SAR=46;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0102019;STB=0.503552;STBP=0.702;TYPE=snp;VARB=0.00137468;OID=.;OPOS=21100240;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:104:104:1:3:101:101:0.971154:46:55:0:1:46:55:2:1
chr18	21109250	.	T	C	446.31	PASS	AF=1;AO=13;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0220153;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=134.475;QD=57.5883;RBI=0.0238695;REFB=0;REVB=0.00922374;RO=0;SAF=10;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000149709;OID=.;OPOS=21109250;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:13:31:1:3:10:0:0:9:22:0:0
chr18	21111680	.	GTTTTTT	GTTTTTA,GTTTTT	143.4	PASS	AF=0.0394737,0.434211;AO=4,29;DP=77;FAO=3,33;FDP=76;FR=.;FRO=40;FSAF=3,17;FSAR=0,16;FSRF=25;FSRR=15;FWDB=-0.0278703,-0.114228;FXX=0.0129853;HRUN=7,7;LEN=1,1;MLLD=248.94,9.94577;QD=7.54721;RBI=0.0318512,0.259322;REFB=-0.0101957,-0.126963;REVB=0.0154188,0.232809;RO=41;SAF=4,18;SAR=0,11;SRF=23;SRR=18;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.53997,0.064053;STB=0.995689,0.560431;STBP=0.149,0.363;TYPE=snp,del;VARB=0.057597,0.132793;OID=.,.;OPOS=21111686,21111681;OREF=T,T;OALT=A,-;OMAPALT=GTTTTTA,GTTTTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0.0394737,0.434211:4,29:77:3,33:76:40:3,17:0,16:25:15:99:41:4,18:0,11:23:18
chr18	21124945	.	C	G	375.68	PASS	AF=1;AO=23;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0179295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.6013;QD=55.6558;RBI=0.0381705;REFB=0;REVB=-0.0336974;RO=0;SAF=10;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00027427;OID=.;OPOS=21124945;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:23:27:1:13:10:0:0:15:12:0:0
chr18	21413869	.	T	C	1615.68	PASS	AF=0.990909;AO=99;DP=100;FAO=109;FDP=110;FR=.;FRO=1;FSAF=68;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00672954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.808;QD=58.7521;RBI=0.0784896;REFB=0.0212436;REVB=0.0782006;RO=1;SAF=68;SAR=31;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00692557;STB=0.503649;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.00211676;OID=.;OPOS=21413869;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:100:110:1:1:99:109:0.990909:31:68:1:0:41:68:1:0
chr18	21424991	.	C	A	459.68	PASS	AF=0.719298;AO=41;DP=57;FAO=41;FDP=57;FR=.;FRO=16;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=-0.0188765;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.119;QD=32.2581;RBI=0.0289399;REFB=-0.0013389;REVB=-0.0219361;RO=16;SAF=20;SAR=21;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0912547;STB=0.549332;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=0.000401717;OID=.;OPOS=21424991;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:16:16:41:41:0.719298:21:20:5:11:21:20:5:11
chr18	21511089	.	A	G	1188.33	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0953965;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.523;QD=60.9399;RBI=0.0955006;REFB=0;REVB=0.00445654;RO=0;SAF=38;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000267364;OID=.;OPOS=21511089;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:78:0:0:76:78:1:38:38:0:0:38:40:0:0
chr18	21710321	.	C	T	1963.46	PASS	AF=1;AO=124;DP=124;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0311374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.951;QD=61.8413;RBI=0.0359102;REFB=0;REVB=-0.0178887;RO=0;SAF=45;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.49369e-05;OID=.;OPOS=21710321;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:124:127:0:0:124:127:1:79:45:0:0:80:47:0:0
chr18	21736933	.	T	G	1290.36	PASS	AF=1;AO=83;DP=85;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0342547;FXX=0.0235266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.097;QD=62.1859;RBI=0.0371178;REFB=0;REVB=-0.014295;RO=0;SAF=30;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.1129e-05;OID=.;OPOS=21736933;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:83:0:0:83:83:1:53:30:0:0:53:30:0:0
chr18	21739725	.	T	C	117.44	PASS	AF=0.590909;AO=13;DP=22;FAO=13;FDP=22;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=-0.0237101;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.231;QD=21.3531;RBI=0.0278336;REFB=0.022014;REVB=-0.0145788;RO=9;SAF=6;SAR=7;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.225945;STB=0.627399;STBP=0.196;TYPE=snp;VARB=-0.0125878;OID=.;OPOS=21739725;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:22:22:9:9:13:13:0.590909:7:6:7:2:7:6:7:2
chr18	21759055	.	G	C	740.43	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0473606;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.562;QD=56.9563;RBI=0.0492082;REFB=0;REVB=-0.0133573;RO=0;SAF=25;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000177326;OID=.;OPOS=21759055;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:27:25:0:0:27:25:0:0
chr18	22020543	.	C	G	395.57	PASS	AF=0.692308;AO=35;DP=52;FAO=36;FDP=52;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=29;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=0.0104242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=296.285;QD=30.4285;RBI=0.0114693;REFB=0.00912493;REVB=-0.00478349;RO=15;SAF=6;SAR=29;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.189873;STB=0.579952;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=-0.00339941;OID=.;OPOS=22020543;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:15:16:35:36:0.692308:29:6:6:9:29:7:6:10
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chr18	23865851	.	C	T	64.45	PASS	AF=0.346154;AO=9;DP=26;FAO=9;FDP=26;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.00587618;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.4676;QD=9.91615;RBI=0.0114263;REFB=0.000533317;REVB=0.00979955;RO=17;SAF=6;SAR=3;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154634;STB=0.594378;STBP=0.493;TYPE=snp;VARB=-0.000716781;OID=.;OPOS=23865851;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:26:26:17:17:9:9:0.346154:3:6:9:8:3:6:9:8
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chr18	23879134	.	T	C	53.45	PASS	AF=0.777778;AO=7;DP=9;FAO=7;FDP=9;FR=.;FRO=2;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00111509;FXX=0;HRUN=10;LEN=1;MLLD=312.558;QD=23.7534;RBI=0.014804;REFB=0.0165504;REVB=0.0147619;RO=1;SAF=5;SAR=2;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173072;STB=0.666171;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=-0.00328298;OID=.;OPOS=23879134;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:9:9:1:2:7:7:0.777778:2:5:0:1:2:5:0:2
chr18	23879142	.	T	A	43.68	PASS	AF=0.75;AO=6;DP=8;FAO=6;FDP=8;FR=.;FRO=2;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00934416;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=44.8788;QD=21.8419;RBI=0.0223291;REFB=-0.0608717;REVB=0.02028;RO=1;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171372;STB=0.666109;STBP=0.205;TYPE=snp;VARB=0.0204528;OID=.;OPOS=23879142;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:8:8:1:2:6:6:0.75:2:4:0:1:2:4:0:2
chr18	24035399	.	A	G	483.2	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103259;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.6378;QD=58.5697;RBI=0.0583955;REFB=0;REVB=-0.0574753;RO=0;SAF=15;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.64315e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000957843;OID=.;OPOS=24035399;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:18:15:0:0:18:15:0:0
chr18	24269386	.	G	A	1287.34	PASS	AF=0.988235;AO=84;DP=85;FAO=84;FDP=85;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00566277;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.673;QD=60.5807;RBI=0.0116298;REFB=-0.0574721;REVB=0.010158;RO=0;SAF=35;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505049;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.000489691;OID=.;OPOS=24269386;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:85:85:0:1:84:84:0.988235:49:35:0:0:49:35:0:1
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chr18	25570228	.	G	C	1563.87	PASS	AF=0.972727;AO=107;DP=110;FAO=107;FDP=110;FR=.;FRO=3;FSAF=63;FSAR=44;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.00437877;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=268.972;QD=56.8681;RBI=0.0231658;REFB=0.0282919;REVB=0.0227482;RO=3;SAF=63;SAR=44;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00416376;STB=0.502195;STBP=0.793;TYPE=snp;VARB=-5.09098e-05;OID=.;OPOS=25570228;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:110:110:3:3:107:107:0.972727:44:63:2:1:44:63:2:1
chr18	28570025	.	G	T	990.64	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0328677;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.1104;QD=59.1428;RBI=0.0329469;REFB=0;REVB=-0.00228394;RO=0;SAF=28;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.74073e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000194185;OID=.;OPOS=28570025;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:39:28:0:0:39:28:0:0
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chr18	28934681	.	A	T	117.61	PASS	AF=0.274194;AO=17;DP=62;FAO=17;FDP=62;FR=.;FRO=45;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=21;FSRR=24;FWDB=0.021986;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.31;QD=7.5874;RBI=0.0237917;REFB=-0.00291496;REVB=-0.00909182;RO=45;SAF=5;SAR=12;SRF=21;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.219512;STB=0.633982;STBP=0.2;TYPE=snp;VARB=0.00689612;OID=.;OPOS=28934681;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:45:45:17:17:0.274194:12:5:21:24:12:5:21:24
chr18	28956904	.	C	T	83.26	PASS	AF=0.220339;AO=13;DP=59;FAO=13;FDP=59;FR=.;FRO=46;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=23;FSRR=23;FWDB=0.00614345;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.371;QD=5.64446;RBI=0.0501541;REFB=0.00105082;REVB=-0.0497764;RO=46;SAF=7;SAR=6;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0473508;STB=0.52998;STBP=0.833;TYPE=snp;VARB=-0.0120103;OID=.;OPOS=28956904;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:59:59:46:46:13:13:0.220339:6:7:23:23:6:7:23:23
chr18	28968369	.	CGG	CG,CGA	1387.88	PASS	AF=0.0333333,0.966667;AO=19,70;DP=91;FAO=3,87;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=3,36;FSAR=0,51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0127691,-0.00991779;FXX=0.0109878;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=20.6942,39.4258;QD=61.6834;RBI=0.0402728,0.13875;REFB=0,0;REVB=0.0381949,0.138396;RO=0;SAF=3,36;SAR=16,34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.097978,0.00728008;OID=.,.;OPOS=28968370,28968371;OREF=G,G;OALT=-,A;OMAPALT=CG,CGA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0333333,0.966667:19,70:91:3,87:90:0:3,36:0,51:0:0:8:0:3,36:16,34:0:0
chr18	28968959	.	C	T	708.55	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0282979;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.781;QD=62.9823;RBI=0.031931;REFB=0;REVB=0.0147925;RO=0;SAF=25;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.09779e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.77648e-05;OID=.;OPOS=28968959;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:20:25:0:0:20:25:0:0
chr18	28986333	.	A	C	680.0	PASS	AF=1;AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186249;FXX=0.0444346;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.608;QD=63.2556;RBI=0.019984;REFB=0;REVB=0.00724382;RO=0;SAF=20;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000291536;OID=.;OPOS=28986333;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:43:0:0:43:43:1:23:20:0:0:23:20:0:0
chr18	28993183	.	A	G	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0292063;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.974;QD=51.9162;RBI=0.0293211;REFB=0;REVB=0.00259204;RO=0;SAF=6;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000275248;OID=.;OPOS=28993183;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:15:6:0:0:15:6:0:0
chr18	28993501	.	C	A	45.55	PASS	AF=0.857143;AO=6;DP=7;FAO=6;FDP=7;FR=.;FRO=1;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.132448;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=49.8244;QD=26.0275;RBI=0.145931;REFB=-0.0912114;REVB=-0.0612661;RO=1;SAF=2;SAR=4;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171372;STB=0.599655;STBP=0.252;TYPE=snp;VARB=0.00104122;OID=.;OPOS=28993501;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:7:7:1:1:6:6:0.857143:4:2:1:0:4:2:1:0
chr18	29055957	.	A	G	1097.15	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0151685;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.7606;QD=60.1179;RBI=0.0165342;REFB=0;REVB=0.00657997;RO=0;SAF=29;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.74557e-05;OID=.;OPOS=29055957;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:44:29:0:0:44:29:0:0
chr18	29104698	.	C	T	77.29	PASS	AF=0.434783;AO=10;DP=23;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.0631171;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.756;QD=13.4417;RBI=0.0666999;REFB=0.0124282;REVB=0.0215665;RO=13;SAF=7;SAR=3;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.239425;STB=0.641907;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=-0.0207402;OID=.;OPOS=29104698;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:23:23:13:13:10:10:0.434783:3:7:6:7:3:7:6:7
chr18	29122799	.	G	A	75.67	PASS	AF=0.75;AO=8;DP=11;FAO=9;FDP=12;FR=.;FRO=3;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0252132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.007;QD=25.2233;RBI=0.068823;REFB=-0.0285388;REVB=0.0640382;RO=3;SAF=7;SAR=1;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.379258;STB=0.72665;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.0102125;OID=.;OPOS=29122799;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:11:12:3:3:8:9:0.75:1:7:1:2:1:8:1:2
chr18	29126670	.	T	C	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186068;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.345;QD=59.4356;RBI=0.0192369;REFB=0;REVB=0.00488331;RO=0;SAF=15;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000101921;OID=.;OPOS=29126670;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:20:15:0:0:20:15:0:0
chr18	29178513	.	G	C	1516.56	PASS	AF=0.989691;AO=96;DP=97;FAO=96;FDP=97;FR=.;FRO=1;FSAF=49;FSAR=47;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0143086;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.475;QD=62.5386;RBI=0.0288722;REFB=-0.104578;REVB=0.0250773;RO=1;SAF=49;SAR=47;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00958021;STB=0.505049;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.000349603;OID=.;OPOS=29178513;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:97:97:1:1:96:96:0.989691:47:49:1:0:47:49:1:0
chr18	29204762	.	A	G	56.67	PASS	AF=0.173077;AO=10;DP=53;FAO=9;FDP=52;FR=.;FRO=43;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=27;FWDB=-0.0341711;FXX=0.0188644;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.7948;QD=4.3592;RBI=0.0393691;REFB=-0.00233136;REVB=-0.0195515;RO=43;SAF=3;SAR=7;SRF=16;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0989762;STB=0.535132;STBP=0.867;TYPE=snp;VARB=0.00880312;OID=.;OPOS=29204762;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:53:52:43:43:10:9:0.173077:7:3:16:27:6:3:16:27
chr18	29339910	.	G	T	207.42	PASS	AF=0.857143;AO=18;DP=22;FAO=18;FDP=21;FR=.;FRO=3;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0243181;FXX=0.0454339;HRUN=2;LEN=1;MLLD=233.6;QD=39.5093;RBI=0.0321853;REFB=-0.0746651;REVB=-0.0210838;RO=3;SAF=4;SAR=14;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.247046;STB=0.636198;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.00150261;OID=.;OPOS=29339910;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:22:21:3:3:18:18:0.857143:14:4:3:0:14:4:3:0
chr18	29497573	.	A	G	740.46	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0109093;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.532;QD=63.0182;RBI=0.0221354;REFB=0;REVB=0.0192604;RO=0;SAF=22;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000101419;OID=.;OPOS=29497573;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:25:22:0:0:25:22:0:0
chr18	29598847	.	C	T	656.94	PASS	AF=0.633333;AO=57;DP=90;FAO=57;FDP=90;FR=.;FRO=33;FSAF=38;FSAR=19;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=0.00353934;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.606;QD=29.1974;RBI=0.0048469;REFB=-0.0181618;REVB=-0.00331142;RO=33;SAF=38;SAR=19;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192306;STB=0.604613;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.00885658;OID=.;OPOS=29598847;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:33:33:57:57:0.633333:19:38:13:20:19:38:13:20
chr18	29710880	.	A	AAG,G	597.59	PASS	AF=0.859649,0;AO=44,3;DP=60;FAO=49,0;FDP=57;FR=.;FRO=8;FSAF=26,0;FSAR=23,0;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.0136977,0.0123838;FXX=0.0172384;HRUN=2,2;LEN=2,1;MLLD=314.604,211.905;QD=41.9361;RBI=0.0140857,0.0138943;REFB=0.00521729,0.00726325;REVB=-0.00328328,-0.00630025;RO=10;SAF=23,0;SAR=21,3;SRF=7;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0614766,-0.71177;STB=0.513314,0.5;STBP=0.658,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.00141926,0;OID=.,.;OPOS=29710881,29710880;OREF=-,A;OALT=AG,G;OMAPALT=AAG,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:60:57:10:8:44,3:49,0:0.859649,0:21,3:23,0:7:3:23,0:26,0:5:3
chr18	29784171	.	G	A	123.82	PASS	AF=0.231707;AO=19;DP=81;FAO=19;FDP=82;FR=.;FRO=63;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=32;FSRR=31;FWDB=-0.0199269;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=197.986;QD=6.04011;RBI=0.0221056;REFB=-0.00817988;REVB=-0.00956947;RO=62;SAF=5;SAR=14;SRF=32;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.324445;STB=0.696958;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=0.0217231;OID=.;OPOS=29784171;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:82:62:63:19:19:0.231707:14:5:32:30:14:5:32:31
chr18	29795076	.	T	A,C	744.32	PASS	AF=0.0625,0.9375;AO=2,45;DP=47;FAO=3,45;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=2,24;FSAR=1,21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00603336,0.00939754;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=185.732,231.496;QD=62.027;RBI=0.00864901,0.0162127;REFB=0,0;REVB=0.0061971,0.0132113;RO=0;SAF=1,24;SAR=1,21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0434035,-0.00239667;OID=.,.;OPOS=29795076,29795076;OREF=T,T;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:11:47:48:0:0:2,45:3,45:0.0625,0.9375:1,21:1,24:0:0:1,21:2,24:0:0
chr18	29795101	.	T	C	752.76	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0203946;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.771;QD=56.8118;RBI=0.056654;REFB=0;REVB=0.0528558;RO=0;SAF=26;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94283e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000104555;OID=.;OPOS=29795101;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:53:0:0:51:53:1:25:26:0:0:25:28:0:0
chr18	30253010	.	T	C,TC	336.8	PASS	AF=0,0.8;AO=5,21;DP=37;FAO=0,28;FDP=35;FR=.;FRO=7;FSAF=0,17;FSAR=0,11;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.0156535,0.0405943;FXX=0;HRUN=4,0;LEN=1,1;MLLD=46.9162,52.795;QD=38.4914;RBI=0.0489235,0.115965;REFB=-0.0613968,-0.0939474;REVB=0.0463517,0.108627;RO=7;SAF=3,12;SAR=2,9;SRF=6;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.275355,-0.136212;STB=0.5,0.536815;STBP=1,0.386;TYPE=snp,ins;VARB=0,0.0266965;OID=.,.;OPOS=30253010,30253011;OREF=T,-;OALT=C,C;OMAPALT=C,TC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:35:37:35:7:7:5,21:0,28:0,0.8:2,9:3,12:6:1:0,11:0,17:3:4
chr18	30349691	.	C	T	535.99	PASS	AF=0.948718;AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=39;FR=.;FRO=2;FSAF=24;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00508479;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.339;QD=54.9728;RBI=0.0104965;REFB=-0.114228;REVB=0.00918272;RO=1;SAF=24;SAR=13;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0346573;STB=0.535695;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.000804364;OID=.;OPOS=30349691;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:38:39:1:2:37:37:0.948718:13:24:0:1:13:24:0:2
chr18	30350404	.	GC	AA	147.67	PASS	AF=0.681818;AO=15;DP=22;FAO=15;FDP=22;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=-0.0414922;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=234.281;QD=26.8493;RBI=0.0424604;REFB=-0.00333485;REVB=0.00901574;RO=6;SAF=4;SAR=11;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0681464;STB=0.552779;STBP=0.586;TYPE=mnp;VARB=0.00125325;OID=.;OPOS=30350404;OREF=GC;OALT=AA;OMAPALT=AA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:22:22:6:7:15:15:0.681818:11:4:1:5:11:4:1:6
chr18	30352078	.	G	C	34.83	PASS	AF=0.833333;AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0665968;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.8648;QD=23.2169;RBI=0.0665968;REFB=-0.0456022;REVB=0;RO=1;SAF=5;SAR=0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00874789;OID=.;OPOS=30352078;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:6:6:1:1:5:5:0.833333:0:5:1:0:0:5:1:0
chr18	30804756	.	C	T	751.31	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0528268;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.269;QD=56.7024;RBI=0.0528774;REFB=0;REVB=-0.00231371;RO=0;SAF=31;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.76368e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000626894;OID=.;OPOS=30804756;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:22:31:0:0:22:31:0:0
chr18	30846895	.	A	T	1021.78	PASS	AF=1;AO=67;DP=68;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0255713;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.765;QD=59.2338;RBI=0.0308896;REFB=0;REVB=-0.0173284;RO=0;SAF=28;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.74073e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.67022e-05;OID=.;OPOS=30846895;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:68:69:0:0:67:69:1:39:28:0:0:40:29:0:0
chr18	30908046	.	GATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT	G	69.33	PASS	AF=1;AO=5;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0280988;FXX=0;HRUN=1;LEN=24;MLLD=102.922;QD=34.6654;RBI=0.16433;REFB=0;REVB=-0.16191;RO=0;SAF=1;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000209156;OID=.;OPOS=30908047;OREF=ATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:5:8:8:8:0:3:5:0:0:4:0:1:4:0:0
chr18	31320229	.	A	G	669.88	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00210202;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=111.776;QD=62.3142;RBI=0.0537468;REFB=0;REVB=0.0537057;RO=0;SAF=22;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000267493;OID=.;OPOS=31320229;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:21:22:0:0:21:22:0:0
chr18	31324934	.	A	G	411.1	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0388754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.9294;QD=56.704;RBI=0.0394182;REFB=0;REVB=-0.00651932;RO=0;SAF=11;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000260937;OID=.;OPOS=31324934;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:18:11:0:0:18:11:0:0
chr18	32558525	.	C	A	341.02	PASS	AF=0.84375;AO=27;DP=32;FAO=27;FDP=32;FR=.;FRO=5;FSAF=19;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=-0.0226695;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.825;QD=42.6275;RBI=0.0252641;REFB=0.0301252;REVB=-0.0111522;RO=5;SAF=19;SAR=8;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0338598;STB=0.518296;STBP=0.713;TYPE=snp;VARB=-0.00267122;OID=.;OPOS=32558525;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:26:32:32:5:5:27:27:0.84375:8:19:4:1:8:19:4:1
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chr18	33702162	.	G	A	335.09	PASS	AF=0.7;AO=27;DP=39;FAO=28;FDP=40;FR=.;FRO=12;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=12;FWDB=-0.00256862;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.422;QD=33.5091;RBI=0.00992464;REFB=-0.00361035;REVB=-0.00958648;RO=10;SAF=13;SAR=14;SRF=0;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.242696;STB=0.642765;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.000866599;OID=.;OPOS=33702162;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:39:40:10:12:27:28:0.7:14:13:0:10:15:13:0:12
chr18	33706610	.	C	T	152.26	PASS	AF=0.333333;AO=20;DP=59;FAO=20;FDP=60;FR=.;FRO=40;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=18;FWDB=0.0170889;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.462;QD=10.1506;RBI=0.0850316;REFB=-0.00668225;REVB=-0.0832967;RO=38;SAF=10;SAR=10;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0884138;STB=0.5333;STBP=0.697;TYPE=snp;VARB=0.0162684;OID=.;OPOS=33706610;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:60:38:40:20:20:0.333333:10:10:22:16:10:10:22:18
chr18	33706614	.	C	G	885.67	PASS	AF=1;AO=57;DP=59;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0250837;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.85;QD=58.077;RBI=0.0651195;REFB=0;REVB=0.0600946;RO=1;SAF=32;SAR=25;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0184904;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.35012e-05;OID=.;OPOS=33706614;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:61:1:0:57:61:1:25:32:0:1:29:32:0:0
chr18	33721325	.	C	T	63.01	PASS	AF=0.3;AO=9;DP=30;FAO=9;FDP=30;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=16;FSRR=5;FWDB=-0.00465026;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.103;QD=8.40199;RBI=0.0237934;REFB=-0.0118403;REVB=-0.0233345;RO=21;SAF=7;SAR=2;SRF=16;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0254235;STB=0.515754;STBP=0.986;TYPE=snp;VARB=0.0252892;OID=.;OPOS=33721325;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:30:30:21:21:9:9:0.3:2:7:16:5:2:7:16:5
chr18	33754507	.	A	G	229.23	PASS	AF=0.677419;AO=21;DP=31;FAO=21;FDP=31;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=-0.0170526;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.5784;QD=29.5783;RBI=0.0353297;REFB=-0.0162224;REVB=-0.0309418;RO=10;SAF=5;SAR=16;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.247492;STB=0.637539;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=0.0241063;OID=.;OPOS=33754507;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:31:31:10:10:21:21:0.677419:16:5:6:4:16:5:6:4
chr18	33779821	.	C	A	817.71	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0109003;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.358;QD=57.3832;RBI=0.0167434;REFB=0;REVB=-0.0127093;RO=0;SAF=26;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.19358e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000113267;OID=.;OPOS=33779821;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:31:26:0:0:31:26:0:0
chr18	33779855	.	C	T	698.62	PASS	AF=0.980392;AO=48;DP=50;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00405084;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=113.639;QD=54.7936;RBI=0.0249232;REFB=-0.130295;REVB=0.0245917;RO=1;SAF=23;SAR=25;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.018447;STB=0.509087;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.000796419;OID=.;OPOS=33779855;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:50:51:1:1:48:50:0.980392:25:23:0:1:27:23:0:1
chr18	33779896	.	A	G	575.79	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.029365;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.207;QD=60.6099;RBI=0.0293817;REFB=0;REVB=0.000990307;RO=0;SAF=21;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.53998e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000116107;OID=.;OPOS=33779896;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:17:21:0:0:17:21:0:0
chr18	33780020	.	A	G	386.7	PASS	AF=1;AO=24;DP=29;FAO=28;FDP=28;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00930637;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.8977;QD=55.2435;RBI=0.0289497;REFB=0;REVB=-0.027413;RO=0;SAF=13;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000145233;OID=.;OPOS=33780020;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:28:0:0:24:28:1:11:13:0:0:13:15:0:0
chr18	33785093	.	G	A	575.8	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0101976;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.366;QD=60.6103;RBI=0.0120825;REFB=0;REVB=-0.00648048;RO=0;SAF=22;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.59525e-06;OID=.;OPOS=33785093;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:16:22:0:0:16:22:0:0
chr18	33785185	.	A	G	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00125425;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.719;QD=52.6132;RBI=0.00485056;REFB=0;REVB=0.00468559;RO=0;SAF=13;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2029e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.58559e-05;OID=.;OPOS=33785185;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:9:13:0:0:9:13:0:0
chr18	34205551	.	C	T	791.95	PASS	AF=0.657407;AO=71;DP=109;FAO=71;FDP=108;FR=.;FRO=37;FSAF=33;FSAR=38;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=0.0210286;FXX=0.00917347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.777;QD=29.3314;RBI=0.0210321;REFB=-0.0284153;REVB=-0.000383193;RO=36;SAF=33;SAR=38;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0220102;STB=0.516732;STBP=0.639;TYPE=snp;VARB=0.0160963;OID=.;OPOS=34205551;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:108:36:37:71:71:0.657407:38:33:18:18:38:33:19:18
chr18	34289228	.	GA	G	43.98	PASS	AF=0.4;AO=13;DP=26;FAO=10;FDP=25;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=13;FWDB=-0.1014;FXX=0.0384468;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.6151;QD=7.03751;RBI=0.102393;REFB=-0.0924111;REVB=-0.0142248;RO=11;SAF=7;SAR=6;SRF=1;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.355888;STB=0.760769;STBP=0.071;TYPE=del;VARB=0.111976;OID=.;OPOS=34289229;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.4:13:26:10:25:15:6:4:2:13:43:11:7:6:1:10
chr18	34850846	.	G	A	30.5	PASS	AF=0.454545;AO=5;DP=11;FAO=5;FDP=11;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.0300165;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.203;QD=11.0923;RBI=0.0386579;REFB=0.00795185;REVB=-0.0243607;RO=6;SAF=3;SAR=2;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.369772;STB=0.723349;STBP=0.278;TYPE=snp;VARB=-0.0168876;OID=.;OPOS=34850846;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:11:11:6:6:5:5:0.454545:2:3:1:5:2:3:1:5
chr18	39761310	.	A	G	562.27	PASS	AF=0.906977;AO=39;DP=43;FAO=39;FDP=43;FR=.;FRO=4;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.00978311;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.471;QD=52.3043;RBI=0.0106912;REFB=-0.223443;REVB=-0.00431195;RO=3;SAF=19;SAR=20;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0684464;STB=0.547595;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=0.0051834;OID=.;OPOS=39761310;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:43:43:3:4:39:39:0.906977:20:19:3:0:20:19:4:0
chr18	39761342	.	C	T	129.42	PASS	AF=0.375;AO=15;DP=40;FAO=15;FDP=40;FR=.;FRO=25;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.0142736;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.425;QD=12.9421;RBI=0.0177222;REFB=-0.00182778;REVB=-0.0105043;RO=25;SAF=10;SAR=5;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.16369;STB=0.596359;STBP=0.378;TYPE=snp;VARB=0.00258016;OID=.;OPOS=39761342;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:25:25:15:15:0.375:5:10:13:12:5:10:13:12
chr18	40323497	.	G	T	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00609413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.339;QD=40.7629;RBI=0.00642512;REFB=0;REVB=0.00203563;RO=0;SAF=4;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.5949e-05;OID=.;OPOS=40323497;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:6:4:0:0:6:4:0:0
chr18	42532606	.	G	A	109.48	PASS	AF=0.242857;AO=17;DP=71;FAO=17;FDP=70;FR=.;FRO=53;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=26;FSRR=27;FWDB=-0.031576;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.951;QD=6.25569;RBI=0.0334104;REFB=-0.00400744;REVB=0.0109185;RO=53;SAF=6;SAR=11;SRF=26;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172574;STB=0.606768;STBP=0.374;TYPE=snp;VARB=0.0135578;OID=.;OPOS=42532606;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:70:53:53:17:17:0.242857:11:6:26:27:11:6:26:27
chr18	42533130	.	A	G	805.19	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00127249;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.593;QD=64.4151;RBI=0.0207757;REFB=0;REVB=0.0207367;RO=0;SAF=16;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.14921e-05;OID=.;OPOS=42533130;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:34:16:0:0:34:16:0:0
chr18	43206985	.	A	G	1157.44	PASS	AF=0.987179;AO=77;DP=78;FAO=77;FDP=78;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.035665;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.787;QD=59.3559;RBI=0.0387863;REFB=-0.0266088;REVB=-0.0152443;RO=1;SAF=38;SAR=39;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0119811;STB=0.506327;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=3.35852e-05;OID=.;OPOS=43206985;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:78:78:1:1:77:77:0.987179:39:38:0:1:39:38:0:1
chr18	43262359	.	G	A	377.83	PASS	AF=0.686275;AO=34;DP=50;FAO=35;FDP=51;FR=.;FRO=16;FSAF=12;FSAR=23;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=0.0351539;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.0173;QD=29.6338;RBI=0.0356104;REFB=-0.0655908;REVB=-0.00568357;RO=15;SAF=11;SAR=23;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0370866;STB=0.510632;STBP=0.852;TYPE=snp;VARB=0.0308873;OID=.;OPOS=43262359;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:51:15:16:34:35:0.686275:23:11:4:11:23:12:5:11
chr18	43307246	.	C	T	144.31	PASS	AF=0.432432;AO=16;DP=37;FAO=16;FDP=37;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=-0.00359495;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.943;QD=15.6008;RBI=0.0496013;REFB=-0.0179407;REVB=-0.0494708;RO=21;SAF=11;SAR=5;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0235652;STB=0.513601;STBP=0.886;TYPE=snp;VARB=0.0207111;OID=.;OPOS=43307246;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:21:21:16:16:0.432432:5:11:14:7:5:11:14:7
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chr18	44135143	.	T	C	389.75	PASS	AF=0.541667;AO=39;DP=72;FAO=39;FDP=72;FR=.;FRO=33;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=0.016048;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.728;QD=21.6529;RBI=0.0167346;REFB=-0.0116975;REVB=0.00474443;RO=32;SAF=22;SAR=17;SRF=12;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153754;STB=0.591184;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=0.0141536;OID=.;OPOS=44135143;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:32:33:39:39:0.541667:17:22:12:20:17:22:12:21
chr18	44560300	.	C	T	175.67	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0114049;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.1628;QD=46.8452;RBI=0.0187834;REFB=0;REVB=-0.0149246;RO=0;SAF=11;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33019e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.45401e-05;OID=.;OPOS=44560300;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:4:11:0:0:4:11:0:0
chr18	44560429	.	C	A	429.01	PASS	AF=1;AO=25;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0019877;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.649;QD=57.2006;RBI=0.0440339;REFB=0;REVB=0.043989;RO=0;SAF=15;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000278012;OID=.;OPOS=44560429;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:25:30:1:10:15:0:0:15:15:0:0
chr18	44560875	.	C	A	1108.27	PASS	AF=0.986667;AO=75;DP=75;FAO=74;FDP=75;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0264533;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.853;QD=59.1078;RBI=0.0288946;REFB=-0.0903285;REVB=0.0116241;RO=0;SAF=32;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507934;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.000606291;OID=.;OPOS=44560875;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:75:75:0:1:75:74:0.986667:43:32:0:0:43:31:1:0
chr18	44561100	.	C	G	144.5	PASS	AF=1;AO=12;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0386483;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.5067;QD=44.4626;RBI=0.0495996;REFB=0;REVB=0.0310875;RO=1;SAF=7;SAR=5;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0601692;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000359694;OID=.;OPOS=44561100;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:1:0:12:13:1:5:7:1:0:5:8:0:0
chr18	44561795	.	C	T	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0207564;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.9189;QD=47.8218;RBI=0.0399121;REFB=0;REVB=-0.0340903;RO=0;SAF=6;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000371599;OID=.;OPOS=44561795;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:10:6:0:0:10:6:0:0
chr18	44585955	.	G	A	80.12	PASS	AF=0.555556;AO=9;DP=17;FAO=10;FDP=18;FR=.;FRO=8;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0122815;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.754;QD=17.8043;RBI=0.0172299;REFB=0.00581031;REVB=0.0120845;RO=8;SAF=6;SAR=3;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14199;STB=0.597357;STBP=0.416;TYPE=snp;VARB=-0.00518775;OID=.;OPOS=44585955;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:17:18:8:8:9:10:0.555556:3:6:4:4:3:7:4:4
chr18	44593458	.	T	G	118.7	PASS	AF=0.278689;AO=17;DP=61;FAO=17;FDP=61;FR=.;FRO=44;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=27;FWDB=0.00570489;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.9259;QD=7.78353;RBI=0.00594791;REFB=0.0388118;REVB=-0.00168279;RO=44;SAF=9;SAR=8;SRF=17;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.16993;STB=0.602178;STBP=0.329;TYPE=snp;VARB=-0.0919243;OID=.;OPOS=44593458;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:44:44:17:17:0.278689:8:9:17:27:8:9:17:27
chr18	44610718	.	T	C	135.87	PASS	AF=0.321429;AO=18;DP=56;FAO=18;FDP=56;FR=.;FRO=38;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=0.00231855;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=264.956;QD=9.70527;RBI=0.00428265;REFB=-0.00802748;REVB=0.00360075;RO=37;SAF=14;SAR=4;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.36038;STB=0.723873;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.01679;OID=.;OPOS=44610718;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:37:38:18:18:0.321429:4:14:18:19:4:14:18:20
chr18	44626630	.	T	G	62.39	PASS	AF=0.28125;AO=9;DP=32;FAO=9;FDP=32;FR=.;FRO=23;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=-0.0224222;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.548;QD=7.79847;RBI=0.028747;REFB=-0.0127377;REVB=-0.0179898;RO=22;SAF=3;SAR=6;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.244319;STB=0.637985;STBP=0.353;TYPE=snp;VARB=0.029781;OID=.;OPOS=44626630;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:32:32:22:23:9:9:0.28125:6:3:12:10:6:3:12:11
chr18	45555829	.	T	C	195.14	PASS	AF=0.387097;AO=24;DP=62;FAO=24;FDP=62;FR=.;FRO=38;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=26;FSRR=12;FWDB=-0.0753458;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.4714;QD=12.5895;RBI=0.0822766;REFB=0.00425093;REVB=-0.0330524;RO=38;SAF=11;SAR=13;SRF=26;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.238412;STB=0.636136;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=-0.0101483;OID=.;OPOS=45555829;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:38:38:24:24:0.387097:13:11:26:12:13:11:26:12
chr18	45566276	.	G	A	43.41	PASS	AF=0.233333;AO=7;DP=30;FAO=7;FDP=30;FR=.;FRO=23;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.0179438;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=295.059;QD=5.78797;RBI=0.0225847;REFB=-0.0082561;REVB=0.0137145;RO=23;SAF=4;SAR=3;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109374;STB=0.571225;STBP=0.716;TYPE=snp;VARB=0.0301202;OID=.;OPOS=45566276;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:30:30:23:23:7:7:0.233333:3:4:11:12:3:4:11:12
chr18	45696158	.	G	A	141.02	PASS	AF=1;AO=12;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0311636;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.521;QD=43.3915;RBI=0.0313448;REFB=0;REVB=-0.00336555;RO=0;SAF=1;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.23983e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000157422;OID=.;OPOS=45696158;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:12:13:1:11:1:0:0:12:1:0:0
chr18	45696204	.	T	C	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0462548;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.29;QD=48.7365;RBI=0.0535513;REFB=0;REVB=-0.0269859;RO=0;SAF=3;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.53656e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00018156;OID=.;OPOS=45696204;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:14:3:0:0:14:3:0:0
chr18	45696255	.	CA	CG,TG	283.47	PASS	AF=0.909091,0.0909091;AO=20,2;DP=22;FAO=20,2;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=8,0;FSAR=12,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0119171,-0.00942478;FXX=0;HRUN=2,1;LEN=1,2;MLLD=208.154,140.802;QD=51.5407;RBI=0.030213,0.00948919;REFB=0,0;REVB=0.0277635,0.0011037;RO=0;SAF=8,0;SAR=12,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=-0.00109546,0.0183737;OID=.,.;OPOS=45696256,45696255;OREF=A,CA;OALT=G,TG;OMAPALT=CG,TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:22:22:0:0:20,2:20,2:0.909091,0.0909091:12,2:8,0:0:0:12,2:8,0:0:0
chr18	45711740	.	T	C	120.43	PASS	AF=0.301887;AO=15;DP=52;FAO=16;FDP=53;FR=.;FRO=37;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=-0.0088186;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.224;QD=9.08894;RBI=0.0155605;REFB=-0.0110407;REVB=0.0128204;RO=37;SAF=10;SAR=5;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123825;STB=0.590675;STBP=0.405;TYPE=snp;VARB=0.0297849;OID=.;OPOS=45711740;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:53:37:37:15:16:0.301887:5:10:21:16:5:11:21:16
chr18	46001932	.	A	G	538.73	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0106883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.815;QD=59.8585;RBI=0.0198384;REFB=0;REVB=-0.0167129;RO=0;SAF=15;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.16012e-05;OID=.;OPOS=46001932;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:36:0:0:35:36:1:20:15:0:0:20:16:0:0
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chr18	47563299	.	T	C	483.34	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.014699;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.8884;QD=58.5868;RBI=0.01499;REFB=0;REVB=0.00293949;RO=0;SAF=10;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000352149;OID=.;OPOS=47563299;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:23:10:0:0:23:10:0:0
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chr18	48190440	.	G	A	218.86	PASS	AF=0.307692;AO=28;DP=91;FAO=28;FDP=91;FR=.;FRO=63;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=32;FSRR=31;FWDB=-0.0240079;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.2798;QD=9.62001;RBI=0.0407851;REFB=-0.018248;REVB=0.0329704;RO=63;SAF=15;SAR=13;SRF=32;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0327578;STB=0.519262;STBP=0.812;TYPE=snp;VARB=0.043469;OID=.;OPOS=48190440;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:63:63:28:28:0.307692:13:15:32:31:13:15:32:31
chr18	48327815	.	G	A	514.61	PASS	AF=0.676471;AO=46;DP=67;FAO=46;FDP=68;FR=.;FRO=22;FSAF=27;FSAR=19;FSRF=6;FSRR=16;FWDB=0.0157934;FXX=0.0144907;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.811;QD=30.271;RBI=0.0176885;REFB=-0.0055639;REVB=0.00796574;RO=21;SAF=27;SAR=19;SRF=5;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20039;STB=0.601101;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.00283109;OID=.;OPOS=48327815;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:68:21:22:46:46:0.676471:19:27:5:16:19:27:6:16
chr18	48331553	.	T	C	45.74	PASS	AF=0.145455;AO=8;DP=55;FAO=8;FDP=55;FR=.;FRO=47;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=23;FSRR=24;FWDB=0.0360527;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.7124;QD=3.32654;RBI=0.036058;REFB=-0.0134951;REVB=-0.000622296;RO=47;SAF=3;SAR=5;SRF=23;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139846;STB=0.598828;STBP=0.582;TYPE=snp;VARB=0.0958678;OID=.;OPOS=48331553;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:55:55:47:47:8:8:0.145455:5:3:23:24:5:3:23:24
chr18	48333203	.	C	G	645.9	PASS	AF=1;AO=42;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0317378;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.917;QD=60.0832;RBI=0.0518163;REFB=-0.0141413;REVB=0.040959;RO=1;SAF=20;SAR=22;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0228919;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000280422;OID=.;OPOS=48333203;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:43:43:1:0:42:43:1:22:20:1:0:22:21:0:0
chr18	48346026	.	A	G	574.97	PASS	AF=0.694444;AO=50;DP=72;FAO=50;FDP=72;FR=.;FRO=22;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.006413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.414;QD=31.9426;RBI=0.00938582;REFB=-0.0213451;REVB=0.00685326;RO=22;SAF=27;SAR=23;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0226993;STB=0.512272;STBP=0.765;TYPE=snp;VARB=0.00861525;OID=.;OPOS=48346026;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:22:22:50:50:0.694444:23:27:11:11:23:27:11:11
chr18	48577782	.	G	C	342.57	PASS	AF=0.725;AO=28;DP=39;FAO=29;FDP=40;FR=.;FRO=11;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=2;FWDB=-0.00705375;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.463;QD=34.2566;RBI=0.032445;REFB=-0.0151514;REVB=0.031669;RO=11;SAF=14;SAR=14;SRF=9;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164884;STB=0.591705;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.010065;OID=.;OPOS=48577782;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:81:39:40:11:11:28:29:0.725:14:14:9:2:15:14:9:2
chr18	48578991	.	AT	A,TA,TT	43.81	PASS	AF=0.313725,0,0;AO=15,2,2;DP=52;FAO=16,0,0;FDP=51;FR=.;FRO=35;FSAF=3,0,0;FSAR=13,0,0;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=0.126092,0.129844,0.0169037;FXX=0.0377287;HRUN=7,1,1;LEN=1,2,1;MLLD=10.1938,16.794,229.104;QD=3.43572;RBI=0.149226,0.129926,0.0195336;REFB=-0.0547118,-0.0409564,0.000638574;REVB=-0.0798086,-0.00461643,0.00978912;RO=25;SAF=3,0,2;SAR=12,2,0;SRF=13;SRR=12;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.382059,-0.490704,0.47348;STB=0.719811,0.5,0.5;STBP=0.057,1,1;TYPE=del,mnp,snp;VARB=0.078172,0.0760339,0;OID=.,.,.;OPOS=48578992,48578991,48578991;OREF=T,AT,A;OALT=-,TA,T;OMAPALT=A,TA,TT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:52:51:25:35:15,2,2:16,0,0:0.313725,0,0:12,2,0:3,0,2:13:12:13,0,0:3,0,0:16:19
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chr18	48723217	.	C	T	397.34	PASS	AF=0.882353;AO=30;DP=34;FAO=30;FDP=34;FR=.;FRO=4;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0235379;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=216.063;QD=46.7462;RBI=0.0316969;REFB=-0.0214128;REVB=0.0212288;RO=3;SAF=20;SAR=10;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0618719;STB=0.521724;STBP=0.555;TYPE=snp;VARB=0.000366536;OID=.;OPOS=48723217;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:19:34:34:3:4:30:30:0.882353:10:20:1:2:10:20:2:2
chr18	49072801	.	C	T	217.8	PASS	AF=0.461538;AO=24;DP=51;FAO=24;FDP=52;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=-0.000950422;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.676;QD=16.7541;RBI=0.0098086;REFB=0.0127272;REVB=-0.00976245;RO=27;SAF=11;SAR=13;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0131253;STB=0.503223;STBP=0.965;TYPE=snp;VARB=-0.025923;OID=.;OPOS=49072801;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:52:27:28:24:24:0.461538:13:11:12:15:13:11:13:15
chr18	49867224	.	T	C	2351.13	PASS	AF=1;AO=146;DP=147;FAO=147;FDP=147;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.042591;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.809;QD=63.9764;RBI=0.0426375;REFB=0;REVB=-0.00199201;RO=0;SAF=65;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.00316e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.64882e-05;OID=.;OPOS=49867224;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:147:147:0:0:146:147:1:81:65:0:0:82:65:0:0
chr18	50432602	.	C	G	807.64	PASS	AF=0.966667;AO=58;DP=60;FAO=58;FDP=60;FR=.;FRO=2;FSAF=32;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0338954;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.8416;QD=53.8425;RBI=0.0344602;REFB=-0.00663878;REVB=0.00621341;RO=1;SAF=32;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0145145;STB=0.501742;STBP=0.87;TYPE=snp;VARB=0.000904209;OID=.;OPOS=50432602;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:60:60:1:2:58:58:0.966667:26:32:1:0:26:32:1:1
chr18	50866236	.	G	A	102.56	PASS	AF=0.217949;AO=16;DP=77;FAO=17;FDP=78;FR=.;FRO=61;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=22;FSRR=39;FWDB=-0.0499364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.462;QD=5.25938;RBI=0.0572956;REFB=-0.00905542;REVB=0.0280916;RO=59;SAF=7;SAR=9;SRF=22;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0832222;STB=0.587058;STBP=0.451;TYPE=snp;VARB=0.0307274;OID=.;OPOS=50866236;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:78:59:61:16:17:0.217949:9:7:22:37:9:8:22:39
chr18	50936994	.	T	C	1226.35	PASS	AF=1;AO=78;DP=79;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0236696;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.897;QD=61.3173;RBI=0.0351171;REFB=0;REVB=0.0259415;RO=0;SAF=26;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.60598e-05;OID=.;OPOS=50936994;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:79:80:0:0:78:80:1:52:26:0:0:52:28:0:0
chr18	50942653	.	C	T	1283.18	PASS	AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0064935;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.236;QD=61.8398;RBI=0.00692307;REFB=0;REVB=0.00240071;RO=0;SAF=46;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.12122e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.46443e-05;OID=.;OPOS=50942653;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:37:46:0:0:37:46:0:0
chr18	51795957	.	GCGACGACGAC	GCGACGAC,GCGACGACGA,GCGGCGACGAC	271.18	PASS	AF=0.531915,0.0638298,0;AO=19,8,3;DP=50;FAO=25,3,0;FDP=47;FR=.;FRO=19;FSAF=9,0,0;FSAR=16,3,0;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=0.0229943,0.036993,0.0156313;FXX=0.078416;HRUN=1,1,1;LEN=3,1,1;MLLD=157.288,31.2416,76.1846;QD=23.0795;RBI=0.0290782,0.0469417,0.0172163;REFB=-0.0503337,-0.136787,-0.0383878;REVB=0.0177989,-0.028897,-0.0072155;RO=9;SAF=9,0,2;SAR=10,8,1;SRF=5;SRR=4;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.0475086,-0.788558,0.123106;STB=0.503934,0.99548,0.5;STBP=0.968,0.142,1;TYPE=del,del,snp;VARB=0.0317823,0.274805,0;OID=.,.,.;OPOS=51795958,51795967,51795960;OREF=CGA,C,A;OALT=-,-,G;OMAPALT=GCGACGAC,GCGACGACGA,GCGGCGACGAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.531915,0.0638298,0:19,8,3:50:25,3,0:47:19:9,0,0:16,3,0:7:12:99:9:9,0,2:10,8,1:5:4
chr18	51820805	.	G	A	132.15	PASS	AF=0.636364;AO=14;DP=22;FAO=14;FDP=22;FR=.;FRO=8;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=0.0383541;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.115;QD=24.0275;RBI=0.0455771;REFB=-0.0244463;REVB=0.0246218;RO=8;SAF=7;SAR=7;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.24425;STB=0.636183;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=0.0160376;OID=.;OPOS=51820805;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:22:22:8:8:14:14:0.636364:7:7:1:7:7:7:1:7
chr18	52265308	.	A	C	465.1	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0114582;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.949;QD=58.1375;RBI=0.0147616;REFB=0;REVB=-0.00930668;RO=0;SAF=11;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00043404;OID=.;OPOS=52265308;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:21:11:0:0:21:11:0:0
chr18	52570281	.	G	A	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0284755;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.338;QD=51.9167;RBI=0.0527933;REFB=0;REVB=0.0444553;RO=0;SAF=11;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.54071e-05;OID=.;OPOS=52570281;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:10:11:0:0:10:11:0:0
chr18	52570345	.	C	A	67.91	PASS	AF=0.409091;AO=9;DP=23;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.020295;FXX=0.0434594;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.92;QD=12.3466;RBI=0.0252548;REFB=-0.00377022;REVB=0.0150306;RO=14;SAF=4;SAR=5;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0163296;STB=0.510181;STBP=0.951;TYPE=snp;VARB=0.0042519;OID=.;OPOS=52570345;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:23:22:14:13:9:9:0.409091:5:4:6:8:5:4:6:7
chr18	52605188	.	C	T	158.24	PASS	AF=0.833333;AO=15;DP=18;FAO=15;FDP=18;FR=.;FRO=3;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0567172;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.6013;QD=35.1651;RBI=0.0567289;REFB=0.0443618;REVB=0.00115204;RO=3;SAF=4;SAR=11;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0253526;STB=0.514;STBP=0.874;TYPE=snp;VARB=-0.0101161;OID=.;OPOS=52605188;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:18:18:3:3:15:15:0.833333:11:4:1:2:11:4:1:2
chr18	53177774	.	G	C	330.44	PASS	AF=0.961538;AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0510011;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.219;QD=50.8362;RBI=0.0513813;REFB=0.00158844;REVB=-0.0062397;RO=1;SAF=17;SAR=8;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.026521;STB=0.514274;STBP=0.603;TYPE=snp;VARB=-0.0177547;OID=.;OPOS=53177774;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:26:26:1:1:25:25:0.961538:8:17:1:0:8:17:1:0
chr18	53303101	.	C	G	834.16	PASS	AF=1;AO=32;DP=58;FAO=57;FDP=57;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=26;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00238374;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.957;QD=58.5376;RBI=0.123418;REFB=0;REVB=0.123395;RO=0;SAF=26;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000281946;OID=.;OPOS=53303101;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:57:0:0:32:57:1:6:26:0:0:31:26:0:0
chr18	54339818	.	C	G	1161.4	PASS	AF=0.975;AO=78;DP=79;FAO=78;FDP=80;FR=.;FRO=2;FSAF=49;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0124151;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.0309;QD=58.07;RBI=0.0172525;REFB=-0.0961797;REVB=0.0119797;RO=1;SAF=49;SAR=29;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0160409;STB=0.503424;STBP=0.776;TYPE=snp;VARB=0.0213494;OID=.;OPOS=54339818;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:79:80:1:2:78:78:0.975:29:49:0:1:29:49:1:1
chr18	54448778	.	G	A	785.73	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0217187;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.479;QD=64.1415;RBI=0.140881;REFB=0;REVB=0.139197;RO=0;SAF=35;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.22152e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000445593;OID=.;OPOS=54448778;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:14:35:0:0:14:35:0:0
chr18	54815025	.	G	T	340.89	PASS	AF=0.818182;AO=27;DP=34;FAO=27;FDP=33;FR=.;FRO=6;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.00770929;FXX=0.0294031;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.2213;QD=41.3199;RBI=0.0298951;REFB=-0.000927658;REVB=0.028884;RO=6;SAF=9;SAR=18;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000626928;OID=.;OPOS=54815025;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:34:33:6:6:27:27:0.818182:18:9:2:4:18:9:2:4
chr18	55144045	.	G	A	34.43	PASS	AF=0.1875;AO=6;DP=32;FAO=6;FDP=32;FR=.;FRO=26;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.00734735;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.5805;QD=4.30361;RBI=0.00741725;REFB=0.00228486;REVB=-0.00101592;RO=26;SAF=3;SAR=3;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0455768;STB=0.531146;STBP=0.902;TYPE=snp;VARB=-0.0182132;OID=.;OPOS=55144045;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:32:32:26:26:6:6:0.1875:3:3:12:14:3:3:12:14
chr18	55144748	.	G	A	87.38	PASS	AF=0.21875;AO=14;DP=64;FAO=14;FDP=64;FR=.;FRO=50;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=27;FSRR=23;FWDB=-0.00142433;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.876;QD=5.46148;RBI=0.0174517;REFB=-0.00360924;REVB=0.0173935;RO=50;SAF=7;SAR=7;SRF=27;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.04944;STB=0.531206;STBP=0.81;TYPE=snp;VARB=0.0112106;OID=.;OPOS=55144748;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:64:64:50:50:14:14:0.21875:7:7:27:23:7:7:27:23
chr18	55145377	.	G	A	44.79	PASS	AF=0.291667;AO=7;DP=24;FAO=7;FDP=24;FR=.;FRO=17;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=-0.0391541;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.501;QD=7.46508;RBI=0.0460869;REFB=-0.00616293;REVB=-0.0243097;RO=17;SAF=3;SAR=4;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.241432;STB=0.650753;STBP=0.379;TYPE=snp;VARB=0.00819118;OID=.;OPOS=55145377;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:24:24:17:17:7:7:0.291667:4:3:11:6:4:3:11:6
chr18	55145575	.	C	G	733.98	PASS	AF=0.979167;AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=48;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0221412;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.7026;QD=61.1647;RBI=0.0576096;REFB=-0.120822;REVB=0.0531849;RO=0;SAF=23;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.510634;STBP=0.547;TYPE=snp;VARB=0.0045483;OID=.;OPOS=55145575;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:48:48:0:1:47:47:0.979167:24:23:0:0:24:23:1:0
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chr18	55145906	.	C	T	430.5	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0646044;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.5603;QD=57.4003;RBI=0.0646323;REFB=0;REVB=0.0018981;RO=0;SAF=17;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.63861e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.9664e-05;OID=.;OPOS=55145906;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:13:17:0:0:13:17:0:0
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chr18	55153371	.	T	C	70.5	PASS	AF=0.25;AO=10;DP=40;FAO=10;FDP=40;FR=.;FRO=30;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=10;FWDB=-0.0171033;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.492;QD=7.04964;RBI=0.0172644;REFB=-0.00264416;REVB=0.00235326;RO=29;SAF=2;SAR=8;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.520359;STB=0.829572;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.00915265;OID=.;OPOS=55153371;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:70:40:40:29:30:10:10:0.25:8:2:19:10:8:2:20:10
chr18	55154066	.	A	G	558.0	PASS	AF=0.662162;AO=49;DP=76;FAO=49;FDP=74;FR=.;FRO=25;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=0.00825882;FXX=0.038956;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.476;QD=30.1621;RBI=0.0092615;REFB=0.00221087;REVB=0.00419133;RO=23;SAF=20;SAR=29;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0424046;STB=0.511081;STBP=0.798;TYPE=snp;VARB=-0.00103181;OID=.;OPOS=55154066;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:74:23:25:49:49:0.662162:29:20:11:12:29:20:11:14
chr18	55155489	.	A	G	984.55	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00770234;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=231.25;QD=58.7792;RBI=0.00775842;REFB=0;REVB=-0.000931203;RO=0;SAF=38;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.00839e-05;OID=.;OPOS=55155489;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:29:38:0:0:29:38:0:0
chr18	55155711	.	C	G	103.88	PASS	AF=0.393939;AO=13;DP=33;FAO=13;FDP=33;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=-0.0076552;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.249;QD=12.5915;RBI=0.00792719;REFB=0.00940889;REVB=0.00205871;RO=20;SAF=7;SAR=6;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.193058;STB=0.612735;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=-0.00932196;OID=.;OPOS=55155711;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:20:20:13:13:0.393939:6:7:7:13:6:7:7:13
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chr18	55362532	.	T	G	731.22	PASS	AF=1;AO=51;DP=52;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0358054;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=286.906;QD=55.1864;RBI=0.0411325;REFB=-0.0323283;REVB=0.0202447;RO=1;SAF=24;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0192158;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00024508;OID=.;OPOS=55362532;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:52:53:1:0:51:53:1:27:24:1:0:27:26:0:0
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chr18	56148796	.	A	G	152.97	PASS	AF=0.933333;AO=14;DP=15;FAO=14;FDP=15;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0275827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.837;QD=40.7917;RBI=0.033543;REFB=-0.126724;REVB=-0.0190874;RO=1;SAF=6;SAR=8;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0534678;STB=0.52937;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.00107217;OID=.;OPOS=56148796;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:15:15:1:1:14:14:0.933333:8:6:0:1:8:6:0:1
chr18	56149099	.	T	C	753.44	PASS	AF=0.979592;AO=48;DP=49;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0337813;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.41;QD=61.5056;RBI=0.0339948;REFB=-0.0887295;REVB=0.00380417;RO=0;SAF=21;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.511623;STBP=0.342;TYPE=snp;VARB=0.000764809;OID=.;OPOS=56149099;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:49:49:0:1:48:48:0.979592:27:21:0:0:27:21:1:0
chr18	56202418	.	T	C	81.93	PASS	AF=0.9;AO=9;DP=10;FAO=9;FDP=10;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0790313;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=65.5412;QD=32.7701;RBI=0.0963093;REFB=0.169636;REVB=0.0550411;RO=1;SAF=3;SAR=6;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0684198;STB=0.538378;STBP=0.622;TYPE=snp;VARB=-0.0224688;OID=.;OPOS=56202418;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:10:10:1:1:9:9:0.9:6:3:0:1:6:3:0:1
chr18	56204489	.	C	G	523.64	PASS	AF=0.844444;AO=38;DP=45;FAO=38;FDP=45;FR=.;FRO=7;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.0148227;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.9429;QD=46.5457;RBI=0.0429727;REFB=0.0107174;REVB=-0.0403353;RO=7;SAF=18;SAR=20;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0283266;STB=0.515215;STBP=0.634;TYPE=snp;VARB=-0.00292511;OID=.;OPOS=56204489;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:40:45:45:7:7:38:38:0.844444:20:18:4:3:20:18:4:3
chr18	56246439	.	CTTT	CTT,CTTC	738.18	PASS	AF=0.0208333,0.979167;AO=16,25;DP=48;FAO=1,47;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=0,29;FSAR=1,18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.124259,0.163644;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=25.1266,30.56;QD=61.5148;RBI=0.168935,0.230675;REFB=0,0;REVB=-0.114449,-0.162578;RO=0;SAF=14,11;SAR=2,14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-3.99383e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0427465,0.0157073;OID=.,.;OPOS=56246440,56246442;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=CTT,CTTC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0208333,0.979167:16,25:48:1,47:48:0:0,29:1,18:0:0:8:0:14,11:2,14:0:0
chr18	56247180	.	T	C	393.32	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0734828;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.187;QD=56.1886;RBI=0.0785506;REFB=0;REVB=0.0277574;RO=0;SAF=13;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00102937;OID=.;OPOS=56247180;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:15:13:0:0:15:13:0:0
chr18	56247567	.	A	G	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0438308;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.21;QD=55.0986;RBI=0.0440375;REFB=0;REVB=-0.00426244;RO=0;SAF=10;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.71087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000158656;OID=.;OPOS=56247567;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:16:10:0:0:16:10:0:0
chr18	56247600	.	C	A	272.91	PASS	AF=0.916667;AO=22;DP=24;FAO=22;FDP=24;FR=.;FRO=2;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00445744;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=201.83;QD=45.4844;RBI=0.0344901;REFB=0.0119185;REVB=-0.0342009;RO=2;SAF=14;SAR=8;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102305;STB=0.555504;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=-0.000336832;OID=.;OPOS=56247600;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:24:24:2:2:22:22:0.916667:8:14:0:2:8:14:0:2
chr18	56279025	.	T	G	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0172701;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=256.241;QD=51.9167;RBI=0.0191335;REFB=0;REVB=0.00823608;RO=0;SAF=12;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.20187e-05;OID=.;OPOS=56279025;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:9:12:0:0:9:12:0:0
chr18	56415236	.	A	G	354.05	PASS	AF=0.625;AO=30;DP=48;FAO=30;FDP=48;FR=.;FRO=18;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.00794483;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.501;QD=29.5043;RBI=0.0131622;REFB=0.010323;REVB=0.010494;RO=17;SAF=19;SAR=11;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111503;STB=0.55229;STBP=0.365;TYPE=snp;VARB=-0.00670243;OID=.;OPOS=56415236;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:17:18:30:30:0.625:11:19:8:9:11:19:9:9
chr18	56593521	.	T	G	268.99	PASS	AF=0.615385;AO=24;DP=39;FAO=24;FDP=39;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.044651;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.9633;QD=27.5888;RBI=0.0449988;REFB=0.0125471;REVB=0.00558387;RO=14;SAF=7;SAR=17;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155385;STB=0.602747;STBP=0.114;TYPE=snp;VARB=-0.00494024;OID=.;OPOS=56593521;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:14:15:24:24:0.615385:17:7:7:7:17:7:8:7
chr18	56651227	.	G	A	53.24	PASS	AF=0.160714;AO=9;DP=56;FAO=9;FDP=56;FR=.;FRO=47;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=27;FSRR=20;FWDB=-0.000306902;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.491;QD=3.80251;RBI=0.0233367;REFB=-0.00644694;REVB=0.0233347;RO=46;SAF=5;SAR=4;SRF=27;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0392369;STB=0.516093;STBP=0.922;TYPE=snp;VARB=0.0415598;OID=.;OPOS=56651227;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:56:56:46:47:9:9:0.160714:4:5:27:19:4:5:27:20
chr18	56887507	.	C	A	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.044498;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.089;QD=45.8068;RBI=0.060206;REFB=0;REVB=0.0405548;RO=0;SAF=5;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000885671;OID=.;OPOS=56887507;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:9:5:0:0:9:5:0:0
chr18	57640352	.	C	CAA	273.63	PASS	AF=1;AO=22;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0415642;FXX=0;HRUN=4;LEN=2;MLLD=28.8241;QD=42.0971;RBI=0.0974076;REFB=-0.11381;REVB=-0.0880946;RO=1;SAF=12;SAR=10;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0369717;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00310158;OID=.;OPOS=57640353;OREF=-;OALT=AA;OMAPALT=CAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:22:26:26:26:0:14:12:0:0:4:1:12:10:1:0
chr18	59166541	.	C	T	61.53	PASS	AF=0.257143;AO=9;DP=35;FAO=9;FDP=35;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=0.00753972;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.451;QD=7.0322;RBI=0.0165904;REFB=-0.0144431;REVB=-0.0147781;RO=26;SAF=7;SAR=2;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.311238;STB=0.69952;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=0.0266676;OID=.;OPOS=59166541;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:35:35:26:26:9:9:0.257143:2:7:14:12:2:7:14:12
chr18	59170304	.	C	G	727.79	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00496364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.898;QD=63.2857;RBI=0.0362568;REFB=0;REVB=0.0359154;RO=0;SAF=25;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.85991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000187338;OID=.;OPOS=59170304;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:21:25:0:0:21:25:0:0
chr18	59482283	.	A	G	51.44	PASS	AF=0.222222;AO=8;DP=36;FAO=8;FDP=36;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=0.00532569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.162;QD=5.71532;RBI=0.108924;REFB=-0.00408554;REVB=0.108794;RO=27;SAF=6;SAR=2;SRF=18;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120118;STB=0.599733;STBP=0.612;TYPE=snp;VARB=0.0488177;OID=.;OPOS=59482283;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:51:36:36:27:28:8:8:0.222222:2:6:18:9:2:6:18:10
chr18	59805532	.	T	C	754.59	PASS	AF=0.981818;AO=54;DP=55;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0247031;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.1217;QD=54.8795;RBI=0.0252396;REFB=-0.00219333;REVB=0.0051764;RO=1;SAF=29;SAR=25;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0184775;STB=0.5098;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.000777301;OID=.;OPOS=59805532;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:55:55:1:1:54:54:0.981818:25:29:0:1:25:29:0:1
chr18	59807635	.	T	C	129.27	PASS	AF=0.583333;AO=13;DP=23;FAO=14;FDP=24;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.0048168;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.652;QD=21.5453;RBI=0.0272879;REFB=-0.0033138;REVB=-0.0268594;RO=9;SAF=3;SAR=10;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0972524;STB=0.549925;STBP=0.639;TYPE=snp;VARB=0.0012466;OID=.;OPOS=59807635;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:23:24:9:10:13:14:0.583333:10:3:3:6:11:3:3:7
chr18	59814268	.	G	A	310.39	PASS	AF=0.551724;AO=32;DP=58;FAO=32;FDP=58;FR=.;FRO=26;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=0.0192162;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.024;QD=21.4061;RBI=0.0227775;REFB=-0.00484513;REVB=0.0122292;RO=26;SAF=16;SAR=16;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0311413;STB=0.517231;STBP=0.787;TYPE=snp;VARB=0.00359462;OID=.;OPOS=59814268;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:26:26:32:32:0.551724:16:16:14:12:16:16:14:12
chr18	59814324	.	G	C	260.71	PASS	AF=0.571429;AO=24;DP=42;FAO=24;FDP=42;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.00924619;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.372;QD=24.8293;RBI=0.0119099;REFB=0.00367147;REVB=-0.00750693;RO=17;SAF=9;SAR=15;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118729;STB=0.555508;STBP=0.407;TYPE=snp;VARB=-0.00436326;OID=.;OPOS=59814324;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:17:18:24:24:0.571429:15:9:9:8:15:9:9:9
chr18	60027241	.	C	T	429.0	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0523469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.782;QD=57.1999;RBI=0.052704;REFB=0;REVB=0.0061247;RO=0;SAF=19;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000321579;OID=.;OPOS=60027241;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:11:19:0:0:11:19:0:0
chr18	60036083	.	A	G	432.94	PASS	AF=1;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0489326;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.337;QD=57.7249;RBI=0.0512393;REFB=0;REVB=0.0152009;RO=0;SAF=7;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000562299;OID=.;OPOS=60036083;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:30:0:0:30:30:1:23:7:0:0:23:7:0:0
chr18	60111488	.	G	A	366.61	PASS	AF=0.805556;AO=29;DP=36;FAO=29;FDP=36;FR=.;FRO=7;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=-0.0400539;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.9759;QD=40.7339;RBI=0.0527408;REFB=-0.00792623;REVB=-0.0343114;RO=7;SAF=9;SAR=20;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0724946;STB=0.539144;STBP=0.422;TYPE=snp;VARB=0.000405399;OID=.;OPOS=60111488;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:42:36:36:7:7:29:29:0.805556:20:9:1:6:20:9:1:6
chr18	60237388	.	A	G	613.17	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0124684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.2855;QD=61.3166;RBI=0.0399572;REFB=0;REVB=-0.037962;RO=0;SAF=20;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000304342;OID=.;OPOS=60237388;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:20:20:0:0:20:20:0:0
chr18	60241732	.	C	T	340.74	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0260377;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=249.968;QD=54.5176;RBI=0.0394054;REFB=0;REVB=0.0295775;RO=0;SAF=18;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000184878;OID=.;OPOS=60241732;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:7:18:0:0:7:18:0:0
chr18	60244856	.	A	G	1695.5	PASS	AF=1;AO=111;DP=111;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0155909;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.278;QD=60.5535;RBI=0.0182823;REFB=0;REVB=0.00954816;RO=0;SAF=58;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.30705e-05;OID=.;OPOS=60244856;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:111:112:0:0:111:112:1:53:58:0:0:53:59:0:0
chr18	60793444	.	G	A	338.5	PASS	AF=0.627451;AO=32;DP=51;FAO=32;FDP=51;FR=.;FRO=19;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=-0.0265848;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.374;QD=26.5493;RBI=0.0267098;REFB=-0.00310083;REVB=0.00258113;RO=19;SAF=18;SAR=14;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0480006;STB=0.526299;STBP=0.619;TYPE=snp;VARB=0.00152968;OID=.;OPOS=60793444;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:19:19:32:32:0.627451:14:18:12:7:14:18:12:7
chr18	60985879	.	T	C	43.07	PASS	AF=0.225806;AO=7;DP=31;FAO=7;FDP=31;FR=.;FRO=24;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.00080236;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.228;QD=5.55726;RBI=0.00991528;REFB=-0.0106785;REVB=-0.00988276;RO=24;SAF=3;SAR=4;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132954;STB=0.586909;STBP=0.623;TYPE=snp;VARB=0.0457614;OID=.;OPOS=60985879;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:31:31:24:24:7:7:0.225806:4:3:13:11:4:3:13:11
chr18	60995261	.	G	C	77.94	PASS	AF=0.454545;AO=10;DP=22;FAO=10;FDP=22;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=1;FWDB=0.027891;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.048;QD=14.17;RBI=0.029602;REFB=0.0105788;REVB=-0.00991821;RO=11;SAF=2;SAR=8;SRF=10;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.592515;STB=0.851844;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=-0.0199569;OID=.;OPOS=60995261;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:22:22:11:12:10:10:0.454545:8:2:10:1:8:2:11:1
chr18	61022791	.	C	T	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0155623;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.881;QD=56.1916;RBI=0.0251767;REFB=0;REVB=-0.0197909;RO=0;SAF=10;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.07364e-05;OID=.;OPOS=61022791;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:18:10:0:0:18:10:0:0
chr18	61151697	.	C	T	583.11	PASS	AF=0.87234;AO=41;DP=47;FAO=41;FDP=47;FR=.;FRO=6;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.00940672;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.618;QD=49.6264;RBI=0.00944016;REFB=0.0233603;REVB=0.000793905;RO=6;SAF=24;SAR=17;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0616081;STB=0.532957;STBP=0.256;TYPE=snp;VARB=-0.00223451;OID=.;OPOS=61151697;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:32:47:47:6:6:41:41:0.87234:17:24:5:1:17:24:5:1
chr18	61156606	.	G	C	849.86	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00162921;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.5117;QD=57.6176;RBI=0.0181192;REFB=0;REVB=-0.0180458;RO=0;SAF=26;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.09576e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000161087;OID=.;OPOS=61156606;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:59:0:0:58:59:1:32:26:0:0:32:27:0:0
chr18	61160287	.	T	C	1047.91	PASS	AF=0.986111;AO=71;DP=72;FAO=71;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0304757;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=55.3889;QD=58.2173;RBI=0.0598459;REFB=-0.0867628;REVB=-0.051505;RO=0;SAF=21;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.93928e-08;STB=0.504949;STBP=0.606;TYPE=snp;VARB=0.00105356;OID=.;OPOS=61160287;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:72:72:0:1:71:71:0.986111:50:21:0:0:50:21:0:1
chr18	61160320	.	G	C	786.81	PASS	AF=1;AO=55;DP=56;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0117915;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.2984;QD=57.2226;RBI=0.0565289;REFB=0;REVB=0.0552855;RO=0;SAF=16;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00102793;OID=.;OPOS=61160320;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:55:0:0:55:55:1:39:16:0:0:39:16:0:0
chr18	61170925	.	T	C	766.41	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0102595;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.184;QD=63.8674;RBI=0.0223788;REFB=0;REVB=0.0198885;RO=0;SAF=23;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.49102e-05;OID=.;OPOS=61170925;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:25:23:0:0:25:23:0:0
chr18	61233907	.	C	T	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0301922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.9793;QD=33.4281;RBI=0.0337253;REFB=0;REVB=-0.0150277;RO=0;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00107369;OID=.;OPOS=61233907;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:5:1:0:0:5:1:0:0
chr18	61234004	.	G	C	376.13	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0243843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.8831;QD=55.7223;RBI=0.0795221;REFB=0;REVB=0.0756913;RO=0;SAF=9;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000843951;OID=.;OPOS=61234004;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:27:0:0:26:27:1:17:9:0:0:18:9:0:0
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chr18	61264298	.	G	A	1362.37	PASS	AF=0.988764;AO=87;DP=89;FAO=88;FDP=89;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.000103259;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.018;QD=61.2301;RBI=0.0139529;REFB=-0.0193195;REVB=0.0139525;RO=1;SAF=43;SAR=44;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0108921;STB=0.505746;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.000448886;OID=.;OPOS=61264298;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:89:89:1:1:87:88:0.988764:44:43:1:0:45:43:1:0
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chr18	61326609	.	T	G	599.01	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00324959;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.701;QD=61.4366;RBI=0.00324959;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=39;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000555612;OID=.;OPOS=61326609;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:0:39:0:0:0:39:0:0
chr18	61377579	.	A	C	692.98	PASS	AF=1;AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0296462;FXX=0.0222173;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.58;QD=62.998;RBI=0.0386774;REFB=0;REVB=0.0248404;RO=0;SAF=17;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.54734e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000128824;OID=.;OPOS=61377579;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:44:0:0:44:44:1:27:17:0:0:27:17:0:0
chr18	61379838	.	T	G	483.34	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0260512;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.0754;QD=58.5863;RBI=0.0384251;REFB=0;REVB=0.0282457;RO=0;SAF=20;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.82173e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000637136;OID=.;OPOS=61379838;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:13:20:0:0:13:20:0:0
chr18	61387312	.	G	A	821.6	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00887291;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.34;QD=57.6558;RBI=0.0444886;REFB=0;REVB=-0.0435949;RO=0;SAF=27;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000185473;OID=.;OPOS=61387312;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:30:27:0:0:30:27:0:0
chr18	61387333	.	T	A	739.93	PASS	AF=1;AO=51;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0139416;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.832;QD=56.9175;RBI=0.0244916;REFB=0;REVB=0.0201363;RO=0;SAF=23;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.97956e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.28629e-05;OID=.;OPOS=61387333;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:51:52:1:28:23:0:0:29:23:0:0
chr18	61387389	.	G	A	526.73	PASS	AF=0.972973;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00243245;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.935;QD=56.944;RBI=0.0173035;REFB=0.0566663;REVB=0.0171316;RO=1;SAF=15;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.021769;STB=0.511621;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=-0.00243014;OID=.;OPOS=61387389;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:37:37:1:1:36:36:0.972973:21:15:0:1:21:15:0:1
chr18	61390316	.	C	A	445.5	PASS	AF=0.941176;AO=32;DP=34;FAO=32;FDP=34;FR=.;FRO=2;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0136228;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=223.12;QD=52.4114;RBI=0.0185614;REFB=-0.178288;REVB=0.0126074;RO=0;SAF=21;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.522713;STBP=0.435;TYPE=snp;VARB=0.00169597;OID=.;OPOS=61390316;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:34:34:0:2:32:32:0.941176:11:21:0:0:11:21:2:0
chr18	61390332	.	C	T	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0345899;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.836;QD=59.4355;RBI=0.0355699;REFB=0;REVB=-0.00829204;RO=0;SAF=23;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000208674;OID=.;OPOS=61390332;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:12:23:0:0:12:23:0:0
chr18	61390361	.	T	C	557.39	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0116004;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=327.814;QD=60.2581;RBI=0.0162122;REFB=0;REVB=-0.0113255;RO=0;SAF=24;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.04044e-07;OID=.;OPOS=61390361;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:37:0:0:36:37:1:12:24:0:0:13:24:0:0
chr18	61390570	.	T	G	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0176175;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=260.048;QD=48.7373;RBI=0.0208367;REFB=0;REVB=0.0111262;RO=0;SAF=6;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000116785;OID=.;OPOS=61390570;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:11:6:0:0:11:6:0:0
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chr18	61570503	.	C	G	955.16	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0571592;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.5187;QD=58.7788;RBI=0.065266;REFB=0;REVB=-0.0315036;RO=0;SAF=34;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.90682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000183739;OID=.;OPOS=61570503;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:31:34:0:0:31:34:0:0
chr18	61570529	.	C	G	747.08	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0127723;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.778;QD=63.5814;RBI=0.0352068;REFB=0;REVB=-0.0328084;RO=0;SAF=25;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.34921e-05;OID=.;OPOS=61570529;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:22:25:0:0:22:25:0:0
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chr18	61650841	.	G	A	434.6	PASS	AF=0.73913;AO=34;DP=46;FAO=34;FDP=46;FR=.;FRO=12;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.062969;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.7844;QD=37.7914;RBI=0.0811535;REFB=0.0262497;REVB=-0.0511937;RO=12;SAF=20;SAR=14;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00243199;STB=0.501319;STBP=0.994;TYPE=snp;VARB=-0.00909175;OID=.;OPOS=61650841;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:90:46:46:12:12:34:34:0.73913:14:20:7:5:14:20:7:5
chr18	61654463	.	A	G	411.02	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.10808;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.7511;QD=56.6927;RBI=0.123796;REFB=0;REVB=0.0603657;RO=0;SAF=12;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.0947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00368963;OID=.;OPOS=61654463;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:17:12:0:0:17:12:0:0
chr18	62036875	.	G	A	1405.2	PASS	AF=1;AO=89;DP=89;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00843497;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.163;QD=62.4532;RBI=0.00933579;REFB=0;REVB=-0.00400102;RO=0;SAF=48;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.30324e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.38293e-05;OID=.;OPOS=62036875;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:89:90:0:0:89:90:1:41:48:0:0:41:49:0:0
chr18	63489378	.	C	T	769.46	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00386948;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.1055;QD=56.9972;RBI=0.0259316;REFB=0;REVB=-0.0256413;RO=0;SAF=26;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.52846e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0002072;OID=.;OPOS=63489378;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:28:26:0:0:28:26:0:0
chr18	63530016	.	A	G	1062.44	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00821844;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.009;QD=59.8557;RBI=0.0296925;REFB=0;REVB=-0.0285324;RO=0;SAF=45;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.6518e-05;OID=.;OPOS=63530016;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:26:45:0:0:26:45:0:0
chr18	65178103	.	G	GCA	46.68	PASS	AF=0.318182;AO=7;DP=29;FAO=7;FDP=22;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=-0.0244984;FXX=0.0434594;HRUN=1;LEN=2;MLLD=130.669;QD=8.48687;RBI=0.0330075;REFB=-0.042918;REVB=-0.0221206;RO=21;SAF=4;SAR=3;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.567382;STBP=0.741;TYPE=ins;VARB=0.118476;OID=.;OPOS=65178104;OREF=-;OALT=CA;OMAPALT=GCA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.318182:7:29:7:22:15:4:3:10:5:46:21:4:3:12:9
chr18	66504093	.	A	C	769.88	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0250615;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.579;QD=57.0282;RBI=0.0251311;REFB=0;REVB=-0.00186836;RO=0;SAF=35;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.57e-05;OID=.;OPOS=66504093;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:54:0:0:53:54:1:18:35:0:0:18:36:0:0
chr18	66504459	.	A	T	639.5	PASS	AF=0.976744;AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00173831;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=135.435;QD=59.4885;RBI=0.0478764;REFB=-0.153857;REVB=0.0478449;RO=0;SAF=15;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.13648e-08;STB=0.509087;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.000671488;OID=.;OPOS=66504459;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:43:43:0:1:42:42:0.976744:27:15:0:0:27:15:0:1
chr18	66506160	.	G	T	400.96	PASS	AF=0.590909;AO=39;DP=66;FAO=39;FDP=66;FR=.;FRO=27;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=0.0143785;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.871;QD=24.3005;RBI=0.0194383;REFB=-0.0243931;REVB=-0.0130807;RO=27;SAF=17;SAR=22;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0343715;STB=0.518858;STBP=0.736;TYPE=snp;VARB=0.0202013;OID=.;OPOS=66506160;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:27:27:39:39:0.590909:22:17:13:14:22:17:13:14
chr18	66513615	.	A	G	501.42	PASS	AF=1;AO=33;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.011194;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.3066;QD=58.9908;RBI=0.0116778;REFB=0;REVB=0.00332663;RO=1;SAF=19;SAR=14;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0322;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000154792;OID=.;OPOS=66513615;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:1:0:33:34:1:14:19:0:1:15:19:0:0
chr18	66526176	.	T	C	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0933184;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.478;QD=37.4885;RBI=0.0966434;REFB=0;REVB=-0.0251324;RO=0;SAF=7;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.78849e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00596592;OID=.;OPOS=66526176;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:1:7:0:0:1:7:0:0
chr18	67345034	.	T	C	842.34	PASS	AF=1;AO=57;DP=59;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.014625;FXX=0.0333278;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.155;QD=58.0925;RBI=0.0620549;REFB=0;REVB=0.0603069;RO=0;SAF=23;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000511133;OID=.;OPOS=67345034;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:58:0:0:57:58:1:34:23:0:0:34:24:0:0
chr18	67365668	.	A	G	773.03	PASS	AF=0.982143;AO=55;DP=57;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0154535;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.22;QD=55.2162;RBI=0.015619;REFB=0.0405525;REVB=-0.00226752;RO=1;SAF=30;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154549;STB=0.508194;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=1.84736e-05;OID=.;OPOS=67365668;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:57:56:1:1:55:55:0.982143:25:30:1:0:25:30:1:0
chr18	67531642	.	T	C	592.13	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0306574;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.879;QD=60.731;RBI=0.0413856;REFB=0;REVB=0.0278009;RO=0;SAF=12;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.05056e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000296748;OID=.;OPOS=67531642;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:39:0:0:38:39:1:26:12:0:0:26:13:0:0
chr18	67718688	.	A	G	820.42	PASS	AF=1;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0201662;FXX=0.0172384;HRUN=3;LEN=1;MLLD=232.512;QD=57.573;RBI=0.0205545;REFB=0;REVB=0.0039763;RO=1;SAF=27;SAR=30;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0154619;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.21486e-05;OID=.;OPOS=67718688;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:57:1:0:57:57:1:30:27:0:1:30:27:0:0
chr18	67863850	.	T	TCTC	136.73	PASS	AF=0.866667;AO=12;DP=16;FAO=13;FDP=15;FR=.;FRO=2;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0248582;FXX=0.062461;HRUN=1;LEN=3;MLLD=200.256;QD=36.4615;RBI=0.0250201;REFB=-0.0416887;REVB=-0.00284168;RO=2;SAF=4;SAR=8;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0471732;STB=0.529365;STBP=0.596;TYPE=ins;VARB=0.00563884;OID=.;OPOS=67863851;OREF=-;OALT=CTC;OMAPALT=TCTC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.866667:12:16:13:15:2:4:9:1:1:10:2:4:8:1:1
chr18	67871343	.	A	C	754.42	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0417662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.309;QD=56.9376;RBI=0.0534968;REFB=0;REVB=0.0334289;RO=0;SAF=22;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.76368e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000623354;OID=.;OPOS=67871343;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:31:22:0:0:31:22:0:0
chr18	70209177	.	C	T	1128.99	PASS	AF=1;AO=74;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0869096;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.781;QD=60.2128;RBI=0.0923341;REFB=0;REVB=0.0311819;RO=0;SAF=28;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000270027;OID=.;OPOS=70209177;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:75:0:0:74:75:1:46:28:0:0:46:29:0:0
chr18	70417304	.	C	T	527.12	PASS	AF=0.681159;AO=47;DP=69;FAO=47;FDP=69;FR=.;FRO=22;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=-0.00763954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.044;QD=30.5574;RBI=0.0283785;REFB=-0.0140386;REVB=-0.0273309;RO=22;SAF=24;SAR=23;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0863994;STB=0.546778;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.00615012;OID=.;OPOS=70417304;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:22:22:47:47:0.681159:23:24:8:14:23:24:8:14
chr18	70417396	.	C	T	747.1	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0576503;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.674;QD=63.5827;RBI=0.0612502;REFB=0;REVB=-0.0206891;RO=0;SAF=22;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000304496;OID=.;OPOS=70417396;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:25:22:0:0:25:22:0:0
chr18	70532840	.	T	G	1190.43	PASS	AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00635853;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.034;QD=61.0478;RBI=0.0154133;REFB=0;REVB=-0.0140406;RO=0;SAF=30;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.36898e-05;OID=.;OPOS=70532840;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:48:30:0:0:48:30:0:0
chr18	71927987	.	T	C	105.14	PASS	AF=0.846154;AO=11;DP=13;FAO=11;FDP=13;FR=.;FRO=2;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.042225;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.5103;QD=32.35;RBI=0.0927172;REFB=0.0861135;REVB=-0.0825441;RO=2;SAF=6;SAR=5;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.012578;STB=0.507029;STBP=0.901;TYPE=snp;VARB=-0.028156;OID=.;OPOS=71927987;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:13:13:2:2:11:11:0.846154:5:6:1:1:5:6:1:1
chr18	72009309	.	C	T	809.98	PASS	AF=0.730337;AO=64;DP=88;FAO=65;FDP=89;FR=.;FRO=24;FSAF=40;FSAR=25;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=-0.0108205;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=222.962;QD=36.4036;RBI=0.0134269;REFB=-0.01374;REVB=0.0079497;RO=23;SAF=40;SAR=24;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0753906;STB=0.532364;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.00708162;OID=.;OPOS=72009309;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:89:23:24:64:65:0.730337:24:40:11:12:25:40:12:12
chr18	72020983	.	A	G	475.85	PASS	AF=0.782609;AO=36;DP=46;FAO=36;FDP=46;FR=.;FRO=10;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=0.0435799;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.64;QD=41.3786;RBI=0.0449635;REFB=0.0153871;REVB=0.0110681;RO=10;SAF=16;SAR=20;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101005;STB=0.554426;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=-0.00551614;OID=.;OPOS=72020983;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:68:46:46:10:10:36:36:0.782609:20:16:2:8:20:16:2:8
chr18	72021717	.	T	C	238.97	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0394083;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.5745;QD=50.3098;RBI=0.0411113;REFB=0;REVB=-0.0117099;RO=0;SAF=7;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00177419;OID=.;OPOS=72021717;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:12:7:0:0:12:7:0:0
chr18	72114181	.	C	T	235.48	PASS	AF=1;AO=18;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0494244;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.43;QD=49.575;RBI=0.0560582;REFB=0;REVB=0.0264529;RO=1;SAF=8;SAR=10;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0539582;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000799187;OID=.;OPOS=72114181;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:1:0:18:19:1:10:8:1:0:10:9:0:0
chr18	72114455	.	C	T	640.35	PASS	AF=1;AO=28;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0689492;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.215;QD=62.473;RBI=0.158772;REFB=0;REVB=0.143019;RO=0;SAF=18;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000870282;OID=.;OPOS=72114455;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:28:41:1:10:18:0:0:21:20:0:0
chr18	72114490	.	G	A	560.01	PASS	AF=1;AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0256916;FXX=0.0263089;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.5561;QD=60.5414;RBI=0.0392268;REFB=0;REVB=0.0296426;RO=0;SAF=18;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.68991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.73179e-05;OID=.;OPOS=72114490;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:37:0:0:37:37:1:19:18:0:0:19:18:0:0
chr18	72223591	.	G	GTGC	213.75	PASS	AF=0.947368;AO=16;DP=19;FAO=18;FDP=19;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0437895;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=232.186;QD=44.9992;RBI=0.100381;REFB=-0.103561;REVB=0.0903265;RO=3;SAF=6;SAR=10;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0127953;STB=0.538418;STBP=0.288;TYPE=ins;VARB=0.0062206;OID=.;OPOS=72223592;OREF=-;OALT=TGC;OMAPALT=GTGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.947368:16:19:18:19:1:6:12:1:0:4:3:6:10:1:2
chr18	72228124	.	A	G	1502.18	PASS	AF=1;AO=94;DP=96;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0377546;FXX=0.0309246;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.9356;QD=63.9224;RBI=0.0475264;REFB=0;REVB=-0.0288678;RO=0;SAF=42;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000484405;OID=.;OPOS=72228124;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:96:94:0:0:94:94:1:52:42:0:0:52:42:0:0
chr18	72234635	.	C	T	96.74	PASS	AF=0.387097;AO=12;DP=31;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.0350319;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.653;QD=12.4824;RBI=0.0499118;REFB=-0.000838726;REVB=-0.0355522;RO=19;SAF=2;SAR=10;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.431099;STB=0.75901;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.00198779;OID=.;OPOS=72234635;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:31:31:19:19:12:12:0.387097:10:2:10:9:10:2:10:9
chr18	72343008	.	T	C	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.012306;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.504;QD=51.1844;RBI=0.0345098;REFB=0;REVB=0.0322411;RO=0;SAF=8;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00037361;OID=.;OPOS=72343008;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:12:8:0:0:12:8:0:0
chr18	72347482	.	T	C	271.22	PASS	AF=0.648649;AO=23;DP=38;FAO=24;FDP=37;FR=.,HEALED;FRO=13;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.00466554;FXX=0.0263089;HRUN=5;LEN=1;MLLD=227.439;QD=29.3212;RBI=0.00476975;REFB=-0.0243565;REVB=-0.000991585;RO=9;SAF=11;SAR=12;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153001;STB=0.55501;STBP=0.342;TYPE=snp;VARB=0.00731502;OID=.;OPOS=72347482;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:38:37:9:13:23:24:0.648649:12:11:7:2:13:11:8:5
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chr18	72776307	.	CGGGGC	CGGG,CGGGC	35.78	PASS	AF=0.16129,0.16129;AO=6,5;DP=30;FAO=5,5;FDP=31;FR=.;FRO=21;FSAF=4,4;FSAR=1,1;FSRF=19;FSRR=2;FWDB=-0.0963561,-0.0964143;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=2,1;MLLD=23.3465,12.5551;QD=4.61657;RBI=0.108881,0.0982146;REFB=-0.0692974,-0.128331;REVB=0.0507011,-0.0187187;RO=18;SAF=5,4;SAR=1,1;SRF=17;SRR=1;SSEN=0.43408,0.43408;SSEP=0,0;SSSB=-0.309137,-0.365002;STB=0.656664,0.656664;STBP=0.829,0.829;TYPE=del,del;VARB=0.174689,0.193083;OID=.,.;OPOS=72776311,72776308;OREF=GC,G;OALT=-,-;OMAPALT=CGGG,CGGGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.16129,0.16129:6,5:30:5,5:31:21:4,4:1,1:19:2:17:18:5,4:1,1:17:1
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chr18	74091718	.	G	A	1849.44	PASS	AF=0.772973;AO=143;DP=185;FAO=143;FDP=185;FR=.;FRO=42;FSAF=65;FSAR=78;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=-0.00781227;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.0929;QD=39.9878;RBI=0.0145937;REFB=0.00454687;REVB=0.0123266;RO=41;SAF=65;SAR=78;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0242831;STB=0.510384;STBP=0.598;TYPE=snp;VARB=-0.00154967;OID=.;OPOS=74091718;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:185:185:41:42:143:143:0.772973:78:65:21:20:78:65:21:21
chr18	74208573	.	G	A	50.08	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0875072;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.5214;QD=33.3885;RBI=0.149877;REFB=0;REVB=0.121678;RO=0;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00340205;OID=.;OPOS=74208573;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:2:4:0:0:2:4:0:0
chr18	74611127	.	A	G	538.45	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0296549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.03;QD=59.8275;RBI=0.0361397;REFB=0;REVB=0.0206557;RO=0;SAF=23;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.21415e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000412371;OID=.;OPOS=74611127;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:13:23:0:0:13:23:0:0
chr18	74635105	.	C	T	212.09	PASS	AF=0.376812;AO=26;DP=69;FAO=26;FDP=69;FR=.;FRO=43;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=25;FSRR=18;FWDB=0.0010117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.6032;QD=12.2953;RBI=0.0230792;REFB=-0.00134782;REVB=-0.023057;RO=43;SAF=13;SAR=13;SRF=25;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0882137;STB=0.550686;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=0.00198965;OID=.;OPOS=74635105;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:43:43:26:26:0.376812:13:13:25:18:13:13:25:18
chr18	74671768	.	T	C	579.18	PASS	AF=1;AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0320292;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.704;QD=60.9658;RBI=0.035961;REFB=0;REVB=-0.0163502;RO=0;SAF=19;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000250709;OID=.;OPOS=74671768;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:38:0:0:38:38:1:19:19:0:0:19:19:0:0
chr18	74680208	.	C	T	38.44	PASS	AF=0.214286;AO=6;DP=30;FAO=6;FDP=28;FR=.,HEALED;FRO=22;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=-0.0297136;FXX=0.0666445;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.728;QD=5.49133;RBI=0.0298002;REFB=-0.00762047;REVB=0.00226999;RO=20;SAF=2;SAR=4;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141693;STB=0.563883;STBP=0.768;TYPE=snp;VARB=0.0183579;OID=.;OPOS=74680208;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:30:28:20:22:6:6:0.214286:4:2:9:11:4:2:9:13
chr18	74680259	.	C	T	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.035434;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.86;QD=56.1913;RBI=0.0389766;REFB=0;REVB=0.016236;RO=0;SAF=12;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00052581;OID=.;OPOS=74680259;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:16:12:0:0:16:12:0:0
chr18	74680262	.	C	T	53.13	PASS	AF=0.275862;AO=8;DP=29;FAO=8;FDP=29;FR=.;FRO=21;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.00996283;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.801;QD=7.32771;RBI=0.0154993;REFB=0.00230573;REVB=0.0118731;RO=21;SAF=2;SAR=6;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.280468;STB=0.67877;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=-0.00570707;OID=.;OPOS=74680262;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:29:29:21:21:8:8:0.275862:6:2:10:11:6:2:10:11
chr18	74682214	.	C	T	126.74	PASS	AF=0.2;AO=21;DP=105;FAO=21;FDP=105;FR=.;FRO=84;FSAF=4;FSAR=17;FSRF=32;FSRR=52;FWDB=-0.0202994;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.9943;QD=4.82817;RBI=0.058384;REFB=-0.00426247;REVB=-0.0547415;RO=84;SAF=4;SAR=17;SRF=32;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.291602;STB=0.688988;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.0214154;OID=.;OPOS=74682214;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:105:84:84:21:21:0.2:17:4:32:52:17:4:32:52
chr18	74701984	.	G	A	1003.26	PASS	AF=0.666667;AO=86;DP=129;FAO=86;FDP=129;FR=.;FRO=43;FSAF=38;FSAR=48;FSRF=28;FSRR=15;FWDB=0.0102288;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.207;QD=31.1089;RBI=0.0170211;REFB=-0.00358074;REVB=0.0136048;RO=43;SAF=38;SAR=48;SRF=28;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129161;STB=0.569563;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.00256479;OID=.;OPOS=74701984;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:129:129:43:43:86:86:0.666667:48:38:28:15:48:38:28:15
chr18	74980809	.	G	A	409.1	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0526072;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.9096;QD=56.4281;RBI=0.0531044;REFB=0;REVB=0.00724992;RO=0;SAF=11;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000719296;OID=.;OPOS=74980809;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:29:0:0:27:29:1:16:11:0:0:18:11:0:0
chr18	76754466	.	C	T	289.1	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0252436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.7057;QD=52.5629;RBI=0.04745;REFB=0;REVB=0.0401778;RO=0;SAF=2;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.80459e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000759334;OID=.;OPOS=76754466;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:20:2:0:0:20:2:0:0
chr18	76873288	.	A	G	92.2	PASS	AF=0.55;AO=11;DP=20;FAO=11;FDP=20;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.0371442;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.2373;QD=18.4403;RBI=0.069148;REFB=0.00499715;REVB=-0.0583246;RO=9;SAF=4;SAR=7;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153845;STB=0.588621;STBP=0.446;TYPE=snp;VARB=-0.00659521;OID=.;OPOS=76873288;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:20:20:9:9:11:11:0.55:7:4:5:4:7:4:5:4
chr18	77171061	.	T	G	198.41	PASS	AF=0.944444;AO=17;DP=18;FAO=17;FDP=18;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0433542;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.535;QD=44.0918;RBI=0.0449739;REFB=-0.00903989;REVB=0.0119607;RO=1;SAF=11;SAR=6;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0703222;STB=0.538415;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=0.0009769;OID=.;OPOS=77171061;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:18:18:1:1:17:17:0.944444:6:11:0:1:6:11:0:1
chr18	77208922	.	C	T	92.58	PASS	AF=0.3;AO=12;DP=40;FAO=12;FDP=40;FR=.;FRO=28;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.0134518;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.572;QD=9.25751;RBI=0.0227723;REFB=-0.0140218;REVB=-0.0183746;RO=26;SAF=8;SAR=4;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152316;STB=0.596326;STBP=0.459;TYPE=snp;VARB=0.0275686;OID=.;OPOS=77208922;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:40:40:26:28:12:12:0.3:4:8:14:12:4:8:15:13
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chr18	77513721	.	T	C	888.86	PASS	AF=1;AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0164976;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.203;QD=58.2857;RBI=0.0185959;REFB=0;REVB=-0.00858117;RO=0;SAF=25;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.7362e-05;OID=.;OPOS=77513721;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:61:0:0:61:61:1:36:25:0:0:36:25:0:0
chr18	77728135	.	G	T	323.47	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0127842;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.839;QD=53.911;RBI=0.0242981;REFB=0;REVB=-0.020663;RO=0;SAF=9;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000224771;OID=.;OPOS=77728135;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:15:9:0:0:15:9:0:0
chr18	77736735	.	T	C	340.73	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0556507;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=62.2969;QD=54.5166;RBI=0.0591366;REFB=0;REVB=0.0200036;RO=0;SAF=5;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000928479;OID=.;OPOS=77736735;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:20:5:0:0:20:5:0:0
chr18	77772974	.	C	A	49.18	PASS	AF=0.166667;AO=8;DP=48;FAO=8;FDP=48;FR=.;FRO=40;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=14;FSRR=26;FWDB=-0.0156417;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.1562;QD=4.09872;RBI=0.0204099;REFB=-0.00206135;REVB=0.0131111;RO=40;SAF=5;SAR=3;SRF=14;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.325476;STB=0.717327;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=0.0160185;OID=.;OPOS=77772974;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:49:48:48:40:40:8:8:0.166667:3:5:14:26:3:5:14:26
chr18	77773006	.	A	G	270.75	PASS	AF=0.46875;AO=30;DP=64;FAO=30;FDP=64;FR=.;FRO=34;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=0.0135953;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.677;QD=16.922;RBI=0.0195131;REFB=-0.0130377;REVB=-0.0139975;RO=34;SAF=14;SAR=16;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0242591;STB=0.513618;STBP=0.853;TYPE=snp;VARB=0.0277122;OID=.;OPOS=77773006;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:34:34:30:30:0.46875:16:14:15:19:16:14:15:19
chr18	77773035	.	G	A	289.41	PASS	AF=0.545455;AO=30;DP=57;FAO=30;FDP=55;FR=.;FRO=25;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=0.00752199;FXX=0.0350816;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.867;QD=21.048;RBI=0.0183314;REFB=0.00730067;REVB=0.0167171;RO=25;SAF=14;SAR=16;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0763591;STB=0.542345;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=-0.00654778;OID=.;OPOS=77773035;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:55:25:25:30:30:0.545455:16:14:14:11:16:14:14:11
chr18	77805856	.	A	C	203.49	PASS	AF=0.703704;AO=19;DP=27;FAO=19;FDP=27;FR=.;FRO=8;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=0.0161464;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.2743;QD=30.1463;RBI=0.07377;REFB=0.00825611;REVB=-0.0719813;RO=8;SAF=14;SAR=5;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101116;STB=0.555501;STBP=0.486;TYPE=snp;VARB=-0.00612034;OID=.;OPOS=77805856;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:27:27:8:8:19:19:0.703704:5:14:7:1:5:14:7:1
chr18	77894844	.	G	A	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156292;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.559;QD=37.4885;RBI=0.0205476;REFB=0;REVB=-0.0133391;RO=0;SAF=4;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.07666e-05;OID=.;OPOS=77894844;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:4:4:0:0:4:4:0:0
chr18	77896242	.	C	T	336.8	PASS	AF=0.818182;AO=26;DP=32;FAO=27;FDP=33;FR=.;FRO=6;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0210621;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.7213;QD=40.8239;RBI=0.0795093;REFB=-0.0685001;REVB=0.0766688;RO=5;SAF=14;SAR=12;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0788755;STB=0.527007;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.0145831;OID=.;OPOS=77896242;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:32:33:5:6:26:27:0.818182:12:14:4:1:13:14:4:2
chr18	77918221	.	C	T	125.33	PASS	AF=0.5;AO=12;DP=27;FAO=14;FDP=28;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=0.0347201;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.262;QD=17.9042;RBI=0.0349392;REFB=-0.0188461;REVB=0.00390667;RO=14;SAF=8;SAR=4;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0245398;STB=0.542107;STBP=0.697;TYPE=snp;VARB=0.0191652;OID=.;OPOS=77918221;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:28:14:14:12:14:0.5:4:8:9:5:4:10:9:5
chr19	362283	.	C	T	257.41	PASS	AF=0.394737;AO=30;DP=77;FAO=30;FDP=76;FR=.;FRO=46;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=29;FWDB=-0.0186317;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.77;QD=13.548;RBI=0.0189466;REFB=-0.000221319;REVB=-0.00343987;RO=47;SAF=17;SAR=13;SRF=18;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194231;STB=0.617571;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=0.000276409;OID=.;OPOS=362283;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:76:47:46:30:30:0.394737:13:17:18:29:13:17:17:29
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chr19	372661	.	C	A	127.95	PASS	AF=0.56;AO=14;DP=25;FAO=14;FDP=25;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=10;FWDB=-0.00336338;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.789;QD=20.4723;RBI=0.033099;REFB=-0.00149344;REVB=0.0329277;RO=11;SAF=5;SAR=9;SRF=1;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.246408;STB=0.637415;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=0.0026408;OID=.;OPOS=372661;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:25:25:11:11:14:14:0.56:9:5:1:10:9:5:1:10
chr19	453160	.	A	G	523.79	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00946184;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.491;QD=59.8611;RBI=0.0134631;REFB=0;REVB=0.00957748;RO=0;SAF=21;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.27896e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.48969e-05;OID=.;OPOS=453160;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:14:21:0:0:14:21:0:0
chr19	463528	.	G	A	2295.27	PASS	AF=1;AO=143;DP=144;FAO=144;FDP=144;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0626853;FXX=0.00689608;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.204;QD=63.7574;RBI=0.0711979;REFB=0;REVB=0.0337593;RO=0;SAF=74;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.12649e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000159579;OID=.;OPOS=463528;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:144:144:0:0:143:144:1:69:74:0:0:69:75:0:0
chr19	464310	.	A	G	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00555816;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.1919;QD=33.4281;RBI=0.0258448;REFB=0;REVB=-0.0252401;RO=0;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000589356;OID=.;OPOS=464310;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:4:2:0:0:4:2:0:0
chr19	498524	.	A	G	712.02	PASS	AF=1;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00888626;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.243;QD=63.2911;RBI=0.0310674;REFB=0;REVB=-0.0297694;RO=0;SAF=20;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.09779e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.61054e-05;OID=.;OPOS=498524;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:45:0:0:45:45:1:25:20:0:0:25:20:0:0
chr19	501719	.	T	C	49.69	PASS	AF=0.538462;AO=6;DP=12;FAO=7;FDP=13;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=-0.0302513;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.8491;QD=15.2882;RBI=0.0315881;REFB=-0.000988732;REVB=0.00909204;RO=6;SAF=3;SAR=3;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.280783;STB=0.627576;STBP=0.417;TYPE=snp;VARB=0.000622597;OID=.;OPOS=501719;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:12:13:6:6:6:7:0.538462:3:3:1:5:4:3:1:5
chr19	549678	.	A	G	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00603027;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.763;QD=55.098;RBI=0.0438778;REFB=0;REVB=-0.0434614;RO=0;SAF=7;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.63811e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.29324e-05;OID=.;OPOS=549678;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:19:7:0:0:19:7:0:0
chr19	549725	.	T	C	62.75	PASS	AF=0.428571;AO=7;DP=19;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=0.0890393;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.265;QD=11.9526;RBI=0.0908435;REFB=-0.0639763;REVB=0.0180152;RO=12;SAF=2;SAR=5;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0462091;STB=0.615148;STBP=0.396;TYPE=snp;VARB=0.0793771;OID=.;OPOS=549725;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:19:21:12:12:7:9:0.428571:5:2:3:9:5:4:3:9
chr19	579010	.	G	A	167.36	PASS	AF=1;AO=14;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0197254;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.444;QD=44.6281;RBI=0.0476042;REFB=0;REVB=0.0433251;RO=0;SAF=8;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0026974;OID=.;OPOS=579010;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:14:15:1:6:8:0:0:7:8:0:0
chr19	579035	.	C	T	116.03	PASS	AF=0.565217;AO=13;DP=23;FAO=13;FDP=23;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=-0.000189282;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.66;QD=20.1782;RBI=0.0194416;REFB=-0.00961006;REVB=0.0194406;RO=10;SAF=7;SAR=6;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0474842;STB=0.526986;STBP=0.797;TYPE=snp;VARB=0.0122727;OID=.;OPOS=579035;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:23:23:10:10:13:13:0.565217:6:7:6:4:6:7:6:4
chr19	579100	.	C	T	93.56	PASS	AF=0.351351;AO=11;DP=37;FAO=13;FDP=37;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.0318941;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.4556;QD=10.1141;RBI=0.0324871;REFB=-0.00305205;REVB=-0.00617871;RO=24;SAF=6;SAR=5;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00430506;STB=0.549279;STBP=0.663;TYPE=snp;VARB=0.0236581;OID=.;OPOS=579100;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:93:37:37:24:24:11:13:0.351351:5:6:13:11:5:8:13:11
chr19	579157	.	T	C	46.36	PASS	AF=0.368421;AO=7;DP=19;FAO=7;FDP=19;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=0.0418974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.734;QD=9.76002;RBI=0.0430697;REFB=-0.0193392;REVB=0.00998053;RO=12;SAF=3;SAR=4;SRF=2;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.29761;STB=0.676997;STBP=0.358;TYPE=snp;VARB=0.0348771;OID=.;OPOS=579157;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:19:19:12:12:7:7:0.368421:4:3:2:10:4:3:2:10
chr19	579450	.	G	A	128.26	PASS	AF=0.357143;AO=15;DP=42;FAO=15;FDP=42;FR=.;FRO=27;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=-0.0299644;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.537;QD=12.2153;RBI=0.039635;REFB=-0.0128545;REVB=0.0259435;RO=27;SAF=7;SAR=8;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106654;STB=0.562619;STBP=0.549;TYPE=snp;VARB=0.0218179;OID=.;OPOS=579450;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:27:27:15:15:0.357143:8:7:10:17:8:7:10:17
chr19	579627	.	C	T	196.07	PASS	AF=0.454545;AO=20;DP=44;FAO=20;FDP=44;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=6;FWDB=0.0116923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.6131;QD=17.8249;RBI=0.0460144;REFB=0.00805622;REVB=0.0445041;RO=24;SAF=12;SAR=8;SRF=18;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156069;STB=0.588153;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=-0.00599349;OID=.;OPOS=579627;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:24:24:20:20:0.454545:8:12:18:6:8:12:18:6
chr19	580388	.	C	G	263.5	PASS	AF=0.518519;AO=28;DP=54;FAO=28;FDP=54;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=6;FWDB=-0.0630288;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.9341;QD=19.5183;RBI=0.0642987;REFB=-0.00650312;REVB=-0.0127162;RO=26;SAF=12;SAR=16;SRF=20;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.288088;STB=0.659686;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.00425127;OID=.;OPOS=580388;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:26:26:28:28:0.518519:16:12:20:6:16:12:20:6
chr19	580665	.	T	C	273.12	PASS	AF=0.520833;AO=25;DP=50;FAO=25;FDP=48;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=0.00937885;FXX=0.039992;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.594;QD=22.7599;RBI=0.0101564;REFB=-0.0270245;REVB=0.00389744;RO=23;SAF=9;SAR=16;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.052672;STB=0.529389;STBP=0.735;TYPE=snp;VARB=0.0227117;OID=.;OPOS=580665;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:48:23:23:25:25:0.520833:16:9:7:16:16:9:7:16
chr19	582505	.	G	A	118.48	PASS	AF=0.5;AO=13;DP=30;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=0.0397887;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.3447;QD=15.7977;RBI=0.0640451;REFB=-0.0209253;REVB=-0.050186;RO=15;SAF=9;SAR=4;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.332251;STB=0.706139;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.0288582;OID=.;OPOS=582505;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:15:15:13:15:0.5:4:9:5:10:4:11:5:10
chr19	582775	.	A	G	616.96	PASS	AF=1;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0529074;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.6947;QD=61.6963;RBI=0.0536786;REFB=0;REVB=0.0090661;RO=0;SAF=32;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000606727;OID=.;OPOS=582775;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:40:0:0:40:40:1:8:32:0:0:8:32:0:0
chr19	582927	.	T	A	472.35	PASS	AF=0.897436;AO=34;DP=38;FAO=35;FDP=39;FR=.;FRO=4;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0108712;FXX=0.0249938;HRUN=7;LEN=1;MLLD=242.967;QD=48.4458;RBI=0.0121824;REFB=-0.0108121;REVB=0.00549798;RO=4;SAF=21;SAR=13;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.024254;STB=0.510632;STBP=0.734;TYPE=snp;VARB=0.000209287;OID=.;OPOS=582927;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:19:38:39:4:4:34:35:0.897436:13:21:2:2:14:21:2:2
chr19	605171	.	T	C	1811.05	PASS	AF=1;AO=114;DP=116;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0748815;FXX=0.00833264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.593;QD=60.8755;RBI=0.0762745;REFB=0;REVB=0.0145109;RO=0;SAF=50;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.2792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000672657;OID=.;OPOS=605171;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:116:119:0:0:114:119:1:64:50:0:0:67:52:0:0
chr19	613898	.	T	C	621.5	PASS	AF=0.611111;AO=55;DP=90;FAO=55;FDP=90;FR=.;FRO=35;FSAF=38;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=0.00714741;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.55;QD=27.6223;RBI=0.00835859;REFB=-0.0307106;REVB=-0.00433366;RO=32;SAF=38;SAR=17;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119893;STB=0.587164;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.0235622;OID=.;OPOS=613898;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:32:35:55:55:0.611111:17:38:17:15:17:38:17:18
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chr19	621070	.	G	A	320.15	PASS	AF=0.387097;AO=36;DP=93;FAO=36;FDP=93;FR=.;FRO=57;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=42;FSRR=15;FWDB=0.0154309;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.011;QD=13.7699;RBI=0.0163634;REFB=-0.0222975;REVB=-0.00544488;RO=57;SAF=20;SAR=16;SRF=42;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.204369;STB=0.615325;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=0.0311671;OID=.;OPOS=621070;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:57:57:36:36:0.387097:16:20:42:15:16:20:42:15
chr19	687142	.	G	A	88.2	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00882842;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.79;QD=39.202;RBI=0.044327;REFB=0;REVB=-0.043439;RO=0;SAF=6;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.58669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00107366;OID=.;OPOS=687142;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:9:0:0:8:9:1:2:6:0:0:3:6:0:0
chr19	691909	.	T	C	231.03	PASS	AF=0.464286;AO=26;DP=56;FAO=26;FDP=56;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=-0.0367438;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.497;QD=16.502;RBI=0.0392674;REFB=-0.0235113;REVB=0.0138501;RO=30;SAF=11;SAR=15;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10519;STB=0.559346;STBP=0.395;TYPE=snp;VARB=0.0238797;OID=.;OPOS=691909;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:30:30:26:26:0.464286:15:11:16:14:15:11:16:14
chr19	731144	.	A	G	1141.06	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.011573;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.596;QD=60.8567;RBI=0.0166028;REFB=0;REVB=0.0119046;RO=0;SAF=37;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.64272e-05;OID=.;OPOS=731144;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:38:37:0:0:38:37:0:0
chr19	812090	.	T	G	281.22	PASS	AF=0.517241;AO=30;DP=58;FAO=30;FDP=58;FR=.;FRO=28;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=19;FWDB=0.000326275;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.663;QD=19.3943;RBI=0.00881345;REFB=0.00355456;REVB=0.00880741;RO=28;SAF=18;SAR=12;SRF=9;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.238479;STB=0.632566;STBP=0.056;TYPE=snp;VARB=-0.00376168;OID=.;OPOS=812090;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:28:28:30:30:0.517241:12:18:9:19:12:18:9:19
chr19	815086	.	A	G	159.42	PASS	AF=0.435897;AO=17;DP=39;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=16;FWDB=0.00612839;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.324;QD=16.3511;RBI=0.0191379;REFB=-0.0347029;REVB=-0.0181302;RO=22;SAF=6;SAR=11;SRF=6;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.089133;STB=0.550963;STBP=0.618;TYPE=snp;VARB=0.0214477;OID=.;OPOS=815086;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:22:22:17:17:0.435897:11:6:6:16:11:6:6:16
chr19	829568	.	C	T	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.006012;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=229.293;QD=51.1846;RBI=0.0131801;REFB=0;REVB=0.0117291;RO=0;SAF=5;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.39173e-05;OID=.;OPOS=829568;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:15:5:0:0:15:5:0:0
chr19	830854	.	T	C	1467.62	PASS	AF=1;AO=93;DP=96;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00642287;FXX=0.0208312;HRUN=3;LEN=1;MLLD=260.846;QD=62.4521;RBI=0.015843;REFB=-0.11238;REVB=0.0144827;RO=0;SAF=33;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000115072;OID=.;OPOS=830854;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:96:94:0:0:93:94:1:60:33:0:0:61:33:0:0
chr19	856014	.	C	T	226.97	PASS	AF=0.511628;AO=22;DP=43;FAO=22;FDP=43;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0437541;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.421;QD=21.1139;RBI=0.0438114;REFB=-0.00662251;REVB=-0.00224085;RO=21;SAF=11;SAR=11;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0206751;STB=0.511617;STBP=0.892;TYPE=snp;VARB=0.00740387;OID=.;OPOS=856014;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:21:21:22:22:0.511628:11:11:11:10:11:11:11:10
chr19	880066	.	G	A	786.41	PASS	AF=0.982456;AO=55;DP=56;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0115632;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.702;QD=55.1867;RBI=0.011635;REFB=-0.117842;REVB=0.00129061;RO=1;SAF=32;SAR=23;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0145046;STB=0.50769;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=-0.000137086;OID=.;OPOS=880066;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:56:57:1:1:55:56:0.982456:23:32:1:0:24:32:1:0
chr19	885818	.	A	G	613.36	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.10419;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=62.299;QD=61.3356;RBI=0.115632;REFB=0;REVB=-0.0501516;RO=0;SAF=24;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00223449;OID=.;OPOS=885818;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:16:24:0:0:16:24:0:0
chr19	900951	.	A	G	435.78	PASS	AF=0.44898;AO=42;DP=96;FAO=44;FDP=98;FR=.;FRO=54;FSAF=17;FSAR=27;FSRF=26;FSRR=28;FWDB=0.0461186;FXX=0.019998;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.487;QD=17.7871;RBI=0.0509838;REFB=-0.0279382;REVB=0.0217354;RO=51;SAF=15;SAR=27;SRF=26;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154392;STB=0.553887;STBP=0.348;TYPE=snp;VARB=0.033804;OID=.;OPOS=900951;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:98:51:54:42:44:0.44898:27:15:26:25:27:17:26:28
chr19	901507	.	A	G	265.1	PASS	AF=0.476923;AO=26;DP=61;FAO=31;FDP=65;FR=.;FRO=34;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=0.0147922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.096;QD=16.3139;RBI=0.0234369;REFB=-0.025611;REVB=0.0181791;RO=34;SAF=14;SAR=12;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00907633;STB=0.523794;STBP=0.737;TYPE=snp;VARB=0.0210026;OID=.;OPOS=901507;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:65:34:34:26:31:0.476923:12:14:18:16:16:15:18:16
chr19	965043	.	T	C	271.54	PASS	AF=1;AO=20;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0221386;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.533;QD=51.7222;RBI=0.0397742;REFB=0;REVB=0.0330435;RO=0;SAF=11;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000396514;OID=.;OPOS=965043;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:20:21:1:9:11:0:0:10:11:0:0
chr19	990281	.	G	A	310.34	PASS	AF=0.584906;AO=31;DP=54;FAO=31;FDP=53;FR=.;FRO=22;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=0.0141003;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.925;QD=23.4215;RBI=0.0147321;REFB=-0.00865133;REVB=-0.00426796;RO=22;SAF=19;SAR=12;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0186938;STB=0.510303;STBP=0.884;TYPE=snp;VARB=0.00682559;OID=.;OPOS=990281;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:53:22:22:31:31:0.584906:12:19:14:8:12:19:14:8
chr19	1003172	.	C	T	348.05	PASS	AF=0.39604;AO=40;DP=101;FAO=40;FDP=101;FR=.;FRO=61;FSAF=14;FSAR=26;FSRF=22;FSRR=39;FWDB=-0.0220528;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.32;QD=13.784;RBI=0.0289521;REFB=-0.0210352;REVB=-0.0187589;RO=61;SAF=14;SAR=26;SRF=22;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0124025;STB=0.507039;STBP=0.924;TYPE=snp;VARB=0.0238448;OID=.;OPOS=1003172;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:101:61:61:40:40:0.39604:26:14:22:39:26:14:22:39
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chr19	1032689	.	G	T	135.22	PASS	AF=0.681818;AO=13;DP=22;FAO=15;FDP=22;FR=.;FRO=7;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.0399803;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=79.9115;QD=24.585;RBI=0.0636044;REFB=-0.0128734;REVB=0.0494682;RO=8;SAF=6;SAR=7;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145706;STB=0.604806;STBP=0.173;TYPE=snp;VARB=0.0090072;OID=.;OPOS=1032689;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:22:22:8:7:13:15:0.681818:7:6:2:6:8:7:1:6
chr19	1036552	.	T	C	300.29	PASS	AF=0.359223;AO=37;DP=103;FAO=37;FDP=103;FR=.;FRO=66;FSAF=30;FSAR=7;FSRF=44;FSRR=22;FWDB=-0.105117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.432;QD=11.6616;RBI=0.10632;REFB=0.00499989;REVB=-0.0159465;RO=64;SAF=30;SAR=7;SRF=42;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.229125;STB=0.626725;STBP=0.081;TYPE=snp;VARB=-0.0143357;OID=.;OPOS=1036552;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:103:64:66:37:37:0.359223:7:30:42:22:7:30:44:22
chr19	1036574	.	C	T	552.45	PASS	AF=0.566667;AO=51;DP=90;FAO=51;FDP=90;FR=.;FRO=39;FSAF=36;FSAR=15;FSRF=30;FSRR=9;FWDB=0.0117595;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=129.391;QD=24.5535;RBI=0.0150201;REFB=-0.0157333;REVB=0.00934441;RO=38;SAF=36;SAR=15;SRF=29;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0552455;STB=0.533968;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=0.00840238;OID=.;OPOS=1036574;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:38:39:51:51:0.566667:15:36:29:9:15:36:30:9
chr19	1038995	.	A	C	551.58	PASS	AF=0.382353;AO=65;DP=169;FAO=65;FDP=170;FR=.;FRO=105;FSAF=25;FSAR=40;FSRF=50;FSRR=55;FWDB=-0.00838047;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.976;QD=12.9784;RBI=0.00926807;REFB=-0.00148031;REVB=-0.00395789;RO=103;SAF=25;SAR=40;SRF=50;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111996;STB=0.558121;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=0.00194988;OID=.;OPOS=1038995;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:169:170:103:105:65:65:0.382353:40:25:50:53:40:25:50:55
chr19	1042809	.	A	G	78.64	PASS	AF=0.47619;AO=10;DP=21;FAO=10;FDP=21;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=-0.00490414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.101;QD=14.9787;RBI=0.00496429;REFB=-0.0117605;REVB=-0.000770411;RO=11;SAF=3;SAR=7;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0294979;STB=0.517207;STBP=0.894;TYPE=snp;VARB=0.0128609;OID=.;OPOS=1042809;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:21:21:11:11:10:10:0.47619:7:3:3:8:7:3:3:8
chr19	1045173	.	G	A	240.36	PASS	AF=0.647059;AO=22;DP=34;FAO=22;FDP=34;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.0157871;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.2789;QD=28.277;RBI=0.0265947;REFB=-0.0595025;REVB=0.021402;RO=12;SAF=8;SAR=14;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0912834;STB=0.550515;STBP=0.404;TYPE=snp;VARB=0.0319167;OID=.;OPOS=1045173;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:34:34:12:12:22:22:0.647059:14:8:6:6:14:8:6:6
chr19	1047002	.	A	G	120.18	PASS	AF=0.411765;AO=14;DP=34;FAO=14;FDP=34;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=-0.0504304;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.9759;QD=14.1391;RBI=0.083435;REFB=-0.0582424;REVB=-0.0664694;RO=20;SAF=7;SAR=7;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151967;STB=0.588113;STBP=0.387;TYPE=snp;VARB=0.0508436;OID=.;OPOS=1047002;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:20:20:14:14:0.411765:7:7:13:7:7:7:13:7
chr19	1047161	.	A	G	445.75	PASS	AF=0.431034;AO=48;DP=114;FAO=50;FDP=116;FR=.;FRO=66;FSAF=33;FSAR=17;FSRF=31;FSRR=35;FWDB=-0.0104802;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.453;QD=15.3706;RBI=0.0204792;REFB=-0.0126883;REVB=-0.0175944;RO=65;SAF=31;SAR=17;SRF=30;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192757;STB=0.611937;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.0172576;OID=.;OPOS=1047161;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:114:116:65:66:48:50:0.431034:17:31:30:35:17:33:31:35
chr19	1047537	.	A	C	308.0	PASS	AF=0.588235;AO=30;DP=51;FAO=30;FDP=51;FR=.;FRO=21;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=-0.0202007;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.4931;QD=24.1571;RBI=0.0255547;REFB=-0.00147869;REVB=-0.0156517;RO=21;SAF=19;SAR=11;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121477;STB=0.567119;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=0.000405524;OID=.;OPOS=1047537;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:21:21:30:30:0.588235:11:19:10:11:11:19:10:11
chr19	1049305	.	C	A	1048.13	PASS	AF=0.430712;AO=115;DP=267;FAO=115;FDP=267;FR=.;FRO=152;FSAF=35;FSAR=80;FSRF=80;FSRR=72;FWDB=0.0238548;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.0373;QD=15.7023;RBI=0.0607813;REFB=-0.0138298;REVB=0.0559045;RO=149;SAF=35;SAR=80;SRF=77;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.22845;STB=0.633585;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0188993;OID=.;OPOS=1049305;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:267:267:149:152:115:115:0.430712:80:35:77:72:80:35:80:72
chr19	1051214	.	A	G	207.89	PASS	AF=0.446809;AO=20;DP=46;FAO=21;FDP=47;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.0268001;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.031;QD=17.6925;RBI=0.0295751;REFB=-0.0267524;REVB=-0.0125076;RO=25;SAF=10;SAR=10;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0194604;STB=0.513172;STBP=0.813;TYPE=snp;VARB=0.0323724;OID=.;OPOS=1051214;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:47:25:26:20:21:0.446809:10:10:13:12:10:11:13:13
chr19	1053524	.	C	G	66.27	PASS	AF=0.409091;AO=9;DP=22;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=3;FWDB=0.0094895;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.018;QD=12.0487;RBI=0.0722118;REFB=-0.0230786;REVB=-0.0715855;RO=13;SAF=4;SAR=5;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.316785;STB=0.685902;STBP=0.2;TYPE=snp;VARB=0.0337015;OID=.;OPOS=1053524;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:22:22:13:13:9:9:0.409091:5:4:10:3:5:4:10:3
chr19	1056492	.	G	C	101.86	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0117994;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.2573;QD=40.743;RBI=0.0160807;REFB=0;REVB=0.0109253;RO=0;SAF=2;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.0233e-05;OID=.;OPOS=1056492;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:8:2:0:0:8:2:0:0
chr19	1058176	.	A	G	233.2	PASS	AF=0.479167;AO=22;DP=47;FAO=23;FDP=48;FR=.;FRO=25;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.0512092;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.0666;QD=19.433;RBI=0.0521023;REFB=0.00324824;REVB=-0.00960549;RO=24;SAF=14;SAR=8;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0915131;STB=0.526293;STBP=0.745;TYPE=snp;VARB=-0.00611352;OID=.;OPOS=1058176;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:48:24:25:22:23:0.479167:8:14:13:11:9:14:14:11
chr19	1062192	.	T	C	257.79	PASS	AF=0.519231;AO=27;DP=52;FAO=27;FDP=52;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=-0.0238398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.3352;QD=19.8296;RBI=0.0238429;REFB=-0.0144971;REVB=-0.000383848;RO=24;SAF=9;SAR=18;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.250601;STB=0.649239;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.0302695;OID=.;OPOS=1062192;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:24:25:27:27:0.519231:18:9:15:9:18:9:16:9
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chr19	1068734	.	T	C	283.68	PASS	AF=0.366667;AO=33;DP=90;FAO=33;FDP=90;FR=.;FRO=57;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=32;FSRR=25;FWDB=-0.012509;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.601;QD=12.608;RBI=0.0424522;REFB=-0.0152917;REVB=-0.0405675;RO=56;SAF=14;SAR=19;SRF=31;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141668;STB=0.586525;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=0.0289583;OID=.;OPOS=1068734;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:56:57:33:33:0.366667:19:14:31:25:19:14:32:25
chr19	1068738	.	G	A	296.53	PASS	AF=0.377778;AO=34;DP=90;FAO=34;FDP=90;FR=.;FRO=56;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=31;FSRR=25;FWDB=0.0222919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.753;QD=13.1792;RBI=0.0399953;REFB=-0.0115392;REVB=0.0332068;RO=56;SAF=15;SAR=19;SRF=31;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121976;STB=0.569711;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.0102652;OID=.;OPOS=1068738;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:56:56:34:34:0.377778:19:15:31:25:19:15:31:25
chr19	1074000	.	A	T	230.05	PASS	AF=0.358974;AO=28;DP=79;FAO=28;FDP=78;FR=.;FRO=50;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=31;FSRR=19;FWDB=-0.0130397;FXX=0.0126566;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.29;QD=11.7974;RBI=0.0156709;REFB=-0.0145071;REVB=-0.00869165;RO=50;SAF=11;SAR=17;SRF=31;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.248677;STB=0.643143;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.0203201;OID=.;OPOS=1074000;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:78:50:50:28:28:0.358974:17:11:31:19:17:11:31:19
chr19	1077985	.	A	G	30.99	PASS	AF=0.5;AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.0025442;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.484;QD=12.3958;RBI=0.0193009;REFB=-0.0417081;REVB=0.0191325;RO=5;SAF=3;SAR=2;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0401604;OID=.;OPOS=1077985;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:27:10:10:5:5:5:5:0.5:2:3:3:2:2:3:3:2
chr19	1080311	.	G	C	47.2	PASS	AF=0.411765;AO=7;DP=17;FAO=7;FDP=17;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=0.0288875;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.3318;QD=11.1063;RBI=0.0657511;REFB=0.00327513;REVB=0.0590654;RO=10;SAF=5;SAR=2;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125396;STB=0.576693;STBP=0.698;TYPE=snp;VARB=-0.00640858;OID=.;OPOS=1080311;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:17:17:10:10:7:7:0.411765:2:5:6:4:2:5:6:4
chr19	1094004	.	G	A	1115.4	PASS	AF=1;AO=71;DP=73;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0314629;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.864;QD=60.2921;RBI=0.031466;REFB=0;REVB=-0.00044717;RO=0;SAF=42;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.11804e-05;OID=.;OPOS=1094004;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:74:0:0:71:74:1:29:42:0:0:29:45:0:0
chr19	1106615	.	T	C	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.105728;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.827;QD=37.4885;RBI=0.109755;REFB=0;REVB=0.0294562;RO=0;SAF=1;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.78849e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00138535;OID=.;OPOS=1106615;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:7:1:0:0:7:1:0:0
chr19	1109213	.	A	G	159.87	PASS	AF=0.548387;AO=15;DP=30;FAO=17;FDP=31;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=-0.0191243;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.533;QD=20.6288;RBI=0.021297;REFB=-0.014853;REVB=-0.00937156;RO=14;SAF=4;SAR=11;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.384686;STB=0.692078;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.0342891;OID=.;OPOS=1109213;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:31:14:14:15:17:0.548387:11:4:10:4:12:5:10:4
chr19	1113701	.	G	A	161.49	PASS	AF=0.5;AO=17;DP=34;FAO=17;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.00208447;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=166.524;QD=18.9991;RBI=0.00806053;REFB=-0.0204181;REVB=-0.00778634;RO=17;SAF=9;SAR=8;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103195;STB=0.558552;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.0199108;OID=.;OPOS=1113701;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:17:17:17:17:0.5:8:9:7:10:8:9:7:10
chr19	1119019	.	C	T	291.6	PASS	AF=0.516667;AO=31;DP=60;FAO=31;FDP=60;FR=.;FRO=29;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=0.00126423;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.895;QD=19.44;RBI=0.00912482;REFB=-0.0357348;REVB=0.00903681;RO=29;SAF=17;SAR=14;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00292445;STB=0.501628;STBP=0.998;TYPE=snp;VARB=0.0266684;OID=.;OPOS=1119019;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:29:29:31:31:0.516667:14:17:16:13:14:17:16:13
chr19	1119963	.	A	G	340.39	PASS	AF=0.586207;AO=33;DP=57;FAO=34;FDP=58;FR=.;FRO=24;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=-0.00697106;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.29;QD=23.4748;RBI=0.0160319;REFB=0.0109825;REVB=-0.014437;RO=23;SAF=19;SAR=14;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137567;STB=0.571386;STBP=0.21;TYPE=snp;VARB=-0.00545219;OID=.;OPOS=1119963;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:58:23:24:33:34:0.586207:14:19:9:14:14:20:10:14
chr19	1122147	.	G	A	125.85	PASS	AF=0.518519;AO=14;DP=27;FAO=14;FDP=27;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=-0.0119017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.22;QD=18.6442;RBI=0.0349208;REFB=0.00101314;REVB=-0.03283;RO=13;SAF=8;SAR=6;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106175;STB=0.560356;STBP=0.579;TYPE=snp;VARB=-0.00148068;OID=.;OPOS=1122147;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:13:13:14:14:0.518519:6:8:9:4:6:8:9:4
chr19	1124053	.	A	G	39.05	PASS	AF=0.461538;AO=6;DP=13;FAO=6;FDP=13;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=-0.00884576;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.173;QD=12.0157;RBI=0.0165338;REFB=-0.00883114;REVB=-0.0139685;RO=7;SAF=5;SAR=1;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.505451;STB=0.809724;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=0.0313707;OID=.;OPOS=1124053;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:13:13:7:7:6:6:0.461538:1:5:2:5:1:5:2:5
chr19	1222012	.	G	C	427.87	PASS	AF=0.939394;AO=31;DP=33;FAO=31;FDP=33;FR=.;FRO=2;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00518092;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.2428;QD=51.8625;RBI=0.00810664;REFB=-0.121922;REVB=0.00623504;RO=2;SAF=14;SAR=17;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0620846;STB=0.533312;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=0.00769872;OID=.;OPOS=1222012;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:33:33:2:2:31:31:0.939394:17:14:2:0:17:14:2:0
chr19	1231142	.	T	C	346.08	PASS	AF=0.961538;AO=19;DP=30;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0104324;FXX=0.133289;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.201;QD=53.2428;RBI=0.0450973;REFB=-0.112654;REVB=0.043874;RO=0;SAF=16;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512185;STBP=0.633;TYPE=snp;VARB=0.00129747;OID=.;OPOS=1231142;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:30:26:0:1:19:25:0.961538:3:16:0:0:5:20:1:0
chr19	1235060	.	A	C	300.15	PASS	AF=0.296296;AO=41;DP=135;FAO=40;FDP=135;FR=.;FRO=95;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=50;FSRR=45;FWDB=-0.0281985;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.4965;QD=8.89336;RBI=0.0385067;REFB=-0.0124025;REVB=0.0262224;RO=92;SAF=24;SAR=17;SRF=47;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0892303;STB=0.534666;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=0.0293531;OID=.;OPOS=1235060;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:135:135:92:95:41:40:0.296296:17:24:47:45:17:23:50:45
chr19	1272040	.	T	C	1402.59	PASS	AF=0.989011;AO=90;DP=92;FAO=90;FDP=91;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0157663;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.272;QD=61.6523;RBI=0.0227818;REFB=-0.0129659;REVB=0.0164448;RO=1;SAF=45;SAR=45;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0104166;STB=0.505493;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=6.60854e-05;OID=.;OPOS=1272040;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:92:91:1:1:90:90:0.989011:45:45:1:0:45:45:1:0
chr19	1277275	.	G	C	375.63	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0214532;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.8935;QD=55.6494;RBI=0.0450837;REFB=0;REVB=0.0396523;RO=0;SAF=18;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000511344;OID=.;OPOS=1277275;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:9:18:0:0:9:18:0:0
chr19	1279122	.	A	G	35.42	PASS	AF=0.118644;AO=7;DP=56;FAO=7;FDP=59;FR=.;FRO=52;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=24;FSRR=28;FWDB=-0.0219092;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=40.9322;QD=2.40106;RBI=0.0933067;REFB=-0.0169119;REVB=-0.0906981;RO=49;SAF=4;SAR=3;SRF=23;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120454;STB=0.595882;STBP=0.65;TYPE=snp;VARB=0.111103;OID=.;OPOS=1279122;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:56:59:49:52:7:7:0.118644:3:4:23:26:3:4:24:28
chr19	1438865	.	C	T	123.13	PASS	AF=0.466667;AO=14;DP=30;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.0288991;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.939;QD=16.4179;RBI=0.0335323;REFB=0.0082977;REVB=0.0170075;RO=16;SAF=3;SAR=11;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.251797;STB=0.646828;STBP=0.184;TYPE=snp;VARB=-0.00589112;OID=.;OPOS=1438865;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:16:16:14:14:0.466667:11:3:7:9:11:3:7:9
chr19	1453308	.	G	A	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00425625;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=121.1;QD=37.4885;RBI=0.0520607;REFB=0;REVB=0.0518864;RO=0;SAF=2;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.58669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00130723;OID=.;OPOS=1453308;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:6:2:0:0:6:2:0:0
chr19	1495634	.	G	A	378.36	PASS	AF=0.642857;AO=35;DP=55;FAO=36;FDP=56;FR=.;FRO=20;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=0.0270182;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.361;QD=27.0258;RBI=0.0282427;REFB=-0.0234698;REVB=0.00822593;RO=20;SAF=13;SAR=22;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0202086;STB=0.504164;STBP=0.943;TYPE=snp;VARB=0.021086;OID=.;OPOS=1495634;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:56:20:20:35:36:0.642857:22:13:8:12:22:14:8:12
chr19	1497543	.	A	G	367.6	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0339625;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.218;QD=54.4587;RBI=0.0345447;REFB=0;REVB=-0.0063153;RO=0;SAF=8;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00032101;OID=.;OPOS=1497543;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:27:0:0:25:27:1:17:8:0:0:17:10:0:0
chr19	1510661	.	A	G	102.05	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0035065;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.738;QD=40.8198;RBI=0.0570942;REFB=0;REVB=0.0569864;RO=0;SAF=6;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00188104;OID=.;OPOS=1510661;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:10:0:0:9:10:1:3:6:0:0:4:6:0:0
chr19	1533972	.	C	G	1507.41	PASS	AF=0.990291;AO=102;DP=103;FAO=102;FDP=103;FR=.;FRO=1;FSAF=50;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00834375;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.111;QD=58.5404;RBI=0.0481873;REFB=-0.121077;REVB=0.0474594;RO=0;SAF=50;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504761;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.000664954;OID=.;OPOS=1533972;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:103:103:0:1:102:102:0.990291:52:50:0:0:52:50:0:1
chr19	1534042	.	T	C,G	865.29	PASS	AF=0.918033,0.0819672;AO=55,6;DP=61;FAO=56,5;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=25,1;FSAR=31,4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0303727,-0.0282337;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=77.4434,137.096;QD=56.7404;RBI=0.0360689,0.0311696;REFB=0,0;REVB=-0.0194541,0.0132062;RO=0;SAF=24,2;SAR=31,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0039305,0.0308557;OID=.,.;OPOS=1534042,1534042;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:19:61:61:0:0:55,6:56,5:0.918033,0.0819672:31,4:24,2:0:0:31,4:25,1:0:0
chr19	1535084	.	G	A	1415.43	PASS	AF=1;AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0106955;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=268.092;QD=62.9079;RBI=0.0149005;REFB=0;REVB=0.0103745;RO=0;SAF=48;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.4082e-05;OID=.;OPOS=1535084;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:90:90:0:0:90:90:1:42:48:0:0:42:48:0:0
chr19	1535193	.	GCCC	G,GCCA	736.87	PASS	AF=0.833333,0.166667;AO=37,10;DP=50;FAO=40,8;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=14,3;FSAR=26,5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0221964,-0.0212201;FXX=0.039992;HRUN=5,5;LEN=3,1;MLLD=43.4082,181.357;QD=61.406;RBI=0.0350312,0.0232401;REFB=0,0;REVB=0.0271018,0.00947686;RO=0;SAF=11,5;SAR=26,5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.00351673,0.00457351;OID=.,.;OPOS=1535194,1535196;OREF=CCC,C;OALT=-,A;OMAPALT=G,GCCA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.833333,0.166667:37,10:50:40,8:48:0:14,3:26,5:0:0:51:0:11,5:26,5:0:0
chr19	1535205	.	G	C	765.74	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0434854;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.824;QD=63.8114;RBI=0.101446;REFB=0;REVB=-0.0916536;RO=0;SAF=20;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.56477e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000637397;OID=.;OPOS=1535205;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:28:20:0:0:28:20:0:0
chr19	1609267	.	A	G	508.41	PASS	AF=0.972222;AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0098049;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=244.869;QD=56.4901;RBI=0.00984222;REFB=-0.076453;REVB=-0.000856238;RO=1;SAF=18;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0252795;STB=0.513506;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.000230089;OID=.;OPOS=1609267;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:36:36:1:1:35:35:0.972222:17:18:1:0:17:18:1:0
chr19	1615707	.	T	G	33.48	PASS	AF=0.714286;AO=4;DP=6;FAO=5;FDP=7;FR=.;FRO=2;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00505903;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.497;QD=19.1295;RBI=0.0182236;REFB=0.00611483;REVB=0.0175073;RO=2;SAF=2;SAR=2;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.277405;STB=0.666029;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=-0.0117948;OID=.;OPOS=1615707;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:6:7:2:2:4:5:0.714286:2:2:0:2:2:3:0:2
chr19	1624007	.	A	G	863.23	PASS	AF=0.453659;AO=92;DP=202;FAO=93;FDP=205;FR=.;FRO=112;FSAF=48;FSAR=45;FSRF=56;FSRR=56;FWDB=-0.0220185;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.3644;QD=16.8435;RBI=0.0364944;REFB=0.000656723;REVB=-0.0291036;RO=110;SAF=48;SAR=44;SRF=56;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0124402;STB=0.508814;STBP=0.809;TYPE=snp;VARB=-0.00108078;OID=.;OPOS=1624007;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:202:205:110:112:92:93:0.453659:44:48:56:54:45:48:56:56
chr19	1782798	.	A	G	136.86	PASS	AF=0.5;AO=15;DP=30;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.00227029;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.256;QD=18.2483;RBI=0.0303442;REFB=0.00999335;REVB=0.0302591;RO=15;SAF=5;SAR=10;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124555;STB=0.571331;STBP=0.486;TYPE=snp;VARB=-0.00826418;OID=.;OPOS=1782798;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:15:15:15:15:0.5:10:5:7:8:10:5:7:8
chr19	1783261	.	C	T	125.74	PASS	AF=0.538462;AO=14;DP=26;FAO=14;FDP=26;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.000321076;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.3602;QD=19.3445;RBI=0.0592467;REFB=0.0105931;REVB=0.0592458;RO=12;SAF=7;SAR=7;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0675494;STB=0.538407;STBP=0.687;TYPE=snp;VARB=-0.00697012;OID=.;OPOS=1783261;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:26:12:12:14:14:0.538462:7:7:7:5:7:7:7:5
chr19	1784890	.	A	G	187.92	PASS	AF=0.513514;AO=19;DP=37;FAO=19;FDP=37;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.0146393;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.693;QD=20.3158;RBI=0.0157934;REFB=-0.0288439;REVB=0.00592629;RO=17;SAF=9;SAR=10;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0522087;STB=0.541504;STBP=0.612;TYPE=snp;VARB=0.0253591;OID=.;OPOS=1784890;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:17:18:19:19:0.513514:10:9:7:10:10:9:7:11
chr19	1784944	.	A	G	103.51	PASS	AF=0.545455;AO=12;DP=22;FAO=12;FDP=22;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.0417713;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.514;QD=18.8203;RBI=0.0424753;REFB=-0.0265074;REVB=-0.007701;RO=10;SAF=3;SAR=9;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0511116;STB=0.529361;STBP=0.835;TYPE=snp;VARB=0.027989;OID=.;OPOS=1784944;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:22:22:10:10:12:12:0.545455:9:3:3:7:9:3:3:7
chr19	1789556	.	C	T	106.86	PASS	AF=0.371429;AO=13;DP=35;FAO=13;FDP=35;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.00247293;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.6759;QD=12.2126;RBI=0.0541438;REFB=-0.0068222;REVB=-0.0540873;RO=22;SAF=10;SAR=3;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.358935;STB=0.713936;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=0.00867101;OID=.;OPOS=1789556;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:22:22:13:13:0.371429:3:10:10:12:3:10:10:12
chr19	1796166	.	C	T	638.24	PASS	AF=1;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00138039;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.871;QD=62.2669;RBI=0.0255729;REFB=0;REVB=0.0255356;RO=0;SAF=24;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.2194e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000226252;OID=.;OPOS=1796166;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:41:0:0:41:41:1:17:24:0:0:17:24:0:0
chr19	1806083	.	A	C	56.27	PASS	AF=0.4;AO=8;DP=20;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=-0.0365487;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.6616;QD=11.2542;RBI=0.09862;REFB=-0.00667567;REVB=-0.0915975;RO=12;SAF=6;SAR=2;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000207746;OID=.;OPOS=1806083;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:20:20:12:12:8:8:0.4:2:6:9:3:2:6:9:3
chr19	1810605	.	T	C	135.77	PASS	AF=0.7;AO=14;DP=20;FAO=14;FDP=20;FR=.;FRO=6;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.00372761;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.884;QD=27.154;RBI=0.00812105;REFB=-0.0203618;REVB=-0.00721501;RO=6;SAF=6;SAR=8;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0526313;STB=0.52937;STBP=0.71;TYPE=snp;VARB=0.0128166;OID=.;OPOS=1810605;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:20:20:6:6:14:14:0.7:8:6:2:4:8:6:2:4
chr19	1826974	.	T	A	214.82	PASS	AF=0.346154;AO=27;DP=80;FAO=27;FDP=78;FR=.;FRO=51;FSAF=22;FSAR=5;FSRF=29;FSRR=22;FWDB=-0.0156149;FXX=0.0249969;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.199;QD=11.0165;RBI=0.0728995;REFB=-0.00892464;REVB=0.0712075;RO=51;SAF=22;SAR=5;SRF=29;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.338088;STB=0.699481;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.0167113;OID=.;OPOS=1826974;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:78:51:51:27:27:0.346154:5:22:29:22:5:22:29:22
chr19	1854728	.	G	A	309.83	PASS	AF=0.421687;AO=33;DP=82;FAO=35;FDP=83;FR=.;FRO=48;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=26;FSRR=22;FWDB=0.00264955;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.619;QD=14.9313;RBI=0.00290531;REFB=-0.0142475;REVB=-0.00119194;RO=40;SAF=13;SAR=20;SRF=26;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.246384;STB=0.56548;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=0.0244452;OID=.;OPOS=1854728;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:83:40:48:33:35:0.421687:20:13:26:14:20:15:26:22
chr19	1925970	.	T	C	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0166882;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.187;QD=48.7363;RBI=0.0222405;REFB=0;REVB=0.0147018;RO=0;SAF=3;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.53656e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.2602e-06;OID=.;OPOS=1925970;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:14:3:0:0:14:3:0:0
chr19	1979811	.	A	G	55.86	PASS	AF=0.380952;AO=8;DP=21;FAO=8;FDP=21;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=0.0135777;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=139.41;QD=10.6403;RBI=0.017796;REFB=0.0124233;REVB=0.0115041;RO=13;SAF=3;SAR=5;SRF=3;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.16722;STB=0.599771;STBP=0.574;TYPE=snp;VARB=-0.00622809;OID=.;OPOS=1979811;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:21:21:13:13:8:8:0.380952:5:3:3:10:5:3:3:10
chr19	1979907	.	C	T	134.24	PASS	AF=0.454545;AO=15;DP=33;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=-0.029919;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.1568;QD=16.2712;RBI=0.03289;REFB=-0.0249414;REVB=0.0136605;RO=18;SAF=6;SAR=9;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0669461;STB=0.538411;STBP=0.688;TYPE=snp;VARB=0.0296866;OID=.;OPOS=1979907;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:18:18:15:15:0.454545:9:6:6:12:9:6:6:12
chr19	2041032	.	T	C	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00531331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.918;QD=56.1914;RBI=0.0487861;REFB=0;REVB=-0.0484959;RO=0;SAF=22;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.54875e-05;OID=.;OPOS=2041032;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:6:22:0:0:6:22:0:0
chr19	2098770	.	C	T	196.74	PASS	AF=0.465116;AO=20;DP=43;FAO=20;FDP=43;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.0310546;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=260.228;QD=18.3009;RBI=0.0364162;REFB=-0.0139113;REVB=0.0190197;RO=23;SAF=9;SAR=11;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0267609;STB=0.515207;STBP=0.831;TYPE=snp;VARB=0.0186241;OID=.;OPOS=2098770;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:23:23:20:20:0.465116:11:9:11:12:11:9:11:12
chr19	2250469	.	G	A	165.94	PASS	AF=0.761905;AO=16;DP=21;FAO=16;FDP=21;FR=.;FRO=5;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=-0.0116616;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=157.827;QD=31.6076;RBI=0.0126075;REFB=-0.06107;REVB=0.00479143;RO=5;SAF=6;SAR=10;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0823487;STB=0.545399;STBP=0.545;TYPE=snp;VARB=0.0502973;OID=.;OPOS=2250469;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:21:21:5:5:16:16:0.761905:10:6:1:4:10:6:1:4
chr19	2251817	.	T	C	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00520355;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.691;QD=59.4352;RBI=0.0247549;REFB=0;REVB=-0.0242018;RO=0;SAF=13;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.39865e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000143298;OID=.;OPOS=2251817;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:22:13:0:0:22:13:0:0
chr19	2252990	.	C	G	771.32	PASS	AF=0.982143;AO=55;DP=56;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00783385;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=256.825;QD=55.0945;RBI=0.0317251;REFB=-0.163353;REVB=0.0307427;RO=0;SAF=23;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.49259e-08;STB=0.510634;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.000629847;OID=.;OPOS=2252990;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:56:56:0:1:55:55:0.982143:32:23:0:0:32:23:1:0
chr19	2337468	.	G	A	141.93	PASS	AF=0.322034;AO=19;DP=59;FAO=19;FDP=59;FR=.;FRO=40;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=26;FWDB=0.0118583;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.073;QD=9.62229;RBI=0.0118641;REFB=-0.00469934;REVB=0.000371248;RO=40;SAF=6;SAR=13;SRF=14;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0443604;STB=0.526288;STBP=0.822;TYPE=snp;VARB=0.0115171;OID=.;OPOS=2337468;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:40:40:19:19:0.322034:13:6:14:26:13:6:14:26
chr19	2339958	.	T	C	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0425912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=299.496;QD=55.0987;RBI=0.0425941;REFB=0;REVB=-0.00049137;RO=0;SAF=3;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00017019;OID=.;OPOS=2339958;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:23:3:0:0:23:3:0:0
chr19	2340154	.	G	GC	1276.19	PASS	AF=1;AO=103;DP=136;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.127129;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=14.0948;QD=37.813;RBI=0.256715;REFB=0;REVB=0.223026;RO=30;SAF=41;SAR=62;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0155113;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.0039372;OID=.;OPOS=2340155;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:103:136:135:135:0:52:83:0:0:25:30:41:62:13:17
chr19	2341059	.	GT	AC,GC	187.21	PASS	AF=0.1875,0.8125;AO=3,13;DP=16;FAO=3,13;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=2,3;FSAR=1,10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0461192,0.0478619;FXX=0;HRUN=3,1;LEN=2,1;MLLD=99.6031,115.866;QD=46.8034;RBI=0.0465061,0.0505537;REFB=0,0;REVB=-0.00598643,0.0162761;RO=0;SAF=2,3;SAR=1,10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=-0.0131081,0.00726556;OID=.,.;OPOS=2341059,2341060;OREF=GT,T;OALT=AC,C;OMAPALT=AC,GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:14:16:16:0:0:3,13:3,13:0.1875,0.8125:1,10:2,3:0:0:1,10:2,3:0:0
chr19	2341577	.	G	A	143.66	PASS	AF=0.4;AO=15;DP=41;FAO=16;FDP=40;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=0.00208155;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.088;QD=14.3663;RBI=0.00583272;REFB=0.000159116;REVB=0.00544865;RO=23;SAF=5;SAR=10;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.285453;STB=0.624844;STBP=0.217;TYPE=snp;VARB=-0.000787068;OID=.;OPOS=2341577;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:40:23:24:15:16:0.4:10:5:14:9:10:6:14:10
chr19	2344022	.	G	A	141.34	PASS	AF=0.576923;AO=15;DP=26;FAO=15;FDP=26;FR=.;FRO=11;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=-0.0287341;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.3495;QD=21.7443;RBI=0.0458005;REFB=-0.00265494;REVB=0.0356657;RO=11;SAF=8;SAR=7;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00912176;STB=0.505148;STBP=0.957;TYPE=snp;VARB=0.00220623;OID=.;OPOS=2344022;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:26:26:11:11:15:15:0.576923:7:8:6:5:7:8:6:5
chr19	2353150	.	C	A	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0363724;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=232.119;QD=51.916;RBI=0.0608108;REFB=0;REVB=0.048734;RO=0;SAF=9;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000385419;OID=.;OPOS=2353150;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:12:9:0:0:12:9:0:0
chr19	2396556	.	C	T	130.4	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.045432;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.411;QD=43.4654;RBI=0.0744452;REFB=0;REVB=0.0589748;RO=0;SAF=3;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00115162;OID=.;OPOS=2396556;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:12:0:0:11:12:1:8:3:0:0:8:4:0:0
chr19	2396611	.	C	T	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0237796;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.202;QD=46.8478;RBI=0.0480475;REFB=0;REVB=0.0417504;RO=0;SAF=3;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000130454;OID=.;OPOS=2396611;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:12:3:0:0:12:3:0:0
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chr19	2405456	.	C	T	249.81	PASS	AF=0.416667;AO=29;DP=70;FAO=30;FDP=72;FR=.;FRO=42;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=18;FSRR=24;FWDB=-0.0159561;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.779;QD=13.8781;RBI=0.0421566;REFB=-0.0102061;REVB=-0.0390203;RO=41;SAF=11;SAR=18;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.064053;STB=0.53806;STBP=0.635;TYPE=snp;VARB=0.0128776;OID=.;OPOS=2405456;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:72:41:42:29:30:0.416667:18:11:18:23:19:11:18:24
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chr19	2714720	.	A	G	244.37	PASS	AF=1;AO=19;DP=20;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0450624;FXX=0.049975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.881;QD=51.4453;RBI=0.0494682;REFB=0;REVB=0.0204079;RO=0;SAF=14;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000129246;OID=.;OPOS=2714720;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:19:0:0:19:19:1:5:14:0:0:5:14:0:0
chr19	2714770	.	GT	CC,GC	441.27	PASS	AF=0.03125,0.96875;AO=3,25;DP=32;FAO=1,31;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=1,24;FSAR=0,7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.088013,-0.152597;FXX=0;HRUN=3,1;LEN=2,1;MLLD=24.0855,52.7889;QD=55.159;RBI=0.0979101,0.162839;REFB=0,0;REVB=0.0428965,0.0568391;RO=0;SAF=3,19;SAR=0,6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0540901,-0.0114175;OID=.,.;OPOS=2714770,2714771;OREF=GT,T;OALT=CC,C;OMAPALT=CC,GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:5:32:32:0:0:3,25:1,31:0.03125,0.96875:0,6:3,19:0:0:0,7:1,24:0:0
chr19	2717256	.	C	G	64.46	PASS	AF=0.346154;AO=9;DP=26;FAO=9;FDP=26;FR=.;FRO=17;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=-0.00473304;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=148.903;QD=9.91651;RBI=0.00501013;REFB=-0.0123088;REVB=0.00164309;RO=17;SAF=2;SAR=7;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.502527;STB=0.802636;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.0514829;OID=.;OPOS=2717256;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:26:26:17:17:9:9:0.346154:7:2:12:5:7:2:12:5
chr19	2732986	.	T	C	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0360907;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=248.68;QD=45.8067;RBI=0.0374931;REFB=0;REVB=-0.0101584;RO=0;SAF=7;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000217784;OID=.;OPOS=2732986;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:7:7:0:0:7:7:0:0
chr19	2762585	.	A	C	465.14	PASS	AF=1;AO=31;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0582447;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.027;QD=58.1421;RBI=0.0680435;REFB=0;REVB=0.0351778;RO=0;SAF=16;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000621457;OID=.;OPOS=2762585;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:31:32:1:15:16:0:0:15:17:0:0
chr19	2767192	.	G	T	1011.54	PASS	AF=0.972222;AO=68;DP=70;FAO=70;FDP=72;FR=.;FRO=2;FSAF=35;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00718796;FXX=0.0270234;HRUN=4;LEN=1;MLLD=104.925;QD=56.1967;RBI=0.0307766;REFB=0.118549;REVB=0.0299254;RO=1;SAF=35;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141074;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.74293e-06;OID=.;OPOS=2767192;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:70:72:1:2:68:70:0.972222:33:35:0:1:35:35:1:1
chr19	2808314	.	A	C	192.41	PASS	AF=0.416667;AO=20;DP=48;FAO=20;FDP=48;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=9;FWDB=-0.00747543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.324;QD=16.0343;RBI=0.0268251;REFB=-0.00727692;REVB=-0.0257624;RO=26;SAF=6;SAR=14;SRF=18;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.381842;STB=0.717;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0085701;OID=.;OPOS=2808314;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:26:28:20:20:0.416667:14:6:18:8:14:6:19:9
chr19	2833802	.	A	G	538.56	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000469403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.41;QD=59.8394;RBI=0.0432495;REFB=0;REVB=0.043247;RO=0;SAF=21;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000114758;OID=.;OPOS=2833802;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:15:21:0:0:15:21:0:0
chr19	2833864	.	G	A	805.98	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0208488;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.8209;QD=64.4786;RBI=0.0318848;REFB=0;REVB=-0.024124;RO=0;SAF=31;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.58521e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00031414;OID=.;OPOS=2833864;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:50:0:0:49:50:1:18:31:0:0:19:31:0:0
chr19	2853566	.	A	G	191.28	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00964881;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.94;QD=47.8196;RBI=0.0354676;REFB=0;REVB=-0.03413;RO=0;SAF=6;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000394909;OID=.;OPOS=2853566;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:10:6:0:0:10:6:0:0
chr19	2896818	.	C	T	902.67	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0150083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.7064;QD=58.2367;RBI=0.0189817;REFB=0;REVB=-0.0116213;RO=0;SAF=29;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.50316e-05;OID=.;OPOS=2896818;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:33:29:0:0:33:29:0:0
chr19	2896948	.	T	C	1229.29	PASS	AF=1;AO=80;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0702222;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.2282;QD=60.7058;RBI=0.0754809;REFB=0;REVB=0.0276805;RO=0;SAF=46;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.3274e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000563006;OID=.;OPOS=2896948;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:81:0:0:80:81:1:34:46:0:0:34:47:0:0
chr19	2896953	.	A	G	1190.46	PASS	AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00666521;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.422;QD=61.0492;RBI=0.00855097;REFB=0;REVB=-0.00535668;RO=0;SAF=46;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5329e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.71705e-06;OID=.;OPOS=2896953;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:32:46:0:0:32:46:0:0
chr19	2915738	.	T	A	937.56	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0357507;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.109;QD=58.5973;RBI=0.0362738;REFB=0;REVB=0.00613808;RO=0;SAF=28;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000180727;OID=.;OPOS=2915738;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:36:28:0:0:36:28:0:0
chr19	2917186	.	T	C	817.55	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00875887;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.767;QD=57.3721;RBI=0.0101187;REFB=0;REVB=-0.00506665;RO=0;SAF=24;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.31216e-06;OID=.;OPOS=2917186;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:56:57:0:0:56:57:1:32:24:0:0:33:24:0:0
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chr19	2917287	.	C	A	781.61	PASS	AF=0.982456;AO=54;DP=55;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0772166;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.648;QD=54.8496;RBI=0.104857;REFB=-0.0723523;REVB=-0.0709404;RO=1;SAF=23;SAR=31;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0200481;STB=0.5102;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.00170607;OID=.;OPOS=2917287;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:55:57:1:1:54:56:0.982456:31:23:1:0:32:24:1:0
chr19	2917612	.	T	C	596.6	PASS	AF=1;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0104013;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.806;QD=61.1894;RBI=0.0136803;REFB=0;REVB=-0.00888614;RO=0;SAF=21;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.34792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.17321e-05;OID=.;OPOS=2917612;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:39:0:0:39:39:1:18:21:0:0:18:21:0:0
chr19	2934282	.	T	C	163.76	PASS	AF=0.367347;AO=18;DP=49;FAO=18;FDP=49;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=-0.0322439;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.146;QD=13.3678;RBI=0.0333438;REFB=0.00516819;REVB=0.00849367;RO=31;SAF=9;SAR=9;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122668;STB=0.571351;STBP=0.463;TYPE=snp;VARB=-0.0186642;OID=.;OPOS=2934282;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:31:31:18:18:0.367347:9:9:12:19:9:9:12:19
chr19	2936623	.	C	T	142.62	PASS	AF=0.4;AO=16;DP=40;FAO=16;FDP=40;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=-0.0168667;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.858;QD=14.262;RBI=0.017555;REFB=0.00340438;REVB=0.00486763;RO=24;SAF=8;SAR=8;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0861018;STB=0.549938;STBP=0.621;TYPE=snp;VARB=-0.00545347;OID=.;OPOS=2936623;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:24:24:16:16:0.4:8:8:10:14:8:8:10:14
chr19	2939289	.	A	C	91.24	PASS	AF=0.52381;AO=11;DP=21;FAO=11;FDP=21;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=-0.0227012;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.2114;QD=17.3781;RBI=0.0465735;REFB=0.0127969;REVB=0.0406662;RO=10;SAF=6;SAR=5;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0376028;STB=0.521699;STBP=0.937;TYPE=snp;VARB=-0.00944022;OID=.;OPOS=2939289;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:21:21:10:10:11:11:0.52381:5:6:5:5:5:6:5:5
chr19	2939396	.	T	C	66.83	PASS	AF=0.428571;AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=-0.0591388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.184;QD=12.73;RBI=0.0595222;REFB=-0.0168282;REVB=-0.00674526;RO=12;SAF=4;SAR=5;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.211189;STB=0.624732;STBP=0.38;TYPE=snp;VARB=0.0203004;OID=.;OPOS=2939396;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:21:21:12:12:9:9:0.428571:5:4:8:4:5:4:8:4
chr19	2939401	.	C	G	66.83	PASS	AF=0.428571;AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=0.00672981;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.484;QD=12.73;RBI=0.0278031;REFB=0.0117221;REVB=-0.0269764;RO=12;SAF=4;SAR=5;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.211189;STB=0.624732;STBP=0.38;TYPE=snp;VARB=-0.0129438;OID=.;OPOS=2939401;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:21:21:12:12:9:9:0.428571:5:4:8:4:5:4:8:4
chr19	2993427	.	T	C	1153.61	PASS	AF=1;AO=75;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0216836;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.183;QD=60.7161;RBI=0.0413668;REFB=0;REVB=0.0352284;RO=0;SAF=35;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.71047e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.09922e-05;OID=.;OPOS=2993427;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:75:76:1:40:35:0:0:41:35:0:0
chr19	3028871	.	G	C	127.63	PASS	AF=0.56;AO=13;DP=24;FAO=14;FDP=25;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.0234076;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.251;QD=20.4207;RBI=0.0236772;REFB=-0.0616636;REVB=0.00356309;RO=11;SAF=6;SAR=7;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0672983;STB=0.55165;STBP=0.606;TYPE=snp;VARB=0.0295599;OID=.;OPOS=3028871;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:24:25:11:11:13:14:0.56:7:6:6:5:8:6:6:5
chr19	3062857	.	T	C	278.55	PASS	AF=0.455882;AO=31;DP=68;FAO=31;FDP=68;FR=.;FRO=37;FSAF=28;FSAR=3;FSRF=32;FSRR=5;FWDB=0.0053745;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.4049;QD=16.385;RBI=0.0323036;REFB=-0.0214181;REVB=-0.0318534;RO=37;SAF=28;SAR=3;SRF=32;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0958604;STB=0.554417;STBP=0.619;TYPE=snp;VARB=0.0278703;OID=.;OPOS=3062857;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:37:37:31:31:0.455882:3:28:32:5:3:28:32:5
chr19	3119239	.	C	T	152.36	PASS	AF=0.551724;AO=16;DP=29;FAO=16;FDP=29;FR=.;FRO=13;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.0103084;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=255.804;QD=21.0155;RBI=0.0302288;REFB=-0.00253254;REVB=0.0284169;RO=13;SAF=10;SAR=6;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132778;STB=0.575126;STBP=0.42;TYPE=snp;VARB=0.00208696;OID=.;OPOS=3119239;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:13:13:16:16:0.551724:6:10:6:7:6:10:6:7
chr19	3150238	.	A	G	411.12	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0105484;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.709;QD=56.7066;RBI=0.0119305;REFB=0;REVB=-0.00557391;RO=0;SAF=11;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.70308e-05;OID=.;OPOS=3150238;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:18:11:0:0:18:11:0:0
chr19	3155902	.	G	A	871.02	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0280783;FXX=0.0161264;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.479;QD=57.1164;RBI=0.0298256;REFB=0;REVB=-0.0100586;RO=0;SAF=30;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00130085;OID=.;OPOS=3155902;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:61:0:0:59:61:1:29:30:0:0:29:32:0:0
chr19	3186085	.	G	T	1606.4	PASS	AF=1;AO=100;DP=100;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0394284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.444;QD=64.2562;RBI=0.0571402;REFB=0;REVB=0.041357;RO=0;SAF=70;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000149596;OID=.;OPOS=3186085;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:100:100:0:0:100:100:1:30:70:0:0:30:70:0:0
chr19	3193410	.	C	T	172.77	PASS	AF=0.315068;AO=23;DP=73;FAO=23;FDP=73;FR=.;FRO=50;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=29;FSRR=21;FWDB=-0.0167099;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.856;QD=9.467;RBI=0.0167099;REFB=-0.0107193;REVB=3.36599e-05;RO=50;SAF=13;SAR=10;SRF=29;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0175235;STB=0.510319;STBP=0.931;TYPE=snp;VARB=0.0352258;OID=.;OPOS=3193410;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:50:50:23:23:0.315068:10:13:29:21:10:13:29:21
chr19	3208890	.	T	C	1116.93	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0535961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.5005;QD=60.3746;RBI=0.0834521;REFB=0;REVB=0.0639664;RO=0;SAF=33;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.04432e-05;OID=.;OPOS=3208890;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:41:33:0:0:41:33:0:0
chr19	3224896	.	G	C	419.47	PASS	AF=0.462366;AO=42;DP=92;FAO=43;FDP=93;FR=.;FRO=50;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=29;FSRR=21;FWDB=-0.0041432;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.816;QD=18.0417;RBI=0.00673287;REFB=-0.00915848;REVB=0.0053071;RO=45;SAF=21;SAR=21;SRF=25;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0516338;STB=0.549154;STBP=0.454;TYPE=snp;VARB=0.0101676;OID=.;OPOS=3224896;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:93:45:50:42:43:0.462366:21:21:25:20:22:21:29:21
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chr19	3534842	.	G	A	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00178113;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=227.129;QD=49.5992;RBI=0.00294393;REFB=0;REVB=0.002344;RO=0;SAF=9;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.47544e-05;OID=.;OPOS=3534842;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:9:9:0:0:9:9:0:0
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chr19	3576314	.	CCTT	C	371.72	PASS	AF=0.918919;AO=29;DP=33;FAO=34;FDP=37;FR=.;FRO=3;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0184105;FXX=0;HRUN=2;LEN=3;MLLD=255.199;QD=40.1862;RBI=0.0194177;REFB=-0.013503;REVB=-0.00617265;RO=0;SAF=10;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506575;STBP=0.799;TYPE=del;VARB=0.00123144;OID=.;OPOS=3576315;OREF=CTT;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.918919:29:33:34:37:3:14:20:1:2:8:0:10:19:0:0
chr19	3595923	.	G	A	183.18	PASS	AF=0.62069;AO=18;DP=28;FAO=18;FDP=29;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=16;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=0.0220562;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.534;QD=25.2656;RBI=0.0229923;REFB=-0.0193528;REVB=0.00649397;RO=10;SAF=2;SAR=16;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126934;STB=0.624838;STBP=0.215;TYPE=snp;VARB=0.00993756;OID=.;OPOS=3595923;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:28:29:10:11:18:18:0.62069:16:2:2:8:16:2:3:8
chr19	3611283	.	C	CG	41.12	PASS	AF=0.169231;AO=12;DP=66;FAO=11;FDP=65;FR=.;FRO=54;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=24;FSRR=30;FWDB=-0.00372583;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=82.7094;QD=2.53031;RBI=0.0110744;REFB=-0.00649917;REVB=-0.0104289;RO=53;SAF=11;SAR=1;SRF=24;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.60646;STB=0.900407;STBP=0.007;TYPE=ins;VARB=0.191181;OID=.;OPOS=3611284;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.169231:12:66:11:65:54:10:1:24:30:41:53:11:1:24:29
chr19	3611765	.	A	G	56.78	PASS	AF=0.421053;AO=7;DP=18;FAO=8;FDP=19;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.00392811;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=349.261;QD=11.9536;RBI=0.00403589;REFB=0.00849272;REVB=-0.000926483;RO=10;SAF=4;SAR=3;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0695696;STB=0.547823;STBP=0.75;TYPE=snp;VARB=-0.00962887;OID=.;OPOS=3611765;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:18:19:10:11:7:8:0.421053:3:4:5:5:3:5:6:5
chr19	3614403	.	T	C	323.47	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0115021;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.607;QD=53.9111;RBI=0.0468395;REFB=0;REVB=0.0454053;RO=0;SAF=14;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000214348;OID=.;OPOS=3614403;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:10:14:0:0:10:14:0:0
chr19	3614538	.	C	T	203.23	PASS	AF=0.540541;AO=20;DP=37;FAO=20;FDP=37;FR=.;FRO=17;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=0.0162354;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.455;QD=21.971;RBI=0.0255017;REFB=-0.0274468;REVB=0.019666;RO=17;SAF=11;SAR=9;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0810706;STB=0.54541;STBP=0.567;TYPE=snp;VARB=0.018039;OID=.;OPOS=3614538;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:17:17:20:20:0.540541:9:11:11:6:9:11:11:6
chr19	3618928	.	G	A	123.98	PASS	AF=0.482759;AO=14;DP=29;FAO=14;FDP=29;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.00065714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.371;QD=17.1002;RBI=0.0108711;REFB=-0.0180481;REVB=-0.0108513;RO=15;SAF=7;SAR=7;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0299972;STB=0.517217;STBP=0.881;TYPE=snp;VARB=0.0163876;OID=.;OPOS=3618928;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:15:15:14:14:0.482759:7:7:8:7:7:7:8:7
chr19	3633192	.	A	G	66.49	PASS	AF=0.8;AO=7;DP=10;FAO=8;FDP=10;FR=.;FRO=2;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0498708;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.9051;QD=26.5969;RBI=0.057476;REFB=0.0119776;REVB=0.0285727;RO=3;SAF=6;SAR=1;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175667;STB=0.562356;STBP=0.67;TYPE=snp;VARB=-0.00508853;OID=.;OPOS=3633192;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:10:10:3:2:7:8:0.8:1:6:3:0:1:7:2:0
chr19	3653525	.	C	T	275.51	PASS	AF=0.581395;AO=25;DP=43;FAO=25;FDP=43;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=5;FSRR=13;FWDB=0.000313657;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=251.448;QD=25.6285;RBI=0.00177271;REFB=-0.00732363;REVB=0.00174474;RO=18;SAF=11;SAR=14;SRF=5;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126691;STB=0.570004;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.00700214;OID=.;OPOS=3653525;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:18:18:25:25:0.581395:14:11:5:13:14:11:5:13
chr19	3728609	.	G	A	211.35	PASS	AF=0.461538;AO=15;DP=52;FAO=24;FDP=52;FR=.,HEALED;FRO=27;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=0.00686596;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.86;QD=16.2579;RBI=0.0696399;REFB=-0.0231743;REVB=0.0693006;RO=19;SAF=7;SAR=8;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0964265;STB=0.534854;STBP=0.659;TYPE=snp;VARB=0.0388381;OID=.;OPOS=3728609;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:19:27:15:24:0.461538:8:7:7:12:10:14:14:13
chr19	3730041	.	C	T	519.95	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0376502;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.5615;QD=59.4232;RBI=0.0497701;REFB=0;REVB=0.0325504;RO=0;SAF=17;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.60901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.69527e-05;OID=.;OPOS=3730041;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:35:0:0:33:35:1:16:17:0:0:18:17:0:0
chr19	3731985	.	G	A	44.94	PASS	AF=0.291667;AO=7;DP=23;FAO=7;FDP=24;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=-0.0272979;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=168.061;QD=7.48998;RBI=0.0275552;REFB=-0.0192043;REVB=-0.00375618;RO=16;SAF=4;SAR=3;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147359;STB=0.571225;STBP=0.715;TYPE=snp;VARB=0.0339435;OID=.;OPOS=3731985;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:23:24:16:17:7:7:0.291667:3:4:7:9:3:4:8:9
chr19	3738649	.	A	C	465.12	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0355091;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.9919;QD=58.1397;RBI=0.0376754;REFB=0;REVB=0.0125913;RO=0;SAF=17;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00047725;OID=.;OPOS=3738649;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:15:17:0:0:15:17:0:0
chr19	3738971	.	A	G	792.69	PASS	AF=1;AO=49;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0106866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.1149;QD=63.415;RBI=0.0191696;REFB=0;REVB=-0.0159145;RO=0;SAF=24;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0045079;OID=.;OPOS=3738971;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:49:50:1:25:24:0:0:25:25:0:0
chr19	3740658	.	T	G	1012.03	PASS	AF=0.985714;AO=69;DP=70;FAO=69;FDP=70;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00268905;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.972;QD=57.8301;RBI=0.0210671;REFB=0.0237206;REVB=0.0208948;RO=0;SAF=40;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506171;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=-0.000422998;OID=.;OPOS=3740658;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:70:70:0:1:69:69:0.985714:29:40:0:0:29:40:1:0
chr19	3746087	.	G	A	803.45	PASS	AF=0.982759;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0111527;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=235.249;QD=55.4103;RBI=0.0163826;REFB=-0.0299119;REVB=0.0120004;RO=0;SAF=22;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50704;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=6.15144e-05;OID=.;OPOS=3746087;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:58:58:0:1:57:57:0.982759:35:22:0:0:35:22:0:1
chr19	3750205	.	T	TGG	472.67	PASS	AF=1;AO=34;DP=45;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0173322;FXX=0;HRUN=4;LEN=2;MLLD=31.4244;QD=48.4794;RBI=0.0874518;REFB=0;REVB=-0.0857171;RO=6;SAF=12;SAR=22;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185484;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000128655;OID=.;OPOS=3750206;OREF=-;OALT=GG;OMAPALT=TGG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:34:45:39:39:0:14:25:0:0:8:6:12:22:6:0
chr19	3750615	.	T	C	538.55	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.020939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=326.787;QD=59.8394;RBI=0.0235735;REFB=0;REVB=-0.0108289;RO=0;SAF=19;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.23279e-05;OID=.;OPOS=3750615;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:17:19:0:0:17:19:0:0
chr19	3750622	.	A	C	557.13	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000955939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.848;QD=60.2307;RBI=0.0130079;REFB=0;REVB=-0.0129727;RO=0;SAF=20;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.71161e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000106008;OID=.;OPOS=3750622;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:17:20:0:0:17:20:0:0
chr19	3752874	.	A	G	388.56	PASS	AF=0.653061;AO=32;DP=49;FAO=32;FDP=49;FR=.;FRO=17;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=0.00755749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.538;QD=31.7195;RBI=0.0137393;REFB=-0.0309413;REVB=0.011474;RO=17;SAF=17;SAR=15;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0741542;STB=0.540515;STBP=0.46;TYPE=snp;VARB=0.0151973;OID=.;OPOS=3752874;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:17:17:32:32:0.653061:15:17:11:6:15:17:11:6
chr19	3753769	.	C	T	217.81	PASS	AF=0.461538;AO=24;DP=52;FAO=24;FDP=52;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=-0.0115604;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=233.182;QD=16.7547;RBI=0.0124903;REFB=-0.0254925;REVB=0.00472928;RO=27;SAF=9;SAR=15;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.237604;STB=0.642739;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=0.0299064;OID=.;OPOS=3753769;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:27:28:24:24:0.461538:15:9:17:10:15:9:18:10
chr19	3762698	.	C	T	765.53	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0440247;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.348;QD=56.7059;RBI=0.046736;REFB=0;REVB=0.0156868;RO=0;SAF=28;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000192377;OID=.;OPOS=3762698;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:54:0:0:52:54:1:24:28:0:0:26:28:0:0
chr19	3767265	.	C	T	650.52	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.035222;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.83;QD=61.9539;RBI=0.0413531;REFB=0;REVB=0.0216677;RO=0;SAF=15;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.13648e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.13681e-05;OID=.;OPOS=3767265;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:27:15:0:0:27:15:0:0
chr19	3820191	.	C	T	34.83	PASS	AF=0.833333;AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0100428;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.7257;QD=23.2184;RBI=0.0380077;REFB=0.0937322;REVB=-0.0366569;RO=1;SAF=3;SAR=2;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169284;STB=0.599598;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=-0.0346583;OID=.;OPOS=3820191;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:6:6:1:1:5:5:0.833333:2:3:0:1:2:3:0:1
chr19	3831449	.	G	A	97.69	PASS	AF=0.6875;AO=11;DP=15;FAO=11;FDP=16;FR=.;FRO=5;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.00282367;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=154.771;QD=24.4237;RBI=0.0109944;REFB=-0.0612469;REVB=0.0106256;RO=4;SAF=6;SAR=5;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0215993;STB=0.51721;STBP=0.909;TYPE=snp;VARB=0.0133128;OID=.;OPOS=3831449;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:15:16:4:5:11:11:0.6875:5:6:2:2:5:6:3:2
chr19	3831525	.	C	A	303.47	PASS	AF=0.806452;AO=24;DP=30;FAO=25;FDP=31;FR=.;FRO=6;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0922041;FXX=0.0312402;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.0506;QD=39.157;RBI=0.0934499;REFB=-0.0641595;REVB=-0.0152083;RO=5;SAF=15;SAR=9;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00843595;STB=0.528902;STBP=0.557;TYPE=snp;VARB=0.0191934;OID=.;OPOS=3831525;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:30:31:5:6:24:25:0.806452:9:15:3:2:9:16:3:3
chr19	3831737	.	G	A	64.06	PASS	AF=0.333333;AO=9;DP=27;FAO=9;FDP=27;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=0.0113951;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.501;QD=9.49004;RBI=0.0654898;REFB=-0.00988688;REVB=0.0644908;RO=18;SAF=6;SAR=3;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0660765;STB=0.540449;STBP=0.79;TYPE=snp;VARB=0.0212284;OID=.;OPOS=3831737;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:27:27:18:18:9:9:0.333333:3:6:11:7:3:6:11:7
chr19	3831765	.	G	A	257.77	PASS	AF=0.676471;AO=23;DP=34;FAO=23;FDP=34;FR=.;FRO=11;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=-0.0156764;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.316;QD=30.3257;RBI=0.0208365;REFB=0.012687;REVB=0.0137263;RO=11;SAF=15;SAR=8;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0495209;STB=0.527197;STBP=0.676;TYPE=snp;VARB=-0.00202008;OID=.;OPOS=3831765;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:34:34:11:11:23:23:0.676471:8:15:8:3:8:15:8:3
chr19	3969690	.	A	AC	49.16	PASS	AF=0.274194;AO=18;DP=62;FAO=17;FDP=62;FR=.;FRO=45;FSAF=15;FSAR=2;FSRF=21;FSRR=24;FWDB=-0.034865;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=120.558;QD=3.17137;RBI=0.0353546;REFB=-0.00634729;REVB=0.00586373;RO=44;SAF=16;SAR=2;SRF=20;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.575892;STB=0.843706;STBP=0.003;TYPE=ins;VARB=0.192755;OID=.;OPOS=3969691;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.274194:18:62:17:62:45:15:2:21:24:49:44:16:2:20:24
chr19	3977486	.	A	G	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0180987;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.268;QD=53.2763;RBI=0.0230608;REFB=0;REVB=0.0142913;RO=0;SAF=13;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000300288;OID=.;OPOS=3977486;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:10:13:0:0:10:13:0:0
chr19	3979408	.	AT	GC,GT	406.22	PASS	AF=0.0689655,0.931034;AO=2,27;DP=30;FAO=2,27;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=2,11;FSAR=0,16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0505171,-0.0227007;FXX=0.0333222;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=65.5376,61.9721;QD=56.0303;RBI=0.0521894,0.0229004;REFB=0,0;REVB=0.0131056,0.00301775;RO=0;SAF=2,11;SAR=0,16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.5146e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0165214,-0.00167834;OID=.,.;OPOS=3979408,3979408;OREF=AT,A;OALT=GC,G;OMAPALT=GC,GT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:10:30:29:0:0:2,27:2,27:0.0689655,0.931034:0,16:2,11:0:0:0,16:2,11:0:0
chr19	4028783	.	C	T	453.89	PASS	AF=0.969697;AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=33;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0563469;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=139.881;QD=55.0167;RBI=0.0567047;REFB=-0.144572;REVB=0.00636036;RO=0;SAF=14;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.513505;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.00239692;OID=.;OPOS=4028783;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:33:33:0:1:32:32:0.969697:18:14:0:0:18:14:0:1
chr19	4033462	.	T	C	1980.42	PASS	AF=1;AO=127;DP=128;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0602501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.552;QD=61.888;RBI=0.0603091;REFB=0;REVB=0.00266848;RO=0;SAF=73;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.33451e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000101806;OID=.;OPOS=4033462;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:128:128:0:0:127:128:1:54:73:0:0:54:74:0:0
chr19	4042858	.	G	A	677.64	PASS	AF=0.977778;AO=43;DP=44;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0010787;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.431;QD=60.2345;RBI=0.0134948;REFB=-0.0846661;REVB=0.0134516;RO=1;SAF=24;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0191664;STB=0.509799;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.000901671;OID=.;OPOS=4042858;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:44:45:1:1:43:44:0.977778:19:24:1:0:19:25:1:0
chr19	4042923	.	A	G	874.15	PASS	AF=1;AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00574091;FXX=0.0322529;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.7353;QD=58.2766;RBI=0.0246189;REFB=0;REVB=-0.0239402;RO=0;SAF=39;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000128152;OID=.;OPOS=4042923;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:60:0:0:60:60:1:21:39:0:0:21:39:0:0
chr19	4043024	.	T	C	727.79	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.048943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.923;QD=63.2856;RBI=0.0528259;REFB=0;REVB=-0.0198786;RO=0;SAF=22;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.72073e-05;OID=.;OPOS=4043024;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:24:22:0:0:24:22:0:0
chr19	4101062	.	G	T	708.46	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0634597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.89;QD=62.974;RBI=0.0693092;REFB=0;REVB=0.027868;RO=0;SAF=23;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000341756;OID=.;OPOS=4101062;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:45:0:0:44:45:1:21:23:0:0:21:24:0:0
chr19	4168437	.	C	A	37.15	PASS	AF=0.333333;AO=6;DP=18;FAO=6;FDP=18;FR=.;FRO=12;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=-0.0548785;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.0567;QD=8.25453;RBI=0.0727142;REFB=-0.0480585;REVB=-0.0477043;RO=12;SAF=1;SAR=5;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.243254;STB=0.657294;STBP=0.452;TYPE=snp;VARB=0.0798058;OID=.;OPOS=4168437;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:18:18:12:12:6:6:0.333333:5:1:4:8:5:1:4:8
chr19	4180836	.	C	T	487.42	PASS	AF=1;AO=33;DP=34;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0149554;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.34;QD=59.0817;RBI=0.0310539;REFB=0;REVB=0.0272155;RO=0;SAF=15;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.64315e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00128996;OID=.;OPOS=4180836;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:33:0:0:33:33:1:18:15:0:0:18:15:0:0
chr19	4186395	.	T	G	161.51	PASS	AF=0.5;AO=17;DP=34;FAO=17;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=0.0152097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.203;QD=19.0005;RBI=0.0168961;REFB=-0.0167578;REVB=-0.00735829;RO=17;SAF=8;SAR=9;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104816;STB=0.559372;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=0.0149548;OID=.;OPOS=4186395;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:17:17:17:17:0.5:9:8:6:11:9:8:6:11
chr19	4207940	.	G	A	545.37	PASS	AF=0.973684;AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0303948;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=250.159;QD=57.4075;RBI=0.0389322;REFB=-0.0933916;REVB=0.0243285;RO=1;SAF=19;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0240105;STB=0.512814;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=0.000469978;OID=.;OPOS=4207940;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:38:38:1:1:37:37:0.973684:18:19:1:0:18:19:1:0
chr19	4210356	.	G	A	411.12	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0411956;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.237;QD=56.7066;RBI=0.0413692;REFB=0;REVB=0.00378505;RO=0;SAF=21;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.4007e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00031566;OID=.;OPOS=4210356;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:8:21:0:0:8:21:0:0
chr19	4217207	.	T	G	483.35	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0127811;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.919;QD=58.5876;RBI=0.026094;REFB=0;REVB=0.0227495;RO=0;SAF=22;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.72683e-05;OID=.;OPOS=4217207;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:33:0:0:32:33:1:10:22:0:0:10:23:0:0
chr19	4283059	.	G	A	220.44	PASS	AF=0.583333;AO=21;DP=36;FAO=21;FDP=36;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.000771551;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=248.131;QD=24.4929;RBI=0.00169901;REFB=0.00134459;REVB=-0.00151372;RO=15;SAF=7;SAR=14;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10729;STB=0.559941;STBP=0.396;TYPE=snp;VARB=-0.000668288;OID=.;OPOS=4283059;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:15:15:21:21:0.583333:14:7:7:8:14:7:7:8
chr19	4294623	.	C	A	116.2	PASS	AF=0.565217;AO=13;DP=23;FAO=13;FDP=23;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=-0.0262744;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=52.7811;QD=20.2079;RBI=0.0304356;REFB=0.0053615;REVB=0.0153617;RO=9;SAF=5;SAR=8;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128523;STB=0.588109;STBP=0.422;TYPE=snp;VARB=-0.00488012;OID=.;OPOS=4294623;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:23:23:9:10:13:13:0.565217:8:5:2:7:8:5:2:8
chr19	4306311	.	T	C	38.57	PASS	AF=0.428571;AO=6;DP=14;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=-0.00780173;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.6057;QD=11.0198;RBI=0.00821832;REFB=-0.00554565;REVB=-0.00258338;RO=8;SAF=5;SAR=1;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.264432;STB=0.66603;STBP=0.405;TYPE=snp;VARB=0.00465551;OID=.;OPOS=4306311;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:14:14:8:8:6:6:0.428571:1:5:5:3:1:5:5:3
chr19	4325433	.	G	A	361.8	PASS	AF=0.931034;AO=26;DP=29;FAO=27;FDP=29;FR=.;FRO=2;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.018837;FXX=0.0644953;HRUN=5;LEN=1;MLLD=237.273;QD=49.9039;RBI=0.036611;REFB=0.0552674;REVB=0.0313932;RO=2;SAF=8;SAR=18;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0294963;STB=0.512811;STBP=0.753;TYPE=snp;VARB=-0.00024485;OID=.;OPOS=4325433;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:29:29:2:2:26:27:0.931034:18:8:1:1:18:9:1:1
chr19	4333711	.	C	T	1325.66	PASS	AF=1;AO=83;DP=84;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0133616;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.4618;QD=60.9501;RBI=0.104472;REFB=-0.080631;REVB=0.103614;RO=1;SAF=41;SAR=42;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0111436;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00313443;OID=.;OPOS=4333711;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:84:87:1:0:83:87:1:42:41:0:1:46:41:0:0
chr19	4357555	.	A	G	742.95	PASS	AF=0.96;AO=48;DP=50;FAO=48;FDP=50;FR=.;FRO=2;FSAF=17;FSAR=31;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0307635;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.402;QD=59.4358;RBI=0.0350339;REFB=-0.13981;REVB=-0.0167626;RO=2;SAF=17;SAR=31;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0521739;STB=0.527766;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.00534582;OID=.;OPOS=4357555;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:50:50:2:2:48:48:0.96:31:17:2:0:31:17:2:0
chr19	4362691	.	G	C	1415.15	PASS	AF=0.98913;AO=91;DP=92;FAO=91;FDP=92;FR=.;FRO=1;FSAF=51;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0264803;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=178.211;QD=61.5283;RBI=0.0311311;REFB=-0.141146;REVB=0.016369;RO=1;SAF=51;SAR=40;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0117028;STB=0.506171;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=0.000153126;OID=.;OPOS=4362691;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:92:92:1:1:91:91:0.98913:40:51:0:1:40:51:0:1
chr19	4409263	.	A	G	119.19	PASS	AF=0.590909;AO=12;DP=22;FAO=13;FDP=22;FR=.;FRO=9;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=-0.0158799;FXX=0.0434594;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.707;QD=21.6712;RBI=0.0166065;REFB=0.00562112;REVB=-0.0048586;RO=9;SAF=8;SAR=4;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.253577;STB=0.651933;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=-0.00786724;OID=.;OPOS=4409263;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:22:22:9:9:12:13:0.590909:4:8:3:6:4:9:3:6
chr19	4442336	.	C	T	1052.64	PASS	AF=1;AO=70;DP=72;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0243399;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.857;QD=59.3036;RBI=0.0526851;REFB=0;REVB=0.0467257;RO=0;SAF=25;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000232432;OID=.;OPOS=4442336;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:71:0:0:70:71:1:45:25:0:0:46:25:0:0
chr19	4442999	.	T	G	632.16	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0155008;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.6548;QD=61.6742;RBI=0.0533191;REFB=0;REVB=0.0510162;RO=0;SAF=29;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000336614;OID=.;OPOS=4442999;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:12:29:0:0:12:29:0:0
chr19	4443046	.	T	C	888.77	PASS	AF=1;AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00189255;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.147;QD=58.2798;RBI=0.0169951;REFB=0;REVB=0.0168894;RO=0;SAF=39;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.01474e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.30587e-05;OID=.;OPOS=4443046;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:61:0:0:61:61:1:22:39:0:0:22:39:0:0
chr19	4457650	.	C	T	786.51	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0716732;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.687;QD=64.2052;RBI=0.0720006;REFB=0;REVB=0.00685857;RO=0;SAF=10;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.54368e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000136284;OID=.;OPOS=4457650;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:49:0:0:46:49:1:36:10:0:0:37:12:0:0
chr19	4493708	.	A	G	357.65	PASS	AF=0.354839;AO=43;DP=122;FAO=44;FDP=124;FR=.;FRO=80;FSAF=28;FSAR=16;FSRF=33;FSRR=47;FWDB=-0.0312268;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.467;QD=11.537;RBI=0.0313417;REFB=-0.00952101;REVB=-0.00268089;RO=77;SAF=27;SAR=16;SRF=33;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.223266;STB=0.643731;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.0198075;OID=.;OPOS=4493708;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:122:124:77:80:43:44:0.354839:16:27:33:44:16:28:33:47
chr19	4508945	.	A	G	785.43	PASS	AF=1;AO=41;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0214223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.684;QD=64.117;RBI=0.0486335;REFB=0;REVB=0.0436612;RO=0;SAF=15;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.2402e-05;OID=.;OPOS=4508945;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:41:49:1:26:15:0:0:26:23:0:0
chr19	4510560	.	C	T	337.93	PASS	AF=0.467532;AO=36;DP=76;FAO=36;FDP=77;FR=.;FRO=41;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=16;FSRR=25;FWDB=0.00329779;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.869;QD=17.5546;RBI=0.00354484;REFB=0.00335688;REVB=-0.00130019;RO=40;SAF=15;SAR=21;SRF=16;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0161894;STB=0.514533;STBP=0.825;TYPE=snp;VARB=-0.00566123;OID=.;OPOS=4510560;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:77:40:41:36:36:0.467532:21:15:16:24:21:15:16:25
chr19	4511140	.	C	G	33.48	PASS	AF=0.714286;AO=5;DP=7;FAO=5;FDP=7;FR=.;FRO=2;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0171221;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=294.044;QD=19.134;RBI=0.0364783;REFB=-0.0168061;REVB=0.0322102;RO=2;SAF=3;SAR=2;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.212944;STB=0.62455;STBP=0.425;TYPE=snp;VARB=0.0108909;OID=.;OPOS=4511140;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:7:7:2:2:5:5:0.714286:2:3:2:0:2:3:2:0
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chr19	4511281	.	G	A	85.27	PASS	AF=0.366667;AO=11;DP=30;FAO=11;FDP=30;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.0027168;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.186;QD=11.3689;RBI=0.0125992;REFB=-0.0144206;REVB=0.0123028;RO=19;SAF=4;SAR=7;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175257;STB=0.604745;STBP=0.418;TYPE=snp;VARB=0.013769;OID=.;OPOS=4511281;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:30:30:19:19:11:11:0.366667:7:4:10:9:7:4:10:9
chr19	4511283	.	CA	TG	74.24	PASS	AF=0.344828;AO=10;DP=29;FAO=10;FDP=29;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=-0.0221126;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=170.274;QD=10.2403;RBI=0.0231212;REFB=-0.00617307;REVB=-0.00675451;RO=19;SAF=7;SAR=3;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.403168;STB=0.741262;STBP=0.074;TYPE=mnp;VARB=0.0233974;OID=.;OPOS=4511283;OREF=CA;OALT=TG;OMAPALT=TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:29:29:19:19:10:10:0.344828:3:7:6:13:3:7:6:13
chr19	4511350	.	T	A	258.3	PASS	AF=0.814815;AO=21;DP=26;FAO=22;FDP=27;FR=.;FRO=5;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0611918;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=72.5484;QD=38.2664;RBI=0.061823;REFB=-0.00341414;REVB=0.00881227;RO=5;SAF=12;SAR=9;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130694;STB=0.563701;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.00443223;OID=.;OPOS=4511350;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:27:26:27:5:5:21:22:0.814815:9:12:1:4:10:12:1:4
chr19	4511453	.	G	A	365.24	PASS	AF=0.964286;AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0653266;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.9191;QD=52.1777;RBI=0.0870646;REFB=-0.131076;REVB=0.0575558;RO=0;SAF=12;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.516117;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.00895099;OID=.;OPOS=4511453;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:28:28:0:1:27:27:0.964286:15:12:0:0:15:12:0:1
chr19	4511525	.	A	G	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000627397;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.409;QD=53.2767;RBI=0.0142789;REFB=0;REVB=0.0142651;RO=0;SAF=13;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000113593;OID=.;OPOS=4511525;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:10:13:0:0:10:13:0:0
chr19	4511647	.	C	G	322.38	PASS	AF=1;AO=24;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0894797;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.9713;QD=51.5813;RBI=0.0913181;REFB=0;REVB=0.0182312;RO=1;SAF=16;SAR=8;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0280951;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0041743;OID=.;OPOS=4511647;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:1:0:24:25:1:8:16:1:0:8:17:0:0
chr19	4511677	.	A	G	54.0	PASS	AF=0.307692;AO=8;DP=26;FAO=8;FDP=26;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=5;FWDB=-0.0236934;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.794;QD=8.30736;RBI=0.0301237;REFB=0.0217367;REVB=-0.0186026;RO=18;SAF=4;SAR=4;SRF=13;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.251967;STB=0.653498;STBP=0.335;TYPE=snp;VARB=-0.0402883;OID=.;OPOS=4511677;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:26:26:18:18:8:8:0.307692:4:4:13:5:4:4:13:5
chr19	4511724	.	CT	CC,C	255.16	PASS	AF=0.95,0.05;AO=17,3;DP=21;FAO=19,1;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=7,0;FSAR=12,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0466344,0.0417829;FXX=0.0475964;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=39.9042,28.3246;QD=51.0325;RBI=0.0480419,0.128668;REFB=0,0;REVB=0.0115438,-0.121695;RO=0;SAF=6,1;SAR=11,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,del;VARB=0.0160547,-0.0982085;OID=.,.;OPOS=4511725,4511725;OREF=T,T;OALT=C,-;OMAPALT=CC,C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.95,0.05:17,3:21:19,1:20:0:7,0:12,1:0:0:5:0:6,1:11,2:0:0
chr19	4511730	.	T	C	288.36	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00749018;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.568;QD=52.4291;RBI=0.0430967;REFB=0;REVB=0.0424409;RO=0;SAF=8;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00023091;OID=.;OPOS=4511730;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:14:8:0:0:14:8:0:0
chr19	4511737	.	T	C	119.92	PASS	AF=0.65;AO=12;DP=20;FAO=13;FDP=20;FR=.,HEALED;FRO=7;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.0167293;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=40.1901;QD=23.9843;RBI=0.0168655;REFB=-0.0537381;REVB=0.00213844;RO=6;SAF=1;SAR=11;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.529426;STB=0.747135;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.028461;OID=.;OPOS=4511737;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:20:20:6:7:12:13:0.65:11:1:4:2:11:2:5:2
chr19	4511791	.	A	C	92.37	PASS	AF=0.285714;AO=11;DP=41;FAO=12;FDP=42;FR=.;FRO=30;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=21;FWDB=-0.0200714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.355;QD=8.79756;RBI=0.0200831;REFB=-0.00689246;REVB=0.000687011;RO=29;SAF=4;SAR=7;SRF=9;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0694491;STB=0.527228;STBP=0.868;TYPE=snp;VARB=0.0129359;OID=.;OPOS=4511791;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:41:42:29:30:11:12:0.285714:7:4:9:20:8:4:9:21
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chr19	4511929	.	A	G	275.58	PASS	AF=0.491803;AO=30;DP=61;FAO=30;FDP=61;FR=.;FRO=31;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=0.0272041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.207;QD=18.0706;RBI=0.0280505;REFB=-0.019848;REVB=0.00683888;RO=31;SAF=13;SAR=17;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133526;STB=0.57465;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=0.0181702;OID=.;OPOS=4511929;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:31:31:30:30:0.491803:17:13:18:13:17:13:18:13
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chr19	4513143	.	CA	TG	109.05	PASS	AF=0.916667;AO=11;DP=12;FAO=11;FDP=12;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00193118;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=170.274;QD=36.3484;RBI=0.0774517;REFB=-0.184837;REVB=-0.0774276;RO=1;SAF=8;SAR=3;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127515;STB=0.571292;STBP=0.289;TYPE=mnp;VARB=0.00591827;OID=.;OPOS=4513143;OREF=CA;OALT=TG;OMAPALT=TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:12:12:1:1:11:11:0.916667:3:8:0:1:3:8:0:1
chr19	4513559	.	A	G	443.25	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00301025;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.7398;QD=57.193;RBI=0.0127966;REFB=0;REVB=-0.0124375;RO=0;SAF=7;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0069384;OID=.;OPOS=4513559;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:31:0:0:30:31:1:23:7:0:0:24:7:0:0
chr19	4525046	.	A	G	79.34	PASS	AF=0.5;AO=10;DP=20;FAO=10;FDP=20;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.0506044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.878;QD=15.8677;RBI=0.052034;REFB=-0.013443;REVB=-0.0121135;RO=10;SAF=6;SAR=4;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.253163;STB=0.646773;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=0.0575272;OID=.;OPOS=4525046;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:20:20:10:10:10:10:0.5:4:6:3:7:4:6:3:7
chr19	4538599	.	G	A	575.13	PASS	AF=0.472441;AO=60;DP=127;FAO=60;FDP=127;FR=.;FRO=67;FSAF=31;FSAR=29;FSRF=24;FSRR=43;FWDB=0.013747;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=262.205;QD=18.1144;RBI=0.0142849;REFB=-0.00884943;REVB=0.00388314;RO=67;SAF=31;SAR=29;SRF=24;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150313;STB=0.583197;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.0109976;OID=.;OPOS=4538599;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:127:127:67:67:60:60:0.472441:29:31:24:43:29:31:24:43
chr19	4558431	.	C	G	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0617771;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.462;QD=53.2757;RBI=0.0656437;REFB=0;REVB=0.0221965;RO=0;SAF=13;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00108407;OID=.;OPOS=4558431;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:10:13:0:0:10:13:0:0
chr19	4652822	.	C	G	289.87	PASS	AF=0.590909;AO=25;DP=43;FAO=26;FDP=44;FR=.;FRO=18;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=5;FWDB=0.00303629;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.748;QD=26.3514;RBI=0.0383273;REFB=-0.00472952;REVB=0.0382068;RO=18;SAF=16;SAR=9;SRF=13;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0689163;STB=0.547135;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00428593;OID=.;OPOS=4652822;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:44:18:18:25:26:0.590909:9:16:13:5:10:16:13:5
chr19	4653351	.	C	G	93.39	PASS	AF=0.315789;AO=12;DP=38;FAO=12;FDP=38;FR=.;FRO=26;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=-0.00409474;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.024;QD=9.8303;RBI=0.00615669;REFB=0.00962249;REVB=-0.0045976;RO=26;SAF=4;SAR=8;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108659;STB=0.565925;STBP=0.608;TYPE=snp;VARB=-0.0191157;OID=.;OPOS=4653351;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:93:38:38:26:26:12:12:0.315789:8:4:11:15:8:4:11:15
chr19	4653370	.	C	G	93.39	PASS	AF=0.315789;AO=12;DP=38;FAO=12;FDP=38;FR=.;FRO=26;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=-0.00957719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.426;QD=9.83025;RBI=0.0692511;REFB=0.00246805;REVB=-0.0685857;RO=26;SAF=4;SAR=8;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108659;STB=0.565925;STBP=0.608;TYPE=snp;VARB=-0.00673806;OID=.;OPOS=4653370;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:93:38:38:26:26:12:12:0.315789:8:4:11:15:8:4:11:15
chr19	4653420	.	A	G	85.26	PASS	AF=0.366667;AO=11;DP=30;FAO=11;FDP=30;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.0216432;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.7776;QD=11.3684;RBI=0.0243792;REFB=0.0069549;REVB=-0.0112213;RO=19;SAF=4;SAR=7;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175257;STB=0.604745;STBP=0.418;TYPE=snp;VARB=-0.0106653;OID=.;OPOS=4653420;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:30:30:19:19:11:11:0.366667:7:4:10:9:7:4:10:9
chr19	4654163	.	A	C	100.74	PASS	AF=0.48;AO=12;DP=25;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.0206377;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.297;QD=16.1191;RBI=0.0246148;REFB=0.00558981;REVB=0.0134155;RO=13;SAF=2;SAR=10;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.271519;STB=0.660072;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=-0.00506322;OID=.;OPOS=4654163;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:25:13:13:12:12:0.48:10:2:5:8:10:2:5:8
chr19	4655166	.	A	G	38.59	PASS	AF=0.3;AO=6;DP=20;FAO=6;FDP=20;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=-0.0213941;FXX=0.0475964;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.1;QD=7.71841;RBI=0.0573047;REFB=-0.0306223;REVB=0.0531613;RO=13;SAF=5;SAR=1;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110573;STB=0.624531;STBP=0.562;TYPE=snp;VARB=0.115761;OID=.;OPOS=4655166;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:20:20:13:14:6:6:0.3:1:5:10:3:1:5:10:4
chr19	4658047	.	A	G	80.18	PASS	AF=0.526316;AO=10;DP=19;FAO=10;FDP=19;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.0174717;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.4858;QD=16.881;RBI=0.0177716;REFB=-0.0136087;REVB=0.00325087;RO=9;SAF=3;SAR=7;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0318185;STB=0.518481;STBP=0.971;TYPE=snp;VARB=0.0168196;OID=.;OPOS=4658047;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:19:19:9:9:10:10:0.526316:7:3:3:6:7:3:3:6
chr19	4685259	.	G	A	192.38	PASS	AF=0.416667;AO=20;DP=48;FAO=20;FDP=48;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=26;FSRR=2;FWDB=-0.0190731;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.453;QD=16.0313;RBI=0.0924432;REFB=-0.00827658;REVB=0.0904542;RO=28;SAF=12;SAR=8;SRF=26;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.39053;STB=0.716819;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=0.0185888;OID=.;OPOS=4685259;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:28:28:20:20:0.416667:8:12:26:2:8:12:26:2
chr19	4685276	.	A	C	258.52	PASS	AF=0.460317;AO=29;DP=63;FAO=29;FDP=63;FR=.;FRO=34;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=28;FSRR=6;FWDB=-0.0339121;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.3419;QD=16.4137;RBI=0.0371002;REFB=0.0240461;REVB=0.0150464;RO=33;SAF=18;SAR=11;SRF=27;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.212274;STB=0.623077;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=-0.0398034;OID=.;OPOS=4685276;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:33:34:29:29:0.460317:11:18:27:6:11:18:28:6
chr19	4688830	.	G	T	162.37	PASS	AF=0.666667;AO=16;DP=24;FAO=16;FDP=24;FR=.;FRO=8;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=0.00229355;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=76.6941;QD=27.0614;RBI=0.0347171;REFB=0.0244018;REVB=-0.0346412;RO=8;SAF=9;SAR=7;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115989;STB=0.564438;STBP=0.432;TYPE=snp;VARB=-0.00709388;OID=.;OPOS=4688830;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:24:24:8:8:16:16:0.666667:7:9:6:2:7:9:6:2
chr19	4724069	.	G	A	203.35	PASS	AF=0.421053;AO=23;DP=56;FAO=24;FDP=57;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=23;FSRR=10;FWDB=-0.0267352;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.2123;QD=14.2702;RBI=0.0533083;REFB=-0.0171085;REVB=0.0461195;RO=33;SAF=9;SAR=14;SRF=23;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.30697;STB=0.657994;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.0341338;OID=.;OPOS=4724069;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:57:33:33:23:24:0.421053:14:9:23:10:14:10:23:10
chr19	4724157	.	G	A	208.78	PASS	AF=0.456522;AO=21;DP=46;FAO=21;FDP=46;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=-0.0318313;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.585;QD=18.1547;RBI=0.0332461;REFB=-0.0113363;REVB=-0.00959529;RO=25;SAF=9;SAR=12;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162969;STB=0.592505;STBP=0.27;TYPE=snp;VARB=0.00998028;OID=.;OPOS=4724157;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:25:25:21:21:0.456522:12:9:15:10:12:9:15:10
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chr19	4945917	.	C	T	171.07	PASS	AF=0.439024;AO=18;DP=42;FAO=18;FDP=41;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=-0.0274659;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.66;QD=16.6897;RBI=0.0297911;REFB=-0.0100117;REVB=-0.0115384;RO=22;SAF=9;SAR=9;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131387;STB=0.560909;STBP=0.546;TYPE=snp;VARB=0.0279087;OID=.;OPOS=4945917;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:41:22:23:18:18:0.439024:9:9:8:14:9:9:9:14
chr19	4945955	.	C	CG,G	32.85	PASS	AF=0.458333,0;AO=7,2;DP=26;FAO=11,0;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=4,0;FSAR=7,0;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.179153,-0.0156013;FXX=0;HRUN=6,1;LEN=1,1;MLLD=8.73466,181.323;QD=5.47448;RBI=0.188783,0.015713;REFB=-0.0853871,-0.000907463;REVB=0.0595246,0.00187026;RO=16;SAF=3,1;SAR=4,1;SRF=8;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0793713,0;STB=0.636116,0.5;STBP=0.261,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.130582,0;OID=.,.;OPOS=4945956,4945955;OREF=-,C;OALT=G,G;OMAPALT=CG,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:26:24:16:13:7,2:11,0:0.458333,0:4,1:3,1:8:8:7,0:4,0:8:5
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chr19	5114324	.	C	T	153.59	PASS	AF=0.571429;AO=16;DP=27;FAO=16;FDP=28;FR=.;FRO=12;FSAF=1;FSAR=15;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=0.0703016;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.6756;QD=21.9408;RBI=0.0787875;REFB=0.0122308;REVB=0.035569;RO=11;SAF=1;SAR=15;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.467743;STB=0.76486;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=-0.00546591;OID=.;OPOS=5114324;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:27:28:11:12:16:16:0.571429:15:1:4:7:15:1:4:8
chr19	5135392	.	A	G	1184.23	PASS	AF=0.94186;AO=80;DP=85;FAO=81;FDP=86;FR=.;FRO=5;FSAF=53;FSAR=28;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.00334002;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=210.842;QD=55.0806;RBI=0.029663;REFB=0.0218167;REVB=0.0294743;RO=5;SAF=53;SAR=27;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0322441;STB=0.516176;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=-0.000821085;OID=.;OPOS=5135392;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:85:86:5:5:80:81:0.94186:27:53:2:3:28:53:2:3
chr19	5206775	.	A	G	118.73	PASS	AF=0.466667;AO=12;DP=28;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=-0.0471861;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=38.3089;QD=15.8308;RBI=0.0536905;REFB=-0.0456951;REVB=-0.0256153;RO=16;SAF=9;SAR=3;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147216;STB=0.510294;STBP=0.942;TYPE=snp;VARB=0.0531278;OID=.;OPOS=5206775;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:30:16:16:12:14:0.466667:3:9:10:6:5:9:10:6
chr19	5214697	.	A	G	651.23	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000147121;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.222;QD=62.0219;RBI=0.064776;REFB=0;REVB=-0.0647758;RO=0;SAF=25;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.98888e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000210542;OID=.;OPOS=5214697;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:17:25:0:0:17:25:0:0
chr19	5455611	.	C	T	532.89	PASS	AF=1;AO=35;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0874106;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.286;QD=59.2104;RBI=0.100192;REFB=0;REVB=0.0489676;RO=0;SAF=22;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.39865e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00261752;OID=.;OPOS=5455611;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:35:36:1:13:22:0:0:13:23:0:0
chr19	5455735	.	G	A	176.17	PASS	AF=0.529412;AO=18;DP=34;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=0.0499456;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.1661;QD=20.7254;RBI=0.0608604;REFB=-0.0312037;REVB=0.0347769;RO=16;SAF=6;SAR=12;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.247442;STB=0.639842;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=0.04237;OID=.;OPOS=5455735;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:16:16:18:18:0.529412:12:6:10:6:12:6:10:6
chr19	5455796	.	A	G	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0529778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.586;QD=55.0984;RBI=0.0535265;REFB=0;REVB=-0.00764422;RO=0;SAF=11;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000203238;OID=.;OPOS=5455796;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:15:11:0:0:15:11:0:0
chr19	5455971	.	G	T	850.16	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0307797;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.448;QD=57.6382;RBI=0.0416087;REFB=0;REVB=0.0279981;RO=0;SAF=30;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000269202;OID=.;OPOS=5455971;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:29:30:0:0:29:30:0:0
chr19	5455978	.	T	C	868.26	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00353243;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.008;QD=57.8838;RBI=0.0160944;REFB=0;REVB=0.015702;RO=0;SAF=31;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.7335e-05;OID=.;OPOS=5455978;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:60:0:0:59:60:1:28:31:0:0:28:32:0:0
chr19	5455989	.	C	T	398.71	PASS	AF=0.58209;AO=39;DP=67;FAO=39;FDP=67;FR=.;FRO=28;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=0.00641003;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.747;QD=23.8037;RBI=0.0240753;REFB=-0.0157985;REVB=0.0232063;RO=28;SAF=23;SAR=16;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0143523;STB=0.507882;STBP=0.89;TYPE=snp;VARB=0.0162654;OID=.;OPOS=5455989;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:28:28:39:39:0.58209:16:23:16:12:16:23:16:12
chr19	5455990	.	G	A	238.71	PASS	AF=0.411765;AO=28;DP=68;FAO=28;FDP=68;FR=.;FRO=40;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=23;FSRR=17;FWDB=0.0273186;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.731;QD=14.0417;RBI=0.0288665;REFB=-0.017791;REVB=-0.0093259;RO=40;SAF=16;SAR=12;SRF=23;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00376795;STB=0.502144;STBP=0.997;TYPE=snp;VARB=0.0171338;OID=.;OPOS=5455990;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:40:40:28:28:0.411765:12:16:23:17:12:16:23:17
chr19	5456450	.	T	C	429.02	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0242396;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.603;QD=57.2026;RBI=0.0254684;REFB=0;REVB=0.00781537;RO=0;SAF=8;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.62779e-05;OID=.;OPOS=5456450;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:22:8:0:0:22:8:0:0
chr19	5456810	.	G	A	289.73	PASS	AF=0.508197;AO=31;DP=61;FAO=31;FDP=61;FR=.;FRO=30;FSAF=22;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=0.0105714;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=309.356;QD=18.9986;RBI=0.0110223;REFB=-0.0137571;REVB=0.00312059;RO=30;SAF=22;SAR=9;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172549;STB=0.596633;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=0.0108472;OID=.;OPOS=5456810;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:30:30:31:31:0.508197:9:22:16:14:9:22:16:14
chr19	5587093	.	T	C	315.7	PASS	AF=0.472222;AO=34;DP=72;FAO=34;FDP=72;FR=.;FRO=38;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=0.0033805;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=144.392;QD=17.5391;RBI=0.0099116;REFB=6.18686e-05;REVB=-0.00931729;RO=38;SAF=17;SAR=17;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000212106;OID=.;OPOS=5587093;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:38:38:34:34:0.472222:17:17:19:19:17:17:19:19
chr19	5590297	.	AG	A	175.66	PASS	AF=0.8125;AO=7;DP=32;FAO=26;FDP=32;FR=.;FRO=6;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0198375;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=12.5813;QD=21.957;RBI=0.0851442;REFB=-0.165294;REVB=0.082801;RO=7;SAF=3;SAR=4;SRF=2;SRR=5;SSEN=0.309524;SSEP=0;SSSB=0.125462;STB=0.524253;STBP=0.589;TYPE=del;VARB=0.0767082;OID=.;OPOS=5590298;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.8125:7:32:26:32:6:12:14:2:4:12:7:3:4:2:5
chr19	5591735	.	G	A	167.43	PASS	AF=0.586207;AO=17;DP=29;FAO=17;FDP=29;FR=.;FRO=12;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=0.0242151;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=106.671;QD=23.0937;RBI=0.0366771;REFB=-0.0313275;REVB=0.027547;RO=12;SAF=10;SAR=7;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186812;STB=0.604716;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=0.00834188;OID=.;OPOS=5591735;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:29:29:12:12:17:17:0.586207:7:10:4:8:7:10:4:8
chr19	5696146	.	G	A	77.93	PASS	AF=0.454545;AO=10;DP=22;FAO=10;FDP=22;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.0389947;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.083;QD=14.1696;RBI=0.0389967;REFB=-0.00641575;REVB=-0.00039177;RO=12;SAF=6;SAR=4;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0943118;STB=0.555443;STBP=0.618;TYPE=snp;VARB=0.0147366;OID=.;OPOS=5696146;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:22:22:12:12:10:10:0.454545:4:6:6:6:4:6:6:6
chr19	5766090	.	T	C	402.71	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0237756;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.8612;QD=55.5456;RBI=0.0262182;REFB=0;REVB=-0.0110506;RO=0;SAF=16;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000415487;OID=.;OPOS=5766090;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:29:0:0:27:29:1:11:16:0:0:11:18:0:0
chr19	5772950	.	G	A	719.23	PASS	AF=0.978723;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0018613;FXX=0.020829;HRUN=6;LEN=1;MLLD=127.268;QD=61.2109;RBI=0.00670641;REFB=-0.135661;REVB=0.00644294;RO=1;SAF=18;SAR=28;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0253996;STB=0.513508;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.000743941;OID=.;OPOS=5772950;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:47:47:1:1:46:46:0.978723:28:18:1:0:28:18:1:0
chr19	5831672	.	G	C	101.87	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0315348;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.8199;QD=40.7486;RBI=0.0373116;REFB=0;REVB=-0.0199427;RO=0;SAF=7;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00078114;OID=.;OPOS=5831672;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:3:7:0:0:3:7:0:0
chr19	5832209	.	G	A	743.09	PASS	AF=0.96;AO=48;DP=50;FAO=48;FDP=50;FR=.;FRO=2;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00683238;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=233.362;QD=59.447;RBI=0.00859158;REFB=-0.0569798;REVB=0.00520902;RO=1;SAF=20;SAR=28;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0165072;STB=0.503423;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=0.00175143;OID=.;OPOS=5832209;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:50:50:1:2:48:48:0.96:28:20:0:1:28:20:1:1
chr19	5843784	.	A	T	129.57	PASS	AF=0.357143;AO=15;DP=43;FAO=15;FDP=42;FR=.;FRO=27;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=18;FWDB=-0.0143311;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.736;QD=12.3399;RBI=0.0230313;REFB=-0.0175318;REVB=-0.0180294;RO=28;SAF=7;SAR=8;SRF=9;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163888;STB=0.586985;STBP=0.418;TYPE=snp;VARB=0.028319;OID=.;OPOS=5843784;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:42:28:27:15:15:0.357143:8:7:9:19:8:7:9:18
chr19	5844537	.	A	G	766.46	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0222254;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.922;QD=63.8716;RBI=0.0326986;REFB=0;REVB=0.023984;RO=0;SAF=20;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.56477e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.05211e-05;OID=.;OPOS=5844537;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:28:20:0:0:28:20:0:0
chr19	5844649	.	G	A	88.17	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00759236;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.593;QD=39.1881;RBI=0.0213499;REFB=0;REVB=0.0199543;RO=0;SAF=4;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000181877;OID=.;OPOS=5844649;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:5:4:0:0:5:4:0:0
chr19	5844792	.	A	C	71.16	PASS	AF=0.75;AO=8;DP=12;FAO=9;FDP=12;FR=.;FRO=3;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.00190789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.049;QD=23.7189;RBI=0.0263246;REFB=-0.112291;REVB=0.0262554;RO=3;SAF=4;SAR=4;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0790568;STB=0.528239;STBP=0.804;TYPE=snp;VARB=0.0414061;OID=.;OPOS=5844792;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:12:12:3:3:8:9:0.75:4:4:1:2:5:4:1:2
chr19	5866654	.	A	G	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0146135;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.844;QD=47.8223;RBI=0.0190176;REFB=0;REVB=-0.0121702;RO=0;SAF=5;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.36667e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.02075e-05;OID=.;OPOS=5866654;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:11:5:0:0:11:5:0:0
chr19	5866724	.	G	A	32.4	PASS	AF=0.625;AO=5;DP=8;FAO=5;FDP=8;FR=.;FRO=3;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0560165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.472;QD=16.199;RBI=0.0669081;REFB=-0.0014891;REVB=0.0365903;RO=3;SAF=1;SAR=4;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.335094;STB=0.704971;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=0.000763197;OID=.;OPOS=5866724;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:8:8:3:3:5:5:0.625:4:1:2:1:4:1:2:1
chr19	5867748	.	G	T	39.62	PASS	AF=0.5;AO=6;DP=12;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.0130494;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.597;QD=13.2053;RBI=0.0509009;REFB=-0.0185581;REVB=0.0491998;RO=6;SAF=2;SAR=4;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168138;STB=0.599699;STBP=0.621;TYPE=snp;VARB=0.0183665;OID=.;OPOS=5867748;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:12:12:6:6:6:6:0.5:4:2:1:5:4:2:1:5
chr19	5892954	.	T	C	519.81	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00871287;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.737;QD=59.4065;RBI=0.00876001;REFB=0;REVB=-0.000907626;RO=0;SAF=22;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.39865e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.59229e-05;OID=.;OPOS=5892954;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:13:22:0:0:13:22:0:0
chr19	6042059	.	C	T	108.0	PASS	AF=0.393939;AO=13;DP=33;FAO=13;FDP=33;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=0.00946403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.496;QD=13.0912;RBI=0.0102513;REFB=-0.00359676;REVB=0.00393974;RO=20;SAF=6;SAR=7;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.064306;STB=0.537678;STBP=0.78;TYPE=snp;VARB=0.00633712;OID=.;OPOS=6042059;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:20:20:13:13:0.393939:7:6:8:12:7:6:8:12
chr19	6156483	.	T	C	224.11	PASS	AF=0.470588;AO=24;DP=48;FAO=24;FDP=51;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=18;FWDB=-0.00035481;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=119.485;QD=17.5775;RBI=0.00456018;REFB=-0.027361;REVB=-0.00454635;RO=24;SAF=8;SAR=16;SRF=6;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0864761;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.035776;OID=.;OPOS=6156483;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:51:24:27:24:24:0.470588:16:8:6:18:16:8:9:18
chr19	6375831	.	G	A	73.78	PASS	AF=0.333333;AO=10;DP=30;FAO=10;FDP=30;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=-0.0307447;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=206.072;QD=9.83746;RBI=0.032882;REFB=-0.00772686;REVB=-0.0116614;RO=20;SAF=4;SAR=6;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0563151;STB=0.534177;STBP=0.788;TYPE=snp;VARB=0.0375217;OID=.;OPOS=6375831;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:30:30:20:20:10:10:0.333333:6:4:9:11:6:4:9:11
chr19	6376722	.	A	G	305.75	PASS	AF=0.368421;AO=35;DP=95;FAO=35;FDP=95;FR=.;FRO=60;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=24;FSRR=36;FWDB=0.0163419;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.5325;QD=12.8737;RBI=0.0587507;REFB=0.00454812;REVB=-0.0564321;RO=59;SAF=17;SAR=18;SRF=24;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0869783;STB=0.554317;STBP=0.455;TYPE=snp;VARB=-0.00812113;OID=.;OPOS=6376722;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:59:60:35:35:0.368421:18:17:24:35:18:17:24:36
chr19	6411830	.	C	G	374.71	PASS	AF=0.408163;AO=40;DP=100;FAO=40;FDP=98;FR=.;FRO=58;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=38;FSRR=20;FWDB=-0.0113755;FXX=0.019998;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.5755;QD=15.2944;RBI=0.0212684;REFB=-0.00916614;REVB=0.0179707;RO=58;SAF=23;SAR=17;SRF=38;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0873012;STB=0.549234;STBP=0.42;TYPE=snp;VARB=0.0117702;OID=.;OPOS=6411830;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:98:58:58:40:40:0.408163:17:23:38:20:17:23:38:20
chr19	6415443	.	T	C	362.02	PASS	AF=1;AO=22;DP=27;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0129983;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.0299;QD=55.6953;RBI=0.0208736;REFB=0;REVB=0.0163325;RO=0;SAF=18;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000633115;OID=.;OPOS=6415443;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:26:0:0:22:26:1:4:18:0:0:8:18:0:0
chr19	6417855	.	G	A	96.32	PASS	AF=0.647059;AO=11;DP=16;FAO=11;FDP=17;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=-0.00367133;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=167.238;QD=22.6624;RBI=0.00634003;REFB=-0.0418084;REVB=-0.00516889;RO=5;SAF=5;SAR=6;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144298;STB=0.604217;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=0.0350655;OID=.;OPOS=6417855;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:16:17:5:6:11:11:0.647059:6:5:1:4:6:5:1:5
chr19	6419275	.	A	G	292.58	PASS	AF=0.604651;AO=26;DP=43;FAO=26;FDP=43;FR=.;FRO=17;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=-0.0665535;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=49.5602;QD=27.217;RBI=0.0742157;REFB=-0.0141948;REVB=-0.032842;RO=17;SAF=15;SAR=11;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0768245;STB=0.542463;STBP=0.464;TYPE=snp;VARB=0.00639891;OID=.;OPOS=6419275;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:17:17:26:26:0.604651:11:15:8:9:11:15:8:9
chr19	6468591	.	C	T	194.34	PASS	AF=0.59375;AO=19;DP=32;FAO=19;FDP=32;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=-0.0101616;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=124.219;QD=24.2926;RBI=0.0179133;REFB=-0.0265726;REVB=-0.0147522;RO=12;SAF=5;SAR=14;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0606122;STB=0.522797;STBP=0.782;TYPE=snp;VARB=0.0123332;OID=.;OPOS=6468591;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:12:13:19:19:0.59375:14:5:4:8:14:5:4:9
chr19	6477256	.	G	T	173.54	PASS	AF=0.45;AO=18;DP=40;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=-0.000746635;FXX=0.0243843;HRUN=9;LEN=1;MLLD=238.925;QD=17.3542;RBI=0.00585836;REFB=-0.00677014;REVB=0.00581059;RO=21;SAF=12;SAR=6;SRF=15;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0516387;STB=0.509423;STBP=0.954;TYPE=snp;VARB=0.00543203;OID=.;OPOS=6477256;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:21:22:18:18:0.45:6:12:15:6:6:12:15:7
chr19	6535080	.	T	C	625.16	PASS	AF=0.424242;AO=70;DP=163;FAO=70;FDP=165;FR=.;FRO=95;FSAF=46;FSAR=24;FSRF=47;FSRR=48;FWDB=-0.00711541;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.63;QD=15.1554;RBI=0.0181603;REFB=-0.012849;REVB=-0.0167083;RO=92;SAF=46;SAR=24;SRF=45;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177303;STB=0.597374;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.00996034;OID=.;OPOS=6535080;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:163:165:92:95:70:70:0.424242:24:46:45:47:24:46:47:48
chr19	6586268	.	G	A	250.26	PASS	AF=0.621622;AO=22;DP=36;FAO=23;FDP=37;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=0.0479075;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.98;QD=27.0549;RBI=0.0506432;REFB=-0.0273569;REVB=0.0164198;RO=14;SAF=7;SAR=15;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0871933;STB=0.557593;STBP=0.448;TYPE=snp;VARB=0.0214228;OID=.;OPOS=6586268;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:37:14:14:22:23:0.621622:15:7:3:11:15:8:3:11
chr19	6665020	.	T	C	464.98	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.109504;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.2144;QD=58.1226;RBI=0.109511;REFB=0;REVB=0.00126849;RO=0;SAF=17;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00242238;OID=.;OPOS=6665020;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:15:17:0:0:15:17:0:0
chr19	6677989	.	G	A	141.8	PASS	AF=0.311475;AO=19;DP=61;FAO=19;FDP=61;FR=.;FRO=42;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=22;FWDB=0.00571687;FXX=0.0468677;HRUN=3;LEN=1;MLLD=204.13;QD=9.2981;RBI=0.00572883;REFB=-0.0145024;REVB=0.000369983;RO=42;SAF=8;SAR=11;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0646761;STB=0.538421;STBP=0.73;TYPE=snp;VARB=0.0318202;OID=.;OPOS=6677989;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:42:42:19:19:0.311475:11:8:20:22:11:8:20:22
chr19	6678474	.	G	A	90.35	PASS	AF=0.5;AO=9;DP=22;FAO=11;FDP=22;FR=.;FRO=11;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=1;FWDB=0.0116853;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=214.656;QD=16.4268;RBI=0.0476971;REFB=-0.0177045;REVB=0.0462435;RO=6;SAF=7;SAR=2;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.267143;STB=0.659953;STBP=0.248;TYPE=snp;VARB=0.0131476;OID=.;OPOS=6678474;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:22:22:6:11:9:11:0.5:2:7:6:0:4:7:10:1
chr19	6679511	.	C	T	129.5	PASS	AF=0.384615;AO=15;DP=39;FAO=15;FDP=39;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.0225495;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.9519;QD=13.2818;RBI=0.0616382;REFB=-0.0202333;REVB=-0.0573654;RO=22;SAF=10;SAR=5;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.221949;STB=0.654964;STBP=0.138;TYPE=snp;VARB=0.0435979;OID=.;OPOS=6679511;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:22:24:15:15:0.384615:5:10:10:12:5:10:10:14
chr19	6696597	.	G	A	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0596461;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.63;QD=43.4861;RBI=0.0634914;REFB=0;REVB=0.02176;RO=0;SAF=3;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00169724;OID=.;OPOS=6696597;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:9:3:0:0:9:3:0:0
chr19	6697406	.	A	G	1246.1	PASS	AF=1;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0111336;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.539;QD=61.5357;RBI=0.0144736;REFB=0;REVB=0.00924814;RO=0;SAF=32;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.32002e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.05541e-05;OID=.;OPOS=6697406;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:81:0:0:81:81:1:49:32:0:0:49:32:0:0
chr19	6702157	.	C	G	727.73	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00526305;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.578;QD=63.2806;RBI=0.0868945;REFB=0;REVB=0.0867349;RO=0;SAF=24;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000522994;OID=.;OPOS=6702157;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:22:24:0:0:22:24:0:0
chr19	6709848	.	C	T	613.35	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0136242;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.8068;QD=61.3346;RBI=0.0301057;REFB=0;REVB=-0.0268465;RO=0;SAF=18;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.19993e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000316669;OID=.;OPOS=6709848;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:22:18:0:0:22:18:0:0
chr19	6735929	.	C	T	167.49	PASS	AF=0.9375;AO=15;DP=16;FAO=15;FDP=16;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00503441;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.349;QD=41.8718;RBI=0.00508111;REFB=-0.139962;REVB=0.000687279;RO=0;SAF=11;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33019e-08;STB=0.555478;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.00611371;OID=.;OPOS=6735929;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:16:16:0:1:15:15:0.9375:4:11:0:0:4:11:0:1
chr19	6737481	.	T	C	525.52	PASS	AF=1;AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0111071;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.453;QD=60.0597;RBI=0.0530138;REFB=0;REVB=-0.0518372;RO=0;SAF=25;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.03206e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000227384;OID=.;OPOS=6737481;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:35:0:0:35:35:1:10:25:0:0:10:25:0:0
chr19	6737509	.	G	A	669.59	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0636264;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.467;QD=62.2877;RBI=0.0662512;REFB=0;REVB=0.0184636;RO=0;SAF=31;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.72514e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000265611;OID=.;OPOS=6737509;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:43:0:0:42:43:1:11:31:0:0:11:32:0:0
chr19	6751279	.	A	G	157.04	PASS	AF=0.435897;AO=17;DP=39;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=-0.0221368;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.367;QD=16.1065;RBI=0.0262163;REFB=-0.00274628;REVB=-0.0140449;RO=22;SAF=7;SAR=10;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174965;STB=0.600483;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=0.00396052;OID=.;OPOS=6751279;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:22:22:17:17:0.435897:10:7:13:9:10:7:13:9
chr19	6751281	.	C	T	156.29	PASS	AF=0.435897;AO=17;DP=39;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.00845013;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=50.2882;QD=16.03;RBI=0.0144926;REFB=-0.028832;REVB=-0.0117742;RO=22;SAF=7;SAR=10;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174965;STB=0.600483;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=0.0379334;OID=.;OPOS=6751281;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:22:22:17:17:0.435897:10:7:13:9:10:7:13:9
chr19	6751293	.	T	G	168.54	PASS	AF=0.428571;AO=19;DP=41;FAO=18;FDP=42;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=-0.0104514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.763;QD=16.0513;RBI=0.0106165;REFB=0.00780449;REVB=0.00186518;RO=21;SAF=7;SAR=12;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.231388;STB=0.633361;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=-0.0157718;OID=.;OPOS=6751293;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:42:21:24:19:18:0.428571:12:7:13:8:11:7:15:9
chr19	6754188	.	T	C	212.82	PASS	AF=0.5;AO=21;DP=42;FAO=21;FDP=42;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.0343569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.0515;QD=20.2682;RBI=0.0379457;REFB=0.0103708;REVB=0.0161082;RO=21;SAF=9;SAR=12;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0849174;STB=0.547899;STBP=0.555;TYPE=snp;VARB=-0.0137662;OID=.;OPOS=6754188;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:21:21:21:21:0.5:12:9:11:10:12:9:11:10
chr19	6755007	.	T	C	66.83	PASS	AF=0.428571;AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=-0.00872146;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=269.363;QD=12.73;RBI=0.0243518;REFB=0.0043202;REVB=0.0227365;RO=12;SAF=4;SAR=5;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.289502;STB=0.669755;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=-0.00525424;OID=.;OPOS=6755007;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:21:21:12:12:9:9:0.428571:5:4:9:3:5:4:9:3
chr19	6833777	.	A	G	190.9	PASS	AF=0.363636;AO=24;DP=66;FAO=24;FDP=66;FR=.;FRO=42;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=27;FSRR=15;FWDB=-0.0248435;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.296;QD=11.5694;RBI=0.0267616;REFB=-0.0145377;REVB=0.00994929;RO=42;SAF=12;SAR=12;SRF=27;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157654;STB=0.590836;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=0.0286637;OID=.;OPOS=6833777;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:42:42:24:24:0.363636:12:12:27:15:12:12:27:15
chr19	6833989	.	G	T	128.54	PASS	AF=0.625;AO=13;DP=21;FAO=15;FDP=24;FR=.;FRO=9;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=0.0265027;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=39.2451;QD=21.4237;RBI=0.0380462;REFB=-0.0320908;REVB=0.0272969;RO=8;SAF=6;SAR=7;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.275661;STB=0.615236;STBP=0.173;TYPE=snp;VARB=0.0182334;OID=.;OPOS=6833989;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:21:24:8:9:13:15:0.625:7:6:7:1:8:7:7:2
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chr19	6897464	.	C	G	188.19	PASS	AF=0.527778;AO=18;DP=35;FAO=19;FDP=36;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.0232824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.518;QD=20.9104;RBI=0.023307;REFB=-0.0290292;REVB=0.00106949;RO=17;SAF=6;SAR=12;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0734303;STB=0.521716;STBP=0.811;TYPE=snp;VARB=0.0324719;OID=.;OPOS=6897464;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:36:17:17:18:19:0.527778:12:6:7:10:12:7:7:10
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chr19	6913811	.	A	G	733.97	PASS	AF=1;AO=46;DP=48;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0155979;FXX=0.041658;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.8278;QD=63.8234;RBI=0.0175299;REFB=0;REVB=-0.00800013;RO=0;SAF=27;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00025913;OID=.;OPOS=6913811;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:46:0:0:46:46:1:19:27:0:0:19:27:0:0
chr19	6919624	.	A	C	757.13	PASS	AF=0.981818;AO=54;DP=55;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0180593;FXX=0.017854;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.027;QD=55.0642;RBI=0.0228707;REFB=0.0261788;REVB=-0.0140332;RO=1;SAF=17;SAR=37;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0125691;STB=0.506664;STBP=0.632;TYPE=snp;VARB=-0.00108382;OID=.;OPOS=6919624;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:55:55:1:1:54:54:0.981818:37:17:0:1:37:17:0:1
chr19	6919753	.	A	G	371.13	PASS	AF=0.964286;AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0388228;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.43;QD=53.0185;RBI=0.0452068;REFB=-0.0699795;REVB=-0.0231612;RO=1;SAF=5;SAR=22;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0841886;STB=0.545419;STBP=0.104;TYPE=snp;VARB=0.0010208;OID=.;OPOS=6919753;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:28:28:1:1:27:27:0.964286:22:5:1:0:22:5:1:0
chr19	6972357	.	C	T	522.25	PASS	AF=0.947368;AO=36;DP=39;FAO=36;FDP=38;FR=.;FRO=2;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0358043;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.044;QD=54.9736;RBI=0.0369942;REFB=-0.0469712;REVB=-0.00930724;RO=1;SAF=16;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0283532;STB=0.529395;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=0.00297017;OID=.;OPOS=6972357;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:39:38:1:2:36:36:0.947368:20:16:1:0:20:16:2:0
chr19	6974556	.	C	A	210.5	PASS	AF=0.625;AO=20;DP=32;FAO=20;FDP=32;FR=.;FRO=12;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=0.000224139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.084;QD=26.313;RBI=0.00489831;REFB=-0.0002892;REVB=0.00489317;RO=12;SAF=9;SAR=11;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0803379;STB=0.544542;STBP=0.548;TYPE=snp;VARB=0.000274957;OID=.;OPOS=6974556;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:32:32:12:12:20:20:0.625:11:9:4:8:11:9:4:8
chr19	7005905	.	T	A	419.24	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0362008;FXX=0.0644953;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.5158;QD=57.8258;RBI=0.0382933;REFB=0;REVB=0.0124851;RO=0;SAF=12;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.0947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0032368;OID=.;OPOS=7005905;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:17:12:0:0:17:12:0:0
chr19	7006048	.	G	A	66.28	PASS	AF=0.409091;AO=9;DP=22;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.001916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.263;QD=12.0517;RBI=0.0126164;REFB=-0.00620284;REVB=0.01247;RO=13;SAF=5;SAR=4;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0170594;STB=0.510181;STBP=0.954;TYPE=snp;VARB=0.00539945;OID=.;OPOS=7006048;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:22:22:13:13:9:9:0.409091:4:5:7:6:4:5:7:6
chr19	7012026	.	A	G	60.73	PASS	AF=0.175439;AO=7;DP=54;FAO=10;FDP=57;FR=.;FRO=47;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=15;FSRR=32;FWDB=0.0385865;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.729;QD=4.26183;RBI=0.0423082;REFB=-0.00201177;REVB=-0.0173511;RO=47;SAF=4;SAR=3;SRF=15;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.29948;STB=0.787282;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=0.0203085;OID=.;OPOS=7012026;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:60:54:57:47:47:7:10:0.175439:3:4:15:32:3:7:15:32
chr19	7076418	.	C	A	221.15	PASS	AF=0.412698;AO=26;DP=64;FAO=26;FDP=63;FR=.;FRO=37;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=-0.000218544;FXX=0.0156226;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.122;QD=14.0413;RBI=0.0338304;REFB=-0.00906348;REVB=-0.0338297;RO=37;SAF=14;SAR=12;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0535631;STB=0.530539;STBP=0.694;TYPE=snp;VARB=0.0139176;OID=.;OPOS=7076418;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:63:37:37:26:26:0.412698:12:14:18:19:12:14:18:19
chr19	7112265	.	G	A	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0236912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.8089;QD=43.4861;RBI=0.0830826;REFB=0;REVB=0.0796332;RO=0;SAF=8;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00442191;OID=.;OPOS=7112265;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:4:8:0:0:4:8:0:0
chr19	7141775	.	G	A	253.2	PASS	AF=0.509434;AO=27;DP=53;FAO=27;FDP=53;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=-0.0323259;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.271;QD=19.1092;RBI=0.0380151;REFB=0.0172275;REVB=-0.0200047;RO=25;SAF=10;SAR=17;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0629878;STB=0.527306;STBP=0.716;TYPE=snp;VARB=-0.0221264;OID=.;OPOS=7141775;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:25:26:27:27:0.509434:17:10:11:14:17:10:11:15
chr19	7504982	.	C	T	244.81	PASS	AF=0.521739;AO=23;DP=45;FAO=24;FDP=46;FR=.;FRO=22;FSAF=20;FSAR=4;FSRF=16;FSRR=6;FWDB=0.0138794;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.496;QD=21.2878;RBI=0.0182104;REFB=-0.0412552;REVB=-0.011789;RO=22;SAF=19;SAR=4;SRF=16;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133627;STB=0.581321;STBP=0.35;TYPE=snp;VARB=0.0434289;OID=.;OPOS=7504982;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:46:22:22:23:24:0.521739:4:19:16:6:4:20:16:6
chr19	7528734	.	A	G	277.43	PASS	AF=1;AO=21;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00533243;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.4368;QD=50.4426;RBI=0.00560395;REFB=0;REVB=0.00172323;RO=0;SAF=12;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00507065;OID=.;OPOS=7528734;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:21:22:1:9:12:0:0:9:13:0:0
chr19	7533767	.	T	G	708.56	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0288177;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.44;QD=62.9829;RBI=0.037164;REFB=0;REVB=0.023467;RO=0;SAF=32;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.33579e-05;OID=.;OPOS=7533767;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:13:32:0:0:13:32:0:0
chr19	7533850	.	A	G	937.56	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0063079;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.509;QD=58.5976;RBI=0.0166809;REFB=0;REVB=-0.0154423;RO=0;SAF=47;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.23474e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.14238e-05;OID=.;OPOS=7533850;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:17:47:0:0:17:47:0:0
chr19	7538039	.	A	G	1098.72	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0296232;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.393;QD=60.204;RBI=0.0438933;REFB=0;REVB=-0.0323896;RO=0;SAF=33;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.93225e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.41026e-06;OID=.;OPOS=7538039;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:40:33:0:0:40:33:0:0
chr19	7538117	.	A	G	747.07	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00996448;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.297;QD=63.5806;RBI=0.017716;REFB=0;REVB=-0.0146481;RO=0;SAF=24;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.8207e-05;OID=.;OPOS=7538117;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:23:24:0:0:23:24:0:0
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chr19	7712277	.	A	G	676.86	PASS	AF=0.51145;AO=65;DP=129;FAO=67;FDP=131;FR=.;FRO=64;FSAF=42;FSAR=25;FSRF=38;FSRR=26;FWDB=0.00578357;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.869;QD=20.6676;RBI=0.00579735;REFB=-0.0257423;REVB=0.000399465;RO=64;SAF=41;SAR=24;SRF=38;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0353617;STB=0.517136;STBP=0.734;TYPE=snp;VARB=0.0195426;OID=.;OPOS=7712277;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:129:131:64:64:65:67:0.51145:24:41:38:26:25:42:38:26
chr19	7743879	.	C	T	81.22	PASS	AF=0.555556;AO=10;DP=18;FAO=10;FDP=18;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=-0.0190552;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.963;QD=18.0479;RBI=0.0289525;REFB=-0.00480017;REVB=-0.0217979;RO=8;SAF=6;SAR=4;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.264286;STB=0.651879;STBP=0.18;TYPE=snp;VARB=0.00361479;OID=.;OPOS=7743879;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:18:18:8:8:10:10:0.555556:4:6:2:6:4:6:2:6
chr19	7747404	.	G	A	256.33	PASS	AF=0.394737;AO=30;DP=76;FAO=30;FDP=76;FR=.;FRO=46;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=27;FSRR=19;FWDB=-0.00225402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.728;QD=13.4911;RBI=0.0309209;REFB=0.00873293;REVB=0.0308386;RO=45;SAF=16;SAR=14;SRF=26;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0471764;STB=0.532722;STBP=0.662;TYPE=snp;VARB=-0.0154119;OID=.;OPOS=7747404;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:45:46:30:30:0.394737:14:16:26:19:14:16:27:19
chr19	7755056	.	G	A	375.67	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0255217;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.5304;QD=55.6554;RBI=0.0258904;REFB=0;REVB=0.00435381;RO=0;SAF=12;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000258249;OID=.;OPOS=7755056;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:15:12:0:0:15:12:0:0
chr19	7763703	.	A	G	287.91	PASS	AF=0.5;AO=31;DP=62;FAO=31;FDP=62;FR=.;FRO=31;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=-0.030191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.4553;QD=18.5748;RBI=0.0497523;REFB=0.00196764;REVB=-0.0395449;RO=31;SAF=17;SAR=14;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0579364;STB=0.532338;STBP=0.621;TYPE=snp;VARB=-0.00358816;OID=.;OPOS=7763703;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:31:31:31:31:0.5:14:17:15:16:14:17:15:16
chr19	7913974	.	T	C	769.5	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0276348;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.097;QD=57.0003;RBI=0.0303101;REFB=0;REVB=-0.0124506;RO=0;SAF=26;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.52846e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000166943;OID=.;OPOS=7913974;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:28:26:0:0:28:26:0:0
chr19	7916620	.	A	G	358.12	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0388813;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.561;QD=55.0953;RBI=0.042244;REFB=0;REVB=-0.0165166;RO=0;SAF=11;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000105258;OID=.;OPOS=7916620;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:15:11:0:0:15:11:0:0
chr19	7928462	.	T	C	1264.73	PASS	AF=1;AO=80;DP=80;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00158382;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.167;QD=61.6941;RBI=0.0464265;REFB=0;REVB=0.0463995;RO=0;SAF=43;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.98399e-05;OID=.;OPOS=7928462;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:80:82:0:0:80:82:1:37:43:0:0:38:44:0:0
chr19	7928788	.	A	C	447.02	PASS	AF=1;AO=30;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0227795;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.521;QD=57.6803;RBI=0.0228696;REFB=0;REVB=0.00202786;RO=0;SAF=13;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.63861e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000120723;OID=.;OPOS=7928788;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:30:31:1:17:13:0:0:18:13:0:0
chr19	7936208	.	A	G	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00460428;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.459;QD=44.6898;RBI=0.0230598;REFB=0;REVB=-0.0225954;RO=0;SAF=7;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00018946;OID=.;OPOS=7936208;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:6:7:0:0:6:7:0:0
chr19	7938306	.	A	AG,G	471.23	PASS	AF=1,0;AO=28,2;DP=36;FAO=35,0;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=22,0;FSAR=13,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0504502,0.000971405;FXX=0.0277701;HRUN=2,1;LEN=1,1;MLLD=23.0202,109.829;QD=53.8547;RBI=0.0685991,0.0328648;REFB=0,0;REVB=0.0464824,-0.0328504;RO=6;SAF=20,1;SAR=8,1;SRF=2;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.141535,0.168213;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=-0.00364575,0;OID=.,.;OPOS=7938307,7938306;OREF=-,A;OALT=G,G;OMAPALT=AG,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:35:6:0:28,2:35,0:1,0:8,1:20,1:2:4:13,0:22,0:0:0
chr19	7944348	.	TC	T	238.98	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00382162;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=35.9231;QD=45.5194;RBI=0.0258834;REFB=0;REVB=-0.0255998;RO=0;SAF=5;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.78933e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.00180289;OID=.;OPOS=7944349;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:21:21:21:21:0:5:16:0:0:4:0:5:16:0:0
chr19	7963914	.	A	C	246.24	PASS	AF=0.952381;AO=20;DP=21;FAO=20;FDP=21;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0455846;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.166;QD=46.9028;RBI=0.0458021;REFB=-0.075677;REVB=-0.00445844;RO=1;SAF=9;SAR=11;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0400637;STB=0.521717;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=0.0101793;OID=.;OPOS=7963914;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:21:21:1:1:20:20:0.952381:11:9:0:1:11:9:0:1
chr19	7968168	.	G	A	272.52	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0588723;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.05;QD=51.9088;RBI=0.0713058;REFB=0;REVB=0.0402315;RO=0;SAF=11;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000329559;OID=.;OPOS=7968168;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:10:11:0:0:10:11:0:0
chr19	7976127	.	C	G	188.73	PASS	AF=0.692308;AO=18;DP=26;FAO=18;FDP=26;FR=.;FRO=8;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.0215136;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=203.661;QD=29.0353;RBI=0.02237;REFB=-0.0178179;REVB=0.00613022;RO=7;SAF=7;SAR=11;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0948483;STB=0.535358;STBP=0.615;TYPE=snp;VARB=0.00542138;OID=.;OPOS=7976127;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:26:26:7:8:18:18:0.692308:11:7:4:3:11:7:4:4
chr19	7986638	.	C	G	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.042017;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=292.567;QD=52.6132;RBI=0.0428953;REFB=0;REVB=0.00863593;RO=0;SAF=11;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000146012;OID=.;OPOS=7986638;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:11:11:0:0:11:11:0:0
chr19	8122737	.	G	A	212.82	PASS	AF=0.5;AO=21;DP=42;FAO=21;FDP=42;FR=.;FRO=21;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=-0.012098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.9333;QD=20.2688;RBI=0.0627712;REFB=-0.0441068;REVB=-0.0615943;RO=21;SAF=12;SAR=9;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167799;STB=0.594505;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=0.0405161;OID=.;OPOS=8122737;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:21:21:21:21:0.5:9:12:8:13:9:12:8:13
chr19	8122767	.	T	C	766.45	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0150461;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.582;QD=63.8712;RBI=0.0150876;REFB=0;REVB=0.00111839;RO=0;SAF=24;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.70162e-05;OID=.;OPOS=8122767;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:24:24:0:0:24:24:0:0
chr19	8152725	.	A	G	885.4	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0594456;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.464;QD=58.0592;RBI=0.0594519;REFB=0;REVB=-0.000866961;RO=0;SAF=27;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000201101;OID=.;OPOS=8152725;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:34:27:0:0:34:27:0:0
chr19	8154990	.	C	T	55.27	PASS	AF=0.380952;AO=8;DP=21;FAO=8;FDP=21;FR=.;FRO=13;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=0.0420988;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.7461;QD=10.5285;RBI=0.056735;REFB=0.00285225;REVB=-0.0380335;RO=13;SAF=2;SAR=6;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0743475;STB=0.545336;STBP=0.848;TYPE=snp;VARB=-0.00414267;OID=.;OPOS=8154990;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:21:21:13:13:8:8:0.380952:6:2:4:9:6:2:4:9
chr19	8159362	.	G	T	137.83	PASS	AF=0.517241;AO=15;DP=29;FAO=15;FDP=29;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=-0.00620125;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=267.797;QD=19.011;RBI=0.00894364;REFB=-0.00322474;REVB=0.00644463;RO=14;SAF=8;SAR=7;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156623;STB=0.588672;STBP=0.351;TYPE=snp;VARB=0.00314287;OID=.;OPOS=8159362;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:14:14:15:15:0.517241:7:8:10:4:7:8:10:4
chr19	8159409	.	G	T	105.0	PASS	AF=0.521739;AO=8;DP=23;FAO=12;FDP=23;FR=.,HEALED;FRO=11;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.0471021;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=130.025;QD=18.2607;RBI=0.0774443;REFB=-0.0313479;REVB=-0.0614736;RO=5;SAF=5;SAR=3;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128939;STB=0.521703;STBP=0.851;TYPE=snp;VARB=0.0254026;OID=.;OPOS=8159409;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:23:23:5:11:8:12:0.521739:3:5:4:1:6:6:5:6
chr19	8160897	.	G	C	85.72	PASS	AF=0.22807;AO=13;DP=57;FAO=13;FDP=57;FR=.;FRO=44;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=23;FSRR=21;FWDB=0.0216024;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.881;QD=6.01511;RBI=0.0469831;REFB=0.00228266;REVB=0.0417223;RO=44;SAF=7;SAR=6;SRF=23;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0193382;STB=0.512176;STBP=0.967;TYPE=snp;VARB=-0.00405377;OID=.;OPOS=8160897;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:57:57:44:44:13:13:0.22807:6:7:23:21:6:7:23:21
chr19	8165868	.	G	A	492.95	PASS	AF=0.698413;AO=44;DP=63;FAO=44;FDP=63;FR=.;FRO=19;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.00609101;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=230.686;QD=31.2987;RBI=0.0194122;REFB=-0.0232507;REVB=-0.0184319;RO=19;SAF=25;SAR=19;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0531707;STB=0.528798;STBP=0.486;TYPE=snp;VARB=0.0097567;OID=.;OPOS=8165868;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:19:19:44:44:0.698413:19:25:9:10:19:25:9:10
chr19	8176569	.	G	A	44.78	PASS	AF=0.291667;AO=7;DP=24;FAO=7;FDP=24;FR=.;FRO=17;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=-0.0415006;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.1962;QD=7.46351;RBI=0.051946;REFB=-0.00477298;REVB=0.0312424;RO=16;SAF=2;SAR=5;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0354434;STB=0.507226;STBP=0.999;TYPE=snp;VARB=0.017831;OID=.;OPOS=8176569;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:24:24:16:17:7:7:0.291667:5:2:5:11:5:2:5:12
chr19	8176640	.	C	T	107.42	PASS	AF=0.382353;AO=13;DP=34;FAO=13;FDP=34;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=15;FWDB=0.0113747;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.996;QD=12.6374;RBI=0.011915;REFB=-0.00518969;REVB=0.00354747;RO=20;SAF=6;SAR=7;SRF=5;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.226814;STB=0.610951;STBP=0.339;TYPE=snp;VARB=0.0106258;OID=.;OPOS=8176640;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:20:21:13:13:0.382353:7:6:5:15:7:6:6:15
chr19	8176919	.	C	T	248.77	PASS	AF=0.575;AO=23;DP=41;FAO=23;FDP=40;FR=.;FRO=17;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.0057347;FXX=0.0243843;HRUN=4;LEN=1;MLLD=246.217;QD=24.8765;RBI=0.0110461;REFB=0.0104305;REVB=0.00944083;RO=16;SAF=11;SAR=12;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0302011;STB=0.503265;STBP=0.962;TYPE=snp;VARB=-0.00690024;OID=.;OPOS=8176919;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:40:16:17:23:23:0.575:12:11:7:9:12:11:8:9
chr19	8183871	.	G	A	160.48	PASS	AF=0.485714;AO=17;DP=34;FAO=17;FDP=35;FR=.;FRO=18;FSAF=1;FSAR=16;FSRF=4;FSRR=14;FWDB=-0.0950342;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.715;QD=18.34;RBI=0.0958223;REFB=-0.0209106;REVB=-0.0122641;RO=17;SAF=1;SAR=16;SRF=3;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.307838;STB=0.726917;STBP=0.116;TYPE=snp;VARB=0.0226289;OID=.;OPOS=8183871;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:35:17:18:17:17:0.485714:16:1:3:14:16:1:4:14
chr19	8188812	.	C	T	88.1	PASS	AF=0.44;AO=11;DP=25;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.0594053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.501;QD=14.096;RBI=0.0603984;REFB=0.00643991;REVB=-0.0109077;RO=14;SAF=7;SAR=4;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0654098;STB=0.538391;STBP=0.789;TYPE=snp;VARB=-0.00679242;OID=.;OPOS=8188812;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:25:25:14:14:11:11:0.44:4:7:8:6:4:7:8:6
chr19	8191238	.	C	T	357.54	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0125938;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=45.047;QD=55.0056;RBI=0.0667704;REFB=0;REVB=0.065572;RO=0;SAF=17;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00122564;OID=.;OPOS=8191238;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:26:0:0:25:26:1:8:17:0:0:9:17:0:0
chr19	8191248	.	A	G	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.012629;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=270.134;QD=55.656;RBI=0.0246107;REFB=0;REVB=0.0211233;RO=0;SAF=18;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000103521;OID=.;OPOS=8191248;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:9:18:0:0:9:18:0:0
chr19	8191401	.	G	A	66.97	PASS	AF=0.428571;AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.00367217;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.4291;QD=12.7571;RBI=0.121016;REFB=-0.0274727;REVB=0.12096;RO=11;SAF=2;SAR=7;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.255081;STB=0.636033;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=0.0609829;OID=.;OPOS=8191401;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:21:21:11:12:9:9:0.428571:7:2:5:6:7:2:5:7
chr19	8196444	.	C	T	614.77	PASS	AF=1;AO=30;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=29;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0158188;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=304.013;QD=61.4766;RBI=0.0600609;REFB=0;REVB=0.0579403;RO=0;SAF=22;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000390167;OID=.;OPOS=8196444;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:30:40:1:8:22:0:0:11:29:0:0
chr19	8196499	.	G	A	332.71	PASS	AF=0.589286;AO=33;DP=57;FAO=33;FDP=56;FR=.;FRO=23;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=-0.00140239;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.423;QD=23.7651;RBI=0.00428883;REFB=-0.0397876;REVB=-0.00405307;RO=23;SAF=18;SAR=15;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0478195;STB=0.5263;STBP=0.659;TYPE=snp;VARB=0.0270825;OID=.;OPOS=8196499;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:56:23:23:33:33:0.589286:15:18:14:9:15:18:14:9
chr19	8212263	.	G	A	199.46	PASS	AF=0.431373;AO=22;DP=51;FAO=22;FDP=51;FR=.;FRO=29;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.0292761;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.7676;QD=15.6439;RBI=0.0506388;REFB=-0.00990005;REVB=-0.0413182;RO=29;SAF=16;SAR=6;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.230333;STB=0.632284;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=0.0165047;OID=.;OPOS=8212263;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:29:29:22:22:0.431373:6:16:15:14:6:16:15:14
chr19	8321182	.	A	T	695.99	PASS	AF=0.980392;AO=50;DP=52;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00864073;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.4053;QD=54.5872;RBI=0.00867189;REFB=0.0169633;REVB=-0.00073444;RO=1;SAF=28;SAR=22;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0209158;STB=0.511107;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=-0.00028535;OID=.;OPOS=8321182;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:52:51:1:1:50:50:0.980392:22:28:0:1:22:28:0:1
chr19	8321946	.	T	C	393.32	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.016473;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.915;QD=56.1879;RBI=0.0166458;REFB=0;REVB=0.002392;RO=0;SAF=14;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000133489;OID=.;OPOS=8321946;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:14:14:0:0:14:14:0:0
chr19	8326904	.	G	A	549.77	PASS	AF=0.974359;AO=37;DP=39;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00923941;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=123.403;QD=56.3869;RBI=0.0326038;REFB=-0.0344527;REVB=0.0312672;RO=1;SAF=20;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0267496;STB=0.513506;STBP=0.328;TYPE=snp;VARB=0.000584132;OID=.;OPOS=8326904;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:39:39:1:1:37:38:0.974359:17:20:0:1:18:20:0:1
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chr19	8376431	.	G	A	216.34	PASS	AF=0.538462;AO=21;DP=39;FAO=21;FDP=39;FR=.;FRO=18;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=0.0200787;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=137.34;QD=22.1885;RBI=0.0237787;REFB=0.00969705;REVB=0.0127387;RO=18;SAF=14;SAR=7;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0987524;STB=0.555501;STBP=0.479;TYPE=snp;VARB=-0.00589278;OID=.;OPOS=8376431;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:18:18:21:21:0.538462:7:14:10:8:7:14:10:8
chr19	8387207	.	G	A	1176.68	PASS	AF=0.975309;AO=79;DP=81;FAO=79;FDP=81;FR=.;FRO=2;FSAF=53;FSAR=26;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0128328;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.314;QD=58.1079;RBI=0.058671;REFB=-0.0597518;REVB=0.0572504;RO=2;SAF=53;SAR=26;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0175289;STB=0.509257;STBP=0.412;TYPE=snp;VARB=0.00179096;OID=.;OPOS=8387207;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:81:81:2:2:79:79:0.975309:26:53:2:0:26:53:2:0
chr19	8389405	.	G	A	87.92	PASS	AF=0.28125;AO=9;DP=32;FAO=9;FDP=32;FR=.,HEALED;FRO=18;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.0223168;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=253.969;QD=10.99;RBI=0.0231221;REFB=-0.0209428;REVB=-0.00604901;RO=16;SAF=4;SAR=5;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00743536;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00982704;OID=.;OPOS=8389405;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:68:32:32:16:18:9:9:0.28125:5:4:7:9:5:4:8:10
chr19	8389892	.	GTCC	G	197.14	PASS	AF=0.434783;AO=20;DP=49;FAO=20;FDP=46;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=-0.00978205;FXX=0.041658;HRUN=1;LEN=3;MLLD=297.982;QD=17.1428;RBI=0.0198275;REFB=-0.00302594;REVB=-0.0172465;RO=26;SAF=11;SAR=9;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12494;STB=0.571358;STBP=0.428;TYPE=del;VARB=0.00355967;OID=.;OPOS=8389893;OREF=TCC;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.434783:20:49:20:46:26:11:9:11:15:99:26:11:9:11:15
chr19	8398006	.	C	T	423.65	PASS	AF=0.488636;AO=41;DP=86;FAO=43;FDP=88;FR=.;FRO=45;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=25;FSRR=20;FWDB=0.0536416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.878;QD=19.2568;RBI=0.0559688;REFB=-0.00947776;REVB=-0.0159714;RO=44;SAF=24;SAR=17;SRF=24;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0379094;STB=0.513507;STBP=0.83;TYPE=snp;VARB=0.00955714;OID=.;OPOS=8398006;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:88:44:45:41:43:0.488636:17:24:24:20:18:25:25:20
chr19	8398714	.	A	G	210.72	PASS	AF=0.477273;AO=21;DP=44;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.0232642;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.868;QD=19.1564;RBI=0.0299916;REFB=-0.0226497;REVB=0.0189281;RO=22;SAF=15;SAR=6;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.211772;STB=0.633669;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=0.0147178;OID=.;OPOS=8398714;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:22:23:21:21:0.477273:6:15:11:11:6:15:11:12
chr19	8398889	.	TC	T	31.27	PASS	AF=0.466667;AO=6;DP=15;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.0249446;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=14.4056;QD=8.33958;RBI=0.123469;REFB=0.00408164;REVB=-0.120923;RO=8;SAF=1;SAR=5;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.264432;STB=0.68509;STBP=0.269;TYPE=del;VARB=-0.0228541;OID=.;OPOS=8398890;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.466667:6:15:7:15:8:1:6:3:5:31:8:1:5:3:5
chr19	8398949	.	CTCGCTGTCGCCA	C	30.25	PASS	AF=0.3125;AO=5;DP=17;FAO=5;FDP=16;FR=.;FRO=11;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.00637794;FXX=0.0587889;HRUN=1;LEN=12;MLLD=259.093;QD=7.56125;RBI=0.0161578;REFB=-0.0210562;REVB=0.0148458;RO=10;SAF=1;SAR=4;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.347085;STB=0.755664;STBP=0.215;TYPE=del;VARB=0.0475419;OID=.;OPOS=8398950;OREF=TCGCTGTCGCCA;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.3125:5:17:5:16:11:1:4:6:5:30:10:1:4:5:5
chr19	8399272	.	G	A	185.94	PASS	AF=0.389831;AO=23;DP=59;FAO=23;FDP=59;FR=.;FRO=36;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=24;FSRR=12;FWDB=0.0177581;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.445;QD=12.6062;RBI=0.0233118;REFB=-0.0113487;REVB=0.0151027;RO=36;SAF=16;SAR=7;SRF=24;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0356217;STB=0.52053;STBP=0.836;TYPE=snp;VARB=0.0197535;OID=.;OPOS=8399272;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:36:36:23:23:0.389831:7:16:24:12:7:16:24:12
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chr19	8503864	.	AC	A	63.52	PASS	AF=0.392857;AO=10;DP=27;FAO=11;FDP=28;FR=.;FRO=17;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=-0.067005;FXX=0.0344709;HRUN=4;LEN=1;MLLD=19.0401;QD=9.07401;RBI=0.0994901;REFB=-0.0126777;REVB=-0.0735432;RO=15;SAF=0;SAR=10;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0.308176;SSSB=-0.775287;STB=0.680301;STBP=0.162;TYPE=del;VARB=0.0051801;OID=.;OPOS=8503865;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.392857:10:27:11:28:17:2:9:7:10:63:15:0:10:6:9
chr19	8531206	.	G	T	246.64	PASS	AF=0.357143;AO=30;DP=84;FAO=30;FDP=84;FR=.;FRO=54;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=28;FSRR=26;FWDB=-0.0177795;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.14;QD=11.7449;RBI=0.0213152;REFB=-0.0170805;REVB=-0.0117571;RO=54;SAF=12;SAR=18;SRF=28;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133158;STB=0.576871;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=0.0341322;OID=.;OPOS=8531206;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:54:54:30:30:0.357143:18:12:28:26:18:12:28:26
chr19	8551094	.	T	C	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00371458;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.659;QD=37.4878;RBI=0.0491754;REFB=0;REVB=0.0490349;RO=0;SAF=3;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000526984;OID=.;OPOS=8551094;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:5:3:0:0:5:3:0:0
chr19	8553630	.	C	T	1302.12	PASS	AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0117871;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.933;QD=62.0059;RBI=0.0144631;REFB=0;REVB=0.00838131;RO=0;SAF=39;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.93822e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.49588e-05;OID=.;OPOS=8553630;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:45:39:0:0:45:39:0:0
chr19	8578035	.	T	C	292.75	PASS	AF=0.604651;AO=25;DP=42;FAO=26;FDP=43;FR=.;FRO=17;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=4;FWDB=-0.00758846;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.127;QD=27.2323;RBI=0.0201935;REFB=-0.00676876;REVB=0.0187134;RO=16;SAF=12;SAR=13;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18986;STB=0.618287;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.00297162;OID=.;OPOS=8578035;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:43:16:17:25:26:0.604651:13:12:12:4:14:12:13:4
chr19	8612914	.	G	A	56.02	PASS	AF=0.333333;AO=8;DP=25;FAO=8;FDP=24;FR=.;FRO=16;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=-0.036405;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.5186;QD=9.33693;RBI=0.0390286;REFB=0.00679468;REVB=0.014068;RO=15;SAF=2;SAR=6;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10912;STB=0.552494;STBP=0.706;TYPE=snp;VARB=-0.0139314;OID=.;OPOS=8612914;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:25:24:15:16:8:8:0.333333:6:2:5:10:6:2:5:11
chr19	8645785	.	CAT	CCT,CT,CTC	712.73	PASS	AF=0.941176,0.0588235,0;AO=37,11,2;DP=51;FAO=48,3,0;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=26,3,0;FSAR=22,0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0324332,0.0101693,-0.00518036;FXX=0;HRUN=1,1,1;LEN=1,1,2;MLLD=157.997,140.882,90.3399;QD=55.9004;RBI=0.0559938,0.0415632,0.0133841;REFB=0,0,0;REVB=0.0456442,0.0402999,0.0123409;RO=0;SAF=15,11,2;SAR=22,0,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-3.82408e-08,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=snp,del,mnp;VARB=0.00451963,-0.0282007,0;OID=.,.,.;OPOS=8645786,8645786,8645786;OREF=A,A,AT;OALT=C,-,TC;OMAPALT=CCT,CT,CTC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.941176,0.0588235,0:37,11,2:51:48,3,0:51:0:26,3,0:22,0,0:0:0:6:0:15,11,2:22,0,0:0:0
chr19	8669931	.	G	C	851.26	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0556347;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=260.831;QD=57.7124;RBI=0.0587924;REFB=0;REVB=0.0190085;RO=0;SAF=20;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000108706;OID=.;OPOS=8669931;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:39:20:0:0:39:20:0:0
chr19	8808373	.	G	T	1102.41	PASS	AF=0.986667;AO=74;DP=75;FAO=74;FDP=75;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0128534;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.1145;QD=58.795;RBI=0.107342;REFB=-0.0550481;REVB=0.106569;RO=1;SAF=40;SAR=34;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.011681;STB=0.506171;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=0.00204521;OID=.;OPOS=8808373;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:75:75:1:1:74:74:0.986667:34:40:1:0:34:40:1:0
chr19	8808942	.	A	G	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0773357;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.298;QD=35.5751;RBI=0.0990707;REFB=0;REVB=0.0619209;RO=0;SAF=6;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00123283;OID=.;OPOS=8808942;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:1:6:0:0:1:6:0:0
chr19	8841558	.	T	C	205.1	PASS	AF=0.42;AO=21;DP=50;FAO=21;FDP=50;FR=.;FRO=29;FSAF=16;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=20;FWDB=0.0321263;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.452;QD=16.4082;RBI=0.0405835;REFB=-0.0143054;REVB=0.0247976;RO=29;SAF=16;SAR=5;SRF=9;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.456996;STB=0.761655;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0118682;OID=.;OPOS=8841558;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:29:29:21:21:0.42:5:16:9:20:5:16:9:20
chr19	8953801	.	T	C	671.24	PASS	AF=0.918367;AO=45;DP=49;FAO=45;FDP=49;FR=.;FRO=4;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=-0.0222194;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.2084;QD=54.7951;RBI=0.0618724;REFB=-0.188429;REVB=-0.0577451;RO=4;SAF=20;SAR=25;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.069469;STB=0.537021;STBP=0.116;TYPE=snp;VARB=0.0103887;OID=.;OPOS=8953801;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:16:49:49:4:4:45:45:0.918367:25:20:0:4:25:20:0:4
chr19	8953922	.	C	T	517.86	PASS	AF=0.947368;AO=36;DP=38;FAO=36;FDP=38;FR=.;FRO=2;FSAF=12;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00432241;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.086;QD=54.512;RBI=0.011271;REFB=-0.0463878;REVB=0.0104092;RO=2;SAF=12;SAR=24;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0374231;STB=0.519989;STBP=0.403;TYPE=snp;VARB=0.0010043;OID=.;OPOS=8953922;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:38:38:2:2:36:36:0.947368:24:12:0:2:24:12:0:2
chr19	8961981	.	C	G	1709.35	PASS	AF=1;AO=112;DP=112;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00641838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.802;QD=60.5079;RBI=0.0466104;REFB=0;REVB=0.0461663;RO=0;SAF=48;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.41465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000533376;OID=.;OPOS=8961981;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:112:113:0:0:112:113:1:64:48:0:0:64:49:0:0
chr19	8968903	.	A	G	143.03	PASS	AF=0.289855;AO=19;DP=67;FAO=20;FDP=69;FR=.;FRO=49;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=20;FSRR=29;FWDB=-0.00271844;FXX=0.028165;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.193;QD=8.29175;RBI=0.00349893;REFB=-0.00404986;REVB=-0.00220286;RO=48;SAF=10;SAR=9;SRF=20;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130281;STB=0.599615;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.00771294;OID=.;OPOS=8968903;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:69:48:49:19:20:0.289855:9:10:20:28:9:11:20:29
chr19	8999429	.	G	T	54.04	PASS	AF=0.117647;AO=12;DP=102;FAO=12;FDP=102;FR=.;FRO=90;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=52;FSRR=38;FWDB=-0.0146802;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=84.5249;QD=2.11912;RBI=0.0552622;REFB=-0.00135029;REVB=0.0532767;RO=89;SAF=8;SAR=4;SRF=51;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119459;STB=0.583191;STBP=0.622;TYPE=snp;VARB=0.0305781;OID=.;OPOS=8999429;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:102:102:89:90:12:12:0.117647:4:8:51:38:4:8:52:38
chr19	8999438	.	A	T	134.52	PASS	AF=0.207921;AO=21;DP=101;FAO=21;FDP=101;FR=.;FRO=80;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=46;FSRR=34;FWDB=-0.030221;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.1689;QD=5.32754;RBI=0.0308475;REFB=-0.0111927;REVB=-0.0061854;RO=80;SAF=14;SAR=7;SRF=46;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122496;STB=0.577389;STBP=0.445;TYPE=snp;VARB=0.0284968;OID=.;OPOS=8999438;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:101:80:80:21:21:0.207921:7:14:46:34:7:14:46:34
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chr19	9001833	.	A	G	340.74	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00444577;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.643;QD=54.5176;RBI=0.0234962;REFB=0;REVB=0.0230717;RO=0;SAF=13;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000124799;OID=.;OPOS=9001833;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:12:13:0:0:12:13:0:0
chr19	9001835	.	G	A	315.35	PASS	AF=0.96;AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=25;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0147067;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=144.722;QD=50.4559;RBI=0.0300497;REFB=-0.143403;REVB=0.0262049;RO=1;SAF=13;SAR=11;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.040273;STB=0.521721;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=0.00299598;OID=.;OPOS=9001835;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:25:25:1:1:24:24:0.96:11:13:0:1:11:13:0:1
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chr19	9005719	.	A	G	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0149597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.737;QD=52.613;RBI=0.0177399;REFB=0;REVB=0.00953476;RO=0;SAF=11;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000316132;OID=.;OPOS=9005719;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:11:11:0:0:11:11:0:0
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chr19	9012840	.	G	A	48.59	PASS	AF=0.0882353;AO=15;DP=169;FAO=15;FDP=170;FR=.;FRO=155;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=74;FSRR=81;FWDB=-0.000858924;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.486;QD=1.14336;RBI=0.0321926;REFB=-0.00291148;REVB=0.0321811;RO=153;SAF=3;SAR=12;SRF=73;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.336207;STB=0.767705;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.0356243;OID=.;OPOS=9012840;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:48:169:170:153:155:15:15:0.0882353:12:3:73:80:12:3:74:81
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chr19	9088330	.	G	A	212.81	PASS	AF=0.5;AO=21;DP=42;FAO=21;FDP=42;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=15;FWDB=0.0443171;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.7586;QD=20.2674;RBI=0.0505893;REFB=-0.0141194;REVB=0.0243982;RO=21;SAF=9;SAR=12;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132605;STB=0.5744;STBP=0.385;TYPE=snp;VARB=0.00848985;OID=.;OPOS=9088330;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:21:21:21:21:0.5:12:9:6:15:12:9:6:15
chr19	9088772	.	T	C	536.07	PASS	AF=0.534653;AO=52;DP=99;FAO=54;FDP=101;FR=.;FRO=47;FSAF=31;FSAR=23;FSRF=19;FSRR=28;FWDB=-0.00359562;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.315;QD=21.2304;RBI=0.00361327;REFB=-0.00330932;REVB=-0.00035675;RO=46;SAF=30;SAR=22;SRF=18;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157787;STB=0.57888;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=0.0032656;OID=.;OPOS=9088772;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:101:46:47:52:54:0.534653:22:30:18:28:23:31:19:28
chr19	9090182	.	T	C	117.2	PASS	AF=0.358974;AO=14;DP=39;FAO=14;FDP=39;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=0.022211;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=215.825;QD=12.0204;RBI=0.0233309;REFB=-0.00789284;REVB=0.00714156;RO=25;SAF=6;SAR=8;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0126125;STB=0.507452;STBP=0.969;TYPE=snp;VARB=0.0119486;OID=.;OPOS=9090182;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:25:25:14:14:0.358974:8:6:11:14:8:6:11:14
chr19	9090784	.	C	T	134.67	PASS	AF=0.46875;AO=14;DP=32;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.0029343;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.785;QD=16.834;RBI=0.00953675;REFB=-0.0175018;REVB=0.00907411;RO=17;SAF=10;SAR=4;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192804;STB=0.622468;STBP=0.255;TYPE=snp;VARB=0.0156518;OID=.;OPOS=9090784;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:17:17:14:15:0.46875:4:10:9:8:4:11:9:8
chr19	9204307	.	A	G	689.38	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00368876;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.756;QD=62.6708;RBI=0.014131;REFB=0;REVB=-0.0136411;RO=0;SAF=28;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.35981e-05;OID=.;OPOS=9204307;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:16:28:0:0:16:28:0:0
chr19	9213026	.	T	C	424.8	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0531408;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.4005;QD=56.6394;RBI=0.0646914;REFB=0;REVB=-0.0368922;RO=0;SAF=13;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00195728;OID=.;OPOS=9213026;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:30:0:0:29:30:1:16:13:0:0:16:14:0:0
chr19	9213079	.	A	C	262.93	PASS	AF=0.954545;AO=21;DP=22;FAO=21;FDP=22;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0235546;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.1382;QD=47.8054;RBI=0.0417078;REFB=-0.0338228;REVB=0.0344198;RO=1;SAF=11;SAR=10;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0439301;STB=0.523787;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.0047015;OID=.;OPOS=9213079;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:22:22:1:1:21:21:0.954545:10:11:0:1:10:11:0:1
chr19	9213132	.	A	G	289.28	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0390159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.0744;QD=52.5965;RBI=0.0481454;REFB=0;REVB=0.0282088;RO=0;SAF=13;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2029e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00126828;OID=.;OPOS=9213132;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:9:13:0:0:9:13:0:0
chr19	9346427	.	T	C	464.3	PASS	AF=1;AO=31;DP=32;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0379097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.292;QD=54.6232;RBI=0.0489202;REFB=0;REVB=0.0309199;RO=1;SAF=18;SAR=13;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0252169;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00074177;OID=.;OPOS=9346427;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:34:1:0:31:34:1:13:18:1:0:14:20:0:0
chr19	9346599	.	C	G	715.02	PASS	AF=0.978723;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.000396669;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.437;QD=60.8527;RBI=0.00118118;REFB=-0.0690414;REVB=0.00111258;RO=0;SAF=24;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5102;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=-5.81156e-05;OID=.;OPOS=9346599;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:47:47:0:1:46:46:0.978723:22:24:0:0:22:24:1:0
chr19	9362343	.	C	T	64.07	PASS	AF=0.333333;AO=9;DP=27;FAO=9;FDP=27;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=4;FWDB=-0.0470646;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.336;QD=9.49156;RBI=0.0475635;REFB=-0.00729154;REVB=0.00687105;RO=18;SAF=5;SAR=4;SRF=14;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.259858;STB=0.654871;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.0127343;OID=.;OPOS=9362343;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:27:27:18:18:9:9:0.333333:4:5:14:4:4:5:14:4
chr19	9362443	.	C	T	94.71	PASS	AF=0.342857;AO=12;DP=35;FAO=12;FDP=35;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=0.00280784;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=306.304;QD=10.8237;RBI=0.00411916;REFB=-0.00721375;REVB=-0.0030139;RO=23;SAF=8;SAR=4;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0693119;STB=0.541596;STBP=0.763;TYPE=snp;VARB=0.015215;OID=.;OPOS=9362443;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:35:35:23:23:12:12:0.342857:4:8:14:9:4:8:14:9
chr19	9362799	.	T	G	137.02	PASS	AF=0.5;AO=15;DP=29;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.00784823;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=284.206;QD=18.2696;RBI=0.0130799;REFB=-0.0115712;REVB=-0.0104637;RO=14;SAF=6;SAR=9;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0381971;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0113574;OID=.;OPOS=9362799;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:30:14:15:15:15:0.5:9:6:5:9:9:6:6:9
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chr19	9449888	.	A	G	489.67	PASS	AF=0.48;AO=48;DP=100;FAO=48;FDP=100;FR=.;FRO=52;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=26;FSRR=26;FWDB=-0.00985896;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.74;QD=19.5868;RBI=0.0250259;REFB=0.00468756;REVB=-0.0230021;RO=52;SAF=22;SAR=26;SRF=26;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0391061;STB=0.52173;STBP=0.668;TYPE=snp;VARB=-0.0030445;OID=.;OPOS=9449888;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:52:52:48:48:0.48:26:22:26:26:26:22:26:26
chr19	9452026	.	ACT	A	228.33	PASS	AF=0.6;AO=20;DP=38;FAO=21;FDP=35;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.00423098;FXX=0.0789266;HRUN=1;LEN=2;MLLD=232.329;QD=26.0944;RBI=0.017716;REFB=-0.00128863;REVB=-0.0172034;RO=14;SAF=8;SAR=12;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0218355;STB=0.519981;STBP=0.792;TYPE=del;VARB=0.000939021;OID=.;OPOS=9452027;OREF=CT;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.6:20:38:21:35:14:8:13:6:8:99:14:8:12:6:8
chr19	9490814	.	C	T	82.91	PASS	AF=0.37931;AO=10;DP=30;FAO=11;FDP=29;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=0.00242125;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=288.679;QD=11.4355;RBI=0.0177699;REFB=-0.011425;REVB=0.0176042;RO=18;SAF=8;SAR=2;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.309114;STB=0.619488;STBP=0.419;TYPE=snp;VARB=0.018895;OID=.;OPOS=9490814;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:82:30:29:18:18:10:11:0.37931:2:8:10:8:3:8:10:8
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chr19	9492370	.	A	T	104.45	PASS	AF=0.571429;AO=11;DP=20;FAO=12;FDP=21;FR=.;FRO=9;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.00754808;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.339;QD=19.8943;RBI=0.0398228;REFB=-0.0146794;REVB=0.0391009;RO=9;SAF=7;SAR=4;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153845;STB=0.559899;STBP=0.597;TYPE=snp;VARB=0.0170232;OID=.;OPOS=9492370;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:20:21:9:9:11:12:0.571429:4:7:4:5:5:7:4:5
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chr19	9868404	.	C	T	67.43	PASS	AF=0.45;AO=9;DP=20;FAO=9;FDP=20;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.0154351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.745;QD=13.486;RBI=0.0563105;REFB=0.00641992;REVB=-0.0541538;RO=11;SAF=5;SAR=4;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00947861;STB=0.505605;STBP=0.959;TYPE=snp;VARB=-0.00738743;OID=.;OPOS=9868404;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:20:20:11:11:9:9:0.45:4:5:6:5:4:5:6:5
chr19	9968434	.	C	T	226.01	PASS	AF=0.5;AO=22;DP=44;FAO=22;FDP=44;FR=.;FRO=22;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=0.00436005;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.276;QD=20.5464;RBI=0.0224396;REFB=-0.0223459;REVB=-0.0220119;RO=21;SAF=11;SAR=11;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103525;STB=0.568121;STBP=0.381;TYPE=snp;VARB=0.0369337;OID=.;OPOS=9968434;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:21:22:22:22:0.5:11:11:8:13:11:11:8:14
chr19	10071063	.	T	C	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0506218;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.634;QD=43.4861;RBI=0.0544691;REFB=0;REVB=0.0201077;RO=0;SAF=5;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00110297;OID=.;OPOS=10071063;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:7:5:0:0:7:5:0:0
chr19	10077419	.	C	G	39.6	PASS	AF=0.5;AO=6;DP=12;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.0619262;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.613;QD=13.1999;RBI=0.0626345;REFB=-0.00347501;REVB=-0.00939304;RO=6;SAF=5;SAR=1;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.550714;STB=0.83222;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.0133493;OID=.;OPOS=10077419;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:12:12:6:6:6:6:0.5:1:5:1:5:1:5:1:5
chr19	10079093	.	C	T	215.5	PASS	AF=0.393939;AO=26;DP=66;FAO=26;FDP=66;FR=.;FRO=40;FSAF=7;FSAR=19;FSRF=20;FSRR=20;FWDB=0.0124934;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.075;QD=13.0605;RBI=0.0234851;REFB=-0.02024;REVB=-0.0198863;RO=39;SAF=7;SAR=19;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.249925;STB=0.652548;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.0273272;OID=.;OPOS=10079093;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:39:40:26:26:0.393939:19:7:19:20:19:7:20:20
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chr19	10081276	.	C	G	116.1	PASS	AF=0.341463;AO=14;DP=41;FAO=14;FDP=41;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=22;FSRR=5;FWDB=-0.0172086;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=204.314;QD=11.3267;RBI=0.0172551;REFB=-0.0186867;REVB=0.00126586;RO=27;SAF=12;SAR=2;SRF=22;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0875156;STB=0.552551;STBP=0.722;TYPE=snp;VARB=0.0398817;OID=.;OPOS=10081276;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:27:27:14:14:0.341463:2:12:22:5:2:12:22:5
chr19	10084292	.	C	G	76.69	PASS	AF=0.416667;AO=10;DP=24;FAO=10;FDP=24;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=0.0549023;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.151;QD=12.7818;RBI=0.0582131;REFB=0.00106126;REVB=-0.0193521;RO=14;SAF=8;SAR=2;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.553471;STB=0.824781;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=-0.00356312;OID=.;OPOS=10084292;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:24:24:14:14:10:10:0.416667:2:8:3:11:2:8:3:11
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chr19	10089262	.	G	A	281.32	PASS	AF=0.705882;AO=23;DP=34;FAO=24;FDP=34;FR=.;FRO=10;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=-0.0308057;FXX=0.0285633;HRUN=3;LEN=1;MLLD=98.5846;QD=33.0965;RBI=0.0314035;REFB=-0.0133315;REVB=-0.00609805;RO=9;SAF=10;SAR=13;SRF=1;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173894;STB=0.577438;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.00476883;OID=.;OPOS=10089262;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:34:34:9:10:23:24:0.705882:13:10:1:8:13:11:2:8
chr19	10090649	.	A	G	200.51	PASS	AF=0.655172;AO=18;DP=28;FAO=19;FDP=29;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=15;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=-0.00690146;FXX=0.0333222;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.5523;QD=27.6568;RBI=0.0150906;REFB=-0.0275083;REVB=0.01342;RO=10;SAF=4;SAR=14;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0687917;STB=0.543993;STBP=0.614;TYPE=snp;VARB=0.0256531;OID=.;OPOS=10090649;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:28:29:10:10:18:19:0.655172:14:4:3:7:15:4:3:7
chr19	10100061	.	C	A	315.1	PASS	AF=0.56;AO=28;DP=50;FAO=28;FDP=50;FR=.;FRO=22;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=-0.0401366;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.217;QD=25.2082;RBI=0.0626877;REFB=-0.0201157;REVB=0.0481539;RO=22;SAF=15;SAR=13;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171432;STB=0.594835;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=0.0102766;OID=.;OPOS=10100061;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:22:22:28:28:0.56:13:15:7:15:13:15:7:15
chr19	10102676	.	A	G	39.61	PASS	AF=0.5;AO=6;DP=12;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.021557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.382;QD=13.2038;RBI=0.0340333;REFB=-0.0292406;REVB=0.0263355;RO=6;SAF=2;SAR=4;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.275357;STB=0.66611;STBP=0.321;TYPE=snp;VARB=0.0505332;OID=.;OPOS=10102676;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:12:12:6:6:6:6:0.5:4:2:4:2:4:2:4:2
chr19	10106936	.	G	C	55.41	PASS	AF=0.363636;AO=8;DP=22;FAO=8;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.0134877;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.737;QD=10.0747;RBI=0.0265517;REFB=-0.0229382;REVB=0.0228708;RO=14;SAF=3;SAR=5;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133032;STB=0.581189;STBP=0.592;TYPE=snp;VARB=0.0308242;OID=.;OPOS=10106936;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:22:22:14:14:8:8:0.363636:5:3:7:7:5:3:7:7
chr19	10108714	.	G	A	173.77	PASS	AF=0.359375;AO=21;DP=62;FAO=23;FDP=64;FR=.;FRO=41;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=25;FSRR=16;FWDB=0.0238904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.8499;QD=10.8605;RBI=0.0249928;REFB=-0.0236022;REVB=0.00734067;RO=41;SAF=13;SAR=8;SRF=25;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0110722;STB=0.529386;STBP=0.751;TYPE=snp;VARB=0.0291826;OID=.;OPOS=10108714;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:64:41:41:21:23:0.359375:8:13:25:16:8:15:25:16
chr19	10112346	.	T	C	740.44	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00515959;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.373;QD=56.9569;RBI=0.0082144;REFB=0;REVB=0.0063918;RO=0;SAF=26;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.47492e-06;OID=.;OPOS=10112346;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:26:26:0:0:26:26:0:0
chr19	10116292	.	A	AG	31.35	PASS	AF=0.195652;AO=9;DP=46;FAO=9;FDP=46;FR=.;FRO=37;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=0.0417514;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=44.8319;QD=2.726;RBI=0.0629056;REFB=-0.0214947;REVB=-0.0470524;RO=34;SAF=1;SAR=8;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.525373;STB=0.836351;STBP=0.042;TYPE=ins;VARB=0.132994;OID=.;OPOS=10116293;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.195652:9:46:9:46:37:1:8:17:20:31:34:1:8:17:17
chr19	10116375	.	G	T	51.89	PASS	AF=0.235294;AO=8;DP=34;FAO=8;FDP=34;FR=.;FRO=26;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=21;FWDB=-0.0260432;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.214;QD=6.10494;RBI=0.0495996;REFB=0.00574829;REVB=0.0422122;RO=26;SAF=2;SAR=6;SRF=5;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0984378;STB=0.562355;STBP=0.8;TYPE=snp;VARB=-0.0127184;OID=.;OPOS=10116375;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:51:34:34:26:26:8:8:0.235294:6:2:5:21:6:2:5:21
chr19	10129422	.	T	C	221.16	PASS	AF=0.480769;AO=24;DP=51;FAO=25;FDP=52;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=8;FWDB=-0.0143413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.901;QD=17.0124;RBI=0.0315109;REFB=-0.000425749;REVB=0.0280582;RO=27;SAF=10;SAR=14;SRF=19;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.264217;STB=0.654016;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.000527475;OID=.;OPOS=10129422;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:52:27:27:24:25:0.480769:14:10:19:8:15:10:19:8
chr19	10131999	.	T	C	958.69	PASS	AF=0.985075;AO=66;DP=67;FAO=66;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.005119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.19;QD=57.2352;RBI=0.0388083;REFB=-0.0914985;REVB=0.0384692;RO=0;SAF=42;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.1333e-08;STB=0.510201;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=0.000547498;OID=.;OPOS=10131999;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:67:67:0:1:66:66:0.985075:24:42:0:0:24:42:0:1
chr19	10132290	.	C	T	276.31	PASS	AF=1;AO=9;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=0;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0374682;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.846;QD=52.6305;RBI=0.0536206;REFB=0;REVB=0.0383575;RO=0;SAF=0;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000548795;OID=.;OPOS=10132290;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:9:21:1:9:0:0:0:9:12:0:0
chr19	10132859	.	T	A	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=287.391;QD=33.4285;RBI=0.0085518;REFB=0;REVB=-0.0085518;RO=0;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.20734e-05;OID=.;OPOS=10132859;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:6:0:0:0:6:0:0:0
chr19	10218332	.	A	G	37.45	PASS	AF=0.352941;AO=6;DP=17;FAO=6;FDP=17;FR=.;FRO=11;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=10;FWDB=0.0224274;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.425;QD=8.81106;RBI=0.0295314;REFB=-0.0013014;REVB=0.0192124;RO=11;SAF=1;SAR=5;SRF=1;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164673;STB=0.599715;STBP=0.793;TYPE=snp;VARB=0.0192445;OID=.;OPOS=10218332;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:17:17:11:11:6:6:0.352941:5:1:1:10:5:1:1:10
chr19	10224526	.	C	T	64.35	PASS	AF=0.727273;AO=8;DP=11;FAO=8;FDP=11;FR=.;FRO=3;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-8.82167e-05;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=245.399;QD=23.3999;RBI=0.0398669;REFB=-0.0330585;REVB=0.0398668;RO=3;SAF=6;SAR=2;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176687;STB=0.59978;STBP=0.538;TYPE=snp;VARB=0.0144688;OID=.;OPOS=10224526;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:11:11:3:3:8:8:0.727273:2:6:3:0:2:6:3:0
chr19	10225777	.	A	G	64.07	PASS	AF=0.333333;AO=9;DP=27;FAO=9;FDP=27;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=-0.0250105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.369;QD=9.49164;RBI=0.0308775;REFB=-0.0154695;REVB=-0.0181078;RO=18;SAF=6;SAR=3;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.033854;OID=.;OPOS=10225777;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:27:27:18:18:9:9:0.333333:3:6:12:6:3:6:12:6
chr19	10229297	.	C	A	104.37	PASS	AF=0.325;AO=13;DP=39;FAO=13;FDP=40;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=-0.00488067;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.857;QD=10.4374;RBI=0.0107603;REFB=0.0124524;REVB=-0.00958975;RO=26;SAF=6;SAR=7;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17041;STB=0.587654;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=-0.030324;OID=.;OPOS=10229297;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:40:26:27:13:13:0.325:7:6:16:10:7:6:16:11
chr19	10265312	.	T	C	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00309308;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.943;QD=55.0985;RBI=0.0062149;REFB=0;REVB=0.00539053;RO=0;SAF=10;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.71087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.41291e-06;OID=.;OPOS=10265312;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:16:10:0:0:16:10:0:0
chr19	10267077	.	T	C	260.51	PASS	AF=0.416667;AO=30;DP=72;FAO=30;FDP=72;FR=.;FRO=42;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=18;FSRR=24;FWDB=0.00837951;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.493;QD=14.4727;RBI=0.00863109;REFB=-0.00765342;REVB=0.00206872;RO=41;SAF=9;SAR=21;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155742;STB=0.583275;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=0.0182459;OID=.;OPOS=10267077;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:41:42:30:30:0.416667:21:9:18:23:21:9:18:24
chr19	10334663	.	T	G	38.56	PASS	AF=0.428571;AO=6;DP=14;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=-0.0512677;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.426;QD=11.017;RBI=0.17174;REFB=-0.0426113;REVB=-0.163909;RO=8;SAF=5;SAR=1;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.46433;STB=0.788428;STBP=0.118;TYPE=snp;VARB=0.0179354;OID=.;OPOS=10334663;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:14:14:8:8:6:6:0.428571:1:5:3:5:1:5:3:5
chr19	10370490	.	T	A	183.6	PASS	AF=0.62069;AO=17;DP=28;FAO=18;FDP=29;FR=.;FRO=11;FSAF=1;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=11;FWDB=0.161608;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.509;QD=25.3236;RBI=0.162027;REFB=-0.0297977;REVB=0.0116409;RO=11;SAF=0;SAR=17;SRF=0;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.622115;STBP=0.703;TYPE=snp;VARB=0.0124069;OID=.;OPOS=10370490;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:28:29:11:11:17:18:0.62069:17:0:0:11:17:1:0:11
chr19	10385540	.	A	T	239.33	PASS	AF=0.5;AO=23;DP=46;FAO=23;FDP=46;FR=.;FRO=23;FSAF=18;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.00597251;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.348;QD=20.8116;RBI=0.0122596;REFB=-0.00100464;REVB=-0.0107064;RO=23;SAF=18;SAR=5;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.313926;STB=0.678322;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=0.00136832;OID=.;OPOS=10385540;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:23:23:23:23:0.5:5:18:11:12:5:18:11:12
chr19	10395248	.	C	T	35.16	PASS	AF=0.625;AO=5;DP=9;FAO=5;FDP=8;FR=.;FRO=3;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0107371;FXX=0.110988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.3857;QD=17.5779;RBI=0.0122945;REFB=-0.0105633;REVB=0.00598913;RO=3;SAF=2;SAR=3;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.2842;STB=0.666107;STBP=0.34;TYPE=snp;VARB=0.00301209;OID=.;OPOS=10395248;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:17:9:8:3:3:5:5:0.625:3:2:0:3:3:2:0:3
chr19	10426422	.	A	C	161.8	PASS	AF=0.695652;AO=16;DP=21;FAO=16;FDP=23;FR=.;FRO=7;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.0336553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.976;QD=28.1385;RBI=0.0606704;REFB=-0.0374017;REVB=-0.0504799;RO=5;SAF=11;SAR=5;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.220785;STB=0.668294;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.00736294;OID=.;OPOS=10426422;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:21:23:5:7:16:16:0.695652:5:11:1:4:5:11:1:6
chr19	10426597	.	T	C	58.59	PASS	AF=0.5;AO=8;DP=16;FAO=8;FDP=16;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=0.048782;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.149;QD=14.6481;RBI=0.0503183;REFB=0.00660287;REVB=0.0123389;RO=8;SAF=3;SAR=5;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.246848;STB=0.64255;STBP=0.395;TYPE=snp;VARB=-0.0102494;OID=.;OPOS=10426597;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:16:16:8:8:8:8:0.5:5:3:1:7:5:3:1:7
chr19	10426628	.	T	C	78.64	PASS	AF=0.47619;AO=10;DP=21;FAO=10;FDP=21;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=-0.00964217;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.4254;QD=14.9783;RBI=0.0832524;REFB=0.0182956;REVB=-0.0826921;RO=11;SAF=6;SAR=4;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20973;STB=0.622399;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=-0.0172261;OID=.;OPOS=10426628;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:21:21:11:11:10:10:0.47619:4:6:4:7:4:6:4:7
chr19	10439501	.	C	T	179.7	PASS	AF=0.413043;AO=19;DP=46;FAO=19;FDP=46;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=-0.0110105;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.67;QD=15.6262;RBI=0.0135005;REFB=-0.0259892;REVB=-0.00781236;RO=27;SAF=13;SAR=6;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179564;STB=0.603799;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=0.0421346;OID=.;OPOS=10439501;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:27:27:19:19:0.413043:6:13:14:13:6:13:14:13
chr19	10439540	.	A	G	182.12	PASS	AF=0.44186;AO=19;DP=43;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=-0.0345663;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.915;QD=16.9415;RBI=0.0378713;REFB=-0.00677487;REVB=0.015473;RO=24;SAF=10;SAR=9;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0256938;STB=0.51469;STBP=0.829;TYPE=snp;VARB=0.0080906;OID=.;OPOS=10439540;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:24:24:19:19:0.44186:9:10:12:12:9:10:12:12
chr19	10439711	.	A	G	189.07	PASS	AF=0.527778;AO=19;DP=36;FAO=19;FDP=36;FR=.;FRO=17;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=-0.0230284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.8557;QD=21.0074;RBI=0.0500728;REFB=-0.0035852;REVB=-0.0444633;RO=17;SAF=13;SAR=6;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.32675;STB=0.684016;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.000944899;OID=.;OPOS=10439711;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:17:17:19:19:0.527778:6:13:5:12:6:13:5:12
chr19	10445806	.	C	T	268.23	PASS	AF=0.54;AO=26;DP=50;FAO=27;FDP=50;FR=.;FRO=23;FSAF=20;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=6;FWDB=0.00322857;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.428;QD=21.4586;RBI=0.0639528;REFB=-0.00506215;REVB=0.0638712;RO=24;SAF=19;SAR=7;SRF=17;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0241423;STB=0.500963;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00460739;OID=.;OPOS=10445806;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:24:23:26:27:0.54:7:19:17:7:7:20:17:6
chr19	10446568	.	T	C	267.6	PASS	AF=0.568182;AO=23;DP=43;FAO=25;FDP=44;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.00714858;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.052;QD=24.3268;RBI=0.00714987;REFB=-0.00854151;REVB=0.000135987;RO=19;SAF=8;SAR=15;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150704;STB=0.555511;STBP=0.43;TYPE=snp;VARB=0.0130782;OID=.;OPOS=10446568;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:44:19:19:23:25:0.568182:15:8:10:9:15:10:10:9
chr19	10449358	.	T	C	164.05	PASS	AF=0.727273;AO=16;DP=22;FAO=16;FDP=22;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.0263684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.815;QD=29.8275;RBI=0.0315648;REFB=-0.0120143;REVB=0.0173505;RO=6;SAF=4;SAR=12;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.235356;STB=0.631402;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=0.00287543;OID=.;OPOS=10449358;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:22:22:6:6:16:16:0.727273:12:4:4:2:12:4:4:2
chr19	10449392	.	A	G	539.0	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0216895;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=309.236;QD=59.8889;RBI=0.0222836;REFB=0;REVB=0.00511092;RO=0;SAF=15;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.04254e-05;OID=.;OPOS=10449392;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:36:0:0:35:36:1:20:15:0:0:20:16:0:0
chr19	10449514	.	T	C	445.6	PASS	AF=0.744681;AO=34;DP=45;FAO=35;FDP=47;FR=.;FRO=12;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=-0.0248516;FXX=0.020829;HRUN=4;LEN=1;MLLD=129.46;QD=37.9235;RBI=0.0337772;REFB=-0.0344673;REVB=0.0228756;RO=11;SAF=12;SAR=22;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0493456;STB=0.512283;STBP=0.809;TYPE=snp;VARB=0.00989733;OID=.;OPOS=10449514;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:45:47:11:12:34:35:0.744681:22:12:5:6:22:13:5:7
chr19	10475652	.	C	A	256.13	PASS	AF=0.491228;AO=28;DP=57;FAO=28;FDP=57;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=0.0890314;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.339;QD=17.9743;RBI=0.0900448;REFB=-0.0120118;REVB=0.0134713;RO=29;SAF=11;SAR=17;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.206097;STB=0.615399;STBP=0.109;TYPE=snp;VARB=0.0124839;OID=.;OPOS=10475652;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:29:29:28:28:0.491228:17:11:18:11:17:11:18:11
chr19	10477206	.	G	A	158.04	PASS	AF=0.64;AO=16;DP=25;FAO=16;FDP=25;FR=.;FRO=9;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.0141616;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.349;QD=25.2855;RBI=0.0150104;REFB=-0.0175187;REVB=-0.00497601;RO=9;SAF=9;SAR=7;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0763025;STB=0.54266;STBP=0.631;TYPE=snp;VARB=0.0136151;OID=.;OPOS=10477206;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:25:25:9:9:16:16:0.64:7:9:4:5:7:9:4:5
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chr19	10531609	.	C	T	34.83	PASS	AF=0.833333;AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=0;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.5171;QD=23.2185;RBI=0.0558041;REFB=-0.0698863;REVB=0.0558041;RO=1;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0139613;OID=.;OPOS=10531609;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:6:6:1:1:5:5:0.833333:5:0:0:1:5:0:0:1
chr19	10541321	.	G	A	473.23	PASS	AF=0.56962;AO=45;DP=79;FAO=45;FDP=79;FR=.;FRO=34;FSAF=14;FSAR=31;FSRF=11;FSRR=23;FWDB=0.017083;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=289.024;QD=23.961;RBI=0.017126;REFB=-0.00194391;REVB=0.00121292;RO=33;SAF=14;SAR=31;SRF=10;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00729636;STB=0.506202;STBP=0.915;TYPE=snp;VARB=0.00116685;OID=.;OPOS=10541321;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:33:34:45:45:0.56962:31:14:10:23:31:14:11:23
chr19	10577843	.	C	A	44.29	PASS	AF=0.269231;AO=7;DP=26;FAO=7;FDP=26;FR=.;FRO=19;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=0.0172471;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.06;QD=6.81333;RBI=0.0429403;REFB=-0.0191466;REVB=-0.0393244;RO=19;SAF=3;SAR=4;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.008787;STB=0.505602;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0432585;OID=.;OPOS=10577843;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:26:26:19:19:7:7:0.269231:4:3:8:11:4:3:8:11
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chr19	10600442	.	G	C	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0245949;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.335;QD=49.599;RBI=0.0270637;REFB=0;REVB=0.011293;RO=0;SAF=7;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000105003;OID=.;OPOS=10600442;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:11:7:0:0:11:7:0:0
chr19	10624838	.	C	T	31.6	PASS	AF=0.555556;AO=5;DP=9;FAO=5;FDP=9;FR=.;FRO=4;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.102694;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.992;QD=14.0439;RBI=0.10457;REFB=0.00671328;REVB=-0.0197203;RO=4;SAF=1;SAR=4;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0543107;STB=0.533194;STBP=0.995;TYPE=snp;VARB=-0.0015163;OID=.;OPOS=10624838;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:9:9:4:4:5:5:0.555556:4:1:1:3:4:1:1:3
chr19	10668452	.	A	G	236.88	PASS	AF=1;AO=17;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0598859;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.4803;QD=49.8699;RBI=0.06414;REFB=0;REVB=0.0229699;RO=0;SAF=11;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00334107;OID=.;OPOS=10668452;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:17:19:1:6:11:0:0:7:12:0:0
chr19	10670184	.	C	G	789.34	PASS	AF=1;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000768638;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.311;QD=64.4357;RBI=0.0267703;REFB=0;REVB=0.0267592;RO=0;SAF=27;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.30731e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000167931;OID=.;OPOS=10670184;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:49:0:0:49:49:1:22:27:0:0:22:27:0:0
chr19	10683477	.	A	G	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00869199;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.633;QD=59.4356;RBI=0.0165792;REFB=0;REVB=0.014118;RO=0;SAF=21;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.27896e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.16346e-06;OID=.;OPOS=10683477;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:14:21:0:0:14:21:0:0
chr19	10692000	.	T	C	902.71	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00416179;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.676;QD=58.2395;RBI=0.00831014;REFB=0;REVB=-0.00719291;RO=0;SAF=27;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.46408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.58507e-06;OID=.;OPOS=10692000;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:35:27:0:0:35:27:0:0
chr19	10738639	.	C	T	523.68	PASS	AF=1;AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0233424;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.2254;QD=59.8489;RBI=0.024689;REFB=0;REVB=-0.00804228;RO=0;SAF=15;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000117766;OID=.;OPOS=10738639;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:35:0:0:35:35:1:20:15:0:0:20:15:0:0
chr19	10742170	.	A	G	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0544177;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.7669;QD=48.7361;RBI=0.0672328;REFB=0;REVB=-0.0394837;RO=0;SAF=6;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00272364;OID=.;OPOS=10742170;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:11:6:0:0:11:6:0:0
chr19	10794123	.	GAAAA	GAAAC,GAAA	35.65	PASS	AF=0.0634921,0.142857;AO=3,15;DP=63;FAO=4,9;FDP=63;FR=.;FRO=50;FSAF=0,5;FSAR=4,4;FSRF=18;FSRR=32;FWDB=-0.0629586,-0.1339;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=115.394,11.6259;QD=2.26333;RBI=0.0630401,0.14398;REFB=-0.0040083,-0.0904479;REVB=-0.00320415,-0.0529246;RO=40;SAF=0,6;SAR=3,9;SRF=14;SRR=26;SSEN=0,0;SSEP=0,0.326531;SSSB=-0.447364,0.063291;STB=0.996684,0.661431;STBP=0.084,0.333;TYPE=snp,del;VARB=0.147339,0.0760728;OID=.,.;OPOS=10794127,10794124;OREF=A,A;OALT=C,-;OMAPALT=GAAAC,GAAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0.0634921,0.142857:3,15:63:4,9:63:50:0,5:4,4:18:32:21:40:0,6:3,9:14:26
chr19	10794630	.	G	T	1175.94	PASS	AF=0.987342;AO=78;DP=79;FAO=78;FDP=79;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0351524;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.538;QD=59.5412;RBI=0.0351976;REFB=-0.0870699;REVB=-0.00178477;RO=1;SAF=40;SAR=38;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0116869;STB=0.506171;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.00031711;OID=.;OPOS=10794630;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:79:79:1:1:78:78:0.987342:38:40:1:0:38:40:1:0
chr19	10939792	.	T	C	509.09	PASS	AF=0.526882;AO=48;DP=92;FAO=49;FDP=93;FR=.;FRO=44;FSAF=13;FSAR=36;FSRF=7;FSRR=37;FWDB=-0.0143814;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.638;QD=21.8965;RBI=0.0146309;REFB=-0.0103157;REVB=0.00269035;RO=44;SAF=13;SAR=35;SRF=7;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131676;STB=0.568578;STBP=0.255;TYPE=snp;VARB=0.0110071;OID=.;OPOS=10939792;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:93:44:44:48:49:0.526882:35:13:7:37:36:13:7:37
chr19	10943337	.	CG	AC,CA	232.36	PASS	AF=0,0.7;AO=2,19;DP=30;FAO=0,21;FDP=30;FR=.;FRO=9;FSAF=0,11;FSAR=0,10;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.0151047,-0.0134609;FXX=0;HRUN=4,1;LEN=2,1;MLLD=222.875,257.205;QD=30.9818;RBI=0.0183055,0.0268184;REFB=-0.0145338,-0.014675;REVB=0.0103411,0.0231955;RO=9;SAF=0,11;SAR=2,8;SRF=4;SRR=5;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.565098,0.0788921;STB=0.5,0.523787;STBP=1,0.715;TYPE=mnp,snp;VARB=0,0.00461476;OID=.,.;OPOS=10943337,10943338;OREF=CG,G;OALT=AC,A;OMAPALT=AC,CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:62:30:30:9:9:2,19:0,21:0,0.7:2,8:0,11:4:5:0,10:0,11:4:5
chr19	11034846	.	C	T	156.41	PASS	AF=0.615385;AO=16;DP=26;FAO=16;FDP=26;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.0412943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.5501;QD=24.0627;RBI=0.0429452;REFB=0.00128837;REVB=-0.0117926;RO=10;SAF=5;SAR=11;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140152;STB=0.578845;STBP=0.344;TYPE=snp;VARB=-0.000702629;OID=.;OPOS=11034846;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:26:26:10:10:16:16:0.615385:11:5:5:5:11:5:5:5
chr19	11105608	.	T	C	130.63	PASS	AF=0.394737;AO=15;DP=38;FAO=15;FDP=38;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=-0.0453652;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.11;QD=13.751;RBI=0.04865;REFB=-0.00462903;REVB=0.0175733;RO=23;SAF=7;SAR=8;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0791205;STB=0.546039;STBP=0.651;TYPE=snp;VARB=0.00865693;OID=.;OPOS=11105608;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:23:23:15:15:0.394737:8:7:9:14:8:7:9:14
chr19	11122452	.	C	G	125.09	PASS	AF=0.5;AO=14;DP=27;FAO=14;FDP=28;FR=.;FRO=14;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=0.0246473;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.7743;QD=17.8704;RBI=0.051331;REFB=-0.0323904;REVB=-0.0450265;RO=13;SAF=9;SAR=5;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0249743;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0277597;OID=.;OPOS=11122452;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:28:13:14:14:14:0.5:5:9:8:5:5:9:9:5
chr19	11122531	.	G	T	150.31	PASS	AF=0.327869;AO=20;DP=61;FAO=20;FDP=61;FR=.;FRO=41;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=26;FSRR=15;FWDB=0.00745525;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.413;QD=9.85655;RBI=0.0253275;REFB=0.00172521;REVB=-0.0242054;RO=41;SAF=13;SAR=7;SRF=26;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0197096;STB=0.511616;STBP=0.916;TYPE=snp;VARB=-0.00559032;OID=.;OPOS=11122531;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:41:41:20:20:0.327869:7:13:26:15:7:13:26:15
chr19	11170839	.	T	C	66.47	PASS	AF=0.409091;AO=8;DP=21;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.0687131;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.629;QD=12.0847;RBI=0.0690188;REFB=-0.00359194;REVB=-0.00648841;RO=13;SAF=3;SAR=5;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0104179;STB=0.533258;STBP=0.845;TYPE=snp;VARB=0.00431619;OID=.;OPOS=11170839;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:21:22:13:13:8:9:0.409091:5:3:5:8:6:3:5:8
chr19	11224265	.	A	G	147.29	PASS	AF=0.516129;AO=15;DP=30;FAO=16;FDP=31;FR=.;FRO=15;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=0.00664433;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.864;QD=19.0053;RBI=0.0139905;REFB=-0.0151845;REVB=0.0123121;RO=15;SAF=9;SAR=6;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512804;STBP=0.931;TYPE=snp;VARB=0.0140676;OID=.;OPOS=11224265;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:31:15:15:15:16:0.516129:6:9:9:6:6:10:9:6
chr19	11233941	.	A	G	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0274664;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.823;QD=47.8224;RBI=0.0315785;REFB=0;REVB=-0.0155821;RO=0;SAF=7;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.13263e-05;OID=.;OPOS=11233941;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:9:7:0:0:9:7:0:0
chr19	11242044	.	G	A	194.03	PASS	AF=0.434783;AO=20;DP=46;FAO=20;FDP=46;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=19;FWDB=-0.0148333;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.568;QD=16.8718;RBI=0.0152195;REFB=-0.00942864;REVB=-0.00340678;RO=26;SAF=5;SAR=15;SRF=7;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0249256;STB=0.514271;STBP=0.886;TYPE=snp;VARB=0.0150374;OID=.;OPOS=11242044;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:26:26:20:20:0.434783:15:5:7:19:15:5:7:19
chr19	11242133	.	G	A	245.21	PASS	AF=0.444444;AO=28;DP=63;FAO=28;FDP=63;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=13;FWDB=-0.00773906;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.737;QD=15.5686;RBI=0.00950944;REFB=0.00843742;REVB=-0.00552598;RO=35;SAF=14;SAR=14;SRF=22;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126614;STB=0.571379;STBP=0.347;TYPE=snp;VARB=-0.00774286;OID=.;OPOS=11242133;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:35:35:28:28:0.444444:14:14:22:13:14:14:22:13
chr19	11242765	.	A	G	65.15	PASS	AF=0.375;AO=9;DP=24;FAO=9;FDP=24;FR=.;FRO=15;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=-0.107174;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.623;QD=10.8578;RBI=0.116056;REFB=-0.0196586;REVB=-0.044527;RO=15;SAF=1;SAR=8;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.362611;STB=0.726652;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=0.0237646;OID=.;OPOS=11242765;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:24:24:15:15:9:9:0.375:8:1:5:10:8:1:5:10
chr19	11244187	.	TTATATATATATATAT	TTATATATATATAT,TTATATATATATATAC	238.7	PASS	AF=0.55,0.4;AO=9,6;DP=23;FAO=11,8;FDP=20;FR=.;FRO=1;FSAF=7,2;FSAR=4,6;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0418954,0.146844;FXX=0.19992;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=134.958,63.5388;QD=47.7392;RBI=0.0431821,0.156265;REFB=-0.0825821,-0.0912194;REVB=0.0104627,0.0534381;RO=1;SAF=7,2;SAR=2,4;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.175672,0.0962265;STB=0.555452,0.538369;STBP=0.317,0.64;TYPE=del,snp;VARB=0.0234832,-0.000384692;OID=.,.;OPOS=11244188,11244202;OREF=TA,T;OALT=-,C;OMAPALT=TTATATATATATAT,TTATATATATATATAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.55,0.4:9,6:23:11,8:20:1:7,2:4,6:0:1:65:1:7,2:2,4:0:1
chr19	11257865	.	C	A	37.64	PASS	AF=0.375;AO=6;DP=16;FAO=6;FDP=16;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=0;FWDB=-0.00572644;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.854;QD=9.40879;RBI=0.132183;REFB=0.00422875;REVB=0.132059;RO=10;SAF=4;SAR=2;SRF=10;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.486101;STB=0.777232;STBP=0.406;TYPE=snp;VARB=-0.00299272;OID=.;OPOS=11257865;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:16:16:10:10:6:6:0.375:2:4:10:0:2:4:10:0
chr19	11277232	.	G	A	207.94	PASS	AF=0.403226;AO=25;DP=62;FAO=25;FDP=62;FR=.;FRO=37;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=-0.00239989;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.4917;QD=13.4157;RBI=0.00556843;REFB=-0.0143983;REVB=-0.00502473;RO=37;SAF=14;SAR=11;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104818;STB=0.559952;STBP=0.46;TYPE=snp;VARB=0.0231651;OID=.;OPOS=11277232;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:37:37:25:25:0.403226:11:14:17:20:11:14:17:20
chr19	11303469	.	C	G	76.97	PASS	AF=0.642857;AO=3;DP=15;FAO=9;FDP=14;FR=.,HEALED;FRO=5;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=-0.262103;FXX=0.0666222;HRUN=12;LEN=1;MLLD=156.932;QD=21.9912;RBI=0.262832;REFB=-0.0132029;REVB=0.0195686;RO=2;SAF=0;SAR=3;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.631339;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=0.0165949;OID=.;OPOS=11303469;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:19:15:14:2:5:3:9:0.642857:3:0:0:2:7:2:0:5
chr19	11319491	.	G	A	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00853572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.4785;QD=51.1833;RBI=0.0656217;REFB=0;REVB=0.0650642;RO=0;SAF=8;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00186392;OID=.;OPOS=11319491;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:12:8:0:0:12:8:0:0
chr19	11326119	.	A	G	465.12	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0109646;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.802;QD=58.1399;RBI=0.0314955;REFB=0;REVB=0.0295253;RO=0;SAF=20;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.25759e-05;OID=.;OPOS=11326119;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:12:20:0:0:12:20:0:0
chr19	11326125	.	C	T	411.1	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0772872;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.446;QD=56.7039;RBI=0.0830447;REFB=0;REVB=0.0303827;RO=0;SAF=20;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00103888;OID=.;OPOS=11326125;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:9:20:0:0:9:20:0:0
chr19	11327608	.	T	C	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112016;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.556;QD=53.2771;RBI=0.0139462;REFB=0;REVB=0.0083078;RO=0;SAF=13;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000111959;OID=.;OPOS=11327608;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:10:13:0:0:10:13:0:0
chr19	11327626	.	A	G	483.34	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0241788;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=110.433;QD=58.5868;RBI=0.0315198;REFB=0;REVB=-0.0202209;RO=0;SAF=21;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000327894;OID=.;OPOS=11327626;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:12:21:0:0:12:21:0:0
chr19	11332570	.	T	A	288.42	PASS	AF=0.543478;AO=20;DP=47;FAO=25;FDP=46;FR=.,HEALED;FRO=20;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=0.019501;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.882;QD=25.0799;RBI=0.0417232;REFB=-0.0456188;REVB=0.0368855;RO=19;SAF=7;SAR=13;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0328768;STB=0.515139;STBP=0.842;TYPE=snp;VARB=0.0349712;OID=.;OPOS=11332570;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:46:19:20:20:25:0.543478:13:7:6:13:17:8:7:13
chr19	11347493	.	T	C	199.76	PASS	AF=0.5;AO=20;DP=40;FAO=20;FDP=40;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=0.0146372;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.405;QD=19.976;RBI=0.0220854;REFB=-0.0159554;REVB=0.0165384;RO=20;SAF=10;SAR=10;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133037;STB=0.574927;STBP=0.377;TYPE=snp;VARB=0.011215;OID=.;OPOS=11347493;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:20:20:20:20:0.5:10:10:13:7:10:10:13:7
chr19	11350340	.	C	G	230.83	PASS	AF=0.55;AO=22;DP=40;FAO=22;FDP=40;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=4;FSRR=14;FWDB=0.0298799;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.98;QD=23.0827;RBI=0.0298799;REFB=-0.0434877;REVB=-1.0122e-06;RO=18;SAF=6;SAR=16;SRF=4;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0527522;STB=0.529386;STBP=0.768;TYPE=snp;VARB=0.0184963;OID=.;OPOS=11350340;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:18:18:22:22:0.55:16:6:4:14:16:6:4:14
chr19	11350488	.	C	T	85.27	PASS	AF=0.366667;AO=11;DP=30;FAO=11;FDP=30;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=0.00551649;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.492;QD=11.3692;RBI=0.0126702;REFB=-0.027903;REVB=-0.0114062;RO=18;SAF=6;SAR=5;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129996;STB=0.589906;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.0412851;OID=.;OPOS=11350488;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:30:30:18:19:11:11:0.366667:5:6:12:6:5:6:13:6
chr19	11352752	.	G	A	38.08	PASS	AF=0.4;AO=6;DP=15;FAO=6;FDP=15;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.00647862;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=123.428;QD=10.1552;RBI=0.052427;REFB=-0.026367;REVB=-0.0520252;RO=9;SAF=2;SAR=4;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.219799;STB=0.635901;STBP=0.398;TYPE=snp;VARB=0.027393;OID=.;OPOS=11352752;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:15:15:9:9:6:6:0.4:4:2:5:4:4:2:5:4
chr19	11358799	.	G	A	35.45	PASS	AF=0.333333;AO=5;DP=18;FAO=6;FDP=18;FR=.,HEALED;FRO=12;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=11;FSRR=1;FWDB=-0.0180227;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=92.7532;QD=7.87816;RBI=0.139443;REFB=-0.0304656;REVB=0.138273;RO=10;SAF=4;SAR=1;SRF=9;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.192903;STB=0.615066;STBP=0.783;TYPE=snp;VARB=0.0794467;OID=.;OPOS=11358799;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:18:18:10:12:5:6:0.333333:1:4:9:1:1:5:11:1
chr19	11363146	.	A	T	56.84	PASS	AF=0.363636;AO=8;DP=23;FAO=8;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=-0.0142516;FXX=0.0434594;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.9423;QD=10.334;RBI=0.0231752;REFB=-0.025491;REVB=0.0182752;RO=14;SAF=2;SAR=6;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0479673;STB=0.529336;STBP=0.895;TYPE=snp;VARB=0.0576486;OID=.;OPOS=11363146;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:23:22:14:14:8:8:0.363636:6:2:4:10:6:2:4:10
chr19	11465316	.	G	C	169.98	PASS	AF=0.375;AO=20;DP=56;FAO=21;FDP=56;FR=.;FRO=35;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=21;FSRR=14;FWDB=-0.037648;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.168;QD=12.1412;RBI=0.0464745;REFB=-0.0171201;REVB=-0.0272489;RO=35;SAF=5;SAR=15;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.391699;STB=0.699289;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.0318023;OID=.;OPOS=11465316;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:35:35:20:21:0.375:15:5:21:14:15:6:21:14
chr19	11516007	.	T	G	113.19	PASS	AF=0.666667;AO=12;DP=18;FAO=12;FDP=18;FR=.;FRO=6;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=-0.001751;FXX=0.0526039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.021;QD=25.1533;RBI=0.0742429;REFB=-0.00359471;REVB=-0.0742222;RO=6;SAF=7;SAR=5;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.334867;STB=0.687213;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.00100005;OID=.;OPOS=11516007;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:18:18:6:6:12:12:0.666667:5:7:0:6:5:7:0:6
chr19	11526759	.	G	A	303.97	PASS	AF=0.478261;AO=33;DP=70;FAO=33;FDP=69;FR=.;FRO=36;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=25;FWDB=-0.0121312;FXX=0.0142837;HRUN=3;LEN=1;MLLD=82.995;QD=17.6212;RBI=0.0153381;REFB=-0.00453384;REVB=0.00938578;RO=36;SAF=20;SAR=13;SRF=11;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.275126;STB=0.653392;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0162159;OID=.;OPOS=11526759;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:69:36:36:33:33:0.478261:13:20:11:25:13:20:11:25
chr19	11526765	.	G	T	312.88	PASS	AF=0.507692;AO=33;DP=66;FAO=33;FDP=65;FR=.;FRO=32;FSAF=22;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=22;FWDB=0.02189;FXX=0.0151492;HRUN=6;LEN=1;MLLD=229.819;QD=19.254;RBI=0.0247335;REFB=-0.00263294;REVB=0.011514;RO=32;SAF=22;SAR=11;SRF=10;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.311635;STB=0.673365;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.00259202;OID=.;OPOS=11526765;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:65:32:32:33:33:0.507692:11:22:10:22:11:22:10:22
chr19	11664068	.	A	G	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00675853;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.248;QD=42.1826;RBI=0.00997782;REFB=0;REVB=-0.00734025;RO=0;SAF=9;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000124627;OID=.;OPOS=11664068;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:2:9:0:0:2:9:0:0
chr19	11891003	.	G	A	542.28	PASS	AF=1;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0214554;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.119;QD=60.2532;RBI=0.0220129;REFB=0;REVB=-0.00492265;RO=0;SAF=14;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000107361;OID=.;OPOS=11891003;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:36:0:0:36:36:1:22:14:0:0:22:14:0:0
chr19	11943697	.	G	A	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0285729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.747;QD=45.8068;RBI=0.0370276;REFB=0;REVB=0.0235506;RO=0;SAF=6;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000345943;OID=.;OPOS=11943697;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:8:6:0:0:8:6:0:0
chr19	12128726	.	T	C	195.79	PASS	AF=0.454545;AO=20;DP=44;FAO=20;FDP=44;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=17;FWDB=0.00426967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.565;QD=17.7993;RBI=0.00456105;REFB=-0.0199527;REVB=-0.00160408;RO=24;SAF=9;SAR=11;SRF=7;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156737;STB=0.588701;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=0.0242232;OID=.;OPOS=12128726;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:24:24:20:20:0.454545:11:9:7:17:11:9:7:17
chr19	12222381	.	C	G	747.1	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.011887;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.564;QD=63.583;RBI=0.0131434;REFB=0;REVB=0.00560788;RO=0;SAF=31;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.07024e-05;OID=.;OPOS=12222381;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:16:31:0:0:16:31:0:0
chr19	12224438	.	C	T	85.04	PASS	AF=0.666667;AO=10;DP=15;FAO=10;FDP=15;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.00577057;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=234.414;QD=22.6785;RBI=0.00636044;REFB=-0.0124804;REVB=0.002675;RO=5;SAF=5;SAR=5;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0584143;STB=0.533267;STBP=0.771;TYPE=snp;VARB=0.0052371;OID=.;OPOS=12224438;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:15:15:5:5:10:10:0.666667:5:5:2:3:5:5:2:3
chr19	12256358	.	T	G	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0295397;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.124;QD=55.0986;RBI=0.0326881;REFB=0;REVB=0.0139969;RO=0;SAF=15;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000202868;OID=.;OPOS=12256358;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:11:15:0:0:11:15:0:0
chr19	12402087	.	GT	G	105.46	PASS	AF=0.65;AO=10;DP=19;FAO=13;FDP=20;FR=.;FRO=7;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.0727054;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=17.6548;QD=21.0926;RBI=0.0869674;REFB=-0.119667;REVB=0.0477205;RO=8;SAF=6;SAR=4;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172877;STB=0.538402;STBP=0.681;TYPE=del;VARB=0.0861654;OID=.;OPOS=12402088;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.65:10:19:13:20:7:7:6:3:4:33:8:6:4:3:5
chr19	12502457	.	A	G	257.13	PASS	AF=0.519231;AO=27;DP=52;FAO=27;FDP=52;FR=.;FRO=25;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=0.0317504;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.009;QD=19.7794;RBI=0.031886;REFB=-0.00256774;REVB=-0.00293805;RO=25;SAF=18;SAR=9;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168839;STB=0.594522;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=0.0037618;OID=.;OPOS=12502457;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:25:25:27:27:0.519231:9:18:12:13:9:18:12:13
chr19	12541214	.	G	T	289.22	PASS	AF=0.477612;AO=31;DP=67;FAO=32;FDP=67;FR=.;FRO=35;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=20;FSRR=15;FWDB=0.0084049;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.4956;QD=17.267;RBI=0.0608057;REFB=0.0439882;REVB=-0.060222;RO=35;SAF=11;SAR=20;SRF=20;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20795;STB=0.621699;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=-0.0466327;OID=.;OPOS=12541214;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:35:35:31:32:0.477612:20:11:20:15:21:11:20:15
chr19	12541532	.	C	A	370.46	PASS	AF=0.666667;AO=34;DP=51;FAO=34;FDP=51;FR=.;FRO=17;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=4;FSRR=13;FWDB=0.00232506;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.54;QD=29.0555;RBI=0.0175615;REFB=-0.00379672;REVB=-0.0174069;RO=17;SAF=13;SAR=21;SRF=4;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0977422;STB=0.553161;STBP=0.328;TYPE=snp;VARB=0.00244117;OID=.;OPOS=12541532;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:17:17:34:34:0.666667:21:13:4:13:21:13:4:13
chr19	12541542	.	C	T	365.18	PASS	AF=0.636364;AO=35;DP=55;FAO=35;FDP=55;FR=.;FRO=20;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=4;FSRR=16;FWDB=0.020425;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=184.297;QD=26.5582;RBI=0.0205753;REFB=0.00659943;REVB=-0.00248172;RO=20;SAF=14;SAR=21;SRF=4;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143454;STB=0.578083;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=-0.00393634;OID=.;OPOS=12541542;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:20:20:35:35:0.636364:21:14:4:16:21:14:4:16
chr19	12541544	.	A	C	352.88	PASS	AF=0.62963;AO=34;DP=54;FAO=34;FDP=54;FR=.;FRO=20;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=4;FSRR=16;FWDB=-0.00466767;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.981;QD=26.1391;RBI=0.0151256;REFB=-0.004053;REVB=-0.0143873;RO=20;SAF=14;SAR=20;SRF=4;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15285;STB=0.583287;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.00452537;OID=.;OPOS=12541544;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:20:20:34:34:0.62963:20:14:4:16:20:14:4:16
chr19	12541795	.	C	A	465.53	PASS	AF=0.542169;AO=44;DP=82;FAO=45;FDP=83;FR=.;FRO=38;FSAF=19;FSAR=26;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=0.031383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.311;QD=22.4353;RBI=0.0349636;REFB=-0.0130858;REVB=-0.0154132;RO=38;SAF=19;SAR=25;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0798978;STB=0.548087;STBP=0.375;TYPE=snp;VARB=0.00682585;OID=.;OPOS=12541795;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:83:38:38:44:45:0.542169:25:19:20:18:26:19:20:18
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chr19	12989560	.	G	A	377.02	PASS	AF=0.575758;AO=37;DP=64;FAO=38;FDP=66;FR=.;FRO=28;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=0.00796088;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.553;QD=22.8494;RBI=0.0251933;REFB=-0.00879312;REVB=0.0239025;RO=27;SAF=15;SAR=22;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0597038;STB=0.533963;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.00563757;OID=.;OPOS=12989560;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:66:27:28:37:38:0.575758:22:15:13:14:22:16:14:14
chr19	12996740	.	A	G	98.42	PASS	AF=0.413793;AO=12;DP=29;FAO=12;FDP=29;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=0.00232706;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.351;QD=13.5753;RBI=0.00262128;REFB=-0.00763984;REVB=0.00120661;RO=17;SAF=6;SAR=6;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.207284;STB=0.6205;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.01427;OID=.;OPOS=12996740;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:29:29:17:17:12:12:0.413793:6:6:5:12:6:6:5:12
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chr19	13010520	.	A	G	784.74	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0216368;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.214;QD=62.7793;RBI=0.0217012;REFB=0;REVB=-0.00167098;RO=0;SAF=21;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000158368;OID=.;OPOS=13010520;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:50:0:0:48:50:1:27:21:0:0:29:21:0:0
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chr19	13445208	.	C	T	708.55	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0187371;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.505;QD=62.982;RBI=0.0415234;REFB=0;REVB=0.0370556;RO=0;SAF=27;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000252911;OID=.;OPOS=13445208;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:18:27:0:0:18:27:0:0
chr19	13868669	.	G	A	37.78	PASS	AF=0.375;AO=6;DP=16;FAO=6;FDP=16;FR=.;FRO=10;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=-0.0425844;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.85;QD=9.44489;RBI=0.0757084;REFB=-0.020654;REVB=0.0625965;RO=10;SAF=2;SAR=4;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173695;STB=0.608323;STBP=0.576;TYPE=snp;VARB=0.0179719;OID=.;OPOS=13868669;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:16:16:10:10:6:6:0.375:4:2:5:5:4:2:5:5
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chr19	13988416	.	A	G	351.34	PASS	AF=0.583333;AO=34;DP=59;FAO=35;FDP=60;FR=.;FRO=25;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=0.0136425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.96;QD=23.4228;RBI=0.0176794;REFB=-0.074978;REVB=-0.0112446;RO=25;SAF=20;SAR=14;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00935288;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0408628;OID=.;OPOS=13988416;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:60:25:25:34:35:0.583333:14:20:15:10:14:21:15:10
chr19	14000170	.	T	C	188.78	PASS	AF=0.465116;AO=18;DP=42;FAO=20;FDP=43;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=5;FWDB=0.00495647;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.9089;QD=17.5612;RBI=0.0152342;REFB=-0.0232108;REVB=0.0144054;RO=23;SAF=13;SAR=5;SRF=18;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0768877;STB=0.554861;STBP=0.561;TYPE=snp;VARB=0.0306645;OID=.;OPOS=14000170;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:43:23:23:18:20:0.465116:5:13:18:5:6:14:18:5
chr19	14000400	.	A	G	426.4	PASS	AF=0.677966;AO=37;DP=58;FAO=40;FDP=59;FR=.;FRO=19;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=3;FSRR=16;FWDB=-0.00109991;FXX=0.0327815;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.539;QD=28.9087;RBI=0.00419373;REFB=-0.0296343;REVB=0.00404692;RO=21;SAF=25;SAR=12;SRF=3;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.349198;STB=0.648462;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0232884;OID=.;OPOS=14000400;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:59:21:19:37:40:0.677966:12:25:3:18:15:25:3:16
chr19	14000870	.	C	T	197.63	PASS	AF=0.393443;AO=24;DP=62;FAO=24;FDP=61;FR=.;FRO=37;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=28;FSRR=9;FWDB=0.027529;FXX=0.0161264;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.707;QD=12.9594;RBI=0.0290546;REFB=-0.0223427;REVB=0.00929097;RO=37;SAF=13;SAR=11;SRF=28;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.236643;STB=0.634216;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=0.0241629;OID=.;OPOS=14000870;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:61:37:37:24:24:0.393443:11:13:28:9:11:13:28:9
chr19	14015711	.	C	A	205.85	PASS	AF=0.571429;AO=20;DP=35;FAO=20;FDP=35;FR=.;FRO=15;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=2;FSRR=13;FWDB=0.0924242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.812;QD=23.5262;RBI=0.0931313;REFB=0.0144092;REVB=-0.0114545;RO=15;SAF=10;SAR=10;SRF=2;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.283884;STB=0.657001;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=-0.0174607;OID=.;OPOS=14015711;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:15:15:20:20:0.571429:10:10:2:13:10:10:2:13
chr19	14030689	.	T	C	153.18	PASS	AF=0.53125;AO=13;DP=32;FAO=17;FDP=32;FR=.;FRO=15;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=4;FWDB=-0.00408098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.6189;QD=19.1478;RBI=0.0148203;REFB=0.00849211;REVB=0.0142474;RO=12;SAF=7;SAR=6;SRF=10;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.257347;STB=0.545403;STBP=0.639;TYPE=snp;VARB=-0.0039148;OID=.;OPOS=14030689;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:12:15:13:17:0.53125:6:7:10:2:6:11:11:4
chr19	14040896	.	G	A	69.64	PASS	AF=0.529412;AO=9;DP=17;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.0358647;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.5956;QD=16.385;RBI=0.0601002;REFB=0.000106089;REVB=0.0482261;RO=8;SAF=3;SAR=6;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14199;STB=0.583142;STBP=0.575;TYPE=snp;VARB=0.000621822;OID=.;OPOS=14040896;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:17:17:8:8:9:9:0.529412:6:3:4:4:6:3:4:4
chr19	14185226	.	T	C	95.19	PASS	AF=0.48;AO=11;DP=24;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=0.0230162;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.9357;QD=15.2297;RBI=0.0322792;REFB=0.0209308;REVB=0.0226319;RO=13;SAF=6;SAR=5;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140078;STB=0.559345;STBP=0.615;TYPE=snp;VARB=-0.00371967;OID=.;OPOS=14185226;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:24:25:13:13:11:12:0.48:5:6:9:4:5:7:9:4
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chr19	14512489	.	G	A	212.58	PASS	AF=0.9;AO=18;DP=20;FAO=18;FDP=20;FR=.;FRO=2;FSAF=15;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0185418;FXX=0.0475964;HRUN=6;LEN=1;MLLD=52.8405;QD=42.515;RBI=0.0635909;REFB=-0.107136;REVB=0.0608276;RO=2;SAF=15;SAR=3;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.226414;STB=0.624843;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.00916368;OID=.;OPOS=14512489;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:20:20:2:2:18:18:0.9:3:15:0:2:3:15:0:2
chr19	14561722	.	A	G	153.49	PASS	AF=1;AO=9;DP=13;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0433933;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.253;QD=43.8549;RBI=0.0446185;REFB=0;REVB=0.0103842;RO=0;SAF=5;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.37338e-06;OID=.;OPOS=14561722;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:14:0:0:9:14:1:4:5:0:0:5:9:0:0
chr19	14582468	.	G	A	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0188494;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.973;QD=46.848;RBI=0.0409755;REFB=0;REVB=0.0363826;RO=0;SAF=6;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000769294;OID=.;OPOS=14582468;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:9:6:0:0:9:6:0:0
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chr19	14600563	.	T	C	69.24	PASS	AF=0.692308;AO=8;DP=12;FAO=9;FDP=13;FR=.;FRO=4;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.00556982;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=185.256;QD=21.3054;RBI=0.00562954;REFB=-0.00610044;REVB=0.000817838;RO=4;SAF=5;SAR=3;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0788369;STB=0.529348;STBP=0.82;TYPE=snp;VARB=0.00214199;OID=.;OPOS=14600563;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:12:13:4:4:8:9:0.692308:3:5:3:1:3:6:3:1
chr19	14682804	.	G	C	188.7	PASS	AF=0.415094;AO=22;DP=53;FAO=22;FDP=53;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=0.00242668;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=270.768;QD=14.2418;RBI=0.00363782;REFB=-0.00691871;REVB=-0.00271016;RO=30;SAF=10;SAR=12;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0123128;STB=0.501729;STBP=0.998;TYPE=snp;VARB=0.00996552;OID=.;OPOS=14682804;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:30:31:22:22:0.415094:12:10:14:16:12:10:14:17
chr19	14744032	.	G	A	44.53	PASS	AF=0.28;AO=7;DP=25;FAO=7;FDP=25;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=-0.0284133;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.538;QD=7.12514;RBI=0.028751;REFB=-0.0191019;REVB=0.00439417;RO=16;SAF=5;SAR=2;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0499583;STB=0.540421;STBP=0.833;TYPE=snp;VARB=0.0542002;OID=.;OPOS=14744032;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:25:25:16:18:7:7:0.28:2:5:12:4:2:5:12:6
chr19	14752325	.	C	G,T	944.55	PASS	AF=0.0447761,0.955224;AO=3,63;DP=67;FAO=3,64;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=3,31;FSAR=0,33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00271792,-0.00575233;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=26.8085,226.514;QD=56.3912;RBI=0.0344458,0.0161345;REFB=-0.0210533,-0.10289;REVB=-0.0343384,0.0150742;RO=0;SAF=3,31;SAR=0,32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0604108,-0.00295643;OID=.,.;OPOS=14752325,14752325;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:10:67:67:0:0:3,63:3,64:0.0447761,0.955224:0,32:3,31:0:0:0,33:3,31:0:0
chr19	14769339	.	C	G	1249.72	PASS	AF=0.573604;AO=113;DP=197;FAO=113;FDP=197;FR=.;FRO=84;FSAF=69;FSAR=44;FSRF=54;FSRR=30;FWDB=0.040509;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.1657;QD=25.3751;RBI=0.0418843;REFB=-0.00884659;REVB=0.010645;RO=84;SAF=69;SAR=44;SRF=54;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0267924;STB=0.514544;STBP=0.651;TYPE=snp;VARB=0.00754513;OID=.;OPOS=14769339;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:197:197:84:84:113:113:0.573604:44:69:54:30:44:69:54:30
chr19	14817548	.	T	A	117.18	PASS	AF=0.358974;AO=14;DP=39;FAO=14;FDP=39;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.030123;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.745;QD=12.0189;RBI=0.0437853;REFB=-0.00781478;REVB=-0.0317766;RO=25;SAF=5;SAR=9;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.221229;STB=0.630808;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=0.0324783;OID=.;OPOS=14817548;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:25:25:14:14:0.358974:9:5:14:11:9:5:14:11
chr19	14829749	.	C	T	244.26	PASS	AF=0.547619;AO=23;DP=42;FAO=23;FDP=42;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=18;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.0149695;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.497;QD=23.2626;RBI=0.0152888;REFB=-0.0545294;REVB=0.00310821;RO=19;SAF=5;SAR=18;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.335093;STB=0.688816;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.0219984;OID=.;OPOS=14829749;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:19:19:23:23:0.547619:18:5:11:8:18:5:11:8
chr19	14862278	.	G	A	285.1	PASS	AF=0.541667;AO=26;DP=48;FAO=26;FDP=48;FR=.;FRO=22;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.042222;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.552;QD=23.758;RBI=0.0422223;REFB=0.0157067;REVB=0.00015956;RO=22;SAF=15;SAR=11;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0118083;STB=0.506574;STBP=0.933;TYPE=snp;VARB=-0.0126722;OID=.;OPOS=14862278;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:22:22:26:26:0.541667:11:15:13:9:11:15:13:9
chr19	14862430	.	C	G	354.3	PASS	AF=0.647059;AO=33;DP=51;FAO=33;FDP=51;FR=.;FRO=18;FSAF=22;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.0165577;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.019;QD=27.7881;RBI=0.0272131;REFB=-0.0436407;REVB=-0.0215962;RO=17;SAF=22;SAR=11;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0926222;STB=0.563341;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=0.0124249;OID=.;OPOS=14862430;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:17:18:33:33:0.647059:11:22:9:8:11:22:9:9
chr19	14875388	.	G	A	54.86	PASS	AF=0.296296;AO=8;DP=28;FAO=8;FDP=27;FR=.;FRO=19;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.0247493;FXX=0.0357015;HRUN=4;LEN=1;MLLD=275.588;QD=8.1269;RBI=0.0249327;REFB=-0.00652956;REVB=0.00301822;RO=19;SAF=3;SAR=5;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113905;STB=0.571247;STBP=0.631;TYPE=snp;VARB=0.0120341;OID=.;OPOS=14875388;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:28:27:19:19:8:8:0.296296:5:3:9:10:5:3:9:10
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chr19	14910438	.	C	T	129.92	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00934607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.864;QD=43.3053;RBI=0.0372188;REFB=0;REVB=0.0360262;RO=0;SAF=1;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00033675;OID=.;OPOS=14910438;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:12:0:0:11:12:1:10:1:0:0:11:1:0:0
chr19	14910573	.	C	T	160.3	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0282349;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.86;QD=45.7987;RBI=0.0327467;REFB=0;REVB=0.0165873;RO=0;SAF=3;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000164165;OID=.;OPOS=14910573;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:11:3:0:0:11:3:0:0
chr19	14938616	.	T	C	323.47	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0114377;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.872;QD=53.9111;RBI=0.0184331;REFB=0;REVB=0.0144553;RO=0;SAF=12;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.22557e-05;OID=.;OPOS=14938616;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:12:12:0:0:12:12:0:0
chr19	14951889	.	A	G	133.38	PASS	AF=0.441176;AO=15;DP=34;FAO=15;FDP=34;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.0286896;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.174;QD=15.6913;RBI=0.060084;REFB=-0.0320802;REVB=-0.052792;RO=19;SAF=4;SAR=11;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171752;STB=0.599859;STBP=0.327;TYPE=snp;VARB=0.0374194;OID=.;OPOS=14951889;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:19:19:15:15:0.441176:11:4:8:11:11:4:8:11
chr19	14974894	.	C	T	318.85	PASS	AF=0.583333;AO=28;DP=48;FAO=28;FDP=48;FR=.;FRO=20;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.0267053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.617;QD=26.5706;RBI=0.0267592;REFB=-0.0104111;REVB=-0.00169665;RO=19;SAF=13;SAR=15;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0838059;STB=0.535689;STBP=0.582;TYPE=snp;VARB=0.00706526;OID=.;OPOS=14974894;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:19:20:28:28:0.583333:15:13:11:8:15:13:11:9
chr19	14974930	.	G	A	205.31	PASS	AF=0.442308;AO=23;DP=52;FAO=23;FDP=52;FR=.;FRO=29;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=-0.0125981;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.71;QD=15.793;RBI=0.012854;REFB=-0.00556045;REVB=0.00255209;RO=29;SAF=14;SAR=9;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125424;STB=0.571366;STBP=0.398;TYPE=snp;VARB=0.00538666;OID=.;OPOS=14974930;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:29:29:23:23:0.442308:9:14:14:15:9:14:14:15
chr19	14991963	.	C	A	58.62	PASS	AF=0.5;AO=8;DP=16;FAO=8;FDP=16;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.0064562;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.638;QD=14.6539;RBI=0.00682917;REFB=-0.0211126;REVB=0.00222598;RO=8;SAF=4;SAR=4;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.213273;STB=0.624707;STBP=0.369;TYPE=snp;VARB=0.0161557;OID=.;OPOS=14991963;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:16:16:8:8:8:8:0.5:4:4:2:6:4:4:2:6
chr19	14992042	.	A	G	127.82	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00276143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.132;QD=42.6061;RBI=0.0482755;REFB=0;REVB=0.0481964;RO=0;SAF=5;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00346685;OID=.;OPOS=14992042;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:12:0:0:11:12:1:6:5:0:0:7:5:0:0
chr19	14992045	.	C	T	39.68	PASS	AF=0.5;AO=6;DP=12;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.0290875;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.0838;QD=13.2274;RBI=0.108733;REFB=-0.02101;REVB=0.10477;RO=6;SAF=4;SAR=2;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.396745;STB=0.736113;STBP=0.189;TYPE=snp;VARB=0.0310968;OID=.;OPOS=14992045;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:12:12:6:6:6:6:0.5:2:4:1:5:2:4:1:5
chr19	14992226	.	A	G	43.68	PASS	AF=0.75;AO=6;DP=8;FAO=6;FDP=8;FR=.;FRO=2;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.41;QD=21.842;RBI=0.00273482;REFB=0.00413235;REVB=0.00273482;RO=2;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00039976;OID=.;OPOS=14992226;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:8:8:2:2:6:6:0.75:6:0:0:2:6:0:0:2
chr19	15052983	.	T	TATC	573.05	PASS	AF=0.836735;AO=41;DP=51;FAO=41;FDP=49;FR=.;FRO=8;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=0.0112272;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=238.81;QD=46.7797;RBI=0.0112325;REFB=-0.02289;REVB=0.000346496;RO=10;SAF=21;SAR=20;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0686458;STB=0.538903;STBP=0.237;TYPE=ins;VARB=0.00334133;OID=.;OPOS=15052984;OREF=-;OALT=ATC;OMAPALT=TATC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.836735:41:51:41:49:8:21:20:6:2:49:10:21:20:7:3
chr19	15083693	.	C	A	542.43	PASS	AF=1;AO=30;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0366483;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.502;QD=60.2695;RBI=0.0558865;REFB=0;REVB=0.0421925;RO=0;SAF=18;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000337659;OID=.;OPOS=15083693;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:30:36:1:12:18:0:0:18:18:0:0
chr19	15131330	.	G	A	538.55	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00420991;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.6336;QD=59.8388;RBI=0.0104859;REFB=0;REVB=0.00960364;RO=0;SAF=17;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.53086e-05;OID=.;OPOS=15131330;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:19:17:0:0:19:17:0:0
chr19	15133733	.	C	G	149.66	PASS	AF=0.34;AO=17;DP=50;FAO=17;FDP=50;FR=.;FRO=33;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=23;FSRR=10;FWDB=0.037879;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.0455;QD=11.9726;RBI=0.0409796;REFB=-0.015164;REVB=0.0156367;RO=33;SAF=12;SAR=5;SRF=23;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0119197;STB=0.507034;STBP=0.972;TYPE=snp;VARB=0.022665;OID=.;OPOS=15133733;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:33:33:17:17:0.34:5:12:23:10:5:12:23:10
chr19	15133762	.	G	C	632.24	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0210035;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.3739;QD=61.6818;RBI=0.0564703;REFB=0;REVB=-0.052419;RO=0;SAF=28;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000795456;OID=.;OPOS=15133762;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:13:28:0:0:13:28:0:0
chr19	15133787	.	C	A	210.31	PASS	AF=0.571429;AO=20;DP=37;FAO=20;FDP=35;FR=.;FRO=15;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=-0.00375517;FXX=0.0540395;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.862;QD=24.0357;RBI=0.00715102;REFB=-0.00486827;REVB=-0.00608571;RO=15;SAF=15;SAR=5;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0809188;STB=0.545407;STBP=0.6;TYPE=snp;VARB=0.00397211;OID=.;OPOS=15133787;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:35:15:15:20:20:0.571429:5:15:10:5:5:15:10:5
chr19	15198263	.	A	G	246.72	PASS	AF=0.952381;AO=17;DP=21;FAO=20;FDP=21;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0516179;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.9783;QD=46.9942;RBI=0.0585212;REFB=-0.124034;REVB=-0.027574;RO=0;SAF=4;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.533299;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.00430145;OID=.;OPOS=15198263;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:21:21:0:1:17:20:0.952381:13:4:0:0:13:7:1:0
chr19	15198292	.	C	G	130.44	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0821312;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=142.933;QD=43.4791;RBI=0.0822886;REFB=0;REVB=0.00508703;RO=0;SAF=5;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00100556;OID=.;OPOS=15198292;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:7:5:0:0:7:5:0:0
chr19	15198507	.	T	C	214.25	PASS	AF=0.947368;AO=18;DP=19;FAO=18;FDP=19;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0128337;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.127;QD=45.1043;RBI=0.0503553;REFB=-0.0953256;REVB=-0.0486925;RO=1;SAF=14;SAR=4;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101506;STB=0.55549;STBP=0.151;TYPE=snp;VARB=0.00422549;OID=.;OPOS=15198507;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:19:19:1:1:18:18:0.947368:4:14:0:1:4:14:0:1
chr19	15198631	.	A	C	766.1	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00901852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=303.952;QD=63.842;RBI=0.0106351;REFB=0;REVB=-0.00563663;RO=0;SAF=30;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.73384e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.0258e-06;OID=.;OPOS=15198631;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:18:30:0:0:18:30:0:0
chr19	15198764	.	T	C	689.38	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00992061;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.3531;QD=62.6707;RBI=0.0245277;REFB=0;REVB=-0.0224319;RO=0;SAF=21;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000112597;OID=.;OPOS=15198764;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:23:21:0:0:23:21:0:0
chr19	15225348	.	T	C	70.19	PASS	AF=0.333333;AO=10;DP=30;FAO=10;FDP=30;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.0187284;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=31.9154;QD=9.35889;RBI=0.0222192;REFB=-0.0277123;REVB=0.0119558;RO=19;SAF=6;SAR=4;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0813642;STB=0.567431;STBP=0.637;TYPE=snp;VARB=0.0586641;OID=.;OPOS=15225348;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:70:30:30:19:20:10:10:0.333333:4:6:10:9:4:6:10:10
chr19	15225358	.	T	A,C	256.03	PASS	AF=0.9,0.1;AO=18,3;DP=21;FAO=18,2;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=6,2;FSAR=12,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0141518,0.0457654;FXX=0.0475964;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=155.575,113.826;QD=51.2067;RBI=0.0145738,0.0459754;REFB=0,0;REVB=0.00348145,0.00438933;RO=0;SAF=6,3;SAR=12,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00355034,0.0143266;OID=.,.;OPOS=15225358,15225358;OREF=T,T;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:11:21:20:0:0:18,3:18,2:0.9,0.1:12,0:6,3:0:0:12,0:6,2:0:0
chr19	15226970	.	G	A	94.54	PASS	AF=0.611111;AO=11;DP=18;FAO=11;FDP=18;FR=.;FRO=7;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.0323148;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.5547;QD=21.0096;RBI=0.033111;REFB=-0.0199858;REVB=-0.00721755;RO=7;SAF=6;SAR=5;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.175522;STB=0.599822;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.0140417;OID=.;OPOS=15226970;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:18:18:7:7:11:11:0.611111:5:6:2:5:5:6:2:5
chr19	15229993	.	A	G	79.41	PASS	AF=0.5;AO=10;DP=20;FAO=10;FDP=20;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.00295591;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.702;QD=15.882;RBI=0.0115454;REFB=0.00865312;REVB=-0.0111606;RO=10;SAF=7;SAR=3;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0103992;OID=.;OPOS=15229993;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:20:20:10:10:10:10:0.5:3:7:7:3:3:7:7:3
chr19	15233581	.	C	A	199.76	PASS	AF=0.5;AO=20;DP=40;FAO=20;FDP=40;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.000215757;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.556;QD=19.976;RBI=0.00658207;REFB=-0.0093379;REVB=0.00657853;RO=20;SAF=12;SAR=8;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0901606;STB=0.550969;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=0.0111262;OID=.;OPOS=15233581;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:20:20:20:20:0.5:8:12:10:10:8:12:10:10
chr19	15271771	.	G	A	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0107539;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.008;QD=33.4285;RBI=0.158983;REFB=0;REVB=0.158619;RO=0;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00258976;OID=.;OPOS=15271771;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:2:4:0:0:2:4:0:0
chr19	15278057	.	A	G	791.89	PASS	AF=0.966102;AO=57;DP=59;FAO=57;FDP=59;FR=.;FRO=2;FSAF=28;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0245018;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.28;QD=53.6875;RBI=0.032513;REFB=-0.0964409;REVB=-0.0213718;RO=2;SAF=28;SAR=29;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000560599;STB=0.500297;STBP=0.879;TYPE=snp;VARB=0.00154861;OID=.;OPOS=15278057;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:59:59:2:2:57:57:0.966102:29:28:1:1:29:28:1:1
chr19	15285052	.	T	C	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0128034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.143;QD=51.1843;RBI=0.0230513;REFB=0;REVB=0.0191686;RO=0;SAF=12;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.36274e-05;OID=.;OPOS=15285052;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:8:12:0:0:8:12:0:0
chr19	15292437	.	T	C	1180.78	PASS	AF=1;AO=67;DP=79;FAO=78;FDP=78;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=42;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0690408;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.245;QD=60.5526;RBI=0.0799181;REFB=0;REVB=0.0402526;RO=0;SAF=32;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.62221e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000504135;OID=.;OPOS=15292437;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:78:0:0:67:78:1:35:32:0:0:36:42:0:0
chr19	15295134	.	G	A	851.97	PASS	AF=1;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.091646;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.5259;QD=57.7605;RBI=0.093419;REFB=0;REVB=0.0181138;RO=0;SAF=25;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.03209e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000868432;OID=.;OPOS=15295134;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:59:0:0:59:59:1:34:25:0:0:34:25:0:0
chr19	15302844	.	T	C	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0134526;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.4906;QD=50.4132;RBI=0.0243584;REFB=0;REVB=0.0203066;RO=0;SAF=10;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000229406;OID=.;OPOS=15302844;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:9:10:0:0:9:10:0:0
chr19	15303225	.	G	A	285.96	PASS	AF=0.557692;AO=28;DP=50;FAO=29;FDP=52;FR=.;FRO=23;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=-0.0303206;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.118;QD=21.9972;RBI=0.0305887;REFB=-0.0283785;REVB=0.00404128;RO=22;SAF=12;SAR=16;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0530726;STB=0.525589;STBP=0.687;TYPE=snp;VARB=0.0172307;OID=.;OPOS=15303225;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:52:22:23:28:29:0.557692:16:12:8:14:16:13:9:14
chr19	15484618	.	TCCCCA	TCCCA,TCCCCAC	58.2	PASS	AF=0.352941,0;AO=11,4;DP=34;FAO=12,0;FDP=34;FR=.;FRO=22;FSAF=2,0;FSAR=10,0;FSRF=4;FSRR=18;FWDB=-0.0244023,0.0563733;FXX=0;HRUN=4,2;LEN=1,1;MLLD=16.8945,16.1683;QD=6.84697;RBI=0.129542,0.282693;REFB=0.026483,-0.0481297;REVB=0.127223,-0.277015;RO=16;SAF=2,0;SAR=9,4;SRF=4;SRR=12;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.104637,-0.599981;STB=0.517212,0.5;STBP=0.944,1;TYPE=del,ins;VARB=-0.010916,0;OID=.,.;OPOS=15484619,15484624;OREF=C,-;OALT=-,C;OMAPALT=TCCCA,TCCCCAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.352941,0:11,4:34:12,0:34:22:2,0:10,0:4:18:58:16:2,0:9,4:4:12
chr19	15508362	.	G	C	1463.64	PASS	AF=0.979167;AO=94;DP=96;FAO=94;FDP=96;FR=.;FRO=2;FSAF=49;FSAR=45;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0082115;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.666;QD=60.9848;RBI=0.022836;REFB=-0.0460837;REVB=0.0213086;RO=0;SAF=49;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509998;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=-0.000133374;OID=.;OPOS=15508362;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:96:96:0:2:94:94:0.979167:45:49:0:0:45:49:2:0
chr19	15512164	.	TG	T	39.99	PASS	AF=0.428571;AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.0614376;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=15.0309;QD=7.61709;RBI=0.0761777;REFB=-0.101911;REVB=0.0450385;RO=12;SAF=2;SAR=7;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0.317919;SSSB=-0.372698;STB=0.723608;STBP=0.104;TYPE=del;VARB=0.133114;OID=.;OPOS=15512165;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.428571:9:21:9:21:12:2:7:7:5:39:12:2:7:7:5
chr19	15533821	.	A	G	313.31	PASS	AF=0.96;AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=25;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0370192;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=224.908;QD=50.1288;RBI=0.0520391;REFB=-0.117782;REVB=0.0365738;RO=0;SAF=15;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.516116;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.00194338;OID=.;OPOS=15533821;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:25:25:0:1:24:24:0.96:9:15:0:0:9:15:1:0
chr19	15539261	.	C	G	326.51	PASS	AF=0.404494;AO=36;DP=89;FAO=36;FDP=89;FR=.;FRO=53;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=28;FSRR=25;FWDB=-0.00801489;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.258;QD=14.6746;RBI=0.0381181;REFB=-0.0172468;REVB=-0.0372659;RO=50;SAF=24;SAR=12;SRF=27;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13836;STB=0.587252;STBP=0.175;TYPE=snp;VARB=0.0232446;OID=.;OPOS=15539261;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:50:53:36:36:0.404494:12:24:27:23:12:24:28:25
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chr19	15574858	.	C	T	143.33	PASS	AF=0.327586;AO=19;DP=58;FAO=19;FDP=58;FR=.;FRO=39;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=25;FSRR=14;FWDB=0.00277194;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=269.267;QD=9.88482;RBI=0.00489916;REFB=-0.00781882;REVB=0.00403957;RO=39;SAF=8;SAR=11;SRF=25;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.246672;STB=0.644614;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=0.0175773;OID=.;OPOS=15574858;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:39:39:19:19:0.327586:11:8:25:14:11:8:25:14
chr19	15586672	.	A	T	67.49	PASS	AF=0.6;AO=8;DP=14;FAO=9;FDP=15;FR=.;FRO=6;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.0128242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.57;QD=17.9975;RBI=0.017287;REFB=-0.00400742;REVB=0.0115922;RO=6;SAF=7;SAR=1;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0651668;STB=0.533262;STBP=0.828;TYPE=snp;VARB=0.00424498;OID=.;OPOS=15586672;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:14:15:6:6:8:9:0.6:1:7:5:1:2:7:5:1
chr19	15587148	.	C	T	187.93	PASS	AF=0.513514;AO=19;DP=37;FAO=19;FDP=37;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.0111696;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.136;QD=20.3164;RBI=0.0288012;REFB=-0.0106869;REVB=-0.0265472;RO=18;SAF=11;SAR=8;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116263;STB=0.565645;STBP=0.423;TYPE=snp;VARB=0.00561069;OID=.;OPOS=15587148;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:18:18:19:19:0.513514:8:11:8:10:8:11:8:10
chr19	15587185	.	C	T	199.43	PASS	AF=0.5;AO=20;DP=40;FAO=20;FDP=40;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=5;FWDB=0.00955434;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.284;QD=19.9432;RBI=0.0101866;REFB=-0.000896596;REVB=0.00353293;RO=20;SAF=7;SAR=13;SRF=15;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.345086;STB=0.693988;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.000776134;OID=.;OPOS=15587185;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:20:20:20:20:0.5:13:7:15:5:13:7:15:5
chr19	15587345	.	T	C	53.39	PASS	AF=0.285714;AO=8;DP=28;FAO=8;FDP=28;FR=.;FRO=20;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=-0.0142869;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.05;QD=7.62708;RBI=0.0150568;REFB=-0.00196905;REVB=0.00475307;RO=20;SAF=1;SAR=7;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.627826;STB=0.88891;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.00780031;OID=.;OPOS=15587345;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:28:28:20:20:8:8:0.285714:7:1:14:6:7:1:14:6
chr19	15729056	.	C	G	180.48	PASS	AF=0.422222;AO=19;DP=45;FAO=19;FDP=45;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=-0.0051502;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=95.3195;QD=16.043;RBI=0.0149933;REFB=-0.00838725;REVB=0.014081;RO=26;SAF=8;SAR=11;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1184;STB=0.568003;STBP=0.469;TYPE=snp;VARB=0.0108536;OID=.;OPOS=15729056;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:26:26:19:19:0.422222:11:8:14:12:11:8:14:12
chr19	15730498	.	G	GC	918.59	PASS	AF=1;AO=63;DP=66;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0269604;FXX=0.0307645;HRUN=0;LEN=1;MLLD=55.3557;QD=58.3233;RBI=0.0307637;REFB=0;REVB=-0.014817;RO=3;SAF=28;SAR=35;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.019244;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000290734;OID=.;OPOS=15730499;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:63:66:63:63:0:28:35:0:0:5:3:28:35:2:1
chr19	15739597	.	A	C	52.86	PASS	AF=0.285714;AO=7;DP=27;FAO=8;FDP=28;FR=.;FRO=20;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.0181195;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.543;QD=7.55089;RBI=0.0220522;REFB=-0.0167558;REVB=0.0125692;RO=20;SAF=2;SAR=5;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.308372;STB=0.721649;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=0.0453462;OID=.;OPOS=15739597;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:27:28:20:20:7:8:0.285714:5:2:11:9:6:2:11:9
chr19	15757927	.	T	C	783.01	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00825663;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.77;QD=56.9458;RBI=0.0269063;REFB=0;REVB=-0.0256081;RO=0;SAF=26;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.52846e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.67468e-05;OID=.;OPOS=15757927;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:55:0:0:54:55:1:28:26:0:0:29:26:0:0
chr19	15763691	.	G	A	360.1	PASS	AF=0.571429;AO=36;DP=62;FAO=36;FDP=63;FR=.;FRO=27;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=8;FSRR=19;FWDB=-0.00127724;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.512;QD=22.8633;RBI=0.00550981;REFB=0.00129859;REVB=0.00535972;RO=26;SAF=17;SAR=19;SRF=8;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127058;STB=0.57623;STBP=0.193;TYPE=snp;VARB=-0.00091212;OID=.;OPOS=15763691;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:63:26:27:36:36:0.571429:19:17:8:18:19:17:8:19
chr19	15769625	.	A	G	109.25	PASS	AF=0.419355;AO=13;DP=31;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.0157414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.157;QD=14.0972;RBI=0.0167874;REFB=0.00539222;REVB=-0.00583295;RO=17;SAF=3;SAR=10;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21212;STB=0.646813;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=-0.00417523;OID=.;OPOS=15769625;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:17:18:13:13:0.419355:10:3:7:10:10:3:8:10
chr19	15784061	.	C	A	631.94	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0166195;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.337;QD=61.653;RBI=0.0210389;REFB=0;REVB=0.0129007;RO=0;SAF=25;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.1719e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000359658;OID=.;OPOS=15784061;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:16:25:0:0:16:25:0:0
chr19	15784386	.	C	T	411.11	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0174718;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.172;QD=56.7054;RBI=0.0218979;REFB=0;REVB=0.0132006;RO=0;SAF=16;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.79477e-05;OID=.;OPOS=15784386;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:13:16:0:0:13:16:0:0
chr19	15789098	.	A	G	508.25	PASS	AF=0.972222;AO=34;DP=35;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0816855;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.6236;QD=56.4723;RBI=0.104282;REFB=-0.107469;REVB=-0.0648239;RO=1;SAF=13;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0346006;STB=0.517231;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=0.00520678;OID=.;OPOS=15789098;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:35:36:1:1:34:35:0.972222:21:13:1:0:21:14:1:0
chr19	15789140	.	A	G	920.07	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0101606;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.824;QD=58.4172;RBI=0.0152607;REFB=0;REVB=0.0113864;RO=0;SAF=34;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.77742e-05;OID=.;OPOS=15789140;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:29:34:0:0:29:34:0:0
chr19	15791132	.	T	A	180.66	PASS	AF=0.413043;AO=19;DP=46;FAO=19;FDP=46;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=7;FWDB=-0.0272683;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.092;QD=15.7096;RBI=0.0283464;REFB=-0.00217835;REVB=-0.0077431;RO=27;SAF=11;SAR=8;SRF=20;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176091;STB=0.600386;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.00204567;OID=.;OPOS=15791132;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:27:27:19:19:0.413043:8:11:20:7:8:11:20:7
chr19	15791180	.	C	T	689.37	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00248217;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.367;QD=62.6701;RBI=0.0408158;REFB=0;REVB=0.0407403;RO=0;SAF=26;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000139188;OID=.;OPOS=15791180;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:18:26:0:0:18:26:0:0
chr19	15793235	.	T	C	143.33	PASS	AF=0.327586;AO=19;DP=58;FAO=19;FDP=58;FR=.;FRO=39;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=0.021713;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.452;QD=9.88457;RBI=0.0294471;REFB=-0.0104039;REVB=0.0198917;RO=39;SAF=8;SAR=11;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.076061;STB=0.544907;STBP=0.632;TYPE=snp;VARB=0.0181991;OID=.;OPOS=15793235;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:39:39:19:19:0.327586:11:8:19:20:11:8:19:20
chr19	15838967	.	G	A	921.42	PASS	AF=0.905405;AO=67;DP=74;FAO=67;FDP=74;FR=.;FRO=7;FSAF=30;FSAR=37;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0621163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.28;QD=49.8064;RBI=0.0988794;REFB=-0.0256003;REVB=0.0769331;RO=7;SAF=30;SAR=37;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0222112;STB=0.511795;STBP=0.54;TYPE=snp;VARB=0.00315879;OID=.;OPOS=15838967;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:74:74:7:7:67:67:0.905405:37:30:4:3:37:30:4:3
chr19	15839168	.	C	T	35.64	PASS	AF=0.26087;AO=6;DP=23;FAO=6;FDP=23;FR=.;FRO=17;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=0.0517226;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.474;QD=6.19888;RBI=0.0517389;REFB=0.00352664;REVB=-0.00129669;RO=17;SAF=2;SAR=4;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0247213;STB=0.516075;STBP=0.964;TYPE=snp;VARB=-0.00735515;OID=.;OPOS=15839168;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:23:23:17:17:6:6:0.26087:4:2:6:11:4:2:6:11
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chr19	15839459	.	G	A	36.87	PASS	AF=0.315789;AO=6;DP=19;FAO=6;FDP=19;FR=.;FRO=13;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.0127912;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.318;QD=7.76199;RBI=0.0184232;REFB=-0.000886871;REVB=0.013259;RO=13;SAF=2;SAR=4;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144953;STB=0.592275;STBP=0.577;TYPE=snp;VARB=0.00231023;OID=.;OPOS=15839459;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:19:19:13:13:6:6:0.315789:4:2:6:7:4:2:6:7
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chr19	15882884	.	C	T	178.39	PASS	AF=0.37931;AO=21;DP=57;FAO=22;FDP=58;FR=.;FRO=36;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=-0.00164443;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.963;QD=12.3026;RBI=0.00842803;REFB=-0.0157905;REVB=-0.00826605;RO=36;SAF=14;SAR=7;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158788;STB=0.601911;STBP=0.263;TYPE=snp;VARB=0.0221004;OID=.;OPOS=15882884;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:58:36:36:21:22:0.37931:7:14:19:17:7:15:19:17
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chr19	15905035	.	G	A	302.07	PASS	AF=0.5;AO=32;DP=67;FAO=32;FDP=64;FR=.;FRO=32;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=0.0271346;FXX=0.0447694;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.379;QD=18.8795;RBI=0.0331976;REFB=-0.0396161;REVB=0.0191258;RO=32;SAF=18;SAR=14;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0843072;STB=0.547029;STBP=0.461;TYPE=snp;VARB=0.028924;OID=.;OPOS=15905035;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:64:32:32:32:32:0.5:14:18:15:17:14:18:15:17
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chr19	16045141	.	T	C	484.9	PASS	AF=1;AO=29;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0541185;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.9;QD=58.7759;RBI=0.0588599;REFB=0;REVB=0.0231448;RO=0;SAF=14;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000363845;OID=.;OPOS=16045141;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:29:33:1:15:14:0:0:16:17:0:0
chr19	16136528	.	G	GCAGCACCTGGC	301.43	PASS	AF=0.261905;AO=42;DP=175;FAO=44;FDP=168;FR=.;FRO=124;FSAF=12;FSAR=32;FSRF=69;FSRR=55;FWDB=-0.0338686;FXX=0.0232545;HRUN=1;LEN=11;MLLD=318.559;QD=7.17699;RBI=0.0338788;REFB=-0.0112968;REVB=-0.000831339;RO=129;SAF=11;SAR=31;SRF=71;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.367397;STB=0.712773;STBP=0.002;TYPE=ins;VARB=0.0245657;OID=.;OPOS=16136529;OREF=-;OALT=CAGCACCTGGC;OMAPALT=GCAGCACCTGGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.261905:42:175:44:168:124:12:32:69:55:99:129:11:31:71:58
chr19	16136923	.	T	C	117.16	PASS	AF=0.52;AO=13;DP=25;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=-0.0237106;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.428;QD=18.7454;RBI=0.0313399;REFB=-0.00401163;REVB=0.0204938;RO=10;SAF=3;SAR=10;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.316108;STB=0.723321;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.00923225;OID=.;OPOS=16136923;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:25:10:12:13:13:0.52:10:3:6:4:10:3:8:4
chr19	16146400	.	A	G	315.67	PASS	AF=0.472222;AO=34;DP=72;FAO=34;FDP=72;FR=.;FRO=38;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=24;FSRR=14;FWDB=-0.0105204;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.302;QD=17.5373;RBI=0.0122812;REFB=0.00119006;REVB=-0.00633622;RO=38;SAF=22;SAR=12;SRF=24;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0158792;STB=0.508892;STBP=0.91;TYPE=snp;VARB=-0.00126251;OID=.;OPOS=16146400;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:38:38:34:34:0.472222:12:22:24:14:12:22:24:14
chr19	16268207	.	TA	T	243.88	PASS	AF=1;AO=23;DP=27;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0720362;FXX=0.0370233;HRUN=6;LEN=1;MLLD=17.2478;QD=37.5195;RBI=0.0847365;REFB=-0.0255432;REVB=-0.0446214;RO=1;SAF=11;SAR=12;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0370176;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.00496999;OID=.;OPOS=16268208;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:23:27:26:26:0:12:14:0:0:3:1:11:12:0:1
chr19	16275655	.	C	T	852.38	PASS	AF=1;AO=43;DP=61;FAO=60;FDP=60;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=32;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00374058;FXX=0.0163908;HRUN=8;LEN=1;MLLD=191.117;QD=56.8255;RBI=0.0368313;REFB=0;REVB=0.0366409;RO=0;SAF=21;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000840954;OID=.;OPOS=16275655;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:60:0:0:43:60:1:22:21:0:0:28:32:0:0
chr19	16301312	.	A	G	67.43	PASS	AF=0.45;AO=9;DP=20;FAO=9;FDP=20;FR=.;FRO=11;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=0.0305425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.9277;QD=13.4858;RBI=0.030548;REFB=-0.0248339;REVB=0.000578198;RO=11;SAF=8;SAR=1;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.272723;STB=0.666221;STBP=0.356;TYPE=snp;VARB=0.0348637;OID=.;OPOS=16301312;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:20:20:11:11:9:9:0.45:1:8:8:3:1:8:8:3
chr19	16591464	.	G	A	73.06	PASS	AF=0.3125;AO=10;DP=32;FAO=10;FDP=32;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.0288501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.745;QD=9.13236;RBI=0.0298627;REFB=-0.000624763;REVB=0.00771033;RO=22;SAF=8;SAR=2;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.373879;STB=0.731889;STBP=0.111;TYPE=snp;VARB=0.00094653;OID=.;OPOS=16591464;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:32:32:22:22:10:10:0.3125:2:8:11:11:2:8:11:11
chr19	16593573	.	G	A	172.12	PASS	AF=0.473684;AO=18;DP=38;FAO=18;FDP=38;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=17;FWDB=0.00291383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.58;QD=18.1177;RBI=0.00337906;REFB=0.00103106;REVB=-0.00171104;RO=20;SAF=8;SAR=10;SRF=3;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.290149;STB=0.662421;STBP=0.104;TYPE=snp;VARB=-0.000795655;OID=.;OPOS=16593573;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:20:20:18:18:0.473684:10:8:3:17:10:8:3:17
chr19	16601194	.	C	T	193.87	PASS	AF=0.416667;AO=20;DP=49;FAO=20;FDP=48;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=-0.011044;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.0955;QD=16.1559;RBI=0.0164627;REFB=-0.00999003;REVB=0.0122086;RO=29;SAF=9;SAR=11;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104413;STB=0.570469;STBP=0.448;TYPE=snp;VARB=0.0181237;OID=.;OPOS=16601194;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:48:29:28:20:20:0.416667:11:9:16:13:11:9:16:12
chr19	16611978	.	T	C	217.63	PASS	AF=0.552632;AO=21;DP=38;FAO=21;FDP=38;FR=.;FRO=17;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=-0.0103124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.605;QD=22.9085;RBI=0.0139253;REFB=-0.00795235;REVB=-0.00935772;RO=17;SAF=13;SAR=8;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.212621;STB=0.618934;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=0.00464026;OID=.;OPOS=16611978;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:17:17:21:21:0.552632:8:13:6:11:8:13:6:11
chr19	16612011	.	T	C	318.2	PASS	AF=0.6;AO=27;DP=47;FAO=27;FDP=45;FR=.;FRO=18;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.0173078;FXX=0.081616;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.732;QD=28.284;RBI=0.0208864;REFB=0.00124806;REVB=0.0116911;RO=16;SAF=15;SAR=12;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0047523;STB=0.522371;STBP=0.721;TYPE=snp;VARB=-0.000190448;OID=.;OPOS=16612011;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:45:16:18:27:27:0.6:12:15:9:7:12:15:9:9
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chr19	16790859	.	C	T	283.69	PASS	AF=0.5;AO=27;DP=59;FAO=31;FDP=62;FR=.;FRO=31;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=8;FSRR=23;FWDB=-0.0192196;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.7053;QD=18.3027;RBI=0.134575;REFB=-0.00906991;REVB=0.133195;RO=30;SAF=13;SAR=14;SRF=8;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.204232;STB=0.585019;STBP=0.206;TYPE=snp;VARB=0.00870857;OID=.;OPOS=16790859;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:62:30:31:27:31:0.5:14:13:8:22:18:13:8:23
chr19	16855265	.	A	G	349.03	PASS	AF=0.612245;AO=29;DP=48;FAO=30;FDP=49;FR=.;FRO=19;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=-0.0124444;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.176;QD=28.492;RBI=0.012547;REFB=-0.0105797;REVB=-0.00160138;RO=19;SAF=19;SAR=10;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.210954;STB=0.604355;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.00819519;OID=.;OPOS=16855265;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:49:19:19:29:30:0.612245:10:19:7:12:11:19:7:12
chr19	16860105	.	G	A	632.26	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0165098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.929;QD=61.6838;RBI=0.0232024;REFB=0;REVB=0.0163027;RO=0;SAF=12;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.84017e-05;OID=.;OPOS=16860105;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:29:12:0:0:29:12:0:0
chr19	16899838	.	A	T	1568.52	PASS	AF=1;AO=98;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0243774;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.15;QD=64.0213;RBI=0.0409332;REFB=0;REVB=-0.0328827;RO=0;SAF=47;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.17491e-05;OID=.;OPOS=16899838;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:98:0:0:98:98:1:51:47:0:0:51:47:0:0
chr19	16926067	.	A	T	186.95	PASS	AF=0.692308;AO=17;DP=25;FAO=18;FDP=26;FR=.;FRO=8;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0112905;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=318.77;QD=28.7613;RBI=0.0118742;REFB=-0.00932693;REVB=-0.00367739;RO=8;SAF=10;SAR=7;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0518376;STB=0.535358;STBP=0.601;TYPE=snp;VARB=0.00652099;OID=.;OPOS=16926067;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:25:26:8:8:17:18:0.692308:7:10:4:4:7:11:4:4
chr19	16976286	.	A	G	727.69	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00550295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.4348;QD=63.2776;RBI=0.00771934;REFB=0;REVB=-0.00541347;RO=0;SAF=13;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.94744e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.46815e-05;OID=.;OPOS=16976286;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:33:13:0:0:33:13:0:0
chr19	17000632	.	G	A	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0213914;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.8842;QD=35.5756;RBI=0.0318163;REFB=0;REVB=0.0235517;RO=0;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00197035;OID=.;OPOS=17000632;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:4:3:0:0:4:3:0:0
chr19	17006714	.	G	A	101.88	PASS	AF=0.202381;AO=17;DP=84;FAO=17;FDP=84;FR=.;FRO=67;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=36;FSRR=31;FWDB=-0.0389067;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.6332;QD=4.85129;RBI=0.115723;REFB=-0.0121106;REVB=-0.108987;RO=60;SAF=12;SAR=5;SRF=34;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186464;STB=0.642682;STBP=0.206;TYPE=snp;VARB=0.0427465;OID=.;OPOS=17006714;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:60:67:17:17:0.202381:5:12:34:26:5:12:36:31
chr19	17006716	.	A	G	98.16	PASS	AF=0.2;AO=16;DP=74;FAO=16;FDP=80;FR=.;FRO=64;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=35;FSRR=29;FWDB=-0.0287023;FXX=0.0243873;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.4361;QD=4.90785;RBI=0.0720523;REFB=-0.0209939;REVB=-0.0660886;RO=56;SAF=11;SAR=5;SRF=33;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131818;STB=0.619051;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.0971493;OID=.;OPOS=17006716;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:74:80:56:64:16:16:0.2:5:11:33:23:5:11:35:29
chr19	17006736	.	A	G	240.82	PASS	AF=0.405797;AO=28;DP=69;FAO=28;FDP=69;FR=.;FRO=41;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=23;FSRR=18;FWDB=0.00816738;FXX=0.028165;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.656;QD=13.9603;RBI=0.0452656;REFB=-0.0458762;REVB=-0.0445227;RO=40;SAF=16;SAR=12;SRF=23;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00376795;STB=0.506325;STBP=0.937;TYPE=snp;VARB=0.0706045;OID=.;OPOS=17006736;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:40:41:28:28:0.405797:12:16:23:17:12:16:23:18
chr19	17006738	.	A	G	535.66	PASS	AF=0.685714;AO=47;DP=70;FAO=48;FDP=70;FR=.;FRO=22;FSAF=28;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=0.0458844;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.0855;QD=30.609;RBI=0.0461079;REFB=-0.0674859;REVB=0.00453446;RO=20;SAF=28;SAR=19;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0312977;STB=0.532165;STBP=0.459;TYPE=snp;VARB=0.0196469;OID=.;OPOS=17006738;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:20:22:47:48:0.685714:19:28:13:7:20:28:15:7
chr19	17006747	.	T	C	35.69	PASS	AF=0.129032;AO=10;DP=61;FAO=8;FDP=62;FR=.;FRO=54;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=27;FSRR=27;FWDB=-0.0877846;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.2677;QD=2.30282;RBI=0.140241;REFB=-0.0142792;REVB=-0.109368;RO=51;SAF=9;SAR=1;SRF=24;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.556808;STB=0.851235;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.168322;OID=.;OPOS=17006747;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:61:62:51:54:10:8:0.129032:1:9:24:27:1:7:27:27
chr19	17008578	.	G	C	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.019502;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=226.368;QD=55.0987;RBI=0.0252455;REFB=0;REVB=0.0160315;RO=0;SAF=16;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.71087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000150857;OID=.;OPOS=17008578;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:10:16:0:0:10:16:0:0
chr19	17017878	.	G	A	65.31	PASS	AF=0.375;AO=9;DP=24;FAO=9;FDP=24;FR=.;FRO=15;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.0142775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.254;QD=10.8848;RBI=0.0713587;REFB=-0.0108997;REVB=0.0699158;RO=15;SAF=1;SAR=8;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.528187;STB=0.826739;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.0348575;OID=.;OPOS=17017878;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:24:24:15:15:9:9:0.375:8:1:8:7:8:1:8:7
chr19	17025292	.	G	A	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00844417;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.968;QD=50.4134;RBI=0.00872413;REFB=0;REVB=-0.00219237;RO=0;SAF=12;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.79754e-05;OID=.;OPOS=17025292;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:7:12:0:0:7:12:0:0
chr19	17081790	.	G	A	145.55	PASS	AF=0.444444;AO=16;DP=36;FAO=16;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=14;FSAR=2;FSRF=17;FSRR=3;FWDB=0.0117425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.046;QD=16.1721;RBI=0.0171176;REFB=-0.0107737;REVB=-0.0124549;RO=20;SAF=14;SAR=2;SRF=17;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0523333;STB=0.530263;STBP=0.835;TYPE=snp;VARB=0.012945;OID=.;OPOS=17081790;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:20:20:16:16:0.444444:2:14:17:3:2:14:17:3
chr19	17111297	.	A	G	255.17	PASS	AF=0.521739;AO=24;DP=46;FAO=24;FDP=46;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=0.0402071;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.707;QD=22.1882;RBI=0.0425778;REFB=-0.00549917;REVB=-0.0140092;RO=22;SAF=10;SAR=14;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110704;STB=0.561992;STBP=0.402;TYPE=snp;VARB=0.00442801;OID=.;OPOS=17111297;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:22:22:24:24:0.521739:14:10:12:10:14:10:12:10
chr19	17170885	.	C	T	76.69	PASS	AF=0.416667;AO=10;DP=24;FAO=10;FDP=24;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=0.0100123;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.661;QD=12.7823;RBI=0.0455918;REFB=-0.0105737;REVB=0.0444788;RO=14;SAF=5;SAR=5;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.212892;STB=0.624765;STBP=0.337;TYPE=snp;VARB=0.0286151;OID=.;OPOS=17170885;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:24:24:14:14:10:10:0.416667:5:5:10:4:5:5:10:4
chr19	17273893	.	G	T	137.2	PASS	AF=0.5;AO=14;DP=29;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.0482706;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.645;QD=18.2933;RBI=0.0494293;REFB=-0.0203934;REVB=0.0106398;RO=15;SAF=5;SAR=9;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103377;STB=0.571331;STBP=0.486;TYPE=snp;VARB=0.029251;OID=.;OPOS=17273893;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:30:15:15:14:15:0.5:9:5:7:8:10:5:7:8
chr19	17303774	.	T	G	902.71	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0139467;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.048;QD=58.2393;RBI=0.0139629;REFB=0;REVB=-0.000671717;RO=0;SAF=31;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.36327e-05;OID=.;OPOS=17303774;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:31:31:0:0:31:31:0:0
chr19	17305440	.	T	C	483.34	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00314648;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.65;QD=58.5869;RBI=0.0225332;REFB=0;REVB=0.0223125;RO=0;SAF=16;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.60901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000232995;OID=.;OPOS=17305440;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:17:16:0:0:17:16:0:0
chr19	17306031	.	T	C	164.53	PASS	AF=1;AO=10;DP=15;FAO=14;FDP=14;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0290409;FXX=0.0666222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.358;QD=47.0075;RBI=0.0487965;REFB=0;REVB=0.0392138;RO=0;SAF=3;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0158632;OID=.;OPOS=17306031;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:14:0:0:10:14:1:7:3:0:0:10:4:0:0
chr19	17312992	.	C	T	556.93	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0445757;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.9005;QD=60.2081;RBI=0.0524417;REFB=0;REVB=0.027625;RO=0;SAF=20;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.71161e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000136613;OID=.;OPOS=17312992;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:17:20:0:0:17:20:0:0
chr19	17316782	.	T	C	538.52	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00517814;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=238.912;QD=59.8356;RBI=0.00729172;REFB=0;REVB=0.00513381;RO=0;SAF=15;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.21227e-05;OID=.;OPOS=17316782;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:21:15:0:0:21:15:0:0
chr19	17317955	.	A	G	780.38	PASS	AF=1;AO=54;DP=56;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.190867;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=45.6308;QD=54.7637;RBI=0.193375;REFB=0;REVB=0.031039;RO=2;SAF=28;SAR=26;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0324755;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00337255;OID=.;OPOS=17317955;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:57:2:0:54:57:1:26:28:2:0:27:30:0:0
chr19	17330060	.	T	C	1098.61	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0428673;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.9345;QD=60.1978;RBI=0.0450771;REFB=0;REVB=-0.0139407;RO=0;SAF=41;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000506255;OID=.;OPOS=17330060;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:32:41:0:0:32:41:0:0
chr19	17366278	.	T	C	557.13	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0189961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.915;QD=60.2307;RBI=0.0213548;REFB=0;REVB=0.00975567;RO=0;SAF=21;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.7558e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.09551e-05;OID=.;OPOS=17366278;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:16:21:0:0:16:21:0:0
chr19	17366313	.	C	T	135.36	PASS	AF=0.636364;AO=14;DP=23;FAO=14;FDP=22;FR=.;FRO=8;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.116838;FXX=0.0434594;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.584;QD=24.6107;RBI=0.117245;REFB=0.0267315;REVB=0.00975179;RO=8;SAF=8;SAR=6;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0355542;STB=0.519972;STBP=0.86;TYPE=snp;VARB=-0.00827925;OID=.;OPOS=17366313;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:23:22:8:8:14:14:0.636364:6:8:5:3:6:8:5:3
chr19	17405612	.	T	C	229.89	PASS	AF=0.45614;AO=26;DP=57;FAO=26;FDP=57;FR=.;FRO=31;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=0.0201735;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.739;QD=16.1323;RBI=0.0206216;REFB=-0.0170567;REVB=-0.00427539;RO=31;SAF=14;SAR=12;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0834687;STB=0.547134;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.0174942;OID=.;OPOS=17405612;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:31:31:26:26:0.45614:12:14:14:17:12:14:14:17
chr19	17412111	.	G	A	183.5	PASS	AF=0.268817;AO=25;DP=94;FAO=25;FDP=93;FR=.;FRO=68;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=51;FSRR=17;FWDB=-0.0114073;FXX=0.0210504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.3009;QD=7.89253;RBI=0.0116907;REFB=-0.016765;REVB=0.00255889;RO=68;SAF=14;SAR=11;SRF=51;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.247665;STB=0.645787;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=0.0465341;OID=.;OPOS=17412111;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:93:68:68:25:25:0.268817:11:14:51:17:11:14:51:17
chr19	17438992	.	C	T	376.35	PASS	AF=0.527778;AO=37;DP=72;FAO=38;FDP=72;FR=.;FRO=34;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=0.0211372;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.982;QD=20.9086;RBI=0.033137;REFB=-0.0250059;REVB=0.0255202;RO=35;SAF=20;SAR=17;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0978589;STB=0.540125;STBP=0.496;TYPE=snp;VARB=0.0209386;OID=.;OPOS=17438992;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:35:34:37:38:0.527778:17:20:15:20:18:20:15:19
chr19	17451981	.	G	A	1157.35	PASS	AF=0.987179;AO=77;DP=78;FAO=77;FDP=78;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0097544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.7192;QD=59.3512;RBI=0.0234378;REFB=-0.117562;REVB=0.0213116;RO=1;SAF=34;SAR=43;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.01088;STB=0.505746;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.00396591;OID=.;OPOS=17451981;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:78:78:1:1:77:77:0.987179:43:34:0:1:43:34:0:1
chr19	17463214	.	C	T	106.18	PASS	AF=0.6;AO=11;DP=19;FAO=12;FDP=20;FR=.;FRO=8;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.0707337;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.9213;QD=21.235;RBI=0.0731025;REFB=0.0344766;REVB=-0.0184589;RO=8;SAF=6;SAR=5;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124659;STB=0.583194;STBP=0.412;TYPE=snp;VARB=-0.0157082;OID=.;OPOS=17463214;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:19:20:8:8:11:12:0.6:5:6:3:5:5:7:3:5
chr19	17544244	.	C	T	181.26	PASS	AF=0.311688;AO=24;DP=77;FAO=24;FDP=77;FR=.;FRO=53;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=23;FSRR=30;FWDB=0.0179328;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=267.065;QD=9.41604;RBI=0.0179613;REFB=-0.00750608;REVB=-0.00101236;RO=53;SAF=17;SAR=7;SRF=23;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.324777;STB=0.691807;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.0154823;OID=.;OPOS=17544244;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:53:53:24:24:0.311688:7:17:23:30:7:17:23:30
chr19	17547292	.	A	G	146.63	PASS	AF=0.339286;AO=19;DP=56;FAO=19;FDP=56;FR=.;FRO=37;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=0.00770902;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.554;QD=10.4737;RBI=0.0162751;REFB=-0.00603386;REVB=-0.0143336;RO=37;SAF=10;SAR=9;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.046653;STB=0.527382;STBP=0.77;TYPE=snp;VARB=0.0175541;OID=.;OPOS=17547292;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:37:37:19:19:0.339286:9:10:21:16:9:10:21:16
chr19	17556054	.	A	G	110.7	PASS	AF=0.448276;AO=13;DP=29;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=0.0656819;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.2178;QD=15.2694;RBI=0.114725;REFB=-0.0125966;REVB=0.0940621;RO=15;SAF=8;SAR=5;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.314671;STB=0.693599;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=0.00858392;OID=.;OPOS=17556054;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:15:16:13:13:0.448276:5:8:4:11:5:8:4:12
chr19	17611490	.	T	G	82.65	PASS	AF=0.282051;AO=11;DP=40;FAO=11;FDP=39;FR=.;FRO=28;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.0344656;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.329;QD=8.47643;RBI=0.0345189;REFB=-0.000984605;REVB=0.00191685;RO=28;SAF=5;SAR=6;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0530436;STB=0.532651;STBP=0.813;TYPE=snp;VARB=0.00253772;OID=.;OPOS=17611490;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:82:40:39:28:28:11:11:0.282051:6:5:14:14:6:5:14:14
chr19	17616171	.	G	A	1226.96	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0729424;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.336;QD=61.3479;RBI=0.0785563;REFB=0;REVB=0.0291633;RO=0;SAF=39;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5078e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000546749;OID=.;OPOS=17616171;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:77:80:0:0:77:80:1:38:39:0:0:38:42:0:0
chr19	17622614	.	C	T	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0126485;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.1053;QD=33.4282;RBI=0.0955284;REFB=0;REVB=0.0946873;RO=0;SAF=3;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00816157;OID=.;OPOS=17622614;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:3:3:0:0:3:3:0:0
chr19	17628587	.	A	G	575.79	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00642551;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.13;QD=60.6096;RBI=0.00899992;REFB=0;REVB=0.0063017;RO=0;SAF=25;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.20531e-06;OID=.;OPOS=17628587;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:13:25:0:0:13:25:0:0
chr19	17648350	.	T	C	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0698892;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.661;QD=45.8061;RBI=0.0698906;REFB=0;REVB=-0.000438149;RO=0;SAF=5;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00036764;OID=.;OPOS=17648350;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:9:5:0:0:9:5:0:0
chr19	17654181	.	C	T	78.89	PASS	AF=0.34375;AO=11;DP=33;FAO=11;FDP=32;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.000556318;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.5457;QD=9.86147;RBI=0.0950043;REFB=-0.0157843;REVB=-0.0950027;RO=21;SAF=7;SAR=4;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.226644;STB=0.636116;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=0.0892569;OID=.;OPOS=17654181;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:33:32:21:21:11:11:0.34375:4:7:9:12:4:7:9:12
chr19	17660300	.	G	A	86.3	PASS	AF=0.392857;AO=11;DP=28;FAO=11;FDP=28;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=2;FWDB=-0.00137087;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.2846;QD=12.3283;RBI=0.00719763;REFB=-0.0060435;REVB=-0.00706587;RO=17;SAF=6;SAR=5;SRF=15;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.373858;STB=0.713979;STBP=0.151;TYPE=snp;VARB=0.00862025;OID=.;OPOS=17660300;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:28:28:17:17:11:11:0.392857:5:6:15:2:5:6:15:2
chr19	17692324	.	T	G	120.66	PASS	AF=0.538462;AO=10;DP=26;FAO=14;FDP=26;FR=.,HEALED;FRO=12;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=-0.0179976;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.778;QD=18.5628;RBI=0.0361837;REFB=-0.00884667;REVB=0.0313902;RO=12;SAF=6;SAR=4;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0655979;STB=0.608543;STBP=0.233;TYPE=snp;VARB=0.0188375;OID=.;OPOS=17692324;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:26:12:12:10:14:0.538462:4:6:8:4:8:6:8:4
chr19	17712711	.	C	T	44.53	PASS	AF=0.28;AO=7;DP=25;FAO=7;FDP=25;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=13;FWDB=0.0133418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.667;QD=7.12514;RBI=0.04162;REFB=0.00759834;REVB=-0.0394236;RO=18;SAF=4;SAR=3;SRF=5;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.327529;STB=0.702782;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=-0.00727683;OID=.;OPOS=17712711;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:25:25:18:18:7:7:0.28:3:4:5:13:3:4:5:13
chr19	17741047	.	A	G	125.85	PASS	AF=0.518519;AO=14;DP=27;FAO=14;FDP=27;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.010876;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=200.085;QD=18.645;RBI=0.0181268;REFB=0.0123736;REVB=-0.0145015;RO=13;SAF=8;SAR=6;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0930297;STB=0.553115;STBP=0.605;TYPE=snp;VARB=-0.0134255;OID=.;OPOS=17741047;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:13:13:14:14:0.518519:6:8:6:7:6:8:6:7
chr19	17746946	.	GAG	GG,GGA,GGG	1130.99	PASS	AF=0,0.0394737,0.960526;AO=26,3,41;DP=73;FAO=0,3,73;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=0,3,38;FSAR=0,0,35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0393974,0.0432342,0.048813;FXX=0.0129853;HRUN=1,1,1;LEN=1,2,1;MLLD=256.868,235.482,267.701;QD=59.5256;RBI=0.0463202,0.051304,0.0532619;REFB=0,0,0;REVB=0.02436,0.0276207,0.0213101;RO=0;SAF=20,3,12;SAR=6,0,29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=5.14057e-08,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,mnp,snp;VARB=0.024899,-0.0143017,0.00310736;OID=.,.,.;OPOS=17746947,17746947,17746947;OREF=A,AG,A;OALT=-,GA,G;OMAPALT=GG,GGA,GGG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	2/3:0,0.0394737,0.960526:26,3,41:73:0,3,73:76:0:0,3,38:0,0,35:0:0:6:0:20,3,12:6,0,29:0:0
chr19	17769068	.	G	A	165.15	PASS	AF=0.377358;AO=20;DP=53;FAO=20;FDP=53;FR=.;FRO=33;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=-0.00744552;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=188.934;QD=12.4641;RBI=0.00944073;REFB=-0.00919811;REVB=0.00580444;RO=33;SAF=8;SAR=12;SRF=12;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0411029;STB=0.523786;STBP=0.819;TYPE=snp;VARB=0.020841;OID=.;OPOS=17769068;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:33:33:20:20:0.377358:12:8:12:21:12:8:12:21
chr19	17777508	.	C	G	82.7	PASS	AF=0.305556;AO=11;DP=36;FAO=11;FDP=36;FR=.;FRO=25;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=-0.00740061;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.218;QD=9.18849;RBI=0.111232;REFB=-0.00258556;REVB=-0.110985;RO=25;SAF=3;SAR=8;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.252878;STB=0.65544;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=-0.000473323;OID=.;OPOS=17777508;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:82:36:36:25:25:11:11:0.305556:8:3:12:13:8:3:12:13
chr19	17885270	.	A	G	181.53	PASS	AF=0.6;AO=17;DP=30;FAO=18;FDP=30;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=2;FWDB=-0.0203823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.104;QD=24.2042;RBI=0.031591;REFB=-0.023256;REVB=0.0241362;RO=10;SAF=7;SAR=10;SRF=8;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.253176;STB=0.672479;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.0122362;OID=.;OPOS=17885270;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:30:30:10:12:17:18:0.6:10:7:8:2:11:7:10:2
chr19	17886940	.	G	A	104.6	PASS	AF=0.571429;AO=12;DP=21;FAO=12;FDP=21;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=0.00918178;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=219.071;QD=19.9235;RBI=0.012454;REFB=-0.0223191;REVB=0.00841403;RO=9;SAF=3;SAR=9;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0282836;STB=0.516103;STBP=0.917;TYPE=snp;VARB=0.0132937;OID=.;OPOS=17886940;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:21:21:9:9:12:12:0.571429:9:3:2:7:9:3:2:7
chr19	17887024	.	T	C	314.14	PASS	AF=0.658537;AO=27;DP=41;FAO=27;FDP=41;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=21;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.00290874;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=246.898;QD=30.648;RBI=0.0325207;REFB=-0.00415352;REVB=0.0323903;RO=14;SAF=6;SAR=21;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112399;STB=0.561995;STBP=0.36;TYPE=snp;VARB=0.00186692;OID=.;OPOS=17887024;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:14:14:27:27:0.658537:21:6:5:9:21:6:5:9
chr19	17892591	.	A	G	40.29	PASS	AF=0.545455;AO=6;DP=11;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=-0.0318481;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.052;QD=14.6525;RBI=0.038488;REFB=-0.0608314;REVB=0.0216108;RO=5;SAF=1;SAR=5;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0435573;STB=0.526224;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0663945;OID=.;OPOS=17892591;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:11:11:5:5:6:6:0.545455:5:1:1:4:5:1:1:4
chr19	17922795	.	G	A	171.09	PASS	AF=0.461538;AO=18;DP=39;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=6;FWDB=0.0130702;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.6109;QD=17.548;RBI=0.0568246;REFB=-0.00151473;REVB=0.0553011;RO=21;SAF=10;SAR=8;SRF=15;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155444;STB=0.588142;STBP=0.34;TYPE=snp;VARB=0.00394083;OID=.;OPOS=17922795;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:21:21:18:18:0.461538:8:10:15:6:8:10:15:6
chr19	17932138	.	T	C	62.24	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0485612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.4093;QD=35.5677;RBI=0.0727664;REFB=0;REVB=0.0541919;RO=0;SAF=2;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.27427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00835755;OID=.;OPOS=17932138;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:5:2:0:0:5:2:0:0
chr19	18123738	.	T	C	178.95	PASS	AF=0.404255;AO=19;DP=47;FAO=19;FDP=47;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=0.000217197;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=328.572;QD=15.2298;RBI=0.00026333;REFB=-0.0029196;REVB=-0.000148889;RO=28;SAF=9;SAR=10;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0271912;STB=0.515679;STBP=0.839;TYPE=snp;VARB=0.00380971;OID=.;OPOS=18123738;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:28:28:19:19:0.404255:10:9:14:14:10:9:14:14
chr19	18124184	.	C	T	90.35	PASS	AF=0.5;AO=11;DP=22;FAO=11;FDP=22;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.00936924;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.753;QD=16.4273;RBI=0.0365175;REFB=-0.0301384;REVB=0.0352951;RO=11;SAF=6;SAR=5;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0202003;OID=.;OPOS=18124184;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:22:22:11:11:11:11:0.5:5:6:6:5:5:6:6:5
chr19	18180413	.	C	G	99.17	PASS	AF=0.245902;AO=15;DP=61;FAO=15;FDP=61;FR=.;FRO=46;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=27;FWDB=0.0290665;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=50.8391;QD=6.50324;RBI=0.0490387;REFB=0.0149789;REVB=0.039496;RO=45;SAF=3;SAR=12;SRF=18;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.290102;STB=0.692629;STBP=0.137;TYPE=snp;VARB=-0.0166091;OID=.;OPOS=18180413;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:45:46:15:15:0.245902:12:3:18:27:12:3:19:27
chr19	18180451	.	A	G	101.42	PASS	AF=0.254237;AO=15;DP=59;FAO=15;FDP=59;FR=.;FRO=44;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=27;FWDB=0.0330365;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.615;QD=6.87568;RBI=0.0442571;REFB=-0.0156304;REVB=-0.0294496;RO=44;SAF=7;SAR=8;SRF=17;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0988449;STB=0.560562;STBP=0.587;TYPE=snp;VARB=0.0392828;OID=.;OPOS=18180451;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:44:44:15:15:0.254237:8:7:17:27:8:7:17:27
chr19	18186575	.	G	A	116.11	PASS	AF=0.451613;AO=12;DP=34;FAO=14;FDP=31;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.00978637;FXX=0.114253;HRUN=4;LEN=1;MLLD=149.001;QD=14.9822;RBI=0.0102102;REFB=-0.0159608;REVB=-0.00291107;RO=14;SAF=6;SAR=6;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0662048;STB=0.509421;STBP=0.944;TYPE=snp;VARB=0.0449551;OID=.;OPOS=18186575;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:31:14:17:12:14:0.451613:6:6:8:6:6:8:10:7
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chr19	18191664	.	C	G	37.14	PASS	AF=0.333333;AO=6;DP=18;FAO=6;FDP=18;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=0.0330803;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.858;QD=8.25269;RBI=0.0446956;REFB=0.00564475;REVB=0.0300565;RO=12;SAF=2;SAR=4;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104655;STB=0.565012;STBP=0.783;TYPE=snp;VARB=-0.00978876;OID=.;OPOS=18191664;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:18:18:12:12:6:6:0.333333:4:2:3:9:4:2:3:9
chr19	18234441	.	C	T	176.25	PASS	AF=0.529412;AO=18;DP=34;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.036815;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.798;QD=20.7358;RBI=0.0385966;REFB=-0.008799;REVB=0.011591;RO=16;SAF=10;SAR=8;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.046583;STB=0.526286;STBP=0.8;TYPE=snp;VARB=0.0133083;OID=.;OPOS=18234441;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:16:16:18:18:0.529412:8:10:8:8:8:10:8:8
chr19	18245512	.	C	T	111.42	PASS	AF=0.464286;AO=13;DP=28;FAO=13;FDP=28;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=-0.0175397;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.057;QD=15.9167;RBI=0.0512881;REFB=-0.0124851;REVB=0.0481957;RO=15;SAF=8;SAR=5;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0509315;STB=0.529367;STBP=0.758;TYPE=snp;VARB=0.027742;OID=.;OPOS=18245512;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:28:15:15:13:13:0.464286:5:8:10:5:5:8:10:5
chr19	18248146	.	T	C	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.026723;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.63;QD=51.1845;RBI=0.034695;REFB=0;REVB=0.0221275;RO=0;SAF=7;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000487501;OID=.;OPOS=18248146;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:13:7:0:0:13:7:0:0
chr19	18255359	.	G	A	369.59	PASS	AF=0.560606;AO=37;DP=66;FAO=37;FDP=66;FR=.;FRO=29;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=0.00927411;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.871;QD=22.3995;RBI=0.0336422;REFB=-0.0115108;REVB=0.0323386;RO=28;SAF=14;SAR=23;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119938;STB=0.500435;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00795086;OID=.;OPOS=18255359;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:28:29:37:37:0.560606:23:14:11:17:23:14:11:18
chr19	18257750	.	C	T	300.47	PASS	AF=0.553571;AO=31;DP=56;FAO=31;FDP=56;FR=.;FRO=25;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=0.022388;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=124.256;QD=21.4623;RBI=0.0237203;REFB=0.00394173;REVB=-0.00783765;RO=25;SAF=17;SAR=14;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119224;STB=0.565974;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=-0.00339895;OID=.;OPOS=18257750;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:25:25:31:31:0.553571:14:17:10:15:14:17:10:15
chr19	18273047	.	T	C	191.53	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0383437;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.14;QD=47.8828;RBI=0.0413783;REFB=0;REVB=0.0155538;RO=0;SAF=4;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33019e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000212966;OID=.;OPOS=18273047;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:16:0:0:15:16:1:11:4:0:0:11:5:0:0
chr19	18279638	.	T	C	1135.22	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0069205;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.947;QD=60.545;RBI=0.00723489;REFB=0;REVB=0.00210958;RO=0;SAF=31;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.87569e-05;OID=.;OPOS=18279638;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:44:31:0:0:44:31:0:0
chr19	18368810	.	G	T	955.73	PASS	AF=0.931507;AO=68;DP=73;FAO=68;FDP=73;FR=.;FRO=5;FSAF=35;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0186424;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.292;QD=52.3688;RBI=0.0211264;REFB=-0.0176462;REVB=0.0099391;RO=3;SAF=35;SAR=33;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.014475;STB=0.52154;STBP=0.231;TYPE=snp;VARB=0.00184849;OID=.;OPOS=18368810;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:16:73:73:3:5:68:68:0.931507:33:35:1:2:33:35:1:4
chr19	18369120	.	G	A	708.48	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0114193;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.9585;QD=62.976;RBI=0.0228738;REFB=0;REVB=0.0198195;RO=0;SAF=24;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000234813;OID=.;OPOS=18369120;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:21:24:0:0:21:24:0:0
chr19	18369644	.	G	A	223.19	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00972705;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=188.82;QD=49.5987;RBI=0.0459504;REFB=0;REVB=-0.0449091;RO=0;SAF=14;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000189333;OID=.;OPOS=18369644;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:4:14:0:0:4:14:0:0
chr19	18375608	.	G	A	854.12	PASS	AF=0.983607;AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.009386;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=291.305;QD=56.0078;RBI=0.0447765;REFB=-0.00514395;REVB=0.0437817;RO=0;SAF=47;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.518512;STBP=0.116;TYPE=snp;VARB=5.28933e-05;OID=.;OPOS=18375608;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:61:61:0:1:60:60:0.983607:13:47:0:0:13:47:0:1
chr19	18375815	.	G	A	1048.74	PASS	AF=1;AO=69;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0117779;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.304;QD=59.9281;RBI=0.023322;REFB=0;REVB=0.0201295;RO=0;SAF=31;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000337932;OID=.;OPOS=18375815;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:69:70:1:38:31:0:0:39:31:0:0
chr19	18375846	.	G	A	658.5	PASS	AF=0.93617;AO=44;DP=47;FAO=44;FDP=47;FR=.;FRO=3;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0521601;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=270.286;QD=56.0426;RBI=0.0574334;REFB=0.00361258;REVB=0.0240399;RO=3;SAF=21;SAR=23;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0574229;STB=0.530598;STBP=0.127;TYPE=snp;VARB=-9.69073e-05;OID=.;OPOS=18375846;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:47:47:3:3:44:44:0.93617:23:21:0:3:23:21:0:3
chr19	18375882	.	G	C	464.74	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148746;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.0706;QD=58.0921;RBI=0.0646499;REFB=0;REVB=0.0629155;RO=0;SAF=19;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00169863;OID=.;OPOS=18375882;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:13:19:0:0:13:19:0:0
chr19	18376407	.	T	A	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0149881;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.44;QD=50.4135;RBI=0.0218648;REFB=0;REVB=0.0159194;RO=0;SAF=15;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.00629e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.41646e-06;OID=.;OPOS=18376407;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:4:15:0:0:4:15:0:0
chr19	18376517	.	C	T	346.42	PASS	AF=0.962963;AO=24;DP=24;FAO=26;FDP=27;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.004608;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=307.831;QD=51.3222;RBI=0.0121329;REFB=-0.0111122;REVB=0.0112238;RO=0;SAF=8;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.529389;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=2.0881e-05;OID=.;OPOS=18376517;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:24:27:0:1:24:26:0.962963:16:8:0:0:18:8:1:0
chr19	18376522	.	T	G	358.45	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00719351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.932;QD=55.1465;RBI=0.0072364;REFB=0;REVB=-0.000786715;RO=0;SAF=8;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.2187e-06;OID=.;OPOS=18376522;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:26:0:0:25:26:1:17:8:0:0:17:9:0:0
chr19	18377274	.	A	G	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00829238;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.732;QD=44.6896;RBI=0.00829238;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=13;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000182049;OID=.;OPOS=18377274;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:0:13:0:0:0:13:0:0
chr19	18377496	.	C	G	666.58	PASS	AF=1;AO=41;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.031241;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.8693;QD=62.0074;RBI=0.0464553;REFB=0;REVB=0.0343816;RO=0;SAF=19;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000837194;OID=.;OPOS=18377496;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:43:0:0:41:43:1:22:19:0:0:23:20:0:0
chr19	18377761	.	A	G	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.145492;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.357;QD=43.4854;RBI=0.150026;REFB=0;REVB=0.036604;RO=0;SAF=4;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00142152;OID=.;OPOS=18377761;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:8:4:0:0:8:4:0:0
chr19	18378219	.	A	G	727.8	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0138365;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.092;QD=63.2868;RBI=0.0140718;REFB=0;REVB=0.00256241;RO=0;SAF=20;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.27705e-05;OID=.;OPOS=18378219;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:26:20:0:0:26:20:0:0
chr19	18444360	.	T	G	74.96	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0206268;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.4926;QD=37.4818;RBI=0.0239485;REFB=0;REVB=-0.0121683;RO=0;SAF=5;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00157044;OID=.;OPOS=18444360;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:3:5:0:0:3:5:0:0
chr19	18497024	.	G	C	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00122623;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=271.712;QD=51.1844;RBI=0.104405;REFB=0;REVB=-0.104398;RO=0;SAF=16;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000452374;OID=.;OPOS=18497024;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:4:16:0:0:4:16:0:0
chr19	18497141	.	T	A	275.86	PASS	AF=0.685714;AO=24;DP=36;FAO=24;FDP=35;FR=.;FRO=11;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=0.0192243;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.1344;QD=31.5268;RBI=0.0196288;REFB=-0.00600199;REVB=-0.00396449;RO=11;SAF=9;SAR=15;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0636069;STB=0.534855;STBP=0.572;TYPE=snp;VARB=0.00245312;OID=.;OPOS=18497141;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:36:35:11:11:24:24:0.685714:15:9:3:8:15:9:3:8
chr19	18499238	.	G	T	125.81	PASS	AF=0.518519;AO=14;DP=27;FAO=14;FDP=27;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=0.0549364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.6101;QD=18.6383;RBI=0.0575033;REFB=-0.0104735;REVB=-0.016989;RO=13;SAF=3;SAR=11;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10776;STB=0.56195;STBP=0.557;TYPE=snp;VARB=0.0112246;OID=.;OPOS=18499238;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:13:13:14:14:0.518519:11:3:4:9:11:3:4:9
chr19	18499422	.	C	G	33.62	PASS	AF=0.714286;AO=4;DP=6;FAO=5;FDP=7;FR=.;FRO=2;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00482778;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.173;QD=19.209;RBI=0.0193332;REFB=-0.104394;REVB=-0.0187207;RO=2;SAF=3;SAR=1;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.210252;STB=0.59965;STBP=0.693;TYPE=snp;VARB=0.00787791;OID=.;OPOS=18499422;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:6:7:2:2:4:5:0.714286:1:3:2:0:1:4:2:0
chr19	18502835	.	G	A	729.01	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000779093;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=192.452;QD=57.1775;RBI=0.00842738;REFB=0;REVB=0.00839129;RO=0;SAF=32;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.2152e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.13132e-05;OID=.;OPOS=18502835;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:19:32:0:0:19:32:0:0
chr19	18675702	.	A	G	125.45	PASS	AF=0.303571;AO=17;DP=56;FAO=17;FDP=56;FR=.;FRO=39;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=-0.00811785;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.198;QD=8.9606;RBI=0.00910478;REFB=-0.00862878;REVB=0.0041228;RO=39;SAF=12;SAR=5;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.318184;STB=0.690604;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.0256335;OID=.;OPOS=18675702;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:39:39:17:17:0.303571:5:12:17:22:5:12:17:22
chr19	18679379	.	C	G	465.51	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.100849;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.8437;QD=58.1892;RBI=0.122911;REFB=0;REVB=0.0702615;RO=0;SAF=17;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00347644;OID=.;OPOS=18679379;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:32:0:0:31:32:1:14:17:0:0:15:17:0:0
chr19	18684563	.	C	T	198.42	PASS	AF=0.944444;AO=17;DP=18;FAO=17;FDP=18;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=9.56116e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=226.938;QD=44.0922;RBI=0.0342191;REFB=0.0111384;REVB=-0.0342189;RO=1;SAF=11;SAR=6;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0398535;STB=0.521714;STBP=0.626;TYPE=snp;VARB=-0.001365;OID=.;OPOS=18684563;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:18:18:1:1:17:17:0.944444:6:11:1:0:6:11:1:0
chr19	18700047	.	A	G	477.32	PASS	AF=0.971429;AO=33;DP=35;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0122972;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=243.804;QD=54.5504;RBI=0.0448877;REFB=-0.109539;REVB=-0.0431704;RO=0;SAF=20;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.82173e-08;STB=0.512188;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.000271075;OID=.;OPOS=18700047;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:35:35:0:1:33:34:0.971429:13:20:0:0:14:20:1:0
chr19	18710535	.	G	A	487.06	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0044208;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.4858;QD=59.0375;RBI=0.0434375;REFB=0;REVB=0.043212;RO=0;SAF=19;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.71297e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00139817;OID=.;OPOS=18710535;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:14:19:0:0:14:19:0:0
chr19	18726856	.	T	C	894.3	PASS	AF=0.969231;AO=63;DP=65;FAO=63;FDP=65;FR=.;FRO=2;FSAF=28;FSAR=35;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.015152;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.261;QD=55.0337;RBI=0.0240826;REFB=-0.0112965;REVB=0.0187186;RO=2;SAF=28;SAR=35;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0325365;STB=0.517236;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.000811427;OID=.;OPOS=18726856;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:65:65:2:2:63:63:0.969231:35:28:2:0:35:28:2:0
chr19	18775077	.	C	T	770.04	PASS	AF=0.513889;AO=74;DP=145;FAO=74;FDP=144;FR=.;FRO=70;FSAF=38;FSAR=36;FSRF=33;FSRR=37;FWDB=0.0241313;FXX=0.00689608;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.4043;QD=21.3899;RBI=0.0241335;REFB=-0.0152798;REVB=0.000327399;RO=67;SAF=38;SAR=36;SRF=30;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0568864;STB=0.520445;STBP=0.618;TYPE=snp;VARB=0.0166104;OID=.;OPOS=18775077;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:145:144:67:70:74:74:0.513889:36:38:30:37:36:38:33:37
chr19	18794623	.	G	A	464.11	PASS	AF=0.463636;AO=50;DP=109;FAO=51;FDP=110;FR=.;FRO=59;FSAF=23;FSAR=28;FSRF=31;FSRR=28;FWDB=-0.0291515;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.7702;QD=16.8767;RBI=0.0608827;REFB=-0.0134406;REVB=0.0534499;RO=59;SAF=23;SAR=27;SRF=31;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0635433;STB=0.539984;STBP=0.447;TYPE=snp;VARB=0.0178718;OID=.;OPOS=18794623;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:110:59:59:50:51:0.463636:27:23:31:28:28:23:31:28
chr19	19040312	.	G	C	95.33	PASS	AF=0.909091;AO=10;DP=11;FAO=10;FDP=11;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0800296;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.2424;QD=34.6649;RBI=0.0809456;REFB=0.0671165;REVB=0.0121427;RO=1;SAF=3;SAR=7;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0596689;STB=0.533268;STBP=0.621;TYPE=snp;VARB=-0.01584;OID=.;OPOS=19040312;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:11:11:1:1:10:10:0.909091:7:3:0:1:7:3:0:1
chr19	19042183	.	CGGGGC	CGGG,CGGGC,CGGGG	38.99	PASS	AF=0.375,0,0;AO=3,4,2;DP=18;FAO=6,0,0;FDP=16;FR=.;FRO=10;FSAF=1,0,0;FSAR=5,0,0;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=-0.074825,0.148112,-0.323209;FXX=0.111049;HRUN=4,4,6;LEN=2,1,1;MLLD=18.0535,10.4359,8.36569;QD=9.74763;RBI=0.0863311,0.157021,0.354163;REFB=-0.105996,-0.106884,-0.0899121;REVB=0.0430612,-0.0521382,0.144803;RO=6;SAF=0,0,2;SAR=3,4,0;SRF=2;SRR=4;SSEN=0.509542,0.509542,0.515152;SSEP=0,0,0.484848;SSSB=-0.637446,-0.684163,0.658493;STB=0.693701,0.5,0.5;STBP=0.28,1,1;TYPE=del,del,del;VARB=0.140252,0.0545706,0;OID=.,.,.;OPOS=19042187,19042184,19042188;OREF=GC,G,C;OALT=-,-,-;OMAPALT=CGGG,CGGGC,CGGGG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.375,0,0:3,4,2:18:6,0,0:16:10:1,0,0:5,0,0:4:6:31:6:0,0,2:3,4,0:2:4
chr19	19049198	.	G	A	206.96	PASS	AF=0.4375;AO=21;DP=48;FAO=21;FDP=48;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=-0.0480104;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.846;QD=17.2469;RBI=0.0494308;REFB=-0.0257098;REVB=-0.0117644;RO=27;SAF=12;SAR=9;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.052726;STB=0.530092;STBP=0.733;TYPE=snp;VARB=0.0242496;OID=.;OPOS=19049198;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:27:27:21:21:0.4375:9:12:14:13:9:12:14:13
chr19	19136541	.	C	T	363.32	PASS	AF=1;AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000470867;FXX=0.0370233;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.637;QD=55.8946;RBI=0.0266866;REFB=0;REVB=-0.0266825;RO=0;SAF=14;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.0415e-05;OID=.;OPOS=19136541;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:26:0:0:26:26:1:12:14:0:0:12:14:0:0
chr19	19230868	.	A	G	1586.9	PASS	AF=1;AO=104;DP=104;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0385615;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.044;QD=59.3234;RBI=0.0433477;REFB=0;REVB=0.0197998;RO=0;SAF=54;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.93321e-05;OID=.;OPOS=19230868;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:104:107:0:0:104:107:1:50:54:0:0:53:54:0:0
chr19	19243175	.	C	T	93.32	PASS	AF=0.578947;AO=11;DP=19;FAO=11;FDP=19;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.00351253;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.023;QD=19.646;RBI=0.00426255;REFB=-0.0176798;REVB=0.00241483;RO=8;SAF=6;SAR=5;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0335209;STB=0.519196;STBP=0.951;TYPE=snp;VARB=0.0260467;OID=.;OPOS=19243175;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:19:19:8:8:11:11:0.578947:5:6:4:4:5:6:4:4
chr19	19267864	.	C	T	71.65	PASS	AF=0.6;AO=9;DP=15;FAO=9;FDP=15;FR=.;FRO=6;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0285793;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.513;QD=19.1066;RBI=0.0503854;REFB=-0.0395338;REVB=-0.0414959;RO=6;SAF=6;SAR=3;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122922;STB=0.571265;STBP=0.539;TYPE=snp;VARB=0.0397097;OID=.;OPOS=19267864;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:15:15:6:6:9:9:0.6:3:6:3:3:3:6:3:3
chr19	19267910	.	G	A	49.57	PASS	AF=0.411765;AO=7;DP=18;FAO=7;FDP=17;FR=.;FRO=10;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.0284923;FXX=0.0555247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.758;QD=11.6646;RBI=0.0531611;REFB=-0.027372;REVB=0.0448808;RO=10;SAF=2;SAR=5;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.22218;STB=0.635955;STBP=0.405;TYPE=snp;VARB=0.0314442;OID=.;OPOS=19267910;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:49:18:17:10:10:7:7:0.411765:5:2:5:5:5:2:5:5
chr19	19312496	.	C	G	72.89	PASS	AF=0.642857;AO=9;DP=14;FAO=9;FDP=14;FR=.;FRO=5;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0793059;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.8866;QD=20.8269;RBI=0.0860785;REFB=0.0355223;REVB=-0.0334676;RO=5;SAF=7;SAR=2;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.275108;STB=0.659987;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=-0.00717377;OID=.;OPOS=19312496;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:14:14:5:5:9:9:0.642857:2:7:2:3:2:7:2:3
chr19	19380996	.	G	T	154.96	PASS	AF=0.592593;AO=16;DP=27;FAO=16;FDP=27;FR=.;FRO=11;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.0785092;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.489;QD=22.957;RBI=0.0792798;REFB=-0.0296789;REVB=0.0110268;RO=11;SAF=9;SAR=7;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143451;STB=0.580545;STBP=0.362;TYPE=snp;VARB=0.0189784;OID=.;OPOS=19380996;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:27:27:11:11:16:16:0.592593:7:9:4:7:7:9:4:7
chr19	19446936	.	G	A	381.43	PASS	AF=0.558824;AO=38;DP=68;FAO=38;FDP=68;FR=.;FRO=30;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=22;FSRR=8;FWDB=-0.030168;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.453;QD=22.437;RBI=0.032717;REFB=-0.0252596;REVB=-0.0126607;RO=30;SAF=18;SAR=20;SRF=22;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.206656;STB=0.61344;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.0251412;OID=.;OPOS=19446936;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:30:30:38:38:0.558824:20:18:22:8:20:18:22:8
chr19	19449686	.	G	T	523.91	PASS	AF=0.661972;AO=47;DP=71;FAO=47;FDP=71;FR=.;FRO=24;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.0166127;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.383;QD=29.5161;RBI=0.0166636;REFB=-0.00819785;REVB=-0.00130141;RO=24;SAF=26;SAR=21;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.085123;STB=0.546199;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=0.00358085;OID=.;OPOS=19449686;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:24:24:47:47:0.661972:21:26:10:14:21:26:10:14
chr19	19466885	.	C	T	175.15	PASS	AF=0.514286;AO=18;DP=35;FAO=18;FDP=35;FR=.;FRO=17;FSAF=2;FSAR=16;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=0.106803;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.037;QD=20.0172;RBI=0.108055;REFB=0.00342208;REVB=-0.0164001;RO=17;SAF=2;SAR=16;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.287743;STB=0.666444;STBP=0.148;TYPE=snp;VARB=-0.00110576;OID=.;OPOS=19466885;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:17:17:18:18:0.514286:16:2:5:12:16:2:5:12
chr19	19467085	.	G	C	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00188053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.59;QD=40.7629;RBI=0.00659756;REFB=0;REVB=-0.00632388;RO=0;SAF=6;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.63627e-05;OID=.;OPOS=19467085;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:4:6:0:0:4:6:0:0
chr19	19467937	.	T	C	78.57	PASS	AF=0.4;AO=10;DP=26;FAO=10;FDP=25;FR=.;FRO=15;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=-0.0425669;FXX=0.0384468;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.293;QD=12.5712;RBI=0.0429806;REFB=-0.0132372;REVB=-0.00594941;RO=15;SAF=3;SAR=7;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.306545;STB=0.682555;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.0100254;OID=.;OPOS=19467937;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:26:25:15:15:10:10:0.4:7:3:9:6:7:3:9:6
chr19	19467996	.	T	A	48.86	PASS	AF=0.5;AO=7;DP=14;FAO=7;FDP=14;FR=.;FRO=7;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.0320372;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.0219;QD=13.9613;RBI=0.0896593;REFB=-0.0507845;REVB=-0.0837402;RO=7;SAF=6;SAR=1;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.439386;STB=0.768342;STBP=0.11;TYPE=snp;VARB=0.0458223;OID=.;OPOS=19467996;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:14:14:7:7:7:7:0.5:1:6:3:4:1:6:3:4
chr19	19468710	.	C	G	99.95	PASS	AF=0.387097;AO=12;DP=31;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.00786661;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.441;QD=12.8966;RBI=0.00918456;REFB=-0.0103778;REVB=-0.00474052;RO=19;SAF=4;SAR=8;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153067;STB=0.590753;STBP=0.413;TYPE=snp;VARB=0.0116966;OID=.;OPOS=19468710;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:19:19:12:12:0.387097:8:4:9:10:8:4:9:10
chr19	19468734	.	G	A	98.55	PASS	AF=0.428571;AO=12;DP=28;FAO=12;FDP=28;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.00200366;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.057;QD=14.0792;RBI=0.00613986;REFB=-0.0144433;REVB=-0.00580372;RO=16;SAF=4;SAR=8;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109071;STB=0.563993;STBP=0.577;TYPE=snp;VARB=0.0178112;OID=.;OPOS=19468734;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:28:28:16:16:12:12:0.428571:8:4:7:9:8:4:7:9
chr19	19606634	.	G	A	205.58	PASS	AF=0.446809;AO=20;DP=45;FAO=21;FDP=47;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.0113281;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.3056;QD=17.4957;RBI=0.0131252;REFB=-0.00150883;REVB=-0.00662898;RO=25;SAF=8;SAR=12;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1182;STB=0.567502;STBP=0.44;TYPE=snp;VARB=0.00407112;OID=.;OPOS=19606634;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:47:25:26:20:21:0.446809:12:8:13:12:13:8:13:13
chr19	19625547	.	A	G	227.17	PASS	AF=0.4;AO=22;DP=62;FAO=28;FDP=70;FR=.;FRO=42;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=0.000826393;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.22;QD=12.981;RBI=0.00311286;REFB=-0.0193331;REVB=0.00300116;RO=39;SAF=11;SAR=11;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0141023;STB=0.521457;STBP=0.773;TYPE=snp;VARB=0.0146276;OID=.;OPOS=19625547;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:70:39:42:22:28:0.4:11:11:20:19:15:13:21:21
chr19	19735257	.	G	T	306.33	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0267213;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=245.002;QD=53.2753;RBI=0.0279819;REFB=0;REVB=0.00830436;RO=0;SAF=3;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000128178;OID=.;OPOS=19735257;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:20:3:0:0:20:3:0:0
chr19	19855654	.	C	T	70.49	PASS	AF=0.25;AO=10;DP=40;FAO=10;FDP=40;FR=.;FRO=30;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=0.0250518;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.278;QD=7.04947;RBI=0.0329997;REFB=-0.00854735;REVB=-0.0214799;RO=30;SAF=5;SAR=5;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0794745;STB=0.549901;STBP=0.769;TYPE=snp;VARB=0.0183139;OID=.;OPOS=19855654;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:70:40:40:30:30:10:10:0.25:5:5:17:13:5:5:17:13
chr19	19910250	.	T	C	277.54	PASS	AF=0.5;AO=30;DP=60;FAO=30;FDP=60;FR=.;FRO=30;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=-0.0100526;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=95.8486;QD=18.5026;RBI=0.0140166;REFB=0.0108542;REVB=-0.0097678;RO=30;SAF=19;SAR=11;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123457;STB=0.569077;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=-0.0110544;OID=.;OPOS=19910250;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:30:30:30:30:0.5:11:19:15:15:11:19:15:15
chr19	20150125	.	T	C	145.94	PASS	AF=0.470588;AO=14;DP=32;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.0399122;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.076;QD=17.1691;RBI=0.0408769;REFB=-0.0123738;REVB=-0.00882818;RO=17;SAF=8;SAR=6;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0960359;STB=0.596892;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.0161062;OID=.;OPOS=20150125;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:34:17:18:14:16:0.470588:6:8:8:9:6:10:8:10
chr19	20150175	.	G	C	98.55	PASS	AF=0.428571;AO=12;DP=28;FAO=12;FDP=28;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=-0.00226459;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.3;QD=14.0787;RBI=0.0107175;REFB=-0.0152958;REVB=0.0104755;RO=16;SAF=5;SAR=7;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107329;STB=0.562399;STBP=0.629;TYPE=snp;VARB=0.0210856;OID=.;OPOS=20150175;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:28:28:16:16:12:12:0.428571:7:5:5:11:7:5:5:11
chr19	20229486	.	G	A	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0327745;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.795;QD=52.6132;RBI=0.0369214;REFB=0;REVB=-0.0170006;RO=0;SAF=12;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.20473e-05;OID=.;OPOS=20229486;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:10:12:0:0:10:12:0:0
chr19	20369503	.	C	G	2102.22	PASS	AF=1;AO=134;DP=134;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0137497;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.6933;QD=62.7528;RBI=0.0167487;REFB=0;REVB=-0.0095637;RO=0;SAF=67;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.5529e-06;OID=.;OPOS=20369503;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:134:134:0:0:134:134:1:67:67:0:0:67:67:0:0
chr19	20808149	.	A	G	708.26	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0369903;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.119;QD=62.9561;RBI=0.0559978;REFB=0;REVB=0.0420414;RO=0;SAF=19;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.15971e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000406667;OID=.;OPOS=20808149;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:26:19:0:0:26:19:0:0
chr19	21299774	.	T	TATA	76.4	PASS	AF=0.75;AO=9;DP=12;FAO=9;FDP=12;FR=.;FRO=3;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0285226;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=260.199;QD=25.4671;RBI=0.0315572;REFB=0.038592;REVB=-0.0135025;RO=3;SAF=2;SAR=7;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.372544;STB=0.713774;STBP=0.033;TYPE=ins;VARB=-0.00447711;OID=.;OPOS=21299775;OREF=-;OALT=ATA;OMAPALT=TATA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.75:9:12:9:12:3:2:7:3:0:15:3:2:7:3:0
chr19	21300462	.	A	G	393.13	PASS	AF=1;AO=27;DP=30;FAO=28;FDP=28;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00602878;FXX=0.0344709;HRUN=4;LEN=1;MLLD=195.101;QD=56.1619;RBI=0.0076328;REFB=0;REVB=-0.00468118;RO=0;SAF=17;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000309047;OID=.;OPOS=21300462;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:28:0:0:27:28:1:10:17:0:0:10:18:0:0
chr19	21477431	.	T	C	700.49	PASS	AF=0.913793;AO=53;DP=58;FAO=53;FDP=58;FR=.;FRO=5;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0215168;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=196.915;QD=48.3097;RBI=0.0261201;REFB=-0.216907;REVB=0.0148084;RO=2;SAF=25;SAR=28;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0324675;STB=0.506203;STBP=0.779;TYPE=snp;VARB=0.00243979;OID=.;OPOS=21477431;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:19:58:58:2:5:53:53:0.913793:28:25:0:2:28:25:2:3
chr19	21492062	.	G	A	483.34	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0164667;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.35;QD=58.587;RBI=0.0920824;REFB=0;REVB=0.0905981;RO=0;SAF=24;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000599455;OID=.;OPOS=21492062;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:9:24:0:0:9:24:0:0
chr19	21544571	.	G	A	1115.09	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156088;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.499;QD=60.2751;RBI=0.0192312;REFB=0;REVB=0.0112341;RO=0;SAF=38;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.90268e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.74748e-05;OID=.;OPOS=21544571;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:74:0:0:73:74:1:35:38:0:0:35:39:0:0
chr19	21606429	.	G	T	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0105249;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.974;QD=51.9167;RBI=0.0230874;REFB=0;REVB=-0.0205488;RO=0;SAF=10;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.14406e-05;OID=.;OPOS=21606429;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:11:10:0:0:11:10:0:0
chr19	21609743	.	G	A	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00578364;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.305;QD=44.6879;RBI=0.0108019;REFB=0;REVB=0.00912302;RO=0;SAF=3;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.73475e-05;OID=.;OPOS=21609743;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:10:3:0:0:10:3:0:0
chr19	21688602	.	C	G	698.59	PASS	AF=0.980392;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0554558;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=154.034;QD=54.7909;RBI=0.0574255;REFB=-0.0841125;REVB=0.0149109;RO=0;SAF=14;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.517234;STBP=0.173;TYPE=snp;VARB=0.000247608;OID=.;OPOS=21688602;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:51:51:0:1:50:50:0.980392:36:14:0:0:36:14:1:0
chr19	21719401	.	T	C	296.38	PASS	AF=0.958333;AO=22;DP=23;FAO=23;FDP=24;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.021693;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=216.436;QD=49.3973;RBI=0.0224458;REFB=-0.0960923;REVB=-0.00576446;RO=1;SAF=9;SAR=13;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0486023;STB=0.523789;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=0.00125912;OID=.;OPOS=21719401;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:23:24:1:1:22:23:0.958333:13:9:1:0:13:10:1:0
chr19	21909948	.	G	A	600.79	PASS	AF=0.97561;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0359481;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.2231;QD=58.6138;RBI=0.0469281;REFB=0.146425;REVB=0.0301659;RO=1;SAF=21;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0240441;STB=0.512814;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=-0.00273414;OID=.;OPOS=21909948;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:41:41:1:1:40:40:0.97561:19:21:0:1:19:21:0:1
chr19	22115982	.	A	G	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0342772;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.92;QD=46.8473;RBI=0.0959824;REFB=0;REVB=0.0896532;RO=0;SAF=1;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00255074;OID=.;OPOS=22115982;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:14:1:0:0:14:1:0:0
chr19	22156585	.	G	T	213.69	PASS	AF=0.947368;AO=18;DP=19;FAO=18;FDP=19;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.111813;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.157;QD=44.9863;RBI=0.114075;REFB=-0.0727468;REVB=0.022602;RO=0;SAF=13;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.545402;STBP=0.173;TYPE=snp;VARB=0.0137942;OID=.;OPOS=22156585;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:19:19:0:1:18:18:0.947368:5:13:0:0:5:13:0:1
chr19	22363826	.	G	C	129.47	PASS	AF=0.8125;AO=13;DP=16;FAO=13;FDP=16;FR=.;FRO=3;FSAF=1;FSAR=12;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.056548;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.909;QD=32.3676;RBI=0.0579321;REFB=-0.0143995;REVB=0.0125879;RO=3;SAF=1;SAR=12;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.409514;STB=0.734224;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.00502229;OID=.;OPOS=22363826;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:16:16:3:3:13:13:0.8125:12:1:2:1:12:1:2:1
chr19	22363844	.	G	A	52.92	PASS	AF=0.7;AO=7;DP=10;FAO=7;FDP=10;FR=.;FRO=3;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.00838055;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.262;QD=21.1692;RBI=0.0362969;REFB=-0.0307895;REVB=0.0353162;RO=3;SAF=1;SAR=6;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.368547;STB=0.719257;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=0.00598666;OID=.;OPOS=22363844;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:10:10:3:3:7:7:0.7:6:1:2:1:6:1:2:1
chr19	22375868	.	C	T	1035.2	PASS	AF=0.948052;AO=69;DP=73;FAO=73;FDP=77;FR=.;FRO=4;FSAF=34;FSAR=39;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0320561;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.351;QD=53.7766;RBI=0.0339339;REFB=0.00557296;REVB=0.0111316;RO=3;SAF=31;SAR=38;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00922706;STB=0.501786;STBP=0.903;TYPE=snp;VARB=-0.00400214;OID=.;OPOS=22375868;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:73:77:3:4:69:73:0.948052:38:31:1:2:39:34:2:2
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chr19	22868896	.	A	T	46.35	PASS	AF=0.368421;AO=7;DP=18;FAO=7;FDP=19;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=0.042048;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.9515;QD=9.75792;RBI=0.138537;REFB=-0.00515058;REVB=-0.132002;RO=11;SAF=5;SAR=2;SRF=9;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138499;STB=0.528223;STBP=0.884;TYPE=snp;VARB=0.000604761;OID=.;OPOS=22868896;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:18:19:11:12:7:7:0.368421:2:5:9:2:2:5:9:3
chr19	22868965	.	T	C	64.87	PASS	AF=0.36;AO=9;DP=25;FAO=9;FDP=25;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=-0.0108581;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.599;QD=10.3786;RBI=0.0696425;REFB=0.00412244;REVB=0.0687908;RO=16;SAF=6;SAR=3;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104147;STB=0.562369;STBP=0.697;TYPE=snp;VARB=-0.00681118;OID=.;OPOS=22868965;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:25:25:16:16:9:9:0.36:3:6:12:4:3:6:12:4
chr19	22937148	.	G	A	63.7	PASS	AF=0.321429;AO=9;DP=28;FAO=9;FDP=28;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=-0.0110443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.345;QD=9.10015;RBI=0.0163056;REFB=-0.00573034;REVB=0.0119957;RO=19;SAF=6;SAR=3;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0427526;STB=0.526256;STBP=0.877;TYPE=snp;VARB=0.0106046;OID=.;OPOS=22937148;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:28:28:19:19:9:9:0.321429:3:6:12:7:3:6:12:7
chr19	22941191	.	T	A	64.35	PASS	AF=0.727273;AO=8;DP=11;FAO=8;FDP=11;FR=.;FRO=3;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0138056;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=285.529;QD=23.3999;RBI=0.0240352;REFB=-0.0518092;REVB=-0.0196748;RO=3;SAF=2;SAR=6;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0509198;STB=0.529336;STBP=0.877;TYPE=snp;VARB=0.019712;OID=.;OPOS=22941191;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:11:11:3:3:8:8:0.727273:6:2:1:2:6:2:1:2
chr19	23159486	.	T	C	135.18	PASS	AF=0.46875;AO=15;DP=32;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=-0.00582853;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.595;QD=16.898;RBI=0.017679;REFB=-0.0232058;REVB=0.0166905;RO=16;SAF=3;SAR=12;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.207948;STB=0.610008;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.0293044;OID=.;OPOS=23159486;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:16:17:15:15:0.46875:12:3:6:10:12:3:6:11
chr19	23316947	.	C	T	118.32	PASS	AF=0.378378;AO=14;DP=37;FAO=14;FDP=37;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=0.0014057;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.575;QD=12.7916;RBI=0.0273744;REFB=0.000606953;REVB=-0.0273383;RO=22;SAF=8;SAR=6;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.25965;STB=0.636176;STBP=0.213;TYPE=snp;VARB=-0.000910108;OID=.;OPOS=23316947;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:22:23:14:14:0.378378:6:8:7:15:6:8:8:15
chr19	23328940	.	G	A	134.24	PASS	AF=0.454545;AO=15;DP=33;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.00754674;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=238.807;QD=16.2717;RBI=0.00858239;REFB=-0.0118333;REVB=-0.00408707;RO=18;SAF=7;SAR=8;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0745182;STB=0.542801;STBP=0.655;TYPE=snp;VARB=0.0122984;OID=.;OPOS=23328940;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:18:18:15:15:0.454545:8:7:7:11:8:7:7:11
chr19	23406165	.	T	C	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0281638;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.119;QD=35.5755;RBI=0.028774;REFB=0;REVB=0.00589413;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000403786;OID=.;OPOS=23406165;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:3:4:0:0:3:4:0:0
chr19	23542290	.	AG	GC	82.33	PASS	AF=0.297297;AO=11;DP=36;FAO=11;FDP=37;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=0.00894142;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=143.82;QD=8.90045;RBI=0.0248983;REFB=-0.00782347;REVB=-0.0232374;RO=25;SAF=7;SAR=4;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.265869;STB=0.672771;STBP=0.177;TYPE=mnp;VARB=0.0247131;OID=.;OPOS=23542290;OREF=AG;OALT=GC;OMAPALT=GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:82:36:37:25:26:11:11:0.297297:4:7:10:15:4:7:10:16
chr19	23542697	.	G	C	48.86	PASS	AF=0.5;AO=7;DP=14;FAO=7;FDP=14;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.0189241;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.087;QD=13.9591;RBI=0.0191639;REFB=0.0159027;REVB=0.00302187;RO=7;SAF=5;SAR=2;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.252798;STB=0.65172;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=-0.0153432;OID=.;OPOS=23542697;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:14:14:7:7:7:7:0.5:2:5:3:4:2:5:3:4
chr19	23543095	.	T	C	159.11	PASS	AF=0.45;AO=17;DP=39;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.0102785;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.416;QD=15.9105;RBI=0.023801;REFB=-0.00817772;REVB=0.0214672;RO=22;SAF=7;SAR=10;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131602;STB=0.586981;STBP=0.346;TYPE=snp;VARB=0.01068;OID=.;OPOS=23543095;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:40:22:22:17:18:0.45:10:7:12:10:11:7:12:10
chr19	23545004	.	G	A	61.38	PASS	AF=0.615385;AO=8;DP=13;FAO=8;FDP=13;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.000382802;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=308.941;QD=18.8866;RBI=0.00144122;REFB=-0.00685744;REVB=0.00138945;RO=5;SAF=4;SAR=4;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0661115;STB=0.538366;STBP=0.77;TYPE=snp;VARB=0.00293868;OID=.;OPOS=23545004;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:13:13:5:5:8:8:0.615385:4:4:2:3:4:4:2:3
chr19	23545447	.	A	G	122.75	PASS	AF=0.378378;AO=14;DP=37;FAO=14;FDP=37;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.0728783;FXX=0.0512689;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.8779;QD=13.2697;RBI=0.0778063;REFB=-0.00636316;REVB=-0.0272502;RO=23;SAF=7;SAR=7;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0229769;STB=0.513494;STBP=0.935;TYPE=snp;VARB=0.00707712;OID=.;OPOS=23545447;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:23:23:14:14:0.378378:7:7:12:11:7:7:12:11
chr19	23837195	.	T	C	613.36	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.035907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.376;QD=61.3364;RBI=0.0410549;REFB=0;REVB=0.0199045;RO=0;SAF=19;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000234495;OID=.;OPOS=23837195;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:21:19:0:0:21:19:0:0
chr19	23837365	.	A	C	323.46	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00239508;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.5102;QD=53.9105;RBI=0.0197369;REFB=0;REVB=-0.0195911;RO=0;SAF=14;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000584299;OID=.;OPOS=23837365;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:10:14:0:0:10:14:0:0
chr19	23869823	.	T	G	509.46	PASS	AF=1;AO=33;DP=34;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0760851;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.686;QD=58.2235;RBI=0.0951376;REFB=0;REVB=0.0571158;RO=0;SAF=20;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.82173e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00312681;OID=.;OPOS=23869823;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:35:0:0:33:35:1:13:20:0:0:15:20:0:0
chr19	23927345	.	T	C	69.28	PASS	AF=0.888889;AO=8;DP=9;FAO=8;FDP=9;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0333482;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=247.145;QD=30.7908;RBI=0.0766842;REFB=0.10326;REVB=0.0690533;RO=1;SAF=5;SAR=3;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125393;STB=0.571246;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=-0.00166441;OID=.;OPOS=23927345;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:9:9:1:1:8:8:0.888889:3:5:0:1:3:5:0:1
chr19	23927468	.	A	G	362.02	PASS	AF=1;AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00758625;FXX=0.0370233;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.575;QD=55.6959;RBI=0.0123575;REFB=0;REVB=0.0097548;RO=0;SAF=14;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.52325e-05;OID=.;OPOS=23927468;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:26:0:0:26:26:1:12:14:0:0:12:14:0:0
chr19	24116757	.	G	A	136.88	PASS	AF=0.5;AO=15;DP=30;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=-0.0175081;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.594;QD=18.2505;RBI=0.0804019;REFB=0.0163442;REVB=-0.0784725;RO=14;SAF=8;SAR=7;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156623;STB=0.56748;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=-0.0196316;OID=.;OPOS=24116757;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:14:15:15:15:0.5:7:8:10:4:7:8:10:5
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chr19	24183723	.	T	G	44.28	PASS	AF=0.269231;AO=7;DP=26;FAO=7;FDP=26;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=0.0161126;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.9863;QD=6.81238;RBI=0.0493022;REFB=0.0146756;REVB=-0.046595;RO=19;SAF=5;SAR=2;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.385725;STB=0.744008;STBP=0.168;TYPE=snp;VARB=-0.0431445;OID=.;OPOS=24183723;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:26:26:19:19:7:7:0.269231:2:5:7:12:2:5:7:12
chr19	24183727	.	A	G	44.53	PASS	AF=0.28;AO=7;DP=25;FAO=7;FDP=25;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.00815687;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.749;QD=7.12432;RBI=0.0179841;REFB=0.00174636;REVB=-0.0160279;RO=18;SAF=5;SAR=2;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.363483;STB=0.729691;STBP=0.191;TYPE=snp;VARB=-0.014882;OID=.;OPOS=24183727;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:25:25:18:18:7:7:0.28:2:5:7:11:2:5:7:11
chr19	24183731	.	T	C	37.2	PASS	AF=0.24;AO=7;DP=25;FAO=6;FDP=25;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.0363369;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.588;QD=5.95184;RBI=0.0380121;REFB=-0.00770765;REVB=-0.0111601;RO=18;SAF=5;SAR=2;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.363483;STB=0.683606;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=0.0404064;OID=.;OPOS=24183731;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:25:25:18:19:7:6:0.24:2:5:7:11:2:4:8:11
chr19	24183734	.	T	C	43.28	PASS	AF=0.28;AO=7;DP=25;FAO=7;FDP=25;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.0261953;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.257;QD=6.92445;RBI=0.0274777;REFB=0.00141636;REVB=-0.00829643;RO=18;SAF=5;SAR=2;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.363483;STB=0.729691;STBP=0.191;TYPE=snp;VARB=-0.0119871;OID=.;OPOS=24183734;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:25:25:18:18:7:7:0.28:2:5:7:11:2:5:7:11
chr19	24183736	.	T	C	41.72	PASS	AF=0.28;AO=7;DP=25;FAO=7;FDP=25;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=-0.0166099;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.059;QD=6.67445;RBI=0.0224977;REFB=-0.0128222;REVB=0.0151741;RO=18;SAF=5;SAR=2;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.363483;STB=0.729691;STBP=0.191;TYPE=snp;VARB=0.0321713;OID=.;OPOS=24183736;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:25:25:18:18:7:7:0.28:2:5:7:11:2:5:7:11
chr19	24184114	.	A	G	107.13	PASS	AF=0.309524;AO=13;DP=45;FAO=13;FDP=42;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.0146792;FXX=0.0666519;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.823;QD=10.203;RBI=0.0147325;REFB=0.00354009;REVB=0.00125156;RO=28;SAF=8;SAR=5;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1722;STB=0.592449;STBP=0.455;TYPE=snp;VARB=-0.00533869;OID=.;OPOS=24184114;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:42:28:29:13:13:0.309524:5:8:13:15:5:8:14:15
chr19	24184152	.	G	C	80.31	PASS	AF=0.209677;AO=13;DP=62;FAO=13;FDP=62;FR=.;FRO=49;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=25;FSRR=24;FWDB=-0.00562562;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=306.361;QD=5.18127;RBI=0.00657571;REFB=-0.00427709;REVB=0.00340475;RO=49;SAF=7;SAR=6;SRF=25;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.03501;STB=0.522354;STBP=0.836;TYPE=snp;VARB=0.0121242;OID=.;OPOS=24184152;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:80:62:62:49:49:13:13:0.209677:6:7:25:24:6:7:25:24
chr19	24184156	.	A	G	61.99	PASS	AF=0.169231;AO=11;DP=65;FAO=11;FDP=65;FR=.;FRO=54;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=29;FSRR=25;FWDB=-0.0133226;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.72;QD=3.81455;RBI=0.0212145;REFB=-0.00126977;REVB=-0.0165094;RO=54;SAF=6;SAR=5;SRF=29;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0104947;STB=0.507029;STBP=0.967;TYPE=snp;VARB=0.00487762;OID=.;OPOS=24184156;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:65:65:54:54:11:11:0.169231:5:6:29:25:5:6:29:25
chr19	24184166	.	A	G	53.38	PASS	AF=0.151515;AO=10;DP=67;FAO=10;FDP=66;FR=.;FRO=56;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=31;FSRR=25;FWDB=-0.00926308;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.232;QD=3.23507;RBI=0.010579;REFB=-0.00778221;REVB=-0.00510979;RO=52;SAF=7;SAR=3;SRF=27;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.229715;STB=0.631983;STBP=0.394;TYPE=snp;VARB=0.0576488;OID=.;OPOS=24184166;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:67:66:52:56:10:10:0.151515:3:7:27:25:3:7:31:25
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chr19	24184295	.	C	T	1539.56	PASS	AF=0.990476;AO=104;DP=105;FAO=104;FDP=105;FR=.;FRO=1;FSAF=61;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0184131;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.495;QD=58.6498;RBI=0.0306077;REFB=-0.0338526;REVB=-0.0244497;RO=1;SAF=61;SAR=43;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0077163;STB=0.504064;STBP=0.489;TYPE=snp;VARB=0.000376054;OID=.;OPOS=24184295;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:105:105:1:1:104:104:0.990476:43:61:1:0:43:61:1:0
chr19	24186114	.	C	G	223.18	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00950525;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.8209;QD=49.595;RBI=0.092646;REFB=0;REVB=0.0921571;RO=0;SAF=13;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00305067;OID=.;OPOS=24186114;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:5:13:0:0:5:13:0:0
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chr19	24311782	.	G	A	122.65	PASS	AF=0.451613;AO=14;DP=31;FAO=14;FDP=31;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=-0.000154724;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.2922;QD=15.8257;RBI=0.0374217;REFB=-0.0348392;REVB=-0.0374214;RO=17;SAF=8;SAR=6;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0743153;STB=0.542797;STBP=0.689;TYPE=snp;VARB=0.016848;OID=.;OPOS=24311782;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:17:17:14:14:0.451613:6:8:11:6:6:8:11:6
chr19	29724086	.	A	C	266.14	PASS	AF=0.5;AO=25;DP=50;FAO=25;FDP=50;FR=.;FRO=25;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=0.00629127;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.318;QD=21.2913;RBI=0.0220885;REFB=0.0195592;REVB=-0.0211736;RO=25;SAF=16;SAR=9;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0201068;OID=.;OPOS=29724086;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:25:25:25:25:0.5:9:16:16:9:9:16:16:9
chr19	29724111	.	T	G	232.98	PASS	AF=0.472727;AO=26;DP=55;FAO=26;FDP=55;FR=.;FRO=29;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=0.110834;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.849;QD=16.9443;RBI=0.122824;REFB=-0.000477782;REVB=-0.0529285;RO=29;SAF=16;SAR=10;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0618301;STB=0.534857;STBP=0.644;TYPE=snp;VARB=0.00125593;OID=.;OPOS=29724111;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:29:29:26:26:0.472727:10:16:16:13:10:16:16:13
chr19	29724209	.	A	G	201.64	PASS	AF=0.526316;AO=20;DP=38;FAO=20;FDP=38;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.0378849;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.7793;QD=21.2249;RBI=0.0379558;REFB=-0.00139092;REVB=0.00231909;RO=18;SAF=5;SAR=15;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.240324;STB=0.636217;STBP=0.087;TYPE=snp;VARB=0.00039688;OID=.;OPOS=29724209;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:18:18:20:20:0.526316:15:5:9:9:15:5:9:9
chr19	30097268	.	C	G	130.46	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0157028;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.075;QD=43.4861;RBI=0.0301855;REFB=0;REVB=-0.0257795;RO=0;SAF=6;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000230259;OID=.;OPOS=30097268;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:12:0:0:11:12:1:5:6:0:0:5:7:0:0
chr19	30101339	.	G	A	376.45	PASS	AF=0.481481;AO=39;DP=81;FAO=39;FDP=81;FR=.;FRO=42;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=23;FWDB=-0.00043838;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.2256;QD=18.5901;RBI=0.052657;REFB=-0.0216297;REVB=0.0526551;RO=40;SAF=25;SAR=14;SRF=17;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199875;STB=0.600207;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=0.0207143;OID=.;OPOS=30101339;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:40:42:39:39:0.481481:14:25:17:23:14:25:19:23
chr19	30102856	.	A	G	754.33	PASS	AF=1;AO=51;DP=52;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.046269;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.662;QD=56.9303;RBI=0.0473604;REFB=0;REVB=-0.0101087;RO=0;SAF=26;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94283e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000178587;OID=.;OPOS=30102856;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:53:0:0:51:53:1:25:26:0:0:27:26:0:0
chr19	30156601	.	G	C	155.4	PASS	AF=0.425;AO=17;DP=41;FAO=17;FDP=40;FR=.;FRO=23;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=0.0487922;FXX=0.0243843;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.4908;QD=15.5399;RBI=0.127603;REFB=0.0158481;REVB=0.117906;RO=23;SAF=13;SAR=4;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.233898;STB=0.63619;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=-0.0141189;OID=.;OPOS=30156601;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:40:23:23:17:17:0.425:4:13:13:10:4:13:13:10
chr19	30165639	.	C	T	36.15	PASS	AF=0.272727;AO=5;DP=22;FAO=6;FDP=22;FR=.;FRO=16;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.0215458;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=188.163;QD=6.5736;RBI=0.0275681;REFB=-0.0162005;REVB=0.0171983;RO=14;SAF=2;SAR=3;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112308;STB=0.580369;STBP=0.758;TYPE=snp;VARB=0.034303;OID=.;OPOS=30165639;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:22:22:14:16:5:6:0.272727:3:2:7:7:4:2:7:9
chr19	30193721	.	G	A	643.97	PASS	AF=0.492424;AO=65;DP=132;FAO=65;FDP=132;FR=.;FRO=67;FSAF=32;FSAR=33;FSRF=36;FSRR=31;FWDB=0.00832738;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.953;QD=19.5142;RBI=0.0107325;REFB=-0.0214412;REVB=-0.00677058;RO=67;SAF=32;SAR=33;SRF=36;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0413381;STB=0.522826;STBP=0.643;TYPE=snp;VARB=0.0206493;OID=.;OPOS=30193721;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:132:132:67:67:65:65:0.492424:33:32:36:31:33:32:36:31
chr19	30414572	.	C	G	194.33	PASS	AF=0.418182;AO=23;DP=55;FAO=23;FDP=55;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=0.00852855;FXX=0.017854;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.33;QD=14.1334;RBI=0.0091096;REFB=-0.0133363;REVB=-0.00320135;RO=32;SAF=11;SAR=12;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0097023;STB=0.505542;STBP=0.954;TYPE=snp;VARB=0.0166569;OID=.;OPOS=30414572;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:32:32:23:23:0.418182:12:11:15:17:12:11:15:17
chr19	30414587	.	G	T	229.51	PASS	AF=0.409091;AO=27;DP=67;FAO=27;FDP=66;FR=.;FRO=39;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=0.00980042;FXX=0.0149231;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.4604;QD=13.9094;RBI=0.024697;REFB=-0.00897488;REVB=-0.0226692;RO=38;SAF=14;SAR=13;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0190167;STB=0.518505;STBP=0.822;TYPE=snp;VARB=0.0142396;OID=.;OPOS=30414587;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:66:38:39:27:27:0.409091:13:14:19:19:13:14:19:20
chr19	30500118	.	GTGATGATGATGATGATGATGATGAT	GTGATGATGATGATGATGATGAT,GTGATGATGATGATGATGATGATGAC	1036.46	PASS	AF=0.942857,0.0571429;AO=51,11;DP=74;FAO=66,4;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=35,2;FSAR=31,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0117577,-0.0210527;FXX=0.0540468;HRUN=1,1;LEN=3,1;MLLD=107.795,84.3184;QD=59.2264;RBI=0.0256484,0.0232996;REFB=0,0;REVB=0.0227946,0.00998281;RO=0;SAF=22,9;SAR=29,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.00412037,-0.00826059;OID=.,.;OPOS=30500119,30500143;OREF=TGA,T;OALT=-,C;OMAPALT=GTGATGATGATGATGATGATGAT,GTGATGATGATGATGATGATGATGAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.942857,0.0571429:51,11:74:66,4:70:0:35,2:31,2:0:0:16:0:22,9:29,2:0:0
chr19	31766328	.	A	G	135.89	PASS	AF=0.483871;AO=15;DP=31;FAO=15;FDP=31;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=2;FWDB=0.000897754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.3449;QD=17.5339;RBI=0.111343;REFB=-0.0190819;REVB=0.111339;RO=16;SAF=10;SAR=5;SRF=14;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.233935;STB=0.631428;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=0.00355886;OID=.;OPOS=31766328;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:16:16:15:15:0.483871:5:10:14:2:5:10:14:2
chr19	31769763	.	G	A	507.19	PASS	AF=1;AO=33;DP=34;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0087113;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.342;QD=57.9643;RBI=0.12463;REFB=0;REVB=0.124325;RO=0;SAF=16;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.60901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00114821;OID=.;OPOS=31769763;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:35:0:0:33:35:1:17:16:0:0:18:17:0:0
chr19	32083696	.	T	C	1472.57	PASS	AF=1;AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0099302;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.941;QD=63.3363;RBI=0.0182829;REFB=0;REVB=-0.015351;RO=0;SAF=60;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.98195e-06;OID=.;OPOS=32083696;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:93:93:0:0:93:93:1:33:60:0:0:33:60:0:0
chr19	32873697	.	CA	C,CG	381.34	PASS	AF=0.178571,0.821429;AO=4,23;DP=27;FAO=5,23;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=4,10;FSAR=1,13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0177865,0.0160772;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=174.475,193.48;QD=54.4766;RBI=0.0260725,0.0222958;REFB=0,0;REVB=0.0190634,0.0154475;RO=0;SAF=3,10;SAR=1,13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=4.86674e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.00713178,-0.00167002;OID=.,.;OPOS=32873698,32873698;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=C,CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.178571,0.821429:4,23:27:5,23:28:0:4,10:1,13:0:0:25:0:3,10:1,13:0:0
chr19	32930069	.	G	A	323.47	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0564855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.715;QD=53.9111;RBI=0.0700663;REFB=0;REVB=0.0414569;RO=0;SAF=15;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000227591;OID=.;OPOS=32930069;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:24:0:0:23:24:1:8:15:0:0:9:15:0:0
chr19	33088126	.	TAG	T	344.64	PASS	AF=1;AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0037297;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=2;MLLD=201.324;QD=55.1427;RBI=0.0684109;REFB=0;REVB=0.0683091;RO=0;SAF=14;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000442841;OID=.;OPOS=33088127;OREF=AG;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:25:26:25:25:0:14:11:0:0:4:0:14:11:0:0
chr19	33106600	.	C	T	256.4	PASS	AF=0.533333;AO=24;DP=45;FAO=24;FDP=45;FR=.;FRO=21;FSAF=19;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0086429;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.7774;QD=22.791;RBI=0.0135219;REFB=0.0103866;REVB=-0.0103991;RO=20;SAF=19;SAR=5;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.288518;STB=0.65503;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=-0.00682535;OID=.;OPOS=33106600;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:20:21:24:24:0.533333:5:19:10:10:5:19:11:10
chr19	33110204	.	T	C	63.55	PASS	AF=0.428571;AO=8;DP=20;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.0381581;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.947;QD=12.1057;RBI=0.097538;REFB=-0.031649;REVB=0.0897643;RO=12;SAF=3;SAR=5;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0434779;STB=0.551606;STBP=0.697;TYPE=snp;VARB=0.0402307;OID=.;OPOS=33110204;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:20:21:12:12:8:9:0.428571:5:3:5:7:6:3:5:7
chr19	33117666	.	T	C	588.12	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00457207;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.417;QD=60.3203;RBI=0.0115928;REFB=0;REVB=0.0106531;RO=0;SAF=18;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.68991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000142449;OID=.;OPOS=33117666;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:39:0:0:37:39:1:19:18:0:0:21:18:0:0
chr19	33146154	.	G	C	30.47	PASS	AF=0.454545;AO=5;DP=11;FAO=5;FDP=11;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.0168189;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.111;QD=11.0809;RBI=0.0718656;REFB=-0.0290826;REVB=0.0698698;RO=6;SAF=2;SAR=3;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.231237;STB=0.6423;STBP=0.444;TYPE=snp;VARB=0.0376126;OID=.;OPOS=33146154;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:11:11:6:6:5:5:0.454545:3:2:4:2:3:2:4:2
chr19	33167879	.	G	A	601.14	PASS	AF=0.97561;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0370606;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.989;QD=58.6481;RBI=0.0452327;REFB=-0.0120294;REVB=0.0259327;RO=1;SAF=28;SAR=12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0164593;STB=0.508768;STBP=0.608;TYPE=snp;VARB=0.000337289;OID=.;OPOS=33167879;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:41:41:1:1:40:40:0.97561:12:28:1:0:12:28:1:0
chr19	33168036	.	G	GT	510.5	PASS	AF=1;AO=45;DP=55;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0434647;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=15.8295;QD=37.8145;RBI=0.177999;REFB=0;REVB=0.172611;RO=6;SAF=14;SAR=31;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.082734;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00499032;OID=.;OPOS=33168037;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:45:55:54:54:0:17:37:0:0:10:6:14:31:0:6
chr19	33168059	.	G	A	739.86	PASS	AF=0.932203;AO=55;DP=59;FAO=55;FDP=59;FR=.;FRO=4;FSAF=14;FSAR=41;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0138025;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.0397;QD=50.1597;RBI=0.056593;REFB=-0.0295274;REVB=0.0548841;RO=3;SAF=14;SAR=41;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0513727;STB=0.521455;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=0.0163776;OID=.;OPOS=33168059;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:59:59:3:4:55:55:0.932203:41:14:2:1:41:14:2:2
chr19	33168412	.	C	T	538.55	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.019634;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=221.207;QD=59.8391;RBI=0.0199196;REFB=0;REVB=0.00336113;RO=0;SAF=9;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.33642e-05;OID=.;OPOS=33168412;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:27:9:0:0:27:9:0:0
chr19	33169003	.	A	C	746.42	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00763554;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.402;QD=63.5254;RBI=0.0387315;REFB=0;REVB=0.0379714;RO=0;SAF=15;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.97859e-05;OID=.;OPOS=33169003;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:47:0:0:46:47:1:31:15:0:0:32:15:0:0
chr19	33239450	.	C	G	340.74	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.022198;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.371;QD=54.5175;RBI=0.0243915;REFB=0;REVB=0.0101091;RO=0;SAF=13;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000177204;OID=.;OPOS=33239450;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:25:0:0:24:25:1:11:13:0:0:12:13:0:0
chr19	33281924	.	A	G	1587.75	PASS	AF=1;AO=99;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0101404;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.292;QD=64.1513;RBI=0.02125;REFB=0;REVB=-0.0186744;RO=0;SAF=54;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.50537e-05;OID=.;OPOS=33281924;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:99:99:0:0:99:99:1:45:54:0:0:45:54:0:0
chr19	33293948	.	G	A	358.13	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0212188;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.2811;QD=55.0974;RBI=0.0321761;REFB=0;REVB=0.0241881;RO=0;SAF=16;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.71087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000502188;OID=.;OPOS=33293948;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:10:16:0:0:10:16:0:0
chr19	33390796	.	G	A,T	1052.26	PASS	AF=0.944444,0.0555556;AO=66,3;DP=69;FAO=68,4;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=26,2;FSAR=42,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0141431,0.0121581;FXX=0.0136968;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=67.7156,169.511;QD=58.459;RBI=0.0299293,0.0133563;REFB=0,0;REVB=-0.0263768,-0.00552911;RO=0;SAF=25,1;SAR=41,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=5.04816e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.0056622,0.0168923;OID=.,.;OPOS=33390796,33390796;OREF=G,G;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:12:69:72:0:0:66,3:68,4:0.944444,0.0555556:41,2:25,1:0:0:42,2:26,2:0:0
chr19	33414420	.	A	G	833.7	PASS	AF=1;AO=57;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0460588;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.117;QD=57.4963;RBI=0.0463373;REFB=0;REVB=0.00507263;RO=0;SAF=27;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.16075e-05;OID=.;OPOS=33414420;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:57:58:1:30:27:0:0:31:27:0:0
chr19	33430816	.	T	G	1848.35	PASS	AF=1;AO=118;DP=120;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0369045;FXX=0.00799936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.4555;QD=59.6243;RBI=0.0441375;REFB=0;REVB=0.0242111;RO=0;SAF=48;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.2502e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00387185;OID=.;OPOS=33430816;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:120:124:0:0:118:124:1:70:48:0:0:72:52:0:0
chr19	33444556	.	T	C	463.33	PASS	AF=0.529412;AO=45;DP=85;FAO=45;FDP=85;FR=.;FRO=40;FSAF=28;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=27;FWDB=-0.0172211;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.4862;QD=21.8036;RBI=0.0441734;REFB=-0.0158703;REVB=-0.0406783;RO=40;SAF=28;SAR=17;SRF=13;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.251487;STB=0.638612;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.0171689;OID=.;OPOS=33444556;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:40:40:45:45:0.529412:17:28:13:27:17:28:13:27
chr19	33444576	.	C	T	320.54	PASS	AF=0.432099;AO=35;DP=82;FAO=35;FDP=81;FR=.;FRO=46;FSAF=24;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=27;FWDB=0.00607083;FXX=0.0121936;HRUN=3;LEN=1;MLLD=161.963;QD=15.8291;RBI=0.00944175;REFB=-0.00936029;REVB=0.0072313;RO=43;SAF=24;SAR=11;SRF=18;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.268938;STB=0.658391;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.00721223;OID=.;OPOS=33444576;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:81:43:46:35:35:0.432099:11:24:18:25:11:24:19:27
chr19	33444588	.	T	G	307.16	PASS	AF=0.425;AO=34;DP=81;FAO=34;FDP=80;FR=.;FRO=46;FSAF=25;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=31;FWDB=0.00488671;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.167;QD=15.3578;RBI=0.00601687;REFB=-0.00278727;REVB=-0.00351039;RO=42;SAF=25;SAR=9;SRF=13;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.418173;STB=0.735156;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.00306316;OID=.;OPOS=33444588;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:80:42:46:34:34:0.425:9:25:13:29:9:25:15:31
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chr19	34584137	.	A	G	54.66	PASS	AF=0.333333;AO=8;DP=24;FAO=8;FDP=24;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.0111895;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=240.942;QD=9.11037;RBI=0.0179127;REFB=-0.00541381;REVB=-0.0139879;RO=16;SAF=4;SAR=4;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135949;STB=0.583131;STBP=0.625;TYPE=snp;VARB=0.017751;OID=.;OPOS=34584137;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:24:24:16:16:8:8:0.333333:4:4:6:10:4:4:6:10
chr19	34842488	.	T	C	483.35	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000966726;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.092;QD=58.5877;RBI=0.0013876;REFB=0;REVB=0.000995432;RO=0;SAF=15;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.64315e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.85784e-06;OID=.;OPOS=34842488;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:18:15:0:0:18:15:0:0
chr19	34843761	.	C	A	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00327757;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=179.333;QD=33.4285;RBI=0.0173787;REFB=0;REVB=0.0170668;RO=0;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000140823;OID=.;OPOS=34843761;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:5:1:0:0:5:1:0:0
chr19	34959979	.	A	G	501.66	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0116733;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.146;QD=59.0187;RBI=0.0292294;REFB=0;REVB=0.0267973;RO=0;SAF=15;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.40663e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000117823;OID=.;OPOS=34959979;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:19:15:0:0:19:15:0:0
chr19	34972146	.	G	C	514.63	PASS	AF=0.972973;AO=35;DP=37;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00224601;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.4331;QD=55.6351;RBI=0.0026197;REFB=0.0753071;REVB=0.00134844;RO=2;SAF=6;SAR=29;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0559565;STB=0.50847;STBP=0.633;TYPE=snp;VARB=-0.00260323;OID=.;OPOS=34972146;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:37:37:2:1:35:36:0.972973:29:6:1:1:29:7:0:1
chr19	35420841	.	A	G	254.48	PASS	AF=0.426471;AO=29;DP=70;FAO=29;FDP=68;FR=.;FRO=39;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=-0.0203688;FXX=0.0285673;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.079;QD=14.9691;RBI=0.0230359;REFB=0.0022305;REVB=-0.0107594;RO=39;SAF=12;SAR=17;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0752884;STB=0.54271;STBP=0.6;TYPE=snp;VARB=-0.00260035;OID=.;OPOS=35420841;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:68:39:39:29:29:0.426471:17:12:19:20:17:12:19:20
chr19	35433604	.	G	T	36.14	PASS	AF=0.272727;AO=6;DP=22;FAO=6;FDP=22;FR=.;FRO=16;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=-0.0763811;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.7571;QD=6.57098;RBI=0.0766029;REFB=0.00420048;REVB=-0.00582545;RO=16;SAF=1;SAR=5;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.603731;STB=0.877291;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=-0.0172273;OID=.;OPOS=35433604;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:22:22:16:16:6:6:0.272727:5:1:12:4:5:1:12:4
chr19	35434238	.	A	G	218.06	PASS	AF=0.446429;AO=25;DP=56;FAO=25;FDP=56;FR=.;FRO=31;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=0.00131874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.239;QD=15.5753;RBI=0.00376713;REFB=-0.00625591;REVB=-0.00352877;RO=31;SAF=8;SAR=17;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0728252;STB=0.541367;STBP=0.612;TYPE=snp;VARB=0.00779118;OID=.;OPOS=35434238;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:31:31:25:25:0.446429:17:8:12:19:17:8:12:19
chr19	35434512	.	T	C	44.06	PASS	AF=0.259259;AO=7;DP=27;FAO=7;FDP=27;FR=.;FRO=20;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=0.0102901;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.002;QD=6.52678;RBI=0.0102919;REFB=-0.0140631;REVB=-0.000196808;RO=20;SAF=2;SAR=5;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.357767;STB=0.728523;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=0.0219089;OID=.;OPOS=35434512;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:27:27:20:20:7:7:0.259259:5:2:12:8:5:2:12:8
chr19	35435006	.	G	A	99.96	PASS	AF=0.461538;AO=12;DP=26;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.0118893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=309.158;QD=15.379;RBI=0.0265651;REFB=-0.0165282;REVB=-0.023756;RO=14;SAF=9;SAR=3;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.193547;STB=0.613434;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.0180295;OID=.;OPOS=35435006;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:26:14:14:12:12:0.461538:3:9:8:6:3:9:8:6
chr19	35435069	.	A	G	110.62	PASS	AF=0.448276;AO=13;DP=29;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=0.00469222;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.161;QD=15.2581;RBI=0.0311208;REFB=-0.0345359;REVB=0.0307651;RO=16;SAF=8;SAR=5;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00967959;STB=0.505609;STBP=0.966;TYPE=snp;VARB=0.0372363;OID=.;OPOS=35435069;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:16:16:13:13:0.448276:5:8:10:6:5:8:10:6
chr19	35435589	.	C	T	38.14	PASS	AF=0.4;AO=6;DP=15;FAO=6;FDP=15;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.0250279;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.4884;QD=10.1717;RBI=0.167489;REFB=-0.052734;REVB=-0.165608;RO=8;SAF=3;SAR=3;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.533223;STBP=0.909;TYPE=snp;VARB=0.0675838;OID=.;OPOS=35435589;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:15:15:8:9:6:6:0.4:3:3:4:4:3:3:4:5
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chr19	35590180	.	T	A	116.16	PASS	AF=0.341463;AO=14;DP=41;FAO=14;FDP=41;FR=.;FRO=27;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=0.00933039;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.943;QD=11.3328;RBI=0.0168018;REFB=-0.0174479;REVB=0.013973;RO=27;SAF=7;SAR=7;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0205041;STB=0.512178;STBP=0.947;TYPE=snp;VARB=0.0329833;OID=.;OPOS=35590180;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:27:27:14:14:0.341463:7:7:14:13:7:7:14:13
chr19	35597352	.	T	C	457.34	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00382298;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.499;QD=57.1679;RBI=0.0325028;REFB=0;REVB=0.0322772;RO=0;SAF=12;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.47712e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000197235;OID=.;OPOS=35597352;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:32:0:0:31:32:1:19:12:0:0:20:12:0:0
chr19	35597462	.	A	G	142.62	PASS	AF=0.4;AO=16;DP=40;FAO=16;FDP=40;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=-0.0234031;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.026;QD=14.2621;RBI=0.0256891;REFB=-0.014892;REVB=-0.0105936;RO=23;SAF=8;SAR=8;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0221035;STB=0.524969;STBP=0.818;TYPE=snp;VARB=0.0224965;OID=.;OPOS=35597462;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:23:24:16:16:0.4:8:8:12:11:8:8:13:11
chr19	35597620	.	C	T	134.24	PASS	AF=0.454545;AO=15;DP=33;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.00374502;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.693;QD=16.2712;RBI=0.0158853;REFB=-0.00195534;REVB=-0.0154375;RO=18;SAF=6;SAR=9;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.043351;STB=0.524966;STBP=0.802;TYPE=snp;VARB=0.00209786;OID=.;OPOS=35597620;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:18:18:15:15:0.454545:9:6:8:10:9:6:8:10
chr19	35597729	.	C	T	101.6	PASS	AF=0.5;AO=12;DP=24;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=-0.00784987;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=56.9447;QD=16.9327;RBI=0.0175396;REFB=-0.0179869;REVB=0.0156849;RO=12;SAF=8;SAR=4;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.288616;STB=0.666389;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=0.0177964;OID=.;OPOS=35597729;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:24:24:12:12:12:12:0.5:4:8:4:8:4:8:4:8
chr19	35622695	.	A	G	766.49	PASS	AF=1;AO=47;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0401486;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.681;QD=63.8745;RBI=0.0450383;REFB=0;REVB=0.0204092;RO=0;SAF=22;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000365444;OID=.;OPOS=35622695;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:47:48:1:25:22:0:0:26:22:0:0
chr19	35648365	.	T	G	419.43	PASS	AF=0.615385;AO=40;DP=65;FAO=40;FDP=65;FR=.;FRO=25;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=0.0201331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.33;QD=25.8109;RBI=0.0383982;REFB=-0.0551313;REVB=-0.0326969;RO=25;SAF=23;SAR=17;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0675469;STB=0.536946;STBP=0.479;TYPE=snp;VARB=0.0265042;OID=.;OPOS=35648365;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:25:25:40:40:0.615385:17:23:12:13:17:23:12:13
chr19	35649281	.	A	G	139.34	PASS	AF=0.355556;AO=16;DP=45;FAO=16;FDP=45;FR=.;FRO=29;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=22;FWDB=-0.0147271;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.1959;QD=12.3856;RBI=0.022688;REFB=0.00424407;REVB=-0.0172586;RO=29;SAF=4;SAR=12;SRF=7;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0126902;STB=0.507453;STBP=0.984;TYPE=snp;VARB=-0.0119966;OID=.;OPOS=35649281;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:29:29:16:16:0.355556:12:4:7:22:12:4:7:22
chr19	35649324	.	C	G	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144693;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.782;QD=49.5992;RBI=0.0197902;REFB=0;REVB=0.0135016;RO=0;SAF=7;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.60284e-05;OID=.;OPOS=35649324;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:11:7:0:0:11:7:0:0
chr19	35655151	.	T	C	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.037213;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.79;QD=48.7372;RBI=0.0455272;REFB=0;REVB=0.0262283;RO=0;SAF=2;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.95117e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000468028;OID=.;OPOS=35655151;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:15:2:0:0:15:2:0:0
chr19	35657284	.	G	T	60.24	PASS	AF=0.571429;AO=8;DP=14;FAO=8;FDP=14;FR=.;FRO=6;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=0.00538617;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.8808;QD=17.2104;RBI=0.195934;REFB=-0.0146062;REVB=-0.19586;RO=6;SAF=7;SAR=1;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.266181;STB=0.649715;STBP=0.738;TYPE=snp;VARB=0.00984945;OID=.;OPOS=35657284;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:14:14:6:6:8:8:0.571429:1:7:6:0:1:7:6:0
chr19	35660508	.	G	A	306.33	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0133412;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.918;QD=53.2751;RBI=0.0172193;REFB=0;REVB=0.0108865;RO=0;SAF=9;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.84921e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000315781;OID=.;OPOS=35660508;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:14:9:0:0:14:9:0:0
chr19	35741375	.	C	T	367.52	PASS	AF=0.513889;AO=30;DP=73;FAO=37;FDP=72;FR=.,HEALED;FRO=34;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=0.0419795;FXX=0.0136968;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.64;QD=20.4178;RBI=0.0539603;REFB=-0.019814;REVB=0.0339033;RO=34;SAF=17;SAR=13;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00754039;STB=0.547503;STBP=0.425;TYPE=snp;VARB=0.0235543;OID=.;OPOS=35741375;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:72:34:34:30:37:0.513889:13:17:19:15:20:17:19:15
chr19	35741456	.	T	C	2045.39	PASS	AF=1;AO=130;DP=130;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0968568;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.5625;QD=62.4546;RBI=0.111859;REFB=0;REVB=-0.0559569;RO=0;SAF=60;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000681559;OID=.;OPOS=35741456;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:130:131:0:0:130:131:1:70:60:0:0:71:60:0:0
chr19	35770056	.	G	A	662.32	PASS	AF=1;AO=42;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0427175;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.752;QD=61.6112;RBI=0.046715;REFB=0;REVB=0.0189078;RO=0;SAF=21;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000422975;OID=.;OPOS=35770056;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:42:43:1:21:21:0:0:22:21:0:0
chr19	35786868	.	C	T	453.52	PASS	AF=0.48913;AO=45;DP=92;FAO=45;FDP=92;FR=.;FRO=47;FSAF=13;FSAR=32;FSRF=16;FSRR=31;FWDB=-0.0183348;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.07;QD=19.718;RBI=0.0188049;REFB=-0.00871886;REVB=0.00417811;RO=47;SAF=13;SAR=32;SRF=16;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0560331;STB=0.531182;STBP=0.579;TYPE=snp;VARB=0.00656133;OID=.;OPOS=35786868;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:47:47:45:45:0.48913:32:13:16:31:32:13:16:31
chr19	35790503	.	G	A	251.04	PASS	AF=0.509804;AO=26;DP=51;FAO=26;FDP=51;FR=.;FRO=25;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.0217212;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.3037;QD=19.6894;RBI=0.1172;REFB=0.00204326;REVB=0.115169;RO=25;SAF=15;SAR=11;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0505672;STB=0.528309;STBP=0.726;TYPE=snp;VARB=0.00178142;OID=.;OPOS=35790503;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:25:25:26:26:0.509804:11:15:13:12:11:15:13:12
chr19	35793589	.	C	T	92.15	PASS	AF=0.292683;AO=12;DP=41;FAO=12;FDP=41;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=22;FWDB=0.0290882;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.804;QD=8.99064;RBI=0.0416002;REFB=-0.0102342;REVB=-0.0297398;RO=29;SAF=6;SAR=6;SRF=7;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.307017;STB=0.682663;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=0.0465438;OID=.;OPOS=35793589;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:41:41:29:29:12:12:0.292683:6:6:7:22:6:6:7:22
chr19	35843086	.	G	A	465.1	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0410774;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.9691;QD=58.138;RBI=0.0691245;REFB=0;REVB=0.0555953;RO=0;SAF=15;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00142978;OID=.;OPOS=35843086;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:17:15:0:0:17:15:0:0
chr19	35849883	.	C	G	163.84	PASS	AF=0.222222;AO=26;DP=117;FAO=26;FDP=117;FR=.,HEALED;FRO=90;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=43;FSRR=47;FWDB=-0.0909528;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=168.806;QD=5.60121;RBI=0.0917669;REFB=-0.008163;REVB=-0.0121959;RO=69;SAF=14;SAR=12;SRF=28;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160122;STB=0.546984;STBP=0.616;TYPE=snp;VARB=0.0242932;OID=.;OPOS=35849883;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:117:117:69:90:26:26:0.222222:12:14:28:41:12:14:43:47
chr19	35849926	.	G	A	365.63	PASS	AF=0.313725;AO=48;DP=152;FAO=48;FDP=153;FR=.;FRO=105;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=46;FSRR=59;FWDB=-0.00355018;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.918;QD=9.55899;RBI=0.0158387;REFB=-0.0178816;REVB=0.0154357;RO=102;SAF=26;SAR=22;SRF=45;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117507;STB=0.570702;STBP=0.244;TYPE=snp;VARB=0.0376484;OID=.;OPOS=35849926;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:152:153:102:105:48:48:0.313725:22:26:45:57:22:26:46:59
chr19	35850672	.	T	C	33.48	PASS	AF=0.714286;AO=5;DP=7;FAO=5;FDP=7;FR=.;FRO=2;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0284289;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.236;QD=19.134;RBI=0.044533;REFB=-0.0295372;REVB=0.034278;RO=2;SAF=1;SAR=4;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.413629;STB=0.748924;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.0173234;OID=.;OPOS=35850672;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:7:7:2:2:5:5:0.714286:4:1:2:0:4:1:2:0
chr19	35863707	.	G	A	112.23	PASS	AF=0.481481;AO=13;DP=27;FAO=13;FDP=27;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.0263924;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=151.676;QD=16.6273;RBI=0.0519372;REFB=-0.00544885;REVB=0.0447315;RO=13;SAF=5;SAR=8;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.515128;STBP=0.871;TYPE=snp;VARB=0.00373972;OID=.;OPOS=35863707;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:13:14:13:13:0.481481:8:5:5:8:8:5:5:9
chr19	35863809	.	T	A	77.93	PASS	AF=0.454545;AO=10;DP=22;FAO=10;FDP=22;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=0.0546818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.138;QD=14.1696;RBI=0.0547012;REFB=0.0162025;REVB=0.00145509;RO=12;SAF=4;SAR=6;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0655979;STB=0.538386;STBP=0.708;TYPE=snp;VARB=-0.0155451;OID=.;OPOS=35863809;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:22:22:12:12:10:10:0.454545:6:4:4:8:6:4:4:8
chr19	35991373	.	C	T	181.25	PASS	AF=0.422222;AO=19;DP=44;FAO=19;FDP=45;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.0216738;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=163.24;QD=16.1112;RBI=0.0446738;REFB=-0.0147323;REVB=-0.039064;RO=25;SAF=8;SAR=11;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0191767;STB=0.523784;STBP=0.836;TYPE=snp;VARB=0.029319;OID=.;OPOS=35991373;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:45:25:26:19:19:0.422222:11:8:11:14:11:8:12:14
chr19	35991442	.	T	G	732.67	PASS	AF=1;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0219817;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.111;QD=63.7102;RBI=0.0493943;REFB=0;REVB=-0.0442335;RO=0;SAF=18;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.06241e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000332765;OID=.;OPOS=35991442;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:46:0:0:46:46:1:28:18:0:0:28:18:0:0
chr19	35997457	.	G	T	84.79	PASS	AF=0.354839;AO=11;DP=31;FAO=11;FDP=31;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=0.0101523;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.2324;QD=10.9402;RBI=0.080831;REFB=0.0107081;REVB=0.0801909;RO=20;SAF=5;SAR=6;SRF=6;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172518;STB=0.602234;STBP=0.438;TYPE=snp;VARB=-0.0128011;OID=.;OPOS=35997457;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:31:31:20:20:11:11:0.354839:6:5:6:14:6:5:6:14
chr19	36004106	.	A	G	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0301606;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.59;QD=43.4862;RBI=0.0349816;REFB=0;REVB=0.0177214;RO=0;SAF=8;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000373164;OID=.;OPOS=36004106;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:4:8:0:0:4:8:0:0
chr19	36017928	.	G	C	85.37	PASS	AF=0.36;AO=7;DP=25;FAO=9;FDP=25;FR=.,HEALED;FRO=14;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.0559974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.407;QD=13.6598;RBI=0.056907;REFB=-0.0211669;REVB=0.010134;RO=14;SAF=1;SAR=6;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.319625;STB=0.516093;STBP=0.96;TYPE=snp;VARB=0.0294002;OID=.;OPOS=36017928;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:25:25:14:14:7:9:0.36:6:1:5:9:6:3:5:9
chr19	36048741	.	G	T	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0356465;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.392;QD=44.6882;RBI=0.0362163;REFB=0;REVB=0.00639924;RO=0;SAF=1;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.00075e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000758834;OID=.;OPOS=36048741;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:12:1:0:0:12:1:0:0
chr19	36050969	.	A	G	239.41	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0251347;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.549;QD=50.4017;RBI=0.117502;REFB=0;REVB=-0.114782;RO=0;SAF=13;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.851e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000611655;OID=.;OPOS=36050969;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:6:13:0:0:6:13:0:0
chr19	36066570	.	A	G	5079.19	PASS	AF=0.906736;AO=349;DP=384;FAO=350;FDP=386;FR=.;FRO=36;FSAF=125;FSAR=225;FSRF=10;FSRR=26;FWDB=-0.000383848;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.024;QD=52.6341;RBI=0.00449438;REFB=-0.0173897;REVB=0.00447796;RO=35;SAF=126;SAR=223;SRF=9;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.01962;STB=0.508097;STBP=0.358;TYPE=snp;VARB=0.00169393;OID=.;OPOS=36066570;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:384:386:35:36:349:350:0.906736:223:126:9:26:225:125:10:26
chr19	36066577	.	A	G	4711.33	PASS	AF=0.894595;AO=329;DP=368;FAO=331;FDP=370;FR=.;FRO=39;FSAF=123;FSAR=208;FSRF=11;FSRR=28;FWDB=0.0100934;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.094;QD=50.9333;RBI=0.0295759;REFB=-0.0201707;REVB=0.0278003;RO=39;SAF=123;SAR=206;SRF=11;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0198395;STB=0.510158;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=0.00144883;OID=.;OPOS=36066577;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:368:370:39:39:329:331:0.894595:206:123:11:28:208:123:11:28
chr19	36066634	.	A	G	3913.81	PASS	AF=0.93617;AO=263;DP=281;FAO=264;FDP=282;FR=.;FRO=18;FSAF=116;FSAR=148;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=-0.00963095;FXX=0.00353344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.8355;QD=55.5151;RBI=0.0151038;REFB=-0.0106785;REVB=-0.0116349;RO=18;SAF=116;SAR=147;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00645085;STB=0.503274;STBP=0.69;TYPE=snp;VARB=0.00120686;OID=.;OPOS=36066634;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:281:282:18:18:263:264:0.93617:147:116:7:11:148:116:7:11
chr19	36066642	.	A	G	3283.09	PASS	AF=0.932773;AO=221;DP=237;FAO=222;FDP=238;FR=.;FRO=16;FSAF=104;FSAR=118;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.00143772;FXX=0.00418393;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.339;QD=55.178;RBI=0.00929759;REFB=0.0123496;REVB=-0.00918575;RO=16;SAF=104;SAR=117;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00426086;STB=0.502091;STBP=0.832;TYPE=snp;VARB=-0.00139266;OID=.;OPOS=36066642;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:237:238:16:16:221:222:0.932773:117:104:7:9:118:104:7:9
chr19	36066645	.	A	G	2950.41	PASS	AF=0.931193;AO=202;DP=217;FAO=203;FDP=218;FR=.;FRO=15;FSAF=102;FSAR=101;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.0116611;FXX=0.013574;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.315;QD=54.1359;RBI=0.0182873;REFB=-0.0388173;REVB=0.014087;RO=15;SAF=102;SAR=100;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0137799;STB=0.507049;STBP=0.468;TYPE=snp;VARB=0.00271683;OID=.;OPOS=36066645;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:217:218:15:15:202:203:0.931193:100:102:6:9:101:102:6:9
chr19	36066661	.	A	G	1941.71	PASS	AF=0.903226;AO=140;DP=155;FAO=140;FDP=155;FR=.;FRO=15;FSAF=85;FSAR=55;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=-0.0170977;FXX=0.00640985;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.381;QD=50.1087;RBI=0.0173324;REFB=0.00170338;REVB=-0.00284275;RO=15;SAF=85;SAR=55;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0519493;STB=0.527442;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=-0.000275224;OID=.;OPOS=36066661;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:155:155:15:15:140:140:0.903226:55:85:5:10:55:85:5:10
chr19	36066667	.	A	G	1626.74	PASS	AF=0.885496;AO=116;DP=132;FAO=116;FDP=131;FR=.;FRO=15;FSAF=77;FSAR=39;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.0250065;FXX=0.00757518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.021;QD=49.6715;RBI=0.0315984;REFB=0.012492;REVB=-0.0193167;RO=16;SAF=77;SAR=39;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0721404;STB=0.533097;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=-0.00130858;OID=.;OPOS=36066667;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:132:131:16:15:116:116:0.885496:39:77:6:10:39:77:6:9
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chr19	36066754	.	A	G	49.2	PASS	AF=0.135135;AO=10;DP=73;FAO=10;FDP=74;FR=.,HEALED;FRO=64;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=42;FSRR=22;FWDB=-0.0128609;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.014;QD=2.6596;RBI=0.019101;REFB=-0.00759341;REVB=-0.0141225;RO=45;SAF=1;SAR=9;SRF=35;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.71751;STB=0.925104;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.0208461;OID=.;OPOS=36066754;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:49:73:74:45:64:10:10:0.135135:9:1:35:10:9:1:42:22
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chr19	36168914	.	T	C	120.37	PASS	AF=0.65;AO=13;DP=20;FAO=13;FDP=20;FR=.;FRO=7;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.0171188;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.1058;QD=24.0731;RBI=0.0450253;REFB=-0.0290691;REVB=-0.041644;RO=7;SAF=9;SAR=4;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0161289;STB=0.509077;STBP=0.954;TYPE=snp;VARB=0.00761066;OID=.;OPOS=36168914;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:20:20:7:7:13:13:0.65:4:9:5:2:4:9:5:2
chr19	36206050	.	A	C	346.09	PASS	AF=0.607143;AO=34;DP=56;FAO=34;FDP=56;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.00639901;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.937;QD=24.7205;RBI=0.0535442;REFB=-0.00282403;REVB=0.0531605;RO=22;SAF=12;SAR=22;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143459;STB=0.5789;STBP=0.163;TYPE=snp;VARB=0.00253364;OID=.;OPOS=36206050;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:22:22:34:34:0.607143:22:12:12:10:22:12:12:10
chr19	36206271	.	C	T	161.72	PASS	AF=0.459459;AO=18;DP=38;FAO=17;FDP=37;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=0.0730525;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.713;QD=17.4829;RBI=0.0730857;REFB=-0.00301152;REVB=0.00220289;RO=20;SAF=7;SAR=11;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19497;STB=0.601147;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=0.00382358;OID=.;OPOS=36206271;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:37:20:20:18:17:0.459459:11:7:12:8:10:7:12:8
chr19	36214632	.	A	AG,G	1271.37	PASS	AF=0.977011,0.0229885;AO=78,4;DP=87;FAO=85,2;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=37,2;FSAR=48,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0624293,-0.0132967;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=27.415,84.7486;QD=58.4537;RBI=0.0805474,0.022924;REFB=0,0;REVB=-0.0508966,-0.0186737;RO=4;SAF=35,3;SAR=43,1;SRF=1;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0185562,0.397043;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.0018072,0.028293;OID=.,.;OPOS=36214633,36214632;OREF=-,A;OALT=G,G;OMAPALT=AG,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:4:87:87:4:0:78,4:85,2:0.977011,0.0229885:43,1:35,3:1:3:48,0:37,2:0:0
chr19	36222857	.	C	T	324.37	PASS	AF=0.515152;AO=34;DP=66;FAO=34;FDP=66;FR=.;FRO=32;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=0.0650117;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.0629;QD=19.6585;RBI=0.0676754;REFB=0.0102198;REVB=0.0188;RO=32;SAF=13;SAR=21;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105463;STB=0.558681;STBP=0.398;TYPE=snp;VARB=-0.00829265;OID=.;OPOS=36222857;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:32:32:34:34:0.515152:21:13:16:16:21:13:16:16
chr19	36223747	.	A	G	148.51	PASS	AF=0.386364;AO=16;DP=43;FAO=17;FDP=44;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=19;FSRR=8;FWDB=0.00369162;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.763;QD=13.5008;RBI=0.0129944;REFB=-0.013374;REVB=-0.012459;RO=27;SAF=13;SAR=3;SRF=19;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165503;STB=0.549235;STBP=0.635;TYPE=snp;VARB=0.0196422;OID=.;OPOS=36223747;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:44:27:27:16:17:0.386364:3:13:19:8:4:13:19:8
chr19	36224705	.	A	G	375.03	PASS	AF=0.631579;AO=35;DP=56;FAO=36;FDP=57;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=25;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.0042819;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.503;QD=26.3178;RBI=0.0281262;REFB=-0.0370272;REVB=0.0277984;RO=21;SAF=11;SAR=24;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0873146;STB=0.551239;STBP=0.35;TYPE=snp;VARB=0.0152172;OID=.;OPOS=36224705;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:57:21:21:35:36:0.631579:24:11:9:12:25:11:9:12
chr19	36230767	.	A	G	44.05	PASS	AF=0.259259;AO=7;DP=27;FAO=7;FDP=27;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=-0.00535157;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.12;QD=6.52643;RBI=0.0146329;REFB=-2.56025e-05;REVB=-0.0136192;RO=20;SAF=5;SAR=2;SRF=6;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.452787;STB=0.783587;STBP=0.114;TYPE=snp;VARB=-0.000796466;OID=.;OPOS=36230767;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:27:27:20:20:7:7:0.259259:2:5:6:14:2:5:6:14
chr19	36243089	.	T	C	789.32	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00644619;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.3884;QD=63.1453;RBI=0.0421432;REFB=0;REVB=0.0416473;RO=0;SAF=30;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00129149;OID=.;OPOS=36243089;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:50:0:0:47:50:1:17:30:0:0:19:31:0:0
chr19	36243813	.	G	A	1259.43	PASS	AF=0.976471;AO=83;DP=85;FAO=83;FDP=85;FR=.;FRO=2;FSAF=33;FSAR=50;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00360414;FXX=0.0116266;HRUN=3;LEN=1;MLLD=155.034;QD=59.2672;RBI=0.00699458;REFB=-0.0667689;REVB=0.00599453;RO=2;SAF=33;SAR=50;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0278364;STB=0.514702;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=0.000140762;OID=.;OPOS=36243813;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:85:85:2:2:83:83:0.976471:50:33:2:0:50:33:2:0
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chr19	36258842	.	G	C	294.33	PASS	AF=0.619048;AO=26;DP=42;FAO=26;FDP=42;FR=.;FRO=16;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.00262144;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.635;QD=28.0312;RBI=0.0126399;REFB=0.00232181;REVB=-0.0123651;RO=16;SAF=11;SAR=15;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.096893;STB=0.553464;STBP=0.366;TYPE=snp;VARB=-0.00157125;OID=.;OPOS=36258842;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:16:16:26:26:0.619048:15:11:9:7:15:11:9:7
chr19	36258937	.	AG	A	316.32	PASS	AF=1;AO=25;DP=28;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.160034;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=18.4872;QD=42.1762;RBI=0.174411;REFB=0;REVB=-0.069342;RO=0;SAF=16;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.00979965;OID=.;OPOS=36258938;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:25:28:30:30:0:19:11:0:0:6:0:16:9:0:0
chr19	36268771	.	C	T	304.91	PASS	AF=0.586957;AO=27;DP=46;FAO=27;FDP=46;FR=.;FRO=19;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.00875664;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=291.545;QD=26.514;RBI=0.00906647;REFB=-0.0119896;REVB=0.00234992;RO=19;SAF=15;SAR=12;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0220304;STB=0.512186;STBP=0.845;TYPE=snp;VARB=0.00799037;OID=.;OPOS=36268771;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:19:19:27:27:0.586957:12:15:10:9:12:15:10:9
chr19	36270052	.	A	G	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00178377;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.785;QD=45.8064;RBI=0.0240241;REFB=0;REVB=-0.0239577;RO=0;SAF=8;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000157539;OID=.;OPOS=36270052;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:6:8:0:0:6:8:0:0
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chr19	36278111	.	C	A	34.83	PASS	AF=0.833333;AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0555508;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.166;QD=23.2183;RBI=0.0684896;REFB=0.0661848;REVB=0.0400616;RO=1;SAF=2;SAR=3;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121807;STB=0.571154;STBP=0.616;TYPE=snp;VARB=-0.00324386;OID=.;OPOS=36278111;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:6:6:1:1:5:5:0.833333:3:2:0:1:3:2:0:1
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chr19	36342267	.	G	A	282.61	PASS	AF=0.641026;AO=25;DP=39;FAO=25;FDP=39;FR=.;FRO=14;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.0112857;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.291;QD=28.9855;RBI=0.0179455;REFB=-0.0183067;REVB=0.0139526;RO=14;SAF=15;SAR=10;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0192918;STB=0.51063;STBP=0.903;TYPE=snp;VARB=0.00870543;OID=.;OPOS=36342267;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:14:14:25:25:0.641026:10:15:8:6:10:15:8:6
chr19	36351839	.	G	A	261.78	PASS	AF=0.533333;AO=24;DP=46;FAO=24;FDP=45;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.00288771;FXX=0.0425441;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.868;QD=23.2691;RBI=0.0107397;REFB=-0.0124839;REVB=0.0103442;RO=21;SAF=13;SAR=11;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0547387;STB=0.530587;STBP=0.704;TYPE=snp;VARB=0.0202359;OID=.;OPOS=36351839;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:45:21:21:24:24:0.533333:11:13:10:11:11:13:10:11
chr19	36355595	.	A	G	640.93	PASS	AF=0.955556;AO=42;DP=44;FAO=43;FDP=45;FR=.;FRO=2;FSAF=16;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0519254;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.9851;QD=56.9713;RBI=0.0841181;REFB=-0.0258737;REVB=-0.0661786;RO=2;SAF=16;SAR=26;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0107263;STB=0.506061;STBP=0.784;TYPE=snp;VARB=-0.000442864;OID=.;OPOS=36355595;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:44:45:2:2:42:43:0.955556:26:16:1:1:27:16:1:1
chr19	36365684	.	G	T	190.99	PASS	AF=0.403509;AO=23;DP=57;FAO=23;FDP=57;FR=.;FRO=34;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=0.022363;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.735;QD=13.4031;RBI=0.0224395;REFB=-0.0435977;REVB=0.00185101;RO=34;SAF=14;SAR=9;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0845597;STB=0.548547;STBP=0.572;TYPE=snp;VARB=0.0749335;OID=.;OPOS=36365684;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:34:34:23:23:0.403509:9:14:18:16:9:14:18:16
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chr19	36486445	.	G	C	465.14	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.052117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.153;QD=58.1421;RBI=0.0677824;REFB=0;REVB=0.0433391;RO=0;SAF=21;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000256281;OID=.;OPOS=36486445;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:11:21:0:0:11:21:0:0
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chr19	36499173	.	C	G,T	407.63	PASS	AF=0.2,0.8;AO=7,22;DP=29;FAO=6,24;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=4,10;FSAR=2,14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0801544,-0.0394794;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=74.4245,98.7397;QD=54.35;RBI=0.0804192,0.0553774;REFB=0,0;REVB=0.00652078,0.0388333;RO=0;SAF=4,10;SAR=3,12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.000119281,0.0250984;OID=.,.;OPOS=36499173,36499173;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:28:29:30:0:0:7,22:6,24:0.2,0.8:3,12:4,10:0:0:2,14:4,10:0:0
chr19	36530562	.	T	C	382.56	PASS	AF=0.965517;AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0508326;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.7906;QD=52.7669;RBI=0.0597838;REFB=-0.0282507;REVB=0.0314666;RO=1;SAF=10;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0442673;STB=0.523792;STBP=0.263;TYPE=snp;VARB=0.0111227;OID=.;OPOS=36530562;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:29:29:1:1:28:28:0.965517:18:10:1:0:18:10:1:0
chr19	36530913	.	C	G,T	698.26	PASS	AF=0.0384615,0.942308;AO=2,49;DP=52;FAO=2,49;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=0,17;FSAR=2,32;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=6.23846e-05,0.0397894;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=107.159,155.817;QD=53.7125;RBI=0.00461317,0.0408817;REFB=0.0413697,0.0428481;REVB=-0.00461275,-0.00938724;RO=1;SAF=0,17;SAR=2,32;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.697199,-0.0268741;STB=0.993266,0.51428;STBP=0.232,0.283;TYPE=snp,snp;VARB=0.041222,-9.90341e-05;OID=.,.;OPOS=36530913,36530913;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:52:52:1:1:2,49:2,49:0.0384615,0.942308:2,32:0,17:1:0:2,32:0,17:1:0
chr19	36590329	.	T	C	246.53	PASS	AF=0.952381;AO=20;DP=21;FAO=20;FDP=21;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0153339;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.845;QD=46.9583;RBI=0.0182901;REFB=-0.0892847;REVB=-0.00996999;RO=0;SAF=5;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.516113;STBP=0.644;TYPE=snp;VARB=0.00333603;OID=.;OPOS=36590329;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:21:21:0:1:20:20:0.952381:15:5:0:0:15:5:0:1
chr19	36592627	.	G	A	2339.77	PASS	AF=0.993548;AO=153;DP=158;FAO=154;FDP=155;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=114;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0668992;FXX=0.0189861;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.5507;QD=60.3812;RBI=0.0800679;REFB=0.0721858;REVB=0.0439928;RO=1;SAF=40;SAR=113;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00419162;STB=0.502183;STBP=0.583;TYPE=snp;VARB=-7.17741e-05;OID=.;OPOS=36592627;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:158:155:1:1:153:154:0.993548:113:40:0:1:114:40:0:1
chr19	36594659	.	A	T	545.22	PASS	AF=0.973684;AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00825747;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.8798;QD=57.3911;RBI=0.0109588;REFB=-0.0182269;REVB=-0.00720476;RO=1;SAF=7;SAR=30;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0153598;STB=0.508192;STBP=0.629;TYPE=snp;VARB=0.000960432;OID=.;OPOS=36594659;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:38:38:1:1:37:37:0.973684:30:7:0:1:30:7:0:1
chr19	36595436	.	A	C	651.23	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0288132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.311;QD=62.022;RBI=0.03529;REFB=0;REVB=-0.0203759;RO=0;SAF=22;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.7798e-05;OID=.;OPOS=36595436;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:42:0:0:41:42:1:19:22:0:0:20:22:0:0
chr19	36602729	.	G	C	594.33	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0190326;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.6121;QD=60.9567;RBI=0.0519442;REFB=0;REVB=0.0483318;RO=0;SAF=18;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.34792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000498035;OID=.;OPOS=36602729;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:21:18:0:0:21:18:0:0
chr19	36603703	.	T	A	702.89	PASS	AF=1;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0155287;FXX=0.0576812;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.923;QD=57.3791;RBI=0.0245143;REFB=0;REVB=0.0189687;RO=0;SAF=32;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.70321e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000294498;OID=.;OPOS=36603703;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:49:0:0:49:49:1:17:32:0:0:17:32:0:0
chr19	36604735	.	CA	C	517.55	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00541256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.783;QD=59.1481;RBI=0.00979363;REFB=0;REVB=0.00816206;RO=0;SAF=17;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=2.0435e-05;OID=.;OPOS=36604736;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:35:35:35:35:0:17:18:0:0:4:0:17:18:0:0
chr19	36642884	.	T	C	340.74	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0402893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=302.396;QD=54.5177;RBI=0.0402894;REFB=0;REVB=-0.000115255;RO=0;SAF=6;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.99916e-05;OID=.;OPOS=36642884;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:19:6:0:0:19:6:0:0
chr19	36727365	.	G	A	757.09	PASS	AF=1;AO=47;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00847117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.025;QD=63.0907;RBI=0.0178002;REFB=0;REVB=0.0156553;RO=1;SAF=28;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.016502;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.42322e-05;OID=.;OPOS=36727365;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:1:0:47:48:1:19:28:1:0:19:29:0:0
chr19	36729041	.	A	G	145.23	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00452671;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.925;QD=44.6862;RBI=0.0261896;REFB=0;REVB=0.0257954;RO=0;SAF=6;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000406055;OID=.;OPOS=36729041;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:7:6:0:0:7:6:0:0
chr19	37117302	.	A	G	570.6	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0329136;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.53;QD=60.0627;RBI=0.0329156;REFB=0;REVB=0.000356857;RO=0;SAF=22;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.39865e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.26442e-05;OID=.;OPOS=37117302;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:38:0:0:35:38:1:13:22:0:0:13:25:0:0
chr19	37210805	.	C	T	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0196655;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.878;QD=53.2767;RBI=0.0463548;REFB=0;REVB=-0.0419767;RO=0;SAF=17;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.9951e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000292936;OID=.;OPOS=37210805;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:6:17:0:0:6:17:0:0
chr19	37690420	.	C	T	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.012301;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=161.851;QD=40.7625;RBI=0.0142927;REFB=0;REVB=0.00727796;RO=0;SAF=4;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000110801;OID=.;OPOS=37690420;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:6:4:0:0:6:4:0:0
chr19	38030265	.	G	A	740.41	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0306152;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.988;QD=56.9548;RBI=0.0355149;REFB=0;REVB=0.0180004;RO=0;SAF=31;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.93989e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000196899;OID=.;OPOS=38030265;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:21:31:0:0:21:31:0:0
chr19	38033251	.	C	T	223.19	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0170343;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.3651;QD=49.5978;RBI=0.020837;REFB=0;REVB=0.0120006;RO=0;SAF=9;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000708698;OID=.;OPOS=38033251;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:9:9:0:0:9:9:0:0
chr19	38046967	.	G	A	789.91	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00261972;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.796;QD=64.4823;RBI=0.0152658;REFB=0;REVB=0.0150394;RO=0;SAF=26;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.23234e-05;OID=.;OPOS=38046967;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:23:26:0:0:23:26:0:0
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chr19	38091932	.	A	T	594.54	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00904062;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.245;QD=60.9781;RBI=0.0137084;REFB=0;REVB=0.0103048;RO=0;SAF=16;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.43889e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.80319e-05;OID=.;OPOS=38091932;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:23:16:0:0:23:16:0:0
chr19	38202516	.	A	C	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0274336;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.109;QD=53.2771;RBI=0.141804;REFB=0;REVB=0.139125;RO=0;SAF=11;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00133683;OID=.;OPOS=38202516;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:12:11:0:0:12:11:0:0
chr19	38314767	.	A	G	598.22	PASS	AF=1;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00228365;FXX=0.0249938;HRUN=4;LEN=1;MLLD=325.421;QD=61.3557;RBI=0.00706268;REFB=0;REVB=0.00668329;RO=0;SAF=20;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.3303e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.19153e-06;OID=.;OPOS=38314767;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:39:0:0:39:39:1:19:20:0:0:19:20:0:0
chr19	38376485	.	T	A	375.59	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0264996;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.793;QD=55.6425;RBI=0.0290778;REFB=0;REVB=0.0119704;RO=0;SAF=9;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.82268e-05;OID=.;OPOS=38376485;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:18:9:0:0:18:9:0:0
chr19	38377564	.	T	C	329.87	PASS	AF=0.961538;AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.109239;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=48.3246;QD=50.7488;RBI=0.11019;REFB=0.0474637;REVB=-0.0144434;RO=1;SAF=10;SAR=15;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0299354;STB=0.516116;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=-0.00673065;OID=.;OPOS=38377564;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:26:26:1:1:25:25:0.961538:15:10:0:1:15:10:0:1
chr19	38377773	.	G	A	632.22	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0426718;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.5501;QD=61.6795;RBI=0.0520194;REFB=0;REVB=-0.0297513;RO=0;SAF=24;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.2194e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000212808;OID=.;OPOS=38377773;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:17:24:0:0:17:24:0:0
chr19	38378107	.	G	A	579.48	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0294504;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.9467;QD=60.9976;RBI=0.0514776;REFB=0;REVB=-0.042221;RO=0;SAF=20;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.51048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00115894;OID=.;OPOS=38378107;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:18:20:0:0:18:20:0:0
chr19	38378539	.	G	C	805.18	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00234751;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.728;QD=64.4143;RBI=0.0122574;REFB=0;REVB=0.0120305;RO=0;SAF=31;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.46384e-05;OID=.;OPOS=38378539;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:19:31:0:0:19:31:0:0
chr19	38379446	.	C	T	594.52	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0258536;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.25;QD=60.9766;RBI=0.0272687;REFB=0;REVB=-0.00867023;RO=0;SAF=18;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.34792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.91367e-05;OID=.;OPOS=38379446;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:21:18:0:0:21:18:0:0
chr19	38382328	.	C	T	1008.45	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00790821;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.0133;QD=59.3207;RBI=0.0132167;REFB=0;REVB=-0.0105897;RO=0;SAF=26;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.33123e-05;OID=.;OPOS=38382328;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:42:26:0:0:42:26:0:0
chr19	38384421	.	C	G	136.32	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0132344;FXX=0.076864;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.1439;QD=45.4407;RBI=0.0184005;REFB=0;REVB=-0.0127839;RO=0;SAF=1;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.23983e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00510675;OID=.;OPOS=38384421;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:11:1:0:0:11:1:0:0
chr19	38702777	.	C	T	144.9	PASS	AF=0.351852;AO=18;DP=53;FAO=19;FDP=54;FR=.;FRO=35;FSAF=2;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=24;FWDB=0.0175193;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.396;QD=10.7335;RBI=0.0179808;REFB=-0.0165356;REVB=-0.00404738;RO=33;SAF=2;SAR=16;SRF=11;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.383309;STB=0.729074;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.0349056;OID=.;OPOS=38702777;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:54:33:35:18:19:0.351852:16:2:11:22:17:2:11:24
chr19	38706989	.	G	A	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00477685;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.092;QD=55.0987;RBI=0.0310926;REFB=0;REVB=0.0307234;RO=0;SAF=18;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.28381e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.64032e-05;OID=.;OPOS=38706989;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:8:18:0:0:8:18:0:0
chr19	38709568	.	C	T	203.82	PASS	AF=1;AO=16;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0569136;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=84.1739;QD=47.9569;RBI=0.0759345;REFB=0;REVB=0.0502682;RO=0;SAF=10;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00205802;OID=.;OPOS=38709568;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:16:17:1:6:10:0:0:7:10:0:0
chr19	38794895	.	T	C	1549.11	PASS	AF=1;AO=97;DP=97;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0098359;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.885;QD=63.8808;RBI=0.0228652;REFB=0;REVB=-0.0206415;RO=0;SAF=48;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.12345e-05;OID=.;OPOS=38794895;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:97:97:0:0:97:97:1:49:48:0:0:49:48:0:0
chr19	38795250	.	G	A,C	661.1	PASS	AF=0.976744,0.0232558;AO=40,2;DP=43;FAO=42,1;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=19,1;FSAR=23,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0431452,0.00128174;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=148.289,122.959;QD=61.4973;RBI=0.0819765,0.0220955;REFB=0,0;REVB=0.0697039,-0.0220583;RO=1;SAF=19,1;SAR=21,1;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0218106,0.25849;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00255082,0.0614614;OID=.,.;OPOS=38795250,38795250;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:4:43:43:1:0:40,2:42,1:0.976744,0.0232558:21,1:19,1:0:1:23,0:19,1:0:0
chr19	38795546	.	TGAAGAAGA	TGAAGA,TGAAGAAGG	531.43	PASS	AF=0.944444,0.0555556;AO=32,2;DP=36;FAO=34,2;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=20,0;FSAR=14,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.03659,-0.0230871;FXX=0.0526177;HRUN=2,2;LEN=3,1;MLLD=256.165,47.8162;QD=59.0476;RBI=0.0418223,0.0633111;REFB=0,0;REVB=0.0202553,-0.0589515;RO=0;SAF=19,0;SAR=13,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.00285758,-0.0457245;OID=.,.;OPOS=38795547,38795554;OREF=GAA,A;OALT=-,G;OMAPALT=TGAAGA,TGAAGAAGG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.944444,0.0555556:32,2:36:34,2:36:0:20,0:14,2:0:0:9:0:19,0:13,2:0:0
chr19	38798086	.	T	C	152.3	PASS	AF=1;AO=13;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0414921;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.217;QD=43.5153;RBI=0.0416163;REFB=0;REVB=-0.00321266;RO=0;SAF=10;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000952929;OID=.;OPOS=38798086;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:13:14:1:3:10:0:0:3:11:0:0
chr19	38800165	.	C	T	446.8	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00966013;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.837;QD=57.6518;RBI=0.0252998;REFB=0;REVB=0.0233829;RO=0;SAF=12;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.0947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000105574;OID=.;OPOS=38800165;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:31:0:0:29:31:1:17:12:0:0:19:12:0:0
chr19	38817486	.	T	C	465.14	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0566299;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=147.967;QD=58.142;RBI=0.0597395;REFB=0;REVB=0.0190226;RO=0;SAF=18;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000206219;OID=.;OPOS=38817486;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:14:18:0:0:14:18:0:0
chr19	38817876	.	G	A	752.76	PASS	AF=1;AO=47;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000374461;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.93;QD=62.7304;RBI=0.0346903;REFB=0;REVB=0.0346883;RO=0;SAF=24;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000134633;OID=.;OPOS=38817876;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:47:48:1:23:24:0:0:24:24:0:0
chr19	38827960	.	T	C	157.97	PASS	AF=0.515152;AO=16;DP=32;FAO=17;FDP=33;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.00236724;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.852;QD=19.148;RBI=0.0268561;REFB=-0.0121814;REVB=0.0267515;RO=16;SAF=9;SAR=7;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512805;STBP=0.905;TYPE=snp;VARB=0.0114804;OID=.;OPOS=38827960;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:33:16:16:16:17:0.515152:7:9:9:7:7:10:9:7
chr19	38847431	.	T	C	179.01	PASS	AF=0.385965;AO=22;DP=57;FAO=22;FDP=57;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=-0.00252966;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.558;QD=12.5622;RBI=0.0137969;REFB=0.00176281;REVB=0.013563;RO=35;SAF=13;SAR=9;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112908;STB=0.565158;STBP=0.452;TYPE=snp;VARB=-0.00315851;OID=.;OPOS=38847431;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:35:35:22:22:0.385965:9:13:17:18:9:13:17:18
chr19	38861333	.	G	A	264.22	PASS	AF=0.518519;AO=28;DP=52;FAO=28;FDP=54;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=-0.0105563;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.116;QD=19.5715;RBI=0.0358265;REFB=-0.0384307;REVB=0.034236;RO=24;SAF=13;SAR=15;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11039;STB=0.5576;STBP=0.417;TYPE=snp;VARB=0.0341428;OID=.;OPOS=38861333;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:54:24:26:28:28:0.518519:15:13:8:16:15:13:9:17
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chr19	38912764	.	A	G	255.03	PASS	AF=0.510638;AO=19;DP=44;FAO=24;FDP=47;FR=.,HEALED;FRO=23;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=17;FWDB=0.00555593;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.511;QD=21.7048;RBI=0.0570318;REFB=-0.0435179;REVB=-0.0567606;RO=14;SAF=12;SAR=7;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.209385;STB=0.635146;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=0.0218821;OID=.;OPOS=38912764;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:47:14:23:19:24:0.510638:7:12:5:9:11:13:6:17
chr19	38935280	.	A	G	1377.39	PASS	AF=1;AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0154679;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.6063;QD=62.6086;RBI=0.0176864;REFB=0;REVB=-0.00857631;RO=0;SAF=46;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.28062e-05;OID=.;OPOS=38935280;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:88:88:0:0:88:88:1:42:46:0:0:42:46:0:0
chr19	38939408	.	T	C	483.21	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0140607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.222;QD=58.5709;RBI=0.0548301;REFB=0;REVB=0.0529965;RO=0;SAF=21;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000274004;OID=.;OPOS=38939408;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:12:21:0:0:12:21:0:0
chr19	38946182	.	G	A	746.84	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00952413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.982;QD=63.5607;RBI=0.00969011;REFB=0;REVB=-0.0017858;RO=0;SAF=25;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.06308e-05;OID=.;OPOS=38946182;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:22:25:0:0:22:25:0:0
chr19	38949904	.	C	T	408.57	PASS	AF=1;AO=24;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0169496;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=100.907;QD=56.3543;RBI=0.045506;REFB=0;REVB=0.0422316;RO=0;SAF=5;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000716027;OID=.;OPOS=38949904;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:24:29:1:19:5:0:0:21:8:0:0
chr19	38956803	.	G	A	2079.49	PASS	AF=1;AO=131;DP=131;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0320715;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.894;QD=62.5411;RBI=0.0491335;REFB=0;REVB=0.0372226;RO=0;SAF=63;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.81943e-05;OID=.;OPOS=38956803;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:131:133:0:0:131:133:1:68:63:0:0:69:64:0:0
chr19	38990336	.	C	T	139.0	PASS	AF=0.555556;AO=14;DP=26;FAO=15;FDP=27;FR=.;FRO=12;FSAF=13;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=0.0189477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.654;QD=20.593;RBI=0.032018;REFB=-0.0118929;REVB=0.0258096;RO=12;SAF=12;SAR=2;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.246078;STB=0.649766;STBP=0.184;TYPE=snp;VARB=0.00549803;OID=.;OPOS=38990336;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:27:12:12:14:15:0.555556:2:12:8:4:2:13:8:4
chr19	38990345	.	C	T	144.2	PASS	AF=0.625;AO=15;DP=24;FAO=15;FDP=24;FR=.;FRO=9;FSAF=13;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.0241633;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=181.252;QD=24.034;RBI=0.0344433;REFB=-0.0175032;REVB=0.0245455;RO=9;SAF=13;SAR=2;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.321265;STB=0.683919;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.00787388;OID=.;OPOS=38990345;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:24:24:9:9:15:15:0.625:2:13:5:4:2:13:5:4
chr19	38993547	.	C	T	260.45	PASS	AF=0.3125;AO=35;DP=112;FAO=35;FDP=112;FR=.;FRO=77;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=55;FSRR=22;FWDB=-0.0155761;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.817;QD=9.30185;RBI=0.0198039;REFB=-0.00281239;REVB=-0.0122303;RO=77;SAF=22;SAR=13;SRF=55;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112401;STB=0.565182;STBP=0.371;TYPE=snp;VARB=0.00671338;OID=.;OPOS=38993547;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:112:77:77:35:35:0.3125:13:22:55:22:13:22:55:22
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chr19	39224413	.	A	G	167.43	PASS	AF=0.586207;AO=17;DP=29;FAO=17;FDP=29;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=14;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.0177277;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=220.992;QD=23.0939;RBI=0.038082;REFB=-0.0129188;REVB=-0.0337042;RO=12;SAF=3;SAR=14;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.311293;STB=0.677182;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.012849;OID=.;OPOS=39224413;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:29:29:12:12:17:17:0.586207:14:3:6:6:14:3:6:6
chr19	39227895	.	C	T	520.94	PASS	AF=0.585366;AO=48;DP=83;FAO=48;FDP=82;FR=.;FRO=34;FSAF=16;FSAR=32;FSRF=3;FSRR=31;FWDB=0.00307296;FXX=0.0238067;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.145;QD=25.4115;RBI=0.00594646;REFB=-0.00532895;REVB=-0.0050909;RO=34;SAF=16;SAR=32;SRF=3;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.228777;STB=0.623718;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.00387047;OID=.;OPOS=39227895;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:82:34:34:48:48:0.585366:32:16:3:31:32:16:3:31
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chr19	39367111	.	T	C	426.54	PASS	AF=0.939394;AO=31;DP=33;FAO=31;FDP=33;FR=.;FRO=2;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0480783;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.2286;QD=51.7023;RBI=0.0504736;REFB=-0.0459207;REVB=-0.0153641;RO=1;SAF=10;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0443701;STB=0.545424;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=0.0202522;OID=.;OPOS=39367111;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:33:33:1:2:31:31:0.939394:21:10:1:0:21:10:2:0
chr19	39385531	.	CT	C,CC	304.94	PASS	AF=0.0434783,0.956522;AO=8,14;DP=22;FAO=1,22;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=0,11;FSAR=1,11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0714862,0.0838245;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=169.718,180.433;QD=53.0333;RBI=0.0735768,0.0848139;REFB=0,0;REVB=0.0174148,0.0129166;RO=0;SAF=7,3;SAR=1,11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=4.78849e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.00708464,0.0103186;OID=.,.;OPOS=39385532,39385532;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0434783,0.956522:8,14:22:1,22:23:0:0,11:1,11:0:0:5:0:7,3:1,11:0:0
chr19	39432783	.	T	C	689.34	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00049003;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.511;QD=62.6669;RBI=0.0167048;REFB=0;REVB=0.0166977;RO=0;SAF=20;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.30465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.78808e-05;OID=.;OPOS=39432783;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:24:20:0:0:24:20:0:0
chr19	39433299	.	A	G	538.55	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0191261;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.552;QD=59.8393;RBI=0.0249819;REFB=0;REVB=-0.0160713;RO=0;SAF=12;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.20143e-06;OID=.;OPOS=39433299;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:36:0:0:35:36:1:23:12:0:0:23:13:0:0
chr19	39590955	.	G	A	86.31	PASS	AF=0.392857;AO=11;DP=28;FAO=11;FDP=28;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.0364675;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.152;QD=12.3295;RBI=0.0367387;REFB=-0.0123503;REVB=-0.00445572;RO=17;SAF=6;SAR=5;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0165255;STB=0.509786;STBP=0.957;TYPE=snp;VARB=0.0156303;OID=.;OPOS=39590955;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:28:28:17:17:11:11:0.392857:5:6:9:8:5:6:9:8
chr19	39592099	.	T	C	258.46	PASS	AF=0.55814;AO=24;DP=43;FAO=24;FDP=43;FR=.;FRO=19;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=-0.0528608;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.0396;QD=24.0423;RBI=0.0595921;REFB=-0.0386532;REVB=-0.0275128;RO=19;SAF=13;SAR=11;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136729;STB=0.576045;STBP=0.265;TYPE=snp;VARB=0.0180037;OID=.;OPOS=39592099;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:19:19:24:24:0.55814:11:13:7:12:11:13:7:12
chr19	39592138	.	C	T	256.44	PASS	AF=0.533333;AO=24;DP=45;FAO=24;FDP=45;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=0.024967;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.044;QD=22.7946;RBI=0.0254053;REFB=-0.0163776;REVB=-0.00469849;RO=21;SAF=11;SAR=13;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106358;STB=0.559274;STBP=0.388;TYPE=snp;VARB=0.0245883;OID=.;OPOS=39592138;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:21:21:24:24:0.533333:13:11:7:14:13:11:7:14
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chr19	39888449	.	C	T	275.98	PASS	AF=0.581395;AO=25;DP=43;FAO=25;FDP=43;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.00583144;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.352;QD=25.6726;RBI=0.0300436;REFB=-0.0365722;REVB=0.0294722;RO=18;SAF=11;SAR=14;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0456248;STB=0.525308;STBP=0.702;TYPE=snp;VARB=0.0193769;OID=.;OPOS=39888449;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:18:18:25:25:0.581395:14:11:9:9:14:11:9:9
chr19	39891161	.	T	C	258.71	PASS	AF=0.352273;AO=31;DP=88;FAO=31;FDP=88;FR=.;FRO=57;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=25;FSRR=32;FWDB=-0.00233706;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.616;QD=11.7597;RBI=0.0274896;REFB=-0.00149189;REVB=0.0273901;RO=57;SAF=17;SAR=14;SRF=25;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122692;STB=0.570758;STBP=0.35;TYPE=snp;VARB=0.00209605;OID=.;OPOS=39891161;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:57:57:31:31:0.352273:14:17:25:32:14:17:25:32
chr19	39891219	.	C	T	230.39	PASS	AF=0.383562;AO=27;DP=74;FAO=28;FDP=73;FR=.;FRO=45;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=28;FWDB=-0.0175582;FXX=0.0266631;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.555;QD=12.6241;RBI=0.0216197;REFB=-0.00155303;REVB=-0.0126143;RO=47;SAF=14;SAR=13;SRF=19;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125487;STB=0.596441;STBP=0.21;TYPE=snp;VARB=0.0077462;OID=.;OPOS=39891219;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:73:47:45:27:28:0.383562:13:14:19:28:13:15:17:28
chr19	39905903	.	A	G	196.72	PASS	AF=0.465116;AO=20;DP=43;FAO=20;FDP=43;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=0.010877;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.655;QD=18.2998;RBI=0.0492502;REFB=-0.0220268;REVB=-0.048034;RO=23;SAF=12;SAR=8;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156045;STB=0.588696;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=0.0229006;OID=.;OPOS=39905903;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:23:23:20:20:0.465116:8:12:10:13:8:12:10:13
chr19	39913634	.	G	A	238.94	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00930467;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.3201;QD=50.304;RBI=0.0189146;REFB=0;REVB=-0.0164677;RO=0;SAF=5;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.66352e-05;OID=.;OPOS=39913634;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:14:5:0:0:14:5:0:0
chr19	39914748	.	G	A	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0233207;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.988;QD=44.6898;RBI=0.0254845;REFB=0;REVB=-0.0102764;RO=0;SAF=4;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.58798e-05;OID=.;OPOS=39914748;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:9:4:0:0:9:4:0:0
chr19	39915758	.	C	G	265.99	PASS	AF=0.954545;AO=21;DP=22;FAO=21;FDP=22;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0639195;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=216.759;QD=48.3626;RBI=0.071868;REFB=-0.0536116;REVB=0.0328527;RO=0;SAF=3;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.571354;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.000672419;OID=.;OPOS=39915758;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:22:22:0:1:21:21:0.954545:18:3:0:0:18:3:1:0
chr19	39916110	.	GGGA	G	525.51	PASS	AF=1;AO=43;DP=47;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0196168;FXX=0.139972;HRUN=3;LEN=3;MLLD=182.365;QD=48.8846;RBI=0.0230639;REFB=0;REVB=-0.0121295;RO=0;SAF=25;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0.318824;SSEP=0;SSSB=-5.65211e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000893118;OID=.;OPOS=39916111;OREF=GGA;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:43:47:43:43:0:25:18:0:0:9:0:25:18:0:0
chr19	39926509	.	A	C	85.28	PASS	AF=0.366667;AO=11;DP=29;FAO=11;FDP=30;FR=.;FRO=19;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=-0.0480902;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.072;QD=11.3709;RBI=0.0575498;REFB=-0.0250935;REVB=-0.0316118;RO=18;SAF=3;SAR=8;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0759404;STB=0.571292;STBP=0.625;TYPE=snp;VARB=0.0426208;OID=.;OPOS=39926509;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:29:30:18:19:11:11:0.366667:8:3:6:12:8:3:7:12
chr19	39926521	.	G	A	73.83	PASS	AF=0.333333;AO=10;DP=30;FAO=10;FDP=30;FR=.;FRO=20;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=0.0186302;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=112.89;QD=9.84392;RBI=0.0186862;REFB=-0.00697033;REVB=-0.00144548;RO=20;SAF=3;SAR=7;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0630627;STB=0.538383;STBP=0.787;TYPE=snp;VARB=0.0142208;OID=.;OPOS=39926521;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:30:30:20:20:10:10:0.333333:7:3:7:13:7:3:7:13
chr19	39932023	.	T	C	1608.18	PASS	AF=0.990826;AO=105;DP=107;FAO=108;FDP=109;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0114482;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.477;QD=59.0158;RBI=0.0602144;REFB=0.0564504;REVB=0.059116;RO=2;SAF=39;SAR=66;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141628;STB=0.503649;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=-6.0066e-05;OID=.;OPOS=39932023;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:107:109:2:1:105:108:0.990826:66:39:0:2:68:40:0:1
chr19	39932066	.	T	C	1408.07	PASS	AF=0.98913;AO=85;DP=85;FAO=91;FDP=92;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=65;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0233291;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.55;QD=61.2202;RBI=0.0549246;REFB=-0.0116566;REVB=0.0497238;RO=0;SAF=24;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.56037e-08;STB=0.509432;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=0.000355866;OID=.;OPOS=39932066;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:85:92:0:1:85:91:0.98913:61:24:0:0:65:26:1:0
chr19	39944082	.	C	T	393.7	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144537;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.147;QD=56.2427;RBI=0.0490654;REFB=0;REVB=0.0468882;RO=0;SAF=11;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000696221;OID=.;OPOS=39944082;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:28:0:0:27:28:1:16:11:0:0:17:11:0:0
chr19	39967318	.	T	C	330.99	PASS	AF=0.896552;AO=26;DP=29;FAO=26;FDP=29;FR=.;FRO=3;FSAF=7;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.17571;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.5252;QD=45.6539;RBI=0.17661;REFB=-0.0312046;REVB=0.0178028;RO=3;SAF=7;SAR=19;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0679039;STB=0.536558;STBP=0.363;TYPE=snp;VARB=0.00671926;OID=.;OPOS=39967318;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:29:29:3:3:26:26:0.896552:19:7:0:3:19:7:0:3
chr19	39967320	.	T	C	344.11	PASS	AF=0.928571;AO=26;DP=28;FAO=26;FDP=28;FR=.;FRO=2;FSAF=7;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0390801;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.3403;QD=49.1586;RBI=0.0402639;REFB=-0.122378;REVB=-0.00969183;RO=2;SAF=7;SAR=19;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0464325;STB=0.524981;STBP=0.569;TYPE=snp;VARB=0.00917894;OID=.;OPOS=39967320;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:28:28:2:2:26:26:0.928571:19:7:0:2:19:7:0:2
chr19	39967322	.	T	C	284.54	PASS	AF=0.92;AO=22;DP=24;FAO=23;FDP=25;FR=.;FRO=2;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0805496;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.704;QD=45.5264;RBI=0.100197;REFB=-0.0316783;REVB=0.0595921;RO=2;SAF=7;SAR=15;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0577469;STB=0.529387;STBP=0.45;TYPE=snp;VARB=0.00554874;OID=.;OPOS=39967322;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:24:25:2:2:22:23:0.92:15:7:0:2:16:7:0:2
chr19	39994711	.	T	C	976.47	PASS	AF=1;AO=66;DP=67;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.016187;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.0374;QD=59.1803;RBI=0.0359592;REFB=0;REVB=0.0321099;RO=0;SAF=28;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.34209e-05;OID=.;OPOS=39994711;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:66:0:0:66:66:1:38:28:0:0:38:28:0:0
chr19	40009396	.	A	G	160.3	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0681582;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=51.9293;QD=45.8006;RBI=0.0861987;REFB=0;REVB=0.0527701;RO=0;SAF=5;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000647413;OID=.;OPOS=40009396;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:9:5:0:0:9:5:0:0
chr19	40023308	.	A	G	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0152362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.096;QD=42.1826;RBI=0.0152412;REFB=0;REVB=-0.000390223;RO=0;SAF=5;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000113272;OID=.;OPOS=40023308;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:6:5:0:0:6:5:0:0
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chr19	40149297	.	T	A	954.49	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0371384;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.3287;QD=58.738;RBI=0.0729874;REFB=0;REVB=0.0628323;RO=0;SAF=20;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000208804;OID=.;OPOS=40149297;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:45:20:0:0:45:20:0:0
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chr19	40225646	.	G	A	109.26	PASS	AF=0.419355;AO=13;DP=31;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=15;FWDB=0.0171213;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.159;QD=14.0976;RBI=0.0174694;REFB=-0.00247108;REVB=-0.00346999;RO=18;SAF=8;SAR=5;SRF=3;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.426688;STB=0.743863;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.00271569;OID=.;OPOS=40225646;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:18:18:13:13:0.419355:5:8:3:15:5:8:3:15
chr19	40363020	.	G	A	107.42	PASS	AF=0.382353;AO=13;DP=34;FAO=13;FDP=34;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=0.00639915;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.637;QD=12.6375;RBI=0.0262559;REFB=-0.0288139;REVB=0.0254642;RO=20;SAF=6;SAR=7;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117418;STB=0.580526;STBP=0.494;TYPE=snp;VARB=0.0644637;OID=.;OPOS=40363020;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:20:21:13:13:0.382353:7:6:7:13:7:6:7:14
chr19	40363926	.	C	G	194.05	PASS	AF=0.434783;AO=19;DP=46;FAO=20;FDP=46;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=0.00143988;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.742;QD=16.8737;RBI=0.0385782;REFB=-0.0125121;REVB=-0.0385513;RO=26;SAF=9;SAR=10;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0650585;STB=0.54995;STBP=0.595;TYPE=snp;VARB=0.00943871;OID=.;OPOS=40363926;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:26:26:19:20:0.434783:10:9:14:12:11:9:14:12
chr19	40366362	.	G	C	140.95	PASS	AF=0.346154;AO=17;DP=51;FAO=18;FDP=52;FR=.;FRO=34;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=0.0150279;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.558;QD=10.8425;RBI=0.0155493;REFB=-0.016927;REVB=-0.00399306;RO=34;SAF=3;SAR=14;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.442527;STB=0.719366;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.0239191;OID=.;OPOS=40366362;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:52:34:34:17:18:0.346154:14:3:18:16:14:4:18:16
chr19	40368327	.	CTTC	CTC,CTTT	344.85	PASS	AF=0.804878,0.146341;AO=15,6;DP=41;FAO=33,6;FDP=41;FR=.;FRO=2;FSAF=15,5;FSAR=18,1;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.215459,-0.0601268;FXX=0;HRUN=2,1;LEN=1,1;MLLD=14.7644,125.101;QD=33.6442;RBI=0.627982,0.0637814;REFB=0.00550062,0.0319008;REVB=0.589863,-0.0212801;RO=18;SAF=12,5;SAR=3,1;SRF=4;SRR=14;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.538599,0.629073;STB=0.531231,0.583085;STBP=0.15,0.683;TYPE=del,snp;VARB=0.110997,0.117676;OID=.,.;OPOS=40368328,40368330;OREF=T,C;OALT=-,T;OMAPALT=CTC,CTTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.804878,0.146341:15,6:41:33,6:41:2:15,5:18,1:2:0:33:18:12,5:3,1:4:14
chr19	40368395	.	C	T	340.52	PASS	AF=0.538462;AO=35;DP=65;FAO=35;FDP=65;FR=.;FRO=30;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.00254824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.427;QD=20.9551;RBI=0.0181266;REFB=-0.0161631;REVB=0.0179465;RO=30;SAF=19;SAR=16;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0200363;STB=0.511085;STBP=0.842;TYPE=snp;VARB=0.0138783;OID=.;OPOS=40368395;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:30:30:35:35:0.538462:16:19:17:13:16:19:17:13
chr19	40368498	.	AA	CC	362.03	PASS	AF=1;AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.024683;FXX=0.0370233;HRUN=3;LEN=2;MLLD=208.805;QD=55.6971;RBI=0.0282187;REFB=0;REVB=-0.0136764;RO=0;SAF=11;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=2.53398e-05;OID=.;OPOS=40368498;OREF=AA;OALT=CC;OMAPALT=CC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:26:0:0:26:26:1:15:11:0:0:15:11:0:0
chr19	40368520	.	G	C	46.1	PASS	AF=0.375;AO=6;DP=16;FAO=6;FDP=16;FR=.,HEALED;FRO=9;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.0775187;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.3838;QD=11.5252;RBI=0.0775367;REFB=0.0550446;REVB=0.00167188;RO=8;SAF=4;SAR=2;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.271446;STB=0.635901;STBP=0.403;TYPE=snp;VARB=-0.0360012;OID=.;OPOS=40368520;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:39:16:16:8:9:6:6:0.375:2:4:3:5:2:4:4:5
chr19	40376675	.	G	A	68.82	PASS	AF=0.5;AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=0.000863279;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.2249;QD=15.2924;RBI=0.0514752;REFB=0.00220641;REVB=0.0514679;RO=9;SAF=6;SAR=3;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.36755;STB=0.713832;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.000569065;OID=.;OPOS=40376675;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:18:18:9:9:9:9:0.5:3:6:2:7:3:6:2:7
chr19	40376880	.	T	C	69.21	PASS	AF=0.222222;AO=10;DP=45;FAO=10;FDP=45;FR=.;FRO=35;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=20;FSRR=15;FWDB=0.0407041;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.2158;QD=6.15191;RBI=0.0652532;REFB=-0.00521865;REVB=-0.0510016;RO=34;SAF=3;SAR=7;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.343457;STB=0.708837;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=0.0157518;OID=.;OPOS=40376880;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:69:45:45:34:35:10:10:0.222222:7:3:20:14:7:3:20:15
chr19	40392482	.	A	G	115.08	PASS	AF=0.541667;AO=13;DP=24;FAO=13;FDP=24;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=-0.0444814;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.0478;QD=19.1802;RBI=0.0997196;REFB=-0.0312554;REVB=-0.0892491;RO=11;SAF=2;SAR=11;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.460257;STB=0.766975;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.012881;OID=.;OPOS=40392482;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:24:24:11:11:13:13:0.541667:11:2:7:4:11:2:7:4
chr19	40392631	.	G	A	124.16	PASS	AF=0.722222;AO=13;DP=18;FAO=13;FDP=18;FR=.;FRO=5;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.00646616;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=209.913;QD=27.592;RBI=0.00964769;REFB=-0.0272252;REVB=-0.00716007;RO=5;SAF=7;SAR=6;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.030782;STB=0.517215;STBP=0.812;TYPE=snp;VARB=0.0126703;OID=.;OPOS=40392631;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:18:18:5:5:13:13:0.722222:6:7:3:2:6:7:3:2
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chr19	40886993	.	C	T	85.27	PASS	AF=0.366667;AO=11;DP=30;FAO=11;FDP=30;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=-0.0127634;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=236.34;QD=11.3694;RBI=0.015093;REFB=-0.0195012;REVB=-0.00805573;RO=19;SAF=6;SAR=5;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0933329;STB=0.555457;STBP=0.676;TYPE=snp;VARB=0.0421296;OID=.;OPOS=40886993;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:30:30:19:19:11:11:0.366667:5:6:12:7:5:6:12:7
chr19	40900865	.	C	T	805.27	PASS	AF=0.967213;AO=58;DP=62;FAO=59;FDP=61;FR=.;FRO=2;FSAF=41;FSAR=18;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0395511;FXX=0.0161264;HRUN=3;LEN=1;MLLD=174.023;QD=52.8045;RBI=0.0409231;REFB=-0.0349868;REVB=0.0105077;RO=3;SAF=41;SAR=17;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00448793;STB=0.511901;STBP=0.41;TYPE=snp;VARB=0.00125711;OID=.;OPOS=40900865;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:62:61:3:2:58:59:0.967213:17:41:2:1:18:41:2:0
chr19	41008178	.	A	G	126.56	PASS	AF=0.764706;AO=13;DP=17;FAO=13;FDP=17;FR=.;FRO=4;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0354018;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.695;QD=29.7791;RBI=0.0376268;REFB=-0.0117567;REVB=-0.0127469;RO=4;SAF=7;SAR=6;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121094;STB=0.567464;STBP=0.366;TYPE=snp;VARB=0.0170949;OID=.;OPOS=41008178;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:17:17:4:4:13:13:0.764706:6:7:1:3:6:7:1:3
chr19	41123093	.	A	AG	277.4	PASS	AF=1;AO=22;DP=36;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.135261;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=12.815;QD=34.6743;RBI=0.186549;REFB=0;REVB=-0.128472;RO=11;SAF=14;SAR=8;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168641;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00893484;OID=.;OPOS=41123094;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:22:36:32:32:0:17:15:0:0:6:11:14:8:4:7
chr19	41186879	.	A	G	54.66	PASS	AF=0.333333;AO=8;DP=24;FAO=8;FDP=24;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=-0.0142419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.9028;QD=9.11033;RBI=0.0150565;REFB=0.00457892;REVB=-0.00488545;RO=16;SAF=3;SAR=5;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0741896;STB=0.545344;STBP=0.797;TYPE=snp;VARB=-0.0108391;OID=.;OPOS=41186879;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:24:24:16:16:8:8:0.333333:5:3:5:11:5:3:5:11
chr19	41209477	.	C	T	91.24	PASS	AF=0.52381;AO=11;DP=21;FAO=11;FDP=21;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.0318567;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.94;QD=17.3782;RBI=0.0481514;REFB=-0.0197087;REVB=0.0361068;RO=10;SAF=7;SAR=4;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0578471;STB=0.533274;STBP=0.811;TYPE=snp;VARB=0.0118647;OID=.;OPOS=41209477;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:21:21:10:10:11:11:0.52381:4:7:7:3:4:7:7:3
chr19	41235120	.	A	G	51.81	PASS	AF=0.538462;AO=7;DP=14;FAO=7;FDP=13;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.0230413;FXX=0.0713776;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.593;QD=15.94;RBI=0.035199;REFB=-0.00484883;REVB=0.0266096;RO=7;SAF=3;SAR=4;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.533237;STBP=0.935;TYPE=snp;VARB=0.00362051;OID=.;OPOS=41235120;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:40:14:13:7:6:7:7:0.538462:4:3:3:4:4:3:3:3
chr19	41255500	.	C	G	56.29	PASS	AF=0.4;AO=8;DP=20;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=0.0528632;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.86;QD=11.2584;RBI=0.070448;REFB=-0.0369532;REVB=-0.0465661;RO=11;SAF=4;SAR=4;SRF=9;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.313604;STB=0.649658;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=0.0110158;OID=.;OPOS=41255500;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:20:20:11:12:8:8:0.4:4:4:9:2:4:4:9:3
chr19	41257396	.	C	T	84.13	PASS	AF=0.458333;AO=10;DP=24;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=0.00571323;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.5538;QD=14.0224;RBI=0.0141497;REFB=0.00312622;REVB=0.012945;RO=13;SAF=7;SAR=3;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.370123;STB=0.673766;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=-0.000483843;OID=.;OPOS=41257396;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:24:24:13:13:10:11:0.458333:3:7:4:9:4:7:4:9
chr19	41263403	.	A	G	70.57	PASS	AF=0.5625;AO=9;DP=16;FAO=9;FDP=16;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=-0.102191;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=160.143;QD=17.6426;RBI=0.102192;REFB=0.00456405;REVB=-0.000296771;RO=7;SAF=5;SAR=4;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.201011;STB=0.616187;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=-0.00604855;OID=.;OPOS=41263403;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:16:16:7:7:9:9:0.5625:4:5:2:5:4:5:2:5
chr19	41281700	.	C	T	169.22	PASS	AF=0.384615;AO=20;DP=52;FAO=20;FDP=52;FR=.;FRO=32;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=-0.00496381;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=242.362;QD=13.0172;RBI=0.0104629;REFB=-0.00899639;REVB=0.00921044;RO=31;SAF=9;SAR=11;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136781;STB=0.5877;STBP=0.343;TYPE=snp;VARB=0.0135577;OID=.;OPOS=41281700;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:31:32:20:20:0.384615:11:9:18:13:11:9:19:13
chr19	41316355	.	T	C	82.14	PASS	AF=0.588235;AO=10;DP=17;FAO=10;FDP=17;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.0459757;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.765;QD=19.3278;RBI=0.0464585;REFB=-0.00465278;REVB=0.00668062;RO=7;SAF=3;SAR=7;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103689;STB=0.559875;STBP=0.598;TYPE=snp;VARB=0.00593984;OID=.;OPOS=41316355;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:17:17:7:7:10:10:0.588235:7:3:3:4:7:3:3:4
chr19	41350594	.	G	A	456.07	PASS	AF=0.479167;AO=40;DP=90;FAO=46;FDP=96;FR=.;FRO=50;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=23;FSRR=27;FWDB=0.0753958;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.4698;QD=19.0028;RBI=0.0922647;REFB=-0.0221492;REVB=0.0531813;RO=50;SAF=19;SAR=21;SRF=23;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.014899;STB=0.520824;STBP=0.721;TYPE=snp;VARB=0.021019;OID=.;OPOS=41350594;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:96:50:50:40:46:0.479167:21:19:23:27:23:23:23:27
chr19	41350664	.	A	T	724.19	PASS	AF=0.981132;AO=51;DP=52;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0850307;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.626;QD=54.6561;RBI=0.0860109;REFB=-0.125007;REVB=-0.0129482;RO=1;SAF=19;SAR=32;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0144898;STB=0.507689;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.000907987;OID=.;OPOS=41350664;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:52:53:1:1:51:52:0.981132:32:19:0:1:32:20:0:1
chr19	41354606	.	G	T	53.71	PASS	AF=0.135802;AO=11;DP=81;FAO=11;FDP=81;FR=.;FRO=70;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=38;FSRR=32;FWDB=0.00610098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.814;QD=2.65229;RBI=0.0180786;REFB=-0.0032288;REVB=0.017018;RO=69;SAF=7;SAR=4;SRF=37;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125828;STB=0.583179;STBP=0.59;TYPE=snp;VARB=0.021427;OID=.;OPOS=41354606;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:81:81:69:70:11:11:0.135802:4:7:37:32:4:7:38:32
chr19	41354661	.	T	C	33.94	PASS	AF=0.111111;AO=7;DP=63;FAO=7;FDP=63;FR=.;FRO=56;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=27;FSRR=29;FWDB=0.00363713;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.277;QD=2.15507;RBI=0.00364718;REFB=-0.000845457;REVB=0.000270659;RO=55;SAF=3;SAR=4;SRF=27;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.07314;STB=0.547808;STBP=0.803;TYPE=snp;VARB=0.0054162;OID=.;OPOS=41354661;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:63:63:55:56:7:7:0.111111:4:3:27:28:4:3:27:29
chr19	41355849	.	A	G	49.26	PASS	AF=0.147541;AO=9;DP=61;FAO=9;FDP=61;FR=.;FRO=52;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=22;FSRR=30;FWDB=-0.031527;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.876;QD=3.2302;RBI=0.0448993;REFB=-0.00361873;REVB=-0.0319686;RO=52;SAF=6;SAR=3;SRF=22;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.292073;STB=0.701694;STBP=0.218;TYPE=snp;VARB=0.0179168;OID=.;OPOS=41355849;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:49:61:61:52:52:9:9:0.147541:3:6:22:30:3:6:22:30
chr19	41356281	.	T	C	611.75	PASS	AF=0.578947;AO=55;DP=95;FAO=55;FDP=95;FR=.;FRO=40;FSAF=36;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=-0.022645;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.8893;QD=25.7578;RBI=0.0254317;REFB=-0.0305102;REVB=-0.0115748;RO=40;SAF=36;SAR=19;SRF=21;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10615;STB=0.558118;STBP=0.205;TYPE=snp;VARB=0.0169063;OID=.;OPOS=41356281;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:40:40:55:55:0.578947:19:36:21:19:19:36:21:19
chr19	41383153	.	A	G	766.38	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.012841;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.675;QD=63.8652;RBI=0.0132063;REFB=0;REVB=-0.00308469;RO=0;SAF=21;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.48235e-05;OID=.;OPOS=41383153;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:27:21:0:0:27:21:0:0
chr19	41383799	.	G	A	1208.6	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00789775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.5051;QD=61.1951;RBI=0.0696562;REFB=0;REVB=0.0692071;RO=0;SAF=50;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00032107;OID=.;OPOS=41383799;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:29:50:0:0:29:50:0:0
chr19	41384675	.	T	C	1694.92	PASS	AF=1;AO=112;DP=112;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0522471;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.7686;QD=60.533;RBI=0.0590427;REFB=0;REVB=0.0275005;RO=0;SAF=51;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000455745;OID=.;OPOS=41384675;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:112:112:0:0:112:112:1:61:51:0:0:61:51:0:0
chr19	41386136	.	A	C	538.5	PASS	AF=1;AO=30;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0349567;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.127;QD=59.8337;RBI=0.0585444;REFB=0;REVB=0.0469625;RO=0;SAF=19;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000536662;OID=.;OPOS=41386136;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:30:36:1:11:19:0:0:15:21:0:0
chr19	41386420	.	A	C	851.18	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.084618;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.7658;QD=57.7071;RBI=0.090088;REFB=0;REVB=-0.0309133;RO=0;SAF=34;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.03209e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00116896;OID=.;OPOS=41386420;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:25:34:0:0:25:34:0:0
chr19	41386485	.	GCA	GAG	863.47	PASS	AF=1;AO=52;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=31;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0405491;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=194.617;QD=57.5644;RBI=0.0421226;REFB=0;REVB=-0.0114052;RO=0;SAF=27;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=5.54209e-05;OID=.;OPOS=41386486;OREF=CA;OALT=AG;OMAPALT=GAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:52:60:60:60:0:31:29:0:0:5:0:27:25:0:0
chr19	41386488	.	A	G	35.45	PASS	AF=0.116667;AO=7;DP=60;FAO=7;FDP=60;FR=.;FRO=53;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=28;FSRR=25;FWDB=-0.0704529;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.0669;QD=2.36356;RBI=0.0704532;REFB=-0.0685856;REVB=-0.000185772;RO=53;SAF=3;SAR=4;SRF=28;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116806;STB=0.587429;STBP=0.664;TYPE=snp;VARB=0.0898908;OID=.;OPOS=41386488;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:60:60:53:53:7:7:0.116667:4:3:28:25:4:3:28:25
chr19	41386494	.	A	C	817.72	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0216097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.823;QD=57.3838;RBI=0.02512;REFB=0;REVB=0.0128077;RO=0;SAF=32;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.87324e-05;OID=.;OPOS=41386494;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:25:32:0:0:25:32:0:0
chr19	41386527	.	G	A	632.24	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00325188;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.983;QD=61.6814;RBI=0.0264209;REFB=0;REVB=0.02622;RO=0;SAF=18;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.95701e-05;OID=.;OPOS=41386527;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:23:18:0:0:23:18:0:0
chr19	41387553	.	GC	G	137.55	PASS	AF=0.68;AO=17;DP=25;FAO=17;FDP=25;FR=.;FRO=8;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.0719595;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=24.4602;QD=22.0079;RBI=0.0887854;REFB=0.0461314;REVB=0.0520066;RO=8;SAF=7;SAR=10;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0982288;STB=0.554393;STBP=0.461;TYPE=del;VARB=-0.0174307;OID=.;OPOS=41387554;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.68:17:25:17:25:8:7:10:2:6:43:8:7:10:2:6
chr19	41387620	.	A	G	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0136723;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.1213;QD=51.1846;RBI=0.02993;REFB=0;REVB=0.0266246;RO=0;SAF=12;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000183285;OID=.;OPOS=41387620;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:8:12:0:0:8:12:0:0
chr19	41387647	.	A	G	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0496804;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.0748;QD=51.1845;RBI=0.050674;REFB=0;REVB=-0.00998546;RO=0;SAF=12;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00117082;OID=.;OPOS=41387647;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:8:12:0:0:8:12:0:0
chr19	41387656	.	A	T	255.91	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000931724;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.666;QD=51.1826;RBI=0.0386799;REFB=0;REVB=0.0386687;RO=0;SAF=12;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000395875;OID=.;OPOS=41387656;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:8:12:0:0:8:12:0:0
chr19	41404196	.	A	G	915.68	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0241323;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.152;QD=58.1386;RBI=0.0246753;REFB=0;REVB=0.00514796;RO=0;SAF=32;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.35158e-05;OID=.;OPOS=41404196;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:31:32:0:0:31:32:0:0
chr19	41405962	.	T	G	543.55	PASS	AF=1;AO=28;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.114017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.018;QD=60.3941;RBI=0.115589;REFB=0;REVB=-0.0189967;RO=0;SAF=14;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000626833;OID=.;OPOS=41405962;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:28:36:1:14:14:0:0:14:22:0:0
chr19	41414481	.	G	A	868.27	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0215058;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.267;QD=57.8848;RBI=0.0221447;REFB=0;REVB=0.00528101;RO=0;SAF=52;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.09955e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00012586;OID=.;OPOS=41414481;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:8:52:0:0:8:52:0:0
chr19	41415818	.	G	A	117.6	PASS	AF=0.274194;AO=17;DP=62;FAO=17;FDP=62;FR=.;FRO=45;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=27;FWDB=-0.0011386;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.015;QD=7.58706;RBI=0.0249212;REFB=0.0121205;REVB=-0.0248952;RO=44;SAF=11;SAR=6;SRF=17;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.305015;STB=0.675775;STBP=0.095;TYPE=snp;VARB=-0.0159506;OID=.;OPOS=41415818;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:44:45:17:17:0.274194:6:11:17:27:6:11:18:27
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chr19	41622107	.	G	GC	138.03	PASS	AF=0.5;AO=19;DP=38;FAO=19;FDP=38;FR=.;FRO=19;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.0530724;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=31.3969;QD=14.5292;RBI=0.0530724;REFB=-0.0225829;REVB=-4.75484e-05;RO=19;SAF=12;SAR=7;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.0262642;OID=.;OPOS=41622108;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.5:19:38:19:38:19:12:7:12:7:99:19:12:7:12:7
chr19	41622189	.	G	A	211.75	PASS	AF=0.488372;AO=21;DP=43;FAO=21;FDP=43;FR=.;FRO=22;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=-0.0172303;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=284.357;QD=19.6972;RBI=0.0349227;REFB=-0.0107332;REVB=0.0303762;RO=22;SAF=11;SAR=10;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14499;STB=0.58158;STBP=0.338;TYPE=snp;VARB=0.0133601;OID=.;OPOS=41622189;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:22:22:21:21:0.488372:10:11:15:7:10:11:15:7
chr19	41627868	.	G	A	72.05	PASS	AF=0.263158;AO=10;DP=39;FAO=10;FDP=38;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=-0.0113948;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.121;QD=7.58391;RBI=0.0202118;REFB=-0.00516408;REVB=0.0166936;RO=28;SAF=7;SAR=3;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.282447;STB=0.677058;STBP=0.22;TYPE=snp;VARB=0.00717735;OID=.;OPOS=41627868;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:39:38:28:28:10:10:0.263158:3:7:13:15:3:7:13:15
chr19	41700493	.	G	C	112.21	PASS	AF=0.481481;AO=13;DP=27;FAO=13;FDP=27;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.044444;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.278;QD=16.6241;RBI=0.0479469;REFB=-0.019696;REVB=0.0179899;RO=14;SAF=8;SAR=5;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106228;STB=0.561308;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.0222002;OID=.;OPOS=41700493;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:14:14:13:13:0.481481:5:8:7:7:5:8:7:7
chr19	41743861	.	A	G	291.84	PASS	AF=0.958333;AO=21;DP=24;FAO=23;FDP=24;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.000559088;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=168.125;QD=48.6391;RBI=0.0204062;REFB=-0.103794;REVB=-0.0203986;RO=0;SAF=12;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.52172;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.000695659;OID=.;OPOS=41743861;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:24:24:0:1:21:23:0.958333:9:12:0:0:11:12:0:1
chr19	41748153	.	A	G	145.05	PASS	AF=0.6;AO=15;DP=26;FAO=15;FDP=25;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=2;FWDB=0.00152922;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=353.745;QD=23.2075;RBI=0.0146933;REFB=-0.00683947;REVB=-0.0146135;RO=11;SAF=7;SAR=8;SRF=9;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.261199;STB=0.631413;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=0.00375292;OID=.;OPOS=41748153;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:26:25:11:10:15:15:0.6:8:7:9:2:8:7:8:2
chr19	41848139	.	GC	G	136.85	PASS	AF=0.933333;AO=11;DP=17;FAO=14;FDP=15;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.11872;FXX=0.117578;HRUN=3;LEN=1;MLLD=17.3262;QD=36.4921;RBI=0.128502;REFB=-0.00150201;REVB=-0.0491749;RO=1;SAF=6;SAR=5;SRF=1;SRR=0;SSEN=0.397173;SSEP=0;SSSB=-0.0690901;STB=0.52937;STBP=0.52;TYPE=del;VARB=-0.0218141;OID=.;OPOS=41848140;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.933333:11:17:14:15:1:8:6:1:0:6:1:6:5:1:0
chr19	41936970	.	G	C	473.24	PASS	AF=0.56962;AO=45;DP=79;FAO=45;FDP=79;FR=.;FRO=34;FSAF=29;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=-0.000131833;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=238.899;QD=23.9612;RBI=0.0197669;REFB=-0.00339936;REVB=-0.0197664;RO=34;SAF=29;SAR=16;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0952645;STB=0.552357;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.00214366;OID=.;OPOS=41936970;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:34:34:45:45:0.56962:16:29:18:16:16:29:18:16
chr19	41937095	.	G	A	538.55	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0646817;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.679;QD=59.8393;RBI=0.0647155;REFB=0;REVB=0.00208875;RO=0;SAF=14;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00033381;OID=.;OPOS=41937095;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:22:14:0:0:22:14:0:0
chr19	41939297	.	C	G	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.020049;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.33;QD=55.0987;RBI=0.0369685;REFB=0;REVB=0.0310597;RO=0;SAF=11;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000205843;OID=.;OPOS=41939297;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:15:11:0:0:15:11:0:0
chr19	41944237	.	T	C	445.44	PASS	AF=0.941176;AO=32;DP=34;FAO=32;FDP=34;FR=.;FRO=2;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0186527;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.43;QD=52.4045;RBI=0.0628029;REFB=-0.105277;REVB=-0.059969;RO=1;SAF=16;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0282865;STB=0.529393;STBP=0.227;TYPE=snp;VARB=0.0188768;OID=.;OPOS=41944237;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:34:34:1:2:32:32:0.941176:16:16:1:0:16:16:2:0
chr19	41945837	.	T	A	754.43	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0063492;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.807;QD=56.9382;RBI=0.00785972;REFB=0;REVB=0.0046328;RO=0;SAF=34;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.97342e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.12583e-06;OID=.;OPOS=41945837;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:19:34:0:0:19:34:0:0
chr19	41949870	.	T	C	575.8	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0107242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.687;QD=60.6103;RBI=0.0208202;REFB=0;REVB=0.0178458;RO=0;SAF=20;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.51048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.31325e-05;OID=.;OPOS=41949870;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:18:20:0:0:18:20:0:0
chr19	42070360	.	C	T	834.4	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0429982;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.449;QD=57.5448;RBI=0.0569307;REFB=0;REVB=0.037313;RO=0;SAF=27;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.07727e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000541809;OID=.;OPOS=42070360;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:31:27:0:0:31:27:0:0
chr19	42070528	.	G	C	524.83	PASS	AF=1;AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0212149;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.068;QD=59.98;RBI=0.0281093;REFB=0;REVB=0.0184407;RO=0;SAF=17;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000101248;OID=.;OPOS=42070528;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:35:0:0:35:35:1:18:17:0:0:18:17:0:0
chr19	42071289	.	T	C	1153.55	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00612253;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.2059;QD=60.7132;RBI=0.0162317;REFB=0;REVB=0.0150327;RO=0;SAF=48;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.00823e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.41221e-05;OID=.;OPOS=42071289;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:76:0:0:75:76:1:27:48:0:0:27:49:0:0
chr19	42083849	.	C	A	833.99	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.100509;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.567;QD=57.5167;RBI=0.10107;REFB=0;REVB=-0.0106402;RO=0;SAF=31;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00108366;OID=.;OPOS=42083849;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:55:58:0:0:55:58:1:24:31:0:0:24:34:0:0
chr19	42085873	.	A	G	594.54	PASS	AF=1;AO=38;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0115016;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.731;QD=60.9784;RBI=0.0119666;REFB=0;REVB=-0.00330339;RO=0;SAF=19;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.66487e-05;OID=.;OPOS=42085873;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:38:39:1:19:19:0:0:19:20:0:0
chr19	42132273	.	C	T	122.11	PASS	AF=0.684211;AO=13;DP=19;FAO=13;FDP=19;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=12;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.121857;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.44;QD=25.7071;RBI=0.122018;REFB=0.00799254;REVB=0.00627163;RO=6;SAF=1;SAR=12;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.332361;STB=0.691932;STBP=0.139;TYPE=snp;VARB=-0.00290543;OID=.;OPOS=42132273;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:19:19:6:6:13:13:0.684211:12:1:2:4:12:1:2:4
chr19	42132314	.	G	C	152.38	PASS	AF=0.933333;AO=13;DP=14;FAO=14;FDP=15;FR=.;FRO=1;FSAF=2;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0282781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.452;QD=40.6357;RBI=0.0386113;REFB=-0.0148932;REVB=0.0262904;RO=1;SAF=1;SAR=12;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0363094;STB=0.519972;STBP=0.655;TYPE=snp;VARB=0.00575901;OID=.;OPOS=42132314;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:14:15:1:1:13:14:0.933333:12:1:0:1:12:2:0:1
chr19	42221607	.	A	G	538.94	PASS	AF=0.925;AO=36;DP=39;FAO=37;FDP=40;FR=.;FRO=3;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0273012;FXX=0.0476077;HRUN=3;LEN=1;MLLD=155.309;QD=53.8939;RBI=0.0276726;REFB=-0.0378733;REVB=-0.00451827;RO=3;SAF=17;SAR=19;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0279652;STB=0.513506;STBP=0.629;TYPE=snp;VARB=0.00205013;OID=.;OPOS=42221607;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:39:40:3:3:36:37:0.925:19:17:2:1:19:18:2:1
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chr19	42265889	.	G	T	185.33	PASS	AF=0.407407;AO=22;DP=55;FAO=22;FDP=54;FR=.;FRO=32;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=20;FSRR=12;FWDB=-0.0221242;FXX=0.0181785;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.3932;QD=13.728;RBI=0.0584613;REFB=-0.00208063;REVB=-0.0541132;RO=29;SAF=13;SAR=9;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.030906;STB=0.521034;STBP=0.822;TYPE=snp;VARB=0.00057118;OID=.;OPOS=42265889;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:54:29:32:22:22:0.407407:9:13:18:11:9:13:20:12
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chr19	42342319	.	A	G	36.77	PASS	AF=0.5;AO=5;DP=14;FAO=7;FDP=14;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.0265843;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.265;QD=10.5069;RBI=0.0269331;REFB=0.0044352;REVB=0.00432013;RO=7;SAF=3;SAR=2;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.413035;STB=0.76852;STBP=0.081;TYPE=snp;VARB=0.00650503;OID=.;OPOS=42342319;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:14:14:7:7:5:7:0.5:2:3:1:6:2:5:1:6
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chr19	42489516	.	A	C	314.3	PASS	AF=0.596154;AO=31;DP=53;FAO=31;FDP=52;FR=.;FRO=21;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.0111124;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=287.868;QD=24.1766;RBI=0.0128743;REFB=-0.0214713;REVB=0.00650094;RO=21;SAF=12;SAR=19;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0675777;STB=0.537251;STBP=0.546;TYPE=snp;VARB=0.0160316;OID=.;OPOS=42489516;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:52:21:21:31:31:0.596154:19:12:10:11:19:12:10:11
chr19	42593716	.	A	G	993.34	PASS	AF=0.441176;AO=105;DP=237;FAO=105;FDP=238;FR=.;FRO=133;FSAF=42;FSAR=63;FSRF=70;FSRR=63;FWDB=-0.0085877;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.705;QD=16.6948;RBI=0.00865262;REFB=-0.00279972;REVB=-0.00105793;RO=132;SAF=42;SAR=63;SRF=69;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124586;STB=0.571415;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.00362879;OID=.;OPOS=42593716;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:237:238:132:133:105:105:0.441176:63:42:69:63:63:42:70:63
chr19	42595791	.	G	A	125.66	PASS	AF=0.764706;AO=11;DP=17;FAO=13;FDP=17;FR=.,HEALED;FRO=4;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.00155649;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=44.1304;QD=29.5668;RBI=0.0533299;REFB=-0.00334446;REVB=0.0533072;RO=4;SAF=7;SAR=4;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0680141;STB=0.528258;STBP=0.681;TYPE=snp;VARB=0.00523696;OID=.;OPOS=42595791;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:20:17:17:4:4:11:13:0.764706:4:7:2:2:5:8:2:2
chr19	42620945	.	AC	A	34.57	PASS	AF=0.472222;AO=15;DP=36;FAO=17;FDP=36;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.188242;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=7.86342;QD=3.84085;RBI=0.208024;REFB=-0.11361;REVB=-0.0885368;RO=19;SAF=6;SAR=9;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0210988;STB=0.56693;STBP=0.453;TYPE=del;VARB=0.110481;OID=.;OPOS=42620946;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.472222:15:36:17:36:19:6:11:9:10:34:19:6:9:8:11
chr19	42736267	.	A	G	754.42	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0374134;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.844;QD=56.9372;RBI=0.0388023;REFB=0;REVB=0.0102885;RO=0;SAF=17;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.19417e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.99165e-05;OID=.;OPOS=42736267;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:36:17:0:0:36:17:0:0
chr19	42748407	.	T	TTG	30.0	PASS	AF=0.833333;AO=2;DP=7;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.212436;FXX=0;HRUN=6;LEN=2;MLLD=17.2981;QD=19.9993;RBI=0.212436;REFB=-0.0802564;REVB=0;RO=4;SAF=2;SAR=0;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.0235282;OID=.;OPOS=42748408;OREF=-;OALT=TG;OMAPALT=TTG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.833333:2:7:5:6:1:5:0:1:0:6:4:2:0:4:0
chr19	42880120	.	C	T	88.79	PASS	AF=0.458333;AO=11;DP=24;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.00617033;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.496;QD=14.7986;RBI=0.00721834;REFB=-0.0285257;REVB=-0.00374587;RO=13;SAF=6;SAR=5;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0065293;STB=0.50381;STBP=0.955;TYPE=snp;VARB=0.0278275;OID=.;OPOS=42880120;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:24:24:13:13:11:11:0.458333:5:6:7:6:5:6:7:6
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chr19	43243238	.	A	G	826.2	PASS	AF=0.619835;AO=74;DP=121;FAO=75;FDP=121;FR=.;FRO=46;FSAF=35;FSAR=40;FSRF=24;FSRR=22;FWDB=-0.016382;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.57;QD=27.3124;RBI=0.025779;REFB=-0.00319679;REVB=-0.0199044;RO=46;SAF=34;SAR=40;SRF=24;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0441326;STB=0.520966;STBP=0.557;TYPE=snp;VARB=0.00145265;OID=.;OPOS=43243238;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:121:121:46:46:74:75:0.619835:40:34:24:22:40:35:24:22
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chr19	43269704	.	TG	CA	280.19	PASS	AF=0.455882;AO=31;DP=69;FAO=31;FDP=68;FR=.;FRO=37;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=23;FWDB=0.00449859;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=2;MLLD=277.322;QD=16.4817;RBI=0.00463605;REFB=-0.00906306;REVB=0.00112056;RO=37;SAF=15;SAR=16;SRF=14;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102665;STB=0.557637;STBP=0.424;TYPE=mnp;VARB=0.0101597;OID=.;OPOS=43269704;OREF=TG;OALT=CA;OMAPALT=CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:68:37:37:31:31:0.455882:16:15:14:23:16:15:14:23
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chr19	43439793	.	G	A	1507.29	PASS	AF=0.990291;AO=102;DP=103;FAO=102;FDP=103;FR=.;FRO=1;FSAF=69;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0024692;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.782;QD=58.5355;RBI=0.00877552;REFB=-0.0745588;REVB=0.00842098;RO=0;SAF=69;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.59797e-08;STB=0.503596;STBP=0.595;TYPE=snp;VARB=0.000441439;OID=.;OPOS=43439793;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:103:103:0:1:102:102:0.990291:33:69:0:0:33:69:1:0
chr19	43519362	.	C	T	1785.86	PASS	AF=1;AO=117;DP=117;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0132464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=330.814;QD=61.0551;RBI=0.0178216;REFB=0;REVB=0.0119223;RO=0;SAF=54;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.30784e-07;OID=.;OPOS=43519362;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:117:117:0:0:117:117:1:63:54:0:0:63:54:0:0
chr19	43519442	.	T	C	1508.17	PASS	AF=0.980952;AO=103;DP=105;FAO=103;FDP=105;FR=.;FRO=2;FSAF=38;FSAR=65;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0330125;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=214.403;QD=57.4541;RBI=0.047827;REFB=0.0794172;REVB=0.0346063;RO=2;SAF=38;SAR=65;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0243145;STB=0.512818;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=-0.000214368;OID=.;OPOS=43519442;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:105:105:2:2:103:103:0.980952:65:38:2:0:65:38:2:0
chr19	43529026	.	CA	TG	756.25	PASS	AF=1;AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00414019;FXX=0.040808;HRUN=1;LEN=2;MLLD=195.335;QD=64.3616;RBI=0.00868491;REFB=0;REVB=0.00763456;RO=0;SAF=24;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.00199936;OID=.;OPOS=43529026;OREF=CA;OALT=TG;OMAPALT=TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:47:0:0:47:47:1:23:24:0:0:23:24:0:0
chr19	43576034	.	C	A	801.98	PASS	AF=0.601626;AO=69;DP=118;FAO=74;FDP=123;FR=.;FRO=49;FSAF=31;FSAR=43;FSRF=27;FSRR=22;FWDB=0.00817137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.17;QD=26.0808;RBI=0.00995985;REFB=-0.0347654;REVB=0.0056945;RO=46;SAF=31;SAR=38;SRF=26;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0853566;STB=0.553102;STBP=0.161;TYPE=snp;VARB=0.0189458;OID=.;OPOS=43576034;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:118:123:46:49:69:74:0.601626:38:31:26:20:43:31:27:22
chr19	43679410	.	A	G	1729.08	PASS	AF=1;AO=111;DP=111;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00515043;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.692;QD=60.6693;RBI=0.0651129;REFB=0;REVB=0.0649089;RO=0;SAF=58;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000110005;OID=.;OPOS=43679410;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:111:114:0:0:111:114:1:53:58:0:0:56:58:0:0
chr19	43680051	.	C	T	1485.64	PASS	AF=1;AO=93;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0122266;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.911;QD=62.5534;RBI=0.0201209;REFB=0;REVB=0.01598;RO=0;SAF=58;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00114941;OID=.;OPOS=43680051;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:95:0:0:93:95:1:35:58:0:0:37:58:0:0
chr19	43680147	.	C	T	499.76	PASS	AF=0.533333;AO=47;DP=90;FAO=48;FDP=90;FR=.;FRO=42;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=-0.042547;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.198;QD=22.2114;RBI=0.0462932;REFB=-0.0233086;REVB=0.0182431;RO=42;SAF=25;SAR=22;SRF=24;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0340336;STB=0.51253;STBP=0.781;TYPE=snp;VARB=0.022797;OID=.;OPOS=43680147;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:42:42:47:48:0.533333:22:25:24:18:23:25:23:19
chr19	43687589	.	G	A	81.61	PASS	AF=0.282051;AO=11;DP=39;FAO=11;FDP=39;FR=.;FRO=28;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=0.00721064;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.0701;QD=8.36983;RBI=0.00779407;REFB=-0.0168304;REVB=-0.00295877;RO=28;SAF=4;SAR=7;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121025;STB=0.574741;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.0424502;OID=.;OPOS=43687589;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:81:39:39:28:28:11:11:0.282051:7:4:13:15:7:4:13:15
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chr19	43689004	.	G	A	298.21	PASS	AF=0.386364;AO=34;DP=88;FAO=34;FDP=88;FR=.;FRO=54;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=26;FSRR=28;FWDB=-0.0173089;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.2413;QD=13.5549;RBI=0.018096;REFB=0.0013426;REVB=0.00527891;RO=54;SAF=16;SAR=18;SRF=26;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0117427;STB=0.506698;STBP=0.94;TYPE=snp;VARB=-0.00239418;OID=.;OPOS=43689004;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:54:54:34:34:0.386364:18:16:26:28:18:16:26:28
chr19	43690506	.	G	C	805.93	PASS	AF=1;AO=49;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=34;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0106028;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.944;QD=56.5568;RBI=0.0405285;REFB=0;REVB=0.039117;RO=0;SAF=28;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0020847;OID=.;OPOS=43690506;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:57:57:0:0:49:57:1:21:28:0:0:23:34:0:0
chr19	43699278	.	A	G	794.78	PASS	AF=0.50625;AO=80;DP=162;FAO=81;FDP=160;FR=.;FRO=79;FSAF=47;FSAR=34;FSRF=34;FSRR=45;FWDB=-0.000656164;FXX=0.0184038;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.893;QD=19.8696;RBI=0.00745525;REFB=-0.00827913;REVB=-0.00742632;RO=77;SAF=46;SAR=34;SRF=33;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130757;STB=0.574127;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.00848992;OID=.;OPOS=43699278;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:162:160:77:79:80:81:0.50625:34:46:33:44:34:47:34:45
chr19	43699336	.	T	C	1877.83	PASS	AF=1;AO=122;DP=122;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0129527;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.46;QD=61.5682;RBI=0.0285209;REFB=0;REVB=0.02541;RO=0;SAF=47;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.98065e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.14176e-05;OID=.;OPOS=43699336;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:122:122:0:0:122:122:1:75:47:0:0:75:47:0:0
chr19	43699417	.	A	G	1806.9	PASS	AF=1;AO=114;DP=115;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0322456;FXX=0.00840265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.9388;QD=61.2509;RBI=0.062368;REFB=0;REVB=0.0533853;RO=0;SAF=50;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.2792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000434417;OID=.;OPOS=43699417;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:115:118:0:0:114:118:1:64:50:0:0:68:50:0:0
chr19	43702342	.	C	T	1568.42	PASS	AF=1;AO=98;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0373018;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.102;QD=64.0171;RBI=0.0376202;REFB=0;REVB=0.0048848;RO=0;SAF=67;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.55209e-05;OID=.;OPOS=43702342;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:98:0:0:98:98:1:31:67:0:0:31:67:0:0
chr19	43708100	.	T	A	1325.24	PASS	AF=0.988506;AO=86;DP=87;FAO=86;FDP=87;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0390977;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.9673;QD=60.9306;RBI=0.0776542;REFB=-0.101756;REVB=0.0670935;RO=1;SAF=43;SAR=43;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.010891;STB=0.505746;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=0.00107129;OID=.;OPOS=43708100;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:87:87:1:1:86:86:0.988506:43:43:0:1:43:43:0:1
chr19	43708968	.	T	C	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00124502;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.856;QD=33.4285;RBI=0.00928991;REFB=0;REVB=-0.0092061;RO=0;SAF=5;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.93197e-05;OID=.;OPOS=43708968;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:1:5:0:0:1:5:0:0
chr19	43709619	.	C	T	357.36	PASS	AF=0.931034;AO=27;DP=29;FAO=27;FDP=29;FR=.;FRO=2;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0231273;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.7893;QD=49.2904;RBI=0.0232049;REFB=0.109324;REVB=0.00189658;RO=2;SAF=18;SAR=9;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0489106;STB=0.526297;STBP=0.392;TYPE=snp;VARB=-0.0096636;OID=.;OPOS=43709619;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:29:29:2:2:27:27:0.931034:9:18:2:0:9:18:2:0
chr19	43709647	.	G	A	445.38	PASS	AF=0.941176;AO=32;DP=34;FAO=32;FDP=34;FR=.;FRO=2;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0250436;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.5785;QD=52.398;RBI=0.143731;REFB=-0.0123697;REVB=0.141533;RO=2;SAF=20;SAR=12;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0444293;STB=0.523795;STBP=0.288;TYPE=snp;VARB=0.00308573;OID=.;OPOS=43709647;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:34:34:2:2:32:32:0.941176:12:20:2:0:12:20:2:0
chr19	43709654	.	C	A	439.51	PASS	AF=0.96875;AO=31;DP=33;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0102605;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.665;QD=54.9384;RBI=0.0855926;REFB=-0.0756897;REVB=0.0849754;RO=1;SAF=20;SAR=11;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0227606;STB=0.512187;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=0.00110684;OID=.;OPOS=43709654;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:33:32:1:1:31:31:0.96875:11:20:1:0:11:20:1:0
chr19	43709656	.	C	G	471.92	PASS	AF=0.970588;AO=33;DP=34;FAO=33;FDP=34;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0183433;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.403;QD=55.5196;RBI=0.0269358;REFB=0.000944541;REVB=0.0197246;RO=1;SAF=21;SAR=12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0217319;STB=0.511621;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=-2.96042e-06;OID=.;OPOS=43709656;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:34:34:1:1:33:33:0.970588:12:21:1:0:12:21:1:0
chr19	43762340	.	T	A	772.11	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0128032;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.5332;QD=57.1934;RBI=0.0732199;REFB=0;REVB=0.0720918;RO=0;SAF=26;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.52846e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000323201;OID=.;OPOS=43762340;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:28:26:0:0:28:26:0:0
chr19	43772270	.	G	T	604.18	PASS	AF=0.55;AO=55;DP=100;FAO=55;FDP=100;FR=.;FRO=45;FSAF=33;FSAR=22;FSRF=27;FSRR=18;FWDB=-0.0641458;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.1583;QD=24.167;RBI=0.104501;REFB=0.0123581;REVB=0.0824968;RO=45;SAF=33;SAR=22;SRF=27;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=0.984;TYPE=snp;VARB=-0.0117579;OID=.;OPOS=43772270;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:45:45:55:55:0.55:22:33:27:18:22:33:27:18
chr19	43772302	.	C	T	425.35	PASS	AF=0.531646;AO=42;DP=79;FAO=42;FDP=79;FR=.;FRO=37;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=-0.00631303;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.092;QD=21.5366;RBI=0.00810053;REFB=-0.0231743;REVB=-0.00507585;RO=36;SAF=18;SAR=24;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0135213;STB=0.514699;STBP=0.769;TYPE=snp;VARB=0.022469;OID=.;OPOS=43772302;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:36:37:42:42:0.531646:24:18:16:20:24:18:17:20
chr19	43773572	.	G	A	250.01	PASS	AF=0.426471;AO=29;DP=68;FAO=29;FDP=68;FR=.;FRO=39;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=23;FWDB=0.0627376;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.2536;QD=14.7067;RBI=0.09693;REFB=-0.0399921;REVB=0.0738879;RO=36;SAF=12;SAR=17;SRF=13;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0538874;STB=0.502091;STBP=0.996;TYPE=snp;VARB=0.0550468;OID=.;OPOS=43773572;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:36:39:29:29:0.426471:17:12:13:23:17:12:16:23
chr19	43773599	.	T	C	1182.73	PASS	AF=0.975309;AO=79;DP=81;FAO=79;FDP=81;FR=.;FRO=2;FSAF=31;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.012953;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.0201;QD=58.4066;RBI=0.0133029;REFB=-0.0633411;REVB=-0.00303107;RO=0;SAF=31;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.510202;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.00101765;OID=.;OPOS=43773599;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:81:81:0:2:79:79:0.975309:48:31:0:0:48:31:0:2
chr19	43857873	.	G	C	1299.07	PASS	AF=1;AO=70;DP=85;FAO=84;FDP=84;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=45;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.085316;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.906;QD=61.8605;RBI=0.0857791;REFB=0;REVB=0.00890134;RO=0;SAF=31;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000358315;OID=.;OPOS=43857873;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:84:0:0:70:84:1:39:31:0:0:39:45:0:0
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chr19	43965029	.	G	A	188.93	PASS	AF=0.527778;AO=19;DP=36;FAO=19;FDP=36;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=0.0157496;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.8571;QD=20.9917;RBI=0.0230802;REFB=-0.00552599;REVB=-0.0168715;RO=17;SAF=8;SAR=11;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187911;STB=0.605687;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=0.00501743;OID=.;OPOS=43965029;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:17:17:19:19:0.527778:11:8:11:6:11:8:11:6
chr19	43979589	.	G	T	83.9	PASS	AF=0.333333;AO=11;DP=33;FAO=11;FDP=33;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=-0.00207706;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.911;QD=10.1703;RBI=0.0221855;REFB=-0.0093181;REVB=-0.022088;RO=21;SAF=10;SAR=1;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.428005;STB=0.7613;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=0.0240544;OID=.;OPOS=43979589;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:33:33:21:22:11:11:0.333333:1:10:14:7:1:10:15:7
chr19	44031324	.	C	T	40.29	PASS	AF=0.545455;AO=6;DP=11;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0283802;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.098;QD=14.6525;RBI=0.0356454;REFB=-0.0207733;REVB=0.0215675;RO=5;SAF=3;SAR=3;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0757641;STB=0.545304;STBP=0.829;TYPE=snp;VARB=0.0162194;OID=.;OPOS=44031324;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:11:11:5:5:6:6:0.545455:3:3:2:3:3:3:2:3
chr19	44047550	.	T	C	122.34	PASS	AF=0.451613;AO=14;DP=30;FAO=14;FDP=31;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=-0.0286462;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.4773;QD=15.7858;RBI=0.0508438;REFB=-0.00679222;REVB=-0.0420058;RO=16;SAF=4;SAR=10;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0298506;STB=0.50561;STBP=0.975;TYPE=snp;VARB=0.00505603;OID=.;OPOS=44047550;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:31:16:17:14:14:0.451613:10:4:5:11:10:4:5:12
chr19	44047826	.	T	A	451.11	PASS	AF=1;AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.056153;FXX=0.0312402;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.494;QD=58.2073;RBI=0.0577263;REFB=0;REVB=0.0133852;RO=0;SAF=13;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.33668e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.46828e-05;OID=.;OPOS=44047826;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:31:0:0:31:31:1:18:13:0:0:18:13:0:0
chr19	44055726	.	T	C	811.05	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0800385;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.943;QD=55.9342;RBI=0.0970818;REFB=0;REVB=0.0549429;RO=0;SAF=22;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00061425;OID=.;OPOS=44055726;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:51:58:0:0:51:58:1:29:22:0:0:29:29:0:0
chr19	44057227	.	T	C	60.48	PASS	AF=0.571429;AO=7;DP=13;FAO=8;FDP=14;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.0163698;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.176;QD=17.2795;RBI=0.0502527;REFB=-0.0289661;REVB=0.0475118;RO=6;SAF=2;SAR=5;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183303;STB=0.624664;STBP=0.386;TYPE=snp;VARB=0.0397209;OID=.;OPOS=44057227;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:13:14:6:6:7:8:0.571429:5:2:3:3:6:2:3:3
chr19	44057574	.	G	A	207.92	PASS	AF=0.446809;AO=21;DP=46;FAO=21;FDP=47;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=19;FWDB=-0.00833632;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.704;QD=17.6949;RBI=0.0120522;REFB=-0.0326143;REVB=-0.00870413;RO=25;SAF=11;SAR=10;SRF=6;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.270486;STB=0.639154;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.0357539;OID=.;OPOS=44057574;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:47:25:26:21:21:0.446809:10:11:6:19:10:11:7:19
chr19	44081288	.	A	G	128.45	PASS	AF=0.466667;AO=14;DP=31;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.0404367;FXX=0.0624805;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.3067;QD=17.127;RBI=0.048579;REFB=-0.0201995;REVB=0.026922;RO=13;SAF=7;SAR=7;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0973626;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0259195;OID=.;OPOS=44081288;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:30:13:16:14:14:0.466667:7:7:5:8:7:7:8:8
chr19	44082945	.	T	C	70.43	PASS	AF=0.45;AO=9;DP=20;FAO=9;FDP=20;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.021374;FXX=0.0475964;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.374;QD=14.0854;RBI=0.0251017;REFB=0.00456843;REVB=-0.0131622;RO=11;SAF=3;SAR=6;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0311955;STB=0.518477;STBP=0.919;TYPE=snp;VARB=-0.00588016;OID=.;OPOS=44082945;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:70:20:20:11:11:9:9:0.45:6:3:4:7:6:3:4:7
chr19	44116956	.	A	G	538.55	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00465663;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.6234;QD=59.8383;RBI=0.0220779;REFB=0;REVB=-0.0215812;RO=0;SAF=18;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000327953;OID=.;OPOS=44116956;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:18:18:0:0:18:18:0:0
chr19	44118191	.	G	A	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00926527;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.661;QD=42.1826;RBI=0.00926527;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=11;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.75235e-05;OID=.;OPOS=44118191;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:0:11:0:0:0:11:0:0
chr19	44126738	.	G	A	631.68	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00494333;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.081;QD=61.6269;RBI=0.0110065;REFB=0;REVB=-0.00983393;RO=0;SAF=29;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.36384e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.92369e-05;OID=.;OPOS=44126738;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:41:0:0:39:41:1:10:29:0:0:12:29:0:0
chr19	44303066	.	C	G	145.83	PASS	AF=0.652174;AO=15;DP=23;FAO=15;FDP=23;FR=.;FRO=8;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.000781674;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.842;QD=25.3616;RBI=0.034124;REFB=0.0112535;REVB=0.034115;RO=8;SAF=9;SAR=6;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140777;STB=0.578841;STBP=0.362;TYPE=snp;VARB=-0.00525661;OID=.;OPOS=44303066;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:23:23:8:8:15:15:0.652174:6:9:3:5:6:9:3:5
chr19	44306482	.	C	T	153.07	PASS	AF=0.255814;AO=22;DP=86;FAO=22;FDP=86;FR=.;FRO=64;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=31;FSRR=33;FWDB=-0.0136514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.45;QD=7.11965;RBI=0.0405398;REFB=-0.00319949;REVB=-0.0381722;RO=63;SAF=9;SAR=13;SRF=31;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102413;STB=0.556693;STBP=0.582;TYPE=snp;VARB=0.00780731;OID=.;OPOS=44306482;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:63:64:22:22:0.255814:13:9:31:32:13:9:31:33
chr19	44351694	.	C	T	104.62	PASS	AF=0.571429;AO=12;DP=21;FAO=12;FDP=21;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.0137917;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.211;QD=19.9284;RBI=0.0205921;REFB=-0.0208807;REVB=-0.0152912;RO=9;SAF=6;SAR=6;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125311;STB=0.571312;STBP=0.493;TYPE=snp;VARB=0.0175126;OID=.;OPOS=44351694;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:21:21:9:9:12:12:0.571429:6:6:6:3:6:6:6:3
chr19	44351836	.	G	A	158.7	PASS	AF=0.459459;AO=17;DP=37;FAO=17;FDP=37;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.00764011;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.948;QD=17.1565;RBI=0.00764171;REFB=-0.0296184;REVB=0.000156135;RO=20;SAF=8;SAR=9;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0278045;STB=0.515905;STBP=0.808;TYPE=snp;VARB=0.0200499;OID=.;OPOS=44351836;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:20:20:17:17:0.459459:9:8:10:10:9:8:10:10
chr19	44352639	.	G	A	130.78	PASS	AF=0.394737;AO=15;DP=37;FAO=15;FDP=38;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=0.0113175;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.254;QD=13.7662;RBI=0.0116465;REFB=-0.00231276;REVB=0.00274864;RO=21;SAF=5;SAR=10;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102929;STB=0.538409;STBP=0.72;TYPE=snp;VARB=0.00396487;OID=.;OPOS=44352639;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:38:21:23:15:15:0.394737:10:5:9:12:10:5:9:14
chr19	44352665	.	T	C	73.83	PASS	AF=0.333333;AO=10;DP=30;FAO=10;FDP=30;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=-0.0166999;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=272.864;QD=9.84378;RBI=0.0173398;REFB=-0.00377974;REVB=0.00466698;RO=20;SAF=7;SAR=3;SRF=6;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.422003;STB=0.752692;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.010867;OID=.;OPOS=44352665;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:30:30:20:20:10:10:0.333333:3:7:6:14:3:7:6:14
chr19	44377357	.	C	A,T	583.29	PASS	AF=0.0512821,0.948718;AO=3,36;DP=39;FAO=2,37;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=0,20;FSAR=2,17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0471964,-0.0390411;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=37.4358,119.098;QD=59.8244;RBI=0.0519519,0.0467383;REFB=0,0;REVB=0.0217139,0.0256956;RO=0;SAF=1,19;SAR=2,17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0142268,0.00104899;OID=.,.;OPOS=44377357,44377357;OREF=C,C;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:39:39:0:0:3,36:2,37:0.0512821,0.948718:2,17:1,19:0:0:2,17:0,20:0:0
chr19	44377669	.	G	A	415.61	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0144091;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.815;QD=57.3251;RBI=0.0353994;REFB=0;REVB=-0.0323341;RO=0;SAF=15;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000366552;OID=.;OPOS=44377669;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:14:15:0:0:14:15:0:0
chr19	44417575	.	A	G	423.55	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0411447;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.9424;QD=54.6512;RBI=0.0692215;REFB=-0.0818399;REVB=-0.0556663;RO=0;SAF=15;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00883177;OID=.;OPOS=44417575;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:30:31:0:0:30:31:1:15:15:0:0:15:16:0:0
chr19	44418077	.	C	T	834.38	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0344348;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.7397;QD=57.5435;RBI=0.0401214;REFB=0;REVB=0.0205904;RO=0;SAF=37;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.3149e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000663433;OID=.;OPOS=44418077;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:21:37:0:0:21:37:0:0
chr19	44418343	.	C	T	772.71	PASS	AF=1;AO=47;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00164407;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.513;QD=64.3926;RBI=0.0295267;REFB=0;REVB=0.0294809;RO=0;SAF=21;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00185464;OID=.;OPOS=44418343;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:47:48:1:26:21:0:0:27:21:0:0
chr19	44418544	.	A	G	1119.35	PASS	AF=1;AO=74;DP=75;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0518392;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.9669;QD=60.5051;RBI=0.0526317;REFB=0;REVB=-0.00909914;RO=0;SAF=38;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.79579e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.61563e-05;OID=.;OPOS=44418544;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:74:0:0:74:74:1:36:38:0:0:36:38:0:0
chr19	44418680	.	G	C	224.17	PASS	AF=0.904762;AO=18;DP=20;FAO=19;FDP=21;FR=.;FRO=2;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0307403;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.218;QD=42.6989;RBI=0.0351643;REFB=0.0213194;REVB=0.0170753;RO=2;SAF=7;SAR=11;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0764328;STB=0.541624;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=-0.00922678;OID=.;OPOS=44418680;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:20:21:2:2:18:19:0.904762:11:7:0:2:11:8:0:2
chr19	44418693	.	T	C	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0324172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.406;QD=50.4125;RBI=0.0339622;REFB=0;REVB=-0.0101271;RO=0;SAF=6;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.851e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00016633;OID=.;OPOS=44418693;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:13:6:0:0:13:6:0:0
chr19	44418824	.	C	T	929.23	PASS	AF=0.970149;AO=65;DP=67;FAO=65;FDP=67;FR=.;FRO=2;FSAF=39;FSAR=26;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0104758;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.8449;QD=55.4766;RBI=0.014776;REFB=0.026778;REVB=-0.0104205;RO=2;SAF=39;SAR=26;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0236094;STB=0.512496;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=-0.00799663;OID=.;OPOS=44418824;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:67:67:2:2:65:65:0.970149:26:39:2:0:26:39:2:0
chr19	44419030	.	A	G	594.52	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00785381;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.807;QD=60.9759;RBI=0.0169207;REFB=0;REVB=-0.0149876;RO=0;SAF=24;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.78647e-05;OID=.;OPOS=44419030;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:15:24:0:0:15:24:0:0
chr19	44470189	.	T	A	594.54	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0387973;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.275;QD=60.9786;RBI=0.0389157;REFB=0;REVB=-0.00303349;RO=0;SAF=18;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.34792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000236974;OID=.;OPOS=44470189;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:21:18:0:0:21:18:0:0
chr19	44470420	.	T	C	397.37	PASS	AF=1;AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00715331;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.3955;QD=56.7676;RBI=0.0431916;REFB=0;REVB=0.0425951;RO=0;SAF=14;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00102823;OID=.;OPOS=44470420;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:28:0:0:28:28:1:14:14:0:0:14:14:0:0
chr19	44470548	.	A	G	357.41	PASS	AF=0.931034;AO=27;DP=29;FAO=27;FDP=29;FR=.;FRO=2;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0649669;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.3601;QD=49.2977;RBI=0.068214;REFB=-0.129956;REVB=0.0207955;RO=1;SAF=10;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0265715;STB=0.527758;STBP=0.334;TYPE=snp;VARB=0.0248423;OID=.;OPOS=44470548;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:29:29:1:2:27:27:0.931034:17:10:0:1:17:10:0:2
chr19	44470663	.	G	C	689.36	PASS	AF=1;AO=35;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00855726;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.325;QD=62.6687;RBI=0.00859872;REFB=0;REVB=-0.00084332;RO=0;SAF=15;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.08088e-05;OID=.;OPOS=44470663;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:35:44:1:20:15:0:0:25:19:0:0
chr19	44471209	.	T	A	306.32	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0126613;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.4035;QD=53.2721;RBI=0.0198913;REFB=0;REVB=-0.0153413;RO=0;SAF=11;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000554047;OID=.;OPOS=44471209;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:12:11:0:0:12:11:0:0
chr19	44471323	.	G	A	714.96	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00363436;FXX=0.0217344;HRUN=5;LEN=1;MLLD=151.704;QD=63.552;RBI=0.0216429;REFB=0;REVB=0.0213355;RO=0;SAF=27;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000295257;OID=.;OPOS=44471323;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:18:27:0:0:18:27:0:0
chr19	44494215	.	T	C	220.28	PASS	AF=0.583333;AO=20;DP=35;FAO=21;FDP=36;FR=.;FRO=15;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.0393053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.8449;QD=24.4753;RBI=0.0783977;REFB=0.00283166;REVB=0.0678329;RO=15;SAF=10;SAR=10;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0255391;STB=0.523787;STBP=0.759;TYPE=snp;VARB=0.00116157;OID=.;OPOS=44494215;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:36:15:15:20:21:0.583333:10:10:7:8:10:11:7:8
chr19	44496070	.	A	G	207.64	PASS	AF=0.436364;AO=24;DP=55;FAO=24;FDP=55;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=-0.0106951;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=257.637;QD=15.1013;RBI=0.0174519;REFB=-0.018383;REVB=-0.0137907;RO=31;SAF=12;SAR=12;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0479693;STB=0.52725;STBP=0.73;TYPE=snp;VARB=0.0208589;OID=.;OPOS=44496070;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:31:31:24:24:0.436364:12:12:17:14:12:12:17:14
chr19	44500478	.	A	T	814.71	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0085156;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.963;QD=57.1726;RBI=0.0417856;REFB=0;REVB=0.0409087;RO=0;SAF=30;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.29784e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000125364;OID=.;OPOS=44500478;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:56:57:0:0:56:57:1:26:30:0:0:26:31:0:0
chr19	44500761	.	G	A	538.56	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0109516;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.176;QD=59.8394;RBI=0.0117151;REFB=0;REVB=0.00416009;RO=0;SAF=11;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.58193e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.8859e-05;OID=.;OPOS=44500761;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:25:11:0:0:25:11:0:0
chr19	44501116	.	A	G	594.54	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0169645;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=314.126;QD=60.9786;RBI=0.0180674;REFB=0;REVB=-0.00621591;RO=0;SAF=17;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.65209e-05;OID=.;OPOS=44501116;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:22:17:0:0:22:17:0:0
chr19	44501227	.	A	G	537.61	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0286166;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.7733;QD=59.7338;RBI=0.0315293;REFB=0;REVB=-0.0132359;RO=0;SAF=22;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000818076;OID=.;OPOS=44501227;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:14:22:0:0:14:22:0:0
chr19	44501518	.	G	A	588.03	PASS	AF=0.545455;AO=54;DP=99;FAO=54;FDP=99;FR=.;FRO=45;FSAF=21;FSAR=33;FSRF=21;FSRR=24;FWDB=-0.0383735;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.304;QD=23.7588;RBI=0.0466811;REFB=0.00599546;REVB=0.0265819;RO=44;SAF=21;SAR=33;SRF=21;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0746066;STB=0.536572;STBP=0.435;TYPE=snp;VARB=-0.00358989;OID=.;OPOS=44501518;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:44:45:54:54:0.545455:33:21:21:23:33:21:21:24
chr19	44501627	.	T	C	110.01	PASS	AF=0.433333;AO=12;DP=28;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=13;FWDB=-0.00445871;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.546;QD=14.6679;RBI=0.0144447;REFB=-0.00800882;REVB=0.0137394;RO=16;SAF=8;SAR=4;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.391968;STB=0.745987;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.0117093;OID=.;OPOS=44501627;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:30:16:17:12:13:0.433333:4:8:4:12:4:9:4:13
chr19	44511223	.	T	G	1171.83	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0175333;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.8905;QD=60.8742;RBI=0.0317994;REFB=0;REVB=0.026529;RO=0;SAF=41;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.52206e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000123424;OID=.;OPOS=44511223;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:36:41:0:0:36:41:0:0
chr19	44515352	.	T	G	364.45	PASS	AF=0.590164;AO=36;DP=61;FAO=36;FDP=61;FR=.;FRO=25;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=-0.0142172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.106;QD=23.8984;RBI=0.0181732;REFB=0.00570554;REVB=0.0113198;RO=25;SAF=19;SAR=17;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0844713;STB=0.546347;STBP=0.417;TYPE=snp;VARB=-0.00399383;OID=.;OPOS=44515352;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:25:25:36:36:0.590164:17:19:16:9:17:19:16:9
chr19	44515514	.	C	A	201.54	PASS	AF=0.413793;AO=24;DP=58;FAO=24;FDP=58;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=20;FWDB=0.0108407;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.0855;QD=13.8992;RBI=0.0109966;REFB=-0.0116816;REVB=0.00184521;RO=34;SAF=10;SAR=14;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00517647;STB=0.502956;STBP=0.986;TYPE=snp;VARB=0.0155475;OID=.;OPOS=44515514;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:34:34:24:24:0.413793:14:10:14:20:14:10:14:20
chr19	44531553	.	A	T	210.71	PASS	AF=0.477273;AO=21;DP=44;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=0.00604413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.65;QD=19.1558;RBI=0.00906542;REFB=-0.0183643;REVB=0.0067565;RO=23;SAF=9;SAR=12;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.204177;STB=0.615277;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=0.0202104;OID=.;OPOS=44531553;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:23:23:21:21:0.477273:12:9:15:8:12:9:15:8
chr19	44564981	.	G	A	572.76	PASS	AF=0.6375;AO=51;DP=80;FAO=51;FDP=80;FR=.;FRO=29;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=-0.00848708;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=257.875;QD=28.638;RBI=0.02624;REFB=-0.0142204;REVB=-0.0248295;RO=29;SAF=25;SAR=26;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0410156;STB=0.522284;STBP=0.598;TYPE=snp;VARB=0.00820535;OID=.;OPOS=44564981;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:29:29:51:51:0.6375:26:25:16:13:26:25:16:13
chr19	44570551	.	G	A	181.53	PASS	AF=0.6;AO=18;DP=30;FAO=18;FDP=30;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=2;FWDB=-0.039473;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.1789;QD=24.2038;RBI=0.0439768;REFB=-0.0327747;REVB=-0.0193865;RO=12;SAF=5;SAR=13;SRF=10;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.397162;STB=0.721975;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.0343481;OID=.;OPOS=44570551;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:30:30:12:12:18:18:0.6:13:5:10:2:13:5:10:2
chr19	44591118	.	CA	C	85.43	PASS	AF=0.55;AO=7;DP=19;FAO=11;FDP=20;FR=.;FRO=9;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=9;FWDB=-0.0382526;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=18.8777;QD=17.0868;RBI=0.257706;REFB=-0.0317839;REVB=0.254851;RO=10;SAF=7;SAR=0;SRF=0;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.848352;STB=0.845567;STBP=0.01;TYPE=del;VARB=0.0460466;OID=.;OPOS=44591119;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.55:7:19:11:20:9:9:2:0:9:38:10:7:0:0:10
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chr19	44610665	.	A	G	91.32	PASS	AF=0.52381;AO=11;DP=21;FAO=11;FDP=21;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=9;FWDB=0.0636017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.087;QD=17.3936;RBI=0.0640541;REFB=0.000926798;REVB=-0.00759957;RO=10;SAF=4;SAR=7;SRF=1;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.25877;STB=0.646239;STBP=0.271;TYPE=snp;VARB=-0.000353618;OID=.;OPOS=44610665;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:21:21:10:10:11:11:0.52381:7:4:1:9:7:4:1:9
chr19	44610798	.	A	T	114.45	PASS	AF=0.297872;AO=14;DP=48;FAO=14;FDP=47;FR=.;FRO=33;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=27;FWDB=0.000929664;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.8444;QD=9.74049;RBI=0.0304419;REFB=-0.0118054;REVB=0.0304277;RO=33;SAF=7;SAR=7;SRF=6;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.382665;STB=0.723149;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=0.00892451;OID=.;OPOS=44610798;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:47:33:33:14:14:0.297872:7:7:6:27:7:7:6:27
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chr19	44611420	.	A	G	257.76	PASS	AF=0.676471;AO=23;DP=34;FAO=23;FDP=34;FR=.;FRO=11;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.0127114;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=329.888;QD=30.3241;RBI=0.0130277;REFB=0.0101557;REVB=0.0028531;RO=11;SAF=14;SAR=9;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0928435;STB=0.551136;STBP=0.403;TYPE=snp;VARB=-0.00510609;OID=.;OPOS=44611420;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:34:34:11:11:23:23:0.676471:9:14:5:6:9:14:5:6
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chr19	44612231	.	A	G	176.27	PASS	AF=0.529412;AO=18;DP=34;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=0.0102538;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=139.013;QD=20.7377;RBI=0.0212024;REFB=-0.0326369;REVB=0.0185581;RO=16;SAF=13;SAR=5;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.349658;STB=0.697761;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.0198093;OID=.;OPOS=44612231;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:16:16:18:18:0.529412:5:13:5:11:5:13:5:11
chr19	44635869	.	G	C	91.32	PASS	AF=0.52381;AO=11;DP=19;FAO=11;FDP=21;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.0838602;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=50.8889;QD=17.3943;RBI=0.116964;REFB=-0.037219;REVB=-0.0815353;RO=8;SAF=5;SAR=6;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124659;STB=0.521699;STBP=0.94;TYPE=snp;VARB=0.0311353;OID=.;OPOS=44635869;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:19:21:8:10:11:11:0.52381:6:5:5:3:6:5:5:5
chr19	44652954	.	G	A	311.85	PASS	AF=0.453333;AO=34;DP=75;FAO=34;FDP=75;FR=.;FRO=41;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=19;FWDB=0.00578191;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=229.413;QD=16.6318;RBI=0.0239604;REFB=-0.0245299;REVB=0.0232523;RO=41;SAF=20;SAR=14;SRF=22;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0512885;STB=0.528829;STBP=0.678;TYPE=snp;VARB=0.0289088;OID=.;OPOS=44652954;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:41:41:34:34:0.453333:14:20:22:19:14:20:22:19
chr19	44660967	.	A	G	71.42	PASS	AF=0.6;AO=9;DP=14;FAO=9;FDP=15;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.0124359;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.3641;QD=19.0454;RBI=0.0479624;REFB=-0.0292334;REVB=-0.0463221;RO=5;SAF=3;SAR=6;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0970608;STB=0.578784;STBP=0.569;TYPE=snp;VARB=0.0190722;OID=.;OPOS=44660967;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:14:15:5:6:9:9:0.6:6:3:1:4:6:3:1:5
chr19	44721699	.	C	T	269.49	PASS	AF=0.407895;AO=31;DP=76;FAO=31;FDP=76;FR=.;FRO=45;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=27;FSRR=18;FWDB=-0.0176979;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.22;QD=14.1838;RBI=0.0204713;REFB=-0.0198604;REVB=-0.0102888;RO=45;SAF=20;SAR=11;SRF=27;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0504056;STB=0.528696;STBP=0.68;TYPE=snp;VARB=0.0204634;OID=.;OPOS=44721699;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:45:45:31:31:0.407895:11:20:27:18:11:20:27:18
chr19	44764064	.	A	G	1044.38	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00951853;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.8265;QD=59.679;RBI=0.0311295;REFB=0;REVB=-0.0296385;RO=0;SAF=33;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000353757;OID=.;OPOS=44764064;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:37:33:0:0:37:33:0:0
chr19	44778405	.	A	C	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0367598;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=288.558;QD=51.9167;RBI=0.0578745;REFB=0;REVB=0.044701;RO=0;SAF=7;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000330798;OID=.;OPOS=44778405;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:14:7:0:0:14:7:0:0
chr19	44778797	.	T	A	44.29	PASS	AF=0.269231;AO=7;DP=26;FAO=7;FDP=26;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.0167436;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.236;QD=6.81337;RBI=0.0200273;REFB=0.00802692;REVB=0.0109883;RO=19;SAF=6;SAR=1;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.393613;STB=0.7597;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=-0.036954;OID=.;OPOS=44778797;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:26:26:19:19:7:7:0.269231:1:6:11:8:1:6:11:8
chr19	44778799	.	G	A	44.09	PASS	AF=0.269231;AO=7;DP=26;FAO=7;FDP=26;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.0390863;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.8354;QD=6.78245;RBI=0.0390886;REFB=-0.0104123;REVB=-0.000424542;RO=19;SAF=6;SAR=1;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.393613;STB=0.7597;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=0.0706942;OID=.;OPOS=44778799;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:26:26:19:19:7:7:0.269231:1:6:11:8:1:6:11:8
chr19	44792701	.	T	G	166.72	PASS	AF=0.409091;AO=17;DP=42;FAO=18;FDP=44;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=0.0129801;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.5772;QD=15.156;RBI=0.0144977;REFB=-0.0153955;REVB=0.00645748;RO=25;SAF=8;SAR=9;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0507581;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0270111;OID=.;OPOS=44792701;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:44:25:26:17:18:0.409091:9:8:13:12:9:9:13:13
chr19	44792969	.	G	A	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00506227;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.4009;QD=44.6897;RBI=0.0262622;REFB=0;REVB=-0.0257697;RO=0;SAF=7;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00055617;OID=.;OPOS=44792969;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:6:7:0:0:6:7:0:0
chr19	44832684	.	T	G	1006.8	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00273029;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.35;QD=59.2235;RBI=0.00983252;REFB=0;REVB=-0.00944584;RO=0;SAF=29;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.47688e-06;OID=.;OPOS=44832684;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:68:0:0:67:68:1:38:29:0:0:39:29:0:0
chr19	44832875	.	A	G	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00209012;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.786;QD=55.656;RBI=0.0160752;REFB=0;REVB=0.0159388;RO=0;SAF=14;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000235742;OID=.;OPOS=44832875;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:13:14:0:0:13:14:0:0
chr19	44832992	.	C	G	728.81	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0284959;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.1588;QD=57.1613;RBI=0.0323248;REFB=0;REVB=0.0152603;RO=0;SAF=26;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94283e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00055046;OID=.;OPOS=44832992;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:25:26:0:0:25:26:0:0
chr19	44833506	.	C	T	724.08	PASS	AF=0.981132;AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0199666;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.9698;QD=54.6471;RBI=0.0223353;REFB=-0.0359311;REVB=-0.0100098;RO=1;SAF=26;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0177719;STB=0.50943;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=0.00441015;OID=.;OPOS=44833506;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:53:53:1:1:52:52:0.981132:26:26:1:0:26:26:1:0
chr19	44833851	.	G	C	746.61	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100769;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.873;QD=56.3478;RBI=0.0573105;REFB=0;REVB=0.0564177;RO=0;SAF=34;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.19096e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000686435;OID=.;OPOS=44833851;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:53:0:0:52:53:1:18:34:0:0:19:34:0:0
chr19	44840789	.	T	C	912.06	PASS	AF=1;AO=61;DP=62;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130774;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.829;QD=57.9083;RBI=0.0364823;REFB=0;REVB=0.0340579;RO=0;SAF=28;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.04957e-05;OID=.;OPOS=44840789;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:63:0:0:61:63:1:33:28:0:0:34:29:0:0
chr19	44890697	.	A	G	523.96	PASS	AF=1;AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0300344;FXX=0.0277701;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.385;QD=59.8814;RBI=0.0415705;REFB=0;REVB=0.028741;RO=0;SAF=21;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.27896e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000405611;OID=.;OPOS=44890697;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:35:0:0:35:35:1:14:21:0:0:14:21:0:0
chr19	44890801	.	T	C	804.72	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0295264;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.5355;QD=64.378;RBI=0.0325716;REFB=0;REVB=0.0137516;RO=0;SAF=26;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.10374e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000234785;OID=.;OPOS=44890801;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:24:26:0:0:24:26:0:0
chr19	44891784	.	T	C	481.47	PASS	AF=0.944444;AO=34;DP=36;FAO=34;FDP=36;FR=.;FRO=2;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00630603;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.949;QD=53.4965;RBI=0.0181293;REFB=-0.0396493;REVB=0.0169972;RO=1;SAF=22;SAR=12;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0373615;STB=0.538438;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=0.00247066;OID=.;OPOS=44891784;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:36:36:1:2:34:34:0.944444:12:22:0:1:12:22:0:2
chr19	44898662	.	C	T	223.15	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00214009;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.1399;QD=49.5889;RBI=0.0022804;REFB=0;REVB=0.000787561;RO=0;SAF=10;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.64896e-05;OID=.;OPOS=44898662;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:8:10:0:0:8:10:0:0
chr19	44930880	.	G	A	3347.39	PASS	AF=1;AO=215;DP=217;FAO=215;FDP=215;FR=.;FRO=0;FSAF=104;FSAR=111;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00752665;FXX=0.00921617;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.287;QD=62.277;RBI=0.0158433;REFB=0;REVB=-0.0139413;RO=0;SAF=104;SAR=111;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.22513e-05;OID=.;OPOS=44930880;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:18:217:215:0:0:215:215:1:111:104:0:0:111:104:0:0
chr19	44932972	.	C	T	610.43	PASS	AF=0.953488;AO=41;DP=43;FAO=41;FDP=43;FR=.;FRO=2;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0583809;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.945;QD=56.7844;RBI=0.0583818;REFB=-0.0279535;REVB=0.000312626;RO=1;SAF=18;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0199652;STB=0.502875;STBP=0.862;TYPE=snp;VARB=0.00160303;OID=.;OPOS=44932972;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:43:43:1:2:41:41:0.953488:23:18:0:1:23:18:1:1
chr19	44933947	.	G	A	937.5	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0103447;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.787;QD=58.5939;RBI=0.0164751;REFB=0;REVB=-0.0128224;RO=0;SAF=42;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000123089;OID=.;OPOS=44933947;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:22:42:0:0:22:42:0:0
chr19	44934489	.	G	A	756.37	PASS	AF=1;AO=53;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0268957;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.3056;QD=56.0274;RBI=0.0520048;REFB=0;REVB=0.0445098;RO=1;SAF=17;SAR=36;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0269038;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000925343;OID=.;OPOS=44934489;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:1:0:53:54:1:36:17:1:0:36:18:0:0
chr19	44981318	.	G	A	66.83	PASS	AF=0.428571;AO=9;DP=20;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=0.0244387;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.966;QD=12.7292;RBI=0.0278104;REFB=-0.00854703;REVB=-0.0132728;RO=11;SAF=2;SAR=7;SRF=2;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0566031;STB=0.548286;STBP=0.795;TYPE=snp;VARB=0.00598664;OID=.;OPOS=44981318;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:20:21:11:12:9:9:0.428571:7:2:2:9:7:2:2:10
chr19	44981525	.	G	A	70.57	PASS	AF=0.5625;AO=9;DP=16;FAO=9;FDP=16;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.0806328;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.4898;QD=17.6431;RBI=0.0824451;REFB=-0.0257216;REVB=-0.0171916;RO=7;SAF=5;SAR=4;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0121106;STB=0.507027;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0156251;OID=.;OPOS=44981525;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:16:16:7:7:9:9:0.5625:4:5:4:3:4:5:4:3
chr19	44981883	.	C	G	164.13	PASS	AF=0.372549;AO=18;DP=51;FAO=19;FDP=51;FR=.;FRO=32;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=0.00661957;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.61;QD=12.8732;RBI=0.0212447;REFB=-0.0082881;REVB=-0.0201871;RO=31;SAF=5;SAR=13;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.241296;STB=0.643517;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=0.0118321;OID=.;OPOS=44981883;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:31:32:18:19:0.372549:13:5:15:16:14:5:15:17
chr19	44983567	.	C	G	273.42	PASS	AF=0.372093;AO=32;DP=86;FAO=32;FDP=86;FR=.;FRO=54;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=35;FWDB=-0.0115651;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.123;QD=12.7172;RBI=0.0142234;REFB=-0.000549979;REVB=0.00827969;RO=54;SAF=15;SAR=17;SRF=19;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130154;STB=0.574329;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.000658784;OID=.;OPOS=44983567;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:54:54:32:32:0.372093:17:15:19:35:17:15:19:35
chr19	45001346	.	G	A	285.8	PASS	AF=0.438356;AO=31;DP=73;FAO=32;FDP=73;FR=.;FRO=41;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=-0.00734557;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.8466;QD=15.6605;RBI=0.0075652;REFB=-0.0173769;REVB=0.00180965;RO=41;SAF=16;SAR=15;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0039628;STB=0.510723;STBP=0.875;TYPE=snp;VARB=0.018206;OID=.;OPOS=45001346;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:41:41:31:32:0.438356:15:16:21:20:15:17:21:20
chr19	45016990	.	CT	C	1713.87	PASS	AF=1;AO=139;DP=145;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0409541;FXX=0.0275843;HRUN=2;LEN=1;MLLD=29.8597;QD=48.6204;RBI=0.100186;REFB=0;REVB=0.0914335;RO=0;SAF=69;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000395758;OID=.;OPOS=45016991;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:139:145:141:141:0:70:71:0:0:31:0:69:70:0:0
chr19	45017249	.	T	C	79.95	PASS	AF=0.526316;AO=10;DP=19;FAO=10;FDP=19;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.0546415;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.4005;QD=16.8308;RBI=0.122787;REFB=-0.0051197;REVB=0.109959;RO=9;SAF=6;SAR=4;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128055;STB=0.574318;STBP=0.549;TYPE=snp;VARB=0.00680693;OID=.;OPOS=45017249;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:19:19:9:9:10:10:0.526316:4:6:4:5:4:6:4:5
chr19	45050747	.	C	T	276.66	PASS	AF=1;AO=21;DP=22;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.013062;FXX=0.0454339;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.1305;QD=52.6976;RBI=0.0499543;REFB=0;REVB=0.0482163;RO=0;SAF=7;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000871896;OID=.;OPOS=45050747;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:21:0:0:21:21:1:14:7:0:0:14:7:0:0
chr19	45162038	.	A	G	801.18	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0149119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.7127;QD=57.2269;RBI=0.0404505;REFB=0;REVB=0.0376016;RO=0;SAF=36;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.57266e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000262201;OID=.;OPOS=45162038;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:20:36:0:0:20:36:0:0
chr19	45162189	.	C	A	287.62	PASS	AF=0.444444;AO=32;DP=72;FAO=32;FDP=72;FR=.;FRO=40;FSAF=8;FSAR=24;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=-0.000701543;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.254;QD=15.979;RBI=0.000732833;REFB=0.00435662;REVB=-0.000211852;RO=40;SAF=8;SAR=24;SRF=18;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.227049;STB=0.628946;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=-0.00649342;OID=.;OPOS=45162189;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:40:40:32:32:0.444444:24:8:18:22:24:8:18:22
chr19	45211407	.	C	T	132.6	PASS	AF=0.32;AO=16;DP=51;FAO=16;FDP=50;FR=.;FRO=34;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=-0.00359261;FXX=0.019604;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.712;QD=10.6077;RBI=0.0045735;REFB=-0.00498479;REVB=0.0028302;RO=34;SAF=8;SAR=8;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0671896;STB=0.53995;STBP=0.692;TYPE=snp;VARB=0.00951058;OID=.;OPOS=45211407;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:50:34:34:16:16:0.32:8:8:19:15:8:8:19:15
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chr19	45389224	.	A	G	344.64	PASS	AF=1;AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0280143;FXX=0.0384468;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.163;QD=55.1426;RBI=0.0282248;REFB=0;REVB=-0.00344097;RO=0;SAF=12;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.74254e-05;OID=.;OPOS=45389224;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:25:0:0:25:25:1:13:12:0:0:13:12:0:0
chr19	45395714	.	T	C	274.92	PASS	AF=0.555556;AO=25;DP=45;FAO=25;FDP=45;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=-0.0645984;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=55.133;QD=24.4376;RBI=0.0672449;REFB=-0.0194317;REVB=0.0186794;RO=20;SAF=9;SAR=16;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0759698;STB=0.542338;STBP=0.547;TYPE=snp;VARB=0.0137287;OID=.;OPOS=45395714;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:20:20:25:25:0.555556:16:9:9:11:16:9:9:11
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chr19	45452694	.	G	GT	90.16	PASS	AF=0.244898;AO=12;DP=53;FAO=12;FDP=49;FR=.;FRO=37;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=0.00241035;FXX=0.019996;HRUN=0;LEN=1;MLLD=274.368;QD=7.35991;RBI=0.0111171;REFB=-0.00104502;REVB=-0.0108526;RO=41;SAF=6;SAR=6;SRF=22;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0446934;STB=0.510187;STBP=0.949;TYPE=ins;VARB=0.00330369;OID=.;OPOS=45452695;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.244898:12:53:12:49:37:6:6:19:18:90:41:6:6:22:19
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chr19	45490570	.	A	G	96.73	PASS	AF=0.387097;AO=12;DP=31;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.0394473;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.355;QD=12.4814;RBI=0.0397735;REFB=-0.00564959;REVB=0.0050839;RO=19;SAF=9;SAR=3;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.308734;STB=0.683885;STBP=0.136;TYPE=snp;VARB=0.00900589;OID=.;OPOS=45490570;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:31:31:19:19:12:12:0.387097:3:9:9:10:3:9:9:10
chr19	45561063	.	A	G	689.35	PASS	AF=1;AO=39;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156635;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.4522;QD=62.6684;RBI=0.0323961;REFB=0;REVB=-0.0283577;RO=0;SAF=18;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.34792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00015245;OID=.;OPOS=45561063;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:39:44:1:21:18:0:0:26:18:0:0
chr19	45728059	.	T	C	88.1	PASS	AF=0.44;AO=11;DP=25;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.073135;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.571;QD=14.0964;RBI=0.0773495;REFB=-0.020789;REVB=-0.0251837;RO=14;SAF=8;SAR=3;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169053;STB=0.599808;STBP=0.413;TYPE=snp;VARB=0.019559;OID=.;OPOS=45728059;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:25:25:14:14:11:11:0.44:3:8:8:6:3:8:8:6
chr19	45728123	.	C	T	102.5	PASS	AF=0.521739;AO=12;DP=23;FAO=12;FDP=23;FR=.;FRO=11;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.0416883;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.969;QD=17.8262;RBI=0.0453818;REFB=-0.00880919;REVB=-0.017933;RO=10;SAF=7;SAR=5;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145313;STB=0.604144;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=0.013451;OID=.;OPOS=45728123;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:23:23:10:11:12:12:0.521739:5:7:4:6:5:7:4:7
chr19	45868309	.	T	G	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0325252;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.324;QD=55.0986;RBI=0.0447592;REFB=0;REVB=0.0307489;RO=0;SAF=16;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.71087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.37999e-05;OID=.;OPOS=45868309;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:10:16:0:0:10:16:0:0
chr19	45882962	.	T	A	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0472339;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.046;QD=48.7373;RBI=0.0472339;REFB=0;REVB=1.63036e-05;RO=0;SAF=10;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000643716;OID=.;OPOS=45882962;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:7:10:0:0:7:10:0:0
chr19	45909934	.	G	A	414.89	PASS	AF=0.939394;AO=30;DP=32;FAO=31;FDP=33;FR=.;FRO=2;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0390781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.487;QD=50.2891;RBI=0.0441254;REFB=-0.109918;REVB=0.0204928;RO=2;SAF=15;SAR=15;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0581794;STB=0.529393;STBP=0.227;TYPE=snp;VARB=0.00110102;OID=.;OPOS=45909934;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:32:33:2:2:30:31:0.939394:15:15:0:2:16:15:0:2
chr19	45910003	.	G	T	540.91	PASS	AF=0.974359;AO=37;DP=39;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0229207;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.2466;QD=55.4777;RBI=0.0660135;REFB=-0.179043;REVB=0.0619066;RO=1;SAF=16;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0217802;STB=0.515144;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.00825693;OID=.;OPOS=45910003;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:39:39:1:1:37:38:0.974359:21:16:0:1:22:16:1:0
chr19	45912002	.	A	C	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0088885;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=370.392;QD=51.1846;RBI=0.0160184;REFB=0;REVB=0.013326;RO=0;SAF=9;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.35867e-05;OID=.;OPOS=45912002;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:11:9:0:0:11:9:0:0
chr19	45912343	.	A	G	545.0	PASS	AF=0.973684;AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0174239;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.828;QD=57.3685;RBI=0.0186492;REFB=0.00892462;REVB=-0.00664829;RO=1;SAF=19;SAR=18;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0253062;STB=0.513506;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=-0.00395411;OID=.;OPOS=45912343;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:38:38:1:1:37:37:0.973684:18:19:0:1:18:19:0:1
chr19	45912406	.	G	A	459.43	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0342438;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.032;QD=57.4284;RBI=0.0354635;REFB=0;REVB=0.00922088;RO=0;SAF=14;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.86631e-05;OID=.;OPOS=45912406;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:32:0:0:31:32:1:17:14:0:0:18:14:0:0
chr19	45923653	.	A	G	825.64	PASS	AF=0.983051;AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0228654;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.738;QD=55.9757;RBI=0.0413693;REFB=-0.0373072;REVB=0.0344759;RO=0;SAF=25;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50746;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.0004518;OID=.;OPOS=45923653;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:59:59:0:1:58:58:0.983051:33:25:0:0:33:25:0:1
chr19	45998381	.	T	C	446.4	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00377872;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.6862;QD=57.5998;RBI=0.0332284;REFB=0;REVB=0.0330128;RO=0;SAF=8;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.39343e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000396142;OID=.;OPOS=45998381;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:23:8:0:0:23:8:0:0
chr19	46002456	.	G	T	808.04	PASS	AF=0.951613;AO=59;DP=62;FAO=59;FDP=62;FR=.;FRO=3;FSAF=33;FSAR=26;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.00127942;FXX=0.0158705;HRUN=4;LEN=1;MLLD=231.789;QD=52.1313;RBI=0.0149084;REFB=-0.0876265;REVB=0.0148534;RO=3;SAF=33;SAR=26;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00994043;STB=0.505273;STBP=0.735;TYPE=snp;VARB=-9.29404e-06;OID=.;OPOS=46002456;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:62:62:3:3:59:59:0.951613:26:33:2:1:26:33:2:1
chr19	46003066	.	T	G	447.02	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00527335;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.429;QD=57.6795;RBI=0.00533443;REFB=0;REVB=-0.000804904;RO=0;SAF=22;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.15349e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.54642e-05;OID=.;OPOS=46003066;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:9:22:0:0:9:22:0:0
chr19	46003068	.	A	G	429.01	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0640667;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.0895;QD=57.2018;RBI=0.0736605;REFB=0;REVB=-0.0363502;RO=0;SAF=22;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00221011;OID=.;OPOS=46003068;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:8:22:0:0:8:22:0:0
chr19	46024582	.	GGT	G,GG	361.87	PASS	AF=0.923077,0.0769231;AO=18,8;DP=28;FAO=24,2;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=19,2;FSAR=5,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0080258,0.00261689;FXX=0.0714031;HRUN=2,1;LEN=2,1;MLLD=243.183,234.563;QD=55.6716;RBI=0.00848718,0.0426159;REFB=0,0;REVB=-0.0027602,-0.0425355;RO=0;SAF=16,5;SAR=2,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,4.46938e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=0.00270232,-0.0294341;OID=.,.;OPOS=46024583,46024584;OREF=GT,T;OALT=-,-;OMAPALT=G,GG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.923077,0.0769231:18,8:28:24,2:26:0:19,2:5,0:0:0:8:0:16,5:2,3:0:0
chr19	46026970	.	T	A	754.31	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0237176;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.7937;QD=56.9287;RBI=0.0244213;REFB=0;REVB=-0.00582028;RO=0;SAF=27;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000208407;OID=.;OPOS=46026970;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:26:27:0:0:26:27:0:0
chr19	46027845	.	C	T	255.96	PASS	AF=0.676471;AO=22;DP=33;FAO=23;FDP=34;FR=.;FRO=11;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.00310222;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.954;QD=30.1129;RBI=0.00540486;REFB=0.00834974;REVB=-0.00442592;RO=11;SAF=10;SAR=12;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0550494;STB=0.52172;STBP=0.734;TYPE=snp;VARB=-0.0029066;OID=.;OPOS=46027845;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:33:34:11:11:22:23:0.676471:12:10:6:5:12:11:6:5
chr19	46029981	.	T	C	2085.21	PASS	AF=0.992593;AO=134;DP=135;FAO=134;FDP=135;FR=.;FRO=1;FSAF=55;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0162578;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.2914;QD=61.7841;RBI=0.0437956;REFB=-0.0933267;REVB=0.0406661;RO=1;SAF=55;SAR=79;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00597952;STB=0.503144;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.000683475;OID=.;OPOS=46029981;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:135:135:1:1:134:134:0.992593:79:55:0:1:79:55:0:1
chr19	46057081	.	A	G	483.35	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0105871;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.234;QD=58.5876;RBI=0.0112546;REFB=0;REVB=-0.00381846;RO=0;SAF=11;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.43939e-05;OID=.;OPOS=46057081;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:22:11:0:0:22:11:0:0
chr19	46133251	.	C	T	80.27	PASS	AF=0.526316;AO=10;DP=19;FAO=10;FDP=19;FR=.;FRO=9;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.0210935;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.109;QD=16.8983;RBI=0.0214311;REFB=-0.0300297;REVB=-0.00378886;RO=9;SAF=7;SAR=3;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130908;STB=0.576311;STBP=0.557;TYPE=snp;VARB=0.0612529;OID=.;OPOS=46133251;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:19:19:9:9:10:10:0.526316:3:7:5:4:3:7:5:4
chr19	46133256	.	G	A	68.81	PASS	AF=0.5;AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.00502674;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.096;QD=15.292;RBI=0.0104841;REFB=-0.0263028;REVB=0.00920047;RO=9;SAF=6;SAR=3;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101784;STB=0.559863;STBP=0.623;TYPE=snp;VARB=0.0269503;OID=.;OPOS=46133256;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:18:18:9:9:9:9:0.5:3:6:5:4:3:6:5:4
chr19	46141845	.	T	C	131.99	PASS	AF=0.416667;AO=15;DP=36;FAO=15;FDP=36;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=6;FWDB=-0.00925535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.342;QD=14.6656;RBI=0.011156;REFB=-0.0125535;REVB=0.00622857;RO=21;SAF=9;SAR=6;SRF=15;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123809;STB=0.571338;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.0163598;OID=.;OPOS=46141845;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:21:21:15:15:0.416667:6:9:15:6:6:9:15:6
chr19	46154806	.	T	C	37.78	PASS	AF=0.375;AO=6;DP=16;FAO=6;FDP=16;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.00214043;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.198;QD=9.44541;RBI=0.0459806;REFB=-0.0185595;REVB=0.0459308;RO=10;SAF=3;SAR=3;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100718;STB=0.562295;STBP=0.758;TYPE=snp;VARB=0.0169985;OID=.;OPOS=46154806;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:16:16:10:10:6:6:0.375:3:3:4:6:3:3:4:6
chr19	46154820	.	G	A	116.21	PASS	AF=0.565217;AO=13;DP=23;FAO=13;FDP=23;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=-0.00603266;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=141.089;QD=20.2098;RBI=0.0161139;REFB=-0.0264295;REVB=0.014942;RO=10;SAF=4;SAR=9;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0795218;STB=0.545383;STBP=0.667;TYPE=snp;VARB=0.0254494;OID=.;OPOS=46154820;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:23:23:10:10:13:13:0.565217:9:4:4:6:9:4:4:6
chr19	46154902	.	G	GC	194.08	PASS	AF=0.55102;AO=26;DP=50;FAO=27;FDP=49;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=-0.0137104;FXX=0.019996;HRUN=0;LEN=1;MLLD=194.125;QD=15.8433;RBI=0.0144924;REFB=0.00666318;REVB=-0.00469633;RO=23;SAF=12;SAR=14;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123281;STB=0.585523;STBP=0.208;TYPE=ins;VARB=-0.00372377;OID=.;OPOS=46154903;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.55102:26:50:27:49:22:12:15:14:8:99:23:12:14:14:9
chr19	46154906	.	C	CT	197.09	PASS	AF=0.574468;AO=26;DP=48;FAO=27;FDP=47;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=0.000904416;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=341.478;QD=16.7732;RBI=0.0102345;REFB=0.00518548;REVB=0.0101944;RO=21;SAF=12;SAR=14;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163713;STB=0.586791;STBP=0.161;TYPE=ins;VARB=-0.0054452;OID=.;OPOS=46154907;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.574468:26:48:27:47:20:12:15:13:7:99:21:12:14:14:7
chr19	46269076	.	G	A	340.36	PASS	AF=0.928571;AO=26;DP=28;FAO=26;FDP=28;FR=.;FRO=2;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0165459;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=111.159;QD=48.6234;RBI=0.0382761;REFB=-0.0331366;REVB=0.0345151;RO=2;SAF=12;SAR=14;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00512114;STB=0.50276;STBP=0.879;TYPE=snp;VARB=0.000600774;OID=.;OPOS=46269076;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:28:28:2:2:26:26:0.928571:14:12:1:1:14:12:1:1
chr19	46269313	.	G	C	74.97	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112369;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=282.025;QD=37.4858;RBI=0.011239;REFB=0;REVB=0.000212572;RO=0;SAF=5;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000143744;OID=.;OPOS=46269313;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:3:5:0:0:3:5:0:0
chr19	46287200	.	C	G	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0222741;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.987;QD=43.486;RBI=0.0286159;REFB=0;REVB=0.0179648;RO=0;SAF=7;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000939287;OID=.;OPOS=46287200;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:5:7:0:0:5:7:0:0
chr19	46289392	.	G	C	587.11	PASS	AF=0.875;AO=42;DP=49;FAO=42;FDP=48;FR=.;FRO=6;FSAF=35;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.00450041;FXX=0.020404;HRUN=8;LEN=1;MLLD=223.236;QD=48.9256;RBI=0.00560872;REFB=-0.081657;REVB=0.00334724;RO=6;SAF=34;SAR=8;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108257;STB=0.597775;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.000863723;OID=.;OPOS=46289392;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:27:49:48:6:6:42:42:0.875:8:34:3:3:7:35:2:4
chr19	46299162	.	C	T	66.5	PASS	AF=0.8;AO=8;DP=10;FAO=8;FDP=10;FR=.;FRO=2;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0274561;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.258;QD=26.601;RBI=0.0323747;REFB=-0.0435684;REVB=0.0171547;RO=2;SAF=2;SAR=6;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12621;STB=0.571264;STBP=0.613;TYPE=snp;VARB=0.016998;OID=.;OPOS=46299162;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:10:10:2:2:8:8:0.8:6:2:0:2:6:2:0:2
chr19	46319352	.	G	C	34.87	PASS	AF=0.206897;AO=6;DP=29;FAO=6;FDP=29;FR=.;FRO=23;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=-0.0254566;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.536;QD=4.80962;RBI=0.0257116;REFB=0.00106359;REVB=-0.00361194;RO=23;SAF=1;SAR=5;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.544424;STB=0.859105;STBP=0.087;TYPE=snp;VARB=-0.00420708;OID=.;OPOS=46319352;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:29:29:23:23:6:6:0.206897:5:1:15:8:5:1:15:8
chr19	46319415	.	G	C	167.47	PASS	AF=0.9375;AO=15;DP=16;FAO=15;FDP=16;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.014792;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=312.966;QD=41.8679;RBI=0.0847193;REFB=0.00448857;REVB=0.083418;RO=1;SAF=13;SAR=2;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0338159;STB=0.518494;STBP=0.66;TYPE=snp;VARB=0.000122057;OID=.;OPOS=46319415;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:16:16:1:1:15:15:0.9375:2:13:1:0:2:13:1:0
chr19	46327053	.	C	T	141.42	PASS	AF=0.363636;AO=16;DP=45;FAO=16;FDP=44;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=-0.00578589;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.51;QD=12.8563;RBI=0.00793364;REFB=-0.0092717;REVB=0.00542827;RO=29;SAF=7;SAR=9;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119587;STB=0.505773;STBP=0.968;TYPE=snp;VARB=0.0144494;OID=.;OPOS=46327053;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:44:29:28:16:16:0.363636:9:7:13:16:9:7:12:16
chr19	46330809	.	G	A	175.31	PASS	AF=0.392157;AO=21;DP=51;FAO=20;FDP=51;FR=.;FRO=31;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=0.0341388;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.6926;QD=13.7502;RBI=0.0374494;REFB=-0.0314371;REVB=0.0153949;RO=30;SAF=11;SAR=10;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0786929;STB=0.518868;STBP=0.823;TYPE=snp;VARB=0.0533964;OID=.;OPOS=46330809;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:30:31:21:20:0.392157:10:11:18:12:9:11:18:13
chr19	46375779	.	C	T	77.29	PASS	AF=0.434783;AO=10;DP=23;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=0.0011502;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.615;QD=13.4417;RBI=0.0124747;REFB=-0.00561429;REVB=-0.0124215;RO=13;SAF=6;SAR=4;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.274414;STB=0.660708;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.00698035;OID=.;OPOS=46375779;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:23:23:13:13:10:10:0.434783:4:6:4:9:4:6:4:9
chr19	46404579	.	A	G	782.35	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0377554;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.758;QD=63.8656;RBI=0.0386897;REFB=0;REVB=-0.00845101;RO=0;SAF=18;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.42928e-05;OID=.;OPOS=46404579;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:49:0:0:45:49:1:27:18:0:0:28:21:0:0
chr19	46443886	.	C	A	88.19	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0434248;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.94;QD=39.1959;RBI=0.0459293;REFB=0;REVB=-0.0149595;RO=0;SAF=8;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000379544;OID=.;OPOS=46443886;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:1:8:0:0:1:8:0:0
chr19	46498353	.	C	G	277.42	PASS	AF=0.5;AO=30;DP=60;FAO=30;FDP=60;FR=.;FRO=30;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=-0.0113368;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=221.105;QD=18.4948;RBI=0.0131484;REFB=-0.00862068;REVB=0.00666007;RO=29;SAF=17;SAR=13;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.193575;STB=0.599054;STBP=0.136;TYPE=snp;VARB=0.00802861;OID=.;OPOS=46498353;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:29:30:30:30:0.5:13:17:10:19:13:17:11:19
chr19	46511548	.	T	C	145.2	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0364964;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.396;QD=44.6782;RBI=0.0365733;REFB=0;REVB=-0.00237015;RO=0;SAF=10;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000681638;OID=.;OPOS=46511548;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:3:10:0:0:3:10:0:0
chr19	46520025	.	CA	C,CG	1086.16	PASS	AF=0.148649,0.851351;AO=11,63;DP=75;FAO=11,63;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=4,32;FSAR=7,31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0179771,0.0166177;FXX=0.0133316;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=239.177,257.911;QD=58.7116;RBI=0.0189467,0.0176462;REFB=0,0;REVB=0.00598338,0.00593639;RO=0;SAF=4,32;SAR=7,31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.00977969,-0.00134812;OID=.,.;OPOS=46520026,46520026;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=C,CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.148649,0.851351:11,63:75:11,63:74:0:4,32:7,31:0:0:47:0:4,32:7,31:0:0
chr19	46520028	.	C	G	61.98	PASS	AF=0.162162;AO=12;DP=75;FAO=12;FDP=74;FR=.;FRO=62;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=31;FSRR=31;FWDB=-2.87528e-05;FXX=0.0133316;HRUN=5;LEN=1;MLLD=36.4666;QD=3.3504;RBI=0.000322234;REFB=-0.0355738;REVB=0.000320949;RO=62;SAF=4;SAR=8;SRF=31;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.210223;STB=0.641961;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.194968;OID=.;OPOS=46520028;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:75:74:62:62:12:12:0.162162:8:4:31:31:8:4:31:31
chr19	46811984	.	A	G	77.93	PASS	AF=0.454545;AO=10;DP=22;FAO=10;FDP=22;FR=.;FRO=12;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=-0.013281;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.299;QD=14.1699;RBI=0.0150749;REFB=-0.0353141;REVB=0.0071323;RO=12;SAF=1;SAR=9;SRF=2;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14509;STB=0.58676;STBP=0.656;TYPE=snp;VARB=0.0421236;OID=.;OPOS=46811984;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:22:22:12:12:10:10:0.454545:9:1:2:10:9:1:2:10
chr19	46815310	.	G	A	136.88	PASS	AF=0.5;AO=15;DP=30;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.00891589;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.69;QD=18.2512;RBI=0.0190944;REFB=-0.00618275;REVB=0.016885;RO=15;SAF=6;SAR=9;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11811;STB=0.567477;STBP=0.488;TYPE=snp;VARB=0.00478888;OID=.;OPOS=46815310;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:15:15:15:15:0.5:9:6:8:7:9:6:8:7
chr19	46815499	.	T	C	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0182919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.8808;QD=48.7369;RBI=0.0254849;REFB=0;REVB=0.017745;RO=0;SAF=2;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.95117e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0011646;OID=.;OPOS=46815499;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:15:2:0:0:15:2:0:0
chr19	46815703	.	ATATT	A	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0791708;FXX=0;HRUN=1;LEN=4;MLLD=300.338;QD=42.1826;RBI=0.0792467;REFB=0;REVB=0.00346766;RO=0;SAF=4;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.00031932;OID=.;OPOS=46815704;OREF=TATT;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:11:11:11:11:0:4:7:0:0:4:0:4:7:0:0
chr19	46815711	.	C	T	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0370302;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.958;QD=44.6898;RBI=0.0391962;REFB=0;REVB=0.0128495;RO=0;SAF=6;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00010167;OID=.;OPOS=46815711;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:7:6:0:0:7:6:0:0
chr19	46823702	.	A	G	720.86	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0130316;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.754;QD=62.6836;RBI=0.0245061;REFB=0;REVB=0.020754;RO=0;SAF=15;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.89709e-05;OID=.;OPOS=46823702;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:46:0:0:43:46:1:28:15:0:0:30:16:0:0
chr19	46823751	.	C	T	805.19	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0254619;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.041;QD=64.4148;RBI=0.0298269;REFB=0;REVB=0.015535;RO=0;SAF=17;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.70321e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000147858;OID=.;OPOS=46823751;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:50:0:0:49:50:1:32:17:0:0:32:18:0:0
chr19	46857015	.	C	T	955.2	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0426995;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.25;QD=58.7816;RBI=0.0482682;REFB=0;REVB=0.0225072;RO=0;SAF=26;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.10038e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000220831;OID=.;OPOS=46857015;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:39:26:0:0:39:26:0:0
chr19	46893810	.	G	A	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0160867;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.3191;QD=45.8066;RBI=0.0902856;REFB=0;REVB=0.0888409;RO=0;SAF=9;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0051858;OID=.;OPOS=46893810;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:5:9:0:0:5:9:0:0
chr19	46914547	.	C	G	223.02	PASS	AF=0.617647;AO=21;DP=34;FAO=21;FDP=34;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=0.00818214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.6699;QD=26.2375;RBI=0.0411966;REFB=-0.00244027;REVB=-0.0403759;RO=13;SAF=6;SAR=15;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0799583;STB=0.544511;STBP=0.548;TYPE=snp;VARB=0.00511006;OID=.;OPOS=46914547;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:13:13:21:21:0.617647:15:6:5:8:15:6:5:8
chr19	46971773	.	T	G	60.74	PASS	AF=0.236842;AO=9;DP=38;FAO=9;FDP=38;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=-0.00960492;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.9263;QD=6.39387;RBI=0.0363716;REFB=-0.000831771;REVB=0.0350805;RO=29;SAF=6;SAR=3;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.260507;STB=0.666297;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=0.00421467;OID=.;OPOS=46971773;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:60:38:38:29:29:9:9:0.236842:3:6:13:16:3:6:13:16
chr19	46973981	.	G	A	255.64	PASS	AF=0.657143;AO=23;DP=35;FAO=23;FDP=35;FR=.;FRO=12;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=0.00699111;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.562;QD=29.2158;RBI=0.0144204;REFB=-0.00536407;REVB=0.0126124;RO=12;SAF=12;SAR=11;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116779;STB=0.564301;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=0.00491572;OID=.;OPOS=46973981;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:35:35:12:12:23:23:0.657143:11:12:4:8:11:12:4:8
chr19	46974233	.	G	A	117.61	PASS	AF=0.466667;AO=13;DP=30;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.0723979;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.0108;QD=15.6817;RBI=0.0730058;REFB=-0.0199369;REVB=-0.00940143;RO=15;SAF=6;SAR=7;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0664503;STB=0.533286;STBP=0.763;TYPE=snp;VARB=0.0465118;OID=.;OPOS=46974233;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:15:16:13:14:0.466667:7:6:8:7:7:7:9:7
chr19	46998349	.	CCG	C,CGG	65.86	PASS	AF=0.238095,0;AO=14,5;DP=79;FAO=15,0;FDP=63;FR=.;FRO=48;FSAF=13,0;FSAR=2,0;FSRF=15;FSRR=33;FWDB=0.0203746,0.0175912;FXX=0.0596926;HRUN=4,4;LEN=2,1;MLLD=25.2391,20.6331;QD=4.18151;RBI=0.149806,0.0640626;REFB=-0.0513675,0.00269142;REVB=-0.148414,0.0616;RO=51;SAF=10,5;SAR=4,0;SRF=24;SRR=27;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.306396,0.590637;STB=0.889936,0.5;STBP=0,1;TYPE=del,snp;VARB=0.163622,0;OID=.,.;OPOS=46998350,46998350;OREF=CG,C;OALT=-,G;OMAPALT=C,CGG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.238095,0:14,5:79:15,0:63:48:13,0:2,0:15:33:66:51:10,5:4,0:24:27
chr19	46999691	.	C	G	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.023679;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=206.55;QD=47.822;RBI=0.0260957;REFB=0;REVB=-0.0109677;RO=0;SAF=6;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.49936e-05;OID=.;OPOS=46999691;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:10:6:0:0:10:6:0:0
chr19	47124714	.	T	G	322.7	PASS	AF=0.5;AO=34;DP=69;FAO=34;FDP=68;FR=.;FRO=34;FSAF=24;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=-0.0116426;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.639;QD=18.9824;RBI=0.0116563;REFB=-0.00152943;REVB=0.000564025;RO=35;SAF=24;SAR=10;SRF=13;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.312581;STB=0.667762;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.00317286;OID=.;OPOS=47124714;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:68:35:34:34:34:0.5:10:24:13:22:10:24:13:21
chr19	47127324	.	C	G	31.59	PASS	AF=0.555556;AO=5;DP=9;FAO=5;FDP=9;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.0329716;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.7678;QD=14.0408;RBI=0.0332162;REFB=-0.0599724;REVB=-0.00402432;RO=4;SAF=2;SAR=3;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.422723;STB=0.749163;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=0.0425703;OID=.;OPOS=47127324;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:9:9:4:4:5:5:0.555556:3:2:4:0:3:2:4:0
chr19	47177913	.	A	G	536.78	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0649591;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.505;QD=59.6424;RBI=0.0766066;REFB=0;REVB=-0.0406065;RO=0;SAF=15;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000222668;OID=.;OPOS=47177913;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:21:15:0:0:21:15:0:0
chr19	47212593	.	A	G	157.98	PASS	AF=0.64;AO=16;DP=25;FAO=16;FDP=25;FR=.;FRO=9;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=-0.104026;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.7839;QD=25.2771;RBI=0.141452;REFB=0.00423805;REVB=-0.0958502;RO=9;SAF=7;SAR=9;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144208;STB=0.580215;STBP=0.33;TYPE=snp;VARB=-0.0101603;OID=.;OPOS=47212593;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:25:25:9:9:16:16:0.64:9:7:2:7:9:7:2:7
chr19	47223543	.	T	C	990.54	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00400621;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.841;QD=59.1366;RBI=0.0364963;REFB=0;REVB=-0.0362757;RO=0;SAF=46;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.35909e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.85666e-05;OID=.;OPOS=47223543;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:21:46:0:0:21:46:0:0
chr19	47226434	.	C	T	246.83	PASS	AF=0.490909;AO=27;DP=55;FAO=27;FDP=55;FR=.;FRO=28;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=19;FWDB=0.018204;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.6617;QD=17.951;RBI=0.0513064;REFB=-0.0163199;REVB=0.0479684;RO=28;SAF=16;SAR=11;SRF=9;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.242603;STB=0.635663;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=0.0179622;OID=.;OPOS=47226434;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:28:28:27:27:0.490909:11:16:9:19:11:16:9:19
chr19	47226450	.	A	G	238.3	PASS	AF=0.457627;AO=27;DP=59;FAO=27;FDP=59;FR=.;FRO=32;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=21;FWDB=0.0221208;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.838;QD=16.1562;RBI=0.0225767;REFB=-0.0200142;REVB=-0.00451427;RO=30;SAF=18;SAR=9;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.310118;STB=0.674029;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.022302;OID=.;OPOS=47226450;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:30:32:27:27:0.457627:9:18:10:20:9:18:11:21
chr19	47258842	.	C	T	529.4	PASS	AF=0.569767;AO=49;DP=86;FAO=49;FDP=86;FR=.;FRO=37;FSAF=19;FSAR=30;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=-0.00216334;FXX=0.0114929;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.318;QD=24.6234;RBI=0.00284718;REFB=-0.0118462;REVB=-0.00185105;RO=36;SAF=19;SAR=30;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0892991;STB=0.555533;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=0.0116162;OID=.;OPOS=47258842;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:36:37:49:49:0.569767:30:19:18:18:30:19:19:18
chr19	47282162	.	G	A	465.14	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0028037;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.777;QD=58.1421;RBI=0.00466131;REFB=0;REVB=0.00372385;RO=0;SAF=15;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.52846e-06;OID=.;OPOS=47282162;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:17:15:0:0:17:15:0:0
chr19	47543774	.	G	A	1682.56	PASS	AF=0.991228;AO=108;DP=110;FAO=113;FDP=114;FR=.;FRO=1;FSAF=50;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.102446;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.1416;QD=59.0374;RBI=0.103487;REFB=0.07174;REVB=0.0146436;RO=2;SAF=45;SAR=63;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00295606;STB=0.503936;STBP=0.494;TYPE=snp;VARB=-0.00386008;OID=.;OPOS=47543774;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:110:114:2:1:108:113:0.991228:63:45:1:1:63:50:0:1
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chr19	47768128	.	G	C	194.05	PASS	AF=0.434783;AO=20;DP=46;FAO=20;FDP=46;FR=.;FRO=26;FSAF=16;FSAR=4;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=0.019512;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.7698;QD=16.874;RBI=0.021361;REFB=0.00861757;REVB=0.00869332;RO=26;SAF=16;SAR=4;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192977;STB=0.611642;STBP=0.253;TYPE=snp;VARB=-0.00343924;OID=.;OPOS=47768128;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:26:26:20:20:0.434783:4:16:17:9:4:16:17:9
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chr19	47823038	.	G	A	239.43	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0484233;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.1446;QD=50.4072;RBI=0.0503521;REFB=0;REVB=0.0138028;RO=0;SAF=7;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00133007;OID=.;OPOS=47823038;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:12:7:0:0:12:7:0:0
chr19	47823484	.	T	C	446.99	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0021453;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.032;QD=57.6758;RBI=0.0181002;REFB=0;REVB=0.0179726;RO=0;SAF=14;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.09768e-05;OID=.;OPOS=47823484;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:17:14:0:0:17:14:0:0
chr19	47823871	.	G	T	741.61	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0150142;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.3807;QD=63.1153;RBI=0.0202598;REFB=0;REVB=0.0136027;RO=0;SAF=28;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.06241e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00113859;OID=.;OPOS=47823871;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:47:0:0:46:47:1:18:28:0:0:18:29:0:0
chr19	47858424	.	G	A	109.55	PASS	AF=0.277778;AO=15;DP=54;FAO=15;FDP=54;FR=.;FRO=39;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=0.0172766;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.444;QD=8.11473;RBI=0.0383145;REFB=-0.00129264;REVB=0.0341982;RO=39;SAF=5;SAR=10;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.217671;STB=0.632731;STBP=0.249;TYPE=snp;VARB=0.00337154;OID=.;OPOS=47858424;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:39:39:15:15:0.277778:10:5:20:19:10:5:20:19
chr19	47865911	.	A	G	128.0	PASS	AF=0.326087;AO=15;DP=47;FAO=15;FDP=46;FR=.;FRO=31;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=-0.00456787;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.694;QD=11.1306;RBI=0.010571;REFB=-0.0108076;REVB=0.00953315;RO=30;SAF=7;SAR=8;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0746519;STB=0.533289;STBP=0.78;TYPE=snp;VARB=0.0196451;OID=.;OPOS=47865911;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:46:30:31:15:15:0.326087:8:7:16:14:8:7:16:15
chr19	47879279	.	G	A	474.25	PASS	AF=0.47;AO=47;DP=100;FAO=47;FDP=100;FR=.;FRO=53;FSAF=31;FSAR=16;FSRF=32;FSRR=21;FWDB=0.0140679;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.774;QD=18.9698;RBI=0.0194188;REFB=-0.000410315;REVB=0.013386;RO=53;SAF=31;SAR=16;SRF=32;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0578022;STB=0.532237;STBP=0.596;TYPE=snp;VARB=0.000638297;OID=.;OPOS=47879279;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:53:53:47:47:0.47:16:31:32:21:16:31:32:21
chr19	47880401	.	G	T	77.29	PASS	AF=0.434783;AO=10;DP=23;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=0.0213857;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.103;QD=13.4413;RBI=0.0215235;REFB=-0.0233163;REVB=-0.00243105;RO=13;SAF=6;SAR=4;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20469;STB=0.620451;STBP=0.346;TYPE=snp;VARB=0.0448581;OID=.;OPOS=47880401;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:23:23:13:13:10:10:0.434783:4:6:5:8:4:6:5:8
chr19	47933257	.	G	A	213.56	PASS	AF=0.666667;AO=16;DP=33;FAO=22;FDP=33;FR=.;FRO=11;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=-0.00425846;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=203.352;QD=25.8866;RBI=0.0891214;REFB=-0.0128429;REVB=0.0890196;RO=10;SAF=12;SAR=4;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12655;STB=0.530699;STBP=0.626;TYPE=snp;VARB=0.0100493;OID=.;OPOS=47933257;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:33:33:10:11:16:22:0.666667:4:12:6:4:10:12:7:4
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chr19	47935572	.	G	A	108.76	PASS	AF=0.40625;AO=13;DP=32;FAO=13;FDP=32;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=-0.0134281;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.4009;QD=13.5949;RBI=0.0395497;REFB=-0.0188749;REVB=-0.0372004;RO=19;SAF=6;SAR=7;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0960223;STB=0.556013;STBP=0.612;TYPE=snp;VARB=0.0237472;OID=.;OPOS=47935572;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:19:19:13:13:0.40625:7:6:7:12:7:6:7:12
chr19	47969394	.	G	A	249.95	PASS	AF=0.521739;AO=23;DP=45;FAO=24;FDP=46;FR=.;FRO=22;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=-0.00783884;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.943;QD=21.7344;RBI=0.00785045;REFB=-0.0180943;REVB=-0.00042675;RO=22;SAF=13;SAR=10;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0636784;STB=0.545918;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=0.021621;OID=.;OPOS=47969394;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:46:22:22:23:24:0.521739:10:13:14:8:11:13:14:8
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chr19	48042976	.	C	T	49.59	PASS	AF=0.538462;AO=7;DP=13;FAO=7;FDP=13;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.00461724;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.1562;QD=15.2576;RBI=0.0517535;REFB=0.00133303;REVB=0.0515472;RO=6;SAF=5;SAR=2;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.304739;STB=0.681283;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=0.00373418;OID=.;OPOS=48042976;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:13:13:6:6:7:7:0.538462:2:5:2:4:2:5:2:4
chr19	48047821	.	C	T	257.76	PASS	AF=0.545455;AO=24;DP=44;FAO=24;FDP=44;FR=.;FRO=20;FSAF=19;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=-0.00603375;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=297.015;QD=23.4331;RBI=0.0133967;REFB=-0.00259869;REVB=-0.011961;RO=20;SAF=19;SAR=5;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.398924;STB=0.724374;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.00226507;OID=.;OPOS=48047821;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:20:20:24:24:0.545455:5:19:7:13:5:19:7:13
chr19	48048515	.	T	C	252.78	PASS	AF=0.5;AO=24;DP=48;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=6;FWDB=-0.0143651;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=257.925;QD=21.0649;RBI=0.0251075;REFB=-0.0125402;REVB=0.0205919;RO=24;SAF=14;SAR=10;SRF=18;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158016;STB=0.588166;STBP=0.252;TYPE=snp;VARB=0.0121983;OID=.;OPOS=48048515;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:24:24:24:24:0.5:10:14:18:6:10:14:18:6
chr19	48084410	.	G	A	103.5	PASS	AF=0.309524;AO=13;DP=42;FAO=13;FDP=42;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=20;FSRR=9;FWDB=0.0199166;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.083;QD=9.85667;RBI=0.0214157;REFB=0.00539711;REVB=-0.00787146;RO=27;SAF=8;SAR=5;SRF=19;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108855;STB=0.555473;STBP=0.669;TYPE=snp;VARB=-0.014977;OID=.;OPOS=48084410;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:27:29:13:13:0.309524:5:8:19:8:5:8:20:9
chr19	48182946	.	T	C	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0233096;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.1141;QD=40.7625;RBI=0.077788;REFB=0;REVB=0.0742135;RO=0;SAF=6;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00288898;OID=.;OPOS=48182946;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:4:6:0:0:4:6:0:0
chr19	48244194	.	A	G	67.43	PASS	AF=0.45;AO=9;DP=20;FAO=9;FDP=20;FR=.;FRO=11;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=-0.017704;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.488;QD=13.486;RBI=0.0513197;REFB=-0.0102058;REVB=-0.0481693;RO=11;SAF=7;SAR=2;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166665;STB=0.59976;STBP=0.496;TYPE=snp;VARB=0.0128138;OID=.;OPOS=48244194;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:20:20:11:11:9:9:0.45:2:7:7:4:2:7:7:4
chr19	48244569	.	G	A	50.32	PASS	AF=0.583333;AO=7;DP=12;FAO=7;FDP=12;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=-0.0294131;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.0153;QD=16.7717;RBI=0.0484475;REFB=-0.0363978;REVB=0.0384971;RO=5;SAF=5;SAR=2;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0775494;STB=0.54533;STBP=0.795;TYPE=snp;VARB=0.0300159;OID=.;OPOS=48244569;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:12:12:5:5:7:7:0.583333:2:5:4:1:2:5:4:1
chr19	48255804	.	A	G	56.28	PASS	AF=0.4;AO=8;DP=20;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.0182047;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.955;QD=11.2551;RBI=0.0656347;REFB=-0.00778322;REVB=-0.0630595;RO=12;SAF=2;SAR=6;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.192383;STB=0.617332;STBP=0.454;TYPE=snp;VARB=0.0341309;OID=.;OPOS=48255804;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:20:20:12:12:8:8:0.4:6:2:5:7:6:2:5:7
chr19	48282077	.	C	CGCAGCGG	48.03	PASS	AF=0.2;AO=6;DP=43;FAO=7;FDP=35;FR=.;FRO=28;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=20;FWDB=0.000797303;FXX=0.186003;HRUN=0;LEN=7;MLLD=278.967;QD=5.489;RBI=0.00259499;REFB=-0.0041312;REVB=0.00246947;RO=37;SAF=4;SAR=2;SRF=11;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.419068;STB=0.808082;STBP=0.1;TYPE=ins;VARB=0.0175693;OID=.;OPOS=48282078;OREF=-;OALT=GCAGCGG;OMAPALT=CGCAGCGG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.2:6:43:7:35:28:5:2:8:20:48:37:4:2:11:26
chr19	48282078	.	C	G	59.37	PASS	AF=0.204545;AO=9;DP=44;FAO=9;FDP=44;FR=.;FRO=35;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=23;FWDB=-0.00731653;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=194.343;QD=5.39767;RBI=0.010911;REFB=-0.00118947;REVB=-0.00809434;RO=35;SAF=3;SAR=6;SRF=12;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129177;STB=0.508456;STBP=0.97;TYPE=snp;VARB=0.0038939;OID=.;OPOS=48282078;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:59:44:44:35:35:9:9:0.204545:6:3:12:23:6:3:12:23
chr19	48389425	.	A	G	1085.45	PASS	AF=0.9375;AO=74;DP=79;FAO=75;FDP=80;FR=.;FRO=5;FSAF=38;FSAR=37;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0161314;FXX=0.0123442;HRUN=3;LEN=1;MLLD=170.47;QD=54.2725;RBI=0.0481552;REFB=-0.135575;REVB=0.0453729;RO=5;SAF=38;SAR=36;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0342925;STB=0.518341;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=0.0019792;OID=.;OPOS=48389425;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:79:80:5:5:74:75:0.9375:36:38:4:1:37:38:4:1
chr19	48484150	.	G	A	123.13	PASS	AF=0.466667;AO=14;DP=30;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.00332396;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.0415;QD=16.4168;RBI=0.0232688;REFB=-0.00873578;REVB=-0.0230301;RO=16;SAF=8;SAR=6;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180327;STB=0.603627;STBP=0.325;TYPE=snp;VARB=0.00507617;OID=.;OPOS=48484150;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:16:16:14:14:0.466667:6:8:6:10:6:8:6:10
chr19	48495304	.	G	A	214.11	PASS	AF=0.431034;AO=25;DP=58;FAO=25;FDP=58;FR=.;FRO=33;FSAF=19;FSAR=6;FSRF=22;FSRR=11;FWDB=-0.0138032;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.2543;QD=14.7664;RBI=0.0332387;REFB=0.000346709;REVB=0.0302371;RO=33;SAF=19;SAR=6;SRF=22;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118166;STB=0.567605;STBP=0.445;TYPE=snp;VARB=-0.000186367;OID=.;OPOS=48495304;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:33:33:25:25:0.431034:6:19:22:11:6:19:22:11
chr19	48495306	.	C	T	226.16	PASS	AF=0.440678;AO=26;DP=59;FAO=26;FDP=59;FR=.;FRO=33;FSAF=20;FSAR=6;FSRF=22;FSRR=11;FWDB=-0.00661035;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.674;QD=15.3329;RBI=0.0168097;REFB=0.00295251;REVB=-0.0154554;RO=32;SAF=20;SAR=6;SRF=22;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104349;STB=0.574264;STBP=0.376;TYPE=snp;VARB=-0.00477756;OID=.;OPOS=48495306;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:32:33:26:26:0.440678:6:20:22:10:6:20:22:11
chr19	48525507	.	G	A	861.19	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0140013;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.3301;QD=57.4124;RBI=0.0201048;REFB=0;REVB=0.014428;RO=0;SAF=15;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000135315;OID=.;OPOS=48525507;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:60:0:0:58:60:1:43:15:0:0:45:15:0:0
chr19	48543862	.	G	A	557.13	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00935267;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=281.121;QD=60.2307;RBI=0.0206754;REFB=0;REVB=0.0184391;RO=0;SAF=26;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.28272e-05;OID=.;OPOS=48543862;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:11:26:0:0:11:26:0:0
chr19	48598823	.	A	G	458.51	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0548891;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.781;QD=57.3141;RBI=0.0570023;REFB=0;REVB=-0.0153766;RO=0;SAF=16;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0003438;OID=.;OPOS=48598823;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:32:0:0:29:32:1:13:16:0:0:13:19:0:0
chr19	48601454	.	T	C	958.41	PASS	AF=1;AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0320585;FXX=0.0151492;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.672;QD=58.979;RBI=0.0333714;REFB=0;REVB=0.00926844;RO=0;SAF=38;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.04073e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00012802;OID=.;OPOS=48601454;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:65:0:0:65:65:1:27:38:0:0:27:38:0:0
chr19	48602948	.	T	C	91.25	PASS	AF=0.52381;AO=11;DP=21;FAO=11;FDP=21;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=-0.0214924;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.097;QD=17.381;RBI=0.0329912;REFB=-0.0592305;REVB=0.0250299;RO=10;SAF=4;SAR=7;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154239;STB=0.588087;STBP=0.46;TYPE=snp;VARB=0.0374035;OID=.;OPOS=48602948;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:21:21:10:10:11:11:0.52381:7:4:2:8:7:4:2:8
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chr19	48622375	.	C	T	595.95	PASS	AF=0.434211;AO=66;DP=153;FAO=66;FDP=152;FR=.;FRO=86;FSAF=31;FSAR=35;FSRF=44;FSRR=42;FWDB=-0.0035188;FXX=0.0129862;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.934;QD=15.6829;RBI=0.0186541;REFB=-0.0299375;REVB=-0.0183192;RO=84;SAF=31;SAR=35;SRF=42;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0304668;STB=0.523736;STBP=0.614;TYPE=snp;VARB=0.0377485;OID=.;OPOS=48622375;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:153:152:84:86:66:66:0.434211:35:31:42:42:35:31:44:42
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chr19	48823545	.	G	A	441.16	PASS	AF=0.772727;AO=33;DP=43;FAO=34;FDP=44;FR=.;FRO=10;FSAF=24;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=0.00918531;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.426;QD=40.1057;RBI=0.00918577;REFB=-0.026931;REVB=9.19654e-05;RO=10;SAF=24;SAR=9;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0664727;STB=0.528285;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.00479553;OID=.;OPOS=48823545;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:69:43:44:10:10:33:34:0.772727:9:24:6:4:10:24:6:4
chr19	48835668	.	G	C	200.76	PASS	AF=0.362319;AO=25;DP=70;FAO=25;FDP=69;FR=.;FRO=44;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=26;FSRR=18;FWDB=0.0109202;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.19;QD=11.6383;RBI=0.0117444;REFB=-0.0163919;REVB=0.00432204;RO=44;SAF=15;SAR=10;SRF=26;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0104041;STB=0.506019;STBP=0.949;TYPE=snp;VARB=0.0304035;OID=.;OPOS=48835668;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:69:44:44:25:25:0.362319:10:15:26:18:10:15:26:18
chr19	48836673	.	G	T	99.64	PASS	AF=0.733333;AO=11;DP=15;FAO=11;FDP=15;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0116981;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.359;QD=26.5702;RBI=0.0126049;REFB=-0.0502328;REVB=0.00469434;RO=4;SAF=4;SAR=7;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0680141;STB=0.53839;STBP=0.673;TYPE=snp;VARB=0.0145801;OID=.;OPOS=48836673;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:15:15:4:4:11:11:0.733333:7:4:2:2:7:4:2:2
chr19	48918157	.	C	T	191.27	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0464816;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.7132;QD=47.8165;RBI=0.0487069;REFB=0;REVB=0.014554;RO=0;SAF=5;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.36667e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000842472;OID=.;OPOS=48918157;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:11:5:0:0:11:5:0:0
chr19	48947648	.	C	G	158.61	PASS	AF=0.459459;AO=17;DP=37;FAO=17;FDP=37;FR=.;FRO=20;FSAF=15;FSAR=2;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=0.0590653;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=98.3816;QD=17.1467;RBI=0.0596665;REFB=0.000428924;REVB=-0.00844867;RO=20;SAF=15;SAR=2;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.296693;STB=0.673912;STBP=0.113;TYPE=snp;VARB=0.000243334;OID=.;OPOS=48947648;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:20:20:17:17:0.459459:2:15:14:6:2:15:14:6
chr19	48979771	.	C	A	383.31	PASS	AF=0.567164;AO=38;DP=67;FAO=38;FDP=67;FR=.;FRO=29;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=0.0045036;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=253.06;QD=22.884;RBI=0.0147459;REFB=-0.0154666;REVB=-0.0140413;RO=29;SAF=16;SAR=22;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0338703;STB=0.518629;STBP=0.753;TYPE=snp;VARB=0.0106723;OID=.;OPOS=48979771;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:29:29:38:38:0.567164:22:16:11:18:22:16:11:18
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chr19	49116553	.	A	AG	355.85	PASS	AF=1;AO=4;DP=39;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.102111;FXX=0.131544;HRUN=1;LEN=1;MLLD=19.6161;QD=43.1331;RBI=0.102499;REFB=0;REVB=0.00891574;RO=33;SAF=2;SAR=2;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0167148;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00343989;OID=.;OPOS=49116554;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:4:39:33:33:0:15:18:0:0:7:33:2:2:16:17
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chr19	49206603	.	C	T	411.12	PASS	AF=1;AO=24;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.058289;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.8432;QD=56.7063;RBI=0.073639;REFB=0;REVB=0.0450011;RO=0;SAF=10;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00217075;OID=.;OPOS=49206603;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:24:29:1:14:10:0:0:19:10:0:0
chr19	49206631	.	A	T	575.8	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00395229;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.008;QD=60.6101;RBI=0.0250931;REFB=0;REVB=0.0247799;RO=0;SAF=18;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.51048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.29672e-05;OID=.;OPOS=49206631;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:20:18:0:0:20:18:0:0
chr19	49217261	.	A	G	670.09	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00248407;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.404;QD=62.3343;RBI=0.0570044;REFB=0;REVB=-0.0569502;RO=0;SAF=27;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.13648e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000330076;OID=.;OPOS=49217261;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:43:0:0:42:43:1:15:27:0:0:15:28:0:0
chr19	49217305	.	A	G	698.99	PASS	AF=0.980392;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00205811;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.06;QD=54.8231;RBI=0.0236548;REFB=-0.0159486;REVB=0.0235651;RO=0;SAF=29;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.20481e-08;STB=0.508471;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=7.28961e-05;OID=.;OPOS=49217305;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:50:51:0:1:50:50:0.980392:21:29:0:0:21:29:1:0
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chr19	49247786	.	G	A	670.26	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00697445;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.154;QD=62.3502;RBI=0.0364877;REFB=0;REVB=0.0358149;RO=0;SAF=19;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000135312;OID=.;OPOS=49247786;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:24:19:0:0:24:19:0:0
chr19	49259529	.	A	G	941.43	PASS	AF=1;AO=63;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0160428;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.333;QD=58.8393;RBI=0.0187452;REFB=0;REVB=0.00969601;RO=0;SAF=47;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.75394e-05;OID=.;OPOS=49259529;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:63:64:1:16:47:0:0:16:48:0:0
chr19	49261368	.	T	C	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00240221;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=383.781;QD=45.8068;RBI=0.00273767;REFB=0;REVB=-0.0013131;RO=0;SAF=6;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.05961e-06;OID=.;OPOS=49261368;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:8:6:0:0:8:6:0:0
chr19	49368843	.	T	C	387.0	PASS	AF=0.738095;AO=31;DP=42;FAO=31;FDP=42;FR=.;FRO=11;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=2;FWDB=0.00895748;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.612;QD=36.8567;RBI=0.0117801;REFB=0.000529206;REVB=-0.00765084;RO=11;SAF=15;SAR=16;SRF=9;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160661;STB=0.587101;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=-0.000115564;OID=.;OPOS=49368843;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:80:42:42:11:11:31:31:0.738095:16:15:9:2:16:15:9:2
chr19	49375676	.	T	C	229.01	PASS	AF=0.444444;AO=24;DP=54;FAO=24;FDP=54;FR=.,HEALED;FRO=28;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=0.0137596;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.313;QD=16.9639;RBI=0.0143653;REFB=-0.00570792;REVB=-0.0041273;RO=28;SAF=12;SAR=12;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0680146;STB=0.53843;STBP=0.641;TYPE=snp;VARB=0.00799902;OID=.;OPOS=49375676;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:28:28:24:24:0.444444:12:12:16:12:12:12:16:12
chr19	49376582	.	G	A	526.42	PASS	AF=0.623377;AO=48;DP=77;FAO=48;FDP=77;FR=.;FRO=29;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=-0.00149708;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.822;QD=27.3465;RBI=0.0419312;REFB=-0.00534379;REVB=0.0419045;RO=29;SAF=20;SAR=28;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0943237;STB=0.551401;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=0.00382882;OID=.;OPOS=49376582;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:29:29:48:48:0.623377:28:20:16:13:28:20:16:13
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chr19	49400634	.	C	T	148.14	PASS	AF=0.484848;AO=16;DP=33;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.0126003;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.0952;QD=17.9558;RBI=0.0261613;REFB=-0.0379298;REVB=0.022927;RO=17;SAF=9;SAR=7;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0831558;STB=0.547469;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=0.030502;OID=.;OPOS=49400634;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:17:17:16:16:0.484848:7:9:8:9:7:9:8:9
chr19	49421966	.	T	C	274.22	PASS	AF=0.568182;AO=25;DP=44;FAO=25;FDP=44;FR=.;FRO=19;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.0103312;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.805;QD=24.9293;RBI=0.0112591;REFB=-0.0135911;REVB=0.00447596;RO=18;SAF=13;SAR=12;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0691082;STB=0.525527;STBP=0.73;TYPE=snp;VARB=0.0118;OID=.;OPOS=49421966;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:18:19:25:25:0.568182:12:13:11:7:12:13:11:8
chr19	49422517	.	T	C	96.74	PASS	AF=0.387097;AO=12;DP=31;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=5;FWDB=0.0100208;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=101.731;QD=12.4822;RBI=0.022524;REFB=0.006287;REVB=-0.0201721;RO=19;SAF=5;SAR=7;SRF=14;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.32414;STB=0.688831;STBP=0.107;TYPE=snp;VARB=-0.0110524;OID=.;OPOS=49422517;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:31:31:19:19:12:12:0.387097:7:5:14:5:7:5:14:5
chr19	49442933	.	T	C	635.89	PASS	AF=1;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0223923;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.284;QD=62.0385;RBI=0.0283115;REFB=0;REVB=0.017324;RO=0;SAF=26;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.44224e-05;OID=.;OPOS=49442933;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:41:0:0:41:41:1:15:26:0:0:15:26:0:0
chr19	49445817	.	T	C	505.39	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0116794;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.366;QD=59.4573;RBI=0.0183377;REFB=0;REVB=0.0141373;RO=0;SAF=16;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000129405;OID=.;OPOS=49445817;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:18:16:0:0:18:16:0:0
chr19	49513273	.	C	T	299.24	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0340881;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.1671;QD=52.0418;RBI=0.0694986;REFB=0;REVB=-0.0605645;RO=0;SAF=9;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2029e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0010206;OID=.;OPOS=49513273;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:23:0:0:22:23:1:13:9:0:0:13:10:0:0
chr19	49513349	.	C	G	212.17	PASS	AF=0.645161;AO=20;DP=31;FAO=20;FDP=31;FR=.;FRO=11;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=-0.0816906;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=82.6735;QD=27.3767;RBI=0.0846776;REFB=-0.0187035;REVB=-0.0222922;RO=11;SAF=10;SAR=10;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0873047;STB=0.548339;STBP=0.482;TYPE=snp;VARB=0.00750435;OID=.;OPOS=49513349;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:31:31:11:11:20:20:0.645161:10:10:7:4:10:10:7:4
chr19	49559518	.	C	G	98.94	PASS	AF=0.461538;AO=12;DP=26;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.0281062;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.7212;QD=15.2219;RBI=0.119222;REFB=-0.0518287;REVB=-0.115862;RO=12;SAF=5;SAR=7;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.214087;STB=0.583194;STBP=0.448;TYPE=snp;VARB=0.0565857;OID=.;OPOS=49559518;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:26:26:12:14:12:12:0.461538:7:5:8:4:7:5:8:6
chr19	49559693	.	T	C	178.07	PASS	AF=0.666667;AO=14;DP=27;FAO=18;FDP=27;FR=.;FRO=9;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.000228861;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=170.109;QD=26.3806;RBI=0.0480493;REFB=-0.0272396;REVB=0.0480488;RO=8;SAF=11;SAR=3;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139114;STB=0.519292;STBP=0.794;TYPE=snp;VARB=0.00656199;OID=.;OPOS=49559693;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:27:27:8:9:14:18:0.666667:3:11:5:3:7:11:5:4
chr19	49560461	.	G	A	279.39	PASS	AF=0.694444;AO=22;DP=34;FAO=25;FDP=36;FR=.;FRO=11;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=0.0118129;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.0707;QD=31.0434;RBI=0.118257;REFB=-0.0593821;REVB=0.117665;RO=12;SAF=10;SAR=12;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134786;STB=0.59992;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.0284246;OID=.;OPOS=49560461;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:79:34:36:12:11:22:25:0.694444:12:10:8:4:15:10:8:3
chr19	49573438	.	A	G	109.24	PASS	AF=0.419355;AO=13;DP=30;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=17;FWDB=0.0312855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.621;QD=14.0956;RBI=0.0329418;REFB=-0.0154331;REVB=-0.0103139;RO=17;SAF=5;SAR=8;SRF=1;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.381816;STB=0.722294;STBP=0.141;TYPE=snp;VARB=0.00861565;OID=.;OPOS=49573438;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:31:17:18:13:13:0.419355:8:5:1:16:8:5:1:17
chr19	49640002	.	G	T	389.85	PASS	AF=0.549296;AO=37;DP=70;FAO=39;FDP=71;FR=.;FRO=32;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=0.0182619;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.442;QD=21.9631;RBI=0.0183138;REFB=-0.0240483;REVB=-0.00137754;RO=32;SAF=21;SAR=16;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0224389;STB=0.501866;STBP=0.986;TYPE=snp;VARB=0.01725;OID=.;OPOS=49640002;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:71:32:32:37:39:0.549296:16:21:19:13:16:23:19:13
chr19	49657710	.	ACAT	A	50.37	PASS	AF=0.666667;AO=5;DP=12;FAO=6;FDP=9;FR=.;FRO=3;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0526389;FXX=0.307456;HRUN=1;LEN=3;MLLD=110.006;QD=22.3863;RBI=0.0536942;REFB=-0.12243;REVB=-0.0105934;RO=1;SAF=3;SAR=2;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169284;STB=0.614989;STBP=0.435;TYPE=del;VARB=0.0504954;OID=.;OPOS=49657711;OREF=CAT;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.666667:5:12:6:9:3:4:2:1:2:19:1:3:2:0:1
chr19	49658209	.	AGA	CGA,TCG	260.21	PASS	AF=0.55814,0;AO=22,2;DP=43;FAO=24,0;FDP=43;FR=.;FRO=19;FSAF=11,0;FSAR=13,0;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=-0.0230324,-0.0392557;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,3;MLLD=167.122,119.932;QD=24.2052;RBI=0.0230383,0.0457683;REFB=-0.0130726,-0.00449693;REVB=-0.000518908,-0.0235313;RO=18;SAF=9,2;SAR=13,0;SRF=7;SRR=11;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0168745,0.571416;STB=0.540242,0.5;STBP=0.552,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.0178803,0;OID=.,.;OPOS=49658209,49658209;OREF=A,AGA;OALT=C,TCG;OMAPALT=CGA,TCG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:18:19:22,2:24,0:0.55814,0:13,0:9,2:7:11:13,0:11,0:7:12
chr19	49658367	.	C	T	275.74	PASS	AF=0.581395;AO=25;DP=43;FAO=25;FDP=43;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.00357681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.515;QD=25.6505;RBI=0.0137147;REFB=-0.0185395;REVB=0.01324;RO=17;SAF=10;SAR=15;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.036133;STB=0.504851;STBP=0.943;TYPE=snp;VARB=0.0116926;OID=.;OPOS=49658367;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:17:18:25:25:0.581395:15:10:6:11:15:10:7:11
chr19	49658390	.	T	C	247.62	PASS	AF=0.575;AO=22;DP=39;FAO=23;FDP=40;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=0.017673;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.451;QD=24.7621;RBI=0.027499;REFB=-0.0434718;REVB=0.021068;RO=17;SAF=8;SAR=14;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00904992;STB=0.50239;STBP=0.977;TYPE=snp;VARB=0.0230357;OID=.;OPOS=49658390;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:40:17:17:22:23:0.575:14:8:6:11:15:8:6:11
chr19	49699866	.	C	T	173.01	PASS	AF=0.360656;AO=22;DP=61;FAO=22;FDP=61;FR=.;FRO=39;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=0.0151447;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.6038;QD=11.3449;RBI=0.0416107;REFB=0.00846443;REVB=0.0387568;RO=39;SAF=11;SAR=11;SRF=18;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0423195;STB=0.524568;STBP=0.775;TYPE=snp;VARB=-0.0135953;OID=.;OPOS=49699866;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:39:39:22:22:0.360656:11:11:18:21:11:11:18:21
chr19	49839015	.	T	C	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0314585;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.362;QD=44.6888;RBI=0.0335009;REFB=0;REVB=0.0115185;RO=0;SAF=3;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000331251;OID=.;OPOS=49839015;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:10:3:0:0:10:3:0:0
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chr19	49930721	.	T	C	124.06	PASS	AF=0.272727;AO=18;DP=66;FAO=18;FDP=66;FR=.;FRO=48;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=25;FSRR=23;FWDB=-0.0121952;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.4312;QD=7.51855;RBI=0.012347;REFB=-0.00528564;REVB=0.00193016;RO=46;SAF=5;SAR=13;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.278387;STB=0.683999;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.00403952;OID=.;OPOS=49930721;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:46:48:18:18:0.272727:13:5:23:23:13:5:25:23
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chr19	49950298	.	C	T	249.95	PASS	AF=0.361446;AO=31;DP=83;FAO=30;FDP=83;FR=.;FRO=53;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=33;FSRR=20;FWDB=0.0180742;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.7438;QD=12.0459;RBI=0.0182181;REFB=0.00221377;REVB=-0.0022854;RO=52;SAF=14;SAR=17;SRF=33;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198014;STB=0.598662;STBP=0.192;TYPE=snp;VARB=-0.00264986;OID=.;OPOS=49950298;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:52:53:31:30:0.361446:17:14:33:19:16:14:33:20
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chr19	50393269	.	A	G	68.82	PASS	AF=0.5;AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=-0.0160411;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=238.906;QD=15.2931;RBI=0.0350461;REFB=-0.0102018;REVB=-0.0311594;RO=9;SAF=3;SAR=6;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.283852;STB=0.666296;STBP=0.216;TYPE=snp;VARB=0.0121681;OID=.;OPOS=50393269;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:18:18:9:9:9:9:0.5:6:3:6:3:6:3:6:3
chr19	50399384	.	G	GC	675.7	PASS	AF=1;AO=49;DP=77;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0309861;FXX=0.0126566;HRUN=4;LEN=1;MLLD=12.9742;QD=34.6514;RBI=0.226505;REFB=0;REVB=0.224376;RO=26;SAF=21;SAR=28;SRF=8;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0798765;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00688418;OID=.;OPOS=50399385;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:49:77:78:78:0:31:47:0:0:13:26:21:28:8:18
chr19	50411742	.	A	G	708.54	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000716545;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.831;QD=62.9816;RBI=0.0224007;REFB=0;REVB=0.0223892;RO=0;SAF=17;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000125669;OID=.;OPOS=50411742;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:28:17:0:0:28:17:0:0
chr19	50412417	.	G	A	135.89	PASS	AF=0.928571;AO=13;DP=14;FAO=13;FDP=14;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00803557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.8183;QD=38.8252;RBI=0.0676678;REFB=-0.0813965;REVB=0.067189;RO=0;SAF=7;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.533282;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.00656083;OID=.;OPOS=50412417;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:14:14:0:1:13:13:0.928571:6:7:0:0:6:7:1:0
chr19	50463670	.	T	G	329.67	PASS	AF=0.539683;AO=34;DP=63;FAO=34;FDP=63;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=26;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=0.00327965;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.2805;QD=20.9313;RBI=0.00755289;REFB=-0.00313169;REVB=-0.00680368;RO=29;SAF=8;SAR=26;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150532;STB=0.583872;STBP=0.191;TYPE=snp;VARB=0.00164008;OID=.;OPOS=50463670;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:29:29:34:34:0.539683:26:8:11:18:26:8:11:18
chr19	50463982	.	T	G	108.61	PASS	AF=0.40625;AO=13;DP=32;FAO=13;FDP=32;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=14;FWDB=-0.0139517;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=296.825;QD=13.5766;RBI=0.0188142;REFB=-0.00554721;REVB=0.0126224;RO=19;SAF=9;SAR=4;SRF=5;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.418597;STB=0.742768;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.0100935;OID=.;OPOS=50463982;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:19:19:13:13:0.40625:4:9:5:14:4:9:5:14
chr19	50475114	.	G	C	632.24	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000985658;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.8259;QD=61.6815;RBI=0.0277383;REFB=0;REVB=0.0277208;RO=0;SAF=18;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00044144;OID=.;OPOS=50475114;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:23:18:0:0:23:18:0:0
chr19	50475174	.	A	C	447.03	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0036741;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.273;QD=57.6807;RBI=0.0275338;REFB=0;REVB=0.0272875;RO=0;SAF=14;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.3825e-05;OID=.;OPOS=50475174;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:17:14:0:0:17:14:0:0
chr19	50475208	.	C	T	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0168802;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=231.846;QD=56.1915;RBI=0.0192095;REFB=0;REVB=0.00916864;RO=0;SAF=10;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.42641e-05;OID=.;OPOS=50475208;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:18:10:0:0:18:10:0:0
chr19	50475211	.	T	G	352.77	PASS	AF=0.964286;AO=26;DP=26;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.081345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.84;QD=50.3958;RBI=0.114821;REFB=-0.153089;REVB=0.0810368;RO=0;SAF=9;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.514275;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=0.00583148;OID=.;OPOS=50475211;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:26:28:0:1:26:27:0.964286:17:9:0:0:17:10:0:1
chr19	50475215	.	G	A,GA	352.41	PASS	AF=0,1;AO=21,4;DP=27;FAO=0,27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=0,10;FSAR=0,17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0288737,0.103046;FXX=0;HRUN=4,1;LEN=1,1;MLLD=14.1099,26.4843;QD=52.2095;RBI=0.0289871,0.120422;REFB=0,0;REVB=0.0025617,0.0623134;RO=2;SAF=7,2;SAR=14,2;SRF=1;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0296733,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,ins;VARB=0.00947031,0.00943965;OID=.,.;OPOS=50475215,50475216;OREF=G,-;OALT=A,A;OMAPALT=A,GA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	2/2:4:27:27:2:0:21,4:0,27:0,1:14,2:7,2:1:1:0,17:0,10:0:0
chr19	50475259	.	G	C	435.93	PASS	AF=0.96875;AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0239794;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.042;QD=54.4913;RBI=0.0254846;REFB=-0.0919009;REVB=0.00862887;RO=0;SAF=16;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.516119;STBP=0.553;TYPE=snp;VARB=0.000862315;OID=.;OPOS=50475259;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:32:32:0:1:31:31:0.96875:15:16:0:0:15:16:0:1
chr19	50479999	.	A	G	613.35	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0199766;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.099;QD=61.3353;RBI=0.0416792;REFB=0;REVB=-0.03658;RO=0;SAF=23;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.4817e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00011138;OID=.;OPOS=50479999;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:17:23:0:0:17:23:0:0
chr19	50562372	.	T	C	323.2	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.01105;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.504;QD=53.8658;RBI=0.0302255;REFB=0;REVB=0.0281333;RO=0;SAF=7;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.67187e-05;OID=.;OPOS=50562372;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:17:7:0:0:17:7:0:0
chr19	50562459	.	T	G	727.73	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0559608;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.113;QD=63.281;RBI=0.0575467;REFB=0;REVB=-0.0134169;RO=0;SAF=23;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00049876;OID=.;OPOS=50562459;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:23:23:0:0:23:23:0:0
chr19	50666392	.	GC	G	82.65	PASS	AF=0.684211;AO=11;DP=19;FAO=13;FDP=19;FR=.;FRO=6;FSAF=12;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.0821504;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=15.7893;QD=17.3997;RBI=0.120942;REFB=-0.00789337;REVB=-0.0887593;RO=6;SAF=10;SAR=1;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.310631;STB=0.691932;STBP=0.139;TYPE=del;VARB=4.19592e-05;OID=.;OPOS=50666393;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.684211:11:19:13:19:6:12:1:4:2:34:6:10:1:4:2
chr19	50726319	.	C	G	367.9	PASS	AF=0.642857;AO=35;DP=55;FAO=36;FDP=56;FR=.;FRO=20;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=0.00292634;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=192.529;QD=26.2788;RBI=0.00440371;REFB=-0.00426298;REVB=-0.00329078;RO=19;SAF=16;SAR=19;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111997;STB=0.545519;STBP=0.374;TYPE=snp;VARB=0.00298746;OID=.;OPOS=50726319;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:56:19:20:35:36:0.642857:19:16:12:7:19:17:12:8
chr19	50726570	.	G	A	207.29	PASS	AF=0.588235;AO=20;DP=34;FAO=20;FDP=34;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=-0.00733385;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.1327;QD=24.3871;RBI=0.00852028;REFB=-0.0371518;REVB=0.00433704;RO=14;SAF=10;SAR=10;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105524;STB=0.558765;STBP=0.41;TYPE=snp;VARB=0.0162669;OID=.;OPOS=50726570;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:14:14:20:20:0.588235:10:10:9:5:10:10:9:5
chr19	50762418	.	A	G	358.13	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00145413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.0136;QD=55.0962;RBI=0.0498238;REFB=0;REVB=-0.0498026;RO=0;SAF=21;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00116134;OID=.;OPOS=50762418;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:5:21:0:0:5:21:0:0
chr19	50763889	.	C	T	64.49	PASS	AF=0.346154;AO=9;DP=26;FAO=9;FDP=26;FR=.;FRO=17;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=4;FWDB=-0.00222174;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=227.185;QD=9.92178;RBI=0.0159209;REFB=-0.0102572;REVB=-0.0157652;RO=16;SAF=2;SAR=7;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.529645;STB=0.826118;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.0121502;OID=.;OPOS=50763889;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:26:26:16:17:9:9:0.346154:7:2:12:4:7:2:13:4
chr19	50771609	.	G	A	175.95	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0285824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.052;QD=46.9207;RBI=0.0384417;REFB=0;REVB=0.0257062;RO=0;SAF=2;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000624524;OID=.;OPOS=50771609;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:15:0:0:14:15:1:12:2:0:0:12:3:0:0
chr19	50796905	.	G	A	557.39	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0676415;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.248;QD=60.2582;RBI=0.0742074;REFB=0;REVB=0.0305183;RO=0;SAF=22;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000511282;OID=.;OPOS=50796905;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:37:0:0:36:37:1:14:22:0:0:15:22:0:0
chr19	50926264	.	TG	CC	101.49	PASS	AF=0.333333;AO=14;DP=44;FAO=14;FDP=42;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=-0.00221512;FXX=0.0666519;HRUN=1;LEN=2;MLLD=230.32;QD=9.66526;RBI=0.0312225;REFB=-0.0453007;REVB=0.0311438;RO=29;SAF=5;SAR=9;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1074;STB=0.524103;STBP=0.833;TYPE=mnp;VARB=0.0837949;OID=.;OPOS=50926264;OREF=TG;OALT=CC;OMAPALT=CC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:42:29:28:14:14:0.333333:9:5:13:16:8:6:13:15
chr19	50954584	.	C	T	213.57	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00203412;FXX=0.0555247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.1218;QD=50.2512;RBI=0.0849808;REFB=0;REVB=0.0849565;RO=0;SAF=11;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00357679;OID=.;OPOS=50954584;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:6:11:0:0:6:11:0:0
chr19	50957397	.	G	A	769.51	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0258365;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.219;QD=57.0006;RBI=0.0263033;REFB=0;REVB=-0.00493373;RO=0;SAF=24;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.25464e-05;OID=.;OPOS=50957397;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:30:24:0:0:30:24:0:0
chr19	50965272	.	T	C	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0591838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.4092;QD=53.2771;RBI=0.0633304;REFB=0;REVB=0.0225393;RO=0;SAF=14;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.84921e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00115499;OID=.;OPOS=50965272;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:9:14:0:0:9:14:0:0
chr19	50967640	.	G	A	134.24	PASS	AF=0.454545;AO=15;DP=33;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=1;FSAR=14;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=-0.00683699;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.309;QD=16.2717;RBI=0.0171197;REFB=-0.000188763;REVB=0.0156952;RO=18;SAF=1;SAR=14;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.482618;STB=0.789805;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.000359438;OID=.;OPOS=50967640;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:18:18:15:15:0.454545:14:1:6:12:14:1:6:12
chr19	50983930	.	C	T	354.39	PASS	AF=0.9;AO=27;DP=31;FAO=27;FDP=30;FR=.;FRO=3;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.000412779;FXX=0.0322477;HRUN=4;LEN=1;MLLD=124.097;QD=47.2522;RBI=0.0269593;REFB=0.0480749;REVB=0.0269561;RO=3;SAF=16;SAR=11;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111111;STB=0.559955;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=-0.000774016;OID=.;OPOS=50983930;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:31:30:3:3:27:27:0.9:11:16:0:3:11:16:0:3
chr19	51009429	.	G	A	324.06	PASS	AF=0.622222;AO=28;DP=45;FAO=28;FDP=45;FR=.;FRO=17;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=-0.0029037;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.705;QD=28.8056;RBI=0.0545699;REFB=-0.0316176;REVB=0.0544926;RO=17;SAF=11;SAR=17;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.213815;STB=0.61761;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.0149179;OID=.;OPOS=51009429;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:17:17:28:28:0.622222:17:11:12:5:17:11:12:5
chr19	51015404	.	T	C	239.42	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0226974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.76;QD=50.4048;RBI=0.0286003;REFB=0;REVB=0.0174013;RO=0;SAF=8;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.41338e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000294686;OID=.;OPOS=51015404;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:11:8:0:0:11:8:0:0
chr19	51128661	.	T	C	75.63	PASS	AF=0.384615;AO=10;DP=26;FAO=10;FDP=26;FR=.;FRO=16;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=14;FWDB=-0.0103192;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.215;QD=11.6353;RBI=0.0184987;REFB=-0.0338218;REVB=0.015353;RO=15;SAF=1;SAR=9;SRF=2;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0846473;STB=0.539915;STBP=0.862;TYPE=snp;VARB=0.0444038;OID=.;OPOS=51128661;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:26:26:15:16:10:10:0.384615:9:1:2:13:9:1:2:14
chr19	51159571	.	T	G	48.23	PASS	AF=0.466667;AO=7;DP=15;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=-0.0265222;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=255.079;QD=12.8607;RBI=0.0279568;REFB=-0.0168971;REVB=-0.00884067;RO=8;SAF=2;SAR=5;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.402505;STB=0.740074;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.0232911;OID=.;OPOS=51159571;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:15:15:8:8:7:7:0.466667:5:2:6:2:5:2:6:2
chr19	51297825	.	GC	AA	302.4	PASS	AF=0.4;AO=33;DP=86;FAO=34;FDP=85;FR=.;FRO=51;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=26;FSRR=25;FWDB=0.027593;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=2;MLLD=143.556;QD=14.2306;RBI=0.0288012;REFB=-0.00526136;REVB=0.00825442;RO=51;SAF=16;SAR=17;SRF=26;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0265765;STB=0.505879;STBP=0.963;TYPE=mnp;VARB=0.0106657;OID=.;OPOS=51297825;OREF=GC;OALT=AA;OMAPALT=AA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:85:51:51:33:34:0.4:17:16:26:25:17:17:26:25
chr19	51301395	.	C	T	522.78	PASS	AF=0.505051;AO=50;DP=99;FAO=50;FDP=99;FR=.;FRO=49;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=29;FSRR=20;FWDB=-0.000865459;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=269.129;QD=21.1223;RBI=0.0159717;REFB=-0.0110396;REVB=0.0159483;RO=48;SAF=26;SAR=24;SRF=28;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0563935;STB=0.5357;STBP=0.463;TYPE=snp;VARB=0.0107781;OID=.;OPOS=51301395;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:48:49:50:50:0.505051:24:26:28:20:24:26:29:20
chr19	51301456	.	G	A	317.19	PASS	AF=0.571429;AO=28;DP=49;FAO=28;FDP=49;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=0.013072;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.255;QD=25.8931;RBI=0.0186984;REFB=-0.00727664;REVB=-0.0133698;RO=21;SAF=11;SAR=17;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139848;STB=0.577492;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=0.00514599;OID=.;OPOS=51301456;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:21:21:28:28:0.571429:17:11:12:9:17:11:12:9
chr19	51302066	.	A	G	124.16	PASS	AF=0.722222;AO=13;DP=18;FAO=13;FDP=18;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.041082;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.574;QD=27.592;RBI=0.0421441;REFB=-0.0153774;REVB=-0.00940185;RO=5;SAF=4;SAR=9;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157777;STB=0.588643;STBP=0.238;TYPE=snp;VARB=0.0118511;OID=.;OPOS=51302066;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:18:18:5:5:13:13:0.722222:9:4:3:2:9:4:3:2
chr19	51302154	.	G	A	47.74	PASS	AF=0.4375;AO=7;DP=16;FAO=7;FDP=16;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.0399304;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.557;QD=11.9341;RBI=0.0608844;REFB=-0.0317254;REVB=0.0459616;RO=9;SAF=2;SAR=5;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.354212;STB=0.713673;STBP=0.206;TYPE=snp;VARB=0.0443018;OID=.;OPOS=51302154;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:16:16:9:9:7:7:0.4375:5:2:6:3:5:2:6:3
chr19	51321813	.	A	G	803.82	PASS	AF=1;AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00862328;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.123;QD=57.4154;RBI=0.0140605;REFB=0;REVB=-0.0111057;RO=0;SAF=28;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.87954e-06;OID=.;OPOS=51321813;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:57:56:0:0:56:56:1:28:28:0:0:28:28:0:0
chr19	51323232	.	T	C	94.44	PASS	AF=0.342857;AO=12;DP=35;FAO=12;FDP=35;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=0.0182091;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=100.95;QD=10.7931;RBI=0.0208095;REFB=-0.00420349;REVB=0.010073;RO=21;SAF=5;SAR=7;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164807;STB=0.596995;STBP=0.439;TYPE=snp;VARB=0.015236;OID=.;OPOS=51323232;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:35:35:21:23:12:12:0.342857:7:5:12:9:7:5:13:10
chr19	51323473	.	C	G	375.4	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0616237;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.198;QD=55.6144;RBI=0.0685457;REFB=0;REVB=0.0300172;RO=0;SAF=14;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000539387;OID=.;OPOS=51323473;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:27:0:0:26:27:1:12:14:0:0:13:14:0:0
chr19	51323501	.	A	G	464.65	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00756581;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.336;QD=58.0818;RBI=0.0227733;REFB=0;REVB=0.0214798;RO=0;SAF=15;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000262148;OID=.;OPOS=51323501;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:17:15:0:0:17:15:0:0
chr19	51330932	.	G	T	483.34	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0346183;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=264.023;QD=58.5867;RBI=0.0429999;REFB=0;REVB=0.0255063;RO=0;SAF=21;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00016476;OID=.;OPOS=51330932;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:12:21:0:0:12:21:0:0
chr19	51359497	.	T	C	429.0	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.030673;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.39;QD=57.2005;RBI=0.0861735;REFB=0;REVB=-0.0805297;RO=0;SAF=16;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.56309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00224557;OID=.;OPOS=51359497;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:14:16:0:0:14:16:0:0
chr19	51359503	.	A	G	533.71	PASS	AF=1;AO=35;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0041544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.344;QD=59.3007;RBI=0.0652447;REFB=0;REVB=0.0651123;RO=0;SAF=19;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.1382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000153823;OID=.;OPOS=51359503;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:35:36:1:16:19:0:0:16:20:0:0
chr19	51379893	.	C	T	150.95	PASS	AF=0.354167;AO=17;DP=47;FAO=17;FDP=48;FR=.;FRO=31;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=-0.00857671;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.8376;QD=12.5789;RBI=0.041736;REFB=0.00778916;REVB=0.0408453;RO=30;SAF=6;SAR=11;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.23397;STB=0.646886;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=-0.0145991;OID=.;OPOS=51379893;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:48:30:31:17:17:0.354167:11:6:17:13:11:6:18:13
chr19	51381777	.	C	T	376.77	PASS	AF=0.481481;AO=39;DP=81;FAO=39;FDP=81;FR=.;FRO=42;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=25;FSRR=17;FWDB=-0.00946883;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=249.182;QD=18.6057;RBI=0.0109783;REFB=-0.00900903;REVB=-0.00555555;RO=42;SAF=17;SAR=22;SRF=25;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147574;STB=0.582189;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.00882272;OID=.;OPOS=51381777;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:42:42:39:39:0.481481:22:17:25:17:22:17:25:17
chr19	51411636	.	G	T	715.48	PASS	AF=1;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0210542;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.716;QD=57.2384;RBI=0.029185;REFB=0;REVB=0.0202109;RO=0;SAF=23;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000235047;OID=.;OPOS=51411636;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:50:0:0:50:50:1:27:23:0:0:27:23:0:0
chr19	51412668	.	A	C	43.79	PASS	AF=0.75;AO=6;DP=7;FAO=6;FDP=8;FR=.;FRO=2;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0383956;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.918;QD=21.8974;RBI=0.0550234;REFB=-0.0351181;REVB=-0.0394125;RO=1;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0789211;STB=0.583085;STBP=0.681;TYPE=snp;VARB=0.0136932;OID=.;OPOS=51412668;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:7:8:1:2:6:6:0.75:5:1:0:1:5:1:0:2
chr19	51452250	.	T	C	769.51	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00121316;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.9;QD=57.0003;RBI=0.0120512;REFB=0;REVB=0.01199;RO=0;SAF=42;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.04464e-05;OID=.;OPOS=51452250;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:12:42:0:0:12:42:0:0
chr19	51455856	.	G	C	68.01	PASS	AF=0.473684;AO=9;DP=19;FAO=9;FDP=19;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=-0.0480699;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.774;QD=14.3172;RBI=0.0687572;REFB=-0.0433258;REVB=-0.0491614;RO=10;SAF=3;SAR=6;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.033981;STB=0.519956;STBP=0.902;TYPE=snp;VARB=0.013678;OID=.;OPOS=51455856;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:19:19:10:10:9:9:0.473684:6:3:3:7:6:3:3:7
chr19	51480840	.	C	G	509.58	PASS	AF=0.505155;AO=49;DP=97;FAO=49;FDP=97;FR=.;FRO=48;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=21;FSRR=27;FWDB=-0.000680324;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.068;QD=21.0137;RBI=0.00257885;REFB=-0.0131446;REVB=-0.0024875;RO=48;SAF=23;SAR=26;SRF=21;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0286916;STB=0.515863;STBP=0.777;TYPE=snp;VARB=0.00903488;OID=.;OPOS=51480840;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:48:48:49:49:0.505155:26:23:21:27:26:23:21:27
chr19	51485622	.	A	G	671.48	PASS	AF=0.347458;AO=82;DP=236;FAO=82;FDP=236;FR=.;FRO=154;FSAF=45;FSAR=37;FSRF=69;FSRR=85;FWDB=-0.0253092;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.4085;QD=11.381;RBI=0.0468239;REFB=0.00523585;REVB=-0.0393944;RO=153;SAF=45;SAR=37;SRF=69;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111411;STB=0.565497;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=-0.00949054;OID=.;OPOS=51485622;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:236:236:153:154:82:82:0.347458:37:45:69:84:37:45:69:85
chr19	51487175	.	T	G	74.67	PASS	AF=0.692308;AO=8;DP=12;FAO=9;FDP=13;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0414302;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.2;QD=22.9753;RBI=0.0425111;REFB=-0.0265845;REVB=-0.00952552;RO=4;SAF=3;SAR=5;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.215906;STB=0.593016;STBP=0.335;TYPE=snp;VARB=0.014643;OID=.;OPOS=51487175;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:12:13:4:4:8:9:0.692308:5:3:3:1:5:4:3:1
chr19	51517731	.	A	G	250.39	PASS	AF=0.48;AO=24;DP=50;FAO=24;FDP=50;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=-0.0119827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.74;QD=20.0308;RBI=0.0178835;REFB=-0.0122487;REVB=0.0132753;RO=25;SAF=10;SAR=14;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130291;STB=0.583264;STBP=0.27;TYPE=snp;VARB=0.0166164;OID=.;OPOS=51517731;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:25:26:24:24:0.48:14:10:14:11:14:10:15:11
chr19	51519236	.	A	G	99.71	PASS	AF=0.578947;AO=7;DP=17;FAO=11;FDP=19;FR=.,HEALED;FRO=6;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0574581;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.37;QD=20.9911;RBI=0.0590152;REFB=-0.0199533;REVB=-0.0134672;RO=3;SAF=6;SAR=1;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.506482;STB=0.754127;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.0191423;OID=.;OPOS=51519236;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:40:17:19:3:6:7:11:0.578947:1:6:0:3:1:10:3:3
chr19	51519259	.	C	T	111.39	PASS	AF=0.464286;AO=13;DP=28;FAO=13;FDP=28;FR=.;FRO=15;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=-0.00611096;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.913;QD=15.9125;RBI=0.00753375;REFB=-0.0176073;REVB=-0.00440608;RO=14;SAF=11;SAR=2;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.268587;STB=0.646799;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=0.0300923;OID=.;OPOS=51519259;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:28:14:15:13:13:0.464286:2:11:9:5:2:11:10:5
chr19	51519364	.	T	G	99.15	PASS	AF=0.393939;AO=11;DP=31;FAO=13;FDP=33;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=-0.0753542;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.5484;QD=12.0181;RBI=0.0768671;REFB=-0.0381407;REVB=-0.0151751;RO=19;SAF=5;SAR=6;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0359763;STB=0.540999;STBP=0.737;TYPE=snp;VARB=0.0687048;OID=.;OPOS=51519364;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:33:19:20:11:13:0.393939:6:5:8:11:8:5:9:11
chr19	51520487	.	A	C	151.95	PASS	AF=0.295775;AO=21;DP=71;FAO=21;FDP=71;FR=.;FRO=50;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=23;FSRR=27;FWDB=-0.0901353;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.6513;QD=8.56067;RBI=0.0901502;REFB=0.000599982;REVB=-0.00163684;RO=49;SAF=8;SAR=13;SRF=23;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106715;STB=0.557344;STBP=0.547;TYPE=snp;VARB=-0.00199833;OID=.;OPOS=51520487;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:49:50:21:21:0.295775:13:8:23:26:13:8:23:27
chr19	51530693	.	G	A	1381.8	PASS	AF=1;AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0503167;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.923;QD=62.8092;RBI=0.0551658;REFB=0;REVB=0.0226164;RO=0;SAF=40;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.43431e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000334072;OID=.;OPOS=51530693;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:88:88:0:0:88:88:1:48:40:0:0:48:40:0:0
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chr19	51566943	.	G	A	1410.54	PASS	AF=0.978495;AO=91;DP=93;FAO=91;FDP=93;FR=.;FRO=2;FSAF=51;FSAR=40;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0199059;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.825;QD=60.6686;RBI=0.0397305;REFB=-0.203114;REVB=-0.0343841;RO=0;SAF=51;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509613;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=0.00150705;OID=.;OPOS=51566943;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:93:93:0:2:91:91:0.978495:40:51:0:0:40:51:2:0
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chr19	51670667	.	G	A	103.49	PASS	AF=0.545455;AO=12;DP=22;FAO=12;FDP=22;FR=.;FRO=10;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=-0.00112711;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.284;QD=18.8159;RBI=0.0223815;REFB=-0.0126354;REVB=0.0223531;RO=10;SAF=1;SAR=11;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.513399;STB=0.804228;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.0325265;OID=.;OPOS=51670667;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:22:22:10:10:12:12:0.545455:11:1:5:5:11:1:5:5
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chr19	51850290	.	G	A	153.92	PASS	AF=0.395349;AO=17;DP=43;FAO=17;FDP=43;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=20;FSRR=6;FWDB=-0.026695;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.7003;QD=14.3184;RBI=0.0330426;REFB=-0.0275534;REVB=0.0194729;RO=26;SAF=12;SAR=5;SRF=20;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0830903;STB=0.547891;STBP=0.65;TYPE=snp;VARB=0.0250484;OID=.;OPOS=51850290;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:26:26:17:17:0.395349:5:12:20:6:5:12:20:6
chr19	51871195	.	G	A	244.29	PASS	AF=0.547619;AO=23;DP=42;FAO=23;FDP=42;FR=.;FRO=19;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.0387531;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.076;QD=23.2653;RBI=0.0461517;REFB=-0.0296398;REVB=-0.0250635;RO=19;SAF=17;SAR=6;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.281565;STB=0.658168;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.0410828;OID=.;OPOS=51871195;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:19:19:23:23:0.547619:6:17:8:11:6:17:8:11
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chr19	51917735	.	G	A	172.21	PASS	AF=0.653846;AO=17;DP=26;FAO=17;FDP=26;FR=.;FRO=9;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.00568757;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.986;QD=26.4935;RBI=0.00585144;REFB=-0.00981259;REVB=-0.0013751;RO=9;SAF=11;SAR=6;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198959;STB=0.610978;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=0.00757114;OID=.;OPOS=51917735;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:26:26:9:9:17:17:0.653846:6:11:3:6:6:11:3:6
chr19	51918112	.	A	G	148.04	PASS	AF=0.484848;AO=16;DP=33;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=4;FWDB=0.0241737;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.1277;QD=17.9436;RBI=0.0291298;REFB=0.00392358;REVB=0.0162536;RO=16;SAF=9;SAR=7;SRF=13;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.232936;STB=0.60857;STBP=0.261;TYPE=snp;VARB=-0.00203522;OID=.;OPOS=51918112;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:16:17:16:16:0.484848:7:9:13:3:7:9:13:4
chr19	51918135	.	G	T	123.97	PASS	AF=0.482759;AO=14;DP=29;FAO=14;FDP=29;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=4;FWDB=0.00537835;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.132;QD=17.0999;RBI=0.0205651;REFB=-0.0182007;REVB=-0.0198494;RO=15;SAF=6;SAR=8;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.269488;STB=0.653638;STBP=0.131;TYPE=snp;VARB=0.021532;OID=.;OPOS=51918135;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:15:15:14:14:0.482759:8:6:11:4:8:6:11:4
chr19	51919240	.	C	T	109.55	PASS	AF=0.277778;AO=15;DP=54;FAO=15;FDP=54;FR=.;FRO=39;FSAF=13;FSAR=2;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=0.00802703;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=283.934;QD=8.11481;RBI=0.0163697;REFB=-0.00557688;REVB=-0.0142666;RO=39;SAF=13;SAR=2;SRF=23;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.421767;STB=0.764291;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=0.0135601;OID=.;OPOS=51919240;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:39:39:15:15:0.277778:2:13:23:16:2:13:23:16
chr19	51919263	.	G	T	71.14	PASS	AF=0.2;AO=11;DP=55;FAO=11;FDP=55;FR=.;FRO=44;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=24;FSRR=20;FWDB=0.0208888;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=44.7883;QD=5.17389;RBI=0.10045;REFB=0.0115088;REVB=0.0982541;RO=43;SAF=10;SAR=1;SRF=24;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.525391;STB=0.859889;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=-0.0495153;OID=.;OPOS=51919263;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:71:55:55:43:44:11:11:0.2:1:10:24:19:1:10:24:20
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chr19	51919321	.	T	C	136.88	PASS	AF=0.5;AO=15;DP=30;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=-0.0147519;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.033;QD=18.2509;RBI=0.0606018;REFB=-0.0177714;REVB=-0.0587789;RO=15;SAF=8;SAR=7;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0589223;STB=0.533588;STBP=0.776;TYPE=snp;VARB=0.0141112;OID=.;OPOS=51919321;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:15:15:15:15:0.5:7:8:9:6:7:8:9:6
chr19	51920613	.	C	T	272.49	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0938282;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.8034;QD=51.9023;RBI=0.137721;REFB=0;REVB=0.100813;RO=0;SAF=12;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00606389;OID=.;OPOS=51920613;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:9:12:0:0:9:12:0:0
chr19	51920619	.	G	C	118.82	PASS	AF=0.619048;AO=13;DP=21;FAO=13;FDP=21;FR=.;FRO=8;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.018105;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=293.61;QD=22.6322;RBI=0.0220833;REFB=-0.00567248;REVB=-0.0126444;RO=8;SAF=8;SAR=5;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0801912;STB=0.545384;STBP=0.599;TYPE=snp;VARB=0.00333797;OID=.;OPOS=51920619;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:21:21:8:8:13:13:0.619048:5:8:4:4:5:8:4:4
chr19	51920850	.	C	T	85.04	PASS	AF=0.666667;AO=10;DP=15;FAO=10;FDP=15;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0286865;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.773;QD=22.6784;RBI=0.0416953;REFB=-0.0111614;REVB=0.0302585;RO=5;SAF=3;SAR=7;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0671499;STB=0.538382;STBP=0.718;TYPE=snp;VARB=0.00757702;OID=.;OPOS=51920850;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:15:15:5:5:10:10:0.666667:7:3:2:3:7:3:2:3
chr19	51955632	.	A	T	158.03	PASS	AF=0.64;AO=16;DP=25;FAO=16;FDP=25;FR=.;FRO=9;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.0206858;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.5539;QD=25.2852;RBI=0.0750165;REFB=-0.00868612;REVB=-0.0721081;RO=9;SAF=10;SAR=6;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119544;STB=0.566925;STBP=0.372;TYPE=snp;VARB=0.00249086;OID=.;OPOS=51955632;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:25:25:9:9:16:16:0.64:6:10:4:5:6:10:4:5
chr19	51957556	.	T	C	288.36	PASS	AF=0.565217;AO=25;DP=45;FAO=26;FDP=46;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=3;FSRR=17;FWDB=0.0187307;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.514;QD=25.0751;RBI=0.0222163;REFB=-0.0105205;REVB=-0.0119468;RO=20;SAF=7;SAR=18;SRF=3;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138541;STB=0.585714;STBP=0.265;TYPE=snp;VARB=0.00840572;OID=.;OPOS=51957556;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:46:20:20:25:26:0.565217:18:7:3:17:18:8:3:17
chr19	51960940	.	A	G	124.88	PASS	AF=0.5;AO=14;DP=28;FAO=14;FDP=28;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.0123446;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=290.814;QD=17.8403;RBI=0.0129536;REFB=-0.00648422;REVB=0.00392497;RO=14;SAF=10;SAR=4;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.264028;STB=0.651947;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=0.00720055;OID=.;OPOS=51960940;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:28:14:14:14:14:0.5:4:10:6:8:4:10:6:8
chr19	51983673	.	G	A	241.23	PASS	AF=0.371795;AO=29;DP=78;FAO=29;FDP=78;FR=.;FRO=49;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=25;FSRR=24;FWDB=-0.00831495;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.72;QD=12.3707;RBI=0.0516524;REFB=-0.00251752;REVB=0.0509788;RO=48;SAF=13;SAR=16;SRF=25;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0788565;STB=0.53898;STBP=0.623;TYPE=snp;VARB=0.00450058;OID=.;OPOS=51983673;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:48:49:29:29:0.371795:16:13:25:23:16:13:25:24
chr19	51984656	.	G	A	160.28	PASS	AF=0.33871;AO=21;DP=62;FAO=21;FDP=62;FR=.;FRO=41;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=19;FWDB=0.0276695;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.27;QD=10.3409;RBI=0.0280613;REFB=-0.00872762;REVB=-0.00467314;RO=41;SAF=7;SAR=14;SRF=22;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.233711;STB=0.63723;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=0.0170634;OID=.;OPOS=51984656;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:41:41:21:21:0.33871:14:7:22:19:14:7:22:19
chr19	51984725	.	T	A	1484.17	PASS	AF=1;AO=98;DP=101;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0104363;FXX=0.0198;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.418;QD=59.9667;RBI=0.0519;REFB=0;REVB=0.0508399;RO=0;SAF=41;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000104759;OID=.;OPOS=51984725;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:101:99:0:0:98:99:1:57:41:0:0:57:42:0:0
chr19	51984727	.	A	G	685.15	PASS	AF=0.623762;AO=62;DP=100;FAO=63;FDP=101;FR=.;FRO=38;FSAF=29;FSAR=34;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=0.0203031;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.712;QD=27.1347;RBI=0.037588;REFB=-0.0135165;REVB=-0.0316329;RO=37;SAF=28;SAR=34;SRF=15;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0322346;STB=0.514897;STBP=0.694;TYPE=snp;VARB=0.00703221;OID=.;OPOS=51984727;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:101:37:38:62:63:0.623762:34:28:15:22:34:29:16:22
chr19	51986546	.	CAT	ATC,CGT	65.59	PASS	AF=0,0.391304;AO=2,9;DP=23;FAO=0,9;FDP=23;FR=.;FRO=14;FSAF=0,6;FSAR=0,3;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=-0.0188279,-0.000169732;FXX=0;HRUN=6,1;LEN=3,1;MLLD=34.1099,116.631;QD=11.4074;RBI=0.11325,0.00869907;REFB=0.0235661,-0.00960717;REVB=-0.111674,-0.00869741;RO=11;SAF=0,6;SAR=2,3;SRF=9;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.711767,-0.171427;STB=0.5,0.516093;STBP=1,0.959;TYPE=mnp,snp;VARB=0,0.0132194;OID=.,.;OPOS=51986546,51986547;OREF=CAT,A;OALT=ATC,G;OMAPALT=ATC,CGT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:65:23:23:11:14:2,9:0,9:0,0.391304:2,3:0,6:9:2:0,3:0,6:9:5
chr19	51988280	.	G	A	122.51	PASS	AF=0.293103;AO=17;DP=58;FAO=17;FDP=58;FR=.;FRO=41;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=0.0372867;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.2096;QD=8.44915;RBI=0.0522102;REFB=-0.00753086;REVB=0.036546;RO=37;SAF=9;SAR=8;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0128587;STB=0.529377;STBP=0.816;TYPE=snp;VARB=0.0234001;OID=.;OPOS=51988280;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:37:41:17:17:0.293103:8:9:20:17:8:9:20:21
chr19	51988326	.	T	C	100.86	PASS	AF=0.265306;AO=13;DP=49;FAO=13;FDP=49;FR=.;FRO=36;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=0.0340215;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=171.441;QD=8.23328;RBI=0.0344618;REFB=-0.00436225;REVB=-0.00549129;RO=36;SAF=6;SAR=7;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0459111;STB=0.528258;STBP=0.825;TYPE=snp;VARB=0.00963578;OID=.;OPOS=51988326;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:36:36:13:13:0.265306:7:6:18:18:7:6:18:18
chr19	52000624	.	T	G	269.53	PASS	AF=0.508772;AO=29;DP=56;FAO=29;FDP=57;FR=.;FRO=28;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=0.00761045;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.323;QD=18.9144;RBI=0.0256464;REFB=-0.0173904;REVB=-0.0244912;RO=27;SAF=15;SAR=14;SRF=9;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15863;STB=0.57826;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=0.0192281;OID=.;OPOS=52000624;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:57:27:28:29:29:0.508772:14:15:9:18:14:15:10:18
chr19	52076960	.	T	C	116.05	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0175202;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.892;QD=42.1989;RBI=0.0281765;REFB=0;REVB=0.0220671;RO=0;SAF=4;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000301906;OID=.;OPOS=52076960;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:11:0:0:10:11:1:6:4:0:0:6:5:0:0
chr19	52076974	.	C	T	153.27	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0198449;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.676;QD=43.792;RBI=0.0266119;REFB=0;REVB=0.0177306;RO=0;SAF=6;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000941097;OID=.;OPOS=52076974;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:14:0:0:13:14:1:7:6:0:0:7:7:0:0
chr19	52077030	.	TGGGGTTTG	T	253.08	PASS	AF=1;AO=19;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0108367;FXX=0;HRUN=4;LEN=8;MLLD=300.898;QD=50.6161;RBI=0.0125167;REFB=0;REVB=-0.00626373;RO=0;SAF=10;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-3.24774e-05;OID=.;OPOS=52077031;OREF=GGGGTTTG;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:19:20:20:20:0:10:10:0:0:4:0:10:9:0:0
chr19	52077069	.	G	A	429.02	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0106351;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.278;QD=57.2026;RBI=0.0250931;REFB=0;REVB=-0.0227279;RO=0;SAF=16;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.56309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.6445e-05;OID=.;OPOS=52077069;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:14:16:0:0:14:16:0:0
chr19	52096033	.	GATAAA	G	285.45	PASS	AF=1;AO=21;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.01525;FXX=0.0434594;HRUN=1;LEN=5;MLLD=338.02;QD=51.9002;RBI=0.0152507;REFB=0;REVB=-0.000145875;RO=0;SAF=21;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=5.26467e-05;OID=.;OPOS=52096034;OREF=ATAAA;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:21:22:22:22:0:22:0:0:0:4:0:21:0:0:0
chr19	52096053	.	T	A	320.86	PASS	AF=0.928571;AO=24;DP=28;FAO=26;FDP=28;FR=.;FRO=2;FSAF=22;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00560446;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=78.7591;QD=45.8365;RBI=0.215172;REFB=-0.115697;REVB=0.215099;RO=4;SAF=22;SAR=2;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.266578;STB=0.521723;STBP=0.675;TYPE=snp;VARB=0.00458466;OID=.;OPOS=52096053;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:28:28:4:2:24:26:0.928571:2:22:2:2:4:22:2:0
chr19	52097461	.	A	C	880.85	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000384633;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.345;QD=57.7609;RBI=0.00418738;REFB=0;REVB=-0.00416968;RO=0;SAF=28;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.14575e-06;OID=.;OPOS=52097461;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:33:28:0:0:33:28:0:0
chr19	52115645	.	G	C	153.93	PASS	AF=0.358491;AO=19;DP=53;FAO=19;FDP=53;FR=.;FRO=34;FSAF=4;FSAR=15;FSRF=8;FSRR=26;FWDB=-0.0586941;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=264.701;QD=11.6171;RBI=0.0663856;REFB=-0.0180434;REVB=-0.0310169;RO=34;SAF=4;SAR=15;SRF=8;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0396468;STB=0.523231;STBP=0.836;TYPE=snp;VARB=0.0272141;OID=.;OPOS=52115645;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:34:34:19:19:0.358491:15:4:8:26:15:4:8:26
chr19	52130488	.	G	A	99.23	PASS	AF=0.444444;AO=12;DP=27;FAO=12;FDP=27;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=12;FWDB=-0.0438044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.752;QD=14.7014;RBI=0.0445131;REFB=0.0749558;REVB=-0.00791148;RO=15;SAF=5;SAR=7;SRF=3;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.224736;STB=0.628946;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=-0.102522;OID=.;OPOS=52130488;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:15:15:12:12:0.444444:7:5:3:12:7:5:3:12
chr19	52132325	.	A	T	171.26	PASS	AF=0.381818;AO=21;DP=55;FAO=21;FDP=55;FR=.;FRO=34;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=0.0352217;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.9894;QD=12.4555;RBI=0.0591551;REFB=-0.00897239;REVB=-0.0475263;RO=34;SAF=14;SAR=7;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.244874;STB=0.641838;STBP=0.128;TYPE=snp;VARB=0.0135287;OID=.;OPOS=52132325;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:34:34:21:21:0.381818:7:14:15:19:7:14:15:19
chr19	52220351	.	G	A	218.06	PASS	AF=0.446429;AO=25;DP=56;FAO=25;FDP=56;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=21;FWDB=0.0066699;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.995;QD=15.5754;RBI=0.0106613;REFB=-0.0108278;REVB=0.00831716;RO=31;SAF=12;SAR=13;SRF=10;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155735;STB=0.587829;STBP=0.25;TYPE=snp;VARB=0.0145521;OID=.;OPOS=52220351;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:31:31:25:25:0.446429:13:12:10:21:13:12:10:21
chr19	52223121	.	A	G	868.23	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0120071;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.137;QD=57.8818;RBI=0.012857;REFB=0;REVB=0.00459714;RO=0;SAF=45;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.91141e-05;OID=.;OPOS=52223121;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:15:45:0:0:15:45:0:0
chr19	52223180	.	A	G	1339.63	PASS	AF=1;AO=84;DP=84;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00502493;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.485;QD=62.3083;RBI=0.0110912;REFB=0;REVB=-0.00988756;RO=0;SAF=50;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.06517e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.92906e-05;OID=.;OPOS=52223180;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:86:0:0:84:86:1:34:50:0:0:35:51:0:0
chr19	52249211	.	T	G	659.56	PASS	AF=1;AO=42;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00980479;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.377;QD=61.3546;RBI=0.0122505;REFB=0;REVB=0.00734452;RO=0;SAF=29;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.36943e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000879763;OID=.;OPOS=52249211;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:42:43:1:13:29:0:0:13:30:0:0
chr19	52249880	.	C	T	132.41	PASS	AF=0.320755;AO=17;DP=53;FAO=17;FDP=53;FR=.;FRO=36;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=-0.0123374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.817;QD=9.99281;RBI=0.0200464;REFB=-0.000550314;REVB=0.0158002;RO=35;SAF=10;SAR=7;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117061;STB=0.578971;STBP=0.473;TYPE=snp;VARB=0.00093798;OID=.;OPOS=52249880;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:35:36:17:17:0.320755:7:10:17:18:7:10:17:19
chr19	52250216	.	A	G	728.98	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0456551;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.336;QD=57.1745;RBI=0.0466426;REFB=0;REVB=0.00954686;RO=0;SAF=26;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94283e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000323639;OID=.;OPOS=52250216;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:25:26:0:0:25:26:0:0
chr19	52506985	.	T	C	159.6	PASS	AF=0.472222;AO=17;DP=36;FAO=17;FDP=36;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=0.0601989;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.393;QD=17.7332;RBI=0.0605885;REFB=0.00203246;REVB=-0.00685998;RO=19;SAF=9;SAR=8;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0998626;STB=0.556937;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=-0.000846196;OID=.;OPOS=52506985;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:19:19:17:17:0.472222:8:9:8:11:8:9:8:11
chr19	52520607	.	C	T	38.57	PASS	AF=0.428571;AO=6;DP=14;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.0325548;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=214.699;QD=11.0198;RBI=0.0327169;REFB=-0.0058633;REVB=0.00325275;RO=8;SAF=2;SAR=4;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162008;STB=0.599657;STBP=0.548;TYPE=snp;VARB=0.0034381;OID=.;OPOS=52520607;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:14:14:8:8:6:6:0.428571:4:2:4:4:4:2:4:4
chr19	52521296	.	G	A	253.05	PASS	AF=0.585366;AO=23;DP=40;FAO=24;FDP=41;FR=.;FRO=17;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=0.00613102;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.049;QD=24.6877;RBI=0.0268333;REFB=-0.0126906;REVB=0.0261235;RO=17;SAF=10;SAR=13;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111355;STB=0.553148;STBP=0.439;TYPE=snp;VARB=0.0125039;OID=.;OPOS=52521296;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:41:17:17:23:24:0.585366:13:10:5:12:14:10:5:12
chr19	52537576	.	T	G	201.99	PASS	AF=0.526316;AO=20;DP=38;FAO=20;FDP=38;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=-0.021433;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.584;QD=21.2623;RBI=0.0239966;REFB=-0.0104539;REVB=-0.0107917;RO=18;SAF=5;SAR=15;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142322;STB=0.58056;STBP=0.339;TYPE=snp;VARB=0.0087388;OID=.;OPOS=52537576;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:18:18:20:20:0.526316:15:5:7:11:15:5:7:11
chr19	52537860	.	GT	G	38.48	PASS	AF=0.366667;AO=7;DP=30;FAO=11;FDP=30;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=0.145393;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=14.3077;QD=5.13022;RBI=0.195912;REFB=-0.056044;REVB=0.131311;RO=23;SAF=4;SAR=3;SRF=10;SRR=13;SSEN=0.3;SSEP=0;SSSB=0.159419;STB=0.578172;STBP=0.557;TYPE=del;VARB=0.159588;OID=.;OPOS=52537861;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.366667:7:30:11:30:19:6:5:8:11:38:23:4:3:10:13
chr19	52569057	.	C	T	216.95	PASS	AF=0.433333;AO=25;DP=59;FAO=26;FDP=60;FR=.;FRO=34;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=-0.00530633;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.978;QD=14.4636;RBI=0.00605905;REFB=-0.0102124;REVB=0.00292489;RO=34;SAF=17;SAR=8;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162603;STB=0.59992;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.0104897;OID=.;OPOS=52569057;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:60:34:34:25:26:0.433333:8:17:18:16:8:18:18:16
chr19	52619065	.	T	C	206.1	PASS	AF=0.428571;AO=21;DP=49;FAO=21;FDP=49;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=-0.0280481;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.58;QD=16.8247;RBI=0.0319788;REFB=0.00663953;REVB=0.0153606;RO=28;SAF=9;SAR=12;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0366753;STB=0.520938;STBP=0.805;TYPE=snp;VARB=-0.0154568;OID=.;OPOS=52619065;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:28:28:21:21:0.428571:12:9:11:17:12:9:11:17
chr19	52658510	.	T	C	47.68	PASS	AF=0.4375;AO=7;DP=16;FAO=7;FDP=16;FR=.;FRO=9;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=-0.0367955;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.4161;QD=11.9195;RBI=0.0368706;REFB=-0.0092238;REVB=0.002351;RO=9;SAF=1;SAR=6;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131013;STB=0.58039;STBP=0.745;TYPE=snp;VARB=0.00651322;OID=.;OPOS=52658510;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:16:16:9:9:7:7:0.4375:6:1:2:7:6:1:2:7
chr19	52659991	.	A	G	340.56	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0616883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.573;QD=54.49;RBI=0.06628;REFB=0;REVB=-0.0242403;RO=0;SAF=14;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000284988;OID=.;OPOS=52659991;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:11:14:0:0:11:14:0:0
chr19	52660279	.	C	T	594.54	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00575905;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.1806;QD=60.9782;RBI=0.0421089;REFB=0;REVB=-0.0417132;RO=0;SAF=22;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000274951;OID=.;OPOS=52660279;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:17:22:0:0:17:22:0:0
chr19	52660783	.	A	G	294.28	PASS	AF=0.735294;AO=25;DP=34;FAO=25;FDP=34;FR=.;FRO=9;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.0113508;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.14;QD=34.6216;RBI=0.0177234;REFB=-0.0112669;REVB=0.0136117;RO=9;SAF=16;SAR=9;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0140785;STB=0.507686;STBP=0.882;TYPE=snp;VARB=0.00351618;OID=.;OPOS=52660783;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:60:34:34:9:9:25:25:0.735294:9:16:6:3:9:16:6:3
chr19	52803669	.	CTG	C	577.47	PASS	AF=1;AO=37;DP=38;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0107854;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=225.992;QD=59.2273;RBI=0.0465453;REFB=0;REVB=0.0452785;RO=0;SAF=22;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.82408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=7.75128e-05;OID=.;OPOS=52803670;OREF=TG;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:37:38:39:39:0:23:16:0:0:4:0:22:15:0:0
chr19	52825032	.	C	T	166.08	PASS	AF=0.566667;AO=17;DP=30;FAO=17;FDP=30;FR=.;FRO=13;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.0112345;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=281.212;QD=22.1441;RBI=0.0116069;REFB=0.012512;REVB=-0.00291654;RO=13;SAF=9;SAR=8;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0667668;STB=0.537506;STBP=0.659;TYPE=snp;VARB=-0.0100326;OID=.;OPOS=52825032;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:13:13:17:17:0.566667:8:9:8:5:8:9:8:5
chr19	52825235	.	A	G	175.65	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00428032;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.673;QD=46.8386;RBI=0.0265296;REFB=0;REVB=-0.026182;RO=0;SAF=5;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00019124;OID=.;OPOS=52825235;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:10:5:0:0:10:5:0:0
chr19	52856955	.	C	T	357.96	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00857012;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.884;QD=55.0707;RBI=0.0320697;REFB=0;REVB=-0.0309034;RO=0;SAF=10;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.71087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000267598;OID=.;OPOS=52856955;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:16:10:0:0:16:10:0:0
chr19	52869022	.	G	T	152.71	PASS	AF=0.377778;AO=17;DP=45;FAO=17;FDP=45;FR=.;FRO=28;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=-0.0362396;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.2485;QD=13.5743;RBI=0.0408132;REFB=-0.00842732;REVB=-0.0187725;RO=28;SAF=8;SAR=9;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0451358;STB=0.526285;STBP=0.792;TYPE=snp;VARB=0.0136671;OID=.;OPOS=52869022;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:28:28:17:17:0.377778:9:8:12:16:9:8:12:16
chr19	52869278	.	G	C	44.79	PASS	AF=0.291667;AO=7;DP=24;FAO=7;FDP=24;FR=.;FRO=17;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.0450822;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.946;QD=7.46536;RBI=0.0451859;REFB=-0.00634457;REVB=0.0030591;RO=17;SAF=1;SAR=6;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.381716;STB=0.749167;STBP=0.183;TYPE=snp;VARB=0.0138368;OID=.;OPOS=52869278;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:24:24:17:17:7:7:0.291667:6:1:7:10:6:1:7:10
chr19	52869312	.	T	C	67.43	PASS	AF=0.45;AO=9;DP=20;FAO=9;FDP=20;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.0111616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.894;QD=13.4856;RBI=0.0400255;REFB=-0.00816101;REVB=0.0384377;RO=11;SAF=2;SAR=7;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.33333;STB=0.69952;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=0.0128908;OID=.;OPOS=52869312;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:20:20:11:11:9:9:0.45:7:2:6:5:7:2:6:5
chr19	52887145	.	TA	T	51.51	PASS	AF=0.37931;AO=11;DP=30;FAO=11;FDP=29;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=0.142943;FXX=0.0333222;HRUN=5;LEN=1;MLLD=15.3568;QD=7.10541;RBI=0.16561;REFB=0.0198662;REVB=-0.0836296;RO=16;SAF=3;SAR=8;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0.3125;SSSB=0.0292487;STB=0.545369;STBP=0.751;TYPE=del;VARB=-0.0329919;OID=.;OPOS=52887146;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.37931:11:30:11:29:18:3:8:6:12:51:16:3:8:4:12
chr19	52887427	.	A	C	96.74	PASS	AF=0.387097;AO=12;DP=31;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=-0.0163108;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.76;QD=12.4824;RBI=0.0165556;REFB=-0.0165846;REVB=-0.00283617;RO=19;SAF=8;SAR=4;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.354572;STB=0.708;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.027426;OID=.;OPOS=52887427;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:31:31:19:19:12:12:0.387097:4:8:6:13:4:8:6:13
chr19	52887437	.	A	C	108.0	PASS	AF=0.393939;AO=13;DP=33;FAO=13;FDP=33;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=-0.0174794;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.066;QD=13.0906;RBI=0.110594;REFB=0.0193265;REVB=0.109204;RO=20;SAF=9;SAR=4;SRF=6;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.39327;STB=0.729391;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=-0.0230733;OID=.;OPOS=52887437;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:20:20:13:13:0.393939:4:9:6:14:4:9:6:14
chr19	52887904	.	T	C	72.89	PASS	AF=0.642857;AO=9;DP=14;FAO=9;FDP=14;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0529291;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.2419;QD=20.8244;RBI=0.0651117;REFB=-0.0660209;REVB=0.0379216;RO=5;SAF=4;SAR=5;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.028019;STB=0.516093;STBP=0.926;TYPE=snp;VARB=0.0422278;OID=.;OPOS=52887904;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:14:14:5:5:9:9:0.642857:5:4:2:3:5:4:2:3
chr19	52917588	.	ACG	ACA,CAA	453.9	PASS	AF=0.787879,0.212121;AO=19,7;DP=34;FAO=26,7;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=11,0;FSAR=15,7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0225978,-0.0311337;FXX=0.0294031;HRUN=1,2;LEN=1,3;MLLD=67.772,52.7886;QD=55.0183;RBI=0.0272114,0.0340743;REFB=0,0;REVB=0.0151592,0.0138474;RO=0;SAF=11,0;SAR=8,7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.41338e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=-0.00864138,0.00737885;OID=.,.;OPOS=52917590,52917588;OREF=G,ACG;OALT=A,CAA;OMAPALT=ACA,CAA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:44:34:33:0:0:19,7:26,7:0.787879,0.212121:8,7:11,0:0:0:15,7:11,0:0:0
chr19	52937339	.	G	A	62.73	PASS	AF=0.391304;AO=9;DP=23;FAO=9;FDP=23;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.0617792;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.0751;QD=10.9088;RBI=0.0756856;REFB=-0.00803658;REVB=0.0437224;RO=14;SAF=4;SAR=5;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0910242;STB=0.554337;STBP=0.76;TYPE=snp;VARB=0.0296818;OID=.;OPOS=52937339;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:23:23:14:14:9:9:0.391304:5:4:5:9:5:4:5:9
chr19	52938361	.	C	A	304.66	PASS	AF=0.419753;AO=34;DP=80;FAO=34;FDP=81;FR=.;FRO=47;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=27;FWDB=-0.022571;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.1493;QD=15.0449;RBI=0.0727062;REFB=0.0128707;REVB=-0.069114;RO=46;SAF=21;SAR=13;SRF=20;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186969;STB=0.611733;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=-0.0206595;OID=.;OPOS=52938361;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:81:46:47:34:34:0.419753:13:21:20:26:13:21:20:27
chr19	52938417	.	A	G	184.29	PASS	AF=0.328767;AO=24;DP=73;FAO=24;FDP=73;FR=.;FRO=49;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=27;FWDB=0.0295676;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.9924;QD=10.0983;RBI=0.0324205;REFB=-0.00422915;REVB=0.0132985;RO=47;SAF=12;SAR=12;SRF=20;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0845254;STB=0.534218;STBP=0.702;TYPE=snp;VARB=0.0175513;OID=.;OPOS=52938417;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:47:49:24:24:0.328767:12:12:20:27:12:12:22:27
chr19	52938459	.	A	G	201.12	PASS	AF=0.433962;AO=23;DP=53;FAO=23;FDP=53;FR=.;FRO=30;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=0.00639982;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.6366;QD=15.1785;RBI=0.00640511;REFB=-0.0152979;REVB=0.000260303;RO=30;SAF=10;SAR=13;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0353687;STB=0.520117;STBP=0.833;TYPE=snp;VARB=0.018094;OID=.;OPOS=52938459;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:30:30:23:23:0.433962:13:10:12:18:13:10:12:18
chr19	52941171	.	T	C	239.36	PASS	AF=0.490566;AO=26;DP=53;FAO=26;FDP=53;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.0251136;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=43.6126;QD=18.0649;RBI=0.0619494;REFB=-0.00749349;REVB=0.0566306;RO=26;SAF=13;SAR=13;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103022;STB=0.547134;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.00924537;OID=.;OPOS=52941171;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:26:27:26:26:0.490566:13:13:10:16:13:13:11:16
chr19	52941540	.	G	A	40.29	PASS	AF=0.545455;AO=6;DP=11;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.00347411;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=309.528;QD=14.6525;RBI=0.01623;REFB=0.00664848;REVB=-0.0158539;RO=5;SAF=4;SAR=2;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.333798;STB=0.691819;STBP=0.34;TYPE=snp;VARB=-0.00478729;OID=.;OPOS=52941540;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:11:11:5:5:6:6:0.545455:2:4:5:0:2:4:5:0
chr19	52941847	.	A	T	57.93	PASS	AF=0.470588;AO=8;DP=17;FAO=8;FDP=17;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=-0.00708947;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.19;QD=13.631;RBI=0.0801638;REFB=-0.0129956;REVB=-0.0798497;RO=9;SAF=5;SAR=3;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.256503;STB=0.6518;STBP=0.26;TYPE=snp;VARB=0.00694523;OID=.;OPOS=52941847;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:17:17:9:9:8:8:0.470588:3:5:3:6:3:5:3:6
chr19	52942445	.	C	T	30.99	PASS	AF=0.5;AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.0278368;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.337;QD=12.3945;RBI=0.0402337;REFB=-0.0297411;REVB=-0.0290493;RO=4;SAF=1;SAR=4;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.268008;STB=0.726279;STBP=0.238;TYPE=snp;VARB=0.0267716;OID=.;OPOS=52942445;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:27:10:10:4:5:5:5:0.5:4:1:2:2:4:1:3:2
chr19	52954507	.	T	C	855.81	PASS	AF=0.483333;AO=87;DP=181;FAO=87;FDP=180;FR=.;FRO=93;FSAF=50;FSAR=37;FSRF=56;FSRR=37;FWDB=-0.0207212;FXX=0.00552456;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.443;QD=19.0179;RBI=0.0226818;REFB=-0.0085514;REVB=-0.00922479;RO=93;SAF=50;SAR=37;SRF=56;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0264084;STB=0.51456;STBP=0.697;TYPE=snp;VARB=0.00903115;OID=.;OPOS=52954507;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:181:180:93:93:87:87:0.483333:37:50:56:37:37:50:56:37
chr19	53014346	.	G	A	100.45	PASS	AF=0.5;AO=10;DP=23;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=-0.0091667;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.16;QD=16.741;RBI=0.0128449;REFB=0.00525511;REVB=-0.00899794;RO=12;SAF=3;SAR=7;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.340037;STB=0.666389;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=-0.00892715;OID=.;OPOS=53014346;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:23:24:12:12:10:12:0.5:7:3:8:4:8:4:8:4
chr19	53015384	.	A	G	51.55	PASS	AF=0.636364;AO=7;DP=11;FAO=7;FDP=11;FR=.;FRO=4;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0830444;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.881;QD=18.7439;RBI=0.084185;REFB=-0.0262524;REVB=0.0138108;RO=4;SAF=1;SAR=6;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.31972;STB=0.691659;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=0.0284773;OID=.;OPOS=53015384;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:11:11:4:4:7:7:0.636364:6:1:2:2:6:1:2:2
chr19	53015864	.	T	G	40.29	PASS	AF=0.545455;AO=6;DP=11;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.109803;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.2708;QD=14.6522;RBI=0.109815;REFB=0.0536385;REVB=0.00162331;RO=5;SAF=5;SAR=1;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.247547;STB=0.651594;STBP=0.396;TYPE=snp;VARB=-0.05137;OID=.;OPOS=53015864;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:11:11:5:5:6:6:0.545455:1:5:3:2:1:5:3:2
chr19	53015987	.	C	G	38.57	PASS	AF=0.428571;AO=6;DP=14;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.00760705;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.7188;QD=11.0198;RBI=0.0579336;REFB=-0.0144439;REVB=0.057432;RO=8;SAF=2;SAR=4;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0912889;STB=0.555379;STBP=0.773;TYPE=snp;VARB=0.0175945;OID=.;OPOS=53015987;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:14:14:8:8:6:6:0.428571:4:2:2:6:4:2:2:6
chr19	53016129	.	G	A	39.62	PASS	AF=0.5;AO=6;DP=12;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.0358659;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.4176;QD=13.2053;RBI=0.0558995;REFB=0.0112598;REVB=-0.0428766;RO=6;SAF=5;SAR=1;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.550714;STB=0.83222;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=-0.0134654;OID=.;OPOS=53016129;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:12:12:6:6:6:6:0.5:1:5:1:5:1:5:1:5
chr19	53059235	.	T	G	38.15	PASS	AF=0.4;AO=6;DP=15;FAO=6;FDP=15;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=0.0119405;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=302.833;QD=10.1734;RBI=0.0120898;REFB=-0.00584557;REVB=0.00189422;RO=9;SAF=2;SAR=4;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129519;STB=0.578703;STBP=0.738;TYPE=snp;VARB=0.00898703;OID=.;OPOS=53059235;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:15:15:9:9:6:6:0.4:4:2:2:7:4:2:2:7
chr19	53075519	.	G	T	110.71	PASS	AF=0.705882;AO=12;DP=17;FAO=12;FDP=17;FR=.;FRO=5;FSAF=11;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=-8.73897e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.527;QD=26.0488;RBI=0.0161555;REFB=0.00454866;REVB=0.0161553;RO=5;SAF=11;SAR=1;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167444;STB=0.592461;STBP=0.657;TYPE=snp;VARB=-0.00152398;OID=.;OPOS=53075519;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:17:17:5:5:12:12:0.705882:1:11:5:0:1:11:5:0
chr19	53077411	.	T	C	398.98	PASS	AF=0.58209;AO=39;DP=67;FAO=39;FDP=67;FR=.;FRO=28;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=0.00479138;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.1808;QD=23.8197;RBI=0.0122475;REFB=0.0303412;REVB=0.0112714;RO=28;SAF=18;SAR=21;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0252885;STB=0.513882;STBP=0.802;TYPE=snp;VARB=-0.0266648;OID=.;OPOS=53077411;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:28:28:39:39:0.58209:21:18:12:16:21:18:12:16
chr19	53085659	.	C	T	61.3	PASS	AF=0.615385;AO=8;DP=13;FAO=8;FDP=13;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0308067;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.822;QD=18.8629;RBI=0.0521336;REFB=-0.00501167;REVB=-0.0420578;RO=5;SAF=3;SAR=5;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128939;STB=0.574292;STBP=0.545;TYPE=snp;VARB=0.00479881;OID=.;OPOS=53085659;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:13:13:5:5:8:8:0.615385:5:3:1:4:5:3:1:4
chr19	53085813	.	T	C	57.32	PASS	AF=0.444444;AO=8;DP=18;FAO=8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=-0.014738;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.524;QD=12.7389;RBI=0.0149553;REFB=0.0108932;REVB=-0.00254056;RO=10;SAF=1;SAR=7;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.3708;STB=0.728476;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=-0.00692153;OID=.;OPOS=53085813;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:18:18:10:10:8:8:0.444444:7:1:4:6:7:1:4:6
chr19	53086124	.	C	A	145.55	PASS	AF=0.444444;AO=16;DP=36;FAO=16;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.0136444;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.117;QD=16.1722;RBI=0.0146888;REFB=0.00284317;REVB=-0.00543978;RO=20;SAF=10;SAR=6;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0753757;STB=0.543423;STBP=0.666;TYPE=snp;VARB=-0.00216649;OID=.;OPOS=53086124;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:20:20:16:16:0.444444:6:10:11:9:6:10:11:9
chr19	53116643	.	T	C	446.93	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0276992;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.879;QD=57.6684;RBI=0.0277785;REFB=0;REVB=0.00209794;RO=0;SAF=12;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.47712e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000171159;OID=.;OPOS=53116643;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:19:12:0:0:19:12:0:0
chr19	53117531	.	C	T	323.46	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0410313;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.124;QD=53.9105;RBI=0.041047;REFB=0;REVB=-0.00113488;RO=0;SAF=8;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000549674;OID=.;OPOS=53117531;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:16:8:0:0:16:8:0:0
chr19	53117809	.	C	A	734.3	PASS	AF=0.979167;AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=48;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0264117;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=95.1966;QD=61.1915;RBI=0.0413038;REFB=-0.149034;REVB=0.0317558;RO=1;SAF=31;SAR=16;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0284823;STB=0.515145;STBP=0.27;TYPE=snp;VARB=0.00133386;OID=.;OPOS=53117809;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:48:48:1:1:47:47:0.979167:16:31:0:1:16:31:0:1
chr19	53269614	.	G	A	220.93	PASS	AF=0.44898;AO=22;DP=49;FAO=22;FDP=49;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=-0.0143248;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.808;QD=18.0354;RBI=0.0146502;REFB=-0.00506067;REVB=-0.00307025;RO=27;SAF=13;SAR=9;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0351417;STB=0.519982;STBP=0.847;TYPE=snp;VARB=0.00703164;OID=.;OPOS=53269614;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:27:27:22:22:0.44898:9:13:15:12:9:13:15:12
chr19	53270384	.	A	G	176.29	PASS	AF=0.529412;AO=18;DP=34;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=0.00930222;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.419;QD=20.7399;RBI=0.0105665;REFB=0.0109296;REVB=-0.00501185;RO=16;SAF=8;SAR=10;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168581;STB=0.594495;STBP=0.262;TYPE=snp;VARB=-0.00612814;OID=.;OPOS=53270384;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:16:16:18:18:0.529412:10:8:4:12:10:8:4:12
chr19	53303527	.	A	G	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00437422;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.852;QD=47.8223;RBI=0.0302553;REFB=0;REVB=0.0299374;RO=0;SAF=10;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000414722;OID=.;OPOS=53303527;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:6:10:0:0:6:10:0:0
chr19	53303890	.	C	G	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0368884;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.512;QD=33.4285;RBI=0.0958863;REFB=0;REVB=0.0885067;RO=0;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00662944;OID=.;OPOS=53303890;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:5:1:0:0:5:1:0:0
chr19	53304563	.	T	C	536.93	PASS	AF=0.948718;AO=37;DP=39;FAO=37;FDP=39;FR=.;FRO=2;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.019623;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.6791;QD=55.0697;RBI=0.0951344;REFB=-0.0967293;REVB=0.0930886;RO=2;SAF=20;SAR=17;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.003913;STB=0.502091;STBP=0.87;TYPE=snp;VARB=0.00881082;OID=.;OPOS=53304563;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:39:39:2:2:37:37:0.948718:17:20:1:1:17:20:1:1
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chr19	53577419	.	G	C	128.83	PASS	AF=0.295082;AO=18;DP=61;FAO=18;FDP=61;FR=.;FRO=43;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=35;FSRR=8;FWDB=-0.0658935;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.3068;QD=8.44798;RBI=0.0721578;REFB=0.0164497;REVB=0.0294075;RO=43;SAF=11;SAR=7;SRF=35;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.276465;STB=0.661041;STBP=0.165;TYPE=snp;VARB=-0.0406123;OID=.;OPOS=53577419;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:43:43:18:18:0.295082:7:11:35:8:7:11:35:8
chr19	53612311	.	T	C	46.0	PASS	AF=0.35;AO=7;DP=20;FAO=7;FDP=20;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=0.0323602;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.686;QD=9.19975;RBI=0.0452756;REFB=0.00650683;REVB=0.0316654;RO=13;SAF=4;SAR=3;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133873;STB=0.581866;STBP=0.61;TYPE=snp;VARB=-0.00195808;OID=.;OPOS=53612311;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:20:20:13:13:7:7:0.35:3:4:9:4:3:4:9:4
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chr19	54385820	.	C	T	1691.79	PASS	AF=0.974359;AO=113;DP=117;FAO=114;FDP=117;FR=.;FRO=3;FSAF=46;FSAR=68;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0168865;FXX=0.00847386;HRUN=3;LEN=1;MLLD=308.914;QD=57.8389;RBI=0.0237724;REFB=-0.100748;REVB=0.0167324;RO=3;SAF=46;SAR=67;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0299575;STB=0.515787;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.000321965;OID=.;OPOS=54385820;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:117:117:3:3:113:114:0.974359:67:46:3:0:68:46:3:0
chr19	54394965	.	T	C	337.95	PASS	AF=0.406593;AO=37;DP=91;FAO=37;FDP=91;FR=.;FRO=54;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=32;FSRR=22;FWDB=-0.00278753;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.205;QD=14.8549;RBI=0.00805708;REFB=0.0083488;REVB=-0.00755951;RO=54;SAF=17;SAR=20;SRF=32;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138705;STB=0.57847;STBP=0.21;TYPE=snp;VARB=-0.0103774;OID=.;OPOS=54394965;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:54:54:37:37:0.406593:20:17:32:22:20:17:32:22
chr19	54561792	.	G	A	86.87	PASS	AF=0.407407;AO=11;DP=27;FAO=11;FDP=27;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=0.00334617;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.639;QD=12.8689;RBI=0.0274501;REFB=-0.0307961;REVB=0.0272454;RO=16;SAF=8;SAR=3;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.410147;STB=0.74129;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.017252;OID=.;OPOS=54561792;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:27:27:16:16:11:11:0.407407:3:8:5:11:3:8:5:11
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chr19	54606209	.	T	G	55.83	PASS	AF=0.380952;AO=8;DP=21;FAO=8;FDP=21;FR=.;FRO=13;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.0175443;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.466;QD=10.6346;RBI=0.0334019;REFB=-0.0203468;REVB=-0.0284233;RO=12;SAF=2;SAR=6;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.345943;STB=0.731115;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=0.0387309;OID=.;OPOS=54606209;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:21:21:12:13:8:8:0.380952:6:2:7:5:6:2:8:5
chr19	54649671	.	T	C	88.21	PASS	AF=1;AO=6;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0677893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.225;QD=39.2059;RBI=0.0691695;REFB=0;REVB=0.0137488;RO=0;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0016011;OID=.;OPOS=54649671;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:6:9:1:5:1:0:0:7:2:0:0
chr19	54657056	.	C	A	98.55	PASS	AF=0.428571;AO=12;DP=28;FAO=12;FDP=28;FR=.;FRO=16;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=0.0242115;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=311.984;QD=14.0793;RBI=0.0260252;REFB=0.00660196;REVB=0.00954541;RO=16;SAF=1;SAR=11;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.409997;STB=0.749463;STBP=0.101;TYPE=snp;VARB=-0.0123276;OID=.;OPOS=54657056;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:28:28:16:16:12:12:0.428571:11:1:5:11:11:1:5:11
chr19	54677759	.	T	C	710.37	PASS	AF=1;AO=49;DP=50;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00342698;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.435;QD=55.7152;RBI=0.0279938;REFB=0;REVB=0.0277833;RO=0;SAF=35;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.22152e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000150158;OID=.;OPOS=54677759;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:51:0:0:49:51:1:14:35:0:0:14:37:0:0
chr19	54722582	.	G	A	311.27	PASS	AF=0.6;AO=30;DP=50;FAO=30;FDP=50;FR=.;FRO=20;FSAF=23;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=-0.0012521;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.025;QD=24.9014;RBI=0.0420672;REFB=-0.0311295;REVB=0.0420485;RO=20;SAF=23;SAR=7;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152794;STB=0.584685;STBP=0.202;TYPE=snp;VARB=0.0156568;OID=.;OPOS=54722582;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:20:20:30:30:0.6:7:23:12:8:7:23:12:8
chr19	54723355	.	A	G	255.66	PASS	AF=0.657143;AO=23;DP=35;FAO=23;FDP=35;FR=.;FRO=12;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=-0.0161216;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.6236;QD=29.2178;RBI=0.0413442;REFB=0.0212905;REVB=-0.0380714;RO=12;SAF=11;SAR=12;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143532;STB=0.578881;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=-0.00933243;OID=.;OPOS=54723355;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:35:35:12:12:23:23:0.657143:12:11:3:9:12:11:3:9
chr19	54723738	.	G	C	164.39	PASS	AF=0.375;AO=18;DP=48;FAO=18;FDP=48;FR=.;FRO=30;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=-0.00425483;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.498;QD=13.6993;RBI=0.0161794;REFB=-0.0122142;REVB=-0.0156099;RO=30;SAF=6;SAR=12;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.219969;STB=0.628425;STBP=0.183;TYPE=snp;VARB=0.0157533;OID=.;OPOS=54723738;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:30:30:18:18:0.375:12:6:16:14:12:6:16:14
chr19	54725798	.	G	T	214.07	PASS	AF=0.947368;AO=18;DP=19;FAO=18;FDP=19;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0426178;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=45.4936;QD=45.0683;RBI=0.176465;REFB=-0.0935783;REVB=0.171241;RO=0;SAF=17;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.51427;STBP=0.643;TYPE=snp;VARB=0.0165909;OID=.;OPOS=54725798;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:19:19:0:1:18:18:0.947368:1:17:0:0:1:17:1:0
chr19	54725930	.	C	T	116.3	PASS	AF=0.378378;AO=13;DP=37;FAO=14;FDP=37;FR=.;FRO=23;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=-0.0216434;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.3006;QD=12.5726;RBI=0.0239093;REFB=0.00563799;REVB=0.0101596;RO=24;SAF=4;SAR=9;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.381748;STB=0.724873;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=-0.00587489;OID=.;OPOS=54725930;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:24:23:13:14:0.378378:9:4:16:8:10:4:15:8
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chr19	54726324	.	G	C	39.75	PASS	AF=0.123077;AO=8;DP=65;FAO=8;FDP=65;FR=.;FRO=57;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=29;FSRR=28;FWDB=-0.0247446;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.724;QD=2.44623;RBI=0.0269443;REFB=-0.00285027;REVB=-0.010663;RO=57;SAF=1;SAR=7;SRF=29;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.477582;STB=0.856202;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=0.011736;OID=.;OPOS=54726324;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:39:65:65:57:57:8:8:0.123077:7:1:29:28:7:1:29:28
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chr19	54744799	.	G	C	557.06	PASS	AF=0.727273;AO=47;DP=66;FAO=48;FDP=66;FR=.;FRO=18;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.00280555;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=235.367;QD=33.7613;RBI=0.00718495;REFB=-0.0110802;REVB=0.00661456;RO=16;SAF=25;SAR=22;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0445286;STB=0.526571;STBP=0.456;TYPE=snp;VARB=0.00413623;OID=.;OPOS=54744799;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:16:18:47:48:0.727273:22:25:7:9:22:26:8:10
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chr19	54782919	.	C	T	387.46	PASS	AF=0.513158;AO=39;DP=77;FAO=39;FDP=76;FR=.;FRO=37;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=0.0208698;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.966;QD=20.3924;RBI=0.0281366;REFB=-0.0230805;REVB=-0.0188711;RO=37;SAF=19;SAR=20;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0468133;STB=0.525948;STBP=0.66;TYPE=snp;VARB=0.0285814;OID=.;OPOS=54782919;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:76:37:37:39:39:0.513158:20:19:20:17:20:19:20:17
chr19	54783375	.	T	A	1844.15	PASS	AF=0.991803;AO=120;DP=121;FAO=121;FDP=122;FR=.;FRO=1;FSAF=71;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0109169;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.04;QD=60.4639;RBI=0.0178226;REFB=-0.0236441;REVB=0.0140878;RO=1;SAF=70;SAR=50;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00940532;STB=0.50495;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=-0.0001325;OID=.;OPOS=54783375;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:121:122:1:1:120:121:0.991803:50:70:0:1:50:71:0:1
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chr19	55176535	.	C	T	245.48	PASS	AF=0.521739;AO=15;DP=48;FAO=24;FDP=46;FR=.,HEALED;FRO=21;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=-0.00237235;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.124;QD=21.3456;RBI=0.0782232;REFB=0.0205827;REVB=-0.0781872;RO=21;SAF=10;SAR=5;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102929;STB=0.55551;STBP=0.442;TYPE=snp;VARB=-0.0187882;OID=.;OPOS=55176535;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:46:21:21:15:24:0.521739:5:10:12:9:12:12:13:8
chr19	55177731	.	C	T	56.29	PASS	AF=0.4;AO=8;DP=20;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.000734311;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.426;QD=11.2571;RBI=0.0651009;REFB=-0.0257497;REVB=0.0650968;RO=12;SAF=7;SAR=1;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.399995;STB=0.749249;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.0619185;OID=.;OPOS=55177731;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:20:20:12:12:8:8:0.4:1:7:7:5:1:7:7:5
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chr19	55237677	.	C	T	620.97	PASS	AF=0.933333;AO=42;DP=45;FAO=42;FDP=45;FR=.;FRO=3;FSAF=16;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0190487;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.275;QD=55.1971;RBI=0.0215121;REFB=-0.0550187;REVB=0.00999585;RO=3;SAF=16;SAR=26;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00631525;STB=0.503369;STBP=0.924;TYPE=snp;VARB=0.00391178;OID=.;OPOS=55237677;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:45:45:3:3:42:42:0.933333:26:16:1:2:26:16:1:2
chr19	55239223	.	G	A	727.18	PASS	AF=1;AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00534749;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.107;QD=57.034;RBI=0.0175033;REFB=0;REVB=0.0166665;RO=0;SAF=22;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.93412e-05;OID=.;OPOS=55239223;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:51:0:0:51:51:1:29:22:0:0:29:22:0:0
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chr19	55258778	.	G	A	183.67	PASS	AF=0.228346;AO=29;DP=127;FAO=29;FDP=127;FR=.;FRO=98;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=59;FSRR=39;FWDB=-0.0315003;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.747;QD=5.78485;RBI=0.0332169;REFB=-0.0091038;REVB=-0.0105402;RO=97;SAF=14;SAR=15;SRF=59;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157677;STB=0.591511;STBP=0.261;TYPE=snp;VARB=0.0543019;OID=.;OPOS=55258778;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:127:127:97:98:29:29:0.228346:15:14:59:38:15:14:59:39
chr19	55258830	.	CG	TA	249.4	PASS	AF=0.245161;AO=38;DP=158;FAO=38;FDP=155;FR=.;FRO=117;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=66;FSRR=51;FWDB=0.00894951;FXX=0.0189861;HRUN=2;LEN=2;MLLD=173.919;QD=6.43602;RBI=0.0120262;REFB=-0.000654739;REVB=-0.00803339;RO=116;SAF=15;SAR=23;SRF=66;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.215835;STB=0.626574;STBP=0.085;TYPE=mnp;VARB=0.00162537;OID=.;OPOS=55258830;OREF=CG;OALT=TA;OMAPALT=TA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:158:155:116:117:38:38:0.245161:23:15:66:50:23:15:66:51
chr19	55266447	.	A	G	56.25	PASS	AF=0.4;AO=8;DP=20;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=11;FSRR=1;FWDB=-0.00435765;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.836;QD=11.2508;RBI=0.0195904;REFB=-0.0166413;REVB=0.0190996;RO=12;SAF=7;SAR=1;SRF=11;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105261;STB=0.562358;STBP=0.809;TYPE=snp;VARB=0.0244961;OID=.;OPOS=55266447;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:20:20:12:12:8:8:0.4:1:7:11:1:1:7:11:1
chr19	55275348	.	C	T	45.43	PASS	AF=0.0909091;AO=13;DP=142;FAO=13;FDP=143;FR=.;FRO=130;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=59;FSRR=71;FWDB=-0.00204129;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=284.618;QD=1.27078;RBI=0.00289324;REFB=-3.51641e-05;REVB=0.00205036;RO=129;SAF=4;SAR=9;SRF=59;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180231;STB=0.639012;STBP=0.324;TYPE=snp;VARB=0.000334285;OID=.;OPOS=55275348;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:142:143:129:130:13:13:0.0909091:9:4:59:70:9:4:59:71
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chr19	55284943	.	CA	AT	30.81	PASS	AF=0.0888889;AO=8;DP=90;FAO=8;FDP=90;FR=.;FRO=82;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=37;FSRR=45;FWDB=0.0101956;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=55.0271;QD=1.36933;RBI=0.033533;REFB=-0.00442075;REVB=-0.0319455;RO=80;SAF=4;SAR=4;SRF=35;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0713145;STB=0.544334;STBP=0.829;TYPE=mnp;VARB=0.0334924;OID=.;OPOS=55284943;OREF=CA;OALT=AT;OMAPALT=AT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:90:90:80:82:8:8:0.0888889:4:4:35:45:4:4:37:45
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chr19	55328959	.	G	T	1171.91	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00532715;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=185.683;QD=60.8782;RBI=0.0053409;REFB=0;REVB=0.000383013;RO=0;SAF=33;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.58027e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.09174e-05;OID=.;OPOS=55328959;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:44:33:0:0:44:33:0:0
chr19	55329783	.	A	G	51.88	PASS	AF=0.235294;AO=8;DP=34;FAO=8;FDP=34;FR=.;FRO=26;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=18;FSRR=8;FWDB=-0.0110976;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=105.613;QD=6.10298;RBI=0.0397156;REFB=-0.00312223;REVB=-0.0381336;RO=25;SAF=4;SAR=4;SRF=17;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.215733;STB=0.646723;STBP=0.39;TYPE=snp;VARB=0.0373343;OID=.;OPOS=55329783;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:51:34:34:25:26:8:8:0.235294:4:4:17:8:4:4:18:8
chr19	55329822	.	A	C	104.38	PASS	AF=0.325;AO=13;DP=40;FAO=13;FDP=40;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=-0.0248156;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.0797;QD=10.4376;RBI=0.0269829;REFB=-0.0116316;REVB=-0.0105955;RO=27;SAF=6;SAR=7;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105416;STB=0.563122;STBP=0.596;TYPE=snp;VARB=0.0357229;OID=.;OPOS=55329822;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:27:27:13:13:0.325:7:6:15:12:7:6:15:12
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chr19	55329934	.	A	G	85.53	PASS	AF=0.366667;AO=10;DP=29;FAO=11;FDP=30;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.0126037;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=302.206;QD=11.404;RBI=0.0191631;REFB=0.00170678;REVB=-0.014435;RO=19;SAF=6;SAR=4;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13765;STB=0.604745;STBP=0.379;TYPE=snp;VARB=-0.00320359;OID=.;OPOS=55329934;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:29:30:19:19:10:11:0.366667:4:6:9:10:4:7:9:10
chr19	55331287	.	G	T	382.22	PASS	AF=0.506494;AO=39;DP=77;FAO=39;FDP=77;FR=.;FRO=38;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=0.00279871;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=243.471;QD=19.8558;RBI=0.0290979;REFB=-0.0101811;REVB=0.028963;RO=38;SAF=23;SAR=16;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0810252;STB=0.545;STBP=0.473;TYPE=snp;VARB=0.00963127;OID=.;OPOS=55331287;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:38:38:39:39:0.506494:16:23:19:19:16:23:19:19
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chr19	55501579	.	A	C	113.31	PASS	AF=0.297872;AO=14;DP=45;FAO=14;FDP=47;FR=.;FRO=33;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=-0.0265276;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.652;QD=9.64313;RBI=0.0339308;REFB=-0.0187395;REVB=-0.0211562;RO=31;SAF=6;SAR=8;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0108006;STB=0.503101;STBP=0.998;TYPE=snp;VARB=0.0422142;OID=.;OPOS=55501579;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:47:31:33:14:14:0.297872:8:6:13:18:8:6:14:19
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chr19	55512232	.	C	A	124.38	PASS	AF=0.342105;AO=12;DP=37;FAO=13;FDP=38;FR=.,HEALED;FRO=22;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=-0.018937;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.726;QD=13.0925;RBI=0.0191192;REFB=-0.0103536;REVB=0.00263305;RO=16;SAF=6;SAR=6;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.184269;STB=0.580663;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.0164006;OID=.;OPOS=55512232;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:38:16:22:12:13:0.342105:6:6:5:11:6:7:9:13
chr19	55525894	.	G	A	44.76	PASS	AF=0.269231;AO=6;DP=25;FAO=7;FDP=26;FR=.;FRO=19;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.0155313;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=114.779;QD=6.88625;RBI=0.0155919;REFB=-0.0113157;REVB=0.00137278;RO=19;SAF=2;SAR=4;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.335001;STB=0.744008;STBP=0.165;TYPE=snp;VARB=0.0242222;OID=.;OPOS=55525894;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:25:26:19:19:6:7:0.269231:4:2:12:7:5:2:12:7
chr19	55526345	.	T	G	93.32	PASS	AF=0.578947;AO=11;DP=19;FAO=11;FDP=19;FR=.;FRO=8;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=0.00396526;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=302.86;QD=19.646;RBI=0.0208675;REFB=-0.0163694;REVB=-0.0204873;RO=8;SAF=8;SAR=3;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14905;STB=0.584277;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.0125569;OID=.;OPOS=55526345;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:19:19:8:8:11:11:0.578947:3:8:7:1:3:8:7:1
chr19	55526359	.	A	T	120.16	PASS	AF=0.65;AO=13;DP=20;FAO=13;FDP=20;FR=.;FRO=7;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=0.0306663;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.208;QD=24.0312;RBI=0.0636262;REFB=-0.0525396;REVB=-0.0557483;RO=7;SAF=10;SAR=3;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0810804;STB=0.545388;STBP=0.713;TYPE=snp;VARB=0.0385222;OID=.;OPOS=55526359;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:20:20:7:7:13:13:0.65:3:10:6:1:3:10:6:1
chr19	55526373	.	G	C	143.04	PASS	AF=0.6;AO=14;DP=24;FAO=15;FDP=25;FR=.;FRO=10;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=-0.0219301;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=130.94;QD=22.8869;RBI=0.0310629;REFB=-0.0191465;REVB=-0.0219994;RO=10;SAF=10;SAR=4;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0127847;STB=0.516756;STBP=0.906;TYPE=snp;VARB=0.00873289;OID=.;OPOS=55526373;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:24:25:10:10:14:15:0.6:4:10:7:3:4:11:7:3
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chr19	55598724	.	A	G	105.79	PASS	AF=0.351351;AO=13;DP=37;FAO=13;FDP=37;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=-0.0257664;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.7471;QD=11.437;RBI=0.11466;REFB=-0.026531;REVB=-0.111727;RO=24;SAF=10;SAR=3;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.469525;STB=0.778266;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.0409001;OID=.;OPOS=55598724;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:24:24:13:13:0.351351:3:10:8:16:3:10:8:16
chr19	55614923	.	T	C	79.22	PASS	AF=1;AO=8;DP=9;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0256843;FXX=0.110988;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.504;QD=39.6104;RBI=0.0391879;REFB=0;REVB=0.0295974;RO=0;SAF=5;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00420601;OID=.;OPOS=55614923;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:8:0:0:8:8:1:3:5:0:0:3:5:0:0
chr19	55644325	.	A	C	191.21	PASS	AF=1;AO=14;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0522756;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.4545;QD=47.8026;RBI=0.0663885;REFB=0;REVB=-0.040923;RO=0;SAF=5;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00095195;OID=.;OPOS=55644325;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:14:16:1:9:5:0:0:10:6:0:0
chr19	55671337	.	C	T	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0291747;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.991;QD=51.9162;RBI=0.0291922;REFB=0;REVB=-0.00100977;RO=0;SAF=7;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000372664;OID=.;OPOS=55671337;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:14:7:0:0:14:7:0:0
chr19	55699454	.	T	C	919.92	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0241995;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.4353;QD=58.4076;RBI=0.077224;REFB=0;REVB=-0.0733344;RO=0;SAF=31;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000365084;OID=.;OPOS=55699454;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:32:31:0:0:32:31:0:0
chr19	55702910	.	C	A	236.49	PASS	AF=0.388889;AO=28;DP=72;FAO=28;FDP=72;FR=.;FRO=44;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=31;FSRR=13;FWDB=0.0285685;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.3396;QD=13.1383;RBI=0.0288896;REFB=-0.00784933;REVB=0.00429549;RO=43;SAF=17;SAR=11;SRF=31;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131173;STB=0.564059;STBP=0.438;TYPE=snp;VARB=0.0132285;OID=.;OPOS=55702910;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:43:44:28:28:0.388889:11:17:31:12:11:17:31:13
chr19	55703237	.	C	CG,G	86.28	PASS	AF=0.37037,0.0740741;AO=9,2;DP=28;FAO=10,2;FDP=27;FR=.;FRO=15;FSAF=6,2;FSAR=4,0;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.0290625,-0.0167945;FXX=0;HRUN=2,1;LEN=1,1;MLLD=23.4021,198.776;QD=12.7829;RBI=0.0881379,0.0173086;REFB=0.00019469,0.00488704;REVB=-0.0832085,0.00418696;RO=16;SAF=5,2;SAR=4,0;SRF=8;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0589112,0.534299;STB=0.580483,0.994743;STBP=0.527,0.174;TYPE=ins,snp;VARB=-0.0388209,0.011011;OID=.,.;OPOS=55703238,55703237;OREF=-,C;OALT=G,G;OMAPALT=CG,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:70:28:27:16:15:9,2:10,2:0.37037,0.0740741:4,0:5,2:8:8:4,0:6,2:7:8
chr19	55716800	.	A	G	477.77	PASS	AF=0.427419;AO=53;DP=124;FAO=53;FDP=124;FR=.;FRO=71;FSAF=29;FSAR=24;FSRF=35;FSRR=36;FWDB=-0.00349075;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.388;QD=15.4121;RBI=0.0126521;REFB=-0.00794502;REVB=-0.012161;RO=71;SAF=29;SAR=24;SRF=35;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0555021;STB=0.531124;STBP=0.585;TYPE=snp;VARB=0.0109623;OID=.;OPOS=55716800;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:124:124:71:71:53:53:0.427419:24:29:35:36:24:29:35:36
chr19	55738634	.	T	C	759.38	PASS	AF=1;AO=50;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=34;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108564;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.8947;QD=56.2501;RBI=0.148271;REFB=0;REVB=0.147873;RO=0;SAF=34;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00259533;OID=.;OPOS=55738634;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:50:54:1:16:34:0:0:20:34:0:0
chr19	55739689	.	G	A	1456.88	PASS	AF=0.989362;AO=93;DP=94;FAO=93;FDP=94;FR=.;FRO=1;FSAF=54;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0113685;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=123.592;QD=61.9949;RBI=0.0119592;REFB=-0.0918076;REVB=-0.0037122;RO=1;SAF=54;SAR=39;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00869954;STB=0.504586;STBP=0.493;TYPE=snp;VARB=1.58405e-05;OID=.;OPOS=55739689;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:94:94:1:1:93:93:0.989362:39:54:1:0:39:54:1:0
chr19	55791091	.	C	T	371.76	PASS	AF=1;AO=25;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0248218;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.682;QD=55.0755;RBI=0.028727;REFB=0;REVB=0.0144609;RO=0;SAF=13;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.20331e-05;OID=.;OPOS=55791091;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:27:0:0:25:27:1:12:13:0:0:12:15:0:0
chr19	55856083	.	T	C	525.29	PASS	AF=1;AO=35;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.008676;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.335;QD=58.366;RBI=0.027852;REFB=0;REVB=-0.0264662;RO=0;SAF=20;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.24286e-05;OID=.;OPOS=55856083;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:35:36:1:15:20:0:0:15:21:0:0
chr19	55856211	.	C	T	613.46	PASS	AF=0.888889;AO=48;DP=54;FAO=48;FDP=54;FR=.;FRO=6;FSAF=16;FSAR=32;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=0.00212956;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=134.87;QD=45.4414;RBI=0.0156358;REFB=-0.120625;REVB=0.0154901;RO=5;SAF=16;SAR=32;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126447;STB=0.578913;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.00199221;OID=.;OPOS=55856211;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:54:54:5:6:48:48:0.888889:32:16:5:0:32:16:6:0
chr19	55859439	.	C	A	785.88	PASS	AF=1;AO=39;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.035635;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.792;QD=64.1538;RBI=0.0359224;REFB=0;REVB=-0.00453452;RO=0;SAF=18;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.34792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.66549e-05;OID=.;OPOS=55859439;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:39:49:1:21:18:0:0:27:22:0:0
chr19	55870104	.	G	C	1264.75	PASS	AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00441963;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=214.993;QD=61.6953;RBI=0.00450265;REFB=0;REVB=-0.000860659;RO=0;SAF=49;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.22047e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.66747e-06;OID=.;OPOS=55870104;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:33:49:0:0:33:49:0:0
chr19	55870289	.	C	T	470.14	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0339675;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.0998;QD=56.987;RBI=0.0415581;REFB=0;REVB=0.0239434;RO=0;SAF=15;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00101729;OID=.;OPOS=55870289;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:33:0:0:32:33:1:17:15:0:0:18:15:0:0
chr19	55870351	.	T	C	198.42	PASS	AF=1;AO=16;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0627068;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.948;QD=46.6864;RBI=0.0637342;REFB=0;REVB=-0.0113975;RO=0;SAF=8;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000148479;OID=.;OPOS=55870351;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:16:17:1:8:8:0:0:8:9:0:0
chr19	55870600	.	C	G	299.53	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0951253;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135;QD=52.0922;RBI=0.113286;REFB=0;REVB=0.0615219;RO=0;SAF=15;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000851701;OID=.;OPOS=55870600;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:23:0:0:20:23:1:5:15:0:0:8:15:0:0
chr19	55871019	.	A	G	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.023472;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.9581;QD=35.5758;RBI=0.0347239;REFB=0;REVB=-0.0255894;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.004284;OID=.;OPOS=55871019;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:3:4:0:0:3:4:0:0
chr19	55872397	.	A	G	88.22	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0605805;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.383;QD=39.2068;RBI=0.0623421;REFB=0;REVB=0.0147154;RO=0;SAF=5;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00172116;OID=.;OPOS=55872397;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:4:5:0:0:4:5:0:0
chr19	55872531	.	C	G	413.61	PASS	AF=0.941176;AO=30;DP=34;FAO=32;FDP=34;FR=.;FRO=2;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00768753;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=53.4645;QD=48.6599;RBI=0.119878;REFB=-0.0742999;REVB=0.119632;RO=2;SAF=16;SAR=14;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00389373;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00701306;OID=.;OPOS=55872531;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:34:34:2:2:30:32:0.941176:14:16:1:1:16:16:1:1
chr19	55872566	.	A	G	483.34	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.038809;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.676;QD=58.5866;RBI=0.0392135;REFB=0;REVB=0.00561795;RO=0;SAF=14;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.71297e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000446126;OID=.;OPOS=55872566;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:19:14:0:0:19:14:0:0
chr19	55873642	.	C	T	835.3	PASS	AF=1;AO=54;DP=55;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0202011;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.315;QD=56.6303;RBI=0.0214934;REFB=0;REVB=0.00734054;RO=0;SAF=30;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00223688;OID=.;OPOS=55873642;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:55:59:0:0:54:59:1:24:30:0:0:24:35:0:0
chr19	55876989	.	CA	C	89.05	PASS	AF=0.592593;AO=14;DP=27;FAO=16;FDP=27;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=14;FSRF=2;FSRR=9;FWDB=0.168341;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=14.9538;QD=13.1928;RBI=0.173465;REFB=-0.0309108;REVB=0.0418488;RO=13;SAF=0;SAR=14;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.804121;STB=0.548954;STBP=0.708;TYPE=del;VARB=0.0513763;OID=.;OPOS=55876990;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.592593:14:27:16:27:11:2:14:2:9:56:13:0:14:4:9
chr19	55877231	.	C	T	162.07	PASS	AF=0.882353;AO=15;DP=16;FAO=15;FDP=17;FR=.;FRO=2;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.024293;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=56.5043;QD=38.1331;RBI=0.0361836;REFB=-0.0742556;REVB=0.0268161;RO=1;SAF=10;SAR=5;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0826301;STB=0.583219;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=0.00401019;OID=.;OPOS=55877231;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:16:17:1:2:15:15:0.882353:5:10:0:1:5:10:0:2
chr19	55879872	.	C	T	609.54	PASS	AF=0.92;AO=46;DP=50;FAO=46;FDP=50;FR=.;FRO=4;FSAF=17;FSAR=29;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0173234;FXX=0.019604;HRUN=5;LEN=1;MLLD=173.353;QD=48.7634;RBI=0.0403895;REFB=-0.195651;REVB=0.0364858;RO=2;SAF=17;SAR=29;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.010919;STB=0.511127;STBP=0.647;TYPE=snp;VARB=0.00144466;OID=.;OPOS=55879872;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:17:50:50:2:4:46:46:0.92:29:17:1:1:29:17:2:2
chr19	55913038	.	C	T	161.49	PASS	AF=0.5;AO=17;DP=34;FAO=17;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=4;FWDB=0.0270509;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.373;QD=18.9987;RBI=0.0738208;REFB=0.00321614;REVB=0.068686;RO=17;SAF=11;SAR=6;SRF=13;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118511;STB=0.566855;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=-0.00231919;OID=.;OPOS=55913038;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:17:17:17:17:0.5:6:11:13:4:6:11:13:4
chr19	55995413	.	A	G	311.87	PASS	AF=0.561404;AO=31;DP=55;FAO=32;FDP=57;FR=.;FRO=25;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.00144903;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.246;QD=21.8854;RBI=0.0205718;REFB=-0.0509832;REVB=-0.0205207;RO=23;SAF=17;SAR=14;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.013118;STB=0.501113;STBP=0.999;TYPE=snp;VARB=0.035805;OID=.;OPOS=55995413;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:57:23:25:31:32:0.561404:14:17:13:10:14:18:14:11
chr19	56011915	.	G	A	277.3	PASS	AF=0.521739;AO=24;DP=46;FAO=24;FDP=46;FR=.,HEALED;FRO=20;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.0376942;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.6;QD=24.1127;RBI=0.0466641;REFB=0.0101432;REVB=0.0275079;RO=20;SAF=10;SAR=14;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0688524;STB=0.538429;STBP=0.623;TYPE=snp;VARB=0.00615145;OID=.;OPOS=56011915;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:20:20:24:24:0.521739:14:10:10:10:14:10:10:10
chr19	56024519	.	T	C	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.034308;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.388;QD=53.2772;RBI=0.0383126;REFB=0;REVB=0.0170533;RO=0;SAF=9;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.84921e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000152479;OID=.;OPOS=56024519;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:14:9:0:0:14:9:0:0
chr19	56041255	.	C	G	223.29	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00714825;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.256;QD=49.6191;RBI=0.0389936;REFB=0;REVB=0.0383328;RO=0;SAF=11;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000190505;OID=.;OPOS=56041255;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:18:0:0:17:18:1:6:11:0:0:7:11:0:0
chr19	56047448	.	A	G	228.78	PASS	AF=0.358974;AO=28;DP=78;FAO=28;FDP=78;FR=.;FRO=50;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=33;FWDB=0.00374738;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.508;QD=11.7323;RBI=0.00740507;REFB=-0.014991;REVB=-0.00638688;RO=50;SAF=14;SAR=14;SRF=17;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.178539;STB=0.602494;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.0210369;OID=.;OPOS=56047448;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:50:50:28:28:0.358974:14:14:17:33:14:14:17:33
chr19	56047544	.	G	T	919.79	PASS	AF=0.614815;AO=78;DP=136;FAO=83;FDP=135;FR=.;FRO=52;FSAF=29;FSAR=54;FSRF=30;FSRR=22;FWDB=0.00986375;FXX=0.0357117;HRUN=3;LEN=1;MLLD=142.194;QD=27.2529;RBI=0.0168713;REFB=-0.0448316;REVB=-0.0136875;RO=41;SAF=28;SAR=50;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0707637;STB=0.591072;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.0220701;OID=.;OPOS=56047544;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:136:135:41:52:78:83:0.614815:50:28:19:22:54:29:30:22
chr19	56114045	.	C	T	276.57	PASS	AF=1;AO=21;DP=22;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0444749;FXX=0.0454339;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.337;QD=52.6809;RBI=0.0698854;REFB=0;REVB=0.053907;RO=0;SAF=7;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000650793;OID=.;OPOS=56114045;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:21:0:0:21:21:1:14:7:0:0:14:7:0:0
chr19	56114237	.	G	A	1049.77	PASS	AF=0.986111;AO=68;DP=69;FAO=71;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0362397;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.5382;QD=58.3207;RBI=0.168025;REFB=-0.0304525;REVB=0.164071;RO=1;SAF=31;SAR=37;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0126038;STB=0.506171;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.00254365;OID=.;OPOS=56114237;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:69:72:1:1:68:71:0.986111:37:31:0:1:40:31:0:1
chr19	56154518	.	GTTT	G	100.65	PASS	AF=0.386364;AO=15;DP=43;FAO=17;FDP=44;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=0.0214343;FXX=0;HRUN=3;LEN=3;MLLD=145.215;QD=9.15015;RBI=0.0285371;REFB=-0.0237078;REVB=-0.0188398;RO=24;SAF=8;SAR=7;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.209085;STB=0.631428;STBP=0.191;TYPE=del;VARB=0.0306243;OID=.;OPOS=56154519;OREF=TTT;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.386364:15:43:17:44:27:10:7:10:17:99:24:8:7:8:16
chr19	56160399	.	T	C	670.23	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0338944;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.4874;QD=62.3471;RBI=0.03418;REFB=0;REVB=0.00440913;RO=0;SAF=22;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000308073;OID=.;OPOS=56160399;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:21:22:0:0:21:22:0:0
chr19	56162776	.	C	T	94.08	PASS	AF=0.307692;AO=12;DP=40;FAO=12;FDP=39;FR=.;FRO=27;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=0.0550201;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.028;QD=9.64939;RBI=0.0559023;REFB=-0.0041117;REVB=-0.00989227;RO=26;SAF=5;SAR=7;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0950042;STB=0.570697;STBP=0.553;TYPE=snp;VARB=0.016742;OID=.;OPOS=56162776;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:40:39:26:27:12:12:0.307692:7:5:13:13:7:5:14:13
chr19	56180968	.	C	T	148.64	PASS	AF=0.345455;AO=19;DP=55;FAO=19;FDP=55;FR=.;FRO=36;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=26;FWDB=0.0172047;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.171;QD=10.81;RBI=0.0172565;REFB=-0.00779855;REVB=0.00133711;RO=36;SAF=8;SAR=11;SRF=10;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170755;STB=0.599093;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=0.0171102;OID=.;OPOS=56180968;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:36:36:19:19:0.345455:11:8:10:26:11:8:10:26
chr19	56241265	.	A	G	708.52	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0145916;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.804;QD=62.9792;RBI=0.020729;REFB=0;REVB=0.0147234;RO=0;SAF=13;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.88908e-07;OID=.;OPOS=56241265;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:32:13:0:0:32:13:0:0
chr19	56274086	.	G	A	65.51	PASS	AF=0.183333;AO=11;DP=60;FAO=11;FDP=60;FR=.;FRO=49;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=22;FSRR=27;FWDB=-0.0025576;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.65;QD=4.36711;RBI=0.0145882;REFB=0.00208303;REVB=0.0143622;RO=48;SAF=6;SAR=5;SRF=21;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132859;STB=0.578172;STBP=0.603;TYPE=snp;VARB=-0.012112;OID=.;OPOS=56274086;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:60:60:48:49:11:11:0.183333:5:6:21:27:5:6:22:27
chr19	56283289	.	A	G	78.88	PASS	AF=0.818182;AO=9;DP=11;FAO=9;FDP=11;FR=.;FRO=2;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.030677;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.6508;QD=28.6825;RBI=0.0995634;REFB=0.047974;REVB=-0.0947195;RO=2;SAF=7;SAR=2;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118266;STB=0.567407;STBP=0.554;TYPE=snp;VARB=-0.0257921;OID=.;OPOS=56283289;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:11:11:2:2:9:9:0.818182:2:7:1:1:2:7:1:1
chr19	56284090	.	G	A	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00916331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.194;QD=52.6121;RBI=0.0563261;REFB=0;REVB=0.0555757;RO=0;SAF=10;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000549163;OID=.;OPOS=56284090;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:12:10:0:0:12:10:0:0
chr19	56284230	.	A	G	418.16	PASS	AF=0.5;AO=42;DP=84;FAO=42;FDP=84;FR=.;FRO=42;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=0.0283472;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.943;QD=19.9124;RBI=0.0315992;REFB=-0.00469786;REVB=-0.0139623;RO=41;SAF=23;SAR=19;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0317305;STB=0.523907;STBP=0.648;TYPE=snp;VARB=0.00433748;OID=.;OPOS=56284230;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:41:42:42:42:0.5:19:23:21:20:19:23:21:21
chr19	56307583	.	A	G	642.84	PASS	AF=0.976744;AO=42;DP=44;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0199401;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.048;QD=59.7991;RBI=0.0358165;REFB=-0.148871;REVB=0.0297526;RO=1;SAF=22;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0208598;STB=0.511106;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.000945232;OID=.;OPOS=56307583;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:44:43:1:1:42:42:0.976744:20:22:1:0:20:22:1:0
chr19	56320200	.	C	T	467.26	PASS	AF=0.42623;AO=52;DP=123;FAO=52;FDP=122;FR=.;FRO=70;FSAF=23;FSAR=29;FSRF=27;FSRR=43;FWDB=0.026884;FXX=0.00812942;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.3316;QD=15.3199;RBI=0.0690257;REFB=0.0063723;REVB=-0.0635751;RO=71;SAF=23;SAR=29;SRF=28;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0503206;STB=0.533149;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=-0.0114925;OID=.;OPOS=56320200;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:123:122:71:70:52:52:0.42623:29:23:28:43:29:23:27:43
chr19	56321295	.	G	A	115.99	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0211251;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.2527;QD=42.1779;RBI=0.0571504;REFB=0;REVB=-0.0531027;RO=0;SAF=7;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00186598;OID=.;OPOS=56321295;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:4:7:0:0:4:7:0:0
chr19	56321414	.	C	A	376.56	PASS	AF=1;AO=24;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0287932;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.388;QD=55.7867;RBI=0.119652;REFB=0;REVB=0.116136;RO=0;SAF=14;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00161482;OID=.;OPOS=56321414;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:24:27:1:10:14:0:0:12:15:0:0
chr19	56369189	.	G	A	147.23	PASS	AF=0.470588;AO=16;DP=34;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.0287393;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.845;QD=17.321;RBI=0.0293655;REFB=0.00650487;REVB=-0.00603187;RO=18;SAF=8;SAR=8;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102873;STB=0.558751;STBP=0.549;TYPE=snp;VARB=-0.00562896;OID=.;OPOS=56369189;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:18:18:16:16:0.470588:8:8:7:11:8:8:7:11
chr19	56369215	.	C	T	145.02	PASS	AF=0.576923;AO=15;DP=26;FAO=15;FDP=26;FR=.;FRO=11;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.00390394;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.156;QD=22.3113;RBI=0.0247731;REFB=-0.0256185;REVB=0.0244635;RO=11;SAF=8;SAR=7;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00912176;STB=0.505148;STBP=0.957;TYPE=snp;VARB=0.0252687;OID=.;OPOS=56369215;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:26:26:11:11:15:15:0.576923:7:8:6:5:7:8:6:5
chr19	56369314	.	G	A	59.38	PASS	AF=0.615385;AO=7;DP=13;FAO=8;FDP=13;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.00440089;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.657;QD=18.2701;RBI=0.0481154;REFB=0.00360844;REVB=0.0479137;RO=5;SAF=5;SAR=2;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.363051;STB=0.659985;STBP=0.198;TYPE=snp;VARB=-0.00208433;OID=.;OPOS=56369314;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:13:13:5:5:7:8:0.615385:2:5:1:4:3:5:1:4
chr19	56369593	.	T	C	115.04	PASS	AF=0.541667;AO=13;DP=24;FAO=13;FDP=24;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=-0.0263954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.632;QD=19.1726;RBI=0.0331451;REFB=-0.0183515;REVB=0.0200469;RO=11;SAF=6;SAR=7;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139543;STB=0.579497;STBP=0.434;TYPE=snp;VARB=0.0101411;OID=.;OPOS=56369593;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:24:24:11:11:13:13:0.541667:7:6:7:4:7:6:7:4
chr19	56373462	.	G	A	766.44	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0228149;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.83;QD=63.8701;RBI=0.0350533;REFB=0;REVB=0.0266122;RO=0;SAF=23;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000146488;OID=.;OPOS=56373462;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:25:23:0:0:25:23:0:0
chr19	56392920	.	C	T	1026.4	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.018251;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.937;QD=59.5015;RBI=0.0185798;REFB=0;REVB=-0.00347991;RO=0;SAF=30;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.24847e-05;OID=.;OPOS=56392920;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:39:30:0:0:39:30:0:0
chr19	56423254	.	G	A	96.2	PASS	AF=0.375;AO=12;DP=32;FAO=12;FDP=32;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=-0.0322121;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.544;QD=12.0244;RBI=0.0332314;REFB=0.00602929;REVB=-0.00816733;RO=19;SAF=7;SAR=5;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110534;STB=0.543407;STBP=0.804;TYPE=snp;VARB=-0.0127028;OID=.;OPOS=56423254;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:32:32:19:20:12:12:0.375:5:7:13:6:5:7:13:7
chr19	56423668	.	G	A	37.78	PASS	AF=0.375;AO=6;DP=16;FAO=6;FDP=16;FR=.;FRO=10;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.00992992;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.187;QD=9.44475;RBI=0.0168362;REFB=-0.00567145;REVB=0.0135961;RO=10;SAF=1;SAR=5;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195996;STB=0.62453;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=0.0144234;OID=.;OPOS=56423668;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:16:16:10:10:6:6:0.375:5:1:3:7:5:1:3:7
chr19	56423692	.	C	T	37.12	PASS	AF=0.333333;AO=6;DP=18;FAO=6;FDP=18;FR=.;FRO=12;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=0.0204091;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.865;QD=8.24911;RBI=0.0251027;REFB=-0.00266577;REVB=0.0146154;RO=11;SAF=1;SAR=5;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.272391;STB=0.657294;STBP=0.452;TYPE=snp;VARB=0.0386212;OID=.;OPOS=56423692;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:18:18:11:12:6:6:0.333333:5:1:4:7:5:1:4:8
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chr19	56424443	.	T	C	30.1	PASS	AF=0.416667;AO=5;DP=12;FAO=5;FDP=12;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.00613482;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.538;QD=10.0339;RBI=0.0348664;REFB=-0.0132222;REVB=-0.0343224;RO=7;SAF=3;SAR=2;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15966;STB=0.5996;STBP=0.662;TYPE=snp;VARB=0.0165351;OID=.;OPOS=56424443;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:12:12:7:7:5:5:0.416667:2:3:3:4:2:3:3:4
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chr19	56477687	.	A	G	545.2	PASS	AF=0.973684;AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0269117;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=79.4627;QD=57.3895;RBI=0.0271628;REFB=0.0871221;REVB=-0.00368478;RO=1;SAF=21;SAR=16;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0283678;STB=0.515143;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=-0.00210584;OID=.;OPOS=56477687;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:38:38:1:1:37:37:0.973684:16:21:0:1:16:21:0:1
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chr19	56487603	.	A	G	1480.6	PASS	AF=0.990291;AO=87;DP=104;FAO=102;FDP=103;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=51;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0278311;FXX=0.00961446;HRUN=2;LEN=1;MLLD=39.0589;QD=57.499;RBI=0.0975647;REFB=0;REVB=0.093511;RO=0;SAF=49;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000750906;OID=.;OPOS=56487603;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:104:103:0:0:87:102:0.990291:38:49:0:0:51:51:0:0
chr19	56490778	.	C	T	168.69	PASS	AF=0.428571;AO=18;DP=42;FAO=18;FDP=42;FR=.;FRO=24;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=17;FSRR=7;FWDB=0.0103675;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.504;QD=16.0661;RBI=0.01339;REFB=0.0021592;REVB=-0.00847398;RO=24;SAF=14;SAR=4;SRF=17;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0932071;STB=0.553894;STBP=0.599;TYPE=snp;VARB=-0.00296016;OID=.;OPOS=56490778;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:24:24:18:18:0.428571:4:14:17:7:4:14:17:7
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chr19	56511082	.	C	G	538.64	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0145689;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.175;QD=59.8484;RBI=0.0177893;REFB=0;REVB=0.0102081;RO=0;SAF=14;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.48532e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.05088e-05;OID=.;OPOS=56511082;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:36:0:0:34:36:1:20:14:0:0:21:15:0:0
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chr19	56693620	.	C	G	136.15	PASS	AF=0.326923;AO=17;DP=52;FAO=17;FDP=52;FR=.;FRO=35;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=26;FWDB=0.0190372;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.5442;QD=10.4728;RBI=0.0237312;REFB=-0.00257746;REVB=-0.0141688;RO=34;SAF=6;SAR=11;SRF=9;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114096;STB=0.573562;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.00433061;OID=.;OPOS=56693620;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:34:35:17:17:0.326923:11:6:9:25:11:6:9:26
chr19	56702323	.	C	T	315.67	PASS	AF=0.472222;AO=34;DP=72;FAO=34;FDP=72;FR=.;FRO=38;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=7;FSRR=31;FWDB=-0.00564256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.278;QD=17.5371;RBI=0.0169102;REFB=-0.00577012;REVB=-0.015941;RO=38;SAF=12;SAR=22;SRF=7;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186629;STB=0.603361;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=0.00705473;OID=.;OPOS=56702323;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:38:38:34:34:0.472222:22:12:7:31:22:12:7:31
chr19	56717353	.	A	G	249.37	PASS	AF=0.733333;AO=22;DP=30;FAO=22;FDP=30;FR=.;FRO=8;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.0241362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.612;QD=33.2495;RBI=0.0372884;REFB=0.00354412;REVB=0.0284231;RO=8;SAF=12;SAR=10;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0222222;STB=0.512184;STBP=0.826;TYPE=snp;VARB=-0.00211043;OID=.;OPOS=56717353;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:30:30:8:8:22:22:0.733333:10:12:4:4:10:12:4:4
chr19	56718585	.	A	G	689.38	PASS	AF=1;AO=43;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100529;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.702;QD=62.6706;RBI=0.0267256;REFB=0;REVB=-0.0247628;RO=0;SAF=13;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00010782;OID=.;OPOS=56718585;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:43:44:1:30:13:0:0:31:13:0:0
chr19	56719405	.	A	C	48.86	PASS	AF=0.5;AO=7;DP=14;FAO=7;FDP=14;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=-0.0224493;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.433;QD=13.96;RBI=0.0274667;REFB=-0.0361484;REVB=-0.0158256;RO=7;SAF=5;SAR=2;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.361846;STB=0.705463;STBP=0.375;TYPE=snp;VARB=0.0446722;OID=.;OPOS=56719405;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:14:14:7:7:7:7:0.5:2:5:7:0:2:5:7:0
chr19	56719822	.	G	T	152.41	PASS	AF=0.933333;AO=14;DP=15;FAO=14;FDP=15;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-6.46504e-05;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=269.487;QD=40.6419;RBI=0.0117846;REFB=-0.109569;REVB=0.0117844;RO=1;SAF=6;SAR=8;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0698108;STB=0.538406;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=0.00124329;OID=.;OPOS=56719822;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:15:15:1:1:14:14:0.933333:8:6:1:0:8:6:1:0
chr19	56719853	.	C	A	349.2	PASS	AF=1;AO=17;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0469612;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=32.8488;QD=53.7234;RBI=0.0672398;REFB=0;REVB=0.0481232;RO=0;SAF=9;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00467434;OID=.;OPOS=56719853;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:17:26:1:8:9:0:0:12:14:0:0
chr19	56733658	.	T	TG,TTG	33.86	PASS	AF=0,0.333333;AO=4,5;DP=30;FAO=0,8;FDP=24;FR=.;FRO=16;FSAF=0,6;FSAR=0,2;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=-0.12968,-0.0573506;FXX=0;HRUN=6,5;LEN=1,2;MLLD=8.71465,19.3392;QD=5.64303;RBI=0.152485,0.135028;REFB=-0.106593,-0.0892238;REVB=-0.0802182,0.122243;RO=19;SAF=1,5;SAR=3,0;SRF=15;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.564413,0.617375;STB=0.5,0.552494;STBP=1,0.728;TYPE=ins,ins;VARB=0,0.205361;OID=.,.;OPOS=56733659,56733659;OREF=-,-;OALT=G,TG;OMAPALT=TG,TTG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,0.333333:4,5:30:0,8:24:16:0,6:0,2:11:5:31:19:1,5:3,0:15:4
chr19	56827938	.	C	A	353.07	PASS	AF=0.59322;AO=35;DP=59;FAO=35;FDP=59;FR=.;FRO=24;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=-0.0720668;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.5872;QD=23.9368;RBI=0.0844771;REFB=-0.00479972;REVB=-0.0440767;RO=24;SAF=14;SAR=21;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167;STB=0.591784;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=0.00127366;OID=.;OPOS=56827938;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:24:24:35:35:0.59322:21:14:15:9:21:14:15:9
chr19	56888454	.	A	C	130.64	PASS	AF=0.394737;AO=14;DP=37;FAO=15;FDP=38;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=18;FWDB=0.0898212;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.4674;QD=13.7519;RBI=0.0950574;REFB=0.0187771;REVB=0.0311136;RO=22;SAF=6;SAR=8;SRF=4;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.280442;STB=0.654493;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=-0.0213554;OID=.;OPOS=56888454;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:38:22:23:14:15:0.394737:8:6:4:18:8:7:5:18
chr19	56888526	.	A	T	35.78	PASS	AF=0.25;AO=6;DP=24;FAO=6;FDP=24;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=15;FWDB=0.113698;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.125;QD=5.96303;RBI=0.113885;REFB=-0.00224151;REVB=0.00653216;RO=18;SAF=3;SAR=3;SRF=3;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.40571;STB=0.749374;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.0109708;OID=.;OPOS=56888526;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:24:24:18:18:6:6:0.25:3:3:3:15:3:3:3:15
chr19	56895496	.	C	T	156.03	PASS	AF=0.615385;AO=15;DP=26;FAO=16;FDP=26;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=-0.00301056;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.6356;QD=24.0049;RBI=0.0215872;REFB=-0.0435168;REVB=0.0213762;RO=10;SAF=3;SAR=12;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.399186;STB=0.730018;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.00915959;OID=.;OPOS=56895496;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:26:26:10:10:15:16:0.615385:12:3:7:3:13:3:7:3
chr19	56935527	.	A	G	214.27	PASS	AF=0.947368;AO=18;DP=19;FAO=18;FDP=19;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0165225;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.731;QD=45.1099;RBI=0.0180051;REFB=-0.0779907;REVB=0.00715492;RO=1;SAF=9;SAR=9;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0483018;STB=0.526287;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.00156401;OID=.;OPOS=56935527;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:19:19:1:1:18:18:0.947368:9:9:1:0:9:9:1:0
chr19	56953585	.	T	C	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000595144;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=329.415;QD=43.4862;RBI=0.0130961;REFB=0;REVB=-0.0130826;RO=0;SAF=4;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.47503e-05;OID=.;OPOS=56953585;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:8:4:0:0:8:4:0:0
chr19	56953863	.	T	C	1096.05	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00178841;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.1211;QD=60.0574;RBI=0.0261107;REFB=0;REVB=0.0260494;RO=0;SAF=40;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.05346e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000193851;OID=.;OPOS=56953863;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:73:0:0:72:73:1:32:40:0:0:33:40:0:0
chr19	57036653	.	G	A	105.86	PASS	AF=0.6;AO=12;DP=20;FAO=12;FDP=20;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=-0.00984875;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.274;QD=21.1712;RBI=0.0225547;REFB=0.00362249;REVB=0.0202908;RO=8;SAF=6;SAR=6;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176469;STB=0.59984;STBP=0.335;TYPE=snp;VARB=-0.00218923;OID=.;OPOS=57036653;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:20:20:8:8:12:12:0.6:6:6:2:6:6:6:2:6
chr19	57036678	.	G	A	48.23	PASS	AF=0.466667;AO=7;DP=15;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=0.016294;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=131.512;QD=12.8607;RBI=0.0476435;REFB=0.00930579;REVB=-0.0447706;RO=8;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.497472;STB=0.785113;STBP=0.101;TYPE=snp;VARB=-0.003542;OID=.;OPOS=57036678;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:15:15:8:8:7:7:0.466667:3:4:0:8:3:4:0:8
chr19	57058998	.	C	G	230.51	PASS	AF=0.55;AO=22;DP=40;FAO=22;FDP=40;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=-0.031413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.9697;QD=23.0513;RBI=0.0473353;REFB=-0.0169758;REVB=-0.0354098;RO=17;SAF=7;SAR=15;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0218672;STB=0.507805;STBP=0.971;TYPE=snp;VARB=0.0139043;OID=.;OPOS=57058998;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:17:18:22:22:0.55:15:7:5:12:15:7:6:12
chr19	57062047	.	C	T	142.12	PASS	AF=0.363636;AO=16;DP=44;FAO=16;FDP=44;FR=.;FRO=28;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.0230478;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.8155;QD=12.9197;RBI=0.0267239;REFB=-0.00587551;REVB=-0.0135264;RO=27;SAF=8;SAR=8;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0198492;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00556442;OID=.;OPOS=57062047;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:27:28:16:16:0.363636:8:8:14:13:8:8:14:14
chr19	57062073	.	T	C	657.76	PASS	AF=0.977273;AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0118259;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=140.401;QD=59.7965;RBI=0.0330779;REFB=-0.0132187;REVB=-0.0308916;RO=1;SAF=20;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0199809;STB=0.510633;STBP=0.493;TYPE=snp;VARB=4.00327e-05;OID=.;OPOS=57062073;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:44:44:1:1:43:43:0.977273:23:20:0:1:23:20:0:1
chr19	57065189	.	T	C	132.41	PASS	AF=0.320755;AO=17;DP=53;FAO=17;FDP=53;FR=.;FRO=36;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=22;FSRR=14;FWDB=0.0280767;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=66.194;QD=9.99321;RBI=0.033541;REFB=0.00241535;REVB=-0.0183494;RO=36;SAF=12;SAR=5;SRF=22;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121796;STB=0.572775;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=-0.00402216;OID=.;OPOS=57065189;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:36:36:17:17:0.320755:5:12:22:14:5:12:22:14
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chr19	57089050	.	C	T	174.97	PASS	AF=0.413043;AO=18;DP=45;FAO=19;FDP=46;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=-0.00193516;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.658;QD=15.2145;RBI=0.00201928;REFB=-0.00926014;REVB=0.000576758;RO=27;SAF=10;SAR=8;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0386588;STB=0.535925;STBP=0.705;TYPE=snp;VARB=0.0220892;OID=.;OPOS=57089050;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:46:27:27:18:19:0.413043:8:10:14:13:8:11:14:13
chr19	57134257	.	G	T	85.05	PASS	AF=0.666667;AO=10;DP=15;FAO=10;FDP=15;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=-0.0204391;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=219.483;QD=22.6787;RBI=0.0255444;REFB=-0.0252769;REVB=0.0153219;RO=5;SAF=5;SAR=5;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176021;STB=0.599808;STBP=0.33;TYPE=snp;VARB=0.011888;OID=.;OPOS=57134257;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:15:15:5:5:10:10:0.666667:5:5:4:1:5:5:4:1
chr19	57135195	.	G	A	1476.01	PASS	AF=0.980583;AO=101;DP=103;FAO=101;FDP=103;FR=.;FRO=2;FSAF=43;FSAR=58;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0125232;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.498;QD=57.3207;RBI=0.0126173;REFB=0.0103674;REVB=0.00153804;RO=2;SAF=43;SAR=58;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0215516;STB=0.511361;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=-0.000166976;OID=.;OPOS=57135195;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:103:103:2:2:101:101:0.980583:58:43:2:0:58:43:2:0
chr19	57175484	.	A	G	115.97	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00445373;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.275;QD=42.171;RBI=0.107545;REFB=0;REVB=-0.107453;RO=0;SAF=4;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00740555;OID=.;OPOS=57175484;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:7:4:0:0:7:4:0:0
chr19	57176198	.	T	G	1153.34	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0147947;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.662;QD=60.7021;RBI=0.0177281;REFB=0;REVB=0.00976748;RO=0;SAF=45;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.29396e-05;OID=.;OPOS=57176198;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:76:0:0:75:76:1:30:45:0:0:31:45:0:0
chr19	57176304	.	T	C,G	693.82	PASS	AF=0.0444444,0.955556;AO=2,43;DP=45;FAO=2,43;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=0,25;FSAR=2,18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0149445,0.00479672;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=177.049,99.7574;QD=61.6732;RBI=0.0155011,0.0190916;REFB=0,0;REVB=0.00411684,0.0184792;RO=0;SAF=0,25;SAR=2,18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-5.65211e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.051249,0.00198751;OID=.,.;OPOS=57176304,57176304;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:45:45:0:0:2,43:2,43:0.0444444,0.955556:2,18:0,25:0:0:2,18:0,25:0:0
chr19	57176482	.	C	T	1362.08	PASS	AF=0.978261;AO=85;DP=86;FAO=90;FDP=92;FR=.;FRO=2;FSAF=45;FSAR=45;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0403678;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.9091;QD=59.221;RBI=0.0694047;REFB=-0.0755018;REVB=0.0564575;RO=0;SAF=41;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.510867;STBP=0.199;TYPE=snp;VARB=0.00346255;OID=.;OPOS=57176482;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:86:92:0:2:85:90:0.978261:44:41:0:0:45:45:2:0
chr19	57176820	.	C	A	705.88	PASS	AF=1;AO=45;DP=47;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0572437;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.798;QD=61.3809;RBI=0.0580558;REFB=-0.0527783;REVB=0.00967693;RO=1;SAF=17;SAR=28;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0268394;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000532038;OID=.;OPOS=57176820;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:47:46:1:0:45:46:1:28:17:1:0:28:18:0:0
chr19	57176838	.	C	G	546.74	PASS	AF=0.926829;AO=38;DP=41;FAO=38;FDP=41;FR=.;FRO=3;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0520296;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=211.504;QD=53.3402;RBI=0.052278;REFB=-0.135958;REVB=-0.00509019;RO=1;SAF=15;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0199387;STB=0.520628;STBP=0.379;TYPE=snp;VARB=0.000922744;OID=.;OPOS=57176838;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:41:41:1:3:38:38:0.926829:23:15:0:1:23:15:2:1
chr19	57293394	.	A	G	285.96	PASS	AF=0.476923;AO=31;DP=66;FAO=31;FDP=65;FR=.;FRO=34;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=-0.0267963;FXX=0.0151492;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.7501;QD=17.5974;RBI=0.0270817;REFB=0.0185852;REVB=0.00392116;RO=34;SAF=13;SAR=18;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103397;STB=0.557962;STBP=0.42;TYPE=snp;VARB=-0.0168696;OID=.;OPOS=57293394;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:65:34:34:31:31:0.476923:18:13:18:16:18:13:18:16
chr19	57293831	.	G	A	130.23	PASS	AF=0.394737;AO=15;DP=37;FAO=15;FDP=38;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=0.0303069;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.2709;QD=13.7085;RBI=0.0646937;REFB=-0.0227507;REVB=-0.0571556;RO=22;SAF=12;SAR=3;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.393032;STB=0.743835;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.0347503;OID=.;OPOS=57293831;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:38:22:23:15:15:0.394737:3:12:10:12:3:12:10:13
chr19	57325083	.	C	T	191.26	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0177924;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.846;QD=47.8143;RBI=0.0331;REFB=0;REVB=-0.0279113;RO=0;SAF=10;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000153897;OID=.;OPOS=57325083;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:6:10:0:0:6:10:0:0
chr19	57433619	.	C	T	805.17	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0147765;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.455;QD=64.4139;RBI=0.0149271;REFB=0;REVB=-0.00211524;RO=0;SAF=32;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.0347e-05;OID=.;OPOS=57433619;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:18:32:0:0:18:32:0:0
chr19	57641146	.	A	G	93.32	PASS	AF=0.578947;AO=11;DP=19;FAO=11;FDP=19;FR=.;FRO=8;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=0.00547644;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.327;QD=19.646;RBI=0.041297;REFB=-0.00218608;REVB=-0.0409323;RO=8;SAF=9;SAR=2;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.524378;STB=0.801413;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.000896131;OID=.;OPOS=57641146;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:19:19:8:8:11:11:0.578947:2:9:1:7:2:9:1:7
chr19	57641799	.	G	A	41.21	PASS	AF=0.6;AO=5;DP=9;FAO=6;FDP=10;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.00695335;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=288.414;QD=16.4833;RBI=0.0295025;REFB=-0.0236233;REVB=0.0286714;RO=4;SAF=2;SAR=3;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118169;STB=0.538337;STBP=0.881;TYPE=snp;VARB=0.0143002;OID=.;OPOS=57641799;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:9:10:4:4:5:6:0.6:3:2:1:3:4:2:1:3
chr19	57642782	.	C	A	423.41	PASS	AF=0.967742;AO=30;DP=32;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0214285;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.2157;QD=54.6334;RBI=0.0262474;REFB=0.0087221;REVB=0.0151574;RO=0;SAF=16;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.56309e-08;STB=0.515141;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=-0.000868665;OID=.;OPOS=57642782;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:32:31:0:1:30:30:0.967742:14:16:0:0:14:16:1:0
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chr19	57643099	.	G	A	62.39	PASS	AF=0.28125;AO=9;DP=32;FAO=9;FDP=32;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=-0.0712909;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.8086;QD=7.79839;RBI=0.0807369;REFB=0.00215823;REVB=0.0378952;RO=23;SAF=5;SAR=4;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.286424;STB=0.67532;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=-0.00790302;OID=.;OPOS=57643099;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:32:32:23:23:9:9:0.28125:4:5:7:16:4:5:7:16
chr19	57647015	.	A	G	205.0	PASS	AF=0.512195;AO=20;DP=41;FAO=21;FDP=41;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.00407105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.2726;QD=20.0001;RBI=0.0131123;REFB=-0.0321652;REVB=0.0124643;RO=17;SAF=11;SAR=9;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0169743;STB=0.535178;STBP=0.73;TYPE=snp;VARB=0.0335426;OID=.;OPOS=57647015;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:17:20:20:21:0.512195:9:11:9:8:9:12:10:10
chr19	57647236	.	T	C	163.65	PASS	AF=0.53125;AO=17;DP=32;FAO=17;FDP=32;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=-0.0148882;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.783;QD=20.456;RBI=0.0152805;REFB=-0.0234662;REVB=-0.00344038;RO=15;SAF=7;SAR=10;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127899;STB=0.571903;STBP=0.444;TYPE=snp;VARB=0.023242;OID=.;OPOS=57647236;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:15:15:17:17:0.53125:10:7:4:11:10:7:4:11
chr19	57649901	.	G	A	316.82	PASS	AF=0.532258;AO=33;DP=62;FAO=33;FDP=62;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=-0.00929702;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=223.956;QD=20.4402;RBI=0.0174685;REFB=-0.0115128;REVB=0.014789;RO=29;SAF=13;SAR=20;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191147;STB=0.605996;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=0.0115551;OID=.;OPOS=57649901;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:29:29:33:33:0.532258:20:13:18:11:20:13:18:11
chr19	57649940	.	A	T	283.7	PASS	AF=0.530612;AO=26;DP=49;FAO=26;FDP=49;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=0.0248205;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.733;QD=23.1592;RBI=0.0265294;REFB=0.00474506;REVB=0.00936786;RO=23;SAF=10;SAR=16;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153887;STB=0.58592;STBP=0.202;TYPE=snp;VARB=-0.00368635;OID=.;OPOS=57649940;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:23:23:26:26:0.530612:16:10:13:10:16:10:13:10
chr19	57742472	.	G	C	464.32	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0449833;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.9911;QD=58.0399;RBI=0.0760441;REFB=0;REVB=0.0613123;RO=0;SAF=20;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00157847;OID=.;OPOS=57742472;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:12:20:0:0:12:20:0:0
chr19	57742489	.	C	T	357.52	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0110074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.632;QD=55.0028;RBI=0.0517801;REFB=0;REVB=0.0505966;RO=0;SAF=18;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.28381e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000407257;OID=.;OPOS=57742489;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:8:18:0:0:8:18:0:0
chr19	57742493	.	AGGACGAGCAGGATT	A	227.24	PASS	AF=1;AO=18;DP=19;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00839947;FXX=0.0526039;HRUN=2;LEN=14;MLLD=367.131;QD=50.4977;RBI=0.018853;REFB=0;REVB=0.0168785;RO=0;SAF=11;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=2.40072e-05;OID=.;OPOS=57742494;OREF=GGACGAGCAGGATT;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:18:19:18:18:0:11:7:0:0:4:0:11:7:0:0
chr19	57772744	.	GGTGT	G	57.77	PASS	AF=0.357143;AO=10;DP=28;FAO=10;FDP=28;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.00647972;FXX=0;HRUN=2;LEN=4;MLLD=299.333;QD=8.25268;RBI=0.0123005;REFB=-0.0124114;REVB=-0.0104554;RO=18;SAF=6;SAR=4;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108084;STB=0.565086;STBP=0.64;TYPE=del;VARB=0.0230746;OID=.;OPOS=57772745;OREF=GTGT;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.357143:10:28:10:28:18:6:4:9:9:57:18:6:4:9:9
chr19	57868336	.	A	G	279.66	PASS	AF=0.956522;AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00352924;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=152.018;QD=48.6363;RBI=0.00986366;REFB=-0.145787;REVB=0.00921066;RO=1;SAF=8;SAR=14;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.031885;STB=0.517226;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=-7.35767e-05;OID=.;OPOS=57868336;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:23:23:1:1:22:22:0.956522:14:8:0:1:14:8:0:1
chr19	57876533	.	T	G	292.19	PASS	AF=0.470588;AO=32;DP=68;FAO=32;FDP=68;FR=.;FRO=36;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=23;FSRR=13;FWDB=0.0123422;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.2578;QD=17.1875;RBI=0.0378825;REFB=-0.00836452;REVB=0.0358155;RO=35;SAF=20;SAR=12;SRF=22;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00355659;STB=0.507869;STBP=0.917;TYPE=snp;VARB=0.0165102;OID=.;OPOS=57876533;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:35:36:32:32:0.470588:12:20:22:13:12:20:23:13
chr19	57909872	.	G	A	857.16	PASS	AF=1;AO=59;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0348067;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.27;QD=57.1437;RBI=0.0356258;REFB=0;REVB=-0.00759544;RO=0;SAF=24;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00118565;OID=.;OPOS=57909872;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:59:60:1:35:24:0:0:35:25:0:0
chr19	57955719	.	G	A	125.72	PASS	AF=0.307692;AO=16;DP=52;FAO=16;FDP=52;FR=.;FRO=36;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=-0.00682307;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.513;QD=9.67086;RBI=0.0342077;REFB=0.0029375;REVB=-0.0335203;RO=35;SAF=9;SAR=7;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0228358;STB=0.504872;STBP=0.968;TYPE=snp;VARB=-0.00548718;OID=.;OPOS=57955719;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:35:36:16:16:0.307692:7:9:19:16:7:9:20:16
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chr19	57956828	.	T	G	397.2	PASS	AF=1;AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0531732;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.1324;QD=56.7424;RBI=0.0714215;REFB=0;REVB=0.0476828;RO=0;SAF=20;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.75204e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00194467;OID=.;OPOS=57956828;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:28:0:0:28:28:1:8:20:0:0:8:20:0:0
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chr19	57984426	.	C	A	222.53	PASS	AF=0.488889;AO=20;DP=43;FAO=22;FDP=45;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=0.00291361;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.139;QD=19.7801;RBI=0.00352907;REFB=0.000994258;REVB=-0.00199129;RO=23;SAF=7;SAR=13;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00224885;STB=0.508764;STBP=0.903;TYPE=snp;VARB=-0.000973804;OID=.;OPOS=57984426;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:45:23:23:20:22:0.488889:13:7:8:15:14:8:8:15
chr19	57984918	.	A	G	320.15	PASS	AF=0.55;AO=32;DP=60;FAO=33;FDP=60;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=0.00908376;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.12;QD=21.3435;RBI=0.0177664;REFB=-0.0180396;REVB=0.0152687;RO=26;SAF=12;SAR=20;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135644;STB=0.55724;STBP=0.346;TYPE=snp;VARB=0.0135318;OID=.;OPOS=57984918;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:26:27:32:33:0.55:20:12:14:12:20:13:14:13
chr19	57985460	.	T	A	483.3	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0570856;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.2196;QD=58.5812;RBI=0.063174;REFB=0;REVB=-0.027059;RO=0;SAF=12;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00184334;OID=.;OPOS=57985460;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:21:12:0:0:21:12:0:0
chr19	57985566	.	G	C	817.75	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00427106;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.048;QD=57.3858;RBI=0.0112083;REFB=0;REVB=0.0103626;RO=0;SAF=31;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.19358e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.8458e-05;OID=.;OPOS=57985566;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:26:31:0:0:26:31:0:0
chr19	57987905	.	G	A	228.9	PASS	AF=0.45614;AO=26;DP=58;FAO=26;FDP=57;FR=.;FRO=31;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=-0.00862232;FXX=0.0172384;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.688;QD=16.0632;RBI=0.00983202;REFB=-0.0195105;REVB=-0.00472485;RO=31;SAF=13;SAR=13;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108824;STB=0.561357;STBP=0.431;TYPE=snp;VARB=0.0328117;OID=.;OPOS=57987905;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:57:31:31:26:26:0.45614:13:13:12:19:13:13:12:19
chr19	57988666	.	A	AGCC	161.81	PASS	AF=0.695652;AO=16;DP=26;FAO=16;FDP=23;FR=.;FRO=7;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.0163828;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=165.792;QD=28.1411;RBI=0.0177048;REFB=-0.0495269;REVB=-0.00671307;RO=10;SAF=9;SAR=7;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0432421;STB=0.547428;STBP=0.525;TYPE=ins;VARB=0.0356179;OID=.;OPOS=57988667;OREF=-;OALT=GCC;OMAPALT=AGCC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.695652:16:26:16:23:7:9:7:5:2:45:10:9:7:5:5
chr19	58001512	.	T	A	342.73	PASS	AF=0.583333;AO=34;DP=59;FAO=35;FDP=60;FR=.;FRO=25;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=-0.00397523;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.221;QD=22.8484;RBI=0.0135473;REFB=-0.00712166;REVB=0.012951;RO=25;SAF=16;SAR=18;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129726;STB=0.564066;STBP=0.262;TYPE=snp;VARB=0.00539363;OID=.;OPOS=58001512;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:60:25:25:34:35:0.583333:18:16:16:9:18:17:16:9
chr19	58002964	.	G	C	279.85	PASS	AF=0.388235;AO=32;DP=84;FAO=33;FDP=85;FR=.;FRO=52;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=27;FSRR=25;FWDB=-0.0228998;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=68.5645;QD=13.1693;RBI=0.0388094;REFB=-0.0195665;REVB=-0.0313332;RO=52;SAF=18;SAR=14;SRF=27;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0472024;STB=0.534997;STBP=0.61;TYPE=snp;VARB=0.0219818;OID=.;OPOS=58002964;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:85:52:52:32:33:0.388235:14:18:27:25:14:19:27:25
chr19	58003488	.	A	G	85.77	PASS	AF=0.37931;AO=11;DP=29;FAO=11;FDP=29;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=0.00579602;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.291;QD=11.8301;RBI=0.0319186;REFB=0.00713308;REVB=0.031388;RO=18;SAF=7;SAR=4;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0881603;STB=0.552534;STBP=0.684;TYPE=snp;VARB=-0.0103335;OID=.;OPOS=58003488;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:29:29:18:18:11:11:0.37931:4:7:10:8:4:7:10:8
chr19	58003580	.	A	G	1415.31	PASS	AF=1;AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.020671;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.031;QD=62.9027;RBI=0.0217263;REFB=0;REVB=0.006689;RO=0;SAF=50;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.21981e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.61706e-05;OID=.;OPOS=58003580;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:90:90:0:0:90:90:1:40:50:0:0:40:50:0:0
chr19	58003613	.	C	T	1209.89	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0239796;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.103;QD=60.4945;RBI=0.025069;REFB=0;REVB=-0.00730984;RO=0;SAF=41;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.93485e-05;OID=.;OPOS=58003613;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:80:0:0:79:80:1:38:41:0:0:38:42:0:0
chr19	58004346	.	G	C	594.54	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0216306;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.9607;QD=60.9784;RBI=0.0218905;REFB=0;REVB=-0.00336367;RO=0;SAF=17;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000116982;OID=.;OPOS=58004346;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:22:17:0:0:22:17:0:0
chr19	58011447	.	C	T	164.27	PASS	AF=0.695652;AO=16;DP=24;FAO=16;FDP=23;FR=.;FRO=7;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.0744386;FXX=0.0416493;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.209;QD=28.5688;RBI=0.0756934;REFB=0.0082496;REVB=0.0137255;RO=7;SAF=7;SAR=9;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168452;STB=0.59311;STBP=0.248;TYPE=snp;VARB=-0.00349865;OID=.;OPOS=58011447;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:24:23:7:7:16:16:0.695652:9:7:1:6:9:7:1:6
chr19	58038964	.	T	A	1307.74	PASS	AF=1;AO=83;DP=83;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00547084;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.9848;QD=61.5408;RBI=0.0892046;REFB=0;REVB=0.0890367;RO=0;SAF=40;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000692025;OID=.;OPOS=58038964;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:85:0:0:83:85:1:43:40:0:0:45:40:0:0
chr19	58048951	.	C	T	101.59	PASS	AF=0.5;AO=12;DP=24;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.0140009;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=259.462;QD=16.9316;RBI=0.0164881;REFB=-0.00690351;REVB=-0.00870814;RO=12;SAF=6;SAR=6;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0722214;STB=0.541598;STBP=0.737;TYPE=snp;VARB=0.00969918;OID=.;OPOS=58048951;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:24:24:12:12:12:12:0.5:6:6:7:5:6:6:7:5
chr19	58049243	.	G	A	93.05	PASS	AF=0.307692;AO=12;DP=39;FAO=12;FDP=39;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=-0.00442288;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.279;QD=9.54363;RBI=0.014602;REFB=-0.00139763;REVB=-0.0139161;RO=25;SAF=6;SAR=6;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112421;STB=0.538398;STBP=0.76;TYPE=snp;VARB=0.00336538;OID=.;OPOS=58049243;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:93:39:39:25:27:12:12:0.307692:6:6:15:10:6:6:15:12
chr19	58058536	.	A	G	423.21	PASS	AF=0.577465;AO=41;DP=71;FAO=41;FDP=71;FR=.;FRO=30;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=-0.0261627;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.7042;QD=23.8427;RBI=0.0560424;REFB=-0.0149083;REVB=-0.0495607;RO=30;SAF=21;SAR=20;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137425;STB=0.575306;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=0.00947656;OID=.;OPOS=58058536;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:30:30:41:41:0.577465:20:21:10:20:20:21:10:20
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chr19	58117223	.	T	A	223.19	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00432361;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.77;QD=49.5981;RBI=0.0484081;REFB=0;REVB=0.0482146;RO=0;SAF=8;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000565972;OID=.;OPOS=58117223;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:10:8:0:0:10:8:0:0
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chr19	58145230	.	C	T	322.38	PASS	AF=0.608696;AO=28;DP=45;FAO=28;FDP=46;FR=.;FRO=18;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=5;FSRR=13;FWDB=0.00507238;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.19;QD=28.0329;RBI=0.00615474;REFB=-0.00322641;REVB=-0.00348594;RO=17;SAF=14;SAR=14;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141547;STB=0.586896;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=0.00333564;OID=.;OPOS=58145230;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:46:17:18:28:28:0.608696:14:14:5:12:14:14:5:13
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chr19	58152361	.	T	A	88.1	PASS	AF=0.44;AO=11;DP=25;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.0394127;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.625;QD=14.0965;RBI=0.0483413;REFB=-0.0102917;REVB=0.0279915;RO=14;SAF=5;SAR=6;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11125;STB=0.565099;STBP=0.589;TYPE=snp;VARB=0.013793;OID=.;OPOS=58152361;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:25:25:14:14:11:11:0.44:6:5:8:6:6:5:8:6
chr19	58152795	.	C	T	74.68	PASS	AF=0.357143;AO=10;DP=28;FAO=10;FDP=28;FR=.;FRO=18;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=-0.0227935;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.206;QD=10.6681;RBI=0.0315096;REFB=-0.000564241;REVB=-0.0217557;RO=18;SAF=2;SAR=8;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.251805;STB=0.654202;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=0.000450403;OID=.;OPOS=58152795;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:28:28:18:18:10:10:0.357143:8:2:7:11:8:2:7:11
chr19	58152817	.	G	C	64.87	PASS	AF=0.36;AO=9;DP=25;FAO=9;FDP=25;FR=.;FRO=16;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=0.0388779;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.8523;QD=10.3785;RBI=0.0522347;REFB=0.0112383;REVB=0.0348852;RO=16;SAF=2;SAR=7;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198652;STB=0.621926;STBP=0.447;TYPE=snp;VARB=-0.0129019;OID=.;OPOS=58152817;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:25:25:16:16:9:9:0.36:7:2:6:10:7:2:6:10
chr19	58153000	.	T	C	34.86	PASS	AF=0.375;AO=4;DP=17;FAO=6;FDP=16;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.0169674;FXX=0.0587889;HRUN=3;LEN=1;MLLD=129.026;QD=8.71518;RBI=0.0478381;REFB=-0.0116173;REVB=0.044728;RO=11;SAF=3;SAR=1;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.408699;STB=0.562295;STBP=0.758;TYPE=snp;VARB=0.0504522;OID=.;OPOS=58153000;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:17:16:11:10:4:6:0.375:1:3:4:7:3:3:4:6
chr19	58153081	.	C	T	113.11	PASS	AF=0.5;AO=13;DP=26;FAO=13;FDP=26;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.00861143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.041;QD=17.4018;RBI=0.0101308;REFB=-0.0459299;REVB=0.00533626;RO=13;SAF=7;SAR=6;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133159;STB=0.576354;STBP=0.458;TYPE=snp;VARB=0.0334713;OID=.;OPOS=58153081;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:26:13:13:13:13:0.5:6:7:5:8:6:7:5:8
chr19	58213952	.	C	A	399.2	PASS	AF=0.471264;AO=40;DP=85;FAO=41;FDP=87;FR=.;FRO=46;FSAF=13;FSAR=28;FSRF=19;FSRR=27;FWDB=-0.0163819;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.0435;QD=18.3538;RBI=0.0339401;REFB=0.0107188;REVB=-0.0297249;RO=45;SAF=12;SAR=28;SRF=18;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107053;STB=0.556148;STBP=0.361;TYPE=snp;VARB=-0.0177103;OID=.;OPOS=58213952;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:87:45:46:40:41:0.471264:28:12:18:27:28:13:19:27
chr19	58258466	.	G	T	177.38	PASS	AF=0.404255;AO=16;DP=45;FAO=19;FDP=47;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=0.0100908;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.238;QD=15.0962;RBI=0.0104415;REFB=-0.00237269;REVB=-0.00268329;RO=28;SAF=8;SAR=8;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0774906;STB=0.557975;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.00335612;OID=.;OPOS=58258466;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:47:28:28:16:19:0.404255:8:8:16:12:10:9:16:12
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chr19	58374130	.	C	T	227.22	PASS	AF=0.65625;AO=21;DP=32;FAO=21;FDP=32;FR=.;FRO=11;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=0.000567886;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.363;QD=28.4028;RBI=0.0150067;REFB=-0.021279;REVB=0.014996;RO=11;SAF=7;SAR=14;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195954;STB=0.608589;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=0.0123298;OID=.;OPOS=58374130;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:32:32:11:11:21:21:0.65625:14:7:7:4:14:7:7:4
chr19	58385954	.	T	C	102.03	PASS	AF=0.5;AO=9;DP=22;FAO=11;FDP=22;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=5;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.022578;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=89.3108;QD=18.55;RBI=0.0711827;REFB=-0.0147739;REVB=0.0675071;RO=3;SAF=4;SAR=5;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0974346;STB=0.51721;STBP=0.902;TYPE=snp;VARB=-0.0424041;OID=.;OPOS=58385954;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:16:22:22:3:5:9:11:0.5:5:4:2:1:6:5:2:3
chr19	58439306	.	G	A	220.44	PASS	AF=0.583333;AO=21;DP=36;FAO=21;FDP=36;FR=.;FRO=15;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=-0.017029;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=157.047;QD=24.493;RBI=0.0272274;REFB=-0.0381858;REVB=0.0212448;RO=15;SAF=12;SAR=9;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0736264;STB=0.540945;STBP=0.619;TYPE=snp;VARB=0.025083;OID=.;OPOS=58439306;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:15:15:21:21:0.583333:9:12:10:5:9:12:10:5
chr19	58455381	.	C	T	828.0	PASS	AF=1;AO=47;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=24;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0818854;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.697;QD=57.1031;RBI=0.0821251;REFB=0;REVB=0.00626983;RO=0;SAF=13;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000491609;OID=.;OPOS=58455381;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:47:58:1:34:13:0:0:34:24:0:0
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chr19	58870765	.	TAAAAA	ATAAAA,TAAAAG,TAAAA	48.54	PASS	AF=0.0322581,0.0967742,0.290323;AO=2,2,7;DP=32;FAO=1,3,9;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=1,3,6;FSAR=0,0,3;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.0104682,0.0632932,0.108988;FXX=0.0605877;HRUN=1,5,5;LEN=2,1,1;MLLD=125.975,36.7214,11.0771;QD=6.26321;RBI=0.0594873,0.0797333,0.113009;REFB=-0.0145495,-0.0500671,-0.103508;REVB=-0.058559,-0.0484909,-0.0298762;RO=14;SAF=2,2,4;SAR=0,0,3;SRF=6;SRR=8;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.576453,0.576453,0.152225;STB=0.989658,0.996208,0.615122;STBP=0.46,0.07,0.415;TYPE=mnp,snp,del;VARB=0.16267,0.115751,0.144309;OID=.,.,.;OPOS=58870765,58870770,58870766;OREF=TA,A,A;OALT=AT,G,-;OMAPALT=ATAAAA,TAAAAG,TAAAA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/3:30:32:31:14:18:2,2,7:1,3,9:0.0322581,0.0967742,0.290323:0,0,3:2,2,4:6:8:0,0,3:1,3,6:9:9
chr19	58870949	.	C	T	42.23	PASS	AF=0.666667;AO=6;DP=9;FAO=6;FDP=9;FR=.;FRO=3;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.126549;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=67.2633;QD=18.7668;RBI=0.128015;REFB=-0.0479024;REVB=0.0193185;RO=3;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.200664;STB=0.615062;STBP=0.683;TYPE=snp;VARB=0.0394066;OID=.;OPOS=58870949;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:9:9:3:3:6:6:0.666667:5:1:0:3:5:1:0:3
chr19	58879965	.	A	G	143.85	PASS	AF=1;AO=11;DP=12;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0266377;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.995;QD=44.2605;RBI=0.129423;REFB=0;REVB=0.126652;RO=0;SAF=8;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0016574;OID=.;OPOS=58879965;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:13:0:0:11:13:1:3:8:0:0:5:8:0:0
chr19	58879976	.	C	T	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0613323;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.6148;QD=42.1823;RBI=0.0878017;REFB=0;REVB=0.062829;RO=0;SAF=7;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00516985;OID=.;OPOS=58879976;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:4:7:0:0:4:7:0:0
chr19	58880184	.	T	C	569.78	PASS	AF=0.582418;AO=51;DP=88;FAO=53;FDP=91;FR=.;FRO=38;FSAF=19;FSAR=34;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=-0.00711845;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.446;QD=25.0455;RBI=0.00721052;REFB=-0.027089;REVB=0.00114859;RO=36;SAF=18;SAR=33;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0956196;STB=0.53943;STBP=0.389;TYPE=snp;VARB=0.0215873;OID=.;OPOS=58880184;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:91:36:38:51:53:0.582418:33:18:17:19:34:19:17:21
chr19	58880242	.	T	C	469.78	PASS	AF=0.555556;AO=45;DP=81;FAO=45;FDP=81;FR=.;FRO=36;FSAF=11;FSAR=34;FSRF=14;FSRR=22;FWDB=0.00411495;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.094;QD=23.1989;RBI=0.00762181;REFB=-0.00682258;REVB=-0.00641554;RO=36;SAF=11;SAR=34;SRF=14;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144336;STB=0.579771;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=0.00390484;OID=.;OPOS=58880242;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:36:36:45:45:0.555556:34:11:14:22:34:11:14:22
chr19	58898193	.	C	T	48.23	PASS	AF=0.466667;AO=7;DP=15;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=0.0108764;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.566;QD=12.8606;RBI=0.015002;REFB=0.00805345;REVB=-0.0103327;RO=7;SAF=4;SAR=3;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125462;STB=0.599733;STBP=0.58;TYPE=snp;VARB=-0.00748462;OID=.;OPOS=58898193;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:15:15:7:8:7:7:0.466667:3:4:5:2:3:4:6:2
chr19	58928302	.	T	C	169.53	PASS	AF=0.465116;AO=18;DP=39;FAO=20;FDP=43;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=-0.0491761;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.5068;QD=15.7707;RBI=0.0651334;REFB=-0.0777;REVB=-0.042709;RO=21;SAF=14;SAR=4;SRF=16;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0213159;STB=0.50276;STBP=0.979;TYPE=snp;VARB=0.0705729;OID=.;OPOS=58928302;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:43:21:23:18:20:0.465116:4:14:16:5:6:14:16:7
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chr19	58929052	.	G	A	37.99	PASS	AF=0.428571;AO=5;DP=14;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=-0.0532622;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=40.8583;QD=10.8552;RBI=0.0579381;REFB=-0.0625625;REVB=-0.0228027;RO=8;SAF=4;SAR=1;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.216791;STB=0.66603;STBP=0.405;TYPE=snp;VARB=0.071434;OID=.;OPOS=58929052;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:14:14:8:8:5:6:0.428571:1:4:5:3:1:5:5:3
chr19	58929136	.	G	A	40.4	PASS	AF=0.545455;AO=5;DP=10;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0981326;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.5409;QD=14.6916;RBI=0.0986682;REFB=-0.040111;REVB=0.0102674;RO=5;SAF=4;SAR=1;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20967;STB=0.651594;STBP=0.396;TYPE=snp;VARB=0.0456467;OID=.;OPOS=58929136;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:10:11:5:5:5:6:0.545455:1:4:3:2:1:5:3:2
chr19	58945961	.	AC	A,AA,AT	325.26	PASS	AF=0.28,0.04,0.68;AO=7,2,16;DP=25;FAO=7,1,17;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=0,1,8;FSAR=7,0,9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0188066,-0.00944697,-0.0152258;FXX=0;HRUN=1,1,1;LEN=1,1,1;MLLD=69.2529,49.2298,74.238;QD=52.0418;RBI=0.035944,0.0403881,0.0337987;REFB=0,0,0;REVB=-0.0306314,-0.0392677,-0.0301749;RO=0;SAF=0,1,8;SAR=7,1,8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,snp,snp;VARB=0.0400445,-0.0208593,0.0133668;OID=.,.,.;OPOS=58945962,58945962,58945962;OREF=C,C,C;OALT=-,A,T;OMAPALT=A,AA,AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/3:0.28,0.04,0.68:7,2,16:25:7,1,17:25:0:0,1,8:7,0,9:0:0:26:0:0,1,8:7,1,8:0:0
chr19	58951123	.	T	C	296.59	PASS	AF=0.377778;AO=34;DP=90;FAO=34;FDP=90;FR=.;FRO=56;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=25;FSRR=31;FWDB=-0.0115475;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=249.928;QD=13.1815;RBI=0.0128361;REFB=-0.0093456;REVB=-0.00560543;RO=56;SAF=16;SAR=18;SRF=25;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0264246;STB=0.515103;STBP=0.819;TYPE=snp;VARB=0.0158871;OID=.;OPOS=58951123;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:56:56:34:34:0.377778:18:16:25:31:18:16:25:31
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chr20	826492	.	G	C	885.43	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000181411;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.855;QD=58.0609;RBI=0.000587396;REFB=0;REVB=-0.000558681;RO=0;SAF=27;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.1891e-07;OID=.;OPOS=826492;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:34:27:0:0:34:27:0:0
chr20	826710	.	C	T	393.23	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.141394;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.1171;QD=56.176;RBI=0.142943;REFB=0;REVB=0.0209863;RO=0;SAF=6;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00283567;OID=.;OPOS=826710;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:22:6:0:0:22:6:0:0
chr20	854940	.	T	C	537.1	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0378812;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.5058;QD=59.6773;RBI=0.0532963;REFB=0;REVB=0.0374902;RO=0;SAF=20;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000248534;OID=.;OPOS=854940;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:36:0:0:35:36:1:15:20:0:0:16:20:0:0
chr20	939130	.	T	A	324.89	PASS	AF=0.615385;AO=33;DP=52;FAO=32;FDP=52;FR=.;FRO=20;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=0.0115555;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=56.0307;QD=24.9916;RBI=0.0211371;REFB=-0.0916831;REVB=-0.0176988;RO=14;SAF=14;SAR=19;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00242315;STB=0.575013;STBP=0.193;TYPE=snp;VARB=0.00760205;OID=.;OPOS=939130;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:14:20:33:32:0.615385:19:14:6:8:19:13:12:8
chr20	939161	.	A	G	417.45	PASS	AF=0.733333;AO=33;DP=45;FAO=33;FDP=45;FR=.;FRO=12;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.0272802;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.1364;QD=37.1066;RBI=0.0544187;REFB=0.025189;REVB=0.047087;RO=12;SAF=12;SAR=21;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112498;STB=0.561144;STBP=0.225;TYPE=snp;VARB=-0.00870259;OID=.;OPOS=939161;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:90:45:45:12:12:33:33:0.733333:21:12:7:5:21:12:7:5
chr20	1099523	.	T	G	81.22	PASS	AF=0.213115;AO=13;DP=61;FAO=13;FDP=61;FR=.;FRO=48;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=22;FSRR=26;FWDB=-0.0165223;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=236.795;QD=5.32584;RBI=0.0168771;REFB=-0.00506377;REVB=-0.00344242;RO=48;SAF=5;SAR=8;SRF=22;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.093191;STB=0.559493;STBP=0.609;TYPE=snp;VARB=0.0161345;OID=.;OPOS=1099523;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:81:61:61:48:48:13:13:0.213115:8:5:22:26:8:5:22:26
chr20	1115919	.	A	G	133.07	PASS	AF=0.866667;AO=13;DP=15;FAO=13;FDP=15;FR=.;FRO=2;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.027447;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.2437;QD=35.4848;RBI=0.0276421;REFB=-0.0103602;REVB=0.00327877;RO=2;SAF=4;SAR=9;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0905744;STB=0.549926;STBP=0.403;TYPE=snp;VARB=0.0081953;OID=.;OPOS=1115919;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:15:15:2:2:13:13:0.866667:9:4:0:2:9:4:0:2
chr20	1214814	.	A	C	33.88	PASS	AF=0.166667;AO=6;DP=36;FAO=6;FDP=36;FR=.;FRO=30;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=22;FSRR=8;FWDB=0.0567815;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.6874;QD=3.7645;RBI=0.0570494;REFB=-0.00658226;REVB=-0.00552229;RO=28;SAF=5;SAR=1;SRF=22;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0910079;STB=0.624532;STBP=0.605;TYPE=snp;VARB=0.0275036;OID=.;OPOS=1214814;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:36:36:28:30:6:6:0.166667:1:5:22:6:1:5:22:8
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chr20	1291076	.	G	C	766.07	PASS	AF=1;AO=47;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0754493;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.729;QD=63.8391;RBI=0.0771354;REFB=0;REVB=0.0160398;RO=0;SAF=21;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000115432;OID=.;OPOS=1291076;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:47:48:1:26:21:0:0:26:22:0:0
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chr20	1293259	.	C	T	143.95	PASS	AF=0.372093;AO=16;DP=44;FAO=16;FDP=43;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.0260113;FXX=0.0444346;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.39;QD=13.3904;RBI=0.0413352;REFB=-0.00921422;REVB=-0.0321249;RO=28;SAF=8;SAR=8;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0387096;STB=0.53484;STBP=0.742;TYPE=snp;VARB=0.0132635;OID=.;OPOS=1293259;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:43:28:27:16:16:0.372093:8:8:13:15:8:8:12:15
chr20	1298794	.	G	A	599.13	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0559549;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.8136;QD=61.4493;RBI=0.0569398;REFB=0;REVB=0.0105446;RO=0;SAF=19;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.3303e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00133672;OID=.;OPOS=1298794;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:20:19:0:0:20:19:0:0
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chr20	1551485	.	C	T	223.19	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0504818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.6724;QD=49.5977;RBI=0.0555216;REFB=0;REVB=-0.0231135;RO=0;SAF=9;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000870327;OID=.;OPOS=1551485;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:9:9:0:0:9:9:0:0
chr20	1552430	.	T	C	3089.24	PASS	AF=1;AO=191;DP=192;FAO=195;FDP=195;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=109;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00241998;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.049;QD=63.3691;RBI=0.0208816;REFB=0;REVB=0.0207409;RO=0;SAF=85;SAR=106;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.69543e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000288196;OID=.;OPOS=1552430;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:17:192:195:0:0:191:195:1:106:85:0:0:109:86:0:0
chr20	1559101	.	T	G	4034.43	PASS	AF=1;AO=258;DP=258;FAO=259;FDP=259;FR=.;FRO=0;FSAF=142;FSAR=117;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00209628;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.5;QD=62.3077;RBI=0.0112984;REFB=0;REVB=0.0111023;RO=0;SAF=142;SAR=116;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.28255e-05;OID=.;OPOS=1559101;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:22:258:259:0:0:258:259:1:116:142:0:0:117:142:0:0
chr20	1610894	.	G	A	575.6	PASS	AF=1;AO=37;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0369069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.341;QD=60.5893;RBI=0.0370237;REFB=0;REVB=0.00293858;RO=0;SAF=9;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.75932e-05;OID=.;OPOS=1610894;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:37:38:1:28:9:0:0:28:10:0:0
chr20	1610939	.	G	A	411.12	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0110196;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=214.274;QD=56.7066;RBI=0.0153512;REFB=0;REVB=-0.0106878;RO=0;SAF=9;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.3903e-06;OID=.;OPOS=1610939;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:20:9:0:0:20:9:0:0
chr20	1615959	.	T	C	1062.43	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0275296;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.506;QD=59.8554;RBI=0.0427108;REFB=0;REVB=0.0326547;RO=0;SAF=51;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000136155;OID=.;OPOS=1615959;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:20:51:0:0:20:51:0:0
chr20	1616137	.	G	A	2385.48	PASS	AF=1;AO=156;DP=156;FAO=156;FDP=156;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0374392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.844;QD=61.1662;RBI=0.0531192;REFB=0;REVB=-0.0376822;RO=0;SAF=72;SAR=84;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.48831e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.55478e-07;OID=.;OPOS=1616137;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:156:156:0:0:156:156:1:84:72:0:0:84:72:0:0
chr20	1616206	.	A	G	1536.76	PASS	AF=1;AO=102;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00882557;FXX=0.00961446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.662;QD=59.6801;RBI=0.0160537;REFB=0;REVB=-0.0134101;RO=0;SAF=47;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.05013e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.90091e-05;OID=.;OPOS=1616206;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:103:103:0:0:102:103:1:55:47:0:0:56:47:0:0
chr20	1616892	.	A	G	2385.92	PASS	AF=1;AO=155;DP=156;FAO=156;FDP=156;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0269323;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.812;QD=61.1774;RBI=0.027562;REFB=0;REVB=-0.00585795;RO=0;SAF=61;SAR=94;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.67899e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.16252e-05;OID=.;OPOS=1616892;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:156:156:0:0:155:156:1:94:61:0:0:95:61:0:0
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chr20	2375262	.	A	G	533.45	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0277568;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.446;QD=59.272;RBI=0.0907486;REFB=0;REVB=-0.0863994;RO=0;SAF=29;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.61498e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000249019;OID=.;OPOS=2375262;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:36:0:0:35:36:1:6:29:0:0:6:30:0:0
chr20	2380323	.	G	A	485.38	PASS	AF=0.788462;AO=41;DP=49;FAO=41;FDP=52;FR=.;FRO=11;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=-0.00487928;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.2854;QD=37.3368;RBI=0.0409442;REFB=-0.0720022;REVB=-0.0406524;RO=8;SAF=18;SAR=23;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0198191;STB=0.536006;STBP=0.36;TYPE=snp;VARB=0.0132835;OID=.;OPOS=2380323;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:70:49:52:8:11:41:41:0.788462:23:18:3:5:23:18:3:8
chr20	2539387	.	G	A	660.42	PASS	AF=1;AO=29;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00840634;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.4455;QD=62.897;RBI=0.250197;REFB=0;REVB=0.250055;RO=0;SAF=17;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.0947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00456481;OID=.;OPOS=2539387;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:29:42:1:12:17:0:0:24:18:0:0
chr20	2591232	.	C	T	59.77	PASS	AF=0.195652;AO=9;DP=46;FAO=9;FDP=46;FR=.;FRO=37;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=-0.0318052;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.448;QD=5.19782;RBI=0.0370774;REFB=0.000857128;REVB=-0.0190569;RO=37;SAF=8;SAR=1;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.493112;STB=0.836351;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=-0.0117135;OID=.;OPOS=2591232;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:59:46:46:37:37:9:9:0.195652:1:8:20:17:1:8:20:17
chr20	2593863	.	T	C	209.62	PASS	AF=0.306818;AO=26;DP=88;FAO=27;FDP=88;FR=.;FRO=61;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=35;FSRR=26;FWDB=-0.00463874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.199;QD=9.52804;RBI=0.0175645;REFB=0.00209189;REVB=-0.0169409;RO=60;SAF=15;SAR=11;SRF=34;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0123749;STB=0.512811;STBP=0.889;TYPE=snp;VARB=-0.00567655;OID=.;OPOS=2593863;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:60:61:26:27:0.306818:11:15:34:26:12:15:35:26
chr20	2618140	.	T	C	689.35	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00466972;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.576;QD=62.6686;RBI=0.0142262;REFB=0;REVB=0.0134379;RO=0;SAF=19;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.60703e-05;OID=.;OPOS=2618140;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:25:19:0:0:25:19:0:0
chr20	2621998	.	T	C	386.69	PASS	AF=0.965517;AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0222091;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=302.857;QD=53.336;RBI=0.0234613;REFB=0.0163077;REVB=-0.00756242;RO=1;SAF=10;SAR=18;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0251595;STB=0.513504;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=-0.000220231;OID=.;OPOS=2621998;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:29:29:1:1:28:28:0.965517:18:10:0:1:18:10:0:1
chr20	2633936	.	T	C	754.33	PASS	AF=1;AO=52;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130382;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.98;QD=56.9303;RBI=0.032145;REFB=0;REVB=-0.029382;RO=0;SAF=37;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.9979e-05;OID=.;OPOS=2633936;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:52:53:1:15:37:0:0:15:38:0:0
chr20	2635212	.	A	G	70.38	PASS	AF=0.211538;AO=10;DP=52;FAO=11;FDP=52;FR=.;FRO=41;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=16;FSRR=25;FWDB=0.00429387;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.745;QD=5.41399;RBI=0.0208068;REFB=0.000230823;REVB=0.0203589;RO=40;SAF=7;SAR=3;SRF=15;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.385014;STB=0.687809;STBP=0.197;TYPE=snp;VARB=0.00162663;OID=.;OPOS=2635212;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:70:52:52:40:41:10:11:0.211538:3:7:15:25:4:7:16:25
chr20	2637071	.	T	C	389.42	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00810378;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=336.899;QD=55.6313;RBI=0.0112581;REFB=0;REVB=-0.00781496;RO=0;SAF=15;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000350823;OID=.;OPOS=2637071;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:28:0:0:26:28:1:11:15:0:0:11:17:0:0
chr20	2638579	.	T	C	325.15	PASS	AF=0.223176;AO=52;DP=234;FAO=52;FDP=233;FR=.;FRO=181;FSAF=24;FSAR=28;FSRF=113;FSRR=68;FWDB=-0.0700572;FXX=0.00427332;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.271;QD=5.58195;RBI=0.0701608;REFB=-0.00596936;REVB=-0.00380985;RO=176;SAF=24;SAR=28;SRF=109;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199351;STB=0.62471;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.0133203;OID=.;OPOS=2638579;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:234:233:176:181:52:52:0.223176:28:24:109:67:28:24:113:68
chr20	2638882	.	T	C	94.72	PASS	AF=0.342857;AO=12;DP=35;FAO=12;FDP=35;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=-0.026637;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.038;QD=10.8252;RBI=0.0269714;REFB=-0.00680504;REVB=-0.00423392;RO=23;SAF=5;SAR=7;SRF=16;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.299696;STB=0.677145;STBP=0.149;TYPE=snp;VARB=0.0130864;OID=.;OPOS=2638882;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:35:35:23:23:12:12:0.342857:7:5:16:7:7:5:16:7
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chr20	2739583	.	T	C	790.33	PASS	AF=0.966667;AO=57;DP=60;FAO=58;FDP=60;FR=.;FRO=2;FSAF=36;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0701767;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.3233;QD=52.6885;RBI=0.070217;REFB=-0.118934;REVB=0.00237851;RO=2;SAF=35;SAR=22;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0261885;STB=0.504262;STBP=0.783;TYPE=snp;VARB=0.00433597;OID=.;OPOS=2739583;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:60:60:2:2:57:58:0.966667:22:35:2:0:22:36:1:1
chr20	2821400	.	C	T	67.43	PASS	AF=0.45;AO=9;DP=20;FAO=9;FDP=20;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.0145587;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=164.662;QD=13.4858;RBI=0.030733;REFB=-0.0289238;REVB=-0.0270659;RO=11;SAF=6;SAR=3;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119999;STB=0.571265;STBP=0.587;TYPE=snp;VARB=0.0630263;OID=.;OPOS=2821400;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:20:20:11:11:9:9:0.45:3:6:6:5:3:6:6:5
chr20	2996497	.	C	T	465.14	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.014039;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.776;QD=58.1421;RBI=0.021456;REFB=0;REVB=0.0162255;RO=0;SAF=18;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.47827e-05;OID=.;OPOS=2996497;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:14:18:0:0:14:18:0:0
chr20	3147762	.	A	G	88.22	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108316;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.286;QD=39.2067;RBI=0.0200139;REFB=0;REVB=0.0168296;RO=0;SAF=3;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000165922;OID=.;OPOS=3147762;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:6:3:0:0:6:3:0:0
chr20	3172246	.	A	C	639.92	PASS	AF=0.934783;AO=43;DP=46;FAO=43;FDP=46;FR=.;FRO=3;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0221652;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=211.561;QD=55.6456;RBI=0.0228985;REFB=-0.155848;REVB=0.00574824;RO=3;SAF=22;SAR=21;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0217931;STB=0.511622;STBP=0.593;TYPE=snp;VARB=0.000897806;OID=.;OPOS=3172246;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:46:46:3:3:43:43:0.934783:21:22:1:2:21:22:1:2
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chr20	3564672	.	C	T	966.96	PASS	AF=0.971014;AO=67;DP=69;FAO=67;FDP=69;FR=.;FRO=2;FSAF=40;FSAR=27;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0113141;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.194;QD=56.0555;RBI=0.0323366;REFB=-0.13995;REVB=0.0302927;RO=2;SAF=40;SAR=27;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0230419;STB=0.512191;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.000882133;OID=.;OPOS=3564672;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:69:69:2:2:67:67:0.971014:27:40:2:0:27:40:2:0
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chr20	3682149	.	G	A	848.15	PASS	AF=0.785714;AO=65;DP=83;FAO=66;FDP=84;FR=.;FRO=18;FSAF=38;FSAR=28;FSRF=3;FSRR=15;FWDB=0.0584036;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=231.667;QD=40.3882;RBI=0.0584202;REFB=0.00271249;REVB=-0.00139456;RO=18;SAF=37;SAR=28;SRF=3;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162364;STB=0.587321;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=-0.00099;OID=.;OPOS=3682149;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:84:18:18:65:66:0.785714:28:37:3:15:28:38:3:15
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chr20	5454400	.	A	T	87.77	PASS	AF=0.458333;AO=10;DP=24;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.050708;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.1133;QD=14.6289;RBI=0.0510438;REFB=-0.0336405;REVB=0.00584502;RO=14;SAF=4;SAR=6;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168645;STB=0.545372;STBP=0.735;TYPE=snp;VARB=0.0887468;OID=.;OPOS=5454400;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:24:24:14:13:10:11:0.458333:6:4:8:6:6:5:7:6
chr20	5454442	.	C	T	47.19	PASS	AF=0.411765;AO=7;DP=17;FAO=7;FDP=17;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=2;FWDB=-0.00279292;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.428;QD=11.1041;RBI=0.0236392;REFB=-0.018686;REVB=0.0234736;RO=10;SAF=4;SAR=3;SRF=8;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.239788;STB=0.642496;STBP=0.417;TYPE=snp;VARB=0.0232777;OID=.;OPOS=5454442;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:17:17:10:10:7:7:0.411765:3:4:8:2:3:4:8:2
chr20	5527176	.	T	A	198.42	PASS	AF=0.944444;AO=17;DP=18;FAO=17;FDP=18;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0104042;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.946;QD=44.093;RBI=0.0113559;REFB=-0.0976212;REVB=0.00455068;RO=0;SAF=4;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.518497;STBP=0.64;TYPE=snp;VARB=-7.46176e-05;OID=.;OPOS=5527176;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:18:18:0:1:17:17:0.944444:13:4:0:0:13:4:0:1
chr20	5527291	.	A	G	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00557636;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=264.782;QD=51.1846;RBI=0.00707121;REFB=0;REVB=0.00434813;RO=0;SAF=7;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.71813e-06;OID=.;OPOS=5527291;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:13:7:0:0:13:7:0:0
chr20	5903388	.	A	C	48.86	PASS	AF=0.5;AO=7;DP=14;FAO=7;FDP=14;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.037499;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.5753;QD=13.9591;RBI=0.0486615;REFB=0.0376531;REVB=-0.0310124;RO=7;SAF=5;SAR=2;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0327469;OID=.;OPOS=5903388;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:14:14:7:7:7:7:0.5:2:5:5:2:2:5:5:2
chr20	5903485	.	G	A	90.67	PASS	AF=0.240741;AO=13;DP=54;FAO=13;FDP=54;FR=.;FRO=41;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=33;FWDB=-0.0188963;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.8736;QD=6.7162;RBI=0.0241546;REFB=-0.00404536;REVB=0.0150457;RO=41;SAF=6;SAR=7;SRF=8;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.350191;STB=0.709801;STBP=0.161;TYPE=snp;VARB=0.0161802;OID=.;OPOS=5903485;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:90:54:54:41:41:13:13:0.240741:7:6:8:33:7:6:8:33
chr20	5903517	.	A	G	651.2	PASS	AF=1;AO=41;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0188603;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.384;QD=62.0187;RBI=0.0356325;REFB=0;REVB=0.0302318;RO=0;SAF=7;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.33091e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000163444;OID=.;OPOS=5903517;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:41:42:1:34:7:0:0:35:7:0:0
chr20	5903848	.	C	G	99.64	PASS	AF=0.6875;AO=11;DP=17;FAO=11;FDP=16;FR=.;FRO=5;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.0669979;FXX=0.0587889;HRUN=4;LEN=1;MLLD=54.7117;QD=24.9103;RBI=0.0683409;REFB=0.0283233;REVB=0.0134819;RO=6;SAF=9;SAR=2;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.263404;STB=0.671289;STBP=0.109;TYPE=snp;VARB=-0.0204733;OID=.;OPOS=5903848;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:17:16:6:5:11:11:0.6875:2:9:3:3:2:9:2:3
chr20	5903894	.	A	G	43.68	PASS	AF=0.75;AO=6;DP=8;FAO=6;FDP=8;FR=.;FRO=2;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.102959;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.2439;QD=21.8421;RBI=0.116163;REFB=-0.0275223;REVB=-0.05379;RO=2;SAF=4;SAR=2;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173071;STB=0.599697;STBP=0.553;TYPE=snp;VARB=-0.00381929;OID=.;OPOS=5903894;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:8:8:2:2:6:6:0.75:2:4:2:0:2:4:2:0
chr20	5904028	.	C	T	122.13	PASS	AF=0.684211;AO=13;DP=19;FAO=13;FDP=19;FR=.;FRO=6;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0197477;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.743;QD=25.7109;RBI=0.0198574;REFB=-0.0440602;REVB=-0.00208461;RO=6;SAF=7;SAR=6;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0216875;STB=0.512176;STBP=0.916;TYPE=snp;VARB=0.0409596;OID=.;OPOS=5904028;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:19:19:6:6:13:13:0.684211:6:7:3:3:6:7:3:3
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chr20	5923223	.	C	T	195.98	PASS	AF=0.285714;AO=26;DP=92;FAO=26;FDP=91;FR=.;FRO=65;FSAF=6;FSAR=20;FSRF=28;FSRR=37;FWDB=0.0059681;FXX=0.0108684;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.7056;QD=8.61457;RBI=0.0221296;REFB=0.0212925;REVB=-0.0213097;RO=66;SAF=6;SAR=20;SRF=29;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.284463;STB=0.665224;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=-0.0517551;OID=.;OPOS=5923223;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:91:66:65:26:26:0.285714:20:6:29:37:20:6:28:37
chr20	5933108	.	C	A	564.25	PASS	AF=0.607143;AO=51;DP=84;FAO=51;FDP=84;FR=.;FRO=33;FSAF=24;FSAR=27;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=-0.00048366;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.883;QD=26.8691;RBI=0.0083385;REFB=-0.00831769;REVB=-0.00832446;RO=33;SAF=24;SAR=27;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0756659;STB=0.541243;STBP=0.362;TYPE=snp;VARB=0.00464445;OID=.;OPOS=5933108;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:33:33:51:51:0.607143:27:24:19:14:27:24:19:14
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chr20	11907058	.	C	T	772.64	PASS	AF=0.98;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00175978;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.248;QD=61.8114;RBI=0.00744704;REFB=-0.0997154;REVB=0.00723613;RO=1;SAF=22;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0209097;STB=0.511107;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=2.52482e-05;OID=.;OPOS=11907058;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:50:50:1:1:49:49:0.98:27:22:1:0:27:22:1:0
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chr20	14306953	.	G	T	1556.75	PASS	AF=0.741176;AO=125;DP=170;FAO=126;FDP=170;FR=.;FRO=44;FSAF=66;FSAR=60;FSRF=26;FSRR=18;FWDB=-0.0446353;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.3747;QD=36.6294;RBI=0.0540482;REFB=0.0295666;REVB=-0.0304778;RO=42;SAF=65;SAR=60;SRF=25;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0355765;STB=0.517433;STBP=0.458;TYPE=snp;VARB=-0.009598;OID=.;OPOS=14306953;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:170:170:42:44:125:126:0.741176:60:65:25:17:60:66:26:18
chr20	15874325	.	A	G	428.95	PASS	AF=0.530864;AO=41;DP=79;FAO=43;FDP=81;FR=.;FRO=38;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=0.000857575;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.263;QD=21.1829;RBI=0.0628423;REFB=-0.00636117;REVB=0.0628364;RO=38;SAF=17;SAR=24;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0291198;STB=0.513793;STBP=0.824;TYPE=snp;VARB=0.00482301;OID=.;OPOS=15874325;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:81:38:38:41:43:0.530864:24:17:17:21:25:18:17:21
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chr20	17705677	.	A	G	1508.61	PASS	AF=0.990385;AO=101;DP=102;FAO=103;FDP=104;FR=.;FRO=1;FSAF=65;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00379301;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.674;QD=58.0236;RBI=0.00714973;REFB=-0.0115098;REVB=-0.00606067;RO=1;SAF=63;SAR=38;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00747181;STB=0.503816;STBP=0.482;TYPE=snp;VARB=2.89618e-05;OID=.;OPOS=17705677;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:102:104:1:1:101:103:0.990385:38:63:1:0:38:65:1:0
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chr20	17968923	.	T	C	185.59	PASS	AF=0.407407;AO=22;DP=54;FAO=22;FDP=54;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=0.00571986;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.9842;QD=13.7477;RBI=0.0170704;REFB=-0.00189797;REVB=0.0160836;RO=32;SAF=12;SAR=10;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0506003;STB=0.528984;STBP=0.721;TYPE=snp;VARB=0.00339822;OID=.;OPOS=17968923;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:32:32:22:22:0.407407:10:12:19:13:10:12:19:13
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chr20	18143117	.	T	G	519.67	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0546853;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.5077;QD=59.3907;RBI=0.0751826;REFB=0;REVB=-0.051594;RO=0;SAF=15;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00149793;OID=.;OPOS=18143117;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:20:15:0:0:20:15:0:0
chr20	18143355	.	C	T	937.44	PASS	AF=0.577922;AO=89;DP=155;FAO=89;FDP=154;FR=.;FRO=65;FSAF=43;FSAR=46;FSRF=46;FSRR=19;FWDB=0.00482773;FXX=0.0064512;HRUN=3;LEN=1;MLLD=237.661;QD=24.3492;RBI=0.00923642;REFB=-0.00188558;REVB=0.0078743;RO=63;SAF=43;SAR=46;SRF=44;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163731;STB=0.59426;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.00206884;OID=.;OPOS=18143355;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:155:154:63:65:89:89:0.577922:46:43:44:19:46:43:46:19
chr20	18167977	.	T	C	1767.73	PASS	AF=0.97541;AO=115;DP=118;FAO=119;FDP=122;FR=.;FRO=3;FSAF=66;FSAR=53;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0463884;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.205;QD=57.9584;RBI=0.0466519;REFB=-0.0287491;REVB=-0.00495127;RO=2;SAF=62;SAR=53;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0150706;STB=0.511109;STBP=0.139;TYPE=snp;VARB=5.40896e-05;OID=.;OPOS=18167977;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:118:122:2:3:115:119:0.97541:53:62:2:0:53:66:3:0
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chr20	18296072	.	T	A	446.98	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0143394;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.139;QD=57.6751;RBI=0.0432433;REFB=0;REVB=0.0407966;RO=0;SAF=8;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.39343e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000316443;OID=.;OPOS=18296072;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:23:8:0:0:23:8:0:0
chr20	18309650	.	GT	GG,G	874.42	PASS	AF=0.0149254,0.955224;AO=3,60;DP=68;FAO=1,64;FDP=67;FR=.;FRO=2;FSAF=0,35;FSAR=1,29;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0120221,0.0374279;FXX=0.0147037;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=7.21641,24.6596;QD=52.2042;RBI=0.015575,0.0374429;REFB=0.00441347,-0.0675189;REVB=0.00990198,0.00106196;RO=2;SAF=2,31;SAR=1,29;SRF=2;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.272699,-0.0294747;STB=0.993266,0.513885;STBP=0.231,0.23;TYPE=snp,del;VARB=0.0426877,0.00449718;OID=.,.;OPOS=18309651,18309651;OREF=T,T;OALT=G,-;OMAPALT=GG,G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0.0149254,0.955224:3,60:68:1,64:67:2:0,35:1,29:2:0:5:2:2,31:1,29:2:0
chr20	18327570	.	G	A	282.94	PASS	AF=0.421053;AO=32;DP=76;FAO=32;FDP=76;FR=.;FRO=44;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=18;FSRR=26;FWDB=-0.00541033;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=158.417;QD=14.8916;RBI=0.00605367;REFB=0.00446372;REVB=0.00271574;RO=44;SAF=14;SAR=18;SRF=18;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0296317;STB=0.516768;STBP=0.814;TYPE=snp;VARB=-0.00855815;OID=.;OPOS=18327570;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:44:44:32:32:0.421053:18:14:18:26:18:14:18:26
chr20	18393312	.	C	G	380.11	PASS	AF=0.421569;AO=43;DP=102;FAO=43;FDP=102;FR=.;FRO=59;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=26;FSRR=33;FWDB=-0.0191409;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.5683;QD=14.9064;RBI=0.0630419;REFB=-0.00351471;REVB=-0.0600659;RO=58;SAF=24;SAR=19;SRF=26;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111982;STB=0.567757;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=0.00326523;OID=.;OPOS=18393312;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:58:59:43:43:0.421569:19:24:26:32:19:24:26:33
chr20	18393499	.	C	T	275.61	PASS	AF=0.491803;AO=30;DP=61;FAO=30;FDP=61;FR=.;FRO=31;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=0.0159549;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=249.126;QD=18.073;RBI=0.0160816;REFB=-0.00645298;REVB=0.00201498;RO=31;SAF=14;SAR=16;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0741451;STB=0.541457;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=0.00644934;OID=.;OPOS=18393499;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:31:31:30:30:0.491803:16:14:17:14:16:14:17:14
chr20	18414356	.	A	G	771.69	PASS	AF=1;AO=56;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.126512;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.6098;QD=50.6024;RBI=0.131069;REFB=-0.0123721;REVB=0.0342595;RO=1;SAF=31;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0149682;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00371138;OID=.;OPOS=18414356;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:61:61:1:0:56:61:1:25:31:1:0:26:35:0:0
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chr20	23016970	.	T	G	1419.28	PASS	AF=0.98913;AO=89;DP=90;FAO=91;FDP=92;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=47;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0118411;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.161;QD=61.708;RBI=0.0122652;REFB=0.057966;REVB=-0.00319746;RO=1;SAF=44;SAR=45;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0106495;STB=0.505617;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=-0.000214077;OID=.;OPOS=23016970;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:90:92:1:1:89:91:0.98913:45:44:1:0:47:44:1:0
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chr20	23017044	.	C	T	1436.09	PASS	AF=0.96875;AO=93;DP=96;FAO=93;FDP=96;FR=.;FRO=3;FSAF=42;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.00939796;FXX=0.0103082;HRUN=4;LEN=1;MLLD=138.45;QD=59.8371;RBI=0.0107257;REFB=-0.0758715;REVB=-0.00516895;RO=1;SAF=42;SAR=51;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00920605;STB=0.514283;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=0.00168758;OID=.;OPOS=23017044;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:96:96:1:3:93:93:0.96875:51:42:0:1:51:42:0:3
chr20	23017082	.	T	C	1753.95	PASS	AF=0.983193;AO=117;DP=119;FAO=117;FDP=119;FR=.;FRO=2;FSAF=64;FSAR=53;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0150373;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.7089;QD=58.9563;RBI=0.0150727;REFB=0.0131576;REVB=-0.00103376;RO=2;SAF=64;SAR=53;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0146089;STB=0.507691;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=-0.00101403;OID=.;OPOS=23017082;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:119:119:2:2:117:117:0.983193:53:64:2:0:53:64:2:0
chr20	23065209	.	G	A	1355.66	PASS	AF=0.595238;AO=125;DP=210;FAO=125;FDP=210;FR=.;FRO=85;FSAF=58;FSAR=67;FSRF=37;FSRR=48;FWDB=0.0187885;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=229.703;QD=25.8221;RBI=0.0313766;REFB=-0.0127397;REVB=0.0251293;RO=80;SAF=58;SAR=67;SRF=36;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0101686;STB=0.511697;STBP=0.69;TYPE=snp;VARB=0.00764075;OID=.;OPOS=23065209;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:210:210:80:85:125:125:0.595238:67:58:36:44:67:58:37:48
chr20	23065342	.	A	G	1529.88	PASS	AF=1;AO=96;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159177;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.857;QD=63.7448;RBI=0.0611826;REFB=0;REVB=-0.0590756;RO=0;SAF=47;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.53995e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.53919e-05;OID=.;OPOS=23065342;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:96:96:0:0:96:96:1:49:47:0:0:49:47:0:0
chr20	23345844	.	A	C	697.28	PASS	AF=1;AO=44;DP=46;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0443951;FXX=0.0434688;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.693;QD=63.3887;RBI=0.0448554;REFB=0;REVB=0.0064093;RO=0;SAF=12;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00166048;OID=.;OPOS=23345844;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:44:0:0:44:44:1:32:12:0:0:32:12:0:0
chr20	23352480	.	A	G	483.34	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0433386;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.1389;QD=58.587;RBI=0.0547442;REFB=0;REVB=-0.0334469;RO=0;SAF=15;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.64315e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00150827;OID=.;OPOS=23352480;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:18:15:0:0:18:15:0:0
chr20	23352685	.	C	A	817.0	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0203226;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.6228;QD=57.3333;RBI=0.0312913;REFB=0;REVB=0.0237936;RO=0;SAF=22;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.43892e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000258693;OID=.;OPOS=23352685;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:56:57:0:0:56:57:1:34:22:0:0:35:22:0:0
chr20	23355436	.	G	T	83.57	PASS	AF=0.625;AO=10;DP=16;FAO=10;FDP=16;FR=.;FRO=6;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0330742;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.712;QD=20.8931;RBI=0.0355134;REFB=-0.0267734;REVB=-0.0129346;RO=6;SAF=8;SAR=2;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123424;STB=0.571275;STBP=0.563;TYPE=snp;VARB=0.0125733;OID=.;OPOS=23355436;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:16:16:6:6:10:10:0.625:2:8:4:2:2:8:4:2
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chr20	23361613	.	C	T	803.29	PASS	AF=0.982759;AO=56;DP=57;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0281159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.964;QD=55.3991;RBI=0.032461;REFB=-0.106245;REVB=0.0162239;RO=0;SAF=26;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.29784e-08;STB=0.507934;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.000518951;OID=.;OPOS=23361613;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:57:58:0:1:56:57:0.982759:30:26:0:0:31:26:0:1
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chr20	25195387	.	A	AT	557.51	PASS	AF=1;AO=10;DP=86;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00556855;FXX=0.0722804;HRUN=6;LEN=1;MLLD=11.2277;QD=28.9618;RBI=0.0865338;REFB=0.00907027;REVB=-0.0863545;RO=75;SAF=4;SAR=6;SRF=46;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.253001;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00532039;OID=.;OPOS=25195388;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:10:86:77:77:0:47:30:0:0:11:75:4:6:46:29
chr20	25195394	.	C	T	1289.53	PASS	AF=0.988372;AO=81;DP=83;FAO=85;FDP=86;FR=.;FRO=1;FSAF=49;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0311886;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.9408;QD=59.9784;RBI=0.0413723;REFB=-0.0431632;REVB=0.0271834;RO=1;SAF=46;SAR=35;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0133364;STB=0.506848;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=0.000623387;OID=.;OPOS=25195394;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:83:86:1:1:81:85:0.988372:35:46:0:1:36:49:0:1
chr20	25195509	.	A	G	1172.01	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0140631;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=297.989;QD=60.8835;RBI=0.0147716;REFB=0;REVB=0.0045198;RO=0;SAF=38;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5078e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.11751e-06;OID=.;OPOS=25195509;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:39:38:0:0:39:38:0:0
chr20	25207074	.	T	C	1665.03	PASS	AF=1;AO=110;DP=111;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0153043;FXX=0.0090082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.613;QD=60.5467;RBI=0.0169008;REFB=0;REVB=0.00717045;RO=0;SAF=38;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.83262e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.79877e-05;OID=.;OPOS=25207074;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:111:110:0:0:110:110:1:72:38:0:0:72:38:0:0
chr20	25259006	.	G	T	684.6	PASS	AF=0.674419;AO=58;DP=86;FAO=58;FDP=86;FR=.;FRO=28;FSAF=28;FSAR=30;FSRF=19;FSRR=9;FWDB=0.00211862;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.473;QD=31.8418;RBI=0.0227137;REFB=-0.0060338;REVB=0.0226147;RO=28;SAF=28;SAR=30;SRF=19;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117641;STB=0.563528;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=0.00233835;OID=.;OPOS=25259006;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:28:28:58:58:0.674419:30:28:19:9:30:28:19:9
chr20	25260931	.	A	G	1008.47	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0178211;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.294;QD=59.3216;RBI=0.01905;REFB=0;REVB=0.00673128;RO=0;SAF=40;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.18649e-05;OID=.;OPOS=25260931;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:28:40:0:0:28:40:0:0
chr20	25262769	.	G	A	571.19	PASS	AF=0.851852;AO=46;DP=54;FAO=46;FDP=54;FR=.;FRO=8;FSAF=29;FSAR=17;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.0109635;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.785;QD=42.3105;RBI=0.0244753;REFB=-0.00405649;REVB=0.0218824;RO=8;SAF=29;SAR=17;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00161295;STB=0.500863;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00109005;OID=.;OPOS=25262769;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:54:54:8:8:46:46:0.851852:17:29:5:3:17:29:5:3
chr20	25264814	.	T	C	572.85	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0174541;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.2586;QD=60.2994;RBI=0.0180087;REFB=0;REVB=0.00443504;RO=0;SAF=22;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00016733;OID=.;OPOS=25264814;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:16:22:0:0:16:22:0:0
chr20	25268920	.	T	C	565.19	PASS	AF=0.95122;AO=40;DP=41;FAO=39;FDP=41;FR=.;FRO=2;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.02334;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.4981;QD=55.1405;RBI=0.0427541;REFB=-0.105746;REVB=0.0358212;RO=0;SAF=23;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.4817e-08;STB=0.529397;STBP=0.136;TYPE=snp;VARB=0.00795768;OID=.;OPOS=25268920;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:41:41:0:2:40:39:0.95122:17:23:0:0:16:23:0:2
chr20	25276297	.	G	A	805.19	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0185712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.846;QD=64.415;RBI=0.0340645;REFB=0;REVB=0.028557;RO=0;SAF=25;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.62787e-05;OID=.;OPOS=25276297;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:25:25:0:0:25:25:0:0
chr20	25282944	.	A	G	685.43	PASS	AF=0.961538;AO=50;DP=52;FAO=50;FDP=52;FR=.;FRO=2;FSAF=20;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0160812;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=226.042;QD=52.7253;RBI=0.0176073;REFB=-0.187604;REVB=0.00717023;RO=0;SAF=20;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.503998;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=1.36328e-05;OID=.;OPOS=25282944;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:52:52:0:2:50:50:0.961538:30:20:0:0:30:20:1:1
chr20	25456888	.	A	G	1472.39	PASS	AF=1;AO=92;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0427118;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.2236;QD=63.3287;RBI=0.0598141;REFB=0;REVB=-0.0418739;RO=0;SAF=39;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.40861e-06;OID=.;OPOS=25456888;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:93:93:0:0:92:93:1:53:39:0:0:54:39:0:0
chr20	25457049	.	GCTCCCA	G	799.14	PASS	AF=1;AO=51;DP=55;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0220899;FXX=0;HRUN=1;LEN=6;MLLD=230.49;QD=57.0815;RBI=0.0303193;REFB=0;REVB=0.0207677;RO=0;SAF=26;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94283e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=5.28946e-05;OID=.;OPOS=25457050;OREF=CTCCCA;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:51:55:56:56:0:30:26:0:0:4:0:26:25:0:0
chr20	25591862	.	A	T	313.09	PASS	AF=0.83871;AO=19;DP=26;FAO=26;FDP=31;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.0122688;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.493;QD=40.399;RBI=0.0313908;REFB=-0.0945908;REVB=0.0288939;RO=7;SAF=4;SAR=15;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173665;STB=0.550984;STBP=0.366;TYPE=snp;VARB=0.0203967;OID=.;OPOS=25591862;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:26:26:31:7:5:19:26:0.83871:15:4:0:7:22:4:0:5
chr20	25591864	.	A	T	340.92	PASS	AF=0.9;AO=23;DP=27;FAO=27;FDP=30;FR=.;FRO=3;FSAF=4;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0383924;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.124;QD=45.456;RBI=0.0413208;REFB=0.0370803;REVB=0.0152785;RO=4;SAF=4;SAR=19;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0880857;STB=0.53059;STBP=0.583;TYPE=snp;VARB=-0.00171271;OID=.;OPOS=25591864;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:27:30:4:3:23:27:0.9:19:4:0:4:23:4:0:3
chr20	25595829	.	C	T	105.07	PASS	AF=0.246154;AO=16;DP=65;FAO=16;FDP=65;FR=.;FRO=49;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=26;FSRR=23;FWDB=0.0104516;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.646;QD=6.46598;RBI=0.0216724;REFB=0.00294863;REVB=-0.0189857;RO=49;SAF=11;SAR=5;SRF=26;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.200715;STB=0.624585;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=-0.010975;OID=.;OPOS=25595829;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:49:49:16:16:0.246154:5:11:26:23:5:11:26:23
chr20	25595868	.	G	A	128.61	PASS	AF=0.256757;AO=19;DP=74;FAO=19;FDP=74;FR=.;FRO=55;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=26;FSRR=29;FWDB=0.00361599;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.3479;QD=6.95172;RBI=0.0125672;REFB=0.00595336;REVB=0.0120357;RO=55;SAF=13;SAR=6;SRF=26;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.262206;STB=0.660206;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=-0.0173373;OID=.;OPOS=25595868;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:55:55:19:19:0.256757:6:13:26:29:6:13:26:29
chr20	25755672	.	G	T	113.62	PASS	AF=0.186275;AO=19;DP=102;FAO=19;FDP=102;FR=.;FRO=83;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=49;FSRR=34;FWDB=0.00589299;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=217.952;QD=4.4555;RBI=0.0234571;REFB=-0.00703113;REVB=-0.0227048;RO=83;SAF=8;SAR=11;SRF=49;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.211733;STB=0.635121;STBP=0.19;TYPE=snp;VARB=0.026791;OID=.;OPOS=25755672;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:83:83:19:19:0.186275:11:8:49:34:11:8:49:34
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chr20	29623210	.	C	T	115.53	PASS	AF=0.13198;AO=26;DP=197;FAO=26;FDP=197;FR=.;FRO=171;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=87;FSRR=84;FWDB=-0.0117977;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.262;QD=2.34582;RBI=0.0147376;REFB=-0.00833139;REVB=-0.00883245;RO=171;SAF=15;SAR=11;SRF=87;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0863624;STB=0.559436;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.0581544;OID=.;OPOS=29623210;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:197:197:171:171:26:26:0.13198:11:15:87:84:11:15:87:84
chr20	29623217	.	C	T	38.29	PASS	AF=0.0732984;AO=14;DP=192;FAO=14;FDP=191;FR=.;FRO=177;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=92;FSRR=85;FWDB=-0.00444902;FXX=0.00520806;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.1075;QD=0.801915;RBI=0.048485;REFB=-0.00222402;REVB=-0.0482805;RO=175;SAF=7;SAR=7;SRF=91;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0221622;STB=0.518299;STBP=0.912;TYPE=snp;VARB=0.035212;OID=.;OPOS=29623217;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:192:191:175:177:14:14:0.0732984:7:7:91:84:7:7:92:85
chr20	29623223	.	T	C	700.72	PASS	AF=0.411765;AO=77;DP=187;FAO=77;FDP=187;FR=.;FRO=110;FSAF=41;FSAR=36;FSRF=57;FSRR=53;FWDB=-0.0108689;FXX=0.00531887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.535;QD=14.9886;RBI=0.0108899;REFB=-0.000449299;REVB=0.000675839;RO=107;SAF=41;SAR=36;SRF=56;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00949217;STB=0.508428;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=0.000458932;OID=.;OPOS=29623223;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:187:187:107:110:77:77:0.411765:36:41:56:51:36:41:57:53
chr20	29623224	.	C	A	105.32	PASS	AF=0.131148;AO=24;DP=184;FAO=24;FDP=183;FR=.;FRO=159;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=81;FSRR=78;FWDB=-0.0413946;FXX=0.0108102;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.632;QD=2.30217;RBI=0.0431208;REFB=-0.00203525;REVB=-0.0120786;RO=151;SAF=14;SAR=10;SRF=75;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109738;STB=0.564566;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.0174599;OID=.;OPOS=29623224;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:184:183:151:159:24:24:0.131148:10:14:75:76:10:14:81:78
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chr20	29625876	.	C	T	248.71	PASS	AF=0.243421;AO=37;DP=152;FAO=37;FDP=152;FR=.;FRO=115;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=62;FSRR=53;FWDB=-0.0537362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.703;QD=6.54501;RBI=0.0575843;REFB=-0.00646611;REVB=-0.0206974;RO=114;SAF=23;SAR=14;SRF=61;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110959;STB=0.564227;STBP=0.368;TYPE=snp;VARB=0.0206293;OID=.;OPOS=29625876;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:152:152:114:115:37:37:0.243421:14:23:61:53:14:23:62:53
chr20	29625877	.	G	A	91.28	PASS	AF=0.130719;AO=19;DP=152;FAO=20;FDP=153;FR=.;FRO=133;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=77;FSRR=56;FWDB=-0.000945034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.439;QD=2.38642;RBI=0.025297;REFB=-0.000538219;REVB=-0.0252793;RO=129;SAF=8;SAR=11;SRF=74;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188726;STB=0.610609;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=0.00604126;OID=.;OPOS=29625877;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:91:152:153:129:133:19:20:0.130719:11:8:74:55:11:9:77:56
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chr20	31025163	.	A	G	201.78	PASS	AF=0.40678;AO=24;DP=59;FAO=24;FDP=59;FR=.;FRO=35;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=22;FSRR=13;FWDB=-0.00948353;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.451;QD=13.6799;RBI=0.0156559;REFB=0.0111479;REVB=-0.0124567;RO=32;SAF=17;SAR=7;SRF=20;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0960951;STB=0.554602;STBP=0.553;TYPE=snp;VARB=-0.016172;OID=.;OPOS=31025163;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:32:35:24:24:0.40678:7:17:20:12:7:17:22:13
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chr20	31676804	.	A	C	1677.22	PASS	AF=1;AO=111;DP=111;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0111193;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.5377;QD=60.4402;RBI=0.0675482;REFB=0;REVB=-0.0666267;RO=0;SAF=53;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000320712;OID=.;OPOS=31676804;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:111:111:0:0:111:111:1:58:53:0:0:58:53:0:0
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chr20	34179907	.	C	T	2584.54	PASS	AF=1;AO=167;DP=167;FAO=167;FDP=167;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0194019;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.0429;QD=61.9052;RBI=0.0385346;REFB=0;REVB=-0.0332939;RO=0;SAF=84;SAR=83;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00018252;OID=.;OPOS=34179907;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:167:167:0:0:167:167:1:83:84:0:0:83:84:0:0
chr20	34183479	.	C	T	425.37	PASS	AF=0.477778;AO=43;DP=90;FAO=43;FDP=90;FR=.;FRO=47;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=23;FWDB=0.00386424;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.3716;QD=18.9055;RBI=0.0323263;REFB=-0.0212486;REVB=-0.0320945;RO=47;SAF=26;SAR=17;SRF=24;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0901404;STB=0.550241;STBP=0.377;TYPE=snp;VARB=0.0327147;OID=.;OPOS=34183479;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:47:47:43:43:0.477778:17:26:24:23:17:26:24:23
chr20	34186953	.	T	C	205.65	PASS	AF=0.313953;AO=27;DP=86;FAO=27;FDP=86;FR=.;FRO=59;FSAF=19;FSAR=8;FSRF=35;FSRR=24;FWDB=-0.0535234;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.4794;QD=9.56486;RBI=0.0591967;REFB=-0.0399995;REVB=-0.0252882;RO=59;SAF=19;SAR=8;SRF=35;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143134;STB=0.58455;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.0473857;OID=.;OPOS=34186953;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:59:59:27:27:0.313953:8:19:35:24:8:19:35:24
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chr20	35236275	.	CTTTTTTT	CTTTTTT,CTTTTTTC	133.28	PASS	AF=0.3125,0.104167;AO=26,10;DP=96;FAO=30,10;FDP=96;FR=.;FRO=56;FSAF=15,8;FSAR=15,2;FSRF=17;FSRR=39;FWDB=-0.0188648,0.113537;FXX=0;HRUN=7,7;LEN=1,1;MLLD=7.41877,21.1732;QD=5.5535;RBI=0.0532772,0.113568;REFB=-0.123355,-0.0776628;REVB=0.0498255,0.00268569;RO=44;SAF=12,7;SAR=14,3;SRF=13;SRR=31;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.18661,0.468476;STB=0.627827,0.867121;STBP=0.094,0.028;TYPE=del,snp;VARB=0.11802,-0.00287132;OID=.,.;OPOS=35236276,35236282;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=CTTTTTT,CTTTTTTC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.3125,0.104167:26,10:96:30,10:96:56:15,8:15,2:17:39:68:44:12,7:14,3:13:31
chr20	35710453	.	T	C	805.14	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0822827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.542;QD=64.4115;RBI=0.0843067;REFB=0;REVB=0.0183625;RO=0;SAF=27;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000449389;OID=.;OPOS=35710453;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:23:27:0:0:23:27:0:0
chr20	35807790	.	G	GCTTACAGACAGGGCCCCGCGGCCGGCACT	183.78	PASS	AF=0.372881;AO=21;DP=68;FAO=22;FDP=59;FR=.;FRO=37;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=27;FSRR=10;FWDB=-0.0093131;FXX=0.16899;HRUN=1;LEN=29;MLLD=578.763;QD=12.4597;RBI=0.0188895;REFB=-0.0123439;REVB=0.0164341;RO=37;SAF=9;SAR=12;SRF=27;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.323256;STB=0.693173;STBP=0.038;TYPE=ins;VARB=0.0130671;OID=.;OPOS=35807791;OREF=-;OALT=CTTACAGACAGGGCCCCGCGGCCGGCACT;OMAPALT=GCTTACAGACAGGGCCCCGCGGCCGGCACT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.372881:21:68:22:59:37:9:13:27:10:99:37:9:12:27:10
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chr20	42310509	.	T	C	743.82	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0521972;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.359;QD=63.3037;RBI=0.0584138;REFB=0;REVB=0.0262226;RO=0;SAF=13;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00022185;OID=.;OPOS=42310509;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:47:0:0:44:47:1:31:13:0:0:31:16:0:0
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chr20	48729677	.	C	G	327.39	PASS	AF=1;AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0126589;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.794;QD=54.5647;RBI=0.0564906;REFB=0;REVB=0.0550539;RO=0;SAF=7;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00019227;OID=.;OPOS=48729677;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:24:0:0:24:24:1:17:7:0:0:17:7:0:0
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chr20	55033713	.	G	A	37.45	PASS	AF=0.352941;AO=6;DP=17;FAO=6;FDP=17;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=10;FWDB=0.0140895;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.859;QD=8.81109;RBI=0.0158233;REFB=-0.00324588;REVB=0.00720166;RO=10;SAF=2;SAR=4;SRF=1;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.309981;STB=0.699503;STBP=0.398;TYPE=snp;VARB=0.00480565;OID=.;OPOS=55033713;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:17:17:10:11:6:6:0.352941:4:2:1:9:4:2:1:10
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chr20	55072459	.	AATTTTG	AATTT,AATTTG,ATTTG	85.73	PASS	AF=0.030303,0.272727,0.242424;AO=4,5,7;DP=35;FAO=1,9,8;FDP=33;FR=.;FRO=15;FSAF=0,0,2;FSAR=1,9,6;FSRF=0;FSRR=15;FWDB=-0.0523788,0.088431,0.0561212;FXX=0;HRUN=4,4,4;LEN=2,1,2;MLLD=216.491,13.1705,23.4834;QD=10.3916;RBI=0.0548316,0.122728,0.0569416;REFB=-0.00660483,-0.189642,-0.0864904;REVB=-0.0162162,-0.0851013,-0.00963078;RO=15;SAF=0,0,2;SAR=4,5,5;SRF=0;SRR=15;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0.531792;STB=0.5,0.5,0.777398;STBP=1,1,0.474;TYPE=del,del,del;VARB=0.0806967,0.194794,0.101916;OID=.,.,.;OPOS=55072464,55072461,55072460;OREF=TG,T,AT;OALT=-,-,-;OMAPALT=AATTT,AATTTG,ATTTG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/3:0.030303,0.272727,0.242424:4,5,7:35:1,9,8:33:15:0,0,2:1,9,6:0:15:43:15:0,0,2:4,5,5:0:15
chr20	55072472	.	A	G	485.7	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0490353;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.868;QD=57.1411;RBI=0.0843579;REFB=0;REVB=0.0686425;RO=0;SAF=2;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000210223;OID=.;OPOS=55072472;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:34:0:0:31:34:1:29:2:0:0:31:3:0:0
chr20	55088404	.	A	G	1305.82	PASS	AF=1;AO=83;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00767024;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.921;QD=62.1821;RBI=0.0101528;REFB=0;REVB=0.00665181;RO=0;SAF=38;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.04629e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000174966;OID=.;OPOS=55088404;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:84:0:0:83:84:1:45:38:0:0:45:39:0:0
chr20	55263544	.	AGT	A	163.65	PASS	AF=0.53125;AO=17;DP=32;FAO=17;FDP=32;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=-0.00906522;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=284.034;QD=20.4561;RBI=0.0164373;REFB=-0.0209564;REVB=0.0137116;RO=15;SAF=6;SAR=11;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0179024;STB=0.51011;STBP=0.967;TYPE=del;VARB=0.02292;OID=.;OPOS=55263545;OREF=GT;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.53125:17:32:17:32:15:6:11:5:10:99:15:6:11:5:10
chr20	55263662	.	T	G	689.31	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0885321;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.9453;QD=62.6641;RBI=0.0885947;REFB=0;REVB=-0.00332829;RO=0;SAF=22;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00146173;OID=.;OPOS=55263662;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:22:22:0:0:22:22:0:0
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chr20	57572675	.	A	G	1677.4	PASS	AF=1;AO=110;DP=111;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0104776;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.565;QD=60.4468;RBI=0.0152541;REFB=0;REVB=0.0110864;RO=0;SAF=63;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.54139e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.40091e-05;OID=.;OPOS=57572675;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:111:111:0:0:110:111:1:47:63:0:0:48:63:0:0
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chr20	57834150	.	A	T	506.09	PASS	AF=0.510417;AO=49;DP=95;FAO=49;FDP=96;FR=.;FRO=47;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=19;FSRR=28;FWDB=0.0024904;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=43.7083;QD=21.0871;RBI=0.00543992;REFB=-0.031801;REVB=-0.00483639;RO=44;SAF=27;SAR=22;SRF=17;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140617;STB=0.571521;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=0.0188605;OID=.;OPOS=57834150;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:96:44:47:49:49:0.510417:22:27:17:27:22:27:19:28
chr20	58523103	.	AG	A,AA	225.52	PASS	AF=0.32,0.48;AO=4,11;DP=21;FAO=8,12;FDP=25;FR=.;FRO=5;FSAF=1,5;FSAR=7,7;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0296708,0.0269116;FXX=0.0384468;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=177.493,178.884;QD=36.0832;RBI=0.0314759,0.0290338;REFB=-0.0501085,-0.0419379;REVB=0.0105059,0.0108963;RO=5;SAF=0,5;SAR=4,6;SRF=5;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.804028,-0.296967;STB=0.856199,0.666405;STBP=0.006,0.05;TYPE=del,snp;VARB=-0.0130165,0.0180515;OID=.,.;OPOS=58523104,58523104;OREF=G,G;OALT=-,A;OMAPALT=A,AA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.32,0.48:4,11:21:8,12:25:5:1,5:7,7:5:0:15:5:0,5:4,6:5:0
chr20	58523276	.	A	G	357.59	PASS	AF=0.354839;AO=44;DP=124;FAO=44;FDP=124;FR=.;FRO=80;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=46;FSRR=34;FWDB=-0.00507823;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.155;QD=11.5352;RBI=0.0241773;REFB=-0.00775449;REVB=0.023638;RO=79;SAF=24;SAR=20;SRF=45;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0274145;STB=0.519279;STBP=0.741;TYPE=snp;VARB=0.0138474;OID=.;OPOS=58523276;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:124:124:79:80:44:44:0.354839:20:24:45:34:20:24:46:34
chr20	58533810	.	C	T	717.87	PASS	AF=0.493333;AO=74;DP=152;FAO=74;FDP=150;FR=.;FRO=76;FSAF=33;FSAR=41;FSRF=33;FSRR=43;FWDB=0.075963;FXX=0.013157;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.992;QD=19.1431;RBI=0.0767945;REFB=-0.0108032;REVB=0.0112705;RO=77;SAF=33;SAR=41;SRF=35;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00803126;STB=0.506022;STBP=0.9;TYPE=snp;VARB=0.011463;OID=.;OPOS=58533810;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:152:150:77:76:74:74:0.493333:41:33:35:42:41:33:33:43
chr20	58883534	.	T	C	282.28	PASS	AF=0.52;AO=26;DP=50;FAO=26;FDP=50;FR=.;FRO=24;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=-0.00661259;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.199;QD=22.5827;RBI=0.00973981;REFB=-0.00719527;REVB=-0.00715105;RO=24;SAF=14;SAR=12;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104305;STB=0.558238;STBP=0.419;TYPE=snp;VARB=0.00712432;OID=.;OPOS=58883534;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:24:24:26:26:0.52:12:14:10:14:12:14:10:14
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chr20	60294278	.	C	CG	169.82	PASS	AF=1;AO=5;DP=25;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0542154;FXX=0.249896;HRUN=0;LEN=1;MLLD=20.1466;QD=37.7383;RBI=0.068382;REFB=0;REVB=-0.0416748;RO=20;SAF=4;SAR=1;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.270391;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.000589636;OID=.;OPOS=60294279;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:1:5:25:18:18:0:10:8:0:0:3:20:4:1:12:8
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chr20	60294296	.	G	A	323.46	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0118939;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.8037;QD=53.9094;RBI=0.0214518;REFB=0;REVB=-0.0178526;RO=0;SAF=16;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000797675;OID=.;OPOS=60294296;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:8:16:0:0:8:16:0:0
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chr20	60512292	.	A	G	40.71	PASS	AF=0.148936;AO=7;DP=47;FAO=7;FDP=47;FR=.;FRO=40;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=26;FWDB=0.00224895;FXX=0;HRUN=19;LEN=1;MLLD=208.178;QD=3.46496;RBI=0.00556831;REFB=0.00366072;REVB=0.00509395;RO=40;SAF=1;SAR=6;SRF=14;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.318875;STB=0.73691;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=-0.0155144;OID=.;OPOS=60512292;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:40:47:47:40:40:7:7:0.148936:6:1:14:26:6:1:14:26
chr20	60572663	.	C	A	1548.54	PASS	AF=1;AO=97;DP=97;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0348974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.7702;QD=63.8575;RBI=0.067806;REFB=0;REVB=0.0581362;RO=0;SAF=57;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.58683e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000356985;OID=.;OPOS=60572663;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:97:97:0:0:97:97:1:40:57:0:0:40:57:0:0
chr20	60712511	.	A	G	911.7	PASS	AF=0.969697;AO=64;DP=66;FAO=64;FDP=66;FR=.;FRO=2;FSAF=22;FSAR=42;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00740182;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.596;QD=55.2547;RBI=0.0103482;REFB=-0.0196744;REVB=-0.00723174;RO=2;SAF=22;SAR=42;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00987156;STB=0.505228;STBP=0.775;TYPE=snp;VARB=1.73642e-07;OID=.;OPOS=60712511;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:66:66:2:2:64:64:0.969697:42:22:1:1:42:22:1:1
chr20	60713311	.	G	A	789.25	PASS	AF=1;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00384222;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.2881;QD=64.4289;RBI=0.0113628;REFB=0;REVB=-0.0106935;RO=0;SAF=28;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000138912;OID=.;OPOS=60713311;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:49:0:0:49:49:1:21:28:0:0:21:28:0:0
chr20	60713332	.	A	G	462.06	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0210121;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.796;QD=57.7573;RBI=0.0619121;REFB=0;REVB=0.0582375;RO=0;SAF=21;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000575388;OID=.;OPOS=60713332;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:32:0:0:27:32:1:6:21:0:0:10:22:0:0
chr20	60734000	.	T	C,TC	36.46	PASS	AF=0.0952381,0.285714;AO=6,2;DP=20;FAO=2,6;FDP=21;FR=.;FRO=13;FSAF=1,5;FSAR=1,1;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.179673,-0.0250373;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=34.1919,12.2438;QD=6.94512;RBI=0.18688,0.0330092;REFB=-0.0378959,-0.158456;REVB=-0.0513994,-0.0215114;RO=12;SAF=5,1;SAR=1,1;SRF=6;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.403885,0;STB=0.533003,0.74376;STBP=0.889,0.219;TYPE=snp,ins;VARB=0.116005,0.183937;OID=.,.;OPOS=60734000,60734001;OREF=T,-;OALT=C,C;OMAPALT=C,TC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:23:20:21:12:13:6,2:2,6:0.0952381,0.285714:1,1:5,1:6:6:1,1:1,5:7:6
chr20	60768497	.	C	T	1339.3	PASS	AF=1;AO=75;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=54;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0307699;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=298.971;QD=62.2932;RBI=0.0423898;REFB=0;REVB=0.0291566;RO=0;SAF=49;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000241413;OID=.;OPOS=60768497;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:86:0:0:75:86:1:26:49:0:0:32:54:0:0
chr20	60808026	.	C	T	894.85	PASS	AF=0.497238;AO=90;DP=181;FAO=90;FDP=181;FR=.;FRO=91;FSAF=44;FSAR=46;FSRF=42;FSRR=49;FWDB=-0.00623384;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.116;QD=19.7756;RBI=0.00659227;REFB=-0.022593;REVB=-0.00214411;RO=90;SAF=44;SAR=46;SRF=41;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0303456;STB=0.513763;STBP=0.715;TYPE=snp;VARB=0.016046;OID=.;OPOS=60808026;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:181:181:90:91:90:90:0.497238:46:44:41:49:46:44:42:49
chr20	60831300	.	G	A	792.14	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0132541;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=184.322;QD=63.3711;RBI=0.0159632;REFB=0;REVB=0.00889679;RO=0;SAF=20;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000589633;OID=.;OPOS=60831300;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:50:0:0:49:50:1:29:20:0:0:29:21:0:0
chr20	60881330	.	G	A	2067.37	PASS	AF=0.992537;AO=133;DP=134;FAO=133;FDP=134;FR=.;FRO=1;FSAF=72;FSAR=61;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00228151;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.967;QD=61.7125;RBI=0.0194682;REFB=-0.112475;REVB=0.019334;RO=1;SAF=72;SAR=61;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00655629;STB=0.503448;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.000239739;OID=.;OPOS=60881330;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:134:134:1:1:133:133:0.992537:61:72:1:0:61:72:1:0
chr20	60881780	.	T	C	1725.46	PASS	AF=1;AO=113;DP=115;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0071046;FXX=0.0086949;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.9823;QD=60.5425;RBI=0.00967971;REFB=0;REVB=-0.00657429;RO=0;SAF=52;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.30758e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00219984;OID=.;OPOS=60881780;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:115:114:0:0:113:114:1:61:52:0:0:62:52:0:0
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chr20	60891827	.	C	G	1741.43	PASS	AF=0.549153;AO=162;DP=295;FAO=162;FDP=295;FR=.;FRO=133;FSAF=75;FSAR=87;FSRF=63;FSRR=70;FWDB=0.032607;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.5739;QD=23.6126;RBI=0.0512593;REFB=0.0167844;REVB=-0.0395512;RO=131;SAF=75;SAR=87;SRF=63;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0148275;STB=0.504856;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=-0.0161164;OID=.;OPOS=60891827;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:295:295:131:133:162:162:0.549153:87:75:63:68:87:75:63:70
chr20	60892526	.	A	G	2373.39	PASS	AF=0.993333;AO=149;DP=150;FAO=149;FDP=150;FR=.;FRO=1;FSAF=74;FSAR=75;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0120987;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.329;QD=63.2903;RBI=0.0139863;REFB=-0.16198;REVB=-0.00701705;RO=1;SAF=74;SAR=75;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00638428;STB=0.503355;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.000297346;OID=.;OPOS=60892526;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:150:150:1:1:149:149:0.993333:75:74:1:0:75:74:1:0
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chr20	60897487	.	C	T	1529.99	PASS	AF=1;AO=96;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0380172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.6148;QD=63.7495;RBI=0.038114;REFB=0;REVB=0.00271496;RO=0;SAF=46;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.54587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000154948;OID=.;OPOS=60897487;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:96:96:0:0:96:96:1:50:46:0:0:50:46:0:0
chr20	60899206	.	C	T	1471.71	PASS	AF=1;AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0535779;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.6401;QD=63.2993;RBI=0.0615197;REFB=0;REVB=0.0302338;RO=0;SAF=47;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00060187;OID=.;OPOS=60899206;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:93:93:0:0:93:93:1:46:47:0:0:46:47:0:0
chr20	60900481	.	A	G	2970.77	PASS	AF=0.989796;AO=174;DP=178;FAO=194;FDP=196;FR=.;FRO=2;FSAF=85;FSAR=109;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.031684;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=34.4273;QD=60.628;RBI=0.0472883;REFB=-0.134086;REVB=0.0351043;RO=3;SAF=79;SAR=95;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00691255;STB=0.500641;STBP=0.854;TYPE=snp;VARB=0.00226601;OID=.;OPOS=60900481;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:178:196:3:2:174:194:0.989796:95:79:2:1:109:85:1:1
chr20	60900579	.	C	A	1548.38	PASS	AF=1;AO=97;DP=97;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0476775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.4197;QD=63.8508;RBI=0.0476844;REFB=0;REVB=-0.000810475;RO=0;SAF=41;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.55487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000215963;OID=.;OPOS=60900579;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:97:97:0:0:97:97:1:56:41:0:0:56:41:0:0
chr20	60904853	.	T	C	875.67	PASS	AF=0.714286;AO=75;DP=106;FAO=75;FDP=105;FR=.;FRO=30;FSAF=30;FSAR=45;FSRF=29;FSRR=1;FWDB=-0.0029428;FXX=0.00943307;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.801;QD=33.359;RBI=0.0314589;REFB=-0.0124926;REVB=0.031321;RO=30;SAF=30;SAR=45;SRF=29;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.294885;STB=0.657952;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00681002;OID=.;OPOS=60904853;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:105:30:30:75:75:0.714286:45:30:29:1:45:30:29:1
chr20	60905878	.	A	G	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0164628;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.577;QD=51.9167;RBI=0.0287194;REFB=0;REVB=-0.0235325;RO=0;SAF=11;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.8427e-05;OID=.;OPOS=60905878;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:10:11:0:0:10:11:0:0
chr20	60907446	.	T	C	1541.88	PASS	AF=0.981308;AO=105;DP=107;FAO=105;FDP=107;FR=.;FRO=2;FSAF=74;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0220155;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=224.176;QD=57.6403;RBI=0.0509893;REFB=-0.120164;REVB=0.0459916;RO=2;SAF=74;SAR=31;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00869098;STB=0.50458;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.00118225;OID=.;OPOS=60907446;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:107:107:2:2:105:105:0.981308:31:74:1:1:31:74:1:1
chr20	60907675	.	G	A	1198.42	PASS	AF=0.9875;AO=79;DP=82;FAO=79;FDP=80;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0406057;FXX=0.0243873;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.105;QD=59.921;RBI=0.0415245;REFB=0.00271378;REVB=0.00868677;RO=1;SAF=43;SAR=36;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0108827;STB=0.505746;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=-0.000151955;OID=.;OPOS=60907675;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:82:80:1:1:79:79:0.9875:36:43:1:0:36:43:1:0
chr20	60908964	.	G	A	340.73	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0180527;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.7502;QD=54.5175;RBI=0.0689487;REFB=0;REVB=0.0665434;RO=0;SAF=17;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.001091;OID=.;OPOS=60908964;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:8:17:0:0:8:17:0:0
chr20	60908969	.	T	C	411.11	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0308833;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.8946;QD=56.7054;RBI=0.0309011;REFB=0;REVB=-0.00105025;RO=0;SAF=20;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000426939;OID=.;OPOS=60908969;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:9:20:0:0:9:20:0:0
chr20	60909060	.	A	G	958.87	PASS	AF=1;AO=63;DP=64;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00532812;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.586;QD=58.1135;RBI=0.0420842;REFB=0;REVB=-0.0417456;RO=0;SAF=39;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51964e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.13876e-05;OID=.;OPOS=60909060;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:66:0:0:63:66:1:24:39:0:0:27:39:0:0
chr20	60911958	.	G	A	138.01	PASS	AF=0.652174;AO=14;DP=22;FAO=15;FDP=23;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.00638351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.151;QD=24.0014;RBI=0.0246569;REFB=-0.0264293;REVB=0.0238162;RO=8;SAF=5;SAR=9;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0971129;STB=0.562414;STBP=0.457;TYPE=snp;VARB=0.0142022;OID=.;OPOS=60911958;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:22:23:8:8:14:15:0.652174:9:5:4:4:10:5:4:4
chr20	60912683	.	T	C	1135.22	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0159995;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.581;QD=60.545;RBI=0.0459317;REFB=0;REVB=-0.0430551;RO=0;SAF=42;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000231133;OID=.;OPOS=60912683;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:75:0:0:74:75:1:32:42:0:0:33:42:0:0
chr20	60913127	.	A	G	176.65	PASS	AF=0.38;AO=19;DP=50;FAO=19;FDP=50;FR=.;FRO=31;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=-0.00341204;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.1145;QD=14.1318;RBI=0.00901458;REFB=0.00936955;REVB=-0.0083439;RO=31;SAF=11;SAR=8;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13593;STB=0.578864;STBP=0.402;TYPE=snp;VARB=-0.00881873;OID=.;OPOS=60913127;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:31:31:19:19:0.38:8:11:14:17:8:11:14:17
chr20	60917294	.	G	A	30.99	PASS	AF=0.5;AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.0653188;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.9042;QD=12.3959;RBI=0.0966956;REFB=0.05049;REVB=-0.0712986;RO=5;SAF=3;SAR=2;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0670283;OID=.;OPOS=60917294;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:27:10:10:5:5:5:5:0.5:2:3:3:2:2:3:3:2
chr20	60920624	.	A	G	68.78	PASS	AF=0.5;AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=0.0615079;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.784;QD=15.2837;RBI=0.0685104;REFB=0.0166228;REVB=-0.0301737;RO=9;SAF=3;SAR=6;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.36755;STB=0.713832;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=-0.0042485;OID=.;OPOS=60920624;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:18:18:9:9:9:9:0.5:6:3:7:2:6:3:7:2
chr20	60920887	.	G	A	230.82	PASS	AF=0.55;AO=22;DP=40;FAO=22;FDP=40;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.0208134;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.5748;QD=23.0816;RBI=0.03942;REFB=-0.0123952;REVB=-0.0334774;RO=18;SAF=10;SAR=12;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0367314;STB=0.520529;STBP=0.824;TYPE=snp;VARB=0.0112564;OID=.;OPOS=60920887;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:18:18:22:22:0.55:12:10:9:9:12:10:9:9
chr20	60921643	.	T	C	308.68	PASS	AF=1;AO=23;DP=24;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0178394;FXX=0.0416493;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.21;QD=53.6832;RBI=0.0603337;REFB=0;REVB=0.057636;RO=0;SAF=13;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00109889;OID=.;OPOS=60921643;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:23:0:0:23:23:1:10:13:0:0:10:13:0:0
chr20	60927349	.	C	T	1403.79	PASS	AF=0.989011;AO=90;DP=92;FAO=90;FDP=91;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00195609;FXX=0.0108684;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.164;QD=61.7052;RBI=0.0189611;REFB=0.0482802;REVB=0.01886;RO=1;SAF=45;SAR=45;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0104166;STB=0.505493;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=-2.32702e-05;OID=.;OPOS=60927349;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:92:91:1:1:90:90:0.989011:45:45:1:0:45:45:1:0
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chr20	61431555	.	CCA	C,CC,CCC	205.73	PASS	AF=0.185185,0.259259,0.0185185;AO=10,8,9;DP=59;FAO=10,14,1;FDP=54;FR=.;FRO=29;FSAF=6,7,0;FSAR=4,7,1;FSRF=8;FSRR=21;FWDB=0.027811,0.0358117,0.0396378;FXX=0.0181785;HRUN=5,1,1;LEN=2,1,1;MLLD=209.238,212.466,212.207;QD=15.239;RBI=0.0341608,0.0395713,0.0421393;REFB=-0.0111695,-0.00845926,-0.00628429;REVB=0.0198371,0.0168349,0.0143025;RO=32;SAF=9,4,0;SAR=1,4,9;SRF=10;SRR=22;SSEN=0,0,0;SSEP=0.3,0,0;SSSB=0.666165,0.231349,-0.691513;STB=0.727758,0.650967,0.985711;STBP=0.141,0.195,0.481;TYPE=del,del,snp;VARB=0.0274985,0.0141851,-0.0158369;OID=.,.,.;OPOS=61431556,61431557,61431557;OREF=CA,A,A;OALT=-,-,C;OMAPALT=C,CC,CCC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0.185185,0.259259,0.0185185:10,8,9:59:10,14,1:54:29:6,7,0:4,7,1:8:21:35:32:9,4,0:1,4,9:10:22
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chr20	61512606	.	T	C	997.32	PASS	AF=1;AO=67;DP=69;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0885785;FXX=0.0289813;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.764;QD=59.5416;RBI=0.0888761;REFB=0;REVB=0.00726603;RO=0;SAF=12;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000405611;OID=.;OPOS=61512606;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:69:67:0:0:67:67:1:55:12:0:0:55:12:0:0
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chr20	61869607	.	C	A	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0169449;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=383.542;QD=33.4285;RBI=0.0704265;REFB=0;REVB=0.0683576;RO=0;SAF=5;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00103415;OID=.;OPOS=61869607;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:1:5:0:0:1:5:0:0
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chr20	61870604	.	CT	CTG,TG	256.62	PASS	AF=0.952381,0.047619;AO=16,4;DP=21;FAO=20,1;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=10,1;FSAR=10,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0117251,-0.0299144;FXX=0;HRUN=3,5;LEN=1,2;MLLD=23.7813,15.9576;QD=48.8804;RBI=0.155471,0.152999;REFB=0,0;REVB=-0.155028,-0.150046;RO=0;SAF=8,3;SAR=8,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,4.86674e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,mnp;VARB=0.0025587,-0.0438673;OID=.,.;OPOS=61870606,61870604;OREF=-,CT;OALT=G,TG;OMAPALT=CTG,TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:6:21:21:0:0:16,4:20,1:0.952381,0.047619:8,1:8,3:0:0:10,0:10,1:0:0
chr20	61870727	.	G	C	153.95	PASS	AF=0.5;AO=16;DP=33;FAO=17;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.0201112;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.524;QD=18.1117;RBI=0.0424391;REFB=-0.0351571;REVB=-0.0373714;RO=17;SAF=10;SAR=6;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0894054;STB=0.561969;STBP=0.477;TYPE=snp;VARB=0.0342842;OID=.;OPOS=61870727;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:34:17:17:16:17:0.5:6:10:9:8:6:11:9:8
chr20	61873080	.	T	A	76.65	PASS	AF=0.384615;AO=10;DP=25;FAO=10;FDP=26;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=13;FWDB=-0.0148135;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.776;QD=11.7922;RBI=0.0149527;REFB=-0.0317684;REVB=0.00203596;RO=15;SAF=5;SAR=5;SRF=2;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.381359;STB=0.69198;STBP=0.161;TYPE=snp;VARB=0.0623842;OID=.;OPOS=61873080;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:25:26:15:16:10:10:0.384615:5:5:2:13:5:5:3:13
chr20	61878950	.	A	C	97.29	PASS	AF=0.4;AO=12;DP=30;FAO=12;FDP=30;FR=.;FRO=18;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=15;FWDB=-0.0324465;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.3309;QD=12.9714;RBI=0.129175;REFB=0.0572007;REVB=0.125034;RO=18;SAF=1;SAR=11;SRF=3;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.212119;STB=0.628316;STBP=0.465;TYPE=snp;VARB=-0.0751125;OID=.;OPOS=61878950;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:30:30:18:18:12:12:0.4:11:1:3:15:11:1:3:15
chr20	61879009	.	G	T	57.08	PASS	AF=0.875;AO=7;DP=8;FAO=7;FDP=8;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0339509;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=130.996;QD=28.5377;RBI=0.0365259;REFB=-0.00138188;REVB=0.0134712;RO=1;SAF=3;SAR=4;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124421;STB=0.571224;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=0.00109118;OID=.;OPOS=61879009;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:8:8:1:1:7:7:0.875:4:3:1:0:4:3:1:0
chr20	61880169	.	T	G	116.67	PASS	AF=0.35;AO=14;DP=40;FAO=14;FDP=40;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=-0.0173025;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=205.198;QD=11.6672;RBI=0.017423;REFB=-0.00304694;REVB=-0.00204586;RO=26;SAF=9;SAR=5;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0323715;STB=0.519203;STBP=0.878;TYPE=snp;VARB=0.00377347;OID=.;OPOS=61880169;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:26:26:14:14:0.35:5:9:16:10:5:9:16:10
chr20	61881296	.	A	G	1305.49	PASS	AF=1;AO=84;DP=85;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0201745;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.932;QD=62.166;RBI=0.0203803;REFB=0;REVB=-0.00288885;RO=0;SAF=31;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17151e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.9668e-05;OID=.;OPOS=61881296;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:84:0:0:84:84:1:53:31:0:0:53:31:0:0
chr20	61912715	.	TG	CG,GC	786.84	PASS	AF=0.946429,0.0535714;AO=49,3;DP=54;FAO=53,3;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=21,3;FSAR=32,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0644341,0.0333546;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=195.466,163.865;QD=56.2027;RBI=0.0645075,0.0333873;REFB=0,0;REVB=0.00307682,0.00147758;RO=0;SAF=19,3;SAR=30,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=4.48867e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=-0.00111052,0.176051;OID=.,.;OPOS=61912715,61912715;OREF=T,TG;OALT=C,GC;OMAPALT=CG,GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:11:54:56:0:0:49,3:53,3:0.946429,0.0535714:30,0:19,3:0:0:32,0:21,3:0:0
chr20	61918164	.	C	G	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0164725;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.551;QD=47.8224;RBI=0.0173287;REFB=0;REVB=-0.00537952;RO=0;SAF=8;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000310036;OID=.;OPOS=61918164;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:8:8:0:0:8:8:0:0
chr20	61918221	.	G	A	80.27	PASS	AF=0.526316;AO=10;DP=19;FAO=10;FDP=19;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.022366;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=255.922;QD=16.8988;RBI=0.0227189;REFB=-0.0099212;REVB=0.00398912;RO=9;SAF=4;SAR=6;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0575228;STB=0.533268;STBP=0.85;TYPE=snp;VARB=0.0063956;OID=.;OPOS=61918221;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:19:19:9:9:10:10:0.526316:6:4:3:6:6:4:3:6
chr20	61926513	.	C	T	367.93	PASS	AF=0.184987;AO=68;DP=375;FAO=69;FDP=373;FR=.;FRO=304;FSAF=34;FSAR=35;FSRF=164;FSRR=140;FWDB=0.0160672;FXX=0.00533319;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.667;QD=3.94563;RBI=0.0290235;REFB=-0.0157003;REVB=-0.0241704;RO=303;SAF=33;SAR=35;SRF=164;SRR=139;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0724922;STB=0.538033;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.0639856;OID=.;OPOS=61926513;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:375:373:303:304:68:69:0.184987:35:33:164:139:35:34:164:140
chr20	61941747	.	A	G	900.99	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0165679;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.182;QD=58.1282;RBI=0.0237469;REFB=0;REVB=-0.0170123;RO=0;SAF=30;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.0183e-06;OID=.;OPOS=61941747;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:62:0:0:59:62:1:29:30:0:0:30:32:0:0
chr20	61943275	.	G	C	35.46	PASS	AF=0.0717489;AO=16;DP=222;FAO=16;FDP=223;FR=.;FRO=207;FSAF=1;FSAR=15;FSRF=69;FSRR=138;FWDB=-0.00700003;FXX=0.00888849;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.7085;QD=0.635976;RBI=0.0492783;REFB=-0.00225746;REVB=-0.0487786;RO=206;SAF=1;SAR=15;SRF=68;SRR=138;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.396281;STB=0.872223;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.062487;OID=.;OPOS=61943275;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:222:223:206:207:16:16:0.0717489:15:1:68:138:15:1:69:138
chr20	61951489	.	G	C	393.07	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.027312;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.7281;QD=56.1529;RBI=0.0296389;REFB=0;REVB=-0.0115118;RO=0;SAF=6;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000849301;OID=.;OPOS=61951489;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:22:6:0:0:22:6:0:0
chr20	61956782	.	T	C	416.99	PASS	AF=0.410256;AO=48;DP=117;FAO=48;FDP=117;FR=.;FRO=69;FSAF=18;FSAR=30;FSRF=27;FSRR=42;FWDB=-0.0275524;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.7721;QD=14.2562;RBI=0.0541787;REFB=0.00206467;REVB=-0.0466497;RO=62;SAF=18;SAR=30;SRF=23;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00433053;STB=0.5102;STBP=0.878;TYPE=snp;VARB=-0.00518019;OID=.;OPOS=61956782;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:117:117:62:69:48:48:0.410256:30:18:23:39:30:18:27:42
chr20	61981536	.	A	G	670.25	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000825156;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.2958;QD=62.3486;RBI=0.0202754;REFB=0;REVB=-0.0202586;RO=0;SAF=27;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000253525;OID=.;OPOS=61981536;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:16:27:0:0:16:27:0:0
chr20	61981554	.	C	A	850.12	PASS	AF=1;AO=48;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0238011;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.04;QD=56.6746;RBI=0.0638658;REFB=0;REVB=0.0592651;RO=0;SAF=32;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000469921;OID=.;OPOS=61981554;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:48:60:1:16:32:0:0:27:33:0:0
chr20	61982085	.	A	G	2370.36	PASS	AF=1;AO=148;DP=148;FAO=148;FDP=148;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.026327;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.032;QD=64.0638;RBI=0.037679;REFB=0;REVB=-0.0269554;RO=0;SAF=69;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.86736e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.37565e-06;OID=.;OPOS=61982085;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:148:148:0:0:148:148:1:79:69:0:0:79:69:0:0
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chr20	62126299	.	C	T	820.81	PASS	AF=0.529032;AO=82;DP=155;FAO=82;FDP=155;FR=.;FRO=73;FSAF=35;FSAR=47;FSRF=33;FSRR=40;FWDB=0.0224674;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.2318;QD=21.1821;RBI=0.0320686;REFB=-0.005091;REVB=-0.0228826;RO=72;SAF=35;SAR=47;SRF=32;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0153263;STB=0.512094;STBP=0.765;TYPE=snp;VARB=0.00531732;OID=.;OPOS=62126299;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:155:155:72:73:82:82:0.529032:47:35:32:40:47:35:33:40
chr20	62172219	.	G	A	2535.29	PASS	AF=1;AO=157;DP=157;FAO=165;FDP=165;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.006947;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.052;QD=61.4615;RBI=0.0583547;REFB=0;REVB=0.0579397;RO=0;SAF=86;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.45549e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.29353e-05;OID=.;OPOS=62172219;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:157:165:0:0:157:165:1:71:86:0:0:77:88:0:0
chr20	62173562	.	G	T	1377.3	PASS	AF=1;AO=86;DP=87;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0240124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.842;QD=62.6044;RBI=0.0240217;REFB=0;REVB=0.000667103;RO=0;SAF=49;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.6843e-05;OID=.;OPOS=62173562;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:88:0:0:86:88:1:37:49:0:0:39:49:0:0
chr20	62174724	.	G	A	1211.76	PASS	AF=1;AO=73;DP=74;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0250087;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.5088;QD=61.3548;RBI=0.0784628;REFB=0;REVB=0.0743705;RO=0;SAF=32;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000661014;OID=.;OPOS=62174724;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:79:0:0:73:79:1:41:32:0:0:47:32:0:0
chr20	62187187	.	T	C	204.75	PASS	AF=0.45098;AO=22;DP=50;FAO=23;FDP=51;FR=.;FRO=28;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=-0.00482225;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.865;QD=16.0592;RBI=0.00488549;REFB=-0.0249214;REVB=-0.0007835;RO=28;SAF=15;SAR=7;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118398;STB=0.547403;STBP=0.55;TYPE=snp;VARB=0.026639;OID=.;OPOS=62187187;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:51:28:28:22:23:0.45098:7:15:16:12:8:15:16:12
chr20	62187439	.	T	C	74.24	PASS	AF=0.344828;AO=10;DP=29;FAO=10;FDP=29;FR=.;FRO=19;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.0277297;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.347;QD=10.2404;RBI=0.0308124;REFB=-0.0209452;REVB=0.0134338;RO=19;SAF=2;SAR=8;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.340715;STB=0.709216;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=0.0152077;OID=.;OPOS=62187439;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:29:29:19:19:10:10:0.344828:8:2:9:10:8:2:9:10
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chr20	62196884	.	A	G	2368.49	PASS	AF=0.993631;AO=155;DP=156;FAO=156;FDP=157;FR=.;FRO=1;FSAF=93;FSAR=63;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00335076;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.5;QD=60.3438;RBI=0.0171143;REFB=-0.0495929;REVB=-0.0167831;RO=0;SAF=92;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.63964e-08;STB=0.502673;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=-1.53217e-05;OID=.;OPOS=62196884;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:156:157:0:1:155:156:0.993631:63:92:0:0:63:93:1:0
chr20	62198236	.	G	A	72.01	PASS	AF=0.285714;AO=10;DP=35;FAO=10;FDP=35;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=0.0122391;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.912;QD=8.23025;RBI=0.0122994;REFB=-0.0272592;REVB=0.00121669;RO=25;SAF=7;SAR=3;SRF=17;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0270486;STB=0.516745;STBP=0.974;TYPE=snp;VARB=0.0466786;OID=.;OPOS=62198236;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:35:35:25:25:10:10:0.285714:3:7:17:8:3:7:17:8
chr20	62198348	.	C	T	1670.29	PASS	AF=1;AO=109;DP=109;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0406936;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.562;QD=60.1906;RBI=0.0444329;REFB=0;REVB=0.0178412;RO=0;SAF=41;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.92771e-05;OID=.;OPOS=62198348;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:109:111:0:0:109:111:1:68:41:0:0:70:41:0:0
chr20	62198662	.	A	G	678.41	PASS	AF=1;AO=41;DP=42;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00699754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.218;QD=61.6732;RBI=0.0285818;REFB=0;REVB=-0.0277119;RO=0;SAF=36;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.52432e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000151061;OID=.;OPOS=62198662;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:44:0:0:41:44:1:5:36:0:0:6:38:0:0
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chr20	62200860	.	A	G	1337.44	PASS	AF=1;AO=85;DP=86;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0521922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.433;QD=61.4913;RBI=0.0655498;REFB=0;REVB=0.039658;RO=0;SAF=47;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.83693e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000423138;OID=.;OPOS=62200860;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:87:0:0:85:87:1:38:47:0:0:39:48:0:0
chr20	62221364	.	G	A	128.83	PASS	AF=0.357143;AO=14;DP=41;FAO=15;FDP=42;FR=.;FRO=27;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=-0.00983707;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.15;QD=12.2698;RBI=0.0193076;REFB=-0.0208626;REVB=0.0166137;RO=27;SAF=3;SAR=11;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.368777;STB=0.673227;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=0.0628005;OID=.;OPOS=62221364;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:42:27:27:14:15:0.357143:11:3:14:13:11:4:14:13
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chr20	62422080	.	T	C	149.64	PASS	AF=0.34;AO=17;DP=50;FAO=17;FDP=50;FR=.;FRO=33;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=-0.00774213;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.234;QD=11.9713;RBI=0.0396981;REFB=-0.000395736;REVB=0.0389358;RO=33;SAF=6;SAR=11;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.217465;STB=0.628419;STBP=0.188;TYPE=snp;VARB=0.00133414;OID=.;OPOS=62422080;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:33:33:17:17:0.34:11:6:18:15:11:6:18:15
chr20	62522466	.	A	G	729.23	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0129763;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.15;QD=57.1941;RBI=0.0291217;REFB=0;REVB=0.0260709;RO=0;SAF=28;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000183299;OID=.;OPOS=62522466;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:51:0:0:49:51:1:21:28:0:0:22:29:0:0
chr20	62540460	.	A	G	613.33	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0309386;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.304;QD=61.3333;RBI=0.0318041;REFB=0;REVB=0.00736872;RO=0;SAF=18;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.19993e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000439825;OID=.;OPOS=62540460;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:22:18:0:0:22:18:0:0
chr20	62550824	.	G	A	51.54	PASS	AF=0.636364;AO=7;DP=11;FAO=7;FDP=11;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0883676;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=234.77;QD=18.7431;RBI=0.0884141;REFB=-0.0395912;REVB=0.00286585;RO=4;SAF=2;SAR=5;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.298189;STB=0.675156;STBP=0.176;TYPE=snp;VARB=0.00513244;OID=.;OPOS=62550824;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:11:11:4:4:7:7:0.636364:5:2:3:1:5:2:3:1
chr20	62590725	.	G	T	131.59	PASS	AF=0.583333;AO=14;DP=25;FAO=14;FDP=24;FR=.;FRO=10;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.0247225;FXX=0.039984;HRUN=4;LEN=1;MLLD=53.3043;QD=21.9308;RBI=0.0546197;REFB=-0.0185965;REVB=0.0487043;RO=10;SAF=8;SAR=6;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0215412;STB=0.555478;STBP=0.567;TYPE=snp;VARB=0.015822;OID=.;OPOS=62590725;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:25:24:10:10:14:14:0.583333:6:8:6:4:6:8:7:3
chr20	62597571	.	C	T	135.73	PASS	AF=0.7;AO=14;DP=20;FAO=14;FDP=20;FR=.;FRO=6;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.00689874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.1658;QD=27.1458;RBI=0.00926469;REFB=0.0115618;REVB=-0.00618401;RO=6;SAF=8;SAR=6;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0388347;STB=0.521708;STBP=0.724;TYPE=snp;VARB=-0.00509653;OID=.;OPOS=62597571;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:20:20:6:6:14:14:0.7:6:8:3:3:6:8:3:3
chr20	62714783	.	C	G	3686.77	PASS	AF=1;AO=231;DP=232;FAO=233;FDP=233;FR=.;FRO=0;FSAF=94;FSAR=139;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0674761;FXX=0.00427332;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.364;QD=63.2922;RBI=0.0737342;REFB=0;REVB=0.0297274;RO=0;SAF=92;SAR=139;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.31501e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000155737;OID=.;OPOS=62714783;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:20:232:233:0:0:231:233:1:139:92:0:0:139:94:0:0
chr20	62729431	.	C	T	78.53	PASS	AF=0.4;AO=10;DP=25;FAO=10;FDP=25;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=12;FWDB=0.018591;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.391;QD=12.5653;RBI=0.0185974;REFB=-0.0127112;REVB=-0.000489759;RO=15;SAF=5;SAR=5;SRF=3;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.308755;STB=0.679686;STBP=0.175;TYPE=snp;VARB=0.0295364;OID=.;OPOS=62729431;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:25:25:15:15:10:10:0.4:5:5:3:12:5:5:3:12
chr20	62737318	.	G	A	966.0	PASS	AF=0.971014;AO=67;DP=69;FAO=67;FDP=69;FR=.;FRO=2;FSAF=44;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0235104;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=281.072;QD=55.9998;RBI=0.0280471;REFB=-0.134202;REVB=0.0152938;RO=2;SAF=44;SAR=23;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00948345;STB=0.50502;STBP=0.765;TYPE=snp;VARB=0.000456482;OID=.;OPOS=62737318;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:69:69:2:2:67:67:0.971014:23:44:1:1:23:44:1:1
chr21	9907271	.	A	G	1199.08	PASS	AF=0.720588;AO=97;DP=136;FAO=98;FDP=136;FR=.;FRO=38;FSAF=48;FSAR=50;FSRF=22;FSRR=16;FWDB=-0.0364453;FXX=0.00729874;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.4395;QD=35.2669;RBI=0.0716305;REFB=-0.0175179;REVB=-0.0616658;RO=38;SAF=47;SAR=50;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0495655;STB=0.52489;STBP=0.369;TYPE=snp;VARB=0.00748709;OID=.;OPOS=9907271;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:136:136:38:38:97:98:0.720588:50:47:22:16:50:48:22:16
chr21	9907302	.	C	T	316.46	PASS	AF=0.258427;AO=46;DP=179;FAO=46;FDP=178;FR=.;FRO=132;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=66;FSRR=66;FWDB=-0.00200242;FXX=0.00558628;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.023;QD=7.11135;RBI=0.0232028;REFB=-0.00378185;REVB=-0.0231163;RO=132;SAF=24;SAR=22;SRF=66;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0270226;STB=0.516122;STBP=0.796;TYPE=snp;VARB=0.0127322;OID=.;OPOS=9907302;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:179:178:132:132:46:46:0.258427:22:24:66:66:22:24:66:66
chr21	9907322	.	G	T	321.09	PASS	AF=0.255435;AO=47;DP=184;FAO=47;FDP=184;FR=.;FRO=137;FSAF=21;FSAR=26;FSRF=71;FSRR=66;FWDB=0.0207028;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.6491;QD=6.9802;RBI=0.0216418;REFB=0.0040191;REVB=-0.00630565;RO=137;SAF=21;SAR=26;SRF=71;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0889965;STB=0.553169;STBP=0.397;TYPE=snp;VARB=-0.0121886;OID=.;OPOS=9907322;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:184:184:137:137:47:47:0.255435:26:21:71:66:26:21:71:66
chr21	9907340	.	A	G	804.6	PASS	AF=0.497006;AO=82;DP=166;FAO=83;FDP=167;FR=.;FRO=84;FSAF=36;FSAR=47;FSRF=43;FSRR=41;FWDB=-0.0065073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.35;QD=19.2719;RBI=0.00886482;REFB=-0.0097096;REVB=-0.00601997;RO=83;SAF=35;SAR=47;SRF=43;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.083974;STB=0.539592;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=0.00726143;OID=.;OPOS=9907340;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:166:167:83:84:82:83:0.497006:47:35:43:40:47:36:43:41
chr21	9907343	.	G	A	50.66	PASS	AF=0.0903614;AO=15;DP=166;FAO=15;FDP=166;FR=.;FRO=151;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=71;FSRR=80;FWDB=-0.0164833;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.534;QD=1.22078;RBI=0.0515875;REFB=-0.000312721;REVB=0.0488832;RO=148;SAF=7;SAR=8;SRF=70;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00742154;STB=0.503222;STBP=0.983;TYPE=snp;VARB=0.00536584;OID=.;OPOS=9907343;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:50:166:166:148:151:15:15:0.0903614:8:7:70:78:8:7:71:80
chr21	9907345	.	C	T	520.56	PASS	AF=0.380368;AO=62;DP=162;FAO=62;FDP=163;FR=.;FRO=101;FSAF=26;FSAR=36;FSRF=49;FSRR=52;FWDB=0.00566967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.393;QD=12.7745;RBI=0.0240411;REFB=-0.00673174;REVB=-0.023363;RO=99;SAF=26;SAR=36;SRF=49;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0830374;STB=0.541286;STBP=0.397;TYPE=snp;VARB=0.0119449;OID=.;OPOS=9907345;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:162:163:99:101:62:62:0.380368:36:26:49:50:36:26:49:52
chr21	9907375	.	T	C	1345.95	PASS	AF=0.736111;AO=106;DP=144;FAO=106;FDP=144;FR=.;FRO=38;FSAF=45;FSAR=61;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=0.0124175;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.3016;QD=37.3875;RBI=0.0160072;REFB=0.0235312;REVB=-0.0101014;RO=37;SAF=45;SAR=61;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0700286;STB=0.534229;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=-0.0167262;OID=.;OPOS=9907375;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:144:144:37:38:106:106:0.736111:61:45:21:16:61:45:21:17
chr21	9907384	.	GC	AA,AC	1297.47	PASS	AF=0.15493,0.598592;AO=21,85;DP=141;FAO=22,85;FDP=142;FR=.;FRO=35;FSAF=9,34;FSAR=13,51;FSRF=22;FSRR=13;FWDB=-0.00691502,0.000530725;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=145.682,161.064;QD=36.5484;RBI=0.0141237,0.0228509;REFB=-0.0132531,-0.0311459;REVB=0.0123151,0.0228448;RO=35;SAF=9,34;SAR=12,51;SRF=22;SRR=13;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.213164,-0.125776;STB=0.632535,0.567551;STBP=0.134,0.026;TYPE=mnp,snp;VARB=0.00684022,0.0109941;OID=.,.;OPOS=9907384,9907384;OREF=GC,G;OALT=AA,A;OMAPALT=AA,AC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:141:142:35:35:21,85:22,85:0.15493,0.598592:12,51:9,34:22:13:13,51:9,34:22:13
chr21	9907397	.	C	T	839.37	PASS	AF=0.587786;AO=77;DP=131;FAO=77;FDP=131;FR=.;FRO=54;FSAF=28;FSAR=49;FSRF=29;FSRR=25;FWDB=-0.0171135;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.556;QD=25.6297;RBI=0.0230997;REFB=-0.00458615;REVB=-0.0155152;RO=53;SAF=28;SAR=49;SRF=28;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12813;STB=0.574081;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=0.0110485;OID=.;OPOS=9907397;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:131:131:53:54:77:77:0.587786:49:28:28:25:49:28:29:25
chr21	9907398	.	G	C	125.79	PASS	AF=0.176923;AO=23;DP=131;FAO=23;FDP=130;FR=.;FRO=107;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=47;FSRR=60;FWDB=-0.0115815;FXX=0.00763301;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.595;QD=3.87048;RBI=0.0139796;REFB=-0.0154657;REVB=0.00782922;RO=106;SAF=9;SAR=14;SRF=46;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0559915;STB=0.540654;STBP=0.7;TYPE=snp;VARB=0.0242045;OID=.;OPOS=9907398;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:131:130:106:107:23:23:0.176923:14:9:46:60:14:9:47:60
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chr21	9907434	.	T	A	135.8	PASS	AF=0.235955;AO=20;DP=86;FAO=21;FDP=89;FR=.;FRO=68;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=23;FSRR=45;FWDB=-0.0556163;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.336;QD=6.10319;RBI=0.057499;REFB=-0.00503828;REVB=0.0145931;RO=65;SAF=8;SAR=12;SRF=20;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124034;STB=0.571841;STBP=0.495;TYPE=snp;VARB=0.0473111;OID=.;OPOS=9907434;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:89:65:68:20:21:0.235955:12:8:20:45:12:9:23:45
chr21	9907438	.	A	T	144.58	PASS	AF=0.256098;AO=21;DP=81;FAO=21;FDP=82;FR=.;FRO=61;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=21;FSRR=40;FWDB=-0.0270212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.724;QD=7.05269;RBI=0.0276161;REFB=-0.0102982;REVB=-0.00570098;RO=58;SAF=9;SAR=12;SRF=20;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106308;STB=0.565157;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.0244497;OID=.;OPOS=9907438;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:82:58:61:21:21:0.256098:12:9:20:38:12:9:21:40
chr21	9907470	.	G	A	114.47	PASS	AF=0.318182;AO=14;DP=44;FAO=14;FDP=44;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=23;FWDB=0.00512609;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=109.172;QD=10.4059;RBI=0.0148393;REFB=-0.0104612;REVB=0.0139258;RO=29;SAF=8;SAR=6;SRF=6;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.402302;STB=0.720226;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=0.0367462;OID=.;OPOS=9907470;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:29:30:14:14:0.318182:6:8:6:23:6:8:7:23
chr21	9908330	.	AC	GC,GG	2267.95	PASS	AF=0.243243,0.756757;AO=36,112;DP=148;FAO=36,112;FDP=148;FR=.;FRO=0;FSAF=16,54;FSAR=20,58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0017084,0.00680315;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,2;MLLD=149.237,106.338;QD=61.296;RBI=0.022499,0.0422296;REFB=0,0;REVB=-0.022434,-0.041678;RO=0;SAF=16,54;SAR=20,58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.9376e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.0259579,-0.00156438;OID=.,.;OPOS=9908330,9908330;OREF=A,AC;OALT=G,GG;OMAPALT=GC,GG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:148:148:0:0:36,112:36,112:0.243243,0.756757:20,58:16,54:0:0:20,58:16,54:0:0
chr21	9908395	.	A	G	40.44	PASS	AF=0.0677291;AO=17;DP=251;FAO=17;FDP=251;FR=.;FRO=234;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=121;FSRR=113;FWDB=-0.0283446;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.836;QD=0.644453;RBI=0.0384548;REFB=-0.00407121;REVB=-0.0259875;RO=230;SAF=14;SAR=3;SRF=118;SRR=112;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.348166;STB=0.800025;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.0383664;OID=.;OPOS=9908395;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:40:251:251:230:234:17:17:0.0677291:3:14:118:112:3:14:121:113
chr21	9908435	.	G	A	55.99	PASS	AF=0.0833333;AO=19;DP=228;FAO=19;FDP=228;FR=.;FRO=209;FSAF=15;FSAR=4;FSRF=115;FSRR=94;FWDB=-0.0229524;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.576;QD=0.98226;RBI=0.0236676;REFB=-0.00037918;REVB=0.0057743;RO=207;SAF=15;SAR=4;SRF=115;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.288846;STB=0.738426;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.00605528;OID=.;OPOS=9908435;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:228:228:207:209:19:19:0.0833333:4:15:115:92:4:15:115:94
chr21	9909078	.	G	A	811.26	PASS	AF=0.408889;AO=91;DP=225;FAO=92;FDP=225;FR=.;FRO=133;FSAF=42;FSAR=50;FSRF=73;FSRR=60;FWDB=-0.001185;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.1;QD=14.4225;RBI=0.0155676;REFB=-0.0255868;REVB=0.0155224;RO=134;SAF=42;SAR=49;SRF=73;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0882825;STB=0.554472;STBP=0.173;TYPE=snp;VARB=0.0361962;OID=.;OPOS=9909078;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:225:225:134:133:91:92:0.408889:49:42:73:61:50:42:73:60
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chr21	9909080	.	G	A	335.4	PASS	AF=0.228448;AO=53;DP=232;FAO=53;FDP=232;FR=.;FRO=179;FSAF=27;FSAR=26;FSRF=88;FSRR=91;FWDB=-0.00569775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.166;QD=5.78283;RBI=0.00571129;REFB=-0.0121137;REVB=0.000393155;RO=178;SAF=27;SAR=26;SRF=87;SRR=91;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0262441;STB=0.513737;STBP=0.848;TYPE=snp;VARB=0.0330664;OID=.;OPOS=9909080;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:232:232:178:179:53:53:0.228448:26:27:87:91:26:27:88:91
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chr21	9909121	.	C	T	791.01	PASS	AF=0.332226;AO=100;DP=300;FAO=100;FDP=301;FR=.;FRO=201;FSAF=54;FSAR=46;FSRF=103;FSRR=98;FWDB=0.0190172;FXX=0.00331115;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.037;QD=10.5117;RBI=0.0247858;REFB=-0.00947846;REVB=0.015896;RO=199;SAF=54;SAR=46;SRF=103;SRR=96;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0261749;STB=0.518465;STBP=0.639;TYPE=snp;VARB=0.0157989;OID=.;OPOS=9909121;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:300:301:199:201:100:100:0.332226:46:54:103:96:46:54:103:98
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chr21	9909163	.	G	A	176.04	PASS	AF=0.136213;AO=38;DP=300;FAO=41;FDP=301;FR=.;FRO=260;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=124;FSRR=136;FWDB=0.00540554;FXX=0.00331115;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.1281;QD=2.3394;RBI=0.0597344;REFB=0.000676664;REVB=0.0594894;RO=261;SAF=21;SAR=17;SRF=125;SRR=136;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0931393;STB=0.551398;STBP=0.492;TYPE=snp;VARB=-0.00204385;OID=.;OPOS=9909163;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:300:301:261:260:38:41:0.136213:17:21:125:136:19:22:124:136
chr21	9909176	.	C	A	2241.17	PASS	AF=0.690037;AO=187;DP=271;FAO=187;FDP=271;FR=.;FRO=84;FSAF=86;FSAR=101;FSRF=42;FSRR=42;FWDB=0.0692073;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.3245;QD=33.0799;RBI=0.0695179;REFB=0.0159701;REVB=0.00656434;RO=81;SAF=86;SAR=101;SRF=41;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0262639;STB=0.512486;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=-0.00674382;OID=.;OPOS=9909176;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:271:271:81:84:187:187:0.690037:101:86:41:40:101:86:42:42
chr21	9909179	.	C	A	277.05	PASS	AF=0.18797;AO=50;DP=267;FAO=50;FDP=266;FR=.;FRO=216;FSAF=20;FSAR=30;FSRF=102;FSRR=114;FWDB=0.0026468;FXX=0.022058;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.412;QD=4.16614;RBI=0.00280308;REFB=-0.00323012;REVB=0.000922896;RO=215;SAF=20;SAR=30;SRF=101;SRR=114;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0914418;STB=0.559609;STBP=0.346;TYPE=snp;VARB=0.0133017;OID=.;OPOS=9909179;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:267:266:215:216:50:50:0.18797:30:20:101:114:30:20:102:114
chr21	9909204	.	C	T	81.7	PASS	AF=0.103139;AO=23;DP=223;FAO=23;FDP=223;FR=.;FRO=200;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=96;FSRR=104;FWDB=0.0234464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.228;QD=1.46551;RBI=0.0245618;REFB=-0.00273108;REVB=-0.00731755;RO=200;SAF=11;SAR=12;SRF=96;SRR=104;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00211657;STB=0.501561;STBP=0.991;TYPE=snp;VARB=0.0164012;OID=.;OPOS=9909204;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:81:223:223:200:200:23:23:0.103139:12:11:96:104:12:11:96:104
chr21	9909208	.	C	T	214.32	PASS	AF=0.185185;AO=37;DP=213;FAO=40;FDP=216;FR=.;FRO=176;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=85;FSRR=91;FWDB=0.0210758;FXX=0.00917389;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.431;QD=3.96893;RBI=0.0247619;REFB=-0.00581716;REVB=-0.0129984;RO=176;SAF=17;SAR=20;SRF=85;SRR=91;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0303368;STB=0.513882;STBP=0.855;TYPE=snp;VARB=0.0363179;OID=.;OPOS=9909208;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:213:216:176:176:37:40:0.185185:20:17:85:91:20:20:85:91
chr21	9909217	.	C	A	40.07	PASS	AF=0.0765027;AO=14;DP=183;FAO=14;FDP=183;FR=.;FRO=169;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=81;FSRR=88;FWDB=-0.00871208;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.519;QD=0.875863;RBI=0.0120883;REFB=-0.000815859;REVB=-0.0083801;RO=167;SAF=6;SAR=8;SRF=80;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0568786;STB=0.547102;STBP=0.769;TYPE=snp;VARB=0.0206038;OID=.;OPOS=9909217;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:40:183:183:167:169:14:14:0.0765027:8:6:80:87:8:6:81:88
chr21	9909218	.	GT	AC,GC	299.31	PASS	AF=0.189655,0.0804598;AO=34,15;DP=177;FAO=33,14;FDP=174;FR=.;FRO=127;FSAF=17,6;FSAR=16,8;FSRF=60;FSRR=67;FWDB=-0.0394229,-0.104827;FXX=0.0169482;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=159.348,84.6213;QD=6.88059;RBI=0.0394878,0.104837;REFB=-0.00897128,-0.0119032;REVB=0.00226336,0.00145817;RO=122;SAF=17,7;SAR=17,8;SRF=55;SRR=67;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0624777,0.019345;STB=0.533843,0.53982;STBP=0.671,0.744;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0276048,0.0320237;OID=.,.;OPOS=9909218,9909219;OREF=GT,T;OALT=AC,C;OMAPALT=AC,GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:177:174:122:127:34,15:33,14:0.189655,0.0804598:17,8:17,7:55:67:16,8:17,6:60:67
chr21	9909236	.	T	C	44.65	PASS	AF=0.0890411;AO=13;DP=146;FAO=13;FDP=146;FR=.;FRO=133;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=63;FSRR=70;FWDB=-0.0485182;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.443;QD=1.22325;RBI=0.0493032;REFB=-0.00237074;REVB=-0.00876324;RO=130;SAF=6;SAR=7;SRF=60;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.511094;STBP=0.968;TYPE=snp;VARB=0.0294085;OID=.;OPOS=9909236;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:146:146:130:133:13:13:0.0890411:7:6:60:70:7:6:63:70
chr21	9909274	.	G	A	34.45	PASS	AF=0.102564;AO=8;DP=78;FAO=8;FDP=78;FR=.;FRO=70;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=31;FSRR=39;FWDB=-0.00990335;FXX=0.0126566;HRUN=4;LEN=1;MLLD=146.307;QD=1.7665;RBI=0.0155657;REFB=-7.26586e-05;REVB=-0.0120089;RO=69;SAF=1;SAR=7;SRF=31;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.416174;STB=0.82871;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.000539804;OID=.;OPOS=9909274;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:78:78:69:70:8:8:0.102564:7:1:31:38:7:1:31:39
chr21	10181174	.	G	A	164.82	PASS	AF=0.548387;AO=17;DP=31;FAO=17;FDP=31;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.00373661;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=286.472;QD=21.2676;RBI=0.004119;REFB=-0.0222853;REVB=-0.00173319;RO=14;SAF=8;SAR=9;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0805621;STB=0.545401;STBP=0.614;TYPE=snp;VARB=0.0188266;OID=.;OPOS=10181174;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:14:14:17:17:0.548387:9:8:8:6:9:8:8:6
chr21	10181184	.	T	C	161.51	PASS	AF=0.5;AO=17;DP=34;FAO=17;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.0385993;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.275;QD=19.0005;RBI=0.0400477;REFB=-0.0234135;REVB=-0.0106731;RO=17;SAF=8;SAR=9;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0200662;OID=.;OPOS=10181184;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:17:17:17:17:0.5:9:8:8:9:9:8:8:9
chr21	10862599	.	C	T	236.38	PASS	AF=0.22619;AO=38;DP=168;FAO=38;FDP=168;FR=.;FRO=130;FSAF=12;FSAR=26;FSRF=66;FSRR=64;FWDB=0.00285503;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=208.378;QD=5.62819;RBI=0.00896218;REFB=-0.000329311;REVB=0.00849526;RO=130;SAF=12;SAR=26;SRF=66;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.248525;STB=0.652428;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.00138281;OID=.;OPOS=10862599;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:168:168:130:130:38:38:0.22619:26:12:66:64:26:12:66:64
chr21	10862618	.	T	C	1892.82	PASS	AF=0.788043;AO=144;DP=187;FAO=145;FDP=184;FR=.;FRO=39;FSAF=68;FSAR=77;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=-0.00979344;FXX=0.0160419;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.63;QD=41.1483;RBI=0.0269858;REFB=-0.0232354;REVB=0.025146;RO=39;SAF=68;SAR=76;SRF=18;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0042965;STB=0.50158;STBP=0.937;TYPE=snp;VARB=0.00498169;OID=.;OPOS=10862618;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:187:184:39:39:144:145:0.788043:76:68:18:21:77:68:18:21
chr21	10862846	.	A	T	1898.52	PASS	AF=1;AO=118;DP=118;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0425648;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.591;QD=61.2425;RBI=0.0427275;REFB=0;REVB=-0.00372441;RO=0;SAF=59;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000151439;OID=.;OPOS=10862846;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:118:124:0:0:118:124:1:59:59:0:0:59:65:0:0
chr21	10862874	.	A	G	321.18	PASS	AF=0.302158;AO=42;DP=139;FAO=42;FDP=139;FR=.;FRO=97;FSAF=26;FSAR=16;FSRF=57;FSRR=40;FWDB=0.0109094;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.4345;QD=9.24246;RBI=0.0368256;REFB=-0.0152263;REVB=-0.0351726;RO=96;SAF=26;SAR=16;SRF=57;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0316086;STB=0.522977;STBP=0.754;TYPE=snp;VARB=0.0341034;OID=.;OPOS=10862874;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:139:139:96:97:42:42:0.302158:16:26:57:39:16:26:57:40
chr21	10862947	.	G	A	281.01	PASS	AF=0.256098;AO=42;DP=164;FAO=42;FDP=164;FR=.;FRO=122;FSAF=30;FSAR=12;FSRF=60;FSRR=62;FWDB=0.00240708;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.801;QD=6.85399;RBI=0.0208134;REFB=-0.00258017;REVB=-0.0206738;RO=120;SAF=30;SAR=12;SRF=59;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.286649;STB=0.672642;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.00585911;OID=.;OPOS=10862947;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:164:164:120:122:42:42:0.256098:12:30:59:61:12:30:60:62
chr21	10906989	.	C	T	366.02	PASS	AF=0.297619;AO=51;DP=168;FAO=50;FDP=168;FR=.;FRO=118;FSAF=22;FSAR=28;FSRF=59;FSRR=59;FWDB=-0.0172463;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.641;QD=8.71474;RBI=0.0242648;REFB=0.00865952;REVB=-0.0170688;RO=117;SAF=22;SAR=29;SRF=59;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0874859;STB=0.542307;STBP=0.486;TYPE=snp;VARB=-0.0247605;OID=.;OPOS=10906989;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:168:168:117:118:51:50:0.297619:29:22:59:58:28:22:59:59
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chr21	10910311	.	T	G	695.14	PASS	AF=0.75;AO=57;DP=76;FAO=57;FDP=76;FR=.;FRO=19;FSAF=28;FSAR=29;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=-0.00394367;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.948;QD=36.5864;RBI=0.00694398;REFB=-0.00154502;REVB=0.00571544;RO=19;SAF=28;SAR=29;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0572305;STB=0.530734;STBP=0.348;TYPE=snp;VARB=0.00035187;OID=.;OPOS=10910311;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:19:19:57:57:0.75:29:28:7:12:29:28:7:12
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chr21	10943003	.	C	T	70.41	PASS	AF=0.125984;AO=16;DP=128;FAO=16;FDP=127;FR=.;FRO=111;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=47;FSRR=64;FWDB=-0.00971784;FXX=0.00781189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.6341;QD=2.21763;RBI=0.030524;REFB=-0.00251183;REVB=-0.0289358;RO=111;SAF=6;SAR=10;SRF=48;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.073543;STB=0.544092;STBP=0.743;TYPE=snp;VARB=0.0202495;OID=.;OPOS=10943003;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:70:128:127:111:111:16:16:0.125984:10:6:48:63:10:6:47:64
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chr21	10951392	.	G	C	273.73	PASS	AF=0.153846;AO=58;DP=377;FAO=58;FDP=377;FR=.;FRO=319;FSAF=34;FSAR=24;FSRF=142;FSRR=177;FWDB=-0.00855303;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.495;QD=2.90428;RBI=0.0103966;REFB=-0.00658565;REVB=-0.00591066;RO=318;SAF=34;SAR=24;SRF=141;SRR=177;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1831;STB=0.617974;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.0445798;OID=.;OPOS=10951392;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:377:377:318:319:58:58:0.153846:24:34:141:177:24:34:142:177
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chr21	11038802	.	G	A	66.19	PASS	AF=0.0702576;AO=30;DP=427;FAO=30;FDP=427;FR=.;FRO=397;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=202;FSRR=195;FWDB=0.0204232;FXX=0.00233639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.49;QD=0.620053;RBI=0.0212307;REFB=-0.00201056;REVB=-0.00579953;RO=396;SAF=16;SAR=14;SRF=201;SRR=195;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.028651;STB=0.522812;STBP=0.838;TYPE=snp;VARB=0.0255735;OID=.;OPOS=11038802;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:427:427:396:397:30:30:0.0702576:14:16:201:195:14:16:202:195
chr21	11038843	.	G	C	2221.45	PASS	AF=0.639344;AO=192;DP=302;FAO=195;FDP=305;FR=.;FRO=110;FSAF=92;FSAR=103;FSRF=60;FSRR=50;FWDB=0.0516552;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.8389;QD=29.1337;RBI=0.0589113;REFB=-0.0272388;REVB=0.0283246;RO=110;SAF=90;SAR=102;SRF=60;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0519618;STB=0.526568;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=0.0191396;OID=.;OPOS=11038843;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:302:305:110:110:192:195:0.639344:102:90:60:50:103:92:60:50
chr21	11049584	.	C	T	203.77	PASS	AF=0.202312;AO=35;DP=173;FAO=35;FDP=173;FR=.;FRO=138;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=67;FSRR=71;FWDB=0.00293648;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=248.891;QD=4.71145;RBI=0.00887146;REFB=-0.00249514;REVB=-0.00837138;RO=133;SAF=19;SAR=16;SRF=64;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0785649;STB=0.545699;STBP=0.54;TYPE=snp;VARB=0.00976475;OID=.;OPOS=11049584;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:173:173:133:138:35:35:0.202312:16:19:64:69:16:19:67:71
chr21	11049592	.	C	T	203.5	PASS	AF=0.201149;AO=35;DP=175;FAO=35;FDP=174;FR=.;FRO=139;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=67;FSRR=72;FWDB=0.0538403;FXX=0.00571396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.543;QD=4.67811;RBI=0.0539867;REFB=-0.00341861;REVB=-0.00397318;RO=138;SAF=19;SAR=16;SRF=68;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0640733;STB=0.548529;STBP=0.563;TYPE=snp;VARB=0.0210886;OID=.;OPOS=11049592;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:175:174:138:139:35:35:0.201149:16:19:68:70:16:19:67:72
chr21	11057855	.	A	T	754.17	PASS	AF=0.696629;AO=62;DP=90;FAO=62;FDP=89;FR=.;FRO=27;FSAF=38;FSAR=24;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.00802506;FXX=0.0111099;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.454;QD=33.8954;RBI=0.0135571;REFB=-0.0154303;REVB=-0.0109268;RO=27;SAF=38;SAR=24;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118219;STB=0.563777;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=0.00827789;OID=.;OPOS=11057855;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:89:27:27:62:62:0.696629:24:38:11:16:24:38:11:16
chr21	11057888	.	T	A	292.19	PASS	AF=0.350515;AO=34;DP=96;FAO=34;FDP=97;FR=.;FRO=63;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=35;FSRR=28;FWDB=-0.013742;FXX=0.010203;HRUN=3;LEN=1;MLLD=197.524;QD=12.0491;RBI=0.0171975;REFB=-0.00789286;REVB=0.0103398;RO=61;SAF=17;SAR=17;SRF=34;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0640711;STB=0.536061;STBP=0.583;TYPE=snp;VARB=0.0145127;OID=.;OPOS=11057888;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:97:61:63:34:34:0.350515:17:17:34:27:17:17:35:28
chr21	11057929	.	TG	CA,CG	48.51	PASS	AF=0.0408163,0.0816327;AO=4,8;DP=98;FAO=4,8;FDP=98;FR=.;FRO=86;FSAF=1,4;FSAR=3,4;FSRF=40;FSRR=46;FWDB=0.00588661,0.00959842;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=178.21,87.4975;QD=1.97989;RBI=0.0219136,0.013209;REFB=-0.000296171,0.000177749;REVB=-0.0211081,-0.00907453;RO=86;SAF=1,4;SAR=3,4;SRF=40;SRR=46;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.189354,0.039091;STB=0.714004,0.531836;STBP=0.402,0.863;TYPE=mnp,snp;VARB=0.00574206,-0.0313904;OID=.,.;OPOS=11057929,11057929;OREF=TG,T;OALT=CA,C;OMAPALT=CA,CG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:29:98:98:86:86:4,8:4,8:0.0408163,0.0816327:3,4:1,4:40:46:3,4:1,4:40:46
chr21	11058226	.	G	C	171.39	PASS	AF=0.149378;AO=36;DP=241;FAO=36;FDP=241;FR=.;FRO=205;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=102;FSRR=103;FWDB=0.00962459;FXX=0.00413206;HRUN=2;LEN=1;MLLD=270.509;QD=2.84466;RBI=0.0096539;REFB=-0.000440299;REVB=0.000751727;RO=204;SAF=15;SAR=21;SRF=101;SRR=103;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101018;STB=0.569107;STBP=0.356;TYPE=snp;VARB=0.00237909;OID=.;OPOS=11058226;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:241:241:204:205:36:36:0.149378:21:15:101:103:21:15:102:103
chr21	11097574	.	T	A	38.9	PASS	AF=0.132075;AO=7;DP=53;FAO=7;FDP=53;FR=.;FRO=46;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=29;FSRR=17;FWDB=-0.00832075;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.545;QD=2.93556;RBI=0.0128248;REFB=-0.00321625;REVB=-0.00975907;RO=44;SAF=4;SAR=3;SRF=28;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0812017;STB=0.552925;STBP=0.766;TYPE=snp;VARB=0.0226132;OID=.;OPOS=11097574;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:53:53:44:46:7:7:0.132075:3:4:28:16:3:4:29:17
chr21	11097608	.	C	T	32.19	PASS	AF=0.104478;AO=7;DP=67;FAO=7;FDP=67;FR=.;FRO=60;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=33;FSRR=27;FWDB=-0.0189516;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.1303;QD=1.92183;RBI=0.0214321;REFB=-0.00477701;REVB=-0.0100085;RO=60;SAF=5;SAR=2;SRF=33;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198475;STB=0.655645;STBP=0.447;TYPE=snp;VARB=0.0484473;OID=.;OPOS=11097608;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:32:67:67:60:60:7:7:0.104478:2:5:33:27:2:5:33:27
chr21	11098674	.	T	C	727.8	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0542407;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.12;QD=63.2867;RBI=0.0607036;REFB=0;REVB=0.0272556;RO=0;SAF=32;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000208382;OID=.;OPOS=11098674;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:14:32:0:0:14:32:0:0
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chr21	14419915	.	A	G	424.55	PASS	AF=0.248996;AO=62;DP=250;FAO=62;FDP=249;FR=.;FRO=187;FSAF=44;FSAR=18;FSRF=89;FSRR=98;FWDB=-0.00989843;FXX=0.00399984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.81;QD=6.82011;RBI=0.020135;REFB=-0.00581504;REVB=0.0175339;RO=188;SAF=44;SAR=18;SRF=89;SRR=99;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.304015;STB=0.680655;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0149314;OID=.;OPOS=14419915;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:250:249:188:187:62:62:0.248996:18:44:89:99:18:44:89:98
chr21	14420005	.	A	G	2627.34	PASS	AF=0.750903;AO=207;DP=277;FAO=208;FDP=277;FR=.;FRO=69;FSAF=118;FSAR=90;FSRF=29;FSRR=40;FWDB=0.00666421;FXX=0.00359699;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.673;QD=37.9399;RBI=0.00666612;REFB=-0.0098433;REVB=-0.000159412;RO=68;SAF=117;SAR=90;SRF=29;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0649752;STB=0.536923;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.00365024;OID=.;OPOS=14420005;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:277:277:68:69:207:208:0.750903:90:117:29:39:90:118:29:40
chr21	14778721	.	A	T	173.53	PASS	AF=1;AO=14;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0511602;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.858;QD=46.2751;RBI=0.0511657;REFB=0;REVB=0.000746158;RO=0;SAF=6;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0012724;OID=.;OPOS=14778721;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:14:15:1:8:6:0:0:9:6:0:0
chr21	14982721	.	A	G	37.43	PASS	AF=0.352941;AO=6;DP=17;FAO=6;FDP=17;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=9;FWDB=0.0374421;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.638;QD=8.80733;RBI=0.051966;REFB=-0.0161056;REVB=-0.0360355;RO=11;SAF=2;SAR=4;SRF=2;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194949;STB=0.6187;STBP=0.563;TYPE=snp;VARB=0.029271;OID=.;OPOS=14982721;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:17:17:11:11:6:6:0.352941:4:2:2:9:4:2:2:9
chr21	15013735	.	A	G	454.91	PASS	AF=0.454545;AO=50;DP=110;FAO=50;FDP=110;FR=.;FRO=60;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=29;FSRR=31;FWDB=-0.00371519;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.426;QD=16.5423;RBI=0.0100678;REFB=-0.0129031;REVB=0.00935727;RO=60;SAF=26;SAR=24;SRF=29;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0358339;STB=0.519992;STBP=0.728;TYPE=snp;VARB=0.0177205;OID=.;OPOS=15013735;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:110:60:60:50:50:0.454545:24:26:29:31:24:26:29:31
chr21	15457283	.	AA	GT	35.83	PASS	AF=0.1875;AO=6;DP=34;FAO=6;FDP=32;FR=.;FRO=26;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.00325199;FXX=0.0588062;HRUN=3;LEN=2;MLLD=244.952;QD=4.47877;RBI=0.017366;REFB=-0.00219346;REVB=-0.0170588;RO=26;SAF=2;SAR=4;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200546;STB=0.63783;STBP=0.472;TYPE=mnp;VARB=0.00968657;OID=.;OPOS=15457283;OREF=AA;OALT=GT;OMAPALT=GT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:34:32:26:26:6:6:0.1875:4:2:13:13:4:2:13:13
chr21	15457293	.	T	G	128.82	PASS	AF=0.365854;AO=15;DP=41;FAO=15;FDP=41;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=0.00857936;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.1481;QD=12.5677;RBI=0.00947288;REFB=0.00277751;REVB=-0.00401622;RO=26;SAF=6;SAR=9;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149835;STB=0.588117;STBP=0.445;TYPE=snp;VARB=-0.00816732;OID=.;OPOS=15457293;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:26:26:15:15:0.365854:9:6:14:12:9:6:14:12
chr21	15457297	.	C	G	166.54	PASS	AF=0.382979;AO=18;DP=48;FAO=18;FDP=47;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=0.0347605;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.4943;QD=14.1737;RBI=0.0439065;REFB=-0.000640853;REVB=-0.0268233;RO=30;SAF=9;SAR=9;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0357603;STB=0.53188;STBP=0.726;TYPE=snp;VARB=0.00204833;OID=.;OPOS=15457297;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:47:30:29:18:18:0.382979:9:9:16:14:9:9:16:13
chr21	15457318	.	T	G	236.26	PASS	AF=0.481481;AO=26;DP=54;FAO=26;FDP=54;FR=.;FRO=28;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.0164366;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.9997;QD=17.501;RBI=0.0198804;REFB=0.00559737;REVB=0.0111833;RO=28;SAF=13;SAR=13;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00269731;OID=.;OPOS=15457318;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:28:28:26:26:0.481481:13:13:14:14:13:13:14:14
chr21	15457339	.	T	G	320.0	PASS	AF=0.546875;AO=31;DP=64;FAO=35;FDP=64;FR=.;FRO=29;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=0.00600713;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.1765;QD=20.0002;RBI=0.0663916;REFB=-0.0392872;REVB=0.0661193;RO=30;SAF=18;SAR=13;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0720245;STB=0.50134;STBP=0.971;TYPE=snp;VARB=0.0459419;OID=.;OPOS=15457339;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:30:29:31:35:0.546875:13:18:15:15:17:18:15:14
chr21	15457350	.	TA	CG	327.45	PASS	AF=0.507463;AO=32;DP=72;FAO=34;FDP=67;FR=.;FRO=33;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=-0.00844719;FXX=0.0694348;HRUN=3;LEN=2;MLLD=292.649;QD=19.5493;RBI=0.030788;REFB=0.00732392;REVB=-0.0296065;RO=33;SAF=17;SAR=15;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0146692;STB=0.507038;STBP=0.926;TYPE=mnp;VARB=-0.00484859;OID=.;OPOS=15457350;OREF=TA;OALT=CG;OMAPALT=CG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:67:33:33:32:34:0.507463:15:17:17:16:16:18:17:16
chr21	15457374	.	G	C	411.04	PASS	AF=0.57971;AO=40;DP=69;FAO=40;FDP=69;FR=.;FRO=29;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=-0.0355198;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.223;QD=23.8285;RBI=0.0380269;REFB=-0.00234128;REVB=0.013579;RO=29;SAF=23;SAR=17;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0975623;STB=0.553584;STBP=0.324;TYPE=snp;VARB=0.00171148;OID=.;OPOS=15457374;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:29:29:40:40:0.57971:17:23:13:16:17:23:13:16
chr21	15457399	.	G	C	358.11	PASS	AF=0.5625;AO=36;DP=64;FAO=36;FDP=64;FR=.;FRO=28;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.0140717;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=262.226;QD=22.3817;RBI=0.0141892;REFB=-0.0152373;REVB=0.00182261;RO=28;SAF=22;SAR=14;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0905452;STB=0.549972;STBP=0.365;TYPE=snp;VARB=0.0115697;OID=.;OPOS=15457399;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:28:28:36:36:0.5625:14:22:14:14:14:22:14:14
chr21	15457410	.	C	G	267.0	PASS	AF=0.528302;AO=28;DP=53;FAO=28;FDP=53;FR=.;FRO=25;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=0.00549494;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.8503;QD=20.1512;RBI=0.0113225;REFB=-0.0192726;REVB=0.00989976;RO=25;SAF=18;SAR=10;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142941;STB=0.579774;STBP=0.239;TYPE=snp;VARB=0.0166688;OID=.;OPOS=15457410;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:25:25:28:28:0.528302:10:18:12:13:10:18:12:13
chr21	15457434	.	G	A	131.3	PASS	AF=0.405405;AO=15;DP=37;FAO=15;FDP=37;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.0135412;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.363;QD=14.1948;RBI=0.0191355;REFB=0.00386125;REVB=-0.0135205;RO=22;SAF=9;SAR=6;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149229;STB=0.58684;STBP=0.373;TYPE=snp;VARB=-0.0142217;OID=.;OPOS=15457434;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:22:22:15:15:0.405405:6:9:10:12:6:9:10:12
chr21	15457463	.	CACACACAGT	C	164.45	PASS	AF=1;AO=14;DP=15;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0500695;FXX=0.0666222;HRUN=1;LEN=9;MLLD=262.199;QD=46.9858;RBI=0.0501643;REFB=0;REVB=0.00308215;RO=0;SAF=4;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.63386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000211586;OID=.;OPOS=15457464;OREF=ACACACAGT;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:14:15:14:14:0:4:10:0:0:4:0:4:10:0:0
chr21	15481365	.	G	T	1143.31	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0371421;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.723;QD=60.1744;RBI=0.0376846;REFB=0;REVB=-0.00637131;RO=0;SAF=41;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.50422e-05;OID=.;OPOS=15481365;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:76:0:0:75:76:1:34:41:0:0:34:42:0:0
chr21	15516976	.	T	A	955.17	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00808948;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.778;QD=58.7796;RBI=0.0409986;REFB=0;REVB=0.0401926;RO=0;SAF=28;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.99207e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000515106;OID=.;OPOS=15516976;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:37:28:0:0:37:28:0:0
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chr21	15984982	.	C	A	303.89	PASS	AF=0.52459;AO=32;DP=61;FAO=32;FDP=61;FR=.;FRO=29;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.0018335;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.6009;QD=19.9274;RBI=0.0586149;REFB=-0.0143987;REVB=-0.0585863;RO=29;SAF=18;SAR=14;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0390947;STB=0.521725;STBP=0.751;TYPE=snp;VARB=0.013197;OID=.;OPOS=15984982;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:29:29:32:32:0.52459:14:18:15:14:14:18:15:14
chr21	16335469	.	T	C	625.59	PASS	AF=0.570093;AO=61;DP=107;FAO=61;FDP=107;FR=.;FRO=46;FSAF=43;FSAR=18;FSRF=24;FSRR=22;FWDB=0.0231145;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.512;QD=23.3866;RBI=0.0286942;REFB=-0.00213385;REVB=0.0170023;RO=46;SAF=43;SAR=18;SRF=24;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160107;STB=0.587803;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.00163579;OID=.;OPOS=16335469;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:107:46:46:61:61:0.570093:18:43:24:22:18:43:24:22
chr21	16335515	.	C	T	484.68	PASS	AF=0.388889;AO=55;DP=137;FAO=56;FDP=144;FR=.;FRO=88;FSAF=30;FSAR=26;FSRF=48;FSRR=40;FWDB=-0.0421311;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.9547;QD=13.4634;RBI=0.0772967;REFB=-0.0474907;REVB=-0.0648055;RO=82;SAF=29;SAR=26;SRF=45;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0229297;STB=0.505986;STBP=0.886;TYPE=snp;VARB=0.0685187;OID=.;OPOS=16335515;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:137:144:82:88:55:56:0.388889:26:29:45:37:26:30:48:40
chr21	16340289	.	C	T	751.74	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00510079;FXX=0.040808;HRUN=4;LEN=1;MLLD=128.365;QD=63.9781;RBI=0.0200944;REFB=0;REVB=-0.0194363;RO=0;SAF=22;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000567838;OID=.;OPOS=16340289;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:47:0:0:46:47:1:24:22:0:0:24:23:0:0
chr21	16424469	.	C	T	455.38	PASS	AF=0.55;AO=44;DP=80;FAO=44;FDP=80;FR=.;FRO=36;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=0.0243482;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.661;QD=22.769;RBI=0.0260673;REFB=-0.0247175;REVB=-0.0093095;RO=36;SAF=25;SAR=19;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0104987;STB=0.505778;STBP=0.918;TYPE=snp;VARB=0.0232838;OID=.;OPOS=16424469;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:36:36:44:44:0.55:19:25:20:16:19:25:20:16
chr21	16986637	.	G	A	689.38	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130909;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.159;QD=62.6709;RBI=0.024134;REFB=0;REVB=0.020275;RO=0;SAF=19;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.86729e-05;OID=.;OPOS=16986637;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:25:19:0:0:25:19:0:0
chr21	17198541	.	C	T	681.89	PASS	AF=0.464968;AO=73;DP=157;FAO=73;FDP=157;FR=.;FRO=84;FSAF=41;FSAR=32;FSRF=48;FSRR=36;FWDB=0.000654762;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.145;QD=17.373;RBI=0.0347118;REFB=0.00274908;REVB=-0.0347056;RO=83;SAF=41;SAR=32;SRF=47;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00450835;STB=0.505322;STBP=0.908;TYPE=snp;VARB=-0.00210324;OID=.;OPOS=17198541;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:157:157:83:84:73:73:0.464968:32:41:47:36:32:41:48:36
chr21	17203785	.	A	T	533.31	PASS	AF=0.529412;AO=53;DP=102;FAO=54;FDP=102;FR=.;FRO=48;FSAF=27;FSAR=27;FSRF=27;FSRR=21;FWDB=0.000495162;FXX=0.0192289;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.35;QD=20.9141;RBI=0.00807821;REFB=-0.00737903;REVB=0.00806302;RO=49;SAF=26;SAR=27;SRF=27;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0526415;STB=0.529401;STBP=0.544;TYPE=snp;VARB=0.00817512;OID=.;OPOS=17203785;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:49:48:53:54:0.529412:27:26:27:22:27:27:27:21
chr21	18827106	.	C	T	714.98	PASS	AF=0.978723;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00149701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.116;QD=60.8496;RBI=0.0939408;REFB=-0.0845065;REVB=0.0939289;RO=1;SAF=23;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0200022;STB=0.510634;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.00109278;OID=.;OPOS=18827106;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:47:47:1:1:46:46:0.978723:23:23:0:1:23:23:0:1
chr21	19161403	.	A	G	360.44	PASS	AF=0.463415;AO=38;DP=82;FAO=38;FDP=82;FR=.;FRO=44;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=21;FSRR=23;FWDB=0.0407204;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.4055;QD=17.5826;RBI=0.0472168;REFB=-0.0243589;REVB=0.0239013;RO=42;SAF=17;SAR=21;SRF=19;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00476188;STB=0.516162;STBP=0.802;TYPE=snp;VARB=0.025594;OID=.;OPOS=19161403;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:42:44:38:38:0.463415:21:17:19:23:21:17:21:23
chr21	19163556	.	A	C	389.18	PASS	AF=0.427184;AO=44;DP=103;FAO=44;FDP=103;FR=.;FRO=59;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=37;FSRR=22;FWDB=0.00813022;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=250.173;QD=15.1139;RBI=0.0128657;REFB=-0.0113377;REVB=0.0099712;RO=59;SAF=20;SAR=24;SRF=37;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174474;STB=0.597859;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=0.0130077;OID=.;OPOS=19163556;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:103:59:59:44:44:0.427184:24:20:37:22:24:20:37:22
chr21	19163707	.	C	T	1031.02	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0167287;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.081;QD=59.7694;RBI=0.0277252;REFB=0;REVB=-0.0221097;RO=0;SAF=32;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000129711;OID=.;OPOS=19163707;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:37:32:0:0:37:32:0:0
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chr21	22746187	.	T	C	337.9	PASS	AF=0.467532;AO=36;DP=77;FAO=36;FDP=77;FR=.;FRO=41;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=-0.016073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.253;QD=17.5534;RBI=0.0237296;REFB=-0.00157043;REVB=-0.0174571;RO=41;SAF=15;SAR=21;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0217757;STB=0.512188;STBP=0.873;TYPE=snp;VARB=0.00126145;OID=.;OPOS=22746187;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:41:41:36:36:0.467532:21:15:18:23:21:15:18:23
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chr21	28296389	.	A	G	226.81	PASS	AF=0.448276;AO=26;DP=58;FAO=26;FDP=58;FR=.;FRO=32;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=-0.0268101;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.3261;QD=15.6421;RBI=0.0661513;REFB=0.00550624;REVB=0.0604749;RO=32;SAF=16;SAR=10;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0845618;STB=0.547908;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=-0.0157863;OID=.;OPOS=28296389;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:32:32:26:26:0.448276:10:16:17:15:10:16:17:15
chr21	28302355	.	A	G	300.34	PASS	AF=0.425;AO=31;DP=77;FAO=34;FDP=80;FR=.;FRO=46;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=25;FSRR=21;FWDB=0.0164436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.962;QD=15.017;RBI=0.0164755;REFB=-0.0139539;REVB=-0.00102484;RO=46;SAF=16;SAR=15;SRF=25;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0287582;STB=0.508923;STBP=0.901;TYPE=snp;VARB=0.0205976;OID=.;OPOS=28302355;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:80:46:46:31:34:0.425:15:16:25:21:15:19:25:21
chr21	28304335	.	T	C	62.09	PASS	AF=0.272727;AO=9;DP=33;FAO=9;FDP=33;FR=.;FRO=24;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=1.70243e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.578;QD=7.52664;RBI=0.0468242;REFB=0.000532055;REVB=-0.0468242;RO=22;SAF=3;SAR=6;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145403;STB=0.565068;STBP=0.641;TYPE=snp;VARB=-0.00532186;OID=.;OPOS=28304335;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:33:33:22:24:9:9:0.272727:6:3:10:12:6:3:10:14
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chr21	30250555	.	T	C	743.09	PASS	AF=0.96;AO=48;DP=50;FAO=48;FDP=50;FR=.;FRO=2;FSAF=33;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.000459336;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=310.666;QD=59.447;RBI=0.00669827;REFB=-0.000569973;REVB=0.0066825;RO=2;SAF=33;SAR=15;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0162924;STB=0.508667;STBP=0.573;TYPE=snp;VARB=2.32902e-05;OID=.;OPOS=30250555;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:50:50:2:2:48:48:0.96:15:33:1:1:15:33:1:1
chr21	30250615	.	T	C	564.86	PASS	AF=0.869565;AO=40;DP=46;FAO=40;FDP=46;FR=.;FRO=6;FSAF=26;FSAR=14;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.019896;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=196.227;QD=49.1178;RBI=0.0199442;REFB=-0.0179997;REVB=-0.00138562;RO=6;SAF=26;SAR=14;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.049867;STB=0.526686;STBP=0.382;TYPE=snp;VARB=0.000353613;OID=.;OPOS=30250615;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:32:46:46:6:6:40:40:0.869565:14:26:5:1:14:26:5:1
chr21	30257568	.	T	C	2396.9	PASS	AF=0.893617;AO=159;DP=187;FAO=168;FDP=188;FR=.;FRO=20;FSAF=70;FSAR=98;FSRF=1;FSRR=19;FWDB=-0.0450998;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.4043;QD=50.9978;RBI=0.0504984;REFB=-0.0339276;REVB=-0.0227178;RO=0;SAF=65;SAR=94;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.45385e-08;STB=0.540661;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.00271064;OID=.;OPOS=30257568;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:187:188:0:20:159:168:0.893617:94:65:0:0:98:70:1:19
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chr21	30313625	.	G	A	275.17	PASS	AF=0.380952;AO=32;DP=84;FAO=32;FDP=84;FR=.;FRO=52;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=26;FSRR=26;FWDB=-0.0103945;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.925;QD=13.1032;RBI=0.0536644;REFB=-0.00350533;REVB=-0.052648;RO=52;SAF=15;SAR=17;SRF=26;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0338491;STB=0.519362;STBP=0.794;TYPE=snp;VARB=0.00427205;OID=.;OPOS=30313625;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:52:52:32:32:0.380952:17:15:26:26:17:15:26:26
chr21	30331935	.	G	A	538.55	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00444004;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.781;QD=59.8387;RBI=0.0126041;REFB=0;REVB=-0.0117961;RO=0;SAF=13;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.21415e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000112638;OID=.;OPOS=30331935;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:23:13:0:0:23:13:0:0
chr21	30339120	.	C	A	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0252678;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.403;QD=42.1817;RBI=0.0453894;REFB=0;REVB=0.037706;RO=0;SAF=8;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000145465;OID=.;OPOS=30339120;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:3:8:0:0:3:8:0:0
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chr21	30341891	.	A	G	279.48	PASS	AF=0.956522;AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0227064;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=195.256;QD=48.605;RBI=0.0235365;REFB=0.147964;REVB=-0.00619563;RO=1;SAF=12;SAR=10;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0439896;STB=0.523788;STBP=0.329;TYPE=snp;VARB=-0.00118557;OID=.;OPOS=30341891;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:23:23:1:1:22:22:0.956522:10:12:0:1:10:12:0:1
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chr21	30717151	.	C	T	1175.85	PASS	AF=0.987342;AO=78;DP=79;FAO=78;FDP=79;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=42;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00368042;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=236.24;QD=59.5369;RBI=0.0727848;REFB=-0.0170234;REVB=-0.0726916;RO=1;SAF=36;SAR=42;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129667;STB=0.506848;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.000187577;OID=.;OPOS=30717151;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:79:79:1:1:78:78:0.987342:42:36:1:0:42:36:1:0
chr21	30718201	.	G	A	632.26	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00298392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.931;QD=61.684;RBI=0.0370601;REFB=0;REVB=0.0369398;RO=0;SAF=22;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.07929e-05;OID=.;OPOS=30718201;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:19:22:0:0:19:22:0:0
chr21	30830393	.	T	G	808.7	PASS	AF=0.464088;AO=84;DP=181;FAO=84;FDP=181;FR=.;FRO=97;FSAF=46;FSAR=38;FSRF=50;FSRR=47;FWDB=-0.0276114;FXX=0.0054942;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.3779;QD=17.8719;RBI=0.0427426;REFB=0.0118871;REVB=0.0326272;RO=97;SAF=46;SAR=38;SRF=50;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0312888;STB=0.517329;STBP=0.685;TYPE=snp;VARB=-0.014669;OID=.;OPOS=30830393;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:181:181:97:97:84:84:0.464088:38:46:50:47:38:46:50:47
chr21	30969901	.	T	C	200.72	PASS	AF=0.678571;AO=19;DP=28;FAO=19;FDP=28;FR=.;FRO=9;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=0.00177101;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.1219;QD=28.6735;RBI=0.00951016;REFB=0.0188125;REVB=0.00934381;RO=9;SAF=8;SAR=11;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12128;STB=0.566861;STBP=0.347;TYPE=snp;VARB=-0.00378142;OID=.;OPOS=30969901;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:28:28:9:9:19:19:0.678571:11:8:2:7:11:8:2:7
chr21	30971183	.	G	A	248.11	PASS	AF=0.459016;AO=28;DP=61;FAO=28;FDP=61;FR=.;FRO=33;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=0.0102816;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.742;QD=16.2695;RBI=0.0383915;REFB=-0.00608577;REVB=-0.0369891;RO=33;SAF=12;SAR=16;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00424324;STB=0.502391;STBP=0.993;TYPE=snp;VARB=0.00623809;OID=.;OPOS=30971183;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:33:33:28:28:0.459016:16:12:14:19:16:12:14:19
chr21	31655212	.	A	C	1024.15	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000526353;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.582;QD=59.3711;RBI=0.0247889;REFB=0;REVB=0.0247833;RO=0;SAF=36;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.49594e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.93077e-05;OID=.;OPOS=31655212;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:68:69:0:0:68:69:1:32:36:0:0:33:36:0:0
chr21	31661691	.	A	G	302.63	PASS	AF=0.563636;AO=28;DP=52;FAO=31;FDP=55;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=4.60104e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.8351;QD=22.0092;RBI=0.102313;REFB=0.0105896;REVB=0.102313;RO=23;SAF=11;SAR=17;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175853;STB=0.619707;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=-0.00733385;OID=.;OPOS=31661691;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:55:23:24:28:31:0.563636:17:11:14:9:20:11:15:9
chr21	31709691	.	G	A	257.97	PASS	AF=0.5;AO=28;DP=56;FAO=28;FDP=56;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.0191676;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.258;QD=18.4266;RBI=0.0271333;REFB=-0.022992;REVB=0.0192046;RO=28;SAF=9;SAR=19;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169759;STB=0.595297;STBP=0.184;TYPE=snp;VARB=0.022144;OID=.;OPOS=31709691;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:28:28:28:28:0.5:19:9:14:14:19:9:14:14
chr21	31744127	.	A	T	313.23	PASS	AF=0.515625;AO=33;DP=64;FAO=33;FDP=64;FR=.;FRO=31;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=11;FSRR=20;FWDB=0.0200146;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.23;QD=19.5769;RBI=0.0200792;REFB=-0.00518492;REVB=-0.00160982;RO=31;SAF=15;SAR=18;SRF=11;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0884932;STB=0.549104;STBP=0.435;TYPE=snp;VARB=0.00812017;OID=.;OPOS=31744127;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:31:31:33:33:0.515625:18:15:11:20:18:15:11:20
chr21	31768539	.	G	C	579.47	PASS	AF=0.542056;AO=58;DP=106;FAO=58;FDP=107;FR=.;FRO=49;FSAF=31;FSAR=27;FSRF=30;FSRR=19;FWDB=0.0161589;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.674;QD=21.6624;RBI=0.0180339;REFB=-0.0204022;REVB=-0.00800688;RO=48;SAF=31;SAR=27;SRF=29;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0580974;STB=0.535946;STBP=0.413;TYPE=snp;VARB=0.0157177;OID=.;OPOS=31768539;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:107:48:49:58:58:0.542056:27:31:29:19:27:31:30:19
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chr21	31913981	.	AG	A,AA	785.57	PASS	AF=0.96,0.04;AO=46,3;DP=49;FAO=48,2;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=24,0;FSAR=24,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0222991,0.0197292;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=259.883,240.76;QD=62.8454;RBI=0.024772,0.0222315;REFB=0,0;REVB=-0.010789,-0.0102469;RO=0;SAF=24,0;SAR=22,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.00130225,-0.0158032;OID=.,.;OPOS=31913982,31913982;OREF=G,G;OALT=-,A;OMAPALT=A,AA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.96,0.04:46,3:49:48,2:50:0:24,0:24,2:0:0:9:0:24,0:22,3:0:0
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chr21	33714976	.	T	TA	49.97	PASS	AF=1;AO=5;DP=7;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0.142653;HRUN=0;LEN=1;MLLD=130.095;QD=33.3141;RBI=0.0204628;REFB=0;REVB=-0.0204628;RO=1;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.000361459;OID=.;OPOS=33714977;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:5:7:6:6:0:0:6:0:0:3:1:0:5:0:1
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chr21	34615992	.	G	A	389.58	PASS	AF=0.43;AO=42;DP=100;FAO=43;FDP=100;FR=.;FRO=57;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=23;FSRR=34;FWDB=-0.0047346;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.716;QD=15.5834;RBI=0.00792703;REFB=-0.0235737;REVB=0.00635778;RO=55;SAF=19;SAR=23;SRF=22;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0536792;STB=0.522265;STBP=0.706;TYPE=snp;VARB=0.0288674;OID=.;OPOS=34615992;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:55:57:42:43:0.43:23:19:22:33:24:19:23:34
chr21	34640788	.	A	G	268.11	PASS	AF=0.5;AO=29;DP=58;FAO=29;FDP=58;FR=.;FRO=29;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=-0.00628125;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=170.727;QD=18.4903;RBI=0.00977683;REFB=-0.0126601;REVB=-0.00749214;RO=29;SAF=17;SAR=12;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0935263;STB=0.55231;STBP=0.46;TYPE=snp;VARB=0.0136051;OID=.;OPOS=34640788;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:29:29:29:29:0.5:12:17:14:15:12:17:14:15
chr21	34666376	.	A	G	453.82	PASS	AF=0.969697;AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=33;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0747401;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.9451;QD=55.008;RBI=0.0771872;REFB=0.0373421;REVB=-0.0192819;RO=1;SAF=23;SAR=9;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0490584;STB=0.526299;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=-0.00245786;OID=.;OPOS=34666376;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:33:33:1:1:32:32:0.969697:9:23:0:1:9:23:0:1
chr21	34668747	.	A	G	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00352557;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.7;QD=51.9156;RBI=0.00756808;REFB=0;REVB=0.00669673;RO=0;SAF=12;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.68867e-05;OID=.;OPOS=34668747;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:9:12:0:0:9:12:0:0
chr21	34787312	.	A	G	242.4	PASS	AF=0.376623;AO=29;DP=76;FAO=29;FDP=77;FR=.;FRO=48;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=34;FWDB=0.00153385;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.909;QD=12.5921;RBI=0.0148618;REFB=-0.0159678;REVB=-0.0147824;RO=47;SAF=14;SAR=15;SRF=14;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.202779;STB=0.620176;STBP=0.109;TYPE=snp;VARB=0.0194155;OID=.;OPOS=34787312;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:77:47:48:29:29:0.376623:15:14:14:33:15:14:14:34
chr21	34821570	.	G	A	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.045065;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.999;QD=47.8218;RBI=0.0553646;REFB=0;REVB=0.0321618;RO=0;SAF=9;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000165438;OID=.;OPOS=34821570;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:7:9:0:0:7:9:0:0
chr21	34822150	.	T	A	755.26	PASS	AF=1;AO=53;DP=54;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.107083;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.9784;QD=54.9279;RBI=0.10913;REFB=0;REVB=0.021041;RO=1;SAF=24;SAR=29;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0159704;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00310268;OID=.;OPOS=34822150;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:55:1:0:53:55:1:29:24:0:1:31:24:0:0
chr21	34822452	.	T	C	306.29	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0263935;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.463;QD=53.2674;RBI=0.0267441;REFB=0;REVB=0.00431672;RO=0;SAF=16;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000347209;OID=.;OPOS=34822452;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:7:16:0:0:7:16:0:0
chr21	34871413	.	G	A,GA	39.64	PASS	AF=0.0185185,0.277778;AO=5,14;DP=54;FAO=1,15;FDP=54;FR=.;FRO=38;FSAF=1,9;FSAR=0,6;FSRF=24;FSRR=14;FWDB=0.00614995,-0.156691;FXX=0;HRUN=1,8;LEN=1,1;MLLD=206.279,7.80438;QD=2.93601;RBI=0.00757716,0.161906;REFB=0.00072204,-0.0540433;REVB=0.00442622,0.0407619;RO=33;SAF=2,9;SAR=3,5;SRF=22;SRR=11;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.304511,-0.0304806;STB=0.987478,0.523778;STBP=0.507,0.847;TYPE=snp,ins;VARB=0.0214049,-0.0301214;OID=.,.;OPOS=34871413,34871414;OREF=G,-;OALT=A,A;OMAPALT=A,GA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:37:54:54:33:38:5,14:1,15:0.0185185,0.277778:3,5:2,9:22:11:0,6:1,9:24:14
chr21	34897113	.	C	T	1142.21	PASS	AF=0.987013;AO=76;DP=78;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00254015;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.791;QD=59.3354;RBI=0.0109389;REFB=-0.155269;REVB=0.0106399;RO=1;SAF=39;SAR=37;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119796;STB=0.506327;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=0.000377208;OID=.;OPOS=34897113;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:78:77:1:1:76:76:0.987013:37:39:1:0:37:39:1:0
chr21	34925142	.	C	T	323.45	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0173381;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.555;QD=53.9077;RBI=0.0309477;REFB=0;REVB=0.025635;RO=0;SAF=12;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000459884;OID=.;OPOS=34925142;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:12:12:0:0:12:12:0:0
chr21	34926260	.	C	T	1377.44	PASS	AF=1;AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00940871;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.702;QD=62.611;RBI=0.0112092;REFB=0;REVB=-0.0060929;RO=0;SAF=39;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.2406e-05;OID=.;OPOS=34926260;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:88:88:0:0:88:88:1:49:39:0:0:49:39:0:0
chr21	34948684	.	G	A,GA	725.22	PASS	AF=0,1;AO=3,48;DP=52;FAO=0,52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=0,20;FSAR=0,32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0183783,0.103802;FXX=0;HRUN=2,1;LEN=1,1;MLLD=4.30258,29.5155;QD=55.7858;RBI=0.0193373,0.112343;REFB=0,0;REVB=0.00601402,0.0429645;RO=0;SAF=3,17;SAR=0,31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,ins;VARB=0,0.00344523;OID=.,.;OPOS=34948684,34948685;OREF=G,-;OALT=A,A;OMAPALT=A,GA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	2/2:4:52:52:0:0:3,48:0,52:0,1:0,31:3,17:0:0:0,32:0,20:0:0
chr21	34948696	.	GA	G	798.86	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0469799;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.115;QD=63.9089;RBI=0.0480004;REFB=0;REVB=-0.00984511;RO=0;SAF=18;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00139637;OID=.;OPOS=34948697;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:50:50:50:50:0:18:32:0:0:4:0:18:32:0:0
chr21	34968503	.	A	G	221.93	PASS	AF=0.42623;AO=26;DP=61;FAO=26;FDP=61;FR=.;FRO=35;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=15;FWDB=0.026299;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.5658;QD=14.5526;RBI=0.03387;REFB=-0.00417768;REVB=0.0213434;RO=34;SAF=11;SAR=15;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164088;STB=0.584841;STBP=0.262;TYPE=snp;VARB=0.00763606;OID=.;OPOS=34968503;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:34:35:26:26:0.42623:15:11:20:14:15:11:20:15
chr21	35201942	.	A	G	210.81	PASS	AF=0.416667;AO=25;DP=60;FAO=25;FDP=60;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=-0.0182615;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.5169;QD=14.0539;RBI=0.0212238;REFB=0.0155164;REVB=-0.0108151;RO=35;SAF=13;SAR=12;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0234353;STB=0.513358;STBP=0.858;TYPE=snp;VARB=-0.0220542;OID=.;OPOS=35201942;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:35:35:25:25:0.416667:12:13:19:16:12:13:19:16
chr21	35201947	.	C	T	205.25	PASS	AF=0.390625;AO=25;DP=64;FAO=25;FDP=64;FR=.;FRO=39;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=0.0133742;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.7728;QD=12.8281;RBI=0.0754434;REFB=0.0160221;REVB=0.0742485;RO=38;SAF=14;SAR=11;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0909616;STB=0.544506;STBP=0.592;TYPE=snp;VARB=-0.0232786;OID=.;OPOS=35201947;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:38:39:25:25:0.390625:11:14:18:20:11:14:19:20
chr21	35237608	.	T	C	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0342611;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.383;QD=51.1845;RBI=0.036069;REFB=0;REVB=0.0112761;RO=0;SAF=5;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000183621;OID=.;OPOS=35237608;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:15:5:0:0:15:5:0:0
chr21	35260481	.	T	C	766.26	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143906;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.163;QD=63.8554;RBI=0.0233929;REFB=0;REVB=0.0184428;RO=0;SAF=17;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000224943;OID=.;OPOS=35260481;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:31:17:0:0:31:17:0:0
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chr21	35281393	.	A	G	769.72	PASS	AF=0.98;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0292572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.632;QD=61.5775;RBI=0.0295094;REFB=0.0051775;REVB=-0.00384977;RO=1;SAF=21;SAR=28;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.021881;STB=0.511623;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.000109614;OID=.;OPOS=35281393;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:50:50:1:1:49:49:0.98:28:21:1:0:28:21:1:0
chr21	35467645	.	A	G	1989.68	PASS	AF=1;AO=126;DP=127;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0239988;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.396;QD=62.1774;RBI=0.0350085;REFB=0;REVB=-0.0254883;RO=0;SAF=59;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.31893e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.05214e-06;OID=.;OPOS=35467645;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:127:128:0:0:126:128:1:67:59:0:0:69:59:0:0
chr21	35469193	.	C	A	246.38	PASS	AF=0.952381;AO=20;DP=21;FAO=20;FDP=21;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0162096;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.2992;QD=46.9296;RBI=0.0347671;REFB=-0.0456732;REVB=-0.0307571;RO=1;SAF=12;SAR=8;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0541413;STB=0.529382;STBP=0.321;TYPE=snp;VARB=0.00189095;OID=.;OPOS=35469193;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:21:21:1:1:20:20:0.952381:8:12:0:1:8:12:0:1
chr21	35469708	.	G	GA	365.64	PASS	AF=1;AO=49;DP=74;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.215089;FXX=0.0142837;HRUN=6;LEN=1;MLLD=7.69255;QD=21.1966;RBI=0.282313;REFB=0.158681;REVB=-0.18286;RO=13;SAF=27;SAR=22;SRF=11;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1182;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00338335;OID=.;OPOS=35469709;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:49:74:69:69:0:41:28:0:0:6:13:27:22:11:2
chr21	35469726	.	G	GT	774.23	PASS	AF=1;AO=66;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.121204;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=23.618;QD=44.8831;RBI=0.122431;REFB=0;REVB=-0.0172951;RO=1;SAF=37;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0125996;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00472382;OID=.;OPOS=35469727;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:66:69:69:69:0:40:29:0:0:15:1:37:29:1:0
chr21	35469852	.	C	A	696.71	PASS	AF=0.978261;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0108079;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.0888;QD=60.5833;RBI=0.0351216;REFB=-0.0779925;REVB=0.0334173;RO=1;SAF=26;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0240908;STB=0.512815;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.00301783;OID=.;OPOS=35469852;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:46:46:1:1:45:45:0.978261:19:26:0:1:19:26:0:1
chr21	35470042	.	G	T	716.75	PASS	AF=1;AO=31;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.030944;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.341;QD=61.0001;RBI=0.0388125;REFB=0;REVB=0.023428;RO=0;SAF=14;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000912674;OID=.;OPOS=35470042;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:31:47:1:17:14:0:0:23:24:0:0
chr21	35470210	.	T	G	435.85	PASS	AF=0.96875;AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0100742;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=230.332;QD=54.4811;RBI=0.0182288;REFB=0.12092;REVB=0.015192;RO=1;SAF=10;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0443701;STB=0.523794;STBP=0.291;TYPE=snp;VARB=-0.000539614;OID=.;OPOS=35470210;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:32:32:1:1:31:31:0.96875:21:10:1:0:21:10:1:0
chr21	35470213	.	C	A	452.85	PASS	AF=0.969697;AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=33;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.000490419;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=68.2887;QD=54.8904;RBI=0.0398407;REFB=-0.0826184;REVB=-0.0398377;RO=1;SAF=12;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0373149;STB=0.519987;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.00110059;OID=.;OPOS=35470213;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:33:33:1:1:32:32:0.969697:20:12:1:0:20:12:1:0
chr21	35773137	.	C	T	769.51	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0222481;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=108.557;QD=57.0006;RBI=0.0235545;REFB=0;REVB=0.00773519;RO=0;SAF=23;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.72004e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00021464;OID=.;OPOS=35773137;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:54:0:0:53:54:1:30:23:0:0:31:23:0:0
chr21	35821821	.	T	C	347.1	PASS	AF=1;AO=24;DP=26;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0236378;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.163;QD=55.5354;RBI=0.0249401;REFB=0;REVB=-0.00795356;RO=0;SAF=9;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000362859;OID=.;OPOS=35821821;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:25:0:0:24:25:1:15:9:0:0:16:9:0:0
chr21	35893737	.	T	C	1011.47	PASS	AF=1;AO=63;DP=65;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.017898;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.46;QD=57.7981;RBI=0.0517832;REFB=0;REVB=0.0485918;RO=0;SAF=20;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.00371e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000407003;OID=.;OPOS=35893737;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:65:70:0:0:63:70:1:43:20:0:0:49:21:0:0
chr21	36042203	.	G	C	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0211054;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.0184;QD=45.8044;RBI=0.0264981;REFB=0;REVB=0.0160221;RO=0;SAF=1;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00165275;OID=.;OPOS=36042203;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:13:1:0:0:13:1:0:0
chr21	36411119	.	G	T	375.68	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00581456;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.173;QD=55.656;RBI=0.0288737;REFB=0;REVB=0.0282822;RO=0;SAF=14;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.26158e-05;OID=.;OPOS=36411119;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:27:0:0:26:27:1:12:14:0:0:12:15:0:0
chr21	37420650	.	G	A	242.94	PASS	AF=0.534884;AO=23;DP=43;FAO=23;FDP=43;FR=.;FRO=20;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=15;FWDB=0.0259847;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.51;QD=22.599;RBI=0.0355006;REFB=-0.011429;REVB=0.0241885;RO=20;SAF=15;SAR=8;SRF=5;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.32814;STB=0.683013;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.00762863;OID=.;OPOS=37420650;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:20:20:23:23:0.534884:8:15:5:15:8:15:5:15
chr21	37429679	.	G	C	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0280156;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.2508;QD=44.6896;RBI=0.0611775;REFB=0;REVB=-0.0543858;RO=0;SAF=3;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0029244;OID=.;OPOS=37429679;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:10:3:0:0:10:3:0:0
chr21	37442632	.	G	C	333.67	PASS	AF=0.6;AO=33;DP=55;FAO=33;FDP=55;FR=.;FRO=22;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=0.0102555;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.834;QD=24.2668;RBI=0.013362;REFB=-0.0345843;REVB=-0.00856547;RO=22;SAF=20;SAR=13;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176934;STB=0.597286;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=0.019094;OID=.;OPOS=37442632;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:22:22:33:33:0.6:13:20:8:14:13:20:8:14
chr21	37444120	.	C	T	389.18	PASS	AF=0.427184;AO=43;DP=103;FAO=44;FDP=103;FR=.;FRO=59;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=23;FSRR=36;FWDB=0.00659996;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.385;QD=15.1136;RBI=0.0107734;REFB=-0.0098795;REVB=0.00851509;RO=59;SAF=21;SAR=22;SRF=23;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101683;STB=0.563079;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=0.0189659;OID=.;OPOS=37444120;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:103:59:59:43:44:0.427184:22:21:23:36:22:22:23:36
chr21	37444696	.	C	T	167.09	PASS	AF=0.381818;AO=20;DP=53;FAO=21;FDP=55;FR=.;FRO=34;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=0.00422039;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.705;QD=12.1519;RBI=0.0223883;REFB=-0.021952;REVB=-0.0219869;RO=32;SAF=8;SAR=12;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107793;STB=0.56244;STBP=0.461;TYPE=snp;VARB=0.0367388;OID=.;OPOS=37444696;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:55:32:34:20:21:0.381818:12:8:16:16:12:9:18:16
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chr21	37507769	.	C	T	224.72	PASS	AF=0.337349;AO=28;DP=83;FAO=28;FDP=83;FR=.;FRO=55;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=30;FSRR=25;FWDB=0.00241354;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.726;QD=10.83;RBI=0.0320658;REFB=0.00662199;REVB=-0.0319748;RO=55;SAF=14;SAR=14;SRF=30;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0517966;STB=0.530099;STBP=0.718;TYPE=snp;VARB=-0.0128376;OID=.;OPOS=37507769;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:55:55:28:28:0.337349:14:14:30:25:14:14:30:25
chr21	37609571	.	T	C	267.05	PASS	AF=0.528302;AO=28;DP=53;FAO=28;FDP=53;FR=.;FRO=25;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.0135146;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.8619;QD=20.1549;RBI=0.018372;REFB=-0.0115546;REVB=0.0124453;RO=25;SAF=16;SAR=12;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0441036;STB=0.524572;STBP=0.741;TYPE=snp;VARB=0.0229823;OID=.;OPOS=37609571;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:25:25:28:28:0.528302:12:16:13:12:12:16:13:12
chr21	37617630	.	T	G	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0297424;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.651;QD=49.5992;RBI=0.0305386;REFB=0;REVB=-0.00692794;RO=0;SAF=12;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000230049;OID=.;OPOS=37617630;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:6:12:0:0:6:12:0:0
chr21	37692589	.	A	T	501.56	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0673135;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.788;QD=59.0074;RBI=0.067452;REFB=0;REVB=-0.00432068;RO=0;SAF=14;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.48532e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000202561;OID=.;OPOS=37692589;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:20:14:0:0:20:14:0:0
chr21	37781046	.	C	T	182.24	PASS	AF=0.452381;AO=19;DP=42;FAO=19;FDP=42;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=0.0612438;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.8997;QD=17.3563;RBI=0.0765258;REFB=0.000877257;REVB=0.0458847;RO=23;SAF=8;SAR=11;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0134659;STB=0.507684;STBP=0.945;TYPE=snp;VARB=0.00195324;OID=.;OPOS=37781046;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:23:23:19:19:0.452381:11:8:10:13:11:8:10:13
chr21	38081562	.	T	G	255.9	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.018497;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.359;QD=51.1798;RBI=0.0237044;REFB=0;REVB=-0.0148243;RO=0;SAF=11;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000158066;OID=.;OPOS=38081562;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:9:11:0:0:9:11:0:0
chr21	38081577	.	C	G	240.06	PASS	AF=1;AO=16;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0985864;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.02;QD=50.5384;RBI=0.141567;REFB=0;REVB=0.101596;RO=0;SAF=9;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000860718;OID=.;OPOS=38081577;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:16:19:1:7:9:0:0:8:11:0:0
chr21	38117040	.	G	A	721.43	PASS	AF=0.555556;AO=69;DP=125;FAO=70;FDP=126;FR=.;FRO=56;FSAF=38;FSAR=32;FSRF=31;FSRR=25;FWDB=0.00105881;FXX=0.0078734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.669;QD=22.9025;RBI=0.0164448;REFB=-0.0252149;REVB=0.0164107;RO=55;SAF=38;SAR=31;SRF=30;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00431757;STB=0.5048;STBP=0.902;TYPE=snp;VARB=0.0214776;OID=.;OPOS=38117040;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:125:126:55:56:69:70:0.555556:31:38:30:25:32:38:31:25
chr21	38117505	.	C	T	152.33	PASS	AF=0.551724;AO=16;DP=29;FAO=16;FDP=29;FR=.;FRO=13;FSAF=14;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.0474295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.3672;QD=21.0111;RBI=0.0626868;REFB=-0.00591521;REVB=-0.0409887;RO=13;SAF=14;SAR=2;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.392632;STB=0.72693;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.0158994;OID=.;OPOS=38117505;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:13:13:16:16:0.551724:2:14:7:6:2:14:7:6
chr21	38444863	.	C	T	1175.86	PASS	AF=0.987342;AO=78;DP=79;FAO=78;FDP=79;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0358009;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.229;QD=59.537;RBI=0.0401861;REFB=-0.142769;REVB=0.0182543;RO=1;SAF=42;SAR=36;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0111373;STB=0.505881;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.00293271;OID=.;OPOS=38444863;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:79:79:1:1:78:78:0.987342:36:42:1:0:36:42:1:0
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chr21	38512956	.	A	G	138.96	PASS	AF=0.347826;AO=16;DP=46;FAO=16;FDP=46;FR=.;FRO=30;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=0.00904213;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.924;QD=12.0839;RBI=0.00995899;REFB=0.00959522;REVB=0.0041739;RO=30;SAF=4;SAR=12;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.265821;STB=0.658325;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=-0.0266904;OID=.;OPOS=38512956;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:30:30:16:16:0.347826:12:4:14:16:12:4:14:16
chr21	38525356	.	T	C	507.94	PASS	AF=0.5;AO=53;DP=107;FAO=53;FDP=106;FR=.;FRO=53;FSAF=19;FSAR=34;FSRF=26;FSRR=27;FWDB=0.0154;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.204;QD=19.1676;RBI=0.0154113;REFB=0.00139441;REVB=-0.000589023;RO=52;SAF=19;SAR=34;SRF=25;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114605;STB=0.568958;STBP=0.163;TYPE=snp;VARB=-0.000500687;OID=.;OPOS=38525356;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:106:52:53:53:53:0.5:34:19:25:27:34:19:26:27
chr21	38532058	.	TG	T	966.92	PASS	AF=1;AO=78;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00262556;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=27.3699;QD=48.346;RBI=0.00272001;REFB=0;REVB=-0.000710585;RO=0;SAF=40;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.42134e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000152664;OID=.;OPOS=38532059;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:78:80:80:80:0:41:39:0:0:17:0:40:38:0:0
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chr21	38885442	.	A	G	220.57	PASS	AF=0.419355;AO=26;DP=62;FAO=26;FDP=62;FR=.;FRO=36;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=12;FWDB=-0.008071;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.034;QD=14.2304;RBI=0.0187934;REFB=-0.00852997;REVB=-0.0169721;RO=35;SAF=12;SAR=14;SRF=23;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19589;STB=0.61756;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=0.00976204;OID=.;OPOS=38885442;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:35:36:26:26:0.419355:14:12:23:12:14:12:24:12
chr21	38997701	.	G	A	1439.18	PASS	AF=0.980198;AO=99;DP=102;FAO=99;FDP=101;FR=.;FRO=2;FSAF=41;FSAR=58;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0173902;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.699;QD=56.9974;RBI=0.0188859;REFB=-0.0307377;REVB=-0.00736599;RO=2;SAF=41;SAR=58;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0225733;STB=0.511902;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=7.89031e-05;OID=.;OPOS=38997701;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:102:101:2:2:99:99:0.980198:58:41:2:0:58:41:2:0
chr21	39213020	.	G	A	613.3	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0276165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.2675;QD=61.3299;RBI=0.0283147;REFB=0;REVB=-0.00624909;RO=0;SAF=20;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.3303e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000186829;OID=.;OPOS=39213020;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:40:0:0:39:40:1:19:20:0:0:20:20:0:0
chr21	39528455	.	A	T	405.56	PASS	AF=0.555556;AO=40;DP=71;FAO=40;FDP=72;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=28;FSRF=12;FSRR=20;FWDB=-0.0312955;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=188.525;QD=22.531;RBI=0.0315133;REFB=0.00412633;REVB=0.00369823;RO=31;SAF=12;SAR=28;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0791702;STB=0.538442;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=-0.00260911;OID=.;OPOS=39528455;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:72:31:32:40:40:0.555556:28:12:12:19:28:12:12:20
chr21	39559559	.	G	A	309.2	PASS	AF=0.384615;AO=35;DP=91;FAO=35;FDP=91;FR=.;FRO=56;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=25;FSRR=31;FWDB=-0.000681407;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=184.165;QD=13.591;RBI=0.00780003;REFB=-0.0031287;REVB=0.00777021;RO=56;SAF=18;SAR=17;SRF=25;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0731014;STB=0.541669;STBP=0.538;TYPE=snp;VARB=0.00519953;OID=.;OPOS=39559559;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:56:56:35:35:0.384615:17:18:25:31:17:18:25:31
chr21	39672624	.	C	G	613.34	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0114139;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.267;QD=61.3343;RBI=0.018693;REFB=0;REVB=0.0148038;RO=0;SAF=17;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.4817e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000122604;OID=.;OPOS=39672624;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:23:17:0:0:23:17:0:0
chr21	39870310	.	G	A	447.0	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00798321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.923;QD=57.6774;RBI=0.0253772;REFB=0;REVB=0.0240888;RO=0;SAF=18;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.33668e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.83661e-05;OID=.;OPOS=39870310;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:13:18:0:0:13:18:0:0
chr21	40191431	.	T	G	1529.18	PASS	AF=1;AO=96;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0199733;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.3001;QD=63.7157;RBI=0.0213684;REFB=0;REVB=-0.00759453;RO=0;SAF=48;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.34992e-05;OID=.;OPOS=40191431;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:96:96:0:0:96:96:1:48:48:0:0:48:48:0:0
chr21	40191638	.	A	G	1062.15	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0328993;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.045;QD=59.8393;RBI=0.0328993;REFB=0;REVB=-1.4211e-05;RO=0;SAF=25;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.50978e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.97946e-05;OID=.;OPOS=40191638;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:46:25:0:0:46:25:0:0
chr21	40195277	.	T	A	2491.62	PASS	AF=1;AO=161;DP=162;FAO=162;FDP=162;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=109;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0470757;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.6608;QD=61.5214;RBI=0.0536876;REFB=0;REVB=-0.0258116;RO=0;SAF=53;SAR=108;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.00985e-05;OID=.;OPOS=40195277;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:162:162:0:0:161:162:1:108:53:0:0:109:53:0:0
chr21	40552307	.	A	G	1453.33	PASS	AF=1;AO=92;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0304696;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.348;QD=63.1881;RBI=0.0314979;REFB=0;REVB=0.00798255;RO=0;SAF=39;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.40233e-05;OID=.;OPOS=40552307;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:92:92:0:0:92:92:1:53:39:0:0:53:39:0:0
chr21	40571246	.	A	G	1540.25	PASS	AF=1;AO=103;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000533257;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.223;QD=59.8157;RBI=0.00468983;REFB=0;REVB=0.00465941;RO=0;SAF=55;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.42336e-06;OID=.;OPOS=40571246;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:103:103:0:0:103:103:1:48:55:0:0:48:55:0:0
chr21	40574305	.	A	G	1376.91	PASS	AF=1;AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.011101;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.3552;QD=62.5867;RBI=0.0436921;REFB=0;REVB=0.0422583;RO=0;SAF=31;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.90485e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000249526;OID=.;OPOS=40574305;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:88:88:0:0:88:88:1:57:31:0:0:57:31:0:0
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chr21	40670460	.	G	C	1350.21	PASS	AF=0.977778;AO=87;DP=90;FAO=88;FDP=90;FR=.;FRO=2;FSAF=41;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00980233;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.29;QD=60.0091;RBI=0.0101389;REFB=-0.0278862;REVB=-0.00259078;RO=2;SAF=40;SAR=47;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0197343;STB=0.510414;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=5.90768e-05;OID=.;OPOS=40670460;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:90:90:2:2:87:88:0.977778:47:40:0:2:47:41:0:2
chr21	40686020	.	C	T	1779.88	PASS	AF=0.97541;AO=119;DP=122;FAO=119;FDP=122;FR=.;FRO=3;FSAF=58;FSAR=61;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.00679169;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=227.239;QD=58.3567;RBI=0.0151161;REFB=-0.0783427;REVB=0.0135045;RO=2;SAF=58;SAR=61;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.016095;STB=0.512603;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.000293973;OID=.;OPOS=40686020;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:122:122:2:3:119:119:0.97541:61:58:2:0:61:58:3:0
chr21	40686078	.	G	C	1559.13	PASS	AF=0.981481;AO=106;DP=108;FAO=106;FDP=108;FR=.;FRO=2;FSAF=50;FSAR=56;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0315988;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.5;QD=57.7456;RBI=0.0334521;REFB=-0.0345826;REVB=0.01098;RO=1;SAF=50;SAR=56;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00939754;STB=0.500526;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=0.000181096;OID=.;OPOS=40686078;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:108:108:1:2:106:106:0.981481:56:50:1:0:56:50:1:1
chr21	40686327	.	T	C	556.84	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0173682;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.314;QD=60.1988;RBI=0.0241837;REFB=0;REVB=0.0168285;RO=0;SAF=14;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.91909e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000172769;OID=.;OPOS=40686327;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:23:14:0:0:23:14:0:0
chr21	40769290	.	A	G	408.97	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0363776;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.893;QD=56.4099;RBI=0.0367977;REFB=0;REVB=0.00554405;RO=0;SAF=14;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000920632;OID=.;OPOS=40769290;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:29:29:0:0:29:29:1:15:14:0:0:15:14:0:0
chr21	40823981	.	G	A	1227.62	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00370392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.187;QD=61.3809;RBI=0.0475184;REFB=0;REVB=0.0473738;RO=0;SAF=32;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.45895e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.89534e-05;OID=.;OPOS=40823981;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:79:80:0:0:79:80:1:47:32:0:0:48:32:0:0
chr21	40871810	.	T	C	375.03	PASS	AF=0.52;AO=37;DP=74;FAO=39;FDP=75;FR=.;FRO=36;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=11;FSRR=25;FWDB=-0.0112081;FXX=0.0384566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.1168;QD=20.0017;RBI=0.0126619;REFB=-0.0493869;REVB=-0.00589097;RO=34;SAF=21;SAR=16;SRF=11;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.208449;STB=0.610493;STBP=0.06;TYPE=snp;VARB=0.0741104;OID=.;OPOS=40871810;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:75:34:36:37:39:0.52:16:21:11:23:18:21:11:25
chr21	40883671	.	G	A,GAGA	145.7	PASS	AF=0.0454545,0.340909;AO=2,15;DP=44;FAO=2,15;FDP=44;FR=.;FRO=27;FSAF=2,10;FSAR=0,5;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.0176544,0.00152638;FXX=0;HRUN=2,1;LEN=1,3;MLLD=54.889,219.035;QD=13.2455;RBI=0.0389325,0.058246;REFB=-0.0134077,-0.0235994;REVB=-0.0346996,-0.058226;RO=27;SAF=2,10;SAR=0,5;SRF=12;SRR=15;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.49706,0.2455;STB=0.995209,0.644965;STBP=0.114,0.168;TYPE=snp,ins;VARB=0.0574375,0.0377654;OID=.,.;OPOS=40883671,40883672;OREF=G,-;OALT=A,AGA;OMAPALT=A,GAGA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:44:44:27:27:2,15:2,15:0.0454545,0.340909:0,5:2,10:12:15:0,5:2,10:12:15
chr21	40969826	.	G	C	1358.62	PASS	AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00319889;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.522;QD=62.4655;RBI=0.0259197;REFB=0;REVB=0.0257216;RO=0;SAF=37;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.03629e-05;OID=.;OPOS=40969826;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:50:37:0:0:50:37:0:0
chr21	41032740	.	T	C	340.73	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0151797;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.247;QD=54.5163;RBI=0.0736948;REFB=0;REVB=0.0721145;RO=0;SAF=9;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000604931;OID=.;OPOS=41032740;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:16:9:0:0:16:9:0:0
chr21	41032804	.	G	A	708.4	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0178133;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.8025;QD=62.9686;RBI=0.05038;REFB=0;REVB=0.0471257;RO=0;SAF=22;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000177879;OID=.;OPOS=41032804;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:23:22:0:0:23:22:0:0
chr21	41137499	.	A	G	207.64	PASS	AF=0.436364;AO=24;DP=55;FAO=24;FDP=55;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=0.0166335;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=244.672;QD=15.101;RBI=0.0175556;REFB=-0.00467208;REVB=0.00561472;RO=31;SAF=9;SAR=15;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.204622;STB=0.616341;STBP=0.151;TYPE=snp;VARB=0.0042303;OID=.;OPOS=41137499;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:31:31:24:24:0.436364:15:9:18:13:15:9:18:13
chr21	41137507	.	G	C	205.13	PASS	AF=0.442308;AO=23;DP=52;FAO=23;FDP=52;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=0.00120538;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.7178;QD=15.7793;RBI=0.00385071;REFB=-0.014318;REVB=-0.00365719;RO=29;SAF=8;SAR=15;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.204287;STB=0.616335;STBP=0.141;TYPE=snp;VARB=0.0207702;OID=.;OPOS=41137507;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:29:29:23:23:0.442308:15:8:16:13:15:8:16:13
chr21	41142932	.	C	T	233.49	PASS	AF=0.435484;AO=27;DP=62;FAO=27;FDP=62;FR=.;FRO=35;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=-0.0105533;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=237.252;QD=15.0641;RBI=0.0105552;REFB=-0.00765164;REVB=0.000198387;RO=35;SAF=11;SAR=16;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135573;STB=0.576866;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.0130397;OID=.;OPOS=41142932;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:35:35:27:27:0.435484:16:11:19:16:16:11:19:16
chr21	41165462	.	C	A	324.49	PASS	AF=0.515152;AO=34;DP=65;FAO=34;FDP=66;FR=.;FRO=32;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=20;FWDB=0.00409403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.607;QD=19.6663;RBI=0.0190188;REFB=-0.00765282;REVB=-0.018573;RO=31;SAF=20;SAR=14;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17234;STB=0.602777;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=0.0071027;OID=.;OPOS=41165462;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:66:31:32:34:34:0.515152:14:20:12:19:14:20:12:20
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chr21	41416066	.	C	T	434.48	PASS	AF=0.463158;AO=44;DP=95;FAO=44;FDP=95;FR=.;FRO=51;FSAF=30;FSAR=14;FSRF=31;FSRR=20;FWDB=0.00024535;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=253.045;QD=18.2939;RBI=0.0240981;REFB=-0.00971259;REVB=-0.0240968;RO=51;SAF=30;SAR=14;SRF=31;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0791247;STB=0.54427;STBP=0.449;TYPE=snp;VARB=0.00980717;OID=.;OPOS=41416066;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:51:51:44:44:0.463158:14:30:31:20:14:30:31:20
chr21	41434841	.	T	C	1268.95	PASS	AF=0.988095;AO=83;DP=84;FAO=83;FDP=84;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=42;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0282131;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.2845;QD=60.4262;RBI=0.0376489;REFB=-0.14758;REVB=0.0249291;RO=1;SAF=41;SAR=42;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.011412;STB=0.506023;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=0.000720318;OID=.;OPOS=41434841;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:84:84:1:1:83:83:0.988095:42:41:1:0:42:41:1:0
chr21	41447058	.	G	C	310.57	PASS	AF=0.435897;AO=33;DP=78;FAO=34;FDP=78;FR=.;FRO=44;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=25;FWDB=-0.0279602;FXX=0.0126566;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.5617;QD=15.9266;RBI=0.0292892;REFB=-0.0136022;REVB=-0.00872259;RO=44;SAF=17;SAR=16;SRF=19;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0841367;STB=0.554855;STBP=0.427;TYPE=snp;VARB=0.0101156;OID=.;OPOS=41447058;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:44:44:33:34:0.435897:16:17:19:25:16:18:19:25
chr21	41559182	.	G	A	863.54	PASS	AF=0.547945;AO=80;DP=146;FAO=80;FDP=146;FR=.;FRO=66;FSAF=36;FSAR=44;FSRF=33;FSRR=33;FWDB=0.0116511;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=197.477;QD=23.6587;RBI=0.0119908;REFB=-0.0060532;REVB=0.00283414;RO=66;SAF=36;SAR=44;SRF=33;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0415721;STB=0.522722;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=0.00487409;OID=.;OPOS=41559182;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:146:146:66:66:80:80:0.547945:44:36:33:33:44:36:33:33
chr21	41885146	.	C	A	118.58	PASS	AF=0.631579;AO=10;DP=20;FAO=12;FDP=19;FR=.,HEALED;FRO=6;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.0399993;FXX=0.049975;HRUN=4;LEN=1;MLLD=43.933;QD=24.9631;RBI=0.0480782;REFB=-0.0267405;REVB=0.0266752;RO=6;SAF=4;SAR=6;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.066985;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0327609;OID=.;OPOS=41885146;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:39:20:19:6:6:10:12:0.631579:6:4:3:3:6:6:3:3
chr21	42622786	.	C	T	1044.18	PASS	AF=1;AO=69;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130948;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.207;QD=59.6674;RBI=0.0196027;REFB=0;REVB=0.0145874;RO=0;SAF=27;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.56939e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.37954e-05;OID=.;OPOS=42622786;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:69:70:1:42:27:0:0:43:27:0:0
chr21	42717662	.	T	C	747.24	PASS	AF=0.96;AO=47;DP=49;FAO=48;FDP=50;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.048784;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.869;QD=59.7795;RBI=0.0668993;REFB=-0.0176164;REVB=0.0457782;RO=0;SAF=23;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5098;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=-0.000343721;OID=.;OPOS=42717662;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:49:50:0:1:47:48:0.96:24:23:0:0:25:23:0:1
chr21	42775555	.	A	G	62.21	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0421782;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.5487;QD=35.5482;RBI=0.0427267;REFB=0;REVB=0.00682397;RO=0;SAF=2;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.27427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00441189;OID=.;OPOS=42775555;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:5:2:0:0:5:2:0:0
chr21	42821113	.	T	C	256.36	PASS	AF=0.533333;AO=24;DP=45;FAO=24;FDP=45;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.00482258;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.388;QD=22.7871;RBI=0.0172255;REFB=-0.0233075;REVB=0.0165366;RO=19;SAF=8;SAR=16;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161318;STB=0.59367;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=0.0217812;OID=.;OPOS=42821113;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:19:21:24:24:0.533333:16:8:10:9:16:8:11:10
chr21	43133145	.	A	G	56.28	PASS	AF=0.4;AO=8;DP=20;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=0.00196864;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=276.274;QD=11.257;RBI=0.0139503;REFB=-0.0133135;REVB=-0.0138107;RO=12;SAF=1;SAR=7;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.620684;STB=0.874062;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.0134081;OID=.;OPOS=43133145;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:20:20:12:12:8:8:0.4:7:1:9:3:7:1:9:3
chr21	43133829	.	A	G	203.54	PASS	AF=0.421053;AO=24;DP=57;FAO=24;FDP=57;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=23;FWDB=-0.0429927;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.387;QD=14.2833;RBI=0.0444255;REFB=-0.00338144;REVB=-0.0111917;RO=33;SAF=11;SAR=13;SRF=10;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162061;STB=0.591855;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=0.00444906;OID=.;OPOS=43133829;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:33:33:24:24:0.421053:13:11:10:23:13:11:10:23
chr21	43161022	.	C	T	97.31	PASS	AF=0.4;AO=12;DP=30;FAO=12;FDP=30;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=0.0310294;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.347;QD=12.9745;RBI=0.0310297;REFB=-0.0398394;REVB=0.000127339;RO=18;SAF=6;SAR=6;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0566036;STB=0.533278;STBP=0.788;TYPE=snp;VARB=0.0562022;OID=.;OPOS=43161022;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:30:30:18:18:12:12:0.4:6:6:10:8:6:6:10:8
chr21	43161357	.	T	C	524.17	PASS	AF=1;AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0139107;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.0591;QD=59.9051;RBI=0.0547087;REFB=0;REVB=0.0529106;RO=0;SAF=20;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.59449e-05;OID=.;OPOS=43161357;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:35:0:0:35:35:1:15:20:0:0:15:20:0:0
chr21	43161805	.	G	A	789.19	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0167808;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.699;QD=64.424;RBI=0.0258126;REFB=0;REVB=0.0196136;RO=0;SAF=29;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.37125e-05;OID=.;OPOS=43161805;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:20:29:0:0:20:29:0:0
chr21	43161877	.	C	T	235.91	PASS	AF=0.469388;AO=23;DP=49;FAO=23;FDP=49;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=8;FWDB=0.0391314;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.937;QD=19.2581;RBI=0.0398251;REFB=-0.0179438;REVB=-0.00740112;RO=26;SAF=14;SAR=9;SRF=18;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0842958;STB=0.547488;STBP=0.59;TYPE=snp;VARB=0.0230536;OID=.;OPOS=43161877;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:26:26:23:23:0.469388:9:14:18:8:9:14:18:8
chr21	43162150	.	G	A	419.89	PASS	AF=0.443299;AO=43;DP=99;FAO=43;FDP=97;FR=.;FRO=54;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=22;FSRR=32;FWDB=0.00174323;FXX=0.0202;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.622;QD=17.3149;RBI=0.0112283;REFB=-0.00724403;REVB=0.0110921;RO=44;SAF=20;SAR=23;SRF=20;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00968105;STB=0.532415;STBP=0.587;TYPE=snp;VARB=0.0077647;OID=.;OPOS=43162150;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:97:44:54:43:43:0.443299:23:20:20:24:23:20:22:32
chr21	43169357	.	C	G	101.59	PASS	AF=0.5;AO=12;DP=24;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.0135942;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.331;QD=16.9316;RBI=0.0138251;REFB=-0.0230585;REVB=0.00251611;RO=12;SAF=7;SAR=5;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0186093;OID=.;OPOS=43169357;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:24:24:12:12:12:12:0.5:5:7:7:5:5:7:7:5
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chr21	43218520	.	G	A	277.6	PASS	AF=0.537037;AO=29;DP=54;FAO=29;FDP=54;FR=.;FRO=25;FSAF=21;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=-0.00651672;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=308.735;QD=20.563;RBI=0.00791969;REFB=0.00504092;REVB=0.00450043;RO=25;SAF=21;SAR=8;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.287661;STB=0.660623;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=-0.00519996;OID=.;OPOS=43218520;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:25:25:29:29:0.537037:8:21:10:15:8:21:10:15
chr21	43218807	.	C	T	154.69	PASS	AF=0.36;AO=18;DP=51;FAO=18;FDP=50;FR=.;FRO=32;FSAF=15;FSAR=3;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=0.0148932;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.4444;QD=12.3751;RBI=0.0606536;REFB=-0.00646202;REVB=0.0587967;RO=30;SAF=15;SAR=3;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.476306;STB=0.783238;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0204239;OID=.;OPOS=43218807;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:50:30:32:18:18:0.36:3:15:13:17:3:15:14:18
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chr21	43220380	.	C	A	261.12	PASS	AF=0.467742;AO=29;DP=63;FAO=29;FDP=62;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=21;FSRR=12;FWDB=0.00544323;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.326;QD=16.8466;RBI=0.0111684;REFB=0.00485972;REVB=-0.00975217;RO=34;SAF=16;SAR=13;SRF=22;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0935705;STB=0.545939;STBP=0.537;TYPE=snp;VARB=-0.00718478;OID=.;OPOS=43220380;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:62:34:33:29:29:0.467742:13:16:22:12:13:16:21:12
chr21	43221483	.	A	G	175.77	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0174611;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.115;QD=46.8723;RBI=0.0204462;REFB=0;REVB=0.0106376;RO=0;SAF=11;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.7592e-05;OID=.;OPOS=43221483;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:15:0:0:14:15:1:3:11:0:0:4:11:0:0
chr21	43221826	.	T	C	135.77	PASS	AF=0.7;AO=14;DP=20;FAO=14;FDP=20;FR=.;FRO=6;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0828562;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.76;QD=27.1541;RBI=0.0828582;REFB=-0.0199123;REVB=0.000579194;RO=6;SAF=6;SAR=8;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127659;STB=0.571326;STBP=0.364;TYPE=snp;VARB=0.00610726;OID=.;OPOS=43221826;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:20:20:6:6:14:14:0.7:8:6:4:2:8:6:4:2
chr21	43239972	.	A	G	675.31	PASS	AF=1;AO=43;DP=44;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0426691;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.224;QD=58.7229;RBI=0.04591;REFB=-0.133729;REVB=0.0169435;RO=1;SAF=29;SAR=14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159212;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00225205;OID=.;OPOS=43239972;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:44:46:1:0:43:46:1:14:29:1:0:14:32:0:0
chr21	43243585	.	A	G	622.43	PASS	AF=0.496063;AO=63;DP=130;FAO=63;FDP=127;FR=.;FRO=64;FSAF=32;FSAR=31;FSRF=39;FSRR=25;FWDB=-0.00767614;FXX=0.0230751;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.7172;QD=19.6042;RBI=0.0345411;REFB=-0.0192562;REVB=-0.0336774;RO=61;SAF=32;SAR=31;SRF=37;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0882656;STB=0.551199;STBP=0.245;TYPE=snp;VARB=0.0384306;OID=.;OPOS=43243585;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:130:127:61:64:63:63:0.496063:31:32:37:24:31:32:39:25
chr21	43256252	.	C	T	220.4	PASS	AF=0.454545;AO=25;DP=55;FAO=25;FDP=55;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=11;FWDB=-0.00529331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.083;QD=16.0288;RBI=0.00604775;REFB=-0.0169973;REVB=-0.00292511;RO=30;SAF=13;SAR=12;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110201;STB=0.562177;STBP=0.412;TYPE=snp;VARB=0.0161024;OID=.;OPOS=43256252;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:30:30:25:25:0.454545:12:13:19:11:12:13:19:11
chr21	43267260	.	C	T	225.2	PASS	AF=0.440678;AO=26;DP=59;FAO=26;FDP=59;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=-0.00715537;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.434;QD=15.268;RBI=0.0112396;REFB=-0.0102759;REVB=-0.00866774;RO=33;SAF=10;SAR=16;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.217706;STB=0.623282;STBP=0.101;TYPE=snp;VARB=0.0121338;OID=.;OPOS=43267260;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:33:33:26:26:0.440678:16:10:20:13:16:10:20:13
chr21	43315057	.	C	T	30.98	PASS	AF=0.5;AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.00795943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.69;QD=12.3925;RBI=0.0382627;REFB=0.0367565;REVB=0.0374257;RO=5;SAF=1;SAR=4;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20967;STB=0.630995;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=-0.0305633;OID=.;OPOS=43315057;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:27:10:10:5:5:5:5:0.5:4:1:2:3:4:1:2:3
chr21	43327793	.	C	T	289.23	PASS	AF=0.545455;AO=30;DP=56;FAO=30;FDP=55;FR=.;FRO=25;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=0.0249285;FXX=0.017854;HRUN=2;LEN=1;MLLD=226.78;QD=21.0348;RBI=0.025329;REFB=-0.0350899;REVB=0.00448637;RO=25;SAF=14;SAR=16;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0763591;STB=0.542345;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.0285744;OID=.;OPOS=43327793;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:55:25:25:30:30:0.545455:16:14:14:11:16:14:14:11
chr21	43327856	.	A	G	151.05	PASS	AF=0.354167;AO=17;DP=48;FAO=17;FDP=48;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=-0.0195899;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=83.2627;QD=12.5871;RBI=0.0258905;REFB=0.0103546;REVB=-0.016928;RO=31;SAF=12;SAR=5;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.288185;STB=0.669845;STBP=0.095;TYPE=snp;VARB=-0.0141307;OID=.;OPOS=43327856;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:31:31:17:17:0.354167:5:12:14:17:5:12:14:17
chr21	43408317	.	T	TAAAGA	281.62	PASS	AF=1;AO=20;DP=26;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00641568;FXX=0;HRUN=3;LEN=5;MLLD=230.527;QD=51.2043;RBI=0.0156147;REFB=0;REVB=-0.0142358;RO=4;SAF=8;SAR=12;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108462;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.000194664;OID=.;OPOS=43408318;OREF=-;OALT=AAAGA;OMAPALT=TAAAGA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:20:26:22:22:0:8:14:0:0:4:4:8:12:3:1
chr21	43413731	.	C	T	1428.49	PASS	AF=0.989362;AO=92;DP=94;FAO=93;FDP=94;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00533581;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.113;QD=60.7867;RBI=0.00796688;REFB=-0.239664;REVB=-0.00591611;RO=0;SAF=44;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505049;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=0.000408223;OID=.;OPOS=43413731;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:94:94:0:1:92:93:0.989362:48:44:0:0:49:44:0:1
chr21	43442385	.	C	T	138.29	PASS	AF=0.347826;AO=16;DP=46;FAO=16;FDP=46;FR=.;FRO=30;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=0.115515;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.9066;QD=12.0248;RBI=0.116132;REFB=0.0414328;REVB=-0.01195;RO=30;SAF=5;SAR=11;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.317696;STB=0.687266;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=-0.0675493;OID=.;OPOS=43442385;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:30:30:16:16:0.347826:11:5:18:12:11:5:18:12
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chr21	43510427	.	T	C	199.91	PASS	AF=0.362319;AO=25;DP=69;FAO=25;FDP=69;FR=.;FRO=44;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=25;FSRR=19;FWDB=-0.0179747;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.686;QD=11.589;RBI=0.0365693;REFB=0.00492785;REVB=0.031847;RO=43;SAF=14;SAR=11;SRF=24;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00206474;STB=0.505296;STBP=0.969;TYPE=snp;VARB=-0.0074429;OID=.;OPOS=43510427;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:43:44:25:25:0.362319:11:14:24:19:11:14:25:19
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chr21	43522349	.	T	C	518.24	PASS	AF=0.972973;AO=35;DP=37;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0533635;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.283;QD=56.0264;RBI=0.053576;REFB=-0.151661;REVB=0.00476645;RO=1;SAF=12;SAR=23;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0373832;STB=0.518508;STBP=0.261;TYPE=snp;VARB=0.00235496;OID=.;OPOS=43522349;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:37:37:1:1:35:36:0.972973:23:12:1:0:23:13:1:0
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chr21	43547788	.	T	C	537.57	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00108391;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.435;QD=59.7296;RBI=0.042244;REFB=0;REVB=0.0422301;RO=0;SAF=22;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.39865e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000101267;OID=.;OPOS=43547788;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:36:0:0:35:36:1:13:22:0:0:14:22:0:0
chr21	43547873	.	G	A	1290.36	PASS	AF=1;AO=82;DP=82;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0300593;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.944;QD=61.4457;RBI=0.0458123;REFB=0;REVB=-0.0345718;RO=0;SAF=57;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.51519e-06;OID=.;OPOS=43547873;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:84:0:0:82:84:1:25:57:0:0:25:59:0:0
chr21	43557559	.	T	A	273.42	PASS	AF=0.455882;AO=31;DP=68;FAO=31;FDP=68;FR=.;FRO=37;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=23;FSRR=14;FWDB=0.00382216;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.3449;QD=16.0834;RBI=0.0410863;REFB=-0.0141521;REVB=0.0409082;RO=36;SAF=20;SAR=11;SRF=22;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0350982;STB=0.513866;STBP=0.849;TYPE=snp;VARB=0.0152097;OID=.;OPOS=43557559;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:36:37:31:31:0.455882:11:20:22:14:11:20:23:14
chr21	43676586	.	A	T	207.85	PASS	AF=0.446809;AO=21;DP=47;FAO=21;FDP=47;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=0.000420683;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.141;QD=17.6896;RBI=0.00193438;REFB=-0.012872;REVB=0.00188808;RO=26;SAF=10;SAR=11;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0518669;STB=0.529504;STBP=0.739;TYPE=snp;VARB=0.0116665;OID=.;OPOS=43676586;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:26:26:21:21:0.446809:11:10:11:15:11:10:11:15
chr21	43679438	.	T	C	109.26	PASS	AF=0.419355;AO=13;DP=31;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.0383484;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.717;QD=14.0981;RBI=0.0402854;REFB=-0.00238018;REVB=0.0123416;RO=18;SAF=7;SAR=6;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0732572;STB=0.542649;STBP=0.726;TYPE=snp;VARB=0.00270935;OID=.;OPOS=43679438;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:18:18:13:13:0.419355:6:7:11:7:6:7:11:7
chr21	43679513	.	C	T	241.2	PASS	AF=0.534884;AO=22;DP=42;FAO=23;FDP=43;FR=.;FRO=20;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.00298747;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.7312;QD=22.4373;RBI=0.0530504;REFB=0.00389214;REVB=-0.0529662;RO=20;SAF=13;SAR=9;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0356034;STB=0.528277;STBP=0.708;TYPE=snp;VARB=-0.00267775;OID=.;OPOS=43679513;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:43:20:20:22:23:0.534884:9:13:11:9:9:14:11:9
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chr21	43810084	.	C	T	336.18	PASS	AF=0.493151;AO=35;DP=72;FAO=36;FDP=73;FR=.;FRO=37;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=0.00267421;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.275;QD=18.4208;RBI=0.0524427;REFB=-0.0172243;REVB=-0.0523745;RO=36;SAF=17;SAR=18;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.037614;STB=0.520537;STBP=0.748;TYPE=snp;VARB=0.0257213;OID=.;OPOS=43810084;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:73:36:37:35:36:0.493151:18:17:16:20:18:18:17:20
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chr21	43985955	.	G	A	209.65	PASS	AF=0.466667;AO=21;DP=45;FAO=21;FDP=45;FR=.;FRO=24;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=-0.0113161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.306;QD=18.6357;RBI=0.0114214;REFB=-0.011067;REVB=0.00154765;RO=24;SAF=14;SAR=7;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.202661;STB=0.615272;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=0.013273;OID=.;OPOS=43985955;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:24:24:21:21:0.466667:7:14:11:13:7:14:11:13
chr21	44189166	.	T	C	1037.15	PASS	AF=0.986111;AO=69;DP=71;FAO=71;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.000100793;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.473;QD=57.6194;RBI=0.0380239;REFB=0.127202;REVB=-0.0380237;RO=1;SAF=46;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0201069;STB=0.510635;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=0.000438753;OID=.;OPOS=44189166;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:71:72:1:1:69:71:0.986111:23:46:0:1:23:48:0:1
chr21	44189172	.	A	C	1190.44	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000128082;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.543;QD=61.048;RBI=0.0153957;REFB=0;REVB=0.0153951;RO=0;SAF=50;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.99741e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.4024e-05;OID=.;OPOS=44189172;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:78:0:0:76:78:1:26:50:0:0:27:51:0:0
chr21	44371114	.	T	C	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0056459;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.39;QD=46.848;RBI=0.0420996;REFB=0;REVB=-0.0417193;RO=0;SAF=7;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000448266;OID=.;OPOS=44371114;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:8:7:0:0:8:7:0:0
chr21	44430325	.	T	C	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00173811;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.057;QD=55.6561;RBI=0.00843622;REFB=0;REVB=0.00825523;RO=0;SAF=13;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.73813e-05;OID=.;OPOS=44430325;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:14:13:0:0:14:13:0:0
chr21	44437142	.	A	G	428.98	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0379353;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.1504;QD=57.1968;RBI=0.0448959;REFB=0;REVB=0.0240115;RO=0;SAF=7;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00114274;OID=.;OPOS=44437142;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:23:7:0:0:23:7:0:0
chr21	44450404	.	C	T	44.46	PASS	AF=0.269231;AO=7;DP=26;FAO=7;FDP=26;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=16;FWDB=0.012816;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.4518;QD=6.83987;RBI=0.0845921;REFB=-0.0377881;REVB=-0.0836156;RO=19;SAF=4;SAR=3;SRF=3;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.470108;STB=0.782906;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=0.0278788;OID=.;OPOS=44450404;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:26:26:19:19:7:7:0.269231:3:4:3:16:3:4:3:16
chr21	44480616	.	G	A	706.81	PASS	AF=0.965517;AO=52;DP=53;FAO=56;FDP=58;FR=.;FRO=2;FSAF=30;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0466633;FXX=0.0169463;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.456;QD=48.7458;RBI=0.0594249;REFB=-0.1871;REVB=0.0367948;RO=1;SAF=26;SAR=26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0177719;STB=0.501237;STBP=0.886;TYPE=snp;VARB=0.0101;OID=.;OPOS=44480616;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:53:58:1:2:52:56:0.965517:26:26:0:1:26:30:1:1
chr21	44579642	.	CGGGG	CGGG,CGGGC	112.71	PASS	AF=0.375,0.1;AO=14,3;DP=41;FAO=15,4;FDP=40;FR=.;FRO=21;FSAF=4,4;FSAR=11,0;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=0.0447346,0.11968;FXX=0.0243843;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=13.3908,18.9608;QD=11.2709;RBI=0.103068,0.120361;REFB=-0.12174,-0.0911447;REVB=-0.0928534,-0.0127893;RO=22;SAF=3,3;SAR=11,0;SRF=15;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.487118,0.522113;STB=0.733022,0.996414;STBP=0.023,0.105;TYPE=del,snp;VARB=0.11122,0.148326;OID=.,.;OPOS=44579643,44579646;OREF=G,G;OALT=-,C;OMAPALT=CGGG,CGGGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.375,0.1:14,3:41:15,4:40:21:4,4:11,0:14:7:96:22:3,3:11,0:15:7
chr21	44749141	.	G	A	41.14	PASS	AF=0.6;AO=6;DP=10;FAO=6;FDP=10;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0515815;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.604;QD=16.4543;RBI=0.0704032;REFB=-0.00129424;REVB=-0.0479161;RO=4;SAF=4;SAR=2;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0648362;STB=0.538337;STBP=0.881;TYPE=snp;VARB=0.00130127;OID=.;OPOS=44749141;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:10:10:4:4:6:6:0.6:2:4:3:1:2:4:3:1
chr21	44835508	.	A	G	107.23	PASS	AF=0.631579;AO=12;DP=19;FAO=12;FDP=19;FR=.;FRO=7;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0133532;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.505;QD=22.5747;RBI=0.0145366;REFB=-0.00450228;REVB=-0.00574495;RO=7;SAF=6;SAR=6;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0463935;STB=0.526272;STBP=0.806;TYPE=snp;VARB=0.00424031;OID=.;OPOS=44835508;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:19:19:7:7:12:12:0.631579:6:6:4:3:6:6:4:3
chr21	44837550	.	CGGGGG	CAGGGA	393.14	PASS	AF=0.62069;AO=33;DP=58;FAO=36;FDP=58;FR=.,HEALED;FRO=17;FSAF=27;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=3;FWDB=0.00750009;FXX=0;HRUN=5;LEN=5;MLLD=303.184;QD=27.1134;RBI=0.00856392;REFB=-0.0362656;REVB=0.00413394;RO=15;SAF=27;SAR=6;SRF=14;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121118;STB=0.53245;STBP=0.588;TYPE=mnp;VARB=0.0190792;OID=.;OPOS=44837551;OREF=GGGGG;OALT=AGGGA;OMAPALT=CAGGGA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.62069:33:58:36:58:17:27:9:14:3:99:15:27:6:14:1
chr21	45092257	.	T	A	239.65	PASS	AF=0.490566;AO=26;DP=53;FAO=26;FDP=53;FR=.;FRO=27;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=0.018661;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.322;QD=18.0866;RBI=0.0221697;REFB=-0.0158464;REVB=0.0119692;RO=27;SAF=14;SAR=12;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0181643;STB=0.510196;STBP=0.898;TYPE=snp;VARB=0.0138241;OID=.;OPOS=45092257;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:27:27:26:26:0.490566:12:14:14:13:12:14:14:13
chr21	45096206	.	G	A	282.21	PASS	AF=0.56;AO=28;DP=51;FAO=28;FDP=50;FR=.;FRO=22;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=-0.0270029;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.618;QD=22.5768;RBI=0.0278056;REFB=0.00413851;REVB=-0.00663267;RO=23;SAF=14;SAR=14;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123743;STB=0.559958;STBP=0.38;TYPE=snp;VARB=-0.00253285;OID=.;OPOS=45096206;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:50:23:22:28:28:0.56:14:14:8:15:14:14:8:14
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chr21	45107562	.	T	C	196.21	PASS	AF=0.342466;AO=25;DP=73;FAO=25;FDP=73;FR=.;FRO=48;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=26;FWDB=-0.00507191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.629;QD=10.7513;RBI=0.00528088;REFB=-0.00603209;REVB=-0.00147086;RO=48;SAF=13;SAR=12;SRF=22;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0695297;STB=0.540449;STBP=0.634;TYPE=snp;VARB=0.0144473;OID=.;OPOS=45107562;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:48:48:25:25:0.342466:12:13:22:26:12:13:22:26
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chr21	45181571	.	A	AG,G	315.31	PASS	AF=0.545455,0.0151515;AO=28,3;DP=75;FAO=36,1;FDP=66;FR=.;FRO=29;FSAF=22,1;FSAR=14,0;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=0.0611552,-0.00838666;FXX=0;HRUN=3,1;LEN=1,1;MLLD=24.5982,242.51;QD=19.1097;RBI=0.0753451,0.0131059;REFB=0.0591374,0.000249485;REVB=-0.0440105,-0.0100712;RO=43;SAF=20,1;SAR=8,2;SRF=19;SRR=24;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.299877,-0.106668;STB=0.504502,0.987619;STBP=0.952,0.474;TYPE=ins,snp;VARB=-0.0529961,0.0202985;OID=.,.;OPOS=45181572,45181571;OREF=-,A;OALT=G,G;OMAPALT=AG,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:66:43:29:28,3:36,1:0.545455,0.0151515:8,2:20,1:19:24:14,0:22,1:18:11
chr21	45210932	.	G	A	216.66	PASS	AF=0.4;AO=26;DP=65;FAO=26;FDP=65;FR=.;FRO=39;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=23;FWDB=-0.0276271;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.163;QD=13.3327;RBI=0.0283707;REFB=-0.013868;REVB=-0.00645275;RO=39;SAF=18;SAR=8;SRF=16;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.300454;STB=0.672154;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.0193646;OID=.;OPOS=45210932;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:39:39:26:26:0.4:8:18:16:23:8:18:16:23
chr21	45215051	.	A	G	275.93	PASS	AF=0.385542;AO=32;DP=82;FAO=32;FDP=83;FR=.;FRO=51;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=25;FSRR=26;FWDB=-0.00856439;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.743;QD=13.2979;RBI=0.0297072;REFB=-0.0129069;REVB=-0.0284459;RO=49;SAF=14;SAR=18;SRF=24;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0558904;STB=0.532605;STBP=0.644;TYPE=snp;VARB=0.0216586;OID=.;OPOS=45215051;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:83:49:51:32:32:0.385542:18:14:24:25:18:14:25:26
chr21	45217559	.	T	C	347.04	PASS	AF=0.493151;AO=36;DP=74;FAO=36;FDP=73;FR=.;FRO=37;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=-0.0457592;FXX=0.0135117;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.984;QD=19.016;RBI=0.0521778;REFB=-0.0276877;REVB=-0.0250722;RO=36;SAF=14;SAR=22;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126956;STB=0.564505;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=0.0237481;OID=.;OPOS=45217559;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:73:36:37:36:36:0.493151:22:14:19:17:22:14:19:18
chr21	45220787	.	A	G	702.27	PASS	AF=1;AO=48;DP=51;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0188969;FXX=0.039208;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.151;QD=57.3279;RBI=0.020892;REFB=0;REVB=0.00890988;RO=0;SAF=24;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.37726e-05;OID=.;OPOS=45220787;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:49:0:0:48:49:1:24:24:0:0:25:24:0:0
chr21	45503121	.	G	A	60.3	PASS	AF=0.571429;AO=8;DP=14;FAO=8;FDP=14;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.00728029;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.388;QD=17.2296;RBI=0.0124997;REFB=-0.000421309;REVB=0.0101607;RO=6;SAF=2;SAR=6;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.426988;STB=0.749374;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.000730929;OID=.;OPOS=45503121;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:14:14:6:6:8:8:0.571429:6:2:5:1:6:2:5:1
chr21	45506819	.	T	C	654.77	PASS	AF=0.626374;AO=55;DP=91;FAO=57;FDP=91;FR=.;FRO=34;FSAF=27;FSAR=30;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=0.00513605;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.661;QD=28.7809;RBI=0.00809583;REFB=-0.0088926;REVB=0.00625807;RO=34;SAF=27;SAR=28;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0349574;STB=0.512191;STBP=0.777;TYPE=snp;VARB=0.00571062;OID=.;OPOS=45506819;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:34:34:55:57:0.626374:28:27:15:19:30:27:15:19
chr21	45528919	.	G	A	512.56	PASS	AF=0.462185;AO=55;DP=119;FAO=55;FDP=119;FR=.;FRO=64;FSAF=34;FSAR=21;FSRF=35;FSRR=29;FWDB=0.00514999;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.016;QD=17.2289;RBI=0.0165922;REFB=-0.00809239;REVB=0.0157727;RO=62;SAF=34;SAR=21;SRF=34;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0691205;STB=0.539839;STBP=0.427;TYPE=snp;VARB=0.0112964;OID=.;OPOS=45528919;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:119:62:64:55:55:0.462185:21:34:34:28:21:34:35:29
chr21	45538647	.	T	C	235.0	PASS	AF=0.442623;AO=27;DP=61;FAO=27;FDP=61;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=12;FWDB=-0.0105121;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=176.381;QD=15.4097;RBI=0.0128616;REFB=-0.00802919;REVB=0.00741062;RO=34;SAF=11;SAR=16;SRF=22;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.232974;STB=0.631484;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=0.0110255;OID=.;OPOS=45538647;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:34:34:27:27:0.442623:16:11:22:12:16:11:22:12
chr21	45538725	.	C	A	279.93	PASS	AF=0.438356;AO=31;DP=74;FAO=32;FDP=73;FR=.,HEALED;FRO=41;FSAF=10;FSAR=22;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=-0.0383434;FXX=0.0135117;HRUN=5;LEN=1;MLLD=177.832;QD=15.3387;RBI=0.0422289;REFB=-0.0247336;REVB=-0.0176938;RO=32;SAF=10;SAR=21;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19901;STB=0.591777;STBP=0.198;TYPE=snp;VARB=0.0233275;OID=.;OPOS=45538725;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:73:32:41:31:32:0.438356:21:10:17:15:22:10:19:22
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chr21	45649494	.	A	G	105.84	PASS	AF=0.351351;AO=13;DP=37;FAO=13;FDP=37;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.0613;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.2989;QD=11.4422;RBI=0.0665389;REFB=-0.00705695;REVB=-0.0258793;RO=24;SAF=6;SAR=7;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132226;STB=0.578393;STBP=0.484;TYPE=snp;VARB=0.0150258;OID=.;OPOS=45649494;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:24:24:13:13:0.351351:7:6:14:10:7:6:14:10
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chr21	45717550	.	T	C	751.46	PASS	AF=0.414634;AO=84;DP=203;FAO=85;FDP=205;FR=.;FRO=120;FSAF=48;FSAR=37;FSRF=65;FSRR=55;FWDB=-0.0104176;FXX=0.00966137;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.917;QD=14.6627;RBI=0.0123774;REFB=-0.0190045;REVB=0.00668388;RO=114;SAF=48;SAR=36;SRF=61;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0379989;STB=0.513664;STBP=0.743;TYPE=snp;VARB=0.0261054;OID=.;OPOS=45717550;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:203:205:114:120:84:85:0.414634:36:48:61:53:37:48:65:55
chr21	45725715	.	A	G	141.96	PASS	AF=0.390244;AO=16;DP=41;FAO=16;FDP=41;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=0.0199069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.727;QD=13.8496;RBI=0.0202679;REFB=-0.00113446;REVB=-0.00380832;RO=25;SAF=5;SAR=11;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101299;STB=0.559245;STBP=0.609;TYPE=snp;VARB=0.0019554;OID=.;OPOS=45725715;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:25:25:16:16:0.390244:11:5:10:15:11:5:10:15
chr21	45732116	.	C	T	319.27	PASS	AF=0.523077;AO=34;DP=65;FAO=34;FDP=65;FR=.;FRO=31;FSAF=28;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=0.00528719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.306;QD=19.6471;RBI=0.00830739;REFB=-0.00804952;REVB=-0.00640768;RO=31;SAF=28;SAR=6;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.435752;STB=0.744521;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0169185;OID=.;OPOS=45732116;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:31:31:34:34:0.523077:6:28:12:19:6:28:12:19
chr21	45844751	.	A	G	2852.28	PASS	AF=0.989189;AO=182;DP=185;FAO=183;FDP=185;FR=.;FRO=2;FSAF=83;FSAR=100;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0406626;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.725;QD=61.671;RBI=0.0486311;REFB=-0.0920063;REVB=-0.0266747;RO=2;SAF=83;SAR=99;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000916667;STB=0.500506;STBP=0.865;TYPE=snp;VARB=0.00266561;OID=.;OPOS=45844751;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:185:185:2:2:182:183:0.989189:99:83:1:1:100:83:1:1
chr21	45856987	.	A	G	124.88	PASS	AF=0.5;AO=14;DP=28;FAO=14;FDP=28;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.0166742;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=108.771;QD=17.8403;RBI=0.078526;REFB=-0.00862296;REVB=-0.0767353;RO=14;SAF=4;SAR=10;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.204512;STB=0.6178;STBP=0.238;TYPE=snp;VARB=0.00947165;OID=.;OPOS=45856987;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:28:14:14:14:14:0.5:10:4:7:7:10:4:7:7
chr21	45876821	.	C	T	242.17	PASS	AF=0.473684;AO=27;DP=57;FAO=27;FDP=57;FR=.;FRO=30;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=10;FWDB=0.0118149;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.9224;QD=16.9944;RBI=0.0195334;REFB=-0.0105726;REVB=0.0155551;RO=29;SAF=16;SAR=11;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0605813;STB=0.540954;STBP=0.544;TYPE=snp;VARB=0.0235112;OID=.;OPOS=45876821;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:29:30:27:27:0.473684:11:16:19:10:11:16:20:10
chr21	45959195	.	G	A	317.19	PASS	AF=0.96;AO=24;DP=26;FAO=24;FDP=25;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0546588;FXX=0.0384468;HRUN=3;LEN=1;MLLD=165.987;QD=50.7509;RBI=0.0585253;REFB=-0.0877725;REVB=0.0209195;RO=0;SAF=4;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.83186e-08;STB=0.512185;STBP=0.638;TYPE=snp;VARB=0.00116207;OID=.;OPOS=45959195;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:26:25:0:1:24:24:0.96:20:4:0:0:20:4:0:1
chr21	45959557	.	ATC	TGA	66.53	PASS	AF=1;AO=7;DP=8;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0621721;FXX=0.124844;HRUN=2;LEN=3;MLLD=269.902;QD=38.0149;RBI=0.0626894;REFB=0;REVB=0.00803688;RO=0;SAF=5;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.27427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.0012009;OID=.;OPOS=45959557;OREF=ATC;OALT=TGA;OMAPALT=TGA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:7:0:0:7:7:1:2:5:0:0:2:5:0:0
chr21	45970718	.	C	T	39.62	PASS	AF=0.5;AO=6;DP=12;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.00938838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.737;QD=13.2053;RBI=0.0183871;REFB=-0.033995;REVB=-0.0158096;RO=6;SAF=5;SAR=1;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.345446;STB=0.713468;STBP=0.206;TYPE=snp;VARB=0.042122;OID=.;OPOS=45970718;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:12:12:6:6:6:6:0.5:1:5:3:3:1:5:3:3
chr21	45970993	.	C	G	62.69	PASS	AF=0.666667;AO=8;DP=12;FAO=8;FDP=12;FR=.;FRO=4;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0514772;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=54.4663;QD=20.8967;RBI=0.109914;REFB=-0.0348033;REVB=-0.0971138;RO=4;SAF=1;SAR=7;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.336275;STB=0.699397;STBP=0.127;TYPE=snp;VARB=0.00777101;OID=.;OPOS=45970993;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:12:12:4:4:8:8:0.666667:7:1:2:2:7:1:2:2
chr21	45971299	.	T	C	39.65	PASS	AF=0.5;AO=6;DP=12;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.0413135;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.028;QD=13.2163;RBI=0.0417354;REFB=-0.0219194;REVB=-0.0059193;RO=6;SAF=5;SAR=1;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.45721;STB=0.780223;STBP=0.098;TYPE=snp;VARB=0.0529138;OID=.;OPOS=45971299;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:12:12:6:6:6:6:0.5:1:5:2:4:1:5:2:4
chr21	45999753	.	C	G	32.4	PASS	AF=0.625;AO=5;DP=8;FAO=5;FDP=8;FR=.;FRO=3;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0215329;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.125;QD=16.199;RBI=0.0524011;REFB=0.0123056;REVB=-0.0477725;RO=3;SAF=4;SAR=1;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.23409;STB=0.635921;STBP=0.698;TYPE=snp;VARB=-0.00825853;OID=.;OPOS=45999753;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:8:8:3:3:5:5:0.625:1:4:3:0:1:4:3:0
chr21	45999908	.	A	C	110.71	PASS	AF=0.705882;AO=12;DP=17;FAO=12;FDP=17;FR=.;FRO=5;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=-0.0175076;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=260.235;QD=26.0488;RBI=0.0176924;REFB=-0.0194766;REVB=0.00255026;RO=5;SAF=6;SAR=6;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157187;STB=0.588093;STBP=0.262;TYPE=snp;VARB=0.00536785;OID=.;OPOS=45999908;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:17:17:5:5:12:12:0.705882:6:6:4:1:6:6:4:1
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chr21	46020527	.	C	T	653.11	PASS	AF=0.93617;AO=43;DP=47;FAO=44;FDP=47;FR=.;FRO=3;FSAF=30;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0614481;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.282;QD=55.5837;RBI=0.0615526;REFB=-0.0946084;REVB=-0.00358544;RO=4;SAF=30;SAR=13;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124529;STB=0.548365;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.00563722;OID=.;OPOS=46020527;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:47:47:4:3:43:44:0.93617:13:30:0:4:14:30:0:3
chr21	46021205	.	C	T	34.8	PASS	AF=0.833333;AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=0;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=35.3768;QD=23.2015;RBI=0.00356336;REFB=-0.132814;REVB=0.00356336;RO=0;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0382634;OID=.;OPOS=46021205;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:6:6:0:1:5:5:0.833333:5:0:0:0:5:0:0:1
chr21	46021370	.	T	C	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.130089;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.54;QD=42.1815;RBI=0.133148;REFB=0;REVB=0.028377;RO=0;SAF=2;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00259039;OID=.;OPOS=46021370;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:9:2:0:0:9:2:0:0
chr21	46021390	.	G	C	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00733533;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.8945;QD=40.7629;RBI=0.0791125;REFB=0;REVB=-0.0787717;RO=0;SAF=2;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00505617;OID=.;OPOS=46021390;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:8:2:0:0:8:2:0:0
chr21	46021481	.	T	C	81.58	PASS	AF=1;AO=8;DP=9;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.115824;FXX=0.110988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.272;QD=40.7887;RBI=0.11585;REFB=0;REVB=-0.0024603;RO=1;SAF=0;SAR=8;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.803989;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0022672;OID=.;OPOS=46021481;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:8:1:0:8:8:1:8:0:1:0:7:1:0:0
chr21	46021494	.	A	G	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0261239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.598;QD=35.5759;RBI=0.0776006;REFB=0;REVB=-0.0730712;RO=0;SAF=1;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0053093;OID=.;OPOS=46021494;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:6:1:0:0:6:1:0:0
chr21	46021607	.	A	G	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.003379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.372;QD=37.4882;RBI=0.0157975;REFB=0;REVB=-0.0154319;RO=0;SAF=4;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000400959;OID=.;OPOS=46021607;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:4:4:0:0:4:4:0:0
chr21	46021759	.	A	G,T	732.62	PASS	AF=0.957447,0.0425532;AO=44,2;DP=47;FAO=45,2;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=23,2;FSAR=22,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.025215,0.0312759;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=160.082,101.26;QD=62.3505;RBI=0.0274638,0.037589;REFB=0,0;REVB=0.010884,0.0208506;RO=0;SAF=23,2;SAR=21,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-5.2717e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.000727789,0.0200375;OID=.,.;OPOS=46021759,46021759;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:47:47:0:0:44,2:45,2:0.957447,0.0425532:21,0:23,2:0:0:22,0:23,2:0:0
chr21	46021934	.	C	T	729.0	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00600859;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.743;QD=57.1764;RBI=0.010712;REFB=0;REVB=-0.00886808;RO=0;SAF=25;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94283e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.55391e-06;OID=.;OPOS=46021934;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:26:25:0:0:26:25:0:0
chr21	46021946	.	C	G	740.41	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0165802;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.9337;QD=56.9545;RBI=0.0306116;REFB=0;REVB=-0.0257326;RO=0;SAF=24;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.48761e-05;OID=.;OPOS=46021946;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:28:24:0:0:28:24:0:0
chr21	46021954	.	CTG	C	583.49	PASS	AF=1;AO=36;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00396207;FXX=0.0731529;HRUN=1;LEN=2;MLLD=290.507;QD=61.4203;RBI=0.0152484;REFB=0;REVB=-0.0147246;RO=0;SAF=15;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-2.05586e-05;OID=.;OPOS=46021955;OREF=TG;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:36:38:38:38:0:15:23:0:0:4:0:15:21:0:0
chr21	46032094	.	A	G	260.27	PASS	AF=1;AO=20;DP=21;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0303013;FXX=0.0475964;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.451;QD=52.0539;RBI=0.0528897;REFB=0;REVB=0.0433492;RO=0;SAF=11;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000503745;OID=.;OPOS=46032094;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:20:0:0:20:20:1:9:11:0:0:9:11:0:0
chr21	46047418	.	C	CT,T	86.73	PASS	AF=0.222222,0.777778;AO=2,6;DP=8;FAO=2,7;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=2,1;FSAR=0,6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0341858,-0.05302;FXX=0;HRUN=0,1;LEN=1,1;MLLD=34.9464,135.26;QD=38.5445;RBI=0.0461068,0.0716175;REFB=0,0;REVB=0.0309381,0.048145;RO=0;SAF=2,1;SAR=0,5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.18042e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.0903972,0.00293985;OID=.,.;OPOS=46047419,46047418;OREF=-,C;OALT=T,T;OMAPALT=CT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:10:8:9:0:0:2,6:2,7:0.222222,0.777778:0,5:2,1:0:0:0,6:2,1:0:0
chr21	46047633	.	A	G	270.32	PASS	AF=1;AO=20;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00918109;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.6897;QD=51.4888;RBI=0.00965808;REFB=0;REVB=0.00299769;RO=0;SAF=9;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000261562;OID=.;OPOS=46047633;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:20:21:1:11:9:0:0:12:9:0:0
chr21	46047710	.	T	C	327.4	PASS	AF=1;AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00564661;FXX=0.039984;HRUN=3;LEN=1;MLLD=248.144;QD=54.5663;RBI=0.0132114;REFB=0;REVB=0.0119439;RO=0;SAF=12;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.57723e-05;OID=.;OPOS=46047710;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:24:0:0:24:24:1:12:12:0:0:12:12:0:0
chr21	46047857	.	C	T	82.07	PASS	AF=0.9;AO=9;DP=10;FAO=9;FDP=10;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0648396;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=224.43;QD=32.8267;RBI=0.0690746;REFB=-0.138311;REVB=0.0238144;RO=1;SAF=5;SAR=4;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.080744;STB=0.545355;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.00269022;OID=.;OPOS=46047857;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:10:10:1:1:9:9:0.9:4:5:1:0:4:5:1:0
chr21	46047925	.	G	T	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0435147;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.309;QD=37.4885;RBI=0.0453923;REFB=0;REVB=0.0129201;RO=0;SAF=5;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000738078;OID=.;OPOS=46047925;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:3:5:0:0:3:5:0:0
chr21	46047971	.	T	C	69.29	PASS	AF=0.888889;AO=8;DP=9;FAO=8;FDP=9;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0668184;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.4446;QD=30.7945;RBI=0.0678597;REFB=-0.0864898;REVB=0.0118427;RO=0;SAF=3;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46938e-08;STB=0.545344;STBP=0.621;TYPE=snp;VARB=0.00673314;OID=.;OPOS=46047971;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:9:9:0:1:8:8:0.888889:5:3:0:0:5:3:0:1
chr21	46048265	.	C	T	57.31	PASS	AF=0.875;AO=7;DP=8;FAO=7;FDP=8;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.021343;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=235.495;QD=28.6537;RBI=0.0652108;REFB=-0.0603156;REVB=0.0616192;RO=1;SAF=6;SAR=1;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.2842;STB=0.666107;STBP=0.137;TYPE=snp;VARB=0.00276326;OID=.;OPOS=46048265;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:8:8:1:1:7:7:0.875:1:6:0:1:1:6:0:1
chr21	46057393	.	T	A	687.46	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0150315;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.18;QD=62.4959;RBI=0.0214398;REFB=0;REVB=0.0152878;RO=0;SAF=29;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.13233e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000567333;OID=.;OPOS=46057393;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:44:0:0:43:44:1:14:29:0:0:14:30:0:0
chr21	46057548	.	A	C	239.44	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0238263;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.3629;QD=50.408;RBI=0.0261143;REFB=0;REVB=0.0106894;RO=0;SAF=9;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00042079;OID=.;OPOS=46057548;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:10:9:0:0:10:9:0:0
chr21	46057958	.	C	T	206.57	PASS	AF=1;AO=17;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.282002;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.0701;QD=45.9038;RBI=0.294318;REFB=0;REVB=0.0842494;RO=0;SAF=4;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.01674;OID=.;OPOS=46057958;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:18:18:0:0:17:18:1:13:4:0:0:13:5:0:0
chr21	46058060	.	C	T	330.44	PASS	AF=0.961538;AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0534341;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.523;QD=50.8366;RBI=0.0746594;REFB=-0.0181993;REVB=0.0521424;RO=1;SAF=9;SAR=16;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0281249;STB=0.515139;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.00114746;OID=.;OPOS=46058060;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:26:26:1:1:25:25:0.961538:16:9:0:1:16:9:0:1
chr21	46066764	.	C	T	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00694057;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.301;QD=40.763;RBI=0.0278491;REFB=0;REVB=0.0269704;RO=0;SAF=2;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000200389;OID=.;OPOS=46066764;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:8:2:0:0:8:2:0:0
chr21	46067180	.	C	T	115.98	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.147547;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.1058;QD=42.1745;RBI=0.161842;REFB=0;REVB=0.0665036;RO=0;SAF=9;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00960191;OID=.;OPOS=46067180;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:2:9:0:0:2:9:0:0
chr21	46074202	.	A	G	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00147003;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.252;QD=35.5759;RBI=0.00655294;REFB=0;REVB=-0.00638592;RO=0;SAF=6;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.69466e-05;OID=.;OPOS=46074202;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:1:6:0:0:1:6:0:0
chr21	46077946	.	A	G	563.71	PASS	AF=0.974359;AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0271805;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.4241;QD=57.8159;RBI=0.029991;REFB=-0.0302883;REVB=-0.0126761;RO=1;SAF=19;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0240222;STB=0.512814;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.00134624;OID=.;OPOS=46077946;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:39:39:1:1:38:38:0.974359:19:19:0:1:19:19:0:1
chr21	46086718	.	GA	CG	164.45	PASS	AF=1;AO=14;DP=15;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0493694;FXX=0.0666222;HRUN=2;LEN=2;MLLD=167.068;QD=46.9858;RBI=0.0582602;REFB=0;REVB=0.0309339;RO=0;SAF=5;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000886065;OID=.;OPOS=46086718;OREF=GA;OALT=CG;OMAPALT=CG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:14:0:0:14:14:1:9:5:0:0:9:5:0:0
chr21	46086757	.	GC	AT	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0582565;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=213.18;QD=44.6898;RBI=0.0588801;REFB=0;REVB=0.00854636;RO=0;SAF=9;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000799275;OID=.;OPOS=46086757;OREF=GC;OALT=AT;OMAPALT=AT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:4:9:0:0:4:9:0:0
chr21	46117962	.	G	A	145.64	PASS	AF=1;AO=13;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00783285;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.9943;QD=41.6106;RBI=0.0516519;REFB=-0.0549011;REVB=0.0510546;RO=1;SAF=7;SAR=6;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0695995;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00326822;OID=.;OPOS=46117962;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:14:14:1:0:13:14:1:6:7:0:1:7:7:0:0
chr21	46233836	.	C	A	211.66	PASS	AF=0.5;AO=20;DP=41;FAO=21;FDP=42;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=0.00782748;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.822;QD=20.1581;RBI=0.0117703;REFB=-0.0286946;REVB=0.00879042;RO=21;SAF=8;SAR=12;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.238229;STB=0.641123;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=0.0159644;OID=.;OPOS=46233836;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:42:21:21:20:21:0.5:12:8:14:7:13:8:14:7
chr21	46311813	.	A	G	153.14	PASS	AF=0.386364;AO=17;DP=44;FAO=17;FDP=44;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.00419026;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.5829;QD=13.922;RBI=0.0264671;REFB=-0.0123592;REVB=-0.0261333;RO=27;SAF=6;SAR=11;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0613818;STB=0.535774;STBP=0.725;TYPE=snp;VARB=0.0197902;OID=.;OPOS=46311813;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:27:27:17:17:0.386364:11:6:11:16:11:6:11:16
chr21	46314907	.	T	A	711.61	PASS	AF=0.962963;AO=51;DP=53;FAO=52;FDP=54;FR=.;FRO=2;FSAF=24;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00386315;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.507;QD=52.7121;RBI=0.0156165;REFB=-0.0103838;REVB=0.0151312;RO=2;SAF=24;SAR=27;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0336073;STB=0.517235;STBP=0.245;TYPE=snp;VARB=0.000303488;OID=.;OPOS=46314907;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:53:54:2:2:51:52:0.962963:27:24:0:2:28:24:0:2
chr21	46320313	.	C	T	467.24	PASS	AF=0.528736;AO=47;DP=88;FAO=46;FDP=87;FR=.;FRO=41;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=16;FSRR=25;FWDB=0.0297311;FXX=0.0113623;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.5578;QD=21.4821;RBI=0.0577476;REFB=0.012071;REVB=0.049506;RO=41;SAF=23;SAR=24;SRF=16;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0840708;STB=0.551702;STBP=0.334;TYPE=snp;VARB=-0.00752045;OID=.;OPOS=46320313;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:87:41:41:47:46:0.528736:24:23:16:25:23:23:16:25
chr21	46328026	.	G	A	820.08	PASS	AF=0.436893;AO=90;DP=204;FAO=90;FDP=206;FR=.;FRO=116;FSAF=46;FSAR=44;FSRF=42;FSRR=74;FWDB=-0.0283724;FXX=0.00483068;HRUN=3;LEN=1;MLLD=120.596;QD=15.9239;RBI=0.0286629;REFB=-0.00470658;REVB=0.00407031;RO=113;SAF=46;SAR=44;SRF=40;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157254;STB=0.583638;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.00585924;OID=.;OPOS=46328026;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:204:206:113:116:90:90:0.436893:44:46:40:73:44:46:42:74
chr21	46328099	.	T	C	1454.11	PASS	AF=0.990099;AO=98;DP=98;FAO=100;FDP=101;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=58;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0157994;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.781;QD=57.5884;RBI=0.0236714;REFB=-0.0796942;REVB=0.0176271;RO=0;SAF=43;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.423e-08;STB=0.505881;STBP=0.277;TYPE=snp;VARB=0.000153088;OID=.;OPOS=46328099;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:98:101:0:1:98:100:0.990099:55:43:0:0:58:42:1:0
chr21	46330628	.	C	T	111.88	PASS	AF=0.28;AO=14;DP=50;FAO=14;FDP=50;FR=.;FRO=36;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=23;FWDB=0.00968659;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.183;QD=8.95055;RBI=0.0116294;REFB=-0.0193772;REVB=0.00643521;RO=36;SAF=7;SAR=7;SRF=13;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165217;STB=0.599863;STBP=0.397;TYPE=snp;VARB=0.035631;OID=.;OPOS=46330628;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:36:36:14:14:0.28:7:7:13:23:7:7:13:23
chr21	46354055	.	A	G	953.34	PASS	AF=1;AO=62;DP=63;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0336329;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.7446;QD=56.9156;RBI=0.0395477;REFB=0;REVB=-0.0208051;RO=0;SAF=38;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000857589;OID=.;OPOS=46354055;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:67:0:0:62:67:1:24:38:0:0:27:40:0:0
chr21	46572572	.	A	G	897.01	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0213761;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.661;QD=56.9531;RBI=0.0216097;REFB=0;REVB=-0.00316824;RO=0;SAF=30;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000309216;OID=.;OPOS=46572572;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:63:0:0:59:63:1:29:30:0:0:33:30:0:0
chr21	46702822	.	A	G	169.45	PASS	AF=0.439024;AO=18;DP=41;FAO=18;FDP=41;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=0.00250713;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.7637;QD=16.532;RBI=0.00389975;REFB=-0.00572343;REVB=-0.00298703;RO=22;SAF=11;SAR=7;SRF=6;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.316784;STB=0.667368;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.00924876;OID=.;OPOS=46702822;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:22:23:18:18:0.439024:7:11:6:16:7:11:7:16
chr21	46705354	.	C	T	165.06	PASS	AF=0.382979;AO=18;DP=47;FAO=18;FDP=47;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=-0.00293931;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=310.82;QD=14.0472;RBI=0.00293952;REFB=-0.011869;REVB=3.54814e-05;RO=29;SAF=9;SAR=9;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0549201;STB=0.53188;STBP=0.726;TYPE=snp;VARB=0.0156479;OID=.;OPOS=46705354;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:29:29:18:18:0.382979:9:9:16:13:9:9:16:13
chr21	46875564	.	T	C	1116.95	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.117934;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.687;QD=60.3757;RBI=0.117949;REFB=0;REVB=0.00187235;RO=0;SAF=30;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.93382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000190914;OID=.;OPOS=46875564;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:44:30:0:0:44:30:0:0
chr21	46876580	.	C	T	60.3	PASS	AF=0.571429;AO=8;DP=14;FAO=8;FDP=14;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.051329;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.6;QD=17.2284;RBI=0.0525712;REFB=0.00463106;REVB=-0.0113606;RO=6;SAF=2;SAR=6;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21129;STB=0.624664;STBP=0.386;TYPE=snp;VARB=-0.0038471;OID=.;OPOS=46876580;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:14:14:6:6:8:8:0.571429:6:2:3:3:6:2:3:3
chr21	46876717	.	G	C	94.06	PASS	AF=0.333333;AO=12;DP=32;FAO=12;FDP=36;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=-0.0349717;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=46.2199;QD=10.4506;RBI=0.117541;REFB=-0.032706;REVB=-0.112218;RO=20;SAF=7;SAR=5;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0735466;STB=0.528254;STBP=0.798;TYPE=snp;VARB=0.0236752;OID=.;OPOS=46876717;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:32:36:20:24:12:12:0.333333:5:7:13:7:5:7:13:11
chr21	46896294	.	G	A	180.37	PASS	AF=0.404255;AO=19;DP=48;FAO=19;FDP=47;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=-0.00760606;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.834;QD=15.3506;RBI=0.0328033;REFB=-0.01473;REVB=-0.0319093;RO=27;SAF=10;SAR=9;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0681024;STB=0.526999;STBP=0.745;TYPE=snp;VARB=0.0314763;OID=.;OPOS=46896294;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:47:27:28:19:19:0.404255:9:10:16:11:9:10:16:12
chr21	46896303	.	C	G	183.37	PASS	AF=0.411765;AO=18;DP=51;FAO=21;FDP=51;FR=.,HEALED;FRO=30;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.0356131;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=34.228;QD=14.3817;RBI=0.0839314;REFB=-0.00314929;REVB=0.0760013;RO=21;SAF=7;SAR=11;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0845838;STB=0.580929;STBP=0.354;TYPE=snp;VARB=0.00428549;OID=.;OPOS=46896303;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:21:30:18:21:0.411765:11:7:10:11:12:9:17:13
chr21	46896312	.	G	T	224.29	PASS	AF=0.433333;AO=26;DP=60;FAO=26;FDP=60;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=-0.00873632;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.003;QD=14.9525;RBI=0.0283723;REFB=-0.00971546;REVB=0.0269937;RO=34;SAF=10;SAR=16;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146552;STB=0.583269;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=0.0330916;OID=.;OPOS=46896312;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:34:34:26:26:0.433333:16:10:18:16:16:10:18:16
chr21	46899842	.	C	T	570.34	PASS	AF=0.425676;AO=63;DP=151;FAO=63;FDP=148;FR=.;FRO=85;FSAF=40;FSAR=23;FSRF=48;FSRR=37;FWDB=-0.00267011;FXX=0.0198662;HRUN=4;LEN=1;MLLD=183.986;QD=15.4145;RBI=0.0026889;REFB=-0.00461934;REVB=0.000317335;RO=82;SAF=40;SAR=23;SRF=46;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0786591;STB=0.542482;STBP=0.385;TYPE=snp;VARB=0.00785138;OID=.;OPOS=46899842;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:151:148:82:85:63:63:0.425676:23:40:46:36:23:40:48:37
chr21	46899857	.	C	T	417.57	PASS	AF=0.35;AO=48;DP=146;FAO=49;FDP=140;FR=.;FRO=91;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=51;FSRR=40;FWDB=0.00602599;FXX=0.0540504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.409;QD=11.9306;RBI=0.00840398;REFB=-0.0102294;REVB=0.00585784;RO=87;SAF=21;SAR=27;SRF=47;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115564;STB=0.585331;STBP=0.151;TYPE=snp;VARB=0.0195039;OID=.;OPOS=46899857;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:146:140:87:91:48:49:0.35:27:21:47:40:28:21:51:40
chr21	46899872	.	C	A	568.9	PASS	AF=0.423611;AO=61;DP=145;FAO=61;FDP=144;FR=.;FRO=83;FSAF=32;FSAR=29;FSRF=43;FSRR=40;FWDB=0.00300202;FXX=0.00689608;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.458;QD=15.8027;RBI=0.0035168;REFB=-0.00703732;REVB=0.00183188;RO=83;SAF=32;SAR=29;SRF=43;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00671808;STB=0.503763;STBP=0.943;TYPE=snp;VARB=0.0136143;OID=.;OPOS=46899872;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:145:144:83:83:61:61:0.423611:29:32:43:40:29:32:43:40
chr21	46900410	.	C	T	99.22	PASS	AF=0.387097;AO=11;DP=30;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.042144;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.87;QD=12.8023;RBI=0.0423824;REFB=-0.0380757;REVB=-0.00448968;RO=17;SAF=7;SAR=4;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0118806;STB=0.523769;STBP=0.854;TYPE=snp;VARB=0.0573748;OID=.;OPOS=46900410;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:31:17:19:11:12:0.387097:4:7:11:6:4:8:12:7
chr21	46902273	.	A	G	83.48	PASS	AF=0.323529;AO=10;DP=33;FAO=11;FDP=34;FR=.;FRO=23;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=17;FWDB=-0.0657624;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.059;QD=9.82151;RBI=0.0660803;REFB=-0.0131643;REVB=-0.00647321;RO=22;SAF=0;SAR=10;SRF=6;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.73343;STB=0.721141;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.0338816;OID=.;OPOS=46902273;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:33:34:22:23:10:11:0.323529:10:0:6:16:10:1:6:17
chr21	46908355	.	T	C	267.52	PASS	AF=0.510204;AO=25;DP=49;FAO=25;FDP=49;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=-0.0433917;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.737;QD=21.8387;RBI=0.0465398;REFB=-0.0109791;REVB=-0.0168261;RO=23;SAF=8;SAR=17;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14598;STB=0.594327;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=0.0077984;OID=.;OPOS=46908355;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:23:24:25:25:0.510204:17:8:11:12:17:8:12:12
chr21	46912658	.	G	GCCCGCCACTGCCCT	36.46	PASS	AF=0.285714;AO=4;DP=21;FAO=6;FDP=21;FR=.;FRO=15;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=-0.0154171;FXX=0;HRUN=3;LEN=14;MLLD=287.039;QD=6.94382;RBI=0.0172206;REFB=-0.00628743;REVB=0.00767228;RO=15;SAF=0;SAR=4;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.701367;STB=0.818575;STBP=0.072;TYPE=ins;VARB=0.018344;OID=.;OPOS=46912659;OREF=-;OALT=CCCGCCACTGCCCT;OMAPALT=GCCCGCCACTGCCCT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.285714:4:21:6:21:15:1:5:9:6:36:15:0:4:9:6
chr21	46913477	.	G	C	150.1	PASS	AF=0.432432;AO=16;DP=37;FAO=16;FDP=37;FR=.,HEALED;FRO=20;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.0459691;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.1283;QD=16.2267;RBI=0.0965879;REFB=-0.0324185;REVB=0.0849474;RO=14;SAF=10;SAR=6;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.275361;STB=0.571338;STBP=0.46;TYPE=snp;VARB=0.031369;OID=.;OPOS=46913477;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:14:20:16:16:0.432432:6:10:4:10:6:10:10:10
chr21	46951556	.	A	G	297.16	PASS	AF=0.492308;AO=31;DP=64;FAO=32;FDP=65;FR=.;FRO=33;FSAF=24;FSAR=8;FSRF=22;FSRR=11;FWDB=-0.00530637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.232;QD=18.2869;RBI=0.0130983;REFB=-0.0225486;REVB=-0.0119753;RO=30;SAF=23;SAR=8;SRF=22;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00984737;STB=0.553363;STBP=0.433;TYPE=snp;VARB=0.0207034;OID=.;OPOS=46951556;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:65:30:33:31:32:0.492308:8:23:22:8:8:24:22:11
chr21	46957794	.	T	C	2083.77	PASS	AF=1;AO=133;DP=133;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0287514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.775;QD=62.6699;RBI=0.0499398;REFB=0;REVB=0.0408331;RO=0;SAF=71;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.78083e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.00813e-05;OID=.;OPOS=46957794;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:133:133:0:0:133:133:1:62:71:0:0:62:71:0:0
chr21	47329352	.	T	C	1130.04	PASS	AF=1;AO=74;DP=75;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0208487;FXX=0.038956;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.779;QD=61.0832;RBI=0.025855;REFB=0;REVB=0.0152909;RO=0;SAF=35;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.80413e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000490096;OID=.;OPOS=47329352;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:74:0:0:74:74:1:39:35:0:0:39:35:0:0
chr21	47355232	.	G	A	235.87	PASS	AF=0.442623;AO=27;DP=61;FAO=27;FDP=61;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=0.00483636;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.746;QD=15.4669;RBI=0.0623587;REFB=-0.0284081;REVB=0.0621709;RO=34;SAF=12;SAR=15;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00325867;STB=0.501844;STBP=0.994;TYPE=snp;VARB=0.0304008;OID=.;OPOS=47355232;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:34:34:27:27:0.442623:15:12:15:19:15:12:15:19
chr21	47355240	.	T	C	253.12	PASS	AF=0.432836;AO=28;DP=67;FAO=29;FDP=67;FR=.;FRO=38;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=0.0100687;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.566;QD=15.1117;RBI=0.0138292;REFB=-0.0189666;REVB=0.00947986;RO=38;SAF=13;SAR=15;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0095687;STB=0.505151;STBP=0.952;TYPE=snp;VARB=0.0175634;OID=.;OPOS=47355240;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:38:38:28:29:0.432836:15:13:18:20:15:14:18:20
chr21	47409503	.	A	G	242.15	PASS	AF=0.473684;AO=27;DP=57;FAO=27;FDP=57;FR=.;FRO=30;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=-0.00966728;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.724;QD=16.993;RBI=0.0152767;REFB=-0.0101421;REVB=-0.0118289;RO=30;SAF=18;SAR=9;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194429;STB=0.609673;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=0.0100219;OID=.;OPOS=47409503;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:30:30:27:27:0.473684:9:18:14:16:9:18:14:16
chr21	47417415	.	C	A	465.52	PASS	AF=0.942857;AO=33;DP=36;FAO=33;FDP=35;FR=.;FRO=2;FSAF=2;FSAR=31;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.130436;FXX=0.0277701;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.9584;QD=53.2027;RBI=0.130972;REFB=-0.0270051;REVB=-0.0118297;RO=2;SAF=2;SAR=31;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.305659;STB=0.666539;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.00266055;OID=.;OPOS=47417415;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:36:35:2:2:33:33:0.942857:31:2:2:0:31:2:2:0
chr21	47420726	.	C	G	1044.05	PASS	AF=1;AO=58;DP=63;FAO=73;FDP=73;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=51;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0119333;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.7749;QD=57.2081;RBI=0.0369539;REFB=0;REVB=0.0349741;RO=0;SAF=50;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.21959e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000251825;OID=.;OPOS=47420726;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:63:73:0:0:58:73:1:8:50:0:0:22:51:0:0
chr21	47423509	.	C	T	235.81	PASS	AF=0.490196;AO=22;DP=49;FAO=25;FDP=51;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=7;FWDB=0.0903411;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.031;QD=18.4952;RBI=0.0913298;REFB=0.00911867;REVB=-0.0134025;RO=26;SAF=9;SAR=13;SRF=19;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.299923;STB=0.626654;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=-0.00302584;OID=.;OPOS=47423509;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:51:26:26:22:25:0.490196:13:9:19:7:13:12:19:7
chr21	47536546	.	C	T	429.97	PASS	AF=0.630769;AO=40;DP=66;FAO=41;FDP=65;FR=.;FRO=24;FSAF=34;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=0.0124583;FXX=0.0151492;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.063;QD=26.4597;RBI=0.0146191;REFB=-0.0218126;REVB=-0.00764911;RO=23;SAF=34;SAR=6;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.406507;STB=0.712942;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.00929101;OID=.;OPOS=47536546;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:65:23:24:40:41:0.630769:6:34:9:14:7:34:9:15
chr21	47538960	.	G	A	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0249288;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.577;QD=52.6129;RBI=0.0332049;REFB=0;REVB=0.0219344;RO=0;SAF=13;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2029e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000364433;OID=.;OPOS=47538960;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:9:13:0:0:9:13:0:0
chr21	47540421	.	T	C	162.25	PASS	AF=0.515152;AO=17;DP=33;FAO=17;FDP=33;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=-0.0022362;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.3354;QD=19.6663;RBI=0.0569812;REFB=-0.0191194;REVB=-0.0569373;RO=16;SAF=8;SAR=9;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.237515;STB=0.633654;STBP=0.151;TYPE=snp;VARB=0.0127421;OID=.;OPOS=47540421;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:16:16:17:17:0.515152:9:8:12:4:9:8:12:4
chr21	47542861	.	A	G	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00181947;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.3562;QD=55.0981;RBI=0.00265682;REFB=0;REVB=0.00193604;RO=0;SAF=8;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.28381e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.80855e-06;OID=.;OPOS=47542861;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:18:8:0:0:18:8:0:0
chr21	47544838	.	G	A	150.9	PASS	AF=0.354167;AO=17;DP=48;FAO=17;FDP=48;FR=.;FRO=31;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=0.0378192;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.9775;QD=12.5748;RBI=0.0617023;REFB=0.0244663;REVB=0.0487533;RO=31;SAF=6;SAR=11;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113664;STB=0.56693;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=-0.0395766;OID=.;OPOS=47544838;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:31:31:17:17:0.354167:11:6:14:17:11:6:14:17
chr21	47545155	.	A	G	740.37	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.010665;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.6081;QD=56.9516;RBI=0.0431726;REFB=0;REVB=-0.0418345;RO=0;SAF=30;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000184055;OID=.;OPOS=47545155;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:22:30:0:0:22:30:0:0
chr21	47545346	.	C	T	89.53	PASS	AF=0.478261;AO=11;DP=23;FAO=11;FDP=23;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.010868;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=148.187;QD=15.571;RBI=0.019619;REFB=-0.0305755;REVB=-0.0163338;RO=9;SAF=6;SAR=5;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0789468;STB=0.519964;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=0.0145915;OID=.;OPOS=47545346;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:23:23:9:12:11:11:0.478261:5:6:4:5:5:6:7:5
chr21	47545768	.	G	A	74.23	PASS	AF=0.344828;AO=10;DP=29;FAO=10;FDP=29;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=-0.0231734;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.6715;QD=10.2392;RBI=0.0457781;REFB=0.00788181;REVB=-0.0394795;RO=19;SAF=8;SAR=2;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168862;STB=0.603547;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=-0.0172415;OID=.;OPOS=47545768;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:29:29:19:19:10:10:0.344828:2:8:13:6:2:8:13:6
chr21	47545823	.	G	A	150.06	PASS	AF=0.354167;AO=17;DP=48;FAO=17;FDP=48;FR=.;FRO=31;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=21;FSRR=10;FWDB=-0.000907681;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=121.016;QD=12.5054;RBI=0.012724;REFB=-0.0134447;REVB=-0.0126916;RO=31;SAF=13;SAR=4;SRF=21;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121994;STB=0.572237;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.0117796;OID=.;OPOS=47545823;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:31:31:17:17:0.354167:4:13:21:10:4:13:21:10
chr21	47545826	.	C	T	166.74	PASS	AF=0.375;AO=18;DP=48;FAO=18;FDP=48;FR=.;FRO=30;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=21;FSRR=9;FWDB=-0.00500642;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.0717;QD=13.8952;RBI=0.0775291;REFB=-0.00960591;REVB=-0.0773673;RO=28;SAF=14;SAR=4;SRF=19;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135932;STB=0.565141;STBP=0.544;TYPE=snp;VARB=0.0427074;OID=.;OPOS=47545826;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:28:30:18:18:0.375:4:14:19:9:4:14:21:9
chr21	47545913	.	G	A	225.89	PASS	AF=0.397059;AO=27;DP=68;FAO=27;FDP=68;FR=.;FRO=41;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=17;FWDB=-9.95544e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.2;QD=13.2874;RBI=0.00380056;REFB=-0.00917042;REVB=0.00379926;RO=41;SAF=13;SAR=14;SRF=24;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109271;STB=0.562386;STBP=0.449;TYPE=snp;VARB=0.012076;OID=.;OPOS=47545913;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:41:41:27:27:0.397059:14:13:24:17:14:13:24:17
chr21	47556792	.	ACC	AC,A,ATC	135.28	PASS	AF=0.210526,0.105263,0.526316;AO=2,3,8;DP=19;FAO=4,2,10;FDP=19;FR=.;FRO=3;FSAF=4,2,4;FSAR=0,0,6;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.301613,-0.164061,-0.0744489;FXX=0;HRUN=3,3,3;LEN=1,2,1;MLLD=15.4991,14.3673,107.217;QD=28.4807;RBI=0.301732,0.164132,0.074477;REFB=-0.111754,-0.0729624,-0.0399104;REVB=-0.00847991,-0.00481065,-0.0020469;RO=2;SAF=2,3,3;SAR=0,0,5;SRF=0;SRR=2;SSEN=0,0,0;SSEP=0.8,0.8,0;SSSB=0.727176,0.74993,0.14689;STB=0.996413,0.993997,0.516097;STBP=0.067,0.153,0.915;TYPE=del,del,snp;VARB=0.0394232,-0.175098,0.0444402;OID=.,.,.;OPOS=47556793,47556793,47556793;OREF=C,CC,C;OALT=-,-,T;OMAPALT=AC,A,ATC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/3:0.210526,0.105263,0.526316:2,3,8:19:4,2,10:19:3:4,2,4:0,0,6:1:2:15:2:2,3,3:0,0,5:0:2
chr21	47557222	.	G	A	280.55	PASS	AF=0.577778;AO=25;DP=45;FAO=26;FDP=45;FR=.;FRO=19;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.0123265;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.051;QD=24.9381;RBI=0.0148825;REFB=-0.0116651;REVB=0.00833944;RO=19;SAF=13;SAR=12;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0872689;STB=0.555513;STBP=0.385;TYPE=snp;VARB=0.0114334;OID=.;OPOS=47557222;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:19:19:25:26:0.577778:12:13:12:7:13:13:12:7
chr21	47558473	.	G	C	33.48	PASS	AF=0.714286;AO=5;DP=7;FAO=5;FDP=7;FR=.;FRO=2;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0187604;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=220.632;QD=19.134;RBI=0.0233229;REFB=-0.0712992;REVB=-0.0138566;RO=2;SAF=4;SAR=1;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190062;STB=0.614874;STBP=0.589;TYPE=snp;VARB=0.0294916;OID=.;OPOS=47558473;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:7:7:2:2:5:5:0.714286:1:4:1:1:1:4:1:1
chr21	47575372	.	C	T	68.09	PASS	AF=0.473684;AO=9;DP=19;FAO=9;FDP=19;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.0760281;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.2963;QD=14.334;RBI=0.0763943;REFB=-0.0198319;REVB=-0.00747151;RO=10;SAF=5;SAR=4;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133598;STB=0.578146;STBP=0.571;TYPE=snp;VARB=0.0262686;OID=.;OPOS=47575372;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:19:19:10:10:9:9:0.473684:4:5:7:3:4:5:7:3
chr21	47608580	.	G	A	740.44	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0271468;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.734;QD=56.9568;RBI=0.0281301;REFB=0;REVB=0.00737249;RO=0;SAF=32;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.00761e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000133618;OID=.;OPOS=47608580;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:20:32:0:0:20:32:0:0
chr21	47609677	.	A	G	520.61	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0520575;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.7381;QD=59.498;RBI=0.103438;REFB=0;REVB=-0.0893832;RO=0;SAF=23;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000342602;OID=.;OPOS=47609677;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:35:0:0:34:35:1:11:23:0:0:11:24:0:0
chr21	47610066	.	T	C	375.68	PASS	AF=1;AO=26;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0109688;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.187;QD=55.6559;RBI=0.0158897;REFB=0;REVB=0.0114965;RO=0;SAF=14;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000103874;OID=.;OPOS=47610066;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:26:27:1:12:14:0:0:12:15:0:0
chr21	47612466	.	A	G	521.58	PASS	AF=0.902439;AO=34;DP=39;FAO=37;FDP=41;FR=.;FRO=4;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.10517;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.63;QD=50.8863;RBI=0.117976;REFB=-0.0445568;REVB=0.0534575;RO=4;SAF=19;SAR=15;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0608985;STB=0.534394;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=0.00882752;OID=.;OPOS=47612466;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:17:39:41:4:4:34:37:0.902439:15:19:1:3:15:22:1:3
chr21	47612471	.	T	C	477.28	PASS	AF=0.918919;AO=34;DP=38;FAO=34;FDP=37;FR=.;FRO=3;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0897093;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.5717;QD=51.5975;RBI=0.0980978;REFB=0.067015;REVB=0.0396917;RO=3;SAF=19;SAR=15;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0847389;STB=0.545428;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=-0.0046332;OID=.;OPOS=47612471;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:38:37:3:3:34:34:0.918919:15:19:0:3:15:19:0:3
chr21	47612512	.	C	CTG,G	290.22	PASS	AF=0.88,0.04;AO=19,2;DP=28;FAO=22,1;FDP=25;FR=.;FRO=2;FSAF=10,1;FSAR=12,0;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0140225,-0.00121159;FXX=0.0384468;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=164.385,58.5154;QD=46.435;RBI=0.0234792,0.0128594;REFB=-0.0103469,-0.01469;REVB=0.0188319,-0.0128022;RO=6;SAF=9,2;SAR=10,0;SRF=3;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0115032,0.606693;STB=0.503813,0.986712;STBP=0.878,0.515;TYPE=ins,snp;VARB=-0.000348663,0.0496347;OID=.,.;OPOS=47612513,47612512;OREF=-,C;OALT=TG,G;OMAPALT=CTG,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:28:25:6:2:19,2:22,1:0.88,0.04:10,0:9,2:3:3:12,0:10,1:1:1
chr21	47612599	.	G	A	42.19	PASS	AF=0.166667;AO=7;DP=42;FAO=7;FDP=42;FR=.;FRO=35;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=20;FSRR=15;FWDB=0.0057316;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.9004;QD=4.01784;RBI=0.00583024;REFB=-0.00194047;REVB=-0.00106796;RO=34;SAF=4;SAR=3;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0154147;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00922929;OID=.;OPOS=47612599;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:42:42:42:34:35:7:7:0.166667:3:4:19:15:3:4:20:15
chr21	47612867	.	A	G	62.23	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0170147;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.939;QD=35.5579;RBI=0.0184646;REFB=0;REVB=0.0071722;RO=0;SAF=5;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.27427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000642881;OID=.;OPOS=47612867;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:2:5:0:0:2:5:0:0
chr21	47613004	.	T	C	118.07	PASS	AF=0.923077;AO=10;DP=13;FAO=12;FDP=13;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0534186;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=43.0995;QD=36.329;RBI=0.12391;REFB=-0.152141;REVB=0.111804;RO=2;SAF=7;SAR=3;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111763;STB=0.526273;STBP=0.66;TYPE=snp;VARB=0.015911;OID=.;OPOS=47613004;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:13:13:2:1:10:12:0.923077:3:7:2:0:3:9:1:0
chr21	47613161	.	C	T	88.2	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.158125;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.4426;QD=39.2012;RBI=0.199843;REFB=0;REVB=-0.122204;RO=0;SAF=2;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0023504;OID=.;OPOS=47613161;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:7:2:0:0:7:2:0:0
chr21	47613623	.	C	T	66.04	PASS	AF=0.173913;AO=12;DP=69;FAO=12;FDP=69;FR=.;FRO=57;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=22;FSRR=35;FWDB=-0.0410578;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.0745;QD=3.82867;RBI=0.0523889;REFB=-0.0171834;REVB=-0.0325401;RO=54;SAF=1;SAR=11;SRF=22;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.512177;STB=0.845444;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.096724;OID=.;OPOS=47613623;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:69:69:54:57:12:12:0.173913:11:1:22:32:11:1:22:35
chr21	47613639	.	C	T	95.2	PASS	AF=0.288889;AO=14;DP=45;FAO=13;FDP=45;FR=.;FRO=32;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=-0.0402729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.2739;QD=8.4622;RBI=0.110249;REFB=-0.0375739;REVB=-0.10263;RO=31;SAF=2;SAR=12;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.43427;STB=0.751692;STBP=0.06;TYPE=snp;VARB=0.0864221;OID=.;OPOS=47613639;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:45:45:31:32:14:13:0.288889:12:2:14:17:11:2:14:18
chr21	47614443	.	A	G	968.79	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00493953;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.8701;QD=58.7144;RBI=0.0214449;REFB=0;REVB=-0.0208683;RO=0;SAF=35;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000164227;OID=.;OPOS=47614443;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:66:0:0:65:66:1:30:35:0:0:30:36:0:0
chr21	47614469	.	A	C	941.02	PASS	AF=0.984848;AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=66;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0151231;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=275.891;QD=57.0312;RBI=0.0156891;REFB=0.05507;REVB=0.00417581;RO=1;SAF=33;SAR=32;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.014534;STB=0.50769;STBP=0.551;TYPE=snp;VARB=2.87651e-05;OID=.;OPOS=47614469;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:66:66:1:1:65:65:0.984848:32:33:0:1:32:33:0:1
chr21	47734824	.	C	T	374.91	PASS	AF=0.527778;AO=37;DP=71;FAO=38;FDP=72;FR=.;FRO=34;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=0.0365452;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.624;QD=20.8282;RBI=0.0368811;REFB=-0.0466467;REVB=-0.0049666;RO=32;SAF=15;SAR=22;SRF=12;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0265965;STB=0.518844;STBP=0.757;TYPE=snp;VARB=0.0695682;OID=.;OPOS=47734824;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:72:32:34:37:38:0.527778:22:15:12:20:22:16:13:21
chr21	47773103	.	C	A	162.96	PASS	AF=0.36;AO=18;DP=50;FAO=18;FDP=50;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=23;FSRR=9;FWDB=-0.0228712;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=276.284;QD=13.037;RBI=0.0273018;REFB=-0.019941;REVB=-0.0149094;RO=32;SAF=11;SAR=7;SRF=23;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12895;STB=0.5748;STBP=0.483;TYPE=snp;VARB=0.0331174;OID=.;OPOS=47773103;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:32:32:18:18:0.36:7:11:23:9:7:11:23:9
chr21	47777063	.	G	A	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00650675;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=278.026;QD=55.0986;RBI=0.0205819;REFB=0;REVB=0.0195263;RO=0;SAF=8;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.28381e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.90678e-05;OID=.;OPOS=47777063;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:18:8:0:0:18:8:0:0
chr21	47783796	.	T	C	557.12	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00710861;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.2537;QD=60.2287;RBI=0.0626652;REFB=0;REVB=-0.0622607;RO=0;SAF=15;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.82408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000549797;OID=.;OPOS=47783796;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:22:15:0:0:22:15:0:0
chr21	47786817	.	C	G	888.16	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0158775;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.1137;QD=58.2398;RBI=0.0473378;REFB=0;REVB=0.0445957;RO=0;SAF=30;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000741472;OID=.;OPOS=47786817;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:31:30:0:0:31:30:0:0
chr21	47787002	.	T	C	594.54	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00638823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.428;QD=60.9784;RBI=0.0142866;REFB=0;REVB=0.0127787;RO=0;SAF=11;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000219982;OID=.;OPOS=47787002;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:28:11:0:0:28:11:0:0
chr21	47836653	.	C	T	142.99	PASS	AF=0.339623;AO=18;DP=53;FAO=18;FDP=53;FR=.;FRO=35;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=23;FWDB=0.0152142;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.4693;QD=10.7917;RBI=0.0217023;REFB=0.0183041;REVB=-0.0154764;RO=33;SAF=10;SAR=8;SRF=12;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.209572;STB=0.637714;STBP=0.183;TYPE=snp;VARB=-0.0237687;OID=.;OPOS=47836653;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:33:35:18:18:0.339623:8:10:12:21:8:10:12:23
chr21	47850484	.	G	C	201.3	PASS	AF=0.403226;AO=24;DP=58;FAO=25;FDP=62;FR=.;FRO=37;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=23;FWDB=0.0135028;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=148.525;QD=12.9873;RBI=0.0689799;REFB=-0.00628099;REVB=-0.0676454;RO=34;SAF=12;SAR=12;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0906085;STB=0.560991;STBP=0.425;TYPE=snp;VARB=0.00738234;OID=.;OPOS=47850484;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:62:34:37:24:25:0.403226:12:12:14:20:13:12:14:23
chr21	47851753	.	A	G	120.97	PASS	AF=0.288136;AO=17;DP=59;FAO=17;FDP=59;FR=.;FRO=42;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=26;FWDB=-0.0237517;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.414;QD=8.20124;RBI=0.0382347;REFB=-0.00752689;REVB=-0.0299625;RO=41;SAF=7;SAR=10;SRF=16;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0262961;STB=0.522795;STBP=0.83;TYPE=snp;VARB=0.0326499;OID=.;OPOS=47851753;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:41:42:17:17:0.288136:10:7:16:25:10:7:16:26
chr21	47855893	.	CGAA	C,CGA	240.32	PASS	AF=0.41791,0;AO=28,9;DP=67;FAO=28,0;FDP=67;FR=.;FRO=39;FSAF=12,0;FSAR=16,0;FSRF=15;FSRR=24;FWDB=0.0436806,-0.0233402;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=3,1;MLLD=205.848,19.8255;QD=14.3473;RBI=0.0605314,0.199053;REFB=-0.0366712,-0.115387;REVB=-0.0419053,-0.19768;RO=27;SAF=12,0;SAR=16,9;SRF=14;SRR=13;SSEN=0,0.30303;SSEP=0,0;SSSB=-0.0795805,-0.752408;STB=0.526297,0.5;STBP=0.746,1;TYPE=del,del;VARB=0.0347735,0;OID=.,.;OPOS=47855894,47855895;OREF=GAA,A;OALT=-,-;OMAPALT=C,CGA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.41791,0:28,9:67:28,0:67:39:12,0:16,0:15:24:99:27:12,0:16,9:14:13
chr21	47863757	.	A	C	218.06	PASS	AF=0.446429;AO=25;DP=56;FAO=25;FDP=56;FR=.;FRO=31;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=-0.0109067;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.823;QD=15.5754;RBI=0.0119595;REFB=-0.00936333;REVB=-0.00490657;RO=31;SAF=13;SAR=12;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0278056;STB=0.515747;STBP=0.843;TYPE=snp;VARB=0.0099636;OID=.;OPOS=47863757;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:31:31:25:25:0.446429:12:13:17:14:12:13:17:14
chr21	47910523	.	A	G	77.93	PASS	AF=0.454545;AO=10;DP=22;FAO=10;FDP=22;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=-0.00246275;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.717;QD=14.17;RBI=0.0184567;REFB=-0.0278532;REVB=-0.0182917;RO=12;SAF=6;SAR=4;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170018;STB=0.5998;STBP=0.429;TYPE=snp;VARB=0.0221669;OID=.;OPOS=47910523;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:22:22:12:12:10:10:0.454545:4:6:5:7:4:6:5:7
chr21	47945533	.	GCTC	G	76.14	PASS	AF=0.4;AO=10;DP=25;FAO=10;FDP=25;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=-0.00505845;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=296.435;QD=12.1817;RBI=0.0124405;REFB=-0.000166947;REVB=0.0113657;RO=14;SAF=4;SAR=6;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.235856;STB=0.655949;STBP=0.219;TYPE=del;VARB=0.000341454;OID=.;OPOS=47945534;OREF=CTC;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.4:10:25:10:25:15:4:6:10:5:76:14:4:6:9:5
chr21	47959692	.	G	A	274.18	PASS	AF=0.568182;AO=25;DP=44;FAO=25;FDP=44;FR=.;FRO=19;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=-0.00229236;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.137;QD=24.9252;RBI=0.0214078;REFB=-0.017265;REVB=-0.0212847;RO=19;SAF=14;SAR=11;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188021;STB=0.604235;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=0.00888076;OID=.;OPOS=47959692;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:19:19:25:25:0.568182:11:14:6:13:11:14:6:13
chr21	47959698	.	C	T	272.77	PASS	AF=0.555556;AO=25;DP=45;FAO=25;FDP=45;FR=.;FRO=20;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=0.0114602;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.272;QD=24.2458;RBI=0.0118345;REFB=-0.0290574;REVB=0.00295289;RO=20;SAF=14;SAR=11;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166505;STB=0.592519;STBP=0.199;TYPE=snp;VARB=0.0253852;OID=.;OPOS=47959698;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:20:20:25:25:0.555556:11:14:7:13:11:14:7:13
chr21	47961711	.	G	A	375.97	PASS	AF=0.417476;AO=43;DP=103;FAO=43;FDP=103;FR=.;FRO=60;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=29;FSRR=31;FWDB=-0.0455068;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.0171;QD=14.6007;RBI=0.0503975;REFB=0.00226553;REVB=-0.0216573;RO=60;SAF=22;SAR=21;SRF=29;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0292244;STB=0.516471;STBP=0.798;TYPE=snp;VARB=-0.00395586;OID=.;OPOS=47961711;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:103:60:60:43:43:0.417476:21:22:29:31:21:22:29:31
chr21	47970581	.	G	A	231.05	PASS	AF=0.464286;AO=26;DP=56;FAO=26;FDP=56;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=-0.0462024;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.7638;QD=16.5038;RBI=0.0474917;REFB=-0.00774174;REVB=0.0109911;RO=30;SAF=12;SAR=14;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.091505;STB=0.551493;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=0.00578298;OID=.;OPOS=47970581;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:30:30:26:26:0.464286:14:12:11:19:14:12:11:19
chr21	47978321	.	G	C,GC	1411.55	PASS	AF=0.0215054,0.978495;AO=4,87;DP=98;FAO=2,91;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=2,45;FSAR=0,46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0325701,0.017217;FXX=0.0210504;HRUN=4,1;LEN=1,1;MLLD=9.26255,29.5209;QD=60.7118;RBI=0.135073,0.149601;REFB=0,0;REVB=0.131088,0.148607;RO=5;SAF=3,42;SAR=1,45;SRF=4;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0609289,-0.0326114;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,ins;VARB=-0.013323,0.00479598;OID=.,.;OPOS=47978321,47978322;OREF=G,-;OALT=C,C;OMAPALT=C,GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:4:98:93:5:0:4,87:2,91:0.0215054,0.978495:1,45:3,42:4:1:0,46:2,45:0:0
chr21	47985655	.	C	T	106.86	PASS	AF=0.371429;AO=13;DP=35;FAO=13;FDP=35;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.00738897;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.53;QD=12.2128;RBI=0.0176521;REFB=-0.0177205;REVB=0.0160312;RO=21;SAF=9;SAR=4;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.235942;STB=0.627703;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=0.02082;OID=.;OPOS=47985655;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:21:22:13:13:0.371429:4:9:10:11:4:9:11:11
chr21	48022230	.	C	G	181.29	PASS	AF=0.431818;AO=19;DP=44;FAO=19;FDP=44;FR=.;FRO=25;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.0358613;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.958;QD=16.4805;RBI=0.0359617;REFB=-0.0030052;REVB=0.00268568;RO=25;SAF=10;SAR=9;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0335463;STB=0.519211;STBP=0.851;TYPE=snp;VARB=0.00347285;OID=.;OPOS=48022230;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:25:25:19:19:0.431818:9:10:14:11:9:10:14:11
chr21	48063476	.	C	G	785.7	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0479432;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.2553;QD=64.1387;RBI=0.0572209;REFB=0;REVB=-0.0312358;RO=0;SAF=23;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000699456;OID=.;OPOS=48063476;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:26:23:0:0:26:23:0:0
chr21	48084820	.	C	G	319.0	PASS	AF=0.432099;AO=35;DP=81;FAO=35;FDP=81;FR=.;FRO=46;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=26;FWDB=-0.034211;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.896;QD=15.7529;RBI=0.0396136;REFB=-0.0114324;REVB=-0.0199711;RO=46;SAF=15;SAR=20;SRF=20;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00637555;STB=0.503595;STBP=0.971;TYPE=snp;VARB=0.0146018;OID=.;OPOS=48084820;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:46:46:35:35:0.432099:20:15:20:26:20:15:20:26
chr22	16287372	.	C	T	92.2	PASS	AF=0.292683;AO=12;DP=41;FAO=12;FDP=41;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=-0.00517582;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.272;QD=8.99495;RBI=0.0417411;REFB=-0.00627827;REVB=-0.041419;RO=29;SAF=9;SAR=3;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132988;STB=0.581945;STBP=0.551;TYPE=snp;VARB=0.011639;OID=.;OPOS=16287372;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:41:41:29:29:12:12:0.292683:3:9:19:10:3:9:19:10
chr22	17072483	.	A	G	587.15	PASS	AF=0.689189;AO=50;DP=74;FAO=51;FDP=74;FR=.;FRO=23;FSAF=33;FSAR=18;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=0.0126839;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.202;QD=31.7378;RBI=0.0136071;REFB=-0.0353998;REVB=-0.00492679;RO=23;SAF=33;SAR=17;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164002;STB=0.582748;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.0126736;OID=.;OPOS=17072483;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:23:23:50:51:0.689189:17:33:9:14:18:33:9:14
chr22	17073066	.	A	G	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0472062;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.6397;QD=42.1825;RBI=0.0911936;REFB=0;REVB=0.0780246;RO=0;SAF=7;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00549417;OID=.;OPOS=17073066;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:4:7:0:0:4:7:0:0
chr22	17073475	.	C	T	428.32	PASS	AF=0.842105;AO=32;DP=40;FAO=32;FDP=38;FR=.;FRO=6;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.00861346;FXX=0.0499875;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.101;QD=45.0862;RBI=0.0404107;REFB=-0.0160815;REVB=0.0394821;RO=6;SAF=16;SAR=16;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0488049;STB=0.526299;STBP=0.428;TYPE=snp;VARB=0.00221521;OID=.;OPOS=17073475;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:40:38:6:6:32:32:0.842105:16:16:2:4:16:16:2:4
chr22	17264565	.	G	T	868.22	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.008636;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.734;QD=57.8814;RBI=0.0150564;REFB=0;REVB=0.0123334;RO=0;SAF=27;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.7886e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.08374e-05;OID=.;OPOS=17264565;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:33:27:0:0:33:27:0:0
chr22	17264904	.	A	G	1384.78	PASS	AF=0.988889;AO=89;DP=91;FAO=89;FDP=90;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0388338;FXX=0.0109878;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.928;QD=61.5459;RBI=0.0426063;REFB=-0.0334041;REVB=0.0175279;RO=1;SAF=42;SAR=47;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00997727;STB=0.505262;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.000355877;OID=.;OPOS=17264904;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:91:90:1:1:89:89:0.988889:47:42:0:1:47:42:0:1
chr22	17265124	.	A	C	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00777225;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=275.813;QD=45.8068;RBI=0.016383;REFB=0;REVB=-0.014422;RO=0;SAF=8;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.79121e-05;OID=.;OPOS=17265124;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:6:8:0:0:6:8:0:0
chr22	17265194	.	G	A	340.74	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0120671;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.663;QD=54.5175;RBI=0.043193;REFB=0;REVB=0.0414732;RO=0;SAF=14;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000205033;OID=.;OPOS=17265194;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:11:14:0:0:11:14:0:0
chr22	17446991	.	C	T	58.46	PASS	AF=0.169492;AO=10;DP=59;FAO=10;FDP=59;FR=.;FRO=49;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=32;FSRR=17;FWDB=0.0103964;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.5325;QD=3.9633;RBI=0.0329677;REFB=-0.00519084;REVB=-0.0312855;RO=48;SAF=6;SAR=4;SRF=32;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0883753;STB=0.546672;STBP=0.781;TYPE=snp;VARB=0.0269677;OID=.;OPOS=17446991;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:58:59:59:48:49:10:10:0.169492:4:6:32:16:4:6:32:17
chr22	17469026	.	G	A	45.54	PASS	AF=0.222222;AO=8;DP=37;FAO=8;FDP=36;FR=.;FRO=28;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=-0.0690083;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.276;QD=5.06011;RBI=0.0702138;REFB=-0.00607547;REVB=-0.0129551;RO=28;SAF=4;SAR=4;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172542;STB=0.610847;STBP=0.55;TYPE=snp;VARB=0.0309857;OID=.;OPOS=17469026;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:37:36:28:28:8:8:0.222222:4:4:10:18:4:4:10:18
chr22	17469049	.	C	A	53.66	PASS	AF=0.258065;AO=8;DP=32;FAO=8;FDP=31;FR=.;FRO=23;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=-0.0121138;FXX=0.0312402;HRUN=3;LEN=1;MLLD=204.869;QD=6.92446;RBI=0.0175227;REFB=-0.00968;REVB=-0.012661;RO=23;SAF=4;SAR=4;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127341;STB=0.580449;STBP=0.656;TYPE=snp;VARB=0.017284;OID=.;OPOS=17469049;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:32:31:23:23:8:8:0.258065:4:4:9:14:4:4:9:14
chr22	17586471	.	C	T	1364.92	PASS	AF=0.978261;AO=84;DP=87;FAO=90;FDP=92;FR=.;FRO=2;FSAF=44;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0601762;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.97;QD=59.3445;RBI=0.0610215;REFB=-0.0438497;REVB=0.0101219;RO=2;SAF=39;SAR=45;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00158067;STB=0.500242;STBP=0.865;TYPE=snp;VARB=0.00106965;OID=.;OPOS=17586471;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:87:92:2:2:84:90:0.978261:45:39:1:1:46:44:1:1
chr22	17589297	.	G	A	1452.84	PASS	AF=1;AO=87;DP=87;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0746948;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.88;QD=62.4876;RBI=0.0757816;REFB=0;REVB=0.0127881;RO=0;SAF=39;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.57206e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.002066;OID=.;OPOS=17589297;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:87:93:0:0:87:93:1:48:39:0:0:50:43:0:0
chr22	17589794	.	C	A	330.43	PASS	AF=0.961538;AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0130124;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=107.336;QD=50.8353;RBI=0.0306222;REFB=-0.0419095;REVB=0.0277199;RO=1;SAF=15;SAR=10;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0299354;STB=0.516116;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.000649904;OID=.;OPOS=17589794;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:26:26:1:1:25:25:0.961538:10:15:1:0:10:15:1:0
chr22	17600293	.	G	A	354.24	PASS	AF=0.964286;AO=26;DP=27;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0357697;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.3691;QD=50.606;RBI=0.0364732;REFB=-0.0171223;REVB=-0.00712903;RO=0;SAF=15;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.51514;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=0.00362999;OID=.;OPOS=17600293;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:27:28:0:1:26:27:0.964286:11:15:0:0:11:16:1:0
chr22	17600393	.	G	A	230.8	PASS	AF=0.833333;AO=20;DP=24;FAO=20;FDP=24;FR=.;FRO=4;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0494366;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.288;QD=38.4663;RBI=0.0769059;REFB=-0.103515;REVB=0.0589113;RO=2;SAF=11;SAR=9;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0918973;STB=0.54995;STBP=0.347;TYPE=snp;VARB=0.00379469;OID=.;OPOS=17600393;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:20:24:24:2:4:20:20:0.833333:9:11:0:2:9:11:1:3
chr22	17600497	.	G	A	130.57	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0595678;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.958;QD=43.5224;RBI=0.0833493;REFB=0;REVB=0.0582991;RO=0;SAF=3;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000508012;OID=.;OPOS=17600497;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:12:0:0:11:12:1:8:3:0:0:9:3:0:0
chr22	17600977	.	G	A	1208.43	PASS	AF=0.987952;AO=72;DP=73;FAO=82;FDP=83;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0103292;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.646;QD=58.2375;RBI=0.244507;REFB=-0.0293854;REVB=0.244288;RO=1;SAF=42;SAR=30;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0155031;STB=0.506171;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.00106249;OID=.;OPOS=17600977;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:73:83:1:1:72:82:0.987952:30:42:0:1:40:42:0:1
chr22	17602839	.	G	A	1048.01	PASS	AF=1;AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00901832;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.749;QD=59.8864;RBI=0.0213107;REFB=0;REVB=-0.0193084;RO=0;SAF=41;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000281522;OID=.;OPOS=17602839;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:70:0:0:70:70:1:29:41:0:0:29:41:0:0
chr22	17603503	.	G	A	519.91	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00821053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.4139;QD=59.4181;RBI=0.00934744;REFB=0;REVB=0.00446787;RO=0;SAF=20;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.19722e-05;OID=.;OPOS=17603503;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:15:20:0:0:15:20:0:0
chr22	17622267	.	C	T	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0387166;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=138.992;QD=49.5991;RBI=0.0415137;REFB=0;REVB=0.0149804;RO=0;SAF=4;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000316383;OID=.;OPOS=17622267;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:14:4:0:0:14:4:0:0
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chr22	17990852	.	G	A	52.36	PASS	AF=0.25;AO=8;DP=32;FAO=8;FDP=32;FR=.;FRO=24;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=-0.0374004;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.596;QD=6.54487;RBI=0.0391346;REFB=-0.00244123;REVB=0.0115205;RO=24;SAF=3;SAR=5;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100486;STB=0.564352;STBP=0.646;TYPE=snp;VARB=0.00529534;OID=.;OPOS=17990852;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:32:32:24:24:8:8:0.25:5:3:11:13:5:3:11:13
chr22	18020118	.	G	A	89.81	PASS	AF=0.255319;AO=11;DP=46;FAO=12;FDP=47;FR=.;FRO=35;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=0.0392323;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.9169;QD=7.6438;RBI=0.0564927;REFB=-0.0112553;REVB=0.040648;RO=35;SAF=5;SAR=6;SRF=13;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102814;STB=0.595591;STBP=0.47;TYPE=snp;VARB=0.0361421;OID=.;OPOS=18020118;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:46:47:35:35:11:12:0.255319:6:5:13:22:6:6:13:22
chr22	18209612	.	CA	C,CG	248.62	PASS	AF=0.4,0.6;AO=8,12;DP=20;FAO=8,12;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=8,1;FSAR=0,11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00249375,-0.0152353;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=70.3149,77.8143;QD=49.7233;RBI=0.0183667,0.0731906;REFB=0,0;REVB=-0.0181966,-0.0715874;RO=0;SAF=8,1;SAR=0,11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-3.23983e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.00562037,0.00398665;OID=.,.;OPOS=18209613,18209613;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=C,CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.4,0.6:8,12:20:8,12:20:0:8,1:0,11:0:0:49:0:8,1:0,11:0:0
chr22	18560919	.	C	G	326.62	PASS	AF=0.72973;AO=27;DP=37;FAO=27;FDP=37;FR=.;FRO=10;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.00336072;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=295.927;QD=35.3103;RBI=0.00791802;REFB=-0.00885548;REVB=-0.00716942;RO=10;SAF=15;SAR=12;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0277579;STB=0.51514;STBP=0.79;TYPE=snp;VARB=0.0029192;OID=.;OPOS=18560919;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:37:37:10:10:27:27:0.72973:12:15:5:5:12:15:5:5
chr22	18571828	.	T	C	393.4	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0698402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.766;QD=56.1999;RBI=0.0700924;REFB=0;REVB=0.00594014;RO=0;SAF=1;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000569744;OID=.;OPOS=18571828;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:28:0:0:27:28:1:26:1:0:0:26:2:0:0
chr22	18609642	.	C	T	657.72	PASS	AF=0.977273;AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0294361;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.2798;QD=59.7928;RBI=0.0297337;REFB=0.000434581;REVB=0.0041962;RO=1;SAF=15;SAR=28;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0302739;STB=0.516121;STBP=0.264;TYPE=snp;VARB=0.000204579;OID=.;OPOS=18609642;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:44:44:1:1:43:43:0.977273:28:15:1:0:28:15:1:0
chr22	18628435	.	G	GC	441.81	PASS	AF=1;AO=6;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.105326;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=35.9202;QD=46.5065;RBI=0.120969;REFB=0;REVB=-0.0594975;RO=31;SAF=2;SAR=4;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.25372;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00167437;OID=.;OPOS=18628436;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:6:38:38:38:0:19:19:0:0:4:31:2:4:17:14
chr22	18628436	.	T	C	422.07	PASS	AF=0.842105;AO=32;DP=38;FAO=32;FDP=38;FR=.;FRO=6;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.00415348;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.343;QD=44.4279;RBI=0.00639707;REFB=0.000381177;REVB=-0.00486529;RO=6;SAF=17;SAR=15;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0579441;STB=0.53123;STBP=0.392;TYPE=snp;VARB=-0.000113595;OID=.;OPOS=18628436;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:38:38:6:6:32:32:0.842105:15:17:2:4:15:17:2:4
chr22	18628437	.	T	G	31.45	PASS	AF=0.153846;AO=6;DP=40;FAO=6;FDP=39;FR=.;FRO=33;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=-0.00257626;FXX=0.0249938;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.214;QD=3.22601;RBI=0.0195561;REFB=-0.00712862;REVB=-0.0193857;RO=32;SAF=2;SAR=4;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.234851;STB=0.654652;STBP=0.47;TYPE=snp;VARB=0.155062;OID=.;OPOS=18628437;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:31:40:39:32:33:6:6:0.153846:4:2:17:15:4:2:17:16
chr22	18628499	.	G	T	908.02	PASS	AF=1;AO=62;DP=63;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0163607;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.601;QD=58.5818;RBI=0.0180392;REFB=0;REVB=-0.00759865;RO=0;SAF=30;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.1866e-05;OID=.;OPOS=18628499;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:62:0:0:62:62:1:32:30:0:0:32:30:0:0
chr22	18628632	.	C	T	972.86	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0197782;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.9974;QD=58.9609;RBI=0.0203341;REFB=0;REVB=0.00472197;RO=0;SAF=22;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000254039;OID=.;OPOS=18628632;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:44:22:0:0:44:22:0:0
chr22	18628715	.	C	T	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00387143;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.479;QD=59.4354;RBI=0.0152702;REFB=0;REVB=0.0147713;RO=0;SAF=10;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.03206e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.91738e-05;OID=.;OPOS=18628715;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:25:10:0:0:25:10:0:0
chr22	18650682	.	C	T	734.09	PASS	AF=0.731707;AO=60;DP=82;FAO=60;FDP=82;FR=.;FRO=22;FSAF=30;FSAR=30;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=-0.0127803;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.474;QD=35.8091;RBI=0.0159933;REFB=-0.0143079;REVB=-0.00961512;RO=22;SAF=30;SAR=30;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0453596;STB=0.524382;STBP=0.48;TYPE=snp;VARB=0.00396582;OID=.;OPOS=18650682;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:22:22:60:60:0.731707:30:30:9:13:30:30:9:13
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chr22	18901004	.	C	T	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0315867;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=216.987;QD=45.8065;RBI=0.0316076;REFB=0;REVB=0.00115071;RO=0;SAF=9;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000330244;OID=.;OPOS=18901004;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:5:9:0:0:5:9:0:0
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chr22	18905978	.	G	A	319.51	PASS	AF=0.787879;AO=26;DP=34;FAO=26;FDP=33;FR=.;FRO=7;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.00741061;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.51;QD=38.7282;RBI=0.0106766;REFB=-0.0238548;REVB=-0.00768585;RO=7;SAF=10;SAR=16;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131187;STB=0.571373;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=0.00393191;OID=.;OPOS=18905978;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:34:33:7:7:26:26:0.787879:16:10:5:2:16:10:5:2
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chr22	18908875	.	A	G	58.83	PASS	AF=0.183673;AO=9;DP=50;FAO=9;FDP=49;FR=.;FRO=40;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=0.162265;FXX=0.019996;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.0789;QD=4.80232;RBI=0.165245;REFB=0.0192473;REVB=-0.0312387;RO=41;SAF=2;SAR=7;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.318095;STB=0.723609;STBP=0.195;TYPE=snp;VARB=-0.0714299;OID=.;OPOS=18908875;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:58:50:49:41:40:9:9:0.183673:7:2:19:22:7:2:19:21
chr22	18910355	.	G	T	559.03	PASS	AF=0.821429;AO=46;DP=56;FAO=46;FDP=56;FR=.;FRO=10;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.00116385;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.0159;QD=39.9308;RBI=0.0602561;REFB=0.0331525;REVB=0.0602449;RO=10;SAF=26;SAR=20;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0220166;STB=0.511806;STBP=0.723;TYPE=snp;VARB=-0.00673487;OID=.;OPOS=18910355;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:56:56:10:10:46:46:0.821429:20:26:5:5:20:26:5:5
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chr22	19028643	.	C	T	1223.36	PASS	AF=0.861111;AO=93;DP=109;FAO=93;FDP=108;FR=.;FRO=15;FSAF=39;FSAR=54;FSRF=3;FSRR=12;FWDB=0.0184961;FXX=0.00917347;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.539;QD=45.3095;RBI=0.0277027;REFB=-0.0456462;REVB=0.0206237;RO=15;SAF=39;SAR=54;SRF=3;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0595827;STB=0.531592;STBP=0.104;TYPE=snp;VARB=0.00641018;OID=.;OPOS=19028643;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:109:108:15:15:93:93:0.861111:54:39:3:12:54:39:3:12
chr22	19034240	.	A	G	707.97	PASS	AF=0.763158;AO=54;DP=73;FAO=58;FDP=76;FR=.;FRO=18;FSAF=25;FSAR=33;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=0.0502066;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.0175;QD=37.2614;RBI=0.055957;REFB=-0.0356915;REVB=0.0247081;RO=18;SAF=23;SAR=31;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112353;STB=0.555992;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=0.0100096;OID=.;OPOS=19034240;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:76:18:18:54:58:0.763158:31:23:12:6:33:25:12:6
chr22	19048413	.	A	G	708.0	PASS	AF=0.74359;AO=58;DP=78;FAO=58;FDP=78;FR=.;FRO=20;FSAF=22;FSAR=36;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=0.0278592;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.588;QD=36.3078;RBI=0.0292665;REFB=-0.00817335;REVB=0.00896624;RO=20;SAF=22;SAR=36;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0104496;STB=0.505616;STBP=0.88;TYPE=snp;VARB=0.00215634;OID=.;OPOS=19048413;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:20:20:58:58:0.74359:36:22:8:12:36:22:8:12
chr22	19119751	.	C	T	49.6	PASS	AF=0.538462;AO=7;DP=13;FAO=7;FDP=13;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.096908;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.624;QD=15.2625;RBI=0.0981058;REFB=-0.0206408;REVB=0.0152835;RO=5;SAF=1;SAR=6;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.275355;STB=0.726508;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=0.0135893;OID=.;OPOS=19119751;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:13:13:5:6:7:7:0.538462:6:1:2:3:6:1:3:3
chr22	19121721	.	C	T	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.028167;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.407;QD=43.485;RBI=0.0349677;REFB=0;REVB=0.020721;RO=0;SAF=8;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00048317;OID=.;OPOS=19121721;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:4:8:0:0:4:8:0:0
chr22	19124866	.	G	A	663.39	PASS	AF=0.881356;AO=51;DP=59;FAO=52;FDP=59;FR=.;FRO=7;FSAF=25;FSAR=27;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.022785;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.3315;QD=44.9753;RBI=0.0632081;REFB=-0.0159545;REVB=0.0589585;RO=7;SAF=25;SAR=26;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0139455;STB=0.506203;STBP=0.813;TYPE=snp;VARB=0.00339822;OID=.;OPOS=19124866;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:59:59:7:7:51:52:0.881356:26:25:3:4:27:25:3:4
chr22	19132061	.	C	T	2071.34	PASS	AF=0.953642;AO=140;DP=148;FAO=144;FDP=151;FR=.;FRO=7;FSAF=112;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.0886296;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.5891;QD=54.87;RBI=0.0906036;REFB=-0.0993125;REVB=0.0188099;RO=5;SAF=109;SAR=31;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0531612;STB=0.540645;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0129156;OID=.;OPOS=19132061;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:148:151:5:7:140:144:0.953642:31:109:1:4:32:112:1:6
chr22	19163577	.	C	CAT	740.79	PASS	AF=1;AO=52;DP=55;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.045265;FXX=0.0188644;HRUN=0;LEN=2;MLLD=284.821;QD=56.9838;RBI=0.0458989;REFB=0;REVB=0.00760216;RO=3;SAF=29;SAR=23;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0113463;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000100456;OID=.;OPOS=19163578;OREF=-;OALT=AT;OMAPALT=CAT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:52:55:52:52:0:29:23:0:0:4:3:29:23:2:1
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chr22	19167409	.	T	C	981.53	PASS	AF=0.985294;AO=66;DP=67;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0110468;FXX=0.0144907;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.3075;QD=57.7372;RBI=0.0114467;REFB=-0.0904952;REVB=0.0029991;RO=1;SAF=32;SAR=34;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0145365;STB=0.50769;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.00302499;OID=.;OPOS=19167409;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:67:68:1:1:66:67:0.985294:34:32:1:0:35:32:1:0
chr22	19172006	.	T	C	1500.5	PASS	AF=1;AO=100;DP=102;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00529094;FXX=0.0194156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.713;QD=59.4256;RBI=0.0210602;REFB=0;REVB=0.0203848;RO=0;SAF=54;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.21299e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000205417;OID=.;OPOS=19172006;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:102:101:0:0:100:101:1:46:54:0:0:46:55:0:0
chr22	19184095	.	T	C	392.72	PASS	AF=0.680851;AO=32;DP=47;FAO=32;FDP=47;FR=.;FRO=15;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=-0.0636652;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.647;QD=33.4227;RBI=0.069852;REFB=0.0238518;REVB=-0.028741;RO=15;SAF=13;SAR=19;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0862699;STB=0.546956;STBP=0.375;TYPE=snp;VARB=-0.00489865;OID=.;OPOS=19184095;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:15:15:32:32:0.680851:19:13:4:11:19:13:4:11
chr22	19189003	.	A	AC,C	508.1	PASS	AF=1,0;AO=23,12;DP=41;FAO=36,0;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=17,0;FSAR=19,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0197322,-0.239674;FXX=0.0270197;HRUN=1,2;LEN=1,1;MLLD=24.4969,4.90503;QD=56.4551;RBI=0.0783387,0.241077;REFB=0,0;REVB=0.0758129,0.025972;RO=6;SAF=5,12;SAR=18,0;SRF=1;SRR=5;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0288128,0.841148;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.00398186,0;OID=.,.;OPOS=19189004,19189003;OREF=-,A;OALT=C,C;OMAPALT=AC,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:36:6:0:23,12:36,0:1,0:18,0:5,12:1:5:19,0:17,0:0:0
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chr22	19468514	.	T	C	119.92	PASS	AF=0.211111;AO=19;DP=90;FAO=19;FDP=90;FR=.;FRO=71;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=24;FSRR=47;FWDB=-0.00600753;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.5121;QD=5.32977;RBI=0.0502585;REFB=-0.00204132;REVB=-0.0498982;RO=71;SAF=9;SAR=10;SRF=24;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174641;STB=0.608433;STBP=0.325;TYPE=snp;VARB=0.0040974;OID=.;OPOS=19468514;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:71:71:19:19:0.211111:10:9:24:47:10:9:24:47
chr22	19511925	.	G	A	367.98	PASS	AF=1;AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.104412;FXX=0.0714031;HRUN=3;LEN=1;MLLD=162.189;QD=56.612;RBI=0.113794;REFB=0;REVB=0.0452466;RO=0;SAF=11;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0014249;OID=.;OPOS=19511925;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:26:0:0:26:26:1:15:11:0:0:15:11:0:0
chr22	19750773	.	T	C	866.62	PASS	AF=0.755556;AO=69;DP=89;FAO=68;FDP=90;FR=.;FRO=22;FSAF=31;FSAR=37;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=-0.012359;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=66.5671;QD=38.5164;RBI=0.0280315;REFB=-0.0271805;REVB=0.0251599;RO=18;SAF=32;SAR=37;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.035614;STB=0.533062;STBP=0.271;TYPE=snp;VARB=0.0045384;OID=.;OPOS=19750773;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:90:18:22:69:68:0.755556:37:32:10:8:37:31:13:9
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chr22	19766782	.	C	T	41.25	PASS	AF=0.145833;AO=7;DP=47;FAO=7;FDP=48;FR=.;FRO=41;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=17;FSRR=24;FWDB=-0.055635;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.8845;QD=3.43726;RBI=0.0690616;REFB=-0.00353311;REVB=-0.0409176;RO=39;SAF=5;SAR=2;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.330073;STB=0.74645;STBP=0.21;TYPE=snp;VARB=0.0226936;OID=.;OPOS=19766782;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:47:48:39:41:7:7:0.145833:2:5:17:22:2:5:17:24
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chr22	19789541	.	A	C	426.27	PASS	AF=0.755556;AO=32;DP=43;FAO=34;FDP=45;FR=.;FRO=11;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=-0.0115458;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.033;QD=37.8907;RBI=0.024349;REFB=-0.0568805;REVB=0.0214375;RO=11;SAF=18;SAR=14;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0355432;STB=0.5263;STBP=0.585;TYPE=snp;VARB=0.0164772;OID=.;OPOS=19789541;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:80:43:45:11:11:32:34:0.755556:14:18:7:4:16:18:7:4
chr22	19868218	.	A	G	223.58	PASS	AF=0.769231;AO=20;DP=26;FAO=20;FDP=26;FR=.;FRO=6;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.00665517;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.0825;QD=34.3968;RBI=0.0238877;REFB=0.00625429;REVB=-0.0229419;RO=6;SAF=10;SAR=10;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00191182;OID=.;OPOS=19868218;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:26:26:6:6:20:20:0.769231:10:10:3:3:10:10:3:3
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chr22	19907118	.	G	A	1130.17	PASS	AF=0.974359;AO=76;DP=79;FAO=76;FDP=78;FR=.;FRO=2;FSAF=23;FSAR=53;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0276207;FXX=0.0126566;HRUN=3;LEN=1;MLLD=229.474;QD=57.9572;RBI=0.0330362;REFB=-0.000587724;REVB=0.0181243;RO=2;SAF=23;SAR=53;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0393775;STB=0.520828;STBP=0.056;TYPE=snp;VARB=5.67227e-05;OID=.;OPOS=19907118;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:79:78:2:2:76:76:0.974359:53:23:2:0:53:23:2:0
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chr22	20137723	.	C	T	481.49	PASS	AF=0.944444;AO=34;DP=36;FAO=34;FDP=36;FR=.;FRO=2;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0296324;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=194.569;QD=53.4989;RBI=0.0296377;REFB=-0.148181;REVB=-0.000561705;RO=0;SAF=18;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.529394;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=0.00111589;OID=.;OPOS=20137723;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:36:36:0:2:34:34:0.944444:16:18:0:0:16:18:0:2
chr22	20138105	.	T	C	766.15	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00712307;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.017;QD=63.8461;RBI=0.0388044;REFB=0;REVB=0.038145;RO=0;SAF=22;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.83083e-05;OID=.;OPOS=20138105;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:48:0:0:47:48:1:25:22:0:0:25:23:0:0
chr22	20771144	.	A	T	1283.41	PASS	AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0135511;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=136.067;QD=61.8511;RBI=0.0168078;REFB=0;REVB=-0.00994338;RO=0;SAF=44;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.03564e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.97157e-05;OID=.;OPOS=20771144;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:39:44:0:0:39:44:0:0
chr22	20819327	.	C	T	106.89	PASS	AF=0.183673;AO=18;DP=98;FAO=18;FDP=98;FR=.;FRO=80;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=38;FSRR=42;FWDB=-0.0146084;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.443;QD=4.36291;RBI=0.0242328;REFB=-0.00613095;REVB=-0.0193345;RO=80;SAF=11;SAR=7;SRF=38;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171925;STB=0.610988;STBP=0.343;TYPE=snp;VARB=0.0240525;OID=.;OPOS=20819327;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:80:80:18:18:0.183673:7:11:38:42:7:11:38:42
chr22	20862646	.	T	G	651.23	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0295303;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.85;QD=62.0217;RBI=0.0304502;REFB=0;REVB=0.00742794;RO=0;SAF=15;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.13648e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000115649;OID=.;OPOS=20862646;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:27:15:0:0:27:15:0:0
chr22	21044848	.	A	T	670.27	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0458439;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=159.646;QD=62.3509;RBI=0.0493017;REFB=0;REVB=-0.018138;RO=0;SAF=29;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.13233e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000111543;OID=.;OPOS=21044848;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:14:29:0:0:14:29:0:0
chr22	21044973	.	G	T	42.13	PASS	AF=0.189189;AO=7;DP=36;FAO=7;FDP=37;FR=.;FRO=30;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=-0.0173169;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.1357;QD=4.55439;RBI=0.025532;REFB=-0.0113446;REVB=0.0187618;RO=29;SAF=5;SAR=2;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20702;STB=0.655275;STBP=0.41;TYPE=snp;VARB=0.0462392;OID=.;OPOS=21044973;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:42:36:37:29:30:7:7:0.189189:2:5:16:13:2:5:16:14
chr22	21072998	.	G	A	91.15	PASS	AF=0.160377;AO=17;DP=105;FAO=17;FDP=106;FR=.;FRO=89;FSAF=16;FSAR=1;FSRF=38;FSRR=51;FWDB=-0.00288855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.596;QD=3.43972;RBI=0.0488376;REFB=0.00327093;REVB=-0.0487521;RO=88;SAF=16;SAR=1;SRF=38;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.655214;STB=0.938527;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=-0.010038;OID=.;OPOS=21072998;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:91:105:106:88:89:17:17:0.160377:1:16:38:50:1:16:38:51
chr22	21087281	.	G	A	34.88	PASS	AF=0.206897;AO=6;DP=29;FAO=6;FDP=29;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=17;FSRR=6;FWDB=-0.0221975;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.401;QD=4.81079;RBI=0.0321788;REFB=-0.000787402;REVB=0.0232968;RO=23;SAF=5;SAR=1;SRF=17;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164016;STB=0.61361;STBP=0.6;TYPE=snp;VARB=0.00420572;OID=.;OPOS=21087281;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:29:29:23:23:6:6:0.206897:1:5:17:6:1:5:17:6
chr22	21105614	.	C	G	87.44	PASS	AF=0.154545;AO=17;DP=109;FAO=17;FDP=110;FR=.;FRO=93;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=43;FSRR=50;FWDB=-0.0172982;FXX=0.0090082;HRUN=2;LEN=1;MLLD=249.175;QD=3.1795;RBI=0.0188165;REFB=-0.00632475;REVB=-0.0074049;RO=92;SAF=5;SAR=12;SRF=43;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.227568;STB=0.64993;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=0.0386857;OID=.;OPOS=21105614;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:109:110:92:93:17:17:0.154545:12:5:43:49:12:5:43:50
chr22	21133619	.	G	A	41.07	PASS	AF=0.159091;AO=7;DP=44;FAO=7;FDP=44;FR=.;FRO=37;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=22;FSRR=15;FWDB=-0.0195679;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.337;QD=3.73334;RBI=0.0232702;REFB=-0.00678542;REVB=-0.0125937;RO=37;SAF=4;SAR=3;SRF=22;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0286493;STB=0.519943;STBP=0.946;TYPE=snp;VARB=0.0351928;OID=.;OPOS=21133619;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:44:44:37:37:7:7:0.159091:3:4:22:15:3:4:22:15
chr22	21213416	.	A	G	784.78	PASS	AF=0.78481;AO=62;DP=79;FAO=62;FDP=79;FR=.;FRO=17;FSAF=38;FSAR=24;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.00246045;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=366.238;QD=39.7359;RBI=0.0129257;REFB=-0.0188625;REVB=-0.0126894;RO=17;SAF=38;SAR=24;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.035039;STB=0.518765;STBP=0.558;TYPE=snp;VARB=0.00480623;OID=.;OPOS=21213416;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:17:17:62:62:0.78481:24:38:9:8:24:38:9:8
chr22	21301005	.	T	C	116.43	PASS	AF=1;AO=7;DP=10;FAO=11;FDP=11;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0607888;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.044;QD=42.339;RBI=0.0609286;REFB=0;REVB=0.00412511;RO=0;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00238497;OID=.;OPOS=21301005;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:11:0:0:7:11:1:7:0:0:0:7:4:0:0
chr22	21304408	.	A	G	501.64	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00819259;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.801;QD=59.0165;RBI=0.0314535;REFB=0;REVB=0.0303678;RO=0;SAF=14;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.48532e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0002375;OID=.;OPOS=21304408;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:20:14:0:0:20:14:0:0
chr22	21305846	.	A	G	110.3	PASS	AF=0.304348;AO=14;DP=46;FAO=14;FDP=46;FR=.;FRO=32;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=0.0698718;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=47.8373;QD=9.59131;RBI=0.0699014;REFB=0.00991244;REVB=-0.00203209;RO=32;SAF=5;SAR=9;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202992;STB=0.622464;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=-0.0196687;OID=.;OPOS=21305846;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:32:32:14:14:0.304348:9:5:17:15:9:5:17:15
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chr22	21307711	.	AAAAC	AA,A	214.97	PASS	AF=0.675,0;AO=11,7;DP=35;FAO=27,0;FDP=40;FR=.;FRO=13;FSAF=9,0;FSAR=18,0;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.00192449,-0.019122;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=3,4;MLLD=151.863,150.2;QD=21.4971;RBI=0.043992,0.0435963;REFB=-0.0595962,-0.0550511;REVB=0.0439499,0.039179;RO=0;SAF=2,0;SAR=9,7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0.325513,0.325513;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.596418,0.5;STBP=0.073,1;TYPE=del,del;VARB=0.0360551,0.06151;OID=.,.;OPOS=21307713,21307712;OREF=AAC,AAAC;OALT=-,-;OMAPALT=AA,A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.675,0:11,7:35:27,0:40:13:9,0:18,0:8:5:76:0:2,0:9,7:0:0
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chr22	21331043	.	A	T	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00658499;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.576;QD=44.6876;RBI=0.025862;REFB=0;REVB=-0.0250097;RO=0;SAF=9;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000125028;OID=.;OPOS=21331043;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:4:9:0:0:4:9:0:0
chr22	21335259	.	C	A	437.65	PASS	AF=0.96875;AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0407897;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=240.196;QD=54.7066;RBI=0.0629774;REFB=-0.164346;REVB=0.0479828;RO=0;SAF=25;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.16261e-08;STB=0.538436;STBP=0.114;TYPE=snp;VARB=0.00112188;OID=.;OPOS=21335259;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:32:32:0:1:31:31:0.96875:6:25:0:0:6:25:0:1
chr22	21335606	.	C	T	632.2	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.104626;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.6377;QD=61.6777;RBI=0.106391;REFB=0;REVB=-0.0192999;RO=0;SAF=24;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.2194e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000956663;OID=.;OPOS=21335606;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:17:24:0:0:17:24:0:0
chr22	21335611	.	A	G	651.23	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0107801;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=159.574;QD=62.022;RBI=0.0114805;REFB=0;REVB=0.00394853;RO=0;SAF=25;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.98888e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.54451e-05;OID=.;OPOS=21335611;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:17:25:0:0:17:25:0:0
chr22	21348914	.	C	T	35.21	PASS	AF=0.222222;AO=6;DP=27;FAO=6;FDP=27;FR=.;FRO=21;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=0.0187943;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.353;QD=5.21556;RBI=0.0190145;REFB=-0.0105955;REVB=-0.00288545;RO=21;SAF=3;SAR=3;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.197729;STB=0.629227;STBP=0.545;TYPE=snp;VARB=0.0240774;OID=.;OPOS=21348914;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:27:27:21:21:6:6:0.222222:3:3:14:7:3:3:14:7
chr22	21354970	.	C	G	813.21	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0013414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=299.289;QD=57.0676;RBI=0.0366844;REFB=0;REVB=0.0366599;RO=0;SAF=31;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.6027e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.71194e-05;OID=.;OPOS=21354970;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:54:57:0:0:54:57:1:23:31:0:0:25:32:0:0
chr22	21356824	.	G	A	103.51	PASS	AF=0.163934;AO=20;DP=122;FAO=20;FDP=122;FR=.;FRO=102;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=60;FSRR=42;FWDB=-0.022679;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.986;QD=3.39373;RBI=0.0233243;REFB=-0.00684503;REVB=-0.00544831;RO=102;SAF=10;SAR=10;SRF=60;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112535;STB=0.573698;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.0310748;OID=.;OPOS=21356824;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:122:122:102:102:20:20:0.163934:10:10:60:42:10:10:60:42
chr22	21356892	.	AAGAC	A	30.76	PASS	AF=0.136842;AO=12;DP=107;FAO=13;FDP=95;FR=.;FRO=82;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=49;FSRR=33;FWDB=-0.00856469;FXX=0.049995;HRUN=3;LEN=4;MLLD=276.605;QD=1.29509;RBI=0.00891831;REFB=-0.00122624;REVB=-0.00248645;RO=89;SAF=5;SAR=7;SRF=53;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.215133;STB=0.615828;STBP=0.379;TYPE=del;VARB=0.00766419;OID=.;OPOS=21356893;OREF=AGAC;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.136842:12:107:13:95:82:6:7:49:33:30:89:5:7:53:36
chr22	21356925	.	T	A	37.52	PASS	AF=0.127273;AO=7;DP=55;FAO=7;FDP=55;FR=.;FRO=48;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=28;FSRR=20;FWDB=-0.0509049;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=45.3063;QD=2.72857;RBI=0.0509893;REFB=-0.00316451;REVB=-0.00293246;RO=46;SAF=6;SAR=1;SRF=28;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.353659;STB=0.786569;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.0319642;OID=.;OPOS=21356925;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:55:55:46:48:7:7:0.127273:1:6:28:18:1:6:28:20
chr22	21377301	.	C	A	1014.24	PASS	AF=0.791667;AO=76;DP=97;FAO=76;FDP=96;FR=.;FRO=20;FSAF=36;FSAR=40;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=-0.0132052;FXX=0.0103082;HRUN=4;LEN=1;MLLD=120.609;QD=42.2599;RBI=0.0165048;REFB=0.0144816;REVB=-0.009901;RO=20;SAF=36;SAR=40;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0881157;STB=0.547034;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=-0.00398038;OID=.;OPOS=21377301;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:96:20:20:76:76:0.791667:40:36:14:6:40:36:14:6
chr22	21385277	.	C	T	675.97	PASS	AF=0.927273;AO=51;DP=55;FAO=51;FDP=55;FR=.;FRO=4;FSAF=22;FSAR=29;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.102118;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.8859;QD=49.1618;RBI=0.10356;REFB=-0.0243904;REVB=0.0172238;RO=4;SAF=22;SAR=29;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00954145;STB=0.505078;STBP=0.851;TYPE=snp;VARB=0.000811683;OID=.;OPOS=21385277;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:17:55:55:4:4:51:51:0.927273:29:22:2:2:29:22:2:2
chr22	21385843	.	G	A	284.21	PASS	AF=0.75;AO=24;DP=32;FAO=24;FDP=32;FR=.;FRO=8;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=-0.0321543;FXX=0.0302939;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.8095;QD=35.5261;RBI=0.044207;REFB=0.015536;REVB=0.0303375;RO=8;SAF=17;SAR=7;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.226496;STB=0.624185;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=-0.00477371;OID=.;OPOS=21385843;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:32:32:8:8:24:24:0.75:7:17:2:6:7:17:2:6
chr22	21570340	.	G	A	68.09	PASS	AF=0.473684;AO=9;DP=19;FAO=9;FDP=19;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=-0.00241367;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.3367;QD=14.3339;RBI=0.0257572;REFB=0.0342034;REVB=-0.0256438;RO=10;SAF=4;SAR=5;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.040409;STB=0.523757;STBP=0.869;TYPE=snp;VARB=-0.037306;OID=.;OPOS=21570340;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:19:19:10:10:9:9:0.473684:5:4:4:6:5:4:4:6
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chr22	21800444	.	T	C	1026.4	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0521248;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.073;QD=59.5016;RBI=0.0541135;REFB=0;REVB=0.0145354;RO=0;SAF=29;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000165483;OID=.;OPOS=21800444;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:40:29:0:0:40:29:0:0
chr22	21801588	.	T	A	575.78	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159992;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.593;QD=60.6086;RBI=0.0160667;REFB=0;REVB=0.00147155;RO=0;SAF=17;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.53998e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.07635e-05;OID=.;OPOS=21801588;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:21:17:0:0:21:17:0:0
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chr22	21841121	.	TTCTTA	T	50.0	PASS	AO=30;DP=45;LEN=5;RO=15;SAF=19;SAR=16;SRF=5;SRR=5;TYPE=del;FR=.;OID=.;OPOS=21841122;OREF=TCTTA;OALT=-;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:RO:AO:SAR:SAF:SRF:SRR	0/1:99:45:15:30:16:19:5:5
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chr22	22517026	.	T	C	689.38	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00974369;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=215.262;QD=62.6711;RBI=0.0117406;REFB=0;REVB=-0.00655005;RO=0;SAF=22;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.59494e-06;OID=.;OPOS=22517026;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:22:22:0:0:22:22:0:0
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chr22	22569448	.	T	A	650.36	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.115499;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.5184;QD=60.4983;RBI=0.115773;REFB=0;REVB=-0.00795892;RO=0;SAF=20;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00184583;OID=.;OPOS=22569448;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:43:0:0:40:43:1:20:20:0:0:21:22:0:0
chr22	22569554	.	C	A	83.51	PASS	AF=0.226415;AO=12;DP=53;FAO=12;FDP=53;FR=.;FRO=41;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=24;FSRR=17;FWDB=-0.0168675;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.594;QD=6.30276;RBI=0.0415143;REFB=-0.0018638;REVB=-0.0379332;RO=41;SAF=10;SAR=2;SRF=24;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.362872;STB=0.735988;STBP=0.116;TYPE=snp;VARB=0.00407061;OID=.;OPOS=22569554;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:53:53:41:41:12:12:0.226415:2:10:24:17:2:10:24:17
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chr22	22989270	.	G	A	61.38	PASS	AF=0.615385;AO=8;DP=13;FAO=8;FDP=13;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.0090299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.485;QD=18.8863;RBI=0.01944;REFB=0.0074707;REVB=-0.0172156;RO=5;SAF=5;SAR=3;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0175135;STB=0.510178;STBP=0.994;TYPE=snp;VARB=-0.00309918;OID=.;OPOS=22989270;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:13:13:5:5:8:8:0.615385:3:5:3:2:3:5:3:2
chr22	22989281	.	T	C	85.04	PASS	AF=0.666667;AO=10;DP=15;FAO=10;FDP=15;FR=.;FRO=5;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.059669;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.504;QD=22.678;RBI=0.0603728;REFB=0.015687;REVB=-0.00919133;RO=5;SAF=6;SAR=4;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0126272;OID=.;OPOS=22989281;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:15:15:5:5:10:10:0.666667:4:6:3:2:4:6:3:2
chr22	23029263	.	T	C	1098.56	PASS	AF=0.986667;AO=74;DP=75;FAO=74;FDP=75;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.129641;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.9909;QD=58.5897;RBI=0.133592;REFB=0.0102238;REVB=-0.0322525;RO=1;SAF=28;SAR=46;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0165947;STB=0.50877;STBP=0.277;TYPE=snp;VARB=-0.00268461;OID=.;OPOS=23029263;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:75:75:1:1:74:74:0.986667:46:28:1:0:46:28:1:0
chr22	23029698	.	T	C	689.37	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0315133;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.514;QD=62.6704;RBI=0.0332483;REFB=0;REVB=0.0106002;RO=0;SAF=19;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000146374;OID=.;OPOS=23029698;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:25:19:0:0:25:19:0:0
chr22	23040462	.	T	C	578.56	PASS	AF=0.867925;AO=46;DP=53;FAO=46;FDP=53;FR=.;FRO=7;FSAF=29;FSAR=17;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=-0.00557599;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.073;QD=43.665;RBI=0.0150948;REFB=0.000819205;REVB=0.0140271;RO=7;SAF=29;SAR=17;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0611764;STB=0.532663;STBP=0.248;TYPE=snp;VARB=-7.89897e-05;OID=.;OPOS=23040462;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:53:53:7:7:46:46:0.867925:17:29:6:1:17:29:6:1
chr22	23040767	.	G	T	1091.23	PASS	AF=0.819048;AO=86;DP=105;FAO=86;FDP=105;FR=.;FRO=19;FSAF=52;FSAR=34;FSRF=4;FSRR=15;FWDB=-0.0204392;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=140.46;QD=41.5708;RBI=0.024365;REFB=0.0231987;REVB=0.0132625;RO=19;SAF=52;SAR=34;SRF=4;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135753;STB=0.57231;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=-0.00537603;OID=.;OPOS=23040767;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:105:19:19:86:86:0.819048:34:52:4:15:34:52:4:15
chr22	23054916	.	G	T	291.51	PASS	AF=0.714286;AO=25;DP=35;FAO=25;FDP=35;FR=.;FRO=10;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.00903573;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.119;QD=33.3155;RBI=0.00987672;REFB=-0.0130831;REVB=-0.00398813;RO=10;SAF=12;SAR=13;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114515;STB=0.562593;STBP=0.249;TYPE=snp;VARB=0.00514023;OID=.;OPOS=23054916;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:35:35:10:10:25:25:0.714286:13:12:7:3:13:12:7:3
chr22	23055421	.	G	A	645.34	PASS	AF=0.779412;AO=53;DP=68;FAO=53;FDP=68;FR=.;FRO=15;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=-0.00754597;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=263.006;QD=37.961;RBI=0.0129176;REFB=-0.0291561;REVB=0.0104845;RO=15;SAF=26;SAR=27;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0449532;STB=0.524117;STBP=0.469;TYPE=snp;VARB=0.00849176;OID=.;OPOS=23055421;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:93:68:68:15:15:53:53:0.779412:27:26:9:6:27:26:9:6
chr22	23055440	.	C	A	601.61	PASS	AF=0.73913;AO=49;DP=67;FAO=51;FDP=69;FR=.;FRO=18;FSAF=20;FSAR=31;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=0.0123075;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.221;QD=34.8762;RBI=0.0192578;REFB=-0.0390721;REVB=0.0148118;RO=18;SAF=18;SAR=31;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0979061;STB=0.543842;STBP=0.252;TYPE=snp;VARB=0.0165459;OID=.;OPOS=23055440;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:69:18:18:49:51:0.73913:31:18:10:8:31:20:10:8
chr22	23055533	.	G	A	1077.79	PASS	AF=0.796296;AO=85;DP=108;FAO=86;FDP=108;FR=.;FRO=22;FSAF=41;FSAR=45;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=-0.0150857;FXX=0.00917347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.45;QD=39.9182;RBI=0.0223235;REFB=-0.00607701;REVB=0.0164548;RO=22;SAF=41;SAR=44;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0593149;STB=0.53248;STBP=0.196;TYPE=snp;VARB=0.00108245;OID=.;OPOS=23055533;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:108:22:22:85:86:0.796296:44:41:14:8:45:41:14:8
chr22	23055539	.	G	T	1176.7	PASS	AF=0.814159;AO=92;DP=113;FAO=92;FDP=113;FR=.;FRO=21;FSAF=44;FSAR=48;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=0.0352098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.9076;QD=41.6533;RBI=0.0357528;REFB=0.0305961;REVB=0.00620759;RO=21;SAF=44;SAR=48;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0491318;STB=0.526148;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=-0.00634845;OID=.;OPOS=23055539;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:113:21:21:92:92:0.814159:48:44:13:8:48:44:13:8
chr22	23055691	.	G	A	478.12	PASS	AF=0.693548;AO=43;DP=62;FAO=43;FDP=62;FR=.;FRO=19;FSAF=29;FSAR=14;FSRF=4;FSRR=15;FWDB=0.0544476;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.685;QD=30.8466;RBI=0.057105;REFB=-0.00698956;REVB=0.0172175;RO=19;SAF=29;SAR=14;SRF=4;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.267885;STB=0.645365;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0054223;OID=.;OPOS=23055691;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:19:19:43:43:0.693548:14:29:4:15:14:29:4:15
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chr22	23114938	.	C	A	121.48	PASS	AF=0.189189;AO=21;DP=111;FAO=21;FDP=111;FR=.;FRO=90;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=58;FSRR=32;FWDB=0.0101973;FXX=0.00892777;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.861;QD=4.37756;RBI=0.0110954;REFB=-0.00481297;REVB=-0.004373;RO=88;SAF=10;SAR=11;SRF=58;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.232616;STB=0.634854;STBP=0.191;TYPE=snp;VARB=0.0291054;OID=.;OPOS=23114938;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:111:88:90:21:21:0.189189:11:10:58:30:11:10:58:32
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chr22	23241705	.	G	A	97.65	PASS	AF=0.6875;AO=11;DP=15;FAO=11;FDP=16;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0416512;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=70.6069;QD=24.4127;RBI=0.0887226;REFB=0.00620837;REVB=0.0783382;RO=0;SAF=3;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.726859;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.00290134;OID=.;OPOS=23241705;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:15:16:0:5:11:11:0.6875:8:3:0:0:8:3:5:0
chr22	23241751	.	GCT	CTA,GCTA,GTA	525.0	PASS	AF=0.0526316,0.868421,0.0789474;AO=3,25,3;DP=38;FAO=2,33,3;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=1,19,0;FSAR=1,14,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0308593,0.0323117,0.0114226;FXX=0;HRUN=4,0,1;LEN=3,1,2;MLLD=93.1458,105.705,88.2934;QD=55.2629;RBI=0.0630158,0.0657163,0.0880488;REFB=0,0,0;REVB=0.0549427,0.057224,0.0873048;RO=1;SAF=1,16,0;SAR=2,9,3;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.266641,-0.0281249,-0.727144;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=mnp,ins,mnp;VARB=0.0406741,0.000371096,0.0590925;OID=.,.,.;OPOS=23241751,23241754,23241752;OREF=GCT,-,CT;OALT=CTA,A,TA;OMAPALT=CTA,GCTA,GTA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	2/3:11:38:38:1:0:3,25,3:2,33,3:0.0526316,0.868421,0.0789474:2,9,3:1,16,0:1:0:1,14,3:1,19,0:0:0
chr22	23247082	.	C	G	1008.04	PASS	AF=0.568862;AO=95;DP=166;FAO=95;FDP=167;FR=.;FRO=72;FSAF=69;FSAR=26;FSRF=50;FSRR=22;FWDB=-0.0317463;FXX=0.0118336;HRUN=4;LEN=1;MLLD=45.5925;QD=24.1448;RBI=0.0549775;REFB=0.0189034;REVB=0.0448854;RO=70;SAF=68;SAR=27;SRF=48;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.028421;STB=0.517012;STBP=0.656;TYPE=snp;VARB=-0.013247;OID=.;OPOS=23247082;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:166:167:70:72:95:95:0.568862:27:68:48:22:26:69:50:22
chr22	23248758	.	G	A	125.15	PASS	AF=0.538462;AO=13;DP=25;FAO=14;FDP=26;FR=.,HEALED;FRO=12;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=0.000755195;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.517;QD=19.2537;RBI=0.00275088;REFB=-0.0388952;REVB=-0.00264519;RO=9;SAF=8;SAR=5;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0394853;STB=0.555479;STBP=0.59;TYPE=snp;VARB=0.0295683;OID=.;OPOS=23248758;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:26:9:12:13:14:0.538462:5:8:6:3:5:9:9:3
chr22	23256464	.	G	C	1065.63	PASS	AF=0.986301;AO=72;DP=73;FAO=72;FDP=73;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00904356;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.6739;QD=58.3907;RBI=0.0311664;REFB=-0.00802066;REVB=-0.0298255;RO=1;SAF=31;SAR=41;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0113966;STB=0.506022;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=-2.71592e-05;OID=.;OPOS=23256464;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:73:73:1:1:72:72:0.986301:41:31:0:1:41:31:0:1
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chr22	23438191	.	C	T	541.04	PASS	AF=1;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.035564;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.169;QD=60.1156;RBI=0.037397;REFB=0;REVB=-0.0115643;RO=0;SAF=20;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.9376e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000357727;OID=.;OPOS=23438191;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:36:0:0:36:36:1:16:20:0:0:16:20:0:0
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chr22	23482460	.	A	G	1452.46	PASS	AF=0.969388;AO=94;DP=98;FAO=95;FDP=98;FR=.;FRO=3;FSAF=54;FSAR=41;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.032265;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.6376;QD=59.2841;RBI=0.046245;REFB=-0.0707651;REVB=-0.0331296;RO=4;SAF=54;SAR=40;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00588139;STB=0.503067;STBP=0.772;TYPE=snp;VARB=0.00895766;OID=.;OPOS=23482460;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:98:98:4:3:94:95:0.969388:40:54:2:2:41:54:2:1
chr22	23498329	.	CA	TG	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108684;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=173.044;QD=44.6898;RBI=0.0157514;REFB=0;REVB=0.0114011;RO=0;SAF=10;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000182767;OID=.;OPOS=23498329;OREF=CA;OALT=TG;OMAPALT=TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:3:10:0:0:3:10:0:0
chr22	23498334	.	C	A	64.29	PASS	AF=0.727273;AO=11;DP=11;FAO=8;FDP=11;FR=.;FRO=3;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.000167937;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=108.501;QD=23.3792;RBI=0.060515;REFB=-0.00398725;REVB=-0.0605148;RO=0;SAF=10;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.588042;STBP=0.66;TYPE=snp;VARB=0.0115177;OID=.;OPOS=23498334;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:11:11:0:3:11:8:0.727273:1:10:0:0:1:7:3:0
chr22	23503121	.	G	A	191.29	PASS	AF=1;AO=15;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00910777;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=247.406;QD=47.8223;RBI=0.0171453;REFB=0;REVB=0.0145261;RO=0;SAF=7;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.89581e-05;OID=.;OPOS=23503121;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:15:16:1:8:7:0:0:8:8:0:0
chr22	23513523	.	A	C	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0470646;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.298;QD=49.5992;RBI=0.0508459;REFB=0;REVB=0.0192413;RO=0;SAF=9;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000144293;OID=.;OPOS=23513523;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:9:9:0:0:9:9:0:0
chr22	23523630	.	C	A	803.37	PASS	AF=0.982759;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00951131;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.891;QD=55.4045;RBI=0.0205369;REFB=-0.0910217;REVB=-0.0182016;RO=1;SAF=33;SAR=24;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0192443;STB=0.510201;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.000259498;OID=.;OPOS=23523630;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:58:58:1:1:57:57:0.982759:24:33:0:1:24:33:0:1
chr22	23541488	.	C	T	727.77	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0192858;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.396;QD=63.2841;RBI=0.0348418;REFB=0;REVB=0.0290174;RO=0;SAF=16;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.31553e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.98131e-05;OID=.;OPOS=23541488;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:30:16:0:0:30:16:0:0
chr22	23585132	.	A	G	360.25	PASS	AF=0.666667;AO=30;DP=45;FAO=30;FDP=45;FR=.;FRO=15;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=-0.0122376;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.913;QD=32.0225;RBI=0.0247012;REFB=-0.0153906;REVB=0.0214568;RO=15;SAF=14;SAR=16;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123738;STB=0.567524;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=0.0102654;OID=.;OPOS=23585132;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:15:15:30:30:0.666667:16:14:4:11:16:14:4:11
chr22	23627369	.	A	G	78.65	PASS	AF=0.203125;AO=13;DP=64;FAO=13;FDP=64;FR=.;FRO=51;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=28;FSRR=23;FWDB=-0.0352631;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.264;QD=4.91582;RBI=0.0362577;REFB=-0.0109942;REVB=0.00843442;RO=51;SAF=5;SAR=8;SRF=28;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202718;STB=0.629873;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=0.0548179;OID=.;OPOS=23627369;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:64:64:51:51:13:13:0.203125:8:5:28:23:8:5:28:23
chr22	23655196	.	G	A	57.72	PASS	AF=0.4;AO=8;DP=20;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=0.00488158;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.9766;QD=11.5445;RBI=0.0299823;REFB=-0.0187344;REVB=-0.0295823;RO=12;SAF=7;SAR=1;SRF=2;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.663409;STB=0.894438;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.00750365;OID=.;OPOS=23655196;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:20:20:12:12:8:8:0.4:1:7:2:10:1:7:2:10
chr22	23658372	.	A	G	68.28	PASS	AF=0.5;AO=8;DP=17;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=-0.0113443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.037;QD=15.1728;RBI=0.0140409;REFB=-0.0217575;REVB=-0.00827363;RO=9;SAF=4;SAR=4;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149044;STB=0.556839;STBP=0.735;TYPE=snp;VARB=0.0115168;OID=.;OPOS=23658372;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:17:18:9:9:8:9:0.5:4:4:3:6:5:4:3:6
chr22	24034288	.	A	G	750.66	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000397911;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.6928;QD=62.5553;RBI=0.157486;REFB=0;REVB=0.157486;RO=0;SAF=24;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000629858;OID=.;OPOS=24034288;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:48:0:0:43:48:1:19:24:0:0:23:25:0:0
chr22	24035970	.	C	T	695.7	PASS	AF=0.978261;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0463188;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.941;QD=60.4954;RBI=0.0463195;REFB=-0.00873346;REVB=-0.00025256;RO=1;SAF=22;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0199954;STB=0.510634;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.00053051;OID=.;OPOS=24035970;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:46:46:1:1:45:45:0.978261:23:22:0:1:23:22:0:1
chr22	24036563	.	G	A	336.85	PASS	AF=0.818182;AO=27;DP=33;FAO=27;FDP=33;FR=.;FRO=6;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.0101611;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.0545;QD=40.8296;RBI=0.014476;REFB=-0.00102422;REVB=0.0103105;RO=6;SAF=11;SAR=16;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0851765;STB=0.546066;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=0.000494517;OID=.;OPOS=24036563;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:33:33:6:6:27:27:0.818182:16:11:1:5:16:11:1:5
chr22	24038846	.	GT	G,GC	638.95	PASS	AF=1,0;AO=13,29;DP=42;FAO=42,0;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=24,0;FSAR=18,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0567954,-0.39856;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=30.7591,20.6446;QD=60.8521;RBI=0.0604185,0.419029;REFB=0,0;REVB=-0.0206078,-0.129367;RO=0;SAF=3,21;SAR=10,8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,7.4007e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.000514201,0;OID=.,.;OPOS=24038847,24038847;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=G,GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1,0:13,29:42:42,0:42:0:24,0:18,0:0:0:4:0:3,21:10,8:0:0
chr22	24086107	.	A	G	431.82	PASS	AF=0.723404;AO=34;DP=47;FAO=34;FDP=47;FR=.;FRO=13;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=-0.000914114;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.48;QD=36.7507;RBI=0.0268607;REFB=-0.0217082;REVB=-0.0268452;RO=13;SAF=20;SAR=14;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0553464;STB=0.530009;STBP=0.551;TYPE=snp;VARB=0.00875307;OID=.;OPOS=24086107;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:13:13:34:34:0.723404:14:20:9:4:14:20:9:4
chr22	24087319	.	A	C	514.92	PASS	AF=0.77193;AO=44;DP=57;FAO=44;FDP=57;FR=.;FRO=13;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=-0.012628;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=263.002;QD=36.1348;RBI=0.0128918;REFB=-0.000418758;REVB=-0.00259446;RO=13;SAF=24;SAR=20;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100544;STB=0.554116;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=5.96774e-05;OID=.;OPOS=24087319;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:57:57:13:13:44:44:0.77193:20:24:4:9:20:24:4:9
chr22	24106448	.	G	A	71.69	PASS	AF=0.277778;AO=9;DP=36;FAO=10;FDP=36;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=18;FSRR=8;FWDB=-0.0328719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.095;QD=7.96581;RBI=0.0346034;REFB=-0.011463;REVB=-0.0108089;RO=26;SAF=7;SAR=2;SRF=18;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129911;STB=0.605828;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.023204;OID=.;OPOS=24106448;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:71:36:36:26:26:9:10:0.277778:2:7:18:8:2:8:18:8
chr22	24108412	.	G	A	219.27	PASS	AF=0.863636;AO=19;DP=22;FAO=19;FDP=22;FR=.;FRO=3;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0239893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.725;QD=39.8676;RBI=0.0415738;REFB=-0.0873667;REVB=0.0339543;RO=3;SAF=9;SAR=10;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0352055;STB=0.519211;STBP=0.727;TYPE=snp;VARB=0.0119191;OID=.;OPOS=24108412;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:22:22:3:3:19:19:0.863636:10:9:1:2:10:9:1:2
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chr22	24158895	.	A	G	58.53	PASS	AF=0.111111;AO=4;DP=45;FAO=5;FDP=45;FR=.,HEALED;FRO=36;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=22;FSRR=14;FWDB=-0.0175653;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=307.722;QD=5.20296;RBI=0.0179253;REFB=-0.00505335;REVB=-0.00357475;RO=36;SAF=3;SAR=1;SRF=22;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168189;STB=0.510164;STBP=0.995;TYPE=snp;VARB=0.0295527;OID=.;OPOS=24158895;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:24:45:45:36:36:4:5:0.111111:1:3:22:14:2:3:22:14
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chr22	24628928	.	G	A	84.73	PASS	AF=0.354839;AO=11;DP=31;FAO=11;FDP=31;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=0.106965;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.5778;QD=10.9323;RBI=0.112528;REFB=-0.0213056;REVB=0.0349438;RO=20;SAF=7;SAR=4;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159505;STB=0.509537;STBP=0.975;TYPE=snp;VARB=0.0445911;OID=.;OPOS=24628928;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:31:31:20:20:11:11:0.354839:4:7:13:7:4:7:13:7
chr22	24717850	.	A	G	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.050149;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.148;QD=45.8065;RBI=0.0579693;REFB=0;REVB=0.0290777;RO=0;SAF=10;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.63386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000283624;OID=.;OPOS=24717850;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:4:10:0:0:4:10:0:0
chr22	24761467	.	G	A	769.12	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0238526;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.715;QD=62.785;RBI=0.0643289;REFB=0;REVB=0.0597433;RO=0;SAF=31;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000366511;OID=.;OPOS=24761467;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:49:0:0:46:49:1:15:31:0:0:16:33:0:0
chr22	24811667	.	G	A	375.65	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0430353;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.651;QD=55.6518;RBI=0.045207;REFB=0;REVB=0.0138431;RO=0;SAF=7;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.41836e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000277859;OID=.;OPOS=24811667;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:20:7:0:0:20:7:0:0
chr22	24837301	.	T	C	2320.27	PASS	AF=1;AO=152;DP=152;FAO=152;FDP=152;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=102;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00591297;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.697;QD=61.0596;RBI=0.0117206;REFB=0;REVB=-0.0101198;RO=0;SAF=50;SAR=102;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.13517e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.37316e-05;OID=.;OPOS=24837301;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:152:152:0:0:152:152:1:102:50:0:0:102:50:0:0
chr22	24898310	.	C	T	817.74	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00964179;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.652;QD=57.3853;RBI=0.0144438;REFB=0;REVB=-0.0107545;RO=0;SAF=38;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.11974e-06;OID=.;OPOS=24898310;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:19:38:0:0:19:38:0:0
chr22	24964128	.	T	C	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0493203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.6;QD=55.656;RBI=0.0550297;REFB=0;REVB=-0.0244084;RO=0;SAF=11;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000381594;OID=.;OPOS=24964128;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:16:11:0:0:16:11:0:0
chr22	25003922	.	G	A	518.89	PASS	AF=0.538462;AO=49;DP=89;FAO=49;FDP=91;FR=.;FRO=42;FSAF=17;FSAR=32;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=-0.0591097;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=88.5016;QD=22.8083;RBI=0.0693855;REFB=-0.0461986;REVB=0.0363372;RO=40;SAF=17;SAR=32;SRF=20;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131699;STB=0.574367;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=0.0181343;OID=.;OPOS=25003922;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:91:40:42:49:49:0.538462:32:17:20:20:32:17:21:21
chr22	25003934	.	G	A	465.11	PASS	AF=0.484211;AO=46;DP=95;FAO=46;FDP=95;FR=.;FRO=49;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=17;FSRR=32;FWDB=0.0133418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.983;QD=19.5835;RBI=0.0150718;REFB=-0.0181563;REVB=-0.00701096;RO=48;SAF=23;SAR=23;SRF=17;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134412;STB=0.578914;STBP=0.167;TYPE=snp;VARB=0.0182085;OID=.;OPOS=25003934;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:48:49:46:46:0.484211:23:23:17:31:23:23:17:32
chr22	25045855	.	G	A	617.02	PASS	AF=1;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00156095;FXX=0.0243843;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.518;QD=61.7018;RBI=0.0190279;REFB=0;REVB=0.0189638;RO=0;SAF=29;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.97233e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.8426e-05;OID=.;OPOS=25045855;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:40:0:0:40:40:1:11:29:0:0:11:29:0:0
chr22	25145453	.	C	T	501.66	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0378514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.376;QD=59.0186;RBI=0.0421136;REFB=0;REVB=0.0184614;RO=0;SAF=13;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000364707;OID=.;OPOS=25145453;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:21:13:0:0:21:13:0:0
chr22	25145471	.	A	G	465.13	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0602518;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.185;QD=58.1415;RBI=0.060378;REFB=0;REVB=0.00390213;RO=0;SAF=11;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000206709;OID=.;OPOS=25145471;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:21:11:0:0:21:11:0:0
chr22	25147423	.	C	T	62.96	PASS	AF=0.155844;AO=12;DP=77;FAO=12;FDP=77;FR=.;FRO=65;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=23;FSRR=42;FWDB=-0.00625951;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.045;QD=3.27087;RBI=0.0212608;REFB=-0.00107956;REVB=-0.0203184;RO=65;SAF=4;SAR=8;SRF=23;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0282168;STB=0.519198;STBP=0.898;TYPE=snp;VARB=0.00729056;OID=.;OPOS=25147423;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:77:77:65:65:12:12:0.155844:8:4:23:42:8:4:23:42
chr22	25255688	.	C	T	559.64	PASS	AF=0.738462;AO=48;DP=65;FAO=48;FDP=65;FR=.;FRO=17;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=0.0114766;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.952;QD=34.4394;RBI=0.0123075;REFB=-0.0163137;REVB=0.00444534;RO=17;SAF=24;SAR=24;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0999562;STB=0.553824;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.00326459;OID=.;OPOS=25255688;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:17:17:48:48:0.738462:24:24:12:5:24:24:12:5
chr22	25263048	.	G	A	43.83	PASS	AF=0.25;AO=7;DP=28;FAO=7;FDP=28;FR=.;FRO=21;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=-0.00677213;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.972;QD=6.26094;RBI=0.00702523;REFB=-0.000489361;REVB=0.00186869;RO=20;SAF=2;SAR=5;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.257095;STB=0.651721;STBP=0.438;TYPE=snp;VARB=0.00108016;OID=.;OPOS=25263048;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:28:28:20:21:7:7:0.25:5:2:10:10:5:2:10:11
chr22	25291182	.	TTTC	T	59.42	PASS	AF=0.27907;AO=11;DP=46;FAO=12;FDP=43;FR=.;FRO=31;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=20;FWDB=-0.0340058;FXX=0.0227221;HRUN=4;LEN=3;MLLD=203.346;QD=5.52741;RBI=0.0371335;REFB=-0.00919702;REVB=-0.0149165;RO=33;SAF=4;SAR=7;SRF=12;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.546483;STBP=0.716;TYPE=del;VARB=0.0252795;OID=.;OPOS=25291183;OREF=TTC;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.27907:11:46:12:43:31:5:7:11:20:59:33:4:7:12:21
chr22	25294369	.	G	A	196.8	PASS	AF=0.633333;AO=19;DP=30;FAO=19;FDP=30;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.00978402;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.4776;QD=26.2401;RBI=0.0473825;REFB=-0.0274755;REVB=0.0463613;RO=11;SAF=6;SAR=13;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101095;STB=0.556359;STBP=0.46;TYPE=snp;VARB=0.0176122;OID=.;OPOS=25294369;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:30:30:11:11:19:19:0.633333:13:6:5:6:13:6:5:6
chr22	25294376	.	C	T	166.08	PASS	AF=0.566667;AO=17;DP=30;FAO=17;FDP=30;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=0.02766;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.2769;QD=22.1438;RBI=0.0295878;REFB=-0.0338188;REVB=0.0105055;RO=13;SAF=6;SAR=11;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0264293;STB=0.514876;STBP=0.884;TYPE=snp;VARB=0.0244265;OID=.;OPOS=25294376;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:13:13:17:17:0.566667:11:6:5:8:11:6:5:8
chr22	25425403	.	T	C	32.73	PASS	AF=0.133333;AO=6;DP=45;FAO=6;FDP=45;FR=.;FRO=39;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=24;FSRR=15;FWDB=0.014493;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.0855;QD=2.90975;RBI=0.0530562;REFB=-0.00299623;REVB=-0.0510383;RO=38;SAF=4;SAR=2;SRF=23;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0776541;STB=0.548222;STBP=0.838;TYPE=snp;VARB=0.0137025;OID=.;OPOS=25425403;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:32:45:45:38:39:6:6:0.133333:2:4:23:15:2:4:24:15
chr22	25577688	.	G	A	538.02	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0282541;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.2948;QD=59.7798;RBI=0.0283746;REFB=0;REVB=-0.00261203;RO=0;SAF=15;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000276141;OID=.;OPOS=25577688;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:21:15:0:0:21:15:0:0
chr22	25577733	.	T	C	464.62	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0416943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.75;QD=58.077;RBI=0.0576411;REFB=0;REVB=-0.0398006;RO=0;SAF=15;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.31713e-05;OID=.;OPOS=25577733;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:17:15:0:0:17:15:0:0
chr22	25601196	.	C	G	834.4	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0198865;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.3602;QD=57.545;RBI=0.0369356;REFB=0;REVB=0.031125;RO=0;SAF=17;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00011628;OID=.;OPOS=25601196;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:41:17:0:0:41:17:0:0
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chr22	26159289	.	G	A	397.19	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0217056;FXX=0.0344709;HRUN=5;LEN=1;MLLD=276.585;QD=56.7418;RBI=0.0246201;REFB=0;REVB=0.0116195;RO=0;SAF=13;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.42272e-05;OID=.;OPOS=26159289;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:28:0:0:29:28:1:16:13:0:0:15:13:0:0
chr22	26164079	.	C	T	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0450092;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=148.891;QD=56.1909;RBI=0.0480829;REFB=0;REVB=0.0169156;RO=0;SAF=14;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000367467;OID=.;OPOS=26164079;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:14:14:0:0:14:14:0:0
chr22	26166900	.	G	C	313.39	PASS	AF=0.96;AO=23;DP=25;FAO=24;FDP=25;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0172449;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=251.361;QD=50.1422;RBI=0.0209756;REFB=0.0105791;REVB=0.0119411;RO=1;SAF=8;SAR=15;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0298695;STB=0.515139;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=-8.14781e-06;OID=.;OPOS=26166900;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:25:25:1:1:23:24:0.96:15:8:0:1:16:8:0:1
chr22	26173661	.	T	C	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0102448;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.381;QD=55.0986;RBI=0.0283406;REFB=0;REVB=0.0264241;RO=0;SAF=8;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.28381e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.85977e-05;OID=.;OPOS=26173661;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:18:8:0:0:18:8:0:0
chr22	26193982	.	C	G	80.54	PASS	AF=0.22;AO=9;DP=48;FAO=11;FDP=50;FR=.;FRO=39;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=-0.0495064;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.4665;QD=6.44348;RBI=0.0579659;REFB=-0.0125149;REVB=0.0301524;RO=38;SAF=5;SAR=4;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0358908;STB=0.545372;STBP=0.769;TYPE=snp;VARB=0.0303601;OID=.;OPOS=26193982;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:80:48:50:38:39:9:11:0.22:4:5:20:18:6:5:20:19
chr22	26194045	.	T	C	62.52	PASS	AF=0.272727;AO=9;DP=34;FAO=9;FDP=33;FR=.;FRO=24;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=20;FWDB=0.00532059;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.761;QD=7.57832;RBI=0.00996365;REFB=-0.00714153;REVB=-0.00842411;RO=24;SAF=3;SAR=6;SRF=4;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.247957;STB=0.649724;STBP=0.426;TYPE=snp;VARB=0.0137141;OID=.;OPOS=26194045;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:34:33:24:24:9:9:0.272727:6:3:4:20:6:3:4:20
chr22	26239850	.	C	A	222.89	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00957302;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.9387;QD=49.5305;RBI=0.0288386;REFB=0;REVB=0.0272033;RO=0;SAF=10;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00146349;OID=.;OPOS=26239850;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:8:10:0:0:8:10:0:0
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chr22	26854441	.	G	A	785.69	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000144985;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.7797;QD=64.1378;RBI=0.0278267;REFB=0;REVB=0.0278263;RO=0;SAF=27;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.30731e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000231054;OID=.;OPOS=26854441;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:22:27:0:0:22:27:0:0
chr22	26859942	.	C	T	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0201513;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=286.196;QD=55.0987;RBI=0.0243042;REFB=0;REVB=0.0135876;RO=0;SAF=9;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000108832;OID=.;OPOS=26859942;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:17:9:0:0:17:9:0:0
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chr22	26862212	.	T	C	951.44	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.461;QD=58.55;RBI=0.0411099;REFB=0;REVB=0.0383165;RO=0;SAF=40;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.3845e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.1009e-05;OID=.;OPOS=26862212;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:65:0:0:64:65:1:24:40:0:0:25:40:0:0
chr22	26879967	.	A	G	56.9	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0163815;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=325.676;QD=32.5143;RBI=0.0445646;REFB=0;REVB=0.0414446;RO=0;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00159274;OID=.;OPOS=26879967;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:7:0:0:6:7:1:2:4:0:0:2:5:0:0
chr22	26884039	.	G	A	532.7	PASS	AF=0.741935;AO=46;DP=62;FAO=46;FDP=62;FR=.;FRO=16;FSAF=15;FSAR=31;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.0114179;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.194;QD=34.3679;RBI=0.0127482;REFB=-0.0202149;REVB=0.00566979;RO=16;SAF=15;SAR=31;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0592146;STB=0.531967;STBP=0.445;TYPE=snp;VARB=0.00230293;OID=.;OPOS=26884039;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:16:16:46:46:0.741935:31:15:7:9:31:15:7:9
chr22	26895337	.	G	A	1008.49	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0179741;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.564;QD=59.3229;RBI=0.0183986;REFB=0;REVB=-0.00392951;RO=0;SAF=39;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.34296e-05;OID=.;OPOS=26895337;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:29:39:0:0:29:39:0:0
chr22	26932150	.	G	A	518.02	PASS	AF=0.737705;AO=44;DP=60;FAO=45;FDP=61;FR=.;FRO=16;FSAF=34;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=-0.00173532;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.1112;QD=33.9683;RBI=0.00965713;REFB=0.0421159;REVB=-0.00949993;RO=16;SAF=33;SAR=11;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0785714;STB=0.544236;STBP=0.327;TYPE=snp;VARB=-0.0155906;OID=.;OPOS=26932150;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:61:16:16:44:45:0.737705:11:33:10:6:11:34:10:6
chr22	26937327	.	C	G	458.02	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0263463;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.799;QD=57.252;RBI=0.0498441;REFB=0;REVB=0.0423121;RO=0;SAF=12;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000144295;OID=.;OPOS=26937327;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:32:0:0:30:32:1:18:12:0:0:19:13:0:0
chr22	27021457	.	T	C	447.02	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.013698;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=241.046;QD=57.6803;RBI=0.0231927;REFB=0;REVB=0.0187154;RO=0;SAF=23;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.39343e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.63675e-05;OID=.;OPOS=27021457;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:8:23:0:0:8:23:0:0
chr22	28316591	.	T	TG	286.86	PASS	AF=1;AO=27;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00190825;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=15.8443;QD=37.0135;RBI=0.153833;REFB=0;REVB=-0.153821;RO=2;SAF=8;SAR=19;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0464732;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.006653;OID=.;OPOS=28316592;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:27:31:31:31:0:8:23:0:0:6:2:8:19:0:2
chr22	29182500	.	C	A	50.68	PASS	AF=0.140845;AO=9;DP=71;FAO=10;FDP=71;FR=.;FRO=61;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=20;FSRR=41;FWDB=-0.022532;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.643;QD=2.85542;RBI=0.0225321;REFB=-0.00208527;REVB=-8.39485e-05;RO=61;SAF=4;SAR=5;SRF=20;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148916;STB=0.566138;STBP=0.672;TYPE=snp;VARB=0.0275677;OID=.;OPOS=29182500;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:50:71:71:61:61:9:10:0.140845:5:4:20:41:6:4:20:41
chr22	29446611	.	A	C	1103.42	PASS	AF=0.926829;AO=62;DP=82;FAO=76;FDP=82;FR=.,HEALED;FRO=5;FSAF=58;FSAR=18;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0466864;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.665;QD=53.8256;RBI=0.107538;REFB=-0.100642;REVB=0.0968754;RO=5;SAF=51;SAR=11;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00541439;STB=0.503155;STBP=0.889;TYPE=snp;VARB=0.00949016;OID=.;OPOS=29446611;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:16:82:82:5:5:62:76:0.926829:11:51:4:1:18:58:4:1
chr22	29449691	.	AAT	AA,A	141.89	PASS	AF=0,0.947368;AO=5,9;DP=27;FAO=0,18;FDP=19;FR=.;FRO=1;FSAF=0,6;FSAR=0,12;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0182186,0.172219;FXX=0.269127;HRUN=7,6;LEN=1,2;MLLD=7.69255,16.3744;QD=29.8722;RBI=0.129606,0.209225;REFB=-0.0550918,-0.0697608;REVB=0.128319,0.11881;RO=4;SAF=3,2;SAR=2,7;SRF=2;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0744193,-0.187655;STB=0.5,0.519978;STBP=1,0.61;TYPE=del,del;VARB=0.0577499,0.0176708;OID=.,.;OPOS=29449693,29449692;OREF=T,AT;OALT=-,-;OMAPALT=AA,A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,0.947368:5,9:27:0,18:19:1:0,6:0,12:0:1:4:4:3,2:2,7:2:2
chr22	29450923	.	A	G	300.35	PASS	AF=0.857143;AO=24;DP=29;FAO=24;FDP=28;FR=.;FRO=4;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0242004;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.748;QD=42.9077;RBI=0.0481021;REFB=0.0160297;REVB=0.041571;RO=4;SAF=11;SAR=13;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0767789;STB=0.541632;STBP=0.346;TYPE=snp;VARB=0.000165674;OID=.;OPOS=29450923;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:20:29:28:4:4:24:24:0.857143:13:11:3:1:13:11:3:1
chr22	29453027	.	A	G	307.6	PASS	AF=0.833333;AO=25;DP=30;FAO=25;FDP=30;FR=.;FRO=5;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.00762703;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.463;QD=41.0134;RBI=0.0235361;REFB=-0.0222734;REVB=0.022266;RO=4;SAF=17;SAR=8;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0206479;STB=0.515139;STBP=0.726;TYPE=snp;VARB=0.00406232;OID=.;OPOS=29453027;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:26:30:30:4:5:25:25:0.833333:8:17:3:1:8:17:3:2
chr22	29453193	.	G	C	469.96	PASS	AF=0.711864;AO=42;DP=59;FAO=42;FDP=59;FR=.;FRO=17;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=0.00932453;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.844;QD=31.8618;RBI=0.00939543;REFB=-0.032244;REVB=0.00115207;RO=17;SAF=21;SAR=21;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0782982;STB=0.542353;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.0149097;OID=.;OPOS=29453193;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:17:17:42:42:0.711864:21:21:11:6:21:21:11:6
chr22	29454778	.	G	A	579.32	PASS	AF=0.8;AO=48;DP=60;FAO=48;FDP=60;FR=.;FRO=12;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=0.00826859;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.317;QD=38.621;RBI=0.0274071;REFB=0.00699272;REVB=0.02613;RO=12;SAF=22;SAR=26;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0471204;STB=0.52527;STBP=0.461;TYPE=snp;VARB=-0.00090061;OID=.;OPOS=29454778;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:60:60:12:12:48:48:0.8:26:22:4:8:26:22:4:8
chr22	29456699	.	A	G	1339.32	PASS	AF=0.77037;AO=104;DP=136;FAO=104;FDP=135;FR=.;FRO=31;FSAF=56;FSAR=48;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=0.0265749;FXX=0.0073524;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.848;QD=39.6834;RBI=0.0307404;REFB=-0.00681748;REVB=-0.0154514;RO=31;SAF=56;SAR=48;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0651951;STB=0.534771;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=0.00152254;OID=.;OPOS=29456699;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:136:135:31:31:104:104:0.77037:48:56:12:19:48:56:12:19
chr22	29456733	.	T	C	141.93	PASS	AF=0.214953;AO=23;DP=107;FAO=23;FDP=107;FR=.;FRO=84;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=47;FSRR=37;FWDB=0.0189771;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.7889;QD=5.30573;RBI=0.0190131;REFB=-0.00727856;REVB=-0.00116826;RO=84;SAF=8;SAR=15;SRF=47;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.26482;STB=0.664645;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.0266511;OID=.;OPOS=29456733;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:107:84:84:23:23:0.214953:15:8:47:37:15:8:47:37
chr22	29540198	.	T	G	688.97	PASS	AF=1;AO=43;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0176412;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.4148;QD=62.6335;RBI=0.0322489;REFB=0;REVB=0.026996;RO=0;SAF=22;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000573616;OID=.;OPOS=29540198;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:43:44:1:21:22:0:0:22:22:0:0
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chr22	30823113	.	T	G	339.57	PASS	AF=1;AO=24;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.020866;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=212.595;QD=54.3307;RBI=0.0272941;REFB=0;REVB=0.0175947;RO=0;SAF=13;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000160995;OID=.;OPOS=30823113;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:24:25:1:11:13:0:0:12:13:0:0
chr22	30823196	.	T	C	727.77	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00709972;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.974;QD=63.2842;RBI=0.0277965;REFB=0;REVB=-0.0268745;RO=0;SAF=20;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00020248;OID=.;OPOS=30823196;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:26:20:0:0:26:20:0:0
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chr22	30864792	.	C	T	160.1	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0847844;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.4987;QD=45.7441;RBI=0.0851355;REFB=0;REVB=-0.00772459;RO=0;SAF=5;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00296783;OID=.;OPOS=30864792;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:14:0:0:13:14:1:8:5:0:0:8:6:0:0
chr22	30864817	.	A	G	88.21	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.021172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.8316;QD=39.2065;RBI=0.0909859;REFB=0;REVB=0.0884883;RO=0;SAF=3;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00709236;OID=.;OPOS=30864817;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:6:3:0:0:6:3:0:0
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chr22	31333631	.	T	C,G	836.29	PASS	AF=0.916667,0.0833333;AO=52,5;DP=57;FAO=55,5;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=24,2;FSAR=31,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0147448,-0.0149288;FXX=0.0322529;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=123.305,164.519;QD=55.7527;RBI=0.0147453,0.0163975;REFB=0,0;REVB=-0.000110965,-0.00678301;RO=0;SAF=24,2;SAR=28,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.0032408,0.036081;OID=.,.;OPOS=31333631,31333631;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:20:57:60:0:0:52,5:55,5:0.916667,0.0833333:28,3:24,2:0:0:31,3:24,2:0:0
chr22	31342376	.	G	C	1062.34	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0106388;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=221.633;QD=59.8503;RBI=0.0378706;REFB=0;REVB=0.0363455;RO=0;SAF=34;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.12261e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.73538e-05;OID=.;OPOS=31342376;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:37:34:0:0:37:34:0:0
chr22	31354653	.	G	A	688.61	PASS	AF=0.92;AO=46;DP=50;FAO=46;FDP=50;FR=.;FRO=4;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0177744;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=321.141;QD=55.0887;RBI=0.0186249;REFB=-0.0628048;REVB=0.00556406;RO=4;SAF=26;SAR=20;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0670193;STB=0.535699;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.0023731;OID=.;OPOS=31354653;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:18:50:50:4:4:46:46:0.92:20:26:4:0:20:26:4:0
chr22	31521404	.	G	A	133.47	PASS	AF=0.416667;AO=15;DP=37;FAO=15;FDP=36;FR=.;FRO=21;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=16;FWDB=-0.0353549;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.2196;QD=14.8302;RBI=0.0355479;REFB=-0.00326584;REVB=-0.00369929;RO=21;SAF=3;SAR=12;SRF=5;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0571008;STB=0.533287;STBP=0.817;TYPE=snp;VARB=0.00485893;OID=.;OPOS=31521404;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:36:21:21:15:15:0.416667:12:3:5:16:12:3:5:16
chr22	31533796	.	G	C	39.4	PASS	AF=0.105263;AO=9;DP=94;FAO=10;FDP=95;FR=.;FRO=85;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=57;FSRR=28;FWDB=-0.0170627;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.609;QD=1.65884;RBI=0.0197971;REFB=-0.000216356;REVB=-0.0100394;RO=85;SAF=6;SAR=3;SRF=57;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00511732;STB=0.567439;STBP=0.676;TYPE=snp;VARB=0.0017057;OID=.;OPOS=31533796;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:39:94:95:85:85:9:10:0.105263:3:6:57:28:4:6:57:28
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chr22	31673116	.	A	G	567.54	PASS	AF=0.854167;AO=40;DP=47;FAO=41;FDP=48;FR=.;FRO=7;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.0095116;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.084;QD=47.2954;RBI=0.00960682;REFB=-0.00511746;REVB=0.00134928;RO=6;SAF=17;SAR=23;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0186095;STB=0.502091;STBP=0.941;TYPE=snp;VARB=0.000867411;OID=.;OPOS=31673116;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:40:47:48:6:7:40:41:0.854167:23:17:3:3:24:17:3:4
chr22	31679110	.	G	C	593.76	PASS	AF=1;AO=35;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=32;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0117878;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.357;QD=60.8987;RBI=0.0899322;REFB=0;REVB=0.0891563;RO=0;SAF=28;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00029926;OID=.;OPOS=31679110;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:35:39:1:7:28:0:0:7:32:0:0
chr22	31685256	.	C	G	214.79	PASS	AF=0.791667;AO=19;DP=25;FAO=19;FDP=24;FR=.;FRO=5;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=-0.0138761;FXX=0.039984;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.281;QD=35.7987;RBI=0.0193293;REFB=-0.0233253;REVB=0.0134564;RO=5;SAF=13;SAR=6;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.195171;STB=0.607359;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.0110276;OID=.;OPOS=31685256;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:25:24:5:5:19:19:0.791667:6:13:1:4:6:13:1:4
chr22	31722886	.	T	G	64.35	PASS	AF=0.727273;AO=8;DP=11;FAO=8;FDP=11;FR=.;FRO=3;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0208495;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.438;QD=23.3999;RBI=0.0216216;REFB=0.0170081;REVB=0.00572636;RO=3;SAF=4;SAR=4;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0790568;STB=0.545342;STBP=0.71;TYPE=snp;VARB=-0.0102853;OID=.;OPOS=31722886;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:11:11:3:3:8:8:0.727273:4:4:2:1:4:4:2:1
chr22	31744072	.	G	A	297.05	PASS	AF=0.757576;AO=25;DP=33;FAO=25;FDP=33;FR=.;FRO=8;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.00559914;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=299.568;QD=36.0063;RBI=0.0100119;REFB=-0.0121968;REVB=0.00829982;RO=8;SAF=8;SAR=17;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14629;STB=0.579986;STBP=0.148;TYPE=snp;VARB=0.00348888;OID=.;OPOS=31744072;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:33:33:8:8:25:25:0.757576:17:8:5:3:17:8:5:3
chr22	31859859	.	A	G	66.16	PASS	AF=0.192308;AO=10;DP=52;FAO=10;FDP=52;FR=.;FRO=42;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=-0.0102161;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.646;QD=5.0891;RBI=0.0408142;REFB=-0.00207666;REVB=-0.039515;RO=42;SAF=5;SAR=5;SRF=21;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0101737;OID=.;OPOS=31859859;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:52:52:42:42:10:10:0.192308:5:5:21:21:5:5:21:21
chr22	31971258	.	T	C	557.12	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0247148;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.4494;QD=60.2286;RBI=0.0606474;REFB=0;REVB=0.055383;RO=0;SAF=20;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.71161e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000443189;OID=.;OPOS=31971258;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:17:20:0:0:17:20:0:0
chr22	32015450	.	T	G	75.13	PASS	AF=0.37037;AO=10;DP=27;FAO=10;FDP=27;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.00680167;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.6899;QD=11.131;RBI=0.0538921;REFB=0.00987571;REVB=-0.0534612;RO=17;SAF=9;SAR=1;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.512113;STB=0.81741;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=-0.0286797;OID=.;OPOS=32015450;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:27:27:17:17:10:10:0.37037:1:9:9:8:1:9:9:8
chr22	32211412	.	A	C	255.87	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0371249;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.404;QD=51.1748;RBI=0.0606607;REFB=0;REVB=-0.0479735;RO=0;SAF=11;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.53535e-05;OID=.;OPOS=32211412;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:9:11:0:0:9:11:0:0
chr22	32222476	.	C	G	76.08	PASS	AF=0.157303;AO=14;DP=91;FAO=14;FDP=89;FR=.;FRO=75;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=41;FSRR=34;FWDB=-0.023615;FXX=0.0219756;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.449;QD=3.41945;RBI=0.0248181;REFB=-0.00180157;REVB=0.00763332;RO=73;SAF=7;SAR=7;SRF=40;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0601303;STB=0.53927;STBP=0.78;TYPE=snp;VARB=0.00462178;OID=.;OPOS=32222476;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:91:89:73:75:14:14:0.157303:7:7:40:33:7:7:41:34
chr22	32334021	.	T	A	1044.98	PASS	AF=0.827957;AO=75;DP=92;FAO=77;FDP=93;FR=.;FRO=16;FSAF=42;FSAR=35;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=0.00527459;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=304.248;QD=44.9456;RBI=0.00717355;REFB=-0.0207719;REVB=-0.00486195;RO=16;SAF=42;SAR=33;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102393;STB=0.550768;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.00508585;OID=.;OPOS=32334021;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:90:92:93:16:16:75:77:0.827957:33:42:4:12:35:42:4:12
chr22	32334203	.	C	T	115.58	PASS	AF=0.8;AO=12;DP=15;FAO=12;FDP=15;FR=.;FRO=3;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0268672;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=276.477;QD=30.8214;RBI=0.0276251;REFB=-0.0127416;REVB=0.00642619;RO=3;SAF=5;SAR=7;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158797;STB=0.588096;STBP=0.252;TYPE=snp;VARB=0.00375105;OID=.;OPOS=32334203;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:15:15:3:3:12:12:0.8:7:5:0:3:7:5:0:3
chr22	32334229	.	A	C	52.92	PASS	AF=0.7;AO=7;DP=10;FAO=7;FDP=10;FR=.;FRO=3;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.9701;QD=21.1688;RBI=0.00151299;REFB=0.100228;REVB=-0.00151299;RO=3;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.040265;OID=.;OPOS=32334229;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:10:10:3:3:7:7:0.7:7:0:0:3:7:0:0:3
chr22	32377135	.	T	C	456.36	PASS	AF=1;AO=31;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00690858;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.372;QD=57.0445;RBI=0.119693;REFB=0;REVB=0.119494;RO=0;SAF=17;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00102998;OID=.;OPOS=32377135;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:31:32:1:14:17:0:0:14:18:0:0
chr22	32554985	.	A	G	439.66	PASS	AF=0.846154;AO=33;DP=39;FAO=33;FDP=39;FR=.;FRO=6;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=-0.0074526;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.628;QD=45.0936;RBI=0.0238114;REFB=0.0178937;REVB=-0.022615;RO=6;SAF=16;SAR=17;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0993276;STB=0.553456;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=-0.00240488;OID=.;OPOS=32554985;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:39:39:6:6:33:33:0.846154:17:16:5:1:17:16:5:1
chr22	32587023	.	C	G	74.37	PASS	AF=0.113095;AO=19;DP=169;FAO=19;FDP=168;FR=.;FRO=149;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=82;FSRR=67;FWDB=0.04709;FXX=0.00591681;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.5379;QD=1.77082;RBI=0.0647916;REFB=0.00257338;REVB=-0.0445026;RO=149;SAF=6;SAR=13;SRF=81;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.277273;STB=0.704223;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=-0.0226093;OID=.;OPOS=32587023;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:169:168:149:149:19:19:0.113095:13:6:81:68:13:6:82:67
chr22	32587027	.	G	C	84.77	PASS	AF=0.119318;AO=21;DP=176;FAO=21;FDP=176;FR=.;FRO=155;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=87;FSRR=68;FWDB=-0.00494824;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.078;QD=1.92656;RBI=0.0156818;REFB=-0.000883766;REVB=-0.0148806;RO=155;SAF=8;SAR=13;SRF=87;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.221169;STB=0.655724;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=0.00795256;OID=.;OPOS=32587027;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:176:176:155:155:21:21:0.119318:13:8:87:68:13:8:87:68
chr22	32589023	.	C	T	81.07	PASS	AF=0.159574;AO=15;DP=94;FAO=15;FDP=94;FR=.;FRO=79;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=41;FSRR=38;FWDB=0.0184966;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.4714;QD=3.44971;RBI=0.0191808;REFB=0.00037484;REVB=-0.0050774;RO=79;SAF=7;SAR=8;SRF=41;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0656212;STB=0.543851;STBP=0.752;TYPE=snp;VARB=-0.00202586;OID=.;OPOS=32589023;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:81:94:94:79:79:15:15:0.159574:8:7:41:38:8:7:41:38
chr22	32589034	.	T	C	73.35	PASS	AF=0.152174;AO=14;DP=92;FAO=14;FDP=92;FR=.;FRO=78;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=40;FSRR=38;FWDB=-0.0261174;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.198;QD=3.18893;RBI=0.0342756;REFB=-0.00399907;REVB=-0.0221967;RO=78;SAF=6;SAR=8;SRF=40;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105306;STB=0.571327;STBP=0.569;TYPE=snp;VARB=0.0276151;OID=.;OPOS=32589034;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:92:92:78:78:14:14:0.152174:8:6:40:38:8:6:40:38
chr22	32589090	.	C	T	56.81	PASS	AF=0.163934;AO=10;DP=61;FAO=10;FDP=61;FR=.;FRO=51;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=26;FSRR=25;FWDB=-0.00937593;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.4162;QD=3.72523;RBI=0.0170068;REFB=-0.00608038;REVB=-0.0141889;RO=51;SAF=4;SAR=6;SRF=26;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135588;STB=0.591921;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.0306301;OID=.;OPOS=32589090;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:61:61:51:51:10:10:0.163934:6:4:26:25:6:4:26:25
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chr22	32759025	.	G	C	819.8	PASS	AF=1;AO=57;DP=59;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.037732;FXX=0.0338926;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.449;QD=57.5301;RBI=0.0381863;REFB=0;REVB=0.00587269;RO=0;SAF=22;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00021422;OID=.;OPOS=32759025;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:59:57:0:0:57:57:1:35:22:0:0:35:22:0:0
chr22	32795641	.	C	T	795.94	PASS	AF=0.777778;AO=63;DP=81;FAO=63;FDP=81;FR=.;FRO=18;FSAF=33;FSAR=30;FSRF=4;FSRR=14;FWDB=0.0780994;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.9235;QD=39.3057;RBI=0.0815388;REFB=-0.0070777;REVB=0.023432;RO=18;SAF=33;SAR=30;SRF=4;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124704;STB=0.566724;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.00253616;OID=.;OPOS=32795641;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:18:18:63:63:0.777778:30:33:4:14:30:33:4:14
chr22	32811952	.	A	G	768.61	PASS	AF=1;AO=54;DP=55;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0309478;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.583;QD=54.901;RBI=0.0374956;REFB=-0.0934931;REVB=0.0211697;RO=1;SAF=35;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0241545;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0019106;OID=.;OPOS=32811952;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:55:56:1:0:54:56:1:19:35:0:1:21:35:0:0
chr22	32871365	.	G	A	127.68	PASS	AF=0.184;AO=23;DP=125;FAO=23;FDP=125;FR=.;FRO=102;FSAF=19;FSAR=4;FSRF=56;FSRR=46;FWDB=0.00433574;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=297.711;QD=4.08582;RBI=0.00522337;REFB=-0.00181225;REVB=0.00291289;RO=102;SAF=19;SAR=4;SRF=56;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.396393;STB=0.75975;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.00647454;OID=.;OPOS=32871365;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:125:125:102:102:23:23:0.184:4:19:56:46:4:19:56:46
chr22	32875190	.	G	A	71.01	PASS	AF=0.168831;AO=13;DP=77;FAO=13;FDP=77;FR=.;FRO=64;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=40;FSRR=24;FWDB=-0.0498138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.532;QD=3.68874;RBI=0.0538534;REFB=-0.00690853;REVB=-0.020464;RO=63;SAF=8;SAR=5;SRF=40;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0260277;STB=0.508462;STBP=0.966;TYPE=snp;VARB=0.028674;OID=.;OPOS=32875190;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:71:77:77:63:64:13:13:0.168831:5:8:40:23:5:8:40:24
chr22	32887150	.	C	T	62.04	PASS	AF=0.164384;AO=10;DP=71;FAO=12;FDP=73;FR=.;FRO=61;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=34;FSRR=27;FWDB=0.00718834;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.236;QD=3.39931;RBI=0.00829563;REFB=-0.00397535;REVB=0.00414068;RO=60;SAF=4;SAR=6;SRF=33;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.182518;STB=0.684382;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=0.0212167;OID=.;OPOS=32887150;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:71:73:60:61:10:12:0.164384:6:4:33:27:8:4:34:27
chr22	34022284	.	G	A	735.01	PASS	AF=0.979167;AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=48;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00709047;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.171;QD=61.2505;RBI=0.0148217;REFB=-0.145336;REVB=0.0130157;RO=0;SAF=16;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.515145;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=0.00108807;OID=.;OPOS=34022284;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:48:48:0:1:47:47:0.979167:31:16:0:0:31:16:1:0
chr22	35463162	.	A	G	1172.45	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0128323;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.944;QD=60.9064;RBI=0.0177176;REFB=0;REVB=0.0122166;RO=0;SAF=37;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.74139e-06;OID=.;OPOS=35463162;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:77:0:0:76:77:1:39:37:0:0:39:38:0:0
chr22	35463179	.	T	C	1208.22	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0632728;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.184;QD=61.1754;RBI=0.0692368;REFB=0;REVB=0.0281121;RO=0;SAF=37;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000147123;OID=.;OPOS=35463179;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:42:37:0:0:42:37:0:0
chr22	35463249	.	C	T	1134.35	PASS	AF=0.9625;AO=77;DP=80;FAO=77;FDP=80;FR=.;FRO=3;FSAF=29;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.00432481;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=202.623;QD=56.7177;RBI=0.0255254;REFB=0.00363639;REVB=0.0251564;RO=3;SAF=29;SAR=48;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0286624;STB=0.515148;STBP=0.209;TYPE=snp;VARB=9.64278e-06;OID=.;OPOS=35463249;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:80:80:3:3:77:77:0.9625:48:29:0:3:48:29:0:3
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chr22	35679951	.	T	C	145.77	PASS	AF=0.2625;AO=21;DP=80;FAO=21;FDP=80;FR=.;FRO=59;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=29;FSRR=30;FWDB=-0.000593134;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.617;QD=7.28828;RBI=0.0115632;REFB=0.00248409;REVB=-0.011548;RO=59;SAF=5;SAR=16;SRF=29;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.331301;STB=0.702637;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=-0.00550986;OID=.;OPOS=35679951;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:59:59:21:21:0.2625:16:5:29:30:16:5:29:30
chr22	35817553	.	C	T	961.6	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0063291;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.589;QD=59.1753;RBI=0.0765761;REFB=0;REVB=0.0763141;RO=0;SAF=38;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000130556;OID=.;OPOS=35817553;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:65:0:0:64:65:1:26:38:0:0:27:38:0:0
chr22	36007045	.	G	A	695.11	PASS	AF=0.870968;AO=54;DP=62;FAO=54;FDP=62;FR=.;FRO=8;FSAF=26;FSAR=28;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.0360477;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.007;QD=44.8459;RBI=0.0406109;REFB=-0.0155243;REVB=0.0187031;RO=8;SAF=26;SAR=28;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0258168;STB=0.513767;STBP=0.587;TYPE=snp;VARB=0.00209568;OID=.;OPOS=36007045;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:62:62:8:8:54:54:0.870968:28:26:3:5:28:26:3:5
chr22	36007075	.	C	T	591.04	PASS	AF=0.84;AO=42;DP=50;FAO=42;FDP=50;FR=.;FRO=8;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.0104022;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.5055;QD=47.2834;RBI=0.0121054;REFB=-0.0460549;REVB=-0.00619138;RO=8;SAF=20;SAR=22;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00711346;STB=0.503815;STBP=0.923;TYPE=snp;VARB=0.00685376;OID=.;OPOS=36007075;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:48:50:50:8:8:42:42:0.84:22:20:4:4:22:20:4:4
chr22	36055164	.	G	A	47.83	PASS	AF=0.153846;AO=8;DP=52;FAO=8;FDP=52;FR=.;FRO=44;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=0.0262869;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.81;QD=3.67886;RBI=0.0271219;REFB=0.00698541;REVB=-0.00667795;RO=43;SAF=5;SAR=3;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166411;STB=0.606527;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=-0.0475422;OID=.;OPOS=36055164;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:52:52:43:44:8:8:0.153846:3:5:21:22:3:5:22:22
chr22	36122930	.	C	T	1457.16	PASS	AF=1;AO=91;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148901;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.807;QD=63.3547;RBI=0.01494;REFB=0;REVB=0.00121906;RO=0;SAF=42;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.88131e-05;OID=.;OPOS=36122930;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:92:92:0:0:91:92:1:49:42:0:0:50:42:0:0
chr22	36124860	.	C	G	689.36	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.012051;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.168;QD=62.6687;RBI=0.0147607;REFB=0;REVB=0.00852351;RO=0;SAF=22;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.21503e-05;OID=.;OPOS=36124860;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:22:22:0:0:22:22:0:0
chr22	36135057	.	G	A	50.47	PASS	AF=0.195122;AO=8;DP=41;FAO=8;FDP=41;FR=.;FRO=33;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=-0.0132402;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=281.287;QD=4.92362;RBI=0.0170663;REFB=-0.00285827;REVB=0.0107683;RO=33;SAF=4;SAR=4;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0919039;STB=0.560826;STBP=0.746;TYPE=snp;VARB=0.0125653;OID=.;OPOS=36135057;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:50:41:41:33:33:8:8:0.195122:4:4:19:14:4:4:19:14
chr22	36537500	.	A	T	411.12	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00146095;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.906;QD=56.7063;RBI=0.0171993;REFB=0;REVB=0.0171371;RO=0;SAF=15;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.21463e-05;OID=.;OPOS=36537500;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:14:15:0:0:14:15:0:0
chr22	36545137	.	A	T	839.61	PASS	AF=1;AO=56;DP=57;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.020524;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.415;QD=56.9229;RBI=0.0205246;REFB=0;REVB=0.000155355;RO=0;SAF=26;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.29784e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.05792e-05;OID=.;OPOS=36545137;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:59:0:0:56:59:1:30:26:0:0:31:28:0:0
chr22	36556823	.	G	T	937.56	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00787522;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.0945;QD=58.5975;RBI=0.018231;REFB=0;REVB=-0.0164424;RO=0;SAF=32;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00015174;OID=.;OPOS=36556823;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:32:32:0:0:32:32:0:0
chr22	36573945	.	A	G	575.66	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00748282;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=70.7773;QD=60.5952;RBI=0.0225812;REFB=0;REVB=0.0213054;RO=0;SAF=22;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000335207;OID=.;OPOS=36573945;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:16:22:0:0:16:22:0:0
chr22	36575664	.	G	A	1355.08	PASS	AF=0.957447;AO=89;DP=93;FAO=90;FDP=94;FR=.;FRO=4;FSAF=43;FSAR=47;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.00228487;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.727;QD=57.663;RBI=0.0102116;REFB=-0.0842764;REVB=0.00995267;RO=4;SAF=43;SAR=46;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00137364;STB=0.500947;STBP=0.899;TYPE=snp;VARB=0.000771443;OID=.;OPOS=36575664;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:93:94:4:4:89:90:0.957447:46:43:2:2:47:43:2:2
chr22	36587202	.	G	A	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000970257;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.236;QD=50.4135;RBI=0.0189031;REFB=0;REVB=0.0188782;RO=0;SAF=6;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.851e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000273637;OID=.;OPOS=36587202;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:13:6:0:0:13:6:0:0
chr22	36587222	.	TG	T,TC,TT	362.87	PASS	AF=0,0.111111,0.888889;AO=3,3,21;DP=27;FAO=0,3,24;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=0,2,4;FSAR=0,1,20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0053139,0.00270721,0.00485915;FXX=0;HRUN=1,1,1;LEN=1,1,1;MLLD=183.884,174.213,194.745;QD=53.7586;RBI=0.0199495,0.0194785,0.0189438;REFB=0,0,0;REVB=0.0192288,0.0192895,0.0183101;RO=0;SAF=0,2,4;SAR=3,1,17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,4.45803e-08;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,snp,snp;VARB=0,-0.0159807,0.0037859;OID=.,.,.;OPOS=36587223,36587223,36587223;OREF=G,G,G;OALT=-,C,T;OMAPALT=T,TC,TT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	2/3:0,0.111111,0.888889:3,3,21:27:0,3,24:27:0:0,2,4:0,1,20:0:0:14:0:0,2,4:3,1,17:0:0
chr22	36587279	.	A	G	711.61	PASS	AF=0.980769;AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0266473;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.7884;QD=54.7392;RBI=0.0274916;REFB=-0.152846;REVB=-0.00676086;RO=1;SAF=24;SAR=27;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0171217;STB=0.509087;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.00200162;OID=.;OPOS=36587279;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:52:52:1:1:51:51:0.980769:27:24:0:1:27:24:0:1
chr22	36587486	.	A	G	739.73	PASS	AF=0.903226;AO=56;DP=61;FAO=56;FDP=62;FR=.;FRO=6;FSAF=18;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.00890572;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=42.0362;QD=47.7244;RBI=0.0273692;REFB=-0.0982803;REVB=0.0258797;RO=3;SAF=18;SAR=38;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0357817;STB=0.517374;STBP=0.475;TYPE=snp;VARB=0.0105916;OID=.;OPOS=36587486;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:26:61:62:3:6:56:56:0.903226:38:18:0:3:38:18:1:5
chr22	36587511	.	C	T	747.1	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0155986;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.024;QD=63.5829;RBI=0.0197393;REFB=0;REVB=-0.0120964;RO=0;SAF=13;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000232112;OID=.;OPOS=36587511;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:34:13:0:0:34:13:0:0
chr22	36587845	.	A	ACT,T	480.65	PASS	AF=0.891892,0.0540541;AO=33,2;DP=40;FAO=33,2;FDP=37;FR=.;FRO=2;FSAF=21,2;FSAR=12,0;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0105718,-0.0213445;FXX=0;HRUN=1,3;LEN=2,1;MLLD=229.221,67.4774;QD=51.962;RBI=0.0227474,0.0222529;REFB=-0.0203403,-0.0311079;REVB=0.0201415,0.00629286;RO=5;SAF=21,2;SAR=12,0;SRF=2;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0612547,0.64233;STB=0.508375,0.992443;STBP=0.775,0.312;TYPE=ins,snp;VARB=-0.000448857,0.17067;OID=.,.;OPOS=36587846,36587845;OREF=-,A;OALT=CT,T;OMAPALT=ACT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:40:37:5:2:33,2:33,2:0.891892,0.0540541:12,0:21,2:2:3:12,0:21,2:1:1
chr22	36587952	.	C	T	191.21	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0444709;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.7215;QD=47.802;RBI=0.0674481;REFB=0;REVB=-0.0507108;RO=0;SAF=8;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00408943;OID=.;OPOS=36587952;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:8:8:0:0:8:8:0:0
chr22	36591380	.	A	G	689.36	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0132667;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=256.806;QD=62.6693;RBI=0.0961284;REFB=0;REVB=0.0952086;RO=0;SAF=27;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.54734e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000213873;OID=.;OPOS=36591380;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:17:27:0:0:17:27:0:0
chr22	36598049	.	C	G	688.26	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0548658;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.0547;QD=62.5691;RBI=0.0570013;REFB=0;REVB=0.0154559;RO=0;SAF=21;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000983942;OID=.;OPOS=36598049;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:23:21:0:0:23:21:0:0
chr22	36598058	.	T	C	733.38	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0116362;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=108.683;QD=61.1152;RBI=0.0361323;REFB=0;REVB=-0.0342073;RO=0;SAF=21;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000660135;OID=.;OPOS=36598058;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:48:0:0:45:48:1:24:21:0:0:26:22:0:0
chr22	36623731	.	T	C	1325.49	PASS	AF=1;AO=85;DP=87;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0157942;FXX=0.034087;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.081;QD=62.3759;RBI=0.0364201;REFB=0;REVB=0.0328172;RO=0;SAF=40;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.79153e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.13161e-05;OID=.;OPOS=36623731;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:85:0:0:85:85:1:45:40:0:0:45:40:0:0
chr22	36650956	.	G	A	298.35	PASS	AF=0.65;AO=26;DP=40;FAO=26;FDP=40;FR=.;FRO=14;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=0.0852191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.7972;QD=29.8346;RBI=0.0983653;REFB=-0.0578003;REVB=-0.0491267;RO=14;SAF=15;SAR=11;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.227722;STB=0.624906;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.0397866;OID=.;OPOS=36650956;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:14:14:26:26:0.65:11:15:3:11:11:15:3:11
chr22	36661330	.	G	A	491.82	PASS	AF=0.777778;AO=41;DP=53;FAO=42;FDP=54;FR=.;FRO=12;FSAF=11;FSAR=31;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=-0.00093658;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.921;QD=36.4313;RBI=0.00527921;REFB=0.016976;REVB=-0.00519547;RO=12;SAF=11;SAR=30;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0761472;STB=0.542649;STBP=0.321;TYPE=snp;VARB=-0.00216599;OID=.;OPOS=36661330;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:81:53:54:12:12:41:42:0.777778:30:11:5:7:31:11:5:7
chr22	36661536	.	C	A	397.33	PASS	AF=0.882353;AO=30;DP=34;FAO=30;FDP=34;FR=.;FRO=4;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.00169904;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.5424;QD=46.7443;RBI=0.00661444;REFB=-0.0462081;REVB=-0.0063925;RO=4;SAF=9;SAR=21;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111069;STB=0.559959;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=0.00532912;OID=.;OPOS=36661536;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:19:34:34:4:4:30:30:0.882353:21:9:3:1:21:9:3:1
chr22	36661566	.	G	A	357.94	PASS	AF=0.848485;AO=27;DP=32;FAO=28;FDP=33;FR=.;FRO=5;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0110749;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=229.341;QD=43.3867;RBI=0.0144489;REFB=-0.0289101;REVB=-0.00927992;RO=5;SAF=10;SAR=17;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127971;STB=0.570085;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.00545449;OID=.;OPOS=36661566;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:26:32:33:5:5:27:28:0.848485:17:10:4:1:18:10:4:1
chr22	36661646	.	G	A	504.49	PASS	AF=0.807692;AO=42;DP=52;FAO=42;FDP=52;FR=.;FRO=10;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=0.0410641;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.2686;QD=38.8069;RBI=0.0473803;REFB=-0.0318848;REVB=0.0236354;RO=10;SAF=21;SAR=21;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0357722;STB=0.519222;STBP=0.593;TYPE=snp;VARB=0.00891179;OID=.;OPOS=36661646;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:52:52:10:10:42:42:0.807692:21:21:6:4:21:21:6:4
chr22	36661842	.	G	A	105.14	PASS	AF=0.846154;AO=11;DP=13;FAO=11;FDP=13;FR=.;FRO=2;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0261891;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=225.942;QD=32.352;RBI=0.0360956;REFB=-0.0336927;REVB=0.02484;RO=2;SAF=2;SAR=9;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13189;STB=0.574321;STBP=0.355;TYPE=snp;VARB=0.00680014;OID=.;OPOS=36661842;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:13:13:2:2:11:11:0.846154:9:2:1:1:9:2:1:1
chr22	36677400	.	G	A	631.43	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0164222;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.734;QD=61.6027;RBI=0.0333566;REFB=0;REVB=0.029034;RO=0;SAF=22;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.19993e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000195212;OID=.;OPOS=36677400;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:41:0:0:40:41:1:18:22:0:0:19:22:0:0
chr22	36678453	.	C	G	594.48	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0199855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.389;QD=60.9725;RBI=0.0200676;REFB=0;REVB=0.00181368;RO=0;SAF=22;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000122324;OID=.;OPOS=36678453;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:17:22:0:0:17:22:0:0
chr22	36678476	.	C	A	403.65	PASS	AF=1;AO=29;DP=31;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0410755;FXX=0.0624805;HRUN=3;LEN=1;MLLD=165.014;QD=53.8201;RBI=0.0524121;REFB=-0.147056;REVB=0.0325551;RO=1;SAF=14;SAR=15;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0300429;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00142201;OID=.;OPOS=36678476;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:31:30:1:0:29:30:1:15:14:0:1:16:14:0:0
chr22	36684354	.	T	C	223.94	PASS	AF=0.769231;AO=20;DP=26;FAO=20;FDP=26;FR=.;FRO=6;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.00186862;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.548;QD=34.452;RBI=0.00452556;REFB=-0.0620678;REVB=0.00412176;RO=6;SAF=8;SAR=12;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0294061;STB=0.516113;STBP=0.833;TYPE=snp;VARB=0.0138144;OID=.;OPOS=36684354;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:26:26:6:6:20:20:0.769231:12:8:2:4:12:8:2:4
chr22	36684358	.	C	A	208.6	PASS	AF=0.76;AO=19;DP=25;FAO=19;FDP=25;FR=.;FRO=6;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0626279;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.08;QD=33.3757;RBI=0.0845591;REFB=-0.0746925;REVB=0.0568153;RO=6;SAF=7;SAR=12;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0165312;STB=0.509081;STBP=0.912;TYPE=snp;VARB=0.0259788;OID=.;OPOS=36684358;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:25:25:6:6:19:19:0.76:12:7:2:4:12:7:2:4
chr22	36691607	.	A	C	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0245915;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.298;QD=51.1845;RBI=0.0266677;REFB=0;REVB=-0.0103163;RO=0;SAF=12;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000101761;OID=.;OPOS=36691607;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:8:12:0:0:8:12:0:0
chr22	36700175	.	A	G	98.96	PASS	AF=0.216216;AO=16;DP=74;FAO=16;FDP=74;FR=.;FRO=58;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=30;FSRR=28;FWDB=-0.000508334;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.284;QD=5.34932;RBI=0.00826967;REFB=0.00525412;REVB=-0.00825403;RO=58;SAF=7;SAR=9;SRF=30;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0991557;STB=0.562422;STBP=0.619;TYPE=snp;VARB=-0.0255637;OID=.;OPOS=36700175;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:74:74:58:58:16:16:0.216216:9:7:30:28:9:7:30:28
chr22	36892103	.	A	C	41.36	PASS	AF=0.166667;AO=7;DP=42;FAO=7;FDP=42;FR=.;FRO=35;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=-0.0343954;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=262.983;QD=3.93887;RBI=0.0349236;REFB=-0.000420279;REVB=0.00605135;RO=35;SAF=4;SAR=3;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.034789;STB=0.524069;STBP=0.965;TYPE=snp;VARB=0.00164244;OID=.;OPOS=36892103;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:42:42:35:35:7:7:0.166667:3:4:19:16:3:4:19:16
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chr22	37196971	.	C	A	288.18	PASS	AF=1;AO=15;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0144616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.455;QD=52.3958;RBI=0.129697;REFB=0;REVB=0.128888;RO=0;SAF=7;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00161058;OID=.;OPOS=37196971;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:15:22:1:8:7:0:0:15:7:0:0
chr22	37267767	.	A	G	200.16	PASS	AF=0.633333;AO=19;DP=31;FAO=19;FDP=30;FR=.;FRO=11;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.00844033;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.485;QD=26.6875;RBI=0.0217262;REFB=-0.00826999;REVB=-0.0200198;RO=11;SAF=11;SAR=8;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0828023;STB=0.54605;STBP=0.536;TYPE=snp;VARB=0.00673291;OID=.;OPOS=37267767;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:31:30:11:11:19:19:0.633333:8:11:5:6:8:11:5:6
chr22	37268257	.	C	T	485.28	PASS	AF=0.788462;AO=41;DP=52;FAO=41;FDP=52;FR=.;FRO=11;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=2;FSRR=9;FWDB=0.028121;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=247.775;QD=37.3289;RBI=0.0283795;REFB=-0.0190158;REVB=-0.00382165;RO=11;SAF=20;SAR=21;SRF=2;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120812;STB=0.564941;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=0.00508875;OID=.;OPOS=37268257;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:52:52:11:11:41:41:0.788462:21:20:2:9:21:20:2:9
chr22	37271882	.	T	C	157.99	PASS	AF=0.64;AO=16;DP=25;FAO=16;FDP=25;FR=.;FRO=9;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.0024362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.699;QD=25.2787;RBI=0.0235044;REFB=-0.0313293;REVB=0.0233778;RO=9;SAF=8;SAR=8;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0357466;STB=0.519975;STBP=0.805;TYPE=snp;VARB=0.0186167;OID=.;OPOS=37271882;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:25:25:9:9:16:16:0.64:8:8:4:5:8:8:4:5
chr22	37333794	.	A	G	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0376801;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.05;QD=45.8066;RBI=0.0381872;REFB=0;REVB=-0.00620214;RO=0;SAF=4;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.63386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000236154;OID=.;OPOS=37333794;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:10:4:0:0:10:4:0:0
chr22	37398195	.	C	T	727.77	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0180975;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.0122;QD=63.2839;RBI=0.0184566;REFB=0;REVB=-0.00362299;RO=0;SAF=16;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.31553e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000246166;OID=.;OPOS=37398195;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:30:16:0:0:30:16:0:0
chr22	37398201	.	C	A	785.87	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0122656;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.158;QD=64.1529;RBI=0.0137048;REFB=0;REVB=0.00611366;RO=0;SAF=17;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.70321e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.67124e-05;OID=.;OPOS=37398201;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:32:17:0:0:32:17:0:0
chr22	37409319	.	T	C	1029.96	PASS	AF=0.985915;AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=71;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0489945;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.8388;QD=58.0258;RBI=0.0758921;REFB=-0.059444;REVB=0.0579581;RO=1;SAF=36;SAR=34;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129528;STB=0.506847;STBP=0.539;TYPE=snp;VARB=0.001128;OID=.;OPOS=37409319;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:71:71:1:1:70:70:0.985915:34:36:1:0:34:36:1:0
chr22	37453452	.	C	T	479.58	PASS	AF=1;AO=33;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0648213;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.353;QD=56.421;RBI=0.0996552;REFB=-0.0222813;REVB=0.0756925;RO=0;SAF=17;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.60901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00138596;OID=.;OPOS=37453452;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:34:34:0:0:33:34:1:16:17:0:0:17:17:0:0
chr22	37462926	.	G	A	1324.11	PASS	AF=1;AO=85;DP=86;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.033889;FXX=0.0116266;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.067;QD=62.3109;RBI=0.0378987;REFB=0;REVB=0.016966;RO=0;SAF=48;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.85483e-05;OID=.;OPOS=37462926;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:85:0:0:85:85:1:37:48:0:0:37:48:0:0
chr22	37462936	.	A	G	1327.08	PASS	AF=1;AO=82;DP=82;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0325531;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.51;QD=62.451;RBI=0.0383413;REFB=0;REVB=0.0202571;RO=0;SAF=44;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.11453e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000432775;OID=.;OPOS=37462936;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:85:0:0:82:85:1:38:44:0:0:39:46:0:0
chr22	37469591	.	G	A	519.16	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0149313;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.869;QD=59.3322;RBI=0.0254006;REFB=0;REVB=0.0205487;RO=0;SAF=16;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.1382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000223233;OID=.;OPOS=37469591;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:19:16:0:0:19:16:0:0
chr22	37480797	.	C	G,T	695.8	PASS	AF=0.0444444,0.955556;AO=2,43;DP=45;FAO=2,43;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=1,22;FSAR=1,21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000548369,0.0328883;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=143.959,80.5881;QD=61.849;RBI=0.0113326,0.044918;REFB=0,0;REVB=-0.0113194,0.0305939;RO=0;SAF=1,22;SAR=1,21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0922256,-0.00446038;OID=.,.;OPOS=37480797,37480797;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:7:45:45:0:0:2,43:2,43:0.0444444,0.955556:1,21:1,22:0:0:1,21:1,22:0:0
chr22	37485724	.	T	C	1930.88	PASS	AF=1;AO=124;DP=127;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00525427;FXX=0.0157468;HRUN=2;LEN=1;MLLD=243.375;QD=61.7882;RBI=0.00846018;REFB=0;REVB=0.00663078;RO=0;SAF=58;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000206944;OID=.;OPOS=37485724;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:127:125:0:0:124:125:1:66:58:0:0:67:58:0:0
chr22	37538638	.	C	T	135.19	PASS	AF=0.25;AO=20;DP=80;FAO=20;FDP=80;FR=.;FRO=60;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=28;FSRR=32;FWDB=0.0106007;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.214;QD=6.75924;RBI=0.0160699;REFB=-0.00920717;REVB=-0.0120775;RO=60;SAF=8;SAR=12;SRF=28;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0833332;STB=0.550969;STBP=0.576;TYPE=snp;VARB=0.0339639;OID=.;OPOS=37538638;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:60:60:20:20:0.25:12:8:28:32:12:8:28:32
chr22	37578579	.	C	T	97.85	PASS	AF=0.210526;AO=16;DP=76;FAO=16;FDP=76;FR=.;FRO=60;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=23;FSRR=37;FWDB=0.00659657;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.9279;QD=5.14986;RBI=0.00662595;REFB=-0.000648929;REVB=0.000623311;RO=60;SAF=10;SAR=6;SRF=23;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.294738;STB=0.684494;STBP=0.107;TYPE=snp;VARB=0.00179397;OID=.;OPOS=37578579;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:76:76:60:60:16:16:0.210526:6:10:23:37:6:10:23:37
chr22	37578807	.	G	A	74.53	PASS	AF=0.20339;AO=12;DP=59;FAO=12;FDP=59;FR=.;FRO=47;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=20;FSRR=27;FWDB=-0.0176528;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.952;QD=5.05304;RBI=0.0216646;REFB=0.00297147;REVB=0.0125591;RO=47;SAF=6;SAR=6;SRF=20;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.092243;STB=0.559225;STBP=0.634;TYPE=snp;VARB=-0.00998103;OID=.;OPOS=37578807;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:59:59:47:47:12:12:0.20339:6:6:20:27:6:6:20:27
chr22	37581485	.	C	A	330.46	PASS	AF=0.961538;AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0224806;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=174.794;QD=50.8405;RBI=0.0309094;REFB=0.00218894;REVB=0.0212135;RO=1;SAF=10;SAR=15;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0299354;STB=0.516116;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.000136023;OID=.;OPOS=37581485;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:26:26:1:1:25:25:0.961538:15:10:0:1:15:10:0:1
chr22	37602583	.	G	GC	212.75	PASS	AF=1;AO=20;DP=23;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0793859;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=15.8294;QD=38.6821;RBI=0.099099;REFB=0;REVB=0.059317;RO=1;SAF=12;SAR=8;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0368683;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=9.63143e-05;OID=.;OPOS=37602584;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:20:23:22:22:0:14:8:0:0:4:1:12:8:1:0
chr22	37603021	.	G	A	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00990635;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.581;QD=46.848;RBI=0.0137811;REFB=0;REVB=0.00958041;RO=0;SAF=5;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000136893;OID=.;OPOS=37603021;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:10:5:0:0:10:5:0:0
chr22	37603051	.	C	T	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0986804;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.301;QD=45.8061;RBI=0.0990061;REFB=0;REVB=0.0080243;RO=0;SAF=6;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00279612;OID=.;OPOS=37603051;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:8:6:0:0:8:6:0:0
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chr22	37622815	.	A	G	104.27	PASS	AF=0.242424;AO=15;DP=65;FAO=16;FDP=66;FR=.;FRO=50;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=32;FSRR=18;FWDB=-0.00290328;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.518;QD=6.31954;RBI=0.0157586;REFB=-0.0113266;REVB=0.0154888;RO=50;SAF=5;SAR=10;SRF=32;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.365189;STB=0.737039;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.0329134;OID=.;OPOS=37622815;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:66:50:50:15:16:0.242424:10:5:32:18:11:5:32:18
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chr22	37770630	.	G	A	869.1	PASS	AF=0.72549;AO=74;DP=102;FAO=74;FDP=102;FR=.;FRO=28;FSAF=35;FSAR=39;FSRF=6;FSRR=22;FWDB=0.0903203;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.8938;QD=34.0823;RBI=0.0915003;REFB=-0.0714017;REVB=0.0146477;RO=27;SAF=35;SAR=39;SRF=5;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145347;STB=0.571754;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.027406;OID=.;OPOS=37770630;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:27:28:74:74:0.72549:39:35:5:22:39:35:6:22
chr22	37900276	.	A	G	129.47	PASS	AF=0.8125;AO=13;DP=16;FAO=13;FDP=16;FR=.;FRO=3;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0376714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.602;QD=32.3679;RBI=0.0413888;REFB=-0.0204684;REVB=-0.0171435;RO=3;SAF=4;SAR=9;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0100906;STB=0.505609;STBP=0.975;TYPE=snp;VARB=0.00592145;OID=.;OPOS=37900276;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:16:16:3:3:13:13:0.8125:9:4:1:2:9:4:1:2
chr22	37900762	.	G	A	365.04	PASS	AF=0.964286;AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0343745;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=210.024;QD=52.1481;RBI=0.0348541;REFB=-0.0382857;REVB=0.00576202;RO=1;SAF=13;SAR=14;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0320562;STB=0.517229;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.000616194;OID=.;OPOS=37900762;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:28:28:1:1:27:27:0.964286:14:13:0:1:14:13:0:1
chr22	37906262	.	C	T	215.51	PASS	AF=0.253968;AO=32;DP=126;FAO=32;FDP=126;FR=.;FRO=94;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=37;FSRR=57;FWDB=0.0336889;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.9171;QD=6.84152;RBI=0.0337713;REFB=0.00232785;REVB=0.00235706;RO=94;SAF=14;SAR=18;SRF=37;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0558095;STB=0.533516;STBP=0.693;TYPE=snp;VARB=-0.00707936;OID=.;OPOS=37906262;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:126:126:94:94:32:32:0.253968:18:14:37:57:18:14:37:57
chr22	37906308	.	GCTCCTT	G	838.91	PASS	AF=0.524691;AO=84;DP=142;FAO=85;FDP=162;FR=.;FRO=77;FSAF=34;FSAR=51;FSRF=48;FSRR=29;FWDB=-0.0533544;FXX=0.0635801;HRUN=1;LEN=6;MLLD=176.242;QD=20.7139;RBI=0.0535472;REFB=-0.0144607;REVB=-0.00453931;RO=29;SAF=33;SAR=51;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0949461;STB=0.605886;STBP=0.005;TYPE=del;VARB=0.0172945;OID=.;OPOS=37906309;OREF=CTCCTT;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.524691:84:142:85:162:77:34:51:48:29:99:29:33:51:17:12
chr22	37906417	.	G	A	237.22	PASS	AF=0.174603;AO=43;DP=250;FAO=44;FDP=252;FR=.;FRO=208;FSAF=15;FSAR=29;FSRF=101;FSRR=107;FWDB=0.00198058;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.677;QD=3.76545;RBI=0.00914717;REFB=-0.00287955;REVB=0.00893017;RO=207;SAF=14;SAR=29;SRF=100;SRR=107;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.208593;STB=0.622445;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=0.0106289;OID=.;OPOS=37906417;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:250:252:207:208:43:44:0.174603:29:14:100:107:29:15:101:107
chr22	37915100	.	A	G	81.48	PASS	AF=0.226415;AO=12;DP=52;FAO=12;FDP=53;FR=.;FRO=41;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=16;FSRR=25;FWDB=-0.0659981;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.1532;QD=6.14975;RBI=0.0672391;REFB=-0.00923734;REVB=0.0128586;RO=40;SAF=9;SAR=3;SRF=15;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.443644;STB=0.770205;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.050126;OID=.;OPOS=37915100;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:81:52:53:40:41:12:12:0.226415:3:9:15:25:3:9:16:25
chr22	38043444	.	C	A	232.17	PASS	AF=0.95;AO=12;DP=20;FAO=19;FDP=20;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0132162;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=279.083;QD=46.4336;RBI=0.0228714;REFB=-0.171146;REVB=0.0186663;RO=0;SAF=5;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.523785;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.000820684;OID=.;OPOS=38043444;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:20:20:0:1:12:19:0.95:7:5:0:0:10:9:0:1
chr22	38119213	.	G	A	575.79	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0461282;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.755;QD=60.6092;RBI=0.0518237;REFB=0;REVB=0.0236196;RO=0;SAF=20;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.51048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000149384;OID=.;OPOS=38119213;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:18:20:0:0:18:20:0:0
chr22	38119754	.	TCAA	T	209.08	PASS	AF=0.791667;AO=18;DP=24;FAO=19;FDP=24;FR=.;FRO=5;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.00777729;FXX=0.0768935;HRUN=1;LEN=3;MLLD=235.208;QD=34.8474;RBI=0.0175336;REFB=-0.0335439;REVB=-0.0157144;RO=5;SAF=10;SAR=8;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0178192;STB=0.5045;STBP=0.996;TYPE=del;VARB=0.00619956;OID=.;OPOS=38119755;OREF=CAA;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.791667:18:24:19:24:5:11:8:3:2:29:5:10:8:3:2
chr22	38121152	.	C	A	410.45	PASS	AF=0.8;AO=31;DP=40;FAO=32;FDP=40;FR=.;FRO=8;FSAF=23;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0470025;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.3383;QD=41.0447;RBI=0.0544915;REFB=-0.0248118;REVB=-0.0275698;RO=8;SAF=23;SAR=8;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112239;STB=0.551627;STBP=0.251;TYPE=snp;VARB=0.00408238;OID=.;OPOS=38121152;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:50:40:40:8:8:31:32:0.8:8:23:4:4:9:23:4:4
chr22	38122122	.	T	C	624.68	PASS	AF=0.716216;AO=53;DP=74;FAO=53;FDP=74;FR=.;FRO=21;FSAF=14;FSAR=39;FSRF=5;FSRR=16;FWDB=-0.0314774;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.5712;QD=33.7666;RBI=0.0393158;REFB=0.0102265;REVB=-0.0235565;RO=21;SAF=14;SAR=39;SRF=5;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0178047;STB=0.509593;STBP=0.782;TYPE=snp;VARB=-0.00728687;OID=.;OPOS=38122122;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:21:21:53:53:0.716216:39:14:5:16:39:14:5:16
chr22	38122448	.	C	T	129.64	PASS	AF=0.625;AO=12;DP=22;FAO=15;FDP=24;FR=.;FRO=9;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.154947;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.633;QD=21.6067;RBI=0.158821;REFB=-0.109576;REVB=0.0348634;RO=6;SAF=6;SAR=6;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0984044;STB=0.526281;STBP=0.737;TYPE=snp;VARB=0.0532546;OID=.;OPOS=38122448;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:22:24:6:9:12:15:0.625:6:6:4:2:6:9:6:3
chr22	38122462	.	A	G	125.12	PASS	AF=0.8125;AO=12;DP=16;FAO=13;FDP=16;FR=.;FRO=3;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0111974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.645;QD=31.2803;RBI=0.0397176;REFB=-0.0372787;REVB=-0.0381064;RO=3;SAF=8;SAR=4;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.243419;STB=0.636146;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.00208197;OID=.;OPOS=38122462;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:16:16:3:3:12:13:0.8125:4:8:0:3:4:9:0:3
chr22	38129332	.	G	A	1174.06	PASS	AF=0.711111;AO=96;DP=135;FAO=96;FDP=135;FR=.;FRO=39;FSAF=53;FSAR=43;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=-0.0390734;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.6244;QD=34.7868;RBI=0.10197;REFB=-0.0419027;REVB=0.0941867;RO=39;SAF=53;SAR=43;SRF=23;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0205635;STB=0.511022;STBP=0.7;TYPE=snp;VARB=0.0291711;OID=.;OPOS=38129332;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:135:135:39:39:96:96:0.711111:43:53:23:16:43:53:23:16
chr22	38130472	.	T	C	670.27	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00839714;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.481;QD=62.3507;RBI=0.0129489;REFB=0;REVB=-0.00985711;RO=0;SAF=28;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.63598e-05;OID=.;OPOS=38130472;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:15:28:0:0:15:28:0:0
chr22	38170026	.	G	A	88.21	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0234808;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.761;QD=39.2055;RBI=0.0834799;REFB=0;REVB=0.0801096;RO=0;SAF=5;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000567241;OID=.;OPOS=38170026;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:4:5:0:0:4:5:0:0
chr22	38202552	.	T	C	775.96	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0502979;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.1354;QD=63.3438;RBI=0.0506102;REFB=0;REVB=0.00561338;RO=0;SAF=22;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00017435;OID=.;OPOS=38202552;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:49:0:0:47:49:1:25:22:0:0:26:23:0:0
chr22	38202642	.	G	T	167.47	PASS	AF=0.9375;AO=15;DP=16;FAO=15;FDP=16;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0133913;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=182.898;QD=41.8678;RBI=0.0381949;REFB=-0.0253468;REVB=-0.0357704;RO=1;SAF=7;SAR=8;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0607183;STB=0.533289;STBP=0.559;TYPE=snp;VARB=5.45046e-05;OID=.;OPOS=38202642;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:16:16:1:1:15:15:0.9375:8:7:1:0:8:7:1:0
chr22	38202734	.	G	C	152.4	PASS	AF=0.933333;AO=14;DP=15;FAO=14;FDP=15;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00195871;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=293.503;QD=40.6389;RBI=0.0125004;REFB=0.0722182;REVB=-0.012346;RO=0;SAF=6;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.538406;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=-0.000721919;OID=.;OPOS=38202734;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:15:15:0:1:14:14:0.933333:8:6:0:0:8:6:1:0
chr22	38204089	.	C	T	1208.96	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0288995;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.318;QD=61.2132;RBI=0.0372055;REFB=0;REVB=0.0234323;RO=0;SAF=43;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.27805e-05;OID=.;OPOS=38204089;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:36:43:0:0:36:43:0:0
chr22	38341134	.	T	C	1139.01	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0392015;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.219;QD=59.9479;RBI=0.0408807;REFB=0;REVB=-0.0115961;RO=0;SAF=31;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.98661e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.87528e-05;OID=.;OPOS=38341134;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:76:0:0:73:76:1:42:31:0:0:42:34:0:0
chr22	38369976	.	A	G	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0401034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.641;QD=37.4885;RBI=0.040199;REFB=0;REVB=-0.00277011;RO=0;SAF=2;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.58669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000668252;OID=.;OPOS=38369976;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:6:2:0:0:6:2:0:0
chr22	38382243	.	C	A	1610.76	PASS	AF=0.755682;AO=129;DP=174;FAO=133;FDP=176;FR=.;FRO=43;FSAF=65;FSAR=68;FSRF=27;FSRR=16;FWDB=0.0074226;FXX=0.0056494;HRUN=3;LEN=1;MLLD=88.749;QD=36.6082;RBI=0.0377498;REFB=-0.0217937;REVB=0.0370128;RO=43;SAF=63;SAR=66;SRF=27;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0653325;STB=0.533966;STBP=0.109;TYPE=snp;VARB=0.00574679;OID=.;OPOS=38382243;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:174:176:43:43:129:133:0.755682:66:63:27:16:68:65:27:16
chr22	38474696	.	A	G	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.01387;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.453;QD=56.1915;RBI=0.0140867;REFB=0;REVB=0.00246156;RO=0;SAF=9;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.62669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000115568;OID=.;OPOS=38474696;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:19:9:0:0:19:9:0:0
chr22	38503847	.	C	T	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00342104;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.981;QD=33.4285;RBI=0.0408248;REFB=0;REVB=0.0406812;RO=0;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000420466;OID=.;OPOS=38503847;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:5:1:0:0:5:1:0:0
chr22	38506509	.	A	G	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0108179;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=295.457;QD=40.7629;RBI=0.0317206;REFB=0;REVB=0.0298189;RO=0;SAF=5;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000122838;OID=.;OPOS=38506509;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:5:5:0:0:5:5:0:0
chr22	38611045	.	C	A	221.98	PASS	AF=0.189944;AO=31;DP=180;FAO=34;FDP=179;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=142;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=75;FSRR=67;FWDB=-0.0513483;FXX=0.0164826;HRUN=6;LEN=1;MLLD=207.477;QD=4.96046;RBI=0.0536323;REFB=-0.0128383;REVB=-0.0154845;RO=93;SAF=19;SAR=12;SRF=44;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174093;STB=0.573727;STBP=0.355;TYPE=snp;VARB=0.0293045;OID=.;OPOS=38611045;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:180:179:93:142:31:34:0.189944:12:19:44:49:13:21:75:67
chr22	38611080	.	C	G	1329.8	PASS	AF=0.72549;AO=110;DP=153;FAO=111;FDP=153;FR=.;FRO=42;FSAF=48;FSAR=63;FSRF=19;FSRR=23;FWDB=-0.0196491;FXX=0.0316436;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.23;QD=34.766;RBI=0.0283265;REFB=-0.0391708;REVB=-0.0204035;RO=40;SAF=48;SAR=62;SRF=17;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0057654;STB=0.505569;STBP=0.839;TYPE=snp;VARB=0.00969809;OID=.;OPOS=38611080;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:153:153:40:42:110:111:0.72549:62:48:17:23:63:48:19:23
chr22	38615536	.	A	T	136.88	PASS	AF=0.833333;AO=6;DP=15;FAO=15;FDP=18;FR=.;FRO=3;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0248881;FXX=0;HRUN=12;LEN=1;MLLD=78.1459;QD=30.4171;RBI=0.109424;REFB=-0.150153;REVB=0.106556;RO=3;SAF=1;SAR=5;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146968;STB=0.533289;STBP=0.611;TYPE=snp;VARB=0.00240722;OID=.;OPOS=38615536;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:15:18:3:3:6:15:0.833333:5:1:1:2:7:8:1:2
chr22	38620907	.	G	T	53.23	PASS	AF=0.160714;AO=9;DP=56;FAO=9;FDP=56;FR=.;FRO=47;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=20;FSRR=27;FWDB=-0.00898292;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.1775;QD=3.80241;RBI=0.00995022;REFB=-0.0129218;REVB=-0.00427949;RO=47;SAF=6;SAR=3;SRF=20;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.290426;STB=0.697248;STBP=0.225;TYPE=snp;VARB=0.0401989;OID=.;OPOS=38620907;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:56:56:47:47:9:9:0.160714:3:6:20:27:3:6:20:27
chr22	38643800	.	C	T	60.27	PASS	AF=0.225;AO=9;DP=40;FAO=9;FDP=40;FR=.;FRO=31;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=23;FWDB=0.0175641;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.846;QD=6.02721;RBI=0.0646033;REFB=-0.00905785;REVB=-0.0621699;RO=31;SAF=5;SAR=4;SRF=8;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.356554;STB=0.721509;STBP=0.187;TYPE=snp;VARB=0.0224953;OID=.;OPOS=38643800;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:60:40:40:31:31:9:9:0.225:4:5:8:23:4:5:8:23
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chr22	39082227	.	TAAAAAAAC	TAAAAAA,TAAAAAAC	41.15	PASS	AF=0,0.378378;AO=4,9;DP=37;FAO=0,14;FDP=37;FR=.;FRO=23;FSAF=0,2;FSAR=0,12;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=0.0473241,0.154157;FXX=0;HRUN=7,7;LEN=2,1;MLLD=32.595,8.0417;QD=4.44879;RBI=0.0576339,0.154262;REFB=-0.0349914,-0.0447627;REVB=-0.0328952,0.00568384;RO=21;SAF=2,0;SAR=2,9;SRF=14;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.194534,-0.797464;STB=0.5,0.835559;STBP=1,0.004;TYPE=del,del;VARB=0.0799742,0.00535154;OID=.,.;OPOS=39082234,39082228;OREF=AC,A;OALT=-,-;OMAPALT=TAAAAAA,TAAAAAAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,0.378378:4,9:37:0,14:37:23:0,2:0,12:15:8:40:21:2,0:2,9:14:7
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chr22	39148537	.	T	C	937.59	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00237396;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.7314;QD=58.5994;RBI=0.0224277;REFB=0;REVB=0.0223017;RO=0;SAF=29;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000158105;OID=.;OPOS=39148537;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:35:29:0:0:35:29:0:0
chr22	39178701	.	A	G	613.36	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00635441;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.485;QD=61.3357;RBI=0.00847749;REFB=0;REVB=0.00561154;RO=0;SAF=19;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.0267e-06;OID=.;OPOS=39178701;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:21:19:0:0:21:19:0:0
chr22	39222652	.	G	A	1175.75	PASS	AF=1;AO=77;DP=78;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0209164;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.248;QD=61.0778;RBI=0.0283837;REFB=0;REVB=0.019187;RO=0;SAF=38;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5078e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000374882;OID=.;OPOS=39222652;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:77:0:0:77:77:1:39:38:0:0:39:38:0:0
chr22	39382079	.	C	A	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0323834;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=308.887;QD=35.5759;RBI=0.0326112;REFB=0;REVB=0.00384832;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000459835;OID=.;OPOS=39382079;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:3:4:0:0:3:4:0:0
chr22	39440149	.	C	T	62.69	PASS	AF=0.666667;AO=8;DP=12;FAO=8;FDP=12;FR=.;FRO=4;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0329378;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=63.4052;QD=20.8977;RBI=0.0468228;REFB=-0.00506608;REVB=0.0332787;RO=4;SAF=3;SAR=5;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.215906;STB=0.624687;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=0.00744901;OID=.;OPOS=39440149;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:12:12:4:4:8:8:0.666667:5:3:3:1:5:3:3:1
chr22	39441096	.	G	T	631.83	PASS	AF=0.692308;AO=54;DP=78;FAO=54;FDP=78;FR=.;FRO=24;FSAF=23;FSAR=31;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=0.0264486;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.058;QD=32.4014;RBI=0.03011;REFB=-0.0240141;REVB=0.0143903;RO=24;SAF=23;SAR=31;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113774;STB=0.561464;STBP=0.115;TYPE=snp;VARB=0.00778141;OID=.;OPOS=39441096;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:24:24:54:54:0.692308:31:23:15:9:31:23:15:9
chr22	39441203	.	C	T	525.13	PASS	AF=0.902439;AO=37;DP=42;FAO=37;FDP=41;FR=.;FRO=4;FSAF=12;FSAR=25;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0131526;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.134;QD=51.2318;RBI=0.0178635;REFB=0.0712111;REVB=-0.0120878;RO=4;SAF=12;SAR=25;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0854225;STB=0.545826;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=-0.00111021;OID=.;OPOS=39441203;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:19:42:41:4:4:37:37:0.902439:25:12:3:1:25:12:3:1
chr22	39445554	.	G	A	467.58	PASS	AF=0.734694;AO=36;DP=48;FAO=36;FDP=49;FR=.;FRO=13;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.0283326;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.773;QD=38.1694;RBI=0.0331223;REFB=-0.042076;REVB=-0.0171565;RO=12;SAF=16;SAR=20;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0130101;STB=0.504585;STBP=0.937;TYPE=snp;VARB=0.0131404;OID=.;OPOS=39445554;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:93:48:49:12:13:36:36:0.734694:20:16:5:7:20:16:6:7
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chr22	39497404	.	G	C	45.62	PASS	AF=0.134328;AO=9;DP=67;FAO=9;FDP=67;FR=.;FRO=58;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=22;FSRR=36;FWDB=-0.0376817;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=202.116;QD=2.72386;RBI=0.0465249;REFB=-0.00601042;REVB=-0.0272884;RO=58;SAF=4;SAR=5;SRF=22;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.08163;STB=0.557698;STBP=0.775;TYPE=snp;VARB=0.0378797;OID=.;OPOS=39497404;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:67:67:58:58:9:9:0.134328:5:4:22:36:5:4:22:36
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chr22	39712981	.	A	G	538.56	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000939714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=313.82;QD=59.8394;RBI=0.000956477;REFB=0;REVB=-0.000178284;RO=0;SAF=11;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.58193e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.7164e-07;OID=.;OPOS=39712981;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:25:11:0:0:25:11:0:0
chr22	39770597	.	A	G	191.27	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0619835;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.0524;QD=47.8163;RBI=0.0626503;REFB=0;REVB=-0.00911613;RO=0;SAF=11;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.36667e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00147164;OID=.;OPOS=39770597;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:5:11:0:0:5:11:0:0
chr22	39777822	.	C	CCAA	1072.72	PASS	AF=1;AO=67;DP=78;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0285802;FXX=0.0405351;HRUN=3;LEN=3;MLLD=283.311;QD=60.4347;RBI=0.0286032;REFB=0;REVB=-0.00114832;RO=6;SAF=26;SAR=41;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.071311;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=2.33471e-05;OID=.;OPOS=39777823;OREF=-;OALT=CAA;OMAPALT=CCAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:67:78:71:71:0:29:42:0:0:6:6:26:41:5:1
chr22	39781585	.	C	T	885.29	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186862;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.1064;QD=58.052;RBI=0.0238581;REFB=0;REVB=0.0148336;RO=0;SAF=23;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000278472;OID=.;OPOS=39781585;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:38:23:0:0:38:23:0:0
chr22	39883736	.	G	C	82.95	PASS	AF=0.25;AO=8;DP=38;FAO=10;FDP=40;FR=.,HEALED;FRO=26;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=0.0235346;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.369;QD=8.29514;RBI=0.0597602;REFB=-0.00239775;REVB=0.0549309;RO=21;SAF=6;SAR=2;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.280468;STB=0.6996;STBP=0.167;TYPE=snp;VARB=0.0161862;OID=.;OPOS=39883736;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:38:40:21:26:8:10:0.25:2:6:11:10:3:7:11:15
chr22	39887686	.	A	G	61.29	PASS	AF=0.25;AO=9;DP=36;FAO=9;FDP=36;FR=.;FRO=27;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=18;FWDB=-0.0180874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.863;QD=6.8102;RBI=0.0281356;REFB=-0.00821921;REVB=-0.0215513;RO=26;SAF=4;SAR=5;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119891;STB=0.585805;STBP=0.587;TYPE=snp;VARB=0.0199395;OID=.;OPOS=39887686;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:36:36:26:27:9:9:0.25:5:4:9:17:5:4:9:18
chr22	39913557	.	G	A	58.3	PASS	AF=0.134831;AO=12;DP=88;FAO=12;FDP=89;FR=.;FRO=77;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=47;FSRR=30;FWDB=0.00646562;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.8845;QD=2.62006;RBI=0.0157125;REFB=-0.00638284;REVB=-0.0143205;RO=76;SAF=9;SAR=3;SRF=47;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.184081;STB=0.638462;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=0.039093;OID=.;OPOS=39913557;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:58:88:89:76:77:12:12:0.134831:3:9:47:29:3:9:47:30
chr22	39966856	.	C	T	690.17	PASS	AF=1;AO=36;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=15;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0509287;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.1424;QD=62.7431;RBI=0.161654;REFB=0;REVB=0.153422;RO=0;SAF=11;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.58193e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00325457;OID=.;OPOS=39966856;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:36:44:1:25:11:0:0:29:15:0:0
chr22	40054948	.	T	C	414.94	PASS	AF=1;AO=29;DP=30;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0330232;FXX=0.0333222;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.06;QD=57.2327;RBI=0.0531571;REFB=0;REVB=0.0416551;RO=0;SAF=12;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.0947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.66665e-05;OID=.;OPOS=40054948;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:29:0:0:29:29:1:17:12:0:0:17:12:0:0
chr22	40057273	.	T	C	1143.39	PASS	AF=1;AO=74;DP=77;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0326933;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.097;QD=60.1782;RBI=0.0570878;REFB=0;REVB=0.0467992;RO=0;SAF=42;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000270834;OID=.;OPOS=40057273;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:76:0:0:74:76:1:32:42:0:0:33:43:0:0
chr22	40417780	.	C	T	539.31	PASS	AF=0.657534;AO=48;DP=73;FAO=48;FDP=73;FR=.;FRO=25;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=0.0171071;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.392;QD=29.5513;RBI=0.021397;REFB=-0.032244;REVB=-0.0128521;RO=25;SAF=20;SAR=28;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116384;STB=0.563192;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.012685;OID=.;OPOS=40417780;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:25:25:48:48:0.657534:28:20:15:10:28:20:15:10
chr22	40417820	.	A	G	269.43	PASS	AF=0.648649;AO=23;DP=36;FAO=24;FDP=37;FR=.;FRO=13;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=3;FWDB=0.00884485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.068;QD=29.1275;RBI=0.0158572;REFB=-0.0485389;REVB=0.0131612;RO=12;SAF=11;SAR=12;SRF=10;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.219767;STB=0.60793;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.0109407;OID=.;OPOS=40417820;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:37:12:13:23:24:0.648649:12:11:10:2:13:11:10:3
chr22	40574170	.	T	A	228.61	PASS	AF=0.909091;AO=11;DP=22;FAO=20;FDP=22;FR=.;FRO=2;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.158684;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=40.4935;QD=41.5649;RBI=0.160613;REFB=-0.0935689;REVB=-0.0248184;RO=0;SAF=2;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.538424;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.00658133;OID=.;OPOS=40574170;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:22:22:0:2:11:20:0.909091:9:2:0:0:12:8:0:2
chr22	40673999	.	C	T	1060.98	PASS	AF=1;AO=66;DP=67;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0248879;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.9597;QD=58.1357;RBI=0.0463366;REFB=-0.0398183;REVB=0.0390855;RO=1;SAF=32;SAR=34;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0136944;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0017293;OID=.;OPOS=40673999;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:73:1:0:66:73:1:34:32:0:1:39:34:0:0
chr22	40711481	.	T	G,TG	32.25	PASS	AF=0.0178571,0.196429;AO=7,8;DP=55;FAO=1,11;FDP=56;FR=.;FRO=44;FSAF=0,1;FSAR=1,10;FSRF=19;FSRR=25;FWDB=-0.0211363,0.186249;FXX=0;HRUN=1,5;LEN=1,1;MLLD=193.918,10.8683;QD=2.30389;RBI=0.0214943,0.189562;REFB=-0.00305252,-0.0938021;REVB=0.00390676,0.0352882;RO=37;SAF=0,0;SAR=7,8;SRF=18;SRR=19;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.679504,-0.701274;STB=0.98869,0.850304;STBP=0.484,0.03;TYPE=snp,ins;VARB=-0.0479256,0.149786;OID=.,.;OPOS=40711481,40711482;OREF=T,-;OALT=G,G;OMAPALT=G,TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:30:55:56:37:44:7,8:1,11:0.0178571,0.196429:7,8:0,0:18:19:1,10:0,1:19:25
chr22	40720704	.	A	G	1847.69	PASS	AF=0.983871;AO=122;DP=124;FAO=122;FDP=124;FR=.;FRO=2;FSAF=59;FSAR=63;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0358584;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.3935;QD=59.6028;RBI=0.0371722;REFB=0.0106771;REVB=-0.00979527;RO=2;SAF=59;SAR=63;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0158294;STB=0.508332;STBP=0.182;TYPE=snp;VARB=-0.0029846;OID=.;OPOS=40720704;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:124:124:2:2:122:122:0.983871:63:59:2:0:63:59:2:0
chr22	40722745	.	A	G	729.01	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0110817;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=215.686;QD=57.177;RBI=0.017555;REFB=0;REVB=0.0136152;RO=0;SAF=25;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94283e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.24199e-05;OID=.;OPOS=40722745;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:26:25:0:0:26:25:0:0
chr22	40731481	.	CAAAAAA	AAAAAAA,CAAAAA,CAAAA,C	65.84	PASS	AF=0.470588,0.117647,0.235294,0.176471;AO=2,4,2,2;DP=20;FAO=8,2,4,3;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0,1,2;FSAR=8,2,3,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0285756,-0.467489,-0.305643,-0.0949964;FXX=0.149925;HRUN=1,16,16,16;LEN=1,1,2,6;MLLD=65.4014,2.54609,5.03518,10.4481;QD=15.4918;RBI=0.140961,1.14612,0.636444,0.213295;REFB=0.074716,0.00128506,0.0011363,0.00226917;REVB=-0.138035,1.04644,0.55825,0.190972;RO=5;SAF=0,0,0,2;SAR=2,4,2,0;SRF=0;SRR=5;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=0,0,0,0.78221;STB=0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1,1;TYPE=snp,del,del,del;VARB=1.10293,-0.0614139,0.0990035,0.228646;OID=.,.,.,.;OPOS=40731481,40731482,40731482,40731482;OREF=C,A,AA,AAAAAA;OALT=A,-,-,-;OMAPALT=AAAAAAA,CAAAAA,CAAAA,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/4:23:20:17:5:0:2,4,2,2:8,2,4,3:0.470588,0.117647,0.235294,0.176471:2,4,2,0:0,0,0,2:0:5:8,2,3,1:0,0,1,2:0:0
chr22	40803186	.	G	T	34.58	PASS	AF=0.193548;AO=6;DP=31;FAO=6;FDP=31;FR=.;FRO=25;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=-0.0670193;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.2004;QD=4.46152;RBI=0.077932;REFB=-0.000843636;REVB=0.039772;RO=25;SAF=2;SAR=4;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.350987;STB=0.733972;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=0.000349551;OID=.;OPOS=40803186;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:31:31:25:25:6:6:0.193548:4:2:16:9:4:2:16:9
chr22	40814500	.	T	C	52.36	PASS	AF=0.25;AO=8;DP=32;FAO=8;FDP=32;FR=.;FRO=24;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=-0.0224214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.7267;QD=6.54534;RBI=0.0303362;REFB=-0.00143589;REVB=0.0204345;RO=23;SAF=1;SAR=7;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.406071;STB=0.76009;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.00287804;OID=.;OPOS=40814500;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:32:32:23:24:8:8:0.25:7:1:9:14:7:1:9:15
chr22	41075543	.	A	G	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0662289;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.92;QD=37.4884;RBI=0.180616;REFB=0;REVB=0.168036;RO=0;SAF=7;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.78849e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00439039;OID=.;OPOS=41075543;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:1:7:0:0:1:7:0:0
chr22	41075695	.	C	T	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0444771;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.609;QD=44.6896;RBI=0.0447411;REFB=0;REVB=0.004853;RO=0;SAF=8;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000398633;OID=.;OPOS=41075695;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:5:8:0:0:5:8:0:0
chr22	41253239	.	C	T	238.46	PASS	AF=0.733333;AO=20;DP=29;FAO=22;FDP=30;FR=.;FRO=8;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=0.0327368;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.7132;QD=31.7941;RBI=0.0349856;REFB=-0.0222845;REVB=0.0123407;RO=7;SAF=11;SAR=9;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149199;STB=0.580576;STBP=0.173;TYPE=snp;VARB=0.0116512;OID=.;OPOS=41253239;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:29:30:7:8:20:22:0.733333:9:11:6:1:9:13:7:1
chr22	41303623	.	C	A	462.1	PASS	AF=0.795455;AO=35;DP=44;FAO=35;FDP=44;FR=.;FRO=9;FSAF=12;FSAR=23;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=-0.00279319;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=264.578;QD=42.009;RBI=0.0102909;REFB=-0.0337524;REVB=0.00990458;RO=9;SAF=12;SAR=23;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00400941;STB=0.502163;STBP=0.953;TYPE=snp;VARB=0.0067156;OID=.;OPOS=41303623;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:59:44:44:9:9:35:35:0.795455:23:12:3:6:23:12:3:6
chr22	41551039	.	T	A	919.43	PASS	AF=0.929577;AO=66;DP=71;FAO=66;FDP=71;FR=.;FRO=5;FSAF=23;FSAR=43;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0207459;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=165.161;QD=51.799;RBI=0.0241282;REFB=-0.103922;REVB=-0.0123199;RO=5;SAF=23;SAR=43;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0922832;STB=0.549004;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.00136847;OID=.;OPOS=41551039;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:18:71:71:5:5:66:66:0.929577:43:23:5:0:43:23:5:0
chr22	41604399	.	G	A	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0487263;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.8401;QD=42.1809;RBI=0.0491979;REFB=0;REVB=0.00679628;RO=0;SAF=3;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00240736;OID=.;OPOS=41604399;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:8:3:0:0:8:3:0:0
chr22	41617318	.	G	C	865.66	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0228165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.233;QD=57.7105;RBI=0.0245928;REFB=0;REVB=-0.0091768;RO=0;SAF=33;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.00382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.60629e-05;OID=.;OPOS=41617318;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:60:0:0:59:60:1:26:33:0:0:27:33:0:0
chr22	41645757	.	C	G	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0180371;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.64;QD=50.4132;RBI=0.0198103;REFB=0;REVB=0.00819218;RO=0;SAF=8;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.41338e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000348014;OID=.;OPOS=41645757;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:11:8:0:0:11:8:0:0
chr22	41829794	.	C	G	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0205087;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=365.068;QD=55.0987;RBI=0.0212292;REFB=0;REVB=0.00548352;RO=0;SAF=12;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.1569e-05;OID=.;OPOS=41829794;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:14:12:0:0:14:12:0:0
chr22	41833116	.	C	T	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0408994;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.342;QD=50.4133;RBI=0.043457;REFB=0;REVB=0.0146884;RO=0;SAF=11;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.41338e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000463737;OID=.;OPOS=41833116;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:8:11:0:0:8:11:0:0
chr22	41903813	.	A	C	967.72	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00261861;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=307.716;QD=58.6496;RBI=0.0274535;REFB=0;REVB=0.0273284;RO=0;SAF=30;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000109512;OID=.;OPOS=41903813;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:66:0:0:63:66:1:33:30:0:0:36:30:0:0
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chr22	42423110	.	G	C	289.28	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00592826;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.968;QD=52.5963;RBI=0.0665938;REFB=0;REVB=-0.0663294;RO=0;SAF=7;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.79751e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000735068;OID=.;OPOS=42423110;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:15:7:0:0:15:7:0:0
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chr22	42522613	.	G	C	53.35	PASS	AF=0.275862;AO=8;DP=29;FAO=8;FDP=29;FR=.;FRO=21;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=-0.0427182;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=198.35;QD=7.35844;RBI=0.0430689;REFB=-0.00458206;REVB=-0.00548458;RO=21;SAF=4;SAR=4;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137469;STB=0.585998;STBP=0.563;TYPE=snp;VARB=0.0120481;OID=.;OPOS=42522613;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:29:29:21:21:8:8:0.275862:4:4:13:8:4:4:13:8
chr22	42523636	.	C	A	84.14	PASS	AF=0.174419;AO=15;DP=85;FAO=15;FDP=86;FR=.;FRO=71;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=42;FSRR=29;FWDB=0.0105037;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.9594;QD=3.91353;RBI=0.011314;REFB=0.00127369;REVB=-0.00420464;RO=70;SAF=3;SAR=12;SRF=42;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.489564;STB=0.814073;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=-0.00437297;OID=.;OPOS=42523636;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:85:86:70:71:15:15:0.174419:12:3:42:28:12:3:42:29
chr22	42523943	.	A	G	670.27	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0305535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.033;QD=62.3507;RBI=0.0335007;REFB=0;REVB=-0.0137399;RO=0;SAF=19;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000104353;OID=.;OPOS=42523943;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:24:19:0:0:24:19:0:0
chr22	42525756	.	G	A	466.16	PASS	AF=0.769231;AO=39;DP=51;FAO=40;FDP=52;FR=.;FRO=12;FSAF=12;FSAR=28;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.0217941;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.538;QD=35.8586;RBI=0.0421755;REFB=-0.0299554;REVB=0.036108;RO=12;SAF=12;SAR=27;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132812;STB=0.573238;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.0111058;OID=.;OPOS=42525756;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:51:52:12:12:39:40:0.769231:27:12:7:5:28:12:7:5
chr22	42526694	.	G	A	886.79	PASS	AF=0.802326;AO=68;DP=86;FAO=69;FDP=86;FR=.;FRO=17;FSAF=31;FSAR=38;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=0.0620629;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=266.516;QD=41.246;RBI=0.0657076;REFB=-0.0217969;REVB=0.0215797;RO=16;SAF=30;SAR=38;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0468393;STB=0.519311;STBP=0.451;TYPE=snp;VARB=0.00379531;OID=.;OPOS=42526694;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:16:17:68:69:0.802326:38:30:5:11:38:31:6:11
chr22	42536313	.	G	A	300.21	PASS	AF=0.78125;AO=25;DP=32;FAO=25;FDP=32;FR=.;FRO=7;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.00221933;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.071;QD=37.5266;RBI=0.0390809;REFB=-0.0104422;REVB=0.0390178;RO=7;SAF=8;SAR=17;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169314;STB=0.592417;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=0.00333344;OID=.;OPOS=42536313;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:32:32:7:7:25:25:0.78125:17:8:5:2:17:8:5:2
chr22	42537196	.	T	C	66.54	PASS	AF=1;AO=7;DP=8;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.011152;FXX=0.124844;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.206;QD=38.0233;RBI=0.0262287;REFB=0;REVB=0.0237398;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000179005;OID=.;OPOS=42537196;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:7:0:0:7:7:1:3:4:0:0:3:4:0:0
chr22	42537252	.	G	A	88.1	PASS	AF=0.44;AO=11;DP=25;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.0614201;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.316;QD=14.0966;RBI=0.0702609;REFB=-0.00198171;REVB=0.0341199;RO=14;SAF=4;SAR=7;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200253;STB=0.617431;STBP=0.33;TYPE=snp;VARB=0.00206995;OID=.;OPOS=42537252;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:25:25:14:14:11:11:0.44:7:4:8:6:7:4:8:6
chr22	42537271	.	T	C	125.85	PASS	AF=0.518519;AO=14;DP=27;FAO=14;FDP=27;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.0247772;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.387;QD=18.6449;RBI=0.0264455;REFB=-0.00681486;REVB=0.00924416;RO=13;SAF=8;SAR=6;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156693;STB=0.589347;STBP=0.367;TYPE=snp;VARB=0.00970761;OID=.;OPOS=42537271;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:13:13:14:14:0.518519:6:8:5:8:6:8:5:8
chr22	42537404	.	G	C	483.34	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0181679;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.623;QD=58.5868;RBI=0.0408378;REFB=0;REVB=-0.036574;RO=0;SAF=11;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000137978;OID=.;OPOS=42537404;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:22:11:0:0:22:11:0:0
chr22	42537597	.	A	G	88.97	PASS	AF=0.24;AO=11;DP=50;FAO=12;FDP=50;FR=.;FRO=38;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=0.00769312;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.582;QD=7.11738;RBI=0.0129754;REFB=0.001573;REVB=-0.0104488;RO=38;SAF=5;SAR=6;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0553836;STB=0.563652;STBP=0.622;TYPE=snp;VARB=-0.00598388;OID=.;OPOS=42537597;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:50:50:38:38:11:12:0.24:6:5:19:19:7:5:19:19
chr22	42538029	.	A	G	757.81	PASS	AF=1;AO=40;DP=49;FAO=48;FDP=48;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=29;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00913788;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.165;QD=63.1505;RBI=0.0204664;REFB=0;REVB=-0.0183132;RO=0;SAF=23;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.4817e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000690264;OID=.;OPOS=42538029;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:48:0:0:40:48:1:17:23:0:0:19:29:0:0
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chr22	42538514	.	T	TC	260.0	PASS	AF=1;AO=20;DP=29;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.271422;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=16.6183;QD=37.1427;RBI=0.294835;REFB=0;REVB=-0.115143;RO=7;SAF=8;SAR=12;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14916;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00969767;OID=.;OPOS=42538515;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:20:29:28:28:0:13:15:0:0:5:7:8:12:5:2
chr22	42538670	.	G	T	302.66	PASS	AF=0.884615;AO=20;DP=26;FAO=23;FDP=26;FR=.,HEALED;FRO=2;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0246514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.755;QD=46.5635;RBI=0.0325812;REFB=-0.0585808;REVB=-0.0213037;RO=2;SAF=11;SAR=9;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00843034;STB=0.501741;STBP=0.877;TYPE=snp;VARB=0.0152297;OID=.;OPOS=42538670;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:26:26:2:2:20:23:0.884615:9:11:1:1:12:11:1:1
chr22	42538876	.	A	T	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0374414;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.776;QD=37.4885;RBI=0.0486514;REFB=0;REVB=-0.031066;RO=0;SAF=6;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.58669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00272179;OID=.;OPOS=42538876;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:2:6:0:0:2:6:0:0
chr22	42609148	.	T	C	123.14	PASS	AF=0.923077;AO=12;DP=13;FAO=12;FDP=13;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0507749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.802;QD=37.8908;RBI=0.054729;REFB=0.021785;REVB=-0.0204248;RO=1;SAF=9;SAR=3;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0475628;STB=0.526273;STBP=0.66;TYPE=snp;VARB=-0.00783457;OID=.;OPOS=42609148;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:13:13:1:1:12:12:0.923077:3:9:1:0:3:9:1:0
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chr22	43193641	.	G	A	74.86	PASS	AF=0.314286;AO=10;DP=34;FAO=11;FDP=35;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=-0.00678087;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.255;QD=8.5552;RBI=0.00904131;REFB=-0.00567891;REVB=0.0059804;RO=24;SAF=6;SAR=4;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0682721;STB=0.502613;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0120212;OID=.;OPOS=43193641;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:34:35:24:24:10:11:0.314286:4:6:13:11:5:6:13:11
chr22	43435812	.	C	T	167.54	PASS	AF=0.9375;AO=15;DP=16;FAO=15;FDP=16;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0162299;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=170.686;QD=41.8849;RBI=0.0281008;REFB=-0.196009;REVB=0.0229401;RO=0;SAF=5;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.545392;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=0.00403695;OID=.;OPOS=43435812;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:16:16:0:1:15:15:0.9375:10:5:0:0:10:5:1:0
chr22	43455432	.	G	A	1320.87	PASS	AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0141831;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.5;QD=62.1588;RBI=0.0257314;REFB=0;REVB=-0.0214696;RO=0;SAF=43;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.6846e-05;OID=.;OPOS=43455432;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:42:43:0:0:42:43:0:0
chr22	43466217	.	A	G	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00962799;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.921;QD=49.5992;RBI=0.0106003;REFB=0;REVB=0.00443476;RO=0;SAF=7;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.81509e-05;OID=.;OPOS=43466217;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:11:7:0:0:11:7:0:0
chr22	43466247	.	G	C	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0526659;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.224;QD=40.7628;RBI=0.0605029;REFB=0;REVB=0.0297809;RO=0;SAF=2;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00124643;OID=.;OPOS=43466247;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:8:2:0:0:8:2:0:0
chr22	43529314	.	G	C	761.75	PASS	AF=0.792208;AO=55;DP=71;FAO=61;FDP=77;FR=.;FRO=16;FSAF=41;FSAR=20;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.0184655;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.05;QD=39.5713;RBI=0.0264653;REFB=-0.0123327;REVB=0.0189589;RO=16;SAF=36;SAR=19;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0421015;STB=0.525383;STBP=0.393;TYPE=snp;VARB=0.00316863;OID=.;OPOS=43529314;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:71:77:16:16:55:61:0.792208:19:36:9:7:20:41:9:7
chr22	43558926	.	A	G	723.54	PASS	AF=1;AO=50;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00426546;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.9124;QD=56.7479;RBI=0.0238656;REFB=0;REVB=-0.0234813;RO=0;SAF=19;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000252239;OID=.;OPOS=43558926;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:50:51:1:31:19:0:0:31:20:0:0
chr22	43563672	.	A	G	160.11	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0260167;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.2156;QD=45.7462;RBI=0.0260216;REFB=0;REVB=0.000506285;RO=0;SAF=7;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00116363;OID=.;OPOS=43563672;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:7:7:0:0:7:7:0:0
chr22	43606143	.	C	G,T	1125.81	PASS	AF=0.0657895,0.934211;AO=5,71;DP=76;FAO=5,71;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=2,31;FSAR=3,40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000569745,0.0219886;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=185.044,57.091;QD=59.2533;RBI=0.00633255,0.0459364;REFB=0,0;REVB=-0.00630687,0.0403317;RO=0;SAF=2,31;SAR=3,40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,4.18246e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.167431,0.00293753;OID=.,.;OPOS=43606143,43606143;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:17:76:76:0:0:5,71:5,71:0.0657895,0.934211:3,40:2,31:0:0:3,40:2,31:0:0
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chr22	44112845	.	C	T	1283.36	PASS	AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0776403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.7228;QD=61.8489;RBI=0.0784902;REFB=0;REVB=-0.0115195;RO=0;SAF=41;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000370298;OID=.;OPOS=44112845;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:42:41:0:0:42:41:0:0
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chr22	44285765	.	A	G	98.42	PASS	AF=0.254902;AO=13;DP=51;FAO=13;FDP=51;FR=.;FRO=38;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=24;FWDB=0.00235626;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.979;QD=7.7191;RBI=0.00861662;REFB=0.0025889;REVB=-0.00828819;RO=38;SAF=6;SAR=7;SRF=14;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114494;STB=0.570447;STBP=0.552;TYPE=snp;VARB=-0.00587748;OID=.;OPOS=44285765;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:51:51:38:38:13:13:0.254902:7:6:14:24:7:6:14:24
chr22	44324727	.	C	G	861.23	PASS	AF=0.983607;AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.014368;FXX=0.031741;HRUN=4;LEN=1;MLLD=245.643;QD=56.4742;RBI=0.015228;REFB=0.0520831;REVB=-0.00504496;RO=1;SAF=37;SAR=23;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0125858;STB=0.506664;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=3.86539e-05;OID=.;OPOS=44324727;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:61:61:1:1:60:60:0.983607:23:37:1:0:23:37:1:0
chr22	44324730	.	C	T	874.52	PASS	AF=1;AO=60;DP=61;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00472518;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=51.6915;QD=56.4207;RBI=0.0129434;REFB=-0.121493;REVB=0.0120501;RO=1;SAF=37;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.020075;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00587523;OID=.;OPOS=44324730;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:61:62:1:0:60:62:1:23:37:0:1:24:38:0:0
chr22	44342116	.	A	G	429.02	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0355115;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=270.518;QD=57.2026;RBI=0.0396626;REFB=0;REVB=0.017665;RO=0;SAF=14;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.56309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.18515e-05;OID=.;OPOS=44342116;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:16:14:0:0:16:14:0:0
chr22	44368122	.	A	G	773.55	PASS	AF=0.982143;AO=55;DP=57;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0282552;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.377;QD=55.2534;RBI=0.034227;REFB=-0.121922;REVB=0.0193165;RO=1;SAF=26;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0177852;STB=0.509431;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=-0.000427448;OID=.;OPOS=44368122;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:57:56:1:1:55:55:0.982143:29:26:1:0:29:26:1:0
chr22	44368204	.	A	G	1200.02	PASS	AF=0.97561;AO=80;DP=82;FAO=80;FDP=82;FR=.;FRO=2;FSAF=38;FSAR=42;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0860565;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.1667;QD=58.5376;RBI=0.0867118;REFB=0.0410412;REVB=-0.0106399;RO=2;SAF=38;SAR=42;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0242644;STB=0.512817;STBP=0.131;TYPE=snp;VARB=-0.00217062;OID=.;OPOS=44368204;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:82:82:2:2:80:80:0.97561:42:38:2:0:42:38:2:0
chr22	44372632	.	C	T	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103068;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.82;QD=56.1914;RBI=0.0125913;REFB=0;REVB=0.00723264;RO=0;SAF=19;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.62669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.68573e-05;OID=.;OPOS=44372632;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:9:19:0:0:9:19:0:0
chr22	44379822	.	T	C	917.69	PASS	AF=0.956522;AO=64;DP=69;FAO=66;FDP=69;FR=.;FRO=3;FSAF=41;FSAR=25;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.00233902;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.983;QD=53.1992;RBI=0.040642;REFB=0.0233547;REVB=0.0405747;RO=1;SAF=41;SAR=23;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0113822;STB=0.517642;STBP=0.207;TYPE=snp;VARB=-0.00251767;OID=.;OPOS=44379822;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:69:69:1:3:64:66:0.956522:23:41:1:0:25:41:3:0
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chr22	45126775	.	T	C	77.1	PASS	AF=0.170732;AO=13;DP=82;FAO=14;FDP=82;FR=.;FRO=68;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=30;FSRR=38;FWDB=-0.0405035;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.518;QD=3.76112;RBI=0.0492656;REFB=-0.0075551;REVB=0.0280458;RO=68;SAF=3;SAR=10;SRF=30;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.286324;STB=0.63889;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=0.0468505;OID=.;OPOS=45126775;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:82:82:68:68:13:14:0.170732:10:3:30:38:10:4:30:38
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chr22	45244930	.	C	T	54.76	PASS	AF=0.219512;AO=8;DP=41;FAO=9;FDP=41;FR=.;FRO=32;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=0.0993888;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.1176;QD=5.34251;RBI=0.100781;REFB=-0.0156369;REVB=-0.0166964;RO=32;SAF=3;SAR=5;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.224253;STB=0.677029;STBP=0.264;TYPE=snp;VARB=0.0824411;OID=.;OPOS=45244930;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:41:41:32:32:8:9:0.219512:5:3:18:14:6:3:18:14
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chr22	45566843	.	A	G	493.36	PASS	AF=0.787234;AO=37;DP=47;FAO=37;FDP=47;FR=.;FRO=10;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=-0.000280292;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.808;QD=41.9883;RBI=0.00604084;REFB=0.010789;REVB=0.00603434;RO=10;SAF=19;SAR=18;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00533122;STB=0.502875;STBP=0.923;TYPE=snp;VARB=-0.00236936;OID=.;OPOS=45566843;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:68:47:47:10:10:37:37:0.787234:18:19:5:5:18:19:5:5
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chr22	45683304	.	G	C	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00186712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=315.102;QD=51.1846;RBI=0.00190385;REFB=0;REVB=0.000372149;RO=0;SAF=11;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.59457e-06;OID=.;OPOS=45683304;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:9:11:0:0:9:11:0:0
chr22	45685002	.	A	G	429.02	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108506;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=334.171;QD=57.2026;RBI=0.0158769;REFB=0;REVB=0.0115906;RO=0;SAF=10;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.65323e-05;OID=.;OPOS=45685002;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:20:10:0:0:20:10:0:0
chr22	45691594	.	A	G	501.47	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0468082;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.1208;QD=58.9964;RBI=0.0482068;REFB=0;REVB=0.0115276;RO=0;SAF=15;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.40663e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000693237;OID=.;OPOS=45691594;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:19:15:0:0:19:15:0:0
chr22	45718041	.	A	G	98.51	PASS	AF=0.150376;AO=20;DP=133;FAO=20;FDP=133;FR=.;FRO=113;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=66;FSRR=47;FWDB=0.0134877;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.589;QD=2.96271;RBI=0.0191249;REFB=0.00108443;REVB=0.0135588;RO=113;SAF=10;SAR=10;SRF=66;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106926;STB=0.571359;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=-0.00544729;OID=.;OPOS=45718041;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:133:133:113:113:20:20:0.150376:10:10:66:47:10:10:66:47
chr22	45723807	.	G	C	130.45	PASS	AF=0.267606;AO=19;DP=71;FAO=19;FDP=71;FR=.;FRO=52;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=33;FSRR=19;FWDB=0.0147425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.7784;QD=7.34932;RBI=0.0529637;REFB=-0.00839717;REVB=-0.0508705;RO=52;SAF=8;SAR=11;SRF=33;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.253991;STB=0.652524;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=0.017276;OID=.;OPOS=45723807;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:52:52:19:19:0.267606:11:8:33:19:11:8:33:19
chr22	45723842	.	G	A	50.74	PASS	AF=0.152542;AO=9;DP=59;FAO=9;FDP=59;FR=.;FRO=50;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=31;FSRR=19;FWDB=-0.0205946;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=269.801;QD=3.43985;RBI=0.0283138;REFB=0.00516194;REVB=0.0194303;RO=50;SAF=2;SAR=7;SRF=31;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.465759;STB=0.815605;STBP=0.065;TYPE=snp;VARB=-0.0311492;OID=.;OPOS=45723842;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:50:59:59:50:50:9:9:0.152542:7:2:31:19:7:2:31:19
chr22	45728370	.	G	A	78.48	PASS	AF=0.177215;AO=14;DP=79;FAO=14;FDP=79;FR=.;FRO=65;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=32;FSRR=33;FWDB=0.00856214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.202;QD=3.97389;RBI=0.0184552;REFB=0.00168949;REVB=0.0163488;RO=65;SAF=4;SAR=10;SRF=32;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.266898;STB=0.676432;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=-0.0071396;OID=.;OPOS=45728370;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:79:79:65:65:14:14:0.177215:10:4:32:33:10:4:32:33
chr22	45767369	.	A	G	683.25	PASS	AF=0.896552;AO=52;DP=58;FAO=52;FDP=58;FR=.;FRO=6;FSAF=37;FSAR=15;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0104258;FXX=0.0333278;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.3837;QD=47.1208;RBI=0.0226801;REFB=-0.0440002;REVB=0.0201417;RO=6;SAF=37;SAR=15;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0105531;STB=0.505625;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=0.00502812;OID=.;OPOS=45767369;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:58:58:6:6:52:52:0.896552:15:37:4:2:15:37:4:2
chr22	45767455	.	A	G	695.7	PASS	AF=0.978261;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0457148;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.199;QD=60.4956;RBI=0.0457502;REFB=-0.0292303;REVB=0.00180002;RO=0;SAF=29;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.49331e-08;STB=0.508471;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.000531574;OID=.;OPOS=45767455;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:46:46:0:1:45:45:0.978261:16:29:0:0:16:29:1:0
chr22	45782903	.	T	C	157.72	PASS	AF=0.234694;AO=22;DP=97;FAO=23;FDP=98;FR=.;FRO=75;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=37;FSRR=38;FWDB=-0.0101465;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.716;QD=6.43761;RBI=0.0233849;REFB=-0.00123037;REVB=-0.021069;RO=75;SAF=9;SAR=13;SRF=37;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106146;STB=0.579067;STBP=0.398;TYPE=snp;VARB=0.00312697;OID=.;OPOS=45782903;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:98:75:75:22:23:0.234694:13:9:37:38:14:9:37:38
chr22	45789642	.	A	C	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00237891;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=129.631;QD=52.6125;RBI=0.0797321;REFB=0;REVB=0.0796966;RO=0;SAF=15;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.79751e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000811978;OID=.;OPOS=45789642;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:7:15:0:0:7:15:0:0
chr22	45821887	.	G	A	364.97	PASS	AF=0.964286;AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00502229;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.868;QD=52.1385;RBI=0.00741345;REFB=-0.083862;REVB=-0.00545305;RO=1;SAF=8;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0238509;STB=0.512811;STBP=0.624;TYPE=snp;VARB=0.00211742;OID=.;OPOS=45821887;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:28:28:1:1:27:27:0.964286:19:8:0:1:19:8:0:1
chr22	45821956	.	C	G	505.47	PASS	AF=1;AO=20;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=11;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0509716;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.182;QD=59.4675;RBI=0.105209;REFB=0;REVB=0.0920368;RO=0;SAF=11;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00095559;OID=.;OPOS=45821956;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:20:34:1:9:11:0:0:23:11:0:0
chr22	45826880	.	G	A	628.48	PASS	AF=0.954545;AO=42;DP=44;FAO=42;FDP=44;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0324542;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.31;QD=57.1349;RBI=0.0326492;REFB=-0.0425447;REVB=0.00356371;RO=2;SAF=27;SAR=15;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0132029;STB=0.507039;STBP=0.758;TYPE=snp;VARB=0.000588189;OID=.;OPOS=45826880;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:44:44:2:2:42:42:0.954545:15:27:1:1:15:27:1:1
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chr22	45923827	.	A	G	1639.91	PASS	AF=1;AO=108;DP=108;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103278;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.375;QD=60.1802;RBI=0.0106722;REFB=0;REVB=0.00268937;RO=0;SAF=64;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.72235e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.47256e-05;OID=.;OPOS=45923827;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:108:109:0:0:108:109:1:44:64:0:0:45:64:0:0
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chr22	46677607	.	T	C	710.96	PASS	AF=0.962963;AO=52;DP=54;FAO=52;FDP=54;FR=.;FRO=2;FSAF=16;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0395251;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.6016;QD=52.6633;RBI=0.0458171;REFB=0.0135127;REVB=0.0231727;RO=2;SAF=16;SAR=36;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0156274;STB=0.508302;STBP=0.567;TYPE=snp;VARB=-0.00304259;OID=.;OPOS=46677607;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:54:54:2:2:52:52:0.962963:36:16:1:1:36:16:1:1
chr22	46722400	.	T	C	483.34	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00575583;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.059;QD=58.5871;RBI=0.00633106;REFB=0;REVB=0.00263681;RO=0;SAF=19;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.71297e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.144e-05;OID=.;OPOS=46722400;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:14:19:0:0:14:19:0:0
chr22	46725316	.	C	G	507.31	PASS	AF=0.77551;AO=38;DP=49;FAO=38;FDP=49;FR=.;FRO=11;FSAF=11;FSAR=27;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.0313898;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=179.971;QD=41.4132;RBI=0.0345158;REFB=0.0045603;REVB=0.0143535;RO=11;SAF=11;SAR=27;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0802163;STB=0.543373;STBP=0.291;TYPE=snp;VARB=-0.00138026;OID=.;OPOS=46725316;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:49:49:11:11:38:38:0.77551:27:11:5:6:27:11:5:6
chr22	46766127	.	G	A	75.85	PASS	AF=0.191176;AO=13;DP=68;FAO=13;FDP=68;FR=.;FRO=55;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=35;FWDB=-0.0135921;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.221;QD=4.46171;RBI=0.025059;REFB=-0.00166462;REVB=0.0210525;RO=55;SAF=2;SAR=11;SRF=20;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.333364;STB=0.724151;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=0.0120568;OID=.;OPOS=46766127;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:68:68:55:55:13:13:0.191176:11:2:20:35:11:2:20:35
chr22	46858809	.	G	A	441.37	PASS	AF=0.729167;AO=32;DP=45;FAO=35;FDP=48;FR=.;FRO=13;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=10;FSRR=3;FWDB=0.00655654;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.637;QD=36.7808;RBI=0.0213479;REFB=-0.0220213;REVB=-0.0203161;RO=13;SAF=13;SAR=19;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191901;STB=0.591664;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.0180933;OID=.;OPOS=46858809;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:48:13:13:32:35:0.729167:19:13:10:3:20:15:10:3
chr22	46929692	.	A	G	1080.49	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00320761;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.901;QD=60.0271;RBI=0.00422045;REFB=0;REVB=0.00274288;RO=0;SAF=29;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.16073e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.55149e-06;OID=.;OPOS=46929692;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:43:29:0:0:43:29:0:0
chr22	46931077	.	G	C	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00105996;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.354;QD=55.0987;RBI=0.00619651;REFB=0;REVB=0.00610518;RO=0;SAF=15;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.07628e-05;OID=.;OPOS=46931077;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:11:15:0:0:11:15:0:0
chr22	46931793	.	G	C	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0119636;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=236.919;QD=51.9167;RBI=0.0127557;REFB=0;REVB=0.00442478;RO=0;SAF=10;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.34503e-05;OID=.;OPOS=46931793;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:11:10:0:0:11:10:0:0
chr22	46931838	.	G	A	340.74	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00259037;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.114;QD=54.5176;RBI=0.0115556;REFB=0;REVB=-0.0112616;RO=0;SAF=17;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000210651;OID=.;OPOS=46931838;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:8:17:0:0:8:17:0:0
chr22	47058992	.	T	C	2902.41	PASS	AF=0.989418;AO=174;DP=189;FAO=187;FDP=189;FR=.,HEALED;FRO=2;FSAF=88;FSAR=99;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.02671;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=65.0678;QD=61.4267;RBI=0.0296942;REFB=-0.0892461;REVB=0.012974;RO=2;SAF=85;SAR=89;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000248739;STB=0.505617;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.000636063;OID=.;OPOS=47058992;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:189:189:2:2:174:187:0.989418:89:85:1:1:99:88:2:0
chr22	47075462	.	C	T	39.24	PASS	AF=0.121212;AO=8;DP=66;FAO=8;FDP=66;FR=.;FRO=58;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=32;FSRR=26;FWDB=-0.0140331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.738;QD=2.37792;RBI=0.0609123;REFB=-9.08001e-05;REVB=-0.0592738;RO=58;SAF=2;SAR=6;SRF=32;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.355848;STB=0.760552;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=-0.00376328;OID=.;OPOS=47075462;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:39:66:66:58:58:8:8:0.121212:6:2:32:26:6:2:32:26
chr22	47085924	.	G	A	653.16	PASS	AF=0.760563;AO=54;DP=71;FAO=54;FDP=71;FR=.;FRO=17;FSAF=32;FSAR=22;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=0.00517529;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.941;QD=36.7976;RBI=0.027325;REFB=-0.0248289;REVB=0.0268304;RO=17;SAF=32;SAR=22;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0528733;STB=0.528374;STBP=0.419;TYPE=snp;VARB=0.00951941;OID=.;OPOS=47085924;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:17:17:54:54:0.760563:22:32:12:5:22:32:12:5
chr22	47311404	.	A	T	83.35	PASS	AF=0.170455;AO=15;DP=88;FAO=15;FDP=88;FR=.;FRO=73;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=40;FSRR=33;FWDB=-0.00378645;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.595;QD=3.78864;RBI=0.00714986;REFB=-0.0127987;REVB=-0.00606492;RO=73;SAF=9;SAR=6;SRF=40;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0667529;STB=0.544127;STBP=0.719;TYPE=snp;VARB=0.0673871;OID=.;OPOS=47311404;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:88:88:73:73:15:15:0.170455:6:9:40:33:6:9:40:33
chr22	47569571	.	G	C	223.19	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0866481;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.355;QD=49.5981;RBI=0.0869807;REFB=0;REVB=0.00759877;RO=0;SAF=4;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00119251;OID=.;OPOS=47569571;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:14:4:0:0:14:4:0:0
chr22	47569605	.	G	C	62.25	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.140646;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.7486;QD=35.5726;RBI=0.196655;REFB=0;REVB=0.137448;RO=0;SAF=1;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0245629;OID=.;OPOS=47569605;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:6:1:0:0:6:1:0:0
chr22	48023241	.	G	T	920.11	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.018481;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=265.612;QD=58.4197;RBI=0.0184874;REFB=0;REVB=0.00048757;RO=0;SAF=27;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.31521e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.63806e-05;OID=.;OPOS=48023241;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:36:27:0:0:36:27:0:0
chr22	48940553	.	T	C	40.39	PASS	AF=0.142857;AO=7;DP=49;FAO=7;FDP=49;FR=.;FRO=42;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=25;FSRR=17;FWDB=-0.00253677;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.45;QD=3.29747;RBI=0.00550092;REFB=-0.00681848;REVB=-0.00488107;RO=42;SAF=4;SAR=3;SRF=25;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0293387;STB=0.520899;STBP=0.92;TYPE=snp;VARB=0.0306817;OID=.;OPOS=48940553;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:40:49:49:42:42:7:7:0.142857:3:4:25:17:3:4:25:17
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chr22	49145928	.	C	A	855.5	PASS	AF=0.804878;AO=66;DP=82;FAO=66;FDP=82;FR=.;FRO=16;FSAF=22;FSAR=44;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=0.0359397;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.562;QD=41.7316;RBI=0.0432768;REFB=-0.0348051;REVB=0.0241085;RO=15;SAF=22;SAR=44;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124068;STB=0.57389;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.00900844;OID=.;OPOS=49145928;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:82:82:15:16:66:66:0.804878:44:22:10:5:44:22:11:5
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chr22	50018045	.	G	A	108.27	PASS	AF=0.785714;AO=11;DP=14;FAO=11;FDP=14;FR=.;FRO=3;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0649207;FXX=0.0666222;HRUN=4;LEN=1;MLLD=111.002;QD=30.9342;RBI=0.0847333;REFB=-0.0974066;REVB=0.0544521;RO=2;SAF=6;SAR=5;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128043;STB=0.526268;STBP=0.804;TYPE=snp;VARB=0.00389814;OID=.;OPOS=50018045;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:14:14:2:3:11:11:0.785714:5:6:2:0:5:6:2:1
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chr22	50018497	.	G	A	1809.83	PASS	AF=0.991667;AO=115;DP=116;FAO=119;FDP=120;FR=.;FRO=1;FSAF=52;FSAR=67;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0642499;FXX=0.00826378;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.94;QD=60.3276;RBI=0.0682462;REFB=-0.0733577;REVB=0.0230106;RO=0;SAF=51;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504761;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=0.00016711;OID=.;OPOS=50018497;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:116:120:0:1:115:119:0.991667:64:51:0:0:67:52:1:0
chr22	50216754	.	G	A	50.65	PASS	AF=0.134146;AO=11;DP=82;FAO=11;FDP=82;FR=.;FRO=71;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=26;FSRR=45;FWDB=-0.054593;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.3465;QD=2.47089;RBI=0.0568432;REFB=-0.00120698;REVB=0.0158352;RO=71;SAF=9;SAR=2;SRF=26;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.522974;STB=0.85743;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.0170283;OID=.;OPOS=50216754;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:50:82:82:71:71:11:11:0.134146:2:9:26:45:2:9:26:45
chr22	50277835	.	T	C	88.21	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0441937;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.179;QD=39.2041;RBI=0.0572143;REFB=0;REVB=0.0363373;RO=0;SAF=4;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00223346;OID=.;OPOS=50277835;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:5:4:0:0:5:4:0:0
chr22	50277883	.	A	G	239.35	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0751223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.205;QD=50.3896;RBI=0.0751362;REFB=0;REVB=0.00144865;RO=0;SAF=10;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000782983;OID=.;OPOS=50277883;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:9:10:0:0:9:10:0:0
chr22	50278438	.	A	G	670.27	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00640905;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.958;QD=62.3509;RBI=0.00890252;REFB=0;REVB=0.00617892;RO=0;SAF=28;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.32874e-05;OID=.;OPOS=50278438;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:15:28:0:0:15:28:0:0
chr22	50297246	.	C	T	70.77	PASS	AF=0.25641;AO=10;DP=39;FAO=10;FDP=39;FR=.;FRO=29;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=0.00999124;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=131.682;QD=7.25828;RBI=0.0123284;REFB=-0.00330561;REVB=0.00722244;RO=29;SAF=2;SAR=8;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.334408;STB=0.713815;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=0.0132655;OID=.;OPOS=50297246;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:70:39:39:29:29:10:10:0.25641:8:2:13:16:8:2:13:16
chr22	50297435	.	T	C	289.32	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00379413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.9084;QD=52.6033;RBI=0.132134;REFB=0;REVB=0.13208;RO=0;SAF=17;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.58081e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00284285;OID=.;OPOS=50297435;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:5:17:0:0:5:17:0:0
chr22	50301476	.	T	C	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00231875;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.229;QD=53.2772;RBI=0.028411;REFB=0;REVB=0.0283163;RO=0;SAF=6;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.9951e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.138e-05;OID=.;OPOS=50301476;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:17:6:0:0:17:6:0:0
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chr22	50480108	.	C	T	475.55	PASS	AF=0.784314;AO=40;DP=51;FAO=40;FDP=51;FR=.;FRO=11;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=0.0358943;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.335;QD=37.2984;RBI=0.0928116;REFB=0.0323164;REVB=0.0855897;RO=11;SAF=18;SAR=22;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110765;STB=0.559657;STBP=0.115;TYPE=snp;VARB=-0.00741426;OID=.;OPOS=50480108;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:51:51:11:11:40:40:0.784314:22:18:8:3:22:18:8:3
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chr22	50599466	.	C	A	66.45	PASS	AF=0.186441;AO=11;DP=59;FAO=11;FDP=59;FR=.;FRO=48;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=17;FSRR=31;FWDB=-0.0180158;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=293.148;QD=4.50532;RBI=0.0224933;REFB=-0.00367356;REVB=-0.0134678;RO=47;SAF=7;SAR=4;SRF=17;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.329673;STB=0.71811;STBP=0.128;TYPE=snp;VARB=0.0186585;OID=.;OPOS=50599466;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:59:59:47:48:11:11:0.186441:4:7:17:30:4:7:17:31
chr22	50618738	.	G	A	47.68	PASS	AF=0.4375;AO=7;DP=16;FAO=7;FDP=16;FR=.;FRO=9;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.00824191;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=229.527;QD=11.9197;RBI=0.0151035;REFB=-0.00963265;REVB=0.0126565;RO=9;SAF=1;SAR=6;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.371799;STB=0.730929;STBP=0.192;TYPE=snp;VARB=0.014134;OID=.;OPOS=50618738;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:16:16:9:9:7:7:0.4375:6:1:4:5:6:1:4:5
chr22	50637597	.	G	C	740.41	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.030322;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.5;QD=56.9547;RBI=0.03061;REFB=0;REVB=-0.00418963;RO=0;SAF=31;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.13361e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.37142e-05;OID=.;OPOS=50637597;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:52:0:0:51:52:1:20:31:0:0:21:31:0:0
chr22	50646936	.	G	C	613.31	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0339648;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.6416;QD=61.331;RBI=0.0461041;REFB=0;REVB=0.0311766;RO=0;SAF=17;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.4817e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00107207;OID=.;OPOS=50646936;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:23:17:0:0:23:17:0:0
chr22	50657010	.	C	G	725.35	PASS	AF=1;AO=51;DP=53;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.162525;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.0101;QD=53.7298;RBI=0.165962;REFB=-0.0231539;REVB=0.033604;RO=1;SAF=31;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0149495;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00258954;OID=.;OPOS=50657010;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:53:54:1:0:51:54:1:20:31:1:0:20:34:0:0
chr22	50658698	.	T	A	184.53	PASS	AF=0.809524;AO=17;DP=21;FAO=17;FDP=21;FR=.;FRO=4;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0123753;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.3319;QD=35.1476;RBI=0.0235092;REFB=0.0564198;REVB=0.0199884;RO=4;SAF=7;SAR=10;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0585141;STB=0.532126;STBP=0.555;TYPE=snp;VARB=-0.0104832;OID=.;OPOS=50658698;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:20:21:21:4:4:17:17:0.809524:10:7:1:3:10:7:1:3
chr22	50664612	.	A	G	1066.09	PASS	AF=0.986301;AO=72;DP=73;FAO=72;FDP=73;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0342686;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.4358;QD=58.4157;RBI=0.0401748;REFB=0.138926;REVB=0.0209684;RO=1;SAF=22;SAR=50;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00936655;STB=0.504949;STBP=0.597;TYPE=snp;VARB=-0.00346439;OID=.;OPOS=50664612;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:73:73:1:1:72:72:0.986301:50:22:0:1:50:22:0:1
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chr22	50693521	.	C	T	41.77	PASS	AF=0.75;AO=5;DP=7;FAO=6;FDP=8;FR=.;FRO=2;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0457336;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=33.4687;QD=20.8843;RBI=0.0457336;REFB=-0.118318;REVB=0;RO=2;SAF=5;SAR=0;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0869056;OID=.;OPOS=50693521;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:7:8:2:2:5:6:0.75:0:5:2:0:0:6:2:0
chr22	50693534	.	A	G	62.2	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0204189;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.5244;QD=35.5431;RBI=0.142906;REFB=0;REVB=0.14144;RO=0;SAF=6;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00307076;OID=.;OPOS=50693534;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:1:6:0:0:1:6:0:0
chr22	50693538	.	G	A	57.08	PASS	AF=0.875;AO=7;DP=8;FAO=7;FDP=8;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0240144;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.064;QD=28.5418;RBI=0.0976835;REFB=-0.0863723;REVB=0.0946856;RO=1;SAF=6;SAR=1;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0674964;STB=0.538356;STBP=0.653;TYPE=snp;VARB=0.0149464;OID=.;OPOS=50693538;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:8:8:1:1:7:7:0.875:1:6:1:0:1:6:1:0
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chr22	50694297	.	A	G	340.71	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0196031;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.176;QD=54.5134;RBI=0.01969;REFB=0;REVB=-0.00184794;RO=0;SAF=14;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.5961e-05;OID=.;OPOS=50694297;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:11:14:0:0:11:14:0:0
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chr22	50704661	.	T	C	448.75	PASS	AF=0.729167;AO=35;DP=48;FAO=35;FDP=48;FR=.;FRO=13;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=0.00846366;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.586;QD=37.3957;RBI=0.0143151;REFB=-0.0553315;REVB=-0.0115451;RO=13;SAF=21;SAR=14;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109256;STB=0.559288;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.0162978;OID=.;OPOS=50704661;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:13:13:35:35:0.729167:14:21:5:8:14:21:5:8
chr22	50705059	.	A	G	631.92	PASS	AF=0.877193;AO=45;DP=52;FAO=50;FDP=57;FR=.;FRO=7;FSAF=21;FSAR=29;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0740536;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.076;QD=44.3453;RBI=0.0766771;REFB=-0.0446032;REVB=-0.0198857;RO=7;SAF=17;SAR=28;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0510812;STB=0.518962;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=0.00235278;OID=.;OPOS=50705059;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:52:57:7:7:45:50:0.877193:28:17:4:3:29:21:4:3
chr22	50705466	.	A	G	349.36	PASS	AF=1;AO=21;DP=26;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0357849;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=128.174;QD=49.9082;RBI=0.0472389;REFB=0;REVB=0.0308375;RO=0;SAF=7;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00444673;OID=.;OPOS=50705466;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:28:0:0:21:28:1:14:7:0:0:19:9:0:0
chr22	50713866	.	G	C	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0473865;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.996;QD=51.1844;RBI=0.0484479;REFB=0;REVB=-0.0100857;RO=0;SAF=15;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000402618;OID=.;OPOS=50713866;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:5:15:0:0:5:15:0:0
chr22	50716167	.	G	A	124.81	PASS	AF=0.3;AO=16;DP=50;FAO=15;FDP=50;FR=.;FRO=35;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=0.0125474;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.917;QD=9.98478;RBI=0.0136001;REFB=-0.0109599;REVB=0.00524638;RO=34;SAF=11;SAR=5;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.222878;STB=0.68336;STBP=0.101;TYPE=snp;VARB=0.0163178;OID=.;OPOS=50716167;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:34:35:16:15:0.3:5:11:17:17:4:11:17:18
chr22	50719251	.	A	G	80.01	PASS	AF=0.25;AO=11;DP=44;FAO=11;FDP=44;FR=.;FRO=33;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=12;FWDB=-0.0107539;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.004;QD=7.27376;RBI=0.0237819;REFB=-0.0036097;REVB=-0.0212117;RO=33;SAF=2;SAR=9;SRF=21;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.531685;STB=0.830741;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.0171986;OID=.;OPOS=50719251;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:80:44:44:33:33:11:11:0.25:9:2:21:12:9:2:21:12
chr22	50720622	.	C	T	213.05	PASS	AF=0.205714;AO=35;DP=175;FAO=36;FDP=175;FR=.;FRO=139;FSAF=8;FSAR=28;FSRF=77;FSRR=62;FWDB=0.00185182;FXX=0.0056815;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.516;QD=4.86976;RBI=0.0521678;REFB=-0.00653767;REVB=0.0521349;RO=140;SAF=8;SAR=27;SRF=77;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.41645;STB=0.767591;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0291809;OID=.;OPOS=50720622;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:175:175:140:139:35:36:0.205714:27:8:77:63:28:8:77:62
chr22	50721492	.	C	T	284.63	PASS	AF=0.657895;AO=25;DP=38;FAO=25;FDP=38;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=19;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.0306;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.044;QD=29.9615;RBI=0.0333966;REFB=0.0139448;REVB=-0.0133781;RO=13;SAF=6;SAR=19;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.220436;STB=0.622061;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=-0.0116577;OID=.;OPOS=50721492;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:13:13:25:25:0.657895:19:6:7:6:19:6:7:6
chr22	50728062	.	T	C	545.23	PASS	AF=0.973684;AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0181353;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.817;QD=57.3926;RBI=0.0206609;REFB=0.0415766;REVB=0.00989863;RO=1;SAF=21;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0217802;STB=0.511622;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=-0.00395098;OID=.;OPOS=50728062;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:38:38:1:1:37:37:0.973684:16:21:1:0:16:21:1:0
chr22	50750835	.	G	A	272.45	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0141996;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.6102;QD=51.8957;RBI=0.0404763;REFB=0;REVB=0.0379038;RO=0;SAF=12;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000823218;OID=.;OPOS=50750835;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:9:12:0:0:9:12:0:0
chr22	50754512	.	C	T	428.95	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0764178;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.507;QD=57.1927;RBI=0.094249;REFB=0;REVB=0.0551651;RO=0;SAF=17;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.63861e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000889834;OID=.;OPOS=50754512;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:13:17:0:0:13:17:0:0
chr22	50754648	.	T	C	393.28	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00919258;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.686;QD=56.1833;RBI=0.0239765;REFB=0;REVB=0.0221443;RO=0;SAF=15;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.97044e-05;OID=.;OPOS=50754648;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:13:15:0:0:13:15:0:0
chr22	50757470	.	T	C	371.39	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.111786;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.416;QD=55.0203;RBI=0.112044;REFB=0;REVB=0.0075992;RO=0;SAF=9;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00507915;OID=.;OPOS=50757470;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:27:0:0:25:27:1:16:9:0:0:16:11:0:0
chr22	50809687	.	T	C	313.32	PASS	AF=0.96;AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=25;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0180212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.7805;QD=50.1312;RBI=0.0627604;REFB=-0.0640402;REVB=0.0601174;RO=1;SAF=18;SAR=6;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0250636;STB=0.513502;STBP=0.632;TYPE=snp;VARB=0.00616727;OID=.;OPOS=50809687;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:25:25:1:1:24:24:0.96:6:18:1:0:6:18:1:0
chr22	50877166	.	G	C	362.56	PASS	AF=0.928571;AO=22;DP=29;FAO=26;FDP=28;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=20;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0450259;FXX=0.0666445;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.739;QD=51.7939;RBI=0.0488195;REFB=-0.0586549;REVB=0.0188684;RO=1;SAF=18;SAR=4;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10217;STB=0.538431;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=0.00163946;OID=.;OPOS=50877166;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:29:28:1:1:22:26:0.928571:4:18:0:1:6:20:0:1
chr22	50878134	.	C	T	459.32	PASS	AF=0.777778;AO=35;DP=45;FAO=35;FDP=45;FR=.;FRO=10;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.0387556;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.485;QD=40.8282;RBI=0.0433596;REFB=-0.0137357;REVB=0.0194436;RO=9;SAF=20;SAR=15;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0370631;STB=0.529395;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.00362761;OID=.;OPOS=50878134;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:45:45:9:10:35:35:0.777778:15:20:6:3:15:20:7:3
chr22	50885775	.	A	G	385.97	PASS	AF=0.90625;AO=27;DP=30;FAO=29;FDP=32;FR=.;FRO=3;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0160011;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.951;QD=48.2468;RBI=0.0353011;REFB=-0.116796;REVB=0.0314664;RO=3;SAF=11;SAR=16;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0142566;STB=0.504584;STBP=0.958;TYPE=snp;VARB=0.0118364;OID=.;OPOS=50885775;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:30:32:3:3:27:29:0.90625:16:11:1:2:18:11:1:2
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chr22	50922682	.	G	A	441.77	PASS	AF=0.735849;AO=39;DP=53;FAO=39;FDP=53;FR=.;FRO=14;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.0478393;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.653;QD=33.3408;RBI=0.0521748;REFB=-0.0165682;REVB=0.0208234;RO=13;SAF=15;SAR=24;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0372075;STB=0.512189;STBP=0.798;TYPE=snp;VARB=0.00862474;OID=.;OPOS=50922682;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:13:14:39:39:0.735849:24:15:6:7:24:15:6:8
chr22	50923042	.	C	G	88.17	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0609452;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.4473;QD=39.1848;RBI=0.0626773;REFB=0;REVB=0.0146329;RO=0;SAF=2;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00505417;OID=.;OPOS=50923042;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:7:2:0:0:7:2:0:0
chr22	50923217	.	T	C	330.36	PASS	AF=0.961538;AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.000392715;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.3;QD=50.8244;RBI=0.0181513;REFB=-0.109136;REVB=-0.018147;RO=1;SAF=8;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.054487;STB=0.529388;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=0.00319427;OID=.;OPOS=50923217;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:26:26:1:1:25:25:0.961538:17:8:1:0:17:8:1:0
chr22	50928026	.	G	A	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0701372;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.916;QD=40.7629;RBI=0.0908098;REFB=0;REVB=0.0576819;RO=0;SAF=4;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00526003;OID=.;OPOS=50928026;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:6:4:0:0:6:4:0:0
chr22	50941985	.	T	C	203.66	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0339737;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.9906;QD=47.9208;RBI=0.0343139;REFB=0;REVB=0.00482025;RO=0;SAF=6;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00120776;OID=.;OPOS=50941985;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:17:0:0:16:17:1:10:6:0:0:11:6:0:0
chr22	50944163	.	G	A	458.16	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0197451;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.44;QD=57.2694;RBI=0.0197757;REFB=0;REVB=-0.00109893;RO=0;SAF=14;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.56309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00113803;OID=.;OPOS=50944163;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:32:0:0:30:32:1:16:14:0:0:16:16:0:0
chr22	50959434	.	AGGGGG	AGGG,AGGGG,AGGGGC,GGAGGG	303.46	PASS	AF=0.487805,0.268293,0.0487805,0.0243902;AO=12,11,2,2;DP=42;FAO=20,11,2,1;FDP=41;FR=.;FRO=7;FSAF=8,11,2,0;FSAR=12,0,0,1;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=-0.017058,-0.0337242,0.00979291,-0.0145518;FXX=0.0465008;HRUN=5,5,5,1;LEN=2,1,1,3;MLLD=23.7176,12.7857,9.57549,22.4405;QD=29.6057;RBI=0.134208,0.259236,0.153375,0.0874532;REFB=-0.0137845,-0.023711,-0.0562299,-0.00451362;REVB=-0.133119,-0.257033,-0.153062,-0.086234;RO=5;SAF=4,11,2,0;SAR=8,0,0,2;SRF=5;SRR=0;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=-0.342259,0,0,-0.78221;STB=0.652027,0.5,0.5,0.997454;STBP=0.011,1,1,0.056;TYPE=del,del,snp,mnp;VARB=0.0273199,-0.0145137,-0.0498127,-0.0214218;OID=.,.,.,.;OPOS=50959435,50959435,50959439,50959434;OREF=GG,G,G,AGG;OALT=-,-,C,GGA;OMAPALT=AGGG,AGGGG,AGGGGC,GGAGGG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:56:42:41:5:7:12,11,2,2:20,11,2,1:0.487805,0.268293,0.0487805,0.0243902:8,0,0,2:4,11,2,0:5:0:12,0,0,1:8,11,2,0:7:0
chr22	50961169	.	A	G	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0429493;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.299;QD=35.5759;RBI=0.0498787;REFB=0;REVB=0.0253623;RO=0;SAF=5;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.27427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000444829;OID=.;OPOS=50961169;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:2:5:0:0:2:5:0:0
chr22	50962208	.	T	G	1574.21	PASS	AF=1;AO=98;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0306864;FXX=0.0101;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.692;QD=64.2535;RBI=0.0428418;REFB=0;REVB=-0.0298959;RO=0;SAF=63;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.43553e-05;OID=.;OPOS=50962208;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:98:0:0:98:98:1:35:63:0:0:35:63:0:0
chr22	50962782	.	C	G	638.33	PASS	AF=0.976744;AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0224514;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=63.41;QD=59.3796;RBI=0.0227482;REFB=-0.0929424;REVB=-0.00366294;RO=0;SAF=19;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512814;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=0.00165377;OID=.;OPOS=50962782;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:43:43:0:1:42:42:0.976744:23:19:0:0:23:19:1:0
chr22	50988062	.	G	T	1434.04	PASS	AF=0.980583;AO=97;DP=103;FAO=101;FDP=103;FR=.;FRO=2;FSAF=40;FSAR=61;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0901584;FXX=0.00961446;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.6286;QD=55.691;RBI=0.0901584;REFB=-0.0247609;REVB=9.32232e-05;RO=4;SAF=38;SAR=59;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00850368;STB=0.502108;STBP=0.764;TYPE=snp;VARB=0.00154124;OID=.;OPOS=50988062;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:103:103:4:2:97:101:0.980583:59:38:2:2:61:40:1:1
chr22	50988193	.	A	G	130.37	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0583322;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.1027;QD=43.4559;RBI=0.0683732;REFB=0;REVB=-0.0356686;RO=0;SAF=3;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00510277;OID=.;OPOS=50988193;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:9:3:0:0:9:3:0:0
chr22	50989326	.	A	G	175.65	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.013249;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=91.4765;QD=46.8398;RBI=0.0132535;REFB=0;REVB=0.000343328;RO=0;SAF=6;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000181588;OID=.;OPOS=50989326;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:9:6:0:0:9:6:0:0
chr22	51009953	.	C	T	175.82	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0664885;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.118;QD=46.8847;RBI=0.0674754;REFB=0;REVB=0.0114982;RO=0;SAF=9;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00219764;OID=.;OPOS=51009953;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:15:0:0:14:15:1:5:9:0:0:6:9:0:0
chr22	51043278	.	G	A	427.65	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0151287;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.571;QD=57.0196;RBI=0.0213414;REFB=0;REVB=0.0150525;RO=0;SAF=6;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000113935;OID=.;OPOS=51043278;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:30:0:0:29:30:1:23:6:0:0:24:6:0:0
chr22	51045190	.	C	T	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0472999;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=159.783;QD=40.7629;RBI=0.0529586;REFB=0;REVB=0.0238189;RO=0;SAF=3;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000726494;OID=.;OPOS=51045190;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:7:3:0:0:7:3:0:0
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chr22	51176664	.	A	G	68.36	PASS	AF=0.208333;AO=10;DP=48;FAO=10;FDP=48;FR=.;FRO=38;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=22;FSRR=16;FWDB=-0.00656869;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.1735;QD=5.69665;RBI=0.031421;REFB=-0.00177926;REVB=0.0307268;RO=37;SAF=7;SAR=3;SRF=22;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140222;STB=0.604327;STBP=0.435;TYPE=snp;VARB=0.0090363;OID=.;OPOS=51176664;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:68:48:48:37:38:10:10:0.208333:3:7:22:15:3:7:22:16
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chrX	228940	.	A	G	580.63	PASS	AF=0.97561;AO=39;DP=40;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0120125;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=37.6986;QD=56.6471;RBI=0.0889198;REFB=-0.131603;REVB=-0.0881046;RO=1;SAF=35;SAR=4;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0132108;STB=0.506846;STBP=0.639;TYPE=snp;VARB=0.0138749;OID=.;OPOS=228940;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:40:41:1:1:39:40:0.97561:4:35:1:0:4:36:1:0
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chrX	229137	.	A	G	794.7	PASS	AF=0.982759;AO=56;DP=57;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=49;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0105249;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.214;QD=54.8071;RBI=0.0351311;REFB=0.00304087;REVB=0.0335175;RO=0;SAF=49;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.74973e-08;STB=0.505049;STBP=0.658;TYPE=snp;VARB=7.04165e-05;OID=.;OPOS=229137;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:57:58:0:1:56:57:0.982759:7:49:0:0:8:49:1:0
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chrX	295132	.	T	C	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0272652;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.259;QD=49.5992;RBI=0.0306178;REFB=0;REVB=0.0139306;RO=0;SAF=9;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000306407;OID=.;OPOS=295132;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:9:9:0:0:9:9:0:0
chrX	295231	.	A	G	708.55	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0184909;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.375;QD=62.9822;RBI=0.0216308;REFB=0;REVB=-0.0112239;RO=0;SAF=17;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.96194e-05;OID=.;OPOS=295231;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:28:17:0:0:28:17:0:0
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chrX	299591	.	A	G	1914.99	PASS	AF=1;AO=124;DP=124;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0307165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.849;QD=61.7738;RBI=0.0402425;REFB=0;REVB=-0.0259991;RO=0;SAF=64;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.47389e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.95429e-06;OID=.;OPOS=299591;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:124:124:0:0:124:124:1:60:64:0:0:60:64:0:0
chrX	305984	.	G	A	77.38	PASS	AF=0.37037;AO=10;DP=28;FAO=10;FDP=27;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=14;FWDB=0.0378711;FXX=0.0357015;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.5111;QD=11.4631;RBI=0.0576806;REFB=0.0242835;REVB=0.0435066;RO=17;SAF=6;SAR=4;SRF=3;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.428521;STB=0.749583;STBP=0.081;TYPE=snp;VARB=-0.0328667;OID=.;OPOS=305984;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:28:27:17:17:10:10:0.37037:4:6:3:14:4:6:3:14
chrX	306056	.	G	A	85.04	PASS	AF=0.666667;AO=10;DP=15;FAO=10;FDP=15;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0901963;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.6795;QD=22.6772;RBI=0.0929101;REFB=-0.00160064;REVB=0.0222915;RO=5;SAF=5;SAR=5;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0584143;STB=0.533267;STBP=0.771;TYPE=snp;VARB=0.00794836;OID=.;OPOS=306056;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:15:15:5:5:10:10:0.666667:5:5:2:3:5:5:2:3
chrX	306152	.	T	G	74.82	PASS	AF=1;AO=5;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0626781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.506;QD=37.4089;RBI=0.149262;REFB=0;REVB=0.135464;RO=0;SAF=1;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00567042;OID=.;OPOS=306152;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:5:8:1:4:1:0:0:7:1:0:0
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chrX	2724760	.	T	C	1044.77	PASS	AF=1;AO=56;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=24;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0364469;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.613;QD=59.7009;RBI=0.109943;REFB=0;REVB=0.103726;RO=0;SAF=22;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.43892e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00295812;OID=.;OPOS=2724760;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:56:70:1:34:22:0:0:46:24:0:0
chrX	2748253	.	G	C	1854.64	PASS	AF=1;AO=118;DP=118;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0461684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.115;QD=60.3136;RBI=0.0701475;REFB=0;REVB=0.0528123;RO=0;SAF=57;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.03988e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000483955;OID=.;OPOS=2748253;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:118:123:0:0:118:123:1:61:57:0:0:61:62:0:0
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chrX	2825403	.	A	G	783.54	PASS	AF=0.506329;AO=80;DP=158;FAO=80;FDP=158;FR=.;FRO=78;FSAF=31;FSAR=49;FSRF=48;FSRR=30;FWDB=0.00249303;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.061;QD=19.8365;RBI=0.0414812;REFB=-0.00454532;REVB=-0.0414062;RO=78;SAF=31;SAR=49;SRF=48;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.204548;STB=0.612472;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.00657154;OID=.;OPOS=2825403;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:158:158:78:78:80:80:0.506329:49:31:48:30:49:31:48:30
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chrX	13684432	.	T	A	3971.94	PASS	AF=0.984791;AO=259;DP=263;FAO=259;FDP=263;FR=.;FRO=4;FSAF=138;FSAR=121;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.00217495;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=184.471;QD=60.4098;RBI=0.00454712;REFB=0.0351575;REVB=0.00399323;RO=2;SAF=138;SAR=121;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0078138;STB=0.504317;STBP=0.262;TYPE=snp;VARB=-0.000610749;OID=.;OPOS=13684432;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:263:263:2:4:259:259:0.984791:121:138:0:2:121:138:1:3
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chrX	13771576	.	A	G	573.61	PASS	AF=0.440994;AO=62;DP=160;FAO=71;FDP=161;FR=.,HEALED;FRO=87;FSAF=56;FSAR=15;FSRF=52;FSRR=35;FWDB=-0.118673;FXX=0.0122692;HRUN=4;LEN=1;MLLD=24.8173;QD=14.2512;RBI=0.118749;REFB=-0.0598958;REVB=-0.00424613;RO=65;SAF=50;SAR=12;SRF=40;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.235082;STB=0.633443;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0484556;OID=.;OPOS=13771576;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:160:161:65:87:62:71:0.440994:12:50:40:25:15:56:52:35
chrX	15332558	.	A	G	548.73	PASS	AF=0.395062;AO=63;DP=160;FAO=64;FDP=162;FR=.;FRO=98;FSAF=35;FSAR=29;FSRF=55;FSRR=43;FWDB=0.00196105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.3228;QD=13.5489;RBI=0.00350571;REFB=-0.0173315;REVB=-0.0029059;RO=97;SAF=34;SAR=29;SRF=54;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0184374;STB=0.508769;STBP=0.863;TYPE=snp;VARB=0.0295976;OID=.;OPOS=15332558;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:160:162:97:98:63:64:0.395062:29:34:54:43:29:35:55:43
chrX	15821890	.	G	A	136.14	PASS	AF=0.326923;AO=17;DP=52;FAO=17;FDP=52;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=-0.0214006;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.865;QD=10.4719;RBI=0.021431;REFB=-3.16518e-05;REVB=-0.00114052;RO=35;SAF=14;SAR=3;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.40543;STB=0.744361;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=-0.000177952;OID=.;OPOS=15821890;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:35:35:17:17:0.326923:3:14:18:17:3:14:18:17
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chrX	16859628	.	G	A	2004.59	PASS	AF=1;AO=128;DP=128;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0014623;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=295.137;QD=62.158;RBI=0.0207016;REFB=0;REVB=0.0206499;RO=0;SAF=54;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.2275e-05;OID=.;OPOS=16859628;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:128:129:0:0:128:129:1:74:54:0:0:75:54:0:0
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chrX	17171300	.	A	G	483.33	PASS	AF=0.490385;AO=51;DP=104;FAO=51;FDP=104;FR=.;FRO=53;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=35;FSRR=18;FWDB=0.0227545;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=50.6182;QD=18.5896;RBI=0.033687;REFB=0.00714814;REVB=0.0248405;RO=53;SAF=27;SAR=24;SRF=35;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122094;STB=0.56748;STBP=0.204;TYPE=snp;VARB=-0.00661348;OID=.;OPOS=17171300;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:104:53:53:51:51:0.490385:24:27:35:18:24:27:35:18
chrX	17705850	.	C	CT	2144.41	PASS	AF=1;AO=195;DP=213;FAO=211;FDP=211;FR=.;FRO=0;FSAF=115;FSAR=96;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00347902;FXX=0.014018;HRUN=2;LEN=1;MLLD=16.9761;QD=40.6524;RBI=0.00712681;REFB=0;REVB=-0.00621995;RO=8;SAF=112;SAR=83;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.013493;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000677449;OID=.;OPOS=17705851;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:195:213:211:211:0:115:96:0:0:40:8:112:83:6:2
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chrX	21876221	.	A	G	50.45	PASS	AF=0.195122;AO=8;DP=41;FAO=8;FDP=41;FR=.;FRO=33;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=0.0674912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.4566;QD=4.92199;RBI=0.0728972;REFB=0.0184897;REVB=-0.0275488;RO=33;SAF=2;SAR=6;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.329976;STB=0.720948;STBP=0.192;TYPE=snp;VARB=-0.115786;OID=.;OPOS=21876221;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:50:41:41:33:33:8:8:0.195122:6:2:17:16:6:2:17:16
chrX	22025268	.	C	A	559.55	PASS	AF=0.417219;AO=63;DP=152;FAO=63;FDP=151;FR=.;FRO=88;FSAF=32;FSAR=31;FSRF=53;FSRR=35;FWDB=-0.033623;FXX=0.00657851;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.293;QD=14.8224;RBI=0.0359447;REFB=-0.0122881;REVB=-0.0127089;RO=88;SAF=32;SAR=31;SRF=53;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0983512;STB=0.55507;STBP=0.243;TYPE=snp;VARB=0.0154038;OID=.;OPOS=22025268;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:152:151:88:88:63:63:0.417219:31:32:53:35:31:32:53:35
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chrX	24381409	.	G	A	265.35	PASS	AF=0.491525;AO=29;DP=59;FAO=29;FDP=59;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=-0.0472923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.4678;QD=17.9898;RBI=0.0492817;REFB=-0.0200325;REVB=-0.0138608;RO=30;SAF=11;SAR=18;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142549;STB=0.579896;STBP=0.237;TYPE=snp;VARB=0.00824033;OID=.;OPOS=24381409;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:30:30:29:29:0.491525:18:11:16:14:18:11:16:14
chrX	24576191	.	T	C	538.54	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0676359;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.2702;QD=59.8381;RBI=0.068323;REFB=0;REVB=0.00966518;RO=0;SAF=15;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0011477;OID=.;OPOS=24576191;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:21:15:0:0:21:15:0:0
chrX	24578270	.	C	T	1613.83	PASS	AF=0.493902;AO=160;DP=325;FAO=162;FDP=328;FR=.;FRO=166;FSAF=69;FSAR=93;FSRF=84;FSRR=82;FWDB=-0.0333386;FXX=0.00303942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.9555;QD=19.6808;RBI=0.0361949;REFB=-0.0170132;REVB=0.0140928;RO=164;SAF=69;SAR=91;SRF=82;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0640049;STB=0.540939;STBP=0.136;TYPE=snp;VARB=0.0136578;OID=.;OPOS=24578270;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:325:328:164:166:160:162:0.493902:91:69:82:82:93:69:84:82
chrX	24578803	.	C	T	1048.85	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0418941;FXX=0.0277739;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.8037;QD=59.9341;RBI=0.042195;REFB=0;REVB=0.00503022;RO=0;SAF=35;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00038709;OID=.;OPOS=24578803;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:68:70:0:0:68:70:1:33:35:0:0:33:37:0:0
chrX	24751958	.	T	C	2351.78	PASS	AF=1;AO=153;DP=153;FAO=154;FDP=154;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=97;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00741913;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.534;QD=61.0852;RBI=0.0438252;REFB=0;REVB=0.0431926;RO=0;SAF=57;SAR=96;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.85442e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.21829e-05;OID=.;OPOS=24751958;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:153:154:0:0:153:154:1:96:57:0:0:97:57:0:0
chrX	26157220	.	C	T	1954.16	PASS	AF=0.984733;AO=128;DP=131;FAO=129;FDP=131;FR=.;FRO=2;FSAF=86;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00528934;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=248.792;QD=59.6691;RBI=0.00647489;REFB=0.0453778;REVB=-0.00373458;RO=2;SAF=86;SAR=42;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00568549;STB=0.502857;STBP=0.755;TYPE=snp;VARB=-8.56619e-05;OID=.;OPOS=26157220;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:131:131:2:2:128:129:0.984733:42:86:1:1:43:86:1:1
chrX	26157792	.	C	T	1016.66	PASS	AF=1;AO=69;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0448845;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.42;QD=58.0949;RBI=0.0452466;REFB=-0.0853248;REVB=0.00571252;RO=0;SAF=34;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0011516;OID=.;OPOS=26157792;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:70:70:0:0:69:70:1:35:34:0:0:35:35:0:0
chrX	26213364	.	T	TTTGTC	766.18	PASS	AF=0.949153;AO=54;DP=61;FAO=56;FDP=59;FR=.;FRO=3;FSAF=31;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0132844;FXX=0.0166639;HRUN=4;LEN=5;MLLD=308.279;QD=51.9442;RBI=0.0179253;REFB=-0.0319075;REVB=0.0120349;RO=5;SAF=29;SAR=25;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0854079;STB=0.528292;STBP=0.084;TYPE=ins;VARB=0.0027119;OID=.;OPOS=26213365;OREF=-;OALT=TTGTC;OMAPALT=TTTGTC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.949153:54:61:56:59:3:31:25:0:3:11:5:29:25:0:5
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chrX	30236878	.	G	A	4819.81	PASS	AF=1;AO=309;DP=310;FAO=309;FDP=309;FR=.;FRO=0;FSAF=159;FSAR=150;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0208034;FXX=0.0032257;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.5156;QD=62.3923;RBI=0.0237044;REFB=-0.0821306;REVB=0.0113629;RO=1;SAF=159;SAR=150;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00299049;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00052817;OID=.;OPOS=30236878;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:21:310:309:1:0:309:309:1:150:159:1:0:150:159:0:0
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chrX	30254530	.	A	G	294.23	PASS	AF=0.516667;AO=31;DP=61;FAO=31;FDP=60;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=0.0257428;FXX=0.0322529;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.4246;QD=19.6154;RBI=0.0260022;REFB=0.00506374;REVB=-0.00366398;RO=28;SAF=13;SAR=18;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.023322;STB=0.502761;STBP=0.992;TYPE=snp;VARB=-0.00527621;OID=.;OPOS=30254530;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:60:28:29:31:31:0.516667:18:13:11:17:18:13:12:17
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chrX	35821302	.	C	G	594.54	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00895749;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=215.539;QD=60.9786;RBI=0.0101733;REFB=0;REVB=0.00482276;RO=0;SAF=17;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.2103e-05;OID=.;OPOS=35821302;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:22:17:0:0:22:17:0:0
chrX	35821308	.	C	T	608.01	PASS	AF=1;AO=37;DP=38;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0561121;FXX=0.0243843;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.2893;QD=60.8013;RBI=0.137811;REFB=0;REVB=0.12587;RO=1;SAF=18;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0240105;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00117831;OID=.;OPOS=35821308;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:40:1:0:37:40:1:19:18:0:1:22:18:0:0
chrX	35821464	.	A	G	990.63	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00476906;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.609;QD=59.1418;RBI=0.0056039;REFB=0;REVB=0.00294276;RO=0;SAF=28;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.74073e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.50208e-05;OID=.;OPOS=35821464;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:39:28:0:0:39:28:0:0
chrX	35821558	.	G	A	766.46	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0123701;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.109;QD=63.8716;RBI=0.0124062;REFB=0;REVB=0.00094615;RO=0;SAF=25;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.12036e-05;OID=.;OPOS=35821558;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:23:25:0:0:23:25:0:0
chrX	35821763	.	G	A	944.44	PASS	AF=0.918919;AO=67;DP=72;FAO=68;FDP=74;FR=.;FRO=6;FSAF=26;FSAR=42;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0509737;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.5454;QD=51.0508;RBI=0.0569336;REFB=0.0416746;REVB=-0.0253598;RO=5;SAF=25;SAR=42;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00375525;STB=0.504215;STBP=0.855;TYPE=snp;VARB=-0.0145091;OID=.;OPOS=35821763;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:23:72:74:5:6:67:68:0.918919:42:25:2:3:42:26:2:4
chrX	35821789	.	T	G	834.4	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0111225;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.025;QD=57.5448;RBI=0.0311241;REFB=0;REVB=0.0290689;RO=0;SAF=23;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.90063e-05;OID=.;OPOS=35821789;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:35:23:0:0:35:23:0:0
chrX	37026521	.	C	T	1017.97	PASS	AF=0.505102;AO=98;DP=199;FAO=99;FDP=196;FR=.;FRO=97;FSAF=58;FSAR=41;FSRF=47;FSRR=50;FWDB=0.0102122;FXX=0.0150746;HRUN=4;LEN=1;MLLD=280.247;QD=20.7749;RBI=0.0153075;REFB=-0.0199634;REVB=0.0114031;RO=93;SAF=58;SAR=40;SRF=43;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116093;STB=0.550757;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.0184115;OID=.;OPOS=37026521;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:199:196:93:97:98:99:0.505102:40:58:43:50:41:58:47:50
chrX	37701048	.	G	A	1300.18	PASS	AF=1;AO=82;DP=82;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00323409;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.7557;QD=61.9134;RBI=0.016221;REFB=0;REVB=-0.0158954;RO=0;SAF=49;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.22047e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00016168;OID=.;OPOS=37701048;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:84:0:0:82:84:1:33:49:0:0:33:51:0:0
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chrX	41556195	.	A	T	538.55	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00353274;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=293.6;QD=59.8389;RBI=0.0217747;REFB=0;REVB=0.0214862;RO=0;SAF=17;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.52826e-05;OID=.;OPOS=41556195;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:19:17:0:0:19:17:0:0
chrX	41587218	.	T	C	2628.03	PASS	AF=1;AO=167;DP=173;FAO=168;FDP=168;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.012151;FXX=0.045452;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.216;QD=62.5722;RBI=0.0358939;REFB=0;REVB=0.0337746;RO=0;SAF=87;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.03409e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.16338e-06;OID=.;OPOS=41587218;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:173:168:0:0:167:168:1:80:87:0:0:81:87:0:0
chrX	41587569	.	C	G	1008.49	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0344656;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.2241;QD=59.3228;RBI=0.0363034;REFB=0;REVB=0.0114042;RO=0;SAF=38;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00017531;OID=.;OPOS=41587569;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:30:38:0:0:30:38:0:0
chrX	41588169	.	T	C	2137.0	PASS	AF=1;AO=132;DP=134;FAO=136;FDP=136;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00516255;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.888;QD=62.8531;RBI=0.0149345;REFB=0;REVB=0.0140138;RO=1;SAF=64;SAR=68;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00693874;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.00073e-06;OID=.;OPOS=41588169;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:134:136:1:0:132:136:1:68:64:0:1:72:64:0:0
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chrX	46920599	.	C	A	1712.95	PASS	AF=0.974576;AO=115;DP=120;FAO=115;FDP=118;FR=.;FRO=3;FSAF=50;FSAR=65;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.00211278;FXX=0.0166653;HRUN=4;LEN=1;MLLD=307.537;QD=58.0661;RBI=0.00438343;REFB=0.00345957;REVB=0.00384066;RO=3;SAF=50;SAR=65;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00498374;STB=0.502625;STBP=0.731;TYPE=snp;VARB=1.36963e-06;OID=.;OPOS=46920599;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:120:118:3:3:115:115:0.974576:65:50:1:2:65:50:1:2
chrX	46946966	.	T	C	1558.13	PASS	AF=1;AO=99;DP=99;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00889594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.968;QD=59.3573;RBI=0.0405896;REFB=0;REVB=0.0396027;RO=0;SAF=50;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.56732e-05;OID=.;OPOS=46946966;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:99:105:0:0:99:105:1:49:50:0:0:55:50:0:0
chrX	47057647	.	A	G	954.92	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0253983;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.43;QD=58.7644;RBI=0.048371;REFB=0;REVB=0.0411665;RO=0;SAF=31;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000173071;OID=.;OPOS=47057647;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:65:0:0:63:65:1:32:31:0:0:34:31:0:0
chrX	47068940	.	C	T	733.73	PASS	AF=0.514493;AO=71;DP=139;FAO=71;FDP=138;FR=.;FRO=67;FSAF=33;FSAR=38;FSRF=28;FSRR=39;FWDB=-0.00536771;FXX=0.0142847;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.331;QD=21.2676;RBI=0.0184767;REFB=-0.0171101;REVB=0.0176798;RO=67;SAF=33;SAR=38;SRF=28;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0417483;STB=0.522941;STBP=0.579;TYPE=snp;VARB=0.013914;OID=.;OPOS=47068940;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:139:138:67:67:71:71:0.514493:38:33:28:39:38:33:28:39
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chrX	49021537	.	G	C	1507.39	PASS	AF=1;AO=100;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0361925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.6839;QD=59.6987;RBI=0.0568655;REFB=0;REVB=-0.043861;RO=0;SAF=42;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000471606;OID=.;OPOS=49021537;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:101:101:0:0:100:101:1:58:42:0:0:59:42:0:0
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chrX	54836361	.	A	G	1573.37	PASS	AF=1;AO=104;DP=104;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00582979;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.981;QD=59.9378;RBI=0.0215817;REFB=0;REVB=0.0207794;RO=0;SAF=47;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.09077e-05;OID=.;OPOS=54836361;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:104:105:0:0:104:105:1:57:47:0:0:58:47:0:0
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chrX	55172645	.	C	T	1887.9	PASS	AF=0.613718;AO=169;DP=302;FAO=170;FDP=277;FR=.;FRO=107;FSAF=106;FSAR=64;FSRF=64;FSRR=43;FWDB=-0.00054408;FXX=0.0858057;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.335;QD=27.2621;RBI=0.0123556;REFB=0.00385674;REVB=-0.0123436;RO=102;SAF=105;SAR=64;SRF=63;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00271028;STB=0.510394;STBP=0.672;TYPE=snp;VARB=-0.00435808;OID=.;OPOS=55172645;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:302:277:102:107:169:170:0.613718:64:105:63:39:64:106:64:43
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chrX	55247030	.	C	G	2840.19	PASS	AF=1;AO=180;DP=182;FAO=181;FDP=181;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=122;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00299063;FXX=0.0054942;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.824;QD=62.7666;RBI=0.00301594;REFB=0;REVB=0.000389852;RO=0;SAF=58;SAR=122;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.97448e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.50531e-05;OID=.;OPOS=55247030;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:15:182:181:0:0:180:181:1:122:58:0:0:122:59:0:0
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chrX	65822607	.	T	C	2640.21	PASS	AF=1;AO=170;DP=170;FAO=170;FDP=170;FR=.;FRO=0;FSAF=91;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0103728;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.425;QD=62.1226;RBI=0.0317862;REFB=0;REVB=-0.0300461;RO=0;SAF=91;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.82323e-05;OID=.;OPOS=65822607;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:170:170:0:0:170:170:1:79:91:0:0:79:91:0:0
chrX	65824986	.	C	T	1713.45	PASS	AF=1;AO=112;DP=112;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0165825;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.734;QD=60.6531;RBI=0.0310129;REFB=0;REVB=0.0262073;RO=0;SAF=50;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.78196e-06;OID=.;OPOS=65824986;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:112:113:0:0:112:113:1:62:50:0:0:63:50:0:0
chrX	67321920	.	C	T	375.94	PASS	AF=0.417476;AO=43;DP=103;FAO=43;FDP=103;FR=.;FRO=60;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=37;FSRR=23;FWDB=-0.00412665;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.544;QD=14.5996;RBI=0.00833749;REFB=-0.00348363;REVB=0.00724462;RO=60;SAF=26;SAR=17;SRF=37;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0130262;STB=0.507339;STBP=0.917;TYPE=snp;VARB=0.00412532;OID=.;OPOS=67321920;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:103:60:60:43:43:0.417476:17:26:37:23:17:26:37:23
chrX	67942317	.	C	A	405.34	PASS	AF=0.5;AO=41;DP=82;FAO=41;FDP=82;FR=.;FRO=41;FSAF=13;FSAR=28;FSRF=22;FSRR=19;FWDB=-0.0246623;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.928;QD=19.7724;RBI=0.0303778;REFB=-0.0366197;REVB=0.0177365;RO=41;SAF=13;SAR=28;SRF=22;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.208123;STB=0.615906;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.0417168;OID=.;OPOS=67942317;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:41:41:41:41:0.5:28:13:22:19:28:13:22:19
chrX	67943954	.	C	T	65.48	PASS	AF=0.375;AO=9;DP=24;FAO=9;FDP=24;FR=.;FRO=15;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.0161126;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.9344;QD=10.9141;RBI=0.0523225;REFB=-0.00407087;REVB=-0.0497798;RO=14;SAF=2;SAR=7;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.31575;STB=0.67699;STBP=0.218;TYPE=snp;VARB=-0.00154122;OID=.;OPOS=67943954;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:24:24:14:15:9:9:0.375:7:2:7:7:7:2:7:8
chrX	67945420	.	A	G	470.31	PASS	AF=0.681818;AO=40;DP=66;FAO=45;FDP=66;FR=.;FRO=21;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=6;FSRR=15;FWDB=0.229255;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=46.8154;QD=28.5039;RBI=0.242695;REFB=-0.190182;REVB=0.0796426;RO=25;SAF=17;SAR=23;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0107696;STB=0.564837;STBP=0.137;TYPE=snp;VARB=0.0783209;OID=.;OPOS=67945420;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:25:21:40:45:0.681818:23:17:11:14:23:22:6:15
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chrX	71401614	.	C	A	1680.32	PASS	AF=1;AO=111;DP=111;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0115115;FXX=0.00892777;HRUN=1;LEN=1;MLLD=320.56;QD=60.5522;RBI=0.0124829;REFB=0;REVB=-0.00482763;RO=0;SAF=49;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.03816e-06;OID=.;OPOS=71401614;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:111:111:0:0:111:111:1:62:49:0:0:62:49:0:0
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chrX	73066439	.	T	C	1080.45	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00482934;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.705;QD=60.0248;RBI=0.00935954;REFB=0;REVB=0.00801739;RO=0;SAF=52;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.0059e-05;OID=.;OPOS=73066439;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:20:52:0:0:20:52:0:0
chrX	73462520	.	T	C	1339.67	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00126129;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.66;QD=62.3104;RBI=0.0405837;REFB=0;REVB=0.0405641;RO=0;SAF=41;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.97189e-05;OID=.;OPOS=73462520;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:45:41:0:0:45:41:0:0
chrX	73462705	.	G	A	211.13	PASS	AF=0.606061;AO=20;DP=34;FAO=20;FDP=33;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=0.0461639;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.609;QD=25.5918;RBI=0.0508679;REFB=0.00108756;REVB=-0.0213644;RO=13;SAF=5;SAR=15;SRF=3;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0183368;STB=0.510194;STBP=0.915;TYPE=snp;VARB=-0.000785913;OID=.;OPOS=73462705;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:33:13:13:20:20:0.606061:15:5:3:10:15:5:3:10
chrX	73641569	.	T	C	638.86	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.002105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.975;QD=60.8436;RBI=0.00481779;REFB=0;REVB=-0.0043336;RO=0;SAF=17;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.2194e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00068024;OID=.;OPOS=73641569;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:42:0:0:41:42:1:24:17:0:0:24:18:0:0
chrX	74494470	.	T	G	899.55	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0361988;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.255;QD=58.0352;RBI=0.0371627;REFB=0;REVB=0.00840914;RO=0;SAF=32;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.14367e-05;OID=.;OPOS=74494470;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:62:0:0:61:62:1:29:32:0:0:29:33:0:0
chrX	74511202	.	G	C	1955.35	PASS	AF=1;AO=126;DP=127;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0194014;FXX=0.0078734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.6136;QD=62.0746;RBI=0.030931;REFB=0;REVB=0.0240897;RO=0;SAF=67;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.31893e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000148684;OID=.;OPOS=74511202;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:127:126:0:0:126:126:1:59:67:0:0:59:67:0:0
chrX	75004529	.	C	A	1453.27	PASS	AF=1;AO=92;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0341321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.731;QD=63.1858;RBI=0.0417796;REFB=0;REVB=-0.0240942;RO=0;SAF=43;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.70807e-05;OID=.;OPOS=75004529;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:92:92:0:0:92:92:1:49:43:0:0:49:43:0:0
chrX	77298857	.	G	A	1099.22	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00728388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.73;QD=60.2313;RBI=0.0301568;REFB=0;REVB=0.0292639;RO=0;SAF=43;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.30751e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.91131e-05;OID=.;OPOS=77298857;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:73:0:0:71:73:1:28:43:0:0:29:44:0:0
chrX	77528317	.	G	A	1114.77	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000160421;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.031;QD=60.2579;RBI=0.00488792;REFB=0;REVB=-0.00488529;RO=0;SAF=26;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.2476e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.50167e-06;OID=.;OPOS=77528317;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:74:0:0:73:74:1:47:26:0:0:48:26:0:0
chrX	78011737	.	T	C	1001.89	PASS	AF=1;AO=67;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0385376;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.25;QD=58.9345;RBI=0.0726427;REFB=0;REVB=0.0615777;RO=0;SAF=31;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000132663;OID=.;OPOS=78011737;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:67:68:1:36:31:0:0:37:31:0:0
chrX	78216024	.	A	C	801.23	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0160525;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.8981;QD=57.231;RBI=0.109863;REFB=0;REVB=0.108684;RO=0;SAF=23;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000467291;OID=.;OPOS=78216024;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:33:23:0:0:33:23:0:0
chrX	79699998	.	T	A	733.29	PASS	AF=0.589744;AO=69;DP=117;FAO=69;FDP=117;FR=.;FRO=48;FSAF=34;FSAR=35;FSRF=29;FSRR=19;FWDB=0.00320485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.082;QD=25.0696;RBI=0.0343734;REFB=-0.000767355;REVB=-0.0342237;RO=48;SAF=34;SAR=35;SRF=29;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0839094;STB=0.545644;STBP=0.26;TYPE=snp;VARB=0.000464386;OID=.;OPOS=79699998;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:117:117:48:48:69:69:0.589744:35:34:29:19:35:34:29:19
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chrX	79943569	.	T	C	3722.25	PASS	AF=1;AO=233;DP=235;FAO=237;FDP=237;FR=.;FRO=0;FSAF=124;FSAR=113;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0463093;FXX=0.00836785;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.5635;QD=62.8227;RBI=0.053291;REFB=-0.0459087;REVB=0.02637;RO=1;SAF=120;SAR=113;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00395493;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000735363;OID=.;OPOS=79943569;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:15:235:237:1:0:233:237:1:113:120:1:0:113:124:0:0
chrX	79989018	.	C	G	1570.02	PASS	AF=1;AO=100;DP=103;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00157026;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.491;QD=59.8101;RBI=0.0147077;REFB=0;REVB=-0.0146236;RO=0;SAF=48;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.19274e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.26307e-06;OID=.;OPOS=79989018;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:103:105:0:0:100:105:1:52:48:0:0:55:50:0:0
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chrX	84534383	.	A	C	1975.3	PASS	AF=0.985294;AO=69;DP=144;FAO=134;FDP=136;FR=.,HEALED;FRO=2;FSAF=65;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0237406;FXX=0.0555517;HRUN=10;LEN=1;MLLD=117.276;QD=58.0971;RBI=0.126966;REFB=-0.189652;REVB=0.124726;RO=2;SAF=28;SAR=41;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.022501;STB=0.507142;STBP=0.226;TYPE=snp;VARB=7.44818e-05;OID=.;OPOS=84534383;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:144:136:2:2:69:134:0.985294:41:28:0:2:69:65:0:2
chrX	84563135	.	T	A	4048.98	PASS	AF=1;AO=257;DP=257;FAO=260;FDP=260;FR=.;FRO=0;FSAF=130;FSAR=130;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000647931;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.288;QD=62.2919;RBI=0.0132253;REFB=0;REVB=0.0132094;RO=0;SAF=129;SAR=128;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=1.02796e-07;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.239e-05;OID=.;OPOS=84563135;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:22:257:260:0:0:257:260:1:128:129:0:0:130:130:0:0
chrX	86877348	.	G	T	639.8	PASS	AF=0.485294;AO=66;DP=136;FAO=66;FDP=136;FR=.;FRO=70;FSAF=29;FSAR=37;FSRF=32;FSRR=38;FWDB=-0.0162063;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=54.5057;QD=18.8175;RBI=0.048078;REFB=-0.00495408;REVB=-0.0452643;RO=70;SAF=29;SAR=37;SRF=32;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0167252;STB=0.509248;STBP=0.837;TYPE=snp;VARB=0.00407741;OID=.;OPOS=86877348;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:136:136:70:70:66:66:0.485294:37:29:32:38:37:29:32:38
chrX	86887244	.	C	A,T	865.8	PASS	AF=0.0655738,0.934426;AO=3,58;DP=61;FAO=4,57;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=1,30;FSAR=3,27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0605864,-0.0139529;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=19.2537,256.021;QD=56.7739;RBI=0.0844158,0.0210575;REFB=0,0;REVB=-0.0587819,0.0157713;RO=0;SAF=1,30;SAR=2,28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.1582,0.00032847;OID=.,.;OPOS=86887244,86887244;OREF=C,C;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:15:61:61:0:0:3,58:4,57:0.0655738,0.934426:2,28:1,30:0:0:3,27:1,30:0:0
chrX	88008423	.	A	C	1933.53	PASS	AF=1;AO=125;DP=125;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0446571;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.8875;QD=61.873;RBI=0.0745471;REFB=0;REVB=0.059691;RO=0;SAF=60;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000527628;OID=.;OPOS=88008423;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:125:125:0:0:125:125:1:65:60:0:0:65:60:0:0
chrX	88009322	.	A	G	2335.24	PASS	AF=1;AO=146;DP=147;FAO=146;FDP=146;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0106333;FXX=0.00680226;HRUN=3;LEN=1;MLLD=210.244;QD=63.9791;RBI=0.0143203;REFB=0;REVB=0.00959197;RO=0;SAF=65;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.00316e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.97202e-06;OID=.;OPOS=88009322;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:147:146:0:0:146:146:1:81:65:0:0:81:65:0:0
chrX	88009687	.	CCAGA	C	171.7	PASS	AF=0.318182;AO=34;DP=111;FAO=35;FDP=110;FR=.;FRO=75;FSAF=11;FSAR=24;FSRF=52;FSRR=23;FWDB=0.00383316;FXX=0.0178555;HRUN=2;LEN=4;MLLD=314.551;QD=6.24352;RBI=0.00755719;REFB=-0.000435871;REVB=-0.00651291;RO=76;SAF=11;SAR=23;SRF=53;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.42199;STB=0.745065;STBP=0;TYPE=del;VARB=0.000904775;OID=.;OPOS=88009688;OREF=CAGA;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.318182:34:111:35:110:75:11:24:52:23:99:76:11:23:53:23
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chrX	100743037	.	C	T	1212.98	PASS	AF=1;AO=78;DP=78;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.020292;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.109;QD=61.4165;RBI=0.0246034;REFB=0;REVB=0.0139125;RO=0;SAF=48;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.48699e-05;OID=.;OPOS=100743037;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:79:0:0:78:79:1:30:48:0:0:31:48:0:0
chrX	100743826	.	A	G	708.51	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0233496;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.137;QD=62.9789;RBI=0.0575563;REFB=0;REVB=0.0526073;RO=0;SAF=28;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00015637;OID=.;OPOS=100743826;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:17:28:0:0:17:28:0:0
chrX	100745825	.	T	C	405.02	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00645598;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.117;QD=55.8651;RBI=0.0206598;REFB=0;REVB=0.0196252;RO=0;SAF=15;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.23556e-05;OID=.;OPOS=100745825;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:29:0:0:27:29:1:12:15:0:0:13:16:0:0
chrX	100747453	.	G	A	268.56	PASS	AF=0.510204;AO=25;DP=50;FAO=25;FDP=49;FR=.;FRO=24;FSAF=19;FSAR=6;FSRF=19;FSRR=5;FWDB=-0.00779781;FXX=0.019996;HRUN=3;LEN=1;MLLD=127.535;QD=21.9229;RBI=0.0423862;REFB=-0.0105638;REVB=0.0416627;RO=22;SAF=19;SAR=6;SRF=17;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0147552;STB=0.521722;STBP=0.819;TYPE=snp;VARB=0.0166057;OID=.;OPOS=100747453;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:49:22:24:25:25:0.510204:6:19:17:5:6:19:19:5
chrX	100747694	.	G	C	37.99	PASS	AF=0.4;AO=6;DP=15;FAO=6;FDP=15;FR=.;FRO=9;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.0454173;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.5724;QD=10.13;RBI=0.0489096;REFB=-0.0413161;REVB=0.0181499;RO=9;SAF=1;SAR=5;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.33738;STB=0.713469;STBP=0.251;TYPE=snp;VARB=0.0805135;OID=.;OPOS=100747694;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:15:15:9:9:6:6:0.4:5:1:4:5:5:1:4:5
chrX	100748078	.	A	G	501.63	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00708369;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.1573;QD=59.015;RBI=0.00807372;REFB=0;REVB=0.0038738;RO=0;SAF=20;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.48532e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.28801e-05;OID=.;OPOS=100748078;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:14:20:0:0:14:20:0:0
chrX	100749127	.	A	G	358.11	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0172359;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.578;QD=55.0937;RBI=0.0603131;REFB=0;REVB=0.0577978;RO=0;SAF=24;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.21284e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.57615e-05;OID=.;OPOS=100749127;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:2:24:0:0:2:24:0:0
chrX	100871264	.	T	C	73.36	PASS	AF=0.322581;AO=10;DP=31;FAO=10;FDP=31;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=0.00222686;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=242.561;QD=9.46518;RBI=0.00223767;REFB=0.000298027;REVB=0.000219621;RO=21;SAF=6;SAR=4;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0327763;STB=0.51996;STBP=0.916;TYPE=snp;VARB=-0.000453557;OID=.;OPOS=100871264;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:31:31:21:21:10:10:0.322581:4:6:12:9:4:6:12:9
chrX	100880857	.	G	A	287.42	PASS	AF=0.444444;AO=32;DP=72;FAO=32;FDP=72;FR=.;FRO=40;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=20;FSRR=20;FWDB=-0.0558547;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.3562;QD=15.9676;RBI=0.066893;REFB=-0.0118342;REVB=0.0368093;RO=40;SAF=13;SAR=19;SRF=20;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0937633;STB=0.552877;STBP=0.456;TYPE=snp;VARB=0.0194373;OID=.;OPOS=100880857;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:40:40:32:32:0.444444:19:13:20:20:19:13:20:20
chrX	100911066	.	C	T	785.88	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0199104;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.4593;QD=64.1534;RBI=0.0199419;REFB=0;REVB=0.00112029;RO=0;SAF=24;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000130466;OID=.;OPOS=100911066;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:25:24:0:0:25:24:0:0
chrX	100946613	.	T	C	5594.43	PASS	AF=1;AO=340;DP=340;FAO=358;FDP=358;FR=.;FRO=0;FSAF=171;FSAR=187;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0428182;FXX=0.00278544;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.363;QD=62.5076;RBI=0.0428183;REFB=0.0182656;REVB=5.26624e-05;RO=0;SAF=153;SAR=187;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.2011e-06;OID=.;OPOS=100946613;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:25:340:358:0:0:340:358:1:187:153:0:0:187:171:0:0
chrX	101091164	.	T	C	269.56	PASS	AF=0.407895;AO=31;DP=76;FAO=31;FDP=76;FR=.;FRO=45;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=26;FSRR=19;FWDB=-0.0286706;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.853;QD=14.1872;RBI=0.0314198;REFB=-0.0112223;REVB=-0.0128529;RO=45;SAF=11;SAR=20;SRF=26;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.233688;STB=0.632933;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=0.0102632;OID=.;OPOS=101091164;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:45:45:31:31:0.407895:20:11:26:19:20:11:26:19
chrX	101138792	.	T	C	414.36	PASS	AF=1;AO=29;DP=30;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000695471;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.439;QD=57.1533;RBI=0.0311078;REFB=0;REVB=0.0311001;RO=0;SAF=11;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000158239;OID=.;OPOS=101138792;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:29:0:0:29:29:1:18:11:0:0:18:11:0:0
chrX	101395780	.	T	G,TG	502.1	PASS	AF=0,1;AO=7,26;DP=46;FAO=0,41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=0,20;FSAR=0,21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00285847,0.16003;FXX=0;HRUN=2,3;LEN=1,1;MLLD=10.6054,18.034;QD=48.9851;RBI=0.0883929,0.22858;REFB=0,0;REVB=-0.0883467,-0.163215;RO=10;SAF=7,8;SAR=0,18;SRF=8;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.723022,-0.260651;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,ins;VARB=0,-0.00148623;OID=.,.;OPOS=101395780,101395781;OREF=T,-;OALT=G,G;OMAPALT=G,TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	2/2:3:46:41:10:0:7,26:0,41:0,1:0,18:7,8:8:2:0,21:0,20:0:0
chrX	101911337	.	C	T	110.57	PASS	AF=0.448276;AO=13;DP=29;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=0.00554764;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.3848;QD=15.2505;RBI=0.0251582;REFB=-0.0109844;REVB=0.0245389;RO=16;SAF=4;SAR=9;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0665616;STB=0.538404;STBP=0.726;TYPE=snp;VARB=0.0137167;OID=.;OPOS=101911337;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:16:16:13:13:0.448276:9:4:4:12:9:4:4:12
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chrX	101970316	.	A	C	824.13	PASS	AF=0.527027;AO=78;DP=148;FAO=78;FDP=148;FR=.;FRO=70;FSAF=46;FSAR=32;FSRF=27;FSRR=43;FWDB=0.0232046;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.6254;QD=22.2739;RBI=0.0440872;REFB=-0.0153532;REVB=-0.0374864;RO=70;SAF=46;SAR=32;SRF=27;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.175595;STB=0.596242;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0126475;OID=.;OPOS=101970316;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:148:148:70:70:78:78:0.527027:32:46:27:43:32:46:27:43
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chrX	104464281	.	TC	CT,T	206.14	PASS	AF=0,1;AO=2,15;DP=18;FAO=0,18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=0,12;FSAR=0,6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0171167,0.0922485;FXX=0;HRUN=1,4;LEN=2,1;MLLD=112.157,22.813;QD=45.808;RBI=0.0200456,0.0962898;REFB=0,0;REVB=0.0104328,0.0276031;RO=1;SAF=2,9;SAR=0,6;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0.30137;SSEP=0,0;SSSB=0,-0.0479918;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,del;VARB=0,0.00890413;OID=.,.;OPOS=104464281,104464282;OREF=TC,C;OALT=CT,-;OMAPALT=CT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	2/2:4:18:18:1:0:2,15:0,18:0,1:0,6:2,9:1:0:0,6:0,12:0:0
chrX	105152282	.	G	A	750.5	PASS	AF=0.467456;AO=79;DP=170;FAO=79;FDP=169;FR=.;FRO=90;FSAF=39;FSAR=40;FSRF=42;FSRR=48;FWDB=0.00119988;FXX=0.00588201;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.871;QD=17.7633;RBI=0.00259261;REFB=-0.00862633;REVB=0.00229824;RO=90;SAF=39;SAR=40;SRF=42;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0259847;STB=0.514385;STBP=0.727;TYPE=snp;VARB=0.0105905;OID=.;OPOS=105152282;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:170:169:90:90:79:79:0.467456:40:39:42:48:40:39:42:48
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chrX	115304224	.	T	C	495.09	PASS	AF=0.5;AO=48;DP=96;FAO=48;FDP=96;FR=.;FRO=48;FSAF=27;FSAR=21;FSRF=14;FSRR=34;FWDB=-0.00491547;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.106;QD=20.6286;RBI=0.0179448;REFB=-0.00741472;REVB=-0.0172584;RO=48;SAF=27;SAR=21;SRF=14;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.24101;STB=0.632939;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.00754868;OID=.;OPOS=115304224;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:96:48:48:48:48:0.5:21:27:14:34:21:27:14:34
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chrX	118605134	.	G	T	45.35	PASS	AF=0.318182;AO=7;DP=22;FAO=7;FDP=22;FR=.;FRO=15;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=-0.0168293;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.2698;QD=8.24498;RBI=0.0202248;REFB=0.00114169;REVB=-0.0112169;RO=15;SAF=3;SAR=4;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108749;STB=0.567382;STBP=0.717;TYPE=snp;VARB=-0.0051705;OID=.;OPOS=118605134;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:22:22:15:15:7:7:0.318182:4:3:5:10:4:3:5:10
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chrX	118605163	.	C	T	45.35	PASS	AF=0.318182;AO=7;DP=22;FAO=7;FDP=22;FR=.;FRO=15;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=0.000148236;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.394;QD=8.24621;RBI=0.0261921;REFB=-0.00918484;REVB=-0.0261917;RO=15;SAF=3;SAR=4;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108749;STB=0.567382;STBP=0.717;TYPE=snp;VARB=0.0132461;OID=.;OPOS=118605163;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:22:22:15:15:7:7:0.318182:4:3:5:10:4:3:5:10
chrX	118678364	.	G	A	1930.41	PASS	AF=1;AO=122;DP=123;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0161503;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.945;QD=61.283;RBI=0.0207655;REFB=0;REVB=0.0130528;RO=0;SAF=64;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.82961e-06;OID=.;OPOS=118678364;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:123:126:0:0:122:126:1:58:64:0:0:60:66:0:0
chrX	118699320	.	A	G	2324.55	PASS	AF=1;AO=151;DP=151;FAO=153;FDP=153;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.013781;FXX=0.00649309;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.342;QD=60.7726;RBI=0.0293384;REFB=0;REVB=0.0259003;RO=0;SAF=67;SAR=84;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.74685e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.30602e-05;OID=.;OPOS=118699320;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:151:153:0:0:151:153:1:84:67:0:0:85:68:0:0
chrX	118827063	.	T	C	766.87	PASS	AF=0.410377;AO=87;DP=212;FAO=87;FDP=212;FR=.;FRO=125;FSAF=47;FSAR=40;FSRF=77;FSRR=48;FWDB=-0.00716036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.373;QD=14.4692;RBI=0.00987589;REFB=-0.00529067;REVB=0.00680166;RO=125;SAF=47;SAR=40;SRF=77;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0810039;STB=0.545284;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=0.00816607;OID=.;OPOS=118827063;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:212:212:125:125:87:87:0.410377:40:47:77:48:40:47:77:48
chrX	118829479	.	G	A	2060.85	PASS	AF=0.52356;AO=199;DP=381;FAO=200;FDP=382;FR=.;FRO=182;FSAF=125;FSAR=75;FSRF=94;FSRR=88;FWDB=-0.000659619;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.844;QD=21.5796;RBI=0.00997134;REFB=-0.00278587;REVB=0.0099495;RO=179;SAF=125;SAR=74;SRF=92;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102933;STB=0.553663;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.00258831;OID=.;OPOS=118829479;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:381:382:179:182:199:200:0.52356:74:125:92:87:75:125:94:88
chrX	118893054	.	C	A	33.34	PASS	AF=0.714286;AO=4;DP=7;FAO=5;FDP=7;FR=.;FRO=2;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0926037;FXX=0.124844;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.2865;QD=19.0507;RBI=0.0929056;REFB=0.0300651;REVB=0.00748341;RO=2;SAF=2;SAR=2;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.277405;STB=0.666029;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.026226;OID=.;OPOS=118893054;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:7:7:2:2:4:5:0.714286:2:2:0:2:2:3:0:2
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chrX	147088249	.	C	T	649.37	PASS	AF=0.457516;AO=70;DP=154;FAO=70;FDP=153;FR=.;FRO=83;FSAF=38;FSAR=32;FSRF=29;FSRR=54;FWDB=0.00521649;FXX=0.0129024;HRUN=1;LEN=1;MLLD=288.583;QD=16.9769;RBI=0.00542195;REFB=-0.0048215;REVB=0.00147844;RO=82;SAF=38;SAR=32;SRF=29;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.182431;STB=0.603814;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.00462417;OID=.;OPOS=147088249;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:154:153:82:83:70:70:0.457516:32:38:29:53:32:38:29:54
chrX	147903704	.	C	T	2648.15	PASS	AF=0.99422;AO=171;DP=173;FAO=172;FDP=173;FR=.;FRO=1;FSAF=83;FSAR=89;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00656682;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.5398;QD=61.2288;RBI=0.0255141;REFB=-0.0426915;REVB=-0.0246545;RO=1;SAF=82;SAR=89;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0057692;STB=0.502994;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=4.37469e-05;OID=.;OPOS=147903704;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:173:173:1:1:171:172:0.99422:89:82:1:0:89:83:1:0
chrX	147903927	.	C	T	698.94	PASS	AF=0.980392;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0198993;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.825;QD=54.8189;RBI=0.0202464;REFB=0.00546458;REVB=-0.00373284;RO=1;SAF=22;SAR=28;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0209158;STB=0.511107;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=5.03675e-05;OID=.;OPOS=147903927;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:51:51:1:1:50:50:0.980392:28:22:1:0:28:22:1:0
chrX	148627384	.	A	G	62.2	PASS	AF=1;AO=3;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.222011;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=39.023;QD=35.5409;RBI=0.228501;REFB=0;REVB=-0.0540689;RO=0;SAF=2;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0181057;OID=.;OPOS=148627384;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:3:7:1:1:2:0:0:1:6:0:0
chrX	148628490	.	A	T	465.87	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0267108;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.499;QD=58.2332;RBI=0.0303729;REFB=0;REVB=0.0144586;RO=0;SAF=18;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000113328;OID=.;OPOS=148628490;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:32:0:0:30:32:1:12:18:0:0:12:20:0:0
chrX	149013727	.	A	G	583.75	PASS	AF=0.952381;AO=39;DP=41;FAO=40;FDP=42;FR=.;FRO=2;FSAF=14;FSAR=26;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0145604;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.688;QD=55.5954;RBI=0.0176458;REFB=-0.0700159;REVB=0.00996853;RO=2;SAF=14;SAR=25;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0623593;STB=0.533316;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=0.00320442;OID=.;OPOS=149013727;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:41:42:2:2:39:40:0.952381:25:14:2:0:26:14:2:0
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chrX	153051907	.	G	A	265.3	PASS	AF=0.528302;AO=28;DP=53;FAO=28;FDP=53;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=0.000688894;FXX=0.0185151;HRUN=4;LEN=1;MLLD=157.184;QD=20.0224;RBI=0.0261614;REFB=-0.0105699;REVB=-0.0261523;RO=24;SAF=11;SAR=17;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0155877;STB=0.503524;STBP=0.99;TYPE=snp;VARB=0.00968833;OID=.;OPOS=153051907;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:24:25:28:28:0.528302:17:11:9:15:17:11:10:15
chrX	153073319	.	G	A	1201.2	PASS	AF=0.544601;AO=116;DP=212;FAO=116;FDP=213;FR=.;FRO=97;FSAF=56;FSAR=60;FSRF=64;FSRR=33;FWDB=-0.0322213;FXX=0.00467268;HRUN=3;LEN=1;MLLD=103.35;QD=22.5578;RBI=0.0328088;REFB=-0.0277968;REVB=0.00618098;RO=96;SAF=56;SAR=60;SRF=63;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143754;STB=0.580257;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.0155047;OID=.;OPOS=153073319;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:212:213:96:97:116:116:0.544601:60:56:63:33:60:56:64:33
chrX	153149708	.	G	GC	1260.9	PASS	AF=1;AO=91;DP=112;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000466178;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=245.315;QD=48.0341;RBI=0.00714304;REFB=0;REVB=0.00712781;RO=9;SAF=50;SAR=41;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0393717;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=5.82851e-05;OID=.;OPOS=153149709;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:91:112:105:105:0:52:53:0:0:23:9:50:41:7:2
chrX	153149715	.	C	G	1541.68	PASS	AF=1;AO=102;DP=102;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00171039;FXX=0.00961446;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.474;QD=59.871;RBI=0.00545934;REFB=0;REVB=-0.00518449;RO=0;SAF=52;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.306e-05;OID=.;OPOS=153149715;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:102:103:0:0:102:103:1:50:52:0:0:51:52:0:0
chrX	153171993	.	A	G	80.27	PASS	AF=0.526316;AO=10;DP=19;FAO=10;FDP=19;FR=.;FRO=9;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=-0.0124171;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.4844;QD=16.8985;RBI=0.0130678;REFB=-0.00185422;REVB=-0.00407221;RO=9;SAF=8;SAR=2;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150146;STB=0.588044;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=0.000538032;OID=.;OPOS=153171993;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:19:19:9:9:10:10:0.526316:2:8:6:3:2:8:6:3
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chrY	10034954	.	A	G	66.52	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0606854;FXX=0.124844;HRUN=3;LEN=1;MLLD=79.1098;QD=38.0142;RBI=0.0642543;REFB=0;REVB=0.0211164;RO=0;SAF=1;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00644072;OID=.;OPOS=10034954;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:6:1:0:0:6:1:0:0
chrY	10035368	.	G	C	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=50.3488;QD=33.4271;RBI=0.0175121;REFB=0;REVB=0.0175121;RO=0;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00212316;OID=.;OPOS=10035368;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:6:0:0:0:6:0:0:0
chrY	10035378	.	C	G	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.8919;QD=33.4285;RBI=0.042037;REFB=0;REVB=0.042037;RO=0;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0049887;OID=.;OPOS=10035378;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:6:0:0:0:6:0:0:0
chrY	10035382	.	T	C	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.453;QD=33.4285;RBI=0.0052893;REFB=0;REVB=0.0052893;RO=0;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0002407;OID=.;OPOS=10035382;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:6:0:0:0:6:0:0:0
chrY	10035424	.	A	G	88.55	PASS	AF=0.909091;AO=9;DP=10;FAO=10;FDP=11;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0131436;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=70.8038;QD=32.1987;RBI=0.0431047;REFB=-0.0189085;REVB=0.0410519;RO=1;SAF=3;SAR=6;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0684198;STB=0.533268;STBP=0.621;TYPE=snp;VARB=0.0147327;OID=.;OPOS=10035424;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:10:11:1:1:9:10:0.909091:6:3:0:1:7:3:0:1
chrY	10035433	.	T	C	145.82	PASS	AF=1;AO=10;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00150041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=294.376;QD=44.8663;RBI=0.0477157;REFB=0;REVB=0.0476921;RO=0;SAF=2;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000532334;OID=.;OPOS=10035433;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:10:13:1:8:2:0:0:10:3:0:0
chrY	10035449	.	G	C	164.33	PASS	AF=1;AO=14;DP=15;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130796;FXX=0.0666222;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.566;QD=46.9511;RBI=0.0254651;REFB=0;REVB=-0.0218494;RO=0;SAF=4;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.63386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000110985;OID=.;OPOS=10035449;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:14:0:0:14:14:1:10:4:0:0:10:4:0:0
chrY	10035822	.	T	C	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0250045;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.708;QD=35.5759;RBI=0.0251881;REFB=0;REVB=0.0030362;RO=0;SAF=2;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.27427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00085286;OID=.;OPOS=10035822;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:5:2:0:0:5:2:0:0
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chrY	10036164	.	T	C	7127.09	PASS	AF=1;AO=445;DP=446;FAO=445;FDP=445;FR=.;FRO=0;FSAF=352;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00325012;FXX=0.0022421;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.946;QD=64.0637;RBI=0.0216921;REFB=0;REVB=0.0214472;RO=0;SAF=352;SAR=93;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.17206e-06;OID=.;OPOS=10036164;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:38:446:445:0:0:445:445:1:93:352:0:0:93:352:0:0
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chrY	10036204	.	T	C	6918.51	PASS	AF=1;AO=435;DP=436;FAO=436;FDP=436;FR=.;FRO=0;FSAF=350;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0201114;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.8396;QD=63.4726;RBI=0.0772784;REFB=0;REVB=0.0746156;RO=1;SAF=350;SAR=85;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00558221;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000248776;OID=.;OPOS=10036204;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:35:436:436:1:0:435:436:1:85:350:0:1:86:350:0:0
chrY	10036229	.	T	C	4952.36	PASS	AF=1;AO=315;DP=316;FAO=315;FDP=315;FR=.;FRO=0;FSAF=293;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0192983;FXX=0.00316446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.879;QD=62.8871;RBI=0.0234631;REFB=0;REVB=-0.013345;RO=0;SAF=293;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.57098e-05;OID=.;OPOS=10036229;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:27:316:315:0:0:315:315:1:22:293:0:0:22:293:0:0
chrY	10036233	.	G	C	4367.82	PASS	AF=0.989399;AO=275;DP=279;FAO=280;FDP=283;FR=.;FRO=3;FSAF=268;FSAR=12;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0242131;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.967;QD=61.736;RBI=0.0324944;REFB=-0.0452616;REVB=-0.0216705;RO=3;SAF=263;SAR=12;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00540787;STB=0.502783;STBP=0.612;TYPE=snp;VARB=0.000242895;OID=.;OPOS=10036233;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:279:283:3:3:275:280:0.989399:12:263:3:0:12:268:3:0
chrY	10036269	.	A	G	1016.34	PASS	AF=0.985915;AO=69;DP=71;FAO=70;FDP=71;FR=.;FRO=1;FSAF=67;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0174517;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.494;QD=57.2587;RBI=0.0499509;REFB=0.0482616;REVB=-0.0468031;RO=1;SAF=67;SAR=2;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00700538;STB=0.503703;STBP=0.657;TYPE=snp;VARB=0.0010044;OID=.;OPOS=10036269;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:71:71:1:1:69:70:0.985915:2:67:1:0:3:67:1:0
chrY	10036277	.	A	G	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00671581;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=305.242;QD=51.1846;RBI=0.0144994;REFB=0;REVB=0.0128503;RO=0;SAF=17;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.97201e-05;OID=.;OPOS=10036277;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:3:17:0:0:3:17:0:0
chrY	10036280	.	A	G	255.92	PASS	AF=1;AO=19;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00231813;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.121;QD=51.1846;RBI=0.0245225;REFB=0;REVB=0.0244127;RO=0;SAF=16;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.59495e-05;OID=.;OPOS=10036280;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:19:20:1:3:16:0:0:3:17:0:0
chrY	10036383	.	G	C	88.22	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0524392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.666;QD=39.2068;RBI=0.062889;REFB=0;REVB=-0.0347154;RO=0;SAF=3;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000396744;OID=.;OPOS=10036383;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:6:3:0:0:6:3:0:0
chrY	10036408	.	C	A	115.58	PASS	AF=0.8;AO=12;DP=15;FAO=12;FDP=15;FR=.;FRO=3;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0541126;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=165.5;QD=30.8203;RBI=0.0598824;REFB=-0.0179774;REVB=0.0256462;RO=3;SAF=6;SAR=6;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0596449;STB=0.533278;STBP=0.71;TYPE=snp;VARB=0.00995869;OID=.;OPOS=10036408;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:15:15:3:3:12:12:0.8:6:6:1:2:6:6:1:2
chrY	10036422	.	C	T	181.25	PASS	AF=0.772727;AO=17;DP=22;FAO=17;FDP=22;FR=.;FRO=5;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=-0.0284337;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.624;QD=32.9538;RBI=0.0290083;REFB=-0.0194064;REVB=-0.00574513;RO=5;SAF=9;SAR=8;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135111;STB=0.574382;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=0.0289708;OID=.;OPOS=10036422;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:27:22:22:5:5:17:17:0.772727:8:9:1:4:8:9:1:4
chrY	10036431	.	T	C	35.55	PASS	AF=0.24;AO=6;DP=25;FAO=6;FDP=25;FR=.;FRO=19;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.0355976;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.378;QD=5.68777;RBI=0.0390622;REFB=-0.00145153;REVB=0.0160831;RO=19;SAF=1;SAR=5;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.39826;STB=0.768238;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=0.0115403;OID=.;OPOS=10036431;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:25:25:19:19:6:6:0.24:5:1:9:10:5:1:9:10
chrY	10036438	.	C	T	205.91	PASS	AF=0.730769;AO=19;DP=26;FAO=19;FDP=26;FR=.;FRO=7;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.00327432;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.694;QD=31.6785;RBI=0.0100404;REFB=-0.00584884;REVB=-0.00949147;RO=5;SAF=9;SAR=10;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.182989;STB=0.590073;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.0049597;OID=.;OPOS=10036438;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:26:26:5:7:19:19:0.730769:10:9:0:5:10:9:1:6
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chrY	10036453	.	T	G	96.69	PASS	AF=0.375;AO=11;DP=31;FAO=12;FDP=32;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=-0.00811733;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.018;QD=12.086;RBI=0.0325858;REFB=-0.00322883;REVB=0.0315586;RO=19;SAF=5;SAR=6;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0359763;STB=0.521241;STBP=0.863;TYPE=snp;VARB=0.00535301;OID=.;OPOS=10036453;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:31:32:19:20:11:12:0.375:6:5:8:11:7:5:9:11
chrY	10036483	.	T	C	538.53	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0309932;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.739;QD=59.8366;RBI=0.0310098;REFB=0;REVB=-0.00101431;RO=0;SAF=18;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.24239e-05;OID=.;OPOS=10036483;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:18:18:0:0:18:18:0:0
chrY	10036486	.	C	G	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00111416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.821;QD=59.4348;RBI=0.00580548;REFB=0;REVB=0.00569756;RO=0;SAF=18;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.5824e-05;OID=.;OPOS=10036486;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:17:18:0:0:17:18:0:0
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chrY	10037819	.	T	C	6435.11	PASS	AF=0.961883;AO=427;DP=451;FAO=429;FDP=446;FR=.;FRO=17;FSAF=227;FSAR=202;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=-0.00552307;FXX=0.0110862;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.014;QD=57.714;RBI=0.0971056;REFB=-0.117221;REVB=0.0969484;RO=17;SAF=226;SAR=201;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00429682;STB=0.502239;STBP=0.664;TYPE=snp;VARB=0.00445213;OID=.;OPOS=10037819;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:451:446:17:17:427:429:0.961883:201:226:8:9:202:227:8:9
chrY	10037877	.	G	GC	3365.86	PASS	AF=0.99455;AO=321;DP=410;FAO=365;FDP=367;FR=.;FRO=2;FSAF=204;FSAR=161;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0383226;FXX=0.0213328;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.6172;QD=36.6851;RBI=0.144539;REFB=-0.0355169;REVB=0.139366;RO=84;SAF=184;SAR=137;SRF=52;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0183885;STB=0.500326;STBP=0.854;TYPE=ins;VARB=0.0118301;OID=.;OPOS=10037878;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:0.99455:321:410:365:367:2:204:161:1:1:38:84:184:137:52:32
chrY	10037892	.	A	G	4249.78	PASS	AF=0.978417;AO=147;DP=298;FAO=272;FDP=278;FR=.,HEALED;FRO=6;FSAF=166;FSAR=106;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0880033;FXX=0.034721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.176;QD=61.1479;RBI=0.088624;REFB=-0.0439371;REVB=-0.0104705;RO=7;SAF=37;SAR=110;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0359118;STB=0.506265;STBP=0.182;TYPE=snp;VARB=0.0013228;OID=.;OPOS=10037892;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:298:278:7:6:147:272:0.978417:110:37:4:3:106:166:2:4
chrY	10037899	.	T	C	3610.18	PASS	AF=0.960474;AO=242;DP=252;FAO=243;FDP=253;FR=.;FRO=10;FSAF=152;FSAR=91;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=-0.0239496;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.2155;QD=57.078;RBI=0.0406744;REFB=-0.0554814;REVB=0.0328758;RO=10;SAF=151;SAR=91;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0099499;STB=0.50528;STBP=0.429;TYPE=snp;VARB=0.00469999;OID=.;OPOS=10037899;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:252:253:10:10:242:243:0.960474:91:151:5:5:91:152:5:5
chrY	10037912	.	T	G	2315.55	PASS	AF=0.993197;AO=146;DP=147;FAO=146;FDP=147;FR=.;FRO=1;FSAF=80;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0189831;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=98.3455;QD=63.0081;RBI=0.0269752;REFB=-0.0241182;REVB=-0.0191651;RO=1;SAF=80;SAR=66;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00715131;STB=0.503759;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=9.70956e-05;OID=.;OPOS=10037912;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:147:147:1:1:146:146:0.993197:66:80:0:1:66:80:0:1
chrY	10037914	.	T	C	2239.04	PASS	AF=1;AO=141;DP=141;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0298554;FXX=0.00704176;HRUN=3;LEN=1;MLLD=106.299;QD=63.5188;RBI=0.0333651;REFB=0;REVB=0.0148959;RO=0;SAF=80;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.01592e-05;OID=.;OPOS=10037914;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:141:141:0:0:141:141:1:61:80:0:0:61:80:0:0
chrY	13262908	.	C	G	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00283429;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=114.43;QD=35.5757;RBI=0.00283429;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=7;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.76501e-05;OID=.;OPOS=13262908;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:0:7:0:0:0:7:0:0
chrY	13262996	.	C	G	97.27	PASS	AF=0.207792;AO=16;DP=77;FAO=16;FDP=77;FR=.;FRO=61;FSAF=15;FSAR=1;FSRF=42;FSRR=19;FWDB=-0.0244344;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.151;QD=5.05284;RBI=0.0287632;REFB=-0.00822938;REVB=0.015175;RO=61;SAF=15;SAR=1;SRF=42;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.501502;STB=0.839772;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0342236;OID=.;OPOS=13262996;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:77:77:61:61:16:16:0.207792:1:15:42:19:1:15:42:19
chrY	13263010	.	G	A	141.32	PASS	AF=0.238636;AO=21;DP=88;FAO=21;FDP=88;FR=.;FRO=67;FSAF=17;FSAR=4;FSRF=44;FSRR=23;FWDB=-0.0112817;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=209.677;QD=6.42354;RBI=0.0132789;REFB=-0.00447537;REVB=0.00700379;RO=66;SAF=17;SAR=4;SRF=43;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.24988;STB=0.652753;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.0126642;OID=.;OPOS=13263010;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:66:67:21:21:0.238636:4:17:43:23:4:17:44:23
chrY	13263067	.	A	T	897.37	PASS	AF=1;AO=89;DP=93;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.177123;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.2836;QD=34.8494;RBI=0.221279;REFB=0;REVB=0.132634;RO=1;SAF=51;SAR=38;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00920269;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00173357;OID=.;OPOS=13263067;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:93:103:1:0:89:103:1:38:51:1:0:47:56:0:0
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chrY	13263170	.	A	C,T	171.61	PASS	AF=0.533333,0.466667;AO=8,7;DP=15;FAO=8,7;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=0,4;FSAR=8,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.129606,0.0826798;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=118.699,112.997;QD=45.7635;RBI=0.130248,0.0933532;REFB=0,0;REVB=-0.0129134,-0.0433459;RO=0;SAF=0,4;SAR=8,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00575643,0.00623205;OID=.,.;OPOS=13263170,13263170;OREF=A,A;OALT=C,T;OMAPALT=C,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:47:15:15:0:0:8,7:8,7:0.533333,0.466667:8,3:0,4:0:0:8,3:0,4:0:0
chrY	13263175	.	A	G	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0690695;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.0052;QD=45.806;RBI=0.0734898;REFB=0;REVB=-0.0251031;RO=0;SAF=4;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.63386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000559579;OID=.;OPOS=13263175;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:10:4:0:0:10:4:0:0
chrY	13263194	.	T	A	88.19	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.791;QD=39.1968;RBI=0.0384516;REFB=0;REVB=0.0384516;RO=0;SAF=0;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000561189;OID=.;OPOS=13263194;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:9:0:0:0:9:0:0:0
chrY	13263265	.	T	G	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0222125;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.9952;QD=37.4882;RBI=0.184914;REFB=0;REVB=0.183575;RO=0;SAF=7;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.78849e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0119719;OID=.;OPOS=13263265;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:1:7:0:0:1:7:0:0
chrY	13263304	.	C	T	43.68	PASS	AF=0.75;AO=6;DP=8;FAO=6;FDP=8;FR=.;FRO=2;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0106705;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=273.517;QD=21.8423;RBI=0.0260873;REFB=-0.0297738;REVB=0.0238052;RO=2;SAF=5;SAR=1;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144764;STB=0.583085;STBP=0.683;TYPE=snp;VARB=0.00104221;OID=.;OPOS=13263304;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:8:8:2:2:6:6:0.75:1:5:2:0:1:5:2:0
chrY	13524664	.	C	A	45.55	PASS	AF=0.857143;AO=6;DP=7;FAO=6;FDP=7;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0481451;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.186;QD=26.0262;RBI=0.0498651;REFB=-0.00149082;REVB=-0.0129837;RO=1;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171372;STB=0.599655;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.000868923;OID=.;OPOS=13524664;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:7:7:1:1:6:6:0.857143:2:4:0:1:2:4:0:1
chrY	21152662	.	CAA	C	505.75	PASS	AF=1;AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0570271;FXX=0.0227221;HRUN=4;LEN=2;MLLD=38.4584;QD=47.0461;RBI=0.0619767;REFB=0;REVB=0.0242698;RO=0;SAF=25;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.65211e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000663212;OID=.;OPOS=21152663;OREF=AA;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:43:44:43:43:0:25:18:0:0:9:0:25:18:0:0
chrY	21152701	.	G	T	613.36	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0293986;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.689;QD=61.3362;RBI=0.0358078;REFB=0;REVB=-0.0204431;RO=0;SAF=23;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.4817e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00016479;OID=.;OPOS=21152701;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:17:23:0:0:17:23:0:0
chrY	21152719	.	T	C	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0274899;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.833;QD=59.4356;RBI=0.0372378;REFB=0;REVB=0.0251189;RO=0;SAF=20;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00013964;OID=.;OPOS=21152719;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:15:20:0:0:15:20:0:0
chrY	21153609	.	T	C	1083.91	PASS	AF=1;AO=71;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0358274;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.5821;QD=60.2174;RBI=0.0406605;REFB=0;REVB=0.0192268;RO=0;SAF=33;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000450266;OID=.;OPOS=21153609;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:72:0:0:71:72:1:38:33:0:0:39:33:0:0
chrY	21154426	.	G	A	660.0	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00826367;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.634;QD=61.3952;RBI=0.0165557;REFB=0;REVB=-0.0143458;RO=0;SAF=22;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.92599e-05;OID=.;OPOS=21154426;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:21:22:0:0:21:22:0:0
chrY	21154466	.	T	A	613.33	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0596764;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.916;QD=61.3332;RBI=0.0636058;REFB=0;REVB=0.0220095;RO=0;SAF=21;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000144064;OID=.;OPOS=21154466;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:19:21:0:0:19:21:0:0